PeakID (cmd=annotatePeaks.pl S06_S6_SEACR.relaxed.bed hg38 -annStats S06_S6_SEACR.relaxed.log) Chr Start End Strand Peak Score Focus Ratio/Region Size Annotation Detailed Annotation Distance to TSS Nearest PromoterID Entrez ID Nearest Unigene Nearest Refseq Nearest Ensembl Gene Name Gene Alias Gene Description Gene Type chrY 11324623 11324817 157 - chrY:11324645-11324765 NA NA NA NA NA chrX-93 99948241 99948397 125 - chrX:99948305-99948377 NA NA NA NA NA chrX-92 99786899 99787367 252 - chrX:99787157-99787277 NA NA NA NA NA chrX-91 97177054 97177352 166 - chrX:97177271-97177305 NA NA NA NA NA chrX-90 97030276 97030619 221 - chrX:97030318-97030417 NA NA NA NA NA chrX-89 96099595 96099774 134 - chrX:96099648-96099737 NA NA NA NA NA chrX-88 95875807 95876114 171 - chrX:95875861-95875896 NA NA NA NA NA chrX-87 94339960 94340371 263 - chrX:94340014-94340184 NA NA NA NA NA chrX-86 91318994 91319299 171 - chrX:91319209-91319246 NA NA NA NA NA chrX-85 90058198 90058413 123 - chrX:90058382-90058413 NA NA NA NA NA chrX-84 90027389 90027842 311 - chrX:90027590-90027842 NA NA NA NA NA chrX-83 89095623 89095808 140 - chrX:89095686-89095781 NA NA NA NA NA chrX-82 88864482 88864818 188 - chrX:88864663-88864769 NA NA NA NA NA chrX-81 88641109 88641341 120 - chrX:88641170-88641178 NA NA NA NA NA chrX-80 87670553 87670784 147 - chrX:87670651-87670714 NA NA NA NA NA chrX-79 87179862 87180218 171 - chrX:87180014-87180022 NA NA NA NA NA chrX-78 86341709 86341929 119 - chrX:86341784-86341802 NA NA NA NA NA chrX-77 85436018 85436524 273 - chrX:85436313-85436477 NA NA NA NA NA chrX-76 85368100 85368329 205 - chrX:85368130-85368311 NA NA NA NA NA chrX-75 84665452 84665639 125 - chrX:84665506-84665569 NA NA NA NA NA chrX-74 84106853 84107162 137 - chrX:84106942-84107042 NA NA NA NA NA chrX-73 83919529 83919857 166 - chrX:83919637-83919749 NA NA NA NA NA chrX-72 82310700 82311090 246 - chrX:82310978-82311080 NA NA NA NA NA chrX-71 81751333 81751499 145 - chrX:81751375-81751499 NA NA NA NA NA chrX-70 79800232 79800495 154 - chrX:79800357-79800434 NA NA NA NA NA chrX-69 79478960 79479444 257 - chrX:79479223-79479229 NA NA NA NA NA chrX-68 79185914 79186202 170 - chrX:79185966-79186018 NA NA NA NA NA chrX-67 79162400 79162803 255 - chrX:79162502-79162646 NA NA NA NA NA chrX-66 78852910 78853234 250 - chrX:78852993-78853169 NA NA NA NA NA chrX-65 77826432 77826628 119 - chrX:77826575-77826617 NA NA NA NA NA chrX-64 77795207 77795383 125 - chrX:77795255-77795323 NA NA NA NA NA chrX-63 76075081 76075364 184 - chrX:76075197-76075282 NA NA NA NA NA chrX-62 75687252 75687400 132 - chrX:75687302-75687386 NA NA NA NA NA chrX-61 75669846 75670217 165 - chrX:75669896-75669959 NA NA NA NA NA chrX-60 75216934 75217271 267 - chrX:75217033-75217090 NA NA NA NA NA chrX-59 74136725 74137081 168 - chrX:74136942-74136980 NA NA NA NA NA chrX-58 73847743 73847975 205 - chrX:73847751-73847875 NA NA NA NA NA chrX-57 72215998 72216382 268 - chrX:72216208-72216360 NA NA NA NA NA chrX-56 71936378 71936575 151 - chrX:71936454-71936539 NA NA NA NA NA chrX-55 71913921 71914318 259 - chrX:71914054-71914175 NA NA NA NA NA chrX-54 70333394 70333687 269 - chrX:70333395-70333592 NA NA NA NA NA chrX-53 69800793 69801376 304 - chrX:69801057-69801096 NA NA NA NA NA chrX-52 69658367 69658781 254 - chrX:69658535-69658629 NA NA NA NA NA chrX-51 66876008 66876382 191 - chrX:66876205-66876213 NA NA NA NA NA chrX-50 66376763 66376990 160 - chrX:66376767-66376860 NA NA NA NA NA chrX-49 65911695 65911987 181 - chrX:65911896-65911966 NA NA NA NA NA chrX-48 65145446 65145820 211 - chrX:65145615-65145659 NA NA NA NA NA chrX-47 64720100 64720301 178 - chrX:64720100-64720209 NA NA NA NA NA chrX-46 63804496 63805101 355 - chrX:63804801-63804846 NA NA NA NA NA chrX-45 62712042 62712327 129 - chrX:62712237-62712288 NA NA NA NA NA chrX-44 58183139 58183596 236 - chrX:58183284-58183299 NA NA NA NA NA chrX-43 57210634 57210884 164 - chrX:57210655-57210733 NA NA NA NA NA chrX-42 53388508 53388707 137 - chrX:53388548-53388623 NA NA NA NA NA chrX-41 51911382 51911781 318 - chrX:51911429-51911666 NA NA NA NA NA chrX-40 51664049 51664225 143 - chrX:51664100-51664210 NA NA NA NA NA chrX-39 51225245 51225532 244 - chrX:51225321-51225500 NA NA NA NA NA chrX-38 47848720 47849024 184 - chrX:47848764-47848828 NA NA NA NA NA chrX-37 47647628 47647950 195 - chrX:47647786-47647916 NA NA NA NA NA chrX-36 47569873 47570164 143 - chrX:47569979-47570002 NA NA NA NA NA chrX-35 47353536 47353794 135 - chrX:47353627-47353639 NA NA NA NA NA chrX-34 46894447 46894914 236 - chrX:46894520-46894679 NA NA NA NA NA chrX-33 45911502 45911968 258 - chrX:45911548-45911598 NA NA NA NA NA chrX-32 45077702 45077949 173 - chrX:45077743-45077842 NA NA NA NA NA chrX-31 44852765 44852976 151 - chrX:44852897-44852940 NA NA NA NA NA chrX-30 44756471 44756863 222 - chrX:44756645-44756705 NA NA NA NA NA chrX-29 44349602 44349886 215 - chrX:44349743-44349841 NA NA NA NA NA chrX-28 44316652 44316951 154 - chrX:44316737-44316746 NA NA NA NA NA chrX-27 43577755 43578268 261 - chrX:43577950-43577959 NA NA NA NA NA chrX-26 42865479 42865760 187 - chrX:42865645-42865738 NA NA NA NA NA chrX-25 42373154 42373302 147 - chrX:42373156-42373302 NA NA NA NA NA chrX-24 41356630 41356899 199 - chrX:41356701-41356832 NA NA NA NA NA chrX-23 41123332 41123575 203 - chrX:41123395-41123478 NA NA NA NA NA chrX-22 39748334 39748562 137 - chrX:39748440-39748486 NA NA NA NA NA chrX-21 39175028 39175436 220 - chrX:39175096-39175159 NA NA NA NA NA chrX-20 38474136 38474822 356 - chrX:38474457-38474465 NA NA NA NA NA chrX-19 38448717 38448989 193 - chrX:38448772-38448886 NA NA NA NA NA chrX-18 38125110 38125304 133 - chrX:38125208-38125280 NA NA NA NA NA chrX-17 37425119 37425368 228 - chrX:37425144-37425309 NA NA NA NA NA chrX-16 35953423 35953919 235 - chrX:35953755-35953871 NA NA NA NA NA chrX-15 35719495 35719902 136 - chrX:35719847-35719850 NA NA NA NA NA chrX-14 31653731 31654101 189 - chrX:31653923-31653953 NA NA NA NA NA chrX-13 28313514 28313710 122 - chrX:28313610-28313658 NA NA NA NA NA chrX-12 28029397 28029631 202 - chrX:28029427-28029597 NA NA NA NA NA chrX-11 27607329 27607529 125 - chrX:27607404-27607454 NA NA NA NA NA chrX-10 24254902 24255338 357 - chrX:24254990-24255268 NA NA NA NA NA chrX-9 21475900 21476198 136 - chrX:21475999-21476081 NA NA NA NA NA chrX-8 20982797 20983014 159 - chrX:20982910-20983011 NA NA NA NA NA chrX-7 20205953 20206362 247 - chrX:20206021-20206106 NA NA NA NA NA chrX-6 17547461 17547603 118 - chrX:17547496-17547590 NA NA NA NA NA chrX-5 17019339 17019639 247 - chrX:17019387-17019581 NA NA NA NA NA chrX-4 16950702 16950988 169 - chrX:16950729-16950859 NA NA NA NA NA chrX-120 150018099 150018294 178 - chrX:150018166-150018293 NA NA NA NA NA chrX-119 148828974 148829374 233 - chrX:148829147-148829225 NA NA NA NA NA chrX-118 146960082 146960267 133 - chrX:146960108-146960137 NA NA NA NA NA chrX-117 146952370 146952726 174 - chrX:146952573-146952607 NA NA NA NA NA chrX-116 145210312 145210536 210 - chrX:145210312-145210480 NA NA NA NA NA chrX-115 142797488 142797892 164 - chrX:142797509-142797593 NA NA NA NA NA chrX-114 141807963 141808422 237 - chrX:141808137-141808184 NA NA NA NA NA chrX-113 139601857 139602196 159 - chrX:139602065-139602100 NA NA NA NA NA chrX-112 129052303 129052533 131 - chrX:129052501-129052533 NA NA NA NA NA chrX-111 127209839 127210084 145 - chrX:127209948-127209993 NA NA NA NA NA chrX-110 126686968 126687202 165 - chrX:126687101-126687197 NA NA NA NA NA chrX-109 125338291 125338474 171 - chrX:125338314-125338449 NA NA NA NA NA chrX-108 122423448 122423716 168 - chrX:122423545-122423613 NA NA NA NA NA chrX-107 120241486 120241900 181 - chrX:120241793-120241889 NA NA NA NA NA chrX-106 119259363 119259818 319 - chrX:119259410-119259593 NA NA NA NA NA chrX-105 118026765 118027165 274 - chrX:118026848-118026996 NA NA NA NA NA chrX-104 114927471 114927882 285 - chrX:114927486-114927578 NA NA NA NA NA chrX-103 113902506 113902841 281 - chrX:113902617-113902806 NA NA NA NA NA chrX-3 11377174 11377424 143 - chrX:11377324-11377360 NA NA NA NA NA chrX-2 11310509 11310809 161 - chrX:11310749-11310771 NA NA NA NA NA chrX-102 112665635 112665950 225 - chrX:112665738-112665899 NA NA NA NA NA chrX 11135811 11136074 190 - chrX:11135919-11136036 NA NA NA NA NA chrX-101 108740608 108741003 182 - chrX:108740847-108740868 NA NA NA NA NA chrX-100 107833818 107834075 199 - chrX:107833888-107834021 NA NA NA NA NA chrX-99 106896720 106897353 354 - chrX:106897111-106897186 NA NA NA NA NA chrX-98 104961790 104962127 285 - chrX:104961894-104962127 NA NA NA NA NA chrX-97 101781107 101781365 170 - chrX:101781213-101781331 NA NA NA NA NA chrX-96 101063192 101063375 117 - chrX:101063228-101063279 NA NA NA NA NA chrX-95 100277155 100277322 139 - chrX:100277211-100277322 NA NA NA NA NA chrX-94 100216159 100216582 237 - chrX:100216366-100216459 NA NA NA NA NA chrUn_KI270589v1 44114 44435 164 - chrUn_KI270589v1:44272-44336 NA NA NA NA NA chrUn_KI270519v1 81253 81567 201 - chrUn_KI270519v1:81306-81434 NA NA NA NA NA chrUn_GL000216v2 2918 3258 237 - chrUn_GL000216v2:2978-3026 NA NA NA NA NA chr9-266 99780121 99780325 171 - chr9:99780181-99780301 NA NA NA NA NA chr9-265 99683281 99683628 188 - chr9:99683314-99683427 NA NA NA NA NA chr9-264 99180125 99180355 148 - chr9:99180177-99180263 NA NA NA NA NA chr9-263 98888448 98888858 294 - chr9:98888655-98888833 NA NA NA NA NA chr9-262 98883845 98884099 177 - chr9:98883927-98884037 NA NA NA NA NA chr9-261 98296407 98296989 319 - chr9:98296544-98296621 NA NA NA NA NA chr9-23 9800741 9801122 140 - chr9:9801057-9801106 NA NA NA NA NA chr9-260 97801318 97801575 164 - chr9:97801401-97801472 NA NA NA NA NA chr9-259 97683137 97683605 329 - chr9:97683217-97683407 NA NA NA NA NA chr9-258 97345598 97345917 186 - chr9:97345724-97345777 NA NA NA NA NA chr9-257 96708963 96709216 176 - chr9:96708998-96709097 NA NA NA NA NA chr9-256 96258061 96258291 137 - chr9:96258066-96258172 NA NA NA NA NA chr9-255 96255980 96256155 130 - chr9:96256033-96256134 NA NA NA NA NA chr9-254 96222038 96222308 161 - chr9:96222177-96222229 NA NA NA NA NA chr9-253 96161794 96161994 143 - chr9:96161809-96161895 NA NA NA NA NA chr9-252 95970732 95971145 201 - chr9:95970837-95970843 NA NA NA NA NA chr9-251 94877773 94878082 215 - chr9:94877953-94877996 NA NA NA NA NA chr9-250 94736731 94736996 208 - chr9:94736757-94736846 NA NA NA NA NA chr9-249 94534554 94534714 137 - chr9:94534589-94534657 NA NA NA NA NA chr9-248 94446503 94446691 166 - chr9:94446507-94446663 NA NA NA NA NA chr9-247 94244063 94244365 198 - chr9:94244089-94244183 NA NA NA NA NA chr9-246 94034753 94035207 270 - chr9:94034837-94034923 NA NA NA NA NA chr9-245 93792456 93792905 269 - chr9:93792611-93792669 NA NA NA NA NA chr9-244 93174493 93174743 234 - chr9:93174522-93174740 NA NA NA NA NA chr9-243 92449731 92449899 114 - chr9:92449758-92449854 NA NA NA NA NA chr9-242 92304861 92305090 134 - chr9:92304918-92304957 NA NA NA NA NA chr9-241 91744923 91745123 134 - chr9:91744971-91745039 NA NA NA NA NA chr9-240 91455235 91455615 236 - chr9:91455481-91455583 NA NA NA NA NA chr9-239 91453879 91454065 177 - chr9:91453879-91454053 NA NA NA NA NA chr9-238 90917646 90917912 187 - chr9:90917690-90917798 NA NA NA NA NA chr9-237 90871433 90871934 279 - chr9:90871573-90871630 NA NA NA NA NA chr9-236 90646597 90646939 171 - chr9:90646796-90646852 NA NA NA NA NA chr9-235 90425375 90425696 218 - chr9:90425495-90425610 NA NA NA NA NA chr9-234 90244350 90244795 275 - chr9:90244430-90244535 NA NA NA NA NA chr9-233 89841244 89841572 160 - chr9:89841462-89841554 NA NA NA NA NA chr9-232 89787167 89787754 308 - chr9:89787464-89787481 NA NA NA NA NA chr9-231 89473167 89473528 295 - chr9:89473283-89473512 NA NA NA NA NA chr9-230 89433919 89434129 160 - chr9:89433939-89434049 NA NA NA NA NA chr9-229 89338082 89338461 203 - chr9:89338154-89338202 NA NA NA NA NA chr9-228 89299020 89299293 201 - chr9:89299091-89299218 NA NA NA NA NA chr9-227 88951834 88952073 139 - chr9:88951919-88951928 NA NA NA NA NA chr9-226 88849387 88849544 120 - chr9:88849418-88849505 NA NA NA NA NA chr9-225 88603503 88603795 169 - chr9:88603738-88603784 NA NA NA NA NA chr9-224 88028353 88028744 224 - chr9:88028525-88028592 NA NA NA NA NA chr9-223 87878521 87878932 258 - chr9:87878636-87878741 NA NA NA NA NA chr9-222 87781303 87781920 356 - chr9:87781489-87781584 NA NA NA NA NA chr9-221 87649880 87650122 136 - chr9:87650061-87650091 NA NA NA NA NA chr9-220 87503454 87503900 251 - chr9:87503496-87503648 NA NA NA NA NA chr9-219 87203364 87203939 359 - chr9:87203655-87203798 NA NA NA NA NA chr9-218 86374286 86374565 217 - chr9:86374323-86374478 NA NA NA NA NA chr9-217 86343348 86343752 249 - chr9:86343492-86343586 NA NA NA NA NA chr9-216 85982209 85982595 261 - chr9:85982322-85982504 NA NA NA NA NA chr9-215 85956109 85956379 126 - chr9:85956231-85956309 NA NA NA NA NA chr9-214 85484018 85484191 148 - chr9:85484109-85484182 NA NA NA NA NA chr9-213 85344513 85344805 193 - chr9:85344588-85344634 NA NA NA NA NA chr9-212 85199288 85199597 179 - chr9:85199376-85199425 NA NA NA NA NA chr9-211 85158925 85159260 202 - chr9:85159097-85159140 NA NA NA NA NA chr9-210 84991605 84991756 136 - chr9:84991614-84991705 NA NA NA NA NA chr9-209 84889397 84889697 190 - chr9:84889605-84889685 NA NA NA NA NA chr9-208 84703857 84704089 143 - chr9:84703888-84703942 NA NA NA NA NA chr9-207 84202006 84202509 352 - chr9:84202187-84202368 NA NA NA NA NA chr9-206 83691733 83692026 182 - chr9:83691904-83691975 NA NA NA NA NA chr9-205 83638138 83638506 275 - chr9:83638237-83638415 NA NA NA NA NA chr9-204 83317984 83318292 236 - chr9:83318055-83318219 NA NA NA NA NA chr9-203 83263450 83263756 217 - chr9:83263539-83263667 NA NA NA NA NA chr9-22 8314754 8314978 164 - chr9:8314803-8314907 NA NA NA NA NA chr9-202 82606583 82606853 138 - chr9:82606585-82606679 NA NA NA NA NA chr9-201 82604991 82605298 149 - chr9:82605164-82605185 NA NA NA NA NA chr9-200 82579572 82579847 122 - chr9:82579746-82579757 NA NA NA NA NA chr9-199 82555766 82556324 295 - chr9:82556126-82556188 NA NA NA NA NA chr9-198 82539388 82539594 144 - chr9:82539469-82539551 NA NA NA NA NA chr9-197 82136536 82136875 172 - chr9:82136707-82136720 NA NA NA NA NA chr9-21 8180284 8180611 185 - chr9:8180468-8180483 NA NA NA NA NA chr9-196 81771796 81771983 114 - chr9:81771901-81771942 NA NA NA NA NA chr9-195 81040520 81040856 241 - chr9:81040684-81040830 NA NA NA NA NA chr9-194 80992201 80992499 193 - chr9:80992258-80992346 NA NA NA NA NA chr9-20 8092896 8093384 305 - chr9:8093127-8093249 NA NA NA NA NA chr9-193 80664180 80664632 217 - chr9:80664477-80664545 NA NA NA NA NA chr9-192 80443138 80443647 301 - chr9:80443251-80443358 NA NA NA NA NA chr9-191 80341670 80341917 152 - chr9:80341778-80341861 NA NA NA NA NA chr9-190 80028259 80028554 213 - chr9:80028320-80028451 NA NA NA NA NA chr9-189 79902546 79902851 215 - chr9:79902647-79902772 NA NA NA NA NA chr9-188 79350093 79350484 256 - chr9:79350272-79350291 NA NA NA NA NA chr9-187 79236811 79237158 165 - chr9:79236951-79236962 NA NA NA NA NA chr9-186 78694134 78694427 152 - chr9:78694319-78694418 NA NA NA NA NA chr9-185 78569954 78570269 195 - chr9:78569999-78570154 NA NA NA NA NA chr9-184 78221426 78221756 244 - chr9:78221533-78221733 NA NA NA NA NA chr9-183 78044631 78045074 277 - chr9:78044857-78044968 NA NA NA NA NA chr9-182 77642122 77642600 243 - chr9:77642253-77642301 NA NA NA NA NA chr9-181 77580130 77580573 207 - chr9:77580262-77580273 NA NA NA NA NA chr9-180 77428630 77429037 230 - chr9:77428819-77428872 NA NA NA NA NA chr9-179 77342374 77342825 270 - chr9:77342495-77342584 NA NA NA NA NA chr9-178 77042106 77042294 127 - chr9:77042206-77042246 NA NA NA NA NA chr9-177 76929785 76930068 183 - chr9:76929927-76930010 NA NA NA NA NA chr9-176 76706300 76706548 145 - chr9:76706429-76706471 NA NA NA NA NA chr9-175 76471455 76471798 208 - chr9:76471508-76471581 NA NA NA NA NA chr9-174 76274467 76274865 212 - chr9:76274487-76274637 NA NA NA NA NA chr9-173 76247499 76247839 170 - chr9:76247692-76247732 NA NA NA NA NA chr9-172 75977935 75978166 138 - chr9:75978081-75978126 NA NA NA NA NA chr9-171 75956860 75957324 260 - chr9:75957112-75957168 NA NA NA NA NA chr9-170 75442256 75442700 223 - chr9:75442483-75442485 NA NA NA NA NA chr9-169 75395987 75396255 174 - chr9:75396153-75396185 NA NA NA NA NA chr9-168 75000063 75000565 274 - chr9:75000332-75000378 NA NA NA NA NA chr9-167 74674635 74674790 131 - chr9:74674648-74674771 NA NA NA NA NA chr9-166 74664474 74664757 144 - chr9:74664633-74664638 NA NA NA NA NA chr9-165 74621239 74621517 154 - chr9:74621401-74621431 NA NA NA NA NA chr9-164 74506076 74506287 158 - chr9:74506169-74506274 NA NA NA NA NA chr9-163 74242140 74242592 222 - chr9:74242358-74242413 NA NA NA NA NA chr9-162 73923856 73924222 223 - chr9:73924029-73924064 NA NA NA NA NA chr9-161 73894595 73894970 292 - chr9:73894607-73894816 NA NA NA NA NA chr9-160 73809939 73810339 178 - chr9:73810160-73810264 NA NA NA NA NA chr9-159 73390864 73391023 138 - chr9:73390891-73391022 NA NA NA NA NA chr9-158 73095802 73096073 244 - chr9:73095846-73096063 NA NA NA NA NA chr9-157 73073387 73073561 149 - chr9:73073421-73073495 NA NA NA NA NA chr9-156 72957358 72957753 206 - chr9:72957545-72957551 NA NA NA NA NA chr9-155 72834161 72834425 131 - chr9:72834336-72834388 NA NA NA NA NA chr9-154 72551914 72552187 207 - chr9:72551962-72552103 NA NA NA NA NA chr9-153 72470239 72470449 138 - chr9:72470286-72470352 NA NA NA NA NA chr9-152 71607014 71607279 129 - chr9:71607117-71607132 NA NA NA NA NA chr9-151 70945387 70945704 122 - chr9:70945530-70945587 NA NA NA NA NA chr9-150 70912444 70912745 201 - chr9:70912681-70912717 NA NA NA NA NA chr9-149 70800815 70801101 148 - chr9:70800959-70800990 NA NA NA NA NA chr9-148 70405325 70405647 201 - chr9:70405467-70405589 NA NA NA NA NA chr9-147 70382082 70382338 193 - chr9:70382166-70382338 NA NA NA NA NA chr9-146 69514008 69514238 118 - chr9:69514084-69514090 NA NA NA NA NA chr9-145 69219309 69219525 143 - chr9:69219457-69219477 NA NA NA NA NA chr9-144 69108575 69108831 207 - chr9:69108599-69108757 NA NA NA NA NA chr9-143 69043859 69044157 151 - chr9:69043886-69043970 NA NA NA NA NA chr9-142 69007467 69007696 208 - chr9:69007548-69007693 NA NA NA NA NA chr9-141 68967978 68968150 115 - chr9:68968090-68968148 NA NA NA NA NA chr9-140 68493001 68493311 174 - chr9:68493134-68493174 NA NA NA NA NA chr9-19 5873005 5873194 160 - chr9:5873029-5873102 NA NA NA NA NA chr9-18 5806109 5806385 175 - chr9:5806263-5806337 NA NA NA NA NA chr9-17 5561142 5561572 325 - chr9:5561221-5561441 NA NA NA NA NA chr9-16 4704074 4704247 153 - chr9:4704129-4704222 NA NA NA NA NA chr9-15 4613941 4614429 365 - chr9:4614025-4614267 NA NA NA NA NA chr9-14 3968374 3968907 335 - chr9:3968618-3968732 NA NA NA NA NA chr9-13 3881508 3881654 116 - chr9:3881522-3881608 NA NA NA NA NA chr9-139 38356546 38356748 118 - chr9:38356639-38356729 NA NA NA NA NA chr9-138 38259933 38260137 145 - chr9:38260010-38260132 NA NA NA NA NA chr9-137 38202672 38202855 117 - chr9:38202766-38202817 NA NA NA NA NA chr9-136 38174726 38175174 264 - chr9:38174832-38174964 NA NA NA NA NA chr9-135 37779185 37779523 225 - chr9:37779263-37779375 NA NA NA NA NA chr9-134 37661858 37662171 161 - chr9:37662072-37662081 NA NA NA NA NA chr9-133 37604513 37604723 133 - chr9:37604616-37604672 NA NA NA NA NA chr9-12 3754996 3755310 140 - chr9:3755197-3755217 NA NA NA NA NA chr9-132 37262974 37263274 201 - chr9:37263038-37263140 NA NA NA NA NA chr9-131 37244785 37245285 252 - chr9:37244982-37245064 NA NA NA NA NA chr9-130 37228816 37229142 160 - chr9:37228994-37229012 NA NA NA NA NA chr9-129 37186376 37186649 179 - chr9:37186540-37186625 NA NA NA NA NA chr9-128 36989340 36989553 155 - chr9:36989438-36989535 NA NA NA NA NA chr9-127 36719233 36719574 217 - chr9:36719359-36719489 NA NA NA NA NA chr9-126 36636587 36637001 243 - chr9:36636695-36636809 NA NA NA NA NA chr9-125 36574013 36574360 175 - chr9:36574072-36574075 NA NA NA NA NA chr9-11 3643438 3643729 173 - chr9:3643462-3643517 NA NA NA NA NA chr9-10 3630420 3630756 148 - chr9:3630649-3630691 NA NA NA NA NA chr9-124 35876863 35877334 235 - chr9:35876927-35876943 NA NA NA NA NA chr9-123 35872473 35872654 159 - chr9:35872480-35872573 NA NA NA NA NA chr9-122 35720783 35721123 233 - chr9:35720854-35720908 NA NA NA NA NA chr9-121 35602352 35602529 158 - chr9:35602410-35602523 NA NA NA NA NA chr9-120 35494543 35494798 190 - chr9:35494592-35494717 NA NA NA NA NA chr9-119 34776589 34777163 259 - chr9:34776817-34776819 NA NA NA NA NA chr9-118 34771967 34772411 261 - chr9:34772126-34772204 NA NA NA NA NA chr9-117 34335395 34335575 153 - chr9:34335425-34335569 NA NA NA NA NA chr9-116 34310160 34310400 153 - chr9:34310181-34310305 NA NA NA NA NA chr9-115 34269051 34269267 171 - chr9:34269096-34269222 NA NA NA NA NA chr9-114 34234918 34235288 245 - chr9:34235136-34235187 NA NA NA NA NA chr9-113 34224941 34225229 203 - chr9:34224983-34225101 NA NA NA NA NA chr9-112 34027273 34027655 217 - chr9:34027505-34027557 NA NA NA NA NA chr9-111 34005279 34005658 244 - chr9:34005326-34005435 NA NA NA NA NA chr9-110 33925838 33926233 233 - chr9:33926094-33926165 NA NA NA NA NA chr9-109 33286422 33286683 187 - chr9:33286485-33286598 NA NA NA NA NA chr9-108 33196523 33196951 251 - chr9:33196654-33196728 NA NA NA NA NA chr9-107 32769145 32769578 187 - chr9:32769176-32769281 NA NA NA NA NA chr9-106 32615561 32616011 243 - chr9:32615813-32615849 NA NA NA NA NA chr9-105 32542757 32543449 347 - chr9:32542811-32542857 NA NA NA NA NA chr9-104 32366430 32366723 185 - chr9:32366533-32366610 NA NA NA NA NA chr9-103 32307518 32307786 187 - chr9:32307679-32307785 NA NA NA NA NA chr9-102 32174711 32174949 161 - chr9:32174729-32174813 NA NA NA NA NA chr9-101 32140505 32140760 140 - chr9:32140658-32140679 NA NA NA NA NA chr9-100 31876157 31876513 220 - chr9:31876164-31876248 NA NA NA NA NA chr9-99 31834075 31834315 126 - chr9:31834141-31834229 NA NA NA NA NA chr9-98 31743879 31744172 195 - chr9:31743953-31744050 NA NA NA NA NA chr9-97 31365348 31365620 212 - chr9:31365481-31365513 NA NA NA NA NA chr9-96 31145365 31145932 206 - chr9:31145812-31145829 NA NA NA NA NA chr9-95 30983773 30984029 221 - chr9:30983774-30983890 NA NA NA NA NA chr9-94 30982377 30982724 276 - chr9:30982447-30982652 NA NA NA NA NA chr9-93 30912711 30912903 146 - chr9:30912770-30912870 NA NA NA NA NA chr9-92 30863154 30863602 145 - chr9:30863465-30863509 NA NA NA NA NA chr9-91 30621613 30621874 137 - chr9:30621707-30621740 NA NA NA NA NA chr9-90 30500229 30500551 218 - chr9:30500241-30500355 NA NA NA NA NA chr9-89 30410197 30410543 265 - chr9:30410242-30410426 NA NA NA NA NA chr9-88 30400314 30400526 155 - chr9:30400349-30400447 NA NA NA NA NA chr9-87 30317486 30317955 257 - chr9:30317589-30317652 NA NA NA NA NA chr9-9 3026600 3026888 179 - chr9:3026768-3026838 NA NA NA NA NA chr9-86 29858833 29859240 170 - chr9:29858935-29858943 NA NA NA NA NA chr9-85 29615392 29615809 182 - chr9:29615681-29615736 NA NA NA NA NA chr9-84 29585708 29586102 220 - chr9:29585874-29585920 NA NA NA NA NA chr9-83 29465278 29465548 150 - chr9:29465431-29465434 NA NA NA NA NA chr9-82 29424740 29424956 138 - chr9:29424747-29424807 NA NA NA NA NA chr9-81 29389461 29389647 127 - chr9:29389570-29389626 NA NA NA NA NA chr9-80 29140973 29141328 208 - chr9:29141071-29141237 NA NA NA NA NA chr9-79 28674905 28675229 123 - chr9:28674936-28674992 NA NA NA NA NA chr9-78 28504443 28504726 149 - chr9:28504619-28504640 NA NA NA NA NA chr9-77 28474689 28474921 202 - chr9:28474721-28474833 NA NA NA NA NA chr9-76 28433170 28433486 231 - chr9:28433240-28433386 NA NA NA NA NA chr9-8 2837512 2837802 172 - chr9:2837661-2837715 NA NA NA NA NA chr9-75 28294273 28294424 118 - chr9:28294320-28294386 NA NA NA NA NA chr9-74 28207939 28208385 317 - chr9:28208178-28208381 NA NA NA NA NA chr9-73 28204203 28204553 182 - chr9:28204426-28204440 NA NA NA NA NA chr9-72 28071630 28071948 190 - chr9:28071707-28071879 NA NA NA NA NA chr9-71 27917624 27917948 170 - chr9:27917775-27917791 NA NA NA NA NA chr9-70 27907678 27907892 130 - chr9:27907698-27907744 NA NA NA NA NA chr9-69 27717406 27717673 226 - chr9:27717486-27717671 NA NA NA NA NA chr9-68 27525421 27525554 115 - chr9:27525429-27525526 NA NA NA NA NA chr9-67 27520697 27520951 178 - chr9:27520834-27520936 NA NA NA NA NA chr9-66 27455865 27456362 263 - chr9:27456209-27456238 NA NA NA NA NA chr9-65 27403168 27403511 124 - chr9:27403444-27403463 NA NA NA NA NA chr9-64 27329989 27330474 355 - chr9:27330207-27330382 NA NA NA NA NA chr9-63 27142027 27142390 240 - chr9:27142189-27142306 NA NA NA NA NA chr9-62 27099478 27099677 183 - chr9:27099485-27099658 NA NA NA NA NA chr9-61 26981951 26982275 170 - chr9:26982144-26982230 NA NA NA NA NA chr9-60 26967232 26967481 118 - chr9:26967285-26967324 NA NA NA NA NA chr9-59 26784850 26785145 169 - chr9:26784998-26785041 NA NA NA NA NA chr9-58 26759534 26759929 155 - chr9:26759733-26759808 NA NA NA NA NA chr9-57 26457568 26457723 126 - chr9:26457580-26457677 NA NA NA NA NA chr9-56 26171097 26171516 230 - chr9:26171347-26171514 NA NA NA NA NA chr9-55 24517065 24517504 330 - chr9:24517226-24517447 NA NA NA NA NA chr9-54 24401930 24402415 180 - chr9:24402048-24402131 NA NA NA NA NA chr9-53 24333247 24333542 156 - chr9:24333322-24333371 NA NA NA NA NA chr9-52 24297257 24297499 203 - chr9:24297307-24297493 NA NA NA NA NA chr9-51 24169292 24169695 205 - chr9:24169589-24169596 NA NA NA NA NA chr9 240682 241045 295 - chr9:240925-241016 NA NA NA NA NA chr9-50 23133075 23133376 193 - chr9:23133231-23133316 NA NA NA NA NA chr9-49 23101174 23101396 148 - chr9:23101317-23101345 NA NA NA NA NA chr9-48 23060802 23061182 199 - chr9:23060949-23060967 NA NA NA NA NA chr9-47 23034221 23034738 216 - chr9:23034324-23034371 NA NA NA NA NA chr9-46 22613427 22613620 177 - chr9:22613450-22613611 NA NA NA NA NA chr9-45 22145505 22145760 127 - chr9:22145652-22145689 NA NA NA NA NA chr9-44 21627185 21627522 179 - chr9:21627432-21627453 NA NA NA NA NA chr9-43 21137792 21138193 305 - chr9:21137827-21137914 NA NA NA NA NA chr9-42 21117797 21117975 164 - chr9:21117826-21117966 NA NA NA NA NA chr9-7 2111651 2111822 163 - chr9:2111653-2111808 NA NA NA NA NA chr9-41 20411452 20411702 115 - chr9:20411620-20411690 NA NA NA NA NA chr9-40 20004112 20004688 275 - chr9:20004252-20004576 NA NA NA NA NA chr9-39 19672326 19672745 185 - chr9:19672517-19672624 NA NA NA NA NA chr9-38 19331270 19331724 226 - chr9:19331544-19331694 NA NA NA NA NA chr9-37 18631313 18631574 160 - chr9:18631393-18631466 NA NA NA NA NA chr9-36 18433083 18433385 177 - chr9:18433241-18433271 NA NA NA NA NA chr9-35 18244343 18244555 157 - chr9:18244414-18244516 NA NA NA NA NA chr9-34 17804350 17804811 264 - chr9:17804511-17804578 NA NA NA NA NA chr9-6 1726580 1726923 223 - chr9:1726588-1726691 NA NA NA NA NA chr9-33 16680357 16680766 275 - chr9:16680483-16680608 NA NA NA NA NA chr9-5 1615303 1615822 254 - chr9:1615523-1615542 NA NA NA NA NA chr9-4 1469619 1469943 187 - chr9:1469843-1469893 NA NA NA NA NA chr9-32 14528247 14528519 151 - chr9:14528341-14528371 NA NA NA NA NA chr9-31 14426548 14426791 144 - chr9:14426640-14426685 NA NA NA NA NA chr9-30 14399881 14400110 140 - chr9:14399955-14400006 NA NA NA NA NA chr9-29 14279208 14279377 128 - chr9:14279255-14279338 NA NA NA NA NA chr9-28 14084920 14085273 206 - chr9:14085031-14085114 NA NA NA NA NA chr9-345 137693245 137693431 129 - chr9:137693330-137693402 NA NA NA NA NA chr9-344 136036052 136036229 162 - chr9:136036096-136036213 NA NA NA NA NA chr9-343 133783713 133783877 144 - chr9:133783721-133783845 NA NA NA NA NA chr9-342 132579174 132579462 180 - chr9:132579362-132579434 NA NA NA NA NA chr9-341 131616701 131616914 153 - chr9:131616789-131616882 NA NA NA NA NA chr9-340 130702122 130702405 178 - chr9:130702324-130702397 NA NA NA NA NA chr9-339 130550805 130551039 119 - chr9:130550927-130550931 NA NA NA NA NA chr9-338 130080121 130080353 161 - chr9:130080130-130080220 NA NA NA NA NA chr9-337 129006621 129006920 159 - chr9:129006767-129006782 NA NA NA NA NA chr9-27 12887825 12888235 216 - chr9:12888085-12888107 NA NA NA NA NA chr9-336 128706364 128706892 363 - chr9:128706508-128706706 NA NA NA NA NA chr9-335 128429711 128430128 162 - chr9:128429859-128429936 NA NA NA NA NA chr9-334 128116177 128116520 269 - chr9:128116218-128116413 NA NA NA NA NA chr9-333 125601271 125601554 201 - chr9:125601383-125601502 NA NA NA NA NA chr9-332 124411615 124411948 130 - chr9:124411656-124411691 NA NA NA NA NA chr9-331 123925066 123925227 119 - chr9:123925067-123925144 NA NA NA NA NA chr9-330 123851605 123851983 214 - chr9:123851746-123851796 NA NA NA NA NA chr9-329 123176301 123176659 119 - chr9:123176503-123176504 NA NA NA NA NA chr9-328 122518031 122518377 234 - chr9:122518084-122518259 NA NA NA NA NA chr9-26 12229232 12229549 166 - chr9:12229430-12229445 NA NA NA NA NA chr9-327 122184476 122184875 200 - chr9:122184567-122184640 NA NA NA NA NA chr9-326 120627944 120628085 125 - chr9:120627989-120628066 NA NA NA NA NA chr9-25 11972302 11972602 125 - chr9:11972504-11972508 NA NA NA NA NA chr9-325 118903010 118903325 241 - chr9:118903153-118903274 NA NA NA NA NA chr9-324 118847121 118847442 174 - chr9:118847254-118847281 NA NA NA NA NA chr9-323 118734397 118735053 240 - chr9:118734876-118734975 NA NA NA NA NA chr9-322 118711884 118712224 281 - chr9:118712104-118712208 NA NA NA NA NA chr9-321 118324602 118325051 202 - chr9:118324630-118324731 NA NA NA NA NA chr9-320 116708753 116709056 185 - chr9:116708845-116708912 NA NA NA NA NA chr9-319 116390965 116391258 243 - chr9:116391079-116391172 NA NA NA NA NA chr9-318 116188140 116188331 150 - chr9:116188150-116188197 NA NA NA NA NA chr9-317 115882721 115882931 164 - chr9:115882722-115882870 NA NA NA NA NA chr9-316 115251149 115251387 160 - chr9:115251195-115251277 NA NA NA NA NA chr9-315 114682657 114682913 161 - chr9:114682722-114682788 NA NA NA NA NA chr9-314 114312462 114312817 219 - chr9:114312582-114312633 NA NA NA NA NA chr9-313 114011827 114012092 158 - chr9:114012018-114012069 NA NA NA NA NA chr9-312 113521041 113521323 186 - chr9:113521061-113521151 NA NA NA NA NA chr9-311 113336050 113336415 234 - chr9:113336133-113336236 NA NA NA NA NA chr9-3 1123052 1123383 184 - chr9:1123224-1123311 NA NA NA NA NA chr9-310 112092185 112092414 164 - chr9:112092319-112092372 NA NA NA NA NA chr9-309 112042785 112043085 256 - chr9:112042872-112043084 NA NA NA NA NA chr9-308 111748236 111748474 146 - chr9:111748374-111748428 NA NA NA NA NA chr9-307 109804438 109804602 159 - chr9:109804445-109804599 NA NA NA NA NA chr9-306 109028726 109029045 250 - chr9:109028741-109028898 NA NA NA NA NA chr9-305 108662366 108662714 231 - chr9:108662368-108662482 NA NA NA NA NA chr9-304 108055728 108055983 177 - chr9:108055789-108055854 NA NA NA NA NA chr9-303 107912583 107912907 204 - chr9:107912702-107912784 NA NA NA NA NA chr9-302 107796462 107796757 214 - chr9:107796494-107796627 NA NA NA NA NA chr9-301 107712289 107712531 154 - chr9:107712361-107712395 NA NA NA NA NA chr9-300 107320166 107320562 224 - chr9:107320379-107320431 NA NA NA NA NA chr9-299 107061800 107062214 240 - chr9:107061878-107062060 NA NA NA NA NA chr9-298 106856470 106856934 188 - chr9:106856515-106856568 NA NA NA NA NA chr9-297 106843562 106843906 232 - chr9:106843764-106843884 NA NA NA NA NA chr9-296 106670039 106670412 169 - chr9:106670296-106670397 NA NA NA NA NA chr9-295 106548129 106548440 271 - chr9:106548142-106548391 NA NA NA NA NA chr9-294 106316603 106316925 235 - chr9:106316731-106316879 NA NA NA NA NA chr9-293 105980633 105980878 137 - chr9:105980780-105980783 NA NA NA NA NA chr9-292 105607566 105607876 286 - chr9:105607609-105607871 NA NA NA NA NA chr9-291 105427887 105428223 199 - chr9:105428058-105428145 NA NA NA NA NA chr9-290 105266365 105266709 195 - chr9:105266484-105266550 NA NA NA NA NA chr9-289 104516873 104517192 129 - chr9:104516907-104516950 NA NA NA NA NA chr9-288 104286833 104287224 178 - chr9:104287089-104287196 NA NA NA NA NA chr9-287 104210416 104210640 122 - chr9:104210509-104210535 NA NA NA NA NA chr9-286 104007677 104007969 201 - chr9:104007798-104007888 NA NA NA NA NA chr9-285 103983560 103983849 194 - chr9:103983744-103983843 NA NA NA NA NA chr9-284 103910857 103911072 184 - chr9:103910887-103911040 NA NA NA NA NA chr9-283 103600655 103600919 178 - chr9:103600738-103600832 NA NA NA NA NA chr9-282 103505036 103505550 315 - chr9:103505303-103505419 NA NA NA NA NA chr9-281 103412050 103412352 188 - chr9:103412120-103412194 NA NA NA NA NA chr9-280 103282898 103283050 126 - chr9:103282939-103283039 NA NA NA NA NA chr9-279 103148614 103148988 258 - chr9:103148683-103148731 NA NA NA NA NA chr9-24 10281658 10281986 233 - chr9:10281821-10281959 NA NA NA NA NA chr9-278 102741289 102741487 115 - chr9:102741345-102741346 NA NA NA NA NA chr9-277 102708009 102708295 145 - chr9:102708021-102708119 NA NA NA NA NA chr9-276 102670953 102671219 214 - chr9:102670978-102671140 NA NA NA NA NA chr9-275 102636025 102636255 207 - chr9:102636059-102636243 NA NA NA NA NA chr9-2 1022786 1023079 229 - chr9:1022817-1023012 NA NA NA NA NA chr9-274 102083828 102084068 136 - chr9:102084005-102084037 NA NA NA NA NA chr9-273 101917665 101917866 166 - chr9:101917673-101917804 NA NA NA NA NA chr9-272 101644155 101644451 180 - chr9:101644228-101644292 NA NA NA NA NA chr9-271 101642047 101642507 250 - chr9:101642179-101642248 NA NA NA NA NA chr9-270 101447122 101447409 215 - chr9:101447145-101447288 NA NA NA NA NA chr9-269 101396972 101397365 246 - chr9:101396995-101397094 NA NA NA NA NA chr9-268 100912577 100913014 253 - chr9:100912783-100912852 NA NA NA NA NA chr9-267 100149431 100149584 137 - chr9:100149456-100149571 NA NA NA NA NA chr8-352 99936621 99936929 196 - chr8:99936692-99936791 NA NA NA NA NA chr8-351 99930458 99930830 314 - chr8:99930471-99930757 NA NA NA NA NA chr8-350 99848727 99848896 147 - chr8:99848803-99848884 NA NA NA NA NA chr8-349 99788614 99789054 236 - chr8:99788876-99789024 NA NA NA NA NA chr8-348 99553356 99553551 173 - chr8:99553389-99553540 NA NA NA NA NA chr8-347 99537774 99538155 271 - chr8:99537875-99538036 NA NA NA NA NA chr8-346 99459536 99460092 291 - chr8:99459709-99459756 NA NA NA NA NA chr8-345 99101544 99102055 197 - chr8:99101921-99101930 NA NA NA NA NA chr8-344 97912227 97912715 304 - chr8:97912373-97912479 NA NA NA NA NA chr8-343 97396187 97396540 211 - chr8:97396325-97396386 NA NA NA NA NA chr8-342 96586177 96586576 293 - chr8:96586251-96586438 NA NA NA NA NA chr8-341 95533695 95533940 177 - chr8:95533736-95533845 NA NA NA NA NA chr8-340 95012585 95013023 216 - chr8:95012845-95012915 NA NA NA NA NA chr8-339 93104668 93104807 123 - chr8:93104704-93104779 NA NA NA NA NA chr8-338 92417636 92418012 264 - chr8:92417794-92417946 NA NA NA NA NA chr8-337 92277724 92277871 114 - chr8:92277749-92277852 NA NA NA NA NA chr8-336 92008628 92008975 286 - chr8:92008851-92008968 NA NA NA NA NA chr8-335 91737174 91737456 183 - chr8:91737267-91737351 NA NA NA NA NA chr8-334 91695421 91695792 217 - chr8:91695462-91695525 NA NA NA NA NA chr8-333 91694922 91695258 173 - chr8:91694947-91695049 NA NA NA NA NA chr8-332 91656699 91656976 166 - chr8:91656823-91656878 NA NA NA NA NA chr8-331 91637540 91637866 253 - chr8:91637587-91637767 NA NA NA NA NA chr8-330 91392436 91392730 215 - chr8:91392510-91392629 NA NA NA NA NA chr8-12 9137296 9137480 124 - chr8:9137300-9137364 NA NA NA NA NA chr8-329 91261645 91261987 211 - chr8:91261694-91261774 NA NA NA NA NA chr8-328 91058044 91058345 255 - chr8:91058078-91058287 NA NA NA NA NA chr8-327 90476995 90477628 407 - chr8:90477060-90477423 NA NA NA NA NA chr8-326 90145995 90146465 230 - chr8:90146300-90146401 NA NA NA NA NA chr8-325 89869163 89869580 163 - chr8:89869498-89869513 NA NA NA NA NA chr8-324 89836779 89837174 217 - chr8:89836957-89836996 NA NA NA NA NA chr8-323 89758898 89759099 116 - chr8:89759052-89759083 NA NA NA NA NA chr8-322 89732429 89732633 174 - chr8:89732454-89732618 NA NA NA NA NA chr8-11 8953478 8953976 255 - chr8:8953736-8953748 NA NA NA NA NA chr8-10 8949703 8949907 141 - chr8:8949784-8949898 NA NA NA NA NA chr8-321 89443472 89443761 257 - chr8:89443554-89443715 NA NA NA NA NA chr8-320 89121835 89121996 120 - chr8:89121868-89121947 NA NA NA NA NA chr8-319 89063568 89063818 130 - chr8:89063687-89063697 NA NA NA NA NA chr8-9 8902957 8903178 180 - chr8:8903016-8903155 NA NA NA NA NA chr8-318 89016416 89016725 186 - chr8:89016457-89016520 NA NA NA NA NA chr8-317 88807794 88808097 202 - chr8:88807796-88807897 NA NA NA NA NA chr8-316 88626335 88626579 147 - chr8:88626420-88626478 NA NA NA NA NA chr8-315 88545192 88545379 115 - chr8:88545248-88545259 NA NA NA NA NA chr8-314 88323067 88323395 171 - chr8:88323224-88323278 NA NA NA NA NA chr8-313 88309426 88309683 174 - chr8:88309502-88309593 NA NA NA NA NA chr8-312 88274892 88275290 231 - chr8:88275153-88275217 NA NA NA NA NA chr8-311 88119591 88120155 209 - chr8:88119830-88119914 NA NA NA NA NA chr8-310 88071281 88071664 188 - chr8:88071491-88071514 NA NA NA NA NA chr8-309 87986915 87987328 215 - chr8:87987213-87987230 NA NA NA NA NA chr8-308 87791280 87791441 135 - chr8:87791309-87791416 NA NA NA NA NA chr8-307 87615338 87615611 146 - chr8:87615363-87615450 NA NA NA NA NA chr8-306 87558885 87559225 210 - chr8:87559007-87559087 NA NA NA NA NA chr8-305 87496653 87496903 172 - chr8:87496725-87496823 NA NA NA NA NA chr8-304 87458513 87458835 219 - chr8:87458673-87458816 NA NA NA NA NA chr8-303 87298665 87298933 188 - chr8:87298822-87298930 NA NA NA NA NA chr8-302 87292100 87292320 163 - chr8:87292144-87292250 NA NA NA NA NA chr8-301 87110132 87110671 333 - chr8:87110166-87110482 NA NA NA NA NA chr8-300 87034259 87034759 251 - chr8:87034543-87034545 NA NA NA NA NA chr8-299 86839419 86839617 129 - chr8:86839476-86839512 NA NA NA NA NA chr8-298 86536631 86537063 229 - chr8:86536664-86536690 NA NA NA NA NA chr8-297 86453138 86453333 145 - chr8:86453172-86453267 NA NA NA NA NA chr8-296 86447045 86447290 159 - chr8:86447120-86447193 NA NA NA NA NA chr8-295 86440322 86440610 176 - chr8:86440535-86440599 NA NA NA NA NA chr8-294 86337457 86337860 246 - chr8:86337557-86337684 NA NA NA NA NA chr8-293 86316221 86316496 150 - chr8:86316401-86316426 NA NA NA NA NA chr8-292 86216036 86216282 162 - chr8:86216125-86216203 NA NA NA NA NA chr8-291 86208168 86208691 325 - chr8:86208564-86208691 NA NA NA NA NA chr8-290 85832238 85832608 208 - chr8:85832410-85832450 NA NA NA NA NA chr8-289 85471611 85472135 215 - chr8:85471974-85472016 NA NA NA NA NA chr8-288 85365104 85365309 150 - chr8:85365207-85365270 NA NA NA NA NA chr8-287 85351235 85351500 211 - chr8:85351291-85351340 NA NA NA NA NA chr8-286 85308706 85308885 138 - chr8:85308727-85308824 NA NA NA NA NA chr8-285 85208480 85208757 200 - chr8:85208521-85208572 NA NA NA NA NA chr8-284 84824914 84825345 184 - chr8:84825207-84825323 NA NA NA NA NA chr8-283 84749417 84749671 203 - chr8:84749485-84749637 NA NA NA NA NA chr8-282 84586519 84586945 233 - chr8:84586794-84586834 NA NA NA NA NA chr8-281 84582362 84582954 294 - chr8:84582702-84582757 NA NA NA NA NA chr8-280 84579777 84579994 127 - chr8:84579856-84579893 NA NA NA NA NA chr8-279 84571915 84572103 119 - chr8:84571954-84572004 NA NA NA NA NA chr8-278 84544370 84544703 181 - chr8:84544532-84544561 NA NA NA NA NA chr8-277 84521648 84522017 229 - chr8:84521839-84521928 NA NA NA NA NA chr8-276 84348490 84348776 174 - chr8:84348605-84348667 NA NA NA NA NA chr8-275 84169611 84169940 219 - chr8:84169643-84169804 NA NA NA NA NA chr8-274 84089739 84089944 175 - chr8:84089772-84089915 NA NA NA NA NA chr8-273 84056871 84057312 305 - chr8:84057145-84057184 NA NA NA NA NA chr8-272 83940905 83941080 155 - chr8:83940960-83941055 NA NA NA NA NA chr8-271 83920194 83920433 122 - chr8:83920265-83920270 NA NA NA NA NA chr8-270 83842895 83843227 246 - chr8:83843060-83843220 NA NA NA NA NA chr8-269 83645402 83645666 172 - chr8:83645465-83645497 NA NA NA NA NA chr8-268 83420569 83420737 140 - chr8:83420640-83420696 NA NA NA NA NA chr8-267 83304625 83304924 152 - chr8:83304760-83304773 NA NA NA NA NA chr8-266 83252844 83253161 177 - chr8:83253043-83253071 NA NA NA NA NA chr8-265 83219321 83219654 219 - chr8:83219383-83219488 NA NA NA NA NA chr8-264 83181267 83181531 140 - chr8:83181486-83181502 NA NA NA NA NA chr8-263 83017635 83018138 185 - chr8:83018030-83018051 NA NA NA NA NA chr8-262 83014820 83015067 116 - chr8:83014888-83014915 NA NA NA NA NA chr8-261 82961501 82961871 186 - chr8:82961705-82961707 NA NA NA NA NA chr8-260 82929535 82929880 216 - chr8:82929694-82929761 NA NA NA NA NA chr8-259 82865740 82865965 173 - chr8:82865834-82865955 NA NA NA NA NA chr8-258 82658644 82659310 344 - chr8:82658953-82659010 NA NA NA NA NA chr8-257 82537609 82538089 268 - chr8:82537827-82537879 NA NA NA NA NA chr8-256 82466760 82467093 249 - chr8:82466785-82466832 NA NA NA NA NA chr8-255 82426358 82426720 285 - chr8:82426429-82426637 NA NA NA NA NA chr8-254 82368149 82368361 148 - chr8:82368258-82368342 NA NA NA NA NA chr8-253 82171612 82172365 356 - chr8:82171939-82171944 NA NA NA NA NA chr8-252 82012780 82013340 317 - chr8:82012939-82013266 NA NA NA NA NA chr8-251 81996400 81996639 168 - chr8:81996411-81996508 NA NA NA NA NA chr8-250 81981648 81982051 205 - chr8:81981791-81981862 NA NA NA NA NA chr8-249 81587267 81587573 209 - chr8:81587365-81587477 NA NA NA NA NA chr8-248 81027304 81027498 115 - chr8:81027343-81027379 NA NA NA NA NA chr8-247 81012203 81012530 202 - chr8:81012314-81012391 NA NA NA NA NA chr8-246 81011103 81011371 163 - chr8:81011132-81011260 NA NA NA NA NA chr8-245 80436943 80437262 172 - chr8:80437091-80437118 NA NA NA NA NA chr8-244 80340080 80340438 280 - chr8:80340105-80340359 NA NA NA NA NA chr8-243 80103733 80104349 226 - chr8:80103939-80104041 NA NA NA NA NA chr8-242 79980473 79980706 164 - chr8:79980500-79980595 NA NA NA NA NA chr8-241 79961955 79962197 167 - chr8:79961975-79962067 NA NA NA NA NA chr8-240 79931805 79932136 236 - chr8:79931849-79931888 NA NA NA NA NA chr8-239 79821001 79821247 186 - chr8:79821104-79821230 NA NA NA NA NA chr8-238 79574403 79574740 188 - chr8:79574548-79574587 NA NA NA NA NA chr8-237 79483568 79484013 241 - chr8:79483858-79483943 NA NA NA NA NA chr8-236 79356759 79357120 182 - chr8:79356951-79356980 NA NA NA NA NA chr8-235 79249017 79249200 120 - chr8:79249048-79249105 NA NA NA NA NA chr8-234 79023363 79023840 295 - chr8:79023384-79023735 NA NA NA NA NA chr8-233 79008678 79009203 280 - chr8:79008916-79008951 NA NA NA NA NA chr8-232 78816444 78816689 132 - chr8:78816634-78816653 NA NA NA NA NA chr8-231 78811166 78811542 192 - chr8:78811338-78811346 NA NA NA NA NA chr8-230 78722138 78722391 204 - chr8:78722247-78722362 NA NA NA NA NA chr8-229 78696960 78697153 125 - chr8:78697034-78697103 NA NA NA NA NA chr8-228 78394581 78394879 198 - chr8:78394758-78394856 NA NA NA NA NA chr8-227 78369378 78369661 192 - chr8:78369433-78369539 NA NA NA NA NA chr8-226 78322698 78322839 125 - chr8:78322721-78322830 NA NA NA NA NA chr8-225 78279215 78279675 275 - chr8:78279233-78279323 NA NA NA NA NA chr8-224 78160208 78160404 176 - chr8:78160227-78160383 NA NA NA NA NA chr8-223 78037439 78037767 268 - chr8:78037519-78037767 NA NA NA NA NA chr8-222 77927497 77927779 227 - chr8:77927585-77927757 NA NA NA NA NA chr8-221 77872159 77872435 170 - chr8:77872351-77872415 NA NA NA NA NA chr8-220 77783496 77783700 150 - chr8:77783565-77783661 NA NA NA NA NA chr8-219 77578780 77579251 213 - chr8:77579087-77579140 NA NA NA NA NA chr8-218 77377370 77377625 221 - chr8:77377395-77377564 NA NA NA NA NA chr8-217 76924195 76924533 230 - chr8:76924342-76924464 NA NA NA NA NA chr8-216 76891422 76891607 143 - chr8:76891449-76891601 NA NA NA NA NA chr8-215 76820903 76821403 281 - chr8:76820935-76821143 NA NA NA NA NA chr8-214 76782648 76783150 323 - chr8:76782989-76783025 NA NA NA NA NA chr8-213 76706704 76707359 325 - chr8:76706971-76707008 NA NA NA NA NA chr8-212 76680101 76680351 150 - chr8:76680149-76680199 NA NA NA NA NA chr8-211 76490836 76491208 232 - chr8:76490937-76491029 NA NA NA NA NA chr8-210 76295228 76295561 221 - chr8:76295424-76295533 NA NA NA NA NA chr8-209 76277550 76277890 242 - chr8:76277780-76277836 NA NA NA NA NA chr8-208 76237060 76237224 119 - chr8:76237097-76237171 NA NA NA NA NA chr8-207 76077988 76078294 171 - chr8:76078057-76078132 NA NA NA NA NA chr8-206 75844602 75844971 212 - chr8:75844788-75844901 NA NA NA NA NA chr8-205 75077550 75077885 313 - chr8:75077582-75077873 NA NA NA NA NA chr8-204 74908395 74908575 165 - chr8:74908408-74908558 NA NA NA NA NA chr8-203 74875443 74875717 220 - chr8:74875492-74875648 NA NA NA NA NA chr8-202 74661620 74661963 217 - chr8:74661788-74661963 NA NA NA NA NA chr8-201 74009420 74009672 129 - chr8:74009493-74009499 NA NA NA NA NA chr8-200 73966117 73966380 134 - chr8:73966136-73966227 NA NA NA NA NA chr8-199 73506603 73506782 148 - chr8:73506655-73506710 NA NA NA NA NA chr8-198 72826236 72826549 202 - chr8:72826251-72826342 NA NA NA NA NA chr8-197 72213661 72213959 156 - chr8:72213831-72213845 NA NA NA NA NA chr8-196 71897447 71897659 160 - chr8:71897482-71897590 NA NA NA NA NA chr8-195 71592279 71592522 159 - chr8:71592367-71592450 NA NA NA NA NA chr8-194 71513662 71513816 132 - chr8:71513698-71513764 NA NA NA NA NA chr8-193 71473023 71473302 129 - chr8:71473054-71473133 NA NA NA NA NA chr8-192 71469238 71469511 196 - chr8:71469261-71469380 NA NA NA NA NA chr8-191 71329995 71330186 126 - chr8:71330081-71330128 NA NA NA NA NA chr8-190 71289370 71289947 339 - chr8:71289473-71289563 NA NA NA NA NA chr8-189 71243604 71243868 127 - chr8:71243627-71243693 NA NA NA NA NA chr8-188 70830620 70830938 198 - chr8:70830765-70830923 NA NA NA NA NA chr8-187 70633580 70634043 160 - chr8:70633954-70634013 NA NA NA NA NA chr8-186 70410237 70410695 378 - chr8:70410342-70410640 NA NA NA NA NA chr8-185 69830536 69831000 267 - chr8:69830884-69830905 NA NA NA NA NA chr8-184 69262627 69262938 190 - chr8:69262722-69262791 NA NA NA NA NA chr8-183 68584517 68584778 163 - chr8:68584699-68584764 NA NA NA NA NA chr8-182 68544852 68545273 247 - chr8:68544856-68544980 NA NA NA NA NA chr8-181 68386414 68386748 204 - chr8:68386632-68386706 NA NA NA NA NA chr8-180 68082965 68083210 203 - chr8:68082987-68083108 NA NA NA NA NA chr8-179 67915398 67915629 202 - chr8:67915463-67915578 NA NA NA NA NA chr8-178 67769127 67769369 138 - chr8:67769163-67769197 NA NA NA NA NA chr8-177 67235648 67235945 132 - chr8:67235698-67235775 NA NA NA NA NA chr8-176 66928162 66928596 325 - chr8:66928317-66928533 NA NA NA NA NA chr8-175 66850611 66850945 207 - chr8:66850779-66850941 NA NA NA NA NA chr8-174 66695889 66696301 179 - chr8:66696153-66696161 NA NA NA NA NA chr8-173 66509986 66510235 147 - chr8:66510111-66510156 NA NA NA NA NA chr8-172 66324793 66325035 166 - chr8:66324794-66324884 NA NA NA NA NA chr8-171 66258235 66258474 192 - chr8:66258292-66258343 NA NA NA NA NA chr8-170 65799563 65799822 124 - chr8:65799563-65799642 NA NA NA NA NA chr8-169 65739781 65740031 236 - chr8:65739806-65740028 NA NA NA NA NA chr8-168 65700425 65700697 202 - chr8:65700486-65700618 NA NA NA NA NA chr8-167 65362390 65362695 262 - chr8:65362440-65362659 NA NA NA NA NA chr8-166 65355657 65355970 158 - chr8:65355857-65355860 NA NA NA NA NA chr8-165 64963250 64963822 342 - chr8:64963508-64963620 NA NA NA NA NA chr8-164 64046752 64046968 156 - chr8:64046825-64046961 NA NA NA NA NA chr8-163 64022747 64023029 174 - chr8:64022809-64022875 NA NA NA NA NA chr8-162 63752306 63752473 136 - chr8:63752322-63752397 NA NA NA NA NA chr8-161 63201466 63201706 149 - chr8:63201473-63201554 NA NA NA NA NA chr8-160 63170882 63171210 182 - chr8:63171075-63171139 NA NA NA NA NA chr8-159 63167194 63167813 294 - chr8:63167289-63167339 NA NA NA NA NA chr8-158 63037060 63037520 226 - chr8:63037239-63037387 NA NA NA NA NA chr8-157 62448776 62448945 132 - chr8:62448796-62448878 NA NA NA NA NA chr8-156 62392305 62392580 128 - chr8:62392351-62392430 NA NA NA NA NA chr8-155 62114753 62115370 315 - chr8:62115017-62115030 NA NA NA NA NA chr8-154 61951866 61952196 200 - chr8:61952079-61952149 NA NA NA NA NA chr8-153 61727871 61728193 267 - chr8:61727929-61728031 NA NA NA NA NA chr8-152 61707081 61707264 155 - chr8:61707081-61707208 NA NA NA NA NA chr8-151 61106488 61106817 165 - chr8:61106640-61106649 NA NA NA NA NA chr8-150 60940923 60941268 254 - chr8:60940953-60941088 NA NA NA NA NA chr8-149 60692815 60693061 119 - chr8:60692949-60692955 NA NA NA NA NA chr8-148 60671283 60671420 113 - chr8:60671320-60671409 NA NA NA NA NA chr8-147 60537658 60537879 119 - chr8:60537715-60537762 NA NA NA NA NA chr8-146 60471309 60471613 173 - chr8:60471555-60471597 NA NA NA NA NA chr8-145 60257936 60258138 135 - chr8:60258033-60258081 NA NA NA NA NA chr8-144 60252501 60252996 220 - chr8:60252568-60252707 NA NA NA NA NA chr8-143 60235306 60235604 218 - chr8:60235405-60235591 NA NA NA NA NA chr8-8 6022654 6022931 167 - chr8:6022756-6022813 NA NA NA NA NA chr8-142 59644768 59644978 173 - chr8:59644793-59644929 NA NA NA NA NA chr8-141 59498487 59498740 191 - chr8:59498612-59498699 NA NA NA NA NA chr8-140 59441418 59441775 197 - chr8:59441629-59441666 NA NA NA NA NA chr8-139 59253467 59253718 177 - chr8:59253530-59253633 NA NA NA NA NA chr8-138 59074066 59074524 286 - chr8:59074290-59074410 NA NA NA NA NA chr8-137 58303600 58303991 264 - chr8:58303703-58303792 NA NA NA NA NA chr8-136 58142127 58142276 116 - chr8:58142176-58142259 NA NA NA NA NA chr8-135 58100069 58100310 127 - chr8:58100199-58100288 NA NA NA NA NA chr8-134 57576970 57577151 130 - chr8:57577001-57577080 NA NA NA NA NA chr8-133 57483176 57483813 263 - chr8:57483330-57483459 NA NA NA NA NA chr8-132 57414959 57415203 163 - chr8:57415019-57415155 NA NA NA NA NA chr8-131 57354649 57354930 153 - chr8:57354771-57354800 NA NA NA NA NA chr8-130 57088809 57088974 126 - chr8:57088842-57088929 NA NA NA NA NA chr8-129 56881856 56882080 146 - chr8:56881940-56882008 NA NA NA NA NA chr8-128 56703473 56703922 323 - chr8:56703563-56703784 NA NA NA NA NA chr8-127 56497915 56498206 169 - chr8:56497954-56498001 NA NA NA NA NA chr8-126 56496327 56496606 156 - chr8:56496486-56496519 NA NA NA NA NA chr8-125 56450246 56450533 153 - chr8:56450352-56450371 NA NA NA NA NA chr8-124 55792870 55793083 122 - chr8:55792919-55792978 NA NA NA NA NA chr8-7 5558164 5558421 157 - chr8:5558282-5558339 NA NA NA NA NA chr8-6 5539809 5540110 178 - chr8:5539926-5539985 NA NA NA NA NA chr8-123 55352396 55352867 256 - chr8:55352621-55352662 NA NA NA NA NA chr8-122 54888555 54888798 156 - chr8:54888698-54888767 NA NA NA NA NA chr8-121 54820852 54821212 135 - chr8:54821058-54821118 NA NA NA NA NA chr8-5 5460573 5461056 160 - chr8:5460617-5460640 NA NA NA NA NA chr8-120 54563805 54564025 114 - chr8:54563893-54563913 NA NA NA NA NA chr8-119 54558308 54558457 132 - chr8:54558342-54558457 NA NA NA NA NA chr8-118 54323533 54324136 252 - chr8:54323937-54323944 NA NA NA NA NA chr8-117 54197742 54197912 119 - chr8:54197745-54197813 NA NA NA NA NA chr8-116 54185747 54186006 164 - chr8:54185867-54185952 NA NA NA NA NA chr8-115 53892999 53893223 171 - chr8:53893081-53893199 NA NA NA NA NA chr8-114 53474726 53474970 199 - chr8:53474765-53474919 NA NA NA NA NA chr8-113 53363499 53363977 232 - chr8:53363670-53363705 NA NA NA NA NA chr8-112 53083292 53083747 263 - chr8:53083517-53083588 NA NA NA NA NA chr8-111 52895213 52895524 195 - chr8:52895401-52895432 NA NA NA NA NA chr8-110 52740887 52741045 155 - chr8:52740887-52741041 NA NA NA NA NA chr8-109 52460417 52460673 163 - chr8:52460595-52460600 NA NA NA NA NA chr8-108 52325847 52326147 268 - chr8:52325854-52326090 NA NA NA NA NA chr8-107 52195423 52195669 206 - chr8:52195456-52195622 NA NA NA NA NA chr8-106 51926440 51926626 167 - chr8:51926507-51926617 NA NA NA NA NA chr8-105 51692259 51692427 139 - chr8:51692267-51692377 NA NA NA NA NA chr8-104 51604732 51605109 175 - chr8:51604949-51604952 NA NA NA NA NA chr8-103 50797071 50797337 169 - chr8:50797173-50797255 NA NA NA NA NA chr8-102 50016967 50017215 145 - chr8:50017073-50017115 NA NA NA NA NA chr8-101 50011713 50011904 118 - chr8:50011767-50011812 NA NA NA NA NA chr8-100 49930986 49931415 260 - chr8:49931155-49931246 NA NA NA NA NA chr8-99 49670364 49670679 166 - chr8:49670423-49670440 NA NA NA NA NA chr8-98 49260972 49261216 121 - chr8:49261113-49261147 NA NA NA NA NA chr8-97 48615184 48615616 250 - chr8:48615402-48615446 NA NA NA NA NA chr8-4 4836495 4836637 122 - chr8:4836497-4836611 NA NA NA NA NA chr8-96 47069387 47070013 249 - chr8:47069677-47069772 NA NA NA NA NA chr8-95 46289966 46290258 222 - chr8:46289993-46290145 NA NA NA NA NA chr8-94 46081235 46081468 212 - chr8:46081258-46081463 NA NA NA NA NA chr8-3 4527836 4528082 125 - chr8:4527992-4527996 NA NA NA NA NA chr8-93 43845513 43845756 171 - chr8:43845656-43845755 NA NA NA NA NA chr8-92 43256402 43256693 155 - chr8:43256570-43256589 NA NA NA NA NA chr8-91 42948979 42949223 224 - chr8:42948981-42949145 NA NA NA NA NA chr8-90 42639433 42639943 298 - chr8:42639731-42639817 NA NA NA NA NA chr8-89 42577279 42577596 220 - chr8:42577445-42577568 NA NA NA NA NA chr8-88 41730644 41730966 219 - chr8:41730656-41730772 NA NA NA NA NA chr8-87 40724697 40725036 263 - chr8:40724737-40724852 NA NA NA NA NA chr8-86 40618944 40619133 134 - chr8:40619011-40619082 NA NA NA NA NA chr8-85 40422766 40423009 155 - chr8:40422819-40422886 NA NA NA NA NA chr8-84 40342127 40342445 213 - chr8:40342219-40342327 NA NA NA NA NA chr8-83 40289569 40290004 222 - chr8:40289920-40289929 NA NA NA NA NA chr8-2 4028133 4028457 252 - chr8:4028136-4028172 NA NA NA NA NA chr8-82 38609773 38610267 292 - chr8:38610067-38610240 NA NA NA NA NA chr8-81 38397663 38397946 156 - chr8:38397819-38397848 NA NA NA NA NA chr8-80 37920480 37920703 173 - chr8:37920528-37920647 NA NA NA NA NA chr8-79 36436877 36437116 169 - chr8:36436932-36437041 NA NA NA NA NA chr8-78 36310651 36310871 132 - chr8:36310682-36310764 NA NA NA NA NA chr8-77 36276260 36276470 179 - chr8:36276264-36276412 NA NA NA NA NA chr8-76 35885907 35886246 172 - chr8:35886070-35886075 NA NA NA NA NA chr8 3582295 3582545 168 - chr8:3582295-3582381 NA NA NA NA NA chr8-75 35705411 35705710 181 - chr8:35705585-35705648 NA NA NA NA NA chr8-74 35527222 35527649 199 - chr8:35527478-35527505 NA NA NA NA NA chr8-73 35464497 35464919 249 - chr8:35464738-35464814 NA NA NA NA NA chr8-72 35332070 35332281 129 - chr8:35332078-35332125 NA NA NA NA NA chr8-71 34617864 34618045 149 - chr8:34617895-34617948 NA NA NA NA NA chr8-70 33886449 33886813 276 - chr8:33886466-33886654 NA NA NA NA NA chr8-69 33815388 33815698 206 - chr8:33815561-33815663 NA NA NA NA NA chr8-68 32337296 32337630 206 - chr8:32337535-32337613 NA NA NA NA NA chr8-67 32287142 32287511 150 - chr8:32287292-32287369 NA NA NA NA NA chr8-66 31879121 31879402 182 - chr8:31879283-31879366 NA NA NA NA NA chr8-65 31652170 31652510 180 - chr8:31652280-31652300 NA NA NA NA NA chr8-64 31471306 31471537 134 - chr8:31471418-31471485 NA NA NA NA NA chr8-63 31258212 31258398 130 - chr8:31258291-31258365 NA NA NA NA NA chr8-62 30854948 30855180 118 - chr8:30855047-30855051 NA NA NA NA NA chr8-61 30017504 30017718 130 - chr8:30017630-30017676 NA NA NA NA NA chr8-60 29767980 29768422 361 - chr8:29768118-29768398 NA NA NA NA NA chr8-59 29271075 29271543 196 - chr8:29271146-29271204 NA NA NA NA NA chr8-58 28961562 28961869 209 - chr8:28961576-28961687 NA NA NA NA NA chr8-57 28630852 28631053 145 - chr8:28630920-28631009 NA NA NA NA NA chr8-56 28431065 28431523 253 - chr8:28431340-28431487 NA NA NA NA NA chr8-55 28301004 28301228 175 - chr8:28301080-28301206 NA NA NA NA NA chr8-54 28238781 28239139 230 - chr8:28238882-28239002 NA NA NA NA NA chr8-53 27520526 27520818 154 - chr8:27520681-27520697 NA NA NA NA NA chr8-52 26346183 26346551 254 - chr8:26346250-26346390 NA NA NA NA NA chr8-51 26096771 26097228 263 - chr8:26096998-26097067 NA NA NA NA NA chr8-50 25803252 25803649 319 - chr8:25803339-25803598 NA NA NA NA NA chr8-49 25597400 25597879 280 - chr8:25597613-25597642 NA NA NA NA NA chr8-48 25531336 25531646 208 - chr8:25531538-25531644 NA NA NA NA NA chr8-47 25403847 25404236 216 - chr8:25404040-25404083 NA NA NA NA NA chr8-46 25282993 25283308 164 - chr8:25283119-25283132 NA NA NA NA NA chr8-45 24893350 24893684 228 - chr8:24893570-24893616 NA NA NA NA NA chr8-44 24547515 24547765 148 - chr8:24547616-24547662 NA NA NA NA NA chr8-43 24546421 24546700 202 - chr8:24546498-24546623 NA NA NA NA NA chr8-42 24492997 24493413 262 - chr8:24493279-24493387 NA NA NA NA NA chr8-41 24195834 24196075 166 - chr8:24195868-24195877 NA NA NA NA NA chr8-40 24116439 24116678 142 - chr8:24116613-24116658 NA NA NA NA NA chr8-39 23524116 23524373 140 - chr8:23524199-23524222 NA NA NA NA NA chr8-38 22501778 22502137 128 - chr8:22501928-22501979 NA NA NA NA NA chr8-37 20791866 20792200 204 - chr8:20791997-20792073 NA NA NA NA NA chr8-36 20450804 20451011 132 - chr8:20450808-20450915 NA NA NA NA NA chr8-35 20440784 20441124 248 - chr8:20440799-20440955 NA NA NA NA NA chr8-34 20317599 20317887 215 - chr8:20317637-20317779 NA NA NA NA NA chr8-33 20165602 20165905 198 - chr8:20165724-20165887 NA NA NA NA NA chr8-32 20120527 20121079 218 - chr8:20120595-20120649 NA NA NA NA NA chr8-31 20059342 20059591 151 - chr8:20059488-20059541 NA NA NA NA NA chr8-30 19896343 19896717 232 - chr8:19896451-19896541 NA NA NA NA NA chr8-29 19781814 19782193 169 - chr8:19781998-19782097 NA NA NA NA NA chr8-28 19746388 19746889 313 - chr8:19746440-19746635 NA NA NA NA NA chr8-27 19706252 19706519 162 - chr8:19706266-19706323 NA NA NA NA NA chr8-26 19015131 19015298 150 - chr8:19015170-19015269 NA NA NA NA NA chr8-25 18887010 18887191 118 - chr8:18887059-18887114 NA NA NA NA NA chr8-24 18752105 18752335 141 - chr8:18752179-18752241 NA NA NA NA NA chr8-23 18010210 18010536 181 - chr8:18010279-18010315 NA NA NA NA NA chr8-22 16694041 16694528 244 - chr8:16694431-16694432 NA NA NA NA NA chr8-21 15767022 15767377 281 - chr8:15767103-15767310 NA NA NA NA NA chr8-20 15163101 15163381 224 - chr8:15163202-15163340 NA NA NA NA NA chr8-19 14882655 14883087 277 - chr8:14882783-14882905 NA NA NA NA NA chr8-742 144623100 144623259 123 - chr8:144623145-144623232 NA NA NA NA NA chr8-741 144307310 144307629 176 - chr8:144307456-144307487 NA NA NA NA NA chr8-740 144220440 144220703 152 - chr8:144220619-144220657 NA NA NA NA NA chr8-739 144134020 144134185 155 - chr8:144134038-144134183 NA NA NA NA NA chr8-738 144086012 144086293 229 - chr8:144086182-144086255 NA NA NA NA NA chr8-737 143934259 143934631 223 - chr8:143934309-143934449 NA NA NA NA NA chr8-736 143203067 143203241 149 - chr8:143203091-143203215 NA NA NA NA NA chr8-735 143178588 143178952 127 - chr8:143178639-143178653 NA NA NA NA NA chr8-734 142991327 142991655 250 - chr8:142991414-142991586 NA NA NA NA NA chr8-733 142862361 142862760 203 - chr8:142862556-142862561 NA NA NA NA NA chr8-732 142861743 142862257 285 - chr8:142862012-142862092 NA NA NA NA NA chr8-731 142603135 142603772 319 - chr8:142603192-142603310 NA NA NA NA NA chr8-730 142597152 142597379 175 - chr8:142597157-142597280 NA NA NA NA NA chr8-729 142371728 142372068 188 - chr8:142371853-142371889 NA NA NA NA NA chr8-728 142322409 142322704 226 - chr8:142322568-142322665 NA NA NA NA NA chr8-727 142200509 142200743 170 - chr8:142200591-142200608 NA NA NA NA NA chr8-726 141998348 141998548 161 - chr8:141998399-141998443 NA NA NA NA NA chr8-725 141826627 141826881 128 - chr8:141826728-141826730 NA NA NA NA NA chr8-724 141572825 141573189 132 - chr8:141572856-141572890 NA NA NA NA NA chr8-723 141483923 141484208 234 - chr8:141483986-141484161 NA NA NA NA NA chr8-722 141160441 141160650 118 - chr8:141160531-141160556 NA NA NA NA NA chr8-721 140981212 140981390 118 - chr8:140981334-140981348 NA NA NA NA NA chr8-720 140963736 140964047 217 - chr8:140963830-140963953 NA NA NA NA NA chr8-719 140861162 140861358 140 - chr8:140861227-140861311 NA NA NA NA NA chr8-718 140818353 140818527 125 - chr8:140818392-140818468 NA NA NA NA NA chr8-717 140736801 140737247 254 - chr8:140737153-140737215 NA NA NA NA NA chr8-716 140705716 140705972 156 - chr8:140705738-140705846 NA NA NA NA NA chr8-715 140640553 140640925 205 - chr8:140640704-140640722 NA NA NA NA NA chr8-714 140524217 140524695 240 - chr8:140524443-140524514 NA NA NA NA NA chr8-713 140446170 140446568 206 - chr8:140446478-140446492 NA NA NA NA NA chr8-712 140410264 140410682 235 - chr8:140410480-140410510 NA NA NA NA NA chr8-711 140391118 140391437 175 - chr8:140391230-140391261 NA NA NA NA NA chr8-710 140390244 140390517 133 - chr8:140390279-140390342 NA NA NA NA NA chr8-709 140188071 140188576 319 - chr8:140188406-140188439 NA NA NA NA NA chr8-708 140009311 140009502 141 - chr8:140009427-140009474 NA NA NA NA NA chr8-707 139873549 139873887 176 - chr8:139873833-139873847 NA NA NA NA NA chr8-706 139566909 139567332 168 - chr8:139567214-139567297 NA NA NA NA NA chr8-705 139542209 139542459 139 - chr8:139542328-139542372 NA NA NA NA NA chr8-704 139510893 139511693 334 - chr8:139511485-139511524 NA NA NA NA NA chr8-703 139475486 139475719 125 - chr8:139475602-139475651 NA NA NA NA NA chr8-702 139330665 139330846 115 - chr8:139330699-139330792 NA NA NA NA NA chr8-701 139193553 139193904 303 - chr8:139193636-139193795 NA NA NA NA NA chr8-700 139089885 139090247 184 - chr8:139090148-139090154 NA NA NA NA NA chr8-699 139089487 139089663 127 - chr8:139089571-139089649 NA NA NA NA NA chr8-18 13906069 13906303 171 - chr8:13906072-13906222 NA NA NA NA NA chr8-698 139042777 139043100 176 - chr8:139042938-139042967 NA NA NA NA NA chr8-697 138764715 138765116 243 - chr8:138764910-138764995 NA NA NA NA NA chr8-696 138663117 138663369 150 - chr8:138663274-138663322 NA NA NA NA NA chr8-695 138634259 138634494 181 - chr8:138634274-138634437 NA NA NA NA NA chr8-694 138440171 138440760 182 - chr8:138440699-138440716 NA NA NA NA NA chr8-693 138426081 138426390 188 - chr8:138426201-138426266 NA NA NA NA NA chr8-17 13837377 13837600 171 - chr8:13837438-13837557 NA NA NA NA NA chr8-692 138166020 138166480 206 - chr8:138166440-138166478 NA NA NA NA NA chr8-691 138124733 138125005 140 - chr8:138124819-138124871 NA NA NA NA NA chr8-690 138087142 138087485 247 - chr8:138087142-138087357 NA NA NA NA NA chr8-689 138074681 138075002 155 - chr8:138074772-138074791 NA NA NA NA NA chr8-688 138073861 138074336 259 - chr8:138074021-138074064 NA NA NA NA NA chr8-687 138036546 138036702 153 - chr8:138036549-138036699 NA NA NA NA NA chr8-686 137957988 137958141 117 - chr8:137958009-137958114 NA NA NA NA NA chr8-685 137927173 137927649 276 - chr8:137927412-137927566 NA NA NA NA NA chr8-684 137924263 137924463 167 - chr8:137924331-137924399 NA NA NA NA NA chr8-683 137887995 137888452 205 - chr8:137888000-137888121 NA NA NA NA NA chr8-682 137880162 137880418 232 - chr8:137880174-137880390 NA NA NA NA NA chr8-681 137786409 137786616 184 - chr8:137786493-137786608 NA NA NA NA NA chr8-680 137717768 137718038 153 - chr8:137717954-137717990 NA NA NA NA NA chr8-679 137689209 137689697 208 - chr8:137689351-137689371 NA NA NA NA NA chr8-678 137640990 137641217 195 - chr8:137641021-137641182 NA NA NA NA NA chr8-677 137591077 137591395 202 - chr8:137591162-137591248 NA NA NA NA NA chr8-676 137190571 137190737 154 - chr8:137190575-137190725 NA NA NA NA NA chr8-675 137167396 137167699 196 - chr8:137167503-137167592 NA NA NA NA NA chr8-674 136944753 136945000 204 - chr8:136944767-136944870 NA NA NA NA NA chr8-673 136926389 136926574 150 - chr8:136926405-136926520 NA NA NA NA NA chr8-672 136833970 136834507 258 - chr8:136834197-136834362 NA NA NA NA NA chr8-671 136663670 136663975 197 - chr8:136663765-136663828 NA NA NA NA NA chr8-670 136519340 136519677 249 - chr8:136519548-136519629 NA NA NA NA NA chr8-669 136474192 136474645 216 - chr8:136474327-136474374 NA NA NA NA NA chr8-668 136468009 136468282 171 - chr8:136468047-136468184 NA NA NA NA NA chr8-667 136448795 136449139 203 - chr8:136448982-136449044 NA NA NA NA NA chr8-666 136413495 136413854 176 - chr8:136413532-136413598 NA NA NA NA NA chr8-665 136369192 136369448 190 - chr8:136369215-136369253 NA NA NA NA NA chr8-664 136362939 136363310 149 - chr8:136363129-136363204 NA NA NA NA NA chr8-663 136350670 136351016 235 - chr8:136350712-136350882 NA NA NA NA NA chr8-662 136215291 136215951 299 - chr8:136215835-136215866 NA NA NA NA NA chr8-661 136185832 136186316 286 - chr8:136185984-136186174 NA NA NA NA NA chr8-660 136173477 136173778 177 - chr8:136173662-136173759 NA NA NA NA NA chr8-659 136156367 136156514 136 - chr8:136156375-136156502 NA NA NA NA NA chr8-658 136096041 136096339 200 - chr8:136096080-136096182 NA NA NA NA NA chr8-657 136066032 136066260 143 - chr8:136066201-136066259 NA NA NA NA NA chr8-656 136022332 136022483 114 - chr8:136022391-136022468 NA NA NA NA NA chr8-655 135968375 135968671 256 - chr8:135968425-135968561 NA NA NA NA NA chr8-654 135937905 135938252 194 - chr8:135938064-135938117 NA NA NA NA NA chr8-653 135923196 135923546 249 - chr8:135923349-135923497 NA NA NA NA NA chr8-652 135812293 135812561 214 - chr8:135812365-135812561 NA NA NA NA NA chr8-651 135450145 135450446 168 - chr8:135450222-135450257 NA NA NA NA NA chr8-650 135366294 135366560 251 - chr8:135366333-135366539 NA NA NA NA NA chr8-649 135219112 135219466 148 - chr8:135219153-135219205 NA NA NA NA NA chr8-16 13511632 13511915 220 - chr8:13511699-13511856 NA NA NA NA NA chr8-648 135024641 135024984 197 - chr8:135024742-135024793 NA NA NA NA NA chr8-647 134995089 134995398 191 - chr8:134995324-134995397 NA NA NA NA NA chr8-646 134815421 134815694 160 - chr8:134815520-134815574 NA NA NA NA NA chr8-645 134709118 134709557 305 - chr8:134709194-134709365 NA NA NA NA NA chr8-644 134586024 134586321 197 - chr8:134586183-134586280 NA NA NA NA NA chr8-643 134413909 134414370 260 - chr8:134414163-134414222 NA NA NA NA NA chr8-642 134299143 134299478 214 - chr8:134299225-134299344 NA NA NA NA NA chr8-641 134183945 134184183 154 - chr8:134183992-134184118 NA NA NA NA NA chr8-640 134173063 134173434 325 - chr8:134173145-134173408 NA NA NA NA NA chr8-639 133947074 133947420 235 - chr8:133947176-133947415 NA NA NA NA NA chr8-638 133803726 133804217 241 - chr8:133803832-133803958 NA NA NA NA NA chr8-637 133777459 133777763 138 - chr8:133777720-133777728 NA NA NA NA NA chr8-636 133334394 133334721 280 - chr8:133334470-133334703 NA NA NA NA NA chr8-635 133308634 133309077 300 - chr8:133308757-133308770 NA NA NA NA NA chr8-634 133138606 133138896 142 - chr8:133138763-133138775 NA NA NA NA NA chr8-633 132879561 132879903 152 - chr8:132879812-132879896 NA NA NA NA NA chr8-632 132862013 132862709 300 - chr8:132862263-132862264 NA NA NA NA NA chr8-631 132554623 132554873 139 - chr8:132554770-132554798 NA NA NA NA NA chr8-630 132489547 132489905 209 - chr8:132489623-132489713 NA NA NA NA NA chr8-629 132423693 132424108 170 - chr8:132423974-132423984 NA NA NA NA NA chr8-628 132421130 132421446 115 - chr8:132421259-132421307 NA NA NA NA NA chr8-627 132224684 132225561 548 - chr8:132224912-132225366 NA NA NA NA NA chr8-626 132223439 132223765 235 - chr8:132223554-132223648 NA NA NA NA NA chr8-625 131807818 131808094 193 - chr8:131807905-131808015 NA NA NA NA NA chr8-624 131802981 131803264 210 - chr8:131802994-131803131 NA NA NA NA NA chr8-623 131623703 131624027 135 - chr8:131623801-131623873 NA NA NA NA NA chr8-622 131599172 131599338 140 - chr8:131599201-131599321 NA NA NA NA NA chr8-621 131539442 131539675 139 - chr8:131539497-131539568 NA NA NA NA NA chr8-620 131465880 131466014 119 - chr8:131465886-131465972 NA NA NA NA NA chr8-619 131280313 131280540 181 - chr8:131280322-131280457 NA NA NA NA NA chr8-618 131257199 131257429 151 - chr8:131257279-131257353 NA NA NA NA NA chr8-617 131164944 131165116 118 - chr8:131164956-131165020 NA NA NA NA NA chr8-616 131143133 131143552 167 - chr8:131143256-131143310 NA NA NA NA NA chr8-615 131133150 131133406 185 - chr8:131133170-131133182 NA NA NA NA NA chr8-614 131091084 131091240 122 - chr8:131091100-131091152 NA NA NA NA NA chr8-613 131037699 131037970 205 - chr8:131037824-131037963 NA NA NA NA NA chr8-612 130977283 130977433 130 - chr8:130977311-130977421 NA NA NA NA NA chr8-611 130920282 130920511 156 - chr8:130920448-130920469 NA NA NA NA NA chr8-610 130871454 130871760 194 - chr8:130871632-130871670 NA NA NA NA NA chr8-609 130867216 130867567 145 - chr8:130867455-130867460 NA NA NA NA NA chr8-608 130823689 130823923 129 - chr8:130823782-130823814 NA NA NA NA NA chr8-607 130802228 130802547 181 - chr8:130802365-130802406 NA NA NA NA NA chr8-606 130666994 130667338 185 - chr8:130667218-130667244 NA NA NA NA NA chr8-605 130583964 130584243 140 - chr8:130584074-130584075 NA NA NA NA NA chr8-604 130202374 130202679 231 - chr8:130202404-130202605 NA NA NA NA NA chr8-603 130085202 130085552 200 - chr8:130085378-130085398 NA NA NA NA NA chr8-602 130045445 130045617 143 - chr8:130045453-130045525 NA NA NA NA NA chr8-601 129946035 129946228 167 - chr8:129946037-129946178 NA NA NA NA NA chr8-600 129881166 129881400 170 - chr8:129881201-129881249 NA NA NA NA NA chr8-599 129616398 129616902 269 - chr8:129616796-129616830 NA NA NA NA NA chr8-598 129511383 129511746 192 - chr8:129511511-129511532 NA NA NA NA NA chr8-597 129485089 129485495 206 - chr8:129485278-129485284 NA NA NA NA NA chr8-596 129411683 129411949 175 - chr8:129411841-129411925 NA NA NA NA NA chr8-595 129314919 129315140 152 - chr8:129314999-129315104 NA NA NA NA NA chr8-594 129313466 129313657 182 - chr8:129313487-129313652 NA NA NA NA NA chr8-593 129282225 129282430 123 - chr8:129282294-129282335 NA NA NA NA NA chr8-592 129272789 129272922 121 - chr8:129272805-129272922 NA NA NA NA NA chr8-591 129226264 129226852 283 - chr8:129226601-129226643 NA NA NA NA NA chr8-590 129224744 129224983 152 - chr8:129224790-129224855 NA NA NA NA NA chr8-589 129151783 129152169 215 - chr8:129151946-129151990 NA NA NA NA NA chr8-588 129093239 129093713 262 - chr8:129093510-129093560 NA NA NA NA NA chr8-587 129047025 129047222 137 - chr8:129047052-129047129 NA NA NA NA NA chr8-586 128371367 128371735 155 - chr8:128371648-128371732 NA NA NA NA NA chr8-585 128321483 128321673 164 - chr8:128321574-128321660 NA NA NA NA NA chr8-584 128286125 128286276 122 - chr8:128286136-128286229 NA NA NA NA NA chr8-583 128205271 128205565 159 - chr8:128205369-128205393 NA NA NA NA NA chr8-582 128175237 128175657 247 - chr8:128175421-128175443 NA NA NA NA NA chr8-581 128128315 128128656 242 - chr8:128128369-128128545 NA NA NA NA NA chr8-580 128004411 128004953 290 - chr8:128004554-128004592 NA NA NA NA NA chr8-579 127620708 127621104 218 - chr8:127620966-127621026 NA NA NA NA NA chr8-578 127423328 127423677 241 - chr8:127423349-127423498 NA NA NA NA NA chr8-577 127397587 127397902 190 - chr8:127397721-127397797 NA NA NA NA NA chr8-576 127328200 127328767 309 - chr8:127328291-127328478 NA NA NA NA NA chr8-575 127218105 127218282 158 - chr8:127218112-127218227 NA NA NA NA NA chr8-574 127213906 127214122 118 - chr8:127214053-127214073 NA NA NA NA NA chr8-573 127118977 127119351 269 - chr8:127119116-127119350 NA NA NA NA NA chr8-572 127097412 127097813 196 - chr8:127097657-127097724 NA NA NA NA NA chr8-571 127082624 127082958 167 - chr8:127082778-127082807 NA NA NA NA NA chr8-570 126948173 126948405 172 - chr8:126948231-126948383 NA NA NA NA NA chr8-569 126685165 126685408 157 - chr8:126685241-126685292 NA NA NA NA NA chr8-568 126473455 126473640 158 - chr8:126473506-126473637 NA NA NA NA NA chr8-567 126422844 126423100 207 - chr8:126422923-126423061 NA NA NA NA NA chr8-566 126390324 126390472 128 - chr8:126390368-126390436 NA NA NA NA NA chr8-565 126177176 126177786 266 - chr8:126177482-126177652 NA NA NA NA NA chr8-564 126116158 126116338 149 - chr8:126116179-126116297 NA NA NA NA NA chr8-563 126094989 126095259 228 - chr8:126095066-126095252 NA NA NA NA NA chr8-562 126091141 126091409 128 - chr8:126091293-126091305 NA NA NA NA NA chr8-561 126079398 126079883 365 - chr8:126079485-126079779 NA NA NA NA NA chr8-560 126035245 126035786 276 - chr8:126035338-126035349 NA NA NA NA NA chr8-559 126034661 126034858 124 - chr8:126034773-126034824 NA NA NA NA NA chr8-558 125997513 125997701 115 - chr8:125997633-125997675 NA NA NA NA NA chr8-557 125952692 125952832 119 - chr8:125952766-125952822 NA NA NA NA NA chr8-556 125889696 125890185 198 - chr8:125890035-125890038 NA NA NA NA NA chr8-555 125433583 125433891 167 - chr8:125433740-125433766 NA NA NA NA NA chr8-554 125363853 125364048 139 - chr8:125363918-125363995 NA NA NA NA NA chr8-553 125218180 125218469 206 - chr8:125218228-125218351 NA NA NA NA NA chr8-552 125182687 125182849 133 - chr8:125182703-125182825 NA NA NA NA NA chr8-551 125163032 125163503 250 - chr8:125163293-125163406 NA NA NA NA NA chr8-550 125138809 125139042 141 - chr8:125138930-125138979 NA NA NA NA NA chr8-549 125100788 125101188 165 - chr8:125100831-125100889 NA NA NA NA NA chr8-548 125077345 125077671 160 - chr8:125077572-125077620 NA NA NA NA NA chr8-547 125047002 125047258 124 - chr8:125047175-125047255 NA NA NA NA NA chr8-546 124959319 124959545 136 - chr8:124959370-124959416 NA NA NA NA NA chr8-545 124654906 124655130 214 - chr8:124654908-124655096 NA NA NA NA NA chr8-544 124623360 124623720 265 - chr8:124623368-124623538 NA NA NA NA NA chr8-543 124456839 124457007 142 - chr8:124456866-124456982 NA NA NA NA NA chr8-542 124315213 124315384 122 - chr8:124315310-124315351 NA NA NA NA NA chr8-541 124304052 124304443 267 - chr8:124304174-124304442 NA NA NA NA NA chr8-540 124295451 124295741 179 - chr8:124295601-124295643 NA NA NA NA NA chr8-539 124271220 124271582 234 - chr8:124271245-124271351 NA NA NA NA NA chr8-538 124168057 124168374 170 - chr8:124168176-124168199 NA NA NA NA NA chr8-537 124162632 124162938 206 - chr8:124162689-124162795 NA NA NA NA NA chr8-536 124034332 124034567 163 - chr8:124034407-124034496 NA NA NA NA NA chr8-535 123912835 123913046 183 - chr8:123912881-123913036 NA NA NA NA NA chr8-534 123878559 123878905 184 - chr8:123878791-123878813 NA NA NA NA NA chr8-533 123866313 123866544 134 - chr8:123866461-123866498 NA NA NA NA NA chr8-532 123723153 123723509 161 - chr8:123723403-123723408 NA NA NA NA NA chr8-531 123717051 123717585 278 - chr8:123717426-123717448 NA NA NA NA NA chr8-530 123580917 123581277 186 - chr8:123581131-123581259 NA NA NA NA NA chr8-529 123578688 123579071 137 - chr8:123578728-123578783 NA NA NA NA NA chr8-528 123567562 123567733 123 - chr8:123567587-123567662 NA NA NA NA NA chr8-527 123557195 123557394 115 - chr8:123557198-123557285 NA NA NA NA NA chr8-526 123495770 123495943 119 - chr8:123495835-123495922 NA NA NA NA NA chr8-525 123475247 123475744 265 - chr8:123475559-123475734 NA NA NA NA NA chr8-524 123158386 123158630 172 - chr8:123158475-123158623 NA NA NA NA NA chr8-523 123100135 123100412 233 - chr8:123100202-123100391 NA NA NA NA NA chr8-522 122904850 122905308 238 - chr8:122904960-122905023 NA NA NA NA NA chr8-521 122668481 122669196 307 - chr8:122668783-122669006 NA NA NA NA NA chr8-520 122651878 122652106 166 - chr8:122651889-122652027 NA NA NA NA NA chr8-519 122600369 122600583 160 - chr8:122600493-122600578 NA NA NA NA NA chr8-518 122439256 122439508 236 - chr8:122439272-122439492 NA NA NA NA NA chr8-517 122438355 122438691 240 - chr8:122438391-122438415 NA NA NA NA NA chr8-516 122427335 122427745 252 - chr8:122427455-122427464 NA NA NA NA NA chr8-515 122406630 122406865 153 - chr8:122406748-122406819 NA NA NA NA NA chr8-514 122357610 122357849 136 - chr8:122357653-122357726 NA NA NA NA NA chr8-513 122304117 122304427 198 - chr8:122304211-122304297 NA NA NA NA NA chr8-512 122184059 122184327 191 - chr8:122184106-122184220 NA NA NA NA NA chr8-511 122178727 122179041 167 - chr8:122178819-122178839 NA NA NA NA NA chr8-510 121984003 121984526 300 - chr8:121984151-121984222 NA NA NA NA NA chr8-509 121947312 121947658 264 - chr8:121947338-121947520 NA NA NA NA NA chr8-508 121856241 121856565 284 - chr8:121856318-121856562 NA NA NA NA NA chr8-507 121831070 121831308 160 - chr8:121831122-121831152 NA NA NA NA NA chr8-506 121762846 121763043 129 - chr8:121762882-121762943 NA NA NA NA NA chr8-505 121577045 121577279 190 - chr8:121577058-121577204 NA NA NA NA NA chr8-504 121564781 121564949 141 - chr8:121564820-121564926 NA NA NA NA NA chr8-503 121416098 121416421 173 - chr8:121416246-121416369 NA NA NA NA NA chr8-502 121317272 121317503 186 - chr8:121317302-121317453 NA NA NA NA NA chr8-501 121232380 121232660 133 - chr8:121232419-121232503 NA NA NA NA NA chr8-500 121183907 121184136 213 - chr8:121183916-121184099 NA NA NA NA NA chr8-499 121165274 121165702 170 - chr8:121165541-121165620 NA NA NA NA NA chr8-498 121107973 121108472 240 - chr8:121108268-121108343 NA NA NA NA NA chr8-497 121079418 121079652 158 - chr8:121079557-121079639 NA NA NA NA NA chr8-496 121045508 121045933 176 - chr8:121045727-121045820 NA NA NA NA NA chr8-495 121014650 121014936 144 - chr8:121014742-121014744 NA NA NA NA NA chr8-494 120952071 120952324 145 - chr8:120952154-120952191 NA NA NA NA NA chr8-493 120951302 120951506 132 - chr8:120951321-120951429 NA NA NA NA NA chr8-492 120945347 120945736 199 - chr8:120945638-120945647 NA NA NA NA NA chr8-491 120559438 120559709 161 - chr8:120559574-120559625 NA NA NA NA NA chr8-490 120472408 120472686 137 - chr8:120472502-120472592 NA NA NA NA NA chr8-489 120422350 120422567 125 - chr8:120422428-120422461 NA NA NA NA NA chr8-488 119919071 119919374 244 - chr8:119919080-119919147 NA NA NA NA NA chr8-487 119899026 119899334 155 - chr8:119899220-119899222 NA NA NA NA NA chr8-486 119890569 119890793 139 - chr8:119890603-119890657 NA NA NA NA NA chr8-485 119827872 119828199 135 - chr8:119828111-119828148 NA NA NA NA NA chr8-484 119810060 119810363 178 - chr8:119810131-119810184 NA NA NA NA NA chr8-483 119580285 119580576 151 - chr8:119580366-119580377 NA NA NA NA NA chr8-482 119418890 119419271 211 - chr8:119419105-119419116 NA NA NA NA NA chr8-481 119386006 119386181 123 - chr8:119386087-119386158 NA NA NA NA NA chr8-480 119335434 119335780 189 - chr8:119335685-119335717 NA NA NA NA NA chr8-479 119281147 119281501 245 - chr8:119281238-119281374 NA NA NA NA NA chr8-478 119166096 119166337 162 - chr8:119166239-119166322 NA NA NA NA NA chr8-477 118905422 118906025 268 - chr8:118905777-118905824 NA NA NA NA NA chr8-476 118858650 118858866 140 - chr8:118858738-118858826 NA NA NA NA NA chr8-475 118713481 118713802 205 - chr8:118713626-118713698 NA NA NA NA NA chr8-474 118426083 118426357 174 - chr8:118426197-118426299 NA NA NA NA NA chr8-473 118400549 118400829 233 - chr8:118400559-118400651 NA NA NA NA NA chr8-472 118388115 118388498 178 - chr8:118388251-118388270 NA NA NA NA NA chr8-471 118380712 118381045 231 - chr8:118380723-118380852 NA NA NA NA NA chr8-470 118340867 118341136 158 - chr8:118340992-118341039 NA NA NA NA NA chr8-469 118198725 118199038 148 - chr8:118198860-118198863 NA NA NA NA NA chr8-468 118048690 118048935 208 - chr8:118048695-118048866 NA NA NA NA NA chr8-467 117903023 117903184 141 - chr8:117903028-117903159 NA NA NA NA NA chr8-466 117884658 117884936 209 - chr8:117884750-117884936 NA NA NA NA NA chr8-465 117585728 117585998 226 - chr8:117585805-117585987 NA NA NA NA NA chr8-464 117449367 117449519 129 - chr8:117449399-117449505 NA NA NA NA NA chr8-463 117300729 117301095 298 - chr8:117300757-117300977 NA NA NA NA NA chr8-462 117297651 117297809 138 - chr8:117297704-117297782 NA NA NA NA NA chr8-461 117237898 117238097 173 - chr8:117237996-117238095 NA NA NA NA NA chr8-460 117074652 117074983 181 - chr8:117074745-117074776 NA NA NA NA NA chr8-459 117065988 117066468 220 - chr8:117066295-117066349 NA NA NA NA NA chr8-458 117061993 117062365 177 - chr8:117062241-117062329 NA NA NA NA NA chr8-457 117057092 117057244 130 - chr8:117057122-117057186 NA NA NA NA NA chr8-456 117041090 117041293 167 - chr8:117041136-117041287 NA NA NA NA NA chr8-455 116925753 116926127 180 - chr8:116925936-116925942 NA NA NA NA NA chr8-454 116700707 116700905 134 - chr8:116700787-116700857 NA NA NA NA NA chr8-453 116166059 116166548 209 - chr8:116166490-116166519 NA NA NA NA NA chr8-452 116032633 116033070 226 - chr8:116032718-116032817 NA NA NA NA NA chr8-451 115750286 115750590 181 - chr8:115750297-115750466 NA NA NA NA NA chr8-450 115624212 115624422 117 - chr8:115624293-115624317 NA NA NA NA NA chr8-449 115567456 115567685 137 - chr8:115567552-115567597 NA NA NA NA NA chr8-448 115238477 115238887 229 - chr8:115238721-115238727 NA NA NA NA NA chr8-447 115126501 115126805 192 - chr8:115126581-115126661 NA NA NA NA NA chr8-446 115070541 115070731 138 - chr8:115070577-115070663 NA NA NA NA NA chr8-445 114973688 114974090 207 - chr8:114973716-114973820 NA NA NA NA NA chr8-444 114911468 114911818 151 - chr8:114911568-114911586 NA NA NA NA NA chr8-443 114750347 114750665 220 - chr8:114750502-114750586 NA NA NA NA NA chr8-442 114643968 114644091 117 - chr8:114643971-114644084 NA NA NA NA NA chr8-441 114519845 114520224 135 - chr8:114520146-114520151 NA NA NA NA NA chr8-15 11446085 11446603 287 - chr8:11446330-11446437 NA NA NA NA NA chr8-440 114352434 114352600 135 - chr8:114352543-114352595 NA NA NA NA NA chr8-439 114276009 114276209 182 - chr8:114276015-114276191 NA NA NA NA NA chr8-438 114112571 114112835 167 - chr8:114112605-114112675 NA NA NA NA NA chr8-437 114046812 114047050 175 - chr8:114046820-114046932 NA NA NA NA NA chr8-436 113883580 113883761 157 - chr8:113883597-113883746 NA NA NA NA NA chr8-435 113730869 113731147 131 - chr8:113731065-113731147 NA NA NA NA NA chr8-434 113606948 113607129 120 - chr8:113606975-113607034 NA NA NA NA NA chr8-433 113160803 113161050 189 - chr8:113160831-113160962 NA NA NA NA NA chr8-432 112964725 112964921 179 - chr8:112964745-112964873 NA NA NA NA NA chr8-431 112539046 112539396 187 - chr8:112539200-112539206 NA NA NA NA NA chr8-430 112416364 112416788 343 - chr8:112416525-112416787 NA NA NA NA NA chr8-429 112011130 112011429 144 - chr8:112011204-112011247 NA NA NA NA NA chr8-14 11161182 11161350 115 - chr8:11161208-11161288 NA NA NA NA NA chr8-428 111463257 111463681 355 - chr8:111463285-111463489 NA NA NA NA NA chr8-427 111270233 111270651 219 - chr8:111270410-111270430 NA NA NA NA NA chr8-426 111186923 111187088 114 - chr8:111186959-111187032 NA NA NA NA NA chr8-425 111130659 111130912 174 - chr8:111130771-111130844 NA NA NA NA NA chr8-424 110847070 110847303 143 - chr8:110847175-110847218 NA NA NA NA NA chr8-423 110724285 110724557 202 - chr8:110724380-110724464 NA NA NA NA NA chr8-422 110539014 110539314 257 - chr8:110539186-110539314 NA NA NA NA NA chr8-421 110431568 110431801 172 - chr8:110431684-110431795 NA NA NA NA NA chr8-420 110375161 110375739 350 - chr8:110375352-110375434 NA NA NA NA NA chr8-419 110084327 110084733 291 - chr8:110084405-110084507 NA NA NA NA NA chr8-418 109884630 109884763 127 - chr8:109884634-109884759 NA NA NA NA NA chr8-417 109839657 109839954 174 - chr8:109839747-109839820 NA NA NA NA NA chr8-416 109731141 109731584 267 - chr8:109731141-109731232 NA NA NA NA NA chr8-415 109721026 109721241 176 - chr8:109721068-109721205 NA NA NA NA NA chr8-414 109615235 109615443 132 - chr8:109615259-109615315 NA NA NA NA NA chr8-413 109321100 109321278 126 - chr8:109321162-109321256 NA NA NA NA NA chr8-412 109184033 109184503 246 - chr8:109184424-109184442 NA NA NA NA NA chr8-411 109078078 109078367 170 - chr8:109078287-109078338 NA NA NA NA NA chr8-410 109072254 109072529 155 - chr8:109072299-109072334 NA NA NA NA NA chr8-409 108859560 108859836 180 - chr8:108859635-108859737 NA NA NA NA NA chr8-408 108790952 108791142 136 - chr8:108790965-108791047 NA NA NA NA NA chr8-407 108683443 108683657 148 - chr8:108683502-108683584 NA NA NA NA NA chr8-406 108186200 108186409 140 - chr8:108186235-108186306 NA NA NA NA NA chr8-405 108090328 108090603 238 - chr8:108090357-108090484 NA NA NA NA NA chr8-404 107929057 107929562 283 - chr8:107929337-107929398 NA NA NA NA NA chr8-403 107759977 107760186 146 - chr8:107760109-107760146 NA NA NA NA NA chr8-402 107573914 107574195 190 - chr8:107573968-107574067 NA NA NA NA NA chr8-401 107071499 107072008 308 - chr8:107071617-107071724 NA NA NA NA NA chr8-400 107056204 107056477 170 - chr8:107056255-107056258 NA NA NA NA NA chr8-399 107023770 107024041 158 - chr8:107023965-107024010 NA NA NA NA NA chr8-398 106853074 106853676 309 - chr8:106853237-106853253 NA NA NA NA NA chr8-397 106674784 106675175 267 - chr8:106674953-106675096 NA NA NA NA NA chr8-396 106475647 106475851 131 - chr8:106475688-106475746 NA NA NA NA NA chr8-395 106397099 106397399 156 - chr8:106397183-106397195 NA NA NA NA NA chr8-394 106265422 106265698 164 - chr8:106265517-106265535 NA NA NA NA NA chr8-393 106180818 106181101 171 - chr8:106180980-106181039 NA NA NA NA NA chr8-392 106145407 106145612 134 - chr8:106145461-106145524 NA NA NA NA NA chr8-391 105913279 105913605 269 - chr8:105913363-105913461 NA NA NA NA NA chr8-390 105639041 105639534 212 - chr8:105639137-105639176 NA NA NA NA NA chr8-389 105570115 105570343 129 - chr8:105570215-105570245 NA NA NA NA NA chr8-388 105401887 105402063 142 - chr8:105401897-105402005 NA NA NA NA NA chr8-387 105361669 105361844 120 - chr8:105361737-105361828 NA NA NA NA NA chr8-386 105176741 105177217 218 - chr8:105177086-105177094 NA NA NA NA NA chr8-385 104995628 104996073 254 - chr8:104995866-104996023 NA NA NA NA NA chr8-384 104981778 104982159 256 - chr8:104981925-104982056 NA NA NA NA NA chr8-383 104684533 104684976 241 - chr8:104684705-104684740 NA NA NA NA NA chr8-382 104636740 104637068 184 - chr8:104636803-104636864 NA NA NA NA NA chr8-381 104604814 104605171 194 - chr8:104604896-104604927 NA NA NA NA NA chr8-380 104598530 104598740 123 - chr8:104598552-104598588 NA NA NA NA NA chr8-379 104545360 104545563 152 - chr8:104545360-104545461 NA NA NA NA NA chr8-378 104472348 104473113 366 - chr8:104472807-104472824 NA NA NA NA NA chr8-377 103797674 103798110 244 - chr8:103797855-103797885 NA NA NA NA NA chr8-13 10377832 10378333 240 - chr8:10378058-10378211 NA NA NA NA NA chr8-376 103730834 103731411 243 - chr8:103730883-103731160 NA NA NA NA NA chr8-375 103554437 103554792 286 - chr8:103554489-103554705 NA NA NA NA NA chr8-374 103522542 103522954 219 - chr8:103522702-103522728 NA NA NA NA NA chr8-373 103363166 103363702 370 - chr8:103363515-103363684 NA NA NA NA NA chr8-372 103349014 103349307 177 - chr8:103349127-103349188 NA NA NA NA NA chr8-371 103252561 103252754 140 - chr8:103252642-103252729 NA NA NA NA NA chr8-370 103250016 103250292 187 - chr8:103250154-103250252 NA NA NA NA NA chr8-369 103216138 103216380 191 - chr8:103216231-103216317 NA NA NA NA NA chr8-368 103143469 103143740 200 - chr8:103143573-103143680 NA NA NA NA NA chr8-367 102981042 102981227 114 - chr8:102981102-102981123 NA NA NA NA NA chr8-366 102837372 102837592 121 - chr8:102837439-102837527 NA NA NA NA NA chr8-365 102470712 102470976 152 - chr8:102470826-102470866 NA NA NA NA NA chr8-364 102233754 102234021 185 - chr8:102233801-102233904 NA NA NA NA NA chr8-363 101950932 101951123 154 - chr8:101950969-101951086 NA NA NA NA NA chr8-362 101914466 101914825 157 - chr8:101914569-101914590 NA NA NA NA NA chr8-361 101862340 101862505 117 - chr8:101862340-101862441 NA NA NA NA NA chr8-360 101621893 101622246 254 - chr8:101621912-101622164 NA NA NA NA NA chr8-359 101342151 101342427 223 - chr8:101342217-101342413 NA NA NA NA NA chr8-358 101192168 101192403 141 - chr8:101192297-101192344 NA NA NA NA NA chr8-357 101076687 101076942 171 - chr8:101076746-101076783 NA NA NA NA NA chr8-356 100995236 100995465 119 - chr8:100995399-100995408 NA NA NA NA NA chr8-355 100617210 100617631 213 - chr8:100617331-100617394 NA NA NA NA NA chr8-354 100597882 100598066 114 - chr8:100597892-100597976 NA NA NA NA NA chr8-353 100350106 100350367 142 - chr8:100350189-100350236 NA NA NA NA NA chr7-481 99067901 99068117 181 - chr7:99067972-99068048 NA NA NA NA NA chr7-480 98989186 98989533 190 - chr7:98989372-98989463 NA NA NA NA NA chr7-479 98815224 98815635 275 - chr7:98815480-98815619 NA NA NA NA NA chr7-478 98428340 98428720 327 - chr7:98428400-98428688 NA NA NA NA NA chr7-477 98382196 98382422 137 - chr7:98382276-98382306 NA NA NA NA NA chr7-476 98342234 98342699 294 - chr7:98342486-98342609 NA NA NA NA NA chr7-475 98214065 98214276 145 - chr7:98214147-98214226 NA NA NA NA NA chr7-474 97847648 97847980 191 - chr7:97847827-97847877 NA NA NA NA NA chr7-473 97642941 97643389 244 - chr7:97643074-97643122 NA NA NA NA NA chr7-472 97354900 97355103 142 - chr7:97354977-97355058 NA NA NA NA NA chr7-471 96539144 96539460 263 - chr7:96539235-96539339 NA NA NA NA NA chr7-470 96496447 96496732 158 - chr7:96496607-96496638 NA NA NA NA NA chr7-469 96272346 96272704 290 - chr7:96272503-96272589 NA NA NA NA NA chr7-468 96231564 96231788 163 - chr7:96231565-96231667 NA NA NA NA NA chr7-467 96077986 96078377 236 - chr7:96078046-96078127 NA NA NA NA NA chr7-466 95948288 95948663 234 - chr7:95948370-95948610 NA NA NA NA NA chr7-465 95876623 95876928 182 - chr7:95876711-95876776 NA NA NA NA NA chr7-464 95865094 95865302 149 - chr7:95865126-95865234 NA NA NA NA NA chr7-463 95737102 95737369 156 - chr7:95737134-95737179 NA NA NA NA NA chr7-462 95285667 95286273 337 - chr7:95285915-95285983 NA NA NA NA NA chr7-461 95182612 95182818 119 - chr7:95182736-95182768 NA NA NA NA NA chr7-460 95172963 95173188 141 - chr7:95173110-95173167 NA NA NA NA NA chr7-459 95102801 95103249 246 - chr7:95103115-95103159 NA NA NA NA NA chr7-458 94788852 94789076 185 - chr7:94788853-94788999 NA NA NA NA NA chr7-457 94657049 94657276 152 - chr7:94657152-94657229 NA NA NA NA NA chr7-456 94583783 94584070 201 - chr7:94583896-94584011 NA NA NA NA NA chr7-455 94558227 94558482 175 - chr7:94558238-94558333 NA NA NA NA NA chr7-454 94484955 94485400 189 - chr7:94485046-94485089 NA NA NA NA NA chr7-453 94397995 94398222 193 - chr7:94398069-94398160 NA NA NA NA NA chr7-452 94311467 94311961 273 - chr7:94311702-94311782 NA NA NA NA NA chr7-451 94248498 94249044 269 - chr7:94248818-94248896 NA NA NA NA NA chr7-450 94196179 94196331 125 - chr7:94196281-94196329 NA NA NA NA NA chr7-449 94144844 94145117 172 - chr7:94144943-94145014 NA NA NA NA NA chr7-448 93932793 93933164 208 - chr7:93932898-93932943 NA NA NA NA NA chr7-447 93875810 93876186 247 - chr7:93875858-93875976 NA NA NA NA NA chr7-446 93601095 93601334 124 - chr7:93601232-93601241 NA NA NA NA NA chr7-445 93556069 93556419 129 - chr7:93556128-93556144 NA NA NA NA NA chr7-444 93455264 93455451 116 - chr7:93455404-93455449 NA NA NA NA NA chr7-443 93239196 93239533 223 - chr7:93239325-93239464 NA NA NA NA NA chr7-442 92761615 92761962 219 - chr7:92761686-92761777 NA NA NA NA NA chr7-59 9213188 9213506 196 - chr7:9213299-9213351 NA NA NA NA NA chr7-441 92130988 92131179 133 - chr7:92131067-92131128 NA NA NA NA NA chr7-440 92076905 92077083 128 - chr7:92076991-92077069 NA NA NA NA NA chr7-439 91825694 91826058 233 - chr7:91825936-91826038 NA NA NA NA NA chr7-438 91694495 91694820 252 - chr7:91694590-91694769 NA NA NA NA NA chr7-437 91314226 91314767 289 - chr7:91314500-91314537 NA NA NA NA NA chr7-436 91274711 91275030 204 - chr7:91274895-91274984 NA NA NA NA NA chr7-435 91150204 91150378 136 - chr7:91150254-91150352 NA NA NA NA NA chr7-434 90930335 90930620 147 - chr7:90930412-90930421 NA NA NA NA NA chr7-433 90647981 90648150 123 - chr7:90648105-90648130 NA NA NA NA NA chr7-432 89799165 89799575 227 - chr7:89799206-89799250 NA NA NA NA NA chr7-431 89582165 89582461 188 - chr7:89582304-89582384 NA NA NA NA NA chr7-430 89518026 89518635 328 - chr7:89518215-89518229 NA NA NA NA NA chr7-429 89500736 89500919 153 - chr7:89500742-89500805 NA NA NA NA NA chr7-428 89500097 89500323 168 - chr7:89500150-89500260 NA NA NA NA NA chr7-427 89471442 89471743 157 - chr7:89471571-89471584 NA NA NA NA NA chr7-426 89400079 89400301 184 - chr7:89400106-89400252 NA NA NA NA NA chr7-425 89357377 89357726 192 - chr7:89357474-89357549 NA NA NA NA NA chr7-424 89351913 89352126 131 - chr7:89352038-89352087 NA NA NA NA NA chr7-423 89192119 89192432 166 - chr7:89192267-89192286 NA NA NA NA NA chr7-58 8914817 8915056 147 - chr7:8914865-8914920 NA NA NA NA NA chr7-422 88901953 88902252 230 - chr7:88902028-88902188 NA NA NA NA NA chr7-421 88636053 88636485 240 - chr7:88636291-88636339 NA NA NA NA NA chr7-420 88494706 88495071 269 - chr7:88494886-88495059 NA NA NA NA NA chr7-419 88203047 88203283 194 - chr7:88203064-88203132 NA NA NA NA NA chr7-418 88155782 88156196 244 - chr7:88155935-88156009 NA NA NA NA NA chr7-417 88086850 88087082 143 - chr7:88086904-88086958 NA NA NA NA NA chr7-416 87635682 87636120 236 - chr7:87635870-87635904 NA NA NA NA NA chr7-57 8751734 8752035 194 - chr7:8751877-8751940 NA NA NA NA NA chr7-415 86909297 86909607 143 - chr7:86909433-86909438 NA NA NA NA NA chr7-414 86876804 86877270 173 - chr7:86876890-86876908 NA NA NA NA NA chr7-413 86819479 86819842 209 - chr7:86819702-86819711 NA NA NA NA NA chr7-412 86680899 86681239 192 - chr7:86681129-86681173 NA NA NA NA NA chr7-411 86512628 86512854 119 - chr7:86512752-86512795 NA NA NA NA NA chr7-56 8637805 8638017 191 - chr7:8637844-8638014 NA NA NA NA NA chr7-410 86288895 86289132 152 - chr7:86288911-86288978 NA NA NA NA NA chr7-409 86248017 86248200 123 - chr7:86248029-86248092 NA NA NA NA NA chr7-408 86166453 86166666 137 - chr7:86166540-86166601 NA NA NA NA NA chr7-407 86080049 86080230 140 - chr7:86080124-86080223 NA NA NA NA NA chr7-406 85905968 85906276 227 - chr7:85906104-85906250 NA NA NA NA NA chr7-405 85526818 85527026 127 - chr7:85526841-85526887 NA NA NA NA NA chr7-404 85455455 85455781 181 - chr7:85455455-85455554 NA NA NA NA NA chr7-403 85449720 85449948 159 - chr7:85449752-85449768 NA NA NA NA NA chr7-402 85274480 85274872 200 - chr7:85274813-85274844 NA NA NA NA NA chr7-401 85160651 85160999 195 - chr7:85160814-85160876 NA NA NA NA NA chr7-400 85018545 85018811 197 - chr7:85018625-85018753 NA NA NA NA NA chr7-399 84542675 84542869 162 - chr7:84542779-84542845 NA NA NA NA NA chr7-398 84470382 84470967 322 - chr7:84470742-84470755 NA NA NA NA NA chr7-397 84455185 84455707 326 - chr7:84455267-84455380 NA NA NA NA NA chr7-396 84096101 84096286 152 - chr7:84096167-84096286 NA NA NA NA NA chr7-395 84048418 84048892 274 - chr7:84048577-84048651 NA NA NA NA NA chr7-394 84025653 84025898 201 - chr7:84025771-84025840 NA NA NA NA NA chr7-393 83920329 83920672 185 - chr7:83920421-83920448 NA NA NA NA NA chr7-392 83706049 83706549 238 - chr7:83706424-83706487 NA NA NA NA NA chr7-391 83613910 83614178 198 - chr7:83614079-83614141 NA NA NA NA NA chr7-390 83576054 83576618 321 - chr7:83576349-83576610 NA NA NA NA NA chr7-389 83561013 83561243 176 - chr7:83561071-83561193 NA NA NA NA NA chr7-388 83300988 83301271 225 - chr7:83301204-83301255 NA NA NA NA NA chr7-387 83290823 83291081 168 - chr7:83290986-83291064 NA NA NA NA NA chr7-55 8327585 8327961 207 - chr7:8327638-8327676 NA NA NA NA NA chr7-386 83138105 83138290 124 - chr7:83138145-83138208 NA NA NA NA NA chr7-385 82961208 82961581 285 - chr7:82961291-82961488 NA NA NA NA NA chr7-384 82811445 82811683 227 - chr7:82811463-82811679 NA NA NA NA NA chr7-383 82775784 82776273 274 - chr7:82776009-82776088 NA NA NA NA NA chr7-382 82770020 82770320 181 - chr7:82770138-82770200 NA NA NA NA NA chr7-381 82427800 82428073 214 - chr7:82427842-82427997 NA NA NA NA NA chr7-54 8213064 8213416 275 - chr7:8213115-8213313 NA NA NA NA NA chr7-380 81895594 81895833 128 - chr7:81895648-81895703 NA NA NA NA NA chr7-379 81792579 81793305 377 - chr7:81792854-81792988 NA NA NA NA NA chr7-378 81234491 81234659 153 - chr7:81234513-81234621 NA NA NA NA NA chr7-377 80896629 80896861 163 - chr7:80896665-80896805 NA NA NA NA NA chr7-376 80782353 80782821 246 - chr7:80782355-80782521 NA NA NA NA NA chr7-375 80761144 80761382 216 - chr7:80761146-80761340 NA NA NA NA NA chr7-374 80522883 80523164 173 - chr7:80522997-80523062 NA NA NA NA NA chr7-373 80230396 80230688 227 - chr7:80230449-80230481 NA NA NA NA NA chr7-372 80137924 80138150 133 - chr7:80138029-80138131 NA NA NA NA NA chr7-371 80094564 80094991 218 - chr7:80094658-80094667 NA NA NA NA NA chr7-370 79937536 79937961 230 - chr7:79937735-79937783 NA NA NA NA NA chr7-369 79861262 79861415 134 - chr7:79861323-79861400 NA NA NA NA NA chr7-53 7978239 7978474 157 - chr7:7978433-7978449 NA NA NA NA NA chr7-368 79766594 79767080 197 - chr7:79766697-79766729 NA NA NA NA NA chr7-367 79696959 79697162 182 - chr7:79696969-79697130 NA NA NA NA NA chr7-52 7925545 7925744 125 - chr7:7925601-7925652 NA NA NA NA NA chr7-366 79041563 79041961 302 - chr7:79041581-79041787 NA NA NA NA NA chr7-365 78934848 78935151 230 - chr7:78934918-78935075 NA NA NA NA NA chr7-51 7842310 7842437 114 - chr7:7842359-7842434 NA NA NA NA NA chr7-364 78031020 78031270 126 - chr7:78031088-78031090 NA NA NA NA NA chr7-363 77909569 77910062 228 - chr7:77909901-77909975 NA NA NA NA NA chr7-362 77862039 77862247 146 - chr7:77862087-77862143 NA NA NA NA NA chr7-361 77561721 77562056 143 - chr7:77561736-77561815 NA NA NA NA NA chr7-360 77551288 77551560 134 - chr7:77551450-77551489 NA NA NA NA NA chr7-359 77540237 77540516 190 - chr7:77540354-77540511 NA NA NA NA NA chr7-358 77426603 77426852 156 - chr7:77426740-77426803 NA NA NA NA NA chr7-357 77250139 77250526 266 - chr7:77250389-77250448 NA NA NA NA NA chr7-50 7675971 7676426 303 - chr7:7676233-7676384 NA NA NA NA NA chr7-49 7645430 7645624 167 - chr7:7645436-7645590 NA NA NA NA NA chr7-356 76313144 76313607 217 - chr7:76313217-76313352 NA NA NA NA NA chr7-355 76191250 76191660 234 - chr7:76191457-76191577 NA NA NA NA NA chr7-48 7484683 7485549 463 - chr7:7484819-7485026 NA NA NA NA NA chr7-354 74480907 74481129 143 - chr7:74480951-74481015 NA NA NA NA NA chr7-47 7427063 7427425 236 - chr7:7427184-7427370 NA NA NA NA NA chr7-353 74046543 74046734 155 - chr7:74046574-74046683 NA NA NA NA NA chr7-352 73466579 73466866 260 - chr7:73466596-73466829 NA NA NA NA NA chr7-46 7329977 7330373 241 - chr7:7330004-7330172 NA NA NA NA NA chr7-45 7176055 7176347 222 - chr7:7176082-7176234 NA NA NA NA NA chr7-351 70896067 70896392 230 - chr7:70896303-70896344 NA NA NA NA NA chr7-350 70726316 70726504 141 - chr7:70726410-70726504 NA NA NA NA NA chr7-349 70516874 70517324 259 - chr7:70517060-70517128 NA NA NA NA NA chr7-348 70310676 70310944 262 - chr7:70310682-70310942 NA NA NA NA NA chr7-347 70045474 70045697 130 - chr7:70045526-70045563 NA NA NA NA NA chr7-346 70040485 70040875 295 - chr7:70040570-70040775 NA NA NA NA NA chr7-345 69772860 69773188 175 - chr7:69773126-69773148 NA NA NA NA NA chr7-344 69574791 69575293 267 - chr7:69575097-69575129 NA NA NA NA NA chr7-343 69566699 69567213 364 - chr7:69566858-69567176 NA NA NA NA NA chr7-342 69512448 69512737 150 - chr7:69512597-69512628 NA NA NA NA NA chr7-341 69499028 69499217 127 - chr7:69499102-69499167 NA NA NA NA NA chr7-340 68958467 68958735 164 - chr7:68958547-68958623 NA NA NA NA NA chr7-339 68664865 68665138 162 - chr7:68664929-68664980 NA NA NA NA NA chr7-338 68032534 68032775 225 - chr7:68032580-68032757 NA NA NA NA NA chr7-337 67698520 67698742 121 - chr7:67698522-67698608 NA NA NA NA NA chr7-336 67401559 67401999 250 - chr7:67401738-67401776 NA NA NA NA NA chr7-335 66779356 66779608 145 - chr7:66779430-66779490 NA NA NA NA NA chr7-44 6628960 6629277 216 - chr7:6629059-6629170 NA NA NA NA NA chr7-334 65255465 65255848 202 - chr7:65255568-65255589 NA NA NA NA NA chr7-333 64853610 64853849 163 - chr7:64853665-64853710 NA NA NA NA NA chr7-332 64806784 64807044 149 - chr7:64806826-64806910 NA NA NA NA NA chr7-331 64237650 64237948 174 - chr7:64237739-64237815 NA NA NA NA NA chr7-43 6342364 6342647 197 - chr7:6342442-6342537 NA NA NA NA NA chr7-330 63370306 63370609 214 - chr7:63370359-63370484 NA NA NA NA NA chr7-42 6176618 6176905 233 - chr7:6176655-6176823 NA NA NA NA NA chr7-329 61109785 61110004 155 - chr7:61109800-61109891 NA NA NA NA NA chr7-328 57975189 57975414 123 - chr7:57975291-57975380 NA NA NA NA NA chr7-327 57869326 57869584 245 - chr7:57869342-57869580 NA NA NA NA NA chr7-41 5762811 5763198 239 - chr7:5763042-5763133 NA NA NA NA NA chr7-40 5746906 5747158 121 - chr7:5747068-5747120 NA NA NA NA NA chr7-39 5635962 5636308 265 - chr7:5635981-5636165 NA NA NA NA NA chr7-326 56209696 56210118 320 - chr7:56209845-56210063 NA NA NA NA NA chr7-325 56066385 56066656 234 - chr7:56066411-56066608 NA NA NA NA NA chr7-324 55938289 55938640 213 - chr7:55938415-55938468 NA NA NA NA NA chr7-323 55568493 55568749 184 - chr7:55568580-55568692 NA NA NA NA NA chr7-322 55230309 55230474 114 - chr7:55230364-55230461 NA NA NA NA NA chr7-321 55076289 55076755 215 - chr7:55076659-55076667 NA NA NA NA NA chr7-320 55011226 55011535 207 - chr7:55011340-55011513 NA NA NA NA NA chr7-319 54961950 54962222 145 - chr7:54962081-54962107 NA NA NA NA NA chr7-318 54726115 54726369 146 - chr7:54726323-54726361 NA NA NA NA NA chr7-317 53909691 53910023 231 - chr7:53909834-53909964 NA NA NA NA NA chr7-316 53885138 53885404 165 - chr7:53885251-53885315 NA NA NA NA NA chr7-315 53830394 53830714 226 - chr7:53830440-53830572 NA NA NA NA NA chr7-314 53553986 53554163 153 - chr7:53554065-53554146 NA NA NA NA NA chr7-313 53434804 53435013 150 - chr7:53434804-53434895 NA NA NA NA NA chr7-312 53361269 53361701 246 - chr7:53361582-53361642 NA NA NA NA NA chr7-311 53264553 53264915 209 - chr7:53264660-53264818 NA NA NA NA NA chr7-310 53015970 53016139 130 - chr7:53016019-53016110 NA NA NA NA NA chr7-309 52936829 52937159 172 - chr7:52937017-52937031 NA NA NA NA NA chr7-308 52867601 52867881 194 - chr7:52867708-52867858 NA NA NA NA NA chr7-307 52824693 52825004 241 - chr7:52824746-52824917 NA NA NA NA NA chr7-306 52198162 52198531 198 - chr7:52198229-52198256 NA NA NA NA NA chr7-305 52120212 52120426 127 - chr7:52120293-52120321 NA NA NA NA NA chr7-304 52096458 52096913 248 - chr7:52096668-52096707 NA NA NA NA NA chr7-303 52092596 52092910 220 - chr7:52092624-52092750 NA NA NA NA NA chr7-302 52022008 52022268 126 - chr7:52022034-52022098 NA NA NA NA NA chr7-301 51962906 51963180 118 - chr7:51963082-51963148 NA NA NA NA NA chr7-300 51873298 51873528 185 - chr7:51873331-51873501 NA NA NA NA NA chr7-299 51850778 51851286 227 - chr7:51851090-51851138 NA NA NA NA NA chr7-298 51810098 51810417 227 - chr7:51810101-51810236 NA NA NA NA NA chr7-297 51580247 51580484 213 - chr7:51580325-51580466 NA NA NA NA NA chr7-296 51529165 51529554 205 - chr7:51529344-51529365 NA NA NA NA NA chr7-295 51484496 51484781 161 - chr7:51484687-51484724 NA NA NA NA NA chr7-294 51293301 51293658 287 - chr7:51293549-51293626 NA NA NA NA NA chr7-293 51126222 51126402 154 - chr7:51126294-51126370 NA NA NA NA NA chr7-292 50916079 50916586 253 - chr7:50916235-50916297 NA NA NA NA NA chr7-291 50813044 50813173 114 - chr7:50813083-50813166 NA NA NA NA NA chr7-290 50790472 50790890 251 - chr7:50790595-50790735 NA NA NA NA NA chr7-289 50408734 50409199 169 - chr7:50409105-50409128 NA NA NA NA NA chr7-288 50244142 50244482 213 - chr7:50244193-50244366 NA NA NA NA NA chr7-287 49635742 49636119 239 - chr7:49635854-49635903 NA NA NA NA NA chr7-286 49562154 49562436 150 - chr7:49562228-49562246 NA NA NA NA NA chr7-285 49529330 49529876 250 - chr7:49529512-49529542 NA NA NA NA NA chr7-284 49441705 49442004 274 - chr7:49441705-49441974 NA NA NA NA NA chr7-283 49363993 49364199 124 - chr7:49364124-49364166 NA NA NA NA NA chr7-282 49170379 49170614 148 - chr7:49170464-49170525 NA NA NA NA NA chr7-38 4892688 4892889 175 - chr7:4892705-4892854 NA NA NA NA NA chr7-281 48671007 48671459 284 - chr7:48671251-48671381 NA NA NA NA NA chr7-280 48511628 48512012 182 - chr7:48511740-48511772 NA NA NA NA NA chr7-279 48481781 48482000 170 - chr7:48481853-48481974 NA NA NA NA NA chr7-278 48452498 48452726 130 - chr7:48452643-48452675 NA NA NA NA NA chr7-277 48362610 48363002 221 - chr7:48362704-48362754 NA NA NA NA NA chr7-276 48242140 48242353 167 - chr7:48242149-48242270 NA NA NA NA NA chr7-37 4821439 4821716 222 - chr7:4821523-4821690 NA NA NA NA NA chr7-275 48189287 48189689 211 - chr7:48189478-48189498 NA NA NA NA NA chr7-274 48161122 48161366 142 - chr7:48161149-48161189 NA NA NA NA NA chr7-273 47823850 47824090 143 - chr7:47823961-47824007 NA NA NA NA NA chr7-272 47811190 47811466 174 - chr7:47811317-47811389 NA NA NA NA NA chr7-271 47766577 47766844 114 - chr7:47766736-47766799 NA NA NA NA NA chr7-270 47765824 47766249 281 - chr7:47765938-47766015 NA NA NA NA NA chr7-269 47678683 47679020 244 - chr7:47678790-47678941 NA NA NA NA NA chr7-268 47651530 47651846 221 - chr7:47651631-47651736 NA NA NA NA NA chr7-267 47249821 47250041 139 - chr7:47249882-47249900 NA NA NA NA NA chr7-266 47029513 47029819 161 - chr7:47029745-47029761 NA NA NA NA NA chr7-265 46974477 46974732 167 - chr7:46974490-46974569 NA NA NA NA NA chr7-264 46876780 46877049 226 - chr7:46876832-46877033 NA NA NA NA NA chr7-263 46876003 46876172 118 - chr7:46876053-46876120 NA NA NA NA NA chr7-36 4678050 4678257 118 - chr7:4678174-4678203 NA NA NA NA NA chr7-262 46694350 46694621 121 - chr7:46694531-46694602 NA NA NA NA NA chr7-261 46175329 46175513 151 - chr7:46175349-46175441 NA NA NA NA NA chr7-35 4614536 4614753 172 - chr7:4614559-4614642 NA NA NA NA NA chr7-260 46110916 46111150 186 - chr7:46111059-46111101 NA NA NA NA NA chr7-259 46034926 46035253 178 - chr7:46035111-46035140 NA NA NA NA NA chr7-258 45619129 45619340 163 - chr7:45619160-45619241 NA NA NA NA NA chr7-257 45470050 45470367 165 - chr7:45470215-45470254 NA NA NA NA NA chr7-256 45458024 45458453 168 - chr7:45458331-45458412 NA NA NA NA NA chr7-255 45383883 45384160 230 - chr7:45384026-45384115 NA NA NA NA NA chr7-254 45179118 45179372 141 - chr7:45179264-45179270 NA NA NA NA NA chr7-253 45070620 45071064 210 - chr7:45070838-45070970 NA NA NA NA NA chr7-252 45067429 45067777 187 - chr7:45067559-45067585 NA NA NA NA NA chr7-251 44721289 44721719 244 - chr7:44721504-44721562 NA NA NA NA NA chr7-250 44551486 44551906 227 - chr7:44551666-44551674 NA NA NA NA NA chr7-249 44244487 44244829 171 - chr7:44244691-44244757 NA NA NA NA NA chr7-248 43779490 43779766 241 - chr7:43779588-43779752 NA NA NA NA NA chr7-247 43604539 43604727 149 - chr7:43604558-43604628 NA NA NA NA NA chr7-246 42674682 42674872 141 - chr7:42674729-42674817 NA NA NA NA NA chr7-34 4249557 4249900 249 - chr7:4249579-4249734 NA NA NA NA NA chr7-245 42389601 42390018 277 - chr7:42389771-42390001 NA NA NA NA NA chr7-244 42362422 42362942 290 - chr7:42362650-42362706 NA NA NA NA NA chr7-243 42313914 42314309 298 - chr7:42313945-42314231 NA NA NA NA NA chr7-33 4218115 4218429 233 - chr7:4218187-4218339 NA NA NA NA NA chr7-242 42146220 42146466 156 - chr7:42146357-42146423 NA NA NA NA NA chr7-241 42145908 42146145 125 - chr7:42146018-42146031 NA NA NA NA NA chr7-240 41821992 41822220 160 - chr7:41822115-41822207 NA NA NA NA NA chr7-239 41767807 41768093 270 - chr7:41767809-41768063 NA NA NA NA NA chr7-238 41631304 41631804 267 - chr7:41631462-41631496 NA NA NA NA NA chr7-32 4152250 4152500 131 - chr7:4152369-4152381 NA NA NA NA NA chr7-237 41503445 41503792 249 - chr7:41503478-41503629 NA NA NA NA NA chr7-236 41272192 41272530 297 - chr7:41272297-41272471 NA NA NA NA NA chr7-235 41205886 41206148 161 - chr7:41206021-41206081 NA NA NA NA NA chr7-234 41078596 41078781 128 - chr7:41078616-41078687 NA NA NA NA NA chr7-233 41049437 41049759 172 - chr7:41049521-41049587 NA NA NA NA NA chr7-232 41020158 41020471 201 - chr7:41020318-41020407 NA NA NA NA NA chr7-231 40934627 40934987 239 - chr7:40934773-40934891 NA NA NA NA NA chr7-230 40766517 40766797 153 - chr7:40766625-40766651 NA NA NA NA NA chr7-229 40633045 40633407 273 - chr7:40633207-40633391 NA NA NA NA NA chr7-31 4058169 4058641 219 - chr7:4058496-4058557 NA NA NA NA NA chr7-228 40356310 40356722 301 - chr7:40356357-40356658 NA NA NA NA NA chr7-227 40341734 40342163 188 - chr7:40341738-40341821 NA NA NA NA NA chr7-226 40261125 40261669 344 - chr7:40261469-40261664 NA NA NA NA NA chr7-225 39327865 39328373 301 - chr7:39328115-39328247 NA NA NA NA NA chr7-224 39162042 39162322 150 - chr7:39162234-39162254 NA NA NA NA NA chr7-223 39057649 39057857 124 - chr7:39057800-39057840 NA NA NA NA NA chr7-222 38893136 38893527 217 - chr7:38893244-38893403 NA NA NA NA NA chr7-30 3888551 3888843 202 - chr7:3888567-3888679 NA NA NA NA NA chr7-29 3866816 3867003 148 - chr7:3866817-3866952 NA NA NA NA NA chr7-221 38662880 38663289 347 - chr7:38662946-38663240 NA NA NA NA NA chr7-28 3855802 3856076 139 - chr7:3855960-3856002 NA NA NA NA NA chr7-220 38504736 38504922 115 - chr7:38504846-38504864 NA NA NA NA NA chr7-2 384902 385368 217 - chr7:385023-385157 NA NA NA NA NA chr7-219 38268002 38268270 192 - chr7:38268131-38268247 NA NA NA NA NA chr7-218 38241063 38241355 285 - chr7:38241072-38241354 NA NA NA NA NA chr7-217 38208265 38208537 171 - chr7:38208451-38208521 NA NA NA NA NA chr7-216 38206201 38206678 299 - chr7:38206420-38206500 NA NA NA NA NA chr7-215 38140742 38140973 184 - chr7:38140754-38140797 NA NA NA NA NA chr7-214 38103761 38104064 222 - chr7:38103831-38104026 NA NA NA NA NA chr7-213 38037204 38037605 212 - chr7:38037424-38037454 NA NA NA NA NA chr7-27 3799617 3799874 132 - chr7:3799771-3799836 NA NA NA NA NA chr7-26 3797747 3797942 129 - chr7:3797755-3797796 NA NA NA NA NA chr7-212 37756277 37756483 163 - chr7:37756280-37756314 NA NA NA NA NA chr7-211 37138578 37138790 142 - chr7:37138684-37138732 NA NA NA NA NA chr7-210 37100768 37101131 214 - chr7:37100884-37100949 NA NA NA NA NA chr7-209 37080863 37081190 228 - chr7:37080902-37081071 NA NA NA NA NA chr7-208 37053370 37053646 216 - chr7:37053470-37053626 NA NA NA NA NA chr7-207 36589851 36590066 157 - chr7:36589929-36589955 NA NA NA NA NA chr7-206 36485278 36485835 294 - chr7:36485645-36485676 NA NA NA NA NA chr7-205 36364512 36364807 149 - chr7:36364573-36364576 NA NA NA NA NA chr7 363076 363564 245 - chr7:363398-363562 NA NA NA NA NA chr7-25 3628337 3628966 344 - chr7:3628694-3628697 NA NA NA NA NA chr7-204 36185204 36185355 133 - chr7:36185230-36185345 NA NA NA NA NA chr7-203 35996364 35996676 194 - chr7:35996486-35996562 NA NA NA NA NA chr7-202 35694104 35694473 228 - chr7:35694201-35694288 NA NA NA NA NA chr7-201 35585778 35586056 242 - chr7:35585823-35586029 NA NA NA NA NA chr7-24 3504837 3505147 167 - chr7:3504935-3504959 NA NA NA NA NA chr7-200 34760582 34761038 233 - chr7:34760765-34760775 NA NA NA NA NA chr7-199 34551223 34551591 160 - chr7:34551253-34551310 NA NA NA NA NA chr7-198 34467411 34467646 167 - chr7:34467473-34467576 NA NA NA NA NA chr7-197 34339012 34339303 218 - chr7:34339092-34339251 NA NA NA NA NA chr7-196 34332454 34332707 219 - chr7:34332514-34332699 NA NA NA NA NA chr7-195 34175884 34176297 260 - chr7:34176121-34176172 NA NA NA NA NA chr7-194 34146385 34146678 176 - chr7:34146571-34146630 NA NA NA NA NA chr7-193 34114277 34114500 136 - chr7:34114341-34114344 NA NA NA NA NA chr7-192 33964021 33964392 203 - chr7:33964191-33964226 NA NA NA NA NA chr7-191 33860182 33860764 303 - chr7:33860422-33860446 NA NA NA NA NA chr7-190 33741968 33742165 126 - chr7:33742059-33742114 NA NA NA NA NA chr7-189 33283616 33283783 116 - chr7:33283672-33283747 NA NA NA NA NA chr7-188 33265034 33265221 150 - chr7:33265056-33265169 NA NA NA NA NA chr7-187 33047050 33047285 125 - chr7:33047086-33047101 NA NA NA NA NA chr7-186 33023614 33023971 214 - chr7:33023767-33023838 NA NA NA NA NA chr7-185 32945403 32945578 142 - chr7:32945505-32945548 NA NA NA NA NA chr7-23 3278860 3279153 169 - chr7:3279012-3279057 NA NA NA NA NA chr7-22 3272422 3272616 127 - chr7:3272551-3272611 NA NA NA NA NA chr7-184 32594742 32595088 203 - chr7:32594783-32594911 NA NA NA NA NA chr7-183 32592371 32592583 131 - chr7:32592398-32592484 NA NA NA NA NA chr7-182 32542413 32542627 151 - chr7:32542535-32542623 NA NA NA NA NA chr7-181 32536104 32536329 143 - chr7:32536170-32536255 NA NA NA NA NA chr7-180 32535048 32535443 231 - chr7:32535162-32535229 NA NA NA NA NA chr7-179 32459051 32459292 204 - chr7:32459088-32459255 NA NA NA NA NA chr7-178 32400490 32400722 133 - chr7:32400634-32400638 NA NA NA NA NA chr7-177 32238263 32238545 171 - chr7:32238377-32238437 NA NA NA NA NA chr7-176 32200874 32201147 183 - chr7:32200964-32201057 NA NA NA NA NA chr7-175 32192974 32193289 203 - chr7:32193146-32193237 NA NA NA NA NA chr7-174 32095977 32096368 145 - chr7:32096260-32096323 NA NA NA NA NA chr7-173 32040754 32041022 174 - chr7:32040822-32040902 NA NA NA NA NA chr7-172 31870867 31871120 141 - chr7:31870955-31870984 NA NA NA NA NA chr7-171 31858569 31858856 199 - chr7:31858636-31858747 NA NA NA NA NA chr7-170 31840328 31840771 287 - chr7:31840443-31840513 NA NA NA NA NA chr7-169 31822015 31822330 195 - chr7:31822135-31822210 NA NA NA NA NA chr7-168 31774600 31775000 282 - chr7:31774675-31774753 NA NA NA NA NA chr7-167 31565747 31566134 237 - chr7:31565930-31566017 NA NA NA NA NA chr7-166 31555531 31555739 124 - chr7:31555581-31555621 NA NA NA NA NA chr7-165 31438703 31439062 197 - chr7:31438876-31439019 NA NA NA NA NA chr7-164 31293002 31293513 273 - chr7:31293355-31293360 NA NA NA NA NA chr7-163 30751459 30751840 257 - chr7:30751511-30751644 NA NA NA NA NA chr7-162 30506046 30506295 151 - chr7:30506206-30506259 NA NA NA NA NA chr7-161 30433261 30433511 165 - chr7:30433277-30433357 NA NA NA NA NA chr7-160 30306390 30306683 234 - chr7:30306491-30306638 NA NA NA NA NA chr7-159 30211661 30212162 287 - chr7:30211923-30211996 NA NA NA NA NA chr7-158 30083623 30083915 164 - chr7:30083827-30083863 NA NA NA NA NA chr7-157 30016416 30016746 250 - chr7:30016544-30016714 NA NA NA NA NA chr7-156 29364092 29364273 146 - chr7:29364100-29364211 NA NA NA NA NA chr7-21 2901223 2901392 132 - chr7:2901251-2901346 NA NA NA NA NA chr7-155 28785291 28785459 159 - chr7:28785291-28785441 NA NA NA NA NA chr7-154 28707236 28707580 167 - chr7:28707398-28707506 NA NA NA NA NA chr7-153 28606372 28606664 183 - chr7:28606513-28606587 NA NA NA NA NA chr7-152 28600523 28600988 318 - chr7:28600660-28600870 NA NA NA NA NA chr7-151 28430376 28430621 128 - chr7:28430511-28430532 NA NA NA NA NA chr7-150 28395050 28395286 129 - chr7:28395202-28395224 NA NA NA NA NA chr7-149 28284980 28285197 162 - chr7:28285023-28285138 NA NA NA NA NA chr7-148 28264437 28264583 117 - chr7:28264473-28264575 NA NA NA NA NA chr7-147 28128109 28128514 273 - chr7:28128163-28128356 NA NA NA NA NA chr7-146 27801443 27801673 170 - chr7:27801451-27801561 NA NA NA NA NA chr7-145 27702289 27702931 399 - chr7:27702533-27702798 NA NA NA NA NA chr7-144 27553207 27553631 225 - chr7:27553402-27553428 NA NA NA NA NA chr7-143 27255608 27255816 176 - chr7:27255637-27255717 NA NA NA NA NA chr7-142 26975422 26975695 178 - chr7:26975542-26975625 NA NA NA NA NA chr7-141 26941074 26941392 219 - chr7:26941199-26941385 NA NA NA NA NA chr7-140 26937666 26938025 221 - chr7:26937732-26937863 NA NA NA NA NA chr7-139 26918140 26918473 151 - chr7:26918383-26918436 NA NA NA NA NA chr7-138 26693926 26694121 143 - chr7:26693954-26694045 NA NA NA NA NA chr7-137 26478765 26479098 165 - chr7:26478950-26478979 NA NA NA NA NA chr7-136 25951432 25951737 168 - chr7:25951609-25951640 NA NA NA NA NA chr7-135 25885148 25885396 149 - chr7:25885198-25885248 NA NA NA NA NA chr7-134 25557878 25558141 152 - chr7:25558001-25558066 NA NA NA NA NA chr7-133 25393649 25393881 206 - chr7:25393664-25393822 NA NA NA NA NA chr7-132 25241554 25241733 114 - chr7:25241610-25241641 NA NA NA NA NA chr7-20 2523716 2524079 272 - chr7:2523819-2524000 NA NA NA NA NA chr7-19 2480098 2480638 243 - chr7:2480206-2480293 NA NA NA NA NA chr7-131 24700316 24700625 164 - chr7:24700488-24700507 NA NA NA NA NA chr7-130 24641742 24641966 148 - chr7:24641852-24641924 NA NA NA NA NA chr7-18 2459920 2460377 287 - chr7:2460008-2460125 NA NA NA NA NA chr7-129 24594538 24594855 185 - chr7:24594778-24594831 NA NA NA NA NA chr7-128 24462261 24462781 327 - chr7:24462390-24462396 NA NA NA NA NA chr7-127 24314177 24314570 246 - chr7:24314288-24314315 NA NA NA NA NA chr7-126 24114206 24114437 130 - chr7:24114318-24114347 NA NA NA NA NA chr7-125 24046982 24047221 199 - chr7:24046992-24047151 NA NA NA NA NA chr7-124 23878106 23878471 211 - chr7:23878325-23878382 NA NA NA NA NA chr7-17 2354528 2354865 243 - chr7:2354566-2354715 NA NA NA NA NA chr7-123 23391454 23391933 368 - chr7:23391586-23391917 NA NA NA NA NA chr7-122 23176472 23176675 184 - chr7:23176481-23176608 NA NA NA NA NA chr7-16 2290342 2290847 250 - chr7:2290434-2290530 NA NA NA NA NA chr7-121 22552118 22552315 140 - chr7:22552156-22552277 NA NA NA NA NA chr7-120 22548370 22548696 184 - chr7:22548527-22548559 NA NA NA NA NA chr7-119 22315728 22315919 141 - chr7:22315741-22315832 NA NA NA NA NA chr7-118 22248993 22249264 136 - chr7:22249065-22249108 NA NA NA NA NA chr7-117 21842627 21842799 121 - chr7:21842642-21842712 NA NA NA NA NA chr7-116 21738625 21738930 167 - chr7:21738831-21738915 NA NA NA NA NA chr7-115 21660586 21660863 176 - chr7:21660693-21660764 NA NA NA NA NA chr7-114 21395547 21395967 189 - chr7:21395768-21395880 NA NA NA NA NA chr7-113 21293566 21293966 192 - chr7:21293615-21293705 NA NA NA NA NA chr7-15 2128201 2128948 468 - chr7:2128433-2128639 NA NA NA NA NA chr7-112 21089850 21090087 142 - chr7:21089951-21089998 NA NA NA NA NA chr7-111 21054866 21055067 155 - chr7:21054898-21054979 NA NA NA NA NA chr7-110 21044529 21045045 409 - chr7:21044566-21044961 NA NA NA NA NA chr7-109 20630299 20630607 205 - chr7:20630429-20630531 NA NA NA NA NA chr7-108 20450310 20450545 151 - chr7:20450353-20450420 NA NA NA NA NA chr7-14 2025453 2025703 129 - chr7:2025646-2025674 NA NA NA NA NA chr7-13 2019114 2019425 201 - chr7:2019125-2019216 NA NA NA NA NA chr7-12 2015987 2016406 217 - chr7:2016055-2016070 NA NA NA NA NA chr7-107 19907670 19907997 191 - chr7:19907748-19907803 NA NA NA NA NA chr7-106 19731023 19731228 129 - chr7:19731146-19731199 NA NA NA NA NA chr7-105 19539370 19540022 393 - chr7:19539599-19539753 NA NA NA NA NA chr7-104 19513598 19514091 247 - chr7:19513779-19513944 NA NA NA NA NA chr7-103 19439964 19440283 166 - chr7:19440128-19440141 NA NA NA NA NA chr7-102 19129939 19130265 204 - chr7:19130060-19130140 NA NA NA NA NA chr7-101 19016791 19017079 215 - chr7:19016882-19017024 NA NA NA NA NA chr7-100 18939079 18939255 146 - chr7:18939167-18939223 NA NA NA NA NA chr7-99 18477265 18477530 192 - chr7:18477355-18477474 NA NA NA NA NA chr7-98 18357102 18357551 239 - chr7:18357129-18357189 NA NA NA NA NA chr7-97 17932321 17932499 154 - chr7:17932362-17932492 NA NA NA NA NA chr7-96 17776968 17777621 280 - chr7:17777196-17777591 NA NA NA NA NA chr7-95 17751513 17751776 206 - chr7:17751606-17751731 NA NA NA NA NA chr7-11 1737836 1738045 174 - chr7:1737848-1737917 NA NA NA NA NA chr7-94 17325567 17326018 337 - chr7:17325600-17325877 NA NA NA NA NA chr7-93 17091648 17091811 120 - chr7:17091684-17091761 NA NA NA NA NA chr7-92 17047205 17047464 148 - chr7:17047269-17047306 NA NA NA NA NA chr7-91 17046009 17046454 293 - chr7:17046113-17046256 NA NA NA NA NA chr7-90 16906130 16906397 174 - chr7:16906206-16906253 NA NA NA NA NA chr7-89 16776942 16777157 137 - chr7:16777029-16777106 NA NA NA NA NA chr7-88 16764074 16764355 146 - chr7:16764211-16764222 NA NA NA NA NA chr7-87 16707924 16708146 121 - chr7:16708024-16708042 NA NA NA NA NA chr7-10 1656275 1656612 173 - chr7:1656442-1656451 NA NA NA NA NA chr7-9 1651677 1651998 198 - chr7:1651716-1651791 NA NA NA NA NA chr7-86 16342862 16343077 116 - chr7:16342874-16342957 NA NA NA NA NA chr7-85 16058155 16058318 113 - chr7:16058164-16058227 NA NA NA NA NA chr7-8 1605367 1605690 151 - chr7:1605575-1605626 NA NA NA NA NA chr7-84 16011795 16012089 165 - chr7:16011921-16011959 NA NA NA NA NA chr7-83 15920790 15921089 143 - chr7:15920988-15921079 NA NA NA NA NA chr7-597 158628261 158628503 176 - chr7:158628346-158628500 NA NA NA NA NA chr7-596 157963561 157963805 199 - chr7:157963628-157963692 NA NA NA NA NA chr7-595 157464413 157464719 182 - chr7:157464587-157464645 NA NA NA NA NA chr7-82 15527485 15527701 147 - chr7:15527529-15527607 NA NA NA NA NA chr7-81 15488402 15488775 246 - chr7:15488694-15488703 NA NA NA NA NA chr7-594 152341085 152341317 202 - chr7:152341169-152341281 NA NA NA NA NA chr7-593 152316145 152316445 147 - chr7:152316145-152316241 NA NA NA NA NA chr7-80 15199935 15200109 132 - chr7:15199944-15199968 NA NA NA NA NA chr7-592 151943273 151943580 196 - chr7:151943464-151943549 NA NA NA NA NA chr7-7 1487351 1487757 223 - chr7:1487430-1487470 NA NA NA NA NA chr7-79 14822389 14822514 119 - chr7:14822407-14822508 NA NA NA NA NA chr7-78 14800834 14801138 218 - chr7:14800857-14801031 NA NA NA NA NA chr7-591 147453658 147453825 116 - chr7:147453752-147453817 NA NA NA NA NA chr7-590 146878855 146879143 174 - chr7:146878898-146878958 NA NA NA NA NA chr7-589 145917345 145917544 141 - chr7:145917418-145917491 NA NA NA NA NA chr7-588 145780210 145780396 118 - chr7:145780257-145780307 NA NA NA NA NA chr7-77 14564853 14565192 173 - chr7:14564977-14564984 NA NA NA NA NA chr7-587 144760909 144761188 145 - chr7:144760998-144761039 NA NA NA NA NA chr7-586 144734517 144734777 187 - chr7:144734585-144734689 NA NA NA NA NA chr7-585 144388596 144388760 136 - chr7:144388643-144388751 NA NA NA NA NA chr7-76 14398953 14399237 228 - chr7:14399028-14399200 NA NA NA NA NA chr7-584 143888317 143888609 206 - chr7:143888355-143888507 NA NA NA NA NA chr7-583 141832031 141832283 145 - chr7:141832126-141832164 NA NA NA NA NA chr7-582 141545336 141545578 137 - chr7:141545442-141545474 NA NA NA NA NA chr7-581 140596352 140596581 191 - chr7:140596388-140596541 NA NA NA NA NA chr7-580 140554701 140554983 192 - chr7:140554813-140554915 NA NA NA NA NA chr7-579 140439990 140440250 203 - chr7:140440076-140440222 NA NA NA NA NA chr7-578 140286736 140287076 246 - chr7:140286816-140286940 NA NA NA NA NA chr7-577 139887108 139887355 121 - chr7:139887186-139887213 NA NA NA NA NA chr7-576 139727824 139728069 138 - chr7:139727990-139728021 NA NA NA NA NA chr7-575 139191646 139192150 227 - chr7:139191973-139192023 NA NA NA NA NA chr7-574 138951803 138952202 291 - chr7:138951930-138952151 NA NA NA NA NA chr7-75 13893319 13893548 160 - chr7:13893398-13893535 NA NA NA NA NA chr7-573 138379828 138380005 155 - chr7:138379841-138379974 NA NA NA NA NA chr7-74 13748014 13748222 161 - chr7:13748026-13748140 NA NA NA NA NA chr7-572 137365435 137365712 170 - chr7:137365581-137365618 NA NA NA NA NA chr7-571 136890478 136890776 240 - chr7:136890552-136890734 NA NA NA NA NA chr7-570 135553256 135553411 140 - chr7:135553273-135553402 NA NA NA NA NA chr7-569 134865642 134865885 166 - chr7:134865836-134865847 NA NA NA NA NA chr7-568 134562272 134562483 147 - chr7:134562348-134562423 NA NA NA NA NA chr7-567 133619412 133619706 171 - chr7:133619545-133619593 NA NA NA NA NA chr7-566 132858873 132859362 231 - chr7:132859215-132859360 NA NA NA NA NA chr7-565 131930645 131931062 229 - chr7:131930861-131930907 NA NA NA NA NA chr7-564 130698987 130699307 216 - chr7:130699143-130699255 NA NA NA NA NA chr7-73 13045736 13046070 256 - chr7:13045877-13046055 NA NA NA NA NA chr7-563 130320692 130320955 162 - chr7:130320729-130320790 NA NA NA NA NA chr7-562 129480905 129481146 145 - chr7:129480971-129481040 NA NA NA NA NA chr7-561 128123942 128124168 187 - chr7:128124017-128124087 NA NA NA NA NA chr7-560 127783772 127784149 224 - chr7:127783805-127783876 NA NA NA NA NA chr7-6 1277641 1277947 203 - chr7:1277750-1277846 NA NA NA NA NA chr7-559 127704840 127705066 141 - chr7:127704970-127704996 NA NA NA NA NA chr7-558 127411793 127412088 145 - chr7:127411916-127411929 NA NA NA NA NA chr7-557 127038671 127039161 201 - chr7:127039007-127039013 NA NA NA NA NA chr7-556 126396753 126397104 276 - chr7:126396796-126396997 NA NA NA NA NA chr7-72 12634566 12634878 201 - chr7:12634679-12634769 NA NA NA NA NA chr7-555 125735110 125735443 211 - chr7:125735243-125735332 NA NA NA NA NA chr7-554 124656466 124656696 202 - chr7:124656483-124656635 NA NA NA NA NA chr7-553 123703079 123703430 209 - chr7:123703228-123703295 NA NA NA NA NA chr7-552 123617445 123617712 220 - chr7:123617525-123617698 NA NA NA NA NA chr7-551 123165045 123165209 159 - chr7:123165047-123165195 NA NA NA NA NA chr7-550 122826649 122826969 176 - chr7:122826803-122826829 NA NA NA NA NA chr7-549 122621084 122621425 229 - chr7:122621146-122621263 NA NA NA NA NA chr7-548 120587706 120588026 168 - chr7:120587835-120587851 NA NA NA NA NA chr7-547 119075647 119075885 164 - chr7:119075689-119075779 NA NA NA NA NA chr7-71 11806370 11806825 165 - chr7:11806441-11806462 NA NA NA NA NA chr7-70 11663718 11664044 242 - chr7:11663802-11663960 NA NA NA NA NA chr7-546 116617294 116617534 205 - chr7:116617318-116617488 NA NA NA NA NA chr7-545 116578459 116578700 143 - chr7:116578557-116578602 NA NA NA NA NA chr7-544 116462075 116462333 175 - chr7:116462173-116462255 NA NA NA NA NA chr7-543 116192489 116192814 211 - chr7:116192720-116192739 NA NA NA NA NA chr7-542 115719127 115719509 277 - chr7:115719185-115719263 NA NA NA NA NA chr7-541 114849175 114849443 206 - chr7:114849246-114849413 NA NA NA NA NA chr7-540 114475461 114475891 232 - chr7:114475717-114475751 NA NA NA NA NA chr7-69 11441438 11441635 131 - chr7:11441495-11441566 NA NA NA NA NA chr7-539 114080693 114081006 190 - chr7:114080908-114080975 NA NA NA NA NA chr7-538 114018347 114018515 118 - chr7:114018395-114018463 NA NA NA NA NA chr7-68 11366740 11367022 181 - chr7:11366823-11366915 NA NA NA NA NA chr7-537 113381211 113381407 132 - chr7:113381216-113381284 NA NA NA NA NA chr7-536 113378387 113378864 302 - chr7:113378631-113378712 NA NA NA NA NA chr7-5 1131604 1132075 241 - chr7:1131941-1131952 NA NA NA NA NA chr7-535 113112024 113112393 209 - chr7:113112188-113112237 NA NA NA NA NA chr7-534 112903164 112903333 143 - chr7:112903214-112903331 NA NA NA NA NA chr7-533 112526698 112527056 180 - chr7:112526830-112526832 NA NA NA NA NA chr7-532 112462250 112462625 232 - chr7:112462420-112462509 NA NA NA NA NA chr7-531 112243634 112243862 168 - chr7:112243687-112243835 NA NA NA NA NA chr7-530 112196985 112197283 160 - chr7:112197108-112197140 NA NA NA NA NA chr7-529 112070136 112070567 221 - chr7:112070346-112070357 NA NA NA NA NA chr7-528 111954209 111954527 187 - chr7:111954445-111954501 NA NA NA NA NA chr7-67 11172789 11172947 150 - chr7:11172798-11172940 NA NA NA NA NA chr7-527 111461535 111461756 128 - chr7:111461694-111461729 NA NA NA NA NA chr7-526 111366633 111366864 169 - chr7:111366695-111366802 NA NA NA NA NA chr7-525 110984342 110984549 115 - chr7:110984389-110984412 NA NA NA NA NA chr7-524 110737054 110737461 255 - chr7:110737343-110737446 NA NA NA NA NA chr7-523 110415154 110415483 193 - chr7:110415276-110415333 NA NA NA NA NA chr7-522 110413456 110413594 116 - chr7:110413530-110413580 NA NA NA NA NA chr7-521 110380823 110381063 144 - chr7:110380899-110380907 NA NA NA NA NA chr7-520 110319684 110320012 247 - chr7:110319802-110319968 NA NA NA NA NA chr7-519 110170770 110171256 293 - chr7:110170914-110170916 NA NA NA NA NA chr7-518 110134990 110135290 222 - chr7:110135029-110135173 NA NA NA NA NA chr7-66 10999235 10999456 124 - chr7:10999297-10999324 NA NA NA NA NA chr7-517 109883445 109883659 133 - chr7:109883488-109883594 NA NA NA NA NA chr7-516 109641416 109641810 209 - chr7:109641681-109641787 NA NA NA NA NA chr7-515 109602304 109602839 363 - chr7:109602512-109602703 NA NA NA NA NA chr7-514 109381025 109381337 134 - chr7:109381107-109381127 NA NA NA NA NA chr7-4 1091271 1091569 177 - chr7:1091479-1091535 NA NA NA NA NA chr7-513 109137235 109137417 142 - chr7:109137257-109137359 NA NA NA NA NA chr7-512 108974788 108975006 190 - chr7:108974807-108974913 NA NA NA NA NA chr7-511 108929963 108930351 229 - chr7:108930221-108930291 NA NA NA NA NA chr7-510 108607766 108607991 116 - chr7:108607895-108607942 NA NA NA NA NA chr7-509 108560244 108560432 140 - chr7:108560290-108560382 NA NA NA NA NA chr7-508 108370568 108370763 138 - chr7:108370635-108370736 NA NA NA NA NA chr7-507 107937433 107937660 185 - chr7:107937472-107937531 NA NA NA NA NA chr7-65 10772085 10772424 145 - chr7:10772311-10772326 NA NA NA NA NA chr7-506 107623009 107623291 193 - chr7:107623119-107623265 NA NA NA NA NA chr7-505 107456530 107456767 165 - chr7:107456538-107456631 NA NA NA NA NA chr7-504 107399754 107399885 116 - chr7:107399762-107399863 NA NA NA NA NA chr7-503 107235855 107236116 204 - chr7:107235872-107236019 NA NA NA NA NA chr7-502 107139950 107140143 172 - chr7:107139983-107140092 NA NA NA NA NA chr7-501 106874000 106874340 265 - chr7:106874235-106874275 NA NA NA NA NA chr7-500 106773706 106774074 184 - chr7:106773930-106773950 NA NA NA NA NA chr7-499 106577020 106577198 132 - chr7:106577102-106577188 NA NA NA NA NA chr7-498 106093771 106094232 301 - chr7:106094022-106094163 NA NA NA NA NA chr7-497 106012102 106012233 113 - chr7:106012112-106012191 NA NA NA NA NA chr7-496 105683779 105684163 207 - chr7:105683956-105683986 NA NA NA NA NA chr7-495 105553548 105553877 250 - chr7:105553646-105553817 NA NA NA NA NA chr7-494 105233489 105233753 172 - chr7:105233638-105233718 NA NA NA NA NA chr7-493 104848013 104848359 216 - chr7:104848013-104848099 NA NA NA NA NA chr7-492 104598854 104599000 113 - chr7:104598880-104598982 NA NA NA NA NA chr7-3 1043960 1044436 254 - chr7:1044113-1044191 NA NA NA NA NA chr7-491 104146213 104146442 150 - chr7:104146302-104146373 NA NA NA NA NA chr7-490 103820415 103820628 148 - chr7:103820539-103820622 NA NA NA NA NA chr7-489 103726895 103727355 245 - chr7:103727037-103727163 NA NA NA NA NA chr7-488 103025558 103026115 251 - chr7:103025942-103026043 NA NA NA NA NA chr7-487 102996586 102996783 161 - chr7:102996718-102996779 NA NA NA NA NA chr7-486 102937546 102937890 177 - chr7:102937590-102937682 NA NA NA NA NA chr7-64 10226040 10226282 181 - chr7:10226062-10226182 NA NA NA NA NA chr7-485 102125922 102126160 131 - chr7:102125999-102126023 NA NA NA NA NA chr7-484 101390547 101391017 304 - chr7:101390754-101390892 NA NA NA NA NA chr7-63 10129032 10129498 216 - chr7:10129392-10129405 NA NA NA NA NA chr7-483 101019958 101020179 173 - chr7:101020007-101020132 NA NA NA NA NA chr7-62 10090300 10090878 263 - chr7:10090672-10090734 NA NA NA NA NA chr7-482 100905690 100905975 233 - chr7:100905866-100905943 NA NA NA NA NA chr7-61 10070812 10071041 181 - chr7:10070864-10070997 NA NA NA NA NA chr7-60 10036573 10036868 198 - chr7:10036627-10036642 NA NA NA NA NA chr6-308 99989027 99989209 126 - chr6:99989061-99989087 NA NA NA NA NA chr6-307 99695620 99695799 113 - chr6:99695622-99695713 NA NA NA NA NA chr6-306 98219739 98220465 370 - chr6:98220121-98220135 NA NA NA NA NA chr6-305 97652356 97652716 266 - chr6:97652429-97652601 NA NA NA NA NA chr6-304 97266389 97266838 375 - chr6:97266422-97266641 NA NA NA NA NA chr6-303 96836304 96836600 184 - chr6:96836409-96836481 NA NA NA NA NA chr6-302 96767938 96768332 181 - chr6:96767993-96768103 NA NA NA NA NA chr6-301 96523099 96523293 156 - chr6:96523100-96523142 NA NA NA NA NA chr6-300 95723804 95724146 173 - chr6:95723974-95723980 NA NA NA NA NA chr6-299 95329787 95330146 204 - chr6:95329900-95329949 NA NA NA NA NA chr6-298 94708046 94708268 190 - chr6:94708057-94708173 NA NA NA NA NA chr6-14 9464798 9465089 216 - chr6:9464835-9465008 NA NA NA NA NA chr6-297 94552001 94552329 137 - chr6:94552235-94552267 NA NA NA NA NA chr6-296 94411034 94411262 198 - chr6:94411064-94411232 NA NA NA NA NA chr6-295 94333712 94334008 236 - chr6:94333756-94333932 NA NA NA NA NA chr6-294 93964399 93964611 148 - chr6:93964453-93964517 NA NA NA NA NA chr6-293 93512137 93512583 299 - chr6:93512305-93512443 NA NA NA NA NA chr6-292 93239189 93239621 307 - chr6:93239302-93239484 NA NA NA NA NA chr6-291 93060848 93061072 191 - chr6:93060884-93061064 NA NA NA NA NA chr6-290 92597258 92597430 152 - chr6:92597273-92597395 NA NA NA NA NA chr6-289 92524602 92524878 151 - chr6:92524794-92524820 NA NA NA NA NA chr6-13 9020318 9020753 218 - chr6:9020500-9020501 NA NA NA NA NA chr6-288 89818867 89819139 198 - chr6:89818943-89819067 NA NA NA NA NA chr6-287 89474020 89474322 238 - chr6:89474222-89474304 NA NA NA NA NA chr6-286 89162157 89162573 152 - chr6:89162358-89162422 NA NA NA NA NA chr6-285 89137669 89138124 227 - chr6:89137816-89137869 NA NA NA NA NA chr6-284 88836428 88836568 118 - chr6:88836433-88836485 NA NA NA NA NA chr6-283 88653074 88653496 215 - chr6:88653386-88653394 NA NA NA NA NA chr6-282 88536150 88536556 216 - chr6:88536362-88536373 NA NA NA NA NA chr6-281 88376717 88377124 242 - chr6:88376927-88377004 NA NA NA NA NA chr6-280 87990477 87990747 198 - chr6:87990573-87990683 NA NA NA NA NA chr6-279 87708570 87708763 114 - chr6:87708721-87708756 NA NA NA NA NA chr6-278 87067551 87067807 225 - chr6:87067642-87067774 NA NA NA NA NA chr6-277 85085962 85086447 235 - chr6:85086122-85086167 NA NA NA NA NA chr6-276 84323483 84323737 159 - chr6:84323554-84323570 NA NA NA NA NA chr6-275 83939314 83939707 248 - chr6:83939439-83939542 NA NA NA NA NA chr6-274 83824705 83825006 202 - chr6:83824804-83824907 NA NA NA NA NA chr6-273 83816144 83816619 157 - chr6:83816268-83816319 NA NA NA NA NA chr6-272 83669558 83669897 183 - chr6:83669754-83669861 NA NA NA NA NA chr6-12 8220369 8220829 284 - chr6:8220477-8220585 NA NA NA NA NA chr6-271 82042786 82043095 179 - chr6:82042994-82043043 NA NA NA NA NA chr6-270 81925591 81925873 172 - chr6:81925622-81925684 NA NA NA NA NA chr6-269 80987616 80987918 182 - chr6:80987662-80987724 NA NA NA NA NA chr6-268 80444018 80444301 150 - chr6:80444146-80444153 NA NA NA NA NA chr6-267 80395577 80395781 130 - chr6:80395639-80395673 NA NA NA NA NA chr6-266 80198019 80198419 295 - chr6:80198128-80198326 NA NA NA NA NA chr6-265 80178821 80179335 252 - chr6:80178886-80178970 NA NA NA NA NA chr6-264 80054376 80054559 134 - chr6:80054474-80054559 NA NA NA NA NA chr6-263 79212533 79212828 156 - chr6:79212697-79212714 NA NA NA NA NA chr6-262 79105859 79106354 255 - chr6:79106127-79106198 NA NA NA NA NA chr6-11 7866305 7866472 127 - chr6:7866320-7866407 NA NA NA NA NA chr6-261 77981826 77982109 200 - chr6:77982059-77982076 NA NA NA NA NA chr6-260 77646277 77646528 144 - chr6:77646369-77646376 NA NA NA NA NA chr6-259 77146598 77147109 207 - chr6:77146708-77146725 NA NA NA NA NA chr6-258 77124600 77125018 310 - chr6:77124717-77124991 NA NA NA NA NA chr6-257 77092576 77092875 136 - chr6:77092761-77092778 NA NA NA NA NA chr6-256 75455585 75455951 233 - chr6:75455757-75455831 NA NA NA NA NA chr6-255 75329851 75330149 183 - chr6:75329857-75329925 NA NA NA NA NA chr6-254 74878484 74878838 219 - chr6:74878594-74878678 NA NA NA NA NA chr6-253 74603101 74603498 216 - chr6:74603372-74603407 NA NA NA NA NA chr6-252 74180175 74180422 199 - chr6:74180185-74180240 NA NA NA NA NA chr6-251 74002459 74002722 139 - chr6:74002460-74002557 NA NA NA NA NA chr6-250 73772928 73773214 148 - chr6:73772958-73773040 NA NA NA NA NA chr6-249 72653766 72654063 250 - chr6:72653917-72654026 NA NA NA NA NA chr6-248 72608327 72608685 220 - chr6:72608525-72608607 NA NA NA NA NA chr6-247 72323346 72323615 209 - chr6:72323466-72323606 NA NA NA NA NA chr6-246 72236270 72236477 188 - chr6:72236292-72236467 NA NA NA NA NA chr6-245 71560289 71560581 210 - chr6:71560311-71560479 NA NA NA NA NA chr6-244 71529762 71530108 178 - chr6:71529830-71529901 NA NA NA NA NA chr6-243 71345321 71345613 226 - chr6:71345346-71345550 NA NA NA NA NA chr6-242 71279178 71279554 250 - chr6:71279293-71279501 NA NA NA NA NA chr6-241 71044352 71044591 188 - chr6:71044394-71044531 NA NA NA NA NA chr6-240 70987915 70988205 205 - chr6:70987967-70988087 NA NA NA NA NA chr6-239 70875546 70875670 114 - chr6:70875547-70875651 NA NA NA NA NA chr6-238 70456230 70456671 271 - chr6:70456508-70456537 NA NA NA NA NA chr6-237 69335101 69335322 119 - chr6:69335206-69335223 NA NA NA NA NA chr6-236 68832852 68833128 166 - chr6:68833063-68833119 NA NA NA NA NA chr6-235 68714222 68714515 177 - chr6:68714272-68714333 NA NA NA NA NA chr6-234 68667948 68668391 154 - chr6:68667997-68668022 NA NA NA NA NA chr6-233 68575072 68575478 326 - chr6:68575332-68575418 NA NA NA NA NA chr6-232 67718316 67718620 230 - chr6:67718430-67718586 NA NA NA NA NA chr6-231 67638058 67638282 163 - chr6:67638137-67638227 NA NA NA NA NA chr6-230 67628592 67628843 158 - chr6:67628620-67628685 NA NA NA NA NA chr6-229 67311270 67311606 170 - chr6:67311473-67311477 NA NA NA NA NA chr6-228 67036299 67036485 137 - chr6:67036361-67036449 NA NA NA NA NA chr6-227 66973238 66973561 229 - chr6:66973390-66973485 NA NA NA NA NA chr6-226 66664947 66665396 243 - chr6:66665294-66665331 NA NA NA NA NA chr6-225 66577421 66577730 178 - chr6:66577618-66577663 NA NA NA NA NA chr6-224 66307376 66307646 153 - chr6:66307443-66307479 NA NA NA NA NA chr6-223 66109156 66109336 164 - chr6:66109174-66109322 NA NA NA NA NA chr6-222 66106993 66107177 115 - chr6:66107044-66107102 NA NA NA NA NA chr6-221 66066357 66066724 193 - chr6:66066528-66066547 NA NA NA NA NA chr6-220 65522427 65522621 146 - chr6:65522461-65522531 NA NA NA NA NA chr6-219 65511859 65512234 222 - chr6:65511919-65512090 NA NA NA NA NA chr6-218 65363196 65363646 166 - chr6:65363552-65363569 NA NA NA NA NA chr6-217 65184630 65185013 169 - chr6:65184673-65184732 NA NA NA NA NA chr6-216 65079744 65079977 137 - chr6:65079762-65079855 NA NA NA NA NA chr6-215 64982599 64983040 360 - chr6:64982794-64982911 NA NA NA NA NA chr6-214 64871986 64872280 222 - chr6:64871990-64872140 NA NA NA NA NA chr6-213 64612781 64613245 312 - chr6:64612911-64613027 NA NA NA NA NA chr6-212 64601675 64601953 174 - chr6:64601746-64601778 NA NA NA NA NA chr6-211 64357974 64358219 152 - chr6:64357996-64358055 NA NA NA NA NA chr6-210 64228374 64228622 158 - chr6:64228452-64228520 NA NA NA NA NA chr6-209 63981341 63981675 195 - chr6:63981404-63981460 NA NA NA NA NA chr6-208 63971571 63971825 198 - chr6:63971643-63971785 NA NA NA NA NA chr6-207 63720730 63720873 132 - chr6:63720768-63720871 NA NA NA NA NA chr6-206 63416239 63416732 363 - chr6:63416335-63416687 NA NA NA NA NA chr6-205 63334421 63334586 139 - chr6:63334421-63334482 NA NA NA NA NA chr6-204 63150666 63151260 367 - chr6:63150780-63150934 NA NA NA NA NA chr6-203 63047236 63047608 268 - chr6:63047444-63047608 NA NA NA NA NA chr6-202 62971771 62972224 225 - chr6:62972099-62972107 NA NA NA NA NA chr6-201 62864162 62864325 143 - chr6:62864199-62864282 NA NA NA NA NA chr6-10 6255974 6256230 150 - chr6:6256020-6256104 NA NA NA NA NA chr6-200 62451569 62452075 299 - chr6:62451649-62451794 NA NA NA NA NA chr6-199 62447333 62447531 165 - chr6:62447346-62447524 NA NA NA NA NA chr6-198 62342073 62342458 222 - chr6:62342219-62342244 NA NA NA NA NA chr6-197 62310749 62311111 167 - chr6:62310962-62310970 NA NA NA NA NA chr6-196 62250467 62250807 196 - chr6:62250609-62250657 NA NA NA NA NA chr6-195 62136032 62136477 269 - chr6:62136209-62136302 NA NA NA NA NA chr6-194 61972128 61972645 180 - chr6:61972560-61972621 NA NA NA NA NA chr6-193 61708516 61708858 242 - chr6:61708545-61708687 NA NA NA NA NA chr6-192 61614543 61614793 186 - chr6:61614606-61614728 NA NA NA NA NA chr6-191 61564581 61564914 139 - chr6:61564689-61564706 NA NA NA NA NA chr6-190 60230153 60230544 196 - chr6:60230247-60230327 NA NA NA NA NA chr6-189 57420551 57420847 163 - chr6:57420767-57420776 NA NA NA NA NA chr6-188 57332561 57332766 125 - chr6:57332602-57332647 NA NA NA NA NA chr6-187 57316256 57316882 309 - chr6:57316627-57316727 NA NA NA NA NA chr6-186 57198033 57198476 223 - chr6:57198151-57198154 NA NA NA NA NA chr6-185 57160700 57161066 210 - chr6:57160865-57160937 NA NA NA NA NA chr6-184 57100950 57101406 291 - chr6:57101123-57101249 NA NA NA NA NA chr6-183 56527280 56527591 168 - chr6:56527450-56527457 NA NA NA NA NA chr6-182 56497840 56498324 251 - chr6:56498067-56498089 NA NA NA NA NA chr6-181 56425718 56426046 215 - chr6:56425853-56425955 NA NA NA NA NA chr6-180 56105208 56105434 186 - chr6:56105263-56105329 NA NA NA NA NA chr6-179 56081959 56082305 244 - chr6:56081978-56082188 NA NA NA NA NA chr6-178 56061971 56062269 223 - chr6:56062067-56062215 NA NA NA NA NA chr6-177 55970796 55970987 116 - chr6:55970879-55970920 NA NA NA NA NA chr6-176 55846970 55847154 125 - chr6:55847017-55847059 NA NA NA NA NA chr6-175 55753837 55754154 199 - chr6:55753883-55753967 NA NA NA NA NA chr6-174 55594750 55595270 280 - chr6:55595023-55595063 NA NA NA NA NA chr6-173 55577791 55578072 150 - chr6:55577837-55577856 NA NA NA NA NA chr6-172 55547104 55547705 210 - chr6:55547216-55547221 NA NA NA NA NA chr6-171 55504497 55504673 154 - chr6:55504505-55504609 NA NA NA NA NA chr6-170 55444752 55445050 221 - chr6:55444871-55445015 NA NA NA NA NA chr6-169 55269163 55269405 180 - chr6:55269244-55269362 NA NA NA NA NA chr6-168 55263896 55264134 192 - chr6:55263916-55264062 NA NA NA NA NA chr6-167 55229806 55230166 196 - chr6:55230084-55230103 NA NA NA NA NA chr6-166 54988795 54989039 149 - chr6:54988935-54988959 NA NA NA NA NA chr6-165 54811631 54812222 309 - chr6:54811889-54811916 NA NA NA NA NA chr6-164 54657698 54657865 125 - chr6:54657727-54657810 NA NA NA NA NA chr6-163 54653367 54653715 184 - chr6:54653510-54653530 NA NA NA NA NA chr6-162 54650551 54650962 239 - chr6:54650750-54650871 NA NA NA NA NA chr6-161 54522760 54522955 173 - chr6:54522801-54522952 NA NA NA NA NA chr6-160 54358580 54358796 138 - chr6:54358671-54358731 NA NA NA NA NA chr6-159 54024426 54024660 169 - chr6:54024457-54024493 NA NA NA NA NA chr6-158 53944171 53944455 190 - chr6:53944264-53944342 NA NA NA NA NA chr6-157 53888876 53889130 221 - chr6:53888903-53889025 NA NA NA NA NA chr6-156 53493940 53494144 120 - chr6:53493971-53494007 NA NA NA NA NA chr6-9 5347147 5347503 193 - chr6:5347346-5347352 NA NA NA NA NA chr6-155 53429584 53429757 119 - chr6:53429632-53429733 NA NA NA NA NA chr6-154 53296604 53296779 121 - chr6:53296625-53296692 NA NA NA NA NA chr6-153 53038038 53038499 217 - chr6:53038199-53038200 NA NA NA NA NA chr6-152 52686120 52686291 133 - chr6:52686143-52686208 NA NA NA NA NA chr6-151 52682895 52683111 136 - chr6:52683031-52683087 NA NA NA NA NA chr6-150 52679405 52679559 113 - chr6:52679448-52679520 NA NA NA NA NA chr6-149 52230281 52230523 165 - chr6:52230350-52230438 NA NA NA NA NA chr6-148 52188473 52188822 182 - chr6:52188631-52188639 NA NA NA NA NA chr6-147 51831660 51831907 159 - chr6:51831819-51831890 NA NA NA NA NA chr6-146 51721395 51721617 157 - chr6:51721433-51721543 NA NA NA NA NA chr6-145 51376530 51377113 208 - chr6:51376650-51376653 NA NA NA NA NA chr6-144 51355544 51355937 248 - chr6:51355784-51355803 NA NA NA NA NA chr6-143 51312977 51313393 373 - chr6:51312995-51313325 NA NA NA NA NA chr6-142 51269476 51269684 125 - chr6:51269559-51269601 NA NA NA NA NA chr6-141 51085626 51085938 211 - chr6:51085828-51085938 NA NA NA NA NA chr6-140 50976845 50977055 137 - chr6:50977005-50977011 NA NA NA NA NA chr6-139 50873554 50873898 241 - chr6:50873718-50873856 NA NA NA NA NA chr6-138 50770658 50770922 180 - chr6:50770728-50770824 NA NA NA NA NA chr6-137 50748514 50748672 127 - chr6:50748562-50748658 NA NA NA NA NA chr6-136 50737528 50737929 167 - chr6:50737823-50737912 NA NA NA NA NA chr6-135 50367920 50368234 168 - chr6:50368099-50368187 NA NA NA NA NA chr6-134 50196050 50196251 176 - chr6:50196100-50196201 NA NA NA NA NA chr6-133 50127433 50127779 162 - chr6:50127662-50127730 NA NA NA NA NA chr6-132 50118456 50118657 164 - chr6:50118456-50118509 NA NA NA NA NA chr6-131 49873672 49874207 298 - chr6:49874030-49874091 NA NA NA NA NA chr6-130 49591119 49591405 179 - chr6:49591218-49591290 NA NA NA NA NA chr6-129 49227926 49228325 246 - chr6:49228022-49228217 NA NA NA NA NA chr6-128 48737150 48737382 218 - chr6:48737177-48737381 NA NA NA NA NA chr6-127 48402996 48403171 129 - chr6:48403005-48403088 NA NA NA NA NA chr6-126 48242957 48243196 154 - chr6:48243023-48243092 NA NA NA NA NA chr6-125 48169485 48169650 146 - chr6:48169550-48169639 NA NA NA NA NA chr6-124 48154247 48154613 262 - chr6:48154294-48154452 NA NA NA NA NA chr6-123 48128257 48128633 309 - chr6:48128279-48128521 NA NA NA NA NA chr6-122 48073178 48073536 206 - chr6:48073277-48073331 NA NA NA NA NA chr6-121 48020287 48020490 123 - chr6:48020358-48020383 NA NA NA NA NA chr6-120 47992186 47992485 188 - chr6:47992246-47992323 NA NA NA NA NA chr6-119 47985039 47985590 301 - chr6:47985334-47985503 NA NA NA NA NA chr6-118 47941934 47942251 203 - chr6:47942062-47942151 NA NA NA NA NA chr6-117 47722406 47722667 202 - chr6:47722431-47722506 NA NA NA NA NA chr6-116 47707753 47708133 270 - chr6:47707843-47707963 NA NA NA NA NA chr6-115 47013551 47013834 130 - chr6:47013698-47013777 NA NA NA NA NA chr6-114 46778998 46779203 151 - chr6:46779081-46779178 NA NA NA NA NA chr6-113 46476202 46476358 132 - chr6:46476203-46476263 NA NA NA NA NA chr6-112 46310529 46310935 212 - chr6:46310817-46310835 NA NA NA NA NA chr6-111 46246092 46246339 136 - chr6:46246213-46246238 NA NA NA NA NA chr6-110 46135376 46135555 133 - chr6:46135391-46135416 NA NA NA NA NA chr6-109 46047389 46047591 136 - chr6:46047452-46047566 NA NA NA NA NA chr6-108 45936818 45937119 221 - chr6:45936903-45937044 NA NA NA NA NA chr6-107 45749948 45750192 127 - chr6:45749967-45750055 NA NA NA NA NA chr6-106 45579397 45579914 241 - chr6:45579748-45579781 NA NA NA NA NA chr6-105 45387027 45387315 192 - chr6:45387112-45387272 NA NA NA NA NA chr6-104 45336086 45336279 115 - chr6:45336214-45336251 NA NA NA NA NA chr6-103 45135394 45135683 168 - chr6:45135501-45135548 NA NA NA NA NA chr6-102 45072971 45073318 131 - chr6:45073155-45073214 NA NA NA NA NA chr6-101 44833764 44834046 117 - chr6:44833853-44833915 NA NA NA NA NA chr6-100 44827910 44828174 158 - chr6:44828013-44828067 NA NA NA NA NA chr6-8 4423722 4423944 168 - chr6:4423814-4423928 NA NA NA NA NA chr6-99 43750189 43750463 171 - chr6:43750346-43750378 NA NA NA NA NA chr6-98 43605852 43606171 223 - chr6:43605954-43606145 NA NA NA NA NA chr6-97 43583113 43583251 118 - chr6:43583144-43583202 NA NA NA NA NA chr6-96 43395847 43396214 216 - chr6:43396016-43396117 NA NA NA NA NA chr6-95 43003354 43003500 116 - chr6:43003399-43003475 NA NA NA NA NA chr6-94 42867014 42867356 223 - chr6:42867048-42867152 NA NA NA NA NA chr6-93 42461896 42462130 202 - chr6:42461905-42462011 NA NA NA NA NA chr6-92 41750606 41750998 216 - chr6:41750739-41750830 NA NA NA NA NA chr6-91 41455817 41456290 242 - chr6:41455994-41456005 NA NA NA NA NA chr6-90 41100272 41100778 289 - chr6:41100627-41100699 NA NA NA NA NA chr6-89 40994067 40994217 126 - chr6:40994143-40994197 NA NA NA NA NA chr6-88 40724241 40724650 197 - chr6:40724285-40724382 NA NA NA NA NA chr6-87 40689803 40690112 202 - chr6:40689894-40689989 NA NA NA NA NA chr6-86 40547719 40547934 172 - chr6:40547799-40547928 NA NA NA NA NA chr6-85 40223389 40223667 256 - chr6:40223404-40223624 NA NA NA NA NA chr6-84 40123367 40123775 201 - chr6:40123466-40123532 NA NA NA NA NA chr6-83 40047143 40047459 279 - chr6:40047168-40047410 NA NA NA NA NA chr6-82 40040899 40041355 213 - chr6:40041148-40041280 NA NA NA NA NA chr6-81 40032662 40032873 117 - chr6:40032776-40032799 NA NA NA NA NA chr6-80 39795561 39795843 205 - chr6:39795627-39795733 NA NA NA NA NA chr6-79 39754140 39754474 193 - chr6:39754245-39754321 NA NA NA NA NA chr6-78 39678898 39679157 153 - chr6:39679040-39679087 NA NA NA NA NA chr6-77 39652508 39652708 141 - chr6:39652607-39652689 NA NA NA NA NA chr6-76 39613355 39613827 244 - chr6:39613499-39613527 NA NA NA NA NA chr6-75 39545248 39545447 180 - chr6:39545284-39545445 NA NA NA NA NA chr6-74 39406224 39406531 242 - chr6:39406270-39406447 NA NA NA NA NA chr6-73 39191246 39191784 260 - chr6:39191559-39191734 NA NA NA NA NA chr6-72 38885263 38885541 237 - chr6:38885311-38885527 NA NA NA NA NA chr6-71 38787984 38788418 219 - chr6:38788004-38788121 NA NA NA NA NA chr6-70 38671751 38671972 122 - chr6:38671826-38671849 NA NA NA NA NA chr6-69 38630612 38630930 174 - chr6:38630855-38630885 NA NA NA NA NA chr6-68 38463033 38463317 237 - chr6:38463107-38463203 NA NA NA NA NA chr6-67 38444522 38444840 162 - chr6:38444623-38444733 NA NA NA NA NA chr6-66 38332653 38332892 215 - chr6:38332653-38332844 NA NA NA NA NA chr6-65 37903538 37903705 150 - chr6:37903538-37903637 NA NA NA NA NA chr6-64 37892181 37892483 194 - chr6:37892403-37892413 NA NA NA NA NA chr6-63 37742395 37742716 203 - chr6:37742552-37742637 NA NA NA NA NA chr6-62 37627562 37627712 128 - chr6:37627583-37627645 NA NA NA NA NA chr6-61 37156282 37156625 198 - chr6:37156385-37156438 NA NA NA NA NA chr6-60 37141106 37141384 222 - chr6:37141162-37141216 NA NA NA NA NA chr6-59 37098785 37098976 136 - chr6:37098799-37098880 NA NA NA NA NA chr6-58 36841378 36841569 128 - chr6:36841380-36841445 NA NA NA NA NA chr6-57 36687578 36687744 158 - chr6:36687579-36687713 NA NA NA NA NA chr6-56 36442719 36442903 160 - chr6:36442738-36442890 NA NA NA NA NA chr6-55 36228639 36229043 265 - chr6:36228693-36228819 NA NA NA NA NA chr6-54 36123028 36123431 210 - chr6:36123094-36123111 NA NA NA NA NA chr6-53 36032822 36033228 281 - chr6:36033049-36033205 NA NA NA NA NA chr6-52 35790755 35790935 133 - chr6:35790813-35790899 NA NA NA NA NA chr6-51 35594517 35594895 173 - chr6:35594765-35594819 NA NA NA NA NA chr6-50 35585239 35585510 223 - chr6:35585263-35585438 NA NA NA NA NA chr6-49 35547622 35547937 205 - chr6:35547668-35547763 NA NA NA NA NA chr6-48 35364895 35365244 215 - chr6:35364998-35365079 NA NA NA NA NA chr6-47 35341366 35341659 227 - chr6:35341375-35341536 NA NA NA NA NA chr6-46 35017185 35017426 156 - chr6:35017277-35017348 NA NA NA NA NA chr6-45 34694310 34694651 193 - chr6:34694495-34694621 NA NA NA NA NA chr6-44 34613474 34613712 158 - chr6:34613633-34613711 NA NA NA NA NA chr6-43 34499025 34499292 176 - chr6:34499204-34499289 NA NA NA NA NA chr6-7 3113792 3114030 154 - chr6:3113870-3113940 NA NA NA NA NA chr6-6 2896978 2897337 276 - chr6:2897107-2897300 NA NA NA NA NA chr6-42 28366172 28366458 191 - chr6:28366321-28366417 NA NA NA NA NA chr6-41 28082571 28082804 147 - chr6:28082737-28082798 NA NA NA NA NA chr6-5 2752762 2752962 154 - chr6:2752800-2752892 NA NA NA NA NA chr6-40 27030161 27030352 133 - chr6:27030192-27030267 NA NA NA NA NA chr6-39 26416501 26416789 158 - chr6:26416628-26416658 NA NA NA NA NA chr6-38 25324598 25324976 205 - chr6:25324902-25324934 NA NA NA NA NA chr6-37 25237573 25237816 132 - chr6:25237703-25237724 NA NA NA NA NA chr6-4 2449685 2450139 219 - chr6:2449691-2449816 NA NA NA NA NA chr6-36 22225993 22226270 237 - chr6:22226038-22226235 NA NA NA NA NA chr6-35 22183704 22183933 141 - chr6:22183856-22183909 NA NA NA NA NA chr6-3 2207950 2208510 344 - chr6:2208390-2208431 NA NA NA NA NA chr6-34 22044425 22044680 154 - chr6:22044448-22044553 NA NA NA NA NA chr6-33 21998680 21998964 191 - chr6:21998761-21998835 NA NA NA NA NA chr6-32 21549286 21549553 191 - chr6:21549304-21549419 NA NA NA NA NA chr6-31 21397647 21397979 178 - chr6:21397733-21397757 NA NA NA NA NA chr6-30 20795276 20795542 201 - chr6:20795437-20795509 NA NA NA NA NA chr6-29 20325868 20326028 113 - chr6:20325880-20325946 NA NA NA NA NA chr6-28 20083893 20084247 218 - chr6:20083980-20084062 NA NA NA NA NA chr6-27 20041403 20041618 170 - chr6:20041467-20041592 NA NA NA NA NA chr6-26 19710606 19710838 119 - chr6:19710672-19710678 NA NA NA NA NA chr6-25 19652297 19652556 143 - chr6:19652400-19652427 NA NA NA NA NA chr6-24 18339060 18339417 129 - chr6:18339295-18339348 NA NA NA NA NA chr6-23 17664568 17664808 206 - chr6:17664628-17664800 NA NA NA NA NA chr6-22 17186912 17187102 120 - chr6:17187051-17187055 NA NA NA NA NA chr6-535 169203434 169203604 157 - chr6:169203443-169203587 NA NA NA NA NA chr6-534 169177416 169177613 178 - chr6:169177449-169177608 NA NA NA NA NA chr6-533 168505723 168505987 186 - chr6:168505852-168505926 NA NA NA NA NA chr6-532 168475108 168475395 275 - chr6:168475110-168475349 NA NA NA NA NA chr6-531 166620549 166620905 168 - chr6:166620774-166620828 NA NA NA NA NA chr6-530 166488693 166488975 231 - chr6:166488770-166488950 NA NA NA NA NA chr6-529 166464601 166464982 218 - chr6:166464744-166464799 NA NA NA NA NA chr6-528 166129334 166129587 121 - chr6:166129490-166129567 NA NA NA NA NA chr6-527 165930205 165930430 147 - chr6:165930275-165930396 NA NA NA NA NA chr6-526 165483531 165483961 229 - chr6:165483648-165483732 NA NA NA NA NA chr6-525 165412214 165412421 142 - chr6:165412341-165412418 NA NA NA NA NA chr6-524 165291655 165292038 334 - chr6:165291761-165292008 NA NA NA NA NA chr6-523 165221602 165221973 262 - chr6:165221689-165221798 NA NA NA NA NA chr6-522 164079290 164079814 263 - chr6:164079594-164079682 NA NA NA NA NA chr6-521 163789452 163789752 224 - chr6:163789568-163789716 NA NA NA NA NA chr6-520 163674173 163674542 300 - chr6:163674385-163674478 NA NA NA NA NA chr6-519 163456710 163456931 210 - chr6:163456712-163456917 NA NA NA NA NA chr6-518 163453248 163453476 149 - chr6:163453281-163453351 NA NA NA NA NA chr6-517 163366049 163366275 152 - chr6:163366104-163366182 NA NA NA NA NA chr6-516 162857722 162857984 138 - chr6:162857823-162857837 NA NA NA NA NA chr6-515 162333140 162333608 309 - chr6:162333469-162333561 NA NA NA NA NA chr6-514 162180989 162181359 202 - chr6:162181272-162181306 NA NA NA NA NA chr6-513 160473347 160473661 271 - chr6:160473405-160473633 NA NA NA NA NA chr6-512 160403711 160403912 182 - chr6:160403741-160403866 NA NA NA NA NA chr6-511 160353421 160353655 214 - chr6:160353429-160353623 NA NA NA NA NA chr6-21 15993293 15993577 283 - chr6:15993295-15993577 NA NA NA NA NA chr6-510 159747468 159747841 241 - chr6:159747567-159747676 NA NA NA NA NA chr6-509 159344976 159345337 287 - chr6:159345105-159345318 NA NA NA NA NA chr6-508 158904681 158904897 147 - chr6:158904682-158904760 NA NA NA NA NA chr6-507 158859007 158859337 181 - chr6:158859198-158859230 NA NA NA NA NA chr6-506 158595306 158595504 143 - chr6:158595392-158595480 NA NA NA NA NA chr6-505 157874302 157874616 159 - chr6:157874465-157874469 NA NA NA NA NA chr6-504 157354105 157354318 130 - chr6:157354126-157354173 NA NA NA NA NA chr6-503 157070453 157070709 183 - chr6:157070455-157070565 NA NA NA NA NA chr6-502 156377358 156377737 270 - chr6:156377466-156377625 NA NA NA NA NA chr6-501 155862886 155863181 149 - chr6:155863039-155863056 NA NA NA NA NA chr6-500 155724781 155725186 221 - chr6:155724986-155725009 NA NA NA NA NA chr6-499 155600696 155600887 158 - chr6:155600709-155600834 NA NA NA NA NA chr6-498 155582140 155582508 205 - chr6:155582390-155582432 NA NA NA NA NA chr6-497 155282167 155282481 205 - chr6:155282374-155282470 NA NA NA NA NA chr6-496 155097669 155097974 252 - chr6:155097837-155097930 NA NA NA NA NA chr6-495 154859213 154859549 228 - chr6:154859303-154859395 NA NA NA NA NA chr6-494 154595677 154595929 178 - chr6:154595776-154595880 NA NA NA NA NA chr6-493 154180040 154180276 148 - chr6:154180110-154180170 NA NA NA NA NA chr6-492 154033062 154033227 117 - chr6:154033089-154033116 NA NA NA NA NA chr6-491 153934310 153934574 212 - chr6:153934338-153934498 NA NA NA NA NA chr6-490 153072492 153072810 262 - chr6:153072554-153072760 NA NA NA NA NA chr6-489 152986644 152987122 317 - chr6:152986934-152987004 NA NA NA NA NA chr6-488 152940423 152940667 130 - chr6:152940554-152940570 NA NA NA NA NA chr6-487 152434109 152434485 142 - chr6:152434148-152434186 NA NA NA NA NA chr6-486 152205432 152205737 131 - chr6:152205575-152205648 NA NA NA NA NA chr6-485 151066005 151066247 128 - chr6:151066075-151066089 NA NA NA NA NA chr6-484 150662768 150663156 367 - chr6:150662783-150663143 NA NA NA NA NA chr6-483 149836279 149836444 144 - chr6:149836300-149836423 NA NA NA NA NA chr6-482 149740916 149741639 331 - chr6:149741101-149741374 NA NA NA NA NA chr6-481 149510953 149511194 152 - chr6:149511127-149511190 NA NA NA NA NA chr6-20 14926688 14926835 128 - chr6:14926706-14926813 NA NA NA NA NA chr6-480 149027083 149027206 120 - chr6:149027087-149027204 NA NA NA NA NA chr6-479 148852212 148852427 142 - chr6:148852225-148852294 NA NA NA NA NA chr6-478 148386008 148386289 181 - chr6:148386171-148386252 NA NA NA NA NA chr6-477 148156046 148156353 188 - chr6:148156184-148156253 NA NA NA NA NA chr6-476 147888102 147888626 351 - chr6:147888252-147888440 NA NA NA NA NA chr6-475 147489100 147489544 212 - chr6:147489372-147489432 NA NA NA NA NA chr6-474 147298257 147298538 177 - chr6:147298414-147298457 NA NA NA NA NA chr6-473 147289268 147289568 152 - chr6:147289314-147289386 NA NA NA NA NA chr6-472 146987118 146987725 283 - chr6:146987479-146987512 NA NA NA NA NA chr6-471 146583531 146583868 203 - chr6:146583723-146583792 NA NA NA NA NA chr6-470 146427644 146427960 278 - chr6:146427762-146427926 NA NA NA NA NA chr6-469 146397534 146398218 274 - chr6:146398013-146398015 NA NA NA NA NA chr6-468 146008337 146008659 207 - chr6:146008399-146008491 NA NA NA NA NA chr6-467 145373619 145373952 219 - chr6:145373733-145373914 NA NA NA NA NA chr6-466 145145358 145145640 174 - chr6:145145438-145145448 NA NA NA NA NA chr6-465 144213068 144213288 130 - chr6:144213208-144213248 NA NA NA NA NA chr6-19 14388782 14389044 140 - chr6:14388835-14388853 NA NA NA NA NA chr6-464 143701293 143701533 138 - chr6:143701363-143701399 NA NA NA NA NA chr6-18 14369573 14369902 276 - chr6:14369782-14369900 NA NA NA NA NA chr6-463 143262697 143262884 159 - chr6:143262707-143262802 NA NA NA NA NA chr6-462 143153997 143154341 204 - chr6:143154223-143154224 NA NA NA NA NA chr6-461 142798779 142799272 220 - chr6:142798938-142798961 NA NA NA NA NA chr6-460 142679844 142680035 164 - chr6:142679896-142680033 NA NA NA NA NA chr6-459 142601422 142601860 255 - chr6:142601580-142601652 NA NA NA NA NA chr6-458 141873087 141873278 155 - chr6:141873131-141873250 NA NA NA NA NA chr6-457 141853574 141853819 174 - chr6:141853606-141853631 NA NA NA NA NA chr6-456 141588855 141589137 126 - chr6:141588930-141588954 NA NA NA NA NA chr6-455 141546942 141547214 149 - chr6:141547071-141547179 NA NA NA NA NA chr6-454 141199903 141200258 169 - chr6:141200041-141200056 NA NA NA NA NA chr6-453 141063344 141063653 182 - chr6:141063453-141063520 NA NA NA NA NA chr6-452 140654064 140654406 186 - chr6:140654210-140654220 NA NA NA NA NA chr6-451 140224878 140225298 274 - chr6:140225117-140225183 NA NA NA NA NA chr6-450 139795367 139795745 192 - chr6:139795538-139795544 NA NA NA NA NA chr6-449 139737411 139737601 117 - chr6:139737422-139737466 NA NA NA NA NA chr6-448 139600540 139600990 316 - chr6:139600719-139600901 NA NA NA NA NA chr6-447 139521731 139521958 197 - chr6:139521827-139521950 NA NA NA NA NA chr6-446 139451080 139451349 188 - chr6:139451173-139451334 NA NA NA NA NA chr6-445 138990186 138990539 222 - chr6:138990412-138990503 NA NA NA NA NA chr6-444 138899059 138899393 266 - chr6:138899114-138899312 NA NA NA NA NA chr6-443 138776827 138777264 296 - chr6:138777145-138777182 NA NA NA NA NA chr6-442 138464506 138464748 163 - chr6:138464618-138464702 NA NA NA NA NA chr6-441 138431899 138432316 300 - chr6:138432115-138432298 NA NA NA NA NA chr6-440 138377105 138377433 151 - chr6:138377123-138377203 NA NA NA NA NA chr6-439 137923501 137923699 133 - chr6:137923615-137923683 NA NA NA NA NA chr6-438 137855045 137855294 123 - chr6:137855204-137855267 NA NA NA NA NA chr6-437 137675291 137675576 252 - chr6:137675307-137675526 NA NA NA NA NA chr6-436 137541642 137541842 130 - chr6:137541758-137541818 NA NA NA NA NA chr6-435 137447093 137447275 113 - chr6:137447100-137447190 NA NA NA NA NA chr6-434 137435621 137435884 189 - chr6:137435707-137435822 NA NA NA NA NA chr6-433 137311997 137312176 146 - chr6:137312083-137312130 NA NA NA NA NA chr6-432 137084415 137084796 332 - chr6:137084478-137084761 NA NA NA NA NA chr6-431 137049842 137050087 192 - chr6:137049926-137050065 NA NA NA NA NA chr6-430 136974874 136975029 128 - chr6:136974921-136975022 NA NA NA NA NA chr6-429 136793362 136793579 185 - chr6:136793364-136793517 NA NA NA NA NA chr6-428 136582886 136583399 291 - chr6:136583281-136583289 NA NA NA NA NA chr6-427 136533077 136533317 215 - chr6:136533107-136533297 NA NA NA NA NA chr6-426 136254530 136254945 223 - chr6:136254688-136254719 NA NA NA NA NA chr6-425 136019365 136019760 272 - chr6:136019508-136019657 NA NA NA NA NA chr6-424 135789922 135790149 200 - chr6:135790008-135790127 NA NA NA NA NA chr6-423 135659371 135659719 209 - chr6:135659498-135659568 NA NA NA NA NA chr6-422 135460290 135460600 177 - chr6:135460331-135460385 NA NA NA NA NA chr6-421 135259532 135259768 191 - chr6:135259586-135259642 NA NA NA NA NA chr6-420 135219771 135219984 114 - chr6:135219895-135219976 NA NA NA NA NA chr6-419 135020905 135021151 184 - chr6:135020984-135021063 NA NA NA NA NA chr6-418 134845594 134845814 161 - chr6:134845620-134845722 NA NA NA NA NA chr6-417 134062688 134062987 197 - chr6:134062831-134062974 NA NA NA NA NA chr6-416 133462229 133462445 136 - chr6:133462291-133462311 NA NA NA NA NA chr6-415 133446838 133447128 215 - chr6:133447039-133447095 NA NA NA NA NA chr6-414 133137083 133137296 116 - chr6:133137147-133137166 NA NA NA NA NA chr6-413 133032647 133032901 188 - chr6:133032653-133032775 NA NA NA NA NA chr6-412 132764721 132764915 142 - chr6:132764755-132764809 NA NA NA NA NA chr6-411 132663841 132664381 241 - chr6:132664198-132664256 NA NA NA NA NA chr6-410 132576199 132576579 278 - chr6:132576399-132576575 NA NA NA NA NA chr6-409 132382844 132383118 217 - chr6:132382861-132383059 NA NA NA NA NA chr6-408 132326619 132327054 242 - chr6:132326728-132326825 NA NA NA NA NA chr6-407 132286452 132286775 149 - chr6:132286581-132286586 NA NA NA NA NA chr6-406 132198082 132198388 238 - chr6:132198111-132198307 NA NA NA NA NA chr6-405 132025094 132025531 285 - chr6:132025347-132025480 NA NA NA NA NA chr6-404 131914495 131914850 226 - chr6:131914750-131914847 NA NA NA NA NA chr6-403 131890595 131890797 155 - chr6:131890699-131890769 NA NA NA NA NA chr6-402 131758354 131758783 267 - chr6:131758520-131758625 NA NA NA NA NA chr6-401 131599686 131600155 204 - chr6:131599709-131599761 NA NA NA NA NA chr6-400 131483806 131484167 166 - chr6:131483975-131484076 NA NA NA NA NA chr6-399 131474128 131474922 427 - chr6:131474632-131474675 NA NA NA NA NA chr6-398 131220478 131220705 192 - chr6:131220519-131220688 NA NA NA NA NA chr6-397 131175969 131176175 166 - chr6:131176000-131176046 NA NA NA NA NA chr6-396 131075292 131075564 155 - chr6:131075386-131075424 NA NA NA NA NA chr6-395 130578267 130578526 172 - chr6:130578370-130578455 NA NA NA NA NA chr6-394 130310778 130311150 187 - chr6:130310939-130310941 NA NA NA NA NA chr6-393 130230653 130231064 216 - chr6:130230889-130230939 NA NA NA NA NA chr6-392 130104090 130104331 221 - chr6:130104157-130104318 NA NA NA NA NA chr6-391 129746266 129746646 140 - chr6:129746452-129746512 NA NA NA NA NA chr6-390 129721416 129721756 230 - chr6:129721677-129721700 NA NA NA NA NA chr6-389 129626688 129626861 142 - chr6:129626749-129626798 NA NA NA NA NA chr6-388 129391510 129392153 355 - chr6:129391876-129391943 NA NA NA NA NA chr6-17 12918551 12918865 219 - chr6:12918702-12918812 NA NA NA NA NA chr6-387 129151247 129151572 183 - chr6:129151388-129151427 NA NA NA NA NA chr6-386 128796539 128796994 229 - chr6:128796797-128796986 NA NA NA NA NA chr6-385 128699235 128699560 180 - chr6:128699414-128699423 NA NA NA NA NA chr6-384 127629632 127630016 207 - chr6:127629686-127629716 NA NA NA NA NA chr6-383 127539351 127539535 169 - chr6:127539351-127539515 NA NA NA NA NA chr6-382 127509701 127510000 141 - chr6:127509910-127509995 NA NA NA NA NA chr6-381 127507210 127507374 144 - chr6:127507228-127507352 NA NA NA NA NA chr6-380 127158884 127159189 281 - chr6:127158900-127159157 NA NA NA NA NA chr6-379 127103434 127103849 265 - chr6:127103614-127103789 NA NA NA NA NA chr6-378 127079501 127079707 136 - chr6:127079549-127079605 NA NA NA NA NA chr6-377 126556845 126557229 200 - chr6:126557039-126557055 NA NA NA NA NA chr6-376 126317674 126318516 306 - chr6:126318297-126318314 NA NA NA NA NA chr6-375 126302056 126302355 199 - chr6:126302074-126302173 NA NA NA NA NA chr6-374 126277883 126278262 299 - chr6:126278005-126278064 NA NA NA NA NA chr6-373 126124653 126124940 145 - chr6:126124801-126124816 NA NA NA NA NA chr6-372 125668406 125669059 299 - chr6:125668813-125668824 NA NA NA NA NA chr6-371 125340741 125340972 135 - chr6:125340838-125340941 NA NA NA NA NA chr6-370 125129898 125130157 155 - chr6:125130009-125130060 NA NA NA NA NA chr6-369 125043315 125043533 168 - chr6:125043328-125043372 NA NA NA NA NA chr6-368 124649834 124650288 282 - chr6:124650047-124650157 NA NA NA NA NA chr6-367 124405784 124406051 186 - chr6:124405930-124405931 NA NA NA NA NA chr6-366 124159306 124159469 137 - chr6:124159311-124159422 NA NA NA NA NA chr6-365 123887089 123887692 308 - chr6:123887258-123887355 NA NA NA NA NA chr6-364 123530097 123530326 180 - chr6:123530227-123530304 NA NA NA NA NA chr6-363 122760753 122761033 219 - chr6:122760820-122760978 NA NA NA NA NA chr6-362 122589046 122589268 141 - chr6:122589059-122589119 NA NA NA NA NA chr6-361 122312365 122312803 222 - chr6:122312650-122312800 NA NA NA NA NA chr6-360 122037354 122037683 195 - chr6:122037585-122037646 NA NA NA NA NA chr6-359 121993539 121993815 213 - chr6:121993627-121993777 NA NA NA NA NA chr6-358 121834655 121835002 212 - chr6:121834785-121834862 NA NA NA NA NA chr6-357 121820708 121820977 202 - chr6:121820805-121820920 NA NA NA NA NA chr6-356 121522409 121522699 200 - chr6:121522536-121522646 NA NA NA NA NA chr6-355 121417259 121417652 218 - chr6:121417328-121417371 NA NA NA NA NA chr6-354 120762540 120762749 182 - chr6:120762553-120762708 NA NA NA NA NA chr6-353 120666568 120666919 188 - chr6:120666746-120666771 NA NA NA NA NA chr6-352 120513710 120513918 157 - chr6:120513791-120513897 NA NA NA NA NA chr6-351 120404710 120404981 116 - chr6:120404718-120404777 NA NA NA NA NA chr6-350 120385849 120386216 281 - chr6:120385872-120386109 NA NA NA NA NA chr6-349 119845292 119845636 256 - chr6:119845453-119845621 NA NA NA NA NA chr6-348 119743350 119743555 176 - chr6:119743460-119743549 NA NA NA NA NA chr6-16 11963771 11963930 137 - chr6:11963787-11963902 NA NA NA NA NA chr6-347 119326216 119326553 214 - chr6:119326239-119326330 NA NA NA NA NA chr6-346 119189145 119189663 300 - chr6:119189384-119189499 NA NA NA NA NA chr6-345 118642361 118642744 255 - chr6:118642520-118642577 NA NA NA NA NA chr6-344 118172296 118172726 218 - chr6:118172556-118172658 NA NA NA NA NA chr6-343 117484161 117484552 279 - chr6:117484235-117484326 NA NA NA NA NA chr6-15 11695192 11695514 262 - chr6:11695254-11695456 NA NA NA NA NA chr6-342 116573727 116573925 133 - chr6:116573794-116573862 NA NA NA NA NA chr6-341 116513373 116513556 115 - chr6:116513433-116513480 NA NA NA NA NA chr6-340 116369410 116369754 164 - chr6:116369417-116369507 NA NA NA NA NA chr6-339 116223577 116223862 159 - chr6:116223655-116223688 NA NA NA NA NA chr6-338 115624054 115624413 184 - chr6:115624292-115624366 NA NA NA NA NA chr6-337 114956734 114956931 126 - chr6:114956819-114956874 NA NA NA NA NA chr6-336 114780245 114780667 218 - chr6:114780451-114780465 NA NA NA NA NA chr6-335 114376437 114376691 119 - chr6:114376582-114376586 NA NA NA NA NA chr6-334 114030056 114030514 256 - chr6:114030298-114030432 NA NA NA NA NA chr6-333 113892661 113892942 157 - chr6:113892770-113892803 NA NA NA NA NA chr6-332 113737095 113737425 234 - chr6:113737245-113737383 NA NA NA NA NA chr6-331 112886684 112887016 171 - chr6:112886888-112886898 NA NA NA NA NA chr6-330 112656983 112657334 178 - chr6:112657048-112657122 NA NA NA NA NA chr6-2 1116175 1116480 206 - chr6:1116240-1116279 NA NA NA NA NA chr6-329 111604571 111604729 141 - chr6:111604604-111604728 NA NA NA NA NA chr6-328 111357987 111358360 257 - chr6:111358305-111358328 NA NA NA NA NA chr6-327 111321688 111322149 372 - chr6:111321756-111322039 NA NA NA NA NA chr6-326 111128590 111128779 120 - chr6:111128679-111128730 NA NA NA NA NA chr6-325 110600365 110600657 173 - chr6:110600506-110600604 NA NA NA NA NA chr6-324 110547598 110547919 249 - chr6:110547669-110547894 NA NA NA NA NA chr6-323 110195548 110195695 117 - chr6:110195608-110195695 NA NA NA NA NA chr6-322 108406026 108406330 191 - chr6:108406139-108406217 NA NA NA NA NA chr6-321 108068341 108068474 130 - chr6:108068343-108068470 NA NA NA NA NA chr6-320 107194448 107194652 127 - chr6:107194601-107194651 NA NA NA NA NA chr6-319 107052412 107052719 158 - chr6:107052570-107052573 NA NA NA NA NA chr6-318 106585963 106586201 143 - chr6:106586046-106586070 NA NA NA NA NA chr6-317 106465677 106465875 163 - chr6:106465715-106465837 NA NA NA NA NA chr6-316 105848739 105849119 154 - chr6:105849057-105849111 NA NA NA NA NA chr6-315 105403406 105403811 228 - chr6:105403726-105403777 NA NA NA NA NA chr6-314 104481386 104481610 176 - chr6:104481488-104481580 NA NA NA NA NA chr6-313 103073252 103073536 199 - chr6:103073404-103073518 NA NA NA NA NA chr6-312 101805424 101805877 269 - chr6:101805485-101805570 NA NA NA NA NA chr6 1008259 1008651 235 - chr6:1008494-1008572 NA NA NA NA NA chr6-311 100338207 100338428 155 - chr6:100338289-100338410 NA NA NA NA NA chr6-310 100311275 100311566 178 - chr6:100311299-100311366 NA NA NA NA NA chr6-309 100245602 100245863 208 - chr6:100245653-100245808 NA NA NA NA NA chr5-469 99981822 99982199 205 - chr5:99982036-99982041 NA NA NA NA NA chr5-468 99628220 99628468 179 - chr5:99628248-99628276 NA NA NA NA NA chr5-47 9934081 9934700 399 - chr5:9934184-9934407 NA NA NA NA NA chr5-467 99334345 99334540 130 - chr5:99334413-99334484 NA NA NA NA NA chr5-46 9909917 9910149 186 - chr5:9909968-9910108 NA NA NA NA NA chr5-466 98643764 98644121 262 - chr5:98643778-98643943 NA NA NA NA NA chr5-45 9857127 9857345 141 - chr5:9857220-9857284 NA NA NA NA NA chr5-465 98540352 98540590 167 - chr5:98540405-98540465 NA NA NA NA NA chr5-464 98265486 98265822 240 - chr5:98265557-98265651 NA NA NA NA NA chr5-463 98183905 98184444 375 - chr5:98184075-98184420 NA NA NA NA NA chr5-44 9797718 9797930 188 - chr5:9797725-9797855 NA NA NA NA NA chr5-462 97879485 97879767 235 - chr5:97879534-97879722 NA NA NA NA NA chr5-461 97732473 97732899 228 - chr5:97732760-97732790 NA NA NA NA NA chr5-43 9767292 9767663 167 - chr5:9767385-9767422 NA NA NA NA NA chr5-42 9750464 9750744 183 - chr5:9750567-9750649 NA NA NA NA NA chr5-460 97279863 97280161 166 - chr5:97279911-97279945 NA NA NA NA NA chr5-459 97259298 97259488 124 - chr5:97259400-97259458 NA NA NA NA NA chr5-458 97127963 97128268 206 - chr5:97128075-97128248 NA NA NA NA NA chr5-457 96933768 96934021 159 - chr5:96933839-96933904 NA NA NA NA NA chr5-41 9666886 9667208 174 - chr5:9666981-9667007 NA NA NA NA NA chr5-456 96455503 96455792 160 - chr5:96455530-96455647 NA NA NA NA NA chr5-455 95979413 95979594 131 - chr5:95979444-95979525 NA NA NA NA NA chr5-454 95910125 95910747 279 - chr5:95910513-95910539 NA NA NA NA NA chr5-453 95787311 95787575 211 - chr5:95787349-95787401 NA NA NA NA NA chr5-40 9574814 9575001 153 - chr5:9574827-9574960 NA NA NA NA NA chr5-452 94908717 94909257 289 - chr5:94908998-94909036 NA NA NA NA NA chr5-451 94807960 94808167 153 - chr5:94808003-94808102 NA NA NA NA NA chr5-450 94716981 94717281 173 - chr5:94717093-94717149 NA NA NA NA NA chr5-449 94691430 94691634 168 - chr5:94691445-94691505 NA NA NA NA NA chr5-448 94667396 94667731 292 - chr5:94667422-94667671 NA NA NA NA NA chr5-447 94225677 94226114 281 - chr5:94225806-94226035 NA NA NA NA NA chr5-446 93736277 93736632 138 - chr5:93736403-93736412 NA NA NA NA NA chr5-445 92615281 92615482 163 - chr5:92615286-92615411 NA NA NA NA NA chr5-444 92410813 92411078 183 - chr5:92410827-92410928 NA NA NA NA NA chr5-443 92081974 92082226 119 - chr5:92082131-92082165 NA NA NA NA NA chr5 919508 919829 177 - chr5:919551-919680 NA NA NA NA NA chr5-442 91909321 91909553 133 - chr5:91909432-91909435 NA NA NA NA NA chr5-441 91876172 91876420 194 - chr5:91876310-91876394 NA NA NA NA NA chr5-39 9092737 9092979 176 - chr5:9092740-9092892 NA NA NA NA NA chr5-440 90914194 90914501 152 - chr5:90914355-90914364 NA NA NA NA NA chr5-439 90349740 90349983 149 - chr5:90349838-90349893 NA NA NA NA NA chr5-438 90334601 90334786 158 - chr5:90334688-90334779 NA NA NA NA NA chr5-437 90320449 90320685 198 - chr5:90320524-90320684 NA NA NA NA NA chr5-436 90220859 90221221 210 - chr5:90220930-90220934 NA NA NA NA NA chr5-435 89894593 89894867 177 - chr5:89894703-89894809 NA NA NA NA NA chr5-434 89868611 89869002 152 - chr5:89868710-89868755 NA NA NA NA NA chr5-433 89548603 89548812 169 - chr5:89548718-89548767 NA NA NA NA NA chr5-432 89391399 89391709 220 - chr5:89391510-89391640 NA NA NA NA NA chr5-431 89210719 89210936 160 - chr5:89210766-89210869 NA NA NA NA NA chr5-430 89123859 89124099 173 - chr5:89123990-89124096 NA NA NA NA NA chr5-429 89090711 89090962 208 - chr5:89090743-89090908 NA NA NA NA NA chr5-38 8887458 8887882 264 - chr5:8887720-8887798 NA NA NA NA NA chr5-428 88513183 88513571 261 - chr5:88513397-88513531 NA NA NA NA NA chr5-37 8850631 8850797 141 - chr5:8850660-8850726 NA NA NA NA NA chr5-427 88360402 88360975 334 - chr5:88360480-88360520 NA NA NA NA NA chr5-426 88193132 88193321 133 - chr5:88193149-88193226 NA NA NA NA NA chr5-425 87570644 87570847 125 - chr5:87570653-87570700 NA NA NA NA NA chr5-36 8714952 8715220 166 - chr5:8715000-8715064 NA NA NA NA NA chr5-35 8699750 8699967 139 - chr5:8699817-8699930 NA NA NA NA NA chr5-424 86669732 86669939 114 - chr5:86669793-86669876 NA NA NA NA NA chr5-34 8663713 8663938 115 - chr5:8663742-8663801 NA NA NA NA NA chr5-423 86572020 86572244 209 - chr5:86572051-86572215 NA NA NA NA NA chr5-422 86554686 86555043 316 - chr5:86554713-86554988 NA NA NA NA NA chr5-421 85266083 85266414 221 - chr5:85266196-85266307 NA NA NA NA NA chr5-420 84608851 84609223 251 - chr5:84608951-84609081 NA NA NA NA NA chr5-419 84444302 84444672 227 - chr5:84444541-84444572 NA NA NA NA NA chr5-418 84327327 84327716 215 - chr5:84327401-84327486 NA NA NA NA NA chr5-417 84278590 84279111 286 - chr5:84278794-84278845 NA NA NA NA NA chr5-416 84135937 84136322 169 - chr5:84136035-84136132 NA NA NA NA NA chr5-415 83993338 83993762 265 - chr5:83993632-83993648 NA NA NA NA NA chr5-414 83936480 83936820 214 - chr5:83936599-83936673 NA NA NA NA NA chr5-413 83896748 83897006 221 - chr5:83896759-83896869 NA NA NA NA NA chr5-412 83892667 83892847 136 - chr5:83892737-83892829 NA NA NA NA NA chr5-411 83846529 83846928 207 - chr5:83846772-83846889 NA NA NA NA NA chr5-33 8363986 8364192 123 - chr5:8364012-8364052 NA NA NA NA NA chr5-410 83365974 83366234 216 - chr5:83366033-83366117 NA NA NA NA NA chr5-409 83252932 83253151 150 - chr5:83252974-83253055 NA NA NA NA NA chr5-408 83213192 83213568 208 - chr5:83213198-83213238 NA NA NA NA NA chr5-407 83191079 83191271 140 - chr5:83191098-83191186 NA NA NA NA NA chr5-406 82967179 82967392 130 - chr5:82967190-82967237 NA NA NA NA NA chr5-405 82828006 82828245 168 - chr5:82828062-82828169 NA NA NA NA NA chr5-404 82608873 82609147 203 - chr5:82608917-82609049 NA NA NA NA NA chr5-403 82276182 82276386 155 - chr5:82276275-82276381 NA NA NA NA NA chr5-402 81733738 81733949 166 - chr5:81733771-81733900 NA NA NA NA NA chr5-401 81667127 81667348 170 - chr5:81667132-81667285 NA NA NA NA NA chr5-400 81540758 81540955 137 - chr5:81540794-81540823 NA NA NA NA NA chr5-399 81534058 81534273 184 - chr5:81534080-81534233 NA NA NA NA NA chr5-32 8092885 8093201 218 - chr5:8092935-8093055 NA NA NA NA NA chr5-31 8068012 8068447 246 - chr5:8068166-8068223 NA NA NA NA NA chr5-398 80438807 80439093 168 - chr5:80438955-80439005 NA NA NA NA NA chr5-397 80321318 80321631 181 - chr5:80321380-80321395 NA NA NA NA NA chr5-396 80138477 80138789 223 - chr5:80138615-80138749 NA NA NA NA NA chr5-395 80049122 80049440 194 - chr5:80049163-80049233 NA NA NA NA NA chr5-394 79872033 79872306 184 - chr5:79872188-79872283 NA NA NA NA NA chr5-393 79817696 79817900 162 - chr5:79817770-79817890 NA NA NA NA NA chr5-392 79561302 79561451 135 - chr5:79561307-79561410 NA NA NA NA NA chr5-391 79142689 79143085 306 - chr5:79142693-79142969 NA NA NA NA NA chr5-390 78898160 78898492 233 - chr5:78898331-78898465 NA NA NA NA NA chr5-30 7879825 7880054 163 - chr5:7879888-7879987 NA NA NA NA NA chr5-389 78594385 78594546 137 - chr5:78594390-78594465 NA NA NA NA NA chr5-388 78318739 78319064 200 - chr5:78318948-78318967 NA NA NA NA NA chr5-387 77971284 77971741 245 - chr5:77971684-77971717 NA NA NA NA NA chr5-386 77913161 77913526 238 - chr5:77913321-77913410 NA NA NA NA NA chr5-385 77701280 77701474 155 - chr5:77701345-77701461 NA NA NA NA NA chr5-384 77400123 77400452 190 - chr5:77400254-77400314 NA NA NA NA NA chr5-383 77372141 77372408 214 - chr5:77372178-77372307 NA NA NA NA NA chr5-382 77248438 77248793 248 - chr5:77248550-77248641 NA NA NA NA NA chr5-29 7687544 7688035 186 - chr5:7687947-7688030 NA NA NA NA NA chr5-381 76544570 76544856 146 - chr5:76544726-76544732 NA NA NA NA NA chr5-380 76009386 76009884 382 - chr5:76009460-76009802 NA NA NA NA NA chr5-379 75759704 75759939 121 - chr5:75759820-75759831 NA NA NA NA NA chr5-378 75241425 75241860 412 - chr5:75241426-75241815 NA NA NA NA NA chr5-377 75093280 75093646 232 - chr5:75093350-75093448 NA NA NA NA NA chr5-28 7461310 7461594 222 - chr5:7461330-7461406 NA NA NA NA NA chr5-376 74515841 74516244 303 - chr5:74515962-74516165 NA NA NA NA NA chr5-375 74397001 74397352 198 - chr5:74397239-74397284 NA NA NA NA NA chr5-374 74297597 74297788 160 - chr5:74297681-74297748 NA NA NA NA NA chr5-373 73178836 73178997 133 - chr5:73178933-73178992 NA NA NA NA NA chr5-372 73093664 73093910 147 - chr5:73093750-73093798 NA NA NA NA NA chr5-371 72921361 72921597 158 - chr5:72921388-72921502 NA NA NA NA NA chr5-370 72655521 72655785 145 - chr5:72655666-72655692 NA NA NA NA NA chr5-369 72613086 72613291 144 - chr5:72613159-72613242 NA NA NA NA NA chr5-368 72484520 72484982 251 - chr5:72484614-72484673 NA NA NA NA NA chr5-367 72470451 72470695 118 - chr5:72470573-72470649 NA NA NA NA NA chr5-366 72360784 72361112 198 - chr5:72360869-72360937 NA NA NA NA NA chr5-27 7140435 7140844 298 - chr5:7140544-7140836 NA NA NA NA NA chr5-365 69024533 69024898 276 - chr5:69024666-69024853 NA NA NA NA NA chr5-364 68802865 68803113 119 - chr5:68802913-68802957 NA NA NA NA NA chr5-363 68190097 68190463 256 - chr5:68190180-68190326 NA NA NA NA NA chr5-362 68073471 68073769 226 - chr5:68073615-68073769 NA NA NA NA NA chr5-361 67405357 67405638 246 - chr5:67405410-67405551 NA NA NA NA NA chr5-360 67389675 67390008 159 - chr5:67389745-67389846 NA NA NA NA NA chr5-359 67352605 67352917 181 - chr5:67352642-67352692 NA NA NA NA NA chr5-358 66943896 66944251 203 - chr5:66944185-66944236 NA NA NA NA NA chr5-357 66795779 66796177 228 - chr5:66795989-66796047 NA NA NA NA NA chr5-356 66787663 66787950 177 - chr5:66787820-66787887 NA NA NA NA NA chr5-355 66361040 66361399 232 - chr5:66361128-66361233 NA NA NA NA NA chr5-26 6624666 6624830 119 - chr5:6624696-6624770 NA NA NA NA NA chr5-354 66040884 66041751 298 - chr5:66041174-66041181 NA NA NA NA NA chr5-353 65999465 65999915 254 - chr5:65999679-65999737 NA NA NA NA NA chr5-352 65949125 65949344 156 - chr5:65949272-65949309 NA NA NA NA NA chr5-351 65880473 65880758 260 - chr5:65880513-65880748 NA NA NA NA NA chr5-25 6581271 6581500 152 - chr5:6581392-6581467 NA NA NA NA NA chr5-350 65680631 65680823 123 - chr5:65680693-65680747 NA NA NA NA NA chr5-349 65483638 65483815 149 - chr5:65483666-65483787 NA NA NA NA NA chr5-348 65462103 65462461 127 - chr5:65462188-65462238 NA NA NA NA NA chr5-347 65109340 65109692 230 - chr5:65109480-65109588 NA NA NA NA NA chr5-24 6484024 6484248 121 - chr5:6484150-6484168 NA NA NA NA NA chr5-346 64815406 64815709 205 - chr5:64815497-64815604 NA NA NA NA NA chr5-345 64454573 64455144 350 - chr5:64454738-64454941 NA NA NA NA NA chr5-344 64369828 64370140 231 - chr5:64369935-64370085 NA NA NA NA NA chr5-343 64282560 64282905 221 - chr5:64282655-64282752 NA NA NA NA NA chr5-342 64182177 64182410 132 - chr5:64182282-64182288 NA NA NA NA NA chr5-341 63660943 63661206 155 - chr5:63661019-63661066 NA NA NA NA NA chr5-23 6345972 6346243 188 - chr5:6346134-6346239 NA NA NA NA NA chr5-340 63391248 63391585 216 - chr5:63391418-63391513 NA NA NA NA NA chr5-339 63281180 63281522 135 - chr5:63281415-63281481 NA NA NA NA NA chr5-338 63171125 63171533 236 - chr5:63171325-63171389 NA NA NA NA NA chr5-337 63023432 63023793 214 - chr5:63023700-63023767 NA NA NA NA NA chr5-336 62593195 62593439 152 - chr5:62593273-62593305 NA NA NA NA NA chr5-22 6249204 6249561 200 - chr5:6249392-6249403 NA NA NA NA NA chr5-335 62138034 62138220 180 - chr5:62138042-62138220 NA NA NA NA NA chr5-334 61190660 61190875 127 - chr5:61190766-61190779 NA NA NA NA NA chr5-333 61105874 61106207 216 - chr5:61105942-61106119 NA NA NA NA NA chr5-332 60891839 60892111 155 - chr5:60891970-60892036 NA NA NA NA NA chr5-331 60771499 60771907 228 - chr5:60771599-60771647 NA NA NA NA NA chr5-21 6068617 6069109 276 - chr5:6068657-6068762 NA NA NA NA NA chr5-330 60555190 60555458 133 - chr5:60555251-60555339 NA NA NA NA NA chr5-329 60187210 60187533 205 - chr5:60187411-60187498 NA NA NA NA NA chr5-328 60157199 60157528 123 - chr5:60157463-60157496 NA NA NA NA NA chr5-327 59300571 59300743 116 - chr5:59300624-59300686 NA NA NA NA NA chr5-326 58871841 58872409 344 - chr5:58871899-58872230 NA NA NA NA NA chr5-325 58570809 58571094 241 - chr5:58570824-58571021 NA NA NA NA NA chr5-324 58431118 58431628 303 - chr5:58431328-58431430 NA NA NA NA NA chr5-323 58287467 58287746 167 - chr5:58287559-58287614 NA NA NA NA NA chr5-322 58128687 58128973 203 - chr5:58128687-58128807 NA NA NA NA NA chr5-321 57664943 57665134 129 - chr5:57664965-57665032 NA NA NA NA NA chr5-320 57631794 57632075 250 - chr5:57631794-57631951 NA NA NA NA NA chr5-319 57618893 57619353 276 - chr5:57618969-57619174 NA NA NA NA NA chr5-318 57368602 57368781 121 - chr5:57368686-57368749 NA NA NA NA NA chr5-317 57336163 57336433 243 - chr5:57336163-57336397 NA NA NA NA NA chr5-316 57204972 57205358 259 - chr5:57205093-57205213 NA NA NA NA NA chr5-315 57188128 57188402 142 - chr5:57188251-57188261 NA NA NA NA NA chr5-314 57123099 57123482 219 - chr5:57123188-57123293 NA NA NA NA NA chr5-313 57007871 57008038 117 - chr5:57007971-57008038 NA NA NA NA NA chr5-312 56927019 56927229 168 - chr5:56927045-56927171 NA NA NA NA NA chr5-311 56880653 56880974 230 - chr5:56880795-56880934 NA NA NA NA NA chr5-310 56851698 56851926 197 - chr5:56851716-56851820 NA NA NA NA NA chr5-309 56536980 56537312 240 - chr5:56536981-56537129 NA NA NA NA NA chr5-308 56422933 56423277 213 - chr5:56423176-56423258 NA NA NA NA NA chr5-20 5618014 5618392 209 - chr5:5618169-5618209 NA NA NA NA NA chr5-307 55963470 55963652 118 - chr5:55963528-55963586 NA NA NA NA NA chr5-306 55621580 55622170 353 - chr5:55621763-55621771 NA NA NA NA NA chr5-305 55620975 55621310 185 - chr5:55621096-55621231 NA NA NA NA NA chr5-19 5561888 5562131 188 - chr5:5561952-5562079 NA NA NA NA NA chr5-304 55203096 55203576 168 - chr5:55203307-55203371 NA NA NA NA NA chr5-303 55169531 55169812 146 - chr5:55169684-55169695 NA NA NA NA NA chr5-302 54979411 54979688 142 - chr5:54979516-54979543 NA NA NA NA NA chr5-301 54749069 54749357 180 - chr5:54749163-54749235 NA NA NA NA NA chr5-18 5444736 5445116 248 - chr5:5444865-5444981 NA NA NA NA NA chr5-300 54034346 54034624 154 - chr5:54034417-54034444 NA NA NA NA NA chr5-299 53984646 53984846 129 - chr5:53984710-53984754 NA NA NA NA NA chr5-17 5397473 5397756 148 - chr5:5397665-5397675 NA NA NA NA NA chr5-298 53929509 53929794 120 - chr5:53929575-53929596 NA NA NA NA NA chr5-297 53919510 53919886 249 - chr5:53919510-53919632 NA NA NA NA NA chr5-296 53517311 53517504 151 - chr5:53517384-53517493 NA NA NA NA NA chr5-16 5335943 5336251 168 - chr5:5336067-5336095 NA NA NA NA NA chr5-295 53176589 53177085 314 - chr5:53176870-53176876 NA NA NA NA NA chr5-294 52961450 52961746 250 - chr5:52961533-52961737 NA NA NA NA NA chr5-15 5278923 5279308 270 - chr5:5279025-5279138 NA NA NA NA NA chr5-293 52746150 52746409 238 - chr5:52746150-52746367 NA NA NA NA NA chr5-292 52571271 52571549 169 - chr5:52571433-52571493 NA NA NA NA NA chr5-291 52420186 52420507 142 - chr5:52420302-52420307 NA NA NA NA NA chr5-290 52240932 52241102 113 - chr5:52240955-52241049 NA NA NA NA NA chr5-289 52034487 52034852 227 - chr5:52034508-52034675 NA NA NA NA NA chr5-288 51973623 51973838 158 - chr5:51973662-51973763 NA NA NA NA NA chr5-287 51946698 51946923 133 - chr5:51946731-51946772 NA NA NA NA NA chr5-286 51509853 51510190 246 - chr5:51509868-51510023 NA NA NA NA NA chr5-14 5124238 5124766 247 - chr5:5124587-5124689 NA NA NA NA NA chr5-13 5116421 5116652 162 - chr5:5116486-5116625 NA NA NA NA NA chr5-285 50968078 50968217 129 - chr5:50968084-50968203 NA NA NA NA NA chr5-284 50878453 50878739 174 - chr5:50878489-50878550 NA NA NA NA NA chr5-283 50767510 50767783 207 - chr5:50767586-50767727 NA NA NA NA NA chr5-282 50764590 50765011 211 - chr5:50764785-50764796 NA NA NA NA NA chr5-281 49656780 49657102 176 - chr5:49656814-49656840 NA NA NA NA NA chr5-12 4647731 4648025 177 - chr5:4647893-4647953 NA NA NA NA NA chr5-280 46286932 46287143 149 - chr5:46286969-46287056 NA NA NA NA NA chr5-279 46215148 46215467 196 - chr5:46215279-46215349 NA NA NA NA NA chr5-278 46184086 46184303 170 - chr5:46184109-46184232 NA NA NA NA NA chr5-277 45803119 45803380 195 - chr5:45803215-45803344 NA NA NA NA NA chr5-276 45628411 45628609 130 - chr5:45628494-45628546 NA NA NA NA NA chr5-11 4550086 4550352 195 - chr5:4550102-4550183 NA NA NA NA NA chr5-275 45434696 45434933 163 - chr5:45434828-45434917 NA NA NA NA NA chr5-274 45031803 45032210 247 - chr5:45031935-45032064 NA NA NA NA NA chr5-273 44639837 44640130 187 - chr5:44639982-44640037 NA NA NA NA NA chr5-272 44442370 44442578 125 - chr5:44442404-44442446 NA NA NA NA NA chr5-271 44439273 44439537 157 - chr5:44439432-44439482 NA NA NA NA NA chr5-10 4443664 4443929 159 - chr5:4443678-4443731 NA NA NA NA NA chr5-9 4410249 4410462 196 - chr5:4410266-4410411 NA NA NA NA NA chr5-270 43600822 43600993 163 - chr5:43600836-43600991 NA NA NA NA NA chr5-269 43583154 43583333 157 - chr5:43583176-43583311 NA NA NA NA NA chr5-8 4357757 4358340 314 - chr5:4357914-4357919 NA NA NA NA NA chr5-268 43518160 43518423 176 - chr5:43518162-43518251 NA NA NA NA NA chr5-267 43494235 43494483 180 - chr5:43494258-43494280 NA NA NA NA NA chr5-266 43391136 43391492 181 - chr5:43391376-43391382 NA NA NA NA NA chr5-265 42746569 42747120 163 - chr5:42747071-42747074 NA NA NA NA NA chr5-264 42623692 42624023 233 - chr5:42623866-42624001 NA NA NA NA NA chr5-263 42611686 42612055 198 - chr5:42611832-42611859 NA NA NA NA NA chr5-262 42282203 42282600 282 - chr5:42282232-42282403 NA NA NA NA NA chr5-261 42004543 42004789 160 - chr5:42004559-42004633 NA NA NA NA NA chr5-260 41955951 41956185 158 - chr5:41956083-41956165 NA NA NA NA NA chr5-259 41943721 41944069 224 - chr5:41943963-41944063 NA NA NA NA NA chr5-258 41927935 41928197 145 - chr5:41928033-41928061 NA NA NA NA NA chr5-257 41650665 41650962 218 - chr5:41650783-41650922 NA NA NA NA NA chr5-256 41451322 41451591 183 - chr5:41451451-41451537 NA NA NA NA NA chr5-255 41386818 41387126 189 - chr5:41387034-41387104 NA NA NA NA NA chr5-254 41385428 41385682 168 - chr5:41385624-41385681 NA NA NA NA NA chr5-253 41173445 41173826 222 - chr5:41173678-41173709 NA NA NA NA NA chr5-252 41147017 41147568 335 - chr5:41147070-41147219 NA NA NA NA NA chr5-251 40814368 40814661 119 - chr5:40814570-40814571 NA NA NA NA NA chr5-250 40753077 40753482 291 - chr5:40753162-40753415 NA NA NA NA NA chr5-249 40712863 40713304 251 - chr5:40713019-40713080 NA NA NA NA NA chr5-248 40664675 40664968 174 - chr5:40664826-40664866 NA NA NA NA NA chr5-247 40611541 40611789 135 - chr5:40611568-40611590 NA NA NA NA NA chr5-246 40602113 40602293 124 - chr5:40602143-40602211 NA NA NA NA NA chr5-245 40585785 40585990 150 - chr5:40585832-40585911 NA NA NA NA NA chr5-244 40484499 40484941 233 - chr5:40484684-40484724 NA NA NA NA NA chr5-243 40478963 40479121 115 - chr5:40478993-40479065 NA NA NA NA NA chr5-242 40437581 40437726 129 - chr5:40437601-40437714 NA NA NA NA NA chr5-241 40282723 40282914 158 - chr5:40282758-40282887 NA NA NA NA NA chr5-240 40244563 40245014 165 - chr5:40244688-40244698 NA NA NA NA NA chr5-239 40187903 40188233 181 - chr5:40188012-40188023 NA NA NA NA NA chr5-7 4011579 4011988 315 - chr5:4011767-4011988 NA NA NA NA NA chr5-238 40061610 40061852 184 - chr5:40061713-40061839 NA NA NA NA NA chr5-237 40039469 40039634 153 - chr5:40039490-40039631 NA NA NA NA NA chr5-236 39862343 39862543 179 - chr5:39862352-39862518 NA NA NA NA NA chr5-235 38994486 38994758 219 - chr5:38994536-38994702 NA NA NA NA NA chr5-234 38952448 38952657 140 - chr5:38952528-38952599 NA NA NA NA NA chr5-233 38939333 38939626 191 - chr5:38939439-38939528 NA NA NA NA NA chr5-232 38935298 38935614 180 - chr5:38935485-38935495 NA NA NA NA NA chr5-6 3872974 3873346 183 - chr5:3873065-3873067 NA NA NA NA NA chr5-5 3867887 3868327 254 - chr5:3868052-3868120 NA NA NA NA NA chr5-231 38676935 38677527 241 - chr5:38677431-38677459 NA NA NA NA NA chr5-230 38601316 38601736 229 - chr5:38601552-38601560 NA NA NA NA NA chr5-229 38585978 38586406 219 - chr5:38586181-38586191 NA NA NA NA NA chr5-228 38534128 38534503 238 - chr5:38534258-38534359 NA NA NA NA NA chr5-227 38438866 38439051 161 - chr5:38438892-38439045 NA NA NA NA NA chr5-226 38402096 38402329 221 - chr5:38402097-38402306 NA NA NA NA NA chr5-225 38314372 38314577 163 - chr5:38314428-38314549 NA NA NA NA NA chr5-224 38043269 38043574 189 - chr5:38043361-38043386 NA NA NA NA NA chr5-223 37903109 37903339 121 - chr5:37903224-37903248 NA NA NA NA NA chr5-222 37741843 37742259 216 - chr5:37742108-37742254 NA NA NA NA NA chr5-221 37104152 37104437 148 - chr5:37104223-37104234 NA NA NA NA NA chr5-220 37002981 37003254 227 - chr5:37003072-37003253 NA NA NA NA NA chr5-219 36871323 36871594 171 - chr5:36871430-36871515 NA NA NA NA NA chr5-218 36799949 36800179 172 - chr5:36800040-36800154 NA NA NA NA NA chr5-217 36773466 36773829 267 - chr5:36773486-36773721 NA NA NA NA NA chr5-216 36707257 36707669 195 - chr5:36707339-36707407 NA NA NA NA NA chr5-215 36586428 36586734 259 - chr5:36586543-36586661 NA NA NA NA NA chr5-214 36338181 36338524 242 - chr5:36338323-36338407 NA NA NA NA NA chr5-213 36337774 36337953 146 - chr5:36337818-36337865 NA NA NA NA NA chr5-212 36254365 36254582 128 - chr5:36254455-36254496 NA NA NA NA NA chr5-211 36233185 36233452 215 - chr5:36233373-36233432 NA NA NA NA NA chr5-210 36013732 36014097 187 - chr5:36013991-36014001 NA NA NA NA NA chr5-209 35955852 35956402 312 - chr5:35956081-35956137 NA NA NA NA NA chr5-208 35418803 35419258 313 - chr5:35419170-35419191 NA NA NA NA NA chr5-207 35216074 35216413 244 - chr5:35216179-35216328 NA NA NA NA NA chr5-206 35159488 35159686 150 - chr5:35159490-35159624 NA NA NA NA NA chr5-205 34908534 34908748 170 - chr5:34908621-34908659 NA NA NA NA NA chr5-204 34638755 34639151 221 - chr5:34638902-34638948 NA NA NA NA NA chr5-203 34569405 34569840 211 - chr5:34569422-34569547 NA NA NA NA NA chr5-4 3423715 3423938 125 - chr5:3423828-3423855 NA NA NA NA NA chr5-202 34023660 34023946 193 - chr5:34023735-34023835 NA NA NA NA NA chr5-201 33770957 33771463 223 - chr5:33771117-33771139 NA NA NA NA NA chr5-200 33641076 33641274 124 - chr5:33641129-33641137 NA NA NA NA NA chr5-199 33418154 33418459 188 - chr5:33418375-33418446 NA NA NA NA NA chr5-198 33317694 33317967 203 - chr5:33317805-33317938 NA NA NA NA NA chr5-197 33286876 33287113 164 - chr5:33286909-33287000 NA NA NA NA NA chr5-196 33187648 33188008 165 - chr5:33187864-33187876 NA NA NA NA NA chr5-3 3299692 3300036 141 - chr5:3299950-3299998 NA NA NA NA NA chr5-195 32914376 32914550 135 - chr5:32914377-32914473 NA NA NA NA NA chr5-194 32874659 32874850 142 - chr5:32874689-32874782 NA NA NA NA NA chr5-193 32761291 32761481 120 - chr5:32761385-32761435 NA NA NA NA NA chr5-192 32720708 32721287 219 - chr5:32721165-32721218 NA NA NA NA NA chr5-191 32391780 32391937 122 - chr5:32391820-32391907 NA NA NA NA NA chr5-190 32302207 32302478 183 - chr5:32302226-32302321 NA NA NA NA NA chr5-189 32107350 32107588 129 - chr5:32107513-32107533 NA NA NA NA NA chr5-188 31872702 31872975 147 - chr5:31872773-31872827 NA NA NA NA NA chr5-187 31589439 31589696 141 - chr5:31589556-31589568 NA NA NA NA NA chr5-186 31521230 31521692 187 - chr5:31521638-31521690 NA NA NA NA NA chr5-185 31305196 31305755 264 - chr5:31305632-31305695 NA NA NA NA NA chr5-184 31187271 31187488 140 - chr5:31187425-31187488 NA NA NA NA NA chr5-183 30884027 30884310 156 - chr5:30884251-30884280 NA NA NA NA NA chr5-182 30828952 30829121 151 - chr5:30828973-30829106 NA NA NA NA NA chr5-181 30733990 30734175 149 - chr5:30733996-30734129 NA NA NA NA NA chr5-180 30724590 30724976 277 - chr5:30724687-30724853 NA NA NA NA NA chr5-179 30603740 30604213 354 - chr5:30603863-30604145 NA NA NA NA NA chr5-178 30503425 30503668 131 - chr5:30503516-30503549 NA NA NA NA NA chr5-177 30431729 30432103 194 - chr5:30431982-30431996 NA NA NA NA NA chr5-176 29885659 29885967 165 - chr5:29885711-29885733 NA NA NA NA NA chr5-175 29881688 29881933 231 - chr5:29881688-29881905 NA NA NA NA NA chr5-174 29010460 29010664 163 - chr5:29010516-29010628 NA NA NA NA NA chr5-173 29008879 29009149 170 - chr5:29008975-29009037 NA NA NA NA NA chr5-172 28752541 28752914 214 - chr5:28752730-28752785 NA NA NA NA NA chr5-171 28577603 28577786 157 - chr5:28577636-28577781 NA NA NA NA NA chr5-170 28550149 28550312 124 - chr5:28550157-28550242 NA NA NA NA NA chr5-169 28516638 28516873 139 - chr5:28516747-28516816 NA NA NA NA NA chr5-168 28466576 28466857 150 - chr5:28466598-28466617 NA NA NA NA NA chr5-167 28377559 28378217 411 - chr5:28377743-28377942 NA NA NA NA NA chr5-166 28373219 28373468 150 - chr5:28373293-28373294 NA NA NA NA NA chr5-165 27907728 27907898 130 - chr5:27907748-27907838 NA NA NA NA NA chr5-164 27725115 27725428 242 - chr5:27725336-27725407 NA NA NA NA NA chr5-163 27590686 27590963 143 - chr5:27590802-27590823 NA NA NA NA NA chr5-162 27417254 27417575 186 - chr5:27417353-27417428 NA NA NA NA NA chr5-161 27354703 27355410 250 - chr5:27354903-27355008 NA NA NA NA NA chr5-160 27318210 27318480 150 - chr5:27318213-27318243 NA NA NA NA NA chr5-159 27301337 27301743 228 - chr5:27301347-27301644 NA NA NA NA NA chr5-158 27103597 27103809 121 - chr5:27103705-27103769 NA NA NA NA NA chr5-157 27020678 27020941 179 - chr5:27020716-27020779 NA NA NA NA NA chr5-156 26840438 26840707 144 - chr5:26840573-26840592 NA NA NA NA NA chr5-155 26733901 26734139 199 - chr5:26733945-26734131 NA NA NA NA NA chr5-154 26613443 26613774 210 - chr5:26613608-26613697 NA NA NA NA NA chr5-153 26348451 26348840 360 - chr5:26348519-26348792 NA NA NA NA NA chr5-152 26326630 26326920 184 - chr5:26326760-26326886 NA NA NA NA NA chr5-151 26220488 26220989 221 - chr5:26220819-26220862 NA NA NA NA NA chr5-150 26144766 26145020 146 - chr5:26144919-26144927 NA NA NA NA NA chr5-149 25871271 25871938 337 - chr5:25871487-25871570 NA NA NA NA NA chr5-148 25315692 25315901 139 - chr5:25315736-25315753 NA NA NA NA NA chr5-147 25249932 25250182 126 - chr5:25250103-25250105 NA NA NA NA NA chr5-146 25070479 25070775 260 - chr5:25070497-25070683 NA NA NA NA NA chr5-145 25052550 25052895 168 - chr5:25052611-25052669 NA NA NA NA NA chr5-144 25030989 25031223 163 - chr5:25031048-25031148 NA NA NA NA NA chr5-143 24796127 24796289 115 - chr5:24796142-24796210 NA NA NA NA NA chr5-142 24510915 24511055 123 - chr5:24510943-24511049 NA NA NA NA NA chr5-141 24412612 24413217 318 - chr5:24412904-24412945 NA NA NA NA NA chr5-140 24244067 24244387 191 - chr5:24244086-24244198 NA NA NA NA NA chr5-139 23909184 23909560 211 - chr5:23909330-23909338 NA NA NA NA NA chr5-138 23584989 23585532 232 - chr5:23585162-23585175 NA NA NA NA NA chr5-137 23028501 23028837 182 - chr5:23028706-23028734 NA NA NA NA NA chr5-136 22949822 22950409 335 - chr5:22950143-22950226 NA NA NA NA NA chr5-135 22906100 22906453 204 - chr5:22906282-22906337 NA NA NA NA NA chr5-134 22791072 22791490 253 - chr5:22791364-22791398 NA NA NA NA NA chr5-133 22633726 22634235 249 - chr5:22633993-22633996 NA NA NA NA NA chr5-132 22610082 22610467 230 - chr5:22610248-22610345 NA NA NA NA NA chr5-131 22464091 22464359 235 - chr5:22464177-22464313 NA NA NA NA NA chr5-130 22433265 22433506 194 - chr5:22433267-22433414 NA NA NA NA NA chr5-129 22218953 22219321 203 - chr5:22218965-22219105 NA NA NA NA NA chr5-128 22111632 22111877 126 - chr5:22111778-22111785 NA NA NA NA NA chr5-127 21916005 21916192 119 - chr5:21916062-21916091 NA NA NA NA NA chr5-126 21392863 21393136 178 - chr5:21392945-21393002 NA NA NA NA NA chr5-125 21198665 21198859 136 - chr5:21198696-21198774 NA NA NA NA NA chr5-124 20572517 20572938 223 - chr5:20572688-20572713 NA NA NA NA NA chr5-123 20381785 20382049 133 - chr5:20381983-20381985 NA NA NA NA NA chr5-122 20271012 20271283 170 - chr5:20271097-20271166 NA NA NA NA NA chr5-121 20244973 20245149 145 - chr5:20245049-20245133 NA NA NA NA NA chr5-120 20167018 20167236 116 - chr5:20167049-20167131 NA NA NA NA NA chr5-119 19804588 19804782 121 - chr5:19804669-19804717 NA NA NA NA NA chr5-118 19769069 19769375 165 - chr5:19769089-19769113 NA NA NA NA NA chr5-117 19562364 19562654 128 - chr5:19562421-19562495 NA NA NA NA NA chr5-116 19527417 19527747 200 - chr5:19527642-19527715 NA NA NA NA NA chr5-115 19364636 19365011 196 - chr5:19364749-19364786 NA NA NA NA NA chr5-114 19355372 19355577 147 - chr5:19355463-19355552 NA NA NA NA NA chr5-113 19039813 19040196 239 - chr5:19039919-19039938 NA NA NA NA NA chr5-2 1898770 1899131 181 - chr5:1898920-1898921 NA NA NA NA NA chr5-112 18945373 18945531 140 - chr5:18945402-18945524 NA NA NA NA NA chr5-111 18934833 18935067 197 - chr5:18934881-18935063 NA NA NA NA NA chr5-110 18927984 18928396 300 - chr5:18928055-18928287 NA NA NA NA NA chr5-109 18838800 18839009 120 - chr5:18838817-18838848 NA NA NA NA NA chr5-108 18831922 18832085 130 - chr5:18831976-18832007 NA NA NA NA NA chr5-107 18719702 18720059 247 - chr5:18719925-18719999 NA NA NA NA NA chr5-106 18676870 18677097 215 - chr5:18676891-18677094 NA NA NA NA NA chr5-105 18470286 18470732 262 - chr5:18470312-18470473 NA NA NA NA NA chr5-104 18452802 18453057 202 - chr5:18452855-18453004 NA NA NA NA NA chr5-103 18326690 18327022 189 - chr5:18326845-18326893 NA NA NA NA NA chr5-102 18232784 18233153 210 - chr5:18232984-18233035 NA NA NA NA NA chr5-101 18191363 18191983 328 - chr5:18191748-18191842 NA NA NA NA NA chr5-100 18178452 18178916 288 - chr5:18178588-18178614 NA NA NA NA NA chr5-748 180968238 180968504 222 - chr5:180968256-180968346 NA NA NA NA NA chr5-747 180794969 180795283 254 - chr5:180795044-180795228 NA NA NA NA NA chr5-746 180569834 180570202 216 - chr5:180569861-180569925 NA NA NA NA NA chr5-745 180187108 180187637 316 - chr5:180187316-180187419 NA NA NA NA NA chr5-99 18015032 18015490 225 - chr5:18015298-18015356 NA NA NA NA NA chr5-744 179975423 179975730 196 - chr5:179975564-179975709 NA NA NA NA NA chr5-743 179237545 179237745 124 - chr5:179237607-179237655 NA NA NA NA NA chr5-742 179081389 179081658 227 - chr5:179081429-179081614 NA NA NA NA NA chr5-741 178633441 178633610 115 - chr5:178633516-178633577 NA NA NA NA NA chr5-740 178416083 178416332 170 - chr5:178416217-178416308 NA NA NA NA NA chr5-739 177287618 177288007 211 - chr5:177287740-177287773 NA NA NA NA NA chr5-738 177228062 177228522 239 - chr5:177228223-177228241 NA NA NA NA NA chr5-737 177126518 177126752 168 - chr5:177126520-177126666 NA NA NA NA NA chr5-736 176887255 176887503 151 - chr5:176887328-176887334 NA NA NA NA NA chr5-98 17679559 17679754 122 - chr5:17679668-17679717 NA NA NA NA NA chr5-735 176504565 176504879 273 - chr5:176504575-176504807 NA NA NA NA NA chr5-734 176374339 176374965 360 - chr5:176374481-176374687 NA NA NA NA NA chr5-733 176372148 176372366 167 - chr5:176372206-176372356 NA NA NA NA NA chr5-732 175485115 175485359 174 - chr5:175485143-175485163 NA NA NA NA NA chr5-731 175112681 175112926 144 - chr5:175112827-175112899 NA NA NA NA NA chr5-730 174960601 174960791 122 - chr5:174960701-174960755 NA NA NA NA NA chr5-729 174580762 174580957 150 - chr5:174580873-174580934 NA NA NA NA NA chr5-728 173910175 173910405 124 - chr5:173910309-173910327 NA NA NA NA NA chr5-727 173783546 173783739 174 - chr5:173783620-173783737 NA NA NA NA NA chr5-97 17318751 17318922 150 - chr5:17318814-17318915 NA NA NA NA NA chr5-726 172956165 172956401 188 - chr5:172956208-172956252 NA NA NA NA NA chr5-725 172345179 172345792 385 - chr5:172345533-172345606 NA NA NA NA NA chr5-724 172108017 172108243 164 - chr5:172108046-172108170 NA NA NA NA NA chr5-96 17140249 17140780 271 - chr5:17140411-17140412 NA NA NA NA NA chr5-723 171172925 171173213 227 - chr5:171172950-171172994 NA NA NA NA NA chr5-722 170807518 170807729 173 - chr5:170807546-170807681 NA NA NA NA NA chr5-721 170497463 170497624 125 - chr5:170497483-170497572 NA NA NA NA NA chr5-720 170458844 170459054 158 - chr5:170458939-170459045 NA NA NA NA NA chr5-719 170133240 170133428 119 - chr5:170133295-170133345 NA NA NA NA NA chr5-718 169916355 169916776 238 - chr5:169916463-169916518 NA NA NA NA NA chr5-717 169734207 169734439 173 - chr5:169734309-169734423 NA NA NA NA NA chr5-716 169396939 169397331 242 - chr5:169397194-169397292 NA NA NA NA NA chr5-715 169262966 169263291 167 - chr5:169263097-169263106 NA NA NA NA NA chr5-714 169172413 169172774 227 - chr5:169172594-169172687 NA NA NA NA NA chr5-95 16905730 16906042 229 - chr5:16905824-16905970 NA NA NA NA NA chr5-713 169041021 169041181 126 - chr5:169041077-169041169 NA NA NA NA NA chr5-712 168982526 168982833 121 - chr5:168982592-168982607 NA NA NA NA NA chr5-711 168935067 168935465 263 - chr5:168935251-168935431 NA NA NA NA NA chr5-710 168376523 168376858 235 - chr5:168376621-168376752 NA NA NA NA NA chr5-709 168037809 168038028 164 - chr5:168037834-168037963 NA NA NA NA NA chr5-94 16801936 16802239 177 - chr5:16802156-16802208 NA NA NA NA NA chr5-708 167975229 167975543 236 - chr5:167975287-167975445 NA NA NA NA NA chr5-707 167734424 167734699 177 - chr5:167734481-167734560 NA NA NA NA NA chr5-706 167664575 167664900 213 - chr5:167664639-167664740 NA NA NA NA NA chr5-705 167309494 167309655 113 - chr5:167309515-167309598 NA NA NA NA NA chr5-704 167194432 167194868 290 - chr5:167194543-167194617 NA NA NA NA NA chr5-703 167156891 167157175 222 - chr5:167156922-167157020 NA NA NA NA NA chr5-702 167120460 167120793 202 - chr5:167120620-167120749 NA NA NA NA NA chr5-93 16697278 16697441 144 - chr5:16697289-16697376 NA NA NA NA NA chr5-701 166918764 166918972 201 - chr5:166918770-166918964 NA NA NA NA NA chr5-700 166891691 166891937 177 - chr5:166891785-166891893 NA NA NA NA NA chr5-699 166623591 166624022 176 - chr5:166623894-166623911 NA NA NA NA NA chr5-698 166583076 166583488 343 - chr5:166583127-166583447 NA NA NA NA NA chr5-697 165923122 165923323 132 - chr5:165923151-165923260 NA NA NA NA NA chr5-696 165783307 165783721 183 - chr5:165783535-165783587 NA NA NA NA NA chr5-695 165617908 165618065 126 - chr5:165617940-165618035 NA NA NA NA NA chr5-694 165578426 165578674 164 - chr5:165578624-165578628 NA NA NA NA NA chr5-693 165162679 165162944 210 - chr5:165162706-165162861 NA NA NA NA NA chr5-692 164375583 164375785 135 - chr5:164375602-164375702 NA NA NA NA NA chr5-691 164206863 164207334 260 - chr5:164206875-164206924 NA NA NA NA NA chr5-690 163761109 163761486 209 - chr5:163761265-163761388 NA NA NA NA NA chr5-689 163362180 163362464 243 - chr5:163362188-163362412 NA NA NA NA NA chr5-688 163093955 163094300 217 - chr5:163094047-163094136 NA NA NA NA NA chr5-92 16217647 16217860 128 - chr5:16217712-16217715 NA NA NA NA NA chr5-687 162162765 162163237 381 - chr5:162162812-162163102 NA NA NA NA NA chr5-686 162096114 162096872 463 - chr5:162096299-162096817 NA NA NA NA NA chr5-685 161634067 161634344 141 - chr5:161634163-161634168 NA NA NA NA NA chr5-684 161440795 161441240 167 - chr5:161440851-161440888 NA NA NA NA NA chr5-683 160437765 160438032 137 - chr5:160437835-160437842 NA NA NA NA NA chr5-682 160263207 160263484 150 - chr5:160263262-160263285 NA NA NA NA NA chr5-681 160030746 160031354 310 - chr5:160031125-160031137 NA NA NA NA NA chr5-680 159645750 159646002 181 - chr5:159645780-159645890 NA NA NA NA NA chr5-679 159447824 159448141 203 - chr5:159448036-159448125 NA NA NA NA NA chr5-678 159186716 159187006 157 - chr5:159186898-159186922 NA NA NA NA NA chr5-677 159107099 159107337 118 - chr5:159107156-159107196 NA NA NA NA NA chr5-676 158993912 158994330 220 - chr5:158994119-158994205 NA NA NA NA NA chr5-675 158841276 158841486 150 - chr5:158841322-158841412 NA NA NA NA NA chr5-91 15858830 15859013 134 - chr5:15858881-15858906 NA NA NA NA NA chr5-674 158276418 158276837 217 - chr5:158276638-158276663 NA NA NA NA NA chr5-673 158265699 158265877 148 - chr5:158265699-158265817 NA NA NA NA NA chr5-672 158263340 158263656 216 - chr5:158263448-158263564 NA NA NA NA NA chr5-671 157237596 157237967 249 - chr5:157237599-157237749 NA NA NA NA NA chr5-670 156754742 156754939 175 - chr5:156754777-156754930 NA NA NA NA NA chr5-90 15675340 15675589 234 - chr5:15675376-15675565 NA NA NA NA NA chr5-669 156734491 156734790 173 - chr5:156734623-156734670 NA NA NA NA NA chr5-668 155978358 155978572 181 - chr5:155978386-155978468 NA NA NA NA NA chr5-667 155463242 155463761 338 - chr5:155463627-155463683 NA NA NA NA NA chr5-666 155341901 155342242 196 - chr5:155342144-155342195 NA NA NA NA NA chr5-89 15501376 15501607 138 - chr5:15501437-15501544 NA NA NA NA NA chr5-665 154356299 154356605 199 - chr5:154356400-154356480 NA NA NA NA NA chr5-664 154064358 154064528 122 - chr5:154064376-154064450 NA NA NA NA NA chr5-663 154046594 154046942 158 - chr5:154046640-154046704 NA NA NA NA NA chr5-662 154044325 154044831 330 - chr5:154044543-154044697 NA NA NA NA NA chr5-661 153750248 153750449 119 - chr5:153750297-153750356 NA NA NA NA NA chr5-660 153134252 153134658 217 - chr5:153134417-153134461 NA NA NA NA NA chr5-659 152509455 152509704 169 - chr5:152509560-152509649 NA NA NA NA NA chr5-88 15247116 15247646 273 - chr5:15247274-15247290 NA NA NA NA NA chr5-658 152422128 152422328 113 - chr5:152422167-152422193 NA NA NA NA NA chr5-87 15206863 15207052 147 - chr5:15206933-15207038 NA NA NA NA NA chr5-86 15179521 15179990 213 - chr5:15179844-15179935 NA NA NA NA NA chr5-657 151661676 151662058 144 - chr5:151661982-151662024 NA NA NA NA NA chr5-656 150656088 150656281 125 - chr5:150656100-150656157 NA NA NA NA NA chr5-655 150462057 150462234 119 - chr5:150462061-150462122 NA NA NA NA NA chr5-654 150098747 150099047 145 - chr5:150098830-150098868 NA NA NA NA NA chr5-85 14977339 14977960 336 - chr5:14977652-14977703 NA NA NA NA NA chr5-653 149760513 149760709 133 - chr5:149760622-149760692 NA NA NA NA NA chr5-652 149599777 149600169 245 - chr5:149599900-149599950 NA NA NA NA NA chr5-651 148921609 148922271 287 - chr5:148922000-148922004 NA NA NA NA NA chr5-650 148282316 148282727 211 - chr5:148282492-148282503 NA NA NA NA NA chr5-84 14824842 14825264 212 - chr5:14825054-14825056 NA NA NA NA NA chr5-649 148170525 148170727 135 - chr5:148170615-148170683 NA NA NA NA NA chr5-648 148137402 148137698 188 - chr5:148137602-148137682 NA NA NA NA NA chr5-647 148063521 148063828 165 - chr5:148063759-148063782 NA NA NA NA NA chr5-646 148045786 148046072 253 - chr5:148045813-148046033 NA NA NA NA NA chr5-83 14777495 14777702 193 - chr5:14777535-14777686 NA NA NA NA NA chr5-645 147605249 147605565 212 - chr5:147605438-147605546 NA NA NA NA NA chr5-82 14751678 14751999 165 - chr5:14751703-14751816 NA NA NA NA NA chr5-81 14746983 14747172 126 - chr5:14747046-14747109 NA NA NA NA NA chr5-644 147191137 147191568 150 - chr5:147191214-147191219 NA NA NA NA NA chr5-643 147155674 147156051 177 - chr5:147155893-147155908 NA NA NA NA NA chr5-642 146902008 146902267 173 - chr5:146902091-146902180 NA NA NA NA NA chr5-80 14682801 14683081 142 - chr5:14682982-14682986 NA NA NA NA NA chr5-641 146713435 146713675 156 - chr5:146713593-146713665 NA NA NA NA NA chr5-640 146645939 146646147 126 - chr5:146645986-146646033 NA NA NA NA NA chr5-79 14653241 14653546 237 - chr5:14653513-14653546 NA NA NA NA NA chr5-639 146133303 146133567 165 - chr5:146133469-146133535 NA NA NA NA NA chr5-638 146126912 146127110 121 - chr5:146127030-146127074 NA NA NA NA NA chr5-637 145788366 145788555 166 - chr5:145788430-145788527 NA NA NA NA NA chr5-636 145778920 145779518 337 - chr5:145779225-145779518 NA NA NA NA NA chr5-635 145361694 145361921 155 - chr5:145361766-145361849 NA NA NA NA NA chr5-634 145253133 145253332 163 - chr5:145253229-145253284 NA NA NA NA NA chr5-633 145087636 145087956 230 - chr5:145087752-145087892 NA NA NA NA NA chr5-632 145012023 145012305 248 - chr5:145012072-145012286 NA NA NA NA NA chr5-631 144662527 144662734 191 - chr5:144662531-144662706 NA NA NA NA NA chr5-630 144214754 144214973 126 - chr5:144214881-144214914 NA NA NA NA NA chr5-629 144137291 144137532 151 - chr5:144137335-144137396 NA NA NA NA NA chr5-628 143811912 143812350 225 - chr5:143812086-143812124 NA NA NA NA NA chr5-627 143549839 143550074 157 - chr5:143549916-143549995 NA NA NA NA NA chr5-626 142983411 142983686 185 - chr5:142983481-142983576 NA NA NA NA NA chr5-78 14294143 14294573 272 - chr5:14294307-14294417 NA NA NA NA NA chr5-625 142545815 142546006 160 - chr5:142545934-142546001 NA NA NA NA NA chr5-77 14249825 14250210 296 - chr5:14249960-14250125 NA NA NA NA NA chr5-624 142420202 142420447 158 - chr5:142420366-142420437 NA NA NA NA NA chr5-623 142292006 142292271 164 - chr5:142292008-142292071 NA NA NA NA NA chr5-622 142086401 142086607 176 - chr5:142086460-142086606 NA NA NA NA NA chr5-621 141237011 141237320 232 - chr5:141237088-141237243 NA NA NA NA NA chr5-620 140799141 140799518 262 - chr5:140799244-140799367 NA NA NA NA NA chr5-619 140490444 140490703 131 - chr5:140490493-140490536 NA NA NA NA NA chr5-76 14035418 14035611 127 - chr5:14035514-14035575 NA NA NA NA NA chr5-618 140089601 140089925 248 - chr5:140089715-140089887 NA NA NA NA NA chr5-617 139037114 139037325 131 - chr5:139037241-139037292 NA NA NA NA NA chr5-616 138845394 138845739 251 - chr5:138845581-138845676 NA NA NA NA NA chr5-75 13836612 13836783 128 - chr5:13836709-13836758 NA NA NA NA NA chr5-615 137336063 137336293 174 - chr5:137336132-137336276 NA NA NA NA NA chr5-614 136778534 136778699 122 - chr5:136778620-136778699 NA NA NA NA NA chr5-613 135751770 135752060 164 - chr5:135751845-135751883 NA NA NA NA NA chr5-612 135681503 135681911 229 - chr5:135681603-135681653 NA NA NA NA NA chr5-74 13550876 13551258 169 - chr5:13551136-13551186 NA NA NA NA NA chr5-611 135447198 135447390 130 - chr5:135447231-135447299 NA NA NA NA NA chr5-610 135159032 135159239 193 - chr5:135159036-135159215 NA NA NA NA NA chr5-609 134536937 134537237 193 - chr5:134536964-134537074 NA NA NA NA NA chr5-608 133693304 133693475 137 - chr5:133693362-133693465 NA NA NA NA NA chr5-607 133487695 133488093 218 - chr5:133487722-133487880 NA NA NA NA NA chr5-606 133450294 133450579 203 - chr5:133450392-133450513 NA NA NA NA NA chr5-605 133361414 133361797 218 - chr5:133361625-133361678 NA NA NA NA NA chr5-604 133351213 133351678 268 - chr5:133351341-133351412 NA NA NA NA NA chr5-603 133212763 133213010 165 - chr5:133212826-133212909 NA NA NA NA NA chr5-602 133199935 133200232 179 - chr5:133200028-133200101 NA NA NA NA NA chr5-601 132946077 132946243 119 - chr5:132946132-132946204 NA NA NA NA NA chr5-600 132741428 132741833 239 - chr5:132741666-132741691 NA NA NA NA NA chr5-73 13235923 13236141 122 - chr5:13235953-13236023 NA NA NA NA NA chr5-599 131994699 131994881 164 - chr5:131994724-131994870 NA NA NA NA NA chr5-598 131800876 131801122 176 - chr5:131801010-131801116 NA NA NA NA NA chr5-597 131743316 131743477 138 - chr5:131743347-131743462 NA NA NA NA NA chr5-72 13161130 13161474 260 - chr5:13161244-13161400 NA NA NA NA NA chr5-71 13136268 13136567 192 - chr5:13136392-13136511 NA NA NA NA NA chr5-596 131296400 131296696 155 - chr5:131296574-131296588 NA NA NA NA NA chr5-595 131156564 131156851 182 - chr5:131156651-131156728 NA NA NA NA NA chr5-70 13106984 13107255 184 - chr5:13107038-13107193 NA NA NA NA NA chr5-69 13093930 13094155 174 - chr5:13093953-13094020 NA NA NA NA NA chr5-594 130681919 130682153 127 - chr5:130682026-130682046 NA NA NA NA NA chr5-593 130126427 130126637 132 - chr5:130126508-130126562 NA NA NA NA NA chr5-68 13000624 13000795 136 - chr5:13000648-13000749 NA NA NA NA NA chr5-592 129982113 129982436 192 - chr5:129982351-129982412 NA NA NA NA NA chr5-591 129544808 129545371 304 - chr5:129545092-129545137 NA NA NA NA NA chr5-590 129454895 129455279 243 - chr5:129454967-129455060 NA NA NA NA NA chr5-589 129396358 129396534 120 - chr5:129396392-129396456 NA NA NA NA NA chr5-588 129339611 129339998 150 - chr5:129339780-129339851 NA NA NA NA NA chr5-587 128991804 128992150 261 - chr5:128991955-128992087 NA NA NA NA NA chr5-586 128623940 128624272 146 - chr5:128624172-128624256 NA NA NA NA NA chr5-67 12849530 12849740 130 - chr5:12849573-12849623 NA NA NA NA NA chr5-585 127501119 127501663 320 - chr5:127501415-127501463 NA NA NA NA NA chr5-584 127280196 127280353 143 - chr5:127280211-127280312 NA NA NA NA NA chr5-583 127258819 127259053 140 - chr5:127258968-127259014 NA NA NA NA NA chr5-582 127236181 127236444 119 - chr5:127236368-127236429 NA NA NA NA NA chr5-581 126923157 126923596 244 - chr5:126923275-126923324 NA NA NA NA NA chr5-580 126766934 126767364 238 - chr5:126767026-126767072 NA NA NA NA NA chr5-579 125894185 125894513 135 - chr5:125894264-125894282 NA NA NA NA NA chr5-578 125116795 125117191 186 - chr5:125116876-125116938 NA NA NA NA NA chr5-577 124791766 124792048 154 - chr5:124791846-124791866 NA NA NA NA NA chr5-576 124601610 124601894 188 - chr5:124601646-124601738 NA NA NA NA NA chr5-575 124472012 124472297 236 - chr5:124472044-124472197 NA NA NA NA NA chr5-574 124458127 124458406 178 - chr5:124458234-124458307 NA NA NA NA NA chr5-573 124177034 124177440 281 - chr5:124177321-124177436 NA NA NA NA NA chr5-572 123854603 123854912 193 - chr5:123854729-123854826 NA NA NA NA NA chr5-571 123841410 123841662 201 - chr5:123841419-123841597 NA NA NA NA NA chr5-570 123836258 123836628 197 - chr5:123836431-123836455 NA NA NA NA NA chr5-569 123475010 123475304 200 - chr5:123475153-123475259 NA NA NA NA NA chr5-568 123073108 123073315 140 - chr5:123073169-123073242 NA NA NA NA NA chr5-567 122988298 122988766 267 - chr5:122988513-122988642 NA NA NA NA NA chr5-566 122214039 122214395 148 - chr5:122214293-122214325 NA NA NA NA NA chr5-565 122191044 122191394 198 - chr5:122191202-122191244 NA NA NA NA NA chr5-564 122124212 122124485 152 - chr5:122124343-122124394 NA NA NA NA NA chr5-563 122103426 122103649 179 - chr5:122103463-122103598 NA NA NA NA NA chr5-562 122054741 122054958 137 - chr5:122054840-122054897 NA NA NA NA NA chr5-561 121520373 121520742 236 - chr5:121520406-121520509 NA NA NA NA NA chr5-560 121361488 121361726 138 - chr5:121361636-121361642 NA NA NA NA NA chr5-559 121130322 121130557 118 - chr5:121130486-121130487 NA NA NA NA NA chr5-66 12112288 12112603 166 - chr5:12112433-12112442 NA NA NA NA NA chr5-558 121017356 121017600 216 - chr5:121017357-121017491 NA NA NA NA NA chr5-557 120789152 120789511 181 - chr5:120789330-120789333 NA NA NA NA NA chr5-556 120364933 120365260 148 - chr5:120364971-120365034 NA NA NA NA NA chr5-555 120009974 120010345 242 - chr5:120010034-120010193 NA NA NA NA NA chr5-554 119612462 119612813 233 - chr5:119612570-119612685 NA NA NA NA NA chr5-65 11956000 11956182 130 - chr5:11956067-11956145 NA NA NA NA NA chr5-553 119491820 119492122 176 - chr5:119491964-119492014 NA NA NA NA NA chr5-64 11935307 11935689 225 - chr5:11935449-11935527 NA NA NA NA NA chr5-552 119276797 119276978 127 - chr5:119276856-119276965 NA NA NA NA NA chr5-551 119225585 119225919 178 - chr5:119225708-119225752 NA NA NA NA NA chr5-550 118908193 118908592 181 - chr5:118908453-118908473 NA NA NA NA NA chr5-549 118869555 118869898 252 - chr5:118869742-118869839 NA NA NA NA NA chr5-63 11852511 11852715 149 - chr5:11852513-11852607 NA NA NA NA NA chr5-548 118327448 118327729 149 - chr5:118327560-118327577 NA NA NA NA NA chr5-547 118148137 118148315 127 - chr5:118148234-118148310 NA NA NA NA NA chr5-62 11808765 11809116 127 - chr5:11809045-11809098 NA NA NA NA NA chr5-546 117674769 117674925 119 - chr5:117674821-117674890 NA NA NA NA NA chr5-545 117614064 117614391 207 - chr5:117614132-117614219 NA NA NA NA NA chr5-544 117041571 117041794 134 - chr5:117041618-117041691 NA NA NA NA NA chr5-543 116892863 116893299 266 - chr5:116893122-116893218 NA NA NA NA NA chr5-61 11639082 11639338 135 - chr5:11639148-11639162 NA NA NA NA NA chr5-542 116043426 116043832 238 - chr5:116043581-116043651 NA NA NA NA NA chr5-60 11598033 11598550 270 - chr5:11598211-11598280 NA NA NA NA NA chr5-541 115853059 115853478 160 - chr5:115853294-115853320 NA NA NA NA NA chr5-59 11527191 11527650 210 - chr5:11527208-11527335 NA NA NA NA NA chr5-540 114926413 114926659 195 - chr5:114926450-114926594 NA NA NA NA NA chr5-539 114118754 114119243 245 - chr5:114119009-114119010 NA NA NA NA NA chr5-538 114089926 114090270 212 - chr5:114090175-114090255 NA NA NA NA NA chr5-537 114053185 114053690 338 - chr5:114053482-114053666 NA NA NA NA NA chr5-536 113769740 113770075 226 - chr5:113769753-113769870 NA NA NA NA NA chr5-535 113576504 113576773 139 - chr5:113576545-113576554 NA NA NA NA NA chr5-534 113540756 113541049 183 - chr5:113540917-113540956 NA NA NA NA NA chr5-533 113450744 113451010 165 - chr5:113450822-113450840 NA NA NA NA NA chr5-58 11328738 11328986 175 - chr5:11328787-11328889 NA NA NA NA NA chr5-532 113209865 113210161 129 - chr5:113209865-113209927 NA NA NA NA NA chr5-531 113188441 113188620 122 - chr5:113188484-113188549 NA NA NA NA NA chr5-530 113144735 113145398 301 - chr5:113145031-113145220 NA NA NA NA NA chr5-529 113067051 113067311 152 - chr5:113067180-113067224 NA NA NA NA NA chr5-528 112899612 112899826 156 - chr5:112899666-112899785 NA NA NA NA NA chr5-527 112707051 112707327 160 - chr5:112707135-112707179 NA NA NA NA NA chr5-526 112476688 112476991 135 - chr5:112476884-112476963 NA NA NA NA NA chr5-525 112471972 112472319 235 - chr5:112472099-112472252 NA NA NA NA NA chr5-524 111756972 111757216 191 - chr5:111757049-111757171 NA NA NA NA NA chr5-523 111478284 111478582 226 - chr5:111478290-111478492 NA NA NA NA NA chr5-522 111317809 111318304 315 - chr5:111318039-111318174 NA NA NA NA NA chr5-57 11100213 11100623 240 - chr5:11100534-11100614 NA NA NA NA NA chr5-521 110943859 110944310 255 - chr5:110944034-110944107 NA NA NA NA NA chr5-520 110852898 110853423 315 - chr5:110852950-110853345 NA NA NA NA NA chr5-519 110664374 110664983 299 - chr5:110664621-110664635 NA NA NA NA NA chr5-518 110661981 110662178 132 - chr5:110662063-110662130 NA NA NA NA NA chr5-517 110466031 110466297 161 - chr5:110466108-110466234 NA NA NA NA NA chr5-516 110465542 110465831 151 - chr5:110465743-110465756 NA NA NA NA NA chr5-515 109936789 109937269 223 - chr5:109936959-109936982 NA NA NA NA NA chr5-514 109898808 109899429 281 - chr5:109899181-109899260 NA NA NA NA NA chr5-513 109810262 109810554 199 - chr5:109810385-109810553 NA NA NA NA NA chr5-512 109496621 109497134 314 - chr5:109496886-109496968 NA NA NA NA NA chr5-511 109325852 109325994 123 - chr5:109325916-109325982 NA NA NA NA NA chr5-510 109221918 109222298 176 - chr5:109222107-109222215 NA NA NA NA NA chr5-509 109178902 109179378 350 - chr5:109178953-109179177 NA NA NA NA NA chr5-56 10915131 10915466 216 - chr5:10915325-10915422 NA NA NA NA NA chr5-508 109107045 109107393 260 - chr5:109107079-109107251 NA NA NA NA NA chr5-507 108844548 108844993 163 - chr5:108844584-108844629 NA NA NA NA NA chr5-506 108724518 108725019 263 - chr5:108724777-108724802 NA NA NA NA NA chr5-505 108705765 108705993 149 - chr5:108705885-108705955 NA NA NA NA NA chr5-504 108420780 108421020 135 - chr5:108420833-108420933 NA NA NA NA NA chr5-503 108377129 108377357 138 - chr5:108377229-108377337 NA NA NA NA NA chr5-55 10815216 10815562 208 - chr5:10815347-10815403 NA NA NA NA NA chr5-502 107277744 107278020 138 - chr5:107277848-107277940 NA NA NA NA NA chr5-501 107203280 107203502 137 - chr5:107203393-107203501 NA NA NA NA NA chr5-500 107149077 107149320 135 - chr5:107149167-107149266 NA NA NA NA NA chr5-54 10692674 10692810 117 - chr5:10692694-10692807 NA NA NA NA NA chr5-499 106805196 106805580 212 - chr5:106805387-106805427 NA NA NA NA NA chr5-498 106709937 106710104 132 - chr5:106709974-106710071 NA NA NA NA NA chr5-497 106671495 106671623 113 - chr5:106671498-106671566 NA NA NA NA NA chr5-53 10624471 10624681 158 - chr5:10624553-10624659 NA NA NA NA NA chr5-496 106109790 106110018 160 - chr5:106109913-106110005 NA NA NA NA NA chr5-495 105922062 105922274 147 - chr5:105922124-105922161 NA NA NA NA NA chr5-494 105847462 105847730 212 - chr5:105847558-105847714 NA NA NA NA NA chr5-493 105543816 105544242 287 - chr5:105543857-105544005 NA NA NA NA NA chr5-492 105474254 105474495 133 - chr5:105474331-105474347 NA NA NA NA NA chr5-491 105411969 105412166 149 - chr5:105412046-105412147 NA NA NA NA NA chr5-490 105266755 105267014 124 - chr5:105266836-105266861 NA NA NA NA NA chr5-489 105213239 105213561 170 - chr5:105213395-105213413 NA NA NA NA NA chr5-488 105083729 105084075 201 - chr5:105083820-105083965 NA NA NA NA NA chr5-487 104643888 104644104 124 - chr5:104643944-104644000 NA NA NA NA NA chr5-486 104603665 104603828 134 - chr5:104603739-104603814 NA NA NA NA NA chr5-52 10427395 10427770 279 - chr5:10427481-10427664 NA NA NA NA NA chr5-485 104184418 104184707 176 - chr5:104184428-104184491 NA NA NA NA NA chr5-484 103929737 103930137 226 - chr5:103930040-103930092 NA NA NA NA NA chr5-483 103874242 103874458 118 - chr5:103874280-103874300 NA NA NA NA NA chr5-482 103332164 103332815 293 - chr5:103332213-103332321 NA NA NA NA NA chr5-51 10330203 10330644 261 - chr5:10330488-10330569 NA NA NA NA NA chr5-481 103288991 103289301 190 - chr5:103289216-103289269 NA NA NA NA NA chr5-50 10309132 10309654 241 - chr5:10309242-10309316 NA NA NA NA NA chr5-480 102850061 102850265 155 - chr5:102850136-102850242 NA NA NA NA NA chr5-479 102521700 102522034 285 - chr5:102521721-102521859 NA NA NA NA NA chr5-478 102477084 102477287 151 - chr5:102477096-102477195 NA NA NA NA NA chr5-477 102279913 102280464 249 - chr5:102280266-102280315 NA NA NA NA NA chr5-476 101989849 101990104 149 - chr5:101989992-101990035 NA NA NA NA NA chr5-475 101974625 101974814 125 - chr5:101974642-101974703 NA NA NA NA NA chr5-474 101599393 101599561 144 - chr5:101599470-101599542 NA NA NA NA NA chr5-49 10155356 10155682 192 - chr5:10155547-10155605 NA NA NA NA NA chr5-473 101469543 101469884 228 - chr5:101469728-101469843 NA NA NA NA NA chr5-472 101431646 101431856 150 - chr5:101431763-101431815 NA NA NA NA NA chr5-471 101159884 101160220 222 - chr5:101159936-101160044 NA NA NA NA NA chr5-470 100742793 100743004 167 - chr5:100742873-100742996 NA NA NA NA NA chr5-48 10017769 10018206 178 - chr5:10017832-10017869 NA NA NA NA NA chr4-418 99908866 99909344 261 - chr4:99908994-99909038 NA NA NA NA NA chr4-417 99409283 99409557 221 - chr4:99409456-99409518 NA NA NA NA NA chr4-13 9928151 9928357 169 - chr4:9928299-9928357 NA NA NA NA NA chr4-416 99248322 99248547 194 - chr4:99248336-99248499 NA NA NA NA NA chr4-415 98530901 98531059 144 - chr4:98530937-98531039 NA NA NA NA NA chr4-12 9838931 9839192 216 - chr4:9839018-9839189 NA NA NA NA NA chr4-414 97840472 97840751 235 - chr4:97840598-97840701 NA NA NA NA NA chr4-413 97813876 97814169 185 - chr4:97813894-97813971 NA NA NA NA NA chr4-412 97792032 97792402 221 - chr4:97792145-97792217 NA NA NA NA NA chr4-411 97681413 97681695 183 - chr4:97681611-97681695 NA NA NA NA NA chr4-410 97665591 97665969 224 - chr4:97665787-97665941 NA NA NA NA NA chr4-409 97275780 97276072 227 - chr4:97275905-97276067 NA NA NA NA NA chr4-408 97165269 97165870 301 - chr4:97165591-97165592 NA NA NA NA NA chr4-407 96994873 96995175 187 - chr4:96994999-96995093 NA NA NA NA NA chr4-406 96976406 96976699 168 - chr4:96976598-96976641 NA NA NA NA NA chr4-405 96529864 96530107 129 - chr4:96529918-96529973 NA NA NA NA NA chr4-404 96408319 96408460 117 - chr4:96408344-96408437 NA NA NA NA NA chr4-403 96137940 96138089 129 - chr4:96137957-96138060 NA NA NA NA NA chr4-402 94938037 94938275 175 - chr4:94938089-94938201 NA NA NA NA NA chr4-401 94769750 94770081 213 - chr4:94769882-94769977 NA NA NA NA NA chr4-400 94514492 94514717 170 - chr4:94514535-94514626 NA NA NA NA NA chr4-399 94203109 94203595 240 - chr4:94203350-94203508 NA NA NA NA NA chr4-398 93492776 93492965 141 - chr4:93492825-93492920 NA NA NA NA NA chr4-397 93462170 93462603 172 - chr4:93462493-93462578 NA NA NA NA NA chr4-396 93028472 93028905 229 - chr4:93028484-93028637 NA NA NA NA NA chr4-395 92948233 92948484 163 - chr4:92948377-92948452 NA NA NA NA NA chr4-394 92708796 92709141 181 - chr4:92708932-92708949 NA NA NA NA NA chr4-393 92659493 92660008 237 - chr4:92659852-92659973 NA NA NA NA NA chr4-392 92610478 92610901 255 - chr4:92610725-92610812 NA NA NA NA NA chr4-391 92326071 92326345 172 - chr4:92326231-92326301 NA NA NA NA NA chr4-390 92133902 92134287 316 - chr4:92134043-92134242 NA NA NA NA NA chr4-389 91266594 91267067 364 - chr4:91266725-91266980 NA NA NA NA NA chr4-3 908070 908385 176 - chr4:908175-908212 NA NA NA NA NA chr4-388 90752499 90752682 116 - chr4:90752565-90752614 NA NA NA NA NA chr4-387 90573613 90574127 288 - chr4:90573870-90573998 NA NA NA NA NA chr4-386 90305424 90305646 114 - chr4:90305526-90305536 NA NA NA NA NA chr4-385 90040802 90040982 134 - chr4:90040828-90040876 NA NA NA NA NA chr4-384 89894333 89894508 151 - chr4:89894417-89894496 NA NA NA NA NA chr4-383 89760235 89760726 302 - chr4:89760625-89760677 NA NA NA NA NA chr4-382 89381488 89382063 309 - chr4:89381638-89381733 NA NA NA NA NA chr4-381 89008530 89008905 210 - chr4:89008644-89008689 NA NA NA NA NA chr4-380 88683370 88683666 197 - chr4:88683417-88683515 NA NA NA NA NA chr4-379 88680939 88681102 115 - chr4:88680998-88681065 NA NA NA NA NA chr4-378 88529795 88530293 257 - chr4:88529898-88529914 NA NA NA NA NA chr4-377 88490470 88490849 177 - chr4:88490490-88490539 NA NA NA NA NA chr4-376 88413105 88413660 273 - chr4:88413418-88413471 NA NA NA NA NA chr4-375 88393852 88394290 245 - chr4:88393994-88394080 NA NA NA NA NA chr4-374 88209056 88209292 167 - chr4:88209113-88209187 NA NA NA NA NA chr4-373 87954963 87955232 189 - chr4:87955187-87955200 NA NA NA NA NA chr4-372 87926560 87926865 156 - chr4:87926573-87926670 NA NA NA NA NA chr4-371 87897950 87898288 218 - chr4:87897986-87898167 NA NA NA NA NA chr4-370 87835537 87835996 241 - chr4:87835701-87835760 NA NA NA NA NA chr4-369 87025542 87025923 190 - chr4:87025773-87025852 NA NA NA NA NA chr4-368 86859609 86859848 143 - chr4:86859662-86859709 NA NA NA NA NA chr4-367 86616241 86616488 211 - chr4:86616247-86616422 NA NA NA NA NA chr4-366 86496914 86497276 190 - chr4:86497149-86497167 NA NA NA NA NA chr4-365 86314698 86315207 268 - chr4:86314753-86314904 NA NA NA NA NA chr4-364 86101530 86101779 147 - chr4:86101531-86101576 NA NA NA NA NA chr4-363 85989478 85989995 176 - chr4:85989922-85989963 NA NA NA NA NA chr4-362 85671545 85671775 134 - chr4:85671567-85671669 NA NA NA NA NA chr4-361 85106266 85106529 151 - chr4:85106342-85106381 NA NA NA NA NA chr4-360 84681248 84681468 139 - chr4:84681287-84681345 NA NA NA NA NA chr4-359 84307773 84308031 194 - chr4:84307819-84307949 NA NA NA NA NA chr4-358 84223575 84223885 169 - chr4:84223593-84223703 NA NA NA NA NA chr4-357 83360074 83360666 352 - chr4:83360266-83360282 NA NA NA NA NA chr4-356 82751298 82751525 165 - chr4:82751399-82751476 NA NA NA NA NA chr4-355 82612483 82612663 172 - chr4:82612497-82612657 NA NA NA NA NA chr4-354 82341245 82341521 207 - chr4:82341297-82341401 NA NA NA NA NA chr4-353 81938086 81938446 245 - chr4:81938300-81938364 NA NA NA NA NA chr4-352 81901056 81901263 135 - chr4:81901140-81901203 NA NA NA NA NA chr4-351 81127345 81127613 170 - chr4:81127365-81127489 NA NA NA NA NA chr4-350 81120793 81121052 132 - chr4:81120946-81120951 NA NA NA NA NA chr4-349 80821449 80821708 185 - chr4:80821529-80821636 NA NA NA NA NA chr4-348 80585669 80586007 238 - chr4:80585819-80585957 NA NA NA NA NA chr4-347 80559087 80559349 163 - chr4:80559230-80559294 NA NA NA NA NA chr4-11 8053448 8053642 140 - chr4:8053461-8053547 NA NA NA NA NA chr4-346 80306697 80306939 207 - chr4:80306767-80306939 NA NA NA NA NA chr4-345 80299772 80300175 296 - chr4:80299867-80300064 NA NA NA NA NA chr4-344 79664545 79664819 139 - chr4:79664623-79664665 NA NA NA NA NA chr4-343 79548064 79548365 164 - chr4:79548203-79548234 NA NA NA NA NA chr4-342 79422464 79422834 163 - chr4:79422664-79422758 NA NA NA NA NA chr4-2 791485 791818 136 - chr4:791716-791723 NA NA NA NA NA chr4-341 78951915 78952225 202 - chr4:78951995-78952033 NA NA NA NA NA chr4-340 78760921 78761188 177 - chr4:78761017-78761104 NA NA NA NA NA chr4-339 78742407 78742784 236 - chr4:78742446-78742533 NA NA NA NA NA chr4-338 78478806 78479163 195 - chr4:78478863-78478882 NA NA NA NA NA chr4-337 78375928 78376465 259 - chr4:78375992-78376021 NA NA NA NA NA chr4-336 78332600 78332831 179 - chr4:78332662-78332789 NA NA NA NA NA chr4-335 78285156 78285343 127 - chr4:78285177-78285270 NA NA NA NA NA chr4-334 78265861 78266320 213 - chr4:78266195-78266315 NA NA NA NA NA chr4-333 77678807 77678991 138 - chr4:77678841-77678941 NA NA NA NA NA chr4-332 77619889 77620058 124 - chr4:77619930-77620009 NA NA NA NA NA chr4-331 76987341 76987499 122 - chr4:76987384-76987470 NA NA NA NA NA chr4-330 76962856 76963136 187 - chr4:76962985-76963079 NA NA NA NA NA chr4-329 76961187 76961397 161 - chr4:76961271-76961383 NA NA NA NA NA chr4-328 76701766 76702071 191 - chr4:76701890-76701967 NA NA NA NA NA chr4-327 76617677 76617905 119 - chr4:76617763-76617768 NA NA NA NA NA chr4-326 76436596 76436931 181 - chr4:76436690-76436717 NA NA NA NA NA chr4-325 76064499 76064762 170 - chr4:76064603-76064702 NA NA NA NA NA chr4-324 75964398 75964574 123 - chr4:75964491-75964561 NA NA NA NA NA chr4-323 75835548 75835806 145 - chr4:75835764-75835796 NA NA NA NA NA chr4-322 75566281 75566459 146 - chr4:75566294-75566408 NA NA NA NA NA chr4-321 75494557 75494974 200 - chr4:75494714-75494737 NA NA NA NA NA chr4-320 75454279 75454465 118 - chr4:75454296-75454380 NA NA NA NA NA chr4-319 75308249 75308507 162 - chr4:75308268-75308398 NA NA NA NA NA chr4-318 75061042 75061294 143 - chr4:75061137-75061171 NA NA NA NA NA chr4-317 74922644 74922819 161 - chr4:74922652-74922787 NA NA NA NA NA chr4-316 74541117 74541379 181 - chr4:74541189-74541343 NA NA NA NA NA chr4-315 74297791 74298042 219 - chr4:74297832-74298019 NA NA NA NA NA chr4-314 74016241 74016545 228 - chr4:74016248-74016400 NA NA NA NA NA chr4-313 73970491 73970720 202 - chr4:73970507-73970682 NA NA NA NA NA chr4-312 73956009 73956288 150 - chr4:73956175-73956270 NA NA NA NA NA chr4-311 73200196 73200586 155 - chr4:73200230-73200284 NA NA NA NA NA chr4-310 73176246 73176631 303 - chr4:73176550-73176623 NA NA NA NA NA chr4-309 73128601 73128838 134 - chr4:73128725-73128756 NA NA NA NA NA chr4-308 72996078 72996354 149 - chr4:72996190-72996222 NA NA NA NA NA chr4-307 72673824 72673962 122 - chr4:72673832-72673938 NA NA NA NA NA chr4-306 72650917 72651114 115 - chr4:72651017-72651086 NA NA NA NA NA chr4-305 72471077 72471270 114 - chr4:72471122-72471157 NA NA NA NA NA chr4-304 72170092 72170349 147 - chr4:72170262-72170299 NA NA NA NA NA chr4-303 72162387 72162698 204 - chr4:72162510-72162639 NA NA NA NA NA chr4-302 72112598 72112960 226 - chr4:72112677-72112918 NA NA NA NA NA chr4-301 72091239 72091598 188 - chr4:72091371-72091414 NA NA NA NA NA chr4-300 71909462 71909731 212 - chr4:71909575-71909730 NA NA NA NA NA chr4-299 71735547 71735788 167 - chr4:71735570-71735663 NA NA NA NA NA chr4-298 71334955 71335159 160 - chr4:71335005-71335117 NA NA NA NA NA chr4-297 71093873 71094158 195 - chr4:71093938-71094134 NA NA NA NA NA chr4-296 70961534 70961926 198 - chr4:70961729-70961735 NA NA NA NA NA chr4-295 70758271 70758484 150 - chr4:70758349-70758466 NA NA NA NA NA chr4-294 70101991 70102288 252 - chr4:70102060-70102267 NA NA NA NA NA chr4-293 69959854 69960061 169 - chr4:69959921-69959976 NA NA NA NA NA chr4-292 69574741 69575085 215 - chr4:69574793-69574879 NA NA NA NA NA chr4-291 69546318 69546531 152 - chr4:69546475-69546502 NA NA NA NA NA chr4-10 6823557 6824081 296 - chr4:6823801-6823869 NA NA NA NA NA chr4-290 67976960 67977225 231 - chr4:67977007-67977204 NA NA NA NA NA chr4-289 67745503 67745804 154 - chr4:67745567-67745672 NA NA NA NA NA chr4-288 67546215 67546710 258 - chr4:67546543-67546564 NA NA NA NA NA chr4-9 6747416 6747572 136 - chr4:6747433-6747551 NA NA NA NA NA chr4-287 67430926 67431145 114 - chr4:67431031-67431040 NA NA NA NA NA chr4-286 67203681 67204140 329 - chr4:67203749-67204051 NA NA NA NA NA chr4-285 67169054 67169257 168 - chr4:67169064-67169147 NA NA NA NA NA chr4-284 67005944 67006305 248 - chr4:67006099-67006234 NA NA NA NA NA chr4-283 66891981 66892335 182 - chr4:66892156-66892164 NA NA NA NA NA chr4-282 66768527 66768861 258 - chr4:66768563-66768745 NA NA NA NA NA chr4-281 66765799 66766156 228 - chr4:66765820-66765991 NA NA NA NA NA chr4-280 66687300 66687870 279 - chr4:66687650-66687756 NA NA NA NA NA chr4-279 66593479 66593656 174 - chr4:66593479-66593652 NA NA NA NA NA chr4-278 66508411 66508817 312 - chr4:66508577-66508795 NA NA NA NA NA chr4-277 66430483 66430887 202 - chr4:66430652-66430674 NA NA NA NA NA chr4-276 66357481 66357903 275 - chr4:66357771-66357899 NA NA NA NA NA chr4-275 66354733 66355196 229 - chr4:66354991-66355034 NA NA NA NA NA chr4-274 66197517 66197978 243 - chr4:66197789-66197814 NA NA NA NA NA chr4-273 65821997 65822246 204 - chr4:65822144-65822235 NA NA NA NA NA chr4-272 65738048 65738392 218 - chr4:65738048-65738140 NA NA NA NA NA chr4-271 65578066 65578234 163 - chr4:65578074-65578230 NA NA NA NA NA chr4-270 65474015 65474654 353 - chr4:65474332-65474353 NA NA NA NA NA chr4-269 65362043 65362212 153 - chr4:65362064-65362201 NA NA NA NA NA chr4-268 65335009 65335461 403 - chr4:65335068-65335425 NA NA NA NA NA chr4-267 65329078 65329395 177 - chr4:65329174-65329211 NA NA NA NA NA chr4-266 65167111 65167534 228 - chr4:65167288-65167333 NA NA NA NA NA chr4-265 65165079 65165447 261 - chr4:65165185-65165445 NA NA NA NA NA chr4-264 65112606 65112799 141 - chr4:65112658-65112747 NA NA NA NA NA chr4-263 64856943 64857227 158 - chr4:64857062-64857094 NA NA NA NA NA chr4-262 64209551 64209824 202 - chr4:64209662-64209793 NA NA NA NA NA chr4-261 64131322 64131615 222 - chr4:64131328-64131479 NA NA NA NA NA chr4-260 64080047 64080250 164 - chr4:64080074-64080199 NA NA NA NA NA chr4-259 63961098 63961359 156 - chr4:63961117-63961168 NA NA NA NA NA chr4-258 63881214 63881451 205 - chr4:63881244-63881417 NA NA NA NA NA chr4-257 63827375 63827643 162 - chr4:63827484-63827538 NA NA NA NA NA chr4-256 63711930 63712064 119 - chr4:63711954-63712058 NA NA NA NA NA chr4-8 6343430 6343793 347 - chr4:6343485-6343790 NA NA NA NA NA chr4-255 62770666 62771097 221 - chr4:62770922-62770957 NA NA NA NA NA chr4-254 62617548 62617851 177 - chr4:62617690-62617741 NA NA NA NA NA chr4-253 62466244 62466446 132 - chr4:62466308-62466374 NA NA NA NA NA chr4-252 62299761 62299998 194 - chr4:62299808-62299873 NA NA NA NA NA chr4-251 62096938 62097253 168 - chr4:62097157-62097222 NA NA NA NA NA chr4-250 62015845 62016226 165 - chr4:62015947-62016040 NA NA NA NA NA chr4-249 61912346 61912509 140 - chr4:61912368-61912485 NA NA NA NA NA chr4-248 61612388 61612541 127 - chr4:61612484-61612533 NA NA NA NA NA chr4-247 61601640 61601824 130 - chr4:61601655-61601767 NA NA NA NA NA chr4-246 61511040 61511562 284 - chr4:61511394-61511458 NA NA NA NA NA chr4-245 61324652 61324922 132 - chr4:61324753-61324839 NA NA NA NA NA chr4-244 60720550 60720796 172 - chr4:60720586-60720674 NA NA NA NA NA chr4-243 60530647 60530923 172 - chr4:60530745-60530813 NA NA NA NA NA chr4-242 60474939 60475131 138 - chr4:60475006-60475090 NA NA NA NA NA chr4-241 60203124 60203457 188 - chr4:60203296-60203339 NA NA NA NA NA chr4-240 60077386 60077656 191 - chr4:60077409-60077521 NA NA NA NA NA chr4-239 59954982 59955173 117 - chr4:59955053-59955090 NA NA NA NA NA chr4-238 59953770 59954139 150 - chr4:59953812-59953861 NA NA NA NA NA chr4-237 59922594 59923002 273 - chr4:59922674-59922812 NA NA NA NA NA chr4-236 59808268 59808528 186 - chr4:59808375-59808465 NA NA NA NA NA chr4-235 59731479 59731684 180 - chr4:59731513-59731668 NA NA NA NA NA chr4-234 59692951 59693192 216 - chr4:59693039-59693188 NA NA NA NA NA chr4-233 59691851 59692322 358 - chr4:59691935-59692241 NA NA NA NA NA chr4-232 59365547 59365896 119 - chr4:59365833-59365834 NA NA NA NA NA chr4-231 59300429 59300757 186 - chr4:59300539-59300583 NA NA NA NA NA chr4-230 59226234 59226476 155 - chr4:59226348-59226416 NA NA NA NA NA chr4-229 59220490 59220731 156 - chr4:59220589-59220660 NA NA NA NA NA chr4-228 58936935 58937192 128 - chr4:58937015-58937100 NA NA NA NA NA chr4-227 58692337 58692727 215 - chr4:58692533-58692559 NA NA NA NA NA chr4-226 58518037 58518262 132 - chr4:58518139-58518240 NA NA NA NA NA chr4-225 58315526 58315805 179 - chr4:58315696-58315793 NA NA NA NA NA chr4-224 58249808 58250111 193 - chr4:58249976-58250059 NA NA NA NA NA chr4-223 58242002 58242377 303 - chr4:58242025-58242256 NA NA NA NA NA chr4-222 57699687 57699876 113 - chr4:57699753-57699770 NA NA NA NA NA chr4-221 57593350 57593696 190 - chr4:57593502-57593536 NA NA NA NA NA chr4-220 57466812 57467476 394 - chr4:57467077-57467201 NA NA NA NA NA chr4-219 57377339 57377539 126 - chr4:57377359-57377411 NA NA NA NA NA chr4-218 57348101 57348342 165 - chr4:57348132-57348221 NA NA NA NA NA chr4-217 57330171 57330314 138 - chr4:57330185-57330312 NA NA NA NA NA chr4-216 57129210 57129391 162 - chr4:57129220-57129345 NA NA NA NA NA chr4-215 56956098 56956394 209 - chr4:56956216-56956338 NA NA NA NA NA chr4-214 56622336 56622929 399 - chr4:56622536-56622737 NA NA NA NA NA chr4-213 56103292 56103619 164 - chr4:56103362-56103363 NA NA NA NA NA chr4-212 55918813 55919236 182 - chr4:55918931-55918954 NA NA NA NA NA chr4-211 55600225 55600419 119 - chr4:55600270-55600364 NA NA NA NA NA chr4-210 55494403 55494675 171 - chr4:55494455-55494525 NA NA NA NA NA chr4-209 55470625 55470837 130 - chr4:55470717-55470765 NA NA NA NA NA chr4-208 55461022 55461537 281 - chr4:55461159-55461370 NA NA NA NA NA chr4-207 55404410 55404811 152 - chr4:55404699-55404768 NA NA NA NA NA chr4-206 55185632 55186130 232 - chr4:55185952-55186020 NA NA NA NA NA chr4-205 54958854 54959042 137 - chr4:54958875-54958961 NA NA NA NA NA chr4-204 54897465 54897827 273 - chr4:54897483-54897723 NA NA NA NA NA chr4-203 54718665 54718903 166 - chr4:54718806-54718900 NA NA NA NA NA chr4-202 54700350 54700523 115 - chr4:54700454-54700511 NA NA NA NA NA chr4-201 54541241 54541597 139 - chr4:54541248-54541310 NA NA NA NA NA chr4-200 54005022 54005416 207 - chr4:54005278-54005298 NA NA NA NA NA chr4-7 5389390 5389596 178 - chr4:5389393-5389543 NA NA NA NA NA chr4-199 53628700 53629018 234 - chr4:53628718-53628868 NA NA NA NA NA chr4-198 52922596 52922893 228 - chr4:52922662-52922867 NA NA NA NA NA chr4-197 52593961 52594189 144 - chr4:52594087-52594099 NA NA NA NA NA chr4-6 5251095 5251335 162 - chr4:5251192-5251328 NA NA NA NA NA chr4-196 52483170 52483352 116 - chr4:52483230-52483284 NA NA NA NA NA chr4-195 52401567 52401742 127 - chr4:52401600-52401711 NA NA NA NA NA chr4-194 51863585 51863727 124 - chr4:51863607-51863725 NA NA NA NA NA chr4-193 49092001 49092938 442 - chr4:49092700-49092854 NA NA NA NA NA chr4-192 48978435 48978820 314 - chr4:48978479-48978724 NA NA NA NA NA chr4-191 48891309 48891587 159 - chr4:48891421-48891447 NA NA NA NA NA chr4-190 48814725 48815149 188 - chr4:48815013-48815069 NA NA NA NA NA chr4-189 48645981 48646395 244 - chr4:48646265-48646339 NA NA NA NA NA chr4-188 48633174 48633397 146 - chr4:48633293-48633374 NA NA NA NA NA chr4 479153 479406 147 - chr4:479291-479332 NA NA NA NA NA chr4-187 47894072 47894324 211 - chr4:47894099-47894241 NA NA NA NA NA chr4-186 47744713 47745061 188 - chr4:47744751-47744779 NA NA NA NA NA chr4-185 47741967 47742204 173 - chr4:47742074-47742183 NA NA NA NA NA chr4-184 47566332 47566568 119 - chr4:47566433-47566435 NA NA NA NA NA chr4-183 47307162 47307456 156 - chr4:47307247-47307265 NA NA NA NA NA chr4-182 47266647 47266831 142 - chr4:47266729-47266829 NA NA NA NA NA chr4-181 46818724 46819257 341 - chr4:46818773-46818919 NA NA NA NA NA chr4-180 46706355 46706567 117 - chr4:46706450-46706472 NA NA NA NA NA chr4-179 46623285 46623501 201 - chr4:46623320-46623476 NA NA NA NA NA chr4-178 46274406 46274783 237 - chr4:46274510-46274631 NA NA NA NA NA chr4-177 46173707 46174028 198 - chr4:46173720-46173795 NA NA NA NA NA chr4-176 46079609 46079956 222 - chr4:46079711-46079767 NA NA NA NA NA chr4-175 45974049 45974475 242 - chr4:45974133-45974211 NA NA NA NA NA chr4-174 45966587 45967007 230 - chr4:45966635-45966675 NA NA NA NA NA chr4-173 45952950 45953159 181 - chr4:45952954-45953107 NA NA NA NA NA chr4-172 45858373 45858598 148 - chr4:45858395-45858466 NA NA NA NA NA chr4-171 45777017 45777265 235 - chr4:45777017-45777213 NA NA NA NA NA chr4-170 45515070 45515346 139 - chr4:45515164-45515166 NA NA NA NA NA chr4-169 45468793 45469154 216 - chr4:45468863-45468934 NA NA NA NA NA chr4-168 45362823 45363057 204 - chr4:45362831-45363005 NA NA NA NA NA chr4-167 45240511 45240747 167 - chr4:45240520-45240618 NA NA NA NA NA chr4-5 4515196 4515463 222 - chr4:4515258-4515345 NA NA NA NA NA chr4-166 44898717 44898866 138 - chr4:44898731-44898856 NA NA NA NA NA chr4-165 44769024 44769210 165 - chr4:44769027-44769135 NA NA NA NA NA chr4-164 44613445 44613736 173 - chr4:44613579-44613634 NA NA NA NA NA chr4-163 44446377 44446763 232 - chr4:44446405-44446483 NA NA NA NA NA chr4-162 44441099 44441346 205 - chr4:44441146-44441309 NA NA NA NA NA chr4-161 44282099 44282323 140 - chr4:44282180-44282230 NA NA NA NA NA chr4-160 44246047 44246251 139 - chr4:44246140-44246204 NA NA NA NA NA chr4-159 43989903 43990181 176 - chr4:43990115-43990156 NA NA NA NA NA chr4-158 43912321 43912693 331 - chr4:43912335-43912643 NA NA NA NA NA chr4-157 43621974 43622194 198 - chr4:43622008-43622184 NA NA NA NA NA chr4-156 43552452 43552702 132 - chr4:43552516-43552530 NA NA NA NA NA chr4-155 43496884 43497092 132 - chr4:43496948-43497004 NA NA NA NA NA chr4-154 43399721 43400068 191 - chr4:43399897-43400036 NA NA NA NA NA chr4-153 43326663 43326853 129 - chr4:43326714-43326782 NA NA NA NA NA chr4-152 43301103 43301290 133 - chr4:43301110-43301189 NA NA NA NA NA chr4-151 43251263 43251605 208 - chr4:43251419-43251498 NA NA NA NA NA chr4-150 43116525 43116737 129 - chr4:43116525-43116571 NA NA NA NA NA chr4-149 42765255 42765573 166 - chr4:42765318-42765332 NA NA NA NA NA chr4-148 42711246 42711603 229 - chr4:42711501-42711602 NA NA NA NA NA chr4-147 42647711 42647943 164 - chr4:42647832-42647928 NA NA NA NA NA chr4-146 42579147 42579352 175 - chr4:42579178-42579323 NA NA NA NA NA chr4-145 42550804 42551028 134 - chr4:42550924-42550948 NA NA NA NA NA chr4-144 42485106 42485368 141 - chr4:42485313-42485333 NA NA NA NA NA chr4-143 42409699 42409902 180 - chr4:42409706-42409817 NA NA NA NA NA chr4-142 42374746 42374905 117 - chr4:42374812-42374887 NA NA NA NA NA chr4-141 42343055 42343376 261 - chr4:42343057-42343258 NA NA NA NA NA chr4-140 42034784 42035129 231 - chr4:42034976-42034988 NA NA NA NA NA chr4-139 41983930 41984190 228 - chr4:41983944-41984140 NA NA NA NA NA chr4-138 41720414 41720709 158 - chr4:41720463-41720484 NA NA NA NA NA chr4-137 41405887 41406282 261 - chr4:41406074-41406165 NA NA NA NA NA chr4-136 41231565 41231765 153 - chr4:41231623-41231729 NA NA NA NA NA chr4-135 40900550 40900899 225 - chr4:40900803-40900861 NA NA NA NA NA chr4-134 40593280 40593512 144 - chr4:40593405-40593461 NA NA NA NA NA chr4-133 40503657 40503870 151 - chr4:40503744-40503833 NA NA NA NA NA chr4-132 39406553 39406947 244 - chr4:39406782-39406876 NA NA NA NA NA chr4-131 39277346 39277708 200 - chr4:39277558-39277596 NA NA NA NA NA chr4-130 39202527 39202862 172 - chr4:39202746-39202755 NA NA NA NA NA chr4-129 38922922 38923209 154 - chr4:38923022-38923065 NA NA NA NA NA chr4-128 38904146 38904409 218 - chr4:38904147-38904320 NA NA NA NA NA chr4-127 38771082 38771336 186 - chr4:38771216-38771268 NA NA NA NA NA chr4-126 38545171 38545434 210 - chr4:38545176-38545333 NA NA NA NA NA chr4-125 38410918 38411351 254 - chr4:38411120-38411291 NA NA NA NA NA chr4-124 38304411 38304624 155 - chr4:38304437-38304534 NA NA NA NA NA chr4-123 38165496 38165733 161 - chr4:38165587-38165702 NA NA NA NA NA chr4-122 37818110 37818473 173 - chr4:37818204-37818228 NA NA NA NA NA chr4-121 37731880 37732194 186 - chr4:37731987-37732003 NA NA NA NA NA chr4-120 37703467 37703715 128 - chr4:37703533-37703541 NA NA NA NA NA chr4-119 37640903 37641154 186 - chr4:37640923-37640954 NA NA NA NA NA chr4-118 37481931 37482179 200 - chr4:37481953-37482105 NA NA NA NA NA chr4-117 37308835 37309282 241 - chr4:37308876-37308911 NA NA NA NA NA chr4-116 37212343 37212659 182 - chr4:37212473-37212521 NA NA NA NA NA chr4-115 36980766 36981096 181 - chr4:36980908-36980940 NA NA NA NA NA chr4-114 36924998 36925347 192 - chr4:36925183-36925231 NA NA NA NA NA chr4-113 36604202 36604745 252 - chr4:36604213-36604380 NA NA NA NA NA chr4-112 36414218 36414521 165 - chr4:36414296-36414363 NA NA NA NA NA chr4-111 36193924 36194562 348 - chr4:36194269-36194383 NA NA NA NA NA chr4-110 36133903 36134081 148 - chr4:36133921-36134039 NA NA NA NA NA chr4-109 36084151 36084639 315 - chr4:36084266-36084408 NA NA NA NA NA chr4-108 36050093 36050366 184 - chr4:36050264-36050297 NA NA NA NA NA chr4-107 36005105 36005445 230 - chr4:36005185-36005305 NA NA NA NA NA chr4-106 35582038 35582262 151 - chr4:35582048-35582126 NA NA NA NA NA chr4-105 34517450 34517845 309 - chr4:34517676-34517781 NA NA NA NA NA chr4-104 34516128 34516373 194 - chr4:34516229-34516350 NA NA NA NA NA chr4-103 34347629 34347925 206 - chr4:34347725-34347901 NA NA NA NA NA chr4-102 34199800 34200105 247 - chr4:34200009-34200082 NA NA NA NA NA chr4-101 34023568 34023816 151 - chr4:34023650-34023714 NA NA NA NA NA chr4-100 33762378 33762617 159 - chr4:33762491-33762570 NA NA NA NA NA chr4-99 33608270 33608513 147 - chr4:33608273-33608386 NA NA NA NA NA chr4-98 33574182 33574383 142 - chr4:33574254-33574337 NA NA NA NA NA chr4-97 33551011 33551204 142 - chr4:33551102-33551193 NA NA NA NA NA chr4-96 33377250 33377681 249 - chr4:33377468-33377535 NA NA NA NA NA chr4-95 33357222 33357608 214 - chr4:33357510-33357552 NA NA NA NA NA chr4-94 33242629 33242828 134 - chr4:33242631-33242742 NA NA NA NA NA chr4-93 33231422 33231905 287 - chr4:33231584-33231592 NA NA NA NA NA chr4-92 33142219 33142507 192 - chr4:33142226-33142386 NA NA NA NA NA chr4-91 32896673 32896981 154 - chr4:32896839-32896863 NA NA NA NA NA chr4-90 32722225 32722466 122 - chr4:32722311-32722320 NA NA NA NA NA chr4-89 32709156 32709457 247 - chr4:32709214-32709443 NA NA NA NA NA chr4-88 32693069 32693493 299 - chr4:32693189-32693415 NA NA NA NA NA chr4-87 32586385 32586786 178 - chr4:32586657-32586716 NA NA NA NA NA chr4-86 32523889 32524238 186 - chr4:32524058-32524077 NA NA NA NA NA chr4-85 32419372 32419621 156 - chr4:32419558-32419621 NA NA NA NA NA chr4-84 32341152 32341387 191 - chr4:32341154-32341301 NA NA NA NA NA chr4-83 32285042 32285293 150 - chr4:32285129-32285178 NA NA NA NA NA chr4-82 32021253 32021457 127 - chr4:32021319-32021347 NA NA NA NA NA chr4-81 31980654 31980955 245 - chr4:31980710-31980899 NA NA NA NA NA chr4-80 31889764 31890115 228 - chr4:31889894-31890081 NA NA NA NA NA chr4-79 31858283 31858457 126 - chr4:31858290-31858368 NA NA NA NA NA chr4-78 31848206 31848380 141 - chr4:31848238-31848344 NA NA NA NA NA chr4-77 31794830 31795107 127 - chr4:31795037-31795045 NA NA NA NA NA chr4-76 31712277 31712488 141 - chr4:31712404-31712475 NA NA NA NA NA chr4-75 31657860 31658325 250 - chr4:31658032-31658131 NA NA NA NA NA chr4-74 31584033 31584458 217 - chr4:31584327-31584336 NA NA NA NA NA chr4-73 31574004 31574283 144 - chr4:31574140-31574149 NA NA NA NA NA chr4-72 31439823 31440143 258 - chr4:31439867-31440063 NA NA NA NA NA chr4-71 31183330 31183674 204 - chr4:31183498-31183562 NA NA NA NA NA chr4-70 31172029 31172556 368 - chr4:31172424-31172462 NA NA NA NA NA chr4-69 31129921 31130215 268 - chr4:31129940-31130130 NA NA NA NA NA chr4-68 31046715 31046979 197 - chr4:31046815-31046945 NA NA NA NA NA chr4-67 31043006 31043277 240 - chr4:31043027-31043236 NA NA NA NA NA chr4-66 31030161 31030433 130 - chr4:31030225-31030265 NA NA NA NA NA chr4-65 30915652 30916005 199 - chr4:30915852-30915857 NA NA NA NA NA chr4-64 30879731 30879916 156 - chr4:30879773-30879842 NA NA NA NA NA chr4-63 30852012 30852320 192 - chr4:30852106-30852125 NA NA NA NA NA chr4-62 30777435 30777650 143 - chr4:30777487-30777558 NA NA NA NA NA chr4-61 30732488 30732781 198 - chr4:30732580-30732683 NA NA NA NA NA chr4-60 30652489 30652813 210 - chr4:30652672-30652722 NA NA NA NA NA chr4-59 30576134 30576490 234 - chr4:30576307-30576419 NA NA NA NA NA chr4-58 30533146 30533512 260 - chr4:30533293-30533447 NA NA NA NA NA chr4-57 30406118 30406547 262 - chr4:30406452-30406547 NA NA NA NA NA chr4-56 30342446 30342721 233 - chr4:30342598-30342705 NA NA NA NA NA chr4-55 30297701 30298051 211 - chr4:30297922-30297975 NA NA NA NA NA chr4-54 30285588 30285811 200 - chr4:30285646-30285777 NA NA NA NA NA chr4-53 30265274 30265630 233 - chr4:30265338-30265585 NA NA NA NA NA chr4-52 29044320 29044576 115 - chr4:29044496-29044540 NA NA NA NA NA chr4-51 28153138 28153338 115 - chr4:28153264-28153294 NA NA NA NA NA chr4-50 27206498 27206905 218 - chr4:27206730-27206815 NA NA NA NA NA chr4-4 2703920 2704130 156 - chr4:2703980-2704082 NA NA NA NA NA chr4-49 27021412 27021902 300 - chr4:27021674-27021680 NA NA NA NA NA chr4-48 26727633 26728051 321 - chr4:26727713-26727882 NA NA NA NA NA chr4-47 25514375 25514561 137 - chr4:25514427-25514513 NA NA NA NA NA chr4-46 25189982 25190362 155 - chr4:25190048-25190128 NA NA NA NA NA chr4-45 25022089 25022256 116 - chr4:25022194-25022223 NA NA NA NA NA chr4-44 24122605 24122884 169 - chr4:24122686-24122687 NA NA NA NA NA chr4-43 24010273 24010447 146 - chr4:24010292-24010410 NA NA NA NA NA chr4-42 23980987 23981386 218 - chr4:23981187-23981224 NA NA NA NA NA chr4-41 23909275 23909503 210 - chr4:23909308-23909464 NA NA NA NA NA chr4-40 22865082 22865257 120 - chr4:22865149-22865249 NA NA NA NA NA chr4-39 22012603 22012748 118 - chr4:22012612-22012703 NA NA NA NA NA chr4-38 20302158 20302650 291 - chr4:20302324-20302344 NA NA NA NA NA chr4-37 20239710 20240027 209 - chr4:20239855-20239956 NA NA NA NA NA chr4-36 19943950 19944182 154 - chr4:19944078-19944154 NA NA NA NA NA chr4-35 19728800 19729222 370 - chr4:19728856-19729174 NA NA NA NA NA chr4-648 188193999 188194459 283 - chr4:188194082-188194188 NA NA NA NA NA chr4-647 188054302 188054506 140 - chr4:188054425-188054501 NA NA NA NA NA chr4-646 187775796 187776000 165 - chr4:187775846-187775972 NA NA NA NA NA chr4-645 187545588 187545751 133 - chr4:187545603-187545716 NA NA NA NA NA chr4-644 187236116 187236456 211 - chr4:187236240-187236408 NA NA NA NA NA chr4-34 18717731 18718258 339 - chr4:18717858-18718011 NA NA NA NA NA chr4-33 18653468 18653668 128 - chr4:18653593-18653649 NA NA NA NA NA chr4-643 186087973 186088632 390 - chr4:186088155-186088391 NA NA NA NA NA chr4-642 185952288 185952579 166 - chr4:185952416-185952457 NA NA NA NA NA chr4-641 185722207 185722439 148 - chr4:185722306-185722370 NA NA NA NA NA chr4-640 184643820 184644090 136 - chr4:184643903-184643905 NA NA NA NA NA chr4-639 184475681 184475901 158 - chr4:184475761-184475893 NA NA NA NA NA chr4-638 184316623 184316919 219 - chr4:184316712-184316854 NA NA NA NA NA chr4-637 184264582 184265007 248 - chr4:184264728-184264801 NA NA NA NA NA chr4-636 183679960 183680667 465 - chr4:183680470-183680587 NA NA NA NA NA chr4-635 182806473 182806616 119 - chr4:182806503-182806610 NA NA NA NA NA chr4-634 182686230 182686454 178 - chr4:182686265-182686397 NA NA NA NA NA chr4-633 182477104 182477439 239 - chr4:182477151-182477358 NA NA NA NA NA chr4-632 180381872 180382082 167 - chr4:180382025-180382063 NA NA NA NA NA chr4-631 179862790 179863145 197 - chr4:179862931-179862936 NA NA NA NA NA chr4-630 179828667 179828958 168 - chr4:179828734-179828861 NA NA NA NA NA chr4-629 179702651 179702866 191 - chr4:179702683-179702802 NA NA NA NA NA chr4-628 179437367 179437527 131 - chr4:179437388-179437432 NA NA NA NA NA chr4-627 178877720 178878002 186 - chr4:178877761-178877915 NA NA NA NA NA chr4-626 177075571 177075959 140 - chr4:177075892-177075930 NA NA NA NA NA chr4-625 176429269 176429504 151 - chr4:176429369-176429436 NA NA NA NA NA chr4-624 176354232 176354598 214 - chr4:176354263-176354325 NA NA NA NA NA chr4-623 175174119 175174432 181 - chr4:175174180-175174229 NA NA NA NA NA chr4-622 175019141 175019393 166 - chr4:175019272-175019352 NA NA NA NA NA chr4-621 174803230 174803637 284 - chr4:174803299-174803542 NA NA NA NA NA chr4-620 173929972 173930219 150 - chr4:173930045-173930098 NA NA NA NA NA chr4-32 17368165 17368364 132 - chr4:17368218-17368255 NA NA NA NA NA chr4-619 172410627 172410828 171 - chr4:172410682-172410823 NA NA NA NA NA chr4-618 171853776 171853996 133 - chr4:171853884-171853930 NA NA NA NA NA chr4-617 171716411 171716566 141 - chr4:171716454-171716553 NA NA NA NA NA chr4-616 171678866 171679161 169 - chr4:171678919-171678962 NA NA NA NA NA chr4-31 17147144 17147515 193 - chr4:17147203-17147218 NA NA NA NA NA chr4-615 169868647 169868957 189 - chr4:169868786-169868854 NA NA NA NA NA chr4-614 169759775 169760232 328 - chr4:169760063-169760156 NA NA NA NA NA chr4-613 169473594 169473940 178 - chr4:169473634-169473756 NA NA NA NA NA chr4-612 169386375 169386717 227 - chr4:169386387-169386499 NA NA NA NA NA chr4-611 169168685 169168991 202 - chr4:169168741-169168839 NA NA NA NA NA chr4-610 169088921 169089370 201 - chr4:169088980-169088997 NA NA NA NA NA chr4-609 168429055 168429282 190 - chr4:168429082-168429235 NA NA NA NA NA chr4-608 168236987 168237249 204 - chr4:168237030-168237176 NA NA NA NA NA chr4-607 168144278 168144524 157 - chr4:168144420-168144488 NA NA NA NA NA chr4-606 167789795 167789977 159 - chr4:167789803-167789893 NA NA NA NA NA chr4-605 167085700 167086055 164 - chr4:167085906-167085909 NA NA NA NA NA chr4-604 166889415 166889702 225 - chr4:166889489-166889652 NA NA NA NA NA chr4-603 166698298 166698508 197 - chr4:166698318-166698502 NA NA NA NA NA chr4-602 166693286 166693569 146 - chr4:166693470-166693479 NA NA NA NA NA chr4-30 16659783 16660059 230 - chr4:16659797-16659889 NA NA NA NA NA chr4-601 166392689 166392837 132 - chr4:166392693-166392809 NA NA NA NA NA chr4-600 166066504 166066704 122 - chr4:166066556-166066652 NA NA NA NA NA chr4-599 165402126 165402299 136 - chr4:165402195-165402294 NA NA NA NA NA chr4-598 165381499 165381728 121 - chr4:165381641-165381654 NA NA NA NA NA chr4-597 164801591 164801888 176 - chr4:164801619-164801736 NA NA NA NA NA chr4-29 16442193 16442702 204 - chr4:16442570-16442613 NA NA NA NA NA chr4-596 164329555 164329967 242 - chr4:164329710-164329851 NA NA NA NA NA chr4-595 163929456 163929734 153 - chr4:163929593-163929613 NA NA NA NA NA chr4-594 163923486 163923718 176 - chr4:163923507-163923627 NA NA NA NA NA chr4-593 163563891 163564214 171 - chr4:163564103-163564122 NA NA NA NA NA chr4-592 163058485 163058824 212 - chr4:163058716-163058801 NA NA NA NA NA chr4-591 162961976 162962262 189 - chr4:162962115-162962179 NA NA NA NA NA chr4-590 162819457 162819970 268 - chr4:162819580-162819603 NA NA NA NA NA chr4-589 162505365 162505530 137 - chr4:162505376-162505485 NA NA NA NA NA chr4-588 162055106 162055496 215 - chr4:162055165-162055205 NA NA NA NA NA chr4-587 161238329 161238626 181 - chr4:161238559-161238624 NA NA NA NA NA chr4-586 160632984 160633269 219 - chr4:160633113-160633224 NA NA NA NA NA chr4-585 160065161 160066050 436 - chr4:160065832-160065845 NA NA NA NA NA chr4-584 159997879 159998165 166 - chr4:159997984-159998030 NA NA NA NA NA chr4-583 159575981 159576266 222 - chr4:159576085-159576244 NA NA NA NA NA chr4-582 158629643 158629858 145 - chr4:158629768-158629843 NA NA NA NA NA chr4-28 15771089 15771491 221 - chr4:15771147-15771269 NA NA NA NA NA chr4-581 157246555 157246992 242 - chr4:157246642-157246761 NA NA NA NA NA chr4-580 157024568 157025132 303 - chr4:157024664-157024706 NA NA NA NA NA chr4-579 156746401 156746648 204 - chr4:156746469-156746630 NA NA NA NA NA chr4-578 155216963 155217230 211 - chr4:155216987-155217078 NA NA NA NA NA chr4-577 154158587 154158838 173 - chr4:154158668-154158763 NA NA NA NA NA chr4-576 153382488 153382748 157 - chr4:153382537-153382591 NA NA NA NA NA chr4-575 153316435 153316630 154 - chr4:153316584-153316625 NA NA NA NA NA chr4-27 15330909 15331150 195 - chr4:15330973-15331122 NA NA NA NA NA chr4-574 153200596 153200830 139 - chr4:153200609-153200653 NA NA NA NA NA chr4-573 153155598 153155902 281 - chr4:153155605-153155831 NA NA NA NA NA chr4-572 152870586 152870986 265 - chr4:152870695-152870790 NA NA NA NA NA chr4-571 152807571 152807915 196 - chr4:152807713-152807749 NA NA NA NA NA chr4-570 152796962 152797257 215 - chr4:152797105-152797198 NA NA NA NA NA chr4-569 152204063 152204500 299 - chr4:152204121-152204282 NA NA NA NA NA chr4-568 152063250 152063526 240 - chr4:152063265-152063427 NA NA NA NA NA chr4-567 150267412 150267602 113 - chr4:150267558-150267594 NA NA NA NA NA chr4-566 150046019 150046216 159 - chr4:150046038-150046159 NA NA NA NA NA chr4-565 149015337 149015654 143 - chr4:149015415-149015448 NA NA NA NA NA chr4-564 148743485 148743818 203 - chr4:148743658-148743731 NA NA NA NA NA chr4-26 14865898 14866184 193 - chr4:14865954-14866054 NA NA NA NA NA chr4-25 14861162 14861383 190 - chr4:14861260-14861357 NA NA NA NA NA chr4-563 147183013 147183218 129 - chr4:147183053-147183106 NA NA NA NA NA chr4-562 146938690 146938920 156 - chr4:146938721-146938803 NA NA NA NA NA chr4-561 145154352 145154551 154 - chr4:145154362-145154471 NA NA NA NA NA chr4-560 144989850 144990186 238 - chr4:144989904-144989956 NA NA NA NA NA chr4-559 144977992 144978436 217 - chr4:144978265-144978347 NA NA NA NA NA chr4-24 14462559 14463117 377 - chr4:14462741-14462874 NA NA NA NA NA chr4-558 144602117 144602463 145 - chr4:144602324-144602365 NA NA NA NA NA chr4-557 143743263 143743621 233 - chr4:143743340-143743480 NA NA NA NA NA chr4-556 142478156 142478383 159 - chr4:142478157-142478248 NA NA NA NA NA chr4-555 141318611 141318938 123 - chr4:141318833-141318888 NA NA NA NA NA chr4-554 141034614 141034860 204 - chr4:141034716-141034838 NA NA NA NA NA chr4-553 140628717 140628998 150 - chr4:140628840-140628859 NA NA NA NA NA chr4-552 140469617 140470042 232 - chr4:140469858-140469993 NA NA NA NA NA chr4-551 139954451 139954722 165 - chr4:139954532-139954541 NA NA NA NA NA chr4-550 138911859 138912219 216 - chr4:138911894-138911966 NA NA NA NA NA chr4-549 137698007 137698239 117 - chr4:137698175-137698177 NA NA NA NA NA chr4-548 137295872 137296213 173 - chr4:137296050-137296055 NA NA NA NA NA chr4-547 137205912 137206184 147 - chr4:137206091-137206113 NA NA NA NA NA chr4-546 136866593 136866936 226 - chr4:136866719-136866846 NA NA NA NA NA chr4-545 136866023 136866260 141 - chr4:136866149-136866194 NA NA NA NA NA chr4-544 136191985 136192192 161 - chr4:136192003-136192118 NA NA NA NA NA chr4-543 136040189 136040358 151 - chr4:136040240-136040351 NA NA NA NA NA chr4-542 135962225 135962483 196 - chr4:135962257-135962331 NA NA NA NA NA chr4-541 134998852 134999129 165 - chr4:134998938-134998991 NA NA NA NA NA chr4-540 134385274 134385520 228 - chr4:134385283-134385493 NA NA NA NA NA chr4-539 134109546 134109715 134 - chr4:134109586-134109685 NA NA NA NA NA chr4-538 133982187 133982472 174 - chr4:133982313-133982376 NA NA NA NA NA chr4-537 133707518 133707810 268 - chr4:133707535-133707765 NA NA NA NA NA chr4-536 132940794 132941115 203 - chr4:132940893-132940978 NA NA NA NA NA chr4-535 132206041 132206257 205 - chr4:132206051-132206245 NA NA NA NA NA chr4-534 131499412 131499580 121 - chr4:131499419-131499493 NA NA NA NA NA chr4-533 130872536 130872887 204 - chr4:130872692-130872749 NA NA NA NA NA chr4-532 130830093 130830328 150 - chr4:130830236-130830301 NA NA NA NA NA chr4-531 129965468 129965841 145 - chr4:129965752-129965781 NA NA NA NA NA chr4-530 129554067 129554814 371 - chr4:129554653-129554772 NA NA NA NA NA chr4-529 129106422 129106634 121 - chr4:129106450-129106480 NA NA NA NA NA chr4-23 12879650 12879930 136 - chr4:12879800-12879804 NA NA NA NA NA chr4-528 128748576 128748970 214 - chr4:128748680-128748782 NA NA NA NA NA chr4-527 128648228 128648498 156 - chr4:128648310-128648352 NA NA NA NA NA chr4-526 128294035 128294333 186 - chr4:128294166-128294278 NA NA NA NA NA chr4-525 127699032 127699337 181 - chr4:127699104-127699161 NA NA NA NA NA chr4-524 127541345 127541528 147 - chr4:127541391-127541502 NA NA NA NA NA chr4-523 127509182 127509344 153 - chr4:127509213-127509339 NA NA NA NA NA chr4-522 126239724 126240016 153 - chr4:126239889-126239903 NA NA NA NA NA chr4-22 12512597 12512783 163 - chr4:12512640-12512734 NA NA NA NA NA chr4-521 124255517 124255800 194 - chr4:124255620-124255753 NA NA NA NA NA chr4-520 123999658 123999891 198 - chr4:123999749-123999842 NA NA NA NA NA chr4-519 123677000 123677297 165 - chr4:123677067-123677188 NA NA NA NA NA chr4-21 12362879 12363196 179 - chr4:12362925-12363058 NA NA NA NA NA chr4-518 123458994 123459447 189 - chr4:123459329-123459396 NA NA NA NA NA chr4-517 123418094 123418385 166 - chr4:123418248-123418289 NA NA NA NA NA chr4-516 123295845 123296080 140 - chr4:123296026-123296071 NA NA NA NA NA chr4-515 123068866 123069230 237 - chr4:123069000-123069110 NA NA NA NA NA chr4-514 122807485 122807769 177 - chr4:122807627-122807697 NA NA NA NA NA chr4-513 122664519 122664762 130 - chr4:122664562-122664579 NA NA NA NA NA chr4-512 122556395 122556822 211 - chr4:122556578-122556595 NA NA NA NA NA chr4-511 122529374 122529580 125 - chr4:122529408-122529452 NA NA NA NA NA chr4-510 121862012 121862441 150 - chr4:121862377-121862412 NA NA NA NA NA chr4-509 121512461 121512853 204 - chr4:121512684-121512700 NA NA NA NA NA chr4-20 12047804 12048048 148 - chr4:12047971-12048023 NA NA NA NA NA chr4-508 120451124 120451255 117 - chr4:120451159-120451248 NA NA NA NA NA chr4-507 120045417 120045576 128 - chr4:120045425-120045522 NA NA NA NA NA chr4-506 118974946 118975198 144 - chr4:118975045-118975087 NA NA NA NA NA chr4-505 118764544 118764995 220 - chr4:118764719-118764746 NA NA NA NA NA chr4-504 118289250 118289470 144 - chr4:118289285-118289353 NA NA NA NA NA chr4-503 118188735 118189214 243 - chr4:118189043-118189050 NA NA NA NA NA chr4-502 117293259 117293653 244 - chr4:117293472-117293566 NA NA NA NA NA chr4-501 117191222 117191502 159 - chr4:117191409-117191447 NA NA NA NA NA chr4-500 117186565 117186797 175 - chr4:117186635-117186753 NA NA NA NA NA chr4-499 116769392 116769718 186 - chr4:116769473-116769519 NA NA NA NA NA chr4-19 11670099 11670494 223 - chr4:11670276-11670327 NA NA NA NA NA chr4-498 116005034 116005253 174 - chr4:116005081-116005214 NA NA NA NA NA chr4-497 115762646 115762812 118 - chr4:115762716-115762786 NA NA NA NA NA chr4-496 115397924 115398276 196 - chr4:115398064-115398104 NA NA NA NA NA chr4-495 115143731 115144051 182 - chr4:115143755-115143875 NA NA NA NA NA chr4-494 115063310 115063639 219 - chr4:115063435-115063534 NA NA NA NA NA chr4-493 115028984 115029257 129 - chr4:115029072-115029153 NA NA NA NA NA chr4-18 11487984 11488214 176 - chr4:11488046-11488204 NA NA NA NA NA chr4-17 11485842 11486082 145 - chr4:11485934-11485986 NA NA NA NA NA chr4-492 114653373 114653560 161 - chr4:114653437-114653520 NA NA NA NA NA chr4-491 114439925 114440164 177 - chr4:114439965-114440080 NA NA NA NA NA chr4-490 114379209 114379627 202 - chr4:114379298-114379379 NA NA NA NA NA chr4-489 114108891 114109323 193 - chr4:114109164-114109186 NA NA NA NA NA chr4-488 114028617 114029204 243 - chr4:114029027-114029058 NA NA NA NA NA chr4-487 113673987 113674211 171 - chr4:113674010-113674128 NA NA NA NA NA chr4-486 113661820 113662287 328 - chr4:113661851-113662040 NA NA NA NA NA chr4-485 113434390 113435004 349 - chr4:113434672-113434790 NA NA NA NA NA chr4-484 113378623 113378894 193 - chr4:113378759-113378874 NA NA NA NA NA chr4-483 113097156 113097494 188 - chr4:113097308-113097350 NA NA NA NA NA chr4-482 112903567 112903759 146 - chr4:112903574-112903700 NA NA NA NA NA chr4-481 112843359 112843758 153 - chr4:112843619-112843690 NA NA NA NA NA chr4-16 11256671 11256887 140 - chr4:11256784-11256848 NA NA NA NA NA chr4-480 112560071 112560356 138 - chr4:112560250-112560305 NA NA NA NA NA chr4-479 112463801 112464407 292 - chr4:112464186-112464192 NA NA NA NA NA chr4-478 112407119 112407349 153 - chr4:112407250-112407326 NA NA NA NA NA chr4-477 112397302 112397526 165 - chr4:112397408-112397514 NA NA NA NA NA chr4-476 112254663 112254838 138 - chr4:112254790-112254831 NA NA NA NA NA chr4-475 112035763 112036120 225 - chr4:112036000-112036023 NA NA NA NA NA chr4-474 111937457 111937756 197 - chr4:111937522-111937543 NA NA NA NA NA chr4-473 111677340 111677731 176 - chr4:111677468-111677487 NA NA NA NA NA chr4-472 111576427 111576799 232 - chr4:111576505-111576597 NA NA NA NA NA chr4-471 111423421 111423566 122 - chr4:111423500-111423553 NA NA NA NA NA chr4-470 111005349 111005785 315 - chr4:111005465-111005659 NA NA NA NA NA chr4-469 110949493 110949797 118 - chr4:110949608-110949664 NA NA NA NA NA chr4-468 110888809 110888985 152 - chr4:110888840-110888984 NA NA NA NA NA chr4-467 110304386 110304702 246 - chr4:110304473-110304509 NA NA NA NA NA chr4-466 110034155 110034395 156 - chr4:110034249-110034341 NA NA NA NA NA chr4-465 109916165 109916421 224 - chr4:109916207-109916399 NA NA NA NA NA chr4-464 109866028 109866306 241 - chr4:109866164-109866294 NA NA NA NA NA chr4-463 109619743 109619957 149 - chr4:109619795-109619853 NA NA NA NA NA chr4-462 109588345 109588703 274 - chr4:109588361-109588415 NA NA NA NA NA chr4-461 109376724 109377030 170 - chr4:109376829-109376863 NA NA NA NA NA chr4-460 109210821 109211142 160 - chr4:109211001-109211038 NA NA NA NA NA chr4-459 109104090 109104324 205 - chr4:109104092-109104214 NA NA NA NA NA chr4-458 109047861 109048289 278 - chr4:109047896-109048124 NA NA NA NA NA chr4-457 108958898 108959099 144 - chr4:108958949-108959036 NA NA NA NA NA chr4-456 108731783 108731966 157 - chr4:108731815-108731946 NA NA NA NA NA chr4-455 108465020 108465714 290 - chr4:108465469-108465537 NA NA NA NA NA chr4-454 108414635 108414920 209 - chr4:108414665-108414798 NA NA NA NA NA chr4-453 107822496 107822841 184 - chr4:107822775-107822798 NA NA NA NA NA chr4-452 107533294 107533488 132 - chr4:107533339-107533409 NA NA NA NA NA chr4-451 106545104 106545374 164 - chr4:106545195-106545253 NA NA NA NA NA chr4-450 106347476 106347704 142 - chr4:106347615-106347671 NA NA NA NA NA chr4-449 106282299 106282656 213 - chr4:106282484-106282553 NA NA NA NA NA chr4-448 106201693 106201944 133 - chr4:106201811-106201826 NA NA NA NA NA chr4-447 106188204 106188423 114 - chr4:106188264-106188343 NA NA NA NA NA chr4-446 106024236 106024531 266 - chr4:106024259-106024438 NA NA NA NA NA chr4-445 105842336 105842553 189 - chr4:105842424-105842545 NA NA NA NA NA chr4-444 105652154 105652438 160 - chr4:105652230-105652266 NA NA NA NA NA chr4-443 105594302 105594577 149 - chr4:105594451-105594558 NA NA NA NA NA chr4-442 105580124 105580314 124 - chr4:105580190-105580248 NA NA NA NA NA chr4-441 105490163 105490518 241 - chr4:105490235-105490362 NA NA NA NA NA chr4-15 10530316 10530536 121 - chr4:10530429-10530451 NA NA NA NA NA chr4-440 104853425 104853825 358 - chr4:104853508-104853779 NA NA NA NA NA chr4-439 104614755 104614945 132 - chr4:104614790-104614864 NA NA NA NA NA chr4-438 104544186 104544528 236 - chr4:104544269-104544353 NA NA NA NA NA chr4-437 104016676 104016943 158 - chr4:104016797-104016846 NA NA NA NA NA chr4-436 103503690 103503858 137 - chr4:103503710-103503794 NA NA NA NA NA chr4-435 103475337 103475674 263 - chr4:103475426-103475658 NA NA NA NA NA chr4-434 103205947 103206379 324 - chr4:103206127-103206343 NA NA NA NA NA chr4-433 103114452 103114818 260 - chr4:103114475-103114629 NA NA NA NA NA chr4-432 102773812 102774215 209 - chr4:102773998-102774013 NA NA NA NA NA chr4-431 102515957 102516128 152 - chr4:102515961-102516094 NA NA NA NA NA chr4-430 102288643 102288861 122 - chr4:102288685-102288747 NA NA NA NA NA chr4-429 101879406 101879718 173 - chr4:101879468-101879502 NA NA NA NA NA chr4-428 101848149 101848451 187 - chr4:101848308-101848380 NA NA NA NA NA chr4-427 101702578 101702952 255 - chr4:101702666-101702802 NA NA NA NA NA chr4-426 101549007 101549273 216 - chr4:101549046-101549190 NA NA NA NA NA chr4-425 101270762 101271026 173 - chr4:101270920-101271002 NA NA NA NA NA chr4-424 101056055 101056351 131 - chr4:101056275-101056351 NA NA NA NA NA chr4-423 101029576 101029749 130 - chr4:101029624-101029711 NA NA NA NA NA chr4-14 10085429 10085629 139 - chr4:10085487-10085567 NA NA NA NA NA chr4-422 100277885 100278226 189 - chr4:100278025-100278070 NA NA NA NA NA chr4-421 100114986 100115201 149 - chr4:100115074-100115157 NA NA NA NA NA chr4-420 100108504 100108815 200 - chr4:100108702-100108791 NA NA NA NA NA chr4-419 100018657 100019014 220 - chr4:100018875-100018904 NA NA NA NA NA chr3-358 99986089 99986342 191 - chr3:99986092-99986221 NA NA NA NA NA chr3-357 99941906 99942259 263 - chr3:99941928-99941965 NA NA NA NA NA chr3-356 99750634 99750837 171 - chr3:99750683-99750833 NA NA NA NA NA chr3-355 99728851 99729144 229 - chr3:99728855-99728892 NA NA NA NA NA chr3-354 99351459 99351846 236 - chr3:99351485-99351575 NA NA NA NA NA chr3-353 99329422 99329678 154 - chr3:99329464-99329516 NA NA NA NA NA chr3-352 99118131 99118261 114 - chr3:99118152-99118250 NA NA NA NA NA chr3-351 99107709 99108164 299 - chr3:99107813-99107852 NA NA NA NA NA chr3-350 98938951 98939163 133 - chr3:98938995-98939075 NA NA NA NA NA chr3-349 98768756 98768967 159 - chr3:98768814-98768933 NA NA NA NA NA chr3-348 98488308 98488602 208 - chr3:98488408-98488558 NA NA NA NA NA chr3-347 98449982 98450341 219 - chr3:98450017-98450166 NA NA NA NA NA chr3-346 98268605 98269115 303 - chr3:98268687-98268783 NA NA NA NA NA chr3-345 98124333 98124808 240 - chr3:98124649-98124654 NA NA NA NA NA chr3-344 98083901 98084078 156 - chr3:98083915-98084064 NA NA NA NA NA chr3-343 97987845 97988164 246 - chr3:97987975-97988148 NA NA NA NA NA chr3-342 97938021 97938323 129 - chr3:97938224-97938240 NA NA NA NA NA chr3-341 97823488 97823807 160 - chr3:97823556-97823557 NA NA NA NA NA chr3-26 9764115 9764396 205 - chr3:9764160-9764289 NA NA NA NA NA chr3-340 97607829 97608534 364 - chr3:97608185-97608238 NA NA NA NA NA chr3-339 97324871 97325085 127 - chr3:97324912-97324952 NA NA NA NA NA chr3-338 96820894 96821439 275 - chr3:96821111-96821116 NA NA NA NA NA chr3-4 966976 967221 122 - chr3:967031-967112 NA NA NA NA NA chr3-337 96578004 96578274 174 - chr3:96578102-96578125 NA NA NA NA NA chr3-336 96564548 96564759 189 - chr3:96564605-96564728 NA NA NA NA NA chr3-335 96554401 96554701 234 - chr3:96554423-96554591 NA NA NA NA NA chr3-334 96429435 96429683 145 - chr3:96429512-96429554 NA NA NA NA NA chr3-333 96263835 96264321 288 - chr3:96263963-96264053 NA NA NA NA NA chr3-332 96166790 96167150 189 - chr3:96166976-96166994 NA NA NA NA NA chr3-331 96026780 96027377 322 - chr3:96026882-96027125 NA NA NA NA NA chr3-330 95872541 95873173 371 - chr3:95872673-95872763 NA NA NA NA NA chr3-329 95638002 95638144 118 - chr3:95638012-95638106 NA NA NA NA NA chr3-328 95277058 95277507 292 - chr3:95277232-95277367 NA NA NA NA NA chr3-327 95150491 95150763 182 - chr3:95150599-95150727 NA NA NA NA NA chr3-326 94545983 94546184 148 - chr3:94546063-94546140 NA NA NA NA NA chr3-325 94428928 94429159 188 - chr3:94429065-94429124 NA NA NA NA NA chr3-324 94319265 94319634 204 - chr3:94319522-94319561 NA NA NA NA NA chr3-25 9220206 9220587 300 - chr3:9220289-9220482 NA NA NA NA NA chr3-323 90357188 90357440 165 - chr3:90357279-90357365 NA NA NA NA NA chr3-322 90353549 90353838 181 - chr3:90353603-90353712 NA NA NA NA NA chr3-321 89984261 89984660 206 - chr3:89984563-89984576 NA NA NA NA NA chr3-320 89552530 89553164 330 - chr3:89552727-89552753 NA NA NA NA NA chr3-319 89474093 89474281 130 - chr3:89474189-89474261 NA NA NA NA NA chr3-318 89171270 89171564 190 - chr3:89171425-89171511 NA NA NA NA NA chr3-317 89073042 89073342 156 - chr3:89073070-89073178 NA NA NA NA NA chr3-316 89049417 89049694 173 - chr3:89049504-89049539 NA NA NA NA NA chr3-315 88901919 88902164 145 - chr3:88902064-88902109 NA NA NA NA NA chr3-314 88864467 88864656 148 - chr3:88864549-88864656 NA NA NA NA NA chr3-313 88853337 88853588 167 - chr3:88853367-88853450 NA NA NA NA NA chr3-312 88816065 88816313 162 - chr3:88816219-88816252 NA NA NA NA NA chr3-311 88767285 88767467 135 - chr3:88767291-88767379 NA NA NA NA NA chr3-310 88618890 88619415 263 - chr3:88619223-88619224 NA NA NA NA NA chr3-309 88179404 88179599 114 - chr3:88179468-88179501 NA NA NA NA NA chr3-308 88156691 88157055 198 - chr3:88156808-88156833 NA NA NA NA NA chr3-307 88106991 88107333 174 - chr3:88107220-88107226 NA NA NA NA NA chr3-306 88018137 88018367 122 - chr3:88018191-88018205 NA NA NA NA NA chr3-305 87212337 87212688 177 - chr3:87212438-87212479 NA NA NA NA NA chr3-304 87077967 87078183 169 - chr3:87078027-87078175 NA NA NA NA NA chr3-303 86761919 86762122 113 - chr3:86762012-86762033 NA NA NA NA NA chr3-302 85772495 85772783 166 - chr3:85772651-85772695 NA NA NA NA NA chr3-301 85000971 85001184 136 - chr3:85001056-85001096 NA NA NA NA NA chr3-300 84859077 84859340 208 - chr3:84859124-84859277 NA NA NA NA NA chr3-299 84854649 84854873 160 - chr3:84854693-84854749 NA NA NA NA NA chr3-298 84793523 84793857 236 - chr3:84793705-84793843 NA NA NA NA NA chr3-297 84669663 84669922 174 - chr3:84669748-84669843 NA NA NA NA NA chr3-296 84431874 84432098 128 - chr3:84431960-84431992 NA NA NA NA NA chr3-295 84407662 84408084 385 - chr3:84407681-84407955 NA NA NA NA NA chr3-294 84147739 84147993 180 - chr3:84147790-84147896 NA NA NA NA NA chr3-293 83890329 83890655 200 - chr3:83890449-83890527 NA NA NA NA NA chr3-292 83166459 83166726 163 - chr3:83166511-83166570 NA NA NA NA NA chr3-291 83003096 83003399 130 - chr3:83003307-83003340 NA NA NA NA NA chr3-290 82801003 82801408 258 - chr3:82801131-82801242 NA NA NA NA NA chr3-289 82552609 82552778 144 - chr3:82552626-82552695 NA NA NA NA NA chr3-288 82386705 82387008 217 - chr3:82386802-82386933 NA NA NA NA NA chr3-287 82259632 82259886 117 - chr3:82259791-82259815 NA NA NA NA NA chr3-286 82143887 82144233 228 - chr3:82143976-82144086 NA NA NA NA NA chr3-285 81825448 81825751 161 - chr3:81825613-81825632 NA NA NA NA NA chr3-284 81364046 81364278 149 - chr3:81364168-81364208 NA NA NA NA NA chr3-283 80522191 80522426 141 - chr3:80522322-80522369 NA NA NA NA NA chr3-282 80209124 80209434 246 - chr3:80209373-80209427 NA NA NA NA NA chr3-281 80076919 80077196 145 - chr3:80076991-80077092 NA NA NA NA NA chr3-280 79157250 79157588 250 - chr3:79157335-79157530 NA NA NA NA NA chr3-279 79035671 79035933 231 - chr3:79035682-79035882 NA NA NA NA NA chr3-278 78993703 78993927 143 - chr3:78993859-78993871 NA NA NA NA NA chr3-277 78972339 78972616 219 - chr3:78972444-78972605 NA NA NA NA NA chr3-276 78852466 78852730 233 - chr3:78852505-78852723 NA NA NA NA NA chr3-275 78838857 78839256 237 - chr3:78838903-78839086 NA NA NA NA NA chr3-274 78098343 78098764 167 - chr3:78098675-78098743 NA NA NA NA NA chr3-273 78038506 78038842 129 - chr3:78038746-78038806 NA NA NA NA NA chr3-272 77979366 77979798 291 - chr3:77979476-77979626 NA NA NA NA NA chr3-271 77864150 77864520 256 - chr3:77864202-77864268 NA NA NA NA NA chr3-270 77850750 77850968 165 - chr3:77850792-77850904 NA NA NA NA NA chr3-269 77684621 77684891 211 - chr3:77684668-77684820 NA NA NA NA NA chr3-268 77010193 77010419 137 - chr3:77010222-77010270 NA NA NA NA NA chr3-267 76872272 76872631 299 - chr3:76872289-76872408 NA NA NA NA NA chr3-24 7678008 7678344 196 - chr3:7678280-7678336 NA NA NA NA NA chr3-266 76668644 76668903 216 - chr3:76668684-76668857 NA NA NA NA NA chr3-265 76524141 76524400 182 - chr3:76524238-76524383 NA NA NA NA NA chr3-264 76271627 76271934 174 - chr3:76271808-76271817 NA NA NA NA NA chr3-263 76124028 76124177 135 - chr3:76124074-76124167 NA NA NA NA NA chr3-262 76024006 76024280 159 - chr3:76024112-76024156 NA NA NA NA NA chr3-261 74847370 74847687 216 - chr3:74847547-74847662 NA NA NA NA NA chr3-260 74817858 74818026 132 - chr3:74817893-74817989 NA NA NA NA NA chr3-259 74652089 74652335 137 - chr3:74652197-74652225 NA NA NA NA NA chr3-258 73599388 73599614 206 - chr3:73599416-73599602 NA NA NA NA NA chr3-257 73071753 73071897 134 - chr3:73071755-73071859 NA NA NA NA NA chr3-256 72749118 72749453 220 - chr3:72749198-72749303 NA NA NA NA NA chr3-255 72566282 72566456 138 - chr3:72566308-72566434 NA NA NA NA NA chr3-254 72511069 72511426 203 - chr3:72511264-72511313 NA NA NA NA NA chr3-253 72334550 72334815 174 - chr3:72334649-72334732 NA NA NA NA NA chr3-252 71771949 71772141 157 - chr3:71771949-71772071 NA NA NA NA NA chr3-23 7173726 7174108 185 - chr3:7173988-7174106 NA NA NA NA NA chr3-251 71577438 71577773 149 - chr3:71577478-71577565 NA NA NA NA NA chr3-250 71410082 71410357 159 - chr3:71410252-71410259 NA NA NA NA NA chr3-22 7102698 7103022 169 - chr3:7102833-7102847 NA NA NA NA NA chr3-249 70953268 70953496 193 - chr3:70953278-70953386 NA NA NA NA NA chr3-248 70890985 70891318 196 - chr3:70891174-70891233 NA NA NA NA NA chr3-247 70636104 70636412 165 - chr3:70636189-70636211 NA NA NA NA NA chr3-246 70554133 70554487 229 - chr3:70554295-70554473 NA NA NA NA NA chr3-245 70042195 70042478 210 - chr3:70042421-70042456 NA NA NA NA NA chr3-244 69956697 69956965 219 - chr3:69956774-69956944 NA NA NA NA NA chr3-21 6981465 6981726 177 - chr3:6981528-6981621 NA NA NA NA NA chr3-243 68573283 68573501 174 - chr3:68573343-68573473 NA NA NA NA NA chr3-20 6831283 6831506 184 - chr3:6831285-6831456 NA NA NA NA NA chr3-242 68064784 68064958 131 - chr3:68064795-68064883 NA NA NA NA NA chr3-241 67832799 67833139 201 - chr3:67832932-67832994 NA NA NA NA NA chr3-240 67640349 67640768 242 - chr3:67640467-67640532 NA NA NA NA NA chr3-239 67632513 67632686 138 - chr3:67632647-67632684 NA NA NA NA NA chr3-238 67309945 67310330 217 - chr3:67310030-67310157 NA NA NA NA NA chr3-237 67300342 67300581 190 - chr3:67300346-67300397 NA NA NA NA NA chr3-236 67179254 67179569 159 - chr3:67179389-67179406 NA NA NA NA NA chr3-19 6707764 6708073 178 - chr3:6707900-6707957 NA NA NA NA NA chr3-235 66511566 66511984 230 - chr3:66511805-66511847 NA NA NA NA NA chr3-234 65558425 65558661 162 - chr3:65558500-65558590 NA NA NA NA NA chr3-233 65387609 65387903 183 - chr3:65387657-65387803 NA NA NA NA NA chr3-232 64546280 64546555 189 - chr3:64546314-64546417 NA NA NA NA NA chr3-231 64258062 64258345 207 - chr3:64258183-64258314 NA NA NA NA NA chr3-230 64030216 64030512 184 - chr3:64030449-64030460 NA NA NA NA NA chr3-229 63831569 63831902 195 - chr3:63831703-63831752 NA NA NA NA NA chr3-18 6366225 6366461 193 - chr3:6366252-6366316 NA NA NA NA NA chr3-228 63586723 63587046 236 - chr3:63586761-63586910 NA NA NA NA NA chr3-227 63538776 63539279 277 - chr3:63538886-63538918 NA NA NA NA NA chr3-226 63488467 63488699 168 - chr3:63488487-63488591 NA NA NA NA NA chr3-225 63081299 63081762 268 - chr3:63081460-63081590 NA NA NA NA NA chr3-224 62776925 62777164 177 - chr3:62776993-62777108 NA NA NA NA NA chr3-3 621185 621622 224 - chr3:621326-621385 NA NA NA NA NA chr3-223 62016792 62016956 131 - chr3:62016843-62016941 NA NA NA NA NA chr3-222 61860804 61861083 235 - chr3:61860805-61860996 NA NA NA NA NA chr3-221 61627176 61627532 209 - chr3:61627438-61627500 NA NA NA NA NA chr3-220 61355414 61355670 124 - chr3:61355489-61355569 NA NA NA NA NA chr3-219 61158855 61159076 208 - chr3:61158869-61159064 NA NA NA NA NA chr3-218 60931248 60931745 273 - chr3:60931412-60931461 NA NA NA NA NA chr3-217 60318585 60319106 272 - chr3:60318786-60318829 NA NA NA NA NA chr3-216 59976173 59976455 135 - chr3:59976268-59976354 NA NA NA NA NA chr3-215 59875673 59875902 159 - chr3:59875845-59875866 NA NA NA NA NA chr3-214 59583421 59583707 137 - chr3:59583541-59583546 NA NA NA NA NA chr3-213 59554198 59554640 165 - chr3:59554241-59554285 NA NA NA NA NA chr3-212 59281344 59281745 238 - chr3:59281413-59281488 NA NA NA NA NA chr3-211 59269614 59269788 144 - chr3:59269653-59269767 NA NA NA NA NA chr3-210 58213301 58213712 242 - chr3:58213441-58213456 NA NA NA NA NA chr3-209 57998755 57999003 235 - chr3:57998764-57998978 NA NA NA NA NA chr3-208 57465752 57465974 128 - chr3:57465904-57465938 NA NA NA NA NA chr3-207 57395014 57395535 223 - chr3:57395409-57395449 NA NA NA NA NA chr3-206 56680961 56681298 169 - chr3:56681035-56681036 NA NA NA NA NA chr3-205 56491422 56491806 200 - chr3:56491692-56491708 NA NA NA NA NA chr3-204 56114099 56114456 233 - chr3:56114251-56114360 NA NA NA NA NA chr3-203 55703671 55704103 268 - chr3:55703841-55703867 NA NA NA NA NA chr3-202 55396112 55396312 126 - chr3:55396162-55396214 NA NA NA NA NA chr3-201 55254432 55254646 134 - chr3:55254434-55254488 NA NA NA NA NA chr3-200 55105168 55105410 124 - chr3:55105250-55105256 NA NA NA NA NA chr3-199 54967693 54967941 149 - chr3:54967777-54967827 NA NA NA NA NA chr3-198 54666604 54666836 157 - chr3:54666620-54666702 NA NA NA NA NA chr3-17 5460337 5460554 189 - chr3:5460401-5460538 NA NA NA NA NA chr3-197 54380681 54380908 159 - chr3:54380807-54380898 NA NA NA NA NA chr3-196 54202628 54202784 131 - chr3:54202645-54202751 NA NA NA NA NA chr3-195 53452068 53452246 144 - chr3:53452106-53452216 NA NA NA NA NA chr3-16 5270592 5270737 119 - chr3:5270603-5270644 NA NA NA NA NA chr3-194 52462622 52462964 189 - chr3:52462824-52462962 NA NA NA NA NA chr3-193 52207541 52207748 124 - chr3:52207543-52207638 NA NA NA NA NA chr3-192 51845292 51845568 145 - chr3:51845424-51845438 NA NA NA NA NA chr3-191 51581004 51581297 261 - chr3:51581061-51581290 NA NA NA NA NA chr3-15 5150311 5150559 232 - chr3:5150324-5150540 NA NA NA NA NA chr3-190 51333848 51334252 238 - chr3:51333933-51334005 NA NA NA NA NA chr3-189 51241294 51241470 123 - chr3:51241316-51241386 NA NA NA NA NA chr3-188 51238417 51238725 204 - chr3:51238553-51238653 NA NA NA NA NA chr3-187 51205034 51205329 255 - chr3:51205176-51205311 NA NA NA NA NA chr3-186 51086890 51087463 296 - chr3:51087173-51087188 NA NA NA NA NA chr3-185 50940557 50940912 267 - chr3:50940610-50940789 NA NA NA NA NA chr3-184 50871773 50872358 315 - chr3:50872009-50872054 NA NA NA NA NA chr3-183 50808229 50808493 174 - chr3:50808252-50808336 NA NA NA NA NA chr3-182 50801925 50802213 228 - chr3:50801939-50802107 NA NA NA NA NA chr3-181 50770249 50770699 243 - chr3:50770437-50770473 NA NA NA NA NA chr3-180 50299021 50299402 216 - chr3:50299179-50299230 NA NA NA NA NA chr3-179 50031970 50032266 137 - chr3:50032169-50032227 NA NA NA NA NA chr3-178 49641114 49641479 251 - chr3:49641290-49641427 NA NA NA NA NA chr3-14 4944149 4944844 498 - chr3:4944218-4944537 NA NA NA NA NA chr3-177 49241139 49241341 150 - chr3:49241284-49241320 NA NA NA NA NA chr3-176 49229094 49229462 224 - chr3:49229206-49229286 NA NA NA NA NA chr3-13 4900336 4900690 203 - chr3:4900547-4900659 NA NA NA NA NA chr3-175 48979580 48979916 243 - chr3:48979661-48979811 NA NA NA NA NA chr3-174 48963655 48964296 333 - chr3:48963971-48963996 NA NA NA NA NA chr3-12 4888368 4888581 152 - chr3:4888453-4888528 NA NA NA NA NA chr3-173 48753630 48753954 220 - chr3:48753708-48753824 NA NA NA NA NA chr3-11 4819920 4820125 134 - chr3:4820062-4820125 NA NA NA NA NA chr3-172 47893888 47894067 144 - chr3:47893958-47893997 NA NA NA NA NA chr3-171 47511079 47511359 172 - chr3:47511148-47511284 NA NA NA NA NA chr3-170 47492912 47493419 346 - chr3:47493185-47493382 NA NA NA NA NA chr3-169 47411956 47412213 217 - chr3:47412004-47412181 NA NA NA NA NA chr3-168 47109097 47109435 170 - chr3:47109240-47109354 NA NA NA NA NA chr3-167 46799989 46800534 232 - chr3:46800323-46800356 NA NA NA NA NA chr3-166 46165230 46165551 147 - chr3:46165425-46165514 NA NA NA NA NA chr3-165 45867246 45867528 163 - chr3:45867272-45867378 NA NA NA NA NA chr3-164 45856459 45856697 127 - chr3:45856602-45856682 NA NA NA NA NA chr3-163 45565410 45565607 123 - chr3:45565483-45565530 NA NA NA NA NA chr3-162 45197328 45197651 212 - chr3:45197440-45197541 NA NA NA NA NA chr3-161 45086785 45087062 229 - chr3:45086814-45086899 NA NA NA NA NA chr3-160 45000913 45001178 168 - chr3:45000992-45001075 NA NA NA NA NA chr3-159 44637868 44638156 170 - chr3:44637938-44638022 NA NA NA NA NA chr3-158 44487604 44487891 140 - chr3:44487631-44487704 NA NA NA NA NA chr3-157 44300225 44300386 131 - chr3:44300267-44300368 NA NA NA NA NA chr3-156 44013171 44013358 141 - chr3:44013211-44013310 NA NA NA NA NA chr3-155 43853707 43853954 218 - chr3:43853710-43853899 NA NA NA NA NA chr3-154 42868945 42869107 116 - chr3:42868971-42869001 NA NA NA NA NA chr3-153 42781016 42781424 268 - chr3:42781128-42781256 NA NA NA NA NA chr3-152 42705566 42705894 202 - chr3:42705654-42705730 NA NA NA NA NA chr3-151 42644189 42644535 177 - chr3:42644336-42644344 NA NA NA NA NA chr3-150 42642739 42642996 203 - chr3:42642747-42642896 NA NA NA NA NA chr3-149 41728415 41728660 189 - chr3:41728430-41728563 NA NA NA NA NA chr3-10 4154418 4154731 177 - chr3:4154540-4154581 NA NA NA NA NA chr3-9 4117885 4118339 300 - chr3:4118091-4118237 NA NA NA NA NA chr3-148 41144878 41145205 310 - chr3:41144906-41145199 NA NA NA NA NA chr3-147 41018935 41019197 197 - chr3:41018980-41019112 NA NA NA NA NA chr3-146 39880389 39880737 207 - chr3:39880597-39880712 NA NA NA NA NA chr3-145 39797636 39798075 278 - chr3:39797918-39798035 NA NA NA NA NA chr3-144 39572869 39573130 159 - chr3:39572870-39572927 NA NA NA NA NA chr3-143 39383784 39384082 199 - chr3:39383879-39383979 NA NA NA NA NA chr3-142 39333613 39333857 166 - chr3:39333678-39333766 NA NA NA NA NA chr3-141 39296117 39296483 266 - chr3:39296118-39296397 NA NA NA NA NA chr3-140 38879281 38879563 168 - chr3:38879432-38879562 NA NA NA NA NA chr3-139 38677154 38677509 218 - chr3:38677220-38677301 NA NA NA NA NA chr3-138 38405036 38405211 135 - chr3:38405042-38405069 NA NA NA NA NA chr3-137 37907556 37907697 131 - chr3:37907568-37907689 NA NA NA NA NA chr3-136 37903572 37903783 130 - chr3:37903657-37903706 NA NA NA NA NA chr3-135 37704454 37704976 286 - chr3:37704517-37704537 NA NA NA NA NA chr3-134 37108971 37109191 145 - chr3:37109043-37109163 NA NA NA NA NA chr3-133 36735914 36736178 132 - chr3:36736089-36736175 NA NA NA NA NA chr3-132 36699940 36700425 290 - chr3:36700249-36700308 NA NA NA NA NA chr3-131 36665009 36665276 212 - chr3:36665062-36665215 NA NA NA NA NA chr3-130 36316113 36316336 165 - chr3:36316170-36316277 NA NA NA NA NA chr3-129 36192092 36192331 185 - chr3:36192119-36192250 NA NA NA NA NA chr3-128 36098021 36098294 186 - chr3:36098195-36098294 NA NA NA NA NA chr3-127 35703707 35703915 130 - chr3:35703862-35703914 NA NA NA NA NA chr3-126 35562806 35563178 240 - chr3:35563040-35563148 NA NA NA NA NA chr3-125 35500280 35500556 156 - chr3:35500375-35500411 NA NA NA NA NA chr3-124 35406492 35406689 125 - chr3:35406606-35406659 NA NA NA NA NA chr3-123 34795443 34795708 219 - chr3:34795606-34795701 NA NA NA NA NA chr3-122 34566737 34567025 155 - chr3:34566862-34566868 NA NA NA NA NA chr3-121 34499472 34499731 142 - chr3:34499517-34499620 NA NA NA NA NA chr3-120 34334551 34334884 175 - chr3:34334656-34334673 NA NA NA NA NA chr3-119 34325941 34326533 324 - chr3:34326238-34326375 NA NA NA NA NA chr3-118 34050501 34050820 177 - chr3:34050646-34050681 NA NA NA NA NA chr3-117 33941820 33942058 153 - chr3:33941966-33942034 NA NA NA NA NA chr3-116 33232454 33232922 241 - chr3:33232566-33232580 NA NA NA NA NA chr3-115 33016435 33016759 181 - chr3:33016604-33016642 NA NA NA NA NA chr3-114 32520210 32520415 185 - chr3:32520236-32520413 NA NA NA NA NA chr3-113 32434419 32434680 146 - chr3:32434420-32434527 NA NA NA NA NA chr3-112 32418216 32418589 204 - chr3:32418352-32418391 NA NA NA NA NA chr3-8 3226566 3226876 198 - chr3:3226788-3226874 NA NA NA NA NA chr3-111 32026112 32026488 237 - chr3:32026293-32026379 NA NA NA NA NA chr3-110 31384259 31384504 176 - chr3:31384274-31384381 NA NA NA NA NA chr3-109 31160598 31161077 219 - chr3:31160685-31160708 NA NA NA NA NA chr3-108 30974352 30974603 156 - chr3:30974469-30974530 NA NA NA NA NA chr3-107 30809484 30809704 155 - chr3:30809591-30809653 NA NA NA NA NA chr3-106 30732807 30733076 177 - chr3:30732935-30733020 NA NA NA NA NA chr3-105 30382993 30383633 341 - chr3:30383282-30383304 NA NA NA NA NA chr3-104 30006000 30006279 176 - chr3:30006001-30006074 NA NA NA NA NA chr3-103 29775711 29775973 166 - chr3:29775783-29775869 NA NA NA NA NA chr3-102 29495141 29495595 181 - chr3:29495311-29495401 NA NA NA NA NA chr3-101 29364488 29364805 191 - chr3:29364629-29364684 NA NA NA NA NA chr3-100 29356099 29356348 161 - chr3:29356178-29356251 NA NA NA NA NA chr3-99 29089781 29090046 227 - chr3:29089794-29089983 NA NA NA NA NA chr3-98 29069587 29069914 166 - chr3:29069748-29069753 NA NA NA NA NA chr3-97 28934406 28934829 246 - chr3:28934477-28934546 NA NA NA NA NA chr3-96 28763952 28764122 158 - chr3:28763961-28764107 NA NA NA NA NA chr3-95 28762810 28763291 271 - chr3:28763110-28763199 NA NA NA NA NA chr3-94 28694051 28694475 151 - chr3:28694121-28694181 NA NA NA NA NA chr3-93 28534814 28535368 276 - chr3:28535080-28535086 NA NA NA NA NA chr3-92 28436613 28436950 222 - chr3:28436823-28436944 NA NA NA NA NA chr3-91 28049695 28049956 156 - chr3:28049751-28049872 NA NA NA NA NA chr3-90 27868217 27868523 197 - chr3:27868400-27868488 NA NA NA NA NA chr3-89 27675219 27675506 219 - chr3:27675227-27675418 NA NA NA NA NA chr3-88 27469645 27470072 256 - chr3:27469818-27469907 NA NA NA NA NA chr3-87 25505630 25505803 119 - chr3:25505726-25505791 NA NA NA NA NA chr3-86 25236247 25236608 197 - chr3:25236476-25236509 NA NA NA NA NA chr3-85 25154803 25155608 307 - chr3:25155114-25155242 NA NA NA NA NA chr3-84 24874185 24874398 170 - chr3:24874208-24874249 NA NA NA NA NA chr3-83 24299692 24299885 130 - chr3:24299692-24299759 NA NA NA NA NA chr3-82 24233230 24233467 203 - chr3:24233252-24233421 NA NA NA NA NA chr3-81 24025637 24026014 205 - chr3:24025840-24025873 NA NA NA NA NA chr3-80 23860351 23860611 168 - chr3:23860444-23860520 NA NA NA NA NA chr3-79 23293276 23293471 151 - chr3:23293293-23293418 NA NA NA NA NA chr3-78 23228087 23228500 328 - chr3:23228194-23228479 NA NA NA NA NA chr3-77 23220137 23220466 275 - chr3:23220168-23220425 NA NA NA NA NA chr3-76 23133359 23133712 190 - chr3:23133548-23133627 NA NA NA NA NA chr3-75 22875629 22875938 195 - chr3:22875709-22875790 NA NA NA NA NA chr3-74 22737002 22737497 229 - chr3:22737311-22737360 NA NA NA NA NA chr3-73 22276972 22277168 138 - chr3:22276997-22277011 NA NA NA NA NA chr3-72 22212121 22212334 196 - chr3:22212147-22212320 NA NA NA NA NA chr3-71 22136633 22137034 281 - chr3:22136871-22136942 NA NA NA NA NA chr3-70 21896099 21896282 141 - chr3:21896130-21896229 NA NA NA NA NA chr3-69 21847152 21847382 165 - chr3:21847230-21847330 NA NA NA NA NA chr3-68 21755711 21756171 188 - chr3:21755859-21755899 NA NA NA NA NA chr3-67 21740208 21740496 210 - chr3:21740244-21740389 NA NA NA NA NA chr3-66 21146839 21147271 222 - chr3:21146993-21147075 NA NA NA NA NA chr3-7 2113367 2113590 128 - chr3:2113505-2113538 NA NA NA NA NA chr3-65 21041689 21041838 122 - chr3:21041700-21041795 NA NA NA NA NA chr3-64 21004176 21004502 262 - chr3:21004220-21004290 NA NA NA NA NA chr3-63 20928614 20928890 249 - chr3:20928627-20928883 NA NA NA NA NA chr3-62 20895408 20895642 160 - chr3:20895509-20895595 NA NA NA NA NA chr3-61 20847629 20847893 209 - chr3:20847816-20847882 NA NA NA NA NA chr3-60 20686699 20687004 265 - chr3:20686768-20686993 NA NA NA NA NA chr3-59 20244097 20244246 133 - chr3:20244117-20244242 NA NA NA NA NA chr3-58 20185034 20185267 165 - chr3:20185066-20185163 NA NA NA NA NA chr3-57 20132815 20133020 163 - chr3:20132849-20132970 NA NA NA NA NA chr3-56 19966460 19966724 228 - chr3:19966466-19966658 NA NA NA NA NA chr3-678 196136526 196136662 113 - chr3:196136540-196136630 NA NA NA NA NA chr3-677 195584434 195584601 119 - chr3:195584435-195584506 NA NA NA NA NA chr3-676 195558992 195559199 135 - chr3:195559086-195559193 NA NA NA NA NA chr3-2 195407 195690 179 - chr3:195495-195538 NA NA NA NA NA chr3-675 195434385 195434694 164 - chr3:195434410-195434509 NA NA NA NA NA chr3-674 194833750 194834269 268 - chr3:194834107-194834124 NA NA NA NA NA chr3-673 194791687 194791938 188 - chr3:194791717-194791842 NA NA NA NA NA chr3-672 194784390 194784696 196 - chr3:194784599-194784619 NA NA NA NA NA chr3-671 194263468 194263737 201 - chr3:194263596-194263729 NA NA NA NA NA chr3-670 194105754 194106129 212 - chr3:194105798-194105847 NA NA NA NA NA chr3-669 193968540 193968889 228 - chr3:193968706-193968791 NA NA NA NA NA chr3-668 193415917 193416232 142 - chr3:193416083-193416143 NA NA NA NA NA chr3-667 193354431 193354772 212 - chr3:193354615-193354698 NA NA NA NA NA chr3-666 192724816 192725027 151 - chr3:192724857-192724910 NA NA NA NA NA chr3-665 192575450 192575646 131 - chr3:192575573-192575639 NA NA NA NA NA chr3-664 192502034 192502541 272 - chr3:192502306-192502343 NA NA NA NA NA chr3-663 192470707 192470973 180 - chr3:192470769-192470879 NA NA NA NA NA chr3-662 192037096 192037346 235 - chr3:192037097-192037287 NA NA NA NA NA chr3-661 191940841 191941057 178 - chr3:191940849-191940989 NA NA NA NA NA chr3-660 191720407 191720624 139 - chr3:191720526-191720587 NA NA NA NA NA chr3-659 191530040 191530285 196 - chr3:191530057-191530106 NA NA NA NA NA chr3-658 191473313 191473522 131 - chr3:191473350-191473403 NA NA NA NA NA chr3-657 190815900 190816146 127 - chr3:190816058-190816066 NA NA NA NA NA chr3-656 190498631 190498931 184 - chr3:190498631-190498699 NA NA NA NA NA chr3-655 190158817 190159009 140 - chr3:190158882-190158970 NA NA NA NA NA chr3-654 190156270 190156580 207 - chr3:190156301-190156405 NA NA NA NA NA chr3-653 189951682 189951916 186 - chr3:189951717-189951855 NA NA NA NA NA chr3-652 189864378 189864663 174 - chr3:189864391-189864528 NA NA NA NA NA chr3-651 189814476 189814798 184 - chr3:189814580-189814649 NA NA NA NA NA chr3-650 189800881 189801257 152 - chr3:189800949-189800981 NA NA NA NA NA chr3-55 18957196 18957466 186 - chr3:18957270-18957352 NA NA NA NA NA chr3-649 189459696 189459986 229 - chr3:189459925-189459981 NA NA NA NA NA chr3-648 189263007 189263353 278 - chr3:189263045-189263195 NA NA NA NA NA chr3-647 188942682 188942997 174 - chr3:188942802-188942849 NA NA NA NA NA chr3-646 187992801 187993133 206 - chr3:187992909-187992989 NA NA NA NA NA chr3-645 187906058 187906240 139 - chr3:187906142-187906238 NA NA NA NA NA chr3-644 187854320 187854497 129 - chr3:187854397-187854478 NA NA NA NA NA chr3-643 187649204 187649436 151 - chr3:187649280-187649350 NA NA NA NA NA chr3-54 18749158 18749384 160 - chr3:18749275-18749369 NA NA NA NA NA chr3-642 187484165 187484445 222 - chr3:187484213-187484377 NA NA NA NA NA chr3-641 187478000 187478281 181 - chr3:187478143-187478224 NA NA NA NA NA chr3-640 187214778 187215048 142 - chr3:187214874-187214888 NA NA NA NA NA chr3-639 187083735 187084203 260 - chr3:187083884-187083936 NA NA NA NA NA chr3-638 186862828 186863137 246 - chr3:186862930-186863087 NA NA NA NA NA chr3-6 1868600 1868917 186 - chr3:1868625-1868680 NA NA NA NA NA chr3-637 186405929 186406339 161 - chr3:186406005-186406083 NA NA NA NA NA chr3-636 186236486 186236674 160 - chr3:186236568-186236644 NA NA NA NA NA chr3-635 186173308 186173750 178 - chr3:186173325-186173415 NA NA NA NA NA chr3-634 186068011 186068393 199 - chr3:186068180-186068196 NA NA NA NA NA chr3-633 185737005 185737225 118 - chr3:185737129-185737145 NA NA NA NA NA chr3-53 18560007 18560159 128 - chr3:18560090-18560146 NA NA NA NA NA chr3-632 185518239 185518687 205 - chr3:185518514-185518534 NA NA NA NA NA chr3-631 185359903 185360314 237 - chr3:185360029-185360114 NA NA NA NA NA chr3-630 185145102 185145481 199 - chr3:185145361-185145426 NA NA NA NA NA chr3-629 184903887 184904235 202 - chr3:184904020-184904076 NA NA NA NA NA chr3-628 184797051 184797456 227 - chr3:184797225-184797274 NA NA NA NA NA chr3-627 184350066 184350314 147 - chr3:184350143-184350189 NA NA NA NA NA chr3-626 183805390 183805732 187 - chr3:183805518-183805550 NA NA NA NA NA chr3-625 183365229 183365583 192 - chr3:183365330-183365468 NA NA NA NA NA chr3-624 182832954 182833191 200 - chr3:182832983-182833146 NA NA NA NA NA chr3-623 182710262 182710455 130 - chr3:182710346-182710399 NA NA NA NA NA chr3-622 182518895 182519186 120 - chr3:182518974-182519037 NA NA NA NA NA chr3-621 182394696 182394952 178 - chr3:182394739-182394769 NA NA NA NA NA chr3-620 182366501 182366724 124 - chr3:182366629-182366654 NA NA NA NA NA chr3-619 182348977 182349238 168 - chr3:182349066-182349141 NA NA NA NA NA chr3-618 182334662 182334958 186 - chr3:182334735-182334811 NA NA NA NA NA chr3-617 182232502 182232818 205 - chr3:182232623-182232717 NA NA NA NA NA chr3-616 182130163 182130447 176 - chr3:182130224-182130292 NA NA NA NA NA chr3-615 181800453 181800825 282 - chr3:181800714-181800792 NA NA NA NA NA chr3-614 181409873 181410256 299 - chr3:181410036-181410251 NA NA NA NA NA chr3-613 181114396 181114736 229 - chr3:181114443-181114446 NA NA NA NA NA chr3-52 18092352 18092816 220 - chr3:18092510-18092539 NA NA NA NA NA chr3-612 180656793 180657071 166 - chr3:180656859-180656913 NA NA NA NA NA chr3-611 180016902 180017189 155 - chr3:180017029-180017052 NA NA NA NA NA chr3-610 179851536 179851769 165 - chr3:179851573-179851670 NA NA NA NA NA chr3-609 179594716 179595008 169 - chr3:179594927-179594973 NA NA NA NA NA chr3-51 17950302 17950638 223 - chr3:17950445-17950615 NA NA NA NA NA chr3-608 179266016 179266314 160 - chr3:179266037-179266137 NA NA NA NA NA chr3-607 179152840 179153341 265 - chr3:179153131-179153160 NA NA NA NA NA chr3-606 179072404 179072696 199 - chr3:179072460-179072566 NA NA NA NA NA chr3-605 178969920 178970145 130 - chr3:178970006-178970041 NA NA NA NA NA chr3-604 178583027 178583320 147 - chr3:178583109-178583110 NA NA NA NA NA chr3-603 178509707 178510045 226 - chr3:178509781-178509895 NA NA NA NA NA chr3-602 178455954 178456416 234 - chr3:178456153-178456233 NA NA NA NA NA chr3-601 178216291 178216695 211 - chr3:178216424-178216442 NA NA NA NA NA chr3-600 177991084 177991414 212 - chr3:177991325-177991337 NA NA NA NA NA chr3-599 177924445 177924769 195 - chr3:177924519-177924576 NA NA NA NA NA chr3-598 177820308 177820627 197 - chr3:177820428-177820499 NA NA NA NA NA chr3-597 177341316 177341713 220 - chr3:177341511-177341554 NA NA NA NA NA chr3-596 177060968 177061160 133 - chr3:177060991-177061065 NA NA NA NA NA chr3-50 17657882 17658108 165 - chr3:17657918-17657972 NA NA NA NA NA chr3-49 17584375 17584665 217 - chr3:17584498-17584642 NA NA NA NA NA chr3-595 175736351 175736588 146 - chr3:175736415-175736470 NA NA NA NA NA chr3-48 17551519 17551747 206 - chr3:17551543-17551727 NA NA NA NA NA chr3-594 175175859 175176119 180 - chr3:175175931-175176015 NA NA NA NA NA chr3-47 17482829 17483256 253 - chr3:17482936-17483015 NA NA NA NA NA chr3-593 174404271 174404456 133 - chr3:174404308-174404389 NA NA NA NA NA chr3-592 173684939 173685117 118 - chr3:173684966-173685024 NA NA NA NA NA chr3-591 173111597 173112125 201 - chr3:173112008-173112031 NA NA NA NA NA chr3-590 172737452 172737736 193 - chr3:172737506-172737620 NA NA NA NA NA chr3-589 172616219 172616564 187 - chr3:172616353-172616382 NA NA NA NA NA chr3-588 171980035 171980506 282 - chr3:171980249-171980392 NA NA NA NA NA chr3-587 171861342 171861530 116 - chr3:171861391-171861435 NA NA NA NA NA chr3-586 171348575 171348929 240 - chr3:171348633-171348759 NA NA NA NA NA chr3-585 170898618 170899028 262 - chr3:170898855-170898997 NA NA NA NA NA chr3-584 170866823 170867157 202 - chr3:170866847-170866917 NA NA NA NA NA chr3-583 170744224 170744689 294 - chr3:170744439-170744470 NA NA NA NA NA chr3-582 170601864 170602101 195 - chr3:170601864-170601933 NA NA NA NA NA chr3-581 170581557 170581944 211 - chr3:170581623-170581658 NA NA NA NA NA chr3-46 17000885 17001280 214 - chr3:17001057-17001072 NA NA NA NA NA chr3-45 16933144 16933307 150 - chr3:16933149-16933270 NA NA NA NA NA chr3-580 169008381 169008679 244 - chr3:169008442-169008632 NA NA NA NA NA chr3-579 168617377 168617659 145 - chr3:168617542-168617606 NA NA NA NA NA chr3-44 16859409 16859603 115 - chr3:16859512-16859532 NA NA NA NA NA chr3-578 168326126 168326337 133 - chr3:168326261-168326278 NA NA NA NA NA chr3-43 16794299 16794602 157 - chr3:16794478-16794555 NA NA NA NA NA chr3-577 167660906 167661393 301 - chr3:167661068-167661069 NA NA NA NA NA chr3-576 167567086 167567444 204 - chr3:167567126-167567252 NA NA NA NA NA chr3-575 166037545 166038130 391 - chr3:166037606-166037803 NA NA NA NA NA chr3-574 165707245 165707619 302 - chr3:165707359-165707589 NA NA NA NA NA chr3-573 165679494 165679822 202 - chr3:165679555-165679715 NA NA NA NA NA chr3-572 163830396 163830863 260 - chr3:163830560-163830716 NA NA NA NA NA chr3-571 163498461 163498716 138 - chr3:163498595-163498616 NA NA NA NA NA chr3-570 163209329 163209559 190 - chr3:163209357-163209507 NA NA NA NA NA chr3-569 162770964 162771325 228 - chr3:162771063-162771158 NA NA NA NA NA chr3-568 162504807 162505046 166 - chr3:162504846-162504939 NA NA NA NA NA chr3-567 161543815 161544111 178 - chr3:161544003-161544063 NA NA NA NA NA chr3-566 161458801 161459047 170 - chr3:161458863-161458957 NA NA NA NA NA chr3-565 161296857 161297278 331 - chr3:161297001-161297242 NA NA NA NA NA chr3-564 161252358 161252559 129 - chr3:161252477-161252534 NA NA NA NA NA chr3-563 160506002 160506300 194 - chr3:160506088-160506178 NA NA NA NA NA chr3-562 160402086 160402413 191 - chr3:160402149-160402204 NA NA NA NA NA chr3-42 16007948 16008201 155 - chr3:16008022-16008095 NA NA NA NA NA chr3-561 159956240 159956422 136 - chr3:159956264-159956310 NA NA NA NA NA chr3-41 15989526 15989788 221 - chr3:15989537-15989717 NA NA NA NA NA chr3-560 159746124 159746392 169 - chr3:159746231-159746367 NA NA NA NA NA chr3-559 159305992 159306314 197 - chr3:159306045-159306184 NA NA NA NA NA chr3-558 159007143 159007482 132 - chr3:159007327-159007390 NA NA NA NA NA chr3-557 158791378 158791609 159 - chr3:158791504-158791591 NA NA NA NA NA chr3-556 158488486 158489100 361 - chr3:158488827-158488830 NA NA NA NA NA chr3-555 158204879 158205080 169 - chr3:158204879-158205016 NA NA NA NA NA chr3-554 157681951 157682332 257 - chr3:157682021-157682190 NA NA NA NA NA chr3-553 157438448 157438777 187 - chr3:157438581-157438632 NA NA NA NA NA chr3-552 157121839 157122034 160 - chr3:157121864-157121989 NA NA NA NA NA chr3-551 157008109 157008450 244 - chr3:157008152-157008191 NA NA NA NA NA chr3-550 156838249 156838522 183 - chr3:156838313-156838354 NA NA NA NA NA chr3-549 156348088 156348417 153 - chr3:156348189-156348216 NA NA NA NA NA chr3-548 156320140 156320742 220 - chr3:156320231-156320263 NA NA NA NA NA chr3-547 154325557 154325811 143 - chr3:154325752-154325784 NA NA NA NA NA chr3-546 152785579 152785814 114 - chr3:152785652-152785677 NA NA NA NA NA chr3-545 152775096 152775424 169 - chr3:152775266-152775315 NA NA NA NA NA chr3-544 152639745 152640005 156 - chr3:152639848-152639900 NA NA NA NA NA chr3-40 15257032 15257239 169 - chr3:15257045-15257176 NA NA NA NA NA chr3-543 152404782 152405087 171 - chr3:152404854-152404891 NA NA NA NA NA chr3-542 152261082 152261367 146 - chr3:152261219-152261226 NA NA NA NA NA chr3-541 152153895 152154078 156 - chr3:152153943-152154072 NA NA NA NA NA chr3-540 151236147 151236410 198 - chr3:151236182-151236224 NA NA NA NA NA chr3-539 150669053 150669481 184 - chr3:150669350-150669396 NA NA NA NA NA chr3-39 15040414 15040705 163 - chr3:15040448-15040483 NA NA NA NA NA chr3-538 149978135 149978458 226 - chr3:149978322-149978451 NA NA NA NA NA chr3-38 14984499 14984707 159 - chr3:14984575-14984685 NA NA NA NA NA chr3-537 149752259 149752652 224 - chr3:149752533-149752584 NA NA NA NA NA chr3-37 14960132 14960362 193 - chr3:14960154-14960310 NA NA NA NA NA chr3-536 149589959 149590158 184 - chr3:149589972-149590137 NA NA NA NA NA chr3-535 148925698 148926175 256 - chr3:148925844-148925929 NA NA NA NA NA chr3-534 148087092 148087497 272 - chr3:148087221-148087352 NA NA NA NA NA chr3-533 147865550 147866142 436 - chr3:147865612-147866032 NA NA NA NA NA chr3-532 147749780 147750005 170 - chr3:147749803-147749854 NA NA NA NA NA chr3-531 147686438 147686748 190 - chr3:147686552-147686610 NA NA NA NA NA chr3-36 14740928 14741278 153 - chr3:14741153-14741181 NA NA NA NA NA chr3-530 147242240 147242454 144 - chr3:147242250-147242324 NA NA NA NA NA chr3-529 146458329 146458695 178 - chr3:146458354-146458455 NA NA NA NA NA chr3-528 146059150 146059580 370 - chr3:146059255-146059565 NA NA NA NA NA chr3-527 146040870 146041335 228 - chr3:146040999-146041018 NA NA NA NA NA chr3-526 145595415 145595711 240 - chr3:145595597-145595697 NA NA NA NA NA chr3-525 144895766 144896055 168 - chr3:144895887-144895934 NA NA NA NA NA chr3-524 144822905 144823193 175 - chr3:144823009-144823071 NA NA NA NA NA chr3-523 144695148 144695359 142 - chr3:144695155-144695274 NA NA NA NA NA chr3-522 144677300 144677536 155 - chr3:144677312-144677432 NA NA NA NA NA chr3-521 143124332 143124463 116 - chr3:143124339-143124410 NA NA NA NA NA chr3-520 142125014 142125601 330 - chr3:142125422-142125515 NA NA NA NA NA chr3-519 141585292 141585492 146 - chr3:141585367-141585459 NA NA NA NA NA chr3-518 140467847 140468021 139 - chr3:140467910-140468014 NA NA NA NA NA chr3-517 139763696 139764039 208 - chr3:139763883-139763956 NA NA NA NA NA chr3-516 139491277 139491560 188 - chr3:139491413-139491506 NA NA NA NA NA chr3-515 138440847 138441173 256 - chr3:138440927-138441113 NA NA NA NA NA chr3-514 138369468 138369932 241 - chr3:138369688-138369708 NA NA NA NA NA chr3-513 137364489 137364764 133 - chr3:137364538-137364614 NA NA NA NA NA chr3-512 137187766 137188107 173 - chr3:137187843-137187960 NA NA NA NA NA chr3-511 137118810 137118977 141 - chr3:137118850-137118965 NA NA NA NA NA chr3-510 136620932 136621184 174 - chr3:136620988-136621084 NA NA NA NA NA chr3-509 136533436 136533744 203 - chr3:136533512-136533610 NA NA NA NA NA chr3-35 13630670 13630995 196 - chr3:13630832-13630899 NA NA NA NA NA chr3-508 135723383 135723611 183 - chr3:135723391-135723439 NA NA NA NA NA chr3-507 135012933 135013186 122 - chr3:135013093-135013142 NA NA NA NA NA chr3-506 134694418 134694638 124 - chr3:134694570-134694598 NA NA NA NA NA chr3-505 134170477 134170722 163 - chr3:134170555-134170636 NA NA NA NA NA chr3-504 133997734 133997977 129 - chr3:133997857-133997872 NA NA NA NA NA chr3-503 133798962 133799172 158 - chr3:133799003-133799109 NA NA NA NA NA chr3-502 133511014 133511315 153 - chr3:133511148-133511153 NA NA NA NA NA chr3-501 133189321 133189666 173 - chr3:133189593-133189594 NA NA NA NA NA chr3-500 132880490 132880904 222 - chr3:132880702-132880860 NA NA NA NA NA chr3-499 132463120 132463404 188 - chr3:132463196-132463288 NA NA NA NA NA chr3-498 132221749 132221971 187 - chr3:132221818-132221970 NA NA NA NA NA chr3-497 132214510 132214946 260 - chr3:132214611-132214695 NA NA NA NA NA chr3-496 132169210 132169415 120 - chr3:132169211-132169302 NA NA NA NA NA chr3-495 131836994 131837436 168 - chr3:131837359-131837435 NA NA NA NA NA chr3-494 131696250 131696516 165 - chr3:131696324-131696388 NA NA NA NA NA chr3-493 131681760 131681926 116 - chr3:131681859-131681925 NA NA NA NA NA chr3-492 131632642 131632990 195 - chr3:131632769-131632811 NA NA NA NA NA chr3-491 130997454 130997713 175 - chr3:130997479-130997570 NA NA NA NA NA chr3-490 130938111 130938527 225 - chr3:130938300-130938330 NA NA NA NA NA chr3-489 130840987 130841296 182 - chr3:130840998-130841053 NA NA NA NA NA chr3-488 130776932 130777573 347 - chr3:130777296-130777552 NA NA NA NA NA chr3-487 130733393 130733704 182 - chr3:130733411-130733464 NA NA NA NA NA chr3-486 130699229 130699404 128 - chr3:130699281-130699362 NA NA NA NA NA chr3-485 130329127 130329317 126 - chr3:130329197-130329259 NA NA NA NA NA chr3-34 13000799 13001137 172 - chr3:13001029-13001035 NA NA NA NA NA chr3-484 129855810 129856156 148 - chr3:129855909-129855925 NA NA NA NA NA chr3-483 129758724 129759022 231 - chr3:129758808-129758972 NA NA NA NA NA chr3-482 129657903 129658218 159 - chr3:129657904-129658011 NA NA NA NA NA chr3-481 129238914 129239245 233 - chr3:129239026-129239189 NA NA NA NA NA chr3-480 129093705 129093971 144 - chr3:129093895-129093917 NA NA NA NA NA chr3-479 128946612 128947138 249 - chr3:128946978-128947009 NA NA NA NA NA chr3-478 128790983 128791401 211 - chr3:128791136-128791176 NA NA NA NA NA chr3-477 128780232 128780426 126 - chr3:128780321-128780421 NA NA NA NA NA chr3-476 128433503 128433791 169 - chr3:128433643-128433679 NA NA NA NA NA chr3-33 12811394 12811751 230 - chr3:12811534-12811637 NA NA NA NA NA chr3-475 127839432 127839634 166 - chr3:127839452-127839582 NA NA NA NA NA chr3-474 127385723 127386029 227 - chr3:127385823-127385971 NA NA NA NA NA chr3-473 127132057 127132253 122 - chr3:127132166-127132233 NA NA NA NA NA chr3-472 126248986 126249278 202 - chr3:126249026-126249038 NA NA NA NA NA chr3-32 12623189 12623377 115 - chr3:12623262-12623304 NA NA NA NA NA chr3-471 126066330 126066648 168 - chr3:126066501-126066505 NA NA NA NA NA chr3-470 126017487 126017750 158 - chr3:126017616-126017739 NA NA NA NA NA chr3-469 125599726 125600232 279 - chr3:125599735-125599787 NA NA NA NA NA chr3-468 125293560 125293835 159 - chr3:125293681-125293734 NA NA NA NA NA chr3-31 12511256 12511492 158 - chr3:12511403-12511437 NA NA NA NA NA chr3-30 12499783 12500146 188 - chr3:12499907-12499954 NA NA NA NA NA chr3-467 124925458 124925748 184 - chr3:124925576-124925646 NA NA NA NA NA chr3-466 124888242 124888584 247 - chr3:124888368-124888520 NA NA NA NA NA chr3-465 124811665 124811940 248 - chr3:124811755-124811922 NA NA NA NA NA chr3-464 124707098 124707459 186 - chr3:124707192-124707257 NA NA NA NA NA chr3-463 124383830 124384280 269 - chr3:124383976-124384064 NA NA NA NA NA chr3-462 123854638 123855128 259 - chr3:123854660-123854784 NA NA NA NA NA chr3-461 123819779 123820165 215 - chr3:123819966-123820124 NA NA NA NA NA chr3-460 123463727 123463979 131 - chr3:123463820-123463830 NA NA NA NA NA chr3-459 123235491 123235849 184 - chr3:123235726-123235736 NA NA NA NA NA chr3-458 123040170 123040466 215 - chr3:123040271-123040445 NA NA NA NA NA chr3-457 122999392 122999741 205 - chr3:122999561-122999672 NA NA NA NA NA chr3-456 122874962 122875205 203 - chr3:122874974-122875057 NA NA NA NA NA chr3-455 122506752 122507262 263 - chr3:122507045-122507153 NA NA NA NA NA chr3-454 122369159 122369497 235 - chr3:122369241-122369387 NA NA NA NA NA chr3-453 122074129 122074401 225 - chr3:122074187-122074271 NA NA NA NA NA chr3-452 122057810 122058124 171 - chr3:122057852-122057944 NA NA NA NA NA chr3-451 121730481 121730710 144 - chr3:121730562-121730621 NA NA NA NA NA chr3-450 121484890 121485158 168 - chr3:121485008-121485076 NA NA NA NA NA chr3-449 121439715 121440017 225 - chr3:121439812-121439942 NA NA NA NA NA chr3-448 121304518 121304817 249 - chr3:121304679-121304804 NA NA NA NA NA chr3-447 121245715 121245948 154 - chr3:121245765-121245840 NA NA NA NA NA chr3-446 121101920 121102208 172 - chr3:121102045-121102101 NA NA NA NA NA chr3-445 120953574 120953860 219 - chr3:120953611-120953783 NA NA NA NA NA chr3-444 120644217 120644701 206 - chr3:120644488-120644560 NA NA NA NA NA chr3-443 119654828 119655051 160 - chr3:119654876-119654973 NA NA NA NA NA chr3-442 119310954 119311096 127 - chr3:119310979-119311091 NA NA NA NA NA chr3-441 119223480 119223632 151 - chr3:119223481-119223631 NA NA NA NA NA chr3-440 119082297 119082527 119 - chr3:119082423-119082461 NA NA NA NA NA chr3-439 118901964 118902189 134 - chr3:118902107-118902150 NA NA NA NA NA chr3-438 118504321 118504582 141 - chr3:118504465-118504486 NA NA NA NA NA chr3-437 118419323 118419737 245 - chr3:118419336-118419511 NA NA NA NA NA chr3-436 118414867 118415119 126 - chr3:118414911-118414995 NA NA NA NA NA chr3-435 118104577 118104900 175 - chr3:118104609-118104636 NA NA NA NA NA chr3-434 118031470 118031617 113 - chr3:118031506-118031585 NA NA NA NA NA chr3 117836 118242 269 - chr3:117840-117972 NA NA NA NA NA chr3-433 117815454 117815746 184 - chr3:117815563-117815639 NA NA NA NA NA chr3-432 117801165 117801535 190 - chr3:117801295-117801305 NA NA NA NA NA chr3-431 116856514 116856821 153 - chr3:116856744-116856755 NA NA NA NA NA chr3-430 116431147 116431425 143 - chr3:116431235-116431333 NA NA NA NA NA chr3-429 116056198 116056534 243 - chr3:116056258-116056342 NA NA NA NA NA chr3-428 115914696 115914935 152 - chr3:115914700-115914823 NA NA NA NA NA chr3-427 115848442 115848821 245 - chr3:115848669-115848718 NA NA NA NA NA chr3-426 115690790 115691120 264 - chr3:115690872-115691114 NA NA NA NA NA chr3-425 115241100 115241410 232 - chr3:115241100-115241254 NA NA NA NA NA chr3-424 114998342 114998620 147 - chr3:114998500-114998517 NA NA NA NA NA chr3-423 114994038 114994373 218 - chr3:114994181-114994251 NA NA NA NA NA chr3-422 114715778 114716033 183 - chr3:114715799-114715911 NA NA NA NA NA chr3-421 114616760 114617074 146 - chr3:114616981-114617071 NA NA NA NA NA chr3-420 114304722 114305141 198 - chr3:114304835-114304884 NA NA NA NA NA chr3-419 114186606 114187041 224 - chr3:114186925-114187018 NA NA NA NA NA chr3-418 114180682 114181034 205 - chr3:114180797-114180855 NA NA NA NA NA chr3-417 114048592 114048894 178 - chr3:114048791-114048845 NA NA NA NA NA chr3-416 113868394 113868767 261 - chr3:113868522-113868703 NA NA NA NA NA chr3-415 113610980 113611304 207 - chr3:113611102-113611192 NA NA NA NA NA chr3-414 113227461 113227745 199 - chr3:113227483-113227597 NA NA NA NA NA chr3-29 11317813 11318074 151 - chr3:11317864-11317905 NA NA NA NA NA chr3-413 112959412 112959772 288 - chr3:112959471-112959543 NA NA NA NA NA chr3-412 112793251 112793594 290 - chr3:112793305-112793544 NA NA NA NA NA chr3-411 112497032 112497268 144 - chr3:112497064-112497116 NA NA NA NA NA chr3-410 112199554 112200288 477 - chr3:112199866-112200086 NA NA NA NA NA chr3-409 111726300 111726548 196 - chr3:111726400-111726544 NA NA NA NA NA chr3-408 111396369 111396604 121 - chr3:111396546-111396553 NA NA NA NA NA chr3-28 11130741 11130944 122 - chr3:11130829-11130870 NA NA NA NA NA chr3-407 111220067 111220261 125 - chr3:111220069-111220125 NA NA NA NA NA chr3-406 111182450 111182686 114 - chr3:111182589-111182615 NA NA NA NA NA chr3-405 111175948 111176144 176 - chr3:111175950-111176118 NA NA NA NA NA chr3-404 111159540 111159758 150 - chr3:111159600-111159682 NA NA NA NA NA chr3-403 111079619 111079949 247 - chr3:111079906-111079934 NA NA NA NA NA chr3-402 110856041 110856358 216 - chr3:110856101-110856216 NA NA NA NA NA chr3-401 110659723 110660030 174 - chr3:110659864-110659921 NA NA NA NA NA chr3-400 110568449 110568629 129 - chr3:110568498-110568576 NA NA NA NA NA chr3-399 110567012 110567190 135 - chr3:110567080-110567172 NA NA NA NA NA chr3-398 110215478 110215835 246 - chr3:110215640-110215775 NA NA NA NA NA chr3-397 110112191 110112342 118 - chr3:110112227-110112318 NA NA NA NA NA chr3-396 110004227 110004470 154 - chr3:110004271-110004336 NA NA NA NA NA chr3-395 109925121 109925716 225 - chr3:109925457-109925515 NA NA NA NA NA chr3-394 109749566 109749833 140 - chr3:109749746-109749759 NA NA NA NA NA chr3-393 109135819 109136157 290 - chr3:109135871-109136113 NA NA NA NA NA chr3-392 108714132 108714296 136 - chr3:108714153-108714247 NA NA NA NA NA chr3-391 108595573 108596058 272 - chr3:108595663-108595678 NA NA NA NA NA chr3-27 10837585 10838155 379 - chr3:10837712-10837772 NA NA NA NA NA chr3-390 108304279 108304574 165 - chr3:108304426-108304495 NA NA NA NA NA chr3-389 107932585 107933000 267 - chr3:107932702-107932762 NA NA NA NA NA chr3-388 107725658 107726041 202 - chr3:107725678-107725805 NA NA NA NA NA chr3-387 107550234 107550545 248 - chr3:107550284-107550443 NA NA NA NA NA chr3-386 107286579 107286952 245 - chr3:107286784-107286901 NA NA NA NA NA chr3-385 105979931 105980215 174 - chr3:105979997-105980061 NA NA NA NA NA chr3-384 105492764 105493008 179 - chr3:105492832-105492946 NA NA NA NA NA chr3-5 1053526 1053725 164 - chr3:1053559-1053618 NA NA NA NA NA chr3-383 105187906 105188309 273 - chr3:105188125-105188268 NA NA NA NA NA chr3-382 104786210 104786560 122 - chr3:104786512-104786554 NA NA NA NA NA chr3-381 104276755 104276953 134 - chr3:104276841-104276911 NA NA NA NA NA chr3-380 103778674 103778880 166 - chr3:103778725-103778771 NA NA NA NA NA chr3-379 103746148 103746380 177 - chr3:103746197-103746319 NA NA NA NA NA chr3-378 103715115 103715540 222 - chr3:103715414-103715433 NA NA NA NA NA chr3-377 103331482 103331726 151 - chr3:103331482-103331602 NA NA NA NA NA chr3-376 103201566 103201769 172 - chr3:103201648-103201727 NA NA NA NA NA chr3-375 103015014 103015275 137 - chr3:103015160-103015173 NA NA NA NA NA chr3-374 102977292 102977587 247 - chr3:102977369-102977472 NA NA NA NA NA chr3-373 102742922 102743206 135 - chr3:102743011-102743037 NA NA NA NA NA chr3-372 102548986 102549250 183 - chr3:102549004-102549160 NA NA NA NA NA chr3-371 102377511 102377723 164 - chr3:102377574-102377720 NA NA NA NA NA chr3-370 102271314 102271505 166 - chr3:102271408-102271499 NA NA NA NA NA chr3-369 102104090 102104416 142 - chr3:102104157-102104178 NA NA NA NA NA chr3-368 101955459 101955919 254 - chr3:101955634-101955691 NA NA NA NA NA chr3-367 101802131 101802521 209 - chr3:101802277-101802305 NA NA NA NA NA chr3-366 101529166 101529541 152 - chr3:101529422-101529473 NA NA NA NA NA chr3-365 101366517 101366847 178 - chr3:101366657-101366683 NA NA NA NA NA chr3-364 101342261 101342560 204 - chr3:101342310-101342327 NA NA NA NA NA chr3-363 101241339 101241659 187 - chr3:101241382-101241436 NA NA NA NA NA chr3-362 100955335 100955977 333 - chr3:100955581-100955605 NA NA NA NA NA chr3-361 100424586 100424805 149 - chr3:100424705-100424784 NA NA NA NA NA chr3-360 100250630 100250936 304 - chr3:100250634-100250936 NA NA NA NA NA chr3-359 100112518 100112854 179 - chr3:100112598-100112620 NA NA NA NA NA chr2-446 99918594 99918764 120 - chr2:99918683-99918727 NA NA NA NA NA chr2-445 99818034 99818539 224 - chr2:99818201-99818207 NA NA NA NA NA chr2-444 99346021 99346398 235 - chr2:99346225-99346318 NA NA NA NA NA chr2-443 99198593 99198798 136 - chr2:99198616-99198683 NA NA NA NA NA chr2-20 9917437 9917816 257 - chr2:9917479-9917501 NA NA NA NA NA chr2-442 99151946 99152251 166 - chr2:99152043-99152098 NA NA NA NA NA chr2-441 98358747 98359076 258 - chr2:98358748-98358935 NA NA NA NA NA chr2-440 98260062 98261039 551 - chr2:98260177-98260883 NA NA NA NA NA chr2-439 98170545 98170729 165 - chr2:98170570-98170712 NA NA NA NA NA chr2-438 98145111 98145457 220 - chr2:98145117-98145291 NA NA NA NA NA chr2-437 97857481 97857703 113 - chr2:97857620-97857684 NA NA NA NA NA chr2-436 97800990 97801135 119 - chr2:97801088-97801133 NA NA NA NA NA chr2-435 97766090 97766220 118 - chr2:97766102-97766216 NA NA NA NA NA chr2-434 97680156 97680539 205 - chr2:97680464-97680491 NA NA NA NA NA chr2-433 96985391 96985807 235 - chr2:96985576-96985638 NA NA NA NA NA chr2-432 96759528 96759885 150 - chr2:96759746-96759796 NA NA NA NA NA chr2-431 96469044 96469302 147 - chr2:96469155-96469191 NA NA NA NA NA chr2-430 96275401 96275580 139 - chr2:96275534-96275571 NA NA NA NA NA chr2-429 96243872 96244274 169 - chr2:96243940-96243986 NA NA NA NA NA chr2-428 95569128 95569322 143 - chr2:95569178-95569270 NA NA NA NA NA chr2-427 95360621 95360944 184 - chr2:95360784-95360877 NA NA NA NA NA chr2-426 95328462 95328685 136 - chr2:95328553-95328602 NA NA NA NA NA chr2-425 95099830 95100111 154 - chr2:95099922-95099949 NA NA NA NA NA chr2-424 95066582 95066881 198 - chr2:95066613-95066710 NA NA NA NA NA chr2-19 9126891 9127386 235 - chr2:9127059-9127128 NA NA NA NA NA chr2-18 8989112 8989714 272 - chr2:8989336-8989538 NA NA NA NA NA chr2-423 89832704 89832926 188 - chr2:89832736-89832890 NA NA NA NA NA chr2-422 88696595 88696829 179 - chr2:88696705-88696829 NA NA NA NA NA chr2-421 88417317 88417561 163 - chr2:88417398-88417480 NA NA NA NA NA chr2-420 88376652 88376875 178 - chr2:88376705-88376838 NA NA NA NA NA chr2-17 8823956 8824166 158 - chr2:8824048-8824154 NA NA NA NA NA chr2-419 88210440 88210674 145 - chr2:88210459-88210515 NA NA NA NA NA chr2-418 86433999 86434295 152 - chr2:86434201-86434279 NA NA NA NA NA chr2-417 86417683 86418030 258 - chr2:86417709-86417878 NA NA NA NA NA chr2-416 86377104 86377476 168 - chr2:86377316-86377357 NA NA NA NA NA chr2-16 8619763 8619979 159 - chr2:8619789-8619891 NA NA NA NA NA chr2-415 85931834 85932235 230 - chr2:85931894-85931953 NA NA NA NA NA chr2-414 85849303 85849577 184 - chr2:85849360-85849388 NA NA NA NA NA chr2-413 85785284 85785712 287 - chr2:85785336-85785576 NA NA NA NA NA chr2-412 85667495 85668051 280 - chr2:85667511-85667699 NA NA NA NA NA chr2-411 85110229 85110626 213 - chr2:85110447-85110544 NA NA NA NA NA chr2-410 84796905 84797402 272 - chr2:84797164-84797211 NA NA NA NA NA chr2-409 84618945 84619448 262 - chr2:84619216-84619297 NA NA NA NA NA chr2-15 8454516 8454718 152 - chr2:8454517-8454619 NA NA NA NA NA chr2-408 84480207 84480564 291 - chr2:84480275-84480500 NA NA NA NA NA chr2-407 83822451 83822889 259 - chr2:83822563-83822620 NA NA NA NA NA chr2-406 83060136 83060440 195 - chr2:83060178-83060264 NA NA NA NA NA chr2-405 82632789 82633088 253 - chr2:82632905-82633020 NA NA NA NA NA chr2-404 82423148 82423651 241 - chr2:82423441-82423534 NA NA NA NA NA chr2-403 82168153 82168445 154 - chr2:82168316-82168424 NA NA NA NA NA chr2-402 82167606 82167910 145 - chr2:82167799-82167891 NA NA NA NA NA chr2-401 81861444 81861775 236 - chr2:81861445-81861586 NA NA NA NA NA chr2-400 81616442 81616891 238 - chr2:81616712-81616857 NA NA NA NA NA chr2-399 81591130 81591271 115 - chr2:81591139-81591228 NA NA NA NA NA chr2-398 81585235 81585666 307 - chr2:81585312-81585495 NA NA NA NA NA chr2-397 81259243 81259638 273 - chr2:81259297-81259448 NA NA NA NA NA chr2-396 81126105 81126428 179 - chr2:81126235-81126270 NA NA NA NA NA chr2-395 80643629 80643937 168 - chr2:80643766-80643788 NA NA NA NA NA chr2-394 80610559 80610971 228 - chr2:80610782-80610800 NA NA NA NA NA chr2-393 79925194 79925445 178 - chr2:79925318-79925423 NA NA NA NA NA chr2-392 79860750 79860991 130 - chr2:79860821-79860914 NA NA NA NA NA chr2-391 79792658 79792837 126 - chr2:79792692-79792779 NA NA NA NA NA chr2-14 7976311 7976658 200 - chr2:7976493-7976644 NA NA NA NA NA chr2-390 79760721 79761027 257 - chr2:79760779-79760981 NA NA NA NA NA chr2-389 79639516 79639841 265 - chr2:79639554-79639759 NA NA NA NA NA chr2-388 79553186 79553620 325 - chr2:79553402-79553618 NA NA NA NA NA chr2-387 79426035 79426549 194 - chr2:79426085-79426139 NA NA NA NA NA chr2-386 79144371 79144640 250 - chr2:79144371-79144564 NA NA NA NA NA chr2-385 79031131 79031477 217 - chr2:79031271-79031359 NA NA NA NA NA chr2-384 78581025 78581223 126 - chr2:78581149-78581203 NA NA NA NA NA chr2-383 78561473 78561686 156 - chr2:78561509-78561566 NA NA NA NA NA chr2-382 78441668 78442064 214 - chr2:78441846-78441870 NA NA NA NA NA chr2-381 78280779 78281064 165 - chr2:78280937-78280951 NA NA NA NA NA chr2-13 7819043 7819364 123 - chr2:7819113-7819170 NA NA NA NA NA chr2-380 78125719 78125884 144 - chr2:78125774-78125855 NA NA NA NA NA chr2-379 77882168 77882487 237 - chr2:77882271-77882412 NA NA NA NA NA chr2-378 77722995 77723227 127 - chr2:77723010-77723102 NA NA NA NA NA chr2-12 7770715 7770939 171 - chr2:7770725-7770757 NA NA NA NA NA chr2-377 77654079 77654339 169 - chr2:77654108-77654186 NA NA NA NA NA chr2-376 77463420 77463615 120 - chr2:77463469-77463514 NA NA NA NA NA chr2-375 77047576 77047825 155 - chr2:77047735-77047796 NA NA NA NA NA chr2-374 76850034 76850636 263 - chr2:76850422-76850444 NA NA NA NA NA chr2-373 76664038 76664210 149 - chr2:76664052-76664160 NA NA NA NA NA chr2-372 76549436 76549603 119 - chr2:76549506-76549577 NA NA NA NA NA chr2-371 76537113 76537354 126 - chr2:76537225-76537238 NA NA NA NA NA chr2-370 76464562 76464808 114 - chr2:76464735-76464799 NA NA NA NA NA chr2-369 76449390 76449928 191 - chr2:76449747-76449750 NA NA NA NA NA chr2-368 76232831 76233045 121 - chr2:76232913-76232941 NA NA NA NA NA chr2-367 76170734 76171041 124 - chr2:76170776-76170839 NA NA NA NA NA chr2-366 76164026 76164350 216 - chr2:76164134-76164242 NA NA NA NA NA chr2-365 76149586 76149862 230 - chr2:76149615-76149707 NA NA NA NA NA chr2-364 75948197 75948465 160 - chr2:75948239-75948363 NA NA NA NA NA chr2-363 75884161 75884434 219 - chr2:75884195-75884320 NA NA NA NA NA chr2-362 75791707 75791922 171 - chr2:75791778-75791905 NA NA NA NA NA chr2-11 7545868 7546292 218 - chr2:7546074-7546086 NA NA NA NA NA chr2-361 75292138 75292508 247 - chr2:75292279-75292403 NA NA NA NA NA chr2-360 75245286 75245518 136 - chr2:75245377-75245407 NA NA NA NA NA chr2-359 75224249 75224579 127 - chr2:75224468-75224472 NA NA NA NA NA chr2-358 75162101 75162510 227 - chr2:75162322-75162367 NA NA NA NA NA chr2-357 74922779 74923063 148 - chr2:74922890-74922902 NA NA NA NA NA chr2-356 74918686 74918880 131 - chr2:74918791-74918859 NA NA NA NA NA chr2-355 74820881 74821103 152 - chr2:74820951-74821033 NA NA NA NA NA chr2-354 74687975 74688237 230 - chr2:74688006-74688204 NA NA NA NA NA chr2-353 74265630 74266249 241 - chr2:74265753-74265758 NA NA NA NA NA chr2-352 73534405 73534831 219 - chr2:73534507-73534589 NA NA NA NA NA chr2-351 73418786 73419488 325 - chr2:73419123-73419191 NA NA NA NA NA chr2-350 73322533 73322799 172 - chr2:73322570-73322686 NA NA NA NA NA chr2-349 73238731 73239038 187 - chr2:73238957-73239024 NA NA NA NA NA chr2-348 73073445 73073703 147 - chr2:73073607-73073609 NA NA NA NA NA chr2-347 73048035 73048399 199 - chr2:73048210-73048354 NA NA NA NA NA chr2-346 72765124 72765355 226 - chr2:72765124-72765335 NA NA NA NA NA chr2-345 72657657 72658047 198 - chr2:72657879-72657885 NA NA NA NA NA chr2-344 72577034 72577273 122 - chr2:72577140-72577145 NA NA NA NA NA chr2-343 72464661 72465110 161 - chr2:72464682-72464747 NA NA NA NA NA chr2-342 72290790 72291108 231 - chr2:72290955-72291047 NA NA NA NA NA chr2-341 72094350 72094713 289 - chr2:72094368-72094471 NA NA NA NA NA chr2-340 71901454 71901731 158 - chr2:71901590-71901629 NA NA NA NA NA chr2-339 71870939 71871102 128 - chr2:71871001-71871094 NA NA NA NA NA chr2-338 71757936 71758125 115 - chr2:71758010-71758051 NA NA NA NA NA chr2-337 71633790 71634080 170 - chr2:71633935-71634035 NA NA NA NA NA chr2-336 71328904 71329131 198 - chr2:71328955-71329066 NA NA NA NA NA chr2-335 70784270 70784573 156 - chr2:70784346-70784453 NA NA NA NA NA chr2-334 70746099 70746331 170 - chr2:70746187-70746295 NA NA NA NA NA chr2-333 70712550 70712806 168 - chr2:70712586-70712666 NA NA NA NA NA chr2-332 70607505 70607959 211 - chr2:70607563-70607616 NA NA NA NA NA chr2-331 70447265 70447580 196 - chr2:70447369-70447446 NA NA NA NA NA chr2-330 70199822 70200091 227 - chr2:70199895-70200080 NA NA NA NA NA chr2-329 70160458 70160801 184 - chr2:70160572-70160597 NA NA NA NA NA chr2-328 70145871 70146083 131 - chr2:70145949-70145999 NA NA NA NA NA chr2-327 69963439 69963764 174 - chr2:69963664-69963687 NA NA NA NA NA chr2-326 69958978 69959430 230 - chr2:69959286-69959294 NA NA NA NA NA chr2-10 6946704 6946908 165 - chr2:6946763-6946889 NA NA NA NA NA chr2-325 69062039 69062247 158 - chr2:69062111-69062219 NA NA NA NA NA chr2-324 68990154 68990483 288 - chr2:68990230-68990395 NA NA NA NA NA chr2-323 68667657 68668200 242 - chr2:68667868-68667869 NA NA NA NA NA chr2-322 68190331 68190652 170 - chr2:68190498-68190549 NA NA NA NA NA chr2-321 68187222 68187361 132 - chr2:68187228-68187353 NA NA NA NA NA chr2-320 67982376 67982657 172 - chr2:67982464-67982541 NA NA NA NA NA chr2-319 67863500 67863839 170 - chr2:67863679-67863700 NA NA NA NA NA chr2-318 67725472 67725816 140 - chr2:67725606-67725678 NA NA NA NA NA chr2-317 67705595 67705897 172 - chr2:67705809-67705851 NA NA NA NA NA chr2-316 67703247 67703434 135 - chr2:67703392-67703413 NA NA NA NA NA chr2-315 67449537 67449741 114 - chr2:67449642-67449666 NA NA NA NA NA chr2-314 67218333 67218574 135 - chr2:67218403-67218432 NA NA NA NA NA chr2-313 66953055 66953348 212 - chr2:66953190-66953321 NA NA NA NA NA chr2-312 66863494 66863834 234 - chr2:66863546-66863674 NA NA NA NA NA chr2-311 66851250 66851520 176 - chr2:66851343-66851423 NA NA NA NA NA chr2-310 66368523 66368873 199 - chr2:66368663-66368689 NA NA NA NA NA chr2-309 66303862 66304258 202 - chr2:66304064-66304088 NA NA NA NA NA chr2-308 66264474 66264790 154 - chr2:66264675-66264775 NA NA NA NA NA chr2-307 66239081 66239427 232 - chr2:66239165-66239405 NA NA NA NA NA chr2-306 65993726 65993989 175 - chr2:65993787-65993874 NA NA NA NA NA chr2-305 65952183 65952452 231 - chr2:65952250-65952443 NA NA NA NA NA chr2-304 65872463 65872643 136 - chr2:65872507-65872599 NA NA NA NA NA chr2-303 65551231 65551637 249 - chr2:65551302-65551394 NA NA NA NA NA chr2-302 65370319 65370710 260 - chr2:65370442-65370505 NA NA NA NA NA chr2-301 65324983 65325262 165 - chr2:65325041-65325092 NA NA NA NA NA chr2-300 65286574 65286871 136 - chr2:65286776-65286833 NA NA NA NA NA chr2-299 65241243 65241498 180 - chr2:65241355-65241460 NA NA NA NA NA chr2-298 65086463 65086804 245 - chr2:65086652-65086801 NA NA NA NA NA chr2-297 64996915 64997223 166 - chr2:64997025-64997049 NA NA NA NA NA chr2-296 64234164 64234407 155 - chr2:64234246-64234313 NA NA NA NA NA chr2-295 63674335 63674538 129 - chr2:63674365-63674420 NA NA NA NA NA chr2-294 63615633 63615814 166 - chr2:63615657-63615808 NA NA NA NA NA chr2-293 63451066 63451317 188 - chr2:63451150-63451317 NA NA NA NA NA chr2-292 63358264 63358608 195 - chr2:63358422-63358462 NA NA NA NA NA chr2-291 63264645 63265023 250 - chr2:63264793-63264915 NA NA NA NA NA chr2-290 63227603 63227963 191 - chr2:63227824-63227846 NA NA NA NA NA chr2-289 63035470 63035970 305 - chr2:63035628-63035938 NA NA NA NA NA chr2-288 62763310 62763681 184 - chr2:62763479-62763488 NA NA NA NA NA chr2-287 62374917 62375248 204 - chr2:62375096-62375173 NA NA NA NA NA chr2-286 62352081 62352291 145 - chr2:62352144-62352220 NA NA NA NA NA chr2-285 62043328 62043716 257 - chr2:62043351-62043549 NA NA NA NA NA chr2-284 61848034 61848436 325 - chr2:61848159-61848407 NA NA NA NA NA chr2-283 61770704 61771058 339 - chr2:61770762-61771056 NA NA NA NA NA chr2-9 6164106 6164313 190 - chr2:6164125-6164298 NA NA NA NA NA chr2-282 61361566 61362195 376 - chr2:61362045-61362168 NA NA NA NA NA chr2-281 61330956 61331122 130 - chr2:61330998-61331116 NA NA NA NA NA chr2-280 60978861 60979189 233 - chr2:60979000-60979138 NA NA NA NA NA chr2-279 60791888 60792177 181 - chr2:60792005-60792078 NA NA NA NA NA chr2-278 60535795 60536110 181 - chr2:60535956-60536003 NA NA NA NA NA chr2-277 60480625 60481114 306 - chr2:60480749-60480754 NA NA NA NA NA chr2-276 60177214 60177348 117 - chr2:60177218-60177318 NA NA NA NA NA chr2-275 59825310 59825500 135 - chr2:59825383-59825451 NA NA NA NA NA chr2-274 59644089 59644611 194 - chr2:59644122-59644173 NA NA NA NA NA chr2-273 59391302 59391912 310 - chr2:59391699-59391705 NA NA NA NA NA chr2-272 59344968 59345386 225 - chr2:59345080-59345166 NA NA NA NA NA chr2-271 59291383 59291632 196 - chr2:59291588-59291625 NA NA NA NA NA chr2-270 59232539 59232915 153 - chr2:59232651-59232655 NA NA NA NA NA chr2-269 59226704 59226933 150 - chr2:59226749-59226820 NA NA NA NA NA chr2-268 59008574 59008800 124 - chr2:59008703-59008793 NA NA NA NA NA chr2-267 58567650 58568062 352 - chr2:58567890-58568062 NA NA NA NA NA chr2-266 58377121 58377420 178 - chr2:58377226-58377283 NA NA NA NA NA chr2-265 57922278 57922565 193 - chr2:57922410-57922509 NA NA NA NA NA chr2-264 57915620 57915996 288 - chr2:57915777-57915931 NA NA NA NA NA chr2-263 57836345 57836633 233 - chr2:57836447-57836625 NA NA NA NA NA chr2-262 57411633 57411842 118 - chr2:57411736-57411787 NA NA NA NA NA chr2-261 57401593 57402057 175 - chr2:57401693-57401705 NA NA NA NA NA chr2-260 57046517 57046760 164 - chr2:57046569-57046600 NA NA NA NA NA chr2-259 56698890 56699223 175 - chr2:56699047-56699062 NA NA NA NA NA chr2-258 56645680 56645955 207 - chr2:56645755-56645894 NA NA NA NA NA chr2-257 56451218 56451669 362 - chr2:56451319-56451585 NA NA NA NA NA chr2-256 56328185 56328484 176 - chr2:56328220-56328355 NA NA NA NA NA chr2-255 56028649 56028898 172 - chr2:56028715-56028810 NA NA NA NA NA chr2-254 55869742 55869985 148 - chr2:55869873-55869902 NA NA NA NA NA chr2-253 55808997 55809205 141 - chr2:55809163-55809171 NA NA NA NA NA chr2-252 55602985 55603347 223 - chr2:55603087-55603171 NA NA NA NA NA chr2-251 55403091 55403458 206 - chr2:55403199-55403244 NA NA NA NA NA chr2-250 55356390 55356743 208 - chr2:55356622-55356685 NA NA NA NA NA chr2-249 55275747 55276137 159 - chr2:55275820-55275911 NA NA NA NA NA chr2-248 54910874 54911112 127 - chr2:54910898-54910972 NA NA NA NA NA chr2-247 54815848 54816055 147 - chr2:54815922-54816009 NA NA NA NA NA chr2-246 54476066 54476307 136 - chr2:54476189-54476220 NA NA NA NA NA chr2-245 53924922 53925232 180 - chr2:53925034-53925084 NA NA NA NA NA chr2-244 53837895 53838176 184 - chr2:53837941-53838028 NA NA NA NA NA chr2-243 53714354 53714530 146 - chr2:53714364-53714480 NA NA NA NA NA chr2-242 53529114 53529351 192 - chr2:53529116-53529263 NA NA NA NA NA chr2-241 53506208 53506503 159 - chr2:53506400-53506423 NA NA NA NA NA chr2-240 53380724 53380929 125 - chr2:53380815-53380860 NA NA NA NA NA chr2-239 53274262 53274517 183 - chr2:53274382-53274461 NA NA NA NA NA chr2-238 53217132 53217398 156 - chr2:53217245-53217291 NA NA NA NA NA chr2-237 53157510 53157746 121 - chr2:53157592-53157598 NA NA NA NA NA chr2-236 52925035 52925198 115 - chr2:52925069-52925136 NA NA NA NA NA chr2-235 52809815 52810148 168 - chr2:52809881-52809884 NA NA NA NA NA chr2-234 52677147 52677454 169 - chr2:52677227-52677350 NA NA NA NA NA chr2-233 52425104 52425349 131 - chr2:52425230-52425323 NA NA NA NA NA chr2-232 52374526 52374920 225 - chr2:52374711-52374770 NA NA NA NA NA chr2-231 52355263 52355399 118 - chr2:52355305-52355369 NA NA NA NA NA chr2-230 52216331 52216596 207 - chr2:52216352-52216427 NA NA NA NA NA chr2-229 52115893 52116214 177 - chr2:52115898-52115931 NA NA NA NA NA chr2-228 51732136 51732329 135 - chr2:51732154-51732231 NA NA NA NA NA chr2-227 51649451 51649776 175 - chr2:51649566-51649591 NA NA NA NA NA chr2-226 51350882 51351077 185 - chr2:51350892-51351067 NA NA NA NA NA chr2-225 51341835 51342237 307 - chr2:51342104-51342200 NA NA NA NA NA chr2-224 51155303 51155535 171 - chr2:51155352-51155462 NA NA NA NA NA chr2-223 50904749 50905054 257 - chr2:50904770-50904979 NA NA NA NA NA chr2-222 50755491 50756049 213 - chr2:50755850-50755932 NA NA NA NA NA chr2-221 50672404 50672621 156 - chr2:50672494-50672589 NA NA NA NA NA chr2-220 50210618 50210949 206 - chr2:50210787-50210876 NA NA NA NA NA chr2-219 50074724 50075140 235 - chr2:50074809-50074863 NA NA NA NA NA chr2-218 49867610 49867928 284 - chr2:49867681-49867863 NA NA NA NA NA chr2-217 49050936 49051179 213 - chr2:49050988-49051171 NA NA NA NA NA chr2-216 48680799 48681381 317 - chr2:48681097-48681215 NA NA NA NA NA chr2-215 48470207 48470514 236 - chr2:48470227-48470426 NA NA NA NA NA chr2-214 48432426 48432751 274 - chr2:48432600-48432741 NA NA NA NA NA chr2-213 48315937 48316191 166 - chr2:48316055-48316133 NA NA NA NA NA chr2-212 48213636 48213983 251 - chr2:48213724-48213863 NA NA NA NA NA chr2-211 48008531 48008921 196 - chr2:48008816-48008818 NA NA NA NA NA chr2-210 47463281 47463668 247 - chr2:47463490-47463551 NA NA NA NA NA chr2-209 47232866 47233059 163 - chr2:47232891-47233024 NA NA NA NA NA chr2-208 47191466 47191818 271 - chr2:47191503-47191693 NA NA NA NA NA chr2-207 46749578 46749765 121 - chr2:46749595-46749650 NA NA NA NA NA chr2-206 46680783 46681116 188 - chr2:46680883-46680956 NA NA NA NA NA chr2-205 46571481 46571750 134 - chr2:46571496-46571575 NA NA NA NA NA chr2-204 46552730 46553080 188 - chr2:46552846-46552872 NA NA NA NA NA chr2-203 46541381 46541682 216 - chr2:46541410-46541541 NA NA NA NA NA chr2-202 46361525 46361785 219 - chr2:46361594-46361772 NA NA NA NA NA chr2-201 46207262 46207444 153 - chr2:46207275-46207399 NA NA NA NA NA chr2-200 45946791 45947065 238 - chr2:45946802-45947004 NA NA NA NA NA chr2-199 45171085 45171491 221 - chr2:45171343-45171379 NA NA NA NA NA chr2-198 44966043 44966282 138 - chr2:44966197-44966234 NA NA NA NA NA chr2-197 44905809 44906107 168 - chr2:44905848-44905886 NA NA NA NA NA chr2-196 44849704 44849963 145 - chr2:44849891-44849922 NA NA NA NA NA chr2-195 44510560 44510788 180 - chr2:44510611-44510647 NA NA NA NA NA chr2-194 44343471 44344013 330 - chr2:44343725-44343815 NA NA NA NA NA chr2-193 44171517 44172034 373 - chr2:44171574-44171629 NA NA NA NA NA chr2-192 43621881 43622080 122 - chr2:43621895-43621940 NA NA NA NA NA chr2 43515 43797 236 - chr2:43560-43750 NA NA NA NA NA chr2-8 4341900 4342239 175 - chr2:4342093-4342162 NA NA NA NA NA chr2-191 43386494 43386756 176 - chr2:43386554-43386644 NA NA NA NA NA chr2-190 43345215 43345541 216 - chr2:43345376-43345482 NA NA NA NA NA chr2-189 42969724 42969956 163 - chr2:42969770-42969864 NA NA NA NA NA chr2-188 42520464 42520673 138 - chr2:42520552-42520653 NA NA NA NA NA chr2-187 42501014 42501231 136 - chr2:42501070-42501169 NA NA NA NA NA chr2-186 42368630 42368799 150 - chr2:42368665-42368796 NA NA NA NA NA chr2-185 42337797 42338001 141 - chr2:42337867-42337945 NA NA NA NA NA chr2-184 42330720 42331094 212 - chr2:42330837-42330887 NA NA NA NA NA chr2-183 42070584 42070873 247 - chr2:42070595-42070800 NA NA NA NA NA chr2-182 41876120 41876489 249 - chr2:41876209-41876276 NA NA NA NA NA chr2-181 41750075 41750554 279 - chr2:41750359-41750382 NA NA NA NA NA chr2-180 41539752 41540128 268 - chr2:41539818-41539978 NA NA NA NA NA chr2-179 41345714 41345963 167 - chr2:41345826-41345911 NA NA NA NA NA chr2-178 41280815 41281042 141 - chr2:41280922-41280926 NA NA NA NA NA chr2-177 41213347 41213571 196 - chr2:41213354-41213522 NA NA NA NA NA chr2-176 41201976 41202500 282 - chr2:41202064-41202104 NA NA NA NA NA chr2-175 41110413 41110786 226 - chr2:41110547-41110626 NA NA NA NA NA chr2-174 39958152 39958506 234 - chr2:39958231-39958272 NA NA NA NA NA chr2-173 39794395 39794899 244 - chr2:39794693-39794753 NA NA NA NA NA chr2-172 39287130 39287360 117 - chr2:39287212-39287216 NA NA NA NA NA chr2-171 39227384 39227629 188 - chr2:39227386-39227517 NA NA NA NA NA chr2-170 39071411 39071969 261 - chr2:39071528-39071565 NA NA NA NA NA chr2-7 3892789 3893113 144 - chr2:3892900-3892984 NA NA NA NA NA chr2-169 38747145 38747443 145 - chr2:38747325-38747371 NA NA NA NA NA chr2-168 38723533 38723765 143 - chr2:38723623-38723679 NA NA NA NA NA chr2-167 38374688 38374852 135 - chr2:38374711-38374821 NA NA NA NA NA chr2-166 38184091 38184416 165 - chr2:38184170-38184229 NA NA NA NA NA chr2-165 37908104 37908266 116 - chr2:37908109-37908179 NA NA NA NA NA chr2-164 37902357 37902551 119 - chr2:37902372-37902466 NA NA NA NA NA chr2-163 37507808 37508437 295 - chr2:37508200-37508336 NA NA NA NA NA chr2-162 37198145 37198339 141 - chr2:37198175-37198263 NA NA NA NA NA chr2-161 36902001 36902437 234 - chr2:36902205-36902237 NA NA NA NA NA chr2-160 36878925 36879235 214 - chr2:36879033-36879143 NA NA NA NA NA chr2-159 36756086 36756537 252 - chr2:36756271-36756296 NA NA NA NA NA chr2-158 36612380 36612696 221 - chr2:36612533-36612659 NA NA NA NA NA chr2-157 35843865 35844144 178 - chr2:35844042-35844119 NA NA NA NA NA chr2-156 35668050 35668385 205 - chr2:35668179-35668252 NA NA NA NA NA chr2-155 35649922 35650202 221 - chr2:35649935-35650097 NA NA NA NA NA chr2-154 35411258 35411532 225 - chr2:35411322-35411498 NA NA NA NA NA chr2-153 35337536 35337919 150 - chr2:35337828-35337888 NA NA NA NA NA chr2-152 35212850 35213036 141 - chr2:35212925-35213031 NA NA NA NA NA chr2-151 35205287 35205546 203 - chr2:35205296-35205443 NA NA NA NA NA chr2-150 35050156 35050600 269 - chr2:35050452-35050546 NA NA NA NA NA chr2-149 34590979 34591396 184 - chr2:34591269-34591334 NA NA NA NA NA chr2-148 34423716 34424101 202 - chr2:34423907-34423926 NA NA NA NA NA chr2-147 33946046 33946453 244 - chr2:33946088-33946166 NA NA NA NA NA chr2-146 33452090 33452375 168 - chr2:33452142-33452271 NA NA NA NA NA chr2-145 33444216 33444614 205 - chr2:33444456-33444468 NA NA NA NA NA chr2-144 32971892 32972050 123 - chr2:32971958-32972046 NA NA NA NA NA chr2-143 32832225 32832628 165 - chr2:32832522-32832567 NA NA NA NA NA chr2-142 32710026 32710317 164 - chr2:32710199-32710236 NA NA NA NA NA chr2-141 32395315 32395630 156 - chr2:32395453-32395464 NA NA NA NA NA chr2-140 32221740 32221958 136 - chr2:32221841-32221895 NA NA NA NA NA chr2-139 32159558 32160173 411 - chr2:32159804-32159807 NA NA NA NA NA chr2-138 31729344 31729737 238 - chr2:31729495-31729633 NA NA NA NA NA chr2-137 31636005 31636236 189 - chr2:31636134-31636197 NA NA NA NA NA chr2-136 31206432 31206809 224 - chr2:31206565-31206591 NA NA NA NA NA chr2-6 3109792 3110201 230 - chr2:3109958-3110009 NA NA NA NA NA chr2-135 30977594 30977912 267 - chr2:30977648-30977862 NA NA NA NA NA chr2-134 30970493 30970731 153 - chr2:30970563-30970601 NA NA NA NA NA chr2-133 30892299 30892589 268 - chr2:30892330-30892576 NA NA NA NA NA chr2-132 30586432 30586637 132 - chr2:30586470-30586520 NA NA NA NA NA chr2-131 30485528 30485748 173 - chr2:30485588-30485740 NA NA NA NA NA chr2-130 30199722 30199914 146 - chr2:30199808-30199908 NA NA NA NA NA chr2-129 30193326 30193791 234 - chr2:30193642-30193645 NA NA NA NA NA chr2-128 29633729 29633979 139 - chr2:29633873-29633901 NA NA NA NA NA chr2-127 29575809 29575986 122 - chr2:29575886-29575953 NA NA NA NA NA chr2-126 29153807 29154021 152 - chr2:29153871-29153961 NA NA NA NA NA chr2-125 29058031 29058347 233 - chr2:29058035-29058185 NA NA NA NA NA chr2-124 28785393 28785889 251 - chr2:28785631-28785637 NA NA NA NA NA chr2-123 28225054 28225231 120 - chr2:28225074-28225175 NA NA NA NA NA chr2-122 28205724 28206151 313 - chr2:28205856-28206122 NA NA NA NA NA chr2-121 28129230 28129581 216 - chr2:28129360-28129441 NA NA NA NA NA chr2-120 28012617 28012980 223 - chr2:28012719-28012802 NA NA NA NA NA chr2-119 27970392 27970789 228 - chr2:27970601-27970740 NA NA NA NA NA chr2-118 27734486 27734694 124 - chr2:27734541-27734581 NA NA NA NA NA chr2-117 27646049 27646366 161 - chr2:27646272-27646277 NA NA NA NA NA chr2-116 27582692 27583172 163 - chr2:27583094-27583110 NA NA NA NA NA chr2-115 27541854 27542023 135 - chr2:27541899-27542022 NA NA NA NA NA chr2-114 27401132 27401447 218 - chr2:27401150-27401271 NA NA NA NA NA chr2-113 27274443 27274623 135 - chr2:27274480-27274570 NA NA NA NA NA chr2-112 27218311 27218757 284 - chr2:27218484-27218486 NA NA NA NA NA chr2-111 27129129 27129438 180 - chr2:27129306-27129357 NA NA NA NA NA chr2-110 27060329 27060609 141 - chr2:27060496-27060554 NA NA NA NA NA chr2-109 26431429 26431864 245 - chr2:26431701-26431756 NA NA NA NA NA chr2-108 26322239 26322437 159 - chr2:26322296-26322416 NA NA NA NA NA chr2-107 26212546 26212793 162 - chr2:26212711-26212788 NA NA NA NA NA chr2-106 26186727 26186858 120 - chr2:26186738-26186847 NA NA NA NA NA chr2-105 26124907 26125271 261 - chr2:26125064-26125186 NA NA NA NA NA chr2-104 25862627 25862993 187 - chr2:25862806-25862814 NA NA NA NA NA chr2-103 25691615 25691858 204 - chr2:25691668-25691755 NA NA NA NA NA chr2-102 25630086 25630403 195 - chr2:25630229-25630344 NA NA NA NA NA chr2-101 25518079 25518316 158 - chr2:25518143-25518232 NA NA NA NA NA chr2-100 25509306 25509464 120 - chr2:25509316-25509398 NA NA NA NA NA chr2-99 25472491 25472907 221 - chr2:25472658-25472684 NA NA NA NA NA chr2-98 24855211 24855383 121 - chr2:24855281-24855351 NA NA NA NA NA chr2-97 24530095 24530526 222 - chr2:24530402-24530415 NA NA NA NA NA chr2-96 24499191 24499571 178 - chr2:24499285-24499301 NA NA NA NA NA chr2-95 24315947 24316182 215 - chr2:24316003-24316174 NA NA NA NA NA chr2-983 241258563 241258894 259 - chr2:241258585-241258820 NA NA NA NA NA chr2-982 240891252 240891453 181 - chr2:240891265-240891412 NA NA NA NA NA chr2-94 23920540 23920741 167 - chr2:23920580-23920725 NA NA NA NA NA chr2-981 237904126 237904460 246 - chr2:237904255-237904413 NA NA NA NA NA chr2-980 237816170 237816486 180 - chr2:237816273-237816339 NA NA NA NA NA chr2-93 23777367 23777607 230 - chr2:23777387-23777607 NA NA NA NA NA chr2-979 237269296 237269542 164 - chr2:237269420-237269474 NA NA NA NA NA chr2-978 236807780 236808057 203 - chr2:236807869-236808028 NA NA NA NA NA chr2-977 236566423 236566639 156 - chr2:236566461-236566557 NA NA NA NA NA chr2-976 236414441 236414835 286 - chr2:236414541-236414703 NA NA NA NA NA chr2-5 2360508 2360792 178 - chr2:2360685-2360757 NA NA NA NA NA chr2-975 235948020 235948321 218 - chr2:235948141-235948276 NA NA NA NA NA chr2-92 23523585 23523992 245 - chr2:23523793-23523876 NA NA NA NA NA chr2-974 235056968 235057426 218 - chr2:235057271-235057339 NA NA NA NA NA chr2-973 235006181 235006528 196 - chr2:235006354-235006399 NA NA NA NA NA chr2-972 234585579 234585841 155 - chr2:234585684-234585732 NA NA NA NA NA chr2-971 234186267 234186604 209 - chr2:234186379-234186460 NA NA NA NA NA chr2-970 234091269 234091440 119 - chr2:234091355-234091422 NA NA NA NA NA chr2-969 233520149 233520357 185 - chr2:233520170-233520286 NA NA NA NA NA chr2-968 232471546 232472039 164 - chr2:232471710-232471729 NA NA NA NA NA chr2-967 232076107 232076538 268 - chr2:232076212-232076317 NA NA NA NA NA chr2-966 232023774 232023955 158 - chr2:232023830-232023943 NA NA NA NA NA chr2-91 23201076 23201272 190 - chr2:23201079-23201257 NA NA NA NA NA chr2-965 231736620 231736871 117 - chr2:231736652-231736703 NA NA NA NA NA chr2-90 23168259 23168487 169 - chr2:23168420-23168462 NA NA NA NA NA chr2-964 231383592 231383806 143 - chr2:231383664-231383736 NA NA NA NA NA chr2-963 230644405 230644595 131 - chr2:230644449-230644491 NA NA NA NA NA chr2-962 230557516 230557806 212 - chr2:230557571-230557705 NA NA NA NA NA chr2-961 229940304 229940720 286 - chr2:229940523-229940679 NA NA NA NA NA chr2-960 229899094 229899344 138 - chr2:229899203-229899229 NA NA NA NA NA chr2-959 229813397 229813878 249 - chr2:229813428-229813448 NA NA NA NA NA chr2-89 22877761 22878217 169 - chr2:22877772-22877826 NA NA NA NA NA chr2-958 228752692 228752914 126 - chr2:228752779-228752873 NA NA NA NA NA chr2-957 228670650 228670977 114 - chr2:228670815-228670858 NA NA NA NA NA chr2-956 228662219 228662820 329 - chr2:228662508-228662579 NA NA NA NA NA chr2-88 22834358 22834537 141 - chr2:22834433-22834536 NA NA NA NA NA chr2-955 228180083 228180871 352 - chr2:228180609-228180707 NA NA NA NA NA chr2-954 227862952 227863227 165 - chr2:227863050-227863105 NA NA NA NA NA chr2-953 226912244 226912646 318 - chr2:226912260-226912494 NA NA NA NA NA chr2-952 226868148 226868385 139 - chr2:226868226-226868267 NA NA NA NA NA chr2-951 226615288 226615633 184 - chr2:226615507-226615530 NA NA NA NA NA chr2-950 225616410 225616703 224 - chr2:225616451-225616550 NA NA NA NA NA chr2-949 225449300 225449558 145 - chr2:225449497-225449529 NA NA NA NA NA chr2-948 225250919 225251187 160 - chr2:225251046-225251098 NA NA NA NA NA chr2-947 225191268 225191482 193 - chr2:225191295-225191467 NA NA NA NA NA chr2-87 22477406 22477879 245 - chr2:22477706-22477707 NA NA NA NA NA chr2-946 224285243 224285510 219 - chr2:224285249-224285452 NA NA NA NA NA chr2-86 22421045 22421280 126 - chr2:22421159-22421176 NA NA NA NA NA chr2-945 224065195 224065476 217 - chr2:224065244-224065397 NA NA NA NA NA chr2-944 223928746 223929062 160 - chr2:223928819-223928864 NA NA NA NA NA chr2-943 223527008 223527203 138 - chr2:223527085-223527166 NA NA NA NA NA chr2-85 22338971 22339324 234 - chr2:22339033-22339148 NA NA NA NA NA chr2-942 223274184 223274512 212 - chr2:223274313-223274409 NA NA NA NA NA chr2-941 223261776 223262043 194 - chr2:223261806-223261841 NA NA NA NA NA chr2-940 223162807 223162991 130 - chr2:223162888-223162964 NA NA NA NA NA chr2-939 223038026 223038354 229 - chr2:223038167-223038258 NA NA NA NA NA chr2-938 222985142 222985445 192 - chr2:222985242-222985323 NA NA NA NA NA chr2-937 222876931 222877500 362 - chr2:222877248-222877403 NA NA NA NA NA chr2-936 222673915 222674207 282 - chr2:222673917-222674189 NA NA NA NA NA chr2-935 222650215 222650480 163 - chr2:222650345-222650382 NA NA NA NA NA chr2-934 222532323 222532741 227 - chr2:222532551-222532661 NA NA NA NA NA chr2-933 222456890 222457259 308 - chr2:222457014-222457219 NA NA NA NA NA chr2-932 222419910 222420077 125 - chr2:222419921-222420004 NA NA NA NA NA chr2-931 222288118 222288369 137 - chr2:222288315-222288338 NA NA NA NA NA chr2-930 221983161 221983545 243 - chr2:221983263-221983365 NA NA NA NA NA chr2-84 22184330 22184553 195 - chr2:22184362-22184529 NA NA NA NA NA chr2-929 221391288 221391455 156 - chr2:221391293-221391438 NA NA NA NA NA chr2-928 221212482 221212750 156 - chr2:221212589-221212633 NA NA NA NA NA chr2-927 221116115 221116540 294 - chr2:221116181-221116275 NA NA NA NA NA chr2-926 221044295 221044603 262 - chr2:221044369-221044585 NA NA NA NA NA chr2-925 220503493 220503772 181 - chr2:220503557-220503640 NA NA NA NA NA chr2-83 22035666 22035846 158 - chr2:22035693-22035829 NA NA NA NA NA chr2-924 220315453 220315901 297 - chr2:220315709-220315855 NA NA NA NA NA chr2-923 219669972 219670386 180 - chr2:219670056-219670102 NA NA NA NA NA chr2-82 21965709 21966075 187 - chr2:21965940-21965948 NA NA NA NA NA chr2-922 219532218 219532483 145 - chr2:219532254-219532359 NA NA NA NA NA chr2-921 219403479 219403955 335 - chr2:219403749-219403857 NA NA NA NA NA chr2-920 219335194 219335505 158 - chr2:219335251-219335358 NA NA NA NA NA chr2-81 21924018 21924726 314 - chr2:21924508-21924523 NA NA NA NA NA chr2-80 21898257 21898543 225 - chr2:21898338-21898502 NA NA NA NA NA chr2-919 218973445 218973659 141 - chr2:218973586-218973654 NA NA NA NA NA chr2-918 218724637 218724882 140 - chr2:218724733-218724768 NA NA NA NA NA chr2-917 218404216 218404653 268 - chr2:218404390-218404499 NA NA NA NA NA chr2-916 217673659 217674188 308 - chr2:217673959-217674149 NA NA NA NA NA chr2-915 217517344 217517632 137 - chr2:217517393-217517447 NA NA NA NA NA chr2-914 217459926 217460307 257 - chr2:217460056-217460189 NA NA NA NA NA chr2-913 217177261 217177608 182 - chr2:217177282-217177409 NA NA NA NA NA chr2-79 21693100 21693400 169 - chr2:21693217-21693227 NA NA NA NA NA chr2-78 21634583 21634993 311 - chr2:21634591-21634947 NA NA NA NA NA chr2-912 216290818 216291010 168 - chr2:216290824-216290932 NA NA NA NA NA chr2-4 2162569 2162831 141 - chr2:2162701-2162743 NA NA NA NA NA chr2-911 216103207 216103495 160 - chr2:216103236-216103334 NA NA NA NA NA chr2-910 215626824 215627281 303 - chr2:215626952-215627101 NA NA NA NA NA chr2-909 215318099 215318530 239 - chr2:215318308-215318355 NA NA NA NA NA chr2-908 214783043 214783267 145 - chr2:214783118-214783176 NA NA NA NA NA chr2-907 214544022 214544515 199 - chr2:214544394-214544455 NA NA NA NA NA chr2-77 21426090 21426571 304 - chr2:21426276-21426346 NA NA NA NA NA chr2-906 214221446 214221600 125 - chr2:214221510-214221548 NA NA NA NA NA chr2-905 213631601 213631821 162 - chr2:213631636-213631740 NA NA NA NA NA chr2-904 212728837 212729113 176 - chr2:212728953-212729031 NA NA NA NA NA chr2-903 212609173 212609320 122 - chr2:212609198-212609295 NA NA NA NA NA chr2-902 212559215 212559421 115 - chr2:212559309-212559339 NA NA NA NA NA chr2-901 212547384 212547695 208 - chr2:212547514-212547601 NA NA NA NA NA chr2-900 211689009 211689227 177 - chr2:211689057-211689111 NA NA NA NA NA chr2-899 211666115 211666415 177 - chr2:211666197-211666333 NA NA NA NA NA chr2-898 210535390 210535637 154 - chr2:210535513-210535574 NA NA NA NA NA chr2-897 210025843 210026276 135 - chr2:210026234-210026257 NA NA NA NA NA chr2-896 209845517 209845830 156 - chr2:209845555-209845586 NA NA NA NA NA chr2-895 209695595 209695762 116 - chr2:209695637-209695736 NA NA NA NA NA chr2-894 209572179 209572421 149 - chr2:209572302-209572420 NA NA NA NA NA chr2-893 209552859 209553112 164 - chr2:209552984-209553035 NA NA NA NA NA chr2-892 209280142 209280386 155 - chr2:209280244-209280336 NA NA NA NA NA chr2-891 209213835 209214259 242 - chr2:209214012-209214023 NA NA NA NA NA chr2-890 209058712 209059211 323 - chr2:209058736-209058807 NA NA NA NA NA chr2-889 208964762 208965066 178 - chr2:208964823-208964959 NA NA NA NA NA chr2-76 20849089 20849325 152 - chr2:20849201-20849269 NA NA NA NA NA chr2-888 208446556 208446794 206 - chr2:208446627-208446775 NA NA NA NA NA chr2-887 208324302 208324557 155 - chr2:208324468-208324479 NA NA NA NA NA chr2-886 208311348 208311638 240 - chr2:208311401-208311591 NA NA NA NA NA chr2-885 208270390 208270540 116 - chr2:208270411-208270467 NA NA NA NA NA chr2-884 207987152 207987660 353 - chr2:207987511-207987573 NA NA NA NA NA chr2-883 207980727 207981073 240 - chr2:207980805-207980939 NA NA NA NA NA chr2-882 207739724 207739889 126 - chr2:207739762-207739814 NA NA NA NA NA chr2-881 207714751 207714978 153 - chr2:207714813-207714892 NA NA NA NA NA chr2-880 207421829 207422024 138 - chr2:207421849-207421930 NA NA NA NA NA chr2-879 207275647 207276077 202 - chr2:207275807-207275933 NA NA NA NA NA chr2-878 206977739 206978313 320 - chr2:206977989-206977997 NA NA NA NA NA chr2-877 205864487 205865027 280 - chr2:205864886-205864906 NA NA NA NA NA chr2-876 205751459 205752092 306 - chr2:205751588-205751598 NA NA NA NA NA chr2-875 205737798 205737983 152 - chr2:205737864-205737961 NA NA NA NA NA chr2-874 205609604 205609826 133 - chr2:205609737-205609781 NA NA NA NA NA chr2-873 205216760 205217111 114 - chr2:205216856-205216891 NA NA NA NA NA chr2-872 204876413 204876821 245 - chr2:204876616-204876698 NA NA NA NA NA chr2-75 20418133 20418446 161 - chr2:20418236-20418245 NA NA NA NA NA chr2-871 203948079 203948477 255 - chr2:203948184-203948247 NA NA NA NA NA chr2-870 203770384 203770757 226 - chr2:203770525-203770608 NA NA NA NA NA chr2-869 203625307 203625717 274 - chr2:203625482-203625698 NA NA NA NA NA chr2-868 203289185 203289394 127 - chr2:203289203-203289248 NA NA NA NA NA chr2-867 203175828 203176156 255 - chr2:203175844-203176026 NA NA NA NA NA chr2-74 20311355 20311652 141 - chr2:20311507-20311596 NA NA NA NA NA chr2-866 203113049 203113389 190 - chr2:203113223-203113363 NA NA NA NA NA chr2-865 202713330 202713536 198 - chr2:202713353-202713533 NA NA NA NA NA chr2-864 202172178 202172353 123 - chr2:202172204-202172275 NA NA NA NA NA chr2-863 202144143 202144628 270 - chr2:202144283-202144388 NA NA NA NA NA chr2-862 202065277 202065659 154 - chr2:202065543-202065545 NA NA NA NA NA chr2-861 201849367 201849672 190 - chr2:201849485-201849566 NA NA NA NA NA chr2-860 201819711 201819918 134 - chr2:201819760-201819773 NA NA NA NA NA chr2-859 201716732 201716976 183 - chr2:201716772-201716852 NA NA NA NA NA chr2-858 201546556 201546770 113 - chr2:201546622-201546634 NA NA NA NA NA chr2-857 201334209 201334465 199 - chr2:201334213-201334355 NA NA NA NA NA chr2-856 200967393 200967573 161 - chr2:200967403-200967527 NA NA NA NA NA chr2-855 199970920 199971259 151 - chr2:199971003-199971036 NA NA NA NA NA chr2-854 199934372 199934651 189 - chr2:199934416-199934515 NA NA NA NA NA chr2-73 19975071 19975645 353 - chr2:19975153-19975451 NA NA NA NA NA chr2-853 199648640 199648872 129 - chr2:199648755-199648805 NA NA NA NA NA chr2-852 199176514 199176841 205 - chr2:199176583-199176666 NA NA NA NA NA chr2-851 198275294 198275546 198 - chr2:198275435-198275521 NA NA NA NA NA chr2-850 198163634 198164087 205 - chr2:198163800-198163823 NA NA NA NA NA chr2-849 198122023 198122483 289 - chr2:198122251-198122483 NA NA NA NA NA chr2-72 19747690 19748002 215 - chr2:19747711-19747829 NA NA NA NA NA chr2-848 196996175 196996486 180 - chr2:196996318-196996367 NA NA NA NA NA chr2-847 196995795 196995987 166 - chr2:196995814-196995902 NA NA NA NA NA chr2-846 196724070 196724242 115 - chr2:196724163-196724221 NA NA NA NA NA chr2-845 196540585 196540908 188 - chr2:196540782-196540835 NA NA NA NA NA chr2-844 196081318 196081621 138 - chr2:196081331-196081414 NA NA NA NA NA chr2-71 19601662 19601988 131 - chr2:19601832-19601898 NA NA NA NA NA chr2-70 19545303 19545583 233 - chr2:19545386-19545548 NA NA NA NA NA chr2-843 195359549 195359820 159 - chr2:195359712-195359759 NA NA NA NA NA chr2-69 19502105 19502314 165 - chr2:19502155-19502288 NA NA NA NA NA chr2-842 194453092 194453429 137 - chr2:194453160-194453185 NA NA NA NA NA chr2-68 19444143 19444322 124 - chr2:19444234-19444303 NA NA NA NA NA chr2-841 194307305 194307456 121 - chr2:194307359-194307434 NA NA NA NA NA chr2-840 193983250 193983676 222 - chr2:193983582-193983656 NA NA NA NA NA chr2-839 193842659 193842862 140 - chr2:193842727-193842804 NA NA NA NA NA chr2-838 193735529 193735709 124 - chr2:193735533-193735601 NA NA NA NA NA chr2-837 193636282 193636619 236 - chr2:193636419-193636554 NA NA NA NA NA chr2-836 193458469 193458710 143 - chr2:193458545-193458590 NA NA NA NA NA chr2-835 192960884 192961324 197 - chr2:192960891-192961007 NA NA NA NA NA chr2-834 192907391 192907694 173 - chr2:192907530-192907591 NA NA NA NA NA chr2-833 192783593 192783965 209 - chr2:192783769-192783770 NA NA NA NA NA chr2-832 192397431 192398065 268 - chr2:192397852-192397864 NA NA NA NA NA chr2-831 192114902 192115286 195 - chr2:192115123-192115193 NA NA NA NA NA chr2-830 191890070 191890332 210 - chr2:191890129-191890287 NA NA NA NA NA chr2-829 191687262 191687588 199 - chr2:191687482-191687492 NA NA NA NA NA chr2-828 191492895 191493190 200 - chr2:191492999-191493122 NA NA NA NA NA chr2-827 191387128 191387445 246 - chr2:191387272-191387370 NA NA NA NA NA chr2-826 191223553 191223977 227 - chr2:191223802-191223832 NA NA NA NA NA chr2-825 191158967 191159227 145 - chr2:191159059-191159089 NA NA NA NA NA chr2-824 191072618 191072947 192 - chr2:191072693-191072748 NA NA NA NA NA chr2-823 190951372 190951649 156 - chr2:190951468-190951503 NA NA NA NA NA chr2-822 190926432 190926725 174 - chr2:190926662-190926717 NA NA NA NA NA chr2-821 190839532 190839847 224 - chr2:190839570-190839597 NA NA NA NA NA chr2-820 190467010 190467290 180 - chr2:190467040-190467120 NA NA NA NA NA chr2-819 190457737 190457947 159 - chr2:190457751-190457859 NA NA NA NA NA chr2-818 189932496 189932799 190 - chr2:189932745-189932787 NA NA NA NA NA chr2-817 189864160 189864453 128 - chr2:189864283-189864356 NA NA NA NA NA chr2-816 189799305 189799579 115 - chr2:189799383-189799393 NA NA NA NA NA chr2-815 189470604 189470929 173 - chr2:189470716-189470737 NA NA NA NA NA chr2-814 189425275 189425860 341 - chr2:189425489-189425586 NA NA NA NA NA chr2-813 189374351 189374553 126 - chr2:189374389-189374439 NA NA NA NA NA chr2-812 189224090 189224412 273 - chr2:189224093-189224234 NA NA NA NA NA chr2-811 189189698 189189870 147 - chr2:189189728-189189860 NA NA NA NA NA chr2-810 189106723 189106960 153 - chr2:189106773-189106842 NA NA NA NA NA chr2-809 188929860 188930150 275 - chr2:188929888-188930148 NA NA NA NA NA chr2-67 18883731 18883928 119 - chr2:18883776-18883817 NA NA NA NA NA chr2-66 18872910 18873229 203 - chr2:18873012-18873171 NA NA NA NA NA chr2-65 18859156 18859558 273 - chr2:18859227-18859262 NA NA NA NA NA chr2-808 188504724 188504984 175 - chr2:188504772-188504862 NA NA NA NA NA chr2-807 187875795 187876102 205 - chr2:187875805-187875976 NA NA NA NA NA chr2-806 187856914 187857130 127 - chr2:187857054-187857092 NA NA NA NA NA chr2-805 187569909 187570151 163 - chr2:187570058-187570142 NA NA NA NA NA chr2-804 187541576 187541938 237 - chr2:187541820-187541932 NA NA NA NA NA chr2-803 187476782 187477234 259 - chr2:187476874-187476940 NA NA NA NA NA chr2-802 187460976 187461144 115 - chr2:187461049-187461111 NA NA NA NA NA chr2-64 18726152 18726320 124 - chr2:18726234-18726314 NA NA NA NA NA chr2-801 186969248 186969488 168 - chr2:186969314-186969414 NA NA NA NA NA chr2-800 186945911 186946272 201 - chr2:186946062-186946103 NA NA NA NA NA chr2-63 18655974 18656476 320 - chr2:18656104-18656334 NA NA NA NA NA chr2-799 186374465 186374846 217 - chr2:186374639-186374712 NA NA NA NA NA chr2-798 186198048 186198525 195 - chr2:186198232-186198255 NA NA NA NA NA chr2-797 186151481 186151816 241 - chr2:186151533-186151680 NA NA NA NA NA chr2-3 1854944 1855125 166 - chr2:1854950-1855111 NA NA NA NA NA chr2-796 184959719 184959962 222 - chr2:184959743-184959944 NA NA NA NA NA chr2-795 184957807 184958146 223 - chr2:184957928-184958035 NA NA NA NA NA chr2-794 184771291 184771585 260 - chr2:184771415-184771581 NA NA NA NA NA chr2-793 184252264 184252553 177 - chr2:184252394-184252495 NA NA NA NA NA chr2-792 184224681 184224979 218 - chr2:184224824-184224962 NA NA NA NA NA chr2-791 183880837 183881034 152 - chr2:183880878-183880985 NA NA NA NA NA chr2-62 18367317 18367681 184 - chr2:18367416-18367474 NA NA NA NA NA chr2-790 183653414 183653626 178 - chr2:183653433-183653547 NA NA NA NA NA chr2-789 183407995 183408308 175 - chr2:183408153-183408282 NA NA NA NA NA chr2-788 183393193 183393575 205 - chr2:183393235-183393263 NA NA NA NA NA chr2-787 183050034 183050275 158 - chr2:183050109-183050184 NA NA NA NA NA chr2-786 182729137 182729532 206 - chr2:182729387-182729404 NA NA NA NA NA chr2-785 182505132 182505457 201 - chr2:182505262-182505339 NA NA NA NA NA chr2-784 182458901 182459259 197 - chr2:182459016-182459052 NA NA NA NA NA chr2-783 182280134 182280359 120 - chr2:182280221-182280306 NA NA NA NA NA chr2-782 182104940 182105290 193 - chr2:182105066-182105102 NA NA NA NA NA chr2-781 181895434 181895707 169 - chr2:181895526-181895616 NA NA NA NA NA chr2-780 181621902 181622114 152 - chr2:181621967-181622059 NA NA NA NA NA chr2-779 181482896 181483363 255 - chr2:181483050-181483093 NA NA NA NA NA chr2-61 18137554 18137981 235 - chr2:18137736-18137759 NA NA NA NA NA chr2-778 181244125 181244422 158 - chr2:181244326-181244345 NA NA NA NA NA chr2-777 181229400 181229595 149 - chr2:181229439-181229542 NA NA NA NA NA chr2-776 181184828 181185417 362 - chr2:181185109-181185244 NA NA NA NA NA chr2-775 180798662 180798865 149 - chr2:180798708-180798787 NA NA NA NA NA chr2-774 180651386 180651796 297 - chr2:180651558-180651742 NA NA NA NA NA chr2-773 180572398 180572763 212 - chr2:180572402-180572461 NA NA NA NA NA chr2-772 180214585 180214826 163 - chr2:180214705-180214790 NA NA NA NA NA chr2-771 180206835 180207141 184 - chr2:180206918-180207006 NA NA NA NA NA chr2-770 180034187 180034439 205 - chr2:180034303-180034415 NA NA NA NA NA chr2-60 18002287 18002569 193 - chr2:18002466-18002510 NA NA NA NA NA chr2-769 179580741 179581151 217 - chr2:179580952-179580964 NA NA NA NA NA chr2-59 17953310 17953655 180 - chr2:17953440-17953565 NA NA NA NA NA chr2-768 179477693 179478001 167 - chr2:179477822-179477856 NA NA NA NA NA chr2-767 179325634 179325843 140 - chr2:179325673-179325744 NA NA NA NA NA chr2-766 178699044 178699274 174 - chr2:178699075-178699193 NA NA NA NA NA chr2-765 178422360 178422777 168 - chr2:178422507-178422592 NA NA NA NA NA chr2-764 178291132 178291367 153 - chr2:178291211-178291282 NA NA NA NA NA chr2-763 178102573 178102743 119 - chr2:178102594-178102662 NA NA NA NA NA chr2-762 177818518 177818878 164 - chr2:177818549-177818575 NA NA NA NA NA chr2-761 177475887 177476068 152 - chr2:177475916-177476039 NA NA NA NA NA chr2-760 177455743 177456022 181 - chr2:177455835-177455906 NA NA NA NA NA chr2-759 177106656 177106850 113 - chr2:177106757-177106843 NA NA NA NA NA chr2-758 176877488 176878079 311 - chr2:176877628-176877659 NA NA NA NA NA chr2-757 176740142 176740360 133 - chr2:176740231-176740279 NA NA NA NA NA chr2-58 17671963 17672239 181 - chr2:17671983-17672069 NA NA NA NA NA chr2-57 17665812 17666020 170 - chr2:17665833-17665889 NA NA NA NA NA chr2-56 17569711 17569946 157 - chr2:17569818-17569897 NA NA NA NA NA chr2-756 175613434 175613612 125 - chr2:175613503-175613575 NA NA NA NA NA chr2-755 175530465 175530757 250 - chr2:175530476-175530622 NA NA NA NA NA chr2-754 175392707 175393085 232 - chr2:175392717-175392803 NA NA NA NA NA chr2-55 17533316 17533539 148 - chr2:17533424-17533475 NA NA NA NA NA chr2-753 174558336 174558883 275 - chr2:174558585-174558588 NA NA NA NA NA chr2-752 174316595 174317099 262 - chr2:174316903-174317055 NA NA NA NA NA chr2-751 174012469 174012638 157 - chr2:174012473-174012626 NA NA NA NA NA chr2-750 173933672 173933881 159 - chr2:173933728-173933833 NA NA NA NA NA chr2-749 173893781 173894064 147 - chr2:173893916-173893925 NA NA NA NA NA chr2-54 17386562 17386805 137 - chr2:17386727-17386758 NA NA NA NA NA chr2-748 173174624 173174860 192 - chr2:173174663-173174811 NA NA NA NA NA chr2-747 173068576 173069227 363 - chr2:173068591-173068808 NA NA NA NA NA chr2-746 172811728 172812147 301 - chr2:172811729-172811990 NA NA NA NA NA chr2-745 172783411 172783718 211 - chr2:172783453-172783460 NA NA NA NA NA chr2-744 172312124 172312345 205 - chr2:172312134-172312327 NA NA NA NA NA chr2-743 171792341 171792669 171 - chr2:171792428-171792442 NA NA NA NA NA chr2-742 171475507 171475939 306 - chr2:171475529-171475793 NA NA NA NA NA chr2-741 171335070 171335261 127 - chr2:171335157-171335220 NA NA NA NA NA chr2-740 171225226 171225705 244 - chr2:171225490-171225519 NA NA NA NA NA chr2-739 171143235 171143501 210 - chr2:171143384-171143476 NA NA NA NA NA chr2-53 17078833 17079123 255 - chr2:17078888-17079108 NA NA NA NA NA chr2-738 170746860 170746994 126 - chr2:170746873-170746991 NA NA NA NA NA chr2-737 170259845 170260044 156 - chr2:170259848-170259881 NA NA NA NA NA chr2-736 169502307 169502496 162 - chr2:169502344-169502479 NA NA NA NA NA chr2-735 169124110 169124577 214 - chr2:169124406-169124423 NA NA NA NA NA chr2-734 169105686 169105985 154 - chr2:169105876-169105950 NA NA NA NA NA chr2-52 16810544 16810763 146 - chr2:16810612-16810685 NA NA NA NA NA chr2-733 167584605 167584941 205 - chr2:167584721-167584795 NA NA NA NA NA chr2-732 167503461 167503813 178 - chr2:167503568-167503630 NA NA NA NA NA chr2-731 167329457 167329732 240 - chr2:167329479-167329684 NA NA NA NA NA chr2-51 16723098 16723426 247 - chr2:16723246-16723412 NA NA NA NA NA chr2-730 167229616 167229930 170 - chr2:167229727-167229775 NA NA NA NA NA chr2-729 166350449 166350677 129 - chr2:166350604-166350634 NA NA NA NA NA chr2-728 166191531 166191717 129 - chr2:166191555-166191631 NA NA NA NA NA chr2-727 166126840 166127108 226 - chr2:166126850-166127062 NA NA NA NA NA chr2-726 165110371 165110966 402 - chr2:165110538-165110628 NA NA NA NA NA chr2-2 1646714 1646977 155 - chr2:1646855-1646902 NA NA NA NA NA chr2-725 164573566 164573789 170 - chr2:164573653-164573770 NA NA NA NA NA chr2-724 164423746 164423947 126 - chr2:164423784-164423885 NA NA NA NA NA chr2-723 164141155 164141347 146 - chr2:164141247-164141347 NA NA NA NA NA chr2-50 16407993 16408315 199 - chr2:16408045-16408101 NA NA NA NA NA chr2-722 163992729 163992983 174 - chr2:163992867-163992961 NA NA NA NA NA chr2-721 163685908 163686180 151 - chr2:163685981-163686043 NA NA NA NA NA chr2-720 163649054 163649290 132 - chr2:163649071-163649157 NA NA NA NA NA chr2-719 163545781 163545951 162 - chr2:163545781-163545935 NA NA NA NA NA chr2-718 163512841 163513070 155 - chr2:163512949-163513030 NA NA NA NA NA chr2-717 163074425 163074838 288 - chr2:163074426-163074589 NA NA NA NA NA chr2-716 162990135 162990452 191 - chr2:162990246-162990311 NA NA NA NA NA chr2-715 162826035 162826310 203 - chr2:162826150-162826281 NA NA NA NA NA chr2-714 162639916 162640188 156 - chr2:162640112-162640152 NA NA NA NA NA chr2-713 162465633 162465959 157 - chr2:162465809-162465811 NA NA NA NA NA chr2-712 161902784 161903015 162 - chr2:161902822-161902911 NA NA NA NA NA chr2-711 161855966 161856311 228 - chr2:161856079-161856190 NA NA NA NA NA chr2-710 161548872 161549088 130 - chr2:161548982-161549010 NA NA NA NA NA chr2-709 161543058 161543318 143 - chr2:161543285-161543311 NA NA NA NA NA chr2-708 161092464 161092903 257 - chr2:161092464-161092539 NA NA NA NA NA chr2-707 160938160 160938411 219 - chr2:160938215-160938402 NA NA NA NA NA chr2-706 160783058 160783450 250 - chr2:160783066-160783174 NA NA NA NA NA chr2-705 160777854 160778214 246 - chr2:160777988-160778160 NA NA NA NA NA chr2-704 160636319 160636573 244 - chr2:160636359-160636573 NA NA NA NA NA chr2-703 160380455 160380660 128 - chr2:160380563-160380614 NA NA NA NA NA chr2-49 16001451 16002001 289 - chr2:16001700-16001736 NA NA NA NA NA chr2-702 159902250 159902613 210 - chr2:159902408-159902475 NA NA NA NA NA chr2-701 159753858 159754325 318 - chr2:159754128-159754283 NA NA NA NA NA chr2-48 15955328 15955581 158 - chr2:15955449-15955564 NA NA NA NA NA chr2-700 159531399 159531616 117 - chr2:159531497-159531521 NA NA NA NA NA chr2-699 159449633 159449858 121 - chr2:159449725-159449761 NA NA NA NA NA chr2-698 159097597 159097865 154 - chr2:159097748-159097788 NA NA NA NA NA chr2-697 158812841 158813045 123 - chr2:158812842-158812938 NA NA NA NA NA chr2-696 158759559 158759805 168 - chr2:158759572-158759662 NA NA NA NA NA chr2-695 158563766 158564075 257 - chr2:158563789-158563890 NA NA NA NA NA chr2-47 15839716 15839948 195 - chr2:15839776-15839934 NA NA NA NA NA chr2-694 158334250 158334646 213 - chr2:158334394-158334424 NA NA NA NA NA chr2-693 158324586 158324768 113 - chr2:158324642-158324660 NA NA NA NA NA chr2-692 157539474 157539696 183 - chr2:157539544-157539688 NA NA NA NA NA chr2-691 157366594 157366811 162 - chr2:157366658-157366783 NA NA NA NA NA chr2-690 157359926 157360150 168 - chr2:157359993-157360105 NA NA NA NA NA chr2-689 157096934 157097187 114 - chr2:157096980-157097017 NA NA NA NA NA chr2-46 15695683 15696021 214 - chr2:15695759-15695881 NA NA NA NA NA chr2-688 156124641 156124792 132 - chr2:156124666-156124779 NA NA NA NA NA chr2-45 15607690 15608026 129 - chr2:15607856-15607916 NA NA NA NA NA chr2-44 15606998 15607272 153 - chr2:15607139-15607171 NA NA NA NA NA chr2-43 15585611 15585880 163 - chr2:15585698-15585755 NA NA NA NA NA chr2-687 155569614 155570252 301 - chr2:155569907-155569917 NA NA NA NA NA chr2-686 155286432 155286620 129 - chr2:155286470-155286540 NA NA NA NA NA chr2-685 155238066 155238194 115 - chr2:155238074-155238176 NA NA NA NA NA chr2-42 15511080 15511238 131 - chr2:15511105-15511227 NA NA NA NA NA chr2-684 154674393 154674788 240 - chr2:154674443-154674664 NA NA NA NA NA chr2-683 154594265 154594565 182 - chr2:154594475-154594539 NA NA NA NA NA chr2-682 154567334 154567655 184 - chr2:154567544-154567591 NA NA NA NA NA chr2-681 154371787 154372037 197 - chr2:154371924-154372012 NA NA NA NA NA chr2-680 154352713 154352915 149 - chr2:154352783-154352913 NA NA NA NA NA chr2-679 153891815 153892216 240 - chr2:153891881-153891978 NA NA NA NA NA chr2-678 153730132 153730530 283 - chr2:153730388-153730462 NA NA NA NA NA chr2-677 152653181 152653609 276 - chr2:152653314-152653467 NA NA NA NA NA chr2-41 15257143 15257336 133 - chr2:15257230-15257303 NA NA NA NA NA chr2-676 152472035 152472300 140 - chr2:152472133-152472166 NA NA NA NA NA chr2-675 152145519 152145909 154 - chr2:152145817-152145859 NA NA NA NA NA chr2-674 151566363 151566545 151 - chr2:151566383-151566503 NA NA NA NA NA chr2-673 151228691 151229111 173 - chr2:151228962-151229004 NA NA NA NA NA chr2-672 150759412 150759740 120 - chr2:150759684-150759724 NA NA NA NA NA chr2-671 150021151 150021465 163 - chr2:150021317-150021359 NA NA NA NA NA chr2-670 149833208 149833523 163 - chr2:149833371-149833382 NA NA NA NA NA chr2-669 149786358 149786882 285 - chr2:149786536-149786582 NA NA NA NA NA chr2-668 149623502 149623791 232 - chr2:149623534-149623747 NA NA NA NA NA chr2-40 14946456 14946678 148 - chr2:14946512-14946586 NA NA NA NA NA chr2-667 149336083 149336268 155 - chr2:149336099-149336244 NA NA NA NA NA chr2-666 149071374 149071559 126 - chr2:149071424-149071497 NA NA NA NA NA chr2-665 148649219 148649495 142 - chr2:148649406-148649414 NA NA NA NA NA chr2-664 148345944 148346246 144 - chr2:148346111-148346115 NA NA NA NA NA chr2-663 147297384 147297744 226 - chr2:147297614-147297706 NA NA NA NA NA chr2-662 146795952 146796207 140 - chr2:146796115-146796140 NA NA NA NA NA chr2-661 146758076 146758446 175 - chr2:146758142-146758208 NA NA NA NA NA chr2-660 146724296 146724643 202 - chr2:146724372-146724429 NA NA NA NA NA chr2-659 146559401 146559677 164 - chr2:146559486-146559538 NA NA NA NA NA chr2-658 146277613 146278180 224 - chr2:146277775-146277801 NA NA NA NA NA chr2-657 146102921 146103177 154 - chr2:146103028-146103080 NA NA NA NA NA chr2-656 146090430 146090744 169 - chr2:146090638-146090662 NA NA NA NA NA chr2-655 146055298 146055523 190 - chr2:146055340-146055509 NA NA NA NA NA chr2-654 145853617 145853908 194 - chr2:145853750-145853826 NA NA NA NA NA chr2-653 145667442 145667679 164 - chr2:145667534-145667625 NA NA NA NA NA chr2-652 145359089 145359322 211 - chr2:145359117-145359302 NA NA NA NA NA chr2-39 14517808 14518156 303 - chr2:14517884-14518052 NA NA NA NA NA chr2-651 145057983 145058268 115 - chr2:145058045-145058062 NA NA NA NA NA chr2-650 144267404 144267730 170 - chr2:144267497-144267511 NA NA NA NA NA chr2-649 144048960 144049170 174 - chr2:144048961-144049029 NA NA NA NA NA chr2-38 14354792 14355005 195 - chr2:14354816-14355005 NA NA NA NA NA chr2-648 143482341 143482521 154 - chr2:143482357-143482465 NA NA NA NA NA chr2-647 143425106 143425341 155 - chr2:143425152-143425227 NA NA NA NA NA chr2-646 143245455 143245676 137 - chr2:143245519-143245532 NA NA NA NA NA chr2-645 143104091 143104483 218 - chr2:143104325-143104383 NA NA NA NA NA chr2-644 142759758 142760140 267 - chr2:142759882-142760052 NA NA NA NA NA chr2-643 142524045 142524393 214 - chr2:142524306-142524386 NA NA NA NA NA chr2-642 142008817 142009053 206 - chr2:142008891-142009007 NA NA NA NA NA chr2-641 141599136 141599370 160 - chr2:141599208-141599294 NA NA NA NA NA chr2-640 141533181 141533476 208 - chr2:141533391-141533430 NA NA NA NA NA chr2-639 140907875 140908045 161 - chr2:140907885-140908037 NA NA NA NA NA chr2-638 140883094 140883348 149 - chr2:140883165-140883279 NA NA NA NA NA chr2-37 14023377 14023645 235 - chr2:14023422-14023558 NA NA NA NA NA chr2-637 140185335 140185565 189 - chr2:140185489-140185555 NA NA NA NA NA chr2-636 140007633 140007970 232 - chr2:140007702-140007757 NA NA NA NA NA chr2-635 139505624 139505877 150 - chr2:139505680-139505727 NA NA NA NA NA chr2-634 139390050 139390443 180 - chr2:139390313-139390422 NA NA NA NA NA chr2-633 139385382 139385699 260 - chr2:139385427-139385630 NA NA NA NA NA chr2-632 139047692 139048046 132 - chr2:139047786-139047844 NA NA NA NA NA chr2-631 138950910 138951223 164 - chr2:138950985-138951000 NA NA NA NA NA chr2-36 13873945 13874444 280 - chr2:13874317-13874378 NA NA NA NA NA chr2-630 138521609 138521846 198 - chr2:138521670-138521829 NA NA NA NA NA chr2-629 138490440 138490738 196 - chr2:138490556-138490650 NA NA NA NA NA chr2-628 138283007 138283294 173 - chr2:138283025-138283084 NA NA NA NA NA chr2-627 138078517 138078691 123 - chr2:138078551-138078623 NA NA NA NA NA chr2-626 137991642 137992157 284 - chr2:137991841-137991894 NA NA NA NA NA chr2-35 13769202 13769656 251 - chr2:13769326-13769374 NA NA NA NA NA chr2-625 137399657 137399980 244 - chr2:137399664-137399877 NA NA NA NA NA chr2-624 137350577 137350950 241 - chr2:137350829-137350938 NA NA NA NA NA chr2-623 137250585 137250984 223 - chr2:137250671-137250718 NA NA NA NA NA chr2-622 137083532 137083830 190 - chr2:137083636-137083790 NA NA NA NA NA chr2-621 137061211 137061495 214 - chr2:137061375-137061487 NA NA NA NA NA chr2-620 136650006 136650291 152 - chr2:136650162-136650181 NA NA NA NA NA chr2-619 136155699 136156014 256 - chr2:136155751-136155830 NA NA NA NA NA chr2-34 13570570 13570788 127 - chr2:13570646-13570692 NA NA NA NA NA chr2-618 135054369 135054837 194 - chr2:135054664-135054757 NA NA NA NA NA chr2-617 134884038 134884342 191 - chr2:134884080-134884158 NA NA NA NA NA chr2-616 134680199 134680558 200 - chr2:134680346-134680395 NA NA NA NA NA chr2-615 134208081 134208622 222 - chr2:134208208-134208239 NA NA NA NA NA chr2-614 133967938 133968102 151 - chr2:133967942-133968080 NA NA NA NA NA chr2-613 133888825 133889067 163 - chr2:133888916-133889000 NA NA NA NA NA chr2-612 133838957 133839146 168 - chr2:133839013-133839118 NA NA NA NA NA chr2-611 133214046 133214360 239 - chr2:133214104-133214322 NA NA NA NA NA chr2-610 132930971 132931267 118 - chr2:132931035-132931051 NA NA NA NA NA chr2-609 132882021 132882155 129 - chr2:132882024-132882138 NA NA NA NA NA chr2-608 132738975 132739311 220 - chr2:132739119-132739215 NA NA NA NA NA chr2-607 132611664 132611861 128 - chr2:132611679-132611774 NA NA NA NA NA chr2-606 132548081 132548732 284 - chr2:132548574-132548615 NA NA NA NA NA chr2-605 132433060 132433395 244 - chr2:132433215-132433368 NA NA NA NA NA chr2-604 130906307 130906974 483 - chr2:130906623-130906770 NA NA NA NA NA chr2-33 13065783 13066035 185 - chr2:13065830-13065948 NA NA NA NA NA chr2-32 13037452 13037647 115 - chr2:13037592-13037627 NA NA NA NA NA chr2-603 130323743 130324323 421 - chr2:130323791-130324178 NA NA NA NA NA chr2-602 130294620 130294807 135 - chr2:130294700-130294783 NA NA NA NA NA chr2-601 129845481 129845963 381 - chr2:129845501-129845879 NA NA NA NA NA chr2-600 129677844 129678102 125 - chr2:129677863-129677931 NA NA NA NA NA chr2-599 129650473 129650990 368 - chr2:129650857-129650865 NA NA NA NA NA chr2-31 12935561 12935787 166 - chr2:12935611-12935697 NA NA NA NA NA chr2-598 129330418 129330911 339 - chr2:129330490-129330511 NA NA NA NA NA chr2-597 129160859 129161064 145 - chr2:129160880-129160965 NA NA NA NA NA chr2-596 128804076 128804348 182 - chr2:128804161-128804253 NA NA NA NA NA chr2-595 128778930 128779149 135 - chr2:128779009-128779049 NA NA NA NA NA chr2-594 128617894 128618298 233 - chr2:128618178-128618240 NA NA NA NA NA chr2-593 128292971 128293377 256 - chr2:128293181-128293287 NA NA NA NA NA chr2-592 128075872 128076317 288 - chr2:128076001-128076076 NA NA NA NA NA chr2-591 127743424 127743971 296 - chr2:127743466-127743650 NA NA NA NA NA chr2-590 127699731 127700045 203 - chr2:127699784-127699876 NA NA NA NA NA chr2-589 127130483 127130679 137 - chr2:127130557-127130665 NA NA NA NA NA chr2-588 127005184 127005573 275 - chr2:127005343-127005504 NA NA NA NA NA chr2-587 126967401 126967879 315 - chr2:126967593-126967768 NA NA NA NA NA chr2-586 126964200 126964527 190 - chr2:126964347-126964420 NA NA NA NA NA chr2-585 126855251 126855459 156 - chr2:126855308-126855412 NA NA NA NA NA chr2-584 126425060 126425312 169 - chr2:126425104-126425190 NA NA NA NA NA chr2-583 126307434 126307957 278 - chr2:126307721-126307838 NA NA NA NA NA chr2-582 126283650 126283778 114 - chr2:126283670-126283770 NA NA NA NA NA chr2-581 126199793 126200298 275 - chr2:126200023-126200068 NA NA NA NA NA chr2-580 126118105 126118550 242 - chr2:126118177-126118216 NA NA NA NA NA chr2-579 126018132 126018522 222 - chr2:126018157-126018323 NA NA NA NA NA chr2-578 125936787 125937056 231 - chr2:125936838-125936955 NA NA NA NA NA chr2-577 125700623 125701015 264 - chr2:125700653-125701012 NA NA NA NA NA chr2-30 12564333 12564750 174 - chr2:12564357-12564450 NA NA NA NA NA chr2-576 125556271 125556573 155 - chr2:125556521-125556529 NA NA NA NA NA chr2-575 125267151 125267466 163 - chr2:125267315-125267326 NA NA NA NA NA chr2-574 125096129 125096472 180 - chr2:125096271-125096302 NA NA NA NA NA chr2-573 124804644 124804852 135 - chr2:124804705-124804743 NA NA NA NA NA chr2-572 124497806 124498044 152 - chr2:124497818-124497884 NA NA NA NA NA chr2-571 124443071 124443300 161 - chr2:124443136-124443229 NA NA NA NA NA chr2-570 124280815 124281031 123 - chr2:124280821-124280913 NA NA NA NA NA chr2-569 123650534 123650787 135 - chr2:123650606-123650623 NA NA NA NA NA chr2-568 123336325 123336617 228 - chr2:123336441-123336605 NA NA NA NA NA chr2-567 123178563 123178959 149 - chr2:123178751-123178798 NA NA NA NA NA chr2-566 123090788 123090947 138 - chr2:123090811-123090886 NA NA NA NA NA chr2-565 123038817 123039339 322 - chr2:123039103-123039255 NA NA NA NA NA chr2-564 122900269 122900497 153 - chr2:122900408-122900486 NA NA NA NA NA chr2-563 122821239 122821508 130 - chr2:122821405-122821450 NA NA NA NA NA chr2-562 122753323 122754162 444 - chr2:122753633-122753725 NA NA NA NA NA chr2-561 122698273 122698499 194 - chr2:122698293-122698455 NA NA NA NA NA chr2-560 122539542 122540038 277 - chr2:122539670-122539728 NA NA NA NA NA chr2-559 121988794 121989031 152 - chr2:121988812-121988879 NA NA NA NA NA chr2-558 121949856 121950121 167 - chr2:121950006-121950075 NA NA NA NA NA chr2-557 121907648 121908259 357 - chr2:121907927-121908080 NA NA NA NA NA chr2-556 121835438 121835644 157 - chr2:121835447-121835555 NA NA NA NA NA chr2-555 121790321 121790683 143 - chr2:121790593-121790609 NA NA NA NA NA chr2-554 121153169 121153375 115 - chr2:121153269-121153311 NA NA NA NA NA chr2-553 121092612 121092796 121 - chr2:121092612-121092712 NA NA NA NA NA chr2-552 121015778 121016085 209 - chr2:121015865-121015976 NA NA NA NA NA chr2-551 120960758 120961034 184 - chr2:120960878-120961026 NA NA NA NA NA chr2-550 120872746 120873004 152 - chr2:120872756-120872802 NA NA NA NA NA chr2-549 120842091 120842279 142 - chr2:120842120-120842182 NA NA NA NA NA chr2-548 120691935 120692512 445 - chr2:120692017-120692412 NA NA NA NA NA chr2-29 12052890 12053180 128 - chr2:12053094-12053144 NA NA NA NA NA chr2-547 120382247 120382399 132 - chr2:120382262-120382374 NA NA NA NA NA chr2-546 120210170 120210433 224 - chr2:120210194-120210389 NA NA NA NA NA chr2-28 12014653 12015026 164 - chr2:12014915-12014976 NA NA NA NA NA chr2-545 120055136 120055414 142 - chr2:120055218-120055224 NA NA NA NA NA chr2-544 120019310 120019664 237 - chr2:120019384-120019501 NA NA NA NA NA chr2-543 119879488 119879771 156 - chr2:119879584-119879613 NA NA NA NA NA chr2-542 119763292 119763479 118 - chr2:119763388-119763437 NA NA NA NA NA chr2-541 119569632 119569877 227 - chr2:119569668-119569841 NA NA NA NA NA chr2-540 119204208 119204411 136 - chr2:119204261-119204330 NA NA NA NA NA chr2-539 118391638 118391898 137 - chr2:118391770-118391784 NA NA NA NA NA chr2-538 117813253 117813565 139 - chr2:117813291-117813366 NA NA NA NA NA chr2-537 117738889 117739288 156 - chr2:117739174-117739235 NA NA NA NA NA chr2-536 117605936 117606358 251 - chr2:117606155-117606331 NA NA NA NA NA chr2-535 117590304 117590789 236 - chr2:117590399-117590469 NA NA NA NA NA chr2-534 117042195 117042479 128 - chr2:117042274-117042350 NA NA NA NA NA chr2-533 116612117 116612338 176 - chr2:116612246-116612338 NA NA NA NA NA chr2-532 116557820 116557997 154 - chr2:116557848-116557979 NA NA NA NA NA chr2-531 116538061 116538322 177 - chr2:116538064-116538213 NA NA NA NA NA chr2-530 116517174 116517406 187 - chr2:116517291-116517385 NA NA NA NA NA chr2-529 116439516 116439754 139 - chr2:116439573-116439679 NA NA NA NA NA chr2-528 116117864 116118079 205 - chr2:116117888-116118063 NA NA NA NA NA chr2-527 116115035 116115325 119 - chr2:116115224-116115286 NA NA NA NA NA chr2-526 116081005 116081250 179 - chr2:116081200-116081227 NA NA NA NA NA chr2-525 115625137 115625457 147 - chr2:115625214-115625250 NA NA NA NA NA chr2-524 115143898 115144370 238 - chr2:115144060-115144220 NA NA NA NA NA chr2-523 115011325 115011593 170 - chr2:115011477-115011549 NA NA NA NA NA chr2-522 114810535 114810794 180 - chr2:114810612-114810713 NA NA NA NA NA chr2-521 114715146 114715526 311 - chr2:114715359-114715463 NA NA NA NA NA chr2-27 11467963 11468339 257 - chr2:11468067-11468175 NA NA NA NA NA chr2-520 114189380 114189626 168 - chr2:114189442-114189500 NA NA NA NA NA chr2-519 114090685 114091208 219 - chr2:114090851-114090978 NA NA NA NA NA chr2-518 113927479 113927769 177 - chr2:113927698-113927762 NA NA NA NA NA chr2-517 113802871 113803120 203 - chr2:113802886-113803043 NA NA NA NA NA chr2-516 113742469 113742842 226 - chr2:113742657-113742736 NA NA NA NA NA chr2-26 11335313 11335500 139 - chr2:11335331-11335422 NA NA NA NA NA chr2-515 113229293 113229883 271 - chr2:113229736-113229870 NA NA NA NA NA chr2-514 113047635 113048144 258 - chr2:113047763-113047852 NA NA NA NA NA chr2-513 112539540 112539909 243 - chr2:112539620-112539821 NA NA NA NA NA chr2-512 112490744 112491058 186 - chr2:112490986-112491044 NA NA NA NA NA chr2-511 112473352 112473655 121 - chr2:112473582-112473617 NA NA NA NA NA chr2-510 112470135 112470316 147 - chr2:112470161-112470206 NA NA NA NA NA chr2-509 112316878 112317068 160 - chr2:112316883-112316953 NA NA NA NA NA chr2-508 112307382 112307712 177 - chr2:112307486-112307622 NA NA NA NA NA chr2-507 112287964 112288225 171 - chr2:112287964-112288045 NA NA NA NA NA chr2-506 111066911 111067222 212 - chr2:111067012-111067129 NA NA NA NA NA chr2-505 111055124 111055356 185 - chr2:111055175-111055313 NA NA NA NA NA chr2-504 111035436 111035595 118 - chr2:111035460-111035537 NA NA NA NA NA chr2-503 110780362 110780747 188 - chr2:110780574-110780595 NA NA NA NA NA chr2-502 110733315 110733612 189 - chr2:110733418-110733499 NA NA NA NA NA chr2-501 109690502 109690940 232 - chr2:109690682-109690708 NA NA NA NA NA chr2-500 109521435 109521756 209 - chr2:109521667-109521684 NA NA NA NA NA chr2-499 109259315 109259597 148 - chr2:109259472-109259486 NA NA NA NA NA chr2-498 109188752 109189241 273 - chr2:109188968-109189025 NA NA NA NA NA chr2-497 109024871 109025100 149 - chr2:109025024-109025093 NA NA NA NA NA chr2-496 108776713 108776993 223 - chr2:108776811-108776977 NA NA NA NA NA chr2-495 108614197 108614459 235 - chr2:108614217-108614443 NA NA NA NA NA chr2-494 108592116 108592414 153 - chr2:108592306-108592308 NA NA NA NA NA chr2-25 10809084 10809453 135 - chr2:10809132-10809157 NA NA NA NA NA chr2-493 107588387 107588850 198 - chr2:107588460-107588521 NA NA NA NA NA chr2-492 107537210 107537486 171 - chr2:107537274-107537340 NA NA NA NA NA chr2-491 107507238 107507908 417 - chr2:107507298-107507498 NA NA NA NA NA chr2-490 107486714 107486945 126 - chr2:107486839-107486860 NA NA NA NA NA chr2-489 107401543 107401872 204 - chr2:107401632-107401639 NA NA NA NA NA chr2-488 107202617 107203047 215 - chr2:107202759-107202881 NA NA NA NA NA chr2-487 106856223 106856522 223 - chr2:106856361-106856508 NA NA NA NA NA chr2-486 106812033 106812321 135 - chr2:106812096-106812138 NA NA NA NA NA chr2-485 106623488 106623823 284 - chr2:106623555-106623788 NA NA NA NA NA chr2-484 106588120 106588293 172 - chr2:106588124-106588293 NA NA NA NA NA chr2-483 106533374 106533670 195 - chr2:106533422-106533516 NA NA NA NA NA chr2-482 106335080 106335267 123 - chr2:106335166-106335225 NA NA NA NA NA chr2-481 106151595 106151789 146 - chr2:106151667-106151765 NA NA NA NA NA chr2-24 10573760 10573979 207 - chr2:10573770-10573973 NA NA NA NA NA chr2-480 105707931 105708210 207 - chr2:105708024-105708207 NA NA NA NA NA chr2-479 105681181 105681429 146 - chr2:105681292-105681336 NA NA NA NA NA chr2-478 105654205 105654570 183 - chr2:105654380-105654381 NA NA NA NA NA chr2-477 105480494 105480797 214 - chr2:105480591-105480716 NA NA NA NA NA chr2-476 105452020 105452375 196 - chr2:105452167-105452204 NA NA NA NA NA chr2-475 105354798 105355177 242 - chr2:105354835-105354940 NA NA NA NA NA chr2-474 105291065 105291479 328 - chr2:105291150-105291390 NA NA NA NA NA chr2-473 105275539 105275879 232 - chr2:105275720-105275844 NA NA NA NA NA chr2-472 104983004 104983201 129 - chr2:104983070-104983131 NA NA NA NA NA chr2-471 104408049 104408427 257 - chr2:104408127-104408263 NA NA NA NA NA chr2-470 104263965 104264404 337 - chr2:104264086-104264359 NA NA NA NA NA chr2-469 103993064 103993293 190 - chr2:103993114-103993265 NA NA NA NA NA chr2-468 103893466 103893765 202 - chr2:103893547-103893652 NA NA NA NA NA chr2-467 103554681 103555017 261 - chr2:103554730-103554966 NA NA NA NA NA chr2-466 103403426 103403821 160 - chr2:103403728-103403787 NA NA NA NA NA chr2-465 103070863 103071076 157 - chr2:103070876-103070977 NA NA NA NA NA chr2-464 103023436 103023726 225 - chr2:103023477-103023637 NA NA NA NA NA chr2-463 102611237 102611564 191 - chr2:102611414-102611455 NA NA NA NA NA chr2-23 10253578 10254152 251 - chr2:10253766-10253784 NA NA NA NA NA chr2-462 102526851 102527113 169 - chr2:102526943-102527019 NA NA NA NA NA chr2-461 102513501 102513763 186 - chr2:102513510-102513620 NA NA NA NA NA chr2-460 102480535 102480819 174 - chr2:102480643-102480703 NA NA NA NA NA chr2-459 102221895 102222126 211 - chr2:102221897-102222052 NA NA NA NA NA chr2-458 102072544 102072787 192 - chr2:102072571-102072610 NA NA NA NA NA chr2-457 101976643 101976880 172 - chr2:101976678-101976785 NA NA NA NA NA chr2-456 101902228 101902644 245 - chr2:101902567-101902641 NA NA NA NA NA chr2-455 101766009 101766262 210 - chr2:101766009-101766176 NA NA NA NA NA chr2-454 101538460 101539036 294 - chr2:101538691-101538737 NA NA NA NA NA chr2-22 10126757 10127187 247 - chr2:10127016-10127080 NA NA NA NA NA chr2-453 101194309 101194698 199 - chr2:101194448-101194491 NA NA NA NA NA chr2-452 101192408 101192662 168 - chr2:101192608-101192614 NA NA NA NA NA chr2-451 101161859 101162286 268 - chr2:101162124-101162233 NA NA NA NA NA chr2-450 101088113 101088270 119 - chr2:101088162-101088243 NA NA NA NA NA chr2-21 10101154 10101449 159 - chr2:10101250-10101273 NA NA NA NA NA chr2-449 100694068 100694712 347 - chr2:100694327-100694406 NA NA NA NA NA chr2-448 100506796 100507035 128 - chr2:100506928-100506931 NA NA NA NA NA chr2-447 100177311 100177580 164 - chr2:100177395-100177468 NA NA NA NA NA chr22-165 50123724 50123946 135 - chr22:50123812-50123862 NA NA NA NA NA chr22-164 49982133 49982470 129 - chr22:49982300-49982305 NA NA NA NA NA chr22-163 49894428 49894713 237 - chr22:49894449-49894670 NA NA NA NA NA chr22-162 49030467 49030792 175 - chr22:49030656-49030681 NA NA NA NA NA chr22-161 48657915 48658453 200 - chr22:48657974-48658022 NA NA NA NA NA chr22-160 48636686 48637153 254 - chr22:48636909-48636950 NA NA NA NA NA chr22-159 48557158 48557306 134 - chr22:48557159-48557279 NA NA NA NA NA chr22-158 47737921 47738173 202 - chr22:47738091-47738143 NA NA NA NA NA chr22-157 47563522 47563761 148 - chr22:47563612-47563669 NA NA NA NA NA chr22-156 46802199 46802463 207 - chr22:46802289-46802439 NA NA NA NA NA chr22-155 46141727 46141900 137 - chr22:46141747-46141848 NA NA NA NA NA chr22-154 45347379 45347712 265 - chr22:45347500-45347697 NA NA NA NA NA chr22-153 45165196 45165650 240 - chr22:45165422-45165440 NA NA NA NA NA chr22-152 45023056 45023307 159 - chr22:45023064-45023131 NA NA NA NA NA chr22-151 44739356 44739587 141 - chr22:44739463-44739514 NA NA NA NA NA chr22-150 44620119 44620562 202 - chr22:44620459-44620526 NA NA NA NA NA chr22-149 44292277 44292459 143 - chr22:44292323-44292427 NA NA NA NA NA chr22-148 43894029 43894444 280 - chr22:43894193-43894428 NA NA NA NA NA chr22-147 43709351 43709585 193 - chr22:43709356-43709436 NA NA NA NA NA chr22-146 42262660 42262907 206 - chr22:42262672-42262779 NA NA NA NA NA chr22-145 41726347 41726522 138 - chr22:41726396-41726489 NA NA NA NA NA chr22-144 41321300 41321808 295 - chr22:41321326-41321550 NA NA NA NA NA chr22-143 41279996 41280207 148 - chr22:41280052-41280179 NA NA NA NA NA chr22-142 41169653 41169976 208 - chr22:41169768-41169861 NA NA NA NA NA chr22-141 40595893 40596181 162 - chr22:40596005-40596125 NA NA NA NA NA chr22-140 40384188 40384425 141 - chr22:40384288-40384333 NA NA NA NA NA chr22-139 40329222 40329434 117 - chr22:40329283-40329305 NA NA NA NA NA chr22-138 40270645 40270988 187 - chr22:40270743-40270774 NA NA NA NA NA chr22-137 40168684 40169026 134 - chr22:40168952-40168991 NA NA NA NA NA chr22-136 40142568 40143032 186 - chr22:40142920-40142976 NA NA NA NA NA chr22-135 40061705 40061882 138 - chr22:40061758-40061857 NA NA NA NA NA chr22-134 39919713 39919990 171 - chr22:39919818-39919881 NA NA NA NA NA chr22-133 39910573 39910922 196 - chr22:39910773-39910816 NA NA NA NA NA chr22-132 39505313 39505661 214 - chr22:39505575-39505628 NA NA NA NA NA chr22-131 39158646 39158914 142 - chr22:39158747-39158763 NA NA NA NA NA chr22-130 38812893 38813591 443 - chr22:38813024-38813540 NA NA NA NA NA chr22-129 38639788 38639943 121 - chr22:38639809-38639896 NA NA NA NA NA chr22-128 38102716 38103012 225 - chr22:38102727-38102881 NA NA NA NA NA chr22-127 38033683 38033876 127 - chr22:38033730-38033791 NA NA NA NA NA chr22-126 37968671 37969029 272 - chr22:37968741-37968927 NA NA NA NA NA chr22-125 37745099 37745717 312 - chr22:37745331-37745337 NA NA NA NA NA chr22-124 37159212 37159422 115 - chr22:37159258-37159278 NA NA NA NA NA chr22-123 36642122 36642390 147 - chr22:36642310-36642336 NA NA NA NA NA chr22-122 36299782 36300295 305 - chr22:36299859-36299956 NA NA NA NA NA chr22-121 36258756 36259061 278 - chr22:36258799-36259050 NA NA NA NA NA chr22-120 35411403 35411851 226 - chr22:35411525-35411529 NA NA NA NA NA chr22-119 35397905 35398341 227 - chr22:35398206-35398215 NA NA NA NA NA chr22-118 35273932 35274246 217 - chr22:35274100-35274220 NA NA NA NA NA chr22-117 35100438 35100737 132 - chr22:35100521-35100542 NA NA NA NA NA chr22-116 35023289 35023551 175 - chr22:35023314-35023460 NA NA NA NA NA chr22-115 35013972 35014372 283 - chr22:35014227-35014301 NA NA NA NA NA chr22-114 35000481 35000712 125 - chr22:35000590-35000595 NA NA NA NA NA chr22-113 34937847 34938273 249 - chr22:34938113-34938151 NA NA NA NA NA chr22-112 34927967 34928289 158 - chr22:34928144-34928206 NA NA NA NA NA chr22-111 34909235 34909426 128 - chr22:34909244-34909345 NA NA NA NA NA chr22-110 34903301 34903544 174 - chr22:34903375-34903480 NA NA NA NA NA chr22-109 34808963 34809747 333 - chr22:34809419-34809467 NA NA NA NA NA chr22-108 34662317 34662728 209 - chr22:34662401-34662408 NA NA NA NA NA chr22-107 34537493 34537681 125 - chr22:34537510-34537572 NA NA NA NA NA chr22-106 34206054 34206372 165 - chr22:34206117-34206151 NA NA NA NA NA chr22-105 33836502 33836726 152 - chr22:33836644-33836724 NA NA NA NA NA chr22-104 33277906 33278179 139 - chr22:33277995-33278000 NA NA NA NA NA chr22-103 33241673 33242009 151 - chr22:33241905-33241965 NA NA NA NA NA chr22-102 33194078 33194337 150 - chr22:33194181-33194226 NA NA NA NA NA chr22-101 33103548 33104012 266 - chr22:33103790-33103858 NA NA NA NA NA chr22-100 32934216 32934502 147 - chr22:32934367-32934375 NA NA NA NA NA chr22-99 32663169 32663366 155 - chr22:32663271-32663344 NA NA NA NA NA chr22-98 32344040 32344287 142 - chr22:32344059-32344096 NA NA NA NA NA chr22-97 31693595 31693752 135 - chr22:31693655-31693724 NA NA NA NA NA chr22-96 31656682 31657265 354 - chr22:31656780-31656905 NA NA NA NA NA chr22-95 31245122 31245534 196 - chr22:31245269-31245295 NA NA NA NA NA chr22-94 30929245 30929642 268 - chr22:30929316-30929343 NA NA NA NA NA chr22-93 30576086 30576651 288 - chr22:30576342-30576367 NA NA NA NA NA chr22-92 30459468 30459791 166 - chr22:30459627-30459640 NA NA NA NA NA chr22-91 29670334 29670552 156 - chr22:29670354-29670451 NA NA NA NA NA chr22-90 29323749 29324254 245 - chr22:29323892-29323955 NA NA NA NA NA chr22-89 29247390 29247569 169 - chr22:29247391-29247530 NA NA NA NA NA chr22-88 29237803 29238156 225 - chr22:29237848-29237945 NA NA NA NA NA chr22-87 28893276 28893434 116 - chr22:28893357-28893431 NA NA NA NA NA chr22-86 28879957 28880161 171 - chr22:28880022-28880160 NA NA NA NA NA chr22-85 28806233 28806675 269 - chr22:28806369-28806465 NA NA NA NA NA chr22-84 28777289 28777531 155 - chr22:28777358-28777426 NA NA NA NA NA chr22-83 28478217 28478603 175 - chr22:28478478-28478542 NA NA NA NA NA chr22-82 28459486 28459772 168 - chr22:28459587-28459637 NA NA NA NA NA chr22-81 28444611 28444855 177 - chr22:28444707-28444817 NA NA NA NA NA chr22-80 28432700 28433047 209 - chr22:28432824-28432895 NA NA NA NA NA chr22-79 28429351 28429819 200 - chr22:28429680-28429716 NA NA NA NA NA chr22-78 28372601 28372877 202 - chr22:28372789-28372841 NA NA NA NA NA chr22-77 28348645 28348827 132 - chr22:28348690-28348772 NA NA NA NA NA chr22-76 28333499 28333903 294 - chr22:28333550-28333734 NA NA NA NA NA chr22-75 28277800 28278252 227 - chr22:28278054-28278114 NA NA NA NA NA chr22-74 28267642 28268109 193 - chr22:28267810-28267846 NA NA NA NA NA chr22-73 28251963 28252149 128 - chr22:28251977-28252047 NA NA NA NA NA chr22-72 28241375 28241782 167 - chr22:28241421-28241508 NA NA NA NA NA chr22-71 28139234 28139691 223 - chr22:28139597-28139638 NA NA NA NA NA chr22-70 28000394 28000621 166 - chr22:28000455-28000560 NA NA NA NA NA chr22-69 27985704 27986053 255 - chr22:27985861-27986022 NA NA NA NA NA chr22-68 27980810 27980974 113 - chr22:27980896-27980958 NA NA NA NA NA chr22-67 27820633 27820795 135 - chr22:27820644-27820720 NA NA NA NA NA chr22-66 27737206 27737374 128 - chr22:27737223-27737311 NA NA NA NA NA chr22-65 27606669 27606878 122 - chr22:27606669-27606762 NA NA NA NA NA chr22-64 27596001 27596265 203 - chr22:27596058-27596200 NA NA NA NA NA chr22-63 27589592 27589846 219 - chr22:27589595-27589709 NA NA NA NA NA chr22-62 27455458 27455676 160 - chr22:27455519-27455621 NA NA NA NA NA chr22-61 27381688 27381911 182 - chr22:27381693-27381834 NA NA NA NA NA chr22-60 27356047 27356317 179 - chr22:27356119-27356169 NA NA NA NA NA chr22-59 27261724 27261966 173 - chr22:27261852-27261956 NA NA NA NA NA chr22-58 27245849 27246099 159 - chr22:27245877-27245945 NA NA NA NA NA chr22-57 27236359 27236612 192 - chr22:27236516-27236550 NA NA NA NA NA chr22-56 27153422 27153698 217 - chr22:27153458-27153570 NA NA NA NA NA chr22-55 27151892 27152099 115 - chr22:27151987-27152010 NA NA NA NA NA chr22-54 27137441 27137630 120 - chr22:27137530-27137581 NA NA NA NA NA chr22-53 27135979 27136244 176 - chr22:27136140-27136179 NA NA NA NA NA chr22-52 27124487 27124655 138 - chr22:27124595-27124643 NA NA NA NA NA chr22-51 27113012 27113304 227 - chr22:27113077-27113239 NA NA NA NA NA chr22-50 27034246 27034473 193 - chr22:27034379-27034472 NA NA NA NA NA chr22-49 26967441 26967631 156 - chr22:26967453-26967575 NA NA NA NA NA chr22-48 26691194 26691436 154 - chr22:26691331-26691397 NA NA NA NA NA chr22-47 26661464 26661920 311 - chr22:26661703-26661869 NA NA NA NA NA chr22-46 26608200 26608402 125 - chr22:26608279-26608327 NA NA NA NA NA chr22-45 26606418 26606840 224 - chr22:26606666-26606692 NA NA NA NA NA chr22-44 26546556 26546810 167 - chr22:26546706-26546786 NA NA NA NA NA chr22-43 26396028 26396361 206 - chr22:26396118-26396123 NA NA NA NA NA chr22-42 26385451 26385690 164 - chr22:26385597-26385686 NA NA NA NA NA chr22-41 26162477 26162833 177 - chr22:26162713-26162720 NA NA NA NA NA chr22-40 26107674 26107975 177 - chr22:26107824-26107877 NA NA NA NA NA chr22-39 26105058 26105262 119 - chr22:26105170-26105186 NA NA NA NA NA chr22-38 25994679 25994962 245 - chr22:25994751-25994882 NA NA NA NA NA chr22-37 25863241 25863475 177 - chr22:25863242-25863400 NA NA NA NA NA chr22-36 25859098 25859597 172 - chr22:25859480-25859543 NA NA NA NA NA chr22-35 25843057 25843387 163 - chr22:25843164-25843200 NA NA NA NA NA chr22-34 25819323 25819734 228 - chr22:25819571-25819595 NA NA NA NA NA chr22-33 25815777 25815951 120 - chr22:25815817-25815855 NA NA NA NA NA chr22-32 25717329 25718184 474 - chr22:25717534-25717983 NA NA NA NA NA chr22-31 25656620 25656919 152 - chr22:25656725-25656758 NA NA NA NA NA chr22-30 25582913 25583181 170 - chr22:25582931-25583003 NA NA NA NA NA chr22-29 25580449 25580758 195 - chr22:25580494-25580575 NA NA NA NA NA chr22-28 25545652 25545887 166 - chr22:25545743-25545840 NA NA NA NA NA chr22-27 25443257 25443639 226 - chr22:25443366-25443436 NA NA NA NA NA chr22-26 25093468 25093666 147 - chr22:25093514-25093610 NA NA NA NA NA chr22-25 25025018 25025327 176 - chr22:25025160-25025203 NA NA NA NA NA chr22-24 24839797 24840208 224 - chr22:24839820-24839857 NA NA NA NA NA chr22-23 24466449 24466754 153 - chr22:24466579-24466580 NA NA NA NA NA chr22-22 24148365 24148695 162 - chr22:24148478-24148584 NA NA NA NA NA chr22-21 24117294 24117531 143 - chr22:24117400-24117473 NA NA NA NA NA chr22-20 24099224 24099556 188 - chr22:24099420-24099509 NA NA NA NA NA chr22-19 23660743 23661173 225 - chr22:23660966-23660974 NA NA NA NA NA chr22-18 23187191 23187479 184 - chr22:23187197-23187249 NA NA NA NA NA chr22-17 22962958 22963286 209 - chr22:22963083-22963173 NA NA NA NA NA chr22-16 22960675 22961035 191 - chr22:22960761-22960783 NA NA NA NA NA chr22-15 22887457 22887846 226 - chr22:22887579-22887589 NA NA NA NA NA chr22-14 22786094 22786380 246 - chr22:22786168-22786374 NA NA NA NA NA chr22-13 21653460 21653646 146 - chr22:21653485-21653591 NA NA NA NA NA chr22-12 20823948 20824252 237 - chr22:20824007-20824161 NA NA NA NA NA chr22-11 20508902 20509158 126 - chr22:20509017-20509023 NA NA NA NA NA chr22-10 20484174 20484500 161 - chr22:20484352-20484374 NA NA NA NA NA chr22-9 20432716 20433061 192 - chr22:20432816-20432855 NA NA NA NA NA chr22-8 19770406 19770747 174 - chr22:19770496-19770511 NA NA NA NA NA chr22-7 19349580 19349844 172 - chr22:19349645-19349725 NA NA NA NA NA chr22-6 17538937 17539368 278 - chr22:17539014-17539139 NA NA NA NA NA chr22-5 17260238 17260489 175 - chr22:17260368-17260467 NA NA NA NA NA chr22-4 17255031 17255230 159 - chr22:17255067-17255186 NA NA NA NA NA chr22-3 17196087 17196246 136 - chr22:17196133-17196246 NA NA NA NA NA chr22-2 17194781 17195083 167 - chr22:17194905-17194990 NA NA NA NA NA chr22 16776579 16776769 144 - chr22:16776632-16776730 NA NA NA NA NA chr21-114 46377090 46377384 178 - chr21:46377135-46377197 NA NA NA NA NA chr21-113 46026267 46026662 205 - chr21:46026440-46026455 NA NA NA NA NA chr21-112 44606437 44606641 114 - chr21:44606524-44606550 NA NA NA NA NA chr21-111 43591503 43592059 281 - chr21:43591761-43591767 NA NA NA NA NA chr21-110 42173425 42173648 172 - chr21:42173469-42173624 NA NA NA NA NA chr21-109 36369665 36369849 165 - chr21:36369672-36369794 NA NA NA NA NA chr21-108 35372931 35373108 144 - chr21:35373003-35373088 NA NA NA NA NA chr21-107 35312044 35312400 284 - chr21:35312047-35312305 NA NA NA NA NA chr21-106 35153443 35153659 158 - chr21:35153492-35153592 NA NA NA NA NA chr21-105 34895227 34895451 148 - chr21:34895352-34895424 NA NA NA NA NA chr21-104 34774012 34774260 158 - chr21:34774087-34774165 NA NA NA NA NA chr21-103 33858681 33859016 196 - chr21:33858873-33858930 NA NA NA NA NA chr21-102 33856032 33856548 219 - chr21:33856266-33856276 NA NA NA NA NA chr21-101 33234370 33234750 212 - chr21:33234373-33234527 NA NA NA NA NA chr21-100 33190043 33190244 118 - chr21:33190089-33190124 NA NA NA NA NA chr21-99 32521645 32522126 242 - chr21:32521918-32521921 NA NA NA NA NA chr21-98 32232873 32233267 209 - chr21:32233099-32233123 NA NA NA NA NA chr21-97 31907954 31908308 177 - chr21:31908062-31908108 NA NA NA NA NA chr21-96 31829181 31829565 229 - chr21:31829405-31829479 NA NA NA NA NA chr21-95 31549541 31549916 217 - chr21:31549657-31549744 NA NA NA NA NA chr21-94 31396145 31396359 184 - chr21:31396250-31396344 NA NA NA NA NA chr21-93 31013969 31014311 219 - chr21:31013980-31014076 NA NA NA NA NA chr21-92 30913563 30913794 162 - chr21:30913661-30913754 NA NA NA NA NA chr21-91 30902117 30902402 147 - chr21:30902240-30902327 NA NA NA NA NA chr21-90 30897379 30897666 224 - chr21:30897423-30897546 NA NA NA NA NA chr21-89 30890316 30890660 149 - chr21:30890576-30890660 NA NA NA NA NA chr21-88 30637884 30638283 232 - chr21:30637897-30638003 NA NA NA NA NA chr21-87 30590943 30591494 304 - chr21:30591093-30591150 NA NA NA NA NA chr21-86 30587975 30588215 163 - chr21:30588066-30588152 NA NA NA NA NA chr21-85 30558865 30559467 351 - chr21:30559213-30559313 NA NA NA NA NA chr21-84 30510751 30510924 130 - chr21:30510821-30510908 NA NA NA NA NA chr21-83 30439160 30439602 284 - chr21:30439304-30439402 NA NA NA NA NA chr21-82 30341128 30341674 274 - chr21:30341539-30341546 NA NA NA NA NA chr21-81 30295871 30296171 246 - chr21:30295953-30296037 NA NA NA NA NA chr21-80 30218188 30218557 254 - chr21:30218220-30218359 NA NA NA NA NA chr21-79 30099459 30099624 125 - chr21:30099497-30099578 NA NA NA NA NA chr21-78 29962636 29963020 230 - chr21:29962810-29962890 NA NA NA NA NA chr21-77 29635275 29635695 183 - chr21:29635359-29635407 NA NA NA NA NA chr21-76 29568220 29568478 144 - chr21:29568325-29568355 NA NA NA NA NA chr21-75 29503157 29503375 156 - chr21:29503227-29503321 NA NA NA NA NA chr21-74 29222876 29223178 147 - chr21:29222995-29223011 NA NA NA NA NA chr21-73 29098585 29098777 189 - chr21:29098597-29098777 NA NA NA NA NA chr21-72 29004247 29004658 325 - chr21:29004301-29004368 NA NA NA NA NA chr21-71 28914297 28914608 168 - chr21:28914458-28914471 NA NA NA NA NA chr21-70 28885250 28885634 226 - chr21:28885300-28885493 NA NA NA NA NA chr21-69 28458357 28458594 178 - chr21:28458475-28458594 NA NA NA NA NA chr21-68 28361357 28361546 128 - chr21:28361379-28361446 NA NA NA NA NA chr21-67 28292622 28292985 205 - chr21:28292773-28292806 NA NA NA NA NA chr21-66 28245994 28246296 231 - chr21:28246100-28246260 NA NA NA NA NA chr21-65 28210096 28210432 206 - chr21:28210129-28210205 NA NA NA NA NA chr21-64 28133386 28133561 117 - chr21:28133443-28133500 NA NA NA NA NA chr21-63 28112928 28113197 123 - chr21:28113108-28113153 NA NA NA NA NA chr21-62 28097623 28097954 168 - chr21:28097777-28097788 NA NA NA NA NA chr21-61 27843203 27843442 161 - chr21:27843237-27843333 NA NA NA NA NA chr21-60 27730886 27731219 147 - chr21:27731026-27731029 NA NA NA NA NA chr21-59 27656786 27657354 328 - chr21:27657121-27657309 NA NA NA NA NA chr21-58 27504782 27504965 150 - chr21:27504839-27504956 NA NA NA NA NA chr21-57 27495245 27495629 155 - chr21:27495300-27495342 NA NA NA NA NA chr21-56 27286230 27286453 148 - chr21:27286280-27286353 NA NA NA NA NA chr21-55 27238364 27238685 215 - chr21:27238521-27238596 NA NA NA NA NA chr21-54 27209975 27210460 211 - chr21:27210228-27210231 NA NA NA NA NA chr21-53 27130669 27131013 224 - chr21:27130882-27130956 NA NA NA NA NA chr21-52 27119348 27119904 346 - chr21:27119613-27119859 NA NA NA NA NA chr21-51 26842841 26843020 153 - chr21:26842852-26842927 NA NA NA NA NA chr21-50 26765444 26765677 123 - chr21:26765582-26765595 NA NA NA NA NA chr21-49 26201726 26201895 134 - chr21:26201756-26201855 NA NA NA NA NA chr21-48 25571230 25571586 273 - chr21:25571328-25571518 NA NA NA NA NA chr21-47 25279374 25279568 173 - chr21:25279375-25279541 NA NA NA NA NA chr21-46 25134921 25135238 167 - chr21:25135137-25135158 NA NA NA NA NA chr21-45 24338493 24338983 278 - chr21:24338606-24338858 NA NA NA NA NA chr21-44 24138239 24138569 153 - chr21:24138308-24138402 NA NA NA NA NA chr21-43 23645290 23645683 334 - chr21:23645295-23645452 NA NA NA NA NA chr21-42 23399920 23400222 201 - chr21:23400056-23400156 NA NA NA NA NA chr21-41 22905734 22906010 139 - chr21:22905793-22905847 NA NA NA NA NA chr21-40 22557619 22557913 210 - chr21:22557698-22557814 NA NA NA NA NA chr21-39 22527235 22527605 195 - chr21:22527420-22527440 NA NA NA NA NA chr21-38 22036170 22036384 121 - chr21:22036263-22036353 NA NA NA NA NA chr21-37 21969539 21969795 180 - chr21:21969623-21969727 NA NA NA NA NA chr21-36 21432050 21432429 148 - chr21:21432261-21432332 NA NA NA NA NA chr21-35 20880555 20880956 217 - chr21:20880800-20880833 NA NA NA NA NA chr21-34 20316828 20317212 224 - chr21:20316998-20317082 NA NA NA NA NA chr21-33 20251099 20251368 167 - chr21:20251190-20251323 NA NA NA NA NA chr21-32 20121040 20121325 117 - chr21:20121190-20121251 NA NA NA NA NA chr21-31 20104296 20104808 342 - chr21:20104365-20104537 NA NA NA NA NA chr21-30 19858404 19858765 210 - chr21:19858612-19858633 NA NA NA NA NA chr21-29 19830908 19831257 257 - chr21:19830925-19831072 NA NA NA NA NA chr21-28 19722419 19722768 167 - chr21:19722493-19722550 NA NA NA NA NA chr21-27 19563472 19564000 260 - chr21:19563609-19563779 NA NA NA NA NA chr21-26 19082504 19082872 237 - chr21:19082689-19082795 NA NA NA NA NA chr21-25 19014106 19014670 333 - chr21:19014170-19014560 NA NA NA NA NA chr21-24 18933423 18933652 149 - chr21:18933539-18933584 NA NA NA NA NA chr21-23 18472508 18472871 198 - chr21:18472622-18472655 NA NA NA NA NA chr21-22 17868143 17868410 123 - chr21:17868158-17868233 NA NA NA NA NA chr21-21 17804543 17805030 261 - chr21:17804765-17804800 NA NA NA NA NA chr21-20 17797619 17797986 120 - chr21:17797665-17797672 NA NA NA NA NA chr21-19 17589572 17589813 153 - chr21:17589644-17589677 NA NA NA NA NA chr21-18 17552140 17552456 176 - chr21:17552319-17552355 NA NA NA NA NA chr21-17 17456932 17457154 154 - chr21:17456989-17457053 NA NA NA NA NA chr21-16 17047573 17048210 366 - chr21:17048052-17048175 NA NA NA NA NA chr21-15 16734090 16734369 169 - chr21:16734174-16734233 NA NA NA NA NA chr21-14 16578126 16578452 200 - chr21:16578253-16578327 NA NA NA NA NA chr21-13 16497194 16497369 127 - chr21:16497223-16497302 NA NA NA NA NA chr21-12 16138946 16139237 167 - chr21:16139013-16139094 NA NA NA NA NA chr21-11 16096090 16096885 500 - chr21:16096202-16096810 NA NA NA NA NA chr21-10 16038131 16038385 157 - chr21:16038207-16038225 NA NA NA NA NA chr21-9 16020260 16020655 161 - chr21:16020359-16020376 NA NA NA NA NA chr21-8 15857959 15858223 160 - chr21:15858082-15858138 NA NA NA NA NA chr21-7 15347369 15347776 246 - chr21:15347528-15347609 NA NA NA NA NA chr21-6 15287017 15287312 194 - chr21:15287190-15287283 NA NA NA NA NA chr21-5 14816139 14816444 220 - chr21:14816199-14816334 NA NA NA NA NA chr21-4 14639326 14639563 187 - chr21:14639341-14639478 NA NA NA NA NA chr21-3 14477835 14478002 114 - chr21:14477842-14477903 NA NA NA NA NA chr21-2 14307777 14308069 159 - chr21:14307895-14307921 NA NA NA NA NA chr21 14134781 14135139 206 - chr21:14134855-14134961 NA NA NA NA NA chr20-28 9517909 9518208 159 - chr20:9517972-9517991 NA NA NA NA NA chr20-27 8832022 8832283 181 - chr20:8832124-8832217 NA NA NA NA NA chr20-26 8631899 8632084 118 - chr20:8631966-8632017 NA NA NA NA NA chr20-25 8208253 8208426 170 - chr20:8208254-8208417 NA NA NA NA NA chr20-24 8166575 8166837 115 - chr20:8166745-8166759 NA NA NA NA NA chr20-23 7773175 7773562 257 - chr20:7773345-7773552 NA NA NA NA NA chr20-22 7317723 7317946 159 - chr20:7317748-7317765 NA NA NA NA NA chr20-21 7043764 7044105 189 - chr20:7043864-7043874 NA NA NA NA NA chr20-20 6852589 6852814 113 - chr20:6852730-6852731 NA NA NA NA NA chr20-19 6757758 6758032 232 - chr20:6757790-6757960 NA NA NA NA NA chr20-18 6725041 6725354 268 - chr20:6725093-6725346 NA NA NA NA NA chr20-17 6493360 6493630 166 - chr20:6493478-6493568 NA NA NA NA NA chr20-248 63987719 63988066 217 - chr20:63987831-63987918 NA NA NA NA NA chr20-247 63013048 63013322 215 - chr20:63013091-63013263 NA NA NA NA NA chr20-246 62799834 62800227 252 - chr20:62800033-62800144 NA NA NA NA NA chr20-245 62159169 62159393 135 - chr20:62159261-62159307 NA NA NA NA NA chr20-244 61877917 61878152 146 - chr20:61878034-61878091 NA NA NA NA NA chr20-16 6137483 6137748 163 - chr20:6137596-6137679 NA NA NA NA NA chr20-243 60359906 60360112 132 - chr20:60359982-60360044 NA NA NA NA NA chr20-242 60136608 60136833 123 - chr20:60136774-60136795 NA NA NA NA NA chr20-241 60063464 60063978 277 - chr20:60063809-60063849 NA NA NA NA NA chr20-240 60000676 60000915 217 - chr20:60000697-60000848 NA NA NA NA NA chr20-239 59733624 59733925 160 - chr20:59733780-59733789 NA NA NA NA NA chr20-238 59128623 59128853 136 - chr20:59128714-59128750 NA NA NA NA NA chr20-237 58960367 58960730 216 - chr20:58960475-58960544 NA NA NA NA NA chr20-236 58899144 58899374 165 - chr20:58899262-58899362 NA NA NA NA NA chr20-235 58886902 58887186 232 - chr20:58886954-58887134 NA NA NA NA NA chr20-234 58335062 58335395 205 - chr20:58335254-58335364 NA NA NA NA NA chr20-233 58265724 58266090 232 - chr20:58265826-58265924 NA NA NA NA NA chr20-232 58073014 58073202 137 - chr20:58073089-58073175 NA NA NA NA NA chr20-231 58067112 58067460 195 - chr20:58067347-58067389 NA NA NA NA NA chr20-230 57761460 57761859 207 - chr20:57761687-57761847 NA NA NA NA NA chr20-229 57697001 57697208 160 - chr20:57697053-57697184 NA NA NA NA NA chr20-228 57671645 57671814 123 - chr20:57671737-57671814 NA NA NA NA NA chr20-227 57648387 57648724 178 - chr20:57648501-57648626 NA NA NA NA NA chr20-226 57607010 57607188 120 - chr20:57607125-57607149 NA NA NA NA NA chr20-225 57551586 57551829 190 - chr20:57551666-57551803 NA NA NA NA NA chr20-224 57464953 57465161 173 - chr20:57464991-57465127 NA NA NA NA NA chr20-223 57088735 57089104 192 - chr20:57088824-57088839 NA NA NA NA NA chr20-222 57029307 57029624 206 - chr20:57029329-57029477 NA NA NA NA NA chr20-221 57020114 57020418 172 - chr20:57020194-57020234 NA NA NA NA NA chr20-220 56928390 56928622 137 - chr20:56928423-56928465 NA NA NA NA NA chr20-219 56843796 56844030 147 - chr20:56843929-56843989 NA NA NA NA NA chr20-218 56791760 56792000 120 - chr20:56791912-56791992 NA NA NA NA NA chr20-217 56536008 56536242 126 - chr20:56536123-56536141 NA NA NA NA NA chr20-216 56454634 56454766 119 - chr20:56454644-56454744 NA NA NA NA NA chr20-215 56409811 56410001 133 - chr20:56409897-56409973 NA NA NA NA NA chr20-214 56360448 56360726 228 - chr20:56360475-56360653 NA NA NA NA NA chr20-213 56121184 56121480 173 - chr20:56121286-56121350 NA NA NA NA NA chr20-212 55999133 55999451 244 - chr20:55999274-55999422 NA NA NA NA NA chr20-211 55993989 55994211 178 - chr20:55994094-55994140 NA NA NA NA NA chr20-210 55954193 55954479 190 - chr20:55954300-55954458 NA NA NA NA NA chr20-209 55827402 55827873 162 - chr20:55827592-55827651 NA NA NA NA NA chr20-208 55759019 55759294 131 - chr20:55759055-55759114 NA NA NA NA NA chr20-15 5536194 5536395 170 - chr20:5536206-5536283 NA NA NA NA NA chr20-207 55259506 55259867 248 - chr20:55259730-55259865 NA NA NA NA NA chr20-206 55187430 55187590 126 - chr20:55187489-55187581 NA NA NA NA NA chr20-205 55006238 55006522 167 - chr20:55006279-55006329 NA NA NA NA NA chr20-14 5478842 5479276 313 - chr20:5479076-5479215 NA NA NA NA NA chr20-204 54635379 54635753 245 - chr20:54635448-54635650 NA NA NA NA NA chr20-203 54481736 54482225 239 - chr20:54481744-54481871 NA NA NA NA NA chr20-202 54442298 54442622 171 - chr20:54442447-54442457 NA NA NA NA NA chr20-201 54394262 54394491 197 - chr20:54394298-54394463 NA NA NA NA NA chr20-200 54354799 54355037 128 - chr20:54354878-54354896 NA NA NA NA NA chr20-199 54136158 54136538 218 - chr20:54136317-54136481 NA NA NA NA NA chr20-198 54105561 54105756 153 - chr20:54105581-54105648 NA NA NA NA NA chr20-197 53962314 53962611 209 - chr20:53962486-53962551 NA NA NA NA NA chr20-13 5351212 5351510 246 - chr20:5351378-5351496 NA NA NA NA NA chr20-196 53336959 53337522 239 - chr20:53337357-53337420 NA NA NA NA NA chr20-12 5318990 5319315 163 - chr20:5319228-5319229 NA NA NA NA NA chr20-195 52993797 52994065 157 - chr20:52993846-52993966 NA NA NA NA NA chr20-194 52606965 52607271 195 - chr20:52607096-52607180 NA NA NA NA NA chr20-193 52596521 52597189 265 - chr20:52597117-52597118 NA NA NA NA NA chr20-192 52591835 52592011 119 - chr20:52591859-52591959 NA NA NA NA NA chr20-191 52553198 52553421 154 - chr20:52553275-52553406 NA NA NA NA NA chr20-190 52541126 52541419 217 - chr20:52541349-52541392 NA NA NA NA NA chr20-189 52537482 52537789 168 - chr20:52537645-52537658 NA NA NA NA NA chr20-11 5251967 5252143 132 - chr20:5252037-5252125 NA NA NA NA NA chr20-188 52499200 52499419 198 - chr20:52499281-52499418 NA NA NA NA NA chr20-187 52473663 52473906 114 - chr20:52473696-52473767 NA NA NA NA NA chr20-186 52351048 52351441 331 - chr20:52351112-52351381 NA NA NA NA NA chr20-185 52242717 52243167 310 - chr20:52242874-52243078 NA NA NA NA NA chr20-184 51929469 51930053 230 - chr20:51929684-51929725 NA NA NA NA NA chr20-183 51852334 51852842 331 - chr20:51852555-51852709 NA NA NA NA NA chr20-182 51165829 51166088 155 - chr20:51165895-51165902 NA NA NA NA NA chr20-181 51143658 51143916 171 - chr20:51143716-51143800 NA NA NA NA NA chr20-180 51000271 51000770 323 - chr20:51000428-51000575 NA NA NA NA NA chr20-179 50984660 50984919 205 - chr20:50984677-50984754 NA NA NA NA NA chr20-178 50738811 50739094 245 - chr20:50738867-50738998 NA NA NA NA NA chr20-177 50732504 50732904 278 - chr20:50732512-50732668 NA NA NA NA NA chr20-176 50664717 50665179 243 - chr20:50664820-50664844 NA NA NA NA NA chr20-175 50324031 50324284 170 - chr20:50324078-50324189 NA NA NA NA NA chr20-174 50273238 50273885 222 - chr20:50273342-50273353 NA NA NA NA NA chr20-173 50041500 50041696 129 - chr20:50041572-50041644 NA NA NA NA NA chr20-172 50039769 50039986 186 - chr20:50039810-50039903 NA NA NA NA NA chr20-171 49668861 49669057 132 - chr20:49668946-49669000 NA NA NA NA NA chr20-170 49222788 49223057 152 - chr20:49222869-49222904 NA NA NA NA NA chr20-169 49219055 49219286 143 - chr20:49219148-49219213 NA NA NA NA NA chr20-168 49142044 49142625 227 - chr20:49142068-49142161 NA NA NA NA NA chr20-167 49030904 49031107 175 - chr20:49030978-49031069 NA NA NA NA NA chr20-166 48987107 48987404 174 - chr20:48987276-48987327 NA NA NA NA NA chr20-165 48890611 48890966 326 - chr20:48890633-48890872 NA NA NA NA NA chr20-164 48242999 48243647 409 - chr20:48243155-48243561 NA NA NA NA NA chr20-163 48191616 48191970 141 - chr20:48191816-48191886 NA NA NA NA NA chr20-162 47762965 47763252 210 - chr20:47763036-47763169 NA NA NA NA NA chr20-161 47724584 47724819 128 - chr20:47724755-47724776 NA NA NA NA NA chr20-160 47452836 47453101 164 - chr20:47452877-47452940 NA NA NA NA NA chr20-159 47368338 47368593 129 - chr20:47368342-47368429 NA NA NA NA NA chr20-158 47128589 47128892 194 - chr20:47128794-47128879 NA NA NA NA NA chr20-157 47037135 47037535 227 - chr20:47037254-47037308 NA NA NA NA NA chr20-156 46961999 46962273 149 - chr20:46962169-46962193 NA NA NA NA NA chr20-155 46943604 46943748 125 - chr20:46943630-46943736 NA NA NA NA NA chr20-154 46913051 46913338 263 - chr20:46913119-46913310 NA NA NA NA NA chr20-153 46234462 46234661 119 - chr20:46234580-46234619 NA NA NA NA NA chr20-152 46182820 46183074 196 - chr20:46182852-46182938 NA NA NA NA NA chr20-151 46096114 46096426 183 - chr20:46096261-46096315 NA NA NA NA NA chr20-150 45707014 45707359 184 - chr20:45707145-45707168 NA NA NA NA NA chr20-149 45605743 45605989 160 - chr20:45605891-45605913 NA NA NA NA NA chr20-10 4552735 4552953 143 - chr20:4552813-4552887 NA NA NA NA NA chr20-148 45249685 45249957 145 - chr20:45249823-45249841 NA NA NA NA NA chr20-147 45016527 45016815 180 - chr20:45016742-45016814 NA NA NA NA NA chr20-146 44841937 44842179 164 - chr20:44842018-44842110 NA NA NA NA NA chr20-145 44652965 44653386 203 - chr20:44653245-44653354 NA NA NA NA NA chr20-144 44499147 44499517 282 - chr20:44499371-44499514 NA NA NA NA NA chr20-143 44484025 44484550 424 - chr20:44484255-44484494 NA NA NA NA NA chr20-142 44233998 44234363 314 - chr20:44234133-44234294 NA NA NA NA NA chr20-141 43988284 43988587 228 - chr20:43988355-43988508 NA NA NA NA NA chr20-140 43610936 43611129 160 - chr20:43611015-43611076 NA NA NA NA NA chr20-139 43323805 43324015 154 - chr20:43323888-43323986 NA NA NA NA NA chr20-138 43123882 43124226 228 - chr20:43124004-43124116 NA NA NA NA NA chr20-137 42999420 42999644 131 - chr20:42999552-42999590 NA NA NA NA NA chr20-136 42874150 42874489 217 - chr20:42874260-42874331 NA NA NA NA NA chr20-135 42667443 42667933 247 - chr20:42667662-42667666 NA NA NA NA NA chr20-134 42370740 42371202 177 - chr20:42370851-42370859 NA NA NA NA NA chr20-133 42203427 42203596 139 - chr20:42203429-42203538 NA NA NA NA NA chr20-9 4206349 4206546 141 - chr20:4206441-4206526 NA NA NA NA NA chr20-132 42007606 42007998 222 - chr20:42007607-42007699 NA NA NA NA NA chr20-8 4192002 4192392 202 - chr20:4192139-4192187 NA NA NA NA NA chr20-131 41858505 41858731 121 - chr20:41858571-41858657 NA NA NA NA NA chr20-130 41693952 41694140 176 - chr20:41693982-41694122 NA NA NA NA NA chr20-129 41542069 41542389 218 - chr20:41542131-41542167 NA NA NA NA NA chr20-128 41130629 41130799 131 - chr20:41130698-41130790 NA NA NA NA NA chr20-127 40980598 40981103 293 - chr20:40980732-40980813 NA NA NA NA NA chr20-126 40977170 40977478 193 - chr20:40977336-40977414 NA NA NA NA NA chr20-125 40778584 40778849 140 - chr20:40778673-40778688 NA NA NA NA NA chr20-124 40567567 40567905 220 - chr20:40567679-40567785 NA NA NA NA NA chr20-123 40375119 40375486 207 - chr20:40375368-40375404 NA NA NA NA NA chr20-7 3936079 3936322 131 - chr20:3936212-3936231 NA NA NA NA NA chr20-122 39134384 39134672 184 - chr20:39134395-39134475 NA NA NA NA NA chr20-121 38850246 38850413 122 - chr20:38850280-38850357 NA NA NA NA NA chr20-120 38694379 38694518 125 - chr20:38694427-38694510 NA NA NA NA NA chr20-119 38427699 38427907 128 - chr20:38427806-38427836 NA NA NA NA NA chr20-118 38081773 38082013 144 - chr20:38081779-38081827 NA NA NA NA NA chr20-117 37720441 37720581 126 - chr20:37720459-37720543 NA NA NA NA NA chr20-116 37362211 37362448 163 - chr20:37362222-37362353 NA NA NA NA NA chr20-115 37075943 37076327 178 - chr20:37076168-37076178 NA NA NA NA NA chr20-114 36872220 36872532 177 - chr20:36872391-36872523 NA NA NA NA NA chr20-113 36795363 36795825 247 - chr20:36795578-36795610 NA NA NA NA NA chr20-112 36755156 36755467 216 - chr20:36755217-36755270 NA NA NA NA NA chr20-111 36732200 36732597 216 - chr20:36732433-36732468 NA NA NA NA NA chr20-110 36446452 36446673 191 - chr20:36446524-36446657 NA NA NA NA NA chr20-109 36326681 36326936 159 - chr20:36326789-36326844 NA NA NA NA NA chr20-108 35978959 35979176 175 - chr20:35978986-35979119 NA NA NA NA NA chr20-107 35940636 35941038 213 - chr20:35940736-35940872 NA NA NA NA NA chr20-106 35477589 35477817 181 - chr20:35477618-35477658 NA NA NA NA NA chr20-105 35169208 35169458 133 - chr20:35169359-35169435 NA NA NA NA NA chr20-6 3516029 3516420 235 - chr20:3516331-3516410 NA NA NA NA NA chr20-104 34882825 34883042 164 - chr20:34882953-34883014 NA NA NA NA NA chr20-103 34862656 34863143 266 - chr20:34862905-34862966 NA NA NA NA NA chr20-102 34738457 34738788 157 - chr20:34738473-34738535 NA NA NA NA NA chr20-101 34597841 34598341 268 - chr20:34598020-34598099 NA NA NA NA NA chr20-100 34564334 34564626 160 - chr20:34564393-34564421 NA NA NA NA NA chr20-99 34415112 34415512 240 - chr20:34415245-34415271 NA NA NA NA NA chr20-98 34147321 34147847 197 - chr20:34147327-34147376 NA NA NA NA NA chr20-97 34138959 34139185 153 - chr20:34139020-34139076 NA NA NA NA NA chr20-96 33206826 33207113 170 - chr20:33206872-33206925 NA NA NA NA NA chr20-95 33153138 33153426 194 - chr20:33153229-33153331 NA NA NA NA NA chr20-94 33066211 33066708 310 - chr20:33066365-33066510 NA NA NA NA NA chr20-93 32904254 32904775 262 - chr20:32904481-32904484 NA NA NA NA NA chr20-92 32710244 32710598 184 - chr20:32710491-32710495 NA NA NA NA NA chr20-91 32163940 32164157 141 - chr20:32164064-32164129 NA NA NA NA NA chr20-90 31851777 31851935 130 - chr20:31851814-31851916 NA NA NA NA NA chr20-89 31668926 31669175 142 - chr20:31669068-31669103 NA NA NA NA NA chr20-88 31380036 31380576 282 - chr20:31380194-31380299 NA NA NA NA NA chr20-87 25730677 25731086 232 - chr20:25730868-25730923 NA NA NA NA NA chr20-86 25528474 25528747 135 - chr20:25528617-25528706 NA NA NA NA NA chr20-5 2529716 2529953 147 - chr20:2529883-2529940 NA NA NA NA NA chr20-85 25123970 25124224 185 - chr20:25124156-25124194 NA NA NA NA NA chr20-84 25078329 25078636 192 - chr20:25078468-25078545 NA NA NA NA NA chr20-83 24962511 24962888 344 - chr20:24962530-24962841 NA NA NA NA NA chr20-82 24894182 24894481 255 - chr20:24894256-24894379 NA NA NA NA NA chr20-81 24721534 24721800 197 - chr20:24721614-24721742 NA NA NA NA NA chr20-4 2433667 2433940 139 - chr20:2433804-2433807 NA NA NA NA NA chr20-80 24306340 24306559 120 - chr20:24306410-24306431 NA NA NA NA NA chr20-79 23792383 23792711 278 - chr20:23792473-23792601 NA NA NA NA NA chr20-78 23507189 23507414 154 - chr20:23507208-23507291 NA NA NA NA NA chr20-77 23368162 23368523 257 - chr20:23368249-23368368 NA NA NA NA NA chr20-76 22458108 22458458 181 - chr20:22458185-22458197 NA NA NA NA NA chr20-75 22192207 22192449 204 - chr20:22192275-22192441 NA NA NA NA NA chr20-74 22051033 22051354 176 - chr20:22051097-22051182 NA NA NA NA NA chr20-73 21800573 21800774 181 - chr20:21800633-21800754 NA NA NA NA NA chr20-72 21447486 21447649 128 - chr20:21447542-21447635 NA NA NA NA NA chr20-71 21435231 21435700 245 - chr20:21435332-21435435 NA NA NA NA NA chr20-70 21250005 21250306 130 - chr20:21250083-21250104 NA NA NA NA NA chr20-69 21088738 21089111 216 - chr20:21088845-21088904 NA NA NA NA NA chr20-68 20981428 20981668 144 - chr20:20981498-20981546 NA NA NA NA NA chr20-67 20495705 20496112 253 - chr20:20495967-20496066 NA NA NA NA NA chr20-66 20103626 20103889 164 - chr20:20103800-20103815 NA NA NA NA NA chr20-65 20010373 20010684 192 - chr20:20010551-20010606 NA NA NA NA NA chr20-64 19985043 19985446 312 - chr20:19985059-19985281 NA NA NA NA NA chr20-63 18667772 18668221 271 - chr20:18667874-18667979 NA NA NA NA NA chr20-62 18475380 18475619 150 - chr20:18475552-18475613 NA NA NA NA NA chr20-61 18155641 18155968 167 - chr20:18155785-18155792 NA NA NA NA NA chr20-60 17451122 17451327 174 - chr20:17451164-17451245 NA NA NA NA NA chr20-59 17016602 17017000 230 - chr20:17016776-17016834 NA NA NA NA NA chr20-58 16992927 16993154 125 - chr20:16992941-16993032 NA NA NA NA NA chr20-57 16490115 16490427 145 - chr20:16490174-16490224 NA NA NA NA NA chr20-56 16276642 16276864 184 - chr20:16276645-16276791 NA NA NA NA NA chr20-55 16000635 16000812 130 - chr20:16000654-16000734 NA NA NA NA NA chr20-54 15778619 15778871 138 - chr20:15778722-15778724 NA NA NA NA NA chr20-3 1551478 1551697 143 - chr20:1551607-1551674 NA NA NA NA NA chr20-53 15000098 15000408 157 - chr20:15000154-15000158 NA NA NA NA NA chr20-52 14978380 14978556 172 - chr20:14978388-14978548 NA NA NA NA NA chr20-2 1490593 1491075 229 - chr20:1490848-1490950 NA NA NA NA NA chr20-51 14598089 14598348 143 - chr20:14598273-14598300 NA NA NA NA NA chr20-50 14526285 14526468 122 - chr20:14526370-14526431 NA NA NA NA NA chr20-49 14383157 14383563 323 - chr20:14383210-14383390 NA NA NA NA NA chr20-48 14115686 14116044 155 - chr20:14115814-14115816 NA NA NA NA NA chr20-47 13852885 13853381 270 - chr20:13853127-13853171 NA NA NA NA NA chr20-46 13613917 13614249 330 - chr20:13613918-13614246 NA NA NA NA NA chr20-45 13568507 13568770 167 - chr20:13568527-13568598 NA NA NA NA NA chr20-44 13355755 13355943 127 - chr20:13355852-13355918 NA NA NA NA NA chr20-43 13105523 13105776 168 - chr20:13105625-13105708 NA NA NA NA NA chr20-42 12959099 12959360 232 - chr20:12959122-12959325 NA NA NA NA NA chr20-41 12881319 12881672 212 - chr20:12881535-12881556 NA NA NA NA NA chr20-40 12845297 12845667 184 - chr20:12845327-12845429 NA NA NA NA NA chr20-39 12828208 12828435 128 - chr20:12828365-12828394 NA NA NA NA NA chr20-38 12205434 12205663 157 - chr20:12205450-12205535 NA NA NA NA NA chr20-37 11747377 11747769 273 - chr20:11747442-11747632 NA NA NA NA NA chr20-36 11715664 11716126 190 - chr20:11715717-11715781 NA NA NA NA NA chr20-35 11707258 11707600 324 - chr20:11707281-11707587 NA NA NA NA NA chr20-34 11131192 11131337 129 - chr20:11131223-11131336 NA NA NA NA NA chr20-33 10925334 10925617 145 - chr20:10925446-10925453 NA NA NA NA NA chr20-32 10604634 10604836 170 - chr20:10604759-10604833 NA NA NA NA NA chr20-31 10459057 10459259 139 - chr20:10459157-10459233 NA NA NA NA NA chr20-30 10396437 10396669 183 - chr20:10396505-10396639 NA NA NA NA NA chr20-29 10282568 10282756 124 - chr20:10282680-10282708 NA NA NA NA NA chr20 1015477 1015776 188 - chr20:1015595-1015746 NA NA NA NA NA chr1-340 99410215 99410466 144 - chr1:99410314-99410351 NA NA NA NA NA chr1-339 99377930 99378208 175 - chr1:99378011-99378083 NA NA NA NA NA chr1-338 99104170 99104427 169 - chr1:99104201-99104282 NA NA NA NA NA chr1-337 99085218 99085430 115 - chr1:99085326-99085366 NA NA NA NA NA chr1-336 98967997 98968239 184 - chr1:98968108-98968234 NA NA NA NA NA chr1-335 98918551 98918927 226 - chr1:98918590-98918666 NA NA NA NA NA chr1-334 98396969 98397469 253 - chr1:98397173-98397179 NA NA NA NA NA chr1-333 98031428 98031686 180 - chr1:98031458-98031612 NA NA NA NA NA chr1-332 98000906 98001553 339 - chr1:98001142-98001221 NA NA NA NA NA chr1-331 97953103 97953329 118 - chr1:97953252-97953262 NA NA NA NA NA chr1-330 97499840 97500074 189 - chr1:97499840-97499894 NA NA NA NA NA chr1-329 96706870 96707206 234 - chr1:96707047-96707179 NA NA NA NA NA chr1-14 9668104 9668386 127 - chr1:9668193-9668209 NA NA NA NA NA chr1-328 96459380 96459666 211 - chr1:96459439-96459575 NA NA NA NA NA chr1-327 96454645 96455206 317 - chr1:96454990-96455063 NA NA NA NA NA chr1-326 95878426 95878633 129 - chr1:95878523-95878574 NA NA NA NA NA chr1-325 95784076 95784299 132 - chr1:95784158-95784205 NA NA NA NA NA chr1-324 95571702 95572089 217 - chr1:95571872-95571919 NA NA NA NA NA chr1-323 95543987 95544323 232 - chr1:95544073-95544213 NA NA NA NA NA chr1-13 9549720 9549944 190 - chr1:9549759-9549925 NA NA NA NA NA chr1-322 94774523 94774912 136 - chr1:94774773-94774800 NA NA NA NA NA chr1-321 94469947 94470179 154 - chr1:94470028-94470104 NA NA NA NA NA chr1-320 94437384 94437685 114 - chr1:94437438-94437463 NA NA NA NA NA chr1-319 94408065 94408313 126 - chr1:94408109-94408113 NA NA NA NA NA chr1-318 93961841 93961988 114 - chr1:93961907-93961988 NA NA NA NA NA chr1-317 93205775 93206167 216 - chr1:93206009-93206049 NA NA NA NA NA chr1-316 92682098 92682360 229 - chr1:92682176-92682342 NA NA NA NA NA chr1-315 92359993 92360253 215 - chr1:92360075-92360245 NA NA NA NA NA chr1-314 91921286 91921586 215 - chr1:91921467-91921533 NA NA NA NA NA chr1-313 91644549 91644788 163 - chr1:91644658-91644745 NA NA NA NA NA chr1-312 91599732 91600023 214 - chr1:91599804-91599941 NA NA NA NA NA chr1-311 91349871 91350229 276 - chr1:91349919-91350113 NA NA NA NA NA chr1-310 91339850 91340144 134 - chr1:91339863-91339935 NA NA NA NA NA chr1-12 9083109 9083543 258 - chr1:9083343-9083541 NA NA NA NA NA chr1-309 90688925 90689268 153 - chr1:90689058-90689059 NA NA NA NA NA chr1-308 90346024 90346175 113 - chr1:90346064-90346139 NA NA NA NA NA chr1-307 90263510 90263991 287 - chr1:90263627-90263748 NA NA NA NA NA chr1-306 89983084 89983296 118 - chr1:89983190-89983206 NA NA NA NA NA chr1-305 89783169 89783503 230 - chr1:89783209-89783335 NA NA NA NA NA chr1-304 89544065 89544332 137 - chr1:89544141-89544148 NA NA NA NA NA chr1-303 89266655 89266841 132 - chr1:89266686-89266718 NA NA NA NA NA chr1-302 89078500 89078801 239 - chr1:89078512-89078565 NA NA NA NA NA chr1-301 88987581 88987991 145 - chr1:88987802-88987804 NA NA NA NA NA chr1-300 88693102 88693356 166 - chr1:88693161-88693239 NA NA NA NA NA chr1-299 87841758 87841974 129 - chr1:87841859-87841929 NA NA NA NA NA chr1-298 87641767 87642251 275 - chr1:87641845-87641911 NA NA NA NA NA chr1-297 87561900 87562201 154 - chr1:87562038-87562045 NA NA NA NA NA chr1-296 86881460 86881620 124 - chr1:86881468-86881580 NA NA NA NA NA chr1-295 85724743 85725172 263 - chr1:85724878-85725081 NA NA NA NA NA chr1-294 85683095 85683350 213 - chr1:85683103-85683274 NA NA NA NA NA chr1-293 85271141 85271513 188 - chr1:85271295-85271319 NA NA NA NA NA chr1-11 8511034 8511335 135 - chr1:8511230-8511259 NA NA NA NA NA chr1-292 85043511 85043919 232 - chr1:85043634-85043700 NA NA NA NA NA chr1-291 83918624 83918892 141 - chr1:83918763-83918777 NA NA NA NA NA chr1-290 83860089 83860302 122 - chr1:83860145-83860176 NA NA NA NA NA chr1-10 8377421 8377674 190 - chr1:8377500-8377669 NA NA NA NA NA chr1-289 83028111 83028407 185 - chr1:83028304-83028378 NA NA NA NA NA chr1-288 82883437 82883986 288 - chr1:82883550-82883577 NA NA NA NA NA chr1-287 82854016 82854300 207 - chr1:82854080-82854210 NA NA NA NA NA chr1-286 82710949 82711435 310 - chr1:82711020-82711292 NA NA NA NA NA chr1-285 82708602 82708903 231 - chr1:82708655-82708782 NA NA NA NA NA chr1-284 82342227 82342526 168 - chr1:82342454-82342491 NA NA NA NA NA chr1-283 81987253 81987500 148 - chr1:81987358-81987419 NA NA NA NA NA chr1-282 81770996 81771219 155 - chr1:81771105-81771192 NA NA NA NA NA chr1-281 81721104 81721395 184 - chr1:81721244-81721321 NA NA NA NA NA chr1-280 81594957 81595177 124 - chr1:81595053-81595081 NA NA NA NA NA chr1-279 81521093 81521488 198 - chr1:81521376-81521377 NA NA NA NA NA chr1-278 81409097 81409612 302 - chr1:81409444-81409575 NA NA NA NA NA chr1-277 81308644 81308837 126 - chr1:81308703-81308762 NA NA NA NA NA chr1-276 81213419 81213697 217 - chr1:81213436-81213470 NA NA NA NA NA chr1-275 81131909 81132175 152 - chr1:81132011-81132049 NA NA NA NA NA chr1-274 80895872 80896149 197 - chr1:80895958-80896075 NA NA NA NA NA chr1-273 80185050 80185492 193 - chr1:80185053-80185163 NA NA NA NA NA chr1-272 79866069 79866228 147 - chr1:79866084-79866217 NA NA NA NA NA chr1-271 79407485 79407688 166 - chr1:79407518-79407647 NA NA NA NA NA chr1-270 79366278 79366508 163 - chr1:79366333-79366405 NA NA NA NA NA chr1-269 79275802 79276147 206 - chr1:79275812-79275879 NA NA NA NA NA chr1-9 7916024 7916203 113 - chr1:7916122-7916169 NA NA NA NA NA chr1-268 79064797 79065136 191 - chr1:79064967-79065010 NA NA NA NA NA chr1-267 78920006 78920481 206 - chr1:78920041-78920122 NA NA NA NA NA chr1-266 78837665 78837844 122 - chr1:78837711-78837776 NA NA NA NA NA chr1-265 78681043 78681359 149 - chr1:78681233-78681261 NA NA NA NA NA chr1-264 78637978 78638246 171 - chr1:78638059-78638133 NA NA NA NA NA chr1-263 77730131 77730368 171 - chr1:77730169-77730274 NA NA NA NA NA chr1-262 77690027 77690312 138 - chr1:77690161-77690250 NA NA NA NA NA chr1-8 7762442 7762825 220 - chr1:7762628-7762685 NA NA NA NA NA chr1-261 77583577 77583801 153 - chr1:77583588-77583670 NA NA NA NA NA chr1-260 77525681 77526039 187 - chr1:77525856-77525880 NA NA NA NA NA chr1-259 77462382 77462588 129 - chr1:77462414-77462496 NA NA NA NA NA chr1-258 77211698 77211900 139 - chr1:77211836-77211862 NA NA NA NA NA chr1-257 77197436 77197701 173 - chr1:77197608-77197689 NA NA NA NA NA chr1-256 77176082 77176629 284 - chr1:77176282-77176303 NA NA NA NA NA chr1-255 77142800 77143214 250 - chr1:77142966-77143056 NA NA NA NA NA chr1-254 76439329 76439560 216 - chr1:76439380-76439551 NA NA NA NA NA chr1-253 76310788 76310982 115 - chr1:76310851-76310855 NA NA NA NA NA chr1-252 75911657 75911887 136 - chr1:75911806-75911841 NA NA NA NA NA chr1-251 75871436 75871646 150 - chr1:75871526-75871616 NA NA NA NA NA chr1-250 75838272 75838592 209 - chr1:75838400-75838498 NA NA NA NA NA chr1-249 75632955 75633197 144 - chr1:75632989-75633035 NA NA NA NA NA chr1-7 7532011 7532299 230 - chr1:7532059-7532211 NA NA NA NA NA chr1-248 75244395 75245013 433 - chr1:75244418-75244667 NA NA NA NA NA chr1-247 74938523 74939242 407 - chr1:74938919-74939070 NA NA NA NA NA chr1-246 74937173 74937509 212 - chr1:74937378-74937412 NA NA NA NA NA chr1-245 74851751 74851975 175 - chr1:74851796-74851922 NA NA NA NA NA chr1-244 74770082 74770316 133 - chr1:74770270-74770302 NA NA NA NA NA chr1-243 74693920 74694090 131 - chr1:74694052-74694082 NA NA NA NA NA chr1-242 74619268 74619555 179 - chr1:74619425-74619496 NA NA NA NA NA chr1-241 74430205 74430410 162 - chr1:74430250-74430373 NA NA NA NA NA chr1-240 74344456 74344737 248 - chr1:74344485-74344722 NA NA NA NA NA chr1-239 74161985 74162396 225 - chr1:74162141-74162180 NA NA NA NA NA chr1-6 7399241 7399383 126 - chr1:7399244-7399328 NA NA NA NA NA chr1-238 73895779 73895994 146 - chr1:73895882-73895959 NA NA NA NA NA chr1-237 73663128 73663325 129 - chr1:73663235-73663296 NA NA NA NA NA chr1-236 73661281 73661509 142 - chr1:73661442-73661498 NA NA NA NA NA chr1-235 73235253 73235558 182 - chr1:73235348-73235407 NA NA NA NA NA chr1-234 71911308 71911502 160 - chr1:71911383-71911441 NA NA NA NA NA chr1-233 71529932 71530195 141 - chr1:71530028-71530047 NA NA NA NA NA chr1-232 71355945 71356253 192 - chr1:71356030-71356044 NA NA NA NA NA chr1-231 71259174 71259420 156 - chr1:71259177-71259301 NA NA NA NA NA chr1-230 71032424 71032706 204 - chr1:71032505-71032637 NA NA NA NA NA chr1-229 70935389 70935545 117 - chr1:70935409-70935513 NA NA NA NA NA chr1-228 70788231 70788589 169 - chr1:70788283-70788389 NA NA NA NA NA chr1-227 70756438 70756591 121 - chr1:70756457-70756546 NA NA NA NA NA chr1-226 70719831 70720014 149 - chr1:70719846-70719923 NA NA NA NA NA chr1-225 70362554 70362798 121 - chr1:70362692-70362772 NA NA NA NA NA chr1-224 70201336 70201565 157 - chr1:70201381-70201412 NA NA NA NA NA chr1-223 70048831 70048975 120 - chr1:70048845-70048893 NA NA NA NA NA chr1-222 69954614 69954938 172 - chr1:69954778-69954798 NA NA NA NA NA chr1-221 69630784 69631368 275 - chr1:69630931-69631005 NA NA NA NA NA chr1-220 69586685 69586886 129 - chr1:69586829-69586886 NA NA NA NA NA chr1-219 69381842 69382169 155 - chr1:69382035-69382060 NA NA NA NA NA chr1-5 6935919 6936280 194 - chr1:6936071-6936098 NA NA NA NA NA chr1-218 69181478 69181691 126 - chr1:69181587-69181684 NA NA NA NA NA chr1-217 69059530 69059794 145 - chr1:69059697-69059753 NA NA NA NA NA chr1-216 69039593 69039776 131 - chr1:69039655-69039734 NA NA NA NA NA chr1-215 68321104 68321636 294 - chr1:68321405-68321566 NA NA NA NA NA chr1-214 68053488 68053885 206 - chr1:68053663-68053678 NA NA NA NA NA chr1-213 67885202 67885342 121 - chr1:67885278-67885342 NA NA NA NA NA chr1-212 67779587 67779780 132 - chr1:67779678-67779749 NA NA NA NA NA chr1-211 67767645 67767888 205 - chr1:67767756-67767847 NA NA NA NA NA chr1-4 6768878 6769184 174 - chr1:6769034-6769076 NA NA NA NA NA chr1-210 67590196 67590603 186 - chr1:67590222-67590317 NA NA NA NA NA chr1-209 66998803 66999094 216 - chr1:66998871-66999062 NA NA NA NA NA chr1-208 66986152 66986506 192 - chr1:66986283-66986313 NA NA NA NA NA chr1-207 66969649 66970174 268 - chr1:66969788-66969859 NA NA NA NA NA chr1-206 66945471 66945819 287 - chr1:66945679-66945783 NA NA NA NA NA chr1-205 66902854 66903125 160 - chr1:66903019-66903032 NA NA NA NA NA chr1-204 66298123 66298495 246 - chr1:66298216-66298270 NA NA NA NA NA chr1-203 65504470 65504829 296 - chr1:65504636-65504743 NA NA NA NA NA chr1-202 65313987 65314240 117 - chr1:65314033-65314074 NA NA NA NA NA chr1-201 65190488 65191130 310 - chr1:65190575-65190596 NA NA NA NA NA chr1-200 65165839 65166181 205 - chr1:65165945-65165951 NA NA NA NA NA chr1-199 64981313 64981635 162 - chr1:64981556-64981558 NA NA NA NA NA chr1-198 64798728 64798921 127 - chr1:64798809-64798860 NA NA NA NA NA chr1-197 63967767 63968011 212 - chr1:63967767-63967883 NA NA NA NA NA chr1-196 63955069 63955451 184 - chr1:63955246-63955248 NA NA NA NA NA chr1-195 63782195 63782473 173 - chr1:63782266-63782334 NA NA NA NA NA chr1-194 63583477 63583734 194 - chr1:63583572-63583703 NA NA NA NA NA chr1-193 63467319 63467678 246 - chr1:63467538-63467675 NA NA NA NA NA chr1-192 63460534 63460761 114 - chr1:63460659-63460684 NA NA NA NA NA chr1-191 62636008 62636473 285 - chr1:62636260-62636317 NA NA NA NA NA chr1-190 61942193 61942338 118 - chr1:61942201-61942310 NA NA NA NA NA chr1-189 61720614 61720788 140 - chr1:61720621-61720727 NA NA NA NA NA chr1-188 61676494 61676742 136 - chr1:61676600-61676612 NA NA NA NA NA chr1-187 61652778 61652966 158 - chr1:61652829-61652897 NA NA NA NA NA chr1-186 61308145 61308516 213 - chr1:61308351-61308502 NA NA NA NA NA chr1-185 61230307 61230589 229 - chr1:61230310-61230386 NA NA NA NA NA chr1-184 60976561 60976828 249 - chr1:60976576-60976771 NA NA NA NA NA chr1-183 60729292 60729697 177 - chr1:60729353-60729359 NA NA NA NA NA chr1-182 60675270 60675469 139 - chr1:60675304-60675383 NA NA NA NA NA chr1-181 60445636 60445885 156 - chr1:60445797-60445860 NA NA NA NA NA chr1-180 60340971 60341238 169 - chr1:60340975-60341046 NA NA NA NA NA chr1-179 59752873 59753099 160 - chr1:59752963-59753041 NA NA NA NA NA chr1-178 59715135 59715393 207 - chr1:59715232-59715388 NA NA NA NA NA chr1-177 59367657 59367983 186 - chr1:59367743-59367789 NA NA NA NA NA chr1-176 59287591 59288021 235 - chr1:59287638-59287708 NA NA NA NA NA chr1-175 59164601 59164883 253 - chr1:59164631-59164855 NA NA NA NA NA chr1-174 59145013 59145266 203 - chr1:59145167-59145220 NA NA NA NA NA chr1-173 59093287 59093570 233 - chr1:59093370-59093531 NA NA NA NA NA chr1-172 58928034 58928255 180 - chr1:58928036-58928201 NA NA NA NA NA chr1-171 58146439 58146710 165 - chr1:58146645-58146704 NA NA NA NA NA chr1-170 58115985 58116353 196 - chr1:58116206-58116230 NA NA NA NA NA chr1-169 57860019 57860451 249 - chr1:57860115-57860303 NA NA NA NA NA chr1-168 57324943 57325138 123 - chr1:57325070-57325121 NA NA NA NA NA chr1-167 57263708 57264112 200 - chr1:57263959-57264091 NA NA NA NA NA chr1-166 57167688 57168122 269 - chr1:57167920-57168024 NA NA NA NA NA chr1-165 56959033 56959398 238 - chr1:56959196-56959379 NA NA NA NA NA chr1-164 56956591 56956879 179 - chr1:56956639-56956754 NA NA NA NA NA chr1-3 5632171 5632418 184 - chr1:5632241-5632376 NA NA NA NA NA chr1-163 56215798 56216060 155 - chr1:56215979-56216027 NA NA NA NA NA chr1-162 56209134 56209417 226 - chr1:56209204-56209373 NA NA NA NA NA chr1-161 56181602 56181854 166 - chr1:56181799-56181805 NA NA NA NA NA chr1-160 56130659 56130970 256 - chr1:56130775-56130965 NA NA NA NA NA chr1-159 56018541 56018755 121 - chr1:56018571-56018661 NA NA NA NA NA chr1-158 54869036 54869386 284 - chr1:54869265-54869351 NA NA NA NA NA chr1-157 54067525 54067720 156 - chr1:54067538-54067655 NA NA NA NA NA chr1-156 53680953 53681159 157 - chr1:53681025-53681133 NA NA NA NA NA chr1-155 53553869 53554224 250 - chr1:53553964-53554109 NA NA NA NA NA chr1-154 53301666 53302045 257 - chr1:53301778-53301913 NA NA NA NA NA chr1-153 53072441 53072670 139 - chr1:53072548-53072657 NA NA NA NA NA chr1-152 53035083 53035328 140 - chr1:53035155-53035190 NA NA NA NA NA chr1-151 52471855 52472186 211 - chr1:52471967-52472058 NA NA NA NA NA chr1-150 52352550 52352690 113 - chr1:52352633-52352665 NA NA NA NA NA chr1-149 51666176 51666703 344 - chr1:51666191-51666511 NA NA NA NA NA chr1-148 51561399 51561675 224 - chr1:51561459-51561631 NA NA NA NA NA chr1-147 51365449 51365709 145 - chr1:51365539-51365567 NA NA NA NA NA chr1-146 51264502 51264747 182 - chr1:51264554-51264715 NA NA NA NA NA chr1-145 51071602 51071776 142 - chr1:51071608-51071718 NA NA NA NA NA chr1-144 51052266 51052730 281 - chr1:51052491-51052551 NA NA NA NA NA chr1-143 50998360 50998735 184 - chr1:50998435-50998465 NA NA NA NA NA chr1-142 50903295 50903514 145 - chr1:50903323-50903394 NA NA NA NA NA chr1-141 50783436 50783631 135 - chr1:50783511-50783586 NA NA NA NA NA chr1-140 50252965 50253299 203 - chr1:50253178-50253250 NA NA NA NA NA chr1-139 49509684 49509908 132 - chr1:49509806-49509846 NA NA NA NA NA chr1-138 49156750 49157029 260 - chr1:49156826-49157029 NA NA NA NA NA chr1-137 48876273 48876495 138 - chr1:48876336-48876390 NA NA NA NA NA chr1-136 48856937 48857206 133 - chr1:48857090-48857121 NA NA NA NA NA chr1-135 48687750 48687959 184 - chr1:48687789-48687948 NA NA NA NA NA chr1-134 48467228 48467516 157 - chr1:48467387-48467469 NA NA NA NA NA chr1-133 48453549 48453810 181 - chr1:48453682-48453783 NA NA NA NA NA chr1-132 48361336 48361646 266 - chr1:48361511-48361645 NA NA NA NA NA chr1-131 47704541 47704918 131 - chr1:47704815-47704864 NA NA NA NA NA chr1-130 47203185 47203377 134 - chr1:47203256-47203358 NA NA NA NA NA chr1-129 47037775 47037941 145 - chr1:47037817-47037941 NA NA NA NA NA chr1-128 46588329 46588603 161 - chr1:46588442-46588490 NA NA NA NA NA chr1-127 46234795 46235256 256 - chr1:46234947-46234998 NA NA NA NA NA chr1-126 46233842 46234065 145 - chr1:46233942-46234061 NA NA NA NA NA chr1-125 46227557 46227901 264 - chr1:46227593-46227689 NA NA NA NA NA chr1-124 46115479 46115695 178 - chr1:46115629-46115693 NA NA NA NA NA chr1-123 46067321 46067615 191 - chr1:46067505-46067593 NA NA NA NA NA chr1-122 46023950 46024282 263 - chr1:46024169-46024245 NA NA NA NA NA chr1-121 45843300 45843604 211 - chr1:45843362-45843542 NA NA NA NA NA chr1-120 45633456 45633840 231 - chr1:45633583-45633661 NA NA NA NA NA chr1-119 45424345 45424643 210 - chr1:45424413-45424535 NA NA NA NA NA chr1-118 45256824 45257228 191 - chr1:45256842-45256950 NA NA NA NA NA chr1-117 45016039 45016447 230 - chr1:45016388-45016440 NA NA NA NA NA chr1-116 44905286 44905704 274 - chr1:44905516-44905646 NA NA NA NA NA chr1-115 44897431 44897676 183 - chr1:44897437-44897558 NA NA NA NA NA chr1-114 44628793 44629126 234 - chr1:44628888-44629023 NA NA NA NA NA chr1-113 44604773 44604949 126 - chr1:44604826-44604902 NA NA NA NA NA chr1-112 44297247 44297482 155 - chr1:44297329-44297408 NA NA NA NA NA chr1-111 44261221 44261586 251 - chr1:44261229-44261366 NA NA NA NA NA chr1-110 44254978 44255264 139 - chr1:44255037-44255127 NA NA NA NA NA chr1-109 44211489 44211769 161 - chr1:44211673-44211715 NA NA NA NA NA chr1-108 44171311 44171697 250 - chr1:44171336-44171450 NA NA NA NA NA chr1-107 44034299 44034777 241 - chr1:44034533-44034588 NA NA NA NA NA chr1-106 43767337 43767551 194 - chr1:43767352-43767526 NA NA NA NA NA chr1-105 43393917 43394184 180 - chr1:43393952-43394045 NA NA NA NA NA chr1-104 42934340 42934789 240 - chr1:42934575-42934606 NA NA NA NA NA chr1-2 4282778 4283184 187 - chr1:4282986-4283100 NA NA NA NA NA chr1-103 42346147 42346403 207 - chr1:42346159-42346317 NA NA NA NA NA chr1-102 42051569 42051829 163 - chr1:42051659-42051711 NA NA NA NA NA chr1 4187811 4188113 125 - chr1:4187998-4188064 NA NA NA NA NA chr1-101 41852243 41852473 116 - chr1:41852306-41852342 NA NA NA NA NA chr1-100 41831681 41831910 193 - chr1:41831723-41831876 NA NA NA NA NA chr1-99 41828017 41828347 235 - chr1:41828094-41828234 NA NA NA NA NA chr1-98 41797355 41797623 173 - chr1:41797418-41797496 NA NA NA NA NA chr1-97 41463619 41463838 124 - chr1:41463726-41463755 NA NA NA NA NA chr1-96 41154905 41155092 150 - chr1:41154932-41154971 NA NA NA NA NA chr1-95 41126771 41127065 200 - chr1:41126911-41127017 NA NA NA NA NA chr1-94 41122649 41122956 220 - chr1:41122789-41122922 NA NA NA NA NA chr1-93 40883294 40883591 149 - chr1:40883413-40883414 NA NA NA NA NA chr1-92 40691062 40691665 283 - chr1:40691440-40691507 NA NA NA NA NA chr1-91 40618160 40618347 153 - chr1:40618213-40618264 NA NA NA NA NA chr1-90 40351241 40351547 227 - chr1:40351358-40351506 NA NA NA NA NA chr1-89 40332284 40332600 200 - chr1:40332409-40332511 NA NA NA NA NA chr1-88 39983815 39984360 373 - chr1:39984007-39984129 NA NA NA NA NA chr1-87 39868349 39868627 193 - chr1:39868361-39868469 NA NA NA NA NA chr1-86 39847268 39847551 180 - chr1:39847435-39847512 NA NA NA NA NA chr1-85 39659488 39659963 261 - chr1:39659639-39659728 NA NA NA NA NA chr1-84 38876007 38876309 160 - chr1:38876177-38876195 NA NA NA NA NA chr1-83 38808635 38809059 236 - chr1:38808829-38808877 NA NA NA NA NA chr1-82 38491917 38492199 216 - chr1:38492003-38492153 NA NA NA NA NA chr1-81 38387358 38387769 210 - chr1:38387476-38387485 NA NA NA NA NA chr1-80 38189188 38189448 146 - chr1:38189322-38189354 NA NA NA NA NA chr1-79 37753711 37754014 171 - chr1:37753854-37753915 NA NA NA NA NA chr1-78 37636330 37636592 187 - chr1:37636413-37636525 NA NA NA NA NA chr1-77 37589022 37589209 169 - chr1:37589038-37589189 NA NA NA NA NA chr1-76 37232656 37232893 176 - chr1:37232679-37232794 NA NA NA NA NA chr1-75 35490300 35490695 269 - chr1:35490529-35490576 NA NA NA NA NA chr1-74 35404963 35405300 181 - chr1:35405151-35405240 NA NA NA NA NA chr1-73 35345255 35345472 131 - chr1:35345305-35345350 NA NA NA NA NA chr1-72 35307827 35308244 226 - chr1:35308002-35308005 NA NA NA NA NA chr1-71 34903503 34903779 177 - chr1:34903541-34903619 NA NA NA NA NA chr1-70 34541465 34541721 239 - chr1:34541473-34541677 NA NA NA NA NA chr1-69 33952326 33952525 157 - chr1:33952381-33952496 NA NA NA NA NA chr1-68 33737586 33738041 164 - chr1:33737909-33737916 NA NA NA NA NA chr1-67 33622422 33622679 179 - chr1:33622543-33622620 NA NA NA NA NA chr1-66 33584684 33585089 204 - chr1:33584748-33584751 NA NA NA NA NA chr1-65 33425091 33425387 193 - chr1:33425156-33425246 NA NA NA NA NA chr1-64 32938610 32938879 180 - chr1:32938706-32938797 NA NA NA NA NA chr1-63 32928130 32928561 257 - chr1:32928280-32928315 NA NA NA NA NA chr1-62 32479230 32479591 214 - chr1:32479314-32479423 NA NA NA NA NA chr1-61 32325074 32325307 163 - chr1:32325169-32325262 NA NA NA NA NA chr1-60 32191879 32192185 175 - chr1:32192058-32192070 NA NA NA NA NA chr1-59 31981749 31981995 207 - chr1:31981769-31981937 NA NA NA NA NA chr1-58 31605069 31605353 159 - chr1:31605194-31605228 NA NA NA NA NA chr1-57 31596748 31597143 224 - chr1:31596934-31596977 NA NA NA NA NA chr1-56 29179565 29179949 168 - chr1:29179586-29179668 NA NA NA NA NA chr1-55 29031009 29031285 203 - chr1:29031078-29031200 NA NA NA NA NA chr1-54 28941514 28941706 129 - chr1:28941532-28941628 NA NA NA NA NA chr1-53 28889528 28889989 324 - chr1:28889608-28889681 NA NA NA NA NA chr1-52 28741469 28741698 146 - chr1:28741515-28741578 NA NA NA NA NA chr1-51 28614932 28615460 319 - chr1:28615020-28615130 NA NA NA NA NA chr1-50 28055390 28055744 327 - chr1:28055409-28055655 NA NA NA NA NA chr1-49 27824104 27824338 128 - chr1:27824182-27824189 NA NA NA NA NA chr1-48 27801794 27802126 153 - chr1:27802005-27802043 NA NA NA NA NA chr1-47 27718782 27719054 228 - chr1:27718786-27718882 NA NA NA NA NA chr1-46 27583221 27583436 131 - chr1:27583317-27583364 NA NA NA NA NA chr1-45 26624237 26624433 128 - chr1:26624273-26624333 NA NA NA NA NA chr1-44 26059941 26060554 291 - chr1:26060083-26060172 NA NA NA NA NA chr1-43 25235077 25235533 304 - chr1:25235281-25235411 NA NA NA NA NA chr1-42 24972135 24972413 242 - chr1:24972184-24972390 NA NA NA NA NA chr1-41 24892676 24892842 129 - chr1:24892755-24892819 NA NA NA NA NA chr1-40 24878097 24878385 169 - chr1:24878128-24878178 NA NA NA NA NA chr1-790 247918177 247918595 233 - chr1:247918436-247918484 NA NA NA NA NA chr1-789 247679911 247680133 177 - chr1:247680071-247680113 NA NA NA NA NA chr1-788 247606994 247607267 142 - chr1:247607022-247607033 NA NA NA NA NA chr1-787 247476579 247476864 224 - chr1:247476648-247476811 NA NA NA NA NA chr1-786 247010446 247010745 134 - chr1:247010596-247010675 NA NA NA NA NA chr1-785 246849215 246849577 128 - chr1:246849478-246849528 NA NA NA NA NA chr1-784 246466461 246466924 236 - chr1:246466610-246466796 NA NA NA NA NA chr1-783 246230282 246230644 211 - chr1:246230310-246230370 NA NA NA NA NA chr1-782 245010397 245010594 174 - chr1:245010418-245010569 NA NA NA NA NA chr1-781 244612568 244613042 359 - chr1:244612935-244613011 NA NA NA NA NA chr1-780 244432071 244432298 196 - chr1:244432089-244432254 NA NA NA NA NA chr1-779 244212403 244212569 139 - chr1:244212432-244212544 NA NA NA NA NA chr1-39 24403709 24404021 209 - chr1:24403758-24403864 NA NA NA NA NA chr1-778 243935243 243935694 233 - chr1:243935377-243935448 NA NA NA NA NA chr1-777 241629672 241629878 130 - chr1:241629767-241629859 NA NA NA NA NA chr1-776 241527807 241528128 237 - chr1:241527879-241528032 NA NA NA NA NA chr1-775 241327908 241328186 229 - chr1:241328011-241328155 NA NA NA NA NA chr1-774 241322441 241322727 152 - chr1:241322590-241322598 NA NA NA NA NA chr1-773 241259702 241260117 270 - chr1:241259717-241259842 NA NA NA NA NA chr1-772 240872169 240872418 138 - chr1:240872243-240872270 NA NA NA NA NA chr1-771 240315881 240316244 287 - chr1:240315977-240316191 NA NA NA NA NA chr1-770 240116865 240117089 140 - chr1:240116898-240117010 NA NA NA NA NA chr1-769 240036601 240037010 288 - chr1:240036658-240036838 NA NA NA NA NA chr1-768 239555151 239555525 204 - chr1:239555323-239555357 NA NA NA NA NA chr1-767 239454922 239455305 255 - chr1:239454925-239455052 NA NA NA NA NA chr1-766 239397531 239397746 155 - chr1:239397630-239397725 NA NA NA NA NA chr1-765 239337616 239338057 233 - chr1:239337798-239337823 NA NA NA NA NA chr1-764 238907241 238907561 187 - chr1:238907392-238907434 NA NA NA NA NA chr1-763 238790585 238790992 230 - chr1:238790808-238790861 NA NA NA NA NA chr1-762 238639959 238640211 197 - chr1:238640107-238640187 NA NA NA NA NA chr1-761 238380422 238380762 222 - chr1:238380528-238380640 NA NA NA NA NA chr1-38 23784506 23784861 183 - chr1:23784712-23784723 NA NA NA NA NA chr1-760 237616136 237616435 164 - chr1:237616225-237616254 NA NA NA NA NA chr1-759 237562938 237563341 310 - chr1:237563000-237563031 NA NA NA NA NA chr1-37 23746671 23746886 146 - chr1:23746745-23746832 NA NA NA NA NA chr1-758 237401231 237401475 116 - chr1:237401299-237401327 NA NA NA NA NA chr1-757 237356172 237356567 303 - chr1:237356408-237356523 NA NA NA NA NA chr1-756 236341408 236341581 122 - chr1:236341460-236341565 NA NA NA NA NA chr1-755 236266134 236266388 146 - chr1:236266271-236266309 NA NA NA NA NA chr1-754 235855498 235855683 169 - chr1:235855559-235855682 NA NA NA NA NA chr1-36 23545877 23546337 237 - chr1:23546043-23546057 NA NA NA NA NA chr1-753 235415283 235415624 235 - chr1:235415411-235415470 NA NA NA NA NA chr1-752 235269439 235269833 223 - chr1:235269518-235269699 NA NA NA NA NA chr1-751 235177842 235178143 239 - chr1:235177936-235178113 NA NA NA NA NA chr1-750 235055752 235056113 166 - chr1:235056010-235056111 NA NA NA NA NA chr1-749 234936498 234936922 352 - chr1:234936534-234936670 NA NA NA NA NA chr1-748 233962266 233962690 184 - chr1:233962534-233962638 NA NA NA NA NA chr1-747 233886958 233887461 306 - chr1:233887196-233887305 NA NA NA NA NA chr1-746 233805102 233805391 178 - chr1:233805150-233805217 NA NA NA NA NA chr1-745 233694828 233695011 156 - chr1:233694867-233694988 NA NA NA NA NA chr1-744 233307193 233307592 228 - chr1:233307485-233307542 NA NA NA NA NA chr1-35 23306425 23306638 128 - chr1:23306501-23306544 NA NA NA NA NA chr1-743 232908088 232908450 219 - chr1:232908279-232908323 NA NA NA NA NA chr1-742 232806035 232806243 130 - chr1:232806122-232806168 NA NA NA NA NA chr1-34 23233805 23234169 217 - chr1:23233947-23234115 NA NA NA NA NA chr1-741 231796881 231797125 200 - chr1:231796943-231797087 NA NA NA NA NA chr1-740 229332730 229332913 137 - chr1:229332773-229332864 NA NA NA NA NA chr1-739 229292173 229292504 166 - chr1:229292293-229292294 NA NA NA NA NA chr1-738 228731260 228731549 147 - chr1:228731357-228731362 NA NA NA NA NA chr1-737 227934695 227934870 150 - chr1:227934697-227934822 NA NA NA NA NA chr1-736 227802920 227803137 138 - chr1:227802969-227803028 NA NA NA NA NA chr1-33 22768352 22768636 192 - chr1:22768526-22768626 NA NA NA NA NA chr1-32 22743197 22743490 193 - chr1:22743374-22743472 NA NA NA NA NA chr1-735 227105951 227106321 157 - chr1:227106219-227106305 NA NA NA NA NA chr1-734 226968809 226969020 166 - chr1:226968919-226968950 NA NA NA NA NA chr1-733 226925269 226925535 179 - chr1:226925339-226925431 NA NA NA NA NA chr1-732 226752203 226752424 192 - chr1:226752211-226752332 NA NA NA NA NA chr1-31 22561859 22562441 221 - chr1:22562076-22562160 NA NA NA NA NA chr1-731 225596842 225597058 146 - chr1:225596939-225597015 NA NA NA NA NA chr1-730 225540767 225541223 252 - chr1:225541035-225541211 NA NA NA NA NA chr1-729 225423968 225424100 115 - chr1:225423982-225424080 NA NA NA NA NA chr1-728 225329003 225329235 158 - chr1:225329103-225329128 NA NA NA NA NA chr1-727 225288983 225289218 132 - chr1:225289020-225289093 NA NA NA NA NA chr1-726 224997969 224998192 175 - chr1:224997975-224998018 NA NA NA NA NA chr1-725 224774048 224774730 347 - chr1:224774431-224774539 NA NA NA NA NA chr1-724 224447533 224447841 306 - chr1:224447534-224447836 NA NA NA NA NA chr1-723 222739877 222740122 144 - chr1:222740000-222740043 NA NA NA NA NA chr1-722 222632302 222632469 113 - chr1:222632322-222632381 NA NA NA NA NA chr1-721 222197978 222198195 124 - chr1:222198056-222198087 NA NA NA NA NA chr1-720 222082972 222083368 223 - chr1:222083283-222083333 NA NA NA NA NA chr1-719 221930859 221931105 174 - chr1:221930935-221931037 NA NA NA NA NA chr1-718 221623737 221624149 358 - chr1:221623749-221623969 NA NA NA NA NA chr1-717 221524615 221525153 248 - chr1:221524746-221524810 NA NA NA NA NA chr1-716 221378977 221379224 149 - chr1:221378978-221379029 NA NA NA NA NA chr1-715 221108831 221109071 168 - chr1:221108840-221108936 NA NA NA NA NA chr1-714 220956463 220956631 142 - chr1:220956489-220956605 NA NA NA NA NA chr1-713 220281938 220282091 128 - chr1:220281948-220282051 NA NA NA NA NA chr1-712 220034614 220034750 113 - chr1:220034632-220034722 NA NA NA NA NA chr1-711 219187340 219187851 263 - chr1:219187626-219187641 NA NA NA NA NA chr1-710 218976032 218976281 165 - chr1:218976172-218976253 NA NA NA NA NA chr1-709 218483421 218483749 179 - chr1:218483563-218483593 NA NA NA NA NA chr1-30 21813276 21813577 210 - chr1:21813394-21813552 NA NA NA NA NA chr1-708 218125082 218125338 207 - chr1:218125273-218125333 NA NA NA NA NA chr1-707 217891141 217891480 176 - chr1:217891331-217891397 NA NA NA NA NA chr1-706 217757876 217758134 182 - chr1:217757976-217758066 NA NA NA NA NA chr1-705 217746913 217747393 312 - chr1:217747173-217747317 NA NA NA NA NA chr1-704 217732517 217732714 119 - chr1:217732535-217732628 NA NA NA NA NA chr1-29 21759385 21759607 153 - chr1:21759435-21759519 NA NA NA NA NA chr1-703 217455018 217455156 120 - chr1:217455027-217455111 NA NA NA NA NA chr1-702 216779663 216780207 213 - chr1:216779688-216779774 NA NA NA NA NA chr1-701 216745326 216745606 185 - chr1:216745374-216745464 NA NA NA NA NA chr1-700 215985614 215985942 178 - chr1:215985625-215985653 NA NA NA NA NA chr1-699 215531577 215531884 157 - chr1:215531583-215531690 NA NA NA NA NA chr1-698 215325312 215325536 149 - chr1:215325408-215325482 NA NA NA NA NA chr1-697 215239638 215240044 294 - chr1:215239766-215239950 NA NA NA NA NA chr1-696 215160026 215160184 126 - chr1:215160061-215160155 NA NA NA NA NA chr1-695 214914300 214914646 213 - chr1:214914377-214914457 NA NA NA NA NA chr1-694 214846512 214846994 242 - chr1:214846656-214846818 NA NA NA NA NA chr1-693 214548224 214548714 160 - chr1:214548583-214548633 NA NA NA NA NA chr1-692 214009367 214009575 166 - chr1:214009452-214009542 NA NA NA NA NA chr1-691 213960345 213960475 117 - chr1:213960363-213960441 NA NA NA NA NA chr1-690 213541692 213542023 193 - chr1:213541815-213541870 NA NA NA NA NA chr1-689 212949484 212949656 151 - chr1:212949511-212949655 NA NA NA NA NA chr1-688 212564305 212564512 148 - chr1:212564416-212564505 NA NA NA NA NA chr1-687 212476796 212477176 262 - chr1:212476909-212477053 NA NA NA NA NA chr1-686 212420790 212421037 172 - chr1:212420928-212421028 NA NA NA NA NA chr1-685 212101778 212102306 297 - chr1:212102113-212102128 NA NA NA NA NA chr1-684 211984769 211985142 226 - chr1:211985003-211985107 NA NA NA NA NA chr1-683 211966856 211967159 161 - chr1:211967021-211967040 NA NA NA NA NA chr1-682 211942236 211942418 125 - chr1:211942279-211942385 NA NA NA NA NA chr1-681 211883093 211883727 326 - chr1:211883403-211883425 NA NA NA NA NA chr1-680 211780448 211780692 180 - chr1:211780479-211780529 NA NA NA NA NA chr1-679 211165112 211165736 278 - chr1:211165406-211165408 NA NA NA NA NA chr1-678 210925141 210925557 307 - chr1:210925176-210925226 NA NA NA NA NA chr1-677 210710298 210710460 138 - chr1:210710374-210710440 NA NA NA NA NA chr1-676 210068386 210068621 212 - chr1:210068435-210068578 NA NA NA NA NA chr1-675 210001096 210001458 198 - chr1:210001187-210001221 NA NA NA NA NA chr1-674 209860927 209861392 281 - chr1:209861110-209861205 NA NA NA NA NA chr1-673 209653320 209653654 187 - chr1:209653458-209653498 NA NA NA NA NA chr1-672 209534435 209534920 243 - chr1:209534779-209534780 NA NA NA NA NA chr1-671 209363937 209364381 241 - chr1:209364142-209364184 NA NA NA NA NA chr1-670 209192010 209192311 163 - chr1:209192159-209192184 NA NA NA NA NA chr1-669 208748508 208748880 279 - chr1:208748706-208748822 NA NA NA NA NA chr1-668 208511280 208511594 167 - chr1:208511465-208511504 NA NA NA NA NA chr1-667 208463187 208463463 155 - chr1:208463364-208463398 NA NA NA NA NA chr1-666 207962755 207963041 162 - chr1:207962761-207962799 NA NA NA NA NA chr1-665 207030243 207030547 245 - chr1:207030275-207030407 NA NA NA NA NA chr1-664 206982320 206982670 188 - chr1:206982446-206982472 NA NA NA NA NA chr1-663 206866235 206866739 312 - chr1:206866379-206866499 NA NA NA NA NA chr1-662 206722117 206722757 268 - chr1:206722434-206722617 NA NA NA NA NA chr1-661 206702874 206703279 155 - chr1:206703079-206703162 NA NA NA NA NA chr1-660 206611888 206612237 171 - chr1:206611999-206612008 NA NA NA NA NA chr1-659 206580914 206581177 132 - chr1:206581009-206581010 NA NA NA NA NA chr1-658 205319467 205319815 196 - chr1:205319551-205319595 NA NA NA NA NA chr1-657 205178643 205178951 277 - chr1:205178688-205178872 NA NA NA NA NA chr1-656 204751475 204751786 116 - chr1:204751716-204751729 NA NA NA NA NA chr1-655 204583875 204584024 128 - chr1:204583905-204584012 NA NA NA NA NA chr1-654 204026223 204026397 163 - chr1:204026258-204026388 NA NA NA NA NA chr1-653 203993568 203993867 249 - chr1:203993706-203993805 NA NA NA NA NA chr1-652 203854861 203855160 263 - chr1:203854872-203855027 NA NA NA NA NA chr1-651 203545486 203545842 156 - chr1:203545717-203545735 NA NA NA NA NA chr1-650 201086448 201086633 158 - chr1:201086475-201086606 NA NA NA NA NA chr1-649 200695079 200695496 276 - chr1:200695111-200695246 NA NA NA NA NA chr1-648 200532629 200532863 196 - chr1:200532674-200532832 NA NA NA NA NA chr1-647 200444536 200444828 259 - chr1:200444617-200444811 NA NA NA NA NA chr1-646 200381237 200381595 178 - chr1:200381331-200381449 NA NA NA NA NA chr1-645 200273364 200273725 208 - chr1:200273508-200273665 NA NA NA NA NA chr1-644 200074846 200075169 213 - chr1:200074998-200075101 NA NA NA NA NA chr1-643 200073092 200073527 249 - chr1:200073258-200073321 NA NA NA NA NA chr1-642 199995117 199995591 206 - chr1:199995433-199995467 NA NA NA NA NA chr1-641 199481303 199481663 301 - chr1:199481368-199481610 NA NA NA NA NA chr1-640 199421992 199422290 208 - chr1:199422135-199422253 NA NA NA NA NA chr1-639 199169422 199169713 161 - chr1:199169561-199169586 NA NA NA NA NA chr1-638 199082755 199083488 419 - chr1:199083119-199083384 NA NA NA NA NA chr1-637 199034630 199034830 120 - chr1:199034728-199034756 NA NA NA NA NA chr1-636 198786273 198786819 358 - chr1:198786383-198786593 NA NA NA NA NA chr1-635 198740891 198741090 177 - chr1:198740922-198741033 NA NA NA NA NA chr1-634 198359324 198359679 273 - chr1:198359391-198359582 NA NA NA NA NA chr1-633 198304279 198304724 315 - chr1:198304553-198304584 NA NA NA NA NA chr1-632 198291144 198291290 116 - chr1:198291177-198291261 NA NA NA NA NA chr1-631 198222515 198222735 199 - chr1:198222530-198222708 NA NA NA NA NA chr1-630 198191097 198191351 162 - chr1:198191201-198191271 NA NA NA NA NA chr1-629 198169174 198169341 125 - chr1:198169226-198169309 NA NA NA NA NA chr1-628 198031630 198032343 366 - chr1:198031917-198031931 NA NA NA NA NA chr1-28 19794788 19795100 237 - chr1:19794829-19794991 NA NA NA NA NA chr1-627 197903924 197904265 164 - chr1:197904010-197904115 NA NA NA NA NA chr1-626 197514035 197514199 131 - chr1:197514065-197514163 NA NA NA NA NA chr1-625 197168574 197168779 144 - chr1:197168682-197168765 NA NA NA NA NA chr1-624 197108814 197109123 275 - chr1:197108849-197109090 NA NA NA NA NA chr1-623 197066649 197066897 163 - chr1:197066716-197066794 NA NA NA NA NA chr1-622 196498664 196499115 231 - chr1:196498812-196498823 NA NA NA NA NA chr1-621 196437096 196437398 191 - chr1:196437321-196437325 NA NA NA NA NA chr1-620 196254679 196254903 147 - chr1:196254759-196254829 NA NA NA NA NA chr1-27 19618285 19618528 200 - chr1:19618361-19618518 NA NA NA NA NA chr1-619 195991892 195992080 138 - chr1:195991952-195992040 NA NA NA NA NA chr1-618 195525320 195525507 158 - chr1:195525349-195525420 NA NA NA NA NA chr1-617 195524471 195524730 133 - chr1:195524564-195524616 NA NA NA NA NA chr1-616 195323219 195323403 147 - chr1:195323246-195323336 NA NA NA NA NA chr1-615 195018968 195019180 123 - chr1:195019053-195019090 NA NA NA NA NA chr1-614 194539895 194540214 229 - chr1:194539931-194540070 NA NA NA NA NA chr1-613 192784678 192785072 252 - chr1:192784917-192785027 NA NA NA NA NA chr1-612 192366235 192366585 198 - chr1:192366278-192366324 NA NA NA NA NA chr1-611 192336931 192337464 358 - chr1:192337195-192337378 NA NA NA NA NA chr1-610 191996138 191996580 197 - chr1:191996195-191996235 NA NA NA NA NA chr1-609 191977809 191978239 238 - chr1:191978025-191978071 NA NA NA NA NA chr1-608 191955698 191956117 179 - chr1:191955806-191955833 NA NA NA NA NA chr1-607 191600075 191600412 170 - chr1:191600307-191600387 NA NA NA NA NA chr1-606 191455455 191455931 274 - chr1:191455624-191455718 NA NA NA NA NA chr1-605 191305899 191306227 197 - chr1:191306063-191306107 NA NA NA NA NA chr1-604 190533650 190534184 287 - chr1:190534085-190534148 NA NA NA NA NA chr1-603 190508007 190508364 165 - chr1:190508242-190508343 NA NA NA NA NA chr1-602 190179388 190179634 136 - chr1:190179476-190179502 NA NA NA NA NA chr1-601 189481838 189482249 200 - chr1:189482058-189482065 NA NA NA NA NA chr1-600 189376087 189376302 148 - chr1:189376221-189376302 NA NA NA NA NA chr1-599 188687857 188688079 185 - chr1:188687902-188688066 NA NA NA NA NA chr1-598 188674692 188675084 197 - chr1:188674996-188674998 NA NA NA NA NA chr1-597 188465454 188465927 262 - chr1:188465605-188465656 NA NA NA NA NA chr1-596 188360288 188360530 216 - chr1:188360384-188360522 NA NA NA NA NA chr1-595 188051959 188052428 313 - chr1:188052140-188052222 NA NA NA NA NA chr1-594 187264755 187265253 251 - chr1:187265097-187265101 NA NA NA NA NA chr1-593 187087279 187087644 164 - chr1:187087504-187087515 NA NA NA NA NA chr1-592 187062448 187062793 175 - chr1:187062684-187062689 NA NA NA NA NA chr1-591 186776154 186776487 214 - chr1:186776223-186776318 NA NA NA NA NA chr1-590 186749493 186749752 142 - chr1:186749608-186749629 NA NA NA NA NA chr1-589 186478427 186478926 356 - chr1:186478488-186478701 NA NA NA NA NA chr1-588 186475240 186475467 194 - chr1:186475284-186475445 NA NA NA NA NA chr1-587 186443904 186444146 199 - chr1:186443943-186444091 NA NA NA NA NA chr1-586 186320780 186321076 226 - chr1:186320862-186321010 NA NA NA NA NA chr1-585 185815428 185815742 163 - chr1:185815482-185815560 NA NA NA NA NA chr1-584 185673228 185673443 172 - chr1:185673232-185673361 NA NA NA NA NA chr1-583 185120541 185120864 219 - chr1:185120634-185120749 NA NA NA NA NA chr1-582 185099730 185099901 147 - chr1:185099762-185099901 NA NA NA NA NA chr1-581 184693160 184693441 237 - chr1:184693204-184693397 NA NA NA NA NA chr1-580 184404068 184404278 154 - chr1:184404102-184404200 NA NA NA NA NA chr1-579 183984691 183984977 160 - chr1:183984792-183984826 NA NA NA NA NA chr1-578 183845546 183845905 349 - chr1:183845551-183845870 NA NA NA NA NA chr1-577 183642551 183642766 170 - chr1:183642581-183642706 NA NA NA NA NA chr1-26 18336407 18336675 234 - chr1:18336454-18336654 NA NA NA NA NA chr1-576 182630579 182630908 216 - chr1:182630624-182630749 NA NA NA NA NA chr1-575 182361032 182361181 125 - chr1:182361053-182361170 NA NA NA NA NA chr1-574 182152397 182152741 257 - chr1:182152522-182152692 NA NA NA NA NA chr1-573 181940253 181940484 123 - chr1:181940352-181940373 NA NA NA NA NA chr1-572 181939810 181940087 139 - chr1:181939920-181939921 NA NA NA NA NA chr1-571 181642029 181642352 167 - chr1:181642279-181642290 NA NA NA NA NA chr1-570 181328847 181329054 135 - chr1:181328880-181328943 NA NA NA NA NA chr1-569 181173232 181173747 302 - chr1:181173451-181173660 NA NA NA NA NA chr1-568 181144520 181144800 150 - chr1:181144542-181144634 NA NA NA NA NA chr1-567 180917500 180917769 169 - chr1:180917570-180917639 NA NA NA NA NA chr1-566 180719453 180719693 198 - chr1:180719474-180719644 NA NA NA NA NA chr1-25 18065338 18065699 160 - chr1:18065358-18065451 NA NA NA NA NA chr1-565 180627634 180627924 234 - chr1:180627691-180627869 NA NA NA NA NA chr1-24 18029036 18029231 147 - chr1:18029071-18029144 NA NA NA NA NA chr1-564 179799205 179799447 196 - chr1:179799264-179799322 NA NA NA NA NA chr1-563 179761879 179762074 130 - chr1:179761998-179762063 NA NA NA NA NA chr1-562 179508449 179508717 122 - chr1:179508547-179508555 NA NA NA NA NA chr1-561 179321249 179321661 262 - chr1:179321397-179321505 NA NA NA NA NA chr1-560 179171465 179171837 195 - chr1:179171608-179171626 NA NA NA NA NA chr1-559 178920867 178921212 180 - chr1:178920975-178921100 NA NA NA NA NA chr1-558 178562770 178563051 199 - chr1:178562810-178562927 NA NA NA NA NA chr1-557 178464958 178465181 191 - chr1:178464997-178465092 NA NA NA NA NA chr1-556 178358285 178358725 235 - chr1:178358514-178358544 NA NA NA NA NA chr1-555 178310882 178311311 230 - chr1:178311030-178311095 NA NA NA NA NA chr1-554 178082354 178082654 237 - chr1:178082370-178082450 NA NA NA NA NA chr1-553 177350060 177350380 176 - chr1:177350140-177350172 NA NA NA NA NA chr1-552 177286412 177286752 216 - chr1:177286516-177286568 NA NA NA NA NA chr1-551 176107750 176108068 197 - chr1:176107959-176108035 NA NA NA NA NA chr1-550 176052569 176052852 178 - chr1:176052677-176052756 NA NA NA NA NA chr1-549 175838941 175839218 213 - chr1:175839039-175839188 NA NA NA NA NA chr1-548 175691244 175691459 160 - chr1:175691317-175691422 NA NA NA NA NA chr1-547 175616521 175616949 259 - chr1:175616685-175616775 NA NA NA NA NA chr1-546 175498839 175499174 195 - chr1:175499018-175499035 NA NA NA NA NA chr1-545 175427222 175427523 166 - chr1:175427386-175427507 NA NA NA NA NA chr1-544 175396376 175396589 116 - chr1:175396481-175396500 NA NA NA NA NA chr1-543 175352646 175352822 127 - chr1:175352691-175352761 NA NA NA NA NA chr1-542 175274181 175274804 294 - chr1:175274625-175274683 NA NA NA NA NA chr1-541 174872848 174873058 134 - chr1:174872906-174872964 NA NA NA NA NA chr1-540 174818155 174818512 337 - chr1:174818166-174818489 NA NA NA NA NA chr1-539 174462377 174462600 145 - chr1:174462456-174462523 NA NA NA NA NA chr1-538 174413139 174413542 230 - chr1:174413303-174413360 NA NA NA NA NA chr1-537 174209671 174210241 296 - chr1:174209984-174210003 NA NA NA NA NA chr1-536 173945208 173945585 232 - chr1:173945296-173945383 NA NA NA NA NA chr1-535 173040264 173040647 176 - chr1:173040339-173040446 NA NA NA NA NA chr1-534 172861844 172862280 265 - chr1:172861893-172862046 NA NA NA NA NA chr1-533 172639682 172640011 226 - chr1:172639823-172639946 NA NA NA NA NA chr1-532 171919671 171919904 139 - chr1:171919681-171919782 NA NA NA NA NA chr1-531 171520329 171521046 342 - chr1:171520454-171520506 NA NA NA NA NA chr1-530 171511803 171512043 205 - chr1:171511904-171512004 NA NA NA NA NA chr1-529 171487224 171487571 236 - chr1:171487464-171487503 NA NA NA NA NA chr1-528 171327165 171327484 207 - chr1:171327213-171327308 NA NA NA NA NA chr1-527 171296672 171296884 114 - chr1:171296704-171296764 NA NA NA NA NA chr1-526 171071234 171071565 226 - chr1:171071307-171071364 NA NA NA NA NA chr1-525 170848554 170849004 245 - chr1:170848880-170848994 NA NA NA NA NA chr1-524 170677313 170677616 201 - chr1:170677389-170677488 NA NA NA NA NA chr1-523 170168605 170168924 215 - chr1:170168790-170168901 NA NA NA NA NA chr1-522 170064494 170064666 134 - chr1:170064567-170064663 NA NA NA NA NA chr1-521 169748835 169749038 162 - chr1:169748884-169749021 NA NA NA NA NA chr1-520 169588581 169589087 174 - chr1:169588634-169588662 NA NA NA NA NA chr1-519 169366430 169366908 302 - chr1:169366624-169366738 NA NA NA NA NA chr1-518 169327892 169328143 159 - chr1:169328003-169328070 NA NA NA NA NA chr1-517 168347958 168348230 177 - chr1:168348082-168348164 NA NA NA NA NA chr1-516 168158116 168158280 144 - chr1:168158187-168158277 NA NA NA NA NA chr1-515 167816595 167816850 123 - chr1:167816597-167816676 NA NA NA NA NA chr1-514 167523273 167523594 199 - chr1:167523442-167523523 NA NA NA NA NA chr1-513 166906868 166907169 172 - chr1:166906935-166906978 NA NA NA NA NA chr1-512 166906628 166906761 115 - chr1:166906657-166906754 NA NA NA NA NA chr1-511 166562050 166562502 243 - chr1:166562268-166562320 NA NA NA NA NA chr1-510 165398215 165398570 293 - chr1:165398262-165398487 NA NA NA NA NA chr1-509 165393610 165394025 245 - chr1:165393776-165393843 NA NA NA NA NA chr1-508 165391393 165391700 168 - chr1:165391562-165391651 NA NA NA NA NA chr1-507 165295033 165295278 138 - chr1:165295043-165295074 NA NA NA NA NA chr1-506 164807134 164807367 139 - chr1:164807294-164807295 NA NA NA NA NA chr1-505 164770847 164771256 286 - chr1:164770960-164771103 NA NA NA NA NA chr1-504 164756699 164756920 207 - chr1:164756749-164756914 NA NA NA NA NA chr1-503 164720523 164720732 164 - chr1:164720562-164720669 NA NA NA NA NA chr1-502 164266031 164266510 197 - chr1:164266033-164266076 NA NA NA NA NA chr1-501 163064275 163064534 163 - chr1:163064281-163064348 NA NA NA NA NA chr1-500 162831298 162831541 116 - chr1:162831308-162831375 NA NA NA NA NA chr1-499 161818671 161818874 136 - chr1:161818753-161818822 NA NA NA NA NA chr1-498 161327482 161327631 115 - chr1:161327516-161327597 NA NA NA NA NA chr1-497 161090569 161090783 133 - chr1:161090608-161090660 NA NA NA NA NA chr1-496 160846325 160846758 288 - chr1:160846360-160846503 NA NA NA NA NA chr1-495 160410098 160410388 164 - chr1:160410286-160410303 NA NA NA NA NA chr1-494 160191186 160191629 188 - chr1:160191519-160191608 NA NA NA NA NA chr1-493 159722382 159722729 209 - chr1:159722525-159722596 NA NA NA NA NA chr1-492 159532216 159532428 114 - chr1:159532269-159532346 NA NA NA NA NA chr1-491 159174098 159174334 160 - chr1:159174153-159174195 NA NA NA NA NA chr1-490 158908769 158909251 345 - chr1:158909077-158909171 NA NA NA NA NA chr1-489 158821309 158822053 421 - chr1:158821626-158821728 NA NA NA NA NA chr1-488 158607800 158607978 141 - chr1:158607888-158607958 NA NA NA NA NA chr1-487 158590138 158590644 355 - chr1:158590394-158590644 NA NA NA NA NA chr1-486 158519541 158519797 213 - chr1:158519579-158519749 NA NA NA NA NA chr1-485 158436565 158437009 244 - chr1:158436714-158436758 NA NA NA NA NA chr1-484 158248515 158248725 143 - chr1:158248523-158248599 NA NA NA NA NA chr1-483 157988233 157988390 131 - chr1:157988269-157988374 NA NA NA NA NA chr1-482 156733125 156733396 187 - chr1:156733215-156733314 NA NA NA NA NA chr1-481 156623033 156623349 145 - chr1:156623243-156623295 NA NA NA NA NA chr1-480 156143562 156143874 177 - chr1:156143649-156143691 NA NA NA NA NA chr1-479 156108599 156108956 249 - chr1:156108616-156108757 NA NA NA NA NA chr1-478 154991490 154991667 150 - chr1:154991519-154991588 NA NA NA NA NA chr1-477 154818041 154818206 118 - chr1:154818083-154818154 NA NA NA NA NA chr1-476 154557080 154557530 282 - chr1:154557080-154557306 NA NA NA NA NA chr1-475 153564530 153564827 225 - chr1:153564621-153564812 NA NA NA NA NA chr1-474 153518528 153518795 143 - chr1:153518686-153518705 NA NA NA NA NA chr1-473 153391520 153391834 206 - chr1:153391566-153391664 NA NA NA NA NA chr1-472 153164722 153164952 172 - chr1:153164807-153164921 NA NA NA NA NA chr1-23 15287768 15288125 166 - chr1:15287896-15287913 NA NA NA NA NA chr1-471 152819136 152819363 116 - chr1:152819195-152819274 NA NA NA NA NA chr1-470 152474038 152474402 296 - chr1:152474132-152474224 NA NA NA NA NA chr1-469 152172925 152173103 155 - chr1:152172960-152173084 NA NA NA NA NA chr1-468 151888880 151889263 170 - chr1:151889078-151889152 NA NA NA NA NA chr1-467 150807652 150808006 284 - chr1:150807866-150807984 NA NA NA NA NA chr1-466 150699167 150699508 218 - chr1:150699208-150699303 NA NA NA NA NA chr1-465 150684651 150685050 241 - chr1:150684774-150684787 NA NA NA NA NA chr1-464 150457659 150458086 243 - chr1:150457697-150457756 NA NA NA NA NA chr1-463 150375271 150375675 210 - chr1:150375302-150375318 NA NA NA NA NA chr1-462 150271364 150271617 149 - chr1:150271475-150271493 NA NA NA NA NA chr1-461 150232805 150233196 133 - chr1:150232910-150232957 NA NA NA NA NA chr1-460 150168813 150169071 245 - chr1:150168816-150169048 NA NA NA NA NA chr1-459 147880839 147881062 151 - chr1:147880907-147881034 NA NA NA NA NA chr1-458 147850816 147851056 163 - chr1:147850864-147850950 NA NA NA NA NA chr1-457 147712084 147712308 119 - chr1:147712195-147712205 NA NA NA NA NA chr1-22 14750710 14751169 194 - chr1:14751026-14751057 NA NA NA NA NA chr1-456 145955420 145956010 238 - chr1:145955869-145955949 NA NA NA NA NA chr1-455 145867113 145867629 262 - chr1:145867223-145867301 NA NA NA NA NA chr1-454 145839326 145839763 296 - chr1:145839506-145839739 NA NA NA NA NA chr1-453 143254173 143254675 419 - chr1:143254191-143254518 NA NA NA NA NA chr1-452 143252886 143253357 267 - chr1:143253059-143253082 NA NA NA NA NA chr1-21 13553464 13553824 188 - chr1:13553693-13553709 NA NA NA NA NA chr1-20 12600097 12600437 203 - chr1:12600216-12600299 NA NA NA NA NA chr1-19 12266169 12266414 228 - chr1:12266198-12266375 NA NA NA NA NA chr1-18 12121897 12122089 154 - chr1:12122028-12122068 NA NA NA NA NA chr1-451 119969092 119969329 177 - chr1:119969222-119969314 NA NA NA NA NA chr1-450 119870007 119870329 195 - chr1:119870157-119870225 NA NA NA NA NA chr1-449 119833083 119833316 173 - chr1:119833140-119833293 NA NA NA NA NA chr1-448 119795000 119795237 134 - chr1:119795149-119795180 NA NA NA NA NA chr1-447 119225901 119226101 113 - chr1:119226014-119226098 NA NA NA NA NA chr1-446 119130557 119130796 158 - chr1:119130693-119130770 NA NA NA NA NA chr1-445 118980788 118981222 197 - chr1:118980788-118980906 NA NA NA NA NA chr1-444 118902952 118903187 127 - chr1:118903094-118903113 NA NA NA NA NA chr1-443 118736768 118737184 260 - chr1:118737020-118737060 NA NA NA NA NA chr1-442 118732476 118732932 185 - chr1:118732805-118732835 NA NA NA NA NA chr1-441 118731772 118732138 314 - chr1:118731890-118732048 NA NA NA NA NA chr1-440 118613482 118613645 133 - chr1:118613507-118613630 NA NA NA NA NA chr1-439 118607698 118608305 360 - chr1:118607915-118607968 NA NA NA NA NA chr1-438 118314920 118315102 120 - chr1:118315023-118315081 NA NA NA NA NA chr1-437 118222301 118222649 234 - chr1:118222428-118222548 NA NA NA NA NA chr1-436 117974016 117974305 228 - chr1:117974018-117974185 NA NA NA NA NA chr1-435 117825938 117826130 171 - chr1:117825981-117826089 NA NA NA NA NA chr1-434 117701766 117702059 200 - chr1:117701909-117702016 NA NA NA NA NA chr1-433 117504467 117504620 133 - chr1:117504496-117504569 NA NA NA NA NA chr1-432 117422223 117422478 135 - chr1:117422286-117422381 NA NA NA NA NA chr1-431 117377453 117377816 261 - chr1:117377459-117377623 NA NA NA NA NA chr1-430 117230195 117230397 147 - chr1:117230229-117230321 NA NA NA NA NA chr1-17 11656863 11657114 175 - chr1:11657007-11657106 NA NA NA NA NA chr1-429 116163693 116163973 140 - chr1:116163858-116163908 NA NA NA NA NA chr1-428 116017871 116018071 118 - chr1:116017929-116017981 NA NA NA NA NA chr1-427 115992519 115993042 285 - chr1:115992878-115992925 NA NA NA NA NA chr1-426 115980080 115980390 175 - chr1:115980213-115980255 NA NA NA NA NA chr1-425 115954749 115954988 155 - chr1:115954800-115954871 NA NA NA NA NA chr1-424 115789665 115789971 206 - chr1:115789718-115789799 NA NA NA NA NA chr1-423 115680783 115681086 142 - chr1:115680896-115680909 NA NA NA NA NA chr1-422 115553561 115553917 165 - chr1:115553766-115553768 NA NA NA NA NA chr1-421 115448874 115449022 136 - chr1:115448877-115448977 NA NA NA NA NA chr1-420 115292975 115293326 234 - chr1:115293035-115293038 NA NA NA NA NA chr1-419 115273263 115273834 281 - chr1:115273342-115273396 NA NA NA NA NA chr1-418 115267647 115267961 175 - chr1:115267711-115267797 NA NA NA NA NA chr1-417 114929354 114929653 177 - chr1:114929494-114929549 NA NA NA NA NA chr1-416 114821210 114821501 237 - chr1:114821283-114821358 NA NA NA NA NA chr1-415 114796826 114797158 219 - chr1:114797033-114797045 NA NA NA NA NA chr1-414 114715235 114715438 119 - chr1:114715346-114715435 NA NA NA NA NA chr1-413 114697595 114697803 127 - chr1:114697643-114697689 NA NA NA NA NA chr1-412 114683205 114683427 156 - chr1:114683277-114683379 NA NA NA NA NA chr1-411 114675025 114675257 129 - chr1:114675118-114675124 NA NA NA NA NA chr1-410 114664211 114664745 200 - chr1:114664272-114664320 NA NA NA NA NA chr1-409 114617513 114618018 253 - chr1:114617780-114617811 NA NA NA NA NA chr1-408 114436980 114437157 158 - chr1:114437005-114437152 NA NA NA NA NA chr1-407 114086304 114086593 160 - chr1:114086315-114086346 NA NA NA NA NA chr1-16 11394327 11394918 304 - chr1:11394683-11394838 NA NA NA NA NA chr1-406 113684711 113685070 287 - chr1:113684916-113684987 NA NA NA NA NA chr1-405 113519216 113519552 206 - chr1:113519400-113519476 NA NA NA NA NA chr1-404 113141178 113141511 243 - chr1:113141220-113141277 NA NA NA NA NA chr1-403 113117976 113118407 325 - chr1:113118098-113118349 NA NA NA NA NA chr1-402 113091488 113091648 140 - chr1:113091511-113091629 NA NA NA NA NA chr1-401 112993172 112993438 187 - chr1:112993223-112993275 NA NA NA NA NA chr1-400 112950092 112950428 236 - chr1:112950145-112950281 NA NA NA NA NA chr1-399 112925822 112925999 131 - chr1:112925883-112925958 NA NA NA NA NA chr1-398 112901211 112901633 228 - chr1:112901511-112901545 NA NA NA NA NA chr1-397 112868176 112868497 197 - chr1:112868183-112868256 NA NA NA NA NA chr1-396 112698594 112698944 225 - chr1:112698685-112698785 NA NA NA NA NA chr1-395 112439351 112439685 213 - chr1:112439477-112439579 NA NA NA NA NA chr1-394 112373450 112373953 223 - chr1:112373773-112373804 NA NA NA NA NA chr1-393 112343926 112344322 195 - chr1:112343943-112344005 NA NA NA NA NA chr1-392 112322414 112322845 191 - chr1:112322623-112322722 NA NA NA NA NA chr1-391 112050428 112050733 159 - chr1:112050536-112050581 NA NA NA NA NA chr1-390 111916758 111917104 212 - chr1:111916947-111916984 NA NA NA NA NA chr1-389 111907902 111908241 180 - chr1:111908059-111908076 NA NA NA NA NA chr1-388 111553645 111554134 266 - chr1:111553902-111554013 NA NA NA NA NA chr1-387 111457662 111457915 180 - chr1:111457775-111457875 NA NA NA NA NA chr1-386 111219541 111219746 125 - chr1:111219564-111219609 NA NA NA NA NA chr1-385 111050679 111051006 171 - chr1:111050711-111050726 NA NA NA NA NA chr1-384 110660402 110660760 177 - chr1:110660697-110660715 NA NA NA NA NA chr1-383 110363160 110363543 197 - chr1:110363307-110363344 NA NA NA NA NA chr1-382 110348293 110348686 201 - chr1:110348495-110348524 NA NA NA NA NA chr1-381 109276672 109277041 216 - chr1:109276856-109276919 NA NA NA NA NA chr1-380 108890219 108890496 170 - chr1:108890312-108890375 NA NA NA NA NA chr1-379 108874149 108874432 232 - chr1:108874175-108874390 NA NA NA NA NA chr1-378 108828096 108828440 281 - chr1:108828138-108828230 NA NA NA NA NA chr1-377 108802627 108803134 223 - chr1:108802942-108802943 NA NA NA NA NA chr1-376 108744251 108744501 121 - chr1:108744262-108744340 NA NA NA NA NA chr1-375 108602034 108602393 299 - chr1:108602267-108602386 NA NA NA NA NA chr1-374 108553753 108553928 118 - chr1:108553798-108553835 NA NA NA NA NA chr1-373 107887337 107887647 176 - chr1:107887467-107887509 NA NA NA NA NA chr1-372 107686174 107686432 129 - chr1:107686185-107686271 NA NA NA NA NA chr1-371 107310299 107310699 270 - chr1:107310529-107310669 NA NA NA NA NA chr1-370 107249758 107250064 209 - chr1:107249807-107249823 NA NA NA NA NA chr1-369 107021379 107021631 164 - chr1:107021526-107021602 NA NA NA NA NA chr1-368 106714167 106714294 124 - chr1:106714167-106714288 NA NA NA NA NA chr1-367 106713061 106713261 119 - chr1:106713094-106713164 NA NA NA NA NA chr1-366 106376759 106377037 143 - chr1:106376957-106376965 NA NA NA NA NA chr1-15 10607388 10607639 144 - chr1:10607543-10607580 NA NA NA NA NA chr1-365 105633902 105634188 148 - chr1:105634011-105634113 NA NA NA NA NA chr1-364 105456305 105456530 130 - chr1:105456318-105456353 NA NA NA NA NA chr1-363 105011689 105011913 164 - chr1:105011689-105011793 NA NA NA NA NA chr1-362 105006843 105007083 161 - chr1:105006934-105007040 NA NA NA NA NA chr1-361 104449968 104450118 116 - chr1:104449999-104450083 NA NA NA NA NA chr1-360 104390642 104390831 115 - chr1:104390675-104390721 NA NA NA NA NA chr1-359 104379391 104379564 127 - chr1:104379393-104379474 NA NA NA NA NA chr1-358 104199142 104199555 140 - chr1:104199449-104199498 NA NA NA NA NA chr1-357 103784175 103784691 316 - chr1:103784311-103784454 NA NA NA NA NA chr1-356 103546963 103547138 120 - chr1:103547017-103547082 NA NA NA NA NA chr1-355 103186941 103187229 174 - chr1:103187048-103187104 NA NA NA NA NA chr1-354 102942875 102943133 156 - chr1:102942935-102942989 NA NA NA NA NA chr1-353 102720972 102721410 183 - chr1:102721040-102721138 NA NA NA NA NA chr1-352 102587275 102587596 150 - chr1:102587389-102587482 NA NA NA NA NA chr1-351 102566286 102566740 249 - chr1:102566613-102566657 NA NA NA NA NA chr1-350 102537342 102537550 138 - chr1:102537403-102537477 NA NA NA NA NA chr1-349 102203367 102203544 128 - chr1:102203422-102203501 NA NA NA NA NA chr1-348 102192539 102192698 125 - chr1:102192556-102192647 NA NA NA NA NA chr1-347 101721241 101721473 183 - chr1:101721297-101721431 NA NA NA NA NA chr1-346 101210218 101210501 179 - chr1:101210313-101210370 NA NA NA NA NA chr1-345 100938893 100939086 127 - chr1:100938916-100938977 NA NA NA NA NA chr1-344 100617953 100618122 123 - chr1:100617990-100618067 NA NA NA NA NA chr1-343 100594566 100594994 299 - chr1:100594796-100594966 NA NA NA NA NA chr1-342 100410384 100410828 187 - chr1:100410698-100410742 NA NA NA NA NA chr1-341 100250338 100250580 116 - chr1:100250470-100250472 NA NA NA NA NA chr19-2 725769 726122 263 - chr19:725931-726056 NA NA NA NA NA chr19-9 6460399 6460921 274 - chr19:6460467-6460613 NA NA NA NA NA chr19-8 6424964 6425188 196 - chr19:6424993-6425163 NA NA NA NA NA chr19-7 5869510 5869814 220 - chr19:5869592-5869728 NA NA NA NA NA chr19-100 58259626 58260060 218 - chr19:58259853-58259855 NA NA NA NA NA chr19-99 58249525 58249892 164 - chr19:58249794-58249887 NA NA NA NA NA chr19-98 57423267 57423679 139 - chr19:57423398-57423446 NA NA NA NA NA chr19-97 56896607 56896813 183 - chr19:56896653-56896813 NA NA NA NA NA chr19-96 56490909 56491287 216 - chr19:56491188-56491242 NA NA NA NA NA chr19-95 56015372 56015694 226 - chr19:56015378-56015508 NA NA NA NA NA chr19-94 55115990 55116167 128 - chr19:55116088-55116167 NA NA NA NA NA chr19-93 53701423 53701757 211 - chr19:53701547-53701635 NA NA NA NA NA chr19 532563 533265 286 - chr19:532821-532873 NA NA NA NA NA chr19-92 51510263 51510763 219 - chr19:51510438-51510516 NA NA NA NA NA chr19-91 50924541 50924668 123 - chr19:50924545-50924664 NA NA NA NA NA chr19-90 50045174 50045540 248 - chr19:50045195-50045325 NA NA NA NA NA chr19-89 50026820 50027136 182 - chr19:50026891-50026981 NA NA NA NA NA chr19-88 49739465 49739776 163 - chr19:49739713-49739728 NA NA NA NA NA chr19-87 49476392 49476644 183 - chr19:49476420-49476580 NA NA NA NA NA chr19-86 48527911 48528123 125 - chr19:48527952-48528048 NA NA NA NA NA chr19-85 48081972 48082209 126 - chr19:48082088-48082103 NA NA NA NA NA chr19-84 46192093 46192474 300 - chr19:46192224-46192443 NA NA NA NA NA chr19-83 45951153 45951467 211 - chr19:45951252-45951360 NA NA NA NA NA chr19-82 44450950 44451188 173 - chr19:44451015-44451123 NA NA NA NA NA chr19-81 44349858 44350153 210 - chr19:44350048-44350103 NA NA NA NA NA chr19-80 44331171 44331573 287 - chr19:44331350-44331522 NA NA NA NA NA chr19-79 44018673 44018910 120 - chr19:44018807-44018888 NA NA NA NA NA chr19-78 41811752 41812089 241 - chr19:41811917-41812062 NA NA NA NA NA chr19-77 41786216 41786550 213 - chr19:41786397-41786489 NA NA NA NA NA chr19-76 41254392 41254614 133 - chr19:41254485-41254537 NA NA NA NA NA chr19-75 41247055 41247620 290 - chr19:41247544-41247559 NA NA NA NA NA chr19-74 41076449 41076767 205 - chr19:41076560-41076647 NA NA NA NA NA chr19-73 40893264 40893428 162 - chr19:40893272-40893428 NA NA NA NA NA chr19-72 40207407 40207717 151 - chr19:40207452-40207520 NA NA NA NA NA chr19-71 39357900 39358127 172 - chr19:39357938-39358055 NA NA NA NA NA chr19-70 37898751 37899107 209 - chr19:37898883-37898955 NA NA NA NA NA chr19-69 37803396 37803783 190 - chr19:37803624-37803679 NA NA NA NA NA chr19-68 37694061 37694309 187 - chr19:37694115-37694227 NA NA NA NA NA chr19-67 37635787 37636086 223 - chr19:37635919-37636066 NA NA NA NA NA chr19-66 37513928 37514168 135 - chr19:37514019-37514049 NA NA NA NA NA chr19-65 37207669 37208373 461 - chr19:37208004-37208203 NA NA NA NA NA chr19-6 3691309 3691603 189 - chr19:3691333-3691417 NA NA NA NA NA chr19-64 36228440 36228909 252 - chr19:36228796-36228831 NA NA NA NA NA chr19-63 36144801 36144960 129 - chr19:36144816-36144885 NA NA NA NA NA chr19-62 35815867 35816316 237 - chr19:35816132-35816157 NA NA NA NA NA chr19-61 35750289 35750898 219 - chr19:35750594-35750595 NA NA NA NA NA chr19-60 35657932 35658199 153 - chr19:35657987-35658102 NA NA NA NA NA chr19-59 35648663 35648845 115 - chr19:35648745-35648793 NA NA NA NA NA chr19-58 34592548 34592747 126 - chr19:34592604-34592657 NA NA NA NA NA chr19-57 32898935 32899494 307 - chr19:32899218-32899420 NA NA NA NA NA chr19-56 32774119 32774428 179 - chr19:32774274-32774323 NA NA NA NA NA chr19-55 32507684 32507845 124 - chr19:32507757-32507844 NA NA NA NA NA chr19-54 31992194 31992375 146 - chr19:31992232-31992343 NA NA NA NA NA chr19-53 31672645 31672918 142 - chr19:31672806-31672817 NA NA NA NA NA chr19-5 3159918 3160193 136 - chr19:3159967-3160024 NA NA NA NA NA chr19-52 31520454 31520638 132 - chr19:31520587-31520613 NA NA NA NA NA chr19-51 31226812 31226955 119 - chr19:31226899-31226946 NA NA NA NA NA chr19-50 30767836 30768075 136 - chr19:30767869-30767902 NA NA NA NA NA chr19-49 30513216 30513497 239 - chr19:30513216-30513329 NA NA NA NA NA chr19-48 30509276 30509556 149 - chr19:30509395-30509413 NA NA NA NA NA chr19-47 30363357 30363814 196 - chr19:30363735-30363814 NA NA NA NA NA chr19-46 30273235 30273510 197 - chr19:30273357-30273476 NA NA NA NA NA chr19-45 30176603 30176791 122 - chr19:30176683-30176739 NA NA NA NA NA chr19-44 29972103 29972352 126 - chr19:29972244-29972294 NA NA NA NA NA chr19-43 29966632 29966793 141 - chr19:29966648-29966769 NA NA NA NA NA chr19-42 29947350 29947651 155 - chr19:29947591-29947600 NA NA NA NA NA chr19-41 29807484 29807647 139 - chr19:29807485-29807600 NA NA NA NA NA chr19-40 29781125 29781353 194 - chr19:29781145-29781277 NA NA NA NA NA chr19-39 29607332 29607764 222 - chr19:29607511-29607523 NA NA NA NA NA chr19-38 29446714 29447151 242 - chr19:29446895-29446942 NA NA NA NA NA chr19-37 28940285 28940481 160 - chr19:28940324-28940448 NA NA NA NA NA chr19-36 28907533 28907793 165 - chr19:28907664-28907734 NA NA NA NA NA chr19-35 28751789 28752070 200 - chr19:28751789-28751962 NA NA NA NA NA chr19-34 28682967 28683237 180 - chr19:28683081-28683155 NA NA NA NA NA chr19-33 28681092 28681372 203 - chr19:28681334-28681360 NA NA NA NA NA chr19-32 28422674 28422869 168 - chr19:28422695-28422782 NA NA NA NA NA chr19-31 28369976 28370522 274 - chr19:28370270-28370272 NA NA NA NA NA chr19-30 28321517 28321767 169 - chr19:28321651-28321739 NA NA NA NA NA chr19-29 28243615 28243866 159 - chr19:28243653-28243756 NA NA NA NA NA chr19-28 28228664 28228824 147 - chr19:28228701-28228809 NA NA NA NA NA chr19-27 28153235 28153491 133 - chr19:28153380-28153434 NA NA NA NA NA chr19-26 28086789 28087164 252 - chr19:28086918-28087057 NA NA NA NA NA chr19-25 28072403 28072635 117 - chr19:28072523-28072535 NA NA NA NA NA chr19-24 27992274 27992452 124 - chr19:27992295-27992387 NA NA NA NA NA chr19-23 27958191 27958650 161 - chr19:27958364-27958371 NA NA NA NA NA chr19-22 27837375 27837776 227 - chr19:27837605-27837648 NA NA NA NA NA chr19-21 27808097 27808300 153 - chr19:27808183-27808262 NA NA NA NA NA chr19-20 27725862 27726281 226 - chr19:27726096-27726191 NA NA NA NA NA chr19-19 27622314 27622674 229 - chr19:27622409-27622507 NA NA NA NA NA chr19-4 2594417 2594679 190 - chr19:2594484-2594592 NA NA NA NA NA chr19-3 1723947 1724538 247 - chr19:1724376-1724449 NA NA NA NA NA chr19-18 16984592 16984813 150 - chr19:16984713-16984792 NA NA NA NA NA chr19-17 16593651 16593990 199 - chr19:16593841-16593900 NA NA NA NA NA chr19-16 16052688 16053072 310 - chr19:16052771-16053001 NA NA NA NA NA chr19-15 15971500 15971961 225 - chr19:15971547-15971662 NA NA NA NA NA chr19-14 15361824 15362105 185 - chr19:15361838-15361991 NA NA NA NA NA chr19-13 14718454 14718774 213 - chr19:14718608-14718714 NA NA NA NA NA chr19-12 12162295 12162689 188 - chr19:12162447-12162465 NA NA NA NA NA chr19-11 10600111 10600311 197 - chr19:10600112-10600306 NA NA NA NA NA chr19-10 10103456 10103792 197 - chr19:10103533-10103591 NA NA NA NA NA chr18-74 9972661 9972880 138 - chr18:9972779-9972836 NA NA NA NA NA chr18-73 9971567 9971767 168 - chr18:9971585-9971721 NA NA NA NA NA chr18-72 9878601 9879051 280 - chr18:9878753-9878875 NA NA NA NA NA chr18-71 9640571 9640786 117 - chr18:9640709-9640728 NA NA NA NA NA chr18-70 9637227 9637552 210 - chr18:9637247-9637422 NA NA NA NA NA chr18-69 9521174 9521467 166 - chr18:9521296-9521335 NA NA NA NA NA chr18-68 9352136 9352403 229 - chr18:9352184-9352395 NA NA NA NA NA chr18-6 931512 931943 273 - chr18:931746-931756 NA NA NA NA NA chr18-67 9206904 9207275 229 - chr18:9207145-9207166 NA NA NA NA NA chr18-66 9200810 9201289 277 - chr18:9200831-9200906 NA NA NA NA NA chr18-65 9161398 9162057 332 - chr18:9161719-9161724 NA NA NA NA NA chr18-64 8854718 8854976 143 - chr18:8854819-8854847 NA NA NA NA NA chr18-5 853805 853983 122 - chr18:853817-853883 NA NA NA NA NA chr18-63 8430130 8430450 189 - chr18:8430169-8430306 NA NA NA NA NA chr18-62 8236317 8236559 156 - chr18:8236451-8236489 NA NA NA NA NA chr18-61 8043322 8043634 198 - chr18:8043393-8043477 NA NA NA NA NA chr18-60 8015105 8015393 172 - chr18:8015320-8015376 NA NA NA NA NA chr18-235 79962441 79962900 243 - chr18:79962655-79962682 NA NA NA NA NA chr18-59 7977664 7977825 115 - chr18:7977706-7977775 NA NA NA NA NA chr18-4 797179 797390 157 - chr18:797200-797339 NA NA NA NA NA chr18-234 79502521 79502755 153 - chr18:79502643-79502694 NA NA NA NA NA chr18-233 79353297 79353495 163 - chr18:79353302-79353370 NA NA NA NA NA chr18-232 78386666 78386920 224 - chr18:78386716-78386910 NA NA NA NA NA chr18-231 78286630 78287257 314 - chr18:78286855-78286856 NA NA NA NA NA chr18-230 78154359 78154664 224 - chr18:78154425-78154568 NA NA NA NA NA chr18-229 78131084 78131558 247 - chr18:78131286-78131306 NA NA NA NA NA chr18-228 78089792 78090036 134 - chr18:78089946-78089970 NA NA NA NA NA chr18-227 77829232 77829502 214 - chr18:77829246-77829292 NA NA NA NA NA chr18-226 77735355 77735614 145 - chr18:77735557-77735588 NA NA NA NA NA chr18-225 77648391 77648668 130 - chr18:77648415-77648496 NA NA NA NA NA chr18-58 7741381 7741635 158 - chr18:7741436-7741498 NA NA NA NA NA chr18-224 76814306 76814566 186 - chr18:76814372-76814468 NA NA NA NA NA chr18-57 7666125 7666342 175 - chr18:7666170-7666331 NA NA NA NA NA chr18-223 76484986 76485419 311 - chr18:76484993-76485182 NA NA NA NA NA chr18-222 76418811 76419028 156 - chr18:76418851-76418946 NA NA NA NA NA chr18-221 76416465 76417015 279 - chr18:76416683-76416691 NA NA NA NA NA chr18-56 7626248 7626578 218 - chr18:7626287-7626393 NA NA NA NA NA chr18-55 7625349 7625607 154 - chr18:7625442-7625492 NA NA NA NA NA chr18-220 76013346 76013687 222 - chr18:76013480-76013583 NA NA NA NA NA chr18-219 75410827 75411379 295 - chr18:75411143-75411181 NA NA NA NA NA chr18-218 75354965 75355310 281 - chr18:75355185-75355274 NA NA NA NA NA chr18-217 75136944 75137123 143 - chr18:75137021-75137056 NA NA NA NA NA chr18-216 74744637 74744852 148 - chr18:74744690-74744771 NA NA NA NA NA chr18-54 7397644 7397946 247 - chr18:7397676-7397822 NA NA NA NA NA chr18-215 73932169 73932359 139 - chr18:73932184-73932306 NA NA NA NA NA chr18-214 73896156 73896647 268 - chr18:73896477-73896522 NA NA NA NA NA chr18-213 73650755 73650977 174 - chr18:73650825-73650951 NA NA NA NA NA chr18-212 73453038 73453468 229 - chr18:73453168-73453330 NA NA NA NA NA chr18-211 72916804 72917094 153 - chr18:72917032-72917048 NA NA NA NA NA chr18-210 72709848 72710179 210 - chr18:72710032-72710121 NA NA NA NA NA chr18-209 72336175 72336466 182 - chr18:72336320-72336369 NA NA NA NA NA chr18-208 71750076 71750388 155 - chr18:71750197-71750219 NA NA NA NA NA chr18-207 71611350 71611681 124 - chr18:71611365-71611420 NA NA NA NA NA chr18-3 715251 715465 134 - chr18:715286-715370 NA NA NA NA NA chr18-206 71433900 71434270 203 - chr18:71434085-71434157 NA NA NA NA NA chr18-205 71240038 71240369 121 - chr18:71240312-71240363 NA NA NA NA NA chr18-204 71193834 71194006 120 - chr18:71193862-71193930 NA NA NA NA NA chr18-203 70600347 70600610 137 - chr18:70600533-70600544 NA NA NA NA NA chr18-202 70398120 70398400 192 - chr18:70398282-70398386 NA NA NA NA NA chr18-201 70020841 70021244 207 - chr18:70021097-70021108 NA NA NA NA NA chr18-53 6977157 6977412 191 - chr18:6977213-6977340 NA NA NA NA NA chr18-200 69428745 69428972 131 - chr18:69428884-69428919 NA NA NA NA NA chr18-199 69056528 69056819 211 - chr18:69056659-69056790 NA NA NA NA NA chr18-198 68901673 68902139 251 - chr18:68901829-68901865 NA NA NA NA NA chr18-197 68712391 68712774 200 - chr18:68712439-68712456 NA NA NA NA NA chr18-196 68419838 68420109 164 - chr18:68419863-68419920 NA NA NA NA NA chr18-195 68417036 68417274 146 - chr18:68417080-68417166 NA NA NA NA NA chr18-52 6825467 6825696 176 - chr18:6825562-6825685 NA NA NA NA NA chr18-2 677943 678131 137 - chr18:678032-678118 NA NA NA NA NA chr18-51 6778598 6779160 305 - chr18:6778844-6778892 NA NA NA NA NA chr18-50 6757469 6757788 174 - chr18:6757556-6757585 NA NA NA NA NA chr18-49 6755937 6756121 142 - chr18:6755987-6756087 NA NA NA NA NA chr18-194 67409702 67409937 230 - chr18:67409703-67409920 NA NA NA NA NA chr18-193 66744477 66744870 307 - chr18:66744493-66744714 NA NA NA NA NA chr18-192 66353999 66354311 184 - chr18:66354013-66354069 NA NA NA NA NA chr18-48 6630827 6631133 191 - chr18:6630922-6630998 NA NA NA NA NA chr18-191 66286327 66286517 155 - chr18:66286445-66286495 NA NA NA NA NA chr18-190 66276223 66276473 186 - chr18:66276293-66276415 NA NA NA NA NA chr18-189 65710064 65710388 192 - chr18:65710109-65710181 NA NA NA NA NA chr18-188 65669488 65669626 121 - chr18:65669550-65669620 NA NA NA NA NA chr18-47 6559842 6560267 177 - chr18:6560108-6560149 NA NA NA NA NA chr18-187 65379518 65379751 186 - chr18:65379703-65379750 NA NA NA NA NA chr18-186 65114138 65114530 204 - chr18:65114266-65114350 NA NA NA NA NA chr18-185 63766205 63766536 134 - chr18:63766434-63766435 NA NA NA NA NA chr18-184 63595423 63595665 145 - chr18:63595521-63595569 NA NA NA NA NA chr18-46 6336836 6337350 294 - chr18:6336941-6337015 NA NA NA NA NA chr18-183 63201225 63201347 113 - chr18:63201229-63201333 NA NA NA NA NA chr18-45 6309211 6309520 264 - chr18:6309274-6309493 NA NA NA NA NA chr18-182 62790109 62790420 250 - chr18:62790318-62790385 NA NA NA NA NA chr18-181 62617407 62617841 190 - chr18:62617504-62617548 NA NA NA NA NA chr18-44 6254034 6254699 399 - chr18:6254333-6254587 NA NA NA NA NA chr18-180 62169819 62170063 197 - chr18:62169905-62170055 NA NA NA NA NA chr18-179 61676562 61676728 128 - chr18:61676642-61676704 NA NA NA NA NA chr18-178 61225939 61226112 139 - chr18:61225950-61226055 NA NA NA NA NA chr18-177 60978897 60979132 146 - chr18:60978992-60979059 NA NA NA NA NA chr18-176 60676305 60676901 280 - chr18:60676562-60676690 NA NA NA NA NA chr18-43 6046876 6047123 199 - chr18:6047008-6047100 NA NA NA NA NA chr18-175 60420225 60420653 263 - chr18:60420422-60420636 NA NA NA NA NA chr18-174 60102523 60102900 200 - chr18:60102825-60102848 NA NA NA NA NA chr18-173 60056945 60057410 258 - chr18:60057092-60057143 NA NA NA NA NA chr18-172 59530802 59531048 114 - chr18:59530904-59530906 NA NA NA NA NA chr18-171 59349885 59350116 147 - chr18:59349899-59350018 NA NA NA NA NA chr18-170 59113537 59113850 156 - chr18:59113682-59113689 NA NA NA NA NA chr18-169 58980557 58980836 134 - chr18:58980636-58980669 NA NA NA NA NA chr18-168 58875269 58875503 163 - chr18:58875374-58875466 NA NA NA NA NA chr18-167 58628902 58629227 144 - chr18:58628966-58629007 NA NA NA NA NA chr18-42 5728361 5728555 113 - chr18:5728425-5728457 NA NA NA NA NA chr18-166 57218622 57218974 269 - chr18:57218693-57218879 NA NA NA NA NA chr18-165 56802785 56803018 134 - chr18:56802870-56802877 NA NA NA NA NA chr18-41 5586816 5587026 129 - chr18:5586925-5586973 NA NA NA NA NA chr18-40 5523750 5524121 306 - chr18:5523895-5524085 NA NA NA NA NA chr18-164 54973506 54974129 363 - chr18:54973861-54974115 NA NA NA NA NA chr18-163 54630689 54630968 221 - chr18:54630753-54630928 NA NA NA NA NA chr18-39 5448777 5449002 150 - chr18:5448880-5448955 NA NA NA NA NA chr18-162 53382346 53382702 301 - chr18:53382389-53382635 NA NA NA NA NA chr18-161 52618102 52618267 145 - chr18:52618123-52618248 NA NA NA NA NA chr18-160 52454454 52454695 139 - chr18:52454565-52454670 NA NA NA NA NA chr18-159 52112830 52113271 241 - chr18:52113008-52113049 NA NA NA NA NA chr18-158 50948142 50948406 136 - chr18:50948322-50948330 NA NA NA NA NA chr18-157 50687485 50687756 136 - chr18:50687648-50687649 NA NA NA NA NA chr18-38 5049594 5049837 195 - chr18:5049633-5049812 NA NA NA NA NA chr18-156 50215831 50216223 226 - chr18:50216025-50216085 NA NA NA NA NA chr18-155 49802633 49802890 130 - chr18:49802801-49802886 NA NA NA NA NA chr18-154 49178774 49179090 196 - chr18:49178927-49179003 NA NA NA NA NA chr18-37 4861583 4861753 128 - chr18:4861625-4861711 NA NA NA NA NA chr18-153 48486602 48486766 125 - chr18:48486634-48486720 NA NA NA NA NA chr18-152 47827042 47827263 159 - chr18:47827126-47827223 NA NA NA NA NA chr18-151 46801362 46801651 172 - chr18:46801486-46801555 NA NA NA NA NA chr18-150 46591896 46592173 233 - chr18:46591945-46592046 NA NA NA NA NA chr18-149 45107589 45108079 217 - chr18:45107940-45108057 NA NA NA NA NA chr18-148 44588826 44589206 318 - chr18:44588856-44588988 NA NA NA NA NA chr18-36 4392874 4393346 342 - chr18:4392940-4393180 NA NA NA NA NA chr18-147 43789863 43790068 146 - chr18:43789913-43789982 NA NA NA NA NA chr18-146 43576346 43576624 178 - chr18:43576448-43576526 NA NA NA NA NA chr18-145 42940738 42940976 145 - chr18:42940870-42940922 NA NA NA NA NA chr18-144 42835491 42835938 317 - chr18:42835611-42835798 NA NA NA NA NA chr18-143 42179839 42180326 277 - chr18:42180058-42180119 NA NA NA NA NA chr18-142 41737615 41737809 156 - chr18:41737664-41737804 NA NA NA NA NA chr18-141 41701846 41702149 165 - chr18:41702010-41702037 NA NA NA NA NA chr18-140 40799430 40799820 189 - chr18:40799637-40799661 NA NA NA NA NA chr18-139 40639496 40639825 200 - chr18:40639510-40639581 NA NA NA NA NA chr18-138 40425963 40426182 151 - chr18:40426095-40426178 NA NA NA NA NA chr18-137 39663271 39663584 202 - chr18:39663382-39663473 NA NA NA NA NA chr18-136 39594281 39594561 248 - chr18:39594319-39594531 NA NA NA NA NA chr18-135 39288462 39288655 172 - chr18:39288465-39288630 NA NA NA NA NA chr18-35 3890379 3890593 113 - chr18:3890509-3890579 NA NA NA NA NA chr18-34 3862044 3862231 139 - chr18:3862104-3862195 NA NA NA NA NA chr18 385873 386087 152 - chr18:385950-386040 NA NA NA NA NA chr18-134 38501286 38501617 185 - chr18:38501510-38501549 NA NA NA NA NA chr18-33 3841682 3841981 246 - chr18:3841786-3841873 NA NA NA NA NA chr18-133 38207136 38207318 153 - chr18:38207146-38207270 NA NA NA NA NA chr18-32 3812739 3812937 171 - chr18:3812793-3812919 NA NA NA NA NA chr18-31 3762617 3762855 146 - chr18:3762627-3762681 NA NA NA NA NA chr18-30 3648393 3648737 161 - chr18:3648549-3648649 NA NA NA NA NA chr18-132 36205157 36205393 196 - chr18:36205229-36205385 NA NA NA NA NA chr18-29 3600414 3600763 174 - chr18:3600610-3600629 NA NA NA NA NA chr18-131 35827599 35827968 172 - chr18:35827893-35827944 NA NA NA NA NA chr18-28 3581721 3582100 139 - chr18:3581770-3581829 NA NA NA NA NA chr18-130 35368411 35368623 196 - chr18:35368420-35368600 NA NA NA NA NA chr18-27 3493735 3493891 113 - chr18:3493763-3493803 NA NA NA NA NA chr18-26 3492412 3492579 139 - chr18:3492419-3492488 NA NA NA NA NA chr18-129 34917780 34918173 312 - chr18:34917993-34918136 NA NA NA NA NA chr18-128 34798765 34799147 184 - chr18:34798909-34798931 NA NA NA NA NA chr18-127 34737328 34737466 114 - chr18:34737394-34737456 NA NA NA NA NA chr18-126 34690877 34691158 170 - chr18:34691079-34691138 NA NA NA NA NA chr18-125 33916900 33917113 135 - chr18:33916926-33917035 NA NA NA NA NA chr18-124 33476593 33476876 178 - chr18:33476690-33476763 NA NA NA NA NA chr18-25 3344783 3345169 211 - chr18:3344923-3345008 NA NA NA NA NA chr18-123 33318256 33318416 127 - chr18:33318262-33318356 NA NA NA NA NA chr18-24 3279277 3279488 138 - chr18:3279382-3279447 NA NA NA NA NA chr18-122 32750321 32750675 192 - chr18:32750484-32750516 NA NA NA NA NA chr18-121 32726773 32727183 173 - chr18:32726808-32726902 NA NA NA NA NA chr18-23 3204308 3204450 115 - chr18:3204326-3204414 NA NA NA NA NA chr18-22 3145676 3145989 207 - chr18:3145681-3145751 NA NA NA NA NA chr18-21 3118753 3118948 113 - chr18:3118775-3118806 NA NA NA NA NA chr18-120 30897264 30897711 346 - chr18:30897264-30897509 NA NA NA NA NA chr18-119 30895235 30895650 232 - chr18:30895307-30895356 NA NA NA NA NA chr18-118 30263750 30263938 132 - chr18:30263787-30263825 NA NA NA NA NA chr18-20 3014539 3014829 161 - chr18:3014548-3014666 NA NA NA NA NA chr18-19 2977693 2978037 177 - chr18:2977781-2977791 NA NA NA NA NA chr18-117 29579262 29579416 138 - chr18:29579281-29579401 NA NA NA NA NA chr18-116 29342212 29342665 238 - chr18:29342493-29342516 NA NA NA NA NA chr18-115 29043141 29043357 122 - chr18:29043273-29043301 NA NA NA NA NA chr18-18 2818647 2819015 228 - chr18:2818670-2818740 NA NA NA NA NA chr18-114 27895229 27895665 247 - chr18:27895376-27895434 NA NA NA NA NA chr18-17 2666899 2667119 154 - chr18:2666995-2667068 NA NA NA NA NA chr18-16 2627425 2627802 231 - chr18:2627694-2627697 NA NA NA NA NA chr18-15 2573531 2573769 187 - chr18:2573702-2573736 NA NA NA NA NA chr18-113 25582970 25583166 147 - chr18:25582970-25583068 NA NA NA NA NA chr18-14 2423203 2423565 158 - chr18:2423291-2423381 NA NA NA NA NA chr18-112 24043480 24043829 142 - chr18:24043517-24043590 NA NA NA NA NA chr18-111 23799060 23799334 187 - chr18:23799072-23799230 NA NA NA NA NA chr18-110 23640016 23640334 204 - chr18:23640207-23640297 NA NA NA NA NA chr18-109 23126494 23126709 170 - chr18:23126566-23126673 NA NA NA NA NA chr18-108 22946284 22946599 262 - chr18:22946361-22946570 NA NA NA NA NA chr18-107 22426877 22427038 116 - chr18:22426913-22426984 NA NA NA NA NA chr18-13 2225137 2225310 122 - chr18:2225233-2225304 NA NA NA NA NA chr18-106 21578814 21579130 149 - chr18:21578903-21578937 NA NA NA NA NA chr18-105 21211967 21212188 182 - chr18:21211967-21212136 NA NA NA NA NA chr18-104 21090855 21091031 115 - chr18:21090939-21090993 NA NA NA NA NA chr18-103 21083284 21083656 216 - chr18:21083465-21083525 NA NA NA NA NA chr18-12 2094709 2094924 187 - chr18:2094739-2094842 NA NA NA NA NA chr18-11 1690100 1690365 204 - chr18:1690165-1690316 NA NA NA NA NA chr18-10 1552189 1552545 196 - chr18:1552346-1552384 NA NA NA NA NA chr18-102 14014311 14014527 137 - chr18:14014354-14014412 NA NA NA NA NA chr18-9 1400980 1401248 208 - chr18:1401006-1401154 NA NA NA NA NA chr18-101 13959984 13960203 171 - chr18:13960019-13960116 NA NA NA NA NA chr18-100 13872653 13872855 150 - chr18:13872723-13872809 NA NA NA NA NA chr18-99 13754476 13754740 155 - chr18:13754657-13754703 NA NA NA NA NA chr18-98 13293538 13293871 177 - chr18:13293673-13293676 NA NA NA NA NA chr18-97 13226779 13226986 189 - chr18:13226803-13226970 NA NA NA NA NA chr18-96 12999859 13000059 134 - chr18:12999868-12999936 NA NA NA NA NA chr18-95 12986608 12987071 234 - chr18:12986890-12986895 NA NA NA NA NA chr18-94 12960468 12960764 137 - chr18:12960659-12960701 NA NA NA NA NA chr18-93 12941110 12941380 163 - chr18:12941268-12941283 NA NA NA NA NA chr18-92 12938239 12938615 166 - chr18:12938406-12938502 NA NA NA NA NA chr18-91 12931453 12931713 181 - chr18:12931523-12931612 NA NA NA NA NA chr18-8 1273253 1273655 301 - chr18:1273612-1273640 NA NA NA NA NA chr18-90 12676785 12677005 146 - chr18:12676799-12676871 NA NA NA NA NA chr18-89 12647079 12647246 130 - chr18:12647089-12647182 NA NA NA NA NA chr18-88 12484601 12484830 168 - chr18:12484656-12484763 NA NA NA NA NA chr18-87 12232783 12233155 247 - chr18:12232870-12232916 NA NA NA NA NA chr18-86 11846775 11847221 240 - chr18:11847124-11847158 NA NA NA NA NA chr18-85 11767956 11768236 196 - chr18:11768064-11768176 NA NA NA NA NA chr18-84 11402387 11402654 184 - chr18:11402446-11402563 NA NA NA NA NA chr18-83 11346019 11346262 209 - chr18:11346148-11346255 NA NA NA NA NA chr18-82 11291109 11291364 175 - chr18:11291203-11291298 NA NA NA NA NA chr18-81 11123088 11123484 270 - chr18:11123202-11123322 NA NA NA NA NA chr18-80 11086735 11086985 215 - chr18:11086772-11086952 NA NA NA NA NA chr18-79 10965342 10965679 219 - chr18:10965358-10965459 NA NA NA NA NA chr18-78 10953081 10953374 140 - chr18:10953211-10953300 NA NA NA NA NA chr18-77 10827602 10827791 145 - chr18:10827618-10827719 NA NA NA NA NA chr18-76 10230102 10230645 276 - chr18:10230373-10230382 NA NA NA NA NA chr18-75 10061571 10061704 122 - chr18:10061581-10061690 NA NA NA NA NA chr18-7 1000405 1000860 263 - chr18:1000742-1000745 NA NA NA NA NA chr17_KI270729v1_random 3817 4123 186 - chr17_KI270729v1_random:3862-3981 NA NA NA NA NA chr17_GL000205v2_random 1626 1893 182 - chr17_GL000205v2_random:1694-1771 NA NA NA NA NA chr17-10 9863246 9863602 235 - chr17:9863459-9863573 NA NA NA NA NA chr17 861568 861895 271 - chr17:861711-861868 NA NA NA NA NA chr17-9 8326217 8326484 191 - chr17:8326299-8326410 NA NA NA NA NA chr17-307 83147272 83147539 223 - chr17:83147396-83147487 NA NA NA NA NA chr17-306 82904634 82904836 164 - chr17:82904640-82904690 NA NA NA NA NA chr17-305 82867623 82867826 158 - chr17:82867638-82867781 NA NA NA NA NA chr17-304 82524509 82524773 240 - chr17:82524520-82524752 NA NA NA NA NA chr17-303 82492891 82493013 119 - chr17:82492902-82493012 NA NA NA NA NA chr17-302 81908894 81909457 222 - chr17:81908970-81908983 NA NA NA NA NA chr17-301 81219496 81219821 168 - chr17:81219652-81219661 NA NA NA NA NA chr17-300 81024143 81024552 259 - chr17:81024154-81024263 NA NA NA NA NA chr17-299 80984916 80985331 262 - chr17:80984957-80985168 NA NA NA NA NA chr17-298 80905055 80905284 130 - chr17:80905145-80905242 NA NA NA NA NA chr17-297 80863973 80864235 146 - chr17:80864135-80864165 NA NA NA NA NA chr17-296 80828258 80828629 335 - chr17:80828350-80828577 NA NA NA NA NA chr17-295 80789334 80789530 173 - chr17:80789351-80789505 NA NA NA NA NA chr17-294 80705228 80705386 141 - chr17:80705263-80705375 NA NA NA NA NA chr17-293 80703567 80703847 232 - chr17:80703647-80703735 NA NA NA NA NA chr17-8 8061169 8061412 169 - chr17:8061313-8061408 NA NA NA NA NA chr17-292 80289156 80289354 134 - chr17:80289206-80289248 NA NA NA NA NA chr17-291 80139497 80139705 154 - chr17:80139545-80139655 NA NA NA NA NA chr17-290 79253748 79254079 228 - chr17:79253929-79254002 NA NA NA NA NA chr17-289 79175435 79175867 193 - chr17:79175724-79175778 NA NA NA NA NA chr17-288 78777906 78778105 167 - chr17:78777915-78778050 NA NA NA NA NA chr17-287 78754811 78755051 186 - chr17:78754855-78755023 NA NA NA NA NA chr17-286 78568354 78568623 155 - chr17:78568502-78568543 NA NA NA NA NA chr17-285 78164157 78164332 148 - chr17:78164181-78164302 NA NA NA NA NA chr17-284 78065621 78066128 255 - chr17:78065646-78065817 NA NA NA NA NA chr17-283 77950172 77950553 258 - chr17:77950267-77950402 NA NA NA NA NA chr17-282 77947771 77948192 278 - chr17:77947917-77948052 NA NA NA NA NA chr17-281 77862574 77862996 226 - chr17:77862646-77862676 NA NA NA NA NA chr17-280 77537558 77537933 195 - chr17:77537741-77537756 NA NA NA NA NA chr17-279 77529266 77529613 234 - chr17:77529461-77529582 NA NA NA NA NA chr17-278 77319707 77319970 149 - chr17:77319817-77319852 NA NA NA NA NA chr17-277 77178324 77178515 132 - chr17:77178347-77178387 NA NA NA NA NA chr17-276 77046865 77047181 179 - chr17:77046907-77046949 NA NA NA NA NA chr17-275 77045837 77046173 207 - chr17:77045947-77045987 NA NA NA NA NA chr17-274 75856859 75857118 174 - chr17:75856931-75857020 NA NA NA NA NA chr17-273 75650987 75651433 192 - chr17:75651213-75651287 NA NA NA NA NA chr17-272 75488740 75489023 225 - chr17:75488851-75489018 NA NA NA NA NA chr17-271 74986786 74987063 221 - chr17:74986834-74986983 NA NA NA NA NA chr17-270 74532921 74533223 233 - chr17:74533035-74533091 NA NA NA NA NA chr17-269 73728095 73728307 135 - chr17:73728169-73728227 NA NA NA NA NA chr17-268 73689045 73689294 147 - chr17:73689099-73689144 NA NA NA NA NA chr17-267 73518555 73518811 184 - chr17:73518632-73518744 NA NA NA NA NA chr17-266 73485319 73485598 167 - chr17:73485365-73485464 NA NA NA NA NA chr17-265 73464967 73465194 213 - chr17:73465020-73465191 NA NA NA NA NA chr17-264 73281001 73281341 214 - chr17:73281153-73281325 NA NA NA NA NA chr17-263 73261501 73261927 233 - chr17:73261665-73261752 NA NA NA NA NA chr17-262 73052905 73053301 213 - chr17:73053061-73053109 NA NA NA NA NA chr17-261 72942314 72942608 192 - chr17:72942491-72942581 NA NA NA NA NA chr17-260 72718433 72718642 202 - chr17:72718444-72718625 NA NA NA NA NA chr17-259 72621254 72621538 152 - chr17:72621345-72621348 NA NA NA NA NA chr17-258 72440295 72440946 414 - chr17:72440531-72440706 NA NA NA NA NA chr17-257 72401198 72401403 158 - chr17:72401218-72401275 NA NA NA NA NA chr17-256 72375988 72376355 210 - chr17:72376190-72376243 NA NA NA NA NA chr17-255 72049856 72050190 241 - chr17:72049963-72050111 NA NA NA NA NA chr17-254 72001498 72001792 137 - chr17:72001680-72001703 NA NA NA NA NA chr17-253 71998831 71999015 126 - chr17:71998859-71998927 NA NA NA NA NA chr17-252 71934058 71934496 252 - chr17:71934159-71934349 NA NA NA NA NA chr17-251 71914863 71915218 194 - chr17:71915012-71915053 NA NA NA NA NA chr17-250 71497642 71497999 249 - chr17:71497707-71497920 NA NA NA NA NA chr17-249 71488031 71488496 225 - chr17:71488251-71488396 NA NA NA NA NA chr17-248 71478771 71479101 256 - chr17:71478812-71478994 NA NA NA NA NA chr17-247 71433082 71433285 113 - chr17:71433191-71433214 NA NA NA NA NA chr17-246 71398253 71398577 233 - chr17:71398337-71398502 NA NA NA NA NA chr17-245 71261556 71261767 157 - chr17:71261584-71261687 NA NA NA NA NA chr17-244 71259085 71259358 176 - chr17:71259182-71259261 NA NA NA NA NA chr17-243 71207047 71207413 197 - chr17:71207083-71207111 NA NA NA NA NA chr17-242 71115671 71115866 158 - chr17:71115764-71115811 NA NA NA NA NA chr17-241 71112235 71112918 251 - chr17:71112777-71112878 NA NA NA NA NA chr17-240 71034821 71035027 166 - chr17:71034849-71034975 NA NA NA NA NA chr17-239 70987869 70988127 180 - chr17:70987917-70988039 NA NA NA NA NA chr17-238 70964968 70965173 124 - chr17:70965050-70965093 NA NA NA NA NA chr17-237 70961729 70962560 389 - chr17:70962490-70962546 NA NA NA NA NA chr17-236 70866948 70867376 299 - chr17:70867158-70867353 NA NA NA NA NA chr17-235 70703706 70703973 169 - chr17:70703895-70703966 NA NA NA NA NA chr17-234 70544351 70544624 195 - chr17:70544456-70544573 NA NA NA NA NA chr17-233 70535907 70536339 324 - chr17:70536086-70536214 NA NA NA NA NA chr17-232 70289483 70289702 154 - chr17:70289586-70289675 NA NA NA NA NA chr17-231 70012681 70012862 125 - chr17:70012710-70012779 NA NA NA NA NA chr17-230 69653602 69653942 295 - chr17:69653618-69653868 NA NA NA NA NA chr17-229 69499696 69499869 158 - chr17:69499696-69499809 NA NA NA NA NA chr17-228 69330183 69330577 240 - chr17:69330377-69330463 NA NA NA NA NA chr17-227 68988990 68989198 151 - chr17:68989014-68989108 NA NA NA NA NA chr17-226 68923887 68924069 118 - chr17:68923948-68924004 NA NA NA NA NA chr17-225 68829071 68829602 168 - chr17:68829177-68829224 NA NA NA NA NA chr17-224 68720411 68720617 165 - chr17:68720536-68720604 NA NA NA NA NA chr17-223 68624680 68624952 185 - chr17:68624745-68624799 NA NA NA NA NA chr17-222 68460856 68461209 179 - chr17:68460997-68461002 NA NA NA NA NA chr17-221 68456629 68457019 183 - chr17:68456711-68456757 NA NA NA NA NA chr17-220 68293948 68294147 154 - chr17:68294024-68294133 NA NA NA NA NA chr17-219 68094111 68094391 121 - chr17:68094202-68094270 NA NA NA NA NA chr17-218 67656657 67656942 194 - chr17:67656809-67656912 NA NA NA NA NA chr17-217 67471861 67472101 142 - chr17:67471924-67471968 NA NA NA NA NA chr17-216 67343015 67343413 264 - chr17:67343185-67343291 NA NA NA NA NA chr17-215 67161253 67161742 201 - chr17:67161567-67161595 NA NA NA NA NA chr17-214 66795938 66796119 117 - chr17:66796061-66796114 NA NA NA NA NA chr17-213 66705318 66705701 164 - chr17:66705553-66705585 NA NA NA NA NA chr17-212 66700675 66700878 140 - chr17:66700728-66700805 NA NA NA NA NA chr17-211 66594794 66595198 176 - chr17:66595079-66595141 NA NA NA NA NA chr17-210 66082103 66082374 147 - chr17:66082161-66082228 NA NA NA NA NA chr17-209 66062315 66062471 138 - chr17:66062351-66062435 NA NA NA NA NA chr17-208 65909238 65909475 149 - chr17:65909308-65909369 NA NA NA NA NA chr17-207 65734664 65734938 142 - chr17:65734790-65734804 NA NA NA NA NA chr17-206 65557784 65557986 126 - chr17:65557926-65557932 NA NA NA NA NA chr17-205 65334780 65335047 145 - chr17:65334867-65334890 NA NA NA NA NA chr17-204 65221305 65221532 113 - chr17:65221427-65221442 NA NA NA NA NA chr17-203 65040061 65040446 148 - chr17:65040226-65040295 NA NA NA NA NA chr17-202 64680513 64680734 206 - chr17:64680531-64680732 NA NA NA NA NA chr17-201 64629494 64629642 137 - chr17:64629532-64629640 NA NA NA NA NA chr17-200 64604545 64604893 178 - chr17:64604649-64604701 NA NA NA NA NA chr17-199 64480985 64481229 201 - chr17:64481145-64481225 NA NA NA NA NA chr17-198 64361828 64362098 163 - chr17:64361912-64361922 NA NA NA NA NA chr17-197 64233578 64233764 126 - chr17:64233624-64233690 NA NA NA NA NA chr17-196 64148393 64148606 175 - chr17:64148415-64148552 NA NA NA NA NA chr17-195 64057186 64057402 155 - chr17:64057194-64057288 NA NA NA NA NA chr17-194 63977446 63977749 149 - chr17:63977548-63977608 NA NA NA NA NA chr17-193 63716996 63717251 219 - chr17:63717110-63717221 NA NA NA NA NA chr17-192 63691448 63691710 143 - chr17:63691666-63691690 NA NA NA NA NA chr17-191 63452548 63452723 119 - chr17:63452561-63452624 NA NA NA NA NA chr17-190 63264233 63264660 332 - chr17:63264290-63264634 NA NA NA NA NA chr17-189 63221334 63221567 126 - chr17:63221494-63221513 NA NA NA NA NA chr17-188 63193927 63194123 133 - chr17:63194038-63194108 NA NA NA NA NA chr17-187 63118011 63118186 154 - chr17:63118050-63118183 NA NA NA NA NA chr17-186 62856560 62856912 143 - chr17:62856828-62856833 NA NA NA NA NA chr17-185 62823508 62823838 227 - chr17:62823667-62823791 NA NA NA NA NA chr17-184 62818998 62819351 226 - chr17:62819139-62819238 NA NA NA NA NA chr17-183 62760001 62760402 251 - chr17:62760151-62760252 NA NA NA NA NA chr17-182 62745548 62745964 158 - chr17:62745835-62745838 NA NA NA NA NA chr17-181 62733098 62733520 297 - chr17:62733143-62733315 NA NA NA NA NA chr17-180 62673289 62673509 128 - chr17:62673422-62673458 NA NA NA NA NA chr17-179 62671672 62671914 206 - chr17:62671711-62671881 NA NA NA NA NA chr17-178 62210475 62210877 242 - chr17:62210742-62210751 NA NA NA NA NA chr17-177 62102652 62102961 207 - chr17:62102663-62102768 NA NA NA NA NA chr17-176 62039746 62039955 138 - chr17:62039851-62039918 NA NA NA NA NA chr17-175 61941599 61942052 245 - chr17:61941830-61941867 NA NA NA NA NA chr17-174 61900083 61900372 151 - chr17:61900251-61900324 NA NA NA NA NA chr17-173 61771366 61771617 215 - chr17:61771396-61771563 NA NA NA NA NA chr17-172 61746084 61746406 154 - chr17:61746175-61746273 NA NA NA NA NA chr17-171 61645465 61645636 123 - chr17:61645542-61645617 NA NA NA NA NA chr17-170 61598510 61598834 206 - chr17:61598725-61598726 NA NA NA NA NA chr17-169 61470265 61470596 169 - chr17:61470424-61470429 NA NA NA NA NA chr17-168 61356832 61357048 168 - chr17:61356889-61357009 NA NA NA NA NA chr17-167 61355581 61355864 233 - chr17:61355606-61355789 NA NA NA NA NA chr17-166 61229008 61229204 122 - chr17:61229148-61229152 NA NA NA NA NA chr17-165 61200484 61200770 161 - chr17:61200517-61200553 NA NA NA NA NA chr17-164 61120512 61121023 228 - chr17:61120851-61120908 NA NA NA NA NA chr17-163 61053678 61054099 145 - chr17:61053834-61053887 NA NA NA NA NA chr17-162 61025325 61025641 172 - chr17:61025496-61025506 NA NA NA NA NA chr17-161 60973209 60973427 178 - chr17:60973265-60973323 NA NA NA NA NA chr17-160 60954797 60955214 212 - chr17:60954960-60954995 NA NA NA NA NA chr17-159 60907840 60908169 241 - chr17:60908132-60908149 NA NA NA NA NA chr17-158 60887798 60888080 207 - chr17:60887870-60887996 NA NA NA NA NA chr17-157 60819226 60819516 169 - chr17:60819303-60819351 NA NA NA NA NA chr17-156 60779577 60779951 295 - chr17:60779611-60779737 NA NA NA NA NA chr17-155 60670508 60671100 437 - chr17:60670608-60670930 NA NA NA NA NA chr17-154 60659205 60659545 179 - chr17:60659338-60659356 NA NA NA NA NA chr17-153 60586433 60586618 155 - chr17:60586464-60586591 NA NA NA NA NA chr17-152 60563127 60563514 156 - chr17:60563380-60563459 NA NA NA NA NA chr17-151 60545638 60546112 288 - chr17:60545641-60545743 NA NA NA NA NA chr17-150 60529538 60529846 266 - chr17:60529670-60529810 NA NA NA NA NA chr17-149 60232747 60232972 157 - chr17:60232815-60232904 NA NA NA NA NA chr17-148 60152199 60152604 248 - chr17:60152418-60152509 NA NA NA NA NA chr17-147 60151316 60151544 140 - chr17:60151364-60151416 NA NA NA NA NA chr17-146 60081508 60081735 158 - chr17:60081588-60081677 NA NA NA NA NA chr17-145 59854818 59855019 140 - chr17:59854831-59854942 NA NA NA NA NA chr17-144 59813875 59814110 130 - chr17:59813945-59813970 NA NA NA NA NA chr17-143 59782457 59782705 131 - chr17:59782493-59782585 NA NA NA NA NA chr17-142 59770855 59771110 141 - chr17:59770890-59770917 NA NA NA NA NA chr17-141 59648639 59648832 133 - chr17:59648669-59648682 NA NA NA NA NA chr17-140 59622340 59622749 314 - chr17:59622342-59622375 NA NA NA NA NA chr17-139 59541694 59542043 181 - chr17:59541760-59541885 NA NA NA NA NA chr17-138 59241938 59242364 256 - chr17:59241985-59242153 NA NA NA NA NA chr17-137 59150885 59151210 240 - chr17:59150934-59151113 NA NA NA NA NA chr17-136 59085243 59085468 204 - chr17:59085253-59085436 NA NA NA NA NA chr17-135 59061241 59061542 159 - chr17:59061437-59061499 NA NA NA NA NA chr17-134 58940551 58940873 198 - chr17:58940557-58940678 NA NA NA NA NA chr17-133 58915964 58916198 193 - chr17:58915975-58916127 NA NA NA NA NA chr17-132 58861331 58861646 228 - chr17:58861346-58861535 NA NA NA NA NA chr17-131 58496132 58496345 153 - chr17:58496255-58496306 NA NA NA NA NA chr17-130 58458617 58458995 205 - chr17:58458852-58458884 NA NA NA NA NA chr17-129 57975554 57975870 280 - chr17:57975594-57975846 NA NA NA NA NA chr17-128 57822531 57822755 145 - chr17:57822616-57822694 NA NA NA NA NA chr17-127 57818507 57818888 199 - chr17:57818653-57818680 NA NA NA NA NA chr17-126 57600877 57601018 115 - chr17:57600907-57600996 NA NA NA NA NA chr17-125 57533645 57534458 285 - chr17:57534358-57534423 NA NA NA NA NA chr17-124 57474847 57475137 223 - chr17:57474890-57475046 NA NA NA NA NA chr17-123 56870619 56870927 174 - chr17:56870811-56870851 NA NA NA NA NA chr17-122 56811250 56811609 239 - chr17:56811286-56811405 NA NA NA NA NA chr17-121 56541487 56541707 134 - chr17:56541566-56541600 NA NA NA NA NA chr17-120 56302871 56303292 233 - chr17:56303138-56303265 NA NA NA NA NA chr17-119 56273151 56273382 143 - chr17:56273326-56273381 NA NA NA NA NA chr17-118 56257028 56257308 143 - chr17:56257153-56257167 NA NA NA NA NA chr17-117 56224352 56224876 201 - chr17:56224768-56224815 NA NA NA NA NA chr17-116 56125188 56125400 172 - chr17:56125346-56125398 NA NA NA NA NA chr17-115 55616533 55616722 177 - chr17:55616534-55616707 NA NA NA NA NA chr17-114 55601258 55601490 182 - chr17:55601301-55601433 NA NA NA NA NA chr17-113 55553221 55553414 146 - chr17:55553238-55553277 NA NA NA NA NA chr17-112 55293276 55293456 140 - chr17:55293322-55293434 NA NA NA NA NA chr17-111 54764838 54765178 188 - chr17:54764888-54764992 NA NA NA NA NA chr17-110 54748548 54748748 139 - chr17:54748618-54748696 NA NA NA NA NA chr17-109 54525696 54525961 134 - chr17:54525899-54525902 NA NA NA NA NA chr17-7 5396636 5396882 189 - chr17:5396686-5396818 NA NA NA NA NA chr17-108 53964603 53964948 193 - chr17:53964800-53964891 NA NA NA NA NA chr17-107 53865709 53866118 173 - chr17:53865848-53865877 NA NA NA NA NA chr17-106 53332697 53333133 154 - chr17:53332703-53332763 NA NA NA NA NA chr17-6 5332197 5332534 224 - chr17:5332341-5332452 NA NA NA NA NA chr17-105 53289272 53289568 140 - chr17:53289332-53289420 NA NA NA NA NA chr17-104 53253125 53253530 256 - chr17:53253282-53253405 NA NA NA NA NA chr17-103 53245412 53245662 133 - chr17:53245466-53245560 NA NA NA NA NA chr17-102 52782189 52782470 178 - chr17:52782394-52782469 NA NA NA NA NA chr17-101 52071666 52072109 236 - chr17:52071723-52071890 NA NA NA NA NA chr17-100 51798866 51799098 181 - chr17:51799010-51799078 NA NA NA NA NA chr17-99 51048248 51048479 167 - chr17:51048319-51048422 NA NA NA NA NA chr17-98 50986648 50987272 326 - chr17:50986952-50987239 NA NA NA NA NA chr17-97 50868436 50868740 164 - chr17:50868610-50868634 NA NA NA NA NA chr17-96 50497964 50498164 158 - chr17:50498016-50498152 NA NA NA NA NA chr17-95 50155498 50155756 194 - chr17:50155587-50155717 NA NA NA NA NA chr17-94 49757066 49757326 152 - chr17:49757164-49757280 NA NA NA NA NA chr17-93 48397837 48398267 280 - chr17:48397959-48398189 NA NA NA NA NA chr17-92 47872062 47872289 179 - chr17:47872108-47872239 NA NA NA NA NA chr17-91 47680041 47680491 213 - chr17:47680143-47680209 NA NA NA NA NA chr17-90 47427269 47427837 190 - chr17:47427755-47427783 NA NA NA NA NA chr17-89 47405071 47405375 232 - chr17:47405084-47405244 NA NA NA NA NA chr17-88 47376879 47377173 221 - chr17:47376944-47377092 NA NA NA NA NA chr17-87 47143455 47143719 166 - chr17:47143570-47143622 NA NA NA NA NA chr17-86 46958693 46959057 302 - chr17:46958808-46959048 NA NA NA NA NA chr17-85 45271563 45271949 233 - chr17:45271674-45271893 NA NA NA NA NA chr17-5 4493361 4493520 117 - chr17:4493394-4493469 NA NA NA NA NA chr17-84 44638288 44638665 230 - chr17:44638381-44638464 NA NA NA NA NA chr17-83 44571560 44571880 230 - chr17:44571656-44571818 NA NA NA NA NA chr17-82 44544061 44544266 159 - chr17:44544131-44544244 NA NA NA NA NA chr17-81 44455828 44456107 170 - chr17:44456022-44456083 NA NA NA NA NA chr17-80 44084157 44084470 241 - chr17:44084292-44084461 NA NA NA NA NA chr17-79 43081214 43081427 202 - chr17:43081220-43081401 NA NA NA NA NA chr17-78 42940668 42940807 114 - chr17:42940696-42940783 NA NA NA NA NA chr17-77 42917335 42917631 137 - chr17:42917425-42917449 NA NA NA NA NA chr17-76 42862658 42862891 132 - chr17:42862789-42862820 NA NA NA NA NA chr17-75 42766136 42766516 183 - chr17:42766378-42766454 NA NA NA NA NA chr17-74 41976838 41977110 183 - chr17:41976852-41976946 NA NA NA NA NA chr17-73 41906877 41907370 289 - chr17:41907077-41907162 NA NA NA NA NA chr17-72 41846266 41846740 244 - chr17:41846568-41846582 NA NA NA NA NA chr17-4 4151326 4151556 148 - chr17:4151395-4151469 NA NA NA NA NA chr17-71 41439984 41440208 156 - chr17:41440022-41440110 NA NA NA NA NA chr17-70 40836545 40836859 188 - chr17:40836713-40836747 NA NA NA NA NA chr17-69 40816260 40816481 127 - chr17:40816374-40816407 NA NA NA NA NA chr17-68 40677352 40677631 150 - chr17:40677443-40677550 NA NA NA NA NA chr17-67 40114745 40115132 195 - chr17:40114790-40114891 NA NA NA NA NA chr17-66 40073703 40073964 190 - chr17:40073777-40073896 NA NA NA NA NA chr17-65 39901123 39901463 194 - chr17:39901280-39901350 NA NA NA NA NA chr17-64 39860902 39861213 185 - chr17:39861002-39861061 NA NA NA NA NA chr17-63 39851070 39851208 127 - chr17:39851070-39851164 NA NA NA NA NA chr17-62 39117477 39117795 200 - chr17:39117598-39117678 NA NA NA NA NA chr17-61 39004755 39005015 133 - chr17:39004902-39004908 NA NA NA NA NA chr17-60 38977905 38978160 150 - chr17:38977955-38978070 NA NA NA NA NA chr17-3 3834879 3835064 133 - chr17:3834906-3834937 NA NA NA NA NA chr17-59 35757198 35757430 140 - chr17:35757334-35757382 NA NA NA NA NA chr17-58 35268906 35269259 228 - chr17:35269130-35269233 NA NA NA NA NA chr17-57 34467999 34468337 234 - chr17:34468158-34468288 NA NA NA NA NA chr17-56 34104827 34105204 227 - chr17:34105008-34105015 NA NA NA NA NA chr17-55 33444867 33445256 173 - chr17:33445105-33445106 NA NA NA NA NA chr17-54 33122577 33122793 123 - chr17:33122672-33122706 NA NA NA NA NA chr17-53 32623614 32624034 329 - chr17:32623764-32624002 NA NA NA NA NA chr17-52 32353275 32353588 182 - chr17:32353397-32353448 NA NA NA NA NA chr17-51 32294594 32294907 209 - chr17:32294706-32294811 NA NA NA NA NA chr17-50 32217826 32218189 173 - chr17:32217926-32217969 NA NA NA NA NA chr17-49 31706920 31707195 160 - chr17:31707026-31707053 NA NA NA NA NA chr17-48 31521550 31521787 162 - chr17:31521561-31521698 NA NA NA NA NA chr17-47 31334557 31334772 181 - chr17:31334661-31334740 NA NA NA NA NA chr17-46 31250026 31250387 233 - chr17:31250086-31250191 NA NA NA NA NA chr17-45 30793813 30794034 167 - chr17:30793904-30794017 NA NA NA NA NA chr17-44 30478828 30479063 121 - chr17:30478931-30478942 NA NA NA NA NA chr17-43 30265455 30265796 203 - chr17:30265587-30265652 NA NA NA NA NA chr17-42 29049007 29049246 136 - chr17:29049133-29049166 NA NA NA NA NA chr17-41 27906901 27907343 214 - chr17:27907268-27907286 NA NA NA NA NA chr17-40 27815175 27815650 247 - chr17:27815519-27815633 NA NA NA NA NA chr17-39 21538438 21538863 292 - chr17:21538559-21538726 NA NA NA NA NA chr17-38 21529750 21529914 156 - chr17:21529766-21529914 NA NA NA NA NA chr17-37 20988520 20988690 114 - chr17:20988567-20988631 NA NA NA NA NA chr17-36 20301016 20301412 141 - chr17:20301209-20301265 NA NA NA NA NA chr17-35 20133373 20133730 194 - chr17:20133654-20133685 NA NA NA NA NA chr17-34 19874890 19875123 175 - chr17:19874925-19875042 NA NA NA NA NA chr17-33 19406505 19406771 172 - chr17:19406698-19406710 NA NA NA NA NA chr17-32 18920093 18920658 348 - chr17:18920348-18920402 NA NA NA NA NA chr17-31 18855328 18855473 135 - chr17:18855346-18855471 NA NA NA NA NA chr17-30 18776460 18776722 173 - chr17:18776564-18776600 NA NA NA NA NA chr17-29 17498515 17498924 187 - chr17:17498576-17498668 NA NA NA NA NA chr17-28 17196152 17196734 278 - chr17:17196435-17196443 NA NA NA NA NA chr17-27 17128979 17129351 202 - chr17:17129149-17129181 NA NA NA NA NA chr17-26 17026862 17027248 211 - chr17:17027095-17027131 NA NA NA NA NA chr17-25 16940995 16941198 132 - chr17:16941102-16941163 NA NA NA NA NA chr17-24 16005168 16005573 338 - chr17:16005193-16005464 NA NA NA NA NA chr17-2 1524408 1524681 139 - chr17:1524554-1524559 NA NA NA NA NA chr17-23 14948704 14948928 150 - chr17:14948762-14948838 NA NA NA NA NA chr17-22 14815793 14816059 159 - chr17:14816005-14816020 NA NA NA NA NA chr17-21 14734828 14735047 134 - chr17:14734934-14734983 NA NA NA NA NA chr17-20 14696495 14696919 272 - chr17:14696725-14696793 NA NA NA NA NA chr17-19 14002339 14002575 223 - chr17:14002348-14002532 NA NA NA NA NA chr17-18 12799873 12800167 154 - chr17:12800063-12800077 NA NA NA NA NA chr17-17 12569198 12569473 153 - chr17:12569269-12569300 NA NA NA NA NA chr17-16 11653277 11653708 277 - chr17:11653459-11653638 NA NA NA NA NA chr17-15 11625723 11625934 196 - chr17:11625747-11625928 NA NA NA NA NA chr17-14 10861157 10861508 196 - chr17:10861344-10861448 NA NA NA NA NA chr17-13 10661415 10661840 290 - chr17:10661529-10661698 NA NA NA NA NA chr17-12 10405633 10405852 147 - chr17:10405681-10405708 NA NA NA NA NA chr17-11 10241762 10242047 134 - chr17:10241856-10241877 NA NA NA NA NA chr16-31 9328710 9329047 186 - chr16:9328817-9328852 NA NA NA NA NA chr16-30 9233906 9234216 206 - chr16:9234138-9234216 NA NA NA NA NA chr16-232 89253934 89254231 207 - chr16:89254057-89254152 NA NA NA NA NA chr16-231 89082241 89082689 210 - chr16:89082514-89082554 NA NA NA NA NA chr16-29 8780778 8781046 191 - chr16:8780854-8780966 NA NA NA NA NA chr16-230 87654119 87654346 124 - chr16:87654250-87654327 NA NA NA NA NA chr16-229 87412536 87412667 116 - chr16:87412574-87412645 NA NA NA NA NA chr16-228 86752081 86752601 277 - chr16:86752375-86752409 NA NA NA NA NA chr16-227 86685634 86685819 157 - chr16:86685643-86685772 NA NA NA NA NA chr16-226 86655526 86655816 218 - chr16:86655573-86655719 NA NA NA NA NA chr16-225 85935839 85936045 133 - chr16:85935970-85936030 NA NA NA NA NA chr16-224 85548253 85548519 200 - chr16:85548323-85548465 NA NA NA NA NA chr16-223 85515055 85515353 154 - chr16:85515076-85515168 NA NA NA NA NA chr16-28 8509398 8509630 147 - chr16:8509540-8509602 NA NA NA NA NA chr16-222 84748616 84748944 165 - chr16:84748749-84748771 NA NA NA NA NA chr16-221 84726113 84726456 199 - chr16:84726311-84726318 NA NA NA NA NA chr16-220 83852319 83852548 113 - chr16:83852438-83852441 NA NA NA NA NA chr16-219 83765139 83765456 179 - chr16:83765386-83765427 NA NA NA NA NA chr16-218 83599120 83599469 176 - chr16:83599282-83599285 NA NA NA NA NA chr16-217 83455156 83455434 211 - chr16:83455185-83455253 NA NA NA NA NA chr16-216 83195976 83196556 295 - chr16:83196144-83196232 NA NA NA NA NA chr16-215 83191136 83191422 264 - chr16:83191214-83191412 NA NA NA NA NA chr16-214 83108208 83108435 120 - chr16:83108342-83108355 NA NA NA NA NA chr16-213 83073759 83074063 228 - chr16:83073877-83074029 NA NA NA NA NA chr16-27 8263468 8263765 206 - chr16:8263550-8263665 NA NA NA NA NA chr16-212 82530962 82531260 161 - chr16:82531097-82531121 NA NA NA NA NA chr16-211 82492625 82492922 215 - chr16:82492722-82492855 NA NA NA NA NA chr16-210 81379323 81379514 166 - chr16:81379367-81379458 NA NA NA NA NA chr16-209 81196113 81196348 129 - chr16:81196257-81196280 NA NA NA NA NA chr16-208 81052293 81052492 155 - chr16:81052460-81052489 NA NA NA NA NA chr16-207 81014976 81015265 138 - chr16:81015052-81015089 NA NA NA NA NA chr16-206 80907845 80908045 145 - chr16:80907875-80907965 NA NA NA NA NA chr16-26 8083365 8083767 223 - chr16:8083657-8083701 NA NA NA NA NA chr16-205 80530236 80530545 129 - chr16:80530381-80530450 NA NA NA NA NA chr16-204 80320375 80320550 132 - chr16:80320455-80320544 NA NA NA NA NA chr16-203 80254850 80255279 242 - chr16:80255056-80255149 NA NA NA NA NA chr16-202 80191366 80191589 202 - chr16:80191392-80191531 NA NA NA NA NA chr16-201 79959997 79960570 344 - chr16:79960274-79960389 NA NA NA NA NA chr16-200 79484279 79484613 185 - chr16:79484386-79484422 NA NA NA NA NA chr16-25 7946907 7947204 171 - chr16:7947018-7947063 NA NA NA NA NA chr16-199 79362733 79362929 116 - chr16:79362830-79362900 NA NA NA NA NA chr16-198 79128450 79128949 248 - chr16:79128668-79128687 NA NA NA NA NA chr16-197 78628234 78628645 225 - chr16:78628279-78628318 NA NA NA NA NA chr16-24 7852970 7853150 165 - chr16:7852997-7853139 NA NA NA NA NA chr16-196 77593128 77593338 151 - chr16:77593229-77593295 NA NA NA NA NA chr16-195 77509127 77509381 201 - chr16:77509194-77509342 NA NA NA NA NA chr16-194 77423523 77423823 247 - chr16:77423616-77423704 NA NA NA NA NA chr16-23 7715453 7715646 152 - chr16:7715467-7715524 NA NA NA NA NA chr16-193 76786986 76787241 187 - chr16:76787059-76787188 NA NA NA NA NA chr16-22 7676359 7676584 194 - chr16:7676407-7676508 NA NA NA NA NA chr16-192 76642214 76642372 135 - chr16:76642245-76642357 NA NA NA NA NA chr16-191 76630431 76630836 209 - chr16:76630635-76630648 NA NA NA NA NA chr16-190 76497172 76497400 164 - chr16:76497268-76497368 NA NA NA NA NA chr16-21 7647927 7648372 286 - chr16:7647937-7648170 NA NA NA NA NA chr16-189 76327296 76327631 259 - chr16:76327323-76327408 NA NA NA NA NA chr16-188 76153839 76154339 300 - chr16:76154026-76154100 NA NA NA NA NA chr16-187 76067964 76068197 128 - chr16:76068094-76068117 NA NA NA NA NA chr16-20 7602027 7602282 166 - chr16:7602139-7602262 NA NA NA NA NA chr16-186 75514744 75514929 141 - chr16:75514778-75514855 NA NA NA NA NA chr16-185 75153236 75153606 272 - chr16:75153278-75153340 NA NA NA NA NA chr16-184 75096833 75097006 122 - chr16:75096865-75096898 NA NA NA NA NA chr16-183 75013465 75013878 254 - chr16:75013663-75013732 NA NA NA NA NA chr16-182 74364511 74364795 188 - chr16:74364690-74364732 NA NA NA NA NA chr16-181 74028127 74028475 283 - chr16:74028161-74028379 NA NA NA NA NA chr16-180 73618117 73618399 217 - chr16:73618157-73618309 NA NA NA NA NA chr16-179 73583961 73584298 234 - chr16:73584115-73584246 NA NA NA NA NA chr16-178 73029520 73029904 183 - chr16:73029638-73029754 NA NA NA NA NA chr16-177 72873831 72874078 117 - chr16:72873975-72873990 NA NA NA NA NA chr16-176 72622417 72622787 190 - chr16:72622576-72622706 NA NA NA NA NA chr16-175 72053307 72053599 171 - chr16:72053456-72053506 NA NA NA NA NA chr16-174 71943184 71943503 212 - chr16:71943228-71943375 NA NA NA NA NA chr16-173 71642902 71643278 207 - chr16:71643038-71643098 NA NA NA NA NA chr16-172 71394322 71394616 235 - chr16:71394416-71394592 NA NA NA NA NA chr16-171 71276336 71276844 240 - chr16:71276534-71276542 NA NA NA NA NA chr16-170 70433038 70433263 183 - chr16:70433074-70433205 NA NA NA NA NA chr16-169 69901776 69902033 154 - chr16:69901901-69901952 NA NA NA NA NA chr16-168 69736668 69737034 228 - chr16:69736835-69736983 NA NA NA NA NA chr16-167 69649292 69649662 295 - chr16:69649347-69649567 NA NA NA NA NA chr16-166 69504053 69504595 339 - chr16:69504370-69504506 NA NA NA NA NA chr16-165 69433791 69434176 202 - chr16:69434060-69434079 NA NA NA NA NA chr16-164 69381705 69381941 170 - chr16:69381776-69381890 NA NA NA NA NA chr16-163 69349009 69349276 152 - chr16:69349151-69349188 NA NA NA NA NA chr16-162 69229853 69230177 166 - chr16:69229861-69229969 NA NA NA NA NA chr16-161 69136177 69136410 158 - chr16:69136263-69136396 NA NA NA NA NA chr16-160 69135141 69135358 191 - chr16:69135181-69135346 NA NA NA NA NA chr16-159 68417990 68418294 201 - chr16:68418077-68418254 NA NA NA NA NA chr16-19 6815913 6816330 217 - chr16:6815989-6816006 NA NA NA NA NA chr16-158 68132915 68133159 130 - chr16:68132951-68132967 NA NA NA NA NA chr16-18 6790744 6790959 162 - chr16:6790764-6790873 NA NA NA NA NA chr16-157 67610890 67611213 167 - chr16:67610994-67611005 NA NA NA NA NA chr16-156 67469664 67469996 218 - chr16:67469835-67469939 NA NA NA NA NA chr16-155 66561093 66561478 157 - chr16:66561304-66561385 NA NA NA NA NA chr16-154 66430551 66430779 188 - chr16:66430567-66430635 NA NA NA NA NA chr16-153 66368143 66368401 238 - chr16:66368151-66368329 NA NA NA NA NA chr16-152 66179264 66179437 125 - chr16:66179360-66179437 NA NA NA NA NA chr16-151 66114399 66114691 123 - chr16:66114624-66114665 NA NA NA NA NA chr16-150 66066092 66066382 240 - chr16:66066267-66066357 NA NA NA NA NA chr16-149 65267802 65268214 246 - chr16:65267925-65267959 NA NA NA NA NA chr16-148 65164389 65164689 177 - chr16:65164625-65164679 NA NA NA NA NA chr16-147 65025648 65025931 191 - chr16:65025734-65025821 NA NA NA NA NA chr16-146 64994245 64994452 178 - chr16:64994250-64994399 NA NA NA NA NA chr16-145 64567932 64568165 154 - chr16:64567996-64568071 NA NA NA NA NA chr16-144 64366204 64366584 207 - chr16:64366221-64366359 NA NA NA NA NA chr16-143 64166694 64167246 216 - chr16:64166694-64166798 NA NA NA NA NA chr16-142 63791954 63792211 203 - chr16:63791972-63792145 NA NA NA NA NA chr16-141 63206744 63207034 234 - chr16:63206859-63206925 NA NA NA NA NA chr16-140 63092930 63093380 267 - chr16:63093168-63093362 NA NA NA NA NA chr16-139 62913682 62914449 390 - chr16:62914087-62914100 NA NA NA NA NA chr16-138 62888561 62888816 157 - chr16:62888623-62888682 NA NA NA NA NA chr16-137 62750580 62750827 207 - chr16:62750640-62750807 NA NA NA NA NA chr16-17 6258221 6258637 233 - chr16:6258367-6258539 NA NA NA NA NA chr16-16 6256988 6257227 128 - chr16:6257054-6257071 NA NA NA NA NA chr16-136 62555681 62556153 255 - chr16:62555997-62556035 NA NA NA NA NA chr16-135 62301744 62302164 233 - chr16:62301966-62302082 NA NA NA NA NA chr16-134 62275327 62275595 143 - chr16:62275468-62275486 NA NA NA NA NA chr16-133 62133999 62134267 128 - chr16:62134001-62134081 NA NA NA NA NA chr16-132 61290385 61290797 258 - chr16:61290529-61290792 NA NA NA NA NA chr16-131 60843931 60844291 220 - chr16:60844034-60844114 NA NA NA NA NA chr16-130 60203969 60204194 170 - chr16:60204138-60204177 NA NA NA NA NA chr16-129 59734187 59734500 170 - chr16:59734382-59734409 NA NA NA NA NA chr16-128 59510697 59510972 157 - chr16:59510720-59510759 NA NA NA NA NA chr16-127 58794733 58794967 195 - chr16:58794742-58794924 NA NA NA NA NA chr16-15 5859504 5859702 139 - chr16:5859620-5859662 NA NA NA NA NA chr16-126 58585899 58586216 158 - chr16:58585975-58585992 NA NA NA NA NA chr16-14 5843002 5843243 141 - chr16:5843132-5843173 NA NA NA NA NA chr16-125 58122120 58122466 235 - chr16:58122188-58122312 NA NA NA NA NA chr16-124 57595324 57595537 181 - chr16:57595362-57595521 NA NA NA NA NA chr16-123 57158634 57158976 197 - chr16:57158785-57158849 NA NA NA NA NA chr16-122 56715808 56716118 184 - chr16:56715979-56716037 NA NA NA NA NA chr16-121 56578305 56578649 281 - chr16:56578355-56578573 NA NA NA NA NA chr16-120 56286135 56286366 126 - chr16:56286262-56286283 NA NA NA NA NA chr16-119 55289592 55289937 186 - chr16:55289680-55289707 NA NA NA NA NA chr16-118 55222423 55222687 257 - chr16:55222424-55222662 NA NA NA NA NA chr16-117 55126765 55127001 137 - chr16:55126840-55126944 NA NA NA NA NA chr16-116 55095761 55096119 229 - chr16:55095833-55096019 NA NA NA NA NA chr16-115 54779308 54779522 115 - chr16:54779381-54779463 NA NA NA NA NA chr16-114 54729008 54729305 124 - chr16:54729070-54729095 NA NA NA NA NA chr16-113 54390386 54390783 238 - chr16:54390551-54390683 NA NA NA NA NA chr16-112 53616420 53616649 150 - chr16:53616435-53616506 NA NA NA NA NA chr16-111 53614135 53614391 180 - chr16:53614258-53614362 NA NA NA NA NA chr16-110 52950730 52951242 213 - chr16:52951085-52951111 NA NA NA NA NA chr16-109 52721886 52722189 161 - chr16:52722022-52722045 NA NA NA NA NA chr16-108 52609688 52609945 187 - chr16:52609802-52609841 NA NA NA NA NA chr16-107 52301818 52302272 228 - chr16:52302083-52302141 NA NA NA NA NA chr16-106 51874830 51875098 192 - chr16:51874966-51875082 NA NA NA NA NA chr16-105 51823855 51824213 289 - chr16:51823910-51824130 NA NA NA NA NA chr16-104 51819571 51819833 195 - chr16:51819644-51819768 NA NA NA NA NA chr16-103 51683596 51683829 172 - chr16:51683680-51683791 NA NA NA NA NA chr16-102 51680573 51680851 203 - chr16:51680719-51680847 NA NA NA NA NA chr16-101 51143310 51143605 162 - chr16:51143434-51143463 NA NA NA NA NA chr16-100 50452797 50453151 200 - chr16:50452890-50452936 NA NA NA NA NA chr16-99 50418449 50418685 191 - chr16:50418524-50418580 NA NA NA NA NA chr16-98 50157609 50157902 237 - chr16:50157638-50157765 NA NA NA NA NA chr16-97 50155338 50155563 117 - chr16:50155469-50155478 NA NA NA NA NA chr16-96 49783873 49784236 212 - chr16:49784056-49784117 NA NA NA NA NA chr16-95 49468317 49468589 142 - chr16:49468499-49468511 NA NA NA NA NA chr16-94 49465975 49466196 173 - chr16:49466004-49466091 NA NA NA NA NA chr16-93 48678544 48678795 138 - chr16:48678576-48678651 NA NA NA NA NA chr16-92 48426605 48426981 238 - chr16:48426714-48426851 NA NA NA NA NA chr16-91 48046529 48046889 181 - chr16:48046665-48046667 NA NA NA NA NA chr16-90 47688827 47689241 250 - chr16:47688878-47688964 NA NA NA NA NA chr16-89 47356287 47356722 223 - chr16:47356497-47356508 NA NA NA NA NA chr16-88 47345861 47346142 155 - chr16:47346024-47346127 NA NA NA NA NA chr16-87 47117227 47117566 186 - chr16:47117364-47117365 NA NA NA NA NA chr16-13 4705441 4705665 187 - chr16:4705564-4705640 NA NA NA NA NA chr16-86 46806846 46807019 134 - chr16:46806922-46807017 NA NA NA NA NA chr16-85 46732799 46733009 136 - chr16:46732906-46732968 NA NA NA NA NA chr16-12 4160835 4161285 200 - chr16:4160890-4160908 NA NA NA NA NA chr16-11 3931867 3932032 155 - chr16:3931907-3932032 NA NA NA NA NA chr16-10 3754853 3755140 263 - chr16:3754855-3755094 NA NA NA NA NA chr16-9 3741093 3741367 151 - chr16:3741245-3741355 NA NA NA NA NA chr16-8 3584557 3584794 166 - chr16:3584587-3584600 NA NA NA NA NA chr16-84 35586507 35587014 258 - chr16:35586748-35586757 NA NA NA NA NA chr16-83 35267096 35267290 146 - chr16:35267165-35267263 NA NA NA NA NA chr16-7 3507333 3507616 187 - chr16:3507426-3507517 NA NA NA NA NA chr16-82 31671014 31671251 177 - chr16:31671030-31671059 NA NA NA NA NA chr16-81 31668609 31668938 213 - chr16:31668738-31668835 NA NA NA NA NA chr16-80 30842843 30843230 209 - chr16:30842850-30842933 NA NA NA NA NA chr16-79 30556512 30556948 244 - chr16:30556527-30556697 NA NA NA NA NA chr16-78 30159437 30159875 224 - chr16:30159672-30159682 NA NA NA NA NA chr16-77 29747474 29747926 339 - chr16:29747523-29747621 NA NA NA NA NA chr16-76 27308960 27309346 235 - chr16:27308998-27309082 NA NA NA NA NA chr16-75 26651918 26652229 172 - chr16:26651980-26652013 NA NA NA NA NA chr16-74 26426143 26426316 162 - chr16:26426170-26426299 NA NA NA NA NA chr16-73 25594457 25594673 147 - chr16:25594582-25594660 NA NA NA NA NA chr16-72 25591516 25591708 169 - chr16:25591540-25591640 NA NA NA NA NA chr16-71 25371838 25372307 364 - chr16:25371938-25372197 NA NA NA NA NA chr16-70 25255179 25255394 180 - chr16:25255217-25255368 NA NA NA NA NA chr16-69 25233138 25233354 199 - chr16:25233165-25233313 NA NA NA NA NA chr16-68 25092310 25092712 208 - chr16:25092452-25092466 NA NA NA NA NA chr16-67 24947479 24947836 156 - chr16:24947512-24947601 NA NA NA NA NA chr16-66 24754928 24755271 321 - chr16:24754959-24755261 NA NA NA NA NA chr16-65 24558658 24558888 143 - chr16:24558727-24558747 NA NA NA NA NA chr16-64 24427484 24427659 139 - chr16:24427498-24427601 NA NA NA NA NA chr16-63 24244023 24244170 118 - chr16:24244028-24244133 NA NA NA NA NA chr16-62 23662877 23663181 128 - chr16:23662978-23662980 NA NA NA NA NA chr16-6 2316586 2316884 183 - chr16:2316803-2316871 NA NA NA NA NA chr16-61 23040629 23040959 245 - chr16:23040755-23040915 NA NA NA NA NA chr16-60 22639509 22639740 142 - chr16:22639653-22639706 NA NA NA NA NA chr16-59 22385776 22386036 155 - chr16:22385853-22385903 NA NA NA NA NA chr16-5 2221337 2221676 207 - chr16:2221517-2221621 NA NA NA NA NA chr16-4 2182088 2182484 200 - chr16:2182214-2182218 NA NA NA NA NA chr16-58 21184003 21184246 137 - chr16:21184063-21184094 NA NA NA NA NA chr16 205067 205525 241 - chr16:205349-205503 NA NA NA NA NA chr16-57 20162115 20162586 274 - chr16:20162303-20162362 NA NA NA NA NA chr16-56 18789518 18789814 156 - chr16:18789708-18789724 NA NA NA NA NA chr16-55 17827975 17828301 242 - chr16:17828140-17828298 NA NA NA NA NA chr16-54 17226256 17226735 200 - chr16:17226590-17226621 NA NA NA NA NA chr16-3 1721975 1722227 173 - chr16:1722133-1722227 NA NA NA NA NA chr16-53 14375421 14375604 120 - chr16:14375501-14375592 NA NA NA NA NA chr16-52 14094205 14094688 357 - chr16:14094344-14094601 NA NA NA NA NA chr16-51 14066636 14067169 274 - chr16:14066809-14066824 NA NA NA NA NA chr16-50 13972659 13972797 120 - chr16:13972661-13972775 NA NA NA NA NA chr16-49 13949006 13949342 288 - chr16:13949052-13949292 NA NA NA NA NA chr16-48 13843254 13843460 152 - chr16:13843290-13843424 NA NA NA NA NA chr16-47 13613430 13613694 138 - chr16:13613500-13613596 NA NA NA NA NA chr16-46 13557900 13558281 248 - chr16:13558009-13558124 NA NA NA NA NA chr16-45 13307019 13307244 149 - chr16:13307125-13307198 NA NA NA NA NA chr16-2 1328057 1328671 279 - chr16:1328437-1328471 NA NA NA NA NA chr16-44 13015190 13015412 129 - chr16:13015255-13015291 NA NA NA NA NA chr16-43 12895382 12895618 123 - chr16:12895495-12895505 NA NA NA NA NA chr16-42 12815710 12815950 193 - chr16:12815801-12815947 NA NA NA NA NA chr16-41 12649907 12650373 200 - chr16:12650079-12650111 NA NA NA NA NA chr16-40 12632715 12632975 124 - chr16:12632825-12632855 NA NA NA NA NA chr16-39 12502033 12502415 124 - chr16:12502166-12502204 NA NA NA NA NA chr16-38 12295948 12296205 204 - chr16:12296023-12296174 NA NA NA NA NA chr16-37 11862488 11862844 239 - chr16:11862551-11862565 NA NA NA NA NA chr16-36 11836557 11837129 213 - chr16:11836992-11836998 NA NA NA NA NA chr16-35 11581480 11581795 135 - chr16:11581546-11581613 NA NA NA NA NA chr16-34 10086066 10086267 135 - chr16:10086081-10086184 NA NA NA NA NA chr16-33 10047372 10047637 176 - chr16:10047435-10047522 NA NA NA NA NA chr16-32 10016035 10016395 194 - chr16:10016240-10016330 NA NA NA NA NA chr15-263 99686858 99687036 165 - chr15:99686884-99687036 NA NA NA NA NA chr15-262 99325699 99325945 221 - chr15:99325750-99325896 NA NA NA NA NA chr15-261 99301441 99301611 144 - chr15:99301509-99301575 NA NA NA NA NA chr15-260 99162391 99162599 115 - chr15:99162542-99162564 NA NA NA NA NA chr15-259 98961749 98962033 184 - chr15:98961923-98962007 NA NA NA NA NA chr15-258 98594630 98594982 168 - chr15:98594834-98594845 NA NA NA NA NA chr15-257 98304843 98305165 259 - chr15:98304867-98304937 NA NA NA NA NA chr15-256 97667506 97668020 342 - chr15:97667609-97667676 NA NA NA NA NA chr15-255 97445199 97445582 205 - chr15:97445399-97445426 NA NA NA NA NA chr15-254 97190879 97191062 151 - chr15:97190908-97191029 NA NA NA NA NA chr15-253 96889892 96890360 334 - chr15:96890116-96890316 NA NA NA NA NA chr15-252 96498195 96498627 230 - chr15:96498230-96498258 NA NA NA NA NA chr15-251 96442828 96443043 146 - chr15:96442944-96443021 NA NA NA NA NA chr15-250 96424940 96425222 217 - chr15:96425016-96425190 NA NA NA NA NA chr15-249 96197815 96198021 141 - chr15:96197875-96197951 NA NA NA NA NA chr15-248 95947289 95947541 186 - chr15:95947345-95947445 NA NA NA NA NA chr15-247 95833676 95834095 254 - chr15:95833936-95834025 NA NA NA NA NA chr15-246 95096549 95096920 242 - chr15:95096660-95096737 NA NA NA NA NA chr15-245 94802483 94802716 201 - chr15:94802544-94802713 NA NA NA NA NA chr15-244 94664114 94664357 182 - chr15:94664130-94664281 NA NA NA NA NA chr15-243 94125821 94126252 266 - chr15:94125969-94126011 NA NA NA NA NA chr15-242 94034774 94035001 133 - chr15:94034855-94034894 NA NA NA NA NA chr15-241 93964871 93965243 152 - chr15:93964914-93964964 NA NA NA NA NA chr15-240 93953729 93954285 215 - chr15:93953841-93953850 NA NA NA NA NA chr15-239 93899137 93899472 262 - chr15:93899364-93899407 NA NA NA NA NA chr15-238 93839545 93839857 167 - chr15:93839781-93839803 NA NA NA NA NA chr15-237 93760194 93760669 296 - chr15:93760363-93760460 NA NA NA NA NA chr15-236 93494550 93494882 235 - chr15:93494674-93494812 NA NA NA NA NA chr15-235 93388882 93389190 222 - chr15:93389010-93389146 NA NA NA NA NA chr15-234 92964746 92965087 279 - chr15:92964746-92965014 NA NA NA NA NA chr15-233 92952807 92953072 160 - chr15:92952872-92952997 NA NA NA NA NA chr15-232 92619971 92620228 161 - chr15:92620121-92620186 NA NA NA NA NA chr15-231 91646243 91646495 209 - chr15:91646329-91646495 NA NA NA NA NA chr15-230 91518611 91518984 224 - chr15:91518796-91518871 NA NA NA NA NA chr15-229 91338357 91338531 126 - chr15:91338418-91338496 NA NA NA NA NA chr15-228 91152814 91153168 178 - chr15:91153062-91153064 NA NA NA NA NA chr15-227 90979967 90980208 198 - chr15:90980094-90980193 NA NA NA NA NA chr15-226 90909348 90909808 252 - chr15:90909564-90909608 NA NA NA NA NA chr15-225 89671891 89672133 207 - chr15:89672014-89672116 NA NA NA NA NA chr15-224 89626682 89626970 135 - chr15:89626715-89626777 NA NA NA NA NA chr15-223 89604412 89604677 141 - chr15:89604567-89604584 NA NA NA NA NA chr15-222 88453702 88454089 291 - chr15:88453762-88453975 NA NA NA NA NA chr15-221 88393803 88394049 132 - chr15:88393929-88393939 NA NA NA NA NA chr15-220 88171401 88171750 186 - chr15:88171614-88171680 NA NA NA NA NA chr15-219 88009039 88009221 124 - chr15:88009044-88009110 NA NA NA NA NA chr15-218 87778598 87778821 150 - chr15:87778668-87778739 NA NA NA NA NA chr15-217 87369166 87369794 309 - chr15:87369540-87369635 NA NA NA NA NA chr15-216 87174721 87175072 180 - chr15:87174846-87174855 NA NA NA NA NA chr15-215 86799534 86799716 162 - chr15:86799614-86799716 NA NA NA NA NA chr15-214 86502309 86502521 179 - chr15:86502323-86502469 NA NA NA NA NA chr15-213 86357575 86357780 148 - chr15:86357641-86357770 NA NA NA NA NA chr15-212 86105120 86105380 149 - chr15:86105267-86105305 NA NA NA NA NA chr15-211 86099915 86100320 208 - chr15:86100196-86100207 NA NA NA NA NA chr15-210 85977535 85977692 117 - chr15:85977548-85977625 NA NA NA NA NA chr15-209 85808771 85808950 165 - chr15:85808778-85808915 NA NA NA NA NA chr15-208 85732282 85732486 138 - chr15:85732332-85732404 NA NA NA NA NA chr15-207 85404943 85405243 188 - chr15:85405030-85405106 NA NA NA NA NA chr15-206 85060393 85060703 149 - chr15:85060572-85060596 NA NA NA NA NA chr15-205 84826595 84826923 284 - chr15:84826632-84826784 NA NA NA NA NA chr15-204 83907326 83907664 223 - chr15:83907333-83907388 NA NA NA NA NA chr15-203 83786916 83787162 187 - chr15:83786971-83787099 NA NA NA NA NA chr15-202 83587653 83588043 142 - chr15:83587673-83587719 NA NA NA NA NA chr15-201 83401706 83401992 179 - chr15:83401882-83401954 NA NA NA NA NA chr15-200 83312480 83312859 195 - chr15:83312609-83312620 NA NA NA NA NA chr15-199 82742563 82742765 190 - chr15:82742563-82742749 NA NA NA NA NA chr15-198 82161764 82162032 223 - chr15:82161783-82161909 NA NA NA NA NA chr15-197 81941095 81941355 163 - chr15:81941139-81941205 NA NA NA NA NA chr15-196 81686434 81686574 119 - chr15:81686501-81686557 NA NA NA NA NA chr15-195 81579533 81579723 148 - chr15:81579573-81579679 NA NA NA NA NA chr15-194 81205105 81205605 344 - chr15:81205359-81205547 NA NA NA NA NA chr15-193 81201060 81201387 180 - chr15:81201249-81201282 NA NA NA NA NA chr15-192 80671554 80671867 141 - chr15:80671772-80671783 NA NA NA NA NA chr15-191 80447611 80447937 218 - chr15:80447643-80447759 NA NA NA NA NA chr15-190 80309398 80309863 187 - chr15:80309773-80309831 NA NA NA NA NA chr15-189 80102126 80102305 127 - chr15:80102132-80102207 NA NA NA NA NA chr15-188 79784657 79784963 234 - chr15:79784713-79784875 NA NA NA NA NA chr15-187 79621931 79622251 145 - chr15:79622178-79622237 NA NA NA NA NA chr15-186 79532660 79533190 297 - chr15:79532800-79532864 NA NA NA NA NA chr15-185 79523411 79523547 114 - chr15:79523452-79523544 NA NA NA NA NA chr15-184 79270249 79270573 238 - chr15:79270304-79270522 NA NA NA NA NA chr15-183 78585913 78586316 226 - chr15:78586036-78586121 NA NA NA NA NA chr15-182 77723381 77723503 120 - chr15:77723386-77723500 NA NA NA NA NA chr15-181 76991415 76991701 174 - chr15:76991556-76991618 NA NA NA NA NA chr15-180 76906585 76906775 117 - chr15:76906658-76906702 NA NA NA NA NA chr15-179 76240731 76241042 170 - chr15:76240974-76241003 NA NA NA NA NA chr15-178 76062423 76062752 122 - chr15:76062697-76062750 NA NA NA NA NA chr15-177 75844473 75844989 198 - chr15:75844873-75844917 NA NA NA NA NA chr15-176 75448971 75449117 122 - chr15:75449058-75449108 NA NA NA NA NA chr15-175 75243981 75244208 117 - chr15:75244115-75244170 NA NA NA NA NA chr15-174 75051134 75051353 143 - chr15:75051258-75051325 NA NA NA NA NA chr15-173 74838196 74838550 238 - chr15:74838337-74838459 NA NA NA NA NA chr15-172 74345674 74345940 160 - chr15:74345763-74345817 NA NA NA NA NA chr15-171 74215419 74215668 140 - chr15:74215477-74215542 NA NA NA NA NA chr15-170 73651405 73651727 208 - chr15:73651428-73651598 NA NA NA NA NA chr15-169 73547213 73547476 141 - chr15:73547401-73547420 NA NA NA NA NA chr15-168 72770010 72770462 243 - chr15:72770242-72770276 NA NA NA NA NA chr15-167 72707917 72708131 139 - chr15:72707939-72708003 NA NA NA NA NA chr15-166 72556670 72557000 208 - chr15:72556786-72556872 NA NA NA NA NA chr15-165 72293321 72293833 327 - chr15:72293468-72293610 NA NA NA NA NA chr15-164 72229491 72229671 124 - chr15:72229564-72229632 NA NA NA NA NA chr15-163 71902152 71902306 122 - chr15:71902166-71902256 NA NA NA NA NA chr15-162 70818307 70818563 152 - chr15:70818416-70818464 NA NA NA NA NA chr15-161 70699818 70700190 247 - chr15:70699934-70700105 NA NA NA NA NA chr15-160 70627876 70628201 170 - chr15:70628084-70628099 NA NA NA NA NA chr15-159 70626230 70626488 165 - chr15:70626308-70626380 NA NA NA NA NA chr15-158 70516262 70516811 255 - chr15:70516565-70516588 NA NA NA NA NA chr15-157 70473414 70473708 251 - chr15:70473551-70473673 NA NA NA NA NA chr15-156 70360768 70361180 233 - chr15:70360841-70361088 NA NA NA NA NA chr15-155 70184021 70184612 300 - chr15:70184294-70184367 NA NA NA NA NA chr15-154 69891723 69892204 347 - chr15:69891840-69891967 NA NA NA NA NA chr15-153 69765188 69765358 120 - chr15:69765239-69765311 NA NA NA NA NA chr15-152 69616590 69616910 187 - chr15:69616721-69616771 NA NA NA NA NA chr15-151 69473568 69473961 266 - chr15:69473601-69473740 NA NA NA NA NA chr15-150 69293429 69293677 125 - chr15:69293546-69293548 NA NA NA NA NA chr15-149 68925935 68926243 236 - chr15:68926088-68926206 NA NA NA NA NA chr15-148 68506320 68506578 189 - chr15:68506408-68506528 NA NA NA NA NA chr15-147 68476994 68477387 170 - chr15:68477256-68477281 NA NA NA NA NA chr15-146 68189964 68190431 236 - chr15:68190082-68190087 NA NA NA NA NA chr15-145 68114445 68114800 194 - chr15:68114660-68114755 NA NA NA NA NA chr15-144 67971192 67971330 114 - chr15:67971235-67971277 NA NA NA NA NA chr15-143 67751007 67751307 170 - chr15:67751169-67751209 NA NA NA NA NA chr15-142 67689881 67690051 113 - chr15:67689901-67689957 NA NA NA NA NA chr15-141 67351554 67352288 296 - chr15:67351855-67351997 NA NA NA NA NA chr15-140 67321175 67321402 192 - chr15:67321177-67321334 NA NA NA NA NA chr15-139 67236311 67236790 311 - chr15:67236610-67236672 NA NA NA NA NA chr15-138 66924358 66924737 154 - chr15:66924487-66924566 NA NA NA NA NA chr15-137 66884164 66884621 166 - chr15:66884224-66884253 NA NA NA NA NA chr15-136 66761341 66761731 245 - chr15:66761510-66761576 NA NA NA NA NA chr15-135 66637748 66637900 150 - chr15:66637750-66637898 NA NA NA NA NA chr15-134 66324499 66324896 211 - chr15:66324693-66324718 NA NA NA NA NA chr15-133 65757294 65757553 169 - chr15:65757352-65757367 NA NA NA NA NA chr15-132 65660653 65661053 225 - chr15:65660823-65660866 NA NA NA NA NA chr15-131 65593835 65594141 206 - chr15:65593999-65594105 NA NA NA NA NA chr15-130 65277104 65277368 209 - chr15:65277181-65277335 NA NA NA NA NA chr15-129 64994616 64994986 259 - chr15:64994677-64994725 NA NA NA NA NA chr15-128 64732521 64732858 228 - chr15:64732565-64732684 NA NA NA NA NA chr15-127 64655677 64656069 200 - chr15:64655933-64656069 NA NA NA NA NA chr15-126 64608850 64609070 161 - chr15:64608940-64609042 NA NA NA NA NA chr15-125 64453581 64454136 334 - chr15:64453598-64453783 NA NA NA NA NA chr15-124 64419760 64419989 201 - chr15:64419771-64419944 NA NA NA NA NA chr15-123 64252748 64253100 319 - chr15:64252784-64253004 NA NA NA NA NA chr15-122 64209391 64209607 193 - chr15:64209393-64209563 NA NA NA NA NA chr15-121 64035596 64035830 215 - chr15:64035669-64035827 NA NA NA NA NA chr15-120 64029507 64029793 206 - chr15:64029649-64029775 NA NA NA NA NA chr15-119 63978539 63978722 161 - chr15:63978576-63978705 NA NA NA NA NA chr15-118 63945464 63946075 375 - chr15:63945692-63945755 NA NA NA NA NA chr15-117 63854639 63855266 360 - chr15:63854759-63855160 NA NA NA NA NA chr15-116 63707491 63707685 162 - chr15:63707534-63707664 NA NA NA NA NA chr15-115 63706362 63706610 166 - chr15:63706464-63706548 NA NA NA NA NA chr15-114 63536589 63536945 211 - chr15:63536615-63536681 NA NA NA NA NA chr15-113 63373552 63373825 137 - chr15:63373695-63373710 NA NA NA NA NA chr15-112 63061879 63062119 237 - chr15:63061880-63062108 NA NA NA NA NA chr15-111 62852465 62852754 172 - chr15:62852501-62852556 NA NA NA NA NA chr15-110 62538376 62538930 314 - chr15:62538376-62538613 NA NA NA NA NA chr15-109 62513763 62514042 171 - chr15:62513979-62514042 NA NA NA NA NA chr15-108 62450482 62450922 261 - chr15:62450690-62450830 NA NA NA NA NA chr15-107 62300745 62300945 128 - chr15:62300810-62300866 NA NA NA NA NA chr15-106 62108887 62109169 228 - chr15:62108948-62109158 NA NA NA NA NA chr15-105 62028913 62029273 271 - chr15:62028986-62029243 NA NA NA NA NA chr15-104 61877586 61877862 237 - chr15:61877661-61877781 NA NA NA NA NA chr15-103 61611568 61611834 182 - chr15:61611636-61611702 NA NA NA NA NA chr15-102 61369704 61369895 160 - chr15:61369733-61369858 NA NA NA NA NA chr15-101 61263680 61263927 201 - chr15:61263813-61263876 NA NA NA NA NA chr15-100 60980476 60980762 155 - chr15:60980523-60980547 NA NA NA NA NA chr15-99 60942527 60942822 238 - chr15:60942549-60942730 NA NA NA NA NA chr15-98 60920304 60920799 276 - chr15:60920610-60920618 NA NA NA NA NA chr15-97 60753542 60754078 194 - chr15:60753807-60753887 NA NA NA NA NA chr15-96 60630572 60630809 168 - chr15:60630593-60630692 NA NA NA NA NA chr15-95 60517809 60518476 380 - chr15:60518090-60518199 NA NA NA NA NA chr15-94 60511392 60511700 266 - chr15:60511475-60511615 NA NA NA NA NA chr15-93 59980802 59981125 242 - chr15:59980869-59981002 NA NA NA NA NA chr15-92 59790463 59790740 171 - chr15:59790642-59790707 NA NA NA NA NA chr15-91 59691667 59691896 132 - chr15:59691750-59691757 NA NA NA NA NA chr15-90 59501693 59501885 114 - chr15:59501752-59501788 NA NA NA NA NA chr15-89 59416746 59417301 282 - chr15:59416898-59416907 NA NA NA NA NA chr15-88 59164655 59164879 134 - chr15:59164774-59164876 NA NA NA NA NA chr15-87 59124177 59124349 113 - chr15:59124228-59124282 NA NA NA NA NA chr15-86 58907725 58908286 204 - chr15:58907774-58907859 NA NA NA NA NA chr15-85 58742271 58742664 246 - chr15:58742377-58742476 NA NA NA NA NA chr15-84 58616634 58617162 277 - chr15:58616818-58616844 NA NA NA NA NA chr15-83 58590985 58591212 142 - chr15:58591050-58591067 NA NA NA NA NA chr15-82 58583489 58583808 169 - chr15:58583681-58583700 NA NA NA NA NA chr15-81 58498913 58499214 115 - chr15:58499166-58499182 NA NA NA NA NA chr15-80 58382772 58383140 219 - chr15:58382853-58382923 NA NA NA NA NA chr15-79 58318913 58319151 156 - chr15:58319058-58319132 NA NA NA NA NA chr15-78 57937533 57937758 165 - chr15:57937584-57937689 NA NA NA NA NA chr15-77 57937156 57937406 167 - chr15:57937197-57937281 NA NA NA NA NA chr15-76 57736338 57737102 411 - chr15:57736531-57736583 NA NA NA NA NA chr15-75 57546144 57546359 129 - chr15:57546230-57546273 NA NA NA NA NA chr15-74 57505601 57505792 128 - chr15:57505679-57505734 NA NA NA NA NA chr15-73 57354046 57354283 158 - chr15:57354070-57354149 NA NA NA NA NA chr15-72 57243662 57244197 354 - chr15:57243851-57244015 NA NA NA NA NA chr15-71 57218337 57218598 188 - chr15:57218437-57218552 NA NA NA NA NA chr15-70 57171898 57172085 176 - chr15:57171914-57172079 NA NA NA NA NA chr15-69 57126349 57126505 129 - chr15:57126435-57126483 NA NA NA NA NA chr15-68 57063951 57064240 205 - chr15:57064106-57064227 NA NA NA NA NA chr15-67 56496583 56496805 209 - chr15:56496602-56496798 NA NA NA NA NA chr15-66 56262243 56262529 173 - chr15:56262430-56262472 NA NA NA NA NA chr15-65 55958926 55959160 142 - chr15:55959087-55959137 NA NA NA NA NA chr15-64 54507294 54507498 167 - chr15:54507313-54507407 NA NA NA NA NA chr15-63 54114834 54115030 142 - chr15:54114894-54114978 NA NA NA NA NA chr15-62 54018399 54018685 145 - chr15:54018537-54018541 NA NA NA NA NA chr15-61 53314094 53314591 176 - chr15:53314182-53314251 NA NA NA NA NA chr15-60 53267909 53268129 132 - chr15:53268013-53268089 NA NA NA NA NA chr15-59 52602307 52602557 171 - chr15:52602455-52602547 NA NA NA NA NA chr15-58 52480293 52480504 181 - chr15:52480408-52480499 NA NA NA NA NA chr15-57 52326026 52326272 211 - chr15:52326145-52326251 NA NA NA NA NA chr15-56 51732346 51732552 178 - chr15:51732378-51732528 NA NA NA NA NA chr15-55 50391267 50391501 200 - chr15:50391322-50391474 NA NA NA NA NA chr15-54 50300720 50301035 191 - chr15:50300911-50300978 NA NA NA NA NA chr15-53 49656127 49656366 152 - chr15:49656207-49656272 NA NA NA NA NA chr15-52 49371108 49371270 138 - chr15:49371174-49371260 NA NA NA NA NA chr15-51 49281622 49281867 154 - chr15:49281804-49281867 NA NA NA NA NA chr15-50 49120729 49121087 217 - chr15:49120917-49121087 NA NA NA NA NA chr15-49 46935429 46935644 162 - chr15:46935487-46935596 NA NA NA NA NA chr15-48 46227092 46227405 172 - chr15:46227240-46227285 NA NA NA NA NA chr15-47 45050025 45050316 243 - chr15:45050029-45050256 NA NA NA NA NA chr15-46 44502160 44502483 179 - chr15:44502277-44502312 NA NA NA NA NA chr15-45 44381252 44381749 324 - chr15:44381403-44381522 NA NA NA NA NA chr15-44 44168512 44168774 113 - chr15:44168585-44168616 NA NA NA NA NA chr15-43 44075732 44075952 115 - chr15:44075812-44075844 NA NA NA NA NA chr15-42 43987380 43987706 222 - chr15:43987429-43987547 NA NA NA NA NA chr15-41 43478831 43479175 202 - chr15:43478955-43479027 NA NA NA NA NA chr15-40 42321646 42322017 281 - chr15:42321736-42321927 NA NA NA NA NA chr15-39 41395180 41395599 334 - chr15:41395319-41395568 NA NA NA NA NA chr15-38 41322120 41322378 198 - chr15:41322133-41322177 NA NA NA NA NA chr15-37 41087321 41087577 171 - chr15:41087478-41087564 NA NA NA NA NA chr15-36 40476192 40476472 150 - chr15:40476304-40476324 NA NA NA NA NA chr15-35 40320133 40320541 303 - chr15:40320138-40320336 NA NA NA NA NA chr15-34 40151253 40152020 401 - chr15:40151604-40151728 NA NA NA NA NA chr15-33 40020942 40021132 166 - chr15:40020957-40021099 NA NA NA NA NA chr15-32 39384568 39384857 203 - chr15:39384673-39384790 NA NA NA NA NA chr15-31 39158467 39158690 131 - chr15:39158511-39158550 NA NA NA NA NA chr15-30 38375421 38375880 349 - chr15:38375519-38375734 NA NA NA NA NA chr15-29 37423000 37423256 196 - chr15:37423071-37423207 NA NA NA NA NA chr15-28 36847116 36847592 302 - chr15:36847446-36847470 NA NA NA NA NA chr15-27 36506514 36506853 224 - chr15:36506653-36506762 NA NA NA NA NA chr15-26 34766622 34767003 299 - chr15:34766786-34767003 NA NA NA NA NA chr15-25 34687289 34687437 117 - chr15:34687295-34687381 NA NA NA NA NA chr15-24 34675227 34675510 177 - chr15:34675331-34675402 NA NA NA NA NA chr15-23 34216551 34216963 253 - chr15:34216605-34216699 NA NA NA NA NA chr15-22 33332051 33332359 218 - chr15:33332243-33332303 NA NA NA NA NA chr15-21 32957768 32958023 146 - chr15:32957950-32957987 NA NA NA NA NA chr15-20 27813586 27814031 310 - chr15:27813668-27813843 NA NA NA NA NA chr15-19 27661209 27661507 164 - chr15:27661373-27661383 NA NA NA NA NA chr15-18 27434005 27434314 166 - chr15:27434144-27434159 NA NA NA NA NA chr15-17 27411707 27412250 240 - chr15:27411872-27411892 NA NA NA NA NA chr15-16 27208907 27209171 220 - chr15:27208935-27209111 NA NA NA NA NA chr15-15 26853658 26854250 373 - chr15:26853853-26853892 NA NA NA NA NA chr15-14 25893227 25893688 169 - chr15:25893450-25893489 NA NA NA NA NA chr15-13 25872740 25873027 158 - chr15:25872903-25872932 NA NA NA NA NA chr15-12 25436575 25436957 197 - chr15:25436648-25436757 NA NA NA NA NA chr15-11 25344544 25344873 158 - chr15:25344735-25344799 NA NA NA NA NA chr15-10 25336843 25337192 205 - chr15:25336976-25337037 NA NA NA NA NA chr15-9 25150888 25151290 238 - chr15:25151016-25151090 NA NA NA NA NA chr15-8 25095328 25095566 186 - chr15:25095373-25095507 NA NA NA NA NA chr15-7 24988699 24989043 257 - chr15:24988741-24988821 NA NA NA NA NA chr15-6 24881770 24882179 221 - chr15:24881841-24881874 NA NA NA NA NA chr15-5 23973707 23974012 217 - chr15:23973761-23973890 NA NA NA NA NA chr15-4 23892870 23893177 178 - chr15:23892978-23893041 NA NA NA NA NA chr15-3 23856889 23857273 219 - chr15:23856990-23857014 NA NA NA NA NA chr15-2 23779528 23779782 173 - chr15:23779578-23779608 NA NA NA NA NA chr15 23673439 23673833 225 - chr15:23673644-23673788 NA NA NA NA NA chr15-269 101094070 101094349 189 - chr15:101094176-101094335 NA NA NA NA NA chr15-268 100845015 100845334 191 - chr15:100845135-100845198 NA NA NA NA NA chr15-267 100619469 100619722 183 - chr15:100619552-100619665 NA NA NA NA NA chr15-266 100540746 100541103 219 - chr15:100540808-100540925 NA NA NA NA NA chr15-265 100351023 100351515 242 - chr15:100351335-100351356 NA NA NA NA NA chr15-264 100173891 100174353 282 - chr15:100174134-100174194 NA NA NA NA NA chr14-435 99878114 99878361 222 - chr14:99878130-99878327 NA NA NA NA NA chr14-434 99056964 99057310 200 - chr14:99057112-99057166 NA NA NA NA NA chr14-433 98070981 98071112 114 - chr14:98070989-98071064 NA NA NA NA NA chr14-432 96252824 96253103 208 - chr14:96252859-96252996 NA NA NA NA NA chr14-431 96203512 96203810 165 - chr14:96203648-96203678 NA NA NA NA NA chr14-430 95956854 95957225 268 - chr14:95956903-95957104 NA NA NA NA NA chr14-429 95808952 95809164 185 - chr14:95808988-95809146 NA NA NA NA NA chr14-428 95415436 95415674 204 - chr14:95415566-95415668 NA NA NA NA NA chr14-427 94897755 94898079 223 - chr14:94897955-94898006 NA NA NA NA NA chr14-426 92727867 92728201 162 - chr14:92728057-92728083 NA NA NA NA NA chr14-425 90873763 90874044 146 - chr14:90873798-90873809 NA NA NA NA NA chr14-424 89861291 89861551 215 - chr14:89861323-89861493 NA NA NA NA NA chr14-423 88845060 88845404 211 - chr14:88845181-88845267 NA NA NA NA NA chr14-422 88810476 88810733 223 - chr14:88810489-88810636 NA NA NA NA NA chr14-421 88014477 88014806 183 - chr14:88014628-88014746 NA NA NA NA NA chr14-420 88006630 88006891 249 - chr14:88006645-88006890 NA NA NA NA NA chr14-419 87477254 87477425 156 - chr14:87477255-87477396 NA NA NA NA NA chr14-418 87284663 87284831 140 - chr14:87284676-87284750 NA NA NA NA NA chr14-417 87171462 87171763 188 - chr14:87171537-87171578 NA NA NA NA NA chr14-416 86895513 86895699 159 - chr14:86895554-86895632 NA NA NA NA NA chr14-415 86461400 86461628 167 - chr14:86461518-86461586 NA NA NA NA NA chr14-414 86459884 86460167 160 - chr14:86459891-86459928 NA NA NA NA NA chr14-413 86382165 86382570 287 - chr14:86382239-86382408 NA NA NA NA NA chr14-412 86216414 86216853 172 - chr14:86216769-86216852 NA NA NA NA NA chr14-411 86154438 86154746 171 - chr14:86154613-86154647 NA NA NA NA NA chr14-410 85896663 85896872 173 - chr14:85896705-85896854 NA NA NA NA NA chr14-409 85390362 85390603 150 - chr14:85390451-85390510 NA NA NA NA NA chr14-408 84865406 84865741 256 - chr14:84865452-84865651 NA NA NA NA NA chr14-407 84768056 84768387 239 - chr14:84768065-84768149 NA NA NA NA NA chr14-406 84403664 84404040 243 - chr14:84403806-84403910 NA NA NA NA NA chr14-405 84389159 84389584 378 - chr14:84389228-84389534 NA NA NA NA NA chr14-404 83814529 83814820 159 - chr14:83814731-83814758 NA NA NA NA NA chr14-403 83548050 83548557 258 - chr14:83548112-83548531 NA NA NA NA NA chr14-402 82997037 82997225 158 - chr14:82997137-82997205 NA NA NA NA NA chr14-401 82938166 82938825 291 - chr14:82938292-82938371 NA NA NA NA NA chr14-400 82936155 82936355 178 - chr14:82936189-82936345 NA NA NA NA NA chr14-399 82909698 82910020 191 - chr14:82909940-82910000 NA NA NA NA NA chr14-398 82767359 82767743 133 - chr14:82767670-82767672 NA NA NA NA NA chr14-397 82698228 82698507 194 - chr14:82698247-82698356 NA NA NA NA NA chr14-396 82667447 82667681 127 - chr14:82667507-82667527 NA NA NA NA NA chr14-395 82465387 82465836 224 - chr14:82465614-82465617 NA NA NA NA NA chr14-394 82263156 82263513 267 - chr14:82263220-82263469 NA NA NA NA NA chr14-393 82090410 82090614 125 - chr14:82090533-82090579 NA NA NA NA NA chr14-392 82089982 82090238 201 - chr14:82090088-82090234 NA NA NA NA NA chr14-391 81992772 81993023 232 - chr14:81992833-81993008 NA NA NA NA NA chr14-390 81817431 81817794 145 - chr14:81817484-81817532 NA NA NA NA NA chr14-389 81161840 81162185 181 - chr14:81161968-81162009 NA NA NA NA NA chr14-388 80631681 80631934 193 - chr14:80631744-80631875 NA NA NA NA NA chr14-387 80304161 80304479 132 - chr14:80304170-80304240 NA NA NA NA NA chr14-386 80298698 80298875 122 - chr14:80298791-80298858 NA NA NA NA NA chr14-385 80264593 80265028 253 - chr14:80264784-80264873 NA NA NA NA NA chr14-384 80126292 80126570 209 - chr14:80126383-80126523 NA NA NA NA NA chr14-383 80108696 80109461 344 - chr14:80109199-80109277 NA NA NA NA NA chr14-382 79543067 79543436 153 - chr14:79543253-79543334 NA NA NA NA NA chr14-381 79271066 79271315 144 - chr14:79271152-79271179 NA NA NA NA NA chr14-380 79013061 79013579 253 - chr14:79013320-79013356 NA NA NA NA NA chr14-379 78941623 78942146 271 - chr14:78941693-78941712 NA NA NA NA NA chr14-378 78904231 78904610 232 - chr14:78904312-78904397 NA NA NA NA NA chr14-377 78762712 78762917 150 - chr14:78762791-78762886 NA NA NA NA NA chr14-376 78531672 78531899 115 - chr14:78531770-78531773 NA NA NA NA NA chr14-375 78437778 78438079 205 - chr14:78437823-78437932 NA NA NA NA NA chr14-374 77903359 77903847 188 - chr14:77903648-77903736 NA NA NA NA NA chr14-373 77522711 77523038 220 - chr14:77522828-77522941 NA NA NA NA NA chr14-372 77366033 77366425 258 - chr14:77366133-77366284 NA NA NA NA NA chr14-371 77293114 77293426 174 - chr14:77293121-77293249 NA NA NA NA NA chr14-370 77076116 77076275 123 - chr14:77076129-77076216 NA NA NA NA NA chr14-369 76285224 76285580 151 - chr14:76285406-76285443 NA NA NA NA NA chr14-368 76185778 76186040 204 - chr14:76185843-76185989 NA NA NA NA NA chr14-367 75844551 75844951 192 - chr14:75844789-75844833 NA NA NA NA NA chr14-366 75335868 75336115 125 - chr14:75335924-75335971 NA NA NA NA NA chr14-365 75229630 75229846 117 - chr14:75229731-75229749 NA NA NA NA NA chr14-364 75043508 75043774 260 - chr14:75043520-75043774 NA NA NA NA NA chr14-363 74843694 74844310 335 - chr14:74844130-74844133 NA NA NA NA NA chr14-362 74676132 74676399 170 - chr14:74676282-74676355 NA NA NA NA NA chr14-361 74120800 74120999 171 - chr14:74120803-74120946 NA NA NA NA NA chr14-360 73874559 73874929 193 - chr14:73874747-73874785 NA NA NA NA NA chr14-359 73762048 73762428 220 - chr14:73762258-73762337 NA NA NA NA NA chr14-358 73661121 73661401 142 - chr14:73661145-73661225 NA NA NA NA NA chr14-357 73425408 73425694 187 - chr14:73425488-73425538 NA NA NA NA NA chr14-356 73381883 73382437 225 - chr14:73382110-73382113 NA NA NA NA NA chr14-355 73060396 73060692 118 - chr14:73060609-73060619 NA NA NA NA NA chr14-354 72905710 72905932 197 - chr14:72905750-72905922 NA NA NA NA NA chr14-353 72765493 72765780 186 - chr14:72765582-72765667 NA NA NA NA NA chr14-352 72684367 72684603 153 - chr14:72684411-72684481 NA NA NA NA NA chr14-351 72555348 72555669 195 - chr14:72555534-72555603 NA NA NA NA NA chr14-350 72498256 72498544 201 - chr14:72498371-72498485 NA NA NA NA NA chr14-349 72431218 72431445 135 - chr14:72431307-72431350 NA NA NA NA NA chr14-348 72382284 72382724 273 - chr14:72382429-72382491 NA NA NA NA NA chr14-347 72327829 72328066 123 - chr14:72327877-72327886 NA NA NA NA NA chr14-346 72272426 72272836 219 - chr14:72272569-72272670 NA NA NA NA NA chr14-345 72114524 72114908 206 - chr14:72114738-72114742 NA NA NA NA NA chr14-344 72109690 72109960 163 - chr14:72109810-72109870 NA NA NA NA NA chr14-343 71907413 71907647 125 - chr14:71907560-71907576 NA NA NA NA NA chr14-342 71662911 71663260 118 - chr14:71663216-71663257 NA NA NA NA NA chr14-341 71515754 71516088 139 - chr14:71515901-71515975 NA NA NA NA NA chr14-340 71509378 71509580 183 - chr14:71509451-71509577 NA NA NA NA NA chr14-339 71496787 71497004 200 - chr14:71496803-71496986 NA NA NA NA NA chr14-338 71411181 71411524 182 - chr14:71411390-71411446 NA NA NA NA NA chr14-337 71356919 71357294 204 - chr14:71357148-71357293 NA NA NA NA NA chr14-336 71243430 71243826 243 - chr14:71243462-71243514 NA NA NA NA NA chr14-335 71193894 71194172 176 - chr14:71193973-71194047 NA NA NA NA NA chr14-334 71088504 71089300 312 - chr14:71088849-71088878 NA NA NA NA NA chr14-333 71011176 71011357 126 - chr14:71011279-71011350 NA NA NA NA NA chr14-332 70977702 70978077 156 - chr14:70977755-70977821 NA NA NA NA NA chr14-331 70773570 70773816 176 - chr14:70773615-70773671 NA NA NA NA NA chr14-330 70705992 70706410 218 - chr14:70706255-70706275 NA NA NA NA NA chr14-329 70652093 70652454 237 - chr14:70652165-70652245 NA NA NA NA NA chr14-328 70584275 70584525 204 - chr14:70584356-70584514 NA NA NA NA NA chr14-327 70562018 70562490 300 - chr14:70562187-70562309 NA NA NA NA NA chr14-326 70557903 70558183 150 - chr14:70558021-70558041 NA NA NA NA NA chr14-325 70512165 70512498 302 - chr14:70512185-70512456 NA NA NA NA NA chr14-324 70452015 70452251 161 - chr14:70452158-70452244 NA NA NA NA NA chr14-323 70401255 70401552 154 - chr14:70401487-70401498 NA NA NA NA NA chr14-322 70284267 70284493 161 - chr14:70284305-70284419 NA NA NA NA NA chr14-321 70275449 70275644 184 - chr14:70275450-70275628 NA NA NA NA NA chr14-320 70221487 70221742 154 - chr14:70221600-70221677 NA NA NA NA NA chr14-319 70218120 70218386 122 - chr14:70218129-70218203 NA NA NA NA NA chr14-318 70083619 70084053 214 - chr14:70083900-70084016 NA NA NA NA NA chr14-317 70031924 70032154 136 - chr14:70031943-70032035 NA NA NA NA NA chr14-316 70018340 70018621 179 - chr14:70018436-70018501 NA NA NA NA NA chr14-315 69918987 69919451 196 - chr14:69919117-69919118 NA NA NA NA NA chr14-314 69855022 69855171 127 - chr14:69855041-69855140 NA NA NA NA NA chr14-313 69833038 69833493 151 - chr14:69833111-69833112 NA NA NA NA NA chr14-312 69460007 69460289 125 - chr14:69460099-69460135 NA NA NA NA NA chr14-311 69304922 69305111 150 - chr14:69304980-69305091 NA NA NA NA NA chr14-310 68997373 68997577 180 - chr14:68997373-68997529 NA NA NA NA NA chr14-309 68571279 68571589 191 - chr14:68571317-68571443 NA NA NA NA NA chr14-308 68380773 68381093 140 - chr14:68380886-68380966 NA NA NA NA NA chr14-307 68354922 68355418 264 - chr14:68355204-68355224 NA NA NA NA NA chr14-306 68341444 68341649 130 - chr14:68341462-68341517 NA NA NA NA NA chr14-305 68168500 68168663 119 - chr14:68168510-68168585 NA NA NA NA NA chr14-304 68158546 68158815 139 - chr14:68158701-68158784 NA NA NA NA NA chr14-303 68037887 68038185 172 - chr14:68038053-68038099 NA NA NA NA NA chr14-302 67888684 67888894 204 - chr14:67888684-67888886 NA NA NA NA NA chr14-301 67815067 67815314 143 - chr14:67815116-67815155 NA NA NA NA NA chr14-300 67774745 67774991 144 - chr14:67774815-67774857 NA NA NA NA NA chr14-299 67764465 67765018 247 - chr14:67764924-67764941 NA NA NA NA NA chr14-298 67642008 67642399 276 - chr14:67642067-67642228 NA NA NA NA NA chr14-297 67624590 67624947 159 - chr14:67624687-67624780 NA NA NA NA NA chr14-296 67610214 67610636 189 - chr14:67610303-67610355 NA NA NA NA NA chr14-295 67598808 67599160 173 - chr14:67598975-67598977 NA NA NA NA NA chr14-294 67569675 67570240 253 - chr14:67569894-67569897 NA NA NA NA NA chr14-293 67466106 67466286 160 - chr14:67466106-67466246 NA NA NA NA NA chr14-292 67436669 67436948 168 - chr14:67436675-67436802 NA NA NA NA NA chr14-291 67187394 67187553 138 - chr14:67187423-67187540 NA NA NA NA NA chr14-290 67050507 67050868 211 - chr14:67050637-67050698 NA NA NA NA NA chr14-289 67040722 67041039 168 - chr14:67040906-67040925 NA NA NA NA NA chr14-288 67039420 67039609 150 - chr14:67039430-67039541 NA NA NA NA NA chr14-287 66984291 66984602 270 - chr14:66984355-66984502 NA NA NA NA NA chr14-286 66939247 66939533 193 - chr14:66939253-66939353 NA NA NA NA NA chr14-285 66829544 66829930 142 - chr14:66829557-66829609 NA NA NA NA NA chr14-284 66822926 66823154 171 - chr14:66822933-66823085 NA NA NA NA NA chr14-283 66796105 66796273 139 - chr14:66796203-66796255 NA NA NA NA NA chr14-282 66593979 66594169 130 - chr14:66594018-66594088 NA NA NA NA NA chr14-281 66577754 66578016 162 - chr14:66577848-66577938 NA NA NA NA NA chr14-280 66557896 66558207 147 - chr14:66558087-66558134 NA NA NA NA NA chr14-279 66484299 66484678 161 - chr14:66484364-66484430 NA NA NA NA NA chr14-278 66428916 66429420 263 - chr14:66429265-66429287 NA NA NA NA NA chr14-277 66406022 66406480 187 - chr14:66406022-66406097 NA NA NA NA NA chr14-276 66268070 66268433 159 - chr14:66268166-66268257 NA NA NA NA NA chr14-275 66170101 66170686 258 - chr14:66170453-66170540 NA NA NA NA NA chr14-274 66145503 66146062 237 - chr14:66145884-66145936 NA NA NA NA NA chr14-273 66006431 66006607 127 - chr14:66006489-66006567 NA NA NA NA NA chr14-272 65989511 65989707 164 - chr14:65989520-65989588 NA NA NA NA NA chr14-271 65660196 65660350 127 - chr14:65660301-65660347 NA NA NA NA NA chr14-270 65552742 65553125 245 - chr14:65552839-65552891 NA NA NA NA NA chr14-269 65496497 65497155 284 - chr14:65496991-65497005 NA NA NA NA NA chr14-268 65351841 65352110 233 - chr14:65351870-65352067 NA NA NA NA NA chr14-267 65343364 65343600 184 - chr14:65343377-65343431 NA NA NA NA NA chr14-266 65314048 65314326 163 - chr14:65314233-65314281 NA NA NA NA NA chr14-265 64823578 64823829 159 - chr14:64823726-64823793 NA NA NA NA NA chr14-264 64814743 64815038 168 - chr14:64814843-64814884 NA NA NA NA NA chr14-263 64409564 64410072 229 - chr14:64409864-64410000 NA NA NA NA NA chr14-262 64214874 64215124 142 - chr14:64215004-64215082 NA NA NA NA NA chr14-261 64052375 64052726 235 - chr14:64052602-64052647 NA NA NA NA NA chr14-260 64005382 64005689 186 - chr14:64005546-64005611 NA NA NA NA NA chr14-259 63804240 63804464 173 - chr14:63804242-63804364 NA NA NA NA NA chr14-258 63778003 63778163 148 - chr14:63778043-63778155 NA NA NA NA NA chr14-257 63741780 63742044 122 - chr14:63741950-63741999 NA NA NA NA NA chr14-256 63472900 63473528 311 - chr14:63473239-63473307 NA NA NA NA NA chr14-255 63278026 63278259 155 - chr14:63278083-63278160 NA NA NA NA NA chr14-254 63171451 63171710 241 - chr14:63171462-63171671 NA NA NA NA NA chr14-253 63150636 63150963 123 - chr14:63150895-63150924 NA NA NA NA NA chr14-252 63092966 63093252 161 - chr14:63093111-63093186 NA NA NA NA NA chr14-251 62924100 62924396 249 - chr14:62924190-62924392 NA NA NA NA NA chr14-250 62903595 62903856 153 - chr14:62903653-62903698 NA NA NA NA NA chr14-249 62879411 62879670 160 - chr14:62879446-62879507 NA NA NA NA NA chr14-248 62852656 62853332 255 - chr14:62853253-62853296 NA NA NA NA NA chr14-247 62835025 62835227 158 - chr14:62835131-62835200 NA NA NA NA NA chr14-246 62705743 62706495 436 - chr14:62705961-62706002 NA NA NA NA NA chr14-245 62443233 62443441 163 - chr14:62443320-62443438 NA NA NA NA NA chr14-244 62392488 62392730 126 - chr14:62392623-62392633 NA NA NA NA NA chr14-243 62341311 62341479 152 - chr14:62341314-62341424 NA NA NA NA NA chr14-242 62186708 62186888 117 - chr14:62186753-62186807 NA NA NA NA NA chr14-241 62132153 62132495 174 - chr14:62132380-62132386 NA NA NA NA NA chr14-240 61957005 61957316 165 - chr14:61957171-61957230 NA NA NA NA NA chr14-239 61941464 61941956 359 - chr14:61941498-61941790 NA NA NA NA NA chr14-238 61899946 61900148 165 - chr14:61900043-61900131 NA NA NA NA NA chr14-237 61868428 61868593 160 - chr14:61868447-61868592 NA NA NA NA NA chr14-236 61865578 61865941 209 - chr14:61865768-61865823 NA NA NA NA NA chr14-235 61834754 61834970 126 - chr14:61834841-61834937 NA NA NA NA NA chr14-234 61814960 61815230 145 - chr14:61815037-61815114 NA NA NA NA NA chr14-233 61789582 61789784 130 - chr14:61789714-61789772 NA NA NA NA NA chr14-232 61720227 61720480 173 - chr14:61720244-61720379 NA NA NA NA NA chr14-231 61634153 61634457 184 - chr14:61634156-61634223 NA NA NA NA NA chr14-230 61480884 61481131 143 - chr14:61481042-61481127 NA NA NA NA NA chr14-229 61456070 61456354 212 - chr14:61456096-61456144 NA NA NA NA NA chr14-228 61212324 61212557 162 - chr14:61212453-61212544 NA NA NA NA NA chr14-227 61099740 61100383 373 - chr14:61099959-61100062 NA NA NA NA NA chr14-226 60848905 60849227 224 - chr14:60849093-60849219 NA NA NA NA NA chr14-225 60656288 60656460 147 - chr14:60656346-60656446 NA NA NA NA NA chr14-224 60574459 60574837 172 - chr14:60574696-60574724 NA NA NA NA NA chr14-223 60530619 60530914 204 - chr14:60530676-60530827 NA NA NA NA NA chr14-222 60497053 60497235 139 - chr14:60497101-60497197 NA NA NA NA NA chr14-221 60392336 60392567 141 - chr14:60392395-60392446 NA NA NA NA NA chr14-220 60360577 60361106 311 - chr14:60360577-60360674 NA NA NA NA NA chr14-219 60276806 60277046 131 - chr14:60276916-60276938 NA NA NA NA NA chr14-218 60252161 60252920 398 - chr14:60252378-60252673 NA NA NA NA NA chr14-217 59850206 59850614 180 - chr14:59850336-59850346 NA NA NA NA NA chr14-216 59729169 59729519 295 - chr14:59729248-59729400 NA NA NA NA NA chr14-215 59675818 59676078 119 - chr14:59675975-59676047 NA NA NA NA NA chr14-214 59642571 59642758 154 - chr14:59642668-59642723 NA NA NA NA NA chr14-213 59601705 59602024 157 - chr14:59601920-59602023 NA NA NA NA NA chr14-212 59598160 59598488 279 - chr14:59598216-59598446 NA NA NA NA NA chr14-211 59249466 59249685 141 - chr14:59249574-59249637 NA NA NA NA NA chr14-210 59156284 59156698 224 - chr14:59156537-59156571 NA NA NA NA NA chr14-209 58994148 58994513 222 - chr14:58994282-58994367 NA NA NA NA NA chr14-208 58840136 58840420 183 - chr14:58840211-58840293 NA NA NA NA NA chr14-207 58762250 58762462 163 - chr14:58762287-58762377 NA NA NA NA NA chr14-206 58472879 58473022 119 - chr14:58472918-58472965 NA NA NA NA NA chr14-205 58390819 58391084 149 - chr14:58390950-58390983 NA NA NA NA NA chr14-204 58384468 58385019 234 - chr14:58384554-58384625 NA NA NA NA NA chr14-203 58273323 58273683 217 - chr14:58273363-58273437 NA NA NA NA NA chr14-202 58100137 58100345 126 - chr14:58100184-58100228 NA NA NA NA NA chr14-201 57943407 57943611 167 - chr14:57943520-57943576 NA NA NA NA NA chr14-200 57930116 57930266 137 - chr14:57930123-57930251 NA NA NA NA NA chr14-199 57632444 57632800 250 - chr14:57632742-57632758 NA NA NA NA NA chr14-198 57627685 57627970 157 - chr14:57627923-57627952 NA NA NA NA NA chr14-197 57579300 57579592 133 - chr14:57579400-57579480 NA NA NA NA NA chr14-196 57572699 57572995 152 - chr14:57572902-57572910 NA NA NA NA NA chr14-195 57397249 57397687 306 - chr14:57397357-57397633 NA NA NA NA NA chr14-194 57005696 57006158 237 - chr14:57005906-57005918 NA NA NA NA NA chr14-193 56463957 56464239 158 - chr14:56464059-56464093 NA NA NA NA NA chr14-192 56449862 56450231 155 - chr14:56450077-56450124 NA NA NA NA NA chr14-191 56430593 56430898 173 - chr14:56430734-56430863 NA NA NA NA NA chr14-190 56333498 56334001 255 - chr14:56333761-56333798 NA NA NA NA NA chr14-189 56316328 56316525 138 - chr14:56316396-56316493 NA NA NA NA NA chr14-188 55913990 55914487 317 - chr14:55914144-55914229 NA NA NA NA NA chr14-187 55892127 55892349 123 - chr14:55892139-55892221 NA NA NA NA NA chr14-186 55793579 55793910 254 - chr14:55793621-55793798 NA NA NA NA NA chr14-185 55530257 55530785 241 - chr14:55530331-55530427 NA NA NA NA NA chr14-184 55507288 55507506 161 - chr14:55507366-55507470 NA NA NA NA NA chr14-183 55081814 55082197 172 - chr14:55081916-55082017 NA NA NA NA NA chr14-182 54860238 54860512 155 - chr14:54860273-54860365 NA NA NA NA NA chr14-181 54773204 54773756 307 - chr14:54773439-54773501 NA NA NA NA NA chr14-180 54671303 54671675 219 - chr14:54671440-54671608 NA NA NA NA NA chr14-179 54485428 54485766 201 - chr14:54485616-54485680 NA NA NA NA NA chr14-178 54438405 54438893 255 - chr14:54438695-54438717 NA NA NA NA NA chr14-177 54366061 54366427 213 - chr14:54366329-54366389 NA NA NA NA NA chr14-176 54339862 54340054 156 - chr14:54339870-54339990 NA NA NA NA NA chr14-175 54288489 54288835 190 - chr14:54288659-54288693 NA NA NA NA NA chr14-174 54227484 54227701 123 - chr14:54227520-54227549 NA NA NA NA NA chr14-173 54174142 54174378 125 - chr14:54174144-54174232 NA NA NA NA NA chr14-172 53997679 53997979 158 - chr14:53997745-53997829 NA NA NA NA NA chr14-171 53993812 53994067 168 - chr14:53993950-53994031 NA NA NA NA NA chr14-170 53920515 53920850 178 - chr14:53920594-53920615 NA NA NA NA NA chr14-169 53916087 53916296 145 - chr14:53916107-53916188 NA NA NA NA NA chr14-168 53834251 53834674 367 - chr14:53834475-53834674 NA NA NA NA NA chr14-167 53704249 53704468 119 - chr14:53704365-53704384 NA NA NA NA NA chr14-166 53694952 53695336 214 - chr14:53695111-53695133 NA NA NA NA NA chr14-165 53551368 53551716 237 - chr14:53551435-53551635 NA NA NA NA NA chr14-164 53533639 53534040 214 - chr14:53533746-53533773 NA NA NA NA NA chr14-163 53517882 53518146 143 - chr14:53518005-53518031 NA NA NA NA NA chr14-162 53504371 53504610 142 - chr14:53504548-53504593 NA NA NA NA NA chr14-161 53464590 53464814 183 - chr14:53464717-53464777 NA NA NA NA NA chr14-160 53419482 53419801 161 - chr14:53419643-53419652 NA NA NA NA NA chr14-159 53239376 53239525 120 - chr14:53239388-53239479 NA NA NA NA NA chr14-158 52922509 52922714 167 - chr14:52922649-52922702 NA NA NA NA NA chr14-157 52868391 52868843 257 - chr14:52868435-52868497 NA NA NA NA NA chr14-156 52709844 52710002 135 - chr14:52709850-52709962 NA NA NA NA NA chr14-155 52636061 52636504 212 - chr14:52636064-52636199 NA NA NA NA NA chr14-154 52583145 52583397 183 - chr14:52583289-52583353 NA NA NA NA NA chr14-153 52578070 52578348 175 - chr14:52578143-52578215 NA NA NA NA NA chr14-152 52551599 52551864 142 - chr14:52551792-52551811 NA NA NA NA NA chr14-151 52464824 52465074 142 - chr14:52464930-52464960 NA NA NA NA NA chr14-150 52298974 52299159 167 - chr14:52298977-52299090 NA NA NA NA NA chr14-149 52195887 52196104 127 - chr14:52195962-52195969 NA NA NA NA NA chr14-148 52173021 52173219 173 - chr14:52173029-52173177 NA NA NA NA NA chr14-147 51999689 51999930 191 - chr14:51999885-51999926 NA NA NA NA NA chr14-146 51935902 51936060 126 - chr14:51935906-51936000 NA NA NA NA NA chr14-145 51789243 51789504 206 - chr14:51789333-51789484 NA NA NA NA NA chr14-144 51648872 51649282 173 - chr14:51649058-51649152 NA NA NA NA NA chr14-143 51645416 51646044 318 - chr14:51645541-51645626 NA NA NA NA NA chr14-142 51611893 51612235 274 - chr14:51611998-51612068 NA NA NA NA NA chr14-141 51539970 51540387 197 - chr14:51540218-51540227 NA NA NA NA NA chr14-140 51326351 51326534 130 - chr14:51326351-51326428 NA NA NA NA NA chr14-139 50805994 50806361 243 - chr14:50805994-50806113 NA NA NA NA NA chr14-138 50781632 50781894 196 - chr14:50781719-50781849 NA NA NA NA NA chr14-137 50497796 50497987 123 - chr14:50497893-50497948 NA NA NA NA NA chr14-136 50417131 50417371 142 - chr14:50417206-50417250 NA NA NA NA NA chr14-135 50364634 50364876 147 - chr14:50364753-50364805 NA NA NA NA NA chr14-134 50148147 50148514 225 - chr14:50148289-50148372 NA NA NA NA NA chr14-133 50082290 50082490 159 - chr14:50082329-50082447 NA NA NA NA NA chr14-132 49689583 49690109 267 - chr14:49689693-49689772 NA NA NA NA NA chr14-131 49666005 49666383 233 - chr14:49666199-49666317 NA NA NA NA NA chr14-130 49636708 49636928 177 - chr14:49636803-49636851 NA NA NA NA NA chr14-129 49618494 49618726 135 - chr14:49618605-49618643 NA NA NA NA NA chr14-128 49345548 49345737 156 - chr14:49345612-49345735 NA NA NA NA NA chr14-127 49168393 49168589 151 - chr14:49168419-49168525 NA NA NA NA NA chr14-126 48997767 48997951 156 - chr14:48997771-48997843 NA NA NA NA NA chr14-125 48896076 48896414 208 - chr14:48896272-48896306 NA NA NA NA NA chr14-124 48819624 48819872 156 - chr14:48819769-48819833 NA NA NA NA NA chr14-123 48740609 48741318 309 - chr14:48740883-48741098 NA NA NA NA NA chr14-122 48653737 48654063 176 - chr14:48653781-48653883 NA NA NA NA NA chr14-121 48389914 48390148 187 - chr14:48390099-48390145 NA NA NA NA NA chr14-120 48298402 48298677 157 - chr14:48298418-48298474 NA NA NA NA NA chr14-119 48116586 48116750 146 - chr14:48116586-48116678 NA NA NA NA NA chr14-118 48059522 48059868 172 - chr14:48059606-48059720 NA NA NA NA NA chr14-117 47833621 47833900 236 - chr14:47833644-47833797 NA NA NA NA NA chr14-116 47331768 47332385 307 - chr14:47332086-47332181 NA NA NA NA NA chr14-115 47307842 47308141 156 - chr14:47307999-47308012 NA NA NA NA NA chr14-114 47197603 47198217 251 - chr14:47198040-47198076 NA NA NA NA NA chr14-113 46724641 46724822 122 - chr14:46724739-46724802 NA NA NA NA NA chr14-112 46711659 46712038 285 - chr14:46711783-46711974 NA NA NA NA NA chr14-111 46697801 46698381 244 - chr14:46698256-46698361 NA NA NA NA NA chr14-110 46523034 46523339 122 - chr14:46523133-46523194 NA NA NA NA NA chr14-109 46083304 46083564 167 - chr14:46083349-46083423 NA NA NA NA NA chr14-108 45924885 45925116 155 - chr14:45924937-45924968 NA NA NA NA NA chr14-107 45828796 45829130 216 - chr14:45828842-45828940 NA NA NA NA NA chr14-106 45505938 45506202 218 - chr14:45505974-45506146 NA NA NA NA NA chr14-105 45446654 45446852 133 - chr14:45446685-45446753 NA NA NA NA NA chr14-104 45224500 45224795 155 - chr14:45224523-45224538 NA NA NA NA NA chr14-103 45182206 45182595 235 - chr14:45182431-45182488 NA NA NA NA NA chr14-102 44844101 44844403 235 - chr14:44844275-44844309 NA NA NA NA NA chr14-101 44682394 44682805 245 - chr14:44682584-44682647 NA NA NA NA NA chr14-100 44628736 44628946 113 - chr14:44628800-44628816 NA NA NA NA NA chr14-99 43909532 43909979 215 - chr14:43909848-43909927 NA NA NA NA NA chr14-98 43808314 43808708 226 - chr14:43808379-43808437 NA NA NA NA NA chr14-97 43695855 43696161 176 - chr14:43696042-43696050 NA NA NA NA NA chr14-96 43400214 43400537 199 - chr14:43400337-43400410 NA NA NA NA NA chr14-95 43233162 43233498 220 - chr14:43233200-43233304 NA NA NA NA NA chr14-94 43160401 43160595 141 - chr14:43160444-43160532 NA NA NA NA NA chr14-93 43131492 43131660 132 - chr14:43131494-43131590 NA NA NA NA NA chr14-92 42941974 42942215 143 - chr14:42942102-42942147 NA NA NA NA NA chr14-91 42771346 42771538 135 - chr14:42771383-42771421 NA NA NA NA NA chr14-90 42716277 42716634 239 - chr14:42716390-42716511 NA NA NA NA NA chr14-89 42672339 42672757 211 - chr14:42672623-42672627 NA NA NA NA NA chr14-88 42597413 42597664 127 - chr14:42597486-42597489 NA NA NA NA NA chr14-87 42243899 42244108 117 - chr14:42244036-42244061 NA NA NA NA NA chr14-86 42173301 42173574 170 - chr14:42173380-42173463 NA NA NA NA NA chr14-85 41883218 41883702 294 - chr14:41883315-41883419 NA NA NA NA NA chr14-84 41797965 41798255 206 - chr14:41798124-41798246 NA NA NA NA NA chr14-83 41677540 41677930 368 - chr14:41677542-41677888 NA NA NA NA NA chr14-82 41676532 41676971 221 - chr14:41676742-41676745 NA NA NA NA NA chr14-81 41226340 41226737 291 - chr14:41226472-41226657 NA NA NA NA NA chr14-80 40816283 40816800 256 - chr14:40816361-40816478 NA NA NA NA NA chr14-79 40373224 40373525 181 - chr14:40373284-40373385 NA NA NA NA NA chr14-78 39934803 39935074 218 - chr14:39934813-39934978 NA NA NA NA NA chr14-77 39189880 39190102 141 - chr14:39189964-39190024 NA NA NA NA NA chr14-76 39057548 39057788 195 - chr14:39057632-39057782 NA NA NA NA NA chr14-75 38950214 38950439 140 - chr14:38950280-38950335 NA NA NA NA NA chr14-74 38501622 38501954 190 - chr14:38501834-38501882 NA NA NA NA NA chr14-73 38304424 38304717 237 - chr14:38304531-38304712 NA NA NA NA NA chr14-72 38244339 38244911 330 - chr14:38244603-38244691 NA NA NA NA NA chr14-71 38204806 38205097 203 - chr14:38204853-38204946 NA NA NA NA NA chr14-70 38029167 38029457 153 - chr14:38029229-38029295 NA NA NA NA NA chr14-69 37727658 37727842 144 - chr14:37727658-37727762 NA NA NA NA NA chr14-68 37617630 37617913 138 - chr14:37617751-37617760 NA NA NA NA NA chr14-67 37507796 37508080 188 - chr14:37507868-37507976 NA NA NA NA NA chr14-66 37194001 37194277 203 - chr14:37194173-37194237 NA NA NA NA NA chr14-65 37030983 37031506 317 - chr14:37031108-37031393 NA NA NA NA NA chr14-64 36965806 36966116 183 - chr14:36965917-36965941 NA NA NA NA NA chr14-63 36516456 36516858 181 - chr14:36516716-36516754 NA NA NA NA NA chr14-62 36330920 36331141 218 - chr14:36330920-36331137 NA NA NA NA NA chr14-61 36287046 36287288 131 - chr14:36287165-36287201 NA NA NA NA NA chr14-60 36276885 36277222 115 - chr14:36276886-36276927 NA NA NA NA NA chr14-59 36138638 36139031 337 - chr14:36138735-36138904 NA NA NA NA NA chr14-58 35809431 35809645 126 - chr14:35809537-35809611 NA NA NA NA NA chr14-57 35763727 35763971 135 - chr14:35763797-35763893 NA NA NA NA NA chr14-56 35584974 35585266 202 - chr14:35585087-35585245 NA NA NA NA NA chr14-55 35515124 35515349 161 - chr14:35515245-35515342 NA NA NA NA NA chr14-54 35434621 35434939 194 - chr14:35434804-35434874 NA NA NA NA NA chr14-53 34881522 34881983 359 - chr14:34881607-34881857 NA NA NA NA NA chr14-52 34522747 34523192 255 - chr14:34523027-34523032 NA NA NA NA NA chr14-51 34114039 34114340 155 - chr14:34114191-34114196 NA NA NA NA NA chr14-50 33500038 33500228 113 - chr14:33500101-33500137 NA NA NA NA NA chr14-49 32889857 32890185 203 - chr14:32889956-32890034 NA NA NA NA NA chr14-48 32416935 32417156 158 - chr14:32417024-32417119 NA NA NA NA NA chr14-47 31832628 31833065 233 - chr14:31832858-31832939 NA NA NA NA NA chr14-46 31712982 31713337 225 - chr14:31713148-31713243 NA NA NA NA NA chr14-45 31390271 31390428 113 - chr14:31390334-31390403 NA NA NA NA NA chr14-44 31204929 31205353 233 - chr14:31204985-31205027 NA NA NA NA NA chr14-43 30914582 30914858 179 - chr14:30914754-30914786 NA NA NA NA NA chr14-42 30910309 30910515 135 - chr14:30910424-30910488 NA NA NA NA NA chr14-41 30471071 30471530 268 - chr14:30471231-30471308 NA NA NA NA NA chr14-40 29425337 29425553 200 - chr14:29425368-29425520 NA NA NA NA NA chr14-39 29034355 29034675 232 - chr14:29034383-29034567 NA NA NA NA NA chr14-38 28999962 29000312 250 - chr14:29000050-29000200 NA NA NA NA NA chr14-37 28802754 28803106 197 - chr14:28802932-28802958 NA NA NA NA NA chr14-36 28738754 28738941 127 - chr14:28738828-28738895 NA NA NA NA NA chr14-35 28572745 28573157 251 - chr14:28572916-28573006 NA NA NA NA NA chr14-34 28278994 28279272 176 - chr14:28279105-28279179 NA NA NA NA NA chr14-33 28156154 28156449 137 - chr14:28156204-28156255 NA NA NA NA NA chr14-32 28133878 28134086 176 - chr14:28133936-28134080 NA NA NA NA NA chr14-31 27875464 27875852 214 - chr14:27875637-27875793 NA NA NA NA NA chr14-30 27716329 27716704 188 - chr14:27716556-27716557 NA NA NA NA NA chr14-29 27207471 27207712 124 - chr14:27207587-27207592 NA NA NA NA NA chr14-28 27096178 27096497 199 - chr14:27096295-27096368 NA NA NA NA NA chr14-27 25889783 25890034 135 - chr14:25889883-25889902 NA NA NA NA NA chr14-26 25195767 25196365 393 - chr14:25195943-25196304 NA NA NA NA NA chr14-25 24985428 24985598 115 - chr14:24985468-24985498 NA NA NA NA NA chr14-24 24850145 24850792 316 - chr14:24850416-24850465 NA NA NA NA NA chr14-23 24557402 24557678 174 - chr14:24557434-24557506 NA NA NA NA NA chr14-22 24066926 24067143 129 - chr14:24066988-24067029 NA NA NA NA NA chr14-21 24063261 24063605 210 - chr14:24063360-24063436 NA NA NA NA NA chr14-20 23704597 23704991 207 - chr14:23704619-23704749 NA NA NA NA NA chr14-19 23491311 23491587 157 - chr14:23491327-23491365 NA NA NA NA NA chr14-18 23452014 23452340 238 - chr14:23452108-23452258 NA NA NA NA NA chr14-17 23111303 23111481 116 - chr14:23111326-23111406 NA NA NA NA NA chr14-16 21956531 21957020 315 - chr14:21956752-21956841 NA NA NA NA NA chr14-15 21941940 21942298 188 - chr14:21942006-21942024 NA NA NA NA NA chr14-14 21834561 21834754 171 - chr14:21834586-21834733 NA NA NA NA NA chr14-13 21501756 21501981 134 - chr14:21501901-21501908 NA NA NA NA NA chr14-12 21289622 21289858 202 - chr14:21289674-21289830 NA NA NA NA NA chr14-11 21227536 21227792 134 - chr14:21227675-21227721 NA NA NA NA NA chr14-10 21167785 21167908 114 - chr14:21167802-21167907 NA NA NA NA NA chr14-9 21143401 21143860 328 - chr14:21143546-21143743 NA NA NA NA NA chr14-8 21060576 21060847 236 - chr14:21060593-21060794 NA NA NA NA NA chr14-7 20962330 20962701 284 - chr14:20962454-20962651 NA NA NA NA NA chr14-6 20819776 20820152 219 - chr14:20819941-20820043 NA NA NA NA NA chr14-5 20778379 20778610 144 - chr14:20778415-20778502 NA NA NA NA NA chr14-4 20515307 20515607 225 - chr14:20515345-20515495 NA NA NA NA NA chr14-3 20501990 20502275 228 - chr14:20502025-20502196 NA NA NA NA NA chr14-2 20402510 20402813 223 - chr14:20402608-20402801 NA NA NA NA NA chr14 20125100 20125309 128 - chr14:20125188-20125289 NA NA NA NA NA chr14-443 105303388 105303842 352 - chr14:105303465-105303715 NA NA NA NA NA chr14-442 104126247 104126479 123 - chr14:104126349-104126363 NA NA NA NA NA chr14-441 103376904 103377157 180 - chr14:103376956-103377063 NA NA NA NA NA chr14-440 102427160 102427559 227 - chr14:102427303-102427458 NA NA NA NA NA chr14-439 102168554 102168785 156 - chr14:102168592-102168673 NA NA NA NA NA chr14-438 101339153 101339537 268 - chr14:101339371-101339455 NA NA NA NA NA chr14-437 100729163 100729313 127 - chr14:100729199-100729257 NA NA NA NA NA chr14-436 100188808 100189174 196 - chr14:100188891-100188917 NA NA NA NA NA chr13-141 99504006 99504248 154 - chr13:99504134-99504200 NA NA NA NA NA chr13-140 99258209 99258572 205 - chr13:99258334-99258477 NA NA NA NA NA chr13-139 98897948 98898312 227 - chr13:98898097-98898179 NA NA NA NA NA chr13-138 98045216 98045542 224 - chr13:98045268-98045390 NA NA NA NA NA chr13-137 98031183 98031429 164 - chr13:98031266-98031348 NA NA NA NA NA chr13-136 94605311 94605512 143 - chr13:94605348-94605433 NA NA NA NA NA chr13-135 94346835 94347232 265 - chr13:94347117-94347232 NA NA NA NA NA chr13-134 94289279 94289520 153 - chr13:94289294-94289359 NA NA NA NA NA chr13-133 94017452 94017712 157 - chr13:94017558-94017618 NA NA NA NA NA chr13-132 93596641 93596878 124 - chr13:93596784-93596795 NA NA NA NA NA chr13-131 93205556 93205718 122 - chr13:93205572-93205654 NA NA NA NA NA chr13-130 92842097 92842398 241 - chr13:92842163-92842224 NA NA NA NA NA chr13-129 92280098 92280370 153 - chr13:92280125-92280159 NA NA NA NA NA chr13-128 92234586 92235002 212 - chr13:92234944-92234952 NA NA NA NA NA chr13-127 92160511 92160666 127 - chr13:92160523-92160622 NA NA NA NA NA chr13-126 92157108 92157435 218 - chr13:92157178-92157209 NA NA NA NA NA chr13-125 92150104 92150656 291 - chr13:92150448-92150465 NA NA NA NA NA chr13-124 91514759 91515050 191 - chr13:91514836-91514881 NA NA NA NA NA chr13-123 91402077 91402488 356 - chr13:91402182-91402373 NA NA NA NA NA chr13-122 90097657 90097870 204 - chr13:90097659-90097836 NA NA NA NA NA chr13-121 89311495 89311716 175 - chr13:89311570-89311699 NA NA NA NA NA chr13-120 89259870 89260163 150 - chr13:89260021-89260028 NA NA NA NA NA chr13-119 89212904 89213198 159 - chr13:89212923-89212947 NA NA NA NA NA chr13-118 88844601 88845032 253 - chr13:88844808-88844883 NA NA NA NA NA chr13-117 88377073 88377354 154 - chr13:88377255-88377282 NA NA NA NA NA chr13-116 86851577 86851770 169 - chr13:86851640-86851737 NA NA NA NA NA chr13-115 86632085 86632302 136 - chr13:86632157-86632266 NA NA NA NA NA chr13-114 86091245 86091689 232 - chr13:86091549-86091569 NA NA NA NA NA chr13-113 86007813 86008272 264 - chr13:86007958-86008027 NA NA NA NA NA chr13-112 85364534 85364883 179 - chr13:85364726-85364739 NA NA NA NA NA chr13-111 85226943 85227166 118 - chr13:85227082-85227165 NA NA NA NA NA chr13-110 84328107 84328337 152 - chr13:84328208-84328328 NA NA NA NA NA chr13-109 84162229 84162412 158 - chr13:84162234-84162367 NA NA NA NA NA chr13-108 83587687 83587912 146 - chr13:83587784-83587839 NA NA NA NA NA chr13-107 82961880 82962249 209 - chr13:82961920-82961955 NA NA NA NA NA chr13-106 82426523 82426739 167 - chr13:82426558-82426676 NA NA NA NA NA chr13-105 82185057 82185342 153 - chr13:82185168-82185277 NA NA NA NA NA chr13-104 80964767 80964984 114 - chr13:80964826-80964837 NA NA NA NA NA chr13-103 80626597 80627072 327 - chr13:80626847-80627035 NA NA NA NA NA chr13-102 78750178 78750435 145 - chr13:78750269-78750302 NA NA NA NA NA chr13-101 78695434 78695766 192 - chr13:78695679-78695731 NA NA NA NA NA chr13-100 78634697 78634867 146 - chr13:78634728-78634866 NA NA NA NA NA chr13-99 77096986 77097382 240 - chr13:77097031-77097189 NA NA NA NA NA chr13-98 76911444 76911621 132 - chr13:76911513-76911600 NA NA NA NA NA chr13-97 76461894 76462381 269 - chr13:76461962-76462013 NA NA NA NA NA chr13-96 75446809 75447312 278 - chr13:75447208-75447244 NA NA NA NA NA chr13-95 75317938 75318267 231 - chr13:75318077-75318210 NA NA NA NA NA chr13-94 74606020 74606379 191 - chr13:74606116-74606187 NA NA NA NA NA chr13-93 74372522 74372877 275 - chr13:74372541-74372736 NA NA NA NA NA chr13-92 74012160 74012409 170 - chr13:74012243-74012334 NA NA NA NA NA chr13-91 73822172 73822525 166 - chr13:73822393-73822457 NA NA NA NA NA chr13-90 72861133 72861406 200 - chr13:72861173-72861300 NA NA NA NA NA chr13-89 72556580 72556792 132 - chr13:72556642-72556706 NA NA NA NA NA chr13-88 72315678 72315900 166 - chr13:72315776-72315886 NA NA NA NA NA chr13-87 71606510 71606706 154 - chr13:71606512-71606544 NA NA NA NA NA chr13-86 71052536 71052801 195 - chr13:71052551-71052676 NA NA NA NA NA chr13-85 70821220 70821622 232 - chr13:70821223-70821285 NA NA NA NA NA chr13-84 70484389 70484736 181 - chr13:70484423-70484637 NA NA NA NA NA chr13-83 69933080 69933488 248 - chr13:69933281-69933451 NA NA NA NA NA chr13-82 69551581 69551758 120 - chr13:69551661-69551724 NA NA NA NA NA chr13-81 69390657 69391155 255 - chr13:69391033-69391063 NA NA NA NA NA chr13-80 69328601 69328778 143 - chr13:69328625-69328734 NA NA NA NA NA chr13-79 69090652 69090959 196 - chr13:69090799-69090884 NA NA NA NA NA chr13-78 68691339 68691737 344 - chr13:68691359-68691541 NA NA NA NA NA chr13-77 67095597 67096073 270 - chr13:67095687-67095751 NA NA NA NA NA chr13-76 65424987 65425191 155 - chr13:65425111-65425167 NA NA NA NA NA chr13-75 65371585 65371944 192 - chr13:65371729-65371754 NA NA NA NA NA chr13-74 65361054 65361333 220 - chr13:65361102-65361241 NA NA NA NA NA chr13-73 65267414 65267651 141 - chr13:65267431-65267476 NA NA NA NA NA chr13-72 64710022 64710197 147 - chr13:64710053-64710116 NA NA NA NA NA chr13-71 64509710 64509995 195 - chr13:64509717-64509890 NA NA NA NA NA chr13-70 63731402 63731715 177 - chr13:63731576-63731617 NA NA NA NA NA chr13-69 63642502 63642668 136 - chr13:63642505-63642611 NA NA NA NA NA chr13-68 62108057 62108329 140 - chr13:62108120-62108174 NA NA NA NA NA chr13-67 61155572 61155777 119 - chr13:61155607-61155640 NA NA NA NA NA chr13-66 59816867 59817041 122 - chr13:59816888-59816958 NA NA NA NA NA chr13-65 59783931 59784265 294 - chr13:59783994-59784168 NA NA NA NA NA chr13-64 59600234 59600468 153 - chr13:59600347-59600419 NA NA NA NA NA chr13-63 59567676 59567984 234 - chr13:59567757-59567931 NA NA NA NA NA chr13-62 58155640 58156013 305 - chr13:58155738-58155975 NA NA NA NA NA chr13-61 57517350 57517714 203 - chr13:57517587-57517629 NA NA NA NA NA chr13-60 57217006 57217168 134 - chr13:57217033-57217137 NA NA NA NA NA chr13-59 56779173 56779494 264 - chr13:56779216-56779395 NA NA NA NA NA chr13-58 56354322 56354548 146 - chr13:56354449-56354515 NA NA NA NA NA chr13-57 55283217 55283419 118 - chr13:55283334-55283368 NA NA NA NA NA chr13-56 55161945 55162252 242 - chr13:55162124-55162171 NA NA NA NA NA chr13-55 54870440 54870741 149 - chr13:54870481-54870552 NA NA NA NA NA chr13-54 53502148 53502538 206 - chr13:53502370-53502392 NA NA NA NA NA chr13-53 52973828 52974303 375 - chr13:52973949-52974224 NA NA NA NA NA chr13-52 52861842 52862077 140 - chr13:52861999-52862044 NA NA NA NA NA chr13-51 52726169 52726441 163 - chr13:52726311-52726365 NA NA NA NA NA chr13-50 52688162 52688698 279 - chr13:52688329-52688351 NA NA NA NA NA chr13-49 51846835 51847336 179 - chr13:51846884-51846923 NA NA NA NA NA chr13-48 50851475 50851672 116 - chr13:50851572-50851607 NA NA NA NA NA chr13-47 50829037 50829354 226 - chr13:50829115-50829224 NA NA NA NA NA chr13-46 50645871 50646115 192 - chr13:50645882-50646022 NA NA NA NA NA chr13-45 50516841 50517238 203 - chr13:50517033-50517042 NA NA NA NA NA chr13-44 50220461 50220748 216 - chr13:50220601-50220746 NA NA NA NA NA chr13-43 50168832 50169129 265 - chr13:50168859-50169082 NA NA NA NA NA chr13-42 49382602 49382759 116 - chr13:49382667-49382742 NA NA NA NA NA chr13-41 48291291 48291483 127 - chr13:48291341-48291403 NA NA NA NA NA chr13-40 46287450 46287734 195 - chr13:46287566-46287672 NA NA NA NA NA chr13-39 45556169 45556360 168 - chr13:45556178-45556323 NA NA NA NA NA chr13-38 44391064 44391284 157 - chr13:44391103-44391239 NA NA NA NA NA chr13-37 43823484 43823886 275 - chr13:43823542-43823690 NA NA NA NA NA chr13-36 42783976 42784470 282 - chr13:42784200-42784262 NA NA NA NA NA chr13-35 42394432 42394621 157 - chr13:42394542-42394615 NA NA NA NA NA chr13-34 42121514 42121943 249 - chr13:42121555-42121734 NA NA NA NA NA chr13-33 40966941 40967316 179 - chr13:40967168-40967213 NA NA NA NA NA chr13-32 39908422 39908720 195 - chr13:39908522-39908616 NA NA NA NA NA chr13-31 39533054 39533262 185 - chr13:39533090-39533206 NA NA NA NA NA chr13-30 38271090 38271361 185 - chr13:38271155-38271254 NA NA NA NA NA chr13-29 38181251 38181655 236 - chr13:38181332-38181400 NA NA NA NA NA chr13-28 37830742 37831069 209 - chr13:37830828-37830855 NA NA NA NA NA chr13-27 37184115 37184314 169 - chr13:37184136-37184215 NA NA NA NA NA chr13-26 36492213 36492478 155 - chr13:36492377-36492386 NA NA NA NA NA chr13-25 36383561 36383793 204 - chr13:36383598-36383774 NA NA NA NA NA chr13-24 36194084 36194378 230 - chr13:36194312-36194350 NA NA NA NA NA chr13-23 35357781 35358018 218 - chr13:35357832-35357993 NA NA NA NA NA chr13-22 34813673 34813940 180 - chr13:34813690-34813841 NA NA NA NA NA chr13-21 34041385 34041661 227 - chr13:34041481-34041561 NA NA NA NA NA chr13-20 33763033 33763272 149 - chr13:33763123-33763182 NA NA NA NA NA chr13-19 33481876 33482419 262 - chr13:33482069-33482087 NA NA NA NA NA chr13-18 33395529 33395709 158 - chr13:33395566-33395658 NA NA NA NA NA chr13-17 31784380 31784564 127 - chr13:31784451-31784521 NA NA NA NA NA chr13-16 31268751 31268920 137 - chr13:31268825-31268902 NA NA NA NA NA chr13-15 30234276 30234476 132 - chr13:30234378-30234442 NA NA NA NA NA chr13-14 29783335 29784170 294 - chr13:29783932-29784044 NA NA NA NA NA chr13-13 29273324 29273696 225 - chr13:29273440-29273518 NA NA NA NA NA chr13-12 28042512 28042748 166 - chr13:28042606-28042702 NA NA NA NA NA chr13-11 27583803 27584016 173 - chr13:27583830-27583963 NA NA NA NA NA chr13-10 26935112 26935279 135 - chr13:26935114-26935153 NA NA NA NA NA chr13-9 26846674 26846907 154 - chr13:26846700-26846775 NA NA NA NA NA chr13-8 26599411 26599724 215 - chr13:26599526-26599677 NA NA NA NA NA chr13-7 25861364 25861615 169 - chr13:25861504-25861591 NA NA NA NA NA chr13-6 24730760 24731025 162 - chr13:24730914-24730939 NA NA NA NA NA chr13-5 24059573 24059846 177 - chr13:24059657-24059802 NA NA NA NA NA chr13-4 23001048 23001337 241 - chr13:23001065-23001162 NA NA NA NA NA chr13-3 22689955 22690212 156 - chr13:22690006-22690040 NA NA NA NA NA chr13-2 22416291 22416745 268 - chr13:22416436-22416518 NA NA NA NA NA chr13 20377255 20377695 333 - chr13:20377384-20377695 NA NA NA NA NA chr13-165 114264543 114264728 154 - chr13:114264589-114264712 NA NA NA NA NA chr13-164 114134656 114134823 152 - chr13:114134684-114134821 NA NA NA NA NA chr13-163 114094041 114094291 152 - chr13:114094066-114094120 NA NA NA NA NA chr13-162 113857115 113857487 247 - chr13:113857298-113857420 NA NA NA NA NA chr13-161 113810592 113810857 244 - chr13:113810593-113810776 NA NA NA NA NA chr13-160 112679992 112680240 158 - chr13:112680042-112680110 NA NA NA NA NA chr13-159 112626450 112626737 146 - chr13:112626533-112626538 NA NA NA NA NA chr13-158 110631235 110631540 168 - chr13:110631284-110631315 NA NA NA NA NA chr13-157 110482789 110483032 145 - chr13:110482896-110482937 NA NA NA NA NA chr13-156 110275317 110275610 129 - chr13:110275515-110275548 NA NA NA NA NA chr13-155 110264444 110264749 232 - chr13:110264691-110264730 NA NA NA NA NA chr13-154 107328467 107328652 139 - chr13:107328506-107328599 NA NA NA NA NA chr13-153 107199416 107199594 114 - chr13:107199494-107199544 NA NA NA NA NA chr13-152 106426696 106426914 195 - chr13:106426702-106426874 NA NA NA NA NA chr13-151 105582151 105582324 144 - chr13:105582167-105582282 NA NA NA NA NA chr13-150 104243948 104244078 127 - chr13:104243948-104244074 NA NA NA NA NA chr13-149 104013957 104014166 154 - chr13:104014017-104014116 NA NA NA NA NA chr13-148 103947639 103947879 164 - chr13:103947692-103947734 NA NA NA NA NA chr13-147 103405846 103406049 148 - chr13:103405884-103405943 NA NA NA NA NA chr13-146 102571063 102571299 186 - chr13:102571133-102571269 NA NA NA NA NA chr13-145 102428507 102428851 196 - chr13:102428581-102428629 NA NA NA NA NA chr13-144 101241586 101241905 259 - chr13:101241621-101241770 NA NA NA NA NA chr13-143 100484702 100485090 201 - chr13:100484998-100485012 NA NA NA NA NA chr13-142 100148426 100148640 187 - chr13:100148463-100148623 NA NA NA NA NA chr12-330 99986984 99987416 237 - chr12:99987145-99987187 NA NA NA NA NA chr12-329 98721380 98721785 162 - chr12:98721656-98721737 NA NA NA NA NA chr12-328 97856311 97856505 162 - chr12:97856359-97856489 NA NA NA NA NA chr12-327 96780115 96780354 116 - chr12:96780245-96780252 NA NA NA NA NA chr12-326 96288274 96288646 148 - chr12:96288571-96288641 NA NA NA NA NA chr12-325 94217816 94218079 182 - chr12:94217866-94217905 NA NA NA NA NA chr12-324 93728761 93729085 175 - chr12:93728829-93728909 NA NA NA NA NA chr12-323 93722120 93722315 135 - chr12:93722156-93722183 NA NA NA NA NA chr12-322 93336336 93336859 303 - chr12:93336445-93336731 NA NA NA NA NA chr12-321 93321270 93321459 147 - chr12:93321349-93321454 NA NA NA NA NA chr12-320 93019364 93019760 259 - chr12:93019422-93019544 NA NA NA NA NA chr12-47 9195982 9196351 197 - chr12:9196126-9196151 NA NA NA NA NA chr12-46 9182264 9182799 309 - chr12:9182321-9182621 NA NA NA NA NA chr12-319 90141623 90141959 194 - chr12:90141790-90141842 NA NA NA NA NA chr12-318 89465283 89465467 133 - chr12:89465302-89465418 NA NA NA NA NA chr12-317 89050815 89051038 158 - chr12:89050857-89050950 NA NA NA NA NA chr12-45 8872222 8872444 135 - chr12:8872270-8872318 NA NA NA NA NA chr12-316 87879516 87879791 206 - chr12:87879581-87879710 NA NA NA NA NA chr12-315 87585508 87585745 203 - chr12:87585548-87585729 NA NA NA NA NA chr12-314 87114271 87114553 165 - chr12:87114364-87114490 NA NA NA NA NA chr12-313 86636021 86636289 145 - chr12:86636120-86636224 NA NA NA NA NA chr12-312 86271293 86271495 163 - chr12:86271440-86271492 NA NA NA NA NA chr12-311 86215940 86216464 339 - chr12:86216010-86216195 NA NA NA NA NA chr12-44 8607456 8607636 134 - chr12:8607468-8607556 NA NA NA NA NA chr12-310 85342689 85342903 175 - chr12:85342724-85342852 NA NA NA NA NA chr12-43 8454314 8454521 151 - chr12:8454350-8454405 NA NA NA NA NA chr12-5 845353 845700 229 - chr12:845360-845492 NA NA NA NA NA chr12-309 84408846 84409096 152 - chr12:84408937-84408991 NA NA NA NA NA chr12-308 84194862 84195127 218 - chr12:84194916-84195087 NA NA NA NA NA chr12-307 84004110 84004462 158 - chr12:84004160-84004220 NA NA NA NA NA chr12-306 82939275 82939732 254 - chr12:82939553-82939554 NA NA NA NA NA chr12-305 82869673 82869946 221 - chr12:82869881-82869946 NA NA NA NA NA chr12-304 82849554 82849885 229 - chr12:82849569-82849696 NA NA NA NA NA chr12-303 82772185 82772536 169 - chr12:82772397-82772444 NA NA NA NA NA chr12-302 82065645 82065939 154 - chr12:82065662-82065758 NA NA NA NA NA chr12-301 81952923 81953379 251 - chr12:81953194-81953196 NA NA NA NA NA chr12-300 81822332 81822611 159 - chr12:81822451-81822490 NA NA NA NA NA chr12-42 8154976 8155226 183 - chr12:8155051-8155167 NA NA NA NA NA chr12-299 81532903 81533036 127 - chr12:81532909-81533030 NA NA NA NA NA chr12-298 81519316 81519675 261 - chr12:81519428-81519591 NA NA NA NA NA chr12-297 81248879 81249394 210 - chr12:81249001-81249028 NA NA NA NA NA chr12-296 81212790 81213095 175 - chr12:81212958-81213003 NA NA NA NA NA chr12-295 80965754 80966316 174 - chr12:80965898-80965910 NA NA NA NA NA chr12-294 79875551 79875893 179 - chr12:79875699-79875725 NA NA NA NA NA chr12-293 79788426 79788659 130 - chr12:79788525-79788552 NA NA NA NA NA chr12-292 79548022 79548257 183 - chr12:79548093-79548224 NA NA NA NA NA chr12-291 79110112 79110307 150 - chr12:79110126-79110231 NA NA NA NA NA chr12-290 79032722 79032898 144 - chr12:79032759-79032807 NA NA NA NA NA chr12-289 78410641 78410878 128 - chr12:78410711-78410730 NA NA NA NA NA chr12-288 77492744 77492899 129 - chr12:77492760-77492811 NA NA NA NA NA chr12-287 77305032 77305255 164 - chr12:77305091-77305196 NA NA NA NA NA chr12-286 76981295 76981658 186 - chr12:76981525-76981534 NA NA NA NA NA chr12-41 7686375 7686726 243 - chr12:7686539-7686703 NA NA NA NA NA chr12-40 7655530 7655934 299 - chr12:7655678-7655872 NA NA NA NA NA chr12-285 76442543 76442946 233 - chr12:76442743-76442786 NA NA NA NA NA chr12-284 76366155 76366433 170 - chr12:76366352-76366414 NA NA NA NA NA chr12-283 76251003 76251201 157 - chr12:76251010-76251126 NA NA NA NA NA chr12-282 75933771 75934227 236 - chr12:75933885-75934074 NA NA NA NA NA chr12-39 7490436 7490794 193 - chr12:7490608-7490650 NA NA NA NA NA chr12-281 74819469 74819671 128 - chr12:74819585-74819639 NA NA NA NA NA chr12-38 7280170 7280562 198 - chr12:7280448-7280481 NA NA NA NA NA chr12-280 72771129 72771512 245 - chr12:72771313-72771512 NA NA NA NA NA chr12-279 71990057 71990244 159 - chr12:71990167-71990242 NA NA NA NA NA chr12-37 7147727 7147859 122 - chr12:7147728-7147840 NA NA NA NA NA chr12-278 70712044 70712312 146 - chr12:70712173-70712211 NA NA NA NA NA chr12-277 70101050 70101457 222 - chr12:70101183-70101220 NA NA NA NA NA chr12-276 69368833 69369207 190 - chr12:69368981-69368987 NA NA NA NA NA chr12-275 68918881 68919480 315 - chr12:68919069-68919100 NA NA NA NA NA chr12-36 6823992 6824338 240 - chr12:6824181-6824315 NA NA NA NA NA chr12-35 6813750 6814035 181 - chr12:6813928-6814005 NA NA NA NA NA chr12-34 6784321 6784792 186 - chr12:6784593-6784684 NA NA NA NA NA chr12-33 6779102 6779327 139 - chr12:6779158-6779211 NA NA NA NA NA chr12-274 67591186 67591360 145 - chr12:67591189-67591253 NA NA NA NA NA chr12-273 67531448 67531754 189 - chr12:67531518-67531590 NA NA NA NA NA chr12-272 67312857 67313165 160 - chr12:67312973-67312985 NA NA NA NA NA chr12-271 66913133 66913501 279 - chr12:66913146-66913404 NA NA NA NA NA chr12-270 66461052 66461214 155 - chr12:66461064-66461212 NA NA NA NA NA chr12-269 66218438 66218659 116 - chr12:66218480-66218491 NA NA NA NA NA chr12-268 66112510 66112824 125 - chr12:66112569-66112631 NA NA NA NA NA chr12-267 66077469 66077802 234 - chr12:66077576-66077684 NA NA NA NA NA chr12-4 658780 659041 177 - chr12:658911-659004 NA NA NA NA NA chr12-266 65564105 65564651 224 - chr12:65564423-65564457 NA NA NA NA NA chr12-265 65417479 65417787 214 - chr12:65417543-65417663 NA NA NA NA NA chr12-264 65206846 65207304 295 - chr12:65206967-65207099 NA NA NA NA NA chr12-263 64893191 64893419 174 - chr12:64893232-64893352 NA NA NA NA NA chr12-262 64869965 64870467 214 - chr12:64870014-64870132 NA NA NA NA NA chr12-261 64767418 64767687 164 - chr12:64767574-64767599 NA NA NA NA NA chr12-260 64651109 64651406 189 - chr12:64651165-64651246 NA NA NA NA NA chr12-259 64444341 64444685 185 - chr12:64444521-64444547 NA NA NA NA NA chr12-258 64279516 64279779 188 - chr12:64279615-64279728 NA NA NA NA NA chr12-257 63855032 63855361 205 - chr12:63855175-63855256 NA NA NA NA NA chr12-256 63440992 63441250 138 - chr12:63441159-63441177 NA NA NA NA NA chr12-255 63281275 63281450 153 - chr12:63281285-63281372 NA NA NA NA NA chr12-254 63058011 63058387 247 - chr12:63058161-63058279 NA NA NA NA NA chr12-253 62875018 62875501 255 - chr12:62875286-62875291 NA NA NA NA NA chr12-252 62546380 62546630 154 - chr12:62546427-62546485 NA NA NA NA NA chr12-251 62484244 62484406 132 - chr12:62484256-62484358 NA NA NA NA NA chr12-250 61640774 61641081 214 - chr12:61640933-61641054 NA NA NA NA NA chr12-249 61640500 61640694 113 - chr12:61640612-61640644 NA NA NA NA NA chr12-248 61507852 61508058 161 - chr12:61507918-61508034 NA NA NA NA NA chr12-247 61335205 61335476 232 - chr12:61335263-61335378 NA NA NA NA NA chr12-246 61033375 61033736 264 - chr12:61033438-61033624 NA NA NA NA NA chr12-245 60375946 60376199 127 - chr12:60376100-60376101 NA NA NA NA NA chr12-244 59624227 59624463 189 - chr12:59624320-59624368 NA NA NA NA NA chr12-243 58763115 58763358 138 - chr12:58763192-58763225 NA NA NA NA NA chr12-32 5876265 5876538 223 - chr12:5876298-5876471 NA NA NA NA NA chr12-242 58551713 58551964 187 - chr12:58551801-58551924 NA NA NA NA NA chr12-241 58299446 58299815 191 - chr12:58299663-58299772 NA NA NA NA NA chr12-31 5809996 5810183 124 - chr12:5810029-5810090 NA NA NA NA NA chr12-240 57908886 57909468 340 - chr12:57909228-57909326 NA NA NA NA NA chr12-239 57880019 57880414 215 - chr12:57880204-57880239 NA NA NA NA NA chr12-30 5770683 5770902 192 - chr12:5770733-5770844 NA NA NA NA NA chr12-238 57509840 57509995 124 - chr12:57509940-57509987 NA NA NA NA NA chr12-237 57294460 57294693 175 - chr12:57294514-57294631 NA NA NA NA NA chr12-236 56902918 56903038 114 - chr12:56902931-56903027 NA NA NA NA NA chr12-29 5682412 5682744 173 - chr12:5682674-5682688 NA NA NA NA NA chr12-235 56183892 56184211 118 - chr12:56183944-56183995 NA NA NA NA NA chr12-234 55941764 55941986 203 - chr12:55941777-55941965 NA NA NA NA NA chr12-28 5588745 5589164 285 - chr12:5588781-5589010 NA NA NA NA NA chr12-233 55574059 55574229 128 - chr12:55574103-55574189 NA NA NA NA NA chr12-232 55473165 55473471 170 - chr12:55473303-55473337 NA NA NA NA NA chr12-231 55089558 55089844 255 - chr12:55089565-55089727 NA NA NA NA NA chr12-230 54706449 54706797 265 - chr12:54706451-54706520 NA NA NA NA NA chr12-229 54666899 54667191 188 - chr12:54666930-54667014 NA NA NA NA NA chr12-228 54562705 54562980 199 - chr12:54562735-54562858 NA NA NA NA NA chr12-227 54480709 54480909 167 - chr12:54480825-54480893 NA NA NA NA NA chr12-226 53971233 53971685 242 - chr12:53971513-53971685 NA NA NA NA NA chr12-27 5393551 5393823 139 - chr12:5393744-5393750 NA NA NA NA NA chr12-225 53931374 53931965 287 - chr12:53931757-53931898 NA NA NA NA NA chr12-224 53484391 53484626 144 - chr12:53484474-53484511 NA NA NA NA NA chr12-223 52966887 52967163 212 - chr12:52966946-52967094 NA NA NA NA NA chr12-222 50820951 50821166 161 - chr12:50820957-50821064 NA NA NA NA NA chr12-221 50714114 50714389 125 - chr12:50714298-50714341 NA NA NA NA NA chr12-26 5034978 5035299 261 - chr12:5035062-5035263 NA NA NA NA NA chr12-220 50239586 50239832 190 - chr12:50239621-50239769 NA NA NA NA NA chr12-219 49823259 49823645 281 - chr12:49823287-49823463 NA NA NA NA NA chr12-218 49180754 49180987 215 - chr12:49180775-49180978 NA NA NA NA NA chr12-217 48771475 48771762 211 - chr12:48771530-48771665 NA NA NA NA NA chr12-216 48529739 48530050 270 - chr12:48529792-48529939 NA NA NA NA NA chr12-215 48494373 48494629 118 - chr12:48494466-48494538 NA NA NA NA NA chr12-25 4836158 4836396 194 - chr12:4836331-4836395 NA NA NA NA NA chr12-214 47870118 47870324 167 - chr12:47870149-47870303 NA NA NA NA NA chr12-213 47391608 47392063 242 - chr12:47391766-47391795 NA NA NA NA NA chr12-212 47081848 47082138 191 - chr12:47081916-47082008 NA NA NA NA NA chr12-211 46895486 46895677 116 - chr12:46895503-46895544 NA NA NA NA NA chr12-210 46746575 46746715 130 - chr12:46746576-46746696 NA NA NA NA NA chr12-209 46662635 46662964 183 - chr12:46662861-46662898 NA NA NA NA NA chr12-208 46454752 46455175 170 - chr12:46455046-46455070 NA NA NA NA NA chr12-207 46404429 46404685 121 - chr12:46404608-46404684 NA NA NA NA NA chr12-206 46291385 46291909 338 - chr12:46291627-46291876 NA NA NA NA NA chr12-24 4598776 4599106 157 - chr12:4598983-4599035 NA NA NA NA NA chr12-205 45860710 45861025 204 - chr12:45860851-45860944 NA NA NA NA NA chr12-204 45848891 45849344 240 - chr12:45849103-45849130 NA NA NA NA NA chr12-23 4578142 4578350 173 - chr12:4578194-4578332 NA NA NA NA NA chr12-203 44759891 44760219 247 - chr12:44759949-44760169 NA NA NA NA NA chr12-202 44630738 44630998 161 - chr12:44630783-44630911 NA NA NA NA NA chr12-201 44598215 44598631 180 - chr12:44598480-44598482 NA NA NA NA NA chr12-200 44594313 44594665 171 - chr12:44594544-44594613 NA NA NA NA NA chr12-199 44011837 44012076 193 - chr12:44011931-44012046 NA NA NA NA NA chr12-198 43920984 43921341 185 - chr12:43921067-43921080 NA NA NA NA NA chr12-22 4380692 4381124 173 - chr12:4380984-4381004 NA NA NA NA NA chr12-3 433903 434123 143 - chr12:434003-434115 NA NA NA NA NA chr12-197 42972547 42972705 125 - chr12:42972603-42972695 NA NA NA NA NA chr12-196 42811131 42811413 192 - chr12:42811190-42811292 NA NA NA NA NA chr12-195 42642986 42643191 154 - chr12:42643016-42643133 NA NA NA NA NA chr12-194 42620082 42620459 201 - chr12:42620348-42620373 NA NA NA NA NA chr12-21 4243389 4243756 230 - chr12:4243625-4243718 NA NA NA NA NA chr12-193 42406375 42406686 206 - chr12:42406420-42406591 NA NA NA NA NA chr12-192 42129126 42129430 267 - chr12:42129160-42129392 NA NA NA NA NA chr12-20 4212577 4212855 161 - chr12:4212688-4212810 NA NA NA NA NA chr12-191 41929017 41929963 513 - chr12:41929758-41929960 NA NA NA NA NA chr12-190 41578703 41578881 146 - chr12:41578746-41578860 NA NA NA NA NA chr12-189 41567390 41567578 117 - chr12:41567422-41567480 NA NA NA NA NA chr12-188 41456790 41457112 228 - chr12:41456955-41457089 NA NA NA NA NA chr12-187 41448370 41448827 213 - chr12:41448648-41448658 NA NA NA NA NA chr12-186 41056045 41056331 174 - chr12:41056223-41056241 NA NA NA NA NA chr12-185 40912232 40912482 133 - chr12:40912268-40912284 NA NA NA NA NA chr12-184 40851558 40851930 203 - chr12:40851800-40851916 NA NA NA NA NA chr12-183 40823582 40823906 180 - chr12:40823677-40823713 NA NA NA NA NA chr12-182 40666608 40666970 257 - chr12:40666701-40666853 NA NA NA NA NA chr12-181 40379272 40379559 173 - chr12:40379343-40379478 NA NA NA NA NA chr12-180 40291446 40291904 257 - chr12:40291708-40291764 NA NA NA NA NA chr12-179 40207440 40207720 148 - chr12:40207592-40207648 NA NA NA NA NA chr12-178 39934783 39935269 258 - chr12:39935044-39935074 NA NA NA NA NA chr12-177 39921477 39921677 171 - chr12:39921540-39921624 NA NA NA NA NA chr12-176 39551372 39551807 319 - chr12:39551517-39551778 NA NA NA NA NA chr12-175 39387732 39388108 234 - chr12:39387990-39388052 NA NA NA NA NA chr12-174 39245488 39245959 275 - chr12:39245610-39245941 NA NA NA NA NA chr12-173 39176214 39176384 145 - chr12:39176226-39176346 NA NA NA NA NA chr12-172 38889541 38889896 189 - chr12:38889639-38889699 NA NA NA NA NA chr12-171 38727849 38728038 118 - chr12:38727859-38727906 NA NA NA NA NA chr12-170 38606865 38607030 139 - chr12:38606969-38607030 NA NA NA NA NA chr12-19 3860345 3860689 222 - chr12:3860490-3860590 NA NA NA NA NA chr12-169 38582155 38582457 214 - chr12:38582252-38582378 NA NA NA NA NA chr12-168 38553354 38553604 176 - chr12:38553470-38553572 NA NA NA NA NA chr12-18 3796583 3796889 180 - chr12:3796656-3796710 NA NA NA NA NA chr12-167 37923134 37923392 219 - chr12:37923147-37923327 NA NA NA NA NA chr12-166 37280719 37280967 170 - chr12:37280753-37280845 NA NA NA NA NA chr12-17 3713274 3713473 159 - chr12:3713377-3713416 NA NA NA NA NA chr12-165 34661804 34662229 214 - chr12:34661982-34661985 NA NA NA NA NA chr12-164 34648789 34649121 220 - chr12:34648935-34649043 NA NA NA NA NA chr12-16 3446810 3447111 259 - chr12:3446821-3447038 NA NA NA NA NA chr12-163 34426376 34426534 155 - chr12:34426379-34426531 NA NA NA NA NA chr12-162 33863271 33863464 137 - chr12:33863314-33863369 NA NA NA NA NA chr12-161 33837061 33837430 324 - chr12:33837240-33837429 NA NA NA NA NA chr12-160 33748987 33749325 174 - chr12:33749138-33749148 NA NA NA NA NA chr12-159 33564465 33564780 175 - chr12:33564628-33564663 NA NA NA NA NA chr12-158 33451083 33451447 259 - chr12:33451209-33451433 NA NA NA NA NA chr12-157 33428478 33428718 203 - chr12:33428512-33428672 NA NA NA NA NA chr12-156 32781857 32782017 136 - chr12:32781861-32781973 NA NA NA NA NA chr12-155 32685981 32686405 208 - chr12:32686242-32686378 NA NA NA NA NA chr12-154 32570596 32570824 117 - chr12:32570676-32570756 NA NA NA NA NA chr12-153 32409885 32410089 137 - chr12:32410019-32410089 NA NA NA NA NA chr12-152 32217131 32217362 190 - chr12:32217213-32217362 NA NA NA NA NA chr12-151 31545991 31546275 160 - chr12:31546189-31546225 NA NA NA NA NA chr12-150 31524106 31524394 141 - chr12:31524190-31524226 NA NA NA NA NA chr12-149 30746210 30746450 189 - chr12:30746386-30746422 NA NA NA NA NA chr12-15 3017481 3017762 181 - chr12:3017639-3017720 NA NA NA NA NA chr12-148 29987171 29987679 383 - chr12:29987325-29987583 NA NA NA NA NA chr12-147 29785821 29786144 209 - chr12:29786016-29786057 NA NA NA NA NA chr12-146 29557235 29557464 153 - chr12:29557354-29557431 NA NA NA NA NA chr12-145 29438783 29439093 172 - chr12:29438836-29438870 NA NA NA NA NA chr12-144 29371648 29371929 175 - chr12:29371818-29371887 NA NA NA NA NA chr12-143 29363250 29363422 133 - chr12:29363307-29363401 NA NA NA NA NA chr12-142 29267643 29268083 189 - chr12:29267726-29267776 NA NA NA NA NA chr12-141 29153303 29153559 131 - chr12:29153488-29153494 NA NA NA NA NA chr12-14 2908457 2908669 146 - chr12:2908482-2908562 NA NA NA NA NA chr12-140 28595085 28595317 154 - chr12:28595223-28595299 NA NA NA NA NA chr12-139 28435619 28435847 149 - chr12:28435772-28435842 NA NA NA NA NA chr12-138 28323077 28323391 195 - chr12:28323194-28323266 NA NA NA NA NA chr12-137 28173087 28173478 205 - chr12:28173228-28173371 NA NA NA NA NA chr12-136 27938607 27939215 234 - chr12:27939133-27939150 NA NA NA NA NA chr12-135 27481549 27481831 200 - chr12:27481687-27481805 NA NA NA NA NA chr12-134 27463217 27463413 160 - chr12:27463247-27463395 NA NA NA NA NA chr12-133 27243110 27243450 236 - chr12:27243260-27243392 NA NA NA NA NA chr12-132 27186048 27186290 134 - chr12:27186147-27186245 NA NA NA NA NA chr12-131 27019657 27019926 166 - chr12:27019762-27019825 NA NA NA NA NA chr12-130 26809438 26809733 147 - chr12:26809628-26809711 NA NA NA NA NA chr12-2 260310 260561 222 - chr12:260311-260504 NA NA NA NA NA chr12-129 25959691 25960105 223 - chr12:25959914-25959946 NA NA NA NA NA chr12-128 25730703 25730946 143 - chr12:25730770-25730813 NA NA NA NA NA chr12-127 25720235 25720490 147 - chr12:25720365-25720404 NA NA NA NA NA chr12-126 24981092 24981446 286 - chr12:24981102-24981320 NA NA NA NA NA chr12-125 24870435 24870647 113 - chr12:24870507-24870521 NA NA NA NA NA chr12-124 24783000 24783342 227 - chr12:24783005-24783117 NA NA NA NA NA chr12-123 24640992 24641151 154 - chr12:24641001-24641140 NA NA NA NA NA chr12-122 24201298 24201677 297 - chr12:24201305-24201520 NA NA NA NA NA chr12-13 2401786 2402223 300 - chr12:2401998-2402161 NA NA NA NA NA chr12 238550 238951 267 - chr12:238584-238717 NA NA NA NA NA chr12-12 2371644 2371931 232 - chr12:2371650-2371827 NA NA NA NA NA chr12-11 2307682 2308056 234 - chr12:2307742-2307836 NA NA NA NA NA chr12-121 22907019 22907212 115 - chr12:22907089-22907126 NA NA NA NA NA chr12-120 22872473 22872660 121 - chr12:22872539-22872594 NA NA NA NA NA chr12-119 22843977 22844262 199 - chr12:22844090-22844203 NA NA NA NA NA chr12-118 22691359 22691751 261 - chr12:22691408-22691538 NA NA NA NA NA chr12-117 22658538 22658834 144 - chr12:22658706-22658730 NA NA NA NA NA chr12-116 22598231 22598601 207 - chr12:22598414-22598498 NA NA NA NA NA chr12-115 22571581 22571792 146 - chr12:22571682-22571739 NA NA NA NA NA chr12-114 22489528 22489899 202 - chr12:22489742-22489745 NA NA NA NA NA chr12-113 22365574 22365899 165 - chr12:22365769-22365844 NA NA NA NA NA chr12-112 22258982 22259168 132 - chr12:22259021-22259099 NA NA NA NA NA chr12-111 22081489 22081638 125 - chr12:22081504-22081611 NA NA NA NA NA chr12-110 21729932 21730116 116 - chr12:21730051-21730065 NA NA NA NA NA chr12-109 21184096 21184337 183 - chr12:21184209-21184334 NA NA NA NA NA chr12-10 2101405 2101671 193 - chr12:2101420-2101540 NA NA NA NA NA chr12-108 20722701 20722941 152 - chr12:20722713-20722777 NA NA NA NA NA chr12-107 20503422 20503556 121 - chr12:20503425-20503513 NA NA NA NA NA chr12-106 19664247 19664539 223 - chr12:19664326-19664480 NA NA NA NA NA chr12-105 19180223 19180492 116 - chr12:19180277-19180306 NA NA NA NA NA chr12-104 18979859 18980350 398 - chr12:18979859-18980226 NA NA NA NA NA chr12-103 18673822 18674066 177 - chr12:18673878-18673988 NA NA NA NA NA chr12-102 18421440 18421772 246 - chr12:18421685-18421739 NA NA NA NA NA chr12-101 18280391 18280702 260 - chr12:18280455-18280690 NA NA NA NA NA chr12-100 18137562 18138025 333 - chr12:18137693-18137942 NA NA NA NA NA chr12-99 18100685 18100954 161 - chr12:18100865-18100918 NA NA NA NA NA chr12-98 18058285 18058529 195 - chr12:18058439-18058487 NA NA NA NA NA chr12-97 17907124 17907406 138 - chr12:17907210-17907300 NA NA NA NA NA chr12-96 17282407 17282688 178 - chr12:17282561-17282602 NA NA NA NA NA chr12-95 17124977 17125392 183 - chr12:17125243-17125262 NA NA NA NA NA chr12-94 16986661 16986958 169 - chr12:16986793-16986842 NA NA NA NA NA chr12-93 16938368 16938766 249 - chr12:16938671-16938709 NA NA NA NA NA chr12-92 16932356 16932715 262 - chr12:16932356-16932521 NA NA NA NA NA chr12-9 1658014 1658199 125 - chr12:1658109-1658174 NA NA NA NA NA chr12-91 16350083 16350408 230 - chr12:16350162-16350297 NA NA NA NA NA chr12-90 16299128 16299443 187 - chr12:16299142-16299277 NA NA NA NA NA chr12-89 15933417 15933619 132 - chr12:15933533-15933595 NA NA NA NA NA chr12-88 15686504 15686773 217 - chr12:15686660-15686721 NA NA NA NA NA chr12-87 15572609 15572841 142 - chr12:15572640-15572752 NA NA NA NA NA chr12-86 15561153 15561437 217 - chr12:15561279-15561429 NA NA NA NA NA chr12-85 15415732 15416195 199 - chr12:15416020-15416043 NA NA NA NA NA chr12-84 15315018 15315455 263 - chr12:15315258-15315321 NA NA NA NA NA chr12-83 15183014 15183136 113 - chr12:15183021-15183125 NA NA NA NA NA chr12-82 15100397 15100629 169 - chr12:15100423-15100529 NA NA NA NA NA chr12-81 14983148 14983481 152 - chr12:14983388-14983477 NA NA NA NA NA chr12-80 14894435 14894791 310 - chr12:14894619-14894791 NA NA NA NA NA chr12-79 14874956 14875204 122 - chr12:14875104-14875184 NA NA NA NA NA chr12-78 14655224 14655517 234 - chr12:14655234-14655311 NA NA NA NA NA chr12-77 14630183 14630376 123 - chr12:14630193-14630246 NA NA NA NA NA chr12-76 14609652 14609967 208 - chr12:14609689-14609790 NA NA NA NA NA chr12-75 14446330 14446559 164 - chr12:14446354-14446478 NA NA NA NA NA chr12-74 14383977 14384284 226 - chr12:14384008-14384207 NA NA NA NA NA chr12-73 14071355 14071586 161 - chr12:14071377-14071500 NA NA NA NA NA chr12-72 14070549 14070798 173 - chr12:14070660-14070757 NA NA NA NA NA chr12-71 13931976 13932234 160 - chr12:13932059-13932091 NA NA NA NA NA chr12-8 1386773 1387110 187 - chr12:1386837-1386874 NA NA NA NA NA chr12-70 13862190 13862641 192 - chr12:13862511-13862568 NA NA NA NA NA chr12-69 13702817 13703090 190 - chr12:13702921-13703070 NA NA NA NA NA chr12-68 13654256 13654613 273 - chr12:13654445-13654564 NA NA NA NA NA chr12-67 13566414 13566774 223 - chr12:13566647-13566733 NA NA NA NA NA chr12-66 13440413 13440813 203 - chr12:13440596-13440602 NA NA NA NA NA chr12-421 132906031 132906440 209 - chr12:132906229-132906281 NA NA NA NA NA chr12-420 132816327 132816571 191 - chr12:132816336-132816474 NA NA NA NA NA chr12-419 132714451 132714830 229 - chr12:132714603-132714682 NA NA NA NA NA chr12-418 132667521 132667756 182 - chr12:132667536-132667604 NA NA NA NA NA chr12-417 132533512 132533773 248 - chr12:132533531-132533766 NA NA NA NA NA chr12-65 13244159 13244643 264 - chr12:13244377-13244417 NA NA NA NA NA chr12-416 132301791 132302197 262 - chr12:132301918-132302002 NA NA NA NA NA chr12-415 132013675 132014015 285 - chr12:132013735-132013965 NA NA NA NA NA chr12-414 131813949 131814213 136 - chr12:131814047-131814075 NA NA NA NA NA chr12-413 131257213 131257433 177 - chr12:131257213-131257347 NA NA NA NA NA chr12-412 131141634 131141925 198 - chr12:131141691-131141724 NA NA NA NA NA chr12-411 130813037 130813197 139 - chr12:130813092-130813168 NA NA NA NA NA chr12-410 130756450 130756614 149 - chr12:130756452-130756556 NA NA NA NA NA chr12-409 130268332 130268716 161 - chr12:130268360-130268428 NA NA NA NA NA chr12-64 13017638 13017947 204 - chr12:13017810-13017909 NA NA NA NA NA chr12-63 13014115 13014328 123 - chr12:13014232-13014265 NA NA NA NA NA chr12-408 129702018 129702297 135 - chr12:129702210-129702297 NA NA NA NA NA chr12-62 12953882 12954087 188 - chr12:12953885-12954056 NA NA NA NA NA chr12-407 129435931 129436114 143 - chr12:129435969-129436068 NA NA NA NA NA chr12-406 128498929 128499328 162 - chr12:128499066-128499120 NA NA NA NA NA chr12-405 128016950 128017097 123 - chr12:128016961-128017076 NA NA NA NA NA chr12-404 127941033 127941517 318 - chr12:127941046-127941300 NA NA NA NA NA chr12-403 127761557 127761790 186 - chr12:127761587-127761692 NA NA NA NA NA chr12-61 12754703 12755148 181 - chr12:12754979-12755072 NA NA NA NA NA chr12-7 1273685 1274133 230 - chr12:1273949-1273961 NA NA NA NA NA chr12-402 127120346 127120593 173 - chr12:127120423-127120522 NA NA NA NA NA chr12-60 12684778 12685049 215 - chr12:12684862-12685021 NA NA NA NA NA chr12-401 126717035 126717351 209 - chr12:126717200-126717302 NA NA NA NA NA chr12-400 126596760 126597007 144 - chr12:126596890-126596985 NA NA NA NA NA chr12-399 126538990 126539482 291 - chr12:126539383-126539421 NA NA NA NA NA chr12-398 126501031 126501262 175 - chr12:126501111-126501230 NA NA NA NA NA chr12-59 12625189 12625597 249 - chr12:12625391-12625481 NA NA NA NA NA chr12-397 125842605 125842799 118 - chr12:125842739-125842781 NA NA NA NA NA chr12-396 125824240 125824729 156 - chr12:125824603-125824637 NA NA NA NA NA chr12-395 125578457 125578705 145 - chr12:125578540-125578542 NA NA NA NA NA chr12-394 125525288 125525518 209 - chr12:125525341-125525487 NA NA NA NA NA chr12-393 125507353 125507554 137 - chr12:125507379-125507452 NA NA NA NA NA chr12-392 124970551 124970725 157 - chr12:124970573-124970713 NA NA NA NA NA chr12-391 124944420 124944736 150 - chr12:124944602-124944618 NA NA NA NA NA chr12-390 124231755 124232056 196 - chr12:124231784-124231945 NA NA NA NA NA chr12-58 12400959 12401133 131 - chr12:12401000-12401088 NA NA NA NA NA chr12-57 12336302 12336549 155 - chr12:12336455-12336518 NA NA NA NA NA chr12-389 123147194 123147470 141 - chr12:123147246-123147342 NA NA NA NA NA chr12-56 12293947 12294194 122 - chr12:12293955-12294030 NA NA NA NA NA chr12-388 122828734 122828920 119 - chr12:122828750-122828802 NA NA NA NA NA chr12-387 122569929 122570293 193 - chr12:122570172-122570224 NA NA NA NA NA chr12-386 122162736 122162882 142 - chr12:122162747-122162877 NA NA NA NA NA chr12-385 122090574 122090789 124 - chr12:122090702-122090735 NA NA NA NA NA chr12-384 121986959 121987123 119 - chr12:121986997-121987071 NA NA NA NA NA chr12-55 12165991 12166273 171 - chr12:12166089-12166149 NA NA NA NA NA chr12-383 121140697 121141296 294 - chr12:121141162-121141166 NA NA NA NA NA chr12-382 120275819 120276072 185 - chr12:120275831-120275948 NA NA NA NA NA chr12-381 119979796 119980121 147 - chr12:119979884-119979913 NA NA NA NA NA chr12-54 11900517 11900727 144 - chr12:11900592-11900670 NA NA NA NA NA chr12-380 118953917 118954225 139 - chr12:118953984-118954022 NA NA NA NA NA chr12-379 118740876 118741138 190 - chr12:118740944-118741052 NA NA NA NA NA chr12-6 1186699 1187146 227 - chr12:1186840-1186847 NA NA NA NA NA chr12-378 117648935 117649553 345 - chr12:117649038-117649110 NA NA NA NA NA chr12-53 11695738 11696016 131 - chr12:11695933-11696013 NA NA NA NA NA chr12-377 116513718 116513897 131 - chr12:116513725-116513808 NA NA NA NA NA chr12-376 116445119 116445334 123 - chr12:116445137-116445168 NA NA NA NA NA chr12-375 116250207 116250571 180 - chr12:116250252-116250310 NA NA NA NA NA chr12-374 116105209 116105559 154 - chr12:116105459-116105525 NA NA NA NA NA chr12-373 116073512 116073714 142 - chr12:116073570-116073652 NA NA NA NA NA chr12-372 115895734 115896036 155 - chr12:115895879-115895887 NA NA NA NA NA chr12-371 115831106 115831563 267 - chr12:115831300-115831377 NA NA NA NA NA chr12-370 115734053 115734242 131 - chr12:115734095-115734168 NA NA NA NA NA chr12-369 115693349 115693841 366 - chr12:115693482-115693785 NA NA NA NA NA chr12-368 115602357 115602772 268 - chr12:115602442-115602570 NA NA NA NA NA chr12-367 115415913 115416459 297 - chr12:115416054-115416185 NA NA NA NA NA chr12-366 115400874 115401283 247 - chr12:115400945-115401138 NA NA NA NA NA chr12-365 115323479 115323779 159 - chr12:115323609-115323627 NA NA NA NA NA chr12-364 115224138 115224601 197 - chr12:115224349-115224375 NA NA NA NA NA chr12-363 114794825 114795065 186 - chr12:114794854-114794986 NA NA NA NA NA chr12-362 114492129 114492393 138 - chr12:114492261-114492285 NA NA NA NA NA chr12-361 112283396 112283891 183 - chr12:112283622-112283710 NA NA NA NA NA chr12-360 111977760 111978397 332 - chr12:111978024-111978051 NA NA NA NA NA chr12-359 111077726 111077880 130 - chr12:111077789-111077869 NA NA NA NA NA chr12-358 110955578 110955786 138 - chr12:110955610-110955678 NA NA NA NA NA chr12-357 110783661 110784039 221 - chr12:110783926-110783990 NA NA NA NA NA chr12-356 110781838 110782074 126 - chr12:110781893-110781909 NA NA NA NA NA chr12-355 109950897 109951103 161 - chr12:109950924-109951052 NA NA NA NA NA chr12-354 108155915 108156184 150 - chr12:108156064-108156155 NA NA NA NA NA chr12-353 107930340 107930519 155 - chr12:107930407-107930490 NA NA NA NA NA chr12-352 107768454 107768636 117 - chr12:107768503-107768555 NA NA NA NA NA chr12-351 107745684 107746303 245 - chr12:107745860-107745863 NA NA NA NA NA chr12-350 107245206 107245461 229 - chr12:107245300-107245451 NA NA NA NA NA chr12-349 107116903 107117132 169 - chr12:107116909-107117058 NA NA NA NA NA chr12-348 106918494 106918697 148 - chr12:106918566-106918659 NA NA NA NA NA chr12-347 106847819 106848147 237 - chr12:106847834-106847980 NA NA NA NA NA chr12-346 106706669 106706880 185 - chr12:106706750-106706857 NA NA NA NA NA chr12-345 106659139 106659371 141 - chr12:106659287-106659337 NA NA NA NA NA chr12-52 10658832 10659141 176 - chr12:10658945-10658988 NA NA NA NA NA chr12-344 106243784 106244385 192 - chr12:106243860-106243865 NA NA NA NA NA chr12-343 105652336 105652616 157 - chr12:105652398-105652432 NA NA NA NA NA chr12-51 10562018 10562252 153 - chr12:10562083-10562123 NA NA NA NA NA chr12-342 105547564 105547780 201 - chr12:105547565-105547751 NA NA NA NA NA chr12-341 105497711 105498173 298 - chr12:105497875-105498009 NA NA NA NA NA chr12-340 104184922 104185109 152 - chr12:104185017-104185094 NA NA NA NA NA chr12-50 10407374 10407750 227 - chr12:10407465-10407565 NA NA NA NA NA chr12-339 103358831 103359027 127 - chr12:103358930-103358988 NA NA NA NA NA chr12-338 102855190 102855560 199 - chr12:102855308-102855336 NA NA NA NA NA chr12-337 101903405 101903650 188 - chr12:101903485-101903616 NA NA NA NA NA chr12-336 101805729 101806095 193 - chr12:101805838-101805851 NA NA NA NA NA chr12-335 101596503 101596842 172 - chr12:101596632-101596637 NA NA NA NA NA chr12-334 101580299 101580534 208 - chr12:101580357-101580484 NA NA NA NA NA chr12-333 101405317 101405713 180 - chr12:101405532-101405537 NA NA NA NA NA chr12-332 100916889 100917126 189 - chr12:100917073-100917118 NA NA NA NA NA chr12-331 100727080 100727431 140 - chr12:100727327-100727328 NA NA NA NA NA chr12-49 10066693 10066973 231 - chr12:10066868-10066952 NA NA NA NA NA chr12-48 10034534 10034835 189 - chr12:10034611-10034688 NA NA NA NA NA chr11-343 99954055 99954293 182 - chr11:99954151-99954277 NA NA NA NA NA chr11-342 99631028 99631409 216 - chr11:99631044-99631095 NA NA NA NA NA chr11-341 99480066 99480295 158 - chr11:99480090-99480177 NA NA NA NA NA chr11-340 99328171 99328581 252 - chr11:99328355-99328449 NA NA NA NA NA chr11-339 98904895 98905121 191 - chr11:98904923-98905065 NA NA NA NA NA chr11-338 98725821 98726122 152 - chr11:98725980-98725983 NA NA NA NA NA chr11-337 98638539 98638768 120 - chr11:98638657-98638668 NA NA NA NA NA chr11-336 98371212 98371507 240 - chr11:98371287-98371362 NA NA NA NA NA chr11-335 98188691 98189161 227 - chr11:98188854-98188869 NA NA NA NA NA chr11-334 98141345 98141793 264 - chr11:98141526-98141584 NA NA NA NA NA chr11-333 97486947 97487219 177 - chr11:97487134-97487142 NA NA NA NA NA chr11-27 9734521 9734807 196 - chr11:9734651-9734787 NA NA NA NA NA chr11-332 96600448 96600639 123 - chr11:96600496-96600551 NA NA NA NA NA chr11-331 96583821 96584165 174 - chr11:96583992-96583998 NA NA NA NA NA chr11-330 96375837 96376038 196 - chr11:96375854-96376035 NA NA NA NA NA chr11-329 96257983 96258253 194 - chr11:96258028-96258071 NA NA NA NA NA chr11-328 95784722 95785060 199 - chr11:95784931-95784991 NA NA NA NA NA chr11-327 95766642 95766897 160 - chr11:95766774-95766839 NA NA NA NA NA chr11-326 95555563 95555777 128 - chr11:95555735-95555777 NA NA NA NA NA chr11-26 9498407 9498785 217 - chr11:9498668-9498724 NA NA NA NA NA chr11-25 9492709 9492997 218 - chr11:9492722-9492770 NA NA NA NA NA chr11-325 94822465 94822660 154 - chr11:94822471-94822514 NA NA NA NA NA chr11-324 94589128 94589500 193 - chr11:94589198-94589212 NA NA NA NA NA chr11-323 94411199 94411647 231 - chr11:94411327-94411341 NA NA NA NA NA chr11-322 93310661 93311003 268 - chr11:93310873-93310975 NA NA NA NA NA chr11-321 92895063 92895502 252 - chr11:92895326-92895491 NA NA NA NA NA chr11-320 92680196 92680560 253 - chr11:92680235-92680425 NA NA NA NA NA chr11-319 92496343 92496668 182 - chr11:92496529-92496654 NA NA NA NA NA chr11-318 91879831 91880045 133 - chr11:91879863-91879915 NA NA NA NA NA chr11-317 91195357 91195707 197 - chr11:91195468-91195540 NA NA NA NA NA chr11-316 91099451 91099613 114 - chr11:91099459-91099557 NA NA NA NA NA chr11-315 90260757 90260985 185 - chr11:90260838-90260980 NA NA NA NA NA chr11-314 90249086 90249534 154 - chr11:90249106-90249162 NA NA NA NA NA chr11-313 90190973 90191108 117 - chr11:90190998-90191097 NA NA NA NA NA chr11-24 8908425 8908621 145 - chr11:8908500-8908594 NA NA NA NA NA chr11-312 88676931 88677252 199 - chr11:88677155-88677232 NA NA NA NA NA chr11-311 88655719 88655963 222 - chr11:88655742-88655942 NA NA NA NA NA chr11-310 88626557 88626766 138 - chr11:88626656-88626723 NA NA NA NA NA chr11-309 88481885 88482117 133 - chr11:88481999-88482023 NA NA NA NA NA chr11-23 8835522 8835735 131 - chr11:8835620-8835701 NA NA NA NA NA chr11-308 88311033 88311247 184 - chr11:88311060-88311208 NA NA NA NA NA chr11-307 88296168 88296421 225 - chr11:88296217-88296358 NA NA NA NA NA chr11-306 88210828 88210958 122 - chr11:88210840-88210954 NA NA NA NA NA chr11-305 87595471 87595766 187 - chr11:87595530-87595609 NA NA NA NA NA chr11-304 87316401 87316657 174 - chr11:87316509-87316601 NA NA NA NA NA chr11-303 86944867 86945188 158 - chr11:86945021-86945022 NA NA NA NA NA chr11-302 86906905 86907088 129 - chr11:86906972-86907047 NA NA NA NA NA chr11-301 86648643 86648892 165 - chr11:86648744-86648825 NA NA NA NA NA chr11-300 86618490 86618714 176 - chr11:86618537-86618665 NA NA NA NA NA chr11-299 86561436 86561740 169 - chr11:86561645-86561679 NA NA NA NA NA chr11-298 86502692 86502885 137 - chr11:86502823-86502854 NA NA NA NA NA chr11-297 86323046 86323395 176 - chr11:86323240-86323243 NA NA NA NA NA chr11-296 85615583 85615960 202 - chr11:85615791-85615796 NA NA NA NA NA chr11-295 85216880 85217067 149 - chr11:85216901-85217012 NA NA NA NA NA chr11-294 84995276 84995634 180 - chr11:84995492-84995494 NA NA NA NA NA chr11-293 84798872 84799194 215 - chr11:84798986-84799108 NA NA NA NA NA chr11-22 8423715 8424098 197 - chr11:8423813-8423849 NA NA NA NA NA chr11-292 84083381 84083694 203 - chr11:84083505-84083598 NA NA NA NA NA chr11-291 84080061 84080267 168 - chr11:84080131-84080261 NA NA NA NA NA chr11-290 84017945 84018253 155 - chr11:84018074-84018092 NA NA NA NA NA chr11-289 83876993 83877521 292 - chr11:83877213-83877237 NA NA NA NA NA chr11-288 83744670 83744988 144 - chr11:83744870-83744956 NA NA NA NA NA chr11-287 83714228 83714395 118 - chr11:83714256-83714283 NA NA NA NA NA chr11-286 83702889 83703279 214 - chr11:83702918-83703054 NA NA NA NA NA chr11-285 83560699 83560985 175 - chr11:83560831-83560881 NA NA NA NA NA chr11-284 83535863 83536043 137 - chr11:83535906-83536000 NA NA NA NA NA chr11-283 83461714 83461938 129 - chr11:83461843-83461877 NA NA NA NA NA chr11-282 83288666 83289090 214 - chr11:83288814-83288958 NA NA NA NA NA chr11-281 83091723 83092040 205 - chr11:83091853-83091934 NA NA NA NA NA chr11-280 83055606 83055850 147 - chr11:83055706-83055762 NA NA NA NA NA chr11-279 82770147 82770358 123 - chr11:82770161-82770196 NA NA NA NA NA chr11-278 82480384 82480571 168 - chr11:82480423-82480534 NA NA NA NA NA chr11-277 82247904 82248209 221 - chr11:82248022-82248159 NA NA NA NA NA chr11-276 82231067 82231219 126 - chr11:82231156-82231214 NA NA NA NA NA chr11-275 82229850 82230108 204 - chr11:82229919-82229961 NA NA NA NA NA chr11-274 82153117 82153493 223 - chr11:82153390-82153460 NA NA NA NA NA chr11-273 82099742 82099976 126 - chr11:82099838-82099856 NA NA NA NA NA chr11-272 81980159 81980354 123 - chr11:81980236-81980287 NA NA NA NA NA chr11-271 81803613 81803896 136 - chr11:81803723-81803810 NA NA NA NA NA chr11-21 8160188 8160369 139 - chr11:8160272-8160369 NA NA NA NA NA chr11-270 81436889 81437264 274 - chr11:81437026-81437199 NA NA NA NA NA chr11-269 81212710 81212850 123 - chr11:81212732-81212838 NA NA NA NA NA chr11-268 80954778 80954955 165 - chr11:80954782-80954919 NA NA NA NA NA chr11-267 80579619 80579956 178 - chr11:80579813-80579832 NA NA NA NA NA chr11-266 80212432 80212621 143 - chr11:80212523-80212620 NA NA NA NA NA chr11-265 80164456 80164696 199 - chr11:80164618-80164694 NA NA NA NA NA chr11-264 79888543 79888750 178 - chr11:79888564-79888697 NA NA NA NA NA chr11-263 79577598 79577836 200 - chr11:79577681-79577767 NA NA NA NA NA chr11-262 79203394 79204007 333 - chr11:79203908-79203921 NA NA NA NA NA chr11-261 78824636 78825077 217 - chr11:78824881-78824916 NA NA NA NA NA chr11-260 78823332 78824030 335 - chr11:78823614-78823717 NA NA NA NA NA chr11-259 78809731 78810180 328 - chr11:78809821-78809966 NA NA NA NA NA chr11-258 78718375 78718740 194 - chr11:78718683-78718706 NA NA NA NA NA chr11-257 78716172 78716350 152 - chr11:78716200-78716326 NA NA NA NA NA chr11-256 78708057 78708465 217 - chr11:78708290-78708316 NA NA NA NA NA chr11-255 78444158 78444323 117 - chr11:78444205-78444274 NA NA NA NA NA chr11-254 78424282 78424940 304 - chr11:78424588-78424628 NA NA NA NA NA chr11-253 78218623 78218830 128 - chr11:78218697-78218746 NA NA NA NA NA chr11-252 78032767 78032916 113 - chr11:78032790-78032841 NA NA NA NA NA chr11-251 77828736 77829078 191 - chr11:77828886-77828926 NA NA NA NA NA chr11-250 77782560 77782807 153 - chr11:77782567-77782684 NA NA NA NA NA chr11-249 77722115 77722681 311 - chr11:77722424-77722444 NA NA NA NA NA chr11-248 77675753 77676105 274 - chr11:77675786-77676012 NA NA NA NA NA chr11-247 77639795 77639983 121 - chr11:77639815-77639869 NA NA NA NA NA chr11-246 77451588 77452069 306 - chr11:77451811-77451942 NA NA NA NA NA chr11-245 77430363 77430708 159 - chr11:77430577-77430606 NA NA NA NA NA chr11-244 77268361 77268572 122 - chr11:77268483-77268516 NA NA NA NA NA chr11-243 76866570 76867003 288 - chr11:76866859-76866906 NA NA NA NA NA chr11-242 76788322 76788671 175 - chr11:76788418-76788471 NA NA NA NA NA chr11-241 76723833 76724386 325 - chr11:76723967-76724087 NA NA NA NA NA chr11-240 76700432 76700707 180 - chr11:76700458-76700543 NA NA NA NA NA chr11-239 76154122 76154637 296 - chr11:76154445-76154522 NA NA NA NA NA chr11-238 76085168 76085513 325 - chr11:76085199-76085504 NA NA NA NA NA chr11-237 75813445 75813586 126 - chr11:75813500-75813581 NA NA NA NA NA chr11-236 75675204 75675465 178 - chr11:75675289-75675384 NA NA NA NA NA chr11-235 75652976 75653236 191 - chr11:75653074-75653196 NA NA NA NA NA chr11-234 75546939 75547337 250 - chr11:75547174-75547276 NA NA NA NA NA chr11-233 75526946 75527251 184 - chr11:75527104-75527147 NA NA NA NA NA chr11-232 75242934 75243274 179 - chr11:75243123-75243197 NA NA NA NA NA chr11-231 74781556 74781911 259 - chr11:74781605-74781768 NA NA NA NA NA chr11-230 74604628 74605029 284 - chr11:74604868-74604953 NA NA NA NA NA chr11-229 74107307 74107669 210 - chr11:74107462-74107526 NA NA NA NA NA chr11-228 73919695 73919866 121 - chr11:73919770-73919841 NA NA NA NA NA chr11-227 73508137 73508345 144 - chr11:73508189-73508277 NA NA NA NA NA chr11-226 72981872 72982088 119 - chr11:72981935-72981957 NA NA NA NA NA chr11-225 72801125 72801498 204 - chr11:72801339-72801464 NA NA NA NA NA chr11-224 72036417 72036671 188 - chr11:72036455-72036577 NA NA NA NA NA chr11-20 7151737 7152009 162 - chr11:7151783-7151835 NA NA NA NA NA chr11-223 71494313 71494549 215 - chr11:71494340-71494530 NA NA NA NA NA chr11-222 70532527 70532918 253 - chr11:70532791-70532822 NA NA NA NA NA chr11-221 69647667 69647858 132 - chr11:69647735-69647808 NA NA NA NA NA chr11-19 6959689 6959886 163 - chr11:6959724-6959853 NA NA NA NA NA chr11-220 69477298 69477498 128 - chr11:69477357-69477461 NA NA NA NA NA chr11-219 69334112 69334337 127 - chr11:69334259-69334288 NA NA NA NA NA chr11-18 6920381 6920664 142 - chr11:6920560-6920655 NA NA NA NA NA chr11-218 68977340 68977603 156 - chr11:68977383-68977432 NA NA NA NA NA chr11-217 68917169 68917442 125 - chr11:68917354-68917405 NA NA NA NA NA chr11-216 68736214 68736736 298 - chr11:68736400-68736502 NA NA NA NA NA chr11-215 68567612 68567936 141 - chr11:68567845-68567903 NA NA NA NA NA chr11-214 68292481 68292840 165 - chr11:68292618-68292627 NA NA NA NA NA chr11-213 67479478 67479827 211 - chr11:67479616-67479689 NA NA NA NA NA chr11-212 67395122 67395695 320 - chr11:67395369-67395424 NA NA NA NA NA chr11-211 67373918 67374316 208 - chr11:67374114-67374128 NA NA NA NA NA chr11-210 67355590 67355877 232 - chr11:67355682-67355859 NA NA NA NA NA chr11-209 67150054 67150233 146 - chr11:67150162-67150209 NA NA NA NA NA chr11-208 67083328 67083479 135 - chr11:67083328-67083415 NA NA NA NA NA chr11-207 66977854 66978259 232 - chr11:66978128-66978187 NA NA NA NA NA chr11-206 66950612 66950906 154 - chr11:66950661-66950675 NA NA NA NA NA chr11-205 66085568 66086054 348 - chr11:66085606-66085824 NA NA NA NA NA chr11-204 65667406 65667926 272 - chr11:65667691-65667789 NA NA NA NA NA chr11-203 65537348 65537627 190 - chr11:65537521-65537622 NA NA NA NA NA chr11-202 65324886 65325252 182 - chr11:65325085-65325113 NA NA NA NA NA chr11-201 65289102 65289860 392 - chr11:65289698-65289833 NA NA NA NA NA chr11-200 65086591 65086920 223 - chr11:65086747-65086864 NA NA NA NA NA chr11-199 64942946 64943291 244 - chr11:64943122-64943162 NA NA NA NA NA chr11-198 64163669 64163830 123 - chr11:64163702-64163787 NA NA NA NA NA chr11-197 64148694 64148993 191 - chr11:64148898-64148917 NA NA NA NA NA chr11-196 63857717 63857981 139 - chr11:63857728-63857818 NA NA NA NA NA chr11-195 63683077 63683416 204 - chr11:63683086-63683155 NA NA NA NA NA chr11-194 63671486 63671675 178 - chr11:63671501-63671668 NA NA NA NA NA chr11-193 63474267 63474478 121 - chr11:63474329-63474420 NA NA NA NA NA chr11-192 63217711 63218236 281 - chr11:63217961-63217998 NA NA NA NA NA chr11-191 63201665 63201954 192 - chr11:63201733-63201828 NA NA NA NA NA chr11-190 61948758 61949021 183 - chr11:61948811-61948860 NA NA NA NA NA chr11-189 61908445 61908874 295 - chr11:61908585-61908722 NA NA NA NA NA chr11-188 61091008 61091329 259 - chr11:61091105-61091302 NA NA NA NA NA chr11-187 60975032 60975431 213 - chr11:60975265-60975416 NA NA NA NA NA chr11-186 60336906 60337114 175 - chr11:60336920-60337024 NA NA NA NA NA chr11-185 60143020 60143361 221 - chr11:60143152-60143253 NA NA NA NA NA chr11-184 59997945 59998114 126 - chr11:59998005-59998088 NA NA NA NA NA chr11-183 59718061 59718341 199 - chr11:59718203-59718321 NA NA NA NA NA chr11-17 5860072 5860504 206 - chr11:5860318-5860338 NA NA NA NA NA chr11-182 58428125 58428315 131 - chr11:58428190-58428258 NA NA NA NA NA chr11-181 58424448 58424643 133 - chr11:58424500-58424571 NA NA NA NA NA chr11-180 57677903 57678145 190 - chr11:57678055-57678089 NA NA NA NA NA chr11-16 5747584 5748187 282 - chr11:5747946-5748112 NA NA NA NA NA chr11-179 57099353 57099643 149 - chr11:57099415-57099423 NA NA NA NA NA chr11-178 56933447 56933706 160 - chr11:56933599-56933660 NA NA NA NA NA chr11-177 56398360 56398598 199 - chr11:56398361-56398521 NA NA NA NA NA chr11-15 5613943 5614151 127 - chr11:5613988-5614009 NA NA NA NA NA chr11-176 56045939 56046184 222 - chr11:56045981-56046180 NA NA NA NA NA chr11-175 55930840 55931157 187 - chr11:55930914-55930971 NA NA NA NA NA chr11-174 55633210 55633439 135 - chr11:55633244-55633325 NA NA NA NA NA chr11-173 54975209 54975705 292 - chr11:54975354-54975375 NA NA NA NA NA chr11-172 54885645 54886261 418 - chr11:54885756-54886079 NA NA NA NA NA chr11-14 5462255 5462527 168 - chr11:5462282-5462346 NA NA NA NA NA chr11-13 5227286 5227579 146 - chr11:5227299-5227396 NA NA NA NA NA chr11-12 5106143 5106361 136 - chr11:5106209-5106263 NA NA NA NA NA chr11-11 5086292 5086468 120 - chr11:5086330-5086394 NA NA NA NA NA chr11-171 50519217 50519588 289 - chr11:50519251-50519458 NA NA NA NA NA chr11-170 50457888 50458109 166 - chr11:50457947-50458066 NA NA NA NA NA chr11-169 48282818 48283111 181 - chr11:48282999-48283022 NA NA NA NA NA chr11-168 48253737 48253962 150 - chr11:48253765-48253840 NA NA NA NA NA chr11-167 47915169 47915513 272 - chr11:47915200-47915448 NA NA NA NA NA chr11-166 47682396 47682951 279 - chr11:47682814-47682883 NA NA NA NA NA chr11-165 47579640 47579849 126 - chr11:47579763-47579806 NA NA NA NA NA chr11-164 47087015 47087379 197 - chr11:47087268-47087298 NA NA NA NA NA chr11-163 46054448 46054700 167 - chr11:46054584-46054666 NA NA NA NA NA chr11-162 45503588 45503758 128 - chr11:45503665-45503751 NA NA NA NA NA chr11-161 45231151 45231383 127 - chr11:45231257-45231279 NA NA NA NA NA chr11-10 4477607 4477879 142 - chr11:4477771-4477783 NA NA NA NA NA chr11-9 4429682 4430036 239 - chr11:4429784-4429882 NA NA NA NA NA chr11-160 43849508 43849753 172 - chr11:43849616-43849715 NA NA NA NA NA chr11-159 43723153 43723358 164 - chr11:43723158-43723281 NA NA NA NA NA chr11-158 43567318 43567613 189 - chr11:43567484-43567527 NA NA NA NA NA chr11-157 43249730 43250039 202 - chr11:43249767-43249862 NA NA NA NA NA chr11-156 43187434 43187768 207 - chr11:43187509-43187589 NA NA NA NA NA chr11-155 42985436 42985875 228 - chr11:42985781-42985838 NA NA NA NA NA chr11-154 42468631 42469213 273 - chr11:42468990-42469054 NA NA NA NA NA chr11-153 42453002 42453310 186 - chr11:42453118-42453182 NA NA NA NA NA chr11-152 42370679 42370903 145 - chr11:42370808-42370874 NA NA NA NA NA chr11-151 41869722 41869909 120 - chr11:41869731-41869784 NA NA NA NA NA chr11-8 4178138 4178519 201 - chr11:4178186-4178207 NA NA NA NA NA chr11-150 41699933 41700244 173 - chr11:41700106-41700141 NA NA NA NA NA chr11-149 41657899 41658121 220 - chr11:41657903-41658121 NA NA NA NA NA chr11-148 41515841 41516086 148 - chr11:41515878-41515957 NA NA NA NA NA chr11-147 40893100 40893297 113 - chr11:40893174-40893183 NA NA NA NA NA chr11-146 40745947 40746307 192 - chr11:40746145-40746149 NA NA NA NA NA chr11-145 40680396 40680595 130 - chr11:40680493-40680554 NA NA NA NA NA chr11-144 40657929 40658223 210 - chr11:40658023-40658149 NA NA NA NA NA chr11-143 40519183 40519350 137 - chr11:40519187-40519314 NA NA NA NA NA chr11-7 4026610 4026838 114 - chr11:4026730-4026742 NA NA NA NA NA chr11-6 4025595 4025864 155 - chr11:4025741-4025782 NA NA NA NA NA chr11-142 40083999 40084244 187 - chr11:40084006-40084135 NA NA NA NA NA chr11-141 39951406 39951641 128 - chr11:39951516-39951537 NA NA NA NA NA chr11-140 39674345 39674635 164 - chr11:39674484-39674522 NA NA NA NA NA chr11-139 39660994 39661254 154 - chr11:39661080-39661088 NA NA NA NA NA chr11-138 39568486 39568873 250 - chr11:39568592-39568643 NA NA NA NA NA chr11-137 39319557 39319739 113 - chr11:39319585-39319629 NA NA NA NA NA chr11-136 39009315 39009531 121 - chr11:39009370-39009396 NA NA NA NA NA chr11-135 38939238 38939555 162 - chr11:38939423-38939430 NA NA NA NA NA chr11-134 38679261 38679598 162 - chr11:38679478-38679549 NA NA NA NA NA chr11-5 3856769 3857019 206 - chr11:3856852-3856988 NA NA NA NA NA chr11-133 38168774 38169283 272 - chr11:38168951-38169047 NA NA NA NA NA chr11-132 37961257 37961569 182 - chr11:37961345-37961397 NA NA NA NA NA chr11-4 3792325 3792564 179 - chr11:3792354-3792494 NA NA NA NA NA chr11-131 37533087 37533305 167 - chr11:37533133-37533249 NA NA NA NA NA chr11-3 3706415 3706633 148 - chr11:3706468-3706546 NA NA NA NA NA chr11-130 36924908 36925212 181 - chr11:36925054-36925158 NA NA NA NA NA chr11-129 36901472 36901638 144 - chr11:36901485-36901607 NA NA NA NA NA chr11-128 36668159 36668546 205 - chr11:36668371-36668454 NA NA NA NA NA chr11-127 36617517 36617806 174 - chr11:36617674-36617733 NA NA NA NA NA chr11-126 36613532 36613941 263 - chr11:36613535-36613652 NA NA NA NA NA chr11-125 36508313 36508636 241 - chr11:36508410-36508569 NA NA NA NA NA chr11-124 36011566 36011986 248 - chr11:36011780-36011856 NA NA NA NA NA chr11-123 35746929 35747315 239 - chr11:35747066-35747158 NA NA NA NA NA chr11-122 35580658 35580909 136 - chr11:35580758-35580779 NA NA NA NA NA chr11-121 35569984 35570306 156 - chr11:35570098-35570107 NA NA NA NA NA chr11-120 35449736 35450100 172 - chr11:35449838-35449868 NA NA NA NA NA chr11-119 35180992 35181277 186 - chr11:35181115-35181186 NA NA NA NA NA chr11-118 35085755 35086197 235 - chr11:35085861-35086027 NA NA NA NA NA chr11-117 34811059 34811466 251 - chr11:34811285-34811455 NA NA NA NA NA chr11-116 34307820 34308587 296 - chr11:34308298-34308350 NA NA NA NA NA chr11-115 33554872 33555081 177 - chr11:33554994-33555075 NA NA NA NA NA chr11-114 33444794 33444988 154 - chr11:33444827-33444927 NA NA NA NA NA chr11-113 32997463 32997987 226 - chr11:32997879-32997939 NA NA NA NA NA chr11-112 32833369 32833514 117 - chr11:32833382-32833481 NA NA NA NA NA chr11-111 32525500 32525953 259 - chr11:32525658-32525747 NA NA NA NA NA chr11-110 32355286 32355570 178 - chr11:32355485-32355495 NA NA NA NA NA chr11-109 32266774 32267651 384 - chr11:32267413-32267579 NA NA NA NA NA chr11-108 32015016 32015287 158 - chr11:32015140-32015185 NA NA NA NA NA chr11-107 31135881 31136277 227 - chr11:31135948-31136006 NA NA NA NA NA chr11-106 30870749 30871213 217 - chr11:30871035-30871083 NA NA NA NA NA chr11-105 30590568 30590776 118 - chr11:30590604-30590692 NA NA NA NA NA chr11-104 30569327 30569585 158 - chr11:30569396-30569454 NA NA NA NA NA chr11-103 30510899 30511164 174 - chr11:30511005-30511088 NA NA NA NA NA chr11-102 30198570 30198829 164 - chr11:30198663-30198732 NA NA NA NA NA chr11-101 29453362 29453579 165 - chr11:29453366-29453479 NA NA NA NA NA chr11-100 29391368 29391625 176 - chr11:29391420-29391515 NA NA NA NA NA chr11-99 29183981 29184242 189 - chr11:29184109-29184226 NA NA NA NA NA chr11-98 29061276 29061739 198 - chr11:29061340-29061407 NA NA NA NA NA chr11-97 28874918 28875329 235 - chr11:28875186-28875245 NA NA NA NA NA chr11-96 28825533 28825921 223 - chr11:28825628-28825796 NA NA NA NA NA chr11-95 28670733 28670999 173 - chr11:28670801-28670850 NA NA NA NA NA chr11-94 28563076 28563399 276 - chr11:28563092-28563259 NA NA NA NA NA chr11-93 28472593 28472925 209 - chr11:28472725-28472811 NA NA NA NA NA chr11-92 28288814 28289127 181 - chr11:28289003-28289052 NA NA NA NA NA chr11-91 27766180 27766434 172 - chr11:27766327-27766417 NA NA NA NA NA chr11-90 27752877 27753216 202 - chr11:27753139-27753204 NA NA NA NA NA chr11-89 27338757 27339027 132 - chr11:27338774-27338860 NA NA NA NA NA chr11-88 27289247 27289436 117 - chr11:27289309-27289334 NA NA NA NA NA chr11-87 27258651 27258901 192 - chr11:27258698-27258832 NA NA NA NA NA chr11-86 27101681 27102085 185 - chr11:27101759-27101871 NA NA NA NA NA chr11-85 27008881 27009085 137 - chr11:27009004-27009074 NA NA NA NA NA chr11-84 26531358 26531734 215 - chr11:26531558-26531586 NA NA NA NA NA chr11-83 26462243 26462574 163 - chr11:26462484-26462491 NA NA NA NA NA chr11-82 26402728 26403253 205 - chr11:26402821-26402904 NA NA NA NA NA chr11-81 26128917 26129270 234 - chr11:26129001-26129116 NA NA NA NA NA chr11-80 25804810 25805197 165 - chr11:25804895-25804986 NA NA NA NA NA chr11-79 25749977 25750216 195 - chr11:25749990-25750053 NA NA NA NA NA chr11-78 25521731 25522075 190 - chr11:25521842-25521878 NA NA NA NA NA chr11-2 2545996 2546190 121 - chr11:2546042-2546090 NA NA NA NA NA chr11-77 25414231 25414449 174 - chr11:25414284-25414408 NA NA NA NA NA chr11-76 24929641 24929979 227 - chr11:24929796-24929912 NA NA NA NA NA chr11-75 24907873 24908247 261 - chr11:24907902-24908106 NA NA NA NA NA chr11-74 24842726 24843041 230 - chr11:24842788-24842887 NA NA NA NA NA chr11-73 24796582 24796918 168 - chr11:24796788-24796900 NA NA NA NA NA chr11-72 24545952 24546255 215 - chr11:24546019-24546146 NA NA NA NA NA chr11-71 24413835 24414097 173 - chr11:24413938-24414050 NA NA NA NA NA chr11-70 24384809 24385087 216 - chr11:24384952-24385059 NA NA NA NA NA chr11-69 24383961 24384227 135 - chr11:24384102-24384126 NA NA NA NA NA chr11-68 22977219 22977438 123 - chr11:22977342-22977369 NA NA NA NA NA chr11-67 22756770 22757129 206 - chr11:22756952-22757063 NA NA NA NA NA chr11-66 22593320 22593617 180 - chr11:22593377-22593440 NA NA NA NA NA chr11-65 22544899 22545074 131 - chr11:22544941-22545028 NA NA NA NA NA chr11-64 22132340 22132694 242 - chr11:22132501-22132631 NA NA NA NA NA chr11-63 22023784 22024132 192 - chr11:22023890-22023975 NA NA NA NA NA chr11-62 20366713 20366959 164 - chr11:20366783-20366873 NA NA NA NA NA chr11-61 19893744 19894063 170 - chr11:19893880-19893890 NA NA NA NA NA chr11-60 19684502 19684710 153 - chr11:19684611-19684709 NA NA NA NA NA chr11 1934149 1934282 124 - chr11:1934155-1934264 NA NA NA NA NA chr11-59 18318435 18318696 190 - chr11:18318512-18318627 NA NA NA NA NA chr11-58 18239501 18239670 128 - chr11:18239525-18239612 NA NA NA NA NA chr11-57 17670782 17671160 216 - chr11:17670983-17671011 NA NA NA NA NA chr11-56 17627387 17627671 176 - chr11:17627522-17627644 NA NA NA NA NA chr11-55 16689353 16689548 117 - chr11:16689365-16689456 NA NA NA NA NA chr11-54 16190321 16190572 136 - chr11:16190436-16190457 NA NA NA NA NA chr11-53 15683734 15684083 194 - chr11:15683929-15683968 NA NA NA NA NA chr11-52 15560495 15560812 209 - chr11:15560669-15560770 NA NA NA NA NA chr11-51 15290582 15290845 186 - chr11:15290608-15290717 NA NA NA NA NA chr11-50 14919532 14919682 136 - chr11:14919544-14919638 NA NA NA NA NA chr11-49 14834061 14834494 277 - chr11:14834325-14834374 NA NA NA NA NA chr11-48 14704724 14704905 121 - chr11:14704795-14704856 NA NA NA NA NA chr11-47 14645863 14646157 150 - chr11:14645997-14646038 NA NA NA NA NA chr11-46 14504596 14504823 150 - chr11:14504697-14504770 NA NA NA NA NA chr11-45 14299266 14299436 157 - chr11:14299268-14299412 NA NA NA NA NA chr11-44 14135639 14135815 119 - chr11:14135677-14135739 NA NA NA NA NA chr11-43 13942959 13943162 180 - chr11:13942998-13943155 NA NA NA NA NA chr11-450 134279744 134280095 220 - chr11:134279970-134280059 NA NA NA NA NA chr11-449 134190082 134190601 290 - chr11:134190257-134190354 NA NA NA NA NA chr11-42 13359108 13359413 210 - chr11:13359244-13359359 NA NA NA NA NA chr11-448 133203458 133203731 164 - chr11:133203569-133203628 NA NA NA NA NA chr11-447 132770420 132770595 136 - chr11:132770450-132770529 NA NA NA NA NA chr11-41 13198176 13198431 192 - chr11:13198232-13198347 NA NA NA NA NA chr11-446 131228940 131229216 142 - chr11:131229099-131229107 NA NA NA NA NA chr11-445 131152902 131153156 150 - chr11:131153018-131153064 NA NA NA NA NA chr11-40 13099426 13099673 149 - chr11:13099476-13099559 NA NA NA NA NA chr11-444 130198083 130198361 172 - chr11:130198167-130198189 NA NA NA NA NA chr11-39 12992037 12992278 140 - chr11:12992116-12992155 NA NA NA NA NA chr11-443 129886165 129886484 250 - chr11:129886378-129886463 NA NA NA NA NA chr11-442 129514881 129515073 126 - chr11:129514908-129514968 NA NA NA NA NA chr11-38 12926659 12926839 121 - chr11:12926747-12926809 NA NA NA NA NA chr11-441 129055954 129056337 191 - chr11:129056184-129056259 NA NA NA NA NA chr11-440 127833013 127833265 217 - chr11:127833018-127833200 NA NA NA NA NA chr11-439 127596095 127596565 264 - chr11:127596278-127596290 NA NA NA NA NA chr11-37 12728883 12729102 177 - chr11:12728926-12729061 NA NA NA NA NA chr11-438 126622737 126622964 119 - chr11:126622848-126622857 NA NA NA NA NA chr11-437 126537369 126537651 200 - chr11:126537514-126537632 NA NA NA NA NA chr11-436 126269505 126269824 244 - chr11:126269601-126269812 NA NA NA NA NA chr11-435 125445792 125446352 389 - chr11:125446024-125446233 NA NA NA NA NA chr11-36 12530904 12531223 218 - chr11:12531015-12531132 NA NA NA NA NA chr11-434 125121312 125121725 191 - chr11:125121432-125121549 NA NA NA NA NA chr11-35 12452606 12452902 179 - chr11:12452724-12452788 NA NA NA NA NA chr11-433 124300236 124300454 193 - chr11:124300271-124300439 NA NA NA NA NA chr11-34 12375570 12376162 305 - chr11:12375974-12376008 NA NA NA NA NA chr11-432 122933939 122934136 141 - chr11:122933979-122934064 NA NA NA NA NA chr11-431 122512963 122513189 209 - chr11:122512980-122513172 NA NA NA NA NA chr11-430 122149283 122149521 219 - chr11:122149340-122149502 NA NA NA NA NA chr11-429 121970372 121970556 143 - chr11:121970378-121970480 NA NA NA NA NA chr11-428 120773604 120773900 196 - chr11:120773717-120773813 NA NA NA NA NA chr11-427 119420977 119421243 175 - chr11:119421029-119421113 NA NA NA NA NA chr11-426 119247949 119248288 222 - chr11:119248081-119248176 NA NA NA NA NA chr11-425 118414070 118414555 242 - chr11:118414370-118414483 NA NA NA NA NA chr11-424 118088471 118088846 184 - chr11:118088581-118088628 NA NA NA NA NA chr11-423 117609710 117610017 233 - chr11:117609853-117610012 NA NA NA NA NA chr11-422 116733404 116733601 178 - chr11:116733461-116733582 NA NA NA NA NA chr11-421 116666063 116666404 156 - chr11:116666278-116666299 NA NA NA NA NA chr11-420 116546506 116546940 382 - chr11:116546516-116546858 NA NA NA NA NA chr11-33 11632172 11632740 215 - chr11:11632291-11632309 NA NA NA NA NA chr11-419 116244612 116245146 245 - chr11:116244704-116244778 NA NA NA NA NA chr11-418 115749884 115750408 228 - chr11:115750076-115750077 NA NA NA NA NA chr11-417 115628329 115628509 117 - chr11:115628428-115628482 NA NA NA NA NA chr11-416 115553669 115553900 125 - chr11:115553736-115553755 NA NA NA NA NA chr11-415 115523996 115524149 125 - chr11:115523998-115524043 NA NA NA NA NA chr11-414 115468399 115468575 139 - chr11:115468469-115468571 NA NA NA NA NA chr11-413 115447933 115448389 224 - chr11:115448222-115448250 NA NA NA NA NA chr11-32 11524684 11525126 270 - chr11:11524817-11524941 NA NA NA NA NA chr11-412 115170742 115171004 172 - chr11:115170743-115170825 NA NA NA NA NA chr11-411 114892541 114892889 290 - chr11:114892639-114892755 NA NA NA NA NA chr11-410 114733965 114734297 214 - chr11:114734074-114734152 NA NA NA NA NA chr11-409 114725733 114726028 130 - chr11:114725907-114725982 NA NA NA NA NA chr11-408 114722270 114722546 176 - chr11:114722435-114722511 NA NA NA NA NA chr11-407 114424377 114424641 150 - chr11:114424477-114424589 NA NA NA NA NA chr11-406 114335855 114336069 145 - chr11:114335950-114335994 NA NA NA NA NA chr11-31 11428264 11428622 193 - chr11:11428506-11428534 NA NA NA NA NA chr11-405 113991140 113991544 353 - chr11:113991153-113991525 NA NA NA NA NA chr11-404 113990578 113990963 247 - chr11:113990734-113990843 NA NA NA NA NA chr11-403 113838272 113838582 215 - chr11:113838319-113838439 NA NA NA NA NA chr11-402 113344830 113345090 149 - chr11:113344857-113344895 NA NA NA NA NA chr11-401 113204317 113204561 124 - chr11:113204329-113204405 NA NA NA NA NA chr11-400 113042410 113042609 118 - chr11:113042515-113042606 NA NA NA NA NA chr11-399 112984505 112984664 126 - chr11:112984548-112984663 NA NA NA NA NA chr11-398 112933419 112933701 183 - chr11:112933539-112933609 NA NA NA NA NA chr11-397 112721660 112721887 124 - chr11:112721783-112721844 NA NA NA NA NA chr11-396 112605499 112605735 203 - chr11:112605548-112605718 NA NA NA NA NA chr11-395 112504151 112504474 172 - chr11:112504333-112504354 NA NA NA NA NA chr11-394 112037991 112038159 149 - chr11:112038022-112038114 NA NA NA NA NA chr11-393 111832767 111833118 237 - chr11:111832910-111833033 NA NA NA NA NA chr11-392 111567425 111567840 256 - chr11:111567586-111567683 NA NA NA NA NA chr11-391 111498402 111498632 156 - chr11:111498460-111498542 NA NA NA NA NA chr11-390 111237433 111237686 238 - chr11:111237447-111237670 NA NA NA NA NA chr11-389 111236507 111236870 189 - chr11:111236556-111236571 NA NA NA NA NA chr11-388 111058550 111058841 260 - chr11:111058592-111058821 NA NA NA NA NA chr11-387 110799920 110800457 282 - chr11:110800261-110800339 NA NA NA NA NA chr11-386 110321032 110321422 235 - chr11:110321292-110321302 NA NA NA NA NA chr11-385 109809813 109809981 150 - chr11:109809839-109809971 NA NA NA NA NA chr11-384 109766894 109767108 175 - chr11:109766898-109767034 NA NA NA NA NA chr11-383 109312439 109312640 168 - chr11:109312514-109312583 NA NA NA NA NA chr11-382 109251606 109251798 162 - chr11:109251647-109251779 NA NA NA NA NA chr11-381 109108578 109109044 253 - chr11:109108746-109108816 NA NA NA NA NA chr11-380 109104807 109105036 197 - chr11:109104834-109104989 NA NA NA NA NA chr11-379 108876077 108876363 259 - chr11:108876174-108876352 NA NA NA NA NA chr11-378 108515175 108515482 190 - chr11:108515329-108515402 NA NA NA NA NA chr11-377 108021264 108021788 282 - chr11:108021421-108021461 NA NA NA NA NA chr11-376 107687306 107687565 206 - chr11:107687322-107687475 NA NA NA NA NA chr11-375 107604625 107605045 153 - chr11:107604960-107604982 NA NA NA NA NA chr11-374 107360169 107360442 178 - chr11:107360356-107360439 NA NA NA NA NA chr11-373 107196585 107196929 201 - chr11:107196761-107196797 NA NA NA NA NA chr11-372 106967252 106967588 204 - chr11:106967393-106967459 NA NA NA NA NA chr11-371 106894459 106894814 206 - chr11:106894602-106894659 NA NA NA NA NA chr11-30 10672276 10672546 150 - chr11:10672408-10672438 NA NA NA NA NA chr11-370 106616319 106616648 128 - chr11:106616549-106616610 NA NA NA NA NA chr11-369 106520597 106520846 132 - chr11:106520690-106520783 NA NA NA NA NA chr11-368 105611421 105611721 248 - chr11:105611508-105611600 NA NA NA NA NA chr11-367 105609358 105609552 173 - chr11:105609363-105609529 NA NA NA NA NA chr11-366 105519542 105519801 130 - chr11:105519657-105519658 NA NA NA NA NA chr11-365 105314945 105315136 126 - chr11:105315082-105315095 NA NA NA NA NA chr11-364 104954016 104954244 134 - chr11:104954140-104954180 NA NA NA NA NA chr11-363 104890352 104890871 183 - chr11:104890752-104890823 NA NA NA NA NA chr11-29 10461493 10461847 187 - chr11:10461665-10461668 NA NA NA NA NA chr11-362 104600003 104600402 254 - chr11:104600161-104600296 NA NA NA NA NA chr11-361 104581331 104581497 129 - chr11:104581405-104581497 NA NA NA NA NA chr11-360 104242054 104242494 233 - chr11:104242224-104242271 NA NA NA NA NA chr11-359 104035846 104036109 158 - chr11:104035867-104035990 NA NA NA NA NA chr11-358 103924013 103924165 145 - chr11:103924022-103924160 NA NA NA NA NA chr11-357 103637270 103637443 145 - chr11:103637300-103637421 NA NA NA NA NA chr11-356 103541262 103541407 140 - chr11:103541264-103541401 NA NA NA NA NA chr11-355 103253768 103254120 274 - chr11:103253802-103253998 NA NA NA NA NA chr11-354 102772921 102773227 229 - chr11:102773025-102773177 NA NA NA NA NA chr11-353 102464095 102464335 139 - chr11:102464148-102464186 NA NA NA NA NA chr11-352 101947225 101947515 146 - chr11:101947324-101947326 NA NA NA NA NA chr11-28 10193856 10194014 133 - chr11:10193885-10193993 NA NA NA NA NA chr11-351 101908909 101909133 123 - chr11:101908994-101909002 NA NA NA NA NA chr11-350 101800956 101801198 131 - chr11:101801050-101801070 NA NA NA NA NA chr11-349 101746352 101746561 167 - chr11:101746382-101746515 NA NA NA NA NA chr11-348 101551092 101551357 152 - chr11:101551178-101551217 NA NA NA NA NA chr11-347 101171702 101171903 180 - chr11:101171775-101171892 NA NA NA NA NA chr11-346 100973626 100973819 116 - chr11:100973727-100973766 NA NA NA NA NA chr11-345 100415527 100416080 255 - chr11:100415853-100415910 NA NA NA NA NA chr11-344 100222942 100223213 124 - chr11:100223019-100223094 NA NA NA NA NA chr10-453 99799182 99799377 134 - chr10:99799276-99799349 NA NA NA NA NA chr10-452 99474745 99475175 222 - chr10:99474925-99474939 NA NA NA NA NA chr10-451 99410183 99410503 191 - chr10:99410324-99410378 NA NA NA NA NA chr10-14 9825904 9826304 191 - chr10:9826140-9826176 NA NA NA NA NA chr10-450 98169908 98170220 167 - chr10:98170112-98170134 NA NA NA NA NA chr10-449 98069888 98070278 180 - chr10:98070032-98070046 NA NA NA NA NA chr10-448 97733007 97733336 205 - chr10:97733032-97733179 NA NA NA NA NA chr10-447 97263148 97263549 258 - chr10:97263411-97263526 NA NA NA NA NA chr10-446 96935064 96935309 209 - chr10:96935084-96935185 NA NA NA NA NA chr10-445 96791276 96791661 195 - chr10:96791503-96791582 NA NA NA NA NA chr10-444 96035719 96035992 203 - chr10:96035880-96035946 NA NA NA NA NA chr10-443 95433913 95434302 327 - chr10:95433966-95434231 NA NA NA NA NA chr10-442 95327559 95327987 243 - chr10:95327636-95327766 NA NA NA NA NA chr10-441 94210394 94210647 143 - chr10:94210537-94210636 NA NA NA NA NA chr10-13 9416244 9416462 166 - chr10:9416267-9416323 NA NA NA NA NA chr10-440 94105778 94105945 139 - chr10:94105830-94105941 NA NA NA NA NA chr10-439 93939344 93939661 184 - chr10:93939368-93939419 NA NA NA NA NA chr10-438 93836511 93837022 212 - chr10:93836655-93836674 NA NA NA NA NA chr10-437 93669915 93670273 211 - chr10:93669932-93670223 NA NA NA NA NA chr10-436 93179051 93179267 137 - chr10:93179068-93179126 NA NA NA NA NA chr10-435 93161837 93162264 170 - chr10:93162201-93162244 NA NA NA NA NA chr10-434 93028270 93028481 176 - chr10:93028299-93028444 NA NA NA NA NA chr10-433 92879095 92879429 292 - chr10:92879180-92879346 NA NA NA NA NA chr10-432 92447485 92447864 161 - chr10:92447556-92447597 NA NA NA NA NA chr10-12 9227955 9228542 242 - chr10:9228376-9228425 NA NA NA NA NA chr10-431 92172454 92172720 185 - chr10:92172487-92172495 NA NA NA NA NA chr10-430 91926348 91926765 235 - chr10:91926530-91926583 NA NA NA NA NA chr10-429 91596885 91597084 122 - chr10:91597012-91597057 NA NA NA NA NA chr10-428 91399627 91399955 190 - chr10:91399884-91399936 NA NA NA NA NA chr10-427 90908821 90908994 152 - chr10:90908842-90908987 NA NA NA NA NA chr10-11 9062896 9063154 114 - chr10:9062923-9062989 NA NA NA NA NA chr10-426 90594395 90594630 151 - chr10:90594530-90594597 NA NA NA NA NA chr10-425 90338137 90338627 349 - chr10:90338391-90338585 NA NA NA NA NA chr10-424 90332074 90332580 281 - chr10:90332413-90332469 NA NA NA NA NA chr10-423 90030423 90030685 217 - chr10:90030451-90030623 NA NA NA NA NA chr10-422 90000782 90001234 296 - chr10:90000788-90000928 NA NA NA NA NA chr10-10 8976384 8976730 243 - chr10:8976478-8976624 NA NA NA NA NA chr10-421 89677218 89677585 212 - chr10:89677400-89677439 NA NA NA NA NA chr10-420 89544975 89545228 204 - chr10:89545022-89545177 NA NA NA NA NA chr10-419 88986127 88986476 309 - chr10:88986187-88986456 NA NA NA NA NA chr10-418 88943377 88943534 115 - chr10:88943410-88943465 NA NA NA NA NA chr10-417 88874646 88875074 222 - chr10:88874955-88875051 NA NA NA NA NA chr10-416 88788981 88789112 115 - chr10:88789009-88789100 NA NA NA NA NA chr10-415 88698964 88699323 182 - chr10:88699156-88699191 NA NA NA NA NA chr10-414 88667137 88667551 252 - chr10:88667209-88667407 NA NA NA NA NA chr10-413 88364511 88364814 271 - chr10:88364528-88364767 NA NA NA NA NA chr10-412 88105494 88106048 289 - chr10:88105762-88105786 NA NA NA NA NA chr10-411 86432959 86433185 168 - chr10:86433017-86433127 NA NA NA NA NA chr10-410 85872252 85872702 311 - chr10:85872321-85872493 NA NA NA NA NA chr10-409 85381762 85382100 201 - chr10:85381850-85381914 NA NA NA NA NA chr10-408 85211574 85212040 292 - chr10:85211831-85211949 NA NA NA NA NA chr10-407 85172877 85173373 155 - chr10:85173294-85173322 NA NA NA NA NA chr10-406 84960860 84961198 113 - chr10:84961051-84961089 NA NA NA NA NA chr10-405 84919928 84920173 133 - chr10:84920085-84920106 NA NA NA NA NA chr10-404 84915027 84915242 140 - chr10:84915090-84915155 NA NA NA NA NA chr10-403 84897598 84898049 214 - chr10:84897694-84897765 NA NA NA NA NA chr10-402 84772595 84772895 126 - chr10:84772809-84772841 NA NA NA NA NA chr10-401 84740819 84741037 156 - chr10:84740921-84741015 NA NA NA NA NA chr10-400 84350083 84350329 143 - chr10:84350162-84350202 NA NA NA NA NA chr10-399 83889071 83889245 147 - chr10:83889113-83889179 NA NA NA NA NA chr10-398 83385654 83386173 274 - chr10:83385869-83385898 NA NA NA NA NA chr10-397 83259478 83259919 224 - chr10:83259762-83259769 NA NA NA NA NA chr10-396 83228307 83228514 149 - chr10:83228411-83228502 NA NA NA NA NA chr10-395 83026470 83026739 195 - chr10:83026574-83026695 NA NA NA NA NA chr10-394 82998330 82998739 160 - chr10:82998559-82998636 NA NA NA NA NA chr10-393 82788693 82788965 213 - chr10:82788748-82788894 NA NA NA NA NA chr10-392 82592433 82592793 213 - chr10:82592540-82592606 NA NA NA NA NA chr10-391 82503399 82503619 135 - chr10:82503412-82503510 NA NA NA NA NA chr10-390 82459763 82460312 282 - chr10:82459909-82459924 NA NA NA NA NA chr10-389 82403856 82404080 132 - chr10:82403983-82404023 NA NA NA NA NA chr10-388 82316803 82317064 173 - chr10:82316868-82316953 NA NA NA NA NA chr10-387 82161619 82162028 257 - chr10:82161762-82161867 NA NA NA NA NA chr10-386 82126205 82126554 133 - chr10:82126304-82126365 NA NA NA NA NA chr10-385 81840168 81840423 172 - chr10:81840274-81840409 NA NA NA NA NA chr10-384 81836565 81836821 184 - chr10:81836678-81836790 NA NA NA NA NA chr10-383 81718551 81718780 203 - chr10:81718581-81718758 NA NA NA NA NA chr10-382 81716581 81716805 157 - chr10:81716645-81716729 NA NA NA NA NA chr10-381 81705315 81705721 230 - chr10:81705540-81705594 NA NA NA NA NA chr10-380 81625296 81625566 217 - chr10:81625397-81625561 NA NA NA NA NA chr10-379 81615565 81615795 134 - chr10:81615622-81615660 NA NA NA NA NA chr10-378 81595174 81595548 172 - chr10:81595219-81595264 NA NA NA NA NA chr10-377 81570086 81570349 222 - chr10:81570137-81570318 NA NA NA NA NA chr10-376 81500094 81500699 281 - chr10:81500386-81500445 NA NA NA NA NA chr10-375 81382899 81383134 140 - chr10:81382946-81383023 NA NA NA NA NA chr10-374 81301884 81302324 242 - chr10:81301990-81302166 NA NA NA NA NA chr10-373 81280075 81280349 153 - chr10:81280133-81280165 NA NA NA NA NA chr10-372 81229242 81229509 124 - chr10:81229395-81229396 NA NA NA NA NA chr10-371 81198852 81199135 183 - chr10:81198859-81198942 NA NA NA NA NA chr10-370 81022662 81022957 212 - chr10:81022692-81022821 NA NA NA NA NA chr10-369 80972688 80972969 197 - chr10:80972838-80972951 NA NA NA NA NA chr10-368 80002163 80002378 144 - chr10:80002164-80002237 NA NA NA NA NA chr10-367 79569453 79569736 169 - chr10:79569594-79569631 NA NA NA NA NA chr10-9 7950194 7950628 230 - chr10:7950217-7950332 NA NA NA NA NA chr10-366 79265368 79265810 224 - chr10:79265514-79265520 NA NA NA NA NA chr10-365 79212395 79212579 146 - chr10:79212398-79212506 NA NA NA NA NA chr10-364 79060263 79060672 236 - chr10:79060348-79060411 NA NA NA NA NA chr10-363 78945728 78946023 153 - chr10:78945839-78945850 NA NA NA NA NA chr10-362 78636489 78636692 121 - chr10:78636605-78636644 NA NA NA NA NA chr10-361 78590176 78590390 165 - chr10:78590238-78590354 NA NA NA NA NA chr10-8 7806326 7806793 179 - chr10:7806681-7806764 NA NA NA NA NA chr10-360 77709483 77709768 209 - chr10:77709583-77709700 NA NA NA NA NA chr10-359 77379691 77380000 125 - chr10:77379765-77379819 NA NA NA NA NA chr10-358 77250930 77251241 238 - chr10:77251030-77251195 NA NA NA NA NA chr10-357 77054175 77054710 301 - chr10:77054262-77054349 NA NA NA NA NA chr10-356 76831969 76832175 123 - chr10:76832065-76832105 NA NA NA NA NA chr10-355 76823972 76824234 181 - chr10:76824047-76824147 NA NA NA NA NA chr10-354 76807918 76808411 218 - chr10:76808040-76808085 NA NA NA NA NA chr10-7 7672476 7672756 184 - chr10:7672588-7672708 NA NA NA NA NA chr10-353 76566018 76566304 154 - chr10:76566225-76566247 NA NA NA NA NA chr10-352 76471103 76471640 292 - chr10:76471164-76471165 NA NA NA NA NA chr10-351 75997592 75997829 155 - chr10:75997644-75997737 NA NA NA NA NA chr10-350 75964135 75964488 225 - chr10:75964222-75964302 NA NA NA NA NA chr10-349 75895106 75895340 182 - chr10:75895155-75895285 NA NA NA NA NA chr10-348 75817600 75818209 246 - chr10:75818069-75818164 NA NA NA NA NA chr10-347 75748927 75749313 241 - chr10:75749062-75749194 NA NA NA NA NA chr10-346 75665085 75665517 253 - chr10:75665279-75665383 NA NA NA NA NA chr10-345 75508965 75509199 167 - chr10:75509008-75509124 NA NA NA NA NA chr10-344 75412377 75412539 123 - chr10:75412404-75412464 NA NA NA NA NA chr10-343 75228590 75228949 201 - chr10:75228792-75228835 NA NA NA NA NA chr10-342 74986482 74986874 241 - chr10:74986701-74986791 NA NA NA NA NA chr10-341 74792339 74792561 167 - chr10:74792476-74792530 NA NA NA NA NA chr10-340 74763800 74763955 122 - chr10:74763800-74763889 NA NA NA NA NA chr10-339 74156880 74157342 301 - chr10:74157027-74157158 NA NA NA NA NA chr10-338 73905761 73906023 218 - chr10:73905771-73905946 NA NA NA NA NA chr10-337 73433254 73433453 188 - chr10:73433279-73433434 NA NA NA NA NA chr10-336 73257396 73257828 253 - chr10:73257731-73257805 NA NA NA NA NA chr10-335 73209839 73210101 128 - chr10:73209894-73209943 NA NA NA NA NA chr10-334 73205121 73205685 306 - chr10:73205462-73205566 NA NA NA NA NA chr10-333 72977122 72977390 138 - chr10:72977175-72977183 NA NA NA NA NA chr10-332 72971022 72971238 130 - chr10:72971146-72971190 NA NA NA NA NA chr10-331 72909477 72909708 133 - chr10:72909479-72909578 NA NA NA NA NA chr10-6 7233773 7234128 215 - chr10:7233933-7234008 NA NA NA NA NA chr10-330 72170226 72170464 132 - chr10:72170329-72170349 NA NA NA NA NA chr10-329 71811915 71812080 114 - chr10:71811976-71812047 NA NA NA NA NA chr10-328 71664049 71664313 225 - chr10:71664051-71664237 NA NA NA NA NA chr10-327 70813234 70813833 216 - chr10:70813329-70813354 NA NA NA NA NA chr10-326 70636795 70637097 258 - chr10:70636809-70637023 NA NA NA NA NA chr10-325 70370252 70370528 159 - chr10:70370338-70370380 NA NA NA NA NA chr10-324 70215753 70216173 153 - chr10:70216092-70216122 NA NA NA NA NA chr10-323 70192414 70192993 305 - chr10:70192651-70192682 NA NA NA NA NA chr10-322 69845831 69846138 263 - chr10:69845876-69846095 NA NA NA NA NA chr10-321 69840419 69840623 147 - chr10:69840460-69840550 NA NA NA NA NA chr10-320 69701077 69701487 213 - chr10:69701083-69701152 NA NA NA NA NA chr10-319 69582741 69582970 115 - chr10:69582904-69582905 NA NA NA NA NA chr10-318 69534668 69535026 229 - chr10:69534771-69534871 NA NA NA NA NA chr10-317 69236876 69237282 221 - chr10:69237026-69237116 NA NA NA NA NA chr10-316 68780546 68780891 239 - chr10:68780556-68780728 NA NA NA NA NA chr10-5 6865691 6865982 207 - chr10:6865758-6865881 NA NA NA NA NA chr10-315 68224895 68225096 151 - chr10:68224978-68225079 NA NA NA NA NA chr10-314 68200547 68200961 237 - chr10:68200817-68200877 NA NA NA NA NA chr10-313 68191493 68191703 172 - chr10:68191618-68191694 NA NA NA NA NA chr10-312 67940762 67941056 165 - chr10:67940877-67940885 NA NA NA NA NA chr10-311 67859940 67860137 163 - chr10:67859971-67860032 NA NA NA NA NA chr10-310 67050916 67051123 181 - chr10:67050934-67051073 NA NA NA NA NA chr10-309 66935140 66935340 152 - chr10:66935201-66935331 NA NA NA NA NA chr10-308 66929535 66929878 189 - chr10:66929672-66929707 NA NA NA NA NA chr10-307 66775318 66775629 230 - chr10:66775426-66775575 NA NA NA NA NA chr10-306 66358882 66359309 238 - chr10:66359058-66359081 NA NA NA NA NA chr10-305 66225430 66225905 270 - chr10:66225669-66225678 NA NA NA NA NA chr10-304 66183191 66183463 153 - chr10:66183336-66183422 NA NA NA NA NA chr10-303 66059965 66060247 210 - chr10:66060102-66060240 NA NA NA NA NA chr10-302 65929349 65929876 224 - chr10:65929487-65929518 NA NA NA NA NA chr10-301 65702858 65703143 165 - chr10:65703081-65703126 NA NA NA NA NA chr10-300 65595670 65595955 205 - chr10:65595732-65595857 NA NA NA NA NA chr10-299 65449177 65449438 174 - chr10:65449234-65449341 NA NA NA NA NA chr10-298 65294886 65295099 165 - chr10:65294971-65295088 NA NA NA NA NA chr10-297 65283261 65283691 287 - chr10:65283546-65283690 NA NA NA NA NA chr10-296 65244324 65244533 190 - chr10:65244334-65244505 NA NA NA NA NA chr10-295 65060647 65060896 135 - chr10:65060844-65060865 NA NA NA NA NA chr10-294 64857209 64857565 214 - chr10:64857358-64857361 NA NA NA NA NA chr10-293 64821603 64822018 260 - chr10:64821904-64821952 NA NA NA NA NA chr10-292 64748919 64749279 246 - chr10:64748975-64749107 NA NA NA NA NA chr10-291 64221131 64221651 268 - chr10:64221429-64221445 NA NA NA NA NA chr10-290 64174938 64175369 209 - chr10:64175304-64175348 NA NA NA NA NA chr10-289 63992818 63993089 185 - chr10:63992968-63993067 NA NA NA NA NA chr10-288 63878576 63878880 210 - chr10:63878589-63878705 NA NA NA NA NA chr10-287 63513059 63513303 156 - chr10:63513224-63513292 NA NA NA NA NA chr10-286 63434086 63434457 235 - chr10:63434180-63434195 NA NA NA NA NA chr10-285 63073740 63073965 138 - chr10:63073829-63073880 NA NA NA NA NA chr10-284 62965570 62965991 295 - chr10:62965622-62965643 NA NA NA NA NA chr10-283 62590114 62590283 141 - chr10:62590213-62590270 NA NA NA NA NA chr10-282 62504107 62504605 181 - chr10:62504436-62504454 NA NA NA NA NA chr10-281 62467050 62467307 138 - chr10:62467226-62467276 NA NA NA NA NA chr10-280 62408533 62408815 176 - chr10:62408618-62408688 NA NA NA NA NA chr10-279 62234934 62235254 227 - chr10:62235051-62235185 NA NA NA NA NA chr10-278 62125212 62125427 150 - chr10:62125302-62125387 NA NA NA NA NA chr10-277 62045853 62046193 208 - chr10:62045911-62045987 NA NA NA NA NA chr10-276 61997254 61997747 291 - chr10:61997599-61997663 NA NA NA NA NA chr10-275 61875003 61875296 194 - chr10:61875126-61875221 NA NA NA NA NA chr10-274 61764910 61765433 341 - chr10:61764996-61765272 NA NA NA NA NA chr10-273 61667279 61667543 124 - chr10:61667418-61667426 NA NA NA NA NA chr10-272 61666434 61666839 301 - chr10:61666570-61666831 NA NA NA NA NA chr10-271 61639061 61639477 210 - chr10:61639165-61639237 NA NA NA NA NA chr10-270 61574615 61574845 163 - chr10:61574675-61574771 NA NA NA NA NA chr10-269 61512608 61512840 202 - chr10:61512659-61512831 NA NA NA NA NA chr10-268 61413106 61413447 200 - chr10:61413330-61413389 NA NA NA NA NA chr10-267 60845263 60845639 159 - chr10:60845530-60845572 NA NA NA NA NA chr10-266 60829657 60829948 179 - chr10:60829760-60829827 NA NA NA NA NA chr10-265 60796287 60796439 133 - chr10:60796296-60796410 NA NA NA NA NA chr10-264 60757045 60757384 196 - chr10:60757313-60757366 NA NA NA NA NA chr10-263 60418546 60418844 134 - chr10:60418727-60418731 NA NA NA NA NA chr10-262 60225537 60225850 213 - chr10:60225673-60225762 NA NA NA NA NA chr10-261 60123167 60123354 164 - chr10:60123176-60123289 NA NA NA NA NA chr10-260 60035008 60035263 139 - chr10:60035130-60035153 NA NA NA NA NA chr10-259 59932818 59933207 213 - chr10:59933000-59933037 NA NA NA NA NA chr10-258 59921452 59921731 143 - chr10:59921494-59921501 NA NA NA NA NA chr10-257 59687608 59687924 169 - chr10:59687639-59687759 NA NA NA NA NA chr10-256 59668973 59669356 222 - chr10:59669233-59669294 NA NA NA NA NA chr10-255 59259690 59259905 133 - chr10:59259826-59259841 NA NA NA NA NA chr10-254 59241834 59242001 143 - chr10:59241834-59241953 NA NA NA NA NA chr10-253 58987007 58987189 116 - chr10:58987065-58987115 NA NA NA NA NA chr10-252 58803258 58803574 299 - chr10:58803280-58803562 NA NA NA NA NA chr10-251 58627123 58628004 339 - chr10:58627292-58627370 NA NA NA NA NA chr10-250 58548244 58548671 147 - chr10:58548275-58548308 NA NA NA NA NA chr10-249 58311140 58311372 145 - chr10:58311206-58311278 NA NA NA NA NA chr10-248 58290944 58291163 190 - chr10:58290944-58291047 NA NA NA NA NA chr10-247 58228366 58228624 129 - chr10:58228449-58228535 NA NA NA NA NA chr10-246 58028163 58028514 154 - chr10:58028359-58028368 NA NA NA NA NA chr10-245 57943799 57944195 214 - chr10:57943852-57943970 NA NA NA NA NA chr10-244 57868189 57868513 228 - chr10:57868271-57868403 NA NA NA NA NA chr10-243 57773481 57774061 291 - chr10:57773730-57773745 NA NA NA NA NA chr10-242 57685687 57685988 187 - chr10:57685827-57685900 NA NA NA NA NA chr10-241 57621369 57621873 226 - chr10:57621787-57621817 NA NA NA NA NA chr10-240 57133854 57134319 282 - chr10:57134082-57134151 NA NA NA NA NA chr10-239 57030691 57031047 182 - chr10:57030923-57031047 NA NA NA NA NA chr10-238 56972630 56972932 224 - chr10:56972770-56972916 NA NA NA NA NA chr10-237 56650739 56650932 113 - chr10:56650778-56650811 NA NA NA NA NA chr10-236 56617974 56618275 180 - chr10:56618123-56618182 NA NA NA NA NA chr10-235 56591265 56591555 167 - chr10:56591360-56591404 NA NA NA NA NA chr10-234 56449048 56449263 130 - chr10:56449126-56449171 NA NA NA NA NA chr10-233 56397371 56397551 145 - chr10:56397409-56397519 NA NA NA NA NA chr10-232 56337322 56337680 195 - chr10:56337497-56337521 NA NA NA NA NA chr10-231 55523368 55523748 234 - chr10:55523439-55523614 NA NA NA NA NA chr10-230 55464805 55465100 143 - chr10:55465007-55465098 NA NA NA NA NA chr10-229 55221582 55221861 134 - chr10:55221644-55221697 NA NA NA NA NA chr10-228 55140994 55141155 128 - chr10:55141002-55141119 NA NA NA NA NA chr10-227 55127981 55128157 139 - chr10:55128111-55128151 NA NA NA NA NA chr10-226 55042550 55042855 224 - chr10:55042593-55042790 NA NA NA NA NA chr10-225 54850228 54850532 191 - chr10:54850353-54850455 NA NA NA NA NA chr10-224 54617235 54617422 119 - chr10:54617315-54617366 NA NA NA NA NA chr10-223 54375359 54375604 191 - chr10:54375399-54375536 NA NA NA NA NA chr10-222 54351383 54352149 316 - chr10:54351693-54351786 NA NA NA NA NA chr10-221 54038985 54039260 218 - chr10:54039093-54039254 NA NA NA NA NA chr10-220 54038188 54038589 262 - chr10:54038204-54038327 NA NA NA NA NA chr10-219 53608581 53608848 216 - chr10:53608659-53608824 NA NA NA NA NA chr10-218 53267669 53268085 311 - chr10:53267746-53267952 NA NA NA NA NA chr10-217 52780263 52780630 194 - chr10:52780413-52780434 NA NA NA NA NA chr10-216 52722067 52722501 293 - chr10:52722176-52722422 NA NA NA NA NA chr10-215 52597338 52597744 282 - chr10:52597465-52597621 NA NA NA NA NA chr10-214 52289622 52289963 204 - chr10:52289831-52289898 NA NA NA NA NA chr10-213 52155962 52156196 173 - chr10:52156031-52156143 NA NA NA NA NA chr10-212 51957884 51958111 189 - chr10:51957893-51957968 NA NA NA NA NA chr10-211 51901756 51902090 228 - chr10:51901941-51902011 NA NA NA NA NA chr10-210 51806045 51806313 224 - chr10:51806172-51806264 NA NA NA NA NA chr10-209 51791911 51792175 187 - chr10:51791951-51792061 NA NA NA NA NA chr10-208 51738832 51739469 321 - chr10:51739205-51739210 NA NA NA NA NA chr10-207 51733675 51733885 200 - chr10:51733691-51733881 NA NA NA NA NA chr10-206 51590274 51590599 174 - chr10:51590498-51590521 NA NA NA NA NA chr10-205 51352880 51353290 228 - chr10:51352970-51353016 NA NA NA NA NA chr10-204 51145141 51145406 145 - chr10:51145235-51145260 NA NA NA NA NA chr10-203 51099510 51099788 143 - chr10:51099653-51099661 NA NA NA NA NA chr10-202 51080126 51080563 220 - chr10:51080353-51080376 NA NA NA NA NA chr10-201 50888143 50888485 166 - chr10:50888298-50888302 NA NA NA NA NA chr10-200 50863647 50863969 219 - chr10:50863883-50863895 NA NA NA NA NA chr10-199 50635167 50635392 169 - chr10:50635181-50635322 NA NA NA NA NA chr10-198 50522190 50522529 224 - chr10:50522339-50522448 NA NA NA NA NA chr10-197 50517634 50517913 226 - chr10:50517654-50517850 NA NA NA NA NA chr10-196 50205442 50205752 179 - chr10:50205576-50205624 NA NA NA NA NA chr10-195 49681555 49681737 141 - chr10:49681566-49681666 NA NA NA NA NA chr10-194 49662739 49663296 250 - chr10:49663121-49663214 NA NA NA NA NA chr10-193 49635338 49635627 222 - chr10:49635416-49635571 NA NA NA NA NA chr10-192 49547298 49547514 128 - chr10:49547439-49547479 NA NA NA NA NA chr10-191 49530914 49531285 211 - chr10:49531050-49531101 NA NA NA NA NA chr10-190 49406395 49406659 206 - chr10:49406432-49406538 NA NA NA NA NA chr10-189 49392343 49392563 151 - chr10:49392397-49392449 NA NA NA NA NA chr10-188 49289410 49289726 167 - chr10:49289512-49289530 NA NA NA NA NA chr10-187 48742105 48742474 237 - chr10:48742168-48742319 NA NA NA NA NA chr10-186 48612290 48612672 234 - chr10:48612537-48612623 NA NA NA NA NA chr10-185 48440070 48440238 114 - chr10:48440149-48440209 NA NA NA NA NA chr10-184 48415350 48415667 230 - chr10:48415533-48415612 NA NA NA NA NA chr10-183 48390335 48390768 373 - chr10:48390387-48390700 NA NA NA NA NA chr10-182 46319152 46319354 158 - chr10:46319191-46319295 NA NA NA NA NA chr10-4 4624042 4624435 231 - chr10:4624236-4624413 NA NA NA NA NA chr10-181 46223852 46224164 192 - chr10:46224057-46224129 NA NA NA NA NA chr10-180 44859201 44859541 210 - chr10:44859324-44859390 NA NA NA NA NA chr10-179 44447395 44447707 169 - chr10:44447514-44447564 NA NA NA NA NA chr10-178 44425085 44425601 328 - chr10:44425406-44425475 NA NA NA NA NA chr10-177 44344189 44344503 242 - chr10:44344239-44344365 NA NA NA NA NA chr10-176 44296547 44296794 173 - chr10:44296652-44296751 NA NA NA NA NA chr10-175 44291786 44292066 175 - chr10:44291878-44291922 NA NA NA NA NA chr10-174 44034164 44034525 146 - chr10:44034482-44034483 NA NA NA NA NA chr10-173 43705405 43705597 163 - chr10:43705421-43705555 NA NA NA NA NA chr10-172 43661932 43662327 250 - chr10:43662105-43662210 NA NA NA NA NA chr10-171 43630902 43631390 327 - chr10:43631224-43631390 NA NA NA NA NA chr10-170 43570395 43570726 130 - chr10:43570666-43570671 NA NA NA NA NA chr10-169 43494309 43494497 117 - chr10:43494367-43494413 NA NA NA NA NA chr10-168 43386720 43386958 166 - chr10:43386720-43386814 NA NA NA NA NA chr10-167 43314051 43314211 118 - chr10:43314080-43314156 NA NA NA NA NA chr10-3 4320933 4321292 204 - chr10:4320951-4321000 NA NA NA NA NA chr10-166 42927107 42927361 158 - chr10:42927150-42927212 NA NA NA NA NA chr10-165 42810223 42810835 304 - chr10:42810653-42810681 NA NA NA NA NA chr10-2 4267860 4268064 151 - chr10:4267947-4268045 NA NA NA NA NA chr10-164 42311528 42311955 268 - chr10:42311528-42311683 NA NA NA NA NA chr10-163 37979383 37979615 177 - chr10:37979420-37979542 NA NA NA NA NA chr10-162 37863445 37863614 133 - chr10:37863469-37863566 NA NA NA NA NA chr10-161 37843508 37843834 132 - chr10:37843576-37843598 NA NA NA NA NA chr10-160 37763378 37763599 142 - chr10:37763465-37763528 NA NA NA NA NA chr10-159 37451290 37451585 185 - chr10:37451400-37451475 NA NA NA NA NA chr10-158 37156898 37157333 273 - chr10:37157052-37157163 NA NA NA NA NA chr10-157 36948050 36948423 148 - chr10:36948252-36948325 NA NA NA NA NA chr10-156 36758609 36759111 325 - chr10:36758727-36758957 NA NA NA NA NA chr10-155 36696938 36697139 153 - chr10:36697024-36697129 NA NA NA NA NA chr10-154 36620941 36621145 144 - chr10:36621057-36621141 NA NA NA NA NA chr10-153 36583496 36583761 192 - chr10:36583563-36583686 NA NA NA NA NA chr10-152 36310334 36310579 156 - chr10:36310420-36310481 NA NA NA NA NA chr10-151 36034599 36034994 213 - chr10:36034746-36034777 NA NA NA NA NA chr10-150 35808406 35808667 150 - chr10:35808548-35808649 NA NA NA NA NA chr10-149 35391589 35391895 229 - chr10:35391670-35391822 NA NA NA NA NA chr10-148 35289500 35289706 166 - chr10:35289531-35289657 NA NA NA NA NA chr10-147 35218497 35218742 163 - chr10:35218590-35218671 NA NA NA NA NA chr10-146 34752663 34753007 227 - chr10:34752870-34752980 NA NA NA NA NA chr10-145 34681223 34681401 165 - chr10:34681236-34681362 NA NA NA NA NA chr10-144 34642526 34642892 177 - chr10:34642618-34642711 NA NA NA NA NA chr10-143 34439983 34440268 229 - chr10:34440099-34440232 NA NA NA NA NA chr10-142 34415155 34415382 175 - chr10:34415248-34415371 NA NA NA NA NA chr10-141 34302636 34303135 205 - chr10:34302646-34302753 NA NA NA NA NA chr10-140 33894592 33894875 167 - chr10:33894615-33894728 NA NA NA NA NA chr10-139 33779033 33779509 332 - chr10:33779120-33779509 NA NA NA NA NA chr10-138 33654456 33654710 150 - chr10:33654488-33654534 NA NA NA NA NA chr10-137 33652643 33653169 283 - chr10:33652985-33653025 NA NA NA NA NA chr10-136 33624354 33624556 184 - chr10:33624380-33624546 NA NA NA NA NA chr10-135 33453495 33453771 245 - chr10:33453561-33453713 NA NA NA NA NA chr10-134 33359614 33359902 151 - chr10:33359810-33359824 NA NA NA NA NA chr10-133 33265688 33265966 147 - chr10:33265805-33265821 NA NA NA NA NA chr10-132 33204516 33204708 184 - chr10:33204522-33204682 NA NA NA NA NA chr10-131 33169648 33170061 203 - chr10:33169691-33169763 NA NA NA NA NA chr10-130 32895681 32895930 208 - chr10:32895755-32895922 NA NA NA NA NA chr10-129 32793882 32794164 198 - chr10:32794000-32794114 NA NA NA NA NA chr10-128 32793229 32793732 243 - chr10:32793252-32793300 NA NA NA NA NA chr10-127 32680491 32680845 293 - chr10:32680563-32680795 NA NA NA NA NA chr10-126 32445191 32445370 120 - chr10:32445254-32445315 NA NA NA NA NA chr10-125 32184245 32184506 171 - chr10:32184389-32184470 NA NA NA NA NA chr10-124 32113221 32113373 133 - chr10:32113242-32113356 NA NA NA NA NA chr10-123 31663817 31664136 167 - chr10:31663876-31663953 NA NA NA NA NA chr10-122 31503151 31503447 223 - chr10:31503209-31503359 NA NA NA NA NA chr10-121 31374768 31375051 177 - chr10:31374792-31374863 NA NA NA NA NA chr10-120 31330500 31330808 174 - chr10:31330617-31330657 NA NA NA NA NA chr10-119 31193166 31193431 208 - chr10:31193229-31193418 NA NA NA NA NA chr10-118 31065247 31065524 150 - chr10:31065248-31065355 NA NA NA NA NA chr10-117 31033884 31034128 152 - chr10:31033964-31033968 NA NA NA NA NA chr10-116 30881149 30881656 281 - chr10:30881505-30881560 NA NA NA NA NA chr10-115 30319146 30319396 200 - chr10:30319190-30319340 NA NA NA NA NA chr10-114 30265232 30265700 201 - chr10:30265372-30265434 NA NA NA NA NA chr10-113 30082392 30082595 176 - chr10:30082499-30082594 NA NA NA NA NA chr10-112 30052037 30052165 117 - chr10:30052053-30052159 NA NA NA NA NA chr10-111 29586727 29587071 206 - chr10:29586807-29586875 NA NA NA NA NA chr10-110 29122806 29123218 298 - chr10:29122839-29123077 NA NA NA NA NA chr10-109 28891219 28891745 337 - chr10:28891363-28891541 NA NA NA NA NA chr10-108 28740659 28741009 214 - chr10:28740864-28740942 NA NA NA NA NA chr10-107 28635515 28635823 212 - chr10:28635752-28635774 NA NA NA NA NA chr10-106 28545658 28546023 197 - chr10:28545665-28545806 NA NA NA NA NA chr10-105 28422068 28422323 155 - chr10:28422096-28422199 NA NA NA NA NA chr10-104 28284897 28285124 180 - chr10:28284915-28284990 NA NA NA NA NA chr10-103 28223257 28223610 184 - chr10:28223445-28223498 NA NA NA NA NA chr10-102 28189967 28190297 184 - chr10:28190069-28190107 NA NA NA NA NA chr10-101 28057243 28057507 153 - chr10:28057329-28057405 NA NA NA NA NA chr10-100 27814658 27815043 270 - chr10:27814785-27814940 NA NA NA NA NA chr10-99 27810246 27810454 142 - chr10:27810362-27810438 NA NA NA NA NA chr10-98 27738814 27739086 171 - chr10:27738899-27738969 NA NA NA NA NA chr10-97 27663739 27664208 190 - chr10:27664047-27664058 NA NA NA NA NA chr10-96 27525921 27526247 212 - chr10:27526134-27526232 NA NA NA NA NA chr10-95 27208144 27208621 295 - chr10:27208452-27208481 NA NA NA NA NA chr10-94 27077137 27077403 162 - chr10:27077198-27077256 NA NA NA NA NA chr10 2692868 2693154 199 - chr10:2692941-2693111 NA NA NA NA NA chr10-93 25970879 25971172 263 - chr10:25970892-25971091 NA NA NA NA NA chr10-92 25883440 25883655 171 - chr10:25883495-25883622 NA NA NA NA NA chr10-91 25563857 25564166 260 - chr10:25563929-25564140 NA NA NA NA NA chr10-90 24986351 24986688 218 - chr10:24986390-24986489 NA NA NA NA NA chr10-89 24652434 24652717 232 - chr10:24652498-24652679 NA NA NA NA NA chr10-88 24604700 24604931 120 - chr10:24604839-24604904 NA NA NA NA NA chr10-87 24334472 24334711 163 - chr10:24334481-24334647 NA NA NA NA NA chr10-86 24205403 24205843 243 - chr10:24205625-24205671 NA NA NA NA NA chr10-85 23991388 23991539 114 - chr10:23991461-23991538 NA NA NA NA NA chr10-84 23621433 23621664 212 - chr10:23621490-23621645 NA NA NA NA NA chr10-83 23266958 23267127 138 - chr10:23267004-23267111 NA NA NA NA NA chr10-82 23250985 23251219 116 - chr10:23251130-23251182 NA NA NA NA NA chr10-81 23064509 23064847 182 - chr10:23064703-23064729 NA NA NA NA NA chr10-80 23037483 23037674 145 - chr10:23037553-23037636 NA NA NA NA NA chr10-79 22953409 22953818 246 - chr10:22953646-22953729 NA NA NA NA NA chr10-78 22778712 22779059 333 - chr10:22778714-22779005 NA NA NA NA NA chr10-77 22535351 22535603 178 - chr10:22535481-22535585 NA NA NA NA NA chr10-76 22205401 22205909 302 - chr10:22205634-22205730 NA NA NA NA NA chr10-75 22178969 22179380 170 - chr10:22179246-22179247 NA NA NA NA NA chr10-74 22019918 22020160 156 - chr10:22020004-22020074 NA NA NA NA NA chr10-73 21456785 21457111 238 - chr10:21456858-21457018 NA NA NA NA NA chr10-72 21435761 21436141 228 - chr10:21435784-21435860 NA NA NA NA NA chr10-71 20973379 20973721 313 - chr10:20973412-20973696 NA NA NA NA NA chr10-70 20710773 20711022 189 - chr10:20710911-20710988 NA NA NA NA NA chr10-69 20481745 20482188 152 - chr10:20481939-20481994 NA NA NA NA NA chr10-68 20316511 20316699 158 - chr10:20316524-20316652 NA NA NA NA NA chr10-67 20258019 20258308 145 - chr10:20258203-20258204 NA NA NA NA NA chr10-66 20143245 20143413 147 - chr10:20143287-20143413 NA NA NA NA NA chr10-65 20130353 20130821 254 - chr10:20130509-20130514 NA NA NA NA NA chr10-64 20095102 20095396 177 - chr10:20095148-20095286 NA NA NA NA NA chr10-63 20028952 20029277 211 - chr10:20029022-20029119 NA NA NA NA NA chr10-62 19735651 19735864 155 - chr10:19735664-19735844 NA NA NA NA NA chr10-61 19522636 19522790 135 - chr10:19522676-19522778 NA NA NA NA NA chr10-60 19481009 19481573 358 - chr10:19481132-19481413 NA NA NA NA NA chr10-59 19305371 19305825 374 - chr10:19305468-19305816 NA NA NA NA NA chr10-58 19012574 19012902 194 - chr10:19012611-19012671 NA NA NA NA NA chr10-57 18991727 18991987 139 - chr10:18991903-18991921 NA NA NA NA NA chr10-56 18880556 18880854 184 - chr10:18880748-18880766 NA NA NA NA NA chr10-55 18837540 18837787 200 - chr10:18837691-18837750 NA NA NA NA NA chr10-54 18829719 18830044 198 - chr10:18829806-18829877 NA NA NA NA NA chr10-53 18819770 18820157 169 - chr10:18820018-18820029 NA NA NA NA NA chr10-52 18799202 18799771 310 - chr10:18799477-18799528 NA NA NA NA NA chr10-51 18621418 18621644 149 - chr10:18621424-18621496 NA NA NA NA NA chr10-50 18257005 18257270 139 - chr10:18257067-18257080 NA NA NA NA NA chr10-49 17942004 17942372 243 - chr10:17942062-17942180 NA NA NA NA NA chr10-48 17582829 17583008 128 - chr10:17582904-17582981 NA NA NA NA NA chr10-47 17399490 17399893 321 - chr10:17399495-17399734 NA NA NA NA NA chr10-46 17153323 17153572 146 - chr10:17153449-17153538 NA NA NA NA NA chr10-45 16807552 16808296 337 - chr10:16807730-16807760 NA NA NA NA NA chr10-44 16625857 16626235 168 - chr10:16626098-16626118 NA NA NA NA NA chr10-43 16569262 16569535 190 - chr10:16569406-16569513 NA NA NA NA NA chr10-42 16344644 16344841 113 - chr10:16344756-16344785 NA NA NA NA NA chr10-41 16281330 16281559 212 - chr10:16281332-16281527 NA NA NA NA NA chr10-40 15692909 15693281 219 - chr10:15692954-15693020 NA NA NA NA NA chr10-39 15362003 15362212 132 - chr10:15362060-15362075 NA NA NA NA NA chr10-38 15213302 15213744 230 - chr10:15213591-15213677 NA NA NA NA NA chr10-37 15192560 15192812 221 - chr10:15192618-15192769 NA NA NA NA NA chr10-36 15077101 15077539 261 - chr10:15077227-15077280 NA NA NA NA NA chr10-35 14953253 14953646 264 - chr10:14953351-14953572 NA NA NA NA NA chr10-34 14705701 14706091 241 - chr10:14705809-14705819 NA NA NA NA NA chr10-33 14302511 14302969 232 - chr10:14302743-14302761 NA NA NA NA NA chr10-32 14147403 14147892 266 - chr10:14147495-14147538 NA NA NA NA NA chr10-31 14146937 14147082 121 - chr10:14146963-14147060 NA NA NA NA NA chr10-30 13962374 13962837 224 - chr10:13962401-13962534 NA NA NA NA NA chr10-29 13868488 13868736 176 - chr10:13868515-13868619 NA NA NA NA NA chr10-28 13654787 13655029 186 - chr10:13654819-13654949 NA NA NA NA NA chr10-27 13527711 13528174 197 - chr10:13528054-13528075 NA NA NA NA NA chr10-26 13453658 13453959 155 - chr10:13453790-13453810 NA NA NA NA NA chr10-565 132369167 132369364 154 - chr10:132369195-132369306 NA NA NA NA NA chr10-25 13223184 13223433 169 - chr10:13223238-13223275 NA NA NA NA NA chr10-564 131837114 131837445 211 - chr10:131837169-131837260 NA NA NA NA NA chr10-563 130585702 130585956 176 - chr10:130585715-130585813 NA NA NA NA NA chr10-562 129285539 129285831 191 - chr10:129285554-129285644 NA NA NA NA NA chr10-561 128949233 128949718 334 - chr10:128949549-128949622 NA NA NA NA NA chr10-560 128326200 128326606 235 - chr10:128326375-128326409 NA NA NA NA NA chr10-559 127546616 127546794 144 - chr10:127546624-127546705 NA NA NA NA NA chr10-558 127272423 127272651 138 - chr10:127272513-127272561 NA NA NA NA NA chr10-557 127121983 127122238 233 - chr10:127122026-127122193 NA NA NA NA NA chr10-556 126819466 126819807 199 - chr10:126819623-126819680 NA NA NA NA NA chr10-555 126810685 126811072 206 - chr10:126810857-126810888 NA NA NA NA NA chr10-554 126715353 126715545 118 - chr10:126715393-126715437 NA NA NA NA NA chr10-553 126401604 126401738 119 - chr10:126401634-126401738 NA NA NA NA NA chr10-552 126334209 126334351 125 - chr10:126334225-126334333 NA NA NA NA NA chr10-551 126308662 126308875 173 - chr10:126308709-126308842 NA NA NA NA NA chr10-550 126299172 126299505 159 - chr10:126299392-126299493 NA NA NA NA NA chr10-549 126207999 126208288 139 - chr10:126208134-126208223 NA NA NA NA NA chr10-548 126031430 126031732 215 - chr10:126031533-126031574 NA NA NA NA NA chr10-547 125505483 125505812 204 - chr10:125505685-125505764 NA NA NA NA NA chr10-546 125352030 125352219 155 - chr10:125352078-125352199 NA NA NA NA NA chr10-545 125091226 125091715 232 - chr10:125091456-125091459 NA NA NA NA NA chr10-544 124604557 124604838 153 - chr10:124604685-124604710 NA NA NA NA NA chr10-543 124550867 124551223 147 - chr10:124550908-124550958 NA NA NA NA NA chr10-542 124505225 124505811 411 - chr10:124505537-124505556 NA NA NA NA NA chr10-24 12418863 12419108 212 - chr10:12418899-12419078 NA NA NA NA NA chr10-541 124109173 124109403 153 - chr10:124109226-124109318 NA NA NA NA NA chr10-540 123859830 123860084 208 - chr10:123859900-123860046 NA NA NA NA NA chr10-539 123844315 123844609 193 - chr10:123844380-123844496 NA NA NA NA NA chr10-538 123821526 123821944 226 - chr10:123821670-123821704 NA NA NA NA NA chr10-537 123654897 123655086 150 - chr10:123654922-123655033 NA NA NA NA NA chr10-23 12355629 12355899 129 - chr10:12355738-12355820 NA NA NA NA NA chr10-536 122913437 122913706 143 - chr10:122913564-122913580 NA NA NA NA NA chr10-535 122660457 122660683 147 - chr10:122660548-122660551 NA NA NA NA NA chr10-534 122308171 122308393 167 - chr10:122308236-122308368 NA NA NA NA NA chr10-533 121499215 121499489 227 - chr10:121499265-121499445 NA NA NA NA NA chr10-532 120975355 120975730 215 - chr10:120975635-120975690 NA NA NA NA NA chr10-531 120865437 120865793 195 - chr10:120865470-120865504 NA NA NA NA NA chr10-530 120861436 120861855 279 - chr10:120861585-120861742 NA NA NA NA NA chr10-529 120191638 120192009 233 - chr10:120191817-120192004 NA NA NA NA NA chr10-528 120159340 120159737 141 - chr10:120159368-120159405 NA NA NA NA NA chr10-527 119999078 119999419 252 - chr10:119999222-119999385 NA NA NA NA NA chr10-22 11998192 11998362 116 - chr10:11998240-11998338 NA NA NA NA NA chr10-526 119847616 119847789 142 - chr10:119847666-119847715 NA NA NA NA NA chr10-525 119122940 119123402 237 - chr10:119123170-119123182 NA NA NA NA NA chr10-524 118934971 118935233 181 - chr10:118935042-118935196 NA NA NA NA NA chr10-523 118707620 118707856 175 - chr10:118707762-118707822 NA NA NA NA NA chr10-522 118522169 118522399 121 - chr10:118522274-118522286 NA NA NA NA NA chr10-521 117910086 117910305 130 - chr10:117910211-117910228 NA NA NA NA NA chr10-520 117525832 117526071 157 - chr10:117525950-117526001 NA NA NA NA NA chr10-519 117454211 117454930 405 - chr10:117454704-117454707 NA NA NA NA NA chr10-518 117415206 117415434 154 - chr10:117415267-117415321 NA NA NA NA NA chr10-21 11719485 11719746 147 - chr10:11719645-11719678 NA NA NA NA NA chr10-517 116972977 116973170 119 - chr10:116973013-116973058 NA NA NA NA NA chr10-516 116801313 116801657 293 - chr10:116801379-116801651 NA NA NA NA NA chr10-515 116450955 116451230 201 - chr10:116450966-116451135 NA NA NA NA NA chr10-514 116387700 116387956 255 - chr10:116387700-116387954 NA NA NA NA NA chr10-513 116379215 116379432 150 - chr10:116379307-116379388 NA NA NA NA NA chr10-512 116371056 116371253 159 - chr10:116371100-116371217 NA NA NA NA NA chr10-511 116343707 116344048 125 - chr10:116343725-116343766 NA NA NA NA NA chr10-510 116245842 116246061 133 - chr10:116245984-116246031 NA NA NA NA NA chr10-509 116087734 116088316 221 - chr10:116087891-116087965 NA NA NA NA NA chr10-508 115918242 115918583 256 - chr10:115918370-115918541 NA NA NA NA NA chr10-507 115842930 115843087 145 - chr10:115842950-115843083 NA NA NA NA NA chr10-506 115739945 115740144 138 - chr10:115739984-115740061 NA NA NA NA NA chr10-505 114806190 114806855 406 - chr10:114806488-114806635 NA NA NA NA NA chr10-504 114692120 114692374 154 - chr10:114692297-114692351 NA NA NA NA NA chr10-503 114596801 114597066 257 - chr10:114596806-114597057 NA NA NA NA NA chr10-502 114359243 114359598 178 - chr10:114359337-114359338 NA NA NA NA NA chr10-501 114161117 114161545 270 - chr10:114161252-114161318 NA NA NA NA NA chr10-500 113375894 113376059 145 - chr10:113375931-113376056 NA NA NA NA NA chr10-499 112770938 112771367 276 - chr10:112771120-112771345 NA NA NA NA NA chr10-498 112761955 112762179 178 - chr10:112762085-112762125 NA NA NA NA NA chr10-497 112583849 112584090 190 - chr10:112584050-112584089 NA NA NA NA NA chr10-496 112519967 112520280 151 - chr10:112520180-112520271 NA NA NA NA NA chr10-495 112383231 112383555 166 - chr10:112383391-112383399 NA NA NA NA NA chr10-494 111061282 111061552 178 - chr10:111061338-111061424 NA NA NA NA NA chr10-493 110942245 110942473 166 - chr10:110942286-110942390 NA NA NA NA NA chr10-492 110791074 110791262 169 - chr10:110791106-110791256 NA NA NA NA NA chr10-491 110591105 110591284 116 - chr10:110591165-110591220 NA NA NA NA NA chr10-490 110534955 110535268 247 - chr10:110535081-110535174 NA NA NA NA NA chr10-20 11033448 11033889 231 - chr10:11033706-11033867 NA NA NA NA NA chr10-489 110232625 110232934 166 - chr10:110232825-110232848 NA NA NA NA NA chr10-488 110041863 110042117 115 - chr10:110042018-110042026 NA NA NA NA NA chr10-19 10989777 10990122 202 - chr10:10989992-10990051 NA NA NA NA NA chr10-487 109670460 109670652 151 - chr10:109670468-109670578 NA NA NA NA NA chr10-486 109379330 109379517 129 - chr10:109379369-109379402 NA NA NA NA NA chr10-485 109183658 109183829 128 - chr10:109183698-109183783 NA NA NA NA NA chr10-484 108981837 108982219 340 - chr10:108981857-108982071 NA NA NA NA NA chr10-18 10870993 10871207 160 - chr10:10870998-10871104 NA NA NA NA NA chr10-483 108597288 108597567 181 - chr10:108597346-108597429 NA NA NA NA NA chr10-482 108559919 108560124 132 - chr10:108559966-108559973 NA NA NA NA NA chr10-481 107672902 107673095 131 - chr10:107672976-107673045 NA NA NA NA NA chr10-480 107447620 107447883 207 - chr10:107447652-107447803 NA NA NA NA NA chr10-479 107243599 107243783 116 - chr10:107243614-107243662 NA NA NA NA NA chr10-478 107102492 107102747 228 - chr10:107102503-107102650 NA NA NA NA NA chr10-477 106914573 106915015 183 - chr10:106914738-106914835 NA NA NA NA NA chr10-476 106741841 106742029 151 - chr10:106741846-106741960 NA NA NA NA NA chr10-475 106722229 106722432 131 - chr10:106722232-106722339 NA NA NA NA NA chr10-474 106560063 106560421 180 - chr10:106560236-106560238 NA NA NA NA NA chr10-473 106040017 106040238 151 - chr10:106040085-106040166 NA NA NA NA NA chr10-472 105628103 105628421 183 - chr10:105628223-105628361 NA NA NA NA NA chr10-471 105531174 105531570 270 - chr10:105531348-105531460 NA NA NA NA NA chr10-470 105272703 105272971 256 - chr10:105272720-105272964 NA NA NA NA NA chr10-17 10499319 10499511 129 - chr10:10499375-10499427 NA NA NA NA NA chr10-469 104264808 104264985 141 - chr10:104264872-104264977 NA NA NA NA NA chr10-468 104073981 104074161 120 - chr10:104074048-104074122 NA NA NA NA NA chr10-467 104050779 104051056 156 - chr10:104050850-104050885 NA NA NA NA NA chr10-16 10393822 10394125 192 - chr10:10393930-10394005 NA NA NA NA NA chr10-466 103870373 103870793 285 - chr10:103870474-103870627 NA NA NA NA NA chr10-465 103733258 103733535 246 - chr10:103733315-103733513 NA NA NA NA NA chr10-464 103414084 103414262 131 - chr10:103414111-103414195 NA NA NA NA NA chr10-463 103120214 103120414 133 - chr10:103120342-103120408 NA NA NA NA NA chr10-462 102806036 102806341 164 - chr10:102806129-102806184 NA NA NA NA NA chr10-461 102153541 102153781 145 - chr10:102153612-102153662 NA NA NA NA NA chr10-460 102147872 102148127 183 - chr10:102147936-102148031 NA NA NA NA NA chr10-459 102047110 102047938 388 - chr10:102047686-102047787 NA NA NA NA NA chr10-458 101994229 101994488 173 - chr10:101994360-101994447 NA NA NA NA NA chr10-457 101280476 101280648 139 - chr10:101280495-101280601 NA NA NA NA NA chr10-456 100737913 100738149 133 - chr10:100737985-100738015 NA NA NA NA NA chr10-455 100590669 100590899 147 - chr10:100590775-100590839 NA NA NA NA NA chr10-15 10019461 10019614 119 - chr10:10019493-10019578 NA NA NA NA NA chr10-454 100056037 100056592 336 - chr10:100056298-100056561 NA NA NA NA NA 953.25 chrM 10803 11418 + 7.75 NA Intergenic Intergenic -3596 NR_162149 113219467 NR_162149 MIR12136 - microRNA 12136 ncRNA 728.5 chr4 49657461 49657744 + 6.25 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 670960 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 423.75-11 chrM 11746 11875 + 5.5 NA Intergenic Intergenic -4296 NR_162149 113219467 NR_162149 MIR12136 - microRNA 12136 ncRNA 934.25 chrUn_KI270333v1 1873 2235 + 5.25 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 1150.25 chrUn_KI270438v1 104367 104962 + 5 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 947.25 chr16 46394169 46394926 + 4.75 NA Intergenic Intergenic 174550 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 512.25-7 chrUn_KI270438v1 103922 104195 + 4.5 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 520-3 chr3 122395840 122396031 + 4.25 NA intron (NM_014367, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 11753 NM_014367 26355 Hs.584881 NM_014367 ENSG00000114023 FAM162A C3orf28|E2IG5|HGTD-P family with sequence similarity 162 member A protein-coding 1105.25 chrUn_KI270466v1 506 1225 + 4.25 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 1114.75 chr4 49154414 49155258 + 4.25 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 168194 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 706 chr18 13984429 13984812 + 4.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -68913 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 433-8 chr2 89828579 89828731 + 4 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -190748 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 345.25-18 chr5 49666159 49666266 + 4 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 775076 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 754.5 chr17 25920034 25920393 + 4 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1169028 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 925.5 chr16 34593161 34593631 + 4 NA Intergenic (GATTCCATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -211916 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 1540.75 chr4 49148793 49150270 + 4 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 162889 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 864.5 chrUn_KI270442v1 92110 93032 + 3.75 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 996 chrUn_GL000216v2 183 696 + 3.75 NA NA (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 448.5-10 chr9 27016444 27016642 + 3.75 NA intron (NM_001099224, intron 10 of 13) intron (NM_001099224, intron 10 of 13) -10871 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 721.75 chr4 49120701 49121212 + 3.75 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 134314 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 620 chr9 30464768 30465087 + 3.75 NA Intergenic Intergenic -56473 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 513.5-3 chr4 49709675 49710155 + 3.5 NA Intergenic SAR|Satellite|Satellite 723273 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 321.5-4 chr11 27371016 27371272 + 3.5 NA intron (NM_018490, intron 17 of 17) intron (NM_018490, intron 17 of 17) -7896 NM_080654 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 314-2 chr10 41859836 41860000 + 3.5 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 508127 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 490 chr13 111140099 111140310 + 3.5 NA intron (NM_001113512, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 8361 NR_046516 100874226 Hs.577834 NR_046516 ARHGEF7-AS1 - ARHGEF7 antisense RNA 1 ncRNA 477.25-3 chr4 72899653 72900006 + 3.5 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 169887 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 449.75-7 chr5 167720881 167721227 + 3.5 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -33875 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 562.25 chr3 111416398 111416629 + 3.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -125684 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 647.5 chr15 72049002 72049328 + 3.5 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) intron (NM_006901, intron 1 of 41) -65093 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 486.5-3 chr4 59028290 59028573 + 3.5 NA intron (NR_133942, intron 1 of 1) intron (NR_133942, intron 1 of 1) 14858 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 602.25 chr7 28608974 28609313 + 3.5 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -76990 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 391.25-18 chr9 16635397 16635716 + 3.25 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -91258 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 340.25-23 chrUn_KI270336v1 14 242 + 3.25 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 666.5 chr7 42258888 42259417 + 3.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -21943 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 660.5 chr15 50360729 50361223 + 3.25 NA TTS (NR_039862) TTS (NR_039862) 647 NR_039862 100616396 NR_039862 ENSG00000284284 MIR4712 - microRNA 4712 ncRNA 607 chrX 49671768 49672118 + 3.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 24041 NM_003785 8712 Hs.128231 NM_003785 ENSG00000068985 PAGE1 AL5|CT16.3|GAGE-9|GAGEB1|PAGE-1 PAGE family member 1 protein-coding 575 chr16 9435687 9435917 + 3.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 9183 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 711 chr5 11677937 11678410 + 3.25 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -89107 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 459-3 chr5 19872934 19873159 + 3.25 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 13226 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 369.25-9 chr4 34415121 34415372 + 3.25 NA Intergenic Intergenic -145499 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 613.5 chr5 45951158 45951431 + 3.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -254914 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 574.5-2 chr9 99222010 99222233 + 3.25 NA promoter-TSS (NM_033087) promoter-TSS (NM_033087) -161 NM_006808 10952 Hs.191887 NM_006808 ENSG00000106803 SEC61B - SEC61 translocon beta subunit protein-coding 619.75 chr2 75732320 75732724 + 3.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21607 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 397.25-9 chr5 43359896 43360251 + 3.25 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 37064 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 371.75-7 chr14 36972350 36972557 + 3.25 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -20062 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 483-2 chr8 99517590 99517798 + 3.25 NA intron (NM_017890, intron 29 of 61) intron (NM_017890, intron 29 of 61) 19036 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 489-6 chr6 118446115 118446545 + 3.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -55043 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 440-6 chr20 20481540 20481758 + 3.25 NA intron (NM_020343, intron 36 of 39) intron (NM_020343, intron 36 of 39) 113545 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 459.75-3 chr3 35352091 35352285 + 3.25 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 41835 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 536.5-6 chr7 42499356 42499818 + 3.25 NA Intergenic Intergenic 206860 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 563 chr2 74023095 74023416 + 3.25 NA intron (NM_001287491, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu 20563 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 553.25 chr1 39118080 39118411 + 3.25 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) intron (NM_012090, intron 1 of 92) 34078 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 624.75 chr4 94076340 94076675 + 3.25 NA Intergenic Intergenic 131049 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 692 chr2 158666238 158666635 + 3.25 NA exon (NM_001304971, exon 16 of 16) exon (NM_001304971, exon 16 of 16) 68566 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 490.75-2 chr22 49977856 49978138 + 3.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 15131 NR_106879 102465493 NR_106879 ENSG00000276753 MIR6821 hsa-mir-6821 microRNA 6821 ncRNA 452.25-6 chr5 126244970 126245229 + 3.25 NA Intergenic Intergenic 40076 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 636.25-2 chr5 54993048 54993507 + 3.25 NA Intergenic LTR90A|LTR|LTR -7684 NM_001135604 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 427.5-4 chr14 43927613 43927752 + 3.25 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 579601 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 515.75-5 chr2 189045246 189045738 + 3.25 NA intron (NM_000393, intron 46 of 53) intron (NM_000393, intron 46 of 53) 49862 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 436.5-4 chr12 7504753 7504940 + 3.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1028 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 288.75-17 chr14 20967972 20968139 + 3.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 12568 NM_002934 6036 Hs.728 NM_002934 ENSG00000169385 RNASE2 EDN|RAF3|RNS2 ribonuclease A family member 2 protein-coding 454.25-7 chr6 65135497 65135725 + 3.25 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -165807 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 606.75-2 chr8 109740989 109741373 + 3.25 NA Intergenic Intergenic -49390 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 462-9 chr7 7534566 7534835 + 3.25 NA intron (NM_001037763, intron 1 of 34) intron (NM_001037763, intron 1 of 34) 1173 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 456.5-8 chr20 55429163 55429603 + 3.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -2186 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 261-49 chr5 113601696 113601803 + 3.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 88055 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 268.5-62 chr8 115271352 115271501 + 3.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 396587 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 549.75-2 chr14 23009893 23010169 + 3.25 NA intron (NM_001130706, intron 1 of 7) intron (NM_001130706, intron 1 of 7) 112 NM_021944 60686 Hs.255874 NM_021944 ENSG00000100802 C14orf93 RTFC chromosome 14 open reading frame 93 protein-coding 622.75 chr4 30631167 30631718 + 3.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -88927 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 466-4 chr5 133093951 133094151 + 3.25 NA intron (NM_002154, intron 13 of 18) AluSz|SINE|Alu 42038 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 485-4 chr4 51898906 51899183 + 3.25 NA intron (NM_001040402, intron 7 of 10) L1MC4|LINE|L1 55465 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 664 chr3 97554015 97554319 + 3.25 NA intron (NM_001080448, intron 11 of 17) intron (NM_001080448, intron 11 of 17) 114560 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 508.5 chr12 105876641 105876898 + 3.25 NA Intergenic Intergenic 169995 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 916 chr5 49599452 49600188 + 3 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite 841468 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 421-14 chr6 164220256 164220524 + 3 NA Intergenic Intergenic -548906 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 663.25 chr11 82670108 82670505 + 3 NA Intergenic Intergenic 63558 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 823.75 chr2 44433685 44434454 + 3 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 72122 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 534 chr1 246681585 246681872 + 3 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -42681 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 446.25-6 chr8 51424172 51424480 + 3 NA intron (NM_144651, intron 13 of 22) AluJo|SINE|Alu 385119 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 468-6 chr5 40123910 40124202 + 3 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 71765 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 628.75 chr7 111415326 111415678 + 3 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 146789 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 576.25 chr2 146851859 146852224 + 3 NA Intergenic Intergenic 264984 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 463.5-4 chr3 55785156 55785420 + 3 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) 67306 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 689.75 chr2 198663028 198663423 + 3 NA Intergenic UCON1|Unknown|Unknown -288128 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 295-33 chr9 31394928 31395127 + 3 NA Intergenic Intergenic -13537 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 424.75-3 chr15 63506324 63506699 + 3 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) intron (NM_001256702, intron 1 of 13) 1918 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 564.75 chr8 119740037 119740389 + 3 NA intron (NM_003184, intron 25 of 25) intron (NM_003184, intron 25 of 25) -66823 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 313.5-11 chr14 68878839 68879023 + 3 NA intron (NM_001130005, intron 18 of 20) intron (NM_001130005, intron 18 of 20) -82688 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 318.5-12 chr16 47202940 47203154 + 3 NA intron (NM_030790, intron 14 of 17) L1MB3|LINE|L1 58979 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 419.25-4 chr12 113888258 113888555 + 3 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) intron (NM_001146698, intron 21 of 24) 77919 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 375-6 chr18 13480090 13480250 + 3 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) L1MC1|LINE|L1 20223 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 492-2 chr14 70100673 70100924 + 3 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) MIRc|SINE|MIR -20581 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 391-15 chr7 48181718 48181929 + 3 NA intron (NM_152701, intron 1 of 61) intron (NM_152701, intron 1 of 61) 10365 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 475.75-2 chr5 11062281 11062518 + 3 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) intron (NM_001288715, intron 15 of 20) -301165 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 499-7 chrX 84799144 84799366 + 3 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -134896 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 296.75-25 chr4 101728619 101728772 + 3 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -61912 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 699.75 chr8 132120802 132121121 + 3 NA TTS (NM_004519) TTS (NM_004519) -15696 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 463.25-2 chr5 65163211 65163470 + 3 NA intron (NR_135689, intron 25 of 25) intron (NR_135689, intron 25 of 25) 318580 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 524.5 chr10 34075835 34076261 + 3 NA Intergenic Intergenic -303368 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 603.25 chr4 119745886 119746347 + 3 NA Intergenic Intergenic 58399 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 330.5-30 chr7 28325786 28326104 + 3 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 26624 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 395.5-8 chr15 69959823 69960107 + 3 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 119503 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 538.75-2 chr9 30241914 30242469 + 3 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 166263 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 429.5-7 chr5 36810307 36810589 + 3 NA Intergenic Intergenic 66246 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 544-3 chr4 49105565 49106259 + 3 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 119270 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 395-9 chr2 89833229 89833466 + 3 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -195440 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 454.25-4 chr4 59645446 59645809 + 3 NA Intergenic Intergenic 632054 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 483.75-3 chr8 125907362 125907704 + 3 NA Intergenic Intergenic 43664 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 556.25 chr11 82471648 82471920 + 3 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -67871 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 438.75-6 chr4 140632371 140632577 + 3 NA intron (NM_015130, intron 16 of 20) intron (NM_015130, intron 16 of 20) 10606 NR_077215 644962 Hs.676500 NR_077215 TNRC18P1 - trinucleotide repeat containing 18 pseudogene 1 pseudo 479-5 chr7 21244498 21244833 + 3 NA Intergenic Intergenic -183418 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 348.25-9 chr3 158710595 158710777 + 3 NA intron (NM_206963, intron 3 of 5) intron (NM_206963, intron 3 of 5) 21771 NM_206963 5918 Hs.131269 NM_002888 ENSG00000118849 RARRES1 LXNL|PERG-1|TIG1 retinoic acid receptor responder 1 protein-coding 647-2 chr8 84742140 84742490 + 3 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 36388 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 534.25-2 chr3 159263392 159263789 + 3 NA 3' UTR (NM_001042706, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001042706, exon 4 of 4) -9657 NM_014575 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 294.25-2 chr1 101429104 101429291 + 3 NA Intergenic Intergenic 105360 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 511.5-8 chrX 63587724 63588101 + 3 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -26817 NR_152612 92249 Hs.31532 NR_015353 ENSG00000235437 LINC01278 - long intergenic non-protein coding RNA 1278 ncRNA 534-6 chr8 114645168 114645465 + 3 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 1022697 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 455-2 chr20 55215353 55215555 + 3 NA Intergenic Intergenic -207589 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 573-2 chr16 63044277 63044527 + 3 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -1007964 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 233.25-7 chr10 59653615 59653734 + 3 NA intron (NM_194298, intron 5 of 5) intron (NM_194298, intron 5 of 5) 56217 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 428.25 chr15 95444129 95444389 + 3 NA intron (NR_027133, intron 1 of 5) intron (NR_027133, intron 1 of 5) 11166 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 419-6 chr3 103511504 103511806 + 3 NA Intergenic Intergenic 12461 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 609.25 chr8 126086193 126086572 + 3 NA Intergenic Intergenic -135185 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 369.5-20 chr3 65800749 65801022 + 3 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -92931 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 537.25-2 chr5 148775417 148775670 + 3 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie -51050 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 642.5 chr22 26943652 26944066 + 3 NA Intergenic Intergenic 40567 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 411.75-5 chr2 180995094 180995257 + 3 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 14051 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 336-7 chr14 42714327 42714566 + 3 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 1107590 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 436 chr10 72098609 72098874 + 3 NA intron (NM_001369110, intron 8 of 8) intron (NM_001369110, intron 8 of 8) -9709 NM_001134434 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 472.75-4 chr2 19579668 19580163 + 3 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -221292 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 488.25-6 chr4 176079459 176079642 + 3 NA intron (NM_181265, intron 1 of 28) intron (NM_181265, intron 1 of 28) 13709 NM_181265 116966 Hs.532056 NM_170710 ENSG00000150627 WDR17 - WD repeat domain 17 protein-coding 452.25-4 chr20 44221743 44221959 + 3 NA intron (NR_038337, intron 2 of 2) L2|LINE|L2 10765 NR_038337 100505783 Hs.159049 NR_038337 ENSG00000223891 OSER1-DT OSER1-AS1 OSER1 divergent transcript ncRNA 361.75-5 chr12 84926145 84926357 + 3 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -13422 NM_018057 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 381-6 chr13 78365424 78365679 + 3 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -230571 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 483.5-6 chr8 120843735 120844049 + 3 NA Intergenic Intergenic -31846 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 576.75-2 chr2 68207290 68207823 + 3 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) MamRep1527|LTR|LTR 44976 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 322-26 chrX 62977522 62977756 + 3 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 373693 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 594-2 chr5 152903105 152903387 + 3 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 69103 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 369.25-7 chr3 74412356 74412545 + 3 NA intron (NM_020872, intron 4 of 21) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 108690 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 612.75 chr17 72327132 72327360 + 3 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -15565 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 426.75-2 chr15 66552184 66552384 + 3 NA intron (NM_001278562, intron 8 of 11) intron (NM_001278562, intron 8 of 11) 13213 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 553 chr4 32334769 32335079 + 3 NA Intergenic Intergenic -16114 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 611 chr14 58889838 58890196 + 3 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 61729 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 327.75-20 chr5 23272212 23272558 + 3 NA Intergenic Intergenic -235224 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 710.25 chr18 7531443 7531909 + 3 NA Intergenic Intergenic -35640 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 665.5 chr9 27512347 27512648 + 3 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) intron (NM_024761, intron 1 of 3) -11817 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 606.75 chr4 86608368 86608738 + 3 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) MIR|SINE|MIR 14238 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 382.5-11 chr2 96599157 96599365 + 3 NA TTS (NM_001349256) TTS (NM_001349256) 38730 NR_047658 55683 Hs.516341 NM_017991 ENSG00000114982 KANSL3 KIAA1310|NSL3|Rcd1 KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 protein-coding 491-2 chr5 8117629 8117914 + 3 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 248623 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 654.75 chr10 26895618 26895856 + 3 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -34650 NM_001178120 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 407.25-8 chr3 70977203 70977454 + 2.75 NA intron (NR_146142, intron 15 of 19) intron (NR_146142, intron 15 of 19) 87596 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 418.5-3 chr14 57187617 57187878 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 81158 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 515-4 chr7 17206819 17207183 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -91651 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 522.25 chr6 3085864 3086107 + 2.75 NA intron (NM_001354930, intron 6 of 10) L1MB3|LINE|L1 17491 NM_001354933 8737 Hs.519842 NM_003804 ENSG00000137275 RIPK1 IMD57|RIP|RIP-1|RIP1 receptor interacting serine/threonine kinase 1 protein-coding 507-4 chr5 164743544 164743862 + 2.75 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 273424 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 287.75-38 chr4 46955718 46955883 + 2.75 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) intron (NM_001204267, intron 7 of 7) 37781 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 543.5 chr10 99239108 99239409 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -3383 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 500 chr10 17044332 17044567 + 2.75 NA intron (NM_001081, intron 25 of 66) intron (NM_001081, intron 25 of 66) 85368 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 355.25-15 chr8 125148759 125148956 + 2.75 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) MERX|DNA|TcMar-Tigger 56997 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 685.75 chr12 7650085 7650697 + 2.75 NA intron (NM_005889, intron 3 of 3) FAM|SINE|Alu 15517 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 424.25-7 chr9 28293665 28293954 + 2.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 425496 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 599.25 chr10 121808677 121809060 + 2.75 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 119163 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 363.5-9 chr18 66416079 66416232 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 187935 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 532.25 chr10 65062077 65062368 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -137704 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 468.75-3 chr2 58121295 58121609 + 2.75 NA intron (NM_001130483, intron 7 of 13) intron (NM_001130483, intron 7 of 13) 74740 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 375.5-2 chr1 241780804 241781064 + 2.75 NA intron (NM_001367482, intron 22 of 27) intron (NM_001367482, intron 22 of 27) -67257 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 309.25-10 chr15 64296912 64297230 + 2.75 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) intron (NM_001329607, intron 2 of 11) 59102 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 288-18 chr13 48371555 48371725 + 2.75 NA intron (NM_000321, intron 11 of 26) L2c|LINE|L2 41473 NM_001162498 10161 Hs.123464 NM_005767 ENSG00000139679 LPAR6 ARWH1|HYPT8|LAH3|P2RY5|P2Y5 lysophosphatidic acid receptor 6 protein-coding 364.5-4 chr10 90268782 90268995 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 271917 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 589-2 chr4 124414875 124415306 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 143344 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 508-3 chr7 7708309 7708548 + 2.75 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) intron (NM_002947, intron 2 of 7) 10179 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 446-7 chr7 35563865 35564172 + 2.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 131117 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 277.25-47 chr8 142555865 142555985 + 2.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 58554 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 391.75-6 chr5 30225931 30226142 + 2.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 345476 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 447-3 chr17 11548801 11549022 + 2.75 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) intron (NM_001173462, intron 3 of 4) -49559 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 527.5-2 chr17 81233596 81233912 + 2.75 NA intron (NM_144679, intron 5 of 11) intron (NM_144679, intron 5 of 11) 5047 NR_135654 105371925 Hs.620720 NR_135654 LOC105371925 - uncharacterized LOC105371925 ncRNA 475-2 chr15 95717072 95717459 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 284172 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 371.25-4 chr12 77997422 77997579 + 2.75 NA intron (NM_001024383, intron 6 of 39) intron (NM_001024383, intron 6 of 39) 166606 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 439.5-6 chr17 60555223 60555565 + 2.75 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -9152 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 704 chr5 41388393 41388845 + 2.75 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 121982 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 189.75-12 chr10 106462526 106462660 + 2.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 322428 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 406.5-6 chr2 139381914 139382087 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 484676 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 499-6 chr8 126712277 126712531 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -153926 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 395.5-18 chr7 50374423 50374930 + 2.75 NA intron (NM_001291840, intron 2 of 2) intron (NM_001291840, intron 2 of 2) 55628 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 600.25 chr17 63192866 63193256 + 2.75 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 226826 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 241.75 chr1 31337939 31338072 + 2.75 NA intron (NM_001282574, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu 35071 NM_004102 2170 Hs.576372 NM_004102 ENSG00000121769 FABP3 FABP11|H-FABP|M-FABP|MDGI|O-FABP fatty acid binding protein 3 protein-coding 392.75-11 chr9 74329148 74329344 + 2.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42285 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 511.5-7 chr7 47872333 47872580 + 2.75 NA intron (NM_138295, intron 24 of 56) L1MB8|LINE|L1 76035 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 406.75-4 chr13 34140617 34141063 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -207203 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 504-4 chr5 52826672 52826987 + 2.75 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 38913 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 411.5-5 chr2 161724533 161724709 + 2.75 NA intron (NM_001354443, intron 2 of 25) L2b|LINE|L2 100205 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 440.25 chr17 60651837 60652044 + 2.75 NA intron (NM_003620, intron 4 of 5) intron (NM_003620, intron 4 of 5) -25911 NM_017679 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 453.25-4 chr4 31408847 31409036 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -97603 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 433-10 chr5 108651900 108652189 + 2.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 76217 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 335.5-4 chr17 66664915 66665141 + 2.75 NA intron (NM_002737, intron 5 of 16) L2a|LINE|L2 -122044 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 549.25-2 chr5 96376135 96376469 + 2.75 NA intron (NR_130776, intron 3 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 55857 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 397.75-5 chr4 42054821 42054989 + 2.75 NA intron (NM_006345, intron 9 of 17) L1MC5|LINE|L1 64375 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 358.25-7 chr14 68893445 68893631 + 2.75 NA intron (NM_001102, intron 9 of 20) intron (NM_001102, intron 9 of 20) 85764 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 495-2 chr3 87504219 87504509 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -227780 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 659 chr8 102549847 102550205 + 2.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1563 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 417.5-16 chr8 102607218 102607491 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 46610 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 255.5-44 chr2 151979957 151980089 + 2.75 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) -6045 NM_001005747 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 441.5-9 chr7 16629512 16629773 + 2.75 NA intron (NM_020319, intron 2 of 9) intron (NM_020319, intron 2 of 9) 16112 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 335.25-17 chr2 72770806 72771016 + 2.75 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 55122 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 481.5-4 chr6 62029102 62029372 + 2.75 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 256988 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 623.75 chr1 113468311 113468705 + 2.75 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) MER3|DNA|hAT-Charlie 77993 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 480.75-4 chr7 39596889 39597139 + 2.75 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) -26558 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 342.75-22 chr5 109635120 109635310 + 2.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -54151 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 238.25-63 chr5 20248248 20248405 + 2.75 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -57225 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 407-10 chr20 17453297 17453537 + 2.75 NA intron (NM_002594, intron 8 of 11) intron (NM_002594, intron 8 of 11) 77962 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 218.5-124 chr9 31799327 31799443 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -417895 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 487.5-5 chr2 175472846 175473047 + 2.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -291236 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 405.75-10 chr7 39241716 39241992 + 2.75 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) L1ME1|LINE|L1 87280 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 494.75 chr14 64548350 64548647 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -1463 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 317-34 chr9 4070773 4071017 + 2.75 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 81288 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 466.5 chr13 33412465 33412804 + 2.75 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) L1MD1|LINE|L1 -77368 NR_146541 105370154 NR_146541 LINC02344 - long intergenic non-protein coding RNA 2344 ncRNA 238-32 chr2 196931036 196931214 + 2.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4418 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 219.25-80 chr8 129821368 129821450 + 2.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -34785 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 313.25-9 chr12 61461763 61461937 + 2.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 730989 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 446.75-3 chr11 23395201 23395510 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 23835 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 591.75 chr9 33887036 33887355 + 2.75 NA intron (NM_017811, intron 2 of 4) intron (NM_017811, intron 2 of 4) 47169 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 398.5-8 chr2 188813401 188813610 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -23382 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 354-18 chr4 72104699 72104950 + 2.75 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 65692 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 311.75-4 chr11 24350120 24350300 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -146843 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 385.5-4 chr10 65249842 65250248 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -321380 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 413.5-8 chr8 89117988 89118293 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 639571 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 436-7 chr6 51029303 51029644 + 2.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 210602 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 681.5 chr4 72303722 72304187 + 2.75 NA exon (NM_014243, exon 17 of 22) exon (NM_014243, exon 17 of 22) 264822 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 482-5 chr7 12955294 12955590 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 267809 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 598.75-2 chr5 158571273 158571567 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -161647 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 373.25-18 chr8 130739362 130739652 + 2.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -295833 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 480.25 chr10 31897552 31897882 + 2.75 NA intron (NM_001270696, intron 3 of 17) L1MCb|LINE|L1 11209 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 458.25-3 chr21 27087692 27087974 + 2.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -120745 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 480.75-3 chr14 45129018 45129262 + 2.75 NA intron (NM_002013, intron 3 of 6) intron (NM_002013, intron 3 of 6) 5341 NM_002013 2287 Hs.509226 NM_002013 ENSG00000100442 FKBP3 FKBP-25|FKBP-3|FKBP25|PPIase FKBP prolyl isomerase 3 protein-coding 290.75-19 chr16 82630405 82630585 + 2.75 NA intron (NM_001220492, intron 1 of 5) intron (NM_001220492, intron 1 of 5) 3526 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 405.25-3 chr12 11645894 11646086 + 2.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -3864 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 594 chr15 83035585 83035966 + 2.75 NA intron (NM_001011885, intron 4 of 6) L1MEg|LINE|L1 -24136 NM_001160114 123207 Hs.352541 NM_144597 ENSG00000169609 C15orf40 - chromosome 15 open reading frame 40 protein-coding 403-2 chr12 14135978 14136192 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -155729 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 355.25-8 chr3 85254430 85254702 + 2.75 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) MER21B|LTR|ERVL -131144 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 435.5-7 chr20 18905384 18905739 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -75358 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 463.25 chr14 58770263 58770609 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -57852 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 417.5-14 chr7 118227490 118227673 + 2.75 NA intron (NM_019644, intron 1 of 6) L1M3d|LINE|L1 2877 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 462.5-3 chr2 109447592 109447964 + 2.75 NA intron (NM_001099289, intron 7 of 9) intron (NM_001099289, intron 7 of 9) -134153 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 261-47 chr5 65380591 65380792 + 2.75 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) L1M|LINE|L1 101229 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 489.5-3 chr20 17631495 17631963 + 2.75 NA intron (NM_001365613, intron 8 of 24) intron (NM_001365613, intron 8 of 24) 50513 NM_001365613 6238 Hs.472213 NM_004587 ENSG00000125844 RRBP1 ES/130|ES130|RRp|hES ribosome binding protein 1 protein-coding 275-14 chr16 24778952 24779092 + 2.75 NA intron (NM_014494, intron 5 of 24) intron (NM_014494, intron 5 of 24) 49371 NM_014494 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 825.25-2 chr17 59606971 59608041 + 2.75 NA 3' UTR (NM_001166301, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001166301, exon 17 of 17) -12183 NM_001288653 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 690-2 chr2 37603282 37604103 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 68507 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 825.25 chr12 79456348 79457021 + 2.75 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite 37427 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 362.5-22 chr7 36309967 36310256 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 57129 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 406.25-5 chr7 9957122 9957299 + 2.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 322940 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 404.75-4 chr4 44685571 44685899 + 2.75 NA intron (NM_001345869, intron 5 of 15) intron (NM_001345869, intron 5 of 15) 7315 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 433.5-7 chr5 170903383 170903582 + 2.75 NA intron (NM_022897, intron 5 of 27) L1P2|LINE|L1 41464 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 373.75-11 chr4 33498832 33499093 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 540931 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 226.25-20 chr12 12078410 12078525 + 2.75 NA intron (NM_001370269, intron 3 of 7) intron (NM_001370269, intron 3 of 7) 6999 NM_030766 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 378.5-3 chr12 6350482 6350689 + 2.75 NA intron (NM_001038, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu -8468 NM_001065 7132 Hs.279594 NM_001065 ENSG00000067182 TNFRSF1A CD120a|FPF|TBP1|TNF-R|TNF-R-I|TNF-R55|TNFAR|TNFR1|TNFR55|TNFR60|p55|p55-R|p60 TNF receptor superfamily member 1A protein-coding 736.25 chrX 62576342 62576834 + 2.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 774744 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 631.5-2 chr2 34382509 34382927 + 2.75 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -294839 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 443.5-7 chr4 84767024 84767288 + 2.75 NA intron (NM_014991, intron 30 of 67) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 184029 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 563-2 chr3 19378515 19378816 + 2.75 NA intron (NM_144633, intron 5 of 15) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -63734 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 257.75-52 chr8 121632592 121632768 + 2.75 NA intron (NM_005328, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -6666 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 572.75 chr17 63000226 63000835 + 2.75 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) intron (NM_025185, intron 1 of 25) 34295 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 474.75-5 chr6 147309789 147310043 + 2.75 NA intron (NM_139244, intron 9 of 25) intron (NM_139244, intron 9 of 25) -105302 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 280.75-40 chr8 104832482 104832688 + 2.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -243561 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 453.25 chr10 103778495 103778820 + 2.75 NA intron (NM_014631, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 31878 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 481-2 chr11 7775083 7775374 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 21714 NM_153444 120065 Hs.351824 NM_153444 ENSG00000183303 OR5P2 JCG3|JCG4 olfactory receptor family 5 subfamily P member 2 protein-coding 437.5-6 chr2 212839237 212839439 + 2.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 44007 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 474.5-5 chr8 112011991 112012229 + 2.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -631383 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 612 chr1 102151186 102151452 + 2.75 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -154085 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 687.5 chr5 113422158 113422570 + 2.75 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 12625 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 742.75 chr1 94944544 94945002 + 2.75 NA intron (NR_033998, intron 2 of 3) intron (NR_033998, intron 2 of 3) 16745 NR_033998 729970 Hs.297988 NR_033998 ENSG00000235501 LOC729970 - hCG2028352-like ncRNA 384.25-5 chr15 100990408 100990618 + 2.75 NA intron (NM_024652, intron 6 of 33) L1ME4b|LINE|L1 71156 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 348.5-13 chr4 51870093 51870372 + 2.75 NA intron (NM_001040402, intron 3 of 10) intron (NM_001040402, intron 3 of 10) 26653 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 286.75-44 chr9 34500271 34500468 + 2.75 NA intron (NM_001281428, intron 10 of 19) intron (NM_001281428, intron 10 of 19) 22621 NM_198573 375704 Hs.522085 NM_198573 ENSG00000168913 ENHO C9orf165|UNQ470 energy homeostasis associated protein-coding 1038.75 chr20 31053442 31054239 + 2.75 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -203824 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 284-5 chr10 78635362 78635494 + 2.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 368086 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 685.5 chr18 10939131 10939578 + 2.75 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) L1PA8|LINE|L1 -179705 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 638.5-2 chr3 62726996 62727404 + 2.75 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) L1ME3|LINE|L1 148216 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 481.25-3 chr2 189583332 189583557 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -2633 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 365.25-10 chr5 40307630 40307882 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 255465 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 546 chr18 9375280 9375650 + 2.75 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) L1MCa|LINE|L1 40692 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 508.25-3 chrX 44544537 44544971 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -1895 NM_173794 139341 Hs.7549 NM_173794 ENSG00000069509 FUNDC1 - FUN14 domain containing 1 protein-coding 420-16 chr9 86004685 86004899 + 2.75 NA intron (NM_024635, intron 13 of 22) L1M5|LINE|L1 63263 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 242-3 chr1 82589885 82590017 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -313232 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 344.75-2 chr12 58305833 58306213 + 2.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 218131 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 417.75-5 chrX 88710893 88711182 + 2.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -36188 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 562 chr4 35390994 35391314 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 852785 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 393.25-6 chr5 66512956 66513362 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -1555 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 592.5-2 chr4 73750156 73750601 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 9809 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 440-10 chr5 107471496 107471930 + 2.75 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 199224 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 427.5-10 chr7 102453346 102453681 + 2.75 NA 3' UTR (NM_001271818, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001271818, exon 4 of 4) 11350 NM_017621 54784 Hs.658598 NM_017621 ENSG00000160993 ALKBH4 ABH4 alkB homolog 4, lysine demethylase protein-coding 614.5 chr3 130523326 130523707 + 2.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -36818 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 259.75-23 chr19 32364070 32364176 + 2.75 NA intron (NM_001136156, intron 5 of 6) intron (NM_001136156, intron 5 of 6) 18513 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 634.5 chr9 92266054 92266532 + 2.75 NA intron (NR_073446, intron 13 of 32) intron (NR_073446, intron 13 of 32) 26254 NR_037424 100500918 NR_037424 ENSG00000281156 MIR3651 mir-3651 microRNA 3651 ncRNA 433.5-4 chr2 119719295 119719785 + 2.75 NA intron (NR_148341, intron 16 of 16) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 40339 NM_030577 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 382.5-16 chr5 173155619 173155823 + 2.75 NA intron (NM_013980, intron 4 of 5) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 11190 NM_013980 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 412.25 chr1 199981785 199982035 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -45800 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 425.25-2 chr12 15483816 15484035 + 2.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) -62686 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 409.25-9 chrX 73837948 73838221 + 2.75 NA intron (NR_001564, intron 1 of 5) intron (NR_001564, intron 1 of 5) 14669 NR_001564 7503 Hs.529901 NR_001564 ENSG00000229807 XIST DXS1089|DXS399E|LINC00001|NCRNA00001|SXI1|swd66 X inactive specific transcript ncRNA 517.25-4 chr8 77517398 77517847 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 66925 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 417.5-15 chr8 81730898 81731088 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -1455 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 238.25-26 chr18 520547 520671 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -5315 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 640.5 chr12 54563434 54564078 + 2.75 NA intron (NM_001165975, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 2291 NM_001315535 5153 Hs.530871 NM_000924 ENSG00000123360 PDE1B HEL-S-79p|PDE1B1|PDES1B phosphodiesterase 1B protein-coding 270-53 chr8 98716702 98716866 + 2.75 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) L1MB3|LINE|L1 108887 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 438-9 chr9 29053579 29053771 + 2.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 158624 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 501.5-2 chr8 19626271 19626606 + 2.75 NA intron (NR_148898, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 -23893 NM_001354496 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 384-16 chr6 39364393 39364787 + 2.75 NA intron (NM_001289020, intron 15 of 21) L3b|LINE|CR1 -41622 NM_001363784 83795 Hs.287765 NM_032115 ENSG00000095981 KCNK16 K2p16.1|TALK-1|TALK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 16 protein-coding 365.25-12 chr9 32514715 32514879 + 2.75 NA intron (NM_014314, intron 1 of 17) intron (NM_014314, intron 1 of 17) 11399 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 450.75-6 chr6 99582021 99582239 + 2.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13316 NM_001363537 892 Hs.430646 NM_005190 ENSG00000112237 CCNC CycC|SRB11|hSRB11 cyclin C protein-coding 562.75-4 chr5 167285103 167285350 + 2.75 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) intron (NM_001122679, intron 2 of 29) -116825 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 434.5-2 chr11 105340919 105341217 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -201299 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 652.75 chr9 37143305 37143662 + 2.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 22885 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 491.75-4 chr7 35763256 35763527 + 2.75 NA intron (NR_120511, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 37234 NR_120511 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 460-4 chr2 75905469 75905717 + 2.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -194678 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 487.5-6 chr5 33465535 33465912 + 2.75 NA intron (NR_047677, intron 16 of 17) intron (NR_047677, intron 16 of 17) 24947 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 436-10 chr9 79879289 79879646 + 2.75 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) L1MA4|LINE|L1 54937 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 466.5-5 chr2 135572917 135573244 + 2.75 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) L1MB8|LINE|L1 -13272 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 405.75-7 chr5 25350041 25350372 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 159253 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 407.75 chr10 48424311 48424601 + 2.75 NA intron (NM_001323302, intron 9 of 13) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22844 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 299.75-15 chr2 171808508 171808683 + 2.75 NA intron (NR_047549, intron 12 of 16) intron (NR_047549, intron 12 of 16) 85649 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 335-3 chr1 197648752 197648927 + 2.75 NA intron (NM_144977, intron 7 of 15) intron (NM_144977, intron 7 of 15) 126641 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 512.25-4 chr19 7693337 7693600 + 2.75 NA intron (NM_002002, intron 8 of 10) intron (NM_002002, intron 8 of 10) 6011 NM_001207019 2208 Hs.465778 NM_002002 ENSG00000104921 FCER2 BLAST-2|CD23|CD23A|CLEC4J|FCE2|IGEBF Fc fragment of IgE receptor II protein-coding 618.25 chr12 63083225 63083926 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 69235 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 517-6 chr8 88905366 88905669 + 2.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -578034 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 349.25 chr1 34411688 34412199 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 235036 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 351.75-12 chr18 60597722 60598136 + 2.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -225154 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 615.25 chr22 31426686 31427110 + 2.75 NA intron (NM_004147, intron 7 of 8) intron (NM_004147, intron 7 of 8) 27294 NM_004147 4733 Hs.115242 NM_004147 ENSG00000185721 DRG1 NEDD3 developmentally regulated GTP binding protein 1 protein-coding 314-7 chr14 29079806 29080000 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -294116 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 436.5 chr1 87879656 87880047 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -508196 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 303.5-5 chr10 41875355 41875567 + 2.75 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 492584 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 509.5-2 chr20 56632198 56632476 + 2.75 NA intron (NM_003222, intron 3 of 6) intron (NM_003222, intron 3 of 6) 3031 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 372.5-18 chr6 128756382 128756640 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -126627 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 575.25-2 chr8 38664525 38664868 + 2.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -63439 NR_003129 286140 Hs.512071 NR_003129 RNF5P1 - ring finger protein 5 pseudogene 1 pseudo 491.25-2 chr10 43707735 43708037 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -59005 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 498.25 chr11 98273509 98273801 + 2.75 NA Intergenic Intergenic -747294 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 569.75 chr9 28266056 28266286 + 2.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 453134 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 600-3 chr17 2955112 2955403 + 2.75 NA intron (NM_001330058, intron 3 of 24) L1MB5|LINE|L1 10638 NR_110818 101927911 Hs.626373 NR_110818 ENSG00000262884 LOC101927911 - uncharacterized LOC101927911 ncRNA 423.5-6 chr20 31061039 31061352 + 2.75 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -196469 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 917.5 chr14 61985306 61986075 + 2.75 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) intron (NM_001367657, intron 3 of 6) 57995 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 472.5-3 chr5 26573401 26573615 + 2.75 NA Intergenic Intergenic 465078 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 505.75-2 chr3 160435823 160436206 + 2.75 NA 3' UTR (NM_173084, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_173084, exon 3 of 3) 13772 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 356.75-3 chr1 189507040 189507272 + 2.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 968854 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 318-18 chr2 187925008 187925357 + 2.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 362509 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 343-15 chr2 108478060 108478292 + 2.5 NA intron (NR_028063, intron 8 of 21) intron (NR_028063, intron 8 of 21) 28970 NM_181453 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 247.25-17 chr14 70485451 70485598 + 2.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -1768 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 686.75 chr1 211955808 211956453 + 2.5 NA intron (NM_015434, intron 16 of 19) L1M5|LINE|L1 -79423 NM_001286229 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 603.25-2 chrX 80720463 80720951 + 2.5 NA intron (NM_153252, intron 17 of 40) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 89170 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 572.5 chr13 61049777 61050115 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 149934 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 422-9 chr4 114867796 114868068 + 2.5 NA intron (NM_022569, intron 7 of 13) intron (NM_022569, intron 7 of 13) 211173 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 331.5-16 chr20 56880909 56881115 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 251706 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 235-17 chr14 26963060 26963185 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 54480 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 418-4 chr3 88897703 88898057 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -209741 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 1061.25 chr8 115209672 115210510 + 2.5 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 457922 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 262-7 chr10 93517544 93517748 + 2.5 NA intron (NM_018131, intron 6 of 8) intron (NM_018131, intron 6 of 8) 21034 NM_001127182 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 711.75 chr8 55526645 55527214 + 2.5 NA 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) -5951 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 336.5-15 chr2 103972439 103972651 + 2.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 435787 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 326.25-15 chr17 54774360 54774594 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -126214 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 587.75 chr2 75625108 75625621 + 2.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -21419 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 457-5 chr9 88459254 88459659 + 2.5 NA intron (NM_006717, intron 3 of 5) (TTTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 71012 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 319-37 chr8 123106341 123106513 + 2.5 NA intron (NM_001363149, intron 8 of 21) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 33178 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 440-9 chr5 50343253 50343628 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 97848 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 258-18 chr15 59800539 59800668 + 2.5 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -111283 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 575-2 chr2 68263216 68263595 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -10873 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 275-31 chr4 33000288 33000466 + 2.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 649339 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 482.5 chr10 9748238 9748496 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -310355 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 308-16 chr19 9730932 9731194 + 2.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -30287 NR_146444 729648 Hs.626848 NM_001199814 ZNF812P ZNF812 zinc finger protein 812, pseudogene pseudo 341.5-30 chr5 110421928 110422125 + 2.5 NA intron (NM_001039763, intron 13 of 13) intron (NM_001039763, intron 13 of 13) 91889 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 363.5-23 chr8 140028156 140028346 + 2.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 72284 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 438.5-4 chr15 96239907 96240188 + 2.5 NA intron (NR_125738, intron 2 of 4) intron (NR_125738, intron 2 of 4) -85999 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 409.75-4 chr14 51060714 51061001 + 2.5 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) L1ME2|LINE|L1 34847 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 255-50 chr5 24177245 24177351 + 2.5 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 225950 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 429.75-2 chr16 49150155 49150349 + 2.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 131586 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 613 chr7 26096555 26096846 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -55498 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 461 chr11 47646463 47646786 + 2.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -3970 NM_001317231 23788 Hs.269944 NM_014342 ENSG00000109919 MTCH2 HSPC032|MIMP|SLC25A50 mitochondrial carrier 2 protein-coding 340-5 chr12 42884779 42884953 + 2.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 192650 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 408.5-6 chr22 31260159 31260571 + 2.5 NA intron (NM_001031801, intron 4 of 14) L2a|LINE|L2 11981 NM_001031801 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 547.75-4 chr5 41102484 41102880 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -31340 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 580.25 chr3 180979896 180980454 + 2.5 NA 3' UTR (NM_001013439, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001013439, exon 18 of 18) 9343 NM_001190233 131118 Hs.230601 NM_145261 ENSG00000205981 DNAJC19 PAM18|TIM14|TIMM14 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C19 protein-coding 362.5-5 chr14 29502430 29502636 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 424563 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 354-13 chr2 32183985 32184156 + 2.5 NA intron (NM_001193513, intron 5 of 14) intron (NM_001193513, intron 5 of 14) 18206 NM_001330476 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 411-3 chr14 72757581 72757762 + 2.5 NA intron (NM_001280544, intron 2 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger 134978 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 288-45 chr8 117129614 117129864 + 2.5 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -5256 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 757.25 chr10 111173764 111174527 + 2.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 59854 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 522-3 chr7 78602801 78603159 + 2.5 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 255738 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 466.25-2 chr7 34327808 34328102 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -330263 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 422.5-7 chr15 84717428 84717732 + 2.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -1120 NR_073518 23478 Hs.9534 NM_014300 ENSG00000140612 SEC11A 1810012E07Rik|SEC11L1|SPC18|SPCS4A|sid2895 SEC11 homolog A, signal peptidase complex subunit protein-coding 409.25-8 chr8 138010551 138010910 + 2.5 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 72815 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 428.75-3 chr12 65939603 65939873 + 2.5 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -57413 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 280.25-8 chr10 95111780 95111998 + 2.5 NA Intergenic LTR64|LTR|ERV1 -42392 NM_000770 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 277.5-63 chr5 82668635 82668849 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -171413 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 358-4 chr17 60049716 60049937 + 2.5 NA intron (NM_022070, intron 15 of 19) intron (NM_022070, intron 15 of 19) -6721 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 325.5-36 chr7 33773673 33773929 + 2.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -131114 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 351.25-5 chr14 58958395 58958660 + 2.5 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) intron (NR_110547, intron 4 of 5) 130239 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 463.5-3 chr20 43600668 43601004 + 2.5 NA intron (NM_001323578, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu 9899 NM_001323580 51098 Hs.444332 NM_016004 ENSG00000101052 IFT52 C20orf9|CGI-53|NGD2|NGD5 intraflagellar transport 52 protein-coding 355-8 chr2 186064598 186064882 + 2.5 NA intron (NR_110218, intron 3 of 5) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 21577 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 435.25-5 chr6 146157761 146157978 + 2.5 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 128671 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 191-56 chr4 31552330 31552458 + 2.5 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1MC4|LINE|L1 45850 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 448.5-2 chr10 104497713 104497993 + 2.5 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -17578 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 554-2 chr5 23126228 23126625 + 2.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -273082 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 258.25-5 chr1 191439176 191439379 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -210779 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 525-2 chr7 141397620 141398061 + 2.5 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) intron (NM_001195278, intron 2 of 3) -153570 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 278.5-65 chrX 82682877 82683129 + 2.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -825287 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 790.75 chr2 48391150 48392006 + 2.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -49188 NR_024188 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 450-9 chr4 52399070 52399410 + 2.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 257299 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 473.25-7 chr5 179793977 179794480 + 2.5 NA intron (NM_145867, intron 1 of 4) intron (NM_145867, intron 1 of 4) 242 NM_145867 4056 Hs.706741 NM_145867 ENSG00000213316 LTC4S - leukotriene C4 synthase protein-coding 430-9 chr20 49244294 49244606 + 2.5 NA TTS (NM_001348187) TTS (NM_001348187) -25155 NM_001319135 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 554-3 chr8 76783912 76784276 + 2.5 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -100819 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 533.25 chr4 30596823 30597607 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -123154 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 400-6 chr17 69980284 69980514 + 2.5 NA intron (NR_110875, intron 2 of 4) intron (NR_110875, intron 2 of 4) 18692 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 427.75-4 chr8 127371950 127372449 + 2.5 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -28200 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 307.25-31 chr5 104202138 104202511 + 2.5 NA Intergenic (TGTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -639535 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 385.5-6 chr11 81303429 81303966 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -540894 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 242.75-15 chr14 47744528 47744711 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 16485 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 263-20 chr16 52484298 52484415 + 2.5 NA intron (NM_001080430, intron 1 of 6) intron (NM_001080430, intron 1 of 6) 62787 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 250.5-82 chr6 72688823 72688949 + 2.5 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 58391 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 282.5-44 chr3 147090295 147090426 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 168437 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 422.5-6 chr14 83683145 83683333 + 2.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 1040607 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 619.5 chr6 75036396 75036843 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 92163 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 423 chr12 17171675 17171986 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 183083 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 432-10 chr20 59528518 59528745 + 2.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -48878 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 420.5-3 chr10 119856301 119856506 + 2.5 NA intron (NM_024834, intron 5 of 15) L1ME2|LINE|L1 16480 NM_024834 79892 Hs.124246 NM_024834 ENSG00000197771 MCMBP C10orf119|MCM-BP minichromosome maintenance complex binding protein protein-coding 261.75-37 chr5 110143062 110143197 + 2.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 259947 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 289-21 chr2 154517065 154517218 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -59703 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 249.5-38 chr17 43361026 43361159 + 2.5 NA Intergenic CpG 27806 NR_027412 100130581 Hs.546897 NR_027412 ENSG00000188825 LINC00910 - long intergenic non-protein coding RNA 910 ncRNA 235.5-6 chr1 101249893 101250061 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 13228 NM_001400 1901 Hs.154210 NM_001400 ENSG00000170989 S1PR1 CD363|CHEDG1|D1S3362|ECGF1|EDG-1|EDG1|S1P1 sphingosine-1-phosphate receptor 1 protein-coding 626.5 chr11 11864770 11865112 + 2.5 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) L1MDa|LINE|L1 23518 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 337.75-8 chr14 69513677 69513846 + 2.5 NA intron (NM_001161498, intron 6 of 12) L1MC1|LINE|L1 29033 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 694.25 chr20 51584439 51584871 + 2.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21816 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 642.25 chr1 205094581 205095032 + 2.5 NA intron (NM_001193272, intron 13 of 13) intron (NM_001193272, intron 13 of 13) -10346 NM_203376 388730 Hs.146928 NM_203376 ENSG00000174529 TMEM81 HC3107|KVLA2788|UNQ2788 transmembrane protein 81 protein-coding 404.5-9 chr9 79455025 79455369 + 2.5 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -116576 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 330-13 chr2 174435256 174435432 + 2.5 NA 3' UTR (NM_152529, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_152529, exon 16 of 16) 39614 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 550-2 chr12 38578824 38579212 + 2.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 262244 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 240-34 chr3 22703552 22703688 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 498958 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 408-11 chr3 119146921 119147208 + 2.5 NA exon (NM_152539, exon 1 of 3) exon (NM_152539, exon 1 of 3) 899 NM_152539 152405 Hs.730099 NM_152539 ENSG00000163424 TEX55 C3orf30|TSCPA testis expressed 55 protein-coding 298.75-25 chr22 47770735 47770930 + 2.5 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) L1PB4|LINE|L1 139158 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 346.5-14 chr2 80316533 80316711 + 2.5 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 3243 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 240-67 chr9 95289187 95289428 + 2.5 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron 27947 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 348.75-14 chr3 81844477 81844704 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -82945 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 546.25 chr15 58816155 58816484 + 2.5 NA intron (NM_001040450, intron 4 of 8) intron (NM_001040450, intron 4 of 8) 45017 NM_001040450 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 612.5 chr9 127313572 127314058 + 2.5 NA intron (NR_104591, intron 4 of 26) LTR81C|LTR|Gypsy 49041 NM_032293 84253 Hs.29304 NM_032293 ENSG00000136895 GARNL3 bA356B19.1 GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3 protein-coding 387.5-9 chr3 104596584 104596946 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -769948 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 685 chr3 175090670 175091033 + 2.5 NA intron (NR_046390, intron 2 of 3) intron (NR_046390, intron 2 of 3) 24391 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 477.5-2 chr13 112535759 112536201 + 2.5 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) L1MB7|LINE|L1 52173 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 290-12 chr12 5754787 5754953 + 2.5 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) L1MA10|LINE|L1 190389 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 474.5 chr1 210593298 210593667 + 2.5 NA intron (NM_001122834, intron 10 of 11) L1MA3|LINE|L1 264116 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 376.25 chr1 40329842 40330107 + 2.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -12688 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 387.5-2 chr1 246399662 246399926 + 2.5 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) intron (NM_001167740, intron 1 of 11) 17618 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 529.25 chr11 82690173 82690554 + 2.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 43501 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 325.75-6 chr10 116426229 116426452 + 2.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1507 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 402.5 chr1 105022100 105022299 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 596736 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 268.5-70 chrX 121811839 121812117 + 2.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 441006 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 365.75-10 chr2 190667006 190667198 + 2.5 NA intron (NM_001321314, intron 1 of 6) intron (NM_001321314, intron 1 of 6) 7944 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 368.75 chr1 236451069 236451320 + 2.5 NA intron (NM_080738, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 55781 NM_080738 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 301.5-29 chr2 141901213 141901511 + 2.5 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 230339 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 407.5-8 chr4 130274135 130274561 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -102013 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 383.5-11 chr7 18246251 18246538 + 2.5 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) L1MB4|LINE|L1 -43698 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 543.25 chr15 67025300 67025555 + 2.5 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 38755 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 436.5-6 chr22 17911961 17912266 + 2.5 NA intron (NM_015241, intron 1 of 31) FLAM_A|SINE|Alu -5227 NM_001122731 57553 Hs.528024 NM_015241 ENSG00000243156 MICAL3 MICAL-3 microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 protein-coding 439-3 chr10 131633959 131634187 + 2.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 156126 NR_038365 399827 Hs.523353 NM_001001677 ENSG00000189275 LINC01164 - long intergenic non-protein coding RNA 1164 ncRNA 480-6 chr7 16775266 16775516 + 2.5 NA intron (NM_014399, intron 1 of 5) intron (NM_014399, intron 1 of 5) 21636 NM_014399 27075 Hs.364544 NM_014399 ENSG00000106537 TSPAN13 NET-6|NET6|TM4SF13 tetraspanin 13 protein-coding 523 chr2 225098172 225098544 + 2.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -55890 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 340.75-12 chr18 4720927 4721173 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -265743 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 263.5-25 chr17 73670194 73670324 + 2.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -25814 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 437.25-5 chr7 29339001 29339238 + 2.5 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -130149 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 313-24 chr9 85046048 85046225 + 2.5 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR 340235 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 396-11 chr3 82138300 82138590 + 2.5 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 152303 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 605.5 chr4 48664366 48664792 + 2.5 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 115720 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 271-42 chr5 67231381 67231537 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -34660 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 309-36 chr4 186764300 186764544 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -40566 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 504.5-3 chr2 152148737 152148977 + 2.5 NA intron (NM_005843, intron 2 of 13) intron (NM_005843, intron 2 of 13) 26906 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 267.75 chr1 45108597 45108828 + 2.5 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 96458 NR_036510 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 508.5-3 chr8 125295789 125296059 + 2.5 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -134434 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 202.75-107 chr7 155716496 155716601 + 2.5 NA intron (NM_053043, intron 8 of 17) intron (NM_053043, intron 8 of 17) 71887 NM_053043 155435 Hs.591815 NM_053043 ENSG00000184863 RBM33 PRR8 RNA binding motif protein 33 protein-coding 617.5 chr2 74193873 74194259 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -4497 NR_027405 10797 Hs.469030 NM_006636 ENSG00000065911 MTHFD2 NMDMC methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase protein-coding 473.5 chr14 48860355 48860671 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 725867 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 375.5-12 chr2 67525965 67526183 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 128741 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 509-2 chr8 119198955 119199277 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -9247 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 551.75 chr10 83629191 83629450 + 2.5 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 47769 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 591.5 chr1 40478370 40478981 + 2.5 NA intron (NM_001320178, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 1385 NM_198494 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 317.5-14 chr2 44487433 44487594 + 2.5 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 125566 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 434 chr3 118795338 118795569 + 2.5 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 15380 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 426.5-4 chr6 27766665 27767014 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 5095 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 382.75-12 chr6 67070705 67070921 + 2.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -984538 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 335.25-28 chr7 25930086 25930321 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 19783 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 420-10 chr4 101678071 101678334 + 2.5 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -112405 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 354.25-5 chr19 14421551 14421979 + 2.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2382 NR_046366 10212 Hs.311609 NM_005804 ENSG00000123136 DDX39A BAT1|BAT1L|DDX39|DDXL|URH49 DExD-box helicase 39A protein-coding 509.75-2 chr14 59542175 59542568 + 2.5 NA intron (NM_001164399, intron 10 of 19) L1ME4b|LINE|L1 34441 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 640.5-2 chr5 93959306 93959706 + 2.5 NA intron (NM_032042, intron 5 of 10) intron (NM_032042, intron 5 of 10) 152157 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 567.75 chr1 152567611 152567997 + 2.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -1024 NM_178435 353145 Hs.490208 NM_178435 ENSG00000185966 LCE3E LEP17 late cornified envelope 3E protein-coding 663.5 chr17 67172327 67172771 + 2.5 NA intron (NM_001330447, intron 13 of 32) intron (NM_001330447, intron 13 of 32) -72227 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 437.25-4 chr4 91086975 91087336 + 2.5 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 852124 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 320.5-37 chr6 160779103 160779373 + 2.5 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 77045 NM_001168338 5340 Hs.143436 NM_000301 ENSG00000122194 PLG - plasminogen protein-coding 219-68 chr3 41739045 41739251 + 2.5 NA intron (NR_136342, intron 21 of 34) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 222955 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 207.5-59 chr20 6534620 6534794 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 107975 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 376.5-17 chr6 122798650 122798888 + 2.5 NA intron (NM_001286138, intron 2 of 6) intron (NM_001286138, intron 2 of 6) 9511 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 348-10 chr14 68981273 68981461 + 2.5 NA intron (NR_073422, intron 2 of 3) intron (NR_073422, intron 2 of 3) 1685 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 352.5-20 chr4 92228512 92228680 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 48706 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 286.25-14 chr19 28413074 28413287 + 2.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -193508 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 420-15 chr8 127273432 127273690 + 2.5 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 28924 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 319.75-15 chr4 60886856 60887142 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -35620 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 442.75-2 chr11 29303727 29303996 + 2.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -290552 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 428.75-8 chr5 134051342 134051874 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -46633 NM_003374 7416 Hs.519320 NM_003374 ENSG00000213585 VDAC1 PORIN|VDAC-1 voltage dependent anion channel 1 protein-coding 431.25-6 chr4 33906578 33906904 + 2.5 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) L1MC1|LINE|L1 133152 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 529 chr11 40236737 40237127 + 2.5 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 56198 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 443-2 chr15 80205596 80205985 + 2.5 NA intron (NM_001352888, intron 1 of 2) LOR1b|LTR|ERV1 46423 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 374.5-6 chr15 74562890 74563183 + 2.5 NA intron (NM_001307939, intron 2 of 8) CR1_Mam|LINE|CR1 21816 NM_006465 10620 Hs.647642 NM_006465 ENSG00000179361 ARID3B BDP|DRIL2 AT-rich interaction domain 3B protein-coding 397.5-5 chr2 74570814 74571059 + 2.5 NA intron (NM_001321739, intron 7 of 10) L2b|LINE|L2 16776 NM_001318867 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 364.5-14 chr4 32567864 32568125 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 216956 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 384-2 chr10 101959512 101959806 + 2.5 NA intron (NM_024541, intron 20 of 25) intron (NM_024541, intron 20 of 25) 96514 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 550.75-2 chr14 60966703 60967090 + 2.5 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 14183 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 302-19 chr22 28130476 28130766 + 2.5 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) (ATGCAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -210009 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 358.75-2 chr1 109989826 109990195 + 2.5 NA intron (NM_001242673, intron 1 of 16) intron (NM_001242673, intron 1 of 16) 5245 NM_006621 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 481-4 chr13 79755125 79755632 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -49008 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 430.25-6 chr2 67638964 67639199 + 2.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 186481 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 344.75-19 chr9 11144108 11144373 + 2.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 531034 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 507.25-4 chr8 85518615 85519119 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -53952 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 371.5-9 chr4 42846145 42846453 + 2.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -46967 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 293-26 chr3 140861906 140862090 + 2.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -79838 NM_001104647 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 440.5-10 chr4 63485811 63486145 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 923472 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 168.25-99 chr3 77167555 77167681 + 2.5 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 69606 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 303.5-40 chr6 66551995 66552133 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 764185 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 279-41 chr6 81448109 81448227 + 2.5 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 304513 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 552.5 chr6 15978352 15978778 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -150521 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 330.25-7 chr15 72369467 72369753 + 2.5 NA intron (NM_001318825, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 6404 NR_134869 3073 Hs.604479 NM_000520 ENSG00000213614 HEXA TSD hexosaminidase subunit alpha protein-coding 537.5 chr5 52012268 52012542 + 2.5 NA intron (NR_147166, intron 3 of 3) intron (NR_147166, intron 3 of 3) 4374 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 343.75-13 chr6 65684005 65684345 + 2.5 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) intron (NM_001292009, intron 1 of 43) 23050 NM_001292009 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 414-11 chr3 24886845 24887138 + 2.5 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 57668 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 458.25-4 chr7 3936935 3937330 + 2.5 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -192553 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 274.5-33 chr2 24039572 24039726 + 2.5 NA intron (NM_025203, intron 1 of 3) L1MC5a|LINE|L1 7742 NM_025203 80304 Hs.24624 NM_025203 ENSG00000163026 WDCP C2orf44|MMAP|PP384 WD repeat and coiled coil containing protein-coding 543.75-2 chr7 94182970 94183608 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -178934 NR_133908 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 295.75-21 chr4 30580070 30580337 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -140166 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 278.25-10 chr12 33708565 33708756 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -268841 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 415.5-5 chr17 60253879 60254127 + 2.5 NA intron (NM_032582, intron 10 of 33) intron (NM_032582, intron 10 of 33) -22358 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 340.25-18 chr7 116454275 116454469 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -45366 NM_001206747 858 Hs.212332 NM_001233 ENSG00000105971 CAV2 CAV caveolin 2 protein-coding 333.5-7 chr15 97907766 97908042 + 2.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -33475 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 391.25-5 chr10 32843327 32843532 + 2.5 NA intron (NM_001321115, intron 34 of 43) L1MB8|LINE|L1 58043 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 442.75-4 chr13 60819459 60819837 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 146693 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 381.25-7 chr2 146902581 146902797 + 2.5 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 315632 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 269.5-33 chr21 28231532 28231741 + 2.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -2969 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 366.75-16 chr4 39331639 39332152 + 2.5 NA intron (NM_001204747, intron 4 of 24) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 34467 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 340.5-23 chr4 53801641 53801920 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 105879 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 380-16 chr5 2989152 2989403 + 2.5 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac 71423 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 392.75-2 chr10 60292218 60292455 + 2.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 97539 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 291.25-5 chr12 41260911 41261064 + 2.5 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 72667 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 433.75-9 chr4 72311669 72312075 + 2.5 NA intron (NM_014243, intron 13 of 21) intron (NM_014243, intron 13 of 21) 257349 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 460.25-3 chr8 76798534 76798888 + 2.5 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -115436 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 338-8 chr11 107747561 107747747 + 2.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -35598 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 295.5-10 chr12 71772609 71772859 + 2.5 NA intron (NM_014999, intron 3 of 6) intron (NM_014999, intron 3 of 6) 17871 NM_014999 23011 Hs.524590 NM_014999 ENSG00000080371 RAB21 - RAB21, member RAS oncogene family protein-coding 353-17 chr5 5420209 5420728 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -2209 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 477.5-4 chr14 84819203 84819456 + 2.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -452603 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 416.75-2 chr10 107773013 107773255 + 2.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 296159 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 579-3 chr3 143398650 143399270 + 2.5 NA intron (NM_173653, intron 12 of 15) intron (NM_173653, intron 12 of 15) 56714 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 464.25-6 chr8 125620710 125621143 + 2.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 188717 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 449-4 chr8 115515404 115515612 + 2.5 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 152505 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 447.25 chr14 60977017 60977491 + 2.5 NA intron (NM_020810, intron 3 of 4) intron (NM_020810, intron 3 of 4) 3825 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 499.25-3 chr14 48026573 48026863 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -231704 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 360.75-14 chr5 125947473 125947640 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -232021 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 298-27 chr6 168621073 168621195 + 2.5 NA intron (NM_001166412, intron 9 of 12) intron (NM_001166412, intron 9 of 12) 179950 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 327.5-14 chr19 28486450 28486670 + 2.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 -120128 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 443.5-3 chr14 82966745 82967026 + 2.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 324253 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 495.75-3 chr9 134596505 134596930 + 2.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -45088 NM_000093 1289 Hs.210283 NM_000093 ENSG00000130635 COL5A1 EDSC|EDSCL1 collagen type V alpha 1 chain protein-coding 532-2 chr21 27857823 27858090 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 135577 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 440.5-8 chr2 13869022 13869323 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 531786 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 396.25-12 chr4 30615874 30616129 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -104368 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 507.75-2 chr4 65614757 65615001 + 2.5 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) intron (NM_001281767, intron 2 of 16) 54609 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 516.25 chr2 31255642 31255957 + 2.5 NA intron (NM_014600, intron 3 of 5) intron (NM_014600, intron 3 of 5) 21647 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 363.5-10 chr19 57749781 57750118 + 2.5 NA intron (NR_145326, intron 1 of 3) LTR53|LTR|ERVL 3134 NM_173632 284309 Hs.720254 NM_173632 ENSG00000152443 ZNF776 - zinc finger protein 776 protein-coding 561.75-2 chr2 80923872 80924246 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 542887 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 284-24 chr2 67036347 67036613 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -49966 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 432.5-2 chr1 74441078 74441308 + 2.5 NA intron (NM_015978, intron 20 of 24) L1ME1|LINE|L1 42247 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 519.5-3 chr10 120421532 120421986 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -35195 NM_001030059 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 728.75 chr20 41528305 41528909 + 2.5 NA intron (NM_032221, intron 3 of 36) AluYk12|SINE|Alu 89770 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 209.5-119 chr5 49667104 49667222 + 2.5 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 774125 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 533.5 chr15 58009853 58010249 + 2.5 NA intron (NM_170696, intron 4 of 11) intron (NM_170696, intron 4 of 11) 3972 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 250.5-17 chr11 106294768 106294967 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 43460 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 192.5-108 chr5 131917630 131917782 + 2.5 NA intron (NM_001303622, intron 6 of 12) intron (NM_001303622, intron 6 of 12) 27957 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 219.5-98 chr5 32135657 32135781 + 2.5 NA intron (NM_022130, intron 2 of 3) intron (NM_022130, intron 2 of 3) 38600 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 408.5-2 chr12 18590682 18591151 + 2.5 NA intron (NM_001288774, intron 29 of 32) intron (NM_001288774, intron 29 of 32) 146593 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 467.25-7 chr7 48022679 48023156 + 2.5 NA intron (NM_001284350, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 6190 NM_001030019 256979 Hs.406741 NM_152782 ENSG00000164744 SUN3 SUNC1 Sad1 and UNC84 domain containing 3 protein-coding 449.75 chr1 37969520 37969896 + 2.5 NA exon (NM_001320830, exon 11 of 15) exon (NM_001320830, exon 11 of 15) 20314 NM_006802 10946 Hs.77897 NM_006802 ENSG00000183431 SF3A3 PRP9|PRPF9|SAP61|SF3a60 splicing factor 3a subunit 3 protein-coding 248.5-102 chr8 113670146 113670314 + 2.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -233291 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 394.25-4 chr4 90386744 90387065 + 2.5 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 151873 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 525-3 chr9 86510231 86510799 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -156105 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 388.5-6 chr17 58325917 58326126 + 2.5 NA intron (NR_038410, intron 1 of 4) intron (NR_038410, intron 1 of 4) 571 NR_038410 100506779 Hs.718477 NR_038410 ENSG00000265148 TSPOAP1-AS1 BZRAP1-AS1 TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1 ncRNA 563.5-3 chr8 138676734 138677326 + 2.5 NA intron (NM_152888, intron 40 of 64) intron (NM_152888, intron 40 of 64) -179300 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 404-7 chr6 122814335 122814553 + 2.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 25186 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 178.5-131 chr4 187454837 187454981 + 2.5 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) 50704 NR_038931 339975 Hs.639361 NR_038931 LOC339975 - uncharacterized LOC339975 ncRNA 646.25 chr18 1222842 1223466 + 2.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 136475 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 587.5 chr5 119050622 119051021 + 2.5 NA intron (NR_134250, intron 1 of 2) LTR26B|LTR|ERV1 -13160 NR_134249 105379143 Hs.636285 NR_134249 ENSG00000249494 LOC105379143 - uncharacterized LOC105379143 ncRNA 412.75-5 chr6 133348751 133348943 + 2.5 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) L2a|LINE|L2 107348 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 455.5-5 chr5 179875310 179875574 + 2.5 NA intron (NM_198868, intron 11 of 21) intron (NM_198868, intron 11 of 21) 16439 NR_134283 100996419 Hs.314414 NR_134283 ENSG00000245317 LOC100996419 - uncharacterized LOC100996419 ncRNA 298.5-44 chr8 106650716 106650980 + 2.5 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) L1ME4b|LINE|L1 -6960 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 341.25-12 chr17 49109483 49109650 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -22894 NM_001159388 124872 Hs.374679 NM_153446 ENSG00000167080 B4GALNT2 B4GALT|GALGT2 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 2 protein-coding 354.5-16 chr6 62246711 62246946 + 2.5 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 39397 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 533 chr12 15115697 15115996 + 2.5 NA intron (NM_001190726, intron 2 of 3) intron (NM_001190726, intron 2 of 3) -36077 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 564 chr14 51576172 51576537 + 2.5 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 23598 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 391.25-2 chr1 119387858 119388279 + 2.5 NA intron (NM_001005783, intron 6 of 8) intron (NM_001005783, intron 6 of 8) 19122 NR_046780 100874270 NR_046780 ENSG00000230921 HAO2-IT1 - HAO2 intronic transcript 1 ncRNA 554.25 chr7 7415422 7415944 + 2.5 NA intron (NM_001037763, intron 27 of 34) AluSg|SINE|Alu 120190 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 419.5-2 chr22 24922007 24922361 + 2.5 NA intron (NM_001098498, intron 23 of 23) AluY|SINE|Alu 24511 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 253.5-63 chr5 121421582 121421763 + 2.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 99122 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 705.25-2 chr8 103757338 103757942 + 2.5 NA intron (NM_001348496, intron 3 of 23) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -61580 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 277.5 chr1 90882073 90882251 + 2.5 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 30403 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 432.25-2 chr12 69591895 69592220 + 2.5 NA intron (NM_006431, intron 7 of 15) intron (NM_006431, intron 7 of 15) 6168 NM_001198842 10576 Hs.189772 NM_006431 ENSG00000166226 CCT2 99D8.1|CCT-beta|CCTB|HEL-S-100n|PRO1633|TCP-1-beta chaperonin containing TCP1 subunit 2 protein-coding 366-19 chr9 35446113 35446315 + 2.5 NA intron (NR_003581, intron 8 of 17) intron (NR_003581, intron 8 of 17) 39459 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 432.75-4 chr2 159350220 159350399 + 2.5 NA exon (NM_013450, exon 28 of 37) exon (NM_013450, exon 28 of 37) -63606 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 391.25-20 chr9 86555423 86555734 + 2.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -201168 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 483.5 chr14 76528507 76528881 + 2.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 157347 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 284-18 chr18 3954279 3954448 + 2.5 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -7990 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 380.5-13 chr9 12809552 12809746 + 2.5 NA intron (NR_125775, intron 1 of 3) L1MCa|LINE|L1 4740 NR_125775 101929467 Hs.586443 NR_125775 ENSG00000235448 LURAP1L-AS1 - LURAP1L antisense RNA 1 ncRNA 493-2 chr22 28369689 28370027 + 2.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -90011 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 602.75-2 chr6 45560529 45560902 + 2.5 NA Intergenic hAT-N1_Mam|DNA|hAT-Tip100? 138440 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 269.25-22 chr17 67624799 67625017 + 2.5 NA intron (NM_181671, intron 5 of 9) L1ME4c|LINE|L1 -92925 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 421 chr10 27642716 27643048 + 2.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -101733 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 382.25 chr1 110260246 110260508 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 50063 NR_036437 3749 Hs.153521 NM_004978 ENSG00000116396 KCNC4 C1orf30|HKSHIIIC|KSHIIIC|KV3.4 potassium voltage-gated channel subfamily C member 4 protein-coding 346.25 chr1 70162137 70162549 + 2.5 NA intron (NM_017768, intron 9 of 14) intron (NM_017768, intron 9 of 14) 43236 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 618.75-2 chr7 37653749 37654111 + 2.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -29836 NM_181791 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 421-10 chr4 61497274 61497570 + 2.5 NA intron (NM_001322246, intron 3 of 25) intron (NM_001322246, intron 3 of 25) 295250 NM_001371342 483.25-3 chr14 52990983 52991372 + 2.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -40080 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 447-8 chr4 65999858 66000130 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -276830 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 443-3 chr2 61923028 61923249 + 2.5 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) intron (NM_152516, intron 1 of 2) 17496 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 293.5-12 chr13 43920517 43920653 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 40681 NM_153218 144811 Hs.210586 NM_153218 ENSG00000179630 LACC1 C13orf31|FAMIN laccase domain containing 1 protein-coding 435.25-8 chr8 143851223 143851478 + 2.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10377 NM_178564 340371 Hs.521926 NM_178564 ENSG00000185189 NRBP2 TRG16|pp9320 nuclear receptor binding protein 2 protein-coding 413.25-8 chr7 83244286 83244607 + 2.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -81562 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 518.25 chr2 118105857 118106268 + 2.5 NA intron (NM_001321330, intron 2 of 4) intron (NM_001321330, intron 2 of 4) 17512 NM_001321329 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 385-18 chr7 41548999 41549170 + 2.5 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 -144835 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 321.25-22 chr6 130798394 130798591 + 2.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -28913 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 262.5-16 chr14 44442647 44442817 + 2.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 64551 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 360.5-2 chr10 31765582 31765820 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 143225 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 390.25-5 chr20 46091198 46091516 + 2.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -1395 NM_001348151 57727 Hs.654991 NM_020967 ENSG00000124160 NCOA5 CIA|bA465L10.6 nuclear receptor coactivator 5 protein-coding 387-7 chr2 76191990 76192173 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -481166 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 424-3 chr14 97041426 97041704 + 2.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 97986 NR_104113 145249 Hs.592323 NR_104113 ENSG00000225163 LINC00618 C14orf63 long intergenic non-protein coding RNA 618 ncRNA 725.75 chr8 101296189 101296820 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -72389 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 511.5 chr10 73496807 73497116 + 2.5 NA promoter-TSS (NM_021132) promoter-TSS (NM_021132) -937 NM_021132 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 444-3 chr10 84958398 84958658 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 240377 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 434.25-8 chr3 101265032 101265420 + 2.5 NA intron (NM_016247, intron 9 of 18) L1MA5A|LINE|L1 55349 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 462 chr1 150690739 150691123 + 2.5 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) intron (NM_018178, intron 2 of 4) 6223 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 402-6 chr2 185197205 185197405 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -30233 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 264-7 chr10 53230223 53230422 + 2.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -458622 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 297.5-56 chr8 130805130 130805353 + 2.5 NA intron (NM_001115, intron 14 of 17) MIR|SINE|MIR 235668 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 338-26 chr5 36025737 36026046 + 2.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -24869 NM_001171873 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 562.75-3 chr4 58647842 58648348 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -111767 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 494.5-3 chr13 38820008 38820335 + 2.5 NA intron (NM_207361, intron 6 of 23) intron (NM_207361, intron 6 of 23) 7420 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 746.25 chr20 37700792 37701253 + 2.5 NA intron (NM_030877, intron 1 of 15) L1ME4c|LINE|L1 6992 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 487-5 chr4 100260281 100260569 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -69957 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 459.5 chr12 24149757 24149971 + 2.5 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) L1ME2|LINE|L1 -62557 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 409.5-8 chr2 55823349 55823657 + 2.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 100279 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 428.5-7 chr6 62630139 62630525 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -344105 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 509.5-7 chr8 120346915 120347336 + 2.5 NA intron (NM_021110, intron 45 of 47) intron (NM_021110, intron 45 of 47) 98025 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 311.25-25 chr7 90006829 90006981 + 2.5 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) -112495 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 422.5-11 chr5 125620595 125620821 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 127447 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 573.5-2 chr5 36420366 36420892 + 2.5 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -118727 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 476.25 chr10 20981118 20981375 + 2.5 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) intron (NM_001173484, intron 3 of 6) -83644 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 400-10 chr4 36695685 36695992 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -53938 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 392-16 chr5 87724489 87724689 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 62547 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 366-2 chr1 73292260 73292567 + 2.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -13757 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 489.5-4 chr3 178105482 178105754 + 2.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 288753 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 350.5-20 chr4 95991345 95991578 + 2.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 151368 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 384.75-12 chr4 30472550 30472937 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -247626 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 363-24 chr8 75307160 75307411 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -28396 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 355.5-13 chr18 5759579 5759851 + 2.5 NA intron (NR_038839, intron 1 of 4) intron (NR_038839, intron 1 of 4) 10896 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 509.5-6 chr8 118179832 118180257 + 2.5 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) intron (NR_146234, intron 4 of 5) -68225 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 613.75 chr5 45065445 45065833 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 256692 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 512.25 chr10 24196887 24197218 + 2.5 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -11739 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 342.5-28 chr7 51236641 51236823 + 2.5 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 80077 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 390.5-8 chr2 162898368 162898635 + 2.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -59734 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 542.75 chr22 28577334 28577667 + 2.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MA3|LINE|L1 102365 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 400.25-4 chr2 100718667 100718954 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -101329 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 363.5-11 chr2 35574446 35574714 + 2.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 103175 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 398.25-10 chr4 30655756 30656012 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -64485 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 433.75-5 chr16 13273851 13274402 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 372528 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 429.75-5 chr20 50518981 50519283 + 2.5 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) 8749 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 356.5-3 chr10 26541875 26542093 + 2.5 NA intron (NM_019043, intron 11 of 14) intron (NM_019043, intron 11 of 14) 37323 NR_134472 101929117 Hs.127031 NR_134472 LOC101929117 - uncharacterized LOC101929117 ncRNA 676 chr1 57200583 57201000 + 2.5 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) MIRc|SINE|MIR 222321 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 395.5-15 chr3 51225065 51225496 + 2.5 NA intron (NM_004947, intron 14 of 52) intron (NM_004947, intron 14 of 52) -160011 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 332.5-8 chr17 61686750 61686984 + 2.5 NA intron (NM_032043, intron 18 of 19) intron (NM_032043, intron 18 of 19) -95648 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 373.5-14 chr3 28913092 28913248 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 337892 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 234-65 chr7 129962163 129962292 + 2.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9267 NM_182697 7328 Hs.643548 NM_003344 ENSG00000186591 UBE2H E2-20K|GID3|UBC8|UBCH|UBCH2 ubiquitin conjugating enzyme E2 H protein-coding 224-29 chr20 39542398 39542597 + 2.5 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -317749 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 438.25-3 chr4 57581631 57582238 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 156062 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 515 chr22 17490670 17490917 + 2.5 NA intron (NM_001290046, intron 2 of 18) L1MB7|LINE|L1 -72646 NM_001303484 83733 Hs.282982 NM_031481 ENSG00000182902 SLC25A18 GC2 solute carrier family 25 member 18 protein-coding 664.75 chr8 80481567 80481935 + 2.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3842 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 354-24 chr5 23844139 23844380 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -107089 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 319.75-14 chr3 94555438 94555710 + 2.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -382689 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 320-36 chr8 127123591 127123861 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -41505 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 401.5-4 chr13 111983100 111983365 + 2.5 NA intron (NR_120392, intron 1 of 3) L1MA8|LINE|L1 10922 NR_120392 100505996 Hs.654853 NR_120392 ENSG00000224243 SOX1-OT LINC00403 SOX1 overlapping transcript ncRNA 249-35 chr4 44453774 44453929 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -5042 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 408.25-6 chr7 53304295 53304584 + 2.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 268806 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 238-16 chr14 48522256 48522503 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -727365 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 307.25 chr1 159504145 159504291 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 31789 NM_001004469 127385 Hs.553587 NM_001004469 ENSG00000184155 OR10J5 OR1-28 olfactory receptor family 10 subfamily J member 5 protein-coding 454.75-2 chr22 28595301 28595599 + 2.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2c|LINE|L2 84415 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 353-14 chr20 19626377 19626542 + 2.5 NA intron (NM_020689, intron 6 of 16) intron (NM_020689, intron 6 of 16) -260062 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 452-6 chr8 131905309 131905645 + 2.5 NA intron (NM_001323555, intron 1 of 22) intron (NM_001323555, intron 1 of 22) 1384 NM_001323558 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 535.25 chr15 57030775 57031233 + 2.5 NA intron (NM_001322164, intron 3 of 19) intron (NM_001322164, intron 3 of 19) 111559 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 438.25-2 chr10 47135481 47135742 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -164586 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 443.5-2 chr13 56798537 56798865 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -342217 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 325.5-33 chr5 156001397 156001641 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -325238 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 578.5-2 chr9 6465078 6465540 + 2.5 NA intron (NM_152896, intron 4 of 15) L1MEd|LINE|L1 52110 NM_152896 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 216.5-80 chr3 110542031 110542139 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 527874 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 410.5-2 chr11 105775494 105775875 + 2.5 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) L1M2|LINE|L1 164978 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 425-3 chr15 96104975 96105194 + 2.5 NA intron (NR_158193, intron 4 of 7) intron (NR_158193, intron 4 of 7) 22757 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 287.75-9 chr10 75676494 75676711 + 2.5 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 29093 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 432.5-10 chr6 160265414 160265607 + 2.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -6689 NM_003058 6582 Hs.436385 NM_003058 ENSG00000112499 SLC22A2 OCT2 solute carrier family 22 member 2 protein-coding 387-9 chr3 43956444 43956646 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -157667 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 308.5-19 chr2 178823055 178823245 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -15727 NM_003319 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 242.75-69 chr8 118641085 118641269 + 2.5 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) L1MB8|LINE|L1 -19214 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 511.5-5 chr4 49109494 49110116 + 2.5 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 123163 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 483.25-2 chr12 98723681 98723956 + 2.5 NA intron (NM_001160, intron 23 of 25) intron (NM_001160, intron 23 of 25) 78518 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 357.75-5 chr15 89172135 89172376 + 2.5 NA intron (NM_007011, intron 9 of 14) L1MB2|LINE|L1 49324 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 412.25-13 chr7 49018241 49018530 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 93838 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 588.25 chr3 64423756 64424187 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -137375 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 251.5-42 chr2 186449137 186449255 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -37064 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 513-3 chr7 6469598 6470052 + 2.5 NA intron (NM_001100603, intron 2 of 3) intron (NM_001100603, intron 2 of 3) 14327 NM_001100603 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 384-11 chr2 66223652 66223929 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 134538 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 353.5-6 chr14 51344738 51344914 + 2.5 NA intron (NR_038358, intron 1 of 4) intron (NR_038358, intron 1 of 4) 11433 NR_038358 283553 Hs.325752 NR_038358 ENSG00000258479 LINC00640 - long intergenic non-protein coding RNA 640 ncRNA 403.25-5 chr20 42823928 42824221 + 2.5 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) L1ME4a|LINE|L1 138591 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 312.75-2 chr1 186553960 186554250 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -92991 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 211.25-37 chr2 30282579 30282719 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 51115 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 338.75-19 chr7 103665911 103666207 + 2.5 NA intron (NM_005045, intron 11 of 64) AluJb|SINE|Alu -219852 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 257.75-13 chr14 23093384 23093551 + 2.5 NA intron (NM_014977, intron 2 of 18) intron (NM_014977, intron 2 of 18) -2038 NM_017924 55017 Hs.525238 NM_017924 ENSG00000179933 C14orf119 - chromosome 14 open reading frame 119 protein-coding 750.25 chr14 52722695 52723772 + 2.5 NA intron (NM_002806, intron 12 of 13) intron (NM_002806, intron 12 of 13) -6933 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 422.5-4 chr11 78341084 78341346 + 2.5 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 665 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 320.25-8 chr12 32969046 32969227 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -72290 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 385.5-21 chr8 51665401 51665994 + 2.5 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) intron (NM_144651, intron 1 of 22) 143748 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 505.5-2 chr20 38565593 38565970 + 2.5 NA intron (NM_001282917, intron 25 of 29) intron (NM_001282917, intron 25 of 29) -15416 NM_001018082 149685 Hs.368028 NM_174906 ENSG00000182035 ADIG SMAF1 adipogenin protein-coding 320-14 chr18 3799825 3800004 + 2.5 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) intron (NM_001242762, intron 2 of 9) 45444 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 250-4 chr1 237307361 237307521 + 2.5 NA intron (NM_001035, intron 2 of 104) intron (NM_001035, intron 2 of 104) -163678 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 699.5 chr2 40167427 40167744 + 2.5 NA intron (NM_001351483, intron 5 of 8) intron (NM_001351483, intron 5 of 8) 249951 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 391-16 chr8 77559901 77560249 + 2.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 109378 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 232.5-76 chr4 55087383 55087599 + 2.5 NA intron (NM_002253, intron 27 of 29) intron (NM_002253, intron 27 of 29) 38104 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 378.5-14 chr5 56007246 56007469 + 2.5 NA Intergenic (TTATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12190 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 233-12 chr12 5891630 5891809 + 2.5 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) L1MEf|LINE|L1 53540 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 567.25-2 chr2 112468682 112469028 + 2.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -13301 NM_153712 150465 Hs.358997 NM_153712 ENSG00000114999 TTL - tubulin tyrosine ligase protein-coding 476.5-5 chr5 15620105 15620475 + 2.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) AluSq|SINE|Alu -5288 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 340.25-5 chr12 53412753 53412919 + 2.5 NA 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) -11019 NM_001164690 269 Hs.659889 NM_020547 ENSG00000135409 AMHR2 AMHR|MISR2|MISRII|MRII anti-Mullerian hormone receptor type 2 protein-coding 240.5-39 chr16 86547711 86547878 + 2.5 NA intron (NR_027490, intron 4 of 7) intron (NR_027490, intron 4 of 7) 7441 NM_022764 64779 Hs.343627 NM_022764 ENSG00000103248 MTHFSD - methenyltetrahydrofolate synthetase domain containing protein-coding 328-27 chr5 18221420 18221952 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 414412 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 405.25-6 chr22 26190772 26191160 + 2.5 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 21492 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 243.5-20 chr11 69608484 69608622 + 2.5 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -32552 NM_053056 595 Hs.523852 NM_053056 ENSG00000110092 CCND1 BCL1|D11S287E|PRAD1|U21B31 cyclin D1 protein-coding 551.5-3 chr7 3221028 3221460 + 2.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -62671 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 334-10 chr14 40514877 40515063 + 2.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -439741 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 327-16 chr2 52503153 52503410 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 132633 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 461.75 chr12 129913289 129913695 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -9467 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 294.75-16 chr2 109608445 109608710 + 2.5 NA intron (NM_001321509, intron 1 of 10) intron (NM_001321509, intron 1 of 10) 5090 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 386-4 chr1 216109479 216109735 + 2.5 NA intron (NM_206933, intron 21 of 71) intron (NM_206933, intron 21 of 71) 37142 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 224-47 chr6 35906851 35906979 + 2.5 NA intron (NR_034069, intron 2 of 15) L1MC5|LINE|L1 14183 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 663 chr12 16997693 16998159 + 2.5 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 9179 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 523.75-3 chr7 95370211 95370619 + 2.5 NA intron (NM_000940, intron 4 of 8) L2b|LINE|L2 25960 NM_000940 5446 Hs.440967 NM_000940 ENSG00000105852 PON3 - paraoxonase 3 protein-coding 561.5 chr3 96742380 96742707 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -72051 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 438.75-2 chr12 9004655 9005029 + 2.5 NA intron (NM_005810, intron 3 of 4) intron (NM_005810, intron 3 of 4) 15217 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 248.5-52 chr2 78253381 78253508 + 2.5 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 37287 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 517.75-2 chr2 12982464 12982824 + 2.5 NA intron (NR_038434, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR 24369 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 332-2 chr11 83619405 83619833 + 2.5 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) intron (NM_001142699, intron 19 of 27) 62806 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 381.5-10 chr9 80668357 80668573 + 2.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 693442 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 598.75 chr18 55471801 55472133 + 2.5 NA intron (NM_001348217, intron 2 of 18) intron (NM_001348217, intron 2 of 18) -7254 NR_039754 100616290 NR_039754 ENSG00000264571 MIR4529 - microRNA 4529 ncRNA 451.5-5 chr2 54328286 54328671 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -2406 NM_001100396 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 447.25-4 chr7 23403184 23403437 + 2.5 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) MER20B|DNA|hAT-Charlie 6864 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 427.5-7 chr5 24172758 24173207 + 2.5 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 221634 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 330-3 chr1 184623037 184623248 + 2.5 NA 3' UTR (NM_030806, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_030806, exon 6 of 6) 131716 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 492.25-6 chr5 22694460 22694907 + 2.5 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 158661 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 381.75 chr10 63208643 63208982 + 2.5 NA intron (NM_001322258, intron 8 of 24) intron (NM_001322258, intron 8 of 24) 60411 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 487.5-3 chr10 31672352 31672819 + 2.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 236341 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 365.75-11 chr2 220978869 220979221 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 593259 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 717.75 chr6 126950463 126950849 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -168015 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 407-6 chr14 66176837 66177175 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -309365 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 201-31 chr15 94125176 94125273 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -17286 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 344-12 chr20 13231934 13232193 + 2.5 NA intron (NM_080826, intron 1 of 5) intron (NM_080826, intron 1 of 5) 7624 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 478.5-4 chr6 153235195 153235404 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -104017 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 274.75-50 chr8 113374270 113374411 + 2.5 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 2812 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 462-7 chr2 116126113 116126378 + 2.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 782430 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 662.5 chr12 24461902 24462304 + 2.5 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 100388 NM_152989 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 326-17 chr2 65962255 65962455 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 395973 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 304.5-19 chr2 120418084 120418227 + 2.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 48194 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 566-2 chr3 147630061 147630432 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 208919 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 237.5-24 chr12 1410802 1410940 + 2.5 NA intron (NR_027948, intron 18 of 19) intron (NR_027948, intron 18 of 19) -89620 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 576.75-4 chr6 71179628 71179941 + 2.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -109027 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 480.5-5 chr8 117148042 117148267 + 2.5 NA intron (NM_173851, intron 2 of 7) L1ME4a|LINE|L1 13159 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 422.75-5 chr8 133413439 133413787 + 2.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -116309 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 283.5-50 chr6 72006162 72006405 + 2.5 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 119580 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 579.25 chr4 121263461 121263943 + 2.5 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -36219 NM_001244764 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 488.75-3 chr4 117991868 117992344 + 2.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -41216 NR_146513 9348 Hs.480596 NM_004784 ENSG00000164100 NDST3 HSST3 N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 protein-coding 365-8 chr16 54810444 54810660 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 37681 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 441.25 chr1 105168196 105168493 + 2.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 450591 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 421.75-8 chr8 88794756 88794936 + 2.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -467363 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 459.5-9 chr6 114282100 114282325 + 2.5 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -219335 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 336.25-16 chr6 40539387 40539573 + 2.5 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 47884 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 325.25-7 chr17 63645493 63646016 + 2.5 NA intron (NM_203351, intron 3 of 16) intron (NM_203351, intron 3 of 16) 23337 NM_203351 4215 Hs.29282 NM_002401 ENSG00000198909 MAP3K3 MAPKKK3|MEKK3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 protein-coding 382-2 chr1 74785561 74785948 + 2.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -52346 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 314.5 chr1 165958010 165958224 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 50196 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 485.25-3 chr12 128013475 128013752 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 13553 NR_131985 105370070 NR_131985 ENSG00000256643 LINC02441 CRAT8 long intergenic non-protein coding RNA 2441 ncRNA 763 chr17 71344521 71345459 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -142811 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 382.5-13 chr2 236546692 236546900 + 2.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -23029 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 421.25-5 chr17 57229957 57230212 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -25767 NM_001322250 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 512-2 chr2 67856161 67856644 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -30840 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 712.75 chr11 48280218 48280719 + 2.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 16607 NM_001004726 390113 Hs.553742 NM_001004726 ENSG00000176567 OR4X1 OR11-104 olfactory receptor family 4 subfamily X member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 461.75-4 chr6 66419201 66419585 + 2.5 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 631514 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 388.75-8 chr5 16123286 16123481 + 2.5 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 56408 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 333.75-5 chr14 56140206 56140420 + 2.5 NA intron (NM_021255, intron 1 of 5) intron (NM_021255, intron 1 of 5) 21902 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 422.5 chr10 35054583 35055083 + 2.5 NA 5' UTR (NM_001324376, exon 5 of 22) 5' UTR (NM_001324376, exon 5 of 22) 19450 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 267.5-59 chr5 62977687 62977928 + 2.5 NA Intergenic Intergenic 398988 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 352.5-7 chr16 76169327 76169566 + 2.5 NA Intergenic X6B_LINE|LINE|CR1 -107955 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 490-2 chr15 58656296 58656656 + 2.5 NA intron (NM_001320570, intron 5 of 14) L1MA2|LINE|L1 37131 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 638.5 chr10 110637188 110637646 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -6919 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 380-23 chr8 110415577 110415764 + 2.5 NA Intergenic Intergenic -439899 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 680.75 chr14 64340875 64341446 + 2.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -2547 NM_001291712 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 384-6 chr18 5427559 5427886 + 2.25 NA intron (NM_001281535, intron 11 of 21) intron (NM_001281535, intron 11 of 21) 112834 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 376.5-2 chr11 99586434 99586766 + 2.25 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) MIR|SINE|MIR 30455 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 863.25 chr10 33095123 33095798 + 2.25 NA intron (NR_160030, intron 1 of 2) intron (NR_160030, intron 1 of 2) 21347 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 290-8 chr10 8392288 8392547 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -124112 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 149.5-176 chr6 97580435 97580539 + 2.25 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) MER102a|DNA|hAT-Charlie 274901 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 357.75-18 chr8 140438496 140438761 + 2.25 NA intron (NM_001160372, intron 3 of 22) intron (NM_001160372, intron 3 of 22) 19116 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 373.75-4 chr13 109300864 109301233 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -99648 NR_126361 104326054 Hs.569298 NR_126361 ENSG00000229792 LINC00399 TCONS_00021596 long intergenic non-protein coding RNA 399 ncRNA 394.75-9 chr6 141643254 141643519 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 445413 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 306-20 chr22 25892143 25892385 + 2.25 NA intron (NM_001318245, intron 27 of 43) intron (NM_001318245, intron 27 of 43) 150076 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 284.5-39 chr3 43446303 43446526 + 2.25 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) intron (NM_001346464, intron 12 of 13) -94452 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 435.25-2 chr15 49579712 49580002 + 2.25 NA intron (NM_001330293, intron 5 of 10) L1MA4A|LINE|L1 40961 NM_152647 196951 Hs.712959 NM_152647 ENSG00000166262 FAM227B C15orf33 family with sequence similarity 227 member B protein-coding 647 chr3 173771708 173772242 + 2.25 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 148821 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 457.25-5 chr9 25791640 25791876 + 2.25 NA intron (NR_121604, intron 3 of 5) intron (NR_121604, intron 3 of 5) 11702 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 196.5-14 chr10 23958435 23958570 + 2.25 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) -250289 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 177-26 chr13 62895364 62895454 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -88050 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 260.75-45 chr3 64231948 64232297 + 2.25 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) intron (NM_001370528, intron 1 of 7) -6656 NM_198859 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 424.25-4 chr7 70674001 70674548 + 2.25 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -457870 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 209.25-57 chr2 61533795 61533944 + 2.25 NA exon (NM_003400, exon 2 of 25) exon (NM_003400, exon 2 of 25) 4487 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 496-3 chr6 140872095 140872387 + 2.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 188427 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 420.25-4 chr2 122125387 122125733 + 2.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 369909 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 217.5-113 chr6 130560932 130561062 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 123880 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 466.75-3 chr5 164556171 164556587 + 2.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 86100 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 656.5-2 chr21 30155037 30155469 + 2.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 11552 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 509.75-3 chr4 37125411 37125820 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 116376 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 328-25 chr3 170853385 170853704 + 2.25 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 16651 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 393-19 chrX 11987569 11987862 + 2.25 NA intron (NM_001368398, intron 3 of 18) L1MA2|LINE|L1 -77826 NM_001368402 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 147-121 chr6 70118258 70118363 + 2.25 NA intron (NM_001858, intron 16 of 50) intron (NM_001858, intron 16 of 50) 164887 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 484.5-5 chr7 26670111 26670522 + 2.25 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) intron (NM_003930, intron 11 of 12) 32445 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 347.75-8 chr3 41318429 41318727 + 2.25 NA intron (NR_136342, intron 33 of 34) intron (NR_136342, intron 33 of 34) 119073 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 460.75-6 chr6 56257087 56257448 + 2.25 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) -9687 NM_030820 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 400.5-7 chr2 240904784 240905067 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -1411 NM_001351305 728763 Hs.647892 NM_001351305 ENSG00000226321 CROCC2 - ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2 protein-coding 420.75-10 chr5 109855405 109855763 + 2.25 NA intron (NM_002372, intron 20 of 21) intron (NM_002372, intron 20 of 21) -27598 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 520-2 chr18 6633397 6633819 + 2.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -96108 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 405.25-10 chr4 21166111 21166376 + 2.25 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) L1ME1|LINE|L1 137663 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 372-17 chr7 135743364 135743701 + 2.25 NA intron (NM_001369697, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 5281 NM_205855 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 429.5-8 chr5 76569750 76569987 + 2.25 NA intron (NM_006633, intron 3 of 35) intron (NM_006633, intron 3 of 35) 22459 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 297.75-48 chr8 37566186 37566345 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -44879 NR_121621 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 378-16 chr5 40455078 40455317 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -224718 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 284.5-71 chr9 120654284 120654687 + 2.25 NA intron (NM_001080497, intron 2 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 59985 NM_001080497 1955 Hs.744903 NM_001080497 ENSG00000106780 MEGF9 EGFL5 multiple EGF like domains 9 protein-coding 502.5-2 chr2 106233667 106233894 + 2.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -39441 NM_025076 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 485.5-4 chr4 30842351 30842676 + 2.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 122144 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 574.75-2 chr5 54470822 54471148 + 2.25 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 15286 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 328.5-17 chr2 24014702 24014875 + 2.25 NA intron (NM_001346880, intron 2 of 13) L1ME3G|LINE|L1 4703 NM_001346880 388931 Hs.407482 NM_001080473 ENSG00000205639 MFSD2B - major facilitator superfamily domain containing 2B protein-coding 498 chr11 33332256 33332587 + 2.25 NA intron (NM_001278162, intron 3 of 15) intron (NM_001278162, intron 3 of 15) -43687 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 234-4 chr1 216372961 216373149 + 2.25 NA intron (NM_206933, intron 3 of 71) intron (NM_206933, intron 3 of 71) 50341 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 592.5 chr3 192955846 192956460 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -38297 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 305.25-24 chr2 81676264 81676496 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -209434 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 513 chr14 30683817 30684248 + 2.25 NA intron (NM_016106, intron 14 of 24) intron (NM_016106, intron 14 of 24) 61713 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 453-5 chr8 119391339 119391618 + 2.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -24968 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 374-18 chr7 77507222 77507429 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -29970 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 416-10 chr7 91928681 91928946 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -12049 NM_147185 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 892 chr10 38528154 38529156 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 100509 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 328.5-28 chr5 8599726 8599971 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 138923 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 471-7 chr3 84787435 84787834 + 2.25 NA intron (NR_033860, intron 10 of 20) intron (NR_033860, intron 10 of 20) 81941 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 276.75-25 chr2 102741124 102741328 + 2.25 NA intron (NM_001321346, intron 1 of 3) L1MCa|LINE|L1 4291 NM_001321343 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 179.5-77 chr18 10981167 10981327 + 2.25 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 167515 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 596.25 chr10 61956949 61957231 + 2.25 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) intron (NM_032199, intron 3 of 9) 55391 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 472.75 chr1 176778536 176778920 + 2.25 NA intron (NM_020318, intron 17 of 22) intron (NM_020318, intron 17 of 22) 250717 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 569-3 chr3 44464450 44464819 + 2.25 NA intron (NM_181489, intron 1 of 7) HUERS-P1-int|LTR|ERV1 13036 NM_181489 353274 Hs.250481 NM_181489 ENSG00000185219 ZNF445 ZKSCAN15|ZNF168|ZSCAN47 zinc finger protein 445 protein-coding 252-31 chr17 49107856 49108034 + 2.25 NA Intergenic LTR44|LTR|ERV1 -24515 NM_001159388 124872 Hs.374679 NM_153446 ENSG00000167080 B4GALNT2 B4GALT|GALGT2 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 2 protein-coding 319.75-18 chr6 108614125 108614335 + 2.25 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 53313 NM_001455 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 557.25 chr2 122912301 122912743 + 2.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 160959 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 261.25-23 chr21 27696087 27696386 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -26143 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 455.75-5 chr5 98912070 98912301 + 2.25 NA intron (NM_001364113, intron 2 of 36) intron (NM_001364113, intron 2 of 36) 14349 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 220.25-54 chr3 181417067 181417289 + 2.25 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 25308 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 434.25-11 chr4 117080239 117080554 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 5180 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 439.5-18 chr8 123886941 123887297 + 2.25 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) LOR1b|LTR|ERV1 35132 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 375-2 chr11 54972489 54972760 + 2.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 265792 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 181.25-88 chr3 143408916 143409019 + 2.25 NA intron (NM_173653, intron 12 of 15) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 66721 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 425.5-7 chr6 112714455 112714893 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 367344 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 223.5-41 chr14 71256595 71256751 + 2.25 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -63803 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 262-9 chr11 5988555 5988813 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -1699 NM_001005173 338751 Hs.553703 NM_001005173 ENSG00000183313 OR52L1 OR11-50 olfactory receptor family 52 subfamily L member 1 protein-coding 420.25 chr1 246314061 246314352 + 2.25 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 103206 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 381.75-4 chr8 20926507 20926700 + 2.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -27030 NR_130773 102467222 Hs.444226 NR_130773 ENSG00000253147 LOC102467222 - uncharacterized LOC102467222 ncRNA 278.75-21 chr2 68545483 68545665 + 2.25 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) intron (NM_173545, intron 8 of 9) 77989 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 373.25-13 chr4 147746722 147747009 + 2.25 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) intron (NM_024605, intron 1 of 22) 14777 NM_024605 79658 Hs.368631 NM_024605 ENSG00000071205 ARHGAP10 GRAF2|PS-GAP|PSGAP Rho GTPase activating protein 10 protein-coding 527.25-4 chr7 8070037 8070379 + 2.25 NA intron (NM_138426, intron 5 of 7) MIR3|SINE|MIR 101412 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 419.75-2 chr1 118867603 118867975 + 2.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 120554 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 264.75-23 chr2 109175128 109175292 + 2.25 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -33622 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 395.25 chr10 66648818 66649161 + 2.25 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) L2|LINE|L2 -277047 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 234.75-35 chr19 44177653 44177793 + 2.25 NA TTS (NM_001319088) TTS (NM_001319088) 12559 NM_001032372 7769 Hs.145956 NM_015919 ENSG00000167380 ZNF226 - zinc finger protein 226 protein-coding 347.25-17 chr5 55447853 55448202 + 2.25 NA intron (NR_103485, intron 4 of 6) intron (NR_103485, intron 4 of 6) 60899 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 340.75-23 chr7 87159861 87160206 + 2.25 NA intron (NM_021145, intron 3 of 19) intron (NM_021145, intron 3 of 19) 7479 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 467.25 chr15 49097786 49098178 + 2.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -51536 NM_014701 9728 Hs.9997 NM_014701 ENSG00000138593 SECISBP2L SBP2L|SLAN SECIS binding protein 2 like protein-coding 261.5-32 chr2 239512854 239513051 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 111204 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 212-40 chr2 103643246 103643421 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -658904 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 480-2 chr18 48964211 48964752 + 2.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -13770 NM_005904 4092 Hs.465087 NM_005904 ENSG00000101665 SMAD7 CRCS3|MADH7|MADH8 SMAD family member 7 protein-coding 354-19 chr4 74304195 74304499 + 2.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4123 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 351-5 chr14 78793197 78793445 + 2.25 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 389602 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 320.25-11 chr14 55218862 55219042 + 2.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -27367 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 336.75-15 chr5 44742039 44742290 + 2.25 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 66629 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 402-10 chr5 44899685 44900032 + 2.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 90911 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 370 chr1 17013342 17013645 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -1565 NM_001141974 23400 Hs.128866 NM_022089 ENSG00000159363 ATP13A2 CLN12|HSA9947|KRPPD|PARK9|SPG78 ATPase cation transporting 13A2 protein-coding 729.75-2 chr21 28500154 28500552 + 2.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -38965 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 297-14 chr13 109568779 109568929 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -159420 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 368.25-19 chr8 117109829 117110054 + 2.25 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -25054 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 337-24 chr4 107115145 107115431 + 2.25 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -78975 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 308.75-16 chr15 76321633 76321908 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -10301 NM_001127716 2108 Hs.39925 NM_000126 ENSG00000140374 ETFA EMA|GA2|MADD electron transfer flavoprotein subunit alpha protein-coding 458.25-2 chr14 72223187 72223439 + 2.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 289786 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 278-31 chr5 159532375 159532540 + 2.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -66181 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 332.25-30 chr8 120801033 120801261 + 2.25 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) 10899 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 255.5-68 chr5 164291195 164291432 + 2.25 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 176089 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 217.25-5 chr1 159658243 159658347 + 2.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 56294 NM_001329058 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 417.25-6 chr6 54385464 54385684 + 2.25 NA intron (NM_014464, intron 10 of 10) L1ME3|LINE|L1 77133 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 276.25-37 chr6 133852677 133852868 + 2.25 NA non-coding (NR_027030, exon 3 of 3) non-coding (NR_027030, exon 3 of 3) 31625 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 333.5-21 chr8 111744231 111744447 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 367700 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 330.5-19 chr2 179120630 179120882 + 2.25 NA intron (NM_178123, intron 13 of 17) intron (NM_178123, intron 13 of 17) -70619 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 403.5-7 chr5 73772033 73772344 + 2.25 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -41358 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 275.75-22 chr2 25324000 25324170 + 2.25 NA intron (NR_135490, intron 1 of 23) intron (NR_135490, intron 1 of 23) 4636 NR_031570 100302246 NR_031570 ENSG00000221445 MIR1301 MIRN1301|hsa-mir-1301|mir-1301 microRNA 1301 ncRNA 555-2 chr20 21894623 21895156 + 2.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -159201 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 194.75-86 chr7 24987139 24987272 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7027 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 311-10 chr12 132030151 132030352 + 2.25 NA promoter-TSS (NR_002979) promoter-TSS (NR_002979) -973 NR_002979 677829 Hs.742405 NR_002979 ENSG00000208892 SNORA49 ACA49 small nucleolar RNA, H/ACA box 49 snoRNA 331.25-3 chr13 44387433 44387711 + 2.25 NA intron (NM_001010897, intron 2 of 2) intron (NM_001010897, intron 2 of 2) 13730 NR_144535 387923 Hs.377972 NM_001010897 ENSG00000151778 SERP2 C13orf21|bA269C23.1 stress associated endoplasmic reticulum protein family member 2 protein-coding 447-9 chr4 144303101 144303368 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -162516 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 229 chr1 17721806 17722143 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -33359 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 490.75-4 chr3 190327548 190327990 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -5323 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 470.5-9 chr5 12248240 12248830 + 2.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -326322 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 368.25-5 chr14 60238185 60238433 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -7441 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 253.75-10 chr14 40138670 40138837 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -706253 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 387.5-11 chr5 100570186 100570445 + 2.25 NA intron (NM_198507, intron 2 of 2) intron (NM_198507, intron 2 of 2) 34941 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 480.5-3 chr5 63741277 63741827 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 220740 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 338.25-4 chr10 52629374 52629543 + 2.25 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 125946 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 500.25-2 chr20 40063207 40063485 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 58885 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 512.25-5 chr2 210386030 210386383 + 2.25 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) intron (NR_110606, intron 1 of 4) 61494 NR_110604 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 245-3 chr1 112404215 112404410 + 2.25 NA intron (NM_018704, intron 1 of 5) intron (NM_018704, intron 1 of 5) 8098 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 337.5-21 chr3 186157451 186157667 + 2.25 NA intron (NM_001346, intron 24 of 24) L1MD|LINE|L1 -48470 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 587 chr8 136366650 136367353 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -163797 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 804 chr8 142551197 142551784 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 62989 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 506.25-3 chr14 74072258 74072622 + 2.25 NA intron (NM_001278593, intron 3 of 11) intron (NM_001278593, intron 3 of 11) 12013 NM_005589 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 283.5-3 chr1 104829785 104830041 + 2.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 756890 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 338.25-7 chr10 116231455 116231681 + 2.25 NA intron (NM_005264, intron 4 of 10) intron (NM_005264, intron 4 of 10) 24227 NM_001348099 2674 Hs.388347 NM_005264 ENSG00000151892 GFRA1 GDNFR|GDNFRA|GFR-ALPHA-1|RET1L|RETL1|TRNR1 GDNF family receptor alpha 1 protein-coding 443.5-6 chr20 20774701 20775097 + 2.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -62255 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 650.75 chr11 121845574 121846031 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 254042 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 282.75-10 chr12 26729902 26730065 + 2.25 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) intron (NM_002223, intron 2 of 56) 103211 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 365.5-6 chr18 49900065 49900342 + 2.25 NA intron (NM_001080467, intron 21 of 39) intron (NM_001080467, intron 21 of 39) 86180 NR_003003 677769 NR_003003 ENSG00000267322 SCARNA17 U91 small Cajal body-specific RNA 17 ncRNA 301.25-17 chr2 183949981 183950162 + 2.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -428904 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 237.75-35 chr2 14882553 14882703 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 249911 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 257.75-48 chr7 131839041 131839332 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -71034 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 479-3 chr6 120157968 120158295 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 142952 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 387.5-8 chr2 201757795 201758161 + 2.25 NA intron (NM_020919, intron 4 of 33) intron (NM_020919, intron 4 of 33) 22955 NM_001135745 57679 Hs.471096 NM_020919 ENSG00000003393 ALS2 ALS2CR6|ALSJ|IAHSP|PLSJ alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2 protein-coding 304.5-25 chr4 86094934 86095397 + 2.25 NA intron (NM_001363657, intron 8 of 13) intron (NM_001363657, intron 8 of 13) -24641 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 368-5 chr2 25108069 25108455 + 2.25 NA intron (NM_014971, intron 4 of 22) intron (NM_014971, intron 4 of 22) 60318 NM_000939 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 460.75-2 chr17 57673631 57673878 + 2.25 NA intron (NM_138962, intron 11 of 13) intron (NM_138962, intron 11 of 13) -65342 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 302.5-39 chr6 116858506 116858680 + 2.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -18649 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 355 chr1 98217827 98218233 + 2.25 NA intron (NR_046088, intron 1 of 2) intron (NR_046088, intron 1 of 2) 7319 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 439.5-2 chr10 6546385 6546648 + 2.25 NA intron (NM_001323265, intron 1 of 17) L1PA3|LINE|L1 33760 NM_001282644 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 656.5 chr1 114728659 114729037 + 2.25 NA intron (NM_001007553, intron 12 of 19) MIRc|SINE|MIR -12077 NM_002524 4893 Hs.486502 NM_002524 ENSG00000213281 NRAS ALPS4|CMNS|N-ras|NCMS|NRAS1|NS6 NRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 937.25 chr20 50926840 50927519 + 2.25 NA intron (NM_001347511, intron 1 of 4) intron (NM_001347511, intron 1 of 4) -3805 NR_110007 101927631 Hs.301898 NR_110007 ENSG00000259456 ADNP-AS1 - ADNP antisense RNA 1 ncRNA 436.5-8 chr8 90595121 90595651 + 2.25 NA intron (NR_104062, intron 1 of 2) L1MB4|LINE|L1 10677 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 350.75-8 chr4 56066607 56066904 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -103440 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 425.25 chr10 18871248 18871460 + 2.25 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -177447 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 389.5-12 chr7 29316976 29317169 + 2.25 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) intron (NM_001293070, intron 2 of 13) -108102 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 309.5-5 chr1 218329457 218329639 + 2.25 NA intron (NM_016052, intron 4 of 4) intron (NM_016052, intron 4 of 4) -15736 NM_001135599 7042 Hs.133379 NM_003238 ENSG00000092969 TGFB2 G-TSF|LDS4|TGF-beta2 transforming growth factor beta 2 protein-coding 429.5-4 chr19 41693255 41693535 + 2.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -5125 NM_001291485 1087 Hs.74466 NM_006890 ENSG00000007306 CEACAM7 CGM2 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 7 protein-coding 449.75-4 chr4 63397496 63397720 + 2.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 1011842 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 235.25-16 chr12 72755199 72755329 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -403926 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 294.5-41 chr5 39121368 39121647 + 2.25 NA intron (NM_001243093, intron 14 of 18) intron (NM_001243093, intron 14 of 18) -47108 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 244.5-43 chr19 29869331 29869476 + 2.25 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -54254 NM_001252641 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 285.5-35 chr2 132860781 132861011 + 2.25 NA intron (NM_207481, intron 10 of 17) intron (NM_207481, intron 10 of 17) -54661 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 239.25-88 chr8 49746499 49746677 + 2.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -163208 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 143.25-34 chr12 20140684 20140762 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -12822 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 424.5-3 chr11 60380970 60381287 + 2.25 NA intron (NM_021201, intron 1 of 6) intron (NM_021201, intron 1 of 6) 2596 NM_206939 58475 Hs.530735 NM_021201 ENSG00000166927 MS4A7 4SPAN2|CD20L4|CFFM4|MS4A8 membrane spanning 4-domains A7 protein-coding 486.75 chr1 19011466 19011858 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -54986 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 352.75 chr1 156049696 156049953 + 2.25 NA intron (NM_001304342, intron 4 of 10) L2c|LINE|L2 3974 NM_020131 56893 Hs.283739 NM_020131 ENSG00000160803 UBQLN4 A1U|A1Up|C1orf6|CIP75|UBIN ubiquilin 4 protein-coding 234.75-45 chr3 12446211 12446388 + 2.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -38133 NM_001145394 80746 Hs.335550 NM_025265 ENSG00000154743 TSEN2 PCH2B|SEN2|SEN2L tRNA splicing endonuclease subunit 2 protein-coding 365.5-15 chr6 96218682 96219054 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 202894 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 506.75 chr14 81684881 81685198 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 58099 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 242.75 chr1 12337728 12337853 + 2.25 NA intron (NM_018156, intron 39 of 68) intron (NM_018156, intron 39 of 68) 107760 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 427-5 chr18 45992211 45992524 + 2.25 NA intron (NM_024430, intron 10 of 14) AluSx3|SINE|Alu -25038 NM_020964 57724 Hs.514843 NM_020964 ENSG00000152223 EPG5 HEEW1|KIAA1632|VICIS ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog protein-coding 322.5-7 chr11 80339038 80339264 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 423652 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 368.5-16 chr7 16979469 16979839 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -97671 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 366.5-14 chr5 16332900 16333119 + 2.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 108093 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 433.5-3 chr18 1410679 1411088 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -51254 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 210.75-101 chr9 28953990 28954136 + 2.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -65108 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 350.5-15 chr2 64496329 64496690 + 2.25 NA intron (NR_147011, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 10156 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 229.25-82 chr8 78239921 78240160 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -276300 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 424.75-6 chr2 64390614 64390954 + 2.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -49936 NR_106995 102465833 NR_106995 ENSG00000264297 MIR4433B hsa-mir-4433b microRNA 4433b ncRNA 382-22 chr6 130620538 130621151 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 183727 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 329-19 chr2 218845473 218845767 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -13817 NM_017431 53632 Hs.591634 NM_017431 ENSG00000115592 PRKAG3 AMPKG3 protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 3 protein-coding 309.75-37 chr8 121820656 121820851 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -179313 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 404-8 chrX 11329731 11330070 + 2.25 NA intron (NR_109776, intron 1 of 14) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -11214 NR_049865 100847063 NR_049865 ENSG00000263652 MIR548AX - microRNA 548ax ncRNA 460.5-3 chr22 35211468 35211809 + 2.25 NA intron (NR_126356, intron 1 of 5) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 19418 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 471.75 chr1 106076161 106076570 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -48112 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 500.75 chr14 41843567 41844079 + 2.25 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) intron (NM_001330106, intron 2 of 4) 236967 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 258-32 chr3 376733 377036 + 2.25 NA intron (NM_001253388, intron 13 of 24) intron (NM_001253388, intron 13 of 24) 8911 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 403.25-2 chr12 114435729 114435941 + 2.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -27393 NM_000192 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 252.75-27 chr2 33652839 33652967 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -53541 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 404.75-7 chr8 142948696 142948985 + 2.25 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -30997 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 316.75-4 chr12 133096649 133096826 + 2.25 NA intron (NM_001300777, intron 4 of 4) L1MC1|LINE|L1 16534 NM_001300776 7699 Hs.181552 NM_003440 ENSG00000196387 ZNF140 pHZ-39 zinc finger protein 140 protein-coding 477.25-4 chr8 86304868 86305173 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -37527 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 325-2 chr1 172102356 172102527 + 2.25 NA intron (NR_146559, intron 14 of 20) intron (NR_146559, intron 14 of 20) -36367 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 326.5-29 chr8 106744546 106744735 + 2.25 NA intron (NM_181354, intron 12 of 13) intron (NM_181354, intron 12 of 13) 18533 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 261.75-46 chr7 34278529 34278700 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 373075 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 310.5-2 chr1 85365239 85365422 + 2.25 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 39176 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 375.75-21 chrX 50200517 50200756 + 2.25 NA promoter-TSS (NM_139289) promoter-TSS (NM_139289) -264 NM_139289 8852 Hs.97633 NM_003886 ENSG00000147081 AKAP4 AKAP 82|AKAP-4|AKAP82|CT99|FSC1|HI|PRKA4|hAKAP82|p82 A-kinase anchoring protein 4 protein-coding 299-13 chr12 9717700 9717920 + 2.25 NA intron (NM_001267701, intron 2 of 2) L1MCc|LINE|L1 15489 NM_001267701 160365 Hs.560087 NM_172004 ENSG00000184293 CLECL1 DCAL-1|DCAL1 C-type lectin like 1 protein-coding 422.25-8 chr6 153419398 153419754 + 2.25 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -288294 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 547.5-2 chr11 90252654 90252919 + 2.25 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) L1M3e|LINE|L1 1554 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 365.5-9 chr2 234643975 234644421 + 2.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -38470 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 339.25 chr1 184436622 184436925 + 2.25 NA intron (NM_030806, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 49744 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 447.25-5 chr8 85977736 85978093 + 2.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 91754 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 289-11 chr12 27738905 27739073 + 2.25 NA intron (NM_021821, intron 7 of 7) AluSz6|SINE|Alu 28157 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 294.75-34 chr6 66112064 66112345 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 324325 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 467.5-2 chr2 123602714 123603178 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 422228 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 228-86 chr8 128545337 128545664 + 2.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L1MEd|LINE|L1 19179 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 404.25-8 chr4 181149166 181149500 + 2.25 NA intron (NR_033918, intron 2 of 2) intron (NR_033918, intron 2 of 2) 9816 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 321.75-4 chr10 125144919 125145132 + 2.25 NA intron (NM_001290214, intron 1 of 10) intron (NM_001290214, intron 1 of 10) 13752 NM_001321013 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 456-2 chr2 111950707 111951002 + 2.25 NA intron (NM_006343, intron 4 of 18) L1ME2|LINE|L1 52247 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 446.5 chr1 175412773 175412981 + 2.25 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) -219890 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 326.5-34 chr9 130698595 130698823 + 2.25 NA intron (NR_104230, intron 4 of 7) intron (NR_104230, intron 4 of 7) 4929 NM_014285 23404 Hs.654643 NM_014285 ENSG00000130713 EXOSC2 RRP4|Rrp4p|SHRF|hRrp4p|p7 exosome component 2 protein-coding 536.25-2 chr3 97435606 97435991 + 2.25 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) L3|LINE|CR1 -3809 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 402.75 chr13 94592230 94592468 + 2.25 NA intron (NM_001304430, intron 2 of 11) intron (NM_001304430, intron 2 of 11) 3803 NM_014305 23483 Hs.12393 NM_014305 ENSG00000088451 TGDS CATMANS|SDR2E1|TDPGD TDP-glucose 4,6-dehydratase protein-coding 363.25-9 chr5 118819305 118819571 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -155148 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 241.5-42 chr2 85998609 85998768 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 107198 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 394.25 chr10 57219623 57219865 + 2.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 84815 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 219-18 chr11 115454926 115455043 + 2.25 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 49431 NM_001098517 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 354.5-15 chr4 101393309 101393470 + 2.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 45612 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 224.25-94 chr7 35621173 35621386 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 73856 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 262.75 chr1 69813510 69813673 + 2.25 NA intron (NM_001370785, intron 4 of 26) intron (NM_001370785, intron 4 of 26) -105731 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 289-4 chr10 30260610 30260867 + 2.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 48886 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 464.75-3 chr5 27499580 27499979 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 27487 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 284.5-63 chr8 26447496 26447753 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 57211 NM_001330491 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 264.5-60 chr8 57750786 57750933 + 2.25 NA TTS (NR_134276) TTS (NR_134276) 4710 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 197.25-47 chr2 19451535 19451645 + 2.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -92967 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 318.5-16 chr2 39229580 39229789 + 2.25 NA promoter-TSS (NM_001346911) promoter-TSS (NM_001346911) -96 NM_001346911 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 384-8 chr2 13524091 13524396 + 2.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -517230 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 571.5 chr12 8749143 8749429 + 2.25 NA intron (NR_147950, intron 2 of 8) AluSc|SINE|Alu 51295 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 461.5-9 chr8 50427250 50427856 + 2.25 NA intron (NR_135795, intron 4 of 18) AluJr|SINE|Alu 263422 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 329.75-10 chr20 37744701 37744959 + 2.25 NA intron (NM_001281495, intron 4 of 16) intron (NM_001281495, intron 4 of 16) 50800 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 339.75-13 chr14 81956939 81957210 + 2.25 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -213936 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 213.5-69 chr20 12164749 12165032 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 246997 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 453.75-9 chr8 136496673 136496970 + 2.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -33977 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 579-2 chr12 17986219 17986594 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 103787 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 532.5-3 chr8 116205685 116206000 + 2.25 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 119217 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 372-20 chrX 71470070 71470288 + 2.25 NA intron (NR_104387, intron 38 of 39) L1ME4a|LINE|L1 22270 NR_002226 27160 Hs.721806 NR_002226 ENSG00000243468 INGX ING1-like|ING2 inhibitor of growth family, X-linked (pseudogene) pseudo 510.5-4 chr2 212297013 212297388 + 2.25 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 129160 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 375-12 chr6 70823551 70823793 + 2.25 NA intron (NM_001044305, intron 6 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 133388 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 265.5-36 chr2 145196777 145196970 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 528906 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 288-33 chr3 55420221 55420392 + 2.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 61092 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 261.75-29 chr21 35257765 35258021 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -208595 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 175.25-20 chr10 85495556 85495663 + 2.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 46017 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 453.75-6 chr2 145691093 145691385 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -895818 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 437.5-5 chr2 143112486 143112810 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16771 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 288.75-44 chr8 106916525 106916720 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -146378 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 515.5-2 chr9 28923282 28923627 + 2.25 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -34499 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 341.5-26 chr4 107861548 107861741 + 2.25 NA intron (NM_001136258, intron 2 of 6) intron (NM_001136258, intron 2 of 6) -31620 NM_001136257 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 383.75-3 chr18 2064519 2064764 + 2.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 506864 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 507.25 chr1 246538588 246538820 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -14417 NR_040002 255654 Hs.407570 NR_040002 ENSG00000242042 LINC01743 - long intergenic non-protein coding RNA 1743 ncRNA 297.75-39 chr6 47957200 47957364 + 2.25 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 111407 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 455.75-6 chrX 83213546 83213872 + 2.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -294581 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 672 chr8 111393069 111393707 + 2.25 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) intron (NR_146282, intron 2 of 3) 16749 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 500-5 chr9 35379604 35379966 + 2.25 NA intron (NM_006377, intron 16 of 38) intron (NM_006377, intron 16 of 38) -26970 NR_110320 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 369.5-6 chr14 73009612 73010145 + 2.25 NA intron (NM_021260, intron 2 of 11) AluJr|SINE|Alu 17228 NM_001281734 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 458-6 chr6 79989288 79989549 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15187 NM_001166691 7272 Hs.169840 NM_003318 ENSG00000112742 TTK CT96|ESK|MPH1|MPS1|MPS1L1|PYT TTK protein kinase protein-coding 436.25-2 chr16 47695965 47696285 + 2.25 NA intron (NM_001031835, intron 29 of 31) intron (NM_001031835, intron 29 of 31) -162456 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 334.5-22 chr4 60302582 60302843 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -619907 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 524.25-2 chr10 92887991 92888301 + 2.25 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) intron (NM_001319195, intron 1 of 21) 39626 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 374.75-13 chr6 82655164 82655454 + 2.25 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 291065 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 420.75-5 chr14 71595715 71596056 + 2.25 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) intron (NM_001354286, intron 6 of 24) 9587 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 297.5-41 chr3 190091381 190091701 + 2.25 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 29356 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 295.5-53 chr6 46994880 46995089 + 2.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -40045 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 442.5-3 chr4 33390494 33390795 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 649249 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 337.5-15 chr18 36943361 36943570 + 2.25 NA intron (NM_001353918, intron 5 of 9) intron (NM_001353918, intron 5 of 9) -19651 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 335.25-31 chr7 91081104 91081264 + 2.25 NA intron (NM_012395, intron 11 of 13) intron (NM_012395, intron 11 of 13) -183249 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 405.5-2 chr11 83568210 83568555 + 2.25 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) L2c|LINE|L2 114043 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 471-8 chr4 40106450 40106745 + 2.25 NA intron (NM_001318359, intron 5 of 18) AluSz6|SINE|Alu -49398 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 385.5-11 chr18 62881337 62881590 + 2.25 NA intron (NM_194449, intron 4 of 16) intron (NM_194449, intron 4 of 16) 165922 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 454.5-6 chrX 55176091 55176384 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 6205 NM_001190708 100463488 NM_001190708 ENSG00000256045 MTRNR2L10 HN10 MT-RNR2 like 10 protein-coding 438-5 chr8 51311643 51312167 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 497540 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 258.5-56 chr5 4248046 4248247 + 2.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -525335 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 495 chr1 218171951 218172230 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -113203 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 330.75-24 chr7 38378544 38378787 + 2.25 NA TTS (NR_040085) TTS (NR_040085) 37088 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 273 chr1 71176003 71176220 + 2.25 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 94787 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 495.75 chr2 59598400 59598649 + 2.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 380816 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 427.25-7 chr8 16017555 16017892 + 2.25 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 168549 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 228.75-42 chr2 77339096 77339265 + 2.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1PA17|LINE|L1 183196 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 432.5-8 chr5 44173103 44173503 + 2.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -215429 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 257.25-50 chr6 140043466 140043738 + 2.25 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -52341 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 355.25-16 chr9 23969054 23969294 + 2.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -118573 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 226-62 chr7 7923374 7923562 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 45284 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 420-14 chr8 51651643 51651966 + 2.25 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) LTR90B|LTR|LTR 157641 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 350-2 chr12 15587347 15587641 + 2.25 NA intron (NM_030671, intron 12 of 13) intron (NM_030671, intron 12 of 13) 40883 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 463-4 chr3 6567797 6568164 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 237469 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 458.5-7 chr6 38790171 38790436 + 2.25 NA exon (NM_001206927, exon 20 of 93) exon (NM_001206927, exon 20 of 93) 74992 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 305.75-20 chr3 186423533 186423787 + 2.25 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -16685 NR_151709 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 458.5-3 chr17 57596214 57596583 + 2.25 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) intron (NM_001322250, intron 7 of 13) 12014 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 377.5-19 chr7 7274084 7274318 + 2.25 NA intron (NR_108073, intron 3 of 3) intron (NR_108073, intron 3 of 3) 19047 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 340.5-32 chr7 34797885 34798146 + 2.25 NA intron (NM_207172, intron 3 of 8) L1PA3|LINE|L1 36316 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 524.25-5 chr4 33321227 33321693 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 718433 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 339-3 chr10 100840465 100840757 + 2.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -72352 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 429.5-6 chr3 189549961 189550199 + 2.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -46666 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 251.75-68 chr5 152381120 152381288 + 2.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 24075 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 317.25-23 chr4 51910648 51910866 + 2.25 NA intron (NM_015115, intron 8 of 9) intron (NM_015115, intron 8 of 9) 67178 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 413-9 chr5 155683264 155683538 + 2.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -643356 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 331.75-2 chr1 46039345 46039573 + 2.25 NA TTS (NM_001328653) TTS (NM_001328653) 91214 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 551.5-4 chr8 89090804 89091165 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 666727 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 426.75-11 chr6 150288544 150288783 + 2.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -80349 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 288.75-34 chr2 215572998 215573220 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 119402 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 287.25-23 chr17 66496096 66496347 + 2.25 NA exon (NM_002737, exon 3 of 17) exon (NM_002737, exon 3 of 17) -79367 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 332-8 chr16 68961559 68961814 + 2.25 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) intron (NM_024562, intron 14 of 17) 118155 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 281-45 chr9 8228053 8228271 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -428384 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 657-2 chr4 30725496 30726079 + 2.25 NA TTS (NM_032456) TTS (NM_032456) 5418 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 390-3 chr2 31987961 31988243 + 2.25 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 22562 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 337.25-14 chr5 108695682 108695982 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 32429 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 493 chr12 118243156 118243480 + 2.25 NA intron (NM_001346490, intron 5 of 21) intron (NM_001346490, intron 5 of 21) -52783 NM_001346494 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 327.75-16 chr21 26806907 26807091 + 2.25 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? 38410 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 512.25-3 chr18 2712876 2713247 + 2.25 NA intron (NM_015295, intron 17 of 47) MER58B|DNA|hAT-Charlie 57174 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 429-7 chr8 122694098 122694325 + 2.25 NA promoter-TSS (NR_126348) promoter-TSS (NR_126348) -105 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 250-11 chr14 71854430 71854606 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -77653 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 312.75-5 chr12 57930814 57931046 + 2.25 NA TTS (NR_038269) TTS (NR_038269) 5234 NR_038269 100506844 Hs.90286 NR_038269 GIHCG - GIHCG inhibitor of miR-200b/200a/429 expression ncRNA 474.25 chr12 79239147 79239626 + 2.25 NA intron (NM_001291901, intron 3 of 9) L1MC3|LINE|L1 -179871 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 400.25 chr10 93775355 93775667 + 2.25 NA intron (NR_131777, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 17575 NM_005097 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 594.75-2 chr5 105790951 105791534 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 691768 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 423-4 chr3 119517395 119517668 + 2.25 NA intron (NM_016589, intron 6 of 6) intron (NM_016589, intron 6 of 6) 18984 NM_016589 51300 Hs.477287 NM_016589 ENSG00000113845 TIMMDC1 C3orf1|MC1DN31 translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 protein-coding 501-2 chr6 150211841 150212212 + 2.25 NA intron (NM_030949, intron 1 of 3) intron (NM_030949, intron 1 of 3) 68982 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 330.25-18 chr5 128847500 128847738 + 2.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -117508 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 634 chr9 79557822 79558230 + 2.25 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -13747 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 374.5-9 chr2 81548086 81548401 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -81297 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 287.5-6 chr10 14755664 14755881 + 2.25 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) 19125 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 357.75 chr1 32642478 32642665 + 2.25 NA intron (NM_001366257, intron 1 of 6) MER4E1|LTR|ERV1 7979 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 360.5-19 chr8 130390060 130390478 + 2.25 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) MER3|DNA|hAT-Charlie 53391 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 406.25 chr10 99671064 99671405 + 2.25 NA intron (NM_001349962, intron 4 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 11605 NM_001349963 57089 Hs.28326 NM_020354 ENSG00000198018 ENTPD7 LALP1 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 protein-coding 357.5-9 chr16 76663097 76663331 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 28216 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 459.5-10 chr8 143970051 143970385 + 2.25 NA intron (NM_000445, intron 2 of 32) intron (NM_000445, intron 2 of 32) 3311 NM_201378 5339 Hs.434248 NM_000445 ENSG00000178209 PLEC EBS1|EBSMD|EBSND|EBSO|EBSOG|EBSPA|HD1|LGMD2Q|LGMDR17|PCN|PLEC1|PLEC1b|PLTN plectin protein-coding 580.5-2 chr15 71317034 71317559 + 2.25 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -128237 NR_120348 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 314.5-4 chr12 3942868 3943017 + 2.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -69494 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 382.75-5 chr3 67616643 67616891 + 2.25 NA intron (NM_001177599, intron 1 of 10) intron (NM_001177599, intron 1 of 10) 37847 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 567.5-2 chr5 6290944 6291321 + 2.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 46160 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 432.5-11 chr7 96720010 96720369 + 2.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -10298 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 431.25 chr10 82000568 82000855 + 2.25 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 123024 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 227-69 chr8 104767145 104767349 + 2.25 NA Intergenic MER92D|LTR|ERV1 -178223 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 382.5-5 chr10 55284721 55285020 + 2.25 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -314172 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 488.75-4 chr6 120610428 120610914 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 595492 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 315.75-2 chr1 187673826 187674017 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 230293 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 324.25-12 chr21 19374615 19374995 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 524950 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 264.75-33 chr3 187754000 187754237 + 2.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -8650 NM_001706 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 365-14 chr4 70241265 70241577 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -1195 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 386.75-11 chr8 139307449 139307842 + 2.25 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -393604 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 431-12 chr4 108196432 108196873 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 24532 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 318.5-20 chr2 59294061 59294270 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 76457 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 563.5-2 chr3 89328836 89329352 + 2.25 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 221473 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 532.75 chr1 72945018 72945324 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -360999 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 359.75-9 chr18 4335582 4335957 + 2.25 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 71167 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 260.25-37 chr5 4701424 4701558 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -71990 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 659.75 chr7 31544557 31545032 + 2.25 NA intron (NM_001257968, intron 1 of 14) intron (NM_001257968, intron 1 of 14) -8208 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 338.5-28 chr6 62174796 62174979 + 2.25 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 111338 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 316-13 chr14 83153299 83153531 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 510783 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 230.5-83 chr4 32478518 32478704 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 127573 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 361-7 chr12 23377668 23377857 + 2.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 202126 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 448.5-7 chr7 131332492 131332731 + 2.25 NA intron (NM_001321316, intron 1 of 17) L1ME4a|LINE|L1 4735 NM_001321316 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 266.25-45 chr8 21522966 21523124 + 2.25 NA Intergenic (TTCCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 224806 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 390.75-9 chr7 64673776 64674082 + 2.25 NA intron (NM_016220, intron 2 of 6) L1PA15|LINE|L1 -5135 NR_106898 102465505 NR_106898 ENSG00000275667 MIR6839 hsa-mir-6839 microRNA 6839 ncRNA 252.25-4 chr10 41894597 41894809 + 2.25 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 473342 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 320.5-3 chr1 238324251 238324406 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 161689 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 303.75-7 chr1 225554414 225554568 + 2.25 NA intron (NM_001008493, intron 3 of 14) intron (NM_001008493, intron 3 of 14) 98632 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 539.25 chr16 72039688 72040146 + 2.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14588 NM_001318138 3240 Hs.513711 NM_005143 ENSG00000257017 HP BP|HP2ALPHA2|HPA1S haptoglobin protein-coding 464.75-2 chr20 3626421 3626720 + 2.25 NA intron (NM_139321, intron 25 of 28) L1M5|LINE|L1 36829 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 482.5-5 chr4 104537505 104537813 + 2.25 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -42765 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 580.5-3 chr2 190669387 190669750 + 2.25 NA intron (NM_001321314, intron 1 of 6) intron (NM_001321314, intron 1 of 6) 10410 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 401.25-15 chr8 141748005 141748237 + 2.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 38192 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 300-19 chr16 78636393 78636573 + 2.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) UCON39|DNA|TcMar-Tigger 536829 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 468.25 chr10 17072366 17072816 + 2.25 NA intron (NM_001081, intron 17 of 66) L1MEc|LINE|L1 57226 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 287.25-46 chr8 74100740 74101029 + 2.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 109492 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 158.5-91 chr19 58138211 58138318 + 2.25 NA intron (NM_024620, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 12525 NM_024620 79673 Hs.458377 NM_024620 ENSG00000181894 ZNF329 - zinc finger protein 329 protein-coding 206.25-7 chr1 93094811 93094953 + 2.25 NA intron (NM_001164393, intron 1 of 12) L1MC5|LINE|L1 15599 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 495.25-2 chr10 51016095 51016521 + 2.25 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) L3|LINE|CR1 25420 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 499.25-2 chr11 85964381 85964666 + 2.25 NA intron (NM_001008660, intron 19 of 19) MIR|SINE|MIR 104561 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 222.25-38 chr2 208041163 208041310 + 2.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -15709 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 489.5 chr12 28837650 28837983 + 2.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -311462 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 279-6 chr10 57847709 57847908 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 420086 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 556.75-3 chr6 76676470 76676880 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -83052 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 353.5-9 chr19 36557191 36557387 + 2.25 NA intron (NM_001145650, intron 2 of 4) L1M4b|LINE|L1 -15781 NR_110705 101927599 Hs.515376 NR_110703 ENSG00000233527 ZNF529-AS1 - ZNF529 antisense RNA 1 ncRNA 239-16 chr14 54333073 54333205 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -63729 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 274.25-39 chr6 1694157 1694596 + 2.25 NA intron (NM_001253846, intron 9 of 10) intron (NM_001253846, intron 9 of 10) 84461 NM_001453 2296 Hs.348883 NM_001453 ENSG00000054598 FOXC1 ARA|ASGD3|FKHL7|FREAC-3|FREAC3|IGDA|IHG1|IRID1|RIEG3 forkhead box C1 protein-coding 491.75 chr10 8649002 8649309 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -54764 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 307.5-9 chr11 80216862 80217140 + 2.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 545802 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 339.25-14 chr22 31981512 31981730 + 2.25 NA intron (NR_149128, intron 3 of 4) L1MB5|LINE|L1 10798 NR_149128 105372999 Hs.512525 NR_149128 LINC02558 - long intergenic non-protein coding RNA 2558 ncRNA 204.25-107 chr7 39255461 39255569 + 2.25 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) L2b|LINE|L2 73619 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 396.5-6 chr5 6517965 6518316 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -63996 NR_024423 255167 Hs.435515 NR_024423 ENSG00000250056 LINC01018 SRHC long intergenic non-protein coding RNA 1018 ncRNA 275.25-32 chr5 23179822 23180001 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -326567 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 529.75-2 chr15 79503649 79504198 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 71407 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 233-14 chr14 19888897 19889101 + 2.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 12731 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 173-106 chr5 32262583 32262678 + 2.25 NA intron (NM_001294344, intron 7 of 13) (AAACAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 50309 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 729.25-2 chr16 51018025 51018663 + 2.25 NA intron (NR_110913, intron 1 of 2) intron (NR_110913, intron 1 of 2) 586 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 340.5 chr1 61368175 61368370 + 2.25 NA intron (NM_001134673, intron 6 of 10) intron (NM_001134673, intron 6 of 10) -114754 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 378-19 chr8 104789719 104790050 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -200860 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 375.5-20 chr8 108028642 108028906 + 2.25 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) intron (NM_178565, intron 2 of 5) 53165 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 417-4 chr14 55205166 55205393 + 2.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13694 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 281.5-58 chr9 109172594 109172786 + 2.25 NA 3' UTR (NM_019114, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_019114, exon 26 of 26) -5399 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 506.25-2 chr12 124850507 124850874 + 2.25 NA intron (NR_160424, intron 1 of 11) intron (NR_160424, intron 1 of 11) -11019 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 324-16 chr2 171819988 171820181 + 2.25 NA intron (NR_047549, intron 8 of 16) L1PA14|LINE|L1 74160 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 443.75-8 chr8 134347586 134347967 + 2.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -250295 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 393.5-2 chr10 17365058 17365361 + 2.25 NA intron (NM_001004470, intron 3 of 7) intron (NM_001004470, intron 3 of 7) -21727 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 387.75-8 chr17 60839137 60839472 + 2.25 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 161453 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 402 chr1 80899723 80900086 + 2.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 258617 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 373.5-13 chr3 17756872 17757061 + 2.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 14022 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 418.25-4 chr11 85023678 85024043 + 2.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIRb|SINE|MIR -100439 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 322.75-18 chr8 105760580 105760842 + 2.25 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 299792 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 410.5-6 chr15 63552876 63553198 + 2.25 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) intron (NM_006537, intron 3 of 14) -44350 NM_001367809 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 338.75-17 chr22 32264453 32264718 + 2.25 NA intron (NR_149072, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu -9238 NM_014227 6527 Hs.130101 NM_014227 ENSG00000100191 SLC5A4 DJ90G24.4|SAAT1|SGLT3 solute carrier family 5 member 4 protein-coding 398.25-6 chr14 67841581 67841861 + 2.25 NA intron (NM_133509, intron 4 of 10) L1PA16|LINE|L1 18129 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 515.25-4 chr7 125450514 125450915 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -186423 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 518.75 chr14 49450798 49451208 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 135377 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 471-3 chr12 32285946 32286202 + 2.25 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) -113484 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 504-5 chr7 7345254 7345794 + 2.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 90370 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 238.25-80 chr7 22617064 22617184 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 48409 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 375-7 chr22 39772506 39772872 + 2.25 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) L1MEf|LINE|L1 121071 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 497-6 chr5 74733840 74734264 + 2.25 NA intron (NR_104006, intron 15 of 19) intron (NR_104006, intron 15 of 19) 33065 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 567.5 chr1 88884730 88885353 + 2.25 NA intron (NM_001514, intron 2 of 6) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 6526 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 296-25 chr2 67797594 67797772 + 2.25 NA intron (NR_110271, intron 2 of 2) intron (NR_110271, intron 2 of 2) 27879 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 424-11 chr8 59841052 59841393 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 440178 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 457.25-4 chr8 127486688 127487089 + 2.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -4749 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 491.25-3 chr13 78178930 78179268 + 2.25 NA intron (NR_047001, intron 1 of 5) L1PB4|LINE|L1 124244 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 240.75-24 chr14 60379156 60379326 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 56045 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 431.75 chr12 15684345 15684913 + 2.25 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 104759 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 170.25-132 chr5 131516952 131517061 + 2.25 NA intron (NM_016340, intron 7 of 27) intron (NM_016340, intron 7 of 27) 118223 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 289-9 chr11 33847299 33847464 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 22497 NM_001142315 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 382-3 chr1 154116808 154117145 + 2.25 NA intron (NM_001159484, intron 12 of 37) U3|snRNA|snRNA -12384 NR_049883 100847024 NR_049883 ENSG00000263987 MIR5698 - microRNA 5698 ncRNA 296.25-29 chr6 126041158 126041349 + 2.25 NA intron (NR_146803, intron 15 of 16) intron (NR_146803, intron 15 of 16) 54713 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 310.25-16 chr3 160447059 160447452 + 2.25 NA intron (NR_148403, intron 1 of 20) intron (NR_148403, intron 1 of 20) 2531 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 489-7 chr9 28530696 28531025 + 2.25 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 188445 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 407-2 chr10 56405579 56405946 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -44489 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 380-5 chr13 80911043 80911246 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -107247 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 375.75-13 chr4 32976921 32977240 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 626042 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 299.25-49 chrX 44989734 44990018 + 2.25 NA intron (NR_111960, intron 4 of 27) MER58D|DNA|hAT-Charlie 116701 NM_001291418 7403 Hs.522616 NM_021140 ENSG00000147050 KDM6A KABUK2|UTX|bA386N14.2 lysine demethylase 6A protein-coding 279.75-31 chr3 386219 386413 + 2.25 NA promoter-TSS (NR_110739) promoter-TSS (NR_110739) -521 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 256-3 chr1 108917764 108917990 + 2.25 NA intron (NM_013296, intron 11 of 14) L1ME2|LINE|L1 32571 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 467 chr1 55888637 55888856 + 2.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 56217 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 346.5-8 chr14 46889204 46889461 + 2.25 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -237551 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 495.75-2 chr7 85583518 85583933 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 162603 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 413.25-3 chr14 64848873 64849183 + 2.25 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -25648 NM_001024858 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 306-39 chr8 106036514 106036697 + 2.25 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 23898 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 535 chr3 117533902 117534374 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 156787 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 357-5 chr15 60041331 60041571 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 37140 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 271.5-44 chr2 223400290 223400440 + 2.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 201996 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 385.5-15 chr22 45510011 45510306 + 2.25 NA intron (NM_006487, intron 1 of 14) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 7275 NM_001996 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 410.5-9 chr3 79717175 79717479 + 2.25 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 50671 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 650.75-2 chr4 30462814 30463514 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -257205 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 186-47 chr2 103194413 103194586 + 2.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -210070 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 356.75-16 chr8 63230763 63231046 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 61901 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 345.5-33 chr8 134156412 134156649 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 270034 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 271.25-16 chr12 4199099 4199403 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -74511 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 432-5 chr14 67385283 67385567 + 2.25 NA 3' UTR (NM_004094, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_004094, exon 8 of 8) 25097 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 382-16 chr3 40209315 40209753 + 2.25 NA intron (NM_001284424, intron 10 of 15) intron (NM_001284424, intron 10 of 15) 100164 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 334.75-27 chr9 79375460 79375660 + 2.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -196213 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 402-5 chr2 96997663 96998026 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -11264 NM_001122646 51252 Hs.107922 NM_016490 ENSG00000168754 FAM178B - family with sequence similarity 178 member B protein-coding 391.5-2 chr10 78836393 78836757 + 2.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 230873 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 280.5-42 chr5 136940540 136940723 + 2.25 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -187566 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 514-2 chr14 67994216 67994489 + 2.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 170760 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 520.25 chr18 64160125 64160385 + 2.25 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) -11229 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 504-7 chrX 150179067 150179479 + 2.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -48731 NR_031748 100313839 NR_031748 ENSG00000252454 MIR2114 - microRNA 2114 ncRNA 204-71 chr6 89134523 89134684 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -11452 NM_001010853 135293 Hs.356247 NM_001010853 ENSG00000146281 PM20D2 ACY1L2 peptidase M20 domain containing 2 protein-coding 528.75 chr5 170060458 170060864 + 2.25 NA intron (NR_156756, intron 45 of 52) intron (NR_156756, intron 45 of 52) 32173 NR_039609 100616498 NR_039609 ENSG00000263831 MIR378E mir-378e microRNA 378e ncRNA 401.25-14 chr7 67619339 67619658 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 283522 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 382.25-8 chr14 80242532 80242788 + 2.25 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) L1MEc|LINE|L1 -11603 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 544.5 chr17 65889148 65889480 + 2.25 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) intron (NM_001353129, intron 20 of 26) -62771 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 294-14 chr16 83219037 83219342 + 2.25 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) MIRc|SINE|MIR -228891 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 531.75 chr1 62314287 62314575 + 2.25 NA intron (NM_181712, intron 1 of 9) intron (NM_181712, intron 1 of 9) 5003 NM_001320269 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 519-3 chr3 65051924 65052314 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -364119 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 574.25 chr8 144766857 144767375 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -11585 NM_138367 90987 Hs.534516 NM_138367 ENSG00000198169 ZNF251 - zinc finger protein 251 protein-coding 254-16 chr15 91689396 91689568 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -164226 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 713.75 chr4 30365495 30366028 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -354608 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 414-13 chr4 82654911 82655135 + 2.25 NA intron (NM_001037582, intron 3 of 4) intron (NM_001037582, intron 3 of 4) -33586 NR_024087 439934 Hs.457189 NM_001033661 ENSG00000231782 LINC00575 C4orf11 long intergenic non-protein coding RNA 575 ncRNA 277.5-11 chr10 72878017 72878322 + 2.25 NA intron (NM_138357, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu -15570 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 254.5-29 chr17 13693304 13693509 + 2.25 NA Intergenic Tigger17|DNA|TcMar-Tigger -91477 NM_006042 9955 Hs.462270 NM_006042 ENSG00000153976 HS3ST3A1 3-OST-3A|3OST3A1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3A1 protein-coding 359-9 chr22 43457683 43457952 + 2.25 NA intron (NM_001362786, intron 3 of 6) L1M4|LINE|L1 41265 NM_001362786 758 Hs.159538 NM_001044370 ENSG00000186732 MPPED1 239AB|C22orf1|FAM1A metallophosphoesterase domain containing 1 protein-coding 329.75-21 chr8 139189086 139189432 + 2.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -275218 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 235-32 chr2 104006801 104006954 + 2.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 401455 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 470-2 chr14 65067150 65067533 + 2.25 NA intron (NM_197957, intron 3 of 3) L1MC3|LINE|L1 -22577 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 692.25 chr17 59655941 59656539 + 2.25 NA intron (NM_001288653, intron 6 of 31) intron (NM_001288653, intron 6 of 31) 36345 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 343.25-20 chr8 109391665 109392066 + 2.25 NA intron (NM_177531, intron 9 of 77) intron (NM_177531, intron 9 of 77) 29404 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 401.75-12 chr6 89167774 89168004 + 2.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 21834 NM_001010853 135293 Hs.356247 NM_001010853 ENSG00000146281 PM20D2 ACY1L2 peptidase M20 domain containing 2 protein-coding 412-4 chr16 9043426 9043762 + 2.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -48050 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 385.75-5 chr15 75866511 75866795 + 2.25 NA intron (NM_001145335, intron 3 of 12) HAL1ME|LINE|L1 22609 NM_001145335 92912 Hs.23033 NM_173469 ENSG00000140367 UBE2Q2 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 protein-coding 457.25 chr14 69279097 69279325 + 2.25 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) AluSq2|SINE|Alu 19053 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 159-66 chr3 94637306 94637409 + 2.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -300906 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 228-74 chr7 119328397 119328567 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 578893 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 283.5-40 chr3 11373802 11374031 + 2.25 NA intron (NM_001136031, intron 16 of 17) intron (NM_001136031, intron 16 of 17) 101519 NM_006395 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 255.5-91 chr9 80705374 80705553 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 730440 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 189.5-156 chr9 2471402 2471631 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -150271 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 337.25 chr1 89914824 89914993 + 2.25 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 80058 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 768.75 chr9 28410658 28411188 + 2.25 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 308382 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 476-4 chr5 105583245 105583770 + 2.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 484033 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 328-6 chr14 47234122 47234444 + 2.25 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 108963 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 192.75-101 chr4 103449120 103449214 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 24125 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 302-17 chr2 71776681 71776913 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 310098 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 373.5-11 chr20 9845189 9845409 + 2.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -6223 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 262.25-50 chr8 137900332 137900549 + 2.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 183105 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 367.75 chr1 96015813 96016082 + 2.25 NA intron (NR_125991, intron 4 of 4) intron (NR_125991, intron 4 of 4) 23879 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 457.5-2 chr15 64661062 64661550 + 2.25 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 41975 NM_001301302 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 228 chr1 22956871 22957033 + 2.25 NA intron (NM_001289974, intron 6 of 7) L1ME4b|LINE|L1 15914 NM_001289974 646262 NM_001289974 ENSG00000215906 LACTBL1 - lactamase beta like 1 protein-coding 207-97 chr9 103430738 103430882 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -105777 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 252-29 chr16 49501268 49501396 + 2.25 NA intron (NM_001271620, intron 7 of 7) MER102b|DNA|hAT-Charlie 17253 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 321.25-21 chr6 65696794 65697045 + 2.25 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) intron (NM_001292009, intron 1 of 43) 10306 NM_001292009 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 326.25-18 chr2 44142010 44142186 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -26705 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 300-37 chr7 91849617 91849776 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 31006 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 723.75 chr2 24270982 24271677 + 2.25 NA intron (NM_001348182, intron 18 of 38) intron (NM_001348182, intron 18 of 38) 89207 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 376.5-8 chr2 17535002 17535177 + 2.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4675 NM_001321233 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 239-12 chr11 89424561 89424847 + 2.25 NA intron (NM_001143837, intron 10 of 20) L1M5|LINE|L1 66056 NM_001291929 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 382.5-18 chr7 131481274 131481535 + 2.25 NA intron (NM_001321316, intron 17 of 17) intron (NM_001321316, intron 17 of 17) 75224 NM_001018111 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 321.75-14 chr18 9996880 9997218 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 83033 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 311.75-9 chr13 42848052 42848512 + 2.25 NA intron (NR_126389, intron 3 of 4) intron (NR_126389, intron 3 of 4) 24462 NR_126388 104355147 Hs.633967 NR_126388 LINC00428 - long intergenic non-protein coding RNA 428 ncRNA 553.75-2 chr4 107161700 107162153 + 2.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -125613 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 257.25-3 chr10 11228351 11228577 + 2.25 NA intron (NM_001025076, intron 3 of 13) intron (NM_001025076, intron 3 of 13) 63434 NM_001025076 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 678.75 chr2 50703822 50704338 + 2.25 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -7818 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 252.75-42 chr22 28132059 28132231 + 2.25 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -211533 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 734.75 chr8 92260643 92261357 + 2.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -157615 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 646.5 chr6 155488683 155489278 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -25864 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 436.25-7 chr8 13252231 13252586 + 2.25 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) L3|LINE|CR1 24113 NM_001316668 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 156.5-33 chr12 7682420 7682497 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -11859 NM_001304566 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 342.75-6 chr10 14611175 14611427 + 2.25 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -6900 NM_001282696 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 345.25 chr1 114555409 114556010 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 25906 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 512.5-2 chr21 19195098 19195496 + 2.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -435485 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 508 chr10 57439900 57440347 + 2.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -135564 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 536-2 chr7 24982390 24982691 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -2362 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 436.5-5 chr2 40481024 40481260 + 2.25 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29052 NM_001351493 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 239.5-4 chr1 94325853 94326033 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -78197 NM_001328665 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 471.75-3 chr16 27040126 27040473 + 2.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -26628 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 427.5-3 chr12 120868637 120868960 + 2.25 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 35560 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 274.75-13 chr14 61853327 61853461 + 2.25 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 40691 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 386 chr1 26148409 26148769 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10490 NM_024869 79927 Hs.694119 NM_024869 ENSG00000197245 FAM110D GRRP1 family with sequence similarity 110 member D protein-coding 226.75-54 chr3 161467371 161467497 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -29374 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 304.5-7 chr11 22673345 22673502 + 2.25 NA intron (NM_177553, intron 1 of 7) intron (NM_177553, intron 1 of 7) -1351 NM_005256 2620 Hs.711297 NM_005256 ENSG00000148935 GAS2 GAS-2 growth arrest specific 2 protein-coding 442.5-5 chr5 42058523 42058823 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 116672 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 295.5-6 chr1 217771523 217771732 + 2.25 NA intron (NM_138796, intron 6 of 10) intron (NM_138796, intron 6 of 10) 13493 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 629.25 chr10 86470265 86470693 + 2.25 NA intron (NM_001318328, intron 8 of 18) intron (NM_001318328, intron 8 of 18) 51305 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 402-2 chr1 85793679 85793995 + 2.25 NA intron (NM_152890, intron 47 of 59) L3|LINE|CR1 -85404 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 290.25-29 chr6 3809140 3809428 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -40089 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 392.25-6 chr14 35652938 35653149 + 2.25 NA intron (NM_014990, intron 29 of 40) intron (NM_014990, intron 29 of 40) 109888 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 519 chr11 19841092 19841371 + 2.25 NA intron (NM_182964, intron 2 of 37) intron (NM_182964, intron 2 of 37) -81148 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 594.75-3 chr5 114381288 114381673 + 2.25 NA intron (NM_001278204, intron 2 of 6) intron (NM_001278204, intron 2 of 6) 19161 NM_001278204 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 235.5-7 chr1 118578106 118578255 + 2.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -392952 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 448.5 chr10 91479907 91480219 + 2.25 NA intron (NM_182765, intron 6 of 20) intron (NM_182765, intron 6 of 20) 69778 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 228.5-59 chr2 113073985 113074101 + 2.25 NA intron (NM_032556, intron 1 of 3) intron (NM_032556, intron 1 of 3) 1725 NM_032556 84639 Hs.306974 NM_032556 ENSG00000136697 IL1F10 FIL1-theta|FKSG75|IL-1HY2|IL-38|IL1-theta|IL1HY2 interleukin 1 family member 10 protein-coding 259.5-89 chr7 69002041 69002171 + 2.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 595518 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 491.75-2 chr10 65908267 65908699 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 337058 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 440.75 chr17 79395308 79395775 + 2.25 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 120607 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 492.5-2 chr5 106726588 106726988 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 284226 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 604.5 chr2 145697836 145698308 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -888985 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 526.5-2 chr9 32257879 32258332 + 2.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -126498 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 286.5-48 chr4 58268179 58268404 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 268037 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 249.5-66 chr3 88862978 88863136 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -244564 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 276.75-46 chr7 9544733 9544978 + 2.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -89415 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 532.5 chr5 75148621 75148941 + 2.25 NA intron (NM_001164443, intron 12 of 24) intron (NM_001164443, intron 12 of 24) 88097 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 380 chr1 214268474 214268707 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -12569 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 420-12 chr6 54102048 54102271 + 2.25 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR -9284 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 322.5-28 chr5 82053284 82053499 + 2.25 NA intron (NM_031482, intron 2 of 7) L1ME4b|LINE|L1 81368 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 292-2 chr1 170036140 170036410 + 2.25 NA intron (NM_014970, intron 5 of 19) intron (NM_014970, intron 5 of 19) 32640 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 501.5-3 chr8 117360255 117360658 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -160257 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 449.75-3 chr3 59004686 59005065 + 2.25 NA intron (NR_147235, intron 4 of 6) intron (NR_147235, intron 4 of 6) 45150 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 412 chr1 211996464 211996853 + 2.25 NA intron (NM_015434, intron 7 of 19) L1MC|LINE|L1 -38895 NM_001286229 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 473.25-8 chr8 83698782 83699214 + 2.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 295240 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 330.5-27 chr6 125004774 125005052 + 2.25 NA intron (NR_104440, intron 2 of 6) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 21545 NM_152553 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 509.25-3 chr9 129057795 129058089 + 2.25 NA intron (NR_138421, intron 7 of 16) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 21008 NM_032809 84895 Hs.632693 NM_032809 ENSG00000148343 MIGA2 C9orf54|FAM73B mitoguardin 2 protein-coding 360.25-6 chr15 94379220 94379421 + 2.25 NA intron (NM_018349, intron 11 of 21) intron (NM_018349, intron 11 of 21) 23390 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 379.75-5 chr17_KI270729v1_random 5535 5998 + 2.25 NA NA (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 207.75-125 chr8 8393358 8393506 + 2.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -6993 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 548.5-5 chrUn_KI270544v1 56 534 + 2.25 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 392.75-5 chr14 87575942 87576196 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 79225 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 300.75-7 chr11 36860405 36860712 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -262279 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 506.5 chr5 103983806 103984253 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -421240 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 653.5-2 chr7 9582179 9582504 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -51929 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 247.75-33 chr2 153102391 153102653 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 376240 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 263.75-40 chr4 60412995 60413268 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -509488 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 443.5-8 chr5 11709211 11709622 + 2.25 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -120350 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 245.5-4 chr1 103954454 103954732 + 2.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -118430 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 369.75-12 chr2 126725569 126725944 + 2.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 69598 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 436.5-9 chr8 114362384 114362680 + 2.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -925593 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 537 chr16 65676965 65677343 + 2.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -100854 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 268.25-14 chr14 59221006 59221221 + 2.25 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) ERVL-int|LTR|ERVL 32446 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 454.25 chr16 7720351 7720656 + 2.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 387658 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 463.25-3 chr5 143697960 143698244 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 18242 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 332.75-18 chr5 129039895 129040097 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -54753 NM_016048 51015 Hs.483296 NM_016048 ENSG00000066583 ISOC1 CGI-111 isochorismatase domain containing 1 protein-coding 476.25-3 chr7 47266528 47266985 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 198047 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 516.75-7 chr7 29202497 29202848 + 2.25 NA intron (NR_120522, intron 1 of 2) intron (NR_120522, intron 1 of 2) 4931 NM_001293072 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 262.25-41 chr5 159637354 159637470 + 2.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -171136 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 529-3 chr8 140801784 140802165 + 2.25 NA intron (NM_001352716, intron 10 of 34) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -69321 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 531 chr10 76098767 76099209 + 2.25 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) LTR8|LTR|ERV1 316227 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 253-50 chr6 142907003 142907138 + 2.25 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 38106 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 470.25-2 chr2 116393131 116393447 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 1049474 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 246.75-49 chr4 69900761 69900928 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -30224 NM_001025104 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 438-2 chr3 87302827 87303146 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -26402 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 313.75-27 chr9 104061438 104061743 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 30884 NR_121580 101928550 Hs.144722 NR_121580 ENSG00000270332 SMC2-AS1 - SMC2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 599 chr19 57024324 57024704 + 2.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -95627 NM_020903 57663 Hs.515632 NM_020903 ENSG00000131864 USP29 HOM-TES-84/86 ubiquitin specific peptidase 29 protein-coding 242.25-83 chr8 59223818 59224041 + 2.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 104719 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 416-5 chr14 66722355 66722868 + 2.25 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) AluJr|SINE|Alu 215204 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 403.5 chr11 64635123 64635398 + 2.25 NA intron (NM_015080, intron 18 of 22) intron (NM_015080, intron 18 of 22) 8285 NM_138734 9379 Hs.372938 NM_015080 ENSG00000110076 NRXN2 - neurexin 2 protein-coding 302.25-23 chr5 107528784 107528998 + 2.25 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 142046 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 573 chr14 54538418 54538850 + 2.25 NA 3' UTR (NM_006568, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_006568, exon 6 of 6) 28728 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 548-2 chr1 67585805 67586146 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -99226 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 369-12 chr4 58079706 58080013 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 456469 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 349.75-14 chr7 25511734 25511999 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 151274 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 485.25-2 chr12 11684832 11685201 + 2.25 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 35162 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 200.25-85 chr4 109566440 109566561 + 2.25 NA intron (NM_017918, intron 1 of 7) intron (NM_017918, intron 1 of 7) 6254 NM_017918 55013 Hs.234149 NM_017918 ENSG00000005059 MCUB CCDC109B mitochondrial calcium uniporter dominant negative beta subunit protein-coding 310.75-23 chr22 35987775 35987948 + 2.25 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) -26231 NM_001349992 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 186.25-22 chr12 16274355 16274492 + 2.25 NA intron (NM_001170798, intron 1 of 8) intron (NM_001170798, intron 1 of 8) 3262 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 280.5-2 chr1 41175562 41175984 + 2.25 NA intron (NM_001172218, intron 2 of 15) intron (NM_001172218, intron 2 of 15) -12756 NM_001172221 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 268.5-39 chr3 114057494 114057891 + 2.25 NA intron (NM_024638, intron 2 of 9) L1ME3G|LINE|L1 955 NM_001256835 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 311.25-24 chr6 161091667 161091913 + 2.25 NA intron (NM_005922, intron 12 of 26) intron (NM_005922, intron 12 of 26) 70192 NR_024277 79992 Hs.664873 NM_024929 ENSG00000279355 AGPAT4-IT1 C6orf59|NCRNA00241 AGPAT4 intronic transcript 1 ncRNA 384-5 chr16 10804835 10805102 + 2.25 NA intron (NR_134903, intron 1 of 8) L1MB5|LINE|L1 13826 NR_134904 780776 Hs.371576 NM_001079512 ENSG00000166676 TVP23A FAM18A|YDR084C trans-golgi network vesicle protein 23 homolog A protein-coding 469.25-3 chr19 29612305 29612581 + 2.25 NA intron (NR_027368, intron 4 of 5) intron (NR_027368, intron 4 of 5) 6160 NR_027368 10775 Hs.412870 NM_006627 ENSG00000105171 POP4 RPP29 POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 548.25 chr4 85469675 85470197 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -5214 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 339.5 chr1 40689775 40690149 + 2.25 NA non-coding (NR_024567, exon 1 of 1) non-coding (NR_024567, exon 1 of 1) -1742 NM_014223 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 397.5-4 chr14 65804762 65805146 + 2.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 333852 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 275.75-28 chr21 28670303 28670435 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 131051 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 529.75-3 chr20 41479809 41480145 + 2.25 NA intron (NM_032221, intron 16 of 36) HAL1|LINE|L1 -113159 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 319-22 chr3 1602276 1602485 + 2.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -496423 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 395.25-5 chr2 106617211 106617523 + 2.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 130003 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 423.75-10 chr9 109622304 109622567 + 2.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -18353 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 290.25-10 chr13 90812347 90812569 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 114139 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 258.75-76 chr8 78039148 78039460 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -477036 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 299.5-19 chr2 73330175 73330425 + 2.25 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -36752 NM_001965 1961 Hs.3052 NM_001965 ENSG00000135625 EGR4 AT133|NGFI-C|NGFIC|PAT133 early growth response 4 protein-coding 544.75 chr14 71360318 71360765 + 2.25 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -37796 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 325.5-38 chr8 68110707 68110956 + 2.25 NA intron (NM_024870, intron 25 of 39) intron (NM_024870, intron 25 of 39) 158785 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 492-3 chr3 2525333 2525600 + 2.25 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) 286637 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 313-23 chr7 84246954 84247176 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -52276 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 289.75-11 chr14 57898187 57898480 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -32241 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 437.25-3 chr4 18361304 18361706 + 2.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -339630 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 277.25-22 chr2 49986479 49986697 + 2.25 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -12385 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 479.25 chr2 25166269 25166731 + 2.25 NA intron (NM_001319204, intron 1 of 3) intron (NM_001319204, intron 1 of 3) 2080 NM_000939 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 482.5-7 chr5 41376837 41377168 + 2.25 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) intron (NM_001005473, intron 2 of 2) -115533 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 290.5-21 chr2 48952639 48952821 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -106873 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 409.5-12 chr3 67134241 67134595 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -91046 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 445-6 chr3 16963406 16963759 + 2.25 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 30386 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 376-15 chr2 203518648 203519007 + 2.25 NA intron (NM_001329728, intron 1 of 15) AluJr4|SINE|Alu 16474 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 292.75-29 chr5 152687286 152687551 + 2.25 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) intron (NR_109877, intron 3 of 4) -282139 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 588.75-2 chr4 121880218 121880981 + 2.25 NA intron (NM_001130698, intron 11 of 11) intron (NM_001130698, intron 11 of 11) -10102 NM_018190 55212 Hs.591694 NM_018190 ENSG00000138686 BBS7 BBS2L1 Bardet-Biedl syndrome 7 protein-coding 226.5-58 chr3 41497686 41497830 + 2.25 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) AluJo|SINE|Alu 298253 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 418.25-2 chr1 224583689 224583970 + 2.25 NA intron (NR_136294, intron 4 of 8) intron (NR_136294, intron 4 of 8) -32488 NM_001322305 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 440-5 chr2 162589666 162589876 + 2.25 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -179165 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 517.25-3 chr6 147166025 147166627 + 2.25 NA intron (NR_132442, intron 2 of 2) intron (NR_132442, intron 2 of 2) 7401 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 431.75-6 chr5 33583185 33583653 + 2.25 NA intron (NM_001324512, intron 16 of 21) L1MA1|LINE|L1 142643 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 615 chr14 23006803 23007246 + 2.25 NA intron (NM_001130706, intron 1 of 7) CpG 3119 NM_021944 60686 Hs.255874 NM_021944 ENSG00000100802 C14orf93 RTFC chromosome 14 open reading frame 93 protein-coding 378.5-15 chr5 121545151 121545331 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 222691 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 340.75-21 chr6 37944163 37944402 + 2.25 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 124555 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 317.75-5 chr10 102249230 102249384 + 2.25 NA intron (NM_001199378, intron 1 of 39) intron (NM_001199378, intron 1 of 39) 3775 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 234-49 chr4 103301764 103301871 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -103474 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 456.75 chr1 111535695 111536008 + 2.25 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) intron (NM_001081976, intron 1 of 5) -6158 NM_001370216 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 298.5-46 chr9 115703963 115704337 + 2.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 40089 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 341.25-14 chr2 37047748 37047931 + 2.25 NA intron (NM_019024, intron 18 of 35) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 36533 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 600.5 chr3 105495897 105496472 + 2.25 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 129275 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 380.25-2 chr14 72798302 72798517 + 2.25 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 94240 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 440.25-3 chr4 32729480 32729819 + 2.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 378611 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 433.5-5 chr20 47773325 47773771 + 2.25 NA intron (NM_198596, intron 1 of 20) intron (NM_198596, intron 1 of 20) 12516 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 547.25 chr17 61682394 61682847 + 2.25 NA 3' UTR (NM_032043, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_032043, exon 20 of 20) -91401 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 393-2 chr10 84635568 84635800 + 2.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 210515 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 291.75-8 chr11 23106498 23106656 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -246103 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 307.5-13 chr12 61107474 61107638 + 2.25 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 1085283 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 242.75-62 chr7 49093979 49094142 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 169513 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 505.25 chr2 204771631 204771869 + 2.25 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 226275 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 318-4 chr1 184057649 184057812 + 2.25 NA intron (NM_001363643, intron 3 of 3) intron (NM_001363643, intron 3 of 3) 6000 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 579 chr1 241822931 241823585 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -24933 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 642.75 chr18 3469596 3470201 + 2.25 NA intron (NR_110429, intron 2 of 2) intron (NR_110429, intron 2 of 2) 3648 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 374-17 chr6 168238677 168238913 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -4143 NR_110870 101929420 Hs.571211 NR_110870 ENSG00000234647 LOC101929420 - uncharacterized LOC101929420 ncRNA 595.25-2 chr9 35933766 35934232 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 24155 NM_019897 56656 Hs.553540 NM_019897 ENSG00000278889 OR2S2 OR37A|OST715 olfactory receptor family 2 subfamily S member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 516-4 chr8 114010807 114011123 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -574026 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 399.25-7 chr20 41793724 41794119 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -175544 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 289.5-51 chr9 90236817 90237023 + 2.25 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -195421 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 644.75 chr14 89838506 89838940 + 2.25 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) L1MEd|LINE|L1 115813 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 348-6 chr12 18461023 18461246 + 2.25 NA intron (NM_001288774, intron 18 of 32) intron (NM_001288774, intron 18 of 32) 199594 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 369.25-10 chr4 97791255 97791427 + 2.25 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) intron (NM_174952, intron 9 of 10) 352135 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 408-4 chr14 59977946 59978269 + 2.25 NA exon (NM_001355272, exon 15 of 33) exon (NM_001355272, exon 15 of 33) 58394 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 293.25-15 chr2 81456670 81456939 + 2.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 10142 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 468-3 chr11 6830165 6830425 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -15388 NM_178168 144124 Hs.447478 NM_178168 ENSG00000166363 OR10A5 JCG6|OR10A1|OR11-403 olfactory receptor family 10 subfamily A member 5 protein-coding 447-10 chr6 56521693 56522163 + 2.25 NA intron (NM_001144770, intron 61 of 94) intron (NM_001144770, intron 61 of 94) 120961 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 378.5-4 chr12 64005459 64005906 + 2.25 NA intron (NM_001346201, intron 3 of 21) intron (NM_001346201, intron 3 of 21) 160982 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 366.25-8 chr2 14706424 14706697 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 73843 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 319 chr1 65110991 65111205 + 2.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -36451 NM_203464 205 Hs.10862 NM_013410 ENSG00000162433 AK4 AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2 adenylate kinase 4 protein-coding 367.75-14 chrX 144734997 144735317 + 2.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -512346 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 380.75 chr15 84860613 84861087 + 2.25 NA intron (NM_020778, intron 9 of 13) AluSz|SINE|Alu -23811 NM_001287761 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 499.25-4 chr3 107370497 107370949 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -6716 NM_032600 84692 Hs.164799 NM_032600 ENSG00000138483 CCDC54 NYD-SP17|SP17 coiled-coil domain containing 54 protein-coding 147.25-126 chr7 21430984 21431074 + 2.25 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) intron (NM_003112, intron 3 of 5) 2946 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 323.25-5 chr10 112385745 112385958 + 2.25 NA intron (NM_016234, intron 1 of 20) intron (NM_016234, intron 1 of 20) 9653 NM_016234 51703 Hs.11638 NM_016234 ENSG00000197142 ACSL5 ACS2|ACS5|FACL5 acyl-CoA synthetase long chain family member 5 protein-coding 233-45 chr3 150649034 150649277 + 2.25 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 45834 NM_016275 51714 Hs.369052 NM_016275 ENSG00000198843 SELENOT SELT selenoprotein T protein-coding 555.75-4 chr9 38264984 38265359 + 2.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -127531 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 442.75-7 chr4 43941323 43941676 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -75362 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 271-30 chr3 278182 278416 + 2.25 NA intron (NM_001253387, intron 2 of 26) intron (NM_001253387, intron 2 of 26) -41384 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 244.75 chr1 75745535 75745761 + 2.25 NA promoter-TSS (NR_130749) promoter-TSS (NR_130749) -635 NR_130749 1744 Hs.525459 NR_130749 DLSTP1 DLSTP dihydrolipoamide S-succinyltransferase pseudogene 1 pseudo 340.5-4 chr1 241495824 241496021 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 23863 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 226-58 chr5 151851228 151851367 + 2.25 NA intron (NM_000171, intron 7 of 8) intron (NM_000171, intron 7 of 8) 73554 NM_001146040 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 487.5-9 chr6 139402138 139402563 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -27702 NM_006079 10370 Hs.82071 NM_006079 ENSG00000164442 CITED2 ASD8|MRG-1|MRG1|P35SRJ|VSD2 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 protein-coding 286.5-20 chr13 83137278 83137535 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 744987 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 472.25-2 chr5 168836941 168837191 + 2.25 NA intron (NM_003062, intron 6 of 35) intron (NM_003062, intron 6 of 35) -68811 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 385.25-13 chr7 87853236 87853491 + 2.25 NA intron (NM_018843, intron 5 of 11) L1MD1|LINE|L1 22997 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 598.25 chr7 55445466 55445890 + 2.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 80230 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 566.5 chr2 240429182 240429695 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -6225 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 445.5-10 chrX 82836027 82836307 + 2.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -672123 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 467.25-4 chr21 21860087 21860479 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 113298 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 348.5-6 chr2 163118526 163118699 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -279845 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 413.5-4 chr18 22402729 22403152 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 14975 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 371.25-16 chr6 12183192 12183479 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -107026 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 441.25-7 chr6 122137793 122138158 + 2.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -261576 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 273-19 chr13 93894321 93894489 + 2.25 NA intron (NM_005708, intron 3 of 8) intron (NM_005708, intron 3 of 8) -35932 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 219.75-88 chr8 103680788 103680998 + 2.25 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) L1ME3Cz|LINE|L1 -138327 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 302-26 chr6 45366372 45366589 + 2.25 NA intron (NM_181356, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 11038 NR_146635 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 307-29 chr5 52131615 52131849 + 2.25 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 123701 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 394.75-7 chr4 30732190 30732371 + 2.25 NA 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 11911 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 249.5-14 chr10 64115412 64115620 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -593626 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 271.5-51 chr21 37661284 37661426 + 2.25 NA intron (NM_002240, intron 3 of 3) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 241056 NM_130438 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 195-64 chr3 70562487 70562660 + 2.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -249935 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 469.25-5 chr7 12135878 12136345 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -75183 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 509.25-2 chr21 30024834 30025215 + 2.25 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -84972 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 366-13 chr3 5462749 5463035 + 2.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -212637 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 221.75-11 chr1 167997459 167997603 + 2.25 NA intron (NM_001017977, intron 7 of 18) intron (NM_001017977, intron 7 of 18) -1129 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 426.75-5 chr4 31344657 31345017 + 2.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -161707 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 415.25 chr15 26526685 26526895 + 2.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 102300 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 327.25-16 chr4 117294203 117294377 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 66349 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 177.25-126 chr6 62554965 62555106 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -268808 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 421-12 chr6 54425662 54425915 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 117347 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 297.75-41 chr6 93718767 93719030 + 2.25 NA intron (NR_152795, intron 1 of 6) intron (NR_152795, intron 1 of 6) 595 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 276-7 chr10 65246103 65246327 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -321697 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 255.5-6 chr1 102792651 102792813 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 315764 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 312.5-9 chr17 69646541 69646816 + 2.25 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) intron (NR_109972, intron 3 of 4) 52691 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 422.5-14 chr7 79640047 79640435 + 2.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 186281 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 356.5-21 chr9 90187903 90188072 + 2.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -146488 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 265.75-19 chr14 68616046 68616237 + 2.25 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) L1MEc|LINE|L1 12646 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 417.75-2 chr18 9364603 9365013 + 2.25 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu 30035 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 516.75-4 chr3 124662876 124663121 + 2.25 NA intron (NM_007064, intron 12 of 26) AluSp|SINE|Alu -67368 NR_033434 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 209.25-38 chr16 20415774 20415873 + 2.25 NA intron (NM_017888, intron 2 of 13) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 6289 NM_001324373 54988 Hs.659606 NM_017888 ENSG00000183549 ACSM5 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 5 protein-coding 423.75-5 chr2 120012835 120013119 + 2.25 NA promoter-TSS (NR_138472) promoter-TSS (NR_138472) -100 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 264-49 chr5 36277064 36277231 + 2.25 NA intron (NM_001323279, intron 1 of 12) intron (NM_001323279, intron 1 of 12) 24755 NM_001323273 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 635.5 chr12 43265192 43265762 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 110162 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 291-28 chr4 182252460 182252679 + 2.25 NA intron (NM_001080477, intron 1 of 27) intron (NM_001080477, intron 1 of 27) 9167 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 326.5-23 chr5 101786240 101786403 + 2.25 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 509963 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 366-16 chr6 24546084 24546395 + 2.25 NA 3' UTR (NM_001350404, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001350404, exon 20 of 20) 36988 NM_001252328 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 184.25-74 chr21 29021260 29021437 + 2.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -1977 NM_001320724 10069 Hs.713123 NM_016940 ENSG00000156253 RWDD2B C21orf6|GL011 RWD domain containing 2B protein-coding 439.25-6 chr14 43250982 43251384 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 1256100 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 519.5-4 chr8 79666749 79667342 + 2.25 NA TTS (NM_001199214) TTS (NM_001199214) 55928 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 264.75-4 chr1 166496244 166496454 + 2.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -6310 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 351.75-24 chr7 72035612 72035872 + 2.25 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) L1M4c|LINE|L1 301649 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 561.25-2 chr8 121424796 121425127 + 2.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -214385 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 368.25-20 chr8 118120520 118120833 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -8857 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 376-23 chr9 137823738 137823993 + 2.25 NA intron (NM_001354263, intron 25 of 26) L1ME1|LINE|L1 -14554 NR_030333 693187 NR_030333 ENSG00000207693 MIR602 MIRN602|hsa-mir-602 microRNA 602 ncRNA 473.25-4 chr15 58185833 58186551 + 2.25 NA TTS (NM_001320636) TTS (NM_001320636) 47811 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 509.75 chr12 39599992 39600463 + 2.25 NA intron (NM_005164, intron 6 of 9) intron (NM_005164, intron 6 of 9) 19576 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 478.5-3 chr22 45831430 45832076 + 2.25 NA intron (NM_013236, intron 10 of 11) MIR|SINE|MIR 71229 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 316.25-21 chr8 33169668 33170045 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 303290 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 277-21 chr2 58297742 58297932 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 21960 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 478.5 chr19 27759648 27760099 + 2.25 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -33558 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 494.5-2 chr11 29742696 29742947 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 124019 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 222.75-105 chrX 26930209 26930387 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 371961 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 215.5-44 chr18 28665905 28666107 + 2.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -488876 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 369-9 chr20 49116702 49116959 + 2.25 NA intron (NM_004602, intron 12 of 13) intron (NM_004602, intron 12 of 13) 70518 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 531.25 chr7 83915429 83915786 + 2.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -266468 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 394.5-7 chr19 31185382 31185742 + 2.25 NA intron (NR_147209, intron 2 of 4) intron (NR_147209, intron 2 of 4) 18052 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 243-34 chr2 100003724 100003925 + 2.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 101759 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 168.75-44 chr14 63771523 63771651 + 2.25 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -43522 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 504.5 chr10 33405557 33406027 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -70887 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 218.25-92 chr8 24131916 24132097 + 2.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -162034 NR_130709 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 360.25-12 chr3 29789799 29790283 + 2.25 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 144115 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 229.75-58 chr4 170666543 170666712 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 77108 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 711.5 chr4 110244955 110246025 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -46875 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 410.75-2 chr16 62719256 62719738 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -683059 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 395.25-8 chr5 26531446 26531765 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 506981 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 363.25-8 chr5 104285004 104285200 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -722313 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 559-4 chr2 126989930 126990631 + 2.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 91390 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 279.5-69 chrX 111472866 111473121 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -38652 NM_001354473 401613 Hs.98581 NM_001354473 ENSG00000260802 SERTM2 DKFZp686D0853|LINC00890 serine rich and transmembrane domain containing 2 protein-coding 265-19 chr2 40230233 40230376 + 2.25 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 200000 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 469.5 chr14 49455443 49455705 + 2.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 130806 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 491.5 chr15 57756949 57757279 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 50400 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 595.25 chr10 61324628 61325344 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -127653 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 369.75-13 chr2 157470415 157470695 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -26466 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 386.25-6 chr15 36391114 36391324 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -188407 NM_001321758 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 543.5-3 chr9 70266161 70266457 + 2.25 NA intron (NM_015110, intron 2 of 24) MIR3|SINE|MIR 7331 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 465.75-4 chr15 62053126 62053645 + 2.25 NA intron (NM_001018088, intron 1 of 81) intron (NM_001018088, intron 1 of 81) 7062 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 400.25-7 chr7 48228783 48229027 + 2.25 NA intron (NM_152701, intron 6 of 61) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 57447 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 292-44 chr8 43446531 43446698 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 154172 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 465-2 chr12 41912352 41912692 + 2.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 148333 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 319-36 chr6 159745932 159746182 + 2.25 NA intron (NM_152857, intron 5 of 5) intron (NM_152857, intron 5 of 5) -15988 NM_005891 39 Hs.571037 NM_005891 ENSG00000120437 ACAT2 - acetyl-CoA acetyltransferase 2 protein-coding 532.5-2 chr8 107827291 107827603 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 254492 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 250.5-35 chr15 85627176 85627475 + 2.25 NA intron (NM_001270546, intron 1 of 28) intron (NM_001270546, intron 1 of 28) 7375 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 521.5-2 chr5 36958274 36958689 + 2.25 NA intron (NM_015384, intron 4 of 45) intron (NM_015384, intron 4 of 45) 81712 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 569 chr1 97497103 97497499 + 2.25 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) intron (NM_000110, intron 13 of 22) -299620 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 442.75-3 chr11 81516679 81517038 + 2.25 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 373978 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 482-2 chr2 124936421 124936834 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 911340 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 627.75 chr12 31399779 31400261 + 2.25 NA intron (NM_144973, intron 15 of 20) intron (NM_144973, intron 15 of 20) -30719 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 555.75 chr17 72822243 72822738 + 2.25 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) MER115|DNA|hAT-Tip100 -182018 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 450.75-5 chr6 57167404 57168112 + 2.25 NA intron (NM_015555, intron 13 of 13) intron (NM_015555, intron 13 of 13) 4455 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 616.25-2 chr6 48607591 48607890 + 2.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -539051 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 216.75-85 chr9 112138771 112138883 + 2.25 NA intron (NM_022486, intron 5 of 16) L1ME4a|LINE|L1 36470 NM_001282643 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 437.25-2 chr2 100747688 100747928 + 2.25 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -72331 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 449.25-4 chr3 190951415 190951770 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 73662 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 376.25-7 chr14 88642144 88642404 + 2.25 NA intron (NM_183387, intron 30 of 42) intron (NM_183387, intron 30 of 42) 47854 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 460.25-2 chr18 13521991 13522353 + 2.25 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 62225 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 366.75-3 chr11 39386794 39386973 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 738025 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 235.5-30 chr14 28719905 28720116 + 2.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 45309 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 239.5-42 chr2 39012461 39012635 + 2.25 NA intron (NM_005633, intron 13 of 22) L1ME3G|LINE|L1 -52204 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 404 chr10 50551092 50551438 + 2.25 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) L1MC3|LINE|L1 72691 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 360.75-6 chr20 54611904 54612200 + 2.25 NA intron (NM_018431, intron 6 of 7) MER58B|DNA|hAT-Charlie 136459 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 370.75-9 chr5 5654565 5655102 + 2.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 232156 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 751 chr7 8253561 8254179 + 2.25 NA intron (NM_001350826, intron 1 of 14) intron (NM_001350826, intron 1 of 14) 8182 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 359.5-13 chr9 38133728 38134004 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -64639 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 636 chr6 66346250 66346969 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 558730 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 286-35 chr8 81504782 81504981 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -21648 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 206.5-38 chr18 53366824 53366989 + 2.25 NA intron (NM_005215, intron 15 of 28) intron (NM_005215, intron 15 of 28) 129805 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 350.25-8 chr11 80965446 80966080 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -202960 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 344-22 chr6 54858051 54858300 + 2.25 NA intron (NM_001010872, intron 1 of 4) intron (NM_001010872, intron 1 of 4) 11404 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 339.75-20 chr2 205116806 205117064 + 2.25 NA intron (NM_205863, intron 6 of 21) MER135|DNA|DNA -565565 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 392.75-12 chrX 79561990 79562300 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -194593 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 289.25-13 chr2 15475011 15475283 + 2.25 NA intron (NR_052013, intron 14 of 50) intron (NR_052013, intron 14 of 50) 86187 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 198.25-66 chr21 32112414 32112613 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -26218 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 280.75-25 chr2 196298785 196298963 + 2.25 NA intron (NM_020760, intron 13 of 28) intron (NM_020760, intron 13 of 28) 38850 NR_110225 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 312-16 chr2 99194973 99195272 + 2.25 NA exon (NM_145212, exon 5 of 6) exon (NM_145212, exon 5 of 6) 13938 NM_145212 51263 Hs.346736 NM_016503 ENSG00000185414 MRPL30 L28MT|L30MT|MRP-L28|MRP-L30|MRPL28|MRPL28M|RPML28 mitochondrial ribosomal protein L30 protein-coding 146.25-59 chr18 8948048 8948173 + 2.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -154589 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 266-40 chr6 62488659 62488872 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -202538 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 451.5-4 chr14 40887741 40887979 + 2.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -66851 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 201.75-27 chr12 108072948 108073080 + 2.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -56274 NM_014653 9671 Hs.143591 NM_014653 ENSG00000075035 WSCD2 - WSC domain containing 2 protein-coding 343-6 chr14 57395002 57395290 + 2.25 NA intron (NM_001011713, intron 2 of 4) intron (NM_001011713, intron 2 of 4) 4560 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 276.75-49 chr7 90675119 90675272 + 2.25 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -34203 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 208.5-139 chr8 84696186 84696345 + 2.25 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -9662 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 383.25-16 chr3 178690079 178690287 + 2.25 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 131333 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 408.75-3 chr18 7587430 7587672 + 2.25 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 20235 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 392.75-3 chr11 26875837 26876142 + 2.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -118123 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 497 chr1 227319951 227320228 + 2.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -1597 NM_001366019 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 288.75-12 chr11 45448784 45448934 + 2.25 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 77462 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 368.5 chr1 45088122 45088456 + 2.25 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 76035 NR_036510 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 404-6 chr6 27851496 27851819 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 12995 NM_003520 8341 Hs.534368 NM_003520 ENSG00000233822 HIST1H2BN H2B/d|H2BFD histone cluster 1 H2B family member n protein-coding 372.25-3 chr12 784548 784746 + 2.25 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) HAL1|LINE|L1 31724 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 572.25 chr5 170928093 170928378 + 2.25 NA intron (NM_022897, intron 12 of 27) L1ME1|LINE|L1 66217 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 324.75-30 chr8 55681941 55682164 + 2.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 91326 NM_001363176 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 342.5-5 chr10 102503676 102503894 + 2.25 NA promoter-TSS (NM_016169) promoter-TSS (NM_016169) -177 NM_016169 51684 Hs.404089 NM_016169 ENSG00000107882 SUFU JBTS32|PRO1280|SUFUH|SUFUXL SUFU negative regulator of hedgehog signaling protein-coding 301.25-19 chr20 55317690 55317866 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -105265 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 316.5-29 chr4 42003375 42003614 + 2.25 NA intron (NM_006345, intron 2 of 17) L1MEd|LINE|L1 12964 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 222.75-64 chr2 184743342 184743491 + 2.25 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 144887 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 585.5 chr4 45625278 45625645 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 498593 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 377.25-15 chr6 103904653 103904892 + 2.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 954774 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 432.75-6 chr3 142356427 142356886 + 2.25 NA intron (NM_019001, intron 31 of 41) intron (NM_019001, intron 31 of 41) 91381 NM_019001 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 326.25-2 chr1 75903010 75903233 + 2.25 NA intron (NM_002440, intron 19 of 19) L1M3f|LINE|L1 29283 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 187.25-20 chr11 80816469 80816592 + 2.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -53727 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 327-22 chr3 171215609 171215800 + 2.25 NA intron (NM_001161563, intron 3 of 31) intron (NM_001161563, intron 3 of 31) -108945 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 325.5-17 chr2 61324318 61324668 + 2.25 NA intron (NM_014709, intron 21 of 79) intron (NM_014709, intron 21 of 79) 92884 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 285.5-54 chr7 54692825 54693097 + 2.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 66250 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 363-16 chr5 114754808 114755051 + 2.25 NA intron (NR_130785, intron 1 of 12) intron (NR_130785, intron 1 of 12) 18484 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 322.25-17 chr5 25354531 25354695 + 2.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 163660 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 335-12 chr3 95352938 95353107 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 330171 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 380.5-10 chr7 29846793 29847012 + 2.25 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 40348 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 410.75-8 chr7 42024225 42024455 + 2.25 NA intron (NM_000168, intron 9 of 14) intron (NM_000168, intron 9 of 14) 212869 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 398.25-7 chr14 68709668 68710035 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -81064 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 338.25 chr1 59136786 59137008 + 2.25 NA intron (NR_027120, intron 1 of 2) intron (NR_027120, intron 1 of 2) 9910 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 290-41 chr5 160784589 160784824 + 2.25 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) intron (NM_001366652, intron 2 of 24) 67505 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 565 chr3 173936812 173937187 + 2.25 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -16203 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 311.25-28 chr8 60696929 60697077 + 2.25 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) 18263 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 299-25 chr3 78636720 78637034 + 2.25 NA intron (NM_002941, intron 22 of 30) intron (NM_002941, intron 22 of 30) 382582 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 446.75-5 chr16 72802129 72802601 + 2.25 NA intron (NM_001164766, intron 6 of 8) intron (NM_001164766, intron 6 of 8) -137395 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 631 chr1 86464058 86464372 + 2.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -4712 NM_001285 1179 Hs.194659 NM_001285 ENSG00000016490 CLCA1 CACC|CACC1|CLCRG1|CaCC-1|GOB5|hCLCA1|hCaCC-1 chloride channel accessory 1 protein-coding 286.5-25 chr14 71563915 71564119 + 2.25 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) AluJr|SINE|Alu -22281 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 301.5-26 chr2 70492515 70492718 + 2.25 NA intron (NM_003236, intron 2 of 5) intron (NM_003236, intron 2 of 5) -10976 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 534-5 chr4 161520099 161520422 + 2.25 NA intron (NM_020116, intron 10 of 15) intron (NM_020116, intron 10 of 15) -502473 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 299-12 chr11 121560233 121560471 + 2.25 NA intron (NM_003105, intron 21 of 47) intron (NM_003105, intron 21 of 47) 108038 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 283.25-20 chr2 59581845 59582021 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 364225 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 350.25-10 chr13 25259120 25259387 + 2.25 NA intron (NM_004685, intron 6 of 13) intron (NM_004685, intron 6 of 13) 28235 NM_004685 9107 Hs.643702 NM_004685 ENSG00000139505 MTMR6 - myotubularin related protein 6 protein-coding 500.25 chr2 183614591 183614870 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 490287 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 489.75-3 chr4 42835531 42835994 + 2.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -57504 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 310.25-11 chr18 61920618 61920841 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -27722 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 223.25-79 chr8 124005537 124005698 + 2.25 NA intron (NR_040044, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 35165 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 387.75-15 chr6 162480124 162480376 + 2.25 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -246882 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 379-5 chr21 21325570 21325844 + 2.25 NA intron (NM_001352592, intron 7 of 18) intron (NM_001352592, intron 7 of 18) 178545 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 290.25-15 chr18 54632609 54632827 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 41559 NM_173629 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 252-38 chr2 185902333 185902508 + 2.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -102269 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 552.25 chr16 22377947 22378383 + 2.25 NA TTS (NR_148970) TTS (NR_148970) 3278 NR_148970 440346 Hs.680205 NR_148970 ENSG00000260790 LOC440346 - uncharacterized LOC440346 ncRNA 408.75-5 chr3 172155176 172155473 + 2.25 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 114793 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 309-43 chr6 141524399 141524590 + 2.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 564305 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 241.75-54 chr3 153635331 153635573 + 2.25 NA intron (NR_146713, intron 3 of 6) intron (NR_146713, intron 3 of 6) 127074 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 404.25-2 chr1 81791440 81791681 + 2.25 NA intron (NM_001366008, intron 4 of 26) intron (NM_001366008, intron 4 of 26) -8816 NM_001366005 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 391.5-13 chr4 97847471 97847831 + 2.25 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) intron (NM_174952, intron 8 of 10) 295825 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 429.25-5 chr22 44770866 44771134 + 2.25 NA intron (NM_181335, intron 1 of 11) LTR8A|LTR|ERV1 18442 NM_181335 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 284-45 chr7 27818516 27818979 + 2.25 NA intron (NM_001362794, intron 15 of 16) MIR|SINE|MIR 78652 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 222-54 chr3 140151839 140152310 + 2.25 NA intron (NM_022131, intron 1 of 16) intron (NM_022131, intron 1 of 16) 216889 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 447-7 chr2 111997480 111997776 + 2.25 NA intron (NM_006343, intron 10 of 18) intron (NM_006343, intron 10 of 18) -57641 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 393-11 chr4 36096843 36097228 + 2.25 NA intron (NR_146894, intron 27 of 32) intron (NR_146894, intron 27 of 32) 146904 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 551 chr16 35432074 35432507 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 48306 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 663.25-2 chr7 37748779 37749266 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 65256 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 409.5-7 chr18 64979325 64979591 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -719403 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 398-7 chr2 212007351 212007609 + 2.25 NA intron (NM_001042599, intron 2 of 26) intron (NM_001042599, intron 2 of 26) 418880 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 273.25-32 chr5 158195126 158195287 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 214567 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 421.5-7 chr15 92221748 92222003 + 2.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -172006 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 468-7 chr9 85121789 85122005 + 2.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 415996 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 405.75-8 chr6 37965536 37965893 + 2.25 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 145987 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 436.5-3 chr12 5279748 5280013 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -36729 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 376.5 chr10 4433266 4433583 + 2.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 26955 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 326-26 chr5 149729277 149729501 + 2.25 NA promoter-TSS (NM_133263) promoter-TSS (NM_133263) -921 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 454-2 chr2 147716512 147716876 + 2.25 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -127823 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 182-36 chr14 79472993 79473082 + 2.25 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 193657 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 572 chr15 88681838 88682422 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 43114 NM_002201 3669 Hs.459265 NM_002201 ENSG00000172183 ISG20 CD25|HEM45 interferon stimulated exonuclease gene 20 protein-coding 418.5-2 chr14 20122762 20122991 + 2.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 5408 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 580.75-3 chr2 210991074 210991593 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 373762 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 424.25-8 chrX 78732544 78732903 + 2.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -14986 NM_001278000 2846 Hs.522701 NM_005296 ENSG00000147145 LPAR4 GPR23|LPA4|P2RY9|P2Y5-LIKE|P2Y9 lysophosphatidic acid receptor 4 protein-coding 317.5-25 chr5 124044567 124044760 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 393857 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 184.5-175 chrX 89078626 89078794 + 2.25 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 331485 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 331.25-21 chr7 90946404 90946646 + 2.25 NA intron (NM_012395, intron 7 of 13) intron (NM_012395, intron 7 of 13) 236709 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 367-19 chr7 49782822 49783039 + 2.25 NA intron (NR_136188, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 7597 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 293-25 chr3 130361714 130362011 + 2.25 NA intron (NM_001278298, intron 1 of 40) L1MC1|LINE|L1 16346 NM_001278298 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 246.25-9 chr11 38624459 38624666 + 2.25 NA intron (NR_120554, intron 3 of 4) intron (NR_120554, intron 3 of 4) 21794 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 540.75 chr2 121331069 121331441 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -46053 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 409.75-5 chr20 52976636 52976979 + 2.25 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 4449 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 288.75-33 chr2 195146246 195146395 + 2.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 415725 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 319.75-9 chr16 7623063 7623341 + 2.25 NA intron (NM_001142333, intron 10 of 14) MER1A|DNA|hAT-Charlie 290357 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 631.5 chr1 41089054 41089449 + 2.25 NA intron (NM_001172222, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 -67496 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 449-5 chr8 141536567 141537038 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -29572 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 443.5-4 chr14 99372823 99373216 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -100822 NM_001282237 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 217.5-74 chr21 30374085 30374242 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 1215 NR_036221 100422891 NR_036221 ENSG00000265007 MIR4327 - microRNA 4327 ncRNA 497-3 chr14 58895275 58895551 + 2.25 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) intron (NR_110547, intron 2 of 5) 67125 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 422.75-4 chr4 116035905 116036244 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -263651 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 431.75-2 chr2 46934042 46934394 + 2.25 NA intron (NM_001288953, intron 2 of 20) MER110A|LTR|ERV1 -7006 NM_020458 57217 Hs.370603 NM_020458 ENSG00000068724 TTC7A GIDID|MINAT|TTC7 tetratricopeptide repeat domain 7A protein-coding 365.25-9 chr4 180022150 180022529 + 2.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 1136810 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 216.5-112 chr8 15575883 15576071 + 2.25 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) intron (NM_001356429, intron 1 of 10) 35714 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 280-7 chr10 797177 797420 + 2.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -107630 NM_014974 22982 Hs.432397 NM_014974 ENSG00000151240 DIP2C KIAA0934 disco interacting protein 2 homolog C protein-coding 356.75-17 chr8 117483820 117484082 + 2.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -36762 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 353-21 chr6 34971155 34971596 + 2.25 NA intron (NM_015245, intron 3 of 23) intron (NM_015245, intron 3 of 23) 82120 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 341.25-15 chr2 66926945 66927167 + 2.25 NA intron (NR_110169, intron 1 of 4) intron (NR_110169, intron 1 of 4) -4566 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 447.5-2 chr14 88733726 88733950 + 2.25 NA intron (NM_183387, intron 7 of 42) L1MC5|LINE|L1 59115 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 270.75-3 chr10 8960955 8961143 + 2.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 63060 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 549.75 chr10 104212722 104213090 + 2.25 NA intron (NM_025145, intron 4 of 37) intron (NM_025145, intron 4 of 37) 5977 NR_030340 693194 NR_030340 ENSG00000208033 MIR609 MIRN609|hsa-mir-609 microRNA 609 ncRNA 238.5-100 chr9 97484560 97484687 + 2.25 NA intron (NM_001302884, intron 14 of 15) intron (NM_001302884, intron 14 of 15) -16557 NM_001166116 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 398.5-19 chr8 121240915 121241209 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -398284 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 264.5-32 chr2 54869430 54869701 + 2.25 NA intron (NM_001039753, intron 14 of 40) intron (NM_001039753, intron 14 of 40) 140707 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 370-10 chr3 55072023 55072418 + 2.25 NA intron (NM_018398, intron 35 of 37) intron (NM_018398, intron 35 of 37) -105118 NM_001304389 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 304.5-2 chr1 147263966 147264266 + 2.25 NA intron (NM_001348461, intron 5 of 20) intron (NM_001348461, intron 5 of 20) 20974 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 331.5-6 chr12 11895435 11895704 + 2.25 NA TTS (NM_001987) TTS (NM_001987) -154292 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 503.25-2 chr4 137686146 137686428 + 2.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 140556 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 251.25-46 chr6 75342887 75343013 + 2.25 NA intron (NM_001300866, intron 4 of 6) intron (NM_001300866, intron 4 of 6) -40236 NR_125859 101928540 Hs.526972 NR_125859 LOC101928540 - uncharacterized LOC101928540 ncRNA 219-39 chr15 62586527 62586685 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 58575 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 329.25-21 chr4 45235509 45235721 + 2.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -508981 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 461.5-4 chr17 27864897 27865191 + 2.25 NA Intergenic MER85|DNA|PiggyBac 28321 NM_001076680 201229 Hs.687951 NM_001076680 ENSG00000232859 LYRM9 C17orf108|HSD24 LYR motif containing 9 protein-coding 428.75-6 chr4 168074223 168074649 + 2.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18101 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 333.75-23 chr6 45402228 45402506 + 2.25 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) intron (NM_001015051, intron 2 of 7) -19908 NM_001369405 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 346.5-15 chr2 155797404 155797690 + 2.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 457384 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 266.5-38 chr2 157715545 157715680 + 2.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -86748 NM_001111033 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 289-48 chr8 119515448 119515668 + 2.25 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 77450 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 313-13 chr2 57034218 57034420 + 2.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -848549 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 329.25-6 chr12 45112135 45112361 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -46837 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 330.5-21 chr22 26854170 26854339 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5957 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 327.25-9 chr20 18557948 18558223 + 2.25 NA intron (NM_032986, intron 19 of 19) L1MD1|LINE|L1 -9335 NM_001348958 388789 Hs.349092 NM_001348957 ENSG00000232388 SMIM26 LINC00493 small integral membrane protein 26 protein-coding 291.75-17 chr16 73723608 73723872 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 336935 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 227-53 chr5 84558897 84559088 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -174112 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 457-4 chr3 46528812 46529315 + 2.25 NA intron (NM_024512, intron 6 of 8) AluJr|SINE|Alu -28335 NR_073385 83598 Hs.570630 NR_073385 ENSG00000268324 LRRC2-AS1 LUZP3|LUZP3P|LUZPP1 LRRC2 antisense RNA 1 ncRNA 389.75-6 chr8 70523574 70523851 + 2.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 52578 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 245.25-18 chr14 43817918 43818036 + 2.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 689306 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 304.75-11 chr15 90469706 90469939 + 2.25 NA intron (NM_003870, intron 18 of 37) intron (NM_003870, intron 18 of 37) -60101 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 174.75-82 chr3 83769259 83769463 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 1100214 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 283.25-27 chr3 73824110 73824359 + 2.25 NA intron (NR_146637, intron 2 of 3) intron (NR_146637, intron 2 of 3) 14990 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 203-46 chr2 26356368 26356578 + 2.25 NA intron (NR_137633, intron 1 of 9) intron (NR_137633, intron 1 of 9) -9684 NM_153835 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 427.25-3 chr2 61111666 61111948 + 2.25 NA intron (NM_001129993, intron 16 of 21) L1ME1|LINE|L1 33168 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 262-43 chr5 30718632 30718799 + 2.25 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -474971 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 262.25-31 chr4 28062580 28062800 + 2.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -756892 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 331-4 chr10 65358824 65359083 + 2.25 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR -212472 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 438.25-4 chr4 178215205 178215551 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -307442 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 463.5 chr14 23856513 23856848 + 2.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -97090 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 343-28 chr6 63680027 63680271 + 2.25 NA exon (NM_015153, exon 2 of 15) exon (NM_015153, exon 2 of 15) 33623 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 471.75-2 chr11 115686687 115687026 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 47906 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 468.25-4 chr7 106902558 106902871 + 2.25 NA intron (NM_001282426, intron 10 of 10) L1ME4a|LINE|L1 37235 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 280-56 chr7 29116832 29117104 + 2.25 NA intron (NM_001371266, intron 5 of 16) intron (NM_001371266, intron 5 of 16) -8065 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 195.75-89 chr4 174776327 174776456 + 2.25 NA intron (NM_006529, intron 2 of 9) intron (NM_006529, intron 2 of 9) 52856 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 419-2 chr14 40384874 40385260 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -569644 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 574.5 chr5 134300447 134300887 + 2.25 NA intron (NM_001300853, intron 11 of 12) intron (NM_001300853, intron 11 of 12) 66407 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 571.25-2 chrX 76712459 76712947 + 2.25 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 206657 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 276.25-49 chrX 76168189 76168395 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -4637 NM_001300888 51260 Hs.370100 NM_016500 ENSG00000102390 PBDC1 CXorf26 polysaccharide biosynthesis domain containing 1 protein-coding 463.5-2 chr18 5515084 5515425 + 2.25 NA intron (NM_001330557, intron 1 of 21) intron (NM_001330557, intron 1 of 21) 25302 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 569-4 chr4 35560053 35560668 + 2.25 NA Intergenic LTR27E|LTR|ERV1 683579 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 249.75-61 chr8 99300540 99300722 + 2.25 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 236099 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 365.75-13 chr6 44692741 44693046 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -141012 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 156.5-199 chr8 131708355 131708461 + 2.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -195685 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 336.25-8 chr16 78847145 78847416 + 2.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) L1MC4a|LINE|L1 747626 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 400.5-10 chr3 43122487 43122801 + 2.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -16565 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 299.5-49 chr9 27907181 27907358 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -333403 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 286.5-33 chr2 5713653 5713832 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 21358 NM_003108 6664 Hs.432638 NM_003108 ENSG00000176887 SOX11 MRD27 SRY-box transcription factor 11 protein-coding 334.25-9 chr15 61955516 61955766 + 2.25 NA intron (NM_001018088, intron 37 of 81) intron (NM_001018088, intron 37 of 81) 104806 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 504.25 chr20 49775238 49775506 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -37341 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 434.75-3 chr14 26501704 26501984 + 2.25 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 51586 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 273.75-11 chr14 65377591 65377875 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -32859 NM_004480 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 226.5-12 chr10 99682215 99682410 + 2.25 NA intron (NM_001349962, intron 6 of 13) intron (NM_001349962, intron 6 of 13) 22683 NM_001349963 57089 Hs.28326 NM_020354 ENSG00000198018 ENTPD7 LALP1 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 protein-coding 378-18 chr7 5692464 5692679 + 2.25 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) intron (NM_207111, intron 13 of 16) -12110 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 420-5 chr17 31716973 31717186 + 2.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 141668 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 417.75-6 chrX 96461780 96462019 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -123997 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 426.25-7 chr5 89541161 89541367 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 475456 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 373.25-9 chr2 194645053 194645299 + 2.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -85419 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 183-66 chr3 72517275 72517435 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -70732 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 253.75-63 chr8 88727263 88727487 + 2.25 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -399892 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 386.75-10 chr8 29754215 29754531 + 2.25 NA intron (NR_125815, intron 1 of 3) intron (NR_125815, intron 1 of 3) 6064 NR_125815 101929450 Hs.512440 NR_125814 ENSG00000253490 LINC02099 - long intergenic non-protein coding RNA 2099 ncRNA 270.75-45 chr6 49630424 49630566 + 2.25 NA intron (NM_000324, intron 1 of 9) intron (NM_000324, intron 1 of 9) 6379 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 329.75-13 chr4 31952223 31952424 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -45056 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 303-14 chr18 2806172 2806331 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -40755 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 426.75-7 chr4 87095838 87096182 + 2.25 NA intron (NM_005935, intron 7 of 19) intron (NM_005935, intron 7 of 19) 89009 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 224.25-10 chr1 226684105 226684307 + 2.25 NA intron (NM_002221, intron 2 of 7) intron (NM_002221, intron 2 of 7) -9138 NR_103784 100506443 Hs.664293 NR_103784 ITPKB-IT1 - ITPKB intronic transcript 1 ncRNA 473.25-6 chr2 154625638 154625951 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -72787 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 397.5-7 chr22 26875680 26875958 + 2.25 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1MEg2|LINE|L1 15608 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 510-2 chr7 46359104 46359408 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 337866 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 351-9 chr15 91253229 91253517 + 2.25 NA intron (NM_001323036, intron 3 of 11) intron (NM_001323036, intron 3 of 11) 151577 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 451.5-2 chr1 105572829 105573214 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 45914 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 405.25-2 chr1 186808563 186808913 + 2.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -20162 NM_024420 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 545.75 chr19 31252431 31253099 + 2.25 NA intron (NR_138036, intron 1 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 85255 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 244.25-36 chr4 11764843 11765051 + 2.25 NA intron (NR_146995, intron 1 of 3) L1MA10|LINE|L1 4521 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 441.25-2 chr11 101169151 101169501 + 2.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -39513 NM_000926 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 511-2 chr3 187475091 187475419 + 2.25 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 28209 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 439.5-11 chr3 30552676 30552994 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 33967 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 475 chr1 80098100 80098374 + 2.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -437518 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 601.75 chr4 145406445 145407014 + 2.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -66310 NR_147156 105377466 Hs.405641 NR_147156 ENSG00000272727 LINC02266 - long intergenic non-protein coding RNA 2266 ncRNA 326-10 chr15 66449146 66449357 + 2.25 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) L1ME1|LINE|L1 47783 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 270.25-46 chr7 56165322 56165606 + 2.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -49047 NM_001145712 389493 Hs.177948 NM_001145712 ENSG00000185290 NUPR2 NUPR1L nuclear protein 2, transcriptional regulator protein-coding 252-46 chr3 124394365 124394542 + 2.25 NA intron (NM_001024660, intron 11 of 59) intron (NM_001024660, intron 11 of 59) 20121 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 382.25-10 chr16 63472028 63472281 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -1435716 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 291.25-9 chr15 25934965 25935152 + 2.25 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) intron (NR_040082, intron 1 of 4) 32698 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 577.75-2 chr9 28668835 28669296 + 2.25 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 50240 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 466-2 chr15 67238468 67238805 + 2.25 NA intron (NM_001271885, intron 1 of 9) intron (NM_001271885, intron 1 of 9) 16025 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 314.25-8 chr14 75674782 75674929 + 2.25 NA intron (NM_015072, intron 3 of 31) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 13609 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 401.25-9 chr21 35292722 35293051 + 2.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -243588 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 438-8 chr8 121502010 121502447 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -137118 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 623.5 chr17 58874567 58875127 + 2.25 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 118978 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 443.75-5 chr8 11848149 11848542 + 2.25 NA intron (NM_001317237, intron 5 of 9) intron (NM_001317237, intron 5 of 9) 19742 NM_147780 1508 Hs.520898 NM_001908 ENSG00000164733 CTSB APPS|CPSB|RECEUP cathepsin B protein-coding 259.25-43 chr7 98560040 98560289 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -57121 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 339-24 chr5 24222900 24223159 + 2.25 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 271681 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 425-2 chr1 198236780 198237045 + 2.25 NA intron (NM_133494, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 79914 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 249.25-8 chr13 88025737 88025904 + 2.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -117047 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 312.75-21 chr21 37966097 37966264 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -49723 NM_002240 3763 Hs.626242 NM_002240 ENSG00000157542 KCNJ6 BIR1|GIRK-2|GIRK2|KATP-2|KATP2|KCNJ7|KIR3.2|KPLBS|hiGIRK2 potassium voltage-gated channel subfamily J member 6 protein-coding 484.5-3 chr13 33594132 33594410 + 2.25 NA intron (NM_001243476, intron 3 of 17) intron (NM_001243476, intron 3 of 17) 82523 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 328.5-31 chr7 109506701 109506960 + 2.25 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 453383 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 343.25-4 chr12 28255697 28255962 + 2.25 NA intron (NM_001352079, intron 3 of 14) intron (NM_001352079, intron 3 of 14) -65091 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 684.75 chr8 112034493 112035224 + 2.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -608635 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 412.25-5 chr13 108115331 108115836 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 99199 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 231.75-5 chr1 150801470 150801716 + 2.25 NA intron (NM_000396, intron 5 of 7) AluY|SINE|Alu 6667 NM_000396 1513 Hs.632466 NM_000396 ENSG00000143387 CTSK CTS02|CTSO|CTSO1|CTSO2|PKND|PYCD cathepsin K protein-coding 291.75-41 chr8 118296633 118296847 + 2.25 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -184921 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 419.5 chr2 18767814 18768055 + 2.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -178354 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 832.5 chr14 62338737 62339614 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -199202 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 302.75-12 chr18 33720956 33721098 + 2.25 NA intron (NM_030632, intron 8 of 11) intron (NM_030632, intron 8 of 11) 142808 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 297.75-27 chr3 131481144 131481391 + 2.25 NA intron (NM_007208, intron 6 of 9) intron (NM_007208, intron 6 of 9) -2034 NR_002985 677836 Hs.735762 NR_002985 SNORA58 ACA58|SNORA58B small nucleolar RNA, H/ACA box 58 snoRNA 393.75-7 chr2 19076794 19077123 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -49987 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 429.5 chr1 231879001 231879341 + 2.25 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -46663 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 398.5-21 chrX 39205696 39205964 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 121532 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 527.75 chr10 100761645 100762120 + 2.25 NA intron (NM_003988, intron 3 of 10) intron (NM_003988, intron 3 of 10) 16171 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 331.75-20 chr5 126137599 126137890 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -41833 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 351.75-14 chr21 30517277 30517560 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -15277 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 509.5 chr19 31063817 31064147 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -103528 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 277.25-25 chr20 46436610 46436854 + 2.25 NA intron (NR_146919, intron 3 of 3) MamGypLTR3|LTR|Gypsy 20911 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 309.75-6 chr10 88498569 88498832 + 2.25 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) L1MC4|LINE|L1 84618 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 242.25-39 chr17 72610607 72610731 + 2.25 NA intron (NR_033876, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -17865 NR_152516 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 549.5 chr1 52216220 52216553 + 2.25 NA 5' UTR (NM_004799, exon 2 of 19) 5' UTR (NM_004799, exon 2 of 19) 74292 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 354-25 chr5 101950769 101951128 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 345336 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 357-12 chr20 34462390 34462599 + 2.25 NA intron (NM_001257137, intron 15 of 25) intron (NM_001257137, intron 15 of 25) -3831 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 526.5 chr4 43782787 43783239 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -233848 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 235.25-55 chr6 100855626 100855758 + 2.25 NA TTS (NM_022091) TTS (NM_022091) 25637 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 438-7 chr8 120491315 120491615 + 2.25 NA intron (NM_022045, intron 13 of 21) intron (NM_022045, intron 13 of 21) 46046 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 553.75 chr14 43210642 43211144 + 2.25 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 1296390 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 476.5 chr14 57131005 57131269 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 137768 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 182.25-44 chr15 67650353 67650508 + 2.25 NA intron (NM_001206804, intron 11 of 21) L1MB7|LINE|L1 101336 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 310.25-24 chr8 78738763 78738985 + 2.25 NA intron (NM_001199887, intron 3 of 4) intron (NM_001199887, intron 3 of 4) -14500 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 493.5 chr1 60180665 60181023 + 2.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -107074 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 324.5-25 chr4 47929514 47929738 + 2.25 NA intron (NR_125879, intron 1 of 2) L2-3_Crp|LINE|L2 -14959 NR_103795 152518 Hs.646325 NM_152995 ENSG00000170448 NFXL1 CDZFP|HOZFP|OZFP|URCC5 nuclear transcription factor, X-box binding like 1 protein-coding 389.25-4 chr18 12698827 12699305 + 2.25 NA non-coding (NR_073537, exon 4 of 13) non-coding (NR_073537, exon 4 of 13) 3657 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 354-29 chr8 140474056 140474296 + 2.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15597 NM_031466 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 333.25-14 chr3 181675399 181675642 + 2.25 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 -36405 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 348-12 chr17 60239538 60239701 + 2.25 NA intron (NM_032582, intron 11 of 33) L1MB5|LINE|L1 -7974 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 332.25-18 chr2 154569672 154569893 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -112344 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 376.5-11 chr21 26918053 26918516 + 2.25 NA 3' UTR (NM_007038, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_007038, exon 8 of 8) -35677 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 385.5-12 chr2 52945997 52946324 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -243545 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 333.75-24 chr6 104580672 104581000 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 278710 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 503.25-3 chr6 63114517 63115048 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 205195 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 410.25-9 chr3 85819474 85819837 + 2.25 NA intron (NR_046752, intron 1 of 3) intron (NR_046752, intron 1 of 3) 8395 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 400.75-5 chr21 21332258 21332579 + 2.25 NA intron (NM_001352592, intron 7 of 18) L1MEc|LINE|L1 185256 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 195.25-41 chr17 39164469 39164625 + 2.25 NA intron (NM_001143968, intron 2 of 5) intron (NM_001143968, intron 2 of 5) 1614 NM_001143968 390790 Hs.568007 NM_001143968 ENSG00000141748 ARL5C ARL12 ADP ribosylation factor like GTPase 5C protein-coding 155-115 chr5 165025549 165025647 + 2.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 555319 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 410-8 chr20 57103015 57103585 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -110396 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 254-13 chr11 112044081 112044276 + 2.25 NA intron (NM_001931, intron 8 of 13) intron (NM_001931, intron 8 of 13) 19364 NM_001931 1737 Hs.335551 NM_001931 ENSG00000150768 DLAT DLTA|E2|PDC-E2|PDCE2 dihydrolipoamide S-acetyltransferase protein-coding 250.5-12 chr11 43382660 43382809 + 2.25 NA intron (NM_001307943, intron 2 of 19) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 23814 NM_018259 55761 Hs.191186 NM_018259 ENSG00000052841 TTC17 - tetratricopeptide repeat domain 17 protein-coding 340 chr1 78464454 78464678 + 2.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -26408 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 286.75-31 chr3 115153063 115153224 + 2.25 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -5855 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 400 chr1 178859888 178860232 + 2.25 NA intron (NM_004673, intron 3 of 5) intron (NM_004673, intron 3 of 5) 11017 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 285.75-20 chr2 86113231 86113372 + 2.25 NA intron (NM_017952, intron 4 of 23) intron (NM_017952, intron 4 of 23) 7066 NM_017952 55037 Hs.323489 NM_017952 ENSG00000132300 PTCD3 MRP-S39 pentatricopeptide repeat domain 3 protein-coding 858.75 chr4_GL000008v2_random 2415 3108 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 175410 NR_046228 100874392 Hs.648245 NR_046228 ANKRD20A12P - ankyrin repeat domain 20 family member A12, pseudogene pseudo 681.25 chr15 90083240 90083697 + 2.25 NA TTS (NM_002168) TTS (NM_002168) -1261 NR_146321 109729181 Hs.655249 NR_146321 ENSG00000259291 ZNF710-AS1 - ZNF710 antisense RNA 1 ncRNA 484-5 chr8 97314776 97315098 + 2.25 NA intron (NR_125390, intron 2 of 2) intron (NR_125390, intron 2 of 2) -37009 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 194-51 chr20 15647514 15647657 + 2.25 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 275729 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 379.75-6 chr2 55024325 55024768 + 2.25 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) -14274 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 290.25-36 chr8 129558522 129558680 + 2.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 16417 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 299.5-7 chr12 7668011 7668275 + 2.25 NA intron (NM_001304566, intron 1 of 5) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -2235 NM_001644 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 554 chr1 211006088 211006422 + 2.25 NA intron (NM_002238, intron 6 of 10) L1ME3|LINE|L1 127119 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 271.5-95 chr9 16154009 16154222 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 98992 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 397-2 chr12 57026344 57026650 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -9968 NM_013251 6866 Hs.9730 NM_013251 ENSG00000166863 TAC3 HH10|NKB|NKNB|PRO1155|ZNEUROK1 tachykinin 3 protein-coding 616.5 chr8 89933641 89934228 + 2.25 NA 3' UTR (NM_002485, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_002485, exon 16 of 16) 31364 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 264.5-33 chr2 68561112 68561309 + 2.25 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) MIRb|SINE|MIR -82378 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 431.5 chr1 111294356 111294646 + 2.25 NA intron (NM_021797, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 3650 NM_001258003 27159 Hs.128814 NM_021797 ENSG00000134216 CHIA AMCASE|CHIT2|TSA1902 chitinase acidic protein-coding 298.75-2 chr1 31260852 31261084 + 2.25 NA intron (NM_004814, intron 9 of 9) intron (NM_004814, intron 9 of 9) -21081 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 180-81 chr3 56598608 56598782 + 2.25 NA intron (NR_148376, intron 10 of 17) L1MA4A|LINE|L1 41520 NM_001141947 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 238.5-77 chr5 162852906 162853079 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -584579 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 403.25-8 chr5 54924370 54924652 + 2.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 61082 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 367.75-7 chr18 78291568 78291812 + 2.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -297963 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 196.25-97 chr5 18029115 18029285 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 221926 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 434.5-7 chr16 77146178 77146638 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -44782 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 510.5-3 chr16 55063642 55064031 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 132637 NM_001252197 10265 Hs.435730 NM_005853 ENSG00000176842 IRX5 HMMS|IRX-2a|IRXB2 iroquois homeobox 5 protein-coding 476.5-3 chr2 222158514 222158895 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -139443 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 388.5-17 chr7 117566788 117567129 + 2.25 NA intron (NM_000492, intron 11 of 26) intron (NM_000492, intron 11 of 26) -2282 NR_149084 111082987 Hs.583149 NR_149084 ENSG00000232661 CFTR-AS1 BGas CFTR antisense RNA 1 ncRNA 392-18 chr7 51774237 51774520 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -381122 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 339-22 chr4 65557351 65557574 + 2.25 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 112026 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 644.5 chr10 94290797 94291346 + 2.25 NA intron (NM_001165979, intron 21 of 31) intron (NM_001165979, intron 21 of 31) -4001 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 590.5 chr9 27859688 27860212 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -286084 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 376.25-3 chr1 176343326 176343495 + 2.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -119765 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 284.5-38 chr3 5569405 5569576 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -319235 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 326.25-23 chr4 48223294 48223498 + 2.25 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) intron (NM_003215, intron 2 of 17) 46442 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 467.25-3 chr18 3518997 3519515 + 2.25 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) intron (NM_001242762, intron 7 of 9) 53006 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 746.75 chr10 57433649 57434123 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -129327 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 497.5-4 chr6 36472684 36472954 + 2.25 NA intron (NM_001286579, intron 2 of 4) intron (NM_001286579, intron 2 of 4) 29819 NM_001286579 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 351.75-6 chr13 102465000 102465326 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -62720 NM_001321946 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 239.75-77 chr8 129948247 129948392 + 2.25 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) intron (NM_001353256, intron 2 of 13) -8508 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 470.5 chr1 33047120 33047469 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -10383 NM_001319143 204 Hs.470907 NM_001625 ENSG00000004455 AK2 ADK2 adenylate kinase 2 protein-coding 285-7 chr11 82292301 82292508 + 2.25 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MA7|LINE|L1 111509 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 234 chr1 35304708 35304823 + 2.25 NA intron (NM_001350140, intron 2 of 27) AluJr|SINE|Alu 36056 NM_005095 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 368.5-14 chr5 124673258 124673559 + 2.25 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) intron (NM_020747, intron 2 of 8) 71704 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 219.25-65 chr6 70502292 70502434 + 2.25 NA intron (NM_020819, intron 10 of 20) intron (NM_020819, intron 10 of 20) -64567 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 467.75-6 chr8 130798020 130798334 + 2.25 NA intron (NM_001115, intron 15 of 17) intron (NM_001115, intron 15 of 17) 242732 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 420-2 chr11 18840320 18840562 + 2.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -47720 NM_001278236 84867 Hs.79092 NM_006906 ENSG00000110786 PTPN5 PTPSTEP|STEP|STEP61 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 5 protein-coding 364.5-10 chr2 11301035 11301416 + 2.25 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 43411 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 561 chr8 79619324 79619844 + 2.25 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 8467 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 504-2 chr14 45203512 45203952 + 2.25 NA 3' UTR (NM_018353, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_018353, exon 17 of 17) 49470 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 416-6 chr14 87340530 87340852 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 314603 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 398.25-4 chr11 107333229 107333440 + 2.25 NA intron (NM_152434, intron 16 of 17) intron (NM_152434, intron 16 of 17) 124512 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 387.75-17 chr8 118247304 118247563 + 2.25 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L1MA7|LINE|L1 -135614 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 229.25-67 chr6 70083555 70083702 + 2.25 NA intron (NM_001858, intron 15 of 50) intron (NM_001858, intron 15 of 50) 199569 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 420.5-14 chr6 110594233 110594509 + 2.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -117758 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 281.5-60 chr9 132445188 132445480 + 2.25 NA intron (NM_001282957, intron 1 of 5) L1MB3|LINE|L1 35123 NM_207417 389799 Hs.201709 NM_207417 ENSG00000188523 CFAP77 C9orf171 cilia and flagella associated protein 77 protein-coding 606.25 chr13 94341581 94342291 + 2.25 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) 137746 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 348.5-26 chrX 74702046 74702239 + 2.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -87518 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 494.5-7 chr8 15307244 15307475 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -68928 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 280.25-9 chr10 95341719 95341963 + 2.25 NA intron (NM_001034955, intron 24 of 30) intron (NM_001034955, intron 24 of 30) -50838 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 532-3 chr3 78121728 78122170 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -72986 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 395 chr1 179048821 179049286 + 2.25 NA intron (NM_001324310, intron 2 of 7) intron (NM_001324310, intron 2 of 7) 22929 NM_001324311 9917 Hs.5737 NM_014864 ENSG00000116199 FAM20B gxk1 FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase protein-coding 515-3 chr5 34559352 34559709 + 2.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -96798 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 299-35 chr8 133662136 133662323 + 2.25 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 21837 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 314-14 chr3 77234461 77234706 + 2.25 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 136571 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 366.5-11 chr4 53455549 53455851 + 2.25 NA intron (NM_001134938, intron 13 of 14) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -44377 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 494.75-2 chr8 110580622 110581042 + 2.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 446601 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 309.25-28 chr8 89331463 89331683 + 2.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 426138 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 494.5-4 chr16 57965301 57965836 + 2.25 NA intron (NM_001297, intron 2 of 32) intron (NM_001297, intron 2 of 32) 5560 NM_001135639 1258 Hs.147062 NM_001297 ENSG00000070729 CNGB1 CNCG2|CNCG3L|CNCG4|CNG4|CNGB1B|GAR1|GARP|GARP2|RCNC2|RCNCb|RCNCbeta|RP45 cyclic nucleotide gated channel beta 1 protein-coding 309.75-13 chr16 53653214 53653460 + 2.25 NA intron (NM_001127897, intron 14 of 24) intron (NM_001127897, intron 14 of 24) 50522 NM_001330538 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 523.75 chr14 43215808 43216146 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 1291306 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 264.75-57 chr8 78077631 78077766 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -438642 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 514.75-2 chr15 56028431 56028875 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -35041 NM_001329212 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 258.5-65 chr6 112157269 112157410 + 2.25 NA intron (NM_001105206, intron 14 of 38) intron (NM_001105206, intron 14 of 38) 69748 NM_001033564 619208 Hs.591340 NM_001033564 ENSG00000203778 FAM229B C6orf225 family with sequence similarity 229 member B protein-coding 243.5-39 chr2 126773672 126773897 + 2.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 117626 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 583.25 chr17 32792062 32792508 + 2.25 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) L1ME4b|LINE|L1 84839 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 417.25-2 chr14 64544514 64544958 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 4268 NM_021979 3306 Hs.432648 NM_021979 ENSG00000126803 HSPA2 HSP70-2|HSP70-3 heat shock protein family A (Hsp70) member 2 protein-coding 291.75-25 chr2 144698971 144699142 + 2.25 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 31089 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 317.75-27 chr8 87808737 87809056 + 2.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 65119 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 532.75-2 chr8 139256916 139257348 + 2.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -343091 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 527.25-2 chr3 53558972 53559283 + 2.25 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) L1MEf|LINE|L1 64516 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 376.25-10 chr2 63102128 63102324 + 2.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 17316 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 639 chr1 57737767 57738297 + 2.25 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -122549 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 474-2 chr5 92202329 92202550 + 2.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -819122 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 262.5-46 chr3 53055209 53055331 + 2.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9197 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 424.5-6 chr3 31077629 31077944 + 2.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 84001 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 272.5-77 chr9 40927459 40927684 + 2.25 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 1521 NR_031629 100302167 NR_031629 ENSG00000275377 MIR1299 MIRN1299|hsa-mir-1299 microRNA 1299 ncRNA 373.5-19 chr7 11202283 11202570 + 2.25 NA Intergenic Intergenic 228554 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 277.25-8 chr11 73261960 73262112 + 2.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -2469 NM_176797 5031 Hs.16362 NM_004154 ENSG00000171631 P2RY6 P2Y6 pyrimidinergic receptor P2Y6 protein-coding 364.25-20 chr3 8422855 8423212 + 2.25 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 78625 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 220.25-68 chr6 78987791 78988010 + 2.25 NA intron (NM_017934, intron 21 of 39) MIRb|SINE|MIR 90354 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 261.75-21 chr2 50274595 50274785 + 2.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 73064 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 397-11 chr4 66124772 66125124 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -151876 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 398.25-2 chr1 164409735 164409946 + 2.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -149520 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 340.5-34 chr8 84049416 84049706 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -133226 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 536.5-2 chr17 60829524 60829992 + 2.25 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 151907 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 252-55 chr5 117950659 117950865 + 2.25 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 220401 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 421.25-9 chr2 113120542 113120889 + 2.25 NA intron (NM_173841, intron 2 of 5) intron (NM_173841, intron 2 of 5) 2744 NM_001318914 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 583.5 chr7 49859293 49859648 + 2.25 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) L1ME3E|LINE|L1 84137 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 392.25-14 chr6 150069688 150069990 + 2.25 NA promoter-TSS (NM_024518) promoter-TSS (NM_024518) -718 NM_024518 79465 Hs.15422 NM_024518 ENSG00000131019 ULBP3 N2DL-3|NKG2DL3|RAET1N UL16 binding protein 3 protein-coding 319.5-29 chr20 60904200 60904434 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -174747 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 517.5-2 chr18 67010638 67011031 + 2.25 NA Intergenic Intergenic -70750 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 456-4 chr7 47647653 47647956 + 2 NA Intergenic Intergenic -7440 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 372.75-3 chr10 32431598 32432010 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 14252 NR_120660 101929431 Hs.639819 NR_120660 LOC101929431 - uncharacterized LOC101929431 ncRNA 195-43 chr2 39211487 39211601 + 2 NA intron (NM_001009565, intron 3 of 7) L1MC5a|LINE|L1 18044 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 512 chr12 127794203 127794652 + 2 NA Intergenic Intergenic -87190 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 394-6 chr2 109301898 109302117 + 2 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 11618 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 440-12 chr6 70293021 70293281 + 2 NA intron (NM_001851, intron 5 of 37) intron (NM_001851, intron 5 of 37) 9933 NM_001851 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 430.75-8 chr2 204070763 204071138 + 2 NA Intergenic Intergenic 134202 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 352-14 chr8 78261664 78261985 + 2 NA Intergenic Intergenic -254516 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 336.75-7 chr14 57559942 57560136 + 2 NA Intergenic Intergenic -66182 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 319-17 chr2 109193309 109193573 + 2 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 -51853 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 344.75-18 chr8 120419600 120419893 + 2 NA intron (NM_014078, intron 5 of 6) intron (NM_014078, intron 5 of 6) 25404 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 341-20 chr3 194479434 194479644 + 2 NA intron (NM_001367549, intron 2 of 33) intron (NM_001367549, intron 2 of 33) 7463 NM_001367549 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 393.75-4 chr15 64705219 64705571 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2114 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 381 chr1 150092313 150092792 + 2 NA intron (NR_103998, intron 10 of 13) intron (NR_103998, intron 10 of 13) 24776 NM_001279354 11311 Hs.443750 NM_007259 ENSG00000136631 VPS45 H1|H1VPS45|SCN5|VPS45A|VPS45B|VPS54A|VSP45|VSP45A vacuolar protein sorting 45 homolog protein-coding 305-14 chr17 65059350 65059688 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -2779 NM_006572 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 240.75-14 chr11 59583294 59583581 + 2 NA intron (NM_002556, intron 9 of 13) intron (NM_002556, intron 9 of 13) 11721 NR_036120 100422880 NR_036120 ENSG00000264559 MIR3162 mir-3162 microRNA 3162 ncRNA 237-59 chr6 152366471 152366695 + 2 NA intron (NM_182961, intron 62 of 145) intron (NM_182961, intron 62 of 145) -13947 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 252.25-30 chr2 75595374 75595559 + 2 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -25747 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 457.25-3 chr3 193930128 193930664 + 2 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 63842 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 358.5-10 chr17 61271643 61271915 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1MB2|LINE|L1 95925 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 307-19 chr2 178632914 178633164 + 2 NA exon (NM_133432, exon 63 of 192) exon (NM_133432, exon 63 of 192) 109848 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 408.5-12 chr9 128690723 128691204 + 2 NA intron (NM_001248001, intron 1 of 7) intron (NM_001248001, intron 1 of 7) 988 NM_001248001 6418 Hs.436687 NM_003011 ENSG00000119335 SET 2PP2A|I2PP2A|IGAAD|IPP2A2|MRD58|PHAPII|TAF-I|TAF-IBETA SET nuclear proto-oncogene protein-coding 330.75-20 chr5 42510289 42510703 + 2 NA intron (NM_001242401, intron 2 of 10) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -37547 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 352.5-26 chr6 43174405 43174653 + 2 NA intron (NM_001292001, intron 2 of 6) intron (NM_001292001, intron 2 of 6) 2133 NM_001292001 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 220-3 chr1 82971358 82971505 + 2 NA intron (NR_147074, intron 2 of 10) intron (NR_147074, intron 2 of 10) 13491 NR_110632 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 348-15 chr4 77610132 77610525 + 2 NA intron (NM_006419, intron 3 of 4) intron (NM_006419, intron 3 of 4) 98575 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 287-36 chr7 68888519 68888826 + 2 NA Intergenic Intergenic 708952 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 236.75-40 chr4 107607597 107607744 + 2 NA Intergenic Intergenic 112564 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 348.5-8 chr22 42056556 42056943 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 14063 NM_000262 4668 Hs.75372 NM_000262 ENSG00000198951 NAGA D22S674|GALB alpha-N-acetylgalactosaminidase protein-coding 297.25-8 chr15 75469390 75469572 + 2 NA intron (NM_002833, intron 12 of 12) intron (NM_002833, intron 12 of 12) -13666 NM_001145357 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 317.5-3 chr10 68136631 68136932 + 2 NA intron (NM_001256268, intron 6 of 23) intron (NM_001256268, intron 6 of 23) 27293 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 480-4 chr4 186650429 186650712 + 2 NA intron (NM_005245, intron 3 of 26) intron (NM_005245, intron 3 of 26) 73286 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 484.5-2 chr10 57659215 57659731 + 2 NA Intergenic Intergenic -354914 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 391-12 chr22 28326137 28326462 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME1|LINE|L1 -133570 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 563-3 chr8 121896399 121896858 + 2 NA Intergenic Intergenic -255188 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 387-11 chr4 172775311 172775596 + 2 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) -48575 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 264.75-11 chr12 70669157 70669354 + 2 NA intron (NM_130846, intron 6 of 9) intron (NM_130846, intron 6 of 9) -31826 NM_001330204 5787 Hs.201030 NM_002837 ENSG00000127329 PTPRB HPTP-BETA|HPTPB|PTPB|R-PTP-BETA|VEPTP protein tyrosine phosphatase receptor type B protein-coding 292.25-30 chr4 39972490 39972638 + 2 NA intron (NM_001100399, intron 2 of 32) AluJo|SINE|Alu 5347 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 350-7 chr2 72789061 72789254 + 2 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 36876 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 127-41 chr12 20309563 20309632 + 2 NA Intergenic Intergenic -59648 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 298-34 chr9 35731130 35731350 + 2 NA intron (NM_006289, intron 1 of 56) intron (NM_006289, intron 1 of 56) 955 NM_006289 7094 Hs.471014 NM_006289 ENSG00000137076 TLN1 ILWEQ|TLN|talin-1 talin 1 protein-coding 141-102 chr3 72897238 72897369 + 2 NA intron (NM_001080393, intron 1 of 6) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 9257 NR_138564 727936 Hs.710275 NM_001080393 ENSG00000172986 GXYLT2 GLT8D4 glucoside xylosyltransferase 2 protein-coding 450-4 chr12 45891302 45891688 + 2 NA intron (NM_152641, intron 16 of 20) intron (NM_152641, intron 16 of 20) 99079 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 333.75-7 chr14 83250480 83250713 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 607964 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 305-18 chr2 118522255 118522555 + 2 NA Intergenic Intergenic 80561 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 359.25-11 chr6 38496287 38496594 + 2 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) AluJo|SINE|Alu 14844 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 175.25-8 chr1 184270900 184271139 + 2 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -116010 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 144.5-110 chr2 132464969 132465125 + 2 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 31336 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 307-31 chr6 67565088 67565348 + 2 NA Intergenic Intergenic -490133 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 430.5-11 chr8 141503428 141503742 + 2 NA intron (NR_160399, intron 1 of 29) MER65A|LTR|ERV1 3644 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 383.25-19 chr5 51613669 51613929 + 2 NA Intergenic Intergenic 230351 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 335.75-19 chr7 50971174 50971534 + 2 NA Intergenic Intergenic -177901 NM_001371008 241-36 chr4 99471085 99471282 + 2 NA Intergenic Intergenic -35673 NM_000673 131 Hs.389 NM_000673 ENSG00000196344 ADH7 ADH4 alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide protein-coding 407-5 chr12 115791935 115792383 + 2 NA Intergenic Intergenic 356495 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 359.75-14 chr21 27371107 27371432 + 2 NA Intergenic Intergenic -351110 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 375.5-13 chr2 68675329 68675699 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 31926 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 344-26 chr8 33203280 33203618 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 269697 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 544-2 chr22 19538715 19539295 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -13668 NM_001130861 7122 Hs.505337 NM_003277 ENSG00000184113 CLDN5 AWAL|BEC1|CPETRL1|TMDVCF|TMVCF claudin 5 protein-coding 465-7 chr9 136750513 136750834 + 2 NA TTS (NR_033913) TTS (NR_033913) -2148 NM_198946 158062 Hs.522504 NM_198946 ENSG00000267206 LCN6 LCN5|UNQ643|hLcn5 lipocalin 6 protein-coding 392-11 chr4 31349996 31350349 + 2 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -156372 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 373.5-4 chr12 113883172 113883424 + 2 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) intron (NM_001146698, intron 21 of 24) 83027 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 195.25-17 chr10 55979554 55979686 + 2 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 -351678 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 329-35 chr6 64644864 64645147 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -656413 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 256.5-3 chr1 48394145 48394353 + 2 NA intron (NM_019073, intron 8 of 12) intron (NM_019073, intron 8 of 12) 77955 NM_019073 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 439-2 chr10 93783598 93783915 + 2 NA intron (NM_005097, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu 25820 NM_005097 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 372-7 chr14 50632103 50632426 + 2 NA exon (NM_001127713, exon 14 of 14) exon (NM_001127713, exon 14 of 14) 36042 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 272-15 chr2 116213011 116213196 + 2 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 869288 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 388 chr1 36057444 36057785 + 2 NA 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) -26480 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 265.25-11 chr13 80388315 80388607 + 2 NA Intergenic Intergenic -47335 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 295.5-60 chr8 22109011 22109300 + 2 NA exon (NM_024815, exon 1 of 3) exon (NM_024815, exon 1 of 3) 264 NM_024815 79873 Hs.527101 NM_024815 ENSG00000275074 NUDT18 MTH3 nudix hydrolase 18 protein-coding 258.25-25 chr17 60095453 60095640 + 2 NA Intergenic Intergenic -7079 NR_030732 645638 Hs.463652 NR_030732 ENSG00000261040 WFDC21P LNCDC|linc-DC|lnc-DC WAP four-disulfide core domain 21, pseudogene pseudo 305-19 chr2 171060133 171060465 + 2 NA intron (NM_001136555, intron 2 of 18) intron (NM_001136555, intron 2 of 18) 6674 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 385.75-15 chr6 64234760 64235181 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) AluSx1|SINE|Alu 428134 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 356-9 chr6 134090677 134090902 + 2 NA Intergenic Intergenic 26891 NR_037938 387065 Hs.571061 NR_037938 HMGA1P7 HMGA1L7 high mobility group AT-hook 1 pseudogene 7 pseudo 190.5-137 chr6 121901429 121901541 + 2 NA Intergenic Intergenic 465839 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 313.5-43 chrX 91304629 91304906 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -130072 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 337-12 chr18 4710004 4710194 + 2 NA Intergenic Intergenic -254792 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 315.25-16 chr2 134954579 134954763 + 2 NA non-coding (NR_037649, exon 11 of 11) non-coding (NR_037649, exon 11 of 11) 35849 NM_001320748 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 392.5-4 chr15 70543584 70543798 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -37763 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 336.5-12 chr17 35608325 35608620 + 2 NA intron (NM_001030006, intron 5 of 21) intron (NM_001030006, intron 5 of 21) 21150 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 264.5-14 chr11 23143512 23143655 + 2 NA Intergenic Intergenic 275607 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 270-10 chr11 98428661 98429002 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -592118 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 353-3 chr11 79450218 79450428 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -9293 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 264.75-47 chr6 132391610 132391840 + 2 NA intron (NM_015529, intron 1 of 11) intron (NM_015529, intron 1 of 11) 9750 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 468 chr1 215681611 215681989 + 2 NA intron (NM_206933, intron 61 of 71) intron (NM_206933, intron 61 of 71) 114496 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 261.25-6 chr12 41459265 41459518 + 2 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 21652 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 215-78 chr8 136674629 136674833 + 2 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 143933 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 332.5-3 chr10 18585318 18585645 + 2 NA intron (NM_182543, intron 8 of 10) L1MA7|LINE|L1 66106 NM_001351117 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 235.5-84 chr8 64608709 64608897 + 2 NA intron (NM_004820, intron 4 of 5) intron (NM_004820, intron 4 of 5) -26911 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 241-5 chr10 54607074 54607307 + 2 NA TTS (NR_031642) TTS (NR_031642) 767 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 496-4 chr8 116931213 116931655 + 2 NA Intergenic Intergenic -6773 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 309-35 chr4 86717979 86718218 + 2 NA intron (NM_080685, intron 9 of 47) intron (NM_080685, intron 9 of 47) 123783 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 368.5-3 chr10 60209974 60210467 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 10 of 43) L2a|LINE|L2 -69204 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 546.75-2 chr8 139636585 139637058 + 2 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 66302 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 508.25 chr17 70143686 70144069 + 2 NA Intergenic Intergenic 25525 NR_036534 400617 Hs.225661 NR_036534 ENSG00000267365 KCNJ2-AS1 - KCNJ2 antisense RNA 1 ncRNA 477.5 chr10 54079948 54080345 + 2 NA intron (NM_001142765, intron 14 of 31) intron (NM_001142765, intron 14 of 31) -406084 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 433-7 chr18 64936190 64936547 + 2 NA Intergenic Intergenic -676313 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 559-3 chr2 69351057 69351480 + 2 NA intron (NM_002056, intron 8 of 18) intron (NM_002056, intron 8 of 18) 35959 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 326.25-26 chr5 61419181 61419504 + 2 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 87084 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 351.25 chr1 35963642 35964025 + 2 NA intron (NM_177422, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 32728 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 177-100 chr9 29200404 29200522 + 2 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 11836 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 334.75-25 chr8 83807357 83807675 + 2 NA Intergenic Intergenic -375271 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 283-16 chr15 85943681 85943926 + 2 NA Intergenic Intergenic 118168 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 258-25 chr2 134238291 134238503 + 2 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -15675 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 450.25-3 chr19 36981553 36981924 + 2 NA intron (NM_001204839, intron 6 of 8) AluJo|SINE|Alu 65406 NM_001204836 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 376 chr1 244581118 244581426 + 2 NA intron (NM_001130957, intron 11 of 21) L1ME3B|LINE|L1 -71776 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 432.5-5 chr2 105085162 105085555 + 2 NA intron (NM_182640, intron 5 of 10) intron (NM_182640, intron 5 of 10) 17586 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 317.75-7 chr11 26821151 26821340 + 2 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -99185 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 290-17 chr15 68565007 68565197 + 2 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -13891 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 199-70 chr5 96294061 96294234 + 2 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 138012 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 414.5-2 chr10 72785509 72785823 + 2 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 64637 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 328.75-17 chr4 137979193 137979441 + 2 NA Intergenic Intergenic -109697 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 314-11 chr2 83468771 83469089 + 2 NA Intergenic Intergenic -53884 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 378-22 chrX 91328602 91328835 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -106121 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 332-16 chr2 73431581 73432059 + 2 NA intron (NM_015120, intron 6 of 22) intron (NM_015120, intron 6 of 22) -25283 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 241-22 chr18 50041806 50042068 + 2 NA intron (NM_001080467, intron 2 of 39) L1M5|LINE|L1 84626 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 329.25-11 chr15 67078660 67079021 + 2 NA intron (NM_005902, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 13238 NM_005902 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 559.5-2 chr2 86635091 86635549 + 2 NA intron (NM_001198954, intron 2 of 7) intron (NM_001198954, intron 2 of 7) -11443 NM_001198951 7844 Hs.469199 NM_005667 ENSG00000239305 RNF103 HKF-1|KF-1|KF1|ZFP-103|ZFP103 ring finger protein 103 protein-coding 307-17 chr2 68521431 68521826 + 2 NA intron (NM_173545, intron 5 of 9) intron (NM_173545, intron 5 of 9) 54043 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 349.75-12 chr3 4285202 4285444 + 2 NA Intergenic Intergenic -17981 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 388-15 chr8 116908796 116909060 + 2 NA Intergenic Intergenic -29279 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 361.5-12 chr22 28155435 28155942 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -235076 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 323.75-21 chr7 7801486 7801722 + 2 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -82997 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 250-67 chr9 105325879 105326043 + 2 NA intron (NM_001330731, intron 3 of 15) intron (NM_001330731, intron 3 of 15) 81310 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 431-9 chr3 191728030 191728400 + 2 NA Intergenic Intergenic 267052 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 436-8 chr6 95296761 95297040 + 2 NA Intergenic Intergenic 280551 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 310-15 chr2 203263465 203263682 + 2 NA intron (NM_177538, intron 4 of 12) AluSc5|SINE|Alu 25132 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 253-37 chr4 115604180 115604403 + 2 NA Intergenic Intergenic -490671 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 187-58 chr22 31674078 31674188 + 2 NA Intergenic Intergenic -11569 NM_001326421 23761 Hs.420559 NM_014338 ENSG00000241878 PISD DJ858B16|PSD|PSDC|PSSC|dJ858B16.2 phosphatidylserine decarboxylase protein-coding 319-32 chr5 114266165 114266458 + 2 NA Intergenic Intergenic -95759 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 513.5-4 chr8 141010313 141010883 + 2 NA Intergenic Intergenic -8519 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 165.5-187 chr8 23025246 23025383 + 2 NA intron (NM_147187, intron 8 of 9) intron (NM_147187, intron 8 of 9) 25735 NM_015178 23221 Hs.372688 NM_015178 ENSG00000008853 RHOBTB2 DBC2|EIEE64 Rho related BTB domain containing 2 protein-coding 425-6 chr3 102508877 102509294 + 2 NA Intergenic Intergenic 74070 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 272.5-14 chr11 91693215 91693510 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -531672 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 323.5-5 chr10 96717541 96717732 + 2 NA intron (NM_152309, intron 1 of 16) intron (NM_152309, intron 1 of 16) 2878 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 309.5-12 chr12 39462191 39462457 + 2 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -19204 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 366.5-12 chr4 68071461 68071747 + 2 NA intron (NM_207407, intron 5 of 9) intron (NM_207407, intron 5 of 9) -8307 NR_027094 401135 Hs.130270 NM_001014372 SYT14P1 CHR415SYT|SYT14L|SYTDEP synaptotagmin 14 pseudogene 1 pseudo 433.75-10 chr8 91304143 91304491 + 2 NA intron (NM_134266, intron 4 of 18) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 54998 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 371.25-15 chr5 178412220 178412638 + 2 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) intron (NM_173465, intron 2 of 28) 177964 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 311.25-9 chr2 14263205 14263379 + 2 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) intron (NR_103814, intron 2 of 3) 137666 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 337.5-14 chr16 61867764 61868065 + 2 NA intron (NM_001796, intron 3 of 11) intron (NM_001796, intron 3 of 11) 168524 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 374.75-6 chr20 54864742 54865052 + 2 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 389304 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 461.75-3 chr5 61875838 61876251 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -140346 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 325.75-23 chr4 58621033 58621230 + 2 NA Intergenic Intergenic -84803 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 436-2 chr11 118202202 118202537 + 2 NA intron (NM_001098526, intron 6 of 9) intron (NM_001098526, intron 6 of 9) 10577 NM_001286571 120425 Hs.16291 NM_153206 ENSG00000160593 JAML AMICA|AMICA1|CREA7-1|CREA7-4|Gm638 junction adhesion molecule like protein-coding 385-5 chr15 82922006 82922223 + 2 NA intron (NM_004839, intron 1 of 8) intron (NM_004839, intron 1 of 8) 30606 NM_199330 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 469.5-3 chr3 184053151 184053520 + 2 NA intron (NM_130770, intron 1 of 8) intron (NM_130770, intron 1 of 8) 288 NM_130770 170572 Hs.632579 NM_130770 ENSG00000178084 HTR3C - 5-hydroxytryptamine receptor 3C protein-coding 329.5-8 chr2 16693208 16693515 + 2 NA Intergenic Intergenic -27527 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 620.5-2 chr19 30497291 30497841 + 2 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 125182 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 276.5-62 chr7 33222223 33222420 + 2 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) intron (NM_198428, intron 5 of 22) 92757 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 452.75-2 chr11 127007792 127008251 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 5111 NR_040078 283165 Hs.730461 NM_173579 ENSG00000218109 KIRREL3-AS3 NCRNA00288|PRR10 KIRREL3 antisense RNA 3 ncRNA 665.25 chr16 59524516 59525071 + 2 NA Intergenic Intergenic 230398 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 481.5-2 chr2 52188126 52188484 + 2 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) AluJr|SINE|Alu -182343 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 358.75-6 chr2 124311765 124311960 + 2 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) L2c|LINE|L2 286575 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 392 chr1 82309400 82309851 + 2 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 507172 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 279.5-24 chr17 61199087 61199384 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 168469 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 356 chr1 23630355 23630622 + 2 NA intron (NM_001348075, intron 4 of 6) AluSx|SINE|Alu 3154 NM_001348075 259283 Hs.523369 NM_001348075 MDS2 - myelodysplastic syndrome 2 translocation associated protein-coding 323-20 chr5 8367826 8368117 + 2 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 89593 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 343-11 chr19 17457358 17457737 + 2 NA intron (NM_138454, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 3379 NM_138454 115861 Hs.661836 NM_138454 ENSG00000171773 NXNL1 RDCVF|TXNL6 nucleoredoxin like 1 protein-coding 389-4 chr13 110446981 110447206 + 2 NA intron (NM_001846, intron 18 of 47) intron (NM_001846, intron 18 of 47) 16194 NM_001267044 100129836 Hs.640035 NM_001267044 COL4A2-AS2 - COL4A2 antisense 2 protein-coding 274.25-32 chr3 180296350 180296746 + 2 NA Intergenic Intergenic -117625 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 286-34 chr7 111863152 111863330 + 2 NA intron (NM_001363540, intron 23 of 52) intron (NM_001363540, intron 23 of 52) 54736 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 260.75-64 chr8 119612507 119612907 + 2 NA intron (NM_001330600, intron 8 of 25) AluJb|SINE|Alu -19699 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 466 chr1 66613913 66614245 + 2 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) intron (NM_001350218, intron 1 of 22) -14361 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 262.25-8 chr10 125369273 125369423 + 2 NA Intergenic Intergenic -205023 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 200.75-63 chr20 13319308 13319463 + 2 NA Intergenic Intergenic -79698 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 250.5-87 chr7 21277926 21278162 + 2 NA Intergenic Intergenic -150039 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 528-2 chr7 29995723 29996211 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5678 NM_001145514 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 673.75 chr1 74009374 74010066 + 2 NA Intergenic Intergenic 188456 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 253-25 chr2 81566402 81566567 + 2 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -99538 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 327-29 chr8 127033837 127034162 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 20845 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 459.75-4 chr6 63817907 63818336 + 2 NA intron (NR_157848, intron 1 of 1) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 11285 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 381-14 chr3 77238884 77239192 + 2 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) MER8|DNA|TcMar-Tigger 141026 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 234.25-44 chr3 48932115 48932297 + 2 NA intron (NM_001349209, intron 3 of 15) intron (NM_001349209, intron 3 of 15) -12821 NR_161301 646450 Hs.720727 NM_001123040 ENSG00000221883 ARIH2OS C3orf71 ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 2 opposite strand ncRNA 462-2 chr12 64177958 64178230 + 2 NA Intergenic Intergenic 44202 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 323.5-29 chr7 43116965 43117354 + 2 NA promoter-TSS (NR_135295) promoter-TSS (NR_135295) -737 NR_135295 100127950 Hs.666610 NR_135295 ENSG00000181211 HECW1-IT1 - HECW1 intronic transcript 1 ncRNA 353.75-3 chr12 63160788 63161165 + 2 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -8166 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 199.5-74 chr2 45707240 45707366 + 2 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 55628 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 486.5-4 chr5 120017639 120017899 + 2 NA Intergenic Intergenic 388210 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 493.25 chr12 71892884 71893212 + 2 NA intron (NM_022771, intron 5 of 17) (TGTATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -42065 NR_024072 729633 Hs.716256 NR_024072 MRS2P2 - MRS2 pseudogene 2 pseudo 354.75-16 chr5 99765188 99765589 + 2 NA Intergenic Intergenic 231398 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 284-50 chr9 74466691 74466845 + 2 NA Intergenic Intergenic -30567 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 185.75-119 chr7 50132359 50132522 + 2 NA intron (NM_001161834, intron 3 of 8) intron (NM_001161834, intron 3 of 8) 36354 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 240.25-20 chr13 59599981 59600180 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -412638 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 235.5-59 chr4 94344047 94344222 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1298 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 477-5 chr22 45378532 45378912 + 2 NA intron (NM_148674, intron 12 of 24) intron (NM_148674, intron 12 of 24) 34877 NM_001291501 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 467.75-3 chr3 188106648 188107000 + 2 NA Intergenic Intergenic -47074 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 226-4 chr1 205772053 205772201 + 2 NA intron (NM_001135663, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 3355 NM_003929 8934 Hs.115325 NM_003929 ENSG00000117280 RAB29 RAB7L|RAB7L1 RAB29, member RAS oncogene family protein-coding 318.5-5 chr11 110289361 110289622 + 2 NA intron (NM_001260493, intron 1 of 15) intron (NM_001260493, intron 1 of 15) 7221 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 219.75-26 chr17 35250001 35250224 + 2 NA intron (NM_144975, intron 1 of 4) MER89-int|LTR|ERV1 7040 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 374.75-4 chr2 103732718 103733100 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 675423 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 191-12 chr11 33296325 33296422 + 2 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) L1MC4a|LINE|L1 38042 NM_001278162 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 235.25-52 chr5 92689062 92689276 + 2 NA Intergenic Intergenic 882174 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 215-60 chr5 7390253 7390403 + 2 NA Intergenic Intergenic -5810 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 514.75 chr14 59598656 59599227 + 2 NA intron (NM_021136, intron 8 of 8) L3|LINE|CR1 11198 NM_001363702 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 435-4 chr17 19661105 19661458 + 2 NA intron (NM_001369136, intron 7 of 11) intron (NM_001369136, intron 7 of 11) 12530 NM_000382 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 431 chr11 37823095 37823503 + 2 NA Intergenic Intergenic -115302 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 253-5 chr10 28441636 28441865 + 2 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 54063 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 162.5-89 chr2 152518613 152518724 + 2 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 183494 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 287.5-28 chr18 10510709 10511015 + 2 NA Intergenic Intergenic -15165 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 380-13 chr3 138161781 138162007 + 2 NA exon (NM_016216, exon 8 of 8) exon (NM_016216, exon 8 of 8) 13027 NM_016216 51163 Hs.477700 NM_016216 ENSG00000138231 DBR1 - debranching RNA lariats 1 protein-coding 448.5-9 chr9 19322243 19322580 + 2 NA intron (NR_073201, intron 12 of 31) L2|LINE|L2 57825 NM_001010 6194 Hs.408073 NM_001010 ENSG00000137154 RPS6 S6 ribosomal protein S6 protein-coding 249.5-83 chr6 55860443 55860677 + 2 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 15030 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 343-18 chr2 223173032 223173326 + 2 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 121249 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 441.5 chr10 53723473 53723897 + 2 NA Intergenic Intergenic -762545 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 429.5-11 chr8 104160259 104160667 + 2 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -62872 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 259.5-24 chr12 21417244 21417575 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -20246 NM_024854 79912 Hs.709545 NM_024854 ENSG00000121350 PYROXD1 MFM8 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 protein-coding 327.75-12 chr16 6732811 6733080 + 2 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) intron (NM_018723, intron 3 of 15) -40864 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 274.5-69 chrX 76704803 76705193 + 2 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) L1MA5|LINE|L1 214362 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 283-15 chr14 69464449 69464718 + 2 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -20145 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 343.75 chr10 55564667 55565017 + 2 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MB3|LINE|L1 -34200 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 331.25-2 chr10 61328645 61328854 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -123890 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 330-33 chrX 82756809 82757108 + 2 NA Intergenic Intergenic -751332 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 570 chr17 76147578 76148219 + 2 NA intron (NR_040017, intron 6 of 7) intron (NR_040017, intron 6 of 7) -6653 NM_001454 2302 Hs.651204 NM_001454 ENSG00000129654 FOXJ1 FKHL13|HFH-4|HFH4 forkhead box J1 protein-coding 234.25-16 chr11 74916871 74917085 + 2 NA intron (NM_001270380, intron 8 of 14) L1M4c|LINE|L1 32113 NM_182969 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 293-15 chr2 226298536 226298762 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 155855 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 383.5-8 chr2 173585025 173585277 + 2 NA Intergenic Intergenic 230279 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 250.5-68 chr4 143134907 143135119 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 49848 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 280-53 chr6 146628229 146628413 + 2 NA intron (NM_024694, intron 1 of 35) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 29349 NM_024694 79747 Hs.720870 NM_024694 ENSG00000118492 ADGB C6orf103|CAPN16 androglobin protein-coding 247.75-3 chr11 82850661 82850822 + 2 NA intron (NM_199418, intron 4 of 9) intron (NM_199418, intron 4 of 9) 49689 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 185 chr1 25028671 25028854 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 5259 NR_039623 100616365 NR_039623 ENSG00000264371 MIR4425 - microRNA 4425 ncRNA 331.5-12 chr18 22884985 22885246 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -48213 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 241-27 chr2 200707271 200707395 + 2 NA intron (NR_135011, intron 2 of 31) MER21C|LTR|ERVL 11610 NR_135012 107161151 Hs.148269 NR_135011 AOX3P-AOX2P AOX3/AOX3L1 AOX3P-AOX2P readthrough, transcribed pseudogene pseudo 382.25-7 chr14 60686881 60687220 + 2 NA Intergenic Intergenic 37301 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 191-59 chr4 49638057 49638182 + 2 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 651477 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 480.75-2 chr11 80498512 80498868 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 264113 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 414.5-7 chr8 134582479 134582929 + 2 NA intron (NM_020863, intron 10 of 15) intron (NM_020863, intron 10 of 15) -15367 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 438.75 chr11 61744385 61744708 + 2 NA 3' UTR (NM_006133, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_006133, exon 20 of 20) -8090 NM_001127392 745 Hs.473109 NM_013279 ENSG00000124920 MYRF 11orf9|C11orf9|CUGS|MMERV|MRF|Ndt80|pqn-47 myelin regulatory factor protein-coding 246-37 chr21 26977953 26978153 + 2 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -10965 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 355.5-29 chr9 132097728 132097946 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17970 NM_004269 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 362-15 chr5 124057866 124058196 + 2 NA Intergenic Intergenic 380489 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 489-3 chr14 61910902 61911311 + 2 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) intron (NM_001367661, intron 2 of 8) -16589 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 247.75-51 chr5 159401600 159401727 + 2 NA Intergenic Intergenic 64613 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 438.5-8 chr20 57167354 57167742 + 2 NA Intergenic Intergenic -46148 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 487.5-8 chr6 21405486 21406143 + 2 NA Intergenic Intergenic 106078 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 244.5-64 chr3 28013219 28013486 + 2 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -179216 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 343.5-12 chr2 11197929 11198236 + 2 NA intron (NM_001321643, intron 25 of 32) intron (NM_001321643, intron 25 of 32) 42615 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 275.5-2 chr1 76098659 76098826 + 2 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 23996 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 401.25-2 chr1 63173400 63173759 + 2 NA intron (NR_038252, intron 6 of 11) intron (NR_038252, intron 6 of 11) 143678 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 408.75-9 chr7 82916921 82917289 + 2 NA intron (NM_033026, intron 6 of 24) intron (NM_033026, intron 6 of 24) 245779 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 205.5-86 chr20 54045622 54045785 + 2 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) MER57F|LTR|ERV1 13317 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 490.25 chr6 127102294 127102665 + 2 NA Intergenic Intergenic -16192 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 232.25-41 chr21 44277773 44277930 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -8025 NM_000383 326 Hs.129829 NM_000383 ENSG00000160224 AIRE AIRE1|APECED|APS1|APSI|PGA1 autoimmune regulator protein-coding 225.75-77 chr8 129944091 129944256 + 2 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 -4362 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 225-84 chrX 146395596 146395739 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -367795 NR_030581 100126341 NR_030581 ENSG00000216056 MIR891A MIRN891A microRNA 891a ncRNA 338.75-10 chr18 73097616 73097936 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 166722 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 455.5-2 chr2 112051737 112052248 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3277 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 431-10 chr4 20068762 20069165 + 2 NA Intergenic Intergenic -182942 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 346-20 chr6 44611326 44611663 + 2 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -59613 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 338.5-39 chr9 104628140 104628575 + 2 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -10153 NM_001001956 286362 Hs.553682 NM_001001956 ENSG00000136839 OR13C9 OR37L|OR9-13 olfactory receptor family 13 subfamily C member 9 protein-coding 446.25 chr10 51052087 51052482 + 2 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 16268 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 321.5-19 chr2 102203316 102203541 + 2 NA intron (NM_001351448, intron 3 of 8) L1M1|LINE|L1 16114 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 365.5-12 chr3 187933771 187934069 + 2 NA Intergenic Intergenic 42487 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 351.5 chr1 49434228 49434493 + 2 NA intron (NR_046839, intron 2 of 3) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 37725 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 184-6 chr1 174270312 174270409 + 2 NA intron (NM_001366445, intron 7 of 13) intron (NM_001366445, intron 7 of 13) -4740 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 189.25-22 chr12 11471347 11471483 + 2 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) intron (NR_148969, intron 2 of 4) 15263 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 160.5-211 chrX 86622684 86622777 + 2 NA intron (NM_001139515, intron 3 of 11) intron (NM_001139515, intron 3 of 11) 359762 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 285.25-18 chr21 19390108 19390358 + 2 NA Intergenic Intergenic 509522 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 143.75-15 chr10 58112351 58112458 + 2 NA Intergenic Intergenic 155490 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 277-25 chr3 133094713 133094926 + 2 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 -30002 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 304-7 chr10 97093554 97093763 + 2 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -9098 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 411 chr10 79033875 79034260 + 2 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) intron (NR_015429, intron 3 of 7) 33381 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 497.25 chr10 80974217 80975112 + 2 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 324867 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 293-40 chr8 127654203 127654512 + 2 NA Intergenic Intergenic 79610 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 349.5-14 chr3 40616754 40617016 + 2 NA Intergenic Intergenic 91925 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 385-13 chr20 22398431 22398650 + 2 NA Intergenic Intergenic 22103 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 204-67 chr5 109707997 109708200 + 2 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) L2b|LINE|L2 18732 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 426-2 chr1 53149021 53149404 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6574 NM_001287596 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 390.5-9 chr3 51732714 51733043 + 2 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 25810 NM_000839 2912 Hs.121510 NM_000839 ENSG00000164082 GRM2 GLUR2|GPRC1B|MGLUR2|mGlu2 glutamate metabotropic receptor 2 protein-coding 568 chr11 83935209 83935655 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 14 of 27) intron (NM_001142699, intron 14 of 27) -253007 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 193.75-59 chr2 11221875 11222144 + 2 NA intron (NM_001321643, intron 8 of 32) intron (NM_001321643, intron 8 of 32) 66542 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 334.75-17 chr21 8994595 8994927 + 2 NA Intergenic Intergenic 7144 NR_162105 113218501 NR_162105 MIR10396A - microRNA 10396a ncRNA 180.25-70 chr3 41218408 41218547 + 2 NA intron (NM_001904, intron 1 of 14) intron (NM_001904, intron 1 of 14) 18972 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 424 chr10 35507070 35507350 + 2 NA intron (NM_001282854, intron 3 of 7) intron (NM_001282854, intron 3 of 7) -98131 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 194.75-97 chr8 136687410 136687592 + 2 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 156703 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 285-26 chr2 177496004 177496200 + 2 NA intron (NM_003659, intron 12 of 19) intron (NM_003659, intron 12 of 19) 56694 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 232-14 chr14 53830750 53830885 + 2 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 117667 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 342-8 chr2 18723359 18723592 + 2 NA Intergenic Intergenic -133895 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 372.5-14 chr3 151980236 151980466 + 2 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -52176 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 429-8 chr8 140775654 140776035 + 2 NA intron (NR_148036, intron 14 of 34) LTR49-int|LTR|ERV1 -43191 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 304.75-31 chr7 8409021 8409329 + 2 NA Intergenic Intergenic -24434 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 221-45 chr20 58941877 58942014 + 2 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -39311 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 407-9 chr2 71818966 71819301 + 2 NA Intergenic Intergenic 328729 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 341.5-2 chr11 40889848 40890060 + 2 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) 569682 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 376.5-3 chr12 47687253 47687567 + 2 NA intron (NM_024604, intron 8 of 16) intron (NM_024604, intron 8 of 16) 18620 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 433 chr1 162510600 162510879 + 2 NA intron (NM_144624, intron 4 of 6) L1MA6|LINE|L1 12921 NM_175866 127933 Hs.127310 NM_144624 ENSG00000152332 UHMK1 KIS|KIST|P-CIP2 U2AF homology motif kinase 1 protein-coding 266.25-38 chr6 47404133 47404392 + 2 NA Intergenic Intergenic -73527 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 306.75-11 chr19 15746307 15746593 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 5057 NM_013938 26532 Hs.553524 NM_013938 ENSG00000171936 OR10H3 - olfactory receptor family 10 subfamily H member 3 protein-coding 366-10 chr18 60504689 60504929 + 2 NA Intergenic Intergenic -132034 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 360.75-9 chr22 50400679 50401010 + 2 NA intron (NM_001351648, intron 3 of 22) HAL1|LINE|L1 -6598 NR_162128 113218480 NR_162128 MIR12114 - microRNA 12114 ncRNA 263-41 chr5 72185260 72185437 + 2 NA intron (NM_001324255, intron 2 of 5) intron (NM_001324255, intron 2 of 5) 5561 NM_001324255 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 231.5-38 chr18 77229460 77229619 + 2 NA Intergenic Intergenic -20309 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 397.25-6 chr2 111089701 111089938 + 2 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L3|LINE|CR1 25769 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 401.75-6 chr3 150873564 150873901 + 2 NA intron (NM_001351281, intron 10 of 11) intron (NM_001351281, intron 10 of 11) 31707 NM_001351281 646951 Hs.380222 NM_001351281 MINDY4B C3orf76|FAM188B2 MINDY family member 4B protein-coding 363-8 chr2 142790566 142790895 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -86934 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 426.75-9 chr6 34927898 34928231 + 2 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 38809 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 177.5-127 chr4 61199170 61199311 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1990 NM_001371343 565.25-2 chr8 38532044 38532455 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3587 NM_001369355 389649 Hs.546586 NM_207412 ENSG00000196166 C8orf86 - chromosome 8 open reading frame 86 protein-coding 380-21 chr8 59532634 59532855 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 413534 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 292.5-21 chr14 88614260 88614536 + 2 NA TTS (NM_207661) TTS (NM_207661) 19978 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 563.5 chr14 68111629 68112117 + 2 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 288281 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 401.75-11 chr6 74750783 74751138 + 2 NA Intergenic Intergenic 377822 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 165.25-81 chr21 26094429 26094569 + 2 NA intron (NM_001136129, intron 1 of 14) intron (NM_001136129, intron 1 of 14) 45891 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 344.5-36 chr9 87197078 87197298 + 2 NA Intergenic Intergenic 48544 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 247.5-87 chr8 137781198 137781373 + 2 NA Intergenic Intergenic 302260 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 195.5-143 chr7 8273199 8273322 + 2 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 -10648 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 333-4 chr1 115969413 115969970 + 2 NA intron (NR_125970, intron 1 of 4) intron (NR_125970, intron 1 of 4) -6822 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 411.25-5 chr22 26398810 26399075 + 2 NA Intergenic Intergenic -30318 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 252.75-67 chr7 38585256 38585411 + 2 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) intron (NM_001635, intron 1 of 20) 46040 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 180-118 chr9 75479067 75479161 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 390600 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 452.75-5 chr8 140036446 140036907 + 2 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 63859 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 221-60 chr4 109168086 109168367 + 2 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 134432 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 508.25-2 chr4 139851978 139852237 + 2 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 186288 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 374.75-7 chr3 101040953 101041193 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -47583 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 171.75-104 chr4 98848169 98848267 + 2 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 80915 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 240-15 chr12 40596940 40597125 + 2 NA Intergenic Intergenic -95407 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 300-15 chr14 63047734 63048013 + 2 NA Intergenic Intergenic -2415 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 354-15 chr22 26430686 26431182 + 2 NA intron (NM_020437, intron 1 of 3) intron (NM_020437, intron 1 of 3) 1674 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 329-9 chr11 41888419 41888702 + 2 NA Intergenic Intergenic 173992 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 335-2 chr1 110081109 110081333 + 2 NA Intergenic Intergenic -1467 NR_126382 104355139 Hs.628193 NR_126382 ENSG00000258673 LINC01397 - long intergenic non-protein coding RNA 1397 ncRNA 171-106 chr4 137240513 137240682 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -27798 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 343.75-6 chr2 55986268 55986568 + 2 NA intron (NR_126406, intron 2 of 2) intron (NR_126406, intron 2 of 2) 2641 NR_029629 406998 NR_029629 ENSG00000207798 MIR216A MIR216|MIRN216|MIRN216A|miRNA216|mir-216|mir-216a microRNA 216a ncRNA 389.5-13 chr8 136560726 136561041 + 2 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 30085 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 407-12 chr7 9503473 9503873 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -130597 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 366.5-18 chr7 38777899 38778144 + 2 NA intron (NM_014396, intron 10 of 28) intron (NM_014396, intron 10 of 28) -90932 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 380-24 chr8 131838353 131838745 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -65544 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 255-4 chr10 130935913 130936080 + 2 NA Intergenic Intergenic 26672 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 497-4 chr14 65697595 65697924 + 2 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) AluSq|SINE|Alu 226657 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 249-46 chr7 54395119 54395288 + 2 NA Intergenic Intergenic 64506 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 229.25-23 chr13 29015759 29016015 + 2 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) -8570 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 364-17 chr6 56234222 56234455 + 2 NA intron (NM_001318751, intron 1 of 30) L1MEd|LINE|L1 13242 NM_001318751 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 228.5-18 chr10 78060477 78060621 + 2 NA Intergenic Intergenic 26686 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 389.5-7 chr17 44305128 44305464 + 2 NA intron (NR_110802, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 3135 NR_110802 101926996 Hs.666688 NR_110802 RUNDC3A-AS1 - RUNDC3A antisense RNA 1 ncRNA 393-12 chr4 56864382 56864616 + 2 NA Intergenic Intergenic -42630 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 323-8 chr14 55962050 55962434 + 2 NA Intergenic Intergenic -156169 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 206.5-117 chr7 27358442 27358742 + 2 NA Intergenic Intergenic -111363 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 273.5-3 chr1 102915401 102915632 + 2 NA intron (NM_001854, intron 50 of 66) intron (NM_001854, intron 50 of 66) 192980 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 360.25-4 chr14 44736159 44736389 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 62852 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 503 chr16 7234257 7234811 + 2 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -98311 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 315.25-25 chr4 120004702 120005026 + 2 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 61984 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 352.25-18 chr8 103214293 103214640 + 2 NA intron (NM_001364874, intron 3 of 3) intron (NM_001364874, intron 3 of 3) -42326 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 420-3 chr12 83326946 83327211 + 2 NA Intergenic Intergenic 639923 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 297.75-13 chr16 58894416 58894689 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -160236 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 396 chr1 98642074 98642422 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -19473 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 344.75-3 chr17 55080151 55080553 + 2 NA intron (NM_178509, intron 15 of 17) intron (NM_178509, intron 15 of 17) -111567 NM_001162861 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 329-23 chr3 96465476 96465716 + 2 NA Intergenic Intergenic 105632 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 296.75-40 chrX 42982151 42982384 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -194727 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 329.5-30 chr9 28028803 28029066 + 2 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -455068 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 499-4 chr6 129317720 129318224 + 2 NA intron (NM_000426, intron 27 of 64) intron (NM_000426, intron 27 of 64) 392205 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 263.5 chr1 181746295 181746523 + 2 NA intron (NM_001205293, intron 25 of 47) MIRc|SINE|MIR 262892 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 434.75-6 chr3 47685911 47686251 + 2 NA exon (NM_003074, exon 14 of 28) exon (NM_003074, exon 14 of 28) -24387 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 254.5-74 chr7 129013844 129014103 + 2 NA intron (NM_001191028, intron 4 of 21) L1MA4|LINE|L1 41200 NM_001191028 23534 Hs.193613 NM_012470 ENSG00000064419 TNPO3 IPO12|LGMD1F|LGMDD2|MTR10A|TRN-SR|TRN-SR2|TRNSR transportin 3 protein-coding 383.75-5 chr4 180391442 180391673 + 2 NA Intergenic Intergenic 767592 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 292-38 chr6 154608452 154608664 + 2 NA Intergenic Intergenic -97873 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 496.5 chr10 72842382 72842702 + 2 NA intron (NM_138357, intron 2 of 7) Charlie24|DNA|hAT-Charlie -51197 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 236-12 chr11 60952818 60953243 + 2 NA promoter-TSS (NR_027391) promoter-TSS (NR_027391) -854 NM_016582 51296 Hs.237856 NM_016582 ENSG00000110446 SLC15A3 OCTP|PHT2|PTR3 solute carrier family 15 member 3 protein-coding 452-4 chr3 110716611 110717217 + 2 NA Intergenic Intergenic 353045 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 346.25-20 chr9 90635578 90635788 + 2 NA intron (NM_017594, intron 1 of 1) intron (NM_017594, intron 1 of 1) 7141 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 356-2 chr10 17000343 17000660 + 2 NA intron (NM_001081, intron 28 of 66) intron (NM_001081, intron 28 of 66) 129316 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 322.75-15 chr3 118337416 118337687 + 2 NA Intergenic Intergenic -304217 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 424.5-2 chr10 103942928 103943421 + 2 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -23966 NM_001304743 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 353.75-9 chr2 106675786 106676062 + 2 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 188560 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 279-35 chr5 24271963 24272121 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 320694 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 459.5-5 chr2 35019760 35020273 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 342459 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 402.5-9 chr5 177423616 177423918 + 2 NA Intergenic Intergenic -2909 NM_001004105 2870 Hs.235116 NM_002082 ENSG00000198055 GRK6 GPRK6 G protein-coupled receptor kinase 6 protein-coding 366.75-12 chr3 29074959 29075180 + 2 NA Intergenic Intergenic 205870 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 517 chr1 152647733 152648217 + 2 NA Intergenic Intergenic -7502 NR_145430 388699 Hs.516420 NR_145430 LINC00302 C1orf46|NCRNA00302|xp33 long intergenic non-protein coding RNA 302 ncRNA 173.75-136 chr6 103890371 103890552 + 2 NA Intergenic Intergenic 969085 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 389-3 chr13 27116524 27116776 + 2 NA intron (NM_182488, intron 1 of 8) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -8883 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 297.5-49 chr6 76136007 76136226 + 2 NA Intergenic Intergenic -63438 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 217-48 chr22 34339359 34339576 + 2 NA Intergenic Intergenic -416579 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 372-4 chr12 13623837 13624105 + 2 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) L2c|LINE|L2 -247226 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 295.75-8 chr17 53613702 53613921 + 2 NA Intergenic Intergenic -209116 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 158.5-24 chr10 68655287 68655429 + 2 NA intron (NM_030625, intron 6 of 11) intron (NM_030625, intron 6 of 11) -65881 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 336.75-6 chr14 48329076 48329491 + 2 NA Intergenic Intergenic -534269 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 371.25 chr1 160616471 160616818 + 2 NA intron (NR_104400, intron 3 of 4) L1ME3|LINE|L1 30400 NR_104399 6504 Hs.523660 NM_003037 ENSG00000117090 SLAMF1 CD150|CDw150|SLAM signaling lymphocytic activation molecule family member 1 protein-coding 374.25 chr1 168734487 168734884 + 2 NA Intergenic Intergenic -5479 NM_001937 1805 Hs.80552 NM_001937 ENSG00000143196 DPT TRAMP dermatopontin protein-coding 312-30 chr7 68779473 68779847 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 759407 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 237.5-16 chr10 53231527 53231765 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -459946 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 203.75-109 chr8 68694897 68695023 + 2 NA intron (NR_146187, intron 8 of 13) intron (NR_146187, intron 8 of 13) -363469 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 391-11 chr2 186464313 186464649 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -21779 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 315.5-16 chr4 12837129 12837524 + 2 NA Intergenic Intergenic 613875 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 369-14 chr6 165996095 165996397 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -8207 NR_026860 90632 Hs.31917 NR_026860 ENSG00000112541 LINC00473 C6orf176|LNC473|bA142J11.1 long intergenic non-protein coding RNA 473 ncRNA 226.25-26 chr14 74497594 74497876 + 2 NA TTS (NM_000428) TTS (NM_000428) 3970 NM_194279 122961 Hs.291079 NM_194279 ENSG00000165898 ISCA2 HBLD1|ISA2|MMDS4|c14_5557 iron-sulfur cluster assembly 2 protein-coding 186.25-99 chr6 38518880 38519032 + 2 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) 37360 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 247.5-74 chr6 145342409 145342685 + 2 NA Intergenic Intergenic 344330 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 268.75-14 chr15 60646416 60646578 + 2 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -18967 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 347-11 chr16 31312660 31313001 + 2 NA intron (NM_001145808, intron 14 of 29) intron (NM_001145808, intron 14 of 29) -42346 NM_000887 3687 Hs.248472 NM_000887 ENSG00000140678 ITGAX CD11C|SLEB6 integrin subunit alpha X protein-coding 394.25-9 chr9 26782565 26782887 + 2 NA Intergenic Intergenic 110076 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 511.5-2 chr11 28446487 28446816 + 2 NA Intergenic Intergenic 30897 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 329-38 chr7 92954213 92954413 + 2 NA Intergenic Intergenic -117686 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 318.5-22 chr2 186631570 186631794 + 2 NA intron (NM_002210, intron 5 of 29) intron (NM_002210, intron 5 of 29) 31477 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 581 chr16 69573247 69573782 + 2 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) intron (NM_138714, intron 2 of 15) 7548 NM_006599 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 414.5-3 chr14 53545837 53546194 + 2 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner 392661 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 437.75-6 chr4 78620681 78620939 + 2 NA Intergenic Intergenic -25184 NR_038307 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 360-4 chr15 82710362 82710682 + 2 NA promoter-TSS (NM_001348440) promoter-TSS (NM_001348440) -614 NM_001278511 8120 Hs.199593 NM_004644 ENSG00000103723 AP3B2 EIEE48|NAPTB adaptor related protein complex 3 subunit beta 2 protein-coding 247-64 chr9 35519738 35519977 + 2 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR -18775 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 202.75-78 chr3 163491193 163491376 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -187983 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 469-2 chr7 122874909 122875346 + 2 NA intron (NM_001167940, intron 1 of 29) intron (NM_001167940, intron 1 of 29) 11333 NM_001363393 93664 Hs.649459 NM_017954 ENSG00000081803 CADPS2 CAPS2 calcium dependent secretion activator 2 protein-coding 271-18 chr16 81069673 81069953 + 2 NA intron (NM_152337, intron 1 of 3) intron (NM_152337, intron 1 of 3) 7454 NM_152337 123775 Hs.658684 NM_152337 ENSG00000166455 C16orf46 - chromosome 16 open reading frame 46 protein-coding 430.5-5 chr2 199493813 199494261 + 2 NA Intergenic Intergenic -22771 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 406.5-8 chr3 17902702 17903022 + 2 NA Intergenic Intergenic -59690 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 433.5-6 chr3 170431306 170431679 + 2 NA intron (NM_001185056, intron 2 of 2) MER3|DNA|hAT-Charlie 8389 NR_106886 102465497 NR_106886 ENSG00000283474 MIR6828 hsa-mir-6828 microRNA 6828 ncRNA 307.5 chr1 81578776 81579025 + 2 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) -21198 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 411.5-7 chr7 81161097 81161538 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -238928 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 417-8 chr2 41942540 41942764 + 2 NA intron (NR_161189, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 -8929 NR_110263 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 384.5-9 chr2 47965576 47965880 + 2 NA Intergenic (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -59935 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 268-38 chr3 120740040 120740257 + 2 NA intron (NR_157022, intron 1 of 8) intron (NR_157022, intron 1 of 8) 2532 NR_157022 285282 Hs.444360 NM_173825 ENSG00000144840 RABL3 - RAB, member of RAS oncogene family like 3 protein-coding 375.25-4 chr3 46577880 46578067 + 2 NA exon (NM_003212, exon 1 of 6) exon (NM_003212, exon 1 of 6) 185 NM_003212 6997 Hs.385870 NM_003212 ENSG00000241186 TDGF1 CR|CR-1|CRGF|CRIPTO teratocarcinoma-derived growth factor 1 protein-coding 326-3 chr10 71139536 71139793 + 2 NA Intergenic Intergenic -72906 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 248.5-105 chr8 134537566 134537893 + 2 NA intron (NM_020863, intron 11 of 15) intron (NM_020863, intron 11 of 15) -60342 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 329.25-12 chr15 95099815 95100083 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 227151 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 193-8 chr1 196249305 196249429 + 2 NA intron (NM_001287820, intron 25 of 26) L1M1|LINE|L1 -160652 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 219-46 chr18 55701797 55701940 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -65911 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 467-10 chr8 95861232 95861504 + 2 NA Intergenic Intergenic 86980 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 278-23 chr4 54177586 54177855 + 2 NA Intergenic Intergenic -51573 NM_001347827 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 454.5-3 chr5 120171953 120172199 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -292202 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 306.5-29 chr4 56114886 56115202 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55151 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 497.5-2 chr14 34845328 34845695 + 2 NA intron (NM_013448, intron 3 of 26) intron (NM_013448, intron 3 of 26) -28680 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 310-16 chr21 26479015 26479210 + 2 NA intron (NR_135472, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 73169 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 250-27 chr2 123849631 123849844 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 175437 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 252-8 chr10 23584885 23585062 + 2 NA Intergenic Intergenic -109754 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 262.75-32 chr3 15524946 15525198 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3366 NM_005677 8292 Hs.146735 NM_005677 ENSG00000206561 COLQ CMS5|EAD collagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesterase protein-coding 396.5-7 chr5 107125161 107125397 + 2 NA Intergenic Intergenic -114265 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 177.75-140 chr8 119374540 119374692 + 2 NA Intergenic Eulor11|DNA|DNA -41830 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 246.5-54 chr3 105666749 105666947 + 2 NA intron (NR_135809, intron 18 of 18) intron (NR_135809, intron 18 of 18) 200743 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 235-23 chr15 56260803 56260972 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -15805 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 437-2 chr12 42078589 42079000 + 2 NA Intergenic Intergenic 66080 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 190.75-17 chr11 111955453 111955573 + 2 NA intron (NM_001037954, intron 1 of 19) L1MB2|LINE|L1 18170 NM_001037954 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 288.75-20 chr16 56013774 56013928 + 2 NA Intergenic Intergenic -57820 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 457.75-2 chr20 44034761 44035123 + 2 NA intron (NM_001098797, intron 3 of 8) intron (NM_001098797, intron 3 of 8) 89046 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 264-46 chr4 67172406 67172599 + 2 NA Intergenic Intergenic 249498 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 296-35 chr4 95108578 95108876 + 2 NA intron (NM_001256792, intron 2 of 10) intron (NM_001256792, intron 2 of 10) 17236 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 173-53 chr16 31137933 31138036 + 2 NA TTS (NM_173502) TTS (NM_173502) -2257 NM_002773 5652 Hs.75799 NM_002773 ENSG00000052344 PRSS8 CAP1|PROSTASIN serine protease 8 protein-coding 280.5-54 chr8 112368331 112368604 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 34 of 66) intron (NM_001363185, intron 34 of 66) -275026 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 404.25-6 chr3 103182127 103182384 + 2 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 341861 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 388.25-7 chr7 96840808 96841100 + 2 NA Intergenic Intergenic -131063 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 401-9 chr2 122908047 122908460 + 2 NA Intergenic Intergenic 165228 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 326.5-6 chr12 60482364 60482604 + 2 NA Intergenic Intergenic 793114 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 281-12 chr17 74252101 74252333 + 2 NA intron (NM_001330453, intron 10 of 13) intron (NM_001330453, intron 10 of 13) 3851 NM_052869 94015 Hs.27935 NM_032646 ENSG00000141540 TTYH2 C17orf29 tweety family member 2 protein-coding 420.25-14 chr8 125885231 125885566 + 2 NA Intergenic Intergenic 65799 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 681.75 chr17 74801235 74801894 + 2 NA intron (NM_017728, intron 8 of 9) intron (NM_017728, intron 8 of 9) 25065 NM_017728 54868 Hs.370262 NM_017728 ENSG00000109066 TMEM104 - transmembrane protein 104 protein-coding 211-18 chr14 54998069 54998244 + 2 NA intron (NM_007086, intron 10 of 25) AluSx1|SINE|Alu 28943 NM_001008396 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 277.5-49 chr3 120181395 120181773 + 2 NA intron (NM_001168271, intron 6 of 8) intron (NM_001168271, intron 6 of 8) 62711 NM_001168271 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 515.5 chr3 52099144 52099573 + 2 NA intron (NM_015426, intron 9 of 10) intron (NM_015426, intron 9 of 10) -34246 NR_027331 100128378 Hs.640106 NM_001123039 LINC00696 C3orf74 long intergenic non-protein coding RNA 696 ncRNA 381.25-10 chr4 108531191 108531723 + 2 NA Intergenic Intergenic -25776 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 574-2 chr2 75299939 75300535 + 2 NA Intergenic Intergenic -100717 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 301-3 chr12 19895424 19895626 + 2 NA Intergenic Intergenic -119160 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 413.25-7 chr6 65584763 65585174 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -5164 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 261.5-44 chr4 20865278 20865530 + 2 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -14736 NM_147181 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 351.75-3 chr10 114010656 114010978 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -33049 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 427.5-5 chr2 62301396 62301848 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 86101 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 391.75-3 chr2 145636485 145636911 + 2 NA Intergenic Intergenic -950359 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 556.75 chr1 223876700 223877105 + 2 NA Intergenic Intergenic -30930 NM_005426 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 343.5-19 chr6 42037875 42038305 + 2 NA intron (NM_001287434, intron 1 of 4) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 10804 NM_001287434 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 463.75-2 chr16 86048559 86048909 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 130387 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 239-25 chr18 73254208 73254448 + 2 NA intron (NR_034133, intron 2 of 5) L1MCa|LINE|L1 10170 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 350.5-19 chr3 119162592 119162818 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -10893 NM_006952 7348 Hs.271580 NM_006952 ENSG00000114638 UPK1B TSPAN20|UPIB|UPK1 uroplakin 1B protein-coding 272-5 chr10 53752377 53752584 + 2 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -733750 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 295.5-36 chr3 123791927 123792119 + 2 NA intron (NM_053025, intron 4 of 33) intron (NM_053025, intron 4 of 33) 92309 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 347-21 chr6 34746595 34746924 + 2 NA Intergenic Intergenic -10335 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 281-42 chr8 83391905 83392082 + 2 NA Intergenic Intergenic -11765 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 408.25 chr12 18682012 18682361 + 2 NA TTS (NM_001330774) TTS (NM_001330774) 55323 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 270 chr1 29164289 29164469 + 2 NA intron (NM_005626, intron 1 of 5) intron (NM_005626, intron 1 of 5) 17521 NM_005626 6429 Hs.469970 NM_005626 ENSG00000116350 SRSF4 SFRS4|SRP75 serine and arginine rich splicing factor 4 protein-coding 309.25-17 chr20 24758389 24758691 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -190729 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 286-26 chr3 120304003 120304246 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 45230 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 463.75-5 chr5 128202783 128203361 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 119306 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 222-11 chr10 25530430 25530635 + 2 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) intron (NM_020752, intron 5 of 10) -121180 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 423.5-5 chr2 146709052 146709349 + 2 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 122143 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 280.5-29 chr21 14651102 14651380 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -8134 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 541.5-5 chr21 30429054 30429591 + 2 NA promoter-TSS (NM_181600) promoter-TSS (NM_181600) -932 NM_181600 284827 Hs.553677 NM_181600 ENSG00000186971 KRTAP13-4 KAP13.4 keratin associated protein 13-4 protein-coding 234.75-68 chr6 124109692 124109894 + 2 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L1MB1|LINE|L1 -173212 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 499.5-3 chr8 106205346 106206017 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -64497 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 259-33 chr4 160092415 160092563 + 2 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -314705 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 234.75-5 chr1 100454945 100455184 + 2 NA intron (NM_001319212, intron 7 of 13) intron (NM_001319212, intron 7 of 13) -83075 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 308.75-19 chr18 2718309 2718508 + 2 NA exon (NM_015295, exon 19 of 48) exon (NM_015295, exon 19 of 48) 62521 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 281.75-42 chr7 107822653 107822925 + 2 NA Intergenic Intergenic -19556 NM_000111 1811 Hs.1650 NM_000111 ENSG00000091138 SLC26A3 CLD|DRA solute carrier family 26 member 3 protein-coding 526 chr2 196552236 196552505 + 2 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) L2b|LINE|L2 40613 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 426.5 chr17 47658756 47659070 + 2 NA intron (NM_002265, intron 5 of 21) intron (NM_002265, intron 5 of 21) 7848 NM_001276453 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 308-11 chr15 65228139 65228359 + 2 NA Intergenic Intergenic -16776 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 385.75-8 chr17 65053568 65053862 + 2 NA exon (NM_001282425, exon 2 of 4) exon (NM_001282425, exon 2 of 4) 2059 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 486-3 chr14 69613570 69614141 + 2 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 2259 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 308.5-42 chr9 96474226 96474418 + 2 NA intron (NM_014282, intron 5 of 7) intron (NM_014282, intron 5 of 7) 24153 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 353.75-11 chr20 15051295 15051707 + 2 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) MLT2C1|LTR|ERVL -121983 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 349.5-7 chr18 34627636 34627878 + 2 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) intron (NM_001198939, intron 1 of 21) 34422 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 337 chr1 52892807 52893046 + 2 NA exon (NM_001004339, exon 14 of 14) exon (NM_001004339, exon 14 of 14) 28814 NM_018281 55268 Hs.476319 NM_018281 ENSG00000121310 ECHDC2 - enoyl-CoA hydratase domain containing 2 protein-coding 391.75-2 chr14 75814452 75815044 + 2 NA intron (NM_015072, intron 27 of 31) intron (NM_015072, intron 27 of 31) 153502 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 312.5-41 chr9 28254872 28255059 + 2 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1PA13|LINE|L1 464340 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 299.5-34 chr6 39875629 39875838 + 2 NA intron (NM_015345, intron 11 of 24) MER3|DNA|hAT-Charlie 21647 NR_125831 100505635 Hs.668513 NR_125831 ENSG00000235033 LOC100505635 - uncharacterized LOC100505635 ncRNA 399.75-9 chr3 104958863 104959214 + 2 NA Intergenic Intergenic -407675 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 347.75-3 chr12 112668595 112668962 + 2 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) L1PA8|LINE|L1 26398 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 411.25-8 chr8 126307183 126307480 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -18164 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 300-3 chr1 73345466 73345670 + 2 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 39398 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 194-64 chr4 115628436 115628611 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -514903 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 398-9 chr4 46813004 46813338 + 2 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) L1MA5|LINE|L1 96074 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 311.25-22 chr6 80672969 80673236 + 2 NA Intergenic Intergenic 566431 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 254.25-10 chr10 72982575 72982742 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -27852 NM_032562 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 451.5-6 chr2 187806191 187806484 + 2 NA Intergenic Intergenic -251832 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 283.5-17 chr13 20319227 20319525 + 2 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -86981 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 250.5-28 chr14 61511104 61511334 + 2 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 58975 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 475-6 chr8 132776214 132776600 + 2 NA intron (NM_198513, intron 1 of 7) intron (NM_198513, intron 1 of 7) 1019 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 190-3 chr1 46180543 46180646 + 2 NA 5' UTR (NM_005727, exon 2 of 9) 5' UTR (NM_005727, exon 2 of 9) -4106 NM_001328655 110117498 Hs.655387 NM_001328655 ENSG00000250719 P3R3URF - PIK3R3 upstream reading frame protein-coding 352-15 chr8 90247502 90247828 + 2 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) L3|LINE|CR1 26177 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 397.25-7 chr2 133531226 133531539 + 2 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 37081 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 500.5 chr14 43258229 43258930 + 2 NA Intergenic Intergenic 1248704 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 148-16 chr11 113965797 113965896 + 2 NA Intergenic Intergenic -9229 NR_046363 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 453-6 chr8 121690934 121691341 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -49697 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 297-31 chr21 15206093 15206312 + 2 NA Intergenic Intergenic -141202 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 229.75-11 chr11 81265048 81265226 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -502334 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 408.5-4 chr14 53675647 53676088 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 272617 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 339-30 chr6 143039906 143040427 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -2584 NR_038987 100507489 Hs.486645 NR_038987 LINC01277 - long intergenic non-protein coding RNA 1277 ncRNA 201-85 chr9 27835899 27836012 + 2 NA Intergenic Intergenic -262089 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 383.5-13 chr8 50827936 50828329 + 2 NA Intergenic Intergenic 664001 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 532.25-5 chr6 27994683 27995214 + 2 NA Intergenic Intergenic 37707 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 283.25 chr1 71663657 71663929 + 2 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) HAL1ME|LINE|L1 173219 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 372.75-7 chr13 47361208 47361530 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -464293 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 446.5-7 chr5 102718679 102719221 + 2 NA Intergenic Intergenic -35833 NM_001319943 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 376-12 chr2 99809597 99809973 + 2 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) 295798 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 410.75-6 chr4 96654570 96654807 + 2 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 343985 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 183.5-5 chr1 87598444 87598577 + 2 NA Intergenic Intergenic -226855 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 472.75-6 chr8 10120548 10121045 + 2 NA intron (NM_001199729, intron 2 of 6) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 25145 NM_001199729 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 304-9 chr11 81580112 81580303 + 2 NA Intergenic Intergenic 310629 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 379.25-11 chr3 77890427 77890738 + 2 NA Intergenic Intergenic 158381 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 286.5-12 chr11 46112943 46113113 + 2 NA intron (NR_147890, intron 1 of 18) intron (NR_147890, intron 1 of 18) 7791 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 311.5-31 chr7 52032065 52032342 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -638947 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 212-54 chr22 46065533 46065788 + 2 NA non-coding (NR_148973, exon 2 of 2) non-coding (NR_148973, exon 2 of 2) 5361 NR_148973 642648 Hs.631363 NR_148973 LOC642648 - uncharacterized LOC642648 ncRNA 582-2 chr2 71068977 71069872 + 2 NA intron (NM_001365466, intron 1 of 9) intron (NM_001365466, intron 1 of 9) 776 NM_001330425 55577 Hs.7036 NM_017567 ENSG00000124357 NAGK GNK|HSA242910 N-acetylglucosamine kinase protein-coding 340.5-25 chr5 36746876 36747067 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 129723 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 399-5 chr5 52591607 52592014 + 2 NA Intergenic Intergenic -196106 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 290-25 chr2 33371590 33371802 + 2 NA intron (NM_206943, intron 31 of 33) intron (NM_206943, intron 31 of 33) -46820 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 269.75-27 chr18 1245213 1245464 + 2 NA Intergenic Intergenic 114291 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 358.25-17 chr6 49021734 49021921 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 441426 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 303.75-35 chr8 81876414 81876747 + 2 NA Intergenic Intergenic -34294 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 353-19 chr5 110331694 110331936 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 182100 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 235.5-19 chr10 116931566 116931739 + 2 NA intron (NM_001127211, intron 9 of 16) L1ME4b|LINE|L1 73535 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 333-5 chr11 87672250 87672462 + 2 NA Intergenic Intergenic 47055 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 403.25-10 chr6 55929256 55929574 + 2 NA Intergenic Intergenic -53825 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 255.25-50 chr8 27165752 27165958 + 2 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 92549 NM_030795 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 410.75-4 chr2 230210475 230210921 + 2 NA intron (NM_080424, intron 6 of 18) intron (NM_080424, intron 6 of 18) 9286 NM_004509 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 283.5-58 chr8 137614101 137614370 + 2 NA Intergenic Intergenic -200647 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 236.75-70 chrX 152160716 152160906 + 2 NA Intergenic Intergenic -22233 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 563.75-2 chr5 13020213 13020735 + 2 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 12412 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 236-58 chr5 145929520 145929782 + 2 NA Intergenic Intergenic -6927 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 295.75-19 chr3 97699536 97699822 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -64842 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 454.5 chr14 37303271 37303802 + 2 NA intron (NM_138731, intron 8 of 13) intron (NM_138731, intron 8 of 13) 105599 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 416.25-11 chr21 19657457 19657938 + 2 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 242058 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 316.5-21 chr2 196510767 196510985 + 2 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) 82107 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 181-19 chr12 28172698 28172921 + 2 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -17647 NM_001352081 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 246-35 chr2 140188415 140188569 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 398193 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 255-58 chr7 31593676 31593985 + 2 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) L1MC4a|LINE|L1 40828 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 329.5-26 chr6 104668416 104668648 + 2 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 191014 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 380.5-8 chr2 176546359 176546735 + 2 NA Intergenic Intergenic 54505 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 430.75-10 chr4 30751346 30751756 + 2 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 31182 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 439.25-2 chr11 13408704 13409059 + 2 NA intron (NM_032320, intron 6 of 8) L2a|LINE|L2 31398 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 272-25 chr3 100837221 100837444 + 2 NA intron (NM_001349331, intron 22 of 42) intron (NM_001349331, intron 22 of 42) 127790 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 368-4 chr14 60711027 60711214 + 2 NA 3' UTR (NM_017420, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_017420, exon 3 of 3) 13231 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 364.5-16 chr6 18589444 18589751 + 2 NA intron (NR_149116, intron 3 of 7) intron (NR_149116, intron 3 of 7) 17813 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 379.5-10 chr2 185661487 185661892 + 2 NA Intergenic Intergenic 77030 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 378-20 chr8 119910190 119910578 + 2 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 36662 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 523.5-6 chr8 124642154 124642726 + 2 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 86033 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 341.5-4 chr14 63493711 63493976 + 2 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 14395 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 245.25-31 chr19 15755554 15755730 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 14249 NM_013938 26532 Hs.553524 NM_013938 ENSG00000171936 OR10H3 - olfactory receptor family 10 subfamily H member 3 protein-coding 257.5-33 chr2 50323204 50323413 + 2 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MER5A|DNA|hAT-Charlie 24446 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 628.75-2 chr8 125915720 125916211 + 2 NA Intergenic Intergenic 35232 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 245.5-21 chr14 55121741 55121959 + 2 NA Intergenic Intergenic -7402 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 427.5-12 chr8 115711118 115711435 + 2 NA Intergenic Intergenic -42301 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 132-80 chr18 73657749 73657843 + 2 NA Intergenic Intergenic 332855 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 156.75-56 chr14 39423194 39423386 + 2 NA intron (NM_203301, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 9210 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 376.25-11 chr2 149270397 149270741 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -59416 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 320-37 chr8 137776367 137776577 + 2 NA Intergenic Intergenic 307073 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 282-19 chr17 50818142 50818316 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16355 NM_001330341 124857 Hs.211475 NM_175575 ENSG00000173714 WFIKKN2 GASP-1|WFDC20B|WFIKKNRP|hGASP-1 WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 protein-coding 328-18 chr20 459822 460113 + 2 NA intron (NR_111901, intron 1 of 9) intron (NR_111901, intron 1 of 9) 2566 NR_111901 128637 Hs.590876 NM_144628 ENSG00000125875 TBC1D20 C20orf140|WARBM4 TBC1 domain family member 20 protein-coding 250-40 chr4 41723884 41724058 + 2 NA Intergenic Intergenic 24999 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 496.25-4 chr18 9282599 9282893 + 2 NA 3' UTR (NM_015208, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_015208, exon 13 of 13) -52027 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 249.75-10 chr1 183149090 183149275 + 2 NA Intergenic Intergenic -7912 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 430.25-4 chr14 59995175 59995669 + 2 NA intron (NR_075071, intron 17 of 32) intron (NR_075071, intron 17 of 32) 75709 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 773 chr18 3604966 3605812 + 2 NA intron (NR_119377, intron 1 of 2) intron (NR_119377, intron 1 of 2) 1652 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 276-25 chr2 51071567 51071932 + 2 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1ME4a|LINE|L1 39148 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 371.5-12 chr5 107657768 107658088 + 2 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 13009 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 287.5-10 chr11 3351741 3351987 + 2 NA Intergenic Intergenic 27282 NM_001242843 7748 Hs.386294 NM_007152 ENSG00000005801 ZNF195 HRF1|ZNFP104 zinc finger protein 195 protein-coding 334-30 chr7 3683275 3683485 + 2 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 382128 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 319-20 chr2 203290943 203291238 + 2 NA intron (NM_177538, intron 10 of 12) AluJb|SINE|Alu -37149 NM_001282932 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 310.5-40 chr8 114090579 114090778 + 2 NA Intergenic Intergenic -653739 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 269.5-10 chr12 9972100 9972264 + 2 NA intron (NM_201623, intron 1 of 4) intron (NM_201623, intron 1 of 4) 773 NM_201623 160364 Hs.190519 NM_138337 ENSG00000172322 CLEC12A CD371|CLL-1|CLL1|DCAL-2|MICL C-type lectin domain family 12 member A protein-coding 390-10 chr4 113350859 113351091 + 2 NA intron (NM_001354275, intron 37 of 43) intron (NM_001354275, intron 37 of 43) 58136 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 341.25-7 chr11 45933595 45933841 + 2 NA non-coding (NR_147890, exon 19 of 19) non-coding (NR_147890, exon 19 of 19) 11062 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 334-25 chr5 3913264 3913580 + 2 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 317590 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 252-58 chr5 148556564 148556735 + 2 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 80412 NM_001040173 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 481.5-3 chr2 230997924 230998340 + 2 NA intron (NM_139073, intron 1 of 4) intron (NM_139073, intron 1 of 4) 2008 NM_139073 130560 Hs.745178 NM_139073 ENSG00000173699 SPATA3 TSARG1 spermatogenesis associated 3 protein-coding 303.75-9 chr10 55512198 55512516 + 2 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -86685 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 361.75-4 chr11 18192509 18192769 + 2 NA Intergenic Intergenic -16499 NR_026541 494141 Hs.446327 NR_026541 ENSG00000189332 SLC25A51P4 - SLC25A51 pseudogene 4 pseudo 253.25-11 chr11 11623391 11623624 + 2 NA Intergenic Intergenic -1502 NM_198516 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 229-58 chr4 107157113 107157360 + 2 NA Intergenic Intergenic -120923 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 426.75-4 chr2 119299424 119299734 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -50508 NR_046721 100874111 Hs.704682 NR_046721 ENSG00000229867 STEAP3-AS1 - STEAP3 antisense RNA 1 ncRNA 263-51 chr8 74269918 74270087 + 2 NA intron (NM_020647, intron 2 of 5) intron (NM_020647, intron 2 of 5) 51359 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 275.5-69 chr8 136172174 136172451 + 2 NA Intergenic Intergenic -358486 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 383.5-15 chr9 26941509 26941733 + 2 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 -5369 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 462-4 chr14 67017193 67017637 + 2 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -172025 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 291-14 chr14 60062692 60062874 + 2 NA intron (NR_075071, intron 32 of 32) intron (NR_075071, intron 32 of 32) -29128 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 506.75-3 chr4 125774051 125774393 + 2 NA Intergenic Intergenic 266963 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 219-70 chr3 65733903 65734114 + 2 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -159808 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 326.5-7 chr12 97420042 97420253 + 2 NA Intergenic Intergenic -42629 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 362-6 chr18 55642490 55642880 + 2 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -6728 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 517.25-5 chr8 85373760 85374209 + 2 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 4129 NM_001128829 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 431-6 chr3 89860947 89861342 + 2 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 753523 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 557 chr2 40296077 40296432 + 2 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 134050 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 382-14 chr3 23569569 23569912 + 2 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -236215 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 284.5-34 chr2 124011050 124011539 + 2 NA TTS (NR_147976) TTS (NR_147976) 13880 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 311-19 chr2 114806190 114806422 + 2 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) MIRc|SINE|MIR 27242 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 441.5-7 chr2 80765544 80766091 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 452438 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 240.75-64 chr5 91437575 91437869 + 2 NA Intergenic Intergenic -54405 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 301.25 chr1 17111359 17111579 + 2 NA intron (NM_007365, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 7982 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 233.25-36 chr2 123934773 123934903 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 90336 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 255-48 chr4 154410700 154410899 + 2 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) L1MA9|LINE|L1 81000 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 295-32 chr8 140934192 140934472 + 2 NA intron (NM_001352699, intron 1 of 35) FAM|SINE|Alu 66672 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 215-24 chr15 47530574 47530749 + 2 NA intron (NM_001198999, intron 3 of 19) intron (NM_001198999, intron 3 of 19) -186844 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 537-2 chr16 86915290 86915637 + 2 NA Intergenic Intergenic -142321 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 208-84 chr9 72730535 72730679 + 2 NA intron (NM_138691, intron 8 of 23) MER1A|DNA|hAT-Charlie 143502 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 292.25-22 chr20 10115239 10115508 + 2 NA intron (NR_040710, intron 2 of 4) intron (NR_040710, intron 2 of 4) 80386 NM_001303472 63926 Hs.70903 NM_022096 ENSG00000132623 ANKEF1 ANKRD5 ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 protein-coding 191-45 chr2 208427541 208427707 + 2 NA intron (NM_005048, intron 1 of 12) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 20794 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 322-19 chr3 65636744 65636973 + 2 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -256958 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 374-11 chr3 189847187 189847519 + 2 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) AluSx1|SINE|Alu 17431 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 233-41 chr22 34685331 34685486 + 2 NA Intergenic Intergenic 312508 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 546-2 chr3 94535028 94535564 + 2 NA Intergenic Intergenic -402967 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 213-84 chr6 152796107 152796311 + 2 NA Intergenic Intergenic 45412 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 458 chr11 42403041 42403283 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -149472 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 612.25 chr3 152383538 152384105 + 2 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) -42831 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 165.5-81 chr2 117389828 117389921 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -424817 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 278-11 chr14 86172212 86172451 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 237653 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 354.5-2 chr1 113579277 113579565 + 2 NA intron (NM_001142782, intron 2 of 20) L2c|LINE|L2 179734 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 222.25-29 chr19 38273119 38273273 + 2 NA intron (NM_001166103, intron 1 of 5) intron (NM_001166103, intron 1 of 5) 8623 NM_021102 10653 Hs.31439 NM_021102 ENSG00000167642 SPINT2 DIAR3|HAI-2|HAI2|Kop|PB serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2 protein-coding 144-85 chr3 101809606 101809692 + 2 NA intron (NM_001348997, intron 6 of 6) L1MC4a|LINE|L1 -18341 NM_001005474 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 329-27 chr4 72429721 72429962 + 2 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 139380 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 252-5 chr1 176031646 176031874 + 2 NA intron (NM_022457, intron 14 of 19) intron (NM_022457, intron 14 of 19) -63220 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 519.75 chr12 12894136 12894415 + 2 NA intron (NM_003979, intron 1 of 3) intron (NM_003979, intron 1 of 3) 3253 NM_003979 9052 Hs.631733 NM_003979 ENSG00000013588 GPRC5A GPCR5A|PEIG-1|RAI3|RAIG1|TIG1 G protein-coupled receptor class C group 5 member A protein-coding 217.5-127 chr8 114108504 114108720 + 2 NA Intergenic Intergenic -671673 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 453.75-7 chr20 2993952 2994201 + 2 NA intron (NM_080841, intron 8 of 22) ERVL-E-int|LTR|ERVL -49546 NM_178331 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 283-9 chr10 52806458 52806648 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -34853 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 261.5-38 chr21 24781063 24781306 + 2 NA Intergenic Intergenic -59366 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 330-7 chr14 50576123 50576371 + 2 NA intron (NM_015915, intron 1 of 13) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 16222 NM_015915 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 350-4 chr14 29692792 29693108 + 2 NA intron (NM_001330069, intron 2 of 18) intron (NM_001330069, intron 2 of 18) 234146 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 445.5-5 chr3 117043170 117043528 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 121918 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 370-17 chr8 83454910 83455151 + 2 NA Intergenic Intergenic 51272 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 292.25-15 chr14 56629934 56630320 + 2 NA intron (NM_017799, intron 12 of 15) L1MD2|LINE|L1 50329 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 478.25-3 chr8 105509518 105509899 + 2 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 190165 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 260.25-57 chr8 116671344 116671493 + 2 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 19318 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 323.25-21 chr5 94630159 94630448 + 2 NA intron (NM_032290, intron 3 of 20) intron (NM_032290, intron 3 of 20) 11634 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 289.5-32 chr3 9057153 9057443 + 2 NA intron (NM_014850, intron 7 of 21) intron (NM_014850, intron 7 of 21) -93826 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 514.5 chr10 28162224 28162504 + 2 NA intron (NR_134518, intron 2 of 16) L1M6B|LINE|L1 -88986 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 284-23 chr2 51452362 51452616 + 2 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) MER31A|LTR|ERV1 419888 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 314.75-14 chr4 72009716 72009963 + 2 NA Intergenic Intergenic -21965 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 314-23 chr8 77972253 77972436 + 2 NA Intergenic Intergenic 521647 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 160.5-48 chr14 33861875 33861986 + 2 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 89144 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 216.5-32 chr14 62389174 62389346 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -249287 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 480 chr14 52711997 52712306 + 2 NA intron (NR_158967, intron 6 of 14) intron (NR_158967, intron 6 of 14) 4951 NM_002806 5706 Hs.156171 NM_002806 ENSG00000100519 PSMC6 SUG2|p42 proteasome 26S subunit, ATPase 6 protein-coding 361.25-3 chr10 73590865 73591116 + 2 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) intron (NM_001350995, intron 1 of 21) 352 NR_135249 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 281-25 chr4 122243119 122243299 + 2 NA intron (NM_015312, intron 28 of 83) intron (NM_015312, intron 28 of 83) 72606 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 277-6 chr12 6465413 6465598 + 2 NA intron (NR_123717, intron 2 of 3) intron (NR_123717, intron 2 of 3) 5172 NM_001297438 6843 Hs.20021 NM_014231 ENSG00000139190 VAMP1 CMS25|SPAX1|SYB1|VAMP-1 vesicle associated membrane protein 1 protein-coding 281 chr1 68965714 68965962 + 2 NA Intergenic Intergenic -90060 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 279.75-24 chr2 112102596 112102789 + 2 NA intron (NM_001329914, intron 15 of 18) AluSx|SINE|Alu -35693 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 279.5-12 chr11 13760876 13761078 + 2 NA Intergenic Intergenic -23409 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 690 chr17 57876941 57877701 + 2 NA intron (NM_001271875, intron 3 of 10) intron (NM_001271875, intron 3 of 10) 26068 NM_001292025 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 302.5-37 chr5 121494507 121494699 + 2 NA Intergenic Intergenic 172053 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 388.75 chr1 62738823 62739100 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45145 NM_178221 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 561.75 chr2 51802471 51802986 + 2 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -567920 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 271.75-41 chr6 118668239 118668470 + 2 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) -16763 NM_206921 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 302.75-4 chr13 66805886 66806131 + 2 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -19161 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 260.5-63 chr8 49586058 49586256 + 2 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -73977 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 253.75-46 chr4 145799960 145800312 + 2 NA intron (NM_178835, intron 8 of 14) intron (NM_178835, intron 8 of 14) 119932 NM_001080531 646603 NM_001080531 ENSG00000237136 C4orf51 - chromosome 4 open reading frame 51 protein-coding 420-9 chr4 72098008 72098226 + 2 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 58985 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 182-102 chr7 77184541 77184680 + 2 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) 15209 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 461.5-3 chr16 76814118 76814555 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -54600 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 381-21 chr6 21519800 21520036 + 2 NA Intergenic Intergenic -8026 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 344.25-3 chr1 212940309 212940583 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -10095 NM_001301056 79805 Hs.96885 NM_024749 ENSG00000143494 VASH2 - vasohibin 2 protein-coding 401-7 chr18 71753714 71754113 + 2 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 28313 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 246-68 chr9 593658 593837 + 2 NA intron (NM_001256877, intron 2 of 12) intron (NM_001256877, intron 2 of 12) 89192 NM_001354334 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 446.5-6 chr5 36548433 36548813 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -57732 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 452.5-3 chr2 14947361 14947765 + 2 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 314846 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 293.75-37 chr4 100748828 100749192 + 2 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -73897 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 170-74 chr5 4915919 4916028 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -118386 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 344-21 chr6 38493078 38493338 + 2 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) 11612 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 209.75-67 chr4 31498399 31498572 + 2 NA Intergenic Intergenic -8059 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 359.75-3 chr10 41889178 41889631 + 2 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 478641 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 523-4 chr9 32759237 32759848 + 2 NA Intergenic Intergenic -23998 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 266-37 chr5 13764956 13765135 + 2 NA intron (NM_001369, intron 59 of 78) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 179435 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 221-63 chr5 24528400 24528668 + 2 NA intron (NM_001362460, intron 5 of 9) intron (NM_001362460, intron 5 of 9) 116444 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 307-25 chr3 190676385 190676626 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 162420 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 346.5-3 chr12 12881541 12881718 + 2 NA Intergenic Intergenic 6152 NR_003932 387841 Hs.631728 NR_003932 ENSG00000234498 RPL13AP20 RPL13A_9_1211 ribosomal protein L13a pseudogene 20 pseudo 280-22 chr17 17245491 17245691 + 2 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8423 NM_001353229 201163 Hs.31652 NM_144606 ENSG00000154803 FLCN BHD|DENND8B|FLCL folliculin protein-coding 240-45 chr5 2480058 2480254 + 2 NA Intergenic Intergenic -167955 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 484-2 chr16 64863713 64864056 + 2 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 258179 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 300-28 chr3 191018362 191018522 + 2 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 140512 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 156.75-85 chr2 106816272 106816370 + 2 NA intron (NM_001142352, intron 5 of 5) intron (NM_001142352, intron 5 of 5) 69707 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 477.25-2 chr4 47335760 47336276 + 2 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 127684 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 417.5-12 chr6 164821776 164822256 + 2 NA promoter-TSS (NR_131926) promoter-TSS (NR_131926) 47 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 465-6 chr9 26005426 26005792 + 2 NA Intergenic Intergenic -61066 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 319.5-12 chr12 45428637 45428970 + 2 NA intron (NM_001142679, intron 19 of 19) intron (NM_001142679, intron 19 of 19) 136113 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 390-5 chr2 59830726 59831115 + 2 NA Intergenic Intergenic 552116 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 294.25-13 chr15 86949153 86949316 + 2 NA intron (NR_135683, intron 1 of 2) L1ME3A|LINE|L1 16354 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 212-85 chr8 131499887 131500189 + 2 NA Intergenic Intergenic -404055 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 424.5-5 chr2 624966 625250 + 2 NA Intergenic Intergenic 51596 NM_001352681 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 231-21 chr12 99410043 99410223 + 2 NA intron (NM_152788, intron 11 of 25) MER58B|DNA|hAT-Charlie -237620 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 312-32 chr8 135525753 135526042 + 2 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 68441 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 322-9 chr14 85052637 85052812 + 2 NA Intergenic Intergenic -219208 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 259-15 chr12 22062967 22063142 + 2 NA intron (NR_135117, intron 6 of 6) intron (NR_135117, intron 6 of 6) 16836 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 545 chr10 23629563 23630058 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -64917 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 209.5-140 chr8 60172663 60172836 + 2 NA Intergenic Intergenic 108651 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 464-4 chr3 6687208 6687658 + 2 NA intron (NR_110123, intron 2 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118016 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 282-17 chr15 62754036 62754306 + 2 NA intron (NM_015059, intron 33 of 55) intron (NM_015059, intron 33 of 55) -69786 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 303-6 chr13 70287076 70287392 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -178741 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 257.5-40 chr20 16417988 16418193 + 2 NA intron (NM_001199866, intron 15 of 22) L1MD2|LINE|L1 155358 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 333.5-25 chr9 76392753 76392950 + 2 NA intron (NM_018339, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 1575 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 290.5-4 chr1 216215704 216215877 + 2 NA intron (NM_206933, intron 15 of 71) intron (NM_206933, intron 15 of 71) 143325 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 419.25-8 chr6 47875264 47875557 + 2 NA Intergenic Intergenic 88342 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 593.25 chr4 152561582 152562272 + 2 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 25499 NR_039658 100616193 NR_039658 ENSG00000283792 MIR4453 - microRNA 4453 ncRNA 349.5-10 chr2 127880581 127880978 + 2 NA intron (NM_001199140, intron 2 of 7) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4081 NM_031445 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 357.25-16 chr8 122769676 122769980 + 2 NA Intergenic Intergenic -11827 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 339.5-10 chr11 121527491 121527762 + 2 NA intron (NM_003105, intron 11 of 47) L1ME1|LINE|L1 75312 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 484.75 chr12 56252119 56252460 + 2 NA exon (NM_173595, exon 14 of 28) exon (NM_173595, exon 14 of 28) 6095 NM_173595 283373 Hs.524506 NM_173595 ENSG00000139645 ANKRD52 ANKRD33 ankyrin repeat domain 52 protein-coding 248.75-22 chr14 68189166 68189414 + 2 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 365698 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 262-24 chr18 71279685 71279947 + 2 NA Intergenic Intergenic 299140 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 278.5-27 chr2 14466227 14466448 + 2 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -65379 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 282.5-18 chr15 82148831 82149133 + 2 NA intron (NM_001040610, intron 16 of 17) L3|LINE|CR1 60388 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 367.25-4 chr15 94234047 94234398 + 2 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 -63979 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 235.75-43 chr22 33365149 33365402 + 2 NA intron (NM_133642, intron 9 of 14) L1M5|LINE|L1 71394 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 208.75-39 chr2 117756851 117756998 + 2 NA Intergenic Intergenic -57767 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 218.75-57 chr3 104939313 104939442 + 2 NA Intergenic Intergenic -427336 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 381.5-9 chr8 125131260 125131564 + 2 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) intron (NM_001349486, intron 3 of 7) 39552 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 316.75-7 chr18 5704876 5705215 + 2 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -43774 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 322.5-43 chr9 28167628 28167969 + 2 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 551507 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 223-38 chr2 53548965 53549131 + 2 NA Intergenic Intergenic -218735 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 307-9 chr12 21204931 21205152 + 2 NA intron (NM_006446, intron 10 of 14) intron (NM_006446, intron 10 of 14) 73847 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 411-9 chr8 122595058 122595448 + 2 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -26609 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 356.75-4 chr1 217966652 217966914 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 73883 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 391.25-3 chr1 221922844 221923225 + 2 NA intron (NR_149057, intron 1 of 3) intron (NR_149057, intron 1 of 3) -43376 NR_149071 110806276 NR_149071 LINC02474 - long intergenic non-protein coding RNA 2474 ncRNA 345.5-29 chr7 111547170 111547373 + 2 NA intron (NM_001350959, intron 2 of 7) intron (NM_001350959, intron 2 of 7) 15020 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 442-4 chr3 88018614 88019056 + 2 NA Intergenic Intergenic 36259 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 225-51 chr4 31700412 31700599 + 2 NA Intergenic Intergenic 193961 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 286-33 chr5 144008925 144009168 + 2 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 161613 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 323 chr1 68423953 68424311 + 2 NA Intergenic Intergenic 25822 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 340.25-19 chr8 125245395 125245623 + 2 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) L1MD|LINE|L1 153649 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 346-22 chr7 84006722 84007018 + 2 NA intron (NM_006080, intron 10 of 16) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 187919 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 134.75-68 chr14 60747777 60747885 + 2 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 13070 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 163.75-62 chr2 26943344 26943649 + 2 NA intron (NM_020134, intron 11 of 12) AluJb|SINE|Alu -27141 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 630.75-2 chr9 27000061 27000779 + 2 NA intron (NM_022901, intron 1 of 4) intron (NM_022901, intron 1 of 4) 5252 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 303-24 chr5 32258295 32258465 + 2 NA intron (NM_001294344, intron 7 of 13) intron (NM_001294344, intron 7 of 13) 54559 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 310.75-2 chr1 111104520 111104701 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -34773 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 340.25-14 chr4 71275454 71275789 + 2 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) MIR3|SINE|MIR -63432 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 317.75-22 chr3 192572711 192572917 + 2 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 57792 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 367.5-9 chr11 34711265 34711485 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 78809 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 254.25-36 chr20 42235814 42235992 + 2 NA intron (NM_133170, intron 16 of 31) intron (NM_133170, intron 16 of 31) -449580 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 244.75-20 chr14 57374522 57374744 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -15953 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 493-4 chr7 69663039 69663536 + 2 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 64812 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 410.5-3 chr12 98685106 98685497 + 2 NA intron (NM_001160, intron 15 of 25) L1MC5a|LINE|L1 40001 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 174-78 chr5 144548794 144548910 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 343461 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 178.75-85 chr5 80423347 80423443 + 2 NA intron (NR_146172, intron 2 of 20) L1PA5|LINE|L1 15331 NM_001284236 9765 Hs.482660 NM_014733 ENSG00000039319 ZFYVE16 PPP1R69 zinc finger FYVE-type containing 16 protein-coding 311-31 chr8 92325879 92326068 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -222588 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 510 chr20 49036383 49036949 + 2 NA TTS (NM_006420) TTS (NM_006420) 9390 NR_110624 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 367-6 chr2 147333119 147333351 + 2 NA Intergenic Intergenic -511282 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 410.5-8 chr2 161770112 161770668 + 2 NA intron (NM_001354443, intron 2 of 25) intron (NM_001354443, intron 2 of 25) 145974 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 471.5 chr1 56149150 56149557 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 204266 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 292.5-46 chr7 3690409 3690655 + 2 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 389280 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 269-46 chr7 114065682 114065878 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -20547 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 297.5 chr1 42625461 42625784 + 2 NA intron (NM_001080850, intron 11 of 16) L1MA4A|LINE|L1 -32801 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 271-3 chr1 195831256 195831419 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 257378 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 256.75-20 chr17 61865552 61865870 + 2 NA 3' UTR (NM_020748, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_020748, exon 25 of 25) -2152 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 385-12 chr2 222880113 222880394 + 2 NA intron (NM_001354159, intron 1 of 14) intron (NM_001354159, intron 1 of 14) 19217 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 412-3 chr14 53051249 53051584 + 2 NA intron (NM_030637, intron 11 of 11) intron (NM_030637, intron 11 of 11) -100319 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 238.75-21 chr15 60549549 60549711 + 2 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) 42896 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 271-28 chr22 28892653 28892830 + 2 NA intron (NM_001206998, intron 1 of 8) intron (NM_001206998, intron 1 of 8) 9169 NM_001206998 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 170-68 chr4 34507594 34507761 + 2 NA Intergenic Intergenic -237930 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 442.5-6 chr7 92047028 92047569 + 2 NA intron (NM_147185, intron 21 of 49) AluSx1|SINE|Alu 87179 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 229.5-39 chr14 66193168 66193315 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -293130 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 186-27 chr14 59246657 59246806 + 2 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) L1MB2|LINE|L1 -16710 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 322.5-32 chr6 46340824 46341014 + 2 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) intron (NR_125838, intron 2 of 3) -15027 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 391.5-11 chr17 59024876 59025159 + 2 NA intron (NR_148346, intron 19 of 23) intron (NR_148346, intron 19 of 23) 81863 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 711.25 chr10 83372146 83373143 + 2 NA Intergenic Intergenic 304445 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 337-16 chr2 48751858 48752054 + 2 NA intron (NM_000233, intron 1 of 10) intron (NM_000233, intron 1 of 10) 3768 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 240.5-30 chr14 63218458 63218645 + 2 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 14108 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 346-14 chr3 191715677 191715927 + 2 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 254639 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 236.5-54 chr20 58749679 58749819 + 2 NA Intergenic Intergenic -23676 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 320-28 chr4 35237454 35237675 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -967817 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 401.75-8 chr4 31790256 31790502 + 2 NA Intergenic Intergenic -207000 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 286-21 chr2 99633178 99633377 + 2 NA intron (NM_001025108, intron 12 of 23) intron (NM_001025108, intron 12 of 23) -143260 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 605.75 chr12 51809228 51809908 + 2 NA 3' UTR (NM_001177984, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001177984, exon 26 of 26) 22349 NM_001013690 401720 Hs.648218 NM_001013690 ENSG00000261308 FIGNL2 - fidgetin like 2 protein-coding 488 chr3 164684587 164685052 + 2 NA Intergenic Intergenic 146661 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 236-34 chr2 194583712 194583928 + 2 NA Intergenic Intergenic -146775 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 306-14 chr2 37040834 37041401 + 2 NA intron (NM_019024, intron 19 of 35) intron (NM_019024, intron 19 of 35) 43255 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 345.25-5 chr13 88384337 88384600 + 2 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -156361 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 582.5 chr14 66342713 66343146 + 2 NA Intergenic Intergenic -143442 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 252-9 chr10 68804218 68804419 + 2 NA Intergenic Intergenic -23213 NM_001130161 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 191.5-30 chr12 88027451 88027589 + 2 NA intron (NM_001363616, intron 1 of 11) intron (NM_001363616, intron 1 of 11) 1881 NM_152589 160419 Hs.112930 NM_152589 ENSG00000165805 C12orf50 - chromosome 12 open reading frame 50 protein-coding 490.75-5 chr6 24478051 24478488 + 2 NA intron (NM_001503, intron 3 of 24) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 11309 NM_001503 2822 Hs.533291 NM_001503 ENSG00000112293 GPLD1 GPIPLD|GPIPLDM|PIGPLD|PIGPLD1|PLD glycosylphosphatidylinositol specific phospholipase D1 protein-coding 246.25-56 chr5 157161618 157161829 + 2 NA TTS (NM_130899) TTS (NM_130899) 4541 NM_130899 153745 Hs.666099 NM_130899 ENSG00000170613 FAM71B - family with sequence similarity 71 member B protein-coding 279-13 chr15 58415914 58416075 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -15997 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 177.5-145 chr5 113133961 113134109 + 2 NA intron (NM_001085377, intron 5 of 18) L1MA4|LINE|L1 157237 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 269.75-23 chr15 61941738 61941884 + 2 NA exon (NM_017684, exon 44 of 83) exon (NM_017684, exon 44 of 83) 118636 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 338.75-6 chr14 80004212 80004388 + 2 NA Intergenic Intergenic -207119 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 229.75-71 chr7 101738248 101738378 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -77694 NM_001202543 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 249.5-3 chr1 50818040 50818252 + 2 NA intron (NM_007051, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 142121 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 383-12 chr21 29737531 29737828 + 2 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -10496 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 179-60 chr2 164624187 164624312 + 2 NA Intergenic Intergenic -2767 NM_004490 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 214.75-14 chr10 122965749 122965942 + 2 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -11618 NM_024942 80007 Hs.501286 NM_024942 ENSG00000119965 C10orf88 - chromosome 10 open reading frame 88 protein-coding 320-29 chr4 52020712 52020953 + 2 NA promoter-TSS (NM_001024611) promoter-TSS (NM_001024611) -469 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 214.5-91 chr4 99433210 99433442 + 2 NA intron (NM_000673, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 1808 NM_001166504 131 Hs.389 NM_000673 ENSG00000196344 ADH7 ADH4 alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide protein-coding 289-34 chr5 83722719 83723091 + 2 NA Intergenic Intergenic -2050 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 403.25 chr12 16863953 16864570 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -124486 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 326.25-12 chr14 51787731 51788122 + 2 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 70643 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 311-20 chr2 191410635 191410998 + 2 NA intron (NM_012223, intron 24 of 28) intron (NM_012223, intron 24 of 28) 165412 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 307.5-35 chr3 60175592 60175921 + 2 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -94847 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 184-90 chr8 65319731 65319866 + 2 NA Intergenic Intergenic -139458 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 516.25-2 chr4 63936787 63937256 + 2 NA Intergenic Intergenic 472429 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 349-13 chr8 62276662 62276947 + 2 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 27950 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 190-26 chr18 60930806 60930921 + 2 NA Intergenic Intergenic -402567 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 206.75-42 chr2 195679081 195679199 + 2 NA intron (NM_020342, intron 1 of 9) MER3|DNA|hAT-Charlie 21914 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 168.5-131 chr4 61882417 61882595 + 2 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) L2a|LINE|L2 279259 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 325.5-8 chr12 115377853 115378219 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -693861 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 245-4 chr1 177161904 177162097 + 2 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) 2712 NM_001364856 460 Hs.495897 NM_004319 ENSG00000152092 ASTN1 ASTN astrotactin 1 protein-coding 247-24 chr17 39871129 39871353 + 2 NA intron (NM_198844, intron 2 of 6) intron (NM_198844, intron 2 of 6) 3039 NM_198844 124626 Hs.367245 NM_198844 ENSG00000186075 ZPBP2 ZPBPL zona pellucida binding protein 2 protein-coding 303-21 chr3 103575700 103575930 + 2 NA Intergenic Intergenic -51699 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 534-2 chr16 83875535 83875906 + 2 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -23395 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 286-31 chr4 157712258 157712516 + 2 NA Intergenic Intergenic 139897 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 395.75-12 chr9 37150027 37150539 + 2 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 29685 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 262.75-36 chr3 101269116 101269396 + 2 NA intron (NM_016247, intron 8 of 18) intron (NM_016247, intron 8 of 18) 51319 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 233-42 chr3 7774838 7774954 + 2 NA Intergenic Intergenic -239612 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 382-21 chr5 63000730 63000969 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 422030 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 345.5-3 chr1 101324864 101325252 + 2 NA intron (NR_126402, intron 1 of 4) intron (NR_126402, intron 1 of 4) 1221 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 416.5-3 chr14 64252418 64252736 + 2 NA intron (NR_073496, intron 5 of 7) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 30498 NM_001271876 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 338-31 chr8 98798654 98798960 + 2 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) AluJr4|SINE|Alu 26864 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 451-3 chr6 137765096 137765466 + 2 NA Intergenic Intergenic -26244 NR_121618 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 412.25-7 chr2 27928529 27928894 + 2 NA intron (NM_199193, intron 3 of 13) intron (NM_199193, intron 3 of 13) -37597 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 162-30 chr12 27474154 27474344 + 2 NA intron (NM_001145010, intron 3 of 8) L1MC4|LINE|L1 7439 NM_001145010 341346 Hs.282121 NM_001145010 ENSG00000165935 SMCO2 C12orf70 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2 protein-coding 223-21 chr12 48291099 48291251 + 2 NA Intergenic Intergenic -37805 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 247.75-11 chr14 33995778 33995995 + 2 NA Intergenic Intergenic -44812 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 153.5-32 chr11 41350744 41350854 + 2 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L1P4e|LINE|L1 108837 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 409-8 chr6 146419513 146419937 + 2 NA intron (NM_001278067, intron 7 of 7) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -124108 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 329.5-14 chr21 22936637 22936915 + 2 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -142508 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 258.25-21 chr14 49953599 49953829 + 2 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -12685 NR_106724 102464828 NR_106724 ENSG00000278038 MIR6076 hsa-mir-6076 microRNA 6076 ncRNA 544 chr11 38282713 38283115 + 2 NA Intergenic Intergenic 344313 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 224-41 chr5 3041025 3041190 + 2 NA Intergenic Intergenic 123253 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 314-8 chr14 40760469 40760652 + 2 NA Intergenic Intergenic -194151 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 154.5-186 chr8 84896779 84896949 + 2 NA intron (NM_001287244, intron 7 of 7) intron (NM_001287244, intron 7 of 7) 190937 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 485.5-5 chr4 128035480 128035962 + 2 NA intron (NM_001366038, intron 13 of 13) intron (NM_001366038, intron 13 of 13) -25591 NM_032239 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 198.5-35 chr13 80669919 80670029 + 2 NA Intergenic Intergenic -328848 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 272-27 chr3 146392278 146392539 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 76893 NM_001199978 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 200-82 chr7 3871966 3872149 + 2 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) L1MCa|LINE|L1 -257628 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 178.5-170 chr7 79609627 79609772 + 2 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 155739 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 420-11 chr5 8930562 8930853 + 2 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 90975 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 393.75-2 chr11 107649725 107650223 + 2 NA intron (NM_001308018, intron 8 of 12) intron (NM_001308018, intron 8 of 12) 58827 NM_018712 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 509 chr14 55484922 55485413 + 2 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -44622 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 263-26 chr2 134937973 134938229 + 2 NA intron (NR_135468, intron 3 of 9) intron (NR_135468, intron 3 of 9) 19279 NM_001320748 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 300-27 chr3 178742065 178742338 + 2 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 118204 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 473.75-2 chr11 95785181 95785693 + 2 NA intron (NM_001330357, intron 4 of 9) intron (NM_001330357, intron 4 of 9) 4345 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 494.5-5 chr5 112786197 112786546 + 2 NA intron (NM_001354899, intron 6 of 14) intron (NM_001354899, intron 6 of 14) 48486 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 252.25-50 chr5 129873714 129873911 + 2 NA Intergenic Intergenic -30653 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 216.25-11 chr10 26236951 26237090 + 2 NA intron (NM_000818, intron 7 of 16) intron (NM_000818, intron 7 of 16) 20246 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 466-5 chr9 92724942 92725290 + 2 NA intron (NM_001003800, intron 2 of 6) intron (NM_001003800, intron 2 of 6) 39717 NM_015250 23299 Hs.436939 NM_015250 ENSG00000185963 BICD2 SMALED2|SMALED2A|SMALED2B|bA526D8.1 BICD cargo adaptor 2 protein-coding 320.25-18 chr22 25830833 25831132 + 2 NA intron (NM_001318245, intron 15 of 43) L1ME4a|LINE|L1 88794 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 247-58 chr7 53435509 53435731 + 2 NA Intergenic Intergenic 376311 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 223-33 chr17 69198592 69198734 + 2 NA intron (NM_080282, intron 11 of 39) LTR33B|LTR|ERVL 36349 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 352.75-10 chr2 186698020 186698538 + 2 NA intron (NM_177454, intron 1 of 7) intron (NM_177454, intron 1 of 7) 4219 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 446.75-2 chr10 108835307 108835928 + 2 NA Intergenic Intergenic -766324 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 343.75-15 chr7 32021822 32022312 + 2 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 48340 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 240-17 chr14 61440413 61440589 + 2 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 119058 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 385-7 chr18 12526893 12527280 + 2 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) L3|LINE|CR1 94312 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 269.75-5 chr1 224961110 224961257 + 2 NA intron (NM_001349911, intron 4 of 10) MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 31508 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 287-17 chr15 35568592 35568861 + 2 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) intron (NR_038251, intron 1 of 2) 22531 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 357.5-6 chr13 79643663 79643870 + 2 NA Intergenic Intergenic 77039 NR_125772 103724388 Hs.434862 NR_125772 ENSG00000227676 LINC01068 - long intergenic non-protein coding RNA 1068 ncRNA 324.5-19 chr21 21442554 21442840 + 2 NA intron (NM_001352592, intron 13 of 18) L2a|LINE|L2 294622 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 395.75-9 chr3 21147458 21147726 + 2 NA Intergenic Intergenic -258134 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 184-70 chr5 41837415 41837539 + 2 NA intron (NM_001364301, intron 7 of 16) intron (NM_001364301, intron 7 of 16) 6180 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 251-16 chr12 44001423 44001649 + 2 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 165455 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 417-12 chr7 113547140 113547427 + 2 NA Intergenic Intergenic 371726 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 254.25-72 chr8 138526265 138526447 + 2 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -28626 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 406.75-2 chr1 113196981 113197377 + 2 NA non-coding (NR_038846, exon 3 of 3) non-coding (NR_038846, exon 3 of 3) 9074 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 326.25-33 chr8 125434530 125434857 + 2 NA intron (NM_025195, intron 2 of 2) intron (NM_025195, intron 2 of 2) 2484 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 337-17 chr2 163334695 163335129 + 2 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL 401096 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 391-8 chr16 72224229 72224557 + 2 NA Intergenic Intergenic -51943 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 418.25-8 chr21 30261808 30262148 + 2 NA Intergenic Intergenic 20972 NM_001085455 643803 Hs.580883 NM_001085455 ENSG00000188694 KRTAP24-1 KAP24.1 keratin associated protein 24-1 protein-coding 430.75-11 chr5 20501005 20501369 + 2 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 74526 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 204.75-77 chr3 147288650 147288837 + 2 NA Intergenic Intergenic 103687 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 244-10 chr12 21131335 21131622 + 2 NA intron (NM_006446, intron 1 of 14) intron (NM_006446, intron 1 of 14) 284 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 267.75-18 chr15 52417895 52418066 + 2 NA intron (NM_001142495, intron 4 of 39) L2c|LINE|L2 110900 NM_001142495 4644 Hs.21213 NM_000259 ENSG00000197535 MYO5A GS1|MYH12|MYO5|MYR12 myosin VA protein-coding 203-14 chr10 81161337 81161532 + 2 NA Intergenic Intergenic 511637 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 173-50 chr15 94099064 94099190 + 2 NA intron (NR_120320, intron 1 of 8) L1M4a2|LINE|L1 8811 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 341.75-15 chr3 83026036 83026551 + 2 NA Intergenic Intergenic 1040151 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 410.25 chr1 118399844 118400205 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -214796 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 348-13 chr3 75189501 75189779 + 2 NA Intergenic Intergenic -24836 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 286-32 chr5 85965 86196 + 2 NA Intergenic Intergenic -6088 NM_052909 153478 Hs.535800 NM_052909 ENSG00000153404 PLEKHG4B - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B protein-coding 269.25-28 chr22 23054729 23054875 + 2 NA Intergenic Intergenic -15717 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 295-14 chr17 29934048 29934252 + 2 NA intron (NM_001145053, intron 1 of 14) Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -3922 NM_001282130 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 450.75-2 chr2 192740306 192740751 + 2 NA Intergenic Intergenic -9317 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 570.75 chr12 126927410 126928029 + 2 NA intron (NR_104646, intron 4 of 6) AluSz6|SINE|Alu -53029 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 258-26 chr2 152365993 152366152 + 2 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 30898 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 286.75-17 chr2 37561353 37561601 + 2 NA Intergenic Intergenic 110722 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 361.75-7 chr14 25080517 25080859 + 2 NA Intergenic Intergenic -30391 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 224.5-101 chr7 52876347 52876610 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -159155 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 266.25-28 chr2 193559026 193559239 + 2 NA Intergenic Intergenic -785137 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 548 chr1 49567289 49567813 + 2 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) intron (NR_136623, intron 2 of 12) -95466 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 389.25-10 chrX 36305749 36306191 + 2 NA intron (NM_001304548, intron 54 of 63) intron (NM_001304548, intron 54 of 63) 134322 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 430.5-3 chr14 55659339 55659663 + 2 NA intron (NR_073129, intron 31 of 45) intron (NR_073129, intron 31 of 45) 79294 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 229-76 chr9 76801522 76801671 + 2 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) intron (NM_001308048, intron 6 of 17) 37160 NR_132312 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 422-5 chr2 117498439 117498727 + 2 NA Intergenic Intergenic -316108 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 268.75-24 chr21 28200946 28201303 + 2 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) intron (NR_126012, intron 3 of 5) 27543 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 436.75-2 chr11 43970530 43970904 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 28080 NM_001145033 387763 Hs.530443 NM_001145033 ENSG00000187479 C11orf96 AG2 chromosome 11 open reading frame 96 protein-coding 268-34 chr20 32944095 32944264 + 2 NA intron (NM_001143967, intron 23 of 26) L1ME3A|LINE|L1 60254 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 507-5 chr8 26764934 26765381 + 2 NA TTS (NM_033304) TTS (NM_033304) 100498 NM_033303 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 517.25-2 chr5 20185011 20185449 + 2 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 -120321 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 218-62 chr6 152684626 152684792 + 2 NA Intergenic Intergenic -13186 NM_025107 80177 Hs.18160 NM_025107 ENSG00000120279 MYCT1 MTLC MYC target 1 protein-coding 268.25-11 chr13 113920425 113920699 + 2 NA intron (NM_001278674, intron 6 of 7) intron (NM_001278674, intron 6 of 7) 8429 NR_047495 100861555 Hs.353773 NR_047495 ENSG00000260910 LINC00565 - long intergenic non-protein coding RNA 565 ncRNA 224.5-93 chr6 71018296 71018500 + 2 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -61338 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 373-6 chr2 129868166 129868558 + 2 NA intron (NR_149127, intron 3 of 5) intron (NR_149127, intron 3 of 5) 9129 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 243-72 chr8 6181996 6182218 + 2 NA Intergenic Intergenic 224441 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 309.25-29 chr9 70796848 70797112 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 6 of 25) AluJr|SINE|Alu 13104 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 212.75-56 chr20 33496501 33496735 + 2 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) intron (NM_001032999, intron 1 of 10) 6522 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 247.25-15 chr13 73864881 73865078 + 2 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 268950 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 217-4 chr1 203228803 203228993 + 2 NA intron (NR_045784, intron 1 of 12) intron (NR_045784, intron 1 of 12) 775 NM_003465 1118 Hs.201688 NM_003465 ENSG00000133063 CHIT1 CHI3|CHIT|CHITD chitinase 1 protein-coding 220.25-79 chr8 140203852 140204015 + 2 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -103398 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 172.5-155 chr5 63879484 63879622 + 2 NA Intergenic Intergenic 82739 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 272-33 chr6 54088697 54088923 + 2 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -22633 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 662.5-2 chr9 95982301 95982712 + 2 NA intron (NM_020207, intron 17 of 18) intron (NM_020207, intron 17 of 18) 39305 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 385.25-2 chr14 43163653 43163943 + 2 NA Intergenic Intergenic 1343485 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 261-69 chr9 111725795 111726049 + 2 NA intron (NM_173521, intron 11 of 25) intron (NM_173521, intron 11 of 25) 33614 NM_001080551 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 219.5-12 chr1 244166271 244166422 + 2 NA Intergenic Intergenic 113141 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 290.75-42 chr4 55037841 55038073 + 2 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 87638 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 226.75-55 chr3 166970086 166970262 + 2 NA Intergenic Intergenic 71491 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 231-46 chr22 24032430 24032566 + 2 NA intron (NM_001199281, intron 1 of 36) L1MB3|LINE|L1 21128 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 360-14 chr7 110147239 110147567 + 2 NA Intergenic Intergenic -187190 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 390.5 chr11 85204403 85204668 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) L1MA4|LINE|L1 -281114 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 482-4 chr6 11430309 11430905 + 2 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -48259 NM_001142393 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 229.5-51 chr17 55535310 55535602 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -113621 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 251-5 chr1 113261159 113261381 + 2 NA Intergenic Intergenic -55017 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 509.5-5 chr3 14748335 14748736 + 2 NA intron (NM_001184957, intron 12 of 16) L1M4|LINE|L1 62879 NR_135245 152274 Hs.434128 NR_135245 ENSG00000260902 LINC02011 - long intergenic non-protein coding RNA 2011 ncRNA 408-17 chr9 93770283 93770675 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -48878 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 218.75-3 chr1 181179350 181179497 + 2 NA intron (NR_125966, intron 2 of 2) MLT2C1|LTR|ERVL 4939 NR_125966 101928973 Hs.637822 NR_125966 ENSG00000237292 LINC01732 - long intergenic non-protein coding RNA 1732 ncRNA 188.5-169 chr9 100297591 100297726 + 2 NA intron (NR_134606, intron 15 of 16) intron (NR_134606, intron 15 of 16) 54913 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 515.75 chr1 221148632 221149078 + 2 NA Intergenic Intergenic 187441 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 208.25-59 chr3 81779194 81779367 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -17635 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 216-76 chr7 77398835 77398988 + 2 NA intron (NM_001350901, intron 1 of 27) L1ME3G|LINE|L1 -16287 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 341-25 chr8 18137173 18137501 + 2 NA Intergenic Intergenic -33130 NM_001291962 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 263-12 chr11 120551241 120551477 + 2 NA intron (NM_014619, intron 1 of 20) MER21A|LTR|ERVL -13077 NM_001282470 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 607.25 chr12 4938771 4939361 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 29161 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 623 chr7 40072805 40073539 + 2 NA intron (NM_003718, intron 9 of 13) intron (NM_003718, intron 9 of 13) 61450 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 569-2 chr22 24747355 24747845 + 2 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) L1MA2|LINE|L1 -16901 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 295.75-3 chr10 84227168 84227418 + 2 NA Intergenic Intergenic -1704 NM_001284223 340745 Hs.450425 NM_001017924 ENSG00000204033 LRIT2 LRRC22 leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 2 protein-coding 417.75-3 chr3 146801535 146802005 + 2 NA Intergenic Intergenic -120153 NR_135561 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 225.25-39 chr2 28277562 28277720 + 2 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) intron (NM_199193, intron 11 of 13) 32818 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 430.75-14 chr9 27757023 27757531 + 2 NA Intergenic Intergenic -183411 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 693.25 chr3 26004789 26005563 + 2 NA Intergenic Intergenic -131481 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 267.5-16 chr12 42530145 42530422 + 2 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -46273 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 432-13 chr5 81336971 81337438 + 2 NA intron (NM_130767, intron 11 of 14) intron (NM_130767, intron 11 of 14) 35617 NM_001131035 84240 Hs.15536 NM_032280 ENSG00000131732 ZCCHC9 PPP1R41 zinc finger CCHC-type containing 9 protein-coding 524.25-4 chr16 80245220 80245611 + 2 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1MEf|LINE|L1 -295319 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 276.25-47 chr9 18328189 18328388 + 2 NA Intergenic Intergenic -145865 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 232-58 chr4 47342333 47342489 + 2 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 121291 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 344.5 chr1 40178260 40178556 + 2 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 17021 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 355.5-10 chr15 50047771 50047975 + 2 NA intron (NR_073597, intron 3 of 26) L3|LINE|CR1 65506 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 403-10 chr8 86391969 86392376 + 2 NA intron (NM_007013, intron 5 of 24) intron (NM_007013, intron 5 of 24) 49625 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 264-59 chr7 107267813 107268035 + 2 NA intron (NM_181733, intron 14 of 20) intron (NM_181733, intron 14 of 20) 98921 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 392-17 chr5 126464114 126464494 + 2 NA promoter-TSS (NM_001146322) promoter-TSS (NM_001146322) -846 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 261.5-26 chr2 33068658 33068900 + 2 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) MER58D|DNA|hAT-Charlie -65818 NM_001166264 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 519.5-2 chr10 38527392 38527937 + 2 NA Intergenic Intergenic 99518 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 358.75-13 chr6 24273278 24273515 + 2 NA intron (NM_016356, intron 7 of 9) L1PB4|LINE|L1 -83507 NM_181337 353219 Hs.697888 NM_181337 ENSG00000146049 KAAG1 RU2AS kidney associated antigen 1 protein-coding 401.5-20 chr7 52583789 52584207 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -451635 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 398.5-12 chr3 64565441 64565731 + 2 NA intron (NR_110151, intron 1 of 1) intron (NR_110151, intron 1 of 1) 4240 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 473.25-5 chr2 55411730 55412319 + 2 NA intron (NM_001254943, intron 2 of 33) intron (NM_001254943, intron 2 of 33) 7832 NM_001254943 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 359.75-4 chr12 78991598 78991846 + 2 NA intron (NM_001291901, intron 2 of 9) intron (NM_001291901, intron 2 of 9) -53970 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 455-4 chr5 20694954 20695436 + 2 NA intron (NR_149120, intron 3 of 11) intron (NR_149120, intron 3 of 11) -79660 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 411-8 chr5 52054765 52054996 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 46849 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 328.5-15 chr15 63515670 63516110 + 2 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) HAL1|LINE|L1 11297 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 253-46 chr6 55894817 55895042 + 2 NA Intergenic Intergenic -19339 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 437-4 chr19 11737902 11738127 + 2 NA intron (NM_001080493, intron 1 of 3) intron (NM_001080493, intron 1 of 3) 932 NM_001080493 55552 Hs.142167 NM_017507 ENSG00000197933 ZNF823 HSZFP36 zinc finger protein 823 protein-coding 548.5-2 chr5 3745609 3746052 + 2 NA Intergenic Intergenic 149998 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 233.5-55 chr2 123187563 123187775 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -114188 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 405.5 chr11 69565660 69566019 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -75266 NM_053056 595 Hs.523852 NM_053056 ENSG00000110092 CCND1 BCL1|D11S287E|PRAD1|U21B31 cyclin D1 protein-coding 405.25-13 chr7 50395050 50395378 + 2 NA intron (NM_001220765, intron 6 of 6) HAL1b|LINE|L1 55136 NM_001287492 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 145-158 chr8 127120541 127120632 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -38365 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 395-7 chr17 80575537 80575823 + 2 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) L1ME3B|LINE|L1 30842 NM_001163034 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 379.25-9 chr22 22663973 22664322 + 2 NA Intergenic Intergenic 17835 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 342.75-25 chr7 1848345 1848776 + 2 NA intron (NM_001013837, intron 18 of 18) intron (NM_001013837, intron 18 of 18) -4307 NR_039799 100616160 NR_039799 ENSG00000265089 MIR4655 - microRNA 4655 ncRNA 341-18 chr21 31476259 31476507 + 2 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 82704 NM_001353688 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 360-13 chr7 6020211 6020602 + 2 NA intron (NM_001326606, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 3529 NR_145771 109616999 NR_145771 ENSG00000207217 SNORA80D - small nucleolar RNA, H/ACA box 80D snoRNA 459.75 chr10 89451980 89452381 + 2 NA intron (NM_213606, intron 3 of 7) MER45B|DNA|hAT-Tip100 -3811 NR_120614 101926906 Hs.568874 NR_120614 ENSG00000234452 SLC16A12-AS1 - SLC16A12 antisense RNA 1 ncRNA 439.25-8 chr3 78011703 78012187 + 2 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 37018 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 324-30 chr8 113149263 113149632 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 227705 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 453.25-3 chr18 52941037 52941387 + 2 NA intron (NM_005215, intron 5 of 28) intron (NM_005215, intron 5 of 28) -295889 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 180.5-169 chrX 86683335 86683488 + 2 NA intron (NM_001139515, intron 4 of 11) intron (NM_001139515, intron 4 of 11) 420443 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 438.5-11 chr7 43369616 43369955 + 2 NA intron (NM_001287059, intron 5 of 27) intron (NM_001287059, intron 5 of 27) 152757 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 250.75-27 chr2 196951649 196951788 + 2 NA Intergenic Intergenic -25011 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 275-20 chr18 65347121 65347270 + 2 NA Intergenic Intergenic -403057 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 251-43 chr4 137970346 137970532 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -118575 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 409.5-5 chr11 98441881 98442208 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -578905 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 382-20 chr5 46397416 46397728 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -701192 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 535.25-2 chr18 54875934 54876482 + 2 NA intron (NM_004163, intron 1 of 5) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 47731 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 459.5-7 chr4 135465906 135466316 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -342552 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 279.25-41 chr9 31484771 31485237 + 2 NA Intergenic Intergenic -103514 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 178.75-23 chr13 35249342 35249451 + 2 NA intron (NM_015678, intron 34 of 57) L1M4|LINE|L1 227293 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 180-70 chr2 213989697 213989815 + 2 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) intron (NR_047660, intron 11 of 14) 231689 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 497-5 chr4 41584059 41584632 + 2 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) -28364 NM_001330982 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 395-2 chr1 185073191 185073486 + 2 NA intron (NM_007212, intron 1 of 6) intron (NM_007212, intron 1 of 6) 27780 NM_007212 6045 Hs.591490 NM_007212 ENSG00000121481 RNF2 BAP-1|BAP1|DING|HIPI3|RING1B|RING2 ring finger protein 2 protein-coding 245.5-50 chr3 108488510 108488731 + 2 NA intron (NM_014981, intron 10 of 41) L1MA9|LINE|L1 40702 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 343.5-8 chr13 89907754 89908059 + 2 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 211811 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 207-41 chr19 44347897 44348040 + 2 NA intron (NM_001348281, intron 1 of 4) L1MDa|LINE|L1 8712 NM_001348284 7771 Hs.48589 NM_013380 ENSG00000062370 ZNF112 ZFP112|ZNF228 zinc finger protein 112 protein-coding 338.5-17 chr2 192126120 192126475 + 2 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 68636 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 414-8 chr2 115043812 115044219 + 2 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1MA3|LINE|L1 -20558 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 324.75-21 chr3 190358882 190359087 + 2 NA Intergenic Intergenic -28888 NM_006580 10686 Hs.251391 NM_006580 ENSG00000113946 CLDN16 HOMG3|PCLN1 claudin 16 protein-coding 332.25-14 chr16 78147922 78148179 + 2 NA intron (NM_001291997, intron 3 of 7) intron (NM_001291997, intron 3 of 7) 48396 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 313.75-8 chr17 65185883 65186153 + 2 NA intron (NM_003835, intron 9 of 18) intron (NM_003835, intron 9 of 18) 48648 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 714.75 chr7 28782191 28783005 + 2 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 96465 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 273.25-18 chr2 124440900 124441278 + 2 NA intron (NM_130773, intron 5 of 23) intron (NM_130773, intron 5 of 23) 415802 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 171-122 chr7 6690117 6690232 + 2 NA 3' UTR (NM_016265, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_016265, exon 5 of 5) 16773 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 459.5-4 chr12 126113688 126114059 + 2 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 17881 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 405-5 chr16 35679126 35679383 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -67298 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 505.5-3 chr3 151215176 151215446 + 2 NA intron (NM_001081455, intron 2 of 2) MER33|DNA|hAT-Charlie -12095 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 361.5-15 chr5 76310341 76310569 + 2 NA intron (NM_001297716, intron 12 of 12) L2a|LINE|L2 -92830 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 240-66 chr8 125816506 125816734 + 2 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 134577 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 351-10 chr17 73205801 73206051 + 2 NA intron (NM_018714, intron 10 of 13) intron (NM_018714, intron 10 of 13) 12871 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 568.25 chr11 102355184 102355734 + 2 NA intron (NM_001256163, intron 3 of 8) L1MA9|LINE|L1 8085 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 414.25-10 chr8 79169119 79169398 + 2 NA Intergenic Intergenic -162930 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 262.5-66 chr7 4086938 4087167 + 2 NA intron (NM_152744, intron 22 of 44) intron (NM_152744, intron 22 of 44) -42633 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 520 chr13 33134969 33135348 + 2 NA intron (NM_178007, intron 4 of 13) L3|LINE|CR1 50933 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 337-20 chr22 32463179 32463419 + 2 NA Intergenic Intergenic -5913 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 442-2 chr2 10062208 10062586 + 2 NA intron (NM_001037160, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 18014 NM_001037160 192668 Hs.27092 NM_001037160 ENSG00000205795 CYS1 - cystin 1 protein-coding 475-5 chr5 29693712 29693981 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -186714 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 228-64 chr5 116322755 116322957 + 2 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 51714 NR_104675 101927190 Hs.639849 NR_104675 LOC101927190 - uncharacterized LOC101927190 ncRNA 250.5-37 chr18 1902762 1902993 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -543248 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 398.5-5 chr17 63296436 63296780 + 2 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) L1MB5|LINE|L1 143659 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 393-6 chr2 7329707 7329945 + 2 NA Intergenic Intergenic -91435 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 354-11 chr17 44243743 44244084 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -22609 NR_045058 7343 Hs.89781 NM_014233 ENSG00000108312 UBTF CONDBA|NOR-90|UBF|UBF-1|UBF1|UBF2 upstream binding transcription factor protein-coding 303-30 chr7 88573967 88574140 + 2 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -185647 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 204.75-101 chr6 93576582 93576739 + 2 NA Intergenic Intergenic -127357 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 301.5-14 chr11 91207757 91207949 + 2 NA Intergenic Intergenic -338651 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 393.5-4 chr14 66274416 66274764 + 2 NA Intergenic Intergenic -211781 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 358.5 chr1 215166100 215166399 + 2 NA intron (NM_001017424, intron 3 of 6) intron (NM_001017424, intron 3 of 6) 83512 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 489-4 chr2 176650102 176650399 + 2 NA intron (NR_110599, intron 2 of 3) intron (NR_110599, intron 2 of 3) 12496 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 245-37 chr21 42358486 42358618 + 2 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -7558 NM_005423 7032 Hs.2979 NM_005423 ENSG00000160181 TFF2 SML1|SP trefoil factor 2 protein-coding 219.5-129 chr8 122354678 122354927 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 213842 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 395.5-5 chr14 50407381 50407740 + 2 NA Intergenic Intergenic -10262 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 319-5 chr12 5173993 5174272 + 2 NA Intergenic Intergenic 69019 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 323-17 chr3 187109425 187109659 + 2 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 29954 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 153-104 chr4 32740139 32740245 + 2 NA Intergenic Intergenic 389154 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 449.25-3 chr10 61647055 61647521 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15641 NM_001366909 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 278.25-3 chr1 80004121 80004324 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -531533 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 236-32 chr2 106970786 106970923 + 2 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -83745 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 261.5-60 chr6 137505035 137505175 + 2 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10711 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 222.5-116 chr8 135640081 135640550 + 2 NA intron (NM_006558, intron 7 of 8) L2|LINE|L2 182859 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 282.25-7 chr10 124951301 124951576 + 2 NA intron (NM_017580, intron 1 of 8) intron (NM_017580, intron 1 of 8) 9315 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 533.75-2 chrX 8866935 8867305 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -65737 NM_174951 171482 Hs.382062 NM_174951 ENSG00000183304 FAM9A TEX39A family with sequence similarity 9 member A protein-coding 255.5-66 chr5 46178266 46178516 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -482011 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 361.75-15 chr6 88616948 88617372 + 2 NA intron (NM_001286428, intron 12 of 13) AluY|SINE|Alu -77791 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 307.5-30 chr2 161541726 161541914 + 2 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -33918 NR_077058 285116 Hs.470435 NR_077058 AHCTF1P1 AHCTF1P|ELYS-like AT-hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 pseudo 321-8 chr13 64478441 64478753 + 2 NA Intergenic Intergenic -402586 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 429.25-6 chr8 125848571 125849035 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 102394 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 433.75-8 chr2 63165120 63165441 + 2 NA intron (NR_148704, intron 16 of 18) L1MC4|LINE|L1 -45738 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 295.75-29 chr7 7133110 7133373 + 2 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -36455 NR_034022 100131257 Hs.551110 NR_034022 LOC100131257 - zinc finger protein 655 pseudogene pseudo 371-11 chr17 65942755 65943155 + 2 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) intron (NM_001353129, intron 18 of 26) -116412 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 327-6 chr12 963690 963912 + 2 NA intron (NM_001297419, intron 1 of 11) L1MC|LINE|L1 -14079 NM_001297421 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 244-52 chr6 159469893 159470085 + 2 NA Intergenic Intergenic 86458 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 386-10 chr2 180518558 180518834 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -173408 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 404.5-2 chr15 71170761 71171068 + 2 NA intron (NR_120349, intron 1 of 1) L1MEc|LINE|L1 18145 NR_120349 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 433.5-8 chr7 47536642 47536993 + 2 NA intron (NM_022748, intron 1 of 30) CpG 45294 NM_022748 64759 Hs.520814 NM_022748 ENSG00000136205 TNS3 TEM6|TENS1 tensin 3 protein-coding 422-10 chr5 19215386 19215739 + 2 NA Intergenic Intergenic 670710 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 293-29 chr4 80756882 80757078 + 2 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -273728 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 401.75-5 chr3 15983313 15983805 + 2 NA Intergenic Intergenic 109788 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 388.5-11 chr2 112771609 112772041 + 2 NA Intergenic Intergenic -7216 NM_001304361 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 353.25-4 chr12 115077219 115077464 + 2 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -393166 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 416.25-7 chr17 55523017 55523234 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -101290 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 316.25-15 chr3 151545744 151545919 + 2 NA Intergenic Intergenic 20164 NR_049818 100847036 NR_049818 ENSG00000264330 MIR5186 - microRNA 5186 ncRNA 361.75-10 chr17 15382155 15382533 + 2 NA Intergenic Intergenic -40747 NM_031898 64518 Hs.414648 NM_031898 ENSG00000125409 TEKT3 - tektin 3 protein-coding 216.25-70 chr3 110822830 110823106 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 246991 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 226.5-15 chr12 18665191 18665374 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 72227 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 215-69 chr7 33574800 33574954 + 2 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -330038 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 333-15 chr3 75972019 75972275 + 2 NA Intergenic Intergenic -186598 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 323.5-3 chr10 73188184 73188460 + 2 NA intron (NM_173348, intron 3 of 13) L1ME2|LINE|L1 20203 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 300.25-7 chr13 78831894 78832130 + 2 NA intron (NR_046869, intron 1 of 4) intron (NR_046869, intron 1 of 4) 8038 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 372-19 chr9 29536239 29536603 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -322820 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 303-32 chr8 82696997 82697236 + 2 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -214988 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 272.5-2 chr1 48271169 48271392 + 2 NA Intergenic Intergenic 48564 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 217.75-38 chr2 67543199 67543471 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 146002 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 232-39 chr2 114615846 114616066 + 2 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) L2b|LINE|L2 154379 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 218.5-19 chr10 46229933 46230060 + 2 NA intron (NR_103828, intron 2 of 2) L1PB4|LINE|L1 39612 NR_103828 100996567 Hs.546758 NR_103827 ANTXRLP1 - ANTXR like pseudogene 1 pseudo 274-15 chr15 74769640 74769958 + 2 NA Intergenic Intergenic -12281 NM_001127190 1445 Hs.77793 NM_004383 ENSG00000103653 CSK - C-terminal Src kinase protein-coding 382-24 chr8 107087464 107087834 + 2 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 248866 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 290.75-47 chr7 50201201 50201452 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -102738 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 451-4 chr7 15181256 15181599 + 2 NA Intergenic Intergenic -206569 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 369 chr10 4608674 4609037 + 2 NA Intergenic Intergenic -47301 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 235.5-18 chr10 103199974 103200147 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6754 NM_001351176 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 327.5-18 chr2 208916454 208916661 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 373915 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 512.25-2 chr17 60601184 60601935 + 2 NA intron (NM_003620, intron 1 of 5) intron (NM_003620, intron 1 of 5) 1376 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 556 chr5 33696752 33697372 + 2 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) intron (NM_001324512, intron 3 of 21) 194928 NM_030955 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 349-7 chr17 32598693 32598902 + 2 NA intron (NM_001303279, intron 21 of 21) intron (NM_001303279, intron 21 of 21) 111804 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 469-5 chr9 27734161 27734545 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -160487 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 259.5-76 chr5 26369202 26369354 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 669308 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 151.25-197 chr8 135556751 135556887 + 2 NA intron (NM_006558, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 99363 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 280-35 chr3 45717036 45717270 + 2 NA intron (NM_001319071, intron 7 of 19) intron (NM_001319071, intron 7 of 19) 27757 NM_001319072 22908 Hs.156509 NM_014016 ENSG00000211456 SACM1L SAC1 SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase protein-coding 282-16 chr14 67825602 67825789 + 2 NA intron (NM_133509, intron 3 of 10) intron (NM_133509, intron 3 of 10) 2103 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 412.5-9 chr4 42002035 42002488 + 2 NA intron (NM_006345, intron 2 of 17) L1MEd|LINE|L1 11731 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 465 chr11 103907490 103908092 + 2 NA 3' UTR (NM_033135, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_033135, exon 7 of 7) 57885 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 268-61 chr8 122419413 122419620 + 2 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 149128 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 298.75-14 chr13 105310903 105311156 + 2 NA Intergenic Intergenic -154838 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 283.5-32 chr2 198418027 198418221 + 2 NA Intergenic Intergenic -43027 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 200.5-72 chr2 150936757 150936959 + 2 NA Intergenic Intergenic 307961 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 546.5-2 chr5 10141663 10141954 + 2 NA Intergenic Intergenic 108080 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 281-20 chr3 33681238 33681529 + 2 NA intron (NM_001365634, intron 6 of 35) L1MC5|LINE|L1 -21704 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 321-14 chr2 5764492 5764881 + 2 NA Intergenic Intergenic 47910 NR_146954 105373400 Hs.97467 NR_146954 ENSG00000237266 LINC01810 - long intergenic non-protein coding RNA 1810 ncRNA 416-8 chr22 26683248 26683675 + 2 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 10618 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 362-14 chr5 65823503 65823861 + 2 NA 3' UTR (NM_020726, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_020726, exon 13 of 13) 101477 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 227-3 chr1 69159244 69159435 + 2 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 103441 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 353.5-3 chr11 111951496 111951809 + 2 NA intron (NM_001037954, intron 1 of 19) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 14309 NM_001037954 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 165.25-147 chr9 28845829 28845929 + 2 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 17827 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 262-3 chr1 40466137 40466288 + 2 NA Intergenic Intergenic -11078 NM_001320178 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 526.25-3 chr4 147426329 147426608 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -54449 NM_001166055 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 232-21 chr16 83581579 83581726 + 2 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) AluJo|SINE|Alu 73306 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 236-44 chr3 98764561 98764773 + 2 NA intron (NM_001323368, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR 1360 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 234-73 chr9 97935598 97935784 + 2 NA intron (NM_018437, intron 3 of 4) intron (NM_018437, intron 3 of 4) 2481 NM_197978 55363 Hs.176626 NM_018437 ENSG00000136929 HEMGN CT155|EDAG|EDAG-1|NDR hemogen protein-coding 323.25-20 chr5 57707340 57707600 + 2 NA Intergenic Intergenic 56810 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 578.25 chr15 61994467 61995053 + 2 NA intron (NM_001018088, intron 16 of 81) AluSg|SINE|Alu 65687 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 376-21 chr8 126057445 126057654 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -106352 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 228.25-28 chr14 53860115 53860281 + 2 NA Intergenic Intergenic 88286 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 269.5-36 chr4 31110106 31110356 + 2 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -60913 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 276.5-25 chr16 20672666 20672857 + 2 NA intron (NM_001318890, intron 4 of 13) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18495 NM_052956 116285 Hs.306812 NM_052956 ENSG00000166743 ACSM1 BUCS1|MACS1 acyl-CoA synthetase medium chain family member 1 protein-coding 294-35 chr9 70962500 70962745 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -93570 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 515-2 chr3 134298462 134298917 + 2 NA Intergenic (AACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14887 NR_146711 105374119 NR_146711 ENSG00000240006 LINC02004 - long intergenic non-protein coding RNA 2004 ncRNA 353.25-18 chr3 111579909 111580148 + 2 NA intron (NM_001318889, intron 4 of 7) intron (NM_001318889, intron 4 of 7) 15318 NM_024508 79413 Hs.136912 NM_024508 ENSG00000177494 ZBED2 - zinc finger BED-type containing 2 protein-coding 303.75-12 chr14 47896014 47896471 + 2 NA Intergenic Intergenic -101228 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 153-133 chr6 138676478 138676568 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -15145 NR_033896 441172 Hs.92290 NR_033896 FLJ46906 - uncharacterized LOC441172 ncRNA 191-44 chr2 199081597 199081719 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 376281 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 326.25-25 chr4 70102918 70103148 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -30571 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 265.75-49 chr3 66298184 66298449 + 2 NA intron (NM_001350992, intron 4 of 8) intron (NM_001350992, intron 4 of 8) 77313 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 226-52 chr5 44585859 44586077 + 2 NA Intergenic Intergenic -75686 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 291-36 chr9 25091283 25091474 + 2 NA Intergenic Intergenic -545481 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 263.5-20 chr16 35346236 35346528 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -17034 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 173 chr1 53956930 53957136 + 2 NA intron (NM_001256409, intron 3 of 8) intron (NM_001256409, intron 3 of 8) 10683 NM_052940 115353 Hs.40094 NM_052940 ENSG00000116212 LRRC42 dJ167A19.4 leucine rich repeat containing 42 protein-coding 383.25-24 chr7 13268346 13268683 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 580881 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 347.25-22 chr7 25820814 25821072 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -30824 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 343 chr1 46669181 46669469 + 2 NA promoter-TSS (NM_001042546) promoter-TSS (NM_001042546) -898 NM_022745 64756 Hs.100874 NM_022745 ENSG00000123472 ATPAF1 ATP11|ATP11p ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 protein-coding 289.5-41 chr5 74748295 74748590 + 2 NA intron (NR_104006, intron 7 of 19) L1ME2|LINE|L1 18675 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 526.25-2 chr2 188620176 188620498 + 2 NA Intergenic Intergenic 169786 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 471.75-6 chr9 29749501 29749898 + 2 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -536098 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 305.5-23 chr2 121732179 121732363 + 2 NA intron (NM_032390, intron 2 of 6) intron (NM_032390, intron 2 of 6) 4604 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 144.5-22 chr1 195104690 195104846 + 2 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 983947 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 227.75-52 chr3 152120257 152120507 + 2 NA Intergenic Intergenic 85047 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 705 chr4 38454468 38455024 + 2 NA intron (NR_110951, intron 2 of 7) intron (NR_110951, intron 2 of 7) -55021 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 379.75-16 chrX 118069983 118070218 + 2 NA intron (NM_001168301, intron 1 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46765 NM_001168303 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 380-15 chr4 99254745 99255054 + 2 NA intron (NR_037884, intron 4 of 9) intron (NR_037884, intron 4 of 9) -35653 NR_132990 130 Hs.586161 NM_000672 ENSG00000172955 ADH6 ADH-5 alcohol dehydrogenase 6 (class V) protein-coding 150.25-39 chr12 17584840 17584972 + 2 NA intron (NR_146522, intron 2 of 4) intron (NR_146522, intron 2 of 4) 4172 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 377.5-4 chr14 53542394 53542609 + 2 NA Intergenic Intergenic 389147 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 618.75 chr1 86292071 86292756 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 65274 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 393-10 chr3 195471425 195471696 + 2 NA Intergenic Intergenic -28540 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 440.25-5 chr6 124676460 124676899 + 2 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) AluJr|SINE|Alu -285866 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 615-2 chr5 21186562 21186988 + 2 NA Intergenic Intergenic -272705 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 270.5-27 chr18 14023254 14023547 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -107693 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 247.25-26 chr19 28652078 28652387 + 2 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 45544 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 474 chr16 54402581 54402873 + 2 NA Intergenic Intergenic -32028 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 503.5-2 chr6 55491356 55491811 + 2 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) intron (NR_109869, intron 3 of 4) 87631 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 380-18 chr5 83345666 83345883 + 2 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) intron (NM_022550, intron 7 of 7) -125900 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 458-5 chr5 136631903 136632164 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -266557 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 364.5-9 chr15 68241168 68241500 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -11606 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 838 chr17 82317442 82318242 + 2 NA promoter-TSS (NM_006137) promoter-TSS (NM_006137) -234 NM_006137 924 Hs.36972 NM_006137 ENSG00000173762 CD7 GP40|LEU-9|TP41|Tp40 CD7 molecule protein-coding 387-8 chr22 34549056 34549364 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 448706 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 253-36 chr4 36270415 36270564 + 2 NA intron (NR_122080, intron 2 of 2) intron (NR_122080, intron 2 of 2) -11127 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 371-16 chr3 16232081 16232387 + 2 NA TTS (NM_001319051) TTS (NM_001319051) 15458 NM_001319052 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 168.5-15 chr1 172949346 172949526 + 2 NA Intergenic Intergenic 101527 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 210-54 chr2 114088803 114088962 + 2 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -108898 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 306.75-17 chr4 144215185 144215515 + 2 NA Intergenic Intergenic -74632 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 418.5-9 chr8 96439972 96440369 + 2 NA Intergenic Intergenic -52732 NR_125828 102724804 Hs.571415 NR_125828 ENSG00000253105 LOC102724804 - uncharacterized LOC102724804 ncRNA 391-14 chr7 38114932 38115176 + 2 NA Intergenic Intergenic -63191 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 399.5-4 chr3 8018234 8018523 + 2 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -2071 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 269-27 chr19 28424336 28424562 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -182239 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 442-3 chr2 214956243 214956661 + 2 NA intron (NR_103740, intron 44 of 54) MIRb|SINE|MIR 75634 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 344.5-31 chr8 105156707 105156995 + 2 NA Intergenic Intergenic -161587 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 470.5-3 chr14 81603250 81603811 + 2 NA Intergenic Intergenic 19531 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 496.25-2 chr1 214384929 214385494 + 2 NA intron (NM_005401, intron 12 of 18) intron (NM_005401, intron 12 of 18) 104052 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 329.5-5 chr15 97864026 97864274 + 2 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 10279 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 201-84 chr9 26902532 26902724 + 2 NA TTS (NM_001031689) TTS (NM_001031689) -9800 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 172-97 chr6 28331281 28331425 + 2 NA intron (NM_030899, intron 1 of 3) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 4781 NM_001243243 64288 Hs.656413 NM_030899 ENSG00000235109 ZSCAN31 ZNF20-Lp|ZNF310P|ZNF323 zinc finger and SCAN domain containing 31 protein-coding 257-51 chr6 74754287 74754529 + 2 NA Intergenic Intergenic 374374 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 188.75-65 chr2 206976255 206976399 + 2 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 36809 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 469.75 chr1 42514488 42514765 + 2 NA intron (NM_001355227, intron 6 of 18) L1MB7|LINE|L1 -18394 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 321.75-6 chr12 39725770 39726213 + 2 NA intron (NR_135051, intron 12 of 18) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 99808 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 162-131 chrX 88220159 88220242 + 2 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -527025 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 184.25-119 chr8 49759780 49759898 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -149957 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 249.25-6 chr12 32911630 32911904 + 2 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -14921 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 125-64 chr2 9330492 9330724 + 2 NA intron (NM_003887, intron 7 of 27) intron (NM_003887, intron 7 of 27) 91983 NR_134951 9270 Hs.467662 NM_004763 ENSG00000119185 ITGB1BP1 ICAP-1A|ICAP-1B|ICAP-1alpha|ICAP1|ICAP1A|ICAP1B integrin subunit beta 1 binding protein 1 protein-coding 268.5-40 chr3 124459687 124459865 + 2 NA intron (NM_001024660, intron 23 of 59) intron (NM_001024660, intron 23 of 59) 85444 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 162.5-109 chr3 30731279 30731401 + 2 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 124739 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 307.25-2 chr1 165768118 165768355 + 2 NA promoter-TSS (NR_125374) promoter-TSS (NR_125374) 632 NM_001366129 54499 Hs.31498 NM_019026 ENSG00000143183 TMCO1 HP10122|PCIA3|PNAS-136|TMCC4 transmembrane and coiled-coil domains 1 protein-coding 312.5-40 chr8 142066470 142066690 + 2 NA Intergenic Intergenic -109759 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 377-18 chr8 137633835 137634184 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -220421 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 166.5-3 chr1 17891268 17891380 + 2 NA Intergenic Intergenic 135991 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 311-25 chr5 97654505 97654748 + 2 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) L1MA9|LINE|L1 149930 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 270-29 chr20 6124618 6124776 + 2 NA Intergenic Intergenic -1153 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 359-14 chr6 161278400 161278816 + 2 NA Intergenic Intergenic -4547 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 300.5-26 chr2 180155482 180155768 + 2 NA Intergenic Intergenic -148328 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 399.75-3 chr1 53323768 53324091 + 2 NA intron (NM_004631, intron 2 of 18) L2c|LINE|L2 4141 NM_001018054 7804 Hs.280387 NM_004631 ENSG00000157193 LRP8 APOER2|HSZ75190|LRP-8|MCI1 LDL receptor related protein 8 protein-coding 375.5-15 chr20 35386291 35386759 + 2 NA intron (NM_018244, intron 2 of 9) intron (NM_018244, intron 2 of 9) 25448 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 412-2 chr11 44271182 44271569 + 2 NA intron (NM_021926, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 38764 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 366.25 chr1 83965504 83965700 + 2 NA intron (NM_001350214, intron 1 of 21) intron (NM_001350214, intron 1 of 21) 33530 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 400.5 chr10 72912758 72913197 + 2 NA intron (NR_130125, intron 5 of 7) intron (NR_130125, intron 5 of 7) 19238 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 293.75-42 chr7 78936256 78936540 + 2 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -72590 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 257-52 chr6 74873779 74873990 + 2 NA Intergenic Intergenic 254898 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 294.75-7 chr12 101938902 101939194 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 61468 NM_018370 55332 Hs.525634 NM_018370 ENSG00000136048 DRAM1 DRAM DNA damage regulated autophagy modulator 1 protein-coding 211-71 chr9 111818755 111818954 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -23917 NR_109816 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 308-29 chr6 165165080 165165385 + 2 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 144373 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 253.5-46 chr21 31701490 31701753 + 2 NA intron (NM_020706, intron 6 of 19) intron (NM_020706, intron 6 of 19) 30497 NM_001145444 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 310-23 chr6 127020944 127021186 + 2 NA Intergenic Intergenic -97606 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 346-6 chr12 5853526 5853847 + 2 NA intron (NM_001278596, intron 4 of 25) intron (NM_001278596, intron 4 of 25) 91573 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 325.25-32 chr8 60476386 60476596 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -40419 NM_001242644 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 281.75-19 chr15 84134313 84134502 + 2 NA Intergenic Intergenic 36577 NR_033787 440299 Hs.454641 NR_033787 DNM1P41 DNM1DN11-6|DNM1DN11.6|DNM1DN11@ dynamin 1 pseudogene 41 pseudo 417-7 chr2 33809585 33809883 + 2 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) L1ME3E|LINE|L1 -81517 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 415-2 chr17 48848188 48848638 + 2 NA exon (NM_001261395, exon 3 of 12) exon (NM_001261395, exon 3 of 12) 17378 NM_001261393 10241 Hs.514920 NM_005831 ENSG00000136436 CALCOCO2 NDP52 calcium binding and coiled-coil domain 2 protein-coding 400.5-3 chr14 82596771 82597079 + 2 NA Intergenic Intergenic -45707 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 271.5-28 chr16 53923326 53923487 + 2 NA intron (NM_001363894, intron 8 of 9) intron (NM_001363894, intron 8 of 9) -115987 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 387.5-5 chr14 72382850 72383064 + 2 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1ME3D|LINE|L1 -133863 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 132-184 chr9 18321898 18321980 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -152214 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 292.25-11 chr12 15043709 15043902 + 2 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 41972 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 240.75-49 chr21 30257303 30257492 + 2 NA Intergenic Intergenic 25553 NM_001085455 643803 Hs.580883 NM_001085455 ENSG00000188694 KRTAP24-1 KAP24.1 keratin associated protein 24-1 protein-coding 390.5-4 chr14 46070927 46071294 + 2 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 6951 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 265-14 chr17 58010613 58010812 + 2 NA Intergenic Intergenic -3366 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 331-20 chr2 224576873 224577236 + 2 NA intron (NM_003590, intron 1 of 15) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -7099 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 501.25 chr10 101686539 101686947 + 2 NA intron (NM_001323541, intron 1 of 8) intron (NM_001323541, intron 1 of 8) 8427 NR_136613 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 359-6 chr16 7952481 7952692 + 2 NA Intergenic Intergenic 619741 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 292-25 chr2 181306319 181306519 + 2 NA promoter-TSS (NR_039637) promoter-TSS (NR_039637) -767 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 270.75-8 chr10 105040722 105041162 + 2 NA intron (NM_014978, intron 4 of 26) intron (NM_014978, intron 4 of 26) -374726 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 282.25-17 chr2 218363659 218363945 + 2 NA intron (NM_001320865, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu 4100 NR_110573 101928513 Hs.512386 NR_110573 ENSG00000225062 CATIP-AS1 - CATIP antisense RNA 1 ncRNA 434.5-4 chr14 74080833 74081429 + 2 NA intron (NM_001278593, intron 1 of 11) intron (NM_001278593, intron 1 of 11) 3322 NM_005589 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 486-4 chr4 95281076 95281377 + 2 NA intron (NM_003728, intron 3 of 15) intron (NM_003728, intron 3 of 15) 189735 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 231-15 chr12 19695102 19695266 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 254585 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 329-4 chr1 100512177 100512382 + 2 NA intron (NM_001319210, intron 16 of 16) L2c|LINE|L2 -25860 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 232.5-44 chr2 23338054 23338205 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -47050 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 446.75-6 chr4 129036884 129037237 + 2 NA 3' UTR (NM_001300898, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001300898, exon 6 of 6) 56479 NM_001300898 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 284.75-7 chr10 121246603 121246863 + 2 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 284581 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 275.75-13 chr13 83503184 83503532 + 2 NA Intergenic Intergenic 379035 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 319-13 chr15 26422781 26423025 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 206187 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 347-18 chr4 33537690 33538181 + 2 NA Intergenic Intergenic 501958 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 404.25-9 chr5 74959657 74960017 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 92721 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 523.5-5 chr3 59880737 59881077 + 2 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) 200002 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 453-3 chr5 7548349 7548767 + 2 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) intron (NM_020546, intron 3 of 24) 152420 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 258-46 chr5 11695287 11695503 + 2 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -106329 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 415.75-5 chr8 123548532 123548969 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7544 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 294.25-17 chr19 39778260 39778457 + 2 NA intron (NM_001143832, intron 1 of 2) intron (NM_001143832, intron 1 of 2) 1764 NM_001143832 342900 Hs.451638 NM_001143832 ENSG00000213921 LEUTX - leucine twenty homeobox protein-coding 137-85 chr2 147668405 147668489 + 2 NA Intergenic Intergenic -176070 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 494 chr14 49745489 49745928 + 2 NA intron (NM_172193, intron 12 of 12) intron (NM_172193, intron 12 of 12) -22445 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 220-73 chr9 20385546 20385731 + 2 NA intron (NM_001286691, intron 5 of 10) intron (NM_001286691, intron 5 of 10) 25600 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 305-6 chr10 76370526 76370817 + 2 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -517373 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 337.5-13 chr16 48415209 48415406 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -29894 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 273.5-79 chr8 114843146 114843307 + 2 NA Intergenic Intergenic 824787 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 305-24 chr21 24508546 24508869 + 2 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) intron (NR_135519, intron 1 of 2) 79967 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 354-14 chr2 63671758 63672086 + 2 NA Intergenic Intergenic 82771 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 371-18 chr4 35725411 35725703 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 518382 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 176.25-5 chr1 155858096 155858191 + 2 NA promoter-TSS (NM_001282860) promoter-TSS (NM_001282860) -848 NM_001282860 54856 Hs.656361 NM_032292 ENSG00000116580 GON4L GON-4|GON4|YARP gon-4 like protein-coding 207-66 chr5 84366611 84366813 + 2 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 18155 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 351.25-11 chr3 63200167 63200394 + 2 NA Intergenic Intergenic -78028 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 253-2 chr1 118090035 118090222 + 2 NA intron (NM_206996, intron 10 of 48) MIR|SINE|MIR 95100 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 178.5-45 chr14 22181677 22181831 + 2 NA Intergenic Intergenic 250999 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 300-8 chr10 60207539 60207831 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 11 of 43) intron (NM_001204403, intron 11 of 43) -66669 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 372-8 chr14 56207659 56208193 + 2 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 89515 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 270.5-40 chr3 68870373 68870591 + 2 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) L1MA4|LINE|L1 62065 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 293.75-43 chr7 106059319 106059499 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 52903 NM_182715 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 447.5-3 chr2 19526194 19526624 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -167786 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 248.75-26 chr15 67532523 67532739 + 2 NA Intergenic Intergenic -10072 NM_002757 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 263-52 chr8 77553713 77553884 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 103101 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 204-75 chr7 86372043 86372195 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -271790 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 192-14 chr10 45584167 45584337 + 2 NA intron (NM_145021, intron 1 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 10654 NM_145021 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 462.5 chr1 82570139 82570406 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -332911 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 363.25-11 chrX 90006489 90006730 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 84701 NM_138960 90316 Hs.592220 NM_138960 ENSG00000153779 TGIF2LX TGIFLX TGFB induced factor homeobox 2 like X-linked protein-coding 229.25-80 chr8 68004128 68004251 + 2 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) MIRb|SINE|MIR 52143 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 201-15 chr10 102513190 102513437 + 2 NA intron (NM_001178133, intron 2 of 10) intron (NM_001178133, intron 2 of 10) 9341 NM_001178133 51684 Hs.404089 NM_016169 ENSG00000107882 SUFU JBTS32|PRO1280|SUFUH|SUFUXL SUFU negative regulator of hedgehog signaling protein-coding 428.5 chr10 57124149 57124376 + 2 NA Intergenic Intergenic 180297 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 488.25-2 chr2 100865194 100865443 + 2 NA intron (NM_002518, intron 1 of 20) intron (NM_002518, intron 1 of 20) 45179 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 264.5-24 chr16 82202278 82202457 + 2 NA Intergenic Intergenic -32143 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 299-7 chr11 12236639 12236849 + 2 NA intron (NR_144420, intron 16 of 27) intron (NR_144420, intron 16 of 27) -50156 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 377-15 chr6 64888394 64888762 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 18 of 43) intron (NM_001292009, intron 18 of 43) -412840 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 278.75-25 chr3 190294860 190295134 + 2 NA Intergenic Intergenic 27449 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 315-17 chr3 154639690 154639930 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -209620 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 168-103 chr5 58144244 58144389 + 2 NA Intergenic Intergenic -21975 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 333.5-22 chr8 116682616 116683009 + 2 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 30712 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 287-19 chr19 30619825 30620071 + 2 NA intron (NM_001352260, intron 4 of 5) intron (NM_001352260, intron 4 of 5) 247564 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 369.25-3 chr11 94336550 94336900 + 2 NA Intergenic Intergenic 31088 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 437-3 chr16 75358433 75358666 + 2 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 74954 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 404.5-8 chr8 120294695 120295162 + 2 NA intron (NM_021110, intron 34 of 47) intron (NM_021110, intron 34 of 47) 150222 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 306-40 chr8 106380556 106380744 + 2 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) L1MB8|LINE|L1 -67274 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 439-7 chr22 40841117 40841514 + 2 NA intron (NM_003932, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu 15324 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 341-21 chr4 38356903 38357135 + 2 NA Intergenic Intergenic -9895 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 212.25-67 chr4 61032558 61032697 + 2 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 110008 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 410-10 chr4 38340090 38340412 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -26663 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 311.75-2 chr1 240546537 240546809 + 2 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) intron (NM_022469, intron 1 of 1) 65482 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 315.5-28 chr8 114039620 114039813 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -602777 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 252.25-22 chr17 31203797 31204120 + 2 NA intron (NM_001042492, intron 11 of 57) intron (NM_001042492, intron 11 of 57) 93281 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 317-20 chr3 120036096 120036359 + 2 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 48421 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 297.25-23 chr5 30348652 30348900 + 2 NA Intergenic Intergenic 468216 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 231.25-44 chr2 208439455 208439681 + 2 NA intron (NM_005048, intron 4 of 12) intron (NM_005048, intron 4 of 12) 32738 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 273.5-21 chr14 54979731 54979940 + 2 NA intron (NM_007086, intron 16 of 25) L1ME4b|LINE|L1 47264 NM_001008396 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 253.75-29 chr20 56346822 56346980 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12073 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 445.5-2 chr20 61502568 61503033 + 2 NA intron (NM_001252338, intron 1 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 3379 NM_001252338 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 237-40 chr4 59667916 59668102 + 2 NA Intergenic Intergenic 654436 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 573.5-3 chr5 179572488 179572980 + 2 NA intron (NM_001040452, intron 5 of 17) intron (NM_001040452, intron 5 of 17) 13003 NM_001040452 80230 Hs.306769 NM_025158 ENSG00000176783 RUFY1 RABIP4|ZFYVE12 RUN and FYVE domain containing 1 protein-coding 323.5-16 chr2 98857747 98858061 + 2 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 78321 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 327.25-13 chr4 36724911 36725210 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -83160 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 276-36 chr4 153436835 153437081 + 2 NA Intergenic Intergenic -29388 NM_015196 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 317.25-25 chr5 4239435 4239625 + 2 NA Intergenic Intergenic -533951 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 321-26 chr6 140566141 140566436 + 2 NA Intergenic Intergenic -117526 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 160.5-23 chr11 36419571 36419658 + 2 NA intron (NM_001160167, intron 4 of 8) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 18617 NM_001160169 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 171-51 chr17 60253382 60253515 + 2 NA intron (NM_032582, intron 10 of 33) intron (NM_032582, intron 10 of 33) -21803 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 329.25-27 chr8 101783199 101783437 + 2 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) 7651 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 478-3 chr9 102306177 102306593 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -213252 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 527.5-4 chr7 109489230 109489575 + 2 NA Intergenic Intergenic 470811 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 494.25-2 chr13 69189261 69189575 + 2 NA Intergenic Intergenic -32928 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 237.25-73 chr8 60590628 60590974 + 2 NA intron (NM_002865, intron 5 of 7) L1ME3C|LINE|L1 73814 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 318.25-16 chr7 50848350 50848659 + 2 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -55051 NM_001371008 219-84 chr5 124846165 124846327 + 2 NA Intergenic Intergenic -101134 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 319-6 chr12 23479588 23479764 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 104910 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 366.75-8 chr2 16776036 16776285 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -110326 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 160.75-53 chr16 9448812 9448922 + 2 NA intron (NR_126349, intron 2 of 4) L1PB4|LINE|L1 -3882 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 312.5-10 chr18 74815465 74815703 + 2 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) intron (NM_017757, intron 3 of 7) 184621 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 162.5 chr1 56758738 56758860 + 2 NA intron (NM_001004303, intron 5 of 19) intron (NM_001004303, intron 5 of 19) 60605 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 418-2 chr14 46723646 46723927 + 2 NA Intergenic Intergenic -72005 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 271.75-26 chr21 28152112 28152354 + 2 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR 61830 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 207.25-31 chr17 48425375 48425514 + 2 NA intron (NM_001075099, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 4770 NM_001075099 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 426-8 chr2 104791033 104791460 + 2 NA Intergenic Intergenic -33527 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 436-3 chr15 67775068 67775484 + 2 NA intron (NM_001206804, intron 21 of 21) intron (NM_001206804, intron 21 of 21) -50233 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 540.5 chr3 55494012 55494385 + 2 NA Intergenic Intergenic -6556 NM_003392 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 241-57 chr8 121440055 121440335 + 2 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -199151 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 326.25-17 chr2 4225162 4225484 + 2 NA Intergenic Intergenic 251162 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 357-14 chr4 120090016 120090312 + 2 NA Intergenic Intergenic -23316 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 317 chr1 25077858 25078054 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 54453 NR_039623 100616365 NR_039623 ENSG00000264371 MIR4425 - microRNA 4425 ncRNA 559.25-2 chr4 123283346 123283749 + 2 NA intron (NM_001345856, intron 15 of 15) intron (NM_001345856, intron 15 of 15) -113248 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 209.75-76 chr5 68524869 68525070 + 2 NA Intergenic Intergenic 232392 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 388.75-12 chr9 7386511 7386799 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 413123 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 280-30 chr2 200558343 200558555 + 2 NA intron (NM_001160046, intron 5 of 8) L1ME3A|LINE|L1 -27565 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 431-11 chr4 83116348 83116697 + 2 NA Intergenic Intergenic -1793 NM_016619 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 321-9 chr13 70870546 70870833 + 2 NA Intergenic Intergenic -144452 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 538.25-2 chr2 101941574 101942076 + 2 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -41640 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 284-2 chr1 227238416 227238630 + 2 NA intron (NM_001366019, intron 2 of 36) MER58A|DNA|hAT-Charlie 79969 NM_001366011 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 394.75 chr1 98288088 98288384 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 77525 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 392-9 chr3 102317193 102317602 + 2 NA Intergenic Intergenic -117618 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 385.25-8 chr3 66175634 66176072 + 2 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) MLT2B4|LTR|ERVL 42243 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 432-15 chr8 107458967 107459227 + 2 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 38821 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 554.5 chr20 37828278 37828633 + 2 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -74672 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 336.5-6 chr11 48272938 48273128 + 2 NA Intergenic Intergenic 9172 NM_001004726 390113 Hs.553742 NM_001004726 ENSG00000176567 OR4X1 OR11-104 olfactory receptor family 4 subfamily X member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 329-14 chr15 50621387 50621620 + 2 NA intron (NR_149154, intron 12 of 37) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 65294 NR_149154 54822 Hs.512894 NM_017672 ENSG00000092439 TRPM7 ALSPDC|CHAK|CHAK1|LTRPC7|LTrpC-7|TRP-PLIK transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 protein-coding 332.5-9 chr2 22414594 22414912 + 2 NA Intergenic Intergenic -121726 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 201.5-85 chr3 385484 385643 + 2 NA intron (NM_001253388, intron 17 of 24) AluSx4|SINE|Alu 232 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 293.75-11 chr14 64620848 64621110 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 71018 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 335.25-29 chr7 63144259 63144653 + 2 NA Intergenic Intergenic 159600 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 344-10 chr18 77130118 77130390 + 2 NA intron (NM_001025100, intron 1 of 3) intron (NM_001025100, intron 1 of 3) 2529 NM_001025101 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 448.5-6 chr22 30048886 30049213 + 2 NA intron (NR_110541, intron 2 of 4) intron (NR_110541, intron 2 of 4) 31208 NR_110541 101929664 Hs.592197 NR_110541 HORMAD2-AS1 MTMR3-AS1 HORMAD2 and MTMR3 antisense RNA 1 ncRNA 366.75-22 chr6 140743336 140743706 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 59707 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 321.5-21 chr20 4389848 4390047 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -140660 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 256-27 chr2 49253351 49253491 + 2 NA Intergenic Intergenic -98894 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 160.5-192 chr8 115065788 115065889 + 2 NA Intergenic Intergenic 602175 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 367-5 chr17 61504195 61504524 + 2 NA Intergenic Intergenic 47871 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 410-9 chr4 33556081 33556308 + 2 NA Intergenic Intergenic 483699 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 348.75-6 chr16 63700763 63700967 + 2 NA Intergenic Intergenic 1421198 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 363.75-5 chr16 58147012 58147253 + 2 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -17707 NR_136632 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 213-39 chr17 83143709 83143819 + 2 NA Intergenic Intergenic 62618 NM_001363853 284207 Hs.378821 NM_001004431 ENSG00000176845 METRNL - meteorin like, glial cell differentiation regulator protein-coding 363.25 chr10 70979776 70980185 + 2 NA Intergenic Intergenic 40927 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 218-50 chr4 78431047 78431189 + 2 NA intron (NM_001166133, intron 37 of 41) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -120652 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 521.25 chr12 39185598 39186009 + 2 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 257317 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 334-13 chr2 40292858 40293282 + 2 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 137234 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 536.5-3 chr18 54784356 54784824 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -43887 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 402.75-6 chr5 148462378 148462741 + 2 NA intron (NM_001040169, intron 5 of 5) L1MC1|LINE|L1 78601 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 265.25-49 chr6 164972727 164972943 + 2 NA Intergenic Intergenic -150772 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 318.75-10 chr18 11334793 11335090 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -119537 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 316.25-8 chr19 16062532 16062779 + 2 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -3032 NR_146442 105372292 Hs.635664 NR_146442 ENSG00000267517 LINC01855 - long intergenic non-protein coding RNA 1855 ncRNA 245.5-68 chr6 48654308 48654525 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -585727 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 523.5 chr11 20987833 20988409 + 2 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 318535 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 266 chr1 78868906 78869069 + 2 NA Intergenic Intergenic 137743 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 375.5-19 chr7 53828115 53828404 + 2 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -16328 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 395.75-8 chr2 112322902 112323230 + 2 NA intron (NM_198581, intron 9 of 11) intron (NM_198581, intron 9 of 11) 47469 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 224.5-117 chr9 89034602 89034832 + 2 NA intron (NM_016848, intron 11 of 11) L1M4b|LINE|L1 43249 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 311-12 chr15 63099900 63100103 + 2 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -21860 NM_032857 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 649.5 chr12 40282960 40283606 + 2 NA intron (NM_198578, intron 18 of 50) intron (NM_198578, intron 18 of 50) 58286 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 305.5-12 chr12 133041868 133042231 + 2 NA intron (NM_001127372, intron 2 of 4) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 4467 NM_001289972 7637 Hs.445019 NM_003428 ENSG00000198040 ZNF84 HPF2 zinc finger protein 84 protein-coding 326.75 chr1 12419435 12419739 + 2 NA intron (NM_015378, intron 65 of 69) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -87659 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 225.25-15 chr12 13562506 13562743 + 2 NA 3' UTR (NM_000834, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_000834, exon 13 of 13) -185879 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 229-46 chr22 37542170 37542337 + 2 NA Intergenic Intergenic -18227 NM_152243 11135 Hs.225356 NM_152243 ENSG00000128283 CDC42EP1 BORG5|CEP1|MSE55 CDC42 effector protein 1 protein-coding 262-54 chr8 69623912 69624123 + 2 NA exon (NM_001128204, exon 14 of 22) exon (NM_001128204, exon 14 of 22) 31117 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 480.25-4 chr21 35089621 35089939 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -40482 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 536.5 chr14 84169154 84169779 + 2 NA Intergenic Intergenic -1102466 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 578.75 chr22 45704611 45704955 + 2 NA intron (NM_013236, intron 5 of 11) L1M4|LINE|L1 32949 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 253.5-32 chr17 73386476 73386697 + 2 NA intron (NM_001144952, intron 30 of 44) intron (NM_001144952, intron 30 of 44) -74585 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 453.5 chr21 15757499 15757949 + 2 NA intron (NM_001352560, intron 1 of 23) intron (NM_001352560, intron 1 of 23) 27742 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 178.75-68 chr3 158029365 158029477 + 2 NA Intergenic Intergenic 76742 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 259.5-78 chr5 52404867 52405019 + 2 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -382973 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 198-39 chr2 88368316 88368425 + 2 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 84323 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 378.75-4 chr11 60212856 60213133 + 2 NA intron (NM_001351235, intron 5 of 5) intron (NM_001351235, intron 5 of 5) -3838 NR_106758 102465250 NR_106758 ENSG00000275344 MIR6503 hsa-mir-6503 microRNA 6503 ncRNA 315-2 chr1 61560432 61560636 + 2 NA Intergenic Intergenic -93708 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 210.75-80 chr5 101136884 101137054 + 2 NA Intergenic Intergenic -233687 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 410.25-6 chr2 32021187 32021616 + 2 NA intron (NM_001321210, intron 5 of 5) AluSx|SINE|Alu -10393 NM_001301852 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 447.5 chr10 85077663 85077940 + 2 NA Intergenic Intergenic 121104 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 391-2 chr10 56850755 56851000 + 2 NA Intergenic Intergenic 453682 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 493.5-7 chr5 166674893 166675215 + 2 NA Intergenic Intergenic 251316 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 547.75 chr14 68668515 68668950 + 2 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) -39945 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 350-13 chr4 164828529 164828952 + 2 NA Intergenic Intergenic -48438 NM_001297550 100506013 Hs.105196 NM_001297550 ENSG00000248329 APELA ELA|Ende|tdl apelin receptor early endogenous ligand protein-coding 365.75-3 chr10 100188960 100189206 + 2 NA 3' UTR (NM_001320928, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001320928, exon 21 of 21) -3054 NM_001347859 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 289-44 chr7 40229974 40230257 + 2 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) intron (NM_024728, intron 6 of 14) 95139 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 421-11 chr5 174507825 174508237 + 2 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) (ACAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 171677 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 256-60 chr5 155479063 155479236 + 2 NA Intergenic Intergenic 465394 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 303.25-15 chr2 33685984 33686303 + 2 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -20743 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 339.75-14 chr16 70149744 70149956 + 2 NA intron (NM_001322119, intron 15 of 16) AluY|SINE|Alu 23598 NR_126007 400541 Hs.461183 NR_126007 ENSG00000247228 LOC400541 - uncharacterized LOC400541 ncRNA 347.5-3 chr10 82356589 82356835 + 2 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -123792 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 350-18 chr6 150305682 150305893 + 2 NA Intergenic Intergenic -63225 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 540.5-3 chr6 116424536 116425004 + 2 NA intron (NM_001322937, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 -36605 NM_001010919 441168 Hs.381220 NM_001010919 ENSG00000188820 CALHM6 C6orf187|FAM26F|INAM|dJ93H18.5 calcium homeostasis modulator family member 6 protein-coding 422.5-12 chr5 132996703 132997067 + 2 NA TTS (NM_001300822) TTS (NM_001300822) 29664 NM_001300822 54819 Hs.29700 NM_017665 ENSG00000155329 ZCCHC10 - zinc finger CCHC-type containing 10 protein-coding 266.25-32 chr3 111305733 111305974 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 234037 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 312.75-34 chr8 138057550 138057776 + 2 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 25882 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 274.25-52 chr9 100322238 100322508 + 2 NA intron (NM_001161584, intron 9 of 14) intron (NM_001161584, intron 9 of 14) 30198 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 258.5-8 chr10 30885930 30886131 + 2 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) L3b|LINE|CR1 113487 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 230.25-80 chr8 103531828 103532100 + 2 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -30054 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 303.5-38 chr5 160692096 160692279 + 2 NA intron (NM_025153, intron 3 of 25) intron (NM_025153, intron 3 of 25) -6796 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 546.75 chr1 198176638 198177105 + 2 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 19873 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 562.75-2 chr4 31574529 31574891 + 2 NA Intergenic Intergenic 68166 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 285-40 chr5 173162189 173162461 + 2 NA intron (NM_013980, intron 5 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 17794 NM_013980 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 242-36 chr3 95082425 95082635 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 144267 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 280-17 chr13 32201214 32201401 + 2 NA intron (NM_023037, intron 29 of 60) L2c|LINE|L2 110647 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 228-26 chr14 61016711 61016842 + 2 NA intron (NR_033344, intron 4 of 16) L1MA8|LINE|L1 -35086 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 458.5 chr1 113372523 113372840 + 2 NA Intergenic Intergenic -17834 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 337-26 chr5 178410705 178411053 + 2 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) L1MB5|LINE|L1 -178057 NM_001278346 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 320.25-19 chr4 45983929 45984192 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 139994 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 246-34 chr2 124728031 124728269 + 2 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) L1MA9|LINE|L1 702863 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 406-5 chr2 167311021 167311273 + 2 NA Intergenic Intergenic 123775 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 367-8 chr2 165325161 165325497 + 2 NA intron (NM_001040143, intron 13 of 27) intron (NM_001040143, intron 13 of 27) 31274 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 582.25 chr3 132064852 132065488 + 2 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -25564 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 357.25-10 chr2 207145917 207146375 + 2 NA intron (NM_001270943, intron 1 of 3) intron (NM_001270943, intron 1 of 3) -12009 NM_001270944 8609 Hs.59908 NM_003709 ENSG00000118263 KLF7 UKLF Kruppel like factor 7 protein-coding 225-60 chr5 65799575 65799790 + 2 NA intron (NM_020726, intron 9 of 12) intron (NM_020726, intron 9 of 12) 77477 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 166-131 chr9 72909938 72910054 + 2 NA intron (NM_000689, intron 10 of 12) intron (NM_000689, intron 10 of 12) -35887 NR_121180 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 559-2 chr18 3059517 3059819 + 2 NA Intergenic Intergenic -47721 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 460 chr1 78811187 78811574 + 2 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 161549 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 435.5-2 chr12 85688996 85689302 + 2 NA Intergenic Intergenic 147260 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 429.5-10 chr7 107160000 107160489 + 2 NA 3' UTR (NM_002736, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_002736, exon 11 of 11) -8717 NM_001244262 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 399-3 chr17 60452379 60452733 + 2 NA intron (NM_006380, intron 11 of 12) intron (NM_006380, intron 11 of 12) 30067 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 291.5-23 chr2 164652871 164653040 + 2 NA Intergenic Intergenic -31473 NM_004490 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 299.5-30 chr5 33326009 33326250 + 2 NA Intergenic Intergenic 96394 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 292.25-14 chr12 51619793 51620107 + 2 NA intron (NM_001369788, intron 1 of 25) intron (NM_001369788, intron 1 of 25) 28714 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 280-2 chr1 85431788 85431996 + 2 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) -27386 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 417.5-2 chr14 59462850 59463104 + 2 NA 3' UTR (NM_022571, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_022571, exon 1 of 1) 2403 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 332-26 chr8 109180878 109181172 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 94397 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 210-69 chr3 197724425 197724619 + 2 NA intron (NM_001145642, intron 1 of 20) intron (NM_001145642, intron 1 of 20) 12382 NM_014687 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 396.25-5 chr13 85150738 85150997 + 2 NA Intergenic Intergenic -2810 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 368.5-4 chr11 38138135 38138489 + 2 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 199711 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 285.5-62 chr8 120268401 120268653 + 2 NA intron (NM_021110, intron 25 of 47) intron (NM_021110, intron 25 of 47) 143425 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 269-16 chr13 93338550 93338807 + 2 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) MER124|DNA?|DNA? 111871 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 156.5-129 chr4 36973951 36974119 + 2 NA Intergenic Intergenic -27744 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 166-43 chr17 12174626 12174717 + 2 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 92772 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 324.5-5 chr11 97173618 97173785 + 2 NA Intergenic Intergenic 665276 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 302-4 chr10 70664221 70664500 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -8146 NM_080722 140766 Hs.352156 NM_080722 ENSG00000138316 ADAMTS14 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 14 protein-coding 370.75-4 chr2 126005940 126006380 + 2 NA Intergenic Intergenic 111825 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 279.5-13 chr11 19648175 19648429 + 2 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) MER63B|DNA|hAT-Blackjack -64535 NM_145117 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 395.5-12 chr18 49099778 49100067 + 2 NA intron (NM_001353215, intron 15 of 16) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -50154 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 312-10 chr12 65515411 65515671 + 2 NA intron (NR_120431, intron 2 of 3) intron (NR_120431, intron 2 of 3) 41770 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 345-8 chr14 53754333 53754696 + 2 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 193970 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 353-2 chr10 63419448 63419647 + 2 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -11028 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 195.75-66 chr2 211461931 211462063 + 2 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) intron (NM_001042599, intron 20 of 26) 844426 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 391-17 chr8 78807852 78808239 + 2 NA Intergenic Intergenic -2522 NM_001199888 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 172.5-150 chr4 132083680 132083775 + 2 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 318889 NR_125884 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 482.5-2 chr16 51911186 51911578 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 148863 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 262.5-22 chr15 56989745 56990070 + 2 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) intron (NM_207038, intron 3 of 19) 70462 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 339-16 chr2 78259797 78259993 + 2 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MCc|LINE|L1 30836 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 305.25-16 chr14 75181121 75181322 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -4609 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 303.75-13 chr16 51381709 51381891 + 2 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -230528 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 443 chr10 43753220 43753446 + 2 NA Intergenic Intergenic 25492 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 169.5-45 chr13 102768111 102768345 + 2 NA intron (NM_001286776, intron 3 of 4) intron (NM_001286776, intron 3 of 4) 5558 NM_138779 93081 Hs.398111 NM_138779 ENSG00000151287 TEX30 C13orf27 testis expressed 30 protein-coding 211.5-8 chr1 163486231 163486442 + 2 NA Intergenic Intergenic -63145 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 255.5-25 chr14 62998443 62998587 + 2 NA intron (NM_139318, intron 4 of 10) L1MC|LINE|L1 46943 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 314-20 chr6 55136975 55137276 + 2 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) intron (NM_001526, intron 1 of 7) 30665 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 375.75-6 chr15 69405936 69406259 + 2 NA 3' UTR (NM_017705, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_017705, exon 9 of 9) -8252 NR_160296 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 282.5-64 chr8 88956996 88957185 + 2 NA Intergenic Intergenic -629607 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 281.25-3 chr1 82319636 82319836 + 2 NA Intergenic Intergenic 517283 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 220.5-40 chr2 8888744 8888918 + 2 NA intron (NR_135606, intron 4 of 12) FLAM_C|SINE|Alu -51218 NM_020738 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 293-32 chr6 37292722 37292951 + 2 NA intron (NR_130108, intron 8 of 12) intron (NR_130108, intron 8 of 12) -34681 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 393-13 chr4 81467691 81467977 + 2 NA intron (NM_152545, intron 1 of 13) intron (NM_152545, intron 1 of 13) 4073 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 396.25-2 chr10 128916052 128916303 + 2 NA TTS (NR_148990) TTS (NR_148990) 3344 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 536 chr15 89309268 89309648 + 2 NA intron (NM_001113378, intron 34 of 37) MER103C|DNA|hAT-Charlie 17352 NR_106824 102466983 NR_106824 ENSG00000275101 MIR6766 hsa-mir-6766 microRNA 6766 ncRNA 254-9 chr10 128947653 128947913 + 2 NA Intergenic Intergenic 34950 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 394.5-11 chr5 174406487 174406725 + 2 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 70252 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 333.5 chr10 16225559 16225734 + 2 NA Intergenic Intergenic -211297 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 189-90 chr5 81640454 81640585 + 2 NA intron (NM_012446, intron 2 of 16) intron (NM_012446, intron 2 of 16) 110734 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 210-11 chr1 238956031 238956167 + 2 NA Intergenic Intergenic -430469 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 457-2 chr15 85690844 85691298 + 2 NA intron (NM_007200, intron 16 of 36) MIRc|SINE|MIR 67654 NR_120366 101929679 Hs.513112 NR_120366 LOC101929679 - uncharacterized LOC101929679 ncRNA 254.5-73 chr7 127207992 127208326 + 2 NA intron (NR_163850, intron 1 of 9) MER49|LTR|ERV1 -6968 NR_110195 101928333 Hs.551332 NR_110194 ENSG00000236340 LOC101928333 - uncharacterized LOC101928333 ncRNA 388-8 chr3 79476810 79477148 + 2 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -30908 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 317.5-16 chr2 57581057 57581329 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -326458 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 320.75-2 chr1 183442706 183442907 + 2 NA Intergenic Intergenic -24426 NM_015039 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 313.75-13 chr22 41636225 41636538 + 2 NA intron (NM_001288976, intron 4 of 12) intron (NM_001288976, intron 4 of 12) 15086 NM_001288977 2547 Hs.292493 NM_001469 ENSG00000196419 XRCC6 CTC75|CTCBF|G22P1|KU70|ML8|TLAA X-ray repair cross complementing 6 protein-coding 412.5-11 chr5 35969772 35970175 + 2 NA intron (NM_001171873, intron 3 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 21417 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 379.75-3 chr10 96145153 96145683 + 2 NA intron (NM_001330737, intron 4 of 6) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 14796 NM_001330734 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 399.5-8 chr7 33699108 33699419 + 2 NA Intergenic Intergenic -205652 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 214-9 chr10 83371382 83371613 + 2 NA Intergenic (TTTTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 305592 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 250.25-28 chr2 221546233 221546506 + 2 NA intron (NM_001363748, intron 3 of 17) intron (NM_001363748, intron 3 of 17) 25935 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 289.75-7 chr12 8729685 8729869 + 2 NA intron (NR_147950, intron 2 of 8) intron (NR_147950, intron 2 of 8) 31786 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 463.75-3 chr4 55451385 55451733 + 2 NA intron (NM_004898, intron 15 of 22) L2a|LINE|L2 55602 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 318-27 chr3 122852706 122852926 + 2 NA intron (NM_032839, intron 5 of 8) L1MEg|LINE|L1 -33697 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 574 chr10 74877771 74878294 + 2 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) -34754 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 222.75-52 chr18 3658747 3659000 + 2 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 55136 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 356-10 chr6 139531755 139532003 + 2 NA Intergenic Intergenic -57283 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 400.5-8 chr21 46103422 46103665 + 2 NA intron (NM_058174, intron 1 of 27) L1MB3|LINE|L1 5424 NM_058175 1292 Hs.420269 NM_001849 ENSG00000142173 COL6A2 BTHLM1|PP3610|UCMD1 collagen type VI alpha 2 chain protein-coding 452-2 chr17 8226865 8227126 + 2 NA non-coding (NR_046431, exon 22 of 22) non-coding (NR_046431, exon 22 of 22) -2952 NR_026951 284029 Hs.121692 NM_173621 ENSG00000178977 LINC00324 C17orf44|NCRNA00324 long intergenic non-protein coding RNA 324 ncRNA 150-152 chrM 924 1195 + 2 NA promoter-TSS (NR_137295) promoter-TSS (NR_137295) 411 NR_137294 653.25 chr4 53534870 53535884 + 2 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) intron (NM_001126328, intron 2 of 10) 22892 NM_032622 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 486.5 chr3 10737131 10737433 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 26927 NR_152730 285370 Hs.157613 NR_027102 ENSG00000226567 LINC00606 - long intergenic non-protein coding RNA 606 ncRNA 346-11 chr2 53638404 53638621 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -129271 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 312.5-43 chr9 74487195 74487400 + 2 NA intron (NR_125791, intron 1 of 4) intron (NR_125791, intron 1 of 4) -10038 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 256-58 chr5 20391700 20391884 + 2 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 86241 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 286.5-30 chr18 37731871 37732091 + 2 NA Intergenic Intergenic 74846 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 303.75-2 chr1 42558035 42558404 + 2 NA 5' UTR (NM_001355224, exon 12 of 23) 5' UTR (NM_001355224, exon 12 of 23) 25199 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 497.75-3 chr8 126019131 126019924 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -68330 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 163-50 chr18 12864898 12865015 + 2 NA intron (NM_080423, intron 1 of 8) intron (NM_080423, intron 1 of 8) 19281 NM_002828 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 359.25-12 chr7 97252964 97253206 + 2 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 136492 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 293.25 chr1 80262821 80263035 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -272827 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 116.75-127 chr3 88437859 88437933 + 2 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) intron (NM_001368168, intron 2 of 2) 99440 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 188-50 chr4 65637419 65637543 + 2 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) MER102b|DNA|hAT-Charlie 32007 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 322.5-40 chr8 90652854 90653083 + 2 NA Intergenic Intergenic -6885 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 343-14 chr2 103537644 103537872 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -553329 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 349-14 chr8 129473407 129473628 + 2 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 10625 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 359.5-9 chr7 7821542 7821884 + 2 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -103106 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 253-26 chr2 104837537 104837760 + 2 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) intron (NR_037883, intron 1 of 3) 13828 NR_131235 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 373-12 chr5 121535628 121535942 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 213235 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 242-14 chr11 40959079 40959275 + 2 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) MER5B|DNA|hAT-Charlie 500459 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 365.5-16 chr7 95162085 95162401 + 2 NA intron (NM_017650, intron 5 of 15) intron (NM_017650, intron 5 of 15) 162289 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 331.25-24 chr9 23349012 23349250 + 2 NA Intergenic Intergenic 323268 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 395.5-13 chr3 46468854 46469064 + 2 NA intron (NM_001321122, intron 3 of 19) MER63B|DNA|hAT-Blackjack -4054 NM_001321121 4057 Hs.529517 NM_002343 ENSG00000012223 LTF GIG12|HEL110|HLF2|LF lactotransferrin protein-coding 471.5-7 chr5 65649394 65649831 + 2 NA intron (NM_001365342, intron 4 of 10) L1ME4a|LINE|L1 24585 NM_024941 80006 Hs.591760 NM_024941 ENSG00000113597 TRAPPC13 C5orf44|SHLD3 trafficking protein particle complex 13 protein-coding 401-10 chr2 222486548 222486784 + 2 NA intron (NM_152386, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 62123 NM_152386 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 371.75-6 chr11 100051791 100052019 + 2 NA intron (NM_001243270, intron 8 of 23) L1MEc|LINE|L1 495760 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 276.5-59 chr6 138045627 138045787 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 61712 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 376.5-12 chr3 28438089 28438328 + 2 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) L1M4c|LINE|L1 89059 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 298.5-6 chr14 24464937 24465266 + 2 NA intron (NR_110032, intron 2 of 2) CR1_Mam|LINE|CR1 22148 NR_110032 101927045 Hs.637772 NR_110032 LOC101927045 - uncharacterized LOC101927045 ncRNA 223-71 chr6 38613010 38613179 + 2 NA intron (NM_052893, intron 1 of 11) MER33|DNA|hAT-Charlie -17027 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 261.5-6 chr11 20883542 20884005 + 2 NA intron (NM_201551, intron 4 of 18) intron (NM_201551, intron 4 of 18) 214187 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 1073 chr4 49116656 49117325 + 2 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 130348 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 267.75-20 chr16 9285172 9285441 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -70282 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 314.5-2 chr10 9051325 9051717 + 2 NA Intergenic Intergenic 153532 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 297.5-55 chr8 120220971 120221188 + 2 NA intron (NM_021110, intron 14 of 47) intron (NM_021110, intron 14 of 47) 95977 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 446.25-2 chr18 8849333 8849784 + 2 NA Intergenic Intergenic 132177 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 322.5-21 chr4 44656225 44656409 + 2 NA Intergenic Intergenic -4676 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 226.5-57 chr22 43622015 43622240 + 2 NA intron (NM_198856, intron 18 of 29) L1MEf|LINE|L1 105873 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 272.75-33 chr3 190073844 190074063 + 2 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 46944 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 258.5-44 chr22 40939365 40939723 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -11834 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 380.75-4 chr4 35520386 35520793 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 723350 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 329-25 chr4 47200826 47201164 + 2 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 169428 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 252-24 chr15 36606389 36606591 + 2 NA intron (NM_001290232, intron 1 of 10) intron (NM_001290232, intron 1 of 10) 11613 NM_001290232 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 274.25-4 chr1 172453642 172454086 + 2 NA intron (NM_001300760, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 971 NM_001300760 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 333-8 chr13 65971141 65971413 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -4848 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 205.5-15 chr10 108353913 108354066 + 2 NA Intergenic Intergenic -284696 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 257-18 chr15 69413685 69413992 + 2 NA promoter-TSS (NM_001281301) promoter-TSS (NM_001281301) -511 NR_160296 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 450.5 chr10 83308450 83308768 + 2 NA Intergenic Intergenic 368480 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 312-5 chr10 53005303 53005613 + 2 NA Intergenic Intergenic -233758 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 405-12 chr4 34269152 34269514 + 2 NA intron (NR_147184, intron 1 of 3) L1MA5|LINE|L1 414 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 334.25-13 chr2 15496882 15497219 + 2 NA intron (NR_052013, intron 11 of 50) L2c|LINE|L2 64284 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 256-21 chr18 845421 845683 + 2 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -33310 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 324-22 chr5 20322850 20323322 + 2 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 17535 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 493.5-6 chr5 35622419 35622736 + 2 NA intron (NM_144722, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR 4714 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 180-33 chr14 58965340 58965481 + 2 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) intron (NR_110547, intron 4 of 5) 137122 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 237-18 chr16 20866039 20866178 + 2 NA intron (NM_173475, intron 1 of 2) intron (NM_173475, intron 1 of 2) -33774 NM_001369632 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 236.5-62 chr3 99299946 99300121 + 2 NA Intergenic Intergenic -338561 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 320.25-33 chr9 3018046 3018259 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -163437 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 243-69 chr7 18608421 18608636 + 2 NA intron (NM_001321893, intron 7 of 11) intron (NM_001321893, intron 7 of 11) 99258 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 337.75-20 chr8 99322501 99322803 + 2 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 214078 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 287.5-37 chr20 57908554 57908856 + 2 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -95199 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 336.5-30 chr9 29447399 29447616 + 2 NA Intergenic Intergenic -233906 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 164-139 chr8 119766027 119766170 + 2 NA intron (NM_003184, intron 18 of 25) intron (NM_003184, intron 18 of 25) 66743 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 431.5-4 chr4 16679701 16680074 + 2 NA intron (NM_001304435, intron 2 of 7) intron (NM_001304435, intron 2 of 7) 218758 NM_001304434 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 267-5 chr1 190121587 190121779 + 2 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) intron (NM_199051, intron 7 of 7) 354327 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 393.75-3 chr14 46198123 46198353 + 2 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 134079 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 315.25-13 chr18 73780041 73780389 + 2 NA Intergenic Intergenic 367619 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 548.5-4 chr8 125902790 125903265 + 2 NA Intergenic Intergenic 48170 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 184-105 chrX 19264612 19264727 + 2 NA Intergenic Intergenic -79224 NM_001173454 5160 Hs.530331 NM_000284 ENSG00000131828 PDHA1 PDHA|PDHAD|PDHCE1A|PHE1A pyruvate dehydrogenase E1 alpha 1 subunit protein-coding 324.25-7 chr2 64081474 64081876 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -62247 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 415.5-2 chr10 78381577 78381891 + 2 NA Intergenic Intergenic 114392 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 303-25 chr5 75277862 75278103 + 2 NA Intergenic Intergenic -41104 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 440.25-2 chr17 61794652 61795043 + 2 NA intron (NM_032043, intron 9 of 19) L2a|LINE|L2 68712 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 386-8 chr2 29117990 29118278 + 2 NA intron (NM_024692, intron 1 of 15) intron (NM_024692, intron 1 of 15) 2719 NM_024692 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 421.5-13 chr8 61368825 61369116 + 2 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) (TTTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 81000 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 399 chr10 126815561 126815925 + 2 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -89666 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 474.75 chr1 110584409 110584998 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 21655 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 220.5-55 chr2 141099149 141099360 + 2 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -512569 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 351.5-7 chr11 132987380 132987605 + 2 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 -43724 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 364-20 chr8 119784288 119784593 + 2 NA intron (NM_003184, intron 15 of 25) AluSz6|SINE|Alu 48401 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 279-49 chr8 64588347 64588614 + 2 NA intron (NM_001324112, intron 6 of 6) intron (NM_001324112, intron 6 of 6) -6588 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 203-18 chr10 114691099 114691312 + 2 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR -6202 NM_001322882 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 284.75-2 chr1 169091358 169091712 + 2 NA Intergenic Intergenic -4530 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 151.5-32 chr12 11572052 11572157 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 24074 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 378-3 chr11 94496969 94497254 + 2 NA intron (NM_017704, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 3127 NM_017704 54851 Hs.29052 NM_017704 ENSG00000168876 ANKRD49 FGIF|GBIF ankyrin repeat domain 49 protein-coding 341.75-20 chr5 136976466 136976898 + 2 NA 3' UTR (NM_004598, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004598, exon 11 of 11) -151515 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 583 chr7 30044333 30044761 + 2 NA promoter-TSS (NM_001363474) promoter-TSS (NM_001363474) -538 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 397.25-11 chr7 24804548 24804799 + 2 NA intron (NR_104111, intron 20 of 21) L1ME4b|LINE|L1 -46734 NM_004403 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 294.25-4 chr10 44162325 44162537 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -130319 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 250.75-19 chr17 67393555 67393831 + 2 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) 16412 NM_012417 26207 Hs.591185 NM_012417 ENSG00000154217 PITPNC1 M-RDGB-beta|MRDGBbeta|RDGB-BETA|RDGBB|RDGBB1 phosphatidylinositol transfer protein cytoplasmic 1 protein-coding 367.5-20 chr9 24424281 24424496 + 2 NA Intergenic Intergenic 121288 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 470 chr14 51422179 51422606 + 2 NA Intergenic Intergenic -25257 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 304.5-37 chr8 12757840 12758083 + 2 NA Intergenic Intergenic -2435 NR_138256 91694 Hs.180178 NM_152271 ENSG00000154359 LONRF1 RNF191 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 protein-coding 262.75-28 chr2 103170090 103170260 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -185746 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 354.5-8 chr14 50615475 50615837 + 2 NA intron (NM_015915, intron 8 of 13) intron (NM_015915, intron 8 of 13) 52650 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 571-2 chr22 24721737 24722223 + 2 NA intron (NM_001008496, intron 19 of 20) intron (NM_001008496, intron 19 of 20) -42521 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 644.25 chr4 30791035 30792040 + 2 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 71168 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 330.25-13 chr2 197843525 197843807 + 2 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 39073 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 420.5-13 chr5 102400163 102400641 + 2 NA intron (NM_173488, intron 9 of 13) ORSL|DNA|hAT-Tip100 98599 NM_001308014 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 396.75-6 chr7 114104500 114104854 + 2 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 18350 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 267.75-28 chr2 76810477 76810692 + 2 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -175381 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 246-22 chr15 89261236 89261566 + 2 NA intron (NM_001113378, intron 4 of 37) intron (NM_001113378, intron 4 of 37) 17422 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 312.75-13 chr18 12398388 12398637 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -9417 NM_001142405 10650 Hs.514718 NM_006553 ENSG00000141391 PRELID3A C18orf43|HFL-EDDG1|SLMO1 PRELI domain containing 3A protein-coding 454-3 chr4 38225633 38225988 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 105856 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 359.75-13 chr2 219879072 219879379 + 2 NA Intergenic Intergenic 25664 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 299-18 chr2 165384280 165384492 + 2 NA intron (NM_001040143, intron 26 of 27) intron (NM_001040143, intron 26 of 27) -85312 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 155.25-137 chr5 20624160 20624270 + 2 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) intron (NR_149120, intron 1 of 11) -8680 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 375.25-8 chr6 128612984 128613304 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -92545 NM_001291984 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 231-48 chr3 12349139 12349300 + 2 NA intron (NM_001330615, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 -2198 NM_001354668 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 497.25-4 chr7 42545137 42545492 + 2 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 161133 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 409-7 chr5 12412974 12413507 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -161617 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 434.25-12 chr5 11646315 11646621 + 2 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -57402 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 183-22 chr13 85925678 85925835 + 2 NA Intergenic Intergenic -126337 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 347-14 chr2 196674184 196674480 + 2 NA exon (NM_001353339, exon 6 of 23) exon (NM_001353339, exon 6 of 23) 34617 NM_001353339 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 264.75-53 chr7 46054418 46054618 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -133246 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 414.25-9 chr6 126743952 126744385 + 2 NA Intergenic Intergenic 259537 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 300.25-18 chr3 26694694 26694955 + 2 NA intron (NM_001317811, intron 1 of 2) intron (NM_001317811, intron 1 of 2) 267 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 416-11 chr8 73994523 73994790 + 2 NA intron (NM_001195797, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 3264 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 413-4 chr3 196322021 196322301 + 2 NA intron (NR_046724, intron 1 of 1) intron (NR_046724, intron 1 of 1) 3829 NR_046724 100874214 Hs.672105 NR_046724 ENSG00000235897 TM4SF19-AS1 - TM4SF19 antisense RNA 1 ncRNA 337.75-22 chr8 111323069 111323248 + 2 NA Intergenic Intergenic -53481 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 303.25-14 chr2 19594987 19595334 + 2 NA Intergenic Intergenic -236537 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 355-12 chr5 29899761 29900061 + 2 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 19351 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 610 chr8 115160446 115161108 + 2 NA Intergenic Intergenic 507236 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 437.75-3 chr17 50023597 50024088 + 2 NA Intergenic (TGCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28618 NM_005220 1747 Hs.134194 NM_005220 ENSG00000064195 DLX3 AI4|TDO distal-less homeobox 3 protein-coding 261.25-19 chr2 199910955 199911210 + 2 NA promoter-TSS (NM_153689) promoter-TSS (NM_153689) -211 NM_153689 205327 Hs.154494 NM_153689 ENSG00000178074 C2orf69 - chromosome 2 open reading frame 69 protein-coding 547-3 chr3 190557665 190558014 + 2 NA intron (NR_157352, intron 2 of 10) L1ME1|LINE|L1 43754 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 391.5-19 chr8 123550732 123550954 + 2 NA Intergenic Intergenic -9637 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 145-38 chr12 96683192 96683325 + 2 NA intron (NM_001367885, intron 41 of 68) MER20B|DNA|hAT-Charlie 193681 NM_001306084 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 308 chr1 102948067 102948250 + 2 NA intron (NM_001854, intron 41 of 66) intron (NM_001854, intron 41 of 66) 160338 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 252.5-37 chr2 13637682 13637963 + 2 NA Intergenic Intergenic -630809 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 469.75-2 chr11 63296945 63297216 + 2 NA intron (NM_001039752, intron 2 of 9) intron (NM_001039752, intron 2 of 9) 7177 NR_134874 387775 Hs.188982 NM_001039752 ENSG00000184999 SLC22A10 OAT5|hOAT5 solute carrier family 22 member 10 protein-coding 265.75-75 chr8 136651581 136651950 + 2 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 120967 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 301.5-4 chr1 154107013 154107247 + 2 NA intron (NM_001159484, intron 12 of 37) L1M1|LINE|L1 -2538 NR_049883 100847024 NR_049883 ENSG00000263987 MIR5698 - microRNA 5698 ncRNA 506.25-4 chr16 86675344 86675695 + 2 NA Intergenic (AATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46440 NR_135181 101928614 Hs.399823 NR_135181 ENSG00000260026 LINC02189 - long intergenic non-protein coding RNA 2189 ncRNA 339-32 chr7 114019732 114019957 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66483 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 308.75-13 chr14 45724192 45724497 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -8742 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 340-14 chr3 126442455 126442748 + 2 NA intron (NR_104249, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 33290 NR_104249 79364 Hs.440049 NM_025112 ENSG00000070476 ZXDC ZXDL ZXD family zinc finger C protein-coding 204-73 chr6 118758122 118758357 + 2 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -24469 NR_037662 100287632 Hs.334026 NR_037662 SELENOKP3 - selenoprotein K pseudogene 3 pseudo 364-6 chr14 29053498 29053723 + 2 NA Intergenic Intergenic -267823 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 332-12 chr17 17530700 17530950 + 2 NA intron (NM_148173, intron 2 of 6) L1MC5a|LINE|L1 -34430 NM_016084 51655 Hs.25829 NM_016084 ENSG00000108551 RASD1 AGS1|DEXRAS1|MGC:26290 ras related dexamethasone induced 1 protein-coding 188.5 chr1 28940074 28940220 + 2 NA intron (NM_001166006, intron 1 of 14) intron (NM_001166006, intron 1 of 14) 25571 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 440.5-11 chr5 24479834 24480104 + 2 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 165009 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 339-14 chr16 74586184 74586391 + 2 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 20827 NM_012201 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 265.75-37 chr2 141782863 141783282 + 2 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L2b|LINE|L2 348629 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 266-17 chr16 48888380 48888757 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -278388 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 368.5-10 chr3 89090353 89090591 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -17149 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 392-5 chr2 144485864 144486183 + 2 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -33591 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 262-56 chr8 87776626 87776891 + 2 NA Intergenic Intergenic 97257 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 302.5-21 chr2 178579169 178579343 + 2 NA exon (NM_133432, exon 149 of 192) exon (NM_133432, exon 149 of 192) 56065 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 529.5 chr12 7448766 7449201 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -4798 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 408.25-5 chr21 35329638 35329937 + 2 NA Intergenic Intergenic 250977 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 169.5-20 chr10 115712849 115713021 + 2 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 481854 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 459.5-2 chr12 45503920 45504250 + 2 NA Intergenic Intergenic 211395 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 222.75-82 chr6 48634218 48634411 + 2 NA Intergenic Intergenic -565625 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 211.75-55 chr21 16241149 16241262 + 2 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) 43563 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 315.25-9 chr15 86047380 86047667 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -32097 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 389.5-8 chr18 4926051 4926337 + 2 NA Intergenic Intergenic -154988 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 359-17 chr9 110526912 110527156 + 2 NA intron (NM_153366, intron 3 of 47) L1MD1|LINE|L1 52707 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 267.75-40 chr4 12079194 12079354 + 2 NA Intergenic Intergenic -144177 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 262.75-45 chr5 141363292 141363511 + 2 NA promoter-TSS (NM_032054) promoter-TSS (NM_032054) -930 NM_032054 56110 Hs.368160 NM_018918 ENSG00000253485 PCDHGA5 CDH-GAMMA-A5|ME3|PCDH-GAMMA-A5 protocadherin gamma subfamily A, 5 protein-coding 373.75-9 chr20 31468930 31469259 + 2 NA intron (NM_001037500, intron 1 of 1) L1MC5a|LINE|L1 3919 NM_001037500 245937 Hs.381373 NM_001037500 ENSG00000180383 DEFB124 DEFB-24 defensin beta 124 protein-coding 389.5-11 chr5 153659585 153659886 + 2 NA intron (NM_000827, intron 5 of 15) intron (NM_000827, intron 5 of 15) 167563 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 185.75-124 chr8 40771796 40771985 + 2 NA intron (NM_024645, intron 2 of 6) intron (NM_024645, intron 2 of 6) 125936 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 437.5-2 chr1 172408439 172408792 + 2 NA non-coding (NR_146559, exon 21 of 21) non-coding (NR_146559, exon 21 of 21) -12070 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 474.25-2 chr5 72306399 72306690 + 2 NA intron (NM_015084, intron 2 of 10) L1MC5|LINE|L1 13696 NM_015084 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 172-26 chr12 8120414 8120581 + 2 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -3135 NM_194448 50856 Hs.504657 NM_016184 ENSG00000111729 CLEC4A CD367|CLECSF6|DCIR|DDB27|HDCGC13P|LLIR C-type lectin domain family 4 member A protein-coding 338.5-26 chr5 145823720 145823958 + 2 NA intron (NM_205846, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 11503 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 470.25-4 chr6 121005068 121005493 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 329200 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 223-60 chr4 104353826 104354063 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -137021 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 189-26 chr11 111475669 111475781 + 2 NA intron (NM_017589, intron 5 of 5) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron -34877 NR_147706 728196 Hs.363156 NR_147706 ENSG00000286028 LOC728196 - uncharacterized LOC728196 ncRNA 292.5-10 chr11 5817753 5817907 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2506 NM_001005174 390077 Hs.553737 NM_001005174 ENSG00000180988 OR52N2 OR11-57 olfactory receptor family 52 subfamily N member 2 protein-coding 217-59 chr4 46591614 46591810 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -201584 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 311-21 chr2 226372754 226372991 + 2 NA Intergenic Intergenic 230078 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 276.5-63 chr7 93805953 93806121 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 84716 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 250.5-49 chr2 105164810 105164996 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 20790 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 434.25-9 chr3 182856396 182856760 + 2 NA intron (NM_014616, intron 10 of 29) MIRb|SINE|MIR 63074 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 430-8 chr2 128114428 128114693 + 2 NA intron (NR_027671, intron 6 of 40) intron (NR_027671, intron 6 of 40) 23360 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 183.75-100 chr5 127601560 127601664 + 2 NA Intergenic Intergenic -47409 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 353.25-6 chr17 29633297 29633519 + 2 NA intron (NM_033389, intron 14 of 14) intron (NM_033389, intron 14 of 14) -11985 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 185-33 chr17 71921507 71921689 + 2 NA Intergenic Intergenic 104381 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 391.5-10 chr15 45906408 45906664 + 2 NA intron (NR_135680, intron 2 of 4) MER65-int|LTR|ERV1 201341 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 241-48 chr7 33912202 33912405 + 2 NA intron (NM_133468, intron 3 of 15) intron (NM_133468, intron 3 of 15) 6764 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 216.75-74 chr7 20129123 20129316 + 2 NA intron (NR_110114, intron 1 of 5) intron (NR_110114, intron 1 of 5) 11207 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 264.5-20 chr14 67760126 67760361 + 2 NA intron (NM_015346, intron 35 of 41) intron (NM_015346, intron 35 of 41) 56347 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 426-5 chr11 100249238 100249622 + 2 NA intron (NM_001243270, intron 15 of 23) intron (NM_001243270, intron 15 of 23) -437858 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 180.5-125 chr6 14393269 14393424 + 2 NA Intergenic Intergenic -107892 NR_108097 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 254.25-65 chr8 24074362 24074646 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -219536 NR_130709 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 171.5-47 chr14 70172125 70172244 + 2 NA intron (NM_033262, intron 1 of 7) intron (NM_033262, intron 1 of 7) -14924 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 264.25-42 chr5 22259302 22259644 + 2 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -45623 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 420.75 chr10 59147441 59147806 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 28841 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 285.75-5 chr1 215506169 215506594 + 2 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -60923 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 248.5-75 chr4 79465889 79466076 + 2 NA Intergenic Intergenic -26611 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 491-3 chr8 42613040 42613385 + 2 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -71258 NM_006749 6575 Hs.653173 NM_006749 ENSG00000168575 SLC20A2 GLVR-2|GLVR2|IBGC1|IBGC3|MLVAR|PIT-2|PIT2|RAM1|Ram-1 solute carrier family 20 member 2 protein-coding 138-118 chr4 113699757 113699855 + 2 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) intron (NM_001321585, intron 2 of 19) 61932 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 541.5 chr1 65951183 65951524 + 2 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) intron (NM_002600, intron 3 of 16) 38108 NM_001297441 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 561.25 chr2 79660130 79660479 + 2 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10945 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 453-4 chr7 38695451 38696079 + 2 NA Intergenic Intergenic -8676 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 166.75-119 chr5 104878721 104878936 + 2 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -220646 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 665.75 chr11 76990694 76991099 + 2 NA intron (NM_001300953, intron 5 of 9) intron (NM_001300953, intron 5 of 9) -43502 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 253.5-57 chr4 115689422 115689591 + 2 NA Intergenic Intergenic -575886 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 249.5-78 chr5 83859084 83859269 + 2 NA Intergenic Intergenic -138321 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 235-77 chr9 26958947 26959140 + 2 NA intron (NM_001099224, intron 1 of 13) intron (NM_001099224, intron 1 of 13) 2631 NM_025103 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 443.75 chr14 62226847 62227204 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -87052 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 285-16 chr16 49269545 49269728 + 2 NA Intergenic Intergenic 12202 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 182.75-63 chr2 19493675 19493825 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -135127 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 310-10 chr16 25737154 25737460 + 2 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 45348 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 486.75-2 chr10 59434983 59435533 + 2 NA Intergenic Intergenic -72077 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 213.5-110 chr6 135748495 135748682 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -103113 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 261-42 chr4 85056773 85056981 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 89393 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 238-66 chr8 110183333 110183517 + 2 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -207654 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 393.5-14 chr7 109574266 109574631 + 2 NA Intergenic Intergenic 385765 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 224-49 chr6 71006615 71006745 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -49620 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 243-36 chr2 152363194 152363352 + 2 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 28099 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 149.25-183 chr8 92522080 92522195 + 2 NA Intergenic Intergenic 133357 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 490.25-2 chr8 131246095 131246534 + 2 NA Intergenic Intergenic -205405 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 400-11 chr4 54762839 54763083 + 2 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 105033 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 344-29 chr8 131432818 131433118 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -392059 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 166.75-83 chr20 51203562 51203701 + 2 NA Intergenic Intergenic -180524 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 390.75-8 chr5 31954235 31954624 + 2 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) -18270 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 396-9 chr2 199089762 199090065 + 2 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 368026 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 336-21 chr5 117901889 117902128 + 2 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 171647 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 159-44 chr17 53415951 53416104 + 2 NA Intergenic Intergenic -406900 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 307-30 chr5 72522948 72523170 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -15649 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 253.75-18 chr18 60827110 60827553 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -454556 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 224.75-31 chr14 69178886 69179080 + 2 NA Intergenic Intergenic -12494 NM_018199 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 286.5-67 chr8 81483815 81484016 + 2 NA promoter-TSS (NM_001442) promoter-TSS (NM_001442) -682 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 316.5-3 chr1 59911876 59912071 + 2 NA intron (NM_000775, intron 3 of 8) intron (NM_000775, intron 3 of 8) 14800 NM_000775 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 409-4 chr17 31861359 31861667 + 2 NA 3' UTR (NM_018428, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_018428, exon 19 of 19) -2269 NM_018405 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 257-20 chr16 81392674 81392853 + 2 NA Intergenic Intergenic 7745 NR_039871 100616150 NR_039871 ENSG00000284473 MIR4720 - microRNA 4720 ncRNA 527.25 chr22 25727806 25728135 + 2 NA 3' UTR (NM_005160, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_005160, exon 21 of 21) -14218 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 459.5-6 chr22 25130040 25130596 + 2 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L1ME2|LINE|L1 -17626 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 219-7 chr1 188517883 188518008 + 2 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie 1074317 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 316-15 chr16 14226684 14226866 + 2 NA intron (NM_001308142, intron 8 of 16) AluJr4|SINE|Alu 40089 NM_001365413 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 244-31 chr3 8393593 8393844 + 2 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 107940 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 152.5-58 chr16 1831107 1831240 + 2 NA intron (NM_001142398, intron 1 of 1) intron (NM_001142398, intron 1 of 1) 3949 NM_031208 81889 Hs.513265 NM_031208 ENSG00000180185 FAHD1 C16orf36|YISKL fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 protein-coding 517.75-4 chr8 107551998 107552451 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -54306 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 355.75-3 chr13 20026748 20027025 + 2 NA intron (NM_197968, intron 8 of 24) intron (NM_197968, intron 8 of 24) 67072 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 446.25-4 chr7 40034493 40034735 + 2 NA intron (NM_003718, intron 5 of 13) L1ME3G|LINE|L1 84254 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 389-14 chr3 3225265 3225549 + 2 NA Intergenic Intergenic -45690 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 444.5-5 chr6 108338350 108338722 + 2 NA intron (NM_145315, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 43482 NM_001323005 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 312.25-5 chr11 92219801 92220068 + 2 NA Intergenic Intergenic -5100 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 434-3 chr3 174460582 174460908 + 2 NA Intergenic Intergenic -398589 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 337.25-13 chr5 79690359 79690662 + 2 NA intron (NM_153610, intron 1 of 12) intron (NM_153610, intron 1 of 12) 674 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 325.25-26 chr6 159139249 159139564 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -29994 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 348.5 chr15 96190549 96190922 + 2 NA intron (NR_125738, intron 3 of 4) intron (NR_125738, intron 3 of 4) -62894 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 221.25-53 chr3 118411758 118411995 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -229892 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 241-49 chr7 88491529 88491745 + 2 NA Intergenic Intergenic -184743 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 400-8 chr2 35981756 35982104 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 373640 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 373.25-15 chr6 10116292 10116680 + 2 NA Intergenic Intergenic -288016 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 409-9 chr9 82277646 82277928 + 2 NA Intergenic Intergenic 289015 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 290.75-53 chrX 127146338 127146618 + 2 NA Intergenic Intergenic 326749 NM_001122716 100130613 Hs.130370 NM_001122716 ENSG00000183631 PRR32 CXorf64 proline rich 32 protein-coding 430-15 chr5 44474573 44474935 + 2 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 35528 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 288-46 chr9 28828617 28828868 + 2 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 34964 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 387-6 chr14 103449808 103450109 + 2 NA intron (NM_001128920, intron 4 of 15) intron (NM_001128920, intron 4 of 15) 64543 NM_001128918 4140 Hs.35828 NM_002376 ENSG00000075413 MARK3 CTAK1|KP78|PAR1A|Par-1a|VIPB microtubule affinity regulating kinase 3 protein-coding 231.75-51 chr3 132994130 132994483 + 2 NA Intergenic Intergenic -43982 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 234-26 chr2 144568983 144569204 + 2 NA intron (NR_110570, intron 2 of 2) intron (NR_110570, intron 2 of 2) -44649 NR_136320 105373656 Hs.734683 NR_136320 LOC105373656 - uncharacterized LOC105373656 ncRNA 325-7 chr15 66951106 66951296 + 2 NA intron (NR_135687, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 5314 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 194-32 chr13 83143522 83143643 + 2 NA Intergenic Intergenic 738811 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 317.75-25 chr6 142384761 142384946 + 2 NA intron (NM_198569, intron 6 of 24) intron (NM_198569, intron 6 of 24) 82846 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 350.5-4 chr1 162921464 162921746 + 2 NA Intergenic Intergenic -52790 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 354-28 chr8 128956166 128956476 + 2 NA intron (NR_145483, intron 2 of 3) intron (NR_145483, intron 2 of 3) 9680 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 299.5-40 chr7 39543638 39543924 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -22623 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 265-12 chr14 32830840 32831044 + 2 NA 3' UTR (NM_004274, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_004274, exon 14 of 14) -107937 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 366.5-10 chr4 39867293 39867501 + 2 NA intron (NM_001100399, intron 22 of 32) intron (NM_001100399, intron 22 of 32) 110514 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 540.75-3 chr7 129079087 129079648 + 2 NA Intergenic Intergenic 24144 NR_002187 286016 Hs.369665 NR_002187 ENSG00000230359 TPI1P2 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 2 pseudo 212-17 chr11 111965747 111966062 + 2 NA intron (NM_001278542, intron 3 of 5) MIRb|SINE|MIR -11405 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 202.75-57 chr2 95296379 95296515 + 2 NA promoter-TSS (NM_013434) promoter-TSS (NM_013434) -900 NM_013434 30818 Hs.437376 NM_013434 ENSG00000115041 KCNIP3 CSEN|DREAM|KCHIP3 potassium voltage-gated channel interacting protein 3 protein-coding 454.5-5 chr8 138178867 138179317 + 2 NA intron (NM_015912, intron 9 of 19) intron (NM_015912, intron 9 of 19) -95547 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 174-38 chr16 75318840 75318949 + 2 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) intron (NM_006324, intron 5 of 6) -50887 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 372.5-10 chr2 33209329 33209768 + 2 NA intron (NM_206943, intron 7 of 33) intron (NM_206943, intron 7 of 33) 74951 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 317-32 chr8 19758035 19758378 + 2 NA promoter-TSS (NM_001354481) promoter-TSS (NM_001354481) -177 NR_148897 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 353.25-19 chr3 146634172 146634447 + 2 NA Intergenic Intergenic -28093 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 516.75 chr11 24522404 24522783 + 2 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 25540 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 400-2 chr10 60208608 60208926 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 10 of 43) intron (NM_001204403, intron 10 of 43) -67751 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 388.5-10 chr2 65628345 65628767 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -195957 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 760.25 chr10 101380350 101381097 + 2 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 26558 NM_003939 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 528.5 chr14 56793536 56793988 + 2 NA Intergenic Intergenic 11905 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 231.5-39 chr2 7820787 7821068 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 78728 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 246.25-45 chr3 118482728 118482861 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -158974 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 294.5-6 chr10 66329707 66330014 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -596176 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 468.75-2 chr14 77866921 77867188 + 2 NA intron (NM_001366489, intron 4 of 9) L2a|LINE|L2 66945 NM_001142545 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 203.25-71 chr3 144595348 144595482 + 2 NA Intergenic Intergenic 622334 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 307.5-41 chr4 32304051 32304398 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -46814 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 409.5-11 chr3 62765899 62766280 + 2 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 109327 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 318.25-2 chr1 75655430 75655712 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -39408 NM_001320283 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 306-3 chr10 75852905 75853077 + 2 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 70230 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 389-17 chr6 125762823 125763019 + 2 NA Intergenic Intergenic 13289 NM_012259 23493 Hs.144287 NM_012259 ENSG00000135547 HEY2 CHF1|GRIDLOCK|GRL|HERP1|HESR2|HRT2|bHLHb32 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2 protein-coding 187-50 chr20 20312943 20313072 + 2 NA intron (NM_015585, intron 25 of 26) intron (NM_015585, intron 25 of 26) -55097 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 419-8 chr3 192334912 192335197 + 2 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) 73995 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 434.5-9 chr2 8198846 8199152 + 2 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) 129420 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 151.75-26 chr11 5836752 5836874 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 5084 NM_001005167 390078 NM_001005167 ENSG00000205409 OR52E6 OR11-58 olfactory receptor family 52 subfamily E member 6 protein-coding 432.25-7 chr7 29186738 29187134 + 2 NA intron (NM_001371264, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 3121 NM_001371262 302.5-27 chr3 119787999 119788313 + 2 NA intron (NM_022002, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 5446 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 432.5-6 chr22 31355264 31355613 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 8679 NR_120386 54944 Hs.648259 NM_017834 LINC01521 - long intergenic non-protein coding RNA 1521 ncRNA 214.75-48 chr21 25803003 25803145 + 2 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -67420 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 359-15 chr8 3388383 3388570 + 2 NA intron (NM_033225, intron 17 of 69) intron (NM_033225, intron 17 of 69) -660025 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 554.25-2 chr9 69753773 69754301 + 2 NA intron (NM_001099666, intron 1 of 7) intron (NM_001099666, intron 1 of 7) 5974 NM_001099666 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 284-29 chr20 41231543 41231768 + 2 NA intron (NM_015035, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 62632 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 327.25-29 chrX 98764064 98764370 + 2 NA Intergenic Intergenic -1199682 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 278-14 chr18 9946515 9946816 + 2 NA intron (NM_003574, intron 5 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 32649 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 310.75-14 chr14 48092919 48093142 + 2 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -298016 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 227-21 chr14 54937085 54937263 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -34348 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 265.25-20 chr17 62331248 62331476 + 2 NA Intergenic Intergenic -38856 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 328-19 chr20 45237387 45237559 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 16100 NM_003008 6407 Hs.537218 NM_003008 ENSG00000124157 SEMG2 SGII semenogelin 2 protein-coding 255.5-67 chr5 150232928 150233121 + 2 NA intron (NM_001369025, intron 14 of 17) intron (NM_001369025, intron 14 of 17) 42962 NM_014228 6534 Hs.241597 NM_014228 ENSG00000011083 SLC6A7 PROT solute carrier family 6 member 7 protein-coding 583.25-2 chr8 90447465 90447940 + 2 NA Intergenic Intergenic 158361 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 338.75-7 chr15 60450738 60450993 + 2 NA TTS (NM_001276385) TTS (NM_001276385) 28277 NM_001018089 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 227.75-28 chr18 13288236 13288425 + 2 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) Mam_R4|LINE|Dong-R4 10225 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 178-31 chr15 24991603 24991789 + 2 NA intron (NR_146177, intron 15 of 147) intron (NR_146177, intron 15 of 147) 4771 NR_001292 338427 NR_001292 ENSG00000239014 SNORD108 HBII-437 small nucleolar RNA, C/D box 108 snoRNA 524-2 chr4 85715122 85715464 + 2 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -7175 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 186-43 chr2 7649052 7649157 + 2 NA Intergenic Intergenic 227843 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 432.25-5 chr6 14594570 14595030 + 2 NA Intergenic Intergenic -309346 NR_108097 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 248-51 chr3 163765478 163765755 + 2 NA Intergenic Intergenic 405940 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 337.5-27 chr6 63582046 63582376 + 2 NA 3' UTR (NM_003463, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_003463, exon 6 of 6) 10199 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 160.75-133 chr6 56573098 56573183 + 2 NA intron (NM_001144770, intron 43 of 94) intron (NM_001144770, intron 43 of 94) 69749 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 198.25-58 chr2 122915622 122915802 + 2 NA Intergenic Intergenic 157769 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 444.75 chr1 46832729 46833241 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 33939 NM_001319161 1580 Hs.436317 NM_000779 ENSG00000142973 CYP4B1 CYPIVB1|P-450HP cytochrome P450 family 4 subfamily B member 1 protein-coding 296-12 chr12 33081138 33081368 + 2 NA Intergenic Intergenic -184407 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 279.5-47 chr4 67223815 67223966 + 2 NA Intergenic Intergenic 198110 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 363-11 chr3 18725869 18726065 + 2 NA Intergenic Intergenic -280375 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 302-11 chr15 55034858 55035084 + 2 NA Intergenic Intergenic -21776 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 412-9 chr3 167166039 167166461 + 2 NA Intergenic Intergenic 214033 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 515-5 chr8 27357085 27357505 + 2 NA intron (NM_173175, intron 1 of 29) intron (NM_173175, intron 1 of 29) 31731 NM_173175 2185 Hs.491322 NM_004103 ENSG00000120899 PTK2B CADTK|CAKB|FADK2|FAK2|PKB|PTK|PYK2|RAFTK protein tyrosine kinase 2 beta protein-coding 385.5 chr1 200291429 200291823 + 2 NA Intergenic Intergenic 82166 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 208-30 chr17 5830352 5830505 + 2 NA intron (NR_040000, intron 1 of 3) intron (NR_040000, intron 1 of 3) 58194 NR_040000 339166 Hs.736088 NR_040000 ENSG00000284837 LOC339166 - uncharacterized LOC339166 ncRNA 513.5-2 chr21 26899849 26900302 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -53886 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 246-12 chr12 91954155 91954395 + 2 NA Intergenic Intergenic 187438 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 277-13 chr15 42914764 42914944 + 2 NA intron (NM_173500, intron 1 of 14) intron (NM_173500, intron 1 of 14) 5924 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 491.25 chr1 102129779 102130351 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -132831 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 430.75-3 chr14 20765126 20765396 + 2 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -3143 NM_022360 64184 Hs.525202 NM_022360 ENSG00000181552 EDDM3B EP3B|FAM12B|HE3-BETA|HE3B|RAM2 epididymal protein 3B protein-coding 408.5 chr10 115965959 115966213 + 2 NA Intergenic Intergenic 228703 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 468.5-4 chr4 42668811 42669174 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -11887 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 131.5-3 chr1 52776645 52776768 + 2 NA intron (NM_024646, intron 3 of 13) intron (NM_024646, intron 3 of 13) 50253 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 191-40 chr2 165167457 165167598 + 2 NA intron (NM_006922, intron 5 of 27) intron (NM_006922, intron 5 of 27) 36523 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 237.25-65 chr6 26655371 26655589 + 2 NA intron (NM_001242799, intron 1 of 2) MER105|DNA|hAT-Charlie 4266 NM_024639 79692 Hs.126280 NM_024639 ENSG00000181315 ZNF322 HCG12|ZNF322A|ZNF388|ZNF489 zinc finger protein 322 protein-coding 314-17 chr5 11272456 11272803 + 2 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 316288 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 371.5-5 chr14 81352599 81352935 + 2 NA intron (NM_001366849, intron 5 of 8) intron (NM_001366849, intron 5 of 8) 75008 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 408.75 chr11 104891206 104891930 + 2 NA intron (NM_001191016, intron 3 of 7) intron (NM_001191016, intron 3 of 7) 7102 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 334-17 chr3 32089300 32089634 + 2 NA Intergenic LTR3B|LTR|ERVK -17044 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 445.25-7 chr5 109698746 109699042 + 2 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) HAL1ME|LINE|L1 9528 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 250.25-51 chr9 77313989 77314208 + 2 NA exon (NM_015186, exon 36 of 69) exon (NM_015186, exon 36 of 69) -133551 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 265-5 chr10 65301951 65302146 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -269377 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 350.75-15 chr8 141134700 141134993 + 2 NA intron (NM_014957, intron 1 of 22) intron (NM_014957, intron 1 of 22) 6257 NM_001352890 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 256.25-19 chr2 37253015 37253189 + 2 NA non-coding (NR_146406, exon 11 of 11) non-coding (NR_146406, exon 11 of 11) 21444 NR_146410 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 179.5-58 chr14 59011456 59011631 + 2 NA intron (NR_110547, intron 5 of 5) L1M3e|LINE|L1 -177124 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 404-2 chr10 58562608 58563094 + 2 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) L1M2|LINE|L1 49979 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 427.5-9 chr7 7542565 7542983 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6901 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 390.5-13 chr8 113893887 113894250 + 2 NA Intergenic Intergenic -457129 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 410.5-12 chr6 56046198 56046677 + 2 NA Intergenic Intergenic 45225 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 318.25-22 chrX 152110617 152110890 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 7186 NM_021049 4104 Hs.18048 NM_021049 MAGEA5 CT1.5|MAGE5|MAGEA4 MAGE family member A5 protein-coding 360.5-10 chr20 39102977 39103342 + 2 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 121589 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 279-39 chr6 71511864 71512033 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 90921 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 292-29 chr3 81805042 81805223 + 2 NA Intergenic Intergenic -43487 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 364-8 chr17 47686681 47687016 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8416 NM_014726 9755 Hs.94790 NM_014726 ENSG00000198933 TBKBP1 ProSAPiP2|SINTBAD TBK1 binding protein 1 protein-coding 432-11 chr4 31859402 31859735 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -137811 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 201.75-82 chr6 42711995 42712131 + 2 NA intron (NM_000322, intron 1 of 2) L1MC5a|LINE|L1 10534 NM_000322 5961 Hs.654489 NM_000322 ENSG00000112619 PRPH2 AOFMD|AVMD|CACD2|DS|MDBS1|PRPH|RDS|RP7|TSPAN22|rd2 peripherin 2 protein-coding 513.25 chr1 105337506 105337791 + 2 NA Intergenic Intergenic 281287 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 325.5-22 chr21 28953875 28954070 + 2 NA intron (NM_015565, intron 16 of 29) intron (NM_015565, intron 16 of 29) 38905 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 258-48 chr5 32691782 32691967 + 2 NA intron (NM_001364458, intron 1 of 7) L1ME5|LINE|L1 1002 NM_001364458 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 144.5-37 chr11 11874003 11874131 + 2 NA intron (NM_001330208, intron 2 of 28) intron (NM_001330208, intron 2 of 28) 32644 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 290.75 chr1 75723087 75723350 + 2 NA Intergenic LTR10C|LTR|ERV1 -1129 NM_001286044 34 Hs.445040 NM_000016 ENSG00000117054 ACADM ACAD1|MCAD|MCADH acyl-CoA dehydrogenase medium chain protein-coding 318-32 chr5 76485443 76485630 + 2 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) intron (NM_006633, intron 2 of 35) -61873 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 411.75-3 chr1 164538019 164538369 + 2 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -21166 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 370.75-12 chr7 138572990 138573221 + 2 NA intron (NM_003852, intron 11 of 18) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 91119 NM_174959 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 372.5 chr1 96889518 96889760 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 167001 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 303-7 chr13 82409508 82409721 + 2 NA Intergenic Intergenic -1182631 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 294-22 chr20 62810948 62811163 + 2 NA intron (NM_007346, intron 5 of 6) intron (NM_007346, intron 5 of 6) -5468 NR_102430 101409261 Hs.593952 NR_102430 ENSG00000229873 OGFR-AS1 - OGFR antisense RNA 1 ncRNA 268.75-41 chr7 15252020 15252251 + 2 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) LTR87|LTR|ERVL? -277277 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 372-13 chr5 15084558 15084892 + 2 NA Intergenic Intergenic 181835 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 184-58 chr4 23841610 23841762 + 2 NA intron (NM_001330752, intron 3 of 13) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 39606 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 321-31 chr8 84064574 84064811 + 2 NA Intergenic Intergenic -118095 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 298.25-10 chr16 7552049 7552367 + 2 NA intron (NM_145893, intron 2 of 13) intron (NM_145893, intron 2 of 13) 219363 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 281-34 chr6 66673395 66673591 + 2 NA Intergenic Intergenic 885614 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 539 chr14 82652896 82653226 + 2 NA intron (NR_146650, intron 2 of 5) intron (NR_146650, intron 2 of 5) 10429 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 715.25 chr10 51773325 51773987 + 2 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -74061 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 296-22 chr2 50245781 50245964 + 2 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MIRc|SINE|MIR 101882 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 257-50 chr5 116055245 116055472 + 2 NA intron (NM_001195581, intron 2 of 2) L1ME3D|LINE|L1 3892 NM_001195581 644100 Hs.98288 NM_001195581 ENSG00000268223 ARL14EPL - ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein like protein-coding 316-7 chr12 20919432 20919732 + 2 NA intron (NM_001371097, intron 13 of 15) L1MA6|LINE|L1 -96114 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 335.75-8 chr18 73485154 73485458 + 2 NA Intergenic Intergenic 160365 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 316-23 chr6 100293152 100293360 + 2 NA Intergenic Intergenic 170419 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 622.75-2 chr5 104320872 104321482 + 2 NA Intergenic Intergenic -758388 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 163-105 chr5 161795299 161795398 + 2 NA Intergenic Intergenic -51843 NM_000806 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 563.75 chr20 55529961 55530312 + 2 NA Intergenic Intergenic -102939 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 283-25 chr2 161875128 161875345 + 2 NA intron (NM_001354460, intron 9 of 27) intron (NM_001354460, intron 9 of 27) 198979 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 240.5-5 chr10 12161029 12161256 + 2 NA intron (NM_001142627, intron 10 of 11) intron (NM_001142627, intron 10 of 11) -30326 NR_039699 100616488 NR_039699 ENSG00000265653 MIR548AK - microRNA 548ak ncRNA 424.25-2 chr14 23297402 23297811 + 2 NA 3' UTR (NM_001276318, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001276318, exon 5 of 5) 5253 NM_001276318 90673 Hs.601513 NM_001276318 ENSG00000235194 PPP1R3E - protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E protein-coding 315.75-13 chr2 75663304 75663484 + 2 NA 3' UTR (NM_003203, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_003203, exon 17 of 17) 16611 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 414-7 chr2 61742536 61743072 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 111256 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 308.5-15 chr18 26870722 26871031 + 2 NA intron (NR_026908, intron 1 of 7) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -5073 NM_001317384 361 Hs.315369 NM_001650 ENSG00000171885 AQP4 MIWC|WCH4 aquaporin 4 protein-coding 265.25-35 chr3 117447502 117447696 + 2 NA Intergenic Intergenic 243326 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 353.75-6 chr17 5337644 5338177 + 2 NA intron (NM_001083585, intron 4 of 16) intron (NM_001083585, intron 4 of 16) 55626 NM_001291582 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 181-99 chr6 127474130 127474221 + 2 NA intron (NM_001012279, intron 6 of 11) intron (NM_001012279, intron 6 of 11) -14786 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 379.25-6 chr17 62727058 62727422 + 2 NA intron (NM_001288780, intron 7 of 10) intron (NM_001288780, intron 7 of 10) 21034 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 234-51 chr4 175009283 175009476 + 2 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 91021 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 203.75-82 chr5 12557220 12557443 + 2 NA Intergenic Intergenic -17526 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 380.5-5 chr16 55549422 55549785 + 2 NA intron (NM_017839, intron 10 of 13) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -17081 NM_032330 84290 Hs.660027 NM_032330 ENSG00000256812 CAPNS2 CSS2 calpain small subunit 2 protein-coding 346.25-14 chr5 23045734 23045978 + 2 NA Intergenic Intergenic -192512 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 443.25-4 chr2 81444491 81444868 + 2 NA Intergenic Intergenic 22267 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 485 chr13 44034819 44035167 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 12658 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 267.25-18 chr18 11372675 11372862 + 2 NA Intergenic Intergenic -81710 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 312.75-17 chr2 189809821 189810029 + 2 NA intron (NM_000534, intron 4 of 12) intron (NM_000534, intron 4 of 12) 25475 NM_001321049 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 412.25-12 chr3 89388800 89389122 + 2 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 281340 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 439.25-3 chr11 30283310 30283683 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -39608 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 243.5-93 chr9 117223581 117223829 + 2 NA intron (NM_014010, intron 2 of 21) intron (NM_014010, intron 2 of 21) -42504 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 301-25 chr6 155276431 155276655 + 2 NA TTS (NM_001001346) TTS (NM_001001346) 12530 NM_001001346 49861 Hs.567491 NM_001001346 ENSG00000171217 CLDN20 - claudin 20 protein-coding 371-17 chr3 136401289 136401562 + 2 NA intron (NM_005862, intron 21 of 33) L1ME3B|LINE|L1 151085 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 293-27 chr4 17290233 17290482 + 2 NA Intergenic Intergenic 30525 NR_145770 109616994 NR_145770 ENSG00000206780 SNORA75B - small nucleolar RNA, H/ACA box 75B snoRNA 332.75-5 chr10 52498163 52498379 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -27738 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 364-7 chr14 55623329 55623607 + 2 NA intron (NR_073129, intron 6 of 45) AluJb|SINE|Alu 43261 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 276.75-19 chr19 28503749 28504101 + 2 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -102763 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 468.75-6 chr6 120956585 120957035 + 2 NA Intergenic Intergenic 377670 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 301.5-27 chr2 103272940 103273176 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -288629 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 237-7 chr1 245159147 245159335 + 2 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) intron (NM_018012, intron 2 of 14) 4256 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 405.25-4 chr17 56291339 56291669 + 2 NA intron (NM_001370326, intron 3 of 20) (TTATGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 138029 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 382-7 chr12 68167734 68167992 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8123 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 496.25 chr1 114411166 114411498 + 2 NA intron (NM_015906, intron 11 of 19) intron (NM_015906, intron 11 of 19) 99871 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 277.5-40 chr22 47906954 47907230 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 275418 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 379-3 chr16 26887791 26888003 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -179030 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 278.5-55 chr8 17053101 17053254 + 2 NA intron (NR_146233, intron 1 of 15) intron (NR_146233, intron 1 of 15) 25939 NM_001349810 286097 Hs.403594 NM_181723 ENSG00000155970 MICU3 EFHA2 mitochondrial calcium uptake family member 3 protein-coding 358.25-16 chr3 190892390 190892709 + 2 NA Intergenic Intergenic 14619 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 289.25-12 chr2 15220502 15220795 + 2 NA intron (NM_015909, intron 47 of 51) intron (NM_015909, intron 47 of 51) 340686 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 399.5-6 chr5 43549348 43549614 + 2 NA intron (NM_006451, intron 2 of 10) THE1A|LTR|ERVL-MaLR 7596 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 169-62 chr3 113094400 113094516 + 2 NA Intergenic Intergenic 73273 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 251.5-69 chr5 133149890 133150153 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 98008 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 403-7 chr4 138010663 138010958 + 2 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -78204 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 471 chr1 35550331 35550606 + 2 NA intron (NM_024874, intron 2 of 20) intron (NM_024874, intron 2 of 20) 6935 NM_024874 79932 Hs.456507 NM_024874 ENSG00000142687 KIAA0319L AAVR|AAVRL KIAA0319 like protein-coding 531.75-2 chr4 65785953 65786525 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -115744 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 260.25-3 chr1 210868152 210868344 + 2 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) L1ME1|LINE|L1 265126 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 294-8 chr12 104091220 104091465 + 2 NA intron (NM_013320, intron 9 of 14) HAL1|LINE|L1 26811 NM_013320 29915 Hs.506558 NM_013320 ENSG00000111727 HCFC2 HCF-2|HCF2 host cell factor C2 protein-coding 245.5-25 chr14 101341452 101341680 + 2 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 66356 NR_126006 338002 Hs.124848 NR_126006 ENSG00000259023 LINC00524 C14orf71 long intergenic non-protein coding RNA 524 ncRNA 298.5-28 chr3 181089219 181089537 + 2 NA intron (NR_075091, intron 2 of 7) MERX|DNA|TcMar-Tigger 32698 NR_075091 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 304-24 chr21 24149844 24150076 + 2 NA Intergenic Intergenic 171417 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 311.75-19 chr5 55576013 55576242 + 2 NA Intergenic Intergenic -41049 NR_103485 8611 Hs.696231 NM_003711 ENSG00000067113 PLPP1 LLP1a|LPP1|PAP-2a|PAP2|PPAP2A phospholipid phosphatase 1 protein-coding 332-29 chr8 134921479 134921986 + 2 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 71797 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 271.5-57 chr3 108545730 108546015 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -16550 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 316.5-8 chr1 245763485 245763676 + 2 NA intron (NM_022743, intron 11 of 11) intron (NM_022743, intron 11 of 11) -529063 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 290.5-20 chr18 5934422 5934735 + 2 NA Intergenic Intergenic -38624 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 201-56 chr4 32988401 32988550 + 2 NA Intergenic Intergenic 637437 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 411.5-9 chr9 1489919 1490160 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 438552 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 434.75 chr10 7921747 7922108 + 2 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 103422 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 468.75 chr10 116268094 116268491 + 2 NA intron (NM_005264, intron 4 of 10) MIRb|SINE|MIR 3933 NM_145793 2674 Hs.388347 NM_005264 ENSG00000151892 GFRA1 GDNFR|GDNFRA|GFR-ALPHA-1|RET1L|RETL1|TRNR1 GDNF family receptor alpha 1 protein-coding 414-2 chr12 54281683 54281970 + 2 NA exon (NM_031157, exon 3 of 11) exon (NM_031157, exon 3 of 11) 1100 NR_135167 3178 Hs.546261 NM_002136 ENSG00000135486 HNRNPA1 ALS19|ALS20|HNRPA1|HNRPA1L3|IBMPFD3|UP 1|hnRNP A1|hnRNP-A1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 protein-coding 559.5 chr10 33295738 33296310 + 2 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 38643 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 252-2 chr1 74414498 74414745 + 2 NA intron (NM_015978, intron 17 of 24) intron (NM_015978, intron 17 of 24) 68819 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 304.25-27 chr8 119301944 119302184 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -23107 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 278.25-57 chr8 112765462 112765666 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 122071 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 432-4 chr13 50931156 50931463 + 2 NA intron (NM_001142279, intron 4 of 9) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -20597 NR_046552 100874255 Hs.741501 NR_046552 RNASEH2B-AS1 - RNASEH2B antisense RNA 1 ncRNA 143.5-147 chr3 115051069 115051200 + 2 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20280 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 231.5-36 chr17 49351420 49351652 + 2 NA intron (NR_135579, intron 1 of 7) intron (NR_135579, intron 1 of 7) -9629 NR_110884 102724596 Hs.559253 NR_110882 ENSG00000248714 LOC102724596 - uncharacterized LOC102724596 ncRNA 241-44 chr6 36206529 36206692 + 2 NA intron (NM_015695, intron 3 of 12) intron (NM_015695, intron 3 of 12) 9866 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 492-5 chr7 32501529 32501813 + 2 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) intron (NM_015060, intron 1 of 15) 6182 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 243.5-34 chr18 65181280 65181495 + 2 NA Intergenic Intergenic -568865 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 383.25-20 chr5 58418870 58419188 + 2 NA Intergenic Intergenic 41057 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 340-20 chr8 123712481 123712727 + 2 NA intron (NM_001003954, intron 3 of 11) intron (NM_001003954, intron 3 of 11) 24789 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 183.5-91 chr3 113255839 113256024 + 2 NA intron (NM_001301861, intron 4 of 19) MIRc|SINE|MIR 43815 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 477-3 chr2 77914058 77914486 + 2 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -1662 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 361-18 chr9 96336423 96336748 + 2 NA intron (NM_001286990, intron 6 of 8) intron (NM_001286990, intron 6 of 8) -34409 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 148.25-85 chr22 26558805 26558927 + 2 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) MER96B|DNA|hAT-Tip100 -3543 NR_031615 100313914 NR_031615 ENSG00000221760 MIR548J MIRN548J|hsa-mir-548j microRNA 548j ncRNA 235-10 chr10 49506340 49506601 + 2 NA intron (NM_001346440, intron 5 of 20) intron (NM_001346440, intron 5 of 20) 17811 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 547.75-3 chr3 5616294 5616883 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -366333 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 277.5-68 chr6 36257419 36257676 + 2 NA intron (NM_173676, intron 1 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -12913 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 533-4 chr8 109757985 109758516 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -66459 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 274.25-43 chr6 56126396 56126838 + 2 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) intron (NM_030820, intron 12 of 29) -34955 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 334-2 chr1 196149252 196149437 + 2 NA Intergenic Intergenic -60629 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 301.5-31 chr22 32663809 32664181 + 2 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -136821 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 407.25-7 chr2 80675646 80676020 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 362454 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 288-32 chr3 40302432 40302641 + 2 NA intron (NR_033965, intron 1 of 2) intron (NR_033965, intron 1 of 2) 7162 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 221-49 chr3 80731304 80731456 + 2 NA Intergenic Intergenic -33517 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 401.5 chr1 75409039 75409379 + 2 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) L1PA16|LINE|L1 201905 NM_001130058 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 165.75 chr1 34804637 34804863 + 2 NA Intergenic Intergenic 11751 NM_002060 2701 Hs.296310 NM_002060 ENSG00000187513 GJA4 CX37 gap junction protein alpha 4 protein-coding 318-40 chrX 45962140 45962415 + 2 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -110787 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 248-24 chr14 69121223 69121596 + 2 NA intron (NM_003861, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 31190 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 415.5-9 chr7 34269268 34269537 + 2 NA Intergenic Intergenic 363863 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 272.25-51 chr6 65343174 65343344 + 2 NA intron (NM_198283, intron 9 of 9) intron (NM_198283, intron 9 of 9) 41841 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 396.5-2 chr13 76807827 76808147 + 2 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 78418 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 242.75-16 chr14 53501598 53501819 + 2 NA Intergenic Intergenic 348354 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 228-68 chr6 51726990 51727207 + 2 NA intron (NM_170724, intron 60 of 60) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 105228 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 384.75 chr10 60536342 60536595 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 36488 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 458.5-8 chr8 90984262 90984559 + 2 NA intron (NM_001190972, intron 1 of 5) intron (NM_001190972, intron 1 of 5) 667 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 477.75-2 chr14 50916029 50916509 + 2 NA intron (NM_002863, intron 9 of 19) intron (NM_002863, intron 9 of 19) 28214 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 301-22 chr5 15372334 15372501 + 2 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -105857 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 346.5-30 chr9 115826839 115827035 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -82698 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 421-6 chr2 111161112 111161452 + 2 NA intron (NM_001204109, intron 3 of 3) intron (NM_001204109, intron 3 of 3) 40368 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 345.25-19 chr5 120061664 120062109 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -402392 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 159-125 chr8 138426653 138426790 + 2 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 70540 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 292-26 chr21 17442986 17443195 + 2 NA intron (NR_037586, intron 2 of 3) LTR48B|LTR|ERV1 4200 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 293-38 chr7 101304379 101304549 + 2 NA Intergenic Intergenic -3843 NR_110115 101927746 NR_110115 LOC101927746 - uncharacterized LOC101927746 ncRNA 177.5-42 chr14 21213961 21214093 + 2 NA intron (NM_031314, intron 5 of 8) intron (NM_031314, intron 5 of 8) -7127 NR_038971 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 533-2 chr12 108822811 108823160 + 2 NA intron (NM_018984, intron 3 of 14) intron (NM_018984, intron 3 of 14) 4566 NM_001161331 54434 Hs.199763 NM_018984 ENSG00000084112 SSH1 SSH1L slingshot protein phosphatase 1 protein-coding 496.5-4 chr6 41867192 41867571 + 2 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) intron (NM_001286554, intron 1 of 5) 4256 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 405-2 chr14 54638805 54639196 + 2 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 71388 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 316-17 chr17 61290198 61290401 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 77405 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 267.5-71 chr7 103300466 103300675 + 2 NA intron (NM_004279, intron 4 of 12) intron (NM_004279, intron 4 of 12) 3135 NM_004279 9512 Hs.184211 NM_004279 ENSG00000105819 PMPCB Beta-MPP|MPP11|MPPB|MPPP52|P-52 peptidase, mitochondrial processing beta subunit protein-coding 467-3 chr14 71229657 71230001 + 2 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -90647 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 233.25-44 chr22 26608931 26609097 + 2 NA intron (NM_001887, intron 3 of 5) MIRc|SINE|MIR 9013 NM_001887 1414 Hs.37135 NM_001887 ENSG00000100122 CRYBB1 CATCN3|CTRCT17 crystallin beta B1 protein-coding 363-27 chr9 84265499 84265938 + 2 NA Intergenic Intergenic 75040 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 174-45 chr18 2580088 2580184 + 2 NA intron (NM_006101, intron 6 of 16) intron (NM_006101, intron 6 of 16) 8579 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 296.75-15 chr17 66580463 66580709 + 2 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -163732 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 417.25-8 chr9 70999944 71000363 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 121468 NM_001366150 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 444 chr10 56257765 56258151 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 103301 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 231.5-91 chr7 46582605 46582799 + 2 NA Intergenic Intergenic 114420 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 218-66 chr7 84666762 84666920 + 2 NA Intergenic Intergenic 134365 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 349.25-21 chrX 102820732 102821060 + 2 NA intron (NR_146593, intron 2 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 51743 NR_146590 100287765 Hs.556850 NR_038988 LINC00630 - long intergenic non-protein coding RNA 630 ncRNA 185.75-88 chr3 98875592 98875721 + 2 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) L1MC4a|LINE|L1 26039 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 485-2 chr18 62349997 62350458 + 2 NA intron (NM_001270949, intron 3 of 8) MIRc|SINE|MIR 24917 NM_001270951 8792 Hs.204044 NM_003839 ENSG00000141655 TNFRSF11A CD265|FEO|LOH18CR1|ODFR|OFE|OPTB7|OSTS|PDB2|RANK|TRANCER TNF receptor superfamily member 11a protein-coding 493.5-5 chr2 47928352 47928805 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22785 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 294.5-4 chr1 225899577 225899740 + 2 NA Intergenic Intergenic -10512 NM_020997 10637 Hs.656214 NM_020997 ENSG00000243709 LEFTY1 LEFTB|LEFTYB left-right determination factor 1 protein-coding 187.25-24 chr12 112659471 112659658 + 2 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) L1MC4|LINE|L1 35612 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 211-17 chr13 78242042 78242173 + 2 NA intron (NR_047001, intron 2 of 5) intron (NR_047001, intron 2 of 5) 187252 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 299-37 chr9 135873104 135873350 + 2 NA intron (NM_015447, intron 3 of 16) L1ME1|LINE|L1 34319 NM_015447 157922 Hs.522493 NM_015447 ENSG00000130559 CAMSAP1 - calmodulin regulated spectrin associated protein 1 protein-coding 454.75-5 chr5 43650979 43651333 + 2 NA intron (NM_012343, intron 12 of 21) intron (NM_012343, intron 12 of 21) -47926 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 252.5-40 chr2 37693480 37693786 + 2 NA Intergenic Intergenic -21098 NM_001270436 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 428.25-4 chr5 95952964 95953417 + 2 NA intron (NM_012081, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 8661 NM_012081 22936 Hs.192221 NM_012081 ENSG00000118985 ELL2 MRCCAT1 elongation factor for RNA polymerase II 2 protein-coding 199.5-88 chr2 153887957 153888087 + 2 NA intron (NM_052917, intron 1 of 12) intron (NM_052917, intron 1 of 12) 16100 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 386-11 chr8 19625720 19626083 + 2 NA intron (NR_148898, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR -23356 NM_001354496 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 407.5 chr12 39579649 39579896 + 2 NA intron (NM_005164, intron 7 of 9) intron (NM_005164, intron 7 of 9) 40031 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 304.25-4 chr10 57947106 57947448 + 2 NA Intergenic Intergenic 320617 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 293.75-35 chr3 187874541 187874732 + 2 NA Intergenic Intergenic 101771 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 256.25-50 chr8 104064371 104064530 + 2 NA intron (NM_001348499, intron 19 of 23) intron (NM_001348499, intron 19 of 23) -158885 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 388.75-10 chr5 53977561 53977803 + 2 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -26083 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 499.25-5 chr4 79261575 79261996 + 2 NA intron (NR_038342, intron 4 of 5) intron (NR_038342, intron 4 of 5) 64276 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 339.5-9 chr11 87971334 87971556 + 2 NA Intergenic Intergenic 203998 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 404-4 chr4 64979590 64979809 + 2 NA intron (NR_033976, intron 1 of 6) intron (NR_033976, intron 1 of 6) 24801 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 557.5-2 chr12 45691295 45691843 + 2 NA Intergenic Intergenic 36352 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 410.5-7 chr2 95247856 95248124 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -26459 NM_001165978 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 230-33 chr2 56178284 56178443 + 2 NA intron (NR_125368, intron 1 of 2) intron (NR_125368, intron 1 of 2) -5627 NM_001080433 114800 Hs.117136 NM_001080433 ENSG00000055813 CCDC85A - coiled-coil domain containing 85A protein-coding 336.5-31 chr9 116882506 116882798 + 2 NA intron (NM_014010, intron 9 of 21) intron (NM_014010, intron 9 of 21) 195347 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 234-21 chr2 117076442 117076628 + 2 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -738156 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 222.5-54 chr2 142352535 142352709 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -220921 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 242.5-72 chr6 136333677 136333856 + 2 NA Intergenic Intergenic -43915 NM_001077440 9774 Hs.486542 NM_014739 ENSG00000029363 BCLAF1 BTF|bK211L9.1 BCL2 associated transcription factor 1 protein-coding 260-17 chr2 209210965 209211109 + 2 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -213010 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 344.5-18 chr4 49150356 49150612 + 2 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 163842 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 329-2 chr1 62780316 62780594 + 2 NA Intergenic Intergenic -3651 NM_178221 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 606.25-2 chr20 48308270 48308828 + 2 NA Intergenic Intergenic -51362 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 374.25-5 chr2 138639724 138640030 + 2 NA Intergenic Intergenic 138107 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 197.5-55 chr17 10302309 10302443 + 2 NA intron (NM_003802, intron 39 of 40) intron (NM_003802, intron 39 of 40) 70630 NM_003802 8735 Hs.711142 NM_003802 ENSG00000006788 MYH13 MyHC-IIL|MyHC-eo myosin heavy chain 13 protein-coding 437-6 chr2 148293626 148293865 + 2 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) L1MB7|LINE|L1 -272141 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 277.25-40 chr6 80017105 80017267 + 2 NA intron (NM_003318, intron 10 of 21) L1ME3|LINE|L1 12537 NM_003318 7272 Hs.169840 NM_003318 ENSG00000112742 TTK CT96|ESK|MPH1|MPS1|MPS1L1|PYT TTK protein kinase protein-coding 545.75-2 chr22 26221108 26221591 + 2 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 51875 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 387.75-6 chr15 57217262 57217483 + 2 NA intron (NM_207038, intron 8 of 19) intron (NM_207038, intron 8 of 19) -2058 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 497-2 chr13 72035552 72036045 + 2 NA Intergenic Intergenic -168594 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 425-7 chr3 180617891 180618263 + 2 NA 3' UTR (NM_001288582, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001288582, exon 13 of 13) 15914 NM_001288582 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 240-21 chr15 54925758 54925911 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -130913 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 265.75-34 chr2 67232907 67233168 + 2 NA intron (NR_110568, intron 2 of 3) intron (NR_110568, intron 2 of 3) -17718 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 292.25-21 chr2 164362590 164362870 + 2 NA Intergenic Intergenic 205765 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 248-17 chr13 43578149 43578291 + 2 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 51257 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 303-20 chr3 73497604 73497769 + 2 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) L1MC5|LINE|L1 -23054 NM_001303141 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 339.25-19 chr4 150297984 150298217 + 2 NA intron (NM_001199282, intron 53 of 56) intron (NM_001199282, intron 53 of 56) 219655 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 359-16 chr8 108881534 108881837 + 2 NA Intergenic Intergenic -94091 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 430-7 chr2 80503603 80504009 + 2 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 190427 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 376.75-10 chr3 19463974 19464251 + 2 NA intron (NM_144633, intron 11 of 15) L1M5|LINE|L1 -149181 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 506.75-4 chr5 81323882 81324699 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22703 NM_001131035 84240 Hs.15536 NM_032280 ENSG00000131732 ZCCHC9 PPP1R41 zinc finger CCHC-type containing 9 protein-coding 268.75-21 chr20 40802323 40802574 + 2 NA Intergenic Intergenic -87825 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 385.75-13 chr4 61866697 61867084 + 2 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 294875 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 244-12 chr12 71338880 71339042 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -100837 NM_003667 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 365-7 chr13 93615329 93615590 + 2 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 243014 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 296.5-7 chr11 92522394 92522659 + 2 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) LTR51|LTR|ERV1 170430 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 412-7 chr2 136531163 136531398 + 2 NA Intergenic Intergenic -234265 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 189.25-64 chr2 229799855 229800051 + 2 NA intron (NM_001348330, intron 21 of 41) intron (NM_001348330, intron 21 of 41) -85398 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 241.5-71 chr3 160824645 160824819 + 2 NA intron (NM_139245, intron 1 of 3) intron (NM_139245, intron 1 of 3) -17417 NM_001317911 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 337.5-28 chr6 123326673 123326901 + 2 NA intron (NM_006073, intron 23 of 40) intron (NM_006073, intron 23 of 40) -112817 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 407-4 chr10 89825801 89826052 + 2 NA Intergenic Intergenic -3567 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 382.25-12 chr4 95908994 95909249 + 2 NA Intergenic Intergenic 69028 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 210.5-134 chr8 106780377 106780509 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10199 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 151-134 chr8 121807782 121807939 + 2 NA Intergenic Intergenic -166420 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 302.5-19 chr2 80206161 80206404 + 2 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 98470 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 391.25-10 chr15 97886353 97886693 + 2 NA Intergenic Intergenic -12094 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 343-17 chr2 194031890 194032089 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -312280 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 364.5-3 chr10 57346641 57346911 + 2 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -42217 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 280-8 chr10 54721937 54722257 + 2 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) L1PB4|LINE|L1 79134 NM_001354420 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 289-33 chr5 54800310 54800519 + 2 NA Intergenic Intergenic -56156 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 266.75-55 chrX 40925523 40925768 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -92449 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 377.5 chr10 54245751 54246008 + 2 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -240351 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 344.5-3 chr10 36441034 36441274 + 2 NA Intergenic Intergenic 662852 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 355.25-11 chr5 19824095 19824358 + 2 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1PA15|LINE|L1 62046 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 412.25-10 chr2 81411138 81411360 + 2 NA Intergenic Intergenic 55697 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 445.25 chr12 3379953 3380626 + 2 NA Intergenic Intergenic -1060 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 392-4 chr2 11491382 11491750 + 2 NA Intergenic Intergenic -25389 NM_001278275 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 154-30 chr11 83034919 83035022 + 2 NA promoter-TSS (NM_001286059) promoter-TSS (NM_001286059) -696 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 550.25 chr5 130251645 130252188 + 2 NA Intergenic Intergenic 347451 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 282-39 chr5 35471121 35471308 + 2 NA Intergenic Intergenic -146649 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 255-3 chr10 72795540 72795693 + 2 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 74587 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 321.75-31 chr6 155479258 155479673 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -23626 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 314.5-29 chr8 121871661 121871873 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -230327 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 330-4 chr10 52793595 52794081 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -22138 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 517-3 chr13 110395370 110395719 + 2 NA intron (NM_001846, intron 4 of 47) intron (NM_001846, intron 4 of 47) 54586 NR_107040 102465872 NR_107040 ENSG00000276765 MIR8073 hsa-mir-8073 microRNA 8073 ncRNA 300.75-13 chr14 60827736 60828120 + 2 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) intron (NM_002431, intron 6 of 7) 93167 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 248.5-98 chr7 126555833 126556022 + 2 NA intron (NM_001371085, intron 8 of 10) intron (NM_001371085, intron 8 of 10) 502257 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 272-22 chr21 30822065 30822297 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7578 NM_181606 337878 Hs.407656 NM_181606 ENSG00000274749 KRTAP7-1 KAP7.1 keratin associated protein 7-1 (gene/pseudogene) protein-coding 298-32 chr8 109708076 109708236 + 2 NA Intergenic Intergenic -16365 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 149-71 chr21 30406020 30406139 + 2 NA Intergenic Intergenic 10048 NM_181599 140258 Hs.407653 NM_181599 ENSG00000198390 KRTAP13-1 KAP13.1|KRTAP13.1 keratin associated protein 13-1 protein-coding 393.5-11 chr5 25553676 25553919 + 2 NA Intergenic Intergenic 362844 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 368.25-9 chr19 6893858 6894138 + 2 NA intron (NM_001974, intron 2 of 20) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 6419 NM_001256252 2015 Hs.2375 NM_001974 ENSG00000174837 ADGRE1 EMR1|TM7LN3 adhesion G protein-coupled receptor E1 protein-coding 249-26 chr20 22084791 22085001 + 2 NA Intergenic Intergenic 30806 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 272.75-10 chr12 46436447 46436650 + 2 NA intron (NR_125381, intron 2 of 2) intron (NR_125381, intron 2 of 2) 52441 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 284-12 chr14 34868002 34868208 + 2 NA intron (NM_013448, intron 2 of 26) MER58A|DNA|hAT-Charlie -6086 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 259.75-32 chr20 43137072 43137235 + 2 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) MIR3|SINE|MIR 52753 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 148.5-243 chr9 30965517 30965644 + 2 NA Intergenic Intergenic 415910 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 174.25-63 chr16 6829327 6829507 + 2 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 55608 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 297-43 chr7 6000002 6000158 + 2 NA intron (NM_001322007, intron 4 of 13) intron (NM_001322007, intron 4 of 13) 8969 NM_000535 5395 Hs.632637 NM_000535 ENSG00000122512 PMS2 HNPCC4|MLH4|PMS2CL|PMSL2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component protein-coding 322.25-10 chr2 57539026 57539338 + 2 NA Intergenic Intergenic -368469 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 391-6 chr15 35581696 35582040 + 2 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) intron (NR_038251, intron 1 of 2) 35673 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 367-17 chr5 51153107 51153551 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -183142 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 139.5-90 chr18 72423999 72424129 + 2 NA Intergenic Intergenic 120278 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 386.25-2 chr10 34889706 34890010 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 74090 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 299.25-34 chr3 105537977 105538219 + 2 NA intron (NM_001243280, intron 6 of 14) intron (NM_001243280, intron 6 of 14) 171189 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 522.75 chr7 114652667 114653085 + 2 NA promoter-TSS (NR_037439) promoter-TSS (NR_037439) -469 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 251.5-30 chr17 33578765 33578975 + 2 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -45110 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 339.5-23 chr5 13925779 13926080 + 2 NA intron (NM_001369, intron 3 of 78) intron (NM_001369, intron 3 of 78) 18551 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 299-38 chr9 137534994 137535161 + 2 NA intron (NM_001098537, intron 8 of 34) MER58B|DNA|hAT-Charlie 15325 NM_152286 375775 Hs.294147 NM_152286 ENSG00000130653 PNPLA7 C9orf111|NTE-R1|NTEL1 patatin like phospholipase domain containing 7 protein-coding 247-32 chr2 80836390 80836604 + 2 NA Intergenic Intergenic 523118 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 243.5-58 chr4 81018462 81018657 + 2 NA Intergenic Intergenic -12149 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 403.75-3 chr7 6712543 6712745 + 2 NA Intergenic Intergenic -5697 NM_016265 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 292-42 chr7 110046309 110046511 + 2 NA Intergenic Intergenic -86197 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 316.75-11 chr20 58252036 58252290 + 2 NA intron (NR_003505, intron 4 of 16) MIR|SINE|MIR -23510 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 270.75-10 chr11 22827370 22827567 + 2 NA intron (NM_148893, intron 2 of 3) intron (NM_148893, intron 2 of 3) 1911 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 775.5 chr20 51053782 51054473 + 2 NA Intergenic Intergenic -31020 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 703 chr14 47143904 47144661 + 2 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 198964 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 335-6 chr12 24602226 24602511 + 2 NA Intergenic Intergenic -18200 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 472-2 chr3 96855244 96855905 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 1 of 17) L2|LINE|L2 40980 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 291.5-15 chr16 80292668 80292855 + 2 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -247973 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 468.75-5 chr5 58271090 58271348 + 2 NA Intergenic Intergenic -148878 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 311-24 chr4 43734468 43734726 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -242054 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 388-9 chr3 111988079 111988422 + 2 NA intron (NR_073571, intron 2 of 2) intron (NR_073571, intron 2 of 2) 9224 NM_001272069 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 182.75-24 chr10 29411268 29411393 + 2 NA intron (NR_110928, intron 1 of 2) intron (NR_110928, intron 1 of 2) 1087 NR_110928 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 350.5 chr1 36932827 36933110 + 2 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) intron (NM_000831, intron 1 of 15) 101547 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 387.25-12 chr9 85857638 85857893 + 2 NA Intergenic Intergenic 51763 NR_029410 389765 Hs.715986 NR_029410 LOC389765 - kinesin family member 27 pseudogene pseudo 313-19 chr4 89904977 89905443 + 2 NA intron (NM_001371403, intron 2 of 8) intron (NM_001371403, intron 2 of 8) 10356 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 375.25-6 chr5 136839882 136840216 + 2 NA Intergenic Intergenic -288148 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 275.5-26 chr17 9360396 9360600 + 2 NA intron (NM_004853, intron 7 of 7) AluSx|SINE|Alu -181380 NR_110828 101928266 Hs.639880 NR_110828 ENSG00000262966 LOC101928266 - uncharacterized LOC101928266 ncRNA 411.5-8 chr8 50292929 50293150 + 2 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) intron (NR_135797, intron 2 of 20) 128908 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 278.5-31 chr2 71278914 71279135 + 2 NA Intergenic Intergenic -51921 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 433.75-6 chr17 58856568 58856927 + 2 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 100878 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 241.5-29 chr17 72022155 72022316 + 2 NA intron (NR_110876, intron 2 of 2) intron (NR_110876, intron 2 of 2) 3744 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 190-31 chr2 69339839 69339976 + 2 NA intron (NM_002056, intron 12 of 18) intron (NM_002056, intron 12 of 18) 47320 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 373-14 chr8 86224635 86224880 + 2 NA intron (NM_138817, intron 1 of 3) intron (NM_138817, intron 1 of 3) 5624 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 365.25-7 chr22 27411169 27411536 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 100701 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 413-6 chr5 63017090 63017434 + 2 NA Intergenic Intergenic 438443 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 485.25 chr11 83617143 83617634 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) L1ME3|LINE|L1 65037 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 499-2 chr14 61634956 61635452 + 2 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -60309 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 418.5-5 chr2 27352496 27352886 + 2 NA intron (NM_001521, intron 1 of 19) intron (NM_001521, intron 1 of 19) 3801 NM_001318909 2976 Hs.75782 NM_001521 ENSG00000115207 GTF3C2 TFIIIC-BETA|TFIIIC110 general transcription factor IIIC subunit 2 protein-coding 166-2 chr1 42184372 42184525 + 2 NA intron (NM_001198850, intron 11 of 12) intron (NM_001198850, intron 11 of 12) -19703 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 182.5-112 chr3 197071292 197071449 + 2 NA intron (NM_001366207, intron 18 of 24) L1MC5|LINE|L1 -41553 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 165.75-90 chr2 173011310 173011447 + 2 NA intron (NM_001282901, intron 11 of 24) MIRc|SINE|MIR -64468 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 393.5-9 chr2 66954535 66954842 + 2 NA intron (NR_110169, intron 4 of 4) intron (NR_110169, intron 4 of 4) -32198 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 175-107 chr5 151585047 151585197 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -16178 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 348.5-22 chr8 81708642 81708854 + 2 NA intron (NR_033194, intron 5 of 6) intron (NR_033194, intron 5 of 6) 12552 NM_024699 79752 Hs.655453 NM_024699 ENSG00000104231 ZFAND1 - zinc finger AN1-type containing 1 protein-coding 262.25-54 chr9 82335235 82335489 + 2 NA Intergenic Intergenic 346590 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 662 chr18 2947650 2948402 + 2 NA intron (NM_014646, intron 4 of 19) intron (NM_014646, intron 4 of 19) -1403 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 242-30 chr2 210779332 210779500 + 2 NA Intergenic MLT2E|LTR|ERVL 161845 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 248.25-33 chr2 24766325 24766527 + 2 NA intron (NM_147233, intron 20 of 20) intron (NM_147233, intron 20 of 20) -26689 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 303.25-21 chr3 195585543 195585831 + 2 NA Intergenic Intergenic -1747 NM_001647 347 Hs.522555 NM_001647 ENSG00000189058 APOD - apolipoprotein D protein-coding 250.75-3 chr10 68754114 68754318 + 2 NA promoter-TSS (NR_003076) promoter-TSS (NR_003076) -956 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 325.25-34 chr9 29510630 29511120 + 2 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -297274 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 565.25 chr1 118433308 118433830 + 2 NA Intergenic Intergenic -248341 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 374 chr1 230276283 230276528 + 2 NA intron (NM_004481, intron 15 of 15) intron (NM_004481, intron 15 of 15) 149927 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 267.25-15 chr15 76270028 76270240 + 2 NA intron (NM_000126, intron 9 of 11) L1MEf|LINE|L1 -9982 NR_028510 7302 Hs.684881 NR_002721 TYRO3P - TYRO3P protein tyrosine kinase pseudogene pseudo 368.75-2 chr10 74850664 74850889 + 2 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) 24176 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 313-16 chr21 28773950 28774319 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 111233 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 330-24 chr6 121773742 121773996 + 2 NA Intergenic Intergenic 338223 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 326.75-10 chr15 68976771 68977242 + 2 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) L1MD2|LINE|L1 -37689 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 373.25-14 chr5 6218503 6219017 + 2 NA Intergenic Intergenic 118532 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 415 chr14 29206662 29207082 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -421085 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 560 chr12 39867146 39867526 + 2 NA intron (NM_052885, intron 5 of 9) intron (NM_052885, intron 5 of 9) 238745 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 473-2 chr15 69414461 69414721 + 2 NA non-coding (NR_132970, exon 1 of 3) non-coding (NR_132970, exon 1 of 3) 242 NM_004856 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 332.5-11 chr2 105844722 105845138 + 2 NA intron (NM_003581, intron 2 of 4) intron (NM_003581, intron 2 of 4) -6917 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 334.5-30 chr8 108844655 108844871 + 2 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -57169 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 566.75-2 chr12 18013783 18014293 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 76155 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 454.75-4 chr4 156636554 156636861 + 2 NA Intergenic Intergenic 335092 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 310.75-9 chr12 28930329 28930587 + 2 NA Intergenic Intergenic -218820 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 312-18 chr20 43973386 43973700 + 2 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) intron (NM_001098797, intron 2 of 8) 27647 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 322.5-6 chr11 35233837 35234088 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 71012 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 404.75-9 chr9 93501258 93501612 + 2 NA intron (NM_001286722, intron 5 of 17) intron (NM_001286722, intron 5 of 17) -47834 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 199.5-78 chr2 72367286 72367515 + 2 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) L1MEc|LINE|L1 -219538 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 535.5 chr10 36426869 36427277 + 2 NA Intergenic Intergenic 648771 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 341-6 chr10 50635619 50635865 + 2 NA Intergenic Intergenic 10791 NR_126411 104355295 Hs.450493 NR_126411 SGMS1-AS1 - SGMS1 antisense RNA 1 ncRNA 356-5 chr2 161198943 161199201 + 2 NA intron (NM_001199135, intron 2 of 7) intron (NM_001199135, intron 2 of 7) 38644 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 482.5-6 chr5 21432815 21433255 + 2 NA Intergenic Intergenic -26445 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 295.5-16 chr14 69238331 69238597 + 2 NA intron (NM_001193360, intron 9 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger -21694 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 425-9 chr6 18139612 18140049 + 2 NA intron (NM_001346818, intron 4 of 7) intron (NM_001346818, intron 4 of 7) 15339 NM_000367 7172 Hs.444319 NM_000367 ENSG00000137364 TPMT TPMTD thiopurine S-methyltransferase protein-coding 182.75-61 chr18 43136314 43136432 + 2 NA Intergenic Intergenic -20681 NM_001272077 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 204.5-11 chr10 59613932 59614162 + 2 NA Intergenic Intergenic 95844 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 507.75-3 chr8 67081091 67081437 + 2 NA intron (NM_001363133, intron 3 of 27) MER77|LTR|ERVL -2584 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 307-32 chr6 121205727 121205995 + 2 NA intron (NR_104452, intron 22 of 35) intron (NR_104452, intron 22 of 35) 128619 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 429 chr1 188927044 188927475 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 1483631 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 200-37 chr17 60467204 60467384 + 2 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) intron (NM_006380, intron 4 of 12) 44805 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 275.5-28 chr19 5423143 5423410 + 2 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -32141 NM_181710 148066 Hs.126496 NM_181710 ENSG00000105428 ZNRF4 RNF204|SPERIZIN|Ssrzf1|spzn zinc and ring finger 4 protein-coding 251.5-40 chr2 178991927 178992131 + 2 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 58108 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 263.75-28 chr2 70435879 70436079 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 45661 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 400.75-3 chr2 37146065 37146389 + 2 NA intron (NM_002759, intron 4 of 16) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 1595 NM_001135652 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 438.5-5 chr2 16272763 16273204 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 222556 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 329-20 chr21 22020914 22021195 + 2 NA intron (NR_109959, intron 4 of 5) intron (NR_109959, intron 4 of 5) 77405 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 303.75-25 chr4 94058604 94059037 + 2 NA Intergenic Intergenic 148736 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 409-6 chr2 212257153 212257459 + 2 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 169054 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 226.5-28 chr16 76932546 76932744 + 2 NA Intergenic Intergenic 63709 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 287.25-20 chr14 75785485 75785739 + 2 NA intron (NM_015072, intron 26 of 31) L1MB7|LINE|L1 124366 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 246-21 chr15 64264187 64264361 + 2 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) L1MA6|LINE|L1 91899 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 231.75-44 chr21 30018514 30018822 + 2 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -78616 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 216-56 chr3 121498662 121498902 + 2 NA intron (NM_199420, intron 12 of 29) AluJr|SINE|Alu 47206 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 278.75-31 chr4 120878114 120878386 + 2 NA intron (NM_001300824, intron 2 of 13) intron (NM_001300824, intron 2 of 13) 44616 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 333.75-14 chr2 225021769 225022117 + 2 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) -11403 NR_039641 100616207 NR_039641 ENSG00000263828 MIR4439 - microRNA 4439 ncRNA 351.75-23 chr7 27959184 27959516 + 2 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 219255 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 384.25-12 chr3 97595235 97595487 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 12 of 17) intron (NM_001080448, intron 12 of 17) 155754 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 165.5-82 chr2 123546737 123546894 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -473334 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 404.25-10 chr6 142178997 142179232 + 2 NA intron (NM_001286371, intron 4 of 6) L1MEf|LINE|L1 31851 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 427.25-4 chr4 30670723 30671208 + 2 NA Intergenic Intergenic -49404 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 247-29 chr2 33650232 33650430 + 2 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -50969 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 222.5-15 chr10 33141345 33141512 + 2 NA Intergenic Intergenic -24621 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 693 chr7 44177107 44177806 + 2 NA intron (NM_001354800, intron 1 of 10) intron (NM_001354800, intron 1 of 10) 11983 NM_000162 2645 Hs.1270 NM_000162 ENSG00000106633 GCK FGQTL3|GK|GLK|HHF3|HK4|HKIV|HXKP|LGLK|MODY2 glucokinase protein-coding 492.75-2 chr4 112230673 112231148 + 2 NA promoter-TSS (NR_136622) promoter-TSS (NR_136622) -877 NM_018569 55435 Hs.435991 NM_018569 ENSG00000138660 AP1AR 2C18|C4orf16|GBAR|PRO0971|gamma-BAR adaptor related protein complex 1 associated regulatory protein protein-coding 236.5-59 chr3 32830510 32830686 + 2 NA intron (NM_001039111, intron 1 of 3) intron (NM_001039111, intron 1 of 3) 12601 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 334-18 chr3 58998250 58998578 + 2 NA intron (NR_147235, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 51611 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 450.5-4 chr8 129856997 129857700 + 2 NA intron (NM_001353282, intron 4 of 10) L2b|LINE|L2 -70724 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 323.75-15 chr3 120059255 120059517 + 2 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 25262 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 155.5-46 chr12 89932626 89932764 + 2 NA Intergenic Intergenic -14998 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 319.5 chr10 25162408 25162690 + 2 NA intron (NR_027333, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 -12452 NM_020752 57512 Hs.499108 NM_020752 ENSG00000151025 GPR158 - G protein-coupled receptor 158 protein-coding 304.75-6 chr11 20110961 20111185 + 2 NA intron (NM_182964, intron 36 of 37) intron (NM_182964, intron 36 of 37) 49402 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 435-5 chr17 64026220 64026535 + 2 NA Intergenic Intergenic -5743 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 206.75-73 chr5 144223582 144223750 + 2 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 18275 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 286 chr1 57584354 57584532 + 2 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) LTR81A|LTR|Gypsy -159522 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 462.25-5 chr8 50861410 50861696 + 2 NA Intergenic Intergenic 697422 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 382.5-2 chr1 200865604 200865968 + 2 NA Intergenic Intergenic -7195 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 405.25-12 chr6 134867914 134868121 + 2 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 82084 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 331 chr1 67224721 67224947 + 2 NA intron (NM_144701, intron 7 of 10) MIR|SINE|MIR 58380 NM_144701 149233 Hs.677426 NM_144701 ENSG00000162594 IL23R - interleukin 23 receptor protein-coding 339-25 chr5 50821666 50821935 + 2 NA intron (NM_024615, intron 16 of 25) intron (NM_024615, intron 16 of 25) 148387 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 225.5-18 chr11 10585070 10585193 + 2 NA intron (NM_001100163, intron 18 of 20) intron (NM_001100163, intron 18 of 20) -16466 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 216.5-110 chr7 126811267 126811433 + 2 NA intron (NM_001371085, intron 6 of 10) L1P4|LINE|L1 246834 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 247-52 chr6 117819275 117819428 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -87913 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 434.5-10 chr22 28160210 28160764 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -239875 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 194.5-58 chr18 54000835 54001027 + 2 NA Intergenic Intergenic 221481 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 413.5 chr1 74639204 74639625 + 2 NA intron (NM_001002912, intron 5 of 14) intron (NM_001002912, intron 5 of 14) 34378 NM_001002912 127254 Hs.531182 NM_001002912 ENSG00000178965 ERICH3 C1orf173 glutamate rich 3 protein-coding 636.25 chr12 25764463 25765209 + 2 NA Intergenic Intergenic 109243 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 332-22 chr5 116879515 116879781 + 2 NA Intergenic Intergenic -117439 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 443.25 chr10 74440687 74441081 + 2 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L2c|LINE|L2 88440 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 380.25-7 chr7 100658421 100658776 + 2 NA intron (NR_133946, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 2037 NR_133946 105375429 Hs.489345 NR_133946 LOC105375429 - uncharacterized LOC105375429 ncRNA 414-10 chr22 27769032 27769402 + 2 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) MER117|DNA|hAT-Charlie 32539 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 293-17 chr20 52166006 52166242 + 2 NA intron (NM_199427, intron 2 of 8) intron (NM_199427, intron 2 of 8) 25655 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 142-67 chr17 49331028 49331109 + 2 NA intron (NR_135579, intron 1 of 7) AluSp|SINE|Alu -30097 NR_110884 102724596 Hs.559253 NR_110882 ENSG00000248714 LOC102724596 - uncharacterized LOC102724596 ncRNA 331-22 chr3 89813715 89813914 + 2 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 706193 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 760.25-2 chr2 9522669 9523673 + 2 NA intron (NM_003183, intron 7 of 18) intron (NM_003183, intron 7 of 18) 32659 NM_003183 6868 Hs.404914 NM_003183 ENSG00000151694 ADAM17 ADAM18|CD156B|CSVP|NISBD|NISBD1|TACE ADAM metallopeptidase domain 17 protein-coding 499-5 chr8 82427990 82428315 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -483952 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 309.25-4 chr1 151892105 151892530 + 2 NA intron (NM_053055, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 17194 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 274.5-27 chr18 3313182 3313473 + 2 NA Intergenic Intergenic 37232 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 169.5-9 chr1 190305880 190306078 + 2 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 170031 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 163-76 chr3 149327680 149327828 + 2 NA intron (NM_001184723, intron 2 of 4) intron (NM_001184723, intron 2 of 4) 5684 NM_001184723 116441 Hs.22026 NM_138786 ENSG00000163762 TM4SF18 L6D transmembrane 4 L six family member 18 protein-coding 266-30 chr3 107088287 107088477 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 152256 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 257.5-28 chr17 51206474 51206773 + 2 NA intron (NM_017643, intron 7 of 16) MER58B|DNA|hAT-Charlie 39901 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 369.25-5 chr2 102825018 102825383 + 2 NA Intergenic Intergenic 63169 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 430-2 chr1 175984788 175985056 + 2 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -16382 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 330.25-12 chr2 160487051 160487293 + 2 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 6635 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 622 chr2 49495725 49496298 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -341484 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 391.5-3 chr11 26391751 26392212 + 2 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) LTR78|LTR|ERV1 59851 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 282.25-10 chr16 1681087 1681324 + 2 NA intron (NM_144570, intron 1 of 4) intron (NM_144570, intron 1 of 4) 2926 NM_144570 90861 Hs.513261 NM_144570 ENSG00000206053 JPT2 C16orf34|HN1L|L11 Jupiter microtubule associated homolog 2 protein-coding 527.5-3 chr3 23137521 23137994 + 2 NA Intergenic Intergenic 64821 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 300.25-17 chr22 25918961 25919222 + 2 NA intron (NM_001318245, intron 33 of 43) L2c|LINE|L2 176903 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 325.5-11 chr16 8445741 8446048 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 143944 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 341-9 chr12 65060457 65060691 + 2 NA intron (NM_007191, intron 7 of 9) L1MB7|LINE|L1 60731 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 326-28 chr7 45137170 45137399 + 2 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -20507 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 419.75 chr1 51932727 51933044 + 2 NA intron (NM_002867, intron 4 of 4) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -53948 NM_001101662 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 333.75-15 chr20 36222644 36222874 + 2 NA intron (NM_177996, intron 19 of 19) intron (NM_177996, intron 19 of 19) -13658 NM_015511 25980 Hs.11314 NM_015511 ENSG00000131043 AAR2 C20orf4|CGI-23 AAR2 splicing factor protein-coding 437-11 chr7 111781798 111782197 + 2 NA intron (NM_001363540, intron 35 of 52) intron (NM_001363540, intron 35 of 52) -26508 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 266.75-13 chr17 61453832 61454213 + 2 NA intron (NM_001321120, intron 1 of 8) intron (NM_001321120, intron 1 of 8) 1600 NM_001321120 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 332.25-32 chr8 138947652 138947838 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -33704 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 247.75 chr1 210825673 210825862 + 2 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) intron (NM_002238, intron 7 of 10) 307607 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 307-33 chr8 103702149 103702347 + 2 NA intron (NM_001348497, intron 2 of 22) L1MA4|LINE|L1 -116972 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 164-20 chr11 77822826 77822957 + 2 NA intron (NR_133637, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 1777 NR_133637 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 377-16 chr7 55798900 55799182 + 2 NA intron (NM_207366, intron 9 of 9) L1M2|LINE|L1 63711 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 302.75-23 chr5 95015474 95015725 + 2 NA intron (NM_001297777, intron 2 of 19) L1MC4a|LINE|L1 66267 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 200.75-7 chr1 192114169 192114345 + 2 NA Intergenic Intergenic -44205 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 198-32 chr17 54613830 54613931 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -286811 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 390.25 chr1 65610783 65611125 + 2 NA intron (NM_001003679, intron 14 of 19) intron (NM_001003679, intron 14 of 19) 85265 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 400.5-12 chr5 57666229 57666938 + 2 NA intron (NR_104668, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 15923 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 344-6 chr14 39340254 39340529 + 2 NA intron (NM_001354150, intron 20 of 23) intron (NM_001354150, intron 20 of 23) 73006 NM_001354141 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 492.25 chr11 103580971 103581460 + 2 NA Intergenic Intergenic -268691 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 271.25-9 chr11 20510259 20510490 + 2 NA Intergenic Intergenic -89026 NM_004211 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 238.25-48 chr3 65843743 65844028 + 2 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -49931 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 328-12 chr18 38908440 38908639 + 2 NA Intergenic Intergenic 713636 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 374-7 chr15 64424051 64424362 + 2 NA intron (NM_001321924, intron 10 of 12) intron (NM_001321924, intron 10 of 12) 36370 NM_001321924 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 301.75-27 chr4 57737013 57737437 + 2 NA Intergenic Intergenic 311353 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 330.75-5 chr11 104013896 104014201 + 2 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) MER117|DNA|hAT-Charlie -22592 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 353 chr10 31624668 31625089 + 2 NA Intergenic Intergenic -225123 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 537-3 chr21 29411833 29412280 + 2 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 39555 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 388-5 chr2 77863526 77863855 + 2 NA intron (NR_110288, intron 2 of 3) intron (NR_110288, intron 2 of 3) -52244 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 451.5-7 chr3 59027614 59028199 + 2 NA intron (NR_147235, intron 4 of 6) intron (NR_147235, intron 4 of 6) 22119 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 350.75-7 chr3 110792034 110792343 + 2 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL 277771 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 384.25-9 chr2 139941415 139941881 + 2 NA Intergenic Intergenic 645037 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 302.75-5 chr13 79420202 79420448 + 2 NA intron (NR_038991, intron 4 of 6) intron (NR_038991, intron 4 of 6) 14016 NR_038991 100505538 Hs.600720 NR_038991 ENSG00000227354 RBM26-AS1 - RBM26 antisense RNA 1 ncRNA 354-16 chr22 29029434 29029640 + 2 NA intron (NR_046851, intron 2 of 2) intron (NR_046851, intron 2 of 2) 1939 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 453.25-5 chr4 154806885 154807138 + 2 NA intron (NM_144979, intron 4 of 4) intron (NM_144979, intron 4 of 4) 25506 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 299-15 chr17 52753596 52753834 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -108406 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 245.5-20 chr14 54570623 54570839 + 2 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 3119 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 168.75-62 chr17 42107382 42107483 + 2 NA intron (NM_024119, intron 8 of 13) intron (NM_024119, intron 8 of 13) 5282 NM_024119 79132 Hs.55918 NM_024119 ENSG00000108771 DHX58 D11LGP2|D11lgp2e|LGP2|RLR-3 DExH-box helicase 58 protein-coding 415.75-4 chr15 73071568 73071983 + 2 NA intron (NM_002499, intron 1 of 28) AluJb|SINE|Alu 19291 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 248.25-66 chr7 79347150 79347296 + 2 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -105734 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 326-7 chr12 69769672 69769910 + 2 NA intron (NR_103519, intron 3 of 8) Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -9161 NM_001024647 117177 Hs.258209 NM_022456 ENSG00000127328 RAB3IP RABIN3|RABIN8 RAB3A interacting protein protein-coding 453-2 chr2 231727758 231728240 + 2 NA Intergenic Intergenic 14685 NR_036262 100422885 NR_036262 ENSG00000283498 MIR1244-2 - microRNA 1244-2 ncRNA 259.75-20 chr15 26952486 26952744 + 2 NA Intergenic Intergenic -18566 NM_033223 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 325-5 chr14 60357873 60358177 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 34829 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 345.5-31 chr8 4833752 4833959 + 2 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 161059 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 319-19 chr2 125101678 125101902 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1016195 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 247.75-6 chr12 21290826 21291064 + 2 NA intron (NM_021094, intron 11 of 13) L1M5|LINE|L1 43972 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 284-36 chr4 64945699 64945945 + 2 NA intron (NR_033976, intron 2 of 6) intron (NR_033976, intron 2 of 6) 58678 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 302-10 chr14 61715884 61716070 + 2 NA intron (NR_144368, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 18355 NM_001243084 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 724 chr22 28484724 28485286 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 25136 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 204.5-19 chr11 84246244 84246440 + 2 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 26938 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 351.25-4 chr13 107550962 107551261 + 2 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -19863 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 261-59 chr8 25177278 25177477 + 2 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -7312 NM_024940 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 226-13 chr12 32691669 32691910 + 2 NA intron (NM_001330380, intron 1 of 18) L1MEj|LINE|L1 12488 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 266.25-26 chr2 79727256 79727495 + 2 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) intron (NM_001282598, intron 2 of 17) -78016 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 191.75-95 chr4 139070891 139071020 + 2 NA intron (NM_001276458, intron 3 of 6) intron (NM_001276458, intron 3 of 6) 13269 NM_001276458 1998 Hs.634040 NM_006874 ENSG00000109381 ELF2 EU32|NERF|NERF-1A|NERF-1B|NERF-1a,b|NERF-2 E74 like ETS transcription factor 2 protein-coding 315.5-9 chr18 49114304 49114631 + 2 NA intron (NM_001353215, intron 15 of 16) intron (NM_001353215, intron 15 of 16) -64699 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 396.5-3 chr15 93172174 93172411 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -33774 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 335-4 chr10 81615967 81616379 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -259021 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 328.5-34 chr8 92446692 92446990 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 208653 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 170-49 chr2 236702150 236702283 + 2 NA Intergenic Intergenic 132391 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 593 chr2 204362460 204362971 + 2 NA Intergenic Intergenic -182760 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 346.75-7 chr2 112304502 112305010 + 2 NA intron (NM_198581, intron 3 of 11) intron (NM_198581, intron 3 of 11) 29159 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 480-5 chr5 168590166 168590539 + 2 NA Intergenic Intergenic -10984 NM_024594 79646 Hs.388400 NM_024594 ENSG00000120137 PANK3 - pantothenate kinase 3 protein-coding 287.5-26 chr17 66620889 66621058 + 2 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -166099 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 467.25-5 chr7 28372517 28372869 + 2 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) -39825 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 271.25-23 chr14 37906932 37907157 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4920 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 133.25-172 chr5 59900599 59900718 + 2 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -6932 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 380.5-12 chr8 112162091 112162386 + 2 NA Intergenic Intergenic -481255 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 353-12 chr2 191984071 191984324 + 2 NA intron (NM_001305134, intron 7 of 9) intron (NM_001305134, intron 7 of 9) -137109 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 250-13 chr15 64254978 64255178 + 2 NA intron (NM_001329607, intron 3 of 11) AluSx4|SINE|Alu -91923 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 449.25 chr1 247408878 247409390 + 2 NA Intergenic Intergenic -7022 NM_001079821 114548 Hs.159483 NM_004895 ENSG00000162711 NLRP3 AGTAVPRL|AII|AVP|C1orf7|CIAS1|CLR1.1|DFNA34|FCAS|FCAS1|FCU|KEFH|MWS|NALP3|PYPAF1 NLR family pyrin domain containing 3 protein-coding 357-15 chr6 89448524 89448706 + 2 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 15437 NM_001242813 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 421.25-8 chr2 95409583 95409865 + 2 NA intron (NM_016044, intron 3 of 7) L1MC4|LINE|L1 7016 NM_016044 51011 Hs.531247 NM_016044 ENSG00000115042 FAHD2A CGI-105 fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A protein-coding 273.75-46 chr9 27550810 27551069 + 2 NA intron (NM_001256054, intron 8 of 10) intron (NM_001256054, intron 8 of 10) -21125 NM_024761 79817 Hs.369022 NM_024761 ENSG00000120162 MOB3B C9orf35|MOB1D|MOBKL2B MOB kinase activator 3B protein-coding 317.5-17 chr2 219976863 219977097 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -70415 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 671 chr8 52876582 52877309 + 2 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -62963 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 237-22 chr18 47164129 47164322 + 2 NA intron (NM_016097, intron 1 of 2) intron (NM_016097, intron 1 of 2) 12139 NM_016097 51124 Hs.130917 NM_016097 ENSG00000134049 IER3IP1 HSPC039|MEDS|PRO2309 immediate early response 3 interacting protein 1 protein-coding 343.25-3 chr10 118218562 118218836 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 123625 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 160-86 chr5 26032339 26032531 + 2 NA Intergenic Intergenic 841482 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 376-9 chr2 5550837 5551222 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 140089 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 352-13 chr8 54679986 54680266 + 2 NA Intergenic Intergenic 64030 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 451.75-2 chrX 75519875 75520309 + 2 NA intron (NM_144969, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 2945 NM_144969 158866 Hs.253211 NM_144969 ENSG00000102383 ZDHHC15 DHHC15|MRX91 zinc finger DHHC-type containing 15 protein-coding 579.75 chr3 187770720 187771392 + 2 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL -25588 NM_001706 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 550 chr10 67474997 67475437 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1ME1|LINE|L1 -71807 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 346.75-6 chr16 64355245 64355569 + 2 NA Intergenic Intergenic 766656 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 280.75-19 chr18 5204102 5204275 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6436 NM_001330553 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 389-11 chr22 27529296 27529743 + 2 NA Intergenic Intergenic 218868 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 403-6 chr4 63329787 63330116 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1079499 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 345.5-14 chr14 73322752 73323001 + 2 NA intron (NM_001005743, intron 5 of 12) AluJr4|SINE|Alu -76875 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 394.5 chr1 38792523 38792895 + 2 NA Intergenic Intergenic 67063 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 315.75-19 chr3 188444335 188444554 + 2 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) intron (NM_001167672, intron 2 of 9) 124222 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 365.5-7 chr2 17255890 17256204 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 262393 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 430.5-7 chr4 148972052 148972521 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29908 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 283-2 chr1 53965922 53966128 + 2 NA intron (NM_001256409, intron 7 of 8) intron (NM_001256409, intron 7 of 8) 19675 NM_052940 115353 Hs.40094 NM_052940 ENSG00000116212 LRRC42 dJ167A19.4 leucine rich repeat containing 42 protein-coding 398.25-8 chr14 73383306 73383627 + 2 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) L1MEg|LINE|L1 75114 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 250.5-43 chr2 39364079 39364314 + 2 NA intron (NM_003618, intron 2 of 33) L1MB1|LINE|L1 73089 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 581.5 chr13 80394406 80394909 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -53531 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 313.5-40 chr9 87542798 87543018 + 2 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) intron (NM_004938, intron 2 of 25) -10546 NR_146781 100506897 Hs.656160 NR_146781 ENSG00000236709 DAPK1-IT1 - DAPK1 intronic transcript 1 ncRNA 242-60 chr7 110065081 110065231 + 2 NA Intergenic Intergenic -104943 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 426 chr1 38157242 38157592 + 2 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 57350 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 620.75 chr17 56327754 56328117 + 2 NA intron (NM_001370326, intron 4 of 20) intron (NM_001370326, intron 4 of 20) 174460 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 299.25-36 chr4 38348757 38348972 + 2 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -18050 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 287-39 chr8 108830543 108830781 + 2 NA Intergenic Intergenic -43068 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 357-10 chr2 56903978 56904242 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -718340 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 412.5-3 chr10 32810418 32810902 + 2 NA intron (NM_001321115, intron 31 of 43) L1M2b|LINE|L1 90812 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 233.5-105 chr8 62970722 62970937 + 2 NA intron (NR_130764, intron 5 of 6) intron (NR_130764, intron 5 of 6) -7032 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 329.25 chr10 41898648 41899035 + 2 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 469204 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 519.75-3 chr8 116334690 116335088 + 2 NA Intergenic Intergenic -9830 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 176.25-139 chr8 128437537 128437770 + 2 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 127026 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 246-15 chr14 51373212 51373473 + 2 NA Intergenic Intergenic 23793 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 248.5-16 chr12 18490088 18490245 + 2 NA intron (NM_001288774, intron 19 of 32) intron (NM_001288774, intron 19 of 32) 228626 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 350-9 chr20 22704911 22705160 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -19691 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 323-5 chr10 115896543 115896804 + 2 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) L1M5|LINE|L1 298116 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 198.5-75 chr2 76536042 76536224 + 2 NA Intergenic Intergenic -449832 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 330.5-33 chr8 144896296 144896536 + 2 NA intron (NM_001363102, intron 1 of 6) intron (NM_001363102, intron 1 of 6) 3889 NM_001363103 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 394-3 chr11 38818885 38819260 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 170214 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 242-64 chr8 114173710 114173952 + 2 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -736892 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 445.5-8 chr8 79366226 79366497 + 2 NA Intergenic Intergenic 34173 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 368.75-7 chr2 188955311 188955637 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -18899 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 191.75-117 chr7 53057387 53057540 + 2 NA Intergenic Intergenic 21830 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 481.5 chr16 87282408 87282724 + 2 NA intron (NR_104667, intron 3 of 4) AluSx|SINE|Alu 9886 NR_104667 101928682 Hs.149004 NR_104667 ENSG00000261697 LOC101928682 - uncharacterized LOC101928682 ncRNA 284.5-57 chr7 10898671 10898898 + 2 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 41369 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 391.5-4 chr11 38909989 38910246 + 2 NA Intergenic Intergenic 261259 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 374.25-2 chr10 62154176 62154418 + 2 NA Intergenic Intergenic 104940 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 386.25-3 chr10 91516461 91516823 + 2 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 94818 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 252-19 chr12 43099657 43099900 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55537 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 267-28 chr2 122082410 122082662 + 2 NA Intergenic Intergenic 326885 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 277.25-37 chr5 73653387 73653573 + 2 NA intron (NM_001177693, intron 1 of 35) intron (NM_001177693, intron 1 of 35) 27322 NM_001177693 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 419-7 chr3 172873647 172873881 + 2 NA Intergenic Intergenic 122762 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 268-46 chr5 100531947 100532128 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3337 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 306-31 chr4 128327540 128327820 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -39867 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 388.25-4 chr22 48358866 48359330 + 2 NA Intergenic Intergenic 84734 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 389-15 chr3 56493088 56493485 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -24819 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 282-47 chr8 78738422 78738637 + 2 NA exon (NM_000880, exon 4 of 6) exon (NM_000880, exon 4 of 6) -14155 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 333.5-10 chr4 73863495 73863791 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -5750 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 347-3 chr11 28213392 28213582 + 2 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) L1M5|LINE|L1 105099 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 208-77 chr8 61816415 61816579 + 2 NA Intergenic Intergenic -73342 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 507 chr1 207378106 207378390 + 2 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 56570 NM_000574 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 183-73 chr3 113393086 113393258 + 2 NA intron (NM_001164496, intron 15 of 34) intron (NM_001164496, intron 15 of 34) -10826 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 447.5-8 chr8 86998411 86998885 + 2 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 132233 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 328-2 chr10 39317830 39318140 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 621389 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 488.5-5 chr9 71238118 71238457 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -116666 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 368.5-8 chr2 82432355 82432673 + 2 NA Intergenic Intergenic -424289 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 185-29 chr17 31115950 31116095 + 2 NA intron (NM_001042492, intron 1 of 57) intron (NM_001042492, intron 1 of 57) 21045 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 464-3 chr20 14668099 14668485 + 2 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) intron (NM_001351663, intron 4 of 17) 113908 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 300-11 chr11 78263972 78264200 + 2 NA intron (NM_012296, intron 2 of 9) intron (NM_012296, intron 2 of 9) 75167 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 299.75-10 chr18 9786360 9786569 + 2 NA intron (NM_006868, intron 2 of 6) MER21A|LTR|ERVL 78163 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 269-41 chr5 177436448 177436615 + 2 NA intron (NM_001004106, intron 13 of 15) intron (NM_001004106, intron 13 of 15) 9845 NM_002082 2870 Hs.235116 NM_002082 ENSG00000198055 GRK6 GPRK6 G protein-coupled receptor kinase 6 protein-coding 403-12 chr9 91767539 91767921 + 2 NA intron (NM_001318204, intron 2 of 7) intron (NM_001318204, intron 2 of 7) -131385 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 521.25-2 chr6 53255971 53256281 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -20867 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 383-9 chr18 44572027 44572323 + 2 NA Intergenic Intergenic 40396 NR_131768 105667213 Hs.135737 NR_131768 LINC01601 - long intergenic non-protein coding RNA 1601 ncRNA 286.5-13 chr11 80892419 80892642 + 2 NA Intergenic Intergenic -129727 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 289-5 chr10 31203982 31204233 + 2 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) intron (NR_134478, intron 1 of 2) 16224 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 385.75-11 chr21 31601642 31602129 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 42652 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 588.75 chr13 50041334 50041708 + 2 NA intron (NR_152566, intron 8 of 13) intron (NR_152566, intron 8 of 13) 7540 NR_029486 406950 NR_029486 ENSG00000208006 MIR16-1 MIRN16-1|miRNA16-1|mir-16-1 microRNA 16-1 ncRNA 311.5-16 chr2 114958574 114958793 + 2 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -105890 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 290-50 chr9 6936936 6937217 + 2 NA intron (NR_148680, intron 8 of 21) intron (NR_148680, intron 8 of 21) 179726 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 540.5-2 chr3 109141362 109142067 + 2 NA intron (NR_161294, intron 2 of 2) intron (NR_161294, intron 2 of 2) 4995 NR_161294 401081 Hs.280892 NM_001351622 ENSG00000241224 C3orf85 - chromosome 3 open reading frame 85 protein-coding 422.5-13 chr7 36433088 36433469 + 2 NA intron (NM_001284302, intron 19 of 22) L1MEf|LINE|L1 -42921 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 351.75-4 chr11 38409476 38409702 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 236767 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 142-34 chr12 16862464 16862602 + 2 NA Intergenic Intergenic -126214 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 440 chr10 108334718 108335096 + 2 NA Intergenic Intergenic -265614 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 553.5 chr5 36657508 36658009 + 2 NA intron (NM_004172, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 51152 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 291.75-39 chr7 119386614 119386778 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 520679 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 379.5-4 chr10 82401806 82402145 + 2 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -169055 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 197-19 chr15 61647349 61647454 + 2 NA Intergenic Intergenic -82517 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 314.5-22 chr5 81090718 81090972 + 2 NA intron (NM_006909, intron 9 of 26) intron (NM_006909, intron 9 of 26) -129938 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 392-12 chr4 33495101 33495533 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 544576 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 399.5-3 chr20 59878791 59879049 + 2 NA intron (NM_014258, intron 31 of 44) intron (NM_014258, intron 31 of 44) 54717 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 326.25-4 chr11 6033793 6034067 + 2 NA Intergenic Intergenic -6189 NM_001001917 120796 Hs.553543 NM_001001917 ENSG00000180934 OR56A1 OR11-75 olfactory receptor family 56 subfamily A member 1 protein-coding 322.25-8 chr2 19151307 19151493 + 2 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -124429 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 560.5-2 chr7 49062479 49063072 + 2 NA Intergenic Intergenic 138228 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 292-10 chr11 59404153 59404358 + 2 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 18698 NM_001001954 219981 Hs.553648 NM_001001954 ENSG00000172324 OR5A2 - olfactory receptor family 5 subfamily A member 2 protein-coding 424.5-9 chr9 101544155 101544420 + 2 NA intron (NM_019592, intron 5 of 19) intron (NM_019592, intron 5 of 19) 10434 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 272.25-42 chr4 44307624 44307836 + 2 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 141079 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 220-78 chrX 65504716 65504926 + 2 NA 3' UTR (NM_001010888, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001010888, exon 5 of 5) 16086 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 567 chr16 8136508 8136849 + 2 NA Intergenic Intergenic 453160 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 470.25-5 chr8 52429707 52430001 + 2 NA Intergenic Intergenic -19975 NM_001352837 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 462.5-2 chr2 11224087 11224744 + 2 NA exon (NM_004850, exon 7 of 33) exon (NM_004850, exon 7 of 33) 68948 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 326-27 chr6 129119816 129120082 + 2 NA intron (NM_000426, intron 4 of 64) intron (NM_000426, intron 4 of 64) 236808 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 437.75-5 chr20 62671890 62672282 + 2 NA 3' UTR (NM_016354, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_016354, exon 12 of 12) -5465 NR_024470 100127888 Hs.671273 NR_024470 ENSG00000232803 SLCO4A1-AS1 - SLCO4A1 antisense RNA 1 ncRNA 271-47 chr7 117406936 117407194 + 2 NA intron (NM_001301821, intron 4 of 12) L1MEg|LINE|L1 20428 NM_001301822 136991 Hs.352412 NM_130768 ENSG00000154438 ASZ1 ALP1|ANKL1|C7orf7|CT1.19|GASZ|Orf3 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 protein-coding 279.5-61 chr7 48693393 48693564 + 2 NA Intergenic Intergenic -231069 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 255.25-51 chr8 28501077 28501307 + 2 NA intron (NM_017412, intron 2 of 7) intron (NM_017412, intron 2 of 7) 3990 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 499 chr12 38940297 38940604 + 2 NA Intergenic Intergenic -34859 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 305.5 chr1 45451555 45451863 + 2 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) intron (NM_001320800, intron 1 of 9) 39454 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 213.25-32 chr2 207549443 207549651 + 2 NA intron (NR_163946, intron 1 of 8) intron (NR_163946, intron 1 of 8) -9575 NM_001371428 198.25-16 chr10 96799756 96799922 + 2 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 28925 NR_030338 693192 NR_030338 ENSG00000207976 MIR607 MIRN607|hsa-mir-607 microRNA 607 ncRNA 266.75-9 chr14 70316519 70316787 + 2 NA Intergenic Intergenic 43030 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 302-34 chr9 1954121 1954301 + 2 NA Intergenic Intergenic -61136 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 364-21 chr8 121861729 121862147 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -220498 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 210.25-68 chr6 102211064 102211250 + 2 NA Intergenic Intergenic 812172 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 296-17 chr15 81945939 81946143 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 99977 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 170.25-128 chr5 86680923 86681015 + 2 NA Intergenic Intergenic 60463 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 321.5-35 chr8 103923985 103924156 + 2 NA intron (NR_145711, intron 8 of 21) L1ME4a|LINE|L1 104850 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 457 chr10 43763800 43764078 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 14886 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 377.75-3 chr12 108696936 108697227 + 2 NA intron (NM_001105237, intron 2 of 10) intron (NM_001105237, intron 2 of 10) 5917 NM_001105237 23603 Hs.330384 NM_014325 ENSG00000110880 CORO1C HCRNN4 coronin 1C protein-coding 167.5-54 chr13 64480320 64480465 + 2 NA Intergenic Intergenic -404381 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 480.5 chr1 179090768 179091257 + 2 NA intron (NM_022371, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR 8942 NM_022371 64222 Hs.584957 NM_022371 ENSG00000186283 TOR3A ADIR|ADIR2 torsin family 3 member A protein-coding 444-2 chr10 76315349 76315595 + 2 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) MER52A|LTR|ERV1 532711 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 323.5-27 chr6 158839236 158839571 + 2 NA Intergenic Intergenic 18229 NR_028496 202459 Hs.487035 NM_145303 ENSG00000243775 OSTCP1 DC2L|OSTCL oligosaccharyltransferase complex subunit pseudogene 1 pseudo 363.75-11 chr22 28586355 28586704 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 93336 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 525.75 chr8 46096226 46096714 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 521173 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 346.25-3 chr12 113967328 113967630 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -1154 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 302.25-15 chr2 49480083 49480268 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -325648 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 241.25-60 chr6 137176041 137176324 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -2538 NM_181309 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 171-56 chr17 73406136 73406237 + 2 NA intron (NM_001144952, intron 18 of 44) MER2|DNA|TcMar-Tigger -94185 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 262.5-3 chr1 39089085 39089245 + 2 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) AluJb|SINE|Alu 4998 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 423.5-4 chr17 59769953 59770271 + 2 NA intron (NM_001329400, intron 4 of 9) intron (NM_001329400, intron 4 of 9) 62458 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 538.5 chr21 32025679 32026150 + 2 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 60381 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 253.75-62 chr8 88194311 88194467 + 2 NA intron (NM_005941, intron 2 of 9) intron (NM_005941, intron 2 of 9) 133094 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 362.5-3 chr11 44627062 44627369 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61552 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 299.25-41 chr5 73398665 73398827 + 2 NA Intergenic Intergenic 50031 NM_004472 2297 Hs.519385 NM_004472 ENSG00000251493 FOXD1 FKHL8|FREAC-4|FREAC4 forkhead box D1 protein-coding 336.5-2 chr10 13345496 13345964 + 2 NA intron (NM_001195604, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu 2563 NM_001195604 22929 Hs.124027 NM_012247 ENSG00000086475 SEPHS1 SELD|SPS|SPS1 selenophosphate synthetase 1 protein-coding 198.75-6 chr1 191176586 191176740 + 2 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 51835 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 237.5-91 chr6 147961852 147961997 + 2 NA Intergenic Intergenic -310404 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 589 chr4 85906247 85906661 + 2 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) MER96B|DNA|hAT-Tip100 -23562 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 189.5-102 chr4 111281271 111281385 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -420681 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 322.5-31 chr6 27038625 27038876 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -18444 NR_026776 100270746 Hs.590428 NR_026776 LOC100270746 - uncharacterized LOC100270746 ncRNA 416 chr1 112500650 112501095 + 2 NA intron (NM_004185, intron 2 of 5) L1MC3|LINE|L1 -8093 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 187-33 chr18 3971847 3972093 + 2 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 9617 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 320.75-10 chr17 78743381 78743671 + 2 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -6624 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 301.5-8 chr1 238774841 238775420 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -289113 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 371-2 chr10 56497675 56497879 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -136504 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 372.5-13 chr3 89511492 89511931 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 404090 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 235-57 chr5 29901991 29902297 + 2 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 21584 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 256.5-28 chr2 24579511 24579661 + 2 NA intron (NM_001362955, intron 3 of 23) L1MEg|LINE|L1 -4891 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 243.75-62 chr4 45670344 45670577 + 2 NA Intergenic Intergenic 453594 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 598.5 chr12 119013547 119014068 + 2 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) L1ME4b|LINE|L1 32266 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 188-6 chr1 236328472 236328582 + 2 NA Intergenic Intergenic -46569 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 239.25-84 chr7 37004578 37004780 + 2 NA intron (NR_104120, intron 2 of 2) intron (NR_104120, intron 2 of 2) 6883 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 564-2 chr14 57809413 57810159 + 2 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 55213 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 367.25-3 chr11 91728600 91728842 + 2 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -496313 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 360-5 chr16 7440719 7441039 + 2 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 108034 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 232-15 chr14 70444526 70444681 + 2 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -7571 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 270.5-12 chr12 86789597 86789847 + 2 NA intron (NM_001351286, intron 1 of 7) intron (NM_001351286, intron 1 of 7) -44573 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 340.5-14 chr14 59377376 59377654 + 2 NA Intergenic Intergenic 87865 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 182.25-115 chr7 106237100 106237284 + 2 NA Intergenic Intergenic 47791 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 350.25-25 chr4 61880458 61880803 + 2 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) L2c|LINE|L2 281135 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 206.75-81 chr6 129655610 129655804 + 2 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) intron (NM_033515, intron 1 of 14) 54470 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 398.5-4 chr15 67478804 67479138 + 2 NA intron (NM_001284348, intron 15 of 16) intron (NM_001284348, intron 15 of 16) 42002 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 288.5-39 chr6 63726685 63726950 + 2 NA intron (NM_001142800, intron 41 of 42) intron (NM_001142800, intron 41 of 42) -80019 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 407.75-4 chr3 144477262 144477530 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 504315 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 349.25-12 chr4 110340317 110340599 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -135697 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 351.25-12 chr3 93989360 93989639 + 2 NA intron (NM_144996, intron 1 of 7) intron (NM_144996, intron 1 of 7) 9344 NM_001321328 200894 Hs.533086 NM_144996 ENSG00000169379 ARL13B ARL2L1|JBTS8 ADP ribosylation factor like GTPase 13B protein-coding 323.5-7 chr11 16852627 16853038 + 2 NA intron (NM_001329630, intron 6 of 26) intron (NM_001329630, intron 6 of 26) 73190 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 379.25-3 chr11 79831699 79832108 + 2 NA Intergenic Intergenic -390873 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 321-13 chr19 28973793 28974052 + 2 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 5454 NR_110760 102724958 Hs.112651 NR_110760 LOC102724958 - uncharacterized LOC102724958 ncRNA 239-40 chr4 18568779 18568939 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -546984 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 290-14 chr13 22825575 22825793 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 72497 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 401.5-18 chr7 6243459 6243829 + 2 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 28980 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 539.25-2 chr2 162090926 162091275 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 16243 NR_147697 100131604 NR_147697 LOC100131604 - uncharacterized LOC100131604 ncRNA 348.5-11 chr3 132618972 132619241 + 2 NA intron (NM_032169, intron 10 of 19) intron (NM_032169, intron 10 of 19) 18969 NM_178445 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 169-18 chr12 52939773 52939916 + 2 NA intron (NM_001256293, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu -9027 NM_199187 3875 Hs.406013 NM_000224 ENSG00000111057 KRT18 CK-18|CYK18|K18 keratin 18 protein-coding 289-46 chr8 83336599 83336960 + 2 NA Intergenic Intergenic -66979 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 207.5-40 chr18 411839 412034 + 2 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) L1MD1|LINE|L1 88765 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 541.5-2 chr11 113127498 113128034 + 2 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 146135 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 247-5 chr10 21292881 21293073 + 2 NA Intergenic Intergenic 79973 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 165-5 chr1 114861438 114861579 + 2 NA intron (NM_001282542, intron 8 of 30) intron (NM_001282542, intron 8 of 30) 6645 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 208-57 chr3 190130451 190130583 + 2 NA intron (NR_126419, intron 2 of 3) intron (NR_126419, intron 2 of 3) -8080 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 278.25-42 chr4 104465358 104465578 + 2 NA Intergenic Intergenic -25497 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 295-7 chr11 100957756 100957977 + 2 NA intron (NM_001367945, intron 14 of 25) intron (NM_001367945, intron 14 of 25) 23592 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 164-60 chr2 190335294 190335385 + 2 NA Intergenic Intergenic -8250 NM_001128928 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 443.25-6 chr5 107181670 107182003 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -170822 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 162-90 chr4 136682005 136682172 + 2 NA Intergenic Intergenic -511668 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 289.25-9 chr16 8215221 8215394 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 374531 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 456-3 chr5 153988656 153989291 + 2 NA Intergenic Intergenic 49937 NM_001317995 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 522-4 chr8 120966082 120966548 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -154269 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 379.25-5 chr17 42273446 42273982 + 2 NA intron (NM_012448, intron 1 of 18) intron (NM_012448, intron 1 of 18) 2692 NM_012448 6777 Hs.595276 NM_012448 ENSG00000173757 STAT5B STAT5 signal transducer and activator of transcription 5B protein-coding 405.25-15 chr8 85074805 85075127 + 2 NA Intergenic Intergenic -32272 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 388-12 chr5 66687794 66688218 + 2 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) 91613 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 318.75-21 chr8 86775405 86775654 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31854 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 270.25-27 chr18 62547793 62547996 + 2 NA intron (NR_126534, intron 4 of 14) L2a|LINE|L2 24869 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 311-28 chr7 87456768 87457132 + 2 NA intron (NM_018849, intron 4 of 27) intron (NM_018849, intron 4 of 27) 18730 NM_000443 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 313-7 chr12 44476649 44476899 + 2 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 398887 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 383.75-8 chr8 117526244 117526601 + 2 NA intron (NM_001282986, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 5709 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 338.5-7 chr13 102559159 102559466 + 2 NA Intergenic Intergenic -37674 NR_160411 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 267.5-5 chr1 99965536 99965689 + 2 NA Intergenic Intergenic -4384 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 196-89 chr7 51074674 51074853 + 2 NA intron (NM_001287438, intron 7 of 7) intron (NM_001287438, intron 7 of 7) 242046 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 223.25-19 chr14 56474285 56474537 + 2 NA Intergenic Intergenic -39920 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 260.5 chr1 52940667 52940948 + 2 NA intron (NM_001193617, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu 13531 NM_002979 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 374-3 chr12 105833353 105833684 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 126744 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 488.25-7 chr5 42007790 42008127 + 2 NA Intergenic Intergenic 82677 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 514 chr12 15377644 15378110 + 2 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1MB7|LINE|L1 55369 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 320.5-42 chr8 35671316 35671638 + 2 NA TTS (NR_125819) TTS (NR_125819) 38843 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 411.25-2 chr1 221060989 221061282 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -180995 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 407.25-2 chr10 61418135 61418688 + 2 NA intron (NR_134508, intron 4 of 6) MER67D|LTR|ERV1 -34228 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 372.5-8 chr18 4395458 4395784 + 2 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 59645 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 303.25-6 chr11 93995842 93996129 + 2 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -25369 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 291.5-22 chr2 133804574 133804784 + 2 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -236216 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 230.5-13 chr10 44722084 44722229 + 2 NA Intergenic Intergenic -189160 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 239.75-14 chr12 10552468 10552894 + 2 NA promoter-TSS (NR_146455) promoter-TSS (NR_146455) -698 NR_146456 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 370.5-12 chr2 203517750 203518234 + 2 NA intron (NM_001329728, intron 1 of 15) L1MCa|LINE|L1 17309 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 373 chr1 162438840 162439100 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -26834 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 275-12 chr15 23921480 23921820 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -53497 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 276.75 chr1 85565234 85565529 + 2 NA intron (NM_001134445, intron 1 of 6) L1MC4a|LINE|L1 12819 NM_001134445 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 379.5-2 chr1 44978165 44978542 + 2 NA exon (NM_020365, exon 3 of 12) exon (NM_020365, exon 3 of 12) 8242 NM_020365 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 560.5 chr10 53136059 53136552 + 2 NA Intergenic Intergenic -364605 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 458.75-3 chr8 90969242 90969506 + 2 NA intron (NM_001363275, intron 4 of 5) L1MB5|LINE|L1 15703 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 380-25 chr8 136020070 136020456 + 2 NA Intergenic Intergenic -510535 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 352.5 chr10 53144274 53144455 + 2 NA Intergenic Intergenic -372664 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 181.75-99 chr4 177468560 177468666 + 2 NA Intergenic Intergenic -26110 NR_033655 175 Hs.207776 NM_000027 ENSG00000038002 AGA AGU|ASRG|GA aspartylglucosaminidase protein-coding 269-30 chr20 34773876 34774143 + 2 NA intron (NM_001242539, intron 2 of 11) intron (NM_001242539, intron 2 of 11) 8395 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 434.5-5 chr15 92980993 92981357 + 2 NA intron (NM_001271, intron 23 of 38) intron (NM_001271, intron 23 of 38) 76776 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 416.25-2 chr10 11942439 11942818 + 2 NA intron (NM_080599, intron 18 of 21) intron (NM_080599, intron 18 of 21) -47918 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 260.25-29 chr20 52371069 52371253 + 2 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -179176 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 542 chr2 53212637 53213031 + 2 NA Intergenic Intergenic -510219 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 354.5 chr1 20850502 20850733 + 2 NA intron (NM_003760, intron 23 of 31) MIR|SINE|MIR -63929 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 362.75-6 chr2 182902579 182902955 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -36130 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 418.25-6 chr2 170948727 170949134 + 2 NA intron (NM_001201428, intron 2 of 9) intron (NM_001201428, intron 2 of 9) 19677 NM_015530 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 383-5 chr12 79753555 79753874 + 2 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie -62617 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 346-17 chr5 93315056 93315345 + 2 NA Intergenic Intergenic 256143 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 261-53 chr6 120319002 120319160 + 2 NA Intergenic Intergenic 303902 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 557.5 chr1 194285162 194285759 + 2 NA Intergenic Intergenic 980715 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 382 chr1 29987787 29988059 + 2 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 49689 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 483.25-4 chr15 61097098 61097491 + 2 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 132008 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 256-73 chr8 130972467 130972810 + 2 NA intron (NM_001115, intron 2 of 17) intron (NM_001115, intron 2 of 17) 68271 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 222.75-89 chr7 43239532 43239734 + 2 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) intron (NM_015052, intron 2 of 29) 88738 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 192.25-96 chr6 135445176 135445401 + 2 NA intron (NM_017651, intron 12 of 27) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger 52452 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 428-4 chr8 76985673 76986131 + 2 NA intron (NM_001172087, intron 2 of 2) intron (NM_001172087, intron 2 of 2) 14176 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 156.75-99 chr2 189041102 189041195 + 2 NA intron (NM_000393, intron 50 of 53) intron (NM_000393, intron 50 of 53) 45518 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 258-20 chr17 79410214 79410392 + 2 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 105845 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 362.25-6 chr2 63605748 63606074 + 2 NA intron (NM_001316374, intron 7 of 8) intron (NM_001316374, intron 7 of 8) 16760 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 184.5-40 chr14 20566595 20566704 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -5718 NM_001289110 390443 Hs.533972 NM_001001673 ENSG00000188655 RNASE9 HEL128|RAK1|h461 ribonuclease A family member 9 (inactive) protein-coding 500-3 chr3 110328128 110328499 + 2 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 725485 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 343-3 chr10 65231769 65231954 + 2 NA Intergenic Intergenic -307343 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 232-54 chr3 178335778 178335989 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -83318 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 377.25-17 chr8 12901309 12901774 + 2 NA Intergenic MER65B|LTR|ERV1 -44132 NM_020844 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 240.5-47 chr19 57417253 57417511 + 2 NA intron (NM_001330617, intron 2 of 3) MER74B|LTR|ERVL 6221 NM_006959 7565 Hs.729403 NM_006959 ENSG00000186272 ZNF17 HPF3|KOX10 zinc finger protein 17 protein-coding 265.75-53 chr4 57653702 57653890 + 2 NA Intergenic Intergenic 227924 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 251-51 chr7 29601763 29601990 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 36343 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 339.5-14 chr14 85466200 85466510 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -63670 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 494.25-5 chr6 166574778 166575177 + 2 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -30287 NM_001318938 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 224.25-63 chr4 28522388 28522561 + 2 NA Intergenic Intergenic -297108 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 366.25-2 chr1 103103858 103104081 + 2 NA intron (NM_001854, intron 1 of 66) intron (NM_001854, intron 1 of 66) 4527 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 443.5-5 chr2 29120479 29120732 + 2 NA intron (NM_024692, intron 1 of 15) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 5190 NM_024692 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 1199.25 chr17_KI270729v1_random 27656 27877 + 10.25 NA NA (GAATG)n|Satellite|Satellite NA NA 280.25-25 chr19 56865189 56865391 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 24388 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 156.25-156 chr9 78002998 78003157 + 1.75 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) intron (NM_002072, intron 1 of 6) 28734 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 394 chr1 23691565 23692010 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_000975) promoter-TSS (NM_000975) 8 NM_001199802 6135 Hs.719951 NM_000975 ENSG00000142676 RPL11 DBA7|GIG34|L11|uL5 ribosomal protein L11 protein-coding 239-6 chr1 152569989 152570161 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3295 NM_178435 353145 Hs.490208 NM_178435 ENSG00000185966 LCE3E LEP17 late cornified envelope 3E protein-coding 425.25-6 chr6 55557054 55557448 + 1.75 NA intron (NR_109867, intron 1 of 3) intron (NR_109867, intron 1 of 3) 21963 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 241.5-14 chr12 55796781 55796942 + 1.75 NA intron (NM_033082, intron 4 of 10) intron (NM_033082, intron 4 of 10) 20863 NM_033082 84324 Hs.505676 NM_033082 ENSG00000205323 SARNP CIP29|HCC1|HSPC316|THO1 SAP domain containing ribonucleoprotein protein-coding 376-10 chr2 38601560 38601794 + 1.75 NA intron (NM_138394, intron 1 of 12) intron (NM_138394, intron 1 of 12) 1251 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 174-59 chr3 15037954 15038285 + 1.75 NA exon (NM_001291694, exon 12 of 14) exon (NM_001291694, exon 12 of 14) 27196 NM_022497 64432 Hs.657764 NM_022497 ENSG00000131368 MRPS25 MRP-S25|RPMS25 mitochondrial ribosomal protein S25 protein-coding 282 chr1 73894698 73894949 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 220144 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 267.75-6 chr10 87757152 87757558 + 1.75 NA intron (NM_001321967, intron 8 of 9) intron (NM_001321967, intron 8 of 9) 60876 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 341.25-4 chr1 215484432 215484692 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -82742 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 517-2 chr12 2317567 2317995 + 1.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 48005 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 200.5-133 chr8 42998751 42998937 + 1.75 NA intron (NM_032410, intron 16 of 21) intron (NM_032410, intron 16 of 21) -57455 NR_033698 2339 Hs.370312 NM_002027 ENSG00000168522 FNTA FPTA|PGGT1A|PTAR2 farnesyltransferase, CAAX box, alpha protein-coding 174.25-27 chr11 106015171 106015347 + 1.75 NA intron (NM_001318750, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 6981 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 352.5-6 chr13 84567463 84567732 + 1.75 NA intron (NR_046871, intron 6 of 6) intron (NR_046871, intron 6 of 6) -216057 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 239-28 chr2 96277140 96277317 + 1.75 NA exon (NM_014014, exon 42 of 45) exon (NM_014014, exon 42 of 45) 11003 NM_004804 9391 Hs.12109 NM_004804 ENSG00000144021 CIAO1 CIA1|WDR39 cytosolic iron-sulfur assembly component 1 protein-coding 268.75-19 chr2 226390007 226390195 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 247307 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 139.25-34 chr11 92740909 92741042 + 1.75 NA intron (NM_001008781, intron 3 of 24) L2c|LINE|L2 174653 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 238.25-66 chr5 40835423 40835646 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_000997) promoter-TSS (NM_000997) -312 NM_000997 6167 Hs.80545 NM_000997 ENSG00000145592 RPL37 L37 ribosomal protein L37 protein-coding 160.75-81 chr2 146751693 146751806 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 164692 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 240.25-47 chr4 45931055 45931323 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 192865 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 335.75-9 chr2 39977767 39977998 + 1.75 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 60248 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 271.75-18 chr2 65304552 65304827 + 1.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 62089 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 367.75-4 chr11 14279767 14280209 + 1.75 NA intron (NM_001177314, intron 5 of 5) intron (NM_001177314, intron 5 of 5) 78497 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 538.25-3 chr8 130563137 130563657 + 1.75 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -119723 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 214.5-61 chr2 133503397 133503610 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 64960 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 353-5 chr17 59635233 59635677 + 1.75 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) intron (NM_001288653, intron 1 of 31) 15560 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 238.75-31 chr2 82741664 82741835 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -115054 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 187.75-89 chr5 92495257 92495425 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1076002 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 441.5-6 chr17 56824665 56825070 + 1.75 NA intron (NM_001085430, intron 3 of 7) L1ME3B|LINE|L1 9053 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 325.5-21 chr20 45290145 45290642 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16447 NM_014276 11317 Hs.248217 NM_014276 ENSG00000124232 RBPJL RBPL|RBPSUHL|SUHL recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region like protein-coding 308.5-43 chrX 46290471 46290832 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 37023 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 254.75-54 chr8 98881834 98882033 + 1.75 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) AluJo|SINE|Alu -56245 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 372.75-14 chr9 69858837 69859193 + 1.75 NA TTS (NR_131757) TTS (NR_131757) 38198 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 460.75-7 chr8 84239031 84239353 + 1.75 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 54526 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 215.75-60 chr22 49316812 49317012 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 226554 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 347.5-6 chr12 4648084 4648416 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_005002) promoter-TSS (NM_005002) 797 NM_006422 10566 Hs.98397 NM_006422 ENSG00000111254 AKAP3 AKAP 110|AKAP110|CT82|FSP95|HEL159|PRKA3|SOB1 A-kinase anchoring protein 3 protein-coding 206-63 chr5 147679955 147680138 + 1.75 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR 102682 NM_001270941 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 272-28 chr3 190352317 190352489 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29957 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 276-47 chr8 86575468 86575698 + 1.75 NA 3' UTR (NM_019098, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_019098, exon 18 of 18) 61148 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 313.75-21 chr7 29590055 29590539 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 24764 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 319.5-23 chr18 36520797 36521045 + 1.75 NA intron (NM_001281740, intron 5 of 28) intron (NM_001281740, intron 5 of 28) 142497 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 214.5-2 chr1 90033472 90033706 + 1.75 NA 3' UTR (NM_182976, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_182976, exon 12 of 12) 38479 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 534.75-2 chr10 118514518 118514972 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 80903 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 394.75-6 chr4 22698776 22699177 + 1.75 NA intron (NR_102356, intron 1 of 2) L1MA7|LINE|L1 6039 NR_102355 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 204.75-105 chr6 143958341 143958545 + 1.75 NA intron (NM_001289047, intron 2 of 3) intron (NM_001289047, intron 2 of 3) 2967 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 464.5 chr2 71753573 71753998 + 1.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 287086 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 258.75-52 chr3 116058448 116058673 + 1.75 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -153434 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 348-20 chr8 93810543 93810752 + 1.75 NA intron (NR_024522, intron 26 of 28) intron (NR_024522, intron 26 of 28) 55753 NR_024522 91147 Hs.116240 NM_153704 ENSG00000164953 TMEM67 JBTS6|MECKELIN|MKS3|NPHP11|TNEM67 transmembrane protein 67 protein-coding 203.75-44 chr17 53549376 53549589 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -273445 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 222.75-70 chr3 10232019 10232243 + 1.75 NA intron (NM_001570, intron 10 of 12) AluYm1|SINE|Alu -16328 NM_014760 9797 Hs.475401 NM_014760 ENSG00000157014 TATDN2 - TatD DNase domain containing 2 protein-coding 322-22 chr8 15264256 15264513 + 1.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -25953 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 226.25-71 chr8 91760970 91761156 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 256617 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 244.75-36 chr22 39186213 39186682 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -33767 NM_175709 23492 Hs.356416 NM_175709 ENSG00000100307 CBX7 - chromobox 7 protein-coding 216-24 chr16 64243021 64243267 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 878919 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 141.75-144 chr5 132754670 132754819 + 1.75 NA TTS (NM_001287253) TTS (NM_001287253) 7299 NM_001287252 645121 Hs.522057 NM_001039780 ENSG00000205089 CCNI2 - cyclin I family member 2 protein-coding 126-177 chr8 126249365 126249447 + 1.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -76089 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 189.5-11 chr1 162435397 162435564 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23344 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 331.25-8 chr2 80851056 80851287 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 537792 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 375.75-15 chr6 46825851 46826211 + 1.75 NA intron (NM_005588, intron 8 of 13) intron (NM_005588, intron 8 of 13) 32642 NM_005588 4224 Hs.179704 NM_005588 ENSG00000112818 MEP1A PPHA meprin A subunit alpha protein-coding 223.75-29 chr15 94953283 94953516 + 1.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 98036 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 288-49 chr9 87111666 87112008 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26612 NR_036691 494127 Hs.626316 NR_036691 LOC494127 - NFYC pseudogene pseudo 418.25-7 chr20 18134245 18134779 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3351 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 314-10 chr18 6506776 6507139 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4459 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 331.75-5 chr10 97197129 97197499 + 1.75 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) intron (NR_037909, intron 11 of 14) -11355 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 341.25-20 chr4 84541891 84542094 + 1.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -41135 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 377-14 chr5 132047714 132047986 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -12805 NM_000588 3562 Hs.694 NM_000588 ENSG00000164399 IL3 IL-3|MCGF|MULTI-CSF interleukin 3 protein-coding 258.5-2 chr1 96723743 96723991 + 1.75 NA intron (NM_001300990, intron 2 of 12) intron (NM_001300990, intron 2 of 12) 1229 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 304-8 chr11 77019880 77020178 + 1.75 NA intron (NM_001300953, intron 9 of 9) MIRb|SINE|MIR -14369 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 159.5-37 chr11 84123938 84124092 + 1.75 NA intron (NM_001142699, intron 9 of 27) intron (NM_001142699, intron 9 of 27) 149265 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 158-85 chr20 41274259 41274449 + 1.75 NA intron (NM_015035, intron 1 of 3) intron (NM_015035, intron 1 of 3) 25766 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 175.5-164 chr8 102502275 102502480 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -49212 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 455.25-2 chr4 75247399 75247843 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -106455 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 478.75 chr3 20073287 20073585 + 1.75 NA intron (NM_003884, intron 2 of 17) intron (NM_003884, intron 2 of 17) 32990 NM_003884 8850 Hs.533055 NM_003884 ENSG00000114166 KAT2B CAF|P/CAF|PCAF lysine acetyltransferase 2B protein-coding 259.5-83 chr6 135335249 135335418 + 1.75 NA intron (NM_017651, intron 23 of 27) intron (NM_017651, intron 23 of 27) 96173 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 310.25-3 chr10 101326186 101326444 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27718 NM_001256856 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 189.5-115 chr5 160476591 160476892 + 1.75 NA intron (NR_132748, intron 1 of 1) intron (NR_132748, intron 1 of 1) 2339 NR_036095 100422938 NR_036095 MIR3142 - microRNA 3142 ncRNA 339.25-18 chr4 147433721 147434015 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -47049 NM_001166055 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 317.25-12 chr15 59044618 59044839 + 1.75 NA intron (NM_001270529, intron 2 of 13) intron (NM_001270529, intron 2 of 13) 56582 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 124.25-179 chr6 121191418 121191547 + 1.75 NA intron (NM_001367759, intron 23 of 33) intron (NM_001367759, intron 23 of 33) 142998 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 151.5-76 chr2 32043772 32043909 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -4005 NR_135587 84661 Hs.531788 NM_032574 ENSG00000162961 DPY30 Cps25|HDPY-30|Saf19 dpy-30 histone methyltransferase complex regulatory subunit protein-coding 279-55 chr8 105371162 105371484 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 51780 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 215-10 chr10 50555641 50555878 + 1.75 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) intron (NM_147156, intron 2 of 10) 68197 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 371-13 chr2 49658526 49658951 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 315465 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 250.75-29 chr20 16502998 16503210 + 1.75 NA intron (NM_001199866, intron 10 of 22) AluSx1|SINE|Alu 70344 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 309.75-14 chr17 39353188 39353511 + 1.75 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 48277 NM_032875 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 205.5-155 chr8 132079236 132079531 + 1.75 NA intron (NM_001145095, intron 10 of 15) L1MD2|LINE|L1 -20001 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 357.75-13 chr3 154319103 154319731 + 1.75 NA intron (NM_001114397, intron 1 of 24) L2b|LINE|L2 5070 NM_020865 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 173.25-105 chr5 175636042 175636210 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -21945 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 339.5-24 chr5 41960845 41961179 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 35731 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 266.5-20 chr14 98260648 98260885 + 1.75 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -282642 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 452.25-2 chr14 23009055 23009393 + 1.75 NA intron (NM_001130706, intron 1 of 7) intron (NM_001130706, intron 1 of 7) 919 NM_021944 60686 Hs.255874 NM_021944 ENSG00000100802 C14orf93 RTFC chromosome 14 open reading frame 93 protein-coding 343-8 chr14 68388990 68389273 + 1.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) L1ME3A|LINE|L1 239656 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 275.75-11 chr12 121896992 121897219 + 1.75 NA intron (NR_048555, intron 2 of 4) intron (NR_048555, intron 2 of 4) 8315 NM_002813 5715 Hs.131151 NM_002813 ENSG00000110801 PSMD9 Rpn4|p27 proteasome 26S subunit, non-ATPase 9 protein-coding 442-6 chr7 38370749 38371069 + 1.75 NA intron (NR_040085, intron 3 of 3) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 29332 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 227.5-91 chr6 154368743 154368935 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12073 NM_001130700 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 396-5 chr2 53237819 53238201 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -529773 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 327.75-2 chr1 222557407 222557635 + 1.75 NA TTS (NM_005681) TTS (NM_005681) -9417 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 224.5-73 chr3 85622981 85623148 + 1.75 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -103418 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 270.75-6 chr10 66601301 66601519 + 1.75 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -324626 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 776.25 chr14 63429474 63430549 + 1.75 NA intron (NR_104104, intron 2 of 12) intron (NR_104104, intron 2 of 12) 78227 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 209.5-104 chr4 68134155 68134321 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -4369 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 218.25-90 chr7 42671883 42672014 + 1.75 NA intron (NR_110833, intron 2 of 2) intron (NR_110833, intron 2 of 2) 34499 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 260-16 chr2 57967883 57968081 + 1.75 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) 60331 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 430.75-6 chr14 76213123 76213458 + 1.75 NA TTS (NM_017972) TTS (NM_017972) 58936 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 205-28 chr18 11703189 11703336 + 1.75 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) 13998 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 215.25-117 chr9 127494263 127494465 + 1.75 NA intron (NM_001190723, intron 20 of 24) MIRb|SINE|MIR 42109 NM_001005374 90678 Hs.495188 NM_138361 ENSG00000148356 LRSAM1 CMT2P|RIFLE|TAL leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1 protein-coding 344.25-6 chr14 72847778 72848165 + 1.75 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 44678 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 126.25-16 chr10 34587781 34588003 + 1.75 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 227404 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 369.5-5 chr14 29246717 29247184 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -461163 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 260.5-68 chr8 127272880 127273160 + 1.75 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) MER51A|LTR|ERV1 28383 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 222-19 chr11 93007301 93007516 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37785 NM_005959 4544 Hs.569039 NM_005959 ENSG00000134640 MTNR1B FGQTL2|MEL-1B-R|MT2 melatonin receptor 1B protein-coding 304-35 chr8 113290672 113290935 + 1.75 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 86349 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 340.75-2 chr1 102809133 102809572 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 299144 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 514.25-2 chr8 64505526 64505998 + 1.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 71501 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 284-19 chr18 41314569 41314773 + 1.75 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 206006 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 189.75-34 chr14 66910909 66911105 + 1.75 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1ME3D|LINE|L1 -278433 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 288.5-32 chr4 59180748 59181124 + 1.75 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 167363 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 336.25-6 chr14 60043825 60044123 + 1.75 NA intron (NR_075071, intron 29 of 32) L1M2|LINE|L1 -47937 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 334.25-3 chr10 53035882 53036191 + 1.75 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -264336 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 154.5-103 chr2 124197957 124198081 + 1.75 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) L1ME3E|LINE|L1 172732 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 323.75-20 chr6 82018389 82018853 + 1.75 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) intron (NR_149135, intron 3 of 3) -80200 NR_149134 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 193.5-123 chr4 109650617 109650758 + 1.75 NA intron (NM_017918, intron 1 of 7) L1MC4|LINE|L1 52758 NM_032992 839 Hs.654616 NM_001226 ENSG00000138794 CASP6 MCH2 caspase 6 protein-coding 394-4 chr14 43524787 43525095 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 982342 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 216.5-108 chr7 55175856 55176143 + 1.75 NA intron (NM_001346941, intron 13 of 21) intron (NM_001346941, intron 13 of 21) 12950 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 328.25-12 chr2 187702905 187703095 + 1.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -148495 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 165.25-10 chr1 218875437 218875550 + 1.75 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 43018 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 295.25-29 chr7 77619933 77620217 + 1.75 NA intron (NM_001131009, intron 11 of 16) intron (NM_001131009, intron 11 of 16) 76190 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 421.5-6 chr14 65684235 65684591 + 1.75 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 213311 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 245.25-54 chr4 171476873 171477122 + 1.75 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie 161766 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 232.5-103 chr8 88980583 88980745 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -653181 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 372.75-8 chr14 59645030 59645332 + 1.75 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L1PA8|LINE|L1 1839 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 229-41 chr20 20324685 20324917 + 1.75 NA intron (NM_015585, intron 25 of 26) L1ME4a|LINE|L1 -43303 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 340.25-8 chr16 13144951 13145330 + 1.75 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 243542 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 280.25-6 chr10 26252539 26253145 + 1.75 NA intron (NM_000818, intron 8 of 16) AluSp|SINE|Alu 36068 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 295.75-7 chr16 72841567 72841913 + 1.75 NA intron (NM_001164766, intron 3 of 8) intron (NM_001164766, intron 3 of 8) -176770 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 254-29 chr2 208674758 208674926 + 1.75 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) intron (NR_136588, intron 3 of 5) 132200 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 333.25-6 chr2 7543858 7544278 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 122807 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 452.5 chr1 42508064 42508581 + 1.75 NA intron (NM_001355227, intron 6 of 18) HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -24698 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 242.75-67 chr8 58368137 58368474 + 1.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -42959 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 247-15 chr12 54013017 54013158 + 1.75 NA TTS (NM_022658) TTS (NM_022658) -3801 NM_153693 3223 Hs.549040 NM_004503 ENSG00000197757 HOXC6 CP25|HHO.C8|HOX3|HOX3C homeobox C6 protein-coding 312.5-7 chr12 47913218 47913533 + 1.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -8344 NM_001364085 7421 Hs.524368 NM_000376 ENSG00000111424 VDR NR1I1|PPP1R163 vitamin D receptor protein-coding 307.5-17 chr15 70678665 70679011 + 1.75 NA intron (NM_018003, intron 10 of 18) intron (NM_018003, intron 10 of 18) 23444 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 217.75-27 chr15 92292435 92292606 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -101361 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 194-15 chr10 15881867 15882046 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -21423 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 198.25-15 chr10 94353555 94353755 + 1.75 NA intron (NM_022451, intron 6 of 20) intron (NM_022451, intron 6 of 20) 9284 NM_022451 64318 Hs.74899 NM_022451 ENSG00000173145 NOC3L AD24|C10orf117|FAD24 NOC3 like DNA replication regulator protein-coding 270.75-28 chr2 145336358 145336639 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 668531 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 369.75-10 chr18 4325019 4325388 + 1.75 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L1PA15|LINE|L1 60601 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 205-38 chr2 74350894 74351065 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7563 NM_133478 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 330.75-12 chr2 41643190 41643465 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -234228 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 332-5 chr12 98566887 98567104 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26630 NM_005888 5250 Hs.290404 NM_002635 ENSG00000075415 SLC25A3 OK/SW-cl.48|PHC|PTP solute carrier family 25 member 3 protein-coding 308.25-2 chr1 157063884 157064201 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -18300 NM_014784 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 372.5-2 chr1 113829402 113829676 + 1.75 NA intron (NM_012411, intron 16 of 18) intron (NM_012411, intron 16 of 18) 16927 NR_125965 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 322.5-5 chr10 132250676 132250953 + 1.75 NA intron (NM_001318878, intron 1 of 11) intron (NM_001318878, intron 1 of 11) -1706 NR_134911 282974 Hs.469002 NM_173575 ENSG00000165752 STK32C PKE|YANK3 serine/threonine kinase 32C protein-coding 236.25-14 chr11 14473410 14473565 + 1.75 NA intron (NM_016451, intron 14 of 21) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 26371 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 306-35 chr7 133313398 133313594 + 1.75 NA intron (NM_021807, intron 4 of 17) intron (NM_021807, intron 4 of 17) 22615 NR_106749 102465139 NR_106749 ENSG00000276137 MIR6133 hsa-mir-6133 microRNA 6133 ncRNA 455.5-3 chr3 115506810 115507197 + 1.75 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL -116507 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 297-2 chr1 197991375 197991693 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 74162 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 282.25-32 chr6 27712432 27712662 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 18468 NR_038292 100507173 Hs.635987 NR_038292 ENSG00000281706 LINC01012 - long intergenic non-protein coding RNA 1012 ncRNA 315.5-22 chr5 180488203 180488458 + 1.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -6049 NM_001370473 57472 Hs.608380 NM_015455 ENSG00000113300 CNOT6 CCR4|Ccr4a CCR4-NOT transcription complex subunit 6 protein-coding 476.75 chr21 25360964 25361476 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 70481 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 238.25-3 chr1 117536150 117536475 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 69458 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 308.75-27 chr20 46617084 46617390 + 1.75 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) intron (NM_001193340, intron 2 of 12) 34222 NM_001193339 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 220-36 chr2 181043728 181043939 + 1.75 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) L1ME4a|LINE|L1 62709 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 230.75-53 chr4 116959404 116959773 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 125988 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 301.25-6 chr11 22253537 22253853 + 1.75 NA intron (NM_001142649, intron 12 of 21) intron (NM_001142649, intron 12 of 21) 60519 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 245.25-36 chr2 46032264 46032539 + 1.75 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) intron (NM_005400, intron 10 of 14) -265006 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 317-21 chr3 158652903 158653397 + 1.75 NA intron (NM_001308164, intron 7 of 18) intron (NM_001308164, intron 7 of 18) 8622 NM_001308166 85476 Hs.518355 NM_024996 ENSG00000168827 GFM1 COXPD1|EFG|EFG1|EFGM|EGF1|GFM|hEFG1|mtEF-G1 G elongation factor mitochondrial 1 protein-coding 324.75 chr1 44336351 44336701 + 1.75 NA intron (NM_001301701, intron 2 of 7) Plat_L3|LINE|CR1 18731 NM_001301698 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 164.75-158 chrUn_GL000216v2 10319 10428 + 1.75 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 278.25-37 chr3 70738432 70738677 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 326370 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 241.75-27 chr14 82294147 82294503 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -348307 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 404.25-3 chr11 43467228 43467624 + 1.75 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) L1MB2|LINE|L1 -92230 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 219-80 chr5 41141927 41142183 + 1.75 NA TTS (NM_001115131) TTS (NM_001115131) -70713 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 190-40 chr22 28343526 28343745 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -116234 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 170-33 chr14 85695888 85696073 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 162631 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 365.25-11 chr8 133673691 133674124 + 1.75 NA intron (NR_134462, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 10159 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 359.5-4 chr15 91087732 91088277 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11584 NM_001323031 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 256-46 chr3 106704808 106705015 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 535727 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 266.25-13 chr13 51117412 51117695 + 1.75 NA intron (NR_102431, intron 1 of 4) intron (NR_102431, intron 1 of 4) -6325 NM_001351589 647166 Hs.195052 NM_001351589 ENSG00000226792 C13orf42 LINC00371|LINC00372 chromosome 13 open reading frame 42 protein-coding 223.75-26 chr14 83575892 83576040 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 933334 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 245.25-63 chr6 125675518 125675795 + 1.75 NA intron (NR_038906, intron 1 of 3) intron (NR_038906, intron 1 of 3) 1303 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 353.75-16 chr6 64726658 64727072 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -574553 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 651.25 chr8 114253075 114253674 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -816435 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 281.75-5 chr1 185484302 185484572 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 144051 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 285.5-9 chr10 96046514 96046737 + 1.75 NA intron (NM_019084, intron 2 of 5) intron (NM_019084, intron 2 of 5) 3042 NM_019084 54619 Hs.596479 NM_019084 ENSG00000107443 CCNJ bA690P14.1 cyclin J protein-coding 272.25-49 chr5 148367135 148367516 + 1.75 NA intron (NR_105057, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 16525 NR_105057 102546294 Hs.660461 NR_105057 ENSG00000247199 LOC102546294 - uncharacterized LOC102546294 ncRNA 257.5-55 chr4 111281927 111282176 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -421404 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 306.5-13 chr15 56726885 56727169 + 1.75 NA intron (NM_001002843, intron 1 of 20) MER34A|LTR|ERV1 7059 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 324-12 chr2 59812695 59812956 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 570211 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 395-12 chr3 120062487 120062810 + 1.75 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 22000 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 265.75-13 chr14 19922256 19922475 + 1.75 NA TTS (NM_001005483) TTS (NM_001005483) 1758 NM_001005483 79317 Hs.554585 NM_001005483 ENSG00000176281 OR4K5 OR14-16 olfactory receptor family 4 subfamily K member 5 protein-coding 346.5-24 chr4 31345751 31346030 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -160654 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 297.75-21 chr2 210205372 210205575 + 1.75 NA intron (NM_001608, intron 6 of 10) intron (NM_001608, intron 6 of 10) 19974 NM_001608 33 Hs.471277 NM_001608 ENSG00000115361 ACADL ACAD4|LCAD acyl-CoA dehydrogenase long chain protein-coding 472 chr2 69044764 69045564 + 1.75 NA intron (NM_032208, intron 3 of 17) intron (NM_032208, intron 3 of 17) 32020 NM_032208 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 362-10 chr3 44218593 44218945 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -23117 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 253.75-2 chr10 12209730 12209991 + 1.75 NA intron (NM_006023, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 13672 NM_006023 8872 Hs.412842 NM_006023 ENSG00000151465 CDC123 C10orf7|D123 cell division cycle 123 protein-coding 296-24 chr2 58128008 58128277 + 1.75 NA intron (NM_001130483, intron 8 of 13) intron (NM_001130483, intron 8 of 13) 81430 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 442.25-3 chr2 21838348 21838701 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -127872 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 246.25-20 chr14 64461263 64461542 + 1.75 NA intron (NM_001304508, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -4097 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 184-69 chr5 11966052 11966193 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -61676 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 200.5-66 chr2 75022918 75023134 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 64383 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 204.25-47 chr19 52580310 52580508 + 1.75 NA intron (NM_018260, intron 3 of 3) AluSg4|SINE|Alu 9745 NM_001172655 55762 Hs.235167 NM_018260 ENSG00000167562 ZNF701 - zinc finger protein 701 protein-coding 220-5 chr1 159055731 159055925 + 1.75 NA TTS (NM_001364867) TTS (NM_001364867) 20938 NM_004833 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 252.25-62 chr8 112068281 112068573 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -575066 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 264-41 chr20 60525261 60525448 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -39208 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 257.5-21 chr14 61726098 61726307 + 1.75 NA intron (NM_181054, intron 4 of 13) intron (NM_181054, intron 4 of 13) 22887 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 281.25-17 chr14 61325910 61326149 + 1.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) L1ME1|LINE|L1 4586 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 313.5-24 chr21 27376029 27376489 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -346120 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 209-69 chr8 11343248 11343530 + 1.75 NA intron (NR_001578, intron 1 of 8) intron (NR_001578, intron 1 of 8) 3752 NR_001578 157739 Hs.583896 NR_001578 ENSG00000154316 TDH SDR14E1P L-threonine dehydrogenase (pseudogene) pseudo 365.75-15 chr6 145702189 145702539 + 1.75 NA intron (NM_001360064, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -15487 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 246.75-32 chr2 74480296 74480679 + 1.75 NA intron (NM_001365575, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu 2511 NM_001365575 84865 Hs.430199 NM_032779 ENSG00000135637 CCDC142 - coiled-coil domain containing 142 protein-coding 301.5-17 chr12 112448686 112449147 + 1.75 NA intron (NM_001330437, intron 2 of 15) AluSq|SINE|Alu 29969 NM_080601 5781 Hs.506852 NM_002834 ENSG00000179295 PTPN11 BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 protein-coding 527.75-3 chr18 58808016 58808536 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5604 NR_146904 105372147 Hs.210837 NR_146904 ENSG00000267593 LINC01926 - long intergenic non-protein coding RNA 1926 ncRNA 315.75-14 chr2 126324202 126324503 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -206367 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 511 chr17 70180910 70181511 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 11675 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 360.5-4 chr10 62668540 62668916 + 1.75 NA intron (NM_199451, intron 7 of 7) LTR16C|LTR|ERVL -135992 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 224.5-82 chr4 79182663 79182903 + 1.75 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) intron (NR_038342, intron 3 of 5) 143278 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 330-26 chr6 152405396 152405701 + 1.75 NA intron (NM_182961, intron 45 of 145) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 25018 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 383-7 chr15 89446976 89447215 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 46924 NR_160724 105371031 NR_160724 LOC105371031 - uncharacterized LOC105371031 ncRNA 252.5-21 chr12 38546916 38547160 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 230264 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 219.75-83 chr8 63592374 63592520 + 1.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 126598 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 346.5-11 chr18 4254126 4254429 + 1.75 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -10325 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 355.25-4 chr14 59639961 59640193 + 1.75 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L1MEg|LINE|L1 6943 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 347.25-12 chr20 15168740 15169095 + 1.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) L1MB3|LINE|L1 -27923 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 374.75-11 chr6 64384316 64384724 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 577684 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 287.25-17 chr14 46136483 46136793 + 1.75 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1MC4|LINE|L1 72479 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 324.75-2 chr1 98534563 98534916 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -126982 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 358.75-14 chr8 108044164 108044457 + 1.75 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 37629 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 129-3 chr1 63056959 63057086 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -44551 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 384-15 chr4 113653041 113653298 + 1.75 NA intron (NM_001221, intron 3 of 18) intron (NM_001221, intron 3 of 18) 108569 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 309.75-36 chr8 83078180 83078454 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 166213 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 266-46 chr7 120787481 120787668 + 1.75 NA 3' UTR (NM_012338, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_012338, exon 8 of 8) 70570 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 238.25-90 chr9 73325027 73325244 + 1.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 173270 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 346.25-4 chr13 101379936 101380271 + 1.75 NA intron (NM_001350749, intron 3 of 43) L1PREC2|LINE|L1 36405 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 297.25-21 chr4 159223005 159223318 + 1.75 NA intron (NM_001351724, intron 4 of 30) intron (NM_001351724, intron 4 of 30) -4471 NM_001351726 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 268-58 chr8 83050536 83050831 + 1.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 138579 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 267-11 chr11 30033087 30033416 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16221 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 298-26 chr6 63277046 63277286 + 1.75 NA 3' UTR (NM_016571, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_016571, exon 4 of 4) 42811 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 344.25-15 chr6 160553176 160553621 + 1.75 NA intron (NM_005577, intron 30 of 38) L1ME2|LINE|L1 -42274 NR_028092 80350 Hs.654503 NM_024492 ENSG00000213071 LPAL2 APOA2|APOAL|APOARGC|apo(a)rg-C lipoprotein(a) like 2, pseudogene pseudo 488.25-4 chr3 101533457 101533940 + 1.75 NA Intergenic MER84-int|LTR|ERV1 14831 NR_036433 131909 Hs.518125 NR_036433 FAM172BP FAM172B family with sequence similarity 172 member B, pseudogene pseudo 317.25-28 chr6 98954235 98954540 + 1.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -6381 NM_012160 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 393.5-18 chr9 23434318 23434615 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 237933 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 285.75-21 chr2 101809267 101809465 + 1.75 NA intron (NM_145686, intron 3 of 30) (TTTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 111659 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 366.5-5 chr11 50428214 50428441 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 19180 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 148.5-61 chr14 56224000 56224160 + 1.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 105669 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 230.5-103 chr6 114212261 114212508 + 1.75 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) intron (NR_125845, intron 8 of 9) -149507 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 405.75-6 chr4 45959775 45960211 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 164061 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 299.5-38 chr7 15997105 15997376 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -213246 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 312-9 chr12 28874319 28874622 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -274808 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 376.5-19 chr7 124406378 124406675 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -54430 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 515.25-2 chr2 50786898 50787355 + 1.75 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) L3b|LINE|CR1 -90864 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 420.5-16 chr9 26975015 26975460 + 1.75 NA intron (NM_001099224, intron 2 of 13) HERVIP10F-int|LTR|ERV1 18825 NM_025103 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 385.5-17 chr4 177139710 177140130 + 1.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -169954 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 244.75-25 chr17 73035464 73035676 + 1.75 NA intron (NM_001352692, intron 3 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 57118 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 189.75-114 chr7 85037375 85037545 + 1.75 NA intron (NM_152754, intron 9 of 16) intron (NM_152754, intron 9 of 16) 84471 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 312.75-3 chr1 234732135 234732648 + 1.75 NA TTS (NR_038856) TTS (NR_038856) 8349 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 401.25-8 chr20 17254307 17254753 + 1.75 NA intron (NM_001201529, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 27490 NM_002594 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 339.75-8 chr11 77345655 77345899 + 1.75 NA intron (NM_001128620, intron 9 of 15) intron (NM_001128620, intron 9 of 15) -44111 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 153.75-130 chr6 62988914 62989028 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 331006 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 238.75-51 chr5 108463691 108463915 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -81705 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 275.5-73 chr9 116525431 116525771 + 1.75 NA intron (NR_033973, intron 1 of 11) intron (NR_033973, intron 1 of 11) 21318 NR_033973 100128505 Hs.675821 NR_033973 ENSG00000229105 ASTN2-AS1 - ASTN2 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-83 chr2 75809197 75809319 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -98343 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 356.25-5 chr16 12389553 12389938 + 1.75 NA intron (NM_032167, intron 16 of 20) intron (NM_032167, intron 16 of 20) -330576 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 422.25-5 chr4 11943845 11944152 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 160820 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 342.5-2 chr1 97018777 97019148 + 1.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -76961 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 200.25-34 chr14 42815381 42815567 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 1208618 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 278.5-59 chr8 131013650 131013864 + 1.75 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 27152 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 232-46 chr20 34497759 34497992 + 1.75 NA intron (NM_001257137, intron 24 of 25) AluSx|SINE|Alu -18509 NM_014183 83658 Hs.593920 NM_014183 ENSG00000125971 DYNLRB1 BITH|BLP|DNCL2A|DNLC2A|ROBLD1 dynein light chain roadblock-type 1 protein-coding 383.25-15 chr3 157235833 157236298 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -75305 NM_020307 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 345.75-9 chr3 84475983 84476294 + 1.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 393437 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 454-4 chr6 75119683 75120295 + 1.75 NA intron (NM_080645, intron 29 of 50) MIRb|SINE|MIR 8793 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 210.75-56 chr3 10924949 10925184 + 1.75 NA intron (NM_014229, intron 8 of 13) L1ME2|LINE|L1 -67668 NM_001348253 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 307.5-28 chr2 104040167 104040416 + 1.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 368041 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 301.75-33 chr6 144023270 144023545 + 1.75 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) L1MC3|LINE|L1 -14677 NR_002768 57061 Hs.657760 NR_002768 ENSG00000283122 HYMAI NCRNA00020 hydatidiform mole associated and imprinted ncRNA 395.25-7 chr22 28946943 28947383 + 1.75 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 29774 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 394.5-13 chr9 37135110 37135453 + 1.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 14683 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 399.75-12 chr5 117615746 117616086 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -114445 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 361.5-20 chr6 48404228 48404801 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -335825 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 278.5-40 chr4 47964947 47965199 + 1.75 NA intron (NR_125879, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 16460 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 265.25-27 chr20 40138748 40138938 + 1.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 134382 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 164-93 chr4 162448056 162448235 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -284111 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 175.75-106 chr5 42173524 42173700 + 1.75 NA intron (NR_104635, intron 1 of 3) intron (NR_104635, intron 1 of 3) 1733 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 431-7 chr3 95909711 95910064 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -226694 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 276.25-9 chr13 66479185 66479480 + 1.75 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 261082 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 382-11 chr2 157232064 157232436 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -25455 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 279-43 chr7 42609621 42609833 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 96720 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 190.25-14 chr10 34212774 34212966 + 1.75 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -440190 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 344.5-2 chr1 78027430 78027768 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -17371 NM_001304725 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 211.5-89 chr20 46827739 46827920 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -66795 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 341.5-11 chr17 79345100 79345360 + 1.75 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) L1MD|LINE|L1 170918 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 419.25-3 chr11 110838327 110838806 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -125377 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 274-9 chr11 93970461 93970742 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -50753 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 333.5-17 chr7 34335946 34336221 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -322135 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 168.75-147 chr8 77836664 77836840 + 1.75 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 386055 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 272.75-46 chr7 48528972 48529224 + 1.75 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) intron (NM_152701, intron 55 of 61) 357640 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 338-21 chr22 41328288 41328557 + 1.75 NA intron (NM_017590, intron 5 of 22) L2c|LINE|L2 -26053 NM_001317930 5905 Hs.183800 NM_002883 ENSG00000100401 RANGAP1 Fug1|RANGAP|SD Ran GTPase activating protein 1 protein-coding 249.25-12 chr15 65658748 65659017 + 1.75 NA TTS (NM_001144823) TTS (NM_001144823) 16003 NM_001254740 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 179.5-18 chr10 15797739 15797935 + 1.75 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 62670 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 302.5-20 chr2 115280582 115280799 + 1.75 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) -28547 NM_001321907 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 257.5-75 chr8 118560558 118560822 + 1.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -60311 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 318.5-3 chr10 70885448 70885973 + 1.75 NA intron (NM_000281, intron 2 of 3) intron (NM_000281, intron 2 of 3) 2171 NM_001289797 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 299.75 chr1 34225755 34226098 + 1.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 49019 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 178-14 chr11 71435324 71435514 + 1.75 NA exon (NM_001163817, exon 9 of 9) exon (NM_001163817, exon 9 of 9) -12065 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 354.75-12 chr3 23558283 23558626 + 1.75 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -247501 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 332-14 chr19 28634442 28634852 + 1.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1PA15-16|LINE|L1 27959 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 212.25-21 chr12 39717947 39718093 + 1.75 NA intron (NR_135051, intron 12 of 18) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 91837 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 157.5-107 chr2 100579058 100579205 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 16138 NM_024065 79031 Hs.469459 NM_024065 ENSG00000115539 PDCL3 HTPHLP|PHLP2A|PHLP3|VIAF|VIAF1 phosducin like 3 protein-coding 636.5 chr2 137982617 137983104 + 1.75 NA intron (NM_006895, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 18387 NM_001024075 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 278.5-20 chr17 31747800 31748109 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 111008 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 296.5-35 chr6 168266429 168266617 + 1.75 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 23585 NR_110870 101929420 Hs.571211 NR_110870 ENSG00000234647 LOC101929420 - uncharacterized LOC101929420 ncRNA 465.25-3 chr8 107454476 107454890 + 1.75 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 43235 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 250.5-63 chr3 134468165 134468376 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -17454 NM_001353113 80254 Hs.443301 NM_025180 ENSG00000182923 CEP63 SCKL6 centrosomal protein 63 protein-coding 337-5 chr10 60578813 60579076 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -5988 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 350-5 chr14 70089584 70090110 + 1.75 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -9630 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 319.25-9 chr2 77490922 77491151 + 1.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 31340 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 215.25-16 chr11 80250913 80251157 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 511768 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 486.75-6 chr7 70561030 70561361 + 1.75 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -570949 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 205.5-127 chr6 75997071 75997319 + 1.75 NA intron (NM_001563, intron 12 of 16) intron (NM_001563, intron 12 of 16) 75467 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 252.75-37 chr20 42148876 42149214 + 1.75 NA intron (NM_133170, intron 18 of 31) MER90|LTR|ERV1 -530668 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 146.75-151 chr7 41089155 41089292 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -12381 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 494.5 chr10 103015484 103016005 + 1.75 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -97409 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 346.75-12 chr6 120067555 120068150 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 52673 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 303.5-12 chr14 58197176 58197431 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2846 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 164.5-172 chr5 174391318 174391493 + 1.75 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) intron (NR_125806, intron 1 of 5) 55051 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 318.5-38 chr8 88117734 88118040 + 1.75 NA intron (NM_005941, intron 5 of 9) intron (NM_005941, intron 5 of 9) 209596 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 259.5-9 chr1 149996446 149996932 + 1.75 NA intron (NM_020205, intron 1 of 11) intron (NM_020205, intron 1 of 11) 14037 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 346-2 chr10 17485099 17485455 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -30682 NM_001004470 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 198.5-50 chr14 89021322 89021475 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 196747 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 410.75-5 chr4 54240269 54240598 + 1.75 NA intron (NM_001347828, intron 2 of 23) MER66-int|LTR|ERV1 6473 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 198-21 chr14 21780182 21780387 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -109267 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 206.5-92 chr5 26832504 26832711 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 205979 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 275.75-47 chr9 26878843 26879251 + 1.75 NA intron (NM_001167575, intron 4 of 5) L1M7|LINE|L1 13755 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 232.25-19 chr13 73305092 73305286 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 246184 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 250.5-41 chr2 35682094 35682330 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 210807 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 433.75-3 chr12 24588812 24589213 + 1.75 NA Intergenic (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4844 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 217.75-48 chr3 3418028 3418215 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -238404 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 199.25-21 chr12 42153623 42153785 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8830 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 234.25-13 chr10 98812827 98813008 + 1.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 111651 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 364.25-16 chr17 34479134 34479389 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 100108 NR_160787 400591 Hs.514090 NM_207454 C17orf102 - chromosome 17 open reading frame 102 ncRNA 274.5-26 chr17 72396278 72396544 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 53600 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 292.25-9 chr10 8756303 8756604 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -141536 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 201.5-87 chr3 64165054 64165183 + 1.75 NA intron (NM_001370528, intron 2 of 7) intron (NM_001370528, intron 2 of 7) -22426 NR_046702 100874243 Hs.670840 NR_046702 ENSG00000226017 PRICKLE2-AS3 - PRICKLE2 antisense RNA 3 ncRNA 493.75 chr8 35311991 35312635 + 1.75 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) 76838 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 253.25-22 chr14 39532734 39532927 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -100330 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 303-23 chr4 113832983 113833257 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71193 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 220.25-45 chr22 35131006 35131181 + 1.75 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 64935 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 234.25-49 chr4 36120252 36120550 + 1.75 NA intron (NR_146894, intron 23 of 32) intron (NR_146894, intron 23 of 32) 123538 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 231.75-22 chr14 46270603 46270791 + 1.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 -200662 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 248-26 chr15 49902616 49902870 + 1.75 NA intron (NR_073596, intron 20 of 27) intron (NR_073596, intron 20 of 27) 210636 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 159.75-28 chr11 61280006 61280139 + 1.75 NA intron (NM_152718, intron 9 of 19) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 15244 NM_152718 220001 Hs.60640 NM_152718 ENSG00000167992 VWCE URG11|VWC1 von Willebrand factor C and EGF domains protein-coding 375.75 chr10 78350121 78350417 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 82927 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 405.5-14 chr8 84551462 84551850 + 1.75 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) 136172 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 195.75-125 chr9 80426045 80426208 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 451103 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 271-25 chr2 158298052 158298371 + 1.75 NA intron (NM_138803, intron 9 of 13) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 131561 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 273-47 chr5 180569053 180569376 + 1.75 NA exon (NM_001370472, exon 10 of 12) exon (NM_001370472, exon 10 of 12) 22285 NM_052863 92304 Hs.62492 NM_052863 ENSG00000161055 SCGB3A1 HIN-1|HIN1|LU105|PnSP-2|UGRP2 secretoglobin family 3A member 1 protein-coding 215.75-66 chr4 31739295 31739470 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 232838 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 350-6 chr2 22928960 22929209 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 392605 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 260.75-51 chr5 92996587 92996823 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 574638 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 395.5-9 chr15 77522380 77522750 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3030 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 289-23 chr2 183170749 183171024 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 46443 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 466.5-7 chr3 88287118 88287471 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -51162 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 373-15 chr8 124332524 124332897 + 1.75 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) intron (NM_194291, intron 1 of 6) 39989 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 448.5-8 chr8 108244292 108244713 + 1.75 NA intron (NM_001568, intron 1 of 12) intron (NM_001568, intron 1 of 12) 4215 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 342.5-12 chr13 89777974 89778267 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -213707 NR_046991 100874139 Hs.742173 NR_046991 LINC00353 - long intergenic non-protein coding RNA 353 ncRNA 391.25-11 chr22 28321018 28321259 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -138731 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 363.75-4 chr14 100707826 100708133 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -18886 NM_003836 8788 Hs.116631 NM_003836 ENSG00000185559 DLK1 DLK|DLK-1|Delta1|FA1|PREF1|Pref-1|ZOG|pG2 delta like non-canonical Notch ligand 1 protein-coding 364.5-15 chr4 104644077 104644445 + 1.75 NA intron (NR_125926, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR -149367 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 139.75-112 chr21 14491479 14491659 + 1.75 NA intron (NM_022136, intron 7 of 7) MER34|LTR|ERV1 54746 NM_022136 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 164-124 chr7 5682809 5683068 + 1.75 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) L1ME4c|LINE|L1 -2477 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 392.5-9 chr5 106275853 106276146 + 1.75 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner 735015 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 228-13 chr11 31123597 31123748 + 1.75 NA intron (NM_001367979, intron 11 of 38) intron (NM_001367979, intron 11 of 38) -130986 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 287.25 chr1 39034199 39034559 + 1.75 NA intron (NM_001184979, intron 2 of 2) intron (NM_001184979, intron 2 of 2) 8029 NM_004552 4725 Hs.632385 NM_004552 ENSG00000168653 NDUFS5 CI-15k|CI15K NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S5 protein-coding 229.5-84 chr3 28378565 28378857 + 1.75 NA intron (NM_001324170, intron 1 of 6) intron (NM_001324170, intron 1 of 6) 29562 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 321-10 chr14 48839611 48839830 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 746660 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 190.5-49 chr15 58858390 58858622 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001040453, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001040453, exon 9 of 9) 75173 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 115-111 chr3 115352290 115352418 + 1.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -205066 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 145.25-157 chr7 30019885 30020171 + 1.75 NA intron (NR_046479, intron 1 of 2) intron (NR_046479, intron 1 of 2) 6674 NR_046479 55033 Hs.390838 NM_017946 ENSG00000106080 FKBP14 EDSKMH|EDSKSCL2|FKBP22|IPBP12 FKBP prolyl isomerase 14 protein-coding 349.5-2 chr1 77963720 77963982 + 1.75 NA intron (NM_003902, intron 12 of 19) intron (NM_003902, intron 12 of 19) 15221 NR_146539 8880 Hs.567380 NM_003902 ENSG00000162613 FUBP1 FBP|FUBP|hDH V far upstream element binding protein 1 protein-coding 357-3 chr11 37999402 37999842 + 1.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 61021 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 342.25-16 chr5 163677453 163677666 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 171940 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 298-4 chr10 94317532 94317767 + 1.75 NA intron (NM_001165979, intron 28 of 31) intron (NM_001165979, intron 28 of 31) -30579 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 312.75-27 chr4 132907848 132908274 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 241055 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 299.25-31 chr22 26586044 26586237 + 1.75 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) MIR1_Amn|SINE|MIR 3992 NM_001362923 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 174-97 chr8 57634432 57634601 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -111633 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 168.25-74 chr2 77698496 77698681 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -176155 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 519-2 chr2 174245227 174245608 + 1.75 NA intron (NM_001011708, intron 1 of 9) intron (NM_001011708, intron 1 of 9) 3115 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 273.5-49 chr3 86438539 86438843 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -43252 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 325.75-19 chr3 115921018 115921218 + 1.75 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) L1MB1|LINE|L1 -15992 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 349.5-8 chr18 45011507 45011890 + 1.75 NA intron (NM_015559, intron 4 of 5) intron (NM_015559, intron 4 of 5) -41532 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 261.25-28 chr3 138727383 138727703 + 1.75 NA intron (NM_006219, intron 8 of 23) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -19922 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 190-36 chr20 14166844 14167014 + 1.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 170683 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 298.5-15 chr2 78617223 78617515 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71838 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 326.75-7 chr14 60427819 60428087 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 58110 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 430.75-9 chr3 57676135 57676570 + 1.75 NA intron (NM_152678, intron 1 of 19) AluSz6|SINE|Alu 16725 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 325.5-26 chr3 145582177 145582410 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 486892 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 339.75-12 chr14 79065054 79065256 + 1.75 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L1ME3G|LINE|L1 -134827 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 182-58 chr2 49476383 49476550 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -321939 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 204-61 chr4 176394425 176394667 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 74580 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 276.25-12 chr14 53703642 53703839 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 244744 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 238-30 chr2 185354868 185355119 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -187921 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 433.75-4 chr13 85315784 85316111 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -47656 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 224.75-27 chr14 35867066 35867206 + 1.75 NA intron (NM_032352, intron 8 of 9) L2a|LINE|L2 40798 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 157.5-143 chr3 189228963 189229069 + 1.75 NA intron (NM_198485, intron 3 of 5) L1MD|LINE|L1 11578 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 179-76 chr4 83988521 83988654 + 1.75 NA intron (NR_125909, intron 8 of 8) L1ME4b|LINE|L1 310582 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 208-50 chr22 34520494 34520959 + 1.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 477190 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 464.5-2 chr21 28123175 28123490 + 1.75 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) intron (NR_126012, intron 5 of 5) 32929 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 390.25-10 chr8 136513150 136513563 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -17442 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 350.75-10 chr5 63765735 63765990 + 1.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 196430 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 168.75-99 chr3 176205541 176205709 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -38926 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 259.75-54 chr8 90578640 90578851 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 27318 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 227.25-47 chr2 118646529 118646731 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -43664 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 269.25-25 chr2 100936229 100936509 + 1.75 NA intron (NM_002518, intron 4 of 20) intron (NM_002518, intron 4 of 20) 40792 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 234.25-17 chr12 4239165 4239453 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -34453 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 578.5 chr14 55539958 55540384 + 1.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 39921 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 375.5-17 chr6 142775908 142776248 + 1.75 NA intron (NM_006734, intron 4 of 9) intron (NM_006734, intron 4 of 9) -138189 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 255.75-37 chr5 8812666 8812905 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26947 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 312.25 chr1 222527900 222528086 + 1.75 NA intron (NM_024746, intron 6 of 8) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 20111 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 172.5-13 chr1 168556514 168556639 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12579 NM_003175 6846 Hs.458346 NM_003175 ENSG00000143185 XCL2 SCM-1b|SCM1B|SCYC2 X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 262-29 chr2 77715006 77715279 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -192709 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 230.25-55 chr3 7245873 7246083 + 1.75 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) L1ME2|LINE|L1 289306 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 278.5-36 chr21 24693027 24693306 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -147384 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 165.75-65 chr18 12733888 12734021 + 1.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 15468 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 288.75-15 chr12 100913757 100913934 + 1.75 NA intron (NM_178826, intron 2 of 26) intron (NM_178826, intron 2 of 26) 12199 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 261.25-2 chr1 110498290 110498535 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8154 NR_108042 440602 Hs.708945 NR_108042 ENSG00000235407 CYMP-AS1 - CYMP antisense RNA 1 ncRNA 183.75-131 chr8 136777376 136777602 + 1.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 246691 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 386.5-3 chr10 115372052 115372457 + 1.75 NA intron (NM_207303, intron 19 of 28) L1MA7|LINE|L1 278889 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 119.75-39 chr12 8098083 8098217 + 1.75 NA TTS (NR_024260) TTS (NR_024260) 15876 NM_015509 25977 Hs.555927 NM_015509 ENSG00000089818 NECAP1 EIEE21 NECAP endocytosis associated 1 protein-coding 353.25-23 chr8 124076780 124077122 + 1.75 NA intron (NM_001039112, intron 32 of 40) intron (NM_001039112, intron 32 of 40) -36169 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 337-22 chr4 53490319 53490683 + 1.75 NA intron (NM_001126328, intron 6 of 10) intron (NM_001126328, intron 6 of 10) -9576 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 153.25-138 chr8 103645160 103645266 + 1.75 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -143303 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 325.5-19 chr2 144811813 144812121 + 1.75 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 144000 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 345-17 chr9 28679913 28680330 + 1.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) L1MA8|LINE|L1 39184 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 268-17 chr13 86667693 86667878 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -244135 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 327.75-28 chr8 117280435 117280633 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 145539 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 356.75 chr1 161834853 161835184 + 1.75 NA intron (NM_007348, intron 9 of 15) L1MC4a|LINE|L1 68698 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 171-24 chr12 3763144 3763307 + 1.75 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -10116 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 220.5-100 chr5 96114050 96114245 + 1.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 35009 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 194.25-33 chr14 77352664 77352855 + 1.75 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 21150 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 413.75-4 chr3 108825137 108825593 + 1.75 NA intron (NM_001317747, intron 1 of 4) intron (NM_001317747, intron 1 of 4) 2579 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 280.25-20 chr14 44924893 44925216 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001308112, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001308112, exon 5 of 5) -13137 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 496.5-3 chr4 65912486 65912992 + 1.75 NA Intergenic MSTB2-int|LTR|ERVL-MaLR -242244 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 218.25-27 chr14 52881112 52881331 + 1.75 NA intron (NM_006832, intron 5 of 14) intron (NM_006832, intron 5 of 14) 69829 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 332.75-23 chr8 108287342 108287635 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -38771 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 263-18 chr15 57391459 57391834 + 1.75 NA intron (NM_032866, intron 1 of 18) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 15141 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 334.25-18 chr4 118165691 118165929 + 1.75 NA intron (NM_004784, intron 6 of 13) L1MB1|LINE|L1 -112952 NR_003584 100093630 Hs.535762 NR_003584 ENSG00000269893 SNHG8 LINC00060|NCRNA00060 small nucleolar RNA host gene 8 ncRNA 221-16 chr12 41556593 41556784 + 1.75 NA intron (NM_001164595, intron 7 of 9) intron (NM_001164595, intron 7 of 9) 118949 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 165-49 chr15 101047024 101047186 + 1.75 NA intron (NM_024652, intron 21 of 33) intron (NM_024652, intron 21 of 33) 127748 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 383.75-4 chr2 173611621 173611938 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 256907 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 208.25-95 chr8 134886693 134886883 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 36853 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 223.75-30 chr15 97979963 97980215 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 19386 NM_183376 91947 Hs.6093 NM_183376 ENSG00000140450 ARRDC4 - arrestin domain containing 4 protein-coding 193-65 chr4 93500844 93500984 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 11 of 14) intron (NM_001286838, intron 11 of 14) -327839 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 256.5-43 chr3 65249676 65249949 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -561812 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 276-14 chr11 84886077 84886456 + 1.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 37155 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 235.75-37 chr2 162257659 162257852 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14310 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 341.75 chr1 45959672 45960040 + 1.75 NA intron (NM_001324320, intron 5 of 29) intron (NM_001324320, intron 5 of 29) 95508 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 260-22 chr3 79488233 79488597 + 1.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -19472 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 195.75-16 chr10 11257181 11257303 + 1.75 NA intron (NM_001025076, intron 4 of 13) intron (NM_001025076, intron 4 of 13) 87432 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 412-8 chr2 142877984 142878411 + 1.75 NA intron (NM_001032998, intron 1 of 11) intron (NM_001032998, intron 1 of 11) 533 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 457.25-2 chr3 97743305 97743647 + 1.75 NA intron (NM_001080448, intron 16 of 17) intron (NM_001080448, intron 16 of 17) -21045 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 361.5-24 chr8 59053656 59054016 + 1.75 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 65311 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 279-18 chr2 29922167 29922438 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_004304) promoter-TSS (NM_004304) -716 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 252.75-18 chr14 68117329 68117559 + 1.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 293852 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 208.5-23 chr11 82255781 82255972 + 1.75 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 148037 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 448.5-3 chr13 113868975 113869455 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 5038 NR_044993 100506394 Hs.132168 NR_044993 ENSG00000272695 GAS6-DT GAS6-AS2 GAS6 divergent transcript ncRNA 410-5 chr17 78061901 78062320 + 1.75 NA intron (NM_018996, intron 4 of 20) intron (NM_018996, intron 4 of 20) 49689 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 381-18 chr4 31642533 31642941 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 136193 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 135.75-43 chr12 29381788 29381899 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_016570) promoter-TSS (NM_016570) -671 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 272.75-38 chr4 151608246 151608466 + 1.75 NA intron (NM_001109977, intron 7 of 13) (TTTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 152651 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 317.25-11 chr14 48272253 48272512 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -477368 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 263-27 chr2 142603706 142603979 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -273822 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 425.75 chr21 24830467 24830863 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -9885 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 267.25-43 chr8 20723822 20724068 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -109019 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 257.5-83 chrX 130220696 130220965 + 1.75 NA intron (NM_017666, intron 12 of 18) intron (NM_017666, intron 12 of 18) 48069 NM_017666 55609 Hs.308418 NM_017666 ENSG00000056277 ZNF280C SUHW3|ZNF633|ZPET zinc finger protein 280C protein-coding 246.5-47 chr20 38299390 38299551 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -4680 NM_001725 671 Hs.529019 NM_001725 ENSG00000101425 BPI BPIFD1|rBPI bactericidal permeability increasing protein protein-coding 392.25-11 chr4 32858070 32858566 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 507280 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 363.5-8 chr14 71316765 71317009 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3589 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 314.5-28 chr8 116588980 116589309 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -62956 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 258.5-19 chr12 129036214 129036467 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -73350 NR_104173 283352 Hs.665667 NR_104172 ENSG00000249196 TMEM132D-AS1 - TMEM132D antisense RNA 1 ncRNA 192.25-90 chr5 138353865 138354117 + 1.75 NA intron (NM_016604, intron 1 of 23) intron (NM_016604, intron 1 of 23) 1306 NM_016604 51780 Hs.483486 NM_016604 ENSG00000120733 KDM3B 5qNCA|C5orf7|JMJD1B|NET22 lysine demethylase 3B protein-coding 215-66 chr6 96763105 96763366 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 74242 NM_030784 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 460-6 chr3 105330091 105330609 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36363 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 366.75-15 chr4 12729019 12729391 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 505754 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 134.75-156 chr4 46934203 46934300 + 1.75 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) intron (NM_001204267, intron 7 of 7) -25006 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 208.5-32 chr12 71521492 71521631 + 1.75 NA intron (NR_110596, intron 2 of 19) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 81763 NM_001277227 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 323.5-2 chr1 204381289 204381686 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11768 NR_027022 127841 Hs.213144 NR_027022 ENSG00000280924 LINC00628 - long intergenic non-protein coding RNA 628 ncRNA 276.5-21 chr13 84329786 84330028 + 1.75 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) L1MC5|LINE|L1 189305 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 179.25-73 chr2 49155326 49155444 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_181446) promoter-TSS (NM_181446) -858 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 325.5-41 chr9 79707871 79708157 + 1.75 NA intron (NM_001282748, intron 12 of 20) (CCTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -116516 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 287.25-18 chr14 59474888 59475121 + 1.75 NA non-coding (NR_138571, exon 4 of 5) non-coding (NR_138571, exon 4 of 5) 8571 NM_001331159 112849 Hs.729061 NM_144581 ENSG00000126790 L3HYPDH C14orf149 trans-L-3-hydroxyproline dehydratase protein-coding 455.75-2 chr18 61138723 61139331 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -194403 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 242-56 chr7 26654176 26654404 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 16419 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 363.5-15 chr3 127497432 127497855 + 1.75 NA TTS (NR_125397) TTS (NR_125397) 40137 NR_125397 101927149 Hs.407798 NR_125397 ENSG00000239921 LINC01471 - long intergenic non-protein coding RNA 1471 ncRNA 252.75-9 chr11 77548325 77548582 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -22636 NR_130930 646029 Hs.609654 NM_001039908 LOC646029 - uncharacterized LOC646029 ncRNA 377.75 chr1 80889389 80889808 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 248311 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 338-2 chr1 110632840 110633145 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1552 NM_001204269 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 197.25-46 chr2 4071389 4071571 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 97319 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 116-84 chr2 73423264 73423439 + 1.75 NA intron (NM_015120, intron 4 of 22) MIRc|SINE|MIR -33752 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 318.25-21 chr9 131088406 131088634 + 1.75 NA intron (NM_006059, intron 27 of 27) intron (NM_006059, intron 27 of 27) -7956 NR_033701 83543 Hs.4944 NM_031426 ENSG00000126878 AIF1L C9orf58|IBA2 allograft inflammatory factor 1 like protein-coding 300.5-51 chr8 100088270 100088554 + 1.75 NA intron (NM_015668, intron 3 of 27) intron (NM_015668, intron 3 of 27) 17214 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 300.5-21 chr17 79617865 79618172 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6967 NM_001350453 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 237.5-33 chr15 60174520 60174713 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 170305 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 343.5-22 chr7 52473552 52473989 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -561863 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 321.75-8 chr13 54954200 54954445 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -220132 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 278.25-58 chr8 125552067 125552289 + 1.75 NA Intergenic MamRep564|Unknown|Unknown 119969 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 286-5 chr11 13084781 13085062 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 75605 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 242.25-73 chr5 169026110 169026291 + 1.75 NA intron (NR_109897, intron 1 of 4) intron (NR_109897, intron 1 of 4) 12973 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 224.5-34 chr14 54509704 54509867 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_006568) promoter-TSS (NM_006568) -121 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 276-49 chr8 119775395 119775869 + 1.75 NA intron (NM_003184, intron 18 of 25) AluSz|SINE|Alu 57209 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 395.75-10 chr4 32267475 32267861 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -83370 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 175.25-104 chr4 53451386 53451550 + 1.75 NA intron (NM_001134938, intron 12 of 14) intron (NM_001134938, intron 12 of 14) -48609 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 257.25-58 chr8 122474838 122475087 + 1.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 93682 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 200.5-36 chr14 60961278 60961511 + 1.75 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L2b|LINE|L2 19685 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 243.75-35 chr16 83921469 83921681 + 1.75 NA 3' UTR (NM_012213, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_012213, exon 5 of 5) 22460 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 241.75-6 chr10 53319210 53319590 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -547700 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 237.25-72 chr8 58748266 58748512 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -88536 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 268.25-29 chr21 26594485 26594883 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -21398 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 258.25-51 chr6 61731030 61731245 + 1.75 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) intron (NR_146872, intron 7 of 9) 157007 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 250.75-65 chr8 40922346 40922600 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -24647 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 369.25-2 chr11 9361364 9361626 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -23157 NM_006391 10527 Hs.744911 NM_006391 ENSG00000205339 IPO7 Imp7|RANBP7 importin 7 protein-coding 182.25-138 chrX 136055932 136056048 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 70555 NM_006359 10479 Hs.62185 NM_006359 ENSG00000198689 SLC9A6 MRSA|NHE6 solute carrier family 9 member A6 protein-coding 150.75-142 chr4 64119571 64119711 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 289809 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 281-29 chr5 107990520 107990804 + 1.75 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) MIR|SINE|MIR -319725 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 255-53 chr6 138978671 138978871 + 1.75 NA intron (NM_031922, intron 1 of 19) L2|LINE|L2 9490 NM_001128617 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 391.5-17 chr8 80527103 80527588 + 1.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 41119 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 397.25-15 chr8 138661904 138662257 + 1.75 NA exon (NM_152888, exon 43 of 65) exon (NM_152888, exon 43 of 65) -164350 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 356.5-7 chr12 22251930 22252304 + 1.75 NA intron (NM_001304450, intron 2 of 3) intron (NM_001304450, intron 2 of 3) 82597 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 304.75-17 chr2 153731440 153731655 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -140375 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 430-11 chr21 27762390 27762661 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 40146 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 166.25-29 chr11 22422760 22422881 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 69199 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 446.75 chr1 60143585 60143909 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -69977 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 251-38 chr3 3844880 3845147 + 1.75 NA exon (NM_020873, exon 2 of 2) exon (NM_020873, exon 2 of 2) -44138 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 293.75-46 chr8 135526406 135526703 + 1.75 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 69098 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 307.75-19 chr5 73142667 73142962 + 1.75 NA intron (NR_134252, intron 1 of 1) L1MC5a|LINE|L1 7778 NR_134252 105379030 NR_134252 ENSG00000251599 LOC105379030 - uncharacterized LOC105379030 ncRNA 317-14 chr2 14792258 14792635 + 1.75 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger 159729 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 251.75-76 chr8 17170448 17170648 + 1.75 NA intron (NM_001362989, intron 1 of 12) intron (NM_001362989, intron 1 of 12) 13384 NM_001362989 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 166.25-65 chr18 639599 639849 + 1.75 NA intron (NM_199167, intron 6 of 8) AluSz6|SINE|Alu -17929 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 265.5-26 chr15 56246582 56247045 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1731 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 354.25 chr1 44578424 44578838 + 1.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) L3b|LINE|CR1 33138 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 388.75-7 chr4 164335955 164336319 + 1.75 NA intron (NM_001166373, intron 1 of 7) intron (NM_001166373, intron 1 of 7) 47118 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 268.25-42 chr5 159757769 159757941 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 113529 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 252.25-19 chr14 71927089 71927308 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -4973 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 404.5-7 chr6 47231204 47231753 + 1.75 NA TTS (NM_014452) TTS (NM_014452) 78427 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 406.25-6 chr8 15609674 15609937 + 1.75 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) intron (NM_001356429, intron 1 of 10) 69542 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 410-4 chr17 40777025 40777403 + 1.75 NA intron (NM_181537, intron 7 of 7) intron (NM_181537, intron 7 of 7) -5055 NM_181539 353288 Hs.592133 NM_181539 ENSG00000186393 KRT26 CK26|K25|K25IRS2|K26|KRT25B keratin 26 protein-coding 238-11 chr11 4990275 4990594 + 1.75 NA intron (NM_021801, intron 2 of 5) intron (NM_021801, intron 2 of 5) 2243 NM_021801 56547 Hs.204732 NM_021801 ENSG00000167346 MMP26 - matrix metallopeptidase 26 protein-coding 476 chr10 5202257 5202634 + 1.75 NA intron (NM_001818, intron 2 of 8) L1PB2|LINE|L1 5608 NM_001818 1109 Hs.567245 NM_001818 ENSG00000198610 AKR1C4 3-alpha-HSD|C11|CDR|CHDR|DD-4|DD4|HAKRA aldo-keto reductase family 1 member C4 protein-coding 572.75-2 chr18 2782965 2783615 + 1.75 NA intron (NM_015295, intron 44 of 47) intron (NM_015295, intron 44 of 47) -63716 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 501.25-2 chr2 123969551 123970027 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 55385 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 337.5-20 chr3 118585315 118585553 + 1.75 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -56334 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 265.25-24 chr2 58488905 58489149 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -31726 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 381.5-7 chr6 102707823 102708120 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1308986 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 287.25-37 chr5 23087312 23087730 + 1.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -234177 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 562-2 chr7 42713528 42714186 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7410 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 343.25 chr1 94222777 94223204 + 1.75 NA intron (NM_001328665, intron 1 of 21) AluY|SINE|Alu 14594 NM_004815 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 360.5-9 chr20 24223386 24223655 + 1.75 NA intron (NR_040102, intron 3 of 3) MER57-int|LTR|ERV1 23753 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 388-7 chr21 29874571 29875043 + 1.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 65189 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 409.25-5 chr3 97775915 97776330 + 1.75 NA intron (NR_136602, intron 2 of 7) L1MA4|LINE|L1 11364 NM_001323514 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 346-24 chr9 72345401 72345779 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 18966 NM_001278245 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 242.25-27 chr14 60512491 60512794 + 1.75 NA 3' UTR (NM_007374, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_007374, exon 2 of 2) 3496 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 239.75-40 chr21 20866233 20866459 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -63238 NR_109787 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 411.25-3 chr13 99622269 99622613 + 1.75 NA intron (NR_104592, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 15751 NR_104592 171425 Hs.655642 NM_206808 ENSG00000125246 CLYBL CLB citrate lyase beta like protein-coding 397.5-8 chr5 62728215 62728669 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 149623 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 352.5-28 chr7 46080897 46081219 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -159786 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 245-70 chr8 106433709 106433948 + 1.75 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 -14096 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 272.5-32 chr17 80074019 80074403 + 1.75 NA intron (NM_017950, intron 10 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -24617 NR_039607 100616121 NR_039607 ENSG00000265561 MIR1268B - microRNA 1268b ncRNA 197.25-76 chr4 65424308 65424493 + 1.75 NA intron (NM_001281767, intron 5 of 16) intron (NM_001281767, intron 5 of 16) 245088 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 623.75-2 chr18 2092360 2092995 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 478828 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 128-154 chr7 93781580 93781684 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 64704 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 212.75-64 chr3 73657947 73658214 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33139 NM_015009 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 231.5-103 chr8 130458971 130459124 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15373 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 320-33 chr6 47333995 47334299 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -24242 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 468-2 chr10 120758793 120759192 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 92187 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 354.5-5 chr12 32519236 32519497 + 1.75 NA intron (NM_001370297, intron 1 of 14) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -14927 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 201-45 chr2 136645379 136645585 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -120063 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 165.5-58 chr15 96267459 96267704 + 1.75 NA intron (NR_102743, intron 7 of 7) intron (NR_102743, intron 7 of 7) -58465 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 275-36 chr5 52770476 52770705 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -17326 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 209.5-89 chr3 338882 339156 + 1.75 NA intron (NM_001253388, intron 3 of 24) intron (NM_001253388, intron 3 of 24) 19336 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 400.75-4 chr2 68014000 68014423 + 1.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 48793 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 236.75-58 chr8 21601603 21601854 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 187147 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 220.25-36 chr2 163637904 163638058 + 1.75 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 98027 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 277.75-18 chr20 44194576 44194748 + 1.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -7084 NM_020433 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 260.25-43 chr6 109462446 109462669 + 1.75 NA TTS (NM_014797) TTS (NM_014797) 3411 NM_001286613 64780 Hs.33476 NM_022765 ENSG00000135596 MICAL1 MICAL|MICAL-1|NICAL microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 1 protein-coding 608.25 chr5 92069548 92070074 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -686494 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 250-24 chr2 81122113 81122367 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 344706 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 175.5-2 chr1 57063635 57063881 + 1.75 NA intron (NM_001365793, intron 8 of 14) intron (NM_001365793, intron 8 of 14) -97618 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 279.75-32 chr3 39809073 39809340 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_015460) promoter-TSS (NM_015460) 292 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 272.5-45 chr21 22765406 22765629 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -313767 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 334.75-12 chr2 23407043 23407569 + 1.75 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 22127 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 296-27 chr2 138777189 138777474 + 1.75 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 3059 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 252.75-41 chr22 27568703 27568865 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 232972 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 480-3 chr21 30127088 30127858 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39332 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 426-14 chr8 89816455 89816900 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 58861 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 547.5-5 chr2 103255425 103256152 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -271359 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 182.25-89 chr5 11135296 11135479 + 1.75 NA intron (NM_001288715, intron 11 of 20) intron (NM_001288715, intron 11 of 20) -374153 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 411.75 chr1 76046090 76046349 + 1.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -28527 NM_001349107 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 338.5-11 chr19 28369196 28369470 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -237355 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 149.25-174 chr8 30470647 30470762 + 1.75 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -85303 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 484 chr12 10522030 10522366 + 1.75 NA intron (NM_001357731, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 16305 NM_001357734 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 264.5-25 chr17 27270935 27271098 + 1.75 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 22980 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 367.75-2 chr1 216296945 216297263 + 1.75 NA intron (NM_206933, intron 9 of 71) MIRb|SINE|MIR 126292 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 222.25-15 chr12 115057217 115057348 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -373107 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 260.25-21 chr2 24691948 24692206 + 1.75 NA intron (NM_001362950, intron 9 of 23) intron (NM_001362950, intron 9 of 23) -101038 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 416.25-10 chr2 100434141 100434562 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16683 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 331.25-12 chr22 41415672 41415989 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 30971 NM_016272 10766 Hs.474978 NM_016272 ENSG00000183864 TOB2 APRO5|TOB4|TOBL|TROB2 transducer of ERBB2, 2 protein-coding 349.5-3 chr11 113458074 113458349 + 1.75 NA intron (NM_016574, intron 1 of 6) intron (NM_016574, intron 1 of 6) -8123 NR_036183 100422855 NR_036183 ENSG00000265140 MIR4301 - microRNA 4301 ncRNA 329-42 chr8 122982921 122983217 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42703 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 413.5-7 chr4 27769800 27770051 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 552446 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 259.25-20 chr2 61956028 61956220 + 1.75 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) MER106B|DNA|hAT-Charlie 50482 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 413 chr1 212857746 212858227 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_014053) promoter-TSS (NM_014053) 152 NR_027286 642946 Hs.552649 NR_027285 ENSG00000198468 FLVCR1-DT FLVCR1-AS1|LQK1|NCRNA00292 FLVCR1 divergent transcript ncRNA 376.75-6 chr16 74965442 74965686 + 1.75 NA intron (NM_001324172, intron 2 of 13) intron (NM_001324172, intron 2 of 13) 19559 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 257.25-43 chr5 91583328 91583746 + 1.75 NA Intergenic (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -200220 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 311.25-4 chr11 97119957 97120208 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 611657 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 289.75-31 chr8 91302237 91302441 + 1.75 NA intron (NM_134266, intron 4 of 18) intron (NM_134266, intron 4 of 18) 53020 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 310.5 chr1 45064755 45065173 + 1.75 NA intron (NM_020883, intron 2 of 13) intron (NM_020883, intron 2 of 13) 52710 NR_036510 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 382-12 chr2 187719552 187719956 + 1.75 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -165249 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 228-30 chr15 51493858 51494013 + 1.75 NA intron (NM_001174116, intron 19 of 42) (TTTTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 116689 NM_001330297 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 430-3 chr10 72959850 72960126 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5182 NM_032562 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 320-27 chr3 76026390 76026721 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -241006 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 296.5-15 chr17 82452520 82452830 + 1.75 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -1844 NR_036517 79415 Hs.163113 NM_001033046 ENSG00000178927 CYBC1 C17orf62|Eros cytochrome b-245 chaperone 1 protein-coding 379.25-15 chr7 36588232 36588470 + 1.75 NA intron (NM_001177507, intron 11 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 11769 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 406.25-2 chr22 34535689 34536058 + 1.75 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 462043 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 334-23 chr4 121082031 121082234 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9597 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 118-145 chr5 35437835 35437911 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -179990 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 223-40 chr2 63548175 63548313 + 1.75 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) L1MEd|LINE|L1 40233 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 366.25-3 chr10 36506453 36506770 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -619246 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 369.5-19 chr3 59452555 59452843 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 205798 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 580.75-2 chr15 43469114 43469926 + 1.75 NA intron (NM_001355001, intron 11 of 28) intron (NM_001355001, intron 11 of 28) 23636 NM_001141980 7158 Hs.440968 NM_005657 ENSG00000067369 TP53BP1 53BP1|TDRD30|p202|p53BP1 tumor protein p53 binding protein 1 protein-coding 307.25-18 chr2 119364895 119365226 + 1.75 NA intron (NM_001322329, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 1682 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 383.75-7 chr7 68687904 68688325 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 667861 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 312.75-9 chr14 62826018 62826237 + 1.75 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 219331 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 257.5-49 chr3 89806658 89807055 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 699235 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 134.5-242 chr9 82263642 82263750 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 274924 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 344-28 chr8 101115665 101115944 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 63750 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 385.5-24 chr9 30126795 30127120 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 281497 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 351.5-12 chr16 59249825 59250179 + 1.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 505189 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 368.75-10 chr5 42776589 42777135 + 1.75 NA intron (NM_001134848, intron 4 of 8) L1MCa|LINE|L1 20044 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 173-39 chr12 128700033 128700181 + 1.75 NA intron (NM_001136103, intron 8 of 8) intron (NM_001136103, intron 8 of 8) 123851 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 286.75-11 chr12 118573762 118574059 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 187769 NR_134999 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 310.5-4 chr1 112468975 112469272 + 1.75 NA intron (NM_001291880, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 2582 NM_001291880 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 131.5-172 chr4 44094207 44094296 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 77189 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 383.25-4 chr14 27367614 27367994 + 1.75 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -244784 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 335.25-24 chr3 21220434 21220921 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -185049 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 351.5-26 chr7 4849520 4849900 + 1.75 NA intron (NM_018059, intron 2 of 14) Kanga1d|DNA|TcMar-Tc2 -12260 NR_145804 109623455 NR_145804 SNORD165 - small nucleolar RNA, C/D box 165 snoRNA 273.5-55 chr4 131116510 131116928 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -648119 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 286.5-51 chr4 98395520 98395789 + 1.75 NA intron (NM_021159, intron 6 of 14) intron (NM_021159, intron 6 of 14) 134270 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 281.25-43 chr8 84795387 84795593 + 1.75 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) intron (NM_001354322, intron 3 of 6) 89563 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 254-38 chr5 86433373 86433582 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 151033 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 365.25-6 chr20 59947372 59947670 + 1.75 NA 3' UTR (NM_022106, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_022106, exon 4 of 4) 7132 NM_022106 63939 Hs.54973 NM_022106 ENSG00000196227 FAM217B C20orf177|dJ551D2.5 family with sequence similarity 217 member B protein-coding 470.5-11 chr7 3347920 3348402 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 46909 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 223-52 chr3 29913727 29914096 + 1.75 NA intron (NM_001003793, intron 10 of 14) intron (NM_001003793, intron 10 of 14) 20245 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 281.5-2 chr1 206870636 206871091 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 5054 NM_018724 50604 Hs.272373 NM_018724 ENSG00000162891 IL20 IL-20|IL10D|ZCYTO10 interleukin 20 protein-coding 166-117 chr7 70815814 70815919 + 1.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -316278 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 193.5-28 chr12 14701303 14701501 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -4803 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 169-15 chr11 71431095 71431228 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7807 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 333.5-2 chr10 43437832 43438154 + 1.75 NA intron (NM_001355444, intron 1 of 3) intron (NM_001355444, intron 1 of 3) 882 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 374.5-10 chr2 127147522 127147859 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -40536 NM_139345 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 363.25-10 chr6 144758517 144758989 + 1.75 NA intron (NM_007124, intron 57 of 73) intron (NM_007124, intron 57 of 73) 353098 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 302.75-32 chrX 95798898 95799247 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 538830 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 195.75-82 chr3 184799383 184799556 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12674 NM_001349292 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 325-15 chr21 28150123 28150390 + 1.75 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) intron (NR_126012, intron 5 of 5) 59853 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 275-11 chr14 70423744 70424068 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -6816 NM_018373 55333 Hs.443661 NM_018373 ENSG00000213463 SYNJ2BP ARIP2|OMP25 synaptojanin 2 binding protein protein-coding 365.75-9 chr2 105666602 105666967 + 1.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -56225 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 217.25-37 chr2 10221490 10221672 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28910 NR_036222 100422929 NR_036222 ENSG00000265418 MIR4261 - microRNA 4261 ncRNA 215.25-41 chr18 69251115 69251274 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -149694 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 317.5-28 chr6 168547182 168547575 + 1.75 NA intron (NM_001166412, intron 6 of 12) L1MA9|LINE|L1 106194 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 166.25-150 chr9 85946132 85946265 + 1.75 NA intron (NM_024635, intron 2 of 22) AluJr|SINE|Alu 4669 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 122.25-133 chr3 178457444 178457633 + 1.75 NA TTS (NR_046786) TTS (NR_046786) 38337 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 350.25-5 chr10 106721667 106721892 + 1.75 NA intron (NM_001206569, intron 6 of 25) intron (NM_001206569, intron 6 of 25) 442927 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 267.75-66 chr9 89596463 89596727 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -8417 NM_006705 10912 Hs.9701 NM_006705 ENSG00000130222 GADD45G CR6|DDIT2|GADD45gamma|GRP17 growth arrest and DNA damage inducible gamma protein-coding 220.5-65 chr20 47318792 47319141 + 1.75 NA non-coding (NR_024594, exon 1 of 1) non-coding (NR_024594, exon 1 of 1) 464 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 353-20 chr5 163490196 163490542 + 1.75 NA intron (NR_109892, intron 2 of 3) intron (NR_109892, intron 2 of 3) 3689 NR_109892 101927813 Hs.726818 NR_109892 HMMR-AS1 - HMMR antisense RNA 1 ncRNA 304-16 chr16 20361007 20361322 + 1.75 NA intron (NM_174924, intron 10 of 11) intron (NM_174924, intron 10 of 11) -8286 NM_003361 7369 Hs.654425 NM_003361 ENSG00000169344 UMOD ADMCKD2|FJHN|HNFJ|HNFJ1|MCKD2|THGP|THP uromodulin protein-coding 291.75-26 chr21 15642251 15642487 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -87565 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 341-16 chr2 186224792 186225029 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -138593 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 489-5 chr4 85288443 85288770 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -186544 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 338-5 chr10 63699809 63700045 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -178037 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 470.5-12 chr9 21725988 21726354 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -76465 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 202.5-133 chr7 14310653 14310846 + 1.75 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -319324 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 361-10 chr14 76818982 76819371 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -6294 NM_015305 23357 Hs.497448 NM_015305 ENSG00000013523 ANGEL1 Ccr4e|KIAA0759 angel homolog 1 protein-coding 125.25-53 chr13 50617961 50618053 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -90558 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 328.75 chr10 28519819 28520160 + 1.75 NA TTS (NR_033805) TTS (NR_033805) 12365 NR_033805 220906 Hs.403253 NR_033805 WAC-AS1 - WAC antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 258.25-7 chr10 13646183 13646436 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001318337, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001318337, exon 24 of 24) 59344 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 272.5-28 chr15 57982673 57982983 + 1.75 NA intron (NM_170696, intron 6 of 11) intron (NM_170696, intron 6 of 11) 31195 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 245.5-5 chr1 170016103 170016360 + 1.75 NA intron (NM_014970, intron 10 of 19) intron (NM_014970, intron 10 of 19) 52684 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 343-9 chr14 84973999 84974284 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -297791 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 376.75-14 chr4 76009679 76010135 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1273 NM_001130017 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 268-48 chr5 177556392 177556675 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -1970 NM_001190946 54540 Hs.484289 NM_019057 ENSG00000146067 FAM193B IRIZIO family with sequence similarity 193 member B protein-coding 252.25-65 chr9 31615810 31616013 + 1.75 NA Intergenic (TAATGCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -234421 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 287-10 chr12 41522183 41522500 + 1.75 NA intron (NM_001164595, intron 5 of 9) intron (NM_001164595, intron 5 of 9) 84602 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 420.25-12 chr5 149553325 149553695 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2071 NM_001271741 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 404.75-2 chr15 68144045 68144538 + 1.75 NA intron (NM_016166, intron 4 of 13) intron (NM_016166, intron 4 of 13) 61819 NM_001286694 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 368.25-17 chr8 79772858 79773251 + 1.75 NA intron (NR_110954, intron 4 of 5) intron (NR_110954, intron 4 of 5) 4912 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 437.5-8 chr7 35877666 35878059 + 1.75 NA intron (NM_001363715, intron 6 of 13) L2c|LINE|L2 76643 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 232-70 chr6 165032026 165032230 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -210065 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 421.25-12 chr9 69784418 69784712 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -24554 NR_159517 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 435.25-6 chr8 92287317 92287714 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -184130 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 261-62 chr8 88036266 88036526 + 1.75 NA 3' UTR (NM_005941, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_005941, exon 10 of 10) -162381 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 287.75-30 chr2 116381620 116381944 + 1.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 1037967 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 172.5-125 chr3 87800926 87801113 + 1.75 NA intron (NM_001322208, intron 1 of 2) intron (NM_001322208, intron 1 of 2) 8313 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 442.25-4 chr20 41174648 41174977 + 1.75 NA 3' UTR (NM_002660, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_002660, exon 32 of 32) 5789 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 364.25-26 chr8 113502130 113502385 + 1.75 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 -65318 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 392.75-10 chr8 31439749 31440170 + 1.75 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -199793 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 253.5-12 chr10 114997958 114998248 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 3446 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 503.25 chr14 68365380 68365824 + 1.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 263185 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 328.25-8 chr14 51319228 51319593 + 1.75 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) intron (NR_145423, intron 1 of 1) 8975 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 207.75-93 chr4 128590656 128590851 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 162737 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 268.75-40 chr6 21737696 21737893 + 1.75 NA intron (NR_015410, intron 2 of 11) intron (NR_015410, intron 2 of 11) 71381 NR_015410 401237 Hs.712707 NR_015410 CASC15 CANT|LINC00340|lnc-SOX4-1 cancer susceptibility 15 ncRNA 263-53 chr8 115169214 115169389 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 498712 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 300.25-6 chr10 63301876 63302258 + 1.75 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu -32824 NM_001322254 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 267-18 chr15 59292528 59292701 + 1.75 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) intron (NM_004998, intron 1 of 27) 80257 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 401-11 chr3 37301068 37301633 + 1.75 NA intron (NM_001172713, intron 10 of 22) intron (NM_001172713, intron 10 of 22) -57155 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 311-17 chr2 73777353 73777636 + 1.75 NA intron (NM_003584, intron 2 of 8) intron (NM_003584, intron 2 of 8) 2663 NM_003584 8446 Hs.14611 NM_003584 ENSG00000144048 DUSP11 PIR1 dual specificity phosphatase 11 protein-coding 528 chr17 19826998 19827554 + 1.75 NA intron (NM_014683, intron 10 of 26) MIR|SINE|MIR 40660 NM_014683 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 176.75-22 chr11 80330016 80330228 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 432681 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 236.25-12 chr10 97906421 97906605 + 1.75 NA intron (NM_001206528, intron 6 of 14) intron (NM_001206528, intron 6 of 14) -30616 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 155.5-221 chr9 107874103 107874226 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -384395 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 279.25-36 chr6 79679033 79679266 + 1.75 NA intron (NM_031469, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 47820 NM_031469 83699 Hs.302772 NM_031469 ENSG00000198478 SH3BGRL2 - SH3 domain binding glutamate rich protein like 2 protein-coding 285.25-30 chr5 146488233 146488638 + 1.75 NA intron (NM_006706, intron 14 of 21) L1MA5A|LINE|L1 27678 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 176.75-120 chr8 71997003 71997155 + 1.75 NA intron (NR_033652, intron 4 of 4) intron (NR_033652, intron 4 of 4) 78505 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 307.25-10 chr15 33064760 33065088 + 1.75 NA intron (NM_001277313, intron 6 of 20) intron (NM_001277313, intron 6 of 20) 3250 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 262.25-32 chr4 35983762 35984034 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 260041 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 264.75-50 chr6 158086261 158086522 + 1.75 NA intron (NM_003898, intron 22 of 26) intron (NM_003898, intron 22 of 26) 69298 NM_001178088 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 261.5-21 chr15 101661703 101661989 + 1.75 NA intron (NM_152334, intron 15 of 18) intron (NM_152334, intron 15 of 18) -9455 NM_001308026 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 276.5-65 chr8 70213804 70214024 + 1.75 NA exon (NM_001321707, exon 4 of 23) exon (NM_001321707, exon 4 of 23) -142662 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 262.25-40 chr5 153691254 153691465 + 1.75 NA intron (NM_000827, intron 8 of 15) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 199187 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 403.25-3 chr13 108814261 108814746 + 1.75 NA intron (NM_015011, intron 7 of 34) intron (NM_015011, intron 7 of 34) 184892 NM_001198950 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 233-60 chr8 113576707 113576938 + 1.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -139883 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 382-8 chr19 31825186 31825504 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -200517 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 355.25-5 chr2 53154944 53155439 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -452576 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 201.25-35 chr15 64302505 64302697 + 1.75 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) intron (NM_001329606, intron 1 of 11) 53572 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 407-15 chrX 101627489 101627766 + 1.75 NA 3' UTR (NM_177947, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_177947, exon 5 of 5) 4266 NM_177948 51566 Hs.592225 NM_016607 ENSG00000102401 ARMCX3 ALEX3|GASP6|dJ545K15.2 armadillo repeat containing X-linked 3 protein-coding 362.5-17 chr4 34146200 34146502 + 1.75 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) intron (NR_147184, intron 2 of 3) -106458 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 298-14 chr18 27560838 27561125 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -218325 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 255.25-32 chr3 17462136 17462298 + 1.75 NA intron (NM_014744, intron 3 of 21) intron (NM_014744, intron 3 of 21) 237803 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 353.75-10 chr2 237006498 237006762 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 49537 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 464.25 chr15 56360451 56360878 + 1.75 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -4760 NM_001286449 374618 Hs.511476 NM_198524 ENSG00000151575 TEX9 - testis expressed 9 protein-coding 320.75-9 chr17 32558307 32558531 + 1.75 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) intron (NM_015194, intron 21 of 21) 71426 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 376.75-2 chr1 151932533 151932916 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23213 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 451.25 chr22 19991812 19992202 + 1.75 NA intron (NM_001670, intron 2 of 19) intron (NM_001670, intron 2 of 19) 24816 NM_001670 421 Hs.713616 NM_001670 ENSG00000099889 ARVCF - ARVCF delta catenin family member protein-coding 389.5-6 chr16 68343173 68343746 + 1.75 NA intron (NR_147058, intron 9 of 18) X7A_LINE|LINE|CR1 32345 NM_001290018 54496 Hs.640229 NM_019023 ENSG00000132600 PRMT7 SBIDDS protein arginine methyltransferase 7 protein-coding 329.5-25 chr6 24070457 24070940 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -55517 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 123.5-85 chr18 11411236 11411331 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -43195 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 277.25-23 chr2 72695004 72695314 + 1.75 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 130874 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 172.5-74 chr15 60652650 60652859 + 1.75 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -25224 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 358.75-5 chr2 36881542 36881768 + 1.75 NA intron (NM_003162, intron 9 of 17) intron (NM_003162, intron 9 of 17) 84881 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 326.75-3 chr1 228825004 228825320 + 1.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 89683 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 416.5 chr10 49067592 49068012 + 1.75 NA intron (NM_001031746, intron 4 of 7) MIR|SINE|MIR 47720 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 523-2 chr7 26820365 26820734 + 1.75 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 37174 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 286.5-58 chr6 162827439 162827632 + 1.75 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 99565 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 225.5-61 chr2 192306878 192307141 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -112076 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 284.75-11 chr13 92780976 92781172 + 1.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -59460 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 178.25-119 chr8 84981838 84982006 + 1.75 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -125316 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 289.75-13 chr2 7377125 7377415 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -43991 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 354.5-20 chr7 152158982 152159294 + 1.75 NA intron (NM_170606, intron 43 of 58) intron (NM_170606, intron 43 of 58) 84101 NM_001371474 221-43 chr2 227969000 227969298 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 97518 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 220-31 chr2 30380400 30380551 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 33829 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 350-14 chr5 52081402 52081730 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 73535 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 220.25-33 chr2 112123738 112123903 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -14565 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 343-13 chr2 60961739 60962007 + 1.75 NA intron (NM_144709, intron 9 of 17) intron (NM_144709, intron 9 of 17) 55339 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 370.5-2 chr1 187511817 187512241 + 1.75 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 68401 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 336-8 chr16 63053253 63053518 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1016947 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 317.75-6 chr11 5137445 5137768 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -4964 NM_001005160 390054 Hs.546593 NM_001005160 ENSG00000171944 OR52A5 OR11-33 olfactory receptor family 52 subfamily A member 5 protein-coding 363.75-17 chr6 54073635 54074020 + 1.75 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) -26233 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 477-4 chr2 142082334 142082778 + 1.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 49145 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 202.5-75 chr2 99469455 99469699 + 1.75 NA intron (NR_135652, intron 1 of 21) intron (NR_135652, intron 1 of 21) 20440 NR_135650 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 231.25-49 chr21 17081062 17081385 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -357667 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 239.25-14 chr11 81773284 81773562 + 1.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 117413 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 380.75-2 chr2 43591809 43592050 + 1.75 NA intron (NM_001083953, intron 3 of 37) intron (NM_001083953, intron 3 of 37) 4045 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 215.75-52 chr2 133088476 133088739 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) MER20B|DNA|hAT-Charlie 173050 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 431-2 chr14 61948377 61949068 + 1.75 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) intron (NM_001367663, intron 1 of 7) 21027 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 302.25-13 chr17 66369560 66369842 + 1.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 47153 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 334-6 chr11 73105020 73105241 + 1.75 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) MIRc|SINE|MIR 37188 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 315.5-25 chr7 48263699 48264048 + 1.75 NA intron (NM_152701, intron 15 of 61) L1ME1|LINE|L1 92415 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 184.5-24 chr11 35089484 35089645 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 48468 NR_120528 100507144 Hs.673491 NR_120528 ENSG00000255521 LOC100507144 - uncharacterized LOC100507144 ncRNA 405 chr1 86303017 86303305 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 54526 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 336.5-14 chr2 72046591 72046929 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 101102 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 428.75 chr10 58381672 58382393 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3111 NR_073073 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 293 chr1 114805819 114806048 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25248 NR_049741 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 279.75-9 chr11 65202087 65202382 + 1.75 NA intron (NR_040008, intron 9 of 20) intron (NR_040008, intron 9 of 20) -11606 NR_033396 440044 Hs.532372 NM_001004326 ENSG00000197847 SLC22A20P Oat6|SLC22A20 solute carrier family 22 member 20, pseudogene pseudo 477 chr1 228501552 228502512 + 1.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 10256 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 372.5-7 chr16 77026660 77027052 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 157920 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 386.5-13 chr7 31434945 31435488 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -78855 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 193-56 chr3 170485726 170485885 + 1.75 NA intron (NM_020949, intron 5 of 7) intron (NM_020949, intron 5 of 7) 18520 NR_135557 101928583 Hs.407600 NR_135555 ENSG00000285051 SLC7A14-AS1 - SLC7A14 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-71 chr16 75599765 75599895 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001324453, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001324453, exon 7 of 7) 23451 NM_001324453 23536 Hs.729312 NM_012091 ENSG00000065457 ADAT1 HADAT1 adenosine deaminase tRNA specific 1 protein-coding 334.25-8 chr14 72259278 72259557 + 1.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER102c|DNA|hAT-Charlie -257403 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 156-30 chr12 3208649 3208778 + 1.75 NA intron (NM_001168320, intron 2 of 7) intron (NM_001168320, intron 2 of 7) 131334 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 274.25-34 chr4 36776262 36776464 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -134463 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 169.75-99 chr22 48412778 48412885 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -76722 NM_001082967 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 210.25-91 chrX 54919893 54920195 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_016157) promoter-TSS (NM_016157) -519 NM_001271183 7216 Hs.633653 NM_016157 ENSG00000067445 TRO MAGE-d3|MAGED3 trophinin protein-coding 235-46 chr3 162420875 162421070 + 1.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 882329 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 308.75-4 chr10 49369488 49369734 + 1.75 NA intron (NM_001276451, intron 6 of 6) L1MB2|LINE|L1 26478 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 312-2 chr1 198874340 198874598 + 1.75 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) -15316 NR_029626 406995 NR_029626 ENSG00000207759 MIR181A1 MIR213|MIRN181A1|MIRN213|hsa-mir-181a-1|mir-181a-1|mir-213 microRNA 181a-1 ncRNA 404-5 chr5 83628859 83629096 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -66663 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 431.5-7 chr5 129423968 129424467 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27070 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 136.25-10 chr10 24989913 24990033 + 1.75 NA intron (NM_001270383, intron 4 of 5) intron (NM_001270383, intron 4 of 5) 26185 NM_145010 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 508-2 chr18 12376682 12376997 + 1.75 NA intron (NM_006796, intron 1 of 16) CpG 437 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 219-3 chr1 62785697 62785864 + 1.75 NA intron (NM_032852, intron 1 of 10) intron (NM_032852, intron 1 of 10) 1648 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 354-7 chr13 88713458 88713835 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 86793 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 385.25-5 chr19 46093002 46093423 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15583 NR_163175 444882 Hs.531310 NM_001002923 ENSG00000204869 IGFL4 - IGF like family member 4 protein-coding 141.75-153 chr6 78611008 78611160 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71775 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 253.5-79 chr8 129810977 129811222 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -24475 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 306-33 chr5 23832905 23833239 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -118276 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 233-62 chr8 124233619 124233839 + 1.75 NA intron (NR_125420, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 13669 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 393.25-4 chr2 167144867 167145210 + 1.75 NA intron (NM_152381, intron 3 of 10) intron (NM_152381, intron 3 of 10) -4083 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 241.5-2 chr1 102886363 102886532 + 1.75 NA intron (NM_001854, intron 63 of 66) intron (NM_001854, intron 63 of 66) 222049 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 248.75-13 chr12 26367517 26367749 + 1.75 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) intron (NM_002223, intron 55 of 56) 172060 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 238.5-15 chr11 24828116 24828298 + 1.75 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 331154 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 311.75-15 chr3 3933765 3934052 + 1.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -133033 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 341.25-23 chr7 26663834 26664109 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 26100 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 190.5-29 chr11 116952823 116953074 + 1.75 NA intron (NM_001281748, intron 3 of 24) L3|LINE|CR1 -114998 NM_001318021 335 Hs.93194 NM_000039 ENSG00000118137 APOA1 apo(a) apolipoprotein A1 protein-coding 565.75 chr1 89040967 89041685 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -18460 NM_018284 2635 Hs.720167 NM_018284 ENSG00000117226 GBP3 - guanylate binding protein 3 protein-coding 202.5-34 chr12 125218876 125219041 + 1.75 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) L1MB5|LINE|L1 32572 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 351-25 chr7 48457325 48457594 + 1.75 NA intron (NM_152701, intron 43 of 61) intron (NM_152701, intron 43 of 61) 286001 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 240.5-37 chr16 54777998 54778215 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 70127 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 285-29 chr3 7553695 7554000 + 1.75 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -18563 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 363-9 chr21 16431312 16431672 + 1.75 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) intron (NR_136550, intron 1 of 3) 11197 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 212.25-80 chr6 67809679 67809841 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -245591 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 274.25-40 chr6 12886258 12886542 + 1.75 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) -70956 NM_001322311 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 550.75 chr10 72633719 72634201 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7769 NM_006077 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 225.75-6 chr1 156052919 156053110 + 1.75 NA intron (NM_001304342, intron 1 of 10) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 784 NM_020131 56893 Hs.283739 NM_020131 ENSG00000160803 UBQLN4 A1U|A1Up|C1orf6|CIP75|UBIN ubiquilin 4 protein-coding 392.25-17 chr9 7821198 7821595 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -21618 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 295.5-2 chr1 79589915 79590140 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -583297 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 494.5-6 chr6 15689631 15690072 + 1.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -26793 NM_001271667 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 271-44 chr6 147760817 147761135 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 252286 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 288.75-30 chr2 72734438 72734767 + 1.75 NA intron (NM_001321734, intron 1 of 21) MER58A|DNA|hAT-Charlie 91431 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 230.5-31 chr13 93226046 93226234 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_005708) promoter-TSS (NM_005708) -667 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 277.25-24 chr2 171668805 171669106 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18514 NM_001378 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 393.25-5 chr3 76588166 76588474 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -451779 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 312.5-32 chr7 25843670 25843941 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -53686 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 347.5-10 chr16 54707687 54707995 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 140392 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 212.5-22 chr12 4692689 4692936 + 1.75 NA 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 27290 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 368.25-12 chr3 22889523 22889801 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 312916 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 175.75-76 chr2 204988903 204989061 + 1.75 NA intron (NM_205863, intron 3 of 21) L2a|LINE|L2 443507 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 244.5-11 chr1 219027562 219027711 + 1.75 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) MLT2B3|LTR|ERVL -109125 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 197.5-99 chr3 104224903 104225099 + 1.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -700885 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 305.5-9 chr10 115838530 115838899 + 1.75 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 356075 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 297.75-7 chr14 53148812 53149113 + 1.75 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 4361 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 250-52 chr6 152708267 152708442 + 1.75 NA intron (NM_025107, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 10459 NM_025107 80177 Hs.18160 NM_025107 ENSG00000120279 MYCT1 MTLC MYC target 1 protein-coding 287.75-14 chr12 66664086 66664385 + 1.75 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 14841 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 287.75-45 chr7 2945180 2945380 + 1.75 NA intron (NM_001324281, intron 5 of 25) L2c|LINE|L2 98587 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 203.25-36 chr14 67608173 67608355 + 1.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -7963 NM_001363694 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 160.5-116 chr3 61776939 61777036 + 1.75 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) L2c|LINE|L2 215416 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 191.75-10 chr1 190777783 190777963 + 1.75 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) intron (NR_033922, intron 2 of 4) 152983 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 369.5-21 chr3 115066349 115066784 + 1.75 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 4848 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 137.25-48 chr15 48347533 48347673 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 15406 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 393.25-7 chr5 97274777 97275020 + 1.75 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -91651 NM_018343 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 303.25-7 chr11 99167556 99167894 + 1.75 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 146776 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 177.75-108 chr4 109089881 109090099 + 1.75 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 212668 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 253.25-42 chr3 37741384 37741634 + 1.75 NA intron (NM_002207, intron 20 of 27) LTR16C|LTR|ERVL 120271 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 215.25-112 chr8 132165572 132165771 + 1.75 NA intron (NM_001204824, intron 8 of 14) intron (NM_001204824, intron 8 of 14) -60406 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 210.5-80 chr22 25184061 25184300 + 1.75 NA intron (NM_001145206, intron 8 of 10) MIRc|SINE|MIR -15678 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 401.75-16 chr9 30938902 30939359 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 442360 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 223.25-45 chr20 38709427 38709673 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14936 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 450-6 chr3 28657323 28657769 + 1.75 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 82268 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 291.5-48 chr7 79713793 79714225 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 260049 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 312.75-11 chr16 85785946 85786465 + 1.75 NA intron (NM_006067, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -6210 NR_135193 101928557 Hs.662217 NR_135193 ENSG00000270159 LOC101928557 - uncharacterized LOC101928557 ncRNA 256.25-32 chr4 5220806 5221134 + 1.75 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) intron (NM_001306082, intron 4 of 12) 169490 NM_001345969 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 295.5-66 chr9 90539745 90540058 + 1.75 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) intron (NR_034157, intron 1 of 5) 42845 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 362.75-5 chr2 149645439 149645868 + 1.75 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) intron (NR_110240, intron 1 of 2) -57878 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 247-57 chr7 44167973 44168160 + 1.75 NA intron (NM_001354800, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 -8784 NM_033507 2645 Hs.1270 NM_000162 ENSG00000106633 GCK FGQTL3|GK|GLK|HHF3|HK4|HKIV|HXKP|LGLK|MODY2 glucokinase protein-coding 168.25-20 chr11 13550015 13550154 + 1.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -53909 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 418.5-6 chr2 78154315 78154698 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 65776 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 315-14 chr2 78462697 78463102 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -82632 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 250-10 chr14 47215438 47215687 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 127684 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 412.25-14 chr8 100262347 100262866 + 1.75 NA intron (NM_001353837, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 39587 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 415.5-3 chr13 64846007 64846348 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -770166 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 337.75-13 chr2 216292460 216292823 + 1.75 NA intron (NM_020814, intron 1 of 3) intron (NM_020814, intron 1 of 3) 75752 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 348.75-8 chr16 84640086 84640351 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8293 NM_024731 79786 Hs.222731 NM_024731 ENSG00000135686 KLHL36 C16orf44 kelch like family member 36 protein-coding 374.75-10 chr5 106307679 106307995 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 703177 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 252.25-13 chr12 112728064 112728365 + 1.75 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) -33038 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 274.25-7 chr10 82902613 82902842 + 1.75 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -669807 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 342-9 chr2 231060597 231060898 + 1.75 NA intron (NM_001191037, intron 1 of 23) intron (NM_001191037, intron 1 of 23) 3880 NM_002807 5707 Hs.3887 NM_002807 ENSG00000173692 PSMD1 P112|Rpn2|S1 proteasome 26S subunit, non-ATPase 1 protein-coding 278.75-43 chr9 102154811 102155131 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -364666 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 240-28 chr2 112118974 112119197 + 1.75 NA 3' UTR (NM_032824, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_032824, exon 19 of 19) -19300 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 329.75-8 chr16 17705107 17705428 + 1.75 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -234307 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 209-72 chr8 89946209 89946368 + 1.75 NA exon (NM_002485, exon 13 of 16) exon (NM_002485, exon 13 of 16) 38383 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 165-2 chr1 28467735 28467864 + 1.75 NA intron (NM_023923, intron 5 of 12) intron (NM_023923, intron 5 of 12) 29649 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 279.5-58 chr7 8397198 8397778 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -36121 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 208.75-32 chr16 79690294 79690490 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -80079 NR_104660 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 228.25-56 chr4 65095468 65095672 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -91070 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 284.5-14 chr14 55479952 55480242 + 1.75 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -39552 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 192-92 chr7 33036529 33036771 + 1.75 NA intron (NM_001002009, intron 1 of 9) intron (NM_001002009, intron 1 of 9) 4256 NM_016489 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 223.75-77 chr7 8462931 8463087 + 1.75 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 29400 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 256.25-31 chr3 164266062 164266269 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -94609 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 818.75 chr6 135554815 135555766 + 1.75 NA TTS (NR_152843) TTS (NR_152843) 57489 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 532.25-2 chr15 59896542 59897033 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -107524 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 307.5-10 chr11 81763875 81764078 + 1.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 126860 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 265.25-9 chr12 5995082 5995297 + 1.75 NA intron (NM_000552, intron 35 of 51) intron (NM_000552, intron 35 of 51) 44994 NR_145989 109729112 NR_145989 SNORA120 - small nucleolar RNA, H/ACA box 120 snoRNA 405.25-5 chr21 15469295 15469724 + 1.75 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -260425 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 181-84 chr5 23604876 23605007 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 97286 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 379.5-13 chr3 105779074 105779570 + 1.75 NA intron (NR_135809, intron 3 of 18) intron (NR_135809, intron 3 of 18) 88269 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 161-9 chr1 245907447 245907724 + 1.75 NA intron (NM_022743, intron 8 of 11) L1MA4|LINE|L1 509827 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 238.25-22 chr15 70193289 70193477 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -95466 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 182-76 chr3 183336974 183337098 + 1.75 NA intron (NM_015078, intron 5 of 29) L1ME2|LINE|L1 83783 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 190.5-38 chr12 116258936 116259111 + 1.75 NA intron (NM_015335, intron 1 of 30) L1M5|LINE|L1 18163 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 251.5-29 chr17 32953200 32953389 + 1.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 25141 NM_015544 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 218-9 chr1 217707651 217707931 + 1.75 NA intron (NM_138796, intron 5 of 10) L1PREC2|LINE|L1 76447 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 173.25-98 chr5 68894552 68894731 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 135286 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 362.75-9 chr3 193987827 193988079 + 1.75 NA intron (NR_033944, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 6285 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 183.75-32 chr12 87372958 87373092 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 42286 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 357.75-8 chr2 43965539 43965777 + 1.75 NA intron (NM_133259, intron 11 of 37) L1MA9|LINE|L1 30331 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 310-28 chr9 81563484 81563690 + 1.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 125948 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 327.75 chr1 93527048 93527260 + 1.75 NA intron (NM_001024948, intron 5 of 13) intron (NM_001024948, intron 5 of 13) 58008 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 517.5 chr12 115680209 115680615 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 468242 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 393-18 chr9 70344554 70344944 + 1.75 NA intron (NM_015110, intron 18 of 24) intron (NM_015110, intron 18 of 24) 69908 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 203.25-10 chr1 233949751 233949910 + 1.75 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) 45154 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 222.25-42 chr20 58705938 58706115 + 1.75 NA intron (NR_037945, intron 17 of 22) intron (NR_037945, intron 17 of 22) 13226 NM_024663 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 192.5-144 chr9 118864993 118865172 + 1.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 185411 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 164.75-118 chr5 173473330 173473552 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -106193 NR_027108 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 221.5-104 chr8 135351279 135351414 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -106110 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 192.5-50 chr16 66249704 66249868 + 1.75 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -116905 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 164.25-5 chr1 76682906 76683050 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 96289 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 229.25-7 chr10 29985450 29985682 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 74020 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 255-31 chr20 10042815 10043060 + 1.75 NA intron (NM_001303472, intron 3 of 10) intron (NM_001303472, intron 3 of 10) 7950 NM_001303472 63926 Hs.70903 NM_022096 ENSG00000132623 ANKEF1 ANKRD5 ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 protein-coding 213-2 chr1 37543348 37543520 + 1.75 NA intron (NM_024700, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 10859 NM_024700 79753 Hs.47232 NM_024700 ENSG00000163877 SNIP1 PML1|PMRED Smad nuclear interacting protein 1 protein-coding 245-65 chr7 32921635 32921870 + 1.75 NA intron (NR_003500, intron 3 of 5) intron (NR_003500, intron 3 of 5) 21418 NR_003500 441212 Hs.648086 NM_001039754 ENSG00000205763 RP9P - RP9 pseudogene pseudo 245.25-70 chr7 27778149 27778461 + 1.75 NA intron (NM_001362794, intron 5 of 16) Charlie10a|DNA|hAT-Charlie 38210 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 439.5-4 chr14 72218190 72218720 + 1.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 284928 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 260.5-44 chr4 66874103 66874294 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 547802 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 290.5-41 chr8 101569179 101569382 + 1.75 NA intron (NM_024915, intron 4 of 15) intron (NM_024915, intron 4 of 15) 76841 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 242-38 chr3 114437413 114437615 + 1.75 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -16079 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 226.25-41 chr20 45677057 45677195 + 1.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -6887 NM_147197 259239 Hs.374924 NM_147197 ENSG00000180083 WFDC11 WAP11 WAP four-disulfide core domain 11 protein-coding 257.25-12 chr13 84575539 84575736 + 1.75 NA intron (NR_046871, intron 6 of 6) intron (NR_046871, intron 6 of 6) -208017 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 211.5-169 chrX 41834799 41834983 + 1.75 NA intron (NM_003688, intron 2 of 26) intron (NM_003688, intron 2 of 26) 88143 NM_001126055 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 232.25-8 chr10 18014865 18015072 + 1.75 NA intron (NM_001282734, intron 11 of 11) intron (NM_001282734, intron 11 of 11) -4406 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 275-42 chr7 123774910 123775145 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 15684 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 260.5-64 chr8 65772322 65772523 + 1.75 NA intron (NM_001242318, intron 3 of 12) intron (NM_001242318, intron 3 of 12) 16635 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 444-5 chr5 25954793 25955383 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 764135 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 240.5-28 chr14 55944938 55945197 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -148393 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 217-17 chr12 18296265 18296529 + 1.75 NA intron (NM_001288774, intron 5 of 32) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 34857 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 326.25-32 chr8 79999056 79999391 + 1.75 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 31036 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 244-48 chr6 64912880 64913166 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 15 of 43) intron (NM_001292009, intron 15 of 43) -388395 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 328.25-7 chr14 48623964 48624310 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -829123 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 171.75-136 chr8 10269147 10269479 + 1.75 NA intron (NM_001199729, intron 4 of 6) intron (NM_001199729, intron 4 of 6) 173662 NM_001199729 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 383-14 chr5 136663287 136663696 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -298015 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 235.5-80 chr7 92974370 92974564 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -137840 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 354.25-6 chr2 133447756 133448177 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 120497 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 510.5-5 chr8 138800455 138801092 + 1.75 NA intron (NM_152888, intron 11 of 64) intron (NM_152888, intron 11 of 64) 113268 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 281.25-16 chr14 23012096 23012341 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2075 NM_001282970 60686 Hs.255874 NM_021944 ENSG00000100802 C14orf93 RTFC chromosome 14 open reading frame 93 protein-coding 416.5-7 chr17 59069444 59069833 + 1.75 NA intron (NR_148346, intron 9 of 23) MER5B|DNA|hAT-Charlie 37242 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 285-5 chr10 129826677 129826932 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 16570 NR_036179 100422873 NR_036179 ENSG00000266676 MIR4297 - microRNA 4297 ncRNA 436.75-4 chr2 77952985 77953353 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 1857 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 152.25-79 chr2 35980506 35980661 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 374987 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 271.75-8 chr10 86881698 86881884 + 1.75 NA intron (NM_004329, intron 3 of 12) L1MC5|LINE|L1 -73968 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 305-8 chr12 85872019 85872413 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2079 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 222.75-51 chr18 2223864 2224116 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 347515 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 250.75-71 chr9 28505926 28506199 + 1.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 213243 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 340.25-10 chr2 167527965 167528174 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -290603 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 332.75 chr1 147186981 147187411 + 1.75 NA exon (NM_001461, exon 9 of 9) exon (NM_001461, exon 9 of 9) 9345 NR_002305 171423 Hs.658566 NR_002305 PDIA3P1 ERp60|GRP58P|PDIA3P protein disulfide isomerase family A member 3 pseudogene 1 pseudo 296.25-5 chr11 109451709 109452084 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 29706 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 228.75-33 chr18 65397554 65397810 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -352570 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 266.25-10 chr12 30436957 30437220 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 240156 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 306.5-10 chr12 4692123 4692444 + 1.75 NA 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 27819 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 304-5 chr10 71077649 71077866 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -134813 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 254.25-71 chr8 130626589 130627026 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -183133 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 273-50 chr7 28519171 28519493 + 1.75 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) 83717 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 250.75-56 chr5 103872372 103872730 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -309762 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 152.75-5 chr1 91485186 91485328 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15590 NM_001134419 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 473.75 chr11 19146381 19146975 + 1.75 NA intron (NM_019028, intron 3 of 16) intron (NM_019028, intron 3 of 16) 29510 NM_019028 54503 Hs.188569 NM_019028 ENSG00000177054 ZDHHC13 HIP14L|HIP3RP zinc finger DHHC-type containing 13 protein-coding 426.25-8 chr6 120532984 120533329 + 1.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 517977 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 298-33 chr8 144970557 144970737 + 1.75 NA Intergenic LTR65|LTR|ERV1 -19767 NM_006958 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 178.5-29 chr11 86720193 86720313 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -47617 NR_147829 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 307.5-45 chr7 21119677 21120013 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 284414 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 203.25-50 chr2 26904436 26904661 + 1.75 NA intron (NM_020134, intron 2 of 12) MIR3|SINE|MIR 56124 NM_001253724 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 332-15 chr2 53018122 53018351 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -315621 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 317-2 chr1 56284970 56285322 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -129817 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 142.75-130 chr3 60953142 60953240 + 1.75 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) intron (NR_148922, intron 3 of 3) 298261 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 274.25-10 chr10 117542649 117542823 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_144378) promoter-TSS (NR_144378) -10 NM_004098 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 434.75-5 chr2 217708758 217709164 + 1.75 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 47632 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 283.25-36 chr5 59902211 59902629 + 1.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -8694 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 436.75-7 chr9 104311496 104311927 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 41482 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 278.25-44 chr4 131396829 131397102 + 1.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -367873 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 201.5-23 chr10 57861085 57861408 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 406648 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 256.25-57 chrX 79303920 79304098 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 63325 NM_004867 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 356-4 chr18 46119385 46119805 + 1.75 NA intron (NM_138443, intron 3 of 8) L2c|LINE|L2 15210 NR_026978 115106 Hs.436617 NM_138443 ENSG00000152240 HAUS1 CCDC5|HEI-C|HEIC|HsT1461 HAUS augmin like complex subunit 1 protein-coding 288.5-33 chr4 67401700 67401987 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 20157 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 263.25-9 chr10 36265654 36265844 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 487447 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 259.25-2 chr1 51393631 51393873 + 1.75 NA intron (NM_001159969, intron 9 of 12) intron (NM_001159969, intron 9 of 12) 28343 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 210-31 chr15 69813819 69814010 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -21320 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 365.25-4 chr2 97955204 97955577 + 1.75 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) L1MDa|LINE|L1 40558 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 191-39 chr2 161218494 161218705 + 1.75 NA intron (NM_001199135, intron 4 of 7) FRAM|SINE|Alu -26140 NR_110164 100996579 Hs.660929 NR_110163 ENSG00000227403 LINC01806 - long intergenic non-protein coding RNA 1806 ncRNA 314-3 chr10 43628634 43628992 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_038867) promoter-TSS (NR_038867) -4 NR_038867 414201 Hs.666576 NR_038867 ENSG00000223910 ZNF32-AS3 C10orf44|ZNF32-OT1|bA402L1.3 ZNF32 antisense RNA 3 ncRNA 289-28 chr4 48520690 48520912 + 1.75 NA intron (NM_015030, intron 55 of 63) intron (NM_015030, intron 55 of 63) 30549 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 225-47 chr3 89909531 89909720 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 802004 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 213.5-103 chr5 128770111 128770288 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -194928 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 364.25-8 chr13 91696746 91697100 + 1.75 NA intron (NM_004466, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR 298302 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 300.5-56 chr9 107089328 107089551 + 1.75 NA intron (NR_126029, intron 3 of 4) L1MD1|LINE|L1 13549 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 168.25-94 chr21 29194288 29194398 + 1.75 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) LTR37A|LTR|ERV1 849 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 220.5-109 chr6 85224499 85224722 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 165576 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 400.75 chr1 183836650 183837003 + 1.75 NA intron (NM_001297671, intron 2 of 17) intron (NM_001297671, intron 2 of 17) 31706 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 224.25-106 chr8 88885985 88886168 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -558593 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 331.25-15 chr5 158192627 158192848 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 217036 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 219.75-67 chr5 167330514 167330660 + 1.75 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) intron (NM_001122679, intron 2 of 29) -162186 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 201.5-120 chr7 41341054 41341223 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 239534 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 531.5 chr11 77356420 77356982 + 1.75 NA intron (NM_001128620, intron 6 of 15) L2b|LINE|L2 -55035 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 353.25 chr1 97750900 97751375 + 1.75 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) -45784 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 286-14 chr17 63242623 63242909 + 1.75 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) L1ME1|LINE|L1 197501 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 214-30 chr2 19978583 19978734 + 1.75 NA intron (NM_001006657, intron 5 of 27) intron (NM_001006657, intron 5 of 27) 11447 NM_020779 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 160.5-188 chr8 83368496 83368641 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -35190 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 414-16 chr9 76560133 76560594 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 59730 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 445-3 chr12 122501320 122501848 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_017612) promoter-TSS (NM_017612) -652 NM_001350935 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 306-17 chr20 507482 507781 + 1.75 NA intron (NM_177560, intron 1 of 11) intron (NM_177560, intron 1 of 11) 36159 NM_001895 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 344.5-5 chr11 101067685 101067943 + 1.75 NA intron (NR_073142, intron 2 of 6) L1ME3D|LINE|L1 61249 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 368-12 chr6 64514117 64514666 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 707555 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 467.25-2 chr16 7935055 7935579 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 602472 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 360.75-8 chr22 42708671 42709007 + 1.75 NA intron (NM_001318038, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 12031 NR_146459 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 525.25 chr10 105046414 105047060 + 1.75 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) intron (NM_014978, intron 5 of 26) -380521 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 215.25-63 chr3 114540426 114540670 + 1.75 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 83658 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 376-3 chr13 71233175 71233697 + 1.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 218295 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 323-13 chr2 66680171 66680725 + 1.75 NA intron (NR_110156, intron 4 of 5) intron (NR_110156, intron 4 of 5) 22779 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 157.5-2 chr1 10258303 10258451 + 1.75 NA intron (NM_001365953, intron 3 of 20) intron (NM_001365953, intron 3 of 20) 27613 NM_001365953 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 256.5-72 chr7 71150074 71150398 + 1.75 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) intron (NM_022479, intron 1 of 10) 18092 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 547.75-2 chr16 85936642 85937059 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 18503 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 247.5-41 chr2 114149721 114149870 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -169811 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 203-78 chr5 23965517 23965708 + 1.75 NA intron (NR_131245, intron 1 of 4) MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 14264 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 248.25-31 chr19 54019965 54020220 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 27804 NM_145815 59285 Hs.631560 NM_031897 ENSG00000130433 CACNG6 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 6 protein-coding 252.5-76 chr7 92910432 92910712 + 1.75 NA intron (NR_110086, intron 4 of 4) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -73945 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 205.75-59 chr4 128139907 128140128 + 1.75 NA intron (NR_146772, intron 11 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie 78705 NM_001278604 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 551.5 chr13 80968524 80969094 + 1.75 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -49582 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 422.75 chr2 102229069 102229357 + 1.75 NA intron (NM_001351447, intron 7 of 9) intron (NM_001351447, intron 7 of 9) 41899 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 440.75-2 chr2 164726815 164727303 + 1.75 NA intron (NM_001365670, intron 5 of 13) intron (NM_001365670, intron 5 of 13) -39282 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 518 chr1 239441389 239441724 + 1.75 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) intron (NM_001347716, intron 1 of 7) 54988 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 205.75-44 chr3 54721174 54721504 + 1.75 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) L1ME3|LINE|L1 -81482 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 289.25-11 chr2 13548133 13548355 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -541231 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 288.5-6 chr11 41615552 41615906 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -98839 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 242.25-26 chr14 60510741 60511125 + 1.75 NA intron (NM_007374, intron 1 of 1) CpG 1787 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 211.5-22 chr11 29429924 29430053 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -164425 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 344.5-21 chr4 149158143 149158469 + 1.75 NA intron (NR_125887, intron 2 of 12) intron (NR_125887, intron 2 of 12) 4011 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 273-49 chr7 24181182 24181352 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -102923 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 339.5-22 chr4 107511050 107511396 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 209011 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 298.5-14 chr2 60780539 60780901 + 1.75 NA exon (NM_022894, exon 10 of 22) exon (NM_022894, exon 10 of 22) 24452 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 191.25-30 chr14 45917741 45917897 + 1.75 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -146340 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 276.25-43 chr8 79617737 79617936 + 1.75 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 6719 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 396.5-4 chr17 80881942 80882331 + 1.75 NA intron (NM_020761, intron 14 of 33) L1MEd|LINE|L1 -76504 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 116.5-24 chr10 61693362 61693467 + 1.75 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) intron (NM_173554, intron 4 of 6) 30453 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 144.25-21 chr10 21393261 21393349 + 1.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -20355 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 307-15 chr2 26661640 26661905 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -20406 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 187-26 chr13 89880280 89880427 + 1.75 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 239364 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 326.5-13 chr16 18948227 18948493 + 1.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -21956 NM_015092 23049 Hs.460179 NM_015092 ENSG00000157106 SMG1 61E3.4|ATX|LIP SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase protein-coding 163.5-86 chr2 10602711 10602865 + 1.75 NA exon (NM_001261392, exon 15 of 20) exon (NM_001261392, exon 15 of 20) 87187 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 547 chr12 40313822 40314380 + 1.75 NA exon (NM_198578, exon 32 of 51) exon (NM_198578, exon 32 of 51) -79293 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 325-23 chr9 34158525 34158767 + 1.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -20359 NM_001171201 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 156.5-44 chr12 89671897 89672111 + 1.75 NA intron (NM_001001323, intron 1 of 21) intron (NM_001001323, intron 1 of 21) 36834 NM_001366527 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 363.75 chr1 193938884 193939255 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 634324 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 256.5-54 chr5 9483093 9483354 + 1.75 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -28110 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 175.75-92 chr4 105140076 105140276 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5699 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 260.25-24 chr2 140926695 140926954 + 1.75 NA intron (NM_018557, intron 20 of 90) intron (NM_018557, intron 20 of 90) -340139 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 260-47 chr8 127269513 127269743 + 1.75 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 24991 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 352.25-17 chr7 74649560 74649891 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7940 NM_001280800 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 340.75-25 chr8 129432219 129432724 + 1.75 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) L1PB1|LINE|L1 51671 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 179.25-123 chr5 124326869 124327012 + 1.75 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 111580 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 324.75-9 chr12 79886120 79886422 + 1.75 NA intron (NM_001244990, intron 2 of 24) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 27640 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 408-12 chr4 31896251 31896614 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -100947 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 195.5-164 chr9 3428133 3428297 + 1.75 NA intron (NM_001282116, intron 1 of 16) intron (NM_001282116, intron 1 of 16) -32619 NM_002919 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 134.25-72 chr19 15609334 15609444 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5829 NM_007253 11283 Hs.268554 NM_007253 ENSG00000186526 CYP4F8 CPF8|CYPIVF8 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 8 protein-coding 232.75-68 chr9 70839714 70839944 + 1.75 NA intron (NM_001366143, intron 5 of 25) intron (NM_001366143, intron 5 of 25) 29223 NM_206948 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 257.75-51 chr8 99935616 99935923 + 1.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -42062 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 400.75-2 chr17 70867479 70868085 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 334397 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 247.25-40 chr3 56326535 56326706 + 1.75 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) intron (NR_132749, intron 2 of 17) 141847 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 216-6 chr10 105970599 105970855 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -150394 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 226.5-8 chr1 232653484 232653696 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -64481 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 330.5-4 chr10 59673215 59673498 + 1.75 NA intron (NM_194298, intron 2 of 5) intron (NM_194298, intron 2 of 5) 36535 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 197.5-21 chr11 78738556 78738820 + 1.75 NA intron (NM_001098816, intron 19 of 33) intron (NM_001098816, intron 19 of 33) -163824 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 405.25-8 chr3 93985127 93985624 + 1.75 NA intron (NM_144996, intron 1 of 7) intron (NM_144996, intron 1 of 7) 5220 NM_001321328 200894 Hs.533086 NM_144996 ENSG00000169379 ARL13B ARL2L1|JBTS8 ADP ribosylation factor like GTPase 13B protein-coding 569.5 chr1 191709857 191710354 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -448357 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 363-13 chr3 160734053 160734282 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -22064 NM_139245 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 340-2 chr10 33312193 33312544 + 1.75 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 22299 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 280-64 chr9 103279878 103280106 + 1.75 NA intron (NR_121578, intron 3 of 9) intron (NR_121578, intron 3 of 9) 45041 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 345.5-27 chr7 70905896 70906411 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -225991 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 175.5-56 chr15 51674875 51674978 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6427 NM_001165257 29106 Hs.232618 NM_013243 ENSG00000104112 SCG3 SGIII secretogranin III protein-coding 422-11 chr7 50067401 50067694 + 1.75 NA intron (NM_007009, intron 3 of 7) HERV15-int|LTR|ERV1 25699 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 625.25 chr6 63719571 63720145 + 1.75 NA TTS (NM_001142800) TTS (NM_001142800) 73332 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 191.25-50 chr2 20552434 20552580 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 40041 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 248-25 chr14 101390163 101390390 + 1.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 17646 NR_126006 338002 Hs.124848 NR_126006 ENSG00000259023 LINC00524 C14orf71 long intergenic non-protein coding RNA 524 ncRNA 356.75-2 chr1 183936987 183937359 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001303421, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001303421, exon 12 of 12) 100555 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 251.5-55 chr3 136922172 136922371 + 1.75 NA intron (NM_001291999, intron 1 of 3) MER67B|LTR|ERV1 -8231 NM_001190796 4690 Hs.126889 NM_006153 ENSG00000158092 NCK1 NCK|NCKalpha|nck-1 NCK adaptor protein 1 protein-coding 350.5-22 chr8 10814502 10814791 + 1.75 NA intron (NM_001284356, intron 5 of 5) intron (NM_001284356, intron 5 of 5) 10797 NR_031711 100302166 NR_031711 ENSG00000283210 MIR1322 MIRN1322|hsa-mir-1322 microRNA 1322 ncRNA 228.5-7 chr1 80453008 80453210 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -82646 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 394.5-6 chr15 68836042 68836372 + 1.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -15312 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 228-34 chr16 10994733 10994962 + 1.75 NA intron (NM_015226, intron 9 of 22) intron (NM_015226, intron 9 of 22) 50283 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 497.5-6 chr8 130253496 130253995 + 1.75 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 42788 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 461-3 chr4 44039372 44039842 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 22545 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 229.5-125 chr7 33621253 33621506 + 1.75 NA intron (NM_001348041, intron 22 of 22) L1MA9|LINE|L1 -283536 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 277.25-45 chr8 68370063 68370347 + 1.75 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) ERVL-E-int|LTR|ERVL -38714 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 217.75-80 chrX 53809105 53809242 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -122454 NM_031407 10075 Hs.136905 NM_031407 ENSG00000086758 HUWE1 ARF-BP1|HECTH9|HSPC272|Ib772|LASU1|MRXST|MULE|URE-B1|UREB1 HECT, UBA and WWE domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 241.75-40 chr2 65322672 65322921 + 1.75 NA intron (NM_001128210, intron 4 of 5) L1M5|LINE|L1 43982 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 273.5-60 chr5 37881560 37881769 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 41226 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 383.25-9 chr2 121537638 121538010 + 1.75 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) L1ME3B|LINE|L1 6944 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 276.25-15 chr15 63258476 63258652 + 1.75 NA intron (NM_016530, intron 5 of 7) MER51A|LTR|ERV1 -18986 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 237-39 chr4 44761538 44761729 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34999 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 293.25-26 chr5 159537678 159537926 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71526 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 548-4 chr8 87167535 87168306 + 1.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 301505 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 220.5-47 chr2 76911568 76911833 + 1.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -74265 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 192.5-117 chr6 156679473 156679627 + 1.75 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -98305 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 175.25-76 chr2 171547823 171547971 + 1.75 NA intron (NM_001256909, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 25423 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 397-9 chr3 116299437 116299674 + 1.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -60469 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 337-25 chr5 98859631 98859921 + 1.75 NA intron (NM_001364113, intron 34 of 36) L1MC4a|LINE|L1 66758 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 324.25-4 chr14 52859184 52859543 + 1.75 NA TTS (NM_001135000) TTS (NM_001135000) -67756 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 187-9 chr10 19157622 19157790 + 1.75 NA intron (NM_001142308, intron 12 of 39) intron (NM_001142308, intron 12 of 39) 108905 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 276.75-37 chr4 72248412 72248738 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 209443 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 386.25-9 chr3 191212352 191212760 + 1.75 NA TTS (NR_133663) TTS (NR_133663) 13315 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 312.25-9 chr16 8241936 8242308 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 347716 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 273.75-10 chr14 59981640 59981829 + 1.75 NA intron (NR_075071, intron 15 of 32) intron (NR_075071, intron 15 of 32) 62021 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 241.5-62 chr22 33224055 33224340 + 1.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 115668 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 119-201 chr8 130125877 130126027 + 1.75 NA intron (NM_001362925, intron 18 of 29) intron (NM_001362925, intron 18 of 29) -41184 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 246.25-15 chr11 111772548 111772849 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6309 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 414-5 chr17 13065363 13065646 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -47440 NM_001165962 60528 Hs.434232 NM_018127 ENSG00000006744 ELAC2 COXPD17|ELC2|HPC2 elaC ribonuclease Z 2 protein-coding 259.75-22 chr18 3179562 3179874 + 1.75 NA intron (NM_019856, intron 5 of 36) intron (NM_019856, intron 5 of 36) 40250 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 266-14 chr14 73903135 73903381 + 1.75 NA intron (NR_040251, intron 5 of 11) intron (NR_040251, intron 5 of 11) 16399 NM_001242926 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 291.5-20 chr2 47483360 47483653 + 1.75 NA TTS (NM_001258281) TTS (NM_001258281) -44031 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 201-37 chr17 60464960 60465189 + 1.75 NA intron (NM_006380, intron 5 of 12) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 42585 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 300.75-19 chr17 77990047 77990382 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14023 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 336.5-20 chr4 36455185 36455505 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28917 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 347.25-8 chr2 45636435 45636683 + 1.75 NA Intergenic Kanga1d|DNA|TcMar-Tc2 -15116 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 296.5-40 chr7 136160920 136161253 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -183727 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 329-24 chr3 110117240 110117483 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 514533 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 276.5-46 chr4 42182663 42182881 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -30117 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 499.25 chr1 182234825 182235376 + 1.75 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 78961 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 198.5-118 chr5 96137793 96138023 + 1.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1MC3|LINE|L1 58770 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 301.5-12 chr10 86739326 86739721 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -17116 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 303.25-20 chr3 192433285 192433506 + 1.75 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -24346 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 210-23 chr13 34395159 34395337 + 1.75 NA intron (NR_146542, intron 1 of 3) L1MA6|LINE|L1 47205 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 320.5-47 chr8 138441787 138442214 + 1.75 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 55261 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 404.25-5 chr14 57636497 57636866 + 1.75 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -142824 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 378.75-3 chr10 72036752 72037159 + 1.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 51596 NM_001244950 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 132.25-40 chr11 24807516 24807635 + 1.75 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) MER39|LTR|ERV1 310522 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 261.75-47 chr7 42401308 42401515 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -164202 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 137-127 chr4 155717727 155717841 + 1.75 NA intron (NM_001130685, intron 8 of 9) intron (NM_001130685, intron 8 of 9) -41237 NM_001291952 2983 Hs.77890 NM_000857 ENSG00000061918 GUCY1B1 GC-S-beta-1|GC-SB3|GUC1B3|GUCB3|GUCSB3|GUCY1B3 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 1 protein-coding 427-6 chr4 115307872 115308262 + 1.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -194447 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 292.5-35 chr20 12889008 12889222 + 1.75 NA intron (NR_109868, intron 10 of 11) L1ME2z|LINE|L1 47848 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 413.75 chr13 63519890 63520620 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -192161 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 382.75-11 chr5 136632377 136632703 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -267064 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 234-27 chr2 164216880 164217129 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 351491 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 365-17 chr7 34369674 34370053 + 1.75 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie -288355 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 442.25 chr11 27556895 27557475 + 1.75 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) intron (NR_033315, intron 2 of 6) -42138 NR_107054 102465881 NR_107054 ENSG00000278483 MIR8087 hsa-mir-8087 microRNA 8087 ncRNA 233.75-54 chr4 52438962 52439102 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 217507 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 173.75-104 chr3 1853675 1853791 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -245070 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 311.5-35 chr8 137700033 137700332 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -286594 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 159.75-117 chr4 63493448 63493571 + 1.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 915941 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 391.25-13 chr4 61561064 61561357 + 1.75 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 359038 NM_001371342 213.5-62 chr2 104915215 104915390 + 1.75 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -42707 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 274.5-10 chr11 38723344 38723547 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 74587 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 311.5 chr1 84786664 84786947 + 1.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -96337 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 208.5-62 chr18 78864664 78864795 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -115546 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 407.75-7 chr7 52622745 52623203 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -412659 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 245.25-76 chrX 70523952 70524201 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -68082 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 368.75-14 chr8 125694015 125694259 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 257060 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 279.5-10 chr10 88546418 88546621 + 1.75 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 36799 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 385-9 chr2 51994182 51994508 + 1.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -376303 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 219.5-38 chr14 23934072 23934225 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19622 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 333.5-14 chr5 120067265 120067509 + 1.75 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -396891 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 332-6 chr13 72870041 72870379 + 1.75 NA intron (NR_146206, intron 10 of 16) intron (NR_146206, intron 10 of 16) 88077 NR_146206 10464 Hs.441926 NM_006346 ENSG00000083535 PIBF1 C13orf24|CEP90|JBTS33|PIBF progesterone immunomodulatory binding factor 1 protein-coding 439.5-8 chr18 6114244 6114549 + 1.75 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) L2c|LINE|L2 -142348 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 309.75-32 chr5 92181702 92181982 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -798525 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 401.75-2 chr14 19933227 19933698 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2146 NM_001004063 79544 Hs.554584 NM_001004063 ENSG00000155249 OR4K1 OR14-19 olfactory receptor family 4 subfamily K member 1 protein-coding 280-39 chr4 83836612 83836947 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 300671 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 269.25-39 chr5 65149703 65149941 + 1.75 NA non-coding (NR_135689, exon 26 of 26) non-coding (NR_135689, exon 26 of 26) 332098 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 441-7 chr3 162285771 162286198 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 789176 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 424.75 chr12 60457719 60458167 + 1.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 768573 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 321-20 chr4 62156709 62156941 + 1.75 NA intron (NR_110595, intron 2 of 7) intron (NR_110595, intron 2 of 7) 4940 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 265.75-65 chr7 24455440 24455874 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -117795 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 171-52 chr17 60384091 60384252 + 1.75 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) L2a|LINE|L2 7962 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 193-74 chr5 126346665 126346877 + 1.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -13349 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 214.75-66 chr5 111371529 111371695 + 1.75 NA intron (NM_001323376, intron 2 of 8) intron (NM_001323376, intron 2 of 8) -140614 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 181-96 chr6 72863542 72863754 + 1.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 104105 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 352.25-9 chr22 46282410 46282735 + 1.75 NA intron (NM_017931, intron 7 of 13) intron (NM_017931, intron 7 of 13) 14088 NR_024009 150384 Hs.348663 NR_024009 ENSG00000277232 GTSE1-DT CN5H6.4|GTSE1-AS1|LL22NC03-5H6.6 GTSE1 divergent transcript ncRNA 246-13 chr13 35343113 35343319 + 1.75 NA intron (NM_015678, intron 36 of 57) L1MEd|LINE|L1 133473 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 174.75-134 chr8 140466900 140467037 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8389 NM_031466 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 316-21 chr3 90087422 90087702 + 1.75 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 979941 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 505.75 chr10 71415878 71416465 + 1.75 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 19237 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 195.75-59 chr2 45722111 45722309 + 1.75 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 70535 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 274 chr1 69769745 69769940 + 1.75 NA intron (NM_001370785, intron 3 of 26) intron (NM_001370785, intron 3 of 26) -149480 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 338.25-3 chr10 18236395 18236609 + 1.75 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) -24220 NM_000724 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 198.75-13 chr10 62694952 62695130 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -109679 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 309.75-33 chr5 134289566 134289863 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -63641 NM_002715 5515 Hs.105818 NM_002715 ENSG00000113575 PPP2CA NEDLBA|PP2Ac|PP2CA|PP2Calpha|RP-C protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha protein-coding 250-34 chr20 9078248 9078575 + 1.75 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) AluSz|SINE|Alu 9357 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 354.75-15 chr3 145304170 145304563 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 764819 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 392.75-6 chr15 89723383 89723615 + 1.75 NA intron (NM_001284395, intron 8 of 16) L1ME3B|LINE|L1 27810 NM_018670 55897 Hs.447531 NM_018670 ENSG00000166823 MESP1 bHLHc5 mesoderm posterior bHLH transcription factor 1 protein-coding 194.5-118 chr5 53460087 53460470 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -20351 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 397.25-13 chr8 18000283 18000529 + 1.75 NA intron (NM_001352648, intron 30 of 39) L2a|LINE|L2 77418 NM_001352636 5108 Hs.491148 NM_006197 ENSG00000078674 PCM1 PTC4|RET/PCM-1 pericentriolar material 1 protein-coding 471-9 chr7 110321938 110322301 + 1.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -361906 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 195.5-160 chr8 98879793 98879994 + 1.75 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -54205 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 354.25-16 chr8 126029845 126030433 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -78942 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 265.75-41 chr2 208618423 208618700 + 1.75 NA intron (NR_136588, intron 2 of 5) L1PB1|LINE|L1 75919 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 172-88 chr5 17785288 17785495 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -21883 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 304.25-21 chr4 76685501 76685902 + 1.75 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 110150 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 439-4 chr15 25031224 25031501 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_146168) promoter-TSS (NR_146168) -511 NR_146168 100506965 Hs.592473 NR_146168 PWAR6 HBT8|PAR-6 Prader Willi/Angelman region RNA 6 ncRNA 200-27 chr14 58949764 58949958 + 1.75 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) L1ME1|LINE|L1 121573 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 199.75-36 chr17 66359794 66359992 + 1.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 56961 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 131.5-207 chr6 106381463 106381560 + 1.75 NA intron (NM_001371242, intron 1 of 21) LTR16C|LTR|ERVL 20794 NM_001371242 335.75-10 chr2 47592417 47592681 + 1.75 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -22218 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 313.25-19 chr3 71776773 71777152 + 1.75 NA intron (NM_001126128, intron 2 of 3) intron (NM_001126128, intron 2 of 3) 8186 NM_001126128 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 269.75-48 chr6 26251010 26251415 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_021018) promoter-TSS (NM_021018) -439 NM_003524 8345 Hs.247815 NM_003524 ENSG00000275713 HIST1H2BH H2B/j|H2BFJ histone cluster 1 H2B family member h protein-coding 263.25-58 chr8 124866770 124867021 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -44837 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 296.75 chr1 96692446 96692734 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29015 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 340.25-16 chr7 27932024 27932366 + 1.75 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 192100 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 442.25-5 chr4 147673687 147674193 + 1.75 NA intron (NM_001350144, intron 1 of 10) intron (NM_001350144, intron 1 of 10) 10223 NM_138364 90826 Hs.591692 NM_138364 ENSG00000164169 PRMT9 PRMT10 protein arginine methyltransferase 9 protein-coding 517.75-3 chr7 42007253 42007629 + 1.75 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) intron (NM_000168, intron 10 of 14) 229768 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 268-47 chr5 156616158 156616416 + 1.75 NA intron (NM_001128209, intron 5 of 7) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -234008 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 337.75-17 chr5 76117907 76118261 + 1.75 NA intron (NM_014979, intron 1 of 12) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 34701 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 302-22 chr4 32962539 32962777 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 611620 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 311.25-16 chr4 41479958 41480283 + 1.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) MIRb|SINE|MIR -58037 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 370-7 chr13 75698866 75699099 + 1.75 NA intron (NM_001306080, intron 1 of 30) L1MB7|LINE|L1 -61338 NM_001366633 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 265.5-22 chr14 54512461 54512728 + 1.75 NA intron (NM_006568, intron 1 of 5) LTR50|LTR|ERVL 2688 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 442.75-6 chr2 123786060 123786572 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 238858 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 279-33 chr4 100571522 100571725 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53601 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 286.75-22 chr2 129708792 129708985 + 1.75 NA Intergenic MER51B|LTR|ERV1 168603 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 156-56 chr15 81375982 81376135 + 1.75 NA intron (NR_120365, intron 5 of 6) intron (NR_120365, intron 5 of 6) -1845 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 265.75-21 chr14 79572258 79572498 + 1.75 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 292998 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 295.5-26 chr2 63637549 63637797 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 48522 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 395.25-4 chr18 21826138 21826443 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_029675) promoter-TSS (NR_029675) -505 NR_029675 406922 NR_029675 ENSG00000283927 MIR133A1 MIRN133A1|mir-133a-1 microRNA 133a-1 ncRNA 284.75-4 chr10 56297093 56297349 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 64038 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 356-6 chr4 72618137 72618366 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -49030 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 271.5-11 chr11 15323751 15323922 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 174734 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 374.5-4 chr10 119356014 119356323 + 1.75 NA intron (NM_005308, intron 2 of 15) intron (NM_005308, intron 2 of 15) -21804 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 230.25-81 chr8 117826423 117826629 + 1.75 NA intron (NM_000127, intron 4 of 10) intron (NM_000127, intron 4 of 10) 94387 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 184.25-83 chr3 158151888 158152036 + 1.75 NA intron (NM_001271834, intron 3 of 8) intron (NM_001271834, intron 3 of 8) 41873 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 391.5-9 chr14 77290731 77291079 + 1.75 NA intron (NM_013382, intron 10 of 20) intron (NM_013382, intron 10 of 20) -19593 NM_021257 58157 Hs.274363 NM_021257 ENSG00000165553 NGB - neuroglobin protein-coding 280-51 chr6 35533889 35534194 + 1.75 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -21145 NM_001289395 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 377.25 chr1 104097233 104098010 + 1.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 24598 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 218.5-63 chr20 40632429 40632618 + 1.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 56713 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 640 chr10 33983259 33984300 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -211099 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 349.25-2 chr1 85718979 85719220 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10666 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 307-3 chr1 104839080 104839286 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 766160 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 292-22 chr18 3709126 3709361 + 1.75 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 105506 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 365-11 chr22 24778579 24778893 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -4016 NR_045649 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 449.5 chr10 75908462 75909037 + 1.75 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 125988 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 326-30 chr7 123699485 123699799 + 1.75 NA intron (NM_003941, intron 5 of 10) intron (NM_003941, intron 5 of 10) 43776 NM_207163 442721 Hs.592260 NM_207163 ENSG00000170807 LMOD2 C-LMOD|CLMOD leiomodin 2 protein-coding 407.5-3 chr16 9528152 9528585 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -72863 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 485.25-6 chr8 141965564 141966105 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -179521 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 199-30 chr18 60485176 60485378 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -112502 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 279.5-22 chr16 35438233 35438450 + 1.75 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 42255 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 278.5-35 chr21 18133777 18134178 + 1.75 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -110856 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 259-4 chr1 178820208 178820412 + 1.75 NA intron (NM_152663, intron 6 of 19) intron (NM_152663, intron 6 of 19) 50767 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 194.5-90 chr3 88216927 88217114 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 67061 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 233.75-3 chr1 64378669 64378859 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -91365 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 231.5-33 chr16 3802190 3802444 + 1.75 NA intron (NM_004380, intron 3 of 30) AluSz|SINE|Alu 77803 NM_001079846 1387 Hs.459759 NM_004380 ENSG00000005339 CREBBP CBP|KAT3A|MKHK1|RSTS|RSTS1 CREB binding protein protein-coding 524 chr10 63201956 63202524 + 1.75 NA intron (NM_001322258, intron 9 of 24) AluSz6|SINE|Alu 66983 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 205.75-34 chr18 49521961 49522261 + 1.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -29647 NM_001199344 6139 Hs.293653 NM_000985 ENSG00000265681 RPL17 L17|PD-1|RPL23 ribosomal protein L17 protein-coding 178-91 chr7 3738491 3738645 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MA9|LINE|L1 -391117 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 555 chr2 71919329 71919991 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 228202 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 249.75-63 chr9 27679163 27679375 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -105403 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 361.25-7 chr21 31743755 31744265 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -11892 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 285-38 chr5 55271105 55271325 + 1.75 NA intron (NR_144323, intron 18 of 26) intron (NR_144323, intron 18 of 26) 36479 NR_144325 54505 Hs.593268 NM_019030 ENSG00000067248 DHX29 DDX29 DExH-box helicase 29 protein-coding 254.5-41 chr2 160288104 160288364 + 1.75 NA intron (NM_002897, intron 6 of 13) intron (NM_002897, intron 6 of 13) -16339 NR_103775 100505984 Hs.729532 NR_103775 ENSG00000285373 LINC02478 - long intergenic non-protein coding RNA 2478 ncRNA 374.25-9 chr5 156374909 156375227 + 1.75 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) L1MC4|LINE|L1 47904 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 251.5-4 chr1 172023510 172023735 + 1.75 NA intron (NM_001278252, intron 4 of 14) HAL1|LINE|L1 -115186 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 517.75 chr13 113659491 113660117 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1606 NM_000705 496 Hs.434202 NM_000705 ENSG00000186009 ATP4B ATP6B ATPase H+/K+ transporting subunit beta protein-coding 167.25-80 chr2 71911203 71911311 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 236605 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 266.5-62 chr5 24700098 24700503 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -55322 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 420-7 chr17 62979006 62979333 + 1.75 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) L2|LINE|L2 12934 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 245.5-27 chr15 95283181 95283521 + 1.75 NA intron (NR_034095, intron 3 of 3) intron (NR_034095, intron 3 of 3) 43749 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 320.5-15 chr16 78735773 78735974 + 1.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 636219 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 151.5-103 chr21 33363936 33364060 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -38898 NM_005534 3460 Hs.634632 NM_005534 ENSG00000159128 IFNGR2 AF-1|IFGR2|IFNGT1|IMD28 interferon gamma receptor 2 protein-coding 264.75-62 chr9 26097519 26097740 + 1.75 NA intron (NM_001004352, intron 3 of 6) intron (NM_001004352, intron 3 of 6) 30954 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 263.75-11 chr14 54649916 54650239 + 1.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 82465 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 214.75-21 chr14 44635224 44635373 + 1.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 127889 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 240-70 chrX 100085002 100085226 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 325159 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 210.5-110 chr6 49306591 49306782 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 156567 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 317.25-27 chr5 91471810 91472092 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -88634 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 144.5-130 chr3 29947703 29947850 + 1.75 NA intron (NM_001003792, intron 11 of 13) intron (NM_001003792, intron 11 of 13) -13620 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 174.25-99 chr3 94607174 94607336 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -331008 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 464.5-4 chr6 132822207 132822539 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 5154 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 198.25-62 chr2 227428560 227428718 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -43493 NR_049888 100847081 NR_049888 ENSG00000284092 MIR5703 mir-5703 microRNA 5703 ncRNA 287.75-43 chr6 140360680 140360941 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 155558 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 237.75-77 chr7 44744774 44745050 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3654 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 358.5-13 chr2 190967007 190967622 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 46936 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 284.5-64 chr8 82206919 82207201 + 1.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -364774 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 228.25-26 chr14 47438829 47439048 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -95692 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 401-4 chr1 236435076 236435443 + 1.75 NA intron (NM_080738, intron 4 of 5) L2|LINE|L2 39846 NM_080738 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 439.25-5 chr11 95920214 95920654 + 1.75 NA intron (NM_001243571, intron 1 of 17) AluSz6|SINE|Alu 3673 NM_001243571 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 315.25-10 chr17 59388184 59388549 + 1.75 NA exon (NM_001005404, exon 3 of 5) exon (NM_001005404, exon 3 of 5) 22283 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 191.75-48 chr17 62011794 62012020 + 1.75 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) intron (NM_005121, intron 8 of 29) 53371 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 200.5-53 chr17 33971792 33971945 + 1.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 184938 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 161.25-97 chr2 132859027 132859177 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) intron (NM_207481, intron 11 of 17) -56455 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 318.5-15 chr2 36990335 36990604 + 1.75 NA intron (NM_019024, intron 34 of 35) intron (NM_019024, intron 34 of 35) -23933 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 386.25-8 chr22 25924547 25924907 + 1.75 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) L2a|LINE|L2 182539 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 241.5-99 chr8 125545152 125545632 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 113183 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 492.25-2 chr13 105878074 105878697 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 171555 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 373.75-8 chr20 31231653 31232046 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25815 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 209.75-112 chr9 126005116 126005273 + 1.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 257011 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 225.5-109 chrX 124634781 124634938 + 1.75 NA intron (NM_014253, intron 11 of 30) intron (NM_014253, intron 11 of 30) 288577 NM_001114937 4068 Hs.349094 NM_002351 ENSG00000183918 SH2D1A DSHP|EBVS|IMD5|LYP|MTCP1|SAP|SAP/SH2D1A|XLP|XLPD|XLPD1 SH2 domain containing 1A protein-coding 381.25-12 chr6 10008484 10008759 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -395881 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 231.25-59 chr4 57845469 57845609 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 419667 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 449.75-2 chr14 61637927 61638400 + 1.75 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -57350 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 257.25-59 chr9 82067158 82067399 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 78506 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 351-18 chr4 96817574 96817873 + 1.75 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 507020 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 217.75-30 chr17 58976834 58977136 + 1.75 NA intron (NM_014906, intron 6 of 6) intron (NM_014906, intron 6 of 6) 129895 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 301-20 chr4 94834983 94835468 + 1.75 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) intron (NM_001203, intron 1 of 12) 77270 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 326.5-30 chr8 124604047 124604304 + 1.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) AluSx1|SINE|Alu 65052 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 415-5 chr7 6463073 6463389 + 1.75 NA intron (NM_001100603, intron 3 of 3) intron (NM_001100603, intron 3 of 3) -15219 NM_001142936 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 292.25-38 chr6 53373159 53373449 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -24125 NM_001242830 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 455.5-4 chr5 22882553 22883137 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29501 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 181.5-144 chr7 4708342 4708575 + 1.75 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) intron (NM_001037165, intron 1 of 8) 26163 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 281.25-20 chr2 5109274 5109655 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -453242 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 384.5-16 chr7 3435527 3435835 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 134429 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 224.75-4 chr1 40684178 40684318 + 1.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -7456 NM_014223 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 328-15 chr2 150979175 150979377 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 282587 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 338.5-16 chr2 172773874 172774198 + 1.75 NA intron (NM_007023, intron 1 of 30) MER94|DNA|hAT-Blackjack -37830 NR_026995 91149 Hs.711021 NR_026995 ENSG00000228016 RAPGEF4-AS1 - RAPGEF4 antisense RNA 1 ncRNA 290-10 chr11 84778670 84778872 + 1.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MLT2B3|LTR|ERVL -57829 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 314.25-26 chrX 80840555 80840925 + 1.75 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -30863 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 130.25-56 chr14 45620118 45620208 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 95439 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 356.5-11 chr17 20936405 20936751 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1988 NR_160719 339260 Hs.661076 NR_123730 ENSG00000233098 LOC339260 - uncharacterized LOC339260 ncRNA 192.5-61 chr2 687546 687745 + 1.75 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -10239 NM_001352680 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 386.25-4 chr14 57779115 57779462 + 1.75 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1PREC2|LINE|L1 85711 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 310.5-28 chr4 81927593 81927897 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 446246 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 252-28 chr16 46941803 46941969 + 1.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 31788 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 198.5-120 chr5 128857227 128857461 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -107783 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 294.5-52 chr8 111048658 111048906 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -21349 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 249.25 chr1 206618567 206618833 + 1.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -6149 NM_001201478 1939 Hs.497581 NM_006893 ENSG00000143486 EIF2D HCA56|LGTN eukaryotic translation initiation factor 2D protein-coding 225-21 chr12 16278653 16278864 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1073 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 407.5-7 chr21 23877793 23878175 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 443393 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 158.75-2 chr1 48398810 48398961 + 1.75 NA intron (NM_019073, intron 7 of 12) intron (NM_019073, intron 7 of 12) 73319 NM_019073 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 165-37 chr14 37930402 37930517 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28335 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 199.5-41 chr14 58076396 58076579 + 1.75 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) intron (NM_001001872, intron 5 of 7) 75726 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 398.25-9 chr17 50334152 50334896 + 1.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -11602 NR_110010 64132 Hs.463416 NM_022167 ENSG00000015532 XYLT2 PXYLT2|SOS|XT-II|XT2|xylT-II xylosyltransferase 2 protein-coding 314.5-15 chr3 22950779 22950986 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 251696 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 235.25-42 chr21 45084315 45084545 + 1.75 NA intron (NM_001346688, intron 1 of 11) intron (NM_001346688, intron 1 of 11) 9379 NM_001346688 104 Hs.474018 NM_001112 ENSG00000197381 ADARB1 ADAR2|DRABA2|DRADA2|RED1 adenosine deaminase RNA specific B1 protein-coding 138-106 chr3 114264772 114264887 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -27251 NM_007136 7634 Hs.271079 NM_007136 ENSG00000174255 ZNF80 pT17 zinc finger protein 80 protein-coding 283.75-13 chr18 5402727 5403081 + 1.75 NA intron (NM_001281533, intron 15 of 20) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger -105851 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 284.5-27 chr18 44406557 44406752 + 1.75 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) L1M4b|LINE|L1 125043 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 191.25-4 chr1 117827079 117827316 + 1.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 102424 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 195-26 chr14 65371444 65371686 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -36382 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 262-14 chr12 57122013 57122282 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6336 NM_002332 4035 Hs.162757 NM_002332 ENSG00000123384 LRP1 A2MR|APOER|APR|CD91|IGFBP-3R|IGFBP3R|IGFBP3R1|KPA|LRP|LRP1A|TGFBR5 LDL receptor related protein 1 protein-coding 395.75-2 chr11 93960315 93960639 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -60877 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 488.25 chr11 77870679 77871007 + 1.75 NA intron (NR_133637, intron 3 of 4) L1ME3G|LINE|L1 29705 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 184.75-13 chr11 22335968 22336227 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2284 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 367.25-2 chr1 49771431 49771790 + 1.75 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) L1M2|LINE|L1 252344 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 228.25-22 chr14 41222797 41223043 + 1.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 268209 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 229-71 chr7 41805907 41806131 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -102929 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 320.5-31 chr4 36115613 36115964 + 1.75 NA intron (NR_146894, intron 25 of 32) intron (NR_146894, intron 25 of 32) 128151 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 520.75-3 chr9 85896303 85896722 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -44630 NM_001321881 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 206.75-51 chr3 35795155 35795359 + 1.75 NA TTS (NM_001267619) TTS (NM_001267619) 50781 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 153.5-41 chr12 13700677 13700932 + 1.75 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 279552 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 314.75-7 chr18 6576765 6577004 + 1.75 NA intron (NR_120518, intron 3 of 5) intron (NR_120518, intron 3 of 5) 65468 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 274.5-8 chr10 101906538 101906876 + 1.75 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) L2c|LINE|L2 -62787 NM_173192 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 183.25-108 chr7 95906132 95906311 + 1.75 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) MIRb|SINE|MIR 133715 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 290.75-5 chr10 73823200 73823533 + 1.75 NA intron (NM_001367536, intron 16 of 20) AluSx3|SINE|Alu -11546 NR_160744 8509 Hs.654758 NM_003635 ENSG00000166507 NDST2 HSST2|N-HSST 2|NST2 N-deacetylase and N-sulfotransferase 2 protein-coding 191.5-146 chr8 63410881 63411000 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -54909 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 275.25-14 chr12 395431 395800 + 1.75 NA intron (NM_001130148, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu -6029 NM_032358 84318 Hs.631656 NM_032358 ENSG00000120647 CCDC77 - coiled-coil domain containing 77 protein-coding 277-36 chr8 88697457 88697717 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -370104 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 461-2 chr11 116208814 116209418 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -430306 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 188.5-12 chr10 63200690 63200875 + 1.75 NA intron (NM_001322258, intron 9 of 24) intron (NM_001322258, intron 9 of 24) 67454 NM_030759 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 180.75 chr1 50899491 50899645 + 1.75 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) AluSg|SINE|Alu 60699 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 361.75-17 chr8 129680916 129681207 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_130917) promoter-TSS (NR_130917) -822 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 377.25-7 chr19 49470818 49471098 + 1.75 NA TTS (NM_153329) TTS (NM_153329) -3257 NM_001459 2323 Hs.428 NM_001459 ENSG00000090554 FLT3LG FL|FLG3L|FLT3L fms related tyrosine kinase 3 ligand protein-coding 252.75-28 chr2 43431166 43431354 + 1.75 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) L1ME2z|LINE|L1 164714 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 303.5-52 chr9 82844598 82844795 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 218446 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 503-2 chr21 23749029 23749550 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -364454 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 272.75-48 chr7 90422910 90423175 + 1.75 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 19581 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 515.25-3 chr2 59476682 59477265 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 259265 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 347-6 chr12 19096480 19096822 + 1.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -33082 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 194.5-45 chr15 86119932 86120128 + 1.75 NA intron (NM_152336, intron 1 of 24) (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3313 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 385.75-16 chr7 14692804 14693285 + 1.75 NA intron (NM_001350717, intron 9 of 24) intron (NM_001350717, intron 9 of 24) 148406 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 369.5-16 chr2 41683154 41683527 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -194215 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 301.5-41 chr8 117844531 117844894 + 1.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 76201 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 130.5-84 chr13 49571906 49572004 + 1.75 NA intron (NM_001352502, intron 1 of 11) intron (NM_001352502, intron 1 of 11) 13603 NM_001352505 55213 Hs.508021 NM_018191 ENSG00000136144 RCBTB1 CLLD7|CLLL7|GLP|RDEOA RCC1 and BTB domain containing protein 1 protein-coding 489.5-5 chr5 56983460 56983905 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -31552 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 322.75-14 chr3 20156959 20157513 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17050 NR_132785 100874028 Hs.105153 NR_046723 ENSG00000231304 SGO1-AS1 SGOL1-AS1 SGO1 antisense RNA 1 ncRNA 234.25-12 chr10 58791180 58791401 + 1.75 NA intron (NM_001080512, intron 8 of 20) intron (NM_001080512, intron 8 of 20) 76275 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 285.75-35 chr4 164112401 164112605 + 1.75 NA intron (NM_001166373, intron 1 of 7) intron (NM_001166373, intron 1 of 7) 85208 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 268.5-33 chr21 18883658 18883854 + 1.75 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie -123944 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 207-81 chr7 49201860 49202078 + 1.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 277422 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 189.5-29 chr11 68012226 68012418 + 1.75 NA intron (NM_001030010, intron 1 of 8) intron (NM_001030010, intron 1 of 8) 1995 NM_000694 221 Hs.523841 NM_000694 ENSG00000006534 ALDH3B1 ALDH4|ALDH7 aldehyde dehydrogenase 3 family member B1 protein-coding 261.25-46 chr7 38857682 38857956 + 1.75 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) MER4D1|LTR|ERV1 51372 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 371-15 chr20 36403437 36403780 + 1.75 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) L3|LINE|CR1 -57860 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 236.5-22 chr14 20640186 20640416 + 1.75 NA TTS (NM_001001968) TTS (NM_001001968) 1390 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 306.75-20 chr5 176611594 176611932 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1607 NM_052899 114787 Hs.150549 NM_052899 ENSG00000169258 GPRIN1 GRIN1 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 1 protein-coding 183.25-100 chr7 14243345 14243544 + 1.75 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -252019 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 206.25-77 chr4 67857984 67858191 + 1.75 NA intron (NM_004262, intron 2 of 9) intron (NM_004262, intron 2 of 9) 25915 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 219.75-42 chr2 150539882 150540087 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 32237 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 396-4 chr2 1049264 1049590 + 1.75 NA intron (NM_018968, intron 1 of 16) L1MC1|LINE|L1 -98035 NR_136151 101060391 Hs.120377 NR_136151 SNTG2-AS1 - SNTG2 antisense RNA 1 ncRNA 385-19 chr8 123117809 123118130 + 1.75 NA intron (NM_001363156, intron 9 of 19) L1MC4a|LINE|L1 44720 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 297.5-2 chr1 53993887 53994184 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 24151 NM_001276392 388633 Hs.439583 NM_001010978 ENSG00000203985 LDLRAD1 - low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 protein-coding 333.5-12 chr4 123949862 123950227 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 175780 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 370.75-11 chr6 159545772 159546116 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 147297 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 270-2 chr1 45837636 45837883 + 1.75 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) L1ME1|LINE|L1 -26589 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 190.75-108 chr8 103229898 103230064 + 1.75 NA 3' UTR (NM_024812, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_024812, exon 3 of 3) -57841 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 339.25-7 chr18 52625014 52625443 + 1.75 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 285031 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 282.75-3 chr1 87560256 87560462 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -188704 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 314-19 chr6 24181180 24181454 + 1.75 NA intron (NM_016356, intron 8 of 9) intron (NM_016356, intron 8 of 9) 55102 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 298.25-26 chr5 126754410 126754677 + 1.75 NA intron (NR_134485, intron 3 of 3) L1MB7|LINE|L1 21943 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 199.75-50 chr2 129111578 129111726 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 162239 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 322.5-39 chr8 51133650 51133980 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 675630 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 147.75-106 chr3 83283133 83283304 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1297076 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 351.5-8 chr12 23086912 23087173 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -88594 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 257.5-51 chr3 188979762 188980036 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -32260 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 309.25-19 chr3 62445049 62445366 + 1.75 NA intron (NM_003716, intron 27 of 29) intron (NM_003716, intron 27 of 29) -71657 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 283-46 chr8 126489651 126489851 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 68727 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 376.25-14 chr5 92509405 92509906 + 1.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 1061688 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 208.75-62 chr5 12213053 12213221 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -308691 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 299.25-7 chr10 18038725 18038945 + 1.75 NA intron (NM_001282734, intron 11 of 11) intron (NM_001282734, intron 11 of 11) -28273 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 183.75-93 chr5 18831147 18831264 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1023931 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 341.5-6 chr14 84732355 84732676 + 1.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -539417 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 222.25-78 chr7 34776828 34777052 + 1.75 NA intron (NR_015356, intron 1 of 4) L1M1|LINE|L1 -18668 NR_033665 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 342.5-8 chr11 36471143 36471386 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39008 NM_145803 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 218.75-28 chr18 50789860 50790068 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 30052 NM_001127176 83876 Hs.30495 NM_031939 ENSG00000134042 MRO B29|C18orf3 maestro protein-coding 190.75-36 chr17 18047284 18047487 + 1.75 NA intron (NM_024052, intron 2 of 5) LTR90A|LTR|LTR 7977 NM_024052 79018 Hs.187422 NM_024052 ENSG00000141034 GID4 C17orf39|VID2|VID24 GID complex subunit 4 homolog protein-coding 323.75-16 chr4 30679278 30679613 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -40924 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 339.25-15 chr3 58958492 58958827 + 1.75 NA intron (NR_147234, intron 4 of 10) L1ME1|LINE|L1 91366 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 468.25-3 chr6 48471846 48472216 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -403342 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 275.25-29 chr4 119684225 119684523 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -55570 NM_001083 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 295.5-18 chr16 22673478 22673833 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 127957 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 365-6 chr12 119032575 119032922 + 1.75 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 51207 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 249.75-46 chr4 13878388 13878564 + 1.75 NA intron (NR_121681, intron 3 of 3) intron (NR_121681, intron 3 of 3) 223297 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 556.5 chr12 22582104 22582642 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -37827 NM_014802 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 407.5-6 chr2 126227192 126227634 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -109428 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 190-71 chr7 19621469 19621699 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 83852 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 241.5-57 chr20 8046176 8046397 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26525 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 193.5-59 chr16 59122284 59122537 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -388094 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 263-42 chr5 152729494 152729696 + 1.75 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) MER57A-int|LTR|ERV1 242754 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 269-10 chr10 121174910 121175173 + 1.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 323679 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 454-5 chr8 118542381 118542951 + 1.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -78335 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 273.75-33 chr5 39389941 39390159 + 1.75 NA intron (NM_001343, intron 5 of 14) intron (NM_001343, intron 5 of 14) -25555 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 240.25-40 chr20 32486173 32486426 + 1.75 NA intron (NM_001256798, intron 4 of 10) intron (NM_001256798, intron 4 of 10) -2809 NM_001351680 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 400.75-7 chr4 87420857 87421276 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1507 NM_024047 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 149.75-97 chr2 216211672 216211763 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5172 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 348.75-20 chr8 38853584 38853835 + 1.75 NA TTS (NM_001352793) TTS (NM_001352793) -47637 NM_021623 59339 Hs.369123 NM_021623 ENSG00000169499 PLEKHA2 TAPP2 pleckstrin homology domain containing A2 protein-coding 183.5-79 chr2 220921307 220921443 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 650929 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 251.75-56 chr3 152284727 152284996 + 1.75 NA intron (NM_001314057, intron 1 of 11) intron (NM_001314057, intron 1 of 11) -14153 NM_001363870 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 255.25-23 chr2 123377403 123377752 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -304096 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 348-5 chr11 34956993 34957275 + 1.75 NA intron (NM_001166158, intron 3 of 5) L3|LINE|CR1 15297 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 291.5-7 chr10 73280940 73281183 + 1.75 NA intron (NM_001367801, intron 20 of 27) L1M5|LINE|L1 28320 NR_134459 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 347.25-7 chr16 19728559 19728829 + 1.75 NA intron (NM_001305121, intron 2 of 8) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -10467 NM_001348529 400506 Hs.585209 NM_001012991 ENSG00000103550 KNOP1 101F10.1|C16orf88|FAM191A|TSG118 lysine rich nucleolar protein 1 protein-coding 293.25-23 chr4 79441948 79442136 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33814 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 228.25-78 chr7 32140002 32140150 + 1.75 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -68640 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 255-37 chr3 109070645 109070855 + 1.75 NA intron (NM_014429, intron 8 of 27) intron (NM_014429, intron 8 of 27) -30706 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 210.25-61 chr5 4314489 4314730 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -458872 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 384-7 chr2 1882516 1882824 + 1.75 NA intron (NM_015025, intron 18 of 24) intron (NM_015025, intron 18 of 24) -138155 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 230.75-40 chr20 47417398 47417632 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5371 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 369.5-7 chr14 97533358 97533727 + 1.75 NA intron (NR_110166, intron 2 of 4) intron (NR_110166, intron 2 of 4) 74726 NR_110165 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 255.5-45 chr2 216162161 216162336 + 1.75 NA intron (NM_021141, intron 16 of 20) intron (NM_021141, intron 16 of 20) 52900 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 386.75-8 chr7 1465112 1465675 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5923 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 419.25-11 chrX 107296638 107297217 + 1.75 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 90295 NM_001169154 139212 Hs.128836 NM_173494 ENSG00000080572 PIH1D3 CILD36|CXorf41|DNAAF6|NYSAR97|TWISTER PIH1 domain containing 3 protein-coding 183.75-55 chr2 58455289 58455550 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -65334 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 184.25-91 chr4 66610565 66610857 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 333887 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 495.25 chr1 82583245 82583575 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -319773 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 237.25-32 chr15 57858503 57858875 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 151975 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 348-2 chr1 184269936 184270152 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -116985 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 386-13 chr9 99327127 99327544 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 47922 NR_102270 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 257.5-25 chr16 9793565 9793820 + 1.75 NA intron (NM_001134408, intron 11 of 13) intron (NM_001134408, intron 11 of 13) -338187 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 281.75 chr1 103327419 103327707 + 1.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 197948 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 145.75-71 chr2 11097722 11097824 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 34403 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 414 chr12 34510695 34511308 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 488505 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 248.25-22 chr15 57160363 57160624 + 1.75 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -58937 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 405-7 chr18 72903915 72904301 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 35068 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 314.25-23 chr7 105195687 105196026 + 1.75 NA intron (NM_182692, intron 3 of 15) L2a|LINE|L2 73221 NM_001350744 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 197.25-26 chr13 37568411 37568557 + 1.75 NA intron (NM_001286667, intron 17 of 18) intron (NM_001286667, intron 17 of 18) 30284 NM_006475 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 350.5-9 chr12 4469200 4469626 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23799 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 439.25-4 chr11 83284218 83284526 + 1.75 NA intron (NM_001286116, intron 1 of 8) intron (NM_001286116, intron 1 of 8) 2035 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 483.5-5 chr7 33588350 33588853 + 1.75 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) L2a|LINE|L2 -316314 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 202-56 chr5 118220264 118220512 + 1.75 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -62186 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 339.5-3 chr1 189834990 189835195 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 640918 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 221.75-19 chr14 43746545 43746717 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 760652 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 324.25-5 chr16 62274167 62274461 + 1.75 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR -237876 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 286-37 chr9 69906628 69906840 + 1.75 NA TTS (NR_131756) TTS (NR_131756) 85917 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 186.75-6 chr1 159610835 159610947 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 23065 NM_001639 325 Hs.507080 NM_001639 ENSG00000132703 APCS HEL-S-92n|PTX2|SAP amyloid P component, serum protein-coding 331.75-8 chr14 60829388 60829728 + 1.75 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) intron (NM_002431, intron 6 of 7) 94797 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 161-68 chr2 131094804 131094952 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1418 NM_001009993 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 223.25-14 chr12 121946246 121946439 + 1.75 NA intron (NM_001178003, intron 7 of 17) L1ME1|LINE|L1 27750 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 222.25-63 chr4 177103238 177103480 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -206515 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 202.75-38 chr15 59419216 59419402 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -18877 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 196.25-55 chr2 18781199 18781326 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -191682 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 530 chr5 44712062 44712701 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 96412 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 445.5-7 chr7 116675028 116675407 + 1.75 NA intron (NM_001324402, intron 1 of 19) intron (NM_001324402, intron 1 of 19) 3021 NM_001127500 4233 Hs.132966 NM_000245 ENSG00000105976 MET AUTS9|DFNB97|HGFR|RCCP2|c-Met MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 281.5-13 chr11 10447435 10447775 + 1.75 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -2716 NM_001172431 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 198.5-149 chr8 110539413 110539671 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 487891 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 298.5-18 chr2 125329393 125329598 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 788490 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 276.75-20 chr2 11135206 11135528 + 1.75 NA intron (NM_182500, intron 1 of 3) L1MB1|LINE|L1 2239 NM_001371321 377-5 chr2 130972810 130973187 + 1.75 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) MER92-int|LTR|ERV1 120164 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 556.75-2 chr17 61573704 61574234 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 17250 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 233.25-26 chr15 96763671 96763884 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 17877 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 347.25-11 chr2 224483126 224483486 + 1.75 NA intron (NM_001257197, intron 12 of 14) L1M3|LINE|L1 -81199 NM_001122779 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 337.5-30 chr8 16928603 16928846 + 1.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 73621 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 243.25-19 chr16 87062290 87062524 + 1.75 NA intron (NR_126008, intron 2 of 2) intron (NR_126008, intron 2 of 2) 4623 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 405.25 chr1 78331225 78331960 + 1.75 NA intron (NR_027310, intron 3 of 5) intron (NR_027310, intron 3 of 5) 101993 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 265.5-17 chr12 53808444 53808690 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -51533 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 395-10 chr2 226677966 226678460 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19420 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 308.25-22 chr3 163875790 163876161 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 295581 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 197-60 chr7 4546593 4546711 + 1.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -135643 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 346.5-19 chr22 27851146 27851356 + 1.75 NA TTS (NM_001284277) TTS (NM_001284277) -49495 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 311-18 chr2 81164466 81164894 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 302266 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 139.25-179 chr7 51897463 51897551 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -504251 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 208.25-89 chr8 56982923 56983172 + 1.75 NA intron (NM_017813, intron 1 of 4) L1MB8|LINE|L1 10820 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 182-32 chr14 59774845 59775096 + 1.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 95806 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 190.5-62 chr17 63308390 63308581 + 1.75 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) intron (NM_025185, intron 8 of 25) 131782 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 378.75-8 chr5 156656231 156656654 + 1.75 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -193853 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 205.25-102 chr7 88076262 88076416 + 1.75 NA intron (NM_001324421, intron 4 of 28) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -140321 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 279.75-18 chr19 28635016 28635243 + 1.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1PA15-16|LINE|L1 28441 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 348.75-15 chr4 64289346 64289612 + 1.75 NA intron (NM_001363796, intron 9 of 11) intron (NM_001363796, intron 9 of 11) 119971 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 222.25-13 chr12 13926919 13927145 + 1.75 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) L3|LINE|CR1 53324 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 285-4 chr1 200275523 200275699 + 1.75 NA Intergenic LTR72|LTR|ERV1 98181 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 189.5-94 chr3 179318564 179318714 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4392 NM_001303425 51193 Hs.632578 NM_016331 ENSG00000121864 ZNF639 ANC-2H01|ANC_2H01|ZASC1 zinc finger protein 639 protein-coding 312.25-10 chr17 55132334 55132621 + 1.75 NA intron (NM_178509, intron 16 of 17) AluSx|SINE|Alu -132483 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 254.75-13 chr14 36996077 36996276 + 1.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -43785 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 226.75-11 chr11 37014801 37014986 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -416614 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 215.25-19 chr12 48628310 48628489 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 26119 NR_002968 677815 Hs.689717 NR_002968 ENSG00000221491 SNORA2C ACA34|MIR1291|SNORA34 small nucleolar RNA, H/ACA box 2C snoRNA 211.25-70 chr5 21203369 21203579 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -256006 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 550.25-2 chr6 72183820 72184229 + 1.75 NA intron (NM_014989, intron 6 of 33) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -28869 NM_001350455 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 346.25-2 chr10 85701229 85701447 + 1.75 NA intron (NM_017551, intron 12 of 15) intron (NM_017551, intron 12 of 15) 123607 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 288.25-7 chr14 21231715 21231972 + 1.75 NA intron (NM_031314, intron 3 of 8) intron (NM_031314, intron 3 of 8) -24943 NR_038971 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 222.25-70 chr5 85527039 85527281 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -755284 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 200.75-52 chr2 57890982 57891285 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16518 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 211.5-97 chr22 35498520 35498765 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -41852 NM_001366725 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 160-49 chr19 33052367 33052516 + 1.75 NA intron (NM_033103, intron 1 of 14) intron (NM_033103, intron 1 of 14) 12447 NM_033103 85415 Hs.466435 NM_033103 ENSG00000131941 RHPN2 P76RBE|RHOBP rhophilin Rho GTPase binding protein 2 protein-coding 236.5-65 chr3 167713000 167713209 + 1.75 NA intron (NM_145859, intron 3 of 8) L1MA3|LINE|L1 21738 NM_145860 11235 Hs.478150 NM_007217 ENSG00000114209 PDCD10 CCM3|TFAR15 programmed cell death 10 protein-coding 322.75-10 chr2 166972937 166973143 + 1.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 84553 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 420.5-5 chr15 98015696 98016019 + 1.75 NA intron (NR_146563, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 12819 NR_146563 105371008 NR_146563 LINC02251 - long intergenic non-protein coding RNA 2251 ncRNA 293-18 chr21 39462852 39463194 + 1.75 NA intron (NM_001317740, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 11169 NM_007341 6450 Hs.473847 NM_007341 ENSG00000185437 SH3BGR 21-GARP SH3 domain binding glutamate rich protein protein-coding 273.5-77 chr8 14905429 14905717 + 1.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) L1ME5|LINE|L1 -52063 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 449.75-6 chr4 95035891 95036223 + 1.75 NA intron (NM_001256792, intron 1 of 10) L1PB2|LINE|L1 -15620 NM_001256793 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 239.75-30 chr18 21471669 21471915 + 1.75 NA intron (NM_001142966, intron 15 of 32) AluSz|SINE|Alu 128912 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 231.5-65 chr3 98846633 98846898 + 1.75 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) intron (NM_080927, intron 3 of 15) 54930 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 195.5-57 chr18 56670035 56670170 + 1.75 NA intron (NM_015285, intron 1 of 27) intron (NM_015285, intron 1 of 27) 18717 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 256.75-21 chr18 71378976 71379151 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 199893 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 282.5-2 chr1 33784022 33784272 + 1.75 NA intron (NM_052896, intron 12 of 69) intron (NM_052896, intron 12 of 69) -76328 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 335-20 chr8 94359172 94359465 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 77626 NM_001256141 100861412 Hs.30561 NM_001256141 ENSG00000265817 FSBP - fibrinogen silencer binding protein protein-coding 256.5-49 chr4 55156474 55156746 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -31015 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 315.25-26 chr5 18640775 18641150 + 1.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 833688 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 419.5-3 chr7 33208391 33208919 + 1.75 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) L1MC4|LINE|L1 79091 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 133.75-28 chr11 22100335 22100422 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -92707 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 201.5-43 chr12 127916565 127916773 + 1.75 NA intron (NR_046392, intron 1 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 1259 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 346.5-13 chr2 50974785 50975077 + 1.75 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) MER112|DNA|hAT-Charlie 57201 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 331.25-9 chr2 129920287 129920594 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -2737 NR_110285 101927924 Hs.570248 NR_110285 ENSG00000237574 LINC01856 - long intergenic non-protein coding RNA 1856 ncRNA 168.75-27 chr11 75558274 75558446 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3893 NM_001207014 871 Hs.596449 NM_001235 ENSG00000149257 SERPINH1 AsTP3|CBP1|CBP2|HSP47|OI10|PIG14|PPROM|RA-A47|SERPINH2|gp46 serpin family H member 1 protein-coding 485.75 chr2 115212285 115212808 + 1.75 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 50391 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 392.75-9 chr7 55468716 55469175 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 57935 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 468.5-3 chr16 35664904 35665401 + 1.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -81400 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 280.25-35 chr22 44936591 44936799 + 1.75 NA intron (NM_001284296, intron 2 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 66924 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 266.25-31 chr3 94903585 94903817 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34562 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 180-16 chr11 78115923 78116111 + 1.75 NA intron (NM_001007027, intron 5 of 13) intron (NM_001007027, intron 5 of 13) 23609 NM_024079 79053 Hs.503368 NM_024079 ENSG00000159063 ALG8 CDG1H|PCLD3 ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 174.5-97 chr2 71417417 71417682 + 1.75 NA intron (NM_001252613, intron 20 of 27) intron (NM_001252613, intron 20 of 27) -36012 NM_003494 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 325.75-22 chr4 36956515 36956863 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -45090 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 251.25-2 chr1 80163995 80164267 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -371624 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 366.25-10 chr3 120544849 120545094 + 1.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -51365 NM_001168331 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 279.5-32 chr2 199861681 199861871 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10603 NM_001350853 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 347.25-4 chr15 42515958 42516334 + 1.75 NA intron (NM_130798, intron 5 of 6) intron (NM_130798, intron 5 of 6) 20512 NM_003825 8773 Hs.511149 NM_003825 ENSG00000092531 SNAP23 HsT17016|SNAP-23|SNAP23A|SNAP23B synaptosome associated protein 23 protein-coding 384.75-3 chr11 42060285 42060767 + 1.75 NA intron (NR_135065, intron 6 of 9) intron (NR_135065, intron 6 of 9) 24932 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 344.75-6 chr3 101184826 101185071 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 135627 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 140.75-187 chr8 120158000 120158126 + 1.75 NA intron (NM_021110, intron 2 of 47) intron (NM_021110, intron 2 of 47) 32961 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 312.75-35 chr9 114879322 114879557 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 51156 NM_001252290 944 Hs.494901 NM_001244 ENSG00000106952 TNFSF8 CD153|CD30L|CD30LG|TNLG3A TNF superfamily member 8 protein-coding 213.75-41 chr17 8601409 8601666 + 1.75 NA intron (NM_001256012, intron 3 of 42) intron (NM_001256012, intron 3 of 42) 29188 NM_001256012 4628 Hs.16355 NM_005964 ENSG00000133026 MYH10 NMMHC-IIB|NMMHCB myosin heavy chain 10 protein-coding 383-11 chr2 107371856 107372245 + 1.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -22525 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 129.5-28 chr10 98069425 98069529 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -38649 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 407-13 chrX 25026062 25026455 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10293 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 317.5-12 chr2 15343457 15343899 + 1.75 NA intron (NR_052013, intron 35 of 50) intron (NR_052013, intron 35 of 50) 217656 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 115.75-31 chr11 106016097 106016219 + 1.75 NA intron (NM_001318750, intron 1 of 2) intron (NM_001318750, intron 1 of 2) 6082 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 284.25-21 chr3 145505713 145505979 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 563339 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 174.75-5 chr1 113273783 113273916 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -67596 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 214-47 chr4 35667947 35668149 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 575891 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 244.5-41 chr18 5250498 5250686 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 12492 NR_015389 339290 Hs.643553 NR_015389 ENSG00000263753 LINC00667 - long intergenic non-protein coding RNA 667 ncRNA 254.25-28 chr18 4566602 4567003 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -111495 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 364.25-4 chr11 82544638 82544876 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -140844 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 224.5-70 chr20 52355238 52355658 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -163463 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 203-72 chr4 88939855 88940050 + 1.75 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -116591 NM_001015045 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 132.5-149 chr21 29869918 29870029 + 1.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) MER53|DNA|hAT 70023 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 271.75-38 chr5 164952630 164952912 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 482492 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 431.75-3 chr22 36330151 36330476 + 1.75 NA intron (NM_002473, intron 3 of 40) intron (NM_002473, intron 3 of 40) -43406 NR_106877 102465491 NR_106877 ENSG00000278420 MIR6819 hsa-mir-6819 microRNA 6819 ncRNA 304.25-10 chr14 79561806 79562009 + 1.75 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 282527 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 155-46 chr15 53238552 53238721 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 122271 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 468-4 chr11 124962150 124962596 + 1.75 NA intron (NM_025004, intron 4 of 15) L1MC5|LINE|L1 8171 NM_025004 80071 Hs.287555 NM_025004 ENSG00000149548 CCDC15 - coiled-coil domain containing 15 protein-coding 525 chr15 99583427 99583885 + 1.75 NA intron (NM_001352616, intron 1 of 10) intron (NM_001352616, intron 1 of 10) 17173 NM_001352616 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 243.75-85 chr9 87463553 87463859 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33522 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 279.25-23 chr2 182281571 182281842 + 1.75 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -39643 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 344.5-11 chr22 27486172 27486439 + 1.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 175654 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 176.5-178 chr8 129290671 129290901 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -49546 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 524.75 chr6 134820771 134821193 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 129119 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 382-4 chr1 217189165 217189445 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -51603 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 274.75-35 chr3 109094159 109094338 + 1.75 NA intron (NM_014429, intron 7 of 27) intron (NM_014429, intron 7 of 27) -7208 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 197.25-66 chr22 45048415 45048728 + 1.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -38566 NM_138415 112885 Hs.254097 NM_138415 ENSG00000056487 PHF21B BHC80L|PHF4 PHD finger protein 21B protein-coding 286.5-17 chr11 109580725 109580952 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 158648 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 298.5-43 chr8 102491754 102491961 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -59732 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 451.25-3 chr8 109347964 109348240 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 13755 NM_001193557 56943 Hs.492555 NM_020189 ENSG00000120533 ENY2 DC6|Sus1|e(y)2 ENY2 transcription and export complex 2 subunit protein-coding 384.25 chr1 62416488 62416816 + 1.75 NA Intergenic (TGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19652 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 277.75-26 chr5 146598315 146598562 + 1.75 NA intron (NM_181678, intron 9 of 10) L2a|LINE|L2 -82325 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 269.25-61 chrUn_GL000216v2 59668 59915 + 1.75 NA NA (TTCCATTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 261.75-11 chr12 123704757 123704953 + 1.75 NA intron (NM_001143850, intron 15 of 17) intron (NM_001143850, intron 15 of 17) -7498 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 325.75-18 chr3 115140619 115140853 + 1.75 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) 6552 NM_015642 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 271.5-46 chr20 11354757 11355091 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -81541 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 198.75-55 chr20 44957832 44958051 + 1.75 NA intron (NM_006809, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 2456 NM_006809 10953 Hs.517066 NM_006809 ENSG00000025772 TOMM34 HTOM34P|TOM34|URCC3 translocase of outer mitochondrial membrane 34 protein-coding 213.25-25 chr17 61016848 61017042 + 1.75 NA intron (NM_001320470, intron 16 of 25) intron (NM_001320470, intron 16 of 25) 339094 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 363.5-2 chr1 183535658 183535887 + 1.75 NA intron (NM_001331007, intron 11 of 23) intron (NM_001331007, intron 11 of 23) 54832 NM_001190789 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 303.25-28 chr6 62221844 62222121 + 1.75 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) L1MEg|LINE|L1 64243 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 205.5-74 chr2 123091728 123091901 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18333 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 300.25-25 chr6 65469097 65469299 + 1.75 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) MER53|DNA|hAT 110606 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 657 chr2 54912777 54913713 + 1.75 NA intron (NM_001039753, intron 24 of 40) AluJb|SINE|Alu 97027 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 308.5-40 chr9 29666976 29667175 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -453474 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 358-2 chr1 199191768 199192022 + 1.75 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) HAL1ME|LINE|L1 43297 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 260.5-40 chr3 24782550 24782733 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -46682 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 284-49 chr8 134731133 134731380 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -18225 NM_001289394 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 261.5-56 chr6 49047161 49047378 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 415984 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 163-34 chr13 111244503 111244614 + 1.75 NA intron (NM_001330597, intron 8 of 18) intron (NM_001330597, intron 8 of 18) 3384 NM_001354055 8874 Hs.508738 NM_003899 ENSG00000102606 ARHGEF7 BETA-PIX|COOL-1|COOL1|Nbla10314|P50|P50BP|P85|P85COOL1|P85SPR|PAK3|PIXB Rho guanine nucleotide exchange factor 7 protein-coding 243-66 chr6 158319233 158319485 + 1.75 NA intron (NM_020245, intron 1 of 13) intron (NM_020245, intron 1 of 13) -3623 NR_145798 109623462 NR_145798 SNORA116 - small nucleolar RNA, H/ACA box 116 snoRNA 198-10 chr10 26086785 26086959 + 1.75 NA intron (NM_017433, intron 14 of 34) intron (NM_017433, intron 14 of 34) -129435 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 248-23 chr14 59618441 59618677 + 1.75 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) LTR8|LTR|ERV1 -8420 NM_001363702 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 136.25-28 chr11 15677257 15677441 + 1.75 NA intron (NM_001293172, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 33464 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 314-18 chr5 177528419 177528677 + 1.75 NA intron (NM_001190946, intron 5 of 8) intron (NM_001190946, intron 5 of 8) -11587 NM_001321732 51428 Hs.484288 NM_016222 ENSG00000183258 DDX41 ABS|MPLPF DEAD-box helicase 41 protein-coding 388.75-4 chr2 42803350 42803648 + 1.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -10916 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 293.25-19 chr4 30944226 30944527 + 1.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 224007 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 416.25-12 chr4 92670401 92670774 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 366188 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 240.5-105 chr8 87519206 87519432 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 354696 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 335.25-32 chr8 123317184 123317481 + 1.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -30702 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 264.75-24 chr2 110143353 110143538 + 1.75 NA intron (NM_207181, intron 16 of 19) intron (NM_207181, intron 16 of 19) -26879 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 179.25-155 chrX 98805833 98805978 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -1241370 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 176.75-37 chr14 57969363 57969493 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -103336 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 390.75-2 chr1 152225145 152225471 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1112 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 227.25-18 chr11 73445700 73445873 + 1.75 NA intron (NM_001286051, intron 2 of 5) MIR1_Amn|SINE|MIR 69118 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 347.5 chr10 27084461 27084697 + 1.75 NA intron (NM_014915, intron 5 of 33) intron (NM_014915, intron 5 of 33) 15919 NM_014915 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 533.75 chr17 60874851 60875284 + 1.75 NA intron (NM_001330413, intron 9 of 25) intron (NM_001330413, intron 9 of 25) 197216 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 273.5-32 chr2 142097024 142097327 + 1.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 34526 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 305.5-6 chr1 238875551 238875798 + 1.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -389657 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 221.75-87 chr8 124004306 124004500 + 1.75 NA intron (NR_040044, intron 4 of 5) intron (NR_040044, intron 4 of 5) 36379 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 321.25-26 chr9 14929022 14929305 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -18168 NR_163238 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 170.75-34 chr14 57381384 57381488 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9150 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 434.25-3 chr11 44048833 44049164 + 1.75 NA intron (NM_001031854, intron 1 of 13) L2b|LINE|L2 1017 NM_001031854 390110 Hs.558851 NM_001031854 ENSG00000205126 ACCSL - 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) like protein-coding 215.75-25 chr12 14462150 14462372 + 1.75 NA intron (NM_181352, intron 9 of 14) intron (NM_181352, intron 9 of 14) 76980 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 209.75-75 chr5 63298615 63298847 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 663561 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 130.5-20 chr1 188623026 188623123 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1179446 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 262-61 chr8 129498760 129499123 + 1.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -14799 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 217-58 chr4 30388716 30388940 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -331541 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 229.75-20 chr15 42985308 42985747 + 1.75 NA intron (NM_174916, intron 35 of 46) AluSq2|SINE|Alu -64749 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 357.5-7 chr14 45104889 45105180 + 1.75 NA intron (NM_017922, intron 5 of 13) L2a|LINE|L2 -5841 NR_003691 100113389 Hs.712501 NR_003691 ENSG00000239043 SNORD127 - small nucleolar RNA, C/D box 127 snoRNA 822.25 chr8 130788034 130789124 + 1.75 NA intron (NM_001115, intron 15 of 17) L1MA6|LINE|L1 252330 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 434.75-8 chr7 98399145 98399543 + 1.75 NA intron (NM_018842, intron 1 of 13) intron (NM_018842, intron 1 of 13) 1746 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 255.5-84 chr8 79550206 79550375 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -60827 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 339.75-31 chr7 39625984 39626338 + 1.75 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) intron (NM_005402, intron 1 of 4) 2589 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 320.25-27 chr8 47852114 47852384 + 1.75 NA intron (NM_001081640, intron 52 of 84) intron (NM_001081640, intron 52 of 84) 107887 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 175.25-145 chr8 117993644 117993785 + 1.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MER103C|DNA|hAT-Charlie -72801 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 189.25-90 chr4 65866800 65866935 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -196372 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 465.5-2 chr20 33240771 33241235 + 1.75 NA intron (NM_001243193, intron 5 of 8) intron (NM_001243193, intron 5 of 8) 5007 NM_001243193 51297 Hs.211092 NM_016583 ENSG00000198183 BPIFA1 LUNX|NASG|PLUNC|SPLUNC1|SPURT|bA49G10.5 BPI fold containing family A member 1 protein-coding 264.5-2 chr1 176798834 176799083 + 1.75 NA intron (NM_020318, intron 20 of 22) intron (NM_020318, intron 20 of 22) 230487 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 406.75-9 chr20 7153812 7154142 + 1.75 NA intron (NR_110609, intron 5 of 7) intron (NR_110609, intron 5 of 7) 100225 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 244.5-67 chr3 101336129 101336344 + 1.75 NA intron (NM_020654, intron 17 of 23) intron (NM_020654, intron 17 of 23) -15661 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 308.25-13 chr17 81683718 81684097 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001040025) promoter-TSS (NM_001040025) 17 NM_001329608 339231 Hs.658789 NM_001040025 ENSG00000214087 ARL16 - ADP ribosylation factor like GTPase 16 protein-coding 392.75-7 chr18 51977151 51977439 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -362902 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 264.5-7 chr10 33304124 33304378 + 1.75 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 30416 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 387.25-7 chr2 76540960 76541540 + 1.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -444715 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 132.75-190 chr8 125037060 125037174 + 1.75 NA intron (NM_014846, intron 26 of 28) intron (NM_014846, intron 26 of 28) 38612 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 367.75-6 chr16 57122926 57123324 + 1.75 NA intron (NM_152727, intron 9 of 15) MER113|DNA|hAT-Charlie 30542 NM_152727 221184 Hs.339809 NM_152727 ENSG00000140848 CPNE2 COPN2|CPN2 copine 2 protein-coding 273.5-73 chr7 47169636 47169922 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 295024 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 338.5-25 chr5 133225551 133225842 + 1.75 NA exon (NM_015082, exon 9 of 16) exon (NM_015082, exon 9 of 16) 173683 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 226-66 chr7 90951899 90952160 + 1.75 NA intron (NM_012395, intron 7 of 13) L2|LINE|L2 242213 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 435.5-4 chr13 61883813 61884307 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 145488 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 568.75 chr1 40363762 40364347 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9673 NM_022733 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 230-4 chr1 192172967 192173234 + 1.75 NA intron (NM_130782, intron 3 of 4) intron (NM_130782, intron 3 of 4) 14638 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 137.5-237 chr8 144188337 144188422 + 1.75 NA intron (NM_001099281, intron 6 of 11) intron (NM_001099281, intron 6 of 11) 39734 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 263-5 chr1 217702271 217702502 + 1.75 NA intron (NM_138796, intron 5 of 10) L1MEd|LINE|L1 71042 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 334 chr1 108853991 108854331 + 1.75 NA intron (NM_152763, intron 1 of 15) intron (NM_152763, intron 1 of 15) 2933 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 262.5-69 chr7 78751612 78751912 + 1.75 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) L1MEf|LINE|L1 -257226 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 321.75-7 chr12 116981823 116982123 + 1.75 NA intron (NR_103809, intron 2 of 3) L1MEc|LINE|L1 5364 NR_103809 100506551 Hs.657861 NR_103809 ENSG00000257279 LOC100506551 - uncharacterized LOC100506551 ncRNA 206.5-143 chr9 28653469 28653652 + 1.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 65745 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 270.75-47 chr6 151693118 151693395 + 1.75 NA intron (NM_001122742, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 2760 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 226-14 chr12 101783286 101783447 + 1.75 NA intron (NM_024312, intron 5 of 20) intron (NM_024312, intron 5 of 20) -43894 NM_153694 50511 Hs.506504 NM_153694 ENSG00000139351 SYCP3 COR1|RPRGL4|SCP3|SPGF4 synaptonemal complex protein 3 protein-coding 389.75-5 chr5 112946217 112946573 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -24168 NM_005669 7905 Hs.429608 NM_005669 ENSG00000129625 REEP5 C5orf18|D5S346|DP1|TB2|YOP1|Yip2e receptor accessory protein 5 protein-coding 253.75-31 chr22 28134920 28135312 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) L1MDa|LINE|L1 -214504 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 190.5-45 chr14 61193392 61193514 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 87885 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 358.75 chr1 104545754 104546218 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 472963 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 360.75-12 chr5 11192568 11192889 + 1.75 NA intron (NM_001288715, intron 10 of 20) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 396189 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 230-67 chr8 96115511 96115698 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 45202 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 403.25-9 chr5 133548716 133549095 + 1.75 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) L1ME3B|LINE|L1 63636 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 251.75-7 chr1 237531363 237531563 + 1.75 NA intron (NM_001035, intron 25 of 104) intron (NM_001035, intron 25 of 104) 60344 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 215.75-90 chr6 148049084 148049240 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -223166 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 325.75-31 chrX 76970389 76970932 + 1.75 NA intron (NR_110403, intron 1 of 3) intron (NR_110403, intron 1 of 3) 34841 NR_029905 442899 NR_029905 ENSG00000207995 MIR325 MIRN325|hsa-mir-325 microRNA 325 ncRNA 261-39 chr4 37145818 37146113 + 1.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 96026 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 332.5-7 chr15 91678859 91679226 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -174666 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 356.75-12 chr5 41639853 41640261 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -129456 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 169.5-131 chr5 8074555 8074747 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 205503 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 353.5-4 chr12 43959417 43959789 + 1.75 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 123522 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 229-73 chr7 103930605 103930741 + 1.75 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) AluJr|SINE|Alu 58843 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 217.25-89 chr9 89290163 89290379 + 1.75 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -20924 NM_001827 1164 Hs.83758 NM_001827 ENSG00000123975 CKS2 CKSHS2 CDC28 protein kinase regulatory subunit 2 protein-coding 302.5-43 chr7 41777181 41777389 + 1.75 NA non-coding (NR_027118, exon 4 of 4) non-coding (NR_027118, exon 4 of 4) -74195 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 308.5-30 chr6 37740752 37741039 + 1.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -43012 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 143.5-171 chr5 38403266 38403358 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_182798) promoter-TSS (NM_182798) 159 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 399.75-6 chr17 70620254 70620577 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 450880 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 386.75-3 chr2 16385757 16386114 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 279899 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 378.5-2 chr10 69928249 69928478 + 1.75 NA intron (NM_080801, intron 25 of 38) L1ME2|LINE|L1 -124483 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 115-12 chr1 186174518 186174602 + 1.75 NA exon (NM_031935, exon 103 of 107) exon (NM_031935, exon 103 of 107) -121713 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 272.25-26 chr2 60458154 60458435 + 1.75 NA 3' UTR (NM_022893, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_022893, exon 4 of 4) -66919 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 500.25-3 chr7 105030375 105030907 + 1.75 NA intron (NM_182931, intron 1 of 26) intron (NM_182931, intron 1 of 26) 16436 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 195.25-6 chr1 88801538 88801742 + 1.75 NA intron (NM_001320707, intron 8 of 20) intron (NM_001320707, intron 8 of 20) 89927 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 482-3 chr4 74764789 74765143 + 1.75 NA intron (NM_001316963, intron 2 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 29557 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 292.5-4 chr1 167966499 167966774 + 1.75 NA exon (NM_018442, exon 3 of 20) exon (NM_018442, exon 3 of 20) -29564 NM_001143674 25874 Hs.517768 NM_015415 ENSG00000143158 MPC2 BRP44|SLC54A2 mitochondrial pyruvate carrier 2 protein-coding 351.25-3 chr13 30253931 30254351 + 1.75 NA intron (NM_032116, intron 4 of 10) intron (NM_032116, intron 4 of 10) 52870 NM_001014380 84056 Hs.243596 NM_032116 ENSG00000102781 KATNAL1 - katanin catalytic subunit A1 like 1 protein-coding 268.5-41 chr3 147429676 147429980 + 1.75 NA intron (NR_121655, intron 1 of 2) intron (NR_121655, intron 1 of 2) 8501 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 486.75-4 chr21 27282506 27283126 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -315728 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 243-43 chr21 26910836 26911002 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -43042 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 379.75-12 chr9 29150229 29150637 + 1.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1P4a|LINE|L1 61866 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 326-4 chr10 82245154 82245498 + 1.75 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) MER1A|DNA|hAT-Charlie -12406 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 351-28 chr8 86021106 86021361 + 1.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 48435 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 389.25 chr1 30733582 30733830 + 1.75 NA 3' UTR (NM_006762, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_006762, exon 8 of 8) 5526 NR_039616 100616164 NR_039616 ENSG00000264773 MIR4420 mir-4420 microRNA 4420 ncRNA 208.25-28 chr15 26661962 26662201 + 1.75 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) -32991 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 292.25-27 chr22 37721426 37721602 + 1.75 NA intron (NM_001039141, intron 6 of 23) AluJb|SINE|Alu 24430 NR_160696 102724378 NR_160696 LOC102724378 - uncharacterized LOC102724378 ncRNA 189.25-6 chr1 194127945 194128148 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 823301 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 213-10 chr1 182736177 182736316 + 1.75 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 23384 NR_146548 105371644 Hs.496952 NR_146548 ENSG00000227181 LINC01688 - long intergenic non-protein coding RNA 1688 ncRNA 218.75-59 chr3 143009494 143009773 + 1.75 NA intron (NM_001080415, intron 1 of 27) intron (NM_001080415, intron 1 of 27) 8063 NM_001320219 23350 Hs.596572 NM_001080415 ENSG00000163714 U2SURP SR140|fSAPa U2 snRNP associated SURP domain containing protein-coding 345.75-8 chr3 59095563 59096067 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -45783 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 271-27 chr20 31249469 31249664 + 1.75 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -8098 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 316.25-12 chr3 94522042 94522262 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -416111 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 259.5-96 chr8 113363438 113363646 + 1.75 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 13610 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 230-13 chr10 98112862 98113220 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -21583 NM_001256620 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 194.5-36 chr14 47405026 47405365 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -61949 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 255.5-50 chr21 16308503 16308674 + 1.75 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -23820 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 374.75-2 chr2 43597640 43598129 + 1.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 -1838 NM_001345925 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 374-2 chr10 106152023 106152249 + 1.75 NA intron (NR_134330, intron 1 of 4) L1MA9|LINE|L1 11971 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 398-2 chr14 69035818 69036130 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 56292 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 242.75-19 chr15 59271645 59271918 + 1.75 NA intron (NM_004998, intron 2 of 27) intron (NM_004998, intron 2 of 27) 64938 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 273-32 chr20 22813537 22813796 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -128322 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 402-4 chr2 21594943 21595464 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 115449 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 187.75-54 chr2 169354641 169354818 + 1.75 NA intron (NM_004525, intron 1 of 78) intron (NM_004525, intron 1 of 78) 7805 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 292-45 chr8 86642352 86642531 + 1.75 NA intron (NM_019098, intron 10 of 17) intron (NM_019098, intron 10 of 17) 101234 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 297.5-24 chr2 55667733 55667952 + 1.75 NA intron (NM_033109, intron 12 of 27) intron (NM_033109, intron 12 of 27) 26002 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 306.25-2 chr1 66347719 66347959 + 1.75 NA intron (NM_001037339, intron 1 of 9) intron (NM_001037339, intron 1 of 9) -6696 NM_001297442 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 160.25-147 chr7 31989340 31989530 + 1.75 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 80972 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 285.75-13 chr14 76033898 76034161 + 1.75 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) intron (NR_045664, intron 3 of 7) 48266 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 333.5-11 chr4 92784820 92785378 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 480700 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 319.5-28 chr2 232182005 232182322 + 1.75 NA intron (NR_046477, intron 8 of 18) L1MB7|LINE|L1 9510 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 383-18 chr8 11602429 11602828 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 26093 NR_040035 83655 Hs.742430 NR_040035 ENSG00000170983 LINC00208 C8orf14|NCRNA00208|VIR35 long intergenic non-protein coding RNA 208 ncRNA 391.25-12 chr3 24501332 24501667 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5791 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 187.75-36 chr16 74779502 74779688 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4775 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 345.5-7 chr11 88481346 88481652 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23077 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 420.75-11 chr9 104988054 104988407 + 1.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -60075 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 174-61 chr3 54917505 54917680 + 1.75 NA TTS (NM_001304389) TTS (NM_001304389) 10467 NM_020678 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 164-91 chr4 83410328 83410486 + 1.75 NA intron (NM_001297757, intron 16 of 16) L1MC4|LINE|L1 45416 NM_133636 113510 Hs.480101 NM_133636 ENSG00000163312 HELQ HEL308 helicase, POLQ like protein-coding 170-64 chr3 113308035 113308256 + 1.75 NA intron (NM_001164496, intron 29 of 34) intron (NM_001164496, intron 29 of 34) -95853 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 425.5-2 chr10 62304983 62305427 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36361 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 453.75 chr12 47310794 47311232 + 1.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -3614 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 343.5-10 chr16 22660467 22660937 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 115004 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 153-91 chr22 25109958 25110263 + 1.75 NA non-coding (NR_038941, exon 4 of 5) non-coding (NR_038941, exon 4 of 5) 2582 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 179-73 chr4 55151936 55152096 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -26421 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 172.25-11 chr1 208771253 208771564 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 42720 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 245-67 chr8 77245177 77245347 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -205435 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 448.75-2 chr2 107283053 107283703 + 1.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 66147 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 212-61 chr3 191962178 191962375 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -276354 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 387-4 chr11 123877578 123877881 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 7941 NM_001013743 338661 Hs.98377 NM_001013743 ENSG00000204300 TMEM225 PMP22CD|PPP1R154|SPATA47 transmembrane protein 225 protein-coding 122.25-40 chr12 5183564 5183644 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 59547 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 420.5-15 chr8 105559585 105560044 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 240271 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 137.75-182 chr6 126072147 126072256 + 1.75 NA intron (NR_146804, intron 16 of 16) intron (NR_146804, intron 16 of 16) 85661 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 373.75-7 chr2 208794936 208795206 + 1.75 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) intron (NR_136588, intron 3 of 5) 252429 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 441.25-5 chr16 59986904 59987197 + 1.75 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 131697 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 227.25-12 chr10 68041394 68041651 + 1.75 NA intron (NM_001278186, intron 3 of 22) intron (NM_001278186, intron 3 of 22) -30639 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 269.5-8 chr11 13182481 13182855 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -93984 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 227.25-34 chr17 76767909 76768081 + 1.75 NA intron (NM_001353019, intron 10 of 13) intron (NM_001353019, intron 10 of 13) 30494 NM_001242536 79157 Hs.73965 NM_024311 ENSG00000092931 MFSD11 ET major facilitator superfamily domain containing 11 protein-coding 253.5-61 chr5 61126674 61126821 + 1.75 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) intron (NM_174889, intron 3 of 3) -35569 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 390.5-7 chr19 53276263 53276602 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -5858 NR_046365 646508 Hs.574588 NM_001195187 ENSG00000189348 FAM90A27P - family with sequence similarity 90 member A27, pseudogene pseudo 178.25-102 chr6 55604218 55604354 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25072 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 329.25-31 chr9 110559278 110559686 + 1.75 NA intron (NM_153366, intron 1 of 47) L1M5|LINE|L1 20259 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 395.5-4 chr12 29655520 29655808 + 1.75 NA intron (NM_175861, intron 5 of 17) intron (NM_175861, intron 5 of 17) 128278 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 467.5 chr2 49847122 49847801 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 126742 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 300.25-4 chr10 42382653 42382856 + 1.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -14709 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 449.5-2 chr14 70361175 70361619 + 1.75 NA intron (NM_001202548, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu -1714 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 223-4 chr1 234547906 234548114 + 1.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -16231 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 405-4 chr14 70694745 70695050 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3801 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 248.25-42 chr20 32935778 32936055 + 1.75 NA intron (NM_001143967, intron 22 of 26) L1MA8|LINE|L1 68517 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 165.5-105 chr21 32925783 32925895 + 1.75 NA Intergenic L1M6B|LINE|L1 -33049 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 259.25-41 chr7 39446467 39446669 + 1.75 NA intron (NM_001370959, intron 7 of 9) intron (NM_001370959, intron 7 of 9) -40222 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 197.25-84 chr5 128106260 128106474 + 1.75 NA intron (NM_001046, intron 1 of 26) intron (NM_001046, intron 1 of 26) 22601 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 306.25-21 chr2 221465671 221465857 + 1.75 NA intron (NM_001363748, intron 5 of 17) intron (NM_001363748, intron 5 of 17) 106540 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 320-2 chr1 107761565 107761940 + 1.75 NA intron (NM_006113, intron 9 of 26) intron (NM_006113, intron 9 of 26) -73253 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 256-36 chr2 211638849 211639061 + 1.75 NA intron (NM_001042599, intron 16 of 26) intron (NM_001042599, intron 16 of 26) 787405 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 277.5-58 chr4 128298392 128298683 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10724 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 300.5-15 chr14 53687047 53687348 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 261287 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 256.75-9 chr13 85839515 85839709 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -40193 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 136.5-52 chr12 14630900 14631072 + 1.75 NA intron (NM_004963, intron 19 of 26) intron (NM_004963, intron 19 of 26) -63103 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 445 chr1 47753676 47754286 + 1.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 243404 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 214.75-53 chr3 74635784 74636131 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -114817 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 373.25-6 chr14 56732158 56732469 + 1.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 73354 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 398.5-18 chr7 85259066 85259360 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -137282 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 226.5-85 chr6 104156745 104156978 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 702685 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 410.75-7 chr7 35023568 35023925 + 1.75 NA intron (NM_015283, intron 1 of 21) MIRc|SINE|MIR 13739 NM_001366673 23333 Hs.408623 NM_015283 ENSG00000173852 DPY19L1 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 protein-coding 328-11 chr17 62760625 62760886 + 1.75 NA intron (NM_001288780, intron 4 of 10) intron (NM_001288780, intron 4 of 10) 45885 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 365-18 chr8 121755003 121755336 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -113729 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 254.5-6 chr1 102973201 102973410 + 1.75 NA intron (NM_001854, intron 36 of 66) intron (NM_001854, intron 36 of 66) 135191 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 174.75-89 chr4 32490092 32490243 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 139129 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 316-10 chr14 48177128 48177479 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -382289 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 237.25-49 chr3 64312858 64313103 + 1.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -44807 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 384-17 chr6 145944772 145945136 + 1.75 NA intron (NM_001370328, intron 10 of 31) AluJo|SINE|Alu 19143 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 283.5-12 chr12 5857306 5857483 + 1.75 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) L1MA5|LINE|L1 87865 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 266.5-42 chr2 217507278 217507520 + 1.75 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) L1MC4|LINE|L1 224666 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 335.25-16 chr2 48379145 48379469 + 1.75 NA TTS (NM_002158) TTS (NM_002158) -61459 NR_024188 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 176.75-63 chr2 70926816 70926970 + 1.75 NA intron (NM_012476, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR -9007 NM_001692 525 Hs.64173 NM_001692 ENSG00000116039 ATP6V1B1 ATP6B1|RTA1B|VATB|VMA2|VPP3 ATPase H+ transporting V1 subunit B1 protein-coding 286.25-18 chr20 44166092 44166273 + 1.75 NA intron (NM_020433, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 21006 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 255.75-20 chr18 1839042 1839259 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -479521 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 302.75-31 chr9 27287046 27287322 + 1.75 NA intron (NM_001161585, intron 5 of 6) intron (NM_001161585, intron 5 of 6) -4391 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 243.5-10 chr1 178046744 178046911 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8820 NR_037167 730102 Hs.733192 NR_037167 ENSG00000242193 CRYZL2P - crystallin zeta like 2, pseudogene pseudo 159.75-24 chr11 24572600 24572724 + 1.75 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 75609 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 390-13 chr6 43103533 43103936 + 1.75 NA intron (NM_001270398, intron 1 of 19) intron (NM_001270398, intron 1 of 19) 26920 NM_001270398 5754 Hs.90572 NM_002821 ENSG00000112655 PTK7 CCK-4|CCK4 protein tyrosine kinase 7 (inactive) protein-coding 282.25-22 chr3 40927120 40927298 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -272296 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 299.5-25 chr3 25170178 25170580 + 1.75 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie -170423 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 377.75-14 chr8 118140901 118141131 + 1.75 NA intron (NR_146234, intron 5 of 5) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -29197 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 155-45 chr15 42823663 42823799 + 1.75 NA intron (NM_173500, intron 6 of 14) MER30|DNA|hAT-Charlie -86603 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 252.75-66 chr7 29377363 29377536 + 1.75 NA intron (NM_001293072, intron 3 of 12) intron (NM_001293072, intron 3 of 12) -102263 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 116.5-42 chr12 6243191 6243270 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 42830 NM_001769 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 365-4 chr11 41563326 41563637 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -103829 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 445-5 chr2 79894693 79894977 + 1.75 NA intron (NM_001282598, intron 6 of 17) L2c|LINE|L2 -28252 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 352.5-10 chr2 103709177 103709731 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 698878 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 297.75-28 chr3 191343091 191343287 + 1.75 NA intron (NM_178335, intron 1 of 11) MER8|DNA|TcMar-Tigger -12653 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 467.75-4 chr6 91039274 91039578 + 1.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -452354 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 332.5-29 chr8 109101051 109101389 + 1.75 NA intron (NM_003301, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 14592 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 549.25 chr10 22215274 22215967 + 1.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -5637 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 363.5-20 chr7 24831447 24831764 + 1.75 NA intron (NM_015550, intron 15 of 22) intron (NM_015550, intron 15 of 22) 61016 NR_104112 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 324.5-15 chr19 43572170 43572469 + 1.75 NA intron (NM_006297, intron 2 of 16) MIRc|SINE|MIR 3259 NM_006297 7515 Hs.98493 NM_006297 ENSG00000073050 XRCC1 RCC|SCAR26 X-ray repair cross complementing 1 protein-coding 329.5-24 chr5 131528502 131528884 + 1.75 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 106536 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 312-27 chr5 63195912 63196230 + 1.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 617252 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 340.5-31 chr7 23784426 23784667 + 1.75 NA intron (NM_031414, intron 17 of 23) intron (NM_031414, intron 17 of 23) 74327 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 290-30 chr20 9286073 9286363 + 1.75 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) intron (NM_182797, intron 1 of 35) -21582 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 166.25-41 chr12 76825642 76825754 + 1.75 NA intron (NM_015336, intron 8 of 16) L3|LINE|CR1 53321 NM_001321 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 214.75-60 chr4 57745611 57745764 + 1.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 319815 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 237.25-50 chr4 47132057 47132254 + 1.75 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 100588 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 273.5-15 chr11 83498245 83498422 + 1.75 NA intron (NM_001142699, intron 21 of 27) intron (NM_001142699, intron 21 of 27) 184092 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 188.25-31 chr12 80544352 80544489 + 1.75 NA intron (NM_001145026, intron 23 of 44) intron (NM_001145026, intron 23 of 44) 100185 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 429-2 chr17 78362935 78363316 + 1.75 NA intron (NR_110847, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 2123 NR_110846 101928674 Hs.637297 NR_110845 ENSG00000266970 LOC101928674 - uncharacterized LOC101928674 ncRNA 450.75 chr2 17467023 17467339 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 51259 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 197.5-159 chr8 73067421 73067678 + 1.75 NA intron (NM_153225, intron 4 of 4) intron (NM_153225, intron 4 of 4) 25623 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 201.5-88 chr3 106152784 106153131 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -283556 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 409.75-3 chr11 17208684 17209002 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_002645) promoter-TSS (NM_002645) -857 NM_001321378 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 388.25-8 chr8 23931458 23931702 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -76774 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 480.25-6 chr5 31321666 31322263 + 1.75 NA intron (NM_004932, intron 11 of 11) intron (NM_004932, intron 11 of 11) 128278 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 394.25-7 chr8 78789903 78790397 + 1.75 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) intron (NM_001199886, intron 2 of 4) 15313 NM_000880 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 397.75-3 chr2 31663126 31663498 + 1.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -82374 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 168-122 chr8 41035135 41035291 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -137387 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 424.5-8 chr8 94937371 94938064 + 1.75 NA intron (NM_001135733, intron 3 of 4) MER21-int|LTR|ERVL 11661 NM_033285 94241 Hs.492261 NM_033285 ENSG00000164938 TP53INP1 SIP|TP53DINP1|TP53INP1A|TP53INP1B|Teap|p53DINP1 tumor protein p53 inducible nuclear protein 1 protein-coding 183-70 chr3 105440697 105440811 + 1.75 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 73845 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 315.5-14 chr3 17587579 17587778 + 1.75 NA intron (NM_001349088, intron 2 of 21) intron (NM_001349088, intron 2 of 21) 112342 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 222.25-25 chr17 29212612 29212798 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -32307 NM_203318 399687 Hs.462590 NM_078471 ENSG00000196535 MYO18A MAJN|MYSPDZ|SP-R210|SPR210 myosin XVIIIA protein-coding 313.5-6 chr12 30647123 30647407 + 1.75 NA intron (NM_006390, intron 20 of 24) L1MB8|LINE|L1 29979 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 138.25-143 chr5 165088270 165088408 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 618060 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 334-16 chr22 28373415 28373645 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -86339 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 308.75-35 chr7 16408709 16408942 + 1.75 NA intron (NM_001101426, intron 1 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 12713 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 449.5-4 chr9 89833936 89834354 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -135271 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 391.5-14 chr5 39299178 39299462 + 1.75 NA intron (NM_001737, intron 9 of 10) L1ME1|LINE|L1 -28671 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 238.75-53 chr5 163678149 163678312 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 172611 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 123.25-9 chr1 169598590 169598705 + 1.75 NA intron (NM_003005, intron 10 of 16) intron (NM_003005, intron 10 of 16) -12116 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 452.5-4 chr3 79729222 79729817 + 1.75 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 38479 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 236.75-42 chr4 163687882 163688240 + 1.75 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) intron (NM_001166373, intron 4 of 7) -74527 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 152-117 chr4 117314874 117315020 + 1.75 NA intron (NR_147151, intron 6 of 6) intron (NR_147151, intron 6 of 6) 45692 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 307.5-27 chr2 63240704 63240931 + 1.75 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) intron (NR_148705, intron 13 of 16) -121275 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 229.5-69 chr2 147162023 147162200 + 1.75 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 575054 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 236-24 chr19 30015599 30015863 + 1.75 NA non-coding (NR_045557, exon 10 of 10) non-coding (NR_045557, exon 10 of 10) 73492 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 257.25-48 chr6 65101032 65101214 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -200295 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 255.5-2 chr1 49669503 49670000 + 1.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MIRc|SINE|MIR -197666 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 221-79 chr8 123317607 123317861 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -30300 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 197.25-3 chr1 72260098 72260383 + 1.75 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 22299 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 278-24 chr4 114556955 114557148 + 1.75 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -41351 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 241.25-39 chr20 42660281 42660496 + 1.75 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -25095 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 298-28 chr7 27443643 27443898 + 1.75 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -172204 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 598.5-3 chr8 84103654 84104385 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -78768 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 280.25-19 chr13 71539127 71539371 + 1.75 NA intron (NM_004392, intron 2 of 6) intron (NM_004392, intron 2 of 6) 327943 NM_080760 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 241.25-63 chr7 91780274 91780458 + 1.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 100336 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 277-2 chr10 60089592 60089930 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 29 of 43) intron (NM_001204403, intron 29 of 43) 51255 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 312.5-13 chr2 29583514 29583746 + 1.75 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -108253 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 272.75-21 chr18 78173756 78173939 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -180120 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 201.25-12 chr10 35366589 35366841 + 1.75 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) MER3|DNA|hAT-Charlie 29841 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 201.75-18 chr12 3081532 3081757 + 1.75 NA intron (NM_001168320, intron 1 of 7) intron (NM_001168320, intron 1 of 7) 4265 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 287-21 chr2 48618429 48618797 + 1.75 NA intron (NM_001193487, intron 1 of 7) intron (NM_001193487, intron 1 of 7) 757 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 494.5-8 chrX 51356628 51357019 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 24001 NM_001304963 170685 Hs.375178 NM_153183 ENSG00000122824 NUDT10 APS2|DIPP3-alpha|DIPP3a nudix hydrolase 10 protein-coding 250.25-35 chr3 163444825 163445070 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -141646 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 306-23 chr3 48337412 48337853 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9291 NM_001080525 646424 Hs.257687 NM_001080525 ENSG00000229453 SPINK8 - serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (putative) protein-coding 252-45 chr3 115456546 115456836 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -166819 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 338-16 chr17 77753531 77753823 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25118 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 196-49 chr2 55599780 55599915 + 1.75 NA intron (NM_020463, intron 3 of 14) intron (NM_020463, intron 3 of 14) 17775 NM_020463 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 324.75-29 chr7 152402085 152402504 + 1.75 NA intron (NM_170606, intron 1 of 58) intron (NM_170606, intron 1 of 58) 33709 NM_170606 58508 Hs.647120 NM_021230 ENSG00000055609 KMT2C HALR|KLEFS2|MLL3 lysine methyltransferase 2C protein-coding 142.25-40 chr12 30073757 30073878 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -289058 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 228.25-71 chr6 41362789 41363030 + 1.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 27301 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 625.75 chr11 36361112 36361700 + 1.75 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -14579 NM_024841 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 278-5 chr10 15588316 15588590 + 1.75 NA intron (NM_001291494, intron 21 of 28) intron (NM_001291494, intron 21 of 28) 131469 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 247-43 chr3 46527490 46527731 + 1.75 NA intron (NM_024512, intron 6 of 8) intron (NM_024512, intron 6 of 8) 29634 NM_031440 83597 Hs.196584 NM_031440 ENSG00000163825 RTP3 LTM1|TMEM7|Z3CXXC3 receptor transporter protein 3 protein-coding 254.25-24 chr16 23920126 23920324 + 1.75 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) L1MB2|LINE|L1 84242 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 211.5-7 chr1 162664118 162664288 + 1.75 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) intron (NM_006182, intron 2 of 17) 31739 NM_006182 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 344.5-27 chr6 64849134 64849432 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -452135 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 333.75-19 chr4 62050717 62051034 + 1.75 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) intron (NM_001371343, intron 23 of 23) 110890 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 172.25-102 chr4 81987602 81987864 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 386258 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 261-48 chr5 100134755 100134922 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 253416 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 212.5-45 chr2 28650055 28650194 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 83767 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 249.25-53 chr8 145052465 145052612 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_023080) promoter-TSS (NM_023080) 71 NM_023080 65265 Hs.169615 NM_023080 ENSG00000182307 C8orf33 - chromosome 8 open reading frame 33 protein-coding 179.75-66 chr21 26066959 26067135 + 1.75 NA intron (NM_001136131, intron 3 of 15) intron (NM_001136131, intron 3 of 15) 73343 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 229.75-34 chr2 112103706 112103988 + 1.75 NA intron (NM_001329914, intron 15 of 18) L1ME2|LINE|L1 -34538 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 297.75-26 chr3 71380774 71381111 + 1.75 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) -76171 NM_001244812 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 245.25-69 chr7 16240775 16240985 + 1.75 NA intron (NR_038946, intron 2 of 4) intron (NR_038946, intron 2 of 4) 30394 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 323.5-12 chr16 13771074 13771281 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -148980 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 472.25 chr5 19538132 19538740 + 1.75 NA intron (NM_001349559, intron 9 of 12) intron (NM_001349559, intron 9 of 12) 347836 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 507-6 chr8 62171124 62171647 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -77469 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 200-31 chr15 27756433 27756608 + 1.75 NA intron (NM_001300984, intron 22 of 22) intron (NM_001300984, intron 22 of 22) 342795 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 509.75-4 chr4 83199020 83199710 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -84636 NM_016619 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 238-3 chr1 94707660 94707937 + 1.75 NA intron (NR_160784, intron 1 of 3) intron (NR_160784, intron 1 of 3) 38102 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 311.25-35 chrX 54538857 54539175 + 1.75 NA intron (NM_019067, intron 2 of 15) (TCTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8797 NM_001184819 54552 Hs.654677 NM_019067 ENSG00000130119 GNL3L GNL3B G protein nucleolar 3 like protein-coding 522.25-2 chr8 29803967 29804435 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 24303 NR_125817 101929470 Hs.204721 NR_125817 ENSG00000248964 LOC101929470 - uncharacterized LOC101929470 ncRNA 316.25-20 chr6 39570913 39571222 + 1.75 NA intron (NM_001289020, intron 10 of 21) intron (NM_001289020, intron 10 of 21) -139677 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 319-15 chr2 28740914 28741264 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -4884 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 204.5-35 chr14 54980132 54980456 + 1.75 NA intron (NM_007086, intron 16 of 25) AluJb|SINE|Alu 46805 NM_001008396 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 382.25-11 chr3 5047720 5048000 + 1.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -67899 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 287-37 chr8 74671233 74671408 + 1.75 NA intron (NR_033830, intron 2 of 5) intron (NR_033830, intron 2 of 5) -34373 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 245-24 chr18 58748161 58748697 + 1.75 NA 3' UTR (NM_173844, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_173844, exon 16 of 16) -65451 NR_146904 105372147 Hs.210837 NR_146904 ENSG00000267593 LINC01926 - long intergenic non-protein coding RNA 1926 ncRNA 240.5-20 chr12 61795863 61796041 + 1.75 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 396887 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 216-4 chr1 178630227 178630419 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -47426 NR_039622 100616328 NR_039622 ENSG00000266417 MIR4424 - microRNA 4424 ncRNA 480.25-5 chr3 38899853 38900396 + 1.75 NA intron (NM_014139, intron 12 of 25) intron (NM_014139, intron 12 of 25) 50437 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 295.25-8 chr14 65202370 65202786 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 19769 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 209.75-13 chr10 105585400 105585626 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 234820 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 184.25-136 chr9 121124134 121124385 + 1.75 NA intron (NR_163191, intron 2 of 18) intron (NR_163191, intron 2 of 18) 2489 NM_001369892 11064 Hs.653263 NM_007018 ENSG00000119397 CNTRL CEP1|CEP110|FAN|bA165P4.1 centriolin protein-coding 481.25-2 chr2 44220282 44220747 + 1.75 NA intron (NM_177968, intron 5 of 5) intron (NM_177968, intron 5 of 5) 51639 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 196.25-73 chr20 22867521 22867651 + 1.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -167834 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 250.75-35 chr3 45690390 45690764 + 1.75 NA intron (NM_001319073, intron 2 of 20) intron (NM_001319073, intron 2 of 20) 1181 NM_001319072 22908 Hs.156509 NM_014016 ENSG00000211456 SACM1L SAC1 SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase protein-coding 274-32 chr4 65324793 65325040 + 1.75 NA intron (NM_001281765, intron 17 of 17) intron (NM_001281765, intron 17 of 17) -320416 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 165.5-33 chr12 69042720 69042993 + 1.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -79616 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 403.5-4 chr2 51933512 51933862 + 1.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -436961 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 117.75-146 chr3 190747066 190747150 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 115586 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 197.5-110 chr4 115607667 115607796 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -494111 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 136.75-68 chr15 88695183 88695272 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 56211 NM_002201 3669 Hs.459265 NM_002201 ENSG00000172183 ISG20 CD25|HEM45 interferon stimulated exonuclease gene 20 protein-coding 233.5-40 chr16 54967294 54967500 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 36198 NM_001252197 10265 Hs.435730 NM_005853 ENSG00000176842 IRX5 HMMS|IRX-2a|IRXB2 iroquois homeobox 5 protein-coding 344-18 chr4 35048979 35049370 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -779427 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 213.25-9 chr10 29293369 29293526 + 1.75 NA intron (NM_032517, intron 3 of 4) intron (NM_032517, intron 3 of 4) 4377 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 403.75-2 chr4 151629227 151629804 + 1.75 NA intron (NM_001109977, intron 7 of 13) intron (NM_001109977, intron 7 of 13) 131492 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 367.5-2 chr1 75021995 75022352 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -106261 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 356.75-7 chr2 105490440 105490795 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52104 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 360.25-11 chr22 29936026 29936397 + 1.75 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) intron (NM_153051, intron 1 of 18) 53037 NM_153051 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 514.75-3 chr18 1950821 1951420 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -591491 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 273.25-29 chr5 24907010 24907197 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -66520 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 183.5-45 chr14 86853524 86853658 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52187 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 377-13 chr5 64945848 64946420 + 1.75 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 177204 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 306.5-33 chr6 144355671 144356032 + 1.75 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) -49804 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 288.5-5 chr10 52583657 52584031 + 1.75 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -113311 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 402.5-10 chr7 1730489 1730762 + 1.75 NA intron (NM_001128636, intron 2 of 2) L1MC|LINE|L1 11685 NR_120508 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 373-16 chr9 28076625 28076866 + 1.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1ME3E|LINE|L1 -502879 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 151-121 chr6 134868567 134868716 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 81460 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 472.75-2 chr1 210154108 210154553 + 1.75 NA intron (NM_153262, intron 6 of 7) MER1B|DNA|hAT-Charlie -78466 NM_001354173 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 216.75-81 chr9 35210269 35210513 + 1.75 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) MER3|DNA|hAT-Charlie 48382 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 411.25-7 chr6 129072249 129072534 + 1.75 NA intron (NM_000426, intron 3 of 64) L1MEg|LINE|L1 189250 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 248-28 chr17 60982437 60982770 + 1.75 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) intron (NM_001330413, intron 14 of 25) 304752 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 261.25-41 chr6 24484932 24485219 + 1.75 NA intron (NM_001503, intron 2 of 24) intron (NM_001503, intron 2 of 24) 4503 NM_001503 2822 Hs.533291 NM_001503 ENSG00000112293 GPLD1 GPIPLD|GPIPLDM|PIGPLD|PIGPLD1|PLD glycosylphosphatidylinositol specific phospholipase D1 protein-coding 138.25-175 chr9 15007397 15007489 + 1.75 NA intron (NR_003920, intron 3 of 4) intron (NR_003920, intron 3 of 4) 14116 NR_003920 389705 Hs.431257 NR_003920 LOC389705 - histone PARylation factor 1 pseudogene pseudo 351-3 chr10 59544533 59544828 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 165211 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 244-35 chr3 100658014 100658176 + 1.75 NA intron (NM_001308362, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 22557 NM_001308362 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 270.5 chr1 28581902 28582221 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_146381) promoter-TSS (NR_146381) -188 NR_024127 85028 Hs.632377 NR_024127 ENSG00000197989 SNHG12 ASLNC04080|C1orf79|LINC00100|NCRNA00100|PNAS-123 small nucleolar RNA host gene 12 ncRNA 394.25-6 chr5 27059650 27060048 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -21263 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 308.75-26 chr2 222122582 222122781 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -175466 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 281.5-20 chr16 67475705 67476004 + 1.75 NA intron (NM_004691, intron 1 of 7) L1MC5|LINE|L1 5303 NM_004691 9114 Hs.106876 NM_004691 ENSG00000159720 ATP6V0D1 ATP6D|ATP6DV|P39|VATX|VMA6|VPATPD ATPase H+ transporting V0 subunit d1 protein-coding 334.25-15 chr2 62980018 62980288 + 1.75 NA intron (NM_001142615, intron 15 of 22) MER1B|DNA|hAT-Charlie 67558 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 203.5-124 chr6 121257510 121257739 + 1.75 NA intron (NR_104452, intron 15 of 35) L1MC5a|LINE|L1 76856 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 362.75-13 chr9 27031593 27032056 + 1.75 NA intron (NM_025103, intron 13 of 19) (AAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26152 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 168.5-190 chr8 135590552 135590754 + 1.75 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 133197 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 372.25 chr1 35333714 35334008 + 1.75 NA intron (NM_001350140, intron 3 of 27) intron (NM_001350140, intron 3 of 27) 32216 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 353.75-5 chr16 48659710 48660051 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49700 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 298.5-10 chr17 76894060 76894292 + 1.75 NA intron (NM_144677, intron 3 of 16) intron (NM_144677, intron 3 of 16) 21529 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 617 chr7 1328517 1329124 + 1.75 NA Intergenic (TATATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 95948 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 367.5-13 chr2 108832766 108832997 + 1.75 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) intron (NM_001351559, intron 10 of 11) 46110 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 301.25-16 chr17 61222725 61223030 + 1.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 144827 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 490.5 chr14 50617927 50618261 + 1.75 NA intron (NM_015915, intron 8 of 13) intron (NM_015915, intron 8 of 13) 50212 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 356-12 chr7 17327438 17327677 + 1.75 NA intron (NM_001621, intron 3 of 10) intron (NM_001621, intron 3 of 10) 28905 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 308.5-8 chr14 60849800 60850135 + 1.75 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) AluSx1|SINE|Alu 115206 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 346-7 chr12 20267219 20267533 + 1.75 NA Intergenic (ATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -101869 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 185.5-141 chr6 51827788 51828038 + 1.75 NA intron (NM_138694, intron 52 of 66) intron (NM_138694, intron 52 of 66) 206043 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 391.25-9 chr14 66700027 66700581 + 1.75 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 192897 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 522 chr12 123124422 123125132 + 1.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -14288 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 292-33 chr5 18769926 18770200 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 962789 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 225.25-34 chr17 83114515 83114718 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 33470 NM_001363853 284207 Hs.378821 NM_001004431 ENSG00000176845 METRNL - meteorin like, glial cell differentiation regulator protein-coding 320.5-29 chr3 139186360 139186681 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 47002 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 275.5-14 chr11 105620268 105620488 + 1.75 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 9672 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 498.5 chr3 45565666 45566118 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28859 NM_014240 8994 Hs.193370 NM_014240 ENSG00000144791 LIMD1 - LIM domains containing 1 protein-coding 294-34 chr9 17593475 17593760 + 1.75 NA intron (NM_003026, intron 1 of 8) intron (NM_003026, intron 1 of 8) 14551 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 463-3 chr22 39205324 39206016 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 35239 NM_033016 5155 Hs.1976 NM_002608 ENSG00000100311 PDGFB IBGC5|PDGF-2|PDGF2|SIS|SSV|c-sis platelet derived growth factor subunit B protein-coding 277.75-25 chr5 34594488 34594712 + 1.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -61728 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 257.75-21 chr2 43678776 43679008 + 1.75 NA exon (NM_172069, exon 3 of 30) exon (NM_172069, exon 3 of 30) -2463 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 363.75-8 chr2 26281317 26281588 + 1.75 NA intron (NM_001281512, intron 9 of 14) intron (NM_001281512, intron 9 of 14) 36513 NM_000183 3032 Hs.515848 NM_000183 ENSG00000138029 HADHB ECHB|MSTP029|MTPB|TP-BETA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit beta protein-coding 384.25-4 chr11 76776627 76777105 + 1.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -5447 NM_001258210 25987 Hs.8361 NM_015516 ENSG00000182704 TSKU E2IG4|LRRC54|TSK tsukushi, small leucine rich proteoglycan protein-coding 294.75-40 chr8 123276820 123277056 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1397 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 388.75-3 chr18 60209132 60209556 + 1.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 163431 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 367.5-19 chr8 110375828 110376419 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -400352 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 344.75-12 chr4 134540373 134540620 + 1.75 NA intron (NR_147155, intron 3 of 3) intron (NR_147155, intron 3 of 3) 116628 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 285-33 chr4 31240502 31240769 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 69491 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 217.25-27 chr15 61654164 61654360 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -75656 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 291.5-12 chr14 51927237 51927505 + 1.75 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -8800 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 294.75-36 chr6 75260473 75260802 + 1.75 NA intron (NM_001143958, intron 3 of 5) intron (NM_001143958, intron 3 of 5) -10339 NM_001865 1347 Hs.70312 NM_001865 ENSG00000112695 COX7A2 COX7AL|COX7AL1|COXVIIAL|COXVIIa-L|VIIAL cytochrome c oxidase subunit 7A2 protein-coding 436.25 chr11 111550726 111551248 + 1.75 NA intron (NM_178834, intron 3 of 6) LTR33|LTR|ERVL 10479 NM_001258390 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 337-27 chr6 49859702 49860035 + 1.75 NA intron (NM_001205220, intron 1 of 7) L1M2|LINE|L1 6667 NM_170609 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 290.75-17 chr15 96091558 96091808 + 1.75 NA intron (NR_158193, intron 6 of 7) intron (NR_158193, intron 6 of 7) 36158 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 510.5 chr12 2982642 2983035 + 1.75 NA intron (NM_201443, intron 1 of 10) intron (NM_201443, intron 1 of 10) 22903 NM_201443 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 283.75-20 chr2 181203750 181204090 + 1.75 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 80083 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 278.25-9 chr12 1825133 1825310 + 1.75 NA intron (NM_001039029, intron 1 of 4) intron (NM_001039029, intron 1 of 4) 4656 NM_001163926 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 500-2 chr17 71408068 71408871 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -206290 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 329.5-28 chr9 24558221 24558591 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12509 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 271.75-7 chr10 59421681 59421977 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -58648 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 207-61 chr4 93380694 93380918 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -447947 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 113.25-41 chr13 49780624 49780700 + 1.75 NA intron (NM_002267, intron 1 of 16) intron (NM_002267, intron 1 of 16) 12020 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 367.5-11 chr17 47613837 47614283 + 1.75 NA intron (NM_001330257, intron 20 of 23) AluJb|SINE|Alu -35859 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 229.5-62 chr2 71479296 71479545 + 1.75 NA intron (NM_001130985, intron 1 of 54) intron (NM_001130985, intron 1 of 54) 12721 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 414-6 chr17 55571845 55572205 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -150190 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 194.25-116 chr8 100006905 100007043 + 1.75 NA intron (NM_015668, intron 15 of 27) intron (NM_015668, intron 15 of 27) 2392 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 324 chr1 71815599 71815929 + 1.75 NA intron (NR_046218, intron 1 of 2) intron (NR_046218, intron 1 of 2) 21248 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 294.5-42 chr5 92981064 92981265 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 590179 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 424.25 chr10 100995152 100995548 + 1.75 NA TTS (NM_001163814) TTS (NM_001163814) -1721 NM_032429 84445 Hs.523221 NM_032429 ENSG00000107816 LZTS2 LAPSER1 leucine zipper tumor suppressor 2 protein-coding 206.25-10 chr1 199073172 199073349 + 1.75 NA intron (NR_126351, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 -54296 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 233.5-46 chr19 38864843 38865086 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12617 NM_001005335 3191 Hs.644906 NM_001533 ENSG00000104824 HNRNPL HNRPL|P/OKcl.14|hnRNP-L heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L protein-coding 207.75-130 chr9 8321529 8321693 + 1.75 NA intron (NM_130392, intron 29 of 30) intron (NM_130392, intron 29 of 30) 412335 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 255.25-49 chr7 55383458 55383703 + 1.75 NA intron (NM_018697, intron 1 of 8) LTR9B|LTR|ERV1 18132 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 190.25-98 chr5 73041047 73041195 + 1.75 NA intron (NM_001146032, intron 9 of 24) intron (NM_001146032, intron 9 of 24) -79454 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 271.75-46 chr8 112956888 112957173 + 1.75 NA intron (NM_052900, intron 6 of 68) intron (NM_052900, intron 6 of 68) 313537 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 364.25-21 chr3 81696580 81696857 + 1.75 NA intron (NM_000158, intron 2 of 15) intron (NM_000158, intron 2 of 15) 64927 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 270.25-10 chr10 82529360 82529596 + 1.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -296558 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 155.5-183 chr6 85195936 85196071 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 194183 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 417.5-10 chr6 27091592 27092161 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 40920 NM_021058 8970 Hs.591807 NM_021058 ENSG00000124635 HIST1H2BJ H2B/r|H2BFR|H2BJ histone cluster 1 H2B family member j protein-coding 290.25-24 chr4 87825574 87825901 + 1.75 NA intron (NM_001184694, intron 1 of 3) L1PA11|LINE|L1 4339 NM_001184694 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 286.5-59 chr6 166722281 166722508 + 1.75 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -95143 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 222.75-76 chr4 128497735 128497872 + 1.75 NA intron (NR_125882, intron 6 of 8) L1MA5|LINE|L1 69787 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 259.5-39 chr15 65697660 65697881 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_145750) promoter-TSS (NR_145750) -834 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 181-20 chr12 38558385 38558576 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 241706 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 210-98 chr8 98979919 98980090 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33262 NM_152564 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 292-16 chr14 54364132 54364403 + 1.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -32601 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 428.25-3 chr20 4459029 4459499 + 1.75 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -209977 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 513.25-4 chr5 109773383 109774145 + 1.75 NA intron (NM_002372, intron 7 of 21) intron (NM_002372, intron 7 of 21) 84398 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 213.25-16 chr14 55565793 55565961 + 1.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 14215 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 357-18 chr7 92159999 92160368 + 1.75 NA intron (NM_001161528, intron 1 of 4) intron (NM_001161528, intron 1 of 4) 5093 NM_001161528 401387 Hs.671729 NM_001045475 ENSG00000240720 LRRD1 - leucine rich repeats and death domain containing 1 protein-coding 178.75-43 chr2 16154029 16154229 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 103702 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 395.75-5 chr14 72038304 72038676 + 1.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME1|LINE|L1 104963 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 195.25-51 chr2 70941491 70941641 + 1.75 NA TTS (NR_110273) TTS (NR_110273) 5666 NM_001692 525 Hs.64173 NM_001692 ENSG00000116039 ATP6V1B1 ATP6B1|RTA1B|VATB|VMA2|VPP3 ATPase H+ transporting V1 subunit B1 protein-coding 302.5-14 chr16 49151306 49151615 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 130378 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 402.75-3 chr2 159881019 159881668 + 1.75 NA intron (NM_002349, intron 7 of 34) intron (NM_002349, intron 7 of 34) 23413 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 262-19 chr15 54393296 54393462 + 1.75 NA intron (NM_001329919, intron 17 of 31) intron (NM_001329919, intron 17 of 31) 380731 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 450.5-3 chr3 9419281 9419663 + 1.75 NA intron (NM_001080517, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 21772 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 128.75-185 chr7 72326661 72326737 + 1.75 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) intron (NM_001363460, intron 1 of 5) 10692 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 312.75-32 chr8 118589968 118590425 + 1.75 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) L1MDa|LINE|L1 -30805 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 189.25-139 chrX 5012683 5012821 + 1.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -379180 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 273.5-33 chr2 174565304 174565624 + 1.75 NA intron (NM_001077269, intron 7 of 7) intron (NM_001077269, intron 7 of 7) -7392 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 243.25-20 chr17 57933829 57934038 + 1.75 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) intron (NM_001271875, intron 1 of 10) 21479 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 364-9 chr18 12509080 12509304 + 1.75 NA intron (NM_020148, intron 5 of 15) intron (NM_020148, intron 5 of 15) 76418 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 339.75-6 chr10 97540916 97541226 + 1.75 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR -31370 NM_001291218 26287 Hs.73708 NM_020349 ENSG00000165887 ANKRD2 ARPP ankyrin repeat domain 2 protein-coding 331.75-6 chr11 79549930 79550178 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -109024 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 193.5-87 chr2 104005339 104005516 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 402905 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 192.5-83 chr20 36681906 36682177 + 1.75 NA intron (NM_032013, intron 7 of 15) L1ME4a|LINE|L1 -35845 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 248.5-3 chr1 93703972 93704224 + 1.75 NA intron (NM_001261408, intron 3 of 13) intron (NM_001261408, intron 3 of 13) -22261 NM_003567 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 269-35 chr4 63547433 63547759 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 861854 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 312-3 chr1 225409982 225410278 + 1.75 NA intron (NM_194442, intron 10 of 13) intron (NM_194442, intron 10 of 13) 17908 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 293.5-37 chr6 52474502 52474867 + 1.75 NA intron (NR_033327, intron 6 of 9) L1ME3A|LINE|L1 53676 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 330 chr1 114326763 114326988 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -173006 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 465.5 chr15 82954288 82954714 + 1.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -1781 NM_004839 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 356.25-12 chr4 42072994 42073438 + 1.75 NA intron (NM_006345, intron 15 of 17) L1M4|LINE|L1 79439 NM_001159547 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 261-35 chr3 66337766 66337941 + 1.75 NA intron (NR_028475, intron 5 of 9) L1MC5a|LINE|L1 116850 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 285.75-6 chr10 104818741 104819035 + 1.75 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -152672 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 420.25-6 chr3 124224904 124225256 + 1.75 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 92151 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 125.5-275 chrX 99286084 99286222 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 1124120 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 227-10 chr11 133074100 133074359 + 1.75 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -130461 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 159.5-214 chr8 130539058 130539161 + 1.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -95435 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 272.5-37 chr2 157437154 157437433 + 1.75 NA intron (NM_004288, intron 1 of 7) L1MA5A|LINE|L1 6796 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 190.25-49 chr16 85547270 85547392 + 1.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -64078 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 442.5-4 chr5 11219673 11220064 + 1.75 NA intron (NM_001288715, intron 9 of 20) intron (NM_001288715, intron 9 of 20) 369049 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 366.75-17 chr4 40610925 40611247 + 1.75 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) intron (NM_001371114, intron 1 of 5) 18778 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 228.75-88 chr8 119956191 119956505 + 1.75 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) intron (NM_022783, intron 3 of 8) 82626 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 499-3 chr17 73208893 73209501 + 1.75 NA TTS (NM_018714) TTS (NM_018714) 16142 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 283.25-7 chr10 31956617 31956909 + 1.75 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -27887 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 258 chr1 51876517 51876793 + 1.75 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) intron (NM_001101662, intron 1 of 30) 1385 NM_001242361 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 321.75-18 chr2 47118893 47119264 + 1.75 NA intron (NM_001163561, intron 5 of 6) intron (NM_001163561, intron 5 of 6) 36230 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 163.5-216 chr9 35301954 35302098 + 1.75 NA exon (NM_001371189, exon 9 of 40) exon (NM_001371189, exon 9 of 40) -39870 NM_001371188 311.5-34 chr8 113758997 113759360 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -322239 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 249.75-6 chr1 83900356 83900667 + 1.75 NA intron (NM_001350215, intron 17 of 19) intron (NM_001350215, intron 17 of 19) -39515 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 151.25-37 chr12 1127158 1127348 + 1.75 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) L1ME4c|LINE|L1 99505 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 410-12 chr7 52477401 52478118 + 1.75 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -557874 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 271.5-45 chr2 235327698 235327899 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -166245 NM_001244888 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 213.5-41 chr15 95835376 95835561 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 292373 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 178.75-76 chr4 128867826 128867950 + 1.75 NA exon (NM_001287437, exon 10 of 11) exon (NM_001287437, exon 10 of 11) 56044 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 195-19 chr11 42545444 42545587 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -291825 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 151.5-167 chr6 22885346 22885523 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -167510 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 247-33 chr2 102356770 102356981 + 1.75 NA intron (NM_003855, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 592 NM_001282399 8809 Hs.469521 NM_003855 ENSG00000115604 IL18R1 CD218a|CDw218a|IL-1Rrp|IL18RA|IL1RRP interleukin 18 receptor 1 protein-coding 376.5-10 chr2 178741696 178742169 + 1.75 NA intron (NM_001256850, intron 45 of 312) intron (NM_001256850, intron 45 of 312) -34994 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 264.75-16 chr17 27256674 27256966 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37176 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 205.25-111 chr9 99688323 99688511 + 1.75 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 131472 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 390.75-10 chr7 102934678 102935091 + 1.75 NA intron (NM_001031692, intron 2 of 3) intron (NM_001031692, intron 2 of 3) 21884 NM_005824 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 331-3 chr1 174395124 174395472 + 1.75 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -52666 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 370.75-7 chr4 52470211 52470588 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 186140 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 257.5-43 chr21 30691260 30691521 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 27387 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 227-50 chr4 125065983 125066248 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -250297 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 272.25-30 chr21 33635131 33635318 + 1.75 NA intron (NM_145858, intron 1 of 12) intron (NM_145858, intron 1 of 12) 6517 NM_145858 9946 Hs.352671 NM_145311 ENSG00000205758 CRYZL1 4P11|QOH-1 crystallin zeta like 1 protein-coding 268.75-13 chr14 29380707 29380868 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 546309 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 357-7 chr18 2431362 2431619 + 1.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 140015 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 426-6 chr12 5565976 5566355 + 1.75 NA intron (NM_001278596, intron 24 of 25) intron (NM_001278596, intron 24 of 25) 72033 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 265-39 chr8 14296771 14297108 + 1.75 NA intron (NM_001322879, intron 2 of 6) AluSq2|SINE|Alu 556571 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 305-17 chr2 31578925 31579136 + 1.75 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) intron (NM_000348, intron 1 of 4) 1908 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 355.75-8 chr18 40456614 40456864 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 390453 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 570.5 chr14 77356359 77356989 + 1.75 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) L1MC5a|LINE|L1 17235 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 380-9 chr2 4033612 4034158 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 59724 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 163.5-104 chr2 192777756 192777886 + 1.75 NA TTS (NR_002769) TTS (NR_002769) 27976 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 398 chr1 79745958 79746322 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -739410 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 190.5-64 chr17 79497499 79497650 + 1.75 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) intron (NM_001350451, intron 1 of 14) 18574 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 470.25-3 chr3 94270160 94270522 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 207280 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 536.5-5 chr6 27133816 27134565 + 1.75 NA TTS (NM_021064) TTS (NM_021064) 1152 NM_021064 8969 Hs.51011 NM_021064 ENSG00000196787 HIST1H2AG H2A.1b|H2A/p|H2AFP|H2AG|pH2A/f histone cluster 1 H2A family member g protein-coding 280-61 chr8 52347318 52347705 + 1.75 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) HAL1ME|LINE|L1 62245 NM_001352883 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 231.5-47 chr2 118461496 118461730 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 141353 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 235.25-11 chr11 23380493 23380689 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 38599 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 306.75-8 chr14 50773172 50773546 + 1.75 NA intron (NM_016350, intron 7 of 28) intron (NM_016350, intron 7 of 28) -48438 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 252.25 chr1 56934987 56935256 + 1.75 NA intron (NM_000066, intron 9 of 11) MIRb|SINE|MIR 30894 NM_000066 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 444.5-2 chr11 46840424 46840743 + 1.75 NA intron (NM_001008938, intron 1 of 43) intron (NM_001008938, intron 1 of 43) 5697 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 349.75-10 chr2 169950211 169950538 + 1.75 NA intron (NM_172070, intron 23 of 38) intron (NM_172070, intron 23 of 38) 122866 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 527.5 chr12 1688535 1689051 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2277 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 156.5-65 chr17 58448996 58449088 + 1.75 NA intron (NM_001080439, intron 5 of 5) L1MA3|LINE|L1 -31460 NM_017763 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 286.75-18 chr2 46587426 46587658 + 1.75 NA intron (NM_002643, intron 5 of 5) intron (NM_002643, intron 5 of 5) -7304 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 376.75-4 chr13 59324594 59325094 + 1.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -687874 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 229-37 chr2 152018632 152018803 + 1.75 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu -44739 NM_001005747 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 347-16 chr3 3988307 3988599 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -187578 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 287.75-10 chr10 76385875 76386122 + 1.75 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -502046 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 382.5 chr1 48974538 48975003 + 1.75 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) ERVL-E-int|LTR|ERVL -197801 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 255.5-5 chr1 100105922 100106103 + 1.75 NA intron (NM_001304829, intron 11 of 15) intron (NM_001304829, intron 11 of 15) 26918 NM_001304829 163786 Hs.591447 NM_194292 ENSG00000156876 SASS6 MCPH14|SAS-6|SAS6 SAS-6 centriolar assembly protein protein-coding 189.75-116 chr7 91240997 91241169 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23350 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 356-7 chr5 159760979 159761375 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 110207 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 170-69 chr4 64270282 64270409 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 139105 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 248-19 chr13 53454135 53454343 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -302339 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 233.5-5 chr1 76627810 76628102 + 1.75 NA intron (NM_001349111, intron 5 of 5) intron (NM_001349111, intron 5 of 5) 151311 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 358.25-8 chr15 37939245 37939628 + 1.75 NA intron (NM_001330255, intron 6 of 11) intron (NM_001330255, intron 6 of 11) 4794 NM_001370736 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 412.5-7 chr3 71068712 71068974 + 1.75 NA intron (NR_146142, intron 7 of 19) intron (NR_146142, intron 7 of 19) -3919 NM_001244813 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 309.5-29 chr3 57785267 57785463 + 1.75 NA intron (NM_001304420, intron 1 of 21) intron (NM_001304420, intron 1 of 21) 28109 NM_001304420 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 271-6 chr11 80988193 80988400 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -225493 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 323.75-23 chr7 40325229 40325456 + 1.75 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 190366 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 193.75-24 chr11 14269883 14270025 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 88531 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 323.25-3 chr1 236135550 236135822 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -6853 NM_003272 7107 Hs.498160 NM_003272 ENSG00000077585 GPR137B TM7SF1 G protein-coupled receptor 137B protein-coding 200-11 chr10 53324379 53324529 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -552754 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 219-86 chr6 56857575 56857742 + 1.75 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -5742 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 406.5-10 chr7 15487484 15487879 + 1.75 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) intron (NM_001004320, intron 3 of 12) 74334 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 187-63 chr3 119454039 119454183 + 1.75 NA intron (NM_018266, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 9504 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 352-4 chr11 60914520 60914839 + 1.75 NA intron (NM_024092, intron 1 of 3) CpG 521 NM_024092 79073 Hs.13662 NM_024092 ENSG00000110108 TMEM109 - transmembrane protein 109 protein-coding 177.25-135 chr7 52220959 52221082 + 1.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -814613 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 292.75-37 chrM 7828 8256 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_162149).2 promoter-TSS (NR_162149).2 -528 NR_162149 113219467 NR_162149 MIR12136 - microRNA 12136 ncRNA 203-58 chr20 38053084 38053284 + 1.75 NA intron (NM_021215, intron 3 of 6) intron (NM_021215, intron 3 of 6) 19438 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 427.75-2 chr5 163193252 163193724 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -244083 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 208-83 chr9 20470785 20470974 + 1.75 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) 31463 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 166.5-81 chr17 35628602 35628759 + 1.75 NA intron (NM_001030006, intron 9 of 21) intron (NM_001030006, intron 9 of 21) 41358 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 318.75-6 chr14 60372141 60372466 + 1.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 49107 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 201.75-105 chr8 127331654 127331950 + 1.75 NA intron (NR_117099, intron 2 of 3) intron (NR_117099, intron 2 of 3) -68597 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 309.75-8 chr12 38111052 38111362 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -205567 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 235.75-8 chr10 51388596 51388980 + 1.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 89215 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 276.25-4 chr10 31425807 31426088 + 1.75 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -26192 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 295.75-12 chr2 51146206 51146510 + 1.75 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 113757 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 195-4 chr1 185741608 185741745 + 1.75 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) L2a|LINE|L2 7285 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 198.5-78 chr2 104822241 104822398 + 1.75 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) intron (NR_037883, intron 1 of 3) 29157 NR_131235 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 241.25-74 chrX 111727793 111728037 + 1.75 NA intron (NM_001099922, intron 18 of 26) intron (NM_001099922, intron 18 of 26) 46258 NM_001324294 79868 Hs.443061 NM_018466 ENSG00000101901 ALG13 CDG1S|CXorf45|EIEE36|GLT28D1|MDS031|TDRD13|YGL047W ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit protein-coding 288.5-45 chr7 40547457 40547742 + 1.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 412623 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 205.5-53 chr17 29969977 29970134 + 1.75 NA intron (NR_026738, intron 4 of 15) L1M5|LINE|L1 28421 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 447-5 chr18 38854369 38854837 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 767572 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 456.5 chr10 49483878 49484476 + 1.75 NA intron (NM_001346440, intron 8 of 20) AluJb|SINE|Alu 40104 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 228.75-53 chr3 17544799 17545063 + 1.75 NA intron (NM_001349075, intron 1 of 22) intron (NM_001349075, intron 1 of 22) 155089 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 420.25-3 chr2 22096654 22097020 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -386185 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 488.5 chr14 84435120 84435589 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -836578 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 240.25-36 chr2 196902811 196903008 + 1.75 NA intron (NM_001321099, intron 5 of 27) intron (NM_001321099, intron 5 of 27) 23798 NM_001321100 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 497.5 chr1 248589345 248589712 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 4240 NM_001004693 127069 Hs.553585 NM_001004693 ENSG00000184022 OR2T10 OR1-64 olfactory receptor family 2 subfamily T member 10 protein-coding 182.75-87 chr4 30698202 30698365 + 1.75 NA Intergenic (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22086 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 494.25 chr10 67967419 67967868 + 1.75 NA intron (NM_001278185, intron 15 of 23) L1MC5a|LINE|L1 43240 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 199.25-95 chr8 73492245 73492425 + 1.75 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 72261 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 186.25-116 chr8 31386823 31386955 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -252863 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 283-45 chr8 124071465 124071696 + 1.75 NA exon (NM_001039112, exon 31 of 41) exon (NM_001039112, exon 31 of 41) -30798 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 188.5-89 chr21 28631535 28631692 + 1.75 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 92295 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 246.75-16 chr13 108527071 108527263 + 1.75 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -68738 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 147.5-208 chr8 87440000 87440101 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 433965 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 399.5-5 chr3 71516459 71516900 + 1.75 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) AluSx1|SINE|Alu 25410 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 321.25-18 chr4 42730246 42730600 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -73318 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 286.75-30 chr3 89831078 89831261 + 1.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 723548 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 330-21 chr6 52732813 52733049 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 12228 NR_033760 730152 Hs.739662 NR_033760 GSTA7P GSTAP2|GSTAP6 glutathione S-transferase alpha 7, pseudogene pseudo 253-17 chr15 95854312 95854602 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 273384 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 153-146 chr8 24141226 24141396 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -152729 NR_130709 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 268.75-48 chr9 110866214 110866487 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 138088 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 145.75-2 chr1 38447470 38447738 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27592 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 368-9 chr4 39980796 39981137 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3010 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 294.25-35 chr8 138760151 138760481 + 1.75 NA intron (NM_152888, intron 17 of 64) intron (NM_152888, intron 17 of 64) 153725 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 461.5-5 chr21 29975209 29975628 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -35366 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 221.25-82 chr7 34345223 34345508 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -312853 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 187.5-102 chr20 40626227 40626417 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 62914 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 431.75-7 chr6 46536885 46537266 + 1.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -45008 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 323.5-18 chr3 42362763 42363107 + 1.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 47675 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 261-46 chr5 58449588 58449771 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 10407 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 155.25-97 chr2 127527641 127527800 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1231 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 215.25-73 chr4 167833720 167833937 + 1.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -258709 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 182.25-80 chr3 100464441 100464583 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -28107 NM_018004 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 296.25-24 chr3 160434101 160434436 + 1.75 NA 3' UTR (NM_005496, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_005496, exon 23 of 23) 15518 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 118.5-89 chr2 22893667 22893804 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 357256 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 365.75-7 chr15 50516932 50517513 + 1.75 NA intron (NM_203494, intron 6 of 6) AluSq2|SINE|Alu 29444 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 281.75-37 chr6 66091161 66091382 + 1.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 303392 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 275.25-48 chr8 140790927 140791144 + 1.75 NA intron (NR_148037, intron 14 of 34) intron (NR_148037, intron 14 of 34) -58382 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 329.5-4 chr15 38320045 38320340 + 1.75 NA intron (NM_152594, intron 2 of 6) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 67356 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 359-12 chr4 129868811 129869179 + 1.75 NA intron (NR_151713, intron 11 of 16) MIR|SINE|MIR 97376 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 209.75-17 chr11 99622207 99622470 + 1.75 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 66193 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 385-11 chr2 118152424 118152781 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 33784 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 206-57 chr4 142929501 142929742 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -83086 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 138.75-10 chr1 167503458 167503541 + 1.75 NA intron (NM_000734, intron 1 of 7) intron (NM_000734, intron 1 of 7) 15030 NM_000734 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 233.75-73 chr7 7336859 7337060 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 81805 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 283.25-28 chr3 78394892 78395176 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -346071 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 286.5-3 chr1 63010176 63010379 + 1.75 NA intron (NR_146606, intron 1 of 1) intron (NR_146606, intron 1 of 1) 648 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 185.25-76 chr21 19023232 19023447 + 1.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -263527 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 280.75-12 chr12 58699060 58699379 + 1.75 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) L1MA4|LINE|L1 82497 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 240.25-24 chr15 61269868 61270101 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40682 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 149.75-36 chr13 64061464 64061604 + 1.75 NA intron (NR_145420, intron 1 of 5) MLT2B4|LTR|ERVL 14477 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 575.75 chr4 44467132 44467910 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -18712 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 214.5-99 chr5 24425501 24425661 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 219397 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 284.75-17 chr19 15365451 15365818 + 1.75 NA intron (NM_005858, intron 9 of 13) intron (NM_005858, intron 9 of 13) 14153 NM_005858 10270 Hs.594496 NM_005858 ENSG00000105127 AKAP8 AKAP 95|AKAP-8|AKAP-95|AKAP95 A-kinase anchoring protein 8 protein-coding 222-85 chr8 119555221 119555476 + 1.75 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 37660 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 381-4 chr12 64177488 64177915 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 44595 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 303.25-16 chr2 62993229 62993468 + 1.75 NA intron (NM_001142615, intron 16 of 22) intron (NM_001142615, intron 16 of 22) 54363 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 376-20 chr8 46371823 46372054 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 245705 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 291.75-29 chr3 90052531 90052768 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 945028 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 409.5 chr1 84980059 84980458 + 1.75 NA intron (NM_001330647, intron 1 of 14) L1MA2|LINE|L1 16855 NM_001330647 255231 Hs.591446 NM_153259 ENSG00000153898 MCOLN2 TRP-ML2|TRPML2 mucolipin 2 protein-coding 213-3 chr1 40464262 40464508 + 1.75 NA TTS (NM_023070) TTS (NM_023070) -12905 NM_001320178 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 268.5-21 chr14 77102575 77102844 + 1.75 NA intron (NM_033426, intron 1 of 3) intron (NM_033426, intron 1 of 3) 4451 NM_033426 85457 Hs.709066 NM_033426 ENSG00000198894 CIPC KIAA1737 CLOCK interacting pacemaker protein-coding 389-16 chr4 74425625 74425995 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -19326 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 461.75-2 chr14 54021753 54022374 + 1.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -65172 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 484.5-4 chr4 30526644 30526975 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -193560 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 230.5-4 chr1 68578549 68578746 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -81565 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 301.25-18 chr2 224365313 224365583 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 36546 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 377.25-6 chr16 79731100 79731395 + 1.75 NA intron (NR_104663, intron 5 of 5) intron (NR_104663, intron 5 of 5) -39224 NR_104660 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 173.75-80 chr19 33347395 33347525 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26249 NM_001806 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 355.5-9 chr12 127474234 127474461 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -134275 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 219.5-83 chr22 41122577 41122751 + 1.75 NA intron (NM_001429, intron 2 of 30) intron (NM_001429, intron 2 of 30) 30072 NM_001362843 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 242.75-48 chr4 62077673 62077898 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001322402, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001322402, exon 26 of 26) 83980 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 342.25-4 chr10 119077231 119077526 + 1.75 NA intron (NM_003750, intron 1 of 21) AluSz|SINE|Alu 3439 NM_003750 8661 Hs.523299 NM_003750 ENSG00000107581 EIF3A EIF3|EIF3S10|P167|TIF32|eIF3-p170|eIF3-theta|p180|p185 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A protein-coding 254.75-23 chr2 159072063 159072333 + 1.75 NA intron (NM_001350065, intron 4 of 27) AluSx|SINE|Alu 103558 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 256-45 chr3 45460857 45461122 + 1.75 NA intron (NM_001368263, intron 7 of 20) L1MEf|LINE|L1 48556 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 183-34 chr15 58696043 58696246 + 1.75 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu -2537 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 428.25-2 chr17 65770750 65771195 + 1.75 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) L1MEc|LINE|L1 55479 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 239-61 chr8 138608985 138609138 + 1.75 NA intron (NM_152888, intron 56 of 64) intron (NM_152888, intron 56 of 64) -111331 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 405.5-3 chr12 23947845 23948090 + 1.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) 1703 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 266-48 chr8 66947747 66947973 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001193502, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001193502, exon 4 of 4) 14731 NM_001193502 100129654 Hs.120040 NM_001193502 ENSG00000261787 TCF24 TCF-24|bHLHa25 transcription factor 24 protein-coding 174-108 chr9 103194061 103194243 + 1.75 NA intron (NR_121578, intron 7 of 9) L1MC3|LINE|L1 130881 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 151.5-114 chr3 29763297 29763395 + 1.75 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) MER5C1|DNA|hAT-Charlie 170810 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-97 chr2 58465726 58465831 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -54975 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 386-5 chr11 99886480 99886737 + 1.75 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) L1ME3F|LINE|L1 330463 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 319-11 chr12 119439513 119439789 + 1.75 NA intron (NM_178499, intron 2 of 13) MER103C|DNA|hAT-Charlie 104922 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 408-14 chr5 43871782 43872121 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -268721 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 450-5 chr15 67970687 67971059 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -83306 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 271-36 chr5 15826107 15826518 + 1.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -108870 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 181.5-172 chrX 82716759 82716933 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -791444 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 362.75-7 chr20 3009348 3009843 + 1.75 NA intron (NM_080841, intron 10 of 22) intron (NM_080841, intron 10 of 22) -34027 NM_178331 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 238.25-83 chr7 109605089 109605334 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 355002 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 261.5-59 chr6 127238640 127238851 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -27937 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 154.5-179 chr8 19522677 19522814 + 1.75 NA intron (NM_001354497, intron 1 of 7) intron (NM_001354497, intron 1 of 7) 79800 NM_001354491 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 301-6 chr15 39869879 39870141 + 1.75 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -40734 NM_001271855 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 220.75-72 chr8 50899532 50899843 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 735556 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 180.75-92 chr3 82230087 82230298 + 1.75 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 244050 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 281-28 chr5 107557615 107557804 + 1.75 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 113228 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 371-5 chr10 120929462 120929693 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 78215 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 254.5-13 chr10 83596402 83596677 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 80550 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 299.5-50 chr9 82930938 82931139 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 132104 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 311.75-16 chr3 8266728 8266920 + 1.75 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 234834 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 207.75-48 chr19 49576129 49576339 + 1.75 NA intron (NM_001270960, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 4322 NM_001363649 51070 Hs.7236 NM_015953 ENSG00000142546 NOSIP CGI-25 nitric oxide synthase interacting protein protein-coding 170-58 chr3 52664951 52665121 + 1.75 NA intron (NM_001366074, intron 6 of 30) L1MEd|LINE|L1 20563 NM_001350074 55193 Hs.189920 NM_018165 ENSG00000163939 PBRM1 BAF180|PB1 polybromo 1 protein-coding 266.5-34 chr2 112205436 112205667 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 49491 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 264-58 chr7 48643194 48643424 + 1.75 NA exon (NM_152701, exon 60 of 62) exon (NM_152701, exon 60 of 62) -281238 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 188.75-52 chr2 33595457 33595594 + 1.75 NA exon (NM_015475, exon 2 of 8) exon (NM_015475, exon 2 of 8) 3774 NM_015475 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 260.5-61 chr8 21201420 21201586 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -96736 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 358-3 chr10 119817130 119817385 + 1.75 NA intron (NM_014937, intron 15 of 19) L1MB7|LINE|L1 -2000 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 377.5-11 chr2 163381472 163381699 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 354423 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 223.75-19 chr12 123276913 123277160 + 1.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -4796 NR_073007 8099 Hs.433201 NM_004642 ENSG00000111328 CDK2AP1 DOC1|DORC1|ST19|doc-1|p12DOC-1 cyclin dependent kinase 2 associated protein 1 protein-coding 198.25-24 chr11 115164645 115164843 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -168833 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 450.25-4 chr7 72049243 72049646 + 1.75 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) intron (NM_001363460, intron 3 of 5) 287947 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 401.25 chr1 29615454 29615869 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -265547 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 247.5-65 chr5 28134641 28134850 + 1.75 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 152920 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 222.75-59 chr2 39754339 39754524 + 1.75 NA intron (NM_001321475, intron 8 of 10) intron (NM_001321475, intron 8 of 10) 24827 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 471.75-4 chr2 12207861 12208217 + 1.75 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 8909 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 293-11 chr2 88749109 88749325 + 1.75 NA intron (NM_144563, intron 8 of 8) L1ME3A|LINE|L1 -16685 NR_015424 645784 Hs.105323 NR_015424 ENSG00000230006 ANKRD36BP2 - ankyrin repeat domain 36B pseudogene 2 pseudo 267.75-34 chr21 23221012 23221279 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 141861 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 392.25-9 chr3 49821625 49821906 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -7812 NM_003335 7318 Hs.16695 NM_003335 ENSG00000182179 UBA7 D8|UBA1B|UBE1L|UBE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 7 protein-coding 278.75-42 chr9 76169989 76170215 + 1.75 NA intron (NR_120409, intron 12 of 19) intron (NR_120409, intron 12 of 19) 224324 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 387.75-5 chr11 40798075 40798494 + 1.75 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -505154 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 347-24 chr7 140643485 140643873 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2219 NM_001318053 27147 Hs.6385 NM_015689 ENSG00000146966 DENND2A FAM31D|KIAA1277 DENN domain containing 2A protein-coding 268-54 chr7 24869171 24869367 + 1.75 NA intron (NR_104111, intron 4 of 21) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 23352 NR_104112 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 253.5-51 chr3 112646860 112647014 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5794 NM_199511 151887 Hs.477128 NM_199511 ENSG00000091986 CCDC80 CL2|DRO1|SSG1|URB|okuribin coiled-coil domain containing 80 protein-coding 600-2 chr14 88228487 88229128 + 1.75 NA intron (NM_138317, intron 3 of 6) intron (NM_138317, intron 3 of 6) 42104 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 238-70 chrX 101745088 101745418 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -85403 NM_001282231 9823 Hs.48924 NM_014782 ENSG00000184867 ARMCX2 ALEX2|GASP9 armadillo repeat containing X-linked 2 protein-coding 309.25-24 chr5 61838211 61838522 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -102668 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-113 chr3 109049014 109049127 + 1.75 NA intron (NM_014429, intron 14 of 27) intron (NM_014429, intron 14 of 27) -52386 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 481.25-5 chr9 88363860 88364275 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24377 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 342-10 chr22 27389749 27389980 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 79213 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 474.75-2 chr11 117036263 117036725 + 1.75 NA intron (NM_001366687, intron 1 of 4) intron (NM_001366687, intron 1 of 4) 61934 NM_001281749 23387 Hs.167451 NM_025164 ENSG00000160584 SIK3 L19|QSK|SEMDK|SIK-3 SIK family kinase 3 protein-coding 492.75-3 chr7 115956232 115956727 + 1.75 NA intron (NM_001244583, intron 2 of 5) intron (NM_001244583, intron 2 of 5) 11834 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 341-23 chr7 82119836 82120087 + 1.75 NA intron (NM_000722, intron 5 of 38) AluJr|SINE|Alu 110784 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 167.25-40 chr14 54984143 54984284 + 1.75 NA intron (NM_007086, intron 15 of 25) intron (NM_007086, intron 15 of 25) 42886 NM_001008396 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 348.75-17 chr5 90236700 90236943 + 1.75 NA intron (NR_120601, intron 3 of 5) intron (NR_120601, intron 3 of 5) 53250 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 277.75-9 chr16 35375546 35375795 + 1.75 NA intron (NR_027079, intron 1 of 8) intron (NR_027079, intron 1 of 8) 12139 NR_027079 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 265.25-18 chr16 77795589 77795805 + 1.75 NA intron (NM_020927, intron 1 of 8) intron (NM_020927, intron 1 of 8) 7133 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 364.25-6 chr12 27312573 27312826 + 1.75 NA intron (NM_015000, intron 6 of 13) intron (NM_015000, intron 6 of 13) -20137 NM_001248005 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 112.25-94 chr2 52480203 52480285 + 1.75 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 109596 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 230.25-70 chr7 1682968 1683220 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5025 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 158-110 chr5 51470918 51471036 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 87529 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 213-90 chr7 106594724 106594953 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 66320 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 309-41 chr6 92188526 92188843 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -498256 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 296.75-29 chr6 132437659 132437997 + 1.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -36353 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 183.5-9 chr1 175467663 175467951 + 1.75 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) -274820 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 240.25-23 chr14 66013758 66013970 + 1.75 NA Intergenic CpG -472507 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 222.75-6 chr1 183415844 183416009 + 1.75 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) intron (NM_015039, intron 1 of 10) 2454 NM_015039 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 290-7 chr1 211062500 211062814 + 1.75 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) L1MA3|LINE|L1 70717 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 328.75-16 chr4 137432961 137433195 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 99416 NM_001300828 54510 Hs.591691 NM_019035 ENSG00000189184 PCDH18 PCDH68L protocadherin 18 protein-coding 359-3 chr12 49568814 49569184 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001278341) promoter-TSS (NM_001278341) -854 NM_001278341 10445 Hs.25313 NM_006337 ENSG00000187778 MCRS1 ICP22BP|INO80Q|MCRS2|MSP58|P78 microspherule protein 1 protein-coding 340.75-3 chr1 103898689 103899000 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 149003 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 489-2 chr14 58232807 58233276 + 1.75 NA intron (NM_018477, intron 12 of 12) AluSp|SINE|Alu -11764 NM_152132 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 250-22 chr2 55860611 55860878 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 63038 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 577 chr14 20976810 20977356 + 1.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -12897 NM_022734 64745 Hs.512693 NM_022734 ENSG00000165792 METTL17 METT11D1 methyltransferase like 17 protein-coding 274.75-48 chr7 19328830 19329132 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -183560 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 483.75 chr20 9897996 9898328 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -59086 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 265.25-54 chr8 125899952 125900220 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 51111 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 263.25-20 chr14 65963629 65963798 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 492611 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 338.25-32 chr8 126376313 126376610 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 50966 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 410.5 chr10 107080567 107080995 + 1.75 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 83925 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 199.25-78 chr5 45638294 45638466 + 1.75 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 58000 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 224.25-77 chr5 24188954 24189189 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 237723 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 237.25-69 chr7 71314873 71315090 + 1.75 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 -7211 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 326.75-12 chr19 37511515 37511738 + 1.75 NA intron (NM_001013659, intron 2 of 7) AluSg|SINE|Alu -4539 NR_110723 101927720 Hs.18070 NR_110723 ENSG00000266916 ZNF793-AS1 - ZNF793 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 393-4 chr14 50422282 50422846 + 1.75 NA intron (NM_198794, intron 31 of 31) Alu|SINE|Alu -25266 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 318.5-18 chr2 44455559 44455836 + 1.75 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) MIR|SINE|MIR 93750 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 355-19 chr7 144147897 144148182 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 18926 NM_001001659 135941 Hs.534547 NM_001001659 ENSG00000221938 OR2A14 OR2A14P|OR2A6|OST182 olfactory receptor family 2 subfamily A member 14 protein-coding 310.75-28 chr7 41375289 41375549 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 273815 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 341.75-14 chr20 33629950 33630273 + 1.75 NA intron (NM_001039709, intron 8 of 10) intron (NM_001039709, intron 8 of 10) -32216 NM_080825 128864 Hs.324104 NM_080825 ENSG00000149609 C20orf144 dJ63M2.6 chromosome 20 open reading frame 144 protein-coding 189.75-117 chr7 107641189 107641345 + 1.75 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -19561 NM_000441 5172 Hs.571246 NM_000441 ENSG00000091137 SLC26A4 DFNB4|EVA|PDS|TDH2B solute carrier family 26 member 4 protein-coding 299.25-39 chr5 55723872 55724089 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -11645 NM_001349383 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 391.25-19 chr9 37575303 37575700 + 1.75 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 879 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 284.5-12 chr13 101959629 101959848 + 1.75 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 8008 NR_039603 100616110 NR_039603 ENSG00000265164 MIR2681 - microRNA 2681 ncRNA 276.5-50 chr4 127423739 127423985 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -209095 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 153.25-18 chr10 83919038 83919223 + 1.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -220379 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 286.5-64 chr7 81324628 81324918 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 237046 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 383.25-11 chr22 19092585 19093055 + 1.75 NA intron (NM_001184781, intron 1 of 9) L1MD|LINE|L1 29592 NM_005137 9993 Hs.517357 NM_005137 ENSG00000070413 DGCR2 DGS-C|IDD|LAN|SEZ-12 DiGeorge syndrome critical region gene 2 protein-coding 414.75-4 chr11 103461149 103461618 + 1.75 NA intron (NM_001377, intron 87 of 88) intron (NM_001377, intron 87 of 88) 351957 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 211.25-61 chr3 134946890 134947044 + 1.75 NA intron (NM_004441, intron 2 of 15) intron (NM_004441, intron 2 of 15) 151707 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 318.5-6 chr12 7352746 7353019 + 1.75 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 48550 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 285.75-39 chr7 3536596 3536913 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 235502 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 224.75-24 chr12 66084309 66084606 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 46293 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 165-18 chr10 94645677 94645870 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -37956 NM_001128925 1562 Hs.511872 NM_000772 ENSG00000108242 CYP2C18 CPCI|CYP2C|CYP2C17|P450-6B/29C|P450IIC17 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 18 protein-coding 176-3 chr1 102594954 102595088 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 513475 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 233.25-41 chr21 28226466 28226700 + 1.75 NA intron (NR_126012, intron 1 of 5) L1MC4|LINE|L1 2084 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 281.5-18 chr14 104211693 104211969 + 1.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -11753 NR_146611 145195 Hs.534297 NR_146611 ENSG00000258913 LINC02691 C14orf144 long intergenic non-protein coding RNA 2691 ncRNA 322.5-33 chr6 48188627 48188918 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -120083 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 357.75-12 chr3 51019274 51019647 + 1.75 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) intron (NM_004947, intron 5 of 52) 344380 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 512.5 chr19 47509019 47509434 + 1.75 NA intron (NM_003827, intron 1 of 10) intron (NM_003827, intron 1 of 10) 5837 NM_003827 8775 Hs.126938 NM_003827 ENSG00000105402 NAPA SNAPA NSF attachment protein alpha protein-coding 348-8 chr12 95154363 95154646 + 1.75 NA intron (NM_018351, intron 3 of 20) intron (NM_018351, intron 3 of 20) 62963 NM_018351 55785 Hs.506381 NM_018351 ENSG00000180263 FGD6 ZFYVE24 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 6 protein-coding 530.25 chr12 9084720 9085074 + 1.75 NA intron (NM_000014, intron 22 of 35) L1MA7|LINE|L1 19720 NR_137424 144571 Hs.592432 NR_026971 ENSG00000245105 A2M-AS1 - A2M antisense RNA 1 ncRNA 281-37 chr6 146442465 146442679 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -101261 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 277.5-50 chr3 139097250 139097578 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -6771 NR_026783 60467 Hs.512673 NM_021812 ENSG00000232416 BPESC1 NCRNA00187 blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis candidate 1 ncRNA 176.75-61 chr2 65758623 65758774 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -326099 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 407 chr1 182949876 182950154 + 1.75 NA intron (NM_030933, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 3151 NM_030933 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 226.75-21 chr15 85318535 85318752 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -61953 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 251.25-26 chr2 46598713 46598916 + 1.75 NA intron (NM_173074, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 18227 NM_173074 5281 Hs.468415 NM_002643 ENSG00000151665 PIGF - phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class F protein-coding 436.75 chr1 118417450 118417992 + 1.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -232493 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 338-9 chr12 29088224 29088520 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -60906 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 351.75-17 chr5 102670945 102671185 + 1.75 NA intron (NR_103753, intron 1 of 2) intron (NR_103753, intron 1 of 2) 399 NR_103753 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 292.25-34 chr5 38809268 38809630 + 1.75 NA intron (NR_109951, intron 1 of 3) intron (NR_109951, intron 1 of 3) 36380 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 404.75-8 chr9 5801883 5802131 + 1.75 NA intron (NM_024896, intron 10 of 14) intron (NM_024896, intron 10 of 14) 31110 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 212.75 chr1 15532383 15532550 + 1.75 NA intron (NR_109898, intron 2 of 14) intron (NR_109898, intron 2 of 14) 5618 NM_015291 23341 Hs.655410 NM_015291 ENSG00000116138 DNAJC16 - DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C16 protein-coding 183.25-95 chr6 149240580 149240703 + 1.75 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) intron (NM_001292035, intron 2 of 6) 16910 NR_149096 105378049 Hs.615624 NR_149096 ENSG00000225924 TAB2-AS1 - TAB2 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-167 chr8 39908231 39908364 + 1.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -5594 NM_002164 3620 Hs.840 NM_002164 ENSG00000131203 IDO1 IDO|IDO-1|INDO indoleamine 2,3-dioxygenase 1 protein-coding 255.5-21 chr12 96334315 96334521 + 1.75 NA intron (NM_002595, intron 2 of 16) intron (NM_002595, intron 2 of 16) 66021 NM_001170464 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 183.75-15 chr10 44323888 44324032 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 31210 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 444.5-6 chr7 124641487 124641899 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 124099 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 305.5-40 chr6 100440109 100440381 + 1.75 NA intron (NM_005068, intron 8 of 10) MIRb|SINE|MIR 23430 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 266.25-53 chr9 99561246 99561422 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -186077 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 256.25-6 chr10 92853323 92853613 + 1.75 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) L1M4|LINE|L1 4948 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 263-30 chr21 45775034 45775230 + 1.75 NA intron (NM_001348243, intron 3 of 15) L1MA4A|LINE|L1 27118 NM_001348243 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 441.5-3 chr12 3896435 3896939 + 1.75 NA Intergenic (TTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23239 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 273.75-43 chr8 89607934 89608138 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 149675 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 320.5-9 chr11 122899808 122900086 + 1.75 NA intron (NM_001363089, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR 17017 NM_001363089 79864 Hs.164705 NM_024806 ENSG00000109944 JHY C11orf63 junctional cadherin complex regulator protein-coding 345.25-7 chr14 43727611 43728079 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 779438 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 240.25-59 chr7 2919127 2919301 + 1.75 NA intron (NM_001324281, intron 19 of 25) intron (NM_001324281, intron 19 of 25) -74906 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 200.75-111 chr9 38450228 38450401 + 1.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -25860 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 364.75 chr14 56933961 56934455 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 121050 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 297.25-16 chr20 5339453 5339796 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -22892 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 425-8 chr5 74951241 74951729 + 1.75 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -84519 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 229.5-29 chr11 69007391 69007636 + 1.75 NA intron (NM_001098515, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 -4841 NR_120541 101928200 Hs.703759 NR_120541 ENSG00000256508 MRGPRF-AS1 - MRGPRF antisense RNA 1 ncRNA 169-101 chr7 94842130 94842307 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -65376 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 429.5-3 chr12 130603833 130604116 + 1.75 NA intron (NM_001351226, intron 2 of 21) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 24482 NM_015347 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 360.25-13 chr5 114128456 114128889 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -233398 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 592.5-3 chrX 46162709 46163275 + 1.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 164682 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 427-4 chr11 85836391 85836736 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18538 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 320.75-19 chr4 77125339 77125580 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -31748 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 351.5-32 chr9 74321857 74322126 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -49540 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 430-6 chr18 3553775 3554074 + 1.75 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) intron (NM_001242762, intron 6 of 9) -40190 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 319-34 chr6 51516709 51516970 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -105031 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 133.5-138 chr20 53956317 53956460 + 1.75 NA intron (NM_001366297, intron 7 of 8) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -80679 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 295.5-32 chr20 17130218 17130482 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -95757 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 310.75-25 chr5 163154628 163154874 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -282820 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 444.5-4 chr5 110941023 110941709 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -128714 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 438.5-10 chr5 146128938 146129353 + 1.75 NA intron (NM_016460, intron 24 of 30) intron (NM_016460, intron 24 of 30) -23568 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 511.75-2 chr16 59473938 59474467 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 280989 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 228.5-62 chr2 193928739 193928892 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -415454 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 224.25-97 chr7 54661262 54661441 + 1.75 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL 97860 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 391.5-15 chr5 79232278 79232555 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3715 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 368.5-5 chr13 57649822 57650207 + 1.75 NA intron (NM_001040429, intron 1 of 3) intron (NM_001040429, intron 1 of 3) 18270 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 402.25-5 chr3 169305658 169305952 + 1.75 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -142062 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 763.5 chr7 3455179 3455922 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MD2|LINE|L1 154298 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 179.25-68 chr18 22898450 22898611 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -34798 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 440.5-4 chr12 2244041 2244340 + 1.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 -20709 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 332.25-3 chr1 164128688 164128989 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -430522 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 258.75-44 chr21 18808215 18808394 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -48492 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 392.25-3 chr12 16102487 16102839 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 175022 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 281.75-44 chr8 89941908 89942168 + 1.75 NA intron (NM_001024688, intron 15 of 16) intron (NM_001024688, intron 15 of 16) 39468 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 270-18 chr15 40110213 40110476 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1465 NM_001003943 90427 Hs.591104 NM_033503 ENSG00000104081 BMF - Bcl2 modifying factor protein-coding 371.75-14 chr5 87095318 87095720 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 19435 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 199.75-76 chr5 24066613 24066836 + 1.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR 115376 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 285.25-12 chr2 19574323 19574599 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -215838 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 508.5-2 chr14 29739671 29740174 + 1.75 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 187174 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 358-10 chr7 3478203 3478569 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 177134 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 388.5-12 chr20 56833217 56833553 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 204079 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 401-15 chr7 35244060 35244337 + 1.75 NA intron (NM_001166220, intron 4 of 5) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 9902 NM_001077653 57057 Hs.404167 NM_020417 ENSG00000164532 TBX20 ASD4 T-box transcription factor 20 protein-coding 216.5-100 chr6 53973233 53973521 + 1.75 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -25513 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 433.75-7 chr2 36681238 36681810 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15166 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 364.75-2 chr15 27644356 27644690 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 454792 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 285.25-20 chr3 98100708 98101069 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 13715 NM_054106 81050 Hs.554715 NM_054106 ENSG00000196578 OR5AC2 HSA1 olfactory receptor family 5 subfamily AC member 2 protein-coding 135.75-181 chr6 62141105 62141317 + 1.75 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 145014 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 278.75-22 chr2 69091962 69092136 + 1.75 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) L2a|LINE|L2 -11633 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 262.75-6 chr11 15363145 15363384 + 1.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 214162 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 303.25-24 chr4 46667011 46667291 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 242094 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 215.75-93 chr7 61922651 61922802 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1381330 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 323.5-10 chr14 50329015 50329508 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001367064, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367064, exon 9 of 9) 16937 NM_015684 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 133.25-90 chr2 16050585 16050685 + 1.75 NA non-coding (NR_126559, exon 1 of 4) non-coding (NR_126559, exon 1 of 4) 208 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 223.5-20 chr11 15276960 15277208 + 1.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 127982 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 204-4 chr10 30762608 30762753 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39461 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 239.75-50 chr4 20461326 20461528 + 1.75 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) L2b|LINE|L2 -66848 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 249.25-50 chr7 81432222 81432472 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 129472 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 265-26 chr22 28620364 28620546 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 59410 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 361.5-23 chr7 55346885 55347394 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -18309 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 270-4 chr1 192391955 192392220 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 75095 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 142-152 chr7 96159434 96159549 + 1.75 NA intron (NM_001160210, intron 13 of 17) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 60265 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 219.25-30 chr17 75690517 75690793 + 1.75 NA intron (NR_126037, intron 3 of 8) intron (NR_126037, intron 3 of 8) 23317 NM_013260 29115 Hs.655088 NM_013260 ENSG00000161526 SAP30BP HCNGP|HTRG|HTRP SAP30 binding protein protein-coding 383-2 chr11 113526761 113527162 + 1.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -51563 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 283.5-52 chr6 155631005 155631351 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 116334 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 303.25-27 chr5 175184569 175184818 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -188962 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 233.5-81 chr5 22291209 22291584 + 1.75 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) L1MA8|LINE|L1 -77546 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 346.75-2 chr1 231745149 231745395 + 1.75 NA intron (NM_001164544, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 73245 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 386-12 chr9 30623986 30624360 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -215719 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 260.5-37 chr20 16019070 16019237 + 1.75 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) intron (NM_001351663, intron 15 of 17) -33271 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 257.75-15 chr14 66689037 66689194 + 1.75 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) L1M2|LINE|L1 181708 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 179.75-60 chr2 72736114 72736362 + 1.75 NA intron (NM_001321734, intron 1 of 21) intron (NM_001321734, intron 1 of 21) 89795 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 253-56 chrX 154715471 154715691 + 1.75 NA intron (NR_104114, intron 2 of 8) intron (NR_104114, intron 2 of 8) 35496 NM_001282283 139716 Hs.496982 NM_080612 ENSG00000160219 GAB3 - GRB2 associated binding protein 3 protein-coding 509.25 chr19 36052461 36052770 + 1.75 NA intron (NM_001331104, intron 1 of 3) LTR65|LTR|ERV1 1670 NM_152658 199745 Hs.350209 NM_152658 ENSG00000161277 THAP8 - THAP domain containing 8 protein-coding 238-36 chr20 41524587 41524789 + 1.75 NA intron (NM_032221, intron 3 of 36) HAL1ME|LINE|L1 93689 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 194.25-10 chr10 70244250 70244462 + 1.75 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -10927 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 300.5-12 chr12 21778113 21778423 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3562 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 428-2 chr20 47624198 47624523 + 1.75 NA intron (NM_181659, intron 4 of 22) MER1A|DNA|hAT-Charlie 122473 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 387.25-3 chr17 20265234 20265687 + 1.75 NA intron (NM_001033553, intron 12 of 14) L1PA16|LINE|L1 -55714 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 553-3 chrX 139079789 139080247 + 1.75 NA intron (NM_001139501, intron 2 of 7) intron (NM_001139501, intron 2 of 7) 125005 NM_001139500 2258 Hs.6540 NM_004114 ENSG00000129682 FGF13 FGF-13|FGF2|FHF-2|FHF2|LINC00889 fibroblast growth factor 13 protein-coding 226.75-22 chr16 26483759 26483940 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 458612 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 136-15 chr10 48798509 48798670 + 1.75 NA intron (NM_020945, intron 24 of 61) L1M4|LINE|L1 113126 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 341.5-36 chr8 88787639 88787886 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -460279 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 405.75-5 chr3 88263829 88264223 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -74430 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 313.5-25 chr3 122005376 122005644 + 1.75 NA intron (NM_001199799, intron 2 of 7) intron (NM_001199799, intron 2 of 7) 16737 NM_001199800 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 251.5-90 chr8 131109635 131109832 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -68824 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 389.75-3 chr22 45895087 45895568 + 1.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 81835 NM_058238 7477 Hs.512714 NM_058238 ENSG00000188064 WNT7B - Wnt family member 7B protein-coding 294.25-24 chr2 233235169 233235400 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16287 NM_198890 55054 Hs.529322 NM_017974 ENSG00000085978 ATG16L1 APG16L|ATG16A|ATG16L|IBD10|WDR30 autophagy related 16 like 1 protein-coding 241.5-11 chr12 14846452 14846625 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3012 NM_001354646 420 Hs.591158 NM_021071 ENSG00000111339 ART4 ARTC4|CD297|DO|DO/ART4|DOK1 ADP-ribosyltransferase 4 (Dombrock blood group) protein-coding 212-73 chr6 132789441 132789714 + 1.75 NA intron (NM_052831, intron 4 of 13) intron (NM_052831, intron 4 of 13) 9060 NM_052831 116843 Hs.347144 NM_052831 ENSG00000146409 SLC18B1 C6orf192|dJ55C23.6 solute carrier family 18 member B1 protein-coding 294.25-18 chr2 5697985 5698218 + 1.75 NA 3' UTR (NM_003108, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_003108, exon 1 of 1) 5717 NM_003108 6664 Hs.432638 NM_003108 ENSG00000176887 SOX11 MRD27 SRY-box transcription factor 11 protein-coding 225-15 chr10 127503674 127503983 + 1.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -45521 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 317.5-24 chr4 53424781 53425094 + 1.75 NA intron (NM_001134937, intron 10 of 17) intron (NM_001134937, intron 10 of 17) 47284 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 176.5-117 chr3 8337204 8337494 + 1.75 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 164309 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 220.25-13 chr11 29058184 29058436 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -536103 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 355-10 chr4 126938818 126939071 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -694013 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 312.25-27 chr7 49069343 49069617 + 1.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 144933 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 251.25-42 chr4 94629652 94629928 + 1.75 NA intron (NM_006457, intron 8 of 12) intron (NM_006457, intron 8 of 12) 127743 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 254.5-37 chr2 69120693 69120906 + 1.75 NA intron (NM_032208, intron 10 of 17) intron (NM_032208, intron 10 of 17) 17117 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 351.25-16 chrUn_GL000216v2 149476 149758 + 1.75 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 228.75-24 chr16 19559352 19559591 + 1.75 NA intron (NM_001300743, intron 1 of 27) intron (NM_001300743, intron 1 of 27) 3768 NM_001365294 57020 Hs.654964 NM_020314 ENSG00000103544 VPS35L C16orf62 VPS35 endosomal protein sorting factor like protein-coding 289.5-50 chr9 31739228 31739650 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -357949 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 641 chr8 126148007 126148600 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -177192 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 265.5-46 chr4 87358757 87359081 + 1.75 NA intron (NM_016245, intron 4 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 32269 NM_016245 51170 Hs.594923 NM_016245 ENSG00000198189 HSD17B11 17-BETA-HSD11|17-BETA-HSDXI|17BHSD11|DHRS8|PAN1B|RETSDR2|SDR16C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11 protein-coding 398.25 chr1 157405993 157406221 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 146408 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 397-8 chr3 56201148 56201524 + 1.75 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 267131 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 289-39 chr6 95120970 95121266 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 456333 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 274.5-40 chr22 26929436 26929799 + 1.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 26325 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 325.5-39 chr8 87663701 87664000 + 1.75 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 210165 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 222.5-93 chr6 36281152 36281327 + 1.75 NA intron (NM_001145717, intron 1 of 7) (GTGTGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10779 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 513-2 chr14 47422588 47423344 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -79720 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 286-17 chr2 12594646 12594856 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -122121 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 380.5-3 chr14 66288404 66288734 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -197802 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 210-5 chr1 77955364 77955502 + 1.75 NA intron (NM_003902, intron 17 of 19) intron (NM_003902, intron 17 of 19) 23639 NR_146539 8880 Hs.567380 NM_003902 ENSG00000162613 FUBP1 FBP|FUBP|hDH V far upstream element binding protein 1 protein-coding 282-44 chr7 154787581 154787827 + 1.75 NA intron (NR_157196, intron 10 of 25) L2a|LINE|L2 -140813 NR_024477 100132707 Hs.586358 NR_024476 ENSG00000214106 PAXIP1-AS2 PAXIP1OS PAXIP1 antisense RNA 2 ncRNA 227.5-100 chr8 59209773 59210017 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 90685 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 515.75-4 chr2 144275105 144275566 + 1.75 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) AluSc8|SINE|Alu 19158 NM_001006636 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 379.5-19 chr6 148053759 148054062 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -218418 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 173-132 chr7 40528183 40528359 + 1.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 393295 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 241.25-46 chr3 79008137 79008303 + 1.75 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) 11239 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 355-4 chr10 82686563 82686860 + 1.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -453791 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 299.75-17 chr2 218679180 218679382 + 1.75 NA intron (NM_001369423, intron 7 of 26) intron (NM_001369423, intron 7 of 26) 6963 NM_001369423 27148 Hs.471404 NM_015690 ENSG00000163482 STK36 FU serine/threonine kinase 36 protein-coding 288.5-25 chr20 8500496 8500693 + 1.75 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) 251890 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 308.25-32 chr7 33158282 33158580 + 1.75 NA intron (NM_198428, intron 4 of 22) intron (NM_198428, intron 4 of 22) 28867 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 181-111 chr8 103997616 103997838 + 1.75 NA intron (NR_145711, intron 14 of 21) intron (NR_145711, intron 14 of 21) 178507 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 208.25-25 chr13 44786151 44786317 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 23396 NR_038433 144817 Hs.585616 NR_038433 ENSG00000235097 LINC00330 NCRNA00330 long intergenic non-protein coding RNA 330 ncRNA 231-77 chr7 51048093 51048316 + 1.75 NA intron (NM_015198, intron 7 of 12) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -254751 NM_001371008 225.75-39 chr2 78176129 78176307 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 87488 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 349.25-14 chr5 14323756 14324058 + 1.75 NA intron (NM_007118, intron 9 of 56) intron (NM_007118, intron 9 of 56) -140076 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 359.5-5 chr2 188916143 188916500 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -58052 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 311.5-15 chr2 35798087 35798489 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 326883 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 199.25-31 chr14 83235733 83235944 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 593206 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 421.75-5 chr4 138949015 138949371 + 1.75 NA intron (NR_133945, intron 2 of 2) MER20B|DNA|hAT-Charlie 63453 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 283.5-42 chr3 121414042 121414260 + 1.75 NA intron (NM_001348343, intron 25 of 27) L2a|LINE|L2 131837 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 334.5-13 chr2 167911032 167911407 + 1.75 NA intron (NR_131227, intron 1 of 4) L1MC1|LINE|L1 29925 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 226-28 chr16 80794345 80794546 + 1.75 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 10153 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 425.75-3 chrX 88918244 88918650 + 1.75 NA Intergenic MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR 171222 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 257.25-34 chr4 30056012 30056315 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -664206 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 169.75-70 chr18 70153539 70153689 + 1.75 NA intron (NM_001318520, intron 14 of 47) intron (NM_001318520, intron 14 of 47) 52073 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 252-18 chr12 2080971 2081218 + 1.75 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 L1MEd|LINE|L1 27809 NM_001167624 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 359.75 chr1 91628839 91629207 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 127915 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 301-27 chr7 24831988 24832179 + 1.75 NA intron (NM_015550, intron 15 of 22) AluJb|SINE|Alu 60538 NR_104112 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 303-4 chr12 28448069 28448318 + 1.75 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) MIR|SINE|MIR -257455 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 488.5-3 chr4 74588394 74588809 + 1.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 143465 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 294-30 chr7 116057734 116057973 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -27090 NM_001018058 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 153-165 chrX 38422745 38422886 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 70211 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 165.5-200 chr8 103173865 103174021 + 1.75 NA intron (NM_001024372, intron 1 of 1) intron (NM_001024372, intron 1 of 1) -1803 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 252.75-12 chr11 91393910 91394157 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -524831 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 370.75 chr1 79887447 79887669 + 1.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -648197 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 505 chr2 26043260 26043766 + 1.75 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) L1MB4|LINE|L1 9429 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 199.5-91 chr2 200448476 200448654 + 1.75 NA intron (NM_001100423, intron 8 of 12) intron (NM_001100423, intron 8 of 12) 61503 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 267.75-52 chr7 23131357 23131635 + 1.75 NA intron (NM_001031710, intron 4 of 10) intron (NM_001031710, intron 4 of 10) 24835 NM_018846 55975 Hs.654817 NM_018846 ENSG00000122550 KLHL7 CISS3|KLHL6|SBBI26 kelch like family member 7 protein-coding 388.25 chr12 30528105 30528379 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 149002 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 224-57 chr7 77719124 77719312 + 1.75 NA intron (NM_198467, intron 1 of 7) intron (NM_198467, intron 1 of 7) -21873 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 388.25-3 chr2 215443885 215444158 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7951 NM_001306130 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 257.75-35 chr4 160196774 160197008 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -419107 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 296.5-38 chr7 97737203 97737484 + 1.75 NA intron (NM_013997, intron 5 of 5) intron (NM_013997, intron 5 of 5) 5257 NM_013998 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 469.25-4 chr2 81506263 81506705 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -39538 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 287.25-36 chr5 16780002 16780472 + 1.75 NA intron (NM_012334, intron 8 of 40) intron (NM_012334, intron 8 of 40) 156051 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 306.75-18 chr5 145499133 145499350 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 336101 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 328.5-13 chr14 72637924 72638277 + 1.75 NA intron (NM_001280542, intron 8 of 10) intron (NM_001280542, intron 8 of 10) 121280 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 300.25-29 chr9 26220559 26220807 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 154008 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 419-9 chr5 2785071 2785423 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 33116 NM_001294337 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 299.25-44 chr7 27682601 27682902 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19868 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 343-20 chr22 23126493 23126848 + 1.75 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) intron (NM_014433, intron 4 of 6) 15320 NM_014433 27156 Hs.526920 NM_014433 ENSG00000100218 RSPH14 RTDR1 radial spoke head 14 homolog protein-coding 218.75-51 chr22 34186171 34186380 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -263387 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 175-32 chr12 78710103 78710325 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -153768 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 343.25-17 chr8 24545871 24546296 + 1.75 NA intron (NR_125808, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 2535 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 275-9 chr12 15252256 15252491 + 1.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -30956 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 264.25-32 chr2 208958656 208958911 + 1.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 416141 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 265.25-42 chr5 121798845 121799063 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52928 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 534.75 chr1 98608883 98609197 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52681 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 314.75-22 chr9 36275395 36275774 + 1.75 NA intron (NM_001128227, intron 1 of 11) intron (NM_001128227, intron 1 of 11) 1394 NM_001128227 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 496 chr2 124105416 124105916 + 1.75 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) L1M5|LINE|L1 80379 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 236.5-42 chr18 22377157 22377324 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 40675 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 390.5-5 chr16 74667856 74668185 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1143 NM_001370537 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 224.5-112 chr8 127357005 127357235 + 1.75 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -43279 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 467-5 chr3 34495854 34496134 + 1.75 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 697364 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 168-34 chr12 16712741 16712888 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -104600 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 221.25-49 chr22 25075358 25075509 + 1.75 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L1MA9|LINE|L1 37259 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 195-51 chr20 15714598 15714718 + 1.75 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 208656 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 259.5-81 chr6 48527858 48528101 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -459290 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 336-19 chr5 25159816 25160031 + 1.75 NA intron (NR_147006, intron 3 of 4) LTR8|LTR|ERV1 30733 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 288.25-10 chr14 48718025 48718356 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 868190 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 253-24 chr18 10470891 10471106 + 1.75 NA intron (NM_153000, intron 2 of 4) intron (NM_153000, intron 2 of 4) 16363 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 385.5-13 chr2 194494887 194495205 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 150777 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 260.25-19 chr18 21099034 21099273 + 1.75 NA intron (NM_005406, intron 1 of 32) L1MC5a|LINE|L1 12660 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 476.25-4 chr9 30677643 30678115 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -269425 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 191.25-48 chr2 18988159 18988323 + 1.75 NA intron (NR_135287, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 38730 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 255.5-56 chr3 105893950 105894107 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -24627 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 119.75-170 chr5 51145803 51145907 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -175668 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 382.75-13 chr7 3720539 3720793 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MD2|LINE|L1 -409019 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 229-28 chr19 52458992 52459136 + 1.75 NA intron (NM_001366182, intron 3 of 5) intron (NM_001366182, intron 3 of 5) 5511 NM_001099694 147660 Hs.157287 NM_152472 ENSG00000258405 ZNF578 - zinc finger protein 578 protein-coding 128-118 chr4 122507455 122507531 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -50998 NM_000586 3558 Hs.89679 NM_000586 ENSG00000109471 IL2 IL-2|TCGF|lymphokine interleukin 2 protein-coding 209.5-123 chr5 66075539 66075678 + 1.75 NA intron (NM_001253697, intron 23 of 25) intron (NM_001253697, intron 23 of 25) -68692 NM_001323529 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 398.5-15 chr4 96818014 96818420 + 1.75 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 507514 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 270.25-29 chr2 110867143 110867520 + 1.75 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 134758 NM_001371254 235.25-25 chr17 39799283 39799505 + 1.75 NA intron (NM_001257409, intron 2 of 5) L2b|LINE|L2 -21169 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 213.75-53 chr2 120289303 120289463 + 1.75 NA intron (NM_001369400, intron 3 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 36531 NM_002881 5899 Hs.469820 NM_002881 ENSG00000144118 RALB - RAS like proto-oncogene B protein-coding 311.75-21 chr7 51541897 51542167 + 1.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -148776 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 307.75-21 chr7 135860180 135860499 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -111526 NM_001369697 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 332.75-20 chr7 53781549 53781972 + 1.75 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 30171 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 161.75-139 chr9 137764125 137764233 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001354611, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001354611, exon 10 of 10) 24227 NR_147508 651337 Hs.603195 NR_147508 ENSG00000255585 LOC651337 - uncharacterized LOC651337 ncRNA 178-106 chr9 74024220 74024409 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -347217 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 234.5-97 chr8 112752052 112752268 + 1.75 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L2|LINE|L2 108667 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 337.75-3 chr1 190986413 190986650 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 241967 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 294.75-11 chr2 12720341 12720545 + 1.75 NA intron (NM_021643, intron 1 of 2) intron (NM_021643, intron 1 of 2) 3507 NR_027303 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 597.5-3 chr6 9826028 9826461 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -578258 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 169.25-116 chr7 126099360 126099478 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -835128 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 166-26 chr13 75267383 75267550 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 26878 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 330-23 chr6 114283004 114283198 + 1.75 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -220224 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 334.75-2 chr1 112394698 112395029 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1351 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 364.75-9 chr5 44050621 44051022 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -337911 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 251.75-71 chr7 3258560 3258847 + 1.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -42549 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 281.75-29 chr21 28280346 28280611 + 1.75 NA Intergenic Tigger17b|DNA|TcMar-Tigger -51811 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 431.25-8 chr8 77633522 77633891 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 183009 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 225.25-11 chr11 5044305 5044512 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2118 NM_001001916 119679 Hs.553558 NM_001001916 ENSG00000205495 OR52J3 OR11-32 olfactory receptor family 52 subfamily J member 3 protein-coding 245.75-33 chr22 41365593 41365801 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1636 NM_001145398 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 274.5-67 chr8 105994086 105994510 + 1.75 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) MER4D0|LTR|ERV1 66205 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 361-15 chr7 18659684 18659947 + 1.75 NA intron (NM_001321878, intron 13 of 13) UCON1|Unknown|Unknown 150545 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 347.75-2 chr12 43401417 43401652 + 1.75 NA intron (NM_025003, intron 28 of 38) intron (NM_025003, intron 28 of 38) 150669 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 560.5-3 chr8 119037220 119037805 + 1.75 NA 5' UTR (NM_001324095, exon 2 of 8) 5' UTR (NM_001324095, exon 2 of 8) -29735 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 318-10 chr15 58967730 58968021 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -19788 NM_001330331 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 270.25-23 chr17 61474558 61474852 + 1.75 NA intron (NM_001321120, intron 5 of 8) intron (NM_001321120, intron 5 of 8) 18217 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 232-66 chr6 37466618 37466785 + 1.75 NA intron (NM_015050, intron 13 of 23) L1MEf|LINE|L1 33192 NM_138493 154467 Hs.284207 NM_138493 ENSG00000198937 CCDC167 C6orf129|HSPC265 coiled-coil domain containing 167 protein-coding 350.25-31 chr7 109677859 109678217 + 1.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 282175 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 276-4 chr1 101318441 101318612 + 1.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -5311 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 264.75-32 chr3 130878638 130878827 + 1.75 NA intron (NM_001199181, intron 1 of 26) L1MA5|LINE|L1 -15283 NM_001001485 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 302-35 chr9 31474403 31474682 + 1.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -93052 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 511.25 chr1 32473693 32474084 + 1.75 NA intron (NM_001145720, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 8816 NM_001145720 728116 Hs.647658 NM_001145720 ENSG00000273274 ZBTB8B ZNF916B zinc finger and BTB domain containing 8B protein-coding 355.25-10 chr5 9488476 9488775 + 1.75 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -22708 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 243.25-25 chr2 151498295 151498529 + 1.75 NA intron (NM_001271208, intron 170 of 182) intron (NM_001271208, intron 170 of 182) 88510 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 458-7 chr8 99127624 99128028 + 1.75 NA intron (NM_017890, intron 8 of 61) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 114560 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 221-64 chr5 44381341 44381567 + 1.75 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -7278 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 302.5-44 chr8 133223005 133223258 + 1.75 NA intron (NM_003882, intron 3 of 4) intron (NM_003882, intron 3 of 4) 32092 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 236.5-14 chr11 97185326 97185592 + 1.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 677034 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 365.5-8 chr2 137150298 137150637 + 1.75 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 384922 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 378.25-10 chr6 129484376 129484662 + 1.75 NA intron (NM_000426, intron 55 of 64) L1ME3F|LINE|L1 225658 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 370.25-8 chr4 104357653 104358122 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -133078 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 474.75-3 chr3 167560445 167560861 + 1.75 NA intron (NM_001348951, intron 8 of 18) intron (NM_001348951, intron 8 of 18) -86521 NM_001012303 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 320-5 chr10 4746363 4746623 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -68423 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 128.25-64 chr16 61123918 61124022 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -68204 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 322.5-9 chr13 29467609 29467936 + 1.75 NA intron (NM_015233, intron 2 of 8) intron (NM_015233, intron 2 of 8) 19978 NR_046378 100874107 Hs.577987 NR_046378 MTUS2-AS1 - MTUS2 antisense RNA 1 ncRNA 482.75 chr17 11662156 11662705 + 1.75 NA intron (NM_001372, intron 14 of 68) intron (NM_001372, intron 14 of 68) 63960 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 616.25 chr10 15055494 15056083 + 1.75 NA intron (NM_001039702, intron 3 of 7) intron (NM_001039702, intron 3 of 7) 11845 NM_018324 55301 Hs.24309 NM_018324 ENSG00000152463 OLAH AURA1|SAST|TE2|THEDC1 oleoyl-ACP hydrolase protein-coding 229-23 chr17_GL000205v2_random 67269 67466 + 1.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -9401 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 263-13 chr12 9653474 9653745 + 1.75 NA intron (NR_046444, intron 1 of 4) intron (NR_046444, intron 1 of 4) 5562 NR_046444 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 309.25-31 chrX 84733489 84733744 + 1.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -200535 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 257.25-44 chr5 159937803 159937966 + 1.75 NA intron (NM_000679, intron 1 of 1) intron (NM_000679, intron 1 of 1) 21402 NM_000679 147 Hs.368632 NM_000679 ENSG00000170214 ADRA1B ADRA1|ALPHA1BAR adrenoceptor alpha 1B protein-coding 284.75-28 chr5 101479163 101479392 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -575995 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 294.5-22 chr2 150609951 150610194 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18825 NR_110245 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 321.75-28 chr5 110687923 110688208 + 1.75 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) intron (NM_001039763, intron 1 of 13) 38606 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 254.25-74 chrX 99638276 99638490 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 771890 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 257.5-37 chr2 189479678 189479854 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 38292 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 343-22 chr3 171597263 171597543 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -136995 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 261.25-20 chr2 201353772 201354003 + 1.75 NA intron (NM_001289993, intron 1 of 14) AluSx1|SINE|Alu 3458 NM_001289993 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 250.5-97 chr8 85922576 85922819 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -94755 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 414-9 chr2 196151505 196151859 + 1.75 NA intron (NM_004226, intron 3 of 7) intron (NM_004226, intron 3 of 7) 19896 NM_004226 9262 Hs.88297 NM_004226 ENSG00000081320 STK17B DRAK2 serine/threonine kinase 17b protein-coding 203.75-58 chr2 65694540 65694746 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -262044 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 349.25-13 chr4 134745766 134746159 + 1.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 322094 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 282-6 chr11 25787095 25787477 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -401837 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 398.5-13 chr3 89180881 89181148 + 1.75 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 73393 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 394.5-9 chr20 14648067 14648473 + 1.75 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) intron (NM_001351663, intron 4 of 17) 93886 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 385.25-4 chr18 9184660 9184934 + 1.75 NA intron (NM_001204056, intron 2 of 11) L1MB8|LINE|L1 47234 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 213.5-82 chr3 140170005 140170241 + 1.75 NA intron (NM_022131, intron 1 of 16) intron (NM_022131, intron 1 of 16) 234938 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 432.25-4 chr18 13227161 13227621 + 1.75 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) 8631 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 129-183 chr8 127611537 127611670 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 122364 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 405.75-2 chr10 16934650 16935007 + 1.75 NA intron (NM_001081, intron 39 of 66) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -117374 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 174-46 chr18 27536149 27536268 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -193552 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 291-35 chr8 135531888 135532231 + 1.75 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 74603 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 201.5-76 chr2 198979511 198979680 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 478344 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 411.75-4 chr14 28078661 28078939 + 1.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -405579 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 529-2 chr3 132927042 132927410 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -111062 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 364.5-17 chr6 47363356 47363608 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -53577 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 259.75-55 chr8 120267050 120267307 + 1.75 NA intron (NM_021110, intron 25 of 47) intron (NM_021110, intron 25 of 47) 142076 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 112.5-212 chr6 64589636 64589711 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) -711745 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 278.5-62 chr8 142811488 142811707 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23204 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 276-28 chr2 176055659 176055877 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 28194 NM_001080458 344191 Hs.452341 NM_001080458 ENSG00000174279 EVX2 EVX-2 even-skipped homeobox 2 protein-coding 315-20 chr5 123564331 123564534 + 1.75 NA intron (NM_001044723, intron 3 of 12) intron (NM_001044723, intron 3 of 12) 19015 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 125.75-115 chr21 15848010 15848113 + 1.75 NA intron (NM_001283041, intron 19 of 25) intron (NM_001283041, intron 19 of 25) 118079 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 275.75-6 chr10 106809199 106809477 + 1.75 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) intron (NM_001206569, intron 3 of 25) 355368 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 223-7 chr10 34504608 34504764 + 1.75 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) intron (NM_001184789, intron 3 of 22) 310610 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 368.25 chr1 156927108 156927368 + 1.75 NA exon (NM_144702, exon 6 of 15) exon (NM_144702, exon 6 of 15) 6606 NM_144702 149499 Hs.491734 NM_144702 ENSG00000160838 LRRC71 C1orf92 leucine rich repeat containing 71 protein-coding 259.5-33 chr14 81969057 81969260 + 1.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -226020 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 238-20 chr17 61133011 61133194 + 1.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 234602 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 319.25-13 chr4 105706750 105707012 + 1.75 NA intron (NM_020395, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 1808 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 299.5-20 chr2 162435608 162435904 + 1.75 NA intron (NM_033272, intron 7 of 15) intron (NM_033272, intron 7 of 15) 91388 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 167-116 chr8 105435071 105435291 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 2 of 7) intron (NM_001362837, intron 2 of 7) 115638 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 268.25-43 chr6 154070838 154071106 + 1.75 NA intron (NM_001285522, intron 1 of 1) intron (NM_001285522, intron 1 of 1) -15535 NM_001145287 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 161.25-32 chr11 121621665 121621885 + 1.75 NA intron (NM_003105, intron 44 of 47) intron (NM_003105, intron 44 of 47) 169461 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 602-2 chr2 123375338 123376017 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -302196 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 306.25-8 chr10 20155281 20155576 + 1.75 NA intron (NM_032812, intron 6 of 13) intron (NM_032812, intron 6 of 13) 338996 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 182.25-122 chr8 68143791 68143997 + 1.75 NA intron (NM_024870, intron 33 of 39) L1MC1|LINE|L1 -186479 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 318.5-8 chr13 105766701 105766936 + 1.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 59988 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 142.5-46 chr11 106374789 106374878 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 123426 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 174.75-52 chr2 13165353 13165477 + 1.75 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 -158402 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 279.25-17 chr16 49997390 49997648 + 1.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -27687 NM_153261 255919 Hs.59134 NM_153261 ENSG00000205423 CNEP1R1 C16orf69|NEP1-R1|NEP1R1|TMEM188|TMP125 CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 protein-coding 216.25-100 chr9 5793658 5793982 + 1.75 NA intron (NM_024896, intron 13 of 14) L1MC2|LINE|L1 39297 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 194.25-93 chr5 119300457 119300578 + 1.75 NA intron (NM_001077654, intron 1 of 1) intron (NM_001077654, intron 1 of 1) 31758 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 230.75-15 chr12 4488867 4489048 + 1.75 NA non-coding (NR_144379, exon 13 of 13) non-coding (NR_144379, exon 13 of 13) -43343 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 199-37 chr2 101888300 101888477 + 1.75 NA intron (NM_145686, intron 29 of 30) intron (NM_145686, intron 29 of 30) -95077 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 194.5-137 chr7 2837749 2837905 + 1.75 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) L1MEf|LINE|L1 6481 NM_007353 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 258.25-26 chr2 10441602 10441819 + 1.75 NA exon (NM_001287188, exon 11 of 12) exon (NM_001287188, exon 11 of 12) 5139 NR_028374 100302743 Hs.730525 NR_028374 ENSG00000206633 SNORA80B ACA67B small nucleolar RNA, H/ACA box 80B snoRNA 281.25-31 chr3 99082639 99082852 + 1.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -181050 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 309-37 chr5 15133877 15134245 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 132499 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 436.75-6 chr3 69442549 69442896 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -56634 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 259-18 chr19 6870899 6871056 + 1.75 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -16602 NM_001256255 2015 Hs.2375 NM_001974 ENSG00000174837 ADGRE1 EMR1|TM7LN3 adhesion G protein-coupled receptor E1 protein-coding 424.75-5 chr18 74804763 74805168 + 1.75 NA TTS (NM_001146190) TTS (NM_001146190) 174002 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 203.75-50 chr18 68546285 68546476 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 168728 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 269.25-34 chr4 5214837 5215125 + 1.75 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) intron (NM_001306082, intron 4 of 12) 163501 NM_001345969 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 186.5-124 chr7 27791288 27791447 + 1.75 NA intron (NM_001362794, intron 8 of 16) intron (NM_001362794, intron 8 of 16) 51272 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 363.75-18 chr9 75097974 75098333 + 1.75 NA intron (NM_012383, intron 1 of 9) intron (NM_012383, intron 1 of 9) 9639 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 232-53 chr3 158177926 158178190 + 1.75 NA intron (NM_001271834, intron 3 of 8) L1ME3A|LINE|L1 67969 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 271.75-49 chr9 29676538 29676898 + 1.75 NA Intergenic UCON107|DNA|hAT-Tag1 -463117 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 137-41 chr12 24521560 24521711 + 1.75 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) L1MB1|LINE|L1 40856 NM_152989 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 430.75 chr1 238071181 238071477 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -180407 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 271.5-66 chr5 29361493 29361755 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 34352 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 232-49 chr22 26851724 26851943 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8378 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 235.75-73 chr7 124455569 124455767 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -103572 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 266.75-37 chr4 57615964 57616298 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 190259 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 310.75-18 chr18 77584405 77584711 + 1.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 334710 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 182.5-21 chr10 92444549 92444698 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 25962 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 454.5-4 chr8 57499248 57499665 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 155669 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 239.5-55 chr4 47235194 47235386 + 1.75 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) AluSc5|SINE|Alu 203723 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 359.25-14 chr9 138029737 138030192 + 1.75 NA intron (NM_001243812, intron 20 of 45) L1MC2|LINE|L1 15107 NR_121582 101928786 Hs.678847 NR_121582 LOC101928786 - uncharacterized LOC101928786 ncRNA 200.75-42 chr18 10947128 10947293 + 1.75 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) -187561 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 567-2 chr4 70505972 70506345 + 1.75 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? -12411 NM_001286731 401138 Hs.453069 NM_212557 ENSG00000187689 AMTN AI3B|UNQ689 amelotin protein-coding 344.25-12 chr3 48544621 48545154 + 1.75 NA intron (NM_001317135, intron 3 of 13) AluSz6|SINE|Alu 5134 NR_106881 102465494 NR_106881 ENSG00000278799 MIR6823 hsa-mir-6823 microRNA 6823 ncRNA 325.25-21 chr5 932609 932803 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39822 NM_001166260 9319 Hs.436187 NM_004237 ENSG00000071539 TRIP13 16E1BP|MVA3 thyroid hormone receptor interactor 13 protein-coding 273-14 chr11 94993602 94993936 + 1.75 NA intron (NM_018039, intron 2 of 2) intron (NM_018039, intron 2 of 2) 20060 NM_018039 55693 Hs.503598 NM_018039 ENSG00000186280 KDM4D JMJD2D lysine demethylase 4D protein-coding 241.25-12 chr11 3850008 3850542 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5389 NM_001277962 6786 Hs.501735 NM_003156 ENSG00000167323 STIM1 D11S4896E|GOK|IMD10|STRMK|TAM|TAM1 stromal interaction molecule 1 protein-coding 415.75 chr1 80444044 80444315 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -91576 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 386-6 chr16 3675919 3676160 + 1.75 NA exon (NM_016292, exon 7 of 18) exon (NM_016292, exon 7 of 18) 21335 NM_001351825 1773 Hs.629638 NM_005223 ENSG00000213918 DNASE1 DNL1|DRNI deoxyribonuclease 1 protein-coding 196.75-80 chr4 54445594 54445749 + 1.75 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 112779 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 263.75-39 chr4 18234226 18234460 + 1.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -212468 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 267.75-33 chr20 62554986 62555196 + 1.75 NA TTS (NR_029780) TTS (NR_029780) 785 NR_029780 406904 NR_029780 ENSG00000199017 MIR1-1 MIRN1-1|hsa-mir-1-1|miRNA1-1|mir-1-1 microRNA 1-1 ncRNA 383.5-9 chr4 72256424 72256716 + 1.75 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 217438 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 361.5-5 chr12 86467047 86467261 + 1.75 NA intron (NM_013244, intron 1 of 6) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -209855 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 379-9 chr7 93695227 93695617 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21506 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 334.75-24 chr6 107281260 107281712 + 1.75 NA intron (NM_020381, intron 2 of 7) L1ME4b|LINE|L1 -165971 NM_001367314 57673 Hs.418045 NM_001080450 ENSG00000178409 BEND3 KIAA1553 BEN domain containing 3 protein-coding 332.75-11 chr15 61278953 61279202 + 1.75 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -49775 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 245.75-62 chr8 113243107 113243339 + 1.75 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 133929 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 227.75-10 chr10 92532658 92532881 + 1.75 NA intron (NR_136399, intron 3 of 25) intron (NR_136399, intron 3 of 25) -35008 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 212.5-121 chr8 89154696 89154861 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 602933 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 139-143 chr7 84742684 84742819 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 210275 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 240.25-13 chr12 10322959 10323133 + 1.75 NA non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) 15176 NR_147039 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 201.75-47 chr2 105884364 105884525 + 1.75 NA intron (NM_001004720, intron 3 of 3) intron (NM_001004720, intron 3 of 3) 32597 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 200.75-47 chr2 17520015 17520226 + 1.75 NA intron (NM_001321233, intron 2 of 6) intron (NM_001321233, intron 2 of 6) -1680 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 476.5-4 chr4 159300246 159300658 + 1.75 NA intron (NM_001351727, intron 1 of 24) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 32643 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 204-34 chr2 82878431 82878784 + 1.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 21804 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 322.75-13 chr3 956610 956926 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -136256 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 407-7 chr17 29652294 29652759 + 1.75 NA intron (NM_033389, intron 11 of 14) L1MB8|LINE|L1 -31103 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 191.25-107 chr8 99811979 99812181 + 1.75 NA intron (NM_017890, intron 44 of 61) intron (NM_017890, intron 44 of 61) 81627 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 263.25-5 chr1 173250026 173250295 + 1.75 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) intron (NR_037845, intron 2 of 2) -42829 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 249.25-29 chr21 18268402 18268564 + 1.75 NA TTS (NM_002772) TTS (NM_002772) 22608 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 185.75-2 chr1 29071956 29072174 + 1.75 NA intron (NM_001166007, intron 13 of 17) intron (NM_001166007, intron 13 of 17) 50436 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 253.25-18 chr12 59285895 59286127 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -310018 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 202.25-37 chr2 37155081 37155319 + 1.75 NA intron (NM_002759, intron 1 of 16) intron (NM_002759, intron 1 of 16) 1780 NM_001135651 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 212-69 chr5 95470897 95471064 + 1.75 NA intron (NM_014639, intron 40 of 42) intron (NM_014639, intron 40 of 42) 79614 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 168.75-133 chr7 38622337 38622496 + 1.75 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8957 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 497.5-3 chr20 23400852 23401269 + 1.75 NA intron (NM_001283018, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 20428 NR_104266 63908 Hs.269471 NM_022080 ENSG00000125814 NAPB SNAP-BETA|SNAPB NSF attachment protein beta protein-coding 284.5-5 chr10 74945942 74946210 + 1.75 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) L1M5|LINE|L1 33290 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 267.25-31 chr5 21711489 21711725 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -172847 NR_132788 106635540 NR_132788 SNORA105B - small nucleolar RNA, H/ACA box 105B snoRNA 276.25-35 chr5 39090906 39091124 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -16616 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 202.25-84 chr7 7364940 7365098 + 1.75 NA intron (NM_001037763, intron 33 of 34) intron (NM_001037763, intron 33 of 34) 109865 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 337-11 chr17 61488759 61488988 + 1.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 32385 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 236.25-47 chr2 165419024 165419258 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -50557 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 404.25-11 chr8 125366410 125366731 + 1.75 NA intron (NM_001349486, intron 7 of 7) L2a|LINE|L2 -63788 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 168-47 chr14 51976161 51976301 + 1.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -13315 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 209.75-55 chr2 152779569 152779795 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 61045 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 408-13 chr5 33411476 33411778 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29069 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 370.25-2 chr14 37931007 37931553 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29156 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 222.5-103 chr7 74324360 74324546 + 1.75 NA intron (NM_032421, intron 2 of 15) intron (NM_032421, intron 2 of 15) 34978 NM_003388 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 252-54 chr5 59716804 59717013 + 1.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -13205 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 368.25-15 chr5 2799405 2799639 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 47391 NM_001294337 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 225-61 chr5 98202770 98202967 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -41629 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 233-59 chr8 69227181 69227438 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -123119 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 280.5-18 chr17 53712865 53713215 + 1.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -109887 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 369-18 chr8 140352096 140352550 + 1.75 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) intron (NM_001160372, intron 9 of 22) 105421 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 151-33 chr13 112506093 112506188 + 1.75 NA intron (NM_006322, intron 17 of 21) intron (NM_006322, intron 17 of 21) 82013 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 217.25-34 chr18 3184965 3185167 + 1.75 NA intron (NM_019856, intron 5 of 36) intron (NM_019856, intron 5 of 36) 34902 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 444.5 chr10 101574214 101574538 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 13881 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 275.5-62 chr7 72215175 72215424 + 1.75 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) intron (NM_001363460, intron 2 of 5) 122092 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 367.25-5 chr2 83689112 83689372 + 1.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 166428 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 211.75-63 chr3 178662739 178662907 + 1.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 103973 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 385.25-6 chr2 181848375 181848785 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -43150 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 403.25-7 chr4 91637436 91637858 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 639655 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 241.75-55 chr4 52891895 52892156 + 1.75 NA intron (NM_152540, intron 7 of 8) intron (NM_152540, intron 7 of 8) 29708 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 172.5-127 chr3 102668233 102668367 + 1.75 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 233285 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 216-73 chr7 35571010 35571257 + 1.75 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 124002 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 294.25-12 chr15 65608628 65608952 + 1.75 NA intron (NR_045104, intron 1 of 11) intron (NR_045104, intron 1 of 11) 2341 NR_045901 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 187-87 chr7 17157482 17157737 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -141043 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 340.5-9 chr11 124189021 124189300 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 3944 NM_001355213 26497 Hs.538726 NM_001355213 ENSG00000197309 OR10D3 HTPCRX09|OR10D3P olfactory receptor family 10 subfamily D member 3 (putative) protein-coding 346.5-21 chr3 138996045 138996374 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 10059 NM_001134659 729627 Hs.121314 NM_001134659 ENSG00000206260 PRR23A - proline rich 23A protein-coding 271-54 chr9 90862371 90862630 + 1.75 NA intron (NM_001174167, intron 4 of 13) intron (NM_001174167, intron 4 of 13) 35080 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 141.5-42 chr12 67187742 67187965 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -81505 NM_001329676 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 278.75-3 chr11 28354395 28354624 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 123039 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 196.5-174 chr9 32699385 32699538 + 1.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -63792 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 246.75-2 chr1 35355309 35355488 + 1.75 NA intron (NM_001350140, intron 3 of 27) L1ME4b|LINE|L1 10679 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 397.25-12 chr7 32362382 32362772 + 1.75 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) -63249 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 251.25-52 chr7 30206186 30206408 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 71311 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 727.25 chr17 63013602 63014231 + 1.75 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 47681 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 211.5-13 chr10 21522311 21522565 + 1.75 NA intron (NM_207371, intron 2 of 3) intron (NM_207371, intron 2 of 3) 3244 NM_207371 387640 Hs.350848 NM_207371 ENSG00000180592 SKIDA1 C10orf140|DLN-1 SKI/DACH domain containing 1 protein-coding 516.75-5 chr4 115422681 115423254 + 1.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -309347 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 246.75-73 chr8 104993914 104994077 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -324443 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 287.75-12 chr12 16523623 16523839 + 1.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 81648 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 454.75-3 chr3 178883775 178884243 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -23604 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 296.5-20 chr20 56162893 56163217 + 1.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -85677 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 204.5-43 chr15 86014244 86014414 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -65291 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 126.75-217 chr6 153294496 153294607 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -163269 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 374.5-14 chr6 41319926 41320223 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15534 NM_004828 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 421.5-8 chr2 31813074 31813371 + 1.75 NA Intergenic LTR1E|LTR|ERV1 -9242 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 285.25-34 chr7 111230094 111230259 + 1.75 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 139049 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 208.5-56 chr17 54258413 54258623 + 1.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 435591 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 221.75-52 chr4 113729181 113729386 + 1.75 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) L2c|LINE|L2 32455 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 335.5-15 chr7 97429644 97429924 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -302302 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 249.75-15 chr12 45919959 45920138 + 1.75 NA 3' UTR (NM_004719, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_004719, exon 15 of 15) 70526 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 341.75-19 chr5 132968523 132968870 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5062 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 268-25 chr18 7006420 7006670 + 1.75 NA intron (NM_005559, intron 29 of 62) intron (NM_005559, intron 29 of 62) 51868 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 248-18 chr13 49427940 49428169 + 1.75 NA intron (NM_001287337, intron 3 of 11) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -14303 NM_001287338 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 468.75-4 chr5 3197951 3198645 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 20463 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 209.5-58 chr18 51951846 51952054 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -388247 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 294.75-27 chr3 160438374 160438605 + 1.75 NA exon (NM_173084, exon 3 of 3) exon (NM_173084, exon 3 of 3) 11297 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 348-22 chr9 27735301 27735750 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -161659 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 289.5-35 chr4 35586392 35586705 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 657391 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 143.75-124 chr3 155431212 155431302 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -54546 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 289.5-24 chr2 96559388 96559622 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 21626 NM_001319092 10865 Hs.920 NM_006673 ENSG00000196843 ARID5A MRF-1|MRF1|RP11-363D14 AT-rich interaction domain 5A protein-coding 208.75-64 chr5 35121391 35121673 + 1.75 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -3410 NM_001204317 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 228-67 chr5 170342973 170343166 + 1.75 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -10418 NM_001034838 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 324.25-9 chr2 128886795 128887089 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 22342 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 228.75-28 chr17 59286248 59286503 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -45280 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 214.25-6 chr1 106044290 106044440 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16112 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 257.25-11 chr13 77823021 77823235 + 1.75 NA intron (NR_103853, intron 1 of 6) intron (NR_103853, intron 1 of 6) 4191 NR_103853 100505518 Hs.742215 NR_103853 EDNRB-AS1 - EDNRB antisense RNA 1 ncRNA 602 chr18 4842923 4843871 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -237785 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 225.25-78 chr7 77442380 77442640 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26161 NM_001350896 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 208.5-3 chr1 20516135 20516262 + 1.75 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -8047 NM_024544 79594 Hs.10101 NM_024544 ENSG00000090432 MUL1 C1orf166|GIDE|MAPL|MULAN|RNF218 mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 262.75-25 chr2 18252335 18252525 + 1.75 NA Intergenic LTR27D|LTR|ERV1 308223 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 391.25-16 chr7 122828108 122828531 + 1.75 NA intron (NM_001167940, intron 1 of 29) L1MC5|LINE|L1 58141 NM_001363393 93664 Hs.649459 NM_017954 ENSG00000081803 CADPS2 CAPS2 calcium dependent secretion activator 2 protein-coding 506.75-2 chr2 204395713 204396219 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -149509 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 375-5 chr18 4553867 4554196 + 1.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -98724 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 206.25-70 chr3 177777498 177777781 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -39226 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 311-23 chr21 19275700 19275954 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -516015 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 423.5-2 chr11 121048296 121048585 + 1.75 NA intron (NM_001363644, intron 4 of 8) intron (NM_001363644, intron 4 of 8) 24368 NM_001363644 219899 Hs.504136 NM_152715 ENSG00000154114 TBCEL El|LRRC35 tubulin folding cofactor E like protein-coding 360.5-15 chr5 27329886 27330365 + 1.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -142167 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 373.25-10 chr3 22311250 22311726 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 354349 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 129.5-198 chr6 50568783 50568865 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -144720 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 341.5-20 chr3 171442142 171442370 + 1.75 NA intron (NM_001161563, intron 1 of 31) intron (NM_001161563, intron 1 of 31) 18149 NM_001161562 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 545-2 chr5 20165655 20166105 + 1.75 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) Charlie24|DNA|hAT-Charlie -139671 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 268-63 chr9 33319084 33319409 + 1.75 NA intron (NM_002504, intron 9 of 23) intron (NM_002504, intron 9 of 23) 28730 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 317-23 chr3 177533958 177534234 + 1.75 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 92175 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 289.25-22 chr4 95841984 95842264 + 1.75 NA TTS (NM_005390) TTS (NM_005390) 2031 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 339.5-25 chr5 52511726 52512064 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -276021 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 169-112 chr9 79931688 79931931 + 1.75 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -43214 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 339.75-22 chr20 25007601 25008147 + 1.75 NA exon (NM_001252675, exon 14 of 14) exon (NM_001252675, exon 14 of 14) -15123 NM_020531 57136 Hs.472330 NM_020531 ENSG00000101474 APMAP BSCv|C20orf3 adipocyte plasma membrane associated protein protein-coding 259.5-21 chr11 81715835 81716015 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 174911 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 336.25-19 chr9 30195634 30196055 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 212610 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 410 chr10 56996268 56996707 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 308072 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 238.25-36 chr2 98237158 98237349 + 1.75 NA TTS (NR_144298) TTS (NR_144298) 87720 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 370.5-3 chr1 192817107 192817444 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 8236 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 343-7 chr14 59116356 59116831 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -72074 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 169.75-9 chr1 233269026 233269175 + 1.75 NA intron (NM_014801, intron 1 of 33) LTR79|LTR|ERVL 26625 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 198.25-53 chr2 24507235 24507388 + 1.75 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) MIR|SINE|MIR 15434 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 289.25-26 chr7 110188058 110188466 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -228049 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 339.25-10 chr2 121176052 121176478 + 1.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 108937 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 155-111 chr5 105328821 105328918 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 229395 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 246.25-7 chr10 74965262 74965480 + 1.75 NA intron (NM_001370135, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 52585 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 264.5-62 chr8 89085610 89085867 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 671973 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 376.75 chr1 79078161 79078399 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71550 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 242.25-50 chr2 132922273 132922488 + 1.75 NA intron (NR_135572, intron 1 of 1) intron (NR_135572, intron 1 of 1) 6823 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 207.5-121 chr8 121821700 121821831 + 1.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -180325 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 197-57 chr6 53062583 53062864 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_016513) promoter-TSS (NM_016513) -899 NM_014920 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 171-60 chr19 37634422 37634553 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001320671, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001320671, exon 6 of 6) 20978 NM_001320670 22835 Hs.668737 NM_014898 ENSG00000120784 ZFP30 ZNF745 ZFP30 zinc finger protein protein-coding 202.5-39 chr14 44181823 44181996 + 1.75 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 325374 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 358-8 chr22 26472683 26473192 + 1.75 NA exon (NM_001349898, exon 6 of 15) exon (NM_001349898, exon 6 of 15) 6551 NR_073136 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 128.75-56 chr14 36791011 36791093 + 1.75 NA intron (NM_001171170, intron 3 of 10) intron (NM_001171170, intron 3 of 10) 133484 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 216.5-75 chr3 62323297 62323465 + 1.75 NA intron (NM_001291941, intron 4 of 5) intron (NM_001291941, intron 4 of 5) 4359 NM_001291941 57415 Hs.47166 NM_020685 ENSG00000114405 C3orf14 HT021 chromosome 3 open reading frame 14 protein-coding 249.75-19 chr14 68053028 68053382 + 1.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 229613 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 405.5-13 chr8 46615270 46615545 + 1.75 NA intron (NR_146077, intron 1 of 8) intron (NR_146077, intron 1 of 8) 2236 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 438.5-2 chr12 119836607 119837005 + 1.75 NA intron (NM_007174, intron 5 of 46) intron (NM_007174, intron 5 of 46) 40514 NM_007174 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 299-22 chr22 26053131 26053458 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -116168 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 231.25-69 chr6 63481754 63481998 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -90136 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 372.5-4 chr11 15156843 15157299 + 1.75 NA intron (NM_001042536, intron 2 of 12) intron (NM_001042536, intron 2 of 12) 7969 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 130-108 chr3 158650180 158650271 + 1.75 NA intron (NM_001308164, intron 6 of 18) L2a|LINE|L2 5697 NM_001308166 85476 Hs.518355 NM_024996 ENSG00000168827 GFM1 COXPD1|EFG|EFG1|EFGM|EGF1|GFM|hEFG1|mtEF-G1 G elongation factor mitochondrial 1 protein-coding 233-46 chr3 184638369 184638523 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 73618 NM_022149 64110 Hs.306123 NM_022149 ENSG00000177383 MAGEF1 MAGE-F1 MAGE family member F1 protein-coding 221.75-69 chr6 119780292 119780489 + 1.75 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 230582 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 202.25-16 chr11 42164552 42164773 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -79204 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 343.5 chr1 66277035 66277547 + 1.75 NA intron (NM_001037340, intron 5 of 14) L2b|LINE|L2 -54817 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 534-3 chr17 12041163 12041574 + 1.75 NA intron (NM_001281435, intron 2 of 11) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 20491 NM_003010 6416 Hs.514681 NM_003010 ENSG00000065559 MAP2K4 JNKK|JNKK1|MAPKK4|MEK4|MKK4|PRKMK4|SAPKK-1|SAPKK1|SEK1|SERK1|SKK1 mitogen-activated protein kinase kinase 4 protein-coding 327.25-17 chr5 23481886 23482185 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25574 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 196-64 chr3 74848291 74848552 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -327281 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 338.75-12 chr2 176417184 176417483 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 147891 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 539-3 chr8 121294201 121294870 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -344811 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 304.5-8 chr11 127428617 127428893 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 157685 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 390.25-2 chr15 69066368 69066725 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14304 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 219-6 chr1 185743627 185743877 + 1.75 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 9361 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 364.75-3 chr15 62348208 62348543 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 5346 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 518.75-3 chr9 73549649 73550034 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 397976 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 344-5 chr14 29452640 29452975 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 474289 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 228.75-50 chr21 30571216 30571568 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10079 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 328-8 chr14 59172883 59173168 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15642 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 300.75-2 chr1 107851952 107852322 + 1.75 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) intron (NM_006113, intron 2 of 26) -45086 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 363-23 chr7 30865251 30865588 + 1.75 NA intron (NR_037598, intron 15 of 19) intron (NR_037598, intron 15 of 19) -46275 NM_198098 358 Hs.76152 NM_000385 ENSG00000240583 AQP1 AQP-CHIP|CHIP28|CO aquaporin 1 (Colton blood group) protein-coding 231.75-64 chr5 110973894 110974064 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -96101 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 295.5-31 chr2 181544523 181544825 + 1.75 NA intron (NR_027690, intron 10 of 11) intron (NR_027690, intron 10 of 11) 87288 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 383-6 chr15 64767638 64768029 + 1.75 NA intron (NR_138350, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -5318 NR_031674 100302184 NR_031674 ENSG00000221033 MIR1272 MIRN1272|hsa-mir-1272|mir-1272 microRNA 1272 ncRNA 245.5-57 chr5 84503187 84503448 + 1.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -118437 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 162.25-132 chr5 107645883 107646004 + 1.75 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 24994 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 261.75-40 chr5 131108063 131108231 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 57109 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 401.5-17 chr6 131347713 131348080 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 97492 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 407-8 chr18 2961956 2962571 + 1.75 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -15640 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 457-6 chrX 69964246 69964731 + 1.75 NA intron (NM_001005609, intron 2 of 7) intron (NM_001005609, intron 2 of 7) -58369 NR_037494 100500887 NR_037494 ENSG00000211991 MIR676 hsa-mir-676|mir-676 microRNA 676 ncRNA 229.75-75 chr8 76841438 76841634 + 1.75 NA intron (NM_024721, intron 5 of 10) intron (NM_024721, intron 5 of 10) 125314 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 306.25-33 chr5 23247954 23248162 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -259551 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 277.75-3 chr10 95541086 95541476 + 1.75 NA intron (NM_001290295, intron 1 of 24) intron (NM_001290295, intron 1 of 24) 20090 NM_024991 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 153.5-72 chr16 26479130 26479295 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 453975 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 383.5-10 chr5 51184796 51185132 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 198368 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 245.25-55 chr5 61836316 61836466 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -100693 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 351.5-11 chr15 65153686 65154048 + 1.75 NA intron (NM_006660, intron 11 of 13) L2c|LINE|L2 -20059 NM_005707 10081 Hs.458596 NM_005707 ENSG00000090470 PDCD7 ES18|HES18 programmed cell death 7 protein-coding 238.25-16 chr13 49280515 49280828 + 1.75 NA exon (NM_001193478, exon 8 of 10) exon (NM_001193478, exon 8 of 10) 32746 NM_030911 81602 Hs.388220 NM_030911 ENSG00000102543 CDADC1 NYD-SP15|bA103J18.1 cytidine and dCMP deaminase domain containing 1 protein-coding 340.75-22 chr7 40065740 40066058 + 1.75 NA intron (NM_003718, intron 9 of 13) intron (NM_003718, intron 9 of 13) 68723 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 390.5-12 chr5 53738015 53738401 + 1.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 81474 NR_147167 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 353.5-21 chr8 110277869 110278121 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -302224 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 306.25-25 chr21 24478722 24479068 + 1.75 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) intron (NR_135520, intron 4 of 5) 50155 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 148-120 chr7 29753775 29753944 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52695 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 435.5-9 chr4 181491586 181491869 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -226698 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 276.25-48 chrX 45061144 45061338 + 1.75 NA intron (NR_111960, intron 13 of 27) intron (NR_111960, intron 13 of 27) 139635 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 160.25-103 chr3 138948115 138948288 + 1.75 NA intron (NM_001040061, intron 1 of 2) intron (NM_001040061, intron 1 of 2) 984 NM_001040061 401089 Hs.591303 NM_001040061 ENSG00000206262 FOXL2NB C3orf72 FOXL2 neighbor protein-coding 353.25-11 chr2 114503253 114503500 + 1.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 41799 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 200.25-119 chr9 77417052 77417279 + 1.75 NA 3' UTR (NM_033305, exon 72 of 72) 3' UTR (NM_033305, exon 72 of 72) -30484 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 307.25-8 chr12 111206473 111206664 + 1.75 NA intron (NM_001370598, intron 1 of 21) L2c|LINE|L2 -97574 NR_106818 102465455 NR_106818 ENSG00000273700 MIR6760 hsa-mir-6760 microRNA 6760 ncRNA 333.25-5 chr17 63269036 63269274 + 1.75 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) intron (NM_025185, intron 8 of 25) 171112 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 200.5-119 chr5 132384121 132384341 + 1.75 NA exon (NM_001308122, exon 4 of 11) exon (NM_001308122, exon 4 of 11) -14315 NR_110997 553103 Hs.570908 NR_110997 ENSG00000233006 MIR3936HG SLC22A5-AS1 MIR3936 host gene ncRNA 251.75-3 chr1 112859736 112860004 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9227 NR_103746 100996702 Hs.632431 NR_103746 ENSG00000215866 LINC01356 - long intergenic non-protein coding RNA 1356 ncRNA 217-39 chr2 169380229 169380519 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -17840 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 317.75-28 chr8 112137158 112137416 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -506206 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 251.25-36 chr3 150865751 150865972 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39578 NM_001351281 646951 Hs.380222 NM_001351281 MINDY4B C3orf76|FAM188B2 MINDY family member 4B protein-coding 190.5-8 chr1 161496854 161496995 + 1.75 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -8533 NM_021642 2212 Hs.352642 NM_021642 ENSG00000143226 FCGR2A CD32|CD32A|CDw32|FCG2|FCGR2|FCGR2A1|FcGR|IGFR2 Fc fragment of IgG receptor IIa protein-coding 326-21 chr4 63403971 63404244 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1005343 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 258.5-32 chr18 10443153 10443402 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11358 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 413.75-5 chr7 100959384 100959693 + 1.75 NA exon (NM_005960, exon 2 of 12) exon (NM_005960, exon 2 of 12) 10004 NM_005960 4584 Hs.703577 NM_005960 ENSG00000169894 MUC3A MUC-3A|MUC3 mucin 3A, cell surface associated protein-coding 287-7 chr10 110683244 110683492 + 1.75 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 39032 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 392.5-7 chr2 238009260 238009583 + 1.75 NA intron (NR_037904, intron 4 of 18) L1ME1|LINE|L1 40628 NM_001278305 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 257.25-16 chr15 77387334 77387526 + 1.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 32674 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 270.75-17 chr14 99435931 99436150 + 1.75 NA intron (NM_199123, intron 6 of 8) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 44819 NM_199123 84193 Hs.510407 NM_032233 ENSG00000183576 SETD3 C14orf154|hSETD3 SET domain containing 3, actin histidine methyltransferase protein-coding 366.5-13 chr4 91668003 91668320 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 609141 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 227.75-34 chr2 72430047 72430300 + 1.75 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -282311 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 282.5-40 chr3 13666883 13667224 + 1.75 NA intron (NR_027103, intron 1 of 5) L1ME4a|LINE|L1 16332 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 293.5-20 chr18 1762204 1762565 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -402755 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 314 chr1 43173471 43173722 + 1.75 NA intron (NM_001195831, intron 2 of 23) L1ME3D|LINE|L1 -1026 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 368.25-10 chr2 7402901 7403128 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18247 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 286.25-19 chr21 16556518 16556790 + 1.75 NA intron (NR_136547, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 16826 NR_029480 406885 NR_029480 ENSG00000199030 MIRLET7C LET7C|MIRNLET7C|hsa-let-7c|let-7c microRNA let-7c ncRNA 276-51 chr8 121217560 121217815 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -405641 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 173-139 chr8 78482401 78482611 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33834 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 450-10 chr5 112626139 112626581 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2076 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 329.5-16 chr3 193742991 193743184 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 100922 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 307.5-22 chr18 68561934 68562279 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 153002 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 303-2 chr10 51296757 51297000 + 1.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -2695 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 298.25-11 chr17 59686060 59686470 + 1.75 NA intron (NM_001288653, intron 30 of 31) intron (NM_001288653, intron 30 of 31) 21333 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 397.75-4 chr3 125305139 125305446 + 1.75 NA intron (NM_001348436, intron 5 of 8) L1MC4|LINE|L1 51988 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 276-19 chr13 56769841 56770245 + 1.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -370875 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 243-63 chr6 104722849 104723074 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 136585 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 170.75-71 chr2 133556725 133556857 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 11672 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 330.5-17 chr2 16399068 16399460 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 266570 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 219.75-40 chr2 101463181 101463378 + 1.75 NA intron (NM_001367509, intron 2 of 13) intron (NM_001367509, intron 2 of 13) 11833 NM_001367510 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 334.25-4 chr10 83689743 83690112 + 1.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -12838 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 121-189 chr8 96294445 96294559 + 1.75 NA intron (NM_014754, intron 4 of 12) intron (NM_014754, intron 4 of 12) 32600 NM_014754 9791 Hs.292579 NM_014754 ENSG00000156471 PTDSS1 LMHD|PSS1|PSSA phosphatidylserine synthase 1 protein-coding 270.75-30 chr20 8972441 8972782 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -96443 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 345-10 chr17 71033843 71034174 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 168171 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 180-89 chr4 32162260 32162388 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -139902 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 368.75-3 chr10 109065469 109065883 + 1.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 857570 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 254-2 chr1 26050091 26050481 + 1.75 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -4168 NM_001004434 7780 Hs.143545 NM_032513 ENSG00000158014 SLC30A2 PP12488|TNZD|ZNT2|ZnT-2 solute carrier family 30 member 2 protein-coding 279.25-30 chr4 52977092 52977396 + 1.75 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger 114927 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 426-4 chr11 98111059 98111506 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -909667 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 231-18 chr12 41353148 41353373 + 1.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) (CACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -84479 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 186-82 chr6 154461400 154461532 + 1.75 NA intron (NM_001368117, intron 1 of 12) intron (NM_001368117, intron 1 of 12) 17025 NM_001368118 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 348.5-9 chr3 1291676 1292069 + 1.75 NA intron (NM_001349357, intron 5 of 20) intron (NM_001349357, intron 5 of 20) 198848 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 319-31 chr5 54929712 54929968 + 1.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 55753 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 196-22 chr13 34545717 34545885 + 1.75 NA intron (NR_047036, intron 1 of 2) intron (NR_047036, intron 1 of 2) 94884 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 379.25-4 chr16 9937927 9938531 + 1.75 NA exon (NM_000833, exon 4 of 14) exon (NM_000833, exon 4 of 14) 243838 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 395.5-11 chr17 59675683 59676165 + 1.75 NA intron (NM_001288653, intron 16 of 31) intron (NM_001288653, intron 16 of 31) 31674 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 409.5-2 chr1 92865463 92865887 + 1.75 NA intron (NM_001252269, intron 1 of 3) intron (NM_001252269, intron 1 of 3) 11475 NM_001252271 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 327-12 chr15 90740170 90740515 + 1.75 NA intron (NM_001287246, intron 2 of 22) L1MB7|LINE|L1 22996 NM_000057 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 184-50 chr22 24348829 24348998 + 1.75 NA intron (NM_015330, intron 11 of 16) L2a|LINE|L2 6805 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 142.75-25 chr10 77628045 77628182 + 1.75 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 9695 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 221.25-18 chr12 25819416 25819566 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 54588 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 407.25-3 chr14 47836213 47836515 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -41350 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 268.25-38 chr5 11496954 11497207 + 1.75 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 91837 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 188-93 chrX 62846431 62846582 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 504826 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 359-8 chr2 43790597 43790836 + 1.75 NA intron (NM_016008, intron 5 of 12) intron (NM_016008, intron 5 of 12) 16677 NM_016008 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 141.75-27 chr11 14656329 14656461 + 1.75 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) (TTTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12591 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 171-3 chr1 39332084 39332215 + 1.75 NA intron (NM_012090, intron 35 of 92) intron (NM_012090, intron 35 of 92) -76924 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 222.5-42 chr18 7957368 7957661 + 1.75 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 390198 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 175.25-45 chr14 58805877 58805991 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -22354 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 218.25-25 chr13 113669431 113669565 + 1.75 NA intron (NM_002929, intron 1 of 6) intron (NM_002929, intron 1 of 6) 2279 NM_002929 6011 Hs.103501 NM_002929 ENSG00000185974 GRK1 GPRK1|RHOK|RK G protein-coupled receptor kinase 1 protein-coding 262.25-51 chr9 26383721 26383997 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 317184 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 201-81 chr8 127622131 127622342 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 111731 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 288.75-27 chr2 13046520 13046698 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -39596 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 281.25-21 chr2 21623250 21623506 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 87274 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 547.5-4 chr14 59219319 59219830 + 1.75 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) 30907 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 338.25-21 chr3 178236433 178236798 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -182586 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 368.5-13 chr5 117786516 117786849 + 1.75 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 56321 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 188-12 chr11 62657905 62658129 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -4715 NM_030628 80789 Hs.458390 NM_030628 ENSG00000185085 INTS5 INT5|KIAA1698 integrator complex subunit 5 protein-coding 487-4 chr21 20884809 20885164 + 1.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -81878 NR_109787 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 257-7 chr10 12727861 12728069 + 1.75 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) AluSz|SINE|Alu -2612 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 238.5-85 chr7 9475029 9475257 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -159127 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 354.25-4 chr15 95794788 95795018 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 332938 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 166.5-111 chr2 193489691 193489850 + 1.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 739925 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 408.25-4 chr20 49050980 49051308 + 1.75 NA intron (NM_001362762, intron 1 of 24) L2a|LINE|L2 4832 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 439.5-9 chr2 54047795 54048285 + 1.75 NA intron (NM_001320587, intron 2 of 5) intron (NM_001320587, intron 2 of 5) -67575 NM_001320589 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 301.75-28 chr4 161583764 161583980 + 1.75 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) L2|LINE|L2 -438861 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 296.5-42 chr8 81875740 81876176 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33672 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 253.75-43 chr4 93844094 93844324 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 15456 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 267-44 chr6 135891193 135891365 + 1.75 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) intron (NM_018945, intron 1 of 12) 39578 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 523.5-3 chr22 27077257 27077949 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -17085 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 262.75-44 chr5 60168061 60168511 + 1.75 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) 204377 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 446.25-3 chr3 161160255 161160661 + 1.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -55086 NM_001349146 8706 Hs.418062 NM_003781 ENSG00000169255 B3GALNT1 B3GALT3|GLCT3|GLOB|Gb4Cer|P|P1|beta3Gal-T3|galT3 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (globoside blood group) protein-coding 290.5-5 chr10 22456101 22456389 + 1.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -18316 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 290-40 chr5 121183056 121183249 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -139398 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 342.5-31 chr8 133791038 133791296 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13815 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 409.5-16 chr7 115638504 115638785 + 1.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -57203 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 228.25-37 chr18 7262476 7262632 + 1.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 31450 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 356.5-15 chr4 33349671 33350069 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 690023 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 184-41 chr2 56591133 56591273 + 1.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -405433 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 240.5-69 chr3 132187070 132187230 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -130257 NM_001134194 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 324.5-38 chr8 123554725 123554955 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -13634 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 278.25-2 chr1 79117778 79118055 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -111186 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 231.75-50 chr3 118487228 118487447 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -154431 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 294.5-51 chr8 95055501 95055774 + 1.75 NA intron (NR_148915, intron 9 of 9) intron (NR_148915, intron 9 of 9) -17277 NR_036105 100422964 NR_036105 ENSG00000283522 MIR3150A MIR3150|mir-3150a microRNA 3150a ncRNA 337-19 chr2 198349856 198350197 + 1.75 NA intron (NR_110267, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 25071 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 250.75-61 chr7 7444704 7444978 + 1.75 NA intron (NM_001037763, intron 18 of 34) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 91032 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 219-10 chr10 33597631 33597770 + 1.75 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 174980 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 256.75-46 chr9 24682749 24682933 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -136944 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 270-17 chr14 43794419 43794729 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 712709 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 128.25-41 chr12 83134281 83134358 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001320321, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001320321, exon 11 of 11) 447164 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 463-5 chr8 79344922 79345305 + 1.75 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 12925 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 431.5-6 chr4 33408253 33408674 + 1.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 631430 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 437.5 chr1 112367591 112367992 + 1.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -28423 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 194.75-60 chr2 174939648 174939841 + 1.75 NA intron (NM_001025201, intron 4 of 12) intron (NM_001025201, intron 4 of 12) 65509 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 269-36 chr4 74241037 74241212 + 1.75 NA intron (NM_001144978, intron 6 of 7) intron (NM_001144978, intron 6 of 7) -67346 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 405.75-9 chr7 8955735 8956025 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 522271 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 324-33 chr9 73007402 73007619 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -54457 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 266.75-7 chr14 26592837 26593029 + 1.75 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) 3164 NM_001366397 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 439.25-7 chr16 72201073 72201541 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28857 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 315.25-24 chr4 85005216 85005511 + 1.75 NA intron (NR_152780, intron 4 of 4) L1MC5a|LINE|L1 37879 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 523.25-2 chr9 91430391 91430928 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6033 NM_001289999 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 348.75-7 chr16 64692513 64692757 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 429428 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 458.25 chr10 67649370 67649816 + 1.75 NA intron (NM_001291133, intron 1 of 8) intron (NM_001291133, intron 1 of 8) 16067 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 156-146 chr8 30358905 30359053 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25522 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 256.25-53 chr9 28599147 28599343 + 1.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 120060 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 139-23 chr11 4681297 4681442 + 1.75 NA 3' UTR (NM_030774, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_030774, exon 2 of 2) 16484 NM_030774 81285 Hs.501758 NM_030774 ENSG00000167332 OR51E2 HPRAJ|OR51E3P|OR52A2|PSGR olfactory receptor family 51 subfamily E member 2 protein-coding 335.75-12 chr3 107569009 107569253 + 1.75 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 46169 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 319.75-21 chrX 70670282 70670645 + 1.75 NA exon (NM_031276, exon 16 of 30) exon (NM_031276, exon 16 of 30) 175832 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 242.75-4 chr1 153632222 153632600 + 1.75 NA TTS (NM_006271) TTS (NM_006271) -1571 NM_001244664 26097 Hs.611057 NM_015607 ENSG00000160679 CHTOP C10orf77|C1orf77|FL-SRAG|FOP|SRAG|SRAG-3|SRAG-5|pp7704 chromatin target of PRMT1 protein-coding 379 chr10 72311026 72311480 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37329 NM_019058 54541 Hs.744875 NM_019058 ENSG00000168209 DDIT4 Dig2|REDD-1|REDD1 DNA damage inducible transcript 4 protein-coding 262-12 chr12 1980281 1980473 + 1.75 NA intron (NM_152640, intron 3 of 8) L1M4|LINE|L1 24080 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 362.25-18 chr9 136261880 136262168 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16183 NM_181701 169714 Hs.144073 NM_181701 ENSG00000165661 QSOX2 QSCN6L1|SOXN quiescin sulfhydryl oxidase 2 protein-coding 239.75-68 chr6 140035224 140035550 + 1.75 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) intron (NR_121623, intron 1 of 1) -44126 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 207-4 chr1 163219344 163219573 + 1.75 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -16542 NM_001254749 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 244-47 chr5 125526316 125526574 + 1.75 NA intron (NR_109887, intron 3 of 3) L1M7|LINE|L1 33184 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 403.25-6 chr20 46490650 46490960 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 22767 NM_001353813 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 342.75-10 chr14 42561576 42561919 + 1.75 NA Intergenic MER5C1|DNA|hAT-Charlie 954891 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 137-10 chr1 169980059 169980247 + 1.75 NA intron (NM_014970, intron 15 of 19) L1ME3A|LINE|L1 -86194 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 230.25-72 chr7 36731401 36731567 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -6935 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 123.25-114 chr2 210715088 210715206 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 97576 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 248-50 chr3 153609286 153609476 + 1.75 NA intron (NR_146713, intron 3 of 6) L1ME3C|LINE|L1 124886 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 186.25-19 chr11 107107066 107107307 + 1.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -88710 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 385.5-20 chr6 133468201 133468676 + 1.75 NA intron (NM_172103, intron 9 of 18) intron (NM_172103, intron 9 of 18) 226939 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 205.5-60 chr18 12015330 12015511 + 1.75 NA intron (NM_014214, intron 5 of 7) intron (NM_014214, intron 5 of 7) 33913 NM_014214 3613 Hs.743311 NM_014214 ENSG00000141401 IMPA2 - inositol monophosphatase 2 protein-coding 440-4 chr2 55007104 55007579 + 1.75 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) 2931 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 181.75-64 chr2 123600647 123600837 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 424432 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 153.5-156 chr5 45073074 45073233 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 264206 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 168-65 chr2 40382659 40382834 + 1.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 47558 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 233.5-93 chr5 181068845 181068995 + 1.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -25436 NR_107056 102465882 NR_107056 ENSG00000277912 MIR8089 hsa-mir-8089 microRNA 8089 ncRNA 445.25-4 chr2 159336375 159336741 + 1.75 NA intron (NM_001329858, intron 33 of 36) intron (NM_001329858, intron 33 of 36) -49855 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 308.75-38 chr8 88972744 88972956 + 1.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -645367 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 387.75-16 chr7 86184966 86185429 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -458712 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 336.25-15 chr5 94659435 94659740 + 1.75 NA intron (NM_032290, intron 9 of 20) L1M2b|LINE|L1 40918 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 179-80 chr6 50238998 50239149 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -189144 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 280.25-45 chr5 170953354 170953584 + 1.75 NA intron (NM_022897, intron 12 of 27) intron (NM_022897, intron 12 of 27) 91451 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 307-23 chr3 89039804 89040082 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -67678 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 204.25-117 chr9 79539541 79539891 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -32057 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 224-16 chr14 49451420 49451703 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 134819 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 232-16 chr14 70882262 70882461 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -25098 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 240.5-44 chr18 898200 898501 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6521 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 339.75-21 chr2 240067854 240068180 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -21945 NM_173351 150681 Hs.626616 NM_173351 ENSG00000178586 OR6B3 OR6B3P|OR6B3Q olfactory receptor family 6 subfamily B member 3 protein-coding 239.25-78 chr6 52687290 52687494 + 1.75 NA TTS (NM_014051) TTS (NM_014051) 16279 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 438.25 chr1 208374533 208374824 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -130294 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 362-9 chr20 17284922 17285243 + 1.75 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) LTR26C|LTR|ERV1 58042 NM_002594 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 246-31 chr2 55023091 55023342 + 1.75 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 -12944 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 481-5 chr14 47892647 47893106 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -97862 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 222.25-10 chr10 111656519 111656690 + 1.75 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 527161 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 294-16 chr2 40192037 40192216 + 1.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 238178 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 162-27 chr11 109039662 109039833 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 374678 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 226.75-24 chr17 65920781 65921017 + 1.75 NA intron (NM_001353129, intron 19 of 26) L3|LINE|CR1 -94356 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 249-34 chr4 38314627 38314876 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52163 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 223.75-14 chr12 23630291 23630547 + 1.75 NA intron (NM_152989, intron 11 of 17) intron (NM_152989, intron 11 of 17) -45833 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 227.75-89 chrX 22788228 22788392 + 1.75 NA intron (NR_073010, intron 3 of 11) intron (NR_073010, intron 3 of 11) -211650 NM_182699 168400 Hs.434416 NM_182699 ENSG00000184735 DDX53 CAGE|CT26 DEAD-box helicase 53 protein-coding 325.25-9 chr2 21429929 21430260 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 280558 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 165.75-136 chr5 75778871 75779022 + 1.75 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -61509 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 163-103 chr5 148300574 148300743 + 1.75 NA intron (NR_105057, intron 3 of 4) intron (NR_105057, intron 3 of 4) -11765 NM_032566 84651 Hs.244569 NM_032566 ENSG00000145879 SPINK7 ECG2|ECRG2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) protein-coding 226.5-25 chr15 27668575 27668858 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 430599 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 224-15 chr14 20073196 20073405 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 13255 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 343.5-3 chr1 114166738 114167145 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13072 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 332.5-20 chr5 7112842 7113177 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 156345 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 235.75-36 chr2 125534128 125534536 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 583653 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 405.25-7 chr3 11193432 11193769 + 1.75 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -32381 NM_001098211 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 321.75-22 chr22 28618758 28619147 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 60913 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 328.25-15 chr8 81381996 81382208 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 65337 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 320.75-7 chr14 38823290 38823538 + 1.75 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -59182 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 237.5-56 chr2 186687250 186687523 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6674 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 448.75-4 chr8 86094865 86095367 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3794 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 389-21 chr9 30504294 30504579 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -95982 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 233.5-96 chr6 38602124 38602305 + 1.75 NA intron (NM_001099272, intron 1 of 10) intron (NM_001099272, intron 1 of 10) -6147 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 320-39 chrX 64098174 64098531 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 107356 NM_152424 139285 Hs.314225 NM_152424 ENSG00000184675 AMER1 FAM123B|OSCS|WTX APC membrane recruitment protein 1 protein-coding 427.25 chr14 62360614 62360895 + 1.75 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -220781 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 317.5-31 chr7 53573328 53573619 + 1.75 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 238458 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 369.75-5 chr12 29114304 29114695 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34779 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 296.25-14 chr16 48901201 48901520 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -291180 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 211.75-23 chr13 68585026 68585178 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 300223 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 344-7 chr14 73384495 73384797 + 1.75 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu 73934 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 284.5-68 chr8 134266634 134266984 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -331262 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 156.25-113 chr4 126011984 126012155 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 504810 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 175.25-54 chr15 100376473 100376739 + 1.75 NA intron (NR_120374, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 3667 NR_120374 102723320 Hs.416099 NR_120374 CERS3-AS1 - CERS3 antisense RNA 1 ncRNA 401.5-2 chr10 58226228 58226602 + 1.75 NA intron (NM_152230, intron 3 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 41479 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 400.5-9 chr3 34939204 34939684 + 1.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1ME3A|LINE|L1 454579 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 337.25-15 chr5 148306761 148306978 + 1.75 NA intron (NR_105057, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR -5554 NM_032566 84651 Hs.244569 NM_032566 ENSG00000145879 SPINK7 ECG2|ECRG2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) protein-coding 210.5-38 chr14 71735051 71735260 + 1.75 NA intron (NM_001354286, intron 22 of 24) intron (NM_001354286, intron 22 of 24) 148857 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 376.5-13 chr3 35638870 35639251 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001267616) promoter-TSS (NM_001267616) -465 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 308.25 chr1 64394236 64394451 + 1.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -75786 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 244.5-15 chr10 66702291 66702440 + 1.75 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -223671 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 401.75-10 chr5 116071362 116071855 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -13417 NM_016144 51397 Hs.483136 NM_016144 ENSG00000145781 COMMD10 PTD002 COMM domain containing 10 protein-coding 352.25-7 chr2 11890290 11890577 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -53447 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 296.75-13 chr15 68514977 68515165 + 1.75 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -3302 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 332.25-12 chr14 89073954 89074330 + 1.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 249491 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 292.5-9 chr10 87796813 87797145 + 1.75 NA intron (NM_001321967, intron 2 of 9) MER4-int|LTR|ERV1 21252 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 185.5-58 chr15 66495349 66495611 + 1.75 NA intron (NR_138061, intron 1 of 3) intron (NR_138061, intron 1 of 3) 1554 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 175.5-166 chr8 103837152 103837330 + 1.75 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 18021 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 330.5-18 chr2 178890960 178891531 + 1.75 NA intron (NM_001316745, intron 8 of 11) MIR|SINE|MIR -83822 NM_003319 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 151.5-79 chr2 44570511 44570627 + 1.75 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 208622 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 454.25-5 chr5 65418770 65419263 + 1.75 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) L1PA16|LINE|L1 62904 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 340-19 chr8 119244366 119244640 + 1.75 NA 3' UTR (NM_052886, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_052886, exon 4 of 4) 2354 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 341.75-2 chr1 104682600 104682903 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 609728 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 326.5-26 chr7 54240702 54240980 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -89856 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 336-9 chr16 69699092 69699334 + 1.75 NA 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 9462 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 382.25-9 chr16 53709899 53710243 + 1.75 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) L1MC4|LINE|L1 5915 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 142.75-31 chr11 20971355 20971477 + 1.75 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 301830 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 177-56 chr22 19950011 19950138 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001135161) promoter-TSS (NM_001135161) -828 NM_001135161 1312 Hs.370408 NM_000754 ENSG00000093010 COMT HEL-S-98n catechol-O-methyltransferase protein-coding 250.75-15 chr14 99212886 99213252 + 1.75 NA intron (NM_022898, intron 2 of 2) intron (NM_022898, intron 2 of 2) 59128 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 228-43 chr20 12983354 12983536 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -25527 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 308.75-15 chr14 55632377 55632695 + 1.75 NA intron (NR_073129, intron 8 of 45) L1MB3|LINE|L1 52329 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 215.75-27 chr12 38754832 38755144 + 1.75 NA intron (NM_153634, intron 10 of 19) intron (NM_153634, intron 10 of 19) 150603 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 329.5-3 chr13 49918547 49918786 + 1.75 NA intron (NM_020456, intron 4 of 4) AluSz|SINE|Alu 17674 NM_020456 57213 Hs.44235 NM_020456 ENSG00000123178 SPRYD7 C13orf1|CLLD6 SPRY domain containing 7 protein-coding 347-22 chr6 124182301 124182636 + 1.75 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -100537 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 437-10 chr4 42456451 42456902 + 1.75 NA intron (NM_001105529, intron 26 of 35) intron (NM_001105529, intron 26 of 35) 59188 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 175-49 chr16 73581190 73581362 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 194471 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 378.5-17 chr7 68811772 68812169 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 785654 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 304.5-3 chr1 174239063 174239356 + 1.75 NA intron (NM_001366445, intron 4 of 13) L1PA2|LINE|L1 -35891 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 249.75-12 chr11 80274734 80274981 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 487946 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 256-35 chr2 205386482 205386691 + 1.75 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -295914 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 231-56 chr4 30427139 30427315 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -293142 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 200-10 chr10 25536359 25536619 + 1.75 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) intron (NM_020752, intron 5 of 10) -115223 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 264.25-57 chr9 30430456 30430656 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -22102 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 328.5-11 chr14 52545058 52545471 + 1.75 NA intron (NM_001160047, intron 1 of 20) intron (NM_001160047, intron 1 of 20) 7241 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 342.5-11 chr12 91731124 91731343 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 410480 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 284.25-27 chr4 180703294 180703512 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 455746 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 262.75-47 chr6 78141844 78142110 + 1.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 397332 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 220-53 chr6 120200449 120200608 + 1.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 185349 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 248.75-18 chr12 112715794 112715949 + 1.75 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) MER41B|LTR|ERV1 -20695 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 315.5-26 chr7 101698704 101699029 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -69570 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 205-46 chr21 16296694 16296955 + 1.75 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -12056 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 272.75-2 chr1 36988308 36988780 + 1.75 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) intron (NM_000831, intron 1 of 15) 45971 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 274.25-35 chr4 106768122 106768308 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 268098 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 306.5-21 chr17 59330363 59330676 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1136 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 399.25-5 chr17 61175123 61175640 + 1.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluJr|SINE|Alu 192323 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 280.5-57 chr8 141256313 141256728 + 1.75 NA non-coding (NR_161376, exon 2 of 2) non-coding (NR_161376, exon 2 of 2) -1891 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 339.5-26 chr5 65469140 65469440 + 1.75 NA intron (NR_135689, intron 3 of 25) intron (NR_135689, intron 3 of 25) 12630 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 355-18 chr7 121833396 121833703 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -39612 NM_001206839 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 182-33 chr14 64479233 64479405 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001354684, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001354684, exon 4 of 4) 13820 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 312.5-37 chr8 124349913 124350227 + 1.75 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) intron (NM_194291, intron 1 of 6) 22629 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 194.25-78 chr4 18827194 18827365 + 1.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -805404 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 370.75-13 chr8 143891466 143891771 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13154 NM_031308 83481 Hs.200412 NM_031308 ENSG00000261150 EPPK1 EPIPL|EPIPL1 epiplakin 1 protein-coding 270.75-13 chr14 46999092 46999253 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) 344074 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 261.5-8 chr11 101126462 101126779 + 1.75 NA intron (NM_001271162, intron 1 of 7) intron (NM_001271162, intron 1 of 7) 2443 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 196.75-19 chr10 106816622 106816828 + 1.75 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) intron (NM_001206569, intron 3 of 25) 347981 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 487-2 chr13 96114211 96114680 + 1.75 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 23606 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 209.75-79 chr5 147793015 147793134 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10346 NM_014790 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 322.25-3 chr14 59232116 59232398 + 1.75 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -31184 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 179.25-128 chr6 55644565 55644768 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -65452 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 293-2 chr10 3880261 3880522 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 46441 NR_134490 105376365 Hs.460114 NR_134490 ENSG00000230573 LINC02639 - long intergenic non-protein coding RNA 2639 ncRNA 283.25-43 chr9 83493512 83493784 + 1.75 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) MER103C|DNA|hAT-Charlie -25906 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 263.5-31 chr2 57485293 57485645 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -422182 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 316.5-28 chr3 172821755 172822036 + 1.75 NA TTS (NM_001349104) TTS (NM_001349104) 70893 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 279.75-55 chr8 98666507 98666728 + 1.75 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 159054 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 168.25-14 chr10 44495944 44496124 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -110937 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 466-3 chr3 104075510 104075819 + 1.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -551548 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 184.75-53 chr2 70533632 70533788 + 1.75 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) intron (NM_003236, intron 1 of 5) 19736 NM_001308158 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 404.75-3 chr20 11321219 11321684 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -48068 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 312-19 chr3 90079775 90080242 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 972387 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 381-5 chr12 69247710 69248147 + 1.75 NA intron (NM_007007, intron 1 of 9) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 8359 NM_007007 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 367.75-11 chr4 67501547 67501805 + 1.75 NA intron (NR_155754, intron 12 of 18) L1MC4|LINE|L1 43827 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 459.5-3 chr12 119659603 119659907 + 1.75 NA Intergenic AluYk11|SINE|Alu -8378 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 352.5-32 chr8 118873872 118874331 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 77784 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 312.25-26 chr6 143146262 143146698 + 1.75 NA intron (NM_001366353, intron 2 of 4) intron (NM_001366353, intron 2 of 4) -18302 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 382-13 chr20 4884638 4884884 + 1.75 NA exon (NM_203327, exon 8 of 17) exon (NM_203327, exon 8 of 17) -61153 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 248.5-64 chr22 41173374 41173662 + 1.75 NA intron (NM_001429, intron 28 of 30) intron (NM_001429, intron 28 of 30) 23983 NR_110514 101927279 Hs.517517 NR_110514 EP300-AS1 - EP300 antisense RNA 1 ncRNA 259.75-15 chr12 131131434 131131693 + 1.75 NA intron (NM_198827, intron 20 of 24) intron (NM_198827, intron 20 of 24) -33448 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 372-3 chr12 4240232 4240647 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -33323 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 306-15 chr2 114938035 114938274 + 1.75 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1ME4a|LINE|L1 -104606 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 475-3 chr18 34614125 34614675 + 1.75 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21065 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 305.25-46 chr8 78492573 78492874 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23617 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 257.75-45 chr7 30403877 30404130 + 1.75 NA TTS (NR_108081) TTS (NR_108081) 13118 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 426.5-6 chrX 83020957 83021271 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -487176 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 216-50 chr20 45517086 45517310 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -1576 NM_006652 10816 Hs.370724 NM_006652 ENSG00000101446 SPINT3 HKIB9 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3 protein-coding 273-43 chr5 65117284 65117527 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 348475 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 320.25-25 chr7 83816599 83816974 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -167647 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 398.5-10 chr20 18962660 18962993 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -132623 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 154-4 chr1 71293671 71293838 + 1.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 212430 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 223.75-43 chr2 4299460 4299610 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 325374 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 230.75-6 chr10 33383532 33383869 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -48795 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 258.25-43 chr5 39174310 39174537 + 1.75 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) intron (NM_001243093, intron 2 of 18) 45140 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 177.5-169 chr8 73311075 73311337 + 1.75 NA non-coding (NR_125388, exon 6 of 6) non-coding (NR_125388, exon 6 of 6) 16604 NM_172037 157506 Hs.244940 NM_172037 ENSG00000121039 RDH10 SDR16C4 retinol dehydrogenase 10 protein-coding 147.5-9 chr1 55016875 55016992 + 1.75 NA 3' UTR (NM_057176, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_057176, exon 4 of 4) 18000 NM_057176 7809 Hs.151291 NM_057176 ENSG00000162399 BSND BART|DFNB73 barttin CLCNK type accessory beta subunit protein-coding 370.5-7 chr14 65257980 65258227 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -35756 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 310.5-5 chr10 61160415 61160631 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 144248 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 123-25 chr10 75820519 75820620 + 1.75 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) L1PB4|LINE|L1 37808 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 236-3 chr1 91036891 91037035 + 1.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -14708 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 423.5-7 chr21 27108811 27109230 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -141932 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 321.25-3 chr1 107404305 107404563 + 1.75 NA intron (NM_001113226, intron 3 of 6) intron (NM_001113226, intron 3 of 6) 256365 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 580.75 chr12 16403158 16403793 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 50058 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 147.25-129 chr7 29075677 29075916 + 1.75 NA intron (NM_001371264, intron 10 of 15) intron (NM_001371264, intron 10 of 15) -49237 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 288.5-21 chr2 47109439 47109728 + 1.75 NA intron (NM_001163561, intron 5 of 6) intron (NM_001163561, intron 5 of 6) 45725 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 207.25-37 chr2 52332661 52332915 + 1.75 NA intron (NR_135237, intron 8 of 10) AluSq|SINE|Alu -37860 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 225.75-28 chr15 69043483 69043670 + 1.75 NA intron (NM_024505, intron 10 of 15) intron (NM_024505, intron 10 of 15) 28881 NM_024505 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 443.5-9 chr9 69832653 69832951 + 1.75 NA intron (NR_131757, intron 1 of 2) L1PA4|LINE|L1 11985 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 417-3 chr14 32039369 32039776 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37127 NR_027263 84837 Hs.496755 NM_032751 ARHGAP5-AS1 C14orf128 ARHGAP5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 331.25-5 chr14 85900250 85900674 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -34216 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 252-75 chr8 140715812 140716110 + 1.75 NA intron (NR_148037, intron 25 of 34) intron (NR_148037, intron 25 of 34) 2608 NM_001352751 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 211.75-8 chr1 220903456 220903605 + 1.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -23390 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 324.75-28 chr6 123720291 123720558 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -83331 NM_001256021 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 230.5-39 chr15 61750234 61750432 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 20415 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 326.75-21 chr9 990548 990864 + 1.75 NA exon (NM_021240, exon 2 of 2) exon (NM_021240, exon 2 of 2) 14051 NM_021240 58524 Hs.189174 NM_021240 ENSG00000064218 DMRT3 DMRTA3 doublesex and mab-3 related transcription factor 3 protein-coding 401-3 chr1 170398706 170399248 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -114769 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 268-20 chr15 23800210 23800484 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -113042 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 257.25-55 chr8 64170646 64170861 + 1.75 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 197805 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 199.75 chr1 63456441 63456629 + 1.75 NA intron (NM_001347145, intron 4 of 7) intron (NM_001347145, intron 4 of 7) 66738 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 267-39 chr5 56827910 56828079 + 1.75 NA intron (NM_005921, intron 1 of 19) intron (NM_005921, intron 1 of 19) 12445 NM_005921 4214 Hs.653654 NM_005921 ENSG00000095015 MAP3K1 MAPKKK1|MEKK|MEKK 1|MEKK1|SRXY6 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1 protein-coding 492.25-4 chr2 45526153 45526666 + 1.75 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) L1MB7|LINE|L1 84858 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 326.5-10 chr15 68288080 68288313 + 1.75 NA intron (NM_015322, intron 1 of 1) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 10451 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 217.25-38 chr2 12749015 12749389 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 11835 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 116.5-171 chr4 30546732 30546805 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -173601 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 386.5-6 chr12 34420197 34420444 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 397824 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 492.25-7 chr8 144163005 144163445 + 1.75 NA intron (NM_001099280, intron 2 of 12) intron (NM_001099280, intron 2 of 12) 14580 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 330-31 chr8 130124221 130124716 + 1.75 NA intron (NM_001362925, intron 18 of 29) intron (NM_001362925, intron 18 of 29) -39700 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 303.75-3 chr1 43847115 43847396 + 1.75 NA intron (NM_001270466, intron 4 of 4) L1MB2|LINE|L1 8633 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 226-39 chr2 73351366 73351599 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -34276 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 283-12 chr13 49328315 49328554 + 1.75 NA intron (NM_001079670, intron 10 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 73108 NM_030925 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 463.75-4 chr4 93012773 93013061 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 708518 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 289.5-34 chr3 194405746 194405943 + 1.75 NA 3' UTR (NM_024524, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_024524, exon 32 of 32) -6578 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 505-3 chr4 182283732 182284364 + 1.75 NA intron (NM_001080477, intron 1 of 27) intron (NM_001080477, intron 1 of 27) 40646 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 242.5-64 chr4 163341129 163341298 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2634 NM_001317092 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 271.75-27 chr22 35144610 35144858 + 1.75 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) intron (NR_126356, intron 4 of 5) 78576 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 154.75-148 chr8 133430879 133431043 + 1.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -133657 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 142.75-8 chr1 172410761 172410892 + 1.75 NA non-coding (NR_146559, exon 21 of 21) non-coding (NR_146559, exon 21 of 21) -9859 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 276.75-21 chr2 38227863 38228040 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 96846 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 296-9 chr11 22820015 22820335 + 1.75 NA TTS (NR_135213) TTS (NR_135213) 9204 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 176.25-93 chr3 99820906 99821020 + 1.75 NA intron (NR_110821, intron 1 of 2) intron (NR_110821, intron 1 of 2) 2902 NR_110821 101929357 Hs.741615 NR_110821 HP09053 - uncharacterized LOC101929357 ncRNA 455.5-6 chr6 45833387 45833744 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 104032 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 399.5-7 chr5 116228772 116229310 + 1.75 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) -26702 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 378.75-9 chr7 8038213 8038684 + 1.75 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L1PB4|LINE|L1 69652 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 197-18 chr15 61203229 61203409 + 1.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L1ME3|LINE|L1 25983 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 312.5-27 chr4 62576372 62576747 + 1.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -414794 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 242-55 chr7 25410718 25411010 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -182378 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 214.5-96 chr5 16129891 16130035 + 1.75 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 49828 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 270.5-65 chr8 126550838 126551111 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 7504 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 344-20 chr5 97618566 97618825 + 1.75 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) L1PA15|LINE|L1 113999 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 222.75-49 chr17 55067535 55067743 + 1.75 NA intron (NM_178509, intron 12 of 17) intron (NM_178509, intron 12 of 17) -98854 NM_001162861 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 252-42 chr22 26548600 26548783 + 1.75 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) AluJo|SINE|Alu 6632 NR_031615 100313914 NR_031615 ENSG00000221760 MIR548J MIRN548J|hsa-mir-548j microRNA 548j ncRNA 426.25-2 chr14 22861630 22861957 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9947 NM_001329226 26020 Hs.525232 NM_014045 ENSG00000197324 LRP10 LRP-10|LRP9|MST087|MSTP087 LDL receptor related protein 10 protein-coding 235-73 chr8 99527784 99527924 + 1.75 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) HY3|scRNA|scRNA 8876 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 416-9 chr6 21568188 21568687 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -25314 NM_003107 6659 Hs.643910 NM_003107 ENSG00000124766 SOX4 EVI16 SRY-box transcription factor 4 protein-coding 214.25-48 chr20 41229549 41229792 + 1.75 NA intron (NM_015035, intron 2 of 3) L1MB3|LINE|L1 60647 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 151.5-190 chr8 57701706 57701899 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -44347 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 143.75-152 chr6 45250613 45250757 + 1.75 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) HAL1|LINE|L1 -52915 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 355.25-14 chr7 83546806 83547214 + 1.75 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 94421 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 180-21 chr12 56372793 56372910 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -9994 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 390.25-7 chr7 86143294 86143639 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -500443 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 290-39 chr5 40697743 40698052 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 17982 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 409.5-10 chr3 39990634 39990885 + 1.75 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) intron (NM_001284424, intron 2 of 15) -109252 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 534.5 chr1 60874355 60874863 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -49025 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 150.75-36 chr11 38895102 38895259 + 1.75 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 246322 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 265.25-44 chr6 41539955 41540287 + 1.75 NA intron (NR_126415, intron 1 of 1) intron (NR_126415, intron 1 of 1) 6122 NR_126417 101060264 Hs.571099 NR_126415 ENSG00000234753 FOXP4-AS1 - FOXP4 antisense RNA 1 ncRNA 328.5-23 chr3 15681491 15681805 + 1.75 NA intron (NM_001349280, intron 20 of 26) intron (NM_001349280, intron 20 of 26) 15723 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 261.25-37 chr4 84338464 84338741 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -39433 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 299.5-14 chr14 44478697 44478949 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 28460 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 375.75-7 chr17 76642291 76642576 + 1.75 NA intron (NM_001289107, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 1324 NM_018414 55808 Hs.105352 NM_018414 ENSG00000070526 ST6GALNAC1 HSY11339|SIAT7A|ST6GalNAcI|STYI ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 382.25-4 chr12 5398505 5398997 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -33357 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 446.5-3 chr17 26685038 26685379 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 404033 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 233.75-48 chr3 17189473 17189610 + 1.75 NA intron (NM_014744, intron 18 of 21) MIR|SINE|MIR 256345 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 322.75-2 chr10 33179066 33179411 + 1.75 NA non-coding (NR_045259, exon 16 of 16) non-coding (NR_045259, exon 16 of 16) -62431 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 211.25-22 chr14 20648295 20648516 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6714 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 201.5-30 chr10 129610696 129610894 + 1.75 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 143554 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 289.5-29 chr2 162692953 162693234 + 1.75 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -75843 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 252.25-33 chr2 126506262 126506436 + 1.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -149586 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 361.75-14 chr3 182687987 182688364 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -105329 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 287.5-8 chr10 103054717 103055003 + 1.75 NA intron (NM_199076, intron 3 of 6) intron (NM_199076, intron 3 of 6) 98961 NM_001351191 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 180.5-113 chr4 80578155 80578264 + 1.75 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 242489 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 139.25-21 chr10 69606138 69606264 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -24046 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 221-31 chr19 17868364 17868614 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3456 NM_000453 6528 Hs.584804 NM_000453 ENSG00000105641 SLC5A5 NIS|TDH1 solute carrier family 5 member 5 protein-coding 300.5-29 chr2 235175383 235175658 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 147785 NM_001371306 484.75-2 chr2 107372407 107372853 + 1.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -23105 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 453.5-3 chr5 165589088 165589524 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 1119027 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 294.5-35 chr4 40356148 40356442 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 20962 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 328.75-13 chr3 30270354 30270718 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -248332 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 343.75-8 chr21 34101459 34101714 + 1.75 NA 3' UTR (NM_006933, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_006933, exon 2 of 2) 28008 NM_032476 64968 Hs.302742 NM_032476 ENSG00000243927 MRPS6 C21orf101|MRP-S6|RPMS6|S6mt mitochondrial ribosomal protein S6 protein-coding 406-8 chr4 122397520 122397957 + 1.75 NA intron (NM_001159285, intron 6 of 11) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 18220 NM_001159295 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 282.75-34 chr5 55776229 55776471 + 1.75 NA intron (NM_001166534, intron 2 of 14) L1MEd|LINE|L1 9465 NM_001166534 54514 Hs.223581 NM_019039 ENSG00000152670 DDX4 VASA DEAD-box helicase 4 protein-coding 285.75-15 chr16 21069540 21069841 + 1.75 NA intron (NM_001347886, intron 22 of 61) intron (NM_001347886, intron 22 of 61) 81156 NM_001347886 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 268.5-58 chr8 21449157 21449463 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 151071 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 146.25-3 chr1 109460043 109460139 + 1.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -6455 NM_001040709 284612 Hs.528366 NM_001006603 ENSG00000143028 SYPL2 MG29 synaptophysin like 2 protein-coding 456.5-5 chr14 79099310 79099854 + 1.75 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -100400 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 458.5-2 chr14 82865424 82865986 + 1.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 223073 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 172.75-91 chr3 193937437 193937622 + 1.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 56709 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 147-71 chr2 76751797 76751957 + 1.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -234088 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 114-173 chrX 112201628 112201697 + 1.75 NA intron (NM_001004308, intron 2 of 2) intron (NM_001004308, intron 2 of 2) 118637 NM_001004308 340595 Hs.368140 NM_001004308 ENSG00000187823 RTL4 Mar4|Mart4|SIRH11|ZCCHC16 retrotransposon Gag like 4 protein-coding 305.75-6 chr14 51726192 51726408 + 1.75 NA intron (NM_001042481, intron 14 of 14) intron (NM_001042481, intron 14 of 14) 9017 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 368.25-8 chr17 66348263 66348609 + 1.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 45823 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 119.25-8 chr1 77218165 77218282 + 1.75 NA intron (NM_005482, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 1207 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 202.75-17 chr11 36681258 36681453 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -83076 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 336-32 chr9 120301367 120301598 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -56432 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 524.5-2 chr11 17233245 17233651 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -25462 NM_001321378 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 201.75-50 chr2 162973084 162973244 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -134397 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 345.5-9 chr12 4347529 4347926 + 1.75 NA intron (NM_020375, intron 3 of 5) intron (NM_020375, intron 3 of 5) 26514 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 178.75-91 chr6 13539716 13539860 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -34741 NM_001193267 23408 Hs.567431 NM_012241 ENSG00000124523 SIRT5 SIR2L5 sirtuin 5 protein-coding 366.5-21 chr9 34910964 34911354 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15395 NM_001309426 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 344.25 chr1 197777874 197778124 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -2519 NM_001195216 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 254.75-15 chr15 50197439 50197678 + 1.75 NA exon (NM_003645, exon 2 of 10) exon (NM_003645, exon 2 of 10) 15362 NM_001159629 11001 Hs.11729 NM_003645 ENSG00000140284 SLC27A2 ACSVL1|FACVL1|FATP2|HsT17226|VLACS|VLCS|hFACVL1 solute carrier family 27 member 2 protein-coding 343-26 chr5 150636851 150637129 + 1.75 NA intron (NM_001166208, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR -3670 NM_001109974 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 441.5-10 chr8 107803191 107803561 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 278563 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 193-94 chr9 30131969 30132176 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 276382 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 240-37 chr3 114885136 114885451 + 1.75 NA intron (NM_001164343, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 12260 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 205-13 chr10 82754027 82754241 + 1.75 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -521214 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 277.75-31 chr7 46649214 46649645 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 47693 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 213.5-128 chr9 28277804 28278048 + 1.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 441379 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 390.25-3 chr18 59152397 59152668 + 1.75 NA intron (NM_001307941, intron 2 of 4) intron (NM_001307941, intron 2 of 4) 12648 NM_001307941 90701 Hs.45107 NM_033280 ENSG00000166562 SEC11C SEC11L3|SPC21|SPCS4C SEC11 homolog C, signal peptidase complex subunit protein-coding 436.5-2 chr1 190812648 190813155 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 188011 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 255-44 chr4 43281842 43282057 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 210594 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 188.75-103 chr7 26889430 26889544 + 1.75 NA Intergenic (AATTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -24897 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 225-83 chr9 106966539 106966793 + 1.75 NA intron (NM_001347997, intron 7 of 12) L2c|LINE|L2 103500 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 289.5-31 chr20 44562301 44562545 + 1.75 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu -20156 NM_001281445 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 234.25-78 chr8 129757166 129757402 + 1.75 NA intron (NM_031415, intron 6 of 13) L1MA2|LINE|L1 29340 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 299.25-21 chr16 73673379 73673597 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 286683 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 164.75-40 chr12 69510163 69510314 + 1.75 NA intron (NM_001278354, intron 2 of 9) intron (NM_001278354, intron 2 of 9) -5202 NR_145803 109623461 NR_145803 SNORA113 - small nucleolar RNA, H/ACA box 113 snoRNA 567.25 chr19 28057714 28058104 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -263969 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 365-10 chr2 120042104 120042523 + 1.75 NA intron (NM_001330307, intron 3 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 29236 NM_001330310 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 426.75-6 chr4 72513348 72513781 + 1.75 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 55657 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 169-16 chr12 26290524 26290661 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 95019 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 439.5-16 chr6 46945098 46945611 + 1.75 NA intron (NM_015234, intron 1 of 20) intron (NM_015234, intron 1 of 20) 9585 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 424-4 chr15 99283796 99284230 + 1.75 NA intron (NR_135754, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR 26488 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 447.5-7 chr7 43045619 43046034 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -66821 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 243.5-7 chr1 150520041 150520411 + 1.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 4469 NR_051960 100874054 Hs.576460 NR_051960 ENSG00000228126 FALEC FAL1|LINC00568|ncRNA-a1 focally amplified long non-coding RNA in epithelial cancer ncRNA 228.5-33 chr14 32618417 32618578 + 1.75 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) L1PB3|LINE|L1 289199 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 359.25-3 chr16 55212059 55212326 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -112367 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 305.75-7 chr15 65147625 65147837 + 1.75 NA TTS (NR_133680) TTS (NR_133680) -13923 NM_005707 10081 Hs.458596 NM_005707 ENSG00000090470 PDCD7 ES18|HES18 programmed cell death 7 protein-coding 296.5-11 chr14 62593464 62593775 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 451839 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 265-3 chr1 119966320 119966562 + 1.75 NA exon (NM_024408, exon 9 of 34) exon (NM_024408, exon 9 of 34) -69926 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 467-8 chr5 61108695 61109217 + 1.75 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) L1MA3|LINE|L1 -53360 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 300.75-50 chr9 102282482 102282791 + 1.75 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -237001 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 214-32 chr2 124391223 124391411 + 1.75 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 366030 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 423.5-10 chr8 56540865 56541189 + 1.75 NA intron (NR_038236, intron 1 of 2) intron (NR_038236, intron 1 of 2) 18796 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 352.75-14 chr6 130707760 130708298 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -119376 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 306.75-5 chr11 21339190 21339580 + 1.75 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 669799 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 216.75-10 chr10 26153396 26153625 + 1.75 NA intron (NM_017433, intron 23 of 34) intron (NM_017433, intron 23 of 34) -62797 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 183.25-12 chr10 70712371 70712535 + 1.75 NA intron (NM_080722, intron 4 of 21) LTR37A|LTR|ERV1 39947 NM_139155 140766 Hs.352156 NM_080722 ENSG00000138316 ADAMTS14 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 14 protein-coding 206.5-132 chr8 80048411 80048658 + 1.75 NA intron (NM_001287142, intron 4 of 6) MamRep605|LTR?|LTR? -18275 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 359.5-8 chr6 150920495 150920721 + 1.75 NA intron (NM_001350486, intron 9 of 27) intron (NM_001350486, intron 9 of 27) 54122 NM_001350491 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 175-87 chr3 151975243 151975356 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -47124 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 236.25-67 chr5 16031534 16031729 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 96449 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 200-59 chr3 101123822 101123947 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -130394 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 212.25-10 chr10 96009678 96009892 + 1.75 NA intron (NM_001349008, intron 25 of 34) intron (NM_001349008, intron 25 of 34) 9694 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 431.75-5 chr3 171737612 171737928 + 1.75 NA intron (NM_002662, intron 2 of 26) intron (NM_002662, intron 2 of 26) 72713 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 267.25-23 chr2 203472365 203472566 + 1.75 NA intron (NM_001329728, intron 5 of 15) MER41B|LTR|ERV1 62836 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 300-20 chr17 59639896 59640216 + 1.75 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) intron (NM_001288653, intron 1 of 31) 20161 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 193-81 chr6 104460831 104460953 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 398654 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 151-47 chr17 44495296 44495450 + 1.75 NA intron (NM_001002909, intron 1 of 7) intron (NM_001002909, intron 1 of 7) 8033 NM_001304942 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 279.25-12 chr12 55983344 55983643 + 1.75 NA intron (NM_002868, intron 1 of 5) intron (NM_002868, intron 1 of 5) 9415 NM_002868 5869 Hs.157659 NM_002868 ENSG00000111540 RAB5B - RAB5B, member RAS oncogene family protein-coding 208.25-35 chr17 53280893 53281092 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 295487 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 351.5-23 chr5 24684831 24685180 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -40027 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 172.75-67 chr2 146686610 146686778 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 99637 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 279-60 chr9 69782578 69782773 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22664 NR_159517 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 384-21 chr8 85174014 85174400 + 1.75 NA intron (NR_134311, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 2834 NR_134311 102723322 Hs.535913 NR_134311 ENSG00000260493 LOC102723322 - uncharacterized LOC102723322 ncRNA 165-116 chr5 142164514 142164705 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 55830 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 301-5 chr14 63573512 63573740 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -30231 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 238.75-66 chr8 118207057 118207284 + 1.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -95351 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 241.75-20 chr12 58712326 58712561 + 1.75 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 69273 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 366.75-10 chr21 26364212 26364520 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29269 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 239-7 chr1 178241170 178241414 + 1.75 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1ME4b|LINE|L1 -100159 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 191.25-108 chr8 114940350 114940526 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 727575 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 254.25-4 chr1 192771450 192771678 + 1.75 NA Intergenic MER34D|LTR|ERV1 -37475 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 321-5 chr11 99592307 99592570 + 1.75 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) L2a|LINE|L2 36293 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 335.25-27 chr5 160436339 160436664 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 14591 NM_001282383 9232 Hs.350966 NM_004219 ENSG00000164611 PTTG1 EAP1|HPTTG|PTTG|TUTR1 PTTG1 regulator of sister chromatid separation, securin protein-coding 244-26 chr2 124763486 124763660 + 1.75 NA intron (NM_130773, intron 14 of 23) intron (NM_130773, intron 14 of 23) 738286 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 204.75-71 chr22 27875334 27875473 + 1.75 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) intron (NM_001284278, intron 7 of 11) 43811 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 177-45 chr2 112259696 112259863 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -4737 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 378-4 chr12 66093214 66093539 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37374 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 493-5 chr9 3179713 3180124 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1671 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 304.25-11 chr15 59011061 59011291 + 1.75 NA intron (NM_001270530, intron 1 of 13) intron (NM_001270530, intron 1 of 13) 23030 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 231.75-3 chr1 95317828 95318297 + 1.75 NA intron (NR_135588, intron 1 of 1) intron (NR_135588, intron 1 of 1) 201 NR_135588 100996630 Hs.662270 NR_135588 ENSG00000228504 LINC01760 - long intergenic non-protein coding RNA 1760 ncRNA 293.5-32 chr4 97583554 97584011 + 1.75 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) L1PB|LINE|L1 216856 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 147.25-71 chr20 46282498 46282588 + 1.75 NA intron (NM_021248, intron 1 of 11) intron (NM_021248, intron 1 of 11) 25955 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 231.5-55 chr2 192731355 192731620 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18358 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 332-28 chr8 127327365 127327823 + 1.75 NA intron (NR_117099, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR -72805 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 249.5-90 chr7 84840601 84840893 + 1.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 281184 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 370.25-9 chr4 130339413 130339679 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36815 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 299.5-18 chr2 70589904 70590220 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36236 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 248-58 chr5 37038280 37038544 + 1.75 NA intron (NM_015384, intron 33 of 45) intron (NM_015384, intron 33 of 45) 161643 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 377.5-21 chr7 120524765 120525237 + 1.75 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 251826 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 240.75-2 chr1 220931714 220931901 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -51667 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 402.25-3 chr17 66091055 66091444 + 1.75 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) L1MA8|LINE|L1 100643 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 227-46 chr3 180690997 180691141 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11580 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 397.5-14 chrX 89191157 89191538 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 444122 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 216.25-44 chr16 80557633 80557885 + 1.75 NA intron (NR_120307, intron 1 of 5) intron (NR_120307, intron 1 of 5) 5376 NR_120307 102724084 Hs.147884 NR_120307 LOC102724084 - uncharacterized LOC102724084 ncRNA 202.5-8 chr1 175499260 175499421 + 1.75 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) 244255 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 467.75-5 chr8 121088032 121088456 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -276198 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 359.25-13 chr8 92539590 92539812 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 115793 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 412-13 chr8 138147984 138148560 + 1.75 NA intron (NM_015912, intron 14 of 19) (ATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -64727 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 277.25-9 chr11 112144643 112144897 + 1.75 NA intron (NM_001243211, intron 4 of 4) intron (NM_001243211, intron 4 of 4) 19324 NM_001243211 3606 Hs.83077 NM_001562 ENSG00000150782 IL18 IGIF|IL-18|IL-1g|IL1F4 interleukin 18 protein-coding 258.5-68 chr8 26300148 26300410 + 1.75 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) Helitron2Na_Mam|RC?|Helitron? 7063 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 190.75-100 chr6 157211248 157211388 + 1.75 NA TTS (NM_001346813) TTS (NM_001346813) 112941 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 558.75 chr22 25036576 25037371 + 1.75 NA intron (NM_001145206, intron 2 of 10) intron (NM_001145206, intron 2 of 10) 8999 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 149.5-43 chr11 60756241 60756354 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_103481) promoter-TSS (NR_103481) -570 NM_001098835 219995 Hs.207465 NM_152717 ENSG00000166961 MS4A15 - membrane spanning 4-domains A15 protein-coding 310.25-22 chr6 82725069 82725410 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 340602 NM_001350603 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 330.75-19 chr5 35989291 35989524 + 1.75 NA intron (NM_001171873, intron 2 of 5) intron (NM_001171873, intron 2 of 5) 1983 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 257.25-57 chr8 88918319 88918628 + 1.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -590990 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 151.75-153 chr8 107986999 107987331 + 1.75 NA intron (NM_001282863, intron 2 of 4) intron (NM_001282863, intron 2 of 4) 94774 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 295-4 chr10 48557397 48557629 + 1.75 NA intron (NR_144642, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR -45924 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 377-7 chr22 46709638 46709923 + 1.75 NA intron (NM_022766, intron 5 of 12) L1ME4a|LINE|L1 28472 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 406.75-7 chr2 74261516 74262308 + 1.75 NA intron (NM_133478, intron 11 of 30) intron (NM_133478, intron 11 of 30) 53113 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 165.25-143 chr8 124431191 124431345 + 1.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -19552 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 372.5-17 chr5 67279662 67279986 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -83025 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 150.5-17 chr10 61892391 61892538 + 1.75 NA Intergenic Eulor9A|DNA|DNA -9235 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 324-24 chr5 88637856 88638239 + 1.75 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 28892 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 296.25-35 chrX 76728413 76728697 + 1.75 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 190805 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 146.5-186 chr6 39581356 39581461 + 1.75 NA intron (NM_001289020, intron 9 of 21) AluSq2|SINE|Alu 144000 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 217-16 chr12 3941723 3941955 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -68391 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 246.75-76 chr8 119951461 119951671 + 1.75 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) intron (NM_022783, intron 3 of 8) 77844 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 251-40 chr3 94605206 94605435 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -332943 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 318.5-33 chr4 52889302 52889576 + 1.75 NA intron (NM_152540, intron 7 of 8) intron (NM_152540, intron 7 of 8) 27122 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 426.25-6 chr4 88259627 88260009 + 1.75 NA 3' UTR (NM_152542, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_152542, exon 7 of 7) 24743 NM_152542 152926 Hs.43744 NM_152542 ENSG00000163644 PPM1K BDP|MSUDMV|PP2Ckappa|PP2Cm|PTMP|UG0882E07 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1K protein-coding 290-3 chr1 62474831 62475124 + 1.75 NA intron (NM_001367561, intron 47 of 49) intron (NM_001367561, intron 47 of 49) 37928 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 380-6 chr13 106170626 106171048 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -205727 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 260.25-11 chr11 76547486 76547676 + 1.75 NA intron (NM_001300942, intron 21 of 21) MIRb|SINE|MIR 102556 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 322.25-9 chr2 33822951 33823286 + 1.75 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) intron (NR_126403, intron 1 of 5) -94901 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 297.5-16 chr14 53767740 53768019 + 1.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 180605 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 236.25-34 chr16 79637144 79637430 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36550 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 553.25-2 chr1 236323998 236324545 + 1.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -42313 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 297.5-9 chr10 97056614 97056973 + 1.75 NA intron (NM_003061, intron 12 of 36) intron (NM_003061, intron 12 of 36) -45963 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 337.75-18 chr6 109353111 109353405 + 1.75 NA intron (NR_152435, intron 45 of 45) intron (NR_152435, intron 45 of 45) 28481 NM_001346500 8763 Hs.520313 NM_006016 ENSG00000135535 CD164 DFNA66|MGC-24|MGC-24v|MUC-24|endolyn CD164 molecule protein-coding 315.75-17 chr3 110899428 110899834 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 170328 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 293.5-3 chr1 211146740 211147019 + 1.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -12731 NM_172362 3756 Hs.553187 NM_002238 ENSG00000143473 KCNH1 EAG|EAG1|Kv10.1|TMBTS|ZLS1|h-eag|hEAG1 potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 protein-coding 273-22 chr14 65848948 65849115 + 1.75 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 377929 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 206-23 chr14 51675085 51675209 + 1.75 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) intron (NM_001267046, intron 1 of 13) 23237 NM_001267046 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 209.75-83 chr6 57165209 57165421 + 1.75 NA intron (NM_015555, intron 13 of 13) L1M4|LINE|L1 6898 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 193.25-101 chr6 64840764 64840906 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) MER3|DNA|hAT-Charlie -460583 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 280-12 chr11 102435900 102436131 + 1.75 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) L1MB7|LINE|L1 16750 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 292.75-15 chr2 43578466 43578802 + 1.75 NA intron (NM_001083953, intron 8 of 37) intron (NM_001083953, intron 8 of 37) 17340 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 487.5-2 chr10 19777829 19778216 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -38410 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 335.25-3 chr1 186942143 186942474 + 1.75 NA intron (NM_024420, intron 10 of 17) intron (NM_024420, intron 10 of 17) 113359 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 284.75-25 chr4 79949494 79949781 + 1.75 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) MIRb|SINE|MIR 122166 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 390.25-4 chr2 1686765 1687378 + 1.75 NA intron (NM_012293, intron 4 of 22) intron (NM_012293, intron 4 of 22) 57444 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 171.75-49 chr15 42063004 42063132 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12365 NM_001206670 123745 Hs.668060 NM_001080490 ENSG00000188089 PLA2G4E - phospholipase A2 group IVE protein-coding 140.75-197 chr9 31020090 31020178 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 361356 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 277-30 chr5 147577010 147577293 + 1.75 NA intron (NR_038902, intron 1 of 3) intron (NR_038902, intron 1 of 3) 17157 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 379.75 chr1 70286384 70286794 + 1.75 NA intron (NM_030816, intron 9 of 12) L1M5|LINE|L1 65209 NM_001350613 9295 Hs.479693 NM_004768 ENSG00000116754 SRSF11 NET2|SFRS11|dJ677H15.2|p54 serine and arginine rich splicing factor 11 protein-coding 177.75-66 chr2 44322896 44323056 + 1.75 NA intron (NM_006036, intron 11 of 13) intron (NM_006036, intron 11 of 13) 36773 NM_001042385 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 411.25-4 chr2 176077189 176077727 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 6504 NM_001080458 344191 Hs.452341 NM_001080458 ENSG00000174279 EVX2 EVX-2 even-skipped homeobox 2 protein-coding 304.5-24 chr4 58939420 58939724 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -44710 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 235.5-50 chr2 198941275 198941607 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 516498 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 196-57 chr20 54909196 54909370 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 433690 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 367-2 chr1 217434131 217434427 + 1.75 NA intron (NM_018040, intron 9 of 9) intron (NM_018040, intron 9 of 9) 196811 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 284.25-17 chr2 168325652 168326128 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -78295 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 338.25-12 chr14 51667928 51668457 + 1.75 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) intron (NM_001267046, intron 1 of 13) 16282 NM_001267046 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 370-6 chr13 69618506 69618859 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 396336 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 265.25-50 chr7 2784661 2784829 + 1.75 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) intron (NM_007353, intron 2 of 3) -21605 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 310-7 chr14 48713134 48713540 + 1.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 873043 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 279.5-15 chr11 105962172 105962492 + 1.75 NA intron (NR_046356, intron 14 of 16) intron (NR_046356, intron 14 of 16) 59908 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 352.25-21 chr8 140487338 140487657 + 1.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -23801 NR_023360 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 264.5-58 chr7 104540073 104540278 + 1.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 211519 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 175.75-90 chr3 194077624 194077773 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6728 NR_136179 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 246-70 chr9 85240008 85240179 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 501936 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 269.75-43 chr4 139644524 139644821 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -21096 NM_001204366 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 271-8 chr11 111577795 111577990 + 1.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -24557 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 119.75-202 chr8 122702915 122703012 + 1.75 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -8857 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 346.75-8 chr21 14746607 14746934 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -103663 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 352.25-2 chr10 81816138 81816636 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -58807 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 353.75-4 chr15 86980012 86980405 + 1.75 NA intron (NR_135683, intron 1 of 2) intron (NR_135683, intron 1 of 2) 8218 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 143.5-194 chr7 23220025 23220157 + 1.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -26684 NM_002510 10457 Hs.190495 NM_002510 ENSG00000136235 GPNMB HGFIN|NMB|PLCA3 glycoprotein nmb protein-coding 176.75-21 chr11 78500926 78501066 + 1.75 NA intron (NM_024678, intron 6 of 13) AluJb|SINE|Alu -32180 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 251.5-89 chr8 117308922 117309099 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 174015 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 501.5-5 chr9 125175798 125176251 + 1.75 NA intron (NM_002721, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 13779 NM_002721 5537 Hs.744091 NM_002721 ENSG00000119414 PPP6C PP6|PP6C protein phosphatase 6 catalytic subunit protein-coding 213.5-87 chr4 35790445 35790637 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 453398 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 392.5-3 chr12 115678296 115678669 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 470172 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 245.75-46 chr5 55540401 55540547 + 1.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -5396 NR_103485 8611 Hs.696231 NM_003711 ENSG00000067113 PLPP1 LLP1a|LPP1|PAP-2a|PAP2|PPAP2A phospholipid phosphatase 1 protein-coding 244.75-31 chr2 105298115 105298330 + 1.75 NA intron (NM_001142621, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 31434 NR_137328 9392 Hs.446350 NM_004257 ENSG00000135966 TGFBRAP1 TRAP-1|TRAP1|VPS3 transforming growth factor beta receptor associated protein 1 protein-coding 318.75 chr1 23031392 23031676 + 1.75 NA intron (NM_015013, intron 2 of 18) intron (NM_015013, intron 2 of 18) 12066 NM_001363654 23028 Hs.591518 NM_015013 ENSG00000004487 KDM1A AOF2|BHC110|CPRF|KDM1|LSD1 lysine demethylase 1A protein-coding 559.75-3 chr8 84879405 84879895 + 1.75 NA intron (NM_001354323, intron 7 of 7) HAL1|LINE|L1 173723 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 638.25 chr2 160996043 160996715 + 1.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -140576 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 254-40 chr6 108840489 108840722 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7811 NM_001286609 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 188.25-124 chr9 128991222 128991375 + 1.75 NA intron (NM_015354, intron 25 of 43) AluSg4|SINE|Alu 37033 NR_163192 56904 Hs.460238 NM_020145 ENSG00000148341 SH3GLB2 PP6569|PP9455|RRIG1 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B2 protein-coding 180.75-53 chr17 60972166 60972390 + 1.75 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) intron (NM_001330413, intron 14 of 25) 294427 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 334.25-14 chr2 56119630 56120050 + 1.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29458 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 439-6 chr2 38125861 38126321 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5014 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 417.25-9 chr9 92052747 92053163 + 1.75 NA intron (NM_001368273, intron 9 of 15) L1MB5|LINE|L1 62458 NM_001281303 10558 Hs.90458 NM_006415 ENSG00000090054 SPTLC1 HSAN1|HSN1|LBC1|LCB1|SPT1|SPTI serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 protein-coding 286.75 chr1 18514166 18514403 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 33354 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 420.75-9 chr3 159072308 159072695 + 1.75 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 3182 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 373.75-5 chr17 74209591 74209856 + 1.75 NA TTS (NR_026914) TTS (NR_026914) 3598 NR_026914 85001 Hs.706954 NM_032915 ENSG00000246731 MGC16275 - uncharacterized protein MGC16275 ncRNA 286.75-3 chr1 57444156 57444397 + 1.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 -19355 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 254.5-51 chr3 30230143 30230330 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -288632 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 262.5-10 chr11 114241103 114241394 + 1.75 NA intron (NM_006006, intron 4 of 6) intron (NM_006006, intron 4 of 6) -54565 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 275.75-30 chr21 31857038 31857307 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15848 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 292.75-39 chrX 143830895 143831087 + 1.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -53080 NR_121210 389898 Hs.585177 NM_001012989 ENSG00000276380 UBE2NL Li174 ubiquitin conjugating enzyme E2 N like (gene/pseudogene) protein-coding 253.75-15 chr18 6722770 6723111 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6776 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 195.25-42 chr17 60709219 60709365 + 1.75 NA exon (NM_001353146, exon 5 of 26) exon (NM_001353146, exon 5 of 26) 31441 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 303.5-16 chr16 72433542 72433733 + 1.75 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 231333 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 231.25-7 chr10 125664326 125664590 + 1.75 NA intron (NM_001128202, intron 1 of 3) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 18705 NM_001318133 387718 Hs.148259 NM_001128202 ENSG00000175018 TEX36 C10orf122|bA383C5.1 testis expressed 36 protein-coding 328-4 chr11 131074952 131075291 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -158634 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 235-8 chr1 215035747 215036065 + 1.75 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) intron (NM_001017424, intron 1 of 6) 30364 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 322.75-17 chr5 35983659 35984019 + 1.75 NA intron (NM_001171873, intron 3 of 5) L1MA4|LINE|L1 7551 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 375.75-19 chr8 129834855 129835123 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -48365 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 366-5 chr12 32538546 32538845 + 1.75 NA intron (NM_001304480, intron 1 of 16) intron (NM_001304480, intron 1 of 16) 4402 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 307.5-31 chr20 32233185 32233429 + 1.75 NA intron (NM_015352, intron 6 of 6) L2b|LINE|L2 -4488 NR_031726 100302183 NR_031726 ENSG00000284125 MIR1825 MIRN1825|hsa-mir-1825 microRNA 1825 ncRNA 173-91 chr4 35625204 35625458 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 618608 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 181.75-112 chr6 119669518 119669621 + 1.75 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 119761 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 180.75-75 chr2 225065974 225066188 + 1.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -23613 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 369-17 chr8 108802591 108803034 + 1.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -15218 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 190.25-45 chr16 5799748 5800035 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 167424 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 558.5 chr2 212532182 212532681 + 1.75 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 6197 NM_001042599 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 572-2 chr9 120725835 120726237 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11566 NM_001080497 1955 Hs.744903 NM_001080497 ENSG00000106780 MEGF9 EGFL5 multiple EGF like domains 9 protein-coding 615-3 chr7 50292281 50292747 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11550 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 503.5 chr6 21015108 21015465 + 1.75 NA intron (NM_017774, intron 11 of 15) intron (NM_017774, intron 11 of 15) 480829 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 303.5-17 chr18 13097040 13097233 + 1.75 NA intron (NM_032142, intron 36 of 44) intron (NM_032142, intron 36 of 44) 105774 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 334.25-12 chr18 7155160 7155431 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -37498 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 250.5-106 chrX 7554133 7554319 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -288036 NM_013452 26609 Hs.278906 NM_013452 ENSG00000182583 VCX VCX-10r|VCX-B1|VCX1|VCX10R|VCXB1 variable charge X-linked protein-coding 191.75-19 chr10 98486771 98486923 + 1.75 NA intron (NM_021828, intron 10 of 11) MER121|DNA|hAT? -39884 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 324-29 chr8 40241155 40241527 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 87859 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 310.75-32 chr8 109229982 109230258 + 1.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 99813 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 191.25-14 chr10 115429317 115429481 + 1.75 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) L1PA8A|LINE|L1 336034 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 336.25-14 chr4 58960414 58960782 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23684 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 199.75-62 chr3 62023396 62023560 + 1.75 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) intron (NM_002841, intron 4 of 29) 295469 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 274.75-12 chr14 58811853 58812213 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16255 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 490.5-4 chr8 91447827 91448227 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 198708 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 305.5-28 chr22 38016240 38016569 + 1.75 NA intron (NM_001301130, intron 5 of 5) intron (NM_001301130, intron 5 of 5) 27610 NR_039759 100616146 NR_039759 ENSG00000284266 MIR4534 - microRNA 4534 ncRNA 131.75-17 chr1 192314857 192314961 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -2083 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 264.5-56 chr7 18575265 18575463 + 1.75 NA intron (NM_001204147, intron 1 of 9) intron (NM_001204147, intron 1 of 9) 66094 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 275.5-29 chr19 28294319 28294536 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -312261 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 305.5-42 chr6 122416141 122416378 + 1.75 NA exon (NM_001135564, exon 5 of 12) exon (NM_001135564, exon 5 of 12) 16607 NM_001243094 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 671.75 chr1 14499053 14499760 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -79433 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 310.75-10 chr12 54749713 54750038 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -101510 NM_053283 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 440-8 chr3 122413824 122414607 + 1.75 NA 3' UTR (NM_019069, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_019069, exon 1 of 1) 1847 NM_019069 54554 Hs.567513 NM_019069 ENSG00000196981 WDR5B - WD repeat domain 5B protein-coding 336-11 chr17 61440301 61440689 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11927 NM_001321120 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 151.25-52 chr14 33749660 33749780 + 1.75 NA intron (NM_001165893, intron 6 of 10) intron (NM_001165893, intron 6 of 10) 40783 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 523.75-2 chr17 82894276 82894676 + 1.75 NA intron (NM_005993, intron 17 of 38) intron (NM_005993, intron 17 of 38) -54454 NM_024702 79755 Hs.464391 NM_024702 ENSG00000141579 ZNF750 ZFP750 zinc finger protein 750 protein-coding 202.5-131 chr6 161931688 161931996 + 1.75 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 460865 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 185.25-131 chr9 2364926 2365120 + 1.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 206567 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 311.5-19 chr22 28352709 28352946 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -107042 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 364.25 chr1 150382012 150382227 + 1.75 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) intron (NM_015203, intron 1 of 10) 18008 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 228.5-60 chr2 115702497 115702705 + 1.75 NA intron (NM_001321912, intron 8 of 25) L1MB8|LINE|L1 358786 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 358 chr1 86352459 86352949 + 1.75 NA intron (NM_001007022, intron 17 of 17) intron (NM_001007022, intron 17 of 17) 4983 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 301.75-23 chr22 26284707 26284912 + 1.75 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 115335 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 245-46 chr4 39053821 39054086 + 1.75 NA intron (NM_001171654, intron 1 of 10) intron (NM_001171654, intron 1 of 10) -8279 NM_015990 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 173.5-133 chr5 144878937 144879234 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 673694 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 439.5-15 chr4 91840602 91841072 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 436465 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 364.25-9 chr13 109136669 109137109 + 1.75 NA intron (NM_015011, intron 31 of 34) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 30414 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 167-36 chr14 28580591 28580749 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 184649 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 203.5-118 chr6 47004045 47004202 + 1.75 NA intron (NM_153840, intron 13 of 14) intron (NM_153840, intron 13 of 14) 38209 NM_153840 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 382-10 chr2 36621631 36621866 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23580 NM_001042548 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 522-2 chr7 2567827 2568685 + 1.75 NA intron (NM_152558, intron 2 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 9277 NM_001287500 23288 Hs.520627 NM_152558 ENSG00000106012 IQCE 1700028P05Rik|PAPA7 IQ motif containing E protein-coding 162.25-158 chr8 80689550 80689717 + 1.75 NA intron (NM_001033723, intron 3 of 8) intron (NM_001033723, intron 3 of 8) 184835 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 372 chr1 238487402 238487798 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1583 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 189.25-49 chr18 1556444 1556659 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -196922 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 391.25-7 chr12 19376166 19376395 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001256470, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_001256470, exon 32 of 32) -63212 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 385.5-14 chr22 26918836 26919097 + 1.75 NA intron (NR_110540, intron 2 of 2) intron (NR_110540, intron 2 of 2) 15674 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 259.25-49 chr8 116889730 116889951 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14974 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 151-125 chr7 35526904 35527016 + 1.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 168175 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 385.25-9 chr4 124152565 124152986 + 1.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 378511 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 202.75-68 chr22 24018894 24019122 + 1.75 NA intron (NM_001199281, intron 1 of 36) L1MC4a|LINE|L1 7638 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 122-27 chr10 56247350 56247433 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 113868 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 575.25 chr10 81119098 81119655 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 469579 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 447-11 chr8 32063449 32063851 + 1.75 NA intron (NR_104156, intron 3 of 3) intron (NR_104156, intron 3 of 3) 37432 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 345.25-9 chr18 69906032 69906467 + 1.75 NA intron (NM_001303619, intron 1 of 4) intron (NM_001303619, intron 1 of 4) 41624 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 199.25-104 chr9 32985842 32985991 + 1.75 NA intron (NM_001368998, intron 5 of 7) intron (NM_001368998, intron 5 of 7) 15660 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 308-8 chr12 51072586 51072870 + 1.75 NA intron (NR_045072, intron 3 of 4) intron (NR_045072, intron 3 of 4) 10868 NR_045072 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 259.25-39 chr6 78743749 78744034 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -123660 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 404.75 chr11 15321729 15322094 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 172809 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 349.75-15 chr8 53972291 53972641 + 1.75 NA intron (NM_201437, intron 7 of 8) intron (NM_201437, intron 7 of 8) 49982 NR_109901 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 192.75-70 chr20 18510309 18510618 + 1.75 NA intron (NM_001172745, intron 1 of 19) intron (NM_001172745, intron 1 of 19) 2523 NM_001172745 10483 Hs.369373 NM_006363 ENSG00000101310 SEC23B CDA-II|CDAII|CDAN2|CWS7|HEMPAS|hSec23B SEC23 homolog B, coat complex II component protein-coding 421-8 chr3 53317896 53318343 + 1.75 NA intron (NM_001290207, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu 15008 NR_145715 109617024 NR_145715 ENSG00000207109 SNORD38C - small nucleolar RNA, C/D box 38C snoRNA 378.25-11 chr6 157524497 157524814 + 1.75 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) -4477 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 327.5-27 chr6 97939206 97939440 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -85208 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 212.25-62 chr4 31558305 31558448 + 1.75 NA TTS (NR_149122) TTS (NR_149122) 51832 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 320.75-14 chr21 26779928 26780310 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 65290 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 486.25 chr10 89356287 89356695 + 1.75 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -21565 NM_001010987 439996 Hs.500491 NM_001010987 ENSG00000204010 IFIT1B IFIT1L|bA149I23.6 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1B protein-coding 216.75-56 chr4 86630803 86631036 + 1.75 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) intron (NM_080685, intron 1 of 47) 36604 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 141-3 chr1 81253619 81253907 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -52429 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 303.5-50 chr8 69138240 69138562 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34211 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 299.25-28 chr20 45238406 45238692 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 16015 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 269-11 chr10 121785461 121785740 + 1.75 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 142431 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 335.25-21 chr20 17977555 17978051 + 1.75 NA intron (NM_001310338, intron 4 of 5) MER41C|LTR|ERV1 8785 NM_001310339 92667 Hs.320823 NM_052865 ENSG00000125871 MGME1 C20orf72|DDK1|MTDPS11|bA504H3.4 mitochondrial genome maintenance exonuclease 1 protein-coding 256.25-9 chr12 119651926 119652162 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16089 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 294.25-28 chr4 53103070 53103357 + 1.75 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) L1MC4|LINE|L1 240896 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 328.25-3 chr12 2193130 2193371 + 1.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 AluJb|SINE|Alu 30231 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 261.75-23 chr2 211071649 211071874 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 454190 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 198.25-106 chr9 32255120 32255318 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -129384 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 312.25-18 chr3 51506412 51506729 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6555 NM_001349171 9730 Hs.716623 NM_014703 ENSG00000145041 DCAF1 RIP|VPRBP DDB1 and CUL4 associated factor 1 protein-coding 148.25-143 chr8 76160256 76160374 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -246339 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 389.75-2 chr14 81920127 81920478 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -177164 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 442.25-2 chr12 46714620 46715221 + 1.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 111077 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 292 chr1 78946635 78946906 + 1.75 NA intron (NM_022159, intron 2 of 14) intron (NM_022159, intron 2 of 14) 59960 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 237.75-57 chr4 64897011 64897364 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 107313 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 183.25-110 chr8 18079473 18079667 + 1.75 NA intron (NM_004315, intron 1 of 13) intron (NM_004315, intron 1 of 13) 3626 NM_001363743 427 Hs.527412 NM_004315 ENSG00000104763 ASAH1 AC|ACDase|ASAH|PHP|PHP32|SMAPME N-acylsphingosine amidohydrolase 1 protein-coding 269.75-18 chr14 50731622 50731800 + 1.75 NA intron (NM_016350, intron 27 of 28) AluSc|SINE|Alu -63405 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 307.75-20 chr7 50143833 50144179 + 1.75 NA intron (NM_001161834, intron 7 of 8) intron (NM_001161834, intron 7 of 8) 47920 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 470.25-6 chr8 140320004 140320399 + 1.75 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) intron (NM_001160372, intron 9 of 22) 137543 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 209.25-15 chr10 98161600 98161822 + 1.75 NA intron (NM_001351010, intron 4 of 11) L1MC4a|LINE|L1 27054 NM_001351016 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 291.25-26 chr6 50754786 50755069 + 1.75 NA intron (NM_172238, intron 7 of 7) L1MB2|LINE|L1 41383 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 240-19 chr14 89571803 89572059 + 1.75 NA intron (NM_001085471, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR -4285 NR_024620 29018 Hs.673124 NM_014099 ENSG00000259073 FOXN3-AS2 PRO1768 FOXN3 antisense RNA 2 ncRNA 369.5-24 chr8 141952006 141952554 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -165967 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 368.75-13 chr8 8692059 8692569 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9623 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 546.5 chr10 51247052 51247417 + 1.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -52339 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 301.5-20 chr15 87774067 87774376 + 1.75 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie 172047 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 160.25-104 chr3 141590910 141591035 + 1.75 NA intron (NM_001303246, intron 20 of 24) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie -72227 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 175.75-42 chr15 65497662 65497784 + 1.75 NA intron (NR_135485, intron 5 of 20) intron (NR_135485, intron 5 of 20) 19551 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 177.25-87 chr22 28102041 28102168 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 8 of 22) intron (NM_001145418, intron 8 of 22) -181492 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 275-22 chr2 11245583 11245802 + 1.75 NA intron (NM_001321643, intron 4 of 32) L1MC5|LINE|L1 90225 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 215.25-51 chr2 188902347 188902522 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71939 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 370-14 chr5 126126167 126126640 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53174 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 198.25-97 chr8 58762212 58762410 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -102458 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 428.25-5 chr6 65023654 65024142 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 13 of 43) intron (NM_001292009, intron 13 of 43) -277520 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 268.5-38 chr3 78391607 78391809 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -342745 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 509.5-4 chr22 33711371 33711973 + 1.75 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) AluJr|SINE|Alu -6752 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 280.75-24 chr2 184006692 184006868 + 1.75 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -372195 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 230.75-49 chr4 62513955 62514146 + 1.75 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 -352285 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 385.5-8 chr15 27324712 27325129 + 1.75 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -163601 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-54 chr14 39113901 39114045 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001009182) promoter-TSS (NM_001009182) -311 NM_001009182 8487 Hs.652307 NM_003616 ENSG00000092208 GEMIN2 SIP1|SIP1-delta gem nuclear organelle associated protein 2 protein-coding 241-41 chr5 123816434 123816696 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 271148 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 246.25-19 chr14 24995823 24996006 + 1.75 NA intron (NM_001351940, intron 1 of 6) intron (NM_001351940, intron 1 of 6) 53086 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 224.75-46 chr3 12554321 12554637 + 1.75 NA Intergenic (ATATATGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2535 NM_001271707 23609 Hs.591666 NM_014160 ENSG00000075975 MKRN2 HSPC070|RNF62 makorin ring finger protein 2 protein-coding 351.75-5 chr13 84767461 84767771 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16038 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 333-13 chr20 10627389 10627659 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001009608, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001009608, exon 8 of 8) 22171 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 342-5 chr10 129783758 129784024 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 59483 NR_036179 100422873 NR_036179 ENSG00000266676 MIR4297 - microRNA 4297 ncRNA 149.75-77 chr2 41572804 41573078 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -304614 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 360.5-6 chr11 54745554 54745923 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 38906 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 407.25-5 chr2 28400139 28400438 + 1.75 NA intron (NM_005253, intron 1 of 3) intron (NM_005253, intron 1 of 3) -5616 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 470.5-8 chr5 11985670 11986092 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -81435 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 326.5-15 chr16 84665346 84665802 + 1.75 NA 3' UTR (NM_024731, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_024731, exon 5 of 5) 17063 NM_001303451 79786 Hs.222731 NM_024731 ENSG00000135686 KLHL36 C16orf44 kelch like family member 36 protein-coding 475.5 chr5 40771614 40771922 + 1.75 NA exon (NM_001355034, exon 4 of 6) exon (NM_001355034, exon 4 of 6) -15807 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 234.75-52 chr3 117591322 117591567 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 99481 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 256.75-36 chr7 29424422 29424712 + 1.75 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -55145 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 314.25-20 chr4 68125599 68125803 + 1.75 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) intron (NM_207407, intron 1 of 9) 4168 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 240 chr1 2064482 2064708 + 1.75 NA intron (NM_002744, intron 4 of 17) L1MB3|LINE|L1 -8867 NM_001033581 5590 Hs.496255 NM_002744 ENSG00000067606 PRKCZ PKC-ZETA|PKC2 protein kinase C zeta protein-coding 284.75-23 chr3 44372251 44372556 + 1.75 NA intron (NM_001282915, intron 5 of 10) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 33637 NM_173826 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 340-7 chr15 97867394 97867680 + 1.75 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) intron (NR_024172, intron 1 of 2) 6892 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 381-20 chr6 3659421 3659754 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 92425 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 236.75-52 chr7 31159299 31159569 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 106973 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 253-51 chr7 95248683 95248952 + 1.75 NA intron (NM_017650, intron 8 of 15) intron (NM_017650, intron 8 of 15) 75715 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 230.5-123 chr9 91333098 91333447 + 1.75 NA intron (NM_001698, intron 3 of 9) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 28652 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 180.25-114 chr7 131067772 131067968 + 1.75 NA intron (NR_109850, intron 2 of 5) intron (NR_109850, intron 2 of 5) 39160 NR_024153 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 367.5-5 chr1 208532162 208532398 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -196408 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 302.5-16 chr2 26211035 26211343 + 1.75 NA intron (NM_000182, intron 10 of 19) MER112|DNA|hAT-Charlie 30473 NM_001191033 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 378.5-6 chr16 77980338 77980686 + 1.75 NA TTS (NM_020927) TTS (NM_020927) -42036 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 150-30 chr12 27852496 27852660 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 72345 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 357.25-9 chr2 116560244 116560460 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 1216537 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 241-37 chr5 9679996 9680201 + 1.75 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) L1MC3|LINE|L1 -49747 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 189.25-11 chr10 96570648 96570841 + 1.75 NA intron (NM_020123, intron 2 of 14) HAL1|LINE|L1 16268 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 331.75-13 chr2 78207680 78208107 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1PA17|LINE|L1 82838 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 220-70 chr8 129904288 129904426 + 1.75 NA intron (NM_001353291, intron 2 of 11) LTR16E2|LTR|ERVL 35454 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 397.25-3 chr18 78215229 78215495 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -221635 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 299.25-47 chr7 93465611 93465932 + 1.75 NA intron (NM_001164737, intron 8 of 15) intron (NM_001164737, intron 8 of 15) 17084 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 259.75-48 chr7 127788397 127788628 + 1.75 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) intron (NM_014390, intron 10 of 23) 136318 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 289-49 chr8 130550266 130550554 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -106736 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 386.5-11 chr4 65744323 65744645 + 1.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -73989 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 223.5-99 chr5 96183463 96183681 + 1.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 104434 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 257.75-32 chr4 61803608 61803835 + 1.75 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) intron (NM_001371343, intron 8 of 23) 358044 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 310-25 chr7 42311905 42312158 + 1.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -74822 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 259.75-27 chr2 102799323 102799571 + 1.75 NA intron (NM_001321345, intron 4 of 4) MER39B|LTR|ERV1 37416 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 225.75-68 chr5 146956353 146956528 + 1.75 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) intron (NM_001271900, intron 2 of 10) -36934 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 352.25-14 chr4 168551052 168551400 + 1.75 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) L1M5|LINE|L1 54174 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 234.25-3 chr1 78882923 78883078 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 123730 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 405.5-8 chr2 211866379 211866801 + 1.75 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 559770 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 270.75-19 chr15 68049873 68050222 + 1.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -4132 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 210.25-79 chr8 87168666 87168903 + 1.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA2|LINE|L1 302369 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 385-6 chr17 33867583 33867945 + 1.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 289042 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 439.75 chr2 112968879 112969135 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8999 NM_001278568 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 226.5-88 chr7 4657444 4657749 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -24699 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 417.5-6 chr2 110795025 110795473 + 1.75 NA intron (NM_001371254, intron 5 of 18) intron (NM_001371254, intron 5 of 18) 62676 NM_001371254 302.75-13 chr18 49790793 49791018 + 1.75 NA intron (NM_006111, intron 7 of 9) MIRc|SINE|MIR 22628 NM_006111 10449 Hs.200136 NM_006111 ENSG00000167315 ACAA2 DSAEC acetyl-CoA acyltransferase 2 protein-coding 337.25-3 chr1 110159062 110159397 + 1.75 NA intron (NM_001010898, intron 1 of 11) intron (NM_001010898, intron 1 of 11) 8735 NM_001010898 388662 Hs.128382 NM_001010898 ENSG00000197106 SLC6A17 MRT48|NTT4 solute carrier family 6 member 17 protein-coding 260-24 chr3 99572478 99573031 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -65840 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 313-18 chr4 70272695 70273001 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 30232 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 276.75-50 chr7 138298719 138298973 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -161413 NM_015905 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 165-98 chr3 193426134 193426261 + 1.75 NA intron (NM_032279, intron 25 of 29) L1MB4|LINE|L1 -47444 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 227.25-11 chr1 231781576 231781707 + 1.75 NA intron (NM_001164547, intron 6 of 7) intron (NM_001164547, intron 6 of 7) 36876 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 319.5-11 chr12 38883367 38883583 + 1.75 NA intron (NM_153634, intron 1 of 19) L1M5|LINE|L1 22116 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 237.75-31 chr18 56424371 56424581 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 214116 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 273.25-38 chr8 78048049 78048372 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -468130 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 202.25-29 chr16 82384513 82384699 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -214382 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 288.25-6 chr12 127926462 127926822 + 1.75 NA intron (NR_046392, intron 1 of 4) L1PB2|LINE|L1 11232 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 266-41 chr6 71598608 71598835 + 1.75 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 177694 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 205.5-133 chr7 21253821 21254012 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -174167 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 245.75-31 chr2 223775639 223775913 + 1.75 NA intron (NR_110905, intron 3 of 5) intron (NR_110905, intron 3 of 5) 61806 NR_110905 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 189-76 chr3 57721604 57721795 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 28494 NR_135550 101929159 Hs.434396 NR_135550 ENSG00000241933 DENND6A-DT - DENND6A divergent transcript ncRNA 418 chr1 76849099 76849546 + 1.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -18158 NM_030965 81849 Hs.149201 NM_030965 ENSG00000117069 ST6GALNAC5 SIAT7-E|SIAT7E|ST6GalNAcV ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5 protein-coding 358.25-4 chr10 50617512 50617786 + 1.75 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 6307 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 480.25-3 chr15 69205265 69205775 + 1.75 NA intron (NM_001324094, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 44885 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 323.25-9 chr13 110363977 110364273 + 1.75 NA intron (NM_001846, intron 4 of 47) intron (NM_001846, intron 4 of 47) 23167 NR_107040 102465872 NR_107040 ENSG00000276765 MIR8073 hsa-mir-8073 microRNA 8073 ncRNA 229.75-76 chr8 84035662 84035946 + 1.75 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -146983 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 172.25-75 chr2 185752044 185752174 + 1.75 NA intron (NM_173651, intron 7 of 22) L1MEc|LINE|L1 -11632 NR_110217 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 264.25-56 chr9 27007365 27007677 + 1.75 NA intron (NM_001099224, intron 8 of 13) intron (NM_001099224, intron 8 of 13) -1849 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 288.25-29 chr8 119579590 119579920 + 1.75 NA intron (NM_001330600, intron 19 of 25) intron (NM_001330600, intron 19 of 25) 13253 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 248.25-43 chr21 22776033 22776288 + 1.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -303124 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 207.75-84 chr3 191020134 191020277 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 142275 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 298.25-18 chr21 17552642 17553157 + 1.75 NA intron (NM_001207064, intron 3 of 3) intron (NM_001207064, intron 3 of 3) 39856 NM_001207064 1525 Hs.627078 NM_001338 ENSG00000154639 CXADR CAR|CAR4/6|HCAR CXADR Ig-like cell adhesion molecule protein-coding 469.5-2 chr2 202823442 202823781 + 1.75 NA intron (NM_001288624, intron 2 of 3) intron (NM_001288624, intron 2 of 3) 5623 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 318.75-12 chr20 6231242 6231486 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -107820 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 197-8 chr11 76584918 76585169 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 84895 NR_163259 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 279-15 chr19 51638936 51639163 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 7830 NM_001098612 100049587 Hs.707374 NM_001098612 ENSG00000254415 SIGLEC14 - sialic acid binding Ig like lectin 14 protein-coding 303.25-25 chr4 61280734 61280932 + 1.75 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) L1ME4a|LINE|L1 78661 NM_001371342 222.5-50 chr2 77639273 77639470 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -116938 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 222.75-73 chr4 45270115 45270294 + 1.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -543570 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 608.75 chr18 6306149 6307053 + 1.75 NA intron (NM_001365769, intron 3 of 16) intron (NM_001365769, intron 3 of 16) 49857 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 356.75-8 chr20 6033319 6033732 + 1.75 NA intron (NR_136617, intron 4 of 5) intron (NR_136617, intron 4 of 5) 20535 NM_152611 164312 Hs.149133 NM_152611 ENSG00000125872 LRRN4 C20orf75|NLRR-4|NLRR4|dJ1056H1.1 leucine rich repeat neuronal 4 protein-coding 204-46 chr21 18549584 18549789 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 136478 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 457.5-3 chr7 110100430 110100740 + 1.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -140372 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 370.5-11 chr18 69967002 69967348 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10376 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 348-11 chr15 87657147 87657496 + 1.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 80392 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 324.75-7 chr11 84632094 84632575 + 1.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 88608 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 305.5-37 chr6 34707644 34707991 + 1.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 10872 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 341-7 chr12 8572069 8572426 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -31342 NM_014358 26253 Hs.236516 NM_014358 ENSG00000166523 CLEC4E CLECSF9|MINCLE C-type lectin domain family 4 member E protein-coding 439-8 chrX 78473691 78474322 + 1.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -146315 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 158-46 chr14 20303254 20303357 + 1.75 NA intron (NM_138376, intron 1 of 9) FLAM_C|SINE|Alu 2646 NM_138376 91875 Hs.98553 NM_138376 ENSG00000136319 TTC5 Strap tetratricopeptide repeat domain 5 protein-coding 652 chr10 110996780 110997440 + 1.75 NA intron (NM_007373, intron 3 of 8) intron (NM_007373, intron 3 of 8) 8184 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 389.5-2 chr1 104853243 104853538 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 765545 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 197.75-48 chr2 191617035 191617204 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -60953 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 502.5 chr2 5888082 5888403 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -44445 NR_026832 150622 Hs.560891 NR_026832 SILC1 LINC01105 sciatic injury induced lincRNA upregulator of SOX11 ncRNA 559 chr13 20278156 20278590 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -45978 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 241.5-51 chr2 180386130 180386407 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -305836 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 274.5-44 chr3 146831418 146831636 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -90396 NR_135561 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 204.5-18 chr11 26548720 26548894 + 1.75 NA intron (NM_031418, intron 12 of 26) intron (NM_031418, intron 12 of 26) 23456 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 237.25-71 chr8 36116828 36117051 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -406619 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 313.75-15 chr3 96328479 96328761 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -31344 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 226.75-3 chr1 215241297 215241467 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 158645 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 276.25-2 chr1 87965913 87966147 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -594375 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 168.75-80 chr20 21179315 21179489 + 1.75 NA intron (NM_018474, intron 6 of 12) L1MB1|LINE|L1 38887 NR_109956 101929591 Hs.656066 NR_109956 ENSG00000232712 KIZ-AS1 - KIZ antisense RNA 1 ncRNA 444.75-4 chr2 114509063 114509338 + 1.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 47623 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 344-24 chr7 28040302 28040610 + 1.75 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -140001 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 248.25-51 chr4 56545061 56545232 + 1.75 NA intron (NM_001256475, intron 1 of 8) intron (NM_001256475, intron 1 of 8) 14540 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 349.25-3 chr11 105672384 105672596 + 1.75 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 61784 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 282.75-28 chr3 113282348 113282632 + 1.75 NA intron (NM_001301861, intron 15 of 19) L2|LINE|L2 70374 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 207.25-35 chr2 23999416 23999638 + 1.75 NA intron (NM_181713, intron 6 of 6) AluJo|SINE|Alu -10558 NM_001346880 388931 Hs.407482 NM_001080473 ENSG00000205639 MFSD2B - major facilitator superfamily domain containing 2B protein-coding 332.75-7 chr12 65908218 65908503 + 1.75 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -26035 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 209.75-102 chr8 132905017 132905184 + 1.75 NA intron (NM_003235, intron 16 of 47) MIR|SINE|MIR 38142 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 239-45 chr5 85766616 85766867 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -515703 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 295-30 chr8 132795166 132795425 + 1.75 NA intron (NM_198513, intron 4 of 7) intron (NM_198513, intron 4 of 7) 19907 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 217.75-29 chr16 52091684 52091969 + 1.75 NA intron (NR_104655, intron 1 of 2) intron (NR_104655, intron 1 of 2) 6545 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 459-2 chr15 90403115 90403501 + 1.75 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) intron (NM_003870, intron 2 of 37) 15066 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 166-14 chr10 92013648 92013759 + 1.75 NA exon (NM_003972, exon 31 of 38) exon (NM_003972, exon 31 of 38) 89933 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 332-3 chr11 107312745 107312958 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 144995 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 477.25 chr16 76723410 76723945 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 88679 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 294.75-10 chr18 72646630 72646881 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -102413 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 438.75-8 chr7 97064165 97064534 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -39518 NM_005221 1749 Hs.99348 NM_005221 ENSG00000105880 DLX5 SHFM1D distal-less homeobox 5 protein-coding 197.5-72 chr2 114247533 114247776 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -194987 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 349.25-17 chr7 22690185 22690671 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -24895 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 320-22 chr21 19002019 19002244 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -242319 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 359.75-19 chr7 39282255 39282700 + 1.75 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) L1MA6|LINE|L1 46657 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 426-11 chr5 169880290 169880823 + 1.75 NA intron (NM_001129891, intron 3 of 3) intron (NM_001129891, intron 3 of 3) 99939 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 371.75-9 chr20 13083918 13084245 + 1.75 NA intron (NM_001349945, intron 5 of 12) intron (NM_001349945, intron 5 of 12) 75109 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 182.25-92 chr5 75732353 75732489 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14984 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 256-65 chr7 27693183 27693422 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -30419 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 244.25-30 chr3 30884891 30885176 + 1.75 NA intron (NM_207359, intron 1 of 14) intron (NM_207359, intron 1 of 14) 9628 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 247.25-55 chr6 162407033 162407182 + 1.75 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -320025 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 326.5-12 chr16 8542993 8543273 + 1.75 NA intron (NM_001290098, intron 2 of 2) intron (NM_001290098, intron 2 of 2) 46705 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 279-4 chr1 113058463 113058781 + 1.75 NA intron (NR_103777, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 14480 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 280.5-52 chr8 103516893 103517228 + 1.75 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L2c|LINE|L2 -15150 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 359.25-8 chr4 189125693 189125947 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 349163 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 412.5-4 chr14 60232349 60232642 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -13255 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 376.25-4 chr10 54667381 54667774 + 1.75 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -59620 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 302.25-16 chr2 103445423 103445819 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -461192 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 341.25-6 chr11 4913773 4914148 + 1.75 NA TTS (NM_001005238) TTS (NM_001005238) 1703 NM_001005238 81282 Hs.542302 NM_001005238 ENSG00000176893 OR51G2 OR11-28 olfactory receptor family 51 subfamily G member 2 protein-coding 255.5-90 chr9 73256111 73256360 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 104370 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 125.25-121 chr20 40851332 40851419 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -129338 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 275.5-49 chr4 99380945 99381243 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28348 NR_133005 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 298-10 chr16 11354635 11354905 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 9311 NM_152308 116028 Hs.347524 NM_152308 ENSG00000175643 RMI2 BLAP18|C16orf75 RecQ mediated genome instability 2 protein-coding 248.75-60 chr8 109386556 109386755 + 1.75 NA intron (NM_177531, intron 6 of 77) intron (NM_177531, intron 6 of 77) 24194 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 315.75-25 chr8 77632590 77632873 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 182034 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 387.75-13 chr3 115896754 115897105 + 1.75 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) 8197 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 282.75-22 chr2 207780976 207781311 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11237 NM_003468 7855 Hs.17631 NM_003468 ENSG00000163251 FZD5 C2orf31|HFZ5 frizzled class receptor 5 protein-coding 406.25-4 chr5 14902505 14902844 + 1.75 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 -30896 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 225.75-78 chr9 27868598 27868766 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -294816 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 157.5-195 chr7 109037082 109037207 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -152557 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 183.25-29 chr13 66021245 66021466 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -54926 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 456.25 chr1 167538860 167539203 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 14731 NM_003851 8804 Hs.5710 NM_003851 ENSG00000143162 CREG1 CREG cellular repressor of E1A stimulated genes 1 protein-coding 218-7 chr1 185347681 185347854 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12728 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 314.75-23 chr9 38035192 38035468 + 1.75 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 33897 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 547-2 chr14 66931512 66932100 + 1.75 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) L1MA3|LINE|L1 -257634 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 225.25-91 chr9 72009702 72009904 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 50802 NM_001128618 138240 Hs.371235 NM_001128618 ENSG00000204669 C9orf57 - chromosome 9 open reading frame 57 protein-coding 401-2 chr1 41841677 41842117 + 1.75 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 77025 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 331-18 chr2 132705301 132705625 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 17 of 17) L2-3_Crp|LINE|L2 -33937 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 309.75 chr1 5402344 5402682 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 460228 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 369.75 chr1 168950732 168950994 + 1.75 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) intron (NR_104091, intron 3 of 4) 136142 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 300-12 chr12 30516702 30517034 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 160376 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 158.5-42 chr11 76527570 76527686 + 1.75 NA intron (NM_001300942, intron 14 of 21) intron (NM_001300942, intron 14 of 21) 82603 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 148.25-7 chr1 111980995 111981115 + 1.75 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 8100 NM_004980 3752 Hs.666367 NM_004980 ENSG00000171385 KCND3 BRGDA9|KCND3L|KCND3S|KSHIVB|KV4.3|SCA19|SCA22 potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 protein-coding 338.25-33 chr8 138718137 138718444 + 1.75 NA intron (NM_152888, intron 27 of 64) intron (NM_152888, intron 27 of 64) 195751 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 200.75-35 chr15 95192378 95192616 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 134603 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 315.75-20 chr4 25449560 25449888 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 72461 NM_013367 29945 Hs.152173 NM_013367 ENSG00000053900 ANAPC4 APC4 anaphase promoting complex subunit 4 protein-coding 300-42 chr8 121866200 121866493 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -224906 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 346.25-17 chr8 57361497 57361833 + 1.75 NA intron (NR_125818, intron 8 of 8) intron (NR_125818, intron 8 of 8) 17878 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 283.5-6 chr10 53205224 53205572 + 1.75 NA Intergenic MST-int|LTR|ERVL-MaLR -433698 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 270-35 chr3 30273170 30273643 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -245462 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 298.5-41 chr8 86123429 86123707 + 1.75 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) L2|LINE|L2 24658 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 332.75-10 chr15 35943832 35944122 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 17121 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 348.5-17 chr4 169139873 169140258 + 1.75 NA intron (NM_020870, intron 4 of 11) intron (NM_020870, intron 4 of 11) -129810 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 306.75-21 chr6 103935343 103935559 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 924095 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 275.75 chr1 53958017 53958237 + 1.75 NA intron (NM_001256409, intron 3 of 8) intron (NM_001256409, intron 3 of 8) 11777 NM_052940 115353 Hs.40094 NM_052940 ENSG00000116212 LRRC42 dJ167A19.4 leucine rich repeat containing 42 protein-coding 257-33 chr22 26324157 26324381 + 1.75 NA intron (NM_001184776, intron 9 of 14) intron (NM_001184776, intron 9 of 14) -104991 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 231-80 chr8 103887489 103887624 + 1.75 NA intron (NM_001282881, intron 2 of 20) intron (NM_001282881, intron 2 of 20) 68336 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 480.25-2 chr15 59460463 59460922 + 1.75 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) X6A_LINE|LINE|CR1 22506 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 268.5-56 chr6 155766293 155766533 + 1.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -180384 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 320-19 chr2 135207598 135207884 + 1.75 NA exon (NM_032143, exon 19 of 21) exon (NM_032143, exon 19 of 21) 71113 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 279.75-49 chr6 123826970 123827174 + 1.75 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L1MB3|LINE|L1 23207 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 300-9 chr10 74832304 74832501 + 1.75 NA intron (NM_001370142, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 5802 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 228.75-80 chr8 90551472 90551775 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 54440 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 188.5-78 chr2 139074410 139074553 + 1.75 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 177157 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 280.75-35 chr5 96296752 96297041 + 1.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 135263 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 262-36 chr22 34608272 34608534 + 1.75 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie 389513 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 378.25-12 chr7 19254302 19254530 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -108995 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 333.25-7 chr2 103838818 103839162 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 569342 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 196.75-65 chr20 22110675 22110933 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 56714 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 262.5-4 chr1 79325380 79325623 + 1.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -318771 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 334.75-18 chr21 25358113 25358367 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 73461 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 233.5-109 chr8 117338924 117339135 + 1.75 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -181684 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 225-54 chr4 183081554 183081694 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 17575 NR_024008 152641 Hs.745108 NM_153008 ENSG00000251359 WWC2-AS2 C4orf38 WWC2 antisense RNA 2 ncRNA 347-7 chr13 31149105 31149379 + 1.75 NA intron (NM_006644, intron 8 of 17) intron (NM_006644, intron 8 of 17) 12662 NM_006644 10808 Hs.743267 NM_006644 ENSG00000120694 HSPH1 HSP105|HSP105A|HSP105B|NY-CO-25 heat shock protein family H (Hsp110) member 1 protein-coding 504.75-3 chr3 86185925 86186363 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -295799 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 333.5-3 chr10 80430444 80430791 + 1.75 NA intron (NM_001243782, intron 5 of 5) AluJo|SINE|Alu 16784 NM_001243782 84293 Hs.500333 NM_032333 ENSG00000122378 PRXL2A Adrx|C10orf58|FAM213A|PAMM peroxiredoxin like 2A protein-coding 353.75-15 chr5 33207652 33207897 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -21961 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 339-2 chr1 213255349 213255656 + 1.75 NA intron (NM_001136138, intron 11 of 13) intron (NM_001136138, intron 11 of 13) 204261 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 308.25-11 chr17 29839624 29840020 + 1.75 NA intron (NM_033389, intron 1 of 14) intron (NM_033389, intron 1 of 14) -78390 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 179.25-12 chr1 229940580 229940762 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -46763 NR_146475 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 310.5-37 chr8 43212789 43213004 + 1.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72432 NM_001363229 138050 Hs.600384 NM_152419 ENSG00000165102 HGSNAT HGNAT|MPS3C|RP73|TMEM76 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase protein-coding 427-2 chr1 226916216 226916684 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -23844 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 366.5-4 chr10 109005945 109006277 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 917135 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 379.25-12 chr4 76134109 76134487 + 1.75 NA non-coding (NR_103781, exon 4 of 10) non-coding (NR_103781, exon 4 of 10) 14099 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 309-10 chr11 127820316 127820690 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -388263 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 367.25-9 chr8 137172815 137173279 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 240541 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 374-6 chr15 46318279 46318533 + 1.75 NA Intergenic (TTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 613211 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 214.75-83 chr8 37165519 37165728 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 328290 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 471-2 chr11 90294212 90294580 + 1.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 43164 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 304.5-4 chr10 43151580 43151992 + 1.75 NA intron (NM_018590, intron 1 of 7) L1MEc|LINE|L1 -3111 NM_001319656 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 279.5-6 chr10 35115574 35115839 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11135 NM_001881 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 329.75 chr1 164518102 164518418 + 1.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -41100 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 504 chr13 70936660 70937122 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -78250 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 406-10 chr5 132679563 132679939 + 1.75 NA exon (NM_001354990, exon 4 of 5) exon (NM_001354990, exon 4 of 5) 2878 NR_134248 105379176 Hs.73917 NR_134248 LOC105379176 - uncharacterized LOC105379176 ncRNA 429-6 chr6 67446546 67446939 + 1.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -608609 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 274.5-9 chr10 119810695 119810946 + 1.75 NA intron (NM_014937, intron 14 of 19) intron (NM_014937, intron 14 of 19) -8437 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 288.75-21 chr17 58111794 58112159 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 28557 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 371.5-2 chr10 118298883 118299242 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001134672, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001134672, exon 8 of 8) 43262 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 170.25-137 chr6 40281408 40281624 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 74490 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 289.25-33 chr9 37170395 37170633 + 1.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) MER117|DNA|hAT-Charlie 49916 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 297.75-22 chr20 8058313 8058725 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -38758 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 392.25-16 chr8 104540190 104540634 + 1.75 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) intron (NM_013437, intron 1 of 6) 48612 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 150.25-50 chr14 47572798 47572955 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 102078 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 509.5-3 chr21 34971607 34972088 + 1.75 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) intron (NM_001754, intron 2 of 8) 67579 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 309-48 chr8 29924971 29925186 + 1.75 NA intron (NR_024473, intron 2 of 2) L1PB2|LINE|L1 3565 NR_024473 286135 Hs.376840 NR_024473 ENSG00000253279 LINC02209 FAM183CP long intergenic non-protein coding RNA 2209 ncRNA 223.5-92 chr4 158728000 158728201 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4704 NM_005038 5481 Hs.183958 NM_005038 ENSG00000171497 PPID CYP-40|CYPD peptidylprolyl isomerase D protein-coding 319-24 chr3 142162402 142162734 + 1.75 NA non-coding (NR_033289, exon 17 of 17) non-coding (NR_033289, exon 17 of 17) -13024 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 183.25-89 chr6 39623318 39623458 + 1.75 NA intron (NM_001289020, intron 5 of 21) L1M5|LINE|L1 102020 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 262-47 chr6 9370357 9370540 + 1.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 718239 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 241.75-80 chrX 155674428 155674654 + 1.75 NA intron (NM_001304990, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 -61589 NM_001184797 55217 Hs.133321 NM_018196 ENSG00000185973 TMLHE AUTSX6|BBOX2|TMLD|TMLH|TMLHED|XAP130 trimethyllysine hydroxylase, epsilon protein-coding 308.5-33 chr6 156441174 156441717 + 1.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 62695 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 411.25 chr1 105035145 105035484 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 583621 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 204-81 chr8 113169308 113169643 + 1.75 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 207677 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 241.5-19 chr13 64445351 64445540 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -369434 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 332.25-9 chr14 53735649 53735939 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 212690 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 402.25-7 chr4 58655693 58656155 + 1.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -119596 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 344.75-13 chr5 62628285 62628648 + 1.75 NA non-coding (NR_073584, exon 4 of 4) non-coding (NR_073584, exon 4 of 4) 49647 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 165.25-134 chr7 34372444 34372544 + 1.75 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) intron (NR_033665, intron 3 of 3) -285724 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 323.25-12 chr2 63648955 63649173 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 59913 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 340.25-11 chr2 241178852 241179236 + 1.75 NA intron (NM_001282413, intron 8 of 8) intron (NM_001282413, intron 8 of 8) -9633 NM_001370694 50636 Hs.163909 NM_001001666 ENSG00000146205 ANO7 D-TMPP|DTMPP|IPCA-5|IPCA5|NGEP|PCANAP5|PCANAP5L|TMEM16G anoctamin 7 protein-coding 508.75-3 chr2 191912240 191912656 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -65360 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 460.75-4 chr5 26001022 26001494 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 810305 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 244.5-48 chr2 49997203 49997383 + 1.75 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -23090 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 229.5-65 chr2 101772727 101772928 + 1.75 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 75120 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 237.25-5 chr1 76145518 76145764 + 1.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 70895 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 321.5-16 chr2 30028248 30028534 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -106805 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 359.25-5 chr21 32328477 32328775 + 1.75 NA intron (NM_014825, intron 30 of 38) intron (NM_014825, intron 30 of 38) 36813 NM_001285394 56246 Hs.584940 NM_178817 ENSG00000170262 MRAP B27|C21orf61|FALP|FGD2|GCCD2 melanocortin 2 receptor accessory protein protein-coding 259.25-50 chr9 13668998 13669197 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -237768 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 197.5-91 chr3 18107228 18107380 + 1.75 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie 144752 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 218.75-86 chr8 79273893 79274108 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -58188 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 267.5-21 chr14 44181366 44181784 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 325708 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 158.5-162 chr5 168605782 168605931 + 1.75 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -26488 NM_024594 79646 Hs.388400 NM_024594 ENSG00000120137 PANK3 - pantothenate kinase 3 protein-coding 205.25-92 chr6 45231660 45231933 + 1.75 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1M2|LINE|L1 -34026 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 248.75-63 chr9 75383166 75383400 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 294769 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 214.75-52 chr3 66972912 66973129 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25287 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 408.75-7 chr5 36742596 36743007 + 1.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 133893 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 269.75-13 chr10 85651646 85651807 + 1.75 NA intron (NM_017551, intron 12 of 15) intron (NM_017551, intron 12 of 15) 73995 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 228-87 chr8 139415263 139415488 + 1.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 287748 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 504.5-4 chr6 124552524 124553035 + 1.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 269774 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 541.5-3 chr14 62486414 62487099 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -346783 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 501.25-3 chr3 118808131 118808618 + 1.75 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 2459 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 464.25-3 chr2 118887445 118887957 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -39518 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 314-22 chr7 100121294 100121623 + 1.75 NA intron (NM_152755, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu -1600 NM_001190415 6878 Hs.489309 NM_005641 ENSG00000106290 TAF6 ALYUS|MGC:8964|TAF(II)70|TAF(II)80|TAF2E|TAFII-70|TAFII-80|TAFII70|TAFII80|TAFII85 TATA-box binding protein associated factor 6 protein-coding 442-5 chr4 76293137 76293577 + 1.75 NA intron (NM_001242939, intron 6 of 6) ERVL-E-int|LTR|ERVL -12669 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 376-19 chr6 168147170 168147480 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -65768 NR_110312 79981 Hs.266746 NM_024919 ENSG00000153303 FRMD1 bA164L23.1 FERM domain containing 1 protein-coding 343-33 chr8 111966094 111966323 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 589569 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 357.75-2 chr1 181286461 181286838 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 50261 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 437-8 chr3 88554065 88554372 + 1.75 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 215762 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 260.5-57 chr6 134313136 134313365 + 1.75 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 4808 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 250.75-60 chr7 1250904 1251196 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 18178 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 188.5-110 chr4 47510671 47510796 + 1.75 NA intron (NM_020453, intron 1 of 22) intron (NM_020453, intron 1 of 22) 25458 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 340.5-20 chr3 33521149 33521468 + 1.75 NA intron (NM_001365634, intron 31 of 35) L1MC4|LINE|L1 -80903 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 290-26 chr2 123867346 123867531 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 157736 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 362.75-4 chr2 101499936 101500262 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -24987 NM_001367509 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 212.5-38 chr17 42399955 42400151 + 1.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -11558 NM_139276 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 305.5-51 chr9 29542432 29542635 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -328932 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 359.75-15 chr3 24313752 24314036 + 1.75 NA intron (NM_001354710, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 162570 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 264.25-10 chr11 111570902 111571354 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 30620 NM_001258390 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 231.5-63 chr3 74864467 74864696 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -343441 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 293.25-2 chr10 60619563 60619833 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) MIRc|SINE|MIR -46742 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 324.75-20 chr3 160475061 160475383 + 1.75 NA intron (NR_148403, intron 1 of 20) intron (NR_148403, intron 1 of 20) 10525 NR_148403 100174949 NR_148401 ENSG00000248710 TRIM59-IFT80 IFT80-L TRIM59-IFT80 protein ncRNA 355.75-9 chr2 129267338 129267632 + 1.75 NA intron (NR_122042, intron 1 of 3) L1MA9|LINE|L1 6406 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 400-7 chr18 21043527 21043820 + 1.75 NA intron (NM_005406, intron 6 of 32) intron (NM_005406, intron 6 of 32) 68140 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 198.75-79 chr5 149526893 149527047 + 1.75 NA intron (NM_001271742, intron 1 of 9) intron (NM_001271742, intron 1 of 9) 23395 NM_001271742 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 234.75-20 chr14 48648410 48648620 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -853501 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 245.25-26 chr17 80747547 80747738 + 1.75 NA intron (NM_020761, intron 5 of 33) intron (NM_020761, intron 5 of 33) 57990 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 361.5-28 chr8 131854484 131854847 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -49428 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 181.5-30 chr12 24474000 24474255 + 1.75 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 88364 NM_152989 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 340-17 chr5 150019033 150019414 + 1.75 NA intron (NM_014983, intron 6 of 19) intron (NM_014983, intron 6 of 19) 18484 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 360.25-15 chr6 145175310 145175655 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 511395 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 236.25-82 chr7 107581929 107582167 + 1.75 NA intron (NR_163927, intron 2 of 6) intron (NR_163927, intron 2 of 6) 1802 NM_001371354 150.5-77 chr18 74337697 74337797 + 1.75 NA intron (NM_001174123, intron 7 of 13) intron (NM_001174123, intron 7 of 13) 21908 NM_001174123 644041 Hs.465414 NM_001174123 ENSG00000206043 C18orf63 DKFZP781G0119 chromosome 18 open reading frame 63 protein-coding 261.75-55 chr8 144990524 144990837 + 1.75 NA intron (NR_023392, intron 4 of 4) L1PA8|LINE|L1 -4185 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 209.75-39 chr18 25618085 25618282 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -266017 NM_001308225 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 601.25 chr4 94365806 94366484 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -23309 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 199.5 chr1 40262630 40262878 + 1.75 NA intron (NM_005857, intron 2 of 9) intron (NM_005857, intron 2 of 9) 4518 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 230.5-117 chr8 125821093 125821295 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 130003 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 721.25 chr1 157072081 157073061 + 1.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -26829 NM_014784 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 487.5-4 chr13 57942273 57942630 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -223376 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 427.5-2 chr12 45952114 45952489 + 1.75 NA intron (NM_004719, intron 3 of 14) L1ME4b|LINE|L1 38273 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 254.25-56 chr6 140674734 140674925 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8985 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 255-63 chr8 117204824 117205136 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 69985 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 179.5-62 chr14 97530607 97530756 + 1.75 NA intron (NR_110166, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 71865 NR_110165 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 281.25-45 chr8 112686287 112686544 + 1.75 NA intron (NM_001363185, intron 12 of 66) intron (NM_001363185, intron 12 of 66) 42922 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 265-32 chr5 23834477 23834683 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -116768 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 430-18 chr8 119914641 119915048 + 1.75 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) MER5A|DNA|hAT-Charlie 41122 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 330.75-2 chr1 84129612 84129957 + 1.75 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) L1MEf|LINE|L1 -14487 NM_182948 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 405-11 chr22 34849414 34849966 + 1.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L1MD2|LINE|L1 148226 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 343-2 chr1 229054528 229054924 + 1.75 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 120075 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 222.75-97 chr8 87312554 87312684 + 1.75 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) intron (NM_173538, intron 8 of 10) 446204 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 281.25-7 chr10 52283616 52283836 + 1.75 NA intron (NM_001098512, intron 14 of 17) intron (NM_001098512, intron 14 of 17) 30402 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 259.5-54 chr2 48157779 48158053 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -156766 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 373.75 chr1 31645041 31645473 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001359651) promoter-TSS (NM_001359651) -381 NM_012392 553115 Hs.470417 NM_012392 ENSG00000162517 PEF1 ABP32|PEF1A penta-EF-hand domain containing 1 protein-coding 285.75-2 chr1 111582079 111582394 + 1.75 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 -18233 NM_001081976 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 330.5-34 chr9 18152718 18153134 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -321227 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 262.5-47 chr3 81721967 81722148 + 1.75 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) intron (NM_000158, intron 1 of 15) 39588 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 174.75-128 chr8 116021461 116021597 + 1.75 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 303530 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 400-9 chr3 51061748 51062001 + 1.75 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L2a|LINE|L2 -323417 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 431.5-2 chr2 211376346 211376714 + 1.75 NA 3' UTR (NM_005235, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_005235, exon 28 of 28) 758959 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 151.25-25 chr10 107340516 107340638 + 1.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -175871 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 334.25-7 chr14 20635599 20636047 + 1.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 5868 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 194.25-65 chr2 217282045 217282172 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_133642) promoter-TSS (NR_133642) -625 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 372.5-19 chr6 137018087 137018422 + 1.75 NA intron (NM_001278724, intron 1 of 5) intron (NM_001278724, intron 1 of 5) -25023 NR_027994 100294720 Hs.520412 NR_027994 ENSG00000225391 NHEG1 - neuroblastoma highly expressed 1 ncRNA 340.5-7 chr11 11858491 11858784 + 1.75 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) L1ME1|LINE|L1 17214 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 233.75-69 chr6 112024142 112024405 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29802 NM_003880 8838 Hs.558428 NM_003880 ENSG00000112761 CCN6 LIBC|PPAC|PPD|WISP-3|WISP3 cellular communication network factor 6 protein-coding 144.25-185 chr7 29473773 29473863 + 1.75 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) MIR3|SINE|MIR -5894 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 184.5-10 chr1 116450326 116450569 + 1.75 NA intron (NR_125972, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 28379 NR_125973 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 369-13 chr6 71467976 71468209 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 47065 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 345-2 chr10 101957210 101957485 + 1.75 NA intron (NM_024541, intron 21 of 25) intron (NM_024541, intron 21 of 25) 98826 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 309.5-23 chr2 188727934 188728145 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 62084 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 165.25-37 chr12 80427222 80427333 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16958 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 333.75-3 chr10 111752094 111752501 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 431468 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 147.75-59 chr18 69590117 69590240 + 1.75 NA intron (NM_152721, intron 2 of 7) intron (NM_152721, intron 2 of 7) 120247 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 341.5-9 chr16 77410733 77411043 + 1.75 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 24146 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 238.25-62 chr4 156555675 156555900 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 416012 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 460.75 chr10 30573952 30574256 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 55649 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 423.75-7 chr3 18054461 18054895 + 1.75 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) L1PA16|LINE|L1 92126 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 240.25-48 chr4 95732081 95732288 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -107909 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 158.5-158 chr5 126426860 126426984 + 1.75 NA intron (NR_146196, intron 1 of 14) intron (NR_146196, intron 1 of 14) 3513 NM_001349542 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 248.5-20 chr13 47826350 47826498 + 1.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 106198 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 259.25-42 chr7 52880640 52880863 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -154882 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 453.25-6 chr8 127552529 127552989 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -70620 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 269.25-37 chr5 40606809 40607092 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -72965 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 147.75-35 chr14 35011690 35011816 + 1.75 NA intron (NM_003136, intron 8 of 15) intron (NM_003136, intron 8 of 15) 28761 NM_003136 6729 Hs.167535 NM_003136 ENSG00000100883 SRP54 - signal recognition particle 54 protein-coding 231.75-31 chr2 4252419 4252571 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 278334 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 203.25-22 chr11 43835566 43835892 + 1.75 NA intron (NM_016142, intron 7 of 10) intron (NM_016142, intron 7 of 10) -45102 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 148.5-100 chr2 58641703 58642013 + 1.75 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 121105 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 198.25-5 chr1 181862811 181863094 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 198760 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 358.75-10 chr3 108281022 108281375 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -15292 NM_001282556 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 358-13 chr8 138204039 138204565 + 1.75 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) intron (NM_015912, intron 7 of 19) -120757 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 365.75-17 chr7 46418935 46419239 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 278035 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 255.25 chr1 61086724 61086946 + 1.75 NA intron (NM_001134673, intron 1 of 10) intron (NM_001134673, intron 1 of 10) 4274 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 192.25-35 chr17 66313430 66313731 + 1.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 10967 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 201-46 chr2 165757211 165757411 + 1.75 NA intron (NM_004482, intron 6 of 10) intron (NM_004482, intron 6 of 10) 36936 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 142.25-176 chr9 73182911 73183013 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 31097 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 256.5-86 chr9 82127215 82127481 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 138576 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 304.75-35 chr9 31660912 31661134 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -279533 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 286-8 chr11 110128734 110129126 + 1.75 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) intron (NM_033390, intron 1 of 5) 35538 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 320.5-13 chr15 79422725 79423075 + 1.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -9616 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 290-49 chr8 119629881 119630104 + 1.75 NA intron (NM_001330600, intron 2 of 25) intron (NM_001330600, intron 2 of 25) 8847 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 306.5-16 chr15 74453323 74453525 + 1.75 NA intron (NM_032907, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 7736 NM_032907 84993 Hs.334713 NM_032907 ENSG00000138629 UBL7 BMSC-UbP|TCBA1 ubiquitin like 7 protein-coding 214.75-45 chr2 232214373 232214529 + 1.75 NA intron (NR_046477, intron 9 of 18) L3|LINE|CR1 41798 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 439.25-10 chr8 138069348 138069843 + 1.75 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) intron (NR_161374, intron 1 of 7) 13950 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 360.25-2 chr10 96833896 96834527 + 1.75 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) intron (NM_001170766, intron 2 of 8) 1266 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 283.5-31 chr2 187998656 187998955 + 1.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 288886 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 380.25-3 chr17 35026884 35027205 + 1.75 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 36663 NM_001017368 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 283.75-14 chr2 14343122 14343386 + 1.75 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) L1MA9|LINE|L1 57704 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 273.75-50 chrX 53469596 53469824 + 1.75 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -35334 NM_001037811 3028 Hs.171280 NM_004493 ENSG00000072506 HSD17B10 17b-HSD10|ABAD|CAMR|DUPXp11.22|ERAB|HADH2|HCD2|HSD10MD|MHBD|MRPP2|MRX17|MRX31|MRXS10|SCHAD|SDR5C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 10 protein-coding 320-16 chr2 98413491 98413766 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -30959 NM_001351424 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 222-45 chr20 48371430 48371701 + 1.75 NA TTS (NR_026958) TTS (NR_026958) 11654 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 255.25-43 chr5 168109664 168109875 + 1.75 NA intron (NM_001368145, intron 8 of 26) intron (NM_001368145, intron 8 of 26) -56076 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 169-96 chr7 19691000 19691133 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 14370 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 193.75-96 chr4 115422043 115422220 + 1.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -308511 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 133.75-98 chr2 104460264 104460398 + 1.75 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 25984 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 373.5-5 chr14 84516528 84516797 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -755270 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 303.5-46 chr7 39671548 39671774 + 1.75 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) intron (NM_005402, intron 1 of 4) 48089 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 399.75-4 chr11 57229217 57229546 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 7869 NR_027991 187 Hs.438311 NM_005161 ENSG00000134817 APLNR AGTRL1|APJ|APJR|HG11 apelin receptor protein-coding 123.75-143 chr5 35147884 35148072 + 1.75 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29856 NM_001204317 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 353.5-11 chr21 22772718 22773029 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -306411 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 330.5-26 chr5 131536832 131537148 + 1.75 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 98239 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 546.5-3 chr7 15824579 15825095 + 1.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 136459 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 228.5-5 chr1 59125867 59126047 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 20850 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 136.25-86 chr18 3937586 3937667 + 1.75 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -24727 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 354-3 chr1 223125973 223126236 + 1.75 NA intron (NM_003268, intron 5 of 5) L1MB3|LINE|L1 17144 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 196.75-111 chr8 140374668 140374850 + 1.75 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) intron (NM_001160372, intron 7 of 22) 82985 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 305.5-11 chr11 58879526 58879874 + 1.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -25698 NM_001354699 92292 Hs.38085 NM_080661 ENSG00000166840 GLYATL1 GATF-C|GNAT glycine-N-acyltransferase like 1 protein-coding 339-23 chr5 10910289 10910651 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -149236 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 216.5-5 chr1 186645990 186646223 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 34317 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 289.25-31 chr9 1152653 1152899 + 1.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 101289 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 331-23 chr4 30985753 30985968 + 1.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) MIR3|SINE|MIR -185284 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 294.75-14 chr2 77424606 77424784 + 1.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 97681 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 429.25-2 chr16 57157416 57157701 + 1.75 NA intron (NM_001354088, intron 7 of 7) L1ME4b|LINE|L1 24992 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 279-38 chr5 150199630 150199854 + 1.75 NA intron (NM_014228, intron 5 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 9680 NM_014228 6534 Hs.241597 NM_014228 ENSG00000011083 SLC6A7 PROT solute carrier family 6 member 7 protein-coding 308.75-12 chr12 69370790 69371047 + 1.75 NA exon (NM_006530, exon 6 of 7) exon (NM_006530, exon 6 of 7) 11175 NM_006530 8089 Hs.4029 NM_006530 ENSG00000127337 YEATS4 4930573H17Rik|B230215M10Rik|GAS41|NUBI-1|YAF9 YEATS domain containing 4 protein-coding 482.5-8 chr7 94442949 94443288 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 48557 NM_000089 1278 Hs.489142 NM_000089 ENSG00000164692 COL1A2 EDSARTH2|EDSCV|OI4 collagen type I alpha 2 chain protein-coding 336.25-11 chr2 77693103 77693332 + 1.75 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -170784 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 173-36 chr12 82456068 82456185 + 1.75 NA intron (NM_001347934, intron 9 of 12) intron (NM_001347934, intron 9 of 12) -97321 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 156-101 chr3 99203529 99203725 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -301932 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 197.75-81 chr6 151820496 151820678 + 1.75 NA intron (NM_001328100, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 11480 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 384.75-6 chr2 42929513 42929902 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 109836 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 248.75-64 chr9 90844811 90844989 + 1.75 NA intron (NM_001174167, intron 2 of 13) L1ME4b|LINE|L1 17480 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 209.5-12 chr10 15944841 15945069 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -84422 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 342.5-29 chr7 105467428 105467690 + 1.75 NA intron (NM_001318164, intron 12 of 15) AluY|SINE|Alu 40961 NM_001318163 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 223.75-54 chr20 23113747 23113996 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 18765 NR_034149 200261 Hs.352228 NM_182535 ENSG00000233746 LINC00656 - long intergenic non-protein coding RNA 656 ncRNA 156.25-133 chr6 94221109 94221229 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 502866 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 354-9 chr16 68822665 68823017 + 1.75 NA intron (NM_001317185, intron 12 of 15) intron (NM_001317185, intron 12 of 15) -20690 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 184.5-49 chr15 68800320 68800466 + 1.75 NA intron (NM_006305, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 1532 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 305 chr1 238120313 238120496 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -229482 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 456 chr1 154543236 154543634 + 1.75 NA intron (NM_182499, intron 8 of 12) intron (NM_182499, intron 8 of 12) -10174 NR_046668 100874097 NR_046668 ENSG00000229780 UBE2Q1-AS1 - UBE2Q1 antisense RNA 1 ncRNA 503.75 chr21 21784257 21784778 + 1.75 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) intron (NR_109958, intron 2 of 4) 37532 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 149-41 chr15 88597468 88597560 + 1.75 NA intron (NR_120370, intron 2 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 7089 NR_120369 101929743 Hs.558810 NR_120369 ENSG00000249487 LINC01586 - long intergenic non-protein coding RNA 1586 ncRNA 286.25-31 chr8 118368586 118368975 + 1.75 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) intron (NM_001363274, intron 4 of 4) -252221 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 233.75-61 chr5 8832817 8832987 + 1.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -6830 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 227.5-95 chr7 98604366 98604537 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -12834 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 282.5-13 chr11 116276425 116276588 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -362916 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 333.75-22 chr5 143741596 143741936 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 61906 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 323.5-31 chr8 88060496 88060948 + 1.75 NA intron (NM_005941, intron 7 of 9) L2c|LINE|L2 -186707 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 349.75-2 chr10 73072549 73073144 + 1.75 NA intron (NM_001017962, intron 3 of 14) intron (NM_001017962, intron 3 of 14) 24128 NM_001142596 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 609 chr8 117804211 117805041 + 1.75 NA intron (NM_000127, intron 10 of 10) intron (NM_000127, intron 10 of 10) 116287 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 294.5-36 chr4 58666588 58667000 + 1.75 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -130466 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 292-12 chr12 112031142 112031506 + 1.75 NA intron (NM_024953, intron 23 of 23) intron (NM_024953, intron 23 of 23) 6391 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 363.75-10 chr2 229797567 229797965 + 1.75 NA exon (NM_001284215, exon 23 of 41) exon (NM_001284215, exon 23 of 41) -83211 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 153.5-196 chr8 62381415 62381586 + 1.75 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 132646 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 181.5-26 chr11 116551711 116551910 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -87612 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 276-44 chr7 47220620 47220957 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 244015 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 231.25-2 chr1 69964589 69964841 + 1.75 NA intron (NM_001370785, intron 8 of 26) L3|LINE|CR1 45393 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 273.25-4 chr1 238454505 238454919 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 31305 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 428.75-10 chr8 135733790 135734221 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 276549 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 199.25-20 chr12 39577055 39577301 + 1.75 NA intron (NM_005164, intron 8 of 9) (AGATAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 42625 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 213.75-88 chr5 43661178 43661389 + 1.75 NA intron (NM_012343, intron 17 of 21) intron (NM_012343, intron 17 of 21) -58053 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 343.25-16 chr6 87359729 87359939 + 1.75 NA intron (NM_001010868, intron 4 of 4) intron (NM_001010868, intron 4 of 4) 15021 NM_001010868 206412 Hs.646309 NM_001010868 ENSG00000203872 C6orf163 - chromosome 6 open reading frame 163 protein-coding 331-16 chr2 51346788 51347023 + 1.75 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) L1ME1|LINE|L1 314304 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 181.25-9 chr1 150396429 150396607 + 1.75 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) L1PB1|LINE|L1 32407 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 223.25-56 chr4 47424353 47424641 + 1.75 NA intron (NM_000812, intron 8 of 8) intron (NM_000812, intron 8 of 8) 39205 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 247.5-77 chr7 33083254 33083418 + 1.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -20539 NM_001002009 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 267.75-46 chr5 58710031 58710279 + 1.75 NA intron (NM_138453, intron 2 of 4) intron (NM_138453, intron 2 of 4) 127080 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 312.25-7 chr14 66168291 66168564 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -317944 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 405.75-13 chr9 103365138 103365530 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -40301 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 321-15 chr20 52755787 52756108 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 135109 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 438-10 chr9 37812056 37812309 + 1.75 NA intron (NM_024345, intron 1 of 6) L1MEg|LINE|L1 11385 NM_024345 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 403-4 chr2 73521609 73521937 + 1.75 NA intron (NM_015120, intron 11 of 22) intron (NM_015120, intron 11 of 22) 64670 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 286.75-25 chr20 18546357 18546671 + 1.75 NA intron (NM_032986, intron 15 of 19) intron (NM_032986, intron 15 of 19) -20906 NM_001348958 388789 Hs.349092 NM_001348957 ENSG00000232388 SMIM26 LINC00493 small integral membrane protein 26 protein-coding 383-10 chr2 86010444 86010835 + 1.75 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR 95247 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 276.75-9 chr13 68680556 68680788 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 204653 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 132.75-154 chr5 91401991 91402124 + 1.75 NA intron (NR_027435, intron 1 of 2) intron (NR_027435, intron 1 of 2) -18740 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 317-33 chr8 77962913 77963271 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 512395 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 281-33 chr6 55723332 55723734 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -144319 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 177.75-98 chr22 36404539 36404685 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16545 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 265.75-12 chr12 24596815 24597043 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12761 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 244.25-51 chr8 102216117 102216272 + 1.75 NA intron (NM_001172477, intron 6 of 8) L1ME4a|LINE|L1 22637 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 321.25-19 chr5 129618190 129618527 + 1.75 NA intron (NM_133638, intron 8 of 22) intron (NM_133638, intron 8 of 22) -129736 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 348.5-14 chr4 99589038 99589299 + 1.75 NA intron (NM_001300785, intron 3 of 17) intron (NM_001300785, intron 3 of 17) 25090 NM_001300785 4547 Hs.195799 NM_000253 ENSG00000138823 MTTP ABL|MTP microsomal triglyceride transfer protein protein-coding 260-35 chr5 81673832 81674021 + 1.75 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 77327 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 304.5-28 chr5 75665149 75665447 + 1.75 NA intron (NM_001276713, intron 11 of 13) intron (NM_001276713, intron 11 of 13) 47157 NM_152408 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 173.5-158 chr8 32795329 32795511 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 73585 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 213.75-81 chr4 155405729 155405868 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28833 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 248.5-44 chr19 43671242 43671475 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1012 NM_001005376 5329 Hs.466871 NM_002659 ENSG00000011422 PLAUR CD87|U-PAR|UPAR|URKR plasminogen activator, urokinase receptor protein-coding 169-58 chr21 27825590 27825700 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 103266 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 280-58 chr7 98144415 98144628 + 1.75 NA intron (NM_014916, intron 3 of 13) intron (NM_014916, intron 3 of 13) 37659 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 410.25-5 chr18 3991800 3992170 + 1.75 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 29632 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 224.5-113 chr8 136667393 136667671 + 1.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR 136734 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 331-14 chr19 33912819 33913042 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 116060 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 357-4 chr14 62671448 62671763 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 373853 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 117.25-68 chr14 53273079 53273172 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 119771 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 468.25-2 chr11 69458172 69458584 + 1.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -27183 NR_120545 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 210.25-29 chr16 83307939 83308195 + 1.75 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) intron (NM_001220489, intron 4 of 12) -200279 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 385 chr1 92399832 92400242 + 1.75 NA 3' UTR (NM_024813, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_024813, exon 13 of 13) 83917 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 325.5-35 chr6 124280591 124280835 + 1.75 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -2292 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 230.25-26 chr14 78891721 78891979 + 1.75 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -308132 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 469.25-2 chr13 92377879 92378449 + 1.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -25957 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 305.25-12 chr12 48940560 48940806 + 1.75 NA intron (NM_001659, intron 2 of 4) intron (NM_001659, intron 2 of 4) -15136 NM_001143782 51303 Hs.655103 NM_016594 ENSG00000134285 FKBP11 FKBP19 FKBP prolyl isomerase 11 protein-coding 142.75-98 chr2 76105446 76105545 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -394580 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 239.25-45 chr2 37202858 37203026 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001322373, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001322373, exon 6 of 6) 6446 NM_001322376 100505876 Hs.666958 NM_001322373 ENSG00000218739 CEBPZOS CEBPZ-AS1 CEBPZ opposite strand protein-coding 257.5-8 chr10 87106239 87106392 + 1.75 NA intron (NM_001330112, intron 2 of 9) intron (NM_001330112, intron 2 of 9) 11109 NM_019054 54537 Hs.500419 NM_019054 ENSG00000122376 SHLD2 FAM35A|FAM35A1|RINN2|bA163M19.1 shieldin complex subunit 2 protein-coding 217.25-4 chr1 87026242 87026481 + 1.75 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) intron (NM_012262, intron 1 of 6) -103404 NR_026988 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 255.5-14 chr11 79963779 79963962 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -522840 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 145-154 chr8 71285199 71285377 + 1.75 NA intron (NM_001370336, intron 10 of 17) intron (NM_001370336, intron 10 of 17) 71418 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 163-38 chr14 64908137 64908245 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6170 NM_001204064 91612 Hs.731537 NM_145165 ENSG00000258289 CHURC1 C14orf52|My015|chch churchill domain containing 1 protein-coding 474.5-3 chr7 8034989 8035264 + 1.75 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L1PA17|LINE|L1 66330 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 356.75-13 chr5 90783321 90783906 + 1.75 NA intron (NR_003149, intron 66 of 89) intron (NR_003149, intron 66 of 89) 224816 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 469.5-4 chr8 105389509 105389782 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 70102 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 248-5 chr10 18043783 18044035 + 1.75 NA TTS (NM_152725) TTS (NM_152725) -33347 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-9 chr1 235157822 235158004 + 1.75 NA intron (NR_144491, intron 2 of 9) intron (NR_144491, intron 2 of 9) 3337 NM_001346738 23029 Hs.535224 NM_015014 ENSG00000188739 RBM34 - RNA binding motif protein 34 protein-coding 168.75-38 chr13 90046564 90046670 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 73100 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 286-24 chr3 54306417 54306643 + 1.75 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 183978 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 280.5-35 chr3 40226084 40226287 + 1.75 NA intron (NM_001284424, intron 11 of 15) intron (NM_001284424, intron 11 of 15) 83513 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 175.75-17 chr10 33699389 33699533 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 73219 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 465.75-2 chr12 30166533 30167134 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -382074 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 191.75-82 chr3 76359883 76360028 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -574406 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 180.25-127 chr9 3228609 3228738 + 1.75 NA intron (NM_134428, intron 17 of 17) intron (NM_134428, intron 17 of 17) 47084 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 582.5-2 chr9 104515222 104516008 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 11352 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 217.5-36 chr12 96763024 96763197 + 1.75 NA intron (NM_001306084, intron 58 of 67) intron (NM_001306084, intron 58 of 67) -144147 NM_001135176 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 164.25-115 chr4 69562454 69562575 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -36500 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 377.25-14 chr4 109490757 109491096 + 1.75 NA intron (NM_001300813, intron 5 of 24) intron (NM_001300813, intron 5 of 24) 2228 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 201-71 chr7 55460665 55460984 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 66056 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 311.75-3 chr10 8107951 8108176 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 53375 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 422.5-15 chrX 126248225 126248658 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -82152 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 481.75-2 chr5 18568231 18568754 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 761218 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 411-2 chr12 76901962 76902280 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23102 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 204.75-38 chr15 58326805 58327034 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -105072 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 260.5-28 chr2 40579352 40579628 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -67055 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 264.5-42 chr4 107837262 107837492 + 1.75 NA intron (NM_001136258, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 12812 NM_001136258 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 312.25-25 chr6 133327519 133327771 + 1.75 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 86146 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 293.25-10 chr17 71298106 71298413 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -96080 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 318.25-10 chr4 117592527 117592790 + 1.75 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) MER57-int|LTR|ERV1 164260 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 279-27 chr3 74206443 74206630 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 314604 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 200.5-98 chr4 45591447 45591838 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 532412 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 211.5-63 chr18 36577520 36577677 + 1.75 NA intron (NM_001281740, intron 6 of 28) AluSz6|SINE|Alu 85820 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 246.75-61 chr6 73160660 73160854 + 1.75 NA intron (NM_001160132, intron 10 of 13) intron (NM_001160132, intron 10 of 13) -17243 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 419.25-5 chr18 80148333 80148798 + 1.75 NA intron (NR_028340, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 641 NR_028339 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 351.75-21 chr5 113180221 113180785 + 1.75 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 114435 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 230.75-64 chr6 62017592 62017842 + 1.75 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 268508 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 251.75-29 chr16 54904177 54904442 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 24469 NM_001308963 643911 Hs.237396 NM_001308963 CRNDE CRNDEP|LINC00180|NCRNA00180|PNAS-108|lincIRX5 colorectal neoplasia differentially expressed protein-coding 493.5-2 chr1 159470788 159471180 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 31262 NM_012351 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 326.75-2 chr1 118536536 118536825 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -351452 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 318.75-22 chr8 123634475 123634779 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 19174 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 337-23 chr4 54125573 54125867 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 25557 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 326.25-27 chr6 49175266 49175557 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 287842 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 267.5-43 chr20 32851582 32851791 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7237 NM_001143967 388795 NM_001143967 ENSG00000215529 EFCAB8 - EF-hand calcium binding domain 8 protein-coding 251.75 chr1 35969061 35969319 + 1.75 NA intron (NM_024852, intron 3 of 18) L1ME3G|LINE|L1 38085 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 259.75-17 chr14 51693140 51693419 + 1.75 NA intron (NM_001042481, intron 3 of 14) MIRb|SINE|MIR -24004 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 257-3 chr1 167353868 167354171 + 1.75 NA intron (NM_001365849, intron 3 of 16) L1ME3G|LINE|L1 24949 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 421.75-7 chr6 126771215 126771546 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 286749 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 252.25-52 chr6 35142639 35142855 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1337 NM_001261818 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 401.25-13 chr7 52093600 52093985 + 1.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -700536 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 123.5-214 chr8 136471444 136471551 + 1.75 NA Intergenic X6B_LINE|LINE|CR1 -59301 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 290.75-27 chr2 119906314 119906627 + 1.75 NA intron (NM_002830, intron 10 of 26) L1M2|LINE|L1 -106607 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 535.75 chr3 161521991 161522647 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 25511 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 269.75-56 chr8 121781063 121781600 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -139891 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 379.5-20 chr8 130579272 130579929 + 1.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -135926 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 418.75 chr1 90939274 90939801 + 1.75 NA exon (NM_201269, exon 3 of 6) exon (NM_201269, exon 3 of 6) 81971 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 371.75-4 chr10 25020813 25021316 + 1.75 NA intron (NM_024838, intron 1 of 2) intron (NM_024838, intron 1 of 2) 4452 NM_024838 79896 Hs.645274 NM_024838 ENSG00000185875 THNSL1 TSH1 threonine synthase like 1 protein-coding 310.25-26 chr8 144982262 144982470 + 1.75 NA intron (NR_023392, intron 4 of 4) L1M4b|LINE|L1 -12499 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 257.5-65 chr6 119362309 119362582 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12684 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 197-36 chr2 230267199 230267364 + 1.75 NA intron (NM_001278453, intron 9 of 23) intron (NM_001278453, intron 9 of 23) 41545 NM_001278453 11262 Hs.632549 NM_007237 ENSG00000079263 SP140 LYSP100|LYSP100-A|LYSP100-B SP140 nuclear body protein protein-coding 279-3 chr1 111859845 111860184 + 1.75 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) -3109 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 303.5-31 chr4 44175298 44175532 + 1.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 158353 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 299.75-24 chr7 85793511 85793778 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 372522 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 251.5-10 chr10 25920377 25920555 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 13244 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 290.75-49 chr8 88164543 88164769 + 1.75 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 162827 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 407.5-10 chr5 25718217 25718541 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 527426 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 262.25-17 chr16 12119036 12119520 + 1.75 NA intron (NM_032167, intron 11 of 20) intron (NM_032167, intron 11 of 20) 142544 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 210.75-7 chr1 169141125 169141262 + 1.75 NA intron (NR_104229, intron 12 of 12) intron (NR_104229, intron 12 of 12) 34503 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 216.75-84 chr9 98257134 98257397 + 1.75 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 -1616 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 460-2 chr11 82556069 82556571 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -152407 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 265.5-5 chr1 190418902 190419138 + 1.75 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 56990 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 471-10 chr8 85934360 85934879 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -106677 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 387.75-12 chr3 64264909 64265341 + 1.75 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 3048 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 195.25-66 chr4 41777860 41778037 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28978 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 179.5-125 chr3 101642413 101642771 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -33838 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 253.75-55 chr7 3637592 3637944 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 2 of 44) intron (NM_152744, intron 2 of 44) 336516 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 310-2 chr1 189511390 189511607 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 964512 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 307-18 chr2 159763706 159763945 + 1.75 NA intron (NM_001282806, intron 7 of 7) intron (NM_001282806, intron 7 of 7) 29861 NM_001282807 64844 Hs.529272 NM_022826 ENSG00000136536 MARCH7 AXO|AXOT|MARCH-VII|RNF177 membrane associated ring-CH-type finger 7 protein-coding 260.25-44 chr6 158223206 158223359 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 54935 NM_207118 404672 Hs.356224 NM_207118 ENSG00000272047 GTF2H5 C6orf175|TFB5|TFIIH|TGF2H5|TTD|TTD-A|TTD3|TTDA|bA120J8.2 general transcription factor IIH subunit 5 protein-coding 367-3 chr16 934795 935086 + 1.75 NA TTS (NR_110945) TTS (NR_110945) 13907 NR_110945 101929387 Hs.737087 NR_110945 ENSG00000260439 LMF1-AS1 LA16c-366D3.1 LMF1 antisense RNA 1 ncRNA 356.5 chr1 41593433 41593698 + 1.75 NA intron (NM_024503, intron 3 of 8) L1ME4b|LINE|L1 -108882 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 322.75-12 chr20 52242351 52242671 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -50526 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 285-10 chr12 24646548 24647109 + 1.75 NA Intergenic CR1-3_Croc|LINE|CR1 -62660 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 135-90 chr20 16688826 16688936 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -41145 NM_003092 6629 Hs.280378 NM_003092 ENSG00000125870 SNRPB2 Msl1|U2B'' small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 protein-coding 538.25 chr2 46417897 46418336 + 1.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -11074 NR_103805 101805491 Hs.304781 NR_103805 ENSG00000187600 LINC02583 - long intergenic non-protein coding RNA 2583 ncRNA 472.75-7 chr9 5069734 5070105 + 1.75 NA intron (NM_004972, intron 11 of 24) intron (NM_004972, intron 11 of 24) 28226 NM_001322204 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 269-48 chr8 111411573 111411766 + 1.75 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 35030 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 272.5-35 chr2 75894031 75894226 + 1.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -183213 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 331.5-10 chr15 61471992 61472318 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -242853 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 402.5-3 chr11 29848657 29848943 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 133593 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 457.75-3 chr6 129723691 129724211 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13774 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 220.25-53 chr3 165492741 165493076 + 1.75 NA intron (NR_125764, intron 4 of 5) intron (NR_125764, intron 4 of 5) 285948 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 298.25-34 chr8 61142732 61142937 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -145136 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 116-164 chr8 29730021 29730150 + 1.75 NA intron (NR_026765, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 18024 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 129-170 chr7 52682995 52683114 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -352579 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 462.75 chr12 30021134 30021774 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -236695 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 366.25-7 chr18 9483090 9483392 + 1.75 NA intron (NM_006788, intron 1 of 9) L1MB8|LINE|L1 7728 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 339.25-25 chr8 116881096 116881318 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6341 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 207.5-95 chr6 42580388 42580538 + 1.75 NA intron (NM_015255, intron 2 of 46) intron (NM_015255, intron 2 of 46) 16434 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 297.75-4 chr12 61800948 61801205 + 1.75 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) L1MA5|LINE|L1 391763 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 543.5-2 chr3 183624058 183624586 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11301 NM_001349425 54800 Hs.407709 NM_017644 ENSG00000114796 KLHL24 DRE1|EBSSH|KRIP6 kelch like family member 24 protein-coding 406.75-5 chr13 109748474 109748978 + 1.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 20452 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 456.25-2 chr10 60470635 60471051 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -80968 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 380-3 chr11 22550420 22550831 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -58606 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 214-70 chr9 25713106 25713333 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34361 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 277.25-33 chr4 87733797 87734023 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -65644 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 190.25-130 chr9 74013959 74014196 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -357454 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 523-3 chr7 43069733 43070151 + 1.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -42705 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 386.5-4 chr11 4780769 4781161 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11027 NM_001004752 256892 NM_001004752 ENSG00000280021 OR51F1 OR11-21|OR51F1P olfactory receptor family 51 subfamily F member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 306.25-9 chr10 124254459 124254669 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -160966 NM_001270765 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 141.25-35 chr12 24042112 24042292 + 1.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -91170 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 161.25-170 chr8 69183550 69183714 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -79442 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 350.25-28 chr5 125984302 125984610 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -195121 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 276.5-23 chr14 82876572 82876836 + 1.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 234072 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 307.25-4 chr10 129187602 129187872 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 274904 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 286.75-14 chr14 54132308 54132478 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -175502 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 164.25-145 chr6 149324294 149324426 + 1.75 NA intron (NM_015093, intron 1 of 8) intron (NM_015093, intron 1 of 8) 6060 NM_015093 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 346.5-20 chr3 124768378 124768843 + 1.75 NA intron (NM_001354766, intron 11 of 13) L1MB7|LINE|L1 36171 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 410.25-4 chr15 96042720 96042982 + 1.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 84990 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 300.25-28 chr8 131514182 131514559 + 1.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -389723 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 296.5-8 chr12 63514195 63514451 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 154170 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 211.25-39 chr2 73973903 73974027 + 1.75 NA intron (NR_104030, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 7474 NR_104029 100874048 Hs.600674 NR_104029 ENSG00000237883 DGUOK-AS1 - DGUOK antisense RNA 1 ncRNA 242.75-73 chr8 129125740 129125941 + 1.75 NA Intergenic Penelope1_Vert|LINE|Penelope 115400 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 380-12 chr3 6411495 6411811 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 393796 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 383.25-12 chr22 43222917 43223263 + 1.75 NA intron (NM_173050, intron 11 of 21) intron (NM_173050, intron 11 of 21) 10416 NR_134632 105373051 Hs.629290 NR_134632 ENSG00000236272 LOC105373051 - uncharacterized LOC105373051 ncRNA 571 chr21 30164277 30164692 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 2321 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 345.5-30 chr7 127005016 127005324 + 1.75 NA intron (NM_001371085, intron 3 of 10) intron (NM_001371085, intron 3 of 10) 53014 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 518.75-2 chr14 78402996 78403527 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_004796) promoter-TSS (NM_004796) -458 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 406.5-5 chr2 101065955 101066310 + 1.75 NA intron (NM_001102426, intron 2 of 19) AluSx1|SINE|Alu 63843 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 134.25-161 chr6 128873229 128873333 + 1.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -9857 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 206-19 chr12 87253714 87253880 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -76942 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 195.75-64 chr2 176972953 176973161 + 1.75 NA Intergenic (AATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 239354 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 536.75-2 chr6 55265874 55266423 + 1.75 NA intron (NM_001526, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR -61321 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 407.25 chr10 15715929 15716252 + 1.75 NA intron (NM_001291494, intron 2 of 28) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 3832 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 465-3 chr16 65261147 65261613 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -84807 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 231.75-63 chr5 83178111 83178320 + 1.75 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) L2|LINE|L2 100668 NM_003401 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 169.75-85 chr2 147179181 147179318 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 592192 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 137-138 chr5 64429082 64429162 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -76893 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 372.5-23 chr8 122108072 122108562 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 460327 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 316-28 chr7 69221042 69221328 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 376439 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 245-26 chr18 69928156 69928434 + 1.75 NA intron (NM_001303619, intron 1 of 4) intron (NM_001303619, intron 1 of 4) 19578 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 198.25-36 chr15 82989742 82989930 + 1.75 NA TTS (NM_001160115) TTS (NM_001160115) 3626 NM_031452 83640 Hs.80624 NM_031452 ENSG00000169612 RAMAC C15orf18|FAM103A1|HsT19360|RAM|RAMMET RNA guanine-7 methyltransferase activating subunit protein-coding 298-12 chr17 69337558 69337762 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10527 NM_172232 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 284.5-43 chr4 32481150 32481553 + 1.75 NA Intergenic (CACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 130313 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 315.5-18 chr4 45525645 45525853 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 598305 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 271.75-39 chr6 50386876 50387149 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -326532 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 267-7 chr10 19970018 19970203 + 1.75 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 153678 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 344.75-17 chr7 51952531 51952805 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -559412 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 206-69 chr7 47670966 47671144 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 15811 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 419 chr13 47889613 47890033 + 1.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42799 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 306.5-3 chr1 218419661 218419925 + 1.75 NA intron (NR_138148, intron 2 of 6) intron (NR_138148, intron 2 of 6) -17840 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 283.25-19 chr19 42307230 42307480 + 1.75 NA intron (NM_199285, intron 1 of 2) intron (NM_199285, intron 1 of 2) -4555 NM_001145940 5050 Hs.466831 NM_002573 ENSG00000079462 PAFAH1B3 PAFAHG platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 3 protein-coding 344.75-16 chr6 134923550 134923806 + 1.75 NA intron (NM_170771, intron 5 of 5) intron (NM_170771, intron 5 of 5) 26423 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 211.75-64 chr4 41605161 41605446 + 1.75 NA intron (NM_001289122, intron 5 of 25) intron (NM_001289122, intron 5 of 25) -7406 NM_001330982 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 335.75-5 chr11 68110823 68111210 + 1.75 NA intron (NM_001277, intron 1 of 11) L1MC1|LINE|L1 10372 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 315.25-17 chr2 153813434 153813627 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -58392 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 271.25-41 chr7 34061026 34061367 + 1.75 NA intron (NM_133468, intron 11 of 15) intron (NM_133468, intron 11 of 15) 155657 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 184.5-7 chr1 110908742 110908871 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 35658 NM_000560 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 237.75-10 chr11 34605590 34605939 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15329 NM_001206615 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 320-10 chr12 39348480 39348707 + 1.75 NA intron (NM_001173464, intron 11 of 37) intron (NM_001173464, intron 11 of 37) 94527 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 208.5-151 chr9 94607331 94607602 + 1.75 NA intron (NM_000507, intron 4 of 6) intron (NM_000507, intron 4 of 6) -13642 NM_003837 8789 Hs.61255 NM_003837 ENSG00000130957 FBP2 - fructose-bisphosphatase 2 protein-coding 330.75-17 chr4 63870214 63870559 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 539064 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 211.25-86 chr7 90707625 90707799 + 1.75 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -1686 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 187-69 chr4 30279888 30280095 + 1.75 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -440378 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 297.5-39 chr3 130666506 130666723 + 1.75 NA intron (NM_001102608, intron 35 of 35) intron (NM_001102608, intron 35 of 35) 80215 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 255.5-46 chr20 11181485 11181860 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 91711 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 231.75-58 chr5 39756926 39757085 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 236574 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 243.25-26 chr21 31793395 31793546 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -61352 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 365-15 chr5 27296429 27296754 + 1.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -175701 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 400.25-6 chr4 163245081 163245350 + 1.75 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 -78325 NM_001128931 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 212.25-52 chr22 27347970 27348151 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37409 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 261.5-57 chr6 64053104 64053325 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) intron (NM_001292009, intron 33 of 43) 246378 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 340.5-17 chr2 124454172 124454539 + 1.75 NA intron (NM_130773, intron 6 of 23) L1PBa1|LINE|L1 429068 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 235.75-22 chr14 59943569 59943737 + 1.75 NA intron (NR_075071, intron 7 of 32) intron (NR_075071, intron 7 of 32) 23940 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 260.5-60 chr7 118985118 118985280 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 760495 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 163-12 chr10 43994638 43994812 + 1.75 NA Intergenic (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 82323 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 329.25-9 chr14 75044138 75044468 + 1.75 NA intron (NM_014381, intron 2 of 11) intron (NM_014381, intron 2 of 11) 7164 NM_014381 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 114.75-134 chr4 36585550 36585623 + 1.75 NA intron (NR_149124, intron 2 of 4) intron (NR_149124, intron 2 of 4) 56314 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 342.75-20 chr4 138257682 138257908 + 1.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -15446 NM_014331 23657 Hs.390594 NM_014331 ENSG00000151012 SLC7A11 CCBR1|xCT solute carrier family 7 member 11 protein-coding 270.25-11 chr10 102526810 102526986 + 1.75 NA intron (NM_001178133, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 22926 NM_001178133 51684 Hs.404089 NM_016169 ENSG00000107882 SUFU JBTS32|PRO1280|SUFUH|SUFUXL SUFU negative regulator of hedgehog signaling protein-coding 441.5-2 chr11 27426715 27427084 + 1.75 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) intron (NM_018490, intron 1 of 17) -44832 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 297.25-19 chr4 42816334 42816628 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -76785 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 182.25-35 chr14 48602874 48602990 + 1.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -807918 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 290.25-35 chr8 91443662 91443957 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 194490 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 304.5-9 chr12 108828838 108829147 + 1.75 NA intron (NM_018984, intron 2 of 14) intron (NM_018984, intron 2 of 14) -1441 NM_001161331 54434 Hs.199763 NM_018984 ENSG00000084112 SSH1 SSH1L slingshot protein phosphatase 1 protein-coding 334.75-4 chr1 151902380 151902849 + 1.75 NA intron (NM_053055, intron 1 of 5) L1PB1|LINE|L1 6897 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 323-11 chr18 72361885 72362103 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 182348 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 283.25-3 chr1 147562795 147563183 + 1.75 NA intron (NM_004326, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 21488 NM_004326 607 Hs.415209 NM_004326 ENSG00000116128 BCL9 LGS BCL9 transcription coactivator protein-coding 411-4 chr15 38909967 38910246 + 1.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 213508 NR_160786 422-6 chr2 170581638 170581906 + 1.75 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) intron (NM_001083615, intron 31 of 33) 132795 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 436-4 chr2 121261455 121262263 + 1.75 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) L1MC4a|LINE|L1 23343 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 189.5-18 chr1 234631707 234631956 + 1.75 NA intron (NR_033927, intron 1 of 1) intron (NR_033927, intron 1 of 1) 2520 NR_033927 100302691 Hs.209162 NR_033927 ENSG00000224939 LINC00184 HANC|NCRNA00184 long intergenic non-protein coding RNA 184 ncRNA 139-97 chr3 133422949 133423056 + 1.75 NA intron (NM_003571, intron 1 of 6) intron (NM_003571, intron 1 of 6) 22946 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 153-59 chr17 21980539 21980677 + 1.75 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -222387 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 302.5-34 chr5 33177637 33177830 + 1.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -52002 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 185.75-133 chr9 27942543 27942659 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001258282, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001258282, exon 7 of 7) -368735 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 263.5-69 chr9 70929860 70930100 + 1.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MIRb|SINE|MIR -60928 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 299-9 chr11 23024882 23025209 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -164571 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 270.5-17 chr14 63755387 63755655 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27456 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 346.5 chr1 111713646 111713879 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001010935, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001010935, exon 9 of 9) 25633 NM_019099 55924 Hs.193406 NM_019099 ENSG00000197852 INKA2 C1orf183|FAM212B inka box actin regulator 2 protein-coding 309.5-43 chr8 84759031 84759220 + 1.75 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 53198 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 402.5-8 chr5 63568932 63569432 + 1.75 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 393110 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 430.75-13 chr6 54145069 54145345 + 1.75 NA intron (NM_001281746, intron 4 of 11) intron (NM_001281746, intron 4 of 11) 33764 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 253.75-57 chr7 33656097 33656281 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -248726 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 314.25-7 chr14 58584628 58584915 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -49297 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 147.5-73 chr15 84901798 84901907 + 1.75 NA intron (NM_001287761, intron 5 of 14) L1ME1|LINE|L1 17190 NM_201651 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 181.25-73 chr20 22567188 22567309 + 1.75 NA intron (NR_001558, intron 2 of 3) intron (NR_001558, intron 2 of 3) 11394 NR_001558 140828 Hs.9842 NR_001558 ENSG00000259974 LINC00261 ALIEN|C20orf56|DEANR1|FALCOR|HCCDR1|NCRNA00261|TCONS_00027846|onco-lncRNA-17 long intergenic non-protein coding RNA 261 ncRNA 380-11 chr2 177177522 177177829 + 1.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 34736 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 197.5-161 chr8 105513496 105513680 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 194045 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 330.5-5 chr10 70229129 70229567 + 1.75 NA intron (NM_021129, intron 2 of 10) FLAM_C|SINE|Alu 4081 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 266.75-8 chr14 63082396 63082655 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -37067 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 299.25-29 chr20 53956650 53956871 + 1.75 NA intron (NM_001366297, intron 7 of 8) intron (NM_001366297, intron 7 of 8) -81051 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 335.5-13 chr7 956940 957327 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1726 NM_001284308 11033 Hs.602573 NM_006869 ENSG00000105963 ADAP1 CENTA1|GCS1L|p42IP4 ArfGAP with dual PH domains 1 protein-coding 256-55 chr4 107267156 107267472 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -231001 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 377-10 chr3 13505076 13505347 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001330636, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001330636, exon 7 of 7) 24905 NM_024827 79885 Hs.744132 NM_024827 ENSG00000163517 HDAC11 HD11 histone deacetylase 11 protein-coding 392-13 chr4 63679334 63679707 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 729930 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 335.75-6 chr13 61004660 61005052 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 195024 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 298.5-35 chr7 39496660 39497095 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -69527 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 436-5 chr2 134269436 134270207 + 1.75 NA intron (NM_001371457, intron 2 of 16) intron (NM_001371457, intron 2 of 16) 15749 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 377.25-18 chr8 18550818 18551237 + 1.75 NA intron (NM_015310, intron 15 of 15) intron (NM_015310, intron 15 of 15) 159745 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 212.5-103 chr7 30398177 30398380 + 1.75 NA intron (NR_108081, intron 1 of 2) intron (NR_108081, intron 1 of 2) 7393 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 235-40 chr22 47708371 47708546 + 1.75 NA intron (NR_122046, intron 7 of 8) L1ME5|LINE|L1 76784 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 352.75-12 chr3 38634221 38634554 + 1.75 NA intron (NM_198056, intron 1 of 27) intron (NM_198056, intron 1 of 27) 15285 NM_000335 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 182.75-47 chr14 54119678 54119851 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -162873 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 352.75-4 chr10 125794298 125794648 + 1.75 NA intron (NR_136676, intron 9 of 10) intron (NR_136676, intron 9 of 10) -18652 NM_147191 118856 Hs.314141 NM_147191 ENSG00000154485 MMP21 HTX7|MMP-21 matrix metallopeptidase 21 protein-coding 445.5-6 chr5 164961978 164962338 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 491879 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 270.75-41 chr5 57421655 57421827 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 61070 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 197.75-39 chr2 32220430 32220584 + 1.75 NA exon (NM_017964, exon 14 of 14) exon (NM_017964, exon 14 of 14) 44379 NM_001199138 58484 Hs.574741 NM_021209 ENSG00000091106 NLRC4 AIFEC|CARD12|CLAN|CLAN1|CLANA|CLANB|CLANC|CLAND|CLR2.1|FCAS4|IPAF NLR family CARD domain containing 4 protein-coding 207-63 chr4 186291899 186292023 + 1.75 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) intron (NR_033900, intron 1 of 3) 25772 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 298.75-5 chr1 82754170 82754400 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -148898 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 204.5-93 chr3 84426298 84426467 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 443193 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 220-46 chr4 107404615 107404805 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 315524 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 203.5-19 chr10 19048391 19048570 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_001142308) promoter-TSS (NM_001142308) -321 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 173-11 chr10 18210204 18210400 + 1.75 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) -50420 NM_000724 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 338-29 chr6 130581391 130581707 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 144432 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 286.25-25 chr6 138324489 138324730 + 1.75 NA intron (NM_020340, intron 31 of 33) intron (NM_020340, intron 31 of 33) -53034 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 423.25-6 chr7 50948856 50949099 + 1.75 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -155524 NM_001371008 245.25-41 chr2 99162624 99163003 + 1.75 NA non-coding (NR_037936, exon 3 of 3) non-coding (NR_037936, exon 3 of 3) 7739 NM_001204830 51601 Hs.719172 NM_015929 ENSG00000144182 LIPT1 LIPT1D lipoyltransferase 1 protein-coding 482.25 chr13 105406152 105406543 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -59520 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 233-10 chr11 58230269 58230481 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -1457 NM_001004471 219960 Hs.553646 NM_001004471 ENSG00000180475 OR10Q1 OR11-233 olfactory receptor family 10 subfamily Q member 1 protein-coding 455-3 chr4 92668802 92669146 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 364575 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 346.5-6 chr12 111606537 111606770 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6977 NR_132311 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 384-14 chr22 24080124 24080435 + 1.75 NA intron (NM_012295, intron 19 of 36) L1ME3Cz|LINE|L1 68909 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 401.75-3 chr2 40125672 40126216 + 1.75 NA intron (NM_001351483, intron 8 of 8) MIRc|SINE|MIR 208310 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 244-60 chr9 13137071 13137239 + 1.75 NA intron (NM_003829, intron 29 of 45) intron (NM_003829, intron 29 of 45) 142409 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 274.5-48 chr4 38290432 38290620 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -76388 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 281-27 chr5 62874102 62874423 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 295443 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 250.75-67 chr8 82689632 82689828 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -222374 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 197.25-20 chr12 23016631 23016763 + 1.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -158939 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 358.5-8 chr16 11365849 11366121 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 20526 NM_152308 116028 Hs.347524 NM_152308 ENSG00000175643 RMI2 BLAP18|C16orf75 RecQ mediated genome instability 2 protein-coding 161-116 chr8 89990566 89990695 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5906 NM_001024688 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 162.5-118 chr3 155498845 155499001 + 1.75 NA intron (NM_001349252, intron 14 of 24) intron (NM_001349252, intron 14 of 24) 13120 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 421.25-7 chr2 44732421 44732821 + 1.75 NA intron (NM_024766, intron 7 of 10) AluYg6|SINE|Alu 206267 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 430.5-10 chr6 129894125 129894672 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33083 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 391.75-4 chr3 56537926 56538283 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -19052 NR_148376 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 384.25-3 chr10 20619942 20620291 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68146 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 372.75-12 chr7 52056818 52057204 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -663755 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 151.25-111 chr21 24076177 24076309 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 245134 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 315.75-29 chr9 92195034 92195248 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3985 NM_001350291 138652 Hs.742918 NM_001350291 PRSS47 - serine protease 47 protein-coding 344.25-4 chr10 44320143 44320389 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 27516 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 279-29 chr4 20807026 20807327 + 1.75 NA intron (NM_025221, intron 2 of 7) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 43492 NM_147181 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 257-25 chr2 107084255 107084450 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -197243 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 341.5-18 chr22 46987992 46988296 + 1.75 NA intron (NM_001284305, intron 9 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -72102 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 245-38 chr22 27405774 27405923 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 95197 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 207.5-31 chr16 60399719 60399885 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -40009 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 212-3 chr1 164580967 164581145 + 1.75 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 21334 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 328.5-32 chr8 53548274 53548686 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -24515 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 231.5-27 chr14 58388354 58388624 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7441 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 416.75-7 chr8 79964529 79964948 + 1.75 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 65521 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 225-16 chr11 73438672 73438839 + 1.75 NA intron (NM_001286051, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 62087 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 172.25-34 chr14 47481430 47481572 + 1.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -138255 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 347-12 chr16 85691436 85691839 + 1.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -2683 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 222.25-75 chr6 53529040 53529275 + 1.75 NA intron (NM_001498, intron 1 of 15) MER3|DNA|hAT-Charlie 15944 NM_001197115 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 165.25-123 chr6 12685527 12685672 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -31168 NM_001322308 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 282-22 chr18 51190496 51190695 + 1.75 NA intron (NM_016626, intron 1 of 1) intron (NM_016626, intron 1 of 1) 7086 NM_016626 51320 Hs.465144 NM_016626 ENSG00000176624 MEX3C BM-013|MEX-3C|RKHD2|RNF194 mex-3 RNA binding family member C protein-coding 242.25-64 chr4 48609133 48609620 + 1.75 NA intron (NM_015030, intron 8 of 63) AluJb|SINE|Alu 119124 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 218.75-95 chrX 46086066 46086268 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -234677 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 253.75-60 chr7 93379365 93379595 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 103375 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 593.5 chr12 14796875 14797433 + 1.75 NA intron (NM_016312, intron 4 of 11) intron (NM_016312, intron 4 of 11) 6324 NM_016312 51729 Hs.655138 NM_016312 ENSG00000084463 WBP11 NPWBP|PPP1R165|SIPP1|WBP-11 WW domain binding protein 11 protein-coding 198.75-93 chr7 85406596 85406745 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14452 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 282.5-57 chr6 137545128 137545403 + 1.75 NA Intergenic (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50871 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 431.75-4 chr3 97157118 97157405 + 1.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -282346 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 349.25-11 chr3 179363953 179364230 + 1.75 NA intron (NM_033540, intron 5 of 17) intron (NM_033540, intron 5 of 17) 16382 NM_033540 55669 Hs.478383 NM_017927 ENSG00000171109 MFN1 hfzo1|hfzo2 mitofusin 1 protein-coding 201.75-108 chr9 73558184 73558328 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 406391 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 301-14 chr2 238003121 238003400 + 1.75 NA intron (NR_037904, intron 4 of 18) intron (NR_037904, intron 4 of 18) 34467 NM_001278305 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 350.25-21 chr3 8592566 8592780 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 20891 NR_024065 29931 Hs.433151 NM_013343 LINC00312 ERR-10|ERR10|LMCD1DN|LOH3CR2A|NAG-7|NAG7|NCRNA00312 long intergenic non-protein coding RNA 312 ncRNA 351.5-13 chr18 32116597 32117017 + 1.75 NA intron (NM_001191324, intron 3 of 6) AluJr4|SINE|Alu 24201 NM_001191324 51444 Hs.302408 NM_016271 ENSG00000134758 RNF138 HSD-4|NARF|STRIN|hNARF ring finger protein 138 protein-coding 409.25-3 chr2 223982770 223983186 + 1.75 NA intron (NM_001136530, intron 5 of 8) intron (NM_001136530, intron 5 of 8) 25515 NM_022915 65080 Hs.203559 NM_022915 ENSG00000135900 MRPL44 COXPD16|L44MT|MRP-L44 mitochondrial ribosomal protein L44 protein-coding 256.25-8 chr12 39591297 39591525 + 1.75 NA intron (NM_005164, intron 6 of 9) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 28392 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 224.25-22 chr12 6343964 6344215 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1972 NM_001065 7132 Hs.279594 NM_001065 ENSG00000067182 TNFRSF1A CD120a|FPF|TBP1|TNF-R|TNF-R-I|TNF-R55|TNFAR|TNFR1|TNFR55|TNFR60|p55|p55-R|p60 TNF receptor superfamily member 1A protein-coding 173.25-72 chr3 31072126 31072252 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 89598 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 273.25-5 chr10 49088717 49089133 + 1.75 NA intron (NM_001031746, intron 2 of 7) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 26597 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 266.25-21 chr19 31645476 31645902 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 53408 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 376.75-8 chr2 124925662 124925990 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 900539 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 163-73 chr3 102929152 102929261 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 494191 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 401.25-11 chr4 186352889 186353322 + 1.75 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) intron (NR_033900, intron 1 of 3) 86916 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 118.25-216 chr9 69939864 69939960 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -103669 NM_001347990 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 187-64 chr3 143579438 143579578 + 1.75 NA intron (NM_173653, intron 6 of 15) intron (NM_173653, intron 6 of 15) 237262 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 401.5-11 chr22 22082275 22082710 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -38558 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 239.5-80 chr8 99442585 99442817 + 1.75 NA intron (NM_017890, intron 23 of 61) intron (NM_017890, intron 23 of 61) 94029 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 265.25-30 chr21 28775351 28775612 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 109886 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 199.75-10 chr10 112999011 112999260 + 1.75 NA intron (NM_001367943, intron 4 of 14) AluJo|SINE|Alu -46220 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 156-140 chr7 37789926 37790030 + 1.75 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -58619 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 253.75-45 chr4 131384953 131385125 + 1.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -379799 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 186.5-54 chr17 65909956 65910083 + 1.75 NA intron (NM_001353129, intron 19 of 26) HAL1b|LINE|L1 -83476 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 190.75-93 chr6 44210997 44211221 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5817 NM_001315494 101929726 Hs.438979 NM_001315494 ENSG00000262179 MYMX MINION|hMINION myomixer, myoblast fusion factor protein-coding 330.25-21 chr6 142842602 142842860 + 1.75 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 102445 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 223-85 chr8 138012748 138013002 + 1.75 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L1MB5|LINE|L1 70670 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 328-20 chr20 54797680 54797997 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 322245 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 323.25-19 chr5 42316293 42316611 + 1.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -106987 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 304.25-15 chr20 56427466 56427787 + 1.75 NA intron (NM_001164116, intron 2 of 6) intron (NM_001164116, intron 2 of 6) 15366 NM_001164114 57091 Hs.473144 NM_020356 ENSG00000087589 CASS4 C20orf32|CAS4|HEFL|HEPL Cas scaffold protein family member 4 protein-coding 346.5-31 chrX 79077624 79078046 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -93137 NM_032553 84636 Hs.326713 NM_032553 ENSG00000147138 GPR174 FKSG79|GPCR17|LYPSR3 G protein-coupled receptor 174 protein-coding 236-2 chr1 64489498 64489716 + 1.75 NA intron (NM_020925, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR -16307 NM_001293274 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 362-12 chr4 72313215 72313883 + 1.75 NA intron (NM_014243, intron 12 of 21) intron (NM_014243, intron 12 of 21) 255672 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 361-9 chr14 68392716 68393168 + 1.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) MIRc|SINE|MIR 235845 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 366-18 chr9 32421031 32421550 + 1.75 NA intron (NM_001278352, intron 9 of 21) MIRc|SINE|MIR 36647 NM_002197 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 257.5-4 chr1 209253877 209254078 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71479 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 428.75-12 chr9 92858399 92858791 + 1.75 NA intron (NM_001007101, intron 1 of 3) L1MEg|LINE|L1 19373 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 336.5-25 chr5 87689457 87689725 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 27549 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 375-3 chr11 83926900 83927263 + 1.75 NA intron (NM_001142700, intron 7 of 19) intron (NM_001142700, intron 7 of 19) -244656 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 427.5-11 chr7 135991376 135991733 + 1.75 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 -14195 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 408.75-6 chr3 196456375 196456791 + 1.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -24156 NM_015562 26043 Hs.518524 NM_015562 ENSG00000163960 UBXN7 UBXD7 UBX domain protein 7 protein-coding 212.25-104 chr9 110479340 110479546 + 1.75 NA intron (NM_153366, intron 13 of 47) intron (NM_153366, intron 13 of 47) 100298 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 196.5-60 chr16 31513317 31513475 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5005 NM_022744 64755 Hs.9003 NM_022744 ENSG00000140688 C16orf58 RUS chromosome 16 open reading frame 58 protein-coding 309-40 chr6 61044516 61044848 + 1.75 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -529448 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 273.5-61 chr5 78000539 78000718 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001271769, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001271769, exon 27 of 27) 42381 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 411-10 chrX 46772623 46772988 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13687 NM_032591 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 283-49 chr9 97932142 97932443 + 1.75 NA intron (NM_018437, intron 3 of 4) intron (NM_018437, intron 3 of 4) 5880 NM_197978 55363 Hs.176626 NM_018437 ENSG00000136929 HEMGN CT155|EDAG|EDAG-1|NDR hemogen protein-coding 355-7 chr18 64951121 64951501 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -691256 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 173.5-124 chr5 26710980 26711113 + 1.75 NA Intergenic (AATATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 327540 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 421.25-2 chr10 94032444 94032830 + 1.75 NA intron (NM_001288989, intron 2 of 32) intron (NM_001288989, intron 2 of 32) 38706 NM_001288989 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 136.75-112 chr2 227971943 227972025 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 100353 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 331-15 chr19 34549707 34549920 + 1.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -4427 NR_146880 100129800 NR_146880 ZNF807 ZNF181P1|ZNF807P zinc finger protein 807 pseudo 287-30 chr5 69111700 69111899 + 1.75 NA intron (NM_022902, intron 5 of 15) intron (NM_022902, intron 5 of 15) 17785 NM_024055 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 337-30 chr7 110609248 110609724 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -481520 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 424.75-4 chr16 77512335 77512829 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -77548 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 308.5-4 chr10 99023727 99024069 + 1.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MA1|LINE|L1 -99330 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 161-122 chr8 122972274 122972430 + 1.75 NA intron (NM_001362797, intron 4 of 4) intron (NM_001362797, intron 4 of 4) 53420 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 128-116 chr4 104702990 104703113 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -208157 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 281.5-14 chr12 27938020 27938494 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 31719 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 417.25-10 chrX 151717484 151717770 + 1.75 NA intron (NM_033085, intron 2 of 4) intron (NM_033085, intron 2 of 4) 1592 NM_033085 89885 Hs.301960 NM_033085 ENSG00000147378 FATE1 CT43|FATE fetal and adult testis expressed 1 protein-coding 287.5-52 chr8 114082149 114082363 + 1.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -645317 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 264.75-54 chr7 48628845 48629162 + 1.75 NA intron (NM_152701, intron 59 of 61) intron (NM_152701, intron 59 of 61) -295544 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 282.5-48 chr4 89870039 89870346 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9319 NM_001371403 395.5-20 chr8 77614762 77615262 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 164315 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 325.5-27 chr3 173360454 173360672 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35389 NM_001365924 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 354.25-12 chr5 118641189 118641429 + 1.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 45121 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 267.25-29 chr4 87610426 87610657 + 1.75 NA intron (NM_014208, intron 1 of 4) intron (NM_014208, intron 1 of 4) 2012 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 269-25 chr17 76631176 76631383 + 1.75 NA intron (NR_110309, intron 1 of 7) intron (NR_110309, intron 1 of 7) 12478 NM_018414 55808 Hs.105352 NM_018414 ENSG00000070526 ST6GALNAC1 HSY11339|SIAT7A|ST6GalNAcI|STYI ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 262.5-30 chr18 392637 392880 + 1.75 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 107943 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 211-24 chr16 31223932 31224091 + 1.75 NA intron (NM_001008274, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR -6918 NM_152901 260434 Hs.58314 NM_152901 ENSG00000169900 PYDC1 ASC2|POP1|PYC1|cPOP1 pyrin domain containing 1 protein-coding 217-72 chr5 156133565 156133789 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -193080 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 269.5 chr1 41151502 41151812 + 1.75 NA non-coding (NR_135092, exon 5 of 16) non-coding (NR_135092, exon 5 of 16) 9775 NR_135092 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 180.5-2 chr1 34696369 34696534 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26757 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 202.25-33 chr18 78338570 78338698 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -344907 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 370.5-4 chr13 23077375 23077743 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -103362 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 141.75-77 chr18 4910197 4910351 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -170908 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 319.75 chr10 55816238 55816559 + 1.75 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -188456 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 272-8 chr13 102493497 102493694 + 1.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -91152 NM_001321946 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 187.75-66 chr22 26383506 26383778 + 1.75 NA TTS (NM_001184774) TTS (NM_001184774) -45618 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 287.25-4 chr1 170965893 170966091 + 1.75 NA intron (NM_001163629, intron 7 of 21) L1ME3G|LINE|L1 30458 NM_025063 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 169.75-93 chr20 49656953 49657073 + 1.75 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) intron (NM_004776, intron 1 of 8) 56865 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 355.5-8 chr12 23883540 23883992 + 1.75 NA intron (NM_001330785, intron 2 of 14) (TGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 65904 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 280.75-32 chr4 92523888 92524132 + 1.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 219611 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 206.25-89 chr5 157040349 157040580 + 1.75 NA intron (NM_001173393, intron 6 of 8) intron (NM_001173393, intron 6 of 8) 17777 NM_012206 26762 Hs.129711 NM_012206 ENSG00000113249 HAVCR1 CD365|HAVCR|HAVCR-1|KIM-1|KIM1|TIM|TIM-1|TIM1|TIMD-1|TIMD1 hepatitis A virus cellular receptor 1 protein-coding 379-2 chr13 26995645 26996028 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -129697 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 549.75-3 chr2 118648159 118648740 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -45483 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 474.25-4 chr5 113193406 113193821 + 1.75 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 101325 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 190.75-4 chr1 193679949 193680151 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 375305 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 296.25-7 chr14 52561044 52561266 + 1.75 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 8319 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 174.5-131 chr3 196314949 196315109 + 1.75 NA intron (NM_152773, intron 2 of 4) intron (NM_152773, intron 2 of 4) 3211 NM_152773 255758 Hs.733180 NM_152773 ENSG00000213123 TCTEX1D2 SRTD17 Tctex1 domain containing 2 protein-coding 366 chr1 66288541 66288920 + 1.75 NA intron (NM_001037340, intron 5 of 14) intron (NM_001037340, intron 5 of 14) -43378 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 284-35 chr4 48350673 48350946 + 1.75 NA intron (NM_020846, intron 1 of 7) intron (NM_020846, intron 1 of 7) 9280 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 263.5-54 chr5 84447214 84447457 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -62455 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 460-5 chr22 38792837 38793468 + 1.75 NA intron (NM_005740, intron 1 of 3) intron (NM_005740, intron 1 of 3) 991 NM_005740 10126 Hs.632766 NM_005740 ENSG00000100246 DNAL4 MRMV3|PIG27 dynein axonemal light chain 4 protein-coding 204.5-22 chr12 14677484 14677669 + 1.75 NA intron (NM_004963, intron 6 of 26) AluSq2|SINE|Alu 19023 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 233.25-20 chr13 88157445 88157683 + 1.75 NA intron (NR_131919, intron 1 of 4) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 14697 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 475.25 chr10 43784739 43785078 + 1.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 5509 NR_002726 10151 Hs.632956 NR_002726 HNRNPA3P1 D10S102|FBRNP|HNRPA3|HNRPA3P1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 pseudo 376.75-11 chr3 43185692 43185939 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -79736 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 400-13 chr7 95563503 95563807 + 1.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 32861 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 265.25-23 chr18 77086630 77086936 + 1.75 NA intron (NM_001025100, intron 2 of 3) intron (NM_001025100, intron 2 of 3) 46000 NM_001025101 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 156.5-55 chr14 67894520 67894631 + 1.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 70983 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 174-20 chr11 105847548 105847681 + 1.75 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 174626 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 432-12 chr5 65218191 65218591 + 1.75 NA intron (NR_135689, intron 19 of 25) L1MEc|LINE|L1 263529 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 209.5-92 chr3 44330775 44330966 + 1.75 NA intron (NM_001145030, intron 19 of 19) intron (NM_001145030, intron 19 of 19) -7249 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 352-9 chr21 31439948 31440497 + 1.75 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -95868 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 345.5-28 chr7 99200511 99200734 + 1.75 NA intron (NM_001145715, intron 2 of 9) L1MB7|LINE|L1 6867 NM_001145715 402569 Hs.253050 NM_001145715 ENSG00000185467 KPNA7 IPOA8 karyopherin subunit alpha 7 protein-coding 230-58 chr6 159835077 159835272 + 1.75 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 34898 NM_001271862 154197 Hs.349077 NM_173516 ENSG00000146453 PNLDC1 HsPNLDC1 PARN like, ribonuclease domain containing 1 protein-coding 343.5-27 chr8 110104066 110104564 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -128544 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 305.5-7 chr10 26042783 26043063 + 1.75 NA intron (NM_017433, intron 10 of 34) L1M1|LINE|L1 108694 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 265.5-48 chr5 17211466 17211848 + 1.75 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) intron (NR_027253, intron 1 of 2) -5166 NM_001271606 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 329.5-7 chr19 33678383 33678766 + 1.75 NA intron (NM_001127895, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu -5954 NM_022467 64377 Hs.165724 NM_022467 ENSG00000124302 CHST8 GALNAC4ST1|GalNAc4ST|PSS3 carbohydrate sulfotransferase 8 protein-coding 304-11 chr12 10099752 10100077 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_016511) promoter-TSS (NM_016511) -929 NM_001297749 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 241.25-55 chr5 53116796 53117030 + 1.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 7071 NR_104654 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 224.5-114 chr8 136719544 136719770 + 1.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 188859 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 228-41 chr2 145639917 145640194 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -947002 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 261-63 chr8 109236830 109236988 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 93024 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 453.75-4 chr18 25389075 25389555 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -37149 NM_001308225 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 252.5-31 chr17 18859623 18859795 + 1.75 NA intron (NM_001353096, intron 1 of 11) intron (NM_001353096, intron 1 of 11) 369 NM_001353096 5636 Hs.632236 NM_002767 ENSG00000141127 PRPSAP2 PAP41 phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 2 protein-coding 254.25-8 chr10 41904101 41904504 + 1.75 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 463743 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 162.5-123 chr4 40818381 40818487 + 1.75 NA intron (NM_173075, intron 16 of 16) intron (NM_173075, intron 16 of 16) 38721 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 377 chr12 18375288 18375616 + 1.75 NA intron (NM_001288774, intron 13 of 32) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 113912 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 277.25-44 chr7 83005020 83005358 + 1.75 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) L1MA9|LINE|L1 157695 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 363.5-21 chr8 105773337 105773771 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 286949 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 179.75-142 chrUn_KI270438v1 103633 103825 + 1.75 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 398-8 chr2 231951619 231951956 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9796 NM_152383 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 327.5-10 chr14 59045952 59046274 + 1.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -142554 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 336-15 chr21 21503500 21503788 + 1.75 NA intron (NM_001352592, intron 16 of 18) intron (NM_001352592, intron 16 of 18) 233675 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 404.75-6 chr5 25509701 25510076 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 318935 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 445.75-3 chr11 113546810 113547084 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71549 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 250.5-54 chr2 238724065 238724290 + 1.75 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 123730 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 300.25-10 chr16 20791002 20791271 + 1.75 NA intron (NM_080663, intron 8 of 10) intron (NM_080663, intron 8 of 10) 15336 NM_080663 112479 Hs.248437 NM_080663 ENSG00000196678 ERI2 EXOD1|ZGRF5 ERI1 exoribonuclease family member 2 protein-coding 340.5-28 chr5 115644006 115644366 + 1.75 NA intron (NR_104674, intron 4 of 4) intron (NR_104674, intron 4 of 4) -18007 NM_001164469 100302736 NM_001164468 ENSG00000251201 TMED7-TICAM2 MyD88-4|TICAM-2|TICAM2|TIRAP3|TIRP|TRAM TMED7-TICAM2 readthrough protein-coding 450-7 chr3 74395107 74395555 + 1.75 NA intron (NM_020872, intron 4 of 21) intron (NM_020872, intron 4 of 21) 125809 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 384.25-8 chr2 100733039 100733279 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -86980 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 416-2 chr10 10032448 10032797 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -26100 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 308.5-38 chr8 127203078 127203292 + 1.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -5558 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 220-4 chr1 83990752 83990937 + 1.75 NA intron (NM_001350214, intron 1 of 21) L1MB2|LINE|L1 8288 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 422.5-10 chr3 65355559 65355861 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001365903, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001365903, exon 25 of 25) -538106 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 277.5-47 chr3 72832068 72832404 + 1.75 NA intron (NM_018130, intron 5 of 10) intron (NM_018130, intron 5 of 10) 16209 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 417.25-7 chr8 134081368 134081849 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 195112 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 163.5-193 chr7 96717755 96717936 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7954 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 521-2 chr3 97651201 97651645 + 1.75 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -113098 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 470.25 chr17 57508672 57509207 + 1.75 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 14658 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 316.5-18 chr2 148735542 148735763 + 1.75 NA intron (NM_015630, intron 2 of 13) L1MC5|LINE|L1 90901 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 276.5-24 chr15 66368734 66369025 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12163 NM_001289986 54962 Hs.744308 NM_017858 ENSG00000075131 TIPIN - TIMELESS interacting protein protein-coding 211.5-93 chr21 30883914 30884094 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2424 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 228.5-96 chr7 14725865 14726027 + 1.75 NA intron (NM_001350717, intron 5 of 24) MIR|SINE|MIR 115504 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 361.75-13 chr3 80132532 80132816 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -364676 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 124.75-118 chr2 107992781 107992911 + 1.75 NA intron (NM_021815, intron 3 of 8) intron (NM_021815, intron 3 of 8) 6322 NM_001305007 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 295.25-26 chr5 105324388 105324680 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 225060 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 291.75-9 chr11 114356999 114357299 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 22890 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 182-110 chr9 29981843 29981999 + 1.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 426533 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 339.25-16 chr4 65688782 65689107 + 1.75 NA intron (NR_034138, intron 3 of 3) intron (NR_034138, intron 3 of 3) -18449 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 262-20 chr15 68060837 68061073 + 1.75 NA intron (NM_001320687, intron 2 of 14) AluSc|SINE|Alu 6379 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 372.75-13 chr8 121843660 121843975 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -202377 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 432.75-5 chr21 37202946 37203410 + 1.75 NA TTS (NM_001353937) TTS (NM_001353937) -5325 NR_026719 257203 Hs.505159 NM_148675 ENSG00000230366 DSCR9 NCRNA00038 Down syndrome critical region 9 ncRNA 166-125 chr8 76138100 76138221 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -268494 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 231.75-13 chr11 87958053 87958231 + 1.75 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger 217301 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 280.25-53 chr8 86811591 86811909 + 1.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -54665 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 236-40 chr22 41454786 41454937 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8060 NM_016272 10766 Hs.474978 NM_016272 ENSG00000183864 TOB2 APRO5|TOB4|TOBL|TROB2 transducer of ERBB2, 2 protein-coding 407.25-4 chr16 72473929 72474302 + 1.75 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) intron (NR_159371, intron 3 of 5) 190855 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 466.25 chr17 59139662 59139972 + 1.75 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) intron (NM_182620, intron 1 of 3) -1945 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 124.25-20 chr1 238638772 238638866 + 1.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -152802 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 555.75-3 chr5 165081197 165081703 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 611171 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 261.75-27 chr21 24524001 24524325 + 1.75 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 95423 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 291.75-22 chr2 133443617 133443847 + 1.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 124731 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 277.25-4 chr1 197388333 197388587 + 1.75 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) intron (NM_001193640, intron 3 of 9) 120208 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 248.75-21 chr14 43816508 43816756 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 690651 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 321-32 chr8 92735668 92735957 + 1.75 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 50248 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 524-3 chr8 124677418 124678098 + 1.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 50715 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 207.75-126 chr8 88383731 88383916 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -56340 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 226.25-60 chr5 104378489 104378664 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -720898 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 342.25-13 chr2 161443766 161444098 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 27635 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 410.25-7 chr2 76693064 76693333 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -292767 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 190.5-158 chr8 92055248 92055477 + 1.75 NA intron (NM_001198633, intron 1 of 10) intron (NM_001198633, intron 1 of 10) 7272 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 273.75-21 chr2 173774941 173775122 + 1.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 188849 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 302.5-4 chr10 76513608 76513849 + 1.75 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) LTR52-int|LTR|ERVL -374316 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 258-34 chr3 17819923 17820171 + 1.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 77103 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 236.25-73 chr5 137199516 137199722 + 1.75 NA intron (NM_004598, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 71422 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 136.5-84 chr15 95071487 95071606 + 1.75 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 216183 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 234.75-31 chr18 68852813 68853044 + 1.75 NA intron (NM_001093729, intron 6 of 9) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 54848 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 236-37 chr20 36451195 36451532 + 1.75 NA intron (NM_001365621, intron 7 of 12) MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -10105 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 189.5-31 chr11 99848494 99848629 + 1.75 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) intron (NM_001243270, intron 5 of 23) 292416 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 325-11 chr2 215381591 215381939 + 1.75 NA intron (NM_212482, intron 32 of 45) intron (NM_212482, intron 32 of 45) 54303 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 311.25-26 chr8 51008702 51009105 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 800542 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 532.25-6 chr6 150578003 150578601 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -21583 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 313.75-16 chr3 113859633 113859912 + 1.75 NA intron (NM_017577, intron 2 of 17) L1MB7|LINE|L1 20984 NM_017577 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 298.75-23 chr2 188732782 188733174 + 1.75 NA TTS (NR_161166) TTS (NR_161166) 57145 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 386.5 chr1 169813980 169814402 + 1.75 NA intron (NM_001320047, intron 9 of 24) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 19151 NM_001366772 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 202.75-70 chr22 28047191 28047355 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) LTR78|LTR|ERV1 -126661 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 273.5-11 chr10 70817700 70818019 + 1.75 NA intron (NM_003901, intron 2 of 14) intron (NM_003901, intron 2 of 14) 1911 NM_003901 8879 Hs.499984 NM_003901 ENSG00000166224 SGPL1 NPHS14|S1PL|SPL sphingosine-1-phosphate lyase 1 protein-coding 233-52 chr5 43532579 43532790 + 1.75 NA intron (NM_006451, intron 9 of 10) intron (NM_006451, intron 9 of 10) -17536 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 328-23 chr3 56487101 56487385 + 1.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -18776 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 360-8 chr2 29563151 29563616 + 1.75 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -88006 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 285.5-57 chr7 111788741 111789039 + 1.75 NA intron (NM_001363540, intron 31 of 52) intron (NM_001363540, intron 31 of 52) -19615 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 455.25 chr11 104872479 104872950 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 25956 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 327-20 chr3 19392550 19392815 + 1.75 NA intron (NM_144633, intron 6 of 15) intron (NM_144633, intron 6 of 15) -77751 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 334.5-31 chr8 141956712 141956969 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -170527 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 226.25-44 chr22 21555980 21556232 + 1.75 NA intron (NM_001256355, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu -4645 NM_001128633 150221 Hs.447643 NM_001128633 ENSG00000183246 RIMBP3C RIM-BP3.3|RIMBP3.3 RIMS binding protein 3C protein-coding 250.5-85 chr6 158808848 158808998 + 1.75 NA intron (NM_003379, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu -9056 NR_102425 101409257 Hs.571207 NR_102425 ENSG00000233893 EZR-AS1 - EZR antisense RNA 1 ncRNA 231-45 chr20 12314462 12314621 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 396648 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 237-11 chr11 58616023 58616212 + 1.75 NA intron (NM_001197051, intron 9 of 10) intron (NM_001197051, intron 9 of 10) -6548 NM_000614 1270 Hs.524920 NM_000614 ENSG00000242689 CNTF HCNTF ciliary neurotrophic factor protein-coding 259.75 chr1 98292116 98292321 + 1.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 81507 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 459.75-2 chr2 172502729 172503155 + 1.75 NA intron (NM_001365530, intron 25 of 25) intron (NM_001365530, intron 25 of 25) -36920 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 334.75 chr1 79430280 79430576 + 1.75 NA Intergenic MER61C|LTR|ERV1 -423698 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 295-25 chr3 34586905 34587106 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 788375 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 282.5-55 chr6 42662741 42662966 + 1.75 NA intron (NM_015255, intron 31 of 46) AluSx3|SINE|Alu 59744 NM_000322 5961 Hs.654489 NM_000322 ENSG00000112619 PRPH2 AOFMD|AVMD|CACD2|DS|MDBS1|PRPH|RDS|RP7|TSPAN22|rd2 peripherin 2 protein-coding 179.5-70 chr17 35066698 35066888 + 1.75 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) intron (NR_037713, intron 1 of 6) -3086 NM_001017368 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 219-23 chr12 33641912 33642081 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -202177 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 251.75-57 chr3 171532209 171532432 + 1.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -71912 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 259-20 chr2 107763483 107763734 + 1.75 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 9496 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 275.25-13 chr11 95420488 95420670 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -188104 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 338.75-5 chr14 51066613 51066971 + 1.75 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) MER57C2|LTR|ERV1 28912 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 313.5-10 chr14 52351800 52352132 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 37654 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 239-32 chr2 215378457 215378666 + 1.75 NA intron (NM_212482, intron 34 of 45) intron (NM_212482, intron 34 of 45) 57507 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 227.25-35 chr18 5335061 5335254 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -38104 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 532.25-3 chr4 72068900 72069586 + 1.75 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 30111 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 313.5-31 chr5 109511536 109511800 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -101694 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 392.25-8 chr2 217619985 217620353 + 1.75 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) MER103C|DNA|hAT-Charlie 136424 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 288-48 chr9 83015068 83015557 + 1.75 NA intron (NM_152573, intron 4 of 16) intron (NM_152573, intron 4 of 16) 47830 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 321.75-27 chr5 20316384 20316645 + 1.75 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 10963 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 324.25-3 chr14 50418675 50419205 + 1.75 NA 3' UTR (NM_006575, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_006575, exon 32 of 32) -21642 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 232-80 chrX 100236023 100236225 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 174149 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 389.25-3 chr14 29993995 29994365 + 1.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -66333 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 420-8 chr3 123483603 123483869 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -35191 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 334-11 chr18 7974524 7974802 + 1.75 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 392371 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 469.75-3 chr3 153148787 153149344 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13161 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 269.25-8 chr12 111126626 111126972 + 1.75 NA intron (NM_001370598, intron 1 of 21) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 26795 NM_001370598 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 221-80 chr8 125769938 125770144 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 181156 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 272.75-40 chr5 42600449 42600633 + 1.75 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) LTR16A|LTR|ERVL 34677 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 185.5-34 chr12 44715641 44715776 + 1.75 NA intron (NM_006159, intron 10 of 20) intron (NM_006159, intron 10 of 20) 159953 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 414-4 chr15 60886532 60886773 + 1.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 205083 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 328.5-35 chr9 71243661 71243869 + 1.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -122144 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 495-3 chr7 51427700 51428197 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34692 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 322-5 chr11 22768905 22769256 + 1.75 NA intron (NR_147085, intron 10 of 10) intron (NR_147085, intron 10 of 10) 60299 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 172.5-153 chr5 24565057 24565219 + 1.75 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) intron (NM_001362460, intron 2 of 9) 79840 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 280.25-51 chr7 67531112 67531431 + 1.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 195295 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 152.75-35 chr11 65886609 65886703 + 1.75 NA intron (NM_004214, intron 3 of 9) intron (NM_004214, intron 3 of 9) 1815 NM_004214 9158 Hs.7768 NM_004214 ENSG00000172500 FIBP FGFIBP|FIBP-1|TROFAS FGF1 intracellular binding protein protein-coding 252-13 chr11 29135316 29135674 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -458918 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 333-21 chr6 81984207 81984640 + 1.75 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) L1ME2z|LINE|L1 -46002 NR_149134 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 309-44 chr7 4051246 4051503 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 18 of 44) intron (NM_152744, intron 18 of 44) -78311 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 245.25-16 chr12 66881588 66881862 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -77456 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 273-6 chr1 218869258 218869486 + 1.75 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1MA8|LINE|L1 49139 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 586.25 chr14 55606467 55607168 + 1.75 NA intron (NR_073129, intron 2 of 45) intron (NR_073129, intron 2 of 45) 26610 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 321-22 chr5 30697301 30697638 + 1.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -496217 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 299.5-3 chr10 25663818 25664058 + 1.75 NA intron (NR_108067, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 12226 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 375-9 chr3 140535431 140535682 + 1.75 NA intron (NM_022131, intron 9 of 16) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -26767 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 253.25-38 chr21 10753327 10753498 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 231898 NM_199259 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 350.25-6 chr11 32533461 32533770 + 1.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -50216 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 374.5-16 chr8 129414552 129415063 + 1.75 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 69335 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 480.25-7 chr7 8439896 8440527 + 1.75 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 6602 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 401.5-7 chr18 65101163 65101570 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -648886 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 231.5-11 chr10 82399406 82399590 + 1.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -166578 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 437 chr1 95192867 95193252 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001199679, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001199679, exon 7 of 7) 40923 NR_125949 101928118 Hs.656443 NR_125948 ENSG00000226026 LOC101928118 - uncharacterized LOC101928118 ncRNA 276-41 chr5 165034438 165034642 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 564261 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 451.5 chr1 95387931 95388452 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36084 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 320.75-22 chr6 56068793 56069192 + 1.75 NA intron (NM_030820, intron 22 of 29) intron (NM_030820, intron 22 of 29) 22670 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 450.75-4 chr5 60144580 60145043 + 1.75 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) 227852 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 199.5-7 chr1 107556131 107556321 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 132273 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 204.75-106 chr6 155956829 155957024 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 10129 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 273.5-29 chr18 38289550 38289713 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 632496 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 302-20 chr3 34568487 34568764 + 1.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 769995 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 320-13 chr15 70724484 70724857 + 1.75 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) -22388 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 209.5-15 chr10 87796127 87796318 + 1.75 NA intron (NM_001321967, intron 2 of 9) intron (NM_001321967, intron 2 of 9) 22009 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 368-11 chr6 42082735 42083319 + 1.75 NA 3' UTR (NM_138572, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_138572, exon 9 of 9) 32503 NM_138572 129685 Hs.520122 NM_138572 ENSG00000137413 TAF8 II|TAF|TAF(II)43|TAFII-43|TAFII43|TBN TATA-box binding protein associated factor 8 protein-coding 413.75-2 chr18 52956360 52956634 + 1.75 NA intron (NM_005215, intron 5 of 28) L1MC1|LINE|L1 -280604 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 118-166 chr6 117376588 117376807 + 1.75 NA intron (NM_002944, intron 17 of 42) L1ME2|LINE|L1 49158 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 353-7 chr2 102561628 102562039 + 1.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -57720 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 282-27 chr2 63128359 63128545 + 1.75 NA intron (NR_148704, intron 18 of 18) (TTTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8910 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 323-24 chr7 19286297 19286723 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -141089 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 270-47 chr6 63674154 63674478 + 1.75 NA intron (NM_001370350, intron 2 of 14) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 27790 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 364-3 chr12 25961420 25961681 + 1.75 NA intron (NM_001164748, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR -2108 NR_038228 100506451 Hs.560092 NR_038227 RASSF8-AS1 - RASSF8 antisense RNA 1 ncRNA 153-87 chr20 57145975 57146090 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -67664 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 291.25-10 chr16 80428914 80429170 + 1.75 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR -111692 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 367-9 chr2 188996338 188996670 + 1.75 NA TTS (NR_037401) TTS (NR_037401) 874 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 175.25-14 chr1 226712912 226713117 + 1.75 NA intron (NM_002221, intron 2 of 7) (TACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26161 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 206-42 chr2 11438943 11439147 + 1.75 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 27116 NM_001278276 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 351-12 chr2 123200643 123200851 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -127266 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 307.25-5 chr11 115443729 115443961 + 1.75 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 47089 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 216.75-20 chr12 5612640 5612771 + 1.75 NA exon (NM_001364791, exon 19 of 25) exon (NM_001364791, exon 19 of 25) 118573 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 149.25-65 chr17 70770201 70770295 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 431931 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 412.75 chr11 76049296 76049564 + 1.75 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) intron (NM_003369, intron 12 of 14) 157072 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 387.25-8 chr20 35651311 35651731 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001198840, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001198840, exon 2 of 2) 2388 NM_003915 8904 Hs.246413 NM_003915 ENSG00000214078 CPNE1 COPN1|CPN1 copine 1 protein-coding 279.75-7 chr11 50646888 50647209 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 237901 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 333-12 chr2 194139614 194139901 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -204512 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 459.75-5 chr7 136472272 136472671 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -396181 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 310-26 chr8 70483662 70483899 + 1.75 NA intron (NR_110653, intron 3 of 3) intron (NR_110653, intron 3 of 3) 12646 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 276.25-7 chr11 128886980 128887261 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4236 NM_000890 3762 Hs.444595 NM_000890 ENSG00000120457 KCNJ5 CIR|GIRK4|KATP1|KIR3.4|LQT13 potassium voltage-gated channel subfamily J member 5 protein-coding 202.25-88 chr7 82842708 82842938 + 1.75 NA intron (NM_033026, intron 13 of 24) L1MA8|LINE|L1 320061 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 254-33 chr3 99549968 99550230 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -88495 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 436.25-4 chr22 29055725 29056207 + 1.75 NA 3' UTR (NM_032173, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_032173, exon 9 of 9) 5953 NM_015370 25770 Hs.50891 NM_015370 ENSG00000100249 C22orf31 HS747E2A|bK747E2.1 chromosome 22 open reading frame 31 protein-coding 429.25-4 chr21 25626611 25627055 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12425 NM_021219 58494 Hs.517227 NM_021219 ENSG00000154721 JAM2 C21orf43|CD322|JAM-B|JAMB|PRO245|VE-JAM|VEJAM junctional adhesion molecule 2 protein-coding 201.25-96 chr9 87221300 87221537 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 72774 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 476.75-2 chr9 77540427 77540821 + 1.75 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) L1MA4A|LINE|L1 92975 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 264-12 chr11 111637835 111638041 + 1.75 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) HAL1|LINE|L1 35489 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 283-39 chr5 171861483 171861747 + 1.75 NA TTS (NM_033645) TTS (NM_033645) 75743 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 224.5-75 chr3 120834777 120834970 + 1.75 NA intron (NR_135571, intron 1 of 1) intron (NR_135571, intron 1 of 1) 1484 NR_135571 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 435.5-5 chr14 50605421 50605927 + 1.75 NA intron (NM_015915, intron 6 of 13) intron (NM_015915, intron 6 of 13) 45649 NM_015915 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 346.75-4 chr11 21742636 21742917 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -450309 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 155.5-159 chr5 12308938 12309037 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -265870 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 418.75-2 chr16 6492894 6493210 + 1.75 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -280757 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 343-35 chr9 18464699 18464942 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -9333 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 253.25-55 chr6 90878892 90879199 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -291973 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 230.5-12 chr10 23039053 23039378 + 1.75 NA TTS (NM_001282747) TTS (NM_001282747) -56364 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 400.5-2 chr13 69935225 69935691 + 1.75 NA intron (NM_001286725, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 -171755 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 229.25-56 chr3 178715045 178715271 + 1.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 145247 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 190.75-5 chr1 203696846 203696979 + 1.75 NA intron (NM_001001396, intron 2 of 21) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32669 NR_003019 677843 Hs.676135 NR_003019 ENSG00000221643 SNORA77 ACA63|SNORA77A small nucleolar RNA, H/ACA box 77 snoRNA 369.5 chr1 7184654 7184901 + 1.75 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) L1MC4a|LINE|L1 204977 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 177.25-39 chr12 17129065 17129200 + 1.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 140385 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 398.75-6 chr6 70516017 70516395 + 1.75 NA intron (NM_020819, intron 11 of 20) intron (NM_020819, intron 11 of 20) -50724 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 305.75-18 chr3 79517405 79517833 + 1.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L2|LINE|L2 9732 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 235.5-12 chr10 74666013 74666238 + 1.75 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) intron (NM_001369124, intron 8 of 9) -136801 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 144.75-31 chr11 80754137 80754258 + 1.75 NA intron (NR_120570, intron 2 of 2) intron (NR_120570, intron 2 of 2) 8606 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 398.75-2 chr12 110253110 110253527 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27929 NM_170665 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 417.75 chr1 86284206 86284485 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 73342 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 218.75-9 chr10 78632241 78632408 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 364982 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 729.75 chr12 119464903 119465732 + 1.75 NA intron (NM_178499, intron 2 of 13) AluY|SINE|Alu -128457 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 412.75-3 chr22 22120530 22121075 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -76868 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 250.5-75 chr5 77695526 77695755 + 1.75 NA intron (NM_004607, intron 2 of 3) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -56943 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 377.5-6 chr14 86533116 86533493 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -372474 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 384.25-17 chr7 3598041 3598448 + 1.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1ME2|LINE|L1 296992 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 373.75-10 chr21 30454947 30455588 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 14988 NM_181623 254950 Hs.553654 NM_181623 ENSG00000186970 KRTAP15-1 KAP15.1 keratin associated protein 15-1 protein-coding 496.25-3 chr11 115254737 115255197 + 1.75 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 -78610 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 520.5 chr1 65721904 65722391 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -70363 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 287.75-17 chr14 45442231 45442456 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -189141 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 255.75-4 chr1 232142317 232142721 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 216685 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 323.25-29 chr8 133168195 133168526 + 1.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -22679 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 380.5-14 chr9 71928884 71929509 + 1.75 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) intron (NM_001365055, intron 2 of 4) 17557 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 172.5-112 chr20 50941769 50941981 + 1.75 NA intron (NM_001317035, intron 6 of 9) intron (NM_001317035, intron 6 of 9) -10438 NM_001347511 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 557-2 chr4 64480807 64481224 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -71555 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 293.75-40 chr6 64205133 64205339 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 398400 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 132.5-5 chr1 38391821 38391960 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -83306 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 492.5 chr1 31527346 31527838 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 9157 NR_027085 284551 Hs.658659 NR_027085 LINC01226 - long intergenic non-protein coding RNA 1226 ncRNA 135-89 chr2 213803591 213803715 + 1.75 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) L1MEg|LINE|L1 45586 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 302.5-29 chr4 97909677 97909924 + 1.75 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) L1M5|LINE|L1 233676 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 303.75-19 chr2 99351164 99351424 + 1.75 NA intron (NM_015904, intron 1 of 23) L1ME1|LINE|L1 13905 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 315.75-23 chr5 178143392 178143682 + 1.75 NA intron (NM_001288795, intron 5 of 10) intron (NM_001288795, intron 5 of 10) 10423 NM_017838 55651 Hs.744074 NM_017838 ENSG00000145912 NHP2 DKCB2|NHP2P|NOLA2 NHP2 ribonucleoprotein protein-coding 338-30 chr6 149798258 149798482 + 1.75 NA intron (NM_001360452, intron 6 of 7) intron (NM_001360452, intron 6 of 7) 48629 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 344.5-35 chr9 35875962 35876282 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5721 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 385.25-3 chr15 76618329 76618759 + 1.75 NA intron (NR_148227, intron 22 of 32) L1MD|LINE|L1 31897 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 209-22 chr14 69830017 69830271 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 18384 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 205.25-48 chr2 11973177 11973507 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -33774 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 228-36 chr17 42672735 42672915 + 1.75 NA intron (NR_073573, intron 6 of 12) intron (NR_073573, intron 6 of 12) 3186 NR_073574 79990 Hs.632251 NM_024927 ENSG00000068137 PLEKHH3 - pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3 protein-coding 231.25-62 chr4 110026262 110026462 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 113479 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 338.25-29 chr8 87571495 87571981 + 1.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 302277 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 239.75-67 chr6 128620767 128621020 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -100294 NM_001291984 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 206.5-66 chr20 45013871 45014100 + 1.75 NA intron (NM_001352385, intron 9 of 11) intron (NM_001352385, intron 9 of 11) 47473 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 334.25-22 chr9 37721630 37721933 + 1.75 NA intron (NM_001371225, intron 6 of 15) L1ME4c|LINE|L1 -32022 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 215.5-74 chr4 22497362 22497577 + 1.75 NA intron (NM_145290, intron 1 of 18) intron (NM_145290, intron 1 of 18) -17843 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 325.75-3 chr1 227646140 227646398 + 1.75 NA intron (NR_102302, intron 2 of 5) intron (NR_102302, intron 2 of 5) 51438 NR_036753 401983 Hs.681816 NR_036753 ZNF847P gm127 zinc finger protein 847, pseudogene pseudo 735.25 chr7 8012342 8013306 + 1.75 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) L1MB3|LINE|L1 44028 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 462-6 chr2 42236829 42237386 + 1.75 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) AluJb|SINE|Alu -66876 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 279.5-36 chr3 2746706 2746907 + 1.75 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) intron (NM_175607, intron 6 of 24) -145409 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 419.25-9 chr8 109930937 109931347 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 44629 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 334.5-17 chr3 63802763 63803091 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -16372 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 351.5-6 chr11 94583628 94583897 + 1.75 NA intron (NM_152431, intron 5 of 19) intron (NM_152431, intron 5 of 19) 16394 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 563.5-4 chr8 139951064 139951608 + 1.75 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 149199 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 188-69 chr7 82800473 82800623 + 1.75 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) MIR|SINE|MIR -356592 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 485.25-4 chr7 11837428 11837937 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5484 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 186.25-18 chr11 100399264 100399434 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -287939 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 183.5-141 chr7 86217754 86217879 + 1.75 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -426093 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 349.5-4 chr12 38739248 38739583 + 1.75 NA intron (NM_153634, intron 10 of 19) intron (NM_153634, intron 10 of 19) 166176 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 149.5-29 chr10 71713856 71714015 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001168390, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001168390, exon 2 of 2) 5843 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 279.75-22 chr2 105842874 105843185 + 1.75 NA intron (NM_003581, intron 2 of 4) intron (NM_003581, intron 2 of 4) -8818 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 263.75-54 chr9 36337318 36337581 + 1.75 NA 3' UTR (NM_022781, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_022781, exon 12 of 12) -60393 NM_001190388 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 374.5-5 chr14 66340967 66341444 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -145166 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 280-3 chr1 97428967 97429255 + 1.75 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) intron (NM_000110, intron 14 of 22) 333188 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 222-36 chr2 41917659 41917877 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 15955 NR_110262 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 344.25-16 chr8 100133522 100133858 + 1.75 NA non-coding (NR_036491, exon 5 of 5) non-coding (NR_036491, exon 5 of 5) 12127 NR_036491 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 329.5-29 chr9 27237461 27237709 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 45208 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 485.5-3 chr2 83112387 83112787 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 255784 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 274-2 chr1 84083192 84083399 + 1.75 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) intron (NM_002731, intron 1 of 9) 5216 NM_207578 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 237.25-16 chr12 47197722 47197895 + 1.75 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) L1MC|LINE|L1 9996 NR_039847 100616486 NR_039847 ENSG00000263838 MIR4698 - microRNA 4698 ncRNA 278.75-38 chr8 99703026 99703262 + 1.75 NA intron (NM_017890, intron 36 of 61) intron (NM_017890, intron 36 of 61) -166283 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 318-29 chr4 63400717 63400938 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1008623 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 257.75-33 chr4 83345690 83345908 + 1.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -10646 NM_001166498 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 229.5-32 chr11 132439920 132440153 + 1.75 NA intron (NM_002545, intron 3 of 6) intron (NM_002545, intron 3 of 6) 155734 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 303.25-17 chr2 78244266 78244616 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 46290 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 218.5-47 chr17 70646933 70647193 + 1.75 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 477528 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 337-29 chr7 34525435 34525818 + 1.75 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 -132592 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 378.75-7 chr5 83335529 83335797 + 1.75 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 -136011 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 596 chr2 180398380 180399088 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -293370 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 242.75-65 chr8 56079326 56079662 + 1.75 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 4902 NR_149110 105375847 NR_149110 ENSG00000253603 CERNA3 CTA competing endogenous lncRNA 3 for miR-645 ncRNA 309.5-28 chr3 42506739 42506950 + 1.75 NA intron (NM_001251884, intron 1 of 11) intron (NM_001251884, intron 1 of 11) 4201 NM_004624 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 258.25-46 chr5 130800548 130800850 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 364557 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 273.25-27 chr5 1205372 1205679 + 1.75 NA intron (NM_001003841, intron 1 of 11) intron (NM_001003841, intron 1 of 11) 3930 NM_001003841 340024 Hs.481478 NM_001003841 ENSG00000174358 SLC6A19 B0AT1|HND solute carrier family 6 member 19 protein-coding 173.75-112 chr3 188034193 188034373 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -57876 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 247.5-64 chr5 23761223 23761449 + 1.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -190012 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 338.75-18 chr5 26608197 26608627 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 430174 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 325.25-30 chr7 136774259 136774469 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -94288 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 251.5-22 chr13 28388623 28388821 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001159920, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001159920, exon 13 of 13) 106406 NM_001160030 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 155.25-165 chr7 83399753 83399964 + 1.75 NA intron (NM_001178129, intron 11 of 16) MER94|DNA|hAT-Blackjack -236974 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 306-7 chr14 82431119 82431441 + 1.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -211352 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 226.25-46 chr3 55447487 55447620 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 33845 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 372.25-6 chr3 187988677 187989020 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -12441 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 450-2 chr11 23214388 23214822 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 204585 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 233.5-58 chr2 138286302 138286541 + 1.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 184537 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 378-21 chr9 126457702 126458053 + 1.75 NA intron (NM_033446, intron 7 of 9) intron (NM_033446, intron 7 of 9) -47373 NR_045006 641373 Hs.742606 NR_045006 NRON NCRNA00194 non-coding repressor of NFAT ncRNA 341.25-25 chr7 56256160 56256519 + 1.75 NA Intergenic LTR2752|LTR|ERV1 -139922 NM_001145712 389493 Hs.177948 NM_001145712 ENSG00000185290 NUPR2 NUPR1L nuclear protein 2, transcriptional regulator protein-coding 290.75-43 chr4 161601849 161602050 + 1.75 NA intron (NM_001128428, intron 7 of 14) L1MCc|LINE|L1 -420784 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 236-33 chr2 194525425 194525671 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 181279 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 444-4 chr2 125980503 125980958 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 137255 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 225-7 chr1 234866322 234866516 + 1.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 97580 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 218.75-18 chr12 29764490 29764760 + 1.75 NA intron (NM_001367875, intron 2 of 19) intron (NM_001367875, intron 2 of 19) 19317 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 480.5-2 chr17 80573274 80573725 + 1.75 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) L1ME3B|LINE|L1 28661 NM_001163034 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 273.5-84 chrX 121676698 121677032 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 305893 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 173.5-153 chr7 86134525 86134690 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -509302 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 357.5-21 chr8 119685182 119685669 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12035 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 138.25-170 chr8 95464170 95464280 + 1.75 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR -195024 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 199.25-11 chr10 81573956 81574123 + 1.75 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -301155 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 208.25-94 chr8 129911593 129911838 + 1.75 NA intron (NM_001353246, intron 1 of 12) intron (NM_001353246, intron 1 of 12) 28096 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 313.25-13 chr2 97833609 97833882 + 1.75 NA intron (NM_015348, intron 10 of 40) AluSz6|SINE|Alu 99339 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 204.75-109 chr7 39944513 39944636 + 1.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 4845 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 263-39 chr5 7461821 7462061 + 1.75 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 65803 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 170-5 chr1 189727218 189727409 + 1.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 748697 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 244.5-77 chr5 29788321 29788513 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -92143 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 327.75-27 chr8 79271364 79271669 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -60672 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 299.25-18 chr14 59843422 59843708 + 1.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 27211 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 272 chr1 14237139 14237447 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 182680 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 246-42 chr3 182958856 182959073 + 1.75 NA intron (NM_020640, intron 4 of 6) intron (NM_020640, intron 4 of 6) 21574 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 339.75-23 chr22 28100171 28100491 + 1.75 NA intron (NM_001145418, intron 9 of 22) MIRc|SINE|MIR -179719 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 280.25-34 chr22 26777941 26778198 + 1.75 NA intron (NR_110543, intron 4 of 5) AluJo|SINE|Alu -82142 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 213.25-21 chr16 12241028 12241184 + 1.75 NA intron (NM_032167, intron 14 of 20) intron (NM_032167, intron 14 of 20) 264372 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 232.75-28 chr16 83138893 83139105 + 1.75 NA intron (NM_001220490, intron 3 of 12) intron (NM_001220490, intron 3 of 12) -148701 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 260.75 chr1 112189665 112189906 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 199249 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 453.75-3 chr18 22445264 22445526 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27480 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 424-7 chr4 31534100 31534558 + 1.75 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1MC3|LINE|L1 27785 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 248-34 chr2 50797434 50797627 + 1.75 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) MER20|DNA|hAT-Charlie -101268 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 271.25-18 chr12 43160955 43161263 + 1.75 NA intron (NR_146866, intron 3 of 3) intron (NR_146866, intron 3 of 3) 5794 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 246-8 chr11 76944029 76944176 + 1.75 NA intron (NM_001300955, intron 2 of 9) L1M2a1|LINE|L1 83184 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 300.75-47 chr8 116580912 116581136 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -71076 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 296.5-25 chr3 162645884 162646174 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 657272 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 386.5-5 chr11 103259851 103260090 + 1.75 NA exon (NM_001080463, exon 71 of 90) exon (NM_001080463, exon 71 of 90) 150544 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 232.5-21 chr13 108535666 108536009 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -60068 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 260-39 chr7 22772378 22772587 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -44862 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 145-149 chr7 83790626 83790737 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -141542 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 374.5-3 chr10 104031609 104032072 + 1.75 NA 3' UTR (NM_000494, exon 56 of 56) 3' UTR (NM_000494, exon 56 of 56) 16346 NR_030760 100126326 NR_030760 ENSG00000283788 MIR936 MIRN936|hsa-mir-936 microRNA 936 ncRNA 190-4 chr1 81837238 81837364 + 1.75 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 34848 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 323.5-4 chr10 80593161 80593574 + 1.75 NA intron (NM_207372, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 52548 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 300.25-23 chr5 37722140 37722425 + 1.75 NA intron (NM_001345998, intron 14 of 17) intron (NM_001345998, intron 14 of 17) 112540 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 146-132 chr8 138363147 138363282 + 1.75 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) intron (NM_015912, intron 2 of 19) 134047 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 217.75-37 chr2 41248351 41248494 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -629133 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 200-4 chr1 166015667 166015939 + 1.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 107882 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 213.5-26 chr11 81541596 81541814 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 349131 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 539.25-3 chr3 77115842 77116668 + 1.75 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 18243 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 421.75-2 chr1 166332420 166332755 + 1.75 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 157452 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 369.25-4 chr15 67620804 67621104 + 1.75 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) L1MEd|LINE|L1 71860 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 309-42 chr6 118239188 118239436 + 1.75 NA intron (NM_001029858, intron 3 of 7) intron (NM_001029858, intron 3 of 7) 153409 NR_134601 105377967 Hs.692865 NR_134601 LOC105377967 - uncharacterized LOC105377967 ncRNA 184.5-91 chr21 28518388 28518548 + 1.75 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -20850 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 272.25-58 chr8 26535299 26535483 + 1.75 NA intron (NM_001197293, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 21360 NM_001197293 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 346.5-18 chr22 24742920 24743263 + 1.75 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) L1PB1|LINE|L1 -21410 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 423.25-5 chr6 126633846 126634396 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 149490 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 225.5-23 chr12 8862580 8862836 + 1.75 NA intron (NM_001282424, intron 17 of 24) intron (NM_001282424, intron 17 of 24) 17704 NM_001282424 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 272.75-47 chr7 77933551 77933850 + 1.75 NA intron (NM_001366082, intron 10 of 11) L2a|LINE|L2 93570 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 310.75-13 chr14 45964123 45964470 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -99863 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 224.75-2 chr1 29986910 29987106 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 50604 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 372.5-21 chr7 18816932 18817174 + 1.75 NA intron (NM_058176, intron 16 of 22) AluY|SINE|Alu 300583 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 495.5 chr5 115284740 115285174 + 1.75 NA intron (NM_001040440, intron 1 of 9) intron (NM_001040440, intron 1 of 9) 11333 NM_152549 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 265.25 chr1 17605841 17606139 + 1.75 NA intron (NM_018125, intron 6 of 28) intron (NM_018125, intron 6 of 28) -12323 NM_001319838 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 201.5-135 chr9 35771339 35771521 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -17154 NM_001044264 692094 Hs.571601 NM_001044264 ENSG00000215183 MSMP PSMP microseminoprotein, prostate associated protein-coding 233.5-118 chrX 79876992 79877237 + 1.75 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -137639 NM_001109878 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 370.25-11 chr5 137507534 137507797 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -8339 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 215-71 chr8 86142482 86142645 + 1.75 NA intron (NM_152565, intron 4 of 7) intron (NM_152565, intron 4 of 7) 43653 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 312 chr1 172360597 172360972 + 1.75 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) Plat_L3|LINE|CR1 -59901 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 305-7 chr12 18858755 18859040 + 1.75 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 120778 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 335.75-13 chr3 120767846 120768079 + 1.75 NA intron (NM_005513, intron 2 of 4) intron (NM_005513, intron 2 of 4) 25218 NM_005513 2960 Hs.445272 NM_005513 ENSG00000153767 GTF2E1 FE|TF2E1|TFIIE-A general transcription factor IIE subunit 1 protein-coding 155.5-178 chr5 176770690 176770785 + 1.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 27532 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 184.25-85 chr3 190325363 190325541 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3006 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 317.75-3 chr1 209058866 209059071 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 86514 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 261.75-52 chr8 89119490 89119677 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 638128 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 481 chr1 150891815 150892208 + 1.75 NA intron (NR_148929, intron 1 of 1) intron (NR_148929, intron 1 of 1) 4758 NR_148929 100996521 Hs.208452 NR_148929 CTXND2 - cortexin domain containing 2 ncRNA 132.75-167 chr6 129703895 129704065 + 1.75 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) intron (NM_033515, intron 1 of 14) 6197 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 358.5-14 chr20 63267471 63267958 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -5071 NM_001281483 55738 Hs.25584 NM_018209 ENSG00000101199 ARFGAP1 ARF1GAP|HRIHFB2281 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1 protein-coding 484.25 chr12 113916707 113917037 + 1.75 NA intron (NM_001146698, intron 20 of 24) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 49453 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 356.5-17 chr4 111133781 111134060 + 1.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -273273 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 174.5-17 chr1 239290750 239290876 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -95755 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 271.5-85 chr8 105605494 105605691 + 1.75 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 286049 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 185.5-30 chr12 14537826 14537939 + 1.75 NA intron (NM_024829, intron 4 of 10) intron (NM_024829, intron 4 of 10) -29850 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 553.75-3 chr7 94523188 94523816 + 1.75 NA intron (NM_001363427, intron 4 of 17) L1MEd|LINE|L1 13693 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 481-6 chr14 49505200 49505884 + 1.75 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL 80838 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 195.5-15 chr10 62073551 62073806 + 1.75 NA intron (NM_001244638, intron 5 of 6) intron (NM_001244638, intron 5 of 6) 24321 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 489.75 chr1 100846400 100847050 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 48117 NM_001033025 2135 Hs.357637 NM_001439 ENSG00000162694 EXTL2 EXTR2 exostosin like glycosyltransferase 2 protein-coding 414.75-6 chr2 51576767 51577072 + 1.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 544318 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 240-31 chr21 28499383 28499578 + 1.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -39838 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 222.75-42 chr14 70376557 70376724 + 1.75 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -16957 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 295.25-37 chrX 66502222 66502423 + 1.75 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 113708 NM_001242310 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 292-30 chr3 102766677 102766884 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 331765 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 226-68 chr8 94304032 94304275 + 1.75 NA Intergenic UCON105|Unknown|Unknown -41834 NM_005261 2669 Hs.654463 NM_005261 ENSG00000164949 GEM KIR GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle protein-coding 520.75-2 chr15 25271355 25271919 + 1.75 NA intron (NR_146177, intron 144 of 147) intron (NR_146177, intron 144 of 147) 1854 NR_003362 100033822 NR_003362 ENSG00000201634 SNORD115-48 HBII-52-48 small nucleolar RNA, C/D box 115-48 snoRNA 209.25-41 chr17 44084669 44084812 + 1.75 NA intron (NM_001015053, intron 15 of 26) intron (NM_001015053, intron 15 of 26) 13829 NR_028581 92579 Hs.294005 NM_138387 ENSG00000141349 G6PC3 SCN4|UGRP glucose-6-phosphatase catalytic subunit 3 protein-coding 248.25-76 chr8 143006549 143006743 + 1.75 NA intron (NR_026913, intron 1 of 1) L1PA13|LINE|L1 10818 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 337.5-16 chr18 64353110 64353683 + 1.75 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) L1MA5|LINE|L1 -93341 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 406-2 chr11 28845652 28845910 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -368233 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 265.75-39 chr2 172281656 172281857 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -145580 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 385.25-14 chr8 115596202 115596670 + 1.75 NA intron (NM_001282902, intron 3 of 5) (ATACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 71577 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 390.5-14 chr8 123741164 123741553 + 1.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -3965 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 290.75-35 chr22 40421807 40422120 + 1.75 NA intron (NM_001282661, intron 8 of 13) intron (NM_001282661, intron 8 of 13) 41477 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 361.75 chr1 147807214 147807585 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -34037 NM_005266 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 225.25-51 chr21 44909145 44909377 + 1.75 NA intron (NM_001303238, intron 3 of 15) L1MC4|LINE|L1 11638 NM_000211 3689 Hs.375957 NM_000211 ENSG00000160255 ITGB2 CD18|LAD|LCAMB|LFA-1|MAC-1|MF17|MFI7 integrin subunit beta 2 protein-coding 288.75-37 chr5 177347555 177347753 + 1.75 NA intron (NM_006816, intron 2 of 7) intron (NM_006816, intron 2 of 7) 4014 NM_006816 10960 Hs.75864 NM_006816 ENSG00000169223 LMAN2 C5orf8|GP36B|VIP36 lectin, mannose binding 2 protein-coding 259.5-97 chr8 121978220 121978481 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -336910 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 422.75-6 chr9 33012055 33012566 + 1.75 NA intron (NM_001368996, intron 1 of 7) intron (NM_001368996, intron 1 of 7) -10669 NM_175073 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 270-14 chr12 42583617 42583946 + 1.75 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 5965 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 345.5-8 chr11 100920869 100921184 + 1.75 NA intron (NM_001367945, intron 7 of 25) intron (NM_001367945, intron 7 of 25) -13248 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 239-46 chr5 120743621 120743800 + 1.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 212246 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 308.5-39 chr8 140690340 140690616 + 1.75 NA intron (NR_148037, intron 28 of 34) intron (NR_148037, intron 28 of 34) 28091 NM_001352751 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 178.25-28 chr13 85767361 85767529 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 31974 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 337.75-15 chr5 3554984 3555182 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -18989 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 259.75-53 chr8 85249787 85249984 + 1.75 NA intron (NM_198584, intron 1 of 6) intron (NM_198584, intron 1 of 6) 4427 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 309.75-35 chr7 82500779 82501091 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -56979 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 176-10 chr11 67207246 67207407 + 1.75 NA intron (NR_027473, intron 5 of 20) intron (NR_027473, intron 5 of 20) -32688 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 294.5-48 chr6 149167549 149167874 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -50213 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 296.25-6 chr13 79752947 79753212 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -51307 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 290.75-34 chr22 24771918 24772126 + 1.75 NA intron (NR_045648, intron 1 of 21) intron (NR_045648, intron 1 of 21) 2698 NR_045648 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 340.5-26 chr5 65785941 65786339 + 1.75 NA intron (NM_020726, intron 7 of 12) intron (NM_020726, intron 7 of 12) 63935 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 427.5-8 chr5 76755836 76756095 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39839 NM_001992 2149 Hs.482562 NM_001992 ENSG00000181104 F2R CF2R|HTR|PAR-1|PAR1|TR coagulation factor II thrombin receptor protein-coding 185-32 chr17 70301935 70302097 + 1.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 132481 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 269.75-19 chr14 65122103 65122368 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -19540 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 206-58 chr5 30149760 30149902 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 269271 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 267.25-46 chr8 132460905 132461151 + 1.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L1MC3|LINE|L1 -13766 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 325.75-29 chr8 83212743 83213219 + 1.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -190777 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 213-15 chr10 112181677 112181898 + 1.75 NA 5' UTR (NM_020918, exon 3 of 22) 5' UTR (NM_020918, exon 3 of 22) 1978 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 227.75-40 chr2 118153194 118153380 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 33099 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 239.25-34 chr15 95341784 95341983 + 1.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -14783 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 586 chr2 114679166 114679941 + 1.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 153995 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 247.25-20 chr15 86167855 86168015 + 1.75 NA intron (NM_152336, intron 5 of 24) intron (NM_152336, intron 5 of 24) -51218 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 182.5-143 chr6 100495162 100495429 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -31620 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 172.75-14 chr10 72832605 72832803 + 1.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR -61035 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 299.5-21 chr2 196496876 196497163 + 1.75 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) L2b|LINE|L2 95964 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 402.5-2 chr10 60062343 60062781 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 39 of 43) intron (NM_001204403, intron 39 of 43) 78454 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 209-26 chr16 59239552 59239682 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -505301 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 258.5-18 chr12 88468154 88468390 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 112199 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 456.25-4 chr22 27857695 27858272 + 1.75 NA intron (NM_001284278, intron 10 of 11) intron (NM_001284278, intron 10 of 11) -56227 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 350-8 chr2 129736885 129737239 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 140429 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 378.5-12 chr3 153730842 153731105 + 1.75 NA intron (NR_146713, intron 1 of 6) intron (NR_146713, intron 1 of 6) 31553 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 178-73 chr4 84135905 84136196 + 1.75 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) L2|LINE|L2 163119 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 276-39 chr5 101136055 101136286 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -232888 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 207.5-57 chr2 214886758 214886942 + 1.75 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) LTR84a|LTR|ERVL 39903 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 140.5-83 chr17 47179758 47179923 + 1.75 NA intron (NM_001256, intron 2 of 18) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 9455 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 279-58 chr9 29646625 29647035 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -433229 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 393.75 chr10 91808791 91809221 + 1.75 NA intron (NM_025235, intron 1 of 26) intron (NM_025235, intron 1 of 26) 10580 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 166.25-95 chr21 36625953 36626115 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -49465 NM_001146077 23562 Hs.660278 NM_012130 ENSG00000159261 CLDN14 DFNB29 claudin 14 protein-coding 256.5-78 chr8 107970133 107970381 + 1.75 NA intron (NM_001282863, intron 2 of 4) MER58B|DNA|hAT-Charlie 111682 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 555.25 chr5 11578379 11578721 + 1.75 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) AluSg|SINE|Alu 10367 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 317-6 chr1 241146184 241146374 + 1.75 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) MER2|DNA|TcMar-Tigger 14007 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 307-5 chr10 33328105 33328396 + 1.75 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 6417 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 256.25-15 chr16 71661441 71661684 + 1.75 NA intron (NM_001289003, intron 12 of 17) intron (NM_001289003, intron 12 of 17) 35378 NM_001017967 91862 Hs.513706 NM_052858 ENSG00000140832 MARVELD3 MARVD3|MRVLDC3 MARVEL domain containing 3 protein-coding 210.25-23 chr14 62914330 62914601 + 1.75 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 130993 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 358.75-7 chr2 209851136 209851529 + 1.75 NA intron (NM_032504, intron 22 of 63) intron (NM_032504, intron 22 of 63) 79339 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 493.5-4 chr2 35227657 35228397 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -243378 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 420.5-10 chr4 176213878 176214195 + 1.75 NA 3' UTR (NM_080874, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_080874, exon 7 of 7) -18451 NM_144644 132851 Hs.481235 NM_144644 ENSG00000150628 SPATA4 SPEF1B|TSARG2 spermatogenesis associated 4 protein-coding 349-11 chr5 12330967 12331294 + 1.75 NA Intergenic LTR9B|LTR|ERV1 -243727 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 307.75-7 chr17 78595713 78595925 + 1.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -18425 NM_173628 8632 Hs.375975 NM_003727 ENSG00000187775 DNAH17 DNAHL1|DNEL2 dynein axonemal heavy chain 17 protein-coding 320-31 chr4 69955226 69955567 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001302770, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001302770, exon 7 of 7) 5615 NM_001891 1447 Hs.2242 NM_001891 ENSG00000135222 CSN2 CASB casein beta protein-coding 310.75-22 chr22 32758741 32758954 + 1.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) MER20B|DNA|hAT-Charlie -41969 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 244.75-14 chr11 91433271 91433650 + 1.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -564258 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 374.25-10 chr6 50507501 50507758 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -205915 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 132.5-22 chr1 185386034 185386164 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -51060 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 205.25-70 chr3 104012080 104012275 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -488061 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 344.5-13 chr3 58689700 58689970 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -23061 NM_138805 131177 Hs.61265 NM_138805 ENSG00000198643 FAM3D EF7|OIT1 family with sequence similarity 3 member D protein-coding 303.5-10 chr14 38453389 38453768 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -197485 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 205.25-76 chr4 53475517 53475681 + 1.75 NA intron (NM_001126328, intron 9 of 10) intron (NM_001126328, intron 9 of 10) -24478 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 154-34 chr12 4789204 4789376 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19886 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 292.5-30 chr2 37364109 37364378 + 1.75 NA intron (NM_012413, intron 3 of 6) HAL1|LINE|L1 19613 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 391.5-6 chr11 78395888 78396287 + 1.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 21733 NM_080491 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 201.75-52 chr2 198651793 198652003 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -276801 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 408-15 chr6 34991862 34992271 + 1.75 NA intron (NM_015245, intron 9 of 23) intron (NM_015245, intron 9 of 23) 102811 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 242.25-77 chr6 129496743 129496901 + 1.75 NA intron (NM_000426, intron 58 of 64) MIRb|SINE|MIR 213355 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 274.25-30 chr3 78977635 78977909 + 1.75 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) 41687 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 219.25-6 chr1 157078649 157078944 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 21012 NM_001004341 440695 Hs.127138 NM_001004341 ENSG00000253831 ETV3L - ETS variant 3 like protein-coding 371.5-18 chrX 82709326 82709630 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -798812 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 316-32 chr9 26771444 26771755 + 1.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 121203 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 170-45 chr2 146016476 146016668 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -570485 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 471.75-7 chrX 48078811 48079193 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7344 NM_001282201 57232 Hs.650883 NM_001037735 ENSG00000221994 ZNF630 dJ54B20.2 zinc finger protein 630 protein-coding 327.75-8 chr12 68120459 68120882 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 39070 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 283.25-30 chr3 120209150 120209399 + 1.75 NA intron (NM_001168271, intron 2 of 8) intron (NM_001168271, intron 2 of 8) 35021 NM_001168271 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 389-2 chr11 110804651 110805031 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -91652 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 258.5-21 chr14 46036283 46036467 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -27784 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 276.5-35 chr2 169997877 169998095 + 1.75 NA intron (NM_172070, intron 26 of 38) LTR27E|LTR|ERV1 170478 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 465.75 chr1 70359236 70359665 + 1.75 NA intron (NM_001036645, intron 1 of 2) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 4639 NM_001036646 11147 Hs.142245 NM_007071 ENSG00000197568 HHLA3 - HERV-H LTR-associating 3 protein-coding 264-36 chr2 111976965 111977153 + 1.75 NA intron (NM_006343, intron 7 of 18) L1MEc|LINE|L1 -78210 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 156.25-136 chr7 343418 343684 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -35874 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 391.5-7 chr11 111832111 111832408 + 1.75 NA intron (NR_147984, intron 13 of 15) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 39022 NM_001352416 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 270.75-34 chr3 153361272 153361566 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -123076 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 262.5-29 chr17 58833742 58834034 + 1.75 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1PA16|LINE|L1 78019 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 232.25-37 chr20 49140643 49140953 + 1.75 NA intron (NM_004602, intron 5 of 13) L1MB4|LINE|L1 47572 NM_017452 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 229-45 chr22 26969347 26969565 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 66164 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 414.5-6 chr7 106273640 106274120 + 1.75 NA intron (NM_005746, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR 11103 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 192-56 chr2 67658945 67659120 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 166530 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 344-2 chr1 210093161 210093497 + 1.75 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) intron (NM_153262, intron 4 of 7) -139467 NM_001354173 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 318.5-34 chr4 78186470 78186735 + 1.75 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) -102383 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 193.25-18 chr11 21764410 21764548 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -428606 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 326-29 chr7 73483014 73483322 + 1.75 NA intron (NM_001370402, intron 6 of 18) intron (NM_001370402, intron 6 of 18) 39125 NM_032408 9031 Hs.743372 NM_023005 ENSG00000009954 BAZ1B WBSCR10|WBSCR9|WSTF bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B protein-coding 383.25-5 chr14 45085027 45085383 + 1.75 NA intron (NM_017922, intron 1 of 13) intron (NM_017922, intron 1 of 13) 1089 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 278.75-5 chr11 91462534 91462837 + 1.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -593483 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 281.5-3 chr1 207360316 207360513 + 1.75 NA non-coding (NR_125349, exon 11 of 11) non-coding (NR_125349, exon 11 of 11) 38736 NM_000574 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 212.75-71 chr4 49635451 49635628 + 1.75 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 648897 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 292-48 chrX 30494374 30494705 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 83227 NM_025159 80231 Hs.665009 NM_025159 ENSG00000120280 CXorf21 - chromosome X open reading frame 21 protein-coding 275.75-42 chr8 65276781 65277040 + 1.75 NA Intergenic MER97b|DNA|hAT-Tip100 -96570 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 466.5-2 chr2 46737410 46737896 + 1.75 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 38358 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 419-3 chr2 57074954 57075329 + 1.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -832510 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 445.75-8 chr5 157540955 157541393 + 1.75 NA intron (NM_033274, intron 3 of 22) intron (NM_033274, intron 3 of 22) 34601 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 243-29 chr16 58945906 58946061 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -211667 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 331.25-20 chr7 80817818 80818232 + 1.75 NA intron (NM_006379, intron 5 of 17) (TACATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 101026 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 270.75-38 chr4 146478402 146478609 + 1.75 NA intron (NM_032128, intron 4 of 4) intron (NM_032128, intron 4 of 4) 43435 NM_001317816 84068 Hs.659209 NM_032128 ENSG00000120519 SLC10A7 C4orf13|P7|SSASKS solute carrier family 10 member 7 protein-coding 250-12 chr15 48610066 48610277 + 1.75 NA intron (NM_000138, intron 4 of 65) intron (NM_000138, intron 4 of 65) 35617 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 430 chr1 40222031 40222423 + 1.75 NA intron (NM_012421, intron 5 of 7) intron (NM_012421, intron 5 of 7) -25710 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 219.5-27 chr12 40343888 40344105 + 1.75 NA intron (NM_198578, intron 41 of 50) intron (NM_198578, intron 41 of 50) -49398 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 304.75-25 chr4 100360141 100360534 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 34910 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 309-20 chr18 23090248 23090535 + 1.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -44173 NR_023359 91768 Hs.11108 NM_138375 ENSG00000134508 CABLES1 CABL1|CABLES|HsT2563|IK3-1 Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 protein-coding 310.75-27 chr7 16628823 16629195 + 1.75 NA intron (NM_020319, intron 2 of 9) intron (NM_020319, intron 2 of 9) 16745 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 519.75-2 chr3 107283232 107284138 + 1.75 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) intron (NR_028302, intron 1 of 3) 42993 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 397-6 chr2 152736680 152737142 + 1.75 NA intron (NR_146431, intron 3 of 3) MER2|DNA|TcMar-Tigger 18274 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 240-51 chr5 88534469 88534704 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -95496 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 275-2 chr1 195300552 195300823 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 788028 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 184.25-124 chr8 129391364 129391628 + 1.75 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 92646 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 357.5-10 chr16 77239394 77239712 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 40145 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 219.75-38 chr2 83111450 83111611 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 254727 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 428.5-3 chr11 68605202 68605522 + 1.75 NA intron (NR_147971, intron 23 of 24) L1M5|LINE|L1 -79182 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 598.5-2 chr2 43529302 43530054 + 1.75 NA intron (NM_001083953, intron 21 of 37) intron (NM_001083953, intron 21 of 37) 66296 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 330-29 chr8 92780753 92781061 + 1.75 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) UCON31|Unknown|Unknown 5153 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 548.5 chr10 38529237 38529783 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 101364 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 382-18 chr3 146714981 146715287 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -108918 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 405.75-11 chr8 87473932 87474322 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 399888 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 220.5-91 chr4 82975669 82975991 + 1.75 NA intron (NR_110253, intron 2 of 10) intron (NR_110253, intron 2 of 10) 34993 NM_001288996 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 248.75-43 chr3 175099150 175099316 + 1.75 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) 16009 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 323-15 chr22 32886448 32886809 + 1.75 NA intron (NM_003490, intron 4 of 13) L1ME2|LINE|L1 85812 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 199.5-119 chr5 63435360 63435523 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 526851 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 385.5-25 chr9 102163773 102164147 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -355677 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 424-5 chr2 43354309 43354765 + 1.75 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) L1MA3|LINE|L1 127326 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 301.75-7 chr12 19556398 19556701 + 1.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 115950 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 221.25-65 chr4 109376414 109376548 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -57234 NM_001318085 10427 Hs.292472 NM_006323 ENSG00000138802 SEC24B SEC24 SEC24 homolog B, COPII coat complex component protein-coding 235-18 chr14 67603209 67603461 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3034 NM_001363694 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 200.25-44 chr16 8741151 8741342 + 1.75 NA intron (NM_020686, intron 2 of 15) intron (NM_020686, intron 2 of 15) 20533 NM_001127448 18 Hs.336768 NM_000663 ENSG00000183044 ABAT GABA-AT|GABAT|NPD009 4-aminobutyrate aminotransferase protein-coding 180.25-52 chr2 81186118 81186296 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 280739 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 378-6 chr16 55732409 55732828 + 1.75 NA intron (NR_033740, intron 6 of 13) MER58B|DNA|hAT-Charlie 7693 NR_033740 390732 Hs.554599 NR_033740 CES1P2 - carboxylesterase 1 pseudogene 2 pseudo 185.5-124 chr5 7860389 7860547 + 1.75 NA intron (NR_073608, intron 5 of 5) intron (NR_073608, intron 5 of 5) 8563 NM_024091 79072 Hs.653162 NM_024091 ENSG00000124279 FASTKD3 - FAST kinase domains 3 protein-coding 157.5-17 chr1 226012568 226012691 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13286 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 294-5 chr10 95654820 95655246 + 1.75 NA intron (NM_001323419, intron 1 of 14) intron (NM_001323419, intron 1 of 14) 1678 NM_001323413 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 226.5-30 chr17 32723582 32723939 + 1.75 NA intron (NM_015194, intron 14 of 21) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 153364 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 472.75-5 chr2 76071753 76072093 + 1.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -361008 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 323.25-25 chr7 54411103 54411381 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 80545 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 232.75-19 chr12 121898134 121898331 + 1.75 NA intron (NR_048555, intron 2 of 4) intron (NR_048555, intron 2 of 4) 9442 NM_002813 5715 Hs.131151 NM_002813 ENSG00000110801 PSMD9 Rpn4|p27 proteasome 26S subunit, non-ATPase 9 protein-coding 142.5-135 chr22 19555022 19555200 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 11728 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 269.75-9 chr10 67805989 67806259 + 1.75 NA intron (NM_021800, intron 3 of 4) intron (NM_021800, intron 3 of 4) 32055 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 227-12 chr12 28234143 28234437 + 1.75 NA intron (NM_001352082, intron 2 of 13) intron (NM_001352082, intron 2 of 13) -43552 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 136-53 chr17 35712845 35712929 + 1.75 NA intron (NM_001030006, intron 20 of 21) MER103C|DNA|hAT-Charlie -18752 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 264.25-46 chr6 104934641 104934861 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 5776 NR_046407 100113403 Hs.649249 NR_046407 ENSG00000203809 LIN28B-AS1 C6orf220|LINC00577|dJ439I14.1 LIN28B antisense RNA 1 ncRNA 320.25-4 chr10 85896642 85896884 + 1.75 NA intron (NM_017551, intron 5 of 15) L1ME4a|LINE|L1 319032 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 188.25-107 chr7 68128946 68129126 + 1.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 108783 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 356.75-11 chr5 39231981 39232452 + 1.75 NA intron (NM_001243093, intron 1 of 18) intron (NM_001243093, intron 1 of 18) -12653 NM_001349333 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 345.5-22 chr3 122905280 122905647 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 18950 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 178.5-137 chr5 36280994 36281209 + 1.75 NA intron (NM_001323279, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 20801 NM_001323273 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 396.25-7 chr2 68716845 68717294 + 1.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -17742 NM_001007231 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 566 chr2 189552118 189552551 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 28477 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 258.75-27 chr15 94021912 94022164 + 1.75 NA intron (NR_120320, intron 2 of 8) intron (NR_120320, intron 2 of 8) 85900 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 507-3 chr21 19333743 19334062 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 565853 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 317.5-13 chr2 18979121 18979330 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 47746 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 372.25-4 chr14 49783198 49783552 + 1.75 NA TTS (NM_001301732) TTS (NM_001301732) 15222 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 290.75-9 chr11 76279444 76279692 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -73066 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 358.25-13 chr2 78060178 78060486 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1PBa|LINE|L1 -28398 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 236.75-50 chr6 148284977 148285331 + 1.75 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) intron (NM_001346505, intron 1 of 19) 12826 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 261.75-4 chr10 113868634 113868794 + 1.75 NA intron (NM_198514, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 14053 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 304.5-41 chr8 135927606 135927997 + 1.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 470345 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 338-3 chr1 163146722 163147059 + 1.75 NA 3' UTR (NM_003617, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_003617, exon 5 of 5) -14785 NR_110699 101928404 Hs.683933 NR_110699 ENSG00000232892 LOC101928404 - uncharacterized LOC101928404 ncRNA 283-34 chr5 15017008 15017276 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -145364 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 304 chr1 43571328 43571590 + 1.75 NA intron (NM_002840, intron 6 of 33) L2|LINE|L2 40576 NM_002840 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 329.5-27 chr7 141617343 141617642 + 1.75 NA intron (NM_018238, intron 8 of 15) intron (NM_018238, intron 8 of 15) 66082 NM_018238 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 291.75-4 chr10 54587478 54587847 + 1.75 NA intron (NR_134503, intron 2 of 5) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 20295 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 200.5 chr1 43789331 43789460 + 1.75 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 -49227 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 397.5-3 chr12 33665550 33665851 + 1.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -225881 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 185.25-59 chr2 140490543 140490733 + 1.75 NA intron (NM_018557, intron 57 of 90) intron (NM_018557, intron 57 of 90) 96047 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 249.5-84 chr6 64005271 64005486 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) L1PA15|LINE|L1 198542 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 320-11 chr12 66317159 66317563 + 1.75 NA intron (NM_001370285, intron 6 of 12) intron (NM_001370285, intron 6 of 12) 14816 NR_135080 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 169.75-62 chr17 28774185 28774364 + 1.75 NA intron (NM_001288633, intron 1 of 3) intron (NM_001288633, intron 1 of 3) 30263 NM_004295 9618 Hs.8375 NM_004295 ENSG00000076604 TRAF4 CART1|MLN62|RNF83 TNF receptor associated factor 4 protein-coding 297.25-15 chr2 232120465 232121025 + 1.75 NA intron (NR_046477, intron 6 of 18) L2|LINE|L2 -51908 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 345.25-12 chr2 159026147 159026419 + 1.75 NA intron (NM_001350063, intron 2 of 24) intron (NM_001350063, intron 2 of 24) 57643 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 404.5-4 chr2 231293783 231294152 + 1.75 NA intron (NM_001352757, intron 17 of 19) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -68741 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 224.5-105 chr8 59779966 59780397 + 1.75 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 501219 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 242.75-28 chr2 56536767 56537034 + 1.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -351130 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 116-132 chr5 145029284 145029423 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 805989 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 215-43 chr2 88862515 88862724 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 50249 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 159.75-19 chr10 70071348 70071499 + 1.75 NA intron (NM_018649, intron 1 of 8) intron (NM_018649, intron 1 of 8) 18577 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 196.75-69 chr22 34865496 34865610 + 1.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 132363 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 299.25-14 chr14 28934647 28934977 + 1.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -149025 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 422.25-6 chr4 67830813 67831244 + 1.75 NA intron (NM_004262, intron 7 of 9) L2c|LINE|L2 52974 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 250.5-19 chr11 133724057 133724318 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 86189 NR_120444 646522 Hs.560000 NR_120444 ENSG00000255258 LINC02743 - long intergenic non-protein coding RNA 2743 ncRNA 288.75-48 chrUn_KI270333v1 2470 2648 + 1.75 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 376.75-18 chr7 68038102 68038474 + 1.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 18035 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 524.5-3 chr2 100763935 100764324 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -56010 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 611.75 chr2 13945521 13946424 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 454986 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 178.25-106 chr7 6407343 6407550 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 32919 NM_018890 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 350.25-12 chr14 42763485 42763831 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 1156802 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 251-22 chr14 46524341 46524534 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 53078 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 217.5-50 chr17 29720277 29720449 + 1.75 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) intron (NM_033389, intron 2 of 14) 41069 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 234.25-28 chr18 4836031 4836195 + 1.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -245069 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 148-47 chr18 4741003 4741145 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -285767 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 212.25-97 chr8 88423187 88423341 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -95781 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 191.5-97 chr3 67306605 67306783 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 81230 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 470.5-5 chr21 15113984 15114638 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -49311 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 169-111 chr9 68899616 68899906 + 1.75 NA intron (NM_003558, intron 8 of 15) L1PA15|LINE|L1 76080 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 217.5-117 chr7 46712940 46713140 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15918 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 381-23 chr8 87492586 87492959 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 381243 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 189-59 chr2 100004154 100004297 + 1.75 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 101358 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 209.5-118 chr5 37042923 37043196 + 1.75 NA intron (NM_015384, intron 34 of 45) intron (NM_015384, intron 34 of 45) 166290 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 245.25-28 chr18 38748920 38749160 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 873135 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 214.5-110 chr6 56400628 56401035 + 1.75 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -6703 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 296.75-14 chr15 97301381 97301687 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 220277 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 530.25-2 chr9 94194328 94194724 + 1.75 NA intron (NR_160773, intron 2 of 2) L1PB3|LINE|L1 10040 NR_046163 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 352.75-3 chr10 109237049 109237362 + 1.75 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 686041 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 218.75-41 chr2 192470275 192470512 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -275460 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 352.5-33 chr9 30396614 30396898 + 1.75 NA intron (NR_046204, intron 1 of 2) L1MA7|LINE|L1 11698 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 314.75-2 chr10 110255922 110256164 + 1.75 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) L1M4|LINE|L1 30047 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 305.25-8 chr10 105512606 105512786 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 307637 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 183.25-75 chr4 35935590 35935787 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 308251 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 539-2 chr8 87828091 87828466 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 45737 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 423.25-2 chr1 66192128 66192561 + 1.75 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -139764 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 414.75-3 chr10 59811555 59812102 + 1.75 NA intron (NM_005436, intron 5 of 8) MER8|DNA|TcMar-Tigger -58373 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 193-54 chr3 71748418 71748538 + 1.75 NA intron (NM_173359, intron 1 of 7) MamGypLTR1d|LTR|Gypsy 5113 NM_001282886 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 193.5-12 chr1 159983418 159983536 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 22253 NR_038849 100505633 Hs.445045 NR_038849 ENSG00000224259 LINC01133 - long intergenic non-protein coding RNA 1133 ncRNA 284.5-58 chr7 11835306 11835634 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -3272 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 523.5-2 chr11 84010739 84011457 + 1.75 NA intron (NM_001142699, intron 11 of 27) intron (NM_001142699, intron 11 of 27) 262182 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 279.25-31 chr5 7260174 7260444 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 9045 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 347.5-4 chr10 85436450 85436937 + 1.75 NA intron (NR_120670, intron 1 of 2) intron (NR_120670, intron 1 of 2) 3830 NR_120670 101929662 Hs.639355 NR_120670 ENSG00000224504 LOC101929662 - uncharacterized LOC101929662 ncRNA 325.25-11 chr2 118522651 118523026 + 1.75 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? 80128 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 375 chr1 159990440 159990816 + 1.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 29404 NR_038849 100505633 Hs.445045 NR_038849 ENSG00000224259 LINC01133 - long intergenic non-protein coding RNA 1133 ncRNA 528.5-2 chr2 192817525 192818030 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 67932 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 558 chr2 174298543 174299069 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -27221 NR_038897 285084 Hs.275398 NR_038897 ENSG00000231453 LINC01305 - long intergenic non-protein coding RNA 1305 ncRNA 271.5-6 chr1 180459427 180459814 + 1.75 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) intron (NM_032360, intron 3 of 7) -21230 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 337-18 chr2 172508906 172509189 + 1.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -43025 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 274.5-15 chr12 52828880 52829107 + 1.75 NA intron (NM_175834, intron 4 of 8) L3|LINE|CR1 5318 NM_175834 338785 Hs.711471 NM_175834 ENSG00000185640 KRT79 K6L|KRT6L keratin 79 protein-coding 378.5-5 chr14 54904926 54905171 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2222 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 239-54 chr6 163995474 163995673 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -324089 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 233-34 chr2 121429395 121429579 + 1.75 NA intron (NM_015282, intron 20 of 38) intron (NM_015282, intron 20 of 38) -101393 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 184.25-11 chr1 183674640 183674900 + 1.75 NA intron (NM_001297670, intron 1 of 17) intron (NM_001297670, intron 1 of 17) -21454 NM_203454 403314 Hs.97335 NM_203454 ENSG00000173627 APOBEC4 C1orf169 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4 protein-coding 252.75-49 chr4 10138865 10139120 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -22193 NM_005112 9948 Hs.128548 NM_005112 ENSG00000071127 WDR1 AIP1|HEL-S-52|NORI-1 WD repeat domain 1 protein-coding 296-26 chr2 74343135 74343411 + 1.75 NA intron (NM_133478, intron 1 of 30) intron (NM_133478, intron 1 of 30) 143 NM_133478 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 240.5-9 chr10 61060535 61060779 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 44382 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 457.75 chr1 61079157 61079612 + 1.75 NA intron (NM_001145511, intron 1 of 10) intron (NM_001145511, intron 1 of 10) 2157 NM_001145511 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 229.75-74 chr8 68622259 68622530 + 1.75 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) intron (NR_146186, intron 7 of 12) -290903 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 257.75-25 chr2 226038948 226039161 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -103740 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 238.5-99 chr9 75763538 75763747 + 1.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -127002 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 305.25-28 chr2 171754447 171754744 + 1.75 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 66840 NM_001271787 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 354-10 chr16 80808461 80808946 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -4105 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 189.5-73 chr2 128922548 128922714 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 58031 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 334-7 chr11 83777574 83777838 + 1.75 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) -95281 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 311.25-17 chr4 121353308 121353598 + 1.75 NA intron (NM_198179, intron 1 of 5) L1MA4|LINE|L1 27565 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 357.5-2 chr12 3022355 3022672 + 1.75 NA intron (NM_201443, intron 8 of 10) intron (NM_201443, intron 8 of 10) -54842 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 318.75-18 chr5 159075971 159076282 + 1.75 NA intron (NM_001324107, intron 5 of 15) intron (NM_001324107, intron 5 of 15) 21830 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 443.75-4 chr6 145408578 145409080 + 1.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 278048 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 233.25-6 chr10 29752814 29753068 + 1.75 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -16005 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 248-41 chr20 51064489 51064803 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -41539 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 268.5-9 chr10 117592124 117592442 + 1.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -47215 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 180-68 chr2 205213313 205213486 + 1.75 NA intron (NM_205863, intron 15 of 21) L2c|LINE|L2 -469101 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 215.75-2 chr1 26080088 26080242 + 1.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -12531 NM_032588 84676 Hs.279709 NM_032588 ENSG00000158022 TRIM63 IRF|MURF1|MURF2|RNF28|SMRZ tripartite motif containing 63 protein-coding 187-104 chr8 127583169 127583396 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -101143 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 250.25-15 chr17 49635074 49635336 + 1.75 NA intron (NM_001007228, intron 1 of 9) intron (NM_001007228, intron 1 of 9) -8616 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 337-15 chr2 12835002 12835485 + 1.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 97876 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 209-45 chr20 33359906 33360047 + 1.75 NA intron (NM_001365728, intron 14 of 14) intron (NM_001365728, intron 14 of 14) 41543 NM_016408 51654 Hs.435952 NM_016082 ENSG00000101391 CDK5RAP1 C20orf34|C42|CGI-05|HSPC167 CDK5 regulatory subunit associated protein 1 protein-coding 277.25-35 chr5 2224486 2224774 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 87571 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 281.5-31 chr2 163587585 163587878 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 148277 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 333.25-13 chr3 154529075 154529431 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -99063 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 475.25-5 chr5 108100699 108101224 + 1.75 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 281137 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 274.25 chr1 22291150 22291400 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 25036 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 287.75-29 chr2 113958696 113958898 + 1.75 NA non-coding (NR_102318, exon 11 of 11) non-coding (NR_102318, exon 11 of 11) -10525 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 243.75-86 chrX 46734328 46734508 + 1.75 NA intron (NM_001257291, intron 1 of 16) L1M4|LINE|L1 24700 NM_001257291 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 384-12 chr2 106069514 106069887 + 1.75 NA intron (NM_032411, intron 1 of 3) Plat_L3|LINE|CR1 4012 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 246.5-20 chr13 106407612 106407757 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 31120 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 250.75-39 chr3 116532463 116532728 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -19878 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 233.5-62 chr20 22954128 22954344 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -81184 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 425-5 chr20 32822244 32822612 + 1.75 NA intron (NM_012325, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 2474 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 197.25-98 chr7 101074775 101074978 + 1.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -10605 NM_030961 81844 Hs.521092 NM_030961 ENSG00000169871 TRIM56 RNF109 tripartite motif containing 56 protein-coding 246.75-22 chr16 63952106 63952350 + 1.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 1169835 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 341.75-8 chr14 79665929 79666311 + 1.75 NA intron (NM_004796, intron 14 of 16) MamTip1|DNA|hAT-Tip100 386740 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 245.25-3 chr1 101610982 101611236 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 235971 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 352.25-6 chr15 70776745 70777102 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13365 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 432.25-8 chr8 11289025 11289354 + 1.75 NA intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 AluSx|SINE|Alu 4373 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 209.25-79 chr3 109411782 109412237 + 1.75 NA intron (NR_109841, intron 1 of 4) intron (NR_109841, intron 1 of 4) 2019 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 347.75-12 chr6 47837639 47837954 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 50728 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 187.5-40 chr12 59364238 59364379 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -231721 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 287.5-47 chr5 155915187 155915701 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -411313 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 274.5 chr1 8780877 8781041 + 1.75 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 36681 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 252-17 chr12 1139930 1140334 + 1.75 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) intron (NR_027948, intron 6 of 19) 112384 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 189-28 chr12 4177924 4178082 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -95759 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 230.5-34 chr14 59196350 59196502 + 1.75 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) 7759 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 401.25-3 chr1 180503341 180503807 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_032360) promoter-TSS (NM_032360) -997 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 394-9 chr3 24814587 24815080 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14490 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 267-17 chr14 50697000 50697182 + 1.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -28785 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 175-41 chr15 25377740 25377875 + 1.75 NA intron (NM_001354546, intron 1 of 9) intron (NM_001354546, intron 1 of 9) 60422 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 266.75-41 chr5 33613792 33614029 + 1.75 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) MIR3|SINE|MIR 173134 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 273-56 chr8 126263808 126264078 + 1.75 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -61552 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 358.5-17 chr6 64270349 64270560 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 463618 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 296-4 chr10 53290629 53290851 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -519040 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 254.75-25 chr2 171099285 171099464 + 1.75 NA intron (NM_012290, intron 2 of 20) L1MB7|LINE|L1 -32401 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 253.75-42 chr4 31555289 31555546 + 1.75 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 48873 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 374-16 chr6 40530953 40531343 + 1.75 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) L1ME3A|LINE|L1 56216 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 256.5-15 chr12 19538985 19539339 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 98563 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 308.25-34 chr8 93295697 93296062 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -129029 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 306.25-31 chr4 112985582 112985930 + 1.75 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) -63658 NM_001354246 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 272.5-40 chr2 228488602 228488976 + 1.75 NA non-coding (NR_151716, exon 3 of 4) non-coding (NR_151716, exon 3 of 4) 122606 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 283-23 chr2 85107797 85108090 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25449 NM_031283 83439 Hs.516297 NM_031283 ENSG00000152284 TCF7L1 TCF-3|TCF3 transcription factor 7 like 1 protein-coding 244-33 chr3 52617442 52617760 + 1.75 NA intron (NM_001366074, intron 16 of 30) intron (NM_001366074, intron 16 of 30) 67998 NM_001350074 55193 Hs.189920 NM_018165 ENSG00000163939 PBRM1 BAF180|PB1 polybromo 1 protein-coding 471.5-2 chr10 60598210 60598696 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -25497 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 366.75-2 chr11 4931230 4931631 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -7091 NM_001005237 79324 Hs.554541 NM_001005237 ENSG00000278870 OR51G1 OR11-29|OR51G3P olfactory receptor family 51 subfamily G member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 112.75-187 chr7 52888681 52888768 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -146909 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 154-41 chr14 85045781 85045936 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -226074 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 196-28 chr14 60276246 60276451 + 1.75 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 27127 NM_021003 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 397-3 chr12 60743225 60743751 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1054118 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 323.5-24 chr5 18684959 18685297 + 1.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 877854 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 373-4 chr12 26420760 26421100 + 1.75 NA intron (NM_002223, intron 49 of 56) intron (NM_002223, intron 49 of 56) 225357 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 112.5-116 chr2 79058498 79058575 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 29457 NM_006507 5968 Hs.4158 NM_006507 ENSG00000172023 REG1B PSPS2|REGH|REGI-BETA|REGL regenerating family member 1 beta protein-coding 169-108 chr8 116371745 116371910 + 1.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -46768 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 272.25-13 chr12 111657870 111658278 + 1.75 NA intron (NM_006768, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 27882 NM_006768 8315 Hs.530940 NM_006768 ENSG00000089234 BRAP BRAP2|IMP|RNF52 BRCA1 associated protein protein-coding 334.5-32 chr9 36215703 36216073 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001190383, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001190383, exon 11 of 11) 24967 NM_001311204 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 303.25-30 chr7 54741250 54741487 + 1.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 17843 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 304-2 chr1 84569975 84570318 + 1.75 NA intron (NM_004388, intron 2 of 6) intron (NM_004388, intron 2 of 6) 4294 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 327.25-5 chr12 42097682 42098026 + 1.75 NA intron (NM_173601, intron 6 of 7) intron (NM_173601, intron 6 of 7) 47020 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 456.75-3 chr15 79165280 79165897 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -44200 NR_029705 406960 NR_029705 ENSG00000207695 MIR184 EDICT|MIRN184|miR-184 microRNA 184 ncRNA 208.25-76 chr6 148805249 148805468 + 1.75 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 58328 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 250.75-10 chr12 118428590 118428886 + 1.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 52183 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 224.5-98 chr7 23385258 23385463 + 1.75 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) MER5B|DNA|hAT-Charlie -11086 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 247.75-37 chr3 127180214 127180451 + 1.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -12799 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 189.5-144 chr8 71892632 71892815 + 1.75 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) THE1A|LTR|ERVL-MaLR -48227 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 197.5-97 chr3 57401989 57402167 + 1.75 NA intron (NM_001366028, intron 43 of 73) intron (NM_001366028, intron 43 of 73) -109393 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 393.75-6 chr18 24605363 24605750 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -22626 NR_040033 729950 Hs.585850 NR_040033 ENSG00000265485 LINC01915 - long intergenic non-protein coding RNA 1915 ncRNA 318-16 chr2 81798035 81798442 + 1.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -331292 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 303.5-47 chr7 54711277 54711623 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 47761 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 458.25-5 chr7 7704856 7705313 + 1.75 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) intron (NM_002947, intron 2 of 7) 13523 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 259.25-45 chr8 58315187 58315567 + 1.75 NA Intergenic LTR58|LTR|ERV1 -43276 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 206.25-107 chr7 140265552 140265747 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 88388 NR_024451 100134229 Hs.634333 NR_024451 ENSG00000260231 KDM7A-DT JHDM1D-AS1 KDM7A divergent transcript ncRNA 275.5-45 chr4 53527947 53528225 + 1.75 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) intron (NM_001126328, intron 2 of 10) 28009 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 259.5-29 chr13 47082354 47082626 + 1.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -185414 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 207.75-21 chr11 88073646 88073903 + 1.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 101669 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 230.25-91 chrX 73343771 73343933 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -103402 NM_005193 1046 Hs.553488 NM_005193 ENSG00000131264 CDX4 - caudal type homeobox 4 protein-coding 133-91 chr2 198970033 198970178 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 487834 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 287.75-2 chr1 111582483 111582837 + 1.75 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) intron (NM_001370216, intron 1 of 7) -18657 NM_001081976 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 273.5-45 chr3 12008759 12009009 + 1.75 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 4493 NM_133625 6854 Hs.445503 NM_003178 ENSG00000157152 SYN2 SYNII synapsin II protein-coding 417.5-13 chr7 100068476 100068735 + 1.75 NA intron (NM_017715, intron 5 of 5) AluSq4|SINE|Alu 13118 NM_001278292 7551 Hs.435302 NM_017715 ENSG00000166526 ZNF3 A8-51|HF.12|KOX25|PP838|Zfp113 zinc finger protein 3 protein-coding 340.25-21 chr9 26929578 26929813 + 1.75 NA intron (NM_001321546, intron 2 of 12) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -17295 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 222-52 chr3 42965698 42965857 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -13534 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 390.25-6 chr6 73982231 73982562 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -87055 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 155.25-84 chr17 67361479 67361640 + 1.75 NA intron (NM_001316341, intron 2 of 12) AluSz|SINE|Alu 5018 NM_174871 5718 Hs.4295 NM_002816 ENSG00000197170 PSMD12 Rpn5|STISS|p55 proteasome 26S subunit, non-ATPase 12 protein-coding 358.25-9 chr15 64617789 64618180 + 1.75 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 85297 NM_001301302 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 282.75-24 chr2 225701313 225701581 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001371273, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001371273, exon 8 of 8) 300561 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 202-45 chr3 197149926 197150077 + 1.75 NA intron (NM_001366204, intron 5 of 24) intron (NM_001366204, intron 5 of 24) 33871 NM_001366222 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 495.25-3 chr2 155506168 155506509 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 748593 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 340.75-20 chr5 75693386 75693647 + 1.75 NA intron (NM_152408, intron 5 of 10) L1ME3D|LINE|L1 18939 NM_152408 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 262.25-20 chr2 117549078 117549243 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -265531 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 176.75-117 chr7 141539700 141539836 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -11642 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 317.25-19 chr2 158116569 158116843 + 1.75 NA intron (NM_173355, intron 3 of 6) intron (NM_173355, intron 3 of 6) 14836 NM_173355 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 279.5-54 chr5 126215489 126215721 + 1.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 36028 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 487.25 chr14 103055717 103056301 + 1.75 NA intron (NM_006035, intron 1 of 36) intron (NM_006035, intron 1 of 36) 1540 NM_006035 9578 Hs.654634 NM_006035 ENSG00000198752 CDC42BPB MRCKB CDC42 binding protein kinase beta protein-coding 585.25 chr2 195859104 195859511 + 1.75 NA intron (NM_018897, intron 42 of 64) intron (NM_018897, intron 42 of 64) 202081 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 338.5-24 chr5 87318937 87319299 + 1.75 NA non-coding (NR_130929, exon 1 of 1) non-coding (NR_130929, exon 1 of 1) 4510 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 167.25-42 chr14 58516587 58516727 + 1.75 NA TTS (NM_001364700) TTS (NM_001364700) 76976 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 705.25 chr10 41733559 41734342 + 1.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 634095 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 235.75-31 chr17 40776681 40776831 + 1.75 NA TTS (NM_181537) TTS (NM_181537) -4597 NM_181539 353288 Hs.592133 NM_181539 ENSG00000186393 KRT26 CK26|K25|K25IRS2|K26|KRT25B keratin 26 protein-coding 262.5-79 chrX 41765583 41765803 + 1.75 NA intron (NM_003688, intron 3 of 26) L1MC5a|LINE|L1 41512 NM_080817 27197 Hs.567457 NM_080817 ENSG00000171657 GPR82 - G protein-coupled receptor 82 protein-coding 371.25-12 chr4 58944913 58945265 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -39193 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 134.5-59 chr14 48500640 48500724 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -705668 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 367-15 chr5 18281513 18281804 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 474384 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 298.75-29 chr6 84006076 84006482 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -27493 NM_001346543 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 250.5-64 chr4 31001602 31001854 + 1.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -169416 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 229.75-2 chr1 32300092 32300344 + 1.75 NA intron (NM_004964, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 8135 NM_004964 3065 Hs.88556 NM_004964 ENSG00000116478 HDAC1 GON-10|HD1|KDAC1|RPD3|RPD3L1 histone deacetylase 1 protein-coding 349.25-19 chr8 135670705 135671118 + 1.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 213455 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 219.5-14 chr10 58581723 58581920 + 1.75 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 68949 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 457.5 chr14 20206723 20207345 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9698 NM_001005503 390439 Hs.554582 NM_001005503 ENSG00000196832 OR11G2 OR14-34 olfactory receptor family 11 subfamily G member 2 protein-coding 369.25 chr1 51706357 51706722 + 1.75 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -23311 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 268-57 chr8 31851366 31851672 + 1.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -174217 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 372.25-8 chr4 49711404 49711902 + 1.75 NA Intergenic SAR|Satellite|Satellite 725011 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 167.5-163 chr6 65591426 65591558 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -11688 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 238.75-67 chr8 128552655 128552879 + 1.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 11912 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 194.25-7 chr10 60041095 60041261 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 43 of 43) L2c|LINE|L2 -80265 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 325.75-12 chr2 39660892 39661317 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -4394 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 187.5-163 chr8 50924925 50925127 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 760895 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 199.75-38 chr17 74511223 74511410 + 1.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 20159 NM_174892 124599 Hs.313343 NM_174892 ENSG00000178789 CD300LB CD300b|CLM-7|CLM7|CMRF35-A2|IREM-3|IREM3|TREM-5|TREM5 CD300 molecule like family member b protein-coding 292-17 chr17 55622648 55622945 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 100068 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 504.75-2 chr20 21876917 21877506 + 1.75 NA Intergenic (TTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 171547 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 223.25-10 chr12 17361299 17361479 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 227689 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 345.75-7 chr2 205251461 205251805 + 1.75 NA intron (NM_057177, intron 16 of 21) intron (NM_057177, intron 16 of 21) -430867 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 450.75-3 chr21 28604687 28605177 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 65614 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 478-4 chrX 146634856 146635378 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -174654 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 456.5-9 chr22 27188034 27188386 + 1.75 NA intron (NM_001318392, intron 1 of 2) intron (NM_001318392, intron 1 of 2) 694 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 193-6 chr1 119862959 119863144 + 1.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -18171 NM_001047980 343505 NM_001047980 NBPF7 - NBPF member 7 protein-coding 379.75-10 chr7 48318717 48319269 + 1.75 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) L2a|LINE|L2 147535 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 166.5-76 chr16 54074084 54074269 + 1.75 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) 34783 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 138.75-127 chr4 60644408 60644512 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -278159 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 289-8 chr10 81162514 81162697 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 512808 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 343-21 chr3 32496280 32496578 + 1.75 NA intron (NM_017801, intron 1 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 6423 NM_017801 54918 Hs.380627 NM_017801 ENSG00000091317 CMTM6 CKLFSF6|PRO2219 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 6 protein-coding 466.5-4 chr2 114267498 114268172 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -174806 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 376.25-17 chr8 123004071 123004402 + 1.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 21536 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 199.75-23 chr13 24778248 24778516 + 1.75 NA exon (NM_001184993, exon 4 of 36) exon (NM_001184993, exon 4 of 36) 14213 NM_031277 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 367.75-13 chrX 64934108 64934576 + 1.75 NA intron (NM_001178032, intron 1 of 4) L1MD|LINE|L1 42108 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 450.25-2 chr11 47925404 47925854 + 1.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -54930 NM_002843 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 265.25-31 chr21 29954790 29954969 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -14827 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 206.25-98 chr6 145486736 145486886 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 200066 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 199-29 chr18 4077101 4077273 + 1.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 114834 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 326.5-3 chr10 85309297 85309524 + 1.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -110472 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 279.25-22 chr2 125068564 125068849 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 1043419 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 378-11 chr3 164238082 164238459 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -66714 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 424-9 chr7 52441693 52442206 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -593684 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 303.25-11 chr13 56669118 56669513 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -471603 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 209.25-67 chr20 49603471 49603682 + 1.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -35439 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 317.75-15 chr16 28105088 28105543 + 1.75 NA intron (NM_001270940, intron 21 of 24) intron (NM_001270940, intron 21 of 24) -41601 NM_001109763 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 300.25-14 chr2 70649761 70650129 + 1.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -96119 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 396.25 chr1 84103860 84104210 + 1.75 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) L1MA5|LINE|L1 25956 NM_207578 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 259-39 chr8 66596429 66596621 + 1.75 NA intron (NM_001294282, intron 5 of 14) intron (NM_001294282, intron 5 of 14) 16693 NM_001144755 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 188.75-3 chr1 96818368 96818528 + 1.75 NA non-coding (NR_125357, exon 13 of 13) non-coding (NR_125357, exon 13 of 13) 95810 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 287.5-27 chr18 7131063 7131423 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13446 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 234.5-96 chr8 107724190 107724371 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -226362 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 207.25-21 chr14 43097282 43097477 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 1409904 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 361.25 chr1 96807801 96808189 + 1.75 NA intron (NM_001300985, intron 11 of 13) intron (NM_001300985, intron 11 of 13) 85357 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 435-2 chr12 84685066 84685331 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 227601 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 180.75-113 chr5 56389183 56389361 + 1.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 92497 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 187.5-146 chr6 143674698 143674943 + 1.75 NA intron (NM_014721, intron 1 of 12) intron (NM_014721, intron 1 of 12) -3145 NM_001100165 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 237-34 chr21 29154879 29155153 + 1.75 NA intron (NM_001286620, intron 3 of 4) intron (NM_001286620, intron 3 of 4) 9439 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 651.5 chr5 85151358 85151871 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -766734 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 261.5-41 chr3 17323315 17323559 + 1.75 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) L1ME1|LINE|L1 376583 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 303-22 chr4 103881021 103881268 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -161159 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 405-13 chr4 66025640 66025994 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -251007 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 369-2 chr12 127610228 127610564 + 1.75 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 26071 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 423-2 chr18 12802975 12803492 + 1.75 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) L1MA6|LINE|L1 37729 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 135-143 chr5 88000874 88000959 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 267929 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 416.5-6 chr15 71958051 71958513 + 1.75 NA intron (NM_006901, intron 14 of 41) intron (NM_006901, intron 14 of 41) 147728 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 238.25-12 chr11 82854384 82854617 + 1.75 NA intron (NM_001319214, intron 1 of 7) L1PA16|LINE|L1 45930 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 274.75-30 chr2 168135650 168135898 + 1.75 NA intron (NM_013233, intron 8 of 17) intron (NM_013233, intron 8 of 17) 111821 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 238-48 chr3 120822968 120823196 + 1.75 NA intron (NR_135570, intron 1 of 1) MER58B|DNA|hAT-Charlie 13275 NR_135571 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 304.75-15 chr17 55099723 55099927 + 1.75 NA intron (NM_178509, intron 16 of 17) intron (NM_178509, intron 16 of 17) -131040 NM_001162861 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 275-24 chr2 127186220 127186689 + 1.75 NA 3' UTR (NM_001367502, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367502, exon 9 of 9) 19313 NM_001001665 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 321.25-6 chr10 84789624 84789852 + 1.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 364569 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 384-4 chr12 14228585 14228879 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -136900 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 167.75-91 chr3 105341648 105341765 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -25007 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 183-56 chr2 220494241 220494416 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -587763 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 416.75-5 chr3 50596181 50596574 + 1.75 NA TTS (NM_016173) TTS (NM_016173) 15397 NM_145071 1154 Hs.655334 NM_013324 ENSG00000114737 CISH BACTS2|CIS|CIS-1|G18|SOCS cytokine inducible SH2 containing protein protein-coding 231.25-48 chr20 36471833 36472069 + 1.75 NA intron (NM_183006, intron 1 of 6) intron (NM_183006, intron 1 of 6) 10156 NM_183006 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 326.75-24 chr9 85369869 85370255 + 1.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 371967 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 178-13 chr11 70257216 70257449 + 1.75 NA Intergenic (GTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -13358 NR_045286 8500 Hs.530749 NM_003626 ENSG00000131626 PPFIA1 LIP.1|LIP1|LIPRIN PTPRF interacting protein alpha 1 protein-coding 178.75-67 chr3 149056206 149056386 + 1.75 NA intron (NM_001318935, intron 13 of 25) intron (NM_001318935, intron 13 of 25) -30036 NR_046648 100873945 Hs.742423 NR_046648 ENSG00000239718 HLTF-AS1 - HLTF antisense RNA 1 ncRNA 582 chr14 70609173 70609994 + 1.75 NA non-coding (NR_110071, exon 3 of 3) non-coding (NR_110071, exon 3 of 3) -8893 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 439.5 chr1 76773743 76774318 + 1.75 NA intron (NR_149059, intron 1 of 2) intron (NR_149059, intron 1 of 2) 5237 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 519.5 chr1 114291376 114291963 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -137800 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 406.5-3 chr13 38348487 38348922 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1147 NM_001286704 51569 Hs.643655 NM_016617 ENSG00000120686 UFM1 BM-002|C13orf20|HLD14 ubiquitin fold modifier 1 protein-coding 481.25 chr10 52135042 52135533 + 1.75 NA intron (NM_001098512, intron 8 of 17) intron (NM_001098512, intron 8 of 17) 178841 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 216-45 chr2 177338703 177338879 + 1.75 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) ERVL-E-int|LTR|ERVL -24909 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 228.75-26 chr16 52599489 52599773 + 1.75 NA intron (NR_033920, intron 1 of 3) intron (NR_033920, intron 1 of 3) 7344 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 377.5-13 chr3 10485131 10485449 + 1.75 NA intron (NM_001353564, intron 2 of 20) MIRb|SINE|MIR 20294 NM_001363862 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 146.25-111 chr4 73194024 73194126 + 1.75 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) L1ME1|LINE|L1 28982 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 553-2 chr8 135684536 135685111 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 227367 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 181.5-109 chr3 74669795 74669944 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -148729 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 116-91 chr2 211964346 211964445 + 1.75 NA intron (NM_001042599, intron 2 of 26) intron (NM_001042599, intron 2 of 26) 461965 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 232.25-87 chr9 37196142 37196314 + 1.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 75630 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 152.5-48 chr14 62430251 62430424 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -290364 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 231.5-14 chr10 131382039 131382260 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -70428 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 306.25-34 chr5 30619874 30620294 + 1.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -573602 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 344-8 chr15 98742916 98743126 + 1.75 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -41405 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 298.75-12 chr11 104103270 104103504 + 1.75 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 60760 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 376.5-9 chr2 72661600 72661915 + 1.75 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1ME1|LINE|L1 164276 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 288-2 chr1 167382464 167382804 + 1.75 NA intron (NM_001198783, intron 7 of 15) L2b|LINE|L2 53564 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 218.25-22 chr12 46364206 46364496 + 1.75 NA intron (NM_001307936, intron 9 of 14) intron (NM_001307936, intron 9 of 14) 8422 NM_018976 54407 Hs.221847 NM_018976 ENSG00000134294 SLC38A2 ATA2|PRO1068|SAT2|SNAT2 solute carrier family 38 member 2 protein-coding 251.25-37 chr3 153872744 153872909 + 1.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -110300 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 140-101 chr3 4084714 4084852 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -218521 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 170-103 chr9 70747165 70747410 + 1.75 NA intron (NM_001366143, intron 8 of 25) intron (NM_001366143, intron 8 of 25) 62797 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 310.75-26 chr6 63822717 63822994 + 1.75 NA TTS (NR_157848) TTS (NR_157848) 16019 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 305.5-52 chr9 36339549 36339925 + 1.75 NA 3' UTR (NM_022781, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_022781, exon 12 of 12) 60532 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 409.75-8 chr8 126026378 126026702 + 1.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -75343 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 244.5-28 chr13 103497035 103497267 + 1.75 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 71951 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 153-88 chr20 58739885 58740028 + 1.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -33469 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 182.5-14 chr1 221601869 221602043 + 1.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 134944 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 448.5-5 chr20 4191317 4191795 + 1.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -1534 NR_033917 728228 Hs.636379 NR_033917 ENSG00000230176 LINC01433 - long intergenic non-protein coding RNA 1433 ncRNA 143.25-31 chr11 111273257 111273348 + 1.75 NA intron (NM_198498, intron 2 of 4) intron (NM_198498, intron 2 of 4) -25244 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 239.25-42 chr18 73908287 73908499 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 239441 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 289-40 chr6 97836485 97836785 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -187896 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 240.5-57 chr20 3777201 3777390 + 1.75 NA TTS (NM_015417) TTS (NM_015417) 4153 NM_015417 25876 Hs.72620 NM_015417 ENSG00000101222 SPEF1 C20orf28|CLAMP|SPEF1A sperm flagellar 1 protein-coding 402.25-6 chr4 31029707 31029955 + 1.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -141313 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 327.25-4 chr12 16524553 16524951 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 80627 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 161-64 chr2 108831365 108831533 + 1.75 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) intron (NM_001351559, intron 10 of 11) 44678 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 231-82 chr8 129774225 129774382 + 1.75 NA intron (NM_031415, intron 3 of 13) L1MA9|LINE|L1 12321 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 232.75-66 chr8 113919490 113919687 + 1.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -482649 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 371.5-6 chr15 33364169 33364511 + 1.75 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 53373 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 340.5-36 chr8 115909834 115910172 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -241028 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 322-20 chr3 129855005 129855218 + 1.75 NA intron (NM_001349263, intron 2 of 7) intron (NM_001349263, intron 2 of 7) 38465 NM_001128224 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 259-19 chr2 40605757 40606179 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -93533 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 408-10 chr3 27354348 27354671 + 1.75 NA intron (NM_152534, intron 2 of 38) intron (NM_152534, intron 2 of 38) 14874 NM_199347 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 290.25-18 chr2 81931634 81931846 + 1.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -464794 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 314.25-17 chr21 45568317 45568563 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -5415 NM_001352511 6573 Hs.84190 NM_003056 ENSG00000173638 SLC19A1 CHMD|FOLT|IFC-1|IFC1|REFC|RFC|RFC1 solute carrier family 19 member 1 protein-coding 250.75-69 chr8 126798172 126798343 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -214897 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 242.25-33 chr15 94642768 94642937 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -212511 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 297.25-5 chr12 6934684 6934944 + 1.75 NA intron (NM_001940, intron 4 of 9) intron (NM_001940, intron 4 of 9) 6855 NM_001940 1822 Hs.143766 NM_001940 ENSG00000111676 ATN1 B37|D12S755E|DRPLA|HRS|NOD atrophin 1 protein-coding 154-111 chr5 86978007 86978156 + 1.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 136873 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 295.25-17 chr3 3507447 3507678 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -291869 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 305.25-43 chr6 73671959 73672234 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -18104 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 256.5-23 chr17 32575078 32575293 + 1.75 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) intron (NM_015194, intron 21 of 21) 88192 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 273.75-49 chr9 110860512 110860751 + 1.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 132369 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 323.75-19 chr5 33159862 33160093 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -69758 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 164.75-16 chr10 24182507 24182677 + 1.75 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -26199 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 201.25-52 chr20 53386954 53387133 + 1.75 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -165727 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 235-25 chr15 77683358 77683505 + 1.75 NA intron (NM_001301194, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 12717 NM_001301200 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 309-30 chr4 31781302 31781550 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -215953 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 210-53 chr2 78073352 78073590 + 1.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -15259 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 155.75-83 chr2 107607468 107607608 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 78119 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 421.25 chr1 245119051 245119382 + 1.75 NA intron (NM_001143943, intron 6 of 6) intron (NM_001143943, intron 6 of 6) -35769 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 189.75-97 chr6 5207069 5207199 + 1.75 NA intron (NM_001164840, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 53816 NR_104417 57128 Hs.387755 NM_020408 ENSG00000214113 LYRM4 C6orf149|CGI-203|COXPD19|ISD11 LYR motif containing 4 protein-coding 351-24 chr7 36057851 36058356 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -37207 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 209-59 chr7 836331 836564 + 1.75 NA intron (NM_001367695, intron 2 of 19) MLT2B4|LTR|ERVL 3971 NM_001130965 23353 Hs.438072 NM_025154 ENSG00000164828 SUN1 UNC84A Sad1 and UNC84 domain containing 1 protein-coding 232-55 chr3 179133602 179133834 + 1.75 NA intron (NR_125401, intron 1 of 2) L1MA4A|LINE|L1 14255 NR_125401 101928739 Hs.434553 NR_125401 ENSG00000229102 LOC101928739 - uncharacterized LOC101928739 ncRNA 239.75-9 chr10 113105901 113106137 + 1.75 NA intron (NM_001146283, intron 5 of 12) intron (NM_001146283, intron 5 of 12) -20614 NM_001349871 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 184-104 chr9 87761229 87761401 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -11600 NR_027917 392360 Hs.690450 NM_001023564 ENSG00000188029 CTSL3P CTSL3|HCTSL-s cathepsin L family member 3, pseudogene pseudo 186-81 chr6 130237004 130237175 + 1.75 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) intron (NM_001258275, intron 2 of 13) -14138 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 284.75-34 chr6 165804177 165804464 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -142040 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 386.5-9 chr2 38592172 38592682 + 1.75 NA intron (NM_138394, intron 1 of 12) intron (NM_138394, intron 1 of 12) 10501 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 316-2 chr10 12881495 12881718 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 120107 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 252.5-58 chr4 38213125 38213362 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 93289 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 416-12 chr8 80079905 80080268 + 1.75 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) 744 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 228.5-67 chr21 26421470 26421645 + 1.75 NA intron (NR_135515, intron 1 of 3) L1MB2|LINE|L1 15614 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 316.75-8 chr18 30322779 30323111 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 24035 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 279.5-23 chr16 74150318 74150696 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 65014 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 240.25-31 chr2 24314915 24315098 + 1.75 NA intron (NM_001348182, intron 3 of 38) intron (NM_001348182, intron 3 of 38) 45530 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 267.25-33 chr5 37038873 37039055 + 1.75 NA intron (NM_015384, intron 34 of 45) L2c|LINE|L2 162195 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 280.75-23 chr2 161525648 161525903 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -17873 NR_077058 285116 Hs.470435 NR_077058 AHCTF1P1 AHCTF1P|ELYS-like AT-hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 pseudo 298.5-9 chr14 87654892 87655080 + 1.75 NA intron (NR_146551, intron 1 of 2) intron (NR_146551, intron 1 of 2) 308 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 224.25-38 chr2 10210900 10211300 + 1.75 NA non-coding (NR_161344, exon 4 of 4) non-coding (NR_161344, exon 4 of 4) -18429 NR_036222 100422929 NR_036222 ENSG00000265418 MIR4261 - microRNA 4261 ncRNA 515.25 chr10 51838662 51839132 + 1.75 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -139302 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 341.25-5 chr10 60166844 60167366 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 22 of 43) intron (NM_001204403, intron 22 of 43) -26089 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 187-93 chr7 91637516 91637671 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 243109 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 517-5 chr18 13481069 13481625 + 1.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 21400 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 351.5-33 chrX 39758121 39758442 + 1.75 NA Intergenic LTR81|LTR|Gypsy -79280 NR_039763 100616251 NR_039763 ENSG00000263972 MIR1587 - microRNA 1587 ncRNA 132.5-44 chr11 99554896 99555024 + 1.75 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -1185 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 326.75-8 chr14 64326833 64327123 + 1.75 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) intron (NM_001291712, intron 2 of 13) 11572 NM_001291723 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 191-28 chr17 51645400 51645545 + 1.75 NA intron (NM_001082533, intron 7 of 9) intron (NM_001082533, intron 7 of 9) 210045 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 380.5-9 chr5 103466406 103466765 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 75400 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 297-22 chr18 5153160 5153645 + 1.75 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 43855 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 119.25-71 chr16 35859414 35859500 + 1.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 112905 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 227.25-3 chr1 54315017 54315245 + 1.75 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) intron (NM_001009955, intron 4 of 16) 78688 NR_103541 619518 Hs.591438 NM_001034847 ENSG00000198711 SSBP3-AS1 C1orf191|MST128|MSTP128 SSBP3 antisense RNA 1 ncRNA 414.25-7 chr4 123613156 123613661 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -36583 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 423.75-3 chr18 10040167 10040441 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 126288 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 132.25-79 chr17 70286231 70286369 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 116765 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 355.5-25 chr7 36586565 36586847 + 1.75 NA intron (NM_001177507, intron 11 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 13414 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 464.5-3 chr22 24791089 24791504 + 1.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -14915 NM_001098498 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 302-33 chr8 134394253 134394676 + 1.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -203607 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 426.75-3 chr2 2099730 2100089 + 1.75 NA intron (NM_015025, intron 3 of 24) intron (NM_015025, intron 3 of 24) -219323 NR_024468 730811 Hs.629472 NR_024468 ENSG00000225619 MYT1L-AS1 - MYT1L antisense RNA 1 ncRNA 200-80 chr6 142035006 142035160 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 53716 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 131.25-118 chr2 241433394 241433479 + 1.75 NA intron (NM_014808, intron 9 of 26) intron (NM_014808, intron 9 of 26) -44469 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 199.5-22 chr11 75111064 75111255 + 1.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -14269 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 203.25-107 chr8 117230131 117230255 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 95198 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 295-11 chr14 49555350 49555585 + 1.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 30913 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 115.5-131 chr2 122193394 122193527 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 437809 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 225.75-22 chr13 51160574 51160930 + 1.75 NA intron (NR_102431, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 11470 NR_102432 647166 Hs.195052 NM_001351589 ENSG00000226792 C13orf42 LINC00371|LINC00372 chromosome 13 open reading frame 42 protein-coding 264.25-18 chr17 59230766 59231042 + 1.75 NA intron (NM_182569, intron 1 of 9) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 10393 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 404.25 chr1 28379066 28379411 + 1.75 NA intron (NM_001048183, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 9498 NM_001048183 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 334-14 chr2 68197399 68197615 + 1.75 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) L1ME2|LINE|L1 39619 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 527.25-5 chr8 128116970 128117425 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -32919 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 310.5-43 chr9 79023687 79023996 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 121825 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 251-47 chr5 150741824 150742062 + 1.75 NA intron (NM_001135643, intron 4 of 13) intron (NM_001135643, intron 4 of 13) 16577 NM_001135644 51164 Hs.675564 NM_016221 ENSG00000132912 DCTN4 DYN4|P62 dynactin subunit 4 protein-coding 277.5-60 chr4 164398448 164398742 + 1.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -15340 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 232.5-18 chr12 121066781 121066969 + 1.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -27633 NM_198213 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 144.25-87 chr19 30260167 30260288 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -112157 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 245.75 chr1 10514683 10514925 + 1.75 NA intron (NM_004565, intron 2 of 8) intron (NM_004565, intron 2 of 8) 39854 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 405.75 chr1 203618289 203618682 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -8302 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 291.25-19 chr3 114643742 114643918 + 1.75 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) -18885 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 170.5-39 chr11 79404959 79405274 + 1.75 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) -3007 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 201-57 chr4 35358915 35359070 + 1.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 884947 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 381.75-2 chr14 45734532 45735004 + 1.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -19166 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 340.5-2 chr1 92638060 92638385 + 1.75 NA intron (NM_005665, intron 11 of 17) intron (NM_005665, intron 11 of 17) 146886 NM_001350198 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 236.5-11 chr11 25844055 25844288 + 1.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -344952 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 249.25-35 chr4 99042672 99042964 + 1.75 NA intron (NM_015143, intron 6 of 10) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 45431 NR_037455 100500867 NR_037455 ENSG00000265213 MIR3684 - microRNA 3684 ncRNA 486.75-5 chr5 64460832 64461182 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -45008 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 376.25-16 chr8 110844983 110845243 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 182320 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 366.5 chr1 62841869 62842242 + 1.75 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) intron (NM_178221, intron 10 of 10) 57923 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 352-3 chr10 121205538 121205934 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 325578 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 238.75-16 chr13 68316924 68317122 + 1.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 568302 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 190-6 chr1 202440431 202440609 + 1.75 NA intron (NM_002481, intron 10 of 23) intron (NM_002481, intron 10 of 23) -22194 NM_032103 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 297.75-29 chr4 15763561 15763872 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -14612 NM_001775 952 Hs.479214 NM_001775 ENSG00000004468 CD38 ADPRC 1|ADPRC1 CD38 molecule protein-coding 285.25-5 chr13 66661756 66662033 + 1.75 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -163275 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 296-41 chr7 52670287 52670594 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -365193 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 329.25-18 chr2 221880664 221880949 + 1.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -306604 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 305.25-26 chr2 127769032 127769322 + 1.75 NA intron (NM_001006622, intron 2 of 5) intron (NM_001006622, intron 2 of 5) 41994 NM_001006623 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 424.5-7 chr3 187540119 187540480 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 93253 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 402-12 chr7 74145852 74146214 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28323 NM_022170 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 211.5-120 chr4 134547886 134548075 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 124112 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 241.25-57 chr5 173203909 173204063 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 31220 NM_001166175 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 265.75-74 chr8 97079964 97080150 + 1.75 NA intron (NM_016134, intron 7 of 7) intron (NM_016134, intron 7 of 7) 197871 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 246.75-9 chr10 98693684 98693920 + 1.75 NA intron (NM_021828, intron 6 of 11) Penelope1_Vert|LINE|Penelope 230766 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 114.5-241 chr7 50623390 50623466 + 1.75 NA intron (NM_001350816, intron 7 of 17) intron (NM_001350816, intron 7 of 17) -58023 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 178.75-106 chr8 83261219 83261439 + 1.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -142429 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 192.75-121 chr7 77698232 77698501 + 1.75 NA intron (NM_198467, intron 1 of 7) intron (NM_198467, intron 1 of 7) -1021 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 319.75-10 chr16 76297494 76297971 + 1.75 NA intron (NM_001322189, intron 2 of 24) intron (NM_001322189, intron 2 of 24) -12120 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 259.75-44 chr6 64279605 64279793 + 1.75 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 472863 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 256.5-63 chr5 141030669 141030883 + 1.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -20600 NM_013340 29930 Hs.278950 NM_013340 ENSG00000171815 PCDHB1 PCDH-BETA1 protocadherin beta 1 protein-coding 217.75-77 chr8 124750449 124750601 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -22018 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 308-9 chr14 65338152 65338549 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3167 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 353.75-8 chr17 70108357 70108621 + 1.75 NA intron (NM_001270422, intron 3 of 5) intron (NM_001270422, intron 3 of 5) 3644 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 588 chr18 55012299 55012645 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -53011 NM_025214 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 443.75-7 chr8 126995443 126995901 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -17482 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 140.25-33 chr12 1762477 1762572 + 1.75 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -57743 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 218.75-63 chr4 81097701 81097951 + 1.75 NA intron (NM_006259, intron 17 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 56331 NM_001282482 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 345.25-3 chr10 78339889 78340183 + 1.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 72694 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 296.5-29 chr4 111125738 111126004 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -265224 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 174.5-126 chr3 125394387 125394549 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -19114 NM_001348427 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 188.25-65 chr21 28913877 28914031 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -28581 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 347-25 chr8 99144066 99144408 + 1.75 NA intron (NM_017890, intron 13 of 61) AluJb|SINE|Alu 130971 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 269-44 chr7 35639827 35640106 + 1.75 NA intron (NM_022373, intron 5 of 8) intron (NM_022373, intron 5 of 8) 55169 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 179.25-94 chr21 25214619 25214986 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 216899 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 308.75 chr1 24715494 24715813 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -29794 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 257.25-37 chr4 87243645 87243862 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -23135 NM_020803 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 236-48 chr4 49110687 49110865 + 1.75 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 124134 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 182.25-93 chr5 85316931 85317124 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -932147 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 335-19 chr7 47881790 47882082 + 1.75 NA exon (NM_138295, exon 20 of 57) exon (NM_138295, exon 20 of 57) 66555 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 332-10 chr16 74775499 74775721 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_024306) promoter-TSS (NM_024306) -790 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 234.25-76 chr7 131958734 131959050 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 48672 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 267.5-42 chr20 1761831 1762032 + 1.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 17815 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 235-43 chr3 74086957 74087190 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 277829 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 113.5-133 chr2 218581692 218581796 + 1.75 NA intron (NR_073390, intron 2 of 6) intron (NR_073390, intron 2 of 6) 12905 NR_073390 9125 Hs.148767 NM_005444 ENSG00000144580 CNOT9 CAF40|CT129|RCD-1|RCD1|RQCD1 CCR4-NOT transcription complex subunit 9 protein-coding 224.75-37 chr17 29636926 29637189 + 1.75 NA intron (NM_033389, intron 13 of 14) L1ME4b|LINE|L1 -15634 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 471.75-5 chr7 87025381 87026199 + 1.75 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) intron (NM_001142749, intron 1 of 21) 14444 NM_001291991 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 344.5-14 chr3 178190713 178190975 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -228357 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 242-67 chr8 125803454 125803674 + 1.75 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 147633 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 189.75-102 chr6 90861893 90862018 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -274883 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 168.5-143 chr5 9333758 9333900 + 1.75 NA intron (NM_003966, intron 4 of 22) intron (NM_003966, intron 4 of 22) -177504 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 278-33 chr7 31640701 31640968 + 1.75 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) LTR106_Mam|LTR|LTR -46183 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 271-23 chr18 73163905 73164086 + 1.75 NA intron (NR_034133, intron 3 of 5) L1MA2|LINE|L1 100503 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 341.5-19 chr3 88658715 88659208 + 1.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 320505 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 538 chr11 68662839 68663366 + 1.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -21442 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 214-48 chr4 147923488 147923851 + 1.75 NA intron (NM_024605, intron 13 of 22) intron (NM_024605, intron 13 of 22) 141074 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 440.75-4 chr8 118850063 118850502 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 101603 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 189-4 chr1 62919446 62919885 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 91260 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 247.5-75 chr6 149390090 149390319 + 1.75 NA intron (NM_001292034, intron 3 of 6) intron (NM_001292034, intron 3 of 6) -10058 NM_001002255 387082 Hs.657168 NM_001002255 ENSG00000177688 SUMO4 IDDM5|SMT3H4|SUMO-4|dJ281H8.4 small ubiquitin like modifier 4 protein-coding 127.25-66 chr15 76870717 76870795 + 1.75 NA intron (NR_148227, intron 2 of 32) L1MEg|LINE|L1 -8812 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 223.75-21 chr13 61177753 61177954 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22027 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 339.5-35 chr9 28935094 28935403 + 1.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -46293 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 287-26 chr3 54152314 54152635 + 1.75 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) L2c|LINE|L2 29922 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 383.25-18 chr5 28154144 28154507 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 133340 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 312.25-14 chr2 61113624 61113812 + 1.75 NA intron (NM_001129993, intron 16 of 21) L1ME1|LINE|L1 31257 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 259.5-61 chr2 228256155 228256486 + 1.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -74633 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 218.75-92 chr9 79094143 79094340 + 1.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 51425 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 172.25-90 chr3 89308766 89308950 + 1.75 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 201237 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 548-3 chr2 32796241 32796564 + 1.75 NA intron (NM_017735, intron 16 of 19) L1M4|LINE|L1 -29031 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 235.75-29 chr16 24437233 24437467 + 1.75 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -102216 NM_006910 5930 Hs.188553 NM_006910 ENSG00000122257 RBBP6 MY038|P2P-R|PACT|RBQ-1|SNAMA RB binding protein 6, ubiquitin ligase protein-coding 208.75-2 chr1 81260102 81260504 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -45889 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 151.75-128 chr6 119913215 119913424 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -101860 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 272.25-37 chr3 121664685 121665174 + 1.75 NA exon (NM_001366284, exon 20 of 21) exon (NM_001366284, exon 20 of 21) -4026 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 364.5-22 chr8 122405320 122405556 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 163206 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 265.5-49 chr5 25087571 25087790 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 102976 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 114-130 chr5 52020001 52020093 + 1.75 NA intron (NR_147166, intron 3 of 3) intron (NR_147166, intron 3 of 3) 12016 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 431-5 chr2 174555847 174556098 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 2100 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 392.25 chr10 43645463 43645943 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_047558) promoter-TSS (NR_047558) -239 NR_047558 414208 Hs.608956 NR_047558 ENSG00000230565 ZNF32-AS2 ZNF32OS2|b402L1.7 ZNF32 antisense RNA 2 ncRNA 269.75-21 chr15 25905351 25905722 + 1.75 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 3176 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 150-123 chr6 34604483 34604633 + 1.75 NA intron (NM_022758, intron 3 of 3) intron (NM_022758, intron 3 of 3) -48225 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 306.25-20 chr2 104709408 104709824 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 48103 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 426.25-4 chr14 70838455 70838855 + 1.75 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 -29142 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 282.5-4 chr1 224485141 224485400 + 1.75 NA intron (NM_001322302, intron 2 of 6) intron (NM_001322302, intron 2 of 6) 50421 NM_001322304 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 433-2 chr1 184852117 184852514 + 1.75 NA intron (NM_052966, intron 5 of 13) intron (NM_052966, intron 5 of 13) -97457 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 302.75-30 chr8 125961491 125961843 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -10470 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 381.25-11 chr4 174246384 174246613 + 1.75 NA intron (NM_012180, intron 3 of 5) intron (NM_012180, intron 3 of 5) -26100 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 226.75-76 chr8 129602308 129602472 + 1.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1MB5|LINE|L1 -27372 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 269.5-12 chr13 32459376 32459620 + 1.75 NA intron (NM_001320836, intron 6 of 9) L1MA4A|LINE|L1 -31368 NM_001353634 90634 Hs.732118 NM_052818 ENSG00000139597 N4BP2L1 CG018 NEDD4 binding protein 2 like 1 protein-coding 633.25 chr10 41883763 41884250 + 1.75 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 484039 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 281-17 chr20 47013302 47013474 + 1.75 NA intron (NM_172110, intron 4 of 13) L2b|LINE|L2 118545 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 658 chr15 26508650 26509314 + 1.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 120108 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 142.5-54 chr12 120556145 120556247 + 1.75 NA intron (NM_014868, intron 4 of 16) intron (NM_014868, intron 4 of 16) 21840 NM_014868 9921 Hs.442798 NM_014868 ENSG00000022840 RNF10 RIE2 ring finger protein 10 protein-coding 310.25-20 chr6 17517115 17517415 + 1.75 NA intron (NM_006366, intron 7 of 12) intron (NM_006366, intron 7 of 12) -6000 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 306.25-36 chrX 114369796 114370026 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -214167 NM_000868 3358 Hs.149037 NM_000868 ENSG00000147246 HTR2C 5-HT1C|5-HT2C|5-HTR2C|5HTR2C|HTR1C 5-hydroxytryptamine receptor 2C protein-coding 238.75-49 chr5 95962870 95963073 + 1.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 970 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 169.5-170 chr8 85586417 85586555 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 69190 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 375-13 chr6 121908210 121908481 + 1.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 472699 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 274.75-19 chr18 65741304 65741512 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -8844 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 367.5 chr1 69497767 69498108 + 1.75 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 64682 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 381-10 chr2 8451794 8452271 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -123613 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 382.75-10 chr5 132815453 132815811 + 1.75 NA 3' UTR (NM_175873, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_175873, exon 1 of 1) 2330 NM_175873 134548 Hs.13308 NM_175873 ENSG00000198944 SOWAHA ANKRD43 sosondowah ankyrin repeat domain family member A protein-coding 182.75-136 chr8 119999195 119999348 + 1.75 NA intron (NM_022783, intron 4 of 8) AluSp|SINE|Alu 125549 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 151.75-97 chr4 37502048 37502161 + 1.75 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) L1PA13|LINE|L1 48179 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 379.25-2 chr10 23872788 23873144 + 1.75 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 178239 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 220.75-67 chr7 46991728 46991927 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -294705 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 331.75-19 chr5 121794501 121794882 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -57191 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 164.25-91 chr22 32589074 32589245 + 1.75 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) MER66A|LTR|ERV1 113922 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 384.5-7 chr15 61172703 61173088 + 1.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 56407 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 375-10 chr4 8448951 8449250 + 1.75 NA intron (NM_001350233, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 8303 NM_001350233 152992 Hs.566191 NM_024950 ENSG00000155275 TRMT44 C4orf23|METTL19|TRM44 tRNA methyltransferase 44 homolog protein-coding 262.5-55 chr4 61039137 61039365 + 1.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -104405 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 430.5-13 chr9 38044209 38044615 + 1.75 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 24815 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 236.75-71 chrX 153238827 153239012 + 1.75 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 59635 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 384.75-11 chr3 189840896 189841338 + 1.75 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) intron (NM_003722, intron 4 of 13) 11195 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 372.5-6 chr13 101612700 101613176 + 1.75 NA intron (NM_001271754, intron 6 of 10) intron (NM_001271754, intron 6 of 10) 122986 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 225.5-3 chr1 56490521 56490761 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 75678 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 259.5-90 chr7 73721360 73721556 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1789 NM_001165903 6804 Hs.647024 NM_004603 ENSG00000106089 STX1A HPC-1|P35-1|STX1|SYN1A syntaxin 1A protein-coding 328.5-7 chr12 4839443 4839822 + 1.75 NA intron (NM_002235, intron 1 of 1) MamRep1151|LTR?|LTR? 30456 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 280.25-26 chr2 62811614 62811875 + 1.75 NA intron (NM_001142615, intron 5 of 22) L3|LINE|CR1 104847 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 328.75-15 chr4 41464655 41464862 + 1.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) -73399 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 263.75-31 chr2 193564800 193565030 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -779354 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 366-12 chr3 4454863 4455212 + 1.75 NA intron (NM_001164674, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 12232 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 319.75-16 chr5 132287447 132287699 + 1.75 NA Intergenic LTR57|LTR|ERVL -6821 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 278.75-10 chr16 53881572 53881895 + 1.75 NA intron (NM_001363894, intron 6 of 9) MER113|DNA|hAT-Charlie -157660 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 220-65 chr8 78902703 78902882 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 65263 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 221.25-90 chr8 69976995 69977305 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 94102 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 355.5-28 chr8 140768155 140768434 + 1.75 NA intron (NM_001352718, intron 14 of 32) MIRc|SINE|MIR -35641 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 370.25-6 chr3 170476348 170476754 + 1.75 NA intron (NR_135557, intron 1 of 2) intron (NR_135557, intron 1 of 2) 9266 NR_135557 101928583 Hs.407600 NR_135555 ENSG00000285051 SLC7A14-AS1 - SLC7A14 antisense RNA 1 ncRNA 362.5-23 chr7 109057705 109058010 + 1.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -173270 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 190.5-83 chr20 4918414 4918644 + 1.75 NA intron (NM_005116, intron 3 of 16) intron (NM_005116, intron 3 of 16) 82981 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 571.25 chr2 119865206 119866061 + 1.75 NA intron (NM_002830, intron 3 of 26) intron (NM_002830, intron 3 of 26) 105711 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 272.5-24 chr14 37120349 37120618 + 1.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -51543 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 235.25-23 chr14 83575059 83575339 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 932567 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 272-10 chr14 59075139 59075357 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -113419 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 381-11 chr2 55031096 55031563 + 1.75 NA intron (NM_001321904, intron 2 of 9) L1ME2|LINE|L1 15997 NM_001321863 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 392.25-13 chr5 145942687 145943187 + 1.75 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 6359 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 186.5-68 chr2 119838436 119838571 + 1.75 NA intron (NM_002830, intron 2 of 26) intron (NM_002830, intron 2 of 26) 78581 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 266.5-37 chr2 146401751 146401942 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -185211 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 154.5-137 chr4 43574204 43574353 + 1.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -81735 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 305.25-11 chr12 45717989 45718347 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 9753 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 228.75-37 chr2 15120818 15121042 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 440404 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 387.25-13 chrX 107258661 107258904 + 1.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 52150 NM_001169154 139212 Hs.128836 NM_173494 ENSG00000080572 PIH1D3 CILD36|CXorf41|DNAAF6|NYSAR97|TWISTER PIH1 domain containing 3 protein-coding 384.75-5 chr14 48763626 48764055 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 822540 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 488-2 chr4 61386404 61386780 + 1.75 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 184420 NM_001371342 370.5-9 chr15 53005692 53005981 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -110529 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 364.25-15 chr16 64578064 64578352 + 1.75 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 543855 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 155.5-35 chr11 34119802 34119942 + 1.75 NA intron (NM_001144030, intron 6 of 26) L1M5|LINE|L1 14243 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 201.75-77 chr5 121765529 121765787 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -86224 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 219.5-15 chr10 60700259 60700463 + 1.75 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) 33167 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 287.5-48 chr6 43195303 43195486 + 1.75 NA intron (NM_015089, intron 9 of 40) intron (NM_015089, intron 9 of 40) 13198 NM_015089 23113 Hs.485434 NM_015089 ENSG00000112659 CUL9 H7AP1|PARC cullin 9 protein-coding 224-30 chr21 17029000 17029228 + 1.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -409776 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 324.5-26 chr4 64975694 64975966 + 1.75 NA intron (NR_033976, intron 2 of 6) intron (NR_033976, intron 2 of 6) 28670 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 239-60 chr8 121327672 121327887 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -311567 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 228-38 chr19 35632034 35632220 + 1.75 NA intron (NM_001319113, intron 4 of 8) intron (NM_001319113, intron 4 of 8) 3091 NM_024321 79171 Hs.5086 NM_024321 ENSG00000126254 RBM42 - RNA binding motif protein 42 protein-coding 339.25-6 chr18 6997776 6998010 + 1.75 NA intron (NM_005559, intron 32 of 62) intron (NM_005559, intron 32 of 62) 43216 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 200-63 chr4 32496730 32496934 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 145794 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 323-18 chr4 35476999 35477423 + 1.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 766728 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 313.75-26 chr9 94709800 94710100 + 1.75 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -16719 NM_032823 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 197.25-65 chr22 33769783 33769959 + 1.75 NA intron (NM_001362953, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 44885 NR_038949 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 647.25 chr1 74377592 74378146 + 1.75 NA intron (NM_015978, intron 17 of 24) intron (NM_015978, intron 17 of 24) 105571 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 356-11 chr7 11581826 11582093 + 1.75 NA intron (NM_015204, intron 4 of 26) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 250239 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 304.75-32 chr7 49308631 49308845 + 1.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 384191 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 182.5-47 chr14 39350011 39350136 + 1.75 NA intron (NM_001354155, intron 22 of 22) intron (NM_001354155, intron 22 of 22) 82427 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 325.75-28 chr6 156696846 156697265 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -80800 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 353-24 chr9 26800804 26801069 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 91866 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 396-6 chr2 82569150 82569478 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -287489 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 305.25-49 chr9 78238738 78239159 + 1.75 NA intron (NM_001349840, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 2873 NM_001098802 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 228.25-53 chr4 30687296 30687552 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -32945 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 244-22 chr2 75948919 75949250 + 1.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -238169 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 340.75-4 chr10 117244528 117244862 + 1.75 NA intron (NM_003054, intron 3 of 15) intron (NM_003054, intron 3 of 15) 3581 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 225.25-45 chr2 148629226 148629464 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15406 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 511.5-3 chr11 81646976 81647451 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 243623 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 351-2 chr10 58350104 58350485 + 1.75 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) L1ME3A|LINE|L1 15288 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 368.25-13 chr4 48139790 48140112 + 1.75 NA intron (NM_003215, intron 15 of 17) intron (NM_003215, intron 15 of 17) -5701 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 355.75-14 chr5 90410168 90410480 + 1.75 NA promoter-TSS (NM_004365) promoter-TSS (NM_004365) 324 NR_105024 731157 Hs.551062 NR_105024 ENSG00000255647 LOC731157 - uncharacterized LOC731157 ncRNA 311.5-20 chr22 31717579 31717924 + 1.75 NA intron (NM_173566, intron 3 of 8) MLT2A2|LTR|ERVL 32381 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 303.5-48 chr7 90926780 90926979 + 1.75 NA intron (NM_012395, intron 7 of 13) MER21C|LTR|ERVL 217063 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 276.5-16 chr11 111586273 111586701 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -15962 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 201-42 chr2 101652069 101652257 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -45540 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 203.75-108 chr8 25776822 25777018 + 1.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 268493 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 241.5-18 chr13 63550871 63551068 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -186466 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 426-12 chr7 48723236 48723572 + 1.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -201143 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 215.25-33 chr15 56036336 56036520 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -42816 NM_001329212 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 257.75-34 chr4 113684512 113684763 + 1.75 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) intron (NM_001321585, intron 2 of 19) 77101 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 245.5-23 chr14 55460337 55460558 + 1.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -19902 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 506.25-6 chr8 120819206 120819937 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7525 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 348.5-5 chr2 123477633 123477980 + 1.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -404325 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 373.5-20 chr8 72339054 72339437 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -87611 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 377.5-20 chr7 17048715 17049045 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -166897 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 251.75-75 chr7 87994042 87994398 + 1.75 NA intron (NM_001324421, intron 3 of 28) AluY|SINE|Alu 59969 NM_021722 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 198-91 chrX 57153435 57153685 + 1.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -15935 NM_019003 54466 Hs.460725 NM_019003 ENSG00000147059 SPIN2A DXF34|SPIN2|TDRD25|dJ323P24.1 spindlin family member 2A protein-coding 369.75-18 chr8 113682256 113682761 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -245569 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 416.5-5 chr15 63854049 63854552 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 16719 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 536.25 chr21 36834941 36835439 + 1.75 NA intron (NM_001352515, intron 6 of 10) intron (NM_001352515, intron 6 of 10) 127168 NM_001352518 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 225.75-38 chr2 76254089 76254272 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -543265 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 174.25-72 chr17 76310038 76310199 + 1.75 NA TTS (NM_001366236) TTS (NM_001366236) -2438 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 413.75-3 chr2 61412348 61412863 + 1.75 NA intron (NM_014709, intron 2 of 79) HAL1|LINE|L1 4772 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 203.25-27 chr11 108800679 108801047 + 1.75 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 135794 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 317-30 chr7 17410908 17411186 + 1.75 NA intron (NR_110015, intron 1 of 2) L1ME3E|LINE|L1 36130 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 397.25 chr10 20141766 20142147 + 1.75 NA intron (NM_032812, intron 4 of 13) intron (NM_032812, intron 4 of 13) 325524 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 495.5-2 chr8 135618264 135618887 + 1.75 NA intron (NM_006558, intron 7 of 8) intron (NM_006558, intron 7 of 8) 161119 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 235.75-64 chr6 119456684 119456914 + 1.75 NA intron (NR_046100, intron 4 of 5) intron (NR_046100, intron 4 of 5) 34503 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 421.25-3 chr15 57143802 57144233 + 1.75 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) MER34A1|LTR|ERV1 -75413 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 315.75-10 chr17 68562679 68562891 + 1.75 NA intron (NM_017565, intron 1 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -4358 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 114-67 chr2 25806808 25806886 + 1.75 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) intron (NM_018263, intron 2 of 11) -12156 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 317-13 chr16 35227365 35227754 + 1.75 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 31800 NR_157261 112268173 Hs.369226 NR_157261 LOC112268173 - uncharacterized LOC112268173 ncRNA 147.25-147 chr8 114475077 114475205 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -1038202 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 220.25-57 chr4 106179440 106179601 + 1.75 NA intron (NM_001290768, intron 23 of 26) L1MA4|LINE|L1 -136090 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 199-51 chr3 65173214 65173603 + 1.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -485408 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 167.75-41 chr13 64252022 64252206 + 1.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -176103 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 473.5-2 chr22 22016247 22016631 + 1.75 NA intron (NR_135291, intron 4 of 6) AluSx3|SINE|Alu 27495 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 267-33 chr3 130733098 130733317 + 1.75 NA intron (NM_014602, intron 4 of 19) intron (NM_014602, intron 4 of 19) 13622 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 262.5-62 chr5 60157971 60158217 + 1.75 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) MIR|SINE|MIR 214569 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 515.75-2 chr12 18804528 18805208 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 66749 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 339.75-33 chr9 36398904 36399344 + 1.75 NA intron (NM_194330, intron 1 of 11) intron (NM_194330, intron 1 of 11) 1145 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 310-20 chr4 186555010 186555324 + 1.75 NA intron (NM_005958, intron 1 of 1) CpG 400 NM_005958 4543 Hs.243467 NM_005958 ENSG00000168412 MTNR1A MEL-1A-R|MT1 melatonin receptor 1A protein-coding 149.25-117 chr3 123857921 123858109 + 1.75 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) intron (NM_001321309, intron 2 of 32) 26317 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 225.75-26 chr14 99778135 99778335 + 1.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -15178 NM_001008707 2009 Hs.12451 NM_004434 ENSG00000066629 EML1 BH|ELP79|EMAP|EMAPL|HuEMAP EMAP like 1 protein-coding 199.75-37 chr17 69248066 69248269 + 1.75 NA intron (NM_018672, intron 37 of 37) intron (NM_018672, intron 37 of 37) -3352 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 171.5-80 chr2 74128609 74128730 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 19243 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 384.25-7 chr2 30751836 30752478 + 1.75 NA intron (NM_144575, intron 10 of 22) intron (NM_144575, intron 10 of 22) 55289 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 199.25-45 chr17 31683412 31683579 + 1.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 108084 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 461-4 chr5 93925329 93925739 + 1.75 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) MER44D|DNA|TcMar-Tigger -183934 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 190-37 chr20 35543682 35543880 + 1.75 NA intron (NM_198398, intron 4 of 13) L2|LINE|L2 1703 NM_015966 51614 Hs.472558 NM_015966 ENSG00000125991 ERGIC3 C20orf47|C2orf47|CGI-54|Erv46|NY-BR-84|PRO0989|SDBCAG84|dJ477O4.2 ERGIC and golgi 3 protein-coding 374.75-3 chr2 99173749 99174083 + 1.75 NA exon (NM_138798, exon 2 of 7) exon (NM_138798, exon 2 of 7) 7142 NM_001320419 129531 Hs.14222 NM_138798 ENSG00000158411 MITD1 - microtubule interacting and trafficking domain containing 1 protein-coding 368.75-9 chr3 112859670 112860154 + 1.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -13962 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 223.5-101 chr5 120220229 120220452 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -243938 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 210.75-28 chr15 68370610 68370766 + 1.75 NA intron (NM_001004439, intron 2 of 29) intron (NM_001004439, intron 2 of 29) 61475 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 140-66 chr18 61096502 61096584 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -236887 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 115.75-146 chr3 129743682 129743896 + 1.75 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) intron (NM_001349271, intron 2 of 4) -19676 NM_001349274 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 451-5 chr9 1204034 1204301 + 1.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 152680 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 311.25-27 chr8 51863750 51863984 + 1.75 NA intron (NM_001363193, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 35169 NM_052937 115294 Hs.671268 NM_052937 ENSG00000168300 PCMTD1 - protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 338.25-9 chr14 23862334 23862652 + 1.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -91277 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 239.5-14 chr11 70271808 70272139 + 1.75 NA intron (NR_045286, intron 1 of 28) intron (NR_045286, intron 1 of 28) 1273 NM_177423 8500 Hs.530749 NM_003626 ENSG00000131626 PPFIA1 LIP.1|LIP1|LIPRIN PTPRF interacting protein alpha 1 protein-coding 259.5-102 chr9 103006902 103007079 + 1.75 NA intron (NM_001340, intron 5 of 7) L1MA8|LINE|L1 11657 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 254.5-62 chr6 73069434 73069645 + 1.75 NA intron (NM_001160132, intron 3 of 13) L2c|LINE|L2 73975 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 346.5-2 chr10 21128476 21128736 + 1.75 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -45384 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 391-9 chr17 72521234 72521613 + 1.75 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 71381 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 174-22 chr12 46198688 46198816 + 1.75 NA intron (NM_030674, intron 13 of 16) intron (NM_030674, intron 13 of 16) 67764 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 355.75-5 chr14 27381863 27382103 + 1.75 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -230605 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 417.25-4 chr18 36357201 36357550 + 1.75 NA intron (NM_001281740, intron 2 of 28) intron (NM_001281740, intron 2 of 28) 59662 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 316.75-2 chr10 123755596 123755797 + 1.75 NA intron (NM_198148, intron 12 of 13) MIR1_Amn|SINE|MIR 89341 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 386.5-12 chr6 81287517 81287793 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 465026 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 202-79 chr9 31174781 31174948 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 206626 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 324-26 chr6 124119294 124119576 + 1.75 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR -163570 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 434.25-5 chr17 55984001 55984287 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -169331 NM_153228 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 357.5-12 chr2 99535017 99535294 + 1.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -45138 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 299.25-35 chr4 36405095 36405397 + 1.75 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 21182 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 272.25-23 chr18 1587519 1587734 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -227997 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 221-22 chr15 67269032 67269376 + 1.75 NA intron (NM_001031715, intron 3 of 20) L1ME4a|LINE|L1 -14006 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 255.25-35 chr4 6634360 6634547 + 1.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5638 NM_001272054 93621 Hs.406590 NM_033296 ENSG00000179010 MRFAP1 PAM14|PGR1 Morf4 family associated protein 1 protein-coding 408.75-2 chr12 40037849 40038254 + 1.75 NA intron (NM_052885, intron 2 of 9) L1MEf|LINE|L1 68030 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 412.5-12 chr6 107307778 107308295 + 1.75 NA intron (NM_020381, intron 2 of 7) intron (NM_020381, intron 2 of 7) 151528 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 256.25-39 chr5 167687878 167688052 + 1.75 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -66964 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 539.5 chr14 35686909 35687426 + 1.75 NA intron (NM_014990, intron 17 of 40) intron (NM_014990, intron 17 of 40) 75764 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 361.25-4 chr10 90730439 90730710 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 127465 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 243.5-75 chr7 68607170 68607361 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 587012 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 283-14 chr14 65871185 65871582 + 1.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 400281 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 180.75-57 chr18 76304115 76304226 + 1.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 94660 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 132.25-196 chrX 114684387 114684473 + 1.75 NA intron (NM_001256761, intron 2 of 5) intron (NM_001256761, intron 2 of 5) -30803 NR_031578 100302153 NR_031578 ENSG00000221710 MIR1298 MIRN1298|hsa-mir-1298 microRNA 1298 ncRNA 269.75-17 chr13 103533299 103533519 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 108209 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 188.25-99 chr5 167368133 167368301 + 1.75 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -199816 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 203.25-74 chr4 72902327 72902567 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 167269 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 281.25-30 chr3 21857563 21857818 + 1.75 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -99449 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 270.75-37 chr4 81448294 81448594 + 1.75 NA intron (NM_152545, intron 4 of 13) intron (NM_152545, intron 4 of 13) 23463 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 291.5-16 chr17 71196666 71196895 + 1.75 NA intron (NR_104152, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 5399 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 259.5-53 chr2 33404174 33404347 + 1.75 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -14256 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 302.25-6 chr12 10671697 10672055 + 1.75 NA intron (NM_018423, intron 1 of 10) intron (NM_018423, intron 1 of 10) 2176 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 277-27 chr5 58738833 58739097 + 1.75 NA intron (NM_138453, intron 3 of 4) intron (NM_138453, intron 3 of 4) 155890 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 188.25-40 chr14 55139929 55140108 + 1.75 NA intron (NR_003225, intron 1 of 3) intron (NR_003225, intron 1 of 3) 3035 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 267-24 chr2 21968334 21968577 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -257803 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 188-75 chr8 62781065 62781210 + 1.75 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L1MA4A|LINE|L1 -196724 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 148-94 chr4 106600669 106600793 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 167107 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 262.5-70 chr7 109046774 109046947 + 1.75 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -162273 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 332.25-29 chr5 38767934 38768184 + 1.75 NA intron (NR_109951, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR -47786 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 220.75-8 chr10 29652680 29652921 + 1.75 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) L1MB8|LINE|L1 -17829 NM_021738 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 344.25-11 chr2 168054843 168055189 + 1.75 NA intron (NM_013233, intron 14 of 17) L2c|LINE|L2 -113872 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 506 chr5 20433029 20433768 + 1.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 127847 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 287-33 chr5 181255037 181255498 + 1.75 NA 3' UTR (NM_032765, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_032765, exon 2 of 2) 5876 NM_001346051 84851 Hs.458412 NM_032765 ENSG00000183718 TRIM52 RNF102 tripartite motif containing 52 protein-coding 523.75-4 chr8 88083332 88084119 + 1.75 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) L1MC5a|LINE|L1 -209710 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 246.75-85 chrX 142238838 142239029 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -33643 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 387.75-4 chr10 77932159 77932571 + 1.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 5553 NR_024585 100128292 Hs.547908 NR_024585 DLG5-AS1 - DLG5 antisense RNA 1 ncRNA 230.5-54 chr17 60393355 60393495 + 1.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -1292 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 296-42 chr8 3166285 3166633 + 1.75 NA intron (NM_033225, intron 37 of 69) AluSx|SINE|Alu -438008 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 314.5-30 chr8 123180748 123181148 + 1.75 NA intron (NM_032899, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 816 NM_032899 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 275.5-39 chr3 47879325 47879500 + 1.75 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 29857 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 281-39 chr7 100153705 100154007 + 1.75 NA TTS (NM_018275) TTS (NM_018275) 2813 NR_039802 100616439 NR_039802 ENSG00000284518 MIR4658 - microRNA 4658 ncRNA 290.25-3 chr1 187896129 187896370 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 452621 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 260.5-41 chr4 30709899 30710277 + 1.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -10281 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 199-4 chr1 182813385 182813512 + 1.75 NA intron (NM_001200056, intron 6 of 12) intron (NM_001200056, intron 6 of 12) 23675 NM_001200051 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 218.25-104 chr9 26935976 26936137 + 1.75 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) intron (NM_001321546, intron 1 of 12) -10934 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 323.25-17 chr3 96359929 96360162 + 1.75 NA promoter-TSS (NR_107027) promoter-TSS (NR_107027) 81 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 290.75-28 chr2 135504888 135505188 + 1.75 NA intron (NM_032143, intron 1 of 20) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 25547 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 244.5-84 chr6 69048811 69049127 + 1.75 NA intron (NM_001704, intron 14 of 31) intron (NM_001704, intron 14 of 31) 413687 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 203.75-85 chr5 43141868 43142116 + 1.75 NA intron (NM_003432, intron 4 of 7) L1M4|LINE|L1 20427 NM_001330716 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 259.75-57 chr9 72954054 72954336 + 1.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1142 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 196-18 chr12 17800761 17800908 + 1.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 127535 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 407.5-11 chr7 52973945 52974256 + 1.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -61533 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 337.5-6 chr10 58898262 58898755 + 1.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -101010 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 246.25-6 chr10 68529639 68529902 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2247 NM_001324314 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 282-50 chr8 124934916 124935323 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -6889 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 269-42 chr7 28747881 28748119 + 1.75 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 61867 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 226.75-65 chr6 139287368 139287569 + 1.75 NA intron (NM_153235, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 4530 NM_153235 167838 Hs.535820 NM_153235 ENSG00000164440 TXLNB C6orf198|LST001|MDP77|dJ522B19.2 taxilin beta protein-coding 164.25-137 chr6 57079938 57080102 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -10010 NM_015555 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 194.25-57 chr2 101814383 101814627 + 1.75 NA intron (NM_145686, intron 3 of 30) intron (NM_145686, intron 3 of 30) 116798 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 336.25-21 chr9 90188587 90188809 + 1.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -147199 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 291.5-3 chr1 61265199 61265403 + 1.75 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) -11783 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 207.5-7 chr10 94125161 94125293 + 1.75 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) L2a|LINE|L2 -16433 NR_120616 101927049 Hs.144492 NR_120615 ENSG00000232913 PLCE1-AS2 - PLCE1 antisense RNA 2 ncRNA 362.5-19 chr4 52415337 52415676 + 1.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 241033 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 166.5-159 chr5 27867676 27867798 + 1.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 395445 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 160-55 chr2 78741311 78741473 + 1.75 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 195861 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 384.75-9 chr20 41313807 41314175 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13871 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 290-35 chr3 173333241 173333452 + 1.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -62606 NM_001365924 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 203.25-88 chr5 146490451 146490590 + 1.75 NA intron (NM_006706, intron 14 of 21) HAL1|LINE|L1 25593 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 409.5-14 chr6 154090620 154091017 + 1.75 NA intron (NM_001008505, intron 2 of 3) intron (NM_001008505, intron 2 of 3) 1056 NM_001285527 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 281-38 chr7 29003842 29004131 + 1.75 NA intron (NR_038965, intron 4 of 4) MER1B|DNA|hAT-Charlie 24019 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 243-73 chr8 63861392 63861628 + 1.75 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L1MD1|LINE|L1 92080 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 232.75-52 chr4 136882136 136882294 + 1.75 NA intron (NR_149105, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 -311541 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 252.75-57 chr5 23812207 23812487 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -139001 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 334-3 chr10 8574913 8575352 + 1.75 NA intron (NR_134492, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 19259 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 334.5-16 chr22 35032137 35032563 + 1.75 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -33808 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 566.75 chr10 95812433 95812936 + 1.75 NA intron (NM_001312654, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 56521 NM_001164183 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 485.5 chr1 115505994 115506320 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -135813 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 191.25-101 chr8 80806543 80806776 + 1.75 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 67809 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 381-3 chr11 112240175 112240445 + 1.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 13882 NM_000317 5805 Hs.503860 NM_000317 ENSG00000150787 PTS PTPS 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase protein-coding 335.75-18 chr7 31120104 31120426 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 67804 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 355-11 chr5 11867130 11867405 + 1.75 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 37179 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 222.25-82 chr7 81358294 81358436 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 203454 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 326.25-21 chr20 18113650 18114022 + 1.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -24027 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 127.75-155 chr5 52913149 52913275 + 1.75 NA intron (NM_181501, intron 14 of 28) intron (NM_181501, intron 14 of 28) -76140 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 167-115 chr8 104086159 104086363 + 1.75 NA intron (NR_145711, intron 17 of 21) intron (NR_145711, intron 17 of 21) -137074 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 257.75-7 chr10 106895296 106895560 + 1.75 NA intron (NM_001206569, intron 2 of 25) AluSx|SINE|Alu 269278 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 313.25-20 chr4 20786830 20787028 + 1.75 NA intron (NM_025221, intron 2 of 7) MIRc|SINE|MIR 63739 NM_147181 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 143-57 chr17 73794049 73794158 + 1.75 NA intron (NR_040020, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 7281 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 248.75-36 chr2 232074973 232075249 + 1.75 NA intron (NR_046477, intron 5 of 18) intron (NR_046477, intron 5 of 18) -97542 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 242.25-90 chr9 101438457 101438760 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -2834 NM_000035 229 Hs.530274 NM_000035 ENSG00000136872 ALDOB ALDB|ALDO2 aldolase, fructose-bisphosphate B protein-coding 211.75-36 chr18 10591856 10592040 + 1.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 34472 NR_146509 102724470 NR_146509 LINC01887 - long intergenic non-protein coding RNA 1887 ncRNA 227.75-81 chr8 48401662 48401852 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -149810 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 359.75-5 chr14 44662850 44663148 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 136127 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 394.5-5 chr14 32678979 32679463 + 1.75 NA intron (NM_004274, intron 8 of 13) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -259658 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 332.5-2 chr1 239391535 239392097 + 1.75 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) intron (NM_001347716, intron 1 of 7) 5248 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 286.5-37 chr20 59866318 59866639 + 1.75 NA intron (NM_014258, intron 40 of 44) intron (NM_014258, intron 40 of 44) 67159 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 153.75-67 chr2 140938297 140938389 + 1.75 NA intron (NM_018557, intron 20 of 90) intron (NM_018557, intron 20 of 90) -351658 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 321-24 chr5 62610791 62611110 + 1.75 NA intron (NM_016338, intron 29 of 29) intron (NM_016338, intron 29 of 29) 32131 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 259.75-10 chr11 108415495 108415727 + 1.75 NA intron (NM_001351110, intron 2 of 8) L1MCa|LINE|L1 51918 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 211-5 chr1 208796920 208797171 + 1.75 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 68357 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 437.75-8 chr9 30561314 30561722 + 1.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -153064 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 184.75-85 chr6 73528326 73528510 + 1.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7386 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 246.25-17 chr12 15207828 15208107 + 1.75 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) MLT2C1|LTR|ERVL 13450 NM_001190726 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 421.25-4 chr16 11033377 11033760 + 1.75 NA intron (NM_015226, intron 12 of 22) intron (NM_015226, intron 12 of 22) 89004 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 234-44 chr4 46626254 46626473 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -236235 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 294.25-14 chr18 12723990 12724225 + 1.75 NA intron (NM_147163, intron 5 of 6) intron (NM_147163, intron 5 of 6) 21065 NM_020232 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 370.75-5 chr2 194283922 194284230 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -60193 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 445.25-2 chr12 16472948 16473267 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 119690 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 268-32 chr2 220975507 220975738 + 1.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 596682 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 300.75-9 chr11 79141436 79141716 + 1.75 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) L1MA3|LINE|L1 260533 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 224.75-20 chr12 14146349 14146566 + 1.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -166101 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 235-76 chr9 10653976 10654141 + 1.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 40852 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 269.5-29 chr2 149803961 149804261 + 1.75 NA intron (NR_145421, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 55080 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 513.25-2 chr1 228924523 228925212 + 1.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 189388 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 304.75-26 chr4 143713672 143713877 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -13099 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 132-92 chr2 106299186 106299298 + 1.75 NA Intergenic Intergenic -70503 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 141.25-177 chr8 16067231 16067367 + 1.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 118973 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 167.25-118 chr4 83631895 83632052 + 1.75 NA Intergenic Intergenic 95865 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 166.75-137 chr8 18807480 18807669 + 1.75 NA intron (NM_015310, intron 4 of 15) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 1293 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 236.5-91 chr8 78298849 78299024 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -217404 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 268-59 chr8 110354252 110354518 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -378614 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 676.5 chr9 77196856 77197505 + 1.5 NA intron (NM_001018038, intron 1 of 68) L1MB3|LINE|L1 -19263 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 171-14 chr10 63925431 63925629 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -403640 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 327.75-17 chr3 95847451 95847722 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -164393 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 309-52 chr9 12262738 12263152 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -430440 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 253.25-34 chr2 227061050 227061532 + 1.5 NA intron (NM_000092, intron 26 of 47) intron (NM_000092, intron 26 of 47) 103268 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 215.5-37 chr15 88788601 88788780 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14746 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 393.5-7 chr2 27854663 27854946 + 1.5 NA intron (NM_022128, intron 2 of 7) L1MA10|LINE|L1 -33905 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 297-9 chr11 110545274 110545663 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 115520 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 238-38 chr21 14651767 14652087 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -8820 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 177-10 chr10 67937349 67937571 + 1.5 NA intron (NM_001278185, intron 20 of 23) intron (NM_001278185, intron 20 of 23) 46058 NM_001314049 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 316-12 chr14 67557783 67558170 + 1.5 NA intron (NM_020715, intron 4 of 28) intron (NM_020715, intron 4 of 28) -24126 NM_001348546 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 218.25-87 chr7 6477936 6478147 + 1.5 NA intron (NM_001100603, intron 1 of 3) L1ME3G|LINE|L1 6111 NM_001100603 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 168.75-108 chr5 40292414 40292605 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 240218 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 141-160 chr9 30123918 30124040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 284475 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 297-10 chr12 91508453 91508817 + 1.5 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -325818 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 211.5-147 chr7 93634514 93634699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59876 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 199.5-158 chr9 38466770 38467005 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -42433 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 161.25-88 chr2 43409493 43409642 + 1.5 NA intron (NM_001083953, intron 28 of 37) L3b|LINE|CR1 182356 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 290.5-15 chr15 69368589 69368824 + 1.5 NA intron (NM_001104554, intron 3 of 8) L1MEd|LINE|L1 -45643 NR_160296 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 267.75-15 chr14 73864753 73864962 + 1.5 NA intron (NM_001371328, intron 3 of 8) L1MB7|LINE|L1 12910 NM_001146155 145482 Hs.632344 NM_152444 ENSG00000140043 PTGR2 HEL-S-298|PGR2|ZADH1 prostaglandin reductase 2 protein-coding 227-8 chr11 74739767 74739988 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -8451 NM_015424 25884 Hs.432379 NM_015424 ENSG00000054938 CHRDL2 BNF1|CHL2 chordin like 2 protein-coding 197-51 chr5 29892483 29892677 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 12020 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 206-73 chr7 107975084 107975269 + 1.5 NA intron (NM_002291, intron 11 of 33) intron (NM_002291, intron 11 of 33) 27985 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 218-8 chr1 186350876 186351195 + 1.5 NA intron (NM_003292, intron 20 of 50) L1MEc|LINE|L1 24218 NM_003292 7175 Hs.279640 NM_003292 ENSG00000047410 TPR - translocated promoter region, nuclear basket protein protein-coding 178.5-62 chr16 64076848 64077068 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 1045105 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 297.75-2 chr10 55682756 55683137 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -55004 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 175.75-94 chr4 120701871 120702154 + 1.5 NA intron (NM_001300824, intron 13 of 13) intron (NM_001300824, intron 13 of 13) 220854 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 533-3 chr5 55003480 55003899 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18096 NM_001135604 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 267-31 chr3 80001529 80001832 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -233682 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 234.5-106 chrX 93407241 93407499 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 266208 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 195-30 chr14 100936896 100937192 + 1.5 NA TTS (NR_003232) TTS (NR_003232) 553 NR_003232 767564 NR_003232 ENSG00000201672 SNORD113-4 14q(I-4) small nucleolar RNA, C/D box 113-4 snoRNA 301.5-22 chr17 31149771 31150108 + 1.5 NA intron (NM_001042492, intron 1 of 57) MLT2E|LTR|ERVL 54962 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 137.25-125 chr5 50778838 50778968 + 1.5 NA intron (NM_024615, intron 9 of 25) L2a|LINE|L2 111489 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 403-5 chr3 190015016 190015447 + 1.5 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) AluYk11|SINE|Alu 105666 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 227.25-14 chr10 127514743 127514987 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -34484 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 144.5-71 chr14 98310749 98310940 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -332720 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 183-55 chr2 205047120 205047306 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 3 of 21) intron (NM_205863, intron 3 of 21) 501738 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 357-20 chr9 134086511 134086802 + 1.5 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -18630 NM_007371 8019 Hs.522472 NM_007371 ENSG00000169925 BRD3 ORFX|RING3L bromodomain containing 3 protein-coding 161.25-168 chr8 28809443 28809755 + 1.5 NA intron (NR_026826, intron 6 of 14) intron (NR_026826, intron 6 of 14) 80316 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 117-40 chr12 83392692 83392819 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 705600 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 254.25-34 chr2 145025402 145025658 + 1.5 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 357563 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 138-163 chr8 105482652 105482878 + 1.5 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) L1MEd|LINE|L1 163222 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 437.5-7 chr7 29121899 29122279 + 1.5 NA intron (NM_001371261, intron 2 of 13) intron (NM_001371261, intron 2 of 13) -2944 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 255-60 chr7 93301477 93301745 + 1.5 NA intron (NM_001257998, intron 17 of 28) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 69245 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 276.5-13 chr11 76994661 76995022 + 1.5 NA intron (NM_001300953, intron 5 of 9) L2c|LINE|L2 -39557 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 259.5-82 chr6 49469983 49470246 + 1.5 NA intron (NM_018132, intron 1 of 8) intron (NM_018132, intron 1 of 8) 6744 NM_018132 55166 Hs.88663 NM_018132 ENSG00000031691 CENPQ C6orf139|CENP-Q centromere protein Q protein-coding 389-10 chr2 84690975 84691566 + 1.5 NA intron (NM_001370, intron 45 of 76) intron (NM_001370, intron 45 of 76) 174815 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 315-21 chr6 51747144 51747407 + 1.5 NA intron (NM_138694, intron 58 of 66) MIRb|SINE|MIR 125405 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 277.5-46 chr3 65322295 65322533 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -571402 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 263.5-46 chr4 112848639 112848835 + 1.5 NA intron (NM_001354275, intron 1 of 43) L2c|LINE|L2 -12250 NM_001354264 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 326.5-28 chr8 79545614 79545933 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -65344 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 249-37 chr4 153148105 153148278 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -4143 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 231.75-40 chr2 122526507 122526769 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 546843 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 166.5-173 chr6 49027646 49027843 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 435509 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 279-57 chr9 11151769 11152084 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 538720 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 190.5-53 chr15 91726576 91726831 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -127005 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 274.5-21 chr14 50852111 50852461 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19767 NM_001206673 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 200-6 chr1 222644842 222645066 + 1.5 NA intron (NM_001300867, intron 1 of 22) intron (NM_001300867, intron 1 of 22) 651 NM_001324065 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 248-40 chr20 2368617 2369008 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -12089 NM_001254734 343641 Hs.452039 NM_198994 ENSG00000166948 TGM6 SCA35|TG6|TGM3L|TGY|dJ734P14.3 transglutaminase 6 protein-coding 127.5-256 chr8 139083404 139083530 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -169426 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 162-4 chr1 117707185 117707334 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 101211 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 356.5-12 chr18 68158305 68158636 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -343648 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 261.5-72 chrX 93799243 93799457 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125144 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 221.5-92 chr7 69587276 69587554 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10209 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 483.25-6 chr4 86155968 86156603 + 1.5 NA intron (NR_110879, intron 3 of 3) intron (NR_110879, intron 3 of 3) 36479 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 230.25-64 chr4 103544349 103544607 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 119436 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 372-14 chr5 15379187 15379517 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -112792 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 338-27 chr5 84216183 84216497 + 1.5 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) intron (NM_001278642, intron 2 of 9) 168527 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 167-93 chr5 36803742 36803859 + 1.5 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 72894 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 212.5-73 chr3 152007149 152007329 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79064 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 339-15 chr16 78881118 78881440 + 1.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) AluJb|SINE|Alu 719458 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 255.75-26 chr2 108619300 108619580 + 1.5 NA intron (NM_001193482, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu -1811 NM_001193484 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 219-60 chr21 26671611 26671821 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98430 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 311.25-2 chr1 98291283 98291674 + 1.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 80767 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 224.25-25 chr12 106987306 106987521 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_025198) promoter-TSS (NM_025198) -247 NM_025198 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 315.75-9 chr14 80960990 80961315 + 1.5 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) intron (NM_001142626, intron 1 of 8) 5531 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 325.5-40 chr8 120501648 120502106 + 1.5 NA intron (NM_022045, intron 14 of 21) intron (NM_022045, intron 14 of 21) 56458 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 380.5 chr1 70949283 70949579 + 1.5 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -97075 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 354.75-4 chr10 121875721 121876098 + 1.5 NA intron (NM_001001976, intron 7 of 11) MER103C|DNA|hAT-Charlie 52122 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 254.5-64 chr6 83904508 83904785 + 1.5 NA intron (NM_016230, intron 3 of 15) L1MA4A|LINE|L1 44957 NM_016230 51167 Hs.5741 NM_016230 ENSG00000065615 CYB5R4 NCB5OR|cb5/cb5R|dJ676J13.1 cytochrome b5 reductase 4 protein-coding 340.25-15 chr6 81922569 81923016 + 1.5 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) L1MD1|LINE|L1 10688 NR_149136 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 163.5-174 chr6 119713995 119714145 + 1.5 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 164262 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 204.25-26 chr12 34388931 34389102 + 1.5 NA Intergenic GSATII|Satellite|centr 366520 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 137.5-125 chr2 109243285 109243404 + 1.5 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 70281 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 233-38 chr21 20468952 20469183 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -210382 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 359-7 chr16 56763098 56763527 + 1.5 NA intron (NM_014669, intron 3 of 21) intron (NM_014669, intron 3 of 21) -18517 NM_001242795 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 304-3 chr10 17344725 17344944 + 1.5 NA intron (NM_001004470, intron 4 of 7) intron (NM_001004470, intron 4 of 7) -42102 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 748 chr7 2949124 2950092 + 1.5 NA intron (NM_001324281, intron 3 of 25) L1MB8|LINE|L1 94259 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 250.5-45 chr2 46876033 46876273 + 1.5 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 39653 NM_001171509 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 240.5-79 chr4 96946118 96946332 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -420701 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-32 chr17 61264834 61265091 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 102742 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 169-40 chr2 14424203 14424409 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23348 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 296-29 chr2 209876359 209876673 + 1.5 NA intron (NM_032504, intron 23 of 63) intron (NM_032504, intron 23 of 63) 104523 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 134-47 chr13 56397795 56397892 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -743075 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 243-6 chr10 600783 601033 + 1.5 NA intron (NM_014974, intron 1 of 36) intron (NM_014974, intron 1 of 36) -27656 NR_147612 101930421 Hs.654707 NR_147612 ENSG00000225140 LOC101930421 - uncharacterized LOC101930421 ncRNA 255.5 chr1 40262110 40262438 + 1.5 NA intron (NM_005857, intron 2 of 9) intron (NM_005857, intron 2 of 9) 4038 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 237.75-7 chr10 51460179 51460697 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 160865 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 148.5-91 chr18 21423491 21423599 + 1.5 NA intron (NM_001142966, intron 7 of 32) LTR16E1|LTR|ERVL 177159 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 267.5-28 chr15 73202995 73203431 + 1.5 NA intron (NM_002499, intron 7 of 28) L1MB3|LINE|L1 -96697 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 254.5-9 chr1 200022736 200023040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4822 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 246.5-71 chr7 110902499 110902760 + 1.5 NA intron (NM_032549, intron 4 of 5) intron (NM_032549, intron 4 of 5) -188377 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 143-63 chr18 65134643 65134824 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -615519 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 183.75-123 chr8 73275745 73275976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16358 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 449.5-3 chr21 29800198 29800960 + 1.5 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 52404 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 261-56 chr7 49399601 49399835 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -373920 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 216.75-59 chr4 113991558 113991803 + 1.5 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -12033 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 246.5-74 chr8 89392654 89392919 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 364925 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 147-151 chr8 133392186 133392364 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -94971 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 280.75-29 chr3 67719022 67719466 + 1.5 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) L1MDa|LINE|L1 64547 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 232.5-8 chr10 17390103 17390285 + 1.5 NA intron (NR_034129, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 3258 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 171-82 chr20 55183930 55184060 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -239048 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 225.75-24 chr14 68851128 68851337 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54989 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 157.25-157 chr9 10924904 10925128 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 311810 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 290.75-21 chr17 63144619 63145018 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 178583 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 246.75-31 chr2 56584894 56585198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -399276 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 296.75-5 chr11 41880695 41880957 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 166258 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 251.75-16 chr11 109135007 109135246 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -287064 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 237-48 chr5 137136276 137136445 + 1.5 NA intron (NM_004598, intron 4 of 10) AluJr4|SINE|Alu 8163 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 412-10 chr4 103748734 103749151 + 1.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -28957 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 347.5-15 chr5 39041628 39042287 + 1.5 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) AluJo|SINE|Alu 32442 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 319.5-10 chr12 9655523 9656000 + 1.5 NA intron (NR_046444, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 7714 NR_046444 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 202.75-94 chr5 122347699 122347998 + 1.5 NA intron (NM_001308107, intron 1 of 8) intron (NM_001308107, intron 1 of 8) 35611 NM_001308109 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 219.25-15 chr10 49809124 49809313 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -46839 NM_001347823 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 271.5-76 chr6 54603276 54603597 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -243335 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 325.5-6 chr12 53806351 53806620 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49451 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 329-30 chr5 43654116 43654390 + 1.5 NA intron (NM_012343, intron 14 of 21) MER63C|DNA|hAT-Blackjack -51023 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 306.25-10 chr11 95238810 95239040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6450 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 367.5-6 chr1 218479768 218480059 + 1.5 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) intron (NR_031644, intron 2 of 6) -30182 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 254.75-12 chr13 99741977 99742162 + 1.5 NA intron (NR_120421, intron 4 of 4) intron (NR_120421, intron 4 of 4) -13068 NR_120383 101927465 Hs.130690 NR_046525 CLYBL-AS1 - CLYBL antisense RNA 1 ncRNA 365-5 chr12 48462158 48462507 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -10333 NM_012404 23519 Hs.532658 NM_012404 ENSG00000139223 ANP32D PP32R2 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member D protein-coding 160.5-11 chr10 29186104 29186355 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -102841 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 191.25-15 chr11 33137904 33138297 + 1.5 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 23380 NM_001326 1479 Hs.44402 NM_001326 ENSG00000176102 CSTF3 CSTF-77 cleavage stimulation factor subunit 3 protein-coding 309-25 chr21 30229056 30229271 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13066 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 560.75 chr8 77397807 77398397 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52595 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 182.5-46 chr14 25058964 25059190 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8780 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 180-96 chr5 4752078 4752249 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -21318 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 310.5-13 chr14 54110027 54110455 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -153350 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 320.75-16 chr22 34503770 34504259 + 1.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 493902 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 204.75-17 chr10 74479620 74479813 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L1MC4|LINE|L1 49608 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 301.5 chr1 12463364 12463722 + 1.5 NA intron (NM_015378, intron 67 of 69) AluJb|SINE|Alu -43703 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 305-35 chr9 16159741 16159977 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 93248 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 195-13 chr10 63926874 63927033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -405063 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 322.75 chr1 60181069 60181454 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -107491 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 297.25-9 chr15 96500839 96501074 + 1.5 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 167191 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 327-7 chr12 47506124 47506383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91245 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 159.75-44 chr14 63215455 63215626 + 1.5 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 11097 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 306.25-15 chr15 89260382 89260846 + 1.5 NA intron (NM_001113378, intron 3 of 37) intron (NM_001113378, intron 3 of 37) 16635 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 380.5-7 chr2 65759030 65759360 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -326596 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 241.5-66 chr3 98595713 98595951 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2221 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 261-11 chr11 28893417 28893664 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -415992 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 130.5-223 chr7 39028786 39028929 + 1.5 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu -15290 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 341.5-10 chr17 72686656 72687265 + 1.5 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -46488 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 125.25-30 chr10 90789363 90789474 + 1.5 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) intron (NM_019860, intron 1 of 2) 68621 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 178-42 chr2 55437460 55437685 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -17716 NM_018084 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 351.5-30 chr8 129621682 129622097 + 1.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -46871 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 260.25-22 chr2 38938683 38938953 + 1.5 NA intron (NM_001145451, intron 7 of 15) L1MB8|LINE|L1 19455 NM_001145451 100271715 Hs.99841 NM_001145451 ENSG00000214694 ARHGEF33 - Rho guanine nucleotide exchange factor 33 protein-coding 304.5-12 chr16 35403516 35403834 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 40144 NR_027079 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 237.75-27 chr17 41793404 41793670 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6769 NM_001352775 3728 Hs.514174 NM_002230 ENSG00000173801 JUP CTNNG|DP3|DPIII|PDGB|PKGB junction plakoglobin protein-coding 331.5-18 chr21 15498534 15498793 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -231271 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 247.5-35 chr18 72716777 72716959 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 136514 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 308.25-5 chr10 115955574 115955935 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 239035 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 212.5-62 chr20 46557938 46558190 + 1.5 NA 3' UTR (NM_022829, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_022829, exon 13 of 13) -7410 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 268-8 chr1 196998687 196998888 + 1.5 NA intron (NM_030787, intron 7 of 9) intron (NM_030787, intron 7 of 9) 21250 NM_030787 81494 Hs.282594 NM_030787 ENSG00000134389 CFHR5 CFHL5|CFHR5D|FHR-5|FHR5 complement factor H related 5 protein-coding 182.75-36 chr12 32467271 32467530 + 1.5 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) -18572 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 298.25-36 chr9 100750261 100750578 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 172340 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 256.5-9 chr10 73335787 73335997 + 1.5 NA intron (NM_001367801, intron 7 of 27) AluJr4|SINE|Alu 22862 NM_001350934 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 170.25-29 chr12 131784876 131785226 + 1.5 NA intron (NM_004592, intron 14 of 17) intron (NM_004592, intron 14 of 17) -43342 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 165-27 chr11 108923968 108924170 + 1.5 NA intron (NM_004398, intron 17 of 17) intron (NM_004398, intron 17 of 17) 259000 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 180-20 chr12 48689488 48689633 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001277842, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001277842, exon 8 of 8) -7322 NM_017822 54934 Hs.505412 NM_017822 ENSG00000139620 KANSL2 C12orf41|NSL2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 2 protein-coding 343-32 chr8 83613525 83613772 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 209890 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 229-6 chr10 80609990 80610220 + 1.5 NA intron (NM_207372, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -39692 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 225.75-42 chr2 135856481 135857010 + 1.5 NA exon (NM_005915, exon 11 of 17) exon (NM_005915, exon 11 of 17) -19561 NM_002299 3938 Hs.551506 NM_002299 ENSG00000115850 LCT LAC|LPH|LPH1 lactase protein-coding 251.25-21 chr17 56357655 56357890 + 1.5 NA intron (NM_001370326, intron 6 of 20) intron (NM_001370326, intron 6 of 20) 204297 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 201.5-121 chr7 42004244 42004542 + 1.5 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) L1MD|LINE|L1 232816 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 301.25-9 chr13 113139672 113139959 + 1.5 NA intron (NM_001312674, intron 4 of 6) intron (NM_001312674, intron 4 of 6) -9769 NR_126424 104413892 NR_126424 F10-AS1 - F10 antisense RNA 1 ncRNA 208.5-149 chr9 27200076 27200266 + 1.5 NA intron (NM_001290077, intron 11 of 21) L1ME3Cz|LINE|L1 82622 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 232.5-25 chr14 62459140 62459355 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -319274 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 392.5-10 chr5 172783058 172783492 + 1.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -12080 NM_004417 1843 Hs.171695 NM_004417 ENSG00000120129 DUSP1 CL100|HVH1|MKP-1|MKP1|PTPN10 dual specificity phosphatase 1 protein-coding 223.5-54 chr18 65992240 65992465 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 241340 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 329.5-31 chr9 30357040 30357447 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51211 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 171-25 chr12 18870579 18870756 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 132548 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 275.5-47 chr4 75813466 75813795 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001290049, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001290049, exon 26 of 26) 88822 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 205.75-2 chr1 82024805 82024996 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 222447 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 112.75-135 chr3 86865806 86865946 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125273 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 311-9 chr12 41276368 41276803 + 1.5 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 88265 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 360.75-16 chr8 56979159 56979677 + 1.5 NA intron (NM_017813, intron 2 of 4) intron (NM_017813, intron 2 of 4) 14449 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 149-148 chrX 123706182 123706297 + 1.5 NA intron (NM_001081550, intron 3 of 38) intron (NM_001081550, intron 3 of 38) 26813 NM_001081550 57187 Hs.149991 NM_020449 ENSG00000125676 THOC2 CXorf3|MRX12|MRX35|THO2|dJ506G2.1|hTREX120 THO complex 2 protein-coding 353.75 chr11 91444687 91445095 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -575689 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 375.5-7 chr17 55495025 55495429 + 1.5 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -73392 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 118-164 chr6 77870461 77870598 + 1.5 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) intron (NM_001282136, intron 4 of 4) 217490 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 240.5-52 chr2 106157514 106157794 + 1.5 NA intron (NM_025076, intron 5 of 14) L1MB7|LINE|L1 -18773 NM_001253876 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 203.5-130 chr7 64644604 64644762 + 1.5 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -21400 NM_001282359 51427 Hs.50216 NM_016220 ENSG00000196247 ZNF107 Y8|ZFD25|ZNF588|smap-7 zinc finger protein 107 protein-coding 421.5-9 chr3 141411369 141411945 + 1.5 NA intron (NM_001080412, intron 7 of 7) intron (NM_001080412, intron 7 of 7) 9308 NM_001350100 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 205.25-77 chr4 58411627 58411790 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 124620 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 199.25-28 chr13 23737778 23737929 + 1.5 NA intron (NM_005932, intron 18 of 18) intron (NM_005932, intron 18 of 18) -151015 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 233.5-11 chr1 175009324 175009528 + 1.5 NA intron (NM_001007214, intron 5 of 5) AluSx|SINE|Alu 9479 NM_014412 27101 Hs.508524 NM_014412 ENSG00000116161 CACYBP GIG5|PNAS-107|S100A6BP|SIP calcyclin binding protein protein-coding 132-187 chrX 99771249 99771345 + 1.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 638976 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 221-11 chr10 85322815 85323138 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 109796 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 199-74 chr6 65581136 65581302 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -1415 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 201.5-8 chr1 76090322 76090527 + 1.5 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 15678 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 561.75-3 chr8 78758205 78758888 + 1.5 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1M2|LINE|L1 -34172 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 213.75-27 chr12 65314498 65314779 + 1.5 NA intron (NM_001031679, intron 2 of 6) intron (NM_001031679, intron 2 of 6) 35651 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 282.25-30 chr5 73199980 73200240 + 1.5 NA intron (NR_134291, intron 1 of 2) intron (NR_134291, intron 1 of 2) 1851 NR_134291 340090 Hs.434311 NR_134291 LOC340090 - uncharacterized LOC340090 ncRNA 318-8 chr14 62181884 62182181 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -42059 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 210-102 chr9 30827688 30827955 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -419367 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 460-3 chr14 79149683 79150210 + 1.5 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L1PA10|LINE|L1 -50036 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 303.5-13 chr14 83422980 83423293 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 780504 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 318-3 chr1 109299627 109299960 + 1.5 NA intron (NM_001265613, intron 1 of 8) intron (NM_001265613, intron 1 of 8) 7218 NM_001265613 343263 Hs.443402 NM_001010985 ENSG00000221986 MYBPHL - myosin binding protein H like protein-coding 146.75-172 chr8 138286070 138286341 + 1.5 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) intron (NM_015912, intron 3 of 19) -202660 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 205-59 chr5 16272380 16272566 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 92232 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 250.5-86 chr7 13722907 13723171 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 263475 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 286.5-9 chr10 103864110 103864380 + 1.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -8839 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 241.75-46 chr21 28267785 28267995 + 1.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -39223 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 209.5-129 chr5 147041696 147041853 + 1.5 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) intron (NM_181677, intron 2 of 10) 14363 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 245-29 chr2 12449917 12450205 + 1.5 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 250931 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 225-57 chr5 32817423 32817618 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 106199 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 177.75-134 chr8 29603895 29604117 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 144103 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 267.75-62 chr8 144847544 144847884 + 1.5 NA TTS (NM_001330623) TTS (NM_001330623) 5334 NM_014066 28991 Hs.493218 NM_014066 ENSG00000170619 COMMD5 HCARG|HT002 COMM domain containing 5 protein-coding 406-11 chr5 171716725 171717061 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -68979 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 334-19 chr3 60745758 60746205 + 1.5 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) intron (NR_148921, intron 4 of 4) -128111 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 217-18 chr13 108505298 108505555 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -90479 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 244.5-2 chr1 49884004 49884332 + 1.5 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 139786 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 346.25-7 chr16 86952207 86952557 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -105402 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 180.75-116 chr5 81316631 81316943 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 15200 NM_001131035 84240 Hs.15536 NM_032280 ENSG00000131732 ZCCHC9 PPP1R41 zinc finger CCHC-type containing 9 protein-coding 280.25-14 chr12 9172402 9172701 + 1.5 NA intron (NM_002864, intron 15 of 35) L1PA11|LINE|L1 35844 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 327-25 chr6 50151099 50151399 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -101320 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 367-20 chr7 137117853 137118352 + 1.5 NA intron (NR_046103, intron 1 of 3) L1ME3F|LINE|L1 46239 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 170.25-21 chr11 109185333 109185487 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -236780 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 254.75-24 chr2 165982527 165982973 + 1.5 NA intron (NR_110598, intron 1 of 3) intron (NR_110598, intron 1 of 3) 25332 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 394.75-2 chr13 60891722 60892334 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 219073 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 204.5-15 chr10 84216240 84216500 + 1.5 NA 3' UTR (NM_033100, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_033100, exon 17 of 17) 9174 NM_001017924 340745 Hs.450425 NM_001017924 ENSG00000204033 LRIT2 LRRC22 leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 2 protein-coding 121.5-97 chr16 54887611 54887699 + 1.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -39422 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 169.5-94 chr21 32269118 32269281 + 1.5 NA intron (NM_018944, intron 4 of 4) intron (NM_018944, intron 4 of 4) 9850 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 255.75-44 chr5 153633470 153633840 + 1.5 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) intron (NM_001258020, intron 3 of 16) 141483 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 255-29 chr2 135068076 135068394 + 1.5 NA intron (NM_001172435, intron 3 of 24) intron (NM_001172435, intron 3 of 24) 15943 NM_012233 22930 Hs.306327 NM_012233 ENSG00000115839 RAB3GAP1 P130|RAB3GAP|RAB3GAP130|WARBM1 RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1 protein-coding 146.25-27 chr12 129385553 129385709 + 1.5 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) intron (NM_133448, intron 3 of 8) 177030 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 246.75-48 chr4 57340712 57340917 + 1.5 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -85058 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 177.25-117 chr5 45733461 45733660 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -37180 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 516 chr10 39444648 39445394 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 748425 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 177-81 chr5 126077962 126078123 + 1.5 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -101535 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 200.25-102 chr7 109847070 109847324 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 113016 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 570.25 chr8 141745400 141746302 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 40462 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 291.5-28 chr3 20256325 20256628 + 1.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -70243 NM_001012413 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 167.75-8 chr1 106527187 106527400 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -290946 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 347.25-5 chr15 55701770 55702077 + 1.5 NA intron (NM_173814, intron 2 of 19) L1ME1|LINE|L1 41229 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 207.75-112 chr6 103443415 103443632 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1416023 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 226.25-72 chr8 120339093 120339578 + 1.5 NA intron (NM_021110, intron 42 of 47) intron (NM_021110, intron 42 of 47) 105815 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 225.25-49 chr20 40149409 40149568 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 145027 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 240.5-60 chr21 31487903 31488219 + 1.5 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) AluSq10|SINE|Alu 71026 NM_001353688 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 201-16 chr10 110841997 110842201 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28805 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 217.5-11 chr10 18327608 18328012 + 1.5 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) -12899 NM_201590 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 382-25 chrX 38073702 38074137 + 1.5 NA intron (NM_001163334, intron 4 of 16) intron (NM_001163334, intron 4 of 16) 40385 NM_001163334 94122 Hs.662334 NM_138780 ENSG00000147041 SYTL5 slp5 synaptotagmin like 5 protein-coding 286.25-28 chr8 69250540 69250914 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -146537 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 365-20 chr8 135586082 135586351 + 1.5 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 128760 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 280.25-30 chr2 172922924 172923300 + 1.5 NA intron (NM_001282900, intron 3 of 26) intron (NM_001282900, intron 3 of 26) -5093 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 222.5-75 chr4 63524369 63524704 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 884914 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 231.75-55 chr4 127875349 127875512 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -5463 NM_014264 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 527.75-2 chr11 36960093 36960554 + 1.5 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -362044 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 167.75-110 chr5 8321329 8321704 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 136048 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 187.5-10 chr1 182989281 182989420 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34070 NM_002293 3915 Hs.609663 NM_002293 ENSG00000135862 LAMC1 LAMB2 laminin subunit gamma 1 protein-coding 262.25-25 chr20 53856234 53856442 + 1.5 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 19371 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 353-10 chr2 147302542 147302863 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -541815 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 334.5-12 chr2 140375267 140375543 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 68 of 90) L1MC5a|LINE|L1 211280 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 189.5-40 chr13 59676458 59676674 + 1.5 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) intron (NM_001258366, intron 26 of 26) -336152 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 182-39 chr15 51702051 51702208 + 1.5 NA intron (NM_013243, intron 10 of 11) intron (NM_013243, intron 10 of 11) 20626 NM_013243 29106 Hs.232618 NM_013243 ENSG00000104112 SCG3 SGIII secretogranin III protein-coding 177.75-52 chr16 52375007 52375189 + 1.5 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 116534 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 222-90 chr9 92854214 92854418 + 1.5 NA intron (NM_001354537, intron 4 of 4) L1M5|LINE|L1 23652 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 172.5-56 chr12 108945755 108945919 + 1.5 NA intron (NM_018711, intron 6 of 15) L1MC4|LINE|L1 65745 NM_001917 1610 Hs.113227 NM_001917 ENSG00000110887 DAO DAAO|DAMOX|OXDA D-amino acid oxidase protein-coding 315.25-11 chr18 2951265 2951654 + 1.5 NA intron (NM_014646, intron 3 of 19) intron (NM_014646, intron 3 of 19) -4836 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 206.5-110 chr6 68630658 68630917 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 3537 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 246.5-25 chr14 85104755 85104950 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -167080 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 198.5-64 chr2 13557715 13558003 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -550846 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 205-24 chr15 57012276 57012478 + 1.5 NA intron (NM_001322164, intron 3 of 19) intron (NM_001322164, intron 3 of 19) 92932 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 221.75-56 chr4 135895478 135895776 + 1.5 NA intron (NR_103763, intron 1 of 2) intron (NR_103763, intron 1 of 2) -7534 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 333.5-19 chr8 49043100 49043409 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11082 NM_001256596 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 216.25-62 chr21 27545341 27545725 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -176846 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 187-24 chr12 57702190 57702359 + 1.5 NA intron (NM_001017956, intron 5 of 13) L1MB4|LINE|L1 8142 NM_006812 10956 Hs.527861 NM_006812 ENSG00000135506 OS9 ERLEC2|OS-9 OS9 endoplasmic reticulum lectin protein-coding 300.75-8 chr11 41761935 41762166 + 1.5 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 47482 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 296.75-30 chr7 3464392 3464783 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 163335 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 192-35 chr12 28562116 28562291 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -371465 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 433-6 chr14 51177316 51178074 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62552 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 319.5-19 chr15 44391654 44391966 + 1.5 NA intron (NR_157849, intron 9 of 9) L1M5|LINE|L1 -35819 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 239.5-10 chr10 89008931 89009162 + 1.5 NA intron (NM_152871, intron 4 of 7) intron (NM_152871, intron 4 of 7) -16071 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 141.75-108 chr20 19196328 19196487 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16235 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 299-3 chr1 166811352 166811606 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -27996 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 470.5-10 chr5 23716530 23716974 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 209097 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 239.5-84 chr8 138429106 138429283 + 1.5 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 68067 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 130-165 chr8 80052586 80052714 + 1.5 NA non-coding (NR_105033, exon 4 of 9) non-coding (NR_105033, exon 4 of 9) -22391 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 288-29 chr21 25171546 25171831 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 260013 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 178.25-9 chr1 210540113 210540317 + 1.5 NA intron (NM_001122834, intron 9 of 11) intron (NM_001122834, intron 9 of 11) 210849 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 340.75-5 chr11 100032338 100032797 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 8 of 23) intron (NM_001243270, intron 8 of 23) 476422 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 265-11 chr14 26454431 26454696 + 1.5 NA intron (NM_006489, intron 3 of 3) intron (NM_006489, intron 3 of 3) 98867 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 371.5-7 chr2 121341291 121341738 + 1.5 NA intron (NM_015282, intron 38 of 38) L1M4|LINE|L1 -56312 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 175-88 chr4 59769052 59769266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 755586 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 135.25-149 chr4 148159411 148159671 + 1.5 NA intron (NM_000901, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR 282873 NR_148974 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 318 chr1 51741756 51742083 + 1.5 NA intron (NM_001350209, intron 4 of 23) intron (NM_001350209, intron 4 of 23) 12069 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 198.5-80 chr2 135327082 135327551 + 1.5 NA intron (NM_001286569, intron 6 of 21) HAL1|LINE|L1 190688 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 378.25-6 chr20 43870352 43870761 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -24162 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 435.25 chr1 232149907 232150247 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 224243 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 224.25-59 chr3 161199054 161199297 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -22115 NM_001320227 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 259.5-35 chr15 46021157 46021425 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 316096 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 290.25-12 chr15 86194902 86195212 + 1.5 NA intron (NM_152336, intron 5 of 24) intron (NM_152336, intron 5 of 24) -78340 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 166.5-140 chr4 35186159 35186287 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -916476 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 316.75-6 chr17 75773950 75774340 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5634 NM_005324 3021 Hs.180877 NM_005324 ENSG00000132475 H3F3B H3.3B H3 histone family member 3B protein-coding 191.75-25 chr11 85093784 85094034 + 1.5 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -170488 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 183.5-44 chr14 85992219 85992434 + 1.5 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) intron (NR_110155, intron 1 of 3) 57648 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 467.5-3 chr4 71596298 71596859 + 1.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 187501 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 237.75-26 chr17 20202643 20202824 + 1.5 NA intron (NM_001033554, intron 1 of 5) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 46661 NM_001033555 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 171.75-119 chr6 11606852 11607101 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69227 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 214.25-75 chr7 54288976 54289160 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -41629 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 247.5-81 chr8 46051324 46051528 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 566217 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 255-66 chr9 83977670 83978023 + 1.5 NA intron (NM_031262, intron 3 of 16) intron (NM_031262, intron 3 of 16) 2369 NM_031263 3190 Hs.522257 NM_002140 ENSG00000165119 HNRNPK AUKS|CSBP|HNRPK|TUNP heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K protein-coding 288-3 chr1 168557261 168557615 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13441 NM_003175 6846 Hs.458346 NM_003175 ENSG00000143185 XCL2 SCM-1b|SCM1B|SCYC2 X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 164.25-33 chr12 118009328 118009467 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7264 NM_001130113 5985 Hs.731908 NM_007370 ENSG00000111445 RFC5 RFC36 replication factor C subunit 5 protein-coding 221.5-64 chr3 139111066 139111286 + 1.5 NA intron (NR_026783, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 6991 NR_026783 60467 Hs.512673 NM_021812 ENSG00000232416 BPESC1 NCRNA00187 blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis candidate 1 ncRNA 279.5-55 chr5 167446133 167446340 + 1.5 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -127423 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 160.5-19 chr11 20767720 20767846 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 2 of 18) L2a|LINE|L2 98197 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 226.5-99 chr8 80505192 80505356 + 1.5 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 19048 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 248.25-15 chr12 9726259 9726624 + 1.5 NA intron (NM_001253750, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 6858 NM_001267701 160365 Hs.560087 NM_172004 ENSG00000184293 CLECL1 DCAL-1|DCAL1 C-type lectin like 1 protein-coding 156-35 chr12 82467426 82467584 + 1.5 NA intron (NR_144942, intron 8 of 10) L1MA5A|LINE|L1 -108700 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 282-48 chr8 86716529 86716836 + 1.5 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) L1MA5A|LINE|L1 26993 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 269.25-31 chr3 94723607 94723967 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -214476 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 187.5-164 chr8 59587499 59587783 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 468431 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 200-81 chr6 164005785 164006096 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -334456 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 138.5-91 chr19 35135685 35135800 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_139284) promoter-TSS (NM_139284) -683 NM_139284 163175 Hs.65256 NM_139284 ENSG00000153902 LGI4 AMCNMY|LGIL3 leucine rich repeat LGI family member 4 protein-coding 320.5-5 chr10 33266335 33266684 + 1.5 NA intron (NR_045259, intron 2 of 15) intron (NR_045259, intron 2 of 15) 68158 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 397.25-10 chr5 63211855 63212377 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 633297 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 580.5 chr11 47796733 47797367 + 1.5 NA intron (NM_015231, intron 27 of 35) intron (NM_015231, intron 27 of 35) -29709 NM_001318339 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 301-2 chr11 21364813 21365062 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) intron (NM_201551, intron 14 of 18) 695351 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 215-47 chr2 171501706 171501963 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -20399 NM_001256909 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 177.5-70 chr18 77875598 77875724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 118066 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 284.25-33 chrX 97206720 97207083 + 1.5 NA intron (NM_007309, intron 22 of 26) intron (NM_007309, intron 22 of 26) 322993 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 414.25-11 chr8 87196505 87197084 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MamGypLTR2b|LTR|Gypsy 330379 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 308.25-8 chr11 79694082 79694312 + 1.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -253167 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 309.5-32 chr4 41269839 41270229 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 13106 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 261 chr1 40208344 40208570 + 1.5 NA intron (NM_012421, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -39480 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 184.75-106 chr8 75646223 75646384 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 106335 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 179.25-40 chr12 19009723 19009895 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -119924 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 282-38 chr4 30838908 30839274 + 1.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118722 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 163-96 chr5 66637894 66638021 + 1.5 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 41564 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 182.5-5 chr1 107973894 107974099 + 1.5 NA intron (NR_046653, intron 1 of 2) intron (NR_046653, intron 1 of 2) -8816 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 318-21 chr20 40083248 40083612 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 78969 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 129.5-205 chr6 137871822 137871964 + 1.5 NA intron (NM_001270507, intron 2 of 8) intron (NM_001270507, intron 2 of 8) -3660 NR_049793 100130476 Hs.598050 NR_049793 ENSG00000237499 WAKMAR2 lnc-TNFAIP3 wound and keratinocyte migration associated lncRNA 2 ncRNA 334.5-14 chr22 24969757 24970145 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23256 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 253.5-21 chr13 81923326 81923597 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -696478 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 266.5-45 chr20 37130889 37131216 + 1.5 NA intron (NM_152503, intron 13 of 24) Alu|SINE|Alu -35055 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 242.5-49 chr2 148406768 148407140 + 1.5 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) L2c|LINE|L2 -237797 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 208.5-8 chr10 50407888 50408154 + 1.5 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) MER3|DNA|hAT-Charlie -159411 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 120-184 chr8 31329961 31330149 + 1.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -296699 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 179-66 chr3 123523758 123523945 + 1.5 NA intron (NM_001329786, intron 3 of 5) intron (NM_001329786, intron 3 of 5) 60766 NM_001329787 201562 Hs.705480 NM_198402 ENSG00000206527 HACD2 PTPLB 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2 protein-coding 315.75-16 chr3 3628338 3628642 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -170941 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 300.5-33 chr4 49083192 49083483 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 96695 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 338.5-20 chr3 34265679 34266232 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 467325 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 325.25-31 chr7 157695130 157695373 + 1.5 NA intron (NM_130843, intron 11 of 21) intron (NM_130843, intron 11 of 21) -120829 NR_029689 406945 NR_029689 ENSG00000207960 MIR153-2 MIRN153-2|mir-153-2 microRNA 153-2 ncRNA 180-42 chr16 65194993 65195159 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -18503 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 222-16 chr11 25442566 25442759 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -746461 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 133.5-270 chr8 128389235 128389458 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 175333 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 221-39 chr2 126409722 126410014 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -246067 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 245-5 chr1 221440241 221440620 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -104134 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 198-63 chr5 82067266 82067464 + 1.5 NA intron (NM_031482, intron 3 of 7) intron (NM_031482, intron 3 of 7) 95342 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 362.5-13 chr2 224676544 224676975 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -91362 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 166.25-14 chr1 168452130 168452366 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29592 NR_037851 100505918 Hs.568494 NR_037851 LOC100505918 - uncharacterized LOC100505918 ncRNA 286-36 chr9 36341849 36342148 + 1.5 NA intron (NM_194328, intron 11 of 11) intron (NM_194328, intron 11 of 11) 58271 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 391.75-8 chrX 38164680 38165022 + 1.5 NA exon (NM_001170750, exon 4 of 9) exon (NM_001170750, exon 4 of 9) 56020 NM_006307 8406 Hs.15154 NM_006307 ENSG00000101955 SRPX DRS|ETX1|HEL-S-83p|SRPX1 sushi repeat containing protein X-linked protein-coding 185-8 chr10 35284525 35284756 + 1.5 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) L1MEf|LINE|L1 37615 NM_181698 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 208-43 chr2 160437515 160437780 + 1.5 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) -29765 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 247.75-10 chr14 26194883 26195077 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 358450 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 465-5 chr7 63879933 63880535 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -118572 NR_145488 100419780 Hs.742917 NR_145488 ZNF722P ZNF722 zinc finger protein 722, pseudogene pseudo 235-35 chr20 31307224 31307395 + 1.5 NA intron (NM_001037731, intron 1 of 1) L1MA10|LINE|L1 1276 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 159-109 chr8 75139732 75139857 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 138687 NR_103848 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 266.75-42 chr5 91173797 91174193 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 140407 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 292.5-27 chr17 9408172 9408539 + 1.5 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) intron (NM_004853, intron 6 of 7) 167465 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 248.5-27 chr14 65445740 65445936 + 1.5 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu -25264 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 353.25-10 chr2 64656980 64657380 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3267 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 204.5-98 chr4 4474928 4475178 + 1.5 NA intron (NM_001346282, intron 1 of 10) intron (NM_001346282, intron 1 of 10) 6647 NR_126434 104472519 Hs.691848 NR_126434 ENSG00000248221 STX18-IT1 - STX18 intronic transcript 1 ncRNA 241.5-106 chr9 27284229 27284431 + 1.5 NA TTS (NM_020641) TTS (NM_020641) -1537 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 335-18 chr7 42403600 42403847 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -166514 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 240.25-51 chr5 9205617 9206027 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 8 of 22) intron (NM_003966, intron 8 of 22) -151927 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 399-8 chr7 103916333 103916649 + 1.5 NA intron (NM_005045, intron 2 of 64) intron (NM_005045, intron 2 of 64) 73025 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 239-39 chr3 190851027 190851205 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11578 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 147.25-84 chr3 73973304 73973532 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 164174 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 221.25-48 chr21 44808052 44808255 + 1.5 NA intron (NM_006936, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 5912 NR_109928 101928689 Hs.116142 NR_109928 LINC01424 - long intergenic non-protein coding RNA 1424 ncRNA 153-134 chr6 141704196 141704374 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 384514 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 188.5-65 chr2 36554811 36555079 + 1.5 NA intron (NM_005102, intron 7 of 7) intron (NM_005102, intron 7 of 7) 43223 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 181.75-97 chr4 140600190 140600491 + 1.5 NA Intergenic HERVI-int|LTR|ERV1 -31379 NM_021833 7350 Hs.249211 NM_021833 ENSG00000109424 UCP1 SLC25A7|UCP uncoupling protein 1 protein-coding 158.25-92 chr3 117216633 117216780 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 295275 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 196.5-175 chr9 36235009 36235198 + 1.5 NA intron (NM_001190384, intron 2 of 9) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 23345 NM_001190383 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 224.25-91 chr7 19210338 19210501 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -64998 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 277.75-34 chr8 63133180 63133412 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 35146 NR_102684 101410533 Hs.163027 NR_102684 ENSG00000270673 YTHDF3-AS1 - YTHDF3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 233.5-102 chr7 74339503 74339710 + 1.5 NA intron (NM_032421, intron 3 of 15) MIR|SINE|MIR 50131 NM_003388 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 284.5-44 chr4 48434365 48434736 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -48793 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 147.75-154 chr8 99185579 99185747 + 1.5 NA intron (NM_017890, intron 16 of 61) intron (NM_017890, intron 16 of 61) 172397 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 311.5-30 chr7 35757977 35758189 + 1.5 NA intron (NR_120511, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 41646 NR_108083 100506725 Hs.304253 NR_108082 ENSG00000227544 LOC100506725 - uncharacterized LOC100506725 ncRNA 243-4 chr1 157421863 157422075 + 1.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 130546 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 133.25-117 chr20 13989119 13989213 + 1.5 NA intron (NM_001363752, intron 1 of 16) L1MB5|LINE|L1 1448 NM_001271539 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 294.5-13 chr12 133103843 133104061 + 1.5 NA intron (NM_001300778, intron 5 of 5) intron (NM_001300778, intron 5 of 5) 23749 NM_001300776 7699 Hs.181552 NM_003440 ENSG00000196387 ZNF140 pHZ-39 zinc finger protein 140 protein-coding 235.75-25 chr14 65475917 65476201 + 1.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 4957 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 197.5-31 chr12 41243547 41243738 + 1.5 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 55322 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 271.25-12 chr11 93063895 93064261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 94455 NM_005959 4544 Hs.569039 NM_005959 ENSG00000134640 MTNR1B FGQTL2|MEL-1B-R|MT2 melatonin receptor 1B protein-coding 439.5-5 chr14 75032465 75032794 + 1.5 NA intron (NM_014381, intron 6 of 11) intron (NM_014381, intron 6 of 11) 18838 NM_014381 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 243.25-42 chr5 38423774 38424090 + 1.5 NA intron (NM_182798, intron 7 of 16) intron (NM_182798, intron 7 of 16) 20391 NM_182798 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 181.5-15 chr10 84547600 84547784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 122523 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 169.5-74 chr2 71742918 71743121 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 276320 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 440.5-6 chr17 55248704 55249025 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16096 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 280.5-23 chr2 62199454 62200061 + 1.5 NA intron (NM_006577, intron 1 of 1) intron (NM_006577, intron 1 of 1) 3642 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 385.75-9 chr2 123731642 123732000 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 293353 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 232.5-89 chr6 39041007 39041632 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7462 NR_136562 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 170.75-149 chr9 35442799 35443068 + 1.5 NA intron (NR_003581, intron 6 of 17) intron (NR_003581, intron 6 of 17) 36178 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 165.75-137 chr5 87916591 87916783 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 254645 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 432.5-3 chr10 50291841 50292513 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -43567 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 409-5 chr2 11602653 11602953 + 1.5 NA intron (NM_014668, intron 17 of 32) intron (NM_014668, intron 17 of 32) 60117 NM_033090 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 160.5-52 chr14 51046216 51046445 + 1.5 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 49374 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 259.5-49 chr17 70688040 70688386 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 513966 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 253-13 chr13 99332360 99332595 + 1.5 NA intron (NR_026644, intron 6 of 8) intron (NR_026644, intron 6 of 8) -18943 NR_024013 100131561 Hs.721900 NR_024013 FKSG29 - FKSG29 ncRNA 380-4 chr11 45541492 45541909 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 123922 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 139.5-53 chr12 129883579 129883739 + 1.5 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 20366 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 186.25-11 chr1 217337469 217337653 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -199859 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 408-8 chr2 43743342 43743719 + 1.5 NA intron (NM_172069, intron 22 of 29) intron (NM_172069, intron 22 of 29) -30509 NM_001348912 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 213-46 chr2 104893924 104894105 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21419 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 470.5-2 chr1 216376168 216376567 + 1.5 NA intron (NM_206933, intron 3 of 71) intron (NM_206933, intron 3 of 71) 47029 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 271-32 chr3 108226520 108226721 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4196 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 298.5-27 chr3 148824239 148824633 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3375 NM_001871 1360 Hs.477891 NM_001871 ENSG00000153002 CPB1 CPB|PASP|PCPB carboxypeptidase B1 protein-coding 224-33 chr3 94812190 94812374 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -125981 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 170-73 chr4 160719091 160719282 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -941402 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 445.75-4 chr12 45495544 45495894 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 203029 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 220.75-79 chr9 29649682 29649908 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -436194 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 284.5-20 chr16 10029069 10029397 + 1.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) AluSp|SINE|Alu 152834 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 240-36 chr3 111470571 111470744 + 1.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -71540 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 223-25 chr14 62834395 62834638 + 1.5 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) L2a|LINE|L2 210942 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 295.5-65 chr9 87875605 87875951 + 1.5 NA intron (NR_149022, intron 3 of 3) intron (NR_149022, intron 3 of 3) -7099 NM_178828 286234 Hs.130672 NM_178828 ENSG00000177992 SPATA31E1 C9orf79|FAM75E1 SPATA31 subfamily E member 1 protein-coding 217.5-25 chr11 48245380 48245631 + 1.5 NA exon (NM_001004727, exon 1 of 1) exon (NM_001004727, exon 1 of 1) 401 NM_001004727 119764 Hs.553565 NM_001004727 ENSG00000172208 OR4X2 OR11-105 olfactory receptor family 4 subfamily X member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 246.25-14 chr11 111649586 111649971 + 1.5 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 47329 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 223-15 chr12 1991073 1991292 + 1.5 NA TTS (NM_001319292) TTS (NM_001319292) 13275 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 268.5-60 chr8 86579445 86579635 + 1.5 NA intron (NM_019098, intron 15 of 17) intron (NM_019098, intron 15 of 17) 65105 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 365-3 chr10 94963362 94963859 + 1.5 NA intron (NM_000771, intron 5 of 8) L1PA16|LINE|L1 24952 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 257-11 chr13 19880859 19881082 + 1.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -17321 NM_001142684 9205 Hs.530988 NM_014242 ENSG00000132950 ZMYM5 HSPC050|MYM|ZNF198L1|ZNF237 zinc finger MYM-type containing 5 protein-coding 284.75-35 chr7 6215682 6215967 + 1.5 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) L1MD2|LINE|L1 -43687 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 396.5-13 chr8 143509076 143509370 + 1.5 NA intron (NM_015117, intron 3 of 11) intron (NM_015117, intron 3 of 11) -2975 NR_145785 109623485 NR_145785 SNORD149 - small nucleolar RNA, C/D box 149 snoRNA 297-20 chr16 13261044 13261560 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 359704 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 278-8 chr12 72493448 72493664 + 1.5 NA intron (NM_013381, intron 5 of 18) intron (NM_013381, intron 5 of 18) -220047 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 276.75-8 chr12 54006402 54006600 + 1.5 NA Intergenic CpG -2484 NM_022658 3224 Hs.664500 NM_022658 ENSG00000037965 HOXC8 HOX3|HOX3A homeobox C8 protein-coding 156.75-154 chr6 163767741 163767900 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -96336 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 158.75-19 chr10 81408498 81408627 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -466632 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 340.75-27 chr9 37676690 37677040 + 1.5 NA intron (NM_001371223, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 8856 NM_001371223 298.25-23 chr3 94101776 94102064 + 1.5 NA intron (NM_022072, intron 5 of 5) intron (NM_022072, intron 5 of 5) 38859 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 170.5-144 chr5 50926155 50926373 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 43923 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 264-35 chr2 82694486 82694690 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -162215 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 185-7 chr1 207109292 207109641 + 1.5 NA intron (NM_000715, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 5233 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 154.75-146 chr8 109018542 109018714 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -68000 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 341.5-31 chr5 118537269 118537709 + 1.5 NA intron (NR_104610, intron 1 of 9) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 24628 NR_104610 101927280 Hs.543951 NR_104610 LINC02208 HRAT56 long intergenic non-protein coding RNA 2208 ncRNA 426.75 chr10 11946773 11947296 + 1.5 NA intron (NM_080599, intron 16 of 21) AluSz|SINE|Alu -52324 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 376.5-7 chr17 59237080 59237416 + 1.5 NA intron (NM_182569, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 16737 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 270.75-11 chr11 92370109 92370455 + 1.5 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) intron (NM_001008781, intron 1 of 24) 18186 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 305.25-39 chr4 163086226 163086771 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 7130 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 214.5-60 chr2 133243338 133243548 + 1.5 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -22752 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 263.25-22 chr15 101422516 101422730 + 1.5 NA intron (NM_138325, intron 6 of 13) intron (NM_138325, intron 6 of 13) 67084 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 233.5-31 chr12 51348935 51349284 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2430 NM_001971 1990 Hs.348395 NM_001971 ENSG00000139610 CELA1 ELA1 chymotrypsin like elastase 1 protein-coding 392-7 chr2 201641632 201642031 + 1.5 NA intron (NM_001044385, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 839 NM_152388 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 175.5-18 chr10 62269287 62269457 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_145307) promoter-TSS (NM_145307) -528 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 153.75-41 chr14 77077418 77077561 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1298 NR_110553 102724190 Hs.562528 NR_110553 ENSG00000258819 LINC02289 - long intergenic non-protein coding RNA 2289 ncRNA 451.5-8 chr5 152941261 152941569 + 1.5 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 30934 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 277-18 chr2 6748797 6749072 + 1.5 NA intron (NR_038369, intron 1 of 5) MER49|LTR|ERV1 21377 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 194.25-87 chr4 174419102 174419302 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4593 NR_036236 100423042 NR_036236 ENSG00000265846 MIR4276 - microRNA 4276 ncRNA 282-3 chr10 43760744 43761070 + 1.5 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 17918 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 280-48 chr5 110055896 110056124 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 172828 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 147.5-172 chr5 39527043 39527173 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 6677 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 182-46 chr17 27237220 27237367 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 56703 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 191.5-68 chr19 47727212 47727446 + 1.5 NA intron (NM_014601, intron 4 of 5) AluSp|SINE|Alu 13907 NM_014601 30846 Hs.744963 NM_014601 ENSG00000024422 EHD2 PAST2 EH domain containing 2 protein-coding 243-39 chr2 182882422 182882618 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15883 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 182.75-79 chr22 39789277 39789415 + 1.5 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) L2|LINE|L2 104414 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 188-62 chr6 70807683 70807895 + 1.5 NA intron (NM_001044305, intron 6 of 10) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 139259 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 140.25-175 chr7 10390036 10390169 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -312574 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 242.25-65 chr4 67246496 67246775 + 1.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 175365 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 275.25-44 chr8 84861901 84862244 + 1.5 NA intron (NM_001287244, intron 4 of 7) intron (NM_001287244, intron 4 of 7) 156145 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 199.5-93 chr20 10631631 10631840 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 17960 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 219-99 chr9 105601184 105601424 + 1.5 NA exon (NM_001198963, exon 5 of 12) exon (NM_001198963, exon 5 of 12) 43173 NM_001198963 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 193-9 chr1 235974118 235974252 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -90472 NR_102436 1130 Hs.532411 NM_000081 ENSG00000143669 LYST CHS|CHS1 lysosomal trafficking regulator protein-coding 427-8 chr7 3390489 3390940 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 89462 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 381-17 chr3 185037961 185038377 + 1.5 NA intron (NM_001009921, intron 45 of 46) L1PA15|LINE|L1 114891 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 252-21 chr14 22400722 22400932 + 1.5 NA intron (NR_148361, intron 2 of 4) intron (NR_148361, intron 2 of 4) 31926 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 213.5-23 chr11 27747336 27747655 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25465 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 288.75-19 chr14 61739185 61739505 + 1.5 NA intron (NM_181054, intron 10 of 13) intron (NM_181054, intron 10 of 13) 9744 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 206.5-122 chr7 87902002 87902200 + 1.5 NA intron (NM_001318061, intron 10 of 11) intron (NM_001318061, intron 10 of 11) 25608 NM_001318061 10926 Hs.485380 NM_006716 ENSG00000006634 DBF4 ASK|CHIF|DBF4A|ZDBF1 DBF4 zinc finger protein-coding 347-27 chr9 115681354 115681705 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 62710 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 164.5-78 chr16 85887846 85888052 + 1.5 NA Intergenic HERVFH19-int|LTR|ERV1 -11213 NM_002163 3394 Hs.137427 NM_002163 ENSG00000140968 IRF8 H-ICSBP|ICSBP|ICSBP1|IMD32A|IMD32B|IRF-8 interferon regulatory factor 8 protein-coding 436-6 chr4 64808953 64809432 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 195308 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 345.5-11 chr13 28058932 28059346 + 1.5 NA intron (NM_004119, intron 3 of 23) intron (NM_004119, intron 3 of 23) 41437 NR_130706 2322 Hs.507590 NM_004119 ENSG00000122025 FLT3 CD135|FLK-2|FLK2|STK1 fms related tyrosine kinase 3 protein-coding 331-10 chr12 95501407 95501883 + 1.5 NA intron (NM_006838, intron 7 of 10) AluSc|SINE|Alu 27493 NR_133673 10988 Hs.444986 NM_006838 ENSG00000111142 METAP2 MAP2|MNPEP|p67eIF2 methionyl aminopeptidase 2 protein-coding 238-64 chr7 111565329 111565542 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2918 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 241.5-49 chr2 170590508 170590773 + 1.5 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) intron (NM_001083615, intron 31 of 33) 123927 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 125.5-154 chr20 59249892 59249978 + 1.5 NA intron (NM_178457, intron 3 of 4) HAL1|LINE|L1 -50676 NM_207032 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 240.5-78 chr4 91269313 91269519 + 1.5 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 1007886 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 377-12 chr4 162257981 162258532 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -94222 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 364-4 chr12 61608394 61608861 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 584212 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 235.5-56 chr3 72129461 72129709 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21672 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 172.5-20 chr1 201913727 201913914 + 1.5 NA intron (NM_012134, intron 1 of 2) L1MB4|LINE|L1 25143 NM_198149 149345 Hs.632471 NM_198149 ENSG00000198892 SHISA4 C1orf40|TMEM58 shisa family member 4 protein-coding 228-81 chr8 103448318 103448603 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 33074 NM_015420 25879 Hs.532265 NM_015420 ENSG00000164934 DCAF13 GM83|HSPC064|Sof1|WDSOF1 DDB1 and CUL4 associated factor 13 protein-coding 273-38 chr3 175704230 175704516 + 1.5 NA intron (NM_207015, intron 11 of 13) intron (NM_207015, intron 11 of 13) 71960 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 216.25-86 chr5 94578795 94579280 + 1.5 NA intron (NM_001145678, intron 2 of 20) AluSg|SINE|Alu 39567 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 395.75-13 chrX 99731082 99731483 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 678991 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 300.75-28 chr2 145836171 145836476 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -750734 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 127-7 chr1 197966676 197966768 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49350 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 228.25-2 chr1 29842259 29842581 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 195192 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 173.5-59 chr18 1761399 1761575 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -401858 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 327.75-11 chr15 75248037 75248335 + 1.5 NA Intergenic LTR18B|LTR|ERVL -10372 NM_001164404 653641 Hs.540230 NM_001164404 ENSG00000167195 GOLGA6C - golgin A6 family member C protein-coding 351.5-10 chr12 27804472 27804746 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24376 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 281-43 chr8 106971013 106971262 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -200893 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 176.25-131 chr7 87266907 87267046 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46389 NR_138030 79161 Hs.619593 NM_024315 ENSG00000135185 TMEM243 C7orf23|MM-TRAG|MMTRAG transmembrane protein 243 protein-coding 195-71 chr6 24223884 24224141 + 1.5 NA intron (NM_016356, intron 7 of 9) intron (NM_016356, intron 7 of 9) 97797 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 333.25-8 chr2 122541860 122542234 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 531434 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 516.75-6 chr5 153903839 153904308 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5086 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 202.5-3 chr1 58240145 58240444 + 1.5 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 10209 NM_021080 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 280.5-56 chr8 135393109 135393422 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -64191 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 156.5-191 chr8 79485469 79485596 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -125585 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 197-59 chr6 141665102 141665471 + 1.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 423513 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 273-15 chr12 16066330 16066559 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155112 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 238-6 chr1 114325533 114325819 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -171807 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 148.5-171 chr4 88694753 88694954 + 1.5 NA intron (NM_001271602, intron 22 of 24) intron (NM_001271602, intron 22 of 24) 2976 NM_153757 266812 Hs.12554 NM_153757 ENSG00000177432 NAP1L5 DRLM nucleosome assembly protein 1 like 5 protein-coding 378-7 chr2 23824676 23824996 + 1.5 NA intron (NR_125717, intron 15 of 28) intron (NR_125717, intron 15 of 28) 102287 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 326.5-2 chr10 13625890 13626273 + 1.5 NA intron (NM_003675, intron 9 of 9) HAL1|LINE|L1 39116 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 271-46 chr7 55451716 55452013 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 75016 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 306.25-4 chr1 85040193 85040670 + 1.5 NA intron (NM_001253693, intron 2 of 11) intron (NM_001253693, intron 2 of 11) 8069 NM_018298 55283 Hs.535239 NM_018298 ENSG00000055732 MCOLN3 TRP-ML3|TRPML3 mucolipin 3 protein-coding 139.5-165 chr5 13896177 13896305 + 1.5 NA intron (NM_001369, intron 15 of 78) L2a|LINE|L2 48239 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 344.5-16 chr3 185246374 185247111 + 1.5 NA intron (NM_001966, intron 2 of 6) L1M5|LINE|L1 6530 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 247.75-64 chr8 33620999 33621218 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21002 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 144-66 chr2 227302865 227303042 + 1.5 NA intron (NM_000091, intron 43 of 51) intron (NM_000091, intron 43 of 51) 22211 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 342.5-23 chr5 128378542 128379070 + 1.5 NA exon (NM_001999, exon 12 of 65) exon (NM_001999, exon 12 of 65) 159439 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 247.25-43 chr3 120914121 120914316 + 1.5 NA intron (NR_145517, intron 2 of 8) CR1_Mam|LINE|CR1 5541 NM_001348344 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 215.75-83 chr6 38036986 38037347 + 1.5 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 217439 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 341-10 chr13 87318959 87319272 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 299625 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 136.5-6 chr1 76421760 76421925 + 1.5 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 347096 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 293-41 chr9 93286084 93286366 + 1.5 NA intron (NM_001282394, intron 19 of 29) L1MB1|LINE|L1 60078 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 356.25-15 chr6 130732211 130732526 + 1.5 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -95037 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 133-39 chr13 85579147 85579253 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 215597 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 146-8 chr1 194961329 194961489 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1127306 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 189-112 chr9 82034301 82034475 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45616 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 292.5-45 chr6 54678041 54678284 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -168609 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 193.5-156 chr7 89199536 89199736 + 1.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -403899 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 280-62 chr8 84593003 84593384 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1M4|LINE|L1 -112734 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 236-45 chr3 122776157 122776455 + 1.5 NA intron (NM_001320728, intron 2 of 6) intron (NM_001320728, intron 2 of 6) 17525 NM_001320728 79663 Hs.29169 NM_024610 ENSG00000169087 HSPBAP1 PASS1 HSPB1 associated protein 1 protein-coding 207.5-120 chr8 120606331 120606552 + 1.5 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -154812 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 270.5-11 chr12 33768109 33768304 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -254290 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 183-38 chr16 79680334 79680474 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -79667 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 150-9 chr1 151528898 151529078 + 1.5 NA intron (NM_020770, intron 10 of 20) L1MB7|LINE|L1 -11321 NM_001126337 7286 Hs.489922 NM_020127 ENSG00000143367 TUFT1 - tuftelin 1 protein-coding 189.25-77 chr3 67874989 67875186 + 1.5 NA intron (NR_109992, intron 5 of 6) intron (NR_109992, intron 5 of 6) -116505 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 236-8 chr11 3246649 3246934 + 1.5 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -14374 NM_001039165 116534 Hs.745512 NM_001039165 ENSG00000184350 MRGPRE GPR167|MGRF|MRGE MAS related GPR family member E protein-coding 404.5-6 chr4 137447379 137447688 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 84961 NM_001300828 54510 Hs.591691 NM_019035 ENSG00000189184 PCDH18 PCDH68L protocadherin 18 protein-coding 338.5 chr1 48002211 48002627 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5034 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 342.75-27 chr7 103340504 103340896 + 1.5 NA intron (NM_001362668, intron 2 of 17) intron (NM_001362668, intron 2 of 17) 4067 NM_014377 27000 Hs.558476 NM_014377 ENSG00000105821 DNAJC2 MPHOSPH11|MPP11|ZRF1|ZUO1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 protein-coding 225-22 chr12 43186666 43186847 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 31441 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 267.75-4 chr1 151924741 151924989 + 1.5 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -15354 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 444.5-3 chr2 212317376 212317690 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) MER5A|DNA|hAT-Charlie 108827 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 331.5-15 chr2 218939643 218939931 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -9150 NR_110238 101928537 Hs.611129 NR_110238 ENSG00000228135 LINC01494 - long intergenic non-protein coding RNA 1494 ncRNA 126.75-232 chr7 124515639 124515767 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -163607 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 183.75-115 chr7 14732280 14732513 + 1.5 NA intron (NM_001350717, intron 5 of 24) intron (NM_001350717, intron 5 of 24) 109054 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 151.5-110 chr3 3240858 3241015 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61219 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 367.5-10 chr12 33023987 33024320 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -127307 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 240-4 chr1 117572919 117573105 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 32758 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 246-40 chr3 112907243 112907490 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -61416 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 255.5-52 chr3 4748524 4748798 + 1.5 NA TTS (NR_004428) TTS (NR_004428) 2929 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 228.25-70 chr5 140289962 140290184 + 1.5 NA intron (NM_002622, intron 2 of 3) intron (NM_002622, intron 2 of 3) 13028 NM_002622 5201 Hs.483564 NM_002622 ENSG00000113068 PFDN1 PDF|PFD1 prefoldin subunit 1 protein-coding 251.5-5 chr1 189926700 189926925 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 549198 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 248.5-36 chr17 68686301 68686600 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 58296 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 178.25-53 chr18 4923576 4923824 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -157482 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 148.75-113 chr3 131552713 131553030 + 1.5 NA intron (NM_130808, intron 12 of 15) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -49900 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 192.75-117 chr7 32947577 32947776 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -4506 NR_003500 441212 Hs.648086 NM_001039754 ENSG00000205763 RP9P - RP9 pseudogene pseudo 487-7 chr8 98771082 98771568 + 1.5 NA intron (NM_006281, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 54346 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 215-76 chr8 125929993 125930275 + 1.5 NA intron (NR_038447, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 21063 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 210-12 chr10 65071988 65072237 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -147594 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 240.5-27 chr14 54957728 54957966 + 1.5 NA intron (NM_007086, intron 21 of 25) L2a|LINE|L2 -55021 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 304-29 chr5 157702234 157702451 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -29078 NM_001317824 54974 Hs.353090 NM_017872 ENSG00000113272 THG1L ICF45|IHG-1|hTHG1 tRNA-histidine guanylyltransferase 1 like protein-coding 128.75-184 chr7 55199368 55199521 + 1.5 NA intron (NM_001346941, intron 17 of 21) intron (NM_001346941, intron 17 of 21) -10495 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 128.25-66 chr16 65198472 65198604 + 1.5 NA Intergenic Charlie22a|DNA|hAT-Charlie -21965 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 171-32 chr13 81778243 81778418 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -551347 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 141.75-39 chr11 97188631 97188810 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 680295 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 317.75-9 chr12 82265120 82265593 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 93031 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 247.5-62 chr5 6153495 6153721 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 183684 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 210.75-43 chr2 130758670 130758928 + 1.5 NA intron (NM_001105195, intron 1 of 1) intron (NM_001105195, intron 1 of 1) 2455 NM_001105195 205147 Hs.369289 NM_152698 ENSG00000178171 AMER3 FAM123C APC membrane recruitment protein 3 protein-coding 317.75-10 chr14 42592707 42593109 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 986052 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 440.5-5 chr14 48644214 48644700 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -849443 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 189-64 chr2 194505235 194505466 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 161081 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 219-24 chr12 42384980 42385192 + 1.5 NA intron (NM_016488, intron 6 of 12) intron (NM_016488, intron 6 of 12) 53288 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 224-39 chr4 120938387 120938601 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -15628 NM_001300823 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 254.25-11 chr10 85448418 85448744 + 1.5 NA non-coding (NR_120670, exon 3 of 3) non-coding (NR_120670, exon 3 of 3) -1011 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 378.5-8 chr2 81316960 81317355 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 149789 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 206.25-22 chr10 103275686 103276039 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1276 NM_032727 9118 Hs.500916 NM_032727 ENSG00000148798 INA NEF5|NF-66|TXBP-1 internexin neuronal intermediate filament protein alpha protein-coding 229.5-129 chr8 54723906 54724080 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 107897 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 185.5-171 chr9 113779657 113779963 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -96472 NM_133374 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 231.25-19 chr15 64221435 64221689 + 1.5 NA intron (NM_001329607, intron 4 of 11) intron (NM_001329607, intron 4 of 11) -58407 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 181-73 chr3 113991276 113991489 + 1.5 NA intron (NR_148531, intron 11 of 14) L1ME1|LINE|L1 43369 NM_001320468 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 164-44 chr15 101858504 101858663 + 1.5 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 16464 NR_046417 390651 Hs.578689 NR_046417 ENSG00000214344 OR4F13P GPCRLTM7 olfactory receptor family 4 subfamily F member 13 pseudogene pseudo 305-28 chr4 35766566 35767094 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 477109 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 343-29 chr7 26379142 26379538 + 1.5 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -2639 NR_136270 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 307.25-35 chr9 9832607 9832831 + 1.5 NA intron (NM_002839, intron 5 of 45) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 33327 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 161-15 chr10 88685362 88685524 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21001 NM_004190 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 170.75-95 chr4 45041466 45041778 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -314988 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 217-76 chr7 4565080 4565432 + 1.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -117039 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 233.25-16 chr11 81069034 81069335 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -306381 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 372-9 chr15 81126214 81126611 + 1.5 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -7858 NM_001353365 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 207-42 chr2 38440072 38440254 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 8869 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 316-31 chr8 136537787 136538386 + 1.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 7288 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 327.5-9 chr14 20583196 20583497 + 1.5 NA 3' UTR (NM_145250, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_145250, exon 3 of 3) -4878 NR_122043 254028 Hs.652569 NR_122043 ENSG00000258573 LOC254028 - uncharacterized LOC254028 ncRNA 160.5-74 chr18 2046794 2046940 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 524638 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 212.5-97 chr6 136195754 136196061 + 1.5 NA TTS (NM_018945) TTS (NM_018945) 54404 NM_001318738 113115 Hs.121536 NM_138419 ENSG00000146410 MTFR2 DUFD1|FAM54A mitochondrial fission regulator 2 protein-coding 270.5-3 chr1 78424065 78424309 + 1.5 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -66787 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 280.5-3 chr1 52865018 52865337 + 1.5 NA intron (NM_001307931, intron 4 of 12) AluSx|SINE|Alu 22417 NM_001307931 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 226.5-35 chr19 29213543 29213841 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_006003) promoter-TSS (NM_006003) -541 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 203-101 chr8 98172067 98172511 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54449 NM_015029 10940 Hs.252828 NM_015029 ENSG00000104356 POP1 ANXD2 POP1 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 246.75-78 chr8 123898630 123898846 + 1.5 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46751 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 270.5-23 chr16 79525227 79525660 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75294 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 342.75-17 chr3 22278851 22279156 + 1.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 321864 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 390.75 chr1 5928425 5928886 + 1.5 NA intron (NR_111987, intron 10 of 32) L1MD2|LINE|L1 63770 NM_001291593 261734 Hs.462348 NM_015102 ENSG00000131697 NPHP4 POC10|SLSN4 nephrocystin 4 protein-coding 158.5-136 chr3 185312852 185313023 + 1.5 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) 29976 NM_001242317 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 261-54 chr6 125175380 125175625 + 1.5 NA intron (NM_001292026, intron 1 of 4) intron (NM_001292026, intron 1 of 4) 21256 NM_001292026 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 422.5-8 chr17 15042948 15043350 + 1.5 NA intron (NR_135638, intron 1 of 1) intron (NR_135638, intron 1 of 1) 12174 NR_033371 94150 Hs.147654 NR_033371 ENSG00000259944 CDRT7 LINC00025|NCRNA00025 CMT1A duplicated region transcript 7 ncRNA 332.5-32 chr9 27358656 27358927 + 1.5 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) intron (NM_024761, intron 3 of 3) -61641 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 278-13 chr17 82112566 82112931 + 1.5 NA intron (NM_001367828, intron 16 of 16) L1MEc|LINE|L1 -14512 NM_004104 2194 Hs.83190 NM_004104 ENSG00000169710 FASN FAS|OA-519|SDR27X1 fatty acid synthase protein-coding 128.25-189 chr7 38419956 38420098 + 1.5 NA intron (NM_001635, intron 16 of 20) intron (NM_001635, intron 16 of 20) 78450 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 273-63 chr9 115275169 115275448 + 1.5 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) L1MA3|LINE|L1 133490 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 312.5-6 chr11 113742247 113742584 + 1.5 NA intron (NM_004724, intron 10 of 15) intron (NM_004724, intron 10 of 15) 31277 NM_004724 9183 Hs.503886 NM_004724 ENSG00000086827 ZW10 HZW10|KNTC1AP zw10 kinetochore protein protein-coding 418.5 chr10 74327871 74328480 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) AluSz|SINE|Alu 151412 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 237.5-49 chr2 83720822 83721212 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 198203 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 219.75-60 chr4 171198195 171198425 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 12126 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 230.25-58 chr3 53298780 53299084 + 1.5 NA intron (NM_001290207, intron 4 of 7) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 34195 NR_145715 109617024 NR_145715 ENSG00000207109 SNORD38C - small nucleolar RNA, C/D box 38C snoRNA 369-19 chr9 106463136 106463618 + 1.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -137551 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 206-18 chr12 71828819 71829027 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -10836 NM_001146213 64786 Hs.284630 NM_022771 ENSG00000121749 TBC1D15 RAB7-GAP TBC1 domain family member 15 protein-coding 246.5-43 chr2 134926268 134926521 + 1.5 NA intron (NR_135468, intron 2 of 9) HAL1M8|LINE|L1 7572 NM_001320748 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 174.5-4 chr1 59081478 59081700 + 1.5 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 61113 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 283-29 chr3 140526054 140526376 + 1.5 NA intron (NM_022131, intron 8 of 16) L1PA16|LINE|L1 -17426 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 439.75-2 chr4 33819165 33819495 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 220563 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 131.25-62 chr14 61955367 61955503 + 1.5 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) L1MA10|LINE|L1 27740 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 188.5-134 chr6 135080038 135080263 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25328 NM_001363686 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 218-20 chr15 57067051 57067304 + 1.5 NA intron (NM_207038, intron 4 of 19) intron (NM_207038, intron 4 of 19) 147732 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 268-40 chr4 73577943 73578123 + 1.5 NA intron (NM_001270391, intron 7 of 9) intron (NM_001270391, intron 7 of 9) 42403 NM_177532 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 152.25-31 chr11 44190680 44190829 + 1.5 NA intron (NM_207122, intron 8 of 13) intron (NM_207122, intron 8 of 13) 94557 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 323-29 chr9 99971928 99972233 + 1.5 NA 3' UTR (NM_017919, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_017919, exon 8 of 8) 65426 NM_017919 55014 Hs.704031 NM_017919 ENSG00000136874 STX17 - syntaxin 17 protein-coding 152-145 chr7 124594210 124594419 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 171478 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 120.25-214 chr8 82459176 82459265 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -452884 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 129.25-33 chr11 97057716 97057907 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 549386 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 251.75-39 chr2 121155612 121155840 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 129476 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 164.25-88 chr21 31127961 31128129 + 1.5 NA intron (NM_001353684, intron 10 of 12) intron (NM_001353684, intron 10 of 12) 32895 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 222-43 chr2 211394208 211394492 + 1.5 NA intron (NM_005235, intron 25 of 27) intron (NM_005235, intron 25 of 27) 776779 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 164.25-12 chr1 191998503 191998686 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -159868 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 304.25-13 chr2 135763932 135764279 + 1.5 NA intron (NM_014607, intron 6 of 12) AluSz|SINE|Alu -21461 NR_163478 107985946 Hs.591242 NM_001365239 LOC107985946 - uncharacterized LOC107985946 ncRNA 259-35 chr5 73760456 73760688 + 1.5 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -52974 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 173.5-60 chr18 4657984 4658217 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -202793 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 248.5-23 chr14 29671195 29671670 + 1.5 NA intron (NM_001330069, intron 2 of 18) L3|LINE|CR1 255664 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 344.5-34 chr9 9481665 9481949 + 1.5 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -317585 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 250-62 chr8 122289024 122289337 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 279464 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 209.5-108 chr4 124639459 124639647 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 73179 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 256.5-57 chr5 30956226 30956407 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -237370 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 297.5-10 chr11 60205708 60205965 + 1.5 NA intron (NM_001351235, intron 5 of 5) intron (NM_001351235, intron 5 of 5) 3320 NR_106758 102465250 NR_106758 ENSG00000275344 MIR6503 hsa-mir-6503 microRNA 6503 ncRNA 303-10 chr14 79167446 79167739 + 1.5 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -32390 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 417-6 chr19 29271153 29271725 + 1.5 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -58288 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 328.75-6 chr15 65442167 65442870 + 1.5 NA TTS (NR_135486) TTS (NR_135486) -19571 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 158.25-90 chr3 106572038 106572199 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 668520 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 243.75-3 chr1 179350456 179350668 + 1.5 NA intron (NM_001252512, intron 13 of 14) intron (NM_001252512, intron 13 of 14) -15409 NM_144696 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 200-50 chr20 10917049 10917303 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7904 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 127.5-126 chr2 138655196 138655313 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 125136 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 194.25-6 chr1 227944230 227944449 + 1.5 NA intron (NM_003395, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 -2656 NR_049806 100847072 NR_049806 ENSG00000264483 MIR5008 - microRNA 5008 ncRNA 275.5-21 chr14 71361440 71361846 + 1.5 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -36694 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 163.5-16 chr1 219296735 219296959 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 121878 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 297.5-28 chr2 120990031 120990351 + 1.5 NA exon (NM_001371271, exon 14 of 14) exon (NM_001371271, exon 14 of 14) 197910 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 119.5-183 chr5 108160353 108160493 + 1.5 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 221675 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 275-30 chr3 177861248 177861495 + 1.5 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) L1M3b|LINE|L1 44506 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 274.5-68 chr9 27144329 27144597 + 1.5 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) intron (NM_001290078, intron 1 of 20) 35322 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 373.75-6 chr2 45277695 45277972 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -22892 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 243-64 chr6 120966241 120966590 + 1.5 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 368065 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 312.5-14 chr2 61759584 61760064 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 94236 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 206-67 chr7 14535294 14535470 + 1.5 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) AluJo|SINE|Alu 306068 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 274.5-24 chr14 83979367 83979645 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1292426 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 255-67 chr9 87190787 87191043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42271 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 237.5-13 chr10 22222248 22222409 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -12345 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 386.5-7 chr13 74467956 74468370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 48990 NR_047005 100874151 Hs.564552 NR_047005 ENSG00000226240 LINC00381 - long intergenic non-protein coding RNA 381 ncRNA 215.5 chr1 29288467 29288760 + 1.5 NA intron (NM_133177, intron 14 of 30) intron (NM_133177, intron 14 of 30) 52091 NM_133177 10076 Hs.19718 NM_005704 ENSG00000060656 PTPRU FMI|PCP-2|PTP|PTP-J|PTP-PI|PTP-RO|PTPPSI|PTPRO|PTPU2|R-PTP-PSI|R-PTP-U|hPTP-J protein tyrosine phosphatase receptor type U protein-coding 384-3 chr11 96054612 96055069 + 1.5 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) intron (NM_032427, intron 2 of 4) -130633 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 179.25-3 chr1 45048061 45048273 + 1.5 NA intron (NM_020883, intron 5 of 13) AluJb|SINE|Alu 35913 NR_036510 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 216.5-76 chr3 66801542 66801819 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -63344 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 298.75-28 chr5 125656772 125657047 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 163648 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 288-8 chr10 71310643 71310949 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8457 NR_033413 55315 Hs.438419 NM_018344 ENSG00000198246 SLC29A3 ENT3|HCLAP|HJCD|PHID solute carrier family 29 member 3 protein-coding 304.5-14 chr16 79885352 79885721 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 90287 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 374-19 chr8 20044379 20044660 + 1.5 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? 105266 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 318-9 chr14 69884670 69884972 + 1.5 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) L1MA8|LINE|L1 5405 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 295.75-2 chr10 24913072 24913379 + 1.5 NA intron (NM_020200, intron 3 of 8) intron (NM_020200, intron 3 of 8) 39381 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 245-48 chr4 55225853 55226132 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -100397 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 360-10 chr4 31481118 31481644 + 1.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -25163 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 192-77 chr4 32697318 32697565 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 346403 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 255-25 chr2 71326777 71327007 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4863 NM_001252612 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 203.25 chr1 55462681 55462883 + 1.5 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 237141 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 185.25-128 chr8 139969433 139969610 + 1.5 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) MIRb|SINE|MIR 131014 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 316.5-7 chr1 217072350 217072749 + 1.5 NA intron (NM_001350122, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 4443 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 302-14 chr17 71268384 71268812 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -66419 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 253.25-24 chr16 63660693 63661007 + 1.5 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 1461213 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 334.75-14 chr2 216912668 216913178 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42151 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 147-26 chr14 46887561 46887673 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -235836 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 255.25-31 chr3 809166 809604 + 1.5 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) L1PA3|LINE|L1 217280 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 323.25-10 chr14 64174893 64175234 + 1.5 NA exon (NM_182914, exon 95 of 116) exon (NM_182914, exon 95 of 116) -39081 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 372-16 chr7 87167596 87168074 + 1.5 NA intron (NR_024550, intron 4 of 17) intron (NR_024550, intron 4 of 17) 15281 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 273.25 chr1 52270862 52271089 + 1.5 NA intron (NM_007324, intron 6 of 17) AluJo|SINE|Alu 95230 NM_001330585 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 164.25-165 chrX 81484962 81485164 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 282961 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 277.5-37 chr20 32646553 32646875 + 1.5 NA intron (NM_182584, intron 4 of 5) L1ME4b|LINE|L1 27227 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 351-29 chrX 73679404 73679721 + 1.5 NA intron (NM_001300884, intron 4 of 4) intron (NM_001300884, intron 4 of 4) -112643 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 140.5-241 chr8 133743948 133744118 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 33319 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 181-107 chr8 72330490 72330738 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -78980 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 207.75-66 chr21 34857336 34857571 + 1.5 NA intron (NM_001001890, intron 3 of 5) intron (NM_001001890, intron 3 of 5) 31246 NM_001122607 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 253-48 chr6 125995328 125995621 + 1.5 NA intron (NM_001031712, intron 2 of 12) intron (NM_001031712, intron 2 of 12) 8934 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 279.75-56 chr8 115429038 115429404 + 1.5 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 238792 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 282-15 chr14 39918886 39919237 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -486561 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 465.75-3 chr15 26103588 26104317 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11861 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 248-35 chr2 51092916 51093516 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 60615 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 295.5-3 chr1 103151439 103151708 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43051 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 253-42 chr5 56401493 56401784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 80131 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 542-2 chr4 81069598 81070341 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39261 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 270.25-28 chr19 37722811 37723058 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -3173 NM_032689 84775 Hs.116622 NM_032689 ENSG00000198182 ZNF607 - zinc finger protein 607 protein-coding 357.75-16 chr7 50089385 50089686 + 1.5 NA intron (NM_001159878, intron 2 of 7) intron (NM_001159878, intron 2 of 7) 3711 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 249-8 chr11 113100231 113100445 + 1.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) LTR1F2|LTR|ERV1 -136878 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 405.5-4 chr12 77741695 77742033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -89030 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 237.25-38 chr17 67123597 67123777 + 1.5 NA intron (NM_001330447, intron 25 of 32) intron (NM_001330447, intron 25 of 32) 79133 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 291.75-14 chr14 49793078 49793362 + 1.5 NA intron (NM_001301732, intron 25 of 31) L1M5|LINE|L1 25067 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 337.25-4 chr10 34497816 34498198 + 1.5 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) intron (NM_001184789, intron 3 of 22) 317289 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 151.5-52 chr14 70373610 70373790 + 1.5 NA intron (NM_001202547, intron 3 of 5) intron (NM_001202547, intron 3 of 5) -14017 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 176-20 chr14 30128832 30129062 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -201100 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 250 chr1 5761036 5761349 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 101549 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 181.25-126 chr8 82213864 82214148 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -371720 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 227-49 chr4 65063657 65063880 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -59268 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 194.25-29 chr14 49705571 49705771 + 1.5 NA intron (NM_172193, intron 1 of 12) intron (NM_172193, intron 1 of 12) 12551 NM_172193 122773 Hs.509258 NM_172193 ENSG00000197776 KLHDC1 MST025 kelch domain containing 1 protein-coding 369-15 chr8 87199012 87199393 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1M4|LINE|L1 332787 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 138-151 chr7 27844641 27844755 + 1.5 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) intron (NM_175061, intron 3 of 4) 104603 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 251.25-55 chr7 134620544 134620778 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26118 NM_001293085 669 Hs.198365 NM_001724 ENSG00000172331 BPGM DPGM|ECYT8 bisphosphoglycerate mutase protein-coding 246-19 chr14 78323541 78323787 + 1.5 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) intron (NR_073547, intron 4 of 20) -80055 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 284-14 chr17 28095793 28096039 + 1.5 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) intron (NM_016231, intron 1 of 10) 53239 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 241.5-92 chr7 102845784 102846005 + 1.5 NA intron (NM_001287150, intron 16 of 18) intron (NM_001287150, intron 16 of 18) -67106 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 185.5-35 chr12 77818200 77818452 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12568 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 360.75-15 chr7 9804928 9805232 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 170810 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 249.25-47 chr6 55222880 55223069 + 1.5 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) intron (NM_001526, intron 2 of 7) -104495 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 158.5-5 chr1 52827122 52827298 + 1.5 NA 3' UTR (NM_024646, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_024646, exon 14 of 14) -15550 NM_001004339 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 419.75-5 chr8 98976116 98976803 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 32017 NM_001142462 116039 Hs.253247 NM_053001 ENSG00000164920 OSR2 - odd-skipped related transciption factor 2 protein-coding 313.5-13 chr15 58060244 58060599 + 1.5 NA intron (NM_001206897, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR -4804 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 358.75-9 chr3 75156557 75156823 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -57786 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 209.25-20 chr11 105218975 105219271 + 1.5 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -79354 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 232.5-70 chr3 97011684 97012013 + 1.5 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1PA16|LINE|L1 197254 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 221-30 chr18 77634902 77635148 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 358702 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 220.5-85 chr4 61383871 61384120 + 1.5 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 181823 NM_001371342 250.25-37 chr3 194470052 194470432 + 1.5 NA intron (NM_001367549, intron 2 of 33) intron (NM_001367549, intron 2 of 33) -2003 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 221.25-58 chr4 27279164 27279512 + 1.5 NA intron (NR_125921, intron 5 of 5) MIR3|SINE|MIR 61859 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 155.5-173 chr5 122348456 122348613 + 1.5 NA intron (NM_001308107, intron 1 of 8) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 36297 NM_001308109 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 287.5 chr1 33687102 33687389 + 1.5 NA intron (NM_052896, intron 25 of 69) intron (NM_052896, intron 25 of 69) -173230 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 152-26 chr10 113347233 113347462 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -203484 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 137-26 chr10 61918059 61918236 + 1.5 NA intron (NM_032199, intron 2 of 9) intron (NM_032199, intron 2 of 9) 16448 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 203.25-101 chr7 130595415 130595617 + 1.5 NA intron (NM_001290033, intron 9 of 19) L1MB7|LINE|L1 52063 NR_024086 53844 Hs.6421 NR_024086 COPG2IT1 CIT1|COPG2AS|DKFZP761N09121|NCRNA00170 COPG2 imprinted transcript 1 ncRNA 187.5-125 chr4 46143640 46143859 + 1.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -19695 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 231-43 chr2 148929410 148929672 + 1.5 NA intron (NM_004522, intron 3 of 25) intron (NM_004522, intron 3 of 25) -18334 NR_111932 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 227.5-14 chr10 67022643 67023021 + 1.5 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) AluSc8|SINE|Alu 10566 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 131.25-60 chr14 58533216 58533384 + 1.5 NA intron (NM_001329945, intron 29 of 29) intron (NM_001329945, intron 29 of 29) 93619 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 411.5-6 chr2 236319205 236319563 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55039 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 227.5-75 chr3 189346516 189346710 + 1.5 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -106019 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 188.25-51 chr17 55677555 55677694 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45240 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 310-3 chr1 207928427 207928692 + 1.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -17434 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 370.75-6 chr21 29239559 29239899 + 1.5 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) intron (NR_027072, intron 1 of 1) 46235 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 270-48 chr6 155288119 155288492 + 1.5 NA intron (NR_146725, intron 4 of 8) intron (NR_146725, intron 4 of 8) 24292 NM_001001346 49861 Hs.567491 NM_001001346 ENSG00000171217 CLDN20 - claudin 20 protein-coding 176.75-41 chr14 73845683 73845910 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -6035 NM_001371334 284-15 chr17 59440150 59440358 + 1.5 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) intron (NR_110813, intron 2 of 2) 74171 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 240-54 chr6 63613534 63613820 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -22125 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 354.75-10 chr21 23523647 23524016 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -138996 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 223.5-32 chr12 26710143 26710351 + 1.5 NA intron (NM_002223, intron 9 of 56) intron (NM_002223, intron 9 of 56) 122947 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 205.5-33 chr12 113693348 113693579 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 80220 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 273.25-23 chr3 186120371 186120608 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11400 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 196.5-10 chr1 167463546 167463708 + 1.5 NA intron (NM_000734, intron 1 of 7) intron (NM_000734, intron 1 of 7) 54902 NM_000734 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 212-24 chr14 88038899 88039064 + 1.5 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR -12669 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 273.75-12 chr15 57853470 57853758 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 146900 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 276-6 chr10 28184990 28185215 + 1.5 NA intron (NR_134518, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 97021 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 265.5-3 chr1 115839515 115839833 + 1.5 NA intron (NM_001111061, intron 1 of 1) CpG 1029 NM_001111061 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 192.25-13 chr10 80292858 80293199 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3370 NM_000429 4143 Hs.282670 NM_000429 ENSG00000151224 MAT1A MAT|MATA1|SAMS|SAMS1 methionine adenosyltransferase 1A protein-coding 243-79 chr9 126447575 126447849 + 1.5 NA intron (NM_033446, intron 7 of 9) intron (NM_033446, intron 7 of 9) -37208 NR_045006 641373 Hs.742606 NR_045006 NRON NCRNA00194 non-coding repressor of NFAT ncRNA 158.5-147 chr4 138650322 138650474 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 340687 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 242-16 chr12 31962525 31962812 + 1.5 NA intron (NM_018169, intron 2 of 5) intron (NM_018169, intron 2 of 5) 3253 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 364.75-5 chr2 139921981 139922493 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 664448 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 261.5-5 chr10 107535688 107536056 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -371166 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 321.5-28 chr5 22319201 22319495 + 1.5 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -105498 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 170-79 chr5 52948448 52948685 + 1.5 NA intron (NM_181501, intron 28 of 28) intron (NM_181501, intron 28 of 28) -40786 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 239-30 chr2 145602277 145602498 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 934420 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 316.5-35 chr6 169025898 169026135 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 9627 NR_134622 101929460 Hs.355225 NR_134622 ENSG00000229720 LOC101929460 - uncharacterized LOC101929460 ncRNA 296-20 chr2 24680442 24680687 + 1.5 NA intron (NM_001362950, intron 7 of 23) L1MA8|LINE|L1 96087 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 253.75-32 chr22 28238248 28238560 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1MEf|LINE|L1 -221465 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 332.25-33 chr9 37633442 37633765 + 1.5 NA intron (NM_001371224, intron 2 of 16) AluJo|SINE|Alu -17351 NM_014907 22844 Hs.163990 NM_014907 ENSG00000070601 FRMPD1 FRMD2 FERM and PDZ domain containing 1 protein-coding 487-9 chr9 35899958 35900390 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6028 NM_001039792 646962 Hs.208081 NM_001039792 ENSG00000196196 HRCT1 LGLL338|PRO537|UNQ338 histidine rich carboxyl terminus 1 protein-coding 202-39 chr20 20318356 20318569 + 1.5 NA intron (NM_015585, intron 25 of 26) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -49642 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 185.5-44 chr14 42599404 42599593 + 1.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 992642 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 161.25-90 chr2 77351167 77351467 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 171059 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 318.5-28 chr3 99943116 99943517 + 1.5 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 21082 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 273.25-9 chr11 83463047 83463250 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 26 of 27) intron (NM_001142699, intron 26 of 27) -176741 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 318-35 chr7 26542530 26542773 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3826 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 346-21 chr6 77853775 77854261 + 1.5 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) intron (NM_001282136, intron 4 of 4) 200979 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 260-8 chr14 44804629 44804871 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5624 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 311.25-10 chr2 51959759 51960119 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -410709 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 282-23 chr18 65579885 65580135 + 1.5 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -170242 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 198.5-59 chr18 46423450 46423692 + 1.5 NA intron (NM_001256758, intron 1 of 5) intron (NM_001256758, intron 1 of 5) 89347 NM_001256758 494470 Hs.501114 NM_152470 ENSG00000141622 RNF165 ARKL2|Ark2C|RNF111L2 ring finger protein 165 protein-coding 339.75-5 chr10 95895551 95895777 + 1.5 NA intron (NR_038444, intron 2 of 5) L1MEc|LINE|L1 -12301 NM_001130446 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 253.5-44 chr2 116843765 116844186 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -970716 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 263.75-6 chr10 68038292 68038787 + 1.5 NA intron (NM_001278186, intron 3 of 22) intron (NM_001278186, intron 3 of 22) -27656 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 279-40 chr6 76072159 76072410 + 1.5 NA intron (NM_001563, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 378 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 337.5-9 chr12 97389343 97389651 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -73279 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 189.75-26 chr13 35092816 35092973 + 1.5 NA intron (NM_015678, intron 10 of 57) L1ME1|LINE|L1 150607 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 167.75-136 chr7 108619236 108619491 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49489 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 239-47 chr5 130697806 130698067 + 1.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 467320 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 257.25-29 chr3 67737547 67737884 + 1.5 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) intron (NR_109992, intron 3 of 6) 83018 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 452 chr10 95729870 95730616 + 1.5 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 18479 NM_001098175 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 322.5-44 chr9 103938554 103938819 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61023 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 291.75-37 chr7 700681 700935 + 1.5 NA intron (NM_001164760, intron 2 of 10) L1MEf|LINE|L1 11716 NM_002735 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 341.25 chr1 173664681 173665150 + 1.5 NA intron (NM_198493, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 4936 NM_198493 339416 Hs.130054 NM_198493 ENSG00000183831 ANKRD45 CT117 ankyrin repeat domain 45 protein-coding 212.5-122 chr8 118679418 118679620 + 1.5 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 -57556 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 247.75-27 chr17 65851267 65851487 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) -24834 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 127.5-153 chr3 118886197 118886307 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56824 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 180.75-41 chr14 98676975 98677114 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -34569 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 397.5 chr10 52262809 52263310 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 10 of 17) intron (NM_001098512, intron 10 of 17) 51069 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 369.5-9 chr15 99030532 99030925 + 1.5 NA intron (NR_126487, intron 3 of 3) intron (NR_126487, intron 3 of 3) 16024 NR_126487 104564224 Hs.32769 NR_126487 LUNAR1 - leukemia-associated non-coding IGF1R activator RNA 1 ncRNA 225.5-98 chr7 31191207 31191515 + 1.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 138900 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 187.5-137 chr5 68520116 68520317 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 227639 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 293.25-3 chr12 29844738 29844957 + 1.5 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -60088 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 128.5-222 chr8 81062766 81062949 + 1.5 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 49211 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 177.5-124 chr4 34928940 34929091 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -659268 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 224.5-55 chr19 28211165 28211451 + 1.5 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -395380 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 329-6 chr10 60879323 60879740 + 1.5 NA intron (NM_001350906, intron 9 of 12) AluJr|SINE|Alu 64654 NM_001242359 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 221-20 chr14 59228123 59228394 + 1.5 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -35183 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 210-49 chr2 68579818 68580058 + 1.5 NA 3' UTR (NM_173545, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_173545, exon 10 of 10) -63650 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 192.5-113 chr6 35128638 35128828 + 1.5 NA 5' UTR (NM_001366326, exon 3 of 9) 5' UTR (NM_001366326, exon 3 of 9) 12606 NM_001366325 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 404.5 chr1 106808297 106808892 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -9645 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 348.5-18 chr5 9855039 9855400 + 1.5 NA intron (NR_147004, intron 1 of 1) MER54B|LTR|ERVL 842 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 164-14 chr10 57629687 57629832 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -325200 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 368-14 chr8 134820175 134820520 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15402 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 306-2 chr1 233362194 233362537 + 1.5 NA intron (NM_032435, intron 5 of 9) intron (NM_032435, intron 5 of 9) 34641 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 327.5-29 chr8 21494501 21494915 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 196469 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 161.5-72 chr16 4044322 4044454 + 1.5 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) intron (NM_001116, intron 2 of 10) 72054 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 138.75-153 chr5 104564007 104564173 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -535384 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 197.5-7 chr1 101456418 101456576 + 1.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 132660 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 247.5-70 chr6 7399028 7399236 + 1.5 NA intron (NM_001348194, intron 5 of 16) LTR84b|LTR|ERVL 9303 NM_001348194 83732 Hs.437474 NM_031480 ENSG00000124784 RIOK1 AD034|RIO1|RRP10|bA288G3.1 RIO kinase 1 protein-coding 389.25-7 chr4 61512476 61512959 + 1.5 NA intron (NM_001322246, intron 3 of 25) intron (NM_001322246, intron 3 of 25) 310545 NM_001371342 168.5-19 chr1 238203487 238203761 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 282393 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 223.5-104 chr6 14820606 14820776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -425378 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 210.25-51 chr3 60296499 60296840 + 1.5 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) L1MD1|LINE|L1 -215760 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 263-54 chrX 43055009 43055236 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -121872 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 135-196 chr9 34925555 34925743 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -29885 NM_001309426 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 391-18 chr8 143968653 143968992 + 1.5 NA intron (NM_000445, intron 2 of 32) L1MB8|LINE|L1 4707 NM_201378 5339 Hs.434248 NM_000445 ENSG00000178209 PLEC EBS1|EBSMD|EBSND|EBSO|EBSOG|EBSPA|HD1|LGMD2Q|LGMDR17|PCN|PLEC1|PLEC1b|PLTN plectin protein-coding 189.5-151 chr8 123967410 123967632 + 1.5 NA intron (NM_001039112, intron 5 of 40) L1M5|LINE|L1 73261 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 483 chr14 63384027 63384714 + 1.5 NA intron (NR_104104, intron 11 of 12) L2c|LINE|L2 -65435 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 115.75-123 chr20 19206210 19206327 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6374 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 203.5-23 chr10 83140092 83140370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 536858 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 160.5-135 chr4 65950538 65950730 + 1.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -280139 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 224.75-54 chr5 26172347 26172564 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 866131 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 237-66 chr7 106090301 106090479 + 1.5 NA TTS (NM_006754) TTS (NM_006754) 21922 NM_182715 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 222-29 chr17 49611216 49611411 + 1.5 NA exon (NM_001007228, exon 6 of 10) exon (NM_001007228, exon 6 of 10) 15276 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 155-127 chr7 13760538 13760769 + 1.5 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 225861 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 460.5 chr16 62873276 62873860 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -837130 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 255.75-38 chr5 9647129 9647379 + 1.5 NA intron (NR_027112, intron 11 of 12) intron (NR_027112, intron 11 of 12) -16903 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 238-26 chr2 115419298 115419637 + 1.5 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 75652 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 492.5-4 chr8 130439520 130440047 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) intron (NM_001362925, intron 1 of 29) 3877 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 419.25-2 chr10 54302670 54302980 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -183405 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 145.25-86 chr20 35354134 35354350 + 1.5 NA intron (NM_001184977, intron 4 of 7) intron (NM_001184977, intron 4 of 7) 57731 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 195.5-135 chr6 101127701 101128059 + 1.5 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -246508 NM_001284271 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 290.5-38 chr6 45997470 45997881 + 1.5 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) 18185 NM_016929 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 240.75-28 chr15 59541819 59542049 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69849 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 168-107 chr5 158553161 158553314 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -143464 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 222.5-24 chr11 85869044 85869311 + 1.5 NA intron (NM_001286159, intron 2 of 10) intron (NM_001286159, intron 2 of 10) 14076 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 183.5-57 chr19 50804688 50805056 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_032712) promoter-TSS (NM_032712) -19 NM_001290153 84798 Hs.256301 NM_032712 ENSG00000167747 C19orf48 - chromosome 19 open reading frame 48 protein-coding 245.5-17 chr12 93418730 93418989 + 1.5 NA intron (NM_003348, intron 1 of 3) MER33|DNA|hAT-Charlie 23088 NM_003348 7334 Hs.524630 NM_003348 ENSG00000177889 UBE2N HEL-S-71|UBC13|UBCHBEN; UBC13|UbcH-ben|UbcH13 ubiquitin conjugating enzyme E2 N protein-coding 251.25-23 chr18 813257 813507 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1140 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 256-77 chrX 43977204 43977484 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3954 NM_000266 4693 Hs.522615 NM_000266 ENSG00000124479 NDP EVR2|FEVR|ND norrin cystine knot growth factor NDP protein-coding 227.75-31 chr2 36442962 36443156 + 1.5 NA intron (NM_016441, intron 4 of 16) intron (NM_016441, intron 4 of 16) 87281 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 120-88 chr2 99483434 99483572 + 1.5 NA intron (NR_135652, intron 1 of 21) intron (NR_135652, intron 1 of 21) 6514 NR_135650 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 226.75-58 chr4 54580548 54580852 + 1.5 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 26431 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 138.75-99 chr2 173961579 173961696 + 1.5 NA intron (NM_003111, intron 3 of 6) L1MD3|LINE|L1 2243 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 205-83 chrX 123000469 123000687 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -183665 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 252.5-24 chr13 69568814 69569059 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 346590 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 289.5-8 chr11 87785299 87785636 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -66056 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 296.5-30 chr5 32737148 32737527 + 1.5 NA intron (NM_001363652, intron 2 of 7) intron (NM_001363652, intron 2 of 7) 26016 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 260-46 chr8 122126829 122127342 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 441559 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 289.25-7 chr12 62193825 62194183 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1165 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 252-76 chr9 80791624 80791917 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 816747 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 238.5-57 chr3 80543019 80543239 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -221768 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 113.75-116 chr21 21475871 21476010 + 1.5 NA intron (NM_001352592, intron 15 of 18) intron (NM_001352592, intron 15 of 18) 261379 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 131-25 chr10 122491632 122491747 + 1.5 NA intron (NM_002775, intron 3 of 8) intron (NM_002775, intron 3 of 8) 30136 NM_002775 5654 Hs.501280 NM_002775 ENSG00000166033 HTRA1 ARMD7|CADASIL2|CARASIL|HtrA|L56|ORF480|PRSS11 HtrA serine peptidase 1 protein-coding 203-57 chr20 31956203 31956346 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4228 NM_030815 81572 Hs.435755 NM_030815 ENSG00000088356 PDRG1 C20orf126|PDRG p53 and DNA damage regulated 1 protein-coding 230-40 chr20 54392036 54392316 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -83417 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 357.25-2 chr1 176284063 176284466 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -76978 NM_022457 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 117-152 chr5 121868378 121868517 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 16565 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 346.5-5 chr12 44625990 44626319 + 1.5 NA intron (NM_006159, intron 14 of 20) L2a|LINE|L2 249507 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 188-83 chr8 126749521 126749694 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -191129 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 324.5-8 chr14 66644388 66644717 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) MIR|SINE|MIR 137145 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 259.5-11 chr1 194292955 194293281 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 988373 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 393-14 chr4 88457639 88458086 + 1.5 NA intron (NM_016323, intron 1 of 22) intron (NM_016323, intron 1 of 22) 743 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 257-57 chr8 125890707 125890946 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 60371 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 285.25-32 chr7 8088384 8088608 + 1.5 NA 3' UTR (NM_138426, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_138426, exon 8 of 8) 119700 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 251.5-79 chr7 49598299 49598681 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -175148 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 208.5-141 chr8 104639241 104639472 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -50332 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 345.75-11 chr7 62968464 62968725 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 335462 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 186-17 chr11 75923028 75923216 + 1.5 NA intron (NM_003369, intron 6 of 14) AluSq2|SINE|Alu 107912 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 361.5-25 chr8 77664391 77664907 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 213952 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 148.5-86 chr17 58759328 58759501 + 1.5 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 3545 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 186-56 chr21 30918731 30919003 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -37287 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 312.5-15 chr2 77244280 77244778 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 258564 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 270.75-4 chr10 33967908 33968188 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -195368 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 260.5-18 chr16 9952426 9952738 + 1.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 229485 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 348-16 chr5 34525873 34526154 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -130315 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 330-20 chr4 92594298 92594777 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 290138 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 391.5-20 chr9 97763432 97763879 + 1.5 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) intron (NR_147055, intron 5 of 10) -66246 NM_000380 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 232.5-79 chr4 119264174 119264430 + 1.5 NA intron (NM_001371399, intron 10 of 16) intron (NM_001371399, intron 10 of 16) 36343 NM_001001701 401152 Hs.173705 NM_001001701 ENSG00000164096 C4orf3 ALN|HCVFTP1 chromosome 4 open reading frame 3 protein-coding 233.25-57 chr4 161002194 161002503 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1020385 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 249-33 chr3 148446601 148446801 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165810 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 208.5-51 chr16 70331059 70331308 + 1.5 NA intron (NM_007242, intron 9 of 11) AluJr|SINE|Alu 15564 NR_039997 100506083 Hs.635008 NR_039997 ENSG00000261777 LOC100506083 - uncharacterized LOC100506083 ncRNA 184.75-66 chr3 64330996 64331276 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62963 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 248.5-21 chr13 75443581 75443891 + 1.5 NA intron (NM_001286658, intron 1 of 19) intron (NM_001286658, intron 1 of 19) 38432 NM_001286658 9882 Hs.210891 NM_014832 ENSG00000136111 TBC1D4 AS160|NIDDM5 TBC1 domain family member 4 protein-coding 310.25-14 chr2 64315073 64315374 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25536 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 392.5-12 chr9 24658755 24659041 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -113001 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 271-52 chr9 24683723 24684124 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -138026 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 173-21 chr10 117401286 117401497 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25951 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 215.5-71 chr3 97163529 97163771 + 1.5 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -275957 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 375.75-3 chr11 93914421 93914859 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -64022 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 291-13 chr13 86187881 86188195 + 1.5 NA Intergenic HUERS-P2-int|LTR|ERV1 -388619 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 273-44 chr5 67535283 67535565 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 111365 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 181.5-116 chr3 178155502 178155657 + 1.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -263622 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 271.75-35 chr4 72623047 72623249 + 1.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -53927 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 221.75-63 chr5 173677159 173677398 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12181 NR_146727 105377736 Hs.582570 NR_146727 ENSG00000253428 LINC01942 - long intergenic non-protein coding RNA 1942 ncRNA 182-68 chr21 19616092 19616257 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 283581 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 432-2 chr12 18499954 18500279 + 1.5 NA intron (NM_001288774, intron 22 of 32) LTR12C|LTR|ERV1 237393 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 196.5-110 chr4 21933804 21934044 + 1.5 NA intron (NM_147182, intron 1 of 8) intron (NM_147182, intron 1 of 8) 14827 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 168.5-44 chr12 41339664 41339854 + 1.5 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) L1MA3|LINE|L1 -97980 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 280-60 chr8 13903870 13904115 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 274302 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 186.75-5 chr1 107167983 107168168 + 1.5 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 20006 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 254.5-52 chr3 81992414 81992740 + 1.5 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) L1MA9|LINE|L1 6435 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 264-4 chr1 160802668 160803003 + 1.5 NA TTS (NM_001033667) TTS (NM_001033667) 6661 NM_001033667 4063 Hs.403857 NM_002348 ENSG00000122224 LY9 CD229|SLAMF3|hly9|mLY9 lymphocyte antigen 9 protein-coding 218.5-37 chr14 31764059 31764276 + 1.5 NA intron (NM_001201574, intron 1 of 5) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 49598 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 233.25-67 chr7 118253846 118254286 + 1.5 NA Intergenic AluYa5|SINE|Alu 29362 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 324.5-33 chr7 81959536 81959946 + 1.5 NA exon (NM_001366867, exon 37 of 39) exon (NM_001366867, exon 37 of 39) -49436 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 272.75-27 chr2 217493789 217494049 + 1.5 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) intron (NR_026597, intron 2 of 12) 211186 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 264-47 chr4 77948406 77948705 + 1.5 NA intron (NM_020236, intron 7 of 8) intron (NM_020236, intron 7 of 8) 85725 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 301.25-4 chr10 50948605 50948860 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -42156 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 177-60 chr3 23387413 23387665 + 1.5 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 184212 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 217.75-55 chr4 107872820 107873321 + 1.5 NA intron (NR_125929, intron 5 of 6) intron (NR_125929, intron 5 of 6) -20194 NM_001136257 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 194.25-5 chr1 224994015 224994259 + 1.5 NA intron (NM_001349911, intron 8 of 10) L1MA7|LINE|L1 64462 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 223.5-105 chr6 41533042 41533224 + 1.5 NA intron (NR_126415, intron 1 of 1) intron (NR_126415, intron 1 of 1) 13110 NR_126417 101060264 Hs.571099 NR_126415 ENSG00000234753 FOXP4-AS1 - FOXP4 antisense RNA 1 ncRNA 464.75-4 chr8 142125645 142126285 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -50374 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 176.25-49 chr17 31884405 31884574 + 1.5 NA exon (NM_018428, exon 10 of 19) exon (NM_018428, exon 10 of 19) 17219 NM_018428 55813 Hs.589862 NM_018428 ENSG00000108651 UTP6 C17orf40|HCA66 UTP6 small subunit processome component protein-coding 204.75-113 chr7 83813002 83813522 + 1.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -164123 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 248.25-73 chr8 90697018 90697273 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51062 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 470.75 chr11 76365331 76365980 + 1.5 NA intron (NR_130898, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu 15310 NR_130898 5612 Hs.503315 NM_004705 ENSG00000137492 THAP12 DAP4|P52rIPK|PRKRIR|THAP0 THAP domain containing 12 protein-coding 266-2 chr1 152011697 152012024 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -6418 NR_103561 441908 Hs.656557 NR_103561 NBPF18P - NBPF member 18, pseudogene pseudo 264.5 chr1 108839667 108840107 + 1.5 NA intron (NM_152763, intron 6 of 15) AluJo|SINE|Alu 17207 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 162.75-133 chr7 53946267 53946439 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -134422 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 155.5-77 chr18 487873 488009 + 1.5 NA intron (NM_130386, intron 1 of 9) HAL1|LINE|L1 12760 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 202.5-77 chr2 108127966 108128368 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -75412 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 283.75-8 chr13 83162064 83162453 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 720135 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 286.5-53 chr5 27913491 27913773 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 374033 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 160.5-36 chr12 30240733 30240905 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 436425 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 180-49 chr17 75463530 75463753 + 1.5 NA intron (NM_014738, intron 1 of 31) Plat_L3|LINE|CR1 7006 NM_014738 9772 Hs.514474 NM_014738 ENSG00000177728 TMEM94 IDDCDF|KIAA0195 transmembrane protein 94 protein-coding 212.75-50 chr2 68481262 68481520 + 1.5 NA intron (NM_173545, intron 1 of 9) (GTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13806 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 167.5-5 chr1 61710052 61710185 + 1.5 NA intron (NM_032027, intron 2 of 6) intron (NM_032027, intron 2 of 6) 15023 NM_032027 83941 Hs.656790 NM_032027 ENSG00000162604 TM2D1 BBP TM2 domain containing 1 protein-coding 378-9 chr3 44574867 44575164 + 1.5 NA intron (NM_001288592, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu -9949 NR_147692 110354863 Hs.157035 NM_001351732 ZNF660-ZNF197 - ZNF660-ZNF197 readthrough protein-coding 431-4 chr18 9387285 9387684 + 1.5 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) L1MC5a|LINE|L1 52711 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 157.75-43 chr14 27410255 27410451 + 1.5 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -202235 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 250-7 chr12 13599179 13599441 + 1.5 NA intron (NM_000834, intron 9 of 12) intron (NM_000834, intron 9 of 12) -222565 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 274.5-34 chr2 54376746 54377118 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46048 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 351.75-11 chr18 49086564 49087070 + 1.5 NA intron (NM_001353210, intron 16 of 16) AluSx|SINE|Alu -37049 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 185.25-56 chr2 71794721 71794968 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 328145 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 182.75-16 chr1 212146198 212146332 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 68652 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 368-8 chr20 47162652 47162995 + 1.5 NA intron (NM_172110, intron 10 of 13) L1ME3G|LINE|L1 -4144 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 118.5-21 chr10 71413385 71413606 + 1.5 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) L1MEg|LINE|L1 16561 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 210-41 chr17 78710209 78710380 + 1.5 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 6738 NM_001292019 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 354.75-6 chr11 64873329 64873639 + 1.5 NA intron (NM_006795, intron 2 of 4) intron (NM_006795, intron 2 of 4) 5125 NR_162101 113218486 NR_162101 MIR10392 - microRNA 10392 ncRNA 203.5-39 chr13 96833434 96833788 + 1.5 NA 3' UTR (NM_153456, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_153456, exon 2 of 2) 150561 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 220-61 chr7 109549739 109550068 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 410310 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 260.25-53 chr8 77011030 77011287 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10114 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 285.5-58 chr7 144584247 144584620 + 1.5 NA intron (NM_001042482, intron 6 of 7) intron (NM_001042482, intron 6 of 7) 154465 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 222.5-72 chr4 32400231 32400390 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 49272 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 338.5-22 chr4 116826790 116827085 + 1.5 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 258639 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 140-151 chr6 72103383 72103567 + 1.5 NA intron (NM_014989, intron 4 of 33) intron (NM_014989, intron 4 of 33) -109418 NM_001350455 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 141-55 chr16 80566206 80566318 + 1.5 NA TTS (NR_104666) TTS (NR_104666) -3127 NR_120307 102724084 Hs.147884 NR_120307 LOC102724084 - uncharacterized LOC102724084 ncRNA 219-71 chr3 82911218 82911386 + 1.5 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 925160 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 281.25 chr1 55471424 55471683 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 245912 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 329-31 chr5 59950545 59951148 + 1.5 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -57120 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 140-43 chr14 83562352 83562503 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 919795 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 195.75-111 chr7 48542786 48543008 + 1.5 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) intron (NM_152701, intron 55 of 61) 371439 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 281.5-51 chr7 40344317 40344529 + 1.5 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) MER58B|DNA|hAT-Charlie 209447 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 152.25-140 chr6 131166150 131166323 + 1.5 NA intron (NM_016377, intron 4 of 7) intron (NM_016377, intron 4 of 7) 30769 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 282-43 chr7 61935082 61935435 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1368798 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 283.5-56 chr8 119663152 119663429 + 1.5 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 10100 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 260.25-35 chr3 146663883 146664117 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -57784 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 271.5-88 chr8 119246634 119246908 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_149111) promoter-TSS (NR_149111) 86 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 317-29 chr7 15540793 15541066 + 1.5 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) L1ME3|LINE|L1 21086 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 451-2 chr5 41939426 41939817 + 1.5 NA intron (NM_012176, intron 6 of 6) intron (NM_012176, intron 6 of 6) 14340 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 248-38 chr2 155033231 155033464 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 334652 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 157.5-204 chr8 64754455 64754580 + 1.5 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) intron (NM_004820, intron 1 of 5) 44220 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 128.25-116 chr21 28067550 28067680 + 1.5 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) intron (NR_126010, intron 1 of 4) 19201 NR_126010 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 354.5-12 chr21 29980743 29981238 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -40938 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 423.5-3 chr15 87198582 87198923 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -210326 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 314.25-21 chr4 124431790 124432198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 126440 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 286.5-28 chr17 62572660 62572905 + 1.5 NA intron (NM_001284363, intron 9 of 19) intron (NM_001284363, intron 9 of 19) -54888 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 382.5-7 chr10 90935867 90936301 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11216 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 254.75-51 chr8 14827853 14828046 + 1.5 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 25561 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 259.5-38 chr15 65250486 65250762 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 34967 NR_145768 109617003 NR_145768 ENSG00000206903 SNORA24B - small nucleolar RNA, H/ACA box 24B snoRNA 180-76 chr22 24794402 24794588 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -11716 NM_001098498 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 214-24 chr15 39237222 39237379 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13369 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 312.5-26 chr4 31472632 31473010 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33723 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 255.5-11 chr10 60528319 60528542 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) AluSp|SINE|Alu 44526 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 203-25 chr11 50451246 50451500 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 42226 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 191.5-53 chr16 56029433 56029629 + 1.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -73500 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 186-99 chrX 45269158 45269363 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -68384 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 396.25-4 chr11 63482251 63482788 + 1.5 NA intron (NM_054108, intron 3 of 5) L1PB1|LINE|L1 8648 NM_054108 117245 Hs.410316 NM_054108 ENSG00000168004 PLAAT5 HRASLS5|HRLP5|HRSL5|PLAAT-5|RLP1|iNAT phospholipase A and acyltransferase 5 protein-coding 243-3 chr1 116373965 116374135 + 1.5 NA 5' UTR (NM_001160233, exon 1 of 23) 5' UTR (NM_001160233, exon 1 of 23) 183 NM_001160233 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 455.5-7 chr8 122956588 122957076 + 1.5 NA intron (NM_001362797, intron 4 of 4) intron (NM_001362797, intron 4 of 4) 68940 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 202.5-124 chr5 171677220 171677418 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -108553 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 186-46 chr2 98042709 98042923 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -44351 NR_144297 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 297.75-32 chr4 137855707 137855925 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -233198 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 420-13 chr7 40380896 40381275 + 1.5 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 246109 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 202.5-10 chr10 4299536 4299785 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55748 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 123-53 chr14 63755185 63755282 + 1.5 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -27168 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 131.5-164 chr3 156678831 156678949 + 1.5 NA intron (NM_015508, intron 2 of 5) intron (NM_015508, intron 2 of 5) 2226 NM_001184718 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 250-15 chr15 79450557 79450769 + 1.5 NA intron (NM_015206, intron 1 of 3) intron (NM_015206, intron 1 of 3) 18147 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 223.5-122 chr7 96896237 96896450 + 1.5 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -109210 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 324.5-35 chr8 88417120 88417622 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -89888 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 247-30 chr2 63273892 63274114 + 1.5 NA intron (NR_148704, intron 14 of 18) L1M2|LINE|L1 -154461 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 265.75-52 chr4 43680480 43680865 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -188129 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 172-23 chr11 134351956 134352184 + 1.5 NA intron (NM_001370461, intron 5 of 18) L1MB3|LINE|L1 20082 NM_001370462 89944 Hs.436178 NM_138342 ENSG00000149328 GLB1L2 MST114|MSTP114 galactosidase beta 1 like 2 protein-coding 321.25-17 chr3 147157615 147157977 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 234634 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 179.75-119 chr6 111763032 111763381 + 1.5 NA intron (NM_153047, intron 3 of 13) MER4D0|LTR|ERV1 -3289 NM_001370529 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 315.5-27 chr8 18855738 18856129 + 1.5 NA intron (NM_015310, intron 4 of 15) intron (NM_015310, intron 4 of 15) 31124 NM_001362819 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 269.25-11 chr14 47406660 47407007 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -63587 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 207-82 chr7 51483097 51483303 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -89944 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 181-82 chr4 182454409 182454698 + 1.5 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 211151 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 294.5-50 chr8 90244858 90245114 + 1.5 NA intron (NR_051989, intron 1 of 3) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 23498 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 437-12 chrX 93279675 93280050 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 393716 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 342.5-33 chrX 97246142 97246435 + 1.5 NA intron (NM_007309, intron 22 of 26) intron (NM_007309, intron 22 of 26) 318247 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 263-25 chr2 62044505 62044786 + 1.5 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) intron (NM_001321781, intron 2 of 2) 139003 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 181.75-87 chr3 161125547 161125761 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -20282 NM_001349146 8706 Hs.418062 NM_003781 ENSG00000169255 B3GALNT1 B3GALT3|GLCT3|GLOB|Gb4Cer|P|P1|beta3Gal-T3|galT3 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (globoside blood group) protein-coding 609.75 chr10 12836896 12837916 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -112053 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 200.25-6 chr1 170045592 170045762 + 1.5 NA intron (NM_001204514, intron 3 of 20) MER4B-int|LTR|ERV1 23238 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 175.5-97 chr2 192889333 192889517 + 1.5 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 139580 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 202.5-92 chr3 38303459 38303627 + 1.5 NA intron (NM_001320033, intron 1 of 10) L1MC4a|LINE|L1 -2393 NM_004803 9389 Hs.165559 NM_004803 ENSG00000144671 SLC22A14 OCTL2|OCTL4|ORCTL4 solute carrier family 22 member 14 protein-coding 210-80 chr6 50818866 50819036 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_003221) promoter-TSS (NM_003221) 80 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 327.5 chr1 49155562 49155932 + 1.5 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -101664 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 301-18 chr3 174203131 174203510 + 1.5 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -282524 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 224.25-95 chr7 40850322 40850612 + 1.5 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 129472 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 223.5-112 chr6 137055545 137055735 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -10460 NM_014432 53832 Hs.445868 NM_014432 ENSG00000016402 IL20RA CRF2-8|IL-20R-alpha|IL-20R1|IL-20RA interleukin 20 receptor subunit alpha protein-coding 406.5-9 chr3 69198296 69198616 + 1.5 NA intron (NM_015123, intron 12 of 22) L1M4|LINE|L1 -75861 NM_001304418 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 200-17 chr11 92630891 92631168 + 1.5 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 278933 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 163.5-75 chr17 80859205 80859336 + 1.5 NA intron (NM_001163034, intron 13 of 29) intron (NM_001163034, intron 13 of 29) -53638 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 374.75-16 chr8 140884424 140885212 + 1.5 NA intron (NR_148037, intron 4 of 34) intron (NR_148037, intron 4 of 34) 116186 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 122.25-127 chr3 96361311 96361559 + 1.5 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL 1471 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 217.5-89 chr4 35858193 35858469 + 1.5 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 385608 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 188.25-6 chr1 215180344 215180571 + 1.5 NA intron (NM_001017424, intron 5 of 6) L1PA11|LINE|L1 97720 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 196.5-142 chr6 69163527 69163918 + 1.5 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) intron (NM_001704, intron 17 of 31) 528440 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 171-42 chr15 57694015 57694216 + 1.5 NA intron (NR_104368, intron 12 of 13) intron (NR_104368, intron 12 of 13) -12406 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 231.5-49 chr2 129343116 129343321 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -69327 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 400.5-5 chr2 75098378 75098877 + 1.5 NA intron (NM_015727, intron 2 of 3) intron (NM_015727, intron 2 of 3) 7815 NR_049796 100846995 NR_049796 ENSG00000263909 MIR5000 - microRNA 5000 ncRNA 384.25-13 chr4 99330345 99330770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9156 NM_001286650 125 Hs.4 NM_000668 ENSG00000196616 ADH1B ADH2|HEL-S-117 alcohol dehydrogenase 1B (class I), beta polypeptide protein-coding 273.25-36 chr6 133087484 133087839 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_026969) promoter-TSS (NR_026969) -419 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 278.25-54 chr7 42050108 42050715 + 1.5 NA intron (NM_000168, intron 4 of 14) intron (NM_000168, intron 4 of 14) 186798 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 249.5-101 chrX 108402445 108402666 + 1.5 NA intron (NM_001287758, intron 2 of 45) L1MEd|LINE|L1 35867 NM_033641 1288 Hs.145586 NM_001847 ENSG00000197565 COL4A6 CXDELq22.3|DELXq22.3|DFNX6 collagen type IV alpha 6 chain protein-coding 197.5-12 chr10 47188301 47188519 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -111787 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 343.5-11 chr18 11448547 11448793 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -5808 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 141.75-28 chr11 16065604 16065779 + 1.5 NA intron (NM_017508, intron 8 of 14) L1MA2|LINE|L1 -96070 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 263.5-28 chr19 19525155 19525489 + 1.5 NA intron (NM_015965, intron 1 of 4) intron (NM_015965, intron 1 of 4) -3589 NM_198537 374887 Hs.729508 NM_198537 ENSG00000250067 YJEFN3 - YjeF N-terminal domain containing 3 protein-coding 206.5-59 chr2 156902075 156902270 + 1.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -355533 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 269.25-50 chr7 62762778 62762993 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 541171 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 182.25-19 chr10 110096358 110096508 + 1.5 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -88052 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 271.25-4 chr1 98134650 98134845 + 1.5 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -75964 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 245.75-9 chr11 100447666 100448032 + 1.5 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -239439 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 254.25-44 chr3 159970427 159970682 + 1.5 NA intron (NR_108088, intron 9 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -18281 NM_000882 3592 Hs.673 NM_000882 ENSG00000168811 IL12A CLMF|IL-12A|NFSK|NKSF1|P35 interleukin 12A protein-coding 255-64 chr8 128485494 128485809 + 1.5 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 79028 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 206.25-113 chr9 104886472 104886718 + 1.5 NA intron (NM_005502, intron 3 of 49) intron (NM_005502, intron 3 of 49) 41560 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 281.5-40 chr5 13194017 13194296 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -161270 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 282-18 chr17 22690077 22690289 + 1.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 167072 NM_001190452 100462977 Hs.740185 NM_001190452 ENSG00000256618 MTRNR2L1 HN1 MT-RNR2 like 1 protein-coding 348.75-2 chr10 112517314 112517738 + 1.5 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) L1MC3|LINE|L1 -69923 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 230.5-6 chr1 87818116 87818286 + 1.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -446546 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 229.5-10 chr1 208189014 208189242 + 1.5 NA intron (NM_025179, intron 3 of 31) intron (NM_025179, intron 3 of 31) 55256 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 251.25-40 chr4 62351190 62351451 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -189555 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 155-112 chr5 129203036 129203245 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105452 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 265-6 chr10 74329689 74329979 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) intron (NM_001369124, intron 4 of 9) 153071 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 230.5-121 chr9 81406810 81407014 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 282623 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 226.5-83 chr6 90351708 90351981 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39102 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 338.25-14 chr18 77505408 77505751 + 1.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 255731 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 175.25-108 chr4 93780745 93781071 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47845 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 320.5-8 chr11 83158847 83159125 + 1.5 NA intron (NM_001346413, intron 1 of 15) intron (NM_001346413, intron 1 of 15) 1855 NM_001346414 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 191.5-151 chr8 129274113 129274528 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33080 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 401.75-9 chr5 23194921 23195304 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -312497 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 171.5-6 chr1 205792804 205793049 + 1.5 NA intron (NM_173854, intron 10 of 10) intron (NM_173854, intron 10 of 10) -17444 NM_001135664 8934 Hs.115325 NM_003929 ENSG00000117280 RAB29 RAB7L|RAB7L1 RAB29, member RAS oncogene family protein-coding 255.5-73 chr6 130221039 130221224 + 1.5 NA intron (NM_001017373, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 1820 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 181.5-102 chr3 4591768 4591980 + 1.5 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 98526 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 136-114 chr4 88376819 88376958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1851 NM_001165136 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 295-15 chr17 71500314 71500602 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -298279 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 165.75-145 chr6 64153324 64153486 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 346569 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 366-8 chr17 63117658 63117941 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 151564 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 454.75 chr14 69482030 69482715 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2356 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 168.75-142 chr8 13012896 13013162 + 1.5 NA intron (NM_020844, intron 4 of 4) intron (NM_020844, intron 4 of 4) 765 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 335.5-7 chr2 102094073 102094487 + 1.5 NA intron (NM_001320978, intron 1 of 11) intron (NM_001320978, intron 1 of 11) -10324 NM_001320980 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 138-124 chr5 17273353 17273491 + 1.5 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 55791 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 274.5-17 chr12 131589722 131590002 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 58259 NR_146868 105370085 Hs.739274 NR_146868 LINC02414 - long intergenic non-protein coding RNA 2414 ncRNA 219-51 chr2 24627367 24627602 + 1.5 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) intron (NM_001362950, intron 3 of 23) 43007 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 189.75-122 chr8 81701945 81702273 + 1.5 NA TTS (NM_001170797) TTS (NM_001170797) -7051 NM_001010893 347051 Hs.683849 NM_001010893 ENSG00000253598 SLC10A5 P5 solute carrier family 10 member 5 protein-coding 129-111 chr20 51209846 51210000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -186816 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 190.25-131 chr9 82844129 82844292 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 218932 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 242.25-55 chr20 53129970 53130202 + 1.5 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -55197 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 268.5-50 chr5 163293357 163293700 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -144043 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 239-19 chr14 83053044 83053375 + 1.5 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 410577 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 251.5-25 chr13 107394019 107394405 + 1.5 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -73249 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 316-19 chr20 62899185 62899653 + 1.5 NA intron (NM_001193370, intron 6 of 14) intron (NM_001193370, intron 6 of 14) -16516 NR_145839 109623463 NR_145839 SNORA117 - small nucleolar RNA, H/ACA box 117 snoRNA 255.25-28 chr20 46591049 46591257 + 1.5 NA intron (NM_001193340, intron 7 of 12) AluSz|SINE|Alu -40499 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 341-4 chr1 247095173 247095471 + 1.5 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL 9050 NM_001142572 79862 Hs.163754 NM_024804 ENSG00000188295 ZNF669 - zinc finger protein 669 protein-coding 269-20 chr14 75774022 75774324 + 1.5 NA intron (NM_015072, intron 21 of 31) intron (NM_015072, intron 21 of 31) 112927 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 152.5-157 chr5 149369352 149369598 + 1.5 NA 3' UTR (NM_024028, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_024028, exon 6 of 6) 9817 NM_014443 27190 Hs.156979 NM_014443 ENSG00000127743 IL17B IL-17B|IL-20|NIRF|ZCYTO7 interleukin 17B protein-coding 196.5-145 chr6 103531810 103532048 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1327617 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 413.25-4 chr14 84610123 84610620 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -661561 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 334-8 chr12 58496721 58497056 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -94814 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 357.25-11 chr21 43964434 43964832 + 1.5 NA intron (NM_001369880, intron 2 of 8) intron (NM_001369880, intron 2 of 8) 39235 NM_001037553 56894 Hs.248785 NM_020132 ENSG00000160216 AGPAT3 1-AGPAT 3|LPAAT-GAMMA1|LPAAT3 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 protein-coding 180-72 chr20 12352122 12352333 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 434334 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 164.25-100 chr3 85185033 85185162 + 1.5 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -122833 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 142.5-11 chr1 81089126 81089290 + 1.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -216984 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 276.5-52 chr5 25540903 25541158 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 350077 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 250-51 chr6 45764746 45765403 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 172523 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 241-32 chr3 111476493 111476674 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -65614 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 245 chr1 85485598 85485776 + 1.5 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) -20528 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 151.5-40 chr13 69402322 69402493 + 1.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 180061 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 124.25-110 chr2 207493748 207493869 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36154 NM_001371427 316.75-19 chr7 41943788 41944341 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -240974 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 218-67 chr7 131043256 131043485 + 1.5 NA intron (NR_109850, intron 3 of 5) intron (NR_109850, intron 3 of 5) 63660 NR_024153 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 189.75-101 chr6 64839517 64839697 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -461811 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 234.75-90 chr9 111713100 111713303 + 1.5 NA intron (NM_173521, intron 15 of 25) intron (NM_173521, intron 15 of 25) 46335 NM_001080551 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 175.5-177 chr8 142239977 142240185 + 1.5 NA intron (NM_001366901, intron 12 of 13) L1MEd|LINE|L1 41725 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 165.5-62 chr17 48161722 48161919 + 1.5 NA intron (NM_001075099, intron 11 of 12) intron (NM_001075099, intron 11 of 12) -5309 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 259.5-52 chr2 22728639 22728834 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 192257 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 379.5-8 chr14 58704341 58704726 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 65696 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 421.5-5 chr12 65614835 65615189 + 1.5 NA intron (NR_120433, intron 1 of 4) intron (NR_120433, intron 1 of 4) 12143 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 272.25-38 chr3 142926099 142926344 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_038455) promoter-TSS (NR_038455) -454 NR_038455 100507389 Hs.38715 NR_038455 ENSG00000243818 LOC100507389 - uncharacterized LOC100507389 ncRNA 320.25-2 chr1 200221854 200222210 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 151760 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 386.25-10 chr4 112792130 112792596 + 1.5 NA intron (NM_001354269, intron 1 of 43) intron (NM_001354269, intron 1 of 43) -25634 NM_001127493 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 255-47 chr4 104572529 104572765 + 1.5 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -77753 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 223-68 chr5 123828374 123828843 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 283191 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 253.5-37 chr2 43794402 43794719 + 1.5 NA exon (NM_001193464, exon 6 of 13) exon (NM_001193464, exon 6 of 13) 20521 NM_016008 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 374.25-11 chr9 114655389 114655801 + 1.5 NA TTS (NM_001354645) TTS (NM_001354645) 2210 NM_001354645 105376230 Hs.147369 NM_001354645 ENSG00000230054 TEX53 - testis expressed 53 protein-coding 284-34 chr4 30671297 30671779 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -48831 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 387.5 chr1 224518669 224519007 + 1.5 NA intron (NM_001322304, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR 83989 NM_001322304 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 168-77 chr22 19477103 19477244 + 1.5 NA intron (NM_001035247, intron 1 of 11) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 2020 NM_005659 7353 Hs.474213 NM_005659 ENSG00000070010 UFD1 UFD1L ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1 protein-coding 192.75-102 chr4 123479706 123479895 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 80260 NM_005841 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 224-59 chr7 143441152 143441424 + 1.5 NA intron (NR_033897, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 -2165 NM_177437 338398 Hs.688222 NM_177437 ENSG00000185899 TAS2R60 T2R56|T2R60 taste 2 receptor member 60 protein-coding 361-11 chr16 7563477 7563954 + 1.5 NA intron (NM_145893, intron 2 of 13) AluSx3|SINE|Alu 230870 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 328.75-22 chr9 30140199 30140518 + 1.5 NA Intergenic MER66D|LTR|ERV1 268096 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 206.5-107 chr6 52628975 52629247 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35290 NR_024405 730101 Hs.7921 NR_024403 ENSG00000216775 LOC730101 - uncharacterized LOC730101 ncRNA 117.75-122 chr20 10687624 10687757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13691 NM_000214 182 Hs.224012 NM_000214 ENSG00000101384 JAG1 AGS|AGS1|AHD|AWS|CD339|DCHE|HJ1|JAGL1 jagged canonical Notch ligand 1 protein-coding 332.25-8 chr14 22023278 22023612 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -352428 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 222-55 chr3 175775371 175775701 + 1.5 NA intron (NR_046714, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 797 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 298.5-32 chr5 112610992 112611421 + 1.5 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -17230 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 211.25-68 chr4 127032738 127032972 + 1.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -600102 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 273-33 chr20 35502046 35502357 + 1.5 NA intron (NM_007186, intron 29 of 34) intron (NM_007186, intron 29 of 34) 27451 NM_001145350 140873 Hs.158680 NM_080828 ENSG00000125975 C20orf173 dJ477O4.4 chromosome 20 open reading frame 173 protein-coding 187.5-87 chr2 57971146 57971296 + 1.5 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) MER68|LTR|ERVL 63570 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 232-43 chr2 214826748 214827108 + 1.5 NA intron (NR_110292, intron 1 of 3) intron (NR_110292, intron 1 of 3) 16699 NR_110292 101928103 Hs.665619 NR_110292 ENSG00000229267 SNHG31 - small nucleolar RNA host gene 31 ncRNA 270-19 chr17 43415074 43415437 + 1.5 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 16262 NM_001661 379 Hs.183153 NM_001661 ENSG00000175906 ARL4D ARF4L|ARL6 ADP ribosylation factor like GTPase 4D protein-coding 339.25-20 chr4 166057036 166057374 + 1.5 NA exon (NM_012464, exon 14 of 21) exon (NM_012464, exon 14 of 21) 183968 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 320.5-25 chr20 45965053 45965423 + 1.5 NA intron (NM_022095, intron 7 of 27) MIR|SINE|MIR 6965 NM_022095 63925 Hs.174193 NM_022095 ENSG00000198026 ZNF335 MCPH10|NIF-1|NIF1|NIF2 zinc finger protein 335 protein-coding 150.75-164 chr6 166991333 166991484 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 6504 NR_037504 100500857 NR_037504 ENSG00000265828 MIR3939 mir-3939 microRNA 3939 ncRNA 383.75-6 chr7 11742738 11743242 + 1.5 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 89208 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 222.5-25 chr12 39423420 39423687 + 1.5 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 19567 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 413.5-2 chr11 67032794 67033166 + 1.5 NA intron (NM_001318773, intron 3 of 8) intron (NM_001318773, intron 3 of 8) 9846 NM_177963 91683 Hs.287636 NM_177963 ENSG00000173227 SYT12 SYT11|sytXII synaptotagmin 12 protein-coding 201-66 chr6 53176266 53176502 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27543 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 204-50 chr3 33219370 33219563 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_015551) promoter-TSS (NM_015551) -656 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 127.5-220 chr7 11247129 11247287 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 273336 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 269.5-48 chr6 48586636 48586855 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -518056 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 258.25-19 chr14 32509308 32509500 + 1.5 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 180106 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 268-66 chrX 154125675 154125938 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -18437 NM_020061 5956 Hs.247787 NM_020061 ENSG00000102076 OPN1LW CBBM|CBP|COD5|RCP|ROP opsin 1, long wave sensitive protein-coding 248-53 chr3 192506036 192506295 + 1.5 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) MER49|LTR|ERV1 -8857 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 278.25-19 chr16 49720456 49720902 + 1.5 NA intron (NM_001271620, intron 3 of 7) intron (NM_001271620, intron 3 of 7) -56355 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 381-2 chr10 81070824 81071187 + 1.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 421208 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 147-147 chr8 92153237 92153461 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49964 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 394-7 chr2 161159219 161159604 + 1.5 NA intron (NM_004180, intron 1 of 7) intron (NM_004180, intron 1 of 7) -1017 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 148.5-40 chr12 15727308 15727426 + 1.5 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 62021 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 383-16 chr7 86314817 86315259 + 1.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -328871 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 366.5-2 chr1 195574455 195574929 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 514023 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 242.5-48 chr2 125450844 125451174 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 666976 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 277.5-35 chr20 13554545 13554848 + 1.5 NA intron (NM_001323602, intron 4 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 84236 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 266.5-71 chr8 28502267 28502566 + 1.5 NA intron (NM_017412, intron 2 of 7) intron (NM_017412, intron 2 of 7) 2766 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 273.75-28 chr3 106608981 106609274 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 631511 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 414.5 chr10 23606180 23606634 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -88320 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 439.5-3 chr10 54055940 54056408 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) L1MA4A|LINE|L1 -430056 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 260.25-59 chr9 2954354 2954621 + 1.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -110392 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 478.5-2 chr2 11996781 11997119 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10166 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 246-61 chr8 3408330 3408546 + 1.5 NA intron (NM_033225, intron 13 of 69) intron (NM_033225, intron 13 of 69) -679987 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 335.25-14 chr16 74668855 74669140 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2120 NM_001370537 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 164.75-59 chr16 55974727 55974946 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18805 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 121.5-241 chr7 122806262 122806389 + 1.5 NA intron (NM_001167940, intron 1 of 29) intron (NM_001167940, intron 1 of 29) 80135 NM_001363393 93664 Hs.649459 NM_017954 ENSG00000081803 CADPS2 CAPS2 calcium dependent secretion activator 2 protein-coding 165.5-63 chr17 53950122 53950285 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 127276 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 660 chr14 69778805 69779751 + 1.5 NA exon (NM_003049, exon 3 of 5) exon (NM_003049, exon 3 of 5) -11565 NR_029378 100289511 Hs.729250 NR_029378 LOC100289511 - uncharacterized LOC100289511 ncRNA 121-52 chr13 49140904 49141056 + 1.5 NA intron (NM_001079673, intron 7 of 25) L2b|LINE|L2 30663 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 416.25-14 chr6 71815189 71815587 + 1.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -71315 NM_001350412 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 163.5-187 chr7 5688852 5689010 + 1.5 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) intron (NM_207111, intron 13 of 16) -8470 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 239.75-73 chr8 71485775 71486097 + 1.5 NA intron (NM_001370334, intron 2 of 19) intron (NM_001370334, intron 2 of 19) 61768 NM_172059 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 300.5-38 chr5 99244478 99244964 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -289269 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 233-61 chr8 120712009 120712309 + 1.5 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu -49094 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 215.5-70 chr3 88468480 88468760 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 130164 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 325.75-17 chr3 100968759 100969181 + 1.5 NA intron (NM_001349332, intron 1 of 35) intron (NM_001349332, intron 1 of 35) 24520 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 443.25-3 chr2 53512804 53513184 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -254789 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 277-4 chr11 82438575 82438854 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34801 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 112.75-154 chr4 123835788 123835939 + 1.5 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 61599 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 197.25-102 chr8 123950383 123950703 + 1.5 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 90239 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 395-4 chr10 80074703 80075279 + 1.5 NA intron (NR_027432, intron 1 of 3) intron (NR_027432, intron 1 of 3) -3655 NM_001270370 80195 Hs.169982 NM_025125 ENSG00000133678 TMEM254 C10orf57|bA369J21.6 transmembrane protein 254 protein-coding 128-38 chr13 74416360 74416489 + 1.5 NA intron (NR_144452, intron 1 of 1) MamRep605|LTR?|LTR? 2691 NR_144452 100288208 Hs.532467 NM_001013669 ENSG00000177596 LOC100288208 - uncharacterized LOC100288208 ncRNA 315.75-5 chr13 40259602 40259868 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39233 NR_033877 400123 Hs.577960 NR_033877 ENSG00000215483 LINC00548 - long intergenic non-protein coding RNA 548 ncRNA 179.5-129 chr3 153908545 153908862 + 1.5 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -146177 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 343.25-13 chr5 46008592 46009046 + 1.5 NA Intergenic HERVK-int|LTR|ERVK -312439 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 138-101 chr3 36064985 36065111 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -315439 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 325.25-24 chr5 162106008 162106269 + 1.5 NA intron (NM_198904, intron 6 of 9) intron (NM_198904, intron 6 of 9) 38496 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 158.75-138 chr5 43713857 43713962 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -110679 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 286-10 chr14 45395886 45396147 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -142814 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 245-19 chr17 34545627 34545893 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 33609 NR_160787 400591 Hs.514090 NM_207454 C17orf102 - chromosome 17 open reading frame 102 ncRNA 153.75-54 chr16 60252096 60252248 + 1.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 107621 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 322.5-16 chr2 19894559 19894819 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 7294 NM_001008237 130502 Hs.591547 NM_001008237 ENSG00000183891 TTC32 - tetratricopeptide repeat domain 32 protein-coding 245.25-62 chr6 112853634 112853927 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 506450 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 243.5-14 chr10 14635875 14636164 + 1.5 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger -31618 NM_001282696 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 146.25-23 chr12 12371094 12371239 + 1.5 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 L1MC4|LINE|L1 14088 NM_058169 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 456.5-6 chr17 40283226 40283917 + 1.5 NA 3' UTR (NM_133264, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_133264, exon 8 of 8) -4308 NM_001254 990 Hs.405958 NM_001254 ENSG00000094804 CDC6 CDC18L|HsCDC18|HsCDC6|MGORS5 cell division cycle 6 protein-coding 366.75-6 chr13 77407217 77407527 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80278 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 119-70 chr18 3781226 3781373 + 1.5 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) L1ME3G|LINE|L1 64059 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 191.25-54 chr2 95049694 95049898 + 1.5 NA intron (NM_002371, intron 3 of 3) intron (NM_002371, intron 3 of 3) 24088 NM_002371 4118 Hs.80395 NM_002371 ENSG00000172005 MAL MVP17|VIP17 mal, T cell differentiation protein protein-coding 568-2 chr9 106158445 106159145 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -442133 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 219-59 chr20 44546096 44546322 + 1.5 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 14334 NM_007066 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 268-26 chr18 22555947 22556453 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -138285 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 271.5-22 chr14 82519511 82519857 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -122948 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 268-39 chr4 44333390 44333586 + 1.5 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 115321 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 222.75-55 chr19 32370104 32370317 + 1.5 NA intron (NM_001136156, intron 5 of 6) L1MA9|LINE|L1 24600 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 179.5-115 chr22 33300319 33300617 + 1.5 NA intron (NM_133642, intron 12 of 14) AluJo|SINE|Alu 136201 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 219-63 chr22 31828485 31828655 + 1.5 NA intron (NR_146296, intron 24 of 42) intron (NR_146296, intron 24 of 42) 74547 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 238.75-14 chr12 48785893 48786136 + 1.5 NA intron (NM_015270, intron 1 of 21) intron (NM_015270, intron 1 of 21) 3075 NM_015270 112 Hs.525401 NM_015270 ENSG00000174233 ADCY6 AC6|LCCS8 adenylate cyclase 6 protein-coding 149-131 chr8 97552429 97552619 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -91660 NM_001363137 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 201-34 chr16 86420441 86420614 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -74848 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 166.5-38 chr11 46105858 46106044 + 1.5 NA intron (NR_147890, intron 1 of 18) intron (NR_147890, intron 1 of 18) 14868 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 383.5-4 chr11 124167565 124168133 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -17367 NM_001355213 26497 Hs.538726 NM_001355213 ENSG00000197309 OR10D3 HTPCRX09|OR10D3P olfactory receptor family 10 subfamily D member 3 (putative) protein-coding 208.25-45 chr2 103761664 103761974 + 1.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 646513 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 290-5 chr1 190561279 190561723 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -63389 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 304.25-18 chr3 190276866 190277303 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 45362 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 258.75-55 chr4 30778456 30778642 + 1.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 58180 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 243-58 chr5 39835019 39835255 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -217154 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 155.5-142 chr4 48632621 48632777 + 1.5 NA intron (NM_015030, intron 4 of 63) intron (NM_015030, intron 4 of 63) 142447 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 328.75-4 chr14 61233941 61234275 + 1.5 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 47230 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 226.75-28 chr18 65507607 65507791 + 1.5 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -242553 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 320.75 chr1 114827303 114827679 + 1.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -27312 NM_001282542 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 360-16 chr9 132007709 132008058 + 1.5 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) intron (NM_001253881, intron 3 of 6) 71984 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 227.5-37 chr14 104633137 104633406 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28499 NM_001286389 388021 Hs.652298 NM_207379 ENSG00000258986 TMEM179 C14orf90|TMEM179A transmembrane protein 179 protein-coding 255.5-33 chr17 65670019 65670333 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) (TGTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -108528 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 327-11 chr15 74379533 74379900 + 1.5 NA intron (NR_146881, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 634 NR_146881 105370894 NR_146881 LINC02255 - long intergenic non-protein coding RNA 2255 ncRNA 118.25-116 chr20 40224336 40224514 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 219964 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 229.5-14 chr10 50564715 50564988 + 1.5 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) L1PA2|LINE|L1 59105 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 234-50 chr4 167185987 167186200 + 1.5 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) intron (NM_001204352, intron 2 of 11) 48333 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 203.75-34 chr14 81358433 81358669 + 1.5 NA intron (NM_001366849, intron 5 of 8) L1MA7|LINE|L1 69224 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 238-24 chr2 57711285 57711559 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -196229 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 208-19 chr12 90714644 90714812 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -203295 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 150.75-121 chr3 1741248 1741383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -357488 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 327-27 chr6 161721052 161721301 + 1.5 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 250199 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 248.5-92 chr6 144379334 144379631 + 1.5 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -26173 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 196.75-78 chr3 184884414 184884557 + 1.5 NA intron (NM_001009921, intron 20 of 46) L1MEd|LINE|L1 71978 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 207.75-24 chr12 1278776 1278943 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 14 of 19) intron (NR_027948, intron 14 of 19) -221632 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 326.25-13 chr15 86097577 86097859 + 1.5 NA intron (NR_120368, intron 3 of 5) L1MA4A|LINE|L1 18098 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 238-60 chr6 20974372 20974582 + 1.5 NA intron (NM_017774, intron 10 of 15) intron (NM_017774, intron 10 of 15) 440020 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 268.5-35 chr3 22693607 22693813 + 1.5 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? 508868 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 435.25-9 chrX 3571279 3571822 + 1.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -39299 NR_145722 109616969 NR_145722 ENSG00000212214 SNORA48B - small nucleolar RNA, H/ACA box 48B snoRNA 462-5 chr15 81563611 81564232 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -189708 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 282-41 chr5 108190174 108190495 + 1.5 NA intron (NM_001163315, intron 5 of 8) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 191764 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 439 chr1 42819343 42819849 + 1.5 NA intron (NM_001017922, intron 1 of 11) HAL1|LINE|L1 -2199 NM_199342 374969 Hs.113919 NM_199342 ENSG00000177868 SVBP CCDC23 small vasohibin binding protein protein-coding 154-36 chr12 90402547 90402718 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 109314 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 273.75-39 chr7 38414806 38415056 + 1.5 NA intron (NM_139316, intron 16 of 19) AluSx1|SINE|Alu 73354 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 342.5-4 chr10 80374935 80375513 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 18443 NM_032372 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 323.5-8 chr12 41702415 41702736 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61614 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 379.75-9 chr6 65423211 65423834 + 1.5 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 122104 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 331.5-27 chr9 33321147 33321501 + 1.5 NA intron (NM_002504, intron 9 of 23) intron (NM_002504, intron 9 of 23) 30808 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 258.5-73 chr8 116490425 116490703 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -161536 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 195-86 chr7 123117510 123117683 + 1.5 NA exon (NM_001324400, exon 17 of 18) exon (NM_001324400, exon 17 of 18) 82373 NM_022444 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 426.5-3 chr4 161550024 161550375 + 1.5 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) intron (NM_001128428, intron 8 of 14) -472534 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 342.75-18 chr3 169883058 169883392 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13290 NM_001277128 79782 Hs.411295 NM_024727 ENSG00000114248 LRRC31 HEL-S-293 leucine rich repeat containing 31 protein-coding 139-144 chr7 90737685 90737843 + 1.5 NA intron (NM_001287137, intron 2 of 12) intron (NM_001287137, intron 2 of 12) 27948 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 212.25-53 chr22 29977057 29977319 + 1.5 NA intron (NM_153051, intron 3 of 18) AluJo|SINE|Alu -29861 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 148.75-172 chr8 130436189 130436312 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) AluJr|SINE|Alu 7410 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 375.5-11 chr2 49450190 49450513 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -295824 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 171-71 chr2 110715591 110715817 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16869 NM_001365487 55289 Hs.253320 NM_018308 ENSG00000153093 ACOXL - acyl-CoA oxidase like protein-coding 318.25-15 chr6 85521872 85522240 + 1.5 NA intron (NM_001350538, intron 21 of 28) L1M2|LINE|L1 71802 NM_153816 57231 Hs.485871 NM_020468 ENSG00000135317 SNX14 RGS-PX2|SCAR20 sorting nexin 14 protein-coding 336-12 chr17 68772804 68773155 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 144825 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 282.25-13 chr2 72255994 72256208 + 1.5 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -108239 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 306-9 chr15 97982781 97983247 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20024 NR_146564 105371008 NR_146563 LINC02251 - long intergenic non-protein coding RNA 2251 ncRNA 187-71 chr4 122239520 122239780 + 1.5 NA exon (NM_015312, exon 27 of 84) exon (NM_015312, exon 27 of 84) 69047 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 305.25-27 chr2 154693971 154694248 + 1.5 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -4472 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 278.25-11 chr12 43505984 43506208 + 1.5 NA intron (NM_025003, intron 3 of 38) FRAM|SINE|Alu 46107 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 162.25-24 chr11 9860542 9860787 + 1.5 NA intron (NM_030962, intron 17 of 39) intron (NM_030962, intron 17 of 39) 21522 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 233.25-76 chr9 29683135 29683331 + 1.5 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -469632 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 293.75-47 chr9 28159779 28160106 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 559363 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 251.5-13 chr11 13005957 13006481 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3097 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 266-24 chr2 226138863 226139087 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3819 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 131.25-55 chr14 46992352 46992576 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) -340683 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 368.25-22 chr9 69245010 69245352 + 1.5 NA intron (NM_001369870, intron 18 of 23) intron (NM_001369870, intron 18 of 23) 40026 NM_001170416 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 292.75-20 chr21 31622460 31622979 + 1.5 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -36903 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 314.25 chr1 44886789 44887179 + 1.5 NA intron (NM_001166588, intron 6 of 9) MER57-int|LTR|ERV1 -43731 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 185.5-160 chr8 62717172 62717408 + 1.5 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -260571 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 388.5-8 chr2 9821205 9821766 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -21957 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 189-85 chr4 116353472 116353631 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 53826 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 165.5-30 chr12 45652507 45652656 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 75340 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 348.75-18 chr6 68084846 68085332 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 29738 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 175.5-11 chr1 231884993 231885171 + 1.5 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) -40752 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 250-5 chr10 74600079 74600300 + 1.5 NA intron (NM_001369123, intron 8 of 9) L1MC5|LINE|L1 -70865 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 318-2 chr1 91551373 91551737 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 50447 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 341.5-15 chr2 209384901 209385257 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38968 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 157.5-209 chr8 84555382 84555530 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L2c|LINE|L2 139972 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 262.75-43 chr5 2923312 2923677 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5640 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 150-117 chr5 106743676 106743872 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 267240 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 224.25-34 chr16 67064644 67064935 + 1.5 NA intron (NM_001368708, intron 3 of 4) intron (NM_001368708, intron 3 of 4) 35640 NM_001368707 865 Hs.460988 NM_001755 ENSG00000067955 CBFB PEBP2B core-binding factor subunit beta protein-coding 295.25-35 chr8 114622747 114623154 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 1045063 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 282.5-65 chr8 100345908 100346214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9857 NM_001280539 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 225.75-14 chr10 92955828 92956017 + 1.5 NA intron (NM_001319195, intron 17 of 21) intron (NM_001319195, intron 17 of 21) -104876 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 279.5-45 chr4 32447056 32447437 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 96208 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 234.25-79 chr8 130078742 130079069 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 26 of 29) MIRc|SINE|MIR 5863 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 209.25-76 chr3 28898449 28898612 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 323252 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 208.75-68 chr5 117258654 117258899 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -156736 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 258.5-5 chr1 116080037 116080331 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -31571 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 242.25-10 chr10 20170390 20170675 + 1.5 NA intron (NM_032812, intron 7 of 13) intron (NM_032812, intron 7 of 13) 354100 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 200.5-117 chr5 125974845 125975010 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -204650 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 340.5-22 chr3 112284362 112284609 + 1.5 NA intron (NM_001320531, intron 2 of 27).2 Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger 9731 NM_183061 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 157.5-63 chr14 84733697 84733913 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -538127 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 256-30 chr2 84648692 84649049 + 1.5 NA intron (NM_001370, intron 33 of 76) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 132415 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 455.25-3 chr5 33174854 33175295 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54661 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 162-70 chr20 32436590 32436781 + 1.5 NA exon (NM_001363734, exon 11 of 11) exon (NM_001363734, exon 11 of 11) 46805 NM_080616 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 297.5-14 chr13 41879620 41879900 + 1.5 NA intron (NM_001009814, intron 9 of 25) intron (NM_001009814, intron 9 of 25) 81325 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 341-17 chr2 227280073 227280410 + 1.5 NA intron (NM_000091, intron 29 of 51) intron (NM_000091, intron 29 of 51) 44923 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 309.5-38 chr5 178963076 178963429 + 1.5 NA intron (NM_001178089, intron 4 of 4) L1ME3A|LINE|L1 22054 NM_001323308 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 319-30 chr5 54494588 54494951 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -22990 NM_052870 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 332.25-27 chr5 16525806 16526431 + 1.5 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) MLT2D|LTR|ERVL -17120 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 242-37 chr3 110742813 110743037 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 327034 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 241-53 chr8 101056041 101056296 + 1.5 NA intron (NR_033962, intron 2 of 2) intron (NR_033962, intron 2 of 2) 4114 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 471-4 chr14 51316756 51317476 + 1.5 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) intron (NR_145423, intron 1 of 1) 11269 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 327.5-5 chr11 100804135 100804429 + 1.5 NA intron (NM_152432, intron 3 of 23) AluJr4|SINE|Alu -116327 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 152.75-41 chr12 12878889 12879175 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 3555 NR_003932 387841 Hs.631728 NR_003932 ENSG00000234498 RPL13AP20 RPL13A_9_1211 ribosomal protein L13a pseudogene 20 pseudo 325-4 chr13 79529462 79529765 + 1.5 NA intron (NM_019080, intron 2 of 7) intron (NM_019080, intron 2 of 7) -37114 NR_125772 103724388 Hs.434862 NR_125772 ENSG00000227676 LINC01068 - long intergenic non-protein coding RNA 1068 ncRNA 159.25-62 chr19 28318244 28318455 + 1.5 NA Intergenic LTR72|LTR|ERV1 -288339 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 189.75-62 chr2 176208549 176208707 + 1.5 NA Intergenic (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19670 NR_033979 401022 Hs.98661 NR_033979 ENSG00000224189 HAGLR HOXD-AS1|MIR7704HG|Mdgt HOXD antisense growth-associated long non-coding RNA ncRNA 211.5-54 chr15 61262424 61262622 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33221 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 259.75-7 chr11 72215516 72215882 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -1095 NM_000803 2350 Hs.433159 NM_000803 ENSG00000165457 FOLR2 BETA-HFR|FBP|FBP/PL-1|FR-BETA|FR-P3|FRbeta folate receptor beta protein-coding 149.5-67 chr15 95476544 95476780 + 1.5 NA intron (NR_027133, intron 3 of 5) intron (NR_027133, intron 3 of 5) 43569 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 282.75-4 chr1 94644260 94644516 + 1.5 NA intron (NR_160780, intron 3 of 5) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 100686 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 223.25-65 chr6 62753467 62753833 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -467423 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 131.25-172 chr6 43353602 43353752 + 1.5 NA intron (NM_014345, intron 4 of 9) intron (NM_014345, intron 4 of 9) 15970 NM_014345 24149 Hs.509718 NM_014345 ENSG00000171467 ZNF318 HRIHFB2436|TZF|ZFP318 zinc finger protein 318 protein-coding 200.25-103 chr7 120444386 120444711 + 1.5 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 171373 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 362.25-3 chr17 68851314 68851699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 103886 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 440-3 chr14 54515604 54516430 + 1.5 NA intron (NM_006568, intron 1 of 5) L1MEc|LINE|L1 6111 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 169-70 chr4 177269264 177269403 + 1.5 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -40541 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 349.5-18 chr4 130031581 130031928 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 260135 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 301.75-5 chr11 126835605 126835839 + 1.5 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) MER77B|LTR|ERVL -105024 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 338.25-28 chr7 99234257 99234618 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26948 NM_001145715 402569 Hs.253050 NM_001145715 ENSG00000185467 KPNA7 IPOA8 karyopherin subunit alpha 7 protein-coding 373-2 chr10 80362168 80362636 + 1.5 NA intron (NM_032372, intron 2 of 4) intron (NM_032372, intron 2 of 4) 5621 NM_032372 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 178-49 chr2 140269628 140269848 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 86 of 90) intron (NM_018557, intron 86 of 90) 316947 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 166.5-80 chr17 31991856 31992068 + 1.5 NA intron (NM_001321207, intron 9 of 14) intron (NM_001321207, intron 9 of 14) -15421 NM_001321350 114659 Hs.514071 NM_052888 ENSG00000185158 LRRC37B LRRC37 leucine rich repeat containing 37B protein-coding 148.5-69 chr15 99650617 99650775 + 1.5 NA intron (NM_001365201, intron 4 of 11) intron (NM_001365201, intron 4 of 11) 17718 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 261.5-67 chr8 58433300 58433592 + 1.5 NA intron (NM_001077619, intron 4 of 7) intron (NM_001077619, intron 4 of 7) 22085 NM_001077619 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 240.75-57 chr4 37061353 37061604 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 59699 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 542-3 chr6 35907020 35907703 + 1.5 NA intron (NR_034069, intron 2 of 15) L1MC5a|LINE|L1 13737 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 137.5-93 chr17 31203576 31203673 + 1.5 NA intron (NM_001042492, intron 11 of 57) intron (NM_001042492, intron 11 of 57) 93615 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 330.25-20 chr6 129035256 129035613 + 1.5 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) L1PA17|LINE|L1 152293 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 262.75-54 chr8 87410330 87410736 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 463482 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 316.5-5 chr1 182990812 182991182 + 1.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -32423 NM_002293 3915 Hs.609663 NM_002293 ENSG00000135862 LAMC1 LAMB2 laminin subunit gamma 1 protein-coding 179.5-21 chr10 60794608 60794877 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001320918, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001320918, exon 8 of 8) 16264 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 307.5-6 chr10 48990836 48991107 + 1.5 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -5384 NR_036182 100422895 NR_036182 ENSG00000264800 MIR4294 - microRNA 4294 ncRNA 211-35 chr2 123994428 123994648 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 30636 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 155.25-107 chr20 41064479 41064609 + 1.5 NA intron (NM_003286, intron 3 of 20) intron (NM_003286, intron 3 of 20) 35722 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 267.75-37 chr3 13471752 13472102 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 8126 NR_046690 100874101 Hs.535701 NR_046690 ENSG00000244502 HDAC11-AS1 - HDAC11 antisense RNA 1 ncRNA 281.5-12 chr10 120333252 120333619 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21788 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 183.5-107 chr5 41974260 41974486 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 49092 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 236-49 chr4 70235166 70235589 + 1.5 NA TTS (NM_152997) TTS (NM_152997) -7239 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 150-97 chr3 116082056 116082199 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -177001 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 458.25-6 chr8 59747623 59748000 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 533589 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 264.75 chr1 56187528 56187842 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -227278 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 352.25-15 chr5 143359843 143360295 + 1.5 NA intron (NR_157096, intron 1 of 7) intron (NR_157096, intron 1 of 7) 43214 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 255.5-43 chr2 121383818 121383996 + 1.5 NA intron (NM_015282, intron 31 of 38) intron (NM_015282, intron 31 of 38) -98705 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 245-42 chr3 169488521 169488704 + 1.5 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) L1MEd|LINE|L1 40745 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 133.5-244 chr7 36987544 36987694 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) -1353 NR_038120 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 244.25-2 chr1 165513034 165513387 + 1.5 NA intron (NR_026744, intron 4 of 6) intron (NR_026744, intron 4 of 6) -31031 NM_001005214 440699 Hs.664975 NM_001005214 ENSG00000162763 LRRC52 - leucine rich repeat containing 52 protein-coding 204-88 chr9 78227297 78227499 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -8677 NM_001349840 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 169.5-10 chr1 203907025 203907188 + 1.5 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 45259 NM_001328638 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 235.5-87 chr8 73327051 73327440 + 1.5 NA intron (NR_125388, intron 3 of 5) intron (NR_125388, intron 3 of 5) 29216 NR_125388 101926926 Hs.640090 NR_125388 ENSG00000250295 RDH10-AS1 - RDH10 antisense RNA 1 ncRNA 229-59 chr4 140543356 140543651 + 1.5 NA exon (NM_153702, exon 8 of 9) exon (NM_153702, exon 8 of 9) 19335 NM_153702 255520 Hs.450105 NM_153702 ENSG00000179387 ELMOD2 9830169G11Rik ELMO domain containing 2 protein-coding 213-63 chr3 47710822 47710973 + 1.5 NA intron (NM_003074, intron 8 of 27) intron (NM_003074, intron 8 of 27) -49203 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 349.5-22 chr8 83246038 83246428 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -157525 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 412.5-6 chr2 170589474 170590040 + 1.5 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 124810 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 182.25-128 chr8 142786264 142786448 + 1.5 NA intron (NM_003695, intron 1 of 2) intron (NM_003695, intron 1 of 2) 183 NM_003695 8581 Hs.415762 NM_003695 ENSG00000167656 LY6D E48|Ly-6D lymphocyte antigen 6 family member D protein-coding 276.25-45 chr8 87239741 87239935 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) intron (NM_173538, intron 6 of 10) 373423 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 409 chr1 117644435 117644811 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 38575 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 273.5-52 chr3 186027167 186027403 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 67342 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 195.25-19 chr10 127277695 127277926 + 1.5 NA intron (NM_001290223, intron 29 of 51) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -81219 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 174-98 chr8 61458038 61458219 + 1.5 NA intron (NM_173519, intron 4 of 5) intron (NM_173519, intron 4 of 5) 170158 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 278.5-34 chr20 22863589 22863921 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -171665 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 288.5-30 chr3 184226849 184227115 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3371 NM_138345 90113 Hs.584997 NM_138345 ENSG00000145198 VWA5B2 - von Willebrand factor A domain containing 5B2 protein-coding 383.25-17 chr4_GL000008v2_random 3798 4241 + 1.5 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu 174152 NR_046228 100874392 Hs.648245 NR_046228 ANKRD20A12P - ankyrin repeat domain 20 family member A12, pseudogene pseudo 165.5-4 chr1 90540093 90540290 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -117559 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 257-44 chr4 143083348 143083531 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 101422 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 255-2 chr10 27736755 27736995 + 1.5 NA intron (NM_001242702, intron 3 of 6) intron (NM_001242702, intron 3 of 6) -7740 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 161-16 chr10 107681413 107681577 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 387798 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 279.75-12 chr12 49698210 49698476 + 1.5 NA intron (NM_001367835, intron 1 of 26) intron (NM_001367835, intron 1 of 26) 9062 NM_175736 91010 Hs.179838 NM_175736 ENSG00000161791 FMNL3 FHOD3|FRL2|WBP-3|WBP3 formin like 3 protein-coding 210-48 chr2 35636516 35636781 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165243 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 343-12 chr19 24221234 24221627 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -57983 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 119.75-146 chr3 118907264 118907377 + 1.5 NA intron (NM_001353325, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 -35756 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 372.25-10 chr4 165802997 165803576 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60215 NR_121677 101928131 Hs.406479 NR_121677 LOC101928131 - uncharacterized LOC101928131 ncRNA 183-118 chr9 119981506 119981739 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46562 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 179-8 chr1 188358538 188358740 + 1.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 915011 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 265 chr1 35992596 35992901 + 1.5 NA intron (NM_024852, intron 5 of 18) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 61643 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 233.5-47 chr19 42046422 42046689 + 1.5 NA intron (NM_002088, intron 10 of 18) L1ME4b|LINE|L1 19250 NM_002088 2901 Hs.367799 NM_002088 ENSG00000105737 GRIK5 EAA2|GRIK2|GluK5|KA2 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 5 protein-coding 309-4 chr10 19526514 19526915 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 31 of 39) intron (NM_001142308, intron 31 of 39) 201836 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 231.75-43 chr21 17869271 17869499 + 1.5 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 16223 NR_024354 54075 Hs.404306 NR_024354 CHODL-AS1 C21orf39|NCRNA00157 CHODL antisense RNA 1 ncRNA 283.25-31 chr3 143934270 143934575 + 1.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -37376 NM_173552 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 146-104 chr5 38873918 38874064 + 1.5 NA intron (NM_003999, intron 2 of 17) AluJb|SINE|Alu 27979 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 327-19 chr2 222405637 222405935 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18202 NM_001320834 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 342.25-2 chr1 152230997 152231328 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -6966 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 175-67 chr2 74014756 74014985 + 1.5 NA intron (NM_001287491, intron 3 of 11) intron (NM_001287491, intron 3 of 11) 12178 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 210.25-24 chr14 63916951 63917214 + 1.5 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) AluJo|SINE|Alu 64078 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 331.5-23 chr6 61890913 61891343 + 1.5 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 316998 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 151-19 chr11 45706767 45706960 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15087 NR_106976 102465691 NR_106976 ENSG00000276639 MIR7154 hsa-mir-7154 microRNA 7154 ncRNA 184.5-18 chr10 54218206 54218436 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 9 of 34) L1MC5|LINE|L1 -267909 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 120-155 chr5 160035931 160036085 + 1.5 NA intron (NM_003314, intron 3 of 7) intron (NM_003314, intron 3 of 7) 26869 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 353.25-21 chr7 54399790 54400156 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69276 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 257.25-31 chr3 115699205 115699409 + 1.5 NA intron (NM_002045, intron 2 of 2) intron (NM_002045, intron 2 of 2) 75797 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 355.75-10 chr21 28686595 28687156 + 1.5 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 147557 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 208-72 chr6 86854437 86854589 + 1.5 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -83015 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 289.5-14 chr14 67944078 67944387 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 120640 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 423-5 chr5 27691384 27691879 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 219339 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 213.5-47 chr16 63297351 63297740 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1261107 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 473-3 chr4 84387124 84387508 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -88147 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 228.75-51 chr21 31237985 31238190 + 1.5 NA intron (NM_001353686, intron 6 of 27) intron (NM_001353686, intron 6 of 27) -77147 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 507-2 chr10 60582733 60583166 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) L1MA6|LINE|L1 -9993 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 244.5-27 chr13 78871613 78871831 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31672 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 248.25-54 chr5 64402026 64402238 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -103883 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 123.75-104 chr20 3586231 3586339 + 1.5 NA intron (NM_001207047, intron 18 of 24) L1MB7|LINE|L1 77114 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 151-32 chr13 110940339 110940535 + 1.5 NA Intergenic HERVP71A-int|LTR|ERV1 -25368 NR_104586 55608 Hs.525163 NM_017664 ENSG00000088448 ANKRD10 - ankyrin repeat domain 10 protein-coding 204.75-27 chr11 100755973 100756196 + 1.5 NA intron (NM_001367945, intron 1 of 25) intron (NM_001367945, intron 1 of 25) -68129 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 233.5-52 chr2 28247708 28247943 + 1.5 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) intron (NM_199193, intron 11 of 13) -40864 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 145.25-73 chr2 104050945 104051085 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 357317 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 301-24 chr6 139503084 139503362 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -28627 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 208-14 chr11 90784158 90784360 + 1.5 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) 84943 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 223.5-102 chr5 127292058 127292320 + 1.5 NA intron (NM_001308121, intron 1 of 13) intron (NM_001308121, intron 1 of 13) 1393 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 210.75-20 chr12 51469217 51469502 + 1.5 NA intron (NM_001039960, intron 11 of 24) intron (NM_001039960, intron 11 of 24) 44242 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 347.5-23 chrX 113019525 113019806 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -23062 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 159-56 chr20 7826139 7826284 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 114247 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 145.75-151 chr7 38444041 38444141 + 1.5 NA intron (NM_001635, intron 11 of 20) L1ME1|LINE|L1 102514 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 414.75-9 chr8 139171996 139172865 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -258389 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 259.5-12 chr1 211183824 211184098 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49813 NM_172362 3756 Hs.553187 NM_002238 ENSG00000143473 KCNH1 EAG|EAG1|Kv10.1|TMBTS|ZLS1|h-eag|hEAG1 potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 protein-coding 279.75-41 chr5 9239366 9239725 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) intron (NM_003966, intron 5 of 22) -185650 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 230-55 chr6 41845661 41845919 + 1.5 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) Ricksha_a|DNA|MULE-MuDR 25847 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 385.5-5 chr10 85487701 85488131 + 1.5 NA intron (NR_120671, intron 5 of 5) L1MA9|LINE|L1 38324 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 198.5-100 chr3 145540053 145540207 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 529055 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 265.75-28 chr18 7495458 7495802 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -34624 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 202.75-105 chr7 40565358 40565669 + 1.5 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) L2a|LINE|L2 414426 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 248.5-26 chr14 58671407 58671757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 32745 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 415.5-6 chr2 236377617 236378110 + 1.5 NA intron (NR_073043, intron 12 of 19) intron (NR_073043, intron 12 of 19) -113518 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 512.25-6 chr4 106251321 106251753 + 1.5 NA intron (NM_001163437, intron 6 of 25) intron (NM_001163437, intron 6 of 25) -64073 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 196.5-132 chr5 122658213 122658426 + 1.5 NA intron (NR_109881, intron 8 of 11) L1MB7|LINE|L1 72241 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 209.25-84 chr4 29428388 29428577 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 214190 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 266-39 chr5 77488607 77488947 + 1.5 NA intron (NM_018268, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 3539 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 200-73 chr5 110460809 110461001 + 1.5 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 53010 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 482.5-3 chr18 10964360 10964882 + 1.5 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) L1MB5|LINE|L1 184141 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 414.25-2 chr10 27868862 27869332 + 1.5 NA intron (NM_001290021, intron 10 of 13) L1M8|LINE|L1 112774 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 251.5-6 chr1 192743651 192743914 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 27454 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 434.25-2 chr1 235124016 235124570 + 1.5 NA intron (NM_014765, intron 1 of 4) AluSx3|SINE|Alu 3644 NR_002956 677802 Hs.744743 NR_002956 ENSG00000207181 SNORA14B ACA14b small nucleolar RNA, H/ACA box 14B snoRNA 212.25-86 chr7 43624193 43624374 + 1.5 NA intron (NM_004760, intron 6 of 6) intron (NM_004760, intron 6 of 6) 41175 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 201-35 chr17 4164429 4164636 + 1.5 NA non-coding (NR_047571, exon 24 of 24) non-coding (NR_047571, exon 24 of 24) 20835 NM_001254755 124936 Hs.513871 NM_144611 ENSG00000167740 CYB5D2 - cytochrome b5 domain containing 2 protein-coding 258.75-35 chr2 34431370 34431587 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -246079 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 257.5-38 chr2 217539123 217539440 + 1.5 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) intron (NR_026597, intron 2 of 12) 217312 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 177.5-179 chr9 28134052 28134269 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 -560294 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 329-40 chr8 110176483 110176730 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -200835 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 324-20 chr3 144873796 144874119 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 900876 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 347.5-18 chr7 113976177 113976509 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -57334 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 235.5-49 chr2 175637592 175637806 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 364568 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 172-42 chr16 27583195 27583382 + 1.5 NA intron (NM_015202, intron 2 of 27) intron (NM_015202, intron 2 of 27) 33144 NM_015202 23247 Hs.460459 NM_015202 ENSG00000047578 KIAA0556 JBTS26 KIAA0556 protein-coding 209.5-55 chr18 7641224 7641439 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 74015 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 198.75-90 chr7 42453213 42453457 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -216126 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 408-6 chr17 52316556 52316913 + 1.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -73788 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 408-16 chr8 144605038 144605620 + 1.5 NA intron (NM_025251, intron 1 of 10) CpG 366 NM_025251 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 354-22 chr4 158372162 158372442 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -149412 NM_001363776 59350 Hs.591686 NM_021634 ENSG00000171509 RXFP1 LGR7|RXFPR1 relaxin family peptide receptor 1 protein-coding 279.75-42 chr5 55850136 55850427 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -1076 NM_139017 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 188-90 chr9 88073036 88073215 + 1.5 NA intron (NR_135138, intron 1 of 1) L1PB2|LINE|L1 4775 NR_135138 102724156 Hs.633031 NR_135137 LOC102724156 - uncharacterized LOC102724156 ncRNA 203.5-101 chr4 29691389 29691575 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 477190 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 194-31 chr12 128402766 128403089 + 1.5 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 108835 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 312.75-10 chr16 66561831 66562070 + 1.5 NA intron (NM_001204099, intron 2 of 3) intron (NM_001204099, intron 2 of 3) -4489 NM_181271 113540 Hs.15159 NM_052999 ENSG00000089505 CMTM1 CKLFH|CKLFH1|CKLFSF1 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1 protein-coding 298.25-14 chr2 50842775 50843058 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -146654 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 201-30 chr14 84940068 84940323 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -331737 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 336.75-12 chr2 125183331 125183582 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 934529 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 217.5-45 chr14 65424447 65424722 + 1.5 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) AluSx3|SINE|Alu 11854 NR_038170 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 258.25-30 chr20 39412741 39412932 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -188088 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 193.5-157 chr7 110470037 110470205 + 1.5 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -509908 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 214-52 chr5 115381087 115381497 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -84638 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 303.5-15 chr15 68976154 68976432 + 1.5 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) AluJb|SINE|Alu -38402 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 156-67 chr18 8266130 8266252 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 100843 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 254.75-11 chr13 83257559 83257893 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 624667 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 369.25-11 chr7 92454295 92454718 + 1.5 NA non-coding (NR_052016, exon 4 of 6) non-coding (NR_052016, exon 4 of 6) 7024 NR_052016 57798 Hs.21145 NM_021167 ENSG00000157259 GATAD1 CMD2B|ODAG|RG083M05.2 GATA zinc finger domain containing 1 protein-coding 219-58 chr2 229500944 229501223 + 1.5 NA intron (NM_139072, intron 6 of 12) L1MA8|LINE|L1 213472 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 291.75-40 chr8 57720861 57721238 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25100 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 222.5-99 chr6 120182807 120183106 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 167777 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 356.25-14 chr5 143596059 143596453 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -83604 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 248-47 chr3 49073583 49073775 + 1.5 NA intron (NM_017730, intron 3 of 10) AluJb|SINE|Alu 19953 NM_001320582 54870 Hs.297389 NM_017730 ENSG00000198218 QRICH1 AB-DIP|VERBRAS glutamine rich 1 protein-coding 142.75-177 chr7 92487313 92487428 + 1.5 NA 3' UTR (NM_000466, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_000466, exon 24 of 24) -9424 NM_001130925 30816 NM_014590 ENSG00000242950 ERVW-1 ENV|ENVW|ERVWE1|HERV-7q|HERV-W-ENV|HERV7Q|HERVW|HERVWENV endogenous retrovirus group W member 1, envelope protein-coding 231.5-45 chr2 55803635 55803909 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109928 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 249.5-16 chr10 81067698 81067959 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 418031 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 223.75-72 chr5 166593015 166593329 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 333198 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 279-2 chr1 81101072 81101332 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -204990 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 325.5-5 chr11 111558312 111558559 + 1.5 NA intron (NM_178834, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 17927 NM_001258390 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 262-21 chr16 80906398 80906847 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14026 NR_131948 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 173.75-141 chr7 52240661 52240816 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -794895 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 271.75 chr1 97858597 97858800 + 1.5 NA intron (NM_000110, intron 2 of 22) intron (NM_000110, intron 2 of 22) 61777 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 163-26 chr11 131083246 131083499 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -166885 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 249-23 chr2 122893113 122893438 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 180206 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 352.5-9 chr2 69882310 69882600 + 1.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -11501 NR_037862 11017 Hs.54649 NM_006857 ENSG00000124380 SNRNP27 27K|RY1 small nuclear ribonucleoprotein U4/U6.U5 subunit 27 protein-coding 339.75-4 chr10 64696314 64696631 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -129056 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 257-24 chr2 100676109 100676304 + 1.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 72467 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 173.5-85 chr20 46826672 46826838 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -67869 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 392.25-4 chr12 52888900 52889438 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 9815 NR_162090 113218482 NR_162090 MIR9898 - microRNA 9898 ncRNA 352.5-29 chr7 94840161 94840426 + 1.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -67301 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 123.25-176 chr6 110299975 110300088 + 1.5 NA intron (NM_001354594, intron 2 of 3) intron (NM_001354594, intron 2 of 3) 30027 NM_001354595 728464 Hs.634429 NM_001123364 ENSG00000053328 METTL24 C6orf186 methyltransferase like 24 protein-coding 193.5-22 chr11 40215856 40216063 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 77171 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 217-53 chr3 130591430 130591591 + 1.5 NA intron (NM_001102608, intron 12 of 35) intron (NM_001102608, intron 12 of 35) 31176 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 136-13 chr10 36117671 36117846 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 339456 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 382.5-8 chr13 51743083 51743609 + 1.5 NA intron (NM_052950, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR 60816 NM_024705 79758 Hs.266728 NM_024705 ENSG00000102796 DHRS12 SDR40C1 dehydrogenase/reductase 12 protein-coding 279-24 chr3 7138712 7138993 + 1.5 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -244835 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 394-8 chr2 204906173 204906625 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 360924 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 230-25 chr16 59673415 59673664 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 81652 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 113.75-8 chr1 112941867 112941950 + 1.5 NA intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 14155 NM_001166496 6566 Hs.75231 NM_003051 ENSG00000155380 SLC16A1 HHF7|MCT|MCT1|MCT1D solute carrier family 16 member 1 protein-coding 285.75-29 chr3 66820847 66821219 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -82697 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 236-16 chr14 20805441 20805722 + 1.5 NA Intergenic LTR47B3|LTR|ERVL -2737 NM_002933 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 414.75-5 chr13 94668519 94668892 + 1.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 39781 NR_120417 101927248 NR_120417 LOC101927248 - uncharacterized LOC101927248 ncRNA 297.75-45 chr7 78363585 78363861 + 1.5 NA intron (NM_001301128, intron 7 of 20) intron (NM_001301128, intron 7 of 20) 16481 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 346-9 chr16 55558308 55558768 + 1.5 NA intron (NM_017839, intron 11 of 13) intron (NM_017839, intron 11 of 13) -8146 NM_032330 84290 Hs.660027 NM_032330 ENSG00000256812 CAPNS2 CSS2 calpain small subunit 2 protein-coding 403-8 chr5 154194084 154194595 + 1.5 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) intron (NM_198321, intron 1 of 11) 3606 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 221.5-93 chr7 79631515 79631765 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 177680 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 195-95 chr8 129720277 129720560 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -40179 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 244.25-15 chr14 40295363 40295626 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -659217 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 145-61 chr17 60238264 60238488 + 1.5 NA intron (NM_032582, intron 11 of 33) L1MB5|LINE|L1 -6731 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 337-2 chr10 5900880 5901138 + 1.5 NA intron (NM_032807, intron 2 of 21) AluSz6|SINE|Alu 6623 NM_032807 84893 Hs.498543 NM_032807 ENSG00000134452 FBH1 FBXO18|Fbx18|hFBH1 F-box DNA helicase 1 protein-coding 214-50 chr5 35579080 35579261 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -38693 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 259-23 chr20 56478441 56478924 + 1.5 NA intron (NM_001283036, intron 4 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10097 NM_001283037 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 270.75 chr1 159471449 159471700 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 31852 NM_012351 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 326.25-31 chr7 123911175 123911491 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13908 NM_001174044 6677 Hs.121494 NM_003117 ENSG00000106304 SPAM1 HEL-S-96n|HYA1|HYAL1|HYAL3|HYAL5|PH-20|PH20|SPAG15 sperm adhesion molecule 1 protein-coding 233.25-14 chr11 41430221 41430520 + 1.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 29266 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 256.5-39 chr20 6803955 6804297 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 36440 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 287.25-7 chr10 48325919 48326278 + 1.5 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) L1MC3|LINE|L1 19421 NM_001323328 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 466.5-9 chr4 120449344 120449744 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -382696 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 191.75-49 chr17 63684667 63684794 + 1.5 NA intron (NM_203351, intron 8 of 16) AluJo|SINE|Alu 15395 NM_030576 80774 Hs.591166 NM_030576 ENSG00000136490 LIMD2 - LIM domain containing 2 protein-coding 150.5-181 chr5 162045127 162045261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22448 NM_198903 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 363-15 chr5 102719832 102720231 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -34752 NM_001319943 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 256.25-51 chr8 126377116 126377463 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51794 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 365.75-5 chr14 65747854 65748372 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 277011 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 388.5-15 chr5 158932045 158932379 + 1.5 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) L1ME4a|LINE|L1 165744 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 408.75-10 chr7 113549606 113550051 + 1.5 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 369181 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 246.25-42 chr22 22932755 22932995 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45059 NM_001178126 100423062 Hs.449574 NM_001178126 ENSG00000254709 IGLL5 IGL|IGLV|VL-MAR immunoglobulin lambda like polypeptide 5 protein-coding 239.5-69 chr7 2473836 2474090 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 2420 NM_001291784 402635 NM_001291784 GRIFIN - galectin-related inter-fiber protein protein-coding 263-46 chr6 122890171 122890538 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 101096 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 312-20 chr3 101095984 101096300 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -102652 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 217.5-26 chr11 112696998 112697365 + 1.5 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -141379 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 264-37 chr2 174867331 174867670 + 1.5 NA intron (NR_038133, intron 5 of 11) intron (NR_038133, intron 5 of 11) -19882 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 376.5-14 chr3 159092722 159093214 + 1.5 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 23649 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 312-14 chr2 15625906 15626158 + 1.5 NA intron (NM_004939, intron 19 of 25) intron (NM_004939, intron 19 of 25) 34164 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 141-84 chr2 149335406 149335572 + 1.5 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 4902 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 278-17 chr19 35326100 35326401 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -2919 NM_001185101 933 Hs.579691 NM_001771 ENSG00000012124 CD22 SIGLEC-2|SIGLEC2 CD22 molecule protein-coding 263.75-53 chr9 33271624 33272239 + 1.5 NA intron (NM_001195536, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR 6882 NM_016410 51510 Hs.635313 NM_016410 ENSG00000086065 CHMP5 C9orf83|CGI-34|HSPC177|PNAS-2|SNF7DC2|Vps60 charged multivesicular body protein 5 protein-coding 326-9 chr15 61146125 61146429 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 83025 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 332-13 chr17 67124026 67124283 + 1.5 NA intron (NM_001330447, intron 24 of 32) intron (NM_001330447, intron 24 of 32) 79600 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 402.25-4 chr3 144944142 144944565 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 971272 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 228-35 chr17 28987259 28987579 + 1.5 NA intron (NM_001290202, intron 1 of 16) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 18614 NM_178860 124925 Hs.21837 NM_178860 ENSG00000063015 SEZ6 BSRPC seizure related 6 homolog protein-coding 214.25-8 chr1 246803617 246803938 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 14160 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 193.5-37 chr12 127599497 127599634 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 36902 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 320-4 chr1 248778152 248778565 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -22571 NM_001291283 646627 Hs.146268 NM_001085474 ENSG00000259823 LYPD8 - LY6/PLAUR domain containing 8 protein-coding 252-48 chr3 178846684 178846900 + 1.5 NA intron (NR_126561, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 13613 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 318.5-7 chr12 62312432 62312716 + 1.5 NA intron (NM_001351165, intron 4 of 23) intron (NM_001351165, intron 4 of 23) 52170 NM_001252078 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 142.5-119 chr2 223373943 223374045 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 228367 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 295.5-7 chr10 58614744 58615141 + 1.5 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) -100073 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 377-6 chr20 7828745 7829068 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 111552 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 242-46 chr5 57659247 57659454 + 1.5 NA intron (NR_104668, intron 1 of 2) L1PA12|LINE|L1 8690 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 413.5-6 chr20 31704808 31705353 + 1.5 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR -16427 NR_131907 103021294 NR_131907 ENSG00000281376 ABALON INXS apoptotic BCL2L1-antisense long non-coding RNA ncRNA 308.25-29 chr6 64399470 64399785 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 28 of 43) MLT2C1|LTR|ERVL 592791 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 446.5-4 chr3 108489767 108490205 + 1.5 NA intron (NM_014981, intron 10 of 41) intron (NM_014981, intron 10 of 41) 39336 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 357-11 chr20 8970289 8970692 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98564 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 274.5-45 chr3 154046744 154046990 + 1.5 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) intron (NR_037901, intron 2 of 3) -74136 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 278.25-17 chr15 71008633 71008902 + 1.5 NA intron (NM_017691, intron 12 of 15) intron (NM_017691, intron 12 of 15) 116324 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 284.5-6 chr11 10693183 10693509 + 1.5 NA intron (NM_001100163, intron 1 of 20) intron (NM_001100163, intron 1 of 20) 228 NM_001100167 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 216.5-98 chr5 132323630 132323815 + 1.5 NA intron (NM_003059, intron 4 of 9) intron (NM_003059, intron 4 of 9) 29328 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 234.5-61 chr3 75057236 75057614 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -157051 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 249.5-46 chr2 17426207 17426589 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 92042 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 267.75-10 chr12 45793863 45794201 + 1.5 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) intron (NM_152641, intron 3 of 20) 64323 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 278-28 chr5 32303260 32303475 + 1.5 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) intron (NM_001294344, intron 1 of 13) 9572 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 340.5-24 chr5 16390510 16390816 + 1.5 NA intron (NR_104625, intron 7 of 8) intron (NR_104625, intron 7 of 8) 50439 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 274.5-18 chr13 41934999 41935298 + 1.5 NA intron (NM_001009814, intron 2 of 25) intron (NM_001009814, intron 2 of 25) 25937 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 453.75-5 chr2 45522606 45523127 + 1.5 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 88401 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 177.5-183 chr9 73858167 73858301 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -513297 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 308.75-8 chr11 87315017 87315473 + 1.5 NA intron (NR_033149, intron 11 of 13) L1MC5a|LINE|L1 277311 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 236.5-90 chr8 70599836 70600013 + 1.5 NA intron (NM_001317804, intron 3 of 11) intron (NM_001317804, intron 3 of 11) 7745 NM_001317805 23471 Hs.491988 NM_014294 ENSG00000067167 TRAM1 PNAS8|TRAM|TRAMP translocation associated membrane protein 1 protein-coding 350.25-2 chr1 163407963 163408253 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 15083 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 174-26 chr14 87001140 87001263 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 95423 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 278-38 chr8 130889505 130889819 + 1.5 NA intron (NM_001115, intron 7 of 17) intron (NM_001115, intron 7 of 17) 151247 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 163.5-30 chr10 128724249 128724411 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -188503 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 129.5-242 chr9 114757887 114757987 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 34593 NM_001204344 9966 Hs.23349 NM_005118 ENSG00000181634 TNFSF15 TL1|TL1A|TNLG1B|VEGI|VEGI192A TNF superfamily member 15 protein-coding 252.25-43 chr4 62118524 62118803 + 1.5 NA intron (NR_110595, intron 5 of 7) intron (NR_110595, intron 5 of 7) 43102 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 306.5-26 chr3 37124789 37125092 + 1.5 NA intron (NM_001348303, intron 4 of 16) intron (NM_001348303, intron 4 of 16) 49642 NM_006309 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 226.5-22 chr14 71048166 71048466 + 1.5 NA intron (NM_014982, intron 22 of 35) intron (NM_014982, intron 22 of 35) 140857 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 195.75-71 chr22 48050596 48050818 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -223657 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 297-28 chr2 98697200 98697568 + 1.5 NA intron (NM_012214, intron 2 of 15) L1MD2|LINE|L1 33748 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 179-58 chr2 145149326 145149638 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 481515 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 208.5-124 chr6 155073934 155074202 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16221 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 280-19 chr14 56855199 56855557 + 1.5 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 42220 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 281.5-42 chr5 78378787 78379215 + 1.5 NA intron (NM_001290229, intron 1 of 7) intron (NM_001290229, intron 1 of 7) 18384 NM_004866 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 449-2 chr4 87232288 87232860 + 1.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -11956 NM_020803 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 160-8 chr1 222080930 222081251 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -102570 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 123-56 chr14 73040572 73040687 + 1.5 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -13523 NM_021260 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 199.5-20 chr10 106137380 106137631 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -2660 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 444.75-2 chr17 72751400 72751947 + 1.5 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) AluSz6|SINE|Alu -111201 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 352.5-25 chr5 142934179 142934565 + 1.5 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) intron (NR_146198, intron 11 of 22) -65462 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 196.5-5 chr1 95871278 95871475 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -120692 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 254.5-33 chr18 2265778 2266012 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 305610 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 340.25 chr1 42540412 42540889 + 1.5 NA intron (NM_001080850, intron 4 of 16) L1MC4|LINE|L1 7630 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 266.5-57 chr4 121651409 121651710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45421 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 392-3 chr15 58925701 58926117 + 1.5 NA intron (NR_135043, intron 1 of 18) MIRc|SINE|MIR 7770 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 141.75-49 chr13 20768232 20768371 + 1.5 NA intron (NM_001318939, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 5657 NM_174928 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 228-83 chr8 111123200 111123715 + 1.5 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) -96024 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 120-51 chr15 36226398 36226546 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 299616 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 247-54 chr7 10835486 10835868 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55733 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 272.25-28 chr2 83719242 83719543 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 196578 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 167.5-65 chr15 51059973 51060166 + 1.5 NA intron (NM_001311175, intron 1 of 1) intron (NM_001311175, intron 1 of 1) 22581 NR_146310 109729174 NR_146310 ENSG00000259240 MIR4713HG - MIR4713 host gene ncRNA 161.25-25 chr11 79788834 79788976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -347875 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 222-65 chr5 40620440 40620735 + 1.5 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -59328 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 430-10 chr20 52422528 52422880 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -198134 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 186.5-43 chr15 100027516 100027768 + 1.5 NA intron (NM_139057, intron 18 of 21) MER58A|DNA|hAT-Charlie 220619 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 273.5-51 chr3 146065557 146065855 + 1.5 NA TTS (NR_146297) TTS (NR_146297) 3479 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 242.25-13 chr10 65617990 65618185 + 1.5 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) L1PA3|LINE|L1 46662 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 306.75-3 chr10 69151629 69151947 + 1.5 NA intron (NM_001318944, intron 3 of 9) intron (NM_001318944, intron 3 of 9) 27610 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 260.75-68 chr9 86416773 86416967 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62460 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 176.25-102 chr4 102126008 102126143 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 198237 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 370.5-16 chr4 46680099 46680411 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 228990 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 220.75-50 chr3 30075677 30076054 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -141709 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 201-55 chr4 30508543 30508736 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -211730 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 236.25-28 chr15 56847118 56847431 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -70816 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 183.75-85 chr4 73248376 73248600 + 1.5 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 10310 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 241.25-47 chr3 108467066 108467247 + 1.5 NA intron (NM_014981, intron 15 of 41) intron (NM_014981, intron 15 of 41) 62166 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 192.5-63 chr2 16524489 16524831 + 1.5 NA Intergenic MER58D|DNA|hAT-Charlie 141174 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 248.5-70 chr4 40073823 40074213 + 1.5 NA intron (NM_001318359, intron 2 of 18) AluSp|SINE|Alu -16819 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 361-3 chr10 78838592 78838896 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 228704 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 153-126 chr5 169573448 169573553 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10273 NM_001329639 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 425.25-7 chr7 68432681 68433158 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 412666 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 360 chr10 33612322 33612820 + 1.5 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 160109 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 235.5-69 chr5 64630835 64631142 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 55338 NM_001271891 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 238.75-61 chr7 82288714 82289153 + 1.5 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 154844 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 352.5-11 chr2 152654892 152655197 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001365597, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001365597, exon 26 of 26) 62417 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 181.5-97 chr21 19637839 19638000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 261836 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 207.5-19 chr13 72382301 72382485 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 345236 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 289-15 chr15 59964158 59964380 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -40042 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 222.25-88 chr8 81052998 81053263 + 1.5 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 58938 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 307.5-40 chr4 31079326 31079682 + 1.5 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 -91640 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 282.5-9 chr10 52135838 52136057 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 8 of 17) intron (NM_001098512, intron 8 of 17) 178181 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 221-14 chr11 100815748 100816019 + 1.5 NA intron (NM_152432, intron 3 of 23) L1MB2|LINE|L1 -118391 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 160.5-187 chr8 73505699 73505851 + 1.5 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 85701 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 174-87 chr7 264127 264337 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 71661 NM_020223 56975 Hs.134742 NM_020223 ENSG00000177706 FAM20C DMP-4|DMP4|G-CK|GEF-CK|RNS FAM20C golgi associated secretory pathway kinase protein-coding 208.5-2 chr1 18970528 18970784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13980 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 177-84 chr5 171923491 171923627 + 1.5 NA intron (NM_033644, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 83314 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 378.5-13 chr4 99987318 99987722 + 1.5 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) intron (NR_125923, intron 1 of 3) 37026 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 152.75-42 chr12 19600667 19600821 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 160145 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 414.75-8 chr6 41380558 41381108 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 45225 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 261.25 chr1 9473691 9474089 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -44894 NR_104622 100506022 Hs.131775 NR_104622 ENSG00000284693 LINC02606 - long intergenic non-protein coding RNA 2606 ncRNA 259.75-25 chr2 13353569 13353877 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -346710 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 367.25 chr1 32477276 32477736 + 1.5 NA intron (NM_001145720, intron 2 of 3) intron (NM_001145720, intron 2 of 3) 12434 NM_001145720 728116 Hs.647658 NM_001145720 ENSG00000273274 ZBTB8B ZNF916B zinc finger and BTB domain containing 8B protein-coding 196.5-173 chr9 28118562 28118795 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -544812 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 210.75-58 chr3 60833259 60833533 + 1.5 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) HAL1|LINE|L1 -215526 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 463.75-6 chr6 55146249 55146612 + 1.5 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) intron (NM_001526, intron 1 of 7) 39970 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 201-8 chr1 207007628 207007789 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25048 NM_023938 79098 Hs.32417 NM_023938 ENSG00000182795 C1orf116 SARG chromosome 1 open reading frame 116 protein-coding 306-38 chr8 104683824 104684193 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -94984 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 153-98 chr3 114412840 114413033 + 1.5 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -29294 NM_001164342 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 235.5-64 chr5 20171972 20172152 + 1.5 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1PREC2|LINE|L1 -133489 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 175.25-75 chr2 149928941 149929173 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -69866 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 287.5-45 chr4 73416978 73417230 + 1.5 NA intron (NM_000477, intron 10 of 14) intron (NM_000477, intron 10 of 14) 12817 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 231.75-75 chr8 126028519 126028776 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -77450 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 383.5-14 chr8 98629625 98630058 + 1.5 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) MER74A|LTR|ERVL 195830 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 232.25-66 chr6 35594933 35595278 + 1.5 NA intron (NM_001145775, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR 69684 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 328-7 chr14 55311149 55311418 + 1.5 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 39129 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 229.25-19 chr12 54510773 54511045 + 1.5 NA intron (NM_001184976, intron 7 of 30) AluJb|SINE|Alu 12131 NM_001184976 3071 Hs.182014 NM_005337 ENSG00000123338 NCKAP1L HEM1 NCK associated protein 1 like protein-coding 353.25-13 chr20 48557580 48557989 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197873 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 250.5-90 chr7 91862605 91862888 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 17956 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 227-9 chr11 100070692 100070928 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 10 of 23) intron (NM_001243270, intron 10 of 23) 514665 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 172.5-170 chr6 75877954 75878125 + 1.5 NA intron (NM_001300899, intron 20 of 32) intron (NM_001300899, intron 20 of 32) 128800 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 331.25-23 chr8 112077340 112077710 + 1.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -565968 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 274.25-19 chr14 31802690 31803124 + 1.5 NA intron (NM_001201573, intron 5 of 8) intron (NM_001201573, intron 5 of 8) 88338 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 132.75-4 chr1 31085365 31085521 + 1.5 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -19726 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 237.75-28 chr17 60863834 60864067 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) LTR73|LTR|ERV1 186099 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 260.75-54 chr6 25998972 25999310 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 18671 NM_005325 3024 Hs.150206 NM_005325 ENSG00000124610 HIST1H1A H1.1|H1A|H1F1|HIST1 histone cluster 1 H1 family member a protein-coding 295.5-33 chr20 24705496 24705870 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 235722 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 248-39 chr2 214262845 214263064 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) L1MA9|LINE|L1 -148100 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 267.75-23 chr17 73781908 73782159 + 1.5 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) intron (NR_027146, intron 2 of 3) -4789 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 236.25-76 chr6 46261985 46262286 + 1.5 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 -14189 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 271.5-56 chr3 102554857 102555132 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 119979 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 304-21 chr2 27671692 27672140 + 1.5 NA intron (NM_018158, intron 5 of 13) HAL1|LINE|L1 -8076 NM_001282731 9913 Hs.6232 NM_014860 ENSG00000119760 SUPT7L SPT7L|STAF65|STAF65(gamma)|STAF65G|SUPT7H SPT7 like, STAGA complex gamma subunit protein-coding 354-23 chr5 5762436 5762743 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 339912 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 269.5-50 chr6 132487507 132487785 + 1.5 NA intron (NM_001326579, intron 2 of 9) L1PA8|LINE|L1 25137 NM_001326578 8417 Hs.593148 NM_003569 ENSG00000079950 STX7 - syntaxin 7 protein-coding 435-9 chr8 84721224 84721660 + 1.5 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 15515 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 299-39 chrX 151846400 151846815 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 64476 NR_136578 105373368 Hs.256904 NR_136578 MAGEA4-AS1 - MAGEA4 antisense RNA 1 ncRNA 150.5-36 chr12 11622287 11622463 + 1.5 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -27479 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 550.5 chr10 77043958 77044716 + 1.5 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) intron (NM_001271519, intron 14 of 28) -96494 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 502-2 chr8 57842507 57843071 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 96640 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 259.5-37 chr15 64304773 64305004 + 1.5 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) intron (NM_001329606, intron 1 of 11) 51285 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 234.25-29 chr18 46611672 46611872 + 1.5 NA intron (NM_144612, intron 5 of 39) L1ME3Cz|LINE|L1 45261 NM_144612 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 139-46 chr15 70898828 70899091 + 1.5 NA intron (NM_001199018, intron 4 of 16) intron (NM_001199018, intron 4 of 16) 6516 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 211.5-154 chr8 51645208 51645454 + 1.5 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) MLT2B1|LTR|ERVL 164114 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 146-74 chr2 181253065 181253201 + 1.5 NA intron (NR_130784, intron 2 of 4) intron (NR_130784, intron 2 of 4) 52519 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 240-69 chr9 136765415 136765599 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_203347) promoter-TSS (NM_203347) -989 NM_203347 389812 Hs.413902 NM_203347 ENSG00000177984 LCN15 PRO6093|UNQ2541 lipocalin 15 protein-coding 288-10 chr10 85804020 85804380 + 1.5 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1ME2|LINE|L1 226469 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 261.75-7 chr11 99668220 99668470 + 1.5 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 112200 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 209-24 chr15 33662010 33662301 + 1.5 NA exon (NM_001036, exon 35 of 104) exon (NM_001036, exon 35 of 104) -306342 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 291-16 chr16 8541897 8542101 + 1.5 NA intron (NM_001290098, intron 2 of 2) intron (NM_001290098, intron 2 of 2) 47839 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 311.25-34 chr9 97552478 97552896 + 1.5 NA intron (NM_001166116, intron 3 of 9) L1ME4a|LINE|L1 51021 NM_003275 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 168-131 chr9 13452791 13452944 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21538 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 216.5-99 chr6 41577514 41577693 + 1.5 NA intron (NM_001012427, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR -21120 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 179.25-76 chr2 59609448 59609625 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 391828 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 301-9 chr18 7851073 7851394 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) L1MEg|LINE|L1 283917 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 263.75-46 chr6 146137739 146137965 + 1.5 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) L1MA3|LINE|L1 108654 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 387-5 chr14 62352370 62352758 + 1.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -212591 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 302-24 chr5 10691069 10691390 + 1.5 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 70005 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 366.5-20 chr9 5932496 5932828 + 1.5 NA intron (NM_001017969, intron 5 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 41773 NM_005511 2315 Hs.154069 NM_005511 ENSG00000120215 MLANA MART-1|MART1 melan-A protein-coding 164.75-157 chr9 129921452 129921760 + 1.5 NA intron (NM_001363755, intron 10 of 15) AluSx1|SINE|Alu 52001 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 311.25-5 chr11 99760633 99760920 + 1.5 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 204631 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 141-43 chr14 40128446 40128577 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -696011 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 309.5-15 chr14 63240333 63240715 + 1.5 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 36081 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 120-140 chr5 12337123 12337289 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -237651 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 258.25-65 chrX 152217677 152218077 + 1.5 NA intron (NM_000808, intron 6 of 9) L1M4|LINE|L1 -79299 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 255.75-3 chr1 221981780 221982092 + 1.5 NA intron (NR_149071, intron 1 of 2) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie -3416 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 228-4 chr1 150330549 150330807 + 1.5 NA intron (NM_004698, intron 4 of 15) intron (NM_004698, intron 4 of 15) 9145 NM_004698 9129 Hs.11776 NM_004698 ENSG00000117360 PRPF3 HPRP3|HPRP3P|PRP3|Prp3p|RP18|SNRNP90 pre-mRNA processing factor 3 protein-coding 239.5-15 chr11 74173590 74173872 + 1.5 NA intron (NM_001271593, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 2442 NM_016147 51400 Hs.503251 NM_016147 ENSG00000214517 PPME1 ABDH19|PME-1 protein phosphatase methylesterase 1 protein-coding 349.25-8 chr21 30059313 30059790 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 107254 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 198.75-94 chr7 109090904 109091106 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -206418 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 336-18 chr4 156014284 156014691 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -60621 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 179-13 chr10 30157505 30157697 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -42107 NM_001350021 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 210-40 chr17 71457982 71458143 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -255883 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 200.75-19 chr11 88354309 88354634 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16735 NM_001114173 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 148.25-127 chr5 106833300 106833487 + 1.5 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 177621 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 207.25-53 chr21 46355120 46355480 + 1.5 NA intron (NM_001315529, intron 11 of 46) intron (NM_001315529, intron 11 of 46) 30633 NM_001315529 5116 Hs.474069 NM_006031 ENSG00000160299 PCNT KEN|MOPD2|PCN|PCNT2|PCNTB|PCTN2|SCKL4 pericentrin protein-coding 271.25-43 chr8 141927007 141927370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -140875 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 265.5-61 chr8 23095868 23096111 + 1.5 NA intron (NR_046173, intron 2 of 3) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -6825 NM_003841 8794 Hs.655801 NM_003841 ENSG00000173535 TNFRSF10C CD263|DCR1|DCR1-TNFR|LIT|TRAIL-R3|TRAILR3|TRID TNF receptor superfamily member 10c protein-coding 188.5-86 chr2 225997370 225997570 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -145324 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 166.5-2 chr1 8759442 8759621 + 1.5 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) intron (NM_001042681, intron 1 of 22) 58109 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 217-27 chr17 75906005 75906204 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1004 NM_032478 64978 Hs.442609 NM_032478 ENSG00000204316 MRPL38 HSPC262|L38MT|MRP-L3|MRP-L38|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L38 protein-coding 482 chr12 126598293 126599039 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91652 NR_110034 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 300-26 chr3 141262965 141263333 + 1.5 NA intron (NM_001282728, intron 3 of 6) intron (NM_001282728, intron 3 of 6) 31324 NM_152282 92370 Hs.657887 NM_152282 ENSG00000155893 PXYLP1 ACPL2|HEL124|XYLP 2-phosphoxylose phosphatase 1 protein-coding 254.5-7 chr1 107176971 107177281 + 1.5 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 29057 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 129.5-230 chr8 121497484 121497741 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -141734 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 178-56 chr22 20929980 20930217 + 1.5 NA intron (NR_156180, intron 1 of 3) intron (NR_156180, intron 1 of 3) 12691 NR_156180 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 363.5-25 chr9 18584429 18584747 + 1.5 NA intron (NM_052866, intron 4 of 12) MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 11282 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 251-50 chr7 6443839 6444134 + 1.5 NA intron (NM_001142936, intron 2 of 12) intron (NM_001142936, intron 2 of 12) 3968 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 198-15 chr11 29234683 29234858 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -359643 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 214-44 chr3 120871583 120871776 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -35322 NR_135570 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 283.25-24 chr22 28633154 28633630 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 46473 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 297.5-15 chr13 91258484 91258782 + 1.5 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -46935 NR_047004 100874150 Hs.711947 NR_047004 LINC00379 - long intergenic non-protein coding RNA 379 ncRNA 252.75-15 chr12 118817866 118818192 + 1.5 NA TTS (NR_134997) TTS (NR_134997) 15507 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 362 chr10 33799183 33799553 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26688 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 151.5-84 chr2 85369955 85370071 + 1.5 NA intron (NR_138132, intron 8 of 12) intron (NR_138132, intron 8 of 12) 15244 NM_001329792 84173 Hs.269990 NM_032213 ENSG00000115459 ELMOD3 DFNB88|LST3|RBED1|RBM29 ELMO domain containing 3 protein-coding 260-3 chr1 183156229 183156525 + 1.5 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -15107 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 274.5-54 chr5 87582160 87582576 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79674 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 355-14 chr5 164976017 164976443 + 1.5 NA Intergenic MER61D|LTR|ERV1 505951 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 226.5-48 chr2 139100914 139101178 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 203722 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 486-2 chr14 33775225 33775650 + 1.5 NA intron (NM_001165893, intron 7 of 10) intron (NM_001165893, intron 7 of 10) 66500 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 217.5-27 chr11 116002049 116002365 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -242007 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 140-51 chr16 7602587 7602684 + 1.5 NA intron (NM_145893, intron 6 of 13) intron (NM_145893, intron 6 of 13) 269790 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 142.5-63 chr14 56199860 56200045 + 1.5 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 81541 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 240-55 chr7 23649082 23649397 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30960 NM_199136 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 517.5-3 chr8 88889571 88890113 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -562359 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 142.5-103 chr2 35076506 35076666 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -394819 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 234-6 chr10 94581489 94581773 + 1.5 NA intron (NM_001289068, intron 11 of 21) intron (NM_001289068, intron 11 of 21) 35843 NM_001289074 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 291-33 chr8 95916873 95917120 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 31352 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 239-22 chr16 11283627 11283898 + 1.5 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -2432 NM_002761 5619 Hs.2909 NM_002761 ENSG00000175646 PRM1 CT94.1|P1 protamine 1 protein-coding 115-40 chr12 40678334 40678414 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -14065 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 381-13 chr21 23171686 23172133 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 92625 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 249 chr1 216480411 216480665 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -57090 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 217.75-7 chr1 147798729 147798994 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25499 NM_005266 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 232.5-96 chr7 56072896 56073060 + 1.5 NA intron (NM_001042468, intron 2 of 8) intron (NM_001042468, intron 2 of 8) 8692 NM_001130069 25870 Hs.279696 NM_015411 ENSG00000129103 SUMF2 pFGE sulfatase modifying factor 2 protein-coding 276-11 chr11 26401956 26402165 + 1.5 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) L1PA13|LINE|L1 69930 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 340.75-8 chr12 38702111 38702541 + 1.5 NA intron (NM_153634, intron 14 of 19) intron (NM_153634, intron 14 of 19) 203265 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 150-69 chr2 38417855 38418005 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13364 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 255.5-22 chr13 74704721 74705049 + 1.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 152042 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 434-4 chr3 183746296 183746659 + 1.5 NA intron (NM_001351371, intron 8 of 21) L3|LINE|CR1 36238 NM_001351369 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 271.5-87 chr8 117095070 117095264 + 1.5 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MER52A|LTR|ERV1 -39828 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 357.5-4 chr13 62204664 62204996 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7452 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 267.5-73 chr7 113057700 113057922 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28527 NM_001146266 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 483.75-2 chr6 143125156 143125697 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001366358) promoter-TSS (NM_001366358) -713 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 357-13 chr3 136536085 136536477 + 1.5 NA intron (NM_005862, intron 6 of 33) intron (NM_005862, intron 6 of 33) 216097 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 325.5-15 chr19 44105126 44105526 + 1.5 NA TTS (NR_033341) TTS (NR_033341) 7857 NR_033341 100379224 Hs.585869 NR_033341 ENSG00000186019 LOC100379224 - uncharacterized LOC100379224 ncRNA 334.5-28 chr6 142226630 142226890 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -75159 NM_001032395 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 269.5-24 chr18 39609170 39609458 + 1.5 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 12861 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 239-18 chr14 71445601 71445902 + 1.5 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) intron (NM_001284247, intron 1 of 23) 6812 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 310-24 chr6 166036538 166036759 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48609 NR_026860 90632 Hs.31917 NR_026860 ENSG00000112541 LINC00473 C6orf176|LNC473|bA142J11.1 long intergenic non-protein coding RNA 473 ncRNA 398.75 chr1 225283809 225284364 + 1.5 NA intron (NM_001367479, intron 54 of 85) L1MD3|LINE|L1 143952 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 151.75-63 chr2 49278205 49278425 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -123788 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 202.5-90 chr3 6284575 6284823 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 520750 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 276.75-7 chr12 47240979 47241188 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -24640 NR_026544 100233209 Hs.657722 NR_026544 ENSG00000247774 PCED1B-AS1 - PCED1B antisense RNA 1 ncRNA 172.5-106 chr2 215276570 215276738 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35405 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 235-54 chr4 162430462 162430720 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -266557 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 264.5-27 chr17 70850884 70851146 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 351164 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 216-11 chr12 55223697 55223972 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 2809 NM_001005280 121364 Hs.554557 NM_001005280 ENSG00000179919 OR10A7 OR12-6 olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 protein-coding 245.5-40 chr2 234695850 234696108 + 1.5 NA intron (NR_132376, intron 2 of 2) L1MC5|LINE|L1 13311 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 387.5-4 chr12 43127048 43127495 + 1.5 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -28044 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 242.25-62 chr3 189377828 189378110 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -137375 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 343-4 chr12 45764460 45764910 + 1.5 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) L1ME1|LINE|L1 34976 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 178-29 chr14 54599617 54599830 + 1.5 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 32111 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 266-45 chr7 51482285 51482617 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -89195 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 227.5-43 chr17 30274227 30274502 + 1.5 NA intron (NM_000386, intron 6 of 11) intron (NM_000386, intron 6 of 11) 17580 NM_000386 642 Hs.371914 NM_000386 ENSG00000108578 BLMH BH|BMH bleomycin hydrolase protein-coding 307.25-34 chr8 58629595 58630116 + 1.5 NA intron (NM_001144772, intron 6 of 30) intron (NM_001144772, intron 6 of 30) 29552 NM_001144772 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 437.75-4 chr18 1698194 1698671 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -338803 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 271-40 chr5 54660023 54660614 + 1.5 NA non-coding (NR_104659, exon 3 of 3) non-coding (NR_104659, exon 3 of 3) 43006 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 446 chr1 191441409 191441833 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -213123 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 156-5 chr1 113375489 113375620 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14961 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 230-48 chr5 40345465 40345790 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 293336 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 251.5-93 chrX 83679401 83679597 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 171209 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 361.5-9 chr16 7964579 7964937 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 625080 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 350.5-16 chr20 20027149 20027571 + 1.5 NA intron (NM_181528, intron 4 of 4) MER119|DNA|hAT-Charlie 9565 NM_181527 51126 Hs.368783 NM_016100 ENSG00000173418 NAA20 NAT3|NAT3P|NAT5|NAT5P|dJ1002M8.1 N(alpha)-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit protein-coding 162-113 chr8 48204297 48204408 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 195921 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 123.75-175 chr7 49470907 49471062 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -302654 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 243-16 chr12 17864584 17864914 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 191450 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 247.25-22 chr16 62830940 62831214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -794639 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 253.5-16 chr11 106540962 106541255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 289701 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 271.5-62 chr4 74823324 74823660 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -28969 NM_001316963 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 283-48 chr9 32177150 32177450 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -207303 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 143-106 chr4 72890273 72890396 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 179382 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 187.25-93 chr6 64234244 64234483 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 427527 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 229.5-109 chr5 121262142 121262313 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -60323 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 366.5-23 chr9 104044044 104044473 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 44549 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 286-19 chr2 35462708 35463207 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8448 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 273-18 chr13 86834025 86834299 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -77758 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 324-8 chr12 29815893 29816238 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31306 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 216.5-105 chr7 2759490 2759688 + 1.5 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) intron (NM_007353, intron 2 of 3) 3551 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 181-27 chr14 47867594 47867780 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -72673 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 180.5-28 chr12 62257974 62258117 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2295 NM_001351162 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 157.25-25 chr11 54979436 54979634 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 272703 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 265-38 chr7 132428874 132429258 + 1.5 NA intron (NM_001105543, intron 3 of 3) intron (NM_001105543, intron 3 of 3) 147404 NM_001105543 91584 Hs.511454 NM_020911 ENSG00000221866 PLXNA4 FAYV2820|PLEXA4|PLXNA4A|PLXNA4B|PRO34003 plexin A4 protein-coding 250.5-47 chr2 81727757 81728040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -260952 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 304.75-10 chr14 29320111 29320397 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -534467 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 324.5-18 chr21 15241879 15242224 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -177051 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 174.75-6 chr1 164336227 164336418 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -223038 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 278.5-43 chr5 131918973 131919390 + 1.5 NA intron (NM_001303622, intron 6 of 12) L1MC4a|LINE|L1 26482 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 309.75-38 chr8 127895958 127896302 + 1.5 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 52593 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 253.5-9 chr10 64430047 64430244 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -395383 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 144-118 chr7 27970442 27970590 + 1.5 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -209941 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 234.5-37 chr19 3866548 3866778 + 1.5 NA intron (NR_027149, intron 1 of 2) intron (NR_027149, intron 1 of 2) 2375 NM_015174 23217 Hs.65750 NM_015174 ENSG00000105278 ZFR2 KIAA1086 zinc finger RNA binding protein 2 protein-coding 248-48 chr3 88644765 88645017 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 306435 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 196.5-179 chrX 98224103 98224357 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -659695 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 281.75-27 chr2 187795312 187795576 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -240939 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 234.75-80 chr7 136149127 136149329 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -171869 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 248.75-32 chr2 157078437 157078646 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -179164 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 230-61 chr7 106098837 106099325 + 1.5 NA intron (NM_182715, intron 2 of 4) intron (NM_182715, intron 2 of 4) 13231 NM_182715 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 389-18 chr7 8079759 8080083 + 1.5 NA intron (NM_138426, intron 6 of 7) intron (NM_138426, intron 6 of 7) 111125 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 345.5-26 chr5 147898755 147899175 + 1.5 NA intron (NM_206966, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 7573 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 240.5-31 chr14 69274980 69275221 + 1.5 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) intron (NM_020692, intron 1 of 15) 14942 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 226.5-101 chr8 90922167 90922427 + 1.5 NA intron (NM_022351, intron 6 of 12) intron (NM_022351, intron 6 of 12) 62780 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 235.5-91 chr8 130269603 130269824 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 26820 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 186-88 chr7 81165571 81165798 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -243295 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 242.25-21 chr12 29453120 29453509 + 1.5 NA intron (NM_001353179, intron 21 of 25) L2c|LINE|L2 46379 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 256.5 chr1 5776730 5776929 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 85912 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 441-2 chr1 229914025 229914566 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -20387 NR_146475 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 190-28 chr2 32409640 32409850 + 1.5 NA intron (NM_016252, intron 9 of 73) intron (NM_016252, intron 9 of 73) 52717 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 419.25 chr1 93222287 93222730 + 1.5 NA intron (NM_001306076, intron 16 of 28) intron (NM_001306076, intron 16 of 28) 41792 NM_206886 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 165.5-178 chr7 37819257 37819453 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -29242 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 228-37 chr18 66059279 66059475 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 308365 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 229.5-4 chr1 61243625 61243792 + 1.5 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 9810 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 251.5-74 chr6 117570498 117570680 + 1.5 NA TTS (NM_173674) TTS (NM_173674) 31922 NM_001017408 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 253-49 chr6 131028082 131028404 + 1.5 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) -14634 NM_001350309 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 189.25-47 chr17 60263925 60264220 + 1.5 NA intron (NM_032582, intron 9 of 33) intron (NM_032582, intron 9 of 33) -32427 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 158-120 chr6 36715114 36715321 + 1.5 NA intron (NM_001257357, intron 3 of 13) intron (NM_001257357, intron 3 of 13) 17391 NM_001257357 401258 Hs.485258 NM_207498 ENSG00000255587 RAB44 RASD3|RASL13|dJ431A14.3 RAB44, member RAS oncogene family protein-coding 305.5-25 chr2 179806930 179807257 + 1.5 NA intron (NR_148056, intron 1 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 53815 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 321.5-11 chr18 74242389 74242733 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49402 NM_001914 1528 Hs.465413 NM_001914 ENSG00000166347 CYB5A CYB5|MCB5|METAG cytochrome b5 type A protein-coding 188.5-7 chr1 118488260 118488414 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -303109 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 298.75 chr1 23373710 23374008 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4023 NM_001370652 80818 Hs.293798 NM_030634 ENSG00000125945 ZNF436 ZNF|Zfp46 zinc finger protein 436 protein-coding 322.5-20 chr3 176885732 176886147 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -68938 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 330-9 chr14 65514724 65515030 + 1.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 43775 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 248-57 chr4 138788984 138789244 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 223532 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 312.5-42 chr9 32909130 32909447 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 92288 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 288.25-24 chr7 4369109 4369336 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -234385 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 237-4 chr1 152419163 152419403 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5020 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 317.5-21 chr22 50426763 50427041 + 1.5 NA intron (NM_001242899, intron 10 of 22) L1MB4|LINE|L1 19460 NR_162128 113218480 NR_162128 MIR12114 - microRNA 12114 ncRNA 293.25-9 chr17 66591394 66591713 + 1.5 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -174699 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 373.5-18 chr6 64493989 64494445 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) L2|LINE|L2 687381 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 207-40 chr19 41337653 41337947 + 1.5 NA intron (NM_000660, intron 5 of 6) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 16122 NM_000660 7040 Hs.645227 NM_000660 ENSG00000105329 TGFB1 CED|DPD1|IBDIMDE|LAP|TGFB|TGFbeta transforming growth factor beta 1 protein-coding 196-26 chr14 50207011 50207255 + 1.5 NA intron (NM_006939, intron 1 of 22) L1ME3B|LINE|L1 24445 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 142.5-4 chr1 25714537 25714642 + 1.5 NA intron (NM_020379, intron 2 of 11) intron (NM_020379, intron 2 of 11) -85604 NM_020451 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 147.75-18 chr10 93946402 93946558 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15435 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 277.5-16 chr12 23579441 23579770 + 1.5 NA intron (NM_152989, intron 12 of 17) intron (NM_152989, intron 12 of 17) 4981 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 187.75-53 chr2 167453609 167453866 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 266365 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 429-4 chr5 58231852 58232299 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109734 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 213.25-55 chr5 136884975 136885262 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -243079 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 297-29 chr2 124723086 124723454 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 697983 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 297.5-54 chr8 103396863 103397216 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 18068 NM_030780 81034 Hs.532265 NM_030780 ENSG00000164933 SLC25A32 MFT|MFTC|RREI solute carrier family 25 member 32 protein-coding 308-3 chr1 182991879 182992290 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -31336 NM_002293 3915 Hs.609663 NM_002293 ENSG00000135862 LAMC1 LAMB2 laminin subunit gamma 1 protein-coding 231.5-78 chr5 19043384 19043733 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 842714 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 341-24 chr7 99339196 99339556 + 1.5 NA intron (NM_006409, intron 3 of 9) AluJo|SINE|Alu 13478 NM_006409 10552 Hs.124126 NM_006409 ENSG00000241685 ARPC1A Arc40|HEL-68|HEL-S-307|SOP2Hs|SOP2L actin related protein 2/3 complex subunit 1A protein-coding 324-6 chr11 68887743 68888027 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 15947 NM_181514 219927 Hs.503047 NM_181512 ENSG00000197345 MRPL21 L21mt|MRP-L21 mitochondrial ribosomal protein L21 protein-coding 363-14 chr4 63965530 63965976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 443697 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 255.75-2 chr1 176929072 176929407 + 1.5 NA intron (NM_207108, intron 16 of 21) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 100206 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 310-5 chr12 129300607 129300911 + 1.5 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) intron (NM_133448, intron 4 of 8) 92158 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 397-7 chr2 236882127 236882518 + 1.5 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 173845 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 189.5-80 chr20 38203026 38203214 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -36612 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 359.75-17 chr4 32404786 32405298 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54004 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 247-51 chr5 178436082 178436251 + 1.5 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) intron (NM_173465, intron 2 of 28) 154227 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 163-32 chr13 20191878 20192026 + 1.5 NA intron (NM_004004, intron 1 of 1) intron (NM_004004, intron 1 of 1) 986 NM_004004 2706 Hs.524894 NM_004004 ENSG00000165474 GJB2 CX26|DFNA3|DFNA3A|DFNB1|DFNB1A|HID|KID|NSRD1|PPK gap junction protein beta 2 protein-coding 243-55 chr4 115928052 115928255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -371572 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 305-31 chr5 124991430 124991730 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -45251 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 303.25-18 chr2 103076915 103077288 + 1.5 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -92672 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 252.5-46 chr2 223456195 223456408 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 146060 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 151.5-152 chr5 84226736 84226878 + 1.5 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) intron (NM_001278642, intron 2 of 9) 158060 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 188.5-146 chr8 59809982 59810147 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 471336 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 301.5-30 chr20 8610031 8610301 + 1.5 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -221019 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 353.25-25 chr9 11356234 11356673 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 743247 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 171.75-59 chr17 42710390 42710583 + 1.5 NA intron (NM_001321079, intron 11 of 19) intron (NM_001321079, intron 11 of 19) -2335 NR_106838 102466195 NR_106838 ENSG00000275273 MIR6780A hsa-mir-6780a microRNA 6780a ncRNA 183-71 chr3 105899231 105899469 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -29949 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 541.5-4 chr2 210454790 210455254 + 1.5 NA intron (NR_110605, intron 3 of 5) intron (NR_110605, intron 3 of 5) 21683 NM_001136574 10314 Hs.13351 NM_006055 ENSG00000115365 LANCL1 GPR69A|p40 LanC like 1 protein-coding 242-62 chr8 75389925 75390094 + 1.5 NA Intergenic (ATAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17640 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 333.75-26 chr7 110166047 110166347 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -205984 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 341.5-8 chr15 94217237 94217488 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -80839 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 475.75-3 chr7 84638676 84639335 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 106529 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 216.5-96 chr5 120769698 120769949 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 238359 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 282.5-54 chr5 173092967 173093211 + 1.5 NA TTS (NM_001168393) TTS (NM_001168393) 36737 NM_001168394 153222 Hs.484195 NM_153607 ENSG00000164463 CREBRF C5orf41|LRF CREB3 regulatory factor protein-coding 291-4 chr10 35526363 35526713 + 1.5 NA intron (NM_181698, intron 7 of 11) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -78803 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 186-95 chr9 104533678 104533911 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 3019 NM_001001961 138803 Hs.553600 NM_001001961 ENSG00000204246 OR13C3 OR37G|OR9-8 olfactory receptor family 13 subfamily C member 3 protein-coding 194.25-83 chr4 110092905 110093059 + 1.5 NA intron (NM_001130721, intron 3 of 4) intron (NM_001130721, intron 3 of 4) 105633 NM_024090 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 245.5-70 chr6 120856067 120856304 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 478295 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 244-62 chr9 132737041 132737255 + 1.5 NA intron (NM_001317959, intron 13 of 14) L1MB3|LINE|L1 66684 NM_012204 9329 Hs.22302 NM_012204 ENSG00000125484 GTF3C4 KAT12|TF3C-delta|TFIII90|TFIIIC290|TFIIIC90|TFIIICDELTA general transcription factor IIIC subunit 4 protein-coding 207.5-45 chr19 31884498 31884706 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -141260 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 361.25-6 chr2 76375195 76375631 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -610552 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 230-63 chr8 15025805 15025980 + 1.5 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) -172382 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 507.5 chr2 174461103 174461713 + 1.5 NA exon (NM_152529, exon 9 of 16) exon (NM_152529, exon 9 of 16) 25621 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 220.5-42 chr2 39460779 39460959 + 1.5 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) L1ME3A|LINE|L1 23453 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 274-5 chr10 67474561 67474791 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1ME1|LINE|L1 -71266 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 215.5-64 chr3 2801606 2801836 + 1.5 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) intron (NM_175607, intron 6 of 24) -90494 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 204.75-20 chr10 107424198 107424451 + 1.5 NA Intergenic MER68B|LTR|ERVL -259618 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 252.75-70 chr7 120806505 120806701 + 1.5 NA exon (NM_012338, exon 7 of 8) exon (NM_012338, exon 7 of 8) 51541 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 170.25-161 chr9 78113851 78114011 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -82120 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 396-13 chr8 123456278 123456584 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39657 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 147.25-78 chr3 36788631 36788781 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 33794 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 240-12 chr11 7290266 7290621 + 1.5 NA intron (NM_175733, intron 1 of 6) intron (NM_175733, intron 1 of 6) 38539 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 158.5-187 chr8 61570455 61570641 + 1.5 NA intron (NM_004318, intron 16 of 24) intron (NM_004318, intron 16 of 24) 119263 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 257.25-24 chr2 146525502 146525726 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -61443 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 234.75-47 chr3 25552625 25552869 + 1.5 NA intron (NR_110892, intron 3 of 6) L1MC5|LINE|L1 94437 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 181-13 chr11 13501385 13501598 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5316 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 311-7 chr11 95429395 95429758 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -197101 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 129.75-105 chr2 229893269 229893406 + 1.5 NA intron (NM_001348335, intron 1 of 5) L1ME2z|LINE|L1 28342 NM_001348334 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 259.25-3 chr1 115605184 115605392 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -36682 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 337.75-12 chr2 103070170 103070485 + 1.5 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -85898 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 434.5-6 chr16 73983503 73984094 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 231723 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 231-11 chr11 21859892 21860185 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -333047 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 433-11 chr8 134121021 134121444 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 234736 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 314.75-19 chr8 86475771 86476304 + 1.5 NA intron (NM_001286719, intron 7 of 8) L2a|LINE|L2 32649 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 132.5-83 chr16 8360805 8360949 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 228961 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 227-59 chr6 119850896 119851206 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -164128 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 205.5-116 chr5 68471267 68471518 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 178815 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 272.5-20 chr12 50445431 50445774 + 1.5 NA intron (NM_001352308, intron 8 of 14) L1MEf|LINE|L1 -10969 NR_132753 106633800 NR_132753 SNORD133 ZL142|ZL42|ggn68 small nucleolar RNA, C/D box 133 snoRNA 293.5-44 chr9 124952891 124953328 + 1.5 NA intron (NM_173690, intron 18 of 18) MADE2|DNA|TcMar-Mariner -12026 NM_002077 2800 Hs.59504 NM_002077 ENSG00000136935 GOLGA1 golgin-97 golgin A1 protein-coding 243.75-43 chr2 213685534 213685799 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) L2b|LINE|L2 -72401 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 280.5-44 chr6 20805952 20806266 + 1.5 NA intron (NM_017774, intron 8 of 15) L1PA15|LINE|L1 271652 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 338.5-37 chr9 37683135 37683384 + 1.5 NA intron (NM_001371223, intron 1 of 15) intron (NM_001371223, intron 1 of 15) 15250 NM_001371223 214-25 chr17 29948550 29948797 + 1.5 NA intron (NR_026738, intron 3 of 15) intron (NR_026738, intron 3 of 15) 7039 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 240.75-11 chr10 89167073 89167550 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 40006 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 238.5-72 chr5 121233193 121233604 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -89152 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 280.5-9 chr10 101493640 101493951 + 1.5 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) intron (NM_001256856, intron 3 of 13) 94462 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 268.75-28 chr4 30814792 30815139 + 1.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 94596 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 332.25-28 chr5 31567344 31567691 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 35216 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 143-83 chr20 56235603 56235714 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13074 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 307.5-48 chr8 137960446 137960816 + 1.5 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 122914 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 176.25-120 chr6 55750810 55751013 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 124679 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 262.5-73 chr8 92727757 92728018 + 1.5 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 58173 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 295.75-32 chr9 84625303 84625628 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -42993 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 424.5-4 chr11 108094233 108094536 + 1.5 NA intron (NM_003478, intron 13 of 18) intron (NM_003478, intron 13 of 18) -27183 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 158.25-58 chr2 59485113 59485290 + 1.5 NA Intergenic (TTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 267493 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 189-87 chr4 163727024 163727238 + 1.5 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) L1MC1|LINE|L1 -113597 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 118.5-212 chr8 49764687 49764823 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -145041 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 256.5-8 chr10 63965975 63966179 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -444187 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 282.5-56 chr6 71480327 71480625 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 59449 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 342.5 chr1 68140020 68140440 + 1.5 NA intron (NR_040077, intron 9 of 9) MIR|SINE|MIR 43380 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 373.5-22 chr9 92851395 92851735 + 1.5 NA intron (NM_001354537, intron 4 of 4) MER58B|DNA|hAT-Charlie 26403 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 220.5-111 chr6 148034130 148034329 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -238099 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 258.5-66 chr6 139070291 139070594 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 41697 NM_021243 58527 Hs.600861 NM_021243 ENSG00000146386 ABRACL C6orf115|Costars|HSPC280|PRO2013 ABRA C-terminal like protein-coding 379.25-14 chr5 134360626 134361183 + 1.5 NA intron (NM_001300853, intron 1 of 12) intron (NM_001300853, intron 1 of 12) 6170 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 214.5-86 chr4 23302002 23302194 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 579194 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 272-40 chr9 35470326 35470589 + 1.5 NA intron (NR_003581, intron 12 of 17) intron (NR_003581, intron 12 of 17) -19654 NM_014806 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 162.75-125 chr6 74832221 74832461 + 1.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 296441 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 213.25-69 chr9 76442264 76442549 + 1.5 NA intron (NM_001097634, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 740 NM_001097634 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 152.5-97 chr2 181103521 181103677 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20238 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 158.25-156 chr9 90198098 90198260 + 1.5 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -156680 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 159.5-18 chr10 29514904 29515067 + 1.5 NA intron (NM_001323599, intron 17 of 38) intron (NM_001323599, intron 17 of 38) 30112 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 199-84 chr8 103829928 103830180 + 1.5 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) L1MEf|LINE|L1 10834 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 153.5-4 chr1 50057722 50057833 + 1.5 NA intron (NM_001324208, intron 1 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 9722 NM_001324208 1996 Hs.213050 NM_021952 ENSG00000162374 ELAVL4 HUD|PNEM ELAV like RNA binding protein 4 protein-coding 378 chr10 52351601 52352189 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 37614 NM_012242 22943 Hs.40499 NM_012242 ENSG00000107984 DKK1 DKK-1|SK dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 protein-coding 168.25-131 chr7 16581156 16581404 + 1.5 NA intron (NM_001195280, intron 8 of 8) intron (NM_001195280, intron 8 of 8) 54455 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 312.75-4 chr10 91340066 91340490 + 1.5 NA intron (NR_024467, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 -68957 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 260-18 chr2 223872289 223872581 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34853 NM_001039569 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 256.5-50 chr4 57144150 57144467 + 1.5 NA intron (NR_034081, intron 1 of 4) intron (NR_034081, intron 1 of 4) -33923 NM_001553 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 429.25-3 chr2 116199914 116200487 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 856385 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 293.25-18 chr3 145363275 145363652 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 705722 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 236.5-37 chr17 66606910 66607124 + 1.5 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -180055 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 240-61 chr7 129488814 129489032 + 1.5 NA TTS (NM_020704) TTS (NM_020704) -13608 NM_001195243 100287482 Hs.178144 NM_001195243 ENSG00000240204 SMKR1 - small lysine rich protein 1 protein-coding 254-8 chr10 101415837 101416170 + 1.5 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 61838 NM_003939 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 167.5-106 chr20 59991253 59991417 + 1.5 NA intron (NM_177980, intron 9 of 17) intron (NM_177980, intron 9 of 17) -5039 NM_021810 60437 Hs.729046 NM_021810 ENSG00000124215 CDH26 VR20 cadherin 26 protein-coding 206.5-133 chr8 83836502 83836743 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -346165 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 267.75-42 chr4 42942917 42943226 + 1.5 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 49805 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 248.5-2 chr1 48853123 48853490 + 1.5 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -76337 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 299.5-46 chr8 130211277 130211645 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 85072 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 477.5-3 chr14 56058030 56058531 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60131 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 198-31 chr17 53201740 53201995 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 216362 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 208.5-142 chr8 112150230 112150505 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -493126 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 258.75-53 chr3 119690359 119690570 + 1.5 NA Intergenic PRIMAX-int|LTR|ERV1 -12558 NM_001320317 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 200.75-18 chr11 65175998 65176331 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5209 NM_001198868 823 Hs.502842 NM_005186 ENSG00000014216 CAPN1 CANP|CANP1|CANPL1|SPG76|muCANP|muCL calpain 1 protein-coding 234.5-85 chr7 20861919 20862361 + 1.5 NA intron (NR_126381, intron 1 of 5) intron (NR_126381, intron 1 of 5) 26709 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 250-54 chr7 36071205 36071545 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -23935 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 498.75 chr15 96691144 96691672 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 90246 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 162.5-141 chr5 66346017 66346213 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -136669 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 269.75-26 chr17 79267793 79268017 + 1.5 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) intron (NM_001082575, intron 3 of 14) 192968 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 217.5-96 chr5 36969344 36969595 + 1.5 NA intron (NM_015384, intron 6 of 45) L1M5|LINE|L1 92700 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 281-24 chr4 84214591 84214918 + 1.5 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 84415 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 285.5-41 chr3 130413949 130414209 + 1.5 NA exon (NM_153264, exon 22 of 40) exon (NM_153264, exon 22 of 40) 68563 NM_001278298 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 336-3 chr10 82756388 82756770 + 1.5 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -523659 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-152 chr22 25739712 25739844 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2410 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 272-39 chr8 88804932 88805325 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -477645 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 203.5 chr1 7269077 7269333 + 1.5 NA intron (NM_001349608, intron 4 of 21) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 120549 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 129.75-137 chr4 123125581 123125794 + 1.5 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) L2|LINE|L2 202609 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 242-43 chr4 124259046 124259294 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 299264 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 206.25-12 chr10 5302137 5302314 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30989 NR_149060 110806285 NR_149060 ENSG00000224034 LINC02561 - long intergenic non-protein coding RNA 2561 ncRNA 211.5-83 chr2 187626885 187627064 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -72469 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 247-3 chr1 171846224 171846512 + 1.5 NA intron (NM_001278252, intron 1 of 14) intron (NM_001278252, intron 1 of 14) 4870 NM_001350206 26052 Hs.654775 NM_015569 ENSG00000197959 DNM3 Dyna III dynamin 3 protein-coding 296.25-19 chr2 117620754 117621022 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -193803 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 241.75-41 chr2 150356478 150356862 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -99663 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 275.5-59 chr6 164292523 164292751 + 1.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 529426 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 221-52 chr3 182066885 182067239 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 114698 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 369-5 chr13 111008532 111008976 + 1.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 42727 NR_126378 104355135 Hs.649708 NR_126378 LINC00431 - long intergenic non-protein coding RNA 431 ncRNA 309.5-27 chr22 34556601 34556971 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 441130 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 153.75-64 chr2 59189252 59189415 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28375 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 266.5-15 chr12 32879627 32880015 + 1.5 NA intron (NM_001005242, intron 1 of 12) AluSq2|SINE|Alu 17025 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 263.75-5 chr10 47421898 47422157 + 1.5 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 -7552 NR_134499 105378292 Hs.131331 NR_134499 LOC105378292 - uncharacterized LOC105378292 ncRNA 293.25-4 chr12 75927070 75927272 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 104605 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 373.5-16 chr4 30872945 30873350 + 1.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 152778 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 224.25-45 chr2 134548725 134549029 + 1.5 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 170123 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 327.25-28 chr8 106424582 106424937 + 1.5 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) L1ME4a|LINE|L1 -23165 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 225.5-37 chr14 91166051 91166255 + 1.5 NA intron (NM_001102368, intron 3 of 13) L1ME3A|LINE|L1 39727 NR_003709 100124539 Hs.693444 NR_003709 ENSG00000221102 SNORA11B - small nucleolar RNA, H/ACA box 11B snoRNA 212.25-45 chr2 103541471 103541650 + 1.5 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -557131 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 429.5-5 chr2 163795502 163795888 + 1.5 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -59687 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 212-12 chr10 111569031 111569212 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 454830 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 204.75-110 chr7 41596646 41596799 + 1.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -97197 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 174.5-98 chr2 86266017 86266235 + 1.5 NA intron (NM_001164731, intron 1 of 5) L1MEb|LINE|L1 66669 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 393.5-3 chr11 30882252 30882803 + 1.5 NA intron (NM_001367979, intron 36 of 38) L1PA6|LINE|L1 110159 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 279-23 chr20 53767275 53767609 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 108267 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 250.25-19 chr17 77153886 77154094 + 1.5 NA intron (NM_001143999, intron 3 of 16) intron (NM_001143999, intron 3 of 16) 13021 NM_001143999 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 233-50 chr4 122781762 122782003 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -44826 NM_002006 2247 Hs.284244 NM_002006 ENSG00000138685 FGF2 BFGF|FGF-2|FGFB|HBGF-2 fibroblast growth factor 2 protein-coding 142.5-52 chr12 112106643 112106835 + 1.5 NA intron (NM_024953, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 2044 NM_024953 80018 Hs.530941 NM_024953 ENSG00000111300 NAA25 C12orf30|MDM20|NAP1 N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit protein-coding 190.5-162 chr8 118375196 118375387 + 1.5 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -245710 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 201.5-96 chr4 33175329 33175515 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 824384 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 206 chr1 4355530 4355710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56431 NR_027088 284661 Hs.278112 NR_027088 ENSG00000235054 LINC01777 - long intergenic non-protein coding RNA 1777 ncRNA 339.75-32 chr8 113250937 113251384 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 125992 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 254.25-70 chr8 128997299 128997512 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31404 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 283-18 chr2 14471230 14471445 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -70379 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 303.5-45 chr6 153877076 153877433 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -133242 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 281.25-39 chr5 169850021 169850378 + 1.5 NA intron (NR_156756, intron 27 of 52) MIRb|SINE|MIR 130296 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 318-36 chr8 78096190 78096614 + 1.5 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -419938 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 383-23 chr9 126827858 126828361 + 1.5 NA intron (NM_014007, intron 2 of 2) L1P3|LINE|L1 23069 NM_014007 23099 Hs.355581 NM_014007 ENSG00000169155 ZBTB43 ZBTB22B|ZNF-X|ZNF297B zinc finger and BTB domain containing 43 protein-coding 264.75-13 chr14 55823525 55823823 + 1.5 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 -27000 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 166.5-161 chr5 61473902 61474035 + 1.5 NA intron (NM_020928, intron 2 of 13) L1ME3B|LINE|L1 141710 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 191-24 chr13 64303052 64303279 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -227154 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 234.5-35 chr18 60911413 60911589 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -421929 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 271.5-19 chr12 70946808 70947050 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26191 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 219-13 chr10 72820868 72821123 + 1.5 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) -72744 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 230-41 chr21 31512780 31513097 + 1.5 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) AluJb|SINE|Alu 46149 NM_001353688 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 229-77 chr9 98779000 98779188 + 1.5 NA intron (NM_173551, intron 6 of 14) intron (NM_173551, intron 6 of 14) 17461 NM_173551 203286 Hs.406890 NM_173551 ENSG00000165138 ANKS6 ANKRD14|NPHP16|PKDR1|SAMD6 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 protein-coding 255.5-13 chr10 114258825 114259156 + 1.5 NA intron (NM_001272046, intron 4 of 13) L1ME4b|LINE|L1 19376 NM_001320804 340706 Hs.197741 NM_198496 ENSG00000165816 VWA2 AMACO|CCSP-2|CCSP2|NET42 von Willebrand factor A domain containing 2 protein-coding 195.5-19 chr11 9798451 9798684 + 1.5 NA intron (NM_030962, intron 32 of 39) intron (NM_030962, intron 32 of 39) -39034 NR_033972 440028 Hs.677541 NR_033972 ENSG00000245522 LINC02709 - long intergenic non-protein coding RNA 2709 ncRNA 502 chr2 18070274 18070812 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 191876 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 227.25-25 chr13 99070964 99071167 + 1.5 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 15629 NM_001130049 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 230-23 chr15 69194546 69194747 + 1.5 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) intron (NM_001324093, intron 2 of 5) 34011 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 248.5-22 chr13 113433197 113433382 + 1.5 NA intron (NM_199162, intron 3 of 6) intron (NM_199162, intron 3 of 6) 15869 NM_199162 113622 Hs.98669 NM_138430 ENSG00000153531 ADPRHL1 ARH2 ADP-ribosylhydrolase like 1 protein-coding 438.5-6 chr2 174292475 174292997 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33291 NR_038897 285084 Hs.275398 NR_038897 ENSG00000231453 LINC01305 - long intergenic non-protein coding RNA 1305 ncRNA 334.5-5 chr15 66505010 66505482 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_000968) promoter-TSS (NM_000968) -80 NM_017975 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 309-8 chr10 84053354 84053796 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -85934 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 280-13 chr11 111597433 111597707 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4879 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 424.5 chr1 218639209 218639656 + 1.5 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 129337 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 308.75-6 chr10 65892703 65893111 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 321482 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 344.25-7 chr15 81866663 81867181 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 179096 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 173.25-21 chr11 121925486 121925724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 174239 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 234.75-67 chr6 53769248 53769470 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25646 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 228-77 chr8 78843617 78843943 + 1.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 6251 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 258.75-64 chr6 104061313 104061721 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 798029 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 206.5-69 chr22 38047156 38047432 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9961 NM_001039584 9463 Hs.180871 NM_012407 ENSG00000100151 PICK1 PICK|PRKCABP protein interacting with PRKCA 1 protein-coding 245.75-17 chr12 130936629 130936931 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17127 NM_001330497 283383 Hs.719239 NM_198827 ENSG00000111452 ADGRD1 GPR133|PGR25 adhesion G protein-coupled receptor D1 protein-coding 218.75-37 chr2 139857037 139857237 + 1.5 NA Intergenic Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 729548 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 204.25-95 chr5 143984011 143984408 + 1.5 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 172048 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 380-14 chr3 180812443 180812950 + 1.5 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) intron (NR_109986, intron 2 of 13) 57482 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 217.5-109 chr6 61934170 61934374 + 1.5 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) L1MA8|LINE|L1 351953 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 271.5-84 chr8 100238229 100238493 + 1.5 NA intron (NM_003114, intron 16 of 18) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 63832 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 151.5-124 chr3 115326689 115326868 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -179490 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 212-32 chr19 30155168 30155365 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 213027 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 134-187 chr9 100272603 100272756 + 1.5 NA intron (NR_134606, intron 11 of 16) intron (NR_134606, intron 11 of 16) 79892 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 283.5-30 chr2 181851694 181852167 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39800 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 306.75-16 chr4 66442807 66443145 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 166152 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 295-2 chr1 108070960 108071256 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -105928 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 177.75-24 chr11 101689109 101689288 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -105191 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 277-40 chr9 13436693 13437034 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5534 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 248.5-12 chr10 101492681 101492889 + 1.5 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) intron (NM_001256856, intron 3 of 13) 95472 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 342.25-3 chr10 30980988 30981286 + 1.5 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) intron (NR_026560, intron 1 of 6) 18380 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 245-75 chrX 72655292 72655652 + 1.5 NA intron (NM_002637, intron 10 of 31) intron (NM_002637, intron 10 of 31) -33477 NR_110391 101928259 Hs.666679 NR_110391 ENSG00000231944 PHKA1-AS1 - PHKA1 antisense RNA 1 ncRNA 230.5-11 chr1 236446299 236446576 + 1.5 NA intron (NM_080738, intron 4 of 5) AluSx3|SINE|Alu 51024 NM_080738 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 323.5-23 chr5 5917345 5917611 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 419814 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 241.75-69 chr6 104857977 104858341 + 1.5 NA intron (NR_146792, intron 1 of 24) intron (NR_146792, intron 1 of 24) 1387 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 235.25-45 chr3 135983577 135983950 + 1.5 NA intron (NM_001190447, intron 1 of 12) intron (NM_001190447, intron 1 of 12) 18035 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 274.75-24 chr2 57310530 57310774 + 1.5 NA Intergenic MER70C|LTR|ERVL -596999 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 738.5 chr2 66733825 66734899 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31135 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 166.5-79 chr16 72569830 72570107 + 1.5 NA intron (NR_159370, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 95002 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 257-42 chr4 64697984 64698244 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -288654 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 239-21 chr15 68175058 68175239 + 1.5 NA intron (NM_016166, intron 9 of 13) intron (NM_016166, intron 9 of 13) 30962 NM_001286694 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 255-28 chr2 127519364 127519733 + 1.5 NA intron (NM_017969, intron 2 of 13) intron (NM_017969, intron 2 of 13) 6941 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 325.5-4 chr10 85104946 85105202 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 93831 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 250-69 chrX 116475145 116475349 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -12271 NM_001017978 203413 Hs.97892 NM_001017978 ENSG00000204019 CT83 CXorf61|KK-LC-1|KKLC1 cancer/testis antigen 83 protein-coding 415-4 chr6 40589757 40590200 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2614 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 223.5-51 chr17 71921746 71922018 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 104097 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 123.5-170 chr5 117751255 117751406 + 1.5 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 20969 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 178.5-157 chr6 63711797 63711938 + 1.5 NA exon (NM_015153, exon 15 of 15) exon (NM_015153, exon 15 of 15) 65341 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 246.5-60 chr4 69483719 69483944 + 1.5 NA intron (NM_001297615, intron 4 of 4) L1MB8|LINE|L1 12074 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 308.25-28 chr5 45625911 45626301 + 1.5 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 70274 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 271.5-61 chr4 55468222 55468430 + 1.5 NA intron (NM_004898, intron 8 of 22) intron (NM_004898, intron 8 of 22) 72369 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 483.5-3 chr2 98488202 98488878 + 1.5 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 42530 NM_001351428 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 198.5-10 chr1 245110233 245110486 + 1.5 NA intron (NM_001143943, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu -44626 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 283-35 chr5 50884248 50884505 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 85811 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 144-14 chr1 207974743 207975028 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -63760 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 282-10 chr12 16225187 16225438 + 1.5 NA intron (NM_001170798, intron 5 of 8) L1PA5|LINE|L1 52373 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 193-82 chr6 108882536 108882738 + 1.5 NA intron (NM_001286609, intron 4 of 16) L1M7|LINE|L1 34215 NM_032131 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 249.5-49 chr2 88037600 88037980 + 1.5 NA intron (NM_001304526, intron 1 of 3) intron (NM_001304526, intron 1 of 3) 17993 NM_016618 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 162.75-23 chr11 80854900 80855033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92163 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 227.75-25 chr15 58535598 58535846 + 1.5 NA intron (NM_000236, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR -36987 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 221.75-74 chr7 106653955 106654183 + 1.5 NA TTS (NM_175884) TTS (NM_175884) 7089 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 258.25-15 chr12 81035295 81035484 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -42690 NM_024560 79611 Hs.259559 NM_024560 ENSG00000111058 ACSS3 - acyl-CoA synthetase short chain family member 3 protein-coding 300-18 chr16 50585272 50585563 + 1.5 NA intron (NM_033119, intron 3 of 9) intron (NM_033119, intron 3 of 9) 37021 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 180.75-20 chr10 114113629 114113778 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 60476 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 337.25-11 chr22 22366924 22367358 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69043 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 327 chr1 53794306 53794702 + 1.5 NA intron (NR_033142, intron 12 of 16) intron (NR_033142, intron 12 of 16) 43792 NM_001168551 55706 Hs.476525 NM_018087 ENSG00000058804 NDC1 NET3|TMEM48 NDC1 transmembrane nucleoporin protein-coding 324.5-6 chr12 26749320 26749610 + 1.5 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) intron (NM_002223, intron 2 of 56) 83729 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 222.75-13 chr10 8974635 8974856 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 76756 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 266-51 chr9 69665442 69665690 + 1.5 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 6805 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 195-20 chr11 92848277 92848474 + 1.5 NA intron (NM_001008781, intron 18 of 24) intron (NM_001008781, intron 18 of 24) 67253 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 162.75-110 chr4 159879572 159879745 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -101874 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 224-19 chr14 67878644 67878840 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 5 of 10) AluSx1|SINE|Alu 55150 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 119-114 chr3 18723085 18723255 + 1.5 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -277578 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 284-9 chr12 130513084 130513333 + 1.5 NA intron (NM_001351227, intron 2 of 20) intron (NM_001351227, intron 2 of 20) 115248 NM_015347 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 299.25-43 chr6 97073903 97074219 + 1.5 NA intron (NR_104421, intron 5 of 8) intron (NR_104421, intron 5 of 8) 63985 NM_001323263 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 148-22 chr13 80396770 80396890 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -55704 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 344.5-19 chr4 97554559 97555000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 187853 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 266.5-9 chr11 14635527 14635882 + 1.5 NA intron (NM_148976, intron 1 of 10) intron (NM_148976, intron 1 of 10) 7930 NM_148976 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 232.25-36 chr20 38534211 38534705 + 1.5 NA intron (NM_001282918, intron 15 of 29) intron (NM_001282918, intron 15 of 29) 17895 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 277.5-73 chr8 48807079 48807419 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -71938 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 198-12 chr10 62610215 62610509 + 1.5 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) intron (NM_199452, intron 1 of 6) 89914 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 181.25-66 chr2 137573394 137573690 + 1.5 NA intron (NM_001316349, intron 17 of 27) intron (NM_001316349, intron 17 of 27) 354390 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 174.5-8 chr1 96859351 96859528 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 136801 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 154.5-205 chr9 91194225 91194383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75242 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 179.5-81 chr18 39626389 39626580 + 1.5 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) -4309 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 189.75-23 chr12 130952830 130953113 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001330497) promoter-TSS (NM_001330497) -936 NM_001330497 283383 Hs.719239 NM_198827 ENSG00000111452 ADGRD1 GPR133|PGR25 adhesion G protein-coupled receptor D1 protein-coding 205.5-81 chr2 203715575 203715846 + 1.5 NA intron (NM_001243078, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 9071 NM_006139 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 293.25-24 chr5 6919321 6919608 + 1.5 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -91543 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 285-12 chr12 62891653 62891902 + 1.5 NA intron (NM_020700, intron 1 of 9) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 43373 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 306.5-27 chr3 69357436 69357959 + 1.5 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) intron (NM_015123, intron 1 of 22) 28391 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 175-58 chr18 71880013 71880232 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -97896 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 228-72 chr7 36978573 36978876 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) 6388 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 379.5-18 chr6 147629491 147629816 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 120963 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 266.25-6 chr11 46960822 46961199 + 1.5 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 24249 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 213-75 chr5 8556713 8556966 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 95914 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 239.5-61 chr5 148939338 148939640 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 112896 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 362.5-11 chr2 160973530 160973834 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -163273 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 240.5-71 chr4 43500050 43500251 + 1.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -7607 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 395.75-7 chr15 59973560 59974052 + 1.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -30505 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 163.5-78 chr18 45845838 45845987 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 20237 NM_213602 284266 Hs.287692 NM_213602 ENSG00000197046 SIGLEC15 CD33L3|HsT1361|SIGLEC-15 sialic acid binding Ig like lectin 15 protein-coding 335-17 chr6 41829789 41830107 + 1.5 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 41689 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 200.5-65 chr2 69502821 69502971 + 1.5 NA intron (NM_014911, intron 16 of 21) L1M5|LINE|L1 17275 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 363.5-14 chr3 112297143 112297508 + 1.5 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -3109 NR_135297 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 169.5-165 chr7 110191129 110191310 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -231006 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 173-33 chr12 23571393 23571668 + 1.5 NA intron (NM_152989, intron 13 of 17) intron (NM_152989, intron 13 of 17) 13056 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 236.5-97 chr8 115539049 115539411 + 1.5 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 128783 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 181.5-75 chr2 55395889 55396043 + 1.5 NA intron (NM_001254943, intron 2 of 33) intron (NM_001254943, intron 2 of 33) 23890 NM_001254943 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 262-44 chr5 89575110 89575449 + 1.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 441441 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 269-7 chr10 49488436 49488638 + 1.5 NA intron (NM_001346440, intron 8 of 20) intron (NM_001346440, intron 8 of 20) 35744 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 384-20 chr8 56349273 56349599 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -28660 NM_001318049 195814 Hs.170673 NM_138969 ENSG00000170786 SDR16C5 EPHD-2|RDH#2|RDH-E2|RDHE2|retSDR2 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5 protein-coding 203.75-33 chr14 73830038 73830403 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_135238) promoter-TSS (NR_135238) -85 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 237.75-85 chrX 26937054 26937318 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 378849 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 213-33 chr15 83413980 83414265 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33106 NM_001324185 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 144.5-53 chr12 133119913 133120061 + 1.5 NA TTS (NM_001277291) TTS (NM_001277291) 10486 NM_001277291 101060200 Hs.614816 NM_001277291 ENSG00000214029 ZNF891 - zinc finger protein 891 protein-coding 177-58 chr22 32542180 32542351 + 1.5 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) L2b|LINE|L2 67028 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 183.5-7 chr1 115591657 115591915 + 1.5 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -50184 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 529.75 chr10 27623215 27623958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 119282 NM_001256411 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 209.5-76 chr2 234069893 234070158 + 1.5 NA intron (NM_006944, intron 7 of 7) intron (NM_006944, intron 7 of 7) 19323 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 296.25-20 chr2 149354821 149355096 + 1.5 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 24371 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 161-57 chr18 63791385 63791511 + 1.5 NA intron (NM_001261831, intron 2 of 6) intron (NM_001261831, intron 2 of 6) 13671 NM_001261830 8710 Hs.138202 NM_003784 ENSG00000166396 SERPINB7 MEGSIN|PPKN|TP55 serpin family B member 7 protein-coding 132-2 chr1 89002107 89002216 + 1.5 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 -9201 NM_001008662 56267 Hs.481898 NM_001008661 ENSG00000137944 KYAT3 CCBL2|KAT3|KATIII kynurenine aminotransferase 3 protein-coding 145-101 chr3 139031871 139032043 + 1.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -11031 NM_001013650 389151 Hs.531376 NM_001013650 ENSG00000184814 PRR23B - proline rich 23B protein-coding 248.25-75 chr8 137720730 137720936 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -307245 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 183.5-109 chr5 45398778 45398972 + 1.5 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) MER45R|DNA|hAT-Tip100 297505 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 208-87 chr9 109618123 109618370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22542 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 148-20 chr12 92000095 92000260 + 1.5 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) L1MA5A|LINE|L1 141536 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 513.25-3 chr20 58636255 58636820 + 1.5 NA TTS (NR_125359) TTS (NR_125359) 1765 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 172.25-84 chr3 17075064 17075347 + 1.5 NA intron (NM_015184, intron 5 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 142009 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 183-40 chr17 1518101 1518259 + 1.5 NA TTS (NR_028514) TTS (NR_028514) 1261 NR_028514 100306951 Hs.633815 NR_028514 ENSG00000236618 PITPNA-AS1 - PITPNA antisense RNA 1 ncRNA 244.5-57 chr2 164509063 164509322 + 1.5 NA intron (NM_004490, intron 6 of 13) intron (NM_004490, intron 6 of 13) 59303 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 421.25-11 chr8 126744665 126745057 + 1.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -186383 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 327.5-12 chr16 4189340 4189803 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001323668, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001323668, exon 7 of 7) 52509 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 222-49 chr22 35177717 35178036 + 1.5 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) intron (NR_126356, intron 2 of 5) 53180 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 157-59 chr2 119226776 119226972 + 1.5 NA intron (NM_138637, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 3040 NM_182915 55240 Hs.647822 NM_018234 ENSG00000115107 STEAP3 AHMIO2|STMP3|TSAP6|dudlin-2|dudulin-2|pHyde STEAP3 metalloreductase protein-coding 166.5-185 chr7 3363165 3363360 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MD1|LINE|L1 62010 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 263.5-59 chr6 64743152 64743483 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -558101 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 450-12 chr7 46982030 46982624 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -285205 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 336-16 chr3 107909082 107909391 + 1.5 NA intron (NR_015394, intron 1 of 2) LTR39|LTR|ERV1 26031 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 282.75-5 chr10 54795876 54796356 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) 5115 NM_001354420 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 248.25-45 chr3 42452674 42452947 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -36489 NM_001251882 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 174-41 chr17 62764093 62764257 + 1.5 NA intron (NM_001288780, intron 4 of 10) intron (NM_001288780, intron 4 of 10) 42465 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 195.5-94 chr3 1292965 1293160 + 1.5 NA intron (NM_001349357, intron 5 of 20) intron (NM_001349357, intron 5 of 20) 200038 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 429.5-9 chr7 32137745 32138194 + 1.5 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -66533 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 148.5-49 chr13 19645398 19645533 + 1.5 NA intron (NM_017520, intron 2 of 13) intron (NM_017520, intron 2 of 13) 11806 NM_017520 54737 Hs.269654 NM_017520 ENSG00000196199 MPHOSPH8 HSMPP8|TWA3|mpp8 M-phase phosphoprotein 8 protein-coding 315.25-30 chr6 165083344 165083743 + 1.5 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 226062 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 251.25-57 chr8 78141497 78141787 + 1.5 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -374698 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 248.25-64 chr7 20400421 20400687 + 1.5 NA intron (NM_002214, intron 9 of 13) intron (NM_002214, intron 9 of 13) -68792 NR_110119 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 329-13 chr12 5681460 5681885 + 1.5 NA intron (NM_001278596, intron 15 of 25) intron (NM_001278596, intron 15 of 25) 187540 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 290.5-11 chr14 40912283 40912704 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -42218 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 296.75-4 chr10 131379153 131379459 + 1.5 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -67585 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 352.5-5 chr11 91434893 91435359 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -565924 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 355.5-21 chr4 93330563 93331024 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -497960 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 162.75-29 chr12 123221249 123221464 + 1.5 NA intron (NR_103517, intron 6 of 23) intron (NR_103517, intron 6 of 23) 11785 NM_022782 10198 Hs.577404 NM_022782 ENSG00000051825 MPHOSPH9 MPP-9|MPP9 M-phase phosphoprotein 9 protein-coding 194.5-139 chr7 33873904 33874212 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30857 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 297-16 chr14 69882710 69883044 + 1.5 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 3461 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 304.25-2 chr1 226673380 226673723 + 1.5 NA intron (NR_103784, intron 1 of 1) intron (NR_103784, intron 1 of 1) 1517 NR_103784 100506443 Hs.664293 NR_103784 ITPKB-IT1 - ITPKB intronic transcript 1 ncRNA 266.5-81 chrX 39638055 39638303 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23037 NR_037501 100500822 NR_037501 ENSG00000263730 MIR3937 - microRNA 3937 ncRNA 270-49 chr7 47051360 47051589 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -354352 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 172.5-184 chr7 38612898 38613192 + 1.5 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR 18328 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 183-10 chr10 126807491 126807685 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -97821 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 181.25-19 chr11 94200035 94200189 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 71271 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 207.75-38 chr15 91210225 91210452 + 1.5 NA intron (NM_001323040, intron 2 of 12) intron (NM_001323040, intron 2 of 12) 108542 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 325.5-9 chr14 56747621 56747921 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 57896 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 378-13 chr4 43123325 43123745 + 1.5 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 230269 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 288.5-38 chr6 55759854 55760151 + 1.5 NA intron (NM_021073, intron 5 of 6) intron (NM_021073, intron 5 of 6) 115588 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 259-40 chr8 88638474 88638766 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -311137 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 133.5-16 chr1 208395689 208395883 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -151402 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 325-10 chr18 7243669 7243972 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 12716 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 273-7 chr1 244472374 244472589 + 1.5 NA intron (NM_001130957, intron 2 of 21) L1MC2|LINE|L1 11110 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 313-8 chr13 82418404 82418733 + 1.5 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -1191585 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 264-24 chr18 60918683 60919067 + 1.5 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -414555 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 161.5-126 chr3 8610827 8610990 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 33890 NM_001256748 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 597.5 chr1 44859007 44859809 + 1.5 NA intron (NM_020365, intron 10 of 11) AluSq2|SINE|Alu -16155 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 317-10 chr11 102898358 102898667 + 1.5 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -23530 NM_002426 4321 Hs.1695 NM_002426 ENSG00000262406 MMP12 HME|ME|MME|MMP-12 matrix metallopeptidase 12 protein-coding 342.5-10 chr12 75312682 75313124 + 1.5 NA exon (NM_001355025, exon 8 of 18) exon (NM_001355025, exon 8 of 18) 17421 NM_001355024 84698 Hs.733835 NM_032606 ENSG00000180881 CAPS2 UG0636c06 calcyphosine 2 protein-coding 470.5-6 chr22 19461071 19461430 + 1.5 NA intron (NM_001035247, intron 6 of 11) L1MB3|LINE|L1 -13018 NM_173793 128977 Hs.659565 NM_173793 ENSG00000242259 C22orf39 - chromosome 22 open reading frame 39 protein-coding 240.75-42 chr2 60014465 60014773 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 368417 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 155.25-7 chr1 84410049 84410206 + 1.5 NA intron (NM_021233, intron 3 of 5) intron (NM_021233, intron 3 of 5) 1776 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 175.5-163 chr8 98780133 98780348 + 1.5 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) L1MC|LINE|L1 45431 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 375.5-9 chr19 29805602 29805972 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6204 NM_001322262 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 215.25-15 chr11 38289994 38290306 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 351549 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 302.5-36 chr5 86928447 86928749 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 181780 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 386.75-9 chr7 49294372 49294847 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 370062 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 280-59 chr7 146713085 146713324 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61067 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 154-61 chr2 21387379 21387486 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 263446 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 173.25-62 chr2 224628604 224628751 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -43280 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 181.5-74 chr2 52242356 52242507 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1MC4a|LINE|L1 -128217 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 234.5-60 chr3 46764474 46764634 + 1.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -7699 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 189.5-51 chr16 22276759 22276979 + 1.5 NA intron (NM_013302, intron 16 of 17).2 AluSq2|SINE|Alu -20506 NM_001258035 55718 Hs.460298 NM_018119 ENSG00000058600 POLR3E RPC5|SIN RNA polymerase III subunit E protein-coding 384-22 chr8 137672028 137672354 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -258603 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 264-50 chr5 45648279 45648517 + 1.5 NA intron (NM_021072, intron 1 of 7) intron (NM_021072, intron 1 of 7) 47982 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 249-38 chr5 25171497 25171701 + 1.5 NA intron (NR_147006, intron 1 of 4) L1MD2|LINE|L1 19057 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 256-41 chr22 23656675 23657069 + 1.5 NA intron (NR_024448, intron 11 of 11) AluSg|SINE|Alu -24551 NM_016449 51233 Hs.517466 NM_016449 ENSG00000189269 DRICH1 C22orf43|KB-208E9.1 aspartate rich 1 protein-coding 268.75-5 chr12 4362870 4363148 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 16703 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 232-37 chr2 104178971 104179264 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 229215 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 221.25-51 chr3 2748703 2749155 + 1.5 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) L2b|LINE|L2 -143286 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 519.25 chr10 53442328 53442762 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -670845 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 348.5-3 chr2 99805212 99805524 + 1.5 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) 300215 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 146-28 chr12 53770713 53770822 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -13733 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 245-25 chr18 68104037 68104350 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -289371 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 259.5-5 chr1 67605052 67605382 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79984 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 289.5-2 chr1 145759746 145760016 + 1.5 NA intron (NM_014455, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 40382 NR_103845 11126 Hs.488237 NM_007053 ENSG00000117281 CD160 BY55|NK1|NK28 CD160 molecule protein-coding 148.5-83 chr17 29329700 29329880 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -35642 NM_020772 57532 Hs.462598 NM_020772 ENSG00000108256 NUFIP2 182-FIP|82-FIP|FIP-82|PIG1 nuclear FMR1 interacting protein 2 protein-coding 277.5-25 chr15 86847490 86847790 + 1.5 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) L1M4a2|LINE|L1 -85240 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 137-19 chr1 240342850 240343092 + 1.5 NA intron (NM_001348094, intron 11 of 14) L2c|LINE|L2 251088 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 434.25-10 chr4 26602774 26603202 + 1.5 NA intron (NM_001292054, intron 1 of 17) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 18904 NM_018317 55296 Hs.479403 NM_018317 ENSG00000109680 TBC1D19 - TBC1 domain family member 19 protein-coding 212.5-39 chr17 43721705 43721976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 36951 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 181-75 chr3 195033477 195033780 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60960 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 275.25-7 chr10 92336789 92337046 + 1.5 NA intron (NM_017824, intron 2 of 5) AluSz6|SINE|Alu 45750 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 327.75-26 chr7 46650312 46650648 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46642 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 238.5-46 chr2 174708920 174709107 + 1.5 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -10787 NR_002315 440926 Hs.533624 NR_002315 H3F3AP4 p13 H3 histone, family 3A, pseudogene 4 pseudo 256.5-64 chr5 145601490 145601807 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 233694 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 298.5-19 chr2 133707869 133708203 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -139573 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 260.5-9 chr11 86031934 86032134 + 1.5 NA intron (NM_001206947, intron 1 of 18) intron (NM_001206947, intron 1 of 18) 37050 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 322.5-3 chr10 55701921 55702253 + 1.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -74145 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 317.25-8 chr12 26959729 26960021 + 1.5 NA intron (NM_001171887, intron 4 of 5) intron (NM_001171887, intron 4 of 5) 21405 NM_015633 26127 Hs.591162 NM_015633 ENSG00000111790 FGFR1OP2 HSPC123-like|WIT3.0 FGFR1 oncogene partner 2 protein-coding 286.5-54 chr6 2604967 2605310 + 1.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -29362 NR_149119 105374885 NR_149118 LINC02521 - long intergenic non-protein coding RNA 2521 ncRNA 175.5-178 chr9 23709114 23709290 + 1.5 NA intron (NM_004432, intron 3 of 6) intron (NM_004432, intron 3 of 6) -36803 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 156-119 chr5 59085208 59085344 + 1.5 NA intron (NM_006203, intron 5 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -45800 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 435 chr10 76019264 76019856 + 1.5 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 236799 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 287.5-31 chr2 36652692 36652991 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -43849 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 339-10 chr14 82448046 82448383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -194418 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 351.5-18 chr2 166336968 166337247 + 1.5 NA intron (NM_001365536, intron 1 of 26) L2|LINE|L2 38837 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 247-11 chr11 84385376 84385721 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -68209 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 305.25-19 chr17 47332043 47332444 + 1.5 NA intron (NM_001195192, intron 4 of 21) L1MC1|LINE|L1 8288 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 297.5-50 chr7 26440901 26441241 + 1.5 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) -41653 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 221.25-21 chr12 120417529 120417728 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20485 NM_004373 1337 Hs.369624 NM_004373 ENSG00000111775 COX6A1 CMTRID|COX6A|COX6AL cytochrome c oxidase subunit 6A1 protein-coding 161.75-132 chr9 21807652 21807889 + 1.5 NA intron (NM_002451, intron 1 of 7) intron (NM_002451, intron 1 of 7) 5134 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 286.5-49 chr4 67701431 67701649 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_018227) promoter-TSS (NM_018227) 262 NR_015439 550112 Hs.479879 NR_015439 ENSG00000248049 UBA6-AS1 - UBA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 343.75-4 chr18 8306319 8306768 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 18 of 30) intron (NM_002845, intron 18 of 30) 60491 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 161.5-97 chr2 60317228 60317448 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 65698 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 291.5-34 chr5 19431068 19431428 + 1.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 455024 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 276.5-66 chr8 113525425 113525799 + 1.5 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -88673 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 243-27 chr16 27277195 27277469 + 1.5 NA intron (NR_037184, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu -8560 NM_145080 197370 Hs.284295 NM_145080 ENSG00000169189 NSMCE1 NSE1 NSE1 homolog, SMC5-SMC6 complex component protein-coding 386.25 chr1 114943162 114943508 + 1.5 NA intron (NM_001282542, intron 23 of 30) L1ME3E|LINE|L1 -86489 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 237-68 chr8 32455904 32456147 + 1.5 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 15279 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 263.5-65 chr8 119133638 119133905 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -64989 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 293.25-6 chr14 70490777 70491112 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -7188 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 279.75-29 chr2 227238079 227238413 + 1.5 NA intron (NR_102371, intron 9 of 13) intron (NR_102371, intron 9 of 13) 73681 NM_000091 1285 Hs.570065 NM_000091 ENSG00000169031 COL4A3 ATS2|ATS3 collagen type IV alpha 3 chain protein-coding 212.5-113 chr8 49129310 49129589 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 57105 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 415.25-3 chr4 117382398 117383001 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 22047 NR_147153 105377390 Hs.368206 NR_147152 ENSG00000228358 LINC02263 - long intergenic non-protein coding RNA 2263 ncRNA 434-5 chr9 71914192 71914635 + 1.5 NA intron (NR_157409, intron 1 of 4) MER30|DNA|hAT-Charlie 2774 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 192.5-69 chr2 117939492 117939714 + 1.5 NA intron (NM_019044, intron 19 of 23) intron (NM_019044, intron 19 of 23) 74467 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 404.25-7 chr3 179872146 179872568 + 1.5 NA intron (NR_146167, intron 6 of 13) intron (NR_146167, intron 6 of 13) -25837 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 234.5-71 chr4 92819370 92819755 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR 515163 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 170.25-70 chr2 117936572 117936749 + 1.5 NA intron (NM_019044, intron 21 of 23) intron (NM_019044, intron 21 of 23) 77410 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 162-64 chr2 122728869 122729071 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 344511 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 347-17 chr4 31937332 31938061 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59683 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 194.75-41 chr18 33783563 33783799 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 205462 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 358-11 chr7 24528106 24528584 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -45107 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 286.5-73 chrX 53460565 53460791 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26302 NM_001037811 3028 Hs.171280 NM_004493 ENSG00000072506 HSD17B10 17b-HSD10|ABAD|CAMR|DUPXp11.22|ERAB|HADH2|HCD2|HSD10MD|MHBD|MRPP2|MRX17|MRX31|MRXS10|SCHAD|SDR5C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 10 protein-coding 167.25-31 chr13 57802367 57802527 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 170703 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 179-4 chr1 114463803 114463946 + 1.5 NA intron (NM_015906, intron 2 of 19) AluJb|SINE|Alu 47329 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 279.75-17 chr18 71768705 71768984 + 1.5 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 13382 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 196.5-51 chr14 73818635 73818785 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11425 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 288-41 chr5 154451250 154451531 + 1.5 NA intron (NM_024632, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 5393 NR_024084 79685 Hs.592566 NM_024632 ENSG00000164576 SAP30L NS4ATP2 SAP30 like protein-coding 399.25-9 chr5 23181412 23181720 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -326043 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 314.5-26 chr7 101570000 101570286 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1137 NR_103748 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 238.5-23 chr13 83537172 83537449 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 345083 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 158.5-121 chr21 28932672 28932907 + 1.5 NA intron (NM_015565, intron 27 of 29) intron (NM_015565, intron 27 of 29) -47416 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 280.5-28 chr20 52449079 52449445 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -171576 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 232.25-65 chr6 15507989 15508257 + 1.5 NA intron (NM_004973, intron 11 of 17) intron (NM_004973, intron 11 of 17) 154905 NR_036448 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 210-104 chr9 134920215 134920499 + 1.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -2445 NM_002003 2219 Hs.440898 NM_002003 ENSG00000085265 FCN1 FCNM ficolin 1 protein-coding 172.75-88 chr3 145972338 145972719 + 1.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 96657 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 299.25-4 chr1 118610551 118610868 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 377634 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 284.5-45 chr5 8265016 8265249 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 192432 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 221.75-4 chr1 91133677 91133974 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -111570 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 153-138 chr7 25955919 25956076 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -6011 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 138.25-148 chr6 44435211 44435344 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_039785) promoter-TSS (NR_039785) -364 NR_039785 100616352 NR_039785 ENSG00000266619 MIR4642 - microRNA 4642 ncRNA 157.5-192 chr7 44655581 44655815 + 1.5 NA intron (NM_002541, intron 4 of 22) intron (NM_002541, intron 4 of 22) 49071 NM_001003941 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 189.75-28 chr13 82171688 82171956 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -944839 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 262-4 chr1 63727117 63727414 + 1.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -46752 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 343.5-2 chr1 79566995 79567382 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -560458 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 164.5-162 chr5 68673812 68673977 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 356033 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 136-160 chr8 133008440 133008575 + 1.5 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 38074 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 371.25-10 chr20 55077895 55078180 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -345006 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 439.25-9 chr6 142828402 142829020 + 1.5 NA intron (NM_006734, intron 2 of 9) AluSg|SINE|Alu 116465 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 231-16 chr12 23140398 23140648 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35113 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 234.5-102 chr8 135030504 135030811 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 180722 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 218.25-72 chr5 87482106 87482344 + 1.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -69192 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 273.5-8 chr10 24354002 24354248 + 1.5 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 78440 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 426.75-12 chr8 130890960 130891727 + 1.5 NA intron (NM_001115, intron 7 of 17) intron (NM_001115, intron 7 of 17) 149566 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 333-23 chr7 30126377 30126786 + 1.5 NA intron (NM_001350973, intron 13 of 13) LTR37-int|LTR|ERV1 -8405 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 219.75-14 chr10 126861663 126861859 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43648 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 284.75-14 chr17 61523839 61524118 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 67241 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 213.75-59 chr20 51139796 51139953 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116767 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 329.25-25 chr6 169019473 169019857 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15978 NR_134622 101929460 Hs.355225 NR_134622 ENSG00000229720 LOC101929460 - uncharacterized LOC101929460 ncRNA 339.75-9 chr12 60407647 60408083 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 718495 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 430.25-8 chr4 92113243 92113774 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 163794 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 407.75-5 chr3 152965270 152965735 + 1.5 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 130371 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 222.75-36 chr14 49578174 49578393 + 1.5 NA intron (NM_001030001, intron 2 of 2) intron (NM_001030001, intron 2 of 2) 8097 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 256.5-68 chr6 154498930 154499185 + 1.5 NA intron (NM_001368117, intron 1 of 12) intron (NM_001368117, intron 1 of 12) 11189 NM_001368116 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 344.25-8 chr16 50762345 50762662 + 1.5 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) L1M5|LINE|L1 20198 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 221.25-11 chr10 66566516 66566845 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1ME4b|LINE|L1 -359356 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 316.75-18 chr5 162862225 162862738 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -575090 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 175-138 chrX 44772904 44773091 + 1.5 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -71024 NM_022076 63904 Hs.534478 NM_022076 ENSG00000189037 DUSP21 LMWDSP21 dual specificity phosphatase 21 protein-coding 282.75-26 chr22 19363818 19364110 + 1.5 NA intron (NM_003325, intron 15 of 24) L1MC1|LINE|L1 67769 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 291-3 chr1 116307801 116308164 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -65262 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 282-51 chr8 133343545 133343846 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46391 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 428.5-9 chr8 126843015 126843423 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -169935 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 159-134 chrX 50349266 50349451 + 1.5 NA intron (NM_033670, intron 6 of 7) L2b|LINE|L2 64816 NM_033670 85417 Hs.130310 NM_033031 ENSG00000147082 CCNB3 - cyclin B3 protein-coding 149.75-63 chr17 59675341 59675451 + 1.5 NA intron (NM_001288653, intron 16 of 31) MER103C|DNA|hAT-Charlie 32202 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 152.25-172 chrX 43956711 43956919 + 1.5 NA intron (NR_046631, intron 3 of 5) intron (NR_046631, intron 3 of 5) 7083 NR_046631 100873919 NR_046631 ENSG00000236276 NDP-AS1 - NDP antisense RNA 1 ncRNA 213.5-19 chr10 109953413 109953634 + 1.5 NA intron (NR_038943, intron 3 of 4) LTR85a|LTR|Gypsy? -29970 NM_001167604 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 262-6 chr1 113779531 113779788 + 1.5 NA intron (NM_018364, intron 2 of 6) intron (NM_018364, intron 2 of 6) -19771 NM_001323042 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 462-3 chr14 44457212 44457645 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 49855 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 414.25-6 chr4 36050400 36050942 + 1.5 NA intron (NR_146893, intron 33 of 36) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 193268 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 309.5-21 chr2 71001683 71002034 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6985 NM_144582 113419 Hs.516087 NM_144582 ENSG00000144043 TEX261 TEG-261 testis expressed 261 protein-coding 259.5-74 chr4 101446573 101446822 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 98920 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 245-51 chr4 94842491 94842758 + 1.5 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) AluSz6|SINE|Alu 84669 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 273.5-7 chr1 244163557 244163831 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 110489 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 239.5-6 chr10 7186919 7187089 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_132972) promoter-TSS (NR_132972) -220 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 216.5-45 chr17 40577217 40577406 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11839 NM_001838 1236 Hs.370036 NM_001838 ENSG00000126353 CCR7 BLR2|CC-CKR-7|CCR-7|CD197|CDw197|CMKBR7|EBI1 C-C motif chemokine receptor 7 protein-coding 222.25-65 chr5 40143054 40143556 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91014 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 221-69 chr5 179395292 179395511 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -49940 NM_021599 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 309.75-23 chr20 22811113 22811368 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -125896 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 276.75-43 chr6 36387132 36387486 + 1.5 NA intron (NM_001207035, intron 1 of 7) intron (NM_001207035, intron 1 of 7) 360 NM_016135 51513 Hs.272398 NM_016135 ENSG00000010030 ETV7 TEL-2|TEL2|TELB ETS variant 7 protein-coding 186-20 chr11 115797917 115798143 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37830 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 187.5-52 chr13 95886312 95886545 + 1.5 NA intron (NM_020121, intron 26 of 38) intron (NM_020121, intron 26 of 38) 166973 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 164.5-25 chr10 90890391 90890588 + 1.5 NA intron (NM_006413, intron 6 of 10) intron (NM_006413, intron 6 of 10) 18515 NM_001104546 10556 Hs.139120 NM_006413 ENSG00000148688 RPP30 TSG15 ribonuclease P/MRP subunit p30 protein-coding 198-82 chr8 121179382 121179556 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -367423 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 194-55 chr3 27407983 27408177 + 1.5 NA intron (NR_135542, intron 11 of 23) intron (NR_135542, intron 11 of 23) -38620 NM_152534 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 250.5-83 chr6 121002646 121002940 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 331687 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 245-31 chr2 79716019 79716254 + 1.5 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) HAL1|LINE|L1 -66777 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 117-68 chr16 65769535 65769673 + 1.5 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -193304 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 276.75-47 chr7 10086610 10086856 + 1.5 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 452463 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 241.5-8 chr11 39381835 39382088 + 1.5 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 733103 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 303.5-37 chr5 127026349 127026728 + 1.5 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) intron (NM_178450, intron 1 of 4) 4020 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 187-83 chr6 126592190 126592392 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 107660 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 183.75-24 chr11 30043908 30044122 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26985 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 187-85 chr6 157091808 157092021 + 1.5 NA intron (NM_020732, intron 6 of 19) intron (NM_020732, intron 6 of 19) 55487 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 255.5-27 chr15 64428707 64429074 + 1.5 NA intron (NM_001321924, intron 11 of 12) AluSx|SINE|Alu 41054 NM_001321924 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 151-25 chr12 15160450 15160563 + 1.5 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) MIRc|SINE|MIR 8583 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 239-17 chr14 63720609 63720872 + 1.5 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 AluSq|SINE|Alu 7325 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 252-30 chr17 33507162 33507443 + 1.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 26458 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 172.5-86 chr18 44307192 44307311 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 224446 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 240.5-81 chr4 125244711 125245040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -71537 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 235-24 chr15 57490662 57490897 + 1.5 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) L1MC3|LINE|L1 -101125 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 217.5-23 chr11 46195379 46195594 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 23531 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 139.5-60 chr13 76340271 76340465 + 1.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -405236 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 220-64 chr8 77608252 77608642 + 1.5 NA Intergenic (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 157750 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 197-33 chr2 142288810 142289177 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -157292 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 194-27 chr12 19752454 19752616 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -262150 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 183-117 chr9 91188319 91188535 + 1.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 69365 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 373.5-6 chr16 76980054 76980342 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 111262 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 156-44 chr14 50524019 50524198 + 1.5 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) intron (NM_198794, intron 2 of 31) 8461 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 211-29 chr19 16260130 16260277 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 62292 NM_001130524 8907 Hs.71040 NM_032493 ENSG00000072958 AP1M1 AP47|CLAPM2|CLTNM|MU-1A adaptor related protein complex 1 subunit mu 1 protein-coding 214.5-79 chr3 49667481 49667735 + 1.5 NA 3' UTR (NM_003458, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_003458, exon 12 of 12) -6743 NM_001640 327 Hs.517969 NM_001640 ENSG00000164062 APEH AARE|ACPH|APH|D3F15S2|D3S48E|DNF15S2|OPH acylaminoacyl-peptide hydrolase protein-coding 168-114 chr6 129085731 129085903 + 1.5 NA intron (NM_000426, intron 3 of 64) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 202676 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 327.75-3 chr1 235823367 235823683 + 1.5 NA intron (NM_000081, intron 3 of 52) L2b|LINE|L2 29535 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 294-25 chr3 178090022 178090372 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 273332 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 201.75-17 chr11 14727474 14727719 + 1.5 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) intron (NM_000922, intron 1 of 15) 83792 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 267.5-12 chr10 109525623 109525985 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 397442 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 290.25-4 chr1 188503003 188503340 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1059543 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 309-15 chr15 83939102 83939460 + 1.5 NA intron (NM_207517, intron 17 of 29) L1M5|LINE|L1 -140906 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 380.25-4 chr3 143790842 143791212 + 1.5 NA intron (NM_173653, intron 4 of 15) intron (NM_173653, intron 4 of 15) 57441 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 267.5-30 chr16 6551670 6551965 + 1.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -221992 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 150.25-55 chr14 75075012 75075250 + 1.5 NA intron (NM_024643, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 5490 NM_024643 79696 Hs.48642 NM_024643 ENSG00000119703 ZC2HC1C C14orf140|FAM164C zinc finger C2HC-type containing 1C protein-coding 327-2 chr1 71444816 71445082 + 1.5 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 363625 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 265.75-35 chr2 68131848 68132212 + 1.5 NA intron (NM_138458, intron 7 of 7) intron (NM_138458, intron 7 of 7) 25497 NM_001256476 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 322.5-17 chr2 150857202 150857571 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 228489 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 160.25-162 chr8 132138204 132138417 + 1.5 NA intron (NM_001204824, intron 11 of 14) MIR|SINE|MIR -33045 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 223-17 chr12 5407344 5407599 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24637 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 249-56 chr9 80000311 80000574 + 1.5 NA intron (NR_121212, intron 3 of 4) intron (NR_121212, intron 3 of 4) 25419 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 312.75-29 chr6 152215627 152216044 + 1.5 NA intron (NM_182961, intron 121 of 145) MIR|SINE|MIR -30457 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 219-52 chr2 66525409 66525770 + 1.5 NA intron (NM_002398, intron 8 of 12) intron (NM_002398, intron 8 of 12) -48441 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 138-154 chr7 65330223 65330365 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -43505 NM_001287532 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 216.5-67 chr20 47076424 47076670 + 1.5 NA intron (NM_172110, intron 7 of 13) L1PA15|LINE|L1 -90420 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 290-4 chr1 118099654 118100033 + 1.5 NA intron (NM_206996, intron 5 of 48) intron (NM_206996, intron 5 of 48) 85385 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 267.75-29 chr2 134358843 134359181 + 1.5 NA intron (NM_001371457, intron 10 of 16) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 104940 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 271-4 chr10 32118868 32119109 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62563 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 430-4 chr11 2059094 2059450 + 1.5 NA Intergenic (ATTCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -57806 NR_131224 283120 Hs.533566 NR_002196 ENSG00000130600 H19 ASM|ASM1|BWS|D11S813E|LINC00008|MIR675HG|NCRNA00008|WT2 H19 imprinted maternally expressed transcript ncRNA 304-27 chr5 41181503 41181937 + 1.5 NA intron (NM_000065, intron 6 of 17) L2c|LINE|L2 31812 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 173-85 chr3 81759438 81759576 + 1.5 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) intron (NM_000158, intron 1 of 15) 2138 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 225.75-54 chr3 103789051 103789219 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -265019 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 327-8 chr14 61033566 61033863 + 1.5 NA intron (NR_033344, intron 6 of 16) intron (NR_033344, intron 6 of 16) -52024 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 169.5-8 chr1 190189129 190189317 + 1.5 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) L1M3e|LINE|L1 286787 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 230.75-8 chr10 54303046 54303262 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -183076 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 284-42 chr6 66029237 66029675 + 1.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 241577 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 184.5-119 chr5 63182484 63182710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 603778 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 345 chr10 66365919 66366372 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -559891 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 296.25-34 chr8 141847605 141847998 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61488 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 290-38 chr4 176993028 176993261 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 117442 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 279.75-45 chr5 159603626 159603899 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -137486 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 191.75-13 chr10 35905014 35905221 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 126815 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 341-19 chr3 99754757 99755257 + 1.5 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) intron (NM_001850, intron 3 of 4) -62855 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 233.5-50 chr2 18834331 18834521 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 192545 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 183.5-114 chr5 65122311 65122487 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 353469 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 287.25-44 chr7 51862546 51862863 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -469448 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 249-6 chr11 84619390 84619619 + 1.5 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 101438 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 334.5 chr1 35618633 35619091 + 1.5 NA intron (NM_002794, intron 3 of 5) intron (NM_002794, intron 3 of 5) 12675 NM_001199780 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 297-15 chr14 58060020 58060347 + 1.5 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) intron (NM_001001872, intron 5 of 7) 92030 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 217.5-123 chr7 126347480 126347685 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 710602 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 161-121 chr8 122636472 122636620 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 57560 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 126.5-90 chr17 5305674 5305806 + 1.5 NA intron (NM_001291581, intron 1 of 16) intron (NM_001291581, intron 1 of 16) 23456 NM_001291582 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 192-2 chr1 35695979 35696126 + 1.5 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 20859 NM_001348691 127703 Hs.112023 NM_152374 ENSG00000142686 C1orf216 - chromosome 1 open reading frame 216 protein-coding 286.5-14 chr11 83378368 83378691 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -92122 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 271.5-21 chr13 47825476 47825689 + 1.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 107040 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 284.25-11 chr13 49566348 49566555 + 1.5 NA intron (NR_148016, intron 4 of 13) intron (NR_148016, intron 4 of 13) 19107 NM_001352505 55213 Hs.508021 NM_018191 ENSG00000136144 RCBTB1 CLLD7|CLLL7|GLP|RDEOA RCC1 and BTB domain containing protein 1 protein-coding 280-18 chr13 83854335 83854558 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 27947 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 339.5-18 chr3 174753908 174754217 + 1.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -105272 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 139 chr1 13970419 13970569 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 221079 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 357 chr1 73664938 73665276 + 1.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -9572 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 183-80 chr3 192288717 192288865 + 1.5 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) 50161 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 175-46 chr16 11132404 11132573 + 1.5 NA intron (NM_015226, intron 21 of 22) L1MB5|LINE|L1 123694 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 305.5-50 chr8 88078576 88078906 + 1.5 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) intron (NM_005941, intron 6 of 9) -204726 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 318.5-17 chr2 42320056 42320429 + 1.5 NA intron (NM_001145076, intron 18 of 21) FLAM_C|SINE|Alu 39796 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 424-6 chr2 88587953 88588529 + 1.5 NA intron (NM_004836, intron 7 of 16) intron (NM_004836, intron 7 of 16) 36688 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 252.25-6 chr10 122174993 122175334 + 1.5 NA intron (NM_001291878, intron 1 of 16) AluJb|SINE|Alu 11533 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 319-38 chr8 140669339 140669805 + 1.5 NA intron (NM_001352737, intron 30 of 32) intron (NM_001352737, intron 30 of 32) -33939 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 276-38 chr5 38087185 38087531 + 1.5 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -61122 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 164.5-72 chr15 61139812 61140029 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 89382 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 141-141 chr6 123928498 123928663 + 1.5 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 124715 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 114.5-274 chr9 26922429 26922529 + 1.5 NA intron (NM_001321546, intron 7 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -24511 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 253-7 chr10 87708855 87709158 + 1.5 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) intron (NM_001015880, intron 1 of 12) 49128 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 184.5-136 chr6 149158495 149158654 + 1.5 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -59350 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 123-101 chr2 46841724 46841950 + 1.5 NA intron (NR_024452, intron 1 of 2) intron (NR_024452, intron 1 of 2) 13973 NR_024452 100134259 Hs.114449 NR_024452 ENSG00000239332 LINC01119 - long intergenic non-protein coding RNA 1119 ncRNA 368.25-4 chr12 42379183 42379552 + 1.5 NA intron (NM_001364830, intron 4 of 6) L3|LINE|CR1 47569 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 262.5-52 chr4 17347785 17348069 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27045 NR_145770 109616994 NR_145770 ENSG00000206780 SNORA75B - small nucleolar RNA, H/ACA box 75B snoRNA 309-26 chr22 32372949 32373257 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1839 NR_104232 10737 Hs.274285 NR_001450 ENSG00000205853 RFPL3S NCRNA00005|RFPL3-AS|RFPL3-AS1|RFPL3ANT|RFPL3AS RFPL3 antisense ncRNA 213.5-43 chr16 7274957 7275242 + 1.5 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -57746 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 297.75-47 chr7 124011297 124011547 + 1.5 NA intron (NR_133947, intron 3 of 4) intron (NR_133947, intron 3 of 4) 16800 NR_133947 105375483 Hs.435972 NR_133947 ENSG00000241345 LOC105375483 - uncharacterized LOC105375483 ncRNA 307-8 chr11 34616737 34617026 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4212 NM_001206615 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 316.5-37 chr8 85890248 85890503 + 1.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -62433 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 289.5-40 chr5 39571214 39571488 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 50920 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 242.5-8 chr1 210767087 210767392 + 1.5 NA intron (NM_002238, intron 10 of 10) intron (NM_002238, intron 10 of 10) 366135 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 244.75-35 chr22 34858528 34858985 + 1.5 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 139160 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 298.25-6 chr12 4329566 4329826 + 1.5 NA intron (NM_020375, intron 1 of 5) L1MC4a|LINE|L1 8483 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 277.5-51 chr3 190813967 190814249 + 1.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 48586 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 326.25-10 chr13 75971074 75971320 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36065 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 363 chr1 57969242 57969610 + 1.5 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) AluSz6|SINE|Alu 108845 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 150.5-92 chr2 89820635 89820831 + 1.5 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -182826 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 358.5-21 chr8 123125182 123125551 + 1.5 NA intron (NM_001363149, intron 11 of 21) intron (NM_001363149, intron 11 of 21) 52117 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 247.75-5 chr12 12787494 12787915 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001130415, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001130415, exon 2 of 2) 2045 NM_030817 81575 Hs.23388 NM_030817 ENSG00000178878 APOLD1 VERGE apolipoprotein L domain containing 1 protein-coding 146.25-139 chr7 95407996 95408104 + 1.5 NA intron (NM_000305, intron 6 of 8) intron (NM_000305, intron 6 of 8) -11675 NM_000940 5446 Hs.440967 NM_000940 ENSG00000105852 PON3 - paraoxonase 3 protein-coding 174-42 chr17 71999865 72000056 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 26019 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 308.5-26 chr3 153893745 153894087 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -131390 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 157.75-129 chr5 7225131 7225310 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 44134 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 211.5-51 chr14 63207329 63207588 + 1.5 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 3015 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 350-3 chr12 87646123 87646515 + 1.5 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -122493 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 232-20 chr16 71654433 71654809 + 1.5 NA intron (NM_015020, intron 17 of 18) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 28437 NM_001017967 91862 Hs.513706 NM_052858 ENSG00000140832 MARVELD3 MARVD3|MRVLDC3 MARVEL domain containing 3 protein-coding 240.75-7 chr10 24841127 24841316 + 1.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 111385 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 177.5-47 chr14 62350188 62350446 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -210344 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 179-5 chr1 116763477 116763640 + 1.5 NA intron (NM_001767, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR 9128 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 232.5-61 chr20 47986397 47986728 + 1.5 NA intron (NR_110027, intron 2 of 2) LTR47A2|LTR|ERVL 3336 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 375.75-5 chr14 60640194 60640742 + 1.5 NA TTS (NR_126480) TTS (NR_126480) 1252 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 283-17 chr16 76319216 76319512 + 1.5 NA intron (NM_001322191, intron 2 of 22) AluSz6|SINE|Alu 9512 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 158-156 chr9 108270576 108270770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 585313 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 220-10 chr10 63220475 63220806 + 1.5 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 48583 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 234.5-5 chr1 178733065 178733383 + 1.5 NA intron (NM_152663, intron 1 of 19) L1ME3|LINE|L1 7980 NM_152663 55103 Hs.632485 NM_018037 ENSG00000116191 RALGPS2 dJ595C2.1 Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 protein-coding 290.75-36 chr22 47105594 47105817 + 1.5 NA intron (NM_001284305, intron 11 of 12) L1MEd|LINE|L1 -189663 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 206.25-24 chr11 10140586 10140820 + 1.5 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) MER21C|LTR|ERVL 153504 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 244.5-63 chr22 25083010 25083220 + 1.5 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 29577 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 231-65 chr5 8513320 8513539 + 1.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 52504 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 340.75-13 chr2 96585447 96585698 + 1.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 47693 NM_001319092 10865 Hs.920 NM_006673 ENSG00000196843 ARID5A MRF-1|MRF1|RP11-363D14 AT-rich interaction domain 5A protein-coding 304.5-27 chr5 52701608 52701893 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -86166 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 279.75-54 chr8 80331963 80332414 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 90799 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 343.5-6 chr12 21231669 21232088 + 1.5 NA intron (NM_006446, intron 14 of 14) HUERS-P1-int|LTR|ERV1 100684 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 213.5-8 chr1 183215670 183215857 + 1.5 NA intron (NM_005562, intron 3 of 22) MIR|SINE|MIR 29499 NM_005562 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 114-168 chr9 73450115 73450250 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 298317 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 184.25-2 chr1 32088443 32088729 + 1.5 NA intron (NM_018056, intron 5 of 8) intron (NM_018056, intron 5 of 8) 1637 NR_049850 100847018 NR_049850 ENSG00000266203 MIR5585 - microRNA 5585 ncRNA 257-8 chr10 126772500 126772713 + 1.5 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger -102096 NR_146939 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 354.5-11 chr18 38702511 38702924 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 919458 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 410-2 chr12 129279691 129280251 + 1.5 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) intron (NM_133448, intron 4 of 8) 71370 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 302-25 chr5 126357758 126358014 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2234 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 360.5-11 chr3 29576620 29577122 + 1.5 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) L1MA2|LINE|L1 295559 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 210-92 chr7 38958336 38958542 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19470 NM_001370959 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 438 chr14 62006706 62007116 + 1.5 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) 79216 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 279.25-33 chr6 3648016 3648323 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 103843 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 372-5 chr12 32914382 32914775 + 1.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -17732 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 255-39 chr3 121126040 121126354 + 1.5 NA intron (NR_145517, intron 7 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie 76557 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 327.75-18 chr4 62189936 62190250 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28328 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-176 chrX 110347031 110347219 + 1.5 NA intron (NM_001171689, intron 2 of 7) intron (NM_001171689, intron 2 of 7) -29040 NM_015365 9949 Hs.656243 NM_015365 ENSG00000101935 AMMECR1 AMMERC1|MFHIEN Alport syndrome, mental retardation, midface hypoplasia and elliptocytosis chromosomal region gene 1 protein-coding 172-69 chr22 33715344 33715579 + 1.5 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) intron (NM_133642, intron 2 of 14) -9525 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 132.75-196 chr9 2171666 2171836 + 1.5 NA intron (NM_003070, intron 29 of 33) intron (NM_003070, intron 29 of 33) 13295 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 266-35 chr4 56662083 56662311 + 1.5 NA intron (NM_032495, intron 1 of 3) intron (NM_032495, intron 1 of 3) -5675 NM_139211 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 191.5-11 chr1 118297771 118298137 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -112726 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 222.5-21 chr10 118331164 118331550 + 1.5 NA intron (NM_022063, intron 6 of 8) intron (NM_022063, intron 6 of 8) 10967 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 383.25-8 chr2 57718082 57718462 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -189379 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 221-58 chr4 88854995 88855192 + 1.5 NA intron (NM_014883, intron 6 of 23) MIR|SINE|MIR -31732 NM_001015045 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 146.75-141 chr6 123478287 123478550 + 1.5 NA intron (NM_001256020, intron 8 of 8) intron (NM_001256020, intron 8 of 8) 38814 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 190.5-90 chr21 16745952 16746166 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155822 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 140.5-65 chr14 62682533 62682689 + 1.5 NA Intergenic MER73|LTR|ERVL 362847 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 239.75-54 chr4 163871562 163871737 + 1.5 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) -258115 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 244.5-54 chr2 121928272 121928488 + 1.5 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 172729 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 283-21 chr2 41071116 41071641 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -558943 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 160.5-141 chr4 183110598 183110731 + 1.5 NA intron (NM_024949, intron 1 of 22) intron (NM_024949, intron 1 of 22) 11407 NM_024949 80014 Hs.333179 NM_024949 ENSG00000151718 WWC2 BOMB WW and C2 domain containing 2 protein-coding 235.75-63 chr6 104649817 104650117 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 209579 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 217.5-81 chr3 115455552 115455779 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -167845 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 313.5-26 chr4 104211722 104212187 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -279011 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 258.5-72 chr8 115234177 115234529 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 433660 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 376.25-6 chr14 79861716 79862080 + 1.5 NA exon (NM_001330195, exon 21 of 21) exon (NM_001330195, exon 21 of 21) -349521 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 388.5-5 chr14 58992777 58993214 + 1.5 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) LTR16B1|LTR|ERVL 164707 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 280.25-50 chr7 38957540 38957838 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20220 NM_001370959 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 154-9 chr1 163457385 163457563 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34283 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 150.5-115 chr20 38762768 38762928 + 1.5 NA intron (NM_024855, intron 5 of 8) intron (NM_024855, intron 5 of 8) 14388 NM_024855 79913 Hs.371585 NM_024855 ENSG00000101442 ACTR5 Arp5|INO80M actin related protein 5 protein-coding 232-72 chr7 41467914 41468125 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -225900 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 148.25-144 chr8 84821964 84822221 + 1.5 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) intron (NM_001287244, intron 3 of 7) 116165 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 258-49 chr5 78508432 78508684 + 1.5 NA intron (NM_005779, intron 4 of 4) intron (NM_005779, intron 4 of 4) 140214 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 207.25-103 chr8 142031662 142031925 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -144546 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 294-6 chr12 14284444 14284668 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -81076 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 214-63 chr7 112655435 112655712 + 1.5 NA intron (NR_110158, intron 5 of 7) intron (NR_110158, intron 5 of 7) 33192 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 320.5-43 chr8 70785925 70786245 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 116746 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 203.25-114 chrX 36532206 36532455 + 1.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -92038 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 300.25-3 chr1 183138039 183138344 + 1.5 NA TTS (NR_149048) TTS (NR_149048) 3079 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 389-12 chr22 30507390 30507714 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1857 NM_174977 284904 Hs.517541 NM_174977 ENSG00000133488 SEC14L4 TAP3 SEC14 like lipid binding 4 protein-coding 321-33 chr8 110620773 110621017 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 406538 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 278.5-49 chr7 7219895 7220159 + 1.5 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) intron (NM_020156, intron 1 of 3) -35127 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 422.25-2 chr18 76464189 76464511 + 1.5 NA intron (NM_014643, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -27302 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 318-25 chr3 21258031 21258349 + 1.5 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -147536 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 244-32 chr3 24414523 24414792 + 1.5 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -79430 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 450-11 chr7 4828726 4829518 + 1.5 NA intron (NM_018059, intron 5 of 14) intron (NM_018059, intron 5 of 14) 8328 NR_145804 109623455 NR_145804 SNORD165 - small nucleolar RNA, C/D box 165 snoRNA 484-4 chr5 73042293 73042805 + 1.5 NA intron (NM_001146032, intron 10 of 24) intron (NM_001146032, intron 10 of 24) -78026 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 320.5-44 chr8 130140736 130141082 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 14 of 29) intron (NM_001362925, intron 14 of 29) -56141 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 119-21 chr10 125704060 125704230 + 1.5 NA intron (NR_033848, intron 3 of 4) intron (NR_033848, intron 3 of 4) 15348 NR_033847 399821 Hs.535286 NR_033847 ENSG00000224023 EDRF1-DT - EDRF1 divergent transcript ncRNA 375.5-8 chr18 65391653 65392076 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -358388 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 308.5-34 chr7 20476520 20476989 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -138913 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 278.25-31 chr2 153693048 153693390 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -178703 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 151-4 chr1 64124230 64124405 + 1.5 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) intron (NM_005012, intron 4 of 8) -10526 NR_110665 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 123-123 chr21 34218669 34218772 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 38043 NR_027267 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 167.25-93 chr2 189039900 189040054 + 1.5 NA intron (NM_000393, intron 50 of 53) intron (NM_000393, intron 50 of 53) 44347 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 331-25 chr5 106367 106746 + 1.5 NA intron (NM_052909, intron 1 of 19) intron (NM_052909, intron 1 of 19) 14388 NM_052909 153478 Hs.535800 NM_052909 ENSG00000153404 PLEKHG4B - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B protein-coding 310.5-3 chr1 92450587 92450986 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 33168 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 343.5-14 chr20 59703777 59704130 + 1.5 NA intron (NM_001199506, intron 1 of 12) intron (NM_001199506, intron 1 of 12) -17257 NM_183246 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 226-11 chr12 20211654 20211950 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -83901 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 159-38 chr16 13125742 13125897 + 1.5 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 224221 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 295.25-5 chr11 3081379 3081847 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -24190 NM_001014437 833 Hs.274873 NM_001751 ENSG00000110619 CARS CARS1|CYSRS|MGC:11246 cysteinyl-tRNA synthetase protein-coding 305.25 chr1 14501722 14501979 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -81877 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 256.5-38 chr2 209509566 209509782 + 1.5 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -69662 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 213-6 chr1 84900393 84900606 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7293 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 175.75-88 chr3 180161511 180161730 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -124683 NM_016559 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 224-14 chr13 20772610 20772885 + 1.5 NA intron (NM_001318939, intron 1 of 4) intron (NM_001318939, intron 1 of 4) 1211 NM_174928 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 219-49 chr19 36898556 36898801 + 1.5 NA intron (NM_001037232, intron 5 of 5) L1M2|LINE|L1 17361 NM_001171979 374899 Hs.720312 NM_001037232 ENSG00000185869 ZNF829 - zinc finger protein 829 protein-coding 152.75-94 chr2 231142919 231143026 + 1.5 NA intron (NM_001191037, intron 17 of 23) intron (NM_001191037, intron 17 of 23) -17930 NM_000867 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 157.5-149 chr4 92972040 92972199 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L1MA5|LINE|L1 667720 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 357.25-12 chr4 60992430 60992943 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70067 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 211-53 chr5 91684457 91684804 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -301313 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 352.5-12 chr2 196810978 196811284 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_213608) promoter-TSS (NM_213608) -855 NM_213608 401027 Hs.245666 NM_213608 ENSG00000187944 C2orf66 IIDS6411|UNQ6411 chromosome 2 open reading frame 66 protein-coding 165-35 chr13 75883772 75884042 + 1.5 NA TTS (NM_001257995) TTS (NM_001257995) 7021 NR_126373 104326189 Hs.671216 NR_126373 ENSG00000223458 LMO7DN-IT1 C13orf45-IT1|TCONS_00021569 LMO7DN intronic transcript 1 ncRNA 234-24 chr2 139659990 139660304 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 762823 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 225.5-36 chr14 70358046 70358257 + 1.5 NA intron (NM_001202548, intron 3 of 5) L1MB8|LINE|L1 1532 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 179.5-13 chr1 203872811 203872986 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11051 NM_001328638 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 367 chr1 50806158 50806544 + 1.5 NA intron (NM_007051, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 153916 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 277.25-19 chr19 42573523 42573929 + 1.5 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) intron (NR_073180, intron 2 of 2) 21198 NM_001816 1088 Hs.41 NM_001816 ENSG00000124469 CEACAM8 CD66b|CD67|CGM6|NCA-95 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 8 protein-coding 605.75-2 chr8 120549333 120549979 + 1.5 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) intron (NM_021021, intron 4 of 6) 104237 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 222.75-57 chr2 24397733 24397927 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37294 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 193.5-70 chr18 4645487 4645736 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -190304 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 240.25-37 chr2 230502251 230502756 + 1.5 NA intron (NM_001080391, intron 19 of 28) MIR|SINE|MIR 85747 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 345.75-6 chr2 195887050 195887322 + 1.5 NA intron (NM_018897, intron 33 of 64) intron (NM_018897, intron 33 of 64) 181651 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 224.75-66 chr7 34228372 34228664 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 322979 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 250.75-63 chr7 50560256 50560566 + 1.5 NA intron (NM_001082971, intron 1 of 14) intron (NM_001082971, intron 1 of 14) 660 NM_001242886 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 407.5-2 chr14 69816331 69816907 + 1.5 NA TTS (NR_149012) TTS (NR_149012) 4859 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 190.75-109 chr8 114317835 114318046 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -881001 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 252-25 chr15 65041543 65041855 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -3688 NM_178859 123264 Hs.27018 NM_178859 ENSG00000186198 SLC51B OSTB|OSTBETA solute carrier family 51 beta subunit protein-coding 399.5-2 chr16 76709950 76710386 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 75170 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 409.25-2 chr2 76329303 76329678 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -618575 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 254.5-46 chr2 212304617 212304922 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 121591 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 306.25-23 chr20 21265253 21265672 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -37869 NM_012255 22803 Hs.255932 NM_012255 ENSG00000088930 XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 protein-coding 384.5-10 chr2 66812767 66813044 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -91531 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 177-62 chr3 57664024 57664211 + 1.5 NA intron (NM_152678, intron 4 of 19) intron (NM_152678, intron 4 of 19) 28960 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 287-6 chr10 107648042 107648298 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 421123 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 310.75-30 chr8 60846100 60846359 + 1.5 NA intron (NM_017780, intron 23 of 37) intron (NM_017780, intron 23 of 37) 104970 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 164.25-92 chr22 33095972 33096110 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12488 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 256.5-47 chr3 187683877 187684266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13677 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 285-24 chr2 120655637 120655914 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80093 NM_001371271 230.25-36 chr2 29617560 29617787 + 1.5 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MER31B|LTR|ERV1 -142296 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 221-2 chr1 99957711 99957905 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12188 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 182.75-43 chr13 71886078 71886333 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19001 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 282.5-63 chr8 79761666 79762152 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 4566 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 257.25-36 chr4 66682143 66682456 + 1.5 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 405475 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 191.75-134 chr9 102446489 102446738 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -73024 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 271.5-47 chr20 32423753 32424000 + 1.5 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) FLAM_C|SINE|Alu 59614 NM_080616 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 152.5-110 chr22 43523560 43523665 + 1.5 NA intron (NR_046563, intron 2 of 2) L1MCa|LINE|L1 7358 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 274.5-49 chr4 90320918 90321320 + 1.5 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) L1MA3|LINE|L1 86088 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 174-75 chr5 52522487 52522646 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -265350 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 189.75-19 chr11 95261987 95262134 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -29585 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 223 chr1 10493109 10493354 + 1.5 NA intron (NM_004565, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 18281 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 154.25-168 chr8 82863823 82863955 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48215 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 279-42 chr6 131109899 131110133 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25451 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 283.5-44 chr4 67796460 67796678 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -40483 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 185.5-111 chr3 124037261 124037424 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45172 NM_001317775 54763 Hs.567516 NM_017578 ENSG00000065371 ROPN1 CT91|ODF6|RHPNAP1|ROPN1A|ropporin rhophilin associated tail protein 1 protein-coding 210-67 chr3 162917908 162918137 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 385279 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 159-48 chr19 40299113 40299249 + 1.5 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -13836 NM_001626 208 Hs.631535 NM_001626 ENSG00000105221 AKT2 HIHGHH|PKBB|PKBBETA|PRKBB|RAC-BETA AKT serine/threonine kinase 2 protein-coding 215.25-89 chr5 154560932 154561121 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 35046 NR_036094 100422950 NR_036094 ENSG00000264760 MIR3141 mir-3141 microRNA 3141 ncRNA 376-14 chr2 153340257 153340732 + 1.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 138268 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 206.25-72 chr4 440602 440767 + 1.5 NA 3' UTR (NM_133474, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_133474, exon 3 of 3) 33525 NR_002451 79963 Hs.677493 NM_024903 ENSG00000251595 ABCA11P ABCA11|EST1133530 ATP binding cassette subfamily A member 11, pseudogene pseudo 124-55 chr16 25681076 25681164 + 1.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -10839 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 312.75-33 chr8 121342931 121343328 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -296217 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 246-46 chr4 90201554 90201754 + 1.5 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) MER33|DNA|hAT-Charlie -33377 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 379.75-2 chr1 112575414 112575832 + 1.5 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 43518 NM_017744 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 231-19 chr12 62497803 62498107 + 1.5 NA intron (NM_001278469, intron 4 of 35) L1ME1|LINE|L1 31129 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 210.75-95 chr8 76764342 76764541 + 1.5 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -81166 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 392-15 chr5 33602201 33602669 + 1.5 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) intron (NM_001324512, intron 14 of 21) 161659 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 157.5-216 chr8 119267239 119267422 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -20473 NR_149112 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 239-26 chr2 24429751 24429954 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61402 NM_001362950 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 121-90 chr18 53031444 53031567 + 1.5 NA intron (NM_005215, intron 5 of 28) intron (NM_005215, intron 5 of 28) -205596 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 241.5-76 chr4 125462211 125462436 + 1.5 NA intron (NM_001291303, intron 9 of 16) intron (NM_001291303, intron 9 of 16) -44936 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 320-38 chr9 79256316 79256724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -110854 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 434.25 chr1 7075353 7075748 + 1.5 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) intron (NM_001349608, intron 2 of 21) 290096 NM_015215 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 629 chr14 61645678 61646355 + 1.5 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -49497 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 153-162 chr9 30245051 30245291 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 163283 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 203.5-65 chr2 33628075 33628382 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28866 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 321.5-37 chr9 28378345 28378580 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 340843 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 286.5-18 chr11 116938948 116939276 + 1.5 NA intron (NM_001366687, intron 3 of 4) L1MC5a|LINE|L1 -101162 NM_001318021 335 Hs.93194 NM_000039 ENSG00000118137 APOA1 apo(a) apolipoprotein A1 protein-coding 226.5-18 chr13 55265698 55265925 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91357 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 271.75-22 chr2 125609898 125610131 + 1.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 507971 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 145.5-111 chr2 217172169 217172317 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -110490 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 244.75-53 chr6 66891117 66891384 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 1103371 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 202-63 chr6 148283075 148283242 + 1.5 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) intron (NM_001346505, intron 1 of 19) 10830 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 344.75-8 chr3 154365997 154366334 + 1.5 NA intron (NM_001038705, intron 3 of 3) MER4D|LTR|ERV1 -41668 NM_001114397 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 273.75-19 chr2 101840705 101841054 + 1.5 NA intron (NM_145686, intron 10 of 30) intron (NM_145686, intron 10 of 30) -142586 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 267-38 chr5 26078167 26078445 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 887353 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 256-24 chr2 15560480 15560726 + 1.5 NA intron (NR_052013, intron 1 of 50) intron (NR_052013, intron 1 of 50) 731 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 196.75-108 chr8 127074125 127074454 + 1.5 NA intron (NR_119373, intron 3 of 3) intron (NR_119373, intron 3 of 3) -5585 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 249-16 chr16 59025324 59025610 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -291151 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 379-4 chr2 34235312 34235659 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) MER45B|DNA|hAT-Tip100 168259 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 447-6 chr2 40208740 40209120 + 1.5 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) MIR3|SINE|MIR 221374 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 240-63 chr8 54506639 54506955 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 48862 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 353.25-22 chr8 122521674 122522193 + 1.5 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 46711 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 326.75-23 chr9 77543774 77544190 + 1.5 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 96333 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 224.25-72 chr4 121676110 121676311 + 1.5 NA intron (NM_001154, intron 8 of 12) intron (NM_001154, intron 8 of 12) 20770 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 264.25-34 chr20 59256870 59257120 + 1.5 NA 3' UTR (NM_178457, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_178457, exon 5 of 5) -43616 NM_207032 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 260.25-47 chr7 18464616 18464992 + 1.5 NA intron (NM_001204144, intron 3 of 12) L1ME3A|LINE|L1 -30906 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 365 chr1 102865279 102865764 + 1.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 242975 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 326.5-24 chr5 120479576 120479957 + 1.5 NA intron (NM_001308087, intron 1 of 1) intron (NM_001308087, intron 1 of 1) 14135 NM_001308087 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 217.5-58 chr19 45490260 45490502 + 1.5 NA intron (NM_206900, intron 4 of 9) L1ME4a|LINE|L1 2872 NM_206901 6253 Hs.47517 NM_005619 ENSG00000125744 RTN2 NSP2|NSPL1|NSPLI|SPG12 reticulon 2 protein-coding 184-27 chr15 63751676 63751894 + 1.5 NA intron (NM_003922, intron 8 of 77) intron (NM_003922, intron 8 of 77) 82163 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 261-32 chr22 34743557 34743776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 254250 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 154.5-198 chr8 139503216 139503338 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 199846 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 386.75 chr14 63608009 63608420 + 1.5 NA intron (NM_080666, intron 2 of 2) AluSg|SINE|Alu 33657 NM_001258272 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 247-19 chr13 41986092 41986409 + 1.5 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 25081 NR_039974 100507240 Hs.147766 NR_039974 ENSG00000278338 VWA8-AS1 - VWA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 463.5-5 chr9 27594831 27595557 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -21328 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 409-2 chr10 73051854 73052432 + 1.5 NA intron (NM_001017962, intron 6 of 14) intron (NM_001017962, intron 6 of 14) 44831 NM_001142596 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 290.25-17 chr2 63025716 63026061 + 1.5 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 21823 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 256.5-55 chr5 14117981 14118267 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25218 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 268.5-57 chr7 39343561 39343775 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) MIR3|SINE|MIR -14534 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 312-22 chr3 182470448 182470740 + 1.5 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 15768 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 140.25-91 chr2 76316984 76317169 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -606161 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 258.75-4 chr1 180981713 180982047 + 1.5 NA intron (NM_005819, intron 7 of 7) intron (NM_005819, intron 7 of 7) -26993 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 444.25 chr11 79445787 79446128 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4927 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 420.75-6 chr15 77198205 77198618 + 1.5 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 26993 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 261-10 chr11 26386838 26387093 + 1.5 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) L1MC4|LINE|L1 54835 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 169.5-54 chr14 83302779 83303026 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 660270 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 229.5-20 chr10 95926273 95926614 + 1.5 NA intron (NM_001349008, intron 5 of 34) intron (NM_001349008, intron 5 of 34) 18478 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 369.5-17 chr2 83710898 83711402 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 188336 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 263.25-35 chr3 115893789 115894027 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) 11218 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 154.25-46 chr14 60499403 60499580 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9655 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 186-7 chr1 241621180 241621419 + 1.5 NA intron (NM_014322, intron 1 of 3) intron (NM_014322, intron 1 of 3) 14631 NM_001821 1122 Hs.654545 NM_001821 ENSG00000203668 CHML REP2 CHM like Rab escort protein protein-coding 285-36 chr5 11532799 11533051 + 1.5 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 55992 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 237.25-3 chr1 40775682 40775863 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8015 NM_004700 9132 Hs.473058 NM_004700 ENSG00000117013 KCNQ4 DFNA2|DFNA2A|KV7.4 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 4 protein-coding 219.5-34 chr12 122909797 122909976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13762 NM_024667 79720 Hs.507162 NM_024667 ENSG00000139722 VPS37B - VPS37B subunit of ESCRT-I protein-coding 194-6 chr1 92568403 92568575 + 1.5 NA intron (NM_001350198, intron 18 of 19) MER105|DNA|hAT-Charlie -81564 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 402.5-4 chr15 63146162 63146473 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 11160 NM_015920 51065 Hs.108957 NM_015920 ENSG00000185088 RPS27L - ribosomal protein S27 like protein-coding 143.5-196 chr7 53537128 53537380 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 274677 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 195.5-137 chr6 109693444 109693688 + 1.5 NA intron (NM_014845, intron 1 of 22) intron (NM_014845, intron 1 of 22) 2345 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 232.25-49 chr4 45631815 45632044 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 492125 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 135.25-148 chr4 126756665 126756812 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -876219 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 195-42 chr18 3295026 3295213 + 1.5 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 32400 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 290-24 chr18 9953564 9953766 + 1.5 NA intron (NM_194434, intron 5 of 5) intron (NM_194434, intron 5 of 5) 39649 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 243.25-48 chr6 87164360 87164545 + 1.5 NA intron (NM_015021, intron 1 of 7) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 8887 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 143.25-13 chr1 204645520 204645647 + 1.5 NA intron (NM_201630, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 40155 NM_201630 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 385-3 chr12 1187369 1187665 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 10 of 19) FLAM_C|SINE|Alu 159769 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 283-42 chr6 114230193 114230430 + 1.5 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) intron (NR_125845, intron 8 of 9) -167434 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 294-10 chr13 93562554 93562877 + 1.5 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 295758 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 270.5-53 chr5 169676272 169676599 + 1.5 NA intron (NR_156756, intron 6 of 52) intron (NR_156756, intron 6 of 52) 39160 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 217.5-71 chr20 51947752 51947976 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -84951 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 314-13 chr3 6790011 6790507 + 1.5 NA intron (NR_110125, intron 2 of 3) intron (NR_110125, intron 2 of 3) 15190 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 239.25-25 chr13 88756861 88757134 + 1.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 130144 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 214-21 chr14 80605194 80605485 + 1.5 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 336399 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 241.5 chr1 102573746 102574035 + 1.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 534606 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 207.25-75 chr5 118418324 118418482 + 1.5 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 135829 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 295.5-68 chrX 46950797 46951112 + 1.5 NA intron (NM_014735, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 38533 NM_014735 9767 Hs.371977 NM_014735 ENSG00000102221 JADE3 JADE-3|PHF16 jade family PHD finger 3 protein-coding 160-36 chr14 66119839 66120013 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -366445 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 352.25-16 chr6 93103253 93103601 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 316132 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 186-33 chr17 13594819 13595058 + 1.5 NA intron (NM_006042, intron 1 of 1) intron (NM_006042, intron 1 of 1) 6991 NM_006042 9955 Hs.462270 NM_006042 ENSG00000153976 HS3ST3A1 3-OST-3A|3OST3A1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3A1 protein-coding 316.5-31 chr5 18373608 18373902 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 566481 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 174.5-74 chr15 78487668 78487845 + 1.5 NA exon (NM_001320941, exon 13 of 21) exon (NM_001320941, exon 13 of 21) -19808 NM_001083612 123688 Hs.307962 NM_001013619 ENSG00000188266 HYKK AGPHD1 hydroxylysine kinase protein-coding 115.5-20 chr10 6228204 6228325 + 1.5 NA intron (NM_001314063, intron 15 of 15) intron (NM_001314063, intron 15 of 15) 25332 NM_001323017 5209 Hs.195471 NM_004566 ENSG00000170525 PFKFB3 IPFK2|PFK2|iPFK-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 protein-coding 392.5-13 chr9 37613789 37614235 + 1.5 NA intron (NM_001371225, intron 1 of 15) intron (NM_001371225, intron 1 of 15) 10783 NM_001371224 210.75-93 chr8 3229473 3229696 + 1.5 NA intron (NM_033225, intron 27 of 69) intron (NM_033225, intron 27 of 69) -501133 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 195-33 chr16 53321588 53321751 + 1.5 NA intron (NM_001352157, intron 37 of 37) intron (NM_001352157, intron 37 of 37) 49543 NM_001347693 643802 Hs.451336 NM_001207030 LOC643802 - u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein MPP10-like protein-coding 210.75-86 chr6 79568394 79568543 + 1.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -31038 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 208-66 chr5 45988491 45988717 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -292224 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 183.5-138 chr7 54072806 54072962 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -257813 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 269-13 chr11 86012779 86013006 + 1.5 NA intron (NM_001008660, intron 5 of 19) L1MC5|LINE|L1 56192 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 149-33 chr14 68464879 68464993 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) intron (NM_133509, intron 9 of 10) 163851 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 306-18 chr20 16744173 16744455 + 1.5 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 -4039 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 224.75-47 chr3 80360884 80361113 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -403899 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 319-26 chr4 60931837 60932184 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 9391 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 372.75-10 chr4 62025270 62025660 + 1.5 NA intron (NM_001371343, intron 20 of 23) intron (NM_001371343, intron 20 of 23) 136300 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 451.5-3 chr10 62337833 62338320 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36081 NM_199450 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 114.75-54 chr14 67736834 67736953 + 1.5 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 35007 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 341.5-21 chr3 188986355 188986640 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -38858 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 389-13 chr22 50133945 50134325 + 1.5 NA intron (NM_018995, intron 14 of 26) intron (NM_018995, intron 14 of 26) -12920 NM_001164106 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 323.25-13 chr2 71203389 71203760 + 1.5 NA intron (NM_020459, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 23529 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 197.25-40 chr18 8618280 8618504 + 1.5 NA intron (NM_001025300, intron 1 of 5) intron (NM_001025300, intron 1 of 5) 8947 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 233.5-108 chr8 109346905 109347138 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 12674 NM_001193557 56943 Hs.492555 NM_020189 ENSG00000120533 ENY2 DC6|Sus1|e(y)2 ENY2 transcription and export complex 2 subunit protein-coding 167.5-86 chr2 26049906 26050086 + 1.5 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 15912 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 200.5-25 chr12 34633238 34633473 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 610859 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 338.75-22 chr9 37793808 37794136 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -6582 NM_001286810 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 181.5-140 chr6 37317913 37318117 + 1.5 NA intron (NR_130108, intron 12 of 12) L2a|LINE|L2 -35968 NM_003958 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 291-15 chr14 70386513 70386795 + 1.5 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) intron (NM_001202549, intron 2 of 4) -26971 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 277-42 chr9 102733010 102733250 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 213493 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 140.75-140 chr5 29314936 29315058 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 80979 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 162.5-98 chr20 44983960 44984114 + 1.5 NA intron (NM_001352385, intron 4 of 11) intron (NM_001352385, intron 4 of 11) 17525 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 150-87 chr3 30902133 30902317 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7564 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 200.5-135 chr8 63589226 63589425 + 1.5 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 123476 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 223-57 chr4 78961897 78962063 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9768 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 252-73 chr8 100291438 100291678 + 1.5 NA intron (NM_001280539, intron 2 of 10) intron (NM_001280539, intron 2 of 10) 10635 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 443.75-3 chr3 194183164 194183696 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22877 NR_125404 100505920 Hs.436654 NR_125403 ENSG00000225742 LINC02036 - long intergenic non-protein coding RNA 2036 ncRNA 159.25-92 chr3 130234128 130234374 + 1.5 NA intron (NR_027898, intron 9 of 22) intron (NR_027898, intron 9 of 22) 21431 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 224.5-42 chr14 68778384 68778664 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15390 NM_004926 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 276.75-34 chr3 119672563 119672849 + 1.5 NA intron (NM_005694, intron 2 of 2) intron (NM_005694, intron 2 of 2) 4690 NM_005694 10063 Hs.534383 NM_005694 ENSG00000138495 COX17 - cytochrome c oxidase copper chaperone COX17 protein-coding 300.75-38 chr5 22908146 22908519 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54988 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 212.25-57 chr3 35986114 35986357 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 241759 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 306.25-18 chr18 574563 575043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5577 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 132-81 chr18 78066756 78066849 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -73075 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 415.25-2 chr4 33161458 33161898 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 810640 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 332.75-15 chr20 54977509 54977872 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -445353 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 310.5-27 chr4 30493517 30493787 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -226717 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 278.25-6 chr10 113489044 113489236 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -61691 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 205.5-28 chr12 38833001 38833196 + 1.5 NA intron (NM_153634, intron 5 of 19) AluSz|SINE|Alu 72493 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 269-12 chr11 21154954 21155503 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) L2c|LINE|L2 485642 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 140-98 chr22 35153109 35153221 + 1.5 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) intron (NR_126356, intron 4 of 5) 77891 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 295.5-64 chr9 37205998 37206212 + 1.5 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1MEf|LINE|L1 85507 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 247.5-12 chr11 113741504 113741786 + 1.5 NA intron (NM_004724, intron 11 of 15) intron (NM_004724, intron 11 of 15) 32047 NM_004724 9183 Hs.503886 NM_004724 ENSG00000086827 ZW10 HZW10|KNTC1AP zw10 kinetochore protein protein-coding 226.5-31 chr17 63128346 63128592 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 162234 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 230-24 chr16 47446613 47446950 + 1.5 NA intron (NM_030790, intron 5 of 17) intron (NM_030790, intron 5 of 17) 14282 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 214.5-75 chr3 8910479 8910720 + 1.5 NA intron (NM_020165, intron 9 of 12) AluYk3|SINE|Alu 52873 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 212.5-126 chr9 37285224 37285441 + 1.5 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) -137364 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 260.25 chr1 75849521 75849805 + 1.5 NA intron (NM_002440, intron 8 of 19) intron (NM_002440, intron 8 of 19) 52781 NM_002440 4438 Hs.216639 NM_002440 ENSG00000057468 MSH4 - mutS homolog 4 protein-coding 278.5-50 chr7 48360282 48360506 + 1.5 NA intron (NM_152701, intron 31 of 61) intron (NM_152701, intron 31 of 61) 188936 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 253.5-23 chr14 64233477 64233807 + 1.5 NA intron (NM_001437, intron 8 of 8) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 17688 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 339.5-29 chr7 9415078 9415443 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -219010 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 297.75-11 chr15 76779183 76779506 + 1.5 NA intron (NM_001353011, intron 9 of 32) L1MDa|LINE|L1 82600 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 261-28 chr2 175213750 175214061 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32195 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 291.5-45 chr6 145433508 145433870 + 1.5 NA Intergenic MER6B|DNA|TcMar-Tigger 253188 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 279.75-26 chr2 141881857 141882101 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) FLAM_C|SINE|Alu 249722 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 144-95 chr4 141629216 141629327 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -7312 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 282-8 chr11 58762749 58763007 + 1.5 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -30904 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 169-107 chr8 115724793 115724988 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55915 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 269-23 chr17 59900498 59900838 + 1.5 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) intron (NM_001272044, intron 2 of 15) 7547 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 167-44 chr15 44318932 44319158 + 1.5 NA intron (NR_157849, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 30326 NM_177974 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 292.5-23 chr15 62046705 62047261 + 1.5 NA intron (NM_001018088, intron 1 of 81) intron (NM_001018088, intron 1 of 81) 13464 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 273-23 chr14 84777984 84778457 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -493712 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 264-66 chr9 100121728 100122048 + 1.5 NA intron (NR_134606, intron 2 of 16) L1MDa|LINE|L1 22645 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 235.25-29 chr18 4904196 4904524 + 1.5 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -176822 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 329.25-19 chr21 15637678 15638005 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92093 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 342.5-7 chr11 24824691 24825027 + 1.5 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 327806 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 348.5-4 chr2 103703029 103703385 + 1.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 705125 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 222.75-87 chr7 29428675 29428886 + 1.5 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -50932 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 257.5-2 chr1 79086191 79086578 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79654 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 274-3 chr1 92649148 92649469 + 1.5 NA intron (NM_005665, intron 11 of 17) L1MB5|LINE|L1 135800 NM_001350198 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 288-19 chr13 96178185 96178487 + 1.5 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 87497 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 237.5-87 chr6 49039451 49040056 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 423500 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 330.5-10 chr14 68135297 68135637 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L2b|LINE|L2 311875 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 233.5-54 chr2 107112825 107113111 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -225859 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 180.5-108 chr4 19923926 19924134 + 1.5 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -327875 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 270.5-44 chr3 112196613 112196954 + 1.5 NA intron (NM_001320531, intron 19 of 27).2 L1ME3A|LINE|L1 63360 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 271-21 chr17 70829616 70829923 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 372410 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 259.5-40 chr15 68570119 68570409 + 1.5 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) MIRc|SINE|MIR -8729 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 321-25 chr6 34809526 34809897 + 1.5 NA intron (NM_017754, intron 1 of 20) AluSx3|SINE|Alu 17628 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 377-8 chr3 2202454 2202881 + 1.5 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) MIRc|SINE|MIR -36162 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 393-15 chr5 29346680 29347466 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 48903 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 333.25-9 chr2 123899872 123900408 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 125034 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 216-41 chr2 96516372 96516598 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -8376 NR_104346 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 217.5-105 chr6 9719733 9720005 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -684633 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 244-27 chr2 128139963 128140228 + 1.5 NA intron (NR_027671, intron 16 of 40) intron (NR_027671, intron 16 of 40) 48895 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 190-92 chrX 136469978 136470147 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17885 NM_001727 680 Hs.121484 NM_001727 ENSG00000102239 BRS3 BB3|BB3R|BBR3 bombesin receptor subtype 3 protein-coding 130.5-146 chr2 215739170 215739366 + 1.5 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie 21225 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 235.75-77 chr8 77069140 77069475 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -68263 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 191.5-129 chr6 71164194 71164468 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -124480 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 239-29 chr2 102785404 102785702 + 1.5 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) intron (NM_001321346, intron 3 of 3) 23522 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 146.5-110 chr2 134278069 134278194 + 1.5 NA intron (NM_001371457, intron 3 of 16) intron (NM_001371457, intron 3 of 16) 24059 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 213-44 chr2 77237837 77238079 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 251993 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 228-90 chrX 98547462 98547753 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -983072 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 341.25-27 chr8 120133501 120133772 + 1.5 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) intron (NM_021110, intron 1 of 47) 8534 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 222.5-10 chr1 187325431 187325609 + 1.5 NA intron (NR_126347, intron 2 of 3) intron (NR_126347, intron 2 of 3) -118108 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 257.25-19 chr18 13723292 13723530 + 1.5 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) intron (NM_001098801, intron 1 of 4) 3147 NM_001098801 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 239-33 chr20 10195738 10195968 + 1.5 NA intron (NR_040710, intron 2 of 4) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -22945 NM_130811 6616 Hs.167317 NM_003081 ENSG00000132639 SNAP25 CMS18|RIC-4|RIC4|SEC9|SNAP|SNAP-25|SUP|bA416N4.2|dJ1068F16.2 synaptosome associated protein 25 protein-coding 156-122 chr5 86651682 86651863 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 31266 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 305.75-2 chr10 65435582 65435944 + 1.5 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL -135662 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 168.75-8 chr1 85983355 85983556 + 1.5 NA intron (NM_152890, intron 20 of 59) intron (NM_152890, intron 20 of 59) 173016 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 440.25-6 chr9 125979751 125980158 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 231771 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 166.5-123 chr21 28537417 28537686 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1767 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 242.25-23 chr13 112765599 112765811 + 1.5 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) -10974 NR_109811 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 356.25-22 chr9 22368161 22368626 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -78431 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 185.75-123 chr8 31271796 31272042 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -238563 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 729.25 chr1 100919421 100920257 + 1.5 NA intron (NM_133496, intron 7 of 10) intron (NM_133496, intron 7 of 10) 23749 NM_001144884 148867 Hs.533903 NM_133496 ENSG00000162695 SLC30A7 ZNT7|ZnT-7|ZnTL2 solute carrier family 30 member 7 protein-coding 210-22 chr12 125524469 125524747 + 1.5 NA intron (NM_052907, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR -97844 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 437.75-2 chr15 60573738 60574495 + 1.5 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) 18410 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 142.5-126 chr20 53438530 53438643 + 1.5 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -114184 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 351.75-10 chr18 7123450 7123789 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5822 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 245-43 chr3 187060999 187061266 + 1.5 NA intron (NM_173216, intron 5 of 7) L1MB2|LINE|L1 22414 NM_001353916 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 458-8 chrX 58218182 58218598 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -307757 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 231.5-68 chr3 183381705 183381883 + 1.5 NA intron (NM_015078, intron 2 of 29) intron (NM_015078, intron 2 of 29) 46475 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 411-5 chr2 37543264 37543665 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 128735 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 355.5-16 chr2 236458427 236458693 + 1.5 NA intron (NR_073043, intron 6 of 19) intron (NR_073043, intron 6 of 19) 45137 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 244.5-90 chr7 94629369 94629569 + 1.5 NA intron (NM_001301139, intron 1 of 9) intron (NM_001301139, intron 1 of 9) 26664 NM_001362807 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 256.5-73 chr7 80948073 80948365 + 1.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -25830 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 230-26 chr17 9690363 9690851 + 1.5 NA intron (NM_001267576, intron 8 of 14) AluSx1|SINE|Alu 45070 NM_001267576 124739 Hs.709621 NM_153210 ENSG00000154914 USP43 - ubiquitin specific peptidase 43 protein-coding 267-34 chr3 140790439 140790646 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 112478 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 143.5-134 chr21 26149971 26150114 + 1.5 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) MER34A|LTR|ERV1 -9652 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 259.5-48 chr17 9041179 9041409 + 1.5 NA intron (NM_004822, intron 2 of 6) L1MB8|LINE|L1 19784 NM_004822 9423 Hs.660885 NM_004822 ENSG00000065320 NTN1 MRMV4|NTN1L netrin 1 protein-coding 228.75-4 chr1 74370947 74371149 + 1.5 NA intron (NM_015978, intron 17 of 24) intron (NM_015978, intron 17 of 24) 112392 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 287.5-7 chr10 55356157 55356406 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -242761 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 197.25-4 chr1 113615279 113615536 + 1.5 NA intron (NM_001142782, intron 7 of 20) intron (NM_001142782, intron 7 of 20) 143748 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 134.5-102 chr2 123973783 123973918 + 1.5 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 51324 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 126.75-169 chr4 44370134 44370233 + 1.5 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 78626 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 412.75-6 chr8 119554565 119554880 + 1.5 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 38286 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 162.75-26 chr12 22652101 22652226 + 1.5 NA intron (NM_018638, intron 2 of 7) L1MB2|LINE|L1 26992 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 224 chr1 48984929 48985129 + 1.5 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) L1MEc|LINE|L1 -208060 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 133-84 chr2 121171434 121171525 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 113723 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 194.5-70 chr2 86078518 86078683 + 1.5 NA intron (NM_015425, intron 9 of 33) intron (NM_015425, intron 9 of 33) 27286 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 285.5-28 chr18 58067004 58067250 + 1.5 NA intron (NM_001144964, intron 1 of 30) intron (NM_001144964, intron 1 of 30) 19901 NM_001144964 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 251.75-36 chr2 63499812 63500153 + 1.5 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) intron (NR_148705, intron 1 of 16) -61975 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 357.5-17 chr5 112203249 112203613 + 1.5 NA intron (NM_001347887, intron 15 of 23) L2c|LINE|L2 -24852 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 363.5-4 chr12 1706006 1706459 + 1.5 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 MIRb|SINE|MIR 15162 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 342-11 chr3 108336069 108336519 + 1.5 NA intron (NM_001370244, intron 2 of 9) intron (NM_001370244, intron 2 of 9) 24509 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 300-24 chr2 156287204 156287588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32465 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 272-9 chr14 32586903 32587257 + 1.5 NA intron (NM_004274, intron 5 of 13) L1ME4b|LINE|L1 257782 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 278.5-23 chr17 71997839 71998096 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28012 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 218.5-8 chr1 77628280 77628534 + 1.5 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) intron (NM_001308237, intron 4 of 13) 54251 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 300.5-31 chr3 72356658 72356978 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 89805 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 365-2 chr10 66995064 66995554 + 1.5 NA intron (NR_111911, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 16844 NR_111911 101928961 Hs.687014 NR_111911 LOC101928961 - uncharacterized LOC101928961 ncRNA 294-12 chr15 45947549 45947761 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 242460 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 375.75-4 chr13 74889616 74889958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 336944 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 175-72 chr2 129828376 129828641 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 48983 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 163-98 chr5 84005067 84005236 + 1.5 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) L1MA3|LINE|L1 -284296 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 333.75-12 chr2 30448231 30448612 + 1.5 NA intron (NM_001304446, intron 1 of 5) intron (NM_001304446, intron 1 of 5) 1175 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 425.25-8 chr8 124481917 124482363 + 1.5 NA intron (NM_007218, intron 1 of 1) intron (NM_007218, intron 1 of 1) 7373 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 173.5-167 chr8 112866425 112866579 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) intron (NM_001363185, intron 8 of 66) 223009 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 320.5-7 chr11 56636227 56636657 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5997 NM_001002925 338675 Hs.449692 NM_001002925 ENSG00000172464 OR5AP2 OR9J1 olfactory receptor family 5 subfamily AP member 2 protein-coding 212.25-85 chr7 36290507 36290793 + 1.5 NA intron (NM_030636, intron 6 of 7) intron (NM_030636, intron 6 of 7) 76590 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 249.5-23 chr12 49600377 49600695 + 1.5 NA exon (NM_032130, exon 4 of 7) exon (NM_032130, exon 4 of 7) 5103 NM_032130 84070 Hs.524406 NM_032130 ENSG00000135436 FAM186B C12orf25 family with sequence similarity 186 member B protein-coding 313.5-29 chr5 61794091 61794345 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -58520 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 183.75-16 chr10 65832784 65833023 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 261478 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 390 chr10 59810067 59810470 + 1.5 NA intron (NM_005436, intron 5 of 8) intron (NM_005436, intron 5 of 8) -56813 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 259.5-50 chr17 70747660 70747899 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 454400 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 231.25-29 chr19 28147806 28148003 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -353964 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 182.25-42 chr15 53182544 53182704 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 66259 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 211.5-75 chr2 66989763 66989990 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -67386 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 157.5-131 chr3 33519576 33519731 + 1.5 NA intron (NM_001365634, intron 31 of 35) intron (NM_001365634, intron 31 of 35) -79248 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 144-114 chr6 146465070 146465245 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -78676 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 222-81 chr8 101226223 101226486 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -20290 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 415-3 chr5 117200500 117201027 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -214749 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 284.5-7 chr11 21212676 21212937 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) L1MD2|LINE|L1 543220 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 188.25-89 chr5 38872876 38873097 + 1.5 NA intron (NM_003999, intron 2 of 17) intron (NM_003999, intron 2 of 17) 26974 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 256-62 chr6 132250439 132250710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 116596 NR_146223 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 242 chr1 40226700 40227018 + 1.5 NA intron (NM_012421, intron 6 of 7) (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -21078 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 279-46 chr7 90224362 90224694 + 1.5 NA intron (NM_001244944, intron 2 of 5) MER66B|LTR|ERV1 10708 NM_001040666 261729 Hs.489051 NM_152999 ENSG00000157214 STEAP2 IPCA1|PCANAP1|PUMPCn|STAMP1|STMP STEAP2 metalloreductase protein-coding 248.5-24 chr14 39711204 39711408 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -278806 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 445.5-4 chr3 88425120 88425544 + 1.5 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) intron (NM_001368168, intron 2 of 2) 86876 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 202.5-130 chr6 161049811 161049959 + 1.5 NA non-coding (NR_120425, exon 3 of 28) non-coding (NR_120425, exon 3 of 28) 58116 NM_005922 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 179.5-28 chr10 108604074 108604288 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -534888 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 123.75-146 chr5 86039232 86039334 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -243161 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 313.75-20 chr6 152240915 152241472 + 1.5 NA intron (NM_182961, intron 107 of 145) intron (NM_182961, intron 107 of 145) -55815 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 228.75-94 chr9 77143061 77143261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34284 NM_015186 23230 Hs.459790 NM_015186 ENSG00000197969 VPS13A CHAC|CHOREIN vacuolar protein sorting 13 homolog A protein-coding 217-60 chr4 66213118 66213417 + 1.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -63557 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 369.25-6 chr3 18946114 18946742 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -202082 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 282.5-5 chr10 11930045 11930363 + 1.5 NA intron (NM_080599, intron 20 of 21) intron (NM_080599, intron 20 of 21) -35494 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 383.5-7 chr2 62494117 62494524 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11875 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 219.25-43 chr20 11442646 11442924 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -169402 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 279.75-28 chr2 225523289 225523644 + 1.5 NA intron (NM_001371273, intron 4 of 7) L1PB4|LINE|L1 122580 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 121-134 chr3 134210220 134210368 + 1.5 NA intron (NM_001005861, intron 3 of 14) intron (NM_001005861, intron 3 of 14) 40450 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 124.75-16 chr1 180470696 180470977 + 1.5 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) intron (NM_032360, intron 3 of 7) 31741 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 194-83 chr8 138059679 138059904 + 1.5 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) intron (NR_161374, intron 1 of 7) 23754 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 303.5-21 chr2 50431584 50431868 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MER58B|DNA|hAT-Charlie -83970 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 280.5-32 chr3 23959407 23959685 + 1.5 NA intron (NM_005126, intron 3 of 7) intron (NM_005126, intron 3 of 7) 13425 NM_001145425 9975 Hs.37288 NM_005126 ENSG00000174738 NR1D2 BD73|EAR-1R|REVERBB|REVERBbeta|RVR nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 protein-coding 195-39 chr17 62134805 62134995 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69622 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 352.5-23 chr5 84551780 84552166 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -167093 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 372.75-5 chr10 92869325 92869837 + 1.5 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) AluJr4|SINE|Alu 21061 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 191.25-5 chr1 152517093 152517467 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 2798 NM_019060 54544 Hs.110196 NM_019060 ENSG00000169509 CRCT1 C1orf42|NICE-1|NICE1 cysteine rich C-terminal 1 protein-coding 121-47 chr12 43435623 43435772 + 1.5 NA intron (NM_025003, intron 18 of 38) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 116506 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 441.5-8 chr7 3342522 3343094 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MD1|LINE|L1 41556 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 261.5-3 chr10 37789003 37789297 + 1.5 NA intron (NR_147992, intron 6 of 8) L1MB8|LINE|L1 6025 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 208.5-140 chr8 101766913 101767110 + 1.5 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) L1ME3G|LINE|L1 23958 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 227.75-5 chr1 108970090 108970404 + 1.5 NA TTS (NM_001142550) TTS (NM_001142550) -6748 NM_015127 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 433.25-5 chrUn_KI270337v1 327 925 + 1.5 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 294.75-5 chr12 23162614 23162889 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12885 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 210-8 chr1 182933481 182933718 + 1.5 NA intron (NM_030933, intron 5 of 9) L1M4|LINE|L1 19567 NM_030933 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 190.5-11 chr10 15163341 15163593 + 1.5 NA intron (NM_001308295, intron 1 of 12) intron (NM_001308295, intron 1 of 12) 5226 NM_004808 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 346.25-10 chr2 52225925 52226276 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -144548 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 289.75-25 chr4 76386132 76386419 + 1.5 NA intron (NM_001042784, intron 3 of 23) L1MA2|LINE|L1 21030 NM_001042784 339965 Hs.529680 NM_178555 ENSG00000163749 CCDC158 - coiled-coil domain containing 158 protein-coding 248.5-63 chr22 32777495 32777782 + 1.5 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) L2b|LINE|L2 -23178 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 145-81 chr2 176416241 176416375 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 146866 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 233.25-27 chr16 24956436 24956641 + 1.5 NA intron (NM_001006634, intron 9 of 19) intron (NM_001006634, intron 9 of 19) 58831 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 232.5-12 chr10 78228486 78228736 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20014 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 224.75-17 chr11 35398544 35398866 + 1.5 NA intron (NM_001252652, intron 1 of 11) intron (NM_001252652, intron 1 of 11) 20853 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 196.5-67 chr17 64570271 64570512 + 1.5 NA intron (NM_022739, intron 10 of 18) intron (NM_022739, intron 10 of 18) 63414 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 232.5-49 chr2 72308597 72308859 + 1.5 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -160866 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 328.25-4 chr12 33603735 33604088 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -164092 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 278-4 chr1 193696974 193697369 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 392426 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 140-133 chr5 15439678 15439880 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -60401 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 215-62 chr5 69186606 69186791 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2885 NM_022909 64946 Hs.631967 NM_022909 ENSG00000153044 CENPH - centromere protein H protein-coding 398.5 chr10 51250914 51251347 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -48443 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 127-165 chr7 88109065 88109194 + 1.5 NA intron (NM_001324421, intron 5 of 28) L3b|LINE|CR1 -107531 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 280-40 chr4 129860859 129861119 + 1.5 NA intron (NR_151713, intron 10 of 16) intron (NR_151713, intron 10 of 16) 89370 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 214.5-136 chrX 66346495 66346802 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 178898 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 305.5-38 chr6 46607994 46608311 + 1.5 NA intron (NM_016593, intron 7 of 11) intron (NM_016593, intron 7 of 11) 44666 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 338.5-9 chr17 13345274 13345701 + 1.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -38727 NR_146885 105371541 NR_146885 ENSG00000234634 LINC02093 - long intergenic non-protein coding RNA 2093 ncRNA 175.5-134 chr5 22526158 22526296 + 1.5 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) -312377 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 568.75-2 chr5 133050206 133050866 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1477 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 308.25-24 chr4 67663328 67663584 + 1.5 NA intron (NM_018227, intron 11 of 32) intron (NM_018227, intron 11 of 32) 37699 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 238.5-24 chr14 53099981 53100140 + 1.5 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) MER2|DNA|TcMar-Tigger 53263 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 129.5-158 chr3 81543118 81543253 + 1.5 NA intron (NM_000158, intron 12 of 15) intron (NM_000158, intron 12 of 15) 218460 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 224.25-64 chr4 39777355 39777558 + 1.5 NA intron (NM_001111112, intron 5 of 5) intron (NM_001111112, intron 5 of 5) 79320 NM_001111113 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 204-38 chr2 121966699 121966868 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 211132 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 134.5-214 chr8 41479865 41479971 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10478 NM_001362979 51125 Hs.654773 NM_016099 ENSG00000147533 GOLGA7 GCP16|GOLGA3AP1|GOLGA7A|HSPC041 golgin A7 protein-coding 158.25-62 chr2 107722329 107722527 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31684 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 144.5-86 chr17 71421531 71421655 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -219414 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 625.5 chr22 24938358 24939008 + 1.5 NA intron (NM_001001663, intron 2 of 3) intron (NM_001001663, intron 2 of 3) 8012 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 319.5-27 chr2 220842805 220843258 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 729273 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 255-45 chr4 91921406 91921635 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 355782 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 167-46 chr15 70826954 70827129 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26198 NM_001284357 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 183-105 chr7 29884776 29885219 + 1.5 NA intron (NM_001080529, intron 5 of 8) intron (NM_001080529, intron 5 of 8) 78443 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 149.25-83 chr2 98993636 98993842 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -57514 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 381.75-7 chr9 81629251 81629887 + 1.5 NA intron (NM_005077, intron 8 of 19) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 59966 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 282.5-45 chr4 33190704 33190922 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 839775 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 394.5-3 chr11 112070873 112071196 + 1.5 NA intron (NM_001082619, intron 4 of 5) intron (NM_001082619, intron 4 of 5) 3137 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 260.25-52 chr8 51738539 51738801 + 1.5 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) L1MD2|LINE|L1 70775 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 200.25-59 chr2 74068519 74068733 + 1.5 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) L1ME4b|LINE|L1 65934 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 306.5-6 chr10 76152267 76152804 + 1.5 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) L1MB7|LINE|L1 369774 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 521 chr10 65529431 65530120 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -41650 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 140.25-51 chr15 59767458 59767572 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -78195 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 337-33 chr9 5927260 5927559 + 1.5 NA intron (NM_001017969, intron 6 of 7) L2a|LINE|L2 36520 NM_005511 2315 Hs.154069 NM_005511 ENSG00000120215 MLANA MART-1|MART1 melan-A protein-coding 246.75-29 chr2 7036751 7037009 + 1.5 NA intron (NM_001349181, intron 8 of 9) intron (NM_001349181, intron 8 of 9) 41000 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 259-13 chr11 45451448 45451877 + 1.5 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 80265 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 341.25-17 chr20 44901094 44901514 + 1.5 NA intron (NM_003404, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR -8756 NM_001124756 80336 Hs.641481 NM_001124756 ENSG00000101104 PABPC1L C20orf119|EPAB|PABPC1L1|dJ1069P2.3 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like protein-coding 187.5-97 chr2 192775281 192775476 + 1.5 NA intron (NR_152587, intron 3 of 3) intron (NR_152587, intron 3 of 3) 25533 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 329.75-15 chr5 78697819 78698205 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -49240 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 151.5-207 chr9 107484582 107484778 + 1.5 NA TTS (NM_004235) TTS (NM_004235) 5089 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 352-2 chr1 118669655 118670076 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 318478 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 130-15 chr10 74018892 74019047 + 1.5 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) L1ME4b|LINE|L1 20853 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 260.75-33 chr2 134663403 134663815 + 1.5 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 55391 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 347-20 chr4 86200874 86201217 + 1.5 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) L1MA4|LINE|L1 81239 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 233.5-16 chr1 213509189 213509392 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -415459 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 215.5-63 chr21 19843022 19843305 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 56592 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 357.75-17 chr7 158157255 158157622 + 1.5 NA intron (NM_130843, intron 6 of 21) L3|LINE|CR1 302853 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 300.5-9 chr10 93966124 93966383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4338 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 154.5-151 chr5 110348667 110348841 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165161 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 301.5-44 chr9 69639892 69640271 + 1.5 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) L1MC5|LINE|L1 32290 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 319.5-26 chr2 175105001 175105380 + 1.5 NA intron (NR_045773, intron 9 of 13) MamRep1151|LTR?|LTR? 62519 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 505-2 chr4 38976768 38977459 + 1.5 NA intron (NM_024943, intron 5 of 6) AluSz|SINE|Alu 55296 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 212.75-95 chr7 115963756 115963940 + 1.5 NA intron (NM_001018058, intron 2 of 6) L1MB4|LINE|L1 4465 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 318.75-7 chr16 35864858 35865173 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 118463 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 174-39 chr16 87797494 87797695 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -18446 NR_120309 102724467 Hs.587857 NR_120309 LOC102724467 - uncharacterized LOC102724467 ncRNA 264.5-43 chr4 113809944 113810129 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48109 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 301-30 chr8 136038342 136038583 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -492336 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 176.25-138 chr8 103480967 103481144 + 1.5 NA TTS (NR_145697) TTS (NR_145697) 18176 NR_145705 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 246.75-30 chr2 45512131 45512339 + 1.5 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 99032 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 237.75-79 chr8 9668347 9668601 + 1.5 NA intron (NM_003747, intron 3 of 26) intron (NM_003747, intron 3 of 26) -73198 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 241.5-61 chr21 40546491 40546745 + 1.5 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) intron (NR_073202, intron 3 of 32) 84149 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 161-79 chr4 19661048 19661203 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -590780 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 266.25-52 chr9 98923981 98924174 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19830 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 196.25-79 chr22 49287915 49288359 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 255329 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 201.5-109 chr5 99982651 99982869 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 405494 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 229.5-114 chr6 68900098 68900295 + 1.5 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L1ME4c|LINE|L1 264914 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 270-55 chr8 102458199 102458538 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45668 NM_015902 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 332.25-11 chr14 71788742 71789065 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -143268 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 181.5-37 chr13 62637172 62637377 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 159418 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 227-56 chr6 68722879 68723219 + 1.5 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 87767 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 323.5-20 chr4 99151283 99151559 + 1.5 NA intron (NR_037884, intron 2 of 9) MER4-int|LTR|ERV1 -7123 NM_001306171 127 Hs.1219 NM_000670 ENSG00000198099 ADH4 ADH-2|HEL-S-4 alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide protein-coding 350.75-12 chr6 133223600 133223941 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17587 NM_001370458 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 219.75-90 chr9 6186976 6187163 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28080 NM_001314044 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 209.25-114 chr8 133859757 133859987 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26624 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 193.75-109 chr7 13065242 13065479 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 377727 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 298 chr1 34822751 34822975 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 29864 NM_002060 2701 Hs.296310 NM_002060 ENSG00000187513 GJA4 CX37 gap junction protein alpha 4 protein-coding 213-29 chr14 63972149 63972357 + 1.5 NA intron (NM_015180, intron 11 of 114) intron (NM_015180, intron 11 of 114) 119249 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 228-18 chr12 4068922 4069143 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -195584 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 121.25-194 chr8 74197853 74198000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 123435 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 287-29 chr5 17219665 17220073 + 1.5 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 2238 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 284.25-7 chr11 105170177 105170480 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30559 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 279.5-39 chr3 47132469 47132827 + 1.5 NA intron (NR_146158, intron 1 of 21) intron (NR_146158, intron 1 of 21) 31329 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 202.25-89 chr7 91894583 91894837 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14008 NM_006980 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 171-120 chr6 105443507 105443692 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -40517 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 244.5-29 chr13 108322167 108322427 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 52668 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 166.25-149 chr9 78770776 78770914 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 374821 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 335.25-11 chr12 94812657 94813122 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -21509 NR_030171 574449 NR_030171 ENSG00000283998 MIR492 MIRN492|hsa-mir-492 microRNA 492 ncRNA 401-17 chr8 28083759 28084280 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001010906) promoter-TSS (NM_001010906) -83 NM_001010906 389643 Hs.370129 NM_001010906 ENSG00000189233 NUGGC C8orf80|HMFN0672|SLIP-GC nuclear GTPase, germinal center associated protein-coding 242.75-25 chr2 17320650 17320883 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197674 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 344.5-12 chr3 11307160 11307496 + 1.5 NA intron (NM_001136031, intron 4 of 17) intron (NM_001136031, intron 4 of 17) 34931 NM_006395 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 325.5 chr1 29427011 29427477 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -77130 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 144-111 chr6 77989706 77989962 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 336795 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 213-60 chr22 50398535 50398765 + 1.5 NA intron (NM_001351648, intron 3 of 22) AluSx3|SINE|Alu -8792 NR_162128 113218480 NR_162128 MIR12114 - microRNA 12114 ncRNA 244.5-14 chr10 43572853 43573204 + 1.5 NA intron (NM_001324353, intron 2 of 4) intron (NM_001324353, intron 2 of 4) 1588 NM_001324353 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 223-27 chr15 27593434 27593791 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -432293 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 247-23 chr16 31578716 31579017 + 1.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -9342 NR_027011 440359 Hs.650902 NR_027011 YBX3P1 CSDAP1 Y-box binding protein 3 pseudogene 1 pseudo 119.25-154 chr4 131197717 131197909 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -567025 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 283.25-26 chr3 4304986 4305404 + 1.5 NA intron (NM_001320678, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 1891 NM_001276325 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 134-171 chr8 120845758 120845861 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33763 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 320.5-26 chr21 30003686 30003971 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63776 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 324.75-22 chr4 79046958 79047412 + 1.5 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 75437 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 324-19 chr3 44663420 44663811 + 1.5 NA intron (NR_157564, intron 1 of 2) intron (NR_157564, intron 1 of 2) 14883 NM_003420 7584 Hs.288658 NM_003420 ENSG00000169981 ZNF35 HF.10|HF10|Zfp105 zinc finger protein 35 protein-coding 287-16 chr14 71653643 71653960 + 1.5 NA intron (NM_001354286, intron 9 of 24) MIRb|SINE|MIR 67503 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 281.75-11 chr11 104896294 104896518 + 1.5 NA intron (NR_034071, intron 2 of 7) intron (NR_034071, intron 2 of 7) 2264 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 167-83 chr4 31133290 31133435 + 1.5 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -37782 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 187.5-23 chr11 6028675 6028822 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -1007 NM_001001917 120796 Hs.553543 NM_001001917 ENSG00000180934 OR56A1 OR11-75 olfactory receptor family 56 subfamily A member 1 protein-coding 336.5-4 chr10 90476176 90476448 + 1.5 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 64493 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 373.5-21 chr8 77471192 77471454 + 1.5 NA intron (NR_125830, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 20626 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 295.25-18 chr3 48042443 48042764 + 1.5 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) L1MB8|LINE|L1 46245 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 379.75-13 chr9 31435729 31436439 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54594 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 130.75-41 chr12 62493386 62493589 + 1.5 NA intron (NM_001278469, intron 2 of 35) intron (NM_001278469, intron 2 of 35) 26661 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 248.25-74 chr8 126075844 126076068 + 1.5 NA Intergenic (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -124759 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 305.25-31 chr22 35012245 35012598 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14505 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 556.5-2 chr17 66625055 66625550 + 1.5 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -161770 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 123.25-55 chr14 45532456 45532574 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 183087 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 413.5-3 chr14 54687048 54687492 + 1.5 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) -67563 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 272.75-23 chr2 71362687 71363013 + 1.5 NA intron (NM_001252613, intron 3 of 27) intron (NM_001252613, intron 3 of 27) 31068 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 281-30 chr5 110742728 110742965 + 1.5 NA intron (NM_138773, intron 2 of 7) intron (NM_138773, intron 2 of 7) 3839 NM_138773 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 398-6 chr2 37883925 37884290 + 1.5 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -8244 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 278.5-30 chr2 64123937 64124329 + 1.5 NA intron (NM_020651, intron 1 of 6) L1MB8|LINE|L1 20287 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 355.5-19 chr4 61962782 61963186 + 1.5 NA intron (NM_001371343, intron 16 of 23) L2c|LINE|L2 198781 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 342.75-26 chr7 28418919 28419159 + 1.5 NA intron (NM_182898, intron 1 of 10) intron (NM_182898, intron 1 of 10) 6521 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 285-45 chr8 119518473 119518737 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 74403 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 230.5-25 chr11 105613693 105613973 + 1.5 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 3127 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 293.75-48 chr9 86398238 86398553 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -43985 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 212.5-107 chr7 83449254 83449551 + 1.5 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) (TTTAATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 192029 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 270-36 chr3 65985908 65986159 + 1.5 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -31475 NR_145422 151877 Hs.476636 NR_145422 ENSG00000272610 MAGI1-IT1 - MAGI1 intronic transcript 1 ncRNA 336-24 chr6 134610653 134610972 + 1.5 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -70807 NR_125855 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 315-5 chr10 28139957 28140349 + 1.5 NA intron (NR_134518, intron 4 of 16) intron (NR_134518, intron 4 of 16) -66775 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 289.75-23 chr4 47093394 47093729 + 1.5 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 61994 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 304.5-35 chr7 34624136 34624447 + 1.5 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -33927 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 318.75-20 chr7 41431598 41432025 + 1.5 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -262108 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 126.5-180 chr4 146318173 146318340 + 1.5 NA intron (NM_001029998, intron 6 of 11) L2-3_Crp|LINE|L2 -90327 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 262-59 chr8 104950397 104950690 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -361519 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 425.5-3 chr14 27699487 27700137 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26591 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 309-38 chr5 61624543 61624820 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13079 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 193.25-51 chr2 58776648 58776946 + 1.5 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 256044 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 200.5-9 chr1 153135931 153136199 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 5428 NR_003062 6702 Hs.2421 NR_003062 SPRR2C - small proline rich protein 2C (pseudogene) pseudo 221-70 chr6 75327274 75327498 + 1.5 NA intron (NM_001300866, intron 4 of 6) L2|LINE|L2 42372 NR_040081 100506804 Hs.743708 NR_040081 LOC100506804 - uncharacterized LOC100506804 ncRNA 147-79 chr2 124508141 124508278 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 8 of 23) intron (NM_130773, intron 8 of 23) 482922 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 234-56 chr5 175646908 175647205 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11015 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 272.5-71 chr8 118682544 118682756 + 1.5 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) L1MC|LINE|L1 -60687 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 255.5-58 chr3 109986448 109986756 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 383774 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 208-58 chr3 192881820 192882049 + 1.5 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) intron (NM_178496, intron 1 of 1) 35922 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 247.5-30 chr16 57685344 57685583 + 1.5 NA intron (NM_001308360, intron 9 of 10) intron (NM_001308360, intron 9 of 10) -9343 NM_032269 84229 Hs.513635 NM_032269 ENSG00000159625 DRC7 C16orf50|CCDC135|CFAP50|FAP50 dynein regulatory complex subunit 7 protein-coding 190.5-39 chr12 131355873 131356118 + 1.5 NA intron (NR_103736, intron 2 of 3) intron (NR_103736, intron 2 of 3) 8525 NR_103736 338797 Hs.592007 NM_001025466 LINC02370 - long intergenic non-protein coding RNA 2370 ncRNA 282.5-36 chr2 169853064 169853321 + 1.5 NA intron (NM_172070, intron 1 of 38) intron (NM_172070, intron 1 of 38) 25684 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 166.75-124 chr6 63882263 63882403 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 75497 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 231-22 chr13 108022841 108023084 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -155466 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 129.5-192 chr5 163882249 163882405 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 376708 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 227.5-36 chr14 103262468 103262837 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -54632 NR_135269 105378183 Hs.132624 NR_135269 LOC105378183 - uncharacterized LOC105378183 ncRNA 188-51 chr4 105280598 105280765 + 1.5 NA TTS (NM_001127208) TTS (NM_001127208) 72200 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 319.5-25 chr2 53610022 53610311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -157617 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 122-165 chr7 29833599 29833714 + 1.5 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) intron (NM_001080529, intron 1 of 8) 27102 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 204.75-118 chr8 61172384 61172592 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -115482 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 235.25-61 chr7 87773398 87773669 + 1.5 NA intron (NM_138290, intron 8 of 11) L1ME3E|LINE|L1 -60210 NM_001348945 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 276-8 chr10 70073145 70073440 + 1.5 NA intron (NM_018649, intron 1 of 8) intron (NM_018649, intron 1 of 8) 20446 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 245.25-9 chr10 61719955 61720254 + 1.5 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) HAL1b|LINE|L1 57143 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 472.5-5 chr8 60048915 60049256 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 232315 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 136.5-164 chr4 42879217 42879349 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13983 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 243.5-3 chr1 38721285 38721499 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 138380 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 300.5-37 chr5 83639343 83639696 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001884, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001884, exon 5 of 5) -77205 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 184-24 chr14 62329730 62329947 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -189865 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 302.5-9 chr12 118637835 118638150 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 123687 NR_134999 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 331.5-11 chr16 11339186 11339466 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 5886 NR_135174 105371083 Hs.737495 NR_135174 ENSG00000263080 LOC105371083 - uncharacterized LOC105371083 ncRNA 259.5-93 chr8 77491001 77491247 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 40427 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 141.5-213 chr7 92598601 92598705 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8263 NM_152789 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 526-2 chr3 6944320 6945142 + 1.5 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 -50714 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 243-24 chr15 62913386 62913580 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 89526 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 251-41 chr4 100889731 100890225 + 1.5 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -214865 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 169.5-66 chr18 65105686 65105817 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -644501 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 390.5-6 chr19 24380125 24380511 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -216871 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 201.5-123 chr7 107739953 107740149 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 3581 NR_144536 101927974 Hs.432792 NR_144536 ENSG00000241764 LOC101927974 - uncharacterized LOC101927974 ncRNA 166.25-93 chr20 44995060 44995231 + 1.5 NA exon (NM_006282, exon 6 of 11) exon (NM_006282, exon 6 of 11) 28633 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 362.5-9 chr15 98841178 98841616 + 1.5 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) MIR|SINE|MIR 56971 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 189-61 chr2 113988099 113988278 + 1.5 NA intron (NR_148508, intron 1 of 1) intron (NR_148508, intron 1 of 1) -8204 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 292-31 chr3 117076935 117077318 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155695 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 191.5-70 chr2 43871988 43872237 + 1.5 NA exon (NM_022437, exon 7 of 13) exon (NM_022437, exon 7 of 13) 33141 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 268.25-16 chr15 50006762 50006978 + 1.5 NA intron (NR_073597, intron 7 of 26) intron (NR_073597, intron 7 of 26) 106509 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 168-70 chr2 135141697 135141881 + 1.5 NA intron (NM_001172435, intron 17 of 24) L1ME3|LINE|L1 5161 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 244.5-104 chr9 20648094 20648294 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10115 NM_017794 54914 Hs.136247 NM_017794 ENSG00000188352 FOCAD KIAA1797 focadhesin protein-coding 264.75-30 chr3 96133727 96134071 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -226065 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 271-37 chr5 21613176 21613458 + 1.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 153837 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 401-14 chr6 118063225 118063692 + 1.5 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) -22445 NR_134601 105377967 Hs.692865 NR_134601 LOC105377967 - uncharacterized LOC105377967 ncRNA 358.75-4 chr2 32280763 32281284 + 1.5 NA intron (NM_032312, intron 1 of 5) intron (NM_032312, intron 1 of 5) 3119 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 287.75-34 chr21 26617214 26617437 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -44039 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 280.25-13 chr11 11510376 11510807 + 1.5 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) tRNA-Gly-GGA|tRNA|tRNA 111414 NM_001363464 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 331.5-14 chr2 196767264 196767621 + 1.5 NA intron (NM_012086, intron 16 of 17) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 32241 NM_012086 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 201.75-68 chr4 102553957 102554126 + 1.5 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) intron (NM_003998, intron 5 of 23) -51555 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 207.5-38 chr17 60472722 60472906 + 1.5 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) intron (NM_006380, intron 4 of 12) 50325 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 593.5-2 chr21 28582127 28583018 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43254 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 273.75-34 chr5 57668994 57669365 + 1.5 NA intron (NR_104668, intron 2 of 2) intron (NR_104668, intron 2 of 2) 18519 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 283-41 chr6 43325696 43326053 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -17048 NM_206922 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 237.5-30 chr14 48587737 48588050 + 1.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -792879 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 227.75-90 chrX 69791065 69791287 + 1.5 NA intron (NM_001005613, intron 2 of 2) intron (NM_001005613, intron 2 of 2) 175063 NM_001005609 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 208-27 chr16 26267998 26268208 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 242866 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 228-69 chr6 77006455 77006759 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -412984 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 200-87 chr7 109459781 109459970 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 500338 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 214.5-121 chr7 132773958 132774260 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 15139 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 486.5-2 chr4 52023074 52023710 + 1.5 NA 3' UTR (NM_000232, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_000232, exon 6 of 6) -3029 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 249.5-81 chr5 127897853 127898164 + 1.5 NA intron (NM_001317938, intron 6 of 6) intron (NM_001317938, intron 6 of 6) 185167 NR_152813 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 366-6 chr12 33829154 33829833 + 1.5 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -193003 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 191-88 chr8 145055035 145055237 + 1.5 NA 3' UTR (NM_023080, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_023080, exon 5 of 5) 2669 NM_023080 65265 Hs.169615 NM_023080 ENSG00000182307 C8orf33 - chromosome 8 open reading frame 33 protein-coding 146.25-62 chr19 29559650 29559813 + 1.5 NA intron (NM_001146339, intron 4 of 4) intron (NM_001146339, intron 4 of 4) 33147 NM_001146339 342865 Hs.451618 NM_001146339 ENSG00000187135 VSTM2B - V-set and transmembrane domain containing 2B protein-coding 279-12 chr14 96685289 96685493 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55800 NR_146552 105370646 NR_146552 ENSG00000258979 LINC02299 - long intergenic non-protein coding RNA 2299 ncRNA 420.5-8 chr3 57804170 57804597 + 1.5 NA intron (NM_001304420, intron 1 of 21) intron (NM_001304420, intron 1 of 21) 47127 NM_001304420 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 118.5-204 chr7 139248733 139248847 + 1.5 NA intron (NM_173569, intron 2 of 17) intron (NM_173569, intron 2 of 17) 17553 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 296.25-9 chr14 88744144 88744537 + 1.5 NA intron (NM_183387, intron 3 of 42) intron (NM_183387, intron 3 of 42) 48613 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 332.5-13 chr2 191645112 191645416 + 1.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -32808 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 255.75-50 chr8 50052070 50052411 + 1.5 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) L1MB7|LINE|L1 -111891 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 202-18 chr11 109113108 109113433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -308920 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 453.5-2 chr4 117420847 117421215 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7367 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 278.5-8 chr10 25644004 25644272 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -7574 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 362.75 chr1 45341882 45342223 + 1.5 NA exon (NM_025077, exon 5 of 8) exon (NM_025077, exon 5 of 8) -1582 NM_001293190 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 226.5-69 chr4 63856472 63856782 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 552823 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 263-43 chr6 36056094 36056342 + 1.5 NA intron (NM_139012, intron 2 of 11) intron (NM_139012, intron 2 of 11) 28410 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 364.5-5 chr10 94529188 94529683 + 1.5 NA intron (NM_015188, intron 11 of 12) AluSp|SINE|Alu -16332 NM_001289070 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 221.5-82 chr6 40457237 40457487 + 1.5 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 79025 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 360-3 chr14 70026082 70026705 + 1.5 NA intron (NM_022137, intron 11 of 11) intron (NM_022137, intron 11 of 11) 48260 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 248.25-63 chr6 149331028 149331329 + 1.5 NA intron (NM_015093, intron 1 of 8) L1MC|LINE|L1 12878 NM_015093 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 332.75-8 chr12 123727257 123727737 + 1.5 NA intron (NM_012463, intron 5 of 19) AluSg4|SINE|Alu 15144 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 222-48 chr22 31443222 31443460 + 1.5 NA intron (NM_001164502, intron 13 of 16) intron (NM_001164502, intron 13 of 16) 43737 NM_004147 4733 Hs.115242 NM_004147 ENSG00000185721 DRG1 NEDD3 developmentally regulated GTP binding protein 1 protein-coding 207-20 chr12 13235685 13235920 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39076 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 220-15 chr11 98892997 98893247 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -127827 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 286.5-56 chr6 47308029 47308280 + 1.5 NA intron (NM_014452, intron 1 of 5) intron (NM_014452, intron 1 of 5) 1751 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 164.25-38 chr14 56226654 56226829 + 1.5 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 108330 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 369.5-8 chr15 79771787 79772110 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125049 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 207.5-15 chr11 105392936 105393141 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -217035 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 309.5-30 chr3 193960753 193961088 + 1.5 NA intron (NR_033944, intron 1 of 2) intron (NR_033944, intron 1 of 2) 33318 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 318-24 chr3 7507123 7507548 + 1.5 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) intron (NM_000844, intron 7 of 9) 27949 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-99 chr17 66674797 66674964 + 1.5 NA intron (NM_002737, intron 5 of 16) intron (NM_002737, intron 5 of 16) -112192 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 259-38 chr8 34006355 34006584 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -406363 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 387.5-10 chr4 99390845 99391220 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -38286 NR_133005 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 350-21 chrX 45898178 45898480 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46839 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 265.5-57 chr7 16121605 16121919 + 1.5 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) intron (NM_001101426, intron 9 of 9) -88724 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 390-11 chr5 99967860 99968204 + 1.5 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 420222 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 322-16 chr2 185077794 185078089 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 89131 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 245.25-22 chr15 49174709 49175019 + 1.5 NA intron (NM_002044, intron 1 of 9) intron (NM_002044, intron 1 of 9) 4617 NR_147895 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 390.25-8 chr8 102070053 102070503 + 1.5 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 54056 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 284-46 chr7 114278065 114278318 + 1.5 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) -136624 NR_033767 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 205.5-41 chr14 46012054 46012229 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52018 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 191.25-116 chr9 104596523 104596944 + 1.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 2680 NM_001004482 138799 Hs.553598 NM_001004482 ENSG00000277556 OR13C5 OR9-11 olfactory receptor family 13 subfamily C member 5 protein-coding 277.75-10 chr16 48644344 48644602 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -34293 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 291.25-18 chr3 44784695 44785088 + 1.5 NA exon (NM_020242, exon 6 of 35).2 exon (NM_020242, exon 6 of 35).2 23097 NM_020242 56992 Hs.658939 NM_020242 ENSG00000163808 KIF15 HKLP2|KLP2|KNSL7|NY-BR-62 kinesin family member 15 protein-coding 301.75-19 chr2 125935887 125936193 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 181945 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 205.75-27 chr15 90505605 90505746 + 1.5 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -24248 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 258-13 chr14 49172882 49173068 + 1.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 413405 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 288.75-43 chr8 106455957 106456342 + 1.5 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 8225 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 347-15 chr3 2925767 2926282 + 1.5 NA intron (NM_175607, intron 13 of 24) intron (NM_175607, intron 13 of 24) 33809 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 177.5-180 chr9 30063018 30063218 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 345336 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 162.25-7 chr1 76759055 76759269 + 1.5 NA intron (NR_149059, intron 1 of 2) intron (NR_149059, intron 1 of 2) 20105 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 240-24 chr17 43799834 43800186 + 1.5 NA TTS (NM_001330233) TTS (NM_001330233) 19575 NM_001136483 284067 Hs.252707 NM_001136483 ENSG00000231256 CFAP97D1 C17orf105 CFAP97 domain containing 1 protein-coding 376-8 chr17 39676910 39677253 + 1.5 NA intron (NM_001291726, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 8628 NM_002686 5409 Hs.1892 NM_002686 ENSG00000141744 PNMT PENT|PNMTase phenylethanolamine N-methyltransferase protein-coding 217-37 chr2 159231850 159232087 + 1.5 NA 3' UTR (NM_033394, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_033394, exon 27 of 27) 45133 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 296.25-27 chr5 102415914 102416242 + 1.5 NA intron (NM_001308014, intron 3 of 8) L1PB4|LINE|L1 82923 NM_001308014 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 272.75-18 chr17 79015155 79015516 + 1.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -5571 NM_001159773 124583 Hs.8859 NM_138793 ENSG00000171302 CANT1 DBQD|DBQD1|EDM7|SCAN-1|SCAN1|SHAPY calcium activated nucleotidase 1 protein-coding 227.75-7 chr10 43613313 43613688 + 1.5 NA intron (NM_145312, intron 4 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 7062 NM_145312 220992 Hs.147440 NM_145312 ENSG00000198298 ZNF485 - zinc finger protein 485 protein-coding 382.5-4 chr10 22836940 22837408 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -90850 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 338-24 chr4 41251454 41251917 + 1.5 NA intron (NR_102709, intron 1 of 2) AluSq|SINE|Alu 5042 NR_102709 101410542 Hs.518731 NR_102709 ENSG00000251173 UCHL1-AS1 - UCHL1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 351-16 chr4 39085211 39085627 + 1.5 NA intron (NM_199039, intron 3 of 9) intron (NM_199039, intron 3 of 9) 23187 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 244.5-26 chr13 65136712 65136957 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -729213 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 286.75-32 chr4 42662431 42662830 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5525 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 284.5-25 chr17 59903344 59903727 + 1.5 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) L1MB7|LINE|L1 10414 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 167-97 chr6 18588266 18588383 + 1.5 NA intron (NR_149116, intron 3 of 7) intron (NR_149116, intron 3 of 7) 16540 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 418.5-7 chr2 82520557 82520963 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -336043 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 123.5-136 chr3 95251267 95251366 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 313053 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 295.5-30 chr2 161768935 161769280 + 1.5 NA intron (NM_001354443, intron 2 of 25) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 144691 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 179.25-120 chr5 95994562 95994739 + 1.5 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 32649 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 130.5-115 chr17 43514924 43515095 + 1.5 NA intron (NR_136228, intron 17 of 23) L1ME4a|LINE|L1 15426 NM_001261439 2118 Hs.434059 NM_001986 ENSG00000175832 ETV4 E1A-F|E1AF|PEA3|PEAS3 ETS variant 4 protein-coding 218.25-100 chr8 129081369 129081517 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -115442 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 152.75-138 chr6 128720950 128721077 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -162125 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 298.5-42 chr8 101446488 101446714 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45838 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 167.5-129 chr4 113202710 113202900 + 1.5 NA intron (NM_001354275, intron 5 of 43) intron (NM_001354275, intron 5 of 43) 50523 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 155.5-145 chr4 75284033 75284279 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69920 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 214.5-66 chr20 2018686 2018911 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24513 NM_001190899 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 139-78 chr2 110673277 110673390 + 1.5 NA intron (NM_001278616, intron 2 of 23) MER21B|LTR|ERVL 4730 NM_004336 699 Hs.469649 NM_004336 ENSG00000169679 BUB1 BUB1A|BUB1L|hBUB1 BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase protein-coding 302-32 chr8 118929380 118929736 + 1.5 NA intron (NM_002546, intron 2 of 4) intron (NM_002546, intron 2 of 4) 22327 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 237.75-84 chr9 68936675 68936894 + 1.5 NA intron (NM_003558, intron 13 of 15) intron (NM_003558, intron 13 of 15) 39057 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 164.5-209 chr8 95348413 95348600 + 1.5 NA intron (NR_038209, intron 2 of 3) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -79305 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 402-11 chr5 163984722 163985142 + 1.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 479313 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 256.5-60 chr5 75417107 75417417 + 1.5 NA intron (NM_031361, intron 6 of 16) intron (NM_031361, intron 6 of 16) 80042 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 437-5 chr2 33593802 33594292 + 1.5 NA intron (NM_015475, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 5252 NM_015475 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 357.75-7 chr2 14387565 14387876 + 1.5 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) intron (NR_103814, intron 1 of 3) 13238 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 176.75-30 chr13 104160168 104160394 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 735081 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 303.5-39 chr6 66472606 66472999 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 684923 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 289-30 chr4 94730477 94731178 + 1.5 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 26706 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 574.75 chr18 13924804 13925388 + 1.5 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? -9389 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 133.25-12 chr1 242639691 242639837 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -115067 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 115.5-254 chr9 102075821 102075938 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -337299 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 271-51 chr8 137399250 137399468 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 14229 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 198.25-30 chr14 49485873 49486139 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 100374 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 126-142 chr5 73619056 73619214 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -7023 NM_001080479 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 161.5-53 chr13 104728671 104728851 + 1.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -737106 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 163.5-124 chr3 21342203 21342349 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -63450 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 292.5 chr1 111670033 111670367 + 1.5 NA intron (NM_001370217, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 5406 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 191.5-155 chr9 136870978 136871213 + 1.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -4759 NM_153200 8721 Hs.174050 NM_003792 ENSG00000107223 EDF1 CFAP280|EDF-1|MBF1 endothelial differentiation related factor 1 protein-coding 158.5-87 chr19 37966287 37966510 + 1.5 NA intron (NM_015073, intron 1 of 21) intron (NM_015073, intron 1 of 21) 59190 NM_015073 23094 Hs.655502 NM_015073 ENSG00000105738 SIPA1L3 CTRCT45|SPAL3|SPAR3 signal induced proliferation associated 1 like 3 protein-coding 218-43 chr22_KI270879v1_alt 274079 274354 + 1.5 NA intron (NM_001293810, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 4078 NR_132348 106099130 Hs.678440 NR_132348 GSTT1-AS1 - GSTT1 antisense RNA 1 ncRNA 296.75-33 chr7 74381398 74381807 + 1.5 NA intron (NM_032421, intron 10 of 15) L1ME4b|LINE|L1 -72304 NM_001199207 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 251.25-14 chr13 66391318 66391578 + 1.5 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) MER130|DNA|DNA 173198 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 265.5-32 chr17 63137172 63137418 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 171060 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 286-18 chr2 13586068 13586444 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -579243 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 219-53 chr2 127646958 127647206 + 1.5 NA intron (NM_001161417, intron 1 of 1) intron (NM_001161417, intron 1 of 1) 929 NM_005291 2840 Hs.46453 NM_005291 ENSG00000144230 GPR17 - G protein-coupled receptor 17 protein-coding 162.75-94 chr3 61901940 61902107 + 1.5 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 340452 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 374.75 chr15 26705981 26706230 + 1.5 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) 10660 NM_001191320 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 229-70 chr7 40530175 40530355 + 1.5 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) MamGypsy2-LTR|LTR|Gypsy 395289 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 258-5 chr10 28097996 28098281 + 1.5 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -24760 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 285.5-7 chr10 80879783 80880171 + 1.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 230180 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 300.75-11 chr12 132459075 132459289 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30969 NM_001142641 57666 Hs.411138 NM_001142641 ENSG00000112787 FBRSL1 - fibrosin like 1 protein-coding 352.75-19 chr9 130917716 130918109 + 1.5 NA intron (NM_001145106, intron 5 of 7) MIR1_Amn|SINE|MIR -21100 NM_198180 347148 Hs.660704 NM_198180 ENSG00000188710 QRFP 26RFa|P518 pyroglutamylated RFamide peptide protein-coding 318.75-3 chr12 40408596 40409005 + 1.5 NA intron (NM_173600, intron 5 of 173) intron (NM_173600, intron 5 of 173) 15406 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 131-87 chr2 55305121 55305210 + 1.5 NA intron (NM_001254943, intron 25 of 33) (ATTTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22846 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 283-44 chr8 119632516 119632891 + 1.5 NA intron (NM_001330600, intron 2 of 25) intron (NM_001330600, intron 2 of 25) 6136 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 143.5-132 chr21 19047875 19048051 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -288151 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 274.25-47 chr7 111608326 111608699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45995 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 146.25-123 chr6 38401773 38401997 + 1.5 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR -79711 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 276-27 chr2 160883118 160883675 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -253559 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 255.5-7 chr1 152075394 152075652 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 5401 NM_001310142 100131107 NM_001310142 LOC100131107 - putative UPF0607 protein ENSP00000383783 protein-coding 183.25-77 chr4 120919316 120919653 + 1.5 NA intron (NM_001300824, intron 1 of 13) intron (NM_001300824, intron 1 of 13) 3382 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 232.5-4 chr1 113214412 113214600 + 1.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -8253 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 289-12 chr12 60473075 60473373 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 783854 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 200-19 chr12 14523094 14523361 + 1.5 NA intron (NM_024829, intron 6 of 10) L1MA6|LINE|L1 -44505 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 307-27 chr4 56491124 56491349 + 1.5 NA intron (NR_151856, intron 15 of 19) intron (NR_151856, intron 15 of 19) -13973 NM_206919 132946 Hs.444449 NM_206919 ENSG00000196503 ARL9 - ADP ribosylation factor like GTPase 9 protein-coding 379.5-16 chr5 80056382 80056682 + 1.5 NA intron (NM_001306214, intron 3 of 21) intron (NM_001306214, intron 3 of 21) 20509 NM_001306214 7060 Hs.211426 NM_003248 ENSG00000113296 THBS4 TSP-4|TSP4 thrombospondin 4 protein-coding 196-60 chr22 19425287 19425501 + 1.5 NA intron (NM_003325, intron 1 of 24) intron (NM_003325, intron 1 of 24) 6339 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 282.5-20 chr17 61020043 61020373 + 1.5 NA intron (NM_001320470, intron 16 of 25) intron (NM_001320470, intron 16 of 25) 342357 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 326-5 chr10 110233130 110233453 + 1.5 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) intron (NM_001008541, intron 2 of 4) 7295 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 446-6 chr7 3270475 3270984 + 1.5 NA Intergenic (TGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -30523 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 326.75-13 chr2 104680204 104680768 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 77233 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 117-137 chr4 106671616 106671731 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 238049 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 453.25-2 chr16 64193039 64193590 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 928749 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 193.25-76 chr3 159702058 159702324 + 1.5 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 66421 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 205.5-144 chr8 71810230 71810429 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32794 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 299.25-27 chr20 43418521 43418870 + 1.5 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -39201 NM_006275 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 171.25-78 chr2 100655252 100655414 + 1.5 NA Intergenic UCON19|Unknown|Unknown 51594 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 400-4 chr11 35821991 35822304 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -121834 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 242.5-82 chr8 72430785 72431116 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -106275 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 203.25-96 chr7 53584320 53584554 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 227494 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 353.75-13 chr4 156009576 156010041 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55942 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 288.5-18 chr17 69228969 69229314 + 1.5 NA intron (NM_080282, intron 1 of 39) MIR|SINE|MIR 5871 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 133-137 chr5 68370331 68370445 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 77811 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 141.75-88 chr2 50945130 50945253 + 1.5 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 86941 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 192-47 chr15 25407459 25407642 + 1.5 NA intron (NM_001354507, intron 4 of 14) intron (NM_001354507, intron 4 of 14) 30679 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 321 chr1 102058719 102059003 + 1.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -61627 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 345-6 chr14 20454822 20455081 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_080648) promoter-TSS (NM_080648) -139 NM_017807 55644 Hs.525196 NM_017807 ENSG00000092094 OSGEP GAMOS3|GCPL1|KAE1|OSGEP1|PRSMG1|TCS3 O-sialoglycoprotein endopeptidase protein-coding 204.5-16 chr10 105279565 105279762 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 540670 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 324-28 chr7 25286715 25287126 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -58434 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 220.5-121 chr8 74953787 74954085 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30569 NM_031461 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 473.5-4 chr8 125424823 125425435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5229 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 488.25-3 chr2 173452649 173453076 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 97990 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 271.25-14 chr11 112587841 112588190 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32213 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 260.25-20 chr19 27810960 27811448 + 1.5 NA intron (NR_146736, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 -17264 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 416.5-2 chr10 49644191 49644756 + 1.5 NA intron (NM_001142929, intron 7 of 14) intron (NM_001142929, intron 7 of 14) 30436 NM_001142933 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 245-35 chr20 59685973 59686169 + 1.5 NA intron (NM_001199506, intron 1 of 12) intron (NM_001199506, intron 1 of 12) 9410 NM_001199506 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 235.5-39 chr16 8950700 8951033 + 1.5 NA intron (NM_003470, intron 1 of 30) intron (NM_003470, intron 1 of 30) -1212 NR_135826 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 193.5-83 chr2 47894209 47894397 + 1.5 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) intron (NM_001190274, intron 1 of 22) -5584 NM_025133 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 355.5-30 chrX 45393759 45394164 + 1.5 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -111427 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 258-58 chr9 25091704 25091922 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -545916 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 346.25-11 chr2 64242465 64243037 + 1.5 NA intron (NR_120420, intron 2 of 4) intron (NR_120420, intron 2 of 4) 14350 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 125-74 chr2 127357233 127357365 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14070 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 399.75-10 chr4 85644068 85644433 + 1.5 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR -78218 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 387.75-14 chr5 139365706 139366079 + 1.5 NA intron (NM_016480, intron 3 of 3) intron (NM_016480, intron 3 of 3) 17405 NM_005847 9963 Hs.643467 NM_005847 ENSG00000170482 SLC23A1 SLC23A2|SVCT1|YSPL3 solute carrier family 23 member 1 protein-coding 251-20 chr13 109283641 109283893 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116464 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 282.75-39 chr6 96414809 96415063 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -106870 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 485-3 chr4 33756034 33756476 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 283638 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 326.5-19 chr4 66970470 66970876 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 451327 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 168-109 chr6 69018005 69018157 + 1.5 NA intron (NM_001704, intron 12 of 31) intron (NM_001704, intron 12 of 31) 382799 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 236.75-18 chr13 101942849 101943006 + 1.5 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) 24819 NR_039603 100616110 NR_039603 ENSG00000265164 MIR2681 - microRNA 2681 ncRNA 191.25-110 chr8 125551106 125551349 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 119018 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 218.25-21 chr12 6911039 6911315 + 1.5 NA intron (NM_006992, intron 6 of 6) intron (NM_006992, intron 6 of 6) -3403 NM_001975 2026 Hs.511915 NM_001975 ENSG00000111674 ENO2 HEL-S-279|NSE enolase 2 protein-coding 326 chr1 104534414 104534839 + 1.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 461603 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 235.5-33 chr14 68598464 68598786 + 1.5 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 30162 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 458.5-5 chr4 62808656 62809110 + 1.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -647118 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-98 chr2 33472190 33472470 + 1.5 NA intron (NM_001349979, intron 1 of 17) intron (NM_001349979, intron 1 of 17) -4319 NM_001139488 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 204.75-50 chr17 32375375 32375753 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25426 NM_003457 7756 Hs.500775 NM_003457 ENSG00000010244 ZNF207 BuGZ|hBuGZ zinc finger protein 207 protein-coding 227-55 chr6 23997580 23997989 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -128431 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 122.25-128 chr3 97082161 97082298 + 1.5 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) (TTTTGCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 267635 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 177-86 chr6 110831806 110831969 + 1.5 NA intron (NM_001287215, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu -16032 NM_001300964 23097 Hs.744895 NM_015076 ENSG00000155111 CDK19 CDC2L6|CDK11|bA346C16.3 cyclin dependent kinase 19 protein-coding 192-103 chr8 108365624 108365783 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -77880 NR_138033 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 279.75-63 chrX 93846654 93847007 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 172624 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 183-120 chrX 116169899 116170050 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_000686) promoter-TSS (NM_000686) -770 NM_000686 186 Hs.405348 NM_000686 ENSG00000180772 AGTR2 AT2|ATGR2|MRX88 angiotensin II receptor type 2 protein-coding 233.5-97 chr6 41671114 41671366 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 32772 NM_001300806 4188 Hs.520119 NM_005586 ENSG00000112559 MDFI I-MF|I-mfa MyoD family inhibitor protein-coding 172-99 chr7 7041245 7041472 + 1.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 25687 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 467.5-5 chr5 90900638 90901364 + 1.5 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) intron (NR_003149, intron 83 of 89) 342204 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 207-86 chr8 78171695 78171863 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -344561 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 148.5-73 chr16 25226131 25226245 + 1.5 NA intron (NM_001169, intron 4 of 5) L1MA2|LINE|L1 9241 NM_001169 343 Hs.176658 NM_001169 ENSG00000103375 AQP8 AQP-8 aquaporin 8 protein-coding 158.75-142 chr5 146775955 146776125 + 1.5 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) L1MB4|LINE|L1 102745 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 262.5-49 chr3 140209993 140210220 + 1.5 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) intron (NM_022131, intron 2 of 16) 274921 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 344-4 chr12 37634643 37635105 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -681900 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 186-2 chr1 147383457 147383830 + 1.5 NA non-coding (NR_038423, exon 4 of 4) non-coding (NR_038423, exon 4 of 4) 134232 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 232-71 chr7 17420918 17421122 + 1.5 NA intron (NR_110015, intron 1 of 2) intron (NR_110015, intron 1 of 2) 46103 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 171.75-120 chr6 34890744 34890942 + 1.5 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 1588 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 188.25-113 chr8 70680272 70680431 + 1.5 NA intron (NM_001287259, intron 3 of 5) L1ME3G|LINE|L1 11012 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 261.75-49 chr7 110194176 110194501 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -234125 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 138.75-70 chr17 11933618 11933764 + 1.5 NA intron (NM_001372, intron 64 of 68) intron (NM_001372, intron 64 of 68) 50789 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 263.25-10 chr10 43987463 43987783 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75221 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 433.25 chr14 28822149 28822554 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -36564 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 321.25-25 chr8 141881228 141881651 + 1.5 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -95126 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 175-116 chr7 7669544 7669769 + 1.5 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) intron (NM_002947, intron 4 of 7) 28904 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 172.75-127 chr8 93922219 93922414 + 1.5 NA exon (NM_001161780, exon 3 of 3) exon (NM_001161780, exon 3 of 3) 5369 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 402-9 chr4 91124750 91125142 + 1.5 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 889915 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 320.5-20 chr2 19212472 19212986 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -135700 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 461.5 chr10 8307217 8307584 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39095 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 164.75-69 chr19 3049200 3049366 + 1.5 NA intron (NR_031672, intron 2 of 2).3 intron (NR_031672, intron 2 of 2).3 -1648 NM_001144761 7089 Hs.332173 NM_003260 ENSG00000065717 TLE2 ESG|ESG2|GRG2 TLE family member 2, transcriptional corepressor protein-coding 421.75-6 chr5 86989233 86989692 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125492 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 154.25-70 chr18 56755912 56756023 + 1.5 NA intron (NM_015285, intron 14 of 27) intron (NM_015285, intron 14 of 27) 104582 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 252.75-43 chr3 32974378 32974708 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 22899 NM_005508 1233 Hs.184926 NM_005508 ENSG00000183813 CCR4 CC-CKR-4|CD194|CKR4|CMKBR4|ChemR13|HGCN:14099|K5-5 C-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 255-43 chr4 21799134 21799516 + 1.5 NA intron (NM_147182, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 53863 NR_002813 359822 Hs.354058 NR_002813 ENSG00000280650 KCNIP4-IT1 NCRNA00099|UM9(5)|UM9-5 KCNIP4 intronic transcript 1 ncRNA 463-6 chr8 131818062 131818634 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -85745 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 160.5-80 chr19 37077454 37077570 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001329522) promoter-TSS (NM_001329522) -710 NM_001329520 147923 Hs.444992 NM_144689 ENSG00000197050 ZNF420 APAK zinc finger protein 420 protein-coding 324-25 chr6 11958991 11959412 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 42043 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 115-86 chr2 86209577 86209715 + 1.5 NA intron (NM_016622, intron 3 of 3) intron (NM_016622, intron 3 of 3) 10189 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 242.25-31 chr15 90686023 90686426 + 1.5 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) intron (NR_120372, intron 2 of 3) 25990 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 269-24 chr17 71883887 71884198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 141937 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 151.75-154 chr8 110220900 110221201 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -245279 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 419.25-6 chr4 82143217 82143846 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 230460 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 282-11 chr12 28439005 28439365 + 1.5 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -248447 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 235.5-90 chr8 109814104 109814316 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -122419 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 213.5-106 chr6 56165380 56165554 + 1.5 NA intron (NM_030820, intron 7 of 29) intron (NM_030820, intron 7 of 29) -73805 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 137.25-52 chr16 56399207 56399351 + 1.5 NA intron (NM_001144, intron 8 of 13) L1MB5|LINE|L1 25710 NM_001323511 267 Hs.295137 NM_001144 ENSG00000159461 AMFR GP78|RNF45 autocrine motility factor receptor protein-coding 295-26 chr3 194272949 194273343 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22993 NR_125403 100505920 Hs.436654 NR_125403 ENSG00000225742 LINC02036 - long intergenic non-protein coding RNA 2036 ncRNA 400-12 chr5 30420850 30421227 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 540478 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 279.75-62 chr9 117252655 117252957 + 1.5 NA intron (NM_014010, intron 2 of 21) MIRb|SINE|MIR -71605 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 194-56 chr3 69644774 69645160 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -94497 NM_001354604 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 394.5-8 chr2 142876152 142876673 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1252 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 240.75-40 chr2 34032380 34032655 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -34709 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 384.5-3 chr12 44708074 44708474 + 1.5 NA intron (NM_006159, intron 12 of 20) intron (NM_006159, intron 12 of 20) 167387 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 311.25-21 chr5 125654472 125654695 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 161322 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 368.25-3 chr12 28575902 28576208 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -385317 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 335.75-15 chr5 5128731 5129191 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 11093 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 122.5-101 chr19 51022267 51022349 + 1.5 NA TTS (NM_001167605) TTS (NM_001167605) -2133 NM_001077500 5655 Hs.275464 NM_002776 ENSG00000129451 KLK10 NES1|PRSSL1 kallikrein related peptidase 10 protein-coding 257.5-42 chr21 23197077 23197300 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 117904 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 257.25-52 chr7 3797382 3797650 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -332169 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 143-90 chr3 47890301 47890446 + 1.5 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 40818 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 370-13 chr4 115471931 115472290 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -358490 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 277.5-70 chr7 25577472 25578030 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 85389 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 190.5-130 chr5 148685137 148685277 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30680 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 283.5-37 chr22 27019880 27020195 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 40481 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 284-33 chr3 168522162 168522485 + 1.5 NA intron (NR_021485, intron 4 of 15) MER77B|LTR|ERVL -29531 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 241.5-101 chr8 134772178 134772415 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 28311 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 201-38 chr17 62011433 62011692 + 1.5 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) intron (NM_005121, intron 8 of 29) 53716 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 236.25-13 chr10 116382216 116382478 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45500 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 178.5-56 chr15 87692448 87692645 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 115617 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 231-40 chr2 115481991 115482170 + 1.5 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 138265 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 252-67 chr7 135514859 135515126 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4865 NM_001190850 4850 Hs.490224 NM_013316 ENSG00000080802 CNOT4 CLONE243|NOT4|NOT4H CCR4-NOT transcription complex subunit 4 protein-coding 413.25-10 chrX 70644875 70645515 + 1.5 NA intron (NM_001003811, intron 18 of 30) L1MA8|LINE|L1 -189201 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 186.5-48 chr16 75773868 75774118 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47503 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 189-5 chr1 71590436 71590578 + 1.5 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) L2c|LINE|L2 246505 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 201.5-107 chr5 45424907 45425062 + 1.5 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 271396 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 475.25-2 chr11 77713781 77714306 + 1.5 NA intron (NM_016578, intron 5 of 15) L1M8|LINE|L1 -76237 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 234.75-85 chr8 112921167 112921669 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) intron (NM_001363185, intron 8 of 66) 277925 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 139.5-63 chr14 50498678 50498784 + 1.5 NA intron (NM_198794, intron 3 of 31) intron (NM_198794, intron 3 of 31) 33838 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 138.75-129 chr4 92503848 92504032 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 199541 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 371.5 chr1 113023135 113023425 + 1.5 NA intron (NR_103777, intron 2 of 2) FLAM_C|SINE|Alu 49822 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 304-23 chr2 72190746 72191116 + 1.5 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -43069 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 277.5-27 chr18 9592603 9592846 + 1.5 NA intron (NR_052003, intron 3 of 19) intron (NR_052003, intron 3 of 19) 21835 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 460.5-2 chr2 186376932 186377511 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109039 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 294.5-27 chr22 39493833 39494193 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6087 NM_001304564 54471 Hs.728085 NM_013298 ENSG00000100335 MIEF1 AltMIEF1|HSU79252|MID51|MIEF1-MP|SMCR7L|dJ1104E15.3 mitochondrial elongation factor 1 protein-coding 200-78 chr6 50979178 50979418 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 160427 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 299.75-19 chr3 40439507 40439854 + 1.5 NA intron (NR_040100, intron 2 of 3) L1ME4c|LINE|L1 13628 NR_040100 285266 Hs.619663 NR_040100 ENSG00000223797 ENTPD3-AS1 - ENTPD3 antisense RNA 1 ncRNA 573.5 chr2 79329524 79330206 + 1.5 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -170112 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 154.25-56 chr15 63767836 63767955 + 1.5 NA intron (NM_003922, intron 2 of 77) intron (NM_003922, intron 2 of 77) 66053 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 324.5-36 chr8 90736645 90737019 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -54943 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 263-4 chr1 111331109 111331369 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -15321 NR_125338 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 229.5-118 chr6 127009548 127009785 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109005 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 270-57 chr9 79009640 79009904 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 135894 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 284-4 chr10 66059188 66059510 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 487924 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 189.75-82 chr4 43646767 43646957 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -154319 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 262-39 chr3 132672097 132672297 + 1.5 NA intron (NM_198329, intron 8 of 11) intron (NM_198329, intron 8 of 11) 11500 NM_001321238 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 180-58 chr2 37316796 37317016 + 1.5 NA 5' UTR (NM_005813, exon 1 of 18) 5' UTR (NM_005813, exon 1 of 18) 178 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 190.5-61 chr17 41924572 41924766 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5647 NM_001303275 47 Hs.387567 NM_001096 ENSG00000131473 ACLY ACL|ATPCL|CLATP ATP citrate lyase protein-coding 327.75-22 chr6 24772729 24773063 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2041 NM_001251989 51053 Hs.234896 NM_015895 ENSG00000112312 GMNN Gem|MGORS6 geminin DNA replication inhibitor protein-coding 290-42 chr5 177392225 177392635 + 1.5 NA intron (NM_003052, intron 8 of 12) AluSx1|SINE|Alu 7996 NM_001167579 6569 Hs.936 NM_003052 ENSG00000131183 SLC34A1 FRTS2|HCINF2|NAPI-3|NPHLOP1|NPT2|NPTIIa|SLC11|SLC17A2 solute carrier family 34 member 1 protein-coding 229.5-120 chr6 152387360 152387713 + 1.5 NA intron (NM_182961, intron 53 of 145) intron (NM_182961, intron 53 of 145) 7006 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 213-26 chr13 88485142 88485422 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -55547 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 157.5-84 chr18 1347927 1348132 + 1.5 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 11600 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 274.25-50 chr8 130089491 130089832 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 25 of 29) intron (NM_001362925, intron 25 of 29) -4893 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 147.75-101 chr3 44343258 44343413 + 1.5 NA intron (NM_001282914, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 4569 NM_173826 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 287.5-24 chr17 32639542 32639830 + 1.5 NA intron (NM_015194, intron 19 of 21) AluJo|SINE|Alu 152693 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 227.25-19 chr11 99218732 99219014 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 197924 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 207-32 chr15 82287427 82287639 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5750 NR_045529 390660 Hs.640255 NR_045529 ENSG00000274376 ADAMTS7P1 ADAMTS7P2 ADAMTS7 pseudogene 1 pseudo 316-3 chr10 69681108 69681393 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51003 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 249-15 chr16 8226975 8227175 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 362763 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 210-64 chr3 32508743 32509001 + 1.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -2483 NR_106753 102465247 NR_106753 ENSG00000276147 MIR548AY hsa-mir-548ay microRNA 548ay ncRNA 245-41 chr3 117384660 117385110 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 306040 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 555.75-2 chr17 77558844 77559429 + 1.5 NA intron (NR_040050, intron 1 of 1) intron (NR_040050, intron 1 of 1) 12195 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 219-62 chr22 27169699 27169928 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17703 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 523.5-4 chr22 49840864 49841468 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -12678 NM_014838 9889 Hs.475208 NM_014838 ENSG00000100426 ZBED4 - zinc finger BED-type containing 4 protein-coding 302.25-27 chr8 71326027 71326255 + 1.5 NA intron (NM_001370336, intron 5 of 17) intron (NM_001370336, intron 5 of 17) 30565 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 133.25-202 chr7 82466339 82466621 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22524 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 194.5-53 chr18 8965454 8965699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -137123 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 318-31 chr4 82559558 82559897 + 1.5 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) intron (NM_001353454, intron 1 of 7) 2261 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 451.25-2 chr4 80635636 80636190 + 1.5 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 300193 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 311.25-13 chr20 39326792 39327186 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -102241 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 290.25-11 chr14 35618152 35618376 + 1.5 NA intron (NM_014990, intron 34 of 40) L1M5|LINE|L1 84100 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 155.5-220 chr9 103766841 103766980 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -232799 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 302.75-24 chr5 107465010 107465312 + 1.5 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 205776 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 203.5-125 chr7 3532043 3532266 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 230902 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 181.25-123 chr7 111414030 111414289 + 1.5 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) LTR41B|LTR|ERVL 148132 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 132.75-76 chr17 16326026 16326194 + 1.5 NA 3' UTR (NM_004278, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_004278, exon 7 of 7) 27359 NM_181716 201161 Hs.433422 NM_181716 ENSG00000166582 CENPV 3110013H01Rik|CENP-V|PRR6|p30 centromere protein V protein-coding 336.75-3 chr12 43598265 43598649 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46254 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 237.5-94 chr7 20401343 20401594 + 1.5 NA intron (NM_002214, intron 9 of 13) intron (NM_002214, intron 9 of 13) -69706 NR_110119 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 299-32 chr7 85476798 85477062 + 1.5 NA intron (NR_134240, intron 3 of 3) intron (NR_134240, intron 3 of 3) 55808 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 219.5-128 chr8 121683035 121683203 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -41679 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 346.5-7 chr13 97289999 97290454 + 1.5 NA intron (NM_144778, intron 2 of 8) intron (NM_144778, intron 2 of 8) 67893 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 225-8 chr1 241228090 241228307 + 1.5 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 95926 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 247 chr1 34543431 34543725 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 126116 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 218.25-44 chr2 188008843 188009004 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 278768 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 246-45 chr4 72046648 72046942 + 1.5 NA intron (NM_053036, intron 1 of 3) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 7663 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 324-21 chr4 66686867 66687121 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 410170 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 148-112 chr6 48679532 48679770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -610962 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 432.5-4 chr2 81488905 81489407 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -22210 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 376.5-6 chr16 83534156 83534569 + 1.5 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) MIR|SINE|MIR 26016 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 277-35 chr8 9273798 9274018 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51143 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 148.25-10 chr1 171747068 171747176 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5057 NR_033704 8674 Hs.6651 NM_003762 ENSG00000117533 VAMP4 VAMP-4|VAMP24 vesicle associated membrane protein 4 protein-coding 207.75-62 chr2 202451968 202452309 + 1.5 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 75811 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 117.75-166 chr4 144722881 144723000 + 1.5 NA intron (NM_022475, intron 11 of 12) intron (NM_022475, intron 11 of 12) 76784 NM_022475 64399 Hs.507991 NM_022475 ENSG00000164161 HHIP HIP hedgehog interacting protein protein-coding 288.5-31 chr4 52867923 52868162 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5725 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 133.5-276 chr9 28038172 28038287 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -464363 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 295.25-33 chr8 56992842 56993127 + 1.5 NA intron (NM_017813, intron 1 of 4) intron (NM_017813, intron 1 of 4) 883 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 255.75-31 chr3 79344077 79344541 + 1.5 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) MER20|DNA|hAT-Charlie -67418 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 233.25-21 chr13 108980994 108981265 + 1.5 NA intron (NM_015011, intron 20 of 34) intron (NM_015011, intron 20 of 34) 186174 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 281.25-2 chr1 62490126 62490404 + 1.5 NA intron (NM_001367561, intron 41 of 49) AluJr|SINE|Alu 53216 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 295.75-18 chr3 89431818 89432107 + 1.5 NA intron (NM_005233, intron 13 of 16) L1ME4a|LINE|L1 324341 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 425 chr1 187392334 187392941 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -50991 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 472.5 chr1 53817449 53817778 + 1.5 NA intron (NR_033142, intron 5 of 16) L1PB1|LINE|L1 20683 NM_001168551 55706 Hs.476525 NM_018087 ENSG00000058804 NDC1 NET3|TMEM48 NDC1 transmembrane nucleoporin protein-coding 359-4 chr12 127297714 127298080 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13614 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 194.25-41 chr16 68418660 68418936 + 1.5 NA intron (NM_018667, intron 1 of 8) intron (NM_018667, intron 1 of 8) 29710 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 318-22 chr20 53054830 53055127 + 1.5 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) MER102a|DNA|hAT-Charlie 82620 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 236.5-18 chr12 115433302 115433889 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 715059 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 257.5-10 chr10 101247608 101247800 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15846 NR_120621 101927419 Hs.638503 NR_120621 ENSG00000229649 LINC02681 - long intergenic non-protein coding RNA 2681 ncRNA 356.5-16 chr4 48770079 48770465 + 1.5 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 10027 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 139-43 chr14 77103585 77103755 + 1.5 NA intron (NM_033426, intron 1 of 3) intron (NM_033426, intron 1 of 3) 5412 NM_033426 85457 Hs.709066 NM_033426 ENSG00000198894 CIPC KIAA1737 CLOCK interacting pacemaker protein-coding 251.25-48 chr7 7573811 7574014 + 1.5 NA intron (NM_001370078, intron 2 of 8) intron (NM_001370078, intron 2 of 8) 5886 NM_001370078 54468 Hs.520215 NM_019005 ENSG00000164654 MIOS MIO|Sea4|Yulink meiosis regulator for oocyte development protein-coding 135.5-125 chr20 57318724 57318874 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 2792 NR_036219 100422883 NR_036219 ENSG00000266666 MIR4325 - microRNA 4325 ncRNA 372.25-11 chr5 12025430 12025917 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -121227 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 231 chr1 59566965 59567136 + 1.5 NA intron (NM_001350794, intron 8 of 14) intron (NM_001350794, intron 8 of 14) 51420 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 197.25-28 chr14 45381060 45381202 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -127929 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 164-8 chr1 108784050 108784206 + 1.5 NA intron (NM_007269, intron 11 of 18) L1ME3|LINE|L1 37454 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 174.25-97 chr3 63608911 63609068 + 1.5 NA intron (NM_001130003, intron 4 of 5) intron (NM_001130003, intron 4 of 5) -43686 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 228-58 chr4 61047993 61048261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -95529 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 313.25-10 chr12 98390878 98391392 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 66010 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 241.5-90 chr7 50487112 50487450 + 1.5 NA intron (NM_001242888, intron 7 of 12) MER4B-int|LTR|ERV1 -36875 NM_001287495 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 219.75-35 chr2 56788134 56788339 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -602466 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 315-13 chr2 13112591 13112838 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -105701 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 246.5-9 chr10 45040220 45040550 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 39462 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 262.5-2 chr1 34767616 34767913 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 8024 NM_153212 127534 Hs.351203 NM_153212 ENSG00000189433 GJB4 CX30.3|EKV|EKVP2 gap junction protein beta 4 protein-coding 196.5-151 chr7 9604184 9604378 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -29989 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 248-4 chr1 246117854 246118071 + 1.5 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 299450 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 319.5-7 chr11 72950807 72951218 + 1.5 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 136601 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 276.75-44 chr7 3483266 3483610 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MC|LINE|L1 182186 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 133.5-18 chr1 213866770 213866917 + 1.5 NA intron (NR_037850, intron 4 of 5) intron (NR_037850, intron 4 of 5) -57906 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 211.5-95 chr22 25222463 25222671 + 1.5 NA intron (NM_000496, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu 2928 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 401.25-4 chr11 82747006 82747519 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -13398 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 347.5-13 chr20 42342458 42342716 + 1.5 NA intron (NM_133170, intron 11 of 31) intron (NM_133170, intron 11 of 31) -342896 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 146.25-15 chr10 83586008 83586182 + 1.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 90994 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 479 chr1 113182277 113182714 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 23758 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 254.25-40 chr3 60408716 60408970 + 1.5 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 209027 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 240-20 chr15 47561841 47562242 + 1.5 NA intron (NM_001198999, intron 3 of 19) L1MB8|LINE|L1 -155464 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 141.5-4 chr1 42215522 42215702 + 1.5 NA intron (NM_001198850, intron 5 of 12) L1MEf|LINE|L1 -50867 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 343-31 chr7 114498175 114498417 + 1.5 NA intron (NR_033767, intron 2 of 17) intron (NR_033767, intron 2 of 17) 71794 NM_148899 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 270-16 chr12 117050162 117050366 + 1.5 NA intron (NM_001168325, intron 2 of 6) MER58B|DNA|hAT-Charlie 49152 NR_031766 54997 Hs.525709 NM_017899 ENSG00000088992 TESC CHP3|TSC tescalcin protein-coding 279-54 chr8 87133743 87133992 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 267452 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 271-35 chr4 68020037 68020328 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22743 NR_033737 644759 Hs.646883 NR_033737 ENSG00000229009 TMPRSS11GP - transmembrane serine protease 11G, pseudogene pseudo 334-12 chr2 16514357 16514753 + 1.5 NA Intergenic MER124|DNA?|DNA? 151279 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 258.25 chr1 22820540 22820733 + 1.5 NA intron (NM_004442, intron 3 of 15) AluJb|SINE|Alu 42590 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 262-10 chr11 72445472 72445796 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -10950 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 293.75-27 chr20 52154216 52154630 + 1.5 NA intron (NM_199426, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 37356 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 290-22 chr17 70132983 70133364 + 1.5 NA exon (NM_001291622, exon 6 of 6) exon (NM_001291622, exon 6 of 6) 28328 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 238.5-56 chr3 73487544 73487757 + 1.5 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) -13018 NM_001303141 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 326.5-18 chr4 39090292 39090541 + 1.5 NA intron (NM_199039, intron 4 of 9) intron (NM_199039, intron 4 of 9) 28184 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 349.25-16 chr7 12408002 12408310 + 1.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -4215 NM_001346973 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 308.5-28 chr4 124641474 124641760 + 1.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 71115 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 210-83 chr6 72223182 72223345 + 1.5 NA intron (NM_001350474, intron 1 of 21) intron (NM_001350474, intron 1 of 21) 6322 NM_001350471 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 255-42 chr3 197751649 197751904 + 1.5 NA intron (NR_027840, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 1529 NR_027840 84248 Hs.277533 NM_032288 ENSG00000122068 FYTTD1 UIF forty-two-three domain containing 1 protein-coding 339-36 chr9 31606858 31607363 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -225620 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 143.25-154 chr6 33885411 33885547 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11428 NR_038989 100507584 Hs.547104 NR_038989 ENSG00000249346 LINC01016 - long intergenic non-protein coding RNA 1016 ncRNA 316-26 chr7 8690311 8690791 + 1.5 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 256942 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 334-31 chr8 70426419 70426724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22354 NM_001321703 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 178-5 chr10 6780032 6780295 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_108074) promoter-TSS (NR_108074) 565 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 170.5-97 chr2 109624696 109624838 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10403 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 233.25-23 chr14 48216438 48216722 + 1.5 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -421566 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 312.5-11 chr19 40112144 40112537 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21397 NM_001142579 284323 Hs.115140 NM_001010880 ENSG00000197782 ZNF780A ZNF780 zinc finger protein 780A protein-coding 230-3 chr1 119644272 119644567 + 1.5 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) intron (NM_001080470, intron 1 of 2) 3847 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 272-3 chr1 62094825 62095218 + 1.5 NA intron (NM_001350145, intron 33 of 43) intron (NM_001350145, intron 33 of 43) -16165 NR_036059 100422946 NR_036059 ENSG00000283690 MIR3116-2 - microRNA 3116-2 ncRNA 193.5-41 chr13 50427028 50427212 + 1.5 NA intron (NR_109974, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 100329 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 131.25-122 chr21 17979874 17979989 + 1.5 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) intron (NM_001204177, intron 1 of 4) 62591 NM_001204176 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 201.5-105 chr5 16955220 16955587 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -19115 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 196.5-164 chr8 109835016 109835347 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 140590 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 416.25-5 chr15 50883190 50883678 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -25249 NM_001252127 23431 Hs.413366 NM_007347 ENSG00000081014 AP4E1 CPSQ4|SPG51|STUT1 adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1 protein-coding 288.25-30 chr8 119851608 119851931 + 1.5 NA intron (NM_024094, intron 2 of 8) intron (NM_024094, intron 2 of 8) 4125 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 234-16 chr17 74739634 74739930 + 1.5 NA intron (NM_001163990, intron 1 of 7) AluSx3|SINE|Alu 2526 NM_001163990 326624 Hs.351413 NM_175738 ENSG00000172794 RAB37 - RAB37, member RAS oncogene family protein-coding 299.25-19 chr15 59910439 59910877 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -93653 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 177-96 chr8 114439185 114439407 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1002357 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 160-84 chr5 23683240 23683431 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 175680 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 182.5-179 chrX 41091318 41091480 + 1.5 NA intron (NM_001039591, intron 1 of 44) L2a|LINE|L2 5954 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 214-59 chr7 20781079 20781302 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5696 NM_198956 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 269.75 chr1 70039607 70039990 + 1.5 NA intron (NM_001366839, intron 22 of 25) intron (NM_001366839, intron 22 of 25) 120476 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 203.25-97 chr7 81238966 81239258 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -316723 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 180.5-3 chr1 111767870 111768030 + 1.5 NA TTS (NM_007204) TTS (NM_007204) 12049 NM_007204 11218 Hs.591405 NM_007204 ENSG00000064703 DDX20 DP103|GEMIN3 DEAD-box helicase 20 protein-coding 390.75-5 chr17 81573806 81574317 + 1.5 NA intron (NM_001369698, intron 12 of 16) intron (NM_001369698, intron 12 of 16) 3372 NR_130139 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 332.5-19 chr3 40424315 40424777 + 1.5 NA intron (NM_001248, intron 10 of 10) intron (NM_001248, intron 10 of 10) 28762 NR_040100 285266 Hs.619663 NR_040100 ENSG00000223797 ENTPD3-AS1 - ENTPD3 antisense RNA 1 ncRNA 197-14 chr13 58303145 58303371 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -70141 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 217.25-60 chr4 107642455 107642738 + 1.5 NA intron (NM_005443, intron 10 of 11) MIR|SINE|MIR 77638 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 471.5-5 chr17 11469773 11470350 + 1.5 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -128409 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 288.5-48 chr8 80118179 80118453 + 1.5 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) L1MB8|LINE|L1 -37485 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 129-72 chr15 68398675 68398768 + 1.5 NA intron (NM_001004439, intron 2 of 29) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 33442 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 552.75 chr3 24881987 24882704 + 1.5 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 53022 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 354.75-9 chr18 60565477 60565799 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -192863 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 203.25-106 chr8 105822554 105822738 + 1.5 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) LTR9D|LTR|ERV1 237857 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 300.5-7 chr10 33143448 33143869 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26851 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 314.5-23 chr5 86485922 86486367 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -131797 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 220-32 chr2 59776740 59776922 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 559123 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 231.75-24 chr14 53290138 53290366 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 136898 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 186.5-104 chr5 11714499 11714697 + 1.5 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) MIRb|SINE|MIR -125532 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 162-60 chr2 51976729 51976873 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -393847 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 209.75-86 chr6 154151184 154151522 + 1.5 NA intron (NM_001008503, intron 3 of 3) LTR16A1|LTR|ERVL 61591 NM_001285527 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 329-12 chr11 128853465 128853835 + 1.5 NA intron (NM_153766, intron 1 of 2) L1MB8|LINE|L1 -11181 NM_000220 3758 Hs.527830 NM_000220 ENSG00000151704 KCNJ1 KIR1.1|ROMK|ROMK1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 1 protein-coding 343.25-14 chr5 73868555 73868799 + 1.5 NA intron (NM_001177693, intron 20 of 35) AluSx|SINE|Alu 55131 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 231.75-38 chr2 79495881 79496060 + 1.5 NA intron (NR_110289, intron 4 of 4) L1MB7|LINE|L1 4874 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 251.5-31 chr18 8696469 8696684 + 1.5 NA intron (NR_120598, intron 1 of 1) intron (NR_120598, intron 1 of 1) 11045 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 183.25-78 chr4 128894481 128894666 + 1.5 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) L2|LINE|L2 82729 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 297-6 chr10 63585933 63586263 + 1.5 NA intron (NM_001001330, intron 2 of 7) intron (NM_001001330, intron 2 of 7) -64208 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 303.75-31 chr6 119974793 119975121 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -40222 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 230-53 chr5 172385152 172385399 + 1.5 NA intron (NM_001017995, intron 4 of 12) intron (NM_001017995, intron 4 of 12) 69248 NM_001308175 285590 Hs.285666 NM_001017995 ENSG00000174705 SH3PXD2B FAD49|FTHS|HOFI|KIAA1295|TKS4|TSK4 SH3 and PX domains 2B protein-coding 239-31 chr2 191155628 191155814 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4125 NM_001243835 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 211.75-58 chr3 6521030 6521182 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 284343 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 408.5-5 chr16 13631834 13632298 + 1.5 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -288091 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 351.5-19 chr2 182311814 182312240 + 1.5 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) L1ME3|LINE|L1 -69964 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 295-27 chr5 8798804 8799122 + 1.5 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -40769 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 387.5-6 chr2 12242228 12242708 + 1.5 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) L1M4|LINE|L1 43338 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 243.5-61 chr5 15843831 15844117 + 1.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -91208 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 195.5-17 chr10 106475956 106476272 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 335949 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 295.25-7 chr13 62351550 62351754 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 27995 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 356.25-2 chr1 76127737 76128120 + 1.5 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 53182 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 388.5-14 chr5 114677066 114677374 + 1.5 NA intron (NR_130785, intron 1 of 12) L1M4|LINE|L1 96193 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 203.5-38 chr13 70890481 70890644 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -124579 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 232.25-25 chr14 73366531 73366834 + 1.5 NA intron (NM_001320114, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 91898 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 169.5-36 chr12 49087892 49088016 + 1.5 NA 3' UTR (NM_021044, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_021044, exon 3 of 3) 6847 NM_021044 50846 Hs.524382 NM_021044 ENSG00000139549 DHH GDXYM|HHG-3|SRXY7 desert hedgehog signaling molecule protein-coding 245-7 chr10 105231191 105231372 + 1.5 NA intron (NM_014978, intron 20 of 26) L1MC1|LINE|L1 -565065 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 297-39 chr5 113983528 113983828 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -378392 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 177.5-117 chr3 128527570 128527808 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 19854 NR_026954 90246 Hs.635164 NR_026954 LOC90246 - uncharacterized LOC90246 ncRNA 192-55 chr2 63948775 63948916 + 1.5 NA intron (NM_001005739, intron 8 of 22) intron (NM_001005739, intron 8 of 22) 70583 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 278.25-28 chr2 74057218 74057534 + 1.5 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) intron (NM_001287491, intron 4 of 11) 54684 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 385.5-7 chr14 73044289 73044683 + 1.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -14048 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 246.5-30 chr16 22222066 22222249 + 1.5 NA intron (NM_013302, intron 1 of 17).2 intron (NM_013302, intron 1 of 17).2 15879 NM_013302 29904 Hs.498892 NM_013302 ENSG00000103319 EEF2K CaMKIII|HSU93850|eEF-2K eukaryotic elongation factor 2 kinase protein-coding 289.5-27 chr2 150057314 150057582 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -198257 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 185.25-63 chr2 164216565 164216767 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 351829 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 343-19 chr20 2565963 2566291 + 1.5 NA intron (NM_080751, intron 4 of 19) intron (NM_080751, intron 4 of 19) 29520 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 222.75-17 chr10 50603737 50604055 + 1.5 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) intron (NM_147156, intron 1 of 10) 20060 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 285.25-23 chr4 31958364 31958574 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38910 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 236-5 chr1 155470905 155471071 + 1.5 NA intron (NM_018489, intron 3 of 27) intron (NM_018489, intron 3 of 27) 37808 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 384-24 chrX 91425976 91426260 + 1.5 NA intron (NR_110659, intron 1 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -8721 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 489.75-4 chr8 122359382 122360249 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 208829 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 356.5-13 chr18 72562929 72563269 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18757 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 171-5 chr1 57059277 57059473 + 1.5 NA intron (NM_001353986, intron 9 of 14) intron (NM_001353986, intron 9 of 14) -93235 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 264.5-59 chr8 28885280 28885472 + 1.5 NA intron (NM_001145159, intron 1 of 15) intron (NM_001145159, intron 1 of 15) 4539 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 275.5-57 chr6 62296697 62297064 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10653 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 177-14 chr10 109898118 109898349 + 1.5 NA intron (NM_001324131, intron 3 of 20) MIRb|SINE|MIR 25013 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 395.5-22 chrX 96944895 96945193 + 1.5 NA intron (NM_007309, intron 13 of 26) intron (NM_007309, intron 13 of 26) 61136 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 246.75-65 chr7 39411590 39411846 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 6 of 9) intron (NM_001370959, intron 6 of 9) -5372 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 316-24 chr6 152850588 152851085 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 100039 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 230.5-18 chr10 129491931 129492132 + 1.5 NA intron (NM_002412, intron 1 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 24790 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 239.25-38 chr17 74180046 74180238 + 1.5 NA Intergenic LTR90A|LTR|LTR -23536 NM_000999 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 192.5-28 chr11 100440373 100440730 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -246737 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 143.75-78 chr18 70984842 70984966 + 1.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -333950 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 441.75-3 chr8 118575881 118576348 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -44887 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 358.5-18 chr7 37729806 37730277 + 1.5 NA intron (NM_181791, intron 3 of 3) intron (NM_181791, intron 3 of 3) 46275 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 298.5-2 chr1 113331642 113332031 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -58679 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 216.5-84 chr3 178682909 178683160 + 1.5 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 124184 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 237-17 chr14 63501533 63501798 + 1.5 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) L1MB8|LINE|L1 6573 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 393-9 chr21 29832741 29833262 + 1.5 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 84826 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 254-50 chr8 138472962 138473204 + 1.5 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 24178 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 246.5-15 chr11 100542956 100543265 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -144178 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 244.5-66 chr3 55219189 55219537 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 41191 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 206.5-37 chr18 44515906 44516224 + 1.5 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) LTR78|LTR|ERV1 15632 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 262.25-23 chr2 158713804 158714081 + 1.5 NA intron (NR_135242, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 21060 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-134 chr5 24031962 24032135 + 1.5 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 80700 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 170.5-28 chr10 72246118 72246259 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27736 NM_019058 54541 Hs.744875 NM_019058 ENSG00000168209 DDIT4 Dig2|REDD-1|REDD1 DNA damage inducible transcript 4 protein-coding 236-39 chr22 38592735 38593012 + 1.5 NA intron (NM_001013647, intron 15 of 16) MIRb|SINE|MIR 22373 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 189.5-87 chr22 50053526 50053726 + 1.5 NA intron (NM_001350317, intron 3 of 13) intron (NM_001350317, intron 3 of 13) 4601 NM_001350317 164714 Hs.526713 NM_001080447 ENSG00000138892 TTLL8 - tubulin tyrosine ligase like 8 protein-coding 192.75-61 chr2 161863290 161863500 + 1.5 NA intron (NM_001354451, intron 6 of 25) intron (NM_001354451, intron 6 of 25) 210820 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 185.5-16 chr10 63787703 63787907 + 1.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -265915 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 246-24 chr17 18324105 18324436 + 1.5 NA 3' UTR (NM_144775, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_144775, exon 2 of 2) 8977 NM_144775 140775 Hs.592944 NM_144775 ENSG00000176994 SMCR8 DENND8A SMCR8-C9orf72 complex subunit protein-coding 171-11 chr10 48922286 48922561 + 1.5 NA intron (NM_020945, intron 47 of 61) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -8188 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 381-19 chr4 181088467 181088894 + 1.5 NA intron (NR_033918, intron 2 of 2) intron (NR_033918, intron 2 of 2) 70469 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 191.75-84 chr3 106970384 106970588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 270152 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 317-24 chr3 195841179 195841452 + 1.5 NA intron (NR_134939, intron 1 of 1) AluSp|SINE|Alu 12913 NR_134940 101929697 Hs.551750 NR_134939 LINC01983 - long intergenic non-protein coding RNA 1983 ncRNA 232-5 chr1 173572477 173572698 + 1.5 NA intron (NM_178527, intron 9 of 27) MIRb|SINE|MIR 30485 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 179.25-133 chr6 143713906 143714064 + 1.5 NA intron (NM_001100165, intron 2 of 11) intron (NM_001100165, intron 2 of 11) 36020 NM_001100164 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 351.5-2 chr1 200200490 200200915 + 1.5 NA Intergenic LTR1F1|LTR|ERV1 157877 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 198.5-71 chr2 62554987 62555182 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48889 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 225-82 chr9 27326963 27327308 + 1.5 NA 3' UTR (NM_024761, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_024761, exon 4 of 4) -29985 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 271.5-97 chr9 77287390 77287652 + 1.5 NA intron (NM_001018038, intron 31 of 68) intron (NM_001018038, intron 31 of 68) -109604 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 277.5-59 chr4 136967028 136967273 + 1.5 NA intron (NR_149105, intron 2 of 3) intron (NR_149105, intron 2 of 3) -226606 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 126.5-243 chr8 91346604 91346739 + 1.5 NA intron (NM_134266, intron 9 of 18) intron (NM_134266, intron 9 of 18) 97352 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 267.5-20 chr13 54169257 54169560 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36537 NR_108062 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 354.25-2 chr14 61830698 61831178 + 1.5 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1MEf|LINE|L1 18235 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 208.25-37 chr17 66095144 66095381 + 1.5 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) L1MA8|LINE|L1 96630 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 342.5-16 chr2 197010673 197011059 + 1.5 NA intron (NM_001367496, intron 18 of 27) intron (NM_001367496, intron 18 of 27) -84159 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 216.5-79 chr3 108814394 108814628 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -8275 NM_016388 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 181.75-36 chr14 55476643 55476962 + 1.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -36257 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 258.5-28 chr17 9403818 9404089 + 1.5 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 171867 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 151-84 chr3 41295248 41295411 + 1.5 NA intron (NR_136342, intron 33 of 34) L1MC1|LINE|L1 95824 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 288-39 chr5 87775682 87776083 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 113840 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 253-11 chr12 127416900 127417152 + 1.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -76954 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 338.25-24 chr5 168854093 168854475 + 1.5 NA intron (NM_003062, intron 5 of 35) intron (NM_003062, intron 5 of 35) -86029 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 180.5 chr1 25996057 25996358 + 1.5 NA intron (NM_000437, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 1856 NM_000437 5051 Hs.477083 NM_000437 ENSG00000158006 PAFAH2 HSD-PLA2 platelet activating factor acetylhydrolase 2 protein-coding 371.5-10 chr4 92642482 92642758 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L1PA16|LINE|L1 338221 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 258.75-56 chr5 8819223 8819444 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -20399 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 132.25-67 chr15 92853886 92853981 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28910 NR_037601 100507217 Hs.622504 NR_037600 LINC01578 - long intergenic non-protein coding RNA 1578 ncRNA 229.5-132 chr8 126407565 126407757 + 1.5 NA Intergenic (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 82166 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 181.75-54 chr19 28667143 28667355 + 1.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 60445 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 388-14 chr8 112649820 112650267 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 17 of 66) intron (NM_001363185, intron 17 of 66) 6550 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 294.75-32 chr6 41594108 41594443 + 1.5 NA intron (NM_001012427, intron 13 of 16) intron (NM_001012427, intron 13 of 16) -4448 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 216.5-73 chr3 51781746 51782005 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2638 NM_001368368 440956 Hs.444316 NM_001143833 ENSG00000214686 IQCF6 - IQ motif containing F6 protein-coding 378-12 chr4 37848339 37848682 + 1.5 NA intron (NM_018290, intron 10 of 13) intron (NM_018290, intron 10 of 13) 21824 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 185.25-16 chr11 68242635 68242895 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -29117 NM_001300908 51111 Hs.632120 NM_016028 ENSG00000110066 KMT5B CGI-85|CGI85|MRD51|SUV420H1 lysine methyltransferase 5B protein-coding 191.5-62 chr18 2342926 2343126 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 228479 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 294.75-17 chr2 139895757 139896036 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 690789 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 142.25-139 chr6 38732615 38732847 + 1.5 NA intron (NM_001206927, intron 4 of 92) intron (NM_001206927, intron 4 of 92) 17420 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 143.5-91 chr17 63146232 63146347 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) L1M3|LINE|L1 180054 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 253-9 chr11 77355020 77355283 + 1.5 NA intron (NM_001128620, intron 7 of 15) MIRb|SINE|MIR -53485 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 301.75-13 chr14 73085161 73085662 + 1.5 NA intron (NM_021239, intron 5 of 18) L1MC5|LINE|L1 26877 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 192-101 chr8 95353002 95353201 + 1.5 NA intron (NR_038209, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 -83900 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 283.5-62 chr9 103603967 103604203 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -279052 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 280.25-41 chr4 59164934 59165284 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 151536 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 307-20 chr20 1057067 1057454 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -54949 NM_001029871 343637 Hs.444980 NM_001029871 ENSG00000101282 RSPO4 C20orf182|CRISTIN4 R-spondin 4 protein-coding 228-9 chr10 32811550 32811764 + 1.5 NA intron (NM_001321115, intron 31 of 43) L1M2b|LINE|L1 89815 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 213-69 chr4 43931923 43932166 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -84817 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 206.75-22 chr15 82727899 82728137 + 1.5 NA intron (NR_036446, intron 2 of 2) intron (NR_036446, intron 2 of 2) 11762 NR_036446 283693 Hs.560399 NR_036446 ACTG1P17 - actin gamma 1 pseudogene 17 pseudo 158-95 chr22 41149301 41149426 + 1.5 NA intron (NM_001429, intron 13 of 30) intron (NM_001429, intron 13 of 30) 48138 NR_110514 101927279 Hs.517517 NR_110514 EP300-AS1 - EP300 antisense RNA 1 ncRNA 427-3 chr10 108590089 108590636 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -521069 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 240-41 chr4 41182819 41183101 + 1.5 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 31582 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 228.75-86 chr8 110517010 110517289 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 510284 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 281.25-26 chr20 43662935 43663246 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3929 NM_001278610 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 195.75-68 chr20 37028414 37028589 + 1.5 NA intron (NM_002895, intron 16 of 21) AluJr|SINE|Alu 67496 NM_002895 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 214.5-24 chr12 26473170 26473407 + 1.5 NA intron (NM_002223, intron 45 of 56) intron (NM_002223, intron 45 of 56) 277715 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 273.75-48 chr9 104302019 104302366 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 31963 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 252-6 chr1 201121417 201121829 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6251 NM_001270601 647219 Hs.143949 NM_001270601 ENSG00000232237 ASCL5 bHLHa47 achaete-scute family bHLH transcription factor 5 protein-coding 318.75-8 chr17 69099574 69099801 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_039750) promoter-TSS (NR_039750) -55 NR_039750 100616316 NR_039750 ENSG00000283385 MIR4524A MIR4524|hsa-mir-4524a|mir-4524a microRNA 4524a ncRNA 297-19 chr15 61842570 61842951 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 112842 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 375.75-8 chr18 8852286 8852633 + 1.5 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 135078 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 245.5-78 chr8 52377308 52377546 + 1.5 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) 32329 NM_001352883 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 240.75-77 chr8 137801869 137802134 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 281544 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 170-67 chr4 33789837 33790051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 249949 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 205.5-40 chr14 34719224 34719473 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4525 NR_028130 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 166.75-47 chr14 52855154 52855533 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63736 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 204.5-71 chr2 208291612 208291787 + 1.5 NA intron (NM_001178000, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 25432 NM_152671 200576 Hs.744997 NM_015040 ENSG00000115020 PIKFYVE CFD|FAB1|HEL37|PIP5K|PIP5K3|ZFYVE29 phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing protein-coding 478-2 chr2 15036100 15036657 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 403661 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 246-26 chr18 6588389 6588618 + 1.5 NA intron (NR_120518, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 77087 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 295.5-52 chr6 40087363 40087710 + 1.5 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 -153074 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 251.25-13 chr11 132567699 132567951 + 1.5 NA intron (NM_002545, intron 2 of 6) intron (NM_002545, intron 2 of 6) 283523 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 246-60 chr7 116608447 116608635 + 1.5 NA intron (NR_120506, intron 1 of 4) L1ME2z|LINE|L1 6279 NR_120506 100996266 Hs.552122 NR_120506 LINC01510 - long intergenic non-protein coding RNA 1510 ncRNA 302.75-7 chr15 26786712 26787013 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -13099 NM_021912 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 328 chr1 111506043 111506507 + 1.5 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 -2154 NM_000677 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 260.5-54 chr6 79908757 79909093 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 38628 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 292.5-52 chr8 79438233 79438612 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 106234 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 237.25-30 chr14 85421822 85422255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28123 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 320.5-2 chr1 198186921 198187174 + 1.5 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 30049 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 345-14 chr3 80586826 80587145 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -177912 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 144.25-27 chr10 60522126 60522450 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 50668 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 422-3 chr11 40295477 40295844 + 1.5 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) intron (NM_001258419, intron 4 of 6) -2530 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 330.5 chr1 176219121 176219459 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12004 NM_022457 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 152-59 chr16 20997587 20997754 + 1.5 NA intron (NM_001347886, intron 43 of 61) intron (NM_001347886, intron 43 of 61) 96408 NR_161432 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 200.25-64 chr2 124793135 124793343 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 18 of 23) L1MB7|LINE|L1 767952 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 186.5-78 chr20 45853278 45853450 + 1.5 NA intron (NM_005469, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 4028 NM_005469 10005 Hs.444776 NM_005469 ENSG00000101473 ACOT8 HNAACTE|NAP1|PTE-1|PTE-2|PTE1|PTE2|hACTE-III|hTE acyl-CoA thioesterase 8 protein-coding 276.75-3 chr1 152469434 152469792 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -41190 NM_178438 254910 Hs.516410 NM_178438 ENSG00000186207 LCE5A LEP18|SPRL5A late cornified envelope 5A protein-coding 316-8 chr12 33117883 33118337 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -221264 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 349.75-7 chr2 20278616 20278918 + 1.5 NA exon (NM_001352918, exon 13 of 21) exon (NM_001352918, exon 13 of 21) 48619 NM_001282791 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 165.5-32 chr12 63107925 63108074 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 44811 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 209-48 chr21 29934333 29934581 + 1.5 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 5539 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 228-79 chr8 84488853 84489108 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 73496 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 144-80 chr3 37190590 37190728 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14299 NM_001348297 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 222-28 chr17 43876685 43876982 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001278373, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001278373, exon 12 of 12) 23791 NM_001278376 4355 Hs.514208 NM_005374 ENSG00000108852 MPP2 DLG2 membrane palmitoylated protein 2 protein-coding 219.25-75 chr7 109251904 109252190 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -367460 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 250.5-60 chr3 29511462 29511754 + 1.5 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 230296 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 426.5-5 chr7 108545710 108546090 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17722 NM_001256011 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 238.5-44 chr2 149249300 149249651 + 1.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -80510 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 246.75-56 chr5 117025461 117025689 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -263366 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 281.25-23 chr2 94882910 94883150 + 1.5 NA intron (NR_037597, intron 7 of 9) AluJb|SINE|Alu 11600 NM_001286559 150483 Hs.631517 NM_144705 ENSG00000163060 TEKT4 - tektin 4 protein-coding 174-21 chr12 10688752 10688955 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -14801 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 270.75-7 chr10 80318800 80318995 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -25848 NR_070308 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 291.5-18 chr2 40894549 40894788 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -382233 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 283.5-21 chr18 1538445 1538804 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -178995 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 625.25-2 chr9 32539751 32540709 + 1.5 NA TTS (NM_005802) TTS (NM_005802) -10914 NM_001349118 100129250 Hs.664395 NM_001349118 ENSG00000235453 SMIM27 C9orf133|TOPORS-AS1 small integral membrane protein 27 protein-coding 240.75-4 chr10 7527992 7528243 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91556 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 162.75-22 chr11 70857293 70857483 + 1.5 NA intron (NM_012309, intron 10 of 24) intron (NM_012309, intron 10 of 24) -5402 NR_073536 220070 Hs.326766 NM_145308 ENSG00000171671 SHANK2-AS3 C11orf76 SHANK2 antisense RNA 3 ncRNA 310-6 chr14 35257243 35257568 + 1.5 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) L1MB3|LINE|L1 -21153 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 364.25-19 chr2 118529649 118530017 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 73133 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 188.5-91 chr22 20180742 20180902 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 24096 NR_038460 284865 Hs.638498 NR_038460 ENSG00000249923 LOC284865 - uncharacterized LOC284865 ncRNA 130-180 chr9 95686804 95686942 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -169816 NM_001083602 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 125-34 chr12 54858508 54858643 + 1.5 NA TTS (NM_058173) TTS (NM_058173) 4059 NM_058173 118430 Hs.348419 NM_058173 ENSG00000172551 MUCL1 SBEM mucin like 1 protein-coding 235.25-41 chr21 30985873 30986183 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 52448 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 212.5-6 chr1 173036477 173036653 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 14398 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 313.5-16 chr16 73720213 73720614 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 333608 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 337.5-12 chr14 49309427 49309907 + 1.5 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 276713 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 297-41 chr6 65016784 65017038 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 13 of 43) intron (NM_001292009, intron 13 of 43) -284507 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 195.5-29 chr12 21393181 21393412 + 1.5 NA intron (NM_134431, intron 1 of 15) intron (NM_134431, intron 1 of 15) 2141 NM_134431 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 175.5-127 chr4 13735457 13735665 + 1.5 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 80382 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 285.75-30 chr3 145637939 145638334 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 431049 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 181.5-5 chr1 107580460 107580616 + 1.5 NA intron (NM_006113, intron 25 of 26) intron (NM_006113, intron 25 of 26) 107961 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 235-50 chr4 66453776 66454007 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 177067 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 332.75-21 chr7 97031405 97031843 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6793 NM_005221 1749 Hs.99348 NM_005221 ENSG00000105880 DLX5 SHFM1D distal-less homeobox 5 protein-coding 189.25-100 chr5 158647964 158648315 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -238366 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 463.75-7 chr6 91963797 91964312 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -273626 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 238-62 chr7 85124082 85124395 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2307 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 270.75-5 chr10 63312837 63313173 + 1.5 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) L1PB1|LINE|L1 -43762 NM_001322254 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 202.5-30 chr11 128663606 128663869 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22798 NM_001271012 2313 Hs.504281 NM_002017 ENSG00000151702 FLI1 BDPLT21|EWSR2|SIC-1 Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor protein-coding 351.75-2 chr10 106006628 106007262 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -133220 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 172-64 chr20 45108938 45109091 + 1.5 NA TTS (NM_145652) TTS (NM_145652) 6160 NM_145652 149708 Hs.375031 NM_145652 ENSG00000175121 WFDC5 PRG5|WAP1|dJ211D12.5 WAP four-disulfide core domain 5 protein-coding 243-17 chr14 26477172 26477399 + 1.5 NA intron (NM_001366391, intron 4 of 5) intron (NM_001366391, intron 4 of 5) 76145 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 171-135 chr9 25332404 25332662 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 346325 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 119-153 chr5 148295550 148295645 + 1.5 NA intron (NR_105057, intron 3 of 4) Charlie10|DNA|hAT-Charlie -16826 NM_032566 84651 Hs.244569 NM_032566 ENSG00000145879 SPINK7 ECG2|ECRG2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) protein-coding 278.25-52 chr7 8326756 8327000 + 1.5 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -64266 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 345-3 chr11 103019597 103019841 + 1.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -63987 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 143.25-82 chr2 17962327 17962543 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 83768 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 323-6 chr11 108583880 108584177 + 1.5 NA intron (NM_015065, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 9740 NM_015065 23086 Hs.28540 NM_015065 ENSG00000110723 EXPH5 SLAC2-B|SLAC2B exophilin 5 protein-coding 136.5-147 chr3 57879093 57879219 + 1.5 NA intron (NM_001304420, intron 12 of 21) AluJb|SINE|Alu -10758 NM_001311179 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 159.5-137 chr3 1366024 1366188 + 1.5 NA intron (NM_001289080, intron 12 of 22) MER5A|DNA|hAT-Charlie 273082 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 376-16 chr2 227271791 227272121 + 1.5 NA intron (NM_000091, intron 25 of 51) intron (NM_000091, intron 25 of 51) 53208 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 175.75-22 chr11 12838221 12838375 + 1.5 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 151250 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 306-8 chr15 78221982 78222344 + 1.5 NA intron (NM_015162, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 12402 NM_001199377 23205 Hs.655760 NM_015162 ENSG00000103740 ACSBG1 BG|BG1|BGM|GR-LACS|LPD acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 protein-coding 315-3 chr1 83661227 83661470 + 1.5 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) intron (NR_119375, intron 2 of 2) 199198 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 238.5-17 chr11 39727019 39727242 + 1.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 566000 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 157-116 chr8 84499166 84499324 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L1PA17|LINE|L1 83761 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 194.5-165 chr9 68642796 68643088 + 1.5 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -62298 NM_003558 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 270.5-5 chr1 166758442 166758725 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80892 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 416.25-4 chr14 60892751 60893354 + 1.5 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L1M4c|LINE|L1 88027 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 332.75-6 chr10 83033876 83034416 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 642943 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 339-19 chr3 127248229 127248522 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39671 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 219-21 chr12 16603174 16603390 + 1.5 NA intron (NM_001001395, intron 1 of 3) intron (NM_001001395, intron 1 of 3) 2097 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 158-31 chr11 24731392 24731609 + 1.5 NA intron (NM_001009909, intron 2 of 11) intron (NM_001009909, intron 2 of 11) 234447 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 324.5-32 chr7 37558733 37559031 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109556 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 279-9 chr12 58194016 58194305 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 106268 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 308.25-25 chr4 84469151 84469365 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28976 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 297.25-3 chr11 41444317 41444727 + 1.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 15114 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 203.25-112 chr8 141735039 141735212 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51188 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 206.25-55 chr2 151416750 151416899 + 1.5 NA exon (NM_001177663, exon 6 of 35) exon (NM_001177663, exon 6 of 35) 6922 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 187.25-95 chr6 146574352 146574552 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 24479 NR_125860 101928661 Hs.711833 NR_125860 ENSG00000237468 LOC101928661 - uncharacterized LOC101928661 ncRNA 259.5-30 chr14 41305871 41306167 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -300837 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 338 chr1 43420946 43421315 + 1.5 NA intron (NM_015284, intron 10 of 70) intron (NM_015284, intron 10 of 70) -27409 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 266.5-67 chr6 110053804 110054189 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75685 NM_005284 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 326-15 chr2 53351234 53351563 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -416385 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 247.75-58 chr6 124566428 124566856 + 1.5 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) MER103C|DNA|hAT-Charlie 283637 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 283-30 chr3 143838608 143838861 + 1.5 NA intron (NM_173653, intron 1 of 15) intron (NM_173653, intron 1 of 15) 9734 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 226.5-7 chr1 228282896 228283161 + 1.5 NA exon (NM_001098623, exon 32 of 105) exon (NM_001098623, exon 32 of 105) -69364 NR_073154 574407 Hs.650039 NM_001025495 ENSG00000162913 OBSCN-AS1 C1orf145 OBSCN antisense RNA 1 ncRNA 122.25-125 chr3 83287741 83287845 + 1.5 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 1301651 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 314.25-13 chr2 51826863 51827250 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -543592 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 165-42 chr15 62736349 62736500 + 1.5 NA intron (NM_015059, intron 25 of 55) L1ME3|LINE|L1 -87533 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 318.25-11 chr5 164786066 164786433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 315970 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 372.5-5 chr13 87308588 87309063 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 309915 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 211.5-102 chr3 85515815 85516114 + 1.5 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 10905 NM_001256502 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 269.25-42 chr5 127129287 127129480 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55891 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 210.75-16 chr10 133436775 133436990 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -12265 NM_001012508 503542 Hs.64968 NM_001012508 ENSG00000203772 SPRN SHADOO|SHO|bA108K14.1 shadow of prion protein protein-coding 199-88 chr8 122252150 122252405 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 316367 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 375.5-3 chr11 104446356 104446676 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 162786 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 267-58 chr9 103249104 103249446 + 1.5 NA intron (NR_121578, intron 6 of 9) L1MD2|LINE|L1 75758 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 207-83 chr7 62682485 62682708 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 621460 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 219.75-82 chr8 14641212 14641458 + 1.5 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 212175 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 120-168 chr7 7916417 7916561 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 52263 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 210.75-88 chr6 167301459 167301679 + 1.5 NA intron (NM_018974, intron 4 of 7) intron (NM_018974, intron 4 of 7) 10254 NM_018974 54346 Hs.567508 NM_018974 ENSG00000112494 UNC93A Unc-93A|dJ366N23.1|dJ366N23.2 unc-93 homolog A protein-coding 211.75-61 chr3 99493444 99493855 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -144945 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 281.25-38 chr5 128489893 128490246 + 1.5 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) intron (NM_001999, intron 5 of 64) 48176 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 258.5-70 chr8 94662851 94663116 + 1.5 NA intron (NM_017697, intron 6 of 15) intron (NM_017697, intron 6 of 15) 21809 NM_001122827 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 253.5-74 chr7 44619361 44619604 + 1.5 NA intron (NM_002541, intron 1 of 22) L1MB7|LINE|L1 12855 NM_001003941 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 134.75-112 chr2 117747443 117747694 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -67123 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 191.25-17 chr11 67046117 67046364 + 1.5 NA TTS (NR_106920) TTS (NR_106920) 597 NR_106920 102465518 NR_106920 ENSG00000283326 MIR6860 hsa-mir-6860 microRNA 6860 ncRNA 168.5-127 chr4 33677479 33677682 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 362313 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 289.5-43 chr6 47268062 47268388 + 1.5 NA intron (NM_014452, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 41680 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 397.75-6 chr4 117842339 117842706 + 1.5 NA intron (NR_147154, intron 1 of 1) intron (NR_147154, intron 1 of 1) 8121 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 240.75-41 chr2 51531814 51532188 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1ME1|LINE|L1 499400 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 246.75-63 chr7 24565150 24565525 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8115 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 166.5-97 chr2 40137209 40137391 + 1.5 NA intron (NM_001351483, intron 8 of 8) intron (NM_001351483, intron 8 of 8) 219666 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 430-16 chr7 6693542 6693986 + 1.5 NA intron (NM_006956, intron 4 of 5) intron (NM_006956, intron 4 of 5) 13183 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 286.5-10 chr10 127699190 127699537 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -37822 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 134.25-37 chr12 93438248 93438489 + 1.5 NA intron (NM_003348, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 3579 NM_003348 7334 Hs.524630 NM_003348 ENSG00000177889 UBE2N HEL-S-71|UBC13|UBCHBEN; UBC13|UbcH-ben|UbcH13 ubiquitin conjugating enzyme E2 N protein-coding 285.5-22 chr15 69638259 69638470 + 1.5 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) MIR3|SINE|MIR 46164 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 161.5-112 chr2 214079292 214079530 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 12 of 14) intron (NR_047660, intron 12 of 14) 321344 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 147.5-12 chr1 217200454 217200574 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -62812 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 253.75-4 chr11 98005610 98005965 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -1015162 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 386-2 chr1 28435749 28436138 + 1.5 NA intron (NM_001350160, intron 3 of 14) intron (NM_001350160, intron 3 of 14) -2207 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 224.5-71 chr22 31168171 31168452 + 1.5 NA intron (NR_024212, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 8129 NM_152267 91445 Hs.517553 NM_152267 ENSG00000138942 RNF185 - ring finger protein 185 protein-coding 147-40 chr15 75197433 75197588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4372 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 276-21 chr15 61706218 61706521 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -23549 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 208.25-27 chr13 113280772 113280941 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16383 NM_005561 3916 Hs.494419 NM_005561 ENSG00000185896 LAMP1 CD107a|LAMPA|LGP120 lysosomal associated membrane protein 1 protein-coding 296-38 chr6 49895417 49895717 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -18471 NM_001205220 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 246.25-5 chr10 11151068 11151343 + 1.5 NA intron (NM_001326334, intron 2 of 13) intron (NM_001326334, intron 2 of 13) -13676 NM_001326347 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 391.75 chr12 1406928 1407495 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 16 of 19) intron (NR_027948, intron 16 of 19) -93280 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 312.5-30 chr6 69706486 69706821 + 1.5 NA intron (NM_001367272, intron 9 of 15) L1MC4|LINE|L1 89813 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 252.75-45 chr3 107423775 107424103 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6991 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 157-48 chr2 7409389 7409561 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11786 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 188.5-142 chr7 114129076 114129291 + 1.5 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) MIRc|SINE|MIR 42856 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 154.5-76 chr17 28810749 28810906 + 1.5 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) intron (NM_001288635, intron 1 of 3) 1644 NM_001288634 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 231-73 chr6 160181348 160181507 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 59596 NM_153187 6580 Hs.117367 NM_003057 ENSG00000175003 SLC22A1 HOCT1|OCT1|oct1_cds solute carrier family 22 member 1 protein-coding 147-125 chr6 120154520 120154717 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 139439 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 429.5-2 chr12 4419230 4419685 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 26157 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 381-9 chr19 36832899 36833298 + 1.5 NA intron (NM_001242800, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 4929 NM_001242802 388536 Hs.282067 NM_206894 ENSG00000197863 ZNF790 - zinc finger protein 790 protein-coding 235.5-8 chr1 184501432 184501592 + 1.5 NA intron (NM_030806, intron 2 of 5) L2b|LINE|L2 114483 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 280-23 chr17 63183173 63183364 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 217033 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 364.25-17 chr17 61263923 61264243 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) MIR|SINE|MIR 103621 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 177.75-79 chr2 162537326 162537556 + 1.5 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) 193073 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 214-23 chr14 82192766 82192958 + 1.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -449724 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 219.75-45 chr2 189570137 189570320 + 1.5 NA intron (NM_014585, intron 5 of 7) intron (NM_014585, intron 5 of 7) 10583 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 597.5-2 chr14_GL000225v1_random 67260 68135 + 1.5 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 254.5-12 chr10 66665758 66665982 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -260166 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 193-61 chr4 42953774 42953988 + 1.5 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 60615 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 137.25-156 chr7 89560082 89560210 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -559254 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 338-7 chr11 13459610 13460016 + 1.5 NA intron (NM_032320, intron 1 of 8) intron (NM_032320, intron 1 of 8) 3484 NM_032320 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 255.5-28 chr15 90007529 90007821 + 1.5 NA TTS (NR_036135) TTS (NR_036135) 920 NR_036135 100422841 NR_036135 ENSG00000265871 MIR3174 - microRNA 3174 ncRNA 352.75-9 chr2 73446309 73446920 + 1.5 NA intron (NM_015120, intron 7 of 22) intron (NM_015120, intron 7 of 22) -10489 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 249.75-5 chr1 61630303 61630531 + 1.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -23825 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 425.25-9 chr9 85153269 85153608 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 447537 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 227-15 chr12 47433413 47433711 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 18554 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 285.5-30 chr2 11868489 11868763 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -31640 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 193.25-12 chr10 66055780 66056133 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) L1MA5|LINE|L1 484531 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 152.25-142 chr7 3381062 3381250 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 79904 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 371.75-15 chr6 159050407 159050780 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5441 NM_152133 117289 Hs.529984 NM_054114 ENSG00000164691 TAGAP ARHGAP47|FKSG15|IDDM21|TAGAP1 T cell activation RhoGTPase activating protein protein-coding 251.75-6 chr1 167090892 167091242 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_005814) promoter-TSS (NM_005814) -690 NM_005814 10223 Hs.651244 NM_005814 ENSG00000143167 GPA33 A33 glycoprotein A33 protein-coding 265-15 chr17 65673594 65673824 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) L1M5|LINE|L1 -112061 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 168-90 chr4 94455087 94455249 + 1.5 NA intron (NM_001011516, intron 1 of 9) intron (NM_001011516, intron 1 of 9) 3226 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 229.5-61 chr2 64972584 64972868 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -15753 NM_001348406 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 181-30 chr14 98873420 98873642 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 161918 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 125.5-237 chr7 93871930 93872077 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 18750 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 273-54 chr7 137698294 137698590 + 1.5 NA intron (NM_001321708, intron 1 of 32) LTR16|LTR|ERVL 147890 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 248.5-93 chr7 6046196 6046412 + 1.5 NA intron (NM_001134335, intron 5 of 14) intron (NM_001134335, intron 5 of 14) 12871 NM_014413 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 256.5-79 chr8 126926134 126926415 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -86880 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 231-59 chr4 60920846 60921104 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1644 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 255-26 chr2 122527145 122527487 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 546165 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 243.5-35 chr2 37624643 37625029 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 47363 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 360.5 chr1 39812555 39813003 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 23803 NR_135805 101929536 Hs.552820 NR_135805 ENSG00000261798 LOC101929536 - uncharacterized LOC101929536 ncRNA 290-52 chrX 15108427 15108748 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 161496 NM_001031739 140462 Hs.19404 NM_024087 ENSG00000102048 ASB9 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 protein-coding 324.75-31 chr8 79530845 79531207 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -80091 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 287-4 chr1 231932179 231932488 + 1.5 NA intron (NR_126441, intron 1 of 3) intron (NR_126441, intron 1 of 3) 6499 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 162-22 chr11 36613030 36613166 + 1.5 NA intron (NM_001276725, intron 2 of 3) intron (NM_001276725, intron 2 of 3) -14819 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 252.25-61 chr7 93401368 93401606 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 81368 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 278-40 chr9 117012086 117012291 + 1.5 NA intron (NM_014010, intron 5 of 21) intron (NM_014010, intron 5 of 21) 169013 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 327.75-21 chr5 90590905 90591245 + 1.5 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) L1MA3|LINE|L1 32278 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 236.25-43 chr2 39297615 39297957 + 1.5 NA intron (NM_003618, intron 16 of 33) intron (NM_003618, intron 16 of 33) -53803 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 442 chr1 59646177 59646792 + 1.5 NA intron (NM_001350790, intron 12 of 16) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 86812 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 173-147 chr9 27677896 27678109 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -104136 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 181-95 chr6 70397428 70397645 + 1.5 NA intron (NR_125857, intron 3 of 3) intron (NR_125857, intron 3 of 3) 3334 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 320-7 chr10 106134986 106135391 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4977 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 171-73 chr2 164138243 164138426 + 1.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -402326 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 162.75-104 chr4 62789636 62789815 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -627960 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 219-55 chr2 205996257 205996475 + 1.5 NA 3' UTR (NM_017759, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_017759, exon 11 of 11) 89808 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 218.25-9 chr10 33241669 33241886 + 1.5 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 92890 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 122.75-8 chr1 81477692 81477818 + 1.5 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) 79947 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 279.75-5 chr10 121747216 121747431 + 1.5 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) LTR33A_|LTR|ERVL -148865 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 296-43 chr8 17384008 17384302 + 1.5 NA intron (NM_004686, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 29196 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 224-9 chr10 94310722 94310986 + 1.5 NA intron (NM_001165979, intron 26 of 31) MER21C|LTR|ERVL -23784 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 171-99 chr4 30984650 30984918 + 1.5 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -186360 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 148-55 chr2 54108680 54108887 + 1.5 NA intron (NM_001320587, intron 3 of 5) intron (NM_001320587, intron 3 of 5) -6832 NM_001320589 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 137.75-48 chr12 129538678 129538792 + 1.5 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) MER44D|DNA|TcMar-Tigger 330134 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 252-64 chr7 27560670 27560880 + 1.5 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1MC|LINE|L1 -55199 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 351-23 chr6 42869651 42870209 + 1.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9686 NM_198486 285855 Hs.520133 NM_198486 ENSG00000146223 RPL7L1 dJ475N16.4 ribosomal protein L7 like 1 protein-coding 194.5-65 chr2 49269269 49269553 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -114884 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 293-20 chr3 46555223 46555650 + 1.5 NA intron (NM_024512, intron 1 of 8) L1MEf|LINE|L1 -1962 NR_073385 83598 Hs.570630 NR_073385 ENSG00000268324 LRRC2-AS1 LUZP3|LUZP3P|LUZPP1 LRRC2 antisense RNA 1 ncRNA 244.5-81 chr6 39425211 39425418 + 1.5 NA intron (NM_001289020, intron 14 of 21) intron (NM_001289020, intron 14 of 21) 6076 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 310.5-16 chr18 76006162 76006516 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116659 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 251.75-48 chr22 20301690 20302166 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 18132 NM_033257 85359 Hs.410965 NM_033257 ENSG00000128185 DGCR6L DGCR6 DiGeorge syndrome critical region gene 6 like protein-coding 157.75-28 chr11 47045038 47045218 + 1.5 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) L1MEi|LINE|L1 108367 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 288.5-7 chr11 72050086 72050356 + 1.5 NA intron (NR_104476, intron 2 of 24) intron (NR_104476, intron 2 of 24) 22081 NR_036123 100422953 NR_036123 ENSG00000263742 MIR3165 mir-3165 microRNA 3165 ncRNA 213-11 chr10 58820674 58820981 + 1.5 NA intron (NM_001080512, intron 20 of 20) intron (NM_001080512, intron 20 of 20) 105812 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 243-57 chr5 15600688 15600954 + 1.5 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) intron (NM_001278317, intron 1 of 3) 14181 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 265.25-10 chr12 20463937 20464209 + 1.5 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 94828 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 319.5-34 chr4 122236180 122236604 + 1.5 NA intron (NM_015312, intron 25 of 83) intron (NM_015312, intron 25 of 83) 65789 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 218-35 chr2 74567175 74567431 + 1.5 NA intron (NM_001321739, intron 7 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 13143 NM_001318867 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 322.25-19 chr9 9622711 9622972 + 1.5 NA intron (NM_002839, intron 7 of 45) intron (NM_002839, intron 7 of 45) -176551 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 173-142 chr8 121263597 121263758 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -375669 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 297-25 chr2 11729952 11730252 + 1.5 NA intron (NM_001261427, intron 1 of 20) L1MCc|LINE|L1 5787 NM_001261427 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 336.75-10 chr17 14476282 14476679 + 1.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 172740 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 176.5-53 chr14 54091231 54091475 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -134462 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 252-41 chr20 60351409 60351763 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43112 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 267 chr1 20396910 20397194 + 1.5 NA intron (NR_033887, intron 6 of 11) L2b|LINE|L2 31742 NR_033887 339505 Hs.633269 NR_033887 LINC01141 - long intergenic non-protein coding RNA 1141 ncRNA 196-94 chr7 131854951 131855098 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55196 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 224-24 chr18 39842364 39842666 + 1.5 NA intron (NR_151703, intron 1 of 8) intron (NR_151703, intron 1 of 8) 806 NR_151703 105372079 NR_151703 ENSG00000283503 LINC01902 - long intergenic non-protein coding RNA 1902 ncRNA 319-12 chr14 19897484 19898119 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 21533 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 399.75-8 chr3 3064384 3064803 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3448 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-180 chr7 50987669 50987940 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -194351 NM_001371008 295-12 chr15 42631778 42632033 + 1.5 NA intron (NM_020759, intron 3 of 32) L1MA3|LINE|L1 56299 NM_020759 57519 Hs.122061 NM_020759 ENSG00000159433 STARD9 KIF16A StAR related lipid transfer domain containing 9 protein-coding 340-6 chr15 23908696 23909031 + 1.5 NA Intergenic (ATCTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -66284 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 321.75-13 chr17 62869339 62869768 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 61051 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 150.5-231 chr8 142658856 142658968 + 1.5 NA exon (NM_001077527, exon 3 of 3) exon (NM_001077527, exon 3 of 3) 11055 NM_001077527 8629 Hs.535903 NM_003724 ENSG00000234616 JRK JH8|jerky Jrk helix-turn-helix protein protein-coding 386-7 chr17 31164182 31164620 + 1.5 NA intron (NM_001042492, intron 4 of 57) intron (NM_001042492, intron 4 of 57) 69424 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 287.25-54 chrX 45553089 45553312 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 47812 NR_104645 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 119.25-57 chr14 57250975 57251171 + 1.5 NA intron (NM_006544, intron 1 of 17) L1M4c|LINE|L1 17832 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 168-52 chr15 88614156 88614444 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2376 NR_039867 100616238 NR_039867 ENSG00000283484 MIR3529 mir-3529 microRNA 3529 ncRNA 239-11 chr11 41032106 41032332 + 1.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 427417 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 232.25-16 chr11 114445246 114445602 + 1.5 NA intron (NM_015523, intron 4 of 6) intron (NM_015523, intron 4 of 6) 5957 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 126.5-194 chr5 86517859 86517968 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100028 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 231-20 chr12 65885556 65885852 + 1.5 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -3379 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-94 chr5 5948617 5948868 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 388550 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 139.75-81 chr17 80019517 80019650 + 1.5 NA intron (NM_019020, intron 1 of 11) intron (NM_019020, intron 1 of 11) 16289 NM_019020 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 232-59 chr4 54510975 54511334 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 95977 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 226.5-90 chr7 18070353 18070721 + 1.5 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu -16288 NM_001321868 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 229.5-40 chr14 69079487 69079681 + 1.5 NA intron (NM_003861, intron 6 of 8) intron (NM_003861, intron 6 of 8) 73015 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 462.25-3 chr3 150481278 150481838 + 1.5 NA Intergenic Charlie14a|DNA|hAT-Charlie 64938 NM_014445 27230 Hs.518326 NM_014445 ENSG00000120742 SERP1 RAMP4 stress associated endoplasmic reticulum protein 1 protein-coding 205-16 chr12 7513565 7513833 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9881 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 329-7 chr10 123849577 123849976 + 1.5 NA intron (NM_198148, intron 3 of 13) intron (NM_198148, intron 3 of 13) 42031 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 221-76 chr8 89149270 89149489 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 608332 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 189.5-112 chr5 128128530 128128699 + 1.5 NA intron (NM_001046, intron 4 of 26) MIRb|SINE|MIR 44848 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 220.25-30 chr2 56756630 56756944 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -571017 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 366.5-16 chr5 72124178 72124472 + 1.5 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) intron (NM_005909, intron 2 of 6) 16850 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 215-38 chr19 52233301 52233505 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 11383 NR_106859 102466984 NR_106859 ENSG00000274380 MIR6801 hsa-mir-6801 microRNA 6801 ncRNA 168.25-23 chr11 30931768 30932002 + 1.5 NA exon (NM_020869, exon 3 of 20) exon (NM_020869, exon 3 of 20) 60801 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 287-35 chr6 144092973 144093393 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 2390 NM_031287 83443 Hs.110695 NM_031287 ENSG00000169976 SF3B5 SF3b10|Ysf3 splicing factor 3b subunit 5 protein-coding 331.25-4 chr14 47491528 47491825 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -148430 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 359.25-6 chr22 25139597 25140103 + 1.5 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 -27158 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 312.5-23 chr3 99949969 99950497 + 1.5 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 14165 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 157.5 chr1 5328348 5328475 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 534330 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 267.75-13 chr14 46171882 46172114 + 1.5 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 107839 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 247.75-25 chr17 57781774 57782025 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36600 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 219.5-90 chr3 197068493 197068757 + 1.5 NA intron (NM_001366211, intron 19 of 25) intron (NM_001366211, intron 19 of 25) -38808 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 197-34 chr2 159289279 159289431 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2652 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 243-77 chr8 132446923 132447140 + 1.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 231 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 280.75-9 chr10 91779104 91779418 + 1.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 18935 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 333-7 chr12 64902777 64903285 + 1.5 NA intron (NR_033988, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 19257 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 357.5-20 chr8 119056759 119057080 + 1.5 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 -10328 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 317-28 chr7 13364430 13364844 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 621877 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 156-32 chr12 34328765 34328998 + 1.5 NA Intergenic GSATII|Satellite|centr 306385 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 166-107 chr6 55973796 55973972 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98294 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 256-29 chr2 75173352 75173620 + 1.5 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) intron (NM_015727, intron 1 of 3) 26034 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 226.5-27 chr16 59235525 59235709 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -501301 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 369-8 chr2 5477756 5478092 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 213194 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 188-28 chr16 76493208 76493416 + 1.5 NA intron (NR_136213, intron 13 of 23) intron (NR_136213, intron 13 of 23) -141686 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 233.25-4 chr1 195549570 195549769 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 539046 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 174-25 chr14 34930784 34930930 + 1.5 NA intron (NR_151701, intron 2 of 4) intron (NR_151701, intron 2 of 4) -9065 NR_002937 280655 Hs.639271 NR_002937 IGBP1P1 C14orf19 immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 pseudogene 1 pseudo 191-54 chr3 118924450 118924692 + 1.5 NA intron (NM_001353325, intron 5 of 7) intron (NM_001353325, intron 5 of 7) -18505 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 231-62 chr4 101829391 101829632 + 1.5 NA intron (NM_001083907, intron 1 of 16) HAL1b|LINE|L1 15669 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 178.5-153 chr6 52619828 52620022 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42627 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 178.75-75 chr4 112423088 112423216 + 1.5 NA intron (NM_001102406, intron 5 of 15) L2a|LINE|L2 -92227 NR_161159 105377372 NR_161159 LOC105377372 - uncharacterized LOC105377372 ncRNA 175.5-132 chr4 110555478 110555656 + 1.5 NA intron (NM_001977, intron 18 of 19) intron (NM_001977, intron 18 of 19) 59891 NR_147203 110231149 Hs.436030 NR_147203 ENSG00000250103 PANCR - PITX2 adjacent non-coding RNA ncRNA 249.5-26 chr14 48124301 48124585 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -329429 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 157-111 chr7 11119636 11119760 + 1.5 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) intron (NR_033436, intron 16 of 16) 145826 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 443.5 chr12 8726850 8727410 + 1.5 NA intron (NR_147950, intron 2 of 8) L1MC1|LINE|L1 29139 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 171-37 chr14 53168805 53169022 + 1.5 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 15559 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 314.25-16 chr20 53746396 53746776 + 1.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 129123 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 289-37 chr5 126362792 126363154 + 1.5 NA intron (NM_001146319, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 2853 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 470.5-7 chr3 180445769 180446240 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 31831 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 368.25-18 chr8 81059606 81060205 + 1.5 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 52163 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 261-61 chr8 70907503 70907770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 238297 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 176.5-72 chr17 62308614 62308758 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33031 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 249-20 chr18 70194593 70194765 + 1.5 NA intron (NM_001318520, intron 7 of 47) L1MB4|LINE|L1 11008 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 219-22 chr12 25446490 25446771 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 106653 NM_001256266 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 151.75-54 chr17 76970692 76970842 + 1.5 NA Intergenic LTR10F|LTR|ERV1 -1568 NR_136416 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 188.25-85 chr4 156640588 156640731 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 331140 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 292-24 chr2 75857329 75857543 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -146521 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 395-8 chr19 24382043 24382347 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -218748 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 265-10 chr14 21353962 21354183 + 1.5 NA intron (NM_007192, intron 23 of 25) intron (NM_007192, intron 23 of 25) 29947 NM_007192 11198 Hs.213724 NM_007192 ENSG00000092201 SUPT16H CDC68|FACTP140|SPT16|SPT16/CDC68 SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit protein-coding 203-60 chr22 20799722 20799984 + 1.5 NA intron (NM_058004, intron 14 of 54) intron (NM_058004, intron 14 of 54) 25740 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 332.5-31 chr9 17363905 17364251 + 1.5 NA intron (NM_001365029, intron 12 of 25) L1MB5|LINE|L1 -214988 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 285.5-53 chr6 162336962 162337368 + 1.5 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -389967 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 420.25-13 chr7 11293242 11293710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 319604 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 257.25-51 chr6 144787457 144787752 + 1.5 NA intron (NM_007124, intron 60 of 73) intron (NM_007124, intron 60 of 73) 381949 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 281.75-2 chr1 111552881 111553219 + 1.5 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) intron (NM_001370216, intron 1 of 7) 10953 NM_001302680 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 156-76 chr2 14076877 14077034 + 1.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 324003 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 424.25-6 chr8 70499921 70500580 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 29116 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 170.5-50 chr13 48952196 48952413 + 1.5 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -23608 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 256.5-70 chr7 26539715 26540071 + 1.5 NA non-coding (NR_148499, exon 7 of 7) non-coding (NR_148499, exon 7 of 7) -1068 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 239-14 chr12 49393632 49394103 + 1.5 NA intron (NM_001293285, intron 3 of 14) AluJr|SINE|Alu 4693 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 321.25-4 chr1 159537200 159537517 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1351 NM_001004469 127385 Hs.553587 NM_001004469 ENSG00000184155 OR10J5 OR1-28 olfactory receptor family 10 subfamily J member 5 protein-coding 251.25-56 chr8 77122573 77122876 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -121680 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 312.5-25 chr3 166637344 166637717 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -261153 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 196-74 chr4 114999640 114999850 + 1.5 NA intron (NM_022569, intron 2 of 13) intron (NM_022569, intron 2 of 13) 113875 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 332.25-31 chr8 122611623 122611883 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43109 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 259.25-17 chr16 80715263 80715586 + 1.5 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) intron (NM_152342, intron 1 of 6) 89174 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 115.25-217 chr8 132854635 132854806 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -12238 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 334.5-23 chr4 84890454 84890717 + 1.5 NA intron (NM_014991, intron 3 of 67) intron (NM_014991, intron 3 of 67) -75031 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 252.75-47 chr3 182021704 182021909 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 69442 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 337.5-4 chr10 51284168 51284450 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR -15264 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 207.75-110 chr6 46306867 46307012 + 1.5 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 18953 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 349.25-5 chr15 73073021 73073540 + 1.5 NA intron (NM_002499, intron 1 of 28) L2c|LINE|L2 20796 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 206.25-48 chr2 24496592 24496796 + 1.5 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) 4817 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 620.5 chr10 48873745 48874457 + 1.5 NA intron (NM_020945, intron 41 of 61) intron (NM_020945, intron 41 of 61) 40134 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 196-36 chr16 71675289 71675694 + 1.5 NA intron (NM_015020, intron 9 of 18) intron (NM_015020, intron 9 of 18) 23210 NR_033337 100379141 Hs.725116 NR_033337 ENSG00000263666 SNORA70D U70D small nucleolar RNA, H/ACA box 70D snoRNA 254-26 chr2 181498971 181499155 + 1.5 NA intron (NM_000885, intron 15 of 27) intron (NM_000885, intron 15 of 27) 41677 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 252.5-67 chr5 112740157 112740410 + 1.5 NA intron (NM_001354904, intron 2 of 15) intron (NM_001354904, intron 2 of 15) 2398 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 268-62 chr9 26841080 26841501 + 1.5 NA 3' UTR (NM_024828, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_024828, exon 6 of 6) 51512 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 218.75-35 chr2 103451036 103451305 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -466741 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 306-25 chr4 30321311 30321598 + 1.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -398915 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 444-7 chr7 39331998 39332376 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) -3053 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 236-15 chr12 90829042 90829236 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -88884 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 156.75-9 chr1 119724681 119724858 + 1.5 NA intron (NM_006623, intron 3 of 11) intron (NM_006623, intron 3 of 11) 12835 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 184.5-151 chr8 63640163 63640361 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -129168 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 150.5-201 chr7 25516103 25516311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 146933 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 185.25 chr1 63984795 63984995 + 1.5 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 127310 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 170-66 chr4 33780787 33780988 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 259006 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 272-29 chr4 71543499 71543706 + 1.5 NA intron (NM_003759, intron 15 of 22) intron (NM_003759, intron 15 of 22) 204549 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 271.5-71 chr5 115836120 115836406 + 1.5 NA intron (NM_001277783, intron 1 of 2) intron (NM_001277783, intron 1 of 2) 5302 NR_033363 9140 Hs.264482 NM_004707 ENSG00000145782 ATG12 APG12|APG12L|FBR93|HAPG12 autophagy related 12 protein-coding 241-9 chr10 124861203 124861510 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 59537 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 299-21 chr22 25702515 25702867 + 1.5 NA intron (NM_001362778, intron 12 of 19) intron (NM_001362778, intron 12 of 19) -39497 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 363-22 chr7 28545814 28546419 + 1.5 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) L1MB8|LINE|L1 110501 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 322.25-16 chr4 73135452 73135983 + 1.5 NA intron (NM_198889, intron 14 of 32) intron (NM_198889, intron 14 of 32) -65958 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 189-104 chr8 113733803 113733978 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -296951 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 363.5-12 chr20 50904656 50905179 + 1.5 NA intron (NM_001347511, intron 1 of 4) intron (NM_001347511, intron 1 of 4) 4874 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 295.5 chr1 70558651 70559145 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -147555 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 225.75-57 chr3 190940818 190941039 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62998 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 190.5-81 chr2 143611704 143611934 + 1.5 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) intron (NM_018460, intron 11 of 13) -325248 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 275.75-45 chr8 125345147 125345440 + 1.5 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -85065 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 274.75-11 chr14 50984901 50985205 + 1.5 NA intron (NM_015163, intron 7 of 9) intron (NM_015163, intron 7 of 9) -40570 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 229.5-104 chr5 9251952 9252197 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) intron (NM_003966, intron 5 of 22) -198179 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 275.25-36 chr5 151289528 151289817 + 1.5 NA intron (NM_001145017, intron 4 of 10) L1MC4a|LINE|L1 14094 NM_181774 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 296.5-19 chr20 16097204 16097426 + 1.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -111433 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 234.5-2 chr1 62413845 62414079 + 1.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -22342 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 297.75-55 chr9 115233267 115233580 + 1.5 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) intron (NR_163556, intron 2 of 7) 91605 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 430.75-7 chr15 81189940 81190459 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6680 NM_001352685 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 603 chr4 38306823 38307418 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59794 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 212-58 chr3 119577506 119577813 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1833 NM_001125 141 Hs.99884 NM_001125 ENSG00000144843 ADPRH ARH1|hARH1 ADP-ribosylarginine hydrolase protein-coding 157-10 chr10 83986842 83987041 + 1.5 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -152568 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 234-11 chr11 80167338 80167811 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 595229 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 165.5-11 chr1 195943965 195944145 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 144660 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 399.5 chr16 48466055 48466343 + 1.5 NA Intergenic AluYa5|SINE|Alu -80786 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 249.5-24 chr12 124209327 124209566 + 1.5 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -79718 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 371-10 chr15 58141932 58142207 + 1.5 NA intron (NM_020980, intron 1 of 5) intron (NM_020980, intron 1 of 5) 3688 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 228.75-98 chrX 153243696 153243948 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 64538 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 329-39 chr8 104829854 104830161 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -240983 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 284-30 chr22 19600278 19600659 + 1.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -33629 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 158.75-136 chr5 30921499 30921668 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -272103 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 274-8 chr11 93683042 93683387 + 1.5 NA intron (NM_033395, intron 7 of 29) intron (NM_033395, intron 7 of 29) 21532 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 366.5-17 chr6 125429577 125429955 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -127799 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 276.75-5 chr10 60071308 60071562 + 1.5 NA exon (NM_020987, exon 37 of 44) exon (NM_020987, exon 37 of 44) 69581 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 241-7 chr10 67962592 67962936 + 1.5 NA intron (NM_001278185, intron 16 of 23) intron (NM_001278185, intron 16 of 23) 48119 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 222.5-38 chr16 83066970 83067161 + 1.5 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) MamRep605|LTR?|LTR? -76767 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 183-25 chr14 49257583 49257753 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 328712 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 342-4 chr10 115421229 115421638 + 1.5 NA intron (NM_207303, intron 20 of 28) L1MA6|LINE|L1 328068 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 296.5-22 chr3 7663551 7663911 + 1.5 NA intron (NM_000844, intron 8 of 9) intron (NM_000844, intron 8 of 9) -128447 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 321-30 chr8 81527335 81527920 + 1.5 NA intron (NM_001105281, intron 2 of 3) AluSc5|SINE|Alu 3763 NR_144370 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 339-31 chr7 51503858 51504124 + 1.5 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -110735 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 378-8 chr2 77766719 77767108 + 1.5 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu -149021 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 181.5-24 chr11 104991993 104992141 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23493 NM_001225 837 Hs.138378 NM_001225 ENSG00000196954 CASP4 ICE(rel)II|ICEREL-II|ICH-2|Mih1|Mih1/TX|TX caspase 4 protein-coding 162.5-4 chr1 114217530 114217662 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -63727 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 360-12 chr6 69678176 69678604 + 1.5 NA intron (NM_001367272, intron 14 of 15) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 118076 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 169-30 chr15 57935295 57935434 + 1.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 78659 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 261.75-15 chr16 9458584 9458829 + 1.5 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -3201 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 275-37 chr6 10068183 10068393 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -336214 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 333.25 chr1 40568126 40568500 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 36676 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 328.5-29 chr5 26639199 26639447 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 399263 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 232-36 chr2 75608272 75608511 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38392 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 268 chr1 26860243 26860532 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2762 NM_006142 2810 Hs.523718 NM_006142 ENSG00000175793 SFN YWHAS stratifin protein-coding 341.5-37 chr9 93790513 93790818 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -28692 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 241-55 chr8 117741209 117741435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 179591 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 136.75-150 chr4 179268140 179268377 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1360322 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 561.5-2 chr9 89325840 89326571 + 1.5 NA intron (NM_001282688, intron 4 of 16) intron (NM_001282688, intron 4 of 16) 7354 NM_001282690 79048 Hs.59804 NM_024077 ENSG00000187742 SECISBP2 SBP2 SECIS binding protein 2 protein-coding 261-27 chr2 102779178 102779463 + 1.5 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) L1MDa|LINE|L1 17289 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 331-13 chr16 75984155 75984509 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -257842 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 137-125 chr4 99867696 99867859 + 1.5 NA intron (NM_001306151, intron 9 of 9) L1ME3G|LINE|L1 26650 NM_021970 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 243-26 chr16 13410471 13410684 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 508979 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 154.25-79 chr2 65991108 65991284 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 367132 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 309-31 chr4 61236586 61236906 + 1.5 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 34574 NM_001371342 313.25-12 chr15 81161046 81161605 + 1.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 27055 NM_173528 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 364.25-2 chr1 160948541 160948956 + 1.5 NA non-coding (NR_110695, exon 6 of 6) non-coding (NR_110695, exon 6 of 6) 6061 NM_080878 142683 Hs.385631 NM_080878 ENSG00000158764 ITLN2 HL-2|HL2 intelectin 2 protein-coding 352.5-17 chr3 197283541 197283969 + 1.5 NA intron (NM_001366216, intron 3 of 23) intron (NM_001366216, intron 3 of 23) 10193 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 148.5-125 chr20 46331630 46331821 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23227 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 257.5-18 chr14 43823145 43823370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 684026 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 487.5-7 chr5 157548013 157548651 + 1.5 NA intron (NM_033274, intron 3 of 22) L2c|LINE|L2 27443 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 441 chr1 119210120 119210502 + 1.5 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) intron (NR_125975, intron 4 of 6) -69639 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 158-119 chr6 36190002 36190139 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6674 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 309.25-5 chr10 109055693 109055919 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 867440 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 383-19 chr8 83291953 83292600 + 1.5 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 -111482 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 238.75-27 chr17 73452934 73453353 + 1.5 NA intron (NM_001144952, intron 4 of 44) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -60540 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 325.75-26 chr5 53431291 53431746 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -49111 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 231.5 chr1 69156421 69156702 + 1.5 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) L1PB4|LINE|L1 100663 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 177.75-34 chr13 86004164 86004300 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -204813 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 306.75-13 chr20 3636745 3637075 + 1.5 NA intron (NM_139321, intron 26 of 28) intron (NM_139321, intron 26 of 28) 26489 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 283.25-35 chr5 54397157 54397359 + 1.5 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) intron (NR_126379, intron 1 of 4) -58441 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 245.5-31 chr19 41156316 41156528 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36797 NM_030622 29785 Hs.98370 NM_030622 ENSG00000167600 CYP2S1 CYPIIS1 cytochrome P450 family 2 subfamily S member 1 protein-coding 281.25-9 chr10 96871215 96871551 + 1.5 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) intron (NM_001170766, intron 2 of 8) 38438 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 181-79 chr4 70231929 70232182 + 1.5 NA intron (NM_152997, intron 2 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 5931 NM_152997 260436 Hs.733448 NM_152997 ENSG00000181617 FDCSP C4orf7|FDC-SP follicular dendritic cell secreted protein protein-coding 162.5-80 chr2 52228037 52228157 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -142551 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 225-40 chr2 83476367 83476620 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46321 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 481-3 chr11 79118237 79118722 + 1.5 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) L1MB3|LINE|L1 283630 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 311.5-7 chr12 1765763 1766078 + 1.5 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -54347 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 175.5-48 chr14 42870940 42871116 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 1264172 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 488.75 chr1 162306503 162307237 + 1.5 NA intron (NM_014697, intron 4 of 9) AluSx1|SINE|Alu -35676 NR_030283 693141 NR_030283 ENSG00000207729 MIR556 MIRN556|hsa-mir-556|mir-556 microRNA 556 ncRNA 421.75-9 chr8 136979185 136979810 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 434091 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 226.25-12 chr10 78775269 78775493 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 292067 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 196-92 chr7 85736825 85736966 + 1.5 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 315773 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 281.5-55 chr9 27998640 27998929 + 1.5 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) AluSx1|SINE|Alu -424918 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 314.25-22 chr5 143701127 143701461 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21434 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 173.75-128 chr5 145436217 145436431 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 399018 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 195.75-27 chr10 109085062 109085242 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 838094 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 293.25-5 chr12 119813100 119813494 + 1.5 NA intron (NM_007174, intron 9 of 46) intron (NM_007174, intron 9 of 46) 64023 NM_007174 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 190.25-64 chr2 73657318 73657529 + 1.5 NA intron (NR_003683, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 12504 NR_003683 200420 Hs.739204 NM_145300 ENSG00000163016 ALMS1P1 ALMS1L|ALMS1P ALMS1 pseudogene 1 pseudo 290-27 chr2 141165508 141165735 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) (CATCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -578936 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 228.5-81 chr5 72779376 72779637 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -37085 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 331.5 chr1 93320256 93320680 + 1.5 NA intron (NR_034089, intron 8 of 8) MER1A|DNA|hAT-Charlie 25343 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 274.25-11 chr10 123298893 123299282 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 144685 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 299.5-13 chr14 39995707 39995909 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -563308 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 167.5-97 chr2 129237556 129237749 + 1.5 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 36239 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 310.75-5 chr10 58851936 58852404 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 137155 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 361.5 chr10 56790266 56790730 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -429225 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 200-57 chr3 87929286 87929506 + 1.5 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -53180 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 496-2 chr5 141002458 141002845 + 1.5 NA intron (NM_018911, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 35884 NM_031883 56134 Hs.199343 NM_018899 ENSG00000243232 PCDHAC2 PCDH-ALPHA-C2 protocadherin alpha subfamily C, 2 protein-coding 296.5-31 chr5 63651622 63652142 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 310410 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 303.25-26 chr5 25953413 25953841 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 762674 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 137-34 chr11 74962048 74962217 + 1.5 NA intron (NM_014752, intron 1 of 4) intron (NM_014752, intron 1 of 4) 12866 NM_014752 9789 Hs.282700 NM_014752 ENSG00000118363 SPCS2 - signal peptidase complex subunit 2 protein-coding 370-11 chr3 115352680 115352983 + 1.5 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -205543 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 484-3 chr18 4241425 4242210 + 1.5 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -22785 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 170-82 chr5 116974805 116975044 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -212715 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 146.25-164 chr9 81070340 81070625 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 619053 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 263-35 chr3 155285246 155285594 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 8263 NM_001352129 100507537 Hs.518341 NM_001352129 ENSG00000240045 STRIT1 DWORF small transmembrane regulator of ion transport 1 protein-coding 403.5-5 chr20 54649899 54650416 + 1.5 NA intron (NM_018431, intron 7 of 7) intron (NM_018431, intron 7 of 7) 174564 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 233-28 chr2 11888584 11888786 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51699 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 387.25-2 chr10 106274918 106275513 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 135050 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 116.5-85 chr16 13558449 13558604 + 1.5 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -361631 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 301.5-45 chrX 113683680 113684080 + 1.5 NA intron (NR_131204, intron 1 of 2) intron (NR_131204, intron 1 of 2) 254338 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 207.75-29 chr12 115750091 115750317 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 398450 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 384.25-16 chr5 156875567 156876030 + 1.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 25503 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 209.25-19 chr11 42608205 42608438 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -354631 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 333.75-25 chr6 159944346 159944710 + 1.5 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -24571 NM_000876 3482 Hs.487062 NM_000876 ENSG00000197081 IGF2R CD222|CI-M6PR|CIMPR|M6P-R|M6P/IGF2R|MPR 300|MPR1|MPR300|MPRI insulin like growth factor 2 receptor protein-coding 262.75-60 chrX 54336765 54337247 + 1.5 NA intron (NM_001002838, intron 1 of 22) intron (NM_001002838, intron 1 of 22) 20999 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 254.5-43 chr2 187936490 187936848 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 351022 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 359-5 chr14 56719215 56719552 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 86284 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 309-50 chr8 132813456 132813869 + 1.5 NA TTS (NM_198513) TTS (NM_198513) 38274 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 177.75-89 chr20 16937243 16937462 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 188999 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 502.25-3 chr21 45203656 45204214 + 1.5 NA intron (NR_027674, intron 8 of 11) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -30405 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 272-36 chr7 17584294 17584736 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25606 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 302.5-30 chr4 107983442 107983672 + 1.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -6157 NM_001184705 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 246.5-24 chr14 67420273 67420473 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8208 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 364-19 chr7 54469293 54469678 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -72840 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 183-85 chr4 97001728 97002097 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -365014 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 176.25-29 chr12 18667613 18667857 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 69774 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 287.75-19 chr14 103939994 103940299 + 1.5 NA TTS (NM_001257268) TTS (NM_001257268) 2383 NM_001257268 647286 Hs.632325 NM_001257268 ENSG00000227729 RD3L TDRD9-AS1|TDRD9AS1 retinal degeneration 3 like protein-coding 163.75-69 chr2 77403202 77403450 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 119050 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 371.5-4 chr14 70155465 70155845 + 1.5 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -31453 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 224.25-40 chr2 27447229 27447482 + 1.5 NA TTS (NM_001168364) TTS (NM_001168364) 4974 NM_001321325 200634 Hs.59509 NM_173853 ENSG00000157992 KRTCAP3 KCP3 keratinocyte associated protein 3 protein-coding 286.5-40 chr3 47059717 47059922 + 1.5 NA intron (NR_146158, intron 15 of 21) AluSx|SINE|Alu 48277 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 210.25-13 chr11 9969051 9969328 + 1.5 NA intron (NM_030962, intron 13 of 39) L2a|LINE|L2 130047 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 136.75-12 chr1 168300343 168300559 + 1.5 NA exon (NM_005149, exon 5 of 8) exon (NM_005149, exon 5 of 8) 19574 NM_005149 9095 Hs.716656 NM_005149 ENSG00000143178 TBX19 TBS19|TPIT|dJ747L4.1 T-box transcription factor 19 protein-coding 271.5-96 chr9 27290668 27290975 + 1.5 NA intron (NM_001161585, intron 4 of 6) intron (NM_001161585, intron 4 of 6) 6318 NM_001161585 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 162.5-150 chr6 37229782 37229940 + 1.5 NA intron (NM_145316, intron 1 of 3) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 27738 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 170.5-153 chr5 169246478 169246662 + 1.5 NA intron (NM_003062, intron 2 of 35) MIRb|SINE|MIR 17124 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 261-34 chr3 22283882 22284138 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 326871 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 208.5-135 chr8 33023321 33023543 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 301597 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 401.5-9 chr2 195915115 195915589 + 1.5 NA intron (NM_018897, intron 24 of 64) L2c|LINE|L2 153485 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 313-22 chr7 53147610 53148008 + 1.5 NA Intergenic MER107|DNA|hAT-Charlie 112176 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 309-16 chr15 90626278 90626511 + 1.5 NA intron (NM_001042574, intron 10 of 14) intron (NM_001042574, intron 10 of 14) -33840 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 319-18 chr2 115717954 115718316 + 1.5 NA intron (NM_001321912, intron 8 of 25) intron (NM_001321912, intron 8 of 25) 374320 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 311.5-28 chr5 124772595 124772895 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27633 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 296.5-5 chr10 44215181 44215433 + 1.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -77443 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 301-23 chr5 25086205 25086507 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 104300 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 249.75-33 chr2 69105714 69105975 + 1.5 NA intron (NM_032208, intron 10 of 17) intron (NM_032208, intron 10 of 17) 2162 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 298.75-11 chr1 238582438 238583000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -96702 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 351.25-13 chr4 53748111 53748419 + 1.5 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL 52364 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 245.75-25 chr19 29384421 29384784 + 1.5 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) MER66B|LTR|ERV1 141150 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 307.5-26 chr2 58457154 58457416 + 1.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -63468 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 187.75-34 chr15 92075209 92075479 + 1.5 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 221040 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 290.5-39 chr7 28384623 28385061 + 1.5 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) -27676 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 281.25-22 chr2 52924421 52924629 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -221910 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 192-33 chr12 13716397 13716645 + 1.5 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 263835 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 210.75-89 chr7 2439269 2439449 + 1.5 NA 3' UTR (NM_018641, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_018641, exon 2 of 2) 35748 NM_001243794 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 240.25-27 chr16 71290787 71291154 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1248 NM_001324377 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 293.75-6 chr11 115527069 115527477 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22858 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 240.75-74 chr7 138607002 138607246 + 1.5 NA intron (NM_174959, intron 10 of 11) L2a|LINE|L2 57100 NM_174959 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 208.5-37 chr14 69253281 69253483 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6776 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 282-28 chr2 117961861 117962164 + 1.5 NA intron (NM_019044, intron 11 of 23) intron (NM_019044, intron 11 of 23) 52058 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 199.5-43 chr14 60874112 60874285 + 1.5 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) intron (NM_002431, intron 6 of 7) 106881 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 249-28 chr21 15942870 15943090 + 1.5 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -127508 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 461.25-2 chr9 110203478 110204076 + 1.5 NA intron (NM_001012993, intron 1 of 1) intron (NM_001012993, intron 1 of 1) 4356 NM_001012993 401546 Hs.125608 NM_001012993 ENSG00000188959 C9orf152 bA470J20.2 chromosome 9 open reading frame 152 protein-coding 285.5-15 chr13 109917224 109917414 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -130736 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 229.5-82 chr22 35944941 35945212 + 1.5 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) 16554 NM_001349994 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 183-23 chr14 32453963 32454195 + 1.5 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) intron (NM_004274, intron 2 of 13) 124781 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 227.5-92 chr7 6487587 6487789 + 1.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -3536 NM_006854 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 328-3 chr11 81179702 81180111 + 1.5 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -417103 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 394.25-8 chr8 119886565 119886931 + 1.5 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 13026 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 215.25-88 chr5 134008435 134008757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3621 NM_003374 7416 Hs.519320 NM_003374 ENSG00000213585 VDAC1 PORIN|VDAC-1 voltage dependent anion channel 1 protein-coding 322-12 chr16 54448899 54449351 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -78426 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 345.75-3 chr13 81510565 81510886 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -283742 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 142.5-99 chr19 37437666 37437826 + 1.5 NA intron (NM_152484, intron 3 of 5) L1MA3|LINE|L1 29698 NM_001330482 148266 Hs.511848 NM_152484 ENSG00000196437 ZNF569 ZAP1|ZNF zinc finger protein 569 protein-coding 120.75-143 chr6 26978092 26978237 + 1.5 NA intron (NR_026775, intron 2 of 2) intron (NR_026775, intron 2 of 2) 21171 NR_026775 100133205 Hs.526951 NR_026775 ENSG00000224843 LINC00240 C6orf41|NCRNA00240|bA373D17.1 long intergenic non-protein coding RNA 240 ncRNA 233.75 chr1 10791793 10791982 + 1.5 NA intron (NM_001079843, intron 1 of 20) intron (NM_001079843, intron 1 of 20) 4759 NM_001079843 54897 Hs.439894 NM_017766 ENSG00000130940 CASZ1 CAS11|CST|SRG|ZNF693|dJ734G22.1 castor zinc finger 1 protein-coding 245.5-48 chr3 98806821 98807052 + 1.5 NA intron (NM_080927, intron 13 of 15) L2b|LINE|L2 43629 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 374.5-2 chr1 234691033 234691418 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32817 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 321.75-3 chr10 63639403 63639718 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -117670 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 246-38 chr22 25680329 25680552 + 1.5 NA intron (NM_001362778, intron 8 of 19) intron (NM_001362778, intron 8 of 19) -61748 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 234.5-3 chr1 93598916 93599101 + 1.5 NA intron (NR_034091, intron 3 of 3) intron (NR_034091, intron 3 of 3) 7040 NR_034091 100129046 Hs.729244 NR_034091 LOC100129046 - uncharacterized LOC100129046 ncRNA 215-18 chr13 27833790 27833966 + 1.5 NA intron (NR_047484, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 41395 NM_145657 219409 Hs.351785 NM_145657 ENSG00000169840 GSX1 GSH1|Gsh-1 GS homeobox 1 protein-coding 315-25 chrX 103504940 103505179 + 1.5 NA intron (NM_080879, intron 2 of 2) L1ME3A|LINE|L1 14430 NM_080879 142684 Hs.706904 NM_080879 ENSG00000172476 RAB40A RAR2|RAR2A RAB40A, member RAS oncogene family protein-coding 215.25-80 chr5 45081516 45081702 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 272662 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 208.25-54 chr20 50514293 50514495 + 1.5 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) 4011 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 184.5-172 chrX 42251538 42251728 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -328079 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 343.75-3 chr17 58085228 58085799 + 1.5 NA intron (NM_080677, intron 1 of 2) intron (NM_080677, intron 1 of 2) 2094 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 188.5-13 chr10 66521183 66521431 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -404729 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 214.5-116 chr7 3672904 3673121 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 371760 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 216-51 chr22 18039387 18039586 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10101 NR_024417 100192420 Hs.589947 NR_024417 ENSG00000235295 LINC01634 - long intergenic non-protein coding RNA 1634 ncRNA 361.5-22 chr7 7499463 7499727 + 1.5 NA intron (NM_001037763, intron 11 of 34) intron (NM_001037763, intron 11 of 34) 36278 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 333.5-23 chr9 29168081 29168340 + 1.5 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 44089 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 384.75-2 chr11 37081087 37081524 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -483026 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 365.5-10 chr20 57936855 57937186 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -66884 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 273-31 chr2 216186191 216186382 + 1.5 NA intron (NM_021141, intron 16 of 20) intron (NM_021141, intron 16 of 20) -30603 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 283-27 chr2 194818112 194818337 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 87629 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 193-93 chr9 24358954 24359167 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 186616 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 307.5-39 chr4 30970885 30971116 + 1.5 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 -200144 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 137.25-164 chr8 80321115 80321224 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 79780 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 129-88 chr2 40484849 40485015 + 1.5 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) 27503 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 209.25-24 chr12 108379191 108379372 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -39970 NM_001142343 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 330-11 chr16 4878551 4878886 + 1.5 NA intron (NM_001079514, intron 17 of 17) intron (NM_001079514, intron 17 of 17) 30338 NM_001288656 29855 Hs.440219 NM_016936 ENSG00000118900 UBN1 VT|VT4 ubinuclein 1 protein-coding 272-6 chr11 65366547 65366822 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 11933 NM_145719 220359 Hs.632121 NM_145719 ENSG00000173825 TIGD3 - tigger transposable element derived 3 protein-coding 320-34 chr7 8609742 8610059 + 1.5 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 176291 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 255.5-76 chr6 149778111 149778364 + 1.5 NA intron (NM_001252050, intron 3 of 6) AluSz|SINE|Alu 28496 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 391.25-17 chr8 102691180 102691613 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 35148 NR_160673 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 216-29 chr17 62383051 62383328 + 1.5 NA intron (NM_001144933, intron 4 of 11) intron (NM_001144933, intron 4 of 11) 2636 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 214.25-88 chrX 65358839 65359005 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -129813 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 313.5-18 chr17 70218249 70218641 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 48910 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 250.5-94 chr8 28523299 28523468 + 1.5 NA intron (NM_017412, intron 4 of 7) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -18201 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 210-16 chr11 23251162 23251315 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 167952 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 174.5-29 chr10 117976893 117977121 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -69814 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 260.25-42 chr6 53149793 53150040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1075 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 209.25-107 chr7 38191526 38191751 + 1.5 NA intron (NM_001363344, intron 2 of 8) L1M5|LINE|L1 13393 NM_001363343 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 232.75-47 chr4 54968427 54968597 + 1.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 157083 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 279-16 chr2 26025925 26026276 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7984 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 328-9 chr17 49037466 49037877 + 1.5 NA intron (NM_001160423, intron 5 of 12) intron (NM_001160423, intron 5 of 12) 40286 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 275.25 chr1 117575904 117576262 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 29687 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 360.5-5 chr11 23602537 23602852 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -183504 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 300 chr1 55192897 55193166 + 1.5 NA intron (NM_015306, intron 1 of 67) MER2|DNA|TcMar-Tigger 22333 NM_015306 23358 Hs.477009 NM_015306 ENSG00000162402 USP24 - ubiquitin specific peptidase 24 protein-coding 284-20 chr18 47932732 47932997 + 1.5 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -1718 NM_001135937 4087 Hs.12253 NM_005901 ENSG00000175387 SMAD2 JV18|JV18-1|MADH2|MADR2|hMAD-2|hSMAD2 SMAD family member 2 protein-coding 286.25-6 chr11 74806567 74806959 + 1.5 NA intron (NM_001098638, intron 2 of 5) L1ME3A|LINE|L1 57914 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 264.25-11 chr12 8652478 8652768 + 1.5 NA intron (NR_123733, intron 6 of 10) intron (NR_123733, intron 6 of 10) 10203 NR_123734 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 157.5-90 chr18 54521994 54522181 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -65672 NM_001307955 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 197-35 chr2 198214854 198215001 + 1.5 NA Intergenic Ricksha|DNA|MULE-MuDR 160170 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 201-60 chr4 106203631 106203950 + 1.5 NA intron (NM_001290768, intron 21 of 26) intron (NM_001290768, intron 21 of 26) -111820 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 198.5-20 chr10 102639871 102640058 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4531 NM_030912 81603 Hs.336810 NM_030912 ENSG00000171206 TRIM8 GERP|RNF27 tripartite motif containing 8 protein-coding 236.5-84 chr7 51642431 51642602 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -249260 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 211.5-113 chr4 46653019 46653200 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 256136 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 213.5-97 chr4 162642681 162642914 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 450831 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 242.75-24 chr18 5413942 5414184 + 1.5 NA intron (NM_001281535, intron 14 of 21) intron (NM_001281535, intron 14 of 21) -117010 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 254.5-69 chr7 33708128 33708536 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -196583 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 195-101 chrX 42856396 42856585 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -78327 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 156.75-127 chr4 138483544 138483665 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 173893 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 329.5-23 chr5 117659495 117659970 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -70629 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 244-7 chr11 75803882 75804115 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 10799 NR_144531 100506113 Hs.720913 NR_144531 ENSG00000255507 UVRAG-DT - UVRAG divergent transcript ncRNA 166.5-155 chr5 8603278 8603448 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 142438 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 237.5-96 chr7 32384082 32384309 + 1.5 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L2b|LINE|L2 44029 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 257-61 chrX 70382612 70382831 + 1.5 NA intron (NM_012310, intron 18 of 30) FLAM_C|SINE|Alu -40310 NM_001171193 54857 Hs.438712 NM_017711 ENSG00000130055 GDPD2 GDE3|OBDPF glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 2 protein-coding 171-93 chr3 98822483 98822623 + 1.5 NA intron (NM_080927, intron 5 of 15) intron (NM_080927, intron 5 of 15) 59246 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 257.5-59 chr5 32320577 32320844 + 1.5 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -7771 NM_001040446 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 249.5-2 chr1 49201901 49202244 + 1.5 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -55339 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 209-31 chr18 7870213 7870387 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 302984 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 213.75-105 chr8 130055081 130055296 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 29 of 29) MIRb|SINE|MIR 29580 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 212.25-77 chr5 140920152 140920482 + 1.5 NA intron (NM_018904, intron 1 of 3) L1M4b|LINE|L1 -6400 NM_031882 56135 Hs.199343 NM_018898 ENSG00000248383 PCDHAC1 PCDH-ALPHA-C1 protocadherin alpha subfamily C, 1 protein-coding 670 chr1 174439941 174440726 + 1.5 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) L2b|LINE|L2 -7631 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 290.75-38 chr3 97308682 97308987 + 1.5 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L2c|LINE|L2 -130773 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 240.5-15 chr11 12468928 12469145 + 1.5 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 91465 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 333.75-9 chr15 78003593 78004017 + 1.5 NA intron (NM_144572, intron 10 of 12) intron (NM_144572, intron 10 of 12) -9580 NR_026998 91450 Hs.406766 NR_026998 LOC91450 - uncharacterized LOC91450 ncRNA 473.25-3 chr14 65148095 65148571 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45638 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 274.5-41 chr22 27312913 27313361 + 1.5 NA non-coding (NR_134581, exon 1 of 2) non-coding (NR_134581, exon 1 of 2) 2486 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 198-14 chr10 123611598 123611895 + 1.5 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -54609 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 174.5-96 chr2 64051911 64052114 + 1.5 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -32584 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 112.5-223 chr7 85192291 85192437 + 1.5 NA Intergenic (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -70433 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 181-91 chr5 177230105 177230439 + 1.5 NA intron (NM_172349, intron 6 of 23) intron (NM_172349, intron 6 of 23) 73447 NM_001031677 53917 Hs.16258 NM_130781 ENSG00000169228 RAB24 - RAB24, member RAS oncogene family protein-coding 185.25-37 chr15 69998267 69998398 + 1.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 81136 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 359.75-16 chr3 147291443 147292017 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 100700 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 193.5-154 chr7 79086296 79086538 + 1.5 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1M4|LINE|L1 77429 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 398.5-11 chr22 24736053 24736630 + 1.5 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) MER57E1|LTR|ERV1 -28160 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 300.75-43 chr7 40556442 40556812 + 1.5 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) MIR|SINE|MIR 421651 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 126.5-84 chr16 23751584 23751735 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3367 NM_022097 63928 Hs.178589 NM_022097 ENSG00000166869 CHP2 - calcineurin like EF-hand protein 2 protein-coding 166.5-146 chr4 65611350 65611521 + 1.5 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) intron (NM_001281767, intron 2 of 16) 58053 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 417.75-4 chr8 94550932 94551459 + 1.5 NA intron (NM_015496, intron 1 of 23) intron (NM_015496, intron 1 of 23) 2274 NM_015496 25962 Hs.202238 NM_015496 ENSG00000164944 VIRMA KIAA1429|MSTP054|fSAP121 vir like m6A methyltransferase associated protein-coding 266.75-31 chr22 26406100 26406420 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -23000 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 180.5-149 chr8 47687383 47687577 + 1.5 NA intron (NR_148204, intron 11 of 19) L1ME3Cz|LINE|L1 27816 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 359.25-2 chr12 15759393 15759730 + 1.5 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) L1MA2|LINE|L1 29827 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 200.5-76 chr2 196878468 196878642 + 1.5 NA intron (NM_001321099, intron 14 of 27) intron (NM_001321099, intron 14 of 27) 48152 NM_001321100 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 308.5-32 chr6 156187747 156187999 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -190877 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 407.75-6 chr5 162715721 162716267 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 648352 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 383.25-21 chr5 87450710 87451058 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -37851 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 402.75-4 chr3 65613408 65613724 + 1.5 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -280250 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 393.75-11 chrX 69108154 69108513 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 57120 NM_145119 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 287-32 chr5 85326539 85326760 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -941769 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 329.5-13 chr20 53029892 53030144 + 1.5 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 57660 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 284-17 chr17 68719753 68720170 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91807 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 470-5 chr6 66478445 66479007 + 1.5 NA Intergenic LTR18A|LTR|ERVL 690847 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 346.5-29 chr9 109733515 109733869 + 1.5 NA intron (NM_001037293, intron 1 of 6) intron (NM_001037293, intron 1 of 6) -46506 NM_007203 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 189.5-136 chr7 91016003 91016251 + 1.5 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron -248306 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 279-8 chr12 21999993 22000288 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46034 NR_135117 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 128.5-70 chr15 53745508 53745611 + 1.5 NA intron (NR_102334, intron 1 of 19) MER53|DNA|hAT 14104 NM_182758 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 271-48 chr8 63198038 63198243 + 1.5 NA intron (NM_152758, intron 4 of 4) intron (NM_152758, intron 4 of 4) 29137 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 177.5-21 chr11 33867759 33867995 + 1.5 NA intron (NM_001142315, intron 2 of 3) intron (NM_001142315, intron 2 of 3) 2001 NM_001142315 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 175.25-34 chr12 6728693 6728999 + 1.5 NA intron (NM_016319, intron 4 of 7) intron (NM_016319, intron 4 of 7) 4559 NM_001164093 50813 Hs.530823 NM_016319 ENSG00000111652 COPS7A CSN7|CSN7A|SGN7a COP9 signalosome subunit 7A protein-coding 168.75-41 chr14 53166663 53166863 + 1.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 13409 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 299-24 chr22 34844911 34845187 + 1.5 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 152867 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 454.5-2 chr2 117534533 117534999 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -279925 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 234.75-26 chr15 60444229 60444505 + 1.5 NA intron (NR_147171, intron 11 of 16) intron (NR_147171, intron 11 of 16) 34775 NM_001018089 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 245-52 chr4 102047385 102047652 + 1.5 NA intron (NM_017935, intron 11 of 16) intron (NM_017935, intron 11 of 16) 233676 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 355.25-2 chr13 100233458 100233873 + 1.5 NA intron (NR_148031, intron 7 of 22) L2a|LINE|L2 144572 NM_000282 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 195-62 chr3 17641909 17642147 + 1.5 NA intron (NM_001349090, intron 1 of 21) intron (NM_001349090, intron 1 of 21) 57992 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 210-94 chr7 141082244 141082483 + 1.5 NA intron (NM_001195278, intron 1 of 3) intron (NM_001195278, intron 1 of 3) 8299 NM_001195278 100507421 Hs.283851 NM_001195278 ENSG00000261115 TMEM178B - transmembrane protein 178B protein-coding 336.25-9 chr18 1216310 1216825 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 143062 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 127.5-130 chr2 173109145 173109253 + 1.5 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 33353 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 281.25-14 chr13 111583613 111583809 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12298 NR_135814 105370369 NR_135814 ENSG00000215881 LINC02337 - long intergenic non-protein coding RNA 2337 ncRNA 154.5-127 chr3 80300358 80300490 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -464473 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 243-41 chr20 37366355 37366558 + 1.5 NA intron (NM_198291, intron 2 of 13) L1MB8|LINE|L1 20328 NM_198291 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 185-25 chr15 95410806 95411054 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22163 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 222-87 chr8 133553842 133554144 + 1.5 NA intron (NM_003033, intron 1 of 8) intron (NM_003033, intron 1 of 8) 17894 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 372.75-6 chr11 93398310 93398668 + 1.5 NA intron (NM_181645, intron 11 of 13) L1ME4b|LINE|L1 67772 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 217.75-34 chr18 74687114 74687381 + 1.5 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) AluJr4|SINE|Alu 56284 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 215.25-62 chr3 105538813 105539090 + 1.5 NA intron (NM_001243280, intron 6 of 14) intron (NM_001243280, intron 6 of 14) 172042 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 200-62 chr4 10372360 10372623 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 84935 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 433-3 chr1 231798146 231798893 + 1.5 NA intron (NM_001164545, intron 7 of 7) intron (NM_001164545, intron 7 of 7) 19998 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 244.25-52 chr8 109518026 109518452 + 1.5 NA exon (NM_177531, exon 73 of 78) exon (NM_177531, exon 73 of 78) -21461 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 160-76 chr4 62864660 62864874 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -703002 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 345-7 chr14 49470241 49470680 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 115920 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 244.5-99 chr8 125692809 125693095 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 258245 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 308.5-41 chr9 34194630 34194920 + 1.5 NA intron (NM_001171201, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 15732 NR_033243 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 280.5-51 chr8 70673206 70673546 + 1.5 NA intron (NM_001287259, intron 1 of 5) MIR3|SINE|MIR 4037 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 353-11 chr2 182822213 182822539 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 44261 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 242.25-48 chr2 109648431 109648776 + 1.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 34239 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 413-5 chr4 132984877 132985541 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 163907 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 207.75-100 chr5 109852865 109853210 + 1.5 NA intron (NM_002372, intron 19 of 21) intron (NM_002372, intron 19 of 21) -30145 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 232-7 chr10 42998567 42998743 + 1.5 NA TTS (NR_049836) TTS (NR_049836) 1092 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 277.5-14 chr12 12184453 12184765 + 1.5 NA intron (NM_002336, intron 4 of 22).2 intron (NM_002336, intron 4 of 22).2 72657 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 272.25-8 chr12 26509196 26509795 + 1.5 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 313922 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 212.5-94 chr6 123342296 123342513 + 1.5 NA intron (NM_006073, intron 21 of 40) intron (NM_006073, intron 21 of 40) -97200 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 322-24 chr8 106639142 106639576 + 1.5 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -18449 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 271.5-91 chr8 128152513 128152914 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 2597 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 248.25-50 chr3 169136680 169137018 + 1.5 NA intron (NM_001163999, intron 2 of 14) intron (NM_001163999, intron 2 of 14) 8674 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 237-38 chr3 175492621 175492867 + 1.5 NA intron (NM_207015, intron 9 of 13) intron (NM_207015, intron 9 of 13) 123204 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 186-72 chr5 156386218 156386392 + 1.5 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 59141 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 205.5-104 chr4 31659656 31659842 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 153205 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 203.75-97 chr7 19582457 19582660 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 122878 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 256-48 chr3 169112361 169112589 + 1.5 NA intron (NM_001366467, intron 8 of 15) intron (NM_001366467, intron 8 of 15) 33048 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 308.5-25 chr3 130735095 130735476 + 1.5 NA intron (NM_014602, intron 3 of 19) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 11544 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 207-89 chr8 111084082 111084240 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56728 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 269.25-36 chr4 67247196 67247755 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 174525 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 388.25-2 chr14 32983822 32984142 + 1.5 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 45103 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 220-54 chr7 3804956 3805156 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MA8|LINE|L1 -324629 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 156.25-8 chr1 202341165 202341304 + 1.5 NA intron (NM_001310326, intron 1 of 6) intron (NM_001310326, intron 1 of 6) 702 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 200-75 chr5 132276981 132277115 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17346 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 181.75-28 chr12 51189583 51189774 + 1.5 NA non-coding (NR_026893, exon 11 of 11) non-coding (NR_026893, exon 11 of 11) -16543 NM_001173452 7024 Hs.48849 NM_005653 ENSG00000135457 TFCP2 LBP1C|LSF|LSF1D|SEF|TFCP2C transcription factor CP2 protein-coding 202-9 chr1 230044799 230045006 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12887 NM_001291866 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 330-30 chr8 104568405 104568785 + 1.5 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 20429 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 320.75-25 chr6 147155876 147156236 + 1.5 NA intron (NR_034115, intron 3 of 10) intron (NR_034115, intron 3 of 10) -2869 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 281.75-9 chr10 58306571 58306925 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 22931 NR_158219 112268068 Hs.586671 NR_158219 LOC112268068 - uncharacterized LOC112268068 ncRNA 249.75-37 chr2 204376637 204376960 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -168677 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 237-3 chr1 106721190 106721467 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -96911 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 172.5-41 chr11 78463146 78463327 + 1.5 NA intron (NM_024678, intron 11 of 13) AluJr|SINE|Alu -33400 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 314.5-13 chr2 183123638 183124133 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001287585) promoter-TSS (NM_001287585) -470 NR_109856 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 199.5-148 chr8 112291941 112292128 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 51 of 66) intron (NM_001363185, intron 51 of 66) -351459 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 232.5-23 chr14 30444993 30445300 + 1.5 NA intron (NR_151720, intron 3 of 3) intron (NR_151720, intron 3 of 3) -113977 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 202.5-27 chr11 81920547 81920825 + 1.5 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -29850 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 309-39 chr5 81422907 81423333 + 1.5 NA intron (NM_001345886, intron 15 of 15) intron (NM_001345886, intron 15 of 15) -28986 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 127.5-69 chr14 23868671 23868794 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -85038 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 407.5-4 chr18 80157009 80157399 + 1.5 NA TTS (NM_032510) TTS (NM_032510) 9280 NR_028339 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 231.5-82 chr5 74491722 74492024 + 1.5 NA intron (NR_126354, intron 1 of 2) intron (NR_126354, intron 1 of 2) 45103 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 258.75-24 chr15 45127852 45128090 + 1.5 NA intron (NM_001276268, intron 1 of 5) intron (NM_001276268, intron 1 of 5) 1908 NM_001276264 90527 Hs.356664 NM_144565 ENSG00000140254 DUOXA1 NIP|NUMBIP|mol dual oxidase maturation factor 1 protein-coding 493-3 chr6 133814813 133815228 + 1.5 NA intron (NR_109982, intron 2 of 8) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -6127 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 342.75-30 chr8 121206448 121206761 + 1.5 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -394558 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 629.75 chr7 84373735 84374753 + 1.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -158232 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 261.5-28 chr2 48133690 48133986 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -180844 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 279-17 chr2 28903078 28903394 + 1.5 NA intron (NM_015131, intron 2 of 17) L1ME4a|LINE|L1 8569 NM_015131 23160 Hs.622982 NM_015131 ENSG00000163811 WDR43 NET12|UTP5 WD repeat domain 43 protein-coding 348 chr1 82204496 82204762 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 402176 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 300-33 chr7 35761327 35761696 + 1.5 NA intron (NR_120511, intron 3 of 5) intron (NR_120511, intron 3 of 5) 39114 NR_120511 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 206-39 chr19 13552635 13552819 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -46248 NM_000068 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 281.5-34 chr3 66228793 66229131 + 1.5 NA intron (NM_001350992, intron 1 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 7959 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 229-12 chr11 76477668 76477951 + 1.5 NA intron (NM_001300942, intron 9 of 21) intron (NM_001300942, intron 9 of 21) 32784 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 298.5-22 chr2 216443310 216443653 + 1.5 NA intron (NM_001127207, intron 10 of 17) intron (NM_001127207, intron 10 of 17) 30716 NM_001127207 50485 Hs.516674 NM_014140 ENSG00000138375 SMARCAL1 HARP|HHARP SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1 protein-coding 375.25-9 chr8 142321635 142322025 + 1.5 NA intron (NM_001366903, intron 6 of 9) L1MD|LINE|L1 81352 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 386-3 chr1 125055864 125056272 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 3536956 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 463-2 chr2 150746166 150746773 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 117572 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 225-38 chr2 61729353 61729528 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 124620 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 287-20 chr19 35916782 35916997 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -8580 NM_003332 7305 Hs.515369 NM_003332 ENSG00000011600 TYROBP DAP12|KARAP|PLOSL|PLOSL1 TYRO protein tyrosine kinase binding protein protein-coding 287-23 chr2 75265819 75266190 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -66484 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 205-40 chr2 99661629 99661859 + 1.5 NA intron (NM_001025108, intron 11 of 23) intron (NM_001025108, intron 11 of 23) -171727 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 317.5-8 chr16 10055949 10056191 + 1.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 125997 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 307.5-18 chr15 83274298 83274743 + 1.5 NA intron (NM_001717, intron 1 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie 8937 NM_001301206 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 322.5-41 chr8 118310381 118310710 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) LTR67B|LTR|ERVL -198726 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 268.5-69 chrX 64473849 64474099 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -78522 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 336-2 chr1 200201768 200202191 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 159154 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 298.25-35 chr8 83707799 83708207 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 304245 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 423.75 chr10 70518380 70518698 + 1.5 NA intron (NM_014431, intron 1 of 19) L1ME1|LINE|L1 39772 NM_014431 27143 Hs.202351 NM_014431 ENSG00000107719 PALD1 KIAA1274|PALD phosphatase domain containing paladin 1 protein-coding 487.5 chr1 204740592 204741009 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -55062 NM_006338 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 293-37 chr7 24631550 24631794 + 1.5 NA intron (NM_016447, intron 3 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 58220 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 304-28 chr5 129768150 129768384 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 20173 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 175.5-119 chr3 82978420 82978667 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 992401 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 260.5-66 chr8 122890551 122890894 + 1.5 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) L1MA5|LINE|L1 109067 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 339.75-19 chr2 133246698 133247104 + 1.5 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -19294 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 320 chr1 100960073 100960458 + 1.5 NA intron (NM_133496, intron 8 of 10) intron (NM_133496, intron 8 of 10) 64175 NM_001144884 148867 Hs.533903 NM_133496 ENSG00000162695 SLC30A7 ZNT7|ZnT-7|ZnTL2 solute carrier family 30 member 7 protein-coding 386.25-5 chr14 71641872 71642146 + 1.5 NA intron (NM_001354286, intron 8 of 24) L1ME1|LINE|L1 55711 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 481.75 chr10 55398619 55399360 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -200053 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 307.5-11 chr11 113000044 113000446 + 1.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 -36785 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 268-27 chr19 46865757 46865960 + 1.5 NA intron (NM_004491, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 4861 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 339.5-21 chr4 87874717 87875270 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 40290 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 274.5-37 chr2 76258526 76258853 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -547774 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 325-12 chr20 39205802 39206244 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 18725 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 259.5-60 chr2 215545754 215546012 + 1.5 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 92176 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 258.75-17 chr11 113908053 113908301 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001363563) promoter-TSS (NM_001363563) -664 NM_001363563 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 142.5-200 chr7 1318470 1318604 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 85665 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 347.75-5 chr2 139790010 139790435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 796463 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 251.5-67 chr5 105054815 105055162 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -44486 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 125-4 chr1 50319958 50320102 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 103413 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 382.5-14 chr5 4538049 4538460 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -235227 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 212.5-119 chr8 85901859 85902102 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -74038 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 195.75-108 chr7 12643896 12644094 + 1.5 NA intron (NR_156701, intron 11 of 14) intron (NR_156701, intron 11 of 14) -42832 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 268-9 chr10 12621131 12621336 + 1.5 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) L1MD1|LINE|L1 31964 NR_039701 100616320 NR_039701 ENSG00000283699 MIR4481 - microRNA 4481 ncRNA 348.5-23 chr8 132460152 132460680 + 1.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L1MC3|LINE|L1 -13154 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 194-78 chr7 90816441 90816743 + 1.5 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) intron (NM_012395, intron 4 of 13) 106776 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 346.5-26 chr6 123011406 123011698 + 1.5 NA intron (NM_001010852, intron 3 of 5) intron (NM_001010852, intron 3 of 5) 15317 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 163.5-179 chr6 155965514 155965686 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 18803 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 217.5-39 chr14 22118485 22118720 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 314151 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 223-65 chr5 72525631 72525898 + 1.5 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -18354 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 177-47 chr2 139149819 139149966 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 252568 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 140.5-159 chr3 174499796 174499946 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -359463 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 296.75-34 chr8 55958394 55958893 + 1.5 NA intron (NM_002350, intron 8 of 12) L1MB2|LINE|L1 -55788 NR_145767 109617001 NR_145767 ENSG00000199405 SNORA1B - small nucleolar RNA, H/ACA box 1B snoRNA 294-2 chr1 198746288 198746666 + 1.5 NA intron (NM_002838, intron 26 of 32) L2|LINE|L2 107437 NR_052021 5788 Hs.654514 NM_002838 ENSG00000081237 PTPRC B220|CD45|CD45R|GP180|L-CA|LCA|LY5|T200 protein tyrosine phosphatase receptor type C protein-coding 135.75-160 chr4 60384611 60384748 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -537940 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 286-12 chr15 66524834 66525380 + 1.5 NA intron (NM_001287823, intron 7 of 17) intron (NM_001287823, intron 7 of 17) 19781 NM_001287821 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 253.5-10 chr10 68963247 68963441 + 1.5 NA exon (NM_004728, exon 4 of 15) exon (NM_004728, exon 4 of 15) 6904 NM_001256910 9188 Hs.223141 NM_004728 ENSG00000165732 DDX21 GUA|GURDB|RH-II/GU|RH-II/GuA DExD-box helicase 21 protein-coding 259-25 chr22 43692791 43693134 + 1.5 NA intron (NM_198856, intron 8 of 29) L1ME1|LINE|L1 119343 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 205-61 chr5 27770626 27770785 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 298413 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 348.75-12 chr2 150597586 150597940 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25542 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 259.5-26 chr12 40393014 40393237 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_173600) promoter-TSS (NM_173600) -269 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 241-47 chr7 11336938 11337141 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 363167 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 427-7 chr6 133097844 133098342 + 1.5 NA intron (NR_026969, intron 2 of 3) intron (NR_026969, intron 2 of 3) 10013 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 205.5-38 chr14 30166541 30166691 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -238769 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 323.25-26 chr8 82775105 82775505 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -136799 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 286.5-34 chr2 22589382 22589695 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 53059 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 230.5-33 chr14 54546437 54546675 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21056 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 196.5-68 chr17 69397025 69397206 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -17582 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 375-4 chr17 57570099 57570475 + 1.5 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) MER5B|DNA|hAT-Charlie 38125 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 148.5-151 chr3 89387943 89388089 + 1.5 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 280395 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 254.25-35 chr2 194043161 194043426 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -300976 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 142-177 chrX 85687504 85687683 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -148187 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 372.5-12 chr2 101372179 101372597 + 1.5 NA intron (NM_153836, intron 2 of 3) intron (NM_153836, intron 2 of 3) 15115 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 170-72 chr4 91448258 91448421 + 1.5 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 828963 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 168.5-33 chr11 9964459 9964704 + 1.5 NA intron (NM_030962, intron 14 of 39) intron (NM_030962, intron 14 of 39) 125439 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 223.5-36 chr13 75168304 75168552 + 1.5 NA Intergenic (TGTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 71953 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 252-59 chr6 52510962 52511210 + 1.5 NA intron (NM_012288, intron 4 of 10) intron (NM_012288, intron 4 of 10) 65974 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 279.5-50 chr4 95333817 95334117 + 1.5 NA intron (NM_003728, intron 2 of 15) intron (NM_003728, intron 2 of 15) 215006 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 309.5-3 chr1 205099699 205100067 + 1.5 NA intron (NM_001193273, intron 8 of 13) intron (NM_001193273, intron 8 of 13) -15423 NM_203376 388730 Hs.146928 NM_203376 ENSG00000174529 TMEM81 HC3107|KVLA2788|UNQ2788 transmembrane protein 81 protein-coding 179.25-6 chr1 107025808 107025977 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30782 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 385.25 chr1 227223340 227223798 + 1.5 NA intron (NM_001366019, intron 2 of 36) intron (NM_001366019, intron 2 of 36) 94923 NM_001366011 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 362.5 chr1 92059751 92060166 + 1.5 NA intron (NM_173567, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu 15514 NM_001287737 646817 NM_001287737 ENSG00000230667 SETSIP SETP18 SET like protein protein-coding 198-2 chr1 33746076 33746446 + 1.5 NA intron (NM_052896, intron 13 of 69) intron (NM_052896, intron 13 of 69) -114214 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 272.5-69 chr8 76809426 76809661 + 1.5 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -126268 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 428.5-2 chr10 66171865 66172504 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 600759 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 203.5-17 chr1 239033504 239033701 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -352966 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 233.5-39 chr15 92974689 92974954 + 1.5 NA intron (NM_001271, intron 19 of 38) intron (NM_001271, intron 19 of 38) 70422 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 118.5-164 chr5 35862796 35862916 + 1.5 NA intron (NR_120485, intron 2 of 5) intron (NR_120485, intron 2 of 5) 5965 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 393.25-2 chr16 73508558 73509050 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 121999 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 168-56 chr16 76747841 76748012 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 112928 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 273.75-23 chr2 184500097 184500301 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98330 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 175-15 chr10 58774825 58775026 + 1.5 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) L1ME4a|LINE|L1 59910 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 167.5-38 chr11 77023391 77023690 + 1.5 NA 3' UTR (NM_018367, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_018367, exon 11 of 11) -10858 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 325.25-25 chr5 169734555 169734807 + 1.5 NA intron (NR_156756, intron 22 of 52) L1MEd|LINE|L1 97406 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 232.75-50 chr4 65407182 65407353 + 1.5 NA intron (NM_001281767, intron 7 of 16) intron (NM_001281767, intron 7 of 16) 262221 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 209-23 chr14 75743976 75744257 + 1.5 NA intron (NM_015072, intron 15 of 31) intron (NM_015072, intron 15 of 31) 82870 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 397.5-10 chr7 47000803 47001228 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -303893 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 342.5-14 chr16 81428333 81428764 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -16622 NM_198390 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 446-4 chr20 58346918 58347240 + 1.5 NA intron (NM_020673, intron 3 of 6) intron (NM_020673, intron 3 of 6) 37364 NM_020673 57403 Hs.529044 NM_020673 ENSG00000124209 RAB22A - RAB22A, member RAS oncogene family protein-coding 385-2 chr11 11917046 11917431 + 1.5 NA intron (NM_001282659, intron 8 of 27) L1MC4|LINE|L1 75815 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 308-22 chr3 177542497 177542960 + 1.5 NA intron (NR_047568, intron 2 of 3) intron (NR_047568, intron 2 of 3) 100807 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 234.5-27 chr14 69795089 69795359 + 1.5 NA intron (NM_003049, intron 1 of 4) L3b|LINE|CR1 2017 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 150-68 chr18 65725477 65725676 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24676 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 216.5-61 chr2 180885370 180885668 + 1.5 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) L1MA4A|LINE|L1 -94866 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 177.75-132 chr7 107107884 107108131 + 1.5 NA intron (NM_002736, intron 2 of 10) intron (NM_002736, intron 2 of 10) -60954 NM_001244262 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 321-7 chr12 131341899 131342118 + 1.5 NA Intergenic LTR12_|LTR|ERV1 -5462 NR_103736 338797 Hs.592007 NM_001025466 LINC02370 - long intergenic non-protein coding RNA 2370 ncRNA 240-3 chr1 102276858 102277183 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -279786 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 576.75 chr10 65911704 65912376 + 1.5 NA TTS (NM_013266) TTS (NM_013266) 340615 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 169.5-126 chr4 96059997 96060157 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 219984 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 160.25-158 chr8 52298355 52298490 + 1.5 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) -43930 NM_001352841 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 396-7 chr2 86072176 86072481 + 1.5 NA intron (NM_015425, intron 12 of 33) intron (NM_015425, intron 12 of 33) 33558 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 456.25-5 chr6 136409957 136410324 + 1.5 NA intron (NM_001198611, intron 3 of 16) intron (NM_001198611, intron 3 of 16) 56735 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 318.75-15 chr4 82445427 82445810 + 1.5 NA intron (NM_021204, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 15028 NM_001292017 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 326.75-15 chr4 44175955 44176360 + 1.5 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 159095 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 323-21 chr6 155096880 155097230 + 1.5 NA intron (NM_012454, intron 1 of 25) L1MA4|LINE|L1 6766 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 366.75-14 chr3 118785405 118785803 + 1.5 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 25229 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 213.5-113 chr7 1585545 1585869 + 1.5 NA non-coding (NR_027328, exon 4 of 4) non-coding (NR_027328, exon 4 of 4) 15634 NR_021487 114796 Hs.436146 NR_021487 ENSG00000230487 PSMG3-AS1 - PSMG3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 243.75-81 chr8 120182465 120182865 + 1.5 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 57563 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 281.25-27 chr21 16231964 16232301 + 1.5 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) MIR|SINE|MIR 37753 NR_136543 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 189-113 chr9 94574183 94574454 + 1.5 NA intron (NM_003837, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 19273 NR_121566 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 271.5-20 chr12 94172296 94172606 + 1.5 NA intron (NM_005761, intron 2 of 30) intron (NM_005761, intron 2 of 30) 23874 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 183.5-96 chr3 195396265 195396405 + 1.5 NA intron (NM_012287, intron 1 of 22) intron (NM_012287, intron 1 of 22) 46685 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 356.25-11 chr21 28312264 28312717 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -83823 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 131.25-38 chr12 12126332 12126455 + 1.5 NA intron (NM_002336, intron 20 of 22).2 intron (NM_002336, intron 20 of 22).2 14441 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 332-19 chr22 46989702 46990205 + 1.5 NA intron (NM_001284305, intron 9 of 12) AluSz6|SINE|Alu -73911 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 420.5-12 chr5 44660384 44660691 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 148256 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 132-21 chr10 86000277 86000392 + 1.5 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) L1MD|LINE|L1 264454 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 327.5-16 chr2 112254220 112254471 + 1.5 NA intron (NM_032494, intron 1 of 8) intron (NM_032494, intron 1 of 8) 697 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 341.5-13 chr2 10910144 10910630 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1547 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 219.75 chr1 3674674 3674932 + 1.5 NA intron (NM_001204185, intron 1 of 12) intron (NM_001204185, intron 1 of 12) -15869 NM_001204191 7161 Hs.192132 NM_005427 ENSG00000078900 TP73 P73 tumor protein p73 protein-coding 214.5-13 chr10 57254177 57254371 + 1.5 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 50285 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 316.5-41 chr8 128938506 128938937 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 27280 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 180-37 chr14 88684648 88684850 + 1.5 NA intron (NM_183387, intron 20 of 42) intron (NM_183387, intron 20 of 42) 90329 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 192.5-14 chr10 49580125 49580334 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -28866 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 149.25-63 chr17 60877390 60877545 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 9 of 25) intron (NM_001330413, intron 9 of 25) 199616 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 508.75-2 chr14 44848061 44848611 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48939 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 232-18 chr15 73978889 73979128 + 1.5 NA TTS (NM_001256672) TTS (NM_001256672) 13287 NM_001256674 9399 Hs.194816 NM_004809 ENSG00000067221 STOML1 SLP-1|STORP|hUNC-24 stomatin like 1 protein-coding 121-110 chr2 168339736 168339877 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92211 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 290.5-32 chr4 126838220 126838462 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -794616 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 266.25-34 chr3 166781655 166781943 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -116884 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 268.5-44 chr5 52028563 52028875 + 1.5 NA intron (NR_147166, intron 3 of 3) intron (NR_147166, intron 3 of 3) 20688 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 171.25-133 chr5 180781423 180781558 + 1.5 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL 21316 NM_001364393 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 168-6 chr1 84882411 84882578 + 1.5 NA intron (NM_012152, intron 1 of 2) L1M3|LINE|L1 10712 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 183-3 chr1 100516689 100516851 + 1.5 NA intron (NM_001319210, intron 16 of 16) intron (NM_001319210, intron 16 of 16) -21369 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 252.75-78 chr9 30846259 30846574 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -437962 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 122-131 chr4 92709971 92710127 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 405650 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 176.5-160 chr7 101248038 101248284 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3080 NM_016068 51024 Hs.423968 NM_016068 ENSG00000214253 FIS1 CGI-135|TTC11 fission, mitochondrial 1 protein-coding 234-66 chr8 85631379 85631557 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 24208 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 210-79 chr6 39589366 39589585 + 1.5 NA intron (NM_001289020, intron 7 of 21) intron (NM_001289020, intron 7 of 21) 135933 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 310.5-6 chr10 110485337 110485632 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12423 NM_004419 1847 Hs.2128 NM_004419 ENSG00000138166 DUSP5 DUSP|HVH3 dual specificity phosphatase 5 protein-coding 248.75-23 chr14 70358516 70358824 + 1.5 NA intron (NM_001202548, intron 3 of 5) intron (NM_001202548, intron 3 of 5) 1013 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 204.75-72 chr22 38558246 38558506 + 1.5 NA intron (NM_001363017, intron 5 of 11) MamRep1151|LTR?|LTR? 10033 NM_001278208 11144 Hs.339396 NM_007068 ENSG00000100206 DMC1 DMC1H|LIM15|dJ199H16.1 DNA meiotic recombinase 1 protein-coding 288-14 chr11 42620644 42620867 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -367065 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 229.5-5 chr1 75930690 75930914 + 1.5 NA intron (NM_080868, intron 1 of 2) intron (NM_080868, intron 1 of 2) 1602 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 264-63 chr8 115434521 115434888 + 1.5 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 233309 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 247.5-48 chr2 224354097 224354322 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 47785 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 435.5-10 chr6 73519409 73520124 + 1.5 NA intron (NM_001402, intron 2 of 7) intron (NM_001402, intron 2 of 7) 1266 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 385.5-3 chr10 26740386 26740915 + 1.5 NA intron (NM_014317, intron 10 of 11) intron (NM_014317, intron 10 of 11) 42949 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 183.5-23 chr10 71401239 71401453 + 1.5 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) intron (NM_052836, intron 1 of 12) 4412 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 163.5-151 chr4 142620849 142621006 + 1.5 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) L1MD2|LINE|L1 225608 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 277 chr1 76399262 76399580 + 1.5 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 324675 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 268.5-63 chr8 116576424 116576615 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -75581 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 165.5-208 chr9 97474301 97474520 + 1.5 NA intron (NM_001302884, intron 10 of 15) L2c|LINE|L2 -26770 NM_001166116 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 233-44 chr3 115857475 115857664 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) 47557 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 376.25-2 chr1 52199579 52199858 + 1.5 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) L1MC1|LINE|L1 57624 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 292-39 chr7 39518268 39518638 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -47951 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 275.5-44 chr4 37035376 37035627 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 33722 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 210.75-31 chr17 65878310 65878549 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) intron (NM_001353129, intron 20 of 26) -51886 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 298.75-32 chr7 36289825 36290184 + 1.5 NA intron (NM_030636, intron 6 of 7) intron (NM_030636, intron 6 of 7) 77236 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 173.5-80 chr2 203383291 203383617 + 1.5 NA intron (NM_001282925, intron 4 of 10) intron (NM_001282925, intron 4 of 10) 16570 NM_001282927 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 317.25-30 chr6 162897199 162897430 + 1.5 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 156847 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 237.25-79 chr9 103061127 103061425 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 65943 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 392-2 chr14 77386212 77386836 + 1.5 NA intron (NM_001010860, intron 2 of 2) FRAM|SINE|Alu 9146 NM_001010860 161394 Hs.421961 NM_001010860 ENSG00000100583 SAMD15 C14orf174|FAM15A sterile alpha motif domain containing 15 protein-coding 328.5-18 chr2 79488387 79488666 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 12318 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 184-93 chr8 115984094 115984336 + 1.5 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) -315240 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 194.5-102 chr4 34120936 34121127 + 1.5 NA TTS (NR_147183) TTS (NR_147183) -81138 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 242-27 chr18 60369527 60369743 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 3140 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 229.5-31 chr11 115951003 115951273 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -190938 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 175-93 chr5 7944201 7944434 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75169 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 280.5-40 chr5 26994812 26995162 + 1.5 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 43599 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 255.75-36 chr4 184801898 184802280 + 1.5 NA intron (NM_001995, intron 2 of 20) intron (NM_001995, intron 2 of 20) -3043 NR_003542 643036 Hs.689630 NR_003542 ENSG00000249138 SLED1 - proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 pseudogene pseudo 201-80 chr8 123429013 123429188 + 1.5 NA intron (NM_018024, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR 12326 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 198.75-56 chr20 51997763 51997931 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 107637 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 243-32 chr2 89843655 89843994 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -205917 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 307.5-29 chr2 143880616 143880862 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56328 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 314.25-5 chr10 91657689 91658117 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24832 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 303.75-28 chr5 169383461 169383776 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -82479 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 267.5-17 chr12 43711776 43712030 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46887 NM_031292 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 247.5-66 chr5 37619403 37619711 + 1.5 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 215265 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 308-5 chr1 219535273 219535504 + 1.5 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 21936 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 296-13 chr12 81324813 81325279 + 1.5 NA intron (NM_001220474, intron 20 of 30) intron (NM_001220474, intron 20 of 30) 44323 NM_001220479 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 254.5-59 chr5 38515170 38515537 + 1.5 NA intron (NM_001127671, intron 5 of 19) intron (NM_001127671, intron 5 of 19) 41293 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 294.25-15 chr18 22975646 22976212 + 1.5 NA intron (NM_002894, intron 6 of 18) L3|LINE|CR1 42053 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 142.5-173 chr5 87269344 87269487 + 1.5 NA intron (NM_022650, intron 1 of 24) intron (NM_022650, intron 1 of 24) 491 NM_022650 5921 Hs.664080 NM_002890 ENSG00000145715 RASA1 CM-AVM|CMAVM|CMAVM1|GAP|PKWS|RASA|RASGAP|p120|p120GAP|p120RASGAP RAS p21 protein activator 1 protein-coding 367.5-14 chr20 31711793 31712108 + 1.5 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR -9557 NR_131907 103021294 NR_131907 ENSG00000281376 ABALON INXS apoptotic BCL2L1-antisense long non-coding RNA ncRNA 398.5-2 chr10 60022933 60023261 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -62184 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 332.25-23 chr3 74605787 74606279 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -84893 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 400-5 chr11 132737580 132737878 + 1.5 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) L1ME4c|LINE|L1 205908 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 356.25-21 chr9 5413954 5414449 + 1.5 NA intron (NM_018465, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 23724 NM_018465 55848 Hs.584242 NM_018465 ENSG00000107020 PLGRKT AD025|C9orf46|MDS030|PLG-RKT|Plg-R(KT) plasminogen receptor with a C-terminal lysine protein-coding 280.25-16 chr12 29616066 29616343 + 1.5 NA intron (NM_001367875, intron 8 of 19) MER103C|DNA|hAT-Charlie -116511 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 374-12 chr4 28789148 28789516 + 1.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -30250 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 389.5-3 chr10 14046660 14047044 + 1.5 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) -27432 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 224.25-93 chr7 27287233 27287512 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -40143 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 177-48 chr2 146669413 146669622 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 82460 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 234-59 chr6 94341822 94341999 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 623607 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 321.75-35 chr8 121463591 121464076 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -175513 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 350-11 chr3 152382288 152382600 + 1.5 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) -41454 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 189-68 chr2 227123962 227124180 + 1.5 NA intron (NM_000092, intron 4 of 47) intron (NM_000092, intron 4 of 47) 40488 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 343-25 chr5 147020644 147020939 + 1.5 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) intron (NM_001271900, intron 2 of 10) 35346 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 136.5-152 chr3 129932724 129932896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 38939 NR_037893 100507032 Hs.529562 NR_037893 ENSG00000271270 TMCC1-AS1 - TMCC1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 274.5-58 chr6 26405446 26405706 + 1.5 NA exon (NM_001145009, exon 2 of 10) exon (NM_001145009, exon 2 of 10) 3301 NM_194441 11119 Hs.191510 NM_007048 ENSG00000026950 BTN3A1 BT3.1|BTF5|BTN3.1|CD277 butyrophilin subfamily 3 member A1 protein-coding 300.25-5 chr10 43744863 43745082 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 33853 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 250.5-103 chr9 91129753 91129992 + 1.5 NA intron (NR_135306, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 10810 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 389-8 chr2 27046740 27047235 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 3277 NR_046730 100874031 Hs.132725 NR_046730 ENSG00000231636 AGBL5-AS1 - AGBL5 antisense RNA 1 ncRNA 296-15 chr14 20690666 20690932 + 1.5 NA intron (NM_194431, intron 1 of 1) intron (NM_194431, intron 1 of 1) 2035 NM_001097577 283 Hs.283749 NM_001145 ENSG00000214274 ANG ALS9|HEL168|RAA1|RNASE4|RNASE5 angiogenin protein-coding 295.75-10 chr19 49526755 49526999 + 1.5 NA TTS (NM_001136019) TTS (NM_001136019) -1126 NM_020650 57333 Hs.567550 NM_020650 ENSG00000142552 RCN3 RLP49 reticulocalbin 3 protein-coding 224.75-63 chr6 167583841 167584021 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 95292 NR_117091 401286 Hs.487182 NR_117091 ENSG00000272549 LINC02538 - long intergenic non-protein coding RNA 2538 ncRNA 283-6 chr1 169928989 169929322 + 1.5 NA intron (NM_014970, intron 19 of 19) intron (NM_014970, intron 19 of 19) -35196 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 249-54 chr8 126972195 126972561 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -40776 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 228.75-89 chr8 131429342 131429557 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -388540 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 164-148 chr9 31718389 31718543 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -336976 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 258.25-24 chr16 59557926 59558250 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197103 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 158-77 chr2 105073693 105073829 + 1.5 NA intron (NM_182640, intron 4 of 10) intron (NM_182640, intron 4 of 10) 29183 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 239.5-13 chr11 58127932 58128145 + 1.5 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) -8594 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 363.5 chr1 44681272 44681528 + 1.5 NA intron (NM_001145636, intron 1 of 11) AluJr4|SINE|Alu 6686 NM_001145636 339541 Hs.173679 NM_001004307 ENSG00000198520 ARMH1 C1orf228|NCRNA00082|p40 armadillo like helical domain containing 1 protein-coding 155.25-16 chr1 188785834 188786162 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1342370 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 228.5-48 chr2 5421256 5421423 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 269779 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 221-27 chr17 61346107 61346427 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 21437 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 244.5-30 chr14 53026953 53027281 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -76020 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 375.5-18 chr7 15414639 15415225 + 1.5 NA intron (NM_001004320, intron 5 of 12) L1MEf|LINE|L1 147083 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 247.5 chr1 114232525 114232733 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -78760 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 259.5-95 chr8 83429454 83429791 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25864 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 167-33 chr12 99216592 99216768 + 1.5 NA intron (NM_152788, intron 14 of 25) intron (NM_152788, intron 14 of 25) -61590 NM_001352190 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 342.75-5 chr1 231562975 231563521 + 1.5 NA intron (NR_028398, intron 3 of 10) intron (NR_028398, intron 3 of 10) 34579 NM_005999 7257 Hs.13318 NM_005999 ENSG00000116918 TSNAX C3PO|TRAX translin associated factor X protein-coding 177.5-114 chr3 79531627 79531802 + 1.5 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 23827 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 320.25-14 chr2 65679426 65679760 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -246994 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 230-36 chr2 129506139 129506419 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -232388 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 456.5-7 chr2 17502933 17503441 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15253 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 282.5-35 chr2 145867835 145868228 + 1.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -719026 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 181.75-9 chr1 213522751 213523032 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -401858 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 310.5-42 chr8 143964251 143964725 + 1.5 NA intron (NM_000445, intron 2 of 32) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 9041 NM_201378 5339 Hs.434248 NM_000445 ENSG00000178209 PLEC EBS1|EBSMD|EBSND|EBSO|EBSOG|EBSPA|HD1|LGMD2Q|LGMDR17|PCN|PLEC1|PLEC1b|PLTN plectin protein-coding 299 chr1 42117018 42117557 + 1.5 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 -36123 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 477-6 chr3 99081218 99081883 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -179855 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 315.5-21 chr5 127178857 127179143 + 1.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -105508 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 401.5-3 chr10 72834044 72834491 + 1.5 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -59472 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 281.5-7 chr10 63676152 63676444 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -154408 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 277.75-12 chr17 50208077 50208401 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6455 NR_110806 101927230 Hs.514326 NR_110806 LINC01969 - long intergenic non-protein coding RNA 1969 ncRNA 242.5-15 chr10 28847101 28847402 + 1.5 NA exon (NM_001278522, exon 2 of 5) exon (NM_001278522, exon 2 of 5) 843 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 259.5-47 chr16 87239973 87240277 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28010 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 225-13 chr10 88597267 88597481 + 1.5 NA intron (NM_001010939, intron 8 of 10) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 10612 NM_001010939 142910 Hs.440959 NM_001010939 ENSG00000204022 LIPJ LIPL1|bA425M17.2 lipase family member J protein-coding 348.5-7 chr2 182852604 182852916 + 1.5 NA intron (NM_001463, intron 2 of 5) intron (NM_001463, intron 2 of 5) 13877 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 299.75-16 chr2 201319093 201319409 + 1.5 NA intron (NM_139163, intron 9 of 14) L1P4|LINE|L1 38094 NM_001289993 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 390-7 chr2 239029106 239029402 + 1.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 39660 NR_039642 100616397 NR_039642 ENSG00000266109 MIR4440 mir-4440 microRNA 4440 ncRNA 318-28 chr4 40144298 40144578 + 1.5 NA intron (NM_001318359, intron 16 of 18) intron (NM_001318359, intron 16 of 18) -46642 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 183.5-12 chr1 187897279 187897406 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 453714 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 197.5-44 chr15 85715984 85716142 + 1.5 NA intron (NM_007200, intron 20 of 36) intron (NM_007200, intron 20 of 36) 42662 NR_120366 101929679 Hs.513112 NR_120366 LOC101929679 - uncharacterized LOC101929679 ncRNA 171-29 chr12 120676155 120676341 + 1.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -10901 NM_001303628 9761 Hs.744910 NM_014730 ENSG00000110917 MLEC KIAA0152 malectin protein-coding 329-33 chr5 143492415 143492714 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -57052 NM_001018074 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 349-4 chr10 85103612 85104123 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 95038 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 289-42 chr7 31345955 31346182 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5342 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 149.5-201 chr8 77056357 77056501 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55385 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 254-15 chr14 45740271 45740547 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24807 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 182.25-66 chr2 175125265 175125436 + 1.5 NA intron (NR_045770, intron 5 of 15) intron (NR_045770, intron 5 of 15) 42359 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 283-38 chr5 164444520 164444950 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22667 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 292.5-54 chr8 129390839 129391265 + 1.5 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) intron (NR_130918, intron 1 of 2) 93090 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 391.5-21 chr9 98278556 98278890 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23074 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 413-7 chr5 135024708 135025211 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8315 NR_161235 100996485 NR_161235 C5orf66 - chromosome 5 open reading frame 66 ncRNA 177-89 chr7 12359937 12360154 + 1.5 NA intron (NM_001135924, intron 15 of 28) intron (NM_001135924, intron 15 of 28) 43820 NM_001135924 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 141.75-118 chr3 74323727 74323877 + 1.5 NA intron (NM_020872, intron 12 of 21) intron (NM_020872, intron 12 of 21) 197338 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 265.5-38 chr2 171860443 171860645 + 1.5 NA intron (NM_003705, intron 3 of 17) AluSz|SINE|Alu 33700 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 283.75-9 chr14 66192167 66192433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -294071 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 390-4 chr2 34965704 34966291 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 288440 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 333-22 chr7 17984767 17985084 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 42921 NM_175886 221823 Hs.169284 NM_175886 ENSG00000229937 PRPS1L1 PRPS1|PRPS3|PRPSL|PRS-III phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 like 1 protein-coding 405.5-6 chr18 5849333 5849726 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 8834 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 360-2 chr13 47833812 47834129 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 98652 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 294.5-20 chr2 33788928 33789211 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) ERVL-E-int|LTR|ERVL -60852 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 269.75-52 chr7 39638857 39639160 + 1.5 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) L1MB8|LINE|L1 15436 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 230.25-79 chr8 84324272 84324475 + 1.5 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) -91111 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 208.5-94 chr4 32259456 32259644 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -91488 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 333.75-6 chr14 82536212 82536460 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -106296 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 266-44 chr7 30593612 30594080 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001316772) promoter-TSS (NM_001316772) -889 NM_001316772 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 165-87 chr22 32482295 32482483 + 1.5 NA intron (NM_001257990, intron 2 of 8) intron (NM_001257990, intron 2 of 8) 7152 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 174.25-129 chr6 141273110 141273300 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 589391 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 348.5-2 chr2 51011581 51012042 + 1.5 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) L2c|LINE|L2 20321 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 267-4 chr1 179192495 179192714 + 1.5 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) intron (NM_007314, intron 1 of 11) 37073 NM_007314 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 244.5-78 chr5 52802219 52802400 + 1.5 NA 3' UTR (NM_015946, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_015946, exon 3 of 3) 14393 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 235.5-85 chr8 68211924 68212117 + 1.5 NA intron (NM_024870, intron 37 of 39) intron (NM_024870, intron 37 of 39) -118353 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 353.5-19 chr8 29003018 29003262 + 1.5 NA intron (NM_001324384, intron 4 of 10) L1ME3G|LINE|L1 111826 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 155.5-177 chr5 150006066 150006204 + 1.5 NA intron (NM_014983, intron 2 of 19) intron (NM_014983, intron 2 of 19) 5396 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 142.5-32 chr10 65897437 65897593 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 326090 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 172.75-71 chr21 16668386 16668586 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 78249 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 172.25-13 chr10 9633788 9634042 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -338322 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 212.5-98 chr6 138521220 138521538 + 1.5 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu -21885 NM_001144060 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 412-11 chr8 13365863 13366497 + 1.5 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -89396 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 217.5-5 chr1 80403126 80403332 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -132526 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 362-3 chr12 88253226 88253797 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 111204 NM_001366574 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 173.25-7 chr1 157483431 157483588 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 69006 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 148.5-107 chr2 133325380 133325515 + 1.5 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 59252 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 309.5-31 chr4 20219452 20219821 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -32269 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 376.75-3 chr11 39961267 39961538 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 331728 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 118-109 chr3 5186604 5186776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1017 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 321.5-26 chr4 44928522 44928863 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -202058 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 243.75-30 chr15 82157909 82158196 + 1.5 NA intron (NM_001040610, intron 14 of 17) intron (NM_001040610, intron 14 of 17) 69458 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 127.5-193 chr5 81517785 81517915 + 1.5 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) -123716 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 213-20 chr11 77370809 77370994 + 1.5 NA intron (NM_001128620, intron 5 of 15) intron (NM_001128620, intron 5 of 15) -69235 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 259.5-63 chr20 51128450 51128699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -105467 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 382.25-5 chr12 40099733 40100009 + 1.5 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) intron (NM_052885, intron 1 of 9) 6210 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 331.25-14 chr5 39873659 39874037 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -178443 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 408-2 chr12 14879855 14880266 + 1.5 NA TTS (NM_001190839) TTS (NM_001190839) 5794 NM_000900 4256 Hs.365706 NM_000900 ENSG00000111341 MGP GIG36|MGLAP|NTI matrix Gla protein protein-coding 328.25-2 chr10 74006400 74006739 + 1.5 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 8453 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 114-128 chr5 30885002 30885137 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -308617 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 279-11 chr14 67930117 67930468 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1M2|LINE|L1 106700 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 610.25 chr22 30448583 30449462 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 16336 NR_148046 105372990 Hs.565803 NR_148046 LOC105372990 - uncharacterized LOC105372990 ncRNA 176-54 chr4 60341616 60341848 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -580887 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 204.5-26 chr12 98020049 98020283 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24718 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 259.25-23 chr21 27479133 27479429 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -243098 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 436.75-3 chr11 75575515 75575936 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7471 NR_145823 105369391 Hs.689687 NR_145823 ENSG00000255326 LOC105369391 - uncharacterized LOC105369391 ncRNA 262-45 chr5 104633342 104633713 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -465947 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 355-17 chr7 89681013 89681317 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -438235 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 194-59 chr3 169890721 169890913 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20755 NM_182610 344658 Hs.439922 NM_182610 ENSG00000187033 SAMD7 - sterile alpha motif domain containing 7 protein-coding 254-41 chr7 69140041 69140277 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 457465 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 276.5-49 chr4 114596737 114596973 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1547 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 241.5-54 chr2 223828401 223828613 + 1.5 NA intron (NR_110905, intron 1 of 5) intron (NR_110905, intron 1 of 5) 9075 NR_110905 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 219.5-62 chr2 11290061 11290238 + 1.5 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) intron (NM_001321643, intron 1 of 32) 54487 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 378.5-21 chr8 118685218 118685867 + 1.5 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) LTR73|LTR|ERV1 -63579 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 268.25-15 chr14 71006954 71007183 + 1.5 NA intron (NM_014982, intron 8 of 35) intron (NM_014982, intron 8 of 35) 99609 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 134-188 chrX 47108224 47108377 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 29857 NM_152869 9104 Hs.77854 NM_004683 ENSG00000130988 RGN GNL|HEL-S-41|RC|SMP30 regucalcin protein-coding 397-4 chr14 55921007 55921530 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -124594 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 189.75-64 chr20 1423427 1423663 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30373 NM_001199786 2280 Hs.471933 NM_000801 ENSG00000088832 FKBP1A FKBP-12|FKBP-1A|FKBP1|FKBP12|PKC12|PKCI2|PPIASE FKBP prolyl isomerase 1A protein-coding 161.5-193 chr9 5120385 5120521 + 1.5 NA intron (NM_004972, intron 22 of 24) intron (NM_004972, intron 22 of 24) 65186 NM_007179 11172 Hs.632648 NM_007179 ENSG00000120210 INSL6 RIF1 insulin like 6 protein-coding 165-76 chr2 187854899 187855018 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -300453 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 315.25-34 chr8 126929662 126930098 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -83274 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 247.25-57 chr7 52371060 52371300 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -664453 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 219.75-74 chr7 21775629 21775845 + 1.5 NA intron (NM_001277115, intron 56 of 81) intron (NM_001277115, intron 56 of 81) 170162 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 262.25-6 chr10 81631372 81631670 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -243673 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 141-153 chr7 117098453 117098618 + 1.5 NA intron (NR_161419, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 -7754 NR_109980 93654 Hs.628891 NR_002331 ENSG00000226367 ST7-AS2 ST7AS2|ST7OT2 ST7 antisense RNA 2 ncRNA 337-14 chr18 68932276 68932633 + 1.5 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) intron (NM_001093729, intron 8 of 9) 134374 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 335 chr1 60678972 60679363 + 1.5 NA intron (NR_110628, intron 4 of 5) intron (NR_110628, intron 4 of 5) -56482 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 301 chr10 122745898 122746109 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10691 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 248.5-69 chr3 195302727 195303027 + 1.5 NA intron (NM_012287, intron 13 of 22) AluSz6|SINE|Alu -31718 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 195.5-7 chr1 206079272 206079453 + 1.5 NA intron (NM_001007544, intron 1 of 5) L1ME4c|LINE|L1 -4233 NM_001369490 440712 Hs.662248 NM_001007544 ENSG00000263961 RHEX C1orf186 regulator of hemoglobinization and erythroid cell expansion protein-coding 280.5-27 chr20 50968901 50969230 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 10247 NM_014484 27304 Hs.159410 NM_014484 ENSG00000124217 MOCS3 UBA4 molybdenum cofactor synthesis 3 protein-coding 144-57 chr2 64537108 64537324 + 1.5 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) L1ME4b|LINE|L1 11703 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 271-43 chr6 50562309 50562556 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -151112 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 278.25-13 chr12 74706024 74706301 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 168327 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 231-6 chr10 14839409 14839693 + 1.5 NA intron (NR_103464, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 1245 NM_016299 51182 Hs.534169 NM_016299 ENSG00000187522 HSPA14 HSP70-4|HSP70L1 heat shock protein family A (Hsp70) member 14 protein-coding 254.25-6 chr1 217202258 217202485 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -64669 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 401-8 chr2 23024322 23024749 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -360644 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 319.5-22 chr18 33011961 33012233 + 1.5 NA intron (NM_001308126, intron 21 of 23) intron (NM_001308126, intron 21 of 23) -239074 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 395-6 chr11 46146033 46146507 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25285 NM_001352025 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 162.75-106 chr4 96703054 96703184 + 1.5 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 392416 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 277-37 chr8 100922845 100923266 + 1.5 NA intron (NM_001135700, intron 5 of 5) intron (NM_001135700, intron 5 of 5) 27516 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 196.5-130 chr5 110701951 110702145 + 1.5 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 24623 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 150.5-235 chr9 84093554 84093783 + 1.5 NA intron (NR_110995, intron 8 of 8) intron (NR_110995, intron 8 of 8) 30225 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 141.5-54 chr14 48487407 48487533 + 1.5 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -692456 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 313-2 chr10 108945250 108945539 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -876101 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 251.25-54 chr7 54856402 54856628 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 97202 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 242.25-38 chr17 66436143 66436411 + 1.5 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) MIR|SINE|MIR -19423 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 216-48 chr20 37029118 37029412 + 1.5 NA intron (NM_002895, intron 16 of 21) MER8|DNA|TcMar-Tigger 66732 NM_002895 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 445.75 chr10 43951988 43952543 + 1.5 NA intron (NR_033846, intron 5 of 7) L1MB8|LINE|L1 39863 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 364.5-2 chr10 31017112 31017425 + 1.5 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 14669 NR_026560 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 235.25-44 chr3 104001742 104002045 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -477777 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 125.5-107 chr17 53498125 53498226 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -324752 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 270.75-35 chr4 39686622 39686932 + 1.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -11359 NM_001312646 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 639-2 chr2 67070956 67072112 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14912 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 191.5 chr1 14555187 14555321 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43431 NM_201628 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 268.5-3 chr1 62519667 62519965 + 1.5 NA intron (NM_001367561, intron 31 of 49) L1PA7|LINE|L1 -77704 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 377.25-10 chr21 22512555 22513017 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 414169 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 203-9 chr10 19069133 19069283 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 2 of 39) intron (NM_001142308, intron 2 of 39) 20407 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 360-6 chr16 77136298 77136670 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54706 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 237.5-100 chr8 125482550 125482746 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 50439 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 190.75-85 chr5 55117573 55117754 + 1.5 NA intron (NM_152623, intron 11 of 11) intron (NM_152623, intron 11 of 11) 15017 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 256.75-42 chr8 106477416 106477762 + 1.5 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 29665 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 399.25-8 chr3 98678960 98679262 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -53125 NM_001271142 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 248.25-69 chr8 71944327 71944627 + 1.5 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -99981 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 231-71 chr5 146323615 146323968 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15048 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 320.5-10 chr14 38109406 38109896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98253 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 127.75-5 chr1 33612189 33612285 + 1.5 NA intron (NM_052896, intron 40 of 69) intron (NM_052896, intron 40 of 69) 139592 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 245.5-62 chr5 107156406 107156583 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -145480 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 216.5-35 chr15 38803918 38804130 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 107426 NR_160786 268.75-16 chr2 70789376 70789827 + 1.5 NA intron (NM_001004311, intron 1 of 4) intron (NM_001004311, intron 1 of 4) 1042 NM_001004311 344018 Hs.407636 NM_001004311 ENSG00000183733 FIGLA BHLHC8|FIGALPHA|POF6 folliculogenesis specific bHLH transcription factor protein-coding 186-45 chr2 68321873 68322032 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1901 NM_015463 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 148.75-116 chr3 176674070 176674352 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -38679 NR_109968 100505547 Hs.253350 NR_109968 LINC01208 - long intergenic non-protein coding RNA 1208 ncRNA 327.5-20 chr21 36206337 36206685 + 1.5 NA intron (NM_005128, intron 4 of 36) AluJb|SINE|Alu 41970 NM_005128 9980 Hs.204575 NM_005128 ENSG00000142197 DOP1B 21orf5|C21orf5|DOPEY2 DOP1 leucine zipper like protein B protein-coding 244.75-6 chr10 19154110 19154321 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 11 of 39) intron (NM_001142308, intron 11 of 39) 105414 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 183.5-112 chr5 55361217 55361395 + 1.5 NA intron (NM_015360, intron 15 of 26) intron (NM_015360, intron 15 of 26) 53317 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 164-147 chr9 29476334 29476474 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -262803 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 349.75-4 chr14 30354353 30354601 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -204646 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 263.5-60 chr6 143740289 143740486 + 1.5 NA intron (NM_001100165, intron 2 of 11) MER41A|LTR|ERV1 62422 NM_001100164 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 306-32 chr5 14113243 14113518 + 1.5 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -29962 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 320.25-31 chr8 130963188 130963604 + 1.5 NA intron (NM_001115, intron 2 of 17) L2b|LINE|L2 77513 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 220.25-67 chr6 64246576 64246833 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 439868 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 281.5-47 chr6 153444318 153444686 + 1.5 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -313220 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 325.5-34 chr6 50230868 50231214 + 1.5 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -181112 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 279.5-53 chr5 99263084 99263368 + 1.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -270764 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 496.5-2 chr4 53312084 53312430 + 1.5 NA intron (NM_152540, intron 3 of 8) intron (NM_152540, intron 3 of 8) 53804 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 201.25-11 chr10 33165008 33165240 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48317 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 298.5-45 chr8 119253867 119254166 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -7159 NR_149112 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 305-11 chr14 55549219 55549566 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 30700 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 210.25-78 chr8 84243533 84243688 + 1.5 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 58944 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 351-6 chr14 84811745 84812139 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -459990 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 220-21 chr15 61911558 61911916 + 1.5 NA intron (NM_001018088, intron 63 of 81) intron (NM_001018088, intron 63 of 81) 148710 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 427.5-6 chr5 11050156 11050656 + 1.5 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) intron (NM_001288715, intron 15 of 20) -289172 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 252.5-75 chr7 84634872 84635144 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 102532 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 217.5-104 chr6 7373408 7373590 + 1.5 NA exon (NM_001170692, exon 5 of 14) exon (NM_001170692, exon 5 of 14) 16243 NM_001170692 285782 Hs.721486 NM_175745 ENSG00000164304 CAGE1 CT3|CT95|CTAG3|bA69L16.7 cancer antigen 1 protein-coding 154.5-51 chr12 85610077 85610227 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 226257 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 148.75-117 chr3 189228378 189228597 + 1.5 NA intron (NM_198485, intron 3 of 5) L1MD|LINE|L1 12107 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 248.5-103 chr8 131203316 131203574 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -162536 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 190.5-100 chr3 73007223 73007429 + 1.5 NA intron (NM_001318025, intron 2 of 7) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 10515 NM_174907 151987 Hs.431092 NM_174907 ENSG00000163605 PPP4R2 PP4R2 protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 protein-coding 275-44 chr8 129543441 129543740 + 1.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 31428 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 256.5-80 chr8 131079362 131079579 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38561 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 363.5-22 chr8 117188264 117188716 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 53495 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 205.25-105 chr8 78748814 78749004 + 1.5 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) intron (NM_001199886, intron 2 of 4) -24535 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 240.5-95 chr6 166387635 166387943 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4776 NR_073093 51660 Hs.172755 NM_016098 ENSG00000060762 MPC1 BRP44L|CGI-129|MPYCD|SLC54A1 mitochondrial pyruvate carrier 1 protein-coding 321.25-9 chr15 59186651 59187002 + 1.5 NA intron (NM_004998, intron 18 of 27) intron (NM_004998, intron 18 of 27) -15564 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 307.75-8 chr18 730201 730819 + 1.5 NA intron (NM_005433, intron 11 of 11) intron (NM_005433, intron 11 of 11) -17846 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 279-53 chr8 79458060 79458545 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 126114 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 366.5-24 chrX 62794489 62794914 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 556631 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 209.5-40 chr14 45369186 45369448 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116115 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 294.5-3 chr1 161130875 161131213 + 1.5 NA intron (NM_032998, intron 1 of 5) intron (NM_032998, intron 1 of 5) 1422 NM_001039712 9191 Hs.744092 NM_004216 ENSG00000158796 DEDD CASP8IP1|DEDD1|DEFT|FLDED1|KE05 death effector domain containing protein-coding 277.25-31 chr3 175422534 175422933 + 1.5 NA intron (NM_207015, intron 5 of 13) MER67C|LTR|ERV1 53193 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 242.5-43 chr2 34975525 34975852 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 298131 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 383.5-6 chr17 68683934 68684222 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 55924 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 166.5-178 chr6 121347828 121348080 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -13225 NM_001367759 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 326.75-5 chr14 46889640 46890010 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -238044 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 211.5-160 chr8 104538346 104538541 + 1.5 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 50581 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 357.25-8 chr2 77087815 77088394 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 102139 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 164-120 chr6 137278548 137278697 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59192 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 229.5-64 chr2 84880815 84881058 + 1.5 NA exon (NM_001277053, exon 1 of 7) exon (NM_001277053, exon 1 of 7) 148 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 202.5-63 chr18 60532513 60532719 + 1.5 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -159841 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 234-15 chr15 67318140 67318421 + 1.5 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) intron (NM_001322475, intron 3 of 17) -63082 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 331-17 chr2 119773058 119773408 + 1.5 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) intron (NM_002830, intron 1 of 26) 13311 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 401-6 chr18 3440309 3440776 + 1.5 NA intron (NM_001278686, intron 2 of 3) intron (NM_001278686, intron 2 of 3) -7000 NM_173207 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 330-15 chr2 200269466 200269791 + 1.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -36251 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 197.25-25 chr12 101684494 101684755 + 1.5 NA intron (NM_206821, intron 28 of 28) intron (NM_206821, intron 28 of 28) -13016 NM_020244 56994 Hs.293077 NM_020244 ENSG00000111666 CHPT1 CPT|CPT1 choline phosphotransferase 1 protein-coding 299.5-12 chr12 130295825 130296128 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -41911 NM_004764 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 134.5-39 chr11 61385311 61385433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6988 NM_001330285 51259 Hs.26745 NM_016499 ENSG00000187049 TMEM216 HSPC244 transmembrane protein 216 protein-coding 274.5-13 chr11 99946874 99947161 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 6 of 23) intron (NM_001243270, intron 6 of 23) 390872 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 276.75-54 chr9 99355322 99355757 + 1.5 NA non-coding (NR_102270, exon 10 of 10) non-coding (NR_102270, exon 10 of 10) 19718 NR_102270 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 237.75-3 chr1 176041756 176041924 + 1.5 NA intron (NM_022457, intron 14 of 19) AluSx4|SINE|Alu -73300 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 298.5-26 chr22 26001982 26002248 + 1.5 NA intron (NM_001318245, intron 40 of 43) intron (NM_001318245, intron 40 of 43) -167347 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 442.75 chr10 109280691 109281134 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 642334 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 205.25-12 chr11 99627283 99627577 + 1.5 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 71285 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 157-66 chr2 203859856 203860034 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7826 NM_005214 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 251.25-32 chr2 205578361 205578636 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 21 of 21) intron (NM_205863, intron 21 of 21) -104002 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 230.5-3 chr1 45197073 45197397 + 1.5 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) MER101|LTR|ERV1 9370 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 344.5-29 chr7 8060026 8060463 + 1.5 NA exon (NM_138426, exon 5 of 8) exon (NM_138426, exon 5 of 8) 91448 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 181-94 chr6 61686632 61686758 + 1.5 NA intron (NR_146874, intron 8 of 13) MIRb|SINE|MIR 112565 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 283-5 chr1 118336922 118337222 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -151844 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 162.25-53 chr15 33565351 33565575 + 1.5 NA intron (NM_001243996, intron 11 of 102) intron (NM_001243996, intron 11 of 102) 254496 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 242-9 chr10 76207163 76207442 + 1.5 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) L5|LINE|RTE-X 424541 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 135.75-206 chr8 136986899 136987034 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 426622 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 242.5-69 chr6 40771455 40771743 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -184235 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 220-11 chr10 88761057 88761236 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001102469) promoter-TSS (NM_001102469) -260 NM_001102469 643418 Hs.632091 NM_001102469 ENSG00000204020 LIPN ARCI8|LI4|LIPL4|bA186O14.3 lipase family member N protein-coding 345-16 chr8 24321857 24322376 + 1.5 NA intron (NR_130710, intron 8 of 22) L2|LINE|L2 28047 NR_130710 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 166-82 chr3 17853451 17853598 + 1.5 NA Intergenic Charlie13b|DNA|hAT-Charlie -109028 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 176.25-2 chr1 71301093 71301264 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 219854 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 173.5-30 chr11 60238694 60238923 + 1.5 NA intron (NM_001351235, intron 1 of 5) L1P4|LINE|L1 4329 NM_001351235 643680 Hs.559934 NM_001351235 MS4A4E - membrane spanning 4-domains A4E protein-coding 113.5-222 chr7 121958000 121958130 + 1.5 NA intron (NM_001206839, intron 2 of 28) L2|LINE|L2 84904 NM_001369395 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 304-31 chr7 94557877 94558142 + 1.5 NA TTS (NM_022900) TTS (NM_022900) 48200 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 244-28 chr2 169540486 169540794 + 1.5 NA intron (NM_024622, intron 9 of 14) MIR|SINE|MIR 30938 NM_006063 10324 Hs.50550 NM_006063 ENSG00000239474 KLHL41 KBTBD10|Krp1|SARCOSIN kelch like family member 41 protein-coding 368-7 chr2 98033026 98033457 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -37293 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 211-47 chr4 89274884 89275050 + 1.5 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) intron (NM_198281, intron 1 of 1) 32833 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 142.5-139 chr22 39838726 39838846 + 1.5 NA intron (NM_152512, intron 3 of 6) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 54974 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 294.5-18 chr18 9202499 9202787 + 1.5 NA intron (NM_001204056, intron 3 of 11) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 65080 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 253-4 chr10 19238680 19238892 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) L1MA6|LINE|L1 189985 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 273.5-62 chr5 78319944 78320347 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25390 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 208-62 chr4 75209542 75209775 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -124950 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 282.25-15 chr2 139251410 139251702 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 354232 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 152.75-114 chr3 186929003 186929132 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1459 NM_173216 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 517-4 chr14 49563593 49564114 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 22527 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 214-6 chr1 200198646 200198932 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155964 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 218-49 chr4 7860194 7860407 + 1.5 NA intron (NM_198595, intron 3 of 16) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 12008 NM_001371090 311-14 chr18 2644225 2644843 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10861 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 284.5-62 chr8 6244451 6244720 + 1.5 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 161963 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 248.25-10 chr11 35029722 35030007 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 88027 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 256-40 chr21 28640830 28641211 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 101702 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 143.5-39 chr12 9787091 9787284 + 1.5 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -12865 NR_159359 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 403.25-4 chr2 76635035 76635410 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -350743 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 192-85 chr5 10964557 10964774 + 1.5 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -203431 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 340-3 chr10 77134150 77134548 + 1.5 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) intron (NM_001271519, intron 5 of 28) -6482 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 408.5-8 chr4 53059541 53060104 + 1.5 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 197505 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 198.5-124 chr6 65183511 65183677 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L1MD|LINE|L1 -117824 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 361.5-30 chrX 83280216 83280576 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -227894 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 276.75-15 chr16 60949046 60949503 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 106492 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 178-57 chr22 22138695 22138830 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -94828 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 132-94 chr2 119041988 119042095 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 99872 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 193-96 chrX 88369729 88369934 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -377394 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 233.75-82 chr9 35291186 35291525 + 1.5 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) intron (NM_006377, intron 7 of 38) -50541 NM_001371188 204.75-96 chr5 125595769 125596003 + 1.5 NA intron (NR_109887, intron 3 of 3) intron (NR_109887, intron 3 of 3) 102625 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 138.5-72 chr16 62628481 62628640 + 1.5 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -592122 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 258.75-39 chr2 115169866 115170208 + 1.5 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 7882 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 163.25-116 chr5 74924629 74924798 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -57747 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 405.5-10 chr3 88880858 88881388 + 1.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -226498 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 132.5-214 chr6 57197240 57197422 + 1.5 NA intron (NM_001278667, intron 3 of 6) intron (NM_001278667, intron 3 of 6) 24130 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 356.25-6 chr17 65840833 65841289 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) L1MA4|LINE|L1 -14518 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 236.5-47 chr2 54498122 54498350 + 1.5 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) intron (NM_003128, intron 1 of 35) -30986 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 166-128 chr8 103267285 103267458 + 1.5 NA non-coding (NR_148214, exon 4 of 4) non-coding (NR_148214, exon 4 of 4) -31123 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 281.25-46 chr8 117156871 117157287 + 1.5 NA intron (NM_173851, intron 3 of 7) intron (NM_173851, intron 3 of 7) 22084 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 282.5-27 chr2 39389238 39389482 + 1.5 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) L1MEd|LINE|L1 47925 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 326-6 chr10 130078532 130078772 + 1.5 NA intron (NR_149170, intron 3 of 4) intron (NR_149170, intron 3 of 4) -27357 NR_044994 119437 Hs.620802 NR_044994 ENSG00000233122 CTAGE7P CTAGE7|CTAGEP|bA500G10.2|rcCTAGE5 CTAGE family member 7, pseudogene pseudo 166.25-38 chr12 9483026 9483261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28517 NR_153413 408186 NR_153413 OVOS - alpha-2-macroglobulin like 1 pseudogene pseudo 169.5-87 chr20 26196488 26196633 + 1.5 NA intron (NR_040095, intron 2 of 4) intron (NR_040095, intron 2 of 4) 11718 NR_030386 724033 NR_030386 ENSG00000284419 MIR663A MIR663|MIRN663|hsa-mir-663|hsa-mir-663a|mir-663a microRNA 663a ncRNA 342-6 chr11 85165383 85165729 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) LTR54B|LTR|ERV1 -242135 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 180.5-77 chr2 163716626 163716790 + 1.5 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 19300 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 311.5-27 chr5 67033455 67033903 + 1.5 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 29024 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 309-51 chr9 8226194 8226557 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -426597 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 224.5-21 chr10 91802373 91802579 + 1.5 NA intron (NM_025235, intron 1 of 26) L3|LINE|CR1 4050 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 202.5-5 chr1 102989741 102989983 + 1.5 NA intron (NM_001854, intron 28 of 66) intron (NM_001854, intron 28 of 66) 118634 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 364-12 chr3 113493810 113494289 + 1.5 NA exon (NM_144718, exon 5 of 18) exon (NM_144718, exon 5 of 18) 20795 NM_001331079 152185 Hs.477144 NM_144718 ENSG00000163611 SPICE1 CCDC52|SPICE spindle and centriole associated protein 1 protein-coding 288-50 chr9 133501263 133501666 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22365 NM_017585 11182 Hs.244378 NM_017585 ENSG00000160326 SLC2A6 GLUT6|GLUT9|HSA011372 solute carrier family 2 member 6 protein-coding 226.5-97 chr7 127269971 127270251 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -17170 NM_001371085 220.5-17 chr11 77987069 77987349 + 1.5 NA intron (NM_033547, intron 2 of 22) L1MC5|LINE|L1 7459 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 215.75-29 chr13 53870383 53870543 + 1.5 NA intron (NR_047488, intron 4 of 5) intron (NR_047488, intron 4 of 5) 55044 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 372.25-7 chr4 32760491 32761022 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 409718 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 457-3 chr18 2151662 2152164 + 1.5 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 419592 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 283.5-43 chr4 31577386 31577694 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70996 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 207-36 chr18 8795010 8795371 + 1.5 NA intron (NM_015210, intron 8 of 16) intron (NM_015210, intron 8 of 16) 77809 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 243.75-80 chr8 118545710 118546003 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -75145 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 295.5-55 chr6 108736382 108736645 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15141 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 267-21 chr18 24470863 24471283 + 1.5 NA intron (NM_021624, intron 2 of 2) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 10436 NM_021624 59340 Hs.287388 NM_021624 ENSG00000134489 HRH4 AXOR35|BG26|GPCR105|GPRv53|H4|H4R|HH4R histamine receptor H4 protein-coding 283-37 chr5 111386120 111386411 + 1.5 NA intron (NM_001744, intron 4 of 10) intron (NM_001744, intron 4 of 10) -125961 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 299-20 chr2 175205805 175206170 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -24277 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 227.5-7 chr1 224555756 224555968 + 1.5 NA intron (NR_136295, intron 2 of 7) ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 -60455 NM_001322305 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 172-12 chr1 217974497 217974799 + 1.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -68857 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 474.5-4 chr8 51067274 51067783 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 741917 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 142-86 chr2 102602143 102602350 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -17307 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 272.25-45 chr5 76311945 76312192 + 1.5 NA intron (NM_001297716, intron 12 of 12) intron (NM_001297716, intron 12 of 12) -91217 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 314.5-17 chr3 100987025 100987333 + 1.5 NA intron (NM_001349332, intron 1 of 35) intron (NM_001349332, intron 1 of 35) 6311 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 345.25-4 chr11 82622773 82623061 + 1.5 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 110947 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 189.5-135 chr7 84340947 84341175 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -146272 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 193.5-155 chr7 84623675 84623931 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91327 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 153.5-128 chr3 47114154 47114296 + 1.5 NA intron (NR_146158, intron 4 of 21) intron (NR_146158, intron 4 of 21) 49752 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 202.5-105 chr4 109503620 109503846 + 1.5 NA intron (NM_001300813, intron 7 of 24) L1M2|LINE|L1 15035 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 269-15 chr13 61108162 61108381 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91609 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 222.75-20 chr10 71028386 71028626 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 89453 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 300.75-29 chr2 158750502 158750724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15611 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 324.25-11 chr20 42866793 42867208 + 1.5 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) -101743 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 571.75 chr4 29279535 29280137 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 65544 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 252.5-29 chr14 84508584 84508798 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -763241 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 315.75-27 chr8 109917081 109917451 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 58505 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 297-38 chr5 68846531 68846776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 183274 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 233.5-111 chr8 129812305 129812498 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -25777 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 343.75-9 chr22 30746991 30747290 + 1.5 NA intron (NM_030758, intron 2 of 13) L1M4|LINE|L1 15583 NR_036171 100422912 NR_036171 ENSG00000264661 MIR3200 mir-3200 microRNA 3200 ncRNA 365.5-13 chr4 30344969 30345266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -375252 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 399-4 chr3 50836862 50837199 + 1.5 NA intron (NM_004947, intron 2 of 52) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 161950 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 228.5-80 chr5 9120399 9120640 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 14 of 22) intron (NM_003966, intron 14 of 22) -66624 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 259.25-32 chr4 77188907 77189095 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 31794 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 140.25-61 chr16 47868654 47868795 + 1.5 NA intron (NR_110650, intron 2 of 5) intron (NR_110650, intron 2 of 5) 10143 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 336-27 chr8 68324071 68324498 + 1.5 NA intron (NR_038877, intron 1 of 2) intron (NR_038877, intron 1 of 2) -6089 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 244.5-12 chr10 14800161 14800418 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -25392 NM_001282695 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 124.5-61 chr14 53110328 53110490 + 1.5 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 42914 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 276.75-53 chr9 72319220 72319692 + 1.5 NA intron (NR_110952, intron 2 of 4) intron (NR_110952, intron 2 of 4) 14020 NR_110953 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 277.25-28 chr3 84482330 84482585 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 387118 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 227-7 chr11 34212703 34212935 + 1.5 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 107190 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 228.5-14 chr10 25382395 25382647 + 1.5 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -206245 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 175-123 chr7 94962138 94962312 + 1.5 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 52327 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 217-71 chr5 130892761 130892960 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 272396 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 188.5-109 chr4 36276560 36276710 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -4981 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 204-42 chr20 42864730 42864924 + 1.5 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) -103916 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 246.5-55 chr3 111864084 111864477 + 1.5 NA intron (NM_001134439, intron 1 of 17) intron (NM_001134439, intron 1 of 17) 4453 NM_001134439 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 228.5-39 chr15 70119891 70120121 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22089 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 235-62 chr6 43166466 43166766 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4653 NM_003131 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 388.25-6 chr5 97865696 97866043 + 1.5 NA intron (NR_146299, intron 1 of 2) intron (NR_146299, intron 1 of 2) 25111 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 198.25-32 chr14 61022639 61022934 + 1.5 NA intron (NR_033344, intron 5 of 16) intron (NR_033344, intron 5 of 16) -41096 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 129.5-24 chr10 82603754 82603913 + 1.5 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -370913 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 230-9 chr10 68410870 68411084 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -3683 NM_001278225 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 312.75-28 chr5 43802572 43802963 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -199537 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 235.25-30 chr18 59448282 59448438 + 1.5 NA intron (NM_133459, intron 6 of 10) intron (NM_133459, intron 6 of 10) -89095 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 304-30 chr7 7615657 7616011 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24918 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 319.75-3 chr10 90779153 90779693 + 1.5 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) intron (NM_019860, intron 1 of 2) 78616 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 198-23 chr14 48826165 48826383 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 760106 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 252-65 chr7 52145307 52145587 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -752191 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 174.5-111 chr20 58909961 58910315 + 1.5 NA intron (NM_080425, intron 11 of 12) intron (NM_080425, intron 11 of 12) 17975 NR_132272 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 286.5-36 chr2 69799565 69799779 + 1.5 NA intron (NM_001320700, intron 3 of 12) intron (NM_001320700, intron 3 of 12) -29988 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 227.25-81 chr8 105660294 105660716 + 1.5 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 340962 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 277.5-39 chr21 26225914 26226146 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54902 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 250.5-32 chr15 39999821 40000037 + 1.5 NA intron (NM_001013703, intron 20 of 38) intron (NM_001013703, intron 20 of 38) 39252 NM_003134 6727 Hs.533732 NM_003134 ENSG00000140319 SRP14 ALURBP signal recognition particle 14 protein-coding 271.5-16 chr12 24753162 24753503 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 148890 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 204.75-74 chr3 53528282 53528590 + 1.5 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) L1M5|LINE|L1 33825 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 346.25-16 chr7 30032918 30033212 + 1.5 NA intron (NM_001363473, intron 1 of 12) intron (NM_001363473, intron 1 of 12) 4653 NM_001350973 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 228-7 chr10 15958890 15959211 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98517 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 270.75-9 chr11 11987268 11987712 + 1.5 NA intron (NM_015881, intron 4 of 7) MER117|DNA|hAT-Charlie 21149 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 272.5-3 chr1 85757947 85758296 + 1.5 NA intron (NR_146345, intron 55 of 59) intron (NR_146345, intron 55 of 59) -49688 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 258-29 chr20 12074462 12074762 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 156719 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 233.25-38 chr2 213716349 213716687 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -41549 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 219.25-22 chr13 60326572 60326780 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -58572 NR_047022 100874169 Hs.171027 NR_047022 LINC00434 - long intergenic non-protein coding RNA 434 ncRNA 331.25-11 chr21 27489810 27490236 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -232356 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 239.75-80 chrX 151545701 151546014 + 1.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -17818 NM_173493 139135 Hs.160594 NM_173493 ENSG00000166049 PASD1 CT63|CT64|OXTES1 PAS domain containing repressor 1 protein-coding 197.25-51 chr2 103785452 103785642 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 622785 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 386-9 chr2 79199358 79199949 + 1.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -39900 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 288 chr1 167376939 167377179 + 1.5 NA intron (NM_001198783, intron 7 of 15) L2c|LINE|L2 47989 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 271.5-90 chr8 127831188 127831422 + 1.5 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 35343 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 170.5-94 chr2 89842883 89843124 + 1.5 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -205096 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 204.75-59 chr2 33896709 33897030 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu -168652 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 332-4 chr12 19250144 19250696 + 1.5 NA intron (NM_001256787, intron 1 of 25) AluSq2|SINE|Alu 45095 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 261.5-48 chr4 63726641 63726934 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 682663 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 224-52 chr6 138427889 138428110 + 1.5 NA intron (NM_020464, intron 6 of 6) intron (NM_020464, intron 6 of 6) 7295 NR_036099 100423001 NR_036099 ENSG00000266555 MIR3145 mir-3145 microRNA 3145 ncRNA 162-13 chr10 53842392 53842698 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 29 of 34) AluSz|SINE|Alu -643685 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 345.25-16 chr3 134273427 134273785 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22862 NM_001005861 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 198-42 chr2 135142652 135142885 + 1.5 NA intron (NM_001172435, intron 17 of 24) L1ME3|LINE|L1 6140 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 294.75-35 chr6 66647134 66647356 + 1.5 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 859366 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 161-72 chr21 26923614 26923797 + 1.5 NA 3' UTR (NM_007038, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_007038, exon 8 of 8) -30256 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 162.25-33 chr12 15107619 15107924 + 1.5 NA TTS (NM_001190726) TTS (NM_001190726) -44152 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 268.5-37 chr3 34137798 34138177 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 339357 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 288-38 chr5 24575935 24576212 + 1.5 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) intron (NM_001362460, intron 2 of 9) 68905 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 265.5-14 chr11 82649838 82650313 + 1.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 83789 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 206-32 chr16 17171609 17171810 + 1.5 NA intron (NM_022166, intron 5 of 11) intron (NM_022166, intron 5 of 11) 37205 NR_135179 102723692 Hs.737758 NR_135179 ENSG00000261448 LOC102723692 - uncharacterized LOC102723692 ncRNA 223.5-129 chr8 112897759 112898009 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 254391 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 296-31 chr3 192356696 192357027 + 1.5 NA intron (NM_004113, intron 3 of 5) intron (NM_004113, intron 3 of 5) 52188 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 160.25-150 chr7 47745344 47745709 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15950 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 346.5-9 chr14 63213247 63213617 + 1.5 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 8989 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 186-87 chr7 54119043 54119266 + 1.5 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -211543 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 302-8 chr12 27425360 27425649 + 1.5 NA 3' UTR (NM_020183, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_020183, exon 17 of 17) 21130 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 137.75-197 chr7 50741126 50741276 + 1.5 NA intron (NM_001371008, intron 1 of 15) intron (NM_001371008, intron 1 of 15) -8848 NM_001001549 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 257-4 chr1 180749831 180750158 + 1.5 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) intron (NR_137330, intron 2 of 12) 117972 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 173.5-129 chr5 67898328 67898510 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105206 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 478.5-5 chrX 100445054 100445413 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34960 NM_001105243 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 140.5-97 chr2 4859542 4859689 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -203393 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 166-105 chr5 174452167 174452354 + 1.5 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) L1MA5|LINE|L1 115906 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 204-30 chr2 26426895 26427070 + 1.5 NA intron (NM_145038, intron 4 of 16) L1MB2|LINE|L1 25062 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 317.25-18 chr2 121151162 121151525 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 133859 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 181.5-38 chr13 85248338 85248537 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100380 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 251.5-53 chr3 86920028 86920311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70980 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 166-90 chr4 66054530 66054707 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -222206 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 294.5-39 chr4 175974259 175974627 + 1.5 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 28248 NM_001261447 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 315.5-24 chr6 136329803 136330099 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40100 NM_001077440 9774 Hs.486542 NM_014739 ENSG00000029363 BCLAF1 BTF|bK211L9.1 BCL2 associated transcription factor 1 protein-coding 214-13 chr11 132795531 132795788 + 1.5 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 147978 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 301.75-34 chr7 24692348 24692795 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001303037, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001303037, exon 12 of 12) 64893 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 325.75-11 chr2 33591621 33592129 + 1.5 NA intron (NM_015475, intron 3 of 7) intron (NM_015475, intron 3 of 7) 7424 NM_015475 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 198.25-60 chr2 149830571 149830823 + 1.5 NA intron (NR_145421, intron 2 of 4) L1MCa|LINE|L1 28494 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 342.75-13 chr2 228638247 228638669 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27063 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 280.5-15 chr15 76448820 76449184 + 1.5 NA intron (NR_148227, intron 25 of 32) intron (NR_148227, intron 25 of 32) 112229 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 174-23 chr12 118447120 118447267 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 70638 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 290-29 chr20 7051381 7051681 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 202671 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 226.5-39 chr2 26142366 26142630 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -30590 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 366.5-9 chr2 225793114 225793458 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -349508 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 368.75-6 chr18 6767849 6768184 + 1.5 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) L1MEf|LINE|L1 -38154 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 224-40 chr4 148831376 148831854 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 110763 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 215.75-46 chr17 77359451 77359750 + 1.5 NA intron (NM_006640, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu -13737 NM_001113493 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 396.5-8 chr6 147653098 147653492 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 144605 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 379.5-6 chr12 39451925 39452369 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9027 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 255.75-51 chr8 78387307 78387626 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -128874 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 170.25-24 chr12 12040116 12040436 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -9585 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 182.5-175 chr9 68515389 68515572 + 1.5 NA intron (NM_021965, intron 10 of 10) intron (NM_021965, intron 10 of 10) 25387 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 379.5-15 chr4 73588280 73588746 + 1.5 NA intron (NM_001270391, intron 4 of 9) intron (NM_001270391, intron 4 of 9) 31923 NM_177532 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 297-18 chr15 55328631 55328943 + 1.5 NA intron (NM_004855, intron 4 of 11) AluSg|SINE|Alu 9565 NM_004855 9488 Hs.612814 NM_004855 ENSG00000069943 PIGB GPI-MT-III|PIG-B phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class B protein-coding 221-71 chr6 130451742 130452014 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 14761 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 190-47 chr3 176190854 176191117 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -53566 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 440.5-2 chr1 113872773 113873272 + 1.5 NA intron (NR_037864, intron 3 of 4) intron (NR_037864, intron 3 of 4) -1263 NM_012411 26191 Hs.535276 NM_012411 ENSG00000134242 PTPN22 LYP|LYP1|LYP2|PEP|PTPN22.5|PTPN22.6|PTPN8 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22 protein-coding 280-4 chr1 115621728 115622025 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20094 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 207.75-96 chr5 9247675 9247888 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) intron (NM_003966, intron 5 of 22) -193886 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 225.75-12 chr10 31709728 31709985 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 199070 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 212-44 chr2 199868817 199869075 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17773 NM_001350853 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 284-16 chr17 59858134 59858602 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 17102 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 125.25-54 chr13 56121080 56121287 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 946729 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 243-53 chr4 70321613 70321784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13283 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 257-17 chr15 60785179 60785424 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 103732 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 316-30 chr8 67920010 67920444 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31819 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 184-102 chr9 36104101 36104239 + 1.5 NA intron (NM_021111, intron 12 of 20) intron (NM_021111, intron 12 of 20) -32366 NR_104640 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 209.25-32 chr15 62161583 62161819 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 3584 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 286.5-42 chr3 79312413 79312631 + 1.5 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -99205 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 259-34 chr5 4166029 4166243 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 570304 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 197.25-69 chr3 25855040 25855203 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 18574 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 422-4 chr14 48728003 48728823 + 1.5 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X 857967 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 364-5 chr12 110768437 110768710 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -25682 NM_002710 5501 Hs.79081 NM_002710 ENSG00000186298 PPP1CC PP-1G|PP1C|PPP1G protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma protein-coding 281.25-12 chr12 9271549 9271838 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11964 NR_024374 642846 Hs.447869 NR_024374 LOC642846 - DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11-like ncRNA 237.75-23 chr16 35570709 35570906 + 1.5 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -63637 NR_034018 100130700 Hs.97712 NR_034018 TP53TG3HP - TP53 target 3 family member H, pseudogene pseudo 228-8 chr10 19128692 19129016 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 8 of 39) intron (NM_001142308, intron 8 of 39) 80053 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 458.75 chr17 65241596 65242069 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 104462 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 377-2 chr12 41481175 41481634 + 1.5 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 43665 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 319.75-13 chr2 196143451 196143891 + 1.5 NA exon (NM_004226, exon 5 of 8) exon (NM_004226, exon 5 of 8) 27907 NM_004226 9262 Hs.88297 NM_004226 ENSG00000081320 STK17B DRAK2 serine/threonine kinase 17b protein-coding 233.25-11 chr11 29108250 29108519 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -486029 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 309.5-4 chr1 211435367 211435641 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 52749 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 336-6 chr14 27910211 27910648 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -237208 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 169-89 chr6 75637491 75637672 + 1.5 NA intron (NM_001100409, intron 5 of 22) intron (NM_001100409, intron 5 of 22) 35701 NM_001100409 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 290.25-8 chr11 92594555 92594843 + 1.5 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 242603 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 134.5-15 chr1 200391042 200391218 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17338 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 149.5-47 chr12 27823954 27824090 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 43789 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 403.25-11 chr7 14346114 14346506 + 1.5 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -354885 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 362.25-4 chr18 45542369 45542849 + 1.5 NA intron (NM_001371319, intron 5 of 23) intron (NM_001371319, intron 5 of 23) -35573 NR_110899 101927980 Hs.591058 NR_110899 SLC14A2-AS1 - SLC14A2 antisense RNA 1 ncRNA 251.5-77 chr7 31687778 31687954 + 1.5 NA intron (NM_001145123, intron 1 of 3) intron (NM_001145123, intron 1 of 3) 651 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 273-57 chr8 132728541 132728900 + 1.5 NA intron (NM_144649, intron 5 of 9) intron (NM_144649, intron 5 of 9) 31862 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 189-40 chr15 82088459 82088610 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_120367) promoter-TSS (NR_120367) -60 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 395.5-3 chr12 20699881 20700230 + 1.5 NA intron (NM_017435, intron 2 of 14) intron (NM_017435, intron 2 of 14) 4590 NM_001145944 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 361.5-7 chr14 29730738 29731144 + 1.5 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) L1MA8|LINE|L1 196155 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 230-75 chrX 75662965 75663243 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 79975 NR_030737 286495 Hs.567832 NR_030737 TTC3P1 RNF105L|TTC3L tetratricopeptide repeat domain 3 pseudogene 1 pseudo 281-11 chr15 71886740 71887278 + 1.5 NA intron (NM_006901, intron 27 of 41) intron (NM_006901, intron 27 of 41) 76455 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 203.5-34 chr12 59536829 59537222 + 1.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -59004 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 167.5-166 chr6 75393010 75393175 + 1.5 NA intron (NR_125859, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 9906 NR_125859 101928540 Hs.526972 NR_125859 LOC101928540 - uncharacterized LOC101928540 ncRNA 359.25 chr1 191540268 191540743 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -312007 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 356.25-18 chr7 49779787 49780204 + 1.5 NA intron (NR_136188, intron 1 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 4662 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 336.5-7 chr11 67477775 67478117 + 1.5 NA Intergenic SVA_D|Retroposon|SVA -5080 NM_003977 9049 Hs.412433 NM_003977 ENSG00000110711 AIP ARA9|FKBP16|FKBP37|PITA1|SMTPHN|XAP-2|XAP2 aryl hydrocarbon receptor interacting protein protein-coding 209.25-110 chr7 139632769 139632974 + 1.5 NA intron (NM_001113239, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 109186 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 146-54 chr17 59281970 59282103 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49619 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 176-18 chr12 55326354 55326479 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -5285 NM_054104 254786 Hs.553653 NM_054104 ENSG00000205329 OR6C3 OST709 olfactory receptor family 6 subfamily C member 3 protein-coding 207-75 chr6 150321886 150322043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47048 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 450 chr11 8985911 8986290 + 1.5 NA intron (NM_020645, intron 3 of 6) intron (NM_020645, intron 3 of 6) 17901 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 713.5 chr7 97674604 97675270 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -57149 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 345-9 chr14 57701975 57702316 + 1.5 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) MER65A|LTR|ERV1 162854 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 721.5 chr10 63915437 63916308 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -393982 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 261.75-6 chr11 31353710 31353954 + 1.5 NA intron (NM_181807, intron 1 of 8) intron (NM_181807, intron 1 of 8) 15907 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 313.5-15 chr16 17883438 17883684 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -412601 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 272.25-39 chr3 185241050 185241458 + 1.5 NA intron (NM_001966, intron 2 of 6) L1PB1|LINE|L1 12018 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 311-26 chr6 144878917 144879276 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 473441 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 229.5-110 chr5 123910759 123911075 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 365500 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 283.5-35 chr21 28583482 28583718 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 44282 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 199-39 chr2 109445047 109445332 + 1.5 NA intron (NM_001099289, intron 7 of 9) L1MEi|LINE|L1 -131564 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 158.75-97 chr2 229061240 229061496 + 1.5 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) L1MA7|LINE|L1 170724 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 368.25-11 chr2 35465502 35465940 + 1.5 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL -5684 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 207-8 chr1 246263717 246263907 + 1.5 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 153600 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 368-3 chr14 22296459 22296828 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 136110 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 220.5-74 chr3 56258726 56259000 + 1.5 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 209604 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 300.75-18 chr16 11896377 11896761 + 1.5 NA exon (NM_001130006, exon 4 of 15) exon (NM_001130006, exon 4 of 15) 19387 NM_001130006 2935 Hs.528780 NM_002094 ENSG00000103342 GSPT1 551G9.2|ETF3A|GST1|eRF3a G1 to S phase transition 1 protein-coding 295-20 chr2 120938745 120938972 + 1.5 NA intron (NM_005270, intron 3 of 13) intron (NM_005270, intron 3 of 13) 146577 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 254.75-38 chr4 31748731 31749078 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 242360 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 250.5-66 chr4 53221225 53221671 + 1.5 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 144613 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 245.5-44 chr3 32709531 32709801 + 1.5 NA intron (NR_046352, intron 3 of 16) intron (NR_046352, intron 3 of 16) 14125 NM_001256742 25904 Hs.444851 NM_015442 ENSG00000182973 CNOT10 - CCR4-NOT transcription complex subunit 10 protein-coding 201.5-38 chr12 10457003 10457207 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -2420 NM_001304448 3821 Hs.512576 NM_002259 ENSG00000134545 KLRC1 CD159A|NKG2|NKG2A killer cell lectin like receptor C1 protein-coding 251-57 chr8 65773917 65774208 + 1.5 NA intron (NM_001242318, intron 3 of 12) L1ME4b|LINE|L1 14995 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 178.25-60 chr2 20525036 20525350 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23669 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 217-75 chr6 119031874 119032038 + 1.5 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) 37187 NR_030315 693128 NR_030315 ENSG00000207982 MIR548B MIRN548B microRNA 548b ncRNA 256.75-3 chr1 232514859 232515226 + 1.5 NA exon (NM_020808, exon 1 of 21) exon (NM_020808, exon 1 of 21) 566 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 120.75-109 chr3 100754194 100754290 + 1.5 NA intron (NM_001349332, intron 32 of 35) intron (NM_001349332, intron 32 of 35) 44700 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 169.5-111 chr3 76315025 76315174 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -529550 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 222.5-110 chr8 99906365 99906651 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -12801 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 203-95 chr7 86055547 86055802 + 1.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -588235 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 321.25-16 chr20 55265904 55266333 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -156925 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 248.25-29 chr18 13486141 13486437 + 1.5 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 26342 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 382.5-3 chr1 205427894 205428181 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5981 NM_001199051 93273 Hs.655520 NM_001001552 ENSG00000186007 LEMD1 CT50|LEMP-1 LEM domain containing 1 protein-coding 319.5-38 chr7 92022945 92023354 + 1.5 NA intron (NM_147185, intron 14 of 49) intron (NM_147185, intron 14 of 49) 82274 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 293.25-39 chr8 129321653 129322109 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80641 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 135-118 chr3 197204323 197204445 + 1.5 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) -20253 NM_001204387 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 323-3 chr1 214852302 214852711 + 1.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -153036 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 504-3 chr20 10065032 10065622 + 1.5 NA intron (NR_040710, intron 3 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 30340 NM_001303472 63926 Hs.70903 NM_022096 ENSG00000132623 ANKEF1 ANKRD5 ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 protein-coding 279-19 chr2 104038546 104039051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 369534 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 292.5-32 chr2 82402230 82402605 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -454386 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 122.75-200 chr8 87559701 87559870 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 314230 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 137-166 chr7 106132458 106132625 + 1.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -19965 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 344.5-9 chr17 65890734 65891062 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) LTR86B2|LTR|ERVL -64355 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 223-37 chr19 45642162 45642398 + 1.5 NA non-coding (NR_147902, exon 2 of 21) non-coding (NR_147902, exon 2 of 21) 786 NR_130729 100287177 Hs.668611 NM_001242348 ENSG00000267757 EML2-AS1 C19orf83 EML2 antisense RNA 1 ncRNA 206.5-106 chr6 52501936 52502153 + 1.5 NA 3' UTR (NM_012288, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_012288, exon 11 of 11) 75016 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 158-143 chr8 121687235 121687385 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45870 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 154.5-118 chr21 27746815 27747032 + 1.5 NA intron (NR_024357, intron 3 of 3) (TATATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24544 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 215.25-44 chr2 29498201 29498397 + 1.5 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) -22922 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 207.75-36 chr14 84876393 84876538 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -395467 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 432-9 chr20 10187219 10187669 + 1.5 NA intron (NR_040710, intron 2 of 4) intron (NR_040710, intron 2 of 4) -31354 NM_130811 6616 Hs.167317 NM_003081 ENSG00000132639 SNAP25 CMS18|RIC-4|RIC4|SEC9|SNAP|SNAP-25|SUP|bA416N4.2|dJ1068F16.2 synaptosome associated protein 25 protein-coding 276-35 chr4 123108305 123108715 + 1.5 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) intron (NM_001345856, intron 14 of 15) 185432 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 271.5-40 chr2 141954854 141955200 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) L1M5|LINE|L1 176674 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 275-40 chr7 40599963 40600262 + 1.5 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 379827 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 378-15 chr4 81759624 81759956 + 1.5 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -287883 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 447.5-9 chr9 101591393 101591728 + 1.5 NA TTS (NM_147180) TTS (NM_147180) 3409 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 313-3 chr11 58475363 58475809 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 32519 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 238.5-63 chr5 15925052 15925260 + 1.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -10026 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 357.75-6 chr16 58113261 58113552 + 1.5 NA TTS (NR_136632) TTS (NR_136632) 15975 NM_013242 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 225-3 chr1 167891892 167892140 + 1.5 NA intron (NM_018417, intron 8 of 32) AluSz6|SINE|Alu 22118 NM_001167749 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 224.25-48 chr2 213886045 213886249 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 10 of 14) MER39B|LTR|ERV1 128080 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 631.75 chr4 78409713 78410752 + 1.5 NA intron (NM_001166133, intron 31 of 41) intron (NM_001166133, intron 31 of 41) 121247 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 384-19 chr7 110114978 110115296 + 1.5 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -154924 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 358.5-2 chr1 231340602 231340918 + 1.5 NA intron (NM_001261462, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 2467 NM_032018 83932 Hs.554892 NM_032018 ENSG00000010072 SPRTN C1orf124|DVC1|PRO4323|spartan SprT-like N-terminal domain protein-coding 138-156 chr7 113891905 113892025 + 1.5 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 27044 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 141-82 chr2 144627433 144627562 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40470 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 186.5-87 chr3 7321197 7321587 + 1.5 NA intron (NM_000844, intron 4 of 9) intron (NM_000844, intron 4 of 9) 213892 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 302-2 chr1 160252054 160252532 + 1.5 NA intron (NR_028104, intron 1 of 12) intron (NR_028104, intron 1 of 12) -9456 NR_147618 100287049 Hs.657648 NR_147618 ENSG00000228606 LOC100287049 - uncharacterized LOC100287049 ncRNA 174.5-60 chr14 48387865 48388029 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -592933 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 357-16 chr7 17805665 17805968 + 1.5 NA intron (NR_146933, intron 20 of 25) intron (NR_146933, intron 20 of 25) 134678 NM_001350867 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 293.25-40 chr9 71856312 71856567 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54806 NM_016014 51104 Hs.380389 NM_016014 ENSG00000107362 ABHD17B C9orf77|CGI-67|FAM108B1 abhydrolase domain containing 17B protein-coding 444.25-3 chr8 83171048 83171641 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -232414 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 275.5-54 chr5 112271141 112271515 + 1.5 NA intron (NM_001347887, intron 4 of 23) L3|LINE|CR1 43045 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 446.5-8 chr7 36753228 36753556 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -28843 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 487-8 chr9 26821579 26822305 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 70860 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 173-152 chrX 49752467 49752705 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56602 NM_003785 8712 Hs.128231 NM_003785 ENSG00000068985 PAGE1 AL5|CT16.3|GAGE-9|GAGEB1|PAGE-1 PAGE family member 1 protein-coding 257-26 chr2 122466403 122466709 + 1.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 606925 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 284.5-26 chr18 22794176 22794388 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -7445 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 210.5-116 chr6 157935832 157936081 + 1.5 NA intron (NM_016224, intron 13 of 17) intron (NM_016224, intron 13 of 17) -45907 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 241.5-100 chr8 133140865 133141170 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38415 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 239.25-43 chr19 3854767 3855020 + 1.5 NA intron (NM_001145640, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 14145 NM_015174 23217 Hs.65750 NM_015174 ENSG00000105278 ZFR2 KIAA1086 zinc finger RNA binding protein 2 protein-coding 134.75-15 chr1 172223731 172224035 + 1.5 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) intron (NR_146559, intron 15 of 20) -79048 NR_103486 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 213-83 chr6 138928517 138928722 + 1.5 NA intron (NM_031922, intron 9 of 19) intron (NM_031922, intron 9 of 19) 59642 NM_001128617 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 316.5-30 chr4 81354501 81354871 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 117221 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 284.5-54 chr6 98544204 98544482 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 287357 NR_148381 105447646 Hs.211213 NR_148381 PNKY - long intergenic non-protein coding RNA PNKY ncRNA 198.75-27 chr14 78912927 78913171 + 1.5 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) L2a|LINE|L2 -286933 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 393-3 chr14 26877938 26878449 + 1.5 NA intron (NR_110041, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu 5060 NR_110041 101927081 Hs.97955 NR_110041 ENSG00000257612 MIR4307HG - MIR4307 host gene ncRNA 347.25-21 chr6 41328263 41328731 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7111 NM_004828 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 270-46 chr6 27344982 27345306 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 20383 NR_045612 387316 Hs.326753 NM_032030 VN1R10P FKSG83|VNR6I1P|b24o18.2|hs6V1-1p vomeronasal 1 receptor 10 pseudogene pseudo 343.5-13 chr2 26810225 26810549 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 24331 NM_001809 1058 Hs.1594 NM_001809 ENSG00000115163 CENPA CENP-A|CenH3 centromere protein A protein-coding 403-3 chr15 59176086 59176676 + 1.5 NA intron (NM_004998, intron 19 of 27) intron (NM_004998, intron 19 of 27) -5119 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 178.25-25 chr12 59811271 59811447 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 121989 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 178.5-95 chr20 37816691 37816903 + 1.5 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -86330 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 173-129 chr7 376010 376182 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3329 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 321.75-12 chr17 41475725 41475993 + 1.5 NA TTS (NM_002280) TTS (NM_002280) 5281 NM_002280 3886 Hs.73082 NM_002280 ENSG00000197079 KRT35 HA5|Ha-5|K35|KRTHA5|hHa5 keratin 35 protein-coding 297-30 chr2 221550923 221551196 + 1.5 NA intron (NM_001363748, intron 3 of 17) L1MD|LINE|L1 21245 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 256.25-55 chr9 86652861 86653199 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 294476 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 319-28 chr4 102996039 102996316 + 1.5 NA intron (NR_047515, intron 1 of 10) L1MEg|LINE|L1 23528 NR_047513 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 200.5-30 chr12 132199849 132200047 + 1.5 NA intron (NM_001122636, intron 8 of 10) intron (NM_001122636, intron 8 of 10) 6080 NM_021808 50614 Hs.301062 NM_021808 ENSG00000182870 GALNT9 GALNAC-T9|GALNACT9 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 protein-coding 280-33 chr20 35843668 35843966 + 1.5 NA intron (NM_016436, intron 3 of 17) AluJb|SINE|Alu 71802 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 272.5-38 chr2 213826762 213826989 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) L1MA3|LINE|L1 68808 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 271.5-23 chr14 84444363 84444617 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -827442 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 216.5-126 chr8 134815936 134816261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11153 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 241-21 chr17 64508016 64508281 + 1.5 NA intron (NM_138363, intron 1 of 19) intron (NM_138363, intron 1 of 19) 1171 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 305.25-34 chr3 124129815 124130124 + 1.5 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) -2960 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 248-22 chr14 57609956 57610171 + 1.5 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -116206 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 172-44 chr17 56354354 56354538 + 1.5 NA intron (NM_001370326, intron 6 of 20) L2a|LINE|L2 200971 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 396.25-14 chr6 54875726 54876200 + 1.5 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 29192 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 402.5-5 chr2 215484093 215484433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 30556 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 118.5-123 chr3 17728246 17728346 + 1.5 NA intron (NM_001349076, intron 1 of 22) L1M5|LINE|L1 12611 NM_014744 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 259-30 chr3 139184143 139184376 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49263 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 190.5-54 chr15 95344369 95344609 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17389 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 383.5 chr1 206964833 206965237 + 1.5 NA intron (NM_001122979, intron 5 of 7) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 5425 NM_001122979 83953 Hs.145519 NM_032029 ENSG00000162897 FCAMR CD351|FCA/MR|FKSG87 Fc fragment of IgA and IgM receptor protein-coding 395.25-2 chr17 51851173 51851584 + 1.5 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) MIR|SINE|MIR 307336 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 353.25-2 chr10 21720939 21721274 + 1.5 NA intron (NM_001195626, intron 14 of 22) intron (NM_001195626, intron 14 of 22) 186934 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 172-4 chr1 40686637 40686772 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5000 NM_014223 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 321-21 chr4 71253460 71253745 + 1.5 NA intron (NM_001098484, intron 2 of 25) intron (NM_001098484, intron 2 of 25) 66316 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 176.5-180 chr8 134191402 134191627 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 305018 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 264.75-42 chr5 44967475 44967721 + 1.5 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 158651 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 170.25-11 chr10 55086417 55086563 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -285199 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 383-15 chr6 166691030 166691424 + 1.5 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -63976 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 382.5-10 chr16 10061661 10062120 + 1.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 120177 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 356.25-10 chr2 235743144 235743607 + 1.5 NA intron (NM_001037131, intron 4 of 17) intron (NM_001037131, intron 4 of 17) -225454 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 325.5-3 chr1 105609949 105610268 + 1.5 NA intron (NR_125955, intron 1 of 3) intron (NR_125955, intron 1 of 3) 8827 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 244.75-2 chr1 99805988 99806198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39458 NM_001361041 391059 Hs.454779 NM_001013660 ENSG00000156869 FRRS1 SDFR2|SDR2 ferric chelate reductase 1 protein-coding 291.25-12 chr2 36693846 36694230 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2652 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 116.25-23 chr10 99543168 99543271 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 10277 NM_145285 159296 Hs.243272 NM_145285 ENSG00000119919 NKX2-3 CSX3|NK2.3|NKX2.3|NKX2C|NKX4-3 NK2 homeobox 3 protein-coding 300-30 chr4 74921363 74921603 + 1.5 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -11633 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 425.25-3 chr15 66769112 66769581 + 1.5 NA intron (NR_027654, intron 4 of 4) MER45A|DNA|hAT-Tip100 67110 NM_005585 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 456.5-4 chr12 26275885 26276358 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 80548 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 218.75-31 chr2 8559689 8560168 + 1.5 NA TTS (NR_110257) TTS (NR_110257) 23864 NR_110257 101929567 Hs.634706 NR_110257 ENSG00000236008 LINC01814 - long intergenic non-protein coding RNA 1814 ncRNA 166-63 chr2 102273312 102273464 + 1.5 NA Intergenic Charlie14a|DNA|hAT-Charlie -38114 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 179-46 chr17 70676061 70676241 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 506616 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 262.5-60 chr5 13569416 13569687 + 1.5 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 374929 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 317.5-27 chr6 132676001 132676273 + 1.5 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -30111 NM_138327 134864 Hs.375030 NM_138327 ENSG00000146399 TAAR1 TA1|TAR1|TRAR1 trace amine associated receptor 1 protein-coding 284.25-9 chr12 28537421 28537636 + 1.5 NA intron (NM_001352082, intron 13 of 13) intron (NM_001352082, intron 13 of 13) -346790 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 268.5-52 chr6 15714434 15714732 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -51525 NM_001271667 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 164-84 chr3 152148003 152148158 + 1.5 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 57349 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 226.5-56 chr22 35302051 35302249 + 1.5 NA intron (NR_156428, intron 1 of 13) intron (NR_156428, intron 1 of 13) 2256 NM_005488 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 395.5-17 chr6 141139565 141140033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 455985 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 398.25-11 chr8 68840143 68840489 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 263874 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 211.75-47 chr2 117230276 117230537 + 1.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -584285 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 300.5-48 chr7 84102810 84103112 + 1.5 NA intron (NM_006080, intron 4 of 16) intron (NM_006080, intron 4 of 16) 91828 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 314.5-27 chr8 84498030 84498404 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 82733 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 218.75-5 chr1 237966513 237966748 + 1.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -75708 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 251.25-24 chr18 42308045 42308275 + 1.5 NA intron (NR_046457, intron 4 of 6) intron (NR_046457, intron 4 of 6) 121492 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 153.5-198 chr8 85303809 85303981 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 37819 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 160-35 chr14 65411482 65411660 + 1.5 NA non-coding (NR_038167, exon 1 of 9) non-coding (NR_038167, exon 1 of 9) 979 NR_038167 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 199-83 chr8 87689929 87690150 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 183976 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 223-12 chr11 82711685 82711951 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22046 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 243.25 chr1 226112919 226113142 + 1.5 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 29455 NR_146920 105373113 Hs.149726 NR_146920 LINC01703 lncPARP1 long intergenic non-protein coding RNA 1703 ncRNA 287.25-39 chr5 38428344 38428670 + 1.5 NA intron (NM_182798, intron 9 of 16) intron (NM_182798, intron 9 of 16) -17039 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 179-78 chr5 33078496 33078658 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 131134 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 323.75-3 chr1 69799028 69799573 + 1.5 NA intron (NM_001370785, intron 4 of 26) L1PB4|LINE|L1 -120022 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 261-68 chr9 102146974 102147355 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -372473 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 173.75-129 chr5 151974044 151974354 + 1.5 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) MER102a|DNA|hAT-Charlie 15301 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 419.75-4 chr6 82367789 82368115 + 1.5 NA TTS (NM_001166392) TTS (NM_001166392) 3708 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 551.5-2 chr4 101427427 101428182 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 80027 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 123.25-46 chr12 70720352 70720435 + 1.5 NA intron (NM_130846, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 34215 NM_130846 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 147-163 chrX 129511612 129511755 + 1.5 NA intron (NM_003069, intron 6 of 24) MIR|SINE|MIR 11807 NM_001282875 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 248-75 chr8 81733293 81733627 + 1.5 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) intron (NM_152284, intron 1 of 4) 1012 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 256.75-14 chr14 69907107 69907475 + 1.5 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 27875 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 154.5-57 chr13 86449767 86449928 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -462073 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 231-78 chr8 9012952 9013161 + 1.5 NA intron (NM_001354638, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu 9930 NM_001354635 90459 Hs.20000 NM_153332 ENSG00000104626 ERI1 3'HEXO|HEXO|THEX1 exoribonuclease 1 protein-coding 223.75-40 chr18 9586669 9586879 + 1.5 NA intron (NR_052003, intron 5 of 19) intron (NR_052003, intron 5 of 19) 27785 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 152-56 chr15 72596604 72596742 + 1.5 NA 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 9456 NR_030359 693215 NR_030359 ENSG00000283798 MIR630 MIRN630|hsa-mir-630 microRNA 630 ncRNA 280.5-41 chr5 93330755 93330963 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 240484 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 216.5-82 chr3 132398007 132398193 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19402 NM_015268 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 200.25-122 chrX 45463075 45463295 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -42203 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 170.25-69 chr2 113723791 113723982 + 1.5 NA intron (NM_001330315, intron 13 of 16) intron (NM_001330315, intron 13 of 16) -2518 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 250.5-38 chr18 79249098 79249283 + 1.5 NA intron (NR_148360, intron 11 of 31) intron (NR_148360, intron 11 of 31) -146740 NM_172390 4772 Hs.534074 NM_006162 ENSG00000131196 NFATC1 NF-ATC|NF-ATc1.2|NFAT2|NFATc nuclear factor of activated T cells 1 protein-coding 439.5-17 chr8 109477068 109477406 + 1.5 NA exon (NM_177531, exon 53 of 78) exon (NM_177531, exon 53 of 78) -62463 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 174-13 chr11 30018769 30018936 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1822 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 124.5-119 chr2 236947077 236947189 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 109034 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 250.5-57 chr22 25718276 25718492 + 1.5 NA intron (NM_001362778, intron 18 of 19) intron (NM_001362778, intron 18 of 19) -23804 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 318-20 chr20 17442352 17442661 + 1.5 NA intron (NM_002594, intron 8 of 11) LTR83|LTR|ERVL 88873 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 244.5-73 chr4 72602241 72602431 + 1.5 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -33115 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 208.5-45 chr15 69110570 69110795 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 29832 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 445.25-5 chr22 25909519 25910146 + 1.5 NA intron (NM_001318245, intron 32 of 43) intron (NM_001318245, intron 32 of 43) 167644 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 169.5-147 chr6 8762475 8762722 + 1.5 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) L1MC|LINE|L1 110389 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 352-11 chr7 5352255 5352552 + 1.5 NA intron (NM_001080495, intron 16 of 29) intron (NM_001080495, intron 16 of 29) 69460 NM_001300847 222962 Hs.4302 NM_153247 ENSG00000164638 SLC29A4 ENT4|PMAT solute carrier family 29 member 4 protein-coding 213-4 chr1 40850720 40851051 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 11478 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 365.25-5 chr2 159965475 159965944 + 1.5 NA intron (NM_001007267, intron 20 of 26) L1MC1|LINE|L1 -60953 NM_001198759 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 302.5-5 chr10 97636861 97637231 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2890 NM_001098831 118812 Hs.217409 NM_178832 ENSG00000171160 MORN4 C10orf83|UTA|bA548K23.4|rtp MORN repeat containing 4 protein-coding 120.5-232 chr8 117717852 117717966 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197196 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 444.75-3 chr2 13658831 13659300 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -652052 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 317.5-18 chr20 11683373 11683742 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 187158 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 247.5-15 chr12 131870889 131871211 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23572 NM_003565 8408 Hs.47061 NM_003565 ENSG00000177169 ULK1 ATG1|ATG1A|UNC51|Unc51.1|hATG1 unc-51 like autophagy activating kinase 1 protein-coding 188.5-57 chr18 3933783 3934023 + 1.5 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -28450 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 314.5-6 chr16 71500577 71501144 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11536 NM_006961 7567 Hs.660076 NM_006961 ENSG00000157429 ZNF19 KOX12 zinc finger protein 19 protein-coding 277.5-55 chr4 67048209 67048462 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 373665 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 160.5-193 chr8 117028789 117028937 + 1.5 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) intron (NM_001172813, intron 2 of 10) 77888 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 155-149 chr8 139679874 139680060 + 1.5 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 23156 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 351-21 chr5 93134128 93134531 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 437014 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 260.5-49 chr5 44130496 44130688 + 1.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -258140 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 338-15 chr17 19392854 19393112 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5793 NM_001198695 4239 Hs.296049 NM_002404 ENSG00000166482 MFAP4 - microfibril associated protein 4 protein-coding 446-5 chr5 21577617 21577942 + 1.5 NA intron (NR_027026, intron 4 of 4) intron (NR_027026, intron 4 of 4) 118299 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 131-82 chr2 30575790 30575910 + 1.5 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 128604 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 161.25-129 chr4 32925253 32925475 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 574326 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 174-65 chr3 139327287 139327433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16634 NM_001363893 56945 Hs.745001 NM_020191 ENSG00000175110 MRPS22 C3orf5|COXPD5|GIBT|GK002|MRP-S22|ODG7|RPMS22 mitochondrial ribosomal protein S22 protein-coding 238.5-26 chr14 84288861 84289134 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -982935 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 329.75-9 chr18 13091924 13092261 + 1.5 NA intron (NM_032142, intron 33 of 44) MIRb|SINE|MIR 100730 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 288.75-47 chr8 140432947 140433211 + 1.5 NA intron (NM_001160372, intron 4 of 22) AluSz6|SINE|Alu 24665 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 230.75-30 chr17 72734307 72734478 + 1.5 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -93920 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 235.75-11 chr10 87911362 87911707 + 1.5 NA intron (NM_001304718, intron 2 of 8) L1MB3|LINE|L1 47909 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 372.5-9 chr19 43852272 43852684 + 1.5 NA TTS (NM_181845) TTS (NM_181845) 25157 NM_181845 284349 Hs.652513 NM_181845 ENSG00000167637 ZNF283 HZF19|HZF41 zinc finger protein 283 protein-coding 235-64 chr6 109117885 109118164 + 1.5 NA intron (NM_001083535, intron 3 of 12) intron (NM_001083535, intron 3 of 12) -11280 NM_173830 285753 Hs.632616 NM_173830 ENSG00000183137 CEP57L1 C6orf182|bA487F23.2|cep57R centrosomal protein 57 like 1 protein-coding 255-27 chr2 124233458 124233786 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 2 of 23) intron (NM_130773, intron 2 of 23) 208335 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 184.5-162 chr8 133850418 133850640 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -35967 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 297-21 chr18 3876850 3877049 + 1.5 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) -1231 NR_038895 201477 Hs.627208 NR_038895 ENSG00000263724 DLGAP1-AS3 - DLGAP1 antisense RNA 3 ncRNA 235-55 chr5 13429423 13429763 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -396707 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 310.75 chr1 43188326 43188869 + 1.5 NA intron (NM_001195831, intron 6 of 23) L1MB7|LINE|L1 -16027 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 255.25-6 chr10 13576600 13577134 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -10098 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 200.5-145 chr9 29134938 29135236 + 1.5 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1ME4a|LINE|L1 77212 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 171.75-128 chr7 27905869 27906056 + 1.5 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 165867 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 303.5-41 chr6 131225996 131226359 + 1.5 NA intron (NM_016377, intron 7 of 7) MER102c|DNA|hAT-Charlie -24227 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 291.5-54 chrX 43650605 43650907 + 1.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -4151 NM_000240 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 172-102 chr7 119582802 119582949 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 324500 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 210.25-80 chr8 114768053 114768338 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 899818 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 170.75-74 chr2 193955998 193956111 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -388215 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 325.5-16 chr2 57303286 57303633 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -604192 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 347-5 chr11 40932061 40932647 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 527282 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 448.25-2 chr5 134431824 134432197 + 1.5 NA intron (NR_105044, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 3037 NR_105044 102546229 NR_105044 LOC102546229 - uncharacterized LOC102546229 ncRNA 188-9 chr10 92514584 92514864 + 1.5 NA intron (NM_001322794, intron 4 of 23) intron (NM_001322794, intron 4 of 23) -16963 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 198-16 chr11 38458321 38458574 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 187909 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 253.25-59 chr7 28852397 28852646 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105809 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 171.75-17 chr10 65741206 65741380 + 1.5 NA intron (NR_120647, intron 5 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 169868 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 203-7 chr1 75539279 75539528 + 1.5 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) intron (NM_001320285, intron 2 of 25) 71711 NM_001130058 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 244.5-98 chr8 124534357 124534678 + 1.5 NA intron (NM_001317889, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 4568 NM_032026 83940 Hs.170568 NM_032026 ENSG00000147687 TATDN1 CDA11 TatD DNase domain containing 1 protein-coding 367.75-10 chr4 65748238 65748588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -77918 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 271.5-52 chr22 27321921 27322166 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 11392 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 251-10 chr1 226233052 226233350 + 1.5 NA intron (NM_001366239, intron 12 of 13) intron (NM_001366239, intron 12 of 13) 9537 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 237-60 chr7 8683822 8684118 + 1.5 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 250361 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 351.5-3 chr10 34636486 34636926 + 1.5 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 178590 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 262.5-28 chr17 52524876 52525187 + 1.5 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) intron (NR_146898, intron 1 of 3) 134509 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 331-5 chr10 98898286 98898558 + 1.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MC3|LINE|L1 26146 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 381.25-9 chr4 49118513 49119097 + 1.5 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 132163 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 210-21 chr12 16161372 16161630 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 116184 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 254.5-61 chr5 74203996 74204328 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 104163 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 312.5-3 chr10 19188926 19189212 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) L1MB1|LINE|L1 140268 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 351-13 chr3 81216735 81217214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 223106 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 215.75-107 chrX 68734708 68735033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 41231 NM_001142504 9754 Hs.95140 NM_014725 ENSG00000130052 STARD8 ARHGAP38|DLC3|STARTGAP3 StAR related lipid transfer domain containing 8 protein-coding 313.75-23 chr8 105123219 105123695 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -194981 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 234.25-8 chr1 202077670 202077996 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45084 NM_004767 9283 Hs.132049 NM_004767 ENSG00000170075 GPR37L1 ET(B)R-LP-2|ETBR-LP-2|ETBRLP2 G protein-coupled receptor 37 like 1 protein-coding 414.25-5 chr14 66475951 66476497 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10147 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 201-6 chr1 114769229 114769363 + 1.5 NA TTS (NM_001102396) TTS (NM_001102396) -11246 NM_001242891 7812 Hs.69855 NM_007158 ENSG00000009307 CSDE1 D1S155E|UNR cold shock domain containing E1 protein-coding 227-42 chr3 80427538 80427713 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -337272 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 331.75-7 chr12 22229518 22229939 + 1.5 NA intron (NM_003034, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 104986 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 239-42 chr5 17118632 17118992 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 37180 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 205.25-3 chr1 160403917 160404170 + 1.5 NA intron (NM_020335, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 3479 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 204.5-21 chr11 97322244 97322457 + 1.5 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 813925 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 331.75-21 chr5 148050729 148051098 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -13059 NM_006846 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 147-7 chr1 79153674 79153831 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -147022 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 117-194 chr9 33130633 33130715 + 1.5 NA intron (NM_001497, intron 2 of 5) intron (NM_001497, intron 2 of 5) 21982 NR_162131 113219452 NR_162131 MIR12117 - microRNA 12117 ncRNA 200.25-113 chr8 88029320 88029547 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -155418 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 213-65 chr3 157520815 157521001 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17303 NM_001167916 79674 Hs.658046 NM_024621 ENSG00000197415 VEPH1 MELT|VEPH ventricular zone expressed PH domain containing 1 protein-coding 319.5-2 chr10 30424189 30424484 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9685 NM_001244134 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 305.75 chr10 35510169 35510665 + 1.5 NA intron (NM_001282854, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu -94924 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 271.5-74 chr6 7762404 7762687 + 1.5 NA intron (NM_001718, intron 1 of 6) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 36446 NM_001718 654 Hs.285671 NM_001718 ENSG00000153162 BMP6 VGR|VGR1 bone morphogenetic protein 6 protein-coding 306.5-22 chr18 73601646 73601956 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 276860 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 193.5-147 chr7 19919491 19919635 + 1.5 NA intron (NR_110114, intron 5 of 5) intron (NR_110114, intron 5 of 5) -145946 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 340.5-35 chr8 111792844 111793222 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 416394 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 230-11 chr10 91977173 91977517 + 1.5 NA intron (NM_003972, intron 14 of 37) L1MC1|LINE|L1 53575 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 244-15 chr13 85194519 85194809 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -46607 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 183-27 chr14 58173249 58173437 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -21130 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 127-118 chr3 113062536 113062716 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -42955 NM_001319112 25871 Hs.591288 NM_015412 ENSG00000163608 NEPRO C3orf17|NET17 nucleolus and neural progenitor protein protein-coding 352.75-17 chr8 130902699 130903112 + 1.5 NA intron (NM_001115, intron 7 of 17) intron (NM_001115, intron 7 of 17) 138004 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 246-39 chr22 35424737 35425056 + 1.5 NA 3' UTR (NM_006739, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_006739, exon 17 of 17) 24756 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 297-45 chr9 114957503 114957861 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27087 NM_001244 944 Hs.494901 NM_001244 ENSG00000106952 TNFSF8 CD153|CD30L|CD30LG|TNLG3A TNF superfamily member 8 protein-coding 251.5-44 chr2 214442260 214442495 + 1.5 NA intron (NM_001080500, intron 3 of 3) intron (NM_001080500, intron 3 of 3) 31323 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 194.5-18 chr10 73506062 73506248 + 1.5 NA non-coding (NR_132103, exon 5 of 5) non-coding (NR_132103, exon 5 of 5) -10131 NM_021132 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 393-8 chr2 188087491 188087923 + 1.5 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) L1MD2|LINE|L1 199984 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 226 chr1 13613901 13614204 + 1.5 NA intron (NM_198389, intron 4 of 5) intron (NM_198389, intron 4 of 5) 28592 NM_001006624 10630 Hs.468675 NM_006474 ENSG00000162493 PDPN AGGRUS|GP36|GP40|Gp38|HT1A-1|OTS8|PA2.26|T1A|T1A-2|T1A2|TI1A podoplanin protein-coding 491.25-5 chr8 143336660 143337099 + 1.5 NA intron (NM_001258447, intron 1 of 13) L1M4|LINE|L1 -1999 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 223.5-55 chr18 80101676 80101924 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -7462 NM_014913 22850 Hs.131915 NM_014913 ENSG00000101544 ADNP2 ZNF508 ADNP homeobox 2 protein-coding 184.5-108 chr4 52308487 52308680 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 257279 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 211.5-143 chr7 34148283 34148445 + 1.5 NA intron (NM_133468, intron 15 of 15) L2c|LINE|L2 242825 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 385-16 chr5 65155616 65156036 + 1.5 NA intron (NR_135689, intron 25 of 25) intron (NR_135689, intron 25 of 25) 326094 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 532.25-4 chr5 38265144 38266014 + 1.5 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) intron (NM_152403, intron 1 of 21) 7020 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 189-12 chr1 166622360 166622494 + 1.5 NA intron (NR_002925, intron 5 of 6) intron (NR_002925, intron 5 of 6) 18511 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 186.5-56 chr18 3020939 3021129 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9087 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 202.5-21 chr10 105442096 105442447 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 378062 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 430-12 chr3 123363276 123363726 + 1.5 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) L1ME4a|LINE|L1 52841 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 207-35 chr16 5358975 5359177 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 257174 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 337.75-10 chr2 44706072 44706546 + 1.5 NA exon (NM_024766, exon 5 of 11) exon (NM_024766, exon 5 of 11) 232579 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 262-58 chr8 102291499 102291719 + 1.5 NA intron (NM_001282873, intron 34 of 58) L1MEd|LINE|L1 52158 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 324.75-15 chr18 9380030 9380313 + 1.5 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 45398 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 183-28 chr14 65672348 65672558 + 1.5 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) AluJr|SINE|Alu 201351 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 510.5-2 chr16 34081193 34081756 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -82104 NR_162093 113218496 NR_162093 MIR9901 - microRNA 9901 ncRNA 154-117 chr6 91682092 91682236 + 1.5 NA intron (NR_104154, intron 2 of 3) intron (NR_104154, intron 2 of 3) 8264 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 338-18 chr2 24353932 24354227 + 1.5 NA intron (NM_001348182, intron 1 of 38) intron (NM_001348182, intron 1 of 38) 6457 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 319-2 chr1 99421907 99422167 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 65767 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 117-147 chr5 55826075 55826172 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25234 NM_139017 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 144.75-53 chr13 102454234 102454388 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51868 NM_001321946 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 245.5-76 chr7 94929067 94929368 + 1.5 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 19319 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 267.5-23 chr14 72086756 72086988 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 153345 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 197-9 chr11 99318048 99318315 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) -237964 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 130-105 chr3 95663614 95663773 + 1.5 NA intron (NR_077228, intron 3 of 4) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 19500 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 432-6 chr14 85383329 85383800 + 1.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -3711 NR_135155 105370605 NR_135155 ENSG00000258814 LINC02329 - long intergenic non-protein coding RNA 2329 ncRNA 244.5-59 chr20 9375991 9376200 + 1.5 NA intron (NM_000933, intron 9 of 35) intron (NM_000933, intron 9 of 35) 68295 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 307-34 chr8 118285460 118286028 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR -173925 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 330-17 chr2 206280178 206280499 + 1.5 NA intron (NM_020923, intron 2 of 4) intron (NM_020923, intron 2 of 4) 5328 NM_001285549 57683 Hs.110489 NM_020923 ENSG00000204186 ZDBF2 Slx9 zinc finger DBF-type containing 2 protein-coding 279.75-14 chr14 20450807 20451069 + 1.5 NA intron (NM_017807, intron 3 of 10) AluSq2|SINE|Alu 3874 NM_017807 55644 Hs.525196 NM_017807 ENSG00000092094 OSGEP GAMOS3|GCPL1|KAE1|OSGEP1|PRSMG1|TCS3 O-sialoglycoprotein endopeptidase protein-coding 212-13 chr11 66642325 66642487 + 1.5 NA intron (NM_001198844, intron 2 of 2) intron (NM_001198844, intron 2 of 2) 3703 NM_001198844 5936 Hs.523822 NM_002896 ENSG00000173933 RBM4 LARK|RBM4A|ZCCHC21|ZCRB3A RNA binding motif protein 4 protein-coding 176.75-43 chr14 86033776 86033940 + 1.5 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) intron (NR_110155, intron 1 of 3) 99180 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 351-17 chr4 88164553 88164827 + 1.5 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -5367 NM_001348989 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 193-21 chr14 61140523 61140663 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 140745 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 238.25-37 chr2 100726900 100727190 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -93094 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 192.25-99 chr7 6408814 6408945 + 1.5 NA TTS (NM_139179) TTS (NM_139179) 34352 NM_018890 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 267.5-50 chr4 32106740 32107121 + 1.5 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -84508 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 255.5-55 chr3 98877187 98877383 + 1.5 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) L1MC4a|LINE|L1 24410 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 138.75-89 chr2 71404242 71404344 + 1.5 NA intron (NM_001252613, intron 17 of 27) intron (NM_001252613, intron 17 of 27) -49268 NM_003494 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 331-30 chr8 122869289 122869606 + 1.5 NA intron (NM_014943, intron 2 of 3) AluSq2|SINE|Alu 87792 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 316.5 chr1 43986298 43986598 + 1.5 NA intron (NM_001005417, intron 6 of 6) intron (NM_001005417, intron 6 of 6) -5148 NM_001349127 149473 Hs.632394 NM_152499 ENSG00000159214 CCDC24 - coiled-coil domain containing 24 protein-coding 264.75-31 chr3 116154025 116154298 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -205863 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 220-71 chr8 136755299 136755505 + 1.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 224604 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 360-15 chr8 119389290 119389757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26923 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 256.5-16 chr12 45197368 45197702 + 1.5 NA intron (NR_037144, intron 1 of 2) L1MC4|LINE|L1 18471 NR_037144 51054 Hs.233495 NM_015899 ENSG00000134297 PLEKHA8P1 FAPP-2|FAPP2|PLEKHA8|PLEKHA9|hFAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 pseudogene 1 pseudo 135.75-14 chr1 186569018 186569179 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -107984 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 242.25-78 chr6 151371276 151371448 + 1.5 NA intron (NM_020861, intron 2 of 2) intron (NM_020861, intron 2 of 2) 20197 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 198.5-164 chr9 82974359 82974608 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 88659 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 267-8 chr10 41784688 41784931 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 583236 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 270-27 chr2 188255580 188255815 + 1.5 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) intron (NR_126396, intron 1 of 2) 31994 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 214.5-8 chr1 238646674 238646918 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -160779 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 351-7 chr15 73871253 73871672 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2102 NM_153356 161514 Hs.124512 NM_153356 ENSG00000167139 TBC1D21 MgcRabGAP TBC1 domain family member 21 protein-coding 204-10 chr12 101043010 101043264 + 1.5 NA intron (NM_001286616, intron 11 of 26) intron (NM_001286616, intron 11 of 26) -95421 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 274.5-31 chr2 22778433 22778748 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 242111 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 309.75-4 chr10 51360170 51360562 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 60793 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 302-18 chr2 104030262 104030615 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 377894 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 201.5-83 chr21 17010897 17011151 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 420787 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 253-54 chr9 31370734 31371009 + 1.5 NA TTS (NR_135134) TTS (NR_135134) 10619 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 281.5-28 chr2 78414697 78415023 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -124129 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 257.5-19 chr14 44727983 44728396 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70937 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 222-51 chr3 20623320 20623562 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 280973 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 330.5-15 chr18 2988883 2989238 + 1.5 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) MIRb|SINE|MIR 22887 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 241.5-77 chr4 158678247 158678463 + 1.5 NA intron (NM_001281737, intron 1 of 11) L1MD3|LINE|L1 -3753 NM_001281738 2110 Hs.155729 NM_004453 ENSG00000171503 ETFDH ETFQO|MADD electron transfer flavoprotein dehydrogenase protein-coding 338.25-6 chr10 76780789 76781059 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -107120 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 272.75-17 chr17 61286598 61287146 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L2c|LINE|L2 80832 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 243-65 chr6 123727424 123727717 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -76276 NM_001300738 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 326.5-9 chr15 58067441 58067847 + 1.5 NA intron (NR_147215, intron 2 of 2) intron (NR_147215, intron 2 of 2) -1721 NM_001206897 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 316-25 chr6 163014252 163014518 + 1.5 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 39776 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 367.5-16 chr5 121240919 121241277 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -81452 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 170.5-17 chr1 188875930 188876086 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1432380 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 153.5-94 chr2 34835421 34835559 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 157933 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 214.5-38 chr15 70005019 70005301 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 74308 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 354.75-8 chr17 52818293 52818681 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43634 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 467-9 chr5 145595372 145595880 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 239716 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 249-27 chr20 59104669 59104995 + 1.5 NA Intergenic LTR40A1|LTR|ERVL -61986 NR_037929 100533975 Hs.656865 NR_037929 SLMO2-ATP5E - SLMO2-ATP5E readthrough ncRNA 170.25-80 chr2 222143454 222143734 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -154553 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 254.5-76 chr8 80320007 80320286 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 78757 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 297.75-44 chr7 39109334 39109622 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -95911 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 274.25-3 chr1 164607070 164607255 + 1.5 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 47440 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 118.5-101 chr2 97695445 97695583 + 1.5 NA intron (NR_038386, intron 7 of 9) intron (NR_038386, intron 7 of 9) -18054 NM_001079 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 155-56 chr2 13652611 13652798 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -645691 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 192.25-85 chr5 12775361 12775604 + 1.5 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) L1MA9|LINE|L1 107623 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 366.5-15 chr5 62470399 62470715 + 1.5 NA intron (NM_016338, intron 7 of 29) intron (NM_016338, intron 7 of 29) 51673 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 224.75-81 chrX 55575698 55575987 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -47558 NM_198451 139628 Hs.364260 NM_198451 ENSG00000189299 FOXR2 FOXN6 forkhead box R2 protein-coding 207.5-69 chr3 103095871 103096145 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 428108 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 219-74 chr4 26471245 26471447 + 1.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 19138 NM_000730 886 Hs.129 NM_000730 ENSG00000163394 CCKAR CCK-A|CCK1-R|CCK1R|CCKRA cholecystokinin A receptor protein-coding 328.5-20 chr20 10797445 10797766 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 44515 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 191-79 chr8 84947841 84948127 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -159254 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 196-51 chr2 112486180 112486563 + 1.5 NA intron (NM_153712, intron 2 of 6) LTR16A1|LTR|ERVL 4215 NM_153712 150465 Hs.358997 NM_153712 ENSG00000114999 TTL - tubulin tyrosine ligase protein-coding 147.75-130 chr5 133562137 133562263 + 1.5 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) Penelope1_Vert|LINE|Penelope 50341 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 263.5-66 chr8 125465985 125466276 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 33921 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 275.25-30 chr4 124064831 124065119 + 1.5 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 290711 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 203.25-80 chr5 39931718 39931960 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -120452 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 288-16 chr12 43872561 43872818 + 1.5 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) intron (NM_001286213, intron 2 of 6) 36608 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 149.25-150 chr5 181270637 181270783 + 1.5 NA intron (NR_102762, intron 1 of 2) AluSp|SINE|Alu 9498 NR_102761 100507602 Hs.126768 NR_102759 ENSG00000248275 TRIM52-AS1 - TRIM52 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 346.5-10 chr14 65699317 65699665 + 1.5 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 228389 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 260.75-19 chr18 2615558 2615876 + 1.5 NA intron (NM_006101, intron 16 of 16) L1ME3D|LINE|L1 39678 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 317-16 chr2 108924334 108924673 + 1.5 NA intron (NM_022336, intron 4 of 11) intron (NM_022336, intron 4 of 11) 64717 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 247.75-70 chr8 116818531 116818879 + 1.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 52181 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 293-14 chr2 180406431 180406766 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -285506 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 319.5-32 chr3 95539357 95539677 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 143676 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 357.25 chr1 28099967 28100231 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11462 NM_001282562 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 196.25-63 chr2 78332679 78332817 + 1.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -42017 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 302.25-3 chr11 43892885 43893135 + 1.5 NA intron (NM_139178, intron 7 of 9) intron (NM_139178, intron 7 of 9) -4293 NR_026952 729799 Hs.368920 NR_026952 ENSG00000213693 SEC14L1P1 - SEC14 like 1 pseudogene 1 pseudo 135.5-167 chr5 124778748 124778849 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -33686 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 308.75-39 chr8 119073606 119073912 + 1.5 NA intron (NM_006438, intron 1 of 5) intron (NM_006438, intron 1 of 5) -4977 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 292.25-29 chr3 36728751 36729059 + 1.5 NA intron (NM_033403, intron 2 of 4) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 10956 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 226.5 chr1 61504340 61504693 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -149726 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 260.25-32 chr3 17924729 17925064 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -37656 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 298.5-4 chr10 109614904 109615355 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 308117 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 249.75-31 chr2 39728561 39728774 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 50591 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 153-149 chr8 73854236 73854389 + 1.5 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) intron (NR_073119, intron 1 of 5) 24550 NR_073121 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 330.75-8 chr14 95688965 95689592 + 1.5 NA intron (NM_004918, intron 1 of 3) AluY|SINE|Alu 2852 NM_004918 9623 Hs.632346 NM_004918 ENSG00000213231 TCL1B SYN-1|TML1 T cell leukemia/lymphoma 1B protein-coding 282.25-12 chr18 49997465 49997698 + 1.5 NA intron (NM_001080467, intron 5 of 39) intron (NM_001080467, intron 5 of 39) 128982 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 129.75-139 chr4 171398181 171398317 + 1.5 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 212065 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 256.75-12 chr14 65074747 65075122 + 1.5 NA TTS (NM_145113) TTS (NM_145113) -14984 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 193.75-21 chr10 91821804 91821966 + 1.5 NA intron (NM_025235, intron 6 of 26) intron (NM_025235, intron 6 of 26) 23459 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 166.25-104 chr3 103026702 103026958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 497286 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 383.25 chr1 188204925 188205257 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 761463 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 324.5-21 chr3 46728472 46729051 + 1.5 NA intron (NR_147121, intron 3 of 3) intron (NR_147121, intron 3 of 3) 7666 NR_147121 100287362 Hs.673244 NM_001205271 ENSG00000261603 PRSS46P PRSS46|TESSP6 serine protease 46, pseudogene pseudo 327-24 chr5 78008434 78008683 + 1.5 NA intron (NM_003664, intron 26 of 26) intron (NM_003664, intron 26 of 26) 50311 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 369.75-4 chr12 23534511 23534850 + 1.5 NA intron (NM_152989, intron 17 of 17) intron (NM_152989, intron 17 of 17) 49906 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 199-81 chr7 155676396 155676573 + 1.5 NA intron (NM_053043, intron 3 of 17) intron (NM_053043, intron 3 of 17) 31823 NM_053043 155435 Hs.591815 NM_053043 ENSG00000184863 RBM33 PRR8 RNA binding motif protein 33 protein-coding 347.5-12 chr2 119308877 119309274 + 1.5 NA intron (NM_001322332, intron 4 of 4) AluJr|SINE|Alu 57667 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 407.75-2 chr13 86922418 86923008 + 1.5 NA intron (NR_132371, intron 1 of 1) L1MEf|LINE|L1 10793 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 325-18 chr4 91779175 91779473 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 497978 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 195.75-52 chr17 77593141 77593341 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46300 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 179.5-19 chr10 20591560 20591694 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 39657 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 248.25-6 chr1 210054123 210054429 + 1.5 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) L1MEh|LINE|L1 116059 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 188.5-79 chr2 146213893 146214088 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -373067 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 232.5-57 chr20 4807356 4807579 + 1.5 NA intron (NM_014737, intron 2 of 11) L1ME4b|LINE|L1 7656 NM_170774 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 332.25-16 chr2 22782844 22783234 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 246560 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 221.5-17 chr12 70071798 70072084 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -171089 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 122-72 chr17 63316501 63316611 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 9 of 25) intron (NM_025185, intron 9 of 25) 123711 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 416.25-8 chr18 78046243 78046548 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52668 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 244.5-83 chr6 52540935 52541143 + 1.5 NA intron (NM_012288, intron 1 of 10) intron (NM_012288, intron 1 of 10) 36021 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 217.5-8 chr1 184556871 184557130 + 1.5 NA intron (NM_030806, intron 3 of 5) intron (NM_030806, intron 3 of 5) 169971 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 334.25-6 chr11 70329508 70329836 + 1.5 NA intron (NR_045286, intron 7 of 28) AluJb|SINE|Alu 45717 NR_031624 100313770 NR_031624 ENSG00000221333 MIR548K MIRN548K microRNA 548k ncRNA 167-111 chr8 34695271 34695502 + 1.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -88535 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 199-2 chr1 76192988 76193167 + 1.5 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 118331 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 243.75-14 chr11 99701036 99701346 + 1.5 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 145046 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 141-59 chr17 60373814 60374001 + 1.5 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 18226 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 128.5-107 chr2 59924125 59924246 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 458851 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 311.5-11 chr16 27579421 27579725 + 1.5 NA intron (NM_015202, intron 2 of 27) intron (NM_015202, intron 2 of 27) 29429 NM_015202 23247 Hs.460459 NM_015202 ENSG00000047578 KIAA0556 JBTS26 KIAA0556 protein-coding 242.25-18 chr11 93148128 93148323 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001286139, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001286139, exon 11 of 11) 49201 NM_001286139 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 167.75-135 chr7 85069511 85069688 + 1.5 NA intron (NM_152754, intron 4 of 16) intron (NM_152754, intron 4 of 16) 52332 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 214.5-72 chr21 24196985 24197288 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 124241 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 210.75-57 chr3 50052402 50052636 + 1.5 NA intron (NM_001349194, intron 4 of 17) L1MB5|LINE|L1 -36400 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 300.5-18 chr15 83897182 83897535 + 1.5 NA intron (NM_207517, intron 13 of 29) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -182829 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 276-5 chr1 169833784 169834060 + 1.5 NA intron (NM_001366772, intron 15 of 22) AluJo|SINE|Alu 38882 NM_001366772 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 304.5-23 chr3 191087762 191088107 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -111307 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 401-5 chr11 34282442 34282873 + 1.5 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) AluSx|SINE|Alu 75353 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 161.25-116 chr3 7887161 7887333 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 129060 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 226.25-57 chr4 114702112 114702397 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 45495 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 170.5-143 chr5 37876565 37876709 + 1.5 NA TTS (NR_145476) TTS (NR_145476) 36199 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 353.75-2 chr11 116154534 116155094 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -394614 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 296.5-9 chr13 37361611 37361926 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 123016 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 225.75-59 chr4 35510348 35510637 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 733447 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 266-4 chr1 225061637 225061953 + 1.5 NA intron (NM_001367479, intron 17 of 85) L1MEj|LINE|L1 132120 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 385-4 chr15 25878520 25878821 + 1.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -15468 NM_024490 57194 Hs.638517 NM_024490 ENSG00000206190 ATP10A ATP10C|ATPVA|ATPVC ATPase phospholipid transporting 10A (putative) protein-coding 162.5-8 chr1 186670787 186670967 + 1.5 NA TTS (NM_000963) TTS (NM_000963) 9546 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 197.5-13 chr10 51754294 51754516 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -54810 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 551.25-2 chr5 36144821 36145628 + 1.5 NA intron (NM_001007527, intron 1 of 17) intron (NM_001007527, intron 1 of 17) 2764 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 230.25-63 chr4 75855523 75855803 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 46789 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 114-124 chr5 20991618 20991766 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -376157 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 337.5-19 chr22 26388044 26388394 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -41041 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 221.25-37 chr2 67438572 67438825 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 41365 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 342-14 chr8 50283785 50284166 + 1.5 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L1MC3|LINE|L1 119844 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 314-12 chr22 34703486 34703994 + 1.5 NA Intergenic (TTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 294176 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 249-51 chr8 100768294 100768531 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -46324 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 182.75-80 chr3 36687455 36687588 + 1.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 52340 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 311.5-6 chr11 121628639 121628885 + 1.5 NA intron (NM_003105, intron 47 of 47) intron (NM_003105, intron 47 of 47) 176448 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 147-134 chr7 92823134 92823288 + 1.5 NA intron (NM_001259, intron 2 of 7) intron (NM_001259, intron 2 of 7) 10748 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 302-30 chr7 97623687 97623915 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -108285 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 351.75-22 chr6 65209878 65210227 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -91366 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 184.25-33 chr12 66327372 66327595 + 1.5 NA intron (NM_001370285, intron 11 of 12) HAL1ME|LINE|L1 24938 NR_135080 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 237.75-51 chr3 159628792 159629000 + 1.5 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 139716 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 172.5-114 chr21 27200756 27200947 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -233763 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 182-17 chr11 14960594 14960730 + 1.5 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 11624 NM_001033952 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 364.5-24 chr9 72393754 72394167 + 1.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -28752 NM_001102421 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 177-21 chr12 2682283 2682554 + 1.5 NA intron (NM_199460, intron 45 of 49).2 intron (NM_199460, intron 45 of 49).2 8739 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 156-163 chr9 27787287 27787479 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -213517 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 236.75-11 chr10 57385299 57385717 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80949 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 288-11 chr11 6945951 6946449 + 1.5 NA intron (NM_013250, intron 6 of 6) L2c|LINE|L2 18538 NM_001354854 7762 Hs.523457 NM_013250 ENSG00000149054 ZNF215 BAZ-2|BAZ2|ZKSCAN11|ZSCAN43 zinc finger protein 215 protein-coding 185.25-33 chr15 57951973 57952130 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 61972 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 185.25-68 chr2 200386405 200386587 + 1.5 NA intron (NM_001282743, intron 2 of 11) intron (NM_001282743, intron 2 of 11) 77546 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 241.5-44 chr2 119959713 119959890 + 1.5 NA intron (NM_002830, intron 22 of 26) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -53276 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 323.25-14 chr2 134241710 134242015 + 1.5 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -12210 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 253.75-33 chr22 28470276 28470657 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 10597 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 430.5-8 chr5 13648662 13649151 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 295574 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 426-7 chr18 11276246 11276794 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -127758 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 144-58 chr2 76016649 76016866 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -305842 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 160.5-150 chr5 129588519 129588687 + 1.5 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) intron (NM_133638, intron 7 of 22) -127914 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 338.25-26 chr7 12762924 12763242 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 75450 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 200.25-7 chr1 171541542 171541807 + 1.5 NA exon (NM_015172, exon 16 of 34) exon (NM_015172, exon 16 of 34) 56144 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 203.5-126 chr7 8202853 8203137 + 1.5 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 59057 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 338.25-22 chr4 78697161 78697396 + 1.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 51284 NR_038305 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 302.25-8 chr13 107223088 107223441 + 1.5 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 97699 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 233-23 chr15 58767292 58767540 + 1.5 NA TTS (NR_135474) TTS (NR_135474) 3558 NR_135474 101928725 Hs.572321 NR_135474 ENSG00000245975 LOC101928725 - uncharacterized LOC101928725 ncRNA 339-9 chr14 70182879 70183364 + 1.5 NA intron (NM_033262, intron 1 of 7) intron (NM_033262, intron 1 of 7) -3987 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 413-3 chr16 87683020 87683547 + 1.5 NA intron (NM_020655, intron 2 of 4) intron (NM_020655, intron 2 of 4) 80775 NM_020655 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 156.5-88 chr2 175833262 175833401 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 168936 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 216-75 chr7 50361246 50361398 + 1.5 NA intron (NM_001291840, intron 2 of 2) intron (NM_001291840, intron 2 of 2) 42274 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 211.5-116 chr4 72777958 72778133 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -208824 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 256-52 chr4 66863530 66863774 + 1.5 NA Intergenic (ATTTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 558348 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 211-70 chr9 101790086 101790253 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -51589 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 251-8 chr1 165318227 165318493 + 1.5 NA intron (NM_177398, intron 3 of 8) intron (NM_177398, intron 3 of 8) 37881 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 444.75-5 chr22 25022067 25022605 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5638 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 477-2 chr15 101517887 101518504 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -28211 NM_138319 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 135.75-142 chr3 87928587 87928741 + 1.5 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -53912 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 175-105 chr5 123581690 123581849 + 1.5 NA intron (NM_001044723, intron 5 of 12) intron (NM_001044723, intron 5 of 12) 36352 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 263-8 chr11 20460618 20460876 + 1.5 NA intron (NM_005788, intron 11 of 15) L2c|LINE|L2 73031 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 389.5-5 chr15 100979548 100980053 + 1.5 NA intron (NM_024652, intron 3 of 33) L1MD2|LINE|L1 60443 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 341.25-2 chr1 195835173 195835585 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 253336 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 405-8 chr2 165181490 165181918 + 1.5 NA intron (NM_006922, intron 2 of 27) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 22346 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 252.75-48 chr3 198000557 198000796 + 1.5 NA intron (NM_033029, intron 11 of 15) AluSx|SINE|Alu 38791 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 128.5-145 chr3 73056362 73056474 + 1.5 NA intron (NM_001318026, intron 3 of 8) intron (NM_001318026, intron 3 of 8) -5241 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 308.25-16 chr2 47872340 47872562 + 1.5 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) AluSq2|SINE|Alu 16268 NM_025133 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 131.5-185 chr4 178892074 178892197 + 1.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -984199 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 243.75-18 chr12 76783388 76783609 + 1.5 NA intron (NM_015336, intron 1 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 19240 NM_001359626 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 302.25-28 chr8 80633307 80633686 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 147270 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 152.25-112 chr4 62776498 62776684 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -614826 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-91 chr2 103047436 103047656 + 1.5 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -63117 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 263.5-6 chr10 95845274 95845460 + 1.5 NA exon (NM_001312654, exon 6 of 10) exon (NM_001312654, exon 6 of 10) -62598 NM_001130446 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 292-37 chr6 79198718 79199018 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34806 NR_040671 100288198 Hs.586270 NR_040671 ENSG00000270362 HMGN3-AS1 - HMGN3 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-77 chr4 70176193 70176454 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20204 NM_017855 54959 Hs.143811 NM_017855 ENSG00000109205 ODAM APIN odontogenic, ameloblast associated protein-coding 314-9 chr17 3363708 3364053 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 34530 NM_003553 8387 NM_003553 ENSG00000180016 OR1E1 HGM071|OR13-66|OR17-2|OR17-32|OR1E5|OR1E6|OR1E8P|OR1E9P|OST547 olfactory receptor family 1 subfamily E member 1 protein-coding 207.75-128 chr8 119219917 119220226 + 1.5 NA intron (NR_149111, intron 1 of 1) intron (NR_149111, intron 1 of 1) 11708 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 225-77 chr8 107986084 107986351 + 1.5 NA intron (NM_001282863, intron 2 of 4) intron (NM_001282863, intron 2 of 4) 95722 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 195.25-101 chr9 73945127 73945365 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -426285 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 231-61 chr4 75564482 75564693 + 1.5 NA non-coding (NR_046429, exon 5 of 5) non-coding (NR_046429, exon 5 of 5) 8521 NR_046429 152816 Hs.24510 NM_178497 ENSG00000174792 ODAPH AI2A4|C4orf26 odontogenesis associated phosphoprotein protein-coding 299.75-6 chr11 115635492 115635963 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 99035 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 276-57 chrX 99248948 99249155 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 1161222 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 349-6 chr14 48691975 48692370 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 894208 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 162-28 chr12 4167543 4167726 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -106128 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 299-6 chr10 53007823 53008086 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -236254 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 366.5-3 chr10 64645178 64645608 + 1.5 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? -180135 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 333.5-4 chr10 129630757 129631199 + 1.5 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) intron (NM_002412, intron 2 of 4) 163737 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 197-55 chr5 170911890 170912081 + 1.5 NA intron (NM_022897, intron 7 of 27) HAL1|LINE|L1 49967 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 207.25-101 chr8 134568933 134569197 + 1.5 NA intron (NM_020863, intron 10 of 15) intron (NM_020863, intron 10 of 15) -29006 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 132-96 chr2 151575234 151575385 + 1.5 NA intron (NM_001271208, intron 107 of 182) intron (NM_001271208, intron 107 of 182) 159167 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 314.5-21 chr5 56196641 56197075 + 1.5 NA intron (NM_024669, intron 2 of 11) intron (NM_024669, intron 2 of 11) 36472 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 309.5-41 chr7 84390145 84390361 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -142223 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 293.5-6 chr10 34251718 34252058 + 1.5 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) L2a|LINE|L2 -479208 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 352.5-2 chr10 56569803 56570173 + 1.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -208715 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 150-27 chr12 10390929 10391100 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_007360) promoter-TSS (NM_007360) -973 NM_007360 22914 Hs.387787 NM_007360 ENSG00000213809 KLRK1 CD314|D12S2489E|KLR|NKG2-D|NKG2D killer cell lectin like receptor K1 protein-coding 262.25-39 chr5 103664497 103664839 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -101879 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 220-66 chr8 95770796 95770987 + 1.5 NA intron (NR_038205, intron 2 of 2) L1MC1|LINE|L1 177457 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 356.25-13 chr4 102649661 102650090 + 1.5 NA intron (NM_005908, intron 13 of 16) L1ME3|LINE|L1 111093 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 381.5-8 chr8 90132639 90133170 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -50025 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 355.25-6 chr2 190301279 190301707 + 1.5 NA intron (NM_198047, intron 2 of 12) L1MC3|LINE|L1 18333 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 257 chr1 87935206 87935419 + 1.5 NA Intergenic (ACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -563657 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 303.5-4 chr1 226145507 226145753 + 1.5 NA 3' UTR (NM_022735, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_022735, exon 8 of 8) -2373 NR_146443 107985353 Hs.735455 NR_146443 ENSG00000234478 ACBD3-AS1 - ACBD3 antisense RNA 1 ncRNA 363-19 chr6 90147333 90147656 + 1.5 NA intron (NM_021813, intron 4 of 8) intron (NM_021813, intron 4 of 8) 149349 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 220-28 chr18 22845091 22845344 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -58380 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 181.25-84 chr3 80036886 80037141 + 1.5 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -269015 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 243.75-22 chr14 33864964 33865168 + 1.5 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 86008 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 167-10 chr1 150309792 150310049 + 1.5 NA TTS (NM_018997) TTS (NM_018997) -11548 NR_146766 9129 Hs.11776 NM_004698 ENSG00000117360 PRPF3 HPRP3|HPRP3P|PRP3|Prp3p|RP18|SNRNP90 pre-mRNA processing factor 3 protein-coding 374.5-11 chr22 23090877 23091388 + 1.5 NA intron (NM_002073, intron 1 of 2) intron (NM_002073, intron 1 of 2) 20613 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 479-2 chr14 33493235 33493714 + 1.5 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -215463 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 271-2 chr1 64510785 64511069 + 1.5 NA intron (NM_001293274, intron 1 of 25) intron (NM_001293274, intron 1 of 25) 5013 NM_001293274 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 364.75-6 chr2 194421977 194422536 + 1.5 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 77987 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 243.5-21 chr11 80512232 80512526 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 250424 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 253.5-5 chr1 153271155 153271357 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 11569 NM_000427 4014 Hs.251680 NM_000427 ENSG00000203782 LOR - loricrin protein-coding 283.5-51 chr6 144214966 144215313 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 64622 NM_003764 8676 Hs.118958 NM_003764 ENSG00000135604 STX11 FHL4|HLH4|HPLH4 syntaxin 11 protein-coding 235.75-42 chr22 33229449 33229797 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 121094 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 277.25-3 chr1 174223413 174223732 + 1.5 NA intron (NM_001366445, intron 3 of 13) intron (NM_001366445, intron 3 of 13) -51528 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 189.75-120 chr8 38279094 38279466 + 1.5 NA intron (NM_023034, intron 21 of 23) intron (NM_023034, intron 21 of 23) -10048 NM_001354454 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 317.5-35 chr8 108623915 108624195 + 1.5 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 163539 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 207.5-62 chr20 54390755 54390971 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -84730 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 488.5-4 chr8 29484360 29485146 + 1.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -134069 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 252-23 chr14 68485727 68486019 + 1.5 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 142914 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 263-37 chr4 110778787 110779003 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 81752 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 214.25-32 chr18 45021649 45021801 + 1.5 NA intron (NM_015559, intron 4 of 5) intron (NM_015559, intron 4 of 5) -51559 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 153.75-52 chr16 19835833 19836010 + 1.5 NA intron (NR_130968, intron 8 of 8) L1ME4b|LINE|L1 48927 NM_016235 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 234.5-43 chr2 68020289 68020547 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 42586 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 183.25-59 chr2 119144073 119144283 + 1.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 14573 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 148.5-182 chr5 38901453 38901611 + 1.5 NA intron (NM_003999, intron 7 of 17) MER70-int|LTR|ERVL 55520 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 406-7 chr4 45864621 45865068 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 259210 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 321-3 chr10 11084696 11085054 + 1.5 NA intron (NR_046108, intron 4 of 6) intron (NR_046108, intron 4 of 6) 20613 NR_046108 439950 Hs.568157 NR_046108 CELF2-AS2 - CELF2 antisense RNA 2 ncRNA 704.75 chr3 180982066 180983008 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001013439, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001013439, exon 18 of 18) 6981 NM_001190233 131118 Hs.230601 NM_145261 ENSG00000205981 DNAJC19 PAM18|TIM14|TIMM14 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C19 protein-coding 213-14 chr10 107983960 107984225 + 1.5 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 85201 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 347-8 chr14 51386106 51386439 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10863 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 393.25-8 chr7 90555914 90556407 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -40161 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 412.5-10 chr4 98184629 98185157 + 1.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -41417 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 318.75-13 chr3 141557298 141557609 + 1.5 NA intron (NM_006506, intron 7 of 23) intron (NM_006506, intron 7 of 23) 70426 NM_001303246 5922 Hs.98445 NM_006506 ENSG00000155903 RASA2 GAP1M RAS p21 protein activator 2 protein-coding 134.25-104 chr21 35617568 35617779 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -36909 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 267-32 chr3 86782534 86782888 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 208438 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 299-34 chr8 123447539 123447927 + 1.5 NA intron (NR_133926, intron 6 of 6) L1ME3A|LINE|L1 30959 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 223.75-3 chr1 184343924 184344148 + 1.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -42993 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 210-26 chr13 102014347 102014561 + 1.5 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) 31550 NR_039854 100616239 NR_039854 ENSG00000264482 MIR4705 - microRNA 4705 ncRNA 363.5-13 chr3 89108053 89108442 + 1.5 NA intron (NM_182644, intron 1 of 6) intron (NM_182644, intron 1 of 6) 626 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 199.5-27 chr12 10131231 10131375 + 1.5 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 -1034 NM_197947 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 226-16 chr13 88044320 88044592 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98411 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 316.5-4 chr1 86728283 86728538 + 1.5 NA exon (NM_001206651, exon 6 of 10) exon (NM_001206651, exon 6 of 10) 23834 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 165.5-98 chr20 18119354 18119500 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -18436 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 385-10 chr2 61005723 61006356 + 1.5 NA intron (NM_144709, intron 4 of 17) intron (NM_144709, intron 4 of 17) 11173 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 343.5-4 chr1 161780900 161781261 + 1.5 NA intron (NM_007348, intron 2 of 15) intron (NM_007348, intron 2 of 15) 14760 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 306.5-19 chr16 13152746 13153079 + 1.5 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 251314 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 262.5-27 chr17 49780808 49781088 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7733 NM_001199158 11143 Hs.21907 NM_007067 ENSG00000136504 KAT7 HBO1|HBOA|MYST2|ZC2HC7 lysine acetyltransferase 7 protein-coding 197.25-22 chr12 48780418 48780574 + 1.5 NA intron (NM_015270, intron 2 of 21) intron (NM_015270, intron 2 of 21) -8459 NR_039850 100616262 NR_039850 ENSG00000264201 MIR4701 - microRNA 4701 ncRNA 190-35 chr20 7616135 7616429 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 244674 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 162-61 chr2 67064575 67064689 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21814 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 169.25-67 chr20 13035612 13035897 + 1.5 NA intron (NM_001349945, intron 2 of 12) intron (NM_001349945, intron 2 of 12) 26782 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 288.5-36 chr5 171157024 171157381 + 1.5 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) intron (NM_022897, intron 14 of 27) -152046 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 252.5-39 chr2 37327108 37327422 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10181 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 139.5-25 chr11 55693701 55693840 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28603 NM_001004704 219432 Hs.511921 NM_001004704 ENSG00000181903 OR4C6 OR11-138 olfactory receptor family 4 subfamily C member 6 protein-coding 211.5-157 chr8 80704323 80704488 + 1.5 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) MER21B|LTR|ERVL 170063 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 262.75-39 chr4 43525944 43526438 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33648 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 310.5-25 chr3 53661998 53662267 + 1.5 NA intron (NM_001128840, intron 5 of 47) intron (NM_001128840, intron 5 of 47) 167521 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 380-22 chr8 105122760 105123046 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -195535 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 290.5-36 chr5 145196523 145196795 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 638683 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 271.25-15 chr11 120386405 120386664 + 1.5 NA intron (NM_001301084, intron 1 of 40) intron (NM_001301084, intron 1 of 40) 1207 NM_001301084 23365 Hs.24598 NM_015313 ENSG00000196914 ARHGEF12 LARG|PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 protein-coding 241.5-12 chr12 23920873 23921051 + 1.5 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) L2a|LINE|L2 28708 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 364.25-13 chr14 87492593 87493119 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 162438 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 150.25-60 chr16 8246807 8246996 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 342937 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 209-34 chr18 42792970 42793263 + 1.5 NA intron (NM_002930, intron 4 of 4) intron (NM_002930, intron 4 of 4) 322569 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 178.5-44 chr13 103514690 103514926 + 1.5 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 89608 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 229.5-89 chr3 118447680 118447880 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -193988 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 302-27 chr7 14450440 14450723 + 1.5 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 390869 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 286.5-6 chr1 107485051 107485319 + 1.5 NA TTS (NM_001113228) TTS (NM_001113228) 203314 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 268.75-23 chr21 25632586 25633128 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6401 NM_021219 58494 Hs.517227 NM_021219 ENSG00000154721 JAM2 C21orf43|CD322|JAM-B|JAMB|PRO245|VE-JAM|VEJAM junctional adhesion molecule 2 protein-coding 161-117 chr8 90558435 90558639 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 47526 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 242-65 chr8 118738589 118738940 + 1.5 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -116801 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 303.5-43 chr6 144037467 144037698 + 1.5 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 17680 NM_001317159 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 270.25-18 chr13 67578109 67578344 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 205839 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 315.75-18 chr3 124357020 124357382 + 1.5 NA intron (NM_001024660, intron 10 of 59) L2c|LINE|L2 -17131 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 289.5-47 chr7 80121983 80122238 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12721 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 225.25-43 chr2 74856467 74856750 + 1.5 NA intron (NM_000189, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR 23953 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 252.75-76 chr8 132555151 132555364 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 6222 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 377.5-22 chr8 105309234 105309751 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -8946 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 199-31 chr19 56782922 56783091 + 1.5 NA intron (NR_163143, intron 9 of 12) L1MA1|LINE|L1 17684 NR_110744 101929059 Hs.607132 NR_110744 ENSG00000286125 ZIM2-AS1 ZIM2as ZIM2 antisense RNA 1 ncRNA 251.5-49 chr20 51276560 51276898 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 176248 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 242.5-78 chr7 74509357 74509595 + 1.5 NA intron (NM_016328, intron 2 of 26) AluSz6|SINE|Alu 55570 NM_016328 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 285-30 chr3 35802669 35802963 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 58340 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 249.5-70 chr4 42972162 42972545 + 1.5 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) intron (NM_001080476, intron 2 of 3) 79087 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 379.5-11 chr2 204664538 204664937 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 119262 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 199.5-25 chr11 104683244 104683424 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -74032 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 247.5-58 chr3 179069274 179069593 + 1.5 NA intron (NM_022470, intron 1 of 5) intron (NM_022470, intron 1 of 5) 2376 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 348-4 chr10 120189139 120189594 + 1.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 165857 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 215.25-32 chr14 70765380 70765703 + 1.5 NA intron (NM_001284231, intron 1 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 17911 NM_001284231 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 282.75-15 chr16 76383459 76383664 + 1.5 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) L1MC5|LINE|L1 73709 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 376.25-8 chr18 5107175 5107678 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 26244 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 325.75 chr1 69913787 69914174 + 1.5 NA intron (NM_001370785, intron 7 of 26) intron (NM_001370785, intron 7 of 26) -5342 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 174.5-36 chr11 83526189 83526377 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 21 of 27) L2c|LINE|L2 156142 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 211.25-26 chr15 33653930 33654134 + 1.5 NA intron (NM_001243996, intron 32 of 102) MER103C|DNA|hAT-Charlie -314465 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 155.25-186 chr9 75148673 75148835 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 60240 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 217-45 chr21 31385374 31385683 + 1.5 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -41174 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 232-8 chr10 78706086 78706441 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 361185 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-59 chr4 64783414 64783731 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 220928 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 479-4 chr7 20057727 20058237 + 1.5 NA intron (NR_110114, intron 1 of 5) L1PB2|LINE|L1 82444 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 189.25-89 chr4 53090519 53090800 + 1.5 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 228342 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 473 chr14 55698459 55699052 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -67490 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 191.75-89 chr4 31770934 31771196 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -226314 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 250.5-53 chr2 228606112 228606399 + 1.5 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) intron (NR_151716, intron 1 of 3) 5140 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 154.5-194 chr8 129775839 129775971 + 1.5 NA intron (NM_031415, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 10719 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 318-38 chr8 85109651 85110018 + 1.5 NA intron (NM_033402, intron 2 of 18) intron (NM_033402, intron 2 of 18) 2596 NM_001349636 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 566-3 chr6 167156497 167157213 + 1.5 NA TTS (NM_005299) TTS (NM_005299) 976 NM_005299 2853 Hs.248124 NM_005299 ENSG00000120436 GPR31 12-HETER|HETER|HETER1 G protein-coupled receptor 31 protein-coding 217-10 chr10 68428995 68429250 + 1.5 NA intron (NM_001080449, intron 14 of 20) intron (NM_001080449, intron 14 of 20) -21828 NM_001278225 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 177-77 chr5 29984235 29984383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 103749 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 278.75-41 chr9 30387061 30387363 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21242 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 132-165 chr7 77362879 77363015 + 1.5 NA intron (NR_146937, intron 12 of 31) intron (NR_146937, intron 12 of 31) -52251 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 249.75-13 chr12 13128806 13129036 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25254 NM_001080555 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 439.5-13 chr3 67346915 67347309 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 121648 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 185-44 chr2 67862354 67862530 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36880 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 331.25-27 chrX 101809474 101809754 + 1.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 47963 NR_159736 55998 Hs.307077 NM_032946 ENSG00000126952 NXF5 - nuclear RNA export factor 5 protein-coding 136-19 chr10 96814222 96814340 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 14483 NR_030338 693192 NR_030338 ENSG00000207976 MIR607 MIRN607|hsa-mir-607 microRNA 607 ncRNA 319.5-9 chr12 1018703 1019020 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 1 of 19) L2c|LINE|L2 -8887 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 501.5-4 chr8 126912409 126912987 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100456 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 219.75-61 chr5 31723324 31723501 + 1.5 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 84281 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 269.25-17 chr17 14315052 14315419 + 1.5 NA intron (NR_130138, intron 1 of 2) intron (NR_130138, intron 1 of 2) 11495 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 229-32 chr2 37986344 37986563 + 1.5 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) L1MC1|LINE|L1 35989 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 182.5-126 chr5 9549563 9549783 + 1.5 NA TTS (NR_003689) TTS (NR_003689) 846 NR_003689 100113384 NR_003689 SNORD123 - small nucleolar RNA, C/D box 123 snoRNA 211-31 chr2 57965246 57965427 + 1.5 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) 57685 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 341-26 chr8 62935310 62935616 + 1.5 NA intron (NR_130764, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR -42398 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 310.5-38 chr8 46969934 46970248 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 129205 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 321.25-14 chr2 156380517 156380998 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -38637 NR_147695 440918 Hs.641142 NR_147695 FLJ46875 - uncharacterized LOC440918 ncRNA 173-40 chr13 47877555 47877746 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54972 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 409.5-15 chr7 69841546 69842189 + 1.5 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) L1MC5a|LINE|L1 243392 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 387-13 chr7 111123590 111123979 + 1.5 NA exon (NM_001099660, exon 4 of 4) exon (NM_001099660, exon 4 of 4) 32657 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 273.75-17 chr18 57112840 57113180 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34077 NM_001257964 284257 Hs.127882 NM_001257964 ENSG00000228075 BOD1L2 BOD1P|FAM44C biorientation of chromosomes in cell division 1 like 2 protein-coding 475.25-4 chr20 59372484 59373177 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 72219 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 248.5-96 chr7 81194167 81194518 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -271953 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 239.5-60 chr5 128587730 128587921 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49580 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 133.5-42 chr10 108624492 108624601 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -555253 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 283-8 chr10 19704526 19704765 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 38 of 39) intron (NM_001142308, intron 38 of 39) 23905 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 240-14 chr11 114253127 114253386 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001354752, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001354752, exon 5 of 5) -42557 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 245.25-15 chr12 60188668 60188845 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 499386 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 288-43 chr7 109102107 109102309 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -217621 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 274.5-5 chr10 19095273 19095506 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 4 of 39) intron (NM_001142308, intron 4 of 39) 46588 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 184-72 chr5 72641967 72642134 + 1.5 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) intron (NR_105007, intron 1 of 2) 18619 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 177.75-87 chr20 6293634 6293779 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -133026 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 364-11 chr2 174878856 174879199 + 1.5 NA intron (NM_001025201, intron 6 of 12) intron (NM_001025201, intron 6 of 12) -31409 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 324-18 chr3 23537700 23538002 + 1.5 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -268104 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 212.5-3 chr1 73217890 73218189 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -88131 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 328-31 chr5 123886862 123887276 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 341652 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 206-83 chrX 80881706 80881997 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -71974 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 272-41 chr9 73837096 73837404 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -534281 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 483.5-2 chr19 27885265 27885714 + 1.5 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) LTR9B|LTR|ERV1 -91549 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 320.25-30 chr8 127786651 127786928 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -7744 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 183.75-41 chr15 33643897 33644069 + 1.5 NA intron (NM_001243996, intron 27 of 102) intron (NM_001243996, intron 27 of 102) -324514 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 171-113 chr5 106340719 106340917 + 1.5 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 670196 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 158-118 chr6 34740515 34740693 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16490 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 291-21 chr2 233781913 233782223 + 1.5 NA intron (NM_001367507, intron 3 of 41) L1MA5|LINE|L1 6344 NM_001367507 339766 Hs.361778 NM_001287395 ENSG00000185038 MROH2A HEATR7B1 maestro heat like repeat family member 2A protein-coding 267.5-22 chr14 67874072 67874637 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 5 of 10) MER30|DNA|hAT-Charlie 50762 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 265.5-27 chr15 63742880 63743206 + 1.5 NA intron (NM_003922, intron 12 of 77) L1MB7|LINE|L1 90905 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 368.75-4 chr10 109667479 109668123 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 255445 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 402-7 chr22 26040660 26041323 + 1.5 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -128471 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 237-44 chr4 177697813 177698015 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30843 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 323.25-27 chr8 103881048 103881340 + 1.5 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 61974 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 129.75-73 chr16 85961074 85961228 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42804 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 205.5-43 chr14 60230714 60230921 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -14933 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 312.5-19 chr22 26871996 26872276 + 1.5 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 11925 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 143-126 chr6 90539656 90539834 + 1.5 NA intron (NM_145333, intron 11 of 14) LTR86A1|LTR|ERVL 47327 NM_003188 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 194.75-36 chr17 53140808 53140996 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155397 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 592.75-2 chr7 97139469 97140114 + 1.5 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 23198 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 300.5-11 chr12 9080456 9080739 + 1.5 NA intron (NM_000014, intron 22 of 35) intron (NM_000014, intron 22 of 35) 15420 NR_137424 144571 Hs.592432 NR_026971 ENSG00000245105 A2M-AS1 - A2M antisense RNA 1 ncRNA 363.25-3 chr14 42503448 42503805 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 896770 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 114.5-151 chr2 189595309 189595437 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14562 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 180-100 chr5 123592965 123593160 + 1.5 NA intron (NM_001364145, intron 8 of 10) intron (NM_001364145, intron 8 of 10) 47645 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 237-58 chr6 147833883 147834320 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 325411 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 292.5-3 chr1 115072159 115072558 + 1.5 NA intron (NM_005725, intron 2 of 7) (CCTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17142 NM_001308315 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 147.75-54 chr17 73800138 73800271 + 1.5 NA intron (NR_040020, intron 6 of 6) L1MC2|LINE|L1 13382 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 217.5-85 chr3 185460820 185461090 + 1.5 NA intron (NM_004721, intron 7 of 13) intron (NM_004721, intron 7 of 13) 38080 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 215.75-72 chr4 112315252 112315499 + 1.5 NA intron (NM_001102406, intron 1 of 15) LTR83|LTR|ERVL 18006 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 210-86 chr6 132429044 132429213 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27653 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 305-25 chr3 30102319 30102725 + 1.5 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -168366 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 167.25-68 chr18 583475 583656 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 3185 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 210.75-61 chr3 131416317 131416501 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 34635 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 180.5-48 chr15 62024916 62025122 + 1.5 NA intron (NM_001018088, intron 6 of 81) L2c|LINE|L2 35428 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 308.75-36 chr7 79998491 79998989 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -136091 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 154.5-58 chr13 88550416 88550610 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 9684 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 160-25 chr12 58197872 58198096 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 110092 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 167.75-67 chr2 7310917 7311146 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -110230 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 163.25-27 chr11 120340595 120340748 + 1.5 NA intron (NM_015313, intron 1 of 40) intron (NM_015313, intron 1 of 40) 4258 NM_015313 23365 Hs.24598 NM_015313 ENSG00000196914 ARHGEF12 LARG|PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 protein-coding 273-34 chr21 16112186 16112631 + 1.5 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) intron (NR_111005, intron 1 of 6) 41294 NR_111005 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 241.5-55 chr20 7079793 7080047 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 174282 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 435-7 chr3 1920800 1921248 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -177779 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 381.75-3 chr7 113181309 113182023 + 1.5 NA Intergenic (TATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -63084 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 171.75-109 chr5 5112482 5112705 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 27461 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 228.75-71 chr7 7930045 7930468 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 38496 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 290.5-16 chr17 28729041 28729250 + 1.5 NA intron (NM_178170, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 357 NM_178170 284086 Hs.448468 NM_178170 ENSG00000160602 NEK8 JCK|NEK12A|NPHP9|RHPD2 NIMA related kinase 8 protein-coding 412.25-11 chr2 101104169 101104662 + 1.5 NA intron (NM_001102426, intron 1 of 19) L1MC3|LINE|L1 47032 NM_001330348 11138 Hs.442657 NM_007063 ENSG00000204634 TBC1D8 AD3|GRAMD8|HBLP1|TBC1D8A|VRP TBC1 domain family member 8 protein-coding 292.75-18 chr20 12522485 12522849 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 414296 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 349.5-16 chr4 69764062 69764442 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -3632 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 181.5-92 chr2 199121872 199122072 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 335967 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 270-45 chr5 167627226 167627484 + 1.5 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 53696 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 478.25-2 chr2 78509334 78509812 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -35958 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 252.5-32 chr17 71041214 71041564 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 160790 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 235-67 chr7 41361552 41361723 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 260033 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 281.75-40 chr7 28133516 28133825 + 1.5 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -46787 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 262-63 chr9 21700591 21700790 + 1.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -101946 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 378.75-5 chr11 106838243 106838627 + 1.5 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) intron (NM_001256424, intron 4 of 8) 180041 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 233.25-32 chr18 71743189 71743450 + 1.5 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) L1PA15-16|LINE|L1 38907 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 208-64 chr4 180568036 180568259 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 591002 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 313.5-3 chr1 244544223 244544521 + 1.5 NA intron (NM_001130957, intron 8 of 21) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 83001 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 258.5-24 chr15 59959157 59959555 + 1.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -44955 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 163.25-82 chr21 28469606 28469805 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69613 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 361.5-10 chr18 72129676 72130021 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -347622 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 268.5-5 chr1 204772710 204772996 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55799 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 542.75-2 chr8 107328218 107328890 + 1.5 NA intron (NM_001199859, intron 3 of 8) intron (NM_001199859, intron 3 of 8) 7961 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 303.5-34 chr4 83151848 83152080 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -37235 NM_016619 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 437.75 chr10 86500970 86501532 + 1.5 NA intron (NM_001318328, intron 2 of 18) intron (NM_001318328, intron 2 of 18) 20533 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 203-74 chr4 107945750 107945925 + 1.5 NA intron (NM_183075, intron 2 of 4) intron (NM_183075, intron 2 of 4) -13718 NR_125929 101929595 Hs.678014 NR_125929 ENSG00000245293 LOC101929595 - uncharacterized LOC101929595 ncRNA 315.5-13 chr20 50265038 50265268 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2333 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 272.5-17 chr12 5508852 5509126 + 1.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 14857 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 302.5-23 chr2 201726397 201726722 + 1.5 NA intron (NM_020919, intron 18 of 33) intron (NM_020919, intron 18 of 33) -27915 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 213.5-114 chr7 11211319 11211543 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 237559 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 304.25-26 chr8 80088820 80089062 + 1.5 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) AluY|SINE|Alu -8110 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 390.5-2 chr11 95720229 95720652 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69342 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 391-10 chr2 14830996 14831395 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 198478 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 201.75-4 chr1 170057788 170057933 + 1.5 NA intron (NM_014970, intron 1 of 19) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 11055 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 264-44 chr3 82438064 82438407 + 1.5 NA intron (NR_147146, intron 4 of 8) intron (NR_147146, intron 4 of 8) 452093 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 187.75-7 chr1 197653486 197653767 + 1.5 NA intron (NR_125340, intron 6 of 19) intron (NR_125340, intron 6 of 19) 121854 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 158.5-80 chr17 57841011 57841198 + 1.5 NA intron (NM_016070, intron 3 of 4) intron (NM_016070, intron 3 of 4) 8940 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 385-8 chr2 34683301 34683707 + 1.5 NA intron (NR_126404, intron 1 of 2) intron (NR_126404, intron 1 of 2) 5947 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 113.5-157 chr3 61844799 61844926 + 1.5 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 283291 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 219-81 chr5 44474004 44474288 + 1.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 36136 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 396.5-10 chr8 89617589 89618093 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 139870 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 156.5-20 chr10 110609991 110610149 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34266 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 183.75-84 chr4 64680281 64680512 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -270936 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 307-10 chr12 32190250 32190557 + 1.5 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) L1MA9|LINE|L1 83556 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 230-66 chr8 89777508 89777711 + 1.5 NA intron (NM_003821, intron 6 of 10) intron (NM_003821, intron 6 of 10) 19793 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 200.25-23 chr12 10088022 10088222 + 1.5 NA intron (NM_001297748, intron 1 of 4) intron (NM_001297748, intron 1 of 4) 10863 NM_001297751 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 345.5-2 chr1 86541443 86541789 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5462 NM_012128 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 232-76 chr8 137799326 137799545 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 284110 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 124-98 chr2 228234491 228234677 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52897 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 236.5-24 chr14 45942469 45942790 + 1.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -121530 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 194.5-46 chr16 50983140 50983357 + 1.5 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) intron (NR_039672, intron 2 of 6) -34510 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 286.5-21 chr14 39032165 39032495 + 1.5 NA 3' UTR (NM_006364, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_006364, exon 20 of 20) -70810 NR_146545 105370458 NR_146545 ENSG00000258651 SEC23A-AS1 - SEC23A antisense RNA 1 ncRNA 126.5-248 chr8 113037417 113037557 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 339665 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 198.5-162 chr9 40913833 40913970 + 1.5 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 15191 NR_031629 100302167 NR_031629 ENSG00000275377 MIR1299 MIRN1299|hsa-mir-1299 microRNA 1299 ncRNA 168-45 chr14 33880675 33880843 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 70315 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 270-56 chr8 109377624 109377937 + 1.5 NA intron (NM_177531, intron 2 of 77) intron (NM_177531, intron 2 of 77) 15319 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 305-20 chr2 187501668 187501944 + 1.5 NA intron (NM_001318941, intron 3 of 7) intron (NM_001318941, intron 3 of 7) 52629 NM_001329241 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 338.5-2 chr1 56941918 56942201 + 1.5 NA intron (NM_000066, intron 8 of 11) MIR|SINE|MIR 23956 NM_000066 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 264-56 chr6 47001983 47002314 + 1.5 NA intron (NM_153840, intron 13 of 14) intron (NM_153840, intron 13 of 14) 40184 NM_153840 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 204.5-57 chr18 75649623 75649779 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62702 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 270.75-15 chr14 80452316 80452576 + 1.5 NA intron (NR_038355, intron 8 of 8) intron (NR_038355, intron 8 of 8) -221389 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 281.5-17 chr14 68967427 68967694 + 1.5 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) intron (NM_001102, intron 1 of 20) 11742 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 185-51 chr22 36411780 36411940 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -23793 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 163.5-144 chr4 57483397 57483531 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 57592 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 302.25-9 chr14 29666204 29666663 + 1.5 NA intron (NM_001330069, intron 2 of 18) intron (NM_001330069, intron 2 of 18) 260663 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 247.25-47 chr4 80289850 80290194 + 1.5 NA 3' UTR (NM_033143, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_033143, exon 2 of 2) 21757 NM_001291812 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 260-48 chr8 132703829 132704069 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28404 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 195-84 chr7 104241630 104241974 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33755 NM_181747 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 153-72 chr2 63964499 63964628 + 1.5 NA intron (NM_001005739, intron 6 of 22) intron (NM_001005739, intron 6 of 22) 54865 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 337.75-9 chr18 72157305 72157696 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -375274 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 290.25-28 chr5 152823295 152823647 + 1.5 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) L1MD1|LINE|L1 148878 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 348.75-11 chr2 138897815 138898286 + 1.5 NA non-coding (NR_033658, exon 1 of 1) non-coding (NR_033658, exon 1 of 1) 726 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 338.5-13 chr2 67487650 67487980 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 90482 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 227-57 chr6 74727801 74727993 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 400885 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 116.25-230 chr8 118936293 118936411 + 1.5 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) intron (NM_002546, intron 1 of 4) 15533 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 148.5-214 chr7 85279698 85279970 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -141288 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 405-10 chr20 8121639 8122090 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10402 NM_182734 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 185.25-22 chr12 115647298 115647511 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 501250 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 275.25-2 chr1 157876904 157877251 + 1.5 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -35269 NM_005894 922 Hs.134035 NM_005894 ENSG00000073754 CD5L AIM|API6|CT-2|PRO229|SP-ALPHA|Spalpha|hAIM CD5 molecule like protein-coding 306-30 chr4 124316785 124317014 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 241535 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 274-6 chr10 89131438 89131744 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -68180 NR_039827 100616192 NR_039827 ENSG00000265375 MIR4679-2 - microRNA 4679-2 ncRNA 269.5-19 chr15 63997010 63997377 + 1.5 NA intron (NM_014326, intron 2 of 11) intron (NM_014326, intron 2 of 11) 49292 NM_001363730 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 127.5-64 chr13 80725840 80725930 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -292506 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 265.5-59 chr7 52875901 52876234 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -159566 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 146.25-26 chr12 65705487 65705620 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -63181 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 362-13 chr5 51186732 51187227 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 196353 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 276.75-22 chr2 54087204 54087571 + 1.5 NA intron (NM_001320587, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu -28228 NM_001320589 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 362.75-11 chr6 132361705 132362105 + 1.5 NA intron (NM_015529, intron 4 of 11) intron (NM_015529, intron 4 of 11) 39570 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 291-34 chr8 128154329 128154658 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 4377 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 148.5-68 chr15 91593806 91594064 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 130596 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 273.5-78 chr8 31702774 31703087 + 1.5 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 63178 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 277.75-40 chrX 51150779 51151014 + 1.5 NA intron (NR_110382, intron 1 of 8) intron (NR_110382, intron 1 of 8) 20525 NR_110382 101926971 Hs.657995 NR_110382 ENSG00000230317 LINC01284 - long intergenic non-protein coding RNA 1284 ncRNA 297.75-15 chr2 29859837 29860109 + 1.5 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 61613 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 246.75-8 chr10 94283656 94283877 + 1.5 NA intron (NR_033969, intron 1 of 3) intron (NR_033969, intron 1 of 3) 3304 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 347.5-2 chr10 58706578 58707023 + 1.5 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -8215 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 149-51 chr2 39388754 39388994 + 1.5 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) L1MEd|LINE|L1 48411 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 317.25-2 chr1 22510006 22510417 + 1.5 NA intron (NM_001083621, intron 10 of 18) intron (NM_001083621, intron 10 of 18) -53278 NM_020526 2046 Hs.283613 NM_020526 ENSG00000070886 EPHA8 EEK|EK3|HEK3 EPH receptor A8 protein-coding 388-4 chr17 61266230 61266671 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 101254 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 205-81 chrX 28090848 28091091 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109520 NM_001017930 139425 Hs.447365 NM_001017930 ENSG00000226372 DCAF8L1 WDR42B DDB1 and CUL4 associated factor 8 like 1 protein-coding 248.25-72 chr8 82633101 82633374 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -278867 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 262.5-24 chr15 78813642 78813897 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2305 NM_014272 11173 Hs.16441 NM_014272 ENSG00000136378 ADAMTS7 ADAM-TS 7|ADAM-TS7|ADAMTS-7 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 7 protein-coding 356.5-6 chr11 105546235 105546735 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63588 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 285-21 chr2 32491584 32491979 + 1.5 NA intron (NM_016252, intron 44 of 73) intron (NM_016252, intron 44 of 73) -40372 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 201.25-97 chr9 128070445 128070693 + 1.5 NA intron (NM_001006641, intron 1 of 9) (GTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2369 NM_001330988 114789 Hs.5476 NM_052901 ENSG00000148339 SLC25A25 MCSC|PCSCL|SCAMC-2 solute carrier family 25 member 25 protein-coding 296.25-10 chr15 63797380 63797589 + 1.5 NA intron (NM_003922, intron 1 of 77) LTR8B|LTR|ERV1 36464 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 306.5-34 chr7 15985860 15986173 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -224470 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 168-62 chr2 2898030 2898195 + 1.5 NA intron (NR_110228, intron 5 of 6) intron (NR_110228, intron 5 of 6) 227914 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 215-15 chr11 79550798 79550968 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109853 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 219.5-54 chr17 45298185 45298692 + 1.5 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) L1MEi|LINE|L1 18582 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 273-62 chr9 105773798 105774074 + 1.5 NA exon (NM_018112, exon 6 of 6) exon (NM_018112, exon 6 of 6) 79395 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 344.5-17 chr3 189337437 189337825 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -97037 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 179.25-141 chr8 63788706 63788921 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 19383 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 242-21 chr14 64206946 64207263 + 1.5 NA intron (NM_015180, intron 100 of 114) intron (NM_015180, intron 100 of 114) -7040 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 227.75-56 chr4 30318669 30318903 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -401583 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 215.5-21 chr11 83074638 83075132 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 2819 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 271.25-2 chr1 63199796 63200061 + 1.5 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) intron (NR_038252, intron 4 of 11) 117329 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 171.5-139 chr7 36691036 36691238 + 1.5 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) MIRc|SINE|MIR 33357 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 279.5-30 chr2 129649261 129649599 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 228061 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 226.5-61 chr3 70899080 70899275 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165747 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 413-8 chr5 149336466 149337041 + 1.5 NA intron (NM_152406, intron 18 of 18) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -8746 NM_152407 134266 Hs.511816 NM_152407 ENSG00000164284 GRPEL2 Mt-GrpE#2 GrpE like 2, mitochondrial protein-coding 476.25-2 chr21 22911686 22912200 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -167341 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 406-4 chr18 8429327 8429779 + 1.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -62519 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 161-56 chr18 48374167 48374331 + 1.5 NA intron (NM_001371291, intron 1 of 6) intron (NM_001371291, intron 1 of 6) 1378 NM_001371290 238-13 chr12 40093304 40093638 + 1.5 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 12610 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 326.25-16 chr17 69959103 69959433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2439 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 264.75-18 chr19 41854048 41854389 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6037 NM_001022 6223 Hs.438429 NM_001022 ENSG00000105372 RPS19 DBA|DBA1|S19|eS19 ribosomal protein S19 protein-coding 159.5-136 chr3 1164229 1164444 + 1.5 NA intron (NM_001289080, intron 2 of 22) LTR33C|LTR|ERVL 71312 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 171.75-51 chr15 60407471 60407656 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9577 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 186.5-84 chr22 27553424 27553686 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 242904 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 318.5-40 chr8 119582284 119582782 + 1.5 NA non-coding (NR_045555, exon 7 of 14) non-coding (NR_045555, exon 7 of 14) 10475 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 148.75-37 chr12 10662330 10662587 + 1.5 NA intron (NM_018423, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 11594 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 276.5-43 chr3 63719756 63719968 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 67187 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 236-60 chr6 34711087 34711280 + 1.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 14238 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 262.5-74 chr8 102148362 102148577 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 23037 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 538.75 chr2 163470340 163470929 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 265374 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 230.5-10 chr1 218414439 218414629 + 1.5 NA intron (NR_138148, intron 2 of 6) intron (NR_138148, intron 2 of 6) -23099 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 154.5-157 chr6 43054260 43054458 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001168370) promoter-TSS (NM_001168370) -414 NM_014780 9820 Hs.520136 NM_014780 ENSG00000044090 CUL7 3M1|CUL-7|KIAA0076|dJ20C7.5 cullin 7 protein-coding 361.5-13 chr4 163307606 163308017 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 24785 NM_000909 4886 Hs.519057 NM_000909 ENSG00000164128 NPY1R NPY1-R|NPYR neuropeptide Y receptor Y1 protein-coding 291.5-13 chr15 77192893 77193284 + 1.5 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 32316 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 336.5-9 chr13 53420560 53420824 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -268792 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 236.25-72 chr5 111536137 111536364 + 1.5 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -23653 NM_001308057 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 277.5-41 chr3 2963175 2963376 + 1.5 NA intron (NM_175607, intron 13 of 24) intron (NM_175607, intron 13 of 24) 71060 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 152.5-166 chr6 54632854 54633011 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -213839 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 279.5-20 chr15 45349801 45350152 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 28568 NM_001482 2628 Hs.75335 NM_001482 ENSG00000171766 GATM AGAT|AT|CCDS3 glycine amidinotransferase protein-coding 243.75-48 chr20 48297602 48297832 + 1.5 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -62194 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 551.25 chr19 43595774 43596772 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_024327) promoter-TSS (NM_024327) -119 NM_024327 79177 Hs.11110 NM_024327 ENSG00000124444 ZNF576 - zinc finger protein 576 protein-coding 182-117 chrX 108669509 108669681 + 1.5 NA intron (NM_033380, intron 41 of 50) intron (NM_033380, intron 41 of 50) 66782 NM_003604 8471 Hs.407141 NM_003604 ENSG00000133124 IRS4 IRS-4|PY160 insulin receptor substrate 4 protein-coding 342-3 chr10 83764997 83765407 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -88113 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 302-13 chr16 27658950 27659348 + 1.5 NA intron (NM_015202, intron 6 of 27) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 59880 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 316.5-34 chr6 146476312 146476616 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -67369 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 165.5-148 chr5 52617177 52617308 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -170674 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 277-33 chr6 153334601 153334904 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -203470 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 174-12 chr11 26665539 26665678 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 56452 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 114-32 chr11 115827527 115827626 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -67376 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 335.25-5 chr10 52543845 52544210 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -73494 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 277.5-33 chr2 120649358 120649687 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -86346 NM_001371271 212.25-47 chr2 151158540 151158810 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 103188 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 156.25-160 chr9 128923330 128923556 + 1.5 NA intron (NM_001100877, intron 1 of 9) intron (NM_001100877, intron 1 of 9) 1160 NM_001100877 254295 Hs.709447 NM_174933 ENSG00000175287 PHYHD1 - phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1 protein-coding 309.75-22 chr2 237430417 237430749 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -16376 NM_057167 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 261.5-2 chr10 24026900 24027173 + 1.5 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 -181755 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 213-101 chrX 112962408 112962619 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80214 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 244-16 chr14 66674826 66675091 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1MA5|LINE|L1 167551 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 411.5-3 chr13 87456447 87456839 + 1.5 NA intron (NR_033829, intron 4 of 5) intron (NR_033829, intron 4 of 5) 162097 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 318-34 chr5 140603241 140603475 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 29817 NM_000591 929 Hs.163867 NM_000591 ENSG00000170458 CD14 - CD14 molecule protein-coding 125-155 chr8 43375450 43375573 + 1.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 83069 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 252-51 chr4 94570875 94571081 + 1.5 NA intron (NM_001011516, intron 3 of 9) intron (NM_001011516, intron 3 of 9) 119036 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 213-57 chr21 22735635 22735852 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -343541 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 250-18 chr17 77717903 77718220 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 10498 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 153.5-169 chr6 40225937 40226117 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 129979 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 226.75-4 chr10 17138976 17139166 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001321007, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001321007, exon 12 of 12) -9254 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 329.75-4 chr10 30971407 30971819 + 1.5 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) intron (NR_026560, intron 1 of 6) 27904 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 326.25-22 chr20 43581454 43581707 + 1.5 NA intron (NM_170693, intron 12 of 12) AluSz6|SINE|Alu -9357 NM_001303459 51098 Hs.444332 NM_016004 ENSG00000101052 IFT52 C20orf9|CGI-53|NGD2|NGD5 intraflagellar transport 52 protein-coding 492.25-3 chr14 105091940 105092753 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1801 NR_110546 102723354 Hs.569410 NR_110546 LINC02298 - long intergenic non-protein coding RNA 2298 ncRNA 239.25-20 chr12 106448661 106448925 + 1.5 NA intron (NM_001160708, intron 19 of 27) intron (NM_001160708, intron 19 of 27) 90711 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 172-9 chr1 193693268 193693493 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 388635 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 173.75-134 chr6 61828844 61829152 + 1.5 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 254868 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 185.5-146 chr6 142158980 142159247 + 1.5 NA intron (NM_001286372, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 11850 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 406 chr10 49408158 49408652 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12316 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 353.5-20 chr8 48420274 48420647 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -131107 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 122.25-88 chr2 57854312 57854415 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -53288 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 279.5-7 chr10 48325556 48325762 + 1.5 NA intron (NM_001323327, intron 2 of 12) L1MC3|LINE|L1 18982 NM_001323328 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 181.25-60 chr2 48367396 48367585 + 1.5 NA intron (NM_002158, intron 5 of 6) intron (NM_002158, intron 5 of 6) 52808 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 156.25-88 chr21 27155268 27155625 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -188358 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 171.75-66 chr18 69889476 69889683 + 1.5 NA intron (NM_001303618, intron 3 of 5) intron (NM_001303618, intron 3 of 5) 58294 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 252.75-69 chr7 97496799 97497055 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -235159 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 272.25-59 chr8 41806941 41807183 + 1.5 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9440 NM_000037 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 316 chr1 229487190 229487518 + 1.5 NA intron (NM_018230, intron 10 of 25) intron (NM_018230, intron 10 of 25) 20987 NM_018230 55746 Hs.12457 NM_018230 ENSG00000069248 NUP133 GAMOS8|NPHS18|hNUP133 nucleoporin 133 protein-coding 321.75-26 chr4 159230369 159230781 + 1.5 NA intron (NM_001351725, intron 1 of 26) intron (NM_001351725, intron 1 of 26) 2092 NM_001351725 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 163.75-127 chr8 118544779 118545090 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -76067 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 310.5-21 chr20 21560778 21561106 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -9082 NR_109880 101929625 Hs.542413 NR_109880 LINC01727 - long intergenic non-protein coding RNA 1727 ncRNA 335.5-5 chr18 66826309 66826630 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -222379 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 139.5-7 chr1 216235659 216235844 + 1.5 NA intron (NM_206933, intron 13 of 71) intron (NM_206933, intron 13 of 71) 163286 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 363-17 chr5 150041837 150042352 + 1.5 NA intron (NM_014983, intron 15 of 19) intron (NM_014983, intron 15 of 19) 41355 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 158.5-116 chr20 40260965 40261180 + 1.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 256611 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 245.25-43 chr2 161383388 161383664 + 1.5 NA intron (NM_005805, intron 7 of 11) intron (NM_005805, intron 7 of 11) -32771 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 139-145 chr7 92879191 92879295 + 1.5 NA intron (NR_110087, intron 2 of 2) L1M3b|LINE|L1 -42616 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 430-14 chr4 100092484 100093057 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -97263 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 146.5-74 chr15 93380677 93380809 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 174677 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 332.25-21 chr3 8027422 8027746 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11277 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 330-5 chr10 63242873 63243249 + 1.5 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 26162 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 216.5-74 chr3 54316685 54316979 + 1.5 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 194280 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 212-33 chr19 39511406 39511679 + 1.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -3571 NM_001350809 348303 Hs.319284 NM_182704 ENSG00000186838 SELENOV SELV selenoprotein V protein-coding 273.5-72 chr7 40185473 40185747 + 1.5 NA intron (NM_024728, intron 3 of 14) AluSq2|SINE|Alu 50634 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 171.25-55 chr16 49972667 49972931 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52407 NM_153261 255919 Hs.59134 NM_153261 ENSG00000205423 CNEP1R1 C16orf69|NEP1-R1|NEP1R1|TMEM188|TMP125 CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 protein-coding 263.5-11 chr12 24930429 24930793 + 1.5 NA intron (NM_001178091, intron 1 of 9) intron (NM_001178091, intron 1 of 9) 18490 NM_001178092 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 140.25-144 chr5 19772693 19772858 + 1.5 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) MIRb|SINE|MIR 113497 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 353-15 chr20 44207512 44207818 + 1.5 NA intron (NM_016470, intron 1 of 3) intron (NM_016470, intron 1 of 3) 3106 NM_016470 51526 Hs.75798 NM_016470 ENSG00000132823 OSER1 C20orf111|HSPC207|Osr1|Perit1|dJ1183I21.1 oxidative stress responsive serine rich 1 protein-coding 355.5-27 chr8 79498758 79499404 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -112036 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 181.5-100 chr22 25825700 25825864 + 1.5 NA intron (NM_001318245, intron 13 of 43) L1ME4a|LINE|L1 83594 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 280-10 chr10 73128311 73128646 + 1.5 NA intron (NM_001283015, intron 7 of 7) L1MA10|LINE|L1 -2271 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 122.25-18 chr1 238561436 238561587 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -75494 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 280.5-43 chr5 142127820 142128241 + 1.5 NA intron (NM_030571, intron 1 of 7) intron (NM_030571, intron 1 of 7) 19251 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 331.25-13 chr5 8705382 8705803 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -134140 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 127.25-145 chr4 66485756 66485874 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 208991 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 234.75-79 chr7 113607665 113607906 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 311224 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 124.5-98 chr2 24035090 24035175 + 1.5 NA intron (NM_025203, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 12259 NM_025203 80304 Hs.24624 NM_025203 ENSG00000163026 WDCP C2orf44|MMAP|PP384 WD repeat and coiled coil containing protein-coding 222-63 chr5 28390847 28391022 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103269 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 288-28 chr20 46688193 46688503 + 1.5 NA intron (NM_033550, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 1096 NM_033550 112858 Hs.440263 NM_033550 ENSG00000172315 TP53RK BUD32|C20orf64|GAMOS4|Nori-2|Nori-2p|PRPK|dJ101A2 TP53 regulating kinase protein-coding 288-44 chr8 91156517 91156763 + 1.5 NA intron (NR_148895, intron 7 of 10) L1MA5|LINE|L1 -48845 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 297-13 chr13 103702359 103702613 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 277286 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 234.75-33 chr18 80093741 80093954 + 1.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -15415 NM_014913 22850 Hs.131915 NM_014913 ENSG00000101544 ADNP2 ZNF508 ADNP homeobox 2 protein-coding 362.5-12 chr2 169257892 169258234 + 1.5 NA intron (NM_004525, intron 17 of 78) intron (NM_004525, intron 17 of 78) 104471 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 201.75-25 chr12 99751045 99751314 + 1.5 NA intron (NM_152788, intron 8 of 25) intron (NM_152788, intron 8 of 25) 103426 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 228-44 chr20 33221519 33221716 + 1.5 NA intron (NM_178466, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 4265 NM_178466 128861 Hs.360989 NM_178466 ENSG00000131059 BPIFA3 C20orf71|SPLUNC3 BPI fold containing family A member 3 protein-coding 306.5-24 chr2 186709999 186710266 + 1.5 NA intron (NM_177454, intron 1 of 7) intron (NM_177454, intron 1 of 7) 16072 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 564.5 chr7 16625197 16625633 + 1.5 NA intron (NM_020319, intron 3 of 9) intron (NM_020319, intron 3 of 9) 20339 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 194.5-136 chr6 152249828 152250042 + 1.5 NA intron (NM_182961, intron 104 of 145) intron (NM_182961, intron 104 of 145) -64557 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 222.5-34 chr15 84675762 84676091 + 1.5 NA intron (NM_001271919, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 -17727 NM_021077 4828 Hs.386470 NM_021077 ENSG00000197696 NMB - neuromedin B protein-coding 331.5-9 chr14 65233561 65233946 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -11406 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 215.25-38 chr17 59568626 59568840 + 1.5 NA intron (NM_024612, intron 2 of 17) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 3123 NM_024612 79665 Hs.29403 NM_024612 ENSG00000108406 DHX40 ARG147|DDX40|PAD DEAH-box helicase 40 protein-coding 347.5-5 chr10 93642938 93643240 + 1.5 NA intron (NM_006204, intron 14 of 21) MIRb|SINE|MIR 30552 NM_006204 5146 Hs.658121 NM_006204 ENSG00000095464 PDE6C ACHM5|COD4|PDEA2 phosphodiesterase 6C protein-coding 423.75-9 chr4 35854820 35855265 + 1.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 388897 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 126-148 chr5 153943400 153943490 + 1.5 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -44458 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 113-47 chr12 12124450 12124596 + 1.5 NA intron (NM_002336, intron 22 of 22).2 intron (NM_002336, intron 22 of 22).2 12571 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 227-51 chr5 66591038 66591349 + 1.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -5200 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 210-58 chr2 220877212 220877422 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 694987 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 137-189 chr9 85936373 85936474 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4719 NM_001321881 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 200-15 chr10 89919261 89919450 + 1.5 NA intron (NR_110655, intron 3 of 3) intron (NR_110655, intron 3 of 3) 31221 NR_149079 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 303-19 chr22 33680748 33681078 + 1.5 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) intron (NM_133642, intron 2 of 14) 24007 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 225-5 chr1 214671205 214671454 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 68134 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 123-7 chr1 82981542 82981636 + 1.5 NA intron (NR_110633, intron 1 of 2) intron (NR_110633, intron 1 of 2) 3333 NR_110632 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 415.5-4 chr14 71001078 71001703 + 1.5 NA intron (NM_014982, intron 8 of 35) L1ME4a|LINE|L1 93931 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 293.5-8 chr10 107252023 107252471 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -87541 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 312-24 chr4 165812281 165812562 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60816 NM_001204760 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 136.5-216 chr8 21010016 21010131 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 36087 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 277.5-36 chr20 25324821 25325097 + 1.5 NA intron (NM_001042472, intron 2 of 12) intron (NM_001042472, intron 2 of 12) 65876 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 377.5-9 chr2 29466055 29466394 + 1.5 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) 9153 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 341-27 chr8 133779854 133780195 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -2672 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 385.25-10 chr5 87522992 87523357 + 1.5 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -110141 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 371.5-11 chr4 107044865 107045130 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8684 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 288.75-46 chr8 124604878 124605178 + 1.5 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 65905 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 288-6 chr1 214369083 214369507 + 1.5 NA intron (NM_005401, intron 17 of 18) intron (NM_005401, intron 17 of 18) 88136 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 174.75-88 chr4 11697387 11697547 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 72001 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 248.5-4 chr1 153032756 153033078 + 1.5 NA TTS (NM_003125) TTS (NM_003125) 1714 NM_003125 6699 Hs.1076 NM_003125 ENSG00000169469 SPRR1B CORNIFIN|GADD33|SPR-IB|SPRR1 small proline rich protein 1B protein-coding 269.5-11 chr12 24643987 24644301 + 1.5 NA Intergenic LTR103_Mam|LTR|ERV1? -59976 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 303-12 chr15 81248942 81249261 + 1.5 NA intron (NM_001352686, intron 2 of 18) L1ME3E|LINE|L1 -47869 NM_004513 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 335.25-2 chr1 172622531 172622932 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -36277 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 181.5-10 chr1 229816112 229816354 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69585 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 241.75-28 chr14 88735405 88735664 + 1.5 NA intron (NM_183387, intron 7 of 42) L1ME4b|LINE|L1 57419 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 256-12 chr14 88037020 88037215 + 1.5 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) intron (NR_046094, intron 2 of 3) -10805 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 169.5-28 chr11 112069921 112070138 + 1.5 NA intron (NM_138789, intron 5 of 5) intron (NM_138789, intron 5 of 5) 4142 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 116.25-90 chr18 25284300 25284425 + 1.5 NA intron (NM_001308225, intron 2 of 6) intron (NM_001308225, intron 2 of 6) 67804 NM_015461 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 264-8 chr10 55466149 55466330 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -132803 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 306.75-6 chr11 111251235 111251622 + 1.5 NA intron (NM_198498, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 5703 NM_198498 341032 Hs.298685 NM_198498 ENSG00000150750 C11orf53 - chromosome 11 open reading frame 53 protein-coding 266-19 chr17 9055370 9055625 + 1.5 NA intron (NM_004822, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 33987 NM_004822 9423 Hs.660885 NM_004822 ENSG00000065320 NTN1 MRMV4|NTN1L netrin 1 protein-coding 211.5-60 chr17 61088815 61089123 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 278735 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 309-14 chr14 51419497 51419789 + 1.5 NA Intergenic PRIMA4_LTR|LTR|ERV1 -22508 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 153.75-87 chr3 58033628 58033798 + 1.5 NA intron (NM_001164318, intron 1 of 45) L1ME1|LINE|L1 25291 NM_001164319 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 215.5-101 chr7 85770187 85770414 + 1.5 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 349178 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 156.5-198 chr8 130503503 130503705 + 1.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -59930 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 174.5-31 chr11 40446618 40446814 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -153586 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 261.5-16 chr14 65722855 65723177 + 1.5 NA intron (NM_004480, intron 7 of 9) intron (NM_004480, intron 7 of 9) 251914 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 282.5-52 chr5 120450804 120451104 + 1.5 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -13324 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 236.5-52 chr2 182410566 182410734 + 1.5 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 16398 NM_001363871 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 308-4 chr1 200069805 200070072 + 1.5 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 27113 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 382.5-9 chr15 33997109 33997469 + 1.5 NA intron (NM_001320917, intron 1 of 1) L1ME3Cz|LINE|L1 28792 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 222-31 chr18 28871815 28872046 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -694800 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 341.5-23 chr4 38207453 38208028 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 87786 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 151-15 chr10 29128934 29129100 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -160053 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 480.5-4 chr5 161280564 161281123 + 1.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 267281 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 288-21 chr14 51490179 51490566 + 1.5 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 1244 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 222-61 chr5 5796033 5796275 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 373477 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 165.25-137 chr8 28449027 28449247 + 1.5 NA intron (NM_001258211, intron 5 of 7) L1MC5|LINE|L1 41092 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 232.5-102 chr8 88434514 88434676 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -107112 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 113.5-102 chr17 73709089 73709250 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28685 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 258-45 chr4 97309286 97309543 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -57512 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 197.5-160 chr8 78026457 78026658 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -489783 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 320-21 chr20 52696767 52697082 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 76086 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 222-35 chr19 49814119 49814337 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001352262) promoter-TSS (NM_001352262) -936 NM_025129 80199 Hs.288800 NM_025129 ENSG00000010361 FUZ CPLANE3|FY|NTD fuzzy planar cell polarity protein protein-coding 303.75-27 chr5 41619080 41619317 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -108597 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 249.75-56 chr5 85233223 85233476 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -848469 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 305.5-5 chr1 196313856 196314162 + 1.5 NA intron (NM_001287820, intron 19 of 26) intron (NM_001287820, intron 19 of 26) -225294 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 189.75-18 chr11 91742806 91742943 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -482160 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 286-4 chr10 77968879 77969141 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42198 NR_024585 100128292 Hs.547908 NR_024585 DLG5-AS1 - DLG5 antisense RNA 1 ncRNA 214-15 chr12 23433670 23434165 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 150669 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 219.75-58 chr4 150605379 150605552 + 1.5 NA intron (NM_001367550, intron 37 of 56) intron (NM_001367550, intron 37 of 56) 23314 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 141.75-104 chr2 226570088 226570228 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 88635 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 162-127 chr9 74383076 74383348 + 1.5 NA intron (NR_121182, intron 2 of 2) intron (NR_121182, intron 2 of 2) 11681 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 241.5-69 chr3 118342616 118342958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -298981 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 434-2 chr3 124238331 124238826 + 1.5 NA intron (NM_001024660, intron 3 of 59) intron (NM_001024660, intron 3 of 59) 105649 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 196-5 chr1 114130005 114130176 + 1.5 NA intron (NM_001366223, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 22350 NM_205848 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 193-95 chr9 32869652 32869850 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 86211 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 259.5-58 chr2 102441768 102442288 + 1.5 NA intron (NM_003853, intron 7 of 11) intron (NM_003853, intron 7 of 11) 9739 NR_039930 100616157 NR_039930 ENSG00000264764 MIR4772 mir-4772 microRNA 4772 ncRNA 136.5-173 chr5 20007495 20007645 + 1.5 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -19370 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 306-41 chrX 95339760 95340022 + 1.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -276665 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 257.5-70 chr7 26296486 26296729 + 1.5 NA intron (NM_001318199, intron 1 of 6) intron (NM_001318199, intron 1 of 6) 3576 NM_001318199 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 328.5-4 chr10 30099133 30099368 + 1.5 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) 16244 NM_001350022 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 345.25-23 chr8 100538236 100538466 + 1.5 NA intron (NM_001270377, intron 1 of 4) MER2|DNA|TcMar-Tigger 21408 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 309.25-9 chr13 62593248 62593524 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 203306 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 177.75-46 chr14 70768108 70768427 + 1.5 NA intron (NM_001284231, intron 1 of 11) L1MA2|LINE|L1 15185 NM_001284231 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 270-8 chr11 22250476 22250672 + 1.5 NA intron (NM_001142649, intron 10 of 21) intron (NM_001142649, intron 10 of 21) 57398 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 311.5-3 chr1 242670630 242670992 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -146114 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 255.5-65 chr5 26019667 26019977 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 828869 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 305-10 chr14 43636179 43636556 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 870916 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 236.5-50 chr2 167852124 167852455 + 1.5 NA intron (NM_020981, intron 1 of 1) intron (NM_020981, intron 1 of 1) 33617 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 258.75-45 chr21 28132907 28133139 + 1.5 NA intron (NR_126010, intron 3 of 4) intron (NR_126010, intron 3 of 4) 42620 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 243.75-77 chr8 49599732 49599951 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -87661 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 199.5-33 chr12 124078310 124078468 + 1.5 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) MER31B|LTR|ERV1 105174 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 166.5-49 chr12 18654738 18654987 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 82647 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 401.25-5 chr13 48866453 48866869 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109251 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 270-9 chr11 83185946 83186265 + 1.5 NA non-coding (NR_133914, exon 1 of 1) non-coding (NR_133914, exon 1 of 1) 1379 NR_133914 106736475 Hs.595343 NR_133914 PCF11-AS1 - PCF11 antisense RNA 1 ncRNA 258-17 chr14 80909117 80909338 + 1.5 NA intron (NM_152446, intron 4 of 24) L1MEg|LINE|L1 32511 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 179.75-33 chr13 38461978 38462145 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -105663 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 344.5-24 chr5 129425245 129425593 + 1.5 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -28272 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 242.75-70 chr8 119432752 119433136 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 16498 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 182.25-9 chr1 206576369 206576670 + 1.5 NA intron (NM_182665, intron 1 of 4) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 19355 NM_182665 83593 Hs.497579 NM_031437 ENSG00000266094 RASSF5 Maxp1|NORE1|NORE1A|NORE1B|RAPL|RASSF3 Ras association domain family member 5 protein-coding 257-62 chrX 97719327 97719664 + 1.5 NA Intergenic LTR86B1|LTR|ERVL -154960 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 345.25-22 chr6 131136330 131136624 + 1.5 NA intron (NM_016377, intron 1 of 7) intron (NM_016377, intron 1 of 7) 1010 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 317.5-36 chr8 139955696 139956076 + 1.5 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 144649 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 179.5-98 chr2 167799374 167799582 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19194 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 296.25-25 chr4 52059070 52059301 + 1.5 NA intron (NM_001346103, intron 1 of 8) intron (NM_001346103, intron 1 of 8) 7881 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 297-35 chr4 64709206 64709414 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 295190 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 234-19 chr2 10597200 10597412 + 1.5 NA intron (NR_048552, intron 16 of 19) intron (NR_048552, intron 16 of 19) 92669 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 210.5-81 chr22 28495274 28495528 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) HAL1|LINE|L1 35532 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 243-51 chr4 59768162 59768484 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 754750 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 232-68 chr6 114610341 114610515 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -547551 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 396-2 chr11 74986827 74987232 + 1.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -1615 NM_001367865 10825 Hs.191074 NM_006656 ENSG00000162139 NEU3 SIAL3 neuraminidase 3 protein-coding 183.5-72 chr2 156987444 156987713 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -270127 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 387.25 chr1 164918614 164919103 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -144217 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 152.25-159 chr8 119750898 119751092 + 1.5 NA intron (NM_003184, intron 22 of 25) intron (NM_003184, intron 22 of 25) -77605 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 213-87 chr7 30954500 30954725 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -9341 NM_000823 2692 Hs.767 NM_000823 ENSG00000106128 GHRHR GHRFR|GRFR|IGHD1B|IGHD4 growth hormone releasing hormone receptor protein-coding 366.5-19 chr8 136302497 136302917 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -228091 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 246.75-55 chr5 111247407 111247634 + 1.5 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 23136 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 233-47 chr3 193124409 193124604 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116716 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 197.25-62 chr21 28908862 28909134 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23625 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 194.5-80 chr20 15159137 15159343 + 1.5 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -37600 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 242-7 chr1 223010608 223010801 + 1.5 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 82280 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 173-4 chr1 104353960 104354131 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 281022 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 293.5-28 chr21 21250965 21251177 + 1.5 NA intron (NM_001352592, intron 2 of 18) intron (NM_001352592, intron 2 of 18) 103909 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 332-20 chr4 151846886 151847275 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -86057 NM_001363341 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 195-58 chr22 29047679 29047968 + 1.5 NA intron (NM_001206998, intron 6 of 8) intron (NM_001206998, intron 6 of 8) 14096 NM_015370 25770 Hs.50891 NM_015370 ENSG00000100249 C22orf31 HS747E2A|bK747E2.1 chromosome 22 open reading frame 31 protein-coding 264.5-28 chr17_GL000205v2_random 60538 60818 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -2712 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 261-14 chr12 69696263 69696652 + 1.5 NA intron (NM_001282616, intron 1 of 3) intron (NM_001282616, intron 1 of 3) 2846 NM_032735 144453 Hs.280782 NM_032735 ENSG00000127325 BEST3 VMD2L3 bestrophin 3 protein-coding 221.25-44 chr2 179766199 179766398 + 1.5 NA intron (NM_001352809, intron 3 of 10) intron (NM_001352809, intron 3 of 10) -19788 NM_001113397 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 282.75-27 chr3 105176980 105177321 + 1.5 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -189563 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 212.5-8 chr10 12389939 12390174 + 1.5 NA intron (NM_001351032, intron 2 of 11) intron (NM_001351032, intron 2 of 11) 1074 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 209.5-25 chr12 14438128 14438321 + 1.5 NA exon (NM_018179, exon 5 of 15) exon (NM_018179, exon 5 of 15) 52943 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 249.75-11 chr11 72788816 72789072 + 1.5 NA intron (NM_006645, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 4761 NM_006645 10809 Hs.188606 NM_006645 ENSG00000214530 STARD10 CGI-52|NY-CO-28|PCTP2|SDCCAG28 StAR related lipid transfer domain containing 10 protein-coding 376.75-9 chr2 133149933 133150565 + 1.5 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -115946 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 162-119 chr8 121704979 121705107 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -63603 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 158.75-112 chr3 47034668 47034830 + 1.5 NA intron (NR_146158, intron 19 of 21) intron (NR_146158, intron 19 of 21) 23207 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 226.5-50 chr2 211601386 211601635 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 19 of 26) HAL1|LINE|L1 824850 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 151.5-106 chr22 34128882 34129060 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -206083 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 161.75-6 chr1 155526815 155527036 + 1.5 NA intron (NM_018489, intron 1 of 27) AluSz|SINE|Alu -35117 NR_147963 645676 Hs.568693 NR_027023 ENSG00000235919 ASH1L-AS1 - ASH1L antisense RNA 1 ncRNA 217.5-72 chr20 57988758 57988939 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15056 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 338-6 chr11 12030719 12031094 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_135109) promoter-TSS (NR_135109) 31 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 257.5-66 chr6 133048764 133049066 + 1.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -39165 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 320.5-33 chr5 138850696 138851046 + 1.5 NA intron (NM_001323985, intron 7 of 17) intron (NM_001323985, intron 7 of 17) -24359 NM_001324001 1495 Hs.445981 NM_001903 ENSG00000044115 CTNNA1 CAP102|MDPT2 catenin alpha 1 protein-coding 313.75-6 chr16 50648671 50649016 + 1.5 NA 3' UTR (NM_033119, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_033119, exon 10 of 10) -20012 NR_110908 101927272 Hs.460777 NR_110908 ENSG00000260249 LOC101927272 - uncharacterized LOC101927272 ncRNA 331-29 chr6 116380703 116381020 + 1.5 NA intron (NM_013352, intron 1 of 5) intron (NM_013352, intron 1 of 5) -9142 NR_148944 100287467 Hs.458358 NR_148944 LOC100287467 - uncharacterized LOC100287467 ncRNA 289.75-12 chr16 71919787 71920080 + 1.5 NA intron (NM_014761, intron 4 of 9) LTR10E|LTR|ERV1 24402 NM_001270977 9798 Hs.232194 NM_014761 ENSG00000182149 IST1 CHMP8|OLC1 IST1 factor associated with ESCRT-III protein-coding 165-56 chr17 67648164 67648317 + 1.5 NA intron (NM_181671, intron 6 of 9) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -69593 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 214.5-98 chr5 17268565 17268823 + 1.5 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 51063 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 463.75 chr12 131081980 131082534 + 1.5 NA intron (NM_198827, intron 14 of 24) intron (NM_198827, intron 14 of 24) -82754 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 162.25-142 chr6 62076293 62076491 + 1.5 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 209833 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 294.75-23 chr3 44873197 44873487 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1266 NM_003241 7047 Hs.438265 NM_003241 ENSG00000163810 TGM4 TGP|hTGP transglutaminase 4 protein-coding 204-5 chr10 114190885 114191145 + 1.5 NA exon (NM_001365891, exon 3 of 26) exon (NM_001365891, exon 3 of 26) 11662 NM_001365891 56165 Hs.333132 NM_198795 ENSG00000095627 TDRD1 CT41.1 tudor domain containing 1 protein-coding 250.5-70 chr4 172603559 172603779 + 1.5 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 85248 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 224.5-31 chr13 102468220 102468489 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -65911 NM_001321946 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 342.5-3 chr1 113621109 113621433 + 1.5 NA intron (NM_001142782, intron 8 of 20) L2c|LINE|L2 137884 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 544-4 chr6 131941863 131942448 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 9217 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 129.75-77 chr17 71066238 71066397 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 135862 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 215.5-66 chr3 21889092 21889387 + 1.5 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -67900 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 266-22 chr2 56768443 56768891 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -582897 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 128.25-5 chr1 53482282 53482387 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22935 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 300-32 chr5 117589874 117590404 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -140222 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 298.5-5 chr10 132474551 132474870 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 29521 NR_149317 170393 Hs.375059 NR_149317 C10orf91 - chromosome 10 open reading frame 91 (putative) ncRNA 142.5-37 chr10 124766474 124766594 + 1.5 NA intron (NM_001304468, intron 4 of 5) intron (NM_001304468, intron 4 of 5) -22156 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 155.5-104 chr2 201968070 201968221 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -66442 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 314.5-16 chr3 29954965 29955348 + 1.5 NA intron (NM_001003792, intron 11 of 13) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -21000 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 231.5-54 chr2 189421283 189421487 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -20048 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 341.5-25 chr4 97491714 97492217 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125039 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 203.25-84 chr5 85602587 85602759 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -679771 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 256-50 chr4 47219494 47219733 + 1.5 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 188046 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 244-43 chr5 21616017 21616268 + 1.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 156662 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 312-6 chr10 74796926 74797230 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28177 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 260.25-6 chr10 56928015 56928265 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 376419 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 160.5-132 chr4 37691631 37691749 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5314 NM_001085400 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 186.5-51 chr17 59902539 59902810 + 1.5 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) AluJr|SINE|Alu 9553 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 225-26 chr14 51987320 51987606 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2083 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 237.75-32 chr18 69365004 69365203 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35785 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 226-40 chr2 114483353 114483642 + 1.5 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 21920 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 344-9 chr16 59593967 59594225 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 161095 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 201.5-36 chr11 119953544 119953730 + 1.5 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger 175216 NM_001330382 23650 Hs.504115 NM_012101 ENSG00000137699 TRIM29 ATDC tripartite motif containing 29 protein-coding 137.5-29 chr10 63815382 63815582 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -293592 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 230.25-90 chr9 26721910 26722201 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 170747 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 176.75-28 chr12 127209076 127209282 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 75104 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 329-41 chr8 110251824 110252271 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -276276 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 374.5-13 chr5 137636497 137636895 + 1.5 NA intron (NM_017415, intron 11 of 14) intron (NM_017415, intron 11 of 14) 10953 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 265.5-53 chr6 46701675 46701882 + 1.5 NA intron (NR_144468, intron 3 of 3) intron (NR_144468, intron 3 of 3) -13613 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 360.5-12 chr3 70038245 70038535 + 1.5 NA Intergenic MSTA1|LTR|ERVL-MaLR 38646 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 320.25 chr1 162683140 162683531 + 1.5 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) L1MCa|LINE|L1 50871 NM_006182 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 138-18 chr11 79920629 79920797 + 1.5 NA Intergenic LTR90B|LTR|LTR -479683 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 241.5-80 chr5 76857803 76858091 + 1.5 NA intron (NM_130772, intron 1 of 4) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 7933 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 340.75-14 chr2 164757829 164758195 + 1.5 NA intron (NM_001365670, intron 2 of 13) intron (NM_001365670, intron 2 of 13) -70235 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 175.25-155 chrY 11303353 11303523 + 1.5 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1118152 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 113-108 chr22 24743413 24743543 + 1.5 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) L1PB1|LINE|L1 -21023 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 428.5-8 chr8 123873708 123874172 + 1.5 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) L2a|LINE|L2 21953 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 408.25-2 chr12 59946149 59946724 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 257066 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 192.75-123 chr8 34682830 34683042 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -100985 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 409.5-17 chr8 114775829 114776257 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 891970 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 244.5-93 chr8 75997958 75998259 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -408546 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 559.75-2 chr11 39080974 39081604 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 432431 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 219-50 chr2 8409220 8409469 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -80925 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 217 chr1 13946426 13946625 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197110 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 433.5 chr1 188371294 188371921 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 927979 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 252-26 chr15 93525253 93525598 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 319359 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 277.5-76 chr8 103246873 103247142 + 1.5 NA intron (NR_148216, intron 1 of 1) intron (NR_148216, intron 1 of 1) -51487 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 414-15 chr8 33224291 33224781 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 248610 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 224.25-99 chr7 81108197 81108431 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -185925 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 275-43 chr8 103698108 103698668 + 1.5 NA intron (NM_001348497, intron 2 of 22) L1MEc|LINE|L1 -120832 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 186.5-143 chrX 45336660 45336794 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -135851 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 353.25-8 chr17 65910893 65911207 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 19 of 26) HAL1b|LINE|L1 -84507 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 172.5-94 chr2 52617118 52617490 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 85311 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 261-24 chr2 28749710 28750028 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1879 NM_206876 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 274.5-25 chr17 47153544 47153791 + 1.5 NA intron (NR_148340, intron 6 of 16) intron (NR_148340, intron 6 of 16) 35628 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 241-34 chr3 168885591 168885780 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16260 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 233.75-64 chr5 112931267 112931604 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9208 NM_005669 7905 Hs.429608 NM_005669 ENSG00000129625 REEP5 C5orf18|D5S346|DP1|TB2|YOP1|Yip2e receptor accessory protein 5 protein-coding 215.5-110 chr8 119621783 119621964 + 1.5 NA intron (NM_001330600, intron 3 of 25) intron (NM_001330600, intron 3 of 25) 16966 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 191-11 chr11 28833776 28833939 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -356309 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 123-3 chr1 29493811 29493962 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -143772 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 333-25 chr7 104944956 104945307 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18486 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 447.5-4 chr4 54007058 54007642 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20068 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 256-64 chr7 16092441 16092769 + 1.5 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) L2c|LINE|L2 -117881 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 252-37 chr2 127522458 127522719 + 1.5 NA intron (NM_017969, intron 2 of 13) intron (NM_017969, intron 2 of 13) 3901 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 176.25-107 chr4 185402966 185403129 + 1.5 NA intron (NM_018359, intron 11 of 11) intron (NM_018359, intron 11 of 11) 6206 NM_181726 353322 Hs.508154 NM_181726 ENSG00000186352 ANKRD37 Lrp2bp ankyrin repeat domain 37 protein-coding 227.25-33 chr17 59298594 59298860 + 1.5 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -32928 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 162.5-117 chr3 151852805 151852954 + 1.5 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) intron (NR_110203, intron 1 of 2) -20764 NM_033050 56670 Hs.133181 NM_033050 ENSG00000198829 SUCNR1 GPR91 succinate receptor 1 protein-coding 453.5-4 chr8 126157801 126158447 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -167371 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 294-15 chr19 50837339 50837671 + 1.5 NA intron (NR_131205, intron 2 of 2) intron (NR_131205, intron 2 of 2) -5982 NM_017509 55554 Hs.567535 NM_017509 ENSG00000174562 KLK15 ACO|HSRNASPH kallikrein related peptidase 15 protein-coding 339.5-12 chr13 39936409 39936698 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -245256 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 363.75-3 chr13 94311073 94311447 + 1.5 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) AluSz|SINE|Alu -123269 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 346-4 chr10 58789420 58789849 + 1.5 NA intron (NM_001080512, intron 7 of 20) intron (NM_001080512, intron 7 of 20) 74619 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 237-50 chr5 162946689 162947064 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -490695 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 324.5-37 chr8 115376413 115376753 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 291430 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 511-3 chr7 41867855 41868334 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -165004 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 130.5-83 chr12 114229424 114229550 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 12283 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 377.75-9 chr5 57155630 57156017 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -18125 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 266.5-18 chr14 49413861 49414121 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 172389 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 358.5-19 chr7 47938621 47938979 + 1.5 NA intron (NM_138295, intron 3 of 56) MER5B|DNA|hAT-Charlie 9691 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 147-18 chr10 58121422 58121534 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 146416 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 212-79 chr7 122732653 122732841 + 1.5 NA intron (NM_001167940, intron 2 of 29) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29825 NM_198085 378925 Hs.675191 NM_198085 ENSG00000235631 RNF148 - ring finger protein 148 protein-coding 279.5-49 chr4 74171352 74171619 + 1.5 NA intron (NM_001351310, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 13367 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 263.5-41 chr3 160824083 160824402 + 1.5 NA intron (NM_139245, intron 1 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -17907 NM_001317911 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 393-17 chr8 32520015 32520534 + 1.5 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu -27936 NM_001160005 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 440.5-3 chr1 175738486 175738956 + 1.5 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 4874 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 187.5-67 chr16 6567391 6567572 + 1.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) L2a|LINE|L2 -206328 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 140-70 chr2 44130239 44130419 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38474 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 294.5-43 chr5 116833259 116833492 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -71166 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 118.5-11 chr1 152174773 152174905 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -15611 NM_001122965 126638 Hs.376144 NM_152364 ENSG00000215853 RPTN - repetin protein-coding 144.75-55 chr14 23782765 23782889 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 146463 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 282.5-16 chr14 74797248 74797482 + 1.5 NA intron (NM_019589, intron 4 of 20) intron (NM_019589, intron 4 of 20) 34049 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 304.5-21 chr3 88013317 88013700 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 30932 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 349 chr1 79630396 79630707 + 1.5 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -623821 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 246.75-50 chr4 107432742 107433005 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 287361 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 368.25-2 chr10 56317294 56317609 + 1.5 NA Intergenic LTR27E|LTR|ERV1 43808 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 367.5-3 chr1 96912227 96912916 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -183352 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 273-2 chr1 197029585 197029890 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 37530 NM_001994 2165 Hs.435782 NM_001994 ENSG00000143278 F13B FXIIIB coagulation factor XIII B chain protein-coding 160.5-82 chr2 25578137 25578266 + 1.5 NA intron (NM_033147, intron 7 of 19) intron (NM_033147, intron 7 of 19) 72021 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 269.5-49 chr6 55131614 55131959 + 1.5 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) intron (NM_001526, intron 1 of 7) 25326 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 129-148 chr6 19339870 19340010 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -109881 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 351.5-15 chr19 50532901 50533421 + 1.5 NA intron (NM_001080457, intron 2 of 2) L1MEd|LINE|L1 17881 NM_001348568 94030 Hs.120873 NM_001080457 ENSG00000131409 LRRC4B HSM|LRIG4|NGL-3 leucine rich repeat containing 4B protein-coding 213-97 chr8 119816556 119816745 + 1.5 NA intron (NM_003184, intron 3 of 25) intron (NM_003184, intron 3 of 25) 16191 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 247-46 chr4 61273848 61274141 + 1.5 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 71822 NM_001371342 176.5-17 chr10 47394818 47395021 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -10626 NM_153034 118738 Hs.27788 NM_153034 ENSG00000265763 ZNF488 - zinc finger protein 488 protein-coding 254.75-5 chr10 20507928 20508229 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -43892 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 231-7 chr10 43638724 43639171 + 1.5 NA intron (NR_038867, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu -4925 NR_047557 414197 Hs.605832 NR_047557 ENSG00000226245 ZNF32-AS1 ZNF32OS1|bA402L1.8 ZNF32 antisense RNA 1 ncRNA 301.5-10 chr10 55709547 55709766 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -81714 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 357.5-5 chr13 67277574 67277851 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47376 NM_001318373 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 280.25-49 chr6 158697591 158697882 + 1.5 NA intron (NM_001242394, intron 6 of 17) intron (NM_001242394, intron 6 of 17) 34333 NM_001318745 94120 Hs.436977 NM_001009991 ENSG00000164674 SYTL3 SLP3 synaptotagmin like 3 protein-coding 256-68 chr8 52502509 52502772 + 1.5 NA Intergenic MER57E2|LTR|ERV1 62790 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 435-10 chr8 87546489 87547018 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 327262 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 222-78 chr8 87115418 87115665 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 249126 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 234-37 chr3 45670778 45670992 + 1.5 NA intron (NM_014240, intron 4 of 7) intron (NM_014240, intron 4 of 7) 17997 NR_033947 644714 Hs.712889 NR_033947 LIMD1-AS1 - LIMD1 antisense RNA 1 ncRNA 354.5-22 chrX 78578733 78579207 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 80358 NM_152694 203430 Hs.134873 NM_152694 ENSG00000179300 RTL3 Mar3|Mart3|SIRH9|ZCCHC5|ZHC5 retrotransposon Gag like 3 protein-coding 250.5-18 chr11 113102878 113103414 + 1.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -139686 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 299-2 chr1 43653383 43653761 + 1.5 NA intron (NM_014663, intron 2 of 21) intron (NM_014663, intron 2 of 21) 3423 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 126.5-155 chr3 84029546 84029667 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 839969 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 194.5-147 chr7 112148512 112148794 + 1.5 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 57746 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 147-130 chr7 54918797 54918957 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -100140 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 297-11 chr12 121300035 121300367 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1893 NM_153500 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 296.25-33 chr8 115847857 115848068 + 1.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -178987 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 343-34 chr8 120226457 120226746 + 1.5 NA intron (NM_021110, intron 15 of 47) intron (NM_021110, intron 15 of 47) 101499 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 230.25-73 chr7 85299500 85299804 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -121470 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 288.25-25 chr7 53354945 53355253 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 319466 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 188.5-42 chr14 79910625 79910877 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -300668 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 150.25-13 chr1 185964499 185964740 + 1.5 NA intron (NM_031935, intron 13 of 106) intron (NM_031935, intron 13 of 106) 230228 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 417.25-3 chr16 66703444 66703837 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6897 NM_181521 146223 Hs.643961 NM_178818 ENSG00000183723 CMTM4 CKLFSF4 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4 protein-coding 222-30 chr18 9719488 9719722 + 1.5 NA intron (NM_006868, intron 1 of 6) intron (NM_006868, intron 1 of 6) 11304 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 281-35 chr6 72959049 72959342 + 1.5 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 8558 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 410.25-3 chr14 73701294 73701806 + 1.5 NA 3' UTR (NM_031427, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_031427, exon 8 of 8) 12834 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 296-19 chr18 5920018 5920271 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -24190 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 214.75-91 chr9 111367589 111367786 + 1.5 NA intron (NM_001363756, intron 45 of 48) intron (NM_001363756, intron 45 of 48) -37463 NM_205859 26248 Hs.381312 NM_205859 ENSG00000171133 OR2K2 HSHTPCRH06|HTPCRH06|OR2AN1P|OR2AR1P olfactory receptor family 2 subfamily K member 2 protein-coding 278-32 chr6 73110619 73110830 + 1.5 NA intron (NM_001160132, intron 6 of 13) intron (NM_001160132, intron 6 of 13) 32790 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 397-10 chr3 173599084 173599576 + 1.5 NA intron (NM_001365928, intron 1 of 6) MER68C|LTR|ERVL 14896 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 198.75-61 chr3 55083575 55083757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -94506 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 236.5-41 chr18 8387118 8387493 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 29 of 30) intron (NM_002845, intron 29 of 30) -20271 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 308-18 chr2 40035365 40035682 + 1.5 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 117889 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 236.5-49 chr2 117166377 117166778 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -648114 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 271.5-17 chr12 60817455 60817753 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 1128234 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 316.5-15 chr17 39314898 39315353 + 1.5 NA intron (NM_001370209, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu 17725 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 291.25-14 chr2 62747056 62747270 + 1.5 NA intron (NM_001142615, intron 2 of 22) intron (NM_001142615, intron 2 of 22) 40266 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 323.75-11 chr2 35993251 35993613 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 362138 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 374-9 chr2 54619121 54619630 + 1.5 NA intron (NM_178313, intron 6 of 30) intron (NM_178313, intron 6 of 30) 60981 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 445-4 chr14 80185039 80185374 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26213 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 354-27 chr7 77561306 77561645 + 1.5 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) intron (NM_001131009, intron 1 of 16) 23432 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 327.25-6 chr14 46414495 46414741 + 1.5 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -56741 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 336.5-13 chr17 48505606 48505915 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 25251 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 286-23 chr20 51176638 51176852 + 1.5 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -153638 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 276 chr1 43822932 43823293 + 1.5 NA intron (NM_001270460, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 -15510 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 154.5-40 chr11 111570553 111570726 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 30131 NM_001258390 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 137.5-38 chr11 12257354 12257518 + 1.5 NA intron (NR_144420, intron 24 of 27) intron (NR_144420, intron 24 of 27) -29464 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 381-22 chr6 112141225 112141653 + 1.5 NA exon (NM_001105207, exon 21 of 39) exon (NM_001105207, exon 21 of 39) 53848 NM_001033564 619208 Hs.591340 NM_001033564 ENSG00000203778 FAM229B C6orf225 family with sequence similarity 229 member B protein-coding 142.75-203 chr9 131430131 131430316 + 1.5 NA exon (NM_013318, exon 1 of 31) exon (NM_013318, exon 1 of 31) 133 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 203.75-36 chr15 58891173 58891378 + 1.5 NA intron (NR_135042, intron 12 of 18) MER20B|DNA|hAT-Charlie 42404 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 320-32 chr6 46177833 46178214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7013 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 218.5-110 chr6 140129621 140129827 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -75528 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 380.25-9 chr8 127641112 127641554 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 92634 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 224.75-57 chr5 37438160 37438527 + 1.5 NA intron (NM_001345998, intron 6 of 17) intron (NM_001345998, intron 6 of 17) 59025 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 262.5-15 chr14 22221967 22222240 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 210650 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 200.25-97 chr6 130448154 130448422 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11171 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 252.5-16 chr11 65497424 65497627 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_002819) promoter-TSS (NR_002819) -213 NR_144568 378938 Hs.621695 NR_002819 ENSG00000251562 MALAT1 HCN|LINC00047|NCRNA00047|NEAT2|PRO2853 metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1 ncRNA 323-22 chr7 4913998 4914474 + 1.5 NA intron (NR_072989, intron 4 of 8) HAL1b|LINE|L1 -30520 NM_018059 55698 Hs.667336 NM_018059 ENSG00000157927 RADIL RASIP2 Rap associating with DIL domain protein-coding 434.5-11 chr8 73879920 73880283 + 1.5 NA non-coding (NR_147034, exon 1 of 3) non-coding (NR_147034, exon 1 of 3) 1119 NR_147034 101926947 Hs.521636 NR_147034 LINC01617 C8orf23|NCRNA00249|XLOC_006844 long intergenic non-protein coding RNA 1617 ncRNA 188.5-21 chr11 80418651 80418793 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 344081 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 141-36 chr12 52962902 52963005 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -13093 NR_045962 3856 Hs.533782 NM_002273 ENSG00000170421 KRT8 CARD2|CK-8|CK8|CYK8|K2C8|K8|KO keratin 8 protein-coding 309.75-24 chr3 41150768 41151144 + 1.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -48549 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 266-12 chr14 67939027 67939381 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 115612 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 550.5-2 chr17 58395184 58395738 + 1.5 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) intron (NM_001305544, intron 2 of 9) 7260 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 243.75-37 chr17 58425684 58425886 + 1.5 NA intron (NM_001080439, intron 5 of 5) intron (NM_001080439, intron 5 of 5) -8203 NM_017763 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 324.75-12 chr14 84422098 84422474 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -849646 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 282-30 chr2 142425059 142425381 + 1.5 NA Intergenic (TATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -293519 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 160.5-180 chr8 26988371 26988551 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 60502 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 294.25-29 chr4 69861359 69861835 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1452 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 247.5-36 chr19 31002987 31003175 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -164429 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 204-51 chr3 42128818 42128997 + 1.5 NA intron (NM_001349247, intron 2 of 16) intron (NM_001349247, intron 2 of 16) -20328 NM_001265610 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 196-99 chr8 126850881 126851175 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -162126 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 237-42 chr4 117025005 117025273 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 60437 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 186-80 chr6 111246570 111246733 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12688 NM_153369 91749 Hs.400572 NM_153369 ENSG00000173214 MFSD4B KIAA1919|NaGLT1 major facilitator superfamily domain containing 4B protein-coding 267.5-69 chr7 80166480 80166758 + 1.5 NA intron (NM_001256414, intron 1 of 7) intron (NM_001256414, intron 1 of 7) 30835 NM_001256414 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 131-72 chr18 65400175 65400308 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -350011 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 306-6 chr14 54040200 54040644 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -83531 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 200-40 chr18 22360756 22361039 + 1.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 57018 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 325.75-2 chr1 74323948 74324206 + 1.5 NA intron (NM_015978, intron 5 of 24) MER54A|LTR|ERVL 88690 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 282-31 chr2 152041201 152041560 + 1.5 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) 57383 NM_001330113 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 146-99 chr4 95369014 95369176 + 1.5 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 179878 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 203-62 chr3 48705536 48705858 + 1.5 NA intron (NM_016291, intron 1 of 5) intron (NM_016291, intron 1 of 5) 11524 NM_001005910 51447 Hs.595983 NM_016291 ENSG00000068745 IP6K2 IHPK2|InsP6K2|PIUS inositol hexakisphosphate kinase 2 protein-coding 193-38 chr2 41806918 41807087 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -70553 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 320.25-24 chr7 78638618 78638959 + 1.5 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) 291546 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 463.25-4 chr7 8145229 8145885 + 1.5 NA intron (NM_001350838, intron 6 of 11) intron (NM_001350838, intron 6 of 11) 116495 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 298.5-21 chr2 212030506 212030757 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 2 of 26) LTR16C|LTR|ERVL 395729 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 260-23 chr3 95399256 95399473 + 1.5 NA Intergenic MER68-int|LTR|ERVL 283829 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 148.5-212 chr7 55263309 55263499 + 1.5 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -7769 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 262.5-31 chr18 3602968 3603238 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_119377) promoter-TSS (NR_119377) -634 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 189.5-165 chr9 125812866 125813037 + 1.5 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 64768 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 209-15 chr12 79664040 79664414 + 1.5 NA intron (NM_001354732, intron 2 of 6) intron (NM_001354732, intron 2 of 6) 26353 NM_001354732 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 367-10 chr2 220122641 220122984 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -216247 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 232.5-42 chr18 68229470 68229711 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -414768 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 331-11 chr13 25154793 25155174 + 1.5 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 17184 NM_199138 219287 Hs.528335 NM_152704 ENSG00000165566 AMER2 FAM123A APC membrane recruitment protein 2 protein-coding 476-3 chr4 150779329 150779977 + 1.5 NA intron (NM_001367550, intron 34 of 56) intron (NM_001367550, intron 34 of 56) 197502 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 312-29 chr6 72577510 72577902 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -44137 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 247.5-7 chr10 61204906 61205119 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 188737 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 163.5-196 chr7 140216036 140216205 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 38859 NR_024451 100134229 Hs.634333 NR_024451 ENSG00000260231 KDM7A-DT JHDM1D-AS1 KDM7A divergent transcript ncRNA 135.75-79 chr17 67194928 67195040 + 1.5 NA intron (NM_001330447, intron 8 of 32) intron (NM_001330447, intron 8 of 32) -49792 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 164.5-156 chr5 18105880 18106024 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 298678 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 258.5-17 chr12 82118526 82118876 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 164982 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 285.25-31 chr6 53566764 53567056 + 1.5 NA intron (NR_110840, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 6365 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 189.75-65 chr20 58326553 58326698 + 1.5 NA intron (NM_020673, intron 2 of 6) L1ME2|LINE|L1 16910 NM_020673 57403 Hs.529044 NM_020673 ENSG00000124209 RAB22A - RAB22A, member RAS oncogene family protein-coding 150.5-190 chr6 114444470 114444583 + 1.5 NA Intergenic Charlie26a|DNA|hAT-Charlie -381649 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 353.5-10 chr2 28527495 28527864 + 1.5 NA intron (NM_001170585, intron 6 of 56) MIRb|SINE|MIR 31608 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 128-172 chr9 29362477 29362636 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -148955 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 198.75-68 chr4 37648821 37648976 + 1.5 NA intron (NM_001085400, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 37478 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 182-47 chr17 57407794 57408017 + 1.5 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 115692 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 150-150 chr9 79471030 79471199 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100659 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 367-18 chr5 156728890 156729348 + 1.5 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) intron (NM_001128209, intron 6 of 7) -121176 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 327.5-13 chr16 75331252 75331629 + 1.5 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) L1ME2|LINE|L1 -63433 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 202-75 chr8 122811273 122811533 + 1.5 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 29748 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 155-30 chr12 127875165 127875342 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6364 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 289.25-30 chr8 118677455 118677699 + 1.5 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) L1MC4|LINE|L1 -55614 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 192-80 chr4 113017780 113017984 + 1.5 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) -31532 NM_001354246 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 326.25-8 chr12 25046134 25046435 + 1.5 NA intron (NM_001321724, intron 17 of 17) L1M3d|LINE|L1 -5944 NM_001366543 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 252.75-3 chr1 217500786 217501089 + 1.5 NA intron (NM_018040, intron 6 of 9) L1MD1|LINE|L1 130153 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 244-59 chr8 128479854 128480041 + 1.5 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 84732 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 255.75-56 chr9 73576612 73576836 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 424859 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 236.75-46 chr5 103040732 103040990 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 79277 NR_134299 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 389-20 chr9 27774178 27774578 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -200512 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 248.75-41 chr3 102431122 102431390 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3759 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 269.5-22 chr18 11455250 11455550 + 1.5 NA intron (NR_146901, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 922 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 223.25-72 chr7 114137633 114137892 + 1.5 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) L1MC3|LINE|L1 51435 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 218.5-96 chr5 23360538 23360876 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -146902 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 216.5-87 chr4 54757294 54757555 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 99496 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 208.5-115 chr5 160643482 160643820 + 1.5 NA intron (NM_001366652, intron 8 of 24) MIR|SINE|MIR 41740 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 264-2 chr1 93540195 93540437 + 1.5 NA intron (NM_001164473, intron 10 of 16) intron (NM_001164473, intron 10 of 16) 44846 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 365-21 chr8 136514201 136514596 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16400 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 322.5-11 chr17 66193945 66194342 + 1.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -2010 NM_001353128 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 239.25-29 chr14 56386935 56387152 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -127288 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 328.5 chr1 84410793 84411115 + 1.5 NA exon (NM_021233, exon 4 of 6) exon (NM_021233, exon 4 of 6) 2603 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 332.25-4 chr10 69705830 69706176 + 1.5 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 75756 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 173-70 chr2 186393956 186394212 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -92176 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 172.25-115 chr5 123423992 123424192 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001166226) promoter-TSS (NM_001166226) -500 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 245-21 chr17 70250684 70250877 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 81245 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 129.5-209 chr7 32877538 32877648 + 1.5 NA intron (NM_015483, intron 2 of 3) L3|LINE|CR1 14167 NM_015483 25948 Hs.372541 NM_015483 ENSG00000170852 KBTBD2 BKLHD1 kelch repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 223.5-60 chr2 96425589 96425755 + 1.5 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 79685 NM_001285485 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 369.75-3 chr12 1235129 1235486 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) AluJb|SINE|Alu 207559 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 124.25-34 chr11 93201620 93201831 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -3734 NM_152313 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 241.5-73 chr4 51893716 51893940 + 1.5 NA intron (NM_001040402, intron 7 of 10) intron (NM_001040402, intron 7 of 10) 50249 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 273-40 chr4 116954338 116954676 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 131069 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 331-2 chr1 111121163 111121520 + 1.5 NA intron (NR_146306, intron 5 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -18042 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 284.75-30 chr5 150711808 150712026 + 1.5 NA intron (NM_001135643, intron 13 of 13) L1ME3G|LINE|L1 -10855 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 178.75-47 chr2 59781083 59781497 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 563582 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 329.5-17 chr4 55596770 55597013 + 1.5 NA intron (NR_120489, intron 8 of 8) L1M5|LINE|L1 -4646 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 124.25-101 chr2 157773506 157773635 + 1.5 NA intron (NM_001111067, intron 6 of 10) intron (NM_001111067, intron 6 of 10) 65060 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 189-96 chr7 2886333 2886483 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -42100 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 311.75-24 chr8 26951877 26952213 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -84767 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 114-38 chr12 85782248 85782364 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54103 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 321.75-16 chr2 25638500 25638854 + 1.5 NA intron (NM_033147, intron 3 of 19) intron (NM_033147, intron 3 of 19) 11545 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 226.5-40 chr2 30342798 30343058 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -3718 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 565.75-3 chr8 111329961 111330534 + 1.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -46392 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 429.25 chr15 64207948 64208378 + 1.5 NA intron (NM_001329607, intron 6 of 11) intron (NM_001329607, intron 6 of 11) -45008 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 350.25-24 chr4 41369535 41370041 + 1.5 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 8981 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 254.5-3 chr1 67314958 67315167 + 1.5 NA intron (NM_001319233, intron 2 of 15) intron (NM_001319233, intron 2 of 15) 7698 NM_001319233 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 317-11 chr12 26537633 26537975 + 1.5 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 295390 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 189-46 chr18 57358813 57359002 + 1.5 NA intron (NM_015879, intron 3 of 3) intron (NM_015879, intron 3 of 3) 6350 NM_015879 51046 Hs.23172 NM_015879 ENSG00000177511 ST8SIA3 SIAT8C|ST8SiaIII ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 protein-coding 292.5-18 chr14 52751347 52751566 + 1.5 NA intron (NM_001130701, intron 5 of 11) L1ME4b|LINE|L1 21290 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 203.5-64 chr2 29185535 29185766 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 38250 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 150-136 chr7 119142358 119142531 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 764931 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 277-26 chr5 5888960 5889323 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 448151 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 339.5-2 chr1 77152204 77152705 + 1.5 NA intron (NM_005482, intron 9 of 10) L1MA4|LINE|L1 66976 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 308-10 chr15 48448738 48449169 + 1.5 NA intron (NM_000138, intron 45 of 65) intron (NM_000138, intron 45 of 65) 116756 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 293.25-31 chr7 123318160 123318373 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -118295 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 282.5-70 chrX 30996838 30997086 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75079 NM_031894 53940 Hs.333125 NM_031894 ENSG00000132446 FTHL17 CT38 ferritin heavy chain like 17 protein-coding 244-29 chr2 169718965 169719220 + 1.5 NA intron (NR_144936, intron 3 of 4) LTR32|LTR|ERVL -14740 NM_144711 151230 Hs.655150 NM_144711 ENSG00000213160 KLHL23 DITHP kelch like family member 23 protein-coding 177.75-130 chr7 94209887 94210079 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 182209 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 367-16 chr5 38872326 38872659 + 1.5 NA intron (NM_003999, intron 2 of 17) L2c|LINE|L2 26480 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 336.5-32 chrUn_KI270757v1 14798 15060 + 1.5 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 310.5-29 chr5 41101932 41102248 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -30748 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 218.25-99 chr8 128394623 128394843 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 169946 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 277.25-12 chr14 53827469 53827825 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 120837 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 156.25-150 chr8 121646605 121646864 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -5294 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 241.25-16 chr12 70318502 70318716 + 1.5 NA intron (NM_001199302, intron 4 of 16) L2c|LINE|L2 -47681 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 213.25-35 chr20 47377336 47377555 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -20556 NM_001281773 23613 Hs.446240 NM_012408 ENSG00000101040 ZMYND8 PRKCBP1|PRO2893|RACK7 zinc finger MYND-type containing 8 protein-coding 435.5-3 chr12 119978724 119979106 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10321 NM_001367886 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 239-23 chr18 10448761 10448969 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5770 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 284.75-42 chr8 133162412 133162915 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28376 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 268.5-65 chr9 103026017 103026292 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 30821 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 329.5-18 chr4 57630889 57631257 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 205201 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 481.75-3 chr8 109482596 109483347 + 1.5 NA intron (NM_177531, intron 56 of 77) intron (NM_177531, intron 56 of 77) -56729 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 225-59 chr5 64353688 64353949 + 1.5 NA intron (NM_001113561, intron 7 of 7) L1MB4|LINE|L1 -152197 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 295.5-51 chr5 149691331 149691710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38790 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 279.75-4 chr10 54650075 54650360 + 1.5 NA intron (NR_134503, intron 4 of 5) intron (NR_134503, intron 4 of 5) -42260 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 399.75-5 chr14 57851028 57851548 + 1.5 NA intron (NM_001352012, intron 1 of 8) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 13711 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 235-49 chr4 30481619 30481841 + 1.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -238639 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 150.25-87 chr20 11052984 11053133 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 26514 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 184-10 chr10 82825960 82826151 + 1.5 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -593135 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 234-5 chr10 6047159 6047537 + 1.5 NA intron (NM_000417, intron 1 of 7) intron (NM_000417, intron 1 of 7) 15019 NM_001308242 3559 Hs.231367 NM_000417 ENSG00000134460 IL2RA CD25|IDDM10|IL2R|IMD41|TCGFR|p55 interleukin 2 receptor subunit alpha protein-coding 277.5-66 chr5 179854621 179854949 + 1.5 NA intron (NM_001017987, intron 1 of 4).2 intron (NM_001017987, intron 1 of 4).2 4032 NM_016175 51149 Hs.741169 NM_016175 ENSG00000161010 MRNIP C5orf45 MRN complex interacting protein protein-coding 234.25-69 chr7 24622678 24623068 + 1.5 NA intron (NM_016447, intron 2 of 12) L1M4|LINE|L1 49421 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 148-43 chr17 54460471 54460666 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -440123 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 159-17 chr10 89136274 89136479 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 70941 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 286.5-50 chr4 82968523 82968779 + 1.5 NA intron (NM_001288996, intron 2 of 10) MER5B|DNA|hAT-Charlie 42172 NM_001288996 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 176.25-72 chr2 151624208 151624392 + 1.5 NA intron (NM_001271208, intron 71 of 182) intron (NM_001271208, intron 71 of 182) 110176 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 199.5-102 chr3 108662933 108663111 + 1.5 NA intron (NM_014648, intron 21 of 32) intron (NM_014648, intron 21 of 32) 73300 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 320.5-41 chr8 22937238 22937754 + 1.5 NA intron (NM_001363233, intron 1 of 6) L1M4c|LINE|L1 3581 NM_001363233 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 142.5-180 chr5 145095144 145095326 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 740107 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 214.5-107 chr6 45863403 45863623 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 74084 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 346-23 chr8 101659803 101660129 + 1.5 NA intron (NM_024915, intron 14 of 15) intron (NM_024915, intron 14 of 15) 131003 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 179.25-14 chr1 248091916 248092085 + 1.5 NA intron (NM_001304535, intron 1 of 1) L1PA15|LINE|L1 -30136 NR_002141 388762 Hs.528509 NR_002141 OR2M1P JCG10|OR2M1|OST037 olfactory receptor family 2 subfamily M member 1 pseudogene pseudo 164.25-143 chr6 123109972 123110368 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 113935 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 188.5-49 chr16 7283163 7283382 + 1.5 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -49573 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 284-21 chr2 29061153 29061432 + 1.5 NA TTS (NM_199280) TTS (NM_199280) 13231 NM_001029883 388939 Hs.354243 NM_001029883 ENSG00000179270 PCARE C2orf71|RP54 photoreceptor cilium actin regulator protein-coding 310.25-21 chr6 53766846 53767155 + 1.5 NA Intergenic (TCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28005 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 232.5-27 chr14 68193559 68193808 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 370091 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 402-8 chr3 156637602 156637976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36801 NM_015508 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 250-31 chr2 226616846 226617037 + 1.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 41852 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 343-27 chr5 165201511 165202231 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 731592 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 281.5-49 chr7 24597969 24598351 + 1.5 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) intron (NM_001303037, intron 1 of 11) 24708 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 276.75-32 chr3 23996237 23996641 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 50318 NM_001145425 9975 Hs.37288 NM_005126 ENSG00000174738 NR1D2 BD73|EAR-1R|REVERBB|REVERBbeta|RVR nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 protein-coding 129-129 chr4 33453130 33453292 + 1.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 586682 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 285-25 chr2 170720773 170721052 + 1.5 NA intron (NR_110185, intron 5 of 5) intron (NR_110185, intron 5 of 5) 5575 NM_001003845 389058 Hs.368802 NM_001003845 ENSG00000204335 SP5 - Sp5 transcription factor protein-coding 277.25-27 chr3 67486936 67487405 + 1.5 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 167444 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 194-68 chr5 122129263 122129487 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_207317) promoter-TSS (NM_207317) -171 NM_207317 133923 Hs.729673 NM_207317 ENSG00000164185 ZNF474 - zinc finger protein 474 protein-coding 265-44 chr9 3200899 3201276 + 1.5 NA TTS (NR_121585) TTS (NR_121585) 19498 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 194.25-110 chr8 29954177 29954312 + 1.5 NA TTS (NR_024473) TTS (NR_024473) 3104 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 335.25 chr1 40109176 40109490 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11863 NM_000310 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 138-80 chr2 99318951 99319110 + 1.5 NA TTS (NM_005783) TTS (NM_005783) -14255 NM_001371380 216.5-113 chr8 41524946 41525126 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4225 NM_032336 84296 Hs.656996 NM_032336 ENSG00000147536 GINS4 SLD5 GINS complex subunit 4 protein-coding 272.5-39 chr2 227122057 227122400 + 1.5 NA intron (NM_000092, intron 4 of 47) AluSx|SINE|Alu 42331 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 233.75-49 chr3 39668290 39668734 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -140402 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 244.5-60 chr20 33471301 33471593 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18649 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 425.5-6 chr5 67437982 67438544 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 208526 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 266-43 chr6 161453061 161453338 + 1.5 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) MIR|SINE|MIR -17778 NR_134594 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 234.5-10 chr10 48188523 48188703 + 1.5 NA intron (NM_001018071, intron 16 of 28) intron (NM_001018071, intron 16 of 28) -13470 NM_001042512 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 337-34 chrX 54635155 54635465 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 105091 NM_001184819 54552 Hs.654677 NM_019067 ENSG00000130119 GNL3L GNL3B G protein nucleolar 3 like protein-coding 213-64 chr3 134091724 134091888 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -34158 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 236-4 chr1 113208722 113208958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2587 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 411.5-2 chr12 94426651 94427010 + 1.5 NA intron (NM_001368042, intron 1 of 5) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 33037 NM_001346460 51134 Hs.279209 NM_016122 ENSG00000173588 CEP83 CCDC41|NPHP18|NY-REN-58 centrosomal protein 83 protein-coding 211.5-17 chr10 63813603 63813872 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -291847 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 214-75 chrX 69540291 69540516 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 35168 NM_015686 27112 Hs.87619 NM_015686 ENSG00000130054 FAM155B CXorf63|TED|TMEM28|bB57D9.1 family with sequence similarity 155 member B protein-coding 259.75-47 chr7 99475941 99476229 + 1.5 NA intron (NM_001350999, intron 1 of 3) AluSc8|SINE|Alu 3193 NM_001351000 285989 Hs.440384 NM_213603 ENSG00000198556 ZNF789 - zinc finger protein 789 protein-coding 206.5-54 chr2 106904834 106904996 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -17806 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 243-13 chr11 32266314 32266497 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -122493 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 326.5-11 chr15 82657593 82657968 + 1.5 NA intron (NR_046096, intron 3 of 3) intron (NR_046096, intron 3 of 3) 4895 NM_001348441 8120 Hs.199593 NM_004644 ENSG00000103723 AP3B2 EIEE48|NAPTB adaptor related protein complex 3 subunit beta 2 protein-coding 223.25-75 chr8 80307658 80307897 + 1.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 66388 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 140-48 chr15 79973063 79973278 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1974 NM_001114735 597 Hs.227817 NM_004049 ENSG00000140379 BCL2A1 ACC-1|ACC-2|ACC1|ACC2|BCL2L5|BFL1|GRS|HBPA1 BCL2 related protein A1 protein-coding 269-3 chr1 74339967 74340163 + 1.5 NA intron (NM_015978, intron 7 of 24) intron (NM_015978, intron 7 of 24) 104678 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 261-64 chr8 110845945 110846147 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 181387 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 168-106 chr5 152739746 152739943 + 1.5 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) L1MA9|LINE|L1 232505 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 131.25-35 chr11 101850230 101850337 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -64727 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 298.5-34 chr7 32245649 32245945 + 1.5 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 53531 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 183-95 chr6 3840897 3841066 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8392 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 217.5-13 chr10 53418188 53418362 + 1.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -646575 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 270-33 chr22 27665039 27665325 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 136574 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 289.75-10 chr13 69354461 69354812 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 132290 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 190.75-78 chr4 96239110 96239311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -71493 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 192.5-135 chr8 129169292 129169530 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 71829 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 269.25-57 chr9 76098378 76098651 + 1.5 NA intron (NR_120409, intron 8 of 19) intron (NR_120409, intron 8 of 19) 207841 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 145.75-19 chr10 126095158 126095412 + 1.5 NA intron (NM_001288974, intron 10 of 18) AluY|SINE|Alu -122012 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 204.75-112 chr7 69020840 69021025 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 576692 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 174.75-131 chr8 122982406 122982589 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43275 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 164.25-148 chr7 35304643 35304823 + 1.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -9122 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 245.5-33 chr2 76496821 76497086 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -489012 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 297.75-31 chr4 104676006 104676366 + 1.5 NA non-coding (NR_125926, exon 8 of 10) non-coding (NR_125926, exon 8 of 10) -181292 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 240.75-56 chr4 29069199 29069507 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 72569 NR_146499 102723764 NR_146499 LINC02364 - long intergenic non-protein coding RNA 2364 ncRNA 159.5-35 chr11 81859922 81860110 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 30820 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 473.25 chr10 121806187 121806731 + 1.5 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) L1MC4|LINE|L1 121572 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 152-100 chr22 49072104 49072258 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 205411 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 247.5-61 chr4 180666109 180666491 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 492849 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 243-78 chr9 32378508 32378715 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5992 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 279-14 chr17 71391576 71391786 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -189502 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 249-57 chr9 92791207 92791535 + 1.5 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 16716 NR_136301 101929748 Hs.551296 NR_136301 LOC101929748 - uncharacterized LOC101929748 ncRNA 180.75-32 chr13 25210909 25211102 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 29673 NR_120427 102723318 Hs.549877 NR_120427 LINC01053 - long intergenic non-protein coding RNA 1053 ncRNA 324.75-27 chr6 93982264 93982662 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 264160 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 216.75-67 chr6 37793111 37793324 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26510 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 222.75-69 chr22 29933104 29933391 + 1.5 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) AluSc8|SINE|Alu 50073 NM_153051 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 420.5-2 chr10 90718254 90718742 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 139541 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 343.5-26 chr8 108079879 108080332 + 1.5 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) intron (NM_178565, intron 2 of 5) 1834 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 183.75-64 chr20 15449337 15449567 + 1.5 NA intron (NM_001351663, intron 7 of 17) intron (NM_001351663, intron 7 of 17) 252612 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 257.75-14 chr14 59967631 59967939 + 1.5 NA intron (NR_075071, intron 12 of 32) Charlie17|DNA|hAT-Charlie 48072 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 215.5-116 chrX 96441907 96442183 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -104143 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 462.25-4 chr6 55640147 55640738 + 1.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -61228 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 206.5-135 chr8 110682334 110682652 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 344940 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 324.25-10 chr2 237040035 237040736 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15782 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 208.5-147 chr8 143460906 143461080 + 1.5 NA intron (NM_015117, intron 9 of 11) L1MB4|LINE|L1 -30261 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 243-18 chr14 35913081 35913378 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 86891 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 394.5-2 chr11 42920143 42920665 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 348965 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 198-53 chr3 170506916 170507072 + 1.5 NA intron (NM_020949, intron 2 of 7) intron (NM_020949, intron 2 of 7) 39709 NR_135557 101928583 Hs.407600 NR_135555 ENSG00000285051 SLC7A14-AS1 - SLC7A14 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-64 chr5 18156407 18156657 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 349258 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 230.5-36 chr14 68892544 68892753 + 1.5 NA intron (NM_001102, intron 9 of 20) MIR3|SINE|MIR 86654 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 182.25-49 chr17 29025712 29025923 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17324 NM_016518 51268 Hs.462585 NM_016518 ENSG00000179761 PIPOX LPIPOX pipecolic acid and sarcosine oxidase protein-coding 367.5-17 chr5 124923548 124924100 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -113007 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 163.25-23 chr11 21388569 21388747 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) 719072 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 282.25-11 chr17 60073888 60074255 + 1.5 NA intron (NM_022070, intron 2 of 19) intron (NM_022070, intron 2 of 19) 4860 NM_022070 63897 Hs.221899 NM_022070 ENSG00000068097 HEATR6 ABC1 HEAT repeat containing 6 protein-coding 275-5 chr10 43295197 43295444 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28255 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 225.75-80 chrX 83045424 83045711 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -462723 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 255-6 chr11 24149285 24149609 + 1.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -347606 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 139.5-166 chr5 15190387 15190508 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 76113 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 410.5-10 chr5 128604071 128604401 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -65991 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 291.5-9 chr11 40620444 40620997 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -327590 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 298.75-20 chr17 35289199 35289591 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 46323 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 366-11 chr21 23671781 23672078 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -287094 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 234-32 chr20 7801748 7802050 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 138559 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 364.5-19 chr6 66754525 66754975 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 966871 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 143.5-230 chr9 79671015 79671142 + 1.5 NA intron (NM_001351563, intron 7 of 17) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 97901 NM_001351546 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 286-25 chr3 88844035 88844331 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -263438 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 251.25-38 chr3 161796216 161796536 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 299568 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 137.25-82 chr2 214933761 214933867 + 1.5 NA intron (NR_103740, intron 54 of 54) intron (NR_103740, intron 54 of 54) 86867 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 289.5-39 chr5 22429515 22429850 + 1.5 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -215832 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 306-24 chr4 10525196 10525508 + 1.5 NA intron (NM_052964, intron 14 of 18) AluY|SINE|Alu -67926 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 180.75-145 chr8 62627435 62627600 + 1.5 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -350344 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 236.75-15 chr11 118354517 118354842 + 1.5 NA TTS (NM_000073) TTS (NM_000073) -4921 NM_001204077 9354 Hs.75275 NM_004788 ENSG00000110344 UBE4A E4|UBOX2|UFD2 ubiquitination factor E4A protein-coding 202.5-28 chr11 90738075 90738450 + 1.5 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) 130940 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 244.75-54 chr6 162291127 162291389 + 1.5 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -435874 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 168.5-155 chr6 9095685 9095906 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 443586 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 187.5-18 chr10 32190600 32190780 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -134265 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 243-8 chr10 18084289 18084464 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56048 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 220-23 chr16 27666875 27667056 + 1.5 NA intron (NM_015202, intron 6 of 27) L2b|LINE|L2 52064 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 268.25-19 chr17 49446173 49446541 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 15392 NR_110805 101927207 Hs.638402 NR_110805 ENSG00000249497 LINC02075 - long intergenic non-protein coding RNA 2075 ncRNA 415.75-2 chr11 46148347 46148741 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -23411 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 142-112 chr3 168516076 168516269 + 1.5 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) -35682 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 360.75-3 chr12 11939523 11939873 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -110163 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 199.5-5 chr1 84313818 84314011 + 1.5 NA intron (NM_001134663, intron 2 of 3) intron (NM_001134663, intron 2 of 3) 11263 NM_001134664 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 295.75-20 chr3 138042338 138042764 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 32386 NM_016369 51208 Hs.655324 NM_016369 ENSG00000066405 CLDN18 SFTA5|SFTPJ claudin 18 protein-coding 282.5-7 chr10 31661752 31662125 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 246988 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 303.25-10 chr13 23350022 23350421 + 1.5 NA intron (NM_014363, intron 9 of 9) L2c|LINE|L2 25287 NM_001278055 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 182-40 chr15 94636085 94636249 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -219196 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 195.5-107 chr4 85930823 85931026 + 1.5 NA 5' UTR (NM_031305, exon 1 of 7) 5' UTR (NM_031305, exon 1 of 7) 908 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 250.5-74 chr5 76694403 76694587 + 1.5 NA intron (NM_006633, intron 31 of 35) MIR|SINE|MIR -17908 NR_028375 100302746 NR_028375 NCRUPAR NCRNA00193|ncR-uPAR non-protein coding RNA, upstream of F2R/PAR1 ncRNA 342.5-13 chr15 60347716 60348078 + 1.5 NA intron (NM_001002857, intron 13 of 13) intron (NM_001002857, intron 13 of 13) 50089 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 268.5-22 chr15 51922640 51922912 + 1.5 NA non-coding (NR_109775, exon 2 of 3) non-coding (NR_109775, exon 2 of 3) 1344 NR_109775 100422556 Hs.664788 NR_109775 LOC100422556 - LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component pseudogene pseudo 500-4 chr8 54116989 54117410 + 1.5 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -15182 NM_001279356 10434 Hs.744046 NM_006330 ENSG00000120992 LYPLA1 APT-1|APT1|LPL-I|LPL1|hAPT1 lysophospholipase 1 protein-coding 282.5-22 chr17 63211171 63211657 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) L2b|LINE|L2 228853 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 307.5-7 chr10 66229674 66229965 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MA5|LINE|L1 658394 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 244.75-52 chr6 56655570 56655880 + 1.5 NA intron (NM_001144770, intron 7 of 94) L2c|LINE|L2 -12836 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 279-30 chr4 66759569 66759860 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 482890 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 201.5-14 chr1 189276310 189276522 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 1199594 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 119-44 chr14 20794499 20794662 + 1.5 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 7784 NM_198232 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 281.75-28 chr20 32124431 32124647 + 1.5 NA intron (NM_001363731, intron 1 of 17) MIR3|SINE|MIR 14811 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 169-91 chr6 113376943 113377143 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 56404 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 177-90 chr7 19849820 19850031 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -76308 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 203.25-63 chr22 28095648 28095878 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 11 of 22) intron (NM_001145418, intron 11 of 22) -175151 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 322-7 chr13 90342240 90342481 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 111178 NR_030754 693207 NR_030754 ENSG00000283783 MIR622 MIRN622|hsa-mir-622 microRNA 622 ncRNA 255.5-71 chr6 35635749 35636125 + 1.5 NA intron (NM_001145775, intron 4 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 28852 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 325-24 chrX 131016925 131017178 + 1.5 NA intron (NR_126350, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 41095 NR_126350 104266960 Hs.573575 NR_126350 ENSG00000228659 LINC01201 TCONS_00017091 long intergenic non-protein coding RNA 1201 ncRNA 168.75-95 chr3 94596689 94596865 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -341486 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 309.75-9 chr12 88539450 88539801 + 1.5 NA intron (NM_000899, intron 2 of 9) intron (NM_000899, intron 2 of 9) 40846 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 259.5-20 chr11 68519873 68520094 + 1.5 NA intron (NM_001352353, intron 2 of 22) intron (NM_001352353, intron 2 of 22) 59231 NR_147966 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 244.25-11 chr12 121886511 121886757 + 1.5 NA intron (NM_001171993, intron 1 of 15) L1MC4|LINE|L1 1977 NM_001171993 3242 Hs.2899 NM_002150 ENSG00000158104 HPD 4-HPPD|4HPPD|GLOD3|HPPDASE|PPD 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase protein-coding 231.5-44 chr2 51089928 51090146 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 57436 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 323.5 chr1 183862214 183862569 + 1.5 NA intron (NM_001297669, intron 4 of 18) intron (NM_001297669, intron 4 of 18) 57271 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 166.25-136 chr6 149219143 149219270 + 1.5 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) intron (NM_001292035, intron 2 of 6) 1280 NM_001292035 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 267-56 chr8 128225223 128225568 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75279 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 258.5-77 chr9 8625909 8626155 + 1.5 NA intron (NM_130392, intron 3 of 30) intron (NM_130392, intron 3 of 30) 107914 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 260-42 chr7 67682439 67682775 + 1.5 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -337646 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 251.5-2 chr1 84177178 84177510 + 1.5 NA intron (NM_001300915, intron 4 of 11) intron (NM_001300915, intron 4 of 11) -4288 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 169.5-48 chr14 49256544 49256702 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 329757 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 239.25-8 chr10 76852932 76853173 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -34992 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 142.5-177 chr5 120925667 120925799 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 394269 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 134-120 chr3 112807964 112808090 + 1.5 NA intron (NR_149026, intron 2 of 4) intron (NR_149026, intron 2 of 4) 5549 NR_149027 100129297 Hs.570655 NR_149026 CD200R1L-AS1 - CD200R1L antisense RNA 1 ncRNA 240.25-16 chr12 21160190 21160440 + 1.5 NA intron (NM_006446, intron 2 of 14) L1PA14|LINE|L1 29121 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 350.75-11 chr6 38704451 38704962 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1561 NM_006708 2739 Hs.268849 NM_006708 ENSG00000124767 GLO1 GLOD1|GLYI|HEL-S-74 glyoxalase I protein-coding 180-114 chr8 9617727 9617882 + 1.5 NA intron (NM_003747, intron 3 of 26) intron (NM_003747, intron 3 of 26) 61892 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 347.25-6 chr16 8923340 8923875 + 1.5 NA intron (NM_003470, intron 2 of 30) intron (NM_003470, intron 2 of 30) 13032 NM_001286458 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 269.5-6 chr10 64428206 64428480 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -397185 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 242-17 chr13 75283139 75283397 + 1.5 NA TTS (NM_014832) TTS (NM_014832) 42680 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 335-13 chr3 189091744 189092426 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79886 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 345.5-6 chr11 21405070 21405346 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) 735622 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 226-60 chr6 51583438 51583697 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38303 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 208-45 chr2 192819736 192819945 + 1.5 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 69995 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 391-13 chr4 52835048 52835446 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27070 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 344.5-28 chr6 80736310 80736833 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 629900 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 432.5 chr1 59906966 59907469 + 1.5 NA intron (NM_000775, intron 6 of 8) L2c|LINE|L2 19556 NM_000775 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 257.5-60 chr5 68456356 68456538 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 163870 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 128.25-156 chr5 30676838 30676995 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -516770 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 281.25-49 chr9 12423703 12423972 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -269548 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 175.5-20 chr10 67278871 67279010 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) MER4E|LTR|ERV1 124470 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 221.5-25 chr14 51017798 51018027 + 1.5 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) intron (NM_015163, intron 3 of 9) -73429 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 170.25-10 chr10 52675877 52676055 + 1.5 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 79438 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 221-12 chr10 117332070 117332347 + 1.5 NA intron (NM_173791, intron 2 of 4) L3b|LINE|CR1 43232 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 465.25 chr11 19730095 19730864 + 1.5 NA intron (NM_182964, intron 1 of 37) intron (NM_182964, intron 1 of 37) -15807 NR_015384 100126784 Hs.64341 NR_015384 LOC100126784 - uncharacterized LOC100126784 ncRNA 210.75-27 chr14 87067508 87067681 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 161816 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 249.5-99 chrX 45379450 45379892 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -125717 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 300.75-17 chr15 84615470 84615744 + 1.5 NA intron (NM_181877, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 14598 NM_001007072 54993 Hs.594023 NM_017894 ENSG00000176371 ZSCAN2 ZFP29|ZNF854 zinc finger and SCAN domain containing 2 protein-coding 327.5-4 chr10 17200901 17201375 + 1.5 NA intron (NM_004412, intron 1 of 10) intron (NM_004412, intron 1 of 10) 534 NM_001351219 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 348-7 chr12 19710717 19711097 + 1.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 270308 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 308.5-6 chr11 48025484 48025792 + 1.5 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 45079 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 165.25-149 chr9 90678021 90678239 + 1.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -35306 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 181.5-11 chr10 16867042 16867266 + 1.5 NA intron (NM_001081, intron 59 of 66) intron (NM_001081, intron 59 of 66) -49700 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 210-59 chr20 41505331 41505497 + 1.5 NA intron (NM_032221, intron 5 of 36) L1ME3|LINE|L1 112963 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 547.5-3 chr12 14061525 14062234 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -81523 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 220.25-18 chr15 60779788 60780017 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 98333 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 244-44 chr5 35088244 35088581 + 1.5 NA intron (NM_001204318, intron 2 of 6) intron (NM_001204318, intron 2 of 6) 29710 NM_001204314 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 131-15 chr1 209780013 209780210 + 1.5 NA TTS (NR_109871) TTS (NR_109871) 4448 NM_152485 148304 Hs.497642 NM_152485 ENSG00000162757 C1orf74 URLC4 chromosome 1 open reading frame 74 protein-coding 217.25-11 chr10 25859797 25860014 + 1.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 73805 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 148.75-71 chr17 40792650 40792849 + 1.5 NA intron (NM_181535, intron 7 of 7) intron (NM_181535, intron 7 of 7) 7210 NM_181535 162605 Hs.59736 NM_181535 ENSG00000173908 KRT28 K25IRS4|KRT25D keratin 28 protein-coding 387-14 chr8 126299337 126299706 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25974 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 190-69 chr7 7409099 7409237 + 1.5 NA intron (NM_001037763, intron 27 of 34) intron (NM_001037763, intron 27 of 34) 126705 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 260-21 chr3 6178717 6179078 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 626552 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 273-29 chr2 211385077 211385427 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 26 of 26) intron (NM_001042599, intron 26 of 26) 767681 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 144.75-25 chr10 118395173 118395317 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 38137 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 201.5-108 chr5 95551560 95551755 + 1.5 NA intron (NM_014639, intron 1 of 42) intron (NM_014639, intron 1 of 42) 3348 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 163-79 chr4 21914584 21914714 + 1.5 NA intron (NM_147182, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 34102 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 300.5-28 chr2 193814452 193815016 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -529535 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 255-59 chr7 86335784 86336088 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -307973 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 386.5-14 chr8 59409336 59409850 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 290383 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 425.25-4 chr4 33137110 33137636 + 1.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 786335 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 245.5-3 chr1 80286178 80286464 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -249434 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 216.75-41 chr2 148378533 148378813 + 1.5 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) intron (NM_018328, intron 5 of 14) -266078 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 267.5-53 chr4 94858396 94858749 + 1.5 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) intron (NM_001203, intron 1 of 12) 100617 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 286-3 chr10 57881875 57882405 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 385754 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 280.75-34 chr5 32658509 32658931 + 1.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -32152 NM_001364458 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 150.5-193 chr6 136845664 136845823 + 1.5 NA intron (NM_000288, intron 4 of 9) intron (NM_000288, intron 4 of 9) 23151 NM_000288 5191 Hs.280932 NM_000288 ENSG00000112357 PEX7 PBD9B|PTS2R|RCDP1|RD peroxisomal biogenesis factor 7 protein-coding 321.75-37 chr8 125880245 125880876 + 1.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 70637 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 262-16 chr14 24640401 24640756 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6388 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 390.75-4 chr13 114115981 114116461 + 1.5 NA intron (NM_001320821, intron 1 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 1 of 25).2 16402 NM_001320821 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 200-71 chr5 26251118 26251393 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 787331 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 197.25-50 chr2 98765931 98766272 + 1.5 NA intron (NR_126337, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 5797 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 224.25-3 chr1 61954038 61954301 + 1.5 NA intron (NM_001350145, intron 27 of 43) intron (NM_001350145, intron 27 of 43) 108094 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 265-35 chr6 163760060 163760295 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -88693 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 224.5-6 chr1 186803643 186803881 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25138 NM_024420 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 431.5-3 chr3 31745088 31745428 + 1.5 NA intron (NM_001174060, intron 4 of 10) L1MC4|LINE|L1 41045 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 180.5-22 chr11 131199307 131199491 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -171216 NM_001352005 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 328-30 chr5 110736154 110736428 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1854 NM_001303250 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 364.5-6 chr10 107625200 107625702 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 443842 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 403-11 chr8 112420192 112420761 + 1.5 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) L1MC5a|LINE|L1 -223017 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 271.5-82 chr7 136393606 136393868 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -416378 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 492.75 chr10 11420289 11420824 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -75882 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 624 chr11 82616698 82617509 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 116761 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 454 chr10 56235271 56235767 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125740 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 252.75-68 chr7 51708008 51708291 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -314893 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 173.5-87 chr21 28247555 28247712 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18966 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 260.5-58 chr6 142417140 142417320 + 1.5 NA intron (NM_198569, intron 20 of 24) intron (NM_198569, intron 20 of 24) 115223 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 171.25-27 chr11 98784045 98784290 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -236782 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 175-2 chr1 72554550 72554763 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -272117 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 229.25-62 chr5 33001784 33002073 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 54485 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 225-24 chr12 56662895 56663075 + 1.5 NA TTS (NM_006601) TTS (NM_006601) -17001 NM_001686 506 Hs.406510 NM_001686 ENSG00000110955 ATP5F1B ATP5B|ATPMB|ATPSB|HEL-S-271 ATP synthase F1 subunit beta protein-coding 224.25-58 chr3 123016190 123016481 + 1.5 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger 11428 NM_001031702 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 255-46 chr4 92746332 92746569 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 442051 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 225-36 chr2 51340219 51340506 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 307761 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 326.25-5 chr11 43842514 43842759 + 1.5 NA intron (NM_016142, intron 9 of 10) intron (NM_016142, intron 9 of 10) -38195 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 309.75-34 chr5 160315660 160316063 + 1.5 NA intron (NR_131769, intron 1 of 7) intron (NR_131769, intron 1 of 7) -3297 NM_001308173 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 339.5-28 chr5 144656634 144656907 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 451379 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 154.5-42 chr11 115553391 115553572 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49066 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 204-14 chr14 62240625 62240943 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100811 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 262-26 chr2 21562468 21562738 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 148049 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 182.5-83 chr2 153956037 153956301 + 1.5 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) MER66-int|LTR|ERV1 11775 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 160.75-118 chr5 15253585 15253732 + 1.5 NA intron (NR_109944, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 12902 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 193-60 chr4 23303794 23303979 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 577406 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 310.75-21 chr2 137481302 137481701 + 1.5 NA intron (NM_001316349, intron 15 of 27) intron (NM_001316349, intron 15 of 27) 446431 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 165-121 chr6 88369474 88369766 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 169749 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 225-33 chr17 57784460 57784754 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -39308 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 242-10 chr10 89396277 89396547 + 1.5 NA intron (NM_001270930, intron 2 of 2) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 3789 NM_001270927 3434 Hs.20315 NM_001548 ENSG00000185745 IFIT1 C56|G10P1|IFI-56|IFI-56K|IFI56|IFIT-1|IFNAI1|ISG56|P56|RNM561 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 180.25-65 chr21 27413692 27413829 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -308619 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 309-34 chr4 82948994 82949521 + 1.5 NA intron (NM_001288996, intron 2 of 10) L1MA9|LINE|L1 -48341 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 247-47 chr4 81002996 81003261 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -27580 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 343.75-2 chr10 65413121 65413468 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -158131 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 362-4 chr15 88582742 88583165 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 21650 NR_120369 101929743 Hs.558810 NR_120369 ENSG00000249487 LINC01586 - long intergenic non-protein coding RNA 1586 ncRNA 256.25-46 chr7 89010220 89010476 + 1.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -214611 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 393 chr10 30834288 30834659 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 111254 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 258.5-80 chrX 26347357 26347615 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 131317 NM_001271752 347541 Hs.224079 NM_001271752 ENSG00000188408 MAGEB5 CT3.3|MAGE-B5 MAGE family member B5 protein-coding 422-8 chr4 30494515 30494948 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -225638 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 227-35 chr2 204033964 204034166 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 97317 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 127.5-157 chr3 166174639 166174824 + 1.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -337308 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 195-2 chr1 155577460 155577671 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -14762 NM_018489 55870 Hs.491060 NM_018489 ENSG00000116539 ASH1L ASH1|ASH1L1|KMT2H|MRD52 ASH1 like histone lysine methyltransferase protein-coding 321-17 chr3 62727617 62727942 + 1.5 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) intron (NM_003716, intron 3 of 29) 147637 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 437-7 chr21 16481167 16481477 + 1.5 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) L1PB1|LINE|L1 -54250 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 276.75-16 chr18 60288324 60288644 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 84291 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 275.75-23 chr2 39890222 39890430 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27308 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 156-49 chr14 71951918 71952081 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) L1ME3A|LINE|L1 18472 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 211.5-126 chr5 72750408 72750637 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -66069 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 203-67 chr4 3674140 3674335 + 1.5 NA intron (NR_034136, intron 2 of 2) L1MC5a|LINE|L1 3618 NR_034136 100133461 Hs.554274 NR_034136 ENSG00000250632 LINC02171 - long intergenic non-protein coding RNA 2171 ncRNA 255.75-48 chr7 85095833 85096181 + 1.5 NA intron (NM_152754, intron 2 of 16) intron (NM_152754, intron 2 of 16) 25924 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 174-106 chr9 4829582 4829780 + 1.5 NA intron (NM_005772, intron 3 of 8) intron (NM_005772, intron 3 of 8) -10088 NM_001286701 10171 Hs.194121 NM_005772 ENSG00000120158 RCL1 RNAC|RPCL1 RNA terminal phosphate cyclase like 1 protein-coding 434.25-13 chr6 153792276 153792827 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -217945 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 118.5-173 chr5 179085788 179085919 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 25480 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 161.75-109 chr5 149418837 149419035 + 1.5 NA intron (NR_105060, intron 1 of 4) intron (NR_105060, intron 1 of 4) -9982 NR_029684 406935 NR_029684 ENSG00000284182 MIR143 MIRN143|mir-143 microRNA 143 ncRNA 145-160 chr8 135965815 135965954 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 508428 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 206-15 chr11 24952055 24952292 + 1.5 NA intron (NM_001009909, intron 7 of 11) intron (NM_001009909, intron 7 of 11) 455120 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 215-83 chrX 57456108 57456272 + 1.5 NA intron (NR_148564, intron 11 of 11) L1PA16|LINE|L1 -135646 NM_007157 158586 Hs.156257 NM_007157 ENSG00000198455 ZXDB ZNF905|dJ83L6.1 zinc finger X-linked duplicated B protein-coding 232.5-51 chr2 95326986 95327253 + 1.5 NA intron (NM_013434, intron 2 of 8) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -19539 NM_001034914 30818 Hs.437376 NM_013434 ENSG00000115041 KCNIP3 CSEN|DREAM|KCHIP3 potassium voltage-gated channel interacting protein 3 protein-coding 214.5-132 chr9 15363817 15364119 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56608 NM_001168340 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 330.5-22 chr3 19610590 19610943 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -295835 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 386.5-16 chr9 10519202 10519666 + 1.5 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) intron (NM_002839, intron 2 of 45) 93568 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 251.5-33 chr2 41798504 41798817 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -78895 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 342-12 chr3 169404566 169404918 + 1.5 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) -43125 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 204.75-39 chr15 69606205 69606424 + 1.5 NA intron (NR_126438, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 14114 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 179.5-165 chr7 37664103 37664349 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19540 NM_181791 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 262.5-50 chr3 182352619 182352886 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 133610 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 227-39 chr22 27676140 27676316 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125528 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 363.5-19 chr6 143954954 143955433 + 1.5 NA intron (NM_001289047, intron 2 of 3) intron (NM_001289047, intron 2 of 3) 6217 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 247-8 chr10 82191020 82191251 + 1.5 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 41785 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-125 chr5 130161680 130161832 + 1.5 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 257291 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 248-27 chr15 96062907 96063494 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 64641 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 304.5-16 chr18 555040 555409 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25156 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 199.5-133 chr7 12863110 12863360 + 1.5 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 175602 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 382.75-2 chr18 12511702 12512059 + 1.5 NA intron (NM_020148, intron 5 of 15) AluJo|SINE|Alu 79106 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 273-60 chr9 83599525 83599839 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23367 NM_001256915 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 239.75-38 chr20 40158259 40158614 + 1.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 153975 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 207-69 chr6 41398871 41399105 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 63380 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 297.75-43 chr6 144886200 144886487 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 480688 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 355.5-22 chr5 133666207 133666729 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -53927 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 294.5-26 chr20 48706794 48707254 + 1.5 NA intron (NM_020820, intron 6 of 39) LTR67B|LTR|ERVL 120975 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 335.25-6 chr10 66035603 66036086 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 464419 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 124-41 chr13 77219633 77219800 + 1.5 NA intron (NM_015057, intron 20 of 82) intron (NM_015057, intron 20 of 82) 107378 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 276.25-29 chr3 24185258 24185543 + 1.5 NA intron (NR_121667, intron 3 of 3) L1ME4a|LINE|L1 34076 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 201-59 chr4 56591722 56591865 + 1.5 NA intron (NM_001256475, intron 6 of 8) intron (NM_001256475, intron 6 of 8) 61187 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 361-19 chrX 42400311 42400605 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 377705 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 179-45 chr17 44018267 44018517 + 1.5 NA intron (NM_001304813, intron 1 of 4) intron (NM_001304813, intron 1 of 4) 1055 NM_001304814 84336 Hs.514211 NM_032376 ENSG00000091947 TMEM101 - transmembrane protein 101 protein-coding 173.25-77 chr3 88708053 88708202 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 369671 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 211.5-128 chr5 151910262 151910444 + 1.5 NA intron (NM_000171, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 14498 NM_001146040 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 269.5-30 chr2 169307964 169308208 + 1.5 NA intron (NM_004525, intron 3 of 78) intron (NM_004525, intron 3 of 78) 54448 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 261.75-17 chr17 77735931 77736264 + 1.5 NA Intergenic G-rich|Low_complexity|Low_complexity -7538 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 230.25-27 chr15 96673370 96673672 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 108133 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 399.75-2 chr1 26626482 26627003 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 67389 NR_135804 101928728 Hs.128770 NR_135804 ENSG00000260063 LOC101928728 - uncharacterized LOC101928728 ncRNA 308.5-16 chr18 41651171 41651515 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -130666 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 298.75-9 chr1 195984396 195984692 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 104171 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 435-6 chr2 182045585 182046076 + 1.5 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 59977 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 336 chr1 114022834 114023196 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43541 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 287-24 chr2 149307406 149307683 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22441 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 216-8 chr11 40907975 40908275 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) 551511 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 290.5-44 chrX 71388148 71388452 + 1.5 NA exon (NM_138923, exon 16 of 38) exon (NM_138923, exon 16 of 38) 21943 NR_104387 6872 Hs.158560 NM_004606 ENSG00000147133 TAF1 BA2R|CCG1|CCGS|DYT3|DYT3/TAF1|KAT4|MRXS33|N-TAF1|NSCL2|OF|P250|TAF(II)250|TAF2A|TAFII-250|TAFII250|XDP TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 313.5-41 chrX 31500485 31500712 + 1.5 NA intron (NM_000109, intron 56 of 78) intron (NM_000109, intron 56 of 78) 7700 NM_004014 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 210.25-18 chr12 21652977 21653228 + 1.5 NA intron (NM_001174097, intron 2 of 7) intron (NM_001174097, intron 2 of 7) 4692 NM_001174097 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 297.5-42 chr4 51838750 51839083 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4084 NM_015115 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 241-17 chr15 46944279 46944439 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -239730 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 381.5 chr13 106949033 106949412 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 295342 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 126-143 chr5 74727225 74727315 + 1.5 NA intron (NR_104006, intron 16 of 19) intron (NR_104006, intron 16 of 19) 39847 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 318.75-19 chr5 162217968 162218227 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 150455 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 271.5-37 chr2 96782045 96782303 + 1.5 NA intron (NM_020184, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu -16104 NR_036074 100422928 NR_036074 ENSG00000264157 MIR3127 mir-3127 microRNA 3127 ncRNA 284.5-48 chr5 51746498 51746763 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -261401 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 253.5-69 chr6 91730002 91730255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39700 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 333-2 chr1 53018875 53019290 + 1.5 NA intron (NM_001007100, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 4144 NM_001007250 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 455.75-3 chr2 50542693 50543048 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 9 of 22) intron (NM_001330093, intron 9 of 22) 153392 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 153.25-101 chr5 45507573 45507743 + 1.5 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 188722 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 300-2 chr1 65537795 65538025 + 1.5 NA intron (NM_001198687, intron 1 of 18) intron (NM_001198687, intron 1 of 18) 12221 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 353-23 chr7 103939671 103940187 + 1.5 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) L1ME4a|LINE|L1 49587 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 346.75-10 chr3 82204471 82204876 + 1.5 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) LTR1F|LTR|ERV1 218531 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 143.25-97 chr2 220582329 220582515 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -675857 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 434.25-6 chr19 29965002 29965482 + 1.5 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) intron (NR_045557, intron 1 of 9) 23003 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 185.5-27 chr11 85700379 85700591 + 1.5 NA intron (NM_001365826, intron 16 of 18) intron (NM_001365826, intron 16 of 18) -14290 NM_152723 220388 Hs.376241 NM_152723 ENSG00000179071 CCDC89 - coiled-coil domain containing 89 protein-coding 247.5-91 chr9 137572340 137572588 + 1.5 NA intron (NM_001346373, intron 3 of 6) L2|LINE|L2 6162 NM_001346373 92715 Hs.292570 NM_138778 ENSG00000148399 DPH7 C9orf112|RRT2|WDR85 diphthamide biosynthesis 7 protein-coding 247.5-28 chr15 98441008 98441199 + 1.5 NA exon (NM_182562, exon 6 of 7) exon (NM_182562, exon 6 of 7) -20105 NR_146567 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 653.5 chr22 28546131 28546879 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME1|LINE|L1 86636 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 238.5-34 chr17 76264505 76264714 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_182565) promoter-TSS (NM_182565) -739 NM_182565 283991 Hs.744981 NM_182565 ENSG00000185262 UBALD2 FAM100B UBA like domain containing 2 protein-coding 484.5 chr10 25224109 25224901 + 1.5 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -48229 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 223-64 chr5 46309169 46309403 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -612906 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 235-72 chr8 99027330 99027690 + 1.5 NA intron (NR_047582, intron 2 of 8) L1MA5|LINE|L1 14244 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 190.5-106 chr4 31457561 31457764 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48882 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 225.5-84 chr4 150051432 150051598 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -26930 NR_036614 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 172-17 chr11 4977546 4977685 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10576 NM_021801 56547 Hs.204732 NM_021801 ENSG00000167346 MMP26 - matrix metallopeptidase 26 protein-coding 458-3 chr2 4146596 4146923 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 172598 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 242.5-45 chr2 68696707 68696897 + 1.5 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -38009 NM_001007231 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 289.5-13 chr14 49297270 49297606 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 288942 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 397.5-11 chr8 76342190 76342572 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -64273 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 567.5-3 chr9 27047732 27048314 + 1.5 NA intron (NM_025103, intron 15 of 19) intron (NM_025103, intron 15 of 19) -42351 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 229.5-130 chr8 69768086 69768385 + 1.5 NA intron (NM_001146009, intron 1 of 7) intron (NM_001146009, intron 1 of 7) 64934 NM_001146009 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 118.25-206 chr8 127057548 127057773 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -22214 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 254.25 chr1 77181426 77181733 + 1.5 NA intron (NM_005482, intron 3 of 10) intron (NM_005482, intron 3 of 10) 37851 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 249.25-10 chr14 48741748 48742051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 844481 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 163.5-38 chr12 9117131 9117285 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001347424) promoter-TSS (NM_001347424) -979 NM_001347423 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 281-13 chr2 20153219 20153519 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71761 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 252-20 chr13 66473511 66473796 + 1.5 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 255403 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 170-42 chr18 49142069 49142233 + 1.5 NA intron (NM_001353210, intron 14 of 16) AluY|SINE|Alu -92383 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 270.25-2 chr1 75991724 75992075 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19425 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 242.75-21 chr17 61975100 61975346 + 1.5 NA intron (NM_005121, intron 16 of 29) L1MB8|LINE|L1 -47241 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 168.5-181 chr8 80987782 80987918 + 1.5 NA intron (NM_018440, intron 5 of 8) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -113069 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 303-5 chr12 44381932 44382320 + 1.5 NA intron (NM_001286213, intron 6 of 6) X7A_LINE|LINE|CR1 493535 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 228.5-95 chr7 3385815 3386204 + 1.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 84757 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 267-12 chr11 90239696 90239893 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -11438 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 185.5-142 chr6 70371319 70371532 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22777 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 273-41 chr4_GL000008v2_random 576 843 + 1.5 NA Intergenic (GGAGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 177462 NR_046228 100874392 Hs.648245 NR_046228 ANKRD20A12P - ankyrin repeat domain 20 family member A12, pseudogene pseudo 291.75-7 chr11 6743726 6744075 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22021 NR_003945 387751 Hs.494757 NR_003945 ENSG00000254838 GVINP1 GVIN1|GVIN1P|VLIG-1|VLIG1 GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 pseudo 295-19 chr2 51606659 51607017 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 574237 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 576.75-3 chr20 53364887 53365506 + 1.5 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 179913 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 327.5-3 chr1 230783668 230783975 + 1.5 NA intron (NM_016452, intron 10 of 18) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 36433 NM_006615 10753 Hs.498021 NM_006615 ENSG00000135773 CAPN9 GC36|nCL-4 calpain 9 protein-coding 166.75-20 chr11 18869008 18869181 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 65908 NM_147199 259249 Hs.711459 NM_147199 ENSG00000170255 MRGPRX1 GPCR|MGRG2|MRGX1|SNSR4 MAS related GPR family member X1 protein-coding 199.5-36 chr13 114094955 114095141 + 1.5 NA intron (NM_001320821, intron 1 of 25).2 L1MC5|LINE|L1 -17093 NM_001320822 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 288.5-11 chr14 67017900 67018324 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -171328 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 307.5-25 chr2 52183571 52183833 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) LTR16D1|LTR|ERVL -186946 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 355.5-31 chrX 84663157 84663551 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -160901 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 169.5-181 chr9 105154090 105154295 + 1.5 NA Intergenic (AATCAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -90413 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 195-32 chr15 95692833 95693077 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 259862 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 347.25-24 chr8 108801736 108802155 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14351 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 365.25-3 chr2 21832606 21833032 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -122167 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 353.25-5 chr14 59591577 59591850 + 1.5 NA Intergenic LTR3B_|LTR|ERVK -14901 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 247-4 chr10 20115231 20115521 + 1.5 NA intron (NM_032812, intron 4 of 13) intron (NM_032812, intron 4 of 13) 298944 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 243.5-8 chr1 159336628 159336969 + 1.5 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -22139 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 318.5-21 chr2 62402343 62402680 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 103684 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 223.25-13 chr12 33555819 33556075 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116128 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 187.5-41 chr12 60424766 60424945 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 735485 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 187.75-19 chr11 101991923 101992205 + 1.5 NA intron (NM_001363543, intron 10 of 11) L1ME3D|LINE|L1 -55373 NM_032930 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 189.75-132 chr9 102302737 102302912 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -216813 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 248.75-54 chr6 66067350 66067618 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 279605 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 171.75-135 chr8 5532159 5532392 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -537361 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 159-71 chr4 25348335 25348477 + 1.5 NA intron (NM_001318148, intron 6 of 8) intron (NM_001318148, intron 6 of 8) -28857 NM_001286756 29945 Hs.152173 NM_013367 ENSG00000053900 ANAPC4 APC4 anaphase promoting complex subunit 4 protein-coding 271.5-73 chr5 175143478 175143828 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -147922 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 276.5-27 chr17 51044924 51045149 + 1.5 NA intron (NM_001130527, intron 4 of 29) intron (NM_001130527, intron 4 of 29) 1842 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 411.5-4 chr14 31374658 31375101 + 1.5 NA exon (NM_015473, exon 12 of 36) exon (NM_015473, exon 12 of 36) 45671 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 291.5-53 chr9 28213387 28213715 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 505754 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 214.25-31 chr18 43126513 43126802 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10965 NM_001272077 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 112.5-134 chr2 187746801 187746945 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -192368 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 366.75-23 chr8 110291995 110292468 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -316460 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 275-4 chr1 219491643 219491872 + 1.5 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 65567 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 361.5-11 chr2 111626836 111627310 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -131912 NR_024373 541471 Hs.560805 NR_015395 ENSG00000172965 MIR4435-2HG AGD2|LINC00978|MIR4435-1HG|MORRBID|lncRNA-AWPPH MIR4435-2 host gene ncRNA 356.5-19 chr5 78776842 78777443 + 1.5 NA TTS (NM_000046) TTS (NM_000046) -128370 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 229.5-131 chr8 71238778 71238976 + 1.5 NA intron (NM_001370336, intron 12 of 17) L1M5|LINE|L1 117829 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 430.75-4 chr14 54328765 54329478 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -67747 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 272-24 chr3 63337779 63338051 + 1.5 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) L1MC2|LINE|L1 59607 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 300-7 chr10 54054228 54054527 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) intron (NM_001354411, intron 19 of 34) -431853 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 257.25-32 chr3 119882951 119883204 + 1.5 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) intron (NM_002093, intron 7 of 11) 100367 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 370-3 chr1 99248137 99248574 + 1.5 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -15937 NM_001166252 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 248.25-9 chr10 82605637 82606049 + 1.5 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1MC2|LINE|L1 -372923 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 205.5-122 chr6 23481414 23481597 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -644710 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 257.25-13 chr13 95823043 95823392 + 1.5 NA intron (NM_020121, intron 38 of 38) L1PB2|LINE|L1 146078 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 196.5-86 chr2 170198382 170198772 + 1.5 NA intron (NM_001083615, intron 1 of 33) intron (NM_001083615, intron 1 of 33) 20430 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 373-8 chr2 158385530 158385905 + 1.5 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) intron (NM_138803, intron 1 of 13) 71036 NM_138803 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 223.5-80 chr3 44170659 44170905 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 56570 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 255.75-6 chr10 31591398 31591627 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -191757 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 294.75-29 chr4 41289136 41289410 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 32345 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 279.5-25 chr18 6797124 6797447 + 1.5 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -37200 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 249-44 chr6 142831864 142832181 + 1.5 NA intron (NM_006734, intron 2 of 9) AluSq|SINE|Alu 113154 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 265.5-7 chr10 30011811 30012051 + 1.5 NA TTS (NM_001350001) TTS (NM_001350001) 47655 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 253-41 chr5 52981145 52981337 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8111 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 175-135 chr9 73183959 73184111 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 32170 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 255.75-28 chr2 226769078 226769546 + 1.5 NA intron (NM_005544, intron 1 of 1) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 29478 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 322.75-3 chr10 116219872 116220256 + 1.5 NA intron (NM_005264, intron 4 of 10) intron (NM_005264, intron 4 of 10) -25275 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 387-15 chr9 81536747 81537224 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 152550 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 136-149 chr8 82537165 82537285 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -374879 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 313.5-34 chr7 67633565 67634023 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 297818 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 179.5-47 chr12 91260232 91260376 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -77487 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 332.25-2 chr1 119728072 119728600 + 1.5 NA intron (NM_006623, intron 5 of 11) intron (NM_006623, intron 5 of 11) 16402 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 190-56 chr4 166297485 166297717 + 1.5 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 424364 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 248.5-40 chr18 73342051 73342383 + 1.5 NA intron (NR_038340, intron 2 of 2) MER57B1|LTR|ERV1 17276 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 178.5-132 chr5 9701380 9701634 + 1.5 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) intron (NR_027112, intron 9 of 12) -71156 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 182.5-165 chr8 91783395 91783624 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 234171 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 344-11 chr20 7464741 7465137 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 93331 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 383-13 chr4 103317677 103318081 + 1.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -107163 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 159.75-110 chr3 119639448 119639630 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21051 NM_022135 64091 Hs.534383 NM_022135 ENSG00000121577 POPDC2 POP2 popeye domain containing 2 protein-coding 183-98 chr6 34347747 34347952 + 1.5 NA intron (NM_001202470, intron 5 of 8) AluJr|SINE|Alu 44820 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 207-57 chr3 26657881 26658081 + 1.5 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) intron (NM_001317810, intron 2 of 2) 33314 NM_001317810 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 287-34 chr6 132705525 132705913 + 1.5 NA intron (NM_004666, intron 2 of 6) L1MA2|LINE|L1 8336 NM_004666 8876 Hs.12114 NM_004666 ENSG00000112299 VNN1 HDLCQ8|Tiff66 vanin 1 protein-coding 209.25-109 chr7 78555759 78556051 + 1.5 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 208663 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 260-9 chr14 68088058 68088286 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 264580 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 257.75-20 chr18 60118427 60118817 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 218626 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 176.5-165 chr8 41115813 41115992 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 155241 NR_049801 100847068 NR_049801 ENSG00000263372 MIR548AO - microRNA 548ao ncRNA 232.25-57 chr4 152989324 152989652 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46505 NM_033393 85462 Hs.132629 NM_033393 ENSG00000137460 FHDC1 - FH2 domain containing 1 protein-coding 290.5-42 chr8 125233375 125233637 + 1.5 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 141646 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 287.5-12 chr11 91350069 91350437 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -481051 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 370-12 chr3 182104417 182104747 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 152218 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 345-15 chr5 147058436 147058783 + 1.5 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) intron (NM_181677, intron 2 of 10) -2472 NM_181676 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 410-11 chr5 130281983 130282278 + 1.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 377665 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 163-93 chr5 39561115 39561262 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 40757 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 249-29 chr21 24430598 24430885 + 1.5 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) intron (NR_135519, intron 1 of 2) 2001 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 353-22 chr7 1685920 1686221 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -2049 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 168.5-77 chr2 36476556 36476798 + 1.5 NA intron (NM_016441, intron 5 of 16) intron (NM_016441, intron 5 of 16) 120899 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 189-47 chr18 63355028 63355253 + 1.5 NA intron (NM_002035, intron 5 of 9) intron (NM_002035, intron 5 of 9) 12066 NM_002035 2531 Hs.74050 NM_002035 ENSG00000119537 KDSR DHSR|EKVP4|FVT1|SDR35C1 3-ketodihydrosphingosine reductase protein-coding 219.75-54 chr4 67120461 67120943 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 301298 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 240.5-88 chr5 146683706 146683918 + 1.5 NA intron (NM_181678, intron 6 of 10) intron (NM_181678, intron 6 of 10) -167699 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 278.25-55 chr7 68162184 68162466 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 142072 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 384.75-15 chr8 77481498 77481840 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 30972 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 184.5-37 chr12 29512584 29512752 + 1.5 NA intron (NM_001367875, intron 18 of 19) L3|LINE|CR1 -12975 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 155.5-152 chr4 130522180 130522303 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 145880 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 187-67 chr4 7179532 7179706 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -12919 NM_020777 57537 Hs.479099 NM_020777 ENSG00000184985 SORCS2 - sortilin related VPS10 domain containing receptor 2 protein-coding 257-34 chr22 38850751 38850990 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -6842 NM_014293 23467 Hs.91622 NM_014293 ENSG00000221890 NPTXR NPR neuronal pentraxin receptor protein-coding 273-16 chr12 26276648 26277019 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 81260 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 183.25-90 chr6 54504744 54504963 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 196412 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 295.75-9 chr18 3529599 3529839 + 1.5 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) L2c|LINE|L2 63469 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 258.5-38 chr2 42106785 42107088 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 58915 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 180-115 chr8 75184760 75184998 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 93602 NR_103848 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 516-3 chr6 125679132 125679644 + 1.5 NA intron (NR_038906, intron 1 of 3) intron (NR_038906, intron 1 of 3) 5035 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 339.75-11 chr14 57232285 57232596 + 1.5 NA intron (NM_006544, intron 10 of 17) intron (NM_006544, intron 10 of 17) 36465 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 321.75 chr1 180020732 180021073 + 1.5 NA exon (NM_014810, exon 12 of 38) exon (NM_014810, exon 12 of 38) 66092 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 290.25-7 chr11 8474523 8474848 + 1.5 NA exon (NM_001352395, exon 3 of 14) exon (NM_001352395, exon 3 of 14) 119291 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 403.5-3 chr16 68207589 68208005 + 1.5 NA intron (NM_173165, intron 9 of 9) L1MB4|LINE|L1 25702 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 433.25-4 chr6 148138387 148138759 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -133755 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 164-12 chr10 5371816 5371941 + 1.5 NA intron (NM_053049, intron 1 of 1) intron (NM_053049, intron 1 of 1) 6912 NM_053049 114131 Hs.511775 NM_053049 ENSG00000178473 UCN3 SCP|SPC|UCNIII urocortin 3 protein-coding 263 chr1 52710452 52710831 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12294 NM_023077 65260 Hs.349905 NM_023077 ENSG00000162377 COA7 C1orf163|RESA1|SCAN3|SELRC1 cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) protein-coding 219.5-107 chr6 8322551 8322798 + 1.5 NA Intergenic LTR1F|LTR|ERV1 112871 NM_001370478 51000 Hs.285847 NM_015948 ENSG00000124786 SLC35B3 C6orf196|CGI-19|PAPST2 solute carrier family 35 member B3 protein-coding 302.5-13 chr14 64130505 64130803 + 1.5 NA intron (NM_015180, intron 76 of 114) AluSx1|SINE|Alu -35529 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 247.75-67 chr8 71550550 71550725 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2543 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 270.5-21 chr15 66850590 66850870 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105785 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 400.5-16 chr8 111667702 111668070 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 291247 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 118-95 chr2 190722753 190722907 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 63672 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 182.5-106 chr3 132562459 132562670 + 1.5 NA intron (NR_132427, intron 15 of 17) L1ME1|LINE|L1 -34706 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 116-58 chr16 27648141 27648369 + 1.5 NA intron (NM_015202, intron 5 of 27) AluSz6|SINE|Alu 70774 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 225.75-27 chr15 61027227 61027477 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 201950 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 129-189 chr9 28384235 28384331 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) L1ME3F|LINE|L1 335022 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 158.75-35 chr12 6921742 6921941 + 1.5 NA intron (NM_001975, intron 9 of 11) intron (NM_001975, intron 9 of 11) -2618 NM_001007026 1822 Hs.143766 NM_001940 ENSG00000111676 ATN1 B37|D12S755E|DRPLA|HRS|NOD atrophin 1 protein-coding 309.75-11 chr14 57389201 57389593 + 1.5 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -1189 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 140-20 chr10 107833217 107833354 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 236008 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 191.5-57 chr17 58885319 58885461 + 1.5 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 129521 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 371.75-11 chr22 27051638 27052125 + 1.5 NA intron (NM_001318329, intron 1 of 1) MER102c|DNA|hAT-Charlie 8637 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 338.5-36 chr8 73479337 73480001 + 1.5 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 59595 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 223.75-80 chr8 90548647 90548953 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 57263 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 241-19 chr16 70548762 70548945 + 1.5 NA intron (NM_012426, intron 11 of 25) intron (NM_012426, intron 11 of 25) 10848 NR_003079 692214 NR_003079 ENSG00000221066 SNORD111 HBII-82 small nucleolar RNA, C/D box 111 snoRNA 255.75-21 chr18 39811407 39811631 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -30190 NR_151703 105372079 NR_151703 ENSG00000283503 LINC01902 - long intergenic non-protein coding RNA 1902 ncRNA 214.75-3 chr1 92563440 92563691 + 1.5 NA intron (NM_001350198, intron 19 of 19) intron (NM_001350198, intron 19 of 19) -76640 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 269.25-53 chr8 61306528 61306883 + 1.5 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) L1PA13|LINE|L1 18735 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 171.5-137 chr7 18526439 18526658 + 1.5 NA intron (NM_001204147, intron 1 of 9) intron (NM_001204147, intron 1 of 9) 17278 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 183-100 chr6 38122887 38123025 + 1.5 NA intron (NM_021943, intron 5 of 5) intron (NM_021943, intron 5 of 5) 303229 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 291.5-14 chr16 48406738 48407092 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21502 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 213-59 chr21 30775071 30775283 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19749 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 174.75-58 chr2 70181824 70182015 + 1.5 NA exon (NM_001348761, exon 3 of 10) exon (NM_001348761, exon 3 of 10) 8792 NM_001348763 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 390-9 chr21 29650888 29651329 + 1.5 NA intron (NM_000830, intron 6 of 16) intron (NM_000830, intron 6 of 16) 55068 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 216.75-73 chr6 157117828 157118074 + 1.5 NA intron (NM_020732, intron 7 of 19) intron (NM_020732, intron 7 of 19) 81524 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 145.5-92 chr2 28389690 28389891 + 1.5 NA intron (NR_103831, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR -3068 NM_005253 2355 Hs.220971 NM_005253 ENSG00000075426 FOSL2 FRA2 FOS like 2, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 210.75-70 chr4 131447244 131447445 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -317494 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 162-9 chr1 182977221 182977391 + 1.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -24140 NM_001345928 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 255.5-77 chr7 41510629 41510811 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -183199 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 177.5-186 chrX 50734019 50734218 + 1.5 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) L1M4b|LINE|L1 79926 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 149.75-146 chr6 119659538 119659716 + 1.5 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 109819 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 242.75-71 chr8 123644115 123644377 + 1.5 NA TTS (NM_001081675) TTS (NM_001081675) 9555 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 254.5-82 chr9 37362352 37362699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60171 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 205-68 chr6 151981362 151981763 + 1.5 NA intron (NM_001122741, intron 5 of 8) intron (NM_001122741, intron 5 of 8) 172455 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 324.5-10 chr15 63330808 63331213 + 1.5 NA intron (NM_001218, intron 8 of 10) intron (NM_001218, intron 8 of 10) 50836 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 189-45 chr18 45602056 45602233 + 1.5 NA intron (NM_001371319, intron 5 of 23) intron (NM_001371319, intron 5 of 23) -13332 NM_007163 8170 Hs.710927 NM_007163 ENSG00000132874 SLC14A2 HUT2|UT-A2|UT2|UTA|UTR|hUT-A6 solute carrier family 14 member 2 protein-coding 180.5-162 chr8 138506173 138506432 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8572 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 363-4 chr13 94500551 94501052 + 1.5 NA intron (NM_001322184, intron 1 of 8) L1MA9|LINE|L1 -21119 NM_001922 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 225.5-63 chr2 223238756 223239012 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 186954 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 281.5-61 chrX 31361913 31362206 + 1.5 NA intron (NM_000109, intron 60 of 78) intron (NM_000109, intron 60 of 78) -95105 NM_004019 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 258.75-46 chr21 28333144 28333464 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -104637 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 186-91 chr8 73723280 73723482 + 1.5 NA intron (NM_001164380, intron 3 of 14) L1MEc|LINE|L1 23459 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 244.5-5 chr1 150690187 150690446 + 1.5 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) intron (NM_018178, intron 2 of 4) 6838 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 349.5 chr1 29587633 29588081 + 1.5 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -237743 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 135.25-128 chr3 72452091 72452261 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5553 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 272.25-47 chr5 97019970 97020166 + 1.5 NA intron (NM_005575, intron 13 of 17) intron (NM_005575, intron 13 of 17) 61635 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 220-50 chr5 159473675 159473840 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -7481 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 288-40 chr5 92460760 92461068 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1077597 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 247.25-35 chr2 237505744 237506194 + 1.5 NA intron (NM_024101, intron 2 of 15) intron (NM_024101, intron 2 of 15) -4962 NR_106869 102465486 NR_106869 ENSG00000277842 MIR6811 hsa-mir-6811 microRNA 6811 ncRNA 399.5-9 chr8 65878524 65878827 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36611 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 172-35 chr14 58202669 58202822 + 1.5 NA intron (NM_018477, intron 1 of 12) intron (NM_018477, intron 1 of 12) 2596 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 338-22 chr3 177296440 177296852 + 1.5 NA intron (NR_047465, intron 1 of 1) L1MC1|LINE|L1 2204 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 138.75-191 chr8 84711640 84711814 + 1.5 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 5800 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 278-10 chr13 101587296 101587544 + 1.5 NA intron (NM_001271754, intron 5 of 10) intron (NM_001271754, intron 5 of 10) 97468 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 289-36 chr5 120073828 120074065 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -390332 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 227.75-48 chr22 28496171 28496424 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 36428 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 393.5-6 chr18 516535 517220 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1583 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 230-72 chr8 134030854 134031043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 144452 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 229-75 chr9 27427183 27427429 + 1.5 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -97008 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 358.25-11 chr2 17783462 17783947 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001130009, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001130009, exon 14 of 14) 29566 NM_001130009 348654 Hs.467793 NM_182625 ENSG00000178295 GEN1 Gen GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease protein-coding 194-60 chr3 186001883 186002310 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 42153 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 344.75-7 chr3 114838678 114839063 + 1.5 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) intron (NM_001348805, intron 4 of 10) -34163 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 267.75-9 chr11 43148667 43149004 + 1.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 120534 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 225.75-49 chr2 211505293 211505532 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) L1PA15-16|LINE|L1 887841 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 319-35 chr6 103038175 103038435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1639320 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 294-23 chr3 73750513 73750771 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -58602 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 170.5-107 chr2 235330090 235330314 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -163841 NM_001244888 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 492.5-3 chr6 48991484 48991891 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 471566 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 384.5 chr1 248233143 248233511 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5602 NM_017504 26245 Hs.381309 NM_017504 ENSG00000171180 OR2M4 HSHTPCRX18|HTPCRX18|OR1-55|OST710|TPCR100 olfactory receptor family 2 subfamily M member 4 protein-coding 351.75-15 chr4 52666998 52667506 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 7846 NR_125363 643783 Hs.631514 NR_125363 ENSG00000248866 USP46-AS1 - USP46 antisense RNA 1 ncRNA 154.75-25 chr12 7053334 7053449 + 1.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -7327 NM_201442 716 Hs.458355 NM_001734 ENSG00000182326 C1S EDSPD2 complement C1s protein-coding 220.25-27 chr18 64679027 64679298 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -419107 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 136.5-185 chr5 94650738 94650853 + 1.5 NA intron (NM_032290, intron 6 of 20) intron (NM_032290, intron 6 of 20) 32126 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 448.75-3 chr3 21683020 21683580 + 1.5 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 67910 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 298.25-8 chr13 74790000 74790544 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 237429 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 126.5-234 chr8 51031010 51031113 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 778384 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 158.5-61 chr14 45590891 45591028 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 124643 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 315.5-19 chr4 132471600 132471826 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -119376 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 228.5-47 chr19 34430786 34431117 + 1.5 NA intron (NM_005499, intron 2 of 16) intron (NM_005499, intron 2 of 16) 2570 NM_005499 10054 Hs.631580 NM_005499 ENSG00000126261 UBA2 ARX|HRIHFB2115|SAE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 2 protein-coding 321-29 chr8 24812362 24812774 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -101193 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 273.5 chr1 5687139 5687482 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 175431 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 268.5-28 chr18 72799975 72800279 + 1.5 NA intron (NM_001354018, intron 4 of 11) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 53255 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 190.5-66 chr18 9109538 9109683 + 1.5 NA intron (NM_021074, intron 1 of 7) intron (NM_021074, intron 1 of 7) 6911 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 256.25-54 chr9 70464635 70464849 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -50085 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 430-13 chr4 32122871 32123494 + 1.5 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -100760 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 171.75-118 chr6 4155119 4155298 + 1.5 NA intron (NR_103764, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 19136 NR_103764 100507506 Hs.665936 NR_103764 ENSG00000234817 LOC100507506 - uncharacterized LOC100507506 ncRNA 217-13 chr11 84131690 84131882 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 9 of 27) intron (NM_001142699, intron 9 of 27) 141494 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 341.5-5 chr14 72116274 72116557 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie 182888 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 196-83 chr6 34972225 34972447 + 1.5 NA intron (NM_015245, intron 3 of 23) intron (NM_015245, intron 3 of 23) 83081 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 322.5-45 chrX 70497054 70497410 + 1.5 NA intron (NM_020730, intron 8 of 13) intron (NM_020730, intron 8 of 13) -41238 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 405-6 chr17 50487872 50488259 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 9205 NM_018346 55316 Hs.8033 NM_018346 ENSG00000136444 RSAD1 HemW radical S-adenosyl methionine domain containing 1 protein-coding 308.25-17 chr2 155779329 155779636 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 475449 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 228-20 chr12 16549624 16549880 + 1.5 NA non-coding (NR_045012, exon 6 of 6) non-coding (NR_045012, exon 6 of 6) 55627 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 228.75-15 chr13 54926585 54926828 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -247748 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 284.75-26 chr4 156235964 156236222 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -282227 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 270-3 chr1 157083221 157083573 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 16411 NM_001004341 440695 Hs.127138 NM_001004341 ENSG00000253831 ETV3L - ETS variant 3 like protein-coding 250.25-5 chr11 77961781 77961992 + 1.5 NA intron (NM_033547, intron 4 of 22) L1ME3A|LINE|L1 32782 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 180-71 chr2 225026197 225026404 + 1.5 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) -15760 NR_039641 100616207 NR_039641 ENSG00000263828 MIR4439 - microRNA 4439 ncRNA 259.5-7 chr1 79501960 79502214 + 1.5 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -495357 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 267.5-24 chr14 73369358 73369734 + 1.5 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) intron (NM_001005743, intron 2 of 12) 89034 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 230.5-22 chr11 67643043 67643303 + 1.5 NA intron (NM_080658, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR -3613 NM_005995 347853 Hs.454480 NM_005995 ENSG00000167800 TBX10 TBX13|TBX7 T-box transcription factor 10 protein-coding 190-53 chr4 94713677 94713993 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43698 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 261.75-10 chr12 70372285 70372602 + 1.5 NA intron (NM_014505, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 6153 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 155-49 chr16 64202622 64202779 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 919363 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 524.25-3 chr16 56185968 56186469 + 1.5 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) intron (NR_027078, intron 2 of 4) 4876 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 272.25-14 chr14 47510116 47510339 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 164727 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 322-2 chr10 51239453 51239975 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -59859 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 286.75-16 chr2 37140680 37140976 + 1.5 NA intron (NM_002759, intron 5 of 16) intron (NM_002759, intron 5 of 16) 6994 NM_001135652 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 156-54 chr15 68249512 68249698 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -19877 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 259.5-44 chr16 51657555 51657892 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -104796 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 384.5-14 chr4 105827229 105827712 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_125927) promoter-TSS (NR_125927) -298 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 267-55 chr8 110861622 110861967 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165639 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 200.25-55 chr2 13865776 13865935 + 1.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 535103 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 285-13 chr12 84902983 84903224 + 1.5 NA intron (NM_182767, intron 1 of 11) L1MC4a|LINE|L1 9696 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 248.75-2 chr1 115126981 115127413 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37694 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 242-45 chr5 55510534 55510790 + 1.5 NA intron (NR_103485, intron 1 of 6) intron (NR_103485, intron 1 of 6) -1736 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 330-22 chr6 70505094 70505332 + 1.5 NA intron (NM_020819, intron 11 of 20) L1MC4|LINE|L1 -61717 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 151.5-155 chr5 98397730 98397876 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -236564 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 137.75-21 chr10 22341532 22341718 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3820 NM_001253855 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 177.75-2 chr1 38750697 38750929 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 108959 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 216.75-37 chr2 45778616 45778886 + 1.5 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 127076 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 189.5-13 chr1 176589532 176589738 + 1.5 NA intron (NM_021936, intron 2 of 4) intron (NM_021936, intron 2 of 4) 126460 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 407.5-5 chr2 56845773 56846152 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -660192 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 201.5-106 chr5 18228121 18228311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 420942 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 180.25-7 chr10 93391751 93391950 + 1.5 NA intron (NM_133337, intron 16 of 52) intron (NM_133337, intron 16 of 52) 90484 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 276.5-3 chr1 158377912 158378298 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 21361 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 273.75-37 chr6 120589520 120589856 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 574509 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 481.25-4 chr3 121223014 121223334 + 1.5 NA intron (NM_001348343, intron 11 of 27) intron (NM_001348343, intron 11 of 27) 173534 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 181.5-158 chr8 88717796 88718090 + 1.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -390460 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 162.5-133 chr5 7647308 7647507 + 1.5 NA intron (NM_020546, intron 4 of 24) intron (NM_020546, intron 4 of 24) 203726 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 290-9 chr10 112322637 112322921 + 1.5 NA intron (NR_028134, intron 12 of 18) intron (NR_028134, intron 12 of 18) -23091 NR_106772 102465427 NR_106772 ENSG00000283688 MIR6715B hsa-mir-6715b microRNA 6715b ncRNA 233.5-95 chr6 36170404 36170601 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -26242 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 207.75-133 chr9 120200530 120200678 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 44446 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 179.25-85 chr2 225735625 225735846 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 334849 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 190.5-164 chr8 121645055 121645358 + 1.5 NA non-coding (NR_002835, exon 4 of 4) non-coding (NR_002835, exon 4 of 4) -3766 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 299-11 chr11 86490236 86490655 + 1.5 NA intron (NM_001014811, intron 5 of 13) intron (NM_001014811, intron 5 of 13) 115558 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 432.75-7 chr5 124109807 124110229 + 1.5 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 328502 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 194.5-100 chr4 30396847 30397009 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -323441 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 187-84 chr6 131276831 131277065 + 1.5 NA intron (NM_138633, intron 2 of 2) intron (NM_138633, intron 2 of 2) 26544 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 248-9 chr10 115210035 115210324 + 1.5 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MD2|LINE|L1 116814 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 208.75-9 chr10 62988236 62988638 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -144810 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 180-35 chr14 82668064 82668215 + 1.5 NA intron (NR_146650, intron 2 of 5) intron (NR_146650, intron 2 of 5) 25507 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 331-7 chr11 105720921 105721210 + 1.5 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 110359 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 305.25-32 chr3 81504745 81505075 + 1.5 NA intron (NM_000158, intron 14 of 15) intron (NM_000158, intron 14 of 15) 256735 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 383-4 chr12 77848973 77849465 + 1.5 NA intron (NM_001024383, intron 1 of 39) intron (NM_001024383, intron 1 of 39) 18325 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 216.25-19 chr11 102093537 102093765 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -16796 NM_001195044 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 240.75-22 chr14 38467982 38468150 + 1.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -211973 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 290-46 chr8 78870713 78871020 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 33337 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 157-37 chr15 89024706 89024894 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63656 NM_007011 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 373-13 chr6 71387812 71388196 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10973 NR_029598 407032 NR_029598 ENSG00000199094 MIR30C2 MIRN30C2|mir-30c-2 microRNA 30c-2 ncRNA 178.25-121 chr8 121097674 121097848 + 1.5 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -285715 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 342-7 chr11 114397607 114397958 + 1.5 NA TTS (NM_001271562) TTS (NM_001271562) 2729 NM_001271562 54494 Hs.715083 NM_019021 ENSG00000180425 C11orf71 URLC7 chromosome 11 open reading frame 71 protein-coding 254.5-14 chr10 89580575 89580912 + 1.5 NA 3' UTR (NM_148978, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_148978, exon 7 of 7) 12084 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 233.25-37 chr2 150104455 150104683 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 152438 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 267.5-75 chr8 91459949 91460287 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 210799 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 225.75-31 chr17 73587800 73588071 + 1.5 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 56510 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 203-96 chr7 137914039 137914336 + 1.5 NA intron (NM_001318246, intron 3 of 11) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18801 NM_001318246 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 340.75-9 chr12 113084371 113084702 + 1.5 NA intron (NM_004416, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu 26679 NM_004416 1840 Hs.372152 NM_004416 ENSG00000135144 DTX1 RNF140|hDx-1 deltex E3 ubiquitin ligase 1 protein-coding 213.5-50 chr17 19643920 19644284 + 1.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -4048 NM_001369137 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 263.75-12 chr14 71212518 71212882 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -107776 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 154.25-13 chr1 201207154 201207336 + 1.5 NA exon (NM_001164586, exon 12 of 24) exon (NM_001164586, exon 12 of 24) 16420 NM_001164586 91156 Hs.519024 NM_178275 ENSG00000163395 IGFN1 EEF1A2BP1 immunoglobulin like and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 203.5-44 chr14 98611862 98612041 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -99662 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 437.25-7 chr7 107405979 107406406 + 1.5 NA intron (NM_181733, intron 7 of 20) intron (NM_181733, intron 7 of 20) -63865 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 187.5-105 chr21 15221165 15221387 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -156276 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 381-7 chr14 32440847 32441501 + 1.5 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 111876 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 189-56 chr2 41459665 41459904 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -417771 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 248-67 chr6 160017557 160017926 + 1.5 NA intron (NM_000876, intron 4 of 47) L1PB4|LINE|L1 -10077 NR_047511 100271873 Hs.742166 NR_047511 ENSG00000268257 AIRN AIR|IGF2R-AS|IGF2R-AS1|IGF2RAS|NCRNA00088 antisense of IGF2R non-protein coding RNA ncRNA 309.75-18 chr2 20778168 20778475 + 1.5 NA intron (NM_001282722, intron 1 of 4) intron (NM_001282722, intron 1 of 4) 44780 NM_001282724 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 150.25-7 chr1 96164368 96164628 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 172430 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 383.25-6 chr17_GL000205v2_random 23609 23978 + 1.5 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 34173 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 218-29 chr18 72843238 72843477 + 1.5 NA intron (NM_001354021, intron 4 of 4) intron (NM_001354021, intron 4 of 4) 10025 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 250.5-84 chr6 127336577 127336878 + 1.5 NA intron (NM_001002030, intron 1 of 5) intron (NM_001002030, intron 1 of 5) 5680 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 313.5-4 chr10 76170452 76170825 + 1.5 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) L5|LINE|RTE-X 387877 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 282-26 chr2 53671650 53671952 + 1.5 NA intron (NM_001201965, intron 8 of 8) intron (NM_001201965, intron 8 of 8) -95982 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 248.5-50 chr2 46516492 46516714 + 1.5 NA intron (NM_001371283, intron 3 of 3) L1MB1|LINE|L1 -25887 NM_012249 23433 Hs.709193 NM_012249 ENSG00000119729 RHOQ ARHQ|HEL-S-42|RASL7A|TC10|TC10A ras homolog family member Q protein-coding 284-22 chr2 30356272 30356620 + 1.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 9800 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 171.75-105 chr4 140983315 140983529 + 1.5 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 150047 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 292-46 chr8 115113129 115113350 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 554774 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 155.5-180 chr6 35209894 35210080 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3969 NM_001303136 222663 Hs.12923 NM_152753 ENSG00000146197 SCUBE3 CEGF3 signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 protein-coding 275-10 chr14 47133303 47133558 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 4 of 16) L2b|LINE|L2 209816 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 126-68 chr16 65603185 65603346 + 1.5 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -26965 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 262.75-55 chr8 105338034 105338271 + 1.5 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 18609 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 164.5-121 chr21 15559422 15559548 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -170449 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 242.5-75 chr7 21776268 21776534 + 1.5 NA intron (NM_001277115, intron 56 of 81) intron (NM_001277115, intron 56 of 81) 169498 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 251-11 chr1 242093746 242094069 + 1.5 NA intron (NM_001320272, intron 10 of 10) intron (NM_001320272, intron 10 of 10) -94809 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 134.25-84 chr2 111123473 111123599 + 1.5 NA intron (NM_001204109, intron 1 of 3) intron (NM_001204109, intron 1 of 3) 2622 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 401 chr1 19748180 19748659 + 1.5 NA intron (NM_001349112, intron 6 of 14) intron (NM_001349112, intron 6 of 14) 50930 NM_001349115 255104 Hs.466729 NM_181719 ENSG00000162542 TMCO4 - transmembrane and coiled-coil domains 4 protein-coding 312.75 chr1 75003906 75004308 + 1.5 NA Intergenic LTR75_1|LTR|ERV1 -124327 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 305.75-4 chr11 105764440 105764761 + 1.5 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 153894 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 218.5-31 chr12 9069981 9070374 + 1.5 NA intron (NM_000014, intron 32 of 35) intron (NM_000014, intron 32 of 35) 5000 NR_137424 144571 Hs.592432 NR_026971 ENSG00000245105 A2M-AS1 - A2M antisense RNA 1 ncRNA 341-3 chr1 237786660 237787173 + 1.5 NA intron (NM_001035, intron 91 of 104) intron (NM_001035, intron 91 of 104) -75259 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 356.25-20 chr8 129038833 129039278 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -73054 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 192-24 chr11 14295162 14295444 + 1.5 NA intron (NM_001177314, intron 2 of 5) intron (NM_001177314, intron 2 of 5) 63182 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 300.5-14 chr14 53001490 53001854 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -50575 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 219-29 chr13 43732223 43732467 + 1.5 NA intron (NM_001347969, intron 1 of 16) intron (NM_001347969, intron 1 of 16) 54627 NR_145132 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 267-3 chr1 177376595 177376822 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25122 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 273.5-71 chr6 52668767 52669081 + 1.5 NA non-coding (NR_024403, exon 2 of 2) non-coding (NR_024403, exon 2 of 2) -2189 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 193.5-66 chr17 61803815 61804079 + 1.5 NA intron (NM_032043, intron 7 of 19) L1ME4b|LINE|L1 59612 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 177-40 chr2 16889141 16889372 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -223422 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 118.5-234 chr8 142349270 142349384 + 1.5 NA intron (NM_001366903, intron 2 of 9) L1ME3E|LINE|L1 53855 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 137-149 chr6 44982637 44982771 + 1.5 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) intron (NM_181356, intron 8 of 12) 215066 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 181-110 chr8 101777538 101777740 + 1.5 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) intron (NM_001040625, intron 4 of 6) 13330 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 182.75-89 chr4 45651132 45651433 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 472772 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 303-27 chr7 33355061 33355484 + 1.5 NA intron (NM_198428, intron 15 of 22) intron (NM_198428, intron 15 of 22) 225708 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 296.5-3 chr1 201366953 201367367 + 1.5 NA intron (NM_000364, intron 7 of 15) intron (NM_000364, intron 7 of 15) 10520 NM_001276346 7139 Hs.533613 NM_000364 ENSG00000118194 TNNT2 CMD1D|CMH2|CMPD2|LVNC6|RCM3|TnTC|cTnT troponin T2, cardiac type protein-coding 261-52 chr6 92607634 92607864 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 811810 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 211-28 chr18 42072465 42072624 + 1.5 NA intron (NM_001308020, intron 23 of 23) intron (NM_001308020, intron 23 of 23) -114124 NR_046458 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 340.25-6 chr14 75240480 75241041 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38068 NM_005252 2353 Hs.25647 NM_005252 ENSG00000170345 FOS AP-1|C-FOS|p55 Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 354.25-9 chr3 3608972 3609506 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -190192 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 437-9 chr3 116293067 116293555 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -66713 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 353.25-3 chr12 45708021 45708485 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 19668 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 271.75-31 chr3 142688285 142688615 + 1.5 NA intron (NM_001145319, intron 9 of 15) intron (NM_001145319, intron 9 of 15) 31553 NM_001172312 5357 Hs.203637 NM_002670 ENSG00000120756 PLS1 - plastin 1 protein-coding 247.5-88 chr9 27447179 27447431 + 1.5 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -77009 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 363-12 chr3 31449592 31449874 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -83192 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 228.25-82 chr8 102718550 102718813 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62433 NR_160673 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 203.75-72 chr3 151205000 151205155 + 1.5 NA intron (NM_053002, intron 14 of 42) intron (NM_053002, intron 14 of 42) -1861 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 200-98 chrX 103319154 103319542 + 1.5 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -8358 NM_032621 84707 Hs.398989 NM_032621 ENSG00000133134 BEX2 BEX1|DJ79P11.1 brain expressed X-linked 2 protein-coding 276-34 chr3 196426896 196427204 + 1.5 NA intron (NM_015562, intron 1 of 10) intron (NM_015562, intron 1 of 10) -4335 NR_046745 100874034 Hs.617990 NR_046745 UBXN7-AS1 - UBXN7 antisense RNA 1 ncRNA 348.75-9 chr2 13294117 13294672 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -287381 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 191.5-138 chr7 90274252 90274632 + 1.5 NA intron (NM_001039706, intron 9 of 22) L1MEf|LINE|L1 29268 NM_001363438 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 115.5-260 chrX 104480680 104480816 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -85451 NM_017416 26280 Hs.675519 NM_017416 ENSG00000189108 IL1RAPL2 IL-1R9|IL1R9|IL1RAPL-2|TIGIRR-1 interleukin 1 receptor accessory protein like 2 protein-coding 136.25-120 chr3 51416200 51416374 + 1.5 NA intron (NR_146065, intron 17 of 25) L2a|LINE|L2 25002 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 315.75-11 chr18 1367657 1368043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8221 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 174.5-123 chr3 112718337 112718525 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18658 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 252.5-54 chr3 63660778 63661094 + 1.5 NA intron (NM_001080537, intron 3 of 3) intron (NM_001080537, intron 3 of 3) 8261 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 219-56 chr2 216210781 216210960 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6019 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 296.5-28 chr4 66625510 66625899 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 348880 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 369.5-2 chr11 41562825 41563168 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103344 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 276.75-28 chr2 182725605 182725878 + 1.5 NA intron (NR_073367, intron 5 of 22) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 9484 NM_018981 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 293.5-13 chr13 84276609 84276985 + 1.5 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) L1ME1|LINE|L1 136195 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 306.75-23 chr8 80053017 80053405 + 1.5 NA intron (NR_105033, intron 3 of 8) intron (NR_105033, intron 3 of 8) -22952 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 340.5-18 chr2 158817591 158818025 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22491 NM_001017920 92196 Hs.59761 NM_001017920 ENSG00000163331 DAPL1 - death associated protein like 1 protein-coding 313.5-35 chr7 81487949 81488315 + 1.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 73687 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 198.5-76 chr2 77215285 77215583 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 229469 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 332.5-30 chr8 111825238 111825552 + 1.5 NA Intergenic LTR26D|LTR|ERV1 448756 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 505.5 chr14 27485309 27486115 + 1.5 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) L1MA8|LINE|L1 -126876 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 259.75-16 chr14 26493927 26494260 + 1.5 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 59337 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 239.75-59 chr5 61485641 61485873 + 1.5 NA intron (NM_020928, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 -152003 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 190-77 chr8 83577976 83578162 + 1.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 174311 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 213-71 chr4 111518520 111518739 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -626825 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 338.25-5 chr10 56762031 56762423 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -400954 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 250.25-27 chr2 208482029 208482364 + 1.5 NA intron (NM_005048, intron 10 of 12) intron (NM_005048, intron 10 of 12) -60446 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 321.5-24 chr3 99445234 99445591 + 1.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -193182 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 299.75-25 chr9 101414463 101414844 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15799 NM_001278240 7743 Hs.50123 NM_003452 ENSG00000136870 ZNF189 - zinc finger protein 189 protein-coding 139.5-73 chr15 89607500 89607654 + 1.5 NA intron (NM_001308025, intron 14 of 21) intron (NM_001308025, intron 14 of 21) 31990 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 214.5-138 chrX 102128784 102129026 + 1.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 3226 NM_080390 140597 Hs.401835 NM_080390 ENSG00000184905 TCEAL2 MY0876G05|WEX1|my048 transcription elongation factor A like 2 protein-coding 248.25-44 chr3 22440912 22441195 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 483914 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 176.5-148 chr6 41523851 41524055 + 1.5 NA TTS (NR_126415) TTS (NR_126415) 21509 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 602.75 chr2 230273938 230274513 + 1.5 NA intron (NM_001278453, intron 12 of 23) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 48489 NM_001278453 11262 Hs.632549 NM_007237 ENSG00000079263 SP140 LYSP100|LYSP100-A|LYSP100-B SP140 nuclear body protein protein-coding 264 chr1 29166298 29166662 + 1.5 NA intron (NM_005626, intron 1 of 5) intron (NM_005626, intron 1 of 5) 15420 NM_005626 6429 Hs.469970 NM_005626 ENSG00000116350 SRSF4 SFRS4|SRP75 serine and arginine rich splicing factor 4 protein-coding 276.75-31 chr3 11509981 11510171 + 1.5 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) intron (NM_001349238, intron 17 of 17) 58722 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 215.75-84 chr6 45309150 45309446 + 1.5 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1M1|LINE|L1 -19019 NM_001015051 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 364.75-8 chr3 182173692 182173978 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 221471 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 200.25-112 chr8 84566915 84567171 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -138884 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 198-65 chr5 118238751 118238951 + 1.5 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -43723 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 254.5-30 chr17 32948430 32948728 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 20426 NM_015544 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 224.75-59 chr5 44475482 44475709 + 1.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 34687 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 228.5-105 chr8 104767415 104767597 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -178482 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 180-19 chr12 16763945 16764145 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -155831 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 385.25-7 chr20 46869186 46869561 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25251 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 409.5-6 chr14 30027901 30028522 + 1.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -100364 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 277.5-45 chr3 64744737 64745035 + 1.5 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) intron (NR_038264, intron 1 of 5) -56886 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 147-6 chr1 78387429 78387611 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103454 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 227.5-106 chr8 118167441 118167706 + 1.5 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) MER90a|LTR|ERV1 -55754 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 241.5-21 chr14 34696785 34697057 + 1.5 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 16896 NM_021914 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 328.75-19 chr7 25433268 25433680 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -204988 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 176.5-77 chr19 7733458 7733702 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1409 NM_198492 339390 Hs.220649 NM_198492 ENSG00000182566 CLEC4G DTTR431|LP2698|LSECtin|UNQ431 C-type lectin domain family 4 member G protein-coding 136-117 chr4 168292696 168292884 + 1.5 NA intron (NM_017631, intron 7 of 37) L3|LINE|CR1 25962 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 242-39 chr3 184883256 184883536 + 1.5 NA intron (NM_001009921, intron 20 of 46) L2|LINE|L2 70889 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 210-17 chr11 38974341 38974722 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 325673 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 449.25-5 chr5 39450089 39450908 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -25265 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 147-132 chr7 84945126 84945287 + 1.5 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 176725 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 127.5-204 chr5 152545112 152545213 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -139883 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 123.75-5 chr1 61613513 61613619 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -40676 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 250.5-109 chrX 73813975 73814164 + 1.5 NA non-coding (NR_003255, exon 1 of 1) non-coding (NR_003255, exon 1 of 1) 21864 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 187-29 chr15 68743732 68743925 + 1.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 58097 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 577.75 chr10 28961687 28962317 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 115594 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 200-23 chr12 19887028 19887192 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -127575 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 306-34 chr5 39409270 39409550 + 1.5 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) intron (NM_001343, intron 1 of 14) 15570 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 212-70 chr6 34708586 34708844 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 11770 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 668.25 chr3 142072064 142072970 + 1.5 NA intron (NM_001178138, intron 3 of 13) L1MC3|LINE|L1 -43891 NM_001178142 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 199-21 chr12 79733093 79733314 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -42106 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 302.5-18 chr2 60342793 60343033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 40123 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 176.5-100 chr2 173630767 173630914 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 275968 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 310 chr1 170278886 170279202 + 1.5 NA intron (NR_026957, intron 1 of 3) intron (NR_026957, intron 1 of 3) 5164 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 160.5-86 chr2 53337697 53337823 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -430023 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 255.5-80 chr7 144830212 144830458 + 1.5 NA intron (NM_001350887, intron 1 of 6) MER1A|DNA|hAT-Charlie 5605 NM_001350880 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 233.5-2 chr1 50950718 50950899 + 1.5 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) intron (NM_007051, intron 1 of 18) 9459 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 200-45 chr2 114665041 114665345 + 1.5 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 168355 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 331-6 chr11 79459559 79459907 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -18703 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 210-10 chr1 201372879 201373028 + 1.5 NA intron (NM_000364, intron 2 of 15) intron (NM_000364, intron 2 of 15) 4727 NM_001276346 7139 Hs.533613 NM_000364 ENSG00000118194 TNNT2 CMD1D|CMH2|CMPD2|LVNC6|RCM3|TnTC|cTnT troponin T2, cardiac type protein-coding 329.5-22 chr5 80006812 80007189 + 1.5 NA intron (NM_001306213, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 15704 NM_001306213 7060 Hs.211426 NM_003248 ENSG00000113296 THBS4 TSP-4|TSP4 thrombospondin 4 protein-coding 160.5-125 chr3 103122627 103122751 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 401427 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 251.25-10 chr10 78168493 78168798 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -79980 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 264.5-51 chr5 138917150 138917441 + 1.5 NA intron (NM_001324009, intron 5 of 12) intron (NM_001324009, intron 5 of 12) 41895 NM_001324006 1495 Hs.445981 NM_001903 ENSG00000044115 CTNNA1 CAP102|MDPT2 catenin alpha 1 protein-coding 312.75-7 chr14 28805671 28806009 + 1.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -20053 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 223-11 chr11 22078213 22078402 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -114778 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 193.25-27 chr12 62529327 62529529 + 1.5 NA intron (NM_001278469, intron 11 of 35) intron (NM_001278469, intron 11 of 35) 62602 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 173.5-65 chr2 48410099 48410311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30561 NR_024188 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 158.25-29 chr11 124138567 124138678 + 1.5 NA intron (NM_001130142, intron 15 of 18) L1MA8|LINE|L1 23172 NM_001130142 4013 Hs.152944 NM_014622 ENSG00000110002 VWA5A BCSC-1|BCSC1|LOH11CR2A von Willebrand factor A domain containing 5A protein-coding 240.25-69 chr8 88894487 88894750 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -567135 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 254.5-4 chr1 89874951 89875208 + 1.5 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 53140 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 153-30 chr12 63356459 63356670 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -203754 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 121.5-201 chr4 135208342 135208481 + 1.5 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -84852 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 294.75-8 chr17 55694131 55694489 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28554 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 250.75-30 chr20 35697342 35697521 + 1.5 NA intron (NR_037570, intron 3 of 13) MIRb|SINE|MIR 1921 NR_037570 9054 Hs.194692 NM_021100 ENSG00000244005 NFS1 HUSSY-08|IscS|NIFS NFS1 cysteine desulfurase protein-coding 247.75-60 chr7 14227045 14227253 + 1.5 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) MIRb|SINE|MIR -235724 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 154.5-149 chr5 109697079 109697234 + 1.5 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) intron (NM_002372, intron 1 of 21) 7790 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 353.25-20 chr6 36072990 36073420 + 1.5 NA intron (NM_139012, intron 4 of 11) L1MC5|LINE|L1 45397 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 221.25-23 chr13 60303174 60303398 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35182 NR_047022 100874169 Hs.171027 NR_047022 LINC00434 - long intergenic non-protein coding RNA 434 ncRNA 280.5-61 chrX 80709769 80709975 + 1.5 NA intron (NM_153252, intron 20 of 40) intron (NM_153252, intron 20 of 40) 100005 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 261.5-30 chr2 53575780 53576019 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -191884 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 276-15 chr11 108131958 108132192 + 1.5 NA intron (NM_000019, intron 2 of 11) intron (NM_000019, intron 2 of 11) 10508 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 294-18 chr2 82172338 82172907 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -684181 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 352.25-22 chr9 19063355 19063661 + 1.5 NA TTS (NR_003009) TTS (NR_003009) 278 NR_003009 677776 Hs.689635 NR_003009 ENSG00000251733 SCARNA8 U92 small Cajal body-specific RNA 8 ncRNA 467-2 chr10 83096682 83097064 + 1.5 NA Intergenic MER54B|LTR|ERVL 580216 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 342.5-24 chr5 131115830 131116222 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49230 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 310.25-15 chr2 109652711 109653025 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 38504 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 251.25-58 chr8 84571414 84571673 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1PA15-16|LINE|L1 -134384 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 242-42 chr4 61435621 61435982 + 1.5 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) L2|LINE|L2 233629 NM_001371342 192-52 chr17 62863423 62863574 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54996 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 253.25-65 chr9 23754599 23755055 + 1.5 NA intron (NM_004432, intron 2 of 6) MER34A|LTR|ERV1 66482 NM_001351476 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 259.75-46 chr7 50794284 50794662 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1020 NM_001371008 261.5-35 chr20 21145188 21145522 + 1.5 NA intron (NM_001352436, intron 4 of 13) intron (NM_001352436, intron 4 of 13) 19273 NM_001352435 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 145.75-134 chr6 7288428 7288625 + 1.5 NA non-coding (NR_120448, exon 7 of 7) non-coding (NR_120448, exon 7 of 7) 24673 NR_120448 6745 Hs.114033 NM_003144 ENSG00000124783 SSR1 TRAPA signal sequence receptor subunit 1 protein-coding 162.5-180 chr8 118600751 118600965 + 1.5 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) intron (NR_109794, intron 1 of 4) -20143 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 285-19 chr18 72876966 72877270 + 1.5 NA intron (NR_134647, intron 1 of 2) intron (NR_134647, intron 1 of 2) 8078 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 244.5-20 chr11 109803865 109804169 + 1.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -289375 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 304-26 chr5 17888944 17889359 + 1.5 NA intron (NR_134286, intron 5 of 7) intron (NR_134286, intron 5 of 7) 81877 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 412.25-2 chr10 60303992 60304292 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) L1MA9|LINE|L1 85733 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 162.5-10 chr1 214153126 214153319 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -127937 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 202-77 chr8 134414738 134414998 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -183203 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 199.5-130 chr6 139002466 139002750 + 1.5 NA Intergenic (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14347 NM_031922 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 243.5-19 chr10 74705987 74706360 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu -119082 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 245.75-63 chr8 132307647 132308028 + 1.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 139425 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 216-37 chr2 37911081 37911265 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14114 NM_001170791 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 278.5-13 chr12 92830289 92830675 + 1.5 NA intron (NM_003566, intron 11 of 28) L1PA15|LINE|L1 93993 NM_001004330 440107 Hs.591013 NM_001004330 ENSG00000187510 PLEKHG7 - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G7 protein-coding 395-14 chr5 112169691 112170180 + 1.5 NA intron (NM_001347887, intron 20 of 23) intron (NM_001347887, intron 20 of 23) 8450 NR_002922 654322 Hs.689709 NR_002922 ENSG00000238363 SNORA13 ACA13 small nucleolar RNA, H/ACA box 13 snoRNA 397.5-12 chr8 129782116 129782493 + 1.5 NA intron (NM_031415, intron 1 of 13) L1MA2|LINE|L1 4320 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 150-56 chr16 7505420 7505611 + 1.5 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 172670 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 211-33 chr2 108108684 108108897 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56035 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 245-9 chr10 129270035 129270274 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -197087 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 228.75-2 chr1 42289185 42289432 + 1.5 NA intron (NM_001198850, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 45647 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 306-13 chr18 12691149 12691635 + 1.5 NA non-coding (NR_073537, exon 7 of 13) non-coding (NR_073537, exon 7 of 13) 11331 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 242.25-68 chr5 4810638 4810977 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 37326 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 188.25-11 chr10 61887913 61888090 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -13698 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 432.75-3 chr12 59310985 59311428 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -284823 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 314-26 chr9 74093437 74093675 + 1.5 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -277975 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 339.5-4 chr1 193705529 193705906 + 1.5 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 400972 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 196.5-118 chr4 168696410 168696559 + 1.5 NA intron (NM_001166108, intron 8 of 21) HAL1|LINE|L1 64906 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 225.25-31 chr17 63252472 63252750 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) L1MA4A|LINE|L1 187656 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 230.25-59 chr3 147159449 147159757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 232827 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 244-37 chr3 146189639 146189952 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28300 NM_000935 5352 Hs.477866 NM_000935 ENSG00000152952 PLOD2 BRKS2|LH2|TLH procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 protein-coding 112.5-34 chr11 41783122 41783229 + 1.5 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) intron (NR_120584, intron 2 of 5) 68607 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 231.5-109 chrX 139378822 139379110 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -67853 NR_028597 6719 Hs.730315 NR_028597 SRD5A1P1 SRD5AP1 steroid 5 alpha-reductase 1 pseudogene 1 pseudo 288.5-53 chr9 73752287 73752669 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 600613 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 302.5-6 chr11 9949699 9950009 + 1.5 NA intron (NM_030962, intron 16 of 39) L1ME5|LINE|L1 110712 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 257-27 chr2 203703504 203703845 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2801 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 323.5-17 chr2 200577675 200577983 + 1.5 NA intron (NM_152524, intron 8 of 8) L1MC4a|LINE|L1 -8185 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 232.75-43 chr3 118290573 118290911 + 1.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -351026 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 382.25-3 chr11 84621517 84622181 + 1.5 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 99093 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 416.75-4 chr2 117275173 117275467 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -539371 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 151.5-176 chr7 4315005 4315154 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -180242 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 247-25 chr18 2994479 2994872 + 1.5 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie 17272 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 230.5-2 chr1 14755202 14755382 + 1.5 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) 156575 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 129-20 chr10 43639236 43639357 + 1.5 NA intron (NR_038867, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 -4576 NR_047557 414197 Hs.605832 NR_047557 ENSG00000226245 ZNF32-AS1 ZNF32OS1|bA402L1.8 ZNF32 antisense RNA 1 ncRNA 264-11 chr11 109830381 109830738 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -262833 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 154-54 chr18 62876525 62876705 + 1.5 NA intron (NM_194449, intron 4 of 16) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 161074 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 853.75 chr8 129420858 129421686 + 1.5 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 62870 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 378.5-19 chr8 79751628 79752048 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 14637 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 334.5-10 chr2 33734707 33735077 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -6675 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 178-72 chr4 47404973 47405157 + 1.5 NA intron (NM_000812, intron 7 of 8) intron (NM_000812, intron 7 of 8) 58637 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 258-6 chr10 48296941 48297255 + 1.5 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -9541 NM_001278547 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 309-22 chr19 53275092 53275430 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7029 NR_046365 646508 Hs.574588 NM_001195187 ENSG00000189348 FAM90A27P - family with sequence similarity 90 member A27, pseudogene pseudo 174.5-176 chr7 57395410 57395586 + 1.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9269 NR_120505 100653233 Hs.127379 NR_120505 ENSG00000260653 LOC100653233 - uncharacterized LOC100653233 ncRNA 131-75 chr19 28484340 28484447 + 1.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -122295 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 284.5-66 chr8 118328227 118328563 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 -216576 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 216.5-106 chr7 32324192 32324370 + 1.5 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) -24953 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 161.25-152 chr6 64210074 64210207 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 403304 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 257-49 chr5 102926265 102926486 + 1.5 NA intron (NR_157231, intron 7 of 14) intron (NR_157231, intron 7 of 14) 60552 NM_138821 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 325.25-19 chr3 58988306 58988612 + 1.5 NA intron (NR_110820, intron 2 of 2) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 61566 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 126.75-219 chr7 4153133 4153329 + 1.5 NA intron (NM_001079653, intron 4 of 19) intron (NM_001079653, intron 4 of 19) -18394 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 155.5-123 chr3 33050068 33050247 + 1.5 NA intron (NM_001079811, intron 9 of 15) intron (NM_001079811, intron 9 of 15) 46675 NM_001079811 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 131.25-2 chr1 22093714 22093886 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001791, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001791, exon 6 of 6) 41091 NM_001791 998 Hs.467637 NM_001791 ENSG00000070831 CDC42 CDC42Hs|G25K|TKS cell division cycle 42 protein-coding 225-28 chr15 96866074 96866307 + 1.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 82755 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 390.5-3 chr11 103501261 103501594 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -348479 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 126.25-82 chr2 48936857 48936945 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -122702 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 354.5-6 chr12 54287536 54287958 + 1.5 NA TTS (NM_031157) TTS (NM_031157) 7021 NR_135167 3178 Hs.546261 NM_002136 ENSG00000135486 HNRNPA1 ALS19|ALS20|HNRPA1|HNRPA1L3|IBMPFD3|UP 1|hnRNP A1|hnRNP-A1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 protein-coding 408.5-13 chrX 68256387 68256991 + 1.5 NA intron (NM_002547, intron 5 of 24) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 176806 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 201-62 chr5 39523383 39523630 + 1.5 NA intron (NR_104632, intron 2 of 2) L1ME4a|LINE|L1 3075 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 183-42 chr18 1710674 1710909 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -351162 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 135.5-81 chr18 2212973 2213127 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 358455 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 212-74 chr7 4437905 4438080 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -244303 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 416.5-8 chr18 39066767 39067172 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 555206 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 142.5-72 chr15 81692935 81693042 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -318775 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 383 chr10 25228433 25228984 + 1.5 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -52432 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 331.5-17 chr20 60427293 60427582 + 1.5 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 45539 NR_109903 101928048 Hs.572803 NR_109903 LOC101928048 - uncharacterized LOC101928048 ncRNA 147.75-116 chr4 37301406 37301592 + 1.5 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 56756 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 206-2 chr1 42251313 42251601 + 1.5 NA intron (NM_001198850, intron 4 of 12) L1ME2|LINE|L1 83498 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 206.5-139 chr8 126321097 126321294 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4300 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 297.5-4 chr1 93006717 93007003 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -45338 NM_001252269 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 270-25 chr2 78299913 78300231 + 1.5 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -9341 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 257.5-57 chr4 183971479 183971698 + 1.5 NA intron (NM_020225, intron 1 of 3) intron (NM_020225, intron 1 of 3) 66281 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 174.5-48 chr12 47645172 47645425 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 60732 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 181-116 chr9 97392859 97393107 + 1.5 NA intron (NR_026847, intron 4 of 5) intron (NR_026847, intron 4 of 5) 3708 NR_026847 286359 Hs.132262 NM_182600 LOC286359 - uncharacterized LOC286359 ncRNA 319-7 chr12 75036562 75036876 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 173029 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 159-55 chr20 7694187 7694348 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 246191 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 385-15 chr4 76041682 76042147 + 1.5 NA intron (NM_001130017, intron 1 of 9) intron (NM_001130017, intron 1 of 9) -5844 NM_005409 6373 Hs.632592 NM_005409 ENSG00000169248 CXCL11 H174|I-TAC|IP-9|IP9|SCYB11|SCYB9B|b-R1 C-X-C motif chemokine ligand 11 protein-coding 239.25-68 chr5 18463025 18463240 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 655858 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 336-14 chr2 150040916 150041314 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -181924 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 396.5-9 chr7 38967414 38967881 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -10262 NM_001370959 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 309.75-29 chr4 77925767 77926004 + 1.5 NA intron (NM_020236, intron 7 of 8) L1M5|LINE|L1 63055 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 194.5-121 chr5 140798747 140798985 + 1.5 NA intron (NM_018905, intron 1 of 3) intron (NM_018905, intron 1 of 3) -2191 NM_018906 56145 Hs.199343 NM_018906 ENSG00000255408 PCDHA3 PCDH-ALPHA3 protocadherin alpha 3 protein-coding 280-37 chr3 109611504 109611838 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 8843 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 241.5-39 chr2 52114114 52114425 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -256379 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 150.5-91 chr2 73476435 73476594 + 1.5 NA intron (NM_015120, intron 9 of 22) L1MB2|LINE|L1 19411 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 209-10 chr10 111428632 111428896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 314473 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 214.5-131 chr8 125506419 125506653 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 74327 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 222.5-20 chr10 102920145 102920445 + 1.5 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) -1960 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 368-2 chr10 33257489 33257933 + 1.5 NA intron (NM_001244973, intron 4 of 16) intron (NM_001244973, intron 4 of 16) 76956 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 177.5-105 chr21 28990030 28990227 + 1.5 NA intron (NM_015565, intron 1 of 29) L2c|LINE|L2 2749 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 239.25-26 chr13 97549286 97549512 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 115230 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 133-10 chr1 198804275 198804385 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54652 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 267-40 chr5 127139656 127139911 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -66291 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 260.75-42 chr22 48831433 48831692 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -35208 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 183-89 chr5 90613168 90613326 + 1.5 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) intron (NR_003149, intron 1 of 89) 54450 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 245.25-58 chr5 178852971 178853241 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6847 NM_058230 117608 Hs.724051 NM_058230 ENSG00000178338 ZNF354B KID2 zinc finger protein 354B protein-coding 218-30 chr2 20621686 20621963 + 1.5 NA intron (NM_022460, intron 6 of 6) intron (NM_022460, intron 6 of 6) 29274 NM_022460 64342 Hs.531785 NM_022460 ENSG00000118960 HS1BP3 ETM2|HS1-BP3 HCLS1 binding protein 3 protein-coding 192-97 chr8 13323268 13323481 + 1.5 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -46590 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 155.5-128 chr3 74141718 74141894 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 332562 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 179.5-192 chr9 38306217 38306401 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -86393 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 159.5-205 chr8 88520999 88521129 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -193581 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 394.75-8 chr5 148822810 148823338 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3519 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 280-16 chr12 31707090 31707347 + 1.5 NA intron (NR_103523, intron 1 of 5) Charlie9|DNA|hAT-Charlie 21803 NM_001113402 196394 Hs.585084 NM_001113402 ENSG00000151743 AMN1 - antagonist of mitotic exit network 1 homolog protein-coding 290.25-14 chr18 2736206 2736536 + 1.5 NA intron (NM_015295, intron 25 of 47) L1PA16|LINE|L1 80484 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 279-59 chr9 29746290 29746613 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -532850 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 383.25-23 chr5 164565191 164565681 + 1.5 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 95157 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 256-63 chr6 145935922 145936105 + 1.5 NA intron (NM_001370328, intron 13 of 31) intron (NM_001370328, intron 13 of 31) 28084 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 167-113 chr8 59208163 59208380 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 89061 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 248.25-56 chr5 87064481 87064788 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 50320 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 252.5-78 chr8 57653464 57653835 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92500 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 361-6 chr11 102386785 102387268 + 1.5 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 39652 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 369.5-12 chr17 53638394 53639042 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -184209 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 134.5-138 chr3 134247055 134247202 + 1.5 NA intron (NM_001005861, intron 1 of 14) HAL1|LINE|L1 3616 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 228-75 chr8 23454766 23455067 + 1.5 NA intron (NM_004901, intron 1 of 12) intron (NM_004901, intron 1 of 12) 2731 NM_004901 9583 Hs.444389 NM_004901 ENSG00000197217 ENTPD4 LALP70|LAP70|LYSAL1|NTPDase-4|UDPase ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 protein-coding 362.25-15 chr8 41880977 41881448 + 1.5 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) intron (NM_001142446, intron 1 of 42) 15529 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 265.5-47 chr4 134908300 134908611 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 215104 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 290.5-30 chr4 78848299 78848498 + 1.5 NA intron (NM_017593, intron 6 of 13) intron (NM_017593, intron 6 of 13) 72020 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 185.5-155 chr7 124851977 124852111 + 1.5 NA intron (NM_001042594, intron 9 of 17) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -61234 NM_001024603 154872 Hs.444163 NM_001024603 ENSG00000275356 C7orf77 - chromosome 7 open reading frame 77 protein-coding 189-102 chr8 89139564 89139736 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 618061 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 267.5-32 chr17 59377736 59377962 + 1.5 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) intron (NM_001005404, intron 2 of 4) 11766 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 274.5-35 chr2 61887901 61888240 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001321782) promoter-TSS (NM_001321782) 586 NM_006430 10575 Hs.421509 NM_006430 ENSG00000115484 CCT4 CCT-DELTA|Cctd|SRB chaperonin containing TCP1 subunit 4 protein-coding 327.75-5 chr10 76051258 76051592 + 1.5 NA intron (NM_001305581, intron 4 of 6) intron (NM_001305581, intron 4 of 6) 268664 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 156.5-90 chr2 180062203 180062360 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54984 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 430-17 chr8 77906046 77906460 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 455556 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 234-30 chr2 227079373 227079537 + 1.5 NA intron (NM_000092, intron 24 of 47) intron (NM_000092, intron 24 of 47) 85104 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 400.5-14 chr7 2069730 2070067 + 1.5 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) L2|LINE|L2 19154 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 152.5-86 chr2 66417647 66417784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15755 NR_046438 730198 Hs.526753 NR_046438 MEIS1-AS3 - MEIS1 antisense RNA 3 ncRNA 371-3 chr10 83874550 83874908 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -197640 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 162.5-60 chr16 83809813 83809985 + 1.5 NA intron (NM_001537, intron 3 of 3) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 1921 NM_001537 3281 Hs.250899 NM_001537 ENSG00000230989 HSBP1 NPC-A-13 heat shock factor binding protein 1 protein-coding 235.75-30 chr16 80252237 80252546 + 1.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -288343 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 326.5-22 chr5 65442178 65442621 + 1.5 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) L1MEc|LINE|L1 39521 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 301-11 chr2 56081980 56082201 + 1.5 NA intron (NR_135590, intron 1 of 1) intron (NR_135590, intron 1 of 1) 8292 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 286-9 chr11 114269615 114269884 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -26064 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 187-66 chr3 179786430 179786623 + 1.5 NA 3' UTR (NM_003940, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_003940, exon 21 of 21) -111668 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 249.75-16 chr12 53863031 53863304 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -75664 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 283.5-45 chr4 76253064 76253433 + 1.5 NA intron (NM_001242939, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 1527 NM_001136570 100129583 Hs.720509 NM_001136570 ENSG00000189157 FAM47E - family with sequence similarity 47 member E protein-coding 243-74 chr8 89431292 89431550 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 326290 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 207.5-101 chr7 6478369 6478584 + 1.5 NA intron (NM_001100603, intron 1 of 3) L1ME3G|LINE|L1 5676 NM_001100603 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 342.75-14 chr20 46694320 46694762 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -5097 NM_033550 112858 Hs.440263 NM_033550 ENSG00000172315 TP53RK BUD32|C20orf64|GAMOS4|Nori-2|Nori-2p|PRPK|dJ101A2 TP53 regulating kinase protein-coding 236.5-82 chr7 22391154 22391461 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34153 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 202.5-97 chr3 186317957 186318189 + 1.5 NA intron (NM_001346, intron 2 of 24) intron (NM_001346, intron 2 of 24) 44161 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 350.25-14 chr17 59501402 59501892 + 1.5 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) intron (NR_110813, intron 2 of 2) 25210 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 313.5-38 chr8 117040493 117040909 + 1.5 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) 89726 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 232.25-63 chr5 62987711 62987878 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 408975 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 302.75-14 chr2 72167172 72167774 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19611 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 312-23 chr4 73904485 73904826 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 35262 NM_001511 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 269.25-52 chr8 37757963 37758382 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001362878, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001362878, exon 12 of 12) -4374 NM_001349349 11212 Hs.304792 NM_007198 ENSG00000147471 PLPBP EPVB6D|PROSC pyridoxal phosphate binding protein protein-coding 153-63 chr18 72565271 72565414 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21000 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 213-77 chr5 38207300 38207483 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51168 NM_001205301 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 278.25-15 chr12 125250120 125250383 + 1.5 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) intron (NM_001366854, intron 1 of 8) 63865 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 256-16 chr15 67376556 67376830 + 1.5 NA intron (NM_001031715, intron 10 of 20) intron (NM_001031715, intron 10 of 20) -121495 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 160-52 chr2 23007672 23007875 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -377406 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 210.5-98 chr5 65050711 65050920 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 281885 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 348-18 chr6 38418748 38419045 + 1.5 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) FLAM_A|SINE|Alu -62700 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 159-81 chr4 161558820 161558997 + 1.5 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) L2|LINE|L2 -463825 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 237-35 chr3 78062797 78063051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13961 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 237-69 chr8 84539243 84539572 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) 123923 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 210.25-57 chr4 39151347 39151661 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31025 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 383-22 chr9 31413555 31413903 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32239 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 171-104 chr4 84177114 84177283 + 1.5 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) intron (NR_125909, intron 5 of 8) 121971 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 163.75-97 chr3 147612465 147612644 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 191227 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 153.5-194 chr8 50964671 50964842 + 1.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 800625 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 346.25-6 chr16 80171797 80172115 + 1.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -368778 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 197-23 chr15 86662733 86662947 + 1.5 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) intron (NM_152336, intron 22 of 24) -270040 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 152-67 chr17 64198566 64198717 + 1.5 NA intron (NM_018469, intron 2 of 11) intron (NM_018469, intron 2 of 11) 32093 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 338.5-35 chr7 128762806 128763074 + 1.5 NA intron (NM_001199673, intron 5 of 5) AluSz6|SINE|Alu 12850 NM_001708 611 Hs.656404 NM_001708 ENSG00000128617 OPN1SW BCP|BOP|CBT opsin 1, short wave sensitive protein-coding 324-17 chr2 216046563 216046918 + 1.5 NA intron (NM_018441, intron 6 of 7) L1MC5|LINE|L1 -33189 NM_018000 55686 Hs.620391 NM_018000 ENSG00000118242 MREG DSU|WDT2 melanoregulin protein-coding 247.5-37 chr19 57145133 57145544 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_052882) promoter-TSS (NM_052882) -136 NM_052882 114026 Hs.348622 NM_052882 ENSG00000141946 ZIM3 ZNF264|ZNF657 zinc finger imprinted 3 protein-coding 390.75-7 chr4 166586287 166586557 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 648004 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 294-4 chr10 76670627 76670918 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -217272 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 279.5-60 chr7 17076539 17076816 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -194694 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 163.5-184 chr7 3278278 3278469 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -22879 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 470.5-4 chr2 118219433 118220099 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -33380 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 161-34 chr14 41585014 41585147 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -21776 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 490.75-6 chr8 143868952 143869517 + 1.5 NA exon (NM_031308, exon 2 of 2) exon (NM_031308, exon 2 of 2) 9230 NM_031308 83481 Hs.200412 NM_031308 ENSG00000261150 EPPK1 EPIPL|EPIPL1 epiplakin 1 protein-coding 424-2 chr14 63964395 63964797 + 1.5 NA intron (NM_015180, intron 10 of 114) AluSp|SINE|Alu 111592 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 293.25-8 chr16 52238402 52238707 + 1.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -20010 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 277.75-39 chrUn_GL000216v2 44832 45274 + 1.5 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 221.5-48 chr2 106698828 106699012 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 187108 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 417.5-9 chr5 108172810 108173216 + 1.5 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) AluSq2|SINE|Alu 209085 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 255.5-82 chr8 37121229 37121648 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 337064 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 158.75-75 chr18 56502694 56502933 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 135779 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 293-10 chr18 3872861 3873384 + 1.5 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 1180 NM_001242764 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 357-8 chr2 15347510 15347787 + 1.5 NA intron (NR_052013, intron 35 of 50) intron (NR_052013, intron 35 of 50) 213686 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 372.75 chr1 41277210 41277640 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35119 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 294.75-31 chr5 81708986 81709319 + 1.5 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 42101 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 292.75-16 chr2 46132929 46133214 + 1.5 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -164336 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 209.5-107 chr4 116175371 116175632 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -124224 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 328-21 chr21 15170970 15171229 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -106099 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 254.25-16 chr12 10515712 10515926 + 1.5 NA intron (NM_001357731, intron 1 of 1) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9926 NM_001357734 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 240.75-65 chr5 129903261 129903594 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1038 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 360.5-3 chr10 49583648 49584152 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -25195 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 215.5-84 chr5 26065327 26065547 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 874484 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 405.75-12 chr8 139360313 139360814 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 342560 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 286.5-24 chr14 66563649 66563957 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 56396 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 152-151 chr8 128039351 128039458 + 1.5 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) intron (NR_003367, intron 5 of 8) -9748 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 452.5-5 chr4 60124181 60124615 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -798221 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 231-81 chr8 113297348 113297568 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 79694 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 310-13 chr2 165910470 165910697 + 1.5 NA intron (NM_024753, intron 18 of 28) L1ME4b|LINE|L1 -23274 NR_038983 100506134 Hs.672319 NR_038983 TTC21B-AS1 - TTC21B antisense RNA 1 ncRNA 286.5-68 chr8 91876924 91877184 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 140626 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 289-29 chr4 57377775 57378155 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47907 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 176-7 chr10 28565269 28565481 + 1.5 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) AluJo|SINE|Alu 32257 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 263.5-32 chr2 65808847 65809154 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -376401 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 185-92 chr9 133663552 133663773 + 1.5 NA TTS (NM_007101) TTS (NM_007101) -6254 NR_102735 138948 Hs.223858 NR_002783 ENSG00000225756 DBH-AS1 NCRNA00118 DBH antisense RNA 1 ncRNA 216.5-37 chr15 75365797 75366157 + 1.5 NA intron (NM_001256496, intron 4 of 23) AluSx|SINE|Alu 2630 NM_006715 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 135.75-35 chr11 35376056 35376162 + 1.5 NA intron (NM_001252652, intron 1 of 11) intron (NM_001252652, intron 1 of 11) 43449 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 187-41 chr2 67135248 67135424 + 1.5 NA intron (NR_038844, intron 6 of 7) intron (NR_038844, intron 6 of 7) 48890 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 491.25-4 chr2 195901489 195901851 + 1.5 NA intron (NM_018897, intron 27 of 64) intron (NM_018897, intron 27 of 64) 167167 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 271.5-26 chr16 35629644 35629982 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116739 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 462-8 chr4 82853409 82853900 + 1.5 NA exon (NM_001077206, exon 18 of 26) exon (NM_001077206, exon 18 of 26) 37499 NM_001077207 22872 Hs.370024 NM_014933 ENSG00000138674 SEC31A ABP125|ABP130|HSPC275|HSPC334|SEC31L1 SEC31 homolog A, COPII coat complex component protein-coding 291.75-36 chr6 86368742 86369002 + 1.5 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -568656 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 170.25-143 chr7 4669799 4670009 + 1.5 NA Intergenic (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12391 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 280.5-38 chr4 165628965 165629247 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55533 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 197.25-23 chr12 60403138 60403302 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 713850 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 206.5-56 chr2 124304360 124304598 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) L2c|LINE|L2 279192 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 283.75-26 chr4 82432844 82433122 + 1.5 NA intron (NM_021204, intron 1 of 5) intron (NM_021204, intron 1 of 5) 2393 NM_001292017 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 226-43 chr3 57942925 57943111 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 53016 NM_001304422 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 142-129 chr5 81436583 81436748 + 1.5 NA intron (NM_012446, intron 15 of 16) intron (NM_012446, intron 15 of 16) -42531 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 320-25 chr3 45663404 45663746 + 1.5 NA intron (NM_014240, intron 2 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 25307 NR_033947 644714 Hs.712889 NR_033947 LIMD1-AS1 - LIMD1 antisense RNA 1 ncRNA 151.75-92 chr3 108335198 108335348 + 1.5 NA intron (NM_001370244, intron 2 of 9) ERVL-E-int|LTR|ERVL 23488 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 326-18 chr2 190509126 190509472 + 1.5 NA exon (NM_001142645, exon 9 of 9) exon (NM_001142645, exon 9 of 9) 25423 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 139.5-168 chr5 17977252 17977358 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 170031 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 165-89 chr3 28135700 28135861 + 1.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -105839 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 358.5-16 chr3 68152038 68152401 + 1.5 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 147972 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 163.25-122 chr6 48174018 48174218 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -105429 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 268-44 chr5 19344647 19344896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 541501 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 264-30 chr2 40658413 40658798 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -146170 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 343.5-9 chr14 68167620 68167994 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 344215 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 162.75-53 chr17 70529396 70529513 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 359919 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 244-17 chr15 81499594 81499807 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -125487 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 247.5-32 chr16 63054166 63054455 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -1017872 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 204.25-14 chr10 103273332 103273672 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3636 NM_032727 9118 Hs.500916 NM_032727 ENSG00000148798 INA NEF5|NF-66|TXBP-1 internexin neuronal intermediate filament protein alpha protein-coding 236.25-26 chr14 69610798 69611035 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_014734) promoter-TSS (NM_014734) -680 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 412.75-2 chr2 70611897 70612301 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -58273 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 335.5-8 chr2 126847164 126847485 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -51566 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 178-9 chr10 69754076 69754279 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -47729 NM_080802 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 135-51 chr16 66154847 66154994 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -211771 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 421-13 chr6 163794576 163795040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -123324 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 210-30 chr14 88340276 88340505 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13478 NM_021161 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 291.5-33 chr4 46604162 46604386 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -214146 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 174-14 chr11 36788901 36789116 + 1.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -190729 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 180-29 chr14 34123227 34123417 + 1.5 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -172248 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 201.5-110 chr5 111855411 111855655 + 1.5 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -56975 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 329.75-18 chr8 77404305 77404680 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46205 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 253.5-29 chr16 62503334 62503613 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -467035 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 213-76 chr5 17329932 17330224 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 57232 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 438.75-7 chr5 94916641 94917094 + 1.5 NA intron (NM_001297777, intron 6 of 19) MER5A|DNA|hAT-Charlie 164999 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 253.5-11 chr10 103546030 103546366 + 1.5 NA intron (NM_004210, intron 1 of 5) intron (NM_004210, intron 1 of 5) -28756 NR_120676 102724341 Hs.599425 NR_120675 ENSG00000235470 NEURL1-AS1 - NEURL1 antisense RNA 1 ncRNA 207-18 chr12 5564919 5565111 + 1.5 NA intron (NM_001278596, intron 25 of 25) intron (NM_001278596, intron 25 of 25) 70883 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 148.75-110 chr3 106742512 106742636 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 498064 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 351-15 chr4 31419358 31419641 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -87045 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 240.75-69 chr7 69981633 69981845 + 1.5 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 383264 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 157.25-11 chr10 28977783 28977941 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 131454 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 134.5-91 chr18 11338357 11338520 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116040 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 305.25-15 chr14 57424567 57424954 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 34174 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 136.5-104 chr2 40956852 40957050 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -444516 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 276.75-41 chr5 164857982 164858266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 387845 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 289.5-42 chr5 108215064 108215385 + 1.5 NA intron (NM_001163315, intron 5 of 8) L1MB5|LINE|L1 166874 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 143.5-68 chr14 60756654 60756821 + 1.5 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 21976 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 162.5-16 chr10 62137371 62137735 + 1.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 88196 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 171-95 chr3 112617860 112618051 + 1.5 NA intron (NM_199512, intron 4 of 7) MIR|SINE|MIR -15986 NR_109779 100506621 Hs.86538 NR_109779 LINC01279 - long intergenic non-protein coding RNA 1279 ncRNA 322.75-5 chr11 40989913 40990295 + 1.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 469532 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 424.75-2 chr14 53197536 53198201 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 44514 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 274.25-2 chr1 40982585 40982835 + 1.5 NA intron (NR_125440, intron 1 of 17) intron (NR_125440, intron 1 of 17) 3014 NR_125440 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 206.25-9 chr1 147493020 147493219 + 1.5 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 24756 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 230.5-28 chr12 51497762 51498042 + 1.5 NA intron (NM_001039960, intron 22 of 24) AluJr|SINE|Alu 72785 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 245.5-86 chr9 30397991 30398267 + 1.5 NA intron (NR_046204, intron 1 of 2) L1MA7|LINE|L1 10325 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 268-24 chr16 35652870 35653145 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -93545 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 174.5-174 chr7 52881727 52881900 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -153820 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 269.5-39 chr4 99750342 99750623 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -66345 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 344-13 chr22 25644537 25644901 + 1.5 NA intron (NM_005160, intron 3 of 20) intron (NM_005160, intron 3 of 20) 80044 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 148.5-223 chr8 74568271 74568383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19718 NR_049871 100847091 NR_049871 ENSG00000283505 MIR5681B - microRNA 5681b ncRNA 176.25-50 chr17 40627504 40627708 + 1.5 NA 3' UTR (NM_003079, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_003079, exon 11 of 11) 20212 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 216-13 chr12 97435393 97435612 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27274 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 382.25-6 chr14 55871413 55871927 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -74996 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 152.5-129 chr4 32672687 32672860 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 321735 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 179.75-62 chr2 125219646 125219765 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 898280 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 417.5-8 chr4 39313123 39313585 + 1.5 NA intron (NM_001204747, intron 10 of 24) intron (NM_001204747, intron 10 of 24) 53008 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 289-32 chr5 42379973 42380173 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -43366 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 304-37 chrX 44719884 44720219 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -123970 NM_022076 63904 Hs.534478 NM_022076 ENSG00000189037 DUSP21 LMWDSP21 dual specificity phosphatase 21 protein-coding 225.5-79 chr4 62058198 62058419 + 1.5 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) intron (NM_001371343, intron 23 of 23) 103457 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 243-15 chr11 81230556 81230750 + 1.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -467850 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 317.25-24 chr4 122230208 122230563 + 1.5 NA intron (NM_015312, intron 24 of 83) intron (NM_015312, intron 24 of 83) 59782 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 349.75-5 chr15 58676634 58677022 + 1.5 NA intron (NM_001320570, intron 4 of 14) intron (NM_001320570, intron 4 of 14) 16779 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 337-31 chr8 29273747 29274021 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10814 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 355.5-18 chr3 28430987 28431305 + 1.5 NA intron (NM_001040432, intron 3 of 9) intron (NM_001040432, intron 3 of 9) 81997 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 223.5-64 chr2 173168906 173169174 + 1.5 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 93194 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 269-47 chr7 134227848 134228049 + 1.5 NA intron (NM_144648, intron 16 of 19) L1ME3B|LINE|L1 88982 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 146.25-143 chr7 146302041 146302287 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -472107 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 231.25-11 chr12 18751923 18752297 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 13991 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 177.25-45 chr14 59408113 59408346 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 57151 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 267-43 chr6 78201645 78201917 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 337528 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 140-80 chr2 150051203 150051376 + 1.5 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -192098 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 301.25-10 chr14 47640298 47640538 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L2|LINE|L2 34536 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 245-44 chr4 30307134 30307422 + 1.5 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL -413091 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 303.5-42 chr6 140834078 140834403 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 150426 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 201.5-40 chr12 45495191 45495471 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 202641 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 182.5-35 chr11 115837741 115837983 + 1.5 NA Intergenic Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -77662 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 196.25-15 chr10 100005393 100005542 + 1.5 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) L1ME5|LINE|L1 4480 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 285-3 chr1 118159639 118159903 + 1.5 NA intron (NM_206996, intron 1 of 48) intron (NM_206996, intron 1 of 48) 25457 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 311.25-3 chr1 152329523 152329903 + 1.5 NA intron (NR_103778, intron 2 of 6) (AGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4510 NM_002016 2312 Hs.654510 NM_002016 ENSG00000143631 FLG ATOD2 filaggrin protein-coding 275.5-48 chr4 77745836 77746162 + 1.5 NA intron (NM_001365006, intron 6 of 11) intron (NM_001365006, intron 6 of 11) 73065 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 155.5-124 chr3 39424646 39424810 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 13674 NR_002324 6044 Hs.449909 NR_002324 ENSG00000202363 SNORA62 E2|E2-1|RNE2|RNU108 small nucleolar RNA, H/ACA box 62 snoRNA 277.5-42 chr3 24372317 24372601 + 1.5 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -121628 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 220.5-87 chr4 70672332 70672508 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5912 NM_144646 3512 Hs.643431 NM_144646 ENSG00000132465 JCHAIN IGCJ|IGJ|JCH joining chain of multimeric IgA and IgM protein-coding 225.5-66 chr21 14485885 14486307 + 1.5 NA exon (NM_001286523, exon 9 of 9) exon (NM_001286523, exon 9 of 9) 60219 NM_022136 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 172.75-75 chr22 35276712 35276910 + 1.5 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) intron (NM_001003681, intron 5 of 10) 19318 NM_001362972 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 352.5-16 chr3 192670082 192670435 + 1.5 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 57283 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 353.25-24 chr8 130232263 130232700 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 4 of 29) intron (NM_001362925, intron 4 of 29) 64052 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 158-124 chr6 163830778 163830940 + 1.5 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -159375 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 320.75-20 chr4 113381346 113381782 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001354279, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001354279, exon 25 of 25) 88725 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 309.5-42 chr8 34913832 34914123 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 130056 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 235.5-35 chr14 72030506 72030790 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 97121 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 164.5-22 chr10 74428299 74428620 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L1MC4|LINE|L1 100865 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 366.75-4 chr11 103076162 103076470 + 1.5 NA intron (NM_001318740, intron 3 of 6) intron (NM_001318740, intron 3 of 6) 15844 NM_032299 84259 Hs.503716 NM_032299 ENSG00000137692 DCUN1D5 SCCRO5 defective in cullin neddylation 1 domain containing 5 protein-coding 230-15 chr11 104996226 104996485 + 1.5 NA intron (NM_004347, intron 8 of 9) intron (NM_004347, intron 8 of 9) 26813 NM_001136112 838 Hs.213327 NM_004347 ENSG00000137757 CASP5 ICE(rel)III|ICEREL-III|ICH-3 caspase 5 protein-coding 210-18 chr11 56581676 56581849 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -4041 NM_001004741 390167 Hs.553750 NM_001004741 ENSG00000254834 OR5M10 OR11-207 olfactory receptor family 5 subfamily M member 10 protein-coding 237.25-77 chr8 133647177 133647535 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 36710 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 216.25-15 chr10 128080034 128080303 + 1.5 NA intron (NM_001323354, intron 19 of 19) intron (NM_001323354, intron 19 of 19) -17743 NR_136150 105378553 NR_136149 AS-PTPRE - lncRNA antisense to PTPRE protein-coding gene ncRNA 351.5-21 chr3 90744 91159 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 79200 NR_110824 102723448 Hs.543290 NR_110824 LINC01986 - long intergenic non-protein coding RNA 1986 ncRNA 174.75-139 chr9 86244563 86244820 + 1.5 NA intron (NM_001276367, intron 1 of 4) L1ME3E|LINE|L1 11342 NM_001276368 389766 Hs.632073 NM_001010907 ENSG00000187753 C9orf153 bA507D14.1 chromosome 9 open reading frame 153 protein-coding 298.25-25 chr5 44677676 44678004 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 130953 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 205.5-139 chr7 77460018 77460218 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43769 NM_001350896 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 297.25-20 chr4 62403501 62403863 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -241917 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 358.25-20 chr9 4319420 4319901 + 1.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -19592 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 242-52 chr6 95287043 95287253 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 290303 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 257-9 chr12 13478848 13479260 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -102309 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 184.75-42 chr19 36693475 36693633 + 1.5 NA intron (NM_001322920, intron 3 of 6) intron (NM_001322920, intron 3 of 6) 5942 NM_001322920 163081 Hs.412517 NM_152603 ENSG00000189042 ZNF567 - zinc finger protein 567 protein-coding 248.75-51 chr4 112123251 112123477 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22090 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 253-44 chr5 128615830 128616121 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -77730 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 213.75-14 chr10 72568058 72568261 + 1.5 NA intron (NM_006077, intron 1 of 11) intron (NM_006077, intron 1 of 11) -44173 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 280.5-30 chr22 22690149 22690372 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43948 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 220.25-15 chr14 80934684 80934883 + 1.5 NA intron (NM_152446, intron 2 of 24) intron (NM_152446, intron 2 of 24) 6955 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 258-21 chr18 76690474 76690815 + 1.5 NA non-coding (NR_122073, exon 1 of 2) non-coding (NR_122073, exon 1 of 2) 615 NR_122073 400661 Hs.514963 NR_122073 ENSG00000276397 LINC01879 - long intergenic non-protein coding RNA 1879 ncRNA 213-54 chr20 44079058 44079321 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 107999 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 336.5-27 chr6 122860824 122861234 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 71771 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 152.5-30 chr12 9993897 9994098 + 1.5 NA intron (NM_001099431, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 5303 NM_016509 51266 Hs.409794 NM_016509 ENSG00000165682 CLEC1B 1810061I13Rik|CLEC2|CLEC2B|PRO1384|QDED721 C-type lectin domain family 1 member B protein-coding 215.25-26 chr13 100531627 100531977 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001195087, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001195087, exon 3 of 3) 2000 NM_033110 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 290.25-39 chr9 106510892 106511119 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -89923 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 164.5-185 chr7 7343959 7344080 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 88865 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 207.75-117 chr7 29461463 29461733 + 1.5 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -18114 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 289.5-48 chr8 58895124 58895486 + 1.5 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) 223842 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 179-30 chr13 87037557 87037788 + 1.5 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 125752 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 207.5-48 chr19 57539375 57539521 + 1.5 NA 3' UTR (NM_153263, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_153263, exon 3 of 3) 12092 NM_001199295 256051 Hs.744289 NM_153263 ENSG00000121406 ZNF549 - zinc finger protein 549 protein-coding 252.25-38 chr3 120213961 120214240 + 1.5 NA intron (NM_001168271, intron 2 of 8) intron (NM_001168271, intron 2 of 8) 30195 NM_001168271 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 236.5-53 chr20 54405887 54406057 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69621 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 240.75-38 chr19 45749059 45749330 + 1.5 NA intron (NM_001310124, intron 4 of 14) AluJb|SINE|Alu 15943 NM_001310124 388553 Hs.721835 NM_001310124 ENSG00000237452 BHMG1 HMGDC basic helix-loop-helix and HMG-box containing 1 protein-coding 308-12 chr16 52154043 52154324 + 1.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 68902 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 225.25-62 chr5 21015350 21015582 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -399931 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 156.5-169 chr6 159120991 159121193 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48308 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 119.25-43 chr12 15655208 15655300 + 1.5 NA intron (NM_004447, intron 12 of 20) intron (NM_004447, intron 12 of 20) 108643 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 163.5-51 chr14 61235599 61235740 + 1.5 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 45669 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 341.75-7 chr14 25869575 25870096 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 683595 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 249.75-51 chr4 107139435 107139840 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103324 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 283.75-17 chr2 78689707 78690125 + 1.5 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 144385 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 231.5-19 chr12 20677057 20677302 + 1.5 NA intron (NM_000921, intron 15 of 15) L1MA4A|LINE|L1 -18176 NM_001145945 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 241.5-45 chr2 124317571 124317836 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 292416 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 412.25-9 chr2 74111466 74111958 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 36200 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 265-8 chr11 41249534 41249865 + 1.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 209937 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 167.25-149 chr8 80126980 80127143 + 1.5 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 44060 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 163.5-163 chr5 83143692 83143892 + 1.5 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) L1MEf|LINE|L1 66245 NM_003401 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 375.75-14 chr4 82254974 82255325 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 118842 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 145-29 chr10 88761516 88761617 + 1.5 NA intron (NM_001102469, intron 1 of 8) intron (NM_001102469, intron 1 of 8) 160 NM_001102469 643418 Hs.632091 NM_001102469 ENSG00000204020 LIPN ARCI8|LI4|LIPL4|bA186O14.3 lipase family member N protein-coding 313-20 chr6 57228081 57228336 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5894 NR_103822 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 177.75-70 chr2 77329357 77329518 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 192939 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 319-25 chr4 27967342 27967653 + 1.5 NA Intergenic (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 750018 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 354-26 chr6 57162937 57163411 + 1.5 NA intron (NM_015555, intron 13 of 13) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 9039 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 270-39 chr4 30908101 30908473 + 1.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 187918 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 162.5-163 chr7 111561736 111561906 + 1.5 NA intron (NM_001350959, intron 2 of 7) intron (NM_001350959, intron 2 of 7) 470 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 301.75-29 chr5 68902338 68902804 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 127356 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 214.5-58 chr2 127178643 127178868 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 27012 NM_001001665 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 263.25-50 chr5 180597619 180597896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6258 NM_052863 92304 Hs.62492 NM_052863 ENSG00000161055 SCGB3A1 HIN-1|HIN1|LU105|PnSP-2|UGRP2 secretoglobin family 3A member 1 protein-coding 401.75-14 chr7 3013234 3013654 + 1.5 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 30423 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 242.25-20 chr12 22537639 22537875 + 1.5 NA intron (NM_001286176, intron 2 of 26) MIRb|SINE|MIR 6440 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 417.5-5 chr17 63081367 63081725 + 1.5 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) intron (NM_025185, intron 3 of 25) 115311 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 317.25-7 chr12 7347906 7348308 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43775 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 149.5-95 chr2 81341582 81341804 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 125253 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 235.5-92 chr9 11365736 11365994 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 752659 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 375.5-6 chr16 26611092 26611356 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -455703 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 210.75-14 chr10 72185462 72185633 + 1.5 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) L1ME1|LINE|L1 30409 NM_001369111 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 350.5-14 chr2 45372329 45372745 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -117596 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 337-8 chr11 31560454 31560685 + 1.5 NA intron (NM_001288725, intron 3 of 10) intron (NM_001288725, intron 3 of 10) 50802 NM_001288726 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 197.5-98 chr3 85772190 85772375 + 1.5 NA intron (NM_001256504, intron 3 of 10) intron (NM_001256504, intron 3 of 10) 45800 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 238-19 chr16 86231122 86231469 + 1.5 NA intron (NR_104139, intron 3 of 5) intron (NR_104139, intron 3 of 5) 35114 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 188.25-46 chr14 88096396 88096634 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -70203 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 378.75-2 chr10 55993485 55993815 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -365708 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 114.75-47 chr13 38782317 38782461 + 1.5 NA intron (NM_207361, intron 4 of 23) intron (NM_207361, intron 4 of 23) 45202 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 344.25-19 chr9 27015691 27015973 + 1.5 NA intron (NM_001099224, intron 10 of 13) MIRb|SINE|MIR -10160 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 225-50 chr4 5041585 5041770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9803 NM_001306082 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 229.5-45 chr15 66648393 66648616 + 1.5 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) intron (NR_110372, intron 1 of 4) -53732 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 297-12 chr12 130742306 130742528 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -26112 NM_001351233 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 153.5-189 chr8 8436409 8436634 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -50082 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 251.75-73 chr7 23252676 23252854 + 1.5 NA intron (NM_001005340, intron 1 of 10) L1MEc|LINE|L1 5990 NM_001005340 10457 Hs.190495 NM_002510 ENSG00000136235 GPNMB HGFIN|NMB|PLCA3 glycoprotein nmb protein-coding 270-13 chr12 25703303 25703609 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54878 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 161.25-105 chr20 40705906 40706054 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 8643 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 351.75-19 chr5 107755336 107755720 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -84591 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 198.5-34 chr13 79486731 79486959 + 1.5 NA intron (NM_019080, intron 1 of 7) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -5614 NR_046685 100874208 Hs.602801 NR_046685 ENSG00000232132 NDFIP2-AS1 - NDFIP2 antisense RNA 1 ncRNA 212-16 chr11 110382695 110382911 + 1.5 NA intron (NR_135100, intron 3 of 3) intron (NR_135100, intron 3 of 3) 27689 NR_135100 105369486 Hs.611557 NR_135100 LINC02732 - long intergenic non-protein coding RNA 2732 ncRNA 190-60 chr5 90843048 90843224 + 1.5 NA intron (NR_003149, intron 78 of 89) L1M5|LINE|L1 284339 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 249.75-30 chr2 13848655 13848958 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 552152 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 236.5-29 chr14 67653414 67653673 + 1.5 NA intron (NM_006370, intron 4 of 5) intron (NM_006370, intron 4 of 5) 21089 NM_006370 10490 Hs.741177 NM_006370 ENSG00000100568 VTI1B VTI1|VTI1-LIKE|VTI1L|VTI2|v-SNARE|vti1-rp1 vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B protein-coding 185-30 chr17 42370445 42370574 + 1.5 NA intron (NM_213662, intron 1 of 23) AluSx1|SINE|Alu 17933 NM_001369518 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 169-21 chr12 111786868 111786997 + 1.5 NA intron (NM_000690, intron 4 of 12) AluSz|SINE|Alu -12902 NR_106819 102465456 NR_106819 ENSG00000274697 MIR6761 hsa-mir-6761 microRNA 6761 ncRNA 152.25-39 chr12 27727394 27727531 + 1.5 NA intron (NM_001190864, intron 5 of 6) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 16630 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 263.75-47 chr8 3973829 3974364 + 1.5 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) L1MA1|LINE|L1 1020818 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 278.25-20 chr17 15173113 15173317 + 1.5 NA Intergenic (TACATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -67028 NR_103559 94151 Hs.98684 NR_103559 CDRT8 - CMT1A duplicated region transcript 8 ncRNA 288-9 chr10 81621702 81621902 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -253392 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 231.25-13 chr12 98445691 98445896 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 11352 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 136.25-2 chr1 41068666 41068762 + 1.5 NA intron (NM_001172218, intron 11 of 15) intron (NM_001172218, intron 11 of 15) -46959 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 489 chr10 23101973 23102592 + 1.5 NA intron (NM_012228, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 6703 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 213.75-71 chr3 193696475 193696741 + 1.5 NA 3' UTR (NM_130834, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_130834, exon 30 of 30) -69276 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 163.25-153 chrX 56614087 56614319 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 50610 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 283.25-18 chr17 80141511 80141837 + 1.5 NA intron (NM_014740, intron 3 of 11) intron (NM_014740, intron 3 of 11) 5454 NM_014740 9775 Hs.389649 NM_014740 ENSG00000141543 EIF4A3 DDX48|Fal1|MUK34|NMP265|NUK34|RCPS|eIF-4A-III|eIF4A-III|eIF4AIII eukaryotic translation initiation factor 4A3 protein-coding 442.25-6 chr8 89984371 89984715 + 1.5 NA exon (NM_002485, exon 1 of 16) exon (NM_002485, exon 1 of 16) 128 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 226-42 chr2 237003043 237003332 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 52980 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 354-4 chr1 225811112 225811485 + 1.5 NA intron (NM_001291163, intron 1 of 8) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 1164 NM_001291163 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 225.25-21 chr14 76486665 76486985 + 1.5 NA intron (NM_004452, intron 7 of 10) intron (NM_004452, intron 7 of 10) 115478 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 194.75-6 chr1 99334173 99334455 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70022 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 134.75-116 chr2 154301450 154301632 + 1.5 NA exon (NM_001301627, exon 7 of 12) exon (NM_001301627, exon 7 of 12) 155897 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 165-93 chr3 110953455 110953577 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 116443 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 259.5-86 chr7 24201417 24201739 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -82612 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 272.75-20 chr18 75831710 75832058 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -119481 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 250-45 chr5 52064339 52064577 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 56427 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 209.25-33 chr15 85133143 85133440 + 1.5 NA intron (NM_001243137, intron 20 of 21) L1M4|LINE|L1 101490 NR_158179 101929479 Hs.681665 NR_158179 LOC101929479 - golgin A2 pseudogene pseudo 325-6 chr14 61170091 61170473 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 111056 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 232.25-32 chr2 89836410 89836794 + 1.5 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -198695 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 190.25 chr1 20922129 20922339 + 1.5 NA intron (NM_003760, intron 9 of 31) intron (NM_003760, intron 9 of 31) 66198 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 215.5-6 chr1 106923005 106923282 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 104904 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 234-35 chr3 15981331 15981532 + 1.5 NA Intergenic ORSL-2a|DNA|hAT-Tip100 107660 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 313.5-7 chr12 67695035 67695292 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 34312 NR_110063 101927901 Hs.369609 NR_110063 ENSG00000255970 LINC02421 - long intergenic non-protein coding RNA 2421 ncRNA 401-12 chr3 89801876 89802230 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 694432 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 232-29 chr2 11282731 11282934 + 1.5 NA intron (NM_001321643, intron 3 of 32) L1MC1|LINE|L1 61804 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 375.75-12 chr3 103443486 103443966 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 80390 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 243.75-84 chr9 79960445 79960832 + 1.5 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) -14385 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 404-3 chr3 119808121 119808570 + 1.5 NA intron (NM_033013, intron 2 of 8) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 25635 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 236.25-60 chr3 144970288 144970546 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 997336 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 200-96 chr9 87241949 87242196 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 93428 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 218.25-58 chr4 37238522 37238728 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 3366 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 205.5-67 chr2 31264276 31264534 + 1.5 NA intron (NM_014600, intron 5 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 30253 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 185.75-79 chr21 29090840 29090977 + 1.5 NA intron (NM_001286622, intron 2 of 8) MER33|DNA|hAT-Charlie -1346 NM_001286619 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 330.25-19 chr6 123953980 123954318 + 1.5 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L1MA4A|LINE|L1 150284 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 311.75 chr1 70133889 70134154 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 71558 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 180-80 chr3 35871596 35871833 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 127238 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 169.75-68 chr18 25736317 25736439 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 354235 NM_001007559 6760 Hs.129261 NM_005637 ENSG00000141380 SS18 SSXT|SYT SS18 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 333-26 chr7 146520336 146520586 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -253810 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 156.5-105 chr22 36927935 36928105 + 1.5 NA intron (NM_000395, intron 4 of 13) intron (NM_000395, intron 4 of 13) 14392 NM_000395 1439 Hs.592192 NM_000395 ENSG00000100368 CSF2RB CD131|CDw131|IL3RB|IL5RB|SMDP5|betaGMR colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit protein-coding 177-32 chr14 72244331 72244534 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -272388 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 189-14 chr1 208520019 208520214 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -208572 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 218 chr1 59656765 59656971 + 1.5 NA intron (NM_001350790, intron 12 of 16) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 76428 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 153.25-93 chr3 118635477 118635627 + 1.5 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -6216 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 348.75 chr1 95718596 95718840 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 208602 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 379.5-3 chr10 81459363 81459745 + 1.5 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -415640 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 212-91 chrX 154092786 154092977 + 1.5 NA intron (NM_001369391, intron 1 of 6) intron (NM_001369391, intron 1 of 6) 4088 NM_001369394 4204 Hs.200716 NM_004992 ENSG00000169057 MECP2 AUTSX3|MRX16|MRX79|MRXS13|MRXSL|PPMX|RS|RTS|RTT methyl-CpG binding protein 2 protein-coding 180.75-2 chr1 61388269 61388461 + 1.5 NA intron (NM_001134673, intron 7 of 10) intron (NM_001134673, intron 7 of 10) -134847 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 127-95 chr2 28217943 28218095 + 1.5 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) L1MC4|LINE|L1 -11058 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 126-130 chr4 140701340 140701458 + 1.5 NA intron (NM_015130, intron 2 of 20) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 54986 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 163.5-23 chr10 60148213 60148376 + 1.5 NA intron (NM_001204404, intron 23 of 43) intron (NM_001204404, intron 23 of 43) -7278 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 179.75-25 chr11 96052241 96052434 + 1.5 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) intron (NM_032427, intron 2 of 4) -128130 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 284-40 chr5 23247675 23247902 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -259821 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 264.5-11 chr10 88670974 88671259 + 1.5 NA intron (NM_001198829, intron 6 of 10) intron (NM_001198829, intron 6 of 10) 6674 NM_004190 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 550.75-3 chr15 87470901 87471611 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -105673 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 295.75-23 chr5 36858911 36859273 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 17602 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 431.5-5 chr4 30275111 30275516 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -445056 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 307.25-33 chr8 15756559 15756914 + 1.5 NA intron (NM_178234, intron 9 of 9) intron (NM_178234, intron 9 of 9) 216473 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 187.75-104 chr6 130549495 130549679 + 1.5 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 112470 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 210.5-89 chr4 100654649 100654892 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 20343 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 278.5 chr1 27793679 27793943 + 1.5 NA intron (NM_177424, intron 3 of 8) intron (NM_177424, intron 3 of 8) 20592 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 260.25-56 chr8 115611261 115611736 + 1.5 NA intron (NM_001282902, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 56515 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 168.75-102 chr4 66735607 66735776 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 458867 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 445-8 chr9 118443407 118443759 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -236088 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 377-17 chr8 13658136 13658609 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28682 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 204.5-132 chr8 89495815 89496011 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 261798 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 518.5 chr3 89718022 89718571 + 1.5 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 610675 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 226.5-59 chr3 51034462 51034656 + 1.5 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L1MEf|LINE|L1 -350732 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 261.25-36 chr4 84004562 84004987 + 1.5 NA intron (NR_125909, intron 8 of 8) L1PA15|LINE|L1 294395 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 322.25-13 chr3 86631909 86632188 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 150105 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 239.25-32 chr15 76290755 76291015 + 1.5 NA intron (NM_000126, intron 4 of 11) intron (NM_000126, intron 4 of 11) 20584 NM_000126 2108 Hs.39925 NM_000126 ENSG00000140374 ETFA EMA|GA2|MADD electron transfer flavoprotein subunit alpha protein-coding 436.5-7 chr7 79890942 79891283 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -243719 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 337-21 chr4 41256005 41256363 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_004181) promoter-TSS (NM_004181) 543 NR_102709 101410542 Hs.518731 NR_102709 ENSG00000251173 UCHL1-AS1 - UCHL1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 240.75-59 chr5 19015380 19015726 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 870719 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 375-8 chr3 129846199 129846562 + 1.5 NA intron (NM_001349263, intron 2 of 7) intron (NM_001349263, intron 2 of 7) 47196 NM_001128224 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 237.5-34 chr15 62740619 62740831 + 1.5 NA exon (NM_015059, exon 29 of 56) exon (NM_015059, exon 29 of 56) -83232 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 231.5-17 chr11 110829437 110829690 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -116374 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 195.5-88 chr20 39048088 39048319 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 85859 NM_001190809 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 305.5-13 chr14 50045510 50045891 + 1.5 NA intron (NR_131171, intron 4 of 8) intron (NR_131171, intron 4 of 8) -38180 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 619 chr7 22127532 22128493 + 1.5 NA intron (NM_012294, intron 24 of 25) intron (NM_012294, intron 24 of 25) 65733 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 144.5-208 chr7 121540763 121540897 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -144462 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 209-42 chr2 212321323 212321645 + 1.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) AluJo|SINE|Alu 104876 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 287.5-56 chr8 142566025 142566579 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 48177 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 196-71 chr4 91221316 91221531 + 1.5 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 986392 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 208.5-125 chr6 162667758 162668025 + 1.5 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR -59241 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 287-13 chr14 58863612 58863897 + 1.5 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 35466 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 346-3 chr10 33228532 33228944 + 1.5 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 105929 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 215.25-2 chr1 61197882 61198085 + 1.5 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) AluSq2|SINE|Alu 55535 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 204.5-127 chr7 131138454 131138596 + 1.5 NA intron (NM_001145354, intron 1 of 18) intron (NM_001145354, intron 1 of 18) 28431 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 144.25-11 chr1 97649565 97649714 + 1.5 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -147282 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 182.5-115 chr4 41280705 41280905 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 23877 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 181.5-160 chr8 116646885 116647072 + 1.5 NA intron (NM_003756, intron 6 of 7) intron (NM_003756, intron 6 of 7) -5122 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 150.5-139 chr4 6760799 6760987 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -21834 NM_014743 9778 Hs.79276 NM_014743 ENSG00000170871 KIAA0232 - KIAA0232 protein-coding 268-12 chr10 122842310 122842742 + 1.5 NA intron (NM_022034, intron 1 of 8) L1MD|LINE|L1 3331 NM_022034 50624 Hs.647182 NM_022034 ENSG00000138161 CUZD1 ERG-1|ERG1|ITMAP1|UO-44 CUB and zona pellucida like domains 1 protein-coding 154-35 chr12 10734431 10734603 + 1.5 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -11194 NM_003651 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 127-133 chr5 27646177 27646261 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 173927 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 264.75-12 chr13 79524436 79524703 + 1.5 NA intron (NM_019080, intron 2 of 7) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -42158 NR_125772 103724388 Hs.434862 NR_125772 ENSG00000227676 LINC01068 - long intergenic non-protein coding RNA 1068 ncRNA 319-23 chr3 95585148 95585390 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 97924 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 226-17 chr13 102857733 102858014 + 1.5 NA intron (NM_000123, intron 5 of 14) L2a|LINE|L2 12032 NM_000123 2073 Hs.258429 NM_000123 ENSG00000134899 ERCC5 COFS3|ERCC5-201|ERCM2|UVDR|XPG|XPGC ERCC excision repair 5, endonuclease protein-coding 241 chr1 86607076 86607401 + 1.5 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) L1MA2|LINE|L1 -27038 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 274.75-44 chr5 128484423 128484769 + 1.5 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) L1M5|LINE|L1 53649 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 142.5-171 chr5 71692113 71692352 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27043 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 194.5-144 chr7 89143182 89143358 + 1.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -347533 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 161.5-75 chr16 57875352 57875693 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 64885 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 175.5-45 chr13 78494291 78494502 + 1.5 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -101726 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 354.75-18 chr5 147757040 147757377 + 1.5 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 25520 NM_001270941 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 187-18 chr10 82361129 82361282 + 1.5 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -128285 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 331-21 chr3 74622609 74622863 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -101596 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 162.25-91 chr2 192316846 192317055 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -122017 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 132-98 chr21 19738472 19738597 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 161221 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 282.5-61 chr7 115865384 115865724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 102759 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 279.25-40 chr8 122068905 122069284 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -427654 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 135-182 chr8 88892148 88892288 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -564735 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 180.75-133 chr6 139373736 139373892 + 1.5 NA exon (NM_006079, exon 2 of 2) exon (NM_006079, exon 2 of 2) 399 NM_001168389 10370 Hs.82071 NM_006079 ENSG00000164442 CITED2 ASD8|MRG-1|MRG1|P35SRJ|VSD2 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 protein-coding 213.75-28 chr12 110709834 110710092 + 1.5 NA Intergenic (AAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20186 NM_001040107 84329 Hs.211511 NM_032369 ENSG00000122986 HVCN1 HV1|VSOP hydrogen voltage gated channel 1 protein-coding 251.25-39 chr4 43769894 43770098 + 1.5 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -246865 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 350-20 chr9 79540865 79541345 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30668 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 155-63 chr2 60049652 60049787 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 333317 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 237-54 chr6 34734819 34735092 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22139 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 164.5-122 chr21 27181723 27181990 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -214768 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 210 chr1 12774538 12774692 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001080830) promoter-TSS (NM_001080830) -233 NM_001080830 390999 Hs.156406 NM_001080830 ENSG00000116726 PRAMEF12 - PRAME family member 12 protein-coding 251.5 chr1 63342765 63343106 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15951 NR_106716 102464823 NR_106716 ENSG00000275836 MIR6068 hsa-mir-6068 microRNA 6068 ncRNA 253.5-82 chr9 27921422 27921847 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -347768 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 290-47 chr8 86159407 86159622 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 60604 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 131.5-60 chr14 59271910 59272094 + 1.5 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 8561 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 260.75-34 chr2 161642285 161642697 + 1.5 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 18075 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 228.75-79 chr8 88945641 88945865 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -618270 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 213-32 chr15 43970295 43970633 + 1.5 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -92293 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 385.5-10 chr17 43768868 43769261 + 1.5 NA 3' UTR (NM_004090, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_004090, exon 3 of 3) 9913 NM_004090 1845 Hs.181046 NM_004090 ENSG00000108861 DUSP3 VHR dual specificity phosphatase 3 protein-coding 336-13 chr2 19514995 19515441 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -156595 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 147.5-46 chr12 26346984 26347083 + 1.5 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) intron (NM_002223, intron 55 of 56) 151460 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 224.5-92 chr6 63606882 63607151 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -28786 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 292-3 chr1 212312510 212312784 + 1.5 NA intron (NM_001199756, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 10789 NM_001199756 5525 Hs.744012 NM_006243 ENSG00000066027 PPP2R5A B56A|B56alpha|PR61A protein phosphatase 2 regulatory subunit B'alpha protein-coding 265.25-19 chr16 81046753 81047094 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001300728, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001300728, exon 4 of 4) 9725 NM_001300728 23300 Hs.16349 NM_015251 ENSG00000166454 ATMIN ASCIZ|ZNF822 ATM interactor protein-coding 231.25-21 chr15 65408966 65409251 + 1.5 NA intron (NM_020962, intron 3 of 19) AluJo|SINE|Alu 13839 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 282.5-26 chr18 54379866 54380109 + 1.5 NA non-coding (NR_110234, exon 6 of 6) non-coding (NR_110234, exon 6 of 6) 22070 NR_110234 162681 Hs.208701 NM_173529 ENSG00000166845 C18orf54 LAS2 chromosome 18 open reading frame 54 protein-coding 620.75-2 chr5 92553275 92553929 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1017741 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 317-4 chr1 188860746 188861078 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 1417284 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 252-62 chr6 70763648 70763891 + 1.5 NA intron (NM_001044305, intron 3 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 95239 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 249.5-25 chr13 56978863 56979094 + 1.5 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -161940 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 354.75-5 chr11 22009807 22010065 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -183149 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 289-13 chr12 84519109 84519464 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 393513 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 171.5-95 chr21 27670466 27670658 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51817 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 373.25-4 chr11 114622341 114623004 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26886 NM_017678 54827 Hs.179100 NM_017678 ENSG00000137634 NXPE4 C11orf33|FAM55D neurexophilin and PC-esterase domain family member 4 protein-coding 159.5-212 chr8 129648675 129648837 + 1.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 31483 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 373.25-11 chr3 94162059 94162462 + 1.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 99199 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 343-24 chr5 118062971 118063230 + 1.5 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L1PA16|LINE|L1 -219474 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 305-29 chr5 38156175 38156412 + 1.5 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7813 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 171-57 chr17 76641821 76642085 + 1.5 NA intron (NM_001289107, intron 1 of 9) L1ME3G|LINE|L1 1804 NM_018414 55808 Hs.105352 NM_018414 ENSG00000070526 ST6GALNAC1 HSY11339|SIAT7A|ST6GalNAcI|STYI ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 339.5-17 chr3 6322472 6322741 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 482843 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 278-12 chr17 69542905 69543112 + 1.5 NA 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) 40746 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 157-2 chr1 38796935 38797049 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 62780 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 341.5-24 chr4 65871877 65872275 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -201581 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 244-34 chr3 100050180 100050546 + 1.5 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 64150 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 307.5-5 chr10 43878392 43878749 + 1.5 NA intron (NR_038268, intron 4 of 4) intron (NR_038268, intron 4 of 4) 19159 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 269.75-39 chr3 188757450 188757855 + 1.5 NA intron (NM_001167672, intron 6 of 9) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 68871 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 363.25-5 chr16 71847371 71847726 + 1.5 NA intron (NM_001137675, intron 1 of 2) intron (NM_001137675, intron 1 of 2) 1572 NM_001137675 342371 Hs.743239 NM_001137675 ENSG00000224470 ATXN1L BOAT|BOAT1 ataxin 1 like protein-coding 228.75-31 chr18 12692396 12692618 + 1.5 NA intron (NM_001271989, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 10216 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 218.5-100 chr5 44639340 44639528 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -129152 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 306.5-9 chr11 121060144 121060588 + 1.5 NA intron (NM_001363644, intron 8 of 8) intron (NM_001363644, intron 8 of 8) 36294 NM_001363644 219899 Hs.504136 NM_152715 ENSG00000154114 TBCEL El|LRRC35 tubulin folding cofactor E like protein-coding 177.75-110 chr5 33963478 33963641 + 1.5 NA intron (NM_001297417, intron 2 of 3) intron (NM_001297417, intron 2 of 3) 21134 NM_001297417 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 114.25-173 chr6 154926782 154926951 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 73506 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 267.5-31 chr16 84244108 84244556 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4582 NM_172347 93107 Hs.335877 NM_133490 ENSG00000168418 KCNG4 KV6.3|KV6.4 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 4 protein-coding 287-12 chr14 33561479 33561916 + 1.5 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -147240 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 229-15 chr13 91421428 91421609 + 1.5 NA intron (NM_004466, intron 1 of 7) intron (NM_004466, intron 1 of 7) 22897 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 577-2 chr9 79304094 79305014 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -158888 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 310.5-11 chr14 46654859 46655275 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3286 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 420.25-8 chr4 74056539 74057020 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1380 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 505.5-4 chr8 127819334 127819789 + 1.5 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 23599 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 282-32 chr2 227333649 227333839 + 1.5 NA intron (NM_001277068, intron 3 of 7) LTR86B1|LTR|ERVL 5066 NM_001277068 56947 Hs.471528 NM_020194 ENSG00000168958 MFF C2orf33|EMPF2|GL004 mitochondrial fission factor protein-coding 249-32 chr3 23369077 23369357 + 1.5 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 165890 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 203.75-80 chr4 109397243 109397606 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36291 NM_001318085 10427 Hs.292472 NM_006323 ENSG00000138802 SEC24B SEC24 SEC24 homolog B, COPII coat complex component protein-coding 355.5-5 chr10 68013253 68013492 + 1.5 NA intron (NM_001278185, intron 9 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -2489 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 136.5-130 chr20 21842474 21842607 + 1.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 136876 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 432.5-7 chr5 33723368 33723986 + 1.5 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) intron (NM_001324512, intron 3 of 21) 168313 NM_030955 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 273-35 chr3 78789539 78789780 + 1.5 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 229800 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 259.5-13 chr1 223691281 223691576 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10165 NM_001146068 824 Hs.350899 NM_001748 ENSG00000162909 CAPN2 CANP2|CANPL2|CANPml|mCANP calpain 2 protein-coding 258.5-50 chr3 110008237 110008445 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 405513 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 188.5-59 chr18 7956258 7956506 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 389066 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 251.25-33 chr21 43624584 43624883 + 1.5 NA intron (NM_007031, intron 6 of 8) intron (NM_007031, intron 6 of 8) -14744 NR_106718 102464825 NR_106718 ENSG00000278433 MIR6070 hsa-mir-6070 microRNA 6070 ncRNA 302.5-40 chr6 120054337 120054587 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39283 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 148.5-160 chr3 179125470 179125643 + 1.5 NA intron (NR_125401, intron 2 of 2) L1MA4A|LINE|L1 22417 NR_125401 101928739 Hs.434553 NR_125401 ENSG00000229102 LOC101928739 - uncharacterized LOC101928739 ncRNA 305.5-39 chr6 76921144 76921581 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -327739 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 205.25-7 chr10 85010004 85010325 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 188741 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 396.25-9 chr20 41994923 41995504 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -376836 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 249.5-42 chr18 2677895 2678129 + 1.5 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) L1MB7|LINE|L1 22125 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 392-14 chr4 75022363 75022889 + 1.5 NA intron (NM_015393, intron 2 of 3) intron (NM_015393, intron 2 of 3) -52264 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 139-96 chr3 112566685 112566802 + 1.5 NA intron (NM_001348908, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 4698 NM_001348908 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 341.5-33 chr6 166863584 166863957 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1245 NM_001318936 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 242.5-85 chr8 127540403 127540638 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -58381 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 230.25-82 chr8 118521922 118522097 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -98992 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 415-6 chr8 81706577 81707106 + 1.5 NA intron (NR_033194, intron 5 of 6) L1ME3G|LINE|L1 -11783 NM_001010893 347051 Hs.683849 NM_001010893 ENSG00000253598 SLC10A5 P5 solute carrier family 10 member 5 protein-coding 419-4 chr2 210152350 210152662 + 1.5 NA intron (NM_001307976, intron 2 of 13) intron (NM_001307976, intron 2 of 13) 18903 NM_001307976 151050 Hs.282260 NM_152519 ENSG00000144445 KANSL1L C2orf67|MSL1v2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like protein-coding 273.25-6 chr10 68503555 68503898 + 1.5 NA intron (NM_001324317, intron 2 of 7) intron (NM_001324317, intron 2 of 7) 14492 NR_136737 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 282.5-19 chr15 100976368 100976714 + 1.5 NA intron (NM_024652, intron 3 of 33) L1ME3G|LINE|L1 57184 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 207-11 chr10 77072802 77072981 + 1.5 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) intron (NM_001271519, intron 14 of 28) -67940 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 140-107 chr3 66822549 66822731 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -84304 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 206.25-110 chr8 120615235 120615495 + 1.5 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -145888 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 180-11 chr10 22666196 22666381 + 1.5 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 47820 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 283.5-26 chr2 147210162 147210451 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 623249 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 202.5-22 chr10 119318758 119318989 + 1.5 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) -59099 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 288.75-23 chr18 2749303 2749712 + 1.5 NA intron (NM_015295, intron 30 of 47) intron (NM_015295, intron 30 of 47) 93620 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 222.25-67 chr5 52044239 52044555 + 1.5 NA TTS (NR_147166) TTS (NR_147166) 36366 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 215-58 chr4 128636816 128637115 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -172735 NM_024900 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 145.5-169 chr6 23050337 23050585 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -332537 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 281.5-30 chr2 163194678 163195070 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -356107 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 199-11 chr10 49083902 49084163 + 1.5 NA intron (NM_001031746, intron 3 of 7) intron (NM_001031746, intron 3 of 7) 31490 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 150-73 chr2 80646870 80647010 + 1.5 NA intron (NM_001320810, intron 12 of 12) MIR|SINE|MIR 333561 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 130.5-51 chr10 103227591 103227724 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18230 NM_001143909 729020 Hs.458437 NM_001143909 ENSG00000235376 RPEL1 - ribulose-5-phosphate-3-epimerase like 1 protein-coding 419-10 chr5 143268610 143269073 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 76341 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 229.5-128 chr7 140603842 140604029 + 1.5 NA intron (NM_001318052, intron 1 of 18) intron (NM_001318052, intron 1 of 18) -1393 NR_134477 27147 Hs.6385 NM_015689 ENSG00000146966 DENND2A FAM31D|KIAA1277 DENN domain containing 2A protein-coding 165.5-183 chr7 96835726 96835868 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -125906 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 186.5-100 chr4 104697425 104697638 + 1.5 NA TTS (NR_125926) TTS (NR_125926) -202637 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 316.5-2 chr1 52299427 52299735 + 1.5 NA intron (NM_007324, intron 11 of 17) intron (NM_007324, intron 11 of 17) 66624 NM_001330585 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 288-7 chr10 67067742 67068247 + 1.5 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 55728 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 142.5-88 chr17 30269838 30270026 + 1.5 NA intron (NM_000386, intron 10 of 11) intron (NM_000386, intron 10 of 11) 22012 NM_000386 642 Hs.371914 NM_000386 ENSG00000108578 BLMH BH|BMH bleomycin hydrolase protein-coding 267.75-21 chr16 11682928 11683241 + 1.5 NA intron (NR_136673, intron 9 of 9) intron (NR_136673, intron 9 of 9) 14629 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 176-2 chr1 34785815 34786049 + 1.5 NA 3' UTR (NM_024009, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_024009, exon 2 of 2) 3664 NM_001005752 2707 Hs.522561 NM_024009 ENSG00000188910 GJB3 CX31|DFNA2|DFNA2B|EKV|EKVP1 gap junction protein beta 3 protein-coding 196.75-2 chr1 18423871 18424143 + 1.5 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -56923 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 470-4 chr5 13291448 13291956 + 1.5 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -258816 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 237.75-69 chr5 101490243 101490438 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -587058 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 231.75 chr1 50844478 50844752 + 1.5 NA intron (NM_007051, intron 2 of 18) intron (NM_007051, intron 2 of 18) 115652 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 250-44 chr5 31614699 31614944 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24310 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 211.5-117 chr4 84903692 84903873 + 1.5 NA intron (NM_014991, intron 2 of 67) intron (NM_014991, intron 2 of 67) -61834 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 170.5-22 chr10 20371805 20371981 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -180077 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 336-10 chr16 75089937 75090258 + 1.5 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 26675 NM_194436 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 289-25 chr2 241613072 241613269 + 1.5 NA intron (NM_015963, intron 2 of 5) intron (NM_015963, intron 2 of 5) 4331 NM_001164356 51078 Hs.435759 NM_015963 ENSG00000176946 THAP4 CGI-36|Nb(III)|PP238 THAP domain containing 4 protein-coding 126-15 chr10 28758417 28758596 + 1.5 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) L1MC5|LINE|L1 14856 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 210.5-18 chr10 90999484 90999722 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33563 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 230.75-34 chr2 81422545 81422797 + 1.5 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 44275 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 260.75-65 chr8 122192565 122192847 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 375938 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 158.25-69 chr2 186646963 186647143 + 1.5 NA intron (NM_001145000, intron 11 of 27) intron (NM_001145000, intron 11 of 27) 46848 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 148-64 chr2 203972947 203973064 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 36257 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 303.75-4 chr1 51916063 51916289 + 1.5 NA 3' UTR (NM_002867, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_002867, exon 5 of 5) -37239 NM_001101662 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 329-11 chr11 55432528 55432885 + 1.5 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR 64822 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 340.25-9 chr2 37102063 37102433 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001135651, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001135651, exon 17 of 17) 17797 NM_174931 253635 Hs.595250 NM_174931 ENSG00000152133 GPATCH11 CCDC75|CENP-Y|CENPY G-patch domain containing 11 protein-coding 245.5-29 chr16 66431139 66431368 + 1.5 NA intron (NM_001136106, intron 1 of 3) FLAM_A|SINE|Alu 3958 NM_001178020 146227 Hs.97805 NM_001136106 ENSG00000166546 BEAN1 BEAN|SCA31 brain expressed associated with NEDD4 1 protein-coding 162.5-146 chr5 167775992 167776278 + 1.5 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 21206 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 232-48 chr21 30638762 30639094 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 3722 NM_181616 337976 Hs.553698 NM_181616 ENSG00000184032 KRTAP20-2 KAP20.2 keratin associated protein 20-2 protein-coding 159-139 chrX 152210178 152210304 + 1.5 NA intron (NM_000808, intron 6 of 9) Charlie8|DNA|hAT-Charlie -71663 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 291.25-11 chr18 2628455 2628692 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 26822 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 243.25-31 chr3 29177493 29177791 + 1.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 103297 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 232.5-68 chr3 64044078 64044311 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20184 NM_001271780 9861 Hs.152536 NM_014814 ENSG00000163636 PSMD6 Rpn7|S10|SGA-113M|p42A|p44S10 proteasome 26S subunit, non-ATPase 6 protein-coding 272.25-34 chr3 63840279 63840508 + 1.5 NA intron (NM_025075, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -20252 NR_104326 100874039 NR_104326 ENSG00000240549 THOC7-AS1 - THOC7 antisense RNA 1 ncRNA 189.25-60 chr2 133164050 133164266 + 1.5 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) intron (NM_207481, intron 5 of 17) -102037 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 259-29 chr3 119847303 119847568 + 1.5 NA intron (NM_002093, intron 10 of 11) AluSx|SINE|Alu 64725 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 269-6 chr1 172870837 172871080 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 180005 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 126-85 chr19 46431075 46431283 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17615 NM_032040 83987 Hs.97876 NM_032040 ENSG00000169515 CCDC8 3M3|PPP1R20|p90 coiled-coil domain containing 8 protein-coding 242-26 chr18 6743832 6744071 + 1.5 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 -14089 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 214.75-36 chr2 27786756 27787079 + 1.5 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) intron (NM_022128, intron 7 of 7) 15198 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 271 chr1 20908516 20908860 + 1.5 NA intron (NM_003760, intron 9 of 31) intron (NM_003760, intron 9 of 31) 79744 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 240.75-55 chr3 182459237 182459473 + 1.5 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) L1MA5|LINE|L1 27007 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 210.75-96 chr8 89883709 89883922 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18053 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 154.5-150 chr5 110185368 110185544 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 302274 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 251-63 chrX 152366729 152366951 + 1.5 NA intron (NM_000808, intron 1 of 9) intron (NM_000808, intron 1 of 9) 25459 NR_029521 406897 NR_029521 ENSG00000207957 MIR105-1 MIRN105-1|mir-105-1 microRNA 105-1 ncRNA 432-7 chr19 32349864 32350183 + 1.5 NA intron (NM_001136156, intron 2 of 6) intron (NM_001136156, intron 2 of 6) 4413 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 248.25-79 chrX 24323902 24324101 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10608 NM_001136233 170067 Hs.716893 NM_001136233 SUPT20HL2 FAM48B1|FAM48B2 SUPT20H like 2 protein-coding 207-85 chr7 120704498 120704758 + 1.5 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 153516 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 246.75-28 chr19 33652763 33652992 + 1.5 NA intron (NM_001127896, intron 1 of 3) L1MB8|LINE|L1 30924 NM_001127896 64377 Hs.165724 NM_022467 ENSG00000124302 CHST8 GALNAC4ST1|GalNAc4ST|PSS3 carbohydrate sulfotransferase 8 protein-coding 253.5-70 chr7 20613661 20613856 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -1909 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 411-6 chr2 39249940 39250258 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001270425, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_001270425, exon 33 of 33) -6116 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 241.5-88 chr7 26527707 26527904 + 1.5 NA intron (NR_148500, intron 5 of 5) intron (NR_148500, intron 5 of 5) 11020 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 229.5-111 chr5 149903438 149903632 + 1.5 NA intron (NM_000440, intron 8 of 21) intron (NM_000440, intron 8 of 21) 29442 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 278.75-13 chr17 70048175 70048430 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2969 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 149-104 chr5 116475338 116475473 + 1.5 NA intron (NM_001300780, intron 16 of 19) intron (NM_001300780, intron 16 of 19) 27907 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 328.5-16 chr19 30001379 30001749 + 1.5 NA intron (NM_001252641, intron 4 of 10) intron (NM_001252641, intron 4 of 10) 59325 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 327-15 chr2 25720996 25721332 + 1.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -47490 NM_001256304 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 194-47 chr2 159639687 159639952 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -23218 NM_001289975 29994 Hs.470369 NM_013450 ENSG00000123636 BAZ2B WALp4 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B protein-coding 613.25 chr5 39887858 39888502 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -164111 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 221.5-89 chr7 30045346 30045582 + 1.5 NA intron (NM_001363473, intron 2 of 12) intron (NM_001363473, intron 2 of 12) 379 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 226.5-93 chr7 45990216 45990431 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69051 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 389.5-9 chr18 10095888 10096418 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 182137 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 292.5-14 chr12 1314385 1314644 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) L1M5|LINE|L1 -185977 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 127.25-44 chr12 24299543 24299696 + 1.5 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 76348 NR_120473 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 237.5-37 chr16 22786430 22786628 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27633 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 256-8 chr11 47517863 47518278 + 1.5 NA intron (NM_001330272, intron 1 of 15) intron (NM_001330272, intron 1 of 15) 5918 NM_001172639 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 121-23 chr10 52994947 52995078 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -223312 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 265.5-58 chr7 35342251 35342530 + 1.5 NA intron (NR_038864, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 28535 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 414-14 chr4 96553056 96553492 + 1.5 NA intron (NR_147149, intron 2 of 3) intron (NR_147149, intron 2 of 3) 242571 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 198-49 chr3 15697247 15697436 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_036085) promoter-TSS (NR_036085) 30 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 340.75-7 chr12 25065021 25065280 + 1.5 NA intron (NM_001204127, intron 3 of 19) MIR|SINE|MIR 12444 NM_001204126 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 298.25-13 chr18 69816371 69816670 + 1.5 NA intron (NM_152721, intron 7 of 7) intron (NM_152721, intron 7 of 7) 131353 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 276-42 chr6 125341757 125342052 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -39937 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 279.75-57 chr8 121520981 121521278 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -118217 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 180.5-161 chr8 129570331 129570529 + 1.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 4588 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 306.5 chr1 84949633 84950130 + 1.5 NA intron (NM_153259, intron 6 of 13) L1M2|LINE|L1 47232 NM_001330647 255231 Hs.591446 NM_153259 ENSG00000153898 MCOLN2 TRP-ML2|TRPML2 mucolipin 2 protein-coding 180.75-104 chr4 60562998 60563266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -359487 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 300-31 chr4 121670973 121671330 + 1.5 NA intron (NM_001154, intron 10 of 12) intron (NM_001154, intron 10 of 12) 25829 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 223.5-39 chr14 68336175 68336387 + 1.5 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 292506 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 339.25-9 chr2 56497967 56498425 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -312426 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 219.5-104 chr5 101336010 101336222 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -432834 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 148-107 chr5 104560947 104561094 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -538454 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 145.5-199 chr9 134192089 134192277 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27619 NR_023344 100151684 Hs.545589 NR_023344 ENSG00000221676 RNU6ATAC RNU6ATAC1|U6ATAC RNA, U6atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 158.5-205 chrX 99813070 99813253 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 597112 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 233.25-28 chr16 53838959 53839155 + 1.5 NA intron (NM_001363899, intron 3 of 7) intron (NM_001363899, intron 3 of 7) 134901 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 190.5-4 chr1 61928079 61928301 + 1.5 NA intron (NM_001350145, intron 27 of 43) intron (NM_001350145, intron 27 of 43) 82115 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 120.25-93 chr2 69128800 69129036 + 1.5 NA intron (NM_032208, intron 12 of 17) intron (NM_032208, intron 12 of 17) 25236 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 250.5-101 chr8 135132254 135132484 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -101762 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 224-43 chr5 54609020 54609263 + 1.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 91382 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 360.75-10 chr4 85497186 85497642 + 1.5 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) intron (NM_001025616, intron 1 of 9) 22264 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 235-5 chr1 176912389 176912630 + 1.5 NA intron (NM_207108, intron 16 of 21) MER58B|DNA|hAT-Charlie 116936 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 144.75-187 chr8 122366084 122366211 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 202497 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 245-23 chr18 45536621 45536994 + 1.5 NA intron (NM_001371319, intron 5 of 23) intron (NM_001371319, intron 5 of 23) -29771 NR_110899 101927980 Hs.591058 NR_110899 SLC14A2-AS1 - SLC14A2 antisense RNA 1 ncRNA 278.75-28 chr4 43878887 43879150 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -137843 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 134.75-89 chr17 58766805 58767008 + 1.5 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 11037 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 254.5-67 chr6 152070855 152071087 + 1.5 NA intron (NM_001328100, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 97316 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 185.25-116 chr7 69185862 69186078 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 411654 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 292.75-14 chr2 25336727 25337197 + 1.5 NA intron (NR_135490, intron 1 of 23) L2b|LINE|L2 4953 NM_022552 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 401.5-13 chr4 185200095 185200473 + 1.5 NA intron (NM_020827, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 3716 NM_001292033 57587 Hs.535734 NM_020827 ENSG00000164323 CFAP97 KIAA1430|hmw cilia and flagella associated protein 97 protein-coding 275.5-40 chr3 48340534 48340769 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -12310 NM_001080525 646424 Hs.257687 NM_001080525 ENSG00000229453 SPINK8 - serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (putative) protein-coding 359.75-6 chr14 47049090 47049394 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 7 of 16) intron (NM_001113498, intron 7 of 16) 294004 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 296.5-43 chr8 115430311 115430524 + 1.5 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 237596 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 299-28 chr4 112907123 112907336 + 1.5 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) 46242 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 295.5-20 chr17 14031499 14031911 + 1.5 NA intron (NR_049718, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 7207 NR_003261 94158 Hs.633073 NR_003261 CDRT15P1 CDRT15P CMT1A duplicated region transcript 15 pseudogene 1 pseudo 244-11 chr12 59886527 59886784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197285 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 234.75-62 chr5 34844780 34844974 + 1.5 NA intron (NM_001317949, intron 2 of 10) intron (NM_001317949, intron 2 of 10) 5496 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 262.75-31 chr20 17602275 17602637 + 1.5 NA intron (NM_001011546, intron 3 of 4) intron (NM_001011546, intron 3 of 4) 32381 NM_006870 11034 Hs.304192 NM_006870 ENSG00000125868 DSTN ACTDP|ADF|HEL32|bA462D18.2 destrin, actin depolymerizing factor protein-coding 302.75-15 chr21 26344119 26344588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49282 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-26 chr10 60473196 60473292 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) L1ME4a|LINE|L1 -83369 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 353.25-27 chr9 81314929 81315196 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 374473 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 212.25-98 chr8 100143441 100143699 + 1.5 NA intron (NM_001029860, intron 1 of 4) intron (NM_001029860, intron 1 of 4) 2247 NR_036491 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 232-4 chr1 115724606 115724820 + 1.5 NA intron (NM_001232, intron 7 of 10) intron (NM_001232, intron 7 of 10) 44092 NM_001232 845 Hs.57975 NM_001232 ENSG00000118729 CASQ2 PDIB2 calsequestrin 2 protein-coding 240.25-8 chr10 44981270 44981469 + 1.5 NA intron (NM_032023, intron 3 of 10) L1MB1|LINE|L1 -2560 NM_007021 11067 Hs.93675 NM_007021 ENSG00000165507 DEPP1 C10orf10|DEPP|FIG|Fseg DEPP1 autophagy regulator protein-coding 274.5-59 chr6 41955552 41955876 + 1.5 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu -13866 NM_001287427 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 116.5-159 chr3 70155372 70155521 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155702 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 156-91 chr2 203456688 203456860 + 1.5 NA intron (NM_001329728, intron 10 of 15) intron (NM_001329728, intron 10 of 15) 78527 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 288.75-25 chr19 28785683 28785974 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -58134 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 287.5-53 chr8 120911226 120911531 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -99332 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 115.25-104 chr2 129303485 129303693 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -29698 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 443-4 chr2 163088178 163088584 + 1.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -249614 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 364.5-23 chr9 28663420 28663818 + 1.5 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 55686 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 216-14 chr12 125236614 125236902 + 1.5 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) intron (NM_001366854, intron 1 of 8) 50372 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 134.5-173 chr5 65471468 65471565 + 1.5 NA intron (NR_135689, intron 2 of 25) intron (NR_135689, intron 2 of 25) 10404 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 143-69 chr2 14531241 14531385 + 1.5 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -101404 NM_145175 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 370.5-13 chr20 11400067 11400614 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -126957 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 407.25-12 chr5 132812387 132812874 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_175873) promoter-TSS (NM_175873) -672 NM_175873 134548 Hs.13308 NM_175873 ENSG00000198944 SOWAHA ANKRD43 sosondowah ankyrin repeat domain family member A protein-coding 275.25-15 chr12 91997667 91997974 + 1.5 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) L1M2|LINE|L1 143893 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 334-24 chr4 148352835 148353093 + 1.5 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) intron (NM_000901, intron 2 of 8) 89450 NR_148974 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 120-121 chr3 110554843 110554999 + 1.5 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 515038 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-195 chr8 80764770 80764902 + 1.5 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 109632 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 492 chr1 162697327 162697991 + 1.5 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) intron (NM_006182, intron 2 of 17) 65195 NM_006182 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 387.75 chr1 67423843 67424265 + 1.5 NA intron (NM_001018068, intron 5 of 7) intron (NM_001018068, intron 5 of 7) 6348 NM_015640 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 115.5-119 chr2 52796670 52796754 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -94097 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 283.25-25 chr22 33960127 33960434 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -37392 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 445.75-2 chr11 63643682 63644031 + 1.5 NA intron (NM_015459, intron 7 of 12) intron (NM_015459, intron 7 of 12) 27520 NM_015459 25923 Hs.356719 NM_015459 ENSG00000184743 ATL3 HSN1F atlastin GTPase 3 protein-coding 151.75-37 chr12 112202178 112202401 + 1.5 NA intron (NM_001109662, intron 54 of 75) AluSz|SINE|Alu -38968 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 187.75-105 chr6 130608692 130608928 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 171693 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 214-31 chr2 38753752 38753938 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2351 NM_001195446 6432 Hs.309090 NM_006276 ENSG00000115875 SRSF7 9G8|AAG3|SFRS7 serine and arginine rich splicing factor 7 protein-coding 143.75-128 chr4 30205871 30205966 + 1.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -514451 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 124.5-185 chr6 16454904 16455051 + 1.5 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) LTR83|LTR|ERVL 216390 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 410.5-4 chr14 53073552 53074054 + 1.5 NA exon (NM_001160147, exon 6 of 13) exon (NM_001160147, exon 6 of 13) 79520 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 180-22 chr12 81453182 81453382 + 1.5 NA intron (NM_001282536, intron 2 of 29) intron (NM_001282536, intron 2 of 29) 59109 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 218.5-36 chr13 65176783 65177117 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -689097 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 267.5-58 chr5 51337264 51337487 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45957 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 157-95 chr5 72322321 72322537 + 1.5 NA intron (NM_001284403, intron 2 of 6) intron (NM_001284403, intron 2 of 6) 2056 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 231.25-51 chr22 34737590 34737953 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 260145 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 299.5-37 chr6 150636720 150637113 + 1.5 NA intron (NR_138140, intron 1 of 2) HAL1ME|LINE|L1 3952 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 244.5-72 chr4 41551469 41551649 + 1.5 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) 13402 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 255-33 chr21 42528637 42528899 + 1.5 NA intron (NM_001320537, intron 3 of 19) AluSq2|SINE|Alu 14916 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 189.75-37 chr14 86779936 86780179 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -125721 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 326-16 chr2 61054161 61054431 + 1.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -11574 NM_001330434 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 216-57 chr3 140853015 140853238 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -88710 NM_001104647 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 169.5-62 chr17 5099706 5099832 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12166 NR_135657 101928000 Hs.660048 NR_135657 ENSG00000234327 LOC101928000 - uncharacterized LOC101928000 ncRNA 258-31 chr21 18519270 18519506 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -115603 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 339.5-13 chr14 31145743 31146093 + 1.5 NA intron (NM_015382, intron 15 of 42) L1PA16|LINE|L1 61875 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 335-10 chr2 158592778 158593041 + 1.5 NA intron (NM_001005476, intron 3 of 20) intron (NM_001005476, intron 3 of 20) 135957 NM_001005476 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 250.5-99 chr8 123470129 123470404 + 1.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 53492 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 186.5-58 chr2 22024515 22024719 + 1.5 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -313965 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 231-26 chr14 66019935 66020192 + 1.5 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -466308 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 511.75-3 chr2 121910165 121910746 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 154804 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 430.25 chr10 16904782 16905178 + 1.5 NA intron (NM_001081, intron 50 of 66) intron (NM_001081, intron 50 of 66) -87526 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 352-5 chr11 103748404 103748731 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -101339 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 180-48 chr17 71995450 71995704 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 30402 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 365-12 chr3 90269735 90270160 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1162326 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 265.5-45 chr4 74619386 74619696 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 174405 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 234.25 chr1 46350602 46351003 + 1.5 NA intron (NM_001256127, intron 3 of 5) intron (NM_001256127, intron 3 of 5) 9624 NM_001256128 387338 Hs.163424 NM_199044 ENSG00000117481 NSUN4 SHTAP NOP2/Sun RNA methyltransferase 4 protein-coding 282.75-33 chr5 35220962 35221420 + 1.5 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) 9296 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 216.75-78 chr8 118233137 118233489 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -121494 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 179.5-127 chr3 138318720 138318895 + 1.5 NA intron (NM_001349018, intron 3 of 10) intron (NM_001349018, intron 3 of 10) 11044 NM_001349018 347736 Hs.660992 NM_178130 ENSG00000181322 NME9 NM23-H9|TXL-2|TXL2|TXNDC6 NME/NM23 family member 9 protein-coding 261-40 chr4 54376310 54376606 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 43566 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 333.75-28 chr8 143399075 143399460 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18412 NR_126358 104326051 Hs.202140 NR_126358 ENSG00000254338 MAFA-AS1 TCONS_00014882 MAFA antisense RNA 1 ncRNA 323.5-21 chr4 141489416 141489715 + 1.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -147018 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 231-76 chr7 45237498 45237707 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 79811 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 347.75-7 chr3 8737503 8737950 + 1.5 NA intron (NM_001234, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 3924 NM_001234 859 Hs.98303 NM_001234 ENSG00000182533 CAV3 LGMD1C|LQT9|MPDT|RMD2|VIP-21|VIP21 caveolin 3 protein-coding 267.5-67 chr7 34549892 34550206 + 1.5 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -108169 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 157.5-180 chr6 133831346 133831538 + 1.5 NA intron (NR_027030, intron 1 of 2) intron (NR_027030, intron 1 of 2) 10295 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 173.75-22 chr10 34683858 34684332 + 1.5 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 131201 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 273.75-25 chr20 10362102 10362380 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69684 NM_018848 8195 Hs.472119 NM_018848 ENSG00000125863 MKKS BBS6|HMCS|KMS|MKS McKusick-Kaufman syndrome protein-coding 260-14 chr19 36464505 36464804 + 1.5 NA intron (NM_001145345, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 24781 NM_032838 84924 Hs.533939 NM_032838 ENSG00000186017 ZNF566 - zinc finger protein 566 protein-coding 152.25-121 chr4 168696644 168696752 + 1.5 NA intron (NM_001166108, intron 8 of 21) HAL1|LINE|L1 65120 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 177-79 chr5 102454978 102455171 + 1.5 NA intron (NM_173488, intron 6 of 13) intron (NM_173488, intron 6 of 13) 43927 NM_001308014 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 226.5-14 chr11 111378072 111378334 + 1.5 NA intron (NM_006235, intron 1 of 4) intron (NM_006235, intron 1 of 4) 1072 NM_006235 5450 Hs.654525 NM_006235 ENSG00000110777 POU2AF1 BOB1|OBF-1|OBF1|OCAB POU class 2 homeobox associating factor 1 protein-coding 294.5-17 chr16 64462955 64463267 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 658952 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 218.5-27 chr11 55636357 55636555 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1902 NM_001004124 81300 NM_001004124 ENSG00000181927 OR4P4 OR4P3P olfactory receptor family 4 subfamily P member 4 protein-coding 168-124 chr8 77339033 77339198 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -111582 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 191.25-25 chr12 41182237 41182369 + 1.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -6017 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 341-8 chr12 51630136 51630601 + 1.5 NA intron (NM_001369788, intron 1 of 25) L1MB3|LINE|L1 39132 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 292-7 chr11 9478904 9479113 + 1.5 NA intron (NM_001282656, intron 6 of 15) intron (NM_001282656, intron 6 of 15) 17996 NM_003442 7702 Hs.523471 NM_003442 ENSG00000166478 ZNF143 SBF|STAF|pHZ-1 zinc finger protein 143 protein-coding 242.5-16 chr10 66073842 66074109 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 14 of 17) L1ME3A|LINE|L1 502550 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 172.5-88 chr19 3378514 3378739 + 1.5 NA intron (NM_001245002, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 12043 NM_005597 4782 Hs.170131 NM_005597 ENSG00000141905 NFIC CTF|CTF5|NF-I|NFI nuclear factor I C protein-coding 273.25-7 chr10 74492850 74493248 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L1MC4|LINE|L1 36275 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 141.5-121 chr2 205261972 205262075 + 1.5 NA intron (NM_057177, intron 16 of 21) intron (NM_057177, intron 16 of 21) -420477 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 199-50 chr3 4331272 4331580 + 1.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 28122 NM_001276325 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 272-30 chr4 121782546 121782769 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -17257 NM_001317837 132332 Hs.27524 NM_152399 ENSG00000164112 TMEM155 - transmembrane protein 155 protein-coding 377.5-7 chr17 67201632 67202146 + 1.5 NA intron (NM_001330447, intron 6 of 32) intron (NM_001330447, intron 6 of 32) -42887 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 294-9 chr13 88607300 88607542 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19432 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 208-4 chr1 178280291 178280664 + 1.5 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -60974 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 246.5-50 chr20 58668183 58668382 + 1.5 NA intron (NR_037943, intron 4 of 7) intron (NR_037943, intron 4 of 7) 16999 NM_001134772 8675 Hs.307913 NM_003763 ENSG00000124222 STX16 SYN16 syntaxin 16 protein-coding 261-55 chr7 36778327 36778557 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -53893 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 323.25-4 chr10 83849628 83849870 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -172660 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 157.5-138 chr3 114116309 114116570 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 59702 NM_001256835 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 194-85 chr9 70837248 70837460 + 1.5 NA intron (NM_001366143, intron 5 of 25) intron (NM_001366143, intron 5 of 25) -27270 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 317.5-33 chr7 117496571 117496943 + 1.5 NA intron (NM_000492, intron 1 of 26) L1MB8|LINE|L1 16794 NM_000492 1080 Hs.489786 NM_000492 ENSG00000001626 CFTR ABC35|ABCC7|CF|CFTR/MRP|MRP7|TNR-CFTR|dJ760C5.1 CF transmembrane conductance regulator protein-coding 396.5-11 chr8 125005891 125006379 + 1.5 NA intron (NM_003129, intron 3 of 10) intron (NM_003129, intron 3 of 10) 7630 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 148-8 chr11 11131077 11131187 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 222118 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 263.25-40 chr4 149345510 149345783 + 1.5 NA Intergenic UCON132b|DNA|hAT-Tip100 191351 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 157.75-122 chr4 69585411 69585641 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54116 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 120.5-26 chr10 85578710 85578877 + 1.5 NA intron (NR_038986, intron 1 of 2) L1MD1|LINE|L1 1062 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 258.75-71 chr7 41201839 41202070 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 100350 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 237-49 chr5 148077848 148078047 + 1.5 NA intron (NM_006846, intron 4 of 32) L1MB7|LINE|L1 13967 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 394-2 chr1 151514817 151515218 + 1.5 NA intron (NM_020770, intron 1 of 20) AluSx|SINE|Alu 3630 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 195-21 chr12 13375886 13376052 + 1.5 NA intron (NR_036555, intron 2 of 2) intron (NR_036555, intron 2 of 2) 776 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 200.75-37 chr17 12600256 12600443 + 1.5 NA intron (NR_034145, intron 3 of 3) intron (NR_034145, intron 3 of 3) 50381 NR_034145 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 226-10 chr11 109174268 109174435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -247839 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 249.5-9 chr10 12437358 12437563 + 1.5 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu 48478 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 258.75-8 chr10 55361274 55361520 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -237645 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 243-33 chr2 99533576 99533834 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -43688 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 524.25 chr1 154169747 154170593 + 1.5 NA intron (NM_152263, intron 8 of 9) intron (NM_152263, intron 8 of 9) 8034 NM_001278191 7170 Hs.535581 NM_152263 ENSG00000143549 TPM3 CAPM1|CFTD|HEL-189|HEL-S-82p|NEM1|OK/SW-cl.5|TM-5|TM3|TM30|TM30nm|TM5|TPM3nu|TPMsk3|TRK|hscp30 tropomyosin 3 protein-coding 178.5-91 chr2 225368901 225369094 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30713 NM_001371273 125-43 chr14 102711090 102711196 + 1.5 NA intron (NM_015156, intron 7 of 11) intron (NM_015156, intron 7 of 11) -66306 NM_003300 7187 Hs.510528 NM_003300 ENSG00000131323 TRAF3 CAP-1|CAP1|CD40bp|CRAF1|IIAE5|LAP1|RNF118 TNF receptor associated factor 3 protein-coding 275-33 chr4 66340410 66340722 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 63742 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 116.5-121 chr2 101442880 101443029 + 1.5 NA intron (NM_001367509, intron 4 of 13) L1MD2|LINE|L1 32158 NM_001367510 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 473.5-3 chr3 64977379 64977994 + 1.5 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) MER94B|DNA|hAT-Blackjack -289686 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 191-75 chr7 133620357 133620620 + 1.5 NA intron (NM_021807, intron 9 of 17) L1MB7|LINE|L1 204400 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 189.5-78 chr2 205011208 205011350 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 3 of 21) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 465804 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 221-34 chr2 56383891 56384259 + 1.5 NA intron (NM_001348513, intron 5 of 5) intron (NM_001348513, intron 5 of 5) -198305 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 290.5-43 chr8 142036626 142036937 + 1.5 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -139558 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 301.5-43 chr8 122756325 122756641 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25172 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 333.5-9 chr2 65207770 65208178 + 1.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -19721 NM_001005386 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 123.75-128 chr3 148778001 148778143 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 47892 NM_032049 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 139.25-6 chr1 100457362 100457668 + 1.5 NA intron (NM_001319211, intron 8 of 14) AluJo|SINE|Alu -80624 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 321-35 chrX 40808222 40808515 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 24828 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 262-18 chr14 98046423 98046667 + 1.5 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -68421 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 190-93 chrX 152809982 152810147 + 1.5 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 20693 NM_004344 1069 Hs.82794 NM_004344 ENSG00000147400 CETN2 CALT|CEN2 centrin 2 protein-coding 220-59 chr7 77489715 77489931 + 1.5 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -47472 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 254.25-66 chr8 77426561 77426813 + 1.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -24010 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 288.5-20 chr2 45275198 45275411 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -20363 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 353.5-18 chr7 31658880 31659197 + 1.5 NA TTS (NM_001257968) TTS (NM_001257968) -27979 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 299.25-15 chr14 38946593 38946860 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -29844 NR_039982 283547 Hs.675941 NR_039982 ENSG00000259070 LINC00639 - long intergenic non-protein coding RNA 639 ncRNA 370-5 chr10 55958864 55959146 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -331063 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 256.25-37 chr5 52708367 52708896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79285 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 173.25-95 chr5 10705338 10705566 + 1.5 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 55782 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 146.5-13 chr1 117761683 117761937 + 1.5 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 155762 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 160.75-37 chr13 49088124 49088411 + 1.5 NA intron (NM_001079673, intron 3 of 25) intron (NM_001079673, intron 3 of 25) -22050 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 307.5-23 chr19 50851439 50851685 + 1.5 NA TTS (NR_131203) TTS (NR_131203) -3353 NM_001648 354 Hs.171995 NM_001648 ENSG00000142515 KLK3 APS|KLK2A1|PSA|hK3 kallikrein related peptidase 3 protein-coding 281-23 chr4 47449809 47450127 + 1.5 NA TTS (NM_017845) TTS (NM_017845) 13734 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 206.25-43 chr17 69087289 69087462 + 1.5 NA exon (NM_080284, exon 29 of 39) exon (NM_080284, exon 29 of 39) -12167 NR_049834 100847008 NR_049834 ENSG00000265331 MIR4524B - microRNA 4524b ncRNA 142.5-82 chr16 66920350 66920489 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1534 NM_004062 1014 Hs.513660 NM_004062 ENSG00000166589 CDH16 - cadherin 16 protein-coding 252-63 chr7 21984111 21984340 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -38326 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 339.75-27 chr5 141071789 141072152 + 1.5 NA intron (NR_105056, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 6061 NR_105056 101926905 Hs.570900 NR_105056 LOC101926905 - uncharacterized LOC101926905 ncRNA 233.5-104 chr7 109934925 109935128 + 1.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 25187 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 189-83 chr4 88929273 88929472 + 1.5 NA intron (NM_014883, intron 5 of 23) L1M2|LINE|L1 -106011 NM_001015045 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 185.5-23 chr11 29650465 29650655 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 31758 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 199-6 chr1 198094703 198094906 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62194 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 326.75-19 chr7 42727063 42727412 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20790 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 240-68 chr9 98144281 98144549 + 1.5 NA intron (NM_003389, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR -25193 NM_014788 9830 Hs.575631 NM_014788 ENSG00000106785 TRIM14 - tripartite motif containing 14 protein-coding 263.25-29 chr2 144970483 144970918 + 1.5 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 302733 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 246-3 chr1 65680311 65680672 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -112019 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 267.75-2 chr1 74212239 74212467 + 1.5 NA intron (NM_001112808, intron 3 of 26) L2|LINE|L2 14141 NM_001199328 8790 Hs.480085 NM_003838 ENSG00000254685 FPGT GFPP fucose-1-phosphate guanylyltransferase protein-coding 183.25-116 chr8 137486435 137486643 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -72951 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 161-45 chr15 82268314 82268519 + 1.5 NA intron (NM_001348706, intron 2 of 2) intron (NM_001348706, intron 2 of 2) 5598 NM_001348705 283726 Hs.459117 NM_001008226 ENSG00000188659 SAXO2 FAM154B stabilizer of axonemal microtubules 2 protein-coding 275-39 chr6 53332251 53332496 + 1.5 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) intron (NM_001242830, intron 1 of 6) 5244 NR_046241 647190 Hs.520189 NR_046241 RPS16P5 RPS16_3_702 ribosomal protein S16 pseudogene 5 pseudo 354.25-8 chr22 24854529 24854984 + 1.5 NA intron (NM_001098498, intron 5 of 23) AluJr4|SINE|Alu 48535 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 153.5 chr1 23648593 23648759 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21342 NM_001348075 259283 Hs.523369 NM_001348075 MDS2 - myelodysplastic syndrome 2 translocation associated protein-coding 196.5-52 chr14 78017054 78017224 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -153234 NR_158973 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 261-29 chr2 180511114 180511447 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -180824 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 295-35 chrX 100101625 100101976 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 308473 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 459.25 chr10 58378354 58378891 + 1.5 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -6521 NR_073073 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 270-12 chr12 13152876 13153232 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -43672 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 169.75-22 chr10 95159960 95160268 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34086 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 229-64 chr5 37369769 37369958 + 1.5 NA intron (NM_001278312, intron 1 of 33) intron (NM_001278312, intron 1 of 33) 1243 NM_153485 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 213.75-52 chr2 119679225 119679427 + 1.5 NA 5' UTR (NM_001105198, exon 1 of 2) 5' UTR (NM_001105198, exon 1 of 2) 125 NM_030577 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 403.5-9 chr7 9749582 9749910 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 115476 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 352-12 chr8 46045747 46046027 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 571756 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 243-30 chr17 54059677 54059890 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 236856 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 163.25-8 chr1 102581290 102581490 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 527106 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 310.5-15 chr18 11700475 11700815 + 1.5 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) 11381 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 263.5-27 chr18 589740 590160 + 1.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -7048 NM_014410 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 276-12 chr11 57404776 57405123 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -14299 NM_001302927 5553 Hs.512633 NM_002728 ENSG00000186652 PRG2 BMPG|MBP|MBP1|proMBP proteoglycan 2, pro eosinophil major basic protein protein-coding 156-88 chr2 163093048 163093209 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -254361 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 244-9 chr12 1389770 1390037 + 1.5 NA intron (NR_027948, intron 16 of 19) intron (NR_027948, intron 16 of 19) -110588 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 206.75-96 chr8 125327304 125327557 + 1.5 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -102928 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 291.5-47 chr7 55439054 55439287 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 73722 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 329-28 chr4 92704912 92705168 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 400641 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 275.25-45 chr8 99547908 99548174 + 1.5 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) intron (NM_017890, intron 30 of 61) -11180 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 250-38 chr3 173115705 173116056 + 1.5 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) intron (NM_031955, intron 2 of 10) 25355 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 301.75-3 chr10 78387385 78387757 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 120229 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 182.75-58 chr17 76828520 76828727 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27543 NR_135284 283994 Hs.645372 NR_135283 ENSG00000267535 LINC00868 C17orf52 long intergenic non-protein coding RNA 868 ncRNA 382.75 chr11 80740007 80740566 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22517 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 388.75-6 chr4 88433324 88434039 + 1.5 NA intron (NM_001165136, intron 16 of 21) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -23438 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 379-7 chr3 119506029 119506310 + 1.5 NA intron (NM_016589, intron 4 of 6) intron (NM_016589, intron 4 of 6) 7622 NM_016589 51300 Hs.477287 NM_016589 ENSG00000113845 TIMMDC1 C3orf1|MC1DN31 translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 protein-coding 328.5-2 chr1 93214474 93214735 + 1.5 NA intron (NM_001306076, intron 11 of 28) intron (NM_001306076, intron 11 of 28) 33888 NM_206886 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 247.5-11 chr11 113593363 113593609 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 112822 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 282-42 chr5 165734059 165734359 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 1192161 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 373-9 chr21 42312099 42312433 + 1.5 NA exon (NM_003226, exon 3 of 3) exon (NM_003226, exon 3 of 3) 3330 NM_003226 7033 Hs.82961 NM_003226 ENSG00000160180 TFF3 ITF|P1B|TFI trefoil factor 3 protein-coding 208.25-22 chr12 39340764 39341096 + 1.5 NA exon (NM_001173463, exon 14 of 34) exon (NM_001173463, exon 14 of 34) 102190 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 296.5-12 chr15 63057670 63057920 + 1.5 NA intron (NM_000366, intron 3 of 9) intron (NM_000366, intron 3 of 9) -8408 NR_147233 111064646 Hs.602995 NR_147233 TPM1-AS TPM1-AS1 TPM1 antisense RNA ncRNA 155.25-76 chr16 78762045 78762370 + 1.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MIRb|SINE|MIR 662553 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 213.5-42 chr16 3377406 3377576 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4823 NM_001190476 100463285 NM_001190476 ENSG00000232196 MTRNR2L4 HN4 MT-RNR2 like 4 protein-coding 244.25-19 chr2 51301397 51301835 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 269015 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 235.5-52 chr2 213595896 213596088 + 1.5 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -162075 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 187-62 chr3 114062859 114062999 + 1.5 NA intron (NM_024638, intron 2 of 9) intron (NM_024638, intron 2 of 9) 6192 NM_001256835 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 343.5-24 chr8 59474793 59475156 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 355764 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 234.5-46 chr2 117433512 117433776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -381047 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 252-34 chr2 39400406 39400629 + 1.5 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) L1MD|LINE|L1 36768 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 119.25-11 chr1 110727644 110727836 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52800 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 250.5-46 chr2 68760206 68760391 + 1.5 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 -14612 NM_014882 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 258.25-36 chr3 152470834 152471051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -129952 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 217-14 chr11 114709368 114709684 + 1.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 30999 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 460-7 chr8 83976790 83977486 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -205649 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 161-88 chr5 8551912 8552105 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91083 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 188-46 chr3 99378842 99379037 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -259655 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 125.5-75 chr14 37200075 37200209 + 1.5 NA intron (NM_138731, intron 1 of 13) intron (NM_138731, intron 1 of 13) 2205 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 322.5-18 chr2 232238033 232238259 + 1.5 NA intron (NR_046477, intron 9 of 18) intron (NR_046477, intron 9 of 18) 65493 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 273-28 chr2 52225571 52225801 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -144962 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 193-41 chr2 112741550 112741709 + 1.5 NA intron (NR_130712, intron 8 of 9) intron (NR_130712, intron 8 of 9) 20143 NM_001350494 284958 Hs.589714 NM_001350494 ENSG00000144130 NT5DC4 - 5'-nucleotidase domain containing 4 protein-coding 321-2 chr1 217067357 217067692 + 1.5 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 9468 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 284-27 chr2 80913708 80914040 + 1.5 NA Intergenic LTR52-int|LTR|ERVL 553072 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 198-3 chr1 54770278 54770537 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5884 NM_152268 25973 Hs.380169 NM_152268 ENSG00000162396 PARS2 EIEE75|MT-PRORS|proRS prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 159.25-59 chr18 80117847 80118098 + 1.5 NA intron (NM_014913, intron 2 of 3) intron (NM_014913, intron 2 of 3) 8710 NM_014913 22850 Hs.131915 NM_014913 ENSG00000101544 ADNP2 ZNF508 ADNP homeobox 2 protein-coding 267.75-49 chr6 99794659 99794957 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 188034 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 371.25-9 chr2 151367945 151368312 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_039931) promoter-TSS (NR_039931) -206 NR_039931 100616392 NR_039931 ENSG00000264684 MIR4773-1 - microRNA 4773-1 ncRNA 404.25-4 chr12 4175370 4176012 + 1.5 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -98071 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 357.5-13 chr2 228799213 228799548 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -187985 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 204.75-18 chr10 75474587 75474801 + 1.5 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 43070 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 381.5-6 chr5 172266591 172267022 + 1.5 NA intron (NM_152277, intron 1 of 2) AluJr4|SINE|Alu 16958 NM_152277 92181 Hs.131570 NM_152277 ENSG00000168246 UBTD2 DCUBP ubiquitin domain containing 2 protein-coding 227.25-77 chr8 40804263 40804470 + 1.5 NA intron (NM_024645, intron 2 of 6) L1MC1|LINE|L1 93460 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 177.25-134 chr7 40386254 40386548 + 1.5 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 251425 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 309-6 chr10 72155266 72155644 + 1.5 NA intron (NM_001369110, intron 6 of 8) L1ME2|LINE|L1 60501 NM_001369111 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 250-48 chr5 82423789 82424273 + 1.5 NA Intergenic ORSL-2a|DNA|hAT-Tip100 144569 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 183-62 chr21 22452951 22453085 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 354401 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 199-24 chr14 87608874 87609119 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 46298 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 253.5-30 chr16 62794865 62795100 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -758544 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 257.5-36 chr2 161822546 161822783 + 1.5 NA intron (NM_001354443, intron 4 of 25) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 198248 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 478 chr1 63916615 63917093 + 1.5 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 142837 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 235.25-14 chr12 22933172 22933424 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -242338 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 271.5-78 chr6 142356638 142356867 + 1.5 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) MIR3|SINE|MIR 54745 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 405-14 chr5 85702683 85702997 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -579604 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 412.5-5 chr15 71528671 71529145 + 1.5 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -18328 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 166.5-66 chr14 66899839 66900039 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1ME1|LINE|L1 -289501 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 417-2 chr1 223174102 223174591 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -31098 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 247.25-7 chr10 123206018 123206211 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51712 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 229.5-43 chr14 78697478 78697672 + 1.5 NA intron (NR_073547, intron 6 of 20) intron (NR_073547, intron 6 of 20) 293856 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 273.5-59 chr5 35081961 35082291 + 1.5 NA intron (NM_001204314, intron 2 of 6) intron (NM_001204314, intron 2 of 6) -34177 NM_001306173 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 278.25-18 chr15 82172624 82172904 + 1.5 NA intron (NM_001040610, intron 13 of 17) MER20B|DNA|hAT-Charlie 84170 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 367.5-15 chr3 116251135 116251548 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -108683 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 270-28 chr2 204694305 204694506 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 148930 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 131.25-138 chr3 94722198 94722380 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -215974 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 264.75-29 chr3 62213728 62213979 + 1.5 NA intron (NM_002841, intron 12 of 29) intron (NM_002841, intron 12 of 29) 105094 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 392.5-8 chr21 18816121 18816412 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56454 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 181.5-66 chr19 41267797 41267957 + 1.5 NA intron (NM_001301016, intron 1 of 14) intron (NM_001301016, intron 1 of 14) 2796 NM_001301016 11100 Hs.155218 NM_007040 ENSG00000105323 HNRNPUL1 E1B-AP5|E1BAP5|HNRPUL1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1 protein-coding 250.5-29 chr14 96079728 96079995 + 1.5 NA intron (NM_001282463, intron 2 of 2) intron (NM_001282463, intron 2 of 2) 40499 NM_001252507 56967 Hs.6434 NM_020215 ENSG00000227051 C14orf132 C14orf88 chromosome 14 open reading frame 132 protein-coding 208.5-131 chr7 84867628 84867809 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 254213 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 181.5-33 chr12 50456291 50456471 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_132753) promoter-TSS (NR_132753) -190 NR_132753 106633800 NR_132753 SNORD133 ZL142|ZL42|ggn68 small nucleolar RNA, C/D box 133 snoRNA 245-71 chr8 136954904 136955080 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 424194 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 183.75-127 chr8 109582224 109582403 + 1.5 NA intron (NM_001099754, intron 4 of 6) intron (NM_001099754, intron 4 of 6) 21146 NM_001363032 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 332.25-19 chr2 157609434 157609901 + 1.5 NA intron (NM_145259, intron 1 of 8) L1MA4A|LINE|L1 -12107 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 210.5-145 chrX 16352469 16352710 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 185108 NM_001277307 645864 Hs.632792 NM_001277307 ENSG00000182798 MAGEB17 - MAGE family member B17 protein-coding 139.5-177 chr5 62136874 62137002 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -169224 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 205.75-67 chr5 112795793 112796108 + 1.5 NA intron (NM_001354895, intron 7 of 15) HAL1|LINE|L1 58065 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 268.5-53 chr6 37269802 37270084 + 1.5 NA intron (NR_130108, intron 2 of 12) intron (NR_130108, intron 2 of 12) -11788 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 191.25-92 chr6 145912478 145912686 + 1.5 NA intron (NM_001370328, intron 26 of 31) intron (NM_001370328, intron 26 of 31) 51515 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 118-165 chr6 107360666 107360780 + 1.5 NA intron (NM_020381, intron 1 of 7) intron (NM_020381, intron 1 of 7) 98841 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 285.75-38 chr6 168410524 168410756 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30544 NM_022138 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 344-15 chr3 148285 148605 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48151 NM_001253387 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 487.75 chr5 44486814 44487243 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 23254 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 285.5-12 chr12 33844120 33844434 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -178219 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 189.75-71 chr3 43360761 43360975 + 1.5 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -8906 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 200.5-69 chr2 103542531 103542688 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -558180 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 191-14 chr12 13935226 13935382 + 1.5 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 45052 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 204.75-45 chr16 56773593 56773864 + 1.5 NA intron (NM_014669, intron 3 of 21) intron (NM_014669, intron 3 of 21) -8101 NM_001242795 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 420.5-7 chr2 100015381 100015833 + 1.5 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) intron (NM_001025108, intron 2 of 23) 89976 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 324-2 chr1 115204823 115205101 + 1.5 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -78072 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 343-23 chr4 38667836 38668303 + 1.5 NA intron (NM_016531, intron 1 of 5) intron (NM_016531, intron 1 of 5) -3441 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-37 chr14 70991803 70991985 + 1.5 NA intron (NM_014982, intron 7 of 35) intron (NM_014982, intron 7 of 35) 84435 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 319-14 chr18 21112262 21112515 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_005406) promoter-TSS (NM_005406) -575 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 181.25-77 chr21 30425974 30426327 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_181622) promoter-TSS (NM_181622) -224 NM_181622 337960 Hs.553687 NM_181622 ENSG00000240432 KRTAP13-3 KAP13.3 keratin associated protein 13-3 protein-coding 225-25 chr13 76695709 76695906 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 190598 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 269-38 chr4 131614824 131615057 + 1.5 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -149898 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 231.75-41 chr2 142800246 142800519 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -77282 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 243.75 chr1 40828658 40828866 + 1.5 NA intron (NM_004700, intron 9 of 13) intron (NM_004700, intron 9 of 13) 33601 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 169.25-94 chr5 20242260 20242562 + 1.5 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MA7|LINE|L1 -63140 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 333.5-20 chr8 71670938 71671251 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -123000 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 213.75-38 chr15 49431551 49431805 + 1.5 NA intron (NM_002009, intron 2 of 3) intron (NM_002009, intron 2 of 3) 8436 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 244.5-32 chr16 21292295 21292580 + 1.5 NA intron (NM_001888, intron 1 of 9).2 L1M5|LINE|L1 -8412 NR_026675 400508 Hs.578949 NM_001101368 CRYM-AS1 NCRNA00169 CRYM antisense RNA 1 ncRNA 274.5-55 chr5 109885709 109886045 + 1.5 NA TTS (NR_033175) TTS (NR_033175) 2695 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 219.75-49 chr3 96316030 96316247 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -43826 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 219.25-72 chr7 50596447 50596848 + 1.5 NA intron (NM_001350816, intron 16 of 17) L1MC4|LINE|L1 -31242 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 248.25-70 chr8 72349571 72349857 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -98080 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 373-5 chr2 34410037 34410376 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -267351 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 186.25-92 chr5 129104555 129104705 + 1.5 NA intron (NM_016048, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 6942 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 231.75-7 chr1 221987645 221987855 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9230 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 245.5-35 chr2 85918727 85919033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 29600 NR_110569 101928113 Hs.625888 NR_110569 ST3GAL5-AS1 - ST3GAL5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 262.5-59 chr4 178687521 178687805 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -779727 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 364-14 chr4 108909853 108910179 + 1.5 NA intron (NM_198721, intron 12 of 36) MER115|DNA|hAT-Tip100 -146963 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 273-61 chr9 101849617 101849903 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -111180 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 300.5-43 chr6 130402421 130402792 + 1.5 NA intron (NM_001258277, intron 2 of 2) intron (NM_001258277, intron 2 of 2) -18490 NM_001258278 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 261-43 chr5 14237653 14237877 + 1.5 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 94423 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 332.5-18 chr22 26264405 26264663 + 1.5 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 95060 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 296.5-4 chr1 231959177 231959561 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001164542, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001164542, exon 10 of 10) 33535 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 530.75 chr6 159002267 159002931 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2397 NM_031924 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 269.25-47 chr6 122038783 122039021 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -360649 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 372-6 chr14 44000776 44001084 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 506353 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 197.5-172 chr9 75655007 75655214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -235534 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 331.25-26 chr9 101890079 101890465 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -151692 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 324-32 chr8 135097178 135097514 + 1.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -136785 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 315-24 chr8 58261417 58261784 + 1.5 NA intron (NR_105005, intron 2 of 7) intron (NR_105005, intron 2 of 7) 10501 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 190-85 chr8 141062367 141062605 + 1.5 NA Intergenic (GGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -60407 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 255-17 chr15 74033226 74033554 + 1.5 NA exon (NM_033238, exon 6 of 9) exon (NM_033238, exon 6 of 9) 38674 NM_033247 5371 Hs.526464 NM_002675 ENSG00000140464 PML MYL|PP8675|RNF71|TRIM19 promyelocytic leukemia protein-coding 293.5-11 chr12 116583050 116583372 + 1.5 NA Intergenic MER123|DNA?|DNA? 23830 NM_001085481 643246 Hs.356061 NM_001085481 ENSG00000258102 MAP1LC3B2 ATG8G microtubule associated protein 1 light chain 3 beta 2 protein-coding 320.5-27 chr22 26630083 26630332 + 1.5 NA intron (NM_001886, intron 5 of 5) L2b|LINE|L2 8244 NM_001886 1413 Hs.57690 NM_001886 ENSG00000196431 CRYBA4 CTRCT23|CYRBA4|MCOPCT4 crystallin beta A4 protein-coding 160.75-124 chr5 107299708 107299993 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -288836 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 311.5-24 chr4 28094547 28094785 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -724916 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 361-2 chr10 74340381 74340805 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) intron (NM_001369124, intron 4 of 9) 163830 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 170.5-78 chr18 67872947 67873105 + 1.5 NA intron (NR_033921, intron 3 of 4) intron (NR_033921, intron 3 of 4) -58204 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 151.25-143 chr4 111665169 111665322 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -480209 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 283-36 chr5 95575154 95575443 + 1.5 NA intron (NM_198150, intron 3 of 7) L1MA3|LINE|L1 20197 NM_198150 153642 Hs.585051 NM_198150 ENSG00000164291 ARSK TSULF arylsulfatase family member K protein-coding 218.5-109 chr6 119773874 119774097 + 1.5 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 224177 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 346.5-12 chr19 9819693 9820028 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_017703) promoter-TSS (NM_017703) -781 NM_001316942 54850 Hs.12439 NM_017703 ENSG00000127452 FBXL12 Fbl12 F-box and leucine rich repeat protein 12 protein-coding 351-20 chr5 55840517 55840853 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -10672 NM_139017 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 430.25-7 chr3 133770753 133771189 + 1.5 NA intron (NM_001063, intron 14 of 16) L1MC4|LINE|L1 -13052 NM_021203 58477 Hs.12152 NM_021203 ENSG00000144867 SRPRB APMCF1|SR-beta SRP receptor subunit beta protein-coding 559.5-3 chr5 62318007 62318395 + 1.5 NA intron (NM_001243952, intron 2 of 20) AluSc5|SINE|Alu 12039 NM_001098511 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 153-117 chr5 36899767 36899875 + 1.5 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 23052 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 154-115 chr6 44330460 44330610 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12125 NM_145026 221409 Hs.135283 NM_145026 ENSG00000249481 SPATS1 DDIP|SPATA8|SRSP1 spermatogenesis associated serine rich 1 protein-coding 223.25-48 chr21 29418318 29418529 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45922 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 374.25-4 chr17 30810786 30811206 + 1.5 NA intron (NM_015986, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 13696 NM_015986 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 276.5-39 chr20 4646636 4646881 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -39698 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 285.25-29 chr5 41286081 41286379 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24761 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 306-37 chr8 99146319 99146759 + 1.5 NA intron (NM_017890, intron 13 of 61) intron (NM_017890, intron 13 of 61) 133273 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 221.25-79 chr6 122955065 122955245 + 1.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -41080 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 127.75-18 chr1 118147015 118147185 + 1.5 NA intron (NM_206996, intron 3 of 48) L2a|LINE|L2 38128 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 157.5-126 chr22 26710103 26710347 + 1.5 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) MER53|DNA|hAT 37382 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 279.75-38 chr4 84837797 84838095 + 1.5 NA intron (NM_014991, intron 6 of 67) L2c|LINE|L2 -127670 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 273.25-39 chr8 123251478 123251733 + 1.5 NA intron (NR_037874, intron 2 of 2) intron (NR_037874, intron 2 of 2) -10228 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 115.25-188 chr7 73706830 73707015 + 1.5 NA intron (NM_001165903, intron 3 of 9) intron (NM_001165903, intron 3 of 9) -4395 NR_036247 100422948 NR_036247 ENSG00000265724 MIR4284 mir-4284 microRNA 4284 ncRNA 319.5-37 chr6 134799189 134799564 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 150725 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 121.75-147 chr5 50863223 50863404 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 106874 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 203.5-86 chr21 42972734 42972939 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1674 NM_001286258 5316 Hs.431043 NM_004571 ENSG00000160199 PKNOX1 PREP1|pkonx1c PBX/knotted 1 homeobox 1 protein-coding 296-45 chr8 118942784 118943083 + 1.5 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8952 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 253.25-35 chr2 239624244 239624497 + 1.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -138490 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 357.75-14 chr4 144469337 144469712 + 1.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 176495 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 231.5-92 chr7 53305719 53305978 + 1.5 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 270215 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 230.25-39 chr2 53568955 53569134 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -198739 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 314-6 chr13 84482051 84482363 + 1.5 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) intron (NR_046871, intron 3 of 6) -301447 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 373-3 chr10 114122585 114122972 + 1.5 NA non-coding (NR_135815, exon 16 of 16) non-coding (NR_135815, exon 16 of 16) 51401 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 428.5-4 chr14 69387284 69387582 + 1.5 NA intron (NM_004450, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 10866 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 174.5-169 chr7 15868292 15868450 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 179993 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 237-73 chr9 117447312 117447684 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32441 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 256-51 chr4 56599165 56599447 + 1.5 NA intron (NM_001256475, intron 7 of 8) AluJb|SINE|Alu 57216 NM_001145459 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 265.5-55 chr6 166039951 166040165 + 1.5 NA Intergenic (ATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -52019 NR_026860 90632 Hs.31917 NR_026860 ENSG00000112541 LINC00473 C6orf176|LNC473|bA142J11.1 long intergenic non-protein coding RNA 473 ncRNA 275.75-7 chr11 103995432 103995826 + 1.5 NA intron (NM_025208, intron 3 of 6) intron (NM_025208, intron 3 of 6) -41011 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 291.5-21 chr2 125280570 125280882 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 837259 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 222.5-37 chr16 71581171 71581365 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -4176 NM_000353 6898 Hs.161640 NM_000353 ENSG00000198650 TAT - tyrosine aminotransferase protein-coding 230.5-82 chr3 179654929 179655246 + 1.5 NA intron (NM_003940, intron 1 of 20) intron (NM_003940, intron 1 of 20) 2047 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 169-97 chr7 36968839 36969028 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) L1ME4a|LINE|L1 16179 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 242.75-3 chr1 153439270 153439525 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16814 NM_001319198 6279 Hs.416073 NM_002964 ENSG00000143546 S100A8 60B8AG|CAGA|CFAG|CGLA|CP-10|L1Ag|MA387|MIF|MRP8|NIF|P8 S100 calcium binding protein A8 protein-coding 297.75-38 chr6 34675138 34675438 + 1.5 NA intron (NM_022758, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu -20866 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 272.5-16 chr11 102870042 102870418 + 1.5 NA intron (NM_002426, intron 4 of 9) intron (NM_002426, intron 4 of 9) 4752 NM_002426 4321 Hs.1695 NM_002426 ENSG00000262406 MMP12 HME|ME|MME|MMP-12 matrix metallopeptidase 12 protein-coding 205.75-58 chr4 119698557 119698802 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69875 NM_001083 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 161.5-56 chr14 49731778 49731976 + 1.5 NA intron (NM_172193, intron 8 of 12) intron (NM_172193, intron 8 of 12) -36276 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 214.75-69 chr6 37326751 37326899 + 1.5 NA intron (NR_130108, intron 12 of 12) intron (NR_130108, intron 12 of 12) -27158 NM_003958 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 180-83 chr3 98534080 98534261 + 1.5 NA 3' UTR (NM_005290, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_005290, exon 1 of 1) 2192 NM_005290 2838 Hs.162987 NM_005290 ENSG00000154165 GPR15 BOB G protein-coupled receptor 15 protein-coding 241-15 chr14 52027736 52027991 + 1.5 NA intron (NM_007361, intron 11 of 21) AluSc5|SINE|Alu 38317 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 367-7 chr2 149528332 149528721 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -58832 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 315-8 chr14 40001229 40001584 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -568906 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 131.5-149 chr3 28605539 28605682 + 1.5 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) L1ME3G|LINE|L1 30332 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 122-60 chr14 82807075 82807192 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 164501 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 261.25-4 chr11 94256892 94257096 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -48643 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 203.75-14 chr10 108964904 108965233 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -895775 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 352-10 chr3 120337345 120337662 + 1.5 NA intron (NM_001099678, intron 1 of 3) intron (NM_001099678, intron 1 of 3) 11851 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 196-50 chr2 67876627 67876858 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51180 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 232.75-23 chr14 69252429 69252663 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7612 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 241-45 chr6 50899005 50899256 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 80259 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 120-148 chr5 123723108 123723191 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 177732 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 115-115 chr3 169985622 169985789 + 1.5 NA intron (NM_003262, intron 5 of 7) intron (NM_003262, intron 5 of 7) 18898 NM_003262 7095 Hs.744859 NM_003262 ENSG00000008952 SEC62 Dtrp1|HTP1|TLOC1|TP-1 SEC62 homolog, preprotein translocation factor protein-coding 334-22 chr4 94534919 94535336 + 1.5 NA intron (NM_001011516, intron 3 of 9) L2|LINE|L2 83185 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 353-6 chr2 12918899 12919193 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 87967 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 192-3 chr1 37409878 37410035 + 1.5 NA Intergenic Helitron2Na_Mam|RC?|Helitron? 64487 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 161.25-47 chr14 39217283 39217448 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -16550 NM_001329214 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 308-23 chr4 91724888 91725353 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 552182 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 268.25-26 chr2 177559122 177559303 + 1.5 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -6416 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 164.5-85 chr18 42582580 42582789 + 1.5 NA intron (NR_046174, intron 7 of 9) intron (NR_046174, intron 7 of 9) 396016 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 263-36 chr4 39254406 39254650 + 1.5 NA intron (NM_025132, intron 26 of 36) intron (NM_025132, intron 26 of 36) 71999 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 223-16 chr12 4651683 4651985 + 1.5 NA intron (NM_005002, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 2720 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 482.75-2 chr2 127613786 127614455 + 1.5 NA intron (NM_001080527, intron 25 of 46) intron (NM_001080527, intron 25 of 46) -31744 NM_001161415 2840 Hs.46453 NM_005291 ENSG00000144230 GPR17 - G protein-coupled receptor 17 protein-coding 267.75-31 chr2 184743783 184744048 + 1.5 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 145386 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 247-31 chr2 75105770 75106120 + 1.5 NA intron (NM_015727, intron 2 of 3) L1MC3|LINE|L1 15133 NR_049796 100846995 NR_049796 ENSG00000263909 MIR5000 - microRNA 5000 ncRNA 379.5-7 chr14 45616250 45616604 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 99175 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 209-70 chr8 83626233 83626519 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 222618 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 268.25-44 chr7 45884891 45885338 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3374 NM_000596 3484 Hs.642938 NM_000596 ENSG00000146678 IGFBP1 AFBP|IBP1|IGF-BP25|PP12|hIGFBP-1 insulin like growth factor binding protein 1 protein-coding 271-33 chr4 45946701 45946893 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 177257 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 219-15 chr11 38361919 38362164 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 284315 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 295 chr1 35775391 35775800 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5617 NM_001330490 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 209.5-46 chr14_GL000225v1_random 116895 117186 + 1.5 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 240.75-58 chr4 65549614 65549914 + 1.5 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 119724 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 474-3 chr8 77162962 77163379 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -162126 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 282.75-23 chr2 214830269 214830582 + 1.5 NA intron (NR_110292, intron 1 of 3) intron (NR_110292, intron 1 of 3) -16522 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 299-31 chr7 10863023 10863313 + 1.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 76985 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 287.25-27 chr2 127914084 127914453 + 1.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -28328 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 151.5-90 chr2 176213297 176213468 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24424 NR_033979 401022 Hs.98661 NR_033979 ENSG00000224189 HAGLR HOXD-AS1|MIR7704HG|Mdgt HOXD antisense growth-associated long non-coding RNA ncRNA 268.75-3 chr10 117756354 117756667 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -211442 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 241.75-18 chr12 12247952 12248271 + 1.5 NA intron (NM_002336, intron 1 of 22).2 intron (NM_002336, intron 1 of 22).2 18933 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 228-73 chr7 112714792 112714971 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75512 NM_022484 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 248.5-106 chr8 140274858 140275112 + 1.5 NA intron (NM_001160372, intron 15 of 22) LTR101_Mam|LTR|ERVL -174450 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 211-45 chr4 45116965 45117198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -390447 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 216-60 chr4 30510706 30510877 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -209578 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 264.75-34 chr4 16335366 16335719 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 108879 NR_027696 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 287.25-21 chr15 56649507 56649820 + 1.5 NA intron (NM_001002843, intron 18 of 20) intron (NM_001002843, intron 18 of 20) 84423 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 330.75-6 chr12 13369603 13370002 + 1.5 NA TTS (NR_036555) TTS (NR_036555) 6943 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 171 chr1 14739164 14739326 + 1.5 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) 140528 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 420.5-11 chr5 33476470 33476785 + 1.5 NA Intergenic MER34D|LTR|ERV1 35851 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 218-55 chr5 12963128 12963343 + 1.5 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 69651 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 198.5-119 chr5 99108406 99108660 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -178819 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 314.75-20 chr8 114395124 114395558 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -958402 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 293.25-30 chr7 83486384 83486680 + 1.5 NA intron (NM_001178129, intron 2 of 16) intron (NM_001178129, intron 2 of 16) 154899 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 513.75 chr1 79532584 79533165 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -526144 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 227-24 chr14 96505360 96505616 + 1.5 NA intron (NM_001293628, intron 1 of 21) L3|LINE|CR1 2623 NM_001293628 10914 Hs.253726 NM_032632 ENSG00000090060 PAPOLA PAP|PAP-alpha poly(A) polymerase alpha protein-coding 230.5-27 chr12 50675703 50675983 + 1.5 NA intron (NM_173602, intron 7 of 37) intron (NM_173602, intron 7 of 37) -88258 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 304-13 chr12 54533342 54533637 + 1.5 NA intron (NM_001184976, intron 26 of 30) intron (NM_001184976, intron 26 of 30) -15904 NM_001288768 5153 Hs.530871 NM_000924 ENSG00000123360 PDE1B HEL-S-79p|PDE1B1|PDES1B phosphodiesterase 1B protein-coding 302.5-8 chr11 87099509 87099792 + 1.5 NA intron (NM_001168724, intron 4 of 13) L1MD1|LINE|L1 61716 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 284-48 chr8 132019422 132019733 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 39805 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 184.5-170 chr9 116102887 116103047 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -50824 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 365.5-4 chr14 48554839 48555209 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -760010 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 154.5-144 chr5 12931793 12931900 + 1.5 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 101040 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 190.5-108 chr4 38501393 38501574 + 1.5 NA intron (NR_110951, intron 1 of 7) intron (NR_110951, intron 1 of 7) -8284 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 323-14 chr20 1667282 1667531 + 1.5 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 -9627 NM_018556 55423 Hs.590883 NM_018556 ENSG00000089012 SIRPG CD172g|SIRP-B2|SIRPB2|SIRPgamma|bA77C3.1 signal regulatory protein gamma protein-coding 209.5-18 chr11 24525947 24526147 + 1.5 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 28994 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 295.5-45 chr4 168627817 168628046 + 1.5 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) L1ME4b|LINE|L1 -3647 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 149.25-168 chr7 75906258 75906510 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8771 NM_000941 5447 Hs.354056 NM_000941 ENSG00000127948 POR CPR|CYPOR|P450R cytochrome p450 oxidoreductase protein-coding 141-109 chr3 193096421 193096529 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -144747 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 189-31 chr13 21997216 21997384 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -119140 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 290.5-37 chr5 146120711 146121119 + 1.5 NA intron (NM_016460, intron 29 of 30) MIRb|SINE|MIR -15338 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 197.5-130 chr5 126997003 126997248 + 1.5 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) intron (NM_178450, intron 1 of 4) 33433 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 182.25-8 chr1 192020708 192020926 + 1.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -137645 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 386.75-6 chr4 85091284 85091875 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 124095 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 239.25-41 chr18 60215136 60215492 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 157461 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 235.5-74 chr6 69599156 69599441 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 197168 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 178-81 chr5 119754536 119754703 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 125060 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 188.25-94 chr5 99778660 99778842 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 244761 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 133-31 chr12 50863178 50863356 + 1.5 NA intron (NM_182559, intron 3 of 4) L1MD|LINE|L1 20341 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 270.75-23 chr17 57857476 57857680 + 1.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -7534 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 292.5-58 chrX 82147024 82147379 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 945099 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 240.75-79 chr9 27807346 27807580 + 1.5 NA Intergenic LTR46-int|LTR|ERV1 -233597 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 377.75-4 chr18 5884637 5885066 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11103 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 214-36 chr2 214741484 214741783 + 1.5 NA intron (NM_001282549, intron 3 of 4) intron (NM_001282549, intron 3 of 4) 68050 NR_104215 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 277-43 chrX 19596146 19596376 + 1.5 NA intron (NM_001024666, intron 8 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 74738 NM_001353897 30011 Hs.726365 NM_031892 ENSG00000147010 SH3KBP1 AGMX2|CD2BP3|CIN85|GIG10|HSB-1|HSB1|IMD61|MIG18 SH3 domain containing kinase binding protein 1 protein-coding 244.5-86 chr6 155686457 155686708 + 1.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 171738 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 260.75-11 chr13 71857856 71858029 + 1.5 NA intron (NM_080759, intron 1 of 10) intron (NM_080759, intron 1 of 10) 9250 NM_080760 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 255.5-54 chr3 65999364 65999630 + 1.5 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) 39421 NM_001365905 9223 Hs.476636 NM_004742 ENSG00000151276 MAGI1 AIP-3|AIP3|BAIAP1|BAP-1|BAP1|MAGI-1|MAGI-1b|Magi1d|TNRC19|WWP3 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 1 protein-coding 241.5-97 chr8 99937280 99937444 + 1.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -43655 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 202.75-2 chr1 42418993 42419131 + 1.5 NA 3' UTR (NM_173642, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_173642, exon 5 of 5) 36960 NM_032257 84217 Hs.294009 NM_032257 ENSG00000066185 ZMYND12 - zinc finger MYND-type containing 12 protein-coding 230.25-74 chr7 90333108 90333340 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -1999 NR_110085 101927446 Hs.734999 NR_110085 ENSG00000105793 LOC101927446 - uncharacterized LOC101927446 ncRNA 162-50 chr17 62574283 62574471 + 1.5 NA exon (NM_001284333, exon 13 of 23) exon (NM_001284333, exon 13 of 23) -53293 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 321.75-10 chr15 67892728 67893002 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -52820 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 264.75-59 chr8 104672710 104672997 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -83829 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 254.5-86 chrX 132951156 132951361 + 1.5 NA intron (NM_001077188, intron 3 of 5) intron (NM_001077188, intron 3 of 5) 10112 NM_147175 90161 Hs.385956 NM_147175 ENSG00000171004 HS6ST2 MRXSPM heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 protein-coding 117-3 chr1 37823351 37823569 + 1.5 NA intron (NM_005955, intron 8 of 10) AluJb|SINE|Alu -15252 NM_024640 79693 Hs.301564 NM_024640 ENSG00000196449 YRDC DRIP3|IRIP|SUA5 yrdC N6-threonylcarbamoyltransferase domain containing protein-coding 309.75-40 chr9 131452520 131452891 + 1.5 NA intron (NM_013318, intron 8 of 30) intron (NM_013318, intron 8 of 30) 22615 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 163.5-15 chr1 214329912 214330094 + 1.5 NA intron (NM_020197, intron 7 of 11) intron (NM_020197, intron 7 of 11) 48844 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 304-17 chr16 67089420 67089731 + 1.5 NA intron (NM_001755, intron 5 of 5) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -20366 NM_001320543 80262 Hs.513666 NM_025187 ENSG00000125149 C16orf70 C16orf6|LIN10|lin-10 chromosome 16 open reading frame 70 protein-coding 353-13 chr2 228063013 228063435 + 1.5 NA intron (NM_030623, intron 3 of 10) (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118421 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 207.25-82 chr6 10954510 10954665 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_125851) promoter-TSS (NR_125851) -498 NR_125851 101928191 Hs.638939 NR_125851 LOC101928191 - uncharacterized LOC101928191 ncRNA 258.75-47 chr3 36009791 36010125 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 265482 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 203.75-84 chr5 39542891 39543120 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22574 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 174-81 chr6 62416355 62416592 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -130246 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 317.25-3 chr1 106033789 106034117 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -5700 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 277.5-32 chr2 79394777 79395188 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105862 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 218.75-45 chr20 37311053 37311312 + 1.5 NA intron (NM_022077, intron 3 of 3) intron (NM_022077, intron 3 of 3) 21527 NM_001369743 63905 Hs.6126 NM_022077 ENSG00000101363 MANBAL - mannosidase beta like protein-coding 292-8 chr11 42111119 42111330 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25766 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 148-141 chr9 128694202 128694313 + 1.5 NA intron (NM_001122821, intron 7 of 7) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4282 NM_001248001 6418 Hs.436687 NM_003011 ENSG00000119335 SET 2PP2A|I2PP2A|IGAAD|IPP2A2|MRD58|PHAPII|TAF-I|TAF-IBETA SET nuclear proto-oncogene protein-coding 148.75-126 chr4 152488642 152488752 + 1.5 NA TTS (NR_036092) TTS (NR_036092) 719 NR_036092 100422896 NR_036092 ENSG00000264678 MIR3140 mir-3140 microRNA 3140 ncRNA 233.75-27 chr15 54224654 54224911 + 1.5 NA intron (NM_001329919, intron 4 of 31) L1MA3|LINE|L1 212134 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 322.5-37 chr6 156051692 156051917 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105007 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 268-18 chr14 54167824 54168134 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -211088 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 235-13 chr11 74310228 74310423 + 1.5 NA intron (NR_110031, intron 1 of 11) intron (NR_110031, intron 1 of 11) -1037 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 188.25-78 chr3 167377109 167377264 + 1.5 NA intron (NM_001199202, intron 1 of 20) intron (NM_001199202, intron 1 of 20) 3097 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 334.5-29 chr8 82682304 82682636 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -229634 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 155-105 chr5 10426920 10427032 + 1.5 NA intron (NM_001270660, intron 23 of 24) L2|LINE|L2 14875 NR_102746 100505845 Hs.599395 NR_102746 ROPN1L-AS1 - ROPN1L antisense RNA 1 ncRNA 188-39 chr2 76674545 76674765 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -311310 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 153.75-17 chr10 35627024 35627200 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 14140 NR_039831 100616500 NR_039831 ENSG00000284265 MIR4683 - microRNA 4683 ncRNA 297.5-52 chr7 31670327 31670601 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16553 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 186.25-46 chr18 80220251 80220500 + 1.5 NA intron (NM_032510, intron 1 of 2) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 27139 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 309.75-26 chr3 86785599 86786050 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 205325 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 344-17 chr3 183247341 183247779 + 1.5 NA intron (NM_015078, intron 15 of 29) intron (NM_015078, intron 15 of 29) -5693 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 228.75-39 chr2 46115836 46116078 + 1.5 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -181450 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 169.5-69 chr2 12273753 12273905 + 1.5 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 74699 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 280.25-2 chr1 105588818 105589208 + 1.5 NA TTS (NR_125955) TTS (NR_125955) 29922 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 362.25-11 chr5 10192152 10192617 + 1.5 NA Intergenic LTR90B|LTR|LTR 57504 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 136-165 chr9 25712263 25712382 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -33464 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 225.75-51 chr3 21323816 21324028 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -81804 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 231-38 chr2 23899541 23899732 + 1.5 NA intron (NR_125717, intron 1 of 28) AluSx4|SINE|Alu 27487 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 160-61 chr20 4277594 4277784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28402 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 150-52 chr15 65790372 65790521 + 1.5 NA intron (NM_005848, intron 1 of 31) intron (NM_005848, intron 1 of 31) 1847 NM_001320835 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 326.25-6 chr11 61836982 61837316 + 1.5 NA intron (NM_004265, intron 1 of 11) intron (NM_004265, intron 1 of 11) 8849 NM_004265 9415 Hs.502745 NM_004265 ENSG00000134824 FADS2 D6D|DES6|FADSD6|LLCDL2|SLL0262|TU13 fatty acid desaturase 2 protein-coding 156.5-163 chr6 54793171 54793316 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -53528 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 184.5-148 chr8 26401775 26402058 + 1.5 NA intron (NM_004331, intron 3 of 5) intron (NM_004331, intron 3 of 5) 11503 NM_001330491 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 140.5-138 chr21 29346225 29346347 + 1.5 NA TTS (NM_001186) TTS (NM_001186) -26215 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 243.75-79 chr8 88829633 88829875 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -502271 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 184.5-109 chr4 52864340 52864486 + 1.5 NA intron (NM_023940, intron 2 of 3) intron (NM_023940, intron 2 of 3) 2096 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 203.75-4 chr1 170025167 170025376 + 1.5 NA intron (NM_014970, intron 8 of 19) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 43644 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 293-8 chr16 74784570 74785011 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9970 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 268-51 chr6 155359426 155359633 + 1.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -45045 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 176.5-110 chr20 43251894 43252154 + 1.5 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -62118 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 320.5-18 chr18 24857349 24857709 + 1.5 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 130450 NR_146903 105372030 NR_146903 LINC01894 - long intergenic non-protein coding RNA 1894 ncRNA 249-12 chr14 54184387 54184697 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -212326 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 287.5-32 chr2 74983513 74983947 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25087 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 178-20 chr12 101635949 101636098 + 1.5 NA intron (NM_001254721, intron 7 of 28) intron (NM_001254721, intron 7 of 28) 41052 NM_002465 4604 Hs.654589 NM_002465 ENSG00000196091 MYBPC1 LCCS4|MYBPCC|MYBPCS myosin binding protein C, slow type protein-coding 293.5-16 chr15 95686736 95687102 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 253826 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 276.75-11 chr15 101249945 101250338 + 1.5 NA intron (NM_014918, intron 1 of 2) intron (NM_014918, intron 1 of 2) 1907 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 310.75-16 chr16 81873809 81874335 + 1.5 NA intron (NM_002661, intron 7 of 32) intron (NM_002661, intron 7 of 32) 94781 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 188-44 chr21 30216440 30216627 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_199328) promoter-TSS (NM_199328) -436 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 376.25-15 chr8 89147299 89147848 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 610138 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 156.25-106 chr4 4893033 4893174 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27705 NR_125893 101928306 Hs.543743 NR_125893 LOC101928306 - uncharacterized LOC101928306 ncRNA 346-8 chr14 58171126 58171405 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19052 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 339.75-24 chr4 57012767 57013181 + 1.5 NA intron (NM_001303269, intron 14 of 25) AluSx1|SINE|Alu 34078 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 139.5-138 chr3 116643325 116643439 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -66406 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 352.25-10 chr3 84630869 84631361 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 238460 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 249.75-35 chr2 135944453 135944637 + 1.5 NA intron (NM_001293312, intron 3 of 14) intron (NM_001293312, intron 3 of 14) -40631 NR_110200 101928243 Hs.602178 NR_110199 ENSG00000231890 DARS-AS1 - DARS antisense RNA 1 ncRNA 318-13 chr18 4774133 4774395 + 1.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -306918 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 189.25-82 chr3 106485773 106486104 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -616537 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 276.75-27 chr2 117250422 117250699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -564131 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 300-17 chr15 67171428 67171891 + 1.5 NA intron (NM_001145103, intron 5 of 8) intron (NM_001145103, intron 5 of 8) 5504 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 204.75-21 chr10 110828654 110828791 + 1.5 NA intron (NM_001134363, intron 12 of 13) MIRb|SINE|MIR 42182 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 227.25-68 chr6 124254016 124254311 + 1.5 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu -28842 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 172.25-55 chr18 10359995 10360299 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 54223 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 227.5-65 chr21 31635342 31635553 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -24175 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 406-9 chr5 61265924 61266472 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1269 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 157-122 chr9 20488329 20488467 + 1.5 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) 13944 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 256-20 chr17 72536278 72536542 + 1.5 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 56394 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 450-13 chr8 18273176 18273703 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51771 NM_001160174 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 369-6 chr14 49469127 49469382 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 117126 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 425-4 chr16 57494595 57495178 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8393 NM_018110 55715 Hs.279832 NM_018110 ENSG00000125170 DOK4 IRS-5|IRS5 docking protein 4 protein-coding 269-40 chr5 26420308 26420527 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 618169 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 414.5-5 chr6 74911133 74911826 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 217303 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 283-33 chr5 13900379 13900797 + 1.5 NA intron (NM_001369, intron 14 of 78) intron (NM_001369, intron 14 of 78) 43892 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 272.5-18 chr12 14616286 14616524 + 1.5 NA intron (NM_004963, intron 25 of 26) intron (NM_004963, intron 25 of 26) -48522 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 274.5-6 chr10 60244217 60244523 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 8 of 43) intron (NM_001204403, intron 8 of 43) -103354 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 305.25-36 chr3 197308655 197308867 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9440 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 294.75-15 chr2 86751708 86751939 + 1.5 NA intron (NM_022780, intron 2 of 8) intron (NM_022780, intron 2 of 8) -30701 NM_001198954 100526767 Hs.591582 NM_001198954 ENSG00000249884 RNF103-CHMP3 CGI149|CHMP3|NEDF|RNF103-VPS24|VPS24|hVps24 RNF103-CHMP3 readthrough protein-coding 378.25-9 chr6 52531477 52531911 + 1.5 NA intron (NM_012288, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 45366 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 316-29 chr8 63220701 63220988 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 51841 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 324-15 chr2 123670859 123671150 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 354170 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 351 chr1 159339630 159339908 + 1.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -25110 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 435-3 chr12 120855860 120856194 + 1.5 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) MER3|DNA|hAT-Charlie 48331 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 186.5-147 chrX 153201858 153202172 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 22731 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 320-35 chr7 39888051 39888366 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 61211 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 263.5-21 chr17 39187290 39187722 + 1.5 NA exon (NM_000723, exon 4 of 14) exon (NM_000723, exon 4 of 14) 10163 NM_199248 782 Hs.635 NM_000723 ENSG00000067191 CACNB1 CAB1|CACNLB1|CCHLB1 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 1 protein-coding 188-43 chr21 18580607 18580747 + 1.5 NA intron (NR_109925, intron 3 of 3) intron (NR_109925, intron 3 of 3) 105487 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 123.75-30 chr11 95618832 95618957 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 170888 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 224.5-83 chr4 80980798 80981008 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49805 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 432-14 chr7 95890041 95890582 + 1.5 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) L1PREC2|LINE|L1 117805 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 273.75-8 chr14 27569767 27570090 + 1.5 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -42660 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 277.75-6 chr15 61059261 61059711 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 169816 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 274.75-20 chr19 29996206 29996716 + 1.5 NA intron (NM_001252641, intron 4 of 10) L1MB2|LINE|L1 54222 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 203.5-105 chr4 41370436 41370636 + 1.5 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 9729 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 193.5-69 chr18 2993203 2993373 + 1.5 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 18659 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 370.25-12 chr6 36499991 36500569 + 1.5 NA intron (NM_007271, intron 9 of 13) L2b|LINE|L2 47199 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 313.5-21 chr2 43052633 43053015 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -13281 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 255.75-49 chr8 37195149 37195423 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 298627 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 242.5-71 chr6 95295425 95295595 + 1.5 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 281941 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 262.5-56 chr4 70788528 70788788 + 1.5 NA intron (NM_001130709, intron 10 of 11) (TAATTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 50845 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 291.5-4 chr1 118921465 118921848 + 1.5 NA intron (NM_152380, intron 5 of 7) L3|LINE|CR1 66687 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 222-39 chr2 67835447 67835703 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10013 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 194.5-68 chr2 69254965 69255232 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 132129 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 207-15 chr11 73064553 73064768 + 1.5 NA intron (NM_014824, intron 3 of 19) L1PA7|LINE|L1 77658 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 164.5-92 chr2 36750131 36750304 + 1.5 NA intron (NM_001177969, intron 4 of 14) intron (NM_001177969, intron 4 of 14) 53510 NM_001177970 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 158-96 chr3 1758164 1758304 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -340569 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 223-49 chr20 59323360 59323529 + 1.5 NA intron (NM_207032, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 22833 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 242-6 chr1 165646872 165647076 + 1.5 NA intron (NM_004528, intron 1 of 5) intron (NM_004528, intron 1 of 5) 15740 NM_004528 4259 Hs.191734 NM_004528 ENSG00000143198 MGST3 GST-III microsomal glutathione S-transferase 3 protein-coding 201.5-119 chr6 164664790 164664999 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 157169 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 195-93 chr8 117274026 117274427 + 1.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 139231 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 332.5-4 chr11 115031302 115031614 + 1.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -302119 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 227-16 chr13 20636357 20636658 + 1.5 NA intron (NR_148463, intron 18 of 28) MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR -66836 NM_138284 53342 Hs.655142 NM_138284 ENSG00000172458 IL17D IL-17D interleukin 17D protein-coding 282-9 chr12 7802608 7802950 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 13377 NM_024865 79923 Hs.635882 NM_024865 ENSG00000111704 NANOG - Nanog homeobox protein-coding 195.5-84 chr2 238749951 238750317 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 97773 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 361-8 chr12 112930110 112930582 + 1.5 NA intron (NM_001320151, intron 5 of 5) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -8128 NM_006187 4940 Hs.528634 NM_006187 ENSG00000111331 OAS3 p100|p100OAS 2'-5'-oligoadenylate synthetase 3 protein-coding 300-29 chr4 37206543 37206801 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 35319 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 286.75-21 chr2 110169292 110169500 + 1.5 NA intron (NM_207181, intron 5 of 19) intron (NM_207181, intron 5 of 19) 35617 NM_000272 4867 Hs.280388 NM_000272 ENSG00000144061 NPHP1 JBTS4|NPH1|SLSN1 nephrocystin 1 protein-coding 203-106 chr9 92547698 92547983 + 1.5 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) L1M5|LINE|L1 -11748 NM_001197296 1842 Hs.117060 NM_001393 ENSG00000106823 ECM2 - extracellular matrix protein 2 protein-coding 249-48 chr8 43119859 43120118 + 1.5 NA intron (NM_032237, intron 4 of 4) intron (NM_032237, intron 4 of 4) -20476 NM_152419 138050 Hs.600384 NM_152419 ENSG00000165102 HGSNAT HGNAT|MPS3C|RP73|TMEM76 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase protein-coding 229-3 chr1 62416070 62416255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20142 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 286.5-23 chr14 66036402 66036715 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -449813 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 253.5-77 chr8 114305296 114305507 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -868462 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 364.5-18 chr6 56631554 56631913 + 1.5 NA intron (NM_001144770, intron 26 of 94) intron (NM_001144770, intron 26 of 94) 11156 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 238-8 chr10 28760883 28761277 + 1.5 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 17430 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 338-12 chr14 74095594 74095948 + 1.5 NA intron (NM_001024674, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 10818 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 325.25-5 chr14 44611044 44611360 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 103793 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 195-81 chr7 54464227 54464459 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -77982 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 338.25-25 chr6 24603519 24604050 + 1.5 NA intron (NM_001350409, intron 1 of 21) intron (NM_001350409, intron 1 of 21) -20557 NM_001252328 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 308.5-12 chr17 55756814 55757056 + 1.5 NA intron (NM_001102402, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 5830 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 184.5-131 chr6 64515134 64515320 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 708391 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 211.25-20 chr13 73896822 73897217 + 1.5 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 236910 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 192.75-50 chr18 12613247 12613572 + 1.5 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 43323 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 246-41 chr3 129274712 129275007 + 1.5 NA exon (NM_016128, exon 22 of 24) exon (NM_016128, exon 22 of 24) 2713 NR_106884 102465496 NR_106884 ENSG00000278658 MIR6826 hsa-mir-6826 microRNA 6826 ncRNA 289.5-36 chr4 60858961 60859435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63421 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 254-37 chr5 16825333 16825623 + 1.5 NA intron (NM_012334, intron 2 of 40) MER112|DNA|hAT-Charlie 110810 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 142.5-33 chr10 69117255 69117416 + 1.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -6818 NM_001035260 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 216.75-63 chr5 109664771 109664948 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24507 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 223.5-134 chr8 124081692 124082049 + 1.5 NA intron (NM_001039112, intron 32 of 40) MIRb|SINE|MIR -41088 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 130.5-6 chr1 43813258 43813414 + 1.5 NA intron (NM_001270459, intron 3 of 11) intron (NM_001270459, intron 3 of 11) -25286 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 222-91 chr9 95350457 95350644 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32841 NM_001243744 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 259.5-101 chr9 95469033 95469344 + 1.5 NA non-coding (NR_038982, exon 4 of 4) non-coding (NR_038982, exon 4 of 4) 5579 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 178.75-48 chr2 101975942 101976218 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -7385 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 291-30 chr7 52864602 52864889 + 1.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -170888 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 251.5-15 chr11 73892449 73892633 + 1.5 NA intron (NM_001267803, intron 5 of 12) MIRb|SINE|MIR 3760 NM_001363556 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 309.25-21 chr4 70395131 70395421 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2606 NR_126503 58503 Hs.661425 NM_021225 ENSG00000171199 OPRPN BPLP|PRL1|PROL1|opiorphin opiorphin prepropeptide protein-coding 225-12 chr10 66002231 66002513 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 430947 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 305.25-21 chr19 42123194 42123510 + 1.5 NA intron (NM_001207026, intron 1 of 12) intron (NM_001207026, intron 1 of 12) 9094 NM_001247994 5452 Hs.147381 NM_002698 ENSG00000028277 POU2F2 OCT2|OTF2|Oct-2 POU class 2 homeobox 2 protein-coding 220.25-46 chr3 56265307 56265759 + 1.5 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) L1MA9|LINE|L1 202934 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 221.25-25 chr14 30574037 30574289 + 1.5 NA intron (NR_151720, intron 1 of 3) L1MC4|LINE|L1 3194 NR_151720 105370431 Hs.603980 NR_151720 ENSG00000257636 G2E3-AS1 CAT1647 G2E3 antisense RNA 1 ncRNA 203-5 chr1 61439734 61440002 + 1.5 NA intron (NM_001134673, intron 10 of 10) intron (NM_001134673, intron 10 of 10) -186350 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 203-86 chr5 110235164 110235373 + 1.5 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy 278647 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 166-45 chr17 47348763 47348926 + 1.5 NA intron (NM_152347, intron 9 of 24) L1ME4c|LINE|L1 24889 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 246-14 chr14 39963968 39964285 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -531626 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 141.5-100 chr2 78116065 78116212 + 1.5 NA intron (NR_110287, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 27408 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 252.5-19 chr12 15173775 15174139 + 1.5 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) L1MB8|LINE|L1 22034 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 242-31 chr20 15202632 15202901 + 1.5 NA intron (NM_001033087, intron 1 of 13) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 5926 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 184-12 chr11 23243889 23244074 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 175209 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 447.5-5 chr5 93346091 93346403 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 225096 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 172.5-68 chr14 61677016 61677160 + 1.5 NA Intergenic MER106B|DNA|hAT-Charlie -18425 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 136.75-126 chr3 21069802 21069945 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -335853 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 127-153 chr6 143091084 143091254 + 1.5 NA intron (NM_001366355, intron 1 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 30280 NM_001363721 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 190.75-24 chr12 116164593 116164838 + 1.5 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) -16061 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 233.25-49 chr3 83549997 83550315 + 1.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 1319419 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 378-14 chr4 76166194 76166498 + 1.5 NA intron (NM_001204255, intron 6 of 8) intron (NM_001204255, intron 6 of 8) -17831 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 196-68 chr4 10597289 10597557 + 1.5 NA intron (NM_052964, intron 3 of 18) intron (NM_052964, intron 3 of 18) 87345 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 285.75-28 chr20 31268435 31268893 + 1.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 11000 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 430.5-12 chr9 32972582 32973020 + 1.5 NA non-coding (NR_160931, exon 8 of 8) non-coding (NR_160931, exon 8 of 8) 28775 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 399-2 chr11 60625477 60626060 + 1.5 NA intron (NR_026946, intron 2 of 6) L1MA9|LINE|L1 10017 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 189-84 chr4 94431033 94431258 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20712 NM_001011515 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 396-3 chr14 41358899 41359177 + 1.5 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -247818 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 300.25-12 chr19 29114395 29114805 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 98551 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 205.5-31 chr12 77486483 77486773 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -344266 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 397 chr1 115698274 115698658 + 1.5 NA TTS (NM_138959) TTS (NM_138959) 55837 NM_001172412 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 204.75-22 chr10 118044219 118044437 + 1.5 NA intron (NM_014904, intron 1 of 4) intron (NM_014904, intron 1 of 4) -2493 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 280.25-31 chr2 193579770 193580085 + 1.5 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -764342 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 241-56 chr8 119149192 119149525 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -59005 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 218-47 chr3 103811925 103812261 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -287977 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 261.5-14 chr13 56897677 56897965 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -243097 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 359-10 chr3 109147320 109147602 + 1.5 NA intron (NR_161294, intron 2 of 2) intron (NR_161294, intron 2 of 2) 10742 NR_161294 401081 Hs.280892 NM_001351622 ENSG00000241224 C3orf85 - chromosome 3 open reading frame 85 protein-coding 216.75-83 chr9 93205920 93206081 + 1.5 NA intron (NM_006648, intron 1 of 28) MIRb|SINE|MIR 21070 NM_001282394 65268 Hs.654856 NM_006648 ENSG00000165238 WNK2 NY-CO-43|P/OKcl.13|PRKWNK2|SDCCAG43 WNK lysine deficient protein kinase 2 protein-coding 147.75-155 chr8 106178827 106178962 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -91284 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 270.75-51 chr9 3898949 3899197 + 1.5 NA intron (NR_026663, intron 1 of 1) intron (NR_026663, intron 1 of 1) 427 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 212-72 chr6 115457799 115458087 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 185892 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 178-41 chr2 43519732 43519961 + 1.5 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) intron (NM_001083953, intron 22 of 37) 76128 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 300-39 chr8 28727692 28727933 + 1.5 NA intron (NM_001440, intron 3 of 6) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 26311 NM_001440 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 195.75-23 chr10 70090752 70090953 + 1.5 NA intron (NM_018649, intron 3 of 8) MER5C|DNA|hAT-Charlie 38006 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 194.5-103 chr4 53337058 53337256 + 1.5 NA intron (NM_152540, intron 2 of 8) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 28904 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 271.5-41 chr2 158664545 158664847 + 1.5 NA intron (NM_001005476, intron 15 of 20) intron (NM_001005476, intron 15 of 20) 70306 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 418-3 chr16 73883550 73884190 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 331651 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 189.75-119 chr8 15910866 15911096 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 275291 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 209.5-137 chr7 51663563 51663851 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -270451 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 165-147 chr8 115255790 115255935 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 412151 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 261-4 chr1 247814134 247814471 + 1.5 NA TTS (NM_001001966) TTS (NM_001001966) 1427 NM_001001966 284532 Hs.626620 NM_001001966 ENSG00000196772 OR14A16 OR5AT1 olfactory receptor family 14 subfamily A member 16 protein-coding 154.5-119 chr21 46004479 46004646 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001848, exon 35 of 35) 3' UTR (NM_001848, exon 35 of 35) 22813 NM_001848 1291 Hs.474053 NM_001848 ENSG00000142156 COL6A1 BTHLM1|OPLL|UCHMD1 collagen type VI alpha 1 chain protein-coding 393-7 chr2 25125972 25126469 + 1.5 NA intron (NM_014971, intron 5 of 22) AluJb|SINE|Alu 42360 NM_000939 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 128-96 chr22 33953479 33953624 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30663 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 137.75-80 chr16 5423166 5423381 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 192977 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 156-26 chr11 91975191 91975464 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -249707 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 141-78 chr2 116162617 116162732 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 818859 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 325.25-18 chr21 46056281 46056588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -41678 NM_058174 1292 Hs.420269 NM_001849 ENSG00000142173 COL6A2 BTHLM1|PP3610|UCMD1 collagen type VI alpha 2 chain protein-coding 143.75-17 chr10 64820282 64820466 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5154 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 317.25-13 chr15 83028292 83028674 + 1.5 NA intron (NM_025238, intron 5 of 7) L1M5|LINE|L1 -16844 NM_001160114 123207 Hs.352541 NM_144597 ENSG00000169609 C15orf40 - chromosome 15 open reading frame 40 protein-coding 317.5-37 chr8 145006063 145006293 + 1.5 NA TTS (NR_026974) TTS (NR_026974) -3279 NR_023392 286101 Hs.367856 NR_023392 ZNF252P ZNF252 zinc finger protein 252, pseudogene pseudo 271.5-65 chr5 26394482 26394830 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 643930 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 170.5-202 chr9 35325626 35325822 + 1.5 NA intron (NM_006377, intron 10 of 38) L1MB7|LINE|L1 -16172 NM_001371188 407-14 chrX 94431497 94431946 + 1.5 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 631505 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 264-18 chr15 76777283 76777561 + 1.5 NA intron (NM_001353011, intron 9 of 32) AluSq2|SINE|Alu 84522 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 269.25-41 chr5 117027463 117027835 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -265440 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 438.75-5 chr3 129702044 129702665 + 1.5 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) intron (NM_001349271, intron 2 of 4) -13622 NM_015008 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 347.25-14 chr4 31312695 31313051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 141729 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 192.75-48 chr18 9333134 9333421 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1496 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 408.5-11 chr9 100865795 100866249 + 1.5 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -162705 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 272.25-9 chr12 31605717 31605960 + 1.5 NA intron (NR_046909, intron 2 of 2) intron (NR_046909, intron 2 of 2) -14702 NM_001366893 160518 Hs.118166 NM_144973 ENSG00000170456 DENND5B - DENN domain containing 5B protein-coding 206-66 chr6 158036003 158036146 + 1.5 NA intron (NM_003898, intron 4 of 26) L1PA13|LINE|L1 18981 NM_001178088 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 266.5-58 chr4 163395929 163396122 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51923 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 196.25-106 chr6 49338090 49338426 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 124995 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 251.75-51 chr3 26103939 26104329 + 1.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -230439 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 311.5-13 chr2 9826607 9826826 + 1.5 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16726 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 352.75-18 chr9 30122305 30122950 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 285827 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 276-40 chr5 128438335 128438601 + 1.5 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) intron (NM_001999, intron 7 of 64) 99777 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 269.5-43 chr5 36802542 36802934 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 73956 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 237.75-33 chr19 30366632 30366894 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5621 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 257-45 chr4 146088580 146088826 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 33210 NR_038331 100505545 Hs.122199 NR_038331 ENSG00000248809 LINC01095 - long intergenic non-protein coding RNA 1095 ncRNA 417.5 chr11 81464215 81464735 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 426361 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 338.75-14 chr20 54325085 54325460 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 117185 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 201.5-117 chr6 80532641 80532891 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 426095 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 247.5-53 chr3 39479295 39479623 + 1.5 NA intron (NR_103506, intron 1 of 2) intron (NR_103506, intron 1 of 2) 11779 NR_103505 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 174.5-199 chr9 131029435 131029652 + 1.5 NA intron (NM_006059, intron 2 of 27) intron (NM_006059, intron 2 of 27) 20369 NM_006059 10319 Hs.201805 NM_006059 ENSG00000050555 LAMC3 OCCM laminin subunit gamma 3 protein-coding 280.5-31 chr3 15836068 15836673 + 1.5 NA intron (NM_001349279, intron 1 of 28) L1MB7|LINE|L1 23444 NM_015199 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 174-30 chr15 47951543 47951733 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -105402 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 281-46 chr9 133683485 133683844 + 1.5 NA intron (NM_001134707, intron 17 of 20) intron (NM_001134707, intron 17 of 20) -26256 NR_102735 138948 Hs.223858 NR_002783 ENSG00000225756 DBH-AS1 NCRNA00118 DBH antisense RNA 1 ncRNA 187-16 chr10 59448185 59448442 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -85132 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 238-51 chr4 68618464 68618747 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -50078 NM_001077 7367 Hs.575083 NM_001077 ENSG00000197888 UGT2B17 BMND12|UDPGT2B17 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B17 protein-coding 227.25-70 chr6 149391004 149391435 + 1.5 NA intron (NM_001292034, intron 3 of 6) HAL1ME|LINE|L1 -9043 NM_001002255 387082 Hs.657168 NM_001002255 ENSG00000177688 SUMO4 IDDM5|SMT3H4|SUMO-4|dJ281H8.4 small ubiquitin like modifier 4 protein-coding 334.75-9 chr14 22235999 22236290 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 196609 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 143-132 chr7 72226736 72226854 + 1.5 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu 110596 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 205.5-121 chr5 158532405 158532570 + 1.5 NA Intergenic (TTCTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -122714 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 302.5-24 chr2 228646818 228647047 + 1.5 NA Intergenic LTR108e_Mam|LTR|ERVL -35537 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 119.75-163 chr4 163477093 163477255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3420 NM_032136 84076 Hs.303923 NM_032136 ENSG00000151005 TKTL2 - transketolase like 2 protein-coding 176.25-61 chr2 24982726 24982870 + 1.5 NA intron (NR_034113, intron 1 of 2) AluSq10|SINE|Alu 10686 NR_034113 729723 Hs.436366 NR_034113 ENSG00000224165 DNAJC27-AS1 - DNAJC27 antisense RNA 1 ncRNA 288.75-28 chr2 43554613 43554917 + 1.5 NA intron (NM_001083953, intron 17 of 37) L1M5|LINE|L1 41209 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 241-59 chr9 27938451 27938628 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001258282, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001258282, exon 7 of 7) -364673 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 303.5-44 chr6 146971547 146971815 + 1.5 NA intron (NR_034115, intron 7 of 10) intron (NR_034115, intron 7 of 10) -167857 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 441.5-5 chr14 55141982 55142487 + 1.5 NA intron (NR_003225, intron 2 of 3) intron (NR_003225, intron 2 of 3) 5251 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 337.5-5 chr10 53369622 53369871 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -598046 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 233.25-69 chr8 88493978 88494233 + 1.5 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -166622 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 329.25-24 chr6 71520684 71521167 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 99898 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 299.5-28 chr3 82813793 82814131 + 1.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 827820 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 290.5-19 chr17 75344838 75345211 + 1.5 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) intron (NM_002086, intron 2 of 5) -55575 NM_001126122 60386 Hs.514470 NM_021734 ENSG00000125454 SLC25A19 DNC|MCPHA|MUP1|THMD3|THMD4|TPC solute carrier family 25 member 19 protein-coding 364.25-14 chr15 62816766 62817020 + 1.5 NA intron (NM_015059, intron 49 of 55) intron (NM_015059, intron 49 of 55) -7064 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 191.5-35 chr14 42604499 42604741 + 1.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 997764 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 360.5-17 chr8 42246335 42246862 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 24363 NR_125823 101929897 Hs.60288 NR_125823 ENSG00000253408 LOC101929897 - uncharacterized LOC101929897 ncRNA 250-50 chr5 110147751 110147986 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 264686 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 369.75-2 chr11 100721599 100721933 + 1.5 NA intron (NM_001367945, intron 1 of 25) AluSx1|SINE|Alu -33811 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 379-10 chr8 85070873 85071173 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -36215 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 259-12 chr10 121980895 121981208 + 1.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -5834 NM_017615 54780 Hs.258798 NM_017615 ENSG00000107672 NSMCE4A C10orf86|NS4EA|NSE4A NSE4 homolog A, SMC5-SMC6 complex component protein-coding 207.5-51 chr2 47163610 47163889 + 1.5 NA intron (NM_001305625, intron 2 of 5) intron (NM_001305625, intron 2 of 5) -8441 NM_001163561 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 266.25-20 chr18 3995438 3995754 + 1.5 NA intron (NR_102696, intron 3 of 4) intron (NR_102696, intron 3 of 4) 33243 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 285.5-42 chr3 174852508 174852819 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -6671 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 268-37 chr22 36023523 36023906 + 1.5 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) 4823 NM_001349999 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 210-45 chr2 3903404 3903624 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70518 NR_037881 100505964 Hs.190267 NR_037881 ENSG00000237401 LINC01304 - long intergenic non-protein coding RNA 1304 ncRNA 222.25-79 chr7 37388886 37389104 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) -35327 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 237-6 chr1 212604376 212604539 + 1.5 NA intron (NM_001030287, intron 1 of 3) intron (NM_001030287, intron 1 of 3) -4304 NM_001674 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 238.5-69 chr5 68893161 68893343 + 1.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 136675 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 236.75-54 chr7 72019239 72019421 + 1.5 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 318061 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 185.25-89 chr4 80609747 80609943 + 1.5 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 274125 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 131-71 chr18 8420624 8420719 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -53637 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 169.5-110 chr3 52678681 52678836 + 1.5 NA intron (NM_001366074, intron 4 of 30) intron (NM_001366074, intron 4 of 30) 6841 NM_001350074 55193 Hs.189920 NM_018165 ENSG00000163939 PBRM1 BAF180|PB1 polybromo 1 protein-coding 122-169 chr7 73868580 73868712 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 7487 NM_182504 135886 Hs.647026 NM_182504 ENSG00000175877 TMEM270 WBSCR28 transmembrane protein 270 protein-coding 350.5-18 chr22 25551667 25552024 + 1.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -12830 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 249.5-11 chr10 28993871 28994253 + 1.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 147654 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 210-51 chr2 68924218 68924491 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28539 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 282-13 chr13 28840518 28840845 + 1.5 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 20342 NM_001366650 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 465-4 chr5 91839083 91839605 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -456027 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 195.75-2 chr1 17145740 17145883 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26360 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 279.75-53 chr8 49902717 49903135 + 1.5 NA Intergenic Helitron3Na_Mam|RC|Helitron -6870 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 237-46 chr5 123234729 123234982 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -144539 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 184.5-11 chr1 118092862 118093038 + 1.5 NA intron (NM_206996, intron 8 of 48) intron (NM_206996, intron 8 of 48) 92278 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 292-36 chr5 144798106 144798506 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 592915 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 185-65 chr5 27082728 27082998 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -44277 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 460.25 chr10 61126723 61127092 + 1.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 110632 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 284.25-18 chr2 196876006 196876286 + 1.5 NA intron (NM_001321099, intron 14 of 27) intron (NM_001321099, intron 14 of 27) 50561 NM_001321100 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 149.25-33 chr11 113618350 113618539 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 87864 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 306.75-24 chr8 140070112 140070425 + 1.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1ME4c|LINE|L1 30267 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 251-56 chr7 157343431 157343778 + 1.5 NA intron (NM_005494, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 6600 NM_058246 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 225.5-89 chr5 51421097 51421347 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 37774 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 316-6 chr11 9839135 9839449 + 1.5 NA intron (NR_120539, intron 1 of 2) intron (NR_120539, intron 1 of 2) 150 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 256-49 chr4 38780480 38780773 + 1.5 NA intron (NM_001195106, intron 1 of 2) intron (NM_001195106, intron 1 of 2) 2364 NM_001195107 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 248.25-21 chr14 83534966 83535221 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 892461 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 214.5-69 chr20 49055145 49055308 + 1.5 NA intron (NM_001362762, intron 1 of 24) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 8914 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 252.75-74 chr8 121806769 121807046 + 1.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -165467 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 239.25-55 chr21 26676365 26676595 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103194 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 458.75-2 chr4 92609643 92610074 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 305459 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 157.5-168 chr5 170923271 170923452 + 1.5 NA intron (NM_022897, intron 11 of 27) L1ME1|LINE|L1 61343 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 218.5-35 chr13 59687687 59687924 + 1.5 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) intron (NM_001258366, intron 26 of 26) -324913 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 290-43 chr6 44896573 44896820 + 1.5 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) intron (NM_181356, intron 12 of 12) 301074 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 218-70 chr9 90945196 90945454 + 1.5 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 117905 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 112.75-24 chr10 52409653 52409755 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45568 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 182.25-124 chr8 88180767 88181012 + 1.5 NA intron (NM_005941, intron 3 of 9) L1MC2|LINE|L1 146594 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 207-80 chr7 39459080 39459367 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 8 of 9) intron (NM_001370959, intron 8 of 9) -52877 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 193.25-44 chr17 56116931 56117201 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36409 NM_153228 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 241.5-7 chr10 111142857 111143162 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28718 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 313-12 chr2 51272361 51272770 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 239964 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 225.5-5 chr1 86119425 86119699 + 1.5 NA intron (NM_152890, intron 3 of 59) intron (NM_152890, intron 3 of 59) 36909 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 248.25-13 chr11 101241447 101241646 + 1.5 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -111733 NM_000926 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 139.75-38 chr12 68144368 68144511 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15301 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 369.75-14 chr5 36567128 36567528 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -39027 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 369.5-3 chr12 21525656 21526099 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_030572) promoter-TSS (NM_030572) -419 NM_030572 80763 Hs.130692 NM_030572 ENSG00000134548 SPX C12orf39 spexin hormone protein-coding 280.5-26 chr2 139291005 139291345 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 393851 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 285-15 chr15 65242117 65242344 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30757 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 146.25-145 chr8 52375923 52376076 + 1.5 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 33757 NM_001352883 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 216.5-9 chr10 52998981 52999133 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -227357 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 187.5-141 chr5 115687110 115687316 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -14561 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 258.25-10 chr10 80755256 80755631 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105646 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 216-3 chr1 167862253 167862462 + 1.5 NA intron (NM_018417, intron 14 of 32) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 51777 NM_001167749 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 224.25-11 chr10 13494995 13495268 + 1.5 NA intron (NM_001370075, intron 3 of 8) intron (NM_001370075, intron 3 of 8) 7845 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 155-57 chr2 22065976 22066155 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -355413 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 416.5-4 chr15 62413888 62414360 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 71095 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 299.5-45 chr8 123658285 123658695 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4689 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 202.75-115 chrX 155591020 155591465 + 1.5 NA intron (NM_018196, intron 1 of 7) L1MA8|LINE|L1 -21323 NM_001304990 10251 Hs.381912 NM_005840 ENSG00000168939 SPRY3 spry-3 sprouty RTK signaling antagonist 3 protein-coding 315.25-22 chr22 38149535 38149772 + 1.5 NA intron (NM_001349869, intron 2 of 16) L1MEg|LINE|L1 32177 NM_003560 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 262.5-32 chr2 14694459 14694797 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 61911 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 227.25-63 chr5 63636967 63637225 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 325196 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 242.5-18 chr10 111716745 111717041 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 466872 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 145.75-146 chr7 13386141 13386403 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 600242 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 397.75 chr10 61615977 61616461 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46710 NM_001366909 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 275 chr1 20867296 20867667 + 1.5 NA intron (NM_003760, intron 15 of 31) MIRb|SINE|MIR -80793 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 249.5-74 chr4 148990836 148991131 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48605 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 300.5-46 chr7 29808357 29808739 + 1.5 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) intron (NM_001080529, intron 1 of 8) 1994 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 249-7 chr11 84693677 84693997 + 1.5 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2c|LINE|L2 27105 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 176.25-70 chr2 108830386 108830563 + 1.5 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) intron (NM_001351559, intron 10 of 11) 43703 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 345-5 chr13 72512632 72512927 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 214850 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 220.5-60 chr2 201968493 201968798 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -65942 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 268.5-6 chr1 216060219 216060500 + 1.5 NA intron (NM_206933, intron 30 of 71) intron (NM_206933, intron 30 of 71) -12106 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 258-14 chr14 61934663 61934913 + 1.5 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 7093 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 276.5-14 chr11 81768991 81769580 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 121551 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 325-13 chr20 52557150 52557461 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -63533 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 412-6 chr2 34292822 34293266 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 5 of 5) L1MEg|LINE|L1 225818 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 524.5-4 chr3 197229861 197230449 + 1.5 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -46024 NM_001204387 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 266.5-10 chr11 68117306 68117543 + 1.5 NA intron (NM_001277, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 3964 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 179.25-86 chr2 226406053 226406400 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 252567 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 243-22 chr15 25373265 25373480 + 1.5 NA intron (NM_001354542, intron 4 of 11) intron (NM_001354542, intron 4 of 11) 64857 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 194.75-71 chr4 5668446 5668748 + 1.5 NA intron (NM_147127, intron 7 of 21) intron (NM_147127, intron 7 of 21) 39962 NM_147127 132884 Hs.87306 NM_147127 ENSG00000173040 EVC2 LBN|WAD EvC ciliary complex subunit 2 protein-coding 191-16 chr12 37898651 37898808 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -418045 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 352.5-14 chr3 32175458 32175871 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63015 NM_001320308 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 354 chr1 12409117 12409511 + 1.5 NA intron (NM_015378, intron 63 of 69) intron (NM_015378, intron 63 of 69) -97932 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 340.5-29 chr5 129765831 129766148 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001257308, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001257308, exon 3 of 3) 17895 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 273-30 chr2 214754152 214754428 + 1.5 NA intron (NM_001282548, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 55393 NR_104215 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 230.25-89 chr9 22674556 22674875 + 1.5 NA intron (NR_038977, intron 2 of 5) intron (NR_038977, intron 2 of 5) 28515 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 263.75-29 chr2 109089672 109089946 + 1.5 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -39396 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 144.75-173 chr8 77194399 77194577 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -193444 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 431.25-7 chr6 47547234 47547789 + 1.5 NA intron (NM_012120, intron 4 of 17) L1PB1|LINE|L1 69722 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 173.5-99 chr3 79635400 79635572 + 1.5 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 127599 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 151.5-80 chr2 46686489 46686671 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12380 NM_014011 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 458.75-4 chr8 106651283 106651933 + 1.5 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) L1M4|LINE|L1 -6200 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 202.5-48 chr15 25436133 25436451 + 1.5 NA intron (NM_001354507, intron 1 of 14) intron (NM_001354507, intron 1 of 14) 1937 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 181.5-150 chr7 78978533 78978724 + 1.5 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) L1MC3|LINE|L1 -30360 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 353.5-16 chr5 104215986 104216277 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -653342 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 385.75-10 chr21 23042238 23042818 + 1.5 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -36756 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 304.5-31 chr6 75495576 75496034 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2005 NR_110608 27145 Hs.201488 NM_015687 ENSG00000118407 FILIP1 FILIP filamin A interacting protein 1 protein-coding 275-21 chr19 56911727 56911960 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 70941 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 173.5-22 chr10 75674269 75674415 + 1.5 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 26833 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 325-9 chr17 61826189 61826475 + 1.5 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) L1PA13|LINE|L1 37227 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 278-25 chr5 11556137 11556531 + 1.5 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 32583 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 224-48 chr6 44986497 44986761 + 1.5 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 211141 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 289-7 chr10 72723189 72723739 + 1.5 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) L1ME4a|LINE|L1 2435 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 238.5-33 chr17 66842553 66842784 + 1.5 NA intron (NM_145811, intron 1 of 5) intron (NM_145811, intron 1 of 5) 7551 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 196.75-8 chr1 168497123 168497284 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1559 NR_125956 101928565 Hs.563806 NR_125956 ENSG00000228697 LOC101928565 - uncharacterized LOC101928565 ncRNA 243-45 chr3 44085055 44085278 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -29046 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 209-19 chr14 44445515 44445904 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 61574 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 127.25-180 chr6 96501654 96501805 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20077 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 382.5-15 chr5 126705691 126706074 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 70604 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 243.5-65 chr5 75361850 75362146 + 1.5 NA 3' UTR (NM_000859, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_000859, exon 20 of 20) 24778 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 224.25-102 chr7 137160533 137160760 + 1.5 NA intron (NR_046103, intron 1 of 3) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 3695 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 403.5-8 chr6 55968560 55968881 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -93130 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 318-26 chr3 57536625 57536918 + 1.5 NA intron (NM_198564, intron 2 of 11) intron (NM_198564, intron 2 of 11) 7573 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 248.25-16 chr12 22364131 22364302 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -29502 NM_003034 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 242.5-61 chr4 113349023 113349227 + 1.5 NA intron (NM_001354275, intron 36 of 43) MIRb|SINE|MIR 56286 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 271.5-49 chr20 55079410 55079669 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -343504 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 271.75-10 chr14 52920116 52920451 + 1.5 NA intron (NM_006832, intron 2 of 14) intron (NM_006832, intron 2 of 14) 30767 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 264.75-43 chr5 65330876 65331157 + 1.5 NA intron (NR_135689, intron 8 of 25) intron (NR_135689, intron 8 of 25) 150904 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 323.5-13 chr16 81186477 81187115 + 1.5 NA intron (NM_001076780, intron 10 of 17) intron (NM_001076780, intron 10 of 17) -5465 NM_001278425 114780 Hs.413525 NM_052892 ENSG00000166473 PKD1L2 PC1L2 polycystin 1 like 2 (gene/pseudogene) protein-coding 335.25-19 chr2 175225963 175226276 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -44409 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 261-5 chr10 61019724 61020060 + 1.5 NA intron (NR_108052, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 3617 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 289.5-16 chr15 77047806 77048118 + 1.5 NA intron (NM_198902, intron 5 of 5) intron (NM_198902, intron 5 of 5) 23147 NM_198902 10099 Hs.744863 NM_005724 ENSG00000140391 TSPAN3 TM4-A|TM4SF8|TSPAN-3 tetraspanin 3 protein-coding 131-119 chr3 131319571 131319686 + 1.5 NA intron (NM_001353043, intron 17 of 17) intron (NM_001353043, intron 17 of 17) -42217 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 278.25-56 chr8 78607992 78608323 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -49654 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 320-20 chr20 33702896 33703418 + 1.5 NA 3' UTR (NM_007238, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_007238, exon 4 of 4) -16772 NM_005225 1869 Hs.654393 NM_005225 ENSG00000101412 E2F1 E2F-1|RBAP1|RBBP3|RBP3 E2F transcription factor 1 protein-coding 354.5-19 chr7 19585007 19585329 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 120268 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 209.5-62 chr2 45484277 45484451 + 1.5 NA intron (NM_018079, intron 15 of 20) intron (NM_018079, intron 15 of 20) 126903 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 167.75-15 chr1 213022260 213022676 + 1.5 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -6593 NM_001300757 90806 Hs.157078 NM_144567 ENSG00000174606 ANGEL2 Ccr4d|KIAA0759L angel homolog 2 protein-coding 232.25-80 chr8 103055811 103056035 + 1.5 NA exon (NM_001695, exon 8 of 13) exon (NM_001695, exon 8 of 13) 34840 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 163.5-212 chr8 137654885 137655083 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -241396 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 210.75-34 chr19 28725346 28725530 + 1.5 NA intron (NR_110759, intron 2 of 9) intron (NR_110759, intron 2 of 9) 2256 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 265-9 chr12 61177017 61177328 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 1015667 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 327-5 chr11 31309623 31309891 + 1.5 NA intron (NM_181807, intron 3 of 8) intron (NM_181807, intron 3 of 8) 59982 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 242.25-66 chr4 69740369 69740694 + 1.5 NA intron (NM_014465, intron 4 of 7) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 20089 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 362.5-25 chr9 74300182 74300560 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -71160 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 208-49 chr21 35622945 35623142 + 1.5 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -42279 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 151.75-98 chr4 38262916 38263045 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103934 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 128.75-97 chr2 56298538 56298674 + 1.5 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -112836 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 237-45 chr5 64512816 64513058 + 1.5 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR 6922 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 430.5-6 chr3 156955078 156955489 + 1.5 NA intron (NM_001004316, intron 6 of 12) L1PA11|LINE|L1 -126558 NR_135546 105374177 Hs.634263 NR_135546 ENSG00000241544 LINC02029 - long intergenic non-protein coding RNA 2029 ncRNA 303.25-13 chr18 5746312 5746719 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2304 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 138.5-181 chr7 18756304 18756477 + 1.5 NA intron (NM_058176, intron 13 of 22) intron (NM_058176, intron 13 of 22) 247120 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 258.75-54 chr3 191286461 191286929 + 1.5 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) L1M1|LINE|L1 -42699 NM_178335 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 171-101 chr4 43809902 43810041 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -206890 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 197.5-96 chr3 51987537 51987961 + 1.5 NA intron (NM_001316331, intron 14 of 16) intron (NM_001316331, intron 14 of 16) 4214 NM_001198897 95 Hs.334707 NM_000666 ENSG00000243989 ACY1 ACY-1|ACY1D|HEL-S-5 aminoacylase 1 protein-coding 263-31 chr22 21894879 21895188 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -27353 NM_138957 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 224.5-108 chr8 103084693 103085051 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36160 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 175.75-99 chr5 2027475 2027628 + 1.5 NA Intergenic LTR12_|LTR|ERV1 140220 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 189.5-74 chr2 134350232 134350414 + 1.5 NA intron (NM_001371457, intron 10 of 16) intron (NM_001371457, intron 10 of 16) 96251 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 158.75-13 chr10 19492973 19493206 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 30 of 39) L1MB3|LINE|L1 235461 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 354-21 chr4 91016161 91016576 + 1.5 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 781337 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 277.75-27 chr5 157286576 157286872 + 1.5 NA intron (NM_001037333, intron 2 of 30) intron (NM_001037333, intron 2 of 30) 17400 NM_014376 26999 Hs.519702 NM_014376 ENSG00000055163 CYFIP2 EIEE65|PIR121 cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 protein-coding 431.25-4 chr14 103125168 103125553 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_006291) promoter-TSS (NM_006291) -946 NM_006291 7127 Hs.525607 NM_006291 ENSG00000185215 TNFAIP2 B94|EXOC3L3 TNF alpha induced protein 2 protein-coding 287.5-38 chr22 26910328 26910817 + 1.5 NA intron (NR_110540, intron 2 of 2) intron (NR_110540, intron 2 of 2) 7280 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 302.25-19 chr5 9496326 9496562 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -14889 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 266.75-39 chr4 130948113 130948458 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 571924 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 220-35 chr2 112977848 112978167 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_019618) promoter-TSS (NM_019618) 1 NM_019618 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 355.5-4 chr10 28146584 28147030 + 1.5 NA intron (NR_134518, intron 4 of 16) intron (NR_134518, intron 4 of 16) -73429 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 291.75-27 chr21 19446483 19446720 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 453154 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 225-78 chr8 124143850 124144205 + 1.5 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 27495 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 241.5-27 chr16 13018697 13018981 + 1.5 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 117241 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 272-11 chr14 64256866 64257173 + 1.5 NA intron (NR_073496, intron 5 of 7) intron (NR_073496, intron 5 of 7) 26056 NM_001271876 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 210-50 chr2 68782333 68782581 + 1.5 NA intron (NM_001166277, intron 3 of 9) intron (NM_001166277, intron 3 of 9) 7547 NM_001166276 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 393.5-5 chr14 71794312 71794736 + 1.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -137647 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 216.5-54 chr18 66666538 66666711 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62534 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 213.25-61 chr7 29317471 29317624 + 1.5 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -108577 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 139.5-183 chr5 147820201 147820315 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 18973 NM_001354966 6690 Hs.407856 NM_003122 ENSG00000164266 SPINK1 PCTT|PSTI|Spink3|TATI|TCP serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 protein-coding 166-61 chr2 69978189 69978411 + 1.5 NA intron (NR_033872, intron 9 of 10) intron (NR_033872, intron 9 of 10) -16035 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 188.5-123 chr5 25944947 25945129 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 754085 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 218.25-67 chr5 50704834 50705017 + 1.5 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 37511 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 307.5-24 chr2 10108685 10109074 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13689 NM_001165931 6241 Hs.226390 NM_001034 ENSG00000171848 RRM2 R2|RR2|RR2M ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 protein-coding 237.5-23 chr11 27180642 27180861 + 1.5 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) intron (NR_125767, intron 2 of 4) 38017 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 125.25-165 chr5 173123196 173123330 + 1.5 NA intron (NM_153607, intron 8 of 8) intron (NM_153607, intron 8 of 8) -21268 NM_001205 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 317-18 chr22 24852111 24852516 + 1.5 NA intron (NM_001098498, intron 5 of 23) L1MC4a|LINE|L1 46092 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 184-67 chr4 133761280 133761525 + 1.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 440387 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 187.5-29 chr11 40570668 40570865 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -277636 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 211-57 chr5 164721187 164721450 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 251039 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 408 chr10 86326170 86326639 + 1.5 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron 40391 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 338.5-14 chr2 69008634 69008938 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4358 NM_053034 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 223-56 chr4 33369238 33369487 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 670531 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 266.5-80 chr8 135782008 135782299 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 324697 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 270.5-71 chrX 139209405 139209691 + 1.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -4525 NM_001139501 2258 Hs.6540 NM_004114 ENSG00000129682 FGF13 FGF-13|FGF2|FHF-2|FHF2|LINC00889 fibroblast growth factor 13 protein-coding 439-5 chr17 28047884 28048238 + 1.5 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) intron (NM_016231, intron 1 of 10) 5384 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 320.25-28 chr8 107224364 107224763 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 111952 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 330.5-16 chr2 4878340 4878786 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -222341 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 289-50 chrX 74630614 74630868 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16117 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 237.5-88 chr6 60239410 60239695 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1334578 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 250.5-52 chr2 202578636 202578917 + 1.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -56193 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 135-36 chr13 49056301 49056412 + 1.5 NA intron (NM_001079673, intron 2 of 25) L1MEd|LINE|L1 -53961 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 341.75-17 chr5 75010070 75010466 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42290 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 203-88 chr5 151731232 151731493 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 27269 NM_004045 475 Hs.125213 NM_004045 ENSG00000177556 ATOX1 ATX1|HAH1 antioxidant 1 copper chaperone protein-coding 191.5-126 chr6 45883375 45883565 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 54127 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 276.75-45 chr7 7715193 7715430 + 1.5 NA intron (NM_002947, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 3296 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 290.5-23 chr2 102465619 102466084 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7375 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 330.5-2 chr1 191577225 191577801 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -349015 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 137.5-102 chr18 7064424 7064587 + 1.5 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) intron (NM_005559, intron 3 of 62) 53292 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 243-75 chr8 98658869 98659126 + 1.5 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 166674 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 194.5-51 chr17 67179844 67180024 + 1.5 NA intron (NM_001330447, intron 12 of 32) intron (NM_001330447, intron 12 of 32) -64842 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 335-7 chr12 62709701 62710120 + 1.5 NA intron (NM_020700, intron 6 of 9) AluSp|SINE|Alu 106224 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 294.5-33 chr3 195111488 195111797 + 1.5 NA intron (NM_152531, intron 3 of 3) intron (NM_152531, intron 3 of 3) 17054 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 118-124 chr3 194045293 194045444 + 1.5 NA intron (NR_136179, intron 1 of 2) LTR16C|LTR|ERVL 24161 NR_136181 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 182.25-51 chr18 1764860 1765039 + 1.5 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -405320 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 328-10 chr17 53651354 53651729 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -171386 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 171-88 chr3 43405986 43406377 + 1.5 NA intron (NM_001204831, intron 11 of 12) intron (NM_001204831, intron 11 of 12) -54219 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 289.5-17 chr16 87997782 87998039 + 1.5 NA intron (NM_017869, intron 4 of 11) intron (NM_017869, intron 4 of 11) 27892 NM_001173543 54971 Hs.461705 NM_017869 ENSG00000172530 BANP BEND1|SMAR1|SMARBP1 BTG3 associated nuclear protein protein-coding 141.5-95 chr2 52187202 52187326 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -183384 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 252.75-46 chr3 124758606 124758922 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 26325 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 452.25-5 chr4 10860472 10861263 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -176099 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 302-7 chr11 27317764 27318089 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 45289 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 283-11 chr11 46580114 46580355 + 1.5 NA intron (NM_001267782, intron 1 of 19) intron (NM_001267782, intron 1 of 19) 7210 NR_160027 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 246-63 chr8 94778687 94778875 + 1.5 NA intron (NM_181787, intron 14 of 18) L2c|LINE|L2 -44506 NM_017864 55656 Hs.727669 NM_017864 ENSG00000164941 INTS8 C8orf52|INT8 integrator complex subunit 8 protein-coding 320.75-23 chr6 57027292 57027533 + 1.5 NA TTS (NM_152731) TTS (NM_152731) -19120 NM_001286275 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 150-26 chr12 3762797 3762990 + 1.5 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -9784 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 189.75-107 chr6 148552100 148552250 + 1.5 NA TTS (NM_015278) TTS (NM_015278) 43024 NM_001346509 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 188-7 chr10 88965942 88966070 + 1.5 NA intron (NM_001320855, intron 1 of 8) intron (NM_001320855, intron 1 of 8) -13233 NM_001613 59 Hs.500483 NM_001613 ENSG00000107796 ACTA2 ACTSA actin alpha 2, smooth muscle protein-coding 289 chr1 184665184 184665478 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 89527 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 198.25-67 chr3 29148960 29149199 + 1.5 NA Intergenic MER129|LTR?|LTR? 131860 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 322.5-24 chr4 105380829 105381101 + 1.5 NA intron (NM_176869, intron 10 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 -28084 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 242-47 chr5 90563115 90563429 + 1.5 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) intron (NR_003149, intron 1 of 89) 4475 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 342 chr1 52045441 52045729 + 1.5 NA intron (NM_015913, intron 1 of 6) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5333 NR_126385 104355143 Hs.603708 NR_126385 ENSG00000228369 TXNDC12-AS1 - TXNDC12 antisense RNA 1 ncRNA 161-67 chr2 120854128 120854260 + 1.5 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 61913 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 168.5-71 chr18 13653641 13653805 + 1.5 NA TTS (NM_181481) TTS (NM_181481) 11965 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 338.5-18 chr20 45485947 45486415 + 1.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 16428 NM_006103 10406 Hs.2719 NM_006103 ENSG00000101443 WFDC2 EDDM4|HE4|WAP5|dJ461P17.6 WAP four-disulfide core domain 2 protein-coding 274.5-50 chr5 22665591 22665937 + 1.5 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 187580 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 409.5-18 chr9 16673920 16674287 + 1.5 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -52711 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 198-22 chr14 41199803 41200085 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 245233 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 294-33 chr8 133875361 133875620 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -11006 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 138.75-168 chr7 3220363 3220472 + 1.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -61844 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 340.5-13 chr14 47827523 47828020 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32757 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 337.5-26 chr6 45922570 45923061 + 1.5 NA intron (NR_045673, intron 1 of 4) (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 14782 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 211-32 chr2 97715886 97716059 + 1.5 NA intron (NM_001079, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 2404 NM_001079 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 171-111 chr5 95112694 95112894 + 1.5 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) intron (NM_024717, intron 1 of 22) -30928 NM_001297777 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 210-52 chr2 70575574 70575855 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21888 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 309.75-19 chr2 88418027 88418421 + 1.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 34469 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 163-11 chr10 27669109 27669317 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -75402 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 187.5-6 chr1 83992493 83992685 + 1.5 NA intron (NM_001350214, intron 1 of 21) intron (NM_001350214, intron 1 of 21) 6543 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 250.5-81 chr6 69863511 69863777 + 1.5 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -2912 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 421.5-4 chr12 57809826 57810180 + 1.5 NA intron (NM_006576, intron 6 of 18) intron (NM_006576, intron 6 of 18) 6066 NM_006576 10677 Hs.584854 NM_006576 ENSG00000135407 AVIL ADVIL|DOC6|p92 advillin protein-coding 245.5-12 chr12 47603648 47603905 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 102254 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 232-63 chr5 15001254 15001625 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -129661 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 279-20 chr2 123847099 123847294 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 177978 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 212-42 chr2 145693341 145693636 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -893569 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 273-27 chr19 11250591 11250891 + 1.5 NA intron (NM_001367830, intron 6 of 48) intron (NM_001367830, intron 6 of 48) 11122 NM_018687 55908 Hs.534467 NM_018687 ENSG00000130173 ANGPTL8 C19orf80|PRO1185|PVPA599|RIFL|TD26 angiopoietin like 8 protein-coding 330.75-13 chr2 95370304 95370539 + 1.5 NA intron (NM_001034914, intron 1 of 7) intron (NM_001034914, intron 1 of 7) 23763 NM_001034914 30818 Hs.437376 NM_013434 ENSG00000115041 KCNIP3 CSEN|DREAM|KCHIP3 potassium voltage-gated channel interacting protein 3 protein-coding 334.75-16 chr20 57642700 57643099 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -22473 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 314-21 chr7 2243230 2243463 + 1.5 NA intron (NM_198949, intron 2 of 4) LTR1|LTR|ERV1 441 NM_198953 4521 Hs.534331 NM_002452 ENSG00000106268 NUDT1 MTH1 nudix hydrolase 1 protein-coding 191.25-10 chr10 55819319 55819522 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -191478 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 313-14 chr20 8026480 8026729 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6843 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 260.5-48 chr5 24529499 24529686 + 1.5 NA intron (NM_001362460, intron 5 of 9) intron (NM_001362460, intron 5 of 9) 115386 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 151-115 chr5 162058675 162058887 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -8861 NM_198903 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 309.5-10 chr11 87082445 87082794 + 1.5 NA intron (NR_033149, intron 3 of 13) L2|LINE|L2 44685 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 219.5-21 chr11 83832342 83832661 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) L1PA16|LINE|L1 -150076 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 270.5-41 chr3 85827180 85827498 + 1.5 NA intron (NR_046752, intron 1 of 3) intron (NR_046752, intron 1 of 3) 711 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 284.25-23 chr3 190094429 190094653 + 1.5 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 26356 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 208.5-101 chr4 102801127 102801359 + 1.5 NA intron (NM_181889, intron 6 of 7) intron (NM_181889, intron 6 of 7) 24206 NR_125932 102723704 Hs.638374 NR_125932 LOC102723704 - uncharacterized LOC102723704 ncRNA 179.75-144 chrX 82147672 82147900 + 1.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 945684 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 341.25-3 chr1 204844440 204844733 + 1.5 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) intron (NM_001160332, intron 1 of 27) 15932 NM_001005388 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 208-28 chr16 48283283 48283503 + 1.5 NA intron (NM_031490, intron 8 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -35854 NM_001370497 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 543.75-3 chr8 86375562 86376216 + 1.5 NA intron (NM_007013, intron 3 of 24) L1MC5a|LINE|L1 33342 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 323.5-32 chr8 116731486 116731927 + 1.5 NA intron (NM_003756, intron 1 of 7) intron (NM_003756, intron 1 of 7) 24117 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 199.5-153 chr8 124736089 124736291 + 1.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -7683 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 141.5-72 chr16 85265152 85265355 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17705 NR_038859 197196 Hs.679002 NM_153238 ENSG00000179219 LINC00311 NCRNA00311|TMEM148 long intergenic non-protein coding RNA 311 ncRNA 264-16 chr14 83414117 83414344 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 771598 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 291.5-42 chr5 170548246 170548514 + 1.5 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) L1MEd|LINE|L1 44360 NM_001278339 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 212-59 chr3 127296980 127297161 + 1.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -9024 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 171-133 chr8 131422827 131422999 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -382004 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 427 chr1 195037972 195038337 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1050561 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 355.5-17 chr3 23252923 23253190 + 1.5 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 49729 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 155-38 chr14 55356283 55356390 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 55522 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 267.75-39 chr3 105161942 105162211 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -204637 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 388.25-5 chr4 65384747 65385139 + 1.5 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 284545 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 222.75-8 chr1 192838850 192839144 + 1.5 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 29958 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 178-10 chr10 115846015 115846225 + 1.5 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) intron (NM_207303, intron 27 of 28) 348669 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 172-78 chr4 41035671 41035843 + 1.5 NA intron (NM_001330658, intron 3 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger -178565 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 255.75-40 chr5 52554616 52554873 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -233172 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 296.5-16 chr2 51423821 51424063 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) L1M1|LINE|L1 391341 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 320.75-21 chr5 38303595 38303951 + 1.5 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) HAL1|LINE|L1 -12787 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 246.5-13 chr11 18608268 18608526 + 1.5 NA 3' UTR (NM_194285, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_194285, exon 6 of 6) 8608 NM_001355570 100506540 Hs.585529 NM_001355570 ENSG00000247595 SPTY2D1OS SPTY2D1-AS1 SPTY2D1 opposite strand protein-coding 191.25-89 chr5 145628053 145628208 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 207212 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 155.25-87 chr2 2855895 2856029 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 270064 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 149.25-122 chr3 172205672 172205869 + 1.5 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 165239 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 132.5-224 chr7 31532968 31533167 + 1.5 NA intron (NM_001257968, intron 1 of 14) L1MEf|LINE|L1 3605 NM_001257968 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 339.75-28 chr5 171074710 171074967 + 1.5 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) intron (NM_022897, intron 14 of 27) 212820 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 232.5-77 chr4 74996389 74996607 + 1.5 NA intron (NM_015393, intron 1 of 3) intron (NM_015393, intron 1 of 3) -26136 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 163-21 chr11 69459449 69459570 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -26052 NR_120545 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 330-18 chr20 44829602 44830009 + 1.5 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -19259 NM_182970 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 165-15 chr10 58236344 58236680 + 1.5 NA intron (NM_152230, intron 2 of 5) L1MEd|LINE|L1 31382 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 214.5-30 chr14 48145928 48146119 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -351009 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 258.5-48 chr3 64841344 64841580 + 1.5 NA intron (NR_038264, intron 3 of 5) intron (NR_038264, intron 3 of 5) -153462 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 194.5-15 chr10 50915916 50916203 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30384 NM_001198820 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 265.5-62 chr8 89066847 89067148 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 690714 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 240-26 chr18 1353531 1353805 + 1.5 NA intron (NR_023925, intron 2 of 6) L1MEf|LINE|L1 5961 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 149.25-156 chr6 76172667 76172768 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100039 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 134-133 chr4 78618195 78618340 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27727 NR_038307 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 294.5-37 chr4 85072532 85072924 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105244 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 200.75-46 chr2 12408878 12409023 + 1.5 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 209820 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 190.5-128 chr5 118255695 118255958 + 1.5 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -26748 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 152.5-112 chr3 15658203 15658359 + 1.5 NA intron (NM_001370752, intron 4 of 4) intron (NM_001370752, intron 4 of 4) 39090 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 230.75-67 chr7 30458160 30458411 + 1.5 NA intron (NM_006092, intron 3 of 13) intron (NM_006092, intron 3 of 13) 20499 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 312.75-23 chr3 47447148 47447606 + 1.5 NA intron (NM_012235, intron 1 of 22) AluSz|SINE|Alu 28564 NM_012235 22937 Hs.531789 NM_012235 ENSG00000114650 SCAP - SREBF chaperone protein-coding 307.75-6 chr17 52712840 52713156 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -149123 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 290.5-8 chr12 8503038 8503259 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10355 NM_080387 338339 Hs.351811 NM_080387 ENSG00000166527 CLEC4D CD368|CLEC-6|CLEC6|CLECSF8|Dectin-3|MCL|MPCL C-type lectin domain family 4 member D protein-coding 255-57 chr7 27289940 27290189 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -42835 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 245.25-8 chr10 33271963 33272325 + 1.5 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 62523 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 304.25-6 chr12 3527503 3527825 + 1.5 NA intron (NM_019854, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 -34845 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 160-17 chr11 17143135 17143278 + 1.5 NA intron (NM_001321380, intron 7 of 31) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 64780 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 277.75-11 chr16 76388994 76389316 + 1.5 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) intron (NR_136213, intron 3 of 23) 79303 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 354-6 chr10 99711195 99711541 + 1.5 NA TTS (NM_001349963) TTS (NM_001349963) -20866 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 312-21 chr3 170255975 170256323 + 1.5 NA intron (NM_002740, intron 2 of 17) L1MA3|LINE|L1 33725 NM_002740 5584 Hs.478199 NM_002740 ENSG00000163558 PRKCI DXS1179E|PKCI|nPKC-iota protein kinase C iota protein-coding 192-17 chr10 70805024 70805361 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10756 NM_003901 8879 Hs.499984 NM_003901 ENSG00000166224 SGPL1 NPHS14|S1PL|SPL sphingosine-1-phosphate lyase 1 protein-coding 240.25-72 chr8 121426271 121426609 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -212906 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 174.75-66 chr2 129596361 129596601 + 1.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 281010 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 161-94 chr5 84371704 84371940 + 1.5 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 13045 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 265-46 chr9 79207962 79208321 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62475 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 135.5-218 chrX 118379566 118379660 + 1.5 NA intron (NM_001184966, intron 2 of 17) L1ME3E|LINE|L1 -6781 NR_031685 100302214 NR_031685 ENSG00000221463 MIR1277 MIRN1277|hsa-mir-1277 microRNA 1277 ncRNA 267.5-68 chr7 51758780 51759027 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -365647 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 410-3 chr16 58375699 58376084 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16580 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 129.25-6 chr1 110346767 110346957 + 1.5 NA TTS (NM_001201545) TTS (NM_001201545) 7539 NM_022768 64783 Hs.435947 NM_022768 ENSG00000162775 RBM15 OTT|OTT1|SPEN RNA binding motif protein 15 protein-coding 413.25-9 chr9 36056081 36056670 + 1.5 NA intron (NM_021111, intron 2 of 20) L1MC5a|LINE|L1 19462 NM_001316346 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 385.75-14 chr5 19636574 19637069 + 1.5 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 249451 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 216.5-6 chr10 5695146 5695353 + 1.5 NA intron (NM_017782, intron 1 of 20) L2b|LINE|L2 10411 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 285.5-24 chr17 13366075 13366423 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59489 NR_146885 105371541 NR_146885 ENSG00000234634 LINC02093 - long intergenic non-protein coding RNA 2093 ncRNA 249-58 chr9 98063162 98063345 + 1.5 NA intron (NM_018946, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 6521 NM_018946 54187 Hs.522310 NM_018946 ENSG00000095380 NANS HEL-S-100|SAS|SEMDCG|SEMDG N-acetylneuraminate synthase protein-coding 222-40 chr2 76840306 76840585 + 1.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -145520 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 182.5-42 chr13 23867516 23867747 + 1.5 NA intron (NM_005932, intron 7 of 18) L2a|LINE|L2 -21237 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 258.75-58 chr5 52145711 52146041 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 137845 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 228.5-24 chr11 115454550 115454840 + 1.5 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 49720 NM_001098517 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 204-84 chr8 133384017 133384180 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -86794 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 231.25-30 chr2 10242775 10242942 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -50187 NR_036222 100422929 NR_036222 ENSG00000265418 MIR4261 - microRNA 4261 ncRNA 420.75-2 chr11 88293681 88294010 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001814, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001814, exon 7 of 7) 43891 NM_148170 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 207.75-68 chr22 20637518 20637728 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -51932 NR_024592 266697 Hs.558711 NR_024592 POM121L4P - POM121 transmembrane nucleoporin like 4, pseudogene pseudo 308.5-37 chr8 123738660 123739082 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -1478 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 172.5-33 chr10 79007451 79007704 + 1.5 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) intron (NR_015429, intron 3 of 7) 59871 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 230.5-119 chr9 70223820 70224096 + 1.5 NA intron (NR_125850, intron 12 of 13) intron (NR_125850, intron 12 of 13) 34916 NR_039990 100507299 Hs.556816 NR_039990 SMC5-AS1 MAMDC2-AS2 SMC5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 240.5-80 chr4 102400327 102400700 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -55031 NM_001135146 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 232.75-46 chr4 38872537 38872761 + 1.5 NA intron (NM_001330764, intron 2 of 13) intron (NM_001330764, intron 2 of 13) 4617 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 210.75-53 chr21 28502205 28502400 + 1.5 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -37016 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 175.5-14 chr10 32035497 32035701 + 1.5 NA exon (NM_004521, exon 10 of 26) exon (NM_004521, exon 10 of 26) 20826 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 346.5-27 chr6 150540546 150541003 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59111 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 323.25-16 chr3 35239802 35240075 + 1.5 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 154085 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 246-6 chr10 80551816 80552134 + 1.5 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 11156 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 271.5-14 chr11 126349490 126349737 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001350236, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001350236, exon 6 of 6) 5974 NR_033839 399972 Hs.585206 NR_033839 GSEC DCPS-AS1|ST3GAL4-AS1 G-quadruplex forming sequence containing lncRNA ncRNA 232.5-104 chr8 100938495 100938708 + 1.5 NA intron (NM_001135700, intron 2 of 5) intron (NM_001135700, intron 2 of 5) 11970 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 267.5-64 chr6 145925870 145926102 + 1.5 NA intron (NM_001370328, intron 18 of 31) intron (NM_001370328, intron 18 of 31) 38111 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 294.5-11 chr12 4989565 4989813 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -54190 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 385.5-22 chr8 53040986 53041334 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 101252 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 228-33 chr16 3362543 3362830 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 6797 NM_012368 4993 Hs.258574 NM_012368 ENSG00000168158 OR2C1 OLFmf3|OR2C2P olfactory receptor family 2 subfamily C member 1 protein-coding 192.5-106 chr5 35363129 35363288 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -132721 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 147.75-91 chr20 58282070 58282279 + 1.5 NA intron (NR_003505, intron 3 of 16) L1MC2|LINE|L1 27265 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 118.5-175 chr6 34954455 34954616 + 1.5 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 65280 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 190.5-5 chr1 63143323 63143644 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -131012 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 144-71 chr20 3587137 3587302 + 1.5 NA intron (NM_001207047, intron 18 of 24) L1M4|LINE|L1 76180 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 336.5-23 chr5 25026507 25026901 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 163952 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 171-49 chr16 77432561 77432739 + 1.5 NA intron (NM_199355, intron 2 of 22) intron (NM_199355, intron 2 of 22) 2384 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 174.75-76 chr3 6491703 6491897 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 313649 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 434.5-8 chr17 52183295 52183615 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23438 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 283-22 chr2 66823237 66823521 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -81057 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 324.75-17 chr2 22844549 22844963 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 308277 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 239.5-19 chr11 115126766 115126977 + 1.5 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -206706 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 136.5-62 chr13 67383741 67383843 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 11405 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 295.5-42 chr4 105248058 105248285 + 1.5 NA intron (NM_001127208, intron 6 of 10) L1MC5a|LINE|L1 101486 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 205.5-35 chr13 42832925 42833097 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20449 NR_125747 103689845 Hs.422131 NR_125747 ENSG00000271216 LINC01050 - long intergenic non-protein coding RNA 1050 ncRNA 139.5-93 chr2 6169886 6170043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 187986 NR_026833 400940 Hs.378814 NM_207479 LOC400940 - uncharacterized LOC400940 ncRNA 219-83 chr5 83849775 83850036 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -129050 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 313.25-16 chr22 30846718 30847102 + 1.5 NA intron (NM_001282741, intron 1 of 12) L1MB8|LINE|L1 24394 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 171.5-120 chr4 142773196 142773420 + 1.5 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) intron (NM_001331040, intron 1 of 25) 73227 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 282-7 chr11 42476330 42476572 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -222761 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 311-13 chr16 10282705 10283032 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -99960 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 132.5-48 chr12 17230298 17230453 + 1.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 241628 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 258.5-54 chr4 78950499 78950867 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11245 NM_001350106 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 289.25-21 chr4 64878695 64879029 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125638 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 262.5-20 chr14 69415066 69415325 + 1.5 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) L1ME2|LINE|L1 16503 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 219-90 chr7 81564398 81564668 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2714 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 290.25-30 chr6 145285575 145285844 + 1.5 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 401168 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 267.5-44 chr20 51012357 51012733 + 1.5 NA intron (NM_002237, intron 1 of 2) intron (NM_002237, intron 1 of 2) 10562 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 220-51 chr6 13282672 13282920 + 1.5 NA intron (NR_134872, intron 6 of 7) intron (NR_134872, intron 6 of 7) 646 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 359.25-9 chr5 76387718 76387984 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15434 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 335.25-9 chr11 84159488 84159759 + 1.5 NA intron (NM_001142699, intron 9 of 27) L2a|LINE|L2 113657 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 262.25-48 chr8 128160959 128161252 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10989 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 203.25-110 chr8 124837255 124837456 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -15297 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 315-9 chr14 81892841 81893126 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -149845 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 324.75-6 chr10 89176612 89176970 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30526 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 144.5-90 chr18 75040067 75040300 + 1.5 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 165330 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 256.75-45 chr8 144134281 144134569 + 1.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -3349 NM_016458 51236 Hs.300224 NM_016458 ENSG00000235173 HGH1 BRP16|BRP16L|C8orf30A|C8orf30B|FAM203A|FAM203B HGH1 homolog protein-coding 259-14 chr12 8618327 8618664 + 1.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -5636 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 150.75-184 chr8 103087138 103087285 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33821 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 275.25-9 chr11 21802645 21802948 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -390289 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 246.5-65 chr6 149073060 149073269 + 1.5 NA intron (NM_005715, intron 7 of 7) AluJr|SINE|Alu -40503 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 334-5 chr10 104991902 104992161 + 1.5 NA intron (NM_014978, intron 4 of 26) intron (NM_014978, intron 4 of 26) -325815 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 260-32 chr5 56132931 56133178 + 1.5 NA intron (NM_024669, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 100276 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 129.75-160 chr6 74994316 74994462 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 134393 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 280.25-43 chr4 108986941 108987310 + 1.5 NA intron (NM_198721, intron 5 of 36) intron (NM_198721, intron 5 of 36) -224072 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 262.5-75 chr8 117753937 117754231 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 166829 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 215.25-14 chr11 33948781 33948991 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -56810 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 219-16 chr11 68067458 68067646 + 1.5 NA intron (NM_001277, intron 7 of 11) AluJb|SINE|Alu 22758 NR_106811 102465451 NR_106811 ENSG00000275022 MIR6753 hsa-mir-6753 microRNA 6753 ncRNA 239.25-70 chr5 45193029 45193226 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 384180 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 140.5-204 chr7 1104934 1105121 + 1.5 NA intron (NM_001134395, intron 2 of 4) intron (NM_001134395, intron 2 of 4) 16914 NM_001098201 2852 Hs.20961 NM_001505 ENSG00000164850 GPER1 CEPR|CMKRL2|DRY12|FEG-1|GPCR-Br|GPER|GPR30|LERGU|LERGU2|LyGPR|mER G protein-coupled estrogen receptor 1 protein-coding 335-8 chr14 20717484 20717858 + 1.5 NA Intergenic HERVIP10F-int|LTR|ERV1 -28216 NM_006683 10876 Hs.304757 NM_006683 ENSG00000181562 EDDM3A EP3A|FAM12A|HE3-ALPHA|HE3A|HE3ALPHA|RAM1 epididymal protein 3A protein-coding 250-57 chr7 112462674 112462963 + 1.5 NA intron (NM_001007245, intron 9 of 12) intron (NM_001007245, intron 9 of 12) 10760 NM_001197079 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 129-174 chr8 48849315 48849425 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 72059 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 246.5-48 chr20 42026117 42026308 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -407835 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 199.5-129 chr6 91878017 91878265 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -187713 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 379.5-9 chr15 97347639 97348144 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 173920 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 241.25-43 chr22 35565855 35566171 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25182 NM_014310 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 324-13 chr2 74621894 74622239 + 1.5 NA intron (NM_001321739, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 25971 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 431-3 chr15 26314997 26315303 + 1.5 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 199337 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 266.5-11 chr11 88591885 88592193 + 1.5 NA intron (NM_001143831, intron 5 of 8) intron (NM_001143831, intron 5 of 8) 87463 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 272.5-5 chr1 178863936 178864310 + 1.5 NA intron (NM_004673, intron 3 of 5) intron (NM_004673, intron 3 of 5) 6954 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 218.75-58 chr3 135447170 135447475 + 1.5 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -518406 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 231.5-64 chr3 85793963 85794252 + 1.5 NA intron (NM_001256504, intron 3 of 10) intron (NM_001256504, intron 3 of 10) 33943 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 271.5-58 chr3 111678369 111678675 + 1.5 NA intron (NM_001185106, intron 1 of 4) intron (NM_001185106, intron 1 of 4) -1089 NR_046733 100874115 Hs.626740 NR_046733 PLCXD2-AS1 - PLCXD2 antisense RNA 1 ncRNA 415.75-3 chr14 69111416 69111733 + 1.5 NA intron (NM_003861, intron 5 of 8) intron (NM_003861, intron 5 of 8) 41025 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 149.5-61 chr14 72094130 72094302 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 160689 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 465.5-3 chr7 86896792 86897229 + 1.5 NA intron (NM_001291991, intron 18 of 20) intron (NM_001291991, intron 18 of 20) 68889 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 232-73 chr8 10027817 10028068 + 1.5 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -26350 NM_001135670 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 500-6 chr9 36884601 36885365 + 1.5 NA intron (NR_103999, intron 6 of 8) intron (NR_103999, intron 6 of 8) 8548 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 194.25-18 chr11 79568151 79568587 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -127339 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 321.5-33 chr8 53534478 53534859 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10703 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 139.25-5 chr1 80961306 80961464 + 1.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 320098 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 321.5-13 chr19 33897371 33897730 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 100680 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 320.75-12 chr20 63306786 63307105 + 1.5 NA intron (NM_020882, intron 5 of 35) intron (NM_020882, intron 5 of 35) 13759 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 209-12 chr12 6984939 6985083 + 1.5 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) intron (NM_005768, intron 1 of 12) 14098 NR_135131 10436 Hs.558447 NM_006331 ENSG00000126749 EMG1 C2F|Grcc2f|NEP1 EMG1 N1-specific pseudouridine methyltransferase protein-coding 304.5-20 chr3 69151092 69151604 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28753 NM_001304418 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 356.5-10 chr15 70818639 70819027 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34406 NM_001284357 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 129.75-166 chr7 8984517 8984663 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 550981 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 294.75-24 chr3 72784199 72784451 + 1.5 NA intron (NM_018130, intron 10 of 10) intron (NM_018130, intron 10 of 10) 64120 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 398.5-6 chr2 42357982 42358492 + 1.5 NA intron (NM_001319037, intron 1 of 2) L1M4|LINE|L1 1801 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 234-57 chr6 38116056 38116286 + 1.5 NA intron (NM_021943, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 296444 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 208.5-41 chr15 39864367 39864542 + 1.5 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) L1PB4|LINE|L1 -35178 NM_001271855 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 330.5-31 chr8 88257037 88257373 + 1.5 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 70278 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 359.5-3 chr14 42731419 42731937 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1124822 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 285-22 chr2 37445424 37445805 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 100984 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 159.75-169 chr8 53554907 53555053 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -31015 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 177.75-121 chr6 37889607 37889785 + 1.5 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 69969 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 315-19 chr4 143030200 143030508 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 154507 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 183-36 chr16 27479408 27479642 + 1.5 NA intron (NM_001520, intron 27 of 36) intron (NM_001520, intron 27 of 36) -26132 NR_037158 283888 Hs.660935 NR_037158 ENSG00000259954 IL21R-AS1 - IL21R antisense RNA 1 ncRNA 174-84 chr6 112951989 112952263 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 481321 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 198.5-81 chr2 173065878 173066103 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9856 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 165.5-145 chr5 11701333 11701542 + 1.5 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -112371 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 271.5-25 chr15 87268585 87268913 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -280323 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 265.5-54 chr6 159856851 159857110 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -34008 NM_002377 4142 Hs.99900 NM_002377 ENSG00000130368 MAS1 MAS|MGRA MAS1 proto-oncogene, G protein-coupled receptor protein-coding 301.75-11 chr14 25211354 25211776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -161268 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 319-39 chr9 10956727 10956996 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 343655 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 239-34 chr22 28353723 28353926 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MB4|LINE|L1 -106045 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 168-25 chr11 31732172 31732388 + 1.5 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) L1MB1|LINE|L1 68381 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 258-33 chr3 17236843 17237098 + 1.5 NA intron (NM_001349086, intron 15 of 20) intron (NM_001349086, intron 15 of 20) 303774 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 382.25-2 chr11 40125665 40126056 + 1.5 NA intron (NR_047674, intron 1 of 1) intron (NR_047674, intron 1 of 1) 167270 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 311.5-5 chr11 10992292 10992805 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 134331 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 263.25-47 chr5 96541316 96541628 + 1.5 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) L1MC3|LINE|L1 -108224 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 375.75-2 chr10 109451032 109451467 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 471997 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 139.5-71 chr15 83430298 83430443 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16858 NM_001324185 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 336-20 chr5 51322430 51322726 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 60754 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 237.25-21 chr13 103759401 103759630 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 334315 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 218.5-80 chr4 19664144 19664339 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -587664 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 198.5-60 chr18 80202527 80202749 + 1.5 NA intron (NM_032510, intron 2 of 2) intron (NM_032510, intron 2 of 2) 44876 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 285-27 chr2 185286748 185287121 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -119862 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 125.75-97 chr2 116238775 116238895 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 895020 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 140-55 chr16 77681765 77681949 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40635 NM_001243660 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 305.5-36 chr5 158270839 158271182 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 138763 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 180.75-114 chr5 59115009 59115177 + 1.5 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) L2|LINE|L2 -75617 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 393.75-9 chr5 120168925 120169353 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -295139 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 381.75-6 chr8 121149577 121149968 + 1.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -337726 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 292-41 chr7 103784122 103784545 + 1.5 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 205183 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 258-3 chr1 86432843 86433141 + 1.5 NA intron (NM_006536, intron 5 of 13) intron (NM_006536, intron 5 of 13) 8821 NM_006536 9635 Hs.241551 NM_006536 ENSG00000137975 CLCA2 CACC|CACC3|CLCRG2|CaCC-3 chloride channel accessory 2 protein-coding 194.25-74 chr3 136175651 136175793 + 1.5 NA intron (NM_018133, intron 1 of 1) intron (NM_018133, intron 1 of 1) 18746 NM_001145417 55167 Hs.18631 NM_018133 ENSG00000174579 MSL2 MSL-2|MSL2L1|RNF184 MSL complex subunit 2 protein-coding 206-68 chr7 43024179 43024521 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -88297 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 291-26 chr4 14442136 14442376 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 330288 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 193-91 chr8 135078465 135078623 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -155587 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 189-81 chr4 35152048 35152285 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -882419 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 224-2 chr1 57937104 57937352 + 1.5 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) intron (NM_021080, intron 1 of 16) 76647 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 297-27 chr2 19899929 19900242 + 1.5 NA intron (NM_001008237, intron 1 of 2) intron (NM_001008237, intron 1 of 2) 1898 NM_001008237 130502 Hs.591547 NM_001008237 ENSG00000183891 TTC32 - tetratricopeptide repeat domain 32 protein-coding 320.75-13 chr21 10418251 10418738 + 1.5 NA intron (NM_181704, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 4962 NM_182481 85318 Hs.545789 NM_182481 BAGE3 CT2.3 BAGE family member 3 protein-coding 199-32 chr2 5542806 5543030 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 148200 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 128.5-169 chr5 9643349 9643544 + 1.5 NA intron (NR_027112, intron 11 of 12) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -13095 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 193.75-97 chr4 164418125 164418319 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -34967 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 139-59 chr18 31734224 31734340 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 26598 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 189.5-166 chr9 132272780 132272994 + 1.5 NA intron (NM_001351527, intron 23 of 25) L1M4|LINE|L1 81969 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 181.5-163 chr8 133423801 133424063 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -126628 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 267.25-42 chr7 140883863 140884201 + 1.5 NA intron (NR_148928, intron 1 of 17) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 40897 NR_148928 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 493.5-3 chr18 40633185 40633627 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 567120 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 212-56 chr3 86107293 86107494 + 1.5 NA Intergenic LTR34|LTR|ERV1 -279343 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 142-104 chr3 41213994 41214128 + 1.5 NA intron (NM_001904, intron 1 of 14) intron (NM_001904, intron 1 of 14) 14556 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 229.5-24 chr11 10769601 10769853 + 1.5 NA intron (NM_014633, intron 16 of 24) intron (NM_014633, intron 16 of 24) 18481 NM_014633 9646 Hs.725151 NM_014633 ENSG00000198730 CTR9 SH2BP1|TSBP|p150|p150TSP CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 161-90 chr5 41628370 41628550 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -117859 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 252.75-72 chr8 37743793 37744072 + 1.5 NA intron (NM_007175, intron 4 of 11) intron (NM_007175, intron 4 of 11) 4114 NR_003671 728024 Hs.647135 NR_003671 LOC728024 - chromosome X open reading frame 56 pseudogene pseudo 227.25-30 chr15 61624087 61624289 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -105730 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 276.75-36 chr4 66221283 66221585 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55390 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 210.5-117 chr7 10982022 10982205 + 1.5 NA intron (NR_033436, intron 2 of 16) intron (NR_033436, intron 2 of 16) 8241 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 121.25-189 chr7 114025638 114025727 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60645 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 237.75-81 chr8 117063835 117064143 + 1.5 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -71006 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 295-29 chr6 123985572 123985891 + 1.5 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 181866 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 247-17 chr12 112764175 112764517 + 1.5 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) LTR49|LTR|ERV1 -27192 NM_001347953 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 200-41 chr18 67609510 67609731 + 1.5 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) -92900 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 266-23 chr2 108249344 108249758 + 1.5 NA intron (NM_001008743, intron 2 of 7) L1ME1|LINE|L1 9583 NM_001008743 442038 NM_001008743 ENSG00000196228 SULT1C3 ST1C3 sulfotransferase family 1C member 3 protein-coding 300.5 chr1 15971606 15971822 + 1.5 NA intron (NM_001287603, intron 2 of 15) intron (NM_001287603, intron 2 of 15) 4418 NM_001324138 7709 Hs.433764 NM_003443 ENSG00000116809 ZBTB17 MIZ-1|ZNF151|ZNF60|pHZ-67 zinc finger and BTB domain containing 17 protein-coding 423.75-6 chr21 16264784 16265114 + 1.5 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) 19819 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 181-12 chr10 122910366 122910511 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001029888) promoter-TSS (NM_001029888) -172 NM_001029888 118670 Hs.369829 NM_001029888 ENSG00000203795 FAM24A - family with sequence similarity 24 member A protein-coding 316.5-27 chr3 105346904 105347316 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19603 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 157.25-30 chr11 111654963 111655236 + 1.5 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 52650 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 232-22 chr17 21988503 21988810 + 1.5 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -214339 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 309-13 chr13 107253931 107254269 + 1.5 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 66863 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 252.25-12 chr12 26951822 26952066 + 1.5 NA intron (NM_015633, intron 1 of 6) intron (NM_015633, intron 1 of 6) 13474 NM_015633 26127 Hs.591162 NM_015633 ENSG00000111790 FGFR1OP2 HSPC123-like|WIT3.0 FGFR1 oncogene partner 2 protein-coding 289.5-22 chr2 40825205 40825561 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -312948 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 471-5 chr21 21765599 21766254 + 1.5 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 18941 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 281-21 chr3 125437816 125438040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -62574 NM_001348427 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 237-55 chr6 42274527 42274815 + 1.5 NA intron (NM_001297573, intron 4 of 17) AluSz6|SINE|Alu -56810 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 174.5-82 chr17 62811725 62811969 + 1.5 NA intron (NR_135634, intron 1 of 1) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 3345 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 289.5-37 chr4 88140461 88140846 + 1.5 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) intron (NM_001257386, intron 1 of 15) 17986 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 270.25-16 chr13 23161263 23161509 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19535 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 171-87 chr22 28147135 28147366 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -226638 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 231.5-34 chr16 78564990 78565186 + 1.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 465434 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 156-131 chr6 73628722 73628940 + 1.5 NA intron (NM_012434, intron 6 of 10) intron (NM_012434, intron 6 of 10) 25161 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 243.75-29 chr15 66311405 66311677 + 1.5 NA intron (NM_001323944, intron 4 of 16) intron (NM_001323944, intron 4 of 16) 17726 NM_001323943 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 321-23 chr5 46409316 46409713 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -713134 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 122-194 chr9 18036466 18036568 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -437636 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 157-96 chr5 100614024 100614133 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 78704 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 142.75-4 chr1 70912403 70912507 + 1.5 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -134051 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 169-94 chr6 143129393 143129665 + 1.5 NA intron (NM_001366358, intron 1 of 5) intron (NM_001366358, intron 1 of 5) 3390 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 320.25-35 chr9 95866624 95866938 + 1.5 NA intron (NR_023390, intron 1 of 2) intron (NR_023390, intron 1 of 2) -8910 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 218.5-107 chr6 51768335 51768614 + 1.5 NA intron (NM_138694, intron 55 of 66) intron (NM_138694, intron 55 of 66) 146604 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 184.5-89 chr21 18069389 18069542 + 1.5 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) 152125 NM_001204176 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 414.25-4 chr14 29810143 29810609 + 1.5 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 116720 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 288.25-17 chr21 29673627 29674039 + 1.5 NA intron (NM_001320621, intron 1 of 13) intron (NM_001320621, intron 1 of 13) -74342 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-77 chr16 64845421 64845570 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 276568 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 405-3 chr14 64215931 64216385 + 1.5 NA 5' UTR (NM_182910, exon 1 of 9) 5' UTR (NM_182910, exon 1 of 9) 204 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 224.5-51 chr17 68106884 68107161 + 1.5 NA intron (NR_027418, intron 3 of 5) intron (NR_027418, intron 3 of 5) 5467 NR_027418 100499466 Hs.591212 NR_027418 LINC00674 - long intergenic non-protein coding RNA 674 ncRNA 265.75-72 chr8 53281984 53282289 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30439 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 220-22 chr16 23079391 23079664 + 1.5 NA intron (NM_020718, intron 13 of 15) FAM|SINE|Alu 69743 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 194.5-93 chr3 102997467 102997607 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 526579 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 219-61 chr21 30188293 30188479 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21581 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 244-56 chr8 11116109 11116400 + 1.5 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) -49165 NR_134308 101929269 Hs.680442 NR_134308 ENSG00000254839 LOC101929269 - uncharacterized LOC101929269 ncRNA 183.5-68 chr2 104151408 104151554 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 256851 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 138-89 chr20 58392332 58392442 + 1.5 NA intron (NR_036633, intron 1 of 3) intron (NR_036633, intron 1 of 3) 3158 NM_001195677 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 242.5-39 chr18 155994 156198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2461 NM_005151 9097 Hs.464416 NM_005151 ENSG00000101557 USP14 TGT ubiquitin specific peptidase 14 protein-coding 325.75-4 chr10 22303974 22304651 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -12071 NM_001204062 100532731 Hs.380403 NM_001204062 ENSG00000269897 COMMD3-BMI1 BMI1|PCGF4|RNF51 COMMD3-BMI1 readthrough protein-coding 226.5-60 chr3 65034852 65035071 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -346961 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 191-15 chr12 17067263 17067471 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 78620 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 204.5-117 chr7 26385821 26386033 + 1.5 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -9226 NR_136270 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 154.5-64 chr14 83119538 83119719 + 1.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 476996 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 252.5-83 chr8 128399692 128400010 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 164828 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 229.25-24 chr14 42867341 42867667 + 1.5 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 1260648 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 189-79 chr3 114321761 114321905 + 1.5 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -5264 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 227-58 chr6 112513663 112513896 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 166449 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 206.5-2 chr1 48831353 48831530 + 1.5 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) intron (NR_136623, intron 5 of 12) -54472 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 586.5 chr8 68629829 68630270 + 1.5 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) intron (NR_146186, intron 7 of 12) -298558 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 232.25-69 chr6 88329737 88329920 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -162479 NM_001370546 1268 Hs.75110 NM_016083 ENSG00000118432 CNR1 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR cannabinoid receptor 1 protein-coding 270-58 chr9 95282222 95282473 + 1.5 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) L1M1|LINE|L1 34907 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 407.5-12 chr9 27126589 27127015 + 1.5 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) intron (NM_001290078, intron 1 of 20) 17661 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 231.5-72 chr4 59353434 59353605 + 1.5 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 339946 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 235.5-11 chr10 64479669 64479952 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -345718 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 283-50 chrX 43187475 43187738 + 1.5 NA intron (NR_110387, intron 1 of 5) intron (NR_110387, intron 1 of 5) 10612 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 161.25-118 chr3 14232353 14232551 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 53635 NM_014463 27258 Hs.111632 NM_014463 ENSG00000170860 LSM3 SMX4|USS2|YLR438C LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 294.5-44 chr5 127587472 127587716 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61427 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 319.5-8 chr11 82987002 82987371 + 1.5 NA intron (NM_001286059, intron 4 of 4) intron (NM_001286059, intron 4 of 4) 47088 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 122.5-84 chr17 56953540 56953668 + 1.5 NA intron (NM_004645, intron 1 of 6) intron (NM_004645, intron 1 of 6) 7446 NM_004645 8161 Hs.532795 NM_004645 ENSG00000121058 COIL CLN80|p80-coilin coilin protein-coding 246-51 chr5 75894060 75894237 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -176711 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 184.5-48 chr14 77330481 77330684 + 1.5 NA intron (NM_001363703, intron 8 of 8) intron (NM_001363703, intron 8 of 8) 6043 NM_001363703 2954 Hs.655292 NM_001513 ENSG00000100577 GSTZ1 GSTZ1-1|MAAI|MAAID|MAI glutathione S-transferase zeta 1 protein-coding 348.75-21 chr8 130435188 130435574 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) L2b|LINE|L2 8279 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 150-99 chr3 132557900 132558080 + 1.5 NA TTS (NR_132426) TTS (NR_132426) -39280 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 262.5-44 chr22 19502339 19502579 + 1.5 NA intron (NM_001369291, intron 9 of 18) LTR57-int|LTR|ERVL 21951 NM_001363066 7122 Hs.505337 NM_003277 ENSG00000184113 CLDN5 AWAL|BEC1|CPETRL1|TMDVCF|TMVCF claudin 5 protein-coding 224-18 chr14 55379500 55379821 + 1.5 NA intron (NM_014924, intron 7 of 9) intron (NM_014924, intron 7 of 9) 32198 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 271.5-39 chr2 136950391 136950667 + 1.5 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 184984 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 311-27 chr6 158211307 158211581 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 43097 NM_207118 404672 Hs.356224 NM_207118 ENSG00000272047 GTF2H5 C6orf175|TFB5|TFIIH|TGF2H5|TTD|TTD-A|TTD3|TTDA|bA120J8.2 general transcription factor IIH subunit 5 protein-coding 272.5-10 chr10 19240604 19240978 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) L1MA6|LINE|L1 191990 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 243.75-68 chr5 52675266 52675507 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -112530 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 152.25-35 chr11 123365023 123365165 + 1.5 NA intron (NM_001367419, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR 6558 NM_001367421 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 396.25-10 chr21 29663167 29663500 + 1.5 NA intron (NM_000830, intron 4 of 16) intron (NM_000830, intron 4 of 16) 67293 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 229-44 chr20 59084209 59084508 + 1.5 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -41512 NR_037929 100533975 Hs.656865 NR_037929 SLMO2-ATP5E - SLMO2-ATP5E readthrough ncRNA 373-11 chr4 100525102 100525474 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7266 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 425.75-2 chr6 39179216 39179599 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 50068 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 364.5-7 chr10 127166788 127167202 + 1.5 NA intron (NM_001039762, intron 4 of 5) intron (NM_001039762, intron 4 of 5) 29596 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 307-21 chr3 76009288 76009697 + 1.5 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -223943 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 313.5-23 chr2 218913096 218913448 + 1.5 NA intron (NR_110238, intron 3 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 17365 NR_110238 101928537 Hs.611129 NR_110238 ENSG00000228135 LINC01494 - long intergenic non-protein coding RNA 1494 ncRNA 223.5-27 chr11 83115419 83115684 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -41580 NM_015885 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 452-3 chr18 66476757 66477528 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 126948 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 192-19 chr10 97183445 97183713 + 1.5 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR 2380 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 142.5-20 chr1 211382120 211382243 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_026761) promoter-TSS (NR_026761) -574 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 269.25-27 chr21 27682137 27682429 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -40096 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 243.5-73 chr7 39347813 39347981 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) AluJb|SINE|Alu -18763 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 184.75-62 chr3 12024528 12024696 + 1.5 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) L1ME3|LINE|L1 20221 NM_133625 6854 Hs.445503 NM_003178 ENSG00000157152 SYN2 SYNII synapsin II protein-coding 197.5-158 chr8 64471491 64471710 + 1.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 92451 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 173.5-5 chr1 109986917 109987066 + 1.5 NA intron (NM_001242673, intron 1 of 16) intron (NM_001242673, intron 1 of 16) 2226 NM_006621 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 274-26 chr3 77712440 77712660 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 336413 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 246.75-62 chr7 12981802 12982129 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 294332 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 386.25-7 chr20 13550386 13550765 + 1.5 NA intron (NM_001323602, intron 4 of 9) intron (NM_001323602, intron 4 of 9) 88357 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 308-32 chrX 67184511 67184922 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -359305 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 383.75-9 chr8 125852512 125852915 + 1.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 98484 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 155.25-6 chr1 71349013 71349135 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 267750 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 168.75-37 chr13 43642435 43642646 + 1.5 NA intron (NM_001347964, intron 2 of 17) intron (NM_001347964, intron 2 of 17) -13063 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 258.75-37 chr2 55079451 55079744 + 1.5 NA intron (NM_001321904, intron 2 of 9) MER102b|DNA|hAT-Charlie -28325 NM_001321859 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 213-16 chr10 113042733 113042994 + 1.5 NA intron (NM_001198528, intron 4 of 14) intron (NM_001198528, intron 4 of 14) -2492 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 280 chr1 15526480 15526831 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001287811) promoter-TSS (NM_001287811) -158 NM_001287811 23341 Hs.655410 NM_015291 ENSG00000116138 DNAJC16 - DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C16 protein-coding 273-26 chr17 41193536 41193852 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 3807 NM_001190460 728318 Hs.727478 NM_001190460 ENSG00000240542 KRTAP9-1 KAP9.1|KRTAP9L3 keratin associated protein 9-1 protein-coding 234-74 chr9 133616374 133616709 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -19822 NM_000787 1621 Hs.591890 NM_000787 ENSG00000123454 DBH DBM|ORTHYP1 dopamine beta-hydroxylase protein-coding 307.75-15 chr3 52051328 52051756 + 1.5 NA intron (NM_001947, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 5029 NM_001947 1849 Hs.591664 NM_001947 ENSG00000164086 DUSP7 MKPX|PYST2 dual specificity phosphatase 7 protein-coding 130.75-67 chr16 87792060 87792187 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -12975 NR_120309 102724467 Hs.587857 NR_120309 LOC102724467 - uncharacterized LOC102724467 ncRNA 351.25-14 chr8 72102360 72102949 + 1.5 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -27070 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 252.25-45 chr4 159109220 159109527 + 1.5 NA intron (NM_001351724, intron 1 of 30) intron (NM_001351724, intron 1 of 30) 5322 NM_001351724 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 290 chr1 40634283 40634582 + 1.5 NA intron (NM_014747, intron 4 of 7) intron (NM_014747, intron 4 of 7) 31250 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 191.5-67 chr18 75152037 75152335 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 53327 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 452.75 chr1 172905762 172906242 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 144961 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 328-14 chr2 111934734 111935135 + 1.5 NA intron (NM_006343, intron 2 of 18) intron (NM_006343, intron 2 of 18) 36327 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 174-18 chr11 77696695 77696967 + 1.5 NA intron (NM_016578, intron 7 of 15) intron (NM_016578, intron 7 of 15) -59025 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 129.75-128 chr4 11133481 11133586 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -235294 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 227.25-52 chr21 28412063 28412312 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -127131 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 472.5-2 chr5 11801224 11801850 + 1.5 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 102909 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 237.5-7 chr1 179151304 179151553 + 1.5 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) intron (NM_007314, intron 1 of 11) -8352 NM_001136000 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 254.5-63 chr6 76975649 76975837 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -382120 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 306-29 chr4 115333832 115334101 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -220346 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 290-11 chr11 99212802 99213274 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) AluSc8|SINE|Alu 192089 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 251.5-58 chr4 30629745 30629948 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -90523 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 258.5 chr1 49597334 49597653 + 1.5 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 -125408 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 369.75-11 chr18 10554796 10555208 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28975 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 281.75-41 chr7 43630408 43630824 + 1.5 NA TTS (NR_047701) TTS (NR_047701) 47508 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 215.75-55 chr2 225921220 225921448 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -221460 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 312-12 chr13 21508310 21508650 + 1.5 NA intron (NM_152726, intron 8 of 11) intron (NM_152726, intron 8 of 11) -49110 NM_001286638 253832 Hs.564611 NM_153251 ENSG00000180776 ZDHHC20 4933421L13Rik|DHHC-20|DHHC20 zinc finger DHHC-type containing 20 protein-coding 234-52 chr5 13261849 13262175 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -229126 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 316.75-10 chr20 54826974 54827344 + 1.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 351566 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 322.5-29 chr5 108713681 108714033 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 14404 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 163-8 chr1 171576631 171576883 + 1.5 NA intron (NM_015172, intron 25 of 33) AluJr|SINE|Alu -43006 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 197-67 chr9 24185744 24185951 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -335246 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 326.25-24 chr4 65097070 65097503 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92786 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 248-32 chr2 10644846 10645024 + 1.5 NA intron (NR_048552, intron 11 of 19) intron (NR_048552, intron 11 of 19) 45040 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 234.5-67 chr3 185491566 185491746 + 1.5 NA exon (NM_080652, exon 5 of 5) exon (NM_080652, exon 5 of 5) 7379 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 414.25-8 chr5 110255270 110255671 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 258445 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 182.5-163 chr8 86458329 86458591 + 1.5 NA intron (NM_007013, intron 22 of 24) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 50226 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 225-55 chr5 27804223 27804393 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 332016 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 179-37 chr14 73684950 73685097 + 1.5 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) intron (NM_001201366, intron 6 of 8) 29361 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 151.5-8 chr1 96202999 96203296 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 170978 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 220.25-9 chr10 37537421 37537599 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 65421 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 346-16 chr4 92486086 92486455 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 181871 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 227.5-23 chr12 50019061 50019320 + 1.5 NA intron (NM_001320006, intron 1 of 17) intron (NM_001320006, intron 1 of 17) 6304 NM_001319999 29127 Hs.505469 NM_013277 ENSG00000161800 RACGAP1 CYK4|HsCYK-4|ID-GAP|MgcRacGAP Rac GTPase activating protein 1 protein-coding 189.75-58 chr2 55558221 55558391 + 1.5 NA intron (NM_020463, intron 14 of 14) intron (NM_020463, intron 14 of 14) 38711 NM_001282761 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 212.25-66 chr4 59955697 59955939 + 1.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 942245 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 302.5-25 chr21 29388257 29388515 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15885 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 328-33 chr7 23136200 23136431 + 1.5 NA intron (NM_001031710, intron 4 of 10) intron (NM_001031710, intron 4 of 10) 29654 NM_018846 55975 Hs.654817 NM_018846 ENSG00000122550 KLHL7 CISS3|KLHL6|SBBI26 kelch like family member 7 protein-coding 148-70 chr20 16007168 16007307 + 1.5 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) intron (NM_001351663, intron 15 of 17) -21355 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 207.75-61 chr2 188790567 188790839 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_161166) promoter-TSS (NR_161166) -580 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 257-39 chr3 180650330 180650691 + 1.5 NA intron (NM_181426, intron 9 of 19) intron (NM_181426, intron 9 of 19) 28979 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 299.25-26 chr2 147111484 147111723 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 524546 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 231-41 chr2 123416302 123416529 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -342934 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 420-4 chr14 49684086 49684617 + 1.5 NA intron (NM_001348385, intron 1 of 18) AluY|SINE|Alu 3863 NM_001197331 5427 Hs.162777 NM_002692 ENSG00000100479 POLE2 DPE2 DNA polymerase epsilon 2, accessory subunit protein-coding 149.25-41 chr13 69688155 69688330 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -418971 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 342.5-27 chr7 42816361 42816636 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 95345 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 224-55 chr7 19722318 19722600 + 1.5 NA intron (NM_152774, intron 3 of 3) LFSINE_Vert|SINE|tRNA -13422 NM_001002926 221830 Hs.353035 NM_001002926 ENSG00000105849 TWISTNB - TWIST neighbor protein-coding 238.5-12 chr10 79969858 79970314 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -20981 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 231.5-77 chr4 162591971 162592221 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -428062 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 222.5-66 chr3 30048727 30048883 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -114649 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 175.5-41 chr12 51237196 51237322 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1465 NM_001136269 9802 Hs.369761 NM_014764 ENSG00000183283 DAZAP2 PRTB DAZ associated protein 2 protein-coding 281-15 chr2 88044522 88044814 + 1.5 NA intron (NM_001304526, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 11115 NM_016618 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 351.5-17 chr2 100657489 100657796 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 53903 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 394.25-5 chr5 3302246 3302527 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 124551 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 289.5-15 chr14 88220450 88220759 + 1.5 NA intron (NM_138317, intron 4 of 6) L1MC1|LINE|L1 50307 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 415.5 chr1 186684604 186685104 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 4200 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 205.75-36 chr19 11524401 11524778 + 1.5 NA intron (NM_001142465, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 4276 NM_001243204 51295 Hs.515146 NM_016581 ENSG00000130159 ECSIT SITPEC ECSIT signalling integrator protein-coding 250.25-36 chr3 176283803 176284048 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 39374 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 225.5-20 chr11 36303242 36303472 + 1.5 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) intron (NM_001160167, intron 1 of 8) 7069 NM_001160167 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 226-61 chr6 126234380 126234623 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -105288 NM_001012507 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 357.5-16 chr5 24484655 24485039 + 1.5 NA Intergenic (AAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 160131 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 197.5-28 chr12 14827057 14827278 + 1.5 NA 3' UTR (NM_021071, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_021071, exon 3 of 3) -12985 NM_001013698 440087 Hs.220931 NM_001013698 ENSG00000179256 SMCO3 C12orf69 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 3 protein-coding 194.25-60 chr2 124602468 124602599 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) AluJr|SINE|Alu 577246 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 245.5-52 chr3 135651987 135652179 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -313645 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 332.75-14 chr20 34119448 34119969 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7465 NM_001316364 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 134-25 chr10 121375119 121375224 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 156143 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 212.5-93 chr6 69717134 69717379 + 1.5 NA intron (NM_001367272, intron 8 of 15) L1M5|LINE|L1 79210 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 198-54 chr3 173458630 173458829 + 1.5 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 60985 NM_001365925 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 268.5-30 chr2 77979561 77979827 + 1.5 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1PA15|LINE|L1 -24668 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 277.5-61 chr5 3845298 3845511 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 249572 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 321.75-33 chr8 100478609 100478938 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 80986 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 219.75-59 chr4 154234824 154235074 + 1.5 NA exon (NM_001358235, exon 20 of 20) exon (NM_001358235, exon 20 of 20) 256850 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 235.25-22 chr14 82234013 82234205 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -408523 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 259.5 chr1 16634973 16635305 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4233 NR_026752 84809 Hs.631865 NR_026752 ENSG00000215908 CROCCP2 CROCCL1 CROCC pseudogene 2 pseudo 358-5 chr17 60895377 60895761 + 1.5 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) L1PB4|LINE|L1 217718 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 338.25-15 chr2 17640347 17640822 + 1.5 NA intron (NM_001366805, intron 2 of 2) intron (NM_001366805, intron 2 of 2) 99888 NM_001366805 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 220.5-35 chr17 52704960 52705193 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -157045 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 369.5-23 chr4 13731974 13732327 + 1.5 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 76971 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 440.5-7 chr19 50602085 50602525 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2658 NR_004384 100126781 Hs.707968 NR_004384 SNAR-F - small NF90 (ILF3) associated RNA F snRNA 187.5-92 chr2 123397053 123397207 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -323649 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 295.25-21 chr4 60655185 60655481 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -267286 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 258-47 chr5 16152937 16153263 + 1.5 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 26691 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 339.5-15 chr2 9431246 9431518 + 1.5 NA intron (NM_001321835, intron 4 of 17) intron (NM_001321835, intron 4 of 17) 7728 NM_016207 51692 Hs.515972 NM_016207 ENSG00000119203 CPSF3 CPSF-73|CPSF73 cleavage and polyadenylation specific factor 3 protein-coding 347.25-15 chr4 84689381 84689715 + 1.5 NA intron (NM_014991, intron 61 of 67) intron (NM_014991, intron 61 of 67) 106421 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 175-111 chr6 54604660 54604922 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -241980 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 289-10 chr11 106680347 106680741 + 1.5 NA 3' UTR (NM_000855, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_000855, exon 8 of 8) 337932 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 276-24 chr2 41083864 41084086 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -571540 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 357.75-3 chr1 196465013 196465358 + 1.5 NA intron (NM_001287820, intron 8 of 26) intron (NM_001287820, intron 8 of 26) 117296 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 186-10 chr10 91837344 91837485 + 1.5 NA intron (NM_025235, intron 13 of 26) intron (NM_025235, intron 13 of 26) 38988 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 300-40 chr8 49682040 49682306 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -169993 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 197.25-30 chr14 78804309 78804455 + 1.5 NA intron (NR_073547, intron 9 of 20) intron (NR_073547, intron 9 of 20) -395600 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 170.75-7 chr1 218371183 218371475 + 1.5 NA intron (NR_138149, intron 2 of 7) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -25651 NR_046268 728463 Hs.568469 NR_046268 ENSG00000232480 TGFB2-AS1 - TGFB2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 292.25-37 chr5 170955948 170956285 + 1.5 NA intron (NM_022897, intron 13 of 27) intron (NM_022897, intron 13 of 27) 94098 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 304.5-10 chr14 73856040 73856410 + 1.5 NA intron (NM_001371328, intron 1 of 8) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 4278 NM_001146155 145482 Hs.632344 NM_152444 ENSG00000140043 PTGR2 HEL-S-298|PGR2|ZADH1 prostaglandin reductase 2 protein-coding 265-43 chr8 138452423 138452660 + 1.5 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 44720 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 429.75-4 chr2 70437935 70438401 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 43472 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 195-66 chr3 113435165 113435393 + 1.5 NA intron (NM_001164496, intron 1 of 34) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -3079 NR_107043 102466253 NR_107043 ENSG00000275670 MIR8076 hsa-mir-8076 microRNA 8076 ncRNA 346.5-25 chr6 112509618 112510050 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 162504 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 252.5-42 chr2 67230013 67230394 + 1.5 NA intron (NR_110568, intron 2 of 3) intron (NR_110568, intron 2 of 3) -14884 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 132-131 chr5 9462081 9462179 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -49203 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 420.75-8 chr21 23751596 23752033 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -366979 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 214.5-41 chr16 61661244 61661523 + 1.5 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) L1M4b|LINE|L1 375055 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 190.5-134 chr6 42932821 42933001 + 1.5 NA intron (NR_134881, intron 2 of 7) intron (NR_134881, intron 2 of 7) 3431 NR_134890 107080644 Hs.144914 NM_001318856 CNPY3-GNMT - CNPY3-GNMT readthrough protein-coding 190.5-124 chr5 83827364 83827639 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -106646 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 307.75-22 chr9 32881649 32881948 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 98258 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 230.25-22 chr12 52597443 52597668 + 1.5 NA intron (NM_080747, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 3908 NM_080747 140807 Hs.662013 NM_080747 ENSG00000170486 KRT72 K6IRS2|K6irs|KRT6|KRT6IRS2 keratin 72 protein-coding 287.5-36 chr2 222470886 222471248 + 1.5 NA intron (NM_001320833, intron 2 of 5) intron (NM_001320833, intron 2 of 5) 46524 NM_152386 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 243.75-32 chr16 60046519 60046780 + 1.5 NA intron (NR_110917, intron 3 of 3) Eulor11|DNA|DNA 191296 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 164.5-34 chr11 127315071 127315250 + 1.5 NA intron (NR_120580, intron 1 of 2) L1M2|LINE|L1 44090 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 238-12 chr11 81605021 81605313 + 1.5 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 285669 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 226.5-76 chr4 174231941 174232336 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -11740 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 260-25 chr3 174342016 174342438 + 1.5 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -421431 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 387-2 chr1 82481402 82481793 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -421586 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 210.75-32 chr18 1549808 1550220 + 1.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -190385 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 249-2 chr10 4038399 4038729 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13162 NR_120632 101927964 Hs.737041 NR_120632 ENSG00000236990 LOC101927964 - uncharacterized LOC101927964 ncRNA 188-53 chr4 144535661 144535965 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 110206 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 254-11 chr11 90615578 90615747 + 1.5 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) -59805 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 159-122 chr8 135670104 135670226 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 212709 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 266-33 chr3 168144025 168144403 + 1.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -48290 NM_014498 27333 Hs.143600 NM_014498 ENSG00000173905 GOLIM4 GIMPC|GOLPH4|GPP130|P138 golgi integral membrane protein 4 protein-coding 511.5-6 chr5 131093830 131094216 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 71233 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 246.75-24 chr17 73208499 73208797 + 1.5 NA TTS (NM_018714) TTS (NM_018714) 15593 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 232.75-63 chr7 55939224 55939433 + 1.5 NA exon (NM_001366796, exon 7 of 7) exon (NM_001366796, exon 7 of 7) -12549 NM_015969 51373 Hs.44298 NM_015969 ENSG00000239789 MRPS17 HSPC011|MRP-S17|RPMS17|S17mt mitochondrial ribosomal protein S17 protein-coding 266.5-12 chr11 91549545 91549835 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -675344 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 245.25-64 chr6 135703648 135704077 + 1.5 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 -147839 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 364.25-23 chr5 35773581 35774071 + 1.5 NA intron (NM_024867, intron 27 of 36) intron (NM_024867, intron 27 of 36) -83065 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 381.25-8 chr20 34025978 34026275 + 1.5 NA intron (NM_007367, intron 1 of 8) intron (NM_007367, intron 1 of 8) -22993 NR_039911 100616434 NR_039911 ENSG00000264616 MIR4755 mir-4755 microRNA 4755 ncRNA 275.25-37 chr6 49580762 49581087 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30256 NR_146864 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 370.5-20 chr8 98846806 98847396 + 1.5 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) FAM|SINE|Alu -21413 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 229.5-13 chr1 235830245 235830426 + 1.5 NA exon (NM_001301365, exon 3 of 53) exon (NM_001301365, exon 3 of 53) 22725 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 185.5-118 chr4 85760847 85760979 + 1.5 NA intron (NM_001025616, intron 3 of 9) intron (NM_001025616, intron 3 of 9) -17885 NM_001346093 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 202.5-55 chr16 83736362 83736523 + 1.5 NA intron (NM_001220489, intron 9 of 12) intron (NM_001220489, intron 9 of 12) 67534 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 238.75-28 chr2 38003962 38004372 + 1.5 NA exon (NM_001170791, exon 10 of 11) exon (NM_001170791, exon 10 of 11) 32174 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 195-79 chr7 43195671 43195900 + 1.5 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) MER41E|LTR|ERV1 44890 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 244-41 chr4 146884122 146884359 + 1.5 NA intron (NR_133922, intron 6 of 13) intron (NR_133922, intron 6 of 13) 61624 NM_001317806 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 336.75-9 chr16 60415175 60415591 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -55590 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 351-27 chr8 83472046 83472425 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68477 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 151.25-31 chr11 60095472 60095591 + 1.5 NA intron (NM_000139, intron 6 of 6) intron (NM_000139, intron 6 of 6) 6867 NM_000139 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 279.75-50 chr6 146053161 146053484 + 1.5 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) intron (NM_001278065, intron 2 of 9) 24124 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 277.5-26 chr17 72744198 72744446 + 1.5 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) MER20|DNA|hAT-Charlie -103850 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 131.5-141 chr21 15678468 15678610 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -51395 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 236-46 chr3 191522019 191522382 + 1.5 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) L1M4|LINE|L1 61037 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 204.75-19 chr10 106863054 106863265 + 1.5 NA intron (NM_001206569, intron 2 of 25) intron (NM_001206569, intron 2 of 25) 301547 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 188.75-40 chr16 76833113 76833456 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35652 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 202-35 chr2 146799411 146799590 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 212443 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 455.5 chr14 51362591 51363084 + 1.5 NA intron (NR_038358, intron 4 of 4) intron (NR_038358, intron 4 of 4) 29444 NR_038358 283553 Hs.325752 NR_038358 ENSG00000258479 LINC00640 - long intergenic non-protein coding RNA 640 ncRNA 352.5-15 chr3 180708377 180708803 + 1.5 NA non-coding (NR_109986, exon 14 of 14) non-coding (NR_109986, exon 14 of 14) -29101 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 207.25-105 chr9 76450317 76450495 + 1.5 NA intron (NM_001097634, intron 1 of 2) intron (NM_001097634, intron 1 of 2) 8740 NM_001097634 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 183.5-89 chr3 104621913 104622061 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -744726 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 179-98 chrX 81445063 81445224 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 243041 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 268.5-45 chr5 56058533 56058884 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 63541 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 229.5-98 chr4 49144540 49144841 + 1.5 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 158048 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 231-44 chr2 168142829 168143045 + 1.5 NA intron (NM_013233, intron 5 of 17) intron (NM_013233, intron 5 of 17) 104658 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 152-80 chr2 38100268 38100398 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -24152 NM_000104 1545 Hs.154654 NM_000104 ENSG00000138061 CYP1B1 ASGD6|CP1B|CYPIB1|GLC3A|P4501B1 cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 protein-coding 275.75-5 chr10 105910838 105911148 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -90660 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 157.75-90 chr2 141605264 141605438 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) MER58C|DNA|hAT-Charlie 526350 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 201.25-28 chr12 106714931 106715201 + 1.5 NA intron (NM_001206691, intron 10 of 17) intron (NM_001206691, intron 10 of 17) 30337 NM_032491 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 300.75-48 chr8 121751895 121752282 + 1.5 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -110648 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 264.5-44 chr4 120683347 120683635 + 1.5 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 239375 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 155-26 chr12 7006801 7006946 + 1.5 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) intron (NM_005768, intron 1 of 12) 11603 NM_005768 10162 Hs.655248 NM_005768 ENSG00000111684 LPCAT3 C3F|LPCAT|LPLAT 5|LPSAT|MBOAT5|OACT5|nessy lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 protein-coding 230-27 chr18 9563481 9563692 + 1.5 NA intron (NR_052003, intron 10 of 19) intron (NR_052003, intron 10 of 19) 50973 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 536.5-4 chr3 156346393 156346778 + 1.5 NA intron (NM_172159, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 55548 NM_001308222 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 418.75-3 chr3 175106196 175106613 + 1.5 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) 8838 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 130.75-188 chr8 52945679 52945837 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5850 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 239-38 chr3 148962122 148962358 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -29168 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 220-55 chr7 5622646 5622870 + 1.5 NA 3' UTR (NM_207116, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_207116, exon 17 of 17) 29942 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 254-20 chr18 68613496 68613739 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 101491 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 385.75-17 chr7 90826685 90827293 + 1.5 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) L1MC2|LINE|L1 117173 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 449.25-2 chr10 44807482 44807791 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -103680 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 202.5-149 chrX 95217223 95217384 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -154077 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 243.25-36 chr4 62533752 62534233 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -372227 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 407.25-14 chr8 73650979 73651446 + 1.5 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) intron (NM_001164383, intron 1 of 9) 95628 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 432-3 chr12 34563108 34563624 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 540870 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 220.5-131 chr9 104642236 104642451 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -24139 NM_001001956 286362 Hs.553682 NM_001001956 ENSG00000136839 OR13C9 OR37L|OR9-13 olfactory receptor family 13 subfamily C member 9 protein-coding 299.5-27 chr3 63090332 63090621 + 1.5 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -12212 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 480-7 chr9 4756221 4756808 + 1.5 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -14471 NM_001199853 50808 Hs.732022 NM_016282 ENSG00000147853 AK3 AK3L1|AK6|AKL3L|AKL3L1|FIX adenylate kinase 3 protein-coding 150-51 chr15 63565677 63565794 + 1.5 NA intron (NM_001256702, intron 7 of 13) L1ME4b|LINE|L1 -31652 NM_001367809 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 176-9 chr11 1750049 1750217 + 1.5 NA intron (NM_001170820, intron 1 of 2) intron (NM_001170820, intron 1 of 2) 462 NM_001170820 402778 Hs.121575 NM_001170820 ENSG00000244242 IFITM10 DSPA3 interferon induced transmembrane protein 10 protein-coding 141.75-176 chr9 68710956 68711125 + 1.5 NA intron (NM_001278253, intron 1 of 13) intron (NM_001278253, intron 1 of 13) 5626 NM_001278253 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 115-59 chr16 61436312 61436410 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -380595 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 589.75 chr17 70828695 70829478 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 373093 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 204-49 chr3 20153124 20153273 + 1.5 NA 3' UTR (NM_003884, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_003884, exon 18 of 18) 15633 NR_036086 100422901 NR_036086 ENSG00000266745 MIR3135A MIR3135|hsa-mir-3135a microRNA 3135a ncRNA 213.25-50 chr4 103192422 103192578 + 1.5 NA intron (NM_001813, intron 8 of 48) L2|LINE|L2 5843 NM_001813 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 406.5-7 chr2 220732788 220733273 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -826465 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 236-26 chr19 53356381 53356580 + 1.5 NA TTS (NM_001321522) TTS (NM_001321522) -9225 NR_145447 170958 Hs.352638 NM_001348156 ENSG00000203326 ZNF525 - zinc finger protein 525 protein-coding 168.75-100 chr4 52019794 52019995 + 1.5 NA TTS (NM_000232) TTS (NM_000232) 469 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 133.5-132 chr2 238287861 238287971 + 1.5 NA intron (NM_022817, intron 1 of 22) intron (NM_022817, intron 1 of 22) 694 NM_022817 8864 Hs.58756 NM_003894 ENSG00000132326 PER2 FASPS|FASPS1 period circadian regulator 2 protein-coding 321.5-9 chr18 12316634 12316875 + 1.5 NA intron (NM_001303525, intron 3 of 3) intron (NM_001303525, intron 3 of 3) 8513 NM_001303530 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 173.5-146 chr6 137334633 137334784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -115278 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 257.75 chr1 43100141 43100504 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47582 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 190-18 chr14 72646915 72647118 + 1.5 NA intron (NM_001280542, intron 8 of 10) intron (NM_001280542, intron 8 of 10) 130196 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 285.5-4 chr10 13328919 13329205 + 1.5 NA intron (NM_001195602, intron 5 of 7) intron (NM_001195602, intron 5 of 7) 19231 NM_001195604 22929 Hs.124027 NM_012247 ENSG00000086475 SEPHS1 SELD|SPS|SPS1 selenophosphate synthetase 1 protein-coding 202-65 chr7 21416434 21416603 + 1.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11565 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 153-132 chr6 129990995 129991171 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -27286 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 305.25-40 chr5 64793086 64793335 + 1.5 NA intron (NM_001297645, intron 7 of 10) intron (NM_001297645, intron 7 of 10) 24280 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 363-2 chr10 54112206 54112588 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 16 of 34) MER20|DNA|hAT-Charlie -373833 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 289.5-38 chr4 141494234 141494616 + 1.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -142158 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 197.5-56 chr17 59760268 59760410 + 1.5 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) intron (NM_001329401, intron 4 of 9) 52685 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 174.5-93 chr19 56223277 56223471 + 1.5 NA intron (NM_001322077, intron 3 of 4) intron (NM_001322077, intron 3 of 4) 7025 NM_024303 79149 Hs.177688 NM_024303 ENSG00000131848 ZSCAN5A ZNF495|ZSCAN5 zinc finger and SCAN domain containing 5A protein-coding 206.75-93 chr8 104853601 104853849 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -264701 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 233.5-12 chr1 182602743 182603110 + 1.5 NA intron (NM_002928, intron 2 of 4) intron (NM_002928, intron 2 of 4) 1463 NM_002928 6004 Hs.413297 NM_002928 ENSG00000143333 RGS16 A28-RGS14|A28-RGS14P|RGS-R regulator of G protein signaling 16 protein-coding 132.5-186 chr4 139522225 139522373 + 1.5 NA intron (NM_001306199, intron 5 of 7) intron (NM_001306199, intron 5 of 7) 34470 NM_030648 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 121.5-169 chr3 5227017 5227136 + 1.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 23179 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 318.5-36 chr6 118299646 118300016 + 1.5 NA intron (NM_001029858, intron 7 of 7) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -201542 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 285.75-31 chr3 152986673 152986955 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 151683 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 262.25-22 chr2 146687369 146687715 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 100485 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 375.5-16 chr21 15684353 15684886 + 1.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -45315 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 243.75-19 chr13 22091579 22091760 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -118616 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 170.5-49 chr13 28901624 28901800 + 1.5 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) L1MD2|LINE|L1 81373 NM_001366650 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 161.25-154 chr6 72845746 72845911 + 1.5 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 121925 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 216-62 chr4 75061493 75061676 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 23124 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 225-69 chr7 13756910 13757140 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 229489 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 288.75-4 chr1 89681728 89682010 + 1.5 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 48749 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 263-2 chr1 66045554 66045848 + 1.5 NA intron (NR_123718, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 5017 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 327.75-6 chr11 37086624 37086927 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -488496 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 188.5-69 chr2 63751739 63751910 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -89140 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 266-13 chr14 73159407 73159773 + 1.5 NA intron (NM_000021, intron 3 of 11) L1ME1|LINE|L1 23083 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 153.5-147 chr4 163551263 163551407 + 1.5 NA intron (NM_017923, intron 2 of 3) Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger 56645 NM_018352 55319 Hs.267446 NM_018352 ENSG00000198498 TMA16 C4orf43 translation machinery associated 16 homolog protein-coding 229-52 chr3 109273489 109273784 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42881 NM_138815 151871 Hs.351113 NM_138815 ENSG00000163530 DPPA2 CT100|ECAT15-2|PESCRG1 developmental pluripotency associated 2 protein-coding 136-4 chr1 68522577 68522705 + 1.5 NA intron (NR_110671, intron 1 of 2) intron (NR_110671, intron 1 of 2) -25559 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 330.25-15 chr3 95419978 95420349 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 263030 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 264-60 chr8 23786731 23787022 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 67930 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 183.5-76 chr2 191571722 191572088 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -106167 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 350.25-27 chr5 53532344 53532577 + 1.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -28179 NM_002495 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 309.25-18 chr3 39116186 39116608 + 1.5 NA intron (NR_159494, intron 6 of 28) L1MD|LINE|L1 -8034 NM_031899 64689 Hs.721946 NM_031899 ENSG00000114745 GORASP1 GOLPH5|GRASP65|P65 golgi reassembly stacking protein 1 protein-coding 210.75-63 chr3 190261324 190261598 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 60985 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 273.5-14 chr11 76522014 76522250 + 1.5 NA intron (NM_001300942, intron 12 of 21) intron (NM_001300942, intron 12 of 21) 77107 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 215.75-63 chr3 71485285 71485450 + 1.5 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) L1MC5a|LINE|L1 56722 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 204-62 chr5 22506433 22506683 + 1.5 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) L1MC3|LINE|L1 -292708 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 388-11 chr4 89933464 89933863 + 1.5 NA intron (NM_001371403, intron 6 of 8) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 38809 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 137.5-104 chr18 12742684 12742858 + 1.5 NA intron (NR_110763, intron 1 of 1) LTR85b|LTR|Gypsy? 6651 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 207.5-10 chr10 121521705 121522002 + 1.5 NA intron (NR_073009, intron 4 of 16) L1MB1|LINE|L1 9461 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 260-41 chr7 51517454 51517749 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -124345 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 336.25-3 chr12 10059041 10059352 + 1.5 NA intron (NM_207345, intron 5 of 8) L1MD1|LINE|L1 28514 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 167.25-67 chr17 79320925 79321067 + 1.5 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 195152 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 247-22 chr14 92176935 92177218 + 1.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 55107 NM_017437 53981 Hs.657632 NM_017437 ENSG00000165934 CPSF2 CPSF100 cleavage and polyadenylation specific factor 2 protein-coding 343.5-29 chr9 77733147 77733618 + 1.5 NA intron (NM_002072, intron 5 of 6) intron (NM_002072, intron 5 of 6) -85060 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 268-31 chr2 187851747 187852011 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -297374 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 270.5-34 chr20 44625092 44625382 + 1.5 NA intron (NM_001322050, intron 4 of 10) intron (NM_001322050, intron 4 of 10) 26462 NM_000022 100 Hs.654536 NM_000022 ENSG00000196839 ADA - adenosine deaminase protein-coding 191.5-5 chr1 46664447 46664638 + 1.5 NA intron (NM_001256418, intron 2 of 9) intron (NM_001256418, intron 2 of 9) 1336 NM_001243728 64756 Hs.100874 NM_022745 ENSG00000123472 ATPAF1 ATP11|ATP11p ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 protein-coding 163-43 chr15 93712895 93713080 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -143573 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 249.5-86 chr6 90496566 90496751 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 90414 NM_003188 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 237.25-55 chr4 96762123 96762524 + 1.5 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1MA4A|LINE|L1 451620 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 138-31 chr12 125612720 125612856 + 1.5 NA intron (NM_052907, intron 5 of 8) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9664 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 234.5-42 chr2 66912227 66912549 + 1.5 NA intron (NR_110169, intron 1 of 4) intron (NR_110169, intron 1 of 4) 7952 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 226.5-95 chr7 74660834 74661070 + 1.5 NA intron (NM_001163636, intron 1 of 33) intron (NM_001163636, intron 1 of 33) 3234 NM_001518 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 302.5-46 chr9 97649696 97650015 + 1.5 NA intron (NM_001351507, intron 8 of 21) intron (NM_001351507, intron 8 of 21) 16034 NM_002486 4686 Hs.595669 NM_002486 ENSG00000136937 NCBP1 CBP80|NCBP|Sto1 nuclear cap binding protein subunit 1 protein-coding 213.75-46 chr18 46305661 46305887 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -28244 NM_152470 494470 Hs.501114 NM_152470 ENSG00000141622 RNF165 ARKL2|Ark2C|RNF111L2 ring finger protein 165 protein-coding 303.5-35 chr5 46393904 46394227 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -697685 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 281-44 chr8 133840043 133840386 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -46282 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 188.5-17 chr10 113332003 113332241 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 202851 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 213-100 chr9 70667308 70667527 + 1.5 NA intron (NM_001366143, intron 9 of 25) HAL1|LINE|L1 142667 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 278-35 chr7 47757055 47757373 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4262 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 522.75-2 chr9 109010363 109010943 + 1.5 NA intron (NM_003798, intron 1 of 18) L1ME3C|LINE|L1 2846 NM_001286974 8727 Hs.58488 NM_003798 ENSG00000119326 CTNNAL1 ACRP|CLLP|alpha-CATU catenin alpha like 1 protein-coding 339.75-18 chr2 68227770 68228139 + 1.5 NA intron (NM_000945, intron 1 of 5) L1MDa|LINE|L1 24578 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 430.25-3 chr10 68039821 68040311 + 1.5 NA intron (NM_001278186, intron 3 of 22) L2a|LINE|L2 -29183 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 594.75 chr14 61167589 61168193 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 113447 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 320.5-22 chr2 115265244 115265588 + 1.5 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) -43821 NM_001321907 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 309-33 chr4 80977879 80978223 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52657 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 286-29 chr4 42838200 42838452 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -54940 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 453 chr1 168019842 168020393 + 1.5 NA intron (NR_146229, intron 11 of 20) MIR|SINE|MIR 21457 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 307.5-47 chr8 129948733 129949154 + 1.5 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu -9132 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 201-79 chr8 118523744 118523960 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -97149 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 347.25-9 chr2 51036372 51036612 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 1 of 10) intron (NR_135237, intron 1 of 10) 3891 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 312.25-28 chr8 59719864 59720192 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 561372 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 190-68 chr6 165576414 165576706 + 1.5 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) L2|LINE|L2 85540 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 260.75-39 chr20 17159596 17159803 + 1.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -66408 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 162.5-136 chr5 26723139 26723342 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 315346 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 191.75-99 chr5 15727024 15727171 + 1.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) L1M4c|LINE|L1 -112095 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 243-2 chr1 84573193 84573380 + 1.5 NA intron (NM_004388, intron 1 of 6) MER57E1|LTR|ERV1 1154 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 332.75-16 chr22 28587091 28587385 + 1.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSz6|SINE|Alu 92627 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 289.5-18 chr17 58545235 58545588 + 1.5 NA intron (NR_110810, intron 4 of 4) AluSx|SINE|Alu -1083 NM_001368771 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 203-36 chr15 61972816 61973240 + 1.5 NA intron (NM_001018088, intron 26 of 81) L2a|LINE|L2 87419 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 465.75-5 chr3 65394267 65394659 + 1.5 NA intron (NM_001365904, intron 13 of 24) OldhAT1|DNA|hAT-Ac -499353 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 120-4 chr1 88299485 88299594 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -384605 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 268.75-15 chr19 7228213 7228417 + 1.5 NA intron (NM_001079817, intron 2 of 20) intron (NM_001079817, intron 2 of 20) 66099 NM_000208 3643 Hs.465744 NM_000208 ENSG00000171105 INSR CD220|HHF5 insulin receptor protein-coding 252.75-33 chr2 125606382 125606647 + 1.5 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 511471 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 177.5-126 chr4 60764888 60765056 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -157647 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 259-21 chr2 124210798 124211155 + 1.5 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 185689 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 339.75-3 chr10 47156479 47156771 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -143572 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 237-65 chr7 71794335 71794555 + 1.5 NA intron (NM_001363460, intron 5 of 5) intron (NM_001363460, intron 5 of 5) -486675 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 186.75-98 chr6 129020376 129020602 + 1.5 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) LTR48|LTR|ERV1 137348 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 535.5-2 chr2 45135445 45135952 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 119243 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 226.5-89 chr7 7751976 7752256 + 1.5 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -33509 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 207.75-85 chr3 194284790 194285049 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 27885 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 297-33 chr3 176880954 176881273 + 1.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -64112 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 253-21 chr16 86810889 86811130 + 1.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 88918 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 138-159 chr8 76335582 76335742 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -70992 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 363-10 chr21 19501951 19502250 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 397655 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 258-40 chr3 196221259 196221547 + 1.5 NA intron (NM_152672, intron 2 of 8) AluJr|SINE|Alu 4869 NM_152672 200931 Hs.630585 NM_152672 ENSG00000163959 SLC51A OSTA|OSTalpha solute carrier family 51 alpha subunit protein-coding 420 chr1 215621166 215621623 + 1.5 NA 3' UTR (NM_016121, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_016121, exon 18 of 18) 54090 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 257.25-39 chr4 116505947 116506138 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 206317 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 250-2 chr1 111799785 111799989 + 1.5 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 43986 NM_007204 11218 Hs.591405 NM_007204 ENSG00000064703 DDX20 DP103|GEMIN3 DEAD-box helicase 20 protein-coding 161.25-101 chr2 185392294 185392503 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -225326 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 393.5-19 chr9 31204852 31205169 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 176480 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 322-14 chr17 32192475 32192848 + 1.5 NA intron (NM_001033566, intron 9 of 19) intron (NM_001033566, intron 9 of 19) -41090 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 305-21 chr2 190601435 190601938 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47209 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 166-35 chr15 25698429 25698628 + 1.5 NA intron (NM_024490, intron 13 of 20) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 150297 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 226-19 chr14 73992930 73993109 + 1.5 NA intron (NM_001249, intron 3 of 15) AluSz6|SINE|Alu 26269 NM_001321985 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 251.5-70 chr5 147980801 147981095 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -74410 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 324.75-26 chr6 46350026 46350426 + 1.5 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -24334 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 179-6 chr1 159475631 159475775 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 35981 NM_012351 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 132.75-181 chr7 110133827 110133940 + 1.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -173670 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 280.5-39 chr5 26917078 26917440 + 1.5 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) L1MA7|LINE|L1 121327 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 262-17 chr14 74163255 74163502 + 1.5 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu -76071 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 122.5-2 chr1 25933713 25933859 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26909 NM_203399 3925 Hs.209983 NM_005563 ENSG00000117632 STMN1 C1orf215|LAP18|Lag|OP18|PP17|PP19|PR22|SMN stathmin 1 protein-coding 233.75-68 chr6 62885144 62885490 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 434660 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 207.75-64 chr20 12441637 12441803 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 495243 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 339.75-29 chr6 54767133 54767518 + 1.5 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger -79446 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 308-7 chr11 127611316 127611696 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 340436 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 187.75-112 chr8 62574793 62575009 + 1.5 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) L1MA3|LINE|L1 326047 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 306.75-7 chr13 105464037 105464369 + 1.5 NA intron (NR_040247, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 -1664 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 288.75-39 chr6 77249496 77249733 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 214408 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 231.5-37 chr18 3877360 3877579 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_038895) promoter-TSS (NR_038895) -711 NR_038895 201477 Hs.627208 NR_038895 ENSG00000263724 DLGAP1-AS3 - DLGAP1 antisense RNA 3 ncRNA 287.25-24 chr18 23595952 23596218 + 1.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -9579 NM_000271 4864 Hs.464779 NM_000271 ENSG00000141458 NPC1 NPC|POGZ|SLC65A1 NPC intracellular cholesterol transporter 1 protein-coding 476-2 chr14 71422118 71422556 + 1.5 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) L1MB3|LINE|L1 -16602 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 185-42 chr2 30704075 30704255 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 103281 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 452.75-3 chr16 79298861 79299412 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 301601 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 287.25-12 chr11 43211331 43211673 + 1.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 57867 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 140.25-73 chr17 68757218 68757373 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 129141 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 205.5-162 chrX 53704076 53704248 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -17443 NM_031407 10075 Hs.136905 NM_031407 ENSG00000086758 HUWE1 ARF-BP1|HECTH9|HSPC272|Ib772|LASU1|MRXST|MULE|URE-B1|UREB1 HECT, UBA and WWE domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 232.5-38 chr17 67112181 67112400 + 1.5 NA intron (NM_001330447, intron 28 of 32) intron (NM_001330447, intron 28 of 32) 67736 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 200.25-2 chr1 106140368 106140703 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -112282 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 242-22 chr14 73114354 73114595 + 1.5 NA intron (NM_021239, intron 18 of 18) AluJb|SINE|Alu -22033 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 288-15 chr12 250109 250453 + 1.5 NA intron (NM_016615, intron 2 of 14) L1ME2z|LINE|L1 7018 NR_120482 102723544 Hs.669733 NR_120482 ENSG00000255746 LOC102723544 - uncharacterized LOC102723544 ncRNA 219.5-26 chr12 31673050 31673440 + 1.5 NA TTS (NM_001135863) TTS (NM_001135863) 13557 NM_001135863 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 308.5-31 chr6 135132845 135133153 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -48309 NM_001161659 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 212-41 chr2 117493513 117493798 + 1.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -321036 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 274-21 chr2 187894970 187895263 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -340611 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 159-22 chr11 130071206 130071377 + 1.5 NA intron (NM_001243299, intron 1 of 16) intron (NM_001243299, intron 1 of 16) 723 NM_001243299 334 Hs.370247 NM_001642 ENSG00000084234 APLP2 APLP-2|APPH|APPL2|CDEBP amyloid beta precursor like protein 2 protein-coding 443.25-7 chr8 82050180 82050864 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -208236 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 231-49 chr3 61529282 61529538 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32161 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 199.25-63 chr2 239196016 239196370 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_026664) promoter-TSS (NR_026664) -736 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 229-8 chr11 47353988 47354201 + 1.5 NA TTS (NM_003120) TTS (NM_003120) -1392 NM_000256 4607 Hs.524906 NM_000256 ENSG00000134571 MYBPC3 CMD1MM|CMH4|FHC|LVNC10|MYBP-C myosin binding protein C, cardiac protein-coding 246.75-12 chr12 32380108 32380408 + 1.5 NA non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) -19300 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 272.75-16 chr17 39001247 39001525 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25724 NR_135645 105371766 Hs.311469 NR_135645 ENSG00000266013 LINC02079 - long intergenic non-protein coding RNA 2079 ncRNA 204-83 chr8 131058360 131058648 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17595 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 166-113 chr7 2792574 2792767 + 1.5 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) intron (NM_007353, intron 2 of 3) 22560 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 222-84 chr8 117429816 117430087 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -90762 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 167.25-16 chr10 43837347 43837568 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7849 NR_033923 414260 Hs.351856 NR_033923 ENSG00000226808 LINC00619 C10orf136|bA168P8.1 long intergenic non-protein coding RNA 619 ncRNA 222.75-68 chr20 59085070 59085264 + 1.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -42321 NR_037929 100533975 Hs.656865 NR_037929 SLMO2-ATP5E - SLMO2-ATP5E readthrough ncRNA 222-18 chr11 80453842 80454015 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 308875 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 165-60 chr18 5039282 5039414 + 1.5 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -41834 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 241.25-64 chr7 102886306 102886553 + 1.5 NA intron (NR_105043, intron 12 of 20) intron (NR_105043, intron 12 of 20) -26571 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 113.5-182 chr4 75348668 75348754 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5365 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 229.5-123 chr7 10407677 10407953 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -294861 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 248.5-37 chr17 76447482 76447811 + 1.5 NA intron (NM_022066, intron 1 of 17) intron (NM_022066, intron 1 of 17) 5506 NM_022066 63893 Hs.16130 NM_022066 ENSG00000175931 UBE2O E2-230K ubiquitin conjugating enzyme E2 O protein-coding 178.5-17 chr10 115848950 115849152 + 1.5 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) intron (NM_207303, intron 28 of 28) 345738 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 219.5-46 chr15 97307120 97307397 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 214553 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 279-51 chr8 70034076 70034408 + 1.5 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 37010 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 156-58 chr16 67124139 67124302 + 1.5 NA intron (NM_001320543, intron 3 of 15) intron (NM_001320543, intron 3 of 15) 14279 NM_001320541 80262 Hs.513666 NM_025187 ENSG00000125149 C16orf70 C16orf6|LIN10|lin-10 chromosome 16 open reading frame 70 protein-coding 295.5-61 chr8 94677781 94678037 + 1.5 NA intron (NM_017697, intron 12 of 15) intron (NM_017697, intron 12 of 15) 36735 NM_001122827 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 217-30 chr2 22041811 22042037 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -331272 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 215.25-94 chr6 123062771 123063111 + 1.5 NA intron (NM_001010852, intron 5 of 5) intron (NM_001010852, intron 5 of 5) 66706 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 195.5-58 chr18 63317576 63317824 + 1.5 NA TTS (NM_000657) TTS (NM_000657) 1680 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 322.25-11 chr2 72380873 72381101 + 1.5 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -233125 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 269.75-8 chr10 61368241 61368485 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -84276 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 234.75-16 chr12 82316541 82316724 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 41755 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 198.75-67 chr4 34259250 34259420 + 1.5 NA intron (NR_147184, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 10412 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 301-8 chr17 77614170 77614546 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 67417 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 360.25-8 chr2 39313377 39313650 + 1.5 NA intron (NM_003618, intron 13 of 33) (CTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -69530 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 411.5 chr12 23548311 23548711 + 1.5 NA intron (NM_001261414, intron 13 of 16) intron (NM_001261414, intron 13 of 16) 36075 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 332-9 chr16 74008425 74008808 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 206905 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 174.5-119 chr3 39868643 39868916 + 1.5 NA intron (NM_001284424, intron 1 of 15) MER74A|LTR|ERVL 59119 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 147-76 chr2 104512757 104512892 + 1.5 NA TTS (NR_015399) TTS (NR_015399) -2315 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 338.5-32 chr7 48395787 48396079 + 1.5 NA intron (NM_152701, intron 38 of 61) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 224475 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 548.5-3 chr5 29815742 29816135 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -64622 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 278.5-56 chr8 87124182 87124392 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1M3|LINE|L1 257872 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 267.5-37 chr2 164729352 164729792 + 1.5 NA intron (NM_001365670, intron 4 of 13) intron (NM_001365670, intron 4 of 13) -41795 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 382.75-7 chr4 32603937 32604393 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 253127 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 287-28 chr4 169424916 169425151 + 1.5 NA intron (NM_001199400, intron 27 of 32) intron (NM_001199400, intron 27 of 32) -154077 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 146.5-219 chr8 61289428 61289549 + 1.5 NA intron (NM_173519, intron 1 of 5) intron (NM_173519, intron 1 of 5) 1518 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 195.25-8 chr1 151720552 151720759 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001144956) promoter-TSS (NM_001144956) -867 NM_001144956 284485 Hs.297967 NM_001144956 ENSG00000178796 RIIAD1 C1orf230|NCRNA00166 regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 protein-coding 288.75-14 chr12 88034508 88034775 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001009894) promoter-TSS (NM_001009894) -895 NM_001009894 91298 Hs.591009 NM_001009894 ENSG00000133641 C12orf29 - chromosome 12 open reading frame 29 protein-coding 275.75-37 chr5 3688583 3688865 + 1.5 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 92892 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 141.5-25 chr11 75362927 75363039 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11322 NM_020251 408 Hs.503284 NM_004041 ENSG00000137486 ARRB1 ARB1|ARR1 arrestin beta 1 protein-coding 256.25-38 chr5 117186294 117186588 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -229071 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 281.25-5 chr1 181098979 181099346 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10462 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 273.75-15 chr16 14350688 14350998 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 19423 NR_131191 105447648 Hs.554151 NR_131191 ENSG00000260009 LINC02130 - long intergenic non-protein coding RNA 2130 ncRNA 212.5-40 chr17 65422732 65422890 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -34730 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 207-38 chr19 29877765 29877931 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -45809 NM_001252641 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 161.5-157 chr5 113975682 113975811 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -386324 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 435.5-8 chr21 32171129 32171725 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -85132 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 245.75-36 chr3 59132834 59133286 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -83028 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 158.5-102 chr2 117019426 117019653 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -795152 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 214.5-3 chr1 97187913 97188095 + 1.5 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) L1PB4|LINE|L1 92081 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 281-31 chr5 155819988 155820238 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -506644 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 293-7 chr16 14185069 14185360 + 1.5 NA intron (NM_001308142, intron 3 of 16) intron (NM_001308142, intron 3 of 16) -1472 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 339 chr1 158552191 158552681 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4331 NM_001005189 391112 Hs.553780 NM_001005189 ENSG00000197532 OR6Y1 OR1-11|OR6Y2 olfactory receptor family 6 subfamily Y member 1 protein-coding 142-122 chr4 159422857 159423000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 155119 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 345.5-19 chr20 1126224 1126512 + 1.5 NA intron (NM_006814, intron 2 of 6) L1ME3G|LINE|L1 7766 NM_001323410 9491 Hs.471917 NM_006814 ENSG00000125818 PSMF1 PI31 proteasome inhibitor subunit 1 protein-coding 189.75-80 chr4 39016616 39016807 + 1.5 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 15698 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 164.25-141 chr6 117302701 117302850 + 1.5 NA intron (NM_002944, intron 41 of 42) intron (NM_002944, intron 41 of 42) 37217 NM_182645 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 119-56 chr15 59482122 59482203 + 1.5 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) L1ME4c|LINE|L1 43976 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 378.25-7 chr4 60965305 60965905 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 42986 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 167.25-157 chr8 127110586 127110792 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28468 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 292.5-49 chr8 49666650 49667012 + 1.5 NA Intergenic (ATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -154651 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 401.5-16 chr6 47767780 47768163 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -14068 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 200.75-20 chr11 133452465 133452615 + 1.5 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 79961 NM_001012393 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 191.5-31 chr12 128179340 128179471 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 61188 NR_104648 101927694 Hs.524849 NR_104648 ENSG00000256659 LINC02368 - long intergenic non-protein coding RNA 2368 ncRNA 188.5-106 chr3 124719960 124720239 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001322993, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001322993, exon 27 of 27) -10267 NR_033434 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 381.5-2 chr14 60990292 60990593 + 1.5 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 -8752 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 285.5-46 chr4 47562843 47563063 + 1.5 NA intron (NM_020453, intron 14 of 22) L1PB4|LINE|L1 77678 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 372.75-11 chr7 43637676 43638213 + 1.5 NA intron (NR_163914, intron 7 of 8) intron (NR_163914, intron 7 of 8) 54836 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 232.5-66 chr22 45746184 45746447 + 1.5 NA intron (NM_013236, intron 9 of 11) intron (NM_013236, intron 9 of 11) -14209 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 182.25-64 chr2 74964875 74965097 + 1.5 NA intron (NM_019896, intron 3 of 3) L1ME3B|LINE|L1 6343 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 303.75-24 chr3 150612533 150612788 + 1.5 NA intron (NM_016275, intron 1 of 5) intron (NM_016275, intron 1 of 5) 9339 NM_016275 51714 Hs.369052 NM_016275 ENSG00000198843 SELENOT SELT selenoprotein T protein-coding 354.75-20 chr8 76942350 76942616 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 24367 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 426.75-10 chr6 132920965 132921532 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 104029 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 312.75-24 chr4 17826603 17826959 + 1.5 NA intron (NR_073124, intron 10 of 19) intron (NR_073124, intron 10 of 19) 15802 NM_022346 64151 Hs.567567 NM_022346 ENSG00000109805 NCAPG CAPG|CHCG|NY-MEL-3|YCG1 non-SMC condensin I complex subunit G protein-coding 474.5-2 chr11 23608361 23608883 + 1.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -189432 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 124-127 chr4 119241140 119241286 + 1.5 NA intron (NM_001371399, intron 3 of 16) intron (NM_001371399, intron 3 of 16) 28500 NM_001371397 469-4 chr8 135697273 135697969 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 240165 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 172.75-141 chr9 104144136 104144350 + 1.5 NA Intergenic MER70-int|LTR|ERVL 49616 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 466.75 chr1 74367779 74368647 + 1.5 NA intron (NM_015978, intron 13 of 24) intron (NM_015978, intron 13 of 24) 115227 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 179.75-34 chr13 107465023 107465149 + 1.5 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 66162 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 337.75-6 chr11 8689559 8690003 + 1.5 NA TTS (NM_000990) TTS (NM_000990) 4342 NR_002977 677826 Hs.745552 NR_002977 ENSG00000212607 SNORA3B ACA3-2|SNORA45|SNORA45B small nucleolar RNA, H/ACA box 3B snoRNA 275-27 chr21 39055623 39056003 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -78039 NR_109962 101928435 Hs.385528 NR_109962 ENSG00000232837 LINC01700 - long intergenic non-protein coding RNA 1700 ncRNA 284.5-72 chrX 24482649 24482890 + 1.5 NA intron (NM_001142386, intron 1 of 11) intron (NM_001142386, intron 1 of 11) 17483 NM_001142386 5165 Hs.296031 NM_005391 ENSG00000067992 PDK3 CMTX6|GS1-358P8.4 pyruvate dehydrogenase kinase 3 protein-coding 255-21 chr18 1379513 1379833 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -20044 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 255-13 chr12 86596416 86596754 + 1.5 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) LOR1-int|LTR|ERV1 148564 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 255.75-7 chr10 52196915 52197160 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 117091 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 243.75-67 chr5 38072640 38072828 + 1.5 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 47037 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 180.75-99 chr3 172599762 172600140 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4344 NR_146714 105374219 Hs.186269 NR_146714 ENSG00000223387 LINC02068 - long intergenic non-protein coding RNA 2068 ncRNA 279.25-13 chr14 27000607 27000811 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 92067 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 239.75-26 chr16 67884393 67884652 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001348682) promoter-TSS (NM_001348682) -363 NM_001348682 123904 Hs.435464 NM_198443 ENSG00000188038 NRN1L MRCC2446|UNQ2446|cpg15-2 neuritin 1 like protein-coding 355-3 chr1 169585701 169585999 + 1.5 NA intron (NM_000130, intron 1 of 24) intron (NM_000130, intron 1 of 24) 681 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 196.75-68 chr21 31064511 31064827 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26193 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 281-14 chr2 41127990 41128266 + 1.5 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -615693 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 219.75-8 chr1 247684696 247684922 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -11768 NM_001005487 441933 Hs.553834 NM_001005487 ENSG00000197437 OR13G1 OR1-37 olfactory receptor family 13 subfamily G member 1 protein-coding 180.75-91 chr3 78641661 78641828 + 1.5 NA intron (NM_002941, intron 21 of 30) intron (NM_002941, intron 21 of 30) 377715 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 312.25-8 chr15 46839439 46839678 + 1.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -344531 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 271-22 chr18 70895634 70895867 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -244796 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 171.75-47 chr14 86362553 86362698 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 427947 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 220.5-125 chr8 134156052 134156249 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 269654 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 204.5-142 chrX 42552435 42552625 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 225633 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 219.25-53 chr3 197196692 197196941 + 1.5 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12685 NM_001204387 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 309.5-24 chr2 213138419 213138738 + 1.5 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 11859 NM_001371275 340-4 chr10 104562228 104562542 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -78905 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 466.5-3 chr2 99460709 99461203 + 1.5 NA intron (NM_001321455, intron 3 of 23) intron (NM_001321455, intron 3 of 23) 29061 NR_135650 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 205-60 chr5 21190685 21190957 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -268659 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 166.5-216 chrX 80829562 80829774 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -19791 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 180-116 chr8 130574833 130575008 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -131246 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 292.75-28 chr4 63005613 63006005 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -844044 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 230-46 chr3 194523797 194524120 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 36818 NR_033929 401106 Hs.407087 NR_033929 LINC00884 - long intergenic non-protein coding RNA 884 ncRNA 324.5-16 chr2 36202952 36203383 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 152403 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 282-37 chr3 166148830 166149077 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -311530 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 312-34 chr9 86096814 86097202 + 1.5 NA intron (NM_177937, intron 1 of 9) intron (NM_177937, intron 1 of 9) 2550 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 160.75-140 chr7 1131010 1131234 + 1.5 NA intron (NM_001134396, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 7125 NM_001318252 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 194.5-8 chr1 224326577 224326717 + 1.5 NA intron (NM_002533, intron 1 of 22) intron (NM_002533, intron 1 of 22) 3525 NM_002533 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 185.25-51 chr19 12319595 12319817 + 1.5 NA exon (NM_001363608, exon 4 of 5) exon (NM_001363608, exon 4 of 5) 13927 NM_145276 147837 Hs.663510 NM_145276 ENSG00000188868 ZNF563 - zinc finger protein 563 protein-coding 193.5-136 chr5 147159545 147159720 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 75227 NR_147190 105378217 Hs.162649 NR_147190 STK32A-AS1 - STK32A antisense RNA 1 ncRNA 208.5-98 chr4 48776754 48777008 + 1.5 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) intron (NM_015030, intron 1 of 63) 3418 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 173-61 chr2 16665065 16665314 + 1.5 NA intron (NM_030797, intron 1 of 11) intron (NM_030797, intron 1 of 11) 645 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 215-23 chr14 100020128 100020332 + 1.5 NA intron (NM_001330221, intron 1 of 13) intron (NM_001330221, intron 1 of 13) -45192 NM_016337 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 376.5-15 chr4 36363273 36363615 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 62984 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 326-23 chr5 43186413 43186823 + 1.5 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -5607 NM_153361 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 296.5-6 chr11 73927783 73928122 + 1.5 NA TTS (NM_001267806) TTS (NM_001267806) -22367 NM_153614 374407 Hs.567888 NM_153614 ENSG00000187726 DNAJB13 CILD34|RSPH16A|TSARG5|TSARG6 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B13 protein-coding 284-43 chr6 81631022 81631365 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 121488 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 387.25-9 chr3 30938052 30938333 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -43531 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 333-24 chr7 81764566 81764957 + 1.5 NA intron (NM_001010933, intron 1 of 7) intron (NM_001010933, intron 1 of 7) 5286 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 202.75-56 chr2 74810113 74810443 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -22377 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 333-27 chr9 31634086 31634453 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -252779 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 330.5-24 chr5 90009589 90009903 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 6974 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 283-26 chr2 173109754 173110130 + 1.5 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 34096 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 377.25-19 chrX 88595732 88596155 + 1.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -151282 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 285.75-25 chr2 156032134 156032473 + 1.5 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) L1MD3|LINE|L1 222628 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 342.5-30 chr8 70158525 70159011 + 1.5 NA intron (NM_001321711, intron 10 of 21) AluSz6|SINE|Alu -87516 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 235-30 chr17 28671284 28671460 + 1.5 NA intron (NM_003170, intron 1 of 36) intron (NM_003170, intron 1 of 36) 9167 NM_001320755 6830 Hs.250429 NM_003170 ENSG00000109111 SUPT6H SPT6|SPT6H|emb-5 SPT6 homolog, histone chaperone and transcription elongation factor protein-coding 198-78 chr8 103601582 103601786 + 1.5 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MA2|LINE|L1 -99774 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 161.75-33 chr12 102983373 102983601 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25046 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 556.5-3 chr18 4557750 4558483 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -102809 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 173-135 chr7 90646931 90647277 + 1.5 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) L1ME4b|LINE|L1 50783 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 290-23 chr18 7121164 7121559 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3564 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 254-3 chr1 42363298 42363632 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17327 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 222.5-80 chr4 114226121 114226336 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -246581 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 116-44 chr14 44432145 44432278 + 1.5 NA Intergenic UCON103|Unknown|Unknown 75072 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 163.5-10 chr1 97130960 97131074 + 1.5 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) intron (NM_000110, intron 20 of 22) 35094 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 394.5-4 chr12 39572422 39572915 + 1.5 NA intron (NM_005164, intron 9 of 9) intron (NM_005164, intron 9 of 9) 47135 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 147-155 chr9 27849386 27849594 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -275624 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 187.5-45 chr12 118137224 118137363 + 1.5 NA intron (NM_002567, intron 1 of 3) intron (NM_002567, intron 1 of 3) 1169 NM_002567 5037 Hs.433863 NM_002567 ENSG00000089220 PEBP1 HCNP|HCNPpp|HEL-210|HEL-S-34|HEL-S-96|PBP|PEBP|PEBP-1|RKIP phosphatidylethanolamine binding protein 1 protein-coding 251-62 chr9 75150836 75151024 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62416 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 213-7 chr1 111411973 111412270 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 15614 NM_002557 5016 Hs.1154 NM_002557 ENSG00000085465 OVGP1 CHIT5|EGP|MUC9|OGP oviductal glycoprotein 1 protein-coding 216-15 chr14 23289372 23289608 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3358 NM_020834 57594 Hs.632332 NM_020834 ENSG00000215271 HOMEZ KIAA1443 homeobox and leucine zipper encoding protein-coding 193.5-85 chr2 70627029 70627192 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -73284 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 210-85 chr6 116195387 116195581 + 1.5 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) 58591 NM_021648 23270 Hs.284141 NM_021648 ENSG00000187189 TSPYL4 dJ486I3.2 TSPY like 4 protein-coding 154.5-79 chr17 39978043 39978251 + 1.5 NA TTS (NM_178171) TTS (NM_178171) -2660 NM_002809 5709 Hs.12970 NM_002809 ENSG00000108344 PSMD3 P58|RPN3|S3|TSTA2 proteasome 26S subunit, non-ATPase 3 protein-coding 190.5-114 chr4 78359115 78359334 + 1.5 NA intron (NM_001166133, intron 20 of 41) intron (NM_001166133, intron 20 of 41) 70239 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 164.5-214 chr8 128497960 128498199 + 1.5 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L1MC5a|LINE|L1 66600 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 444-6 chr5 150910681 150911028 + 1.5 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 -5871 NM_001172831 91975 Hs.134885 NM_052860 ENSG00000145908 ZNF300 - zinc finger protein 300 protein-coding 230.25-5 chr1 164410089 164410313 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -149159 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 216-53 chr3 24028679 24028858 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 74479 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 187.75-81 chr5 22294388 22294710 + 1.5 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) LTR47A|LTR|ERVL -80699 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 420.5 chr10 23083450 23083878 + 1.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -11915 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 247.25-14 chr13 59936184 59936629 + 1.5 NA intron (NM_001258369, intron 17 of 26) intron (NM_001258369, intron 17 of 26) -76312 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 354.75-21 chr8 88270349 88270820 + 1.5 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 56899 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 229.5-30 chr11 82019928 82020202 + 1.5 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) MIRc|SINE|MIR -129229 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 398-5 chr17 40846610 40847027 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 20405 NM_000223 3859 Hs.66739 NM_000223 ENSG00000187242 KRT12 K12 keratin 12 protein-coding 160.25-38 chr14 56834796 56835051 + 1.5 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 21765 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 270.75-44 chr5 171204712 171205016 + 1.5 NA intron (NM_022897, intron 19 of 27) MIRb|SINE|MIR -104384 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 344.25-9 chr18 13002374 13002711 + 1.5 NA intron (NM_032142, intron 3 of 44) L1ME4a|LINE|L1 11180 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 183-72 chr3 111924269 111924497 + 1.5 NA intron (NM_001134437, intron 6 of 17) L2b|LINE|L2 -54643 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 337-13 chr18 10718550 10718831 + 1.5 NA intron (NM_022068, intron 33 of 51) MER58A|DNA|hAT-Charlie 40959 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 202-20 chr12 115648607 115648793 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 499954 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 122-66 chr16 52742742 52742827 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -135809 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 174-68 chr4 32996518 32996640 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 645541 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 174.5-135 chr4 71758437 71758623 + 1.5 NA intron (NM_000583, intron 6 of 12) intron (NM_000583, intron 6 of 12) 25549 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 310.5-35 chr7 62848922 62849308 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 454941 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 199.25-22 chr12 61682658 61682895 + 1.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 510063 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 158.25-84 chr3 17125022 17125146 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 191888 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 268-53 chr7 16244422 16244688 + 1.5 NA intron (NR_038946, intron 2 of 4) intron (NR_038946, intron 2 of 4) 34069 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 225-79 chr8 125355900 125356236 + 1.5 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -74290 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 266-21 chr2 37281311 37281498 + 1.5 NA intron (NM_005813, intron 6 of 17) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 35680 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 416-4 chr14 65196586 65196988 + 1.5 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack 25560 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 211.5-74 chr2 50221201 50221485 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) UCON71_Crp|Unknown|Unknown 126411 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 309-46 chr7 67350132 67350521 + 1.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 14350 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 139-105 chr4 117570406 117570612 + 1.5 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 142111 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 189.5-101 chr4 105688411 105688554 + 1.5 NA intron (NM_001142471, intron 5 of 6) intron (NM_001142471, intron 5 of 6) 20207 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 203.5-45 chr15 90413776 90414109 + 1.5 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) intron (NM_003870, intron 2 of 37) 25700 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 331-24 chr4 40062779 40063165 + 1.5 NA intron (NM_001318359, intron 1 of 18) intron (NM_001318359, intron 1 of 18) -5773 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 232.25-61 chr5 44478352 44478615 + 1.5 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 31799 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 249-3 chr10 11524926 11525245 + 1.5 NA intron (NM_014688, intron 4 of 14) intron (NM_014688, intron 4 of 14) 7195 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 233.5-120 chrX 113591019 113591193 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 347112 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 281-32 chr6 49966376 49966735 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2391 NM_001037499 245928 Hs.381372 NM_001037499 ENSG00000177684 DEFB114 DEFB-14|DEFB14 defensin beta 114 protein-coding 534.25 chr15 64458013 64458626 + 1.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -41101 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 133.5-194 chr4 182181400 182181495 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 12154 NR_031640 100302270 NR_031640 ENSG00000221227 MIR1305 MIRN1305|hsa-mir-1305|mir-1305 microRNA 1305 ncRNA 224.75-11 chr1 106698478 106698690 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -119655 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 270-11 chr12 12115417 12115720 + 1.5 NA TTS (NM_002336).2 TTS (NM_002336).2 3616 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 235-38 chr21 29552989 29553269 + 1.5 NA 3' UTR (NM_000830, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_000830, exon 17 of 17) -42911 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 267-30 chr22 49913823 49914171 + 1.5 NA intron (NM_024105, intron 1 of 9) L1MD3|LINE|L1 4441 NM_024105 79087 Hs.526711 NM_024105 ENSG00000182858 ALG12 CDG1G|ECM39|PP14673|hALG12 ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferase protein-coding 264.5-8 chr10 60297521 60297895 + 1.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 92167 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 249-49 chr8 77438228 77438461 + 1.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -12353 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 401.75-15 chr8 51254861 51255311 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 554359 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 271.75-17 chr2 54964824 54965132 + 1.5 NA intron (NM_001039753, intron 37 of 40) intron (NM_001039753, intron 37 of 40) 45294 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 212.75-6 chr1 76727497 76727654 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 51692 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 268-43 chr5 14734523 14734844 + 1.5 NA intron (NM_054027, intron 8 of 11) intron (NM_054027, intron 8 of 11) 21989 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 179.5-198 chr9 132286669 132286875 + 1.5 NA intron (NM_001351527, intron 17 of 25) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 68084 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 238.75-59 chr7 37221323 37221538 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 10 of 21) intron (NM_001206480, intron 10 of 21) 132238 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 307.75-9 chr2 70809343 70809569 + 1.5 NA intron (NM_173535, intron 6 of 6) intron (NM_173535, intron 6 of 6) 11143 NM_001258027 165530 Hs.681239 NM_173535 ENSG00000152672 CLEC4F CLECSF13|KCLR C-type lectin domain family 4 member F protein-coding 149.5-224 chrX 67443863 67444093 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100043 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 218.25-108 chrX 44370022 44370239 + 1.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -26458 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 176.25-122 chr6 161246911 161247132 + 1.5 NA intron (NM_020133, intron 1 of 8) intron (NM_020133, intron 1 of 8) 27040 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 228.25-18 chr12 123982095 123982288 + 1.5 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) intron (NM_001347902, intron 2 of 4) 8976 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 205-79 chr9 11416919 11417149 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 803828 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 244-3 chr1 246499311 246499546 + 1.5 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) intron (NM_001167740, intron 1 of 11) 7851 NM_001167740 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 288.75-2 chr1 42007123 42007464 + 1.5 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 28641 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 278.25-50 chr6 106241260 106241523 + 1.5 NA intron (NR_104402, intron 4 of 5) L1MB2|LINE|L1 74875 NR_104403 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 341-14 chr2 13783930 13784474 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 616756 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 397.75-2 chr14 76967793 76968275 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 8396 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 204-24 chr18 7761026 7761288 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 193841 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 329.25-8 chr14 69205003 69205438 + 1.5 NA intron (NM_001193360, intron 2 of 9) L1MEd|LINE|L1 13454 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 237-33 chr20 54891682 54891895 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 416195 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 238.25-25 chr17 65773002 65773317 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) 53292 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 401.25-6 chr15 60764492 60764844 + 1.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 83099 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 191.25-18 chr11 88499912 88500064 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4588 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 251.5-19 chr12 23864914 23865169 + 1.5 NA intron (NM_001330785, intron 2 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 84629 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 178-18 chr12 44303482 44303634 + 1.5 NA intron (NM_001286211, intron 6 of 6) intron (NM_001286211, intron 6 of 6) 467477 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 230.5-35 chr14 60982898 60983166 + 1.5 NA intron (NR_033344, intron 2 of 16) intron (NR_033344, intron 2 of 16) -1342 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 257-40 chr4 42589637 42589889 + 1.5 NA intron (NM_001105529, intron 7 of 35) intron (NM_001105529, intron 7 of 35) 67342 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 144.25-99 chr2 86321954 86322142 + 1.5 NA intron (NM_001164730, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 15578 NM_022912 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 132-85 chr2 56442774 56442884 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -257059 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 201.5-81 chr20 59628774 59629003 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_040513) promoter-TSS (NR_040513) 279 NM_001281507 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 147-15 chr10 12672667 12672804 + 1.5 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) L1MB8|LINE|L1 -19538 NR_039701 100616320 NR_039701 ENSG00000283699 MIR4481 - microRNA 4481 ncRNA 422-2 chr1 81589120 81589748 + 1.5 NA intron (NM_001366008, intron 3 of 26) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -31732 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 371.75-2 chr1 105819357 105819698 + 1.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -200592 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 224.75-62 chr6 81493764 81494068 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 258765 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 387-10 chr3 144358294 144358658 + 1.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 385395 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 203.5-133 chr7 121106565 121106728 + 1.5 NA intron (NM_001105533, intron 6 of 17) intron (NM_001105533, intron 6 of 17) 117255 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 224.25-104 chr8 29131663 29131874 + 1.5 NA intron (NM_015254, intron 23 of 39) intron (NM_015254, intron 23 of 39) 131302 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 268.5-43 chr4 133424746 133425019 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 275588 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 206-33 chr16 63772920 63773143 + 1.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 1349032 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 193-62 chr4 48259068 48259352 + 1.5 NA intron (NM_003215, intron 1 of 17) intron (NM_003215, intron 1 of 17) 10628 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 303-29 chr7 42618849 42619229 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 87408 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 392.25-10 chr3 56167528 56168041 + 1.5 NA intron (NR_132749, intron 4 of 17) intron (NR_132749, intron 4 of 17) 300683 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 237.25-29 chr14 76909288 76909599 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -50195 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 144.5-237 chrX 49777554 49777666 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -51650 NM_001318877 9506 Hs.441038 NM_007003 ENSG00000101951 PAGE4 CT16.7|GAGE-9|GAGEC1|JM-27|JM27|PAGE-1|PAGE-4 PAGE family member 4 protein-coding 148-56 chr2 63892705 63892975 + 1.5 NA 3' UTR (NM_016516, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_016516, exon 23 of 23) 50960 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 219-8 chr1 244122512 244122770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69436 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 118-204 chrX 120133000 120133113 + 1.5 NA intron (NR_131238, intron 2 of 4) LOR1-int|LTR|ERV1 -13356 NR_126557 104797536 NR_126557 ENSG00000228139 LINC01402 GS1-421I3.4|TCONS_00017087 long intergenic non-protein coding RNA 1402 ncRNA 240.5-42 chr17 70089640 70089840 + 1.5 NA intron (NM_001270422, intron 1 of 5) intron (NM_001270422, intron 1 of 5) 14515 NM_018658 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 175-134 chr9 38429711 38429940 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5371 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 399.25-4 chr17 60460622 60461212 + 1.5 NA intron (NM_006380, intron 8 of 12) intron (NM_006380, intron 8 of 12) 38428 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 254.5-42 chr2 167285198 167285486 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 97970 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 309-18 chr17 3143954 3144304 + 1.5 NA intron (NR_147912, intron 3 of 3) L1MDa|LINE|L1 -16578 NM_003555 8390 Hs.248183 NM_003555 ENSG00000183024 OR1G1 OR17-130|OR17-209|OR1G2 olfactory receptor family 1 subfamily G member 1 protein-coding 293.5-17 chr15 98926370 98926640 + 1.5 NA intron (NM_001291858, intron 13 of 20) L1MA8|LINE|L1 79151 NM_001102612 145814 Hs.592021 NM_001102612 ENSG00000183571 PGPEP1L - pyroglutamyl-peptidase I like protein-coding 299.75-8 chr12 117813466 117813722 + 1.5 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) L1MA5A|LINE|L1 155396 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 466.5-8 chr3 147716935 147717410 + 1.5 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 295845 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 190.5-72 chr19 32373853 32374069 + 1.5 NA intron (NM_001136156, intron 5 of 6) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 28351 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 220.5-10 chr10 104116812 104117028 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5138 NM_145247 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 248.75-40 chr3 98102296 98102496 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 15223 NM_054106 81050 Hs.554715 NM_054106 ENSG00000196578 OR5AC2 HSA1 olfactory receptor family 5 subfamily AC member 2 protein-coding 343.5-5 chr12 11687502 11687838 + 1.5 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 37816 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 630.75 chr12 120682732 120683654 + 1.5 NA Intergenic MER95|LTR|ERV1 -3956 NM_001303628 9761 Hs.744910 NM_014730 ENSG00000110917 MLEC KIAA0152 malectin protein-coding 166-33 chr14 75483409 75483614 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -38958 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 287.5-14 chr11 111999132 111999438 + 1.5 NA intron (NM_001037954, intron 17 of 19) intron (NM_001037954, intron 17 of 19) 21976 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 293-24 chr3 121178065 121178330 + 1.5 NA intron (NM_001348343, intron 9 of 27) L1MB3|LINE|L1 128557 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 202-42 chr3 97873904 97874082 + 1.5 NA exon (NM_153605, exon 4 of 22) exon (NM_153605, exon 4 of 22) 51982 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 242.5-65 chr5 25914978 25915306 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 724189 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 165-94 chr3 112825466 112825640 + 1.5 NA intron (NM_001370552, intron 6 of 7) intron (NM_001370552, intron 6 of 7) 20397 NM_001370552 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 288-4 chr1 169704431 169704707 + 1.5 NA exon (NM_000655, exon 5 of 9) exon (NM_000655, exon 5 of 9) 4288 NR_029467 6402 Hs.728756 NM_000655 ENSG00000188404 SELL CD62L|LAM1|LECAM1|LEU8|LNHR|LSEL|LYAM1|PLNHR|TQ1 selectin L protein-coding 268-41 chr4 125752859 125753103 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 245722 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 324-10 chr2 33561718 33562159 + 1.5 NA intron (NM_015376, intron 16 of 16) intron (NM_015376, intron 16 of 16) 7492 NR_146505 105374454 NR_146505 LOC105374454 - uncharacterized LOC105374454 ncRNA 289.5-4 chr1 190446367 190446744 + 1.5 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 29455 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 255.5-85 chr8 84439561 84439859 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 24226 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 186.5-4 chr1 119031404 119031543 + 1.5 NA 3' UTR (NM_201263, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_201263, exon 6 of 6) -15932 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 198-60 chr5 23192484 23192743 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -314996 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 437.25 chr1 248700636 248701087 + 1.5 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 3799 NR_125950 101928226 NR_125950 LYPD9P - LY6/PLAUR domain containing 9, pseudogene pseudo 228-60 chr4 95429542 95429780 + 1.5 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 119312 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 198-28 chr16 65347897 65348134 + 1.5 NA intron (NR_027755, intron 7 of 8) intron (NR_027755, intron 7 of 8) -171442 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 273.25-26 chr4 157009652 157009879 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -37966 NR_036641 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 412.25-16 chr9 73613154 73613606 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 461515 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 326-20 chr20 43018608 43018966 + 1.5 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) L1ME3G|LINE|L1 50044 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 348-17 chr5 173175093 173175649 + 1.5 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 30840 NM_013980 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 290-15 chr14 68964012 68964287 + 1.5 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) intron (NM_001102, intron 1 of 20) 15153 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 300.75-3 chr1 173555053 173555504 + 1.5 NA intron (NM_178527, intron 10 of 27) intron (NM_178527, intron 10 of 27) 47794 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 187.5-183 chrX 139308983 139309160 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -104048 NM_001139501 2258 Hs.6540 NM_004114 ENSG00000129682 FGF13 FGF-13|FGF2|FHF-2|FHF2|LINC00889 fibroblast growth factor 13 protein-coding 142.5-26 chr10 5433846 5433956 + 1.5 NA intron (NM_001047160, intron 3 of 11) L1M8|LINE|L1 -12650 NR_073040 10276 Hs.25155 NM_005863 ENSG00000173848 NET1 ARHGEF8|NET1A neuroepithelial cell transforming 1 protein-coding 193-7 chr1 165347615 165347785 + 1.5 NA intron (NM_177398, intron 3 of 8) intron (NM_177398, intron 3 of 8) 8541 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 185.5-168 chr9 20967853 20968139 + 1.5 NA intron (NM_017794, intron 37 of 45) L1MB5|LINE|L1 63644 NM_001321883 401494 Hs.716678 NM_001010915 ENSG00000188921 HACD4 PTPLAD2 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 protein-coding 270.25-24 chr17 71426607 71427023 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -224636 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 383.25-14 chr3 152415102 152415575 + 1.5 NA intron (NM_207295, intron 2 of 7) intron (NM_207295, intron 2 of 7) -74348 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 253.25-33 chr2 209362343 209362688 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -61532 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 297-32 chr3 134232189 134232492 + 1.5 NA intron (NM_001005861, intron 1 of 14) intron (NM_001005861, intron 1 of 14) 18404 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 206-74 chr7 110820405 110820593 + 1.5 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -270507 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 199.5-70 chr2 28149044 28149281 + 1.5 NA non-coding (NR_120504, exon 3 of 3) non-coding (NR_120504, exon 3 of 3) 57799 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 158.25-109 chr5 33043442 33043550 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 96053 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 285-37 chr5 12605339 12605637 + 1.5 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) L1MEg|LINE|L1 30631 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 329.25-10 chr15 33283300 33283587 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 26802 NR_120326 101928134 Hs.133851 NR_120326 ENSG00000259446 LOC101928134 - uncharacterized LOC101928134 ncRNA 205-82 chrX 78353189 78353438 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -25622 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 185.5-11 chr1 208605762 208605968 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -122823 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 284.5 chr1 68310296 68310794 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -77999 NM_001193334 79971 Hs.647659 NM_024911 ENSG00000116729 WLS C1orf139|EVI|GPR177|MRP|mig-14 Wnt ligand secretion mediator protein-coding 271-49 chr8 118504725 118504920 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -116179 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 194.5-162 chr8 136750054 136750246 + 1.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M3b|LINE|L1 219352 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 445.5 chr18 1657706 1658210 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -298329 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 364.5-13 chr3 192873606 192874050 + 1.5 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 44028 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 165.5-16 chr10 33545490 33545658 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -210669 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 151-37 chr14 84154840 84155017 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1117004 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 172.5-31 chr10 64733220 64733407 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92215 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 211.5-80 chr2 118494758 118494950 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 108112 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 248.5-49 chr2 37955959 37956250 + 1.5 NA intron (NM_144713, intron 2 of 10) L1MB3|LINE|L1 5640 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 264-32 chr2 56544448 56544776 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -358842 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 260.5-10 chr12 18712246 18712424 + 1.5 NA intron (NM_001330769, intron 2 of 10) MamRep1151|LTR?|LTR? 25174 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 309-47 chr7 91446405 91446625 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 182082 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 216-66 chr5 145129549 145129836 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 705650 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 335.25-20 chr2 205381156 205381475 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -301185 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 558.25 chr16 78351548 78352099 + 1.5 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) AluSx|SINE|Alu 252169 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 271-39 chr5 27721804 27721995 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 249607 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 144.5-227 chr8 130407870 130407970 + 1.5 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) intron (NM_001362925, intron 1 of 29) 35740 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 257.25-25 chr20 932140 932486 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15979 NM_015985 51378 Hs.278973 NM_015985 ENSG00000101280 ANGPT4 ANG3|ANG4 angiopoietin 4 protein-coding 317.75-21 chr3 36761067 36761434 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21389 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 329-37 chr7 55480596 55480887 + 1.5 NA intron (NM_001321243, intron 4 of 5) intron (NM_001321243, intron 4 of 5) 46139 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 138.25-99 chr20 46806833 46807026 + 1.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -87695 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 231-67 chr5 35238721 35239040 + 1.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -8393 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 354.75-13 chr3 116377993 116378336 + 1.5 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) FordPrefect_a|DNA|hAT-Tip100 18140 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 151-112 chr5 116342035 116342159 + 1.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 32473 NR_104675 101927190 Hs.639849 NR_104675 LOC101927190 - uncharacterized LOC101927190 ncRNA 381.5-4 chr4 76836014 76836308 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61983 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 326.5-17 chr3 176913385 176913960 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -96671 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 340.5-15 chr16 67598416 67598698 + 1.5 NA intron (NM_001191022, intron 2 of 9) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 27784 NM_001363916 10664 Hs.368367 NM_006565 ENSG00000102974 CTCF MRD21 CCCTC-binding factor protein-coding 230.5-20 chr11 33303320 33303508 + 1.5 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger 45083 NM_001278162 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 204-22 chr17 71254314 71254544 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -52250 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 256-47 chr3 159135635 159135880 + 1.5 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 66438 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 235-69 chr7 114174953 114175219 + 1.5 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 88759 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 447.75 chr10 124103952 124104512 + 1.5 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -10634 NM_001270765 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 149-28 chr14 23519155 23519313 + 1.5 NA intron (NR_046052, intron 2 of 2) intron (NR_046052, intron 2 of 2) 6424 NR_046052 79178 Hs.655179 NM_024328 ENSG00000259431 THTPA THTP|THTPASE thiamine triphosphatase protein-coding 388.25-9 chr9 30208934 30209336 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 199319 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 173.25-101 chr5 89875377 89875578 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 141243 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 279.5-40 chr3 88539912 88540189 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 201594 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 239.25-56 chr21 30074284 30074608 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 92359 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 230-29 chr19 1594350 1594731 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1675 NM_001281453 53615 Hs.178728 NM_003926 ENSG00000071655 MBD3 - methyl-CpG binding domain protein 3 protein-coding 214.75-37 chr2 30524919 30525189 + 1.5 NA intron (NM_001304445, intron 3 of 7) intron (NM_001304445, intron 3 of 7) 77808 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 231.75-34 chr2 39804847 39805088 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -25691 NM_001321474 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 154-65 chr2 47372104 47372256 + 1.5 NA intron (NM_002354, intron 1 of 8) intron (NM_002354, intron 1 of 8) 3032 NM_002354 4072 Hs.542050 NM_002354 ENSG00000119888 EPCAM DIAR5|EGP-2|EGP314|EGP40|ESA|HNPCC8|KS1/4|KSA|M4S1|MIC18|MK-1|TACSTD1|TROP1 epithelial cell adhesion molecule protein-coding 192-22 chr10 114137179 114137378 + 1.5 NA non-coding (NR_135815, exon 8 of 16) non-coding (NR_135815, exon 8 of 16) 36901 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 416.75-6 chr6 154250396 154250689 + 1.5 NA intron (NM_001130699, intron 4 of 12) intron (NM_001130699, intron 4 of 12) 79539 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 301.75-18 chr2 108826192 108826421 + 1.5 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) L1MB8|LINE|L1 39535 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 314.75-9 chr2 54218083 54218499 + 1.5 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 37938 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 117.75-115 chr2 224931553 224931663 + 1.5 NA exon (NM_001363762, exon 2 of 56) exon (NM_001363762, exon 2 of 56) 15441 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 277-38 chr8 131287759 131288057 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -246999 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 334.5-15 chr22 33118536 33118818 + 1.5 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 10148 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 250.5-14 chr11 68293561 68293762 + 1.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -18930 NM_001291902 4041 Hs.6347 NM_002335 ENSG00000162337 LRP5 BMND1|EVR1|EVR4|HBM|LR3|LRP-5|LRP-7|LRP7|OPPG|OPS|OPTA1|PCLD4|VBCH2 LDL receptor related protein 5 protein-coding 287.5-25 chr17 62832496 62832850 + 1.5 NA intron (NR_135634, intron 1 of 1) L1MC3|LINE|L1 24171 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 272.5-55 chr5 87524589 87524961 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -111742 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 305.5-49 chr8 67204750 67204986 + 1.5 NA intron (NM_006421, intron 34 of 38) intron (NM_006421, intron 34 of 38) 121020 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 170-20 chr11 100978824 100978967 + 1.5 NA intron (NM_001367945, intron 23 of 25) intron (NM_001367945, intron 23 of 25) 44621 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 537.25 chr2 70760566 70761025 + 1.5 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) L1ME3B|LINE|L1 6920 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 261.5-31 chr2 160049612 160049947 + 1.5 NA intron (NM_001007267, intron 1 of 26) AluSz6|SINE|Alu 12836 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 329-21 chr3 31616094 31616483 + 1.5 NA intron (NM_178862, intron 6 of 15) MER39|LTR|ERV1 83363 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 267-42 chr6 55478265 55478584 + 1.5 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) intron (NR_109869, intron 3 of 4) 100790 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 440-2 chr11 56535231 56535742 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 7771 NM_001005245 219487 Hs.553632 NM_001005245 ENSG00000255223 OR5M11 OR11-199 olfactory receptor family 5 subfamily M member 11 protein-coding 285-8 chr11 99296802 99297090 + 1.5 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) MER41-int|LTR|ERV1 -259199 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 730.5 chr2 27987872 27988656 + 1.5 NA intron (NM_199193, intron 5 of 13) intron (NM_199193, intron 5 of 13) -8103 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 175.5-28 chr10 129215137 129215314 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -252016 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 319.25-12 chr22 26562025 26562564 + 1.5 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 3047 NM_001008566 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 264.5-49 chr5 83901212 83901541 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -180521 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 141-50 chr14 85753772 85753913 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -180836 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 293.25-11 chr18 70973424 70973736 + 1.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -322626 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 306-19 chr20 19249464 19249791 + 1.5 NA intron (NR_024564, intron 6 of 7) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 34969 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 406.25-3 chr3 121653251 121653765 + 1.5 NA intron (NM_001292041, intron 3 of 12) MIR|SINE|MIR 7395 NM_005335 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 214-76 chrX 82865368 82865585 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -642814 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 216.75-65 chr5 146219378 146219623 + 1.5 NA intron (NM_018989, intron 2 of 20) intron (NM_018989, intron 2 of 20) 15895 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 300-22 chr18 14085923 14086147 + 1.5 NA intron (NR_033354, intron 1 of 5) L1M3e|LINE|L1 46400 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 383-20 chr8 118755398 118755773 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -133622 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 244.5-85 chr6 74270966 74271284 + 1.5 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 201674 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 405.5-5 chr12 130298663 130299026 + 1.5 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -39043 NM_004764 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 209-49 chr22 46068484 46068870 + 1.5 NA intron (NR_148973, intron 1 of 1) intron (NR_148973, intron 1 of 1) 2344 NR_148973 642648 Hs.631363 NR_148973 LOC642648 - uncharacterized LOC642648 ncRNA 330.25-3 chr10 67184426 67184682 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 6 of 17) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 172288 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 440-11 chr6 54388418 54388875 + 1.5 NA intron (NM_014464, intron 10 of 10) intron (NM_014464, intron 10 of 10) 80205 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 162-128 chr9 89724137 89724284 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 84427 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 222-76 chr8 63751156 63751411 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18147 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 365.25-13 chrX 84536390 84536719 + 1.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -34101 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 365-19 chr8 126903859 126904222 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109114 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 279 chr1 49856823 49857158 + 1.5 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) L1M2b|LINE|L1 166964 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 235-11 chr10 53966453 53966622 + 1.5 NA intron (NM_001354411, intron 22 of 34) intron (NM_001354411, intron 22 of 34) -519693 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 153-97 chr3 109709150 109709351 + 1.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 106422 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 432-8 chr2 50593489 50593999 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 102518 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 300.75-23 chr19 37357431 37357770 + 1.5 NA intron (NM_001329779, intron 4 of 4) L1PA17|LINE|L1 -13499 NM_032453 84503 Hs.590940 NM_032453 ENSG00000189164 ZNF527 - zinc finger protein 527 protein-coding 279-34 chr5 6748531 6748834 + 1.5 NA intron (NM_001171805, intron 8 of 12) intron (NM_001171805, intron 8 of 12) 35250 NM_001171805 11044 Hs.481542 NM_006999 ENSG00000112941 TENT4A LAK-1|LAK1|PAPD7|POLK|POLS|TRF4|TRF4-1|TRF41|TUTASE5 terminal nucleotidyltransferase 4A protein-coding 208.5-18 chr11 22398078 22398372 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 59844 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 278 chr1 23845176 23845552 + 1.5 NA 3' UTR (NM_000147, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_000147, exon 8 of 8) -19905 NM_001166059 3155 Hs.533444 NM_000191 ENSG00000117305 HMGCL HL 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase protein-coding 254.25-46 chr3 195414392 195414623 + 1.5 NA intron (NM_012287, intron 1 of 22) L1MC1|LINE|L1 28513 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 300-4 chr1 74199483 74199940 + 1.5 NA exon (NM_001199328, exon 2 of 5) exon (NM_001199328, exon 2 of 5) 1499 NM_001199328 8790 Hs.480085 NM_003838 ENSG00000254685 FPGT GFPP fucose-1-phosphate guanylyltransferase protein-coding 153-116 chr5 34720269 34720554 + 1.5 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) AluY|SINE|Alu 32852 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 228.5-71 chr3 35520584 35520895 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -118786 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 313.75-5 chr16 24826092 24826504 + 1.5 NA TTS (NM_001351850) TTS (NM_001351850) -19565 NM_001258414 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 186.75-51 chr2 50553473 50553638 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 142707 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 318.5-26 chr21 30539880 30540188 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1830 NM_181612 337973 Hs.553695 NM_181612 ENSG00000186925 KRTAP19-6 KAP19.6 keratin associated protein 19-6 protein-coding 227.5-6 chr1 211068034 211068297 + 1.5 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 65209 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 408.25-8 chr8 128384012 128384584 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 180381 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 160-100 chr7 33291905 33292074 + 1.5 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 162425 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 211.5-100 chr3 76821129 76821367 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -218851 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 232.5-17 chr12 73427983 73428170 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 268886 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 269.5-13 chr14 52747099 52747351 + 1.5 NA intron (NM_001130701, intron 4 of 11) intron (NM_001130701, intron 4 of 11) 17059 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 236-42 chr3 37054534 37054788 + 1.5 NA intron (NM_006309, intron 26 of 27) intron (NM_006309, intron 26 of 27) 61311 NM_001258273 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 193.5-161 chr8 51004045 51004199 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 805323 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 237-15 chr12 12925414 12925684 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2177 NR_149063 100506314 Hs.127718 NR_038920 ENSG00000247498 GPRC5D-AS1 - GPRC5D and HEBP1 antisense RNA 1 ncRNA 203-29 chr12 39458259 39458436 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15227 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 350.25-13 chr14 91039412 91039853 + 1.5 NA intron (NM_182398, intron 1 of 12) LTR16E2|LTR|ERVL 20492 NM_001322238 9252 Hs.510225 NM_004755 ENSG00000100784 RPS6KA5 MSK1|MSPK1|RLPK ribosomal protein S6 kinase A5 protein-coding 328.5-30 chr7 72068170 72068464 + 1.5 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 269074 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 294-31 chr8 117254766 117255145 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 119960 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 138-111 chr4 31676693 31676862 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 170233 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 399.75-7 chr17 81555260 81555535 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3044 NR_033338 80233 Hs.313905 NM_025161 ENSG00000185504 FAAP100 C17orf70 FA core complex associated protein 100 protein-coding 199.5-68 chr2 16249122 16249331 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 198799 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 234.75-49 chr3 48978005 48978246 + 1.5 NA intron (NM_001349216, intron 12 of 16) intron (NM_001349216, intron 12 of 16) -11783 NM_177938 54681 Hs.654944 NM_017732 ENSG00000178467 P4HTM EGLN4|HIFPH4|P4H-TM|PH-4|PH4|PHD4 prolyl 4-hydroxylase, transmembrane protein-coding 200.25-21 chr11 114945618 114945841 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 267202 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 249.75-25 chr16 46668484 46668781 + 1.5 NA intron (NM_018206, intron 13 of 16) intron (NM_018206, intron 13 of 16) 20546 NM_018206 55737 Hs.454528 NM_018206 ENSG00000069329 VPS35 MEM3|PARK17 VPS35 retromer complex component protein-coding 272.25-53 chr6 149015124 149015455 + 1.5 NA intron (NM_005715, intron 5 of 7) intron (NM_005715, intron 5 of 7) 17372 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 215.75-79 chr5 90267754 90268058 + 1.5 NA intron (NR_120601, intron 1 of 5) intron (NR_120601, intron 1 of 5) 22165 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 160-107 chr8 65788568 65788766 + 1.5 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) intron (NM_001242318, intron 1 of 12) 390 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 228.5-68 chr22 26717263 26717749 + 1.5 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) intron (NR_110543, intron 2 of 5) 44663 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 293-31 chr5 50870184 50870500 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 99845 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 301.75-6 chr12 5477607 5478029 + 1.5 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) -16314 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 208.5-92 chr3 190635208 190635353 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001364880, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001364880, exon 9 of 9) 121195 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 317.25-17 chr2 53085310 53085696 + 1.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -382888 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 304.25-14 chr2 170411656 170411888 + 1.5 NA intron (NM_001083615, intron 22 of 33) intron (NM_001083615, intron 22 of 33) -60829 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 257.5-45 chr3 8891844 8892099 + 1.5 NA intron (NM_020165, intron 11 of 12) intron (NM_020165, intron 11 of 12) 71501 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 408.5-10 chr7 37910555 37910941 + 1.5 NA intron (NM_003014, intron 4 of 5) L1M5|LINE|L1 6069 NM_003014 6424 Hs.658169 NM_003014 ENSG00000106483 SFRP4 FRP-4|FRPHE|FRZB-2|PYL|sFRP-4 secreted frizzled related protein 4 protein-coding 252.75-44 chr3 62109686 62109976 + 1.5 NA intron (NM_002841, intron 5 of 29) intron (NM_002841, intron 5 of 29) 209116 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 318.5-32 chr4 48205135 48205428 + 1.5 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) intron (NM_003215, intron 2 of 17) 64557 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 275.5-12 chr11 80856753 80856994 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -94070 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 305-23 chr2 221268321 221268635 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 303826 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 180-86 chr3 127774414 127774568 + 1.5 NA intron (NM_001003794, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 48391 NM_001256585 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 178-71 chr4 47365130 47365282 + 1.5 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 98496 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 447-2 chr10 62904029 62904457 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -85076 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 161.5-84 chr19 33148484 33148680 + 1.5 NA intron (NR_135565, intron 4 of 11) AluJr|SINE|Alu 16468 NM_173479 126248 Hs.211046 NM_173479 ENSG00000166359 WDR88 PQWD WD repeat domain 88 protein-coding 242.25-71 chr5 152619067 152619358 + 1.5 NA non-coding (NR_109877, exon 5 of 5) non-coding (NR_109877, exon 5 of 5) -213933 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 381-16 chr3 123836327 123836637 + 1.5 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) L1ME4b|LINE|L1 47850 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 189.5-150 chr8 117410746 117410934 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -109873 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 312.75-12 chr17 44930291 44930596 + 1.5 NA intron (NM_001265577, intron 11 of 15) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 4238 NR_106841 102466734 NR_106841 ENSG00000278223 MIR6783 hsa-mir-6783 microRNA 6783 ncRNA 264.75-58 chr8 79912395 79912658 + 1.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -40789 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 225-65 chr6 45111863 45112016 + 1.5 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 85831 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 275.5-68 chr8 132072858 132073084 + 1.5 NA intron (NM_001145095, intron 13 of 15) LTR37A|LTR|ERV1 -13589 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 429-3 chr2 40648771 40649311 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -136606 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 455.75 chr10 63250639 63251134 + 1.5 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu 18337 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 277-14 chr16 58298985 58299373 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -4132 NM_001080492 221191 Hs.411239 NM_001080492 ENSG00000103023 PRSS54 CT67|KLKBL4 serine protease 54 protein-coding 395.75-4 chr12 105138464 105138948 + 1.5 NA intron (NM_001293640, intron 15 of 32) intron (NM_001293640, intron 15 of 32) 30975 NM_015275 23325 Hs.12144 NM_015275 ENSG00000136051 WASHC4 KIAA1033|MRT43|SWIP WASH complex subunit 4 protein-coding 203-104 chr9 24584071 24584352 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38314 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 208-38 chr2 37267405 37267673 + 1.5 NA intron (NM_005813, intron 12 of 17) intron (NM_005813, intron 12 of 17) 35881 NR_146410 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 287.5-17 chr13 25195172 25195526 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 14017 NR_120427 102723318 Hs.549877 NR_120427 LINC01053 - long intergenic non-protein coding RNA 1053 ncRNA 323-26 chr7 107196828 107197071 + 1.5 NA intron (NM_001244262, intron 9 of 10) intron (NM_001244262, intron 9 of 10) 27946 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 330.25-16 chr3 143763970 143764213 + 1.5 NA intron (NM_173653, intron 4 of 15) intron (NM_173653, intron 4 of 15) 84377 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 130.75-111 chr3 7736295 7736472 + 1.5 NA intron (NM_181874, intron 10 of 10) intron (NM_181874, intron 10 of 10) -201099 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 370.25-7 chr4 97287114 97287528 + 1.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -79605 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 226.5-47 chr2 122822246 122822452 + 1.5 NA Intergenic MER101B|LTR|ERV1 251132 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 227.75-50 chr3 74539816 74540159 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18847 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 282.75-11 chr12 32191489 32191895 + 1.5 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) (ATATAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 84845 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 145.75-102 chr3 114580956 114581185 + 1.5 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 43136 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 389-6 chr16 2343542 2344035 + 1.5 NA intron (NR_003574, intron 1 of 16) intron (NR_003574, intron 1 of 16) 2866 NR_003574 650655 Hs.376281 NR_003574 ENSG00000238098 ABCA17P ABCA17 ATP binding cassette subfamily A member 17, pseudogene pseudo 165.25-99 chr4 38358114 38358329 + 1.5 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -8693 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 248.25-32 chr2 12807698 12808038 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 70501 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 243.5-80 chr8 69343136 69343470 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 104941 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 136.5-169 chr5 4613436 4613611 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -159958 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 218.25-39 chr2 32118643 32118881 + 1.5 NA intron (NM_001363875, intron 6 of 15) intron (NM_001363875, intron 6 of 15) -47079 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 164.5-217 chr8 139444593 139444744 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 258455 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 388-10 chr4 72085498 72085939 + 1.5 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 46586 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 292-47 chr8 117048893 117049479 + 1.5 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -85809 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 237.75-56 chr4 48710077 48710377 + 1.5 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) intron (NM_015030, intron 2 of 63) 70072 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 190.75-94 chr6 55126544 55126760 + 1.5 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) L1PA7|LINE|L1 20192 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 360.25-10 chr20 40618032 40618506 + 1.5 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR 70967 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 307 chr1 8552035 8552372 + 1.5 NA intron (NM_001042681, intron 6 of 22) intron (NM_001042681, intron 6 of 22) -57290 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 323.75-13 chr2 60327540 60328015 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 55259 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 161-21 chr11 81922352 81922505 + 1.5 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MEd|LINE|L1 -31592 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 285-28 chr2 226113709 226113937 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -28971 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 417-5 chr15 100723960 100724412 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 121597 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 170.25-110 chr4 70668398 70668608 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1995 NM_144646 3512 Hs.643431 NM_144646 ENSG00000132465 JCHAIN IGCJ|IGJ|JCH joining chain of multimeric IgA and IgM protein-coding 241.75-43 chr2 221069141 221069342 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 503063 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 222.5-108 chr8 89772807 89773037 + 1.5 NA intron (NM_003821, intron 6 of 10) intron (NM_003821, intron 6 of 10) 15106 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 292.75-24 chr3 81131860 81132091 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 138107 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 426-9 chr20 41497232 41497624 + 1.5 NA exon (NM_032221, exon 8 of 37) exon (NM_032221, exon 8 of 37) 120949 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 250.5-89 chr7 44171785 44171981 + 1.5 NA intron (NM_001354800, intron 1 of 10) AluSg|SINE|Alu -12601 NM_033507 2645 Hs.1270 NM_000162 ENSG00000106633 GCK FGQTL3|GK|GLK|HHF3|HK4|HKIV|HXKP|LGLK|MODY2 glucokinase protein-coding 270-15 chr12 46658174 46658482 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 167669 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 281.25-41 chr7 88646413 88646686 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -113151 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 376.5-20 chr9 117275587 117276030 + 1.5 NA intron (NM_014010, intron 2 of 21) AluSz|SINE|Alu -94607 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 261-41 chr4 61725517 61725773 + 1.5 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 436120 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 206.5-29 chr15 47877582 47877762 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31436 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 289.5-44 chr6 100323813 100324130 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 139704 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 275.5-10 chr10 75721990 75722385 + 1.5 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 9732 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 136.5-190 chr5 167104990 167105119 + 1.5 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) 31812 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 289-18 chr17 59095271 59095623 + 1.5 NA intron (NM_001320987, intron 1 of 22) L2|LINE|L2 11433 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 240-39 chr3 185282246 185282455 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001242314) promoter-TSS (NM_001242314) -591 NR_038322 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 570.5-2 chr20 5617696 5618131 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6907 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 230-6 chr10 33905167 33905439 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -132623 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 243.5-78 chr8 26635910 26636137 + 1.5 NA intron (NM_001244604, intron 8 of 13) intron (NM_001244604, intron 8 of 13) 57618 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 423.5-12 chr8 122690995 122691502 + 1.5 NA intron (NR_126348, intron 2 of 3) intron (NR_126348, intron 2 of 3) 2858 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 156.5-146 chr5 40367043 40367173 + 1.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -312807 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 226.75-20 chr15 84000191 84000396 + 1.5 NA intron (NM_207517, intron 23 of 29) intron (NM_207517, intron 23 of 29) -79894 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 190.5-25 chr11 46090315 46090548 + 1.5 NA intron (NR_147890, intron 2 of 18) L3|LINE|CR1 30388 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 268-13 chr11 113107874 113108250 + 1.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -144602 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 219-37 chr15 61668026 61668206 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -61802 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 201-12 chr10 67722038 67722293 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25970 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 300-36 chr7 83663195 83663741 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -14329 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 229.5-3 chr1 48130889 48131235 + 1.5 NA intron (NR_026749, intron 7 of 9) L1PB4|LINE|L1 51366 NR_026749 391037 Hs.585393 NR_026749 SKINT1L BTN12|SKINT1|SKINTL|SKINTP Skint1 like (pseudogene) pseudo 396-10 chr20 5811105 5811475 + 1.5 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) 60889 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 251.25-64 chr9 13226174 13226441 + 1.5 NA intron (NM_003829, intron 3 of 45) intron (NM_003829, intron 3 of 45) 53257 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 368.5-19 chr8 138615328 138615733 + 1.5 NA intron (NM_152888, intron 55 of 64) AluSx1|SINE|Alu -117800 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 149.25-180 chr8 78564819 78564944 + 1.5 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) L1ME4c|LINE|L1 -6378 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 222-47 chr20 62990829 62991030 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 16035 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 435-8 chr7 44444596 44444940 + 1.5 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) intron (NM_015332, intron 2 of 5) 45890 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 124.5-86 chr18 12338680 12338818 + 1.5 NA intron (NM_006796, intron 15 of 16) HAL1M8|LINE|L1 30508 NM_001303530 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 240-49 chr5 43306555 43306856 + 1.5 NA intron (NM_002130, intron 1 of 9) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 6476 NM_001364188 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 208.75-8 chr10 58210911 58211060 + 1.5 NA intron (NM_152230, intron 4 of 5) intron (NM_152230, intron 4 of 5) 56909 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 251.5-18 chr12 17749272 17749659 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 76166 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 198.25-107 chrX 53423677 53423849 + 1.5 NA intron (NM_001031745, intron 2 of 7) intron (NM_001031745, intron 2 of 7) 890 NM_001031745 158787 Hs.351743 NM_144968 ENSG00000158423 RIBC1 2610028I09Rik RIB43A domain with coiled-coils 1 protein-coding 327.5-28 chr7 121214689 121214952 + 1.5 NA intron (NM_001105533, intron 15 of 17) intron (NM_001105533, intron 15 of 17) -110547 NM_016087 51384 Hs.272375 NM_016087 ENSG00000002745 WNT16 - Wnt family member 16 protein-coding 262.5-43 chr20 59726536 59726826 + 1.5 NA intron (NM_183246, intron 1 of 11) intron (NM_183246, intron 1 of 11) 5471 NM_183244 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 219.5-32 chr12 76157299 76157623 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -72776 NM_001330232 4673 Hs.524599 NM_004537 ENSG00000187109 NAP1L1 NAP1|NAP1L|NRP nucleosome assembly protein 1 like 1 protein-coding 207.75-54 chr2 61033011 61033210 + 1.5 NA intron (NM_002618, intron 2 of 3) intron (NM_002618, intron 2 of 3) -14851 NM_001322127 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 146.75-85 chr2 195291031 195291207 + 1.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -365839 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 245.75-58 chr7 68434780 68435015 + 1.5 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 414644 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 214.25-13 chr11 128477137 128477488 + 1.5 NA intron (NM_001330451, intron 5 of 6) intron (NM_001330451, intron 5 of 6) 44998 NM_001162422 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 316.5-11 chr12 4143613 4143970 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -129971 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 257-36 chr3 95946240 95946491 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -263172 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 250.5-62 chr3 103085814 103086043 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 438188 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 315 chr1 39963461 39963908 + 1.5 NA intron (NM_032793, intron 3 of 13) LTR24B|LTR|ERV1 8539 NM_001136493 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 184.5-28 chr11 89169680 89169901 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8085 NM_000372 7299 Hs.503555 NM_000372 ENSG00000077498 TYR ATN|CMM8|OCA1|OCA1A|OCAIA|SHEP3 tyrosinase protein-coding 287.5-57 chr9 112404742 112404974 + 1.5 NA intron (NM_001195822, intron 2 of 8) L1MC5a|LINE|L1 24750 NM_032303 84263 Hs.59486 NM_032303 ENSG00000119471 HSDL2 C9orf99|SDR13C1 hydroxysteroid dehydrogenase like 2 protein-coding 186.5-101 chr4 107761540 107761756 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -41414 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 201.25-68 chr4 32113350 32113604 + 1.5 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -91055 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 606 chr18 7216101 7216925 + 1.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -14591 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 131.25-156 chr4 62371003 62371161 + 1.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -209317 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 298-30 chr8 34954394 34954722 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 170637 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 217.75-35 chr2 28915556 28915788 + 1.5 NA intron (NM_015131, intron 5 of 17) intron (NM_015131, intron 5 of 17) 2010 NR_003074 692209 NR_003074 ENSG00000264994 SNORD92 HBII-316 small nucleolar RNA, C/D box 92 snoRNA 348-19 chr7 6283035 6283454 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10620 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 174-82 chr6 63200724 63200913 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 119159 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 308.5-11 chr16 62972698 62973101 + 1.5 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -936461 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 227.5-107 chr8 118440887 118441131 + 1.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -179992 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 349.5-17 chr4 117015712 117016096 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 69672 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 127-83 chr17 62364034 62364208 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6097 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 163-31 chr12 87763335 87763503 + 1.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -5393 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 211.75-3 chr1 41313150 41313351 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -48184 NM_001291281 100132074 Hs.559677 NM_001291281 FOXO6 - forkhead box O6 protein-coding 233-58 chr8 34698258 34698591 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -85497 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 298-36 chrX 94318427 94318684 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 644349 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 284.5-28 chr2 894060 894298 + 1.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 11272 NR_110179 101060385 Hs.385965 NR_110179 ENSG00000228799 LINC01939 - long intergenic non-protein coding RNA 1939 ncRNA 132.75-61 chr14 61296827 61296956 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15553 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 128-115 chr4 98076972 98077115 + 1.5 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 66433 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 209.25-13 chr10 24326091 24326301 + 1.5 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 50511 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 293.75-34 chr3 186227371 186227655 + 1.5 NA intron (NM_001346, intron 20 of 24) intron (NM_001346, intron 20 of 24) -118424 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 218-19 chr14 86757452 86757778 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -148163 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 133.5-128 chr2 174275128 174275266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26665 NM_013341 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 330.25-27 chr9 111551833 111552091 + 1.5 NA 3' UTR (NM_133464, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_133464, exon 6 of 6) 26783 NM_133464 158399 Hs.584864 NM_133464 ENSG00000173258 ZNF483 ZKSCAN16|ZSCAN48 zinc finger protein 483 protein-coding 455.75-4 chr4 96302951 96303549 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -7453 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 330-28 chr8 78395958 78396294 + 1.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -120214 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 324-27 chr7 7488104 7488540 + 1.5 NA intron (NM_001037763, intron 13 of 34) intron (NM_001037763, intron 13 of 34) 47551 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 309.75-3 chr10 47262856 47263151 + 1.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -37194 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 160.5-197 chr8 132327129 132327379 + 1.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 120008 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 271.5-29 chr17 31007235 31007530 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001350575) promoter-TSS (NM_001350575) -902 NM_001350578 107984974 Hs.558901 NM_001350575 LOC107984974 - uncharacterized LOC107984974 protein-coding 181.5-115 chr3 171673773 171674012 + 1.5 NA intron (NM_002662, intron 19 of 26) MIR3|SINE|MIR 136591 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 280.75-27 chr22 35050595 35050974 + 1.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -15374 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 166.75-130 chr7 29176666 29176817 + 1.5 NA intron (NM_001371256, intron 3 of 16) L1MEd|LINE|L1 13316 NM_001371262 306.75-10 chr17 79704600 79704940 + 1.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 2479 NR_039893 100616170 NR_039893 ENSG00000266665 MIR4739 mir-4739 microRNA 4739 ncRNA 265.75-51 chr4 29297023 29297295 + 1.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 82867 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 269.5-34 chr3 102533579 102533857 + 1.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 98703 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 291.5-19 chr2 42494553 42494881 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_133329) promoter-TSS (NM_133329) 148 NM_001282755 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 258.5-30 chr17 62576124 62576365 + 1.5 NA intron (NM_001284333, intron 13 of 22) MIRb|SINE|MIR -51426 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 218.75-64 chr4 93281597 93281872 + 1.5 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -547019 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 241-33 chr3 134381585 134381872 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -6311 NM_001278683 51421 Hs.426312 NM_016201 ENSG00000114019 AMOTL2 LCCP angiomotin like 2 protein-coding 386.5-15 chr8 140924852 140925290 + 1.5 NA intron (NM_001352697, intron 3 of 35) intron (NM_001352697, intron 3 of 35) 75933 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 327-3 chr1 111899507 111899996 + 1.5 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) -9906 NR_046619 100873995 Hs.535274 NR_046619 ENSG00000237556 KCND3-AS1 - KCND3 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-45 chr12 21255338 21255456 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 79520 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 261-70 chrX 73641176 73641422 + 1.5 NA intron (NM_001300884, intron 3 of 4) L1PA15|LINE|L1 78151 NM_001300884 53344 Hs.496323 NM_001039840 ENSG00000204116 CHIC1 BRX cysteine rich hydrophobic domain 1 protein-coding 237.75-24 chr16 61702764 61703019 + 1.5 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) MIRb|SINE|MIR 333547 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 467-4 chr22 50371587 50372087 + 1.5 NA intron (NM_001242899, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 28510 NM_001242898 9701 Hs.449098 NM_014678 ENSG00000100239 PPP6R2 KIAA0685|PP6R2|SAP190|SAPS2 protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 protein-coding 285.5-45 chr4 31568470 31568750 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62066 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 301.5-18 chr14 59683963 59684240 + 1.5 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) -37081 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 132.5-96 chr18 10958859 10959010 + 1.5 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) 189828 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 345.75-13 chr8 132722027 132722413 + 1.5 NA intron (NM_001145153, intron 5 of 8) intron (NM_001145153, intron 5 of 8) 38362 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 176.5-26 chr10 119410066 119410253 + 1.5 NA intron (NM_005308, intron 4 of 15) intron (NM_005308, intron 4 of 15) 32187 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 393.75-5 chr17 42374065 42374445 + 1.5 NA intron (NM_213662, intron 1 of 23) intron (NM_213662, intron 1 of 23) 14187 NM_001369518 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 307.5-49 chr9 112551235 112551472 + 1.5 NA intron (NM_133465, intron 1 of 3) L1MB3|LINE|L1 -63709 NM_001350649 100133204 Hs.662552 NM_001350649 C9orf147 - chromosome 9 open reading frame 147 protein-coding 246.75-66 chr7 39465900 39466114 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001166018, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001166018, exon 11 of 11) -59661 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 350-12 chr4 156178079 156178413 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -224380 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 424.25-5 chr8 18926364 18926742 + 1.5 NA intron (NM_015310, intron 2 of 15) L1ME1|LINE|L1 -39496 NM_001362819 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 222.75-58 chr2 26517660 26517968 + 1.5 NA intron (NM_194248, intron 4 of 46) MIR3|SINE|MIR -39690 NM_194323 9381 Hs.91608 NM_004802 ENSG00000115155 OTOF AUNB1|DFNB6|DFNB9|FER1L2|NSRD9 otoferlin protein-coding 246.75-79 chr8 136596995 136597166 + 1.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 66282 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 114-101 chr3 65195099 65195200 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -507149 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 278.75-15 chr18 7934829 7935275 + 1.5 NA intron (NM_002845, intron 5 of 30) intron (NM_002845, intron 5 of 30) 367736 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 251.5-57 chr4 27845268 27845554 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 627932 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 271.25-22 chr13 94482740 94483188 + 1.5 NA intron (NM_001322185, intron 1 of 7) intron (NM_001322185, intron 1 of 7) -3282 NM_001922 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 150-100 chr3 185456134 185456239 + 1.5 NA intron (NM_004721, intron 7 of 13) intron (NM_004721, intron 7 of 13) 42849 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 213.75-8 chr1 199824829 199825109 + 1.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -202741 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 206-24 chr14 53585602 53585872 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 362747 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 333.75-4 chr12 21217451 21217775 + 1.5 NA intron (NM_006446, intron 12 of 14) intron (NM_006446, intron 12 of 14) 86419 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 312-13 chr13 78821758 78822071 + 1.5 NA intron (NR_046869, intron 2 of 4) intron (NR_046869, intron 2 of 4) 18136 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 178-15 chr11 96201554 96201707 + 1.5 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -139808 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 184-43 chr2 134629329 134629538 + 1.5 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 89567 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 186-71 chr5 123795223 123795472 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 249930 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 213-50 chr2 212995779 212996054 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69580 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 358.25-19 chr8 136652002 136652605 + 1.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 121505 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 136.5-98 chr19 52851576 52851755 + 1.5 NA intron (NM_001008801, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 5954 NR_102300 90333 Hs.467223 NM_199132 ENSG00000204604 ZNF468 - zinc finger protein 468 protein-coding 133.5-120 chr2 97693062 97693276 + 1.5 NA intron (NR_038386, intron 7 of 9) L1MB2|LINE|L1 -20399 NM_001079 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 269.25-3 chr1 91569956 91570269 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69004 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 391.5-5 chr11 55617771 55618159 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -13567 NM_001004700 219429 Hs.553620 NM_001004700 ENSG00000172188 OR4C11 OR11-136|OR4C11P olfactory receptor family 4 subfamily C member 11 protein-coding 293-5 chr10 85089922 85090259 + 1.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 108815 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 371.25-5 chr16 64357913 64358285 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 763964 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 133.75-40 chr12 70286638 70286732 + 1.5 NA intron (NM_001199302, intron 3 of 16) L1MEd|LINE|L1 42971 NR_037615 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 258.75-59 chr5 75691654 75691846 + 1.5 NA intron (NM_152408, intron 6 of 10) intron (NM_152408, intron 6 of 10) 20705 NM_152408 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 340-13 chr3 96873595 96873923 + 1.5 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 59165 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 277.25-13 chr16 34090784 34091047 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -72663 NR_162093 113218496 NR_162093 MIR9901 - microRNA 9901 ncRNA 286.25-23 chr5 113299357 113299549 + 1.5 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) -4515 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 407.25-11 chr5 42716184 42716622 + 1.5 NA intron (NM_001242462, intron 7 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie -40415 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 320.25-17 chr20 52353326 52353621 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -161488 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 242.75-44 chr3 140516647 140516935 + 1.5 NA intron (NM_022131, intron 8 of 16) L1PB1|LINE|L1 -8002 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 261.5-66 chr8 51410909 51411304 + 1.5 NA intron (NM_144651, intron 16 of 22) intron (NM_144651, intron 16 of 22) 398339 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 325.5-13 chr16 60961922 60962246 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 93682 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 406.5-11 chr9 94998570 94999033 + 1.5 NA intron (NM_032823, intron 9 of 14) intron (NM_032823, intron 9 of 14) -53247 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 146.25-47 chr16 61789491 61789695 + 1.5 NA intron (NM_001796, intron 7 of 11) intron (NM_001796, intron 7 of 11) 246845 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 246-17 chr14 54543500 54543951 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23887 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 444.25-2 chr20 53598390 53598919 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9700 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 339.25-11 chr2 146213215 146213648 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -373626 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 468-5 chr2 123820961 123821557 + 1.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 203915 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 210.5-19 chr10 95204613 95204895 + 1.5 NA intron (NM_207321, intron 3 of 10) L1M4|LINE|L1 10554 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 303.75-38 chrX 155528656 155529049 + 1.5 NA intron (NM_018196, intron 2 of 7) L1ME3G|LINE|L1 62312 NR_109985 101927830 Hs.638368 NR_109985 LOC101927830 - uncharacterized LOC101927830 ncRNA 136.25-29 chr11 22761212 22761311 + 1.5 NA intron (NM_005256, intron 6 of 6) intron (NM_005256, intron 6 of 6) 68118 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 147.75-128 chr5 67357169 67357299 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -160435 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 205.5-49 chr16 35299297 35299471 + 1.5 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -64032 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 464.25-2 chr16 80369203 80369846 + 1.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -171210 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 284.5-33 chr2 116083369 116083765 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 739752 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 251.5-86 chr8 104130289 104130567 + 1.5 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -92907 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 303-16 chr19 52663667 52664047 + 1.5 NA intron (NM_001348018, intron 1 of 5) intron (NM_001348018, intron 1 of 5) -25466 NM_001105549 55769 Hs.467210 NM_018300 ENSG00000167766 ZNF83 HPF1|ZNF816B zinc finger protein 83 protein-coding 324-14 chr2 89822739 89823075 + 1.5 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -185000 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 286.5-4 chr1 82001178 82001369 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 198820 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 375.75-17 chr7 8411930 8412355 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21467 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 262.5-41 chr20 23229451 23229646 + 1.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -96912 NR_034149 200261 Hs.352228 NM_182535 ENSG00000233746 LINC00656 - long intergenic non-protein coding RNA 656 ncRNA 332-7 chr14 38242779 38243098 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 13155 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 193.5-113 chr4 38297052 38297249 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -69764 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 204.25-56 chr2 67006938 67007229 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79363 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 235.5-73 chr6 45407085 45407250 + 1.5 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu -15108 NM_001369405 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 193-76 chr5 164256375 164256517 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 210956 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 273-64 chr9 115627856 115628117 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 116253 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 209.25-81 chr3 120344643 120344816 + 1.5 NA intron (NM_001099678, intron 1 of 3) intron (NM_001099678, intron 1 of 3) 4625 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 210.5-34 chr14 21922543 21922863 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -251686 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 122.25-11 chr1 176264922 176265049 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -57699 NM_022457 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 276.5-64 chr8 16884153 16884353 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 118092 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 319.5-14 chr12 80406360 80406632 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -37739 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 306.5-4 chr10 67731473 67731874 + 1.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -35478 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 382-5 chr10 79992519 79992950 + 1.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -43629 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 243.5-32 chr17 33950470 33950681 + 1.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 206231 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 270.5-67 chr9 26525222 26525570 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 367406 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 348.5-24 chr8 133580273 133580762 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8630 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 173.75-83 chr2 40062188 40062383 + 1.5 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 144651 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 292.75-6 chr10 110273460 110273788 + 1.5 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) intron (NM_005962, intron 3 of 5) 31296 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 419.25-10 chr9 71721954 71722434 + 1.5 NA intron (NM_013390, intron 12 of 23) intron (NM_013390, intron 12 of 23) 46319 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 370.5-6 chr13 95757105 95757426 + 1.5 NA intron (NM_006260, intron 4 of 11) intron (NM_006260, intron 4 of 11) 80126 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 204.5-45 chr16 23844079 23844364 + 1.5 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 8238 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 200.25-92 chr5 138280301 138280464 + 1.5 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -5761 NM_001496 2676 Hs.58042 NM_001496 ENSG00000146013 GFRA3 GDNFR3 GDNF family receptor alpha 3 protein-coding 140-4 chr1 93096114 93096270 + 1.5 NA intron (NM_001164393, intron 1 of 12) intron (NM_001164393, intron 1 of 12) 16909 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 300.5-49 chr8 89292794 89293110 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 464759 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 224-46 chr5 140629579 140629745 + 1.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 3513 NM_000591 929 Hs.163867 NM_000591 ENSG00000170458 CD14 - CD14 molecule protein-coding 332-11 chr17 9517046 9517370 + 1.5 NA intron (NR_033656, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 58612 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 250-61 chr8 109224627 109224966 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 105137 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 251-45 chr5 13018213 13018486 + 1.5 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 14537 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 253.5-84 chr9 111437164 111437440 + 1.5 NA intron (NM_001363756, intron 5 of 48) intron (NM_001363756, intron 5 of 48) 46260 NM_001364931 23392 Hs.368255 NM_001080398 ENSG00000136813 ECPAS ECM29|KIAA0368 Ecm29 proteasome adaptor and scaffold protein-coding 290-44 chr6 127342494 127342899 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001139510) promoter-TSS (NM_001139510) -289 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 395-5 chr11 5565060 5565584 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -15555 NM_001005162 340980 Hs.553704 NM_001005162 ENSG00000187747 OR52B6 OR11-47 olfactory receptor family 52 subfamily B member 6 protein-coding 423-3 chr2 47157783 47158210 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2688 NM_001163561 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 244-61 chr9 31397781 31397969 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16385 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 233.5-88 chr5 84246811 84247084 + 1.5 NA intron (NM_005711, intron 2 of 10) intron (NM_005711, intron 2 of 10) 137920 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 249.75-49 chr4 88368471 88368786 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10111 NM_001165136 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 247.5-50 chr20 59880617 59880888 + 1.5 NA intron (NM_014258, intron 30 of 44) intron (NM_014258, intron 30 of 44) 52885 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 201-70 chr7 55165788 55166062 + 1.5 NA intron (NM_001346941, intron 9 of 21) AluSq|SINE|Alu 23024 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 348.5-15 chr4 128205229 128205580 + 1.5 NA intron (NR_146772, intron 16 of 19) intron (NR_146772, intron 16 of 19) 82409 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 299.25-17 chr14 56901406 56901671 + 1.5 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 88380 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 192.5-107 chr5 66861200 66861412 + 1.5 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) intron (NM_015183, intron 1 of 27) 32533 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 364-18 chr7 38732927 38733269 + 1.5 NA intron (NM_014396, intron 25 of 28) AluJb|SINE|Alu -46009 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 238.5-68 chr5 41070920 41071197 + 1.5 NA 5' UTR (NM_173489, exon 1 of 42) 5' UTR (NM_173489, exon 1 of 42) 284 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 212.5-53 chr2 102778347 102778681 + 1.5 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) L1MDa|LINE|L1 16483 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 288.75-45 chr8 118631672 118631879 + 1.5 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) L1M1|LINE|L1 -9812 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 310.25-13 chr2 52262061 52262357 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1MEg|LINE|L1 -108439 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 279-28 chr3 112054004 112054302 + 1.5 NA intron (NR_026734, intron 8 of 16) intron (NR_026734, intron 8 of 16) 11175 NM_001366279 344805 Hs.435490 NM_001042575 ENSG00000176040 TMPRSS7 - transmembrane serine protease 7 protein-coding 125.5-223 chr6 130579749 130579913 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 142714 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 149-38 chr15 69965927 69966103 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 113453 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 280-45 chr5 81110816 81111052 + 1.5 NA intron (NM_006909, intron 13 of 26) intron (NM_006909, intron 13 of 26) -122386 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 420.75-3 chr12 111463135 111463578 + 1.5 NA intron (NM_001310123, intron 18 of 21) AluSz6|SINE|Alu 28494 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 390-2 chr13 46918849 46919158 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -21927 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 277.5-22 chr14 53879287 53879552 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 69065 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 228.5-45 chr18 36274017 36274197 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23606 NM_001281739 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 230-68 chr8 116867712 116867971 + 1.5 NA intron (NM_006265, intron 1 of 13) L1MD2|LINE|L1 -6583 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 188.25-39 chr14 41978494 41978729 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 371755 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 416-7 chr15 97186995 97187530 + 1.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 334549 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 434.25-7 chr20 33131214 33131783 + 1.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -30272 NM_001319164 140683 Hs.125960 NM_080574 ENSG00000131050 BPIFA2 C20orf70|PSP|SPLUNC2|bA49G10.1 BPI fold containing family A member 2 protein-coding 341.5-7 chr15 34777406 34777717 + 1.5 NA intron (NR_120329, intron 2 of 2) L1MB8|LINE|L1 17988 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 114.5-134 chr2 57973068 57973223 + 1.5 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1MC5a|LINE|L1 65494 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 295-22 chr2 201714421 201714718 + 1.5 NA intron (NM_020919, intron 25 of 33) MER68B|LTR|ERVL -15925 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 271.5-83 chr8 87430513 87430895 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 443311 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 276.75-39 chr5 52928193 52928496 + 1.5 NA intron (NM_181501, intron 20 of 28) intron (NM_181501, intron 20 of 28) -61008 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 374.75-12 chr6 74762075 74762729 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 366380 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 327.25-21 chr5 81109969 81110233 + 1.5 NA intron (NM_006909, intron 13 of 26) intron (NM_006909, intron 13 of 26) -123219 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 389.25-5 chr20 57335445 57335831 + 1.5 NA intron (NM_198265, intron 6 of 11) L2c|LINE|L2 5835 NM_198265 23626 Hs.159737 NM_012444 ENSG00000054796 SPO11 CT35|SPATA43|TOPVIA SPO11 initiator of meiotic double stranded breaks protein-coding 204.25-118 chr9 111052971 111053364 + 1.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -14169 NM_001351399 1902 Hs.126667 NM_001401 ENSG00000198121 LPAR1 EDG2|GPR26|Gpcr26|LPA1|Mrec1.3|VZG1|edg-2|rec.1.3|vzg-1 lysophosphatidic acid receptor 1 protein-coding 413.25-6 chr5 33142585 33143014 + 1.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -86936 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 137.25-9 chr1 235685870 235686031 + 1.5 NA intron (NM_000081, intron 48 of 52) intron (NM_000081, intron 48 of 52) -35196 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 353.5 chr10 62122299 62122770 + 1.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 73177 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 472.5-4 chr5 115526321 115526725 + 1.5 NA intron (NM_020177, intron 2 of 2) intron (NM_020177, intron 2 of 2) 18252 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 187.75-18 chr11 84234148 84234289 + 1.5 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) MER50|LTR|ERV1 39062 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 253.25-25 chr16 85244347 85244597 + 1.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 36676 NR_162142 113219463 NR_162142 MIR12128 - microRNA 12128 ncRNA 206.25-63 chr3 35087224 35087393 + 1.5 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 306715 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 296.25-32 chr8 108249112 108249478 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001568) promoter-TSS (NM_001568) -578 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 236.75-32 chr2 182098411 182098766 + 1.5 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) intron (NM_001261425, intron 4 of 5) 112735 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 257.25-53 chr7 41977942 41978242 + 1.5 NA intron (NM_000168, intron 11 of 14) intron (NM_000168, intron 11 of 14) 259117 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 125-89 chr21 31114191 31114372 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 46659 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 152.75-152 chr8 115626386 115626573 + 1.5 NA intron (NM_014112, intron 1 of 6) intron (NM_014112, intron 1 of 6) 41534 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 295-6 chr11 37203231 37203592 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -605132 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 172.5-89 chr2 7422076 7422275 + 1.5 NA intron (NR_038432, intron 1 of 5) intron (NR_038432, intron 1 of 5) 914 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 382.75-8 chr4 74146384 74146809 + 1.5 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) L1MB2|LINE|L1 -11512 NM_001144978 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 305.25-29 chr21 19388455 19388789 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 511133 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 196.75-44 chr15 80408993 80409279 + 1.5 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) L1MC1|LINE|L1 4754 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 271.5-55 chr3 67008363 67008614 + 1.5 NA 3' UTR (NM_032505, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_032505, exon 4 of 4) 10181 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 420.5-6 chr2 20094809 20095276 + 1.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -43414 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 264.25-39 chr4 44810046 44810289 + 1.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -83533 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 219-88 chr7 4161162 4161474 + 1.5 NA intron (NM_001079653, intron 5 of 19) intron (NM_001079653, intron 5 of 19) -26481 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 334.75-10 chr16 72463626 72464146 + 1.5 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 201084 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 263-49 chr7 49630176 49630489 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -143306 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 384 chr1 179392686 179393012 + 1.5 NA intron (NR_073544, intron 9 of 25) L1PB2|LINE|L1 26805 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 222-12 chr10 62470754 62471013 + 1.5 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) intron (NM_199451, intron 4 of 7) -49565 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 181-117 chr9 102353885 102354128 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -165631 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 236.5-60 chr3 63319447 63319699 + 1.5 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) L1M2|LINE|L1 41265 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 338-23 chr4 38293518 38293844 + 1.5 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR -73233 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 209.25-80 chr3 112742009 112742274 + 1.5 NA intron (NR_110017, intron 1 of 4) intron (NR_110017, intron 1 of 4) 5052 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 319-27 chr4 102069805 102070022 + 1.5 NA intron (NM_017935, intron 13 of 16) L1ME1|LINE|L1 254399 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 205.5-97 chr3 103924071 103924296 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -400067 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 214.5-93 chr4 106394789 106395161 + 1.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -27540 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 285.75-4 chr1 182478707 182478997 + 1.5 NA intron (NM_001366934, intron 7 of 22) L1MA10|LINE|L1 28706 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 135-124 chr4 51875606 51875726 + 1.5 NA intron (NM_001040402, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 32087 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 181.5-69 chr2 29801429 29801699 + 1.5 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 120022 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 264-22 chr18 11395347 11395557 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59026 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 221.5-96 chr8 23889720 23890010 + 1.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -35059 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 166.25-46 chr14 62879766 62880068 + 1.5 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 165541 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 335.25-13 chr15 33269245 33269514 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21824 NR_046005 100652857 Hs.439998 NR_046005 TMCO5B - transmembrane and coiled-coil domains 5B (pseudogene) pseudo 191.25-8 chr10 20909535 20909750 + 1.5 NA intron (NM_001173484, intron 4 of 6) intron (NM_001173484, intron 4 of 6) -12040 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 129-142 chr5 82919597 82919735 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59830 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 320-30 chr4 54890269 54890555 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 232484 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 293.5-26 chr2 110913491 110913714 + 1.5 NA intron (NM_001371254, intron 11 of 18) L1MB7|LINE|L1 181029 NM_001371254 235.5-77 chr7 45309536 45309845 + 1.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 151899 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 300-38 chr7 92581272 92581659 + 1.5 NA intron (NM_152789, intron 2 of 10) intron (NM_152789, intron 2 of 10) 8584 NM_001288584 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 321.25 chr1 53716730 53716952 + 1.5 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) HAL1|LINE|L1 17363 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 278-27 chr5 18044761 18045154 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 237683 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 143.25-124 chr3 112891938 112892074 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -46056 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 186-37 chr18 13562409 13562646 + 1.5 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) L1MA9|LINE|L1 -48587 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 140.5-112 chr2 98976474 98976633 + 1.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -40328 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 284.5-4 chr1 195009617 195009884 + 1.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 1078965 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 242.75-30 chr2 67073619 67073855 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -12709 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 318.25-3 chr1 85915057 85915401 + 1.5 NA intron (NM_152890, intron 24 of 59) MLT2B1|LTR|ERVL -206796 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 278.25-8 chr11 81991761 81992086 + 1.5 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MC4|LINE|L1 -101087 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 356.5-8 chr12 71242885 71243172 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -85029 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 134.25-6 chr1 51642863 51642977 + 1.5 NA intron (NM_148906, intron 1 of 22) LTR68|LTR|ERV1 25828 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 242.25-24 chr14 40204892 40205354 + 1.5 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -749588 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 321.5-27 chr5 14043023 14043395 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98729 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 219.5-143 chrX 103691537 103691717 + 1.5 NA non-coding (NR_038978, exon 3 of 3) non-coding (NR_038978, exon 3 of 3) -3469 NM_001142431 9643 Hs.326387 NM_012286 ENSG00000123562 MORF4L2 MORFL2|MRGX mortality factor 4 like 2 protein-coding 142.25-111 chr3 117394424 117394572 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 296427 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 277-17 chr18 10126454 10126765 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 212593 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 217-41 chr2 185971614 185971798 + 1.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 114611 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 288.75-49 chrX 56978657 56979013 + 1.5 NA intron (NR_027139, intron 3 of 4) intron (NR_027139, intron 3 of 4) 16706 NM_001010862 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 241.75-12 chr11 13785185 13785436 + 1.5 NA intron (NR_149108, intron 1 of 3) intron (NR_149108, intron 1 of 3) 924 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 260.25-13 chr12 10754722 10754931 + 1.5 NA intron (NR_120463, intron 1 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 4592 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 200-92 chr8 135740010 135740214 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 282656 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 205.5-66 chr2 16788073 16788297 + 1.5 NA Intergenic (TTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -122351 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 363.75-9 chr2 164852686 164853032 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -10783 NM_001365671 22837 Hs.470457 NM_014900 ENSG00000082438 COBLL1 COBLR1 cordon-bleu WH2 repeat protein like 1 protein-coding 409.5-9 chr22 41139419 41139900 + 1.5 NA intron (NM_001429, intron 8 of 30) intron (NM_001429, intron 8 of 30) 47067 NM_001362843 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 297.75 chr1 60177558 60177851 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -103934 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 250.5-4 chr1 166189886 166190156 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23266 NM_001017961 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 197.25-78 chr4 98256670 98256854 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4622 NM_001100427 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 194.5-71 chr2 128311159 128311431 + 1.5 NA intron (NM_004807, intron 1 of 1) intron (NM_004807, intron 1 of 1) 7573 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 243.75-52 chr3 31232916 31233227 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -71284 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 303-13 chr17 66028012 66028326 + 1.5 NA intron (NM_001353129, intron 15 of 26) intron (NM_001353129, intron 15 of 26) 163723 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 306-16 chr2 209445105 209445367 + 1.5 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 21189 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 395.5 chr11 14469326 14469859 + 1.5 NA intron (NM_016451, intron 14 of 21) intron (NM_016451, intron 14 of 21) 30266 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 432.25 chr1 116409572 116410096 + 1.5 NA intron (NR_024125, intron 1 of 2) intron (NR_024125, intron 1 of 2) 8725 NR_024126 84852 Hs.664752 NM_032766 ENSG00000203865 ATP1A1-AS1 ATP1A1OS|C1orf203 ATP1A1 antisense RNA 1 ncRNA 432-16 chr9 74482574 74482988 + 1.5 NA intron (NR_125791, intron 3 of 4) intron (NR_125791, intron 3 of 4) -14554 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 277.5-75 chr8 85999153 85999402 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 70391 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 183-15 chr12 22289842 22290050 + 1.5 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 44768 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 116.5-99 chr18 8364792 8364900 + 1.5 NA intron (NR_024419, intron 3 of 3) intron (NR_024419, intron 3 of 3) 2188 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 250.25-13 chr16 2200322 2200587 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3849 NM_020764 57524 Hs.643537 NM_020764 ENSG00000167971 CASKIN1 ANKS5A CASK interacting protein 1 protein-coding 194.5-161 chr8 134871567 134871764 + 1.5 NA intron (NR_125427, intron 1 of 2) intron (NR_125427, intron 1 of 2) 21730 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 374-14 chr4 62357522 62357977 + 1.5 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -195984 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 247.5-68 chr5 66540134 66540435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -28680 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 256.5-67 chr6 153030106 153030346 + 1.5 NA intron (NM_012419, intron 2 of 4) intron (NM_012419, intron 2 of 4) -27411 NM_001301872 54516 Hs.225836 NM_019041 ENSG00000112031 MTRF1L HMRF1L|MRF1L|mtRF1a mitochondrial translational release factor 1 like protein-coding 190-17 chr14 21868800 21868956 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -197861 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 365.75 chr10 83214383 83214772 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 462512 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 227-44 chr3 133470603 133470860 + 1.5 NA intron (NM_003571, intron 5 of 6) L2b|LINE|L2 -14955 NR_135278 85003 Hs.659202 NR_135276 ENSG00000249993 BFSP2-AS1 - BFSP2 antisense RNA 1 ncRNA 118-113 chr3 77501808 77501887 + 1.5 NA intron (NM_001290039, intron 5 of 26) intron (NM_001290039, intron 5 of 26) 403835 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 129.5-170 chr4 105395184 105395282 + 1.5 NA intron (NM_176869, intron 9 of 11) intron (NM_176869, intron 9 of 11) -42352 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 245.25-2 chr1 55929039 55929253 + 1.5 NA intron (NR_147162, intron 1 of 2) intron (NR_147162, intron 1 of 2) 15817 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 361.5-4 chr11 110448464 110448788 + 1.5 NA intron (NM_004109, intron 2 of 3) intron (NM_004109, intron 2 of 3) 18678 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 212.5-63 chr20 57069215 57069394 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -144392 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 259.5-79 chr5 76008172 76008524 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -75035 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 346 chr1 20953103 20953501 + 1.5 NA intron (NM_003760, intron 7 of 31) intron (NM_003760, intron 7 of 31) 35130 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 347.75 chr1 47987376 47987749 + 1.5 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) intron (NM_001194986, intron 2 of 6) 9823 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 254-19 chr17 48235120 48235431 + 1.5 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -59072 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 168-73 chr2 225670531 225670745 + 1.5 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) intron (NM_001371273, intron 7 of 7) 269752 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 283.75 chr1 104427396 104427673 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 354511 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 286.5-71 chr8 123667402 123667726 + 1.5 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -13763 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 243-19 chr14 51511986 51512289 + 1.5 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 23009 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 288.5-47 chr8 65875653 65875957 + 1.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -33741 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 258.75-20 chr12 126877527 126877806 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2976 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 239.5-62 chr5 172627250 172627585 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13846 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 200.5-22 chr11 27883543 27883771 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -161627 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 332.25-25 chr4 137538480 137538830 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6161 NM_019035 54510 Hs.591691 NM_019035 ENSG00000189184 PCDH18 PCDH68L protocadherin 18 protein-coding 189.5-46 chr15 25983135 25983361 + 1.5 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) MER4D1|LTR|ERV1 80888 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 248.25-62 chr6 141490548 141490771 + 1.5 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 598140 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 221.25-71 chr5 75296349 75296530 + 1.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -40729 NM_001130996 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 280-27 chr2 56397692 56397995 + 1.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -212073 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 220-34 chr2 96325980 96326267 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_178495) promoter-TSS (NM_178495) -74 NM_001324490 150771 Hs.65009 NM_178495 ENSG00000198885 ITPRIPL1 KIAA1754L ITPRIP like 1 protein-coding 352.5-19 chr4 77631395 77631994 + 1.5 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 119941 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 428.5-10 chr9 95885587 95885905 + 1.5 NA intron (NM_020207, intron 2 of 18) MER5A|DNA|hAT-Charlie 9738 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 239.5-57 chr4 111666108 111666318 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -479241 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 289.5-6 chr1 217948744 217949030 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 55987 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 265.5-60 chr7 93485191 93485554 + 1.5 NA intron (NM_001164738, intron 2 of 12) intron (NM_001164738, intron 2 of 12) -1353 NR_030164 574442 NR_030164 ENSG00000207656 MIR489 MIRN489|hsa-mir-489|mir-489 microRNA 489 ncRNA 139.25-175 chr7 41025093 41025196 + 1.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -45205 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 199-61 chr4 58799069 58799244 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -185126 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 225-72 chr7 52901870 52902086 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -133655 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 326.25-11 chr14 45829401 45829732 + 1.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -113964 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 258.75-49 chr3 58221790 58222096 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10940 NM_001256560 1776 Hs.476453 NM_004944 ENSG00000163687 DNASE1L3 DHP2|DNAS1L3|LSD|SLEB16 deoxyribonuclease 1 like 3 protein-coding 354.5-21 chr8 87309449 87309793 + 1.5 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) (TATCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 443206 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 189-111 chr9 80455587 80455842 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 480691 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 251.5-39 chr2 174567459 174567811 + 1.5 NA intron (NM_001077269, intron 6 of 7) intron (NM_001077269, intron 6 of 7) -9563 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 262.5-7 chr1 147219078 147219293 + 1.5 NA intron (NM_001461, intron 2 of 8) L1ME4c|LINE|L1 6154 NM_001461 2330 Hs.642706 NM_001461 ENSG00000131781 FMO5 - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 5 protein-coding 333-18 chr4 149927175 149927553 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -111521 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 231.5-58 chr22 32174735 32174981 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15555 NM_001010859 150297 Hs.426551 NM_001010859 ENSG00000205856 C22orf42 dJ90G24.6 chromosome 22 open reading frame 42 protein-coding 237-41 chr4 78054811 78055099 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2368 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 300.5-19 chr16 49355996 49356241 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17686 NM_144602 123970 Hs.125875 NM_144602 ENSG00000166152 C16orf78 - chromosome 16 open reading frame 78 protein-coding 300.25-26 chr6 114709986 114710246 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -647239 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 127.5-168 chr4 59493974 59494151 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 480489 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 139.5-3 chr1 154178111 154178289 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001278191) promoter-TSS (NM_001278191) 4 NM_001278191 7170 Hs.535581 NM_152263 ENSG00000143549 TPM3 CAPM1|CFTD|HEL-189|HEL-S-82p|NEM1|OK/SW-cl.5|TM-5|TM3|TM30|TM30nm|TM5|TPM3nu|TPMsk3|TRK|hscp30 tropomyosin 3 protein-coding 203-56 chr2 215901216 215901435 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -57789 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 186.5-34 chr12 89879099 89879325 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -68481 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 320.5-4 chr10 23960516 23960933 + 1.5 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -248067 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 154.5-183 chr8 66678366 66678539 + 1.5 NA TTS (NR_161218) TTS (NR_161218) 10856 NR_161216 56260 Hs.661238 NM_019607 ENSG00000213865 C8orf44 - chromosome 8 open reading frame 44 ncRNA 241.5-10 chr12 5728013 5728215 + 1.5 NA intron (NM_001278596, intron 15 of 25) L1MB8|LINE|L1 217145 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 400.25-2 chr11 108285388 108285830 + 1.5 NA intron (NM_001351834, intron 27 of 63) intron (NM_001351834, intron 27 of 63) 62080 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 174.75-42 chr17 32717264 32717421 + 1.5 NA intron (NM_015194, intron 15 of 21) intron (NM_015194, intron 15 of 21) 159782 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 384.75-14 chr8 28967918 28968375 + 1.5 NA intron (NM_001324384, intron 2 of 10) intron (NM_001324384, intron 2 of 10) 76832 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 279.75-34 chr3 182695132 182695431 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -98223 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 427.5-13 chr8 117562115 117562566 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 41627 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 341-13 chr18 2922243 2922651 + 1.5 NA intron (NM_014646, intron 16 of 19) AluSx|SINE|Alu 24176 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 344-14 chr22 33733957 33734228 + 1.5 NA intron (NR_038949, intron 5 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 9106 NR_038949 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 242.75-46 chr4 31473466 31473811 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32906 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 221-55 chr4 42497106 42497296 + 1.5 NA intron (NM_001105529, intron 23 of 35) intron (NM_001105529, intron 23 of 35) 99713 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 273-45 chr5 84013217 84013587 + 1.5 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) intron (NM_001278642, intron 8 of 9) -292547 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 197.75-35 chr18 78249681 78249994 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -256110 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 249.75-57 chr7 12670183 12670486 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16493 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 300.75-32 chr20 28495269 28495671 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 107195 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 218-60 chr6 56025684 56025917 + 1.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 65862 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 343.5-21 chr7 30319747 30320086 + 1.5 NA intron (NM_147128, intron 1 of 4) HAL1b|LINE|L1 -30026 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 161.5-118 chr21 20358722 20358930 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100141 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 291.25-13 chr2 57732511 57732903 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -174944 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 366-4 chr10 50450215 50450713 + 1.5 NA intron (NM_147156, intron 5 of 10) intron (NM_147156, intron 5 of 10) 173492 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 137-153 chr6 101738694 101738837 + 1.5 NA intron (NM_001166247, intron 6 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie 339780 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 228.25-29 chr14 60561007 60561334 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 52024 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 132.75-98 chr2 107004109 107004237 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -117064 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 341.5-17 chr21 26302449 26302863 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -90979 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 258.5-55 chr4 88217709 88217925 + 1.5 NA intron (NM_001348985, intron 1 of 16) AluJr|SINE|Alu 13809 NM_001257386 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 308.25-9 chr13 77177945 77178241 + 1.5 NA intron (NM_015057, intron 34 of 82) intron (NM_015057, intron 34 of 82) 102579 NR_046716 100874212 Hs.569288 NR_046716 ENSG00000236051 MYCBP2-AS1 - MYCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 155-21 chr10 105524498 105524652 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 295758 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 135-68 chr18 41516082 41516245 + 1.5 NA intron (NR_002838, intron 2 of 5) intron (NR_002838, intron 2 of 5) 4514 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 280.5-34 chr3 31689077 31689416 + 1.5 NA intron (NM_001174060, intron 6 of 10) L1MC4|LINE|L1 -14967 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 121.25-67 chr15 77080997 77081077 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9928 NM_005724 10099 Hs.744863 NM_005724 ENSG00000140391 TSPAN3 TM4-A|TM4SF8|TSPAN-3 tetraspanin 3 protein-coding 398-4 chr15 71719038 71719461 + 1.5 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -27710 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 247.5-59 chr4 61180160 61180437 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20932 NM_001371343 272-14 chr2 19103708 19103940 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -76853 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 159.25-46 chr16 6204893 6205183 + 1.5 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 185335 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 162-79 chr3 172919985 172920210 + 1.5 NA intron (NM_031955, intron 8 of 10) MIRc|SINE|MIR 169095 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 193.5-3 chr1 48595985 48596145 + 1.5 NA intron (NM_001323575, intron 9 of 12) MIRc|SINE|MIR -123857 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 131.25-61 chr14 58540288 58540411 + 1.5 NA intron (NM_001329943, intron 30 of 30) intron (NM_001329943, intron 30 of 30) -93719 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 145.5-44 chr12 22332384 22332588 + 1.5 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) intron (NM_003034, intron 1 of 4) 2228 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 328-29 chr5 96964540 96964872 + 1.5 NA intron (NM_175920, intron 1 of 17) L1M5|LINE|L1 6273 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 193.25-111 chr7 101193220 101193397 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 7728 NM_178176 346606 Hs.512217 NM_178176 ENSG00000106384 MOGAT3 DC7|DGAT2L2|MGAT3 monoacylglycerol O-acyltransferase 3 protein-coding 252.5-70 chr6 61539627 61539872 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34381 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 228-14 chr11 81668973 81669292 + 1.5 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 221704 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 276-2 chr1 59130517 59130889 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 16104 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 489.25 chr7 125117563 125118104 + 1.5 NA intron (NR_125718, intron 5 of 10) intron (NR_125718, intron 5 of 10) -66736 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 143.25-60 chr15 94193971 94194121 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -86108 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 371-20 chr8 100001801 100002271 + 1.5 NA intron (NM_015668, intron 18 of 27) intron (NM_015668, intron 18 of 27) -2546 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 438.75-3 chr14 45630014 45630484 + 1.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 85353 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 140.5-149 chr3 44153671 44153791 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 39519 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 271-12 chr14 42930594 42930887 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 1323884 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 284.5-42 chr3 193207812 193208166 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33233 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 249-50 chr8 91314290 91314542 + 1.5 NA intron (NM_134266, intron 4 of 18) intron (NM_134266, intron 4 of 18) 65097 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 256.5-77 chr8 78744998 78745237 + 1.5 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1PA12|LINE|L1 -20743 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 298-13 chr18 22757713 22757985 + 1.5 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 28988 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 227.5-21 chr11 40387339 40387557 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -94318 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 414-3 chr14 94427119 94427663 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 25409 NM_001080451 256394 Hs.145890 NM_001080451 ENSG00000186910 SERPINA11 - serpin family A member 11 protein-coding 154.75-118 chr5 106055303 106055547 + 1.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 955589 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 162-124 chr8 138263035 138263160 + 1.5 NA intron (NM_015912, intron 4 of 19) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -179552 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 216-7 chr11 13636303 13636585 + 1.5 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -32224 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 158.5-94 chr2 56026765 56026915 + 1.5 NA intron (NR_126406, intron 1 of 2) intron (NR_126406, intron 1 of 2) 20486 NR_126406 104355290 Hs.580331 NR_126406 MIR217HG MIR216AHG|MIR216BHG MIR217 host gene ncRNA 180.75-5 chr1 80327719 80327964 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -207914 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 189-2 chr1 18089118 18089349 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -18565 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 438-6 chr8 102089274 102089655 + 1.5 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) MER41-int|LTR|ERV1 34870 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 439.5-7 chr17 70991001 70991467 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 210945 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 261.75-28 chr21 27350513 27350834 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -371706 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 262.5-78 chr9 103367705 103368011 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -42825 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 245.25-56 chr5 67195442 67195762 + 1.5 NA intron (NM_005582, intron 1 of 2) intron (NM_005582, intron 1 of 2) 1197 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 316.25-19 chr5 159560534 159560939 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -94460 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 230.5-116 chr8 123394043 123394301 + 1.5 NA intron (NM_014109, intron 1 of 27) MIR|SINE|MIR 2275 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 200.5-5 chr1 76746340 76746554 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 32820 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 228.75-35 chr19 27670266 27670500 + 1.5 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -123048 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 305.5-30 chr3 122057340 122057724 + 1.5 NA intron (NM_001206925, intron 1 of 5) intron (NM_001206925, intron 1 of 5) 2170 NM_001206925 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 353.5-8 chr18 5815187 5815509 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25347 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 359.5-6 chr20 32218078 32218503 + 1.5 NA TTS (NM_172236) TTS (NM_172236) 10410 NM_172236 23509 Hs.472409 NM_015352 ENSG00000101346 POFUT1 DDD2|FUT12|O-FUT|O-Fuc-T|O-FucT-1|OFUCT1 protein O-fucosyltransferase 1 protein-coding 196.5-155 chr7 39457640 39457827 + 1.5 NA intron (NM_001370959, intron 8 of 9) intron (NM_001370959, intron 8 of 9) -51387 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 433-5 chr12 63502286 63502827 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165937 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 192-60 chr2 121559763 121559966 + 1.5 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) L1MB7|LINE|L1 28984 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 430.5-2 chr12 47167890 47168278 + 1.5 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) intron (NM_001281429, intron 2 of 2) -19728 NR_039847 100616486 NR_039847 ENSG00000263838 MIR4698 - microRNA 4698 ncRNA 225-76 chr7 106122659 106122940 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -10223 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 229.5-88 chr3 117220166 117220510 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 298907 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 156.5-57 chr14 102823205 102823361 + 1.5 NA intron (NM_001199427, intron 1 of 7) intron (NM_001199427, intron 1 of 7) 45804 NM_145725 7187 Hs.510528 NM_003300 ENSG00000131323 TRAF3 CAP-1|CAP1|CD40bp|CRAF1|IIAE5|LAP1|RNF118 TNF receptor associated factor 3 protein-coding 296.5 chr1 3969598 3969803 + 1.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -20720 NR_147024 105376672 Hs.435087 NR_147024 ENSG00000226374 LINC01345 - long intergenic non-protein coding RNA 1345 ncRNA 216.5-86 chr4 38348289 38348507 + 1.5 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -18516 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 165-99 chr3 193689795 193690003 + 1.5 NA intron (NM_130831, intron 26 of 27) intron (NM_130831, intron 26 of 27) -62567 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 255-7 chr11 27910775 27911011 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -145922 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 270.75-40 chr5 43109464 43109677 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -11344 NM_001330709 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 514.25-3 chr8 119577431 119577888 + 1.5 NA intron (NM_001330600, intron 19 of 25) intron (NM_001330600, intron 19 of 25) 15349 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 234.25-33 chr2 54878604 54878882 + 1.5 NA intron (NM_001039753, intron 15 of 40) intron (NM_001039753, intron 15 of 40) 131529 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 228-51 chr3 53686421 53686719 + 1.5 NA intron (NM_000720, intron 8 of 48) L1MEf|LINE|L1 159849 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 272-32 chr6 41853277 41853569 + 1.5 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 18214 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 216.75-7 chr1 218582140 218582374 + 1.5 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) L1ME2|LINE|L1 72162 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 207-31 chr15 69720340 69720568 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -114780 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 299.25-38 chr4 133567332 133567676 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 418210 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 265-28 chr3 194065250 194065526 + 1.5 NA intron (NR_136181, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 4141 NR_136181 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 331-19 chr2 182110418 182110661 + 1.5 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) MamRep605|LTR?|LTR? 124686 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 246-29 chr2 38317115 38317334 + 1.5 NA intron (NM_001135673, intron 4 of 12) intron (NM_001135673, intron 4 of 12) 59306 NM_001330460 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 181.5-22 chr11 88554340 88554559 + 1.5 NA intron (NM_001143831, intron 7 of 8) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 49873 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 243-37 chr2 162058054 162058307 + 1.5 NA intron (NM_001935, intron 2 of 25) LTR24|LTR|ERV1 16035 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 225-43 chr2 212554971 212555239 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16303 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 254.5-48 chr20 16409648 16409919 + 1.5 NA intron (NM_001199866, intron 15 of 22) L2b|LINE|L2 163665 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 304-10 chr11 130299105 130299478 + 1.5 NA intron (NR_163265, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 15421 NM_014155 29068 Hs.721470 NM_014155 ENSG00000196323 ZBTB44 BTBD15|HSPC063|ZNF851 zinc finger and BTB domain containing 44 protein-coding 174-83 chr6 112407350 112407480 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 60085 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 133.5-216 chr5 116831366 116831482 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -69215 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 258-37 chr3 95105303 95105627 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 167202 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 160-6 chr1 64596632 64596799 + 1.5 NA intron (NM_020925, intron 3 of 26) intron (NM_020925, intron 3 of 26) 16868 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 322.5-2 chr1 93153286 93153698 + 1.5 NA non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) 26921 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 432.75-2 chr12 33320834 33321453 + 1.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 118676 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 219.25-51 chr3 120192372 120192608 + 1.5 NA intron (NM_001168271, intron 4 of 8) intron (NM_001168271, intron 4 of 8) 51805 NM_001168271 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 230.25-4 chr1 108768738 108768922 + 1.5 NA intron (NM_007269, intron 6 of 18) intron (NM_007269, intron 6 of 18) 22156 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 417.5-11 chr6 67988416 67988864 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -66711 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 290.75-22 chr18 10676750 10677253 + 1.5 NA intron (NM_022068, intron 49 of 51) intron (NM_022068, intron 49 of 51) 15068 NR_110777 101927410 Hs.436902 NR_110777 ENSG00000260779 LOC101927410 - uncharacterized LOC101927410 ncRNA 340.5-21 chr3 37951664 37951964 + 1.5 NA intron (NM_005808, intron 2 of 6) L1MEj|LINE|L1 -17590 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 342-2 chr1 61039832 61040276 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37173 NM_001145511 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 237-28 chr2 125749407 125749658 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 368453 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 276-20 chr14 50564717 50564940 + 1.5 NA intron (NM_015915, intron 1 of 13) intron (NM_015915, intron 1 of 13) 4803 NM_015915 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 232-69 chr6 117754163 117754384 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 78804 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 365-9 chr18 3908054 3908311 + 1.5 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 22829 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 235.5-70 chr5 94036686 94036963 + 1.5 NA intron (NR_028080, intron 3 of 8) L1MC5a|LINE|L1 74839 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 132-172 chr8 61161386 61161578 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -126488 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 223-87 chr9 9784722 9784933 + 1.5 NA intron (NM_002839, intron 5 of 45) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14565 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 243.25-21 chr17 59442263 59442562 + 1.5 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 76329 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 251-53 chr7 46939606 46939923 + 1.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -242642 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 277.75-22 chr3 28358474 28358892 + 1.5 NA intron (NM_001324170, intron 1 of 6) intron (NM_001324170, intron 1 of 6) 9534 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 236.75-3 chr1 95009610 95009845 + 1.5 NA intron (NM_144988, intron 3 of 3) L1MC4a|LINE|L1 -51869 NR_132786 101928098 Hs.730090 NR_132786 ENSG00000230427 LOC101928098 - uncharacterized LOC101928098 ncRNA 182.5-27 chr11 25465491 25465657 + 1.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -723549 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 267-2 chr1 109493336 109493643 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001134402) promoter-TSS (NM_001134402) -547 NM_001134402 284613 Hs.514682 NM_182580 ENSG00000174151 CYB561D1 - cytochrome b561 family member D1 protein-coding 191.75-30 chr12 56638863 56639012 + 1.5 NA intron (NM_001686, intron 9 of 9) intron (NM_001686, intron 9 of 9) -2578 NM_001351156 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 317.25-20 chr20 24281464 24281854 + 1.5 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 81892 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 179-44 chr17 29175900 29176121 + 1.5 NA intron (NM_078471, intron 1 of 41) AluSg7|SINE|Alu 763 NM_001346767 399687 Hs.462590 NM_078471 ENSG00000196535 MYO18A MAJN|MYSPDZ|SP-R210|SPR210 myosin XVIIIA protein-coding 248.25-12 chr11 92526170 92526660 + 1.5 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 174319 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 300.75-39 chr5 133420201 133420617 + 1.5 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 7297 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 421.75-3 chr11 36876492 36877014 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -278474 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 364.5-8 chr14 72774406 72774819 + 1.5 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 118037 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 123-83 chr17 69680544 69680683 + 1.5 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 86626 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 264.25-35 chr22 27427829 27428164 + 1.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 117345 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 275.75-31 chr3 66246132 66246391 + 1.5 NA intron (NM_001350992, intron 2 of 8) intron (NM_001350992, intron 2 of 8) 25258 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 150.75-160 chr6 57066358 57066513 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 19688 NM_001286276 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 223.5-115 chr7 31202011 31202214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 138614 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 326-31 chr8 25767102 25767510 + 1.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 278107 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 181-119 chr9 116232378 116232523 + 1.5 NA intron (NM_002581, intron 6 of 21) intron (NM_002581, intron 6 of 21) 78659 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 266.75-28 chr2 181105564 181105765 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18173 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 346.75-14 chr7 124124648 124125023 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -91768 NM_001136002 730130 Hs.450249 NM_001136002 ENSG00000234224 TMEM229A - transmembrane protein 229A protein-coding 206.25-16 chr10 44098386 44098657 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 186119 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 145-15 chr1 204665221 204665396 + 1.5 NA intron (NM_201630, intron 1 of 1) intron (NM_201630, intron 1 of 1) 20430 NM_201630 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 219.5-116 chr6 119688087 119688303 + 1.5 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 138387 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 244.75-46 chr5 77717244 77717561 + 1.5 NA intron (NM_004607, intron 1 of 3) intron (NM_004607, intron 1 of 3) 58937 NM_001297738 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 446.75-7 chrX 4020057 4020691 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -99632 NR_146578 729162 Hs.657302 NR_146578 FAM239B - zinc finger protein 839 pseudogene pseudo 398.5-7 chr2 51006981 51007434 + 1.5 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 24925 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 146.5-51 chr12 13725600 13725702 + 1.5 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 254705 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 433-9 chr2 149826452 149826829 + 1.5 NA intron (NR_145421, intron 2 of 4) intron (NR_145421, intron 2 of 4) 32551 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 257-6 chr10 6317406 6317703 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -8990 NR_040079 399715 NR_040079 ENSG00000215244 LINC02649 - long intergenic non-protein coding RNA 2649 ncRNA 199-82 chr8 86127658 86127879 + 1.5 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) intron (NM_152565, intron 2 of 7) 28858 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 341-11 chr17 39503020 39503448 + 1.5 NA intron (NM_015083, intron 6 of 13) AluSx1|SINE|Alu 41748 NM_015083 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 293.75-32 chr3 102199214 102199569 + 1.5 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 35686 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 383.25-13 chr3 4990433 4990854 + 1.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -10682 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 333-19 chr5 18566822 18567164 + 1.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 759719 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 269.75-4 chr1 222731506 222731823 + 1.5 NA intron (NM_144695, intron 12 of 12) intron (NM_144695, intron 12 of 12) -5552 NM_207468 400823 Hs.697608 NM_207468 ENSG00000197520 FAM177B - family with sequence similarity 177 member B protein-coding 438.5 chr12 9830358 9830913 + 1.5 NA intron (NR_120305, intron 1 of 3) L1MC|LINE|L1 3154 NR_159361 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 207-44 chr2 101740705 101740927 + 1.5 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 43109 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 179.75-23 chr11 31437120 31437272 + 1.5 NA intron (NM_001304274, intron 4 of 5) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 67336 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 294.75-37 chr6 143517838 143518062 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6230 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 261-23 chr19 43858885 43859080 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 21154 NM_001033719 342908 Hs.76561 NM_001033719 ENSG00000176222 ZNF404 - zinc finger protein 404 protein-coding 369.75-16 chr7 39884319 39884783 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 64868 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 158-128 chr7 41722477 41722928 + 1.5 NA intron (NR_027118, intron 2 of 3) intron (NR_027118, intron 2 of 3) -19612 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 230.75-46 chr3 35449085 35449371 + 1.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -55205 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 330-25 chr6 126048828 126049081 + 1.5 NA intron (NR_146803, intron 15 of 16) HERVL40-int|LTR|ERVL 62414 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 230-49 chr5 91768462 91768723 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -385275 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 278.25-22 chr18 52509296 52509641 + 1.5 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 169271 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 334.5-7 chr16 54420738 54420991 + 1.5 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -50165 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 154.5-3 chr1 58615670 58615795 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -38480 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 139.5-100 chr2 114440792 114440973 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1759 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 266-29 chr3 99456770 99456967 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -181726 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 165.25-46 chr15 63840876 63841161 + 1.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -7070 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 163.5-45 chr12 105360577 105360734 + 1.5 NA intron (NM_001145199, intron 2 of 5) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 29964 NM_001145199 387882 Hs.368938 NM_207376 ENSG00000235162 C12orf75 AGD3|OCC-1|OCC1 chromosome 12 open reading frame 75 protein-coding 320.5-36 chr6 136698239 136698651 + 1.5 NA intron (NM_005923, intron 4 of 29) intron (NM_005923, intron 4 of 29) 69331 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 223.5-21 chr11 21306465 21306707 + 1.5 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) intron (NM_201551, intron 14 of 18) 637000 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 325-17 chr3 127762678 127762914 + 1.5 NA intron (NM_001003794, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR 60086 NM_001256585 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 220.5-113 chr7 12639128 12639391 + 1.5 NA intron (NR_156701, intron 10 of 14) intron (NR_156701, intron 10 of 14) -47568 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 166.5-114 chr2 215031179 215031354 + 1.5 NA intron (NR_103740, intron 10 of 54) intron (NR_103740, intron 10 of 54) 820 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 332-27 chr8 117524752 117525087 + 1.5 NA intron (NM_001282986, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 4206 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 181.5-136 chr5 150029775 150029909 + 1.5 NA intron (NM_014983, intron 9 of 19) intron (NM_014983, intron 9 of 19) 29103 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 207-19 chr12 11928692 11928844 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -121093 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 140.25-101 chr2 195986627 195986809 + 1.5 NA intron (NM_018897, intron 14 of 64) intron (NM_018897, intron 14 of 64) 82119 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 235-4 chr1 76654151 76654366 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125009 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 383.25-10 chr21 7917189 7917678 + 1.5 NA Intergenic (ATTCCATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -87801 NM_001330065 102723475 NM_001330065 ENSG00000276289 KCNE1B - potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1B protein-coding 197.5-82 chr2 187213816 187213985 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 234352 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 306.75-14 chr3 26980923 26981264 + 1.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 235430 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 403.5-2 chr12 9791781 9792247 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -8038 NR_159359 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 154-105 chr5 28261097 28261210 + 1.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 26512 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 237.75-48 chr22 41662476 41662714 + 1.5 NA intron (NM_001288976, intron 12 of 12) L1ME3G|LINE|L1 26272 NM_001003796 4809 Hs.182255 NM_005008 ENSG00000100138 SNU13 15.5K|FA-1|FA1|NHP2L1|NHPX|OTK27|SNRNP15-5|SPAG12|SSFA1 small nuclear ribonucleoprotein 13 protein-coding 259.5-17 chr10 114819959 114820148 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1727 NM_020940 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 116.5-98 chr18 6713476 6713572 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16192 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 280.25-38 chr3 138092171 138092371 + 1.5 NA intron (NM_001170538, intron 6 of 13) intron (NM_001170538, intron 6 of 13) 21209 NM_001170538 199221 Hs.351403 NM_173543 ENSG00000158163 DZIP1L DZIP2|PKD5 DAZ interacting zinc finger protein 1 like protein-coding 135.5-204 chr8 117988007 117988168 + 1.5 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu -67174 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 270.25-35 chr5 8525913 8526255 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 65159 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 207-45 chr2 175230780 175230955 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -49157 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 161-119 chr8 116895944 116896085 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -21148 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 191-49 chr21 20550693 20550914 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 252305 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 195.5-32 chr12 40446724 40446964 + 1.5 NA intron (NM_173600, intron 38 of 173) intron (NM_173600, intron 38 of 173) 53450 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 395-13 chr5 39614252 39614672 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 94031 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 218.75-48 chr21 27014872 27015093 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -47894 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 194.25-46 chr17 56134939 56135092 + 1.5 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -18460 NM_153228 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 331.5-3 chr10 62746335 62746626 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -58240 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 198.25-103 chr8 136298899 136299082 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -231808 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 336.75-17 chr5 131115104 131115412 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49998 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 257-22 chr2 25486522 25486989 + 1.5 NA intron (NM_033147, intron 9 of 19) intron (NM_033147, intron 9 of 19) -144165 NM_175629 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 233.5-87 chr5 72111845 72112051 + 1.5 NA intron (NM_005909, intron 1 of 6) intron (NM_005909, intron 1 of 6) 4473 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 199-42 chr2 215360612 215360915 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001365518, exon 45 of 45) 3' UTR (NM_001365518, exon 45 of 45) 48704 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 203-64 chr3 61525170 61525448 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -36262 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 445-7 chr5 160095762 160096104 + 1.5 NA intron (NR_146216, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 23517 NM_001130864 114825 Hs.744960 NM_052927 ENSG00000170234 PWWP2A MST101 PWWP domain containing 2A protein-coding 167-40 chr14 55817642 55817789 + 1.5 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -21041 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 294.5-15 chr15 61751358 61751570 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21546 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 145.5-66 chr14 71610622 71610801 + 1.5 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) intron (NM_001354286, intron 6 of 24) 24413 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 337.75-16 chr5 68346083 68346367 + 1.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 53648 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 177.75-31 chr12 110675009 110675136 + 1.5 NA intron (NM_001256413, intron 2 of 6) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 14043 NM_032369 84329 Hs.211511 NM_032369 ENSG00000122986 HVCN1 HV1|VSOP hydrogen voltage gated channel 1 protein-coding 219.5-29 chr12 50673792 50674032 + 1.5 NA intron (NM_173602, intron 5 of 37) intron (NM_173602, intron 5 of 37) -90189 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 256.5-58 chr5 39261769 39262000 + 1.5 NA intron (NM_001243093, intron 1 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 8765 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 236.5 chr1 12767238 12767453 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -7503 NM_001080830 390999 Hs.156406 NM_001080830 ENSG00000116726 PRAMEF12 - PRAME family member 12 protein-coding 317.25-16 chr2 32758154 32758514 + 1.5 NA exon (NM_001193509, exon 13 of 20) exon (NM_001193509, exon 13 of 20) -67099 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 221.5-76 chr5 21235076 21235328 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -224278 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 341.25-19 chr4 39043207 39043598 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -1429 NM_001007075 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 263.25-33 chr22 26576247 26576469 + 1.5 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) intron (NM_001362923, intron 1 of 7) -11017 NM_001008566 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 161.5-18 chr10 15651003 15651163 + 1.5 NA intron (NM_001291494, intron 10 of 28) intron (NM_001291494, intron 10 of 28) 68839 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 248.25-2 chr1 67453359 67453566 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23060 NM_001018067 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 467-7 chr5 19200868 19201440 + 1.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 685118 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 206.5-130 chr8 53411316 53411494 + 1.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 112560 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 251-52 chr7 46227145 46227447 + 1.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -306024 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 401.25-7 chr2 40564558 40564969 + 1.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -52328 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 216.5-115 chr8 53862192 53862351 + 1.5 NA intron (NM_001286674, intron 1 of 2) intron (NM_001286674, intron 1 of 2) 10476 NM_170587 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 147-96 chr3 111426685 111426830 + 1.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -115440 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 287.25-11 chr10 94218940 94219229 + 1.5 NA intron (NM_001165979, intron 3 of 31) L2a|LINE|L2 67986 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-167 chr6 55823026 55823274 + 1.5 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 52440 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 221.75-35 chr2 38570322 38570622 + 1.5 NA intron (NM_138394, intron 8 of 12) L2a|LINE|L2 32456 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 345-13 chr3 70776374 70776770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 288352 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 437.75-7 chr7 11655218 11655634 + 1.5 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L3|LINE|CR1 176772 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 214.5-26 chr12 66109025 66109286 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21595 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 324-4 chr10 89999337 89999605 + 1.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -42098 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 177.25-20 chr10 88894095 88894408 + 1.5 NA intron (NM_020799, intron 1 of 10) intron (NM_020799, intron 1 of 10) 14006 NM_020799 57559 Hs.16229 NM_020799 ENSG00000138134 STAMBPL1 ALMalpha|AMSH-FP|AMSH-LP|bA399O19.2 STAM binding protein like 1 protein-coding 423.5 chr10 124987481 124987892 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001321012, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001321012, exon 11 of 11) 18332 NM_001363508 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 262-32 chr2 157798189 157798433 + 1.5 NA intron (NM_001111067, intron 3 of 10) MER20B|DNA|hAT-Charlie 40319 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 322.25-15 chr3 139924544 139924935 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -10446 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 289-45 chr7 140549100 140549437 + 1.5 NA intron (NM_001318052, intron 11 of 18) AluSz6|SINE|Alu 53274 NR_134477 27147 Hs.6385 NM_015689 ENSG00000146966 DENND2A FAM31D|KIAA1277 DENN domain containing 2A protein-coding 337-6 chr10 63389656 63389916 + 1.5 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L1M2|LINE|L1 -16738 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 213-18 chr10 121535505 121535700 + 1.5 NA intron (NR_073009, intron 4 of 16) intron (NR_073009, intron 4 of 16) -4288 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 407.25-15 chr8 121839213 121839739 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -198036 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 232.5 chr1 39565001 39565224 + 1.5 NA promoter-TSS (NR_125979) promoter-TSS (NR_125979) 42 NR_125979 101929516 Hs.662694 NR_125979 ENSG00000228060 PABPC4-AS1 - PABPC4 antisense RNA 1 ncRNA 164.25-10 chr1 163924501 163924652 + 1.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -501385 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 169.5-116 chr3 159281559 159281721 + 1.5 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) -1006 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 259.5-4 chr1 51186099 51186354 + 1.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 48870 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 272.25-36 chr3 109862620 109862978 + 1.5 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 259971 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 375.5 chr1 108006891 108007186 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -41858 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 429.75-7 chr8 139070318 139070886 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -156561 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 195.75-98 chr5 166348405 166348612 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 577862 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 341-15 chr2 14181284 14181682 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 219475 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 167.75-7 chr1 100293915 100294050 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 12741 NR_030279 693138 NR_030279 ENSG00000207750 MIR553 MIRN553|hsa-mir-553 microRNA 553 ncRNA 272.5-25 chr14 63038085 63038471 + 1.5 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 7180 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 218.5-82 chr4 31061919 31062273 + 1.5 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -109048 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 213.75-5 chr1 83567229 83567437 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 121279 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 272.75-49 chr8 88791000 88791257 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -463645 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 204.5-3 chr1 109385806 109386079 + 1.5 NA intron (NM_002959, intron 1 of 19) L2b|LINE|L2 7415 NM_001205228 6272 Hs.485195 NM_002959 ENSG00000134243 SORT1 Gp95|LDLCQ6|NT3|NTR3 sortilin 1 protein-coding 301.5-42 chr8 119180059 119180438 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -28115 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 189.75-33 chr14 62374762 62374940 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -234878 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 158.5-25 chr10 74182775 74182978 + 1.5 NA intron (NM_001369124, intron 1 of 9) intron (NM_001369124, intron 1 of 9) 6113 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 480.75 chr1 26730028 26730638 + 1.5 NA intron (NM_139135, intron 2 of 19) intron (NM_139135, intron 2 of 19) 34318 NM_006015 8289 Hs.468972 NM_006015 ENSG00000117713 ARID1A B120|BAF250|BAF250a|BM029|C1orf4|CSS2|ELD|MRD14|OSA1|P270|SMARCF1|hELD|hOSA1 AT-rich interaction domain 1A protein-coding 349.5-20 chr7 53582493 53582903 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 229233 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 172.5-175 chr6 152617866 152618028 + 1.5 NA intron (NM_182961, intron 3 of 145) L2c|LINE|L2 18904 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 337.5-18 chr2 34285399 34285668 + 1.5 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L1M5|LINE|L1 218307 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 411.75-2 chr1 115244580 115244998 + 1.5 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -38245 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 195-28 chr14 72190115 72190285 + 1.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 256673 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 306.5-15 chr15 62914845 62915143 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 91037 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 201.25-15 chr10 49175497 49175921 + 1.5 NA intron (NM_001288742, intron 1 of 4) intron (NM_001288742, intron 1 of 4) 12682 NM_001353330 170371 Hs.385493 NM_001010863 ENSG00000204161 TMEM273 C10orf128 transmembrane protein 273 protein-coding 276.5-41 chr3 16297968 16298270 + 1.5 NA intron (NM_001330670, intron 6 of 8) intron (NM_001330670, intron 6 of 8) 32907 NM_001352982 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 449-3 chr6 142908417 142908783 + 1.5 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 36576 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 302.75-6 chr14 37244646 37245036 + 1.5 NA intron (NM_138731, intron 2 of 13) intron (NM_138731, intron 2 of 13) 46904 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 309-2 chr1 171515801 171516044 + 1.5 NA intron (NM_015172, intron 5 of 33) intron (NM_015172, intron 5 of 33) 30392 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 186.5-69 chr2 157835765 157835905 + 1.5 NA intron (NM_001347664, intron 1 of 11) intron (NM_001347664, intron 1 of 11) 2795 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 227.25-69 chr6 147174060 147174322 + 1.5 NA intron (NR_034115, intron 1 of 10) intron (NR_034115, intron 1 of 10) 15266 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 479.5 chr7 77839843 77840331 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_001366089) promoter-TSS (NM_001366089) -41 NM_001127357 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 246-47 chr4 156737163 156737490 + 1.5 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL 234473 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 163-69 chr3 12270752 12270909 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16655 NM_001354666 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 313.5 chr1 7106648 7106936 + 1.5 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) intron (NM_001349608, intron 3 of 21) 282962 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 375.75-11 chr2 121210884 121211193 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 74164 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 385-17 chr5_GL383530v1_alt 54742 55236 + 1.5 NA NA Intergenic NA NA 197-47 chr4 100697807 100697960 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -22770 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 212.25-96 chr8 84065199 84065419 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -117478 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 288-35 chr3 95391991 95392347 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 291024 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 218.25-81 chr6 63992864 63993052 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 34 of 43) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 186122 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 192.5-44 chr15 82995858 82996026 + 1.5 NA 3' UTR (NM_144597, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_144597, exon 4 of 4) 9732 NM_031452 83640 Hs.80624 NM_031452 ENSG00000169612 RAMAC C15orf18|FAM103A1|HsT19360|RAM|RAMMET RNA guanine-7 methyltransferase activating subunit protein-coding 262.5-33 chr2 22512732 22513020 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23603 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 462.25 chr12 41857182 41857699 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 93251 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 242.5-80 chr7 87507590 87507908 + 1.5 NA intron (NM_001348944, intron 28 of 29) intron (NM_001348944, intron 28 of 29) -32046 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 240.5-2 chr1 59967996 59968317 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -41358 NR_134982 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 258.5-51 chr3 175915498 175915879 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -139355 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 241.75-47 chr22 25214423 25214794 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -5031 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 267.5-48 chr3 42388804 42389032 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 21692 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 314-16 chr4 60597515 60597785 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -324969 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 237-43 chr4 135093613 135093857 + 1.5 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 29824 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 212.25-3 chr1 115107592 115107790 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18188 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 278.5-61 chr8 134710900 134711324 + 1.5 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) intron (NM_001289394, intron 1 of 16) 1919 NM_001174157 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 328.5-3 chr1 235035745 235036063 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 33914 NR_027454 731656 Hs.702477 NR_027454 LINC01348 - long intergenic non-protein coding RNA 1348 ncRNA 220.5-38 chr18 3229342 3229501 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -9313 NM_003803 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 179.75-81 chr4 58434437 58434770 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 101725 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 400.5-11 chr3 152060461 152060892 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -132501 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 237.75-2 chr1 174688441 174688609 + 1.5 NA intron (NM_001366446, intron 15 of 25) L1ME3B|LINE|L1 -12014 NM_001366451 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 234.25-62 chr5 143800238 143800658 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11713 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 314.25-4 chr10 23332802 23333072 + 1.5 NA intron (NM_153714, intron 2 of 4) intron (NM_153714, intron 2 of 4) -11020 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 372.5-20 chr7 11075126 11075492 + 1.5 NA intron (NR_033436, intron 15 of 16) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 101437 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 348.25-5 chr10 126622902 126623164 + 1.5 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) intron (NM_001350922, intron 2 of 8) 47477 NM_001350921 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 350.75-9 chr4 76255814 76256247 + 1.5 NA intron (NM_001242939, intron 1 of 6) L1ME5|LINE|L1 4309 NM_001136570 100129583 Hs.720509 NM_001136570 ENSG00000189157 FAM47E - family with sequence similarity 47 member E protein-coding 165-126 chr7 21544243 21544420 + 1.5 NA intron (NM_001277115, intron 1 of 81) intron (NM_001277115, intron 1 of 81) 1292 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 238.5-54 chr3 44312740 44312982 + 1.5 NA intron (NM_001145030, intron 16 of 19) intron (NM_001145030, intron 16 of 19) -25258 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 209.25-78 chr3 99642727 99642912 + 1.5 NA intron (NM_020351, intron 1 of 3) intron (NM_020351, intron 1 of 3) 4225 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 143-7 chr1 217109237 217109364 + 1.5 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) intron (NM_001134285, intron 1 of 8) -18732 NM_001350122 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 274.25-17 chr13 112162860 112163211 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2325 NR_134944 100506016 Hs.371110 NR_134944 LOC100506016 - uncharacterized LOC100506016 ncRNA 241-14 chr13 72876333 72876594 + 1.5 NA intron (NR_146206, intron 10 of 16) L1MC1|LINE|L1 94330 NR_146206 10464 Hs.441926 NM_006346 ENSG00000083535 PIBF1 C13orf24|CEP90|JBTS33|PIBF progesterone immunomodulatory binding factor 1 protein-coding 307.75-17 chr4 62054728 62055054 + 1.5 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) L1M5|LINE|L1 106874 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 148.5-36 chr11 28180719 28180908 + 1.5 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) intron (NM_001113528, intron 3 of 6) 72425 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 276.25-32 chr4 32084741 32085002 + 1.5 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -62449 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 139.25-168 chr6 167585798 167585999 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 93325 NR_117091 401286 Hs.487182 NR_117091 ENSG00000272549 LINC02538 - long intergenic non-protein coding RNA 2538 ncRNA 143.25-62 chr16 8292211 8292342 + 1.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 297562 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 255.5-18 chr12 25918675 25918852 + 1.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 38822 NR_038227 100506451 Hs.560092 NR_038227 RASSF8-AS1 - RASSF8 antisense RNA 1 ncRNA 171-23 chr11 78606678 78606820 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31885 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 215.75-101 chr8 132264564 132264791 + 1.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR -159412 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 176.25-73 chr2 156676793 156677023 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 240529 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 332.25-15 chr19 34070251 34070505 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -102126 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 132.25-115 chr22 18086248 18086379 + 1.5 NA intron (NM_017929, intron 5 of 5) AluSq2|SINE|Alu 8323 NM_017929 55670 Hs.517400 NM_017929 ENSG00000215193 PEX26 PBD7A|PBD7B|PEX26M1T|Pex26pM1T peroxisomal biogenesis factor 26 protein-coding 224-25 chr18 46222986 46223186 + 1.5 NA intron (NM_001008239, intron 2 of 3) intron (NM_001008239, intron 2 of 3) 49052 NM_145055 147339 Hs.116486 NM_145055 ENSG00000152242 C18orf25 ARKL1|Ark2N|RNF111L1 chromosome 18 open reading frame 25 protein-coding 277.5-67 chr6 17693765 17693958 + 1.5 NA intron (NM_005124, intron 1 of 21) AluSz|SINE|Alu -12269 NR_134616 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 239.5-18 chr11 105175743 105176099 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -36152 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 178-100 chr8 66310280 66310409 + 1.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 118230 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 276-31 chr3 28920125 28920353 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 344961 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 155.75-150 chr7 66318097 66318318 + 1.5 NA intron (NM_003596, intron 3 of 5) L1MEd|LINE|L1 82201 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 234-7 chr10 99081233 99081418 + 1.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) MER45B|DNA|hAT-Tip100 154550 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 236.25-11 chr10 79006921 79007219 + 1.5 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) intron (NR_015429, intron 3 of 7) 60378 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 195-76 chr7 25113199 25113369 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 12077 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 351.5-14 chr18 69103547 69104040 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -297095 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 140-60 chr17 57464187 57464346 + 1.5 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) AluJb|SINE|Alu 59331 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 228-54 chr3 84380370 84380589 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 489096 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 279.5-2 chr1 57953369 57953589 + 1.5 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) MIR3|SINE|MIR 92898 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 431.25-5 chr2 24493854 24494260 + 1.5 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) 2180 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 270-43 chr5 12364627 12364900 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -210094 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 153-42 chr14 66902754 66902911 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MA4|LINE|L1 -286608 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 377.25-4 chr14 25903658 25903992 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 649605 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 240-10 chr10 83466780 83467022 + 1.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 210188 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 245.5-79 chr8 92277051 92277222 + 1.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -173751 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 346.75-11 chr4 157199273 157199723 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21086 NM_001083619 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 178-108 chr9 90373465 90373651 + 1.5 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) L1M4b|LINE|L1 59931 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 224-32 chr3 57388031 57388341 + 1.5 NA intron (NM_001366028, intron 45 of 73) L2a|LINE|L2 -95501 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 201.5-74 chr2 141741799 141742141 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L1MA3|LINE|L1 389731 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 171.5-64 chr18 6232293 6232564 + 1.5 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) L1M3|LINE|L1 -24316 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 326.25-34 chr9 95236887 95237236 + 1.5 NA intron (NM_001243744, intron 4 of 13) intron (NM_001243744, intron 4 of 13) 80193 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 246.25-67 chr8 89148311 89148580 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 609266 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 211-38 chr21 22788058 22788236 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -291137 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 324.5-34 chr7 135935714 135935960 + 1.5 NA intron (NM_001128619, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 41522 NM_001128619 767558 Hs.602015 NM_001128619 ENSG00000267697 LUZP6 MPD6|MTPNUT leucine zipper protein 6 protein-coding 162.75-41 chr15 83189889 83190035 + 1.5 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 17861 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 118.5-146 chr4 58977260 58977352 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6976 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 303.25-23 chr4 41152608 41152932 + 1.5 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) L1MEd|LINE|L1 61772 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 158.25-106 chr5 25324778 25324968 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 133920 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 222.5-71 chr4 25162091 25162279 + 1.5 NA intron (NR_037934, intron 1 of 1) MER63D|DNA|hAT-Blackjack 1513 NR_037934 285540 Hs.732278 NR_037934 SEPSECS-AS1 - SEPSECS antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 179.25-137 chr7 66192572 66192763 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -12667 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 276.5-32 chr2 52110508 52110815 + 1.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1MEc|LINE|L1 -259987 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 190.25-21 chr11 78544241 78544419 + 1.5 NA intron (NR_120566, intron 1 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie 11154 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 358.25-6 chr14 57606773 57607278 + 1.5 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 -113168 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 227-5 chr1 244148431 244148610 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 95315 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 294.75-19 chr2 220195623 220195875 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -289184 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 363.5-17 chr4 74047557 74048189 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 7526 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 275.5-31 chr2 219748451 219748772 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 120981 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 309-3 chr1 172885193 172885500 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 165617 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 132-167 chr8 5635127 5635266 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -640282 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 232.5-114 chrX 66470073 66470339 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 145824 NM_001242310 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 408-18 chrX 87839504 87839809 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 321854 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 180-101 chr5 140298715 140298898 + 1.5 NA intron (NM_002622, intron 2 of 3) AluSq2|SINE|Alu 4295 NM_002622 5201 Hs.483564 NM_002622 ENSG00000113068 PFDN1 PDF|PFD1 prefoldin subunit 1 protein-coding 141.5-166 chr5 15211569 15211699 + 1.5 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 54926 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 332.5-22 chr5 145103062 145103535 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 732044 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 350-10 chr20 55999964 56000324 + 1.5 NA intron (NM_080617, intron 2 of 2) intron (NM_080617, intron 2 of 2) 5375 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 180.75-24 chr11 98766411 98766542 + 1.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -254473 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 352.25-13 chr4 113286703 113286978 + 1.5 NA intron (NM_001354275, intron 19 of 43) L2a|LINE|L2 -5999 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 156.75-89 chr2 128119607 128119779 + 1.5 NA intron (NR_027671, intron 8 of 40) intron (NR_027671, intron 8 of 40) 28493 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 174-36 chr16 65407291 65407447 + 1.5 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 168931 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 312-4 chr1 234057758 234058118 + 1.5 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu 153262 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 270.75-27 chr2 115445044 115445321 + 1.5 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 101367 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 259.5-75 chr5 17228344 17228722 + 1.5 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 10902 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 320.75-8 chr15 25917059 25917289 + 1.5 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) L1MA10|LINE|L1 14814 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 218.25-76 chr6 13207942 13208127 + 1.5 NA intron (NM_001322308, intron 7 of 13) intron (NM_001322308, intron 7 of 13) 75408 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 210.5-37 chr14 67146909 67147199 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 17 of 21) AluSz6|SINE|Alu -42386 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 193.75-35 chr12 15398803 15399129 + 1.5 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L3|LINE|CR1 76458 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 203.25-102 chr8 23388198 23388411 + 1.5 NA intron (NM_002318, intron 1 of 13) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 15816 NM_002318 4017 Hs.626637 NM_002318 ENSG00000134013 LOXL2 LOR|LOR2|WS9-14 lysyl oxidase like 2 protein-coding 276-52 chr8 123812021 123812379 + 1.5 NA intron (NM_144963, intron 23 of 23) intron (NM_144963, intron 23 of 23) -39787 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 171-16 chr10 92637364 92637602 + 1.5 NA exon (NM_004523, exon 16 of 22) exon (NM_004523, exon 16 of 22) 44353 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 151-31 chr13 102339206 102339393 + 1.5 NA intron (NM_001321941, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 -21595 NM_001321935 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 313.5-8 chr13 100476685 100476963 + 1.5 NA intron (NR_047686, intron 2 of 4) intron (NR_047686, intron 2 of 4) 4191 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 162.5-134 chr5 10309787 10310144 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2063 NM_138809 134147 Hs.192586 NM_138809 ENSG00000164237 CMBL JS-1 carboxymethylenebutenolidase homolog protein-coding 284.25-10 chr12 112498322 112498673 + 1.5 NA intron (NM_001330437, intron 13 of 15) intron (NM_001330437, intron 13 of 15) -76739 NM_001347952 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 351-4 chr14 63424857 63425460 + 1.5 NA intron (NR_104104, intron 2 of 12) intron (NR_104104, intron 2 of 12) 83080 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 325.25-17 chr21 16596057 16596405 + 1.5 NA intron (NR_136549, intron 3 of 3) intron (NR_136549, intron 3 of 3) 5994 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 349.5-6 chr17 53445477 53445808 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -377285 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 244.25-3 chr1 189732239 189732414 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 743684 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 171-92 chr3 94979890 94980112 + 1.5 NA intron (NR_015400, intron 3 of 7) intron (NR_015400, intron 3 of 7) 41738 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 117.5-58 chr14 53938383 53938519 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 10033 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 304-34 chr8 90401312 90401617 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 179976 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 286.75-23 chr2 205599277 205599642 + 1.5 NA intron (NM_205863, intron 21 of 21) LTR45|LTR|ERV1 -83041 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 171.75-149 chr9 108079746 108080042 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -590125 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 261.75-24 chr20 35846707 35847033 + 1.5 NA intron (NM_016436, intron 3 of 17) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 74855 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 295.5-49 chr5 85133940 85134296 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -749238 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 295.5-67 chr9 115765552 115765823 + 1.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -21448 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 377.25-12 chr3 196978001 196978408 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9371 NM_025163 80235 Hs.518403 NM_025163 ENSG00000119227 PIGZ GPI-MT-IV|PIG-Z|SMP3 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class Z protein-coding 215.5-96 chr7 6084188 6084473 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -20619 NM_001365764 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 243-68 chr7 14401418 14401775 + 1.5 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -410171 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 348.5-12 chr3 148557648 148557998 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -140048 NM_004835 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 145.5-43 chr12 15723372 15723521 + 1.5 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 65942 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 215.5-112 chr9 29401938 29402198 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -188467 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 317.5-7 chr15 97462559 97462835 + 1.5 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) intron (NR_120324, intron 2 of 4) 59114 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 216-72 chr6 165093860 165094092 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 215629 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 138.5-88 chr18 50260734 50260917 + 1.5 NA intron (NM_145020, intron 3 of 7) intron (NM_145020, intron 3 of 7) 5670 NM_145020 220136 Hs.658630 NM_145020 ENSG00000172361 CFAP53 CCDC11|HTX6 cilia and flagella associated protein 53 protein-coding 142.75-73 chr16 68485178 68485344 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -36753 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 422.5-5 chr14 65517227 65517806 + 1.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 46414 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 315.75-7 chr14 65880620 65880916 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 409666 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 228.5-25 chr12 14447893 14448269 + 1.5 NA intron (NM_181352, intron 6 of 14) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 62800 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 319.75-6 chr13 34291773 34292168 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -56073 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 193.25-28 chr12 91040741 91041079 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 17444 NM_007035 11081 Hs.125750 NM_007035 ENSG00000139330 KERA CNA2|KTN|SLRR2B keratocan protein-coding 285.25-13 chr2 50706627 50706908 + 1.5 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -10505 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 277.5-69 chr6 123060737 123061098 + 1.5 NA intron (NM_001010852, intron 5 of 5) intron (NM_001010852, intron 5 of 5) 64682 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 387 chr1 40391881 40392283 + 1.5 NA intron (NM_001198978, intron 1 of 9) intron (NM_001198978, intron 1 of 9) -1263 NM_001198979 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 319.5-35 chr5 19662475 19662828 + 1.5 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) L2|LINE|L2 223621 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 135.75-144 chr3 95997608 95997822 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -314522 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 323.5-30 chr7 82424775 82425018 + 1.5 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 18881 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 231.5-9 chr10 55288722 55288906 + 1.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MB1|LINE|L1 -310228 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 138.75-187 chr8 19530406 19530531 + 1.5 NA intron (NM_001354497, intron 1 of 7) intron (NM_001354497, intron 1 of 7) 72077 NM_001354491 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 331.5-22 chr6 2916254 2916542 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -13089 NM_004155 5272 Hs.104879 NM_004155 ENSG00000170542 SERPINB9 CAP-3|CAP3|PI-9|PI9 serpin family B member 9 protein-coding 376-6 chr16 9929268 9929622 + 1.5 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) L2|LINE|L2 252622 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 180-27 chr13 113238655 113238809 + 1.5 NA intron (NM_001008895, intron 9 of 19) intron (NM_001008895, intron 9 of 19) -24188 NR_107042 102465874 NR_107042 ENSG00000277942 MIR8075 hsa-mir-8075 microRNA 8075 ncRNA 486.75-3 chr14 64190394 64190928 + 1.5 NA intron (NM_015180, intron 99 of 114) intron (NM_015180, intron 99 of 114) -23483 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 345.5-10 chr12 100931901 100932346 + 1.5 NA intron (NM_001286616, intron 2 of 26) intron (NM_001286616, intron 2 of 26) 30477 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 215-36 chr17 70049035 70049223 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2142 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 297.5-44 chr4 163696008 163696344 + 1.5 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) intron (NM_001166373, intron 4 of 7) -82642 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 327.75-14 chr20 59203758 59204226 + 1.5 NA intron (NM_178457, intron 2 of 4) intron (NM_178457, intron 2 of 4) 12972 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 234.5-6 chr1 180200514 180200736 + 1.5 NA 3' UTR (NM_002826, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002826, exon 12 of 12) -29639 NM_033343 89884 Hs.658487 NM_033343 ENSG00000121454 LHX4 CPHD4 LIM homeobox 4 protein-coding 241.75-76 chr8 84160448 84160699 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -22214 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 192.5-102 chr4 157181096 157181285 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39394 NM_001083619 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 236.25-8 chr1 238662310 238662685 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -176480 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 216.5-123 chr8 118435698 118435854 + 1.5 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) LTR37A|LTR|ERV1 -185225 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 254-5 chr10 29196438 29196698 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -92502 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 448.5-4 chr14 55133579 55134117 + 1.5 NA intron (NM_001357678, intron 2 of 6) intron (NM_001357678, intron 2 of 6) -3135 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 361-13 chr2 69440843 69441219 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3403 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 237.75-18 chr14 59543510 59543713 + 1.5 NA intron (NM_001164399, intron 9 of 19) intron (NM_001164399, intron 9 of 19) 33201 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 216-17 chr14 85486226 85486430 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43697 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 171-27 chr12 33608247 33608400 + 1.5 NA Intergenic (AAAAACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -168504 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 202.25-53 chr3 146738590 146738977 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -132567 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 320.5-50 chr9 27172642 27173140 + 1.5 NA intron (NM_001290077, intron 5 of 21) MER91B|DNA|hAT-Tip100 63750 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 143.25-93 chr2 158627341 158627472 + 1.5 NA intron (NM_001005476, intron 7 of 20) intron (NM_001005476, intron 7 of 20) 107596 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 266-49 chr8 115636931 115637250 + 1.5 NA intron (NM_014112, intron 1 of 6) intron (NM_014112, intron 1 of 6) 30923 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 215.25-116 chr9 101971043 101971383 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -232633 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 286.5-32 chr19 31676476 31676831 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 84372 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 245-2 chr1 96816174 96816355 + 1.5 NA non-coding (NR_125357, exon 13 of 13) non-coding (NR_125357, exon 13 of 13) 93626 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 217.5-100 chr5 97761185 97761380 + 1.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -79476 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 205.5-135 chr7 30411757 30412016 + 1.5 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie 21001 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 233.25-9 chr10 110860268 110860477 + 1.5 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10532 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 165-155 chrX 136387136 136387442 + 1.5 NA intron (NM_153834, intron 15 of 25) intron (NM_153834, intron 15 of 25) 86326 NM_153834 139378 Hs.381354 NM_153834 ENSG00000156920 ADGRG4 GPR112|PGR17|RP1-299I16 adhesion G protein-coupled receptor G4 protein-coding 390-6 chr2 157558226 157558726 + 1.5 NA intron (NM_001111031, intron 2 of 8) intron (NM_001111031, intron 2 of 8) 39084 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 159-126 chr9 24798920 24799047 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -253086 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 142-17 chr10 52243954 52244084 + 1.5 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 70109 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 246.5-32 chr17 72308232 72308677 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -34357 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 302.25-4 chr11 57954827 57955182 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -68877 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 292.5-33 chr2 140386034 140386413 + 1.5 NA intron (NM_018557, intron 66 of 90) AluSx|SINE|Alu 200462 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 379.75-4 chr15 25283420 25283823 + 1.5 NA intron (NR_146177, intron 146 of 147) intron (NR_146177, intron 146 of 147) 5278 NR_001289 338429 NR_001289 ENSG00000239169 SNORD109B HBII-438B small nucleolar RNA, C/D box 109B snoRNA 394.5-10 chr4 177837787 177838286 + 1.5 NA intron (NR_108092, intron 1 of 1) intron (NR_108092, intron 1 of 1) 69900 NR_108093 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 294.75-25 chr3 103896793 103897089 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -372825 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 119-12 chr10 8014085 8014170 + 1.5 NA intron (NM_031923, intron 6 of 6) intron (NM_031923, intron 6 of 6) 38364 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 139-28 chr12 41826413 41826523 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62279 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 215.5-30 chr14 32195684 32195893 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -6257 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 218.5-58 chr2 138021278 138021514 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 56923 NM_001024075 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 222-86 chr8 122188901 122189133 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 379627 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 366-3 chr1 106791950 106792399 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -26065 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 343-5 chr14 20438970 20439213 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2925 NM_001365790 123103 Hs.556014 NM_001109997 ENSG00000185271 KLHL33 - kelch like family member 33 protein-coding 307.5-3 chr10 19060648 19061004 + 1.5 NA intron (NM_001142308, intron 1 of 39) intron (NM_001142308, intron 1 of 39) 12025 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 226.5-91 chr7 19054136 19054338 + 1.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 63399 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 262.5-35 chr2 58398141 58398435 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 122411 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 445-2 chr1 107829483 107829986 + 1.5 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) intron (NM_006113, intron 2 of 26) -67489 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 296.25-23 chr3 117933255 117933735 + 1.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -242570 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 270-7 chr11 14318534 14318784 + 1.5 NA intron (NM_001177314, intron 1 of 5) intron (NM_001177314, intron 1 of 5) 39826 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 182.25-103 chr6 135705048 135705279 + 1.5 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) intron (NR_152842, intron 5 of 5) -146538 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 286.5-27 chr16 56135647 56135861 + 1.5 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) intron (NR_027078, intron 2 of 4) 55340 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 278.25-5 chr10 96114502 96114753 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -15088 NR_138482 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 141-92 chr21 30784714 30784832 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 28501 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 303.5-3 chr1 98768752 98769177 + 1.5 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 107243 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 253-43 chr5 67158118 67158383 + 1.5 NA intron (NM_001297651, intron 23 of 25) intron (NM_001297651, intron 23 of 25) 38549 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 165.5-209 chr9 122116891 122117112 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 3166 NR_039690 100616312 NR_039690 ENSG00000266583 MIR4478 mir-4478 microRNA 4478 ncRNA 335.5-9 chr2 192628263 192628652 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -121388 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 261-26 chr2 72304857 72305140 + 1.5 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -157136 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 268.5-23 chr15 55361303 55361515 + 1.5 NA intron (NM_001204450, intron 7 of 8) intron (NM_001204450, intron 7 of 8) 11625 NR_030358 693213 NR_030358 ENSG00000283891 MIR628 MIRN628|hsa-mir-628|mir-628 microRNA 628 ncRNA 165-139 chr8 81921606 81921760 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -79397 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 234-9 chr11 26032899 26033177 + 1.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -156085 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 266.75-43 chr5 161132360 161132801 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -193954 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 445.5-3 chr21 29059951 29060313 + 1.5 NA intron (NM_001282907, intron 15 of 15) intron (NM_001282907, intron 15 of 15) 13516 NM_006585 10694 Hs.125113 NM_006585 ENSG00000156261 CCT8 C21orf112|Cctq|D21S246|PRED71 chaperonin containing TCP1 subunit 8 protein-coding 304.5-22 chr3 136418936 136419205 + 1.5 NA intron (NM_005862, intron 20 of 33) intron (NM_005862, intron 20 of 33) 168730 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 325-14 chr21 24816547 24816851 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -23851 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 156-134 chr6 122636728 122636859 + 1.5 NA intron (NM_032471, intron 2 of 3) L1M4|LINE|L1 -15936 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 275.5-27 chr18 4215546 4215982 + 1.5 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -48838 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 259.5-27 chr12 115171775 115172169 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -487797 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 252.25-54 chr6 55559921 55560140 + 1.5 NA intron (NR_109867, intron 1 of 3) (ATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19184 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 306.5-20 chr16 59804765 59805023 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -49703 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 238.5-91 chr8 106015973 106016292 + 1.5 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 44371 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 334.25-23 chr9 120034880 120035137 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 99948 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 184-101 chr9 27861025 27861188 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -287240 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 285-43 chr8 58864962 58865191 + 1.5 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) -205223 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 228-12 chr10 92996756 92996939 + 1.5 NA intron (NM_001319195, intron 18 of 21) intron (NM_001319195, intron 18 of 21) -63951 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 287-40 chr8 122271607 122271820 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 296931 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 366.75-5 chr13 37809076 37809338 + 1.5 NA intron (NM_003306, intron 1 of 10) intron (NM_003306, intron 1 of 10) 61218 NM_001135955 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 360.75-4 chr16 56962003 56962309 + 1.5 NA intron (NM_001286085, intron 1 of 14) intron (NM_001286085, intron 1 of 14) 206 NM_000078 1071 Hs.89538 NM_000078 ENSG00000087237 CETP BPIFF|HDLCQ10 cholesteryl ester transfer protein protein-coding 238-23 chr2 18450293 18450509 + 1.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 110252 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 283.5-55 chr8 114558583 114558949 + 1.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 1109247 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 263.5-45 chr4 103751078 103751435 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -31271 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 233.5-69 chr22 41212063 41212292 + 1.5 NA intron (NR_148200, intron 2 of 2) intron (NR_148200, intron 2 of 2) 5450 NR_148200 100506544 Hs.627409 NR_148200 ENSG00000235513 LOC100506544 - uncharacterized LOC100506544 ncRNA 190.5-95 chr22 41483088 41483298 + 1.5 NA intron (NM_001098, intron 1 of 17) intron (NM_001098, intron 1 of 17) 14076 NM_001098 50 Hs.643610 NM_001098 ENSG00000100412 ACO2 ACONM|HEL-S-284|ICRD|OCA8|OPA9 aconitase 2 protein-coding 153.75-85 chr3 38890096 38890246 + 1.5 NA intron (NM_014139, intron 15 of 25) L1M4b|LINE|L1 60390 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 307.25-24 chr3 61087859 61088106 + 1.5 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 163470 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 242.25-47 chr2 83572093 83572285 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 49375 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 126-176 chr8 121648317 121648428 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -6932 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 205.5-46 chr15 67172121 67172327 + 1.5 NA intron (NM_001145103, intron 5 of 8) intron (NM_001145103, intron 5 of 8) 6069 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 297.75-16 chr2 39084794 39085069 + 1.5 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) intron (NM_005633, intron 1 of 22) 35532 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 251-17 chr12 50888236 50888549 + 1.5 NA TTS (NM_182559) TTS (NM_182559) -36623 NM_014033 25840 Hs.711113 NM_014033 ENSG00000185432 METTL7A AAM-B|AAMB methyltransferase like 7A protein-coding 236.25-45 chr2 81509320 81509527 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -42477 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 198-13 chr10 108832131 108832287 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -762916 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 155.75-15 chr10 48403116 48403288 + 1.5 NA intron (NM_001323302, intron 4 of 13) AluSg|SINE|Alu 1590 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 349.75-13 chr4 105696147 105696661 + 1.5 NA intron (NM_001142471, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 12285 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 350.5-8 chr11 34360955 34361370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3152 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 208-86 chr9 108349964 108350270 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 505869 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 255.25-10 chr10 114547880 114548171 + 1.5 NA intron (NM_001352440, intron 4 of 20) intron (NM_001352440, intron 4 of 20) -21112 NM_001322899 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 430.25-2 chr10 60073454 60074069 + 1.5 NA exon (NM_020987, exon 37 of 44) exon (NM_020987, exon 37 of 44) 67255 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 159-27 chr12 46593987 46594232 + 1.5 NA intron (NR_125377, intron 3 of 3) L1MB5|LINE|L1 210002 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 280.5-16 chr16 29880455 29880729 + 1.5 NA intron (NM_001243332, intron 8 of 17) AluSp|SINE|Alu 16758 NR_015396 440356 Hs.448823 NR_015396 ENSG00000214725 CDIPTOSP CDIPT-AS1 CDIP transferase opposite strand, pseudogene ncRNA 226.25-14 chr10 114519193 114519425 + 1.5 NA intron (NM_001352440, intron 6 of 20) intron (NM_001352440, intron 6 of 20) 7604 NM_001322894 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 271.5-35 chr2 35671783 35672064 + 1.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 200518 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 167-21 chr10 75594888 75595020 + 1.5 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 42496 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 183-39 chr16 81356304 81356503 + 1.5 NA intron (NM_022041, intron 3 of 10) intron (NM_022041, intron 3 of 10) -28615 NR_039871 100616150 NR_039871 ENSG00000284473 MIR4720 - microRNA 4720 ncRNA 202.5-96 chr3 167239039 167239347 + 1.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 141090 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 200.25-120 chr9 83126988 83127275 + 1.5 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -63989 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 300.5-6 chr10 7397056 7397297 + 1.5 NA intron (NM_001029880, intron 1 of 20) intron (NM_001029880, intron 1 of 20) 12165 NM_001018039 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 400-3 chr10 66733146 66733577 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -192675 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 395.5-2 chr11 98086777 98087229 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -933946 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 220.5-14 chr11 46961686 46961916 + 1.5 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 25040 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 270.25-22 chr16 60577540 60578005 + 1.5 NA Intergenic LTR7B|LTR|ERV1 -217979 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 372-15 chr7 80506776 80507131 + 1.5 NA intron (NM_001102386, intron 1 of 7) L1MA8|LINE|L1 5111 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 415.5-8 chr7 24699599 24699985 + 1.5 NA intron (NM_004403, intron 9 of 9) intron (NM_004403, intron 9 of 9) 57672 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 307.5-2 chr1 193899066 193899410 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 594493 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 261-33 chr22 35963890 35964124 + 1.5 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu -2377 NM_001349992 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 295.5-63 chr9 9564413 9564737 + 1.5 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -234817 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 321-12 chr17 29319447 29319911 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25531 NM_020772 57532 Hs.462598 NM_020772 ENSG00000108256 NUFIP2 182-FIP|82-FIP|FIP-82|PIG1 nuclear FMR1 interacting protein 2 protein-coding 274.75-51 chr8 115328948 115329446 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 338816 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 419-5 chr3 88179864 88180277 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 30111 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 141.75-146 chr5 144968847 144969064 + 1.5 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 763564 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 409.25-4 chr22 27927392 27928072 + 1.5 NA intron (NR_026963, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 -7120 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 226-27 chr16 74145773 74146030 + 1.5 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 69620 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 436-9 chr8 78971163 78971493 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 133799 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 184.75-19 chr11 111795624 111795822 + 1.5 NA intron (NM_001352420, intron 14 of 15) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -29334 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 158.25-40 chr14 83107125 83107272 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 464566 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 266.5-50 chr3 36357242 36357698 + 1.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -23017 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 413.5-5 chr2 48485978 48486431 + 1.5 NA intron (NR_024188, intron 13 of 21) intron (NR_024188, intron 13 of 21) -43721 NM_001198593 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 249.5-58 chr21 15296776 15297037 + 1.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -231906 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 267.25-8 chr11 39932544 39932854 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 360431 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 226.5-63 chr3 101661815 101662007 + 1.5 NA intron (NM_014415, intron 5 of 10) HAL1|LINE|L1 -14519 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 329.25-23 chr5 87121988 87122350 + 1.5 NA intron (NR_105018, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 2021 NR_105018 101929380 NR_105018 LOC101929380 - uncharacterized LOC101929380 ncRNA 380-20 chr6 80379585 80379882 + 1.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 273062 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 224.5-69 chr20 38008207 38008467 + 1.5 NA intron (NM_001303457, intron 2 of 7) L1ME4b|LINE|L1 25119 NM_014657 9675 Hs.655481 NM_014657 ENSG00000101407 TTI1 KIAA0406|smg-10 TELO2 interacting protein 1 protein-coding 128-43 chr14 60136158 60136257 + 1.5 NA 3' UTR (NM_001330177, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001330177, exon 11 of 11) 29191 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 208.5-145 chr8 122727925 122728187 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -33950 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 331.5-4 chr10 75188142 75188434 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21866 NM_001324090 7417 Hs.355927 NM_003375 ENSG00000165637 VDAC2 POR voltage dependent anion channel 2 protein-coding 249.75 chr1 15452240 15452705 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4260 NM_033440 63036 Hs.631866 NM_033440 ENSG00000142615 CELA2A ELA2A|PE-1 chymotrypsin like elastase 2A protein-coding 192.5-48 chr16 50706313 50706592 + 1.5 NA intron (NR_163434, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 7072 NM_001293557 64127 Hs.592072 NM_022162 ENSG00000167207 NOD2 ACUG|BLAU|BLAUS|CARD15|CD|CLR16.3|IBD1|NLRC2|NOD2B|PSORAS1|YAOS nucleotide binding oligomerization domain containing 2 protein-coding 297-4 chr1 222841769 222842006 + 1.5 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) intron (NM_032890, intron 1 of 9) 26848 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 346.25-13 chr4 91807535 91807872 + 1.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 469599 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 393.5-10 chr4 61347129 61347807 + 1.5 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 145296 NM_001371342 154-43 chr15 35888428 35888569 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -38358 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 196.25-59 chr2 36147129 36147326 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 208343 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 202.75-113 chr9 32492305 32492852 + 1.5 NA intron (NM_014314, intron 3 of 17) intron (NM_014314, intron 3 of 17) 33618 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 265-23 chr20 58751886 58752158 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -21403 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 147-154 chr8 140380244 140380357 + 1.5 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) L1MB7|LINE|L1 77444 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 347-2 chr1 241531877 241532296 + 1.5 NA promoter-TSS (NM_003679) promoter-TSS (NM_003679) -292 NM_003679 8564 Hs.731056 NM_003679 ENSG00000117009 KMO dJ317G22.1 kynurenine 3-monooxygenase protein-coding 184.5-161 chr8 133573931 133574168 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2162 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 270.75-21 chr17 9815280 9815548 + 1.5 NA intron (NM_001310219, intron 1 of 4) intron (NM_001310219, intron 1 of 4) 6657 NM_001310219 644070 NM_001310219 ENSG00000214978 GSG1L2 - GSG1 like 2 protein-coding 192-107 chr9 134804119 134804418 + 1.5 NA intron (NM_001278074, intron 39 of 65) intron (NM_001278074, intron 39 of 65) 45101 NR_039691 100616333 NR_039691 ENSG00000264744 MIR3689C - microRNA 3689c ncRNA 191-36 chr2 71252661 71252923 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -25689 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 203-30 chr12 102988954 102989139 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -30605 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 265.5-4 chr1 118436295 118436526 + 1.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -251182 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 219-47 chr18 68165239 68165519 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -350557 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 218.75-80 chr6 133632638 133632917 + 1.5 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) intron (NR_109982, intron 4 of 8) -188370 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 317.25-31 chr8 106160391 106160640 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100012 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-89 chr5 109166205 109166573 + 1.5 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 159980 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 305.5-53 chr9 108846309 108846535 + 1.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 9564 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 188-61 chr6 50870775 50871000 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 52016 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 262-2 chr1 30927250 30927659 + 1.5 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 8322 NR_033295 692235 NR_033295 SNORD103B U103B small nucleolar RNA, C/D box 103B snoRNA 121.25-40 chr11 116807097 116807212 + 1.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -14734 NM_052968 116519 Hs.283923 NM_052968 ENSG00000110243 APOA5 APOAV|RAP3 apolipoprotein A5 protein-coding 177-7 chr1 218359483 218359689 + 1.5 NA intron (NR_138148, intron 1 of 6) intron (NR_138148, intron 1 of 6) -13908 NR_046268 728463 Hs.568469 NR_046268 ENSG00000232480 TGFB2-AS1 - TGFB2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 186.5-109 chr5 99609644 99609829 + 1.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 75746 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 336-23 chr6 122221829 122222070 + 1.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -177602 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 313 chr10 81886667 81887080 + 1.5 NA intron (NR_163252, intron 1 of 8) intron (NR_163252, intron 1 of 8) 9186 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 201.25-40 chr17 55261142 55261375 + 1.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -3702 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 271.5-81 chr7 130164196 130164503 + 1.5 NA TTS (NM_032842) TTS (NM_032842) 22618 NR_149034 100128325 Hs.105944 NR_149033 ENSG00000229196 LOC100128325 - uncharacterized LOC100128325 ncRNA 345.5-32 chr8 129719798 129720119 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39719 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 247.25-2 chr1 195409539 195409713 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 679089 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 254.5-60 chr5 60899712 60900079 + 1.5 NA intron (NM_001007233, intron 8 of 12) intron (NM_001007233, intron 8 of 12) 45175 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 270.25-38 chr5 30165770 30166007 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 285328 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 259.5-77 chr5 44662075 44662431 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 146540 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 255.5-42 chr2 83463395 83463579 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -59327 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 363-18 chr6 66786597 66786973 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 998906 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 243.5-4 chr1 71587727 71588111 + 1.5 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 249093 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 222.25-27 chr18 562700 562872 + 1.5 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -17594 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 265.75-33 chr2 55879301 55879627 + 1.5 NA intron (NM_001039349, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 44318 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 323-10 chr16 8873342 8873710 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -4514 NM_001278260 23589 Hs.632184 NM_014316 ENSG00000153048 CARHSP1 CRHSP-24|CRHSP24|CSDC1 calcium regulated heat stable protein 1 protein-coding 290.75-32 chr20 51502941 51503256 + 1.5 NA intron (NM_012340, intron 3 of 10) L1ME4b|LINE|L1 39621 NM_012340 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 274.5-47 chr3 197597612 197598084 + 1.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -24525 NM_203315 622 Hs.274539 NM_004051 ENSG00000161267 BDH1 BDH|SDR9C1 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 1 protein-coding 172-47 chr18 65437813 65438055 + 1.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -312318 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 129.25-32 chr11 83330315 83330480 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -43990 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 335.25-12 chr13 108345547 108345816 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 76052 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 297.75-8 chr14 55368480 55368691 + 1.5 NA 3' UTR (NM_014924, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_014924, exon 10 of 10) 43273 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 216.5-103 chr6 126741130 126741346 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 256607 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 166.5-131 chr3 40472688 40472837 + 1.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -4351 NM_001145083 285267 Hs.407159 NM_173656 ENSG00000177873 ZNF619 - zinc finger protein 619 protein-coding 291-5 chr10 78325287 78325577 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 58090 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 299.5-10 chr12 103350592 103351028 + 1.5 NA intron (NM_001099336, intron 4 of 5) L1MDa|LINE|L1 145158 NM_001278420 374470 Hs.534649 NM_198521 ENSG00000179088 C12orf42 - chromosome 12 open reading frame 42 protein-coding 214.5-92 chr4 102072817 102073047 + 1.5 NA intron (NM_017935, intron 15 of 16) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 251380 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 264.5-3 chr1 207321682 207321932 + 1.5 NA exon (NM_001300902, exon 1 of 10) exon (NM_001300902, exon 1 of 10) 129 NM_000574 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 230.25-8 chr1 194088930 194089214 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 784327 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 201-28 chr14 59938239 59938678 + 1.5 NA exon (NM_001355272, exon 7 of 33) exon (NM_001355272, exon 7 of 33) 18745 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 237.5-80 chr5 133178093 133178485 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 126276 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 377.5-3 chr14 41551807 41552237 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -54834 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 126-76 chr17 59092510 59092675 + 1.5 NA intron (NM_001320987, intron 1 of 22) intron (NM_001320987, intron 1 of 22) 14288 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 205.5-120 chr5 158157366 158157804 + 1.5 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 252188 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 187-10 chr10 20379318 20379547 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -172538 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 194.5-61 chr2 4936084 4936344 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -279992 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 371.5-14 chr6 45513961 45514474 + 1.5 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) intron (NM_001015051, intron 7 of 7) 91942 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 186.5-15 chr10 32426059 32426364 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 19845 NR_120660 101929431 Hs.639819 NR_120660 LOC101929431 - uncharacterized LOC101929431 ncRNA 215-80 chr9 22156100 22156415 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -146944 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 183.5-67 chr2 100159618 100159896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -17167 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 344.75-5 chr22 23282032 23282394 + 1.5 NA intron (NM_004327, intron 8 of 22) intron (NM_004327, intron 8 of 22) 19446 NR_033408 26226 Hs.729589 NR_033408 ENSG00000230701 FBXW4P1 FBW3|FBXW3|SHFM3P1 F-box and WD repeat domain containing 4 pseudogene 1 pseudo 226.5-11 chr10 96577856 96578168 + 1.5 NA intron (NM_020123, intron 1 of 14) intron (NM_020123, intron 1 of 14) 9000 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 220.25-72 chr7 122458699 122459124 + 1.5 NA intron (NM_001167940, intron 14 of 29) intron (NM_001167940, intron 14 of 29) -154161 NM_001024613 389549 Hs.553970 NM_001024613 ENSG00000128610 FEZF1 FEZ|HH22|ZNF312B FEZ family zinc finger 1 protein-coding 201.75-71 chr4 189344079 189344284 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -315425 NR_121679 101928971 Hs.519164 NR_121679 ENSG00000250739 LINC01262 TCONS_l2_00021807 long intergenic non-protein coding RNA 1262 ncRNA 186-86 chr7 51144601 51144799 + 1.5 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) L1MB5|LINE|L1 172109 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 268.5-20 chr14 65981536 65981899 + 1.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -504654 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 188.75-14 chr11 38480637 38480826 + 1.5 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 165625 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 159-108 chr8 40409845 40410061 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -66590 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 227.5-4 chr1 192333830 192334096 + 1.5 NA intron (NM_001039152, intron 1 of 4) L1MD2|LINE|L1 16971 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 124.5-44 chr12 14621233 14621339 + 1.5 NA intron (NM_004963, intron 22 of 26) intron (NM_004963, intron 22 of 26) -53403 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 261-38 chr3 147633167 147633487 + 1.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 212000 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 291-19 chr2 119080734 119081270 + 1.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 77749 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 248.25-55 chr5 66754108 66754293 + 1.5 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) L1HS|LINE|L1 -74573 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 206-52 chr3 134424568 134424808 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13139 NR_039951 100616281 NR_039951 ENSG00000284561 MIR4788 - microRNA 4788 ncRNA 247.75-72 chr9 82188736 82189039 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 200115 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 225.5-55 chr2 27985526 27985879 + 1.5 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) intron (NM_199193, intron 4 of 13) -10665 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 153.5-114 chr20 4886410 4886607 + 1.5 NA intron (NM_005116, intron 6 of 16) intron (NM_005116, intron 6 of 16) -62900 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 269-22 chr17 55705488 55705784 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 17228 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 134.5-190 chr6 57225213 57225457 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -3021 NR_103822 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 193.5-32 chr12 45910306 45910463 + 1.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 80190 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 258.5-25 chr16 11904830 11905072 + 1.5 NA intron (NM_001130007, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu 11005 NM_001130006 2935 Hs.528780 NM_002094 ENSG00000103342 GSPT1 551G9.2|ETF3A|GST1|eRF3a G1 to S phase transition 1 protein-coding 278.75-12 chr16 73770532 73770833 + 1.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 383877 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 280.5-12 chr13 112510193 112510547 + 1.5 NA intron (NM_006322, intron 17 of 21) intron (NM_006322, intron 17 of 21) 77783 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 254.5-57 chr4 161969607 161969850 + 1.5 NA intron (NM_001128428, intron 3 of 14) intron (NM_001128428, intron 3 of 14) -53005 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 188-48 chr3 187538756 187538899 + 1.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 91781 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 132.75-30 chr10 98849087 98849213 + 1.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) MIRc|SINE|MIR 75418 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 369.75-15 chr6 3748744 3749223 + 1.5 NA intron (NM_183373, intron 1 of 4) intron (NM_183373, intron 1 of 4) 3029 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 407.75-8 chr9 90504660 90505018 + 1.5 NA intron (NR_034157, intron 4 of 5) intron (NR_034157, intron 4 of 5) -71350 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 183-52 chr2 133779415 133779631 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -211060 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 172.5-49 chr12 34367639 34367765 + 1.5 NA Intergenic GSATII|Satellite|centr 345206 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 159.5-8 chr1 173473492 173473690 + 1.5 NA intron (NR_037845, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 3564 NR_037845 100506023 Hs.731284 NR_037845 LOC100506023 - uncharacterized LOC100506023 ncRNA 375.5-5 chr15 101662092 101662647 + 1.5 NA intron (NM_152334, intron 15 of 18) intron (NM_152334, intron 15 of 18) -9978 NM_001308026 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 269-50 chr9 24851699 24851981 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -305943 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 152.25-151 chr8 25347513 25347643 + 1.5 NA intron (NM_024940, intron 26 of 51) intron (NM_024940, intron 26 of 51) 2176 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 219.75-85 chr8 78825414 78825701 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11972 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 273.75-44 chr8 121303907 121304141 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -335322 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 227.5-94 chr7 37112586 37112831 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) intron (NM_001206480, intron 14 of 21) 114912 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 227-43 chr3 95303663 95303945 + 1.5 NA Intergenic (TCTTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 365541 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 255.5-83 chr8 38353316 38353550 + 1.5 NA intron (NM_023034, intron 1 of 23) intron (NM_023034, intron 1 of 23) 28838 NM_023034 54904 Hs.434966 NM_017778 ENSG00000147548 NSD3 KMT3F|KMT3G|WHISTLE|WHSC1L1|pp14328 nuclear receptor binding SET domain protein 3 protein-coding 305-15 chr18 37432571 37432890 + 1.5 NA intron (NM_001353724, intron 2 of 12) intron (NM_001353724, intron 2 of 12) 33774 NR_132967 106635546 NR_132967 SNORA111 - small nucleolar RNA, H/ACA box 111 snoRNA 220-17 chr14 25579038 25579342 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -528893 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 411.75-8 chr8 89232809 89233237 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 524688 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 377.25-13 chr4 108381807 108382367 + 1.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -175146 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 262-62 chr8 139381651 139381882 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 321357 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 428.75-2 chr11 77353281 77353929 + 1.5 NA intron (NM_001128620, intron 7 of 15) intron (NM_001128620, intron 7 of 15) -51939 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 303-31 chr8 27961550 27961999 + 1.5 NA intron (NM_173833, intron 3 of 8) intron (NM_173833, intron 3 of 8) 30899 NM_173833 286133 Hs.591833 NM_173833 ENSG00000168079 SCARA5 NET33|Tesr scavenger receptor class A member 5 protein-coding 228.25-19 chr12 127385089 127385493 + 1.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -45219 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 180.5-68 chr2 13057237 13057382 + 1.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -50296 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 497.75-2 chr7 21164142 21164806 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -263609 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 393.5-12 chr5 50815435 50815875 + 1.5 NA intron (NM_001178056, intron 15 of 24) intron (NM_001178056, intron 15 of 24) 148241 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 236-55 chr5 79315344 79315799 + 1.5 NA intron (NM_152405, intron 9 of 10) intron (NM_152405, intron 9 of 10) 79440 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 157.5-52 chr14 36134325 36134474 + 1.5 NA intron (NR_073454, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 42252 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 221-41 chr2 210090851 210091042 + 1.5 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) intron (NM_001307976, intron 5 of 13) 61024 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 270-6 chr10 132767323 132767554 + 1.5 NA intron (NM_005539, intron 12 of 15) intron (NM_005539, intron 12 of 15) 18709 NM_177400 84504 Hs.134013 NM_177400 ENSG00000148826 NKX6-2 GTX|NKX6.2|NKX6B|SPAX8 NK6 homeobox 2 protein-coding 264.75-39 chr4 160182390 160182683 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -404752 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 225.25-9 chr10 103469668 103469896 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 9458 NM_001129742 119395 Hs.364624 NM_182494 ENSG00000183128 CALHM3 FAM26A|bA225H22.7 calcium homeostasis modulator 3 protein-coding 303-11 chr15 40023370 40023731 + 1.5 NA intron (NM_001013703, intron 32 of 38) L1M5|LINE|L1 15631 NM_003134 6727 Hs.533732 NM_003134 ENSG00000140319 SRP14 ALURBP signal recognition particle 14 protein-coding 284.75-37 chr7 7765998 7766407 + 1.5 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -47595 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 172.5-28 chr10 48615791 48615939 + 1.5 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) L1M4|LINE|L1 -10734 NM_001347737 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 204.5-34 chr14 47499904 47500176 + 1.5 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -156794 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 160-40 chr15 97056514 97056758 + 1.5 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 273201 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 302-29 chr7 33120704 33120985 + 1.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -8441 NR_145411 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 391 chr1 40570049 40570433 + 1.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 38604 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 165-19 chr10 104605270 104605481 + 1.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -35915 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 362.25-2 chr13 105205887 105206269 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -259789 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 371-12 chr2 44493334 44493712 + 1.5 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 131576 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 175.25-53 chr15 97071095 97071320 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 287772 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 347.25-20 chr5 146212456 146212902 + 1.5 NA intron (NM_018989, intron 1 of 20) intron (NM_018989, intron 1 of 20) 9074 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 223.5-95 chr5 26005617 26005827 + 1.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 814769 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 260.75-14 chr14 54116883 54117073 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -160087 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 218.5-44 chr16 58181794 58182152 + 1.5 NA intron (NM_001896, intron 4 of 11) HAL1|LINE|L1 16133 NM_001896 1459 Hs.82201 NM_001896 ENSG00000070770 CSNK2A2 CK2A2|CK2alpha'|CSNK2A1 casein kinase 2 alpha 2 protein-coding 243.5-87 chr8 125846664 125846895 + 1.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 104418 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 207.5-94 chr6 18979323 18979680 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 200979 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 162.25-63 chr16 47867105 47867339 + 1.5 NA intron (NR_110650, intron 2 of 5) intron (NR_110650, intron 2 of 5) 8641 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 300-25 chr20 36829155 36829407 + 1.5 NA intron (NM_199181, intron 2 of 14) intron (NM_199181, intron 2 of 14) 30592 NM_199181 140710 Hs.460807 NM_080627 ENSG00000149639 SOGA1 C20orf117|KIAA0889|SOGA suppressor of glucose, autophagy associated 1 protein-coding 335.5-2 chr10 92929856 92930113 + 1.5 NA intron (NM_001319200, intron 8 of 17) L1MEd|LINE|L1 81464 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 234.25-34 chr2 103812561 103812734 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 595685 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 376.75-15 chr4 113997991 113998481 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -18589 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 144.25-19 chr10 9084129 9084270 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 186210 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 321.5-34 chr8 84632404 84632715 + 1.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -73368 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 160.75-92 chr21 10656937 10657133 + 1.5 NA Intergenic (TCCATTCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 135521 NM_199259 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 214-62 chr7 94546240 94546472 + 1.5 NA intron (NM_001363428, intron 12 of 17) intron (NM_001363428, intron 12 of 17) 36547 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 147.75-25 chr11 115513862 115514023 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9527 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 123.5-193 chr6 155672108 155672224 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 157322 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 361.5-16 chr5 81888676 81889070 + 1.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -83150 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 240.5-24 chr14 52067099 52067276 + 1.5 NA intron (NM_007361, intron 2 of 21) L1ME4a|LINE|L1 1872 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 372.25-2 chr1 154222247 154222643 + 1.5 NA intron (NM_001287816, intron 1 of 26) intron (NM_001287816, intron 1 of 26) 1490 NM_014847 9898 Hs.490551 NM_014847 ENSG00000143569 UBAP2L NICE-4|NICE4 ubiquitin associated protein 2 like protein-coding 218.75-2 chr1 71746408 71746614 + 1.5 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) intron (NM_173808, intron 3 of 6) 90501 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 246.25 chr1 90749557 90749816 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -32384 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 337.5-11 chr14 43527291 43527585 + 1.5 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 979845 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 212.5-11 chr10 67429173 67429352 + 1.5 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -25852 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 151.25-152 chr5 62319315 62319454 + 1.5 NA intron (NM_001243952, intron 2 of 20) intron (NM_001243952, intron 2 of 20) 13222 NM_001098511 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 230.5-5 chr1 70607518 70607744 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -98822 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 320.5-45 chr8 136217194 136217690 + 1.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -313356 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 288-47 chr9 73683997 73684229 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 532248 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 230-57 chr6 149699585 149699975 + 1.5 NA intron (NM_001350340, intron 2 of 8) intron (NM_001350340, intron 2 of 8) 16645 NR_073033 9113 Hs.549084 NM_004690 ENSG00000131023 LATS1 WARTS|wts large tumor suppressor kinase 1 protein-coding 338.25-8 chr11 101781475 101781752 + 1.5 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -133397 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 167.25-65 chr17 62639356 62639628 + 1.5 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) L1M5|LINE|L1 11822 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 204.75-64 chr2 102182883 102183062 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -4001 NM_001351448 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 128-166 chr8 90152020 90152154 + 1.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -69208 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 321.5-31 chr7 37042806 37043048 + 1.5 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) L2a|LINE|L2 45131 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 188.25-82 chr4 61686607 61687059 + 1.5 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) L1MA6|LINE|L1 474932 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 154-121 chr7 1379941 1380086 + 1.5 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 79457 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 210.5-17 chr10 82390697 82391019 + 1.5 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -157938 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 352.75-2 chr10 44870369 44870658 + 1.5 NA intron (NR_033842, intron 2 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -40803 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 304-19 chr16 84322317 84322629 + 1.5 NA intron (NM_001282467, intron 4 of 6) L1MC4|LINE|L1 27595 NM_001282467 58189 Hs.36688 NM_021197 ENSG00000103175 WFDC1 PS20 WAP four-disulfide core domain 1 protein-coding 276-17 chr12 32462381 32462627 + 1.5 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) (TGTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23468 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 298-25 chr5 42098000 42098468 + 1.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 77111 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 203-33 chr14 57852919 57853415 + 1.5 NA intron (NM_001352012, intron 1 of 8) intron (NM_001352012, intron 1 of 8) 11832 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 247.5-63 chr5 9327296 9327592 + 1.5 NA intron (NM_003966, intron 4 of 22) intron (NM_003966, intron 4 of 22) -183889 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 332-25 chr8 32784466 32784744 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 62770 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 273.5-6 chr1 228508932 228509251 + 1.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 3197 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 183-12 chr11 40328997 40329232 + 1.5 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -35984 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 167.5-76 chr17 75537319 75537507 + 1.5 NA intron (NM_001015002, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 11711 NM_001015002 3993 Hs.514477 NM_004524 ENSG00000073350 LLGL2 HGL|Hugl-2|LGL2 LLGL scribble cell polarity complex component 2 protein-coding 351-22 chr6 19156777 19157304 + 1.5 NA intron (NR_110860, intron 3 of 10) MER21C|LTR|ERVL 23440 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 260.75-26 chr2 35596754 35596952 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 125448 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 227-28 chr18 13736778 13737029 + 1.5 NA intron (NM_003799, intron 4 of 11) intron (NM_003799, intron 4 of 11) 10230 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 288-5 chr1 179366249 179366508 + 1.5 NA intron (NR_073544, intron 1 of 25) intron (NR_073544, intron 1 of 25) 334 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 168.5-180 chr8 78998423 78998593 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 160979 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 181.5-129 chr5 8090363 8090554 + 1.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 221310 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 258.25-45 chr5 78056938 78057162 + 1.5 NA intron (NM_003664, intron 22 of 26) intron (NM_003664, intron 22 of 26) 98803 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 182.75-135 chr8 113376167 113376344 + 1.5 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 897 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 222-21 chr12 76569496 76569663 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9808 NM_001319652 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 161-87 chr5 6932155 6932350 + 1.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -104331 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 369.75-17 chr7 48987640 48988028 + 1.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 63287 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 184-52 chr3 16037590 16037891 + 1.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -136940 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 369.5-18 chr2 86022110 86022530 + 1.5 NA 3' UTR (NM_015425, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_015425, exon 34 of 34) 83566 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 273.5-4 chr1 157240175 157240364 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -101678 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 246.75-10 chr11 31254959 31255160 + 1.5 NA intron (NM_001367979, intron 8 of 38) L1MB5|LINE|L1 114680 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 214.5-88 chr4 54473272 54473472 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 133759 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 287-14 chr14 60710134 60710447 + 1.5 NA 3' UTR (NM_017420, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_017420, exon 3 of 3) 14061 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 201-22 chr12 15458221 15458374 + 1.5 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1MB1|LINE|L1 -88314 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 291-27 chr4 47869490 47869768 + 1.5 NA intron (NR_103795, intron 19 of 23) intron (NR_103795, intron 19 of 23) -31523 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 329.5-15 chr3 69446739 69447207 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -60885 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 238.5-76 chr5 160295899 160296060 + 1.5 NA intron (NR_131769, intron 2 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 16585 NM_024565 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 175-65 chr2 47081195 47081370 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 74026 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 137.5-42 chr11 74499622 74499761 + 1.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -5967 NM_001144869 387787 Hs.591971 NM_001144869 ENSG00000175536 LIPT2 - lipoyl(octanoyl) transferase 2 protein-coding 430.25-5 chr17 61369564 61370123 + 1.5 NA intron (NM_001099432, intron 24 of 24) intron (NM_001099432, intron 24 of 24) -2139 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 234.75-61 chr5 5901305 5901472 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 435904 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 217-49 chr22 38236796 38237020 + 1.5 NA intron (NM_001195071, intron 3 of 8) intron (NM_001195071, intron 3 of 8) -12188 NR_132774 106635525 NR_132774 SNORA92 - small nucleolar RNA, H/ACA box 92 snoRNA 375.75-16 chr6 119090095 119090551 + 1.5 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) LTR16E1|LTR|ERVL -11659 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 420.25-7 chr4 57738011 57738496 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 312381 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 249.75-21 chr14 94764953 94765275 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 5048 NM_173849 145258 Hs.440438 NM_173849 ENSG00000133937 GSC SAMS goosecoid homeobox protein-coding 252-69 chr8 15816640 15816874 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 276494 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 302-12 chr15 99108347 99108836 + 1.5 NA intron (NM_145728, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 3511 NM_145728 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 294-17 chr2 41395150 41395410 + 1.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -482275 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 226-6 chr10 117362670 117362862 + 1.5 NA intron (NM_173791, intron 1 of 4) intron (NM_173791, intron 1 of 4) 12674 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 274.5-23 chr14 73881877 73882246 + 1.5 NA intron (NM_001371328, intron 7 of 8) AluSz|SINE|Alu -4798 NM_001242924 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 205.5-71 chr2 80600078 80600331 + 1.5 NA intron (NM_001282599, intron 9 of 11) L1ME3G|LINE|L1 286825 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 249-22 chr2 114387744 114388052 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -54743 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 214.5-82 chr3 180681614 180681879 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2257 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 186.75-2 chr1 78646039 78646232 + 1.5 NA TTS (NM_006820) TTS (NM_006820) -3654 NR_135641 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 168.75-87 chr22 25454189 25454402 + 1.5 NA intron (NR_033733, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 -1351 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 180-112 chr7 45640592 45640730 + 1.5 NA intron (NM_001281768, intron 5 of 9) LTR39|LTR|ERV1 66293 NM_021116 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 147-153 chr8 136490574 136490700 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -40161 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 169.5-22 chr10 124399971 124400125 + 1.5 NA intron (NM_001322969, intron 10 of 10) intron (NM_001322969, intron 10 of 10) 18875 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 150-45 chr14 81766285 81766481 + 1.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -23245 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 214.25-81 chr8 65157192 65157406 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 23041 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 214.5-33 chr14 66658218 66658394 + 1.5 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 150899 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 172-18 chr11 22372855 22373029 + 1.5 NA intron (NM_020346, intron 8 of 11) intron (NM_020346, intron 8 of 11) 34561 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 176.25-44 chr15 59581631 59581841 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -30047 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 402.5-6 chr20 53911574 53912079 + 1.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36117 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 218.5-88 chr4 104060186 104060403 + 1.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -340309 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 229-40 chr2 189273955 189274167 + 1.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -94300 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 287-22 chr2 62054731 62055093 + 1.5 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) Charlie3|DNA|hAT-Charlie -141203 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 291.75-24 chr2 142838117 142838400 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -39406 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 174-60 chr3 32915759 32915932 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -35799 NM_005508 1233 Hs.184926 NM_005508 ENSG00000183813 CCR4 CC-CKR-4|CD194|CKR4|CMKBR4|ChemR13|HGCN:14099|K5-5 C-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 251.25-60 chr8 118811308 118811515 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 140474 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 166.5-16 chr1 199931953 199932154 + 1.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -95657 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 385.5-9 chr16 87469790 87470120 + 1.5 NA intron (NM_015144, intron 1 of 12) SVA_B|Retroposon|SVA 21899 NM_015144 23174 Hs.156231 NM_015144 ENSG00000140948 ZCCHC14 BDG-29|BDG29 zinc finger CCHC-type containing 14 protein-coding 202.25-56 chr4 70784995 70785157 + 1.5 NA intron (NM_001130709, intron 10 of 11) intron (NM_001130709, intron 10 of 11) 50666 NM_001291993 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 228.75-87 chr8 111500140 111500361 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 123611 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 239-44 chr5 52045371 52045613 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 37461 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 321-19 chr3 131962419 131962833 + 1.5 NA intron (NM_001289112, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 23305 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 338.75-11 chr2 105118174 105118522 + 1.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -15404 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 400.5-6 chr2 114134187 114134578 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -154398 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 357-2 chr1 106914510 106914814 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 96423 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 215.5-13 chr10 65471156 65471467 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -100114 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 251.25-50 chr7 22577131 22577376 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 13916 NR_038393 100506178 Hs.668122 NR_038393 ENSG00000232759 LOC100506178 - uncharacterized LOC100506178 ncRNA 349.5-15 chr3 105478629 105478988 + 1.5 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 111899 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 130-117 chr4 56680469 56680668 + 1.5 NA intron (NM_032495, intron 1 of 3) intron (NM_032495, intron 1 of 3) 728 NM_032495 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 211-59 chr6 64372278 64372568 + 1.5 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) L1PA15|LINE|L1 565587 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 169.5-61 chr16 79201385 79201589 + 1.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 399250 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 152.5-178 chr7 31769369 31769485 + 1.5 NA intron (NM_001191059, intron 18 of 18) L1MEi|LINE|L1 82212 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 219.75-15 chr11 6471006 6471375 + 1.5 NA intron (NM_001248006, intron 1 of 11) intron (NM_001248006, intron 1 of 11) 2751 NM_033278 10612 Hs.591992 NM_006458 ENSG00000110171 TRIM3 BERP|HAC1|RNF22|RNF97 tripartite motif containing 3 protein-coding 135-165 chr7 40707791 40707901 + 1.5 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 272093 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 201.25-80 chr6 41676176 41676482 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 37861 NM_001300806 4188 Hs.520119 NM_005586 ENSG00000112559 MDFI I-MF|I-mfa MyoD family inhibitor protein-coding 172.5-181 chr7 26187212 26187406 + 1.5 NA TTS (NM_004289) TTS (NM_004289) 13437 NM_031243 3181 Hs.487774 NM_002137 ENSG00000122566 HNRNPA2B1 HNRNPA2|HNRNPB1|HNRPA2|HNRPA2B1|HNRPB1|IBMPFD2|RNPA2|SNRPB1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 protein-coding 241.25-26 chr18 3101153 3101439 + 1.5 NA intron (NM_019856, intron 22 of 36) intron (NM_019856, intron 22 of 36) -89349 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 246-2 chr1 24587259 24587472 + 1.5 NA intron (NM_001010980, intron 1 of 3) intron (NM_001010980, intron 1 of 3) 31278 NM_001010980 400746 Hs.200253 NM_001010980 ENSG00000184454 NCMAP C1orf130|MP11 non-compact myelin associated protein protein-coding 304-12 chr12 44591430 44591815 + 1.5 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) L1MA5|LINE|L1 284039 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 151.75-95 chr3 149547495 149547770 + 1.5 NA intron (NM_001348362, intron 6 of 9) intron (NM_001348362, intron 6 of 9) 72935 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 227-26 chr16 1405842 1406043 + 1.5 NA intron (NR_160278, intron 2 of 15) intron (NR_160278, intron 2 of 15) 8762 NM_001193388 64718 Hs.643536 NM_001037125 ENSG00000059145 UNKL C16orf28|ZC3H5L|ZC3HDC5L unk like zinc finger protein-coding 138.75-9 chr1 152118301 152118488 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -2940 NM_007113 7062 Hs.432416 NM_007113 ENSG00000159450 TCHH THH|THL|TRHY|UHS3 trichohyalin protein-coding 294.75-38 chr7 101315357 101315577 + 1.5 NA intron (NM_022777, intron 4 of 4) intron (NM_022777, intron 4 of 4) 6345 NM_001130822 64792 Hs.389104 NM_022777 ENSG00000128581 IFT22 RABL5 intraflagellar transport 22 protein-coding 318-39 chr8 86185440 86185717 + 1.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 44803 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 240.25-62 chr7 47509134 47509380 + 1.5 NA intron (NM_022748, intron 2 of 30) intron (NM_022748, intron 2 of 30) -44454 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 436.25-5 chr4 36901890 36902543 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -99563 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 240.5-18 chr12 13352210 13352498 + 1.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 24391 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 482.25-2 chr15 59063748 59064225 + 1.5 NA intron (NM_001270529, intron 5 of 13) intron (NM_001270529, intron 5 of 13) -41160 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 179.25-7 chr1 152090574 152090800 + 1.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1623 NM_001008536 126637 Hs.546477 NM_001008536 ENSG00000182898 TCHHL1 S100A17|THHL1 trichohyalin like 1 protein-coding 435-11 chr8 136282257 136282737 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -248301 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 265.5-19 chr14 44973056 44973353 + 1.5 NA intron (NR_131765, intron 1 of 19) L1MC1|LINE|L1 11014 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 281.5-44 chr5 122916412 122916738 + 1.5 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) LTR90A|LTR|LTR 70962 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 130.5-53 chr10 111604591 111604756 + 1.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 490382 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 228.5-54 chr2 48079261 48079429 + 1.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -173552 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 297.75-24 chr3 4000557 4000881 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -199844 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 388.5 chr1 92401407 92401813 + 1.5 NA 3' UTR (NM_024813, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_024813, exon 13 of 13) 82344 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 283.5-53 chr7 25965953 25966302 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16141 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 330-14 chr2 187418413 187418822 + 1.5 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) intron (NM_005795, intron 1 of 14) 29635 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 230.5-99 chr5 123874977 123875164 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 329653 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 469.25 chr11 36853522 36853937 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -255450 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 269.5-14 chr14 73416131 73416329 + 1.5 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 42350 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 325.5-29 chr5 10400727 10401032 + 1.5 NA intron (NM_001270660, intron 10 of 24) intron (NM_001270660, intron 10 of 24) -1485 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 159.25-86 chr3 87566946 87567106 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -225680 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 192.75-97 chr4 32487544 32487732 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 136600 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 182.5-94 chr21 43671047 43671196 + 1.5 NA intron (NM_015056, intron 2 of 15) intron (NM_015056, intron 2 of 15) 11561 NM_015056 23076 Hs.565725 NM_015056 ENSG00000160208 RRP1B KIAA0179|NNP1L|Nnp1|PPP1R136|RRP1 ribosomal RNA processing 1B protein-coding 227.5-66 chr22 35970060 35970231 + 1.5 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) -8515 NM_001349992 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 423.75-8 chr3 88274411 88274710 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -63896 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 166-37 chr15 39816109 39816356 + 1.5 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) L1MA8|LINE|L1 13044 NM_001271855 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 205.5-30 chr12 68403404 68403612 + 1.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 47976 NR_120458 100507195 Hs.450772 NR_120458 ENSG00000251301 LINC02384 - long intergenic non-protein coding RNA 2384 ncRNA 240-48 chr5 23895277 23895615 + 1.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -55902 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 137.25-32 chr12 30391812 30391917 + 1.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 285380 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 232-47 chr21 14341547 14341745 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 41500 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 266.25-37 chr5 82619559 82619838 + 1.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -220457 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 177.5-153 chr6 54511321 54511507 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 202973 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 176.5-52 chr14 43662575 43662816 + 1.5 NA Intergenic Intergenic 844588 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 237.5-90 chr6 123489579 123489813 + 1.5 NA intron (NM_001256020, intron 8 of 8) Looper|DNA|PiggyBac 50092 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 180-30 chr14 35421034 35421224 + 1.5 NA Intergenic Intergenic -16375 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 250.5-69 chr4 155702171 155702427 + 1.5 NA intron (NM_001130685, intron 3 of 9) intron (NM_001130685, intron 3 of 9) 34637 NM_001130684 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 260.75-15 chr14 58367428 58367674 + 1.5 NA intron (NM_002892, intron 23 of 23) L2c|LINE|L2 -28379 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 206.25-56 chr20 34820217 34820419 + 1.5 NA 5' UTR (NM_001318240, exon 1 of 16) 5' UTR (NM_001318240, exon 1 of 16) 1321 NM_001318240 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 346.75 chr1 26537155 26537585 + 1.5 NA intron (NM_002953, intron 2 of 21) intron (NM_002953, intron 2 of 21) -5742 NM_001330441 6195 Hs.149957 NM_002953 ENSG00000117676 RPS6KA1 HU-1|MAPKAPK1A|RSK|RSK1|p90Rsk ribosomal protein S6 kinase A1 protein-coding 213.5-17 chr10 31045594 31045871 + 1.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13795 NM_001143767 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 263-29 chr21 26864083 26864477 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18871 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 180.5-6 chr1 222863474 222863670 + 1.25 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) L1MC4a|LINE|L1 48533 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 165-117 chr5 144510258 144510447 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 304961 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 239.75-6 chr10 31912567 31912817 + 1.25 NA intron (NM_001270696, intron 1 of 17) intron (NM_001270696, intron 1 of 17) -3766 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 317.25-4 chr1 193971449 193971897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 666928 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 233.25-24 chr14 48330214 48330724 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -535455 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 276.75-10 chr14 62440692 62441059 + 1.25 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -300902 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 203.5-46 chr15 98498279 98498472 + 1.25 NA intron (NM_182562, intron 2 of 6) L1MA5|LINE|L1 15961 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 167.25-98 chr21 39211887 39212123 + 1.25 NA intron (NM_018963, intron 34 of 41) intron (NM_018963, intron 34 of 41) -28491 NM_001320795 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 149.25-141 chr5 32564234 32564418 + 1.25 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -21231 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 238.5-45 chr2 166216139 166216333 + 1.25 NA intron (NM_001365536, intron 24 of 26) L1MA8|LINE|L1 -67075 NM_001353950 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 441.75-2 chr6 63872570 63873070 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) LTR41C|LTR|ERVL 65984 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 212.25-5 chr1 168772037 168772295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14775 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 173.75-91 chr2 145581814 145581982 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 913931 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 226-56 chr5 138289774 138290027 + 1.25 NA intron (NM_001364027, intron 8 of 12) L1MC5|LINE|L1 -15279 NM_001496 2676 Hs.58042 NM_001496 ENSG00000146013 GFRA3 GDNFR3 GDNF family receptor alpha 3 protein-coding 136.25-130 chr4 76603975 76604098 + 1.25 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 28485 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 153-148 chr8 72661916 72662086 + 1.25 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -70044 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 214-17 chr12 80441196 80441403 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2936 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 383-3 chr12 12407414 12407990 + 1.25 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 AluJb|SINE|Alu 50624 NM_058169 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 297.25-28 chr9 82365919 82366227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 377301 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 387.75-3 chr10 55843010 55843557 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -215341 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 190.25-70 chr2 183809093 183809355 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -569751 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 360.75-11 chr5 8790791 8791105 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -48784 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 156.5-141 chr4 168100212 168100418 + 1.25 NA intron (NM_007193, intron 1 of 11) intron (NM_007193, intron 1 of 11) 7778 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 379.5-17 chr5 122795492 122795994 + 1.25 NA intron (NM_003100, intron 2 of 14) intron (NM_003100, intron 2 of 14) 20663 NM_003100 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 167.25-92 chr2 173813831 173814014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149958 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 148-98 chr5 29730172 29730465 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -150242 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 279-45 chr7 68144977 68145258 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 124864 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 180.75-77 chr20 4065852 4066103 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50419 NM_001321749 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 188.5-115 chr4 89952060 89952329 + 1.25 NA intron (NM_001371403, intron 8 of 8) intron (NM_001371403, intron 8 of 8) 57340 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 253.25-16 chr11 130282390 130282709 + 1.25 NA intron (NR_163265, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 32163 NM_014155 29068 Hs.721470 NM_014155 ENSG00000196323 ZBTB44 BTBD15|HSPC063|ZNF851 zinc finger and BTB domain containing 44 protein-coding 184-60 chr4 45185697 45185852 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -459140 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 188-66 chr7 13787731 13787919 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 198689 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 283.75-2 chr1 176546410 176546658 + 1.25 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) intron (NM_021936, intron 1 of 4) 83359 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 369.75-9 chr17 12604002 12604503 + 1.25 NA intron (NR_034145, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 54284 NR_034145 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 168-138 chrX 94774742 94774969 + 1.25 NA Intergenic Ricksha|DNA|MULE-MuDR 288371 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 294.75-28 chr3 176229464 176229864 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -14887 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 172.75-135 chr8 125161850 125162171 + 1.25 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) intron (NR_146191, intron 5 of 8) 70150 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 155.25-15 chr1 180394746 180394995 + 1.25 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) intron (NM_032360, intron 6 of 7) 43520 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 264-53 chr5 116513446 116513770 + 1.25 NA intron (NM_001300780, intron 1 of 19) intron (NM_001300780, intron 1 of 19) -60810 NR_147170 105379132 NR_147170 SEMA6A-AS2 - SEMA6A antisense RNA 2 ncRNA 163.5-18 chr10 31939269 31939514 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10515 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 133.75-30 chr11 40791741 40791959 + 1.25 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -498720 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 221.75-61 chr5 111630821 111631001 + 1.25 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -118314 NM_001308057 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 202-71 chr8 51019416 51019628 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 789923 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 167.25-89 chr2 143485891 143486079 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 356566 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 322.25-2 chr10 113346215 113346539 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204454 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 361.75-6 chr13 95328372 95328850 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27160 NM_001301829 10257 Hs.508423 NM_005845 ENSG00000125257 ABCC4 MOAT-B|MOATB|MRP4 ATP binding cassette subfamily C member 4 protein-coding 194.25-52 chr2 25875062 25875289 + 1.25 NA intron (NM_018263, intron 1 of 11) intron (NM_018263, intron 1 of 11) 3312 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 248.25-3 chr1 94640696 94641044 + 1.25 NA intron (NR_160780, intron 3 of 5) intron (NR_160780, intron 3 of 5) 97168 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 208-41 chr2 122337973 122338204 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 582437 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 228.25-25 chr14 46245119 46245434 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 181117 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 248-72 chr7 97413891 97414152 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 297428 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 593.25-2 chr8 86312395 86313118 + 1.25 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -29791 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 146.25-13 chr10 66627127 66627306 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -298820 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 214.75-81 chr8 24880578 24880820 + 1.25 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -33062 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 181.25-18 chr11 69458996 69459311 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -26408 NR_120545 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 321-4 chr10 24831429 24831878 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -107766 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 183.5-80 chr2 223933113 223933298 + 1.25 NA intron (NM_020830, intron 1 of 11) intron (NM_020830, intron 1 of 11) 12130 NM_020830 57590 Hs.368359 NM_020830 ENSG00000085449 WDFY1 FENS-1|FENS1|WDF1|ZFYVE17 WD repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 287.75-18 chr14 85793396 85793842 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141059 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 318.5-31 chr4 34136315 34136781 + 1.25 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 -96655 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 309.75-15 chr17 60747479 60747980 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) intron (NM_001330413, intron 6 of 25) 69878 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 211-10 chr10 120590282 120590485 + 1.25 NA TTS (NM_001318169) TTS (NM_001318169) -7566 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 184-59 chr4 31877208 31877401 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120075 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 238-27 chr2 161497917 161498221 + 1.25 NA TTS (NR_077058) TTS (NR_077058) 9833 NR_077058 285116 Hs.470435 NR_077058 AHCTF1P1 AHCTF1P|ELYS-like AT-hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 pseudo 285.25-8 chr14 81561791 81562151 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28110 NM_001244984 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 170.5-7 chr1 61849044 61849204 + 1.25 NA intron (NM_001350145, intron 17 of 43) intron (NM_001350145, intron 17 of 43) 3049 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 285.25-39 chr8 113503030 113503355 + 1.25 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 -66253 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 384.5-2 chr10 75267778 75268303 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28343 NR_038224 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 159.5-79 chr17 60411557 60411719 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -10851 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 142.25-106 chr3 38491024 38491176 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001106, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001106, exon 11 of 11) -5172 NM_001145464 9941 Hs.517897 NM_005107 ENSG00000157036 EXOG ENDOGL1|ENDOGL2|ENGL|ENGL-a|ENGL-b|ENGLA|ENGLB exo/endonuclease G protein-coding 193-4 chr1 45455341 45455693 + 1.25 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) LTR26D|LTR|ERV1 35646 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 154.25-20 chr10 109359279 109359483 + 1.25 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 563865 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 237.25-41 chr19 56754992 56755262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10195 NR_110744 101929059 Hs.607132 NR_110744 ENSG00000286125 ZIM2-AS1 ZIM2as ZIM2 antisense RNA 1 ncRNA 296-46 chrX 69311077 69311467 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 131715 NR_103715 100996279 NR_103715 ENSG00000215162 LINC00269 CXorf62|NCRNA00269 long intergenic non-protein coding RNA 269 ncRNA 183.5-27 chr11 27694886 27695195 + 1.25 NA intron (NR_033312, intron 8 of 8) intron (NR_033312, intron 8 of 8) 4627 NM_170734 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 121.25-38 chr11 112648906 112649172 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93237 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 262.25-45 chr7 52229796 52230120 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -805675 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 178.5-107 chr3 63792554 63792717 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26664 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 286.75-35 chr5 30561895 30562322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -631578 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 210-96 chr8 77617699 77618012 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 167158 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 287.75-35 chr3 5304985 5305371 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -54923 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 211-39 chr22 28251397 28251617 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MIR1_Amn|SINE|MIR -208362 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 199.75-11 chr10 117020680 117020866 + 1.25 NA intron (NM_001258300, intron 2 of 17) L1ME2z|LINE|L1 -15196 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 248-49 chr3 144527080 144527339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 554128 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 499.5-2 chr20 45396596 45397095 + 1.25 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu -9148 NM_001197139 55861 Hs.730643 NM_018478 ENSG00000244274 DBNDD2 C20orf35|CK1BP|HSMNP1 dysbindin domain containing 2 protein-coding 207.5-75 chr4 48570290 48570582 + 1.25 NA intron (NM_015030, intron 27 of 63) intron (NM_015030, intron 27 of 63) 80184 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 233.25-8 chr10 65141412 65141664 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -217020 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 167.75-92 chr3 150441100 150441313 + 1.25 NA intron (NR_130136, intron 3 of 4) intron (NR_130136, intron 3 of 4) 32908 NR_130136 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 274-34 chr5 156391851 156392272 + 1.25 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) intron (NM_001128209, intron 2 of 7) 64897 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 373-7 chr2 144587491 144587961 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63282 NR_136320 105373656 Hs.734683 NR_136320 LOC105373656 - uncharacterized LOC105373656 ncRNA 325.75-20 chr3 189134654 189135156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37066 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 323.75-24 chr7 99162693 99163057 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18767 NM_001199847 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 312-31 chr8 121032609 121033021 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -220769 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 283.5-25 chr2 124244325 124244758 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 219254 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 245.75-59 chr8 48446165 48446442 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105264 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 256.75-48 chr9 105988588 105988905 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 294205 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 490-3 chr8 131884157 131884868 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19581 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 232.5-92 chr6 69018630 69018919 + 1.25 NA intron (NM_001704, intron 13 of 31) intron (NM_001704, intron 13 of 31) 383492 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 186-34 chr17 33688864 33689120 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -155232 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 255.75-9 chr11 26243059 26243464 + 1.25 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 44746 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 362.25 chr13 99020333 99020955 + 1.25 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) intron (NM_015296, intron 1 of 55) -4859 NM_001366676 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 142.75-142 chr4 59374338 59374511 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 360851 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 253.25-8 chr10 75391771 75392207 + 1.25 NA intron (NR_120651, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -9539 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 213.25-6 chr1 192264060 192264548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52688 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 232.25-62 chr5 56421029 56421318 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60596 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 128.75-210 chr9 30453375 30453549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45008 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 173.75-138 chr6 150229283 150229532 + 1.25 NA intron (NM_030949, intron 3 of 3) intron (NM_030949, intron 3 of 3) 86363 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 283.25-41 chr9 28468818 28469132 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) L1M4c|LINE|L1 250330 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 116.5-40 chr11 128999782 128999907 + 1.25 NA intron (NM_001142685, intron 10 of 21) intron (NM_001142685, intron 10 of 21) 24344 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 223-81 chr8 115345550 115345757 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 322360 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 173.75-50 chr13 60337824 60338033 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58529 NM_001146071 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 211-50 chr5 16559646 16560001 + 1.25 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -50825 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 140.5-214 chr7 43069272 43069498 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -43262 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 143.75-70 chr17 65263490 65263724 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 126237 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 428.75-9 chr5 149097342 149097847 + 1.25 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) L1PB1|LINE|L1 34277 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 457-7 chrX 87619641 87620156 + 1.25 NA intron (NM_057162, intron 4 of 10) intron (NM_057162, intron 4 of 10) 102096 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 366.25-9 chr2 124377833 124378233 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 352746 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 357.25-4 chr15 56555144 56555625 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -90247 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 281-16 chr2 197001665 197001916 + 1.25 NA exon (NM_001195144, exon 22 of 28) exon (NM_001195144, exon 22 of 28) -75083 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 283.25-4 chr1 153167516 153167920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6800 NR_110685 101928009 Hs.385720 NR_110685 ENSG00000229699 LOC101928009 - uncharacterized LOC101928009 ncRNA 234.5-20 chr12 84551371 84551576 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 361326 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 235.25-38 chr20 19121575 19121819 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90945 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 345.25-2 chr10 76761091 76761400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126799 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 270-41 chr4 139746088 139746346 + 1.25 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 80398 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 152.25-46 chr13 82348460 82348654 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -1121574 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 232.25-82 chr8 115486642 115486934 + 1.25 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 181225 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 227.25-6 chr1 160547637 160547915 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001184879, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001184879, exon 8 of 8) -24521 NM_001184714 114836 Hs.492348 NM_052931 ENSG00000162739 SLAMF6 CD352|KALI|KALIb|Ly108|NTB-A|NTBA|SF2000 SLAM family member 6 protein-coding 243.5-40 chr2 209188629 209188958 + 1.25 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -235254 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 144-132 chr8 101374187 101374488 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 5444 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 270.75-39 chr5 42829410 42829678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17468 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 216.75-76 chr7 102192160 102192392 + 1.25 NA intron (NM_001913, intron 12 of 22) intron (NM_001913, intron 12 of 22) -92865 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 297.75-6 chr14 21095873 21096342 + 1.25 NA intron (NM_001102454, intron 1 of 4) intron (NM_001102454, intron 1 of 4) 2548 NM_016423 51222 Hs.250493 NM_016423 ENSG00000165804 ZNF219 ZFP219 zinc finger protein 219 protein-coding 200.5-4 chr1 54692362 54692819 + 1.25 NA intron (NM_001039464, intron 16 of 23) intron (NM_001039464, intron 16 of 23) -23232 NM_001291333 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 197.5-61 chr19 58538612 58538945 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001316982, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_001316982, exon 1 of 3) 133 NM_001316982 84878 Hs.515662 NM_032792 ENSG00000119574 ZBTB45 ZNF499 zinc finger and BTB domain containing 45 protein-coding 209-36 chr18 72647907 72648136 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103679 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 235.75-4 chr1 190536749 190537060 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 58353 NR_110717 101929120 Hs.602301 NR_110716 LINC01351 - long intergenic non-protein coding RNA 1351 ncRNA 184.25-81 chr3 76462388 76462536 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -577637 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 200-13 chr10 64868868 64869086 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 43449 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 241.75-2 chr1 31706614 31707013 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2796 NM_001856 1307 Hs.368921 NM_001856 ENSG00000084636 COL16A1 447AA|FP1572 collagen type XVI alpha 1 chain protein-coding 299.75-12 chr2 15658925 15659304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31668 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 182.75-116 chr6 55436043 55436229 + 1.25 NA intron (NR_109869, intron 4 of 4) intron (NR_109869, intron 4 of 4) 108667 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 224.25-90 chr7 19101415 19101651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16103 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 142-50 chr14 69121639 69121856 + 1.25 NA intron (NM_003861, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 30852 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 134.25-155 chr6 14284970 14285118 + 1.25 NA intron (NR_108096, intron 1 of 2) intron (NR_108096, intron 1 of 2) 410 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 226.5-46 chr2 113734260 113734553 + 1.25 NA intron (NM_001330315, intron 9 of 16) intron (NM_001330315, intron 9 of 16) -13038 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 240.5-12 chr10 104392039 104392490 + 1.25 NA exon (NM_001008723, exon 10 of 18) exon (NM_001008723, exon 10 of 18) 38431 NM_001008723 159686 Hs.253576 NM_001008723 ENSG00000120051 CFAP58 C10orf80|CCDC147|bA127L20.4|bA127L20.5|bA554P13.1 cilia and flagella associated protein 58 protein-coding 132.25-147 chr5 4304900 4305134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -468464 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 230.5-120 chr9 71245569 71245861 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -124094 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 172.75-81 chr3 39465723 39465934 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1852 NR_103504 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 116.25-36 chr11 40109327 40109437 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 183748 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 239.75-11 chr11 37409696 37409941 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -528783 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 243.25-38 chr4 78494876 78495242 + 1.25 NA intron (NM_025074, intron 59 of 73) L1M5|LINE|L1 -56711 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 113-42 chr11 81751653 81751752 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139134 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 183.75-89 chr4 138050717 138050919 + 1.25 NA intron (NR_037866, intron 7 of 10) MER1B|DNA|hAT-Charlie -38196 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-168 chr7 44559644 44559857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14788 NM_001257189 54606 Hs.654762 NM_019082 ENSG00000136271 DDX56 DDX21|DDX26|NOH61 DEAD-box helicase 56 protein-coding 309-7 chr10 75382057 75382356 + 1.25 NA intron (NR_120651, intron 1 of 3) intron (NR_120651, intron 1 of 3) -19322 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 191.5-125 chr6 45533170 45533452 + 1.25 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) intron (NM_001015051, intron 7 of 7) 111036 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 351.75-8 chr14 47126880 47127272 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) intron (NM_001113498, intron 5 of 16) 216170 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 345.5-17 chr17 67045370 67045891 + 1.25 NA intron (NM_000727, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 1076 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 295.5-37 chr4 30357580 30357875 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -362642 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 154.75-61 chr18 2724733 2724941 + 1.25 NA intron (NM_015295, intron 20 of 47) intron (NM_015295, intron 20 of 47) 68950 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 271-19 chr17 62747872 62748209 + 1.25 NA intron (NM_001288779, intron 4 of 11) intron (NM_001288779, intron 4 of 11) 41834 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 126.5-235 chr8 52686141 52686257 + 1.25 NA intron (NM_001083617, intron 2 of 23) intron (NM_001083617, intron 2 of 23) 28236 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 297.75-49 chr8 70190963 70191247 + 1.25 NA intron (NM_001321711, intron 4 of 21) intron (NM_001321711, intron 4 of 21) -119853 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 300.5-5 chr1 238948631 238949142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -437682 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 287.75-40 chr5 18154358 18154821 + 1.25 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 347315 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 271.75-11 chr14 67646302 67646592 + 1.25 NA TTS (NM_006370) TTS (NM_006370) 26527 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 378.25-8 chr5 158708389 158708939 + 1.25 NA intron (NM_001364155, intron 13 of 14) intron (NM_001364155, intron 13 of 14) -298891 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 116.5-203 chr5 119095613 119095738 + 1.25 NA intron (NM_001290321, intron 1 of 43) intron (NM_001290321, intron 1 of 43) 24588 NM_005509 1657 Hs.181042 NM_005509 ENSG00000172869 DMXL1 - Dmx like 1 protein-coding 418.25 chr1 23585425 23585841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26132 NM_002167 3399 Hs.76884 NM_002167 ENSG00000117318 ID3 HEIR-1|bHLHb25 inhibitor of DNA binding 3, HLH protein protein-coding 178.75-12 chr10 83929479 83929633 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -209953 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 168.25-21 chr11 18098428 18098610 + 1.25 NA intron (NM_138421, intron 2 of 11) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 7563 NM_138421 113174 Hs.591998 NM_138421 ENSG00000166788 SAAL1 SPACIA1 serum amyloid A like 1 protein-coding 221.25-45 chr20 57823332 57823550 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -111905 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 180.5-7 chr10 15985794 15986000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125364 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 199.75-56 chr20 43831685 43831986 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -62883 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 337.75-19 chr6 133077904 133078385 + 1.25 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -9936 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 321-11 chr14 58642703 58643159 + 1.25 NA intron (NM_001079520, intron 3 of 3) intron (NM_001079520, intron 3 of 3) 4094 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 231-25 chr14 57016549 57016924 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203578 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 159.75-181 chr9 11648048 11648186 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1034911 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 173.5-63 chr2 41021194 41021463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -508893 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 204.25-23 chr12 17835636 17835872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162455 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 180-34 chr14 69879493 69879747 + 1.25 NA 5' UTR (NM_022137, exon 1 of 12) 5' UTR (NM_022137, exon 1 of 12) 204 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 363-7 chr2 116152001 116152374 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 808372 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 242.5-22 chr11 105616377 105616761 + 1.25 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 5863 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 309.25-12 chr16 8494723 8495093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94930 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 327-14 chr17 62801580 62801999 + 1.25 NA intron (NM_001288779, intron 1 of 11) intron (NM_001288779, intron 1 of 11) 4851 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 141.75-109 chr20 61251489 61251632 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001794) promoter-TSS (NM_001794) -701 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 195.75-109 chr7 27119589 27119879 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_030661) promoter-TSS (NM_030661) -139 NM_030661 3200 Hs.659337 NM_030661 ENSG00000105997 HOXA3 HOX1|HOX1E homeobox A3 protein-coding 338.75-13 chr20 32103966 32104275 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5594 NM_014742 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 200.5-118 chr5 128627676 128628010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -89598 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 288-25 chr2 20852687 20853088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29757 NM_001282721 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 266-10 chr14 53103714 53104279 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 49327 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 193.25-97 chr5 107686906 107687076 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -16054 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 169.25-101 chr5 158045422 158045566 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186349 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 141.75-162 chr7 99146324 99146558 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2333 NM_001199847 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 183.25-51 chr19 30352176 30352470 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20061 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 196.75-70 chr3 2162682 2162927 + 1.25 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -18563 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 205.25-45 chr19 28682357 28682581 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 45225 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 296-33 chr4 64380463 64380848 + 1.25 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) L1MA4|LINE|L1 28795 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 191.25-102 chr8 86480577 86480910 + 1.25 NA intron (NM_001286719, intron 4 of 8) intron (NM_001286719, intron 4 of 8) 27943 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 175.25-134 chr7 115707609 115707766 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126246 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 308.5-13 chr17 69834411 69834774 + 1.25 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) MamRep605|LTR?|LTR? -127115 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 195.5-39 chr14 61469189 61469408 + 1.25 NA intron (NM_006255, intron 9 of 13) intron (NM_006255, intron 9 of 13) 100896 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 194.5-105 chr4 67697392 67697650 + 1.25 NA intron (NM_018227, intron 1 of 32) L2a|LINE|L2 3634 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 216-78 chr8 20528075 20528410 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 86684 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 345.25-6 chr14 23202734 23203272 + 1.25 NA intron (NM_001370218, intron 2 of 15) L1PB1|LINE|L1 17682 NM_001370218 100507650 NM_001282322 ENSG00000215277 RNF212B C14orf164 ring finger protein 212B protein-coding 141-135 chr5 161710261 161710468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24643 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 199-72 chr5 128203493 128203741 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 119851 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 365.75-14 chr6 144867537 144867946 + 1.25 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 462086 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 269.5-51 chr6 147325309 147325630 + 1.25 NA intron (NM_139244, intron 17 of 25) intron (NM_139244, intron 17 of 25) -120855 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 371-8 chr13 68745976 68746499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139088 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 204.5-58 chr18 77961174 77961417 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 32432 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 211.25-60 chr3 104660148 104660326 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -706476 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 184.25-27 chr11 105511927 105512206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98007 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 134-102 chr2 169366934 169367053 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4459 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 160-117 chr9 74789147 74789370 + 1.25 NA intron (NM_017662, intron 19 of 38) L2b|LINE|L2 98089 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 227-25 chr15 94937427 94937635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82168 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 246-28 chr2 33703630 33703992 + 1.25 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -3075 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 291.5-46 chr7 31452329 31452887 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61463 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 120.5-85 chr15 91781318 91781430 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72334 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 137-111 chr3 184870978 184871165 + 1.25 NA intron (NM_001009921, intron 20 of 46) intron (NM_001009921, intron 20 of 46) 58564 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 295.5-50 chr5 87359358 87359814 + 1.25 NA intron (NM_022650, intron 9 of 24) intron (NM_022650, intron 9 of 24) -35958 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 151.5-98 chr20 31493944 31494088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8238 NR_024358 140875 Hs.283478 NR_024358 ENSG00000233354 LINC00028 C20orf93|NCRNA00028|dJ1093G12.6 long intergenic non-protein coding RNA 28 ncRNA 167-82 chr4 29965349 29965524 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 751144 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 237.25-20 chr12 113005030 113005263 + 1.25 NA exon (NM_016817, exon 7 of 11) exon (NM_016817, exon 7 of 11) 26627 NM_016817 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 158.25-45 chr16 52717089 52717298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110218 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 310.25-8 chr15 64387072 64387494 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_016213) promoter-TSS (NM_016213) 404 NR_109934 9768 Hs.81892 NM_014736 ENSG00000166803 PCLAF KIAA0101|L5|NS5ATP9|OEATC|OEATC-1|OEATC1|PAF|PAF15|p15(PAF)|p15/PAF|p15PAF PCNA clamp associated factor protein-coding 235.25-60 chr7 80587666 80587971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14389 NM_001371074 153.5-184 chr7 77942376 77942639 + 1.25 NA intron (NM_020432, intron 12 of 16) intron (NM_020432, intron 12 of 16) 102377 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 342.5-26 chr6 168700751 168701100 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 259741 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 159.75-49 chr14 76098105 76098343 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53661 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 384.5-13 chr4 32342132 32342566 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8689 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 259-3 chr1 114198684 114198954 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -44950 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 154.5-2 chr1 42343893 42344058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8095 NM_001198850 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 379.75-15 chrX 63968445 63969007 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182639 NR_031567 100302115 NR_031567 ENSG00000222532 MIR1468 MIRN1468|hsa-mir-1468|mir-1468 microRNA 1468 ncRNA 217.25-2 chr1 45877347 45877559 + 1.25 NA intron (NM_001324321, intron 1 of 28) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 13105 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 288.5-34 chr4 73251651 73252039 + 1.25 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 6953 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 130.75-142 chr4 60994564 60994696 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 72011 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 192.25-6 chr1 175262823 175263028 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -69938 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 252.25-67 chrX 67281332 67281558 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -262576 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 275.25-49 chr8 144031100 144031377 + 1.25 NA intron (NM_198572, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 -18160 NR_158554 392275 NR_158554 SMPD5 MA-nSMase sphingomyelin phosphodiesterase 5 pseudo 266.75-34 chr3 174346558 174346806 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -425886 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 251-33 chr2 134196062 134196342 + 1.25 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -57870 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 184.75-7 chr1 184652791 184653073 + 1.25 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 101926 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 124-152 chr6 109501106 109501267 + 1.25 NA intron (NM_001145128, intron 35 of 40) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -17949 NM_014797 9841 Hs.409876 NM_014797 ENSG00000112365 ZBTB24 BIF1|ICF2|PATZ2|ZNF450 zinc finger and BTB domain containing 24 protein-coding 240.5-50 chr2 38441999 38442242 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 10826 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 376-11 chr2 70278117 70278680 + 1.25 NA 3' UTR (NM_016297, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_016297, exon 6 of 6) 14826 NM_001317167 6637 Hs.465167 NM_003096 ENSG00000143977 SNRPG SMG|Sm-G small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G protein-coding 158-4 chr1 41412104 41412302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36534 NR_135817 101929901 NR_135817 ENSG00000229901 LOC101929901 - uncharacterized LOC101929901 ncRNA 295.5-28 chr2 96496850 96497332 + 1.25 NA TTS (NM_001285486) TTS (NM_001285486) 8266 NM_001285485 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 170.75-86 chr3 18076052 18076283 + 1.25 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) intron (NR_161333, intron 4 of 4) 113615 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 279.25-4 chr1 166937829 166938216 + 1.25 NA intron (NM_199351, intron 4 of 9) intron (NM_199351, intron 4 of 9) 37518 NM_199351 387597 Hs.444835 NM_199351 ENSG00000143195 ILDR2 C1orf32|dJ782G3.1 immunoglobulin like domain containing receptor 2 protein-coding 126.75-10 chr1 158000370 158000551 + 1.25 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) intron (NM_001286349, intron 1 of 12) 6815 NM_018240 55243 Hs.272234 NM_018240 ENSG00000183853 KIRREL1 KIRREL|NEPH1 kirre like nephrin family adhesion molecule 1 protein-coding 212-2 chr1 98883851 98884115 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120293 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 235-15 chr12 23198417 23198749 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22947 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 280.75-17 chr18 2213711 2214088 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 357606 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 187.75-96 chr5 171200572 171200751 + 1.25 NA intron (NM_022897, intron 19 of 27) intron (NM_022897, intron 19 of 27) -108587 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 212-68 chr5 78560754 78560999 + 1.25 NA intron (NM_005779, intron 3 of 4) intron (NM_005779, intron 3 of 4) 87896 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 133.25-152 chr4 72827144 72827332 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 242478 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 134.75-23 chr10 34078108 34078261 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -305504 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 199-52 chr3 73129335 73129581 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 67799 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 301.75-14 chr14 80756127 80756398 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 18 of 24) intron (NM_152446, intron 18 of 24) 185476 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 253.5-22 chr14 51921181 51921658 + 1.25 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -2848 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 317.75-19 chr2 107751928 107752262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2017 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 129-41 chr11 98952525 98952716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68329 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 174.5-200 chrX 21504298 21504478 + 1.25 NA intron (NM_001168649, intron 8 of 19) intron (NM_001168649, intron 8 of 19) 129970 NM_001330773 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 351-26 chr8 37442084 37442450 + 1.25 NA intron (NR_121620, intron 3 of 6) LTR50|LTR|ERVL 51646 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 224.75-77 chr8 135517994 135518282 + 1.25 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) intron (NM_006558, intron 1 of 8) 60682 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 236-23 chr19 28487515 28487858 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -119002 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 285.5-38 chr3 63424533 63424802 + 1.25 NA intron (NR_046677, intron 4 of 4) intron (NR_046677, intron 4 of 4) -18645 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 186.25-75 chr3 180704390 180704601 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25006 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 190.25-59 chr18 75180294 75180512 + 1.25 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 25110 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 295-28 chr5 121904937 121905195 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 53184 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 118-203 chrX 41119968 41120083 + 1.25 NA intron (NM_001039591, intron 1 of 44) intron (NM_001039591, intron 1 of 44) 34580 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 248-70 chr7 83457485 83457762 + 1.25 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) intron (NM_001178129, intron 4 of 16) 183808 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 135.25-32 chr10 102010218 102010396 + 1.25 NA intron (NM_024541, intron 11 of 25) intron (NM_024541, intron 11 of 25) 45866 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 155.25-163 chr7 50175271 50175405 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79252 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 294-19 chr2 169493896 169494303 + 1.25 NA intron (NM_152384, intron 7 of 11) intron (NM_152384, intron 7 of 11) 14605 NM_152384 129880 Hs.233398 NM_152384 ENSG00000163093 BBS5 - Bardet-Biedl syndrome 5 protein-coding 250.75-57 chr5 156566863 156567253 + 1.25 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) L3|LINE|CR1 239894 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 246.25-70 chr8 136338852 136339245 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -191750 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 213-79 chr5 83925090 83925326 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -204353 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 258-19 chr17 70529711 70530047 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 360344 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 320.5-40 chr7 145756647 145757075 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -920808 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 205-69 chr7 49969015 49969315 + 1.25 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) (ATATAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 124081 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 167.25-161 chr8 135187747 135187982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46267 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 326.5-4 chr11 94566527 94566990 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_152431) promoter-TSS (NM_152431) -610 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 187-106 chr9 70442935 70443098 + 1.25 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -28359 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 240.75-23 chr14 54251115 54251476 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -145573 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 113.5-49 chr11 77967878 77967993 + 1.25 NA intron (NM_033547, intron 4 of 22) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 26733 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 129.75-55 chr13 27202693 27202858 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 30516 NR_046548 100874071 Hs.735400 NR_046548 USP12-AS2 - USP12 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 137.5-51 chr12 30286228 30286422 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 390919 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 274.75-16 chr17 55723241 55723589 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_018286) promoter-TSS (NM_018286) -551 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 259.25-51 chr9 80676372 80676923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 701624 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 214.25-84 chr8 129569352 129569616 + 1.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 5534 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 123-118 chr20 41979795 41979941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -361491 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 165.25-80 chr20 62069281 62069506 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -3583 NM_003185 6874 Hs.18857 NM_003185 ENSG00000130699 TAF4 TAF2C|TAF2C1|TAF4A|TAFII130|TAFII135 TATA-box binding protein associated factor 4 protein-coding 227.25-23 chr12 66243575 66243888 + 1.25 NA intron (NM_007199, intron 8 of 11) MIRb|SINE|MIR -7351 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 225.75-25 chr14 73013199 73013460 + 1.25 NA intron (NM_021260, intron 2 of 11) AluSq2|SINE|Alu 13777 NM_001281734 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 272.5-60 chr6 134121092 134121343 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -3537 NR_037938 387065 Hs.571061 NR_037938 HMGA1P7 HMGA1L7 high mobility group AT-hook 1 pseudogene 7 pseudo 212.5-58 chr2 171026268 171026556 + 1.25 NA intron (NM_001136555, intron 10 of 18) intron (NM_001136555, intron 10 of 18) 40561 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 307.5-42 chr4 71547479 71547814 + 1.25 NA intron (NM_003759, intron 16 of 22) intron (NM_003759, intron 16 of 22) 208593 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 464.25-4 chr4 6696930 6697705 + 1.25 NA TTS (NM_005980) TTS (NM_005980) 3439 NM_005980 6286 Hs.2962 NM_005980 ENSG00000163993 S100P MIG9 S100 calcium binding protein P protein-coding 339.75-26 chr5 61089930 61090245 + 1.25 NA intron (NM_174889, intron 2 of 3) intron (NM_174889, intron 2 of 3) -72229 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 213.5-101 chr5 91093051 91093292 + 1.25 NA intron (NR_003149, intron 86 of 89) MIR|SINE|MIR 221231 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 238-5 chr1 106462699 106462925 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -355427 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 179-91 chr8 122728553 122728863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34602 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 256.25-18 chr2 6668920 6669301 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18591 NR_110497 102800314 Hs.258100 NR_110497 ENSG00000236172 MIR7515HG - MIR7515 host gene ncRNA 359.25-10 chr5 90166967 90167269 + 1.25 NA intron (NR_120601, intron 4 of 5) intron (NR_120601, intron 4 of 5) 122953 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 193.25-8 chr10 10585808 10586031 + 1.25 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 123369 NM_001326317 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 318.75-4 chr13 103314829 103315346 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110113 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 195.75-122 chr8 129846279 129846439 + 1.25 NA intron (NM_001353307, intron 13 of 13) intron (NM_001353307, intron 13 of 13) -59735 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 336.75 chr10 27121170 27121525 + 1.25 NA intron (NM_139312, intron 13 of 19) L1MB7|LINE|L1 -20849 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 152.5-142 chr4 145793717 145793920 + 1.25 NA intron (NM_178835, intron 8 of 14) intron (NM_178835, intron 8 of 14) 113614 NM_001080531 646603 NM_001080531 ENSG00000237136 C4orf51 - chromosome 4 open reading frame 51 protein-coding 338-13 chr14 83175407 83175821 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 532982 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 162.25-42 chr13 70508335 70508547 + 1.25 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -399948 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 155.75-85 chr2 154193011 154193224 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 4 of 12) intron (NM_052917, intron 4 of 12) 248723 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 165.75-9 chr1 190582963 190583328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41745 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 268.5-27 chr18 60141541 60141932 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 231039 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 408.75-8 chr7 77222858 77223703 + 1.25 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) -23461 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 356-13 chr7 132833447 132833834 + 1.25 NA intron (NR_133671, intron 7 of 10) intron (NR_133671, intron 7 of 10) 74670 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 258-41 chr4 34402187 34402415 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -132554 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 258.25-14 chr12 69506515 69506762 + 1.25 NA intron (NM_001278354, intron 2 of 9) intron (NM_001278354, intron 2 of 9) -8802 NR_145803 109623461 NR_145803 SNORA113 - small nucleolar RNA, H/ACA box 113 snoRNA 159.5-49 chr13 93643348 93643567 + 1.25 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) MER34|LTR|ERV1 215016 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 244.75-11 chr10 129919324 129919688 + 1.25 NA intron (NM_001005463, intron 6 of 15) intron (NM_001005463, intron 6 of 15) 44768 NM_001005463 253738 Hs.591374 NM_001005463 ENSG00000108001 EBF3 COE3|EBF-3|HADDS|O/E-2|OE-2 EBF transcription factor 3 protein-coding 169-65 chr4 30802322 30802657 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 82120 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 209.25-120 chr9 80399779 80400033 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 424883 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 152-123 chr5 27076133 27076531 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -37746 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 196.25-26 chr12 84562841 84563108 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 349825 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 309.75-12 chr16 19303536 19303902 + 1.25 NA intron (NM_001256720, intron 2 of 4) intron (NM_001256720, intron 2 of 4) 17988 NM_001256720 728276 Hs.632180 NM_001256720 ENSG00000261210 CLEC19A - C-type lectin domain containing 19A protein-coding 229.75-49 chr3 97631008 97631382 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 13 of 17) intron (NM_001080448, intron 13 of 17) -133326 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 229.25-66 chr6 65762677 65762912 + 1.25 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -25085 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 273-36 chr3 82112648 82112967 + 1.25 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) L1PA8A|LINE|L1 126665 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 376.25-13 chr4 40025194 40025652 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -31427 NM_018177 55728 Hs.391463 NM_018177 ENSG00000078177 N4BP2 B3BP NEDD4 binding protein 2 protein-coding 248.75-15 chr12 47926362 47926586 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21443 NM_001364085 7421 Hs.524368 NM_000376 ENSG00000111424 VDR NR1I1|PPP1R163 vitamin D receptor protein-coding 245.5-47 chr3 58835998 58836218 + 1.25 NA intron (NM_198463, intron 12 of 15) intron (NM_198463, intron 12 of 15) 11637 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 262-27 chr2 41690625 41691065 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186710 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 296.25-22 chr21 27398716 27399004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -323519 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 192-30 chr11 95325552 95325741 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93171 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 194.75-82 chr6 34798069 34798257 + 1.25 NA intron (NM_017754, intron 1 of 20) L1ME3A|LINE|L1 6080 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 226.75-71 chr8 47247740 47248119 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -12949 NM_001282919 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 207.25-17 chr13 69125359 69125544 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96895 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 291.75-18 chr19 36359910 36360189 + 1.25 NA intron (NM_001297619, intron 4 of 4) L1M5|LINE|L1 19152 NM_020917 57677 Hs.35524 NM_020917 ENSG00000142065 ZFP14 ZNF531 ZFP14 zinc finger protein protein-coding 327-31 chrX 81263219 81263690 + 1.25 NA intron (NM_003022, intron 1 of 3) intron (NM_003022, intron 1 of 3) 61352 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 329.5-10 chr2 54210662 54211202 + 1.25 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 45297 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 192-62 chr2 173636134 173636418 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 281404 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 200-72 chr5 77961984 77962283 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3886 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 322.5-12 chr17 71917321 71917931 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108353 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 260.25-18 chr18 5725993 5726337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22654 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 189-58 chr2 47797264 47797652 + 1.25 NA intron (NM_001281494, intron 3 of 9) MIR3|SINE|MIR 13503 NM_001281494 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 131-168 chr8 60232553 60232798 + 1.25 NA intron (NR_135821, intron 3 of 9) intron (NR_135821, intron 3 of 9) 48725 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 420.5-9 chr3 188316246 188316958 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 91197 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 238.75-29 chr2 50741284 50741644 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -45202 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 278.25-59 chr8 131381825 131382075 + 1.25 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -341041 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 277.25-34 chr4 90269236 90269635 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 34404 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 354.25-15 chr6 145530089 145530439 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 156613 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 237.25-58 chr5 55158020 55158434 + 1.25 NA intron (NM_001145734, intron 2 of 10) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -1944 NM_001306197 493869 Hs.289044 NM_001008397 ENSG00000164294 GPX8 EPLA847|GPx-8|GSHPx-8|UNQ847 glutathione peroxidase 8 (putative) protein-coding 212.75-43 chr17 66450674 66451016 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -33991 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 302 chr1 28570789 28571157 + 1.25 NA intron (NM_017846, intron 6 of 8) AluSc8|SINE|Alu 7849 NR_003077 692212 NR_003077 ENSG00000221539 SNORD99 HBII-420 small nucleolar RNA, C/D box 99 snoRNA 235.75-71 chr7 70061182 70061408 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) MIRb|SINE|MIR 462820 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 329.5-19 chr4 155404619 155404913 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27801 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 216.25-101 chr9 11525416 11525644 + 1.25 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 912324 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 131-102 chr2 191991732 191991851 + 1.25 NA intron (NM_001305134, intron 7 of 9) intron (NM_001305134, intron 7 of 9) -144703 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 174.5-41 chr11 119792144 119792391 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62684 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 124-117 chr3 173368702 173368936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27133 NM_001365924 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 187.25-26 chr13 44707670 44707863 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 67397 NR_149082 106144541 Hs.578031 NR_149082 LINC00407 - long intergenic non-protein coding RNA 407 ncRNA 352-6 chr15 37724785 37725256 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -209587 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 168-71 chr2 194485208 194485383 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 141026 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 145.25-92 chr21 20752314 20752491 + 1.25 NA intron (NR_109787, intron 6 of 6) intron (NR_109787, intron 6 of 6) 50706 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 148.5-200 chr6 142903419 142903706 + 1.25 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 41614 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 166.75-149 chr9 133268167 133268365 + 1.25 NA intron (NM_020469, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 6935 NM_020469 28 Hs.654423 NM_020469 ENSG00000175164 ABO A3GALNT|A3GALT1|GTB|NAGAT ABO, alpha 1-3-N-acetylgalactosaminyltransferase and alpha 1-3-galactosyltransferase protein-coding 371-7 chr12 15181579 15182020 + 1.25 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) (GAGAAGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 29876 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 218.5-50 chr18 34934151 34934485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42610 NM_001143826 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 324.5-30 chr6 158243959 158244294 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -68339 NM_001007466 56995 Hs.486993 NM_020245 ENSG00000130338 TULP4 TUSP TUB like protein 4 protein-coding 293-30 chr4 157087408 157087768 + 1.25 NA intron (NM_000824, intron 2 of 9) intron (NM_000824, intron 2 of 9) 11185 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 176.75-113 chr7 44154027 44154180 + 1.25 NA intron (NM_001354800, intron 1 of 10) intron (NM_001354800, intron 1 of 10) 5179 NM_033508 2645 Hs.1270 NM_000162 ENSG00000106633 GCK FGQTL3|GK|GLK|HHF3|HK4|HKIV|HXKP|LGLK|MODY2 glucokinase protein-coding 176.5-9 chr1 180817660 180817913 + 1.25 NA intron (NR_137330, intron 7 of 12) L1ME3A|LINE|L1 -95111 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 247.5-92 chrX 15113736 15114010 + 1.25 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 156210 NM_001031739 140462 Hs.19404 NM_024087 ENSG00000102048 ASB9 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 protein-coding 249.75-48 chr4 80015072 80015474 + 1.25 NA intron (NM_001286781, intron 11 of 16) L2|LINE|L2 57956 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 328.75-8 chr2 123251375 123251745 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -178079 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 208.75-81 chr8 76975258 76975495 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -8526 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 173.25-54 chr2 12274531 12274805 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 75538 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 422.5-2 chr10 100368176 100368864 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -5056 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 155-68 chr2 124330672 124330882 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) LTR49-int|LTR|ERV1 305490 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 169.75-36 chr12 20464710 20464908 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 95564 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 139.75-9 chr1 201776857 201777007 + 1.25 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) HAL1|LINE|L1 -31679 NR_031599 100302158 NR_031599 ENSG00000221028 MIR1231 MIRN1231|hsa-mir-1231 microRNA 1231 ncRNA 136.75-139 chr3 188434085 188434290 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) intron (NM_001167672, intron 2 of 9) 134479 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 334.75-23 chr5 59643152 59643497 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) L1MEc|LINE|L1 -55699 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 144.5-122 chr21 30411527 30411741 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 14292 NM_181622 337960 Hs.553687 NM_181622 ENSG00000240432 KRTAP13-3 KAP13.3 keratin associated protein 13-3 protein-coding 124.75-150 chr3 170943832 170944083 + 1.25 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -35320 NM_020390 56648 Hs.164144 NM_020390 ENSG00000163577 EIF5A2 EIF-5A2|eIF5AII eukaryotic translation initiation factor 5A2 protein-coding 324-34 chrX 46974311 46974668 + 1.25 NA intron (NM_014735, intron 1 of 10) intron (NM_014735, intron 1 of 10) 62068 NM_014735 9767 Hs.371977 NM_014735 ENSG00000102221 JADE3 JADE-3|PHF16 jade family PHD finger 3 protein-coding 259.75-13 chr12 32508406 32508779 + 1.25 NA intron (NM_001370297, intron 1 of 14) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 6429 NM_001370297 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 186.25-27 chr13 75691171 75691509 + 1.25 NA intron (NM_001306080, intron 1 of 30) intron (NM_001306080, intron 1 of 30) 55010 NM_001306080 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 213.25-43 chr3 29622500 29622738 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 311537 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 254.25-50 chr5 17262098 17262589 + 1.25 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 44712 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 203.5-50 chr16 87726767 87726988 + 1.25 NA non-coding (NR_147833, exon 7 of 12) non-coding (NR_147833, exon 7 of 12) 39109 NM_017566 54758 Hs.123450 NM_017566 ENSG00000104731 KLHDC4 - kelch domain containing 4 protein-coding 145.75-148 chr7 26200776 26200945 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_007276) promoter-TSS (NM_007276) -114 NM_002137 3181 Hs.487774 NM_002137 ENSG00000122566 HNRNPA2B1 HNRNPA2|HNRNPB1|HNRPA2|HNRPA2B1|HNRPB1|IBMPFD2|RNPA2|SNRPB1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 protein-coding 249.75-39 chr20 45299192 45299772 + 1.25 NA intron (NM_003833, intron 7 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -7358 NM_014276 11317 Hs.248217 NM_014276 ENSG00000124232 RBPJL RBPL|RBPSUHL|SUHL recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region like protein-coding 212.25-68 chr4 161289149 161289349 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -733484 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 371 chr1 169197619 169198098 + 1.25 NA intron (NR_104229, intron 10 of 12) L1MB7|LINE|L1 91168 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 137-190 chr9 98326924 98327141 + 1.25 NA intron (NM_005458, intron 13 of 18) intron (NM_005458, intron 13 of 18) -71383 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 157.75-181 chr9 73078204 73078409 + 1.25 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -73559 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 138.5-205 chr9 11068818 11068956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 455681 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 273-37 chr3 173711459 173711713 + 1.25 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 127152 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 146.75-33 chr12 79687120 79687348 + 1.25 NA intron (NM_001354732, intron 2 of 6) intron (NM_001354732, intron 2 of 6) 3346 NM_001354732 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 313.5-14 chr15 79050612 79051049 + 1.25 NA intron (NM_001145648, intron 3 of 26) intron (NM_001145648, intron 3 of 26) 39950 NM_001145648 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 226.5-33 chr18 9546165 9546550 + 1.25 NA TTS (NM_005134) TTS (NM_005134) 68202 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 138-134 chr5 178331883 178332045 + 1.25 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) intron (NM_173465, intron 2 of 28) -99142 NM_001278346 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 225-39 chr2 66470494 66470914 + 1.25 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -30374 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 208-56 chr3 110502228 110502445 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 567623 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 228.75-7 chr1 222288495 222288685 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 259514 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 207.5-27 chr15 69179440 69179821 + 1.25 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) intron (NM_001324093, intron 2 of 5) 18995 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 121.5-7 chr1 63251376 63251529 + 1.25 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) AluJr|SINE|Alu 65805 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 216.5-88 chr4 57692445 57692634 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 266667 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 337.75-11 chr2 49361173 49361587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -206853 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 291.5-50 chr8 82386211 82386605 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -525696 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 214.5-129 chr8 119079164 119079467 + 1.25 NA intron (NM_006438, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR -10533 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 249.75-52 chr4 107165817 107166056 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -129623 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 272.5-48 chr22 25627009 25627453 + 1.25 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) intron (NM_001362778, intron 2 of 19) 62556 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 275-35 chr5 42339724 42340087 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -83534 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 292.5-53 chr8 90079632 90080002 + 1.25 NA intron (NM_004929, intron 2 of 10) intron (NM_004929, intron 2 of 10) 3062 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 228.75-9 chr10 105071555 105071809 + 1.25 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) L1MA1|LINE|L1 -405466 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-41 chr16 30404136 30404373 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3160 NM_016643 51333 Hs.148584 NM_016643 ENSG00000179965 ZNF771 DSC43 zinc finger protein 771 protein-coding 251.5-12 chr10 101529155 101529513 + 1.25 NA intron (NM_001256856, intron 5 of 13) intron (NM_001256856, intron 5 of 13) 58923 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 254.75-8 chr11 77968750 77969123 + 1.25 NA intron (NM_033547, intron 4 of 22) intron (NM_033547, intron 4 of 22) 25732 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 252.25-9 chr12 1531784 1532132 + 1.25 NA intron (NR_160736, intron 1 of 1) intron (NR_160736, intron 1 of 1) 234 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 257.25-27 chr20 51806410 51806794 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -4081 NM_020436 57167 Hs.517113 NM_020436 ENSG00000101115 SALL4 DRRS|HSAL4|ZNF797 spalt like transcription factor 4 protein-coding 317.75-24 chr4 70752080 70752658 + 1.25 NA intron (NM_001291994, intron 2 of 13) L1MB7|LINE|L1 17959 NM_001291993 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 264-52 chr5 105078682 105079054 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20606 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 280.75-37 chr7 53025703 53025962 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9801 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 150.5-185 chr6 57107524 57107717 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001257273, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001257273, exon 4 of 4) 17432 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 186-16 chr11 16629623 16629884 + 1.25 NA intron (NM_001367872, intron 2 of 16) L1PA16|LINE|L1 108724 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 243.25-47 chr6 63411693 63411973 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -91850 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 123.25-188 chr7 50642412 50642578 + 1.25 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) (CACATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 62806 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 112.75-144 chr4 30452530 30452688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -267760 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 324.75-14 chr16 76737285 76737690 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 102489 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 307-28 chr5 3532946 3533352 + 1.25 NA intron (NR_033898, intron 1 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie 2945 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 287-3 chr1 172356663 172357027 + 1.25 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) L1MC4a|LINE|L1 -63840 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 166.5-100 chr2 52718881 52719060 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -16355 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 150.75-191 chr8 132622161 132622367 + 1.25 NA intron (NR_135913, intron 6 of 10) intron (NR_135913, intron 6 of 10) 53281 NM_001321963 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 220.25-26 chr18 5579859 5580177 + 1.25 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) MIR|SINE|MIR -35679 NM_001330557 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 282-21 chr18 13570491 13570808 + 1.25 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -40465 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 216-77 chr7 86781984 86782264 + 1.25 NA intron (NM_001363522, intron 2 of 4) L3|LINE|CR1 138210 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 147.75-90 chr20 52738396 52738587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 117653 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 320-17 chr2 104250302 104250754 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 157804 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 199.5-135 chr7 26952324 26952517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87830 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 195.75-112 chr7 64845168 64845348 + 1.25 NA intron (NR_160269, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 50830 NM_001271640 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 280.75-41 chr8 112840682 112840939 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 9 of 66) intron (NM_001363185, intron 9 of 66) 197317 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 409.25 chr19 34942260 34942702 + 1.25 NA intron (NM_194325, intron 4 of 4) intron (NM_194325, intron 4 of 4) 15578 NM_194325 90075 Hs.657402 NM_194325 ENSG00000168661 ZNF30 KOX28 zinc finger protein 30 protein-coding 213.25-65 chr8 83592373 83592587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 188722 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 158.75-38 chr12 26890134 26890581 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 47624 NM_018164 55726 Hs.505077 NM_018164 ENSG00000064102 INTS13 ASUN|C12orf11|GCT1|Mat89Bb|NET48|SPATA30 integrator complex subunit 13 protein-coding 149.25-87 chr2 146851311 146851548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 264372 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 169.25-93 chr5 14681616 14681837 + 1.25 NA intron (NM_138348, intron 4 of 6) intron (NM_138348, intron 4 of 6) 17008 NM_138348 90268 Hs.406335 NM_138348 ENSG00000154124 OTULIN AIPDS|FAM105B|GUM OTU deubiquitinase with linear linkage specificity protein-coding 335.25-18 chr2 143208296 143208642 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 3 of 13) intron (NM_018460, intron 3 of 13) 79050 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 217.25-39 chr2 29501172 29501421 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) -25919 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 130-116 chr4 54443041 54443214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 110235 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 133.5-15 chr1 194699824 194699977 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1388815 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 314.5-5 chr14 61763774 61764099 + 1.25 NA intron (NM_003082, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 1516 NM_003082 6617 Hs.179312 NM_003082 ENSG00000023608 SNAPC1 PTFgamma|SNAP43 small nuclear RNA activating complex polypeptide 1 protein-coding 337.25-7 chr16 74722230 74722792 + 1.25 NA intron (NM_024306, intron 4 of 6) AluJo|SINE|Alu -21649 NM_152649 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 247.75-66 chr8 59513451 59513807 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 394419 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 272.25-41 chr4 36705644 36705895 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63869 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 308.75-7 chr10 83583082 83583379 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93859 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 340-12 chr3 72932983 72933447 + 1.25 NA intron (NM_001080393, intron 3 of 6) intron (NM_001080393, intron 3 of 6) 45169 NR_138564 727936 Hs.710275 NM_001080393 ENSG00000172986 GXYLT2 GLT8D4 glucoside xylosyltransferase 2 protein-coding 217.5-78 chr22 21788313 21788606 + 1.25 NA intron (NM_002745, intron 5 of 8) intron (NM_002745, intron 5 of 8) -52665 NR_130910 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 346.5-16 chr2 197007217 197007637 + 1.25 NA intron (NM_001367496, intron 20 of 27) L1ME4a|LINE|L1 -80720 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 223-28 chr15 91575734 91576013 + 1.25 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 112534 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 259.75-40 chr4 99134563 99134834 + 1.25 NA intron (NR_037884, intron 2 of 9) intron (NR_037884, intron 2 of 9) 9600 NM_000670 127 Hs.1219 NM_000670 ENSG00000198099 ADH4 ADH-2|HEL-S-4 alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide protein-coding 147-138 chr7 109022723 109023027 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -138288 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 256-2 chr1 92916090 92916359 + 1.25 NA intron (NM_001006605, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 -39074 NM_001252271 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 292-40 chr7 92749414 92749844 + 1.25 NA intron (NM_001259, intron 3 of 7) intron (NM_001259, intron 3 of 7) 84330 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 338.5-15 chr2 155496355 155496684 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 758412 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 334.5-26 chr6 125277223 125277664 + 1.25 NA intron (NM_016063, intron 4 of 5) intron (NM_016063, intron 4 of 5) 24524 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 236.75-8 chr1 195812259 195812612 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 276280 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 140.75-189 chr8 125761492 125761678 + 1.25 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 189612 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 311-8 chr12 10752186 10752449 + 1.25 NA intron (NR_120463, intron 1 of 6) intron (NR_120463, intron 1 of 6) 2083 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 209.5-130 chr6 42393120 42393446 + 1.25 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) MIRc|SINE|MIR 58768 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 126-184 chr9 104176108 104176239 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81546 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 266.75-40 chr5 30799039 30799321 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -394506 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 210.5-124 chr7 93852122 93852349 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 38518 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 262-52 chr7 53245501 53245727 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 209981 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 132.5-71 chr14 64088320 64088503 + 1.25 NA intron (NM_015180, intron 58 of 114) intron (NM_015180, intron 58 of 114) 6714 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 298.5-8 chr14 75726869 75727232 + 1.25 NA intron (NM_015072, intron 12 of 31) intron (NM_015072, intron 12 of 31) 65804 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 160.75-11 chr1 229649364 229649507 + 1.25 NA intron (NM_014777, intron 7 of 9) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 23188 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 229.75-63 chr5 122122142 122122508 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7221 NM_207317 133923 Hs.729673 NM_207317 ENSG00000164185 ZNF474 - zinc finger protein 474 protein-coding 243-56 chr5 12484723 12485096 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -89948 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 225.25-64 chr5 117706873 117707085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23382 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 121.25-72 chr15 99320460 99320577 + 1.25 NA intron (NM_001321676, intron 6 of 10) intron (NM_001321676, intron 6 of 10) 62993 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 244.25-50 chr8 73306681 73306951 + 1.25 NA intron (NM_172037, intron 2 of 5) intron (NM_172037, intron 2 of 5) 12214 NM_172037 157506 Hs.244940 NM_172037 ENSG00000121039 RDH10 SDR16C4 retinol dehydrogenase 10 protein-coding 132-86 chr2 63836890 63837057 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3991 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 153.25-95 chr3 179436659 179436873 + 1.25 NA intron (NM_021629, intron 1 of 9) intron (NM_021629, intron 1 of 9) 14704 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 305.5-31 chr4 112016199 112016618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129046 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 155.5-20 chr10 33431905 33432111 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -97103 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 293.5 chr1 102733241 102733593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 375079 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 329.75-17 chr5 155644927 155645530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 631473 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 190.25-42 chr15 40366287 40366620 + 1.25 NA intron (NM_033510, intron 7 of 7) intron (NM_033510, intron 7 of 7) 8234 NM_033510 85455 Hs.355645 NM_033510 ENSG00000140323 DISP2 C15orf36|DISPB|HsT16908|LINC00594 dispatched RND transporter family member 2 protein-coding 225.25-57 chr4 6089058 6089426 + 1.25 NA intron (NM_001306134, intron 2 of 11) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -70696 NM_001364690 389197 Hs.479065 NM_207405 ENSG00000181215 C4orf50 - chromosome 4 open reading frame 50 protein-coding 176-15 chr12 17976038 17976224 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 114062 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 231-13 chr11 104064556 104064813 + 1.25 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 28044 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 160.25-58 chr18 998988 999256 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71129 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 131.25-119 chr20 13587959 13588134 + 1.25 NA intron (NM_017714, intron 4 of 13) AluJo|SINE|Alu 50886 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 254-48 chr8 130281427 130281676 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 14982 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 278.5-19 chr17 14220512 14220848 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16182 NM_001348781 146822 Hs.447556 NM_001007530 ENSG00000223510 CDRT15 - CMT1A duplicated region transcript 15 protein-coding 216.75-51 chr3 187272914 187273122 + 1.25 NA intron (NR_033519, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR -18254 NR_135551 101929130 NR_135551 ENSG00000283175 LOC101929130 - uncharacterized LOC101929130 ncRNA 248.25-37 chr2 181113221 181113441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10506 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 160.5-29 chr11 106787747 106788008 + 1.25 NA intron (NM_001256424, intron 5 of 8) L1MA3|LINE|L1 230599 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 313.75 chr1 44630708 44631036 + 1.25 NA intron (NM_001319957, intron 4 of 13) intron (NM_001319957, intron 4 of 13) 40184 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 270.5-30 chr2 55885716 55885997 + 1.25 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) intron (NM_001039349, intron 4 of 10) 37926 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 361.5-18 chr5 146410856 146411406 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -36202 NM_001040006 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 372.5-25 chr9 20875341 20875813 + 1.25 NA intron (NM_017794, intron 21 of 45) AluSz6|SINE|Alu 88650 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 251.75-49 chr3 11376247 11376676 + 1.25 NA intron (NM_001136031, intron 16 of 17) intron (NM_001136031, intron 16 of 17) 104064 NM_006395 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 187.5-42 chr12 81912673 81912922 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40922 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 421-2 chr10 35844539 35845274 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 66604 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 390.75-3 chr10 124336711 124337062 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 82037 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 390-14 chr8 105796452 105797035 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 6 of 7) intron (NM_001362837, intron 6 of 7) 263760 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 328-32 chr6 73370393 73370766 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001080507) promoter-TSS (NM_001080507) -787 NM_001080507 441161 Hs.671212 NM_001080507 ENSG00000203907 OOEP C6orf156|FLOPED|HOEP19|KHDC2 oocyte expressed protein protein-coding 247.25-36 chr20 5909579 5909816 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -1813 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 155.75-25 chr10 108260664 108260910 + 1.25 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -191494 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 280-38 chr3 192448574 192448818 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -39647 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 305-9 chr13 43106236 43106622 + 1.25 NA intron (NM_013238, intron 5 of 5) intron (NM_013238, intron 5 of 5) -6736 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 174.25-152 chr9 96594741 96594977 + 1.25 NA intron (NR_147239, intron 1 of 14) L1MEc|LINE|L1 24984 NM_001351567 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 339.25-13 chr21 29340801 29341281 + 1.25 NA intron (NR_027655, intron 4 of 7) intron (NR_027655, intron 4 of 7) -31460 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 386.75-4 chr3 757865 758330 + 1.25 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) L1MA4A|LINE|L1 165992 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 113.75-25 chr10 98880723 98880959 + 1.25 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 43727 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 222-4 chr1 107791128 107791324 + 1.25 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) intron (NM_006113, intron 2 of 26) -102727 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 299.25-8 chr10 56975595 56975864 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 328830 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 296.25-11 chr15 85591062 85591340 + 1.25 NA intron (NM_007200, intron 8 of 36) MIR3|SINE|MIR -28749 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 155-33 chr14 27095584 27095797 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 187048 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 416.25-3 chr14 52518499 52519324 + 1.25 NA intron (NM_001160047, intron 7 of 20) MIR|SINE|MIR 33594 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 268.5-42 chr4 64126323 64126601 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 282988 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 163.5-127 chr3 83013912 83014135 + 1.25 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 1027881 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 209-64 chr7 70742176 70742415 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 6 of 18) intron (NM_015570, intron 6 of 18) -389849 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 340.75-11 chr17 74875389 74875909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2655 NM_001258014 2232 Hs.69745 NM_004110 ENSG00000161513 FDXR ADR|ADXR|ANOA ferredoxin reductase protein-coding 226-2 chr1 73925919 73926146 + 1.25 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 251353 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 148-116 chr6 163921415 163921599 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -250023 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 238.5-27 chr14 98277791 98278105 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -299824 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 162.75-87 chr20 36298433 36298651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7797 NM_001365621 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 384-9 chr2 26058224 26058696 + 1.25 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) FLAM_C|SINE|Alu 24376 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 181.5-46 chr15 54979117 54979304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77537 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 313-4 chr11 82491700 82491983 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -87928 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 221.25-15 chr11 44093774 44094091 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1617 NM_207122 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 141-74 chr2 77419324 77419510 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MER2|DNA|TcMar-Tigger 102959 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 175.75-111 chr6 54337775 54338032 + 1.25 NA intron (NM_014464, intron 4 of 10) intron (NM_014464, intron 4 of 10) 29462 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 308.75-30 chr5 66182346 66182692 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001270492, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001270492, exon 13 of 13) 26927 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 134-113 chr3 23030138 23030247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 172386 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 183.5-78 chr2 214568574 214568877 + 1.25 NA intron (NR_159945, intron 4 of 4) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 58543 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 152.25-164 chr8 141098064 141098258 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -30428 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 220-62 chr8 27132689 27133100 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -83931 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 207.5-122 chr8 121988150 121988400 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -346835 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 222.5-58 chr2 198699551 198699755 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -324556 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 261.25-53 chr9 82199547 82199914 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210958 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 115.25-71 chr16 9403992 9404136 + 1.25 NA non-coding (NR_135195, exon 3 of 3) non-coding (NR_135195, exon 3 of 3) 40921 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 471-6 chr22 21914667 21915449 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23179 NR_147620 100286925 Hs.659180 NR_147620 LOC100286925 - uncharacterized LOC100286925 ncRNA 416.25 chr1 195791890 195792537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 296502 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 123.5-103 chr2 86600241 86600359 + 1.25 NA intron (NM_001198954, intron 3 of 7) intron (NM_001198954, intron 3 of 7) 23565 NM_005667 7844 Hs.469199 NM_005667 ENSG00000239305 RNF103 HKF-1|KF-1|KF1|ZFP-103|ZFP103 ring finger protein 103 protein-coding 325.75-21 chr4 33324523 33324828 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 715218 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 126.5-185 chr5 18027667 18027792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 220455 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 280.25-40 chr4 36743829 36744245 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -102137 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 286.5-8 chr10 67174132 67174489 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 162044 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 217.25-74 chr7 7757616 7757917 + 1.25 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR -39159 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 123-52 chr14 63505242 63505370 + 1.25 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 2932 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 242-33 chr20 64082877 64083102 + 1.25 NA TTS (NM_001007125) TTS (NM_001007125) 1370 NM_001353425 198437 Hs.570316 NM_001007125 ENSG00000171695 LKAAEAR1 C20orf201 LKAAEAR motif containing 1 protein-coding 144.25-121 chr22 47701041 47701214 + 1.25 NA intron (NR_122046, intron 6 of 8) L1ME3|LINE|L1 69453 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 219.5-50 chr16 85937357 85937645 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19154 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 249.25-28 chr20 5548456 5548870 + 1.25 NA intron (NM_019593, intron 19 of 19) HAL1|LINE|L1 -38661 NR_109860 101929207 Hs.516871 NR_109860 ENSG00000225640 LINC01729 - long intergenic non-protein coding RNA 1729 ncRNA 161.75-130 chr8 137612718 137612918 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199230 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 334.5-33 chr9 113841480 113841941 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -34572 NM_133374 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 285.25 chr1 190167328 190167698 + 1.25 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) intron (NM_199051, intron 6 of 7) 308497 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 299.25-23 chr18 6517214 6517862 + 1.25 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 6122 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 293.25-41 chr9 91085825 91086151 + 1.25 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -10856 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 142.25-159 chr7 86425993 86426185 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -217820 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 374-20 chr8 136476373 136476789 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54217 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 300.75-20 chr18 6690121 6690381 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39465 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 151.5-87 chr2 137589210 137589381 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 17 of 27) intron (NM_001316349, intron 17 of 27) 338637 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 194.25-91 chr5 27419305 27419484 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -52898 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 151.5-204 chr9 33047861 33048099 + 1.25 NA intron (NM_018225, intron 11 of 11) intron (NM_018225, intron 11 of 11) 22707 NM_001539 3301 Hs.445203 NM_001539 ENSG00000086061 DNAJA1 DJ-2|DjA1|HDJ2|HSDJ|HSJ-2|HSJ2|HSPF4|NEDD7|hDJ-2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 protein-coding 240.25-68 chr8 40160244 40160615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6947 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 288.25-28 chr8 100065986 100066398 + 1.25 NA exon (NM_001286693, exon 5 of 26) exon (NM_001286693, exon 5 of 26) 39434 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 191.75-128 chr8 123303776 123303960 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -28327 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 201.25-23 chr11 84676123 84676356 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 44703 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 189.5-68 chr2 80389579 80389829 + 1.25 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 76325 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 130.25-117 chr20 20600428 20600561 + 1.25 NA intron (NM_020343, intron 16 of 39) intron (NM_020343, intron 16 of 39) 112150 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 115.25-158 chr5 11276911 11277091 + 1.25 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 311916 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 171.75-71 chr2 28118029 28118229 + 1.25 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 88832 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 251.75-74 chr7 76026720 76026937 + 1.25 NA intron (NM_016086, intron 3 of 8) AluSx3|SINE|Alu 3696 NR_134487 51657 Hs.11615 NM_016086 ENSG00000127952 STYXL1 DUSP24|MK-STYX|MKSTYX serine/threonine/tyrosine interacting like 1 protein-coding 325-8 chr16 8273771 8274115 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 315895 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 268.25-35 chr4 44315941 44316227 + 1.25 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) HAL1ME|LINE|L1 132725 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 270.5-28 chr2 10329132 10329504 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001258357) promoter-TSS (NM_001258357) -845 NM_001258357 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 164.25-118 chr4 85417403 85417573 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57662 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 169-64 chr3 182559992 182560217 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -52980 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 244.5-94 chr8 106917960 106918267 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -147869 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 156.25-127 chr6 15134088 15134284 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -111883 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 210.5-107 chr5 162082527 162082797 + 1.25 NA intron (NM_198904, intron 1 of 9) intron (NM_198904, intron 1 of 9) 15020 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 206.25-92 chr6 40157047 40157248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 198859 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 171.25-154 chr8 139338197 139338449 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 364800 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 211-64 chr7 44482877 44483179 + 1.25 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) L1MEf|LINE|L1 7630 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 266.5-27 chr19 4948158 4948400 + 1.25 NA intron (NM_001290051, intron 11 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie 15592 NR_039902 100616337 NR_039902 ENSG00000263409 MIR4747 mir-4747 microRNA 4747 ncRNA 152.5-128 chr4 12099900 12100136 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -123433 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 263.5-7 chr10 116462607 116463120 + 1.25 NA intron (NM_001011709, intron 7 of 11) intron (NM_001011709, intron 7 of 11) 35016 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 159.5-154 chr3 157692493 157692878 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149341 NM_001243729 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 278.75-2 chr10 103852674 103853116 + 1.25 NA intron (NM_014631, intron 1 of 13) intron (NM_014631, intron 1 of 13) 2511 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 271.5-18 chr12 66082910 66083240 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47675 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 204.5-69 chr2 143803224 143803436 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -133737 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 268-60 chr8 112573091 112573445 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 22 of 66) MIRc|SINE|MIR -70225 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 162.5-188 chr9 26361592 26361789 + 1.25 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 295015 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 162.25-81 chr2 124611818 124612017 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 12 of 23) MIRb|SINE|MIR 586630 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 189.25-109 chr7 7991679 7991910 + 1.25 NA intron (NM_138426, intron 1 of 7) intron (NM_138426, intron 1 of 7) 22998 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 237.25-48 chr3 48692669 48693016 + 1.25 NA TTS (NR_027437) TTS (NR_027437) -6927 NM_184231 51517 Hs.655006 NM_016453 ENSG00000213672 NCKIPSD AF3P21|DIP|DIP1|ORF1|SPIN90|VIP54|WASLBP|WISH NCK interacting protein with SH3 domain protein-coding 152.75-12 chr1 205012416 205012564 + 1.25 NA intron (NM_001160332, intron 26 of 27) intron (NM_001160332, intron 26 of 27) -30459 NM_001346083 6900 Hs.519220 NM_005076 ENSG00000184144 CNTN2 AXT|FAME5|TAG-1|TAX|TAX1 contactin 2 protein-coding 315-11 chr15 57534874 57535410 + 1.25 NA intron (NM_032866, intron 14 of 18) MIR3|SINE|MIR -56762 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 215.5-26 chr12 131113313 131113636 + 1.25 NA intron (NM_198827, intron 18 of 24) intron (NM_198827, intron 18 of 24) -51537 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 191.25-72 chr4 35098119 35098294 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -828459 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 188-92 chrX 16487694 16487963 + 1.25 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 139257 NR_039762 100616428 NR_039762 ENSG00000265144 MIR548AM - microRNA 548am ncRNA 191.5-52 chr16 23892556 23892899 + 1.25 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 56744 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 209.75-28 chr14 67353097 67353373 + 1.25 NA intron (NM_015994, intron 1 of 8) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 6569 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 191.25-7 chr10 11728017 11728185 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14281 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 241.5-46 chr2 124420491 124420818 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 4 of 23) MLT2C1|LTR|ERVL 395367 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 113-142 chr5 14821910 14822028 + 1.25 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 4043 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 282.75-14 chr15 69225289 69225737 + 1.25 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 64878 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 222-6 chr1 163319284 163319517 + 1.25 NA intron (NR_045630, intron 1 of 3) intron (NR_045630, intron 1 of 3) 2391 NR_045630 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 237.5-15 chr10 35100649 35101000 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -10210 NM_001198777 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 202-10 chr10 44100684 44100968 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 188424 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 200.75-22 chr12 2842444 2842690 + 1.25 NA intron (NR_147202, intron 14 of 15) AluJb|SINE|Alu -7532 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 126.25-169 chr5 177274524 177274776 + 1.25 NA intron (NM_172349, intron 18 of 23) Looper|DNA|PiggyBac 29069 NM_001031677 53917 Hs.16258 NM_130781 ENSG00000169228 RAB24 - RAB24, member RAS oncogene family protein-coding 123-132 chr3 82084401 82084539 + 1.25 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 98328 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 224.5-106 chr8 60733890 60734099 + 1.25 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) -7265 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 181.25-33 chr14 75441331 75441567 + 1.25 NA intron (NM_130469, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 9315 NM_001135049 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 194-72 chr6 98901714 98901947 + 1.25 NA intron (NR_103837, intron 4 of 4) intron (NR_103837, intron 4 of 4) 46116 NR_103837 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 133.25-53 chr14 42161947 42162188 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 555211 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 208.5-129 chr7 80503951 80504183 + 1.25 NA intron (NM_001102386, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 7997 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 292.75-13 chr2 20602903 20603153 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -10480 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 269-52 chrX 88872373 88872845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 125384 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 219-87 chr6 162451761 162452012 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) L1MEf|LINE|L1 -275246 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 203.5-134 chr8 61065432 61065748 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -97842 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 157.25-106 chr4 63469980 63470202 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 939359 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 139.25-28 chr11 27501324 27501443 + 1.25 NA intron (NM_018362, intron 3 of 4) intron (NM_018362, intron 3 of 4) 5386 NM_018362 55327 Hs.91393 NM_018362 ENSG00000148943 LIN7C LIN-7-C|LIN-7C|MALS-3|MALS3|VELI3 lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component protein-coding 210-4 chr1 69760929 69761456 + 1.25 NA intron (NM_001370785, intron 3 of 26) intron (NM_001370785, intron 3 of 26) -158130 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 127.75-192 chr7 109484457 109484636 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 475667 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 175-85 chr3 72433581 72433849 + 1.25 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) MER33|DNA|hAT-Charlie 12908 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 305-22 chr2 209290196 209290627 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -133636 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 115.5-74 chr15 59663939 59664072 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001368061, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001368061, exon 8 of 8) -6490 NM_001320930 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 126.5-173 chr4 57763105 57763278 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 337319 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 268.75-7 chr12 66892454 66892694 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -88305 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 377-3 chr14 43722591 43722957 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 784509 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 329.25-13 chr16 89358465 89358873 + 1.25 NA intron (NR_045839, intron 2 of 9) intron (NR_045839, intron 2 of 9) 37536 NM_001242885 100287036 Hs.656995 NM_001242885 LOC100287036 - uncharacterized LOC100287036 protein-coding 221.75-76 chr8 71721540 71721883 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -121412 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 273.5-69 chr6 44911770 44912073 + 1.25 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 285849 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 145.75-160 chr8 119923700 119923927 + 1.25 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) HAL1b|LINE|L1 50091 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 151.75-142 chr7 85430092 85430326 + 1.25 NA intron (NR_134240, intron 1 of 3) L1MA2|LINE|L1 9087 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 238.75-30 chr2 64645548 64645909 + 1.25 NA intron (NM_014755, intron 1 of 1) intron (NM_014755, intron 1 of 1) 8185 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 276.25-27 chr2 144757822 144758214 + 1.25 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 90051 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 190.75-81 chr5 4372271 4372526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -401083 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 359.25-4 chr21 28759440 28759861 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 125717 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 218.5-3 chr1 31479859 31480187 + 1.25 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -20062 NR_034112 149086 Hs.729905 NR_034112 ENSG00000260386 LDC1P LINC01225 leucine decarboxylase 1, pseudogene pseudo 262-41 chr5 12612798 12613045 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) L1PA11|LINE|L1 38064 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 290.5-18 chr17 61907830 61908249 + 1.25 NA intron (NM_001351695, intron 7 of 24) MIRb|SINE|MIR 19943 NM_001351695 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 318-7 chr14 54831132 54831427 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 46914 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 381.75-5 chr8 37914062 37914496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14782 NM_025151 80223 Hs.191179 NM_025151 ENSG00000156675 RAB11FIP1 NOEL1A|RCP|rab11-FIP1 RAB11 family interacting protein 1 protein-coding 293.5-22 chr18 77559265 77559742 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 309655 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 272.5-73 chr8 131887353 131887751 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16541 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 345.5-21 chr3 114332427 114332903 + 1.25 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -16096 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 196-13 chr11 19141509 19141830 + 1.25 NA intron (NM_001001483, intron 1 of 15) intron (NM_001001483, intron 1 of 15) 24501 NM_019028 54503 Hs.188569 NM_019028 ENSG00000177054 ZDHHC13 HIP14L|HIP3RP zinc finger DHHC-type containing 13 protein-coding 123.75-46 chr13 19730237 19730378 + 1.25 NA non-coding (NR_149053, exon 6 of 9) non-coding (NR_149053, exon 6 of 9) 52638 NR_003272 55269 Hs.213198 NM_001042414 ENSG00000121390 PSPC1 PSP1 paraspeckle component 1 protein-coding 248.75-3 chr1 164535635 164535900 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23593 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 257.75-47 chr7 112387248 112387524 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -35758 NM_001197080 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 359.75-2 chr10 31462501 31463110 + 1.25 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) intron (NM_001323678, intron 2 of 6) -63050 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 286.25-3 chr1 197101840 197102382 + 1.25 NA exon (NM_018136, exon 18 of 28) exon (NM_018136, exon 18 of 28) -34844 NM_001994 2165 Hs.435782 NM_001994 ENSG00000143278 F13B FXIIIB coagulation factor XIII B chain protein-coding 411.75-6 chr3 188289057 188289509 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 63878 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 299-10 chr11 72735211 72735594 + 1.25 NA intron (NM_001040118, intron 1 of 34) AluSx1|SINE|Alu -13044 NM_001135190 116985 Hs.503165 NM_015242 ENSG00000186635 ARAP1 CENTD2 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 442.5 chr1 59006138 59006688 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -14063 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 307.75-13 chr2 156681333 156681682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 245128 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 284.5-30 chr2 64556847 64557161 + 1.25 NA intron (NM_001002243, intron 2 of 8) (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31491 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 147.5-144 chr3 105610197 105610397 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 243388 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 124.5-141 chr3 59881576 59881719 + 1.25 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) 199262 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 268.5-34 chr3 9061628 9062093 + 1.25 NA intron (NM_014850, intron 5 of 21) intron (NM_014850, intron 5 of 21) -98388 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 234.25-11 chr10 52858290 52858603 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86746 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 266-5 chr10 19472713 19473086 + 1.25 NA intron (NM_001142308, intron 29 of 39) L1MA10|LINE|L1 255651 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 147-87 chr20 57295640 57295825 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25859 NR_036219 100422883 NR_036219 ENSG00000266666 MIR4325 - microRNA 4325 ncRNA 145-42 chr12 124773231 124773406 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66353 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 127-8 chr1 215168817 215169016 + 1.25 NA intron (NM_001017424, intron 3 of 6) intron (NM_001017424, intron 3 of 6) 86179 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 174.5-26 chr10 103176471 103176678 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001351190, exon 1 of 19) 5' UTR (NM_001351190, exon 1 of 19) 483 NM_001351189 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 234.5-58 chr22 34850006 34850256 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) LTR38B|LTR|ERV1 147785 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 128.5-80 chr16 11278650 11278769 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2229 NM_001286356 5620 Hs.2324 NM_002762 ENSG00000122304 PRM2 CT94.2 protamine 2 protein-coding 200.25-40 chr15 70442455 70442742 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 63330 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 402.25 chr12 127950968 127951582 + 1.25 NA non-coding (NR_046392, exon 5 of 5) non-coding (NR_046392, exon 5 of 5) 32616 NR_126452 104472718 Hs.628661 NR_126452 LINC00508 - long intergenic non-protein coding RNA 508 ncRNA 184-97 chr8 126431072 126431409 + 1.25 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 105745 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 208.5-128 chr7 35709256 35709535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7042 NR_108082 100506725 Hs.304253 NR_108082 ENSG00000227544 LOC100506725 - uncharacterized LOC100506725 ncRNA 219.25-48 chr3 83797922 83798224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1071502 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 196.25-87 chr3 142669028 142669310 + 1.25 NA intron (NM_001145319, intron 2 of 15) FRAM|SINE|Alu 12272 NM_001172312 5357 Hs.203637 NM_002670 ENSG00000120756 PLS1 - plastin 1 protein-coding 203.25-25 chr11 80839021 80839283 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76349 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 205-19 chr14 35606580 35606748 + 1.25 NA intron (NM_014990, intron 34 of 40) intron (NM_014990, intron 34 of 40) 72500 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 262.25-52 chr9 27710414 27710681 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -136681 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 274.25-28 chr2 122655931 122656433 + 1.25 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 417299 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 229.5-58 chr2 4901841 4902081 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -245739 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 298.5 chr1 54101622 54101981 + 1.25 NA 3' UTR (NM_153035, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_153035, exon 5 of 5) 47722 NR_039942 100616315 NR_039942 ENSG00000283749 MIR4781 mir-4781 microRNA 4781 ncRNA 144.25-114 chr20 32797845 32797978 + 1.25 NA intron (NM_175848, intron 13 of 21) AluSx|SINE|Alu 18059 NM_175850 1789 Hs.643024 NM_006892 ENSG00000088305 DNMT3B ICF|ICF1|M.HsaIIIB DNA methyltransferase 3 beta protein-coding 340-15 chr5 22658416 22658753 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 194760 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 150.75-3 chr1 24772003 24772212 + 1.25 NA intron (NM_013943, intron 1 of 5) intron (NM_013943, intron 1 of 5) 26660 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 293-39 chr8 110676149 110676660 + 1.25 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy 351029 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 272.25-33 chr3 21588956 21589396 + 1.25 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 46387 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 151-63 chr2 104161536 104161769 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 246680 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 189.5-35 chr12 26194657 26194915 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001135823) promoter-TSS (NM_001135823) -550 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 154.25-118 chr4 104320411 104320700 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -170410 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 176-62 chr5 102263217 102263421 + 1.25 NA intron (NM_180991, intron 4 of 12) intron (NM_180991, intron 4 of 12) 32965 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 134.5-109 chr2 197873245 197873424 + 1.25 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 68741 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 197-11 chr12 54574202 54574542 + 1.25 NA intron (NM_001165975, intron 9 of 14) MIR|SINE|MIR 12907 NM_001315535 5153 Hs.530871 NM_000924 ENSG00000123360 PDE1B HEL-S-79p|PDE1B1|PDES1B phosphodiesterase 1B protein-coding 273-10 chr10 61710909 61711298 + 1.25 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) L1MEc|LINE|L1 48142 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 311.25-14 chr3 37930304 37930696 + 1.25 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) FLAM_C|SINE|Alu -38904 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 251.75-34 chr2 13576952 13577177 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -570051 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 229.25-11 chr10 117441906 117442224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66625 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 278.75-27 chr4 39717401 39717833 + 1.25 NA intron (NM_001111113, intron 1 of 4) intron (NM_001111113, intron 1 of 4) 19481 NM_001111113 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 218.25-57 chr3 138501031 138501315 + 1.25 NA intron (NM_001320599, intron 13 of 17) intron (NM_001320599, intron 13 of 17) 66557 NM_001322834 83850 Hs.477711 NM_031913 ENSG00000158220 ESYT3 CHR3SYT|E-Syt3|FAM62C extended synaptotagmin 3 protein-coding 346.5-4 chr12 13110562 13111133 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -7180 NM_001080555 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 306.25-28 chr22 27146222 27146683 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41064 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 244.75-22 chr17 17868642 17868944 + 1.25 NA intron (NM_001288787, intron 7 of 13) intron (NM_001288787, intron 7 of 13) -31782 NM_004176 6720 Hs.592123 NM_004176 ENSG00000072310 SREBF1 SREBP1|bHLHd1 sterol regulatory element binding transcription factor 1 protein-coding 482.75-3 chr8 131942207 131942753 + 1.25 NA intron (NM_001323557, intron 2 of 22) MIR|SINE|MIR 25707 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 247-44 chr3 139681767 139682155 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3911 NM_001363968 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 225.5-10 chr10 11526756 11527066 + 1.25 NA intron (NM_014688, intron 3 of 14) intron (NM_014688, intron 3 of 14) 5369 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 124.5-27 chr10 103123546 103123737 + 1.25 NA intron (NM_001351176, intron 2 of 17) intron (NM_001351176, intron 2 of 17) 30180 NM_001351191 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 189.75-50 chr17 32224210 32224431 + 1.25 NA intron (NR_110083, intron 20 of 20) intron (NR_110083, intron 20 of 20) -41512 NM_001330181 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 166.5-75 chr16 53565687 53565904 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62491 NM_001308325 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 238.25-70 chr5 140451464 140451673 + 1.25 NA intron (NM_001197030, intron 7 of 9) AluJb|SINE|Alu 49735 NM_017978 54882 Hs.594084 NM_017747 ENSG00000131503 ANKHD1 MASK|MASK1|PP2500|VBARP ankyrin repeat and KH domain containing 1 protein-coding 123.25-45 chr12 50144378 50144591 + 1.25 NA intron (NR_138536, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 22885 NM_001331073 91012 Hs.270525 NM_147190 ENSG00000139624 CERS5 LASS5|Trh4 ceramide synthase 5 protein-coding 369.75-8 chr16 83398927 83399470 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -109148 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 137.25-56 chr17 43776595 43776749 + 1.25 NA intron (NM_004090, intron 1 of 2) intron (NM_004090, intron 1 of 2) 2305 NM_004090 1845 Hs.181046 NM_004090 ENSG00000108861 DUSP3 VHR dual specificity phosphatase 3 protein-coding 313.25-18 chr3 38446876 38447237 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -6834 NM_001106 93 Hs.174273 NM_001106 ENSG00000114739 ACVR2B ACTRIIB|ActR-IIB|HTX4 activin A receptor type 2B protein-coding 224.25-28 chr13 112639885 112640240 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -6982 NM_207440 400165 Hs.591213 NM_207440 ATP11AUN C13orf35|SMABLO1 ATP11A upstream neighbor protein-coding 340-21 chr8 124342850 124343289 + 1.25 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER57A-int|LTR|ERV1 29630 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 333.5-8 chr17 61864256 61864561 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_032043) promoter-TSS (NM_032043) -849 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 161.25-103 chr2 219979447 219979619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72968 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 342.25-6 chr14 64060811 64061210 + 1.25 NA intron (NM_015180, intron 49 of 114) L1M1|LINE|L1 34115 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 199.25-23 chr12 90961062 90961257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5983 NR_130711 196477 Hs.128574 NM_152638 ENSG00000197651 CCER1 C12orf12 coiled-coil glutamate rich protein 1 protein-coding 207-12 chr11 23128830 23129132 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -268507 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 230.5-52 chr17 60165276 60165527 + 1.25 NA intron (NR_137422, intron 8 of 11) intron (NR_137422, intron 8 of 11) 15428 NM_000717 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 317.5-29 chr7 12505779 12506142 + 1.25 NA intron (NR_136263, intron 1 of 3) intron (NR_136263, intron 1 of 3) 1563 NR_136263 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 340-10 chr3 35721001 35721501 + 1.25 NA intron (NM_016300, intron 13 of 19) intron (NM_016300, intron 13 of 19) -23225 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 256.25-52 chr8 131929832 131930194 + 1.25 NA intron (NM_001323557, intron 1 of 22) intron (NM_001323557, intron 1 of 22) 13240 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 228.5-82 chr5 85301503 85301730 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -916736 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 278.5-3 chr1 42506024 42506423 + 1.25 NA intron (NM_001355227, intron 6 of 18) HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -26797 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 140-63 chr17 73609608 73609826 + 1.25 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 34728 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 162.25-116 chr4 112635366 112635627 + 1.25 NA intron (NM_018392, intron 1 of 27) AluJr|SINE|Alu -1468 NM_001267039 51574 Hs.713663 NM_015454 ENSG00000174720 LARP7 ALAZS|HDCMA18P|PIP7S La ribonucleoprotein domain family member 7 protein-coding 242.5-59 chr4 80934205 80934464 + 1.25 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) L1MA9|LINE|L1 -96374 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 322.5-36 chr6 75390406 75390713 + 1.25 NA intron (NR_125859, intron 2 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 7373 NR_125859 101928540 Hs.526972 NR_125859 LOC101928540 - uncharacterized LOC101928540 ncRNA 158.5-49 chr12 78822796 78822978 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41095 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 128.5-7 chr1 35872847 35873192 + 1.25 NA intron (NM_001317123, intron 1 of 18) SVA_E|Retroposon|SVA 3211 NM_001317123 26523 Hs.22867 NM_012199 ENSG00000092847 AGO1 EIF2C|EIF2C1|GERP95|Q99|hAgo1 argonaute RISC component 1 protein-coding 223.5-76 chr3 7232773 7233031 + 1.25 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) 302382 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 201.25-27 chr12 101000637 101000916 + 1.25 NA intron (NM_001286616, intron 7 of 26) intron (NM_001286616, intron 7 of 26) 99130 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 250.5-76 chr5 92519645 92519872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1051585 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 210.5-142 chr9 74682399 74682592 + 1.25 NA intron (NM_006914, intron 9 of 9) MIR|SINE|MIR 66961 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 218.25-95 chr8 80421115 80421315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64378 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 283.75-29 chr6 101701778 101702138 + 1.25 NA intron (NM_001166247, intron 6 of 16) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 302973 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 267.5 chr1 47461657 47461900 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24461 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 162.75-143 chr8 99702170 99702417 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 36 of 61) intron (NM_017890, intron 36 of 61) -165432 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 219-85 chr5 135540283 135540581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4468 NM_006161 4762 Hs.248149 NM_006161 ENSG00000181965 NEUROG1 AKA|Math4C|NEUROD3|bHLHa6|ngn1 neurogenin 1 protein-coding 159-28 chr12 47559361 47559599 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 144472 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 157.75-188 chrX 46299235 46299474 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 28320 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 154.25-110 chr3 151876175 151876343 + 1.25 NA intron (NM_033050, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 2616 NM_033050 56670 Hs.133181 NM_033050 ENSG00000198829 SUCNR1 GPR91 succinate receptor 1 protein-coding 290-21 chr17 61580061 61580363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11007 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 242.5-88 chr9 27587720 27588061 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14024 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 128.5-8 chr1 51369508 51369656 + 1.25 NA intron (NM_001159969, intron 9 of 12) intron (NM_001159969, intron 9 of 12) -24466 NM_001144832 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 162.75-109 chr4 144291868 144292122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -151277 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 235.25-8 chr10 95753861 95754065 + 1.25 NA non-coding (NR_038444, exon 6 of 6) non-coding (NR_038444, exon 6 of 6) -1689 NM_001164178 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 274.5-43 chr3 42646342 42646666 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001349124, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001349124, exon 17 of 17) -7193 NM_145166 92999 Hs.409561 NM_145166 ENSG00000114853 ZBTB47 ZNF651 zinc finger and BTB domain containing 47 protein-coding 249-10 chr12 45426362 45426667 + 1.25 NA intron (NM_001142679, intron 19 of 19) L2a|LINE|L2 133824 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 167.75-36 chr12 23367253 23367488 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 191734 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 214.75-77 chr7 52677334 52677586 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -358173 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 164.5-193 chr7 90091455 90091622 + 1.25 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) L1PA16|LINE|L1 -27862 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 282.25-24 chr3 97869573 97869927 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 3 of 21) intron (NM_153605, intron 3 of 21) 47739 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 226.75-53 chr3 139229396 139229726 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3961 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 328.5-24 chr3 97051007 97051335 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 236577 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 136-5 chr1 89526912 89527063 + 1.25 NA intron (NM_001369819, intron 2 of 6) intron (NM_001369819, intron 2 of 6) 2149 NM_001369819 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 201.25-26 chr12 65240823 65241067 + 1.25 NA exon (NM_001167614, exon 9 of 13) exon (NM_001167614, exon 9 of 13) -37738 NM_001031679 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 210-42 chr18 1177583 1177911 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 181882 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 242.25-79 chr7 6221367 6221654 + 1.25 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) L1MD2|LINE|L1 -49373 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 166.5-137 chr3 177330777 177331033 + 1.25 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 36463 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 342.25-20 chr8 134632809 134633407 + 1.25 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) intron (NM_020863, intron 3 of 15) 35037 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 205-25 chr16 11245542 11245977 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 10423 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 186.25-115 chr8 19562530 19562902 + 1.25 NA intron (NM_001354497, intron 1 of 7) L1PA10|LINE|L1 39829 NM_001354491 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 252.75-71 chr8 25027050 25027315 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -70313 NM_006158 4747 Hs.521461 NM_006158 ENSG00000277586 NEFL CMT1F|CMT2E|CMTDIG|NF-L|NF68|NFL|PPP1R110 neurofilament light protein-coding 170.5-32 chr11 9646656 9646924 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17287 NM_001297714 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 147-127 chr7 27510841 27511076 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105016 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 305.25-23 chr2 66677278 66677729 + 1.25 NA intron (NR_110156, intron 4 of 5) intron (NR_110156, intron 4 of 5) 25724 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 299.25-25 chr2 130972117 130972533 + 1.25 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) MER92-int|LTR|ERV1 120837 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 163.25-51 chr16 86222930 86223101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26834 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 273.5-17 chr11 102580398 102580653 + 1.25 NA intron (NM_004771, intron 8 of 9) intron (NM_004771, intron 8 of 9) 44807 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 288-12 chr11 25804256 25804517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -384737 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 356.75-14 chr6 139741032 139741554 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -29780 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 127-99 chr2 56030211 56030368 + 1.25 NA intron (NR_126406, intron 1 of 2) intron (NR_126406, intron 1 of 2) 17037 NR_126406 104355290 Hs.580331 NR_126406 MIR217HG MIR216AHG|MIR216BHG MIR217 host gene ncRNA 248.5-58 chr21 27710600 27710840 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -11659 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 246.75-14 chr12 116418152 116418411 + 1.25 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 10037 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 157-107 chr6 53437696 53437868 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88603 NM_001242830 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 181.75-70 chr20 55361384 55361636 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61533 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 295.25-30 chr7 101296114 101296538 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3287 NR_146480 101927721 Hs.148659 NR_146480 ENSG00000232301 LNCPRESS1 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 1 ncRNA 147.25-8 chr1 108881071 108881234 + 1.25 NA intron (NM_001321038, intron 1 of 14) intron (NM_001321038, intron 1 of 14) 4167 NM_001321039 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 272.25-22 chr17 67564646 67565018 + 1.25 NA intron (NM_181671, intron 4 of 9) intron (NM_181671, intron 4 of 9) -93247 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 239.5-71 chr7 66083670 66084021 + 1.25 NA intron (NM_000048, intron 6 of 16) intron (NM_000048, intron 6 of 16) 8026 NM_001024943 435 Hs.632015 NM_000048 ENSG00000126522 ASL ASAL argininosuccinate lyase protein-coding 289-2 chr1 224178990 224179335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4078 NM_003676 8560 Hs.299878 NM_003676 ENSG00000143753 DEGS1 DEGS|DEGS-1|DES1|Des-1|FADS7|HLD18|MIG15|MLD delta 4-desaturase, sphingolipid 1 protein-coding 154-58 chr2 6619079 6619289 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14603 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 267.5-40 chr2 188106423 188106812 + 1.25 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) L1PA15|LINE|L1 181074 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 235.5-41 chr17 55681597 55681975 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41078 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 140-39 chr13 84209164 84209450 + 1.25 NA intron (NR_046871, intron 1 of 6) intron (NR_046871, intron 1 of 6) 68705 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 162-10 chr1 192144238 192144501 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -14093 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 243-42 chr21 24780025 24780333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60371 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 177-16 chr10 113422797 113423010 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -127928 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 182-86 chr4 142248128 142248280 + 1.25 NA intron (NM_001331040, intron 11 of 25) intron (NM_001331040, intron 11 of 25) 598331 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 243.75-24 chr14 81391320 81391921 + 1.25 NA intron (NM_001366850, intron 4 of 7) intron (NM_001366850, intron 4 of 7) 36155 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 285-9 chr11 113710557 113711162 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -4486 NR_110046 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 162.5-190 chr9 37717852 37718117 + 1.25 NA intron (NM_001371225, intron 5 of 15) L3|LINE|CR1 -35819 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 146-25 chr12 4412662 4412872 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 32847 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 241.75-5 chr10 37348136 37348410 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39087 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 124-95 chr2 195458044 195458189 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -198842 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 192.25-88 chr5 112261194 112261404 + 1.25 NA intron (NM_001347887, intron 7 of 23) intron (NM_001347887, intron 7 of 23) 33016 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 193.75-40 chr14 47226461 47226730 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 116651 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 220.5-112 chr7 7081385 7081584 + 1.25 NA non-coding (NR_034022, exon 1 of 1) non-coding (NR_034022, exon 1 of 1) -14439 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 328.25-11 chr2 32624298 32624688 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3557 NM_017735 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 147.75-6 chr1 61446572 61446747 + 1.25 NA intron (NM_001134673, intron 10 of 10) intron (NM_001134673, intron 10 of 10) -193141 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 264.5-38 chr3 112428711 112429116 + 1.25 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 70559 NM_181780 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 268-30 chr2 164012670 164012903 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -276778 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 150.75-182 chr8 89960291 89960496 + 1.25 NA intron (NM_001024688, intron 9 of 16) AluJr|SINE|Alu 24278 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 340.75-19 chr4 97764870 97765274 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) intron (NM_174952, intron 9 of 10) 378404 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 390-8 chr20 62056159 62056566 + 1.25 NA intron (NM_003185, intron 1 of 14) intron (NM_003185, intron 1 of 14) -8440 NR_130463 100422838 NR_130463 ENSG00000265306 MIR3195 - microRNA 3195 ncRNA 255.75-33 chr3 145429616 145429984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 639385 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 210.5-41 chr14 97921981 97922229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56019 NR_152747 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 314.25-6 chr13 110887644 110888043 + 1.25 NA intron (NR_104587, intron 5 of 6) intron (NR_104587, intron 5 of 6) -17535 NR_027701 283487 Hs.245390 NM_178514 ENSG00000255874 LINC00346 C13orf29|NCRNA00346 long intergenic non-protein coding RNA 346 ncRNA 139.5-82 chr17 78933975 78934159 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8680 NM_003255 7077 Hs.633514 NM_003255 ENSG00000035862 TIMP2 CSC-21K|DDC8 TIMP metallopeptidase inhibitor 2 protein-coding 263-22 chr17 56555590 56555941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37934 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 231.25-41 chr2 104031630 104031982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 376526 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 168.5-50 chr13 50076512 50076683 + 1.25 NA intron (NR_152566, intron 1 of 13) intron (NR_152566, intron 1 of 13) 5444 NR_152572 8847 Hs.547964 NR_002612 ENSG00000231607 DLEU2 ALT1|BCMSUN|DLB2|LEU2|LINC00022|MIR15AHG|NCRNA00022|RFP2|RFP2OS|TRIM13OS deleted in lymphocytic leukemia 2 ncRNA 165.25-133 chr7 25670177 25670436 + 1.25 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 425 NR_157816 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 306.25-5 chr1 184745821 184746235 + 1.25 NA intron (NM_025191, intron 2 of 19) intron (NM_025191, intron 2 of 19) 8830 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 170-9 chr10 56279684 56279888 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81473 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 132.25-160 chr5 146377153 146377324 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38399 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 266-27 chr21 19316759 19317028 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -557081 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 263.25-42 chr5 24198385 24198783 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 247236 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 156.5-49 chr13 99291774 99291978 + 1.25 NA intron (NR_026644, intron 4 of 8) L2b|LINE|L2 15523 NM_004951 1880 Hs.784 NM_004951 ENSG00000169508 GPR183 EBI2|hEBI2 G protein-coupled receptor 183 protein-coding 122.75-22 chr10 33860044 33860156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87420 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 150.25-153 chr8 120181575 120181895 + 1.25 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 56633 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 166-95 chr5 25636312 25636589 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 445497 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 196.25-110 chr6 87682146 87682505 + 1.25 NA intron (NM_018064, intron 1 of 4) intron (NM_018064, intron 1 of 4) 19908 NM_018064 55122 Hs.485915 NM_018064 ENSG00000135334 AKIRIN2 C6orf166|FBI1|dJ486L4.2 akirin 2 protein-coding 308.5 chr1 49012400 49012671 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) intron (NM_001323575, intron 5 of 12) -235566 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 238-63 chr7 105939290 105939519 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -23860 NM_152750 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 350.25-30 chr7 53260121 53260523 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 224689 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 141.25-155 chr6 62380216 62380428 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -94095 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 224.5-25 chr11 38885280 38885532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 236548 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 285.25-4 chr12 18812050 18812355 + 1.25 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 74083 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 178.75-115 chr8 132829667 132829856 + 1.25 NA intron (NM_001277196, intron 13 of 19) MIR|SINE|MIR -37197 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 211.5-164 chr8 121130419 121130656 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -318491 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 178.5-152 chr6 16708088 16708299 + 1.25 NA intron (NM_000332, intron 3 of 8) L1ME2|LINE|L1 51991 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 134.25-163 chr6 147625305 147625526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 116725 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 147.5-187 chr6 62860050 62860323 + 1.25 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 459791 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 163.75-96 chr3 140951618 140951796 + 1.25 NA intron (NM_001104647, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 9871 NM_018155 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 164.75-133 chr7 36060971 36061200 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -34225 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 147.75-83 chr2 213726083 213726268 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) LTR16C|LTR|ERVL -31892 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 185.75-117 chr7 34183749 34184014 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 278342 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 171-43 chr15 59930002 59930161 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74230 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 296.75-2 chr1 158586726 158587008 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -6968 NM_001004477 128367 Hs.553589 NM_001004477 ENSG00000279111 OR10X1 OR1-13|OR1-14|OR10X1P olfactory receptor family 10 subfamily X member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 140.25-10 chr1 98521483 98521623 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -140168 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 224.75-7 chr1 69146415 69146647 + 1.25 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 90633 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 206-54 chr3 182657862 182658153 + 1.25 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -135497 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 230-35 chr2 113966779 113967234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2316 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 203.75-105 chr7 135549249 135549501 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8542 NM_015135 23165 Hs.743250 NM_015135 ENSG00000155561 NUP205 C7orf14|NPHS13 nucleoporin 205 protein-coding 181.5-4 chr1 93446591 93446916 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1365 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 178.75-31 chr14 69633836 69634083 + 1.25 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 22363 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 158-3 chr1 39271412 39271570 + 1.25 NA intron (NM_012090, intron 5 of 92) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -137582 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 232.75-18 chr12 76491729 76492030 + 1.25 NA intron (NM_001003712, intron 1 of 22) intron (NM_001003712, intron 1 of 22) 67892 NM_001319653 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 208.75-41 chr2 214671564 214671907 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137948 NR_104215 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 123.75-193 chr8 110887499 110887642 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 139863 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 134.75-31 chr10 90914307 90914502 + 1.25 NA intron (NM_014391, intron 8 of 8) CR1_Mam|LINE|CR1 6871 NM_014391 27063 Hs.448589 NM_014391 ENSG00000148677 ANKRD1 ALRP|C-193|CARP|CVARP|MCARP|bA320F15.2 ankyrin repeat domain 1 protein-coding 342.75-23 chr5 132192414 132192797 + 1.25 NA TTS (NM_004199) TTS (NM_004199) 7729 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 176-12 chr11 79317205 79317481 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) 84766 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 447.25-3 chr7 14763271 14763755 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) MIRc|SINE|MIR 77937 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 374.25-6 chr22 20102194 20102730 + 1.25 NA intron (NM_022720, intron 9 of 13) L1ME1|LINE|L1 12289 NR_106874 102465490 NR_106874 ENSG00000278278 MIR6816 hsa-mir-6816 microRNA 6816 ncRNA 149-36 chr15 59360182 59360450 + 1.25 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) intron (NM_004998, intron 1 of 27) 12555 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 204.25-53 chr2 38221107 38221330 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 90113 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 190.5-31 chr12 8039415 8039655 + 1.25 NA intron (NM_018416, intron 1 of 10) intron (NM_018416, intron 1 of 10) 6819 NM_018416 55810 Hs.120844 NM_018416 ENSG00000065970 FOXJ2 FHX forkhead box J2 protein-coding 223.5-9 chr1 169525786 169526039 + 1.25 NA exon (NM_000130, exon 18 of 25) exon (NM_000130, exon 18 of 25) -39942 NM_001319667 10560 Hs.30246 NM_006996 ENSG00000117479 SLC19A2 TC1|THMD1|THT1|THTR1|TRMA solute carrier family 19 member 2 protein-coding 325.75-9 chr17 14167644 14168090 + 1.25 NA intron (NM_001303, intron 5 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 68995 NM_001348781 146822 Hs.447556 NM_001007530 ENSG00000223510 CDRT15 - CMT1A duplicated region transcript 15 protein-coding 161.25-30 chr11 110973102 110973290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 124122 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 170-62 chr3 86921645 86921825 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69414 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 194.75-88 chr7 55512825 55513058 + 1.25 NA intron (NM_001321242, intron 2 of 4) intron (NM_001321242, intron 2 of 4) 13939 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 327-30 chrX 42044061 42044528 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120740 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 150.5-130 chr3 77369476 77369708 + 1.25 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 271580 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 163-48 chr17 69627379 69627571 + 1.25 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 33488 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 131-77 chr19 51635275 51635398 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4862 NM_003830 8778 Hs.310333 NM_003830 ENSG00000105501 SIGLEC5 CD170|CD33L2|OB-BP2|OBBP2|SIGLEC-5 sialic acid binding Ig like lectin 5 protein-coding 155.5-61 chr16 5669866 5670065 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 37498 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 176.75-17 chr11 8258986 8259148 + 1.25 NA intron (NM_001270428, intron 1 of 3) intron (NM_001270428, intron 1 of 3) 4811 NM_002315 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 206.75-72 chr5 139282194 139282439 + 1.25 NA intron (NM_001282278, intron 4 of 16) intron (NM_001282278, intron 4 of 16) 3536 NR_002915 26821 Hs.684893 NR_002915 ENSG00000200959 SNORA74A RNU19|U19 small nucleolar RNA, H/ACA box 74A snoRNA 177-61 chr3 46029404 46029575 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -2006 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 248.75 chr1 110930714 110931043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33044 NM_018372 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 221-46 chr21 24461643 24461938 + 1.25 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) L1ME1|LINE|L1 33050 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 177-9 chr10 44456712 44456895 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -71706 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 214.75-72 chr6 90488871 90489402 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 97936 NM_003188 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 330-12 chr2 129075459 129075780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 198272 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 127-55 chr14 19954001 19954175 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 18480 NM_001004063 79544 Hs.554584 NM_001004063 ENSG00000155249 OR4K1 OR14-19 olfactory receptor family 4 subfamily K member 1 protein-coding 306.75-4 chr11 8075590 8076003 + 1.25 NA intron (NM_003320, intron 2 of 12) intron (NM_003320, intron 2 of 12) -5566 NM_177972 7275 Hs.568986 NM_003320 ENSG00000166402 TUB RDOB|rd5 TUB bipartite transcription factor protein-coding 197-32 chr2 136841802 136842017 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 76364 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 223-31 chr17 62352131 62352489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17908 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 196-100 chr8 144183309 144183482 + 1.25 NA intron (NM_001099281, intron 6 of 11) AluJb|SINE|Alu 34750 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 245.25-24 chr15 69962171 69962383 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 117191 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 121.5-125 chr2 18209324 18209437 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 330713 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 400.5-4 chr18 6894413 6894866 + 1.25 NA intron (NM_001010000, intron 13 of 16) L1ME4b|LINE|L1 35230 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 279.25-15 chr14 99977069 99977419 + 1.25 NA intron (NM_001330221, intron 1 of 13) intron (NM_001330221, intron 1 of 13) 5822 NM_001330221 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 263.75-23 chr18 8630931 8631304 + 1.25 NA intron (NM_001025300, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 21672 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 244.25-20 chr2 62655916 62656232 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17804 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 276-16 chr12 16553170 16553618 + 1.25 NA intron (NM_001001395, intron 3 of 3) intron (NM_001001395, intron 3 of 3) 51985 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 160.75-138 chr6 164880660 164880879 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58706 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 268.5-24 chr16 47278338 47278826 + 1.25 NA intron (NM_030790, intron 10 of 17) intron (NM_030790, intron 10 of 17) 134514 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 214-11 chr11 60394847 60395096 + 1.25 NA 3' UTR (NM_206940, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_206940, exon 6 of 6) -1043 NM_001261827 84689 Hs.709736 NM_032597 ENSG00000166928 MS4A14 MS4A16|NYD-SP21 membrane spanning 4-domains A14 protein-coding 277.5-43 chr3 46267907 46268191 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25589 NM_001837 1232 Hs.506190 NM_001837 ENSG00000183625 CCR3 CC-CKR-3|CD193|CKR3|CMKBR3 C-C motif chemokine receptor 3 protein-coding 218.25-86 chr6 142008502 142008827 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 80135 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 159-77 chr4 70751384 70751623 + 1.25 NA intron (NM_001291994, intron 2 of 13) L1MB7|LINE|L1 17093 NM_001291993 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 344 chr1 72699800 72700375 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -417548 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 354.25-17 chr8 127857383 127857987 + 1.25 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 61723 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 161-130 chr9 97832504 97832686 + 1.25 NA intron (NR_147055, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu 20485 NR_147055 101928337 NR_147055 ENSG00000236130 PTCSC2 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 2 ncRNA 193.25-63 chr2 235598586 235598863 + 1.25 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -80803 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 212-22 chr14 68275275 68275481 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 353409 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 298.75-7 chr1 177863882 177864387 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 105788 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 302-9 chr12 42126330 42126691 + 1.25 NA intron (NM_001099650, intron 1 of 6) Alu|SINE|Alu 18364 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 298.75-33 chr7 38884763 38885025 + 1.25 NA intron (NM_014396, intron 2 of 28) intron (NM_014396, intron 2 of 28) 24297 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 196.75-93 chr6 87580718 87581125 + 1.25 NA intron (NR_146756, intron 1 of 19) MIR|SINE|MIR 9066 NM_020320 57038 Hs.485910 NM_020320 ENSG00000146282 RARS2 ArgRS|DALRD2|PCH6|PRO1992|RARSL arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 249-25 chr2 213327797 213328187 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 4 of 14) MIRb|SINE|MIR 43528 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 256.5-18 chr12 65928334 65928639 + 1.25 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -46161 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 234.25-26 chr17 44112764 44113123 + 1.25 NA intron (NM_001015053, intron 2 of 26) intron (NM_001015053, intron 2 of 26) -2969 NR_136415 105371789 Hs.579304 NR_136415 ENSG00000267638 LOC105371789 - uncharacterized LOC105371789 ncRNA 251-37 chr21 26000848 26001106 + 1.25 NA intron (NM_001204301, intron 6 of 16) intron (NM_001204301, intron 6 of 16) 139413 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 225-49 chr3 193376589 193376863 + 1.25 NA intron (NM_198505, intron 1 of 29) L1PA11|LINE|L1 2027 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 180.25-90 chr5 26037734 26037926 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 846877 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 327.25-25 chr7 43935445 43935738 + 1.25 NA intron (NM_015983, intron 1 of 6) intron (NM_015983, intron 1 of 6) 9155 NM_015983 51619 Hs.19196 NM_015983 ENSG00000078967 UBE2D4 HBUCE1 ubiquitin conjugating enzyme E2 D4 (putative) protein-coding 159.75-138 chr5 115791282 115791532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25250 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 411.25-6 chr5 42138065 42138527 + 1.25 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 37049 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 294.75-6 chr12 56398446 56398757 + 1.25 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -35744 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 156-51 chr14 80745968 80746114 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 18 of 24) L1MB7|LINE|L1 195697 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 313-11 chr2 7500048 7500473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 78999 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 350.5-3 chr1 116947947 116948286 + 1.25 NA intron (NM_020440, intron 3 of 8) intron (NM_020440, intron 3 of 8) 38200 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 181.75-33 chr14 45603579 45603747 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 111939 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 179.5-158 chr6 116153213 116153470 + 1.25 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) -27209 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 186.25-53 chr2 141999494 141999651 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 132129 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 196.75-53 chr2 27084171 27084344 + 1.25 NA intron (NM_007046, intron 4 of 7) intron (NM_007046, intron 4 of 7) -2515 NM_000221 3795 Hs.567297 NM_000221 ENSG00000138030 KHK - ketohexokinase protein-coding 189.75-38 chr14 87516121 87516359 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 139054 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 174.25-79 chr2 61311283 61311629 + 1.25 NA intron (NM_014709, intron 27 of 79) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 105921 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 250.75-23 chr2 29957192 29957609 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35814 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 216.25-78 chr4 98450990 98451206 + 1.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 189714 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 186-21 chr12 87760445 87760964 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8108 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 236.5-86 chr8 27097411 27097798 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -48641 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 235.25-6 chr1 224141582 224141965 + 1.25 NA intron (NM_001136115, intron 3 of 3) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 27662 NM_015176 23219 Hs.64691 NM_015176 ENSG00000143756 FBXO28 CENP-30|Fbx28 F-box protein 28 protein-coding 155.75-135 chr5 156566073 156566287 + 1.25 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) L1PA7|LINE|L1 239016 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 151.75-15 chr1 211400953 211401197 + 1.25 NA intron (NR_026761, intron 4 of 5) L1MA3|LINE|L1 18320 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 276.25-36 chr6 120298136 120298427 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 283102 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 184.75-50 chr2 51586224 51586459 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 553740 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 347.25-2 chr12 59826896 59827377 + 1.25 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie 137766 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 185.75-134 chr9 32990670 32990930 + 1.25 NA intron (NR_160921, intron 1 of 7) intron (NR_160921, intron 1 of 7) 10776 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 250.5-108 chrX 46887093 46887316 + 1.25 NA TTS (NR_046101) TTS (NR_046101) 12500 NR_046101 724087 Hs.679235 NR_046101 ENSG00000204904 LINC01545 CXorf31 long intergenic non-protein coding RNA 1545 ncRNA 184.75-90 chr6 166947088 166947276 + 1.25 NA intron (NM_003730, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 9368 NM_003730 8635 Hs.529989 NM_003730 ENSG00000026297 RNASET2 RNASE6PL|bA514O12.3 ribonuclease T2 protein-coding 118-111 chr3 23097985 23098086 + 1.25 NA Intergenic MamRep1894|DNA|hAT 104543 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 161.5-4 chr1 35414329 35414621 + 1.25 NA intron (NM_005095, intron 27 of 29) intron (NM_005095, intron 27 of 29) -48398 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 254.25-20 chr14 25512081 25512368 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -461927 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 212-65 chr4 170503913 170504200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 239679 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 126.25-170 chr6 11962944 11963214 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 38165 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 262.75-14 chr14 50044297 50044640 + 1.25 NA intron (NR_131171, intron 4 of 8) intron (NR_131171, intron 4 of 8) -36948 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 292.75-34 chr8 111100203 111100491 + 1.25 NA intron (NR_125418, intron 3 of 3) intron (NR_125418, intron 3 of 3) -72914 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 292.5-8 chr10 47201720 47202090 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98292 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 169.5-106 chr3 39533331 39533547 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 31373 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 199.5-29 chr12 12353904 12354155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3038 NR_024061 503693 Hs.67553 NR_024061 ENSG00000205791 LOH12CR2 LOH2CR12 loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 2 ncRNA 208.5-87 chr3 109956375 109956572 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 353645 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 147.25-115 chr6 17044141 17044422 + 1.25 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -57977 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 174.5-157 chr6 39073846 39074175 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_162114) promoter-TSS (NR_162114) -304 NR_162114 113218508 NR_162114 MIR9983 - microRNA 9983 ncRNA 193.25-60 chr2 191015044 191015227 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_139266) promoter-TSS (NM_139266) -885 NM_007315 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 265.25-26 chr2 229957848 229958131 + 1.25 NA intron (NM_174899, intron 1 of 3) intron (NM_174899, intron 1 of 3) -34809 NM_001348335 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 327.25-23 chr5 127588895 127589310 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -59919 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 199.25-71 chr4 13467951 13468161 + 1.25 NA intron (NM_001017979, intron 3 of 6) L1MCb|LINE|L1 16284 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 322.5-34 chr6 52376238 52376808 + 1.25 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) intron (NM_133367, intron 1 of 1) 14372 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 120.5-142 chr3 85140456 85140583 + 1.25 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -78255 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 221.75-60 chr5 108010573 108010783 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) L1MC5|LINE|L1 -339741 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 267-13 chr11 91167187 91167709 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -298246 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 262.25-29 chr3 99905105 99905485 + 1.25 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 -29092 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 242.75-32 chr2 108820766 108821039 + 1.25 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) L1M4|LINE|L1 34131 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 141.75-115 chr3 60617576 60617806 + 1.25 NA TTS (NR_128708) TTS (NR_128708) 179 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 268.25-3 chr10 51887071 51887530 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -187705 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 230.5-93 chr4 161794465 161794875 + 1.25 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) intron (NM_001128428, intron 4 of 14) -228063 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 193.25-56 chr2 76449983 76450298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -535825 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 204.25-108 chr7 51474610 51474899 + 1.25 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -81498 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 271.5-8 chr1 196547489 196547812 + 1.25 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) HAL1b|LINE|L1 34831 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 246.5-46 chr2 227411295 227411590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32136 NM_024795 79853 Hs.156652 NM_024795 ENSG00000168955 TM4SF20 PRO994|SLI5|TCCE518 transmembrane 4 L six family member 20 protein-coding 244.25-33 chr3 119964410 119964930 + 1.25 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) L1MA10|LINE|L1 119978 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 274.5-19 chr14 42566440 42566696 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 959712 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 157.25-132 chr6 140733242 140733542 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49578 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 207.5-85 chr5 77636448 77636834 + 1.25 NA intron (NM_032109, intron 2 of 2) CpG 2056 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 188.75-107 chr7 42658515 42658759 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 47810 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 209.5-126 chr5 101246473 101246682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -343295 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 395-11 chr3 103040474 103041056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 483351 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 252-70 chr8 26705366 26705683 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 127119 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 299.5-42 chr8 18312584 18312927 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78527 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 128.5-69 chr15 46067241 46067538 + 1.25 NA Intergenic MER57C2|LTR|ERV1 362194 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 184.75-8 chr1 211719096 211719349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43460 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 261.75-14 chr15 69969384 69969682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109935 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 183.5-100 chr4 71431019 71431210 + 1.25 NA intron (NM_003759, intron 4 of 22) L2a|LINE|L2 92061 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 167.25-59 chr16 69326650 69326876 + 1.25 NA TTS (NM_022341) TTS (NM_022341) 3825 NM_022341 64146 Hs.130849 NM_022341 ENSG00000258429 PDF - peptide deformylase, mitochondrial protein-coding 293.5-4 chr10 23751821 23752186 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 57276 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 284.25-24 chr4 97705155 97705593 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) AluSx|SINE|Alu 338448 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 228-66 chr5 164819245 164819518 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 349102 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 174-101 chr8 107867137 107867391 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 214675 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 196.5-47 chr14 43832048 43832305 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 675107 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 211.75-71 chr5 19475728 19475926 + 1.25 NA intron (NM_001349559, intron 12 of 12) intron (NM_001349559, intron 12 of 12) 410445 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 277-32 chr6 109823124 109823462 + 1.25 NA intron (NM_014845, intron 22 of 22) intron (NM_014845, intron 22 of 22) 132072 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 113-123 chr3 141829589 141829789 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -46954 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 288.75-9 chr10 50473786 50474172 + 1.25 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 149977 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 268.75-31 chr4 91193565 91193847 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 958675 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 248.5-55 chr2 139946881 139947144 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 639673 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 175.25-136 chr7 119461987 119462165 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 445299 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 298-6 chr11 100853712 100854191 + 1.25 NA intron (NM_001367945, intron 5 of 25) intron (NM_001367945, intron 5 of 25) -80323 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 377-9 chr3 6332731 6333121 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 472523 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 195.75-86 chr4 98118947 98119135 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 3 of 10) L1MC4|LINE|L1 24435 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 174.25-100 chr3 97379358 97379627 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) AluSx1|SINE|Alu -60115 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 183-50 chr2 101866223 101866438 + 1.25 NA intron (NM_004834, intron 16 of 29) intron (NM_004834, intron 16 of 29) -117135 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 334-15 chr2 213573753 213574261 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -184060 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 197.5-25 chr11 112901595 112901851 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -59697 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 169.25-69 chr20 40519492 40519756 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 169612 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 170.25-92 chr3 31643051 31643287 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -61044 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 169.75-161 chr9 29578714 29578892 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -365202 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 359.75-11 chr18 73365540 73365999 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40828 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 195.75-42 chr13 112557612 112557796 + 1.25 NA intron (NM_006322, intron 5 of 21) intron (NM_006322, intron 5 of 21) 30449 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 220.75-46 chr20 10471809 10472164 + 1.25 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 36681 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 263.5-40 chr3 131646278 131646663 + 1.25 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -143499 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 262.5-53 chr4 27560678 27560922 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 343321 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 145.25-87 chr20 38463130 38463278 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9639 NM_001282918 57148 Hs.598850 NM_020336 ENSG00000170471 RALGAPB KIAA1219|RalGAPbeta Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit protein-coding 239.25-58 chr3 106931894 106932160 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 308611 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 300-5 chr1 231304329 231304687 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33344 NM_175876 149371 Hs.356198 NM_175876 ENSG00000116903 EXOC8 EXO84|Exo84p|SEC84 exocyst complex component 8 protein-coding 231.25-31 chr2 37415403 37415717 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70930 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 176.5-68 chr16 63037034 63037191 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -1000674 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 145-97 chr3 64622036 64622184 + 1.25 NA intron (NM_001318781, intron 17 of 38) intron (NM_001318781, intron 17 of 38) 60764 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 272-19 chr20 1402887 1403263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9903 NM_001199786 2280 Hs.471933 NM_000801 ENSG00000088832 FKBP1A FKBP-12|FKBP-1A|FKBP1|FKBP12|PKC12|PKCI2|PPIASE FKBP prolyl isomerase 1A protein-coding 316.25-23 chr8 137804259 137804719 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 279056 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 241-6 chr10 65947356 65947577 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 17 of 17) MIRb|SINE|MIR 376041 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 184.5-58 chr17 66081385 66081578 + 1.25 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) L1ME3B|LINE|L1 110411 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 184-91 chr8 102057425 102057610 + 1.25 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 66817 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 170.25-115 chr4 91245584 91245775 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1M1|LINE|L1 1010648 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 195.5-90 chr22 19856685 19857009 + 1.25 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -1973 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 197.75-94 chr8 137965111 137965420 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 118280 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 221.5-99 chr8 102526370 102526720 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25044 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 271.75-21 chr2 125249684 125250117 + 1.25 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 868085 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 201.5-62 chr16 47319262 47319457 + 1.25 NA intron (NM_030790, intron 8 of 17) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 141704 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 207.5-91 chr5 162368027 162368292 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 300517 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 160.75-25 chr11 12420759 12420999 + 1.25 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 43308 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 334-4 chr10 67478226 67478845 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1PA16|LINE|L1 -75125 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 219.25-47 chr3 50960306 50960542 + 1.25 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L1MA9|LINE|L1 285344 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 182-57 chr2 43049414 43049589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9958 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 160-115 chr8 133302827 133303118 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5668 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 179.25-83 chr2 205575852 205576064 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 21 of 21) L1MC1|LINE|L1 -106542 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 216.25-66 chr22 34788012 34788260 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L1ME4c|LINE|L1 209780 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 238.5-94 chr8 138183169 138183508 + 1.25 NA intron (NM_015912, intron 9 of 19) MIR|SINE|MIR -99793 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 342.5-25 chr6 37410758 37411098 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -22293 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 316-14 chr14 88633388 88633727 + 1.25 NA intron (NM_183387, intron 32 of 42) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 39137 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 176.75-3 chr1 62950831 62951011 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60004 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 152.75-92 chr2 223637203 223637350 + 1.25 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -34915 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 212.5-19 chr11 45741259 45741489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19066 NR_047569 100507384 Hs.259426 NR_047569 ENSG00000254519 LOC100507384 - uncharacterized LOC100507384 ncRNA 294.25-23 chr2 158053694 158054031 + 1.25 NA intron (NM_001135098, intron 2 of 8) intron (NM_001135098, intron 2 of 8) -48008 NM_173355 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 287.75-11 chr12 5208527 5208882 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 34447 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 131.75-11 chr1 82419191 82419390 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -483893 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 137.25-104 chr3 149230399 149230622 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8681 NM_000096 1356 Hs.558314 NM_000096 ENSG00000047457 CP CP-2 ceruloplasmin protein-coding 333.25-3 chr14 37278364 37278725 + 1.25 NA intron (NM_138731, intron 7 of 13) intron (NM_138731, intron 7 of 13) 80607 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 216.75-12 chr10 87798696 87798988 + 1.25 NA intron (NM_001321967, intron 2 of 9) MER4-int|LTR|ERV1 19389 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 179.25-75 chr2 58230730 58230921 + 1.25 NA intron (NM_001114636, intron 2 of 13) intron (NM_001114636, intron 2 of 13) 10555 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 261.25-47 chr7 53458332 53458806 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 353362 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 239-51 chr6 48034926 48035409 + 1.25 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 33522 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 152.25-113 chr4 65967143 65967431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -296792 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 270.5-31 chr2 65111519 65111918 + 1.25 NA intron (NM_015543, intron 1 of 3) L1MD3|LINE|L1 18388 NM_004161 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 128.75-21 chr10 70209777 70209915 + 1.25 NA intron (NM_021129, intron 6 of 10) intron (NM_021129, intron 6 of 10) 23583 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 156.25-11 chr1 215882297 215882449 + 1.25 NA intron (NM_206933, intron 41 of 71) intron (NM_206933, intron 41 of 71) -190092 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 127.75-53 chr12 4301716 4301863 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001759, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001759, exon 5 of 5) -19424 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 256-70 chr8 112337949 112338248 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 38 of 66) intron (NM_001363185, intron 38 of 66) -305395 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 245.25-45 chr20 1898255 1898590 + 1.25 NA intron (NM_001040023, intron 1 of 7) intron (NM_001040023, intron 1 of 7) 3015 NM_001040023 140885 Hs.581021 NM_080792 ENSG00000198053 SIRPA BIT|CD172A|MFR|MYD-1|P84|PTPNS1|SHPS1|SIRP signal regulatory protein alpha protein-coding 143-76 chr2 129145159 129145346 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 128639 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 208.5-138 chr8 49504246 49504491 + 1.25 NA intron (NR_134294, intron 1 of 1) intron (NR_134294, intron 1 of 1) 7812 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 245.5-11 chr11 84595835 84596054 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 124998 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 158-134 chr8 37499019 37499278 + 1.25 NA Intergenic (TAGCATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -5235 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 274.75-37 chr4 46230664 46231070 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106813 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 246-20 chr15 54353800 54354156 + 1.25 NA intron (NM_001329919, intron 16 of 31) intron (NM_001329919, intron 16 of 31) 341330 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 162.75-2 chr1 54833558 54833712 + 1.25 NA intron (NM_001110533, intron 9 of 9) intron (NM_001110533, intron 9 of 9) 27572 NM_152607 163747 Hs.376018 NM_152607 ENSG00000162398 LEXM C1orf177|LEM lymphocyte expansion molecule protein-coding 113.75-44 chr12 22012304 22012471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33787 NR_135117 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 128.25-42 chr12 119648777 119648971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19259 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 254.75-57 chr9 123023840 123024203 + 1.25 NA intron (NM_012197, intron 13 of 25) intron (NM_012197, intron 13 of 25) -9622 NM_005294 2844 Hs.722039 NM_005294 ENSG00000011454 GPR21 - G protein-coupled receptor 21 protein-coding 269.25-16 chr16 75413093 75413406 + 1.25 NA intron (NM_006324, intron 2 of 6) intron (NM_006324, intron 2 of 6) 20254 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 264.75-26 chr20 48967349 48967632 + 1.25 NA intron (NM_006420, intron 8 of 38) FLAM_A|SINE|Alu 45779 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 211-60 chr6 66300302 66300551 + 1.25 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 512547 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 303.75-17 chr19 16812604 16813005 + 1.25 NA exon (NM_001290355, exon 20 of 21) exon (NM_001290355, exon 20 of 21) -16594 NM_015260 23309 Hs.13999 NM_015260 ENSG00000127511 SIN3B - SIN3 transcription regulator family member B protein-coding 222.75-25 chr10 98041105 98041415 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10432 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 141-51 chr15 67461891 67462055 + 1.25 NA intron (NR_040051, intron 3 of 5) intron (NR_040051, intron 3 of 5) 59000 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 283.75-33 chr8 142220828 142221173 + 1.25 NA intron (NM_001366901, intron 13 of 13) intron (NM_001366901, intron 13 of 13) 22644 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 199.25-49 chr18 22302108 22302384 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 115669 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 265.5-42 chr22 36329666 36329919 + 1.25 NA intron (NM_002473, intron 3 of 40) intron (NM_002473, intron 3 of 40) -42885 NR_106877 102465491 NR_106877 ENSG00000278420 MIR6819 hsa-mir-6819 microRNA 6819 ncRNA 153.25-43 chr14 94487865 94488023 + 1.25 NA intron (NM_001304461, intron 4 of 4) intron (NM_001304461, intron 4 of 4) -11747 NM_001284275 327657 Hs.317970 NM_175739 ENSG00000170054 SERPINA9 GCET1|SERPINA11|SERPINA11b serpin family A member 9 protein-coding 125.25-2 chr1 46236274 46236408 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11347 NM_001370766 8438 Hs.642042 NM_003579 ENSG00000085999 RAD54L HR54|RAD54A|hHR54|hRAD54 RAD54 like protein-coding 210.75-64 chr4 41546837 41547064 + 1.25 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) 8793 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 256.5-29 chr2 50335119 50335636 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 12377 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 143-145 chr8 84743554 84743688 + 1.25 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 37694 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 362.25-8 chr3 9408758 9409282 + 1.25 NA intron (NM_001080517, intron 1 of 22) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 11320 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 405.5-7 chr2 69668510 69669149 + 1.25 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 25021 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 323-2 chr1 113664512 113664869 + 1.25 NA intron (NM_001142782, intron 16 of 20) L1M5|LINE|L1 94465 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 387.75-18 chrX 28396936 28397354 + 1.25 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 98518 NR_106750 102465140 NR_106750 ENSG00000277569 MIR6134 hsa-mir-6134 microRNA 6134 ncRNA 280.25-48 chr6 140328317 140328601 + 1.25 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 123207 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 241.5-94 chr8 25821035 25821364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 224214 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 158.75-105 chr21 28143894 28144204 + 1.25 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) intron (NR_126012, intron 5 of 5) 53646 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 201.5-22 chr10 53302577 53302793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -530985 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 134.5-58 chr14 34585172 34585335 + 1.25 NA intron (NM_001366519, intron 8 of 12) AluSx1|SINE|Alu -28864 NR_004400 26863 NR_004400 ENSG00000206737 RNVU1-18 RNU1-25|RNU1-25P|RNU1-5|RNU1P1|RNU1P9|U1.15|U1P101|U1P15|vU1.18 RNA, variant U1 small nuclear 18 snRNA 165-132 chr7 95887421 95887639 + 1.25 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) intron (NM_004411, intron 6 of 16) 115024 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 249.75-38 chr20 40392036 40392432 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 297002 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 211.5-43 chr13 55245593 55245891 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 71288 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 173-136 chr7 135484815 135485018 + 1.25 NA intron (NM_013316, intron 1 of 10) L1MD2|LINE|L1 25186 NM_001190847 4850 Hs.490224 NM_013316 ENSG00000080802 CNOT4 CLONE243|NOT4|NOT4H CCR4-NOT transcription complex subunit 4 protein-coding 377.25-2 chr10 98101651 98102221 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -32688 NM_001256620 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 144-137 chr8 123662262 123662475 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8567 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 227-52 chr5 74631204 74631678 + 1.25 NA intron (NR_046318, intron 1 of 1) intron (NR_046318, intron 1 of 1) -8582 NM_001292004 3074 Hs.69293 NM_000521 ENSG00000049860 HEXB ENC-1AS|HEL-248|HEL-S-111 hexosaminidase subunit beta protein-coding 122.25-187 chr8 76495809 76495934 + 1.25 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) L1MA3|LINE|L1 89217 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 301.25-24 chr4 116461373 116461830 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 161876 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 207.25-93 chr8 23294139 23294386 + 1.25 NA intron (NR_125897, intron 7 of 8) intron (NR_125897, intron 7 of 8) 6154 NM_001136108 203069 Hs.458644 NM_001136108 ENSG00000104679 R3HCC1 - R3H domain and coiled-coil containing 1 protein-coding 312.5-12 chr2 14486865 14487219 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -86084 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 190.5-132 chr6 18708184 18708372 + 1.25 NA intron (NR_149116, intron 6 of 7) intron (NR_149116, intron 6 of 7) 136494 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 297-36 chr5 3902966 3903243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 307272 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 274-14 chr14 62737500 62737979 + 1.25 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) intron (NM_172375, intron 9 of 9) 307719 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 254.25-52 chr5 55389976 55390270 + 1.25 NA intron (NM_015360, intron 19 of 26) AluSc|SINE|Alu 82134 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 232.5-83 chr5 60647602 60647874 + 1.25 NA intron (NM_001145208, intron 2 of 9) intron (NM_001145208, intron 2 of 9) 52428 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 261-51 chr6 39553866 39554108 + 1.25 NA intron (NM_001289020, intron 10 of 21) intron (NM_001289020, intron 10 of 21) -122597 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 159.75-96 chr21 29653011 29653313 + 1.25 NA intron (NM_000830, intron 5 of 16) intron (NM_000830, intron 5 of 16) 57122 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 227.5-67 chr3 9201547 9201798 + 1.25 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) intron (NM_014850, intron 1 of 21) 9179 NR_121663 101927416 Hs.475364 NR_121663 ENSG00000228723 SRGAP3-AS2 - SRGAP3 antisense RNA 2 ncRNA 234.75-7 chr1 175721638 175722011 + 1.25 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 21771 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 248.5-34 chr16 8298648 8299043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 290993 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 161.75-137 chr9 111932327 111932705 + 1.25 NA TTS (NR_039814) TTS (NR_039814) 416 NR_039814 100616114 NR_039814 ENSG00000266315 MIR4668 mir-4668 microRNA 4668 ncRNA 149.5-137 chr4 89221847 89222016 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 85869 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 158.25-51 chr17 77633199 77633415 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86366 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 187.25-55 chr2 43187877 43188321 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 38507 NM_006887 678 Hs.503093 NM_006887 ENSG00000152518 ZFP36L2 BRF2|ERF-2|ERF2|RNF162C|TIS11D ZFP36 ring finger protein like 2 protein-coding 213-56 chr21 15774095 15774346 + 1.25 NA intron (NM_001352561, intron 3 of 23) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 44238 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 323.75-8 chr12 65467258 65467743 + 1.25 NA TTS (NM_198080) TTS (NM_198080) 89811 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 250.5-91 chr7 93361217 93361501 + 1.25 NA TTS (NM_017667) TTS (NM_017667) 121496 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 280-41 chr4 172170210 172170501 + 1.25 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -356748 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 257.75-4 chr10 53095872 53096277 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -324374 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 235-19 chr14 68623406 68623655 + 1.25 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) MER91A|DNA|hAT-Tip100 5257 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 128.25-177 chr6 123056593 123056869 + 1.25 NA intron (NM_001010852, intron 5 of 5) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 60496 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 254.25-68 chr8 101627382 101627596 + 1.25 NA intron (NM_024915, intron 9 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 135050 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 176.5-138 chr5 19136916 19137160 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 749234 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 125.5-68 chr13 73852236 73852457 + 1.25 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 281583 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 323.75-14 chr2 166494784 166495155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7998 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 293.75-25 chr20 1030482 1030760 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -28310 NM_001029871 343637 Hs.444980 NM_001029871 ENSG00000101282 RSPO4 C20orf182|CRISTIN4 R-spondin 4 protein-coding 340.5-6 chr10 124252494 124252932 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -159115 NM_001270765 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 117.25-14 chr1 158613947 158614192 + 1.25 NA intron (NM_003126, intron 49 of 51) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 7630 NM_001004478 128368 Hs.553590 NM_001004478 ENSG00000198967 OR10Z1 OR1-15 olfactory receptor family 10 subfamily Z member 1 protein-coding 173.75-151 chr8 119560673 119560910 + 1.25 NA intron (NM_001330600, intron 25 of 25) MIRb|SINE|MIR 32217 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 134.5-87 chr17 60405790 60405911 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13717 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 215.5-59 chr20 18106382 18106657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31344 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 373.25-12 chr4 25116346 25116674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43939 NM_016955 51091 Hs.253305 NM_016955 ENSG00000109618 SEPSECS LP|PCH2D|SLA|SLA/LP Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase protein-coding 189-103 chr8 96067132 96067344 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 93568 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 194-34 chr14 52125713 52125872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -56733 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 196-6 chr1 114257694 114257975 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103965 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 170.75-66 chr2 44535969 44536179 + 1.25 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L1PB2|LINE|L1 174127 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 277.25-32 chr3 188517403 188517652 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 3 of 9) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 51139 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 160.25-92 chr3 40923270 40923433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -276154 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 284-6 chr11 20526618 20527233 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -72475 NM_004211 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 338.5-31 chr7 32260691 32261010 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) AluSx1|SINE|Alu 38478 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 123.75-80 chr18 3139286 3139425 + 1.25 NA intron (NM_019856, intron 14 of 36) intron (NM_019856, intron 14 of 36) 80613 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 370.25-10 chr4 170513126 170513477 + 1.25 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 230434 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 140.5-205 chr7 6211657 6211842 + 1.25 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu -39612 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 290.5-24 chr2 144442236 144442547 + 1.25 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -77223 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 151.25-106 chr20 43249016 43249228 + 1.25 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -59216 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 191.5-142 chr7 117423071 117423350 + 1.25 NA intron (NM_001301821, intron 2 of 12) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4283 NM_001301822 136991 Hs.352412 NM_130768 ENSG00000154438 ASZ1 ALP1|ANKL1|C7orf7|CT1.19|GASZ|Orf3 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 protein-coding 117.75-155 chr4 48422412 48422555 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020846, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_020846, exon 8 of 8) -60860 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 316.75-17 chr5 157629634 157630030 + 1.25 NA intron (NM_007017, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 22588 NM_007017 11063 Hs.529462 NM_007017 ENSG00000039600 SOX30 - SRY-box transcription factor 30 protein-coding 179.5-8 chr1 94658204 94658425 + 1.25 NA intron (NR_104131, intron 4 of 4) intron (NR_104131, intron 4 of 4) 87586 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 259.25-37 chr5 118916740 118917218 + 1.25 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) intron (NM_001308081, intron 4 of 5) -57607 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 239.5-86 chrUn_KI270515v1 1246 1588 + 1.25 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 421-9 chr3 116301163 116301648 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -58619 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 331.75-3 chr1 121488967 121489329 + 1.25 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -29964 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 212.5-69 chr3 30582673 30583001 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -23665 NM_001024847 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 298.5-20 chr2 189391309 189391611 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49973 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 251.75-77 chr8 79677872 79678213 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66925 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 221.25-47 chr21 27393016 27393320 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -329211 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 173.5-171 chr8 134824247 134824435 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13728 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 174-67 chr4 27137329 27137508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80061 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 263-17 chr14 67739321 67739769 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37659 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 183.75-73 chr3 62299800 62299982 + 1.25 NA intron (NR_038281, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 19056 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 246-43 chr4 40382439 40382753 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 47263 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 151-97 chr4 58608619 58608813 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72388 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 252.25-21 chr17 10432722 10433039 + 1.25 NA intron (NR_125367, intron 2 of 10) L1ME2z|LINE|L1 -10930 NM_002472 4626 Hs.700484 NM_002472 ENSG00000133020 MYH8 DA7|MyHC-peri|MyHC-pn|gtMHC-F myosin heavy chain 8 protein-coding 250.5-72 chr5 25662208 25662450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 471376 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 312.25-11 chr17 59440987 59441297 + 1.25 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) intron (NR_110813, intron 2 of 2) 75059 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 212.75-5 chr1 56241248 56241642 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -173518 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 149-42 chr15 94657294 94657498 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -197967 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 151.5-194 chr8 121459605 121459793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -179647 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 176.75-123 chr8 87844707 87844941 + 1.25 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 29191 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 245.5-73 chr7 27913647 27914014 + 1.25 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 173735 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 213.25-49 chr4 78849919 78850212 + 1.25 NA intron (NM_017593, intron 6 of 13) intron (NM_017593, intron 6 of 13) 73687 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 154.75-116 chr5 93575045 93575191 + 1.25 NA intron (NR_109818, intron 1 of 6) intron (NR_109818, intron 1 of 6) -3775 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 182.25-61 chr2 41298831 41299009 + 1.25 NA Intergenic Charlie10a|DNA|hAT-Charlie -578635 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 173.75-95 chr2 233620505 233620847 + 1.25 NA intron (NM_019076, intron 1 of 4) intron (NM_019076, intron 1 of 4) 3031 NM_019076 54576 Hs.554822 NM_019076 ENSG00000242366 UGT1A8 GNT1|UDPGT|UDPGT 1-8|UGT-1A|UGT-1H|UGT1|UGT1-01|UGT1-08|UGT1.1|UGT1.8|UGT1A|UGT1A1|UGT1A8S|UGT1H|hUG-BR1 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A8 protein-coding 327.5-24 chr5 105920378 105920878 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 821154 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 175.75-9 chr1 165703461 165703677 + 1.25 NA intron (NR_036683, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 4819 NR_036683 440700 Hs.568703 NR_036683 ENSG00000215838 LOC440700 - carbonic anhydrase 14 pseudogene pseudo 231.75-8 chr10 58650679 58650907 + 1.25 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -64222 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 285-41 chr6 154512150 154512533 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1656 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 235.25-50 chr4 169528444 169528828 + 1.25 NA intron (NM_001199397, intron 19 of 35) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 83947 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 203.75-26 chr13 49189629 49189889 + 1.25 NA intron (NM_001079673, intron 17 of 25) intron (NM_001079673, intron 17 of 25) -30579 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 333.75-16 chr20 43130966 43131451 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) 58698 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 152-52 chr14 65142321 65142531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39731 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 311.75-7 chr12 63105540 63105989 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 47046 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 353.25-17 chr3 105321563 105321906 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -44979 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 314.5-32 chr9 108207172 108207571 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 648615 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 193.5-25 chr11 103890731 103890899 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40909 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 190-39 chr22 22680930 22681195 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 34750 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 261.25-43 chr6 52380353 52380747 + 1.25 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) intron (NM_133367, intron 1 of 1) 18399 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 565.75-2 chr4 58729684 58730270 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -193649 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 168.25-41 chr14 53641624 53641904 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 306720 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 327.5-32 chrX 22027324 22027771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4778 NM_000444 5251 Hs.495834 NM_000444 ENSG00000102174 PHEX HPDR|HPDR1|HYP|HYP1|LXHR|PEX|XLH phosphate regulating endopeptidase homolog X-linked protein-coding 147-39 chr15 63367179 63367498 + 1.25 NA intron (NR_135511, intron 2 of 9) intron (NR_135511, intron 2 of 9) 14508 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 228-10 chr10 38588653 38588949 + 1.25 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -107795 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 148.75-109 chr3 24072354 24072500 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30820 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 259-16 chr13 96061075 96061469 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7871 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 284-11 chr14 23632434 23632853 + 1.25 NA intron (NM_001318835, intron 1 of 4) intron (NM_001318835, intron 1 of 4) 2528 NM_001318835 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 273.75-31 chr4 73059893 73060201 + 1.25 NA intron (NM_001297733, intron 5 of 5) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 9669 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 277.75-33 chr8 4232074 4232329 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) AluSx1|SINE|Alu 762713 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 344-27 chr8 91038405 91038779 + 1.25 NA intron (NM_018710, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 2267 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 289-24 chr2 191143767 191144110 + 1.25 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) intron (NM_003151, intron 3 of 23) 7056 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 211.75-10 chr10 53191416 53191787 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -419901 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 368.75-12 chr7 28662223 28662843 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -23600 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 172.75-8 chr1 199124602 199124920 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -23837 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 169.25-68 chr20 19445260 19445438 + 1.25 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) L3|LINE|CR1 -160753 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 295.5-38 chr4 58114384 58114713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 421780 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 187.25-81 chr4 67238191 67238509 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 183650 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 129.25-166 chr6 48639010 48639199 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -570415 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 177.5-58 chr17 51406355 51406549 + 1.25 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -28975 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 165.5-113 chr3 95905788 95906048 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -222725 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 201.75-86 chr6 124464845 124465164 + 1.25 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L1P3|LINE|L1 181999 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 178.75-97 chr7 40104947 40105143 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 29577 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 188.75-104 chr7 33787709 33787901 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117110 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 241-24 chr2 15707993 15708198 + 1.25 NA intron (NR_110201, intron 4 of 5) intron (NR_110201, intron 4 of 5) 17313 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 156-14 chr10 20891661 20891826 + 1.25 NA intron (NM_006393, intron 2 of 27) intron (NM_006393, intron 2 of 27) 5859 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 265-13 chr17 6150205 6150578 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79777 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 199.75-43 chr2 35304416 35304598 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166898 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 354.5-7 chr12 62140912 62141276 + 1.25 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 51745 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 148.5-233 chr8 130828774 130828923 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 12 of 17) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 212061 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 264.75-36 chr4 48094620 48094927 + 1.25 NA intron (NM_003328, intron 7 of 14) LTR16C|LTR|ERVL 39477 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 277.25-18 chr19 34054059 34054537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118206 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 238.75-26 chr17 59201158 59201400 + 1.25 NA intron (NM_018304, intron 9 of 9) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -8731 NM_018149 55181 Hs.7296 NM_018149 ENSG00000167447 SMG8 C17orf71 SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 209.5-52 chr17 34990111 34990418 + 1.25 NA intron (NM_013975, intron 4 of 19) intron (NM_013975, intron 4 of 19) 9752 NM_013975 3980 Hs.100299 NM_002311 ENSG00000005156 LIG3 LIG2|LIG3alpha DNA ligase 3 protein-coding 355.5-24 chr7 34423201 34423693 + 1.25 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -234771 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 157.5-109 chr2 150818134 150818337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 189338 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 298-24 chr5 16271516 16272159 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 91596 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 356.5-14 chr2 220852698 220853166 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 719372 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 147.5-149 chr3 149208610 149208744 + 1.25 NA intron (NM_000096, intron 4 of 18) intron (NM_000096, intron 4 of 18) 13152 NR_046371 1356 Hs.558314 NM_000096 ENSG00000047457 CP CP-2 ceruloplasmin protein-coding 306.5-7 chr10 90956763 90957160 + 1.25 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 9661 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 166.25-130 chr5 160684180 160684365 + 1.25 NA intron (NM_001366652, intron 5 of 24) MIRb|SINE|MIR 1119 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 179.75-73 chr3 59981107 59981356 + 1.25 NA intron (NM_001320901, intron 5 of 6) intron (NM_001320901, intron 5 of 6) 99678 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 223-20 chr12 33038564 33038843 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -141857 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 204.75-57 chr2 7800854 7801115 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 98671 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 182.75-93 chr4 110473398 110473816 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2548 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 128.25-93 chr2 50276450 50276613 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 71223 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 202.75-8 chr1 213933083 213933324 + 1.25 NA intron (NR_037850, intron 2 of 5) intron (NR_037850, intron 2 of 5) 8454 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 185.5-22 chr11 22359973 22360255 + 1.25 NA intron (NM_020346, intron 4 of 11) intron (NM_020346, intron 4 of 11) 21733 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 157.5-187 chr7 30205476 30205621 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 70562 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 171.25-61 chr17 57467729 57468013 + 1.25 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 55726 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 114.25-39 chr12 54515612 54515752 + 1.25 NA intron (NM_001184976, intron 9 of 30) intron (NM_001184976, intron 9 of 30) 16904 NM_001184976 3071 Hs.182014 NM_005337 ENSG00000123338 NCKAP1L HEM1 NCK associated protein 1 like protein-coding 208.25-44 chr2 59009639 59009948 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 7 of 13) MIR|SINE|MIR -207915 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 200.25-70 chr20 35612631 35612892 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3068 NM_003116 6676 Hs.123159 NM_003116 ENSG00000061656 SPAG4 CT127|SUN4 sperm associated antigen 4 protein-coding 143-5 chr1 168187487 168187686 + 1.25 NA intron (NM_152902, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 8624 NM_001031800 261726 Hs.209431 NM_152902 ENSG00000143155 TIPRL TIP|TIP41|TIPRL1 TOR signaling pathway regulator protein-coding 157.25-46 chr15 100861285 100861480 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_160708) promoter-TSS (NR_160708) -461 NR_160709 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 148.25-139 chr7 71026199 71026385 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -105852 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 117.25-29 chr10 70921182 70921294 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -17815 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 159.25-73 chr2 184042346 184042537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -336534 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 344.75-4 chr2 23098030 23098534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -286897 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 176-77 chr8 137367650 137367926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 45800 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 192.25-12 chr10 76155126 76155383 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 372493 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 149.25-73 chr19 50240722 50240914 + 1.25 NA intron (NM_024729, intron 9 of 40) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 37190 NM_024729 79784 Hs.467142 NM_024729 ENSG00000105357 MYH14 DFNA4|DFNA4A|FP17425|MHC16|MYH17|NMHC II-C|NMHC-II-C|PNMHH|myosin myosin heavy chain 14 protein-coding 131.25-41 chr12 55048608 55048760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28710 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 321.25-11 chr17 66629773 66630099 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) L1MC4a|LINE|L1 -157136 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 261.25-15 chr19 50371109 50371437 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5184 NM_001256647 7376 Hs.432976 NM_007121 ENSG00000131408 NR1H2 LXR-b|LXRB|NER|NER-I|RIP15|UNR nuclear receptor subfamily 1 group H member 2 protein-coding 163.75-126 chr8 104442426 104442675 + 1.25 NA intron (NM_001385, intron 4 of 9) intron (NM_001385, intron 4 of 9) 24505 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 204.5-6 chr1 219919478 219919769 + 1.25 NA intron (NM_018713, intron 2 of 3) AluSq2|SINE|Alu 9028 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 121.25-161 chr5 55843778 55843903 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -7517 NM_139017 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 122.75-51 chr15 61929418 61929589 + 1.25 NA exon (NM_017684, exon 49 of 83) exon (NM_017684, exon 49 of 83) 130944 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 195.5-53 chr17 70881607 70881844 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 320454 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 339-21 chr4 43592349 43592692 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -99977 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 219.5-103 chr5 99913806 99914157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 379991 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 124-118 chr3 179212842 179212965 + 1.25 NA intron (NM_006218, intron 9 of 20) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 38712 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 187.25-3 chr1 58463511 58463754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83094 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 228-59 chr4 65883091 65883361 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -212731 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 162.25-51 chr14 65681202 65681380 + 1.25 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 210189 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 223.5-124 chr7 110393296 110393569 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -433219 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 200.75-29 chr14 52277119 52277618 + 1.25 NA TTS (NM_000953) TTS (NM_000953) 9670 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 259.75-3 chr10 17505511 17505876 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -51098 NM_001004470 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 217.5-61 chr2 38077386 38077595 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1309 NM_000104 1545 Hs.154654 NM_000104 ENSG00000138061 CYP1B1 ASGD6|CP1B|CYPIB1|GLC3A|P4501B1 cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 protein-coding 368 chr1 218234638 218235135 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50407 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 266.25-23 chr2 49386386 49386810 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -232071 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 245.75-48 chr5 104813601 104813982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -285683 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 191.25-53 chr2 56014136 56014357 + 1.25 NA intron (NR_126406, intron 1 of 2) intron (NR_126406, intron 1 of 2) -13451 NR_030623 100126319 NR_030623 ENSG00000211520 MIR216B MIRN216B|mir-216b microRNA 216b ncRNA 150.75-125 chr3 33693957 33694142 + 1.25 NA intron (NM_001365634, intron 2 of 35) intron (NM_001365634, intron 2 of 35) 24205 NM_001365630 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 163.75-46 chr15 26823209 26823441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43737 NM_000810 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 166-92 chr4 174272783 174272977 + 1.25 NA intron (NM_012180, intron 1 of 5) L1MC4|LINE|L1 -11024 NM_001145314 80817 Hs.555989 NM_030633 ENSG00000164118 CEP44 KIAA1712|PS1TP3 centrosomal protein 44 protein-coding 246.5-34 chr18 8467138 8467555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100312 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 189-108 chr8 143437529 143437726 + 1.25 NA TTS (NM_015117) TTS (NM_015117) -6895 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 249.5-79 chr5 96384662 96385200 + 1.25 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) 47228 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 400.75-8 chr5 133173116 133173480 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 121285 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 170.75-23 chr12 25442888 25443132 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 110273 NM_001256266 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 240.5-104 chr8 84654363 84654712 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1MA3|LINE|L1 -51390 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 247.5-13 chr11 125804374 125804719 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16419 NM_001129883 100169851 Hs.131278 NM_001129883 ENSG00000236027 PATE3 HEL-127|PATE-DJ prostate and testis expressed 3 protein-coding 198.75-45 chr2 107160473 107160779 + 1.25 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 188899 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 214.25-27 chr15 85847407 85847629 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21883 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 179.75-84 chr4 62017472 62017639 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 20 of 23) L1M5|LINE|L1 144210 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 147.75-109 chr3 113342643 113342838 + 1.25 NA intron (NM_001164496, intron 23 of 34) AluSx|SINE|Alu -61258 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 190-66 chr6 64320685 64320890 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 513951 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 274-24 chr20 7268631 7269050 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -14638 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 149.25-32 chr11 102977414 102977594 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21772 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 138.25-184 chrX 107431139 107431375 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -91193 NM_032428 84443 Hs.496546 NM_032428 ENSG00000147234 FRMPD3 - FERM and PDZ domain containing 3 protein-coding 117.25-4 chr1 41936498 41936616 + 1.25 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -17635 NR_038260 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 241.25-65 chr7 113310630 113310944 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -192205 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 219.75-28 chr17 60567235 60567472 + 1.25 NA intron (NR_126009, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 2807 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 139.5-65 chr14 55948011 55948205 + 1.25 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -151434 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 247.25-52 chr6 39436217 39436433 + 1.25 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) L1PB3|LINE|L1 -4935 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 143.75-161 chr6 97924727 97924859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99738 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 200-88 chr7 113341177 113341474 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -222743 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 132.75-50 chr12 61410275 61410453 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 782475 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 213.75-37 chr14 71689268 71689512 + 1.25 NA intron (NM_001354286, intron 14 of 24) intron (NM_001354286, intron 14 of 24) 103092 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 232.5-28 chr14 76076565 76076879 + 1.25 NA intron (NM_052873, intron 4 of 7) intron (NM_052873, intron 4 of 7) -75163 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 265.25-32 chr21 38347223 38347581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1326 NR_110545 102724678 Hs.635675 NR_110545 LINC01423 - long intergenic non-protein coding RNA 1423 ncRNA 203.75-27 chr13 61972802 61972994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56650 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 249.25-32 chr3 121719364 121719816 + 1.25 NA intron (NM_001256488, intron 6 of 20) intron (NM_001256488, intron 6 of 20) 30151 NM_001366282 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 248-10 chr11 10448849 10449091 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -1351 NM_001172431 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 200-24 chr12 58744312 58744688 + 1.25 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 37216 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 222.25-50 chr3 175185915 175186202 + 1.25 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) -70816 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 221.25-31 chr15 99746620 99746938 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -13335 NM_001284420 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 310.25-2 chr10 20242421 20242906 + 1.25 NA intron (NM_032812, intron 12 of 13) intron (NM_032812, intron 12 of 13) -309307 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 196.5-113 chr4 67839576 67839759 + 1.25 NA intron (NM_004262, intron 4 of 9) L1MEd|LINE|L1 44335 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 299.5-8 chr12 37854175 37854581 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -462396 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 343.5-25 chr8 78578245 78578671 + 1.25 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) intron (NM_006823, intron 2 of 3) -19955 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 173.75-27 chr10 92867814 92868042 + 1.25 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) LTR37A|LTR|ERV1 19408 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 228-32 chr15 97614444 97614692 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -53870 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 292.75-32 chr7 49546036 49546358 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -227441 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 562.75 chr1 83524247 83524922 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 78530 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 152-66 chr17 63147958 63148325 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) MIR|SINE|MIR 181906 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 253.75-13 chr17 6499676 6500112 + 1.25 NA intron (NM_031220, intron 4 of 19) AluSx|SINE|Alu 55439 NM_001195228 54478 Hs.592116 NM_019013 ENSG00000129195 PIMREG CATS|FAM64A|RCS1 PICALM interacting mitotic regulator protein-coding 203.25-28 chr12 18371474 18371692 + 1.25 NA intron (NM_001288774, intron 13 of 32) intron (NM_001288774, intron 13 of 32) 110043 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 163.5-143 chr4 56817470 56817608 + 1.25 NA intron (NM_001271721, intron 1 of 2) L1M4|LINE|L1 3934 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 394.25-3 chr18 4574360 4574923 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -119334 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 186.75-8 chr1 195462091 195462285 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 626527 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 142-160 chr8 86045106 86045259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24486 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 235.5-26 chr12 21758387 21758735 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16145 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 270.25-42 chr5 100587377 100587655 + 1.25 NA TTS (NM_198507) TTS (NM_198507) 52142 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 429.75-6 chr20 59312918 59313637 + 1.25 NA intron (NM_207032, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 12666 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 166-130 chr8 140671012 140671186 + 1.25 NA intron (NR_148037, intron 31 of 34) intron (NR_148037, intron 31 of 34) -35466 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 177-39 chr19 4592662 4592902 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33098 NM_032108 10501 Hs.465642 NM_020241 ENSG00000167680 SEMA6B SEM-SEMA-Y|SEMA-VIB|SEMAN|semaZ semaphorin 6B protein-coding 279.25-21 chr2 122378256 122378671 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 622812 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 324-9 chr15 83201517 83201990 + 1.25 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 6070 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 186.5-111 chr5 148369415 148369760 + 1.25 NA intron (NR_105057, intron 2 of 4) intron (NR_105057, intron 2 of 4) 14263 NR_105057 102546294 Hs.660461 NR_105057 ENSG00000247199 LOC102546294 - uncharacterized LOC102546294 ncRNA 173.25-100 chr5 83257105 83257286 + 1.25 NA intron (NM_001318012, intron 6 of 7) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 179648 NM_003401 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 209.75-20 chr12 58577204 58577653 + 1.25 NA intron (NR_120452, intron 3 of 7) intron (NR_120452, intron 3 of 7) -14274 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 215-45 chr2 156271163 156271358 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16329 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 206.75-31 chr19 14523747 14524089 + 1.25 NA intron (NM_001313964, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 5404 NM_001313964 3337 Hs.515210 NM_006145 ENSG00000132002 DNAJB1 HSPF1|Hdj1|Hsp40|RSPH16B|Sis1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B1 protein-coding 240.25-53 chr5 78924084 78924492 + 1.25 NA intron (NM_198709, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR 61022 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 274.75-9 chr13 100482976 100483416 + 1.25 NA intron (NR_148027, intron 22 of 23) intron (NR_148027, intron 22 of 23) -2181 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 231-42 chr2 146061035 146061337 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -525871 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 206.25-37 chr14 59236910 59237218 + 1.25 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) MER58A|DNA|hAT-Charlie -26377 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 194.75-39 chr17 81063252 81063487 + 1.25 NA intron (NM_001144888, intron 3 of 13) L1ME3F|LINE|L1 28218 NM_017450 10458 Hs.128316 NM_006340 ENSG00000175866 BAIAP2 BAP2|FLAF3|IRSP53 BAI1 associated protein 2 protein-coding 253.25-51 chr4 57671613 57671871 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 245870 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 263.75-21 chr17 17675627 17675930 + 1.25 NA intron (NR_131243, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 1910 NR_131243 105371564 Hs.369680 NR_131243 ENSG00000223979 SMCR2 TCONS_00025215 Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 2 ncRNA 174.75-4 chr1 109514737 109514917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5100 NM_020703 57463 Hs.12264 NM_020703 ENSG00000181754 AMIGO1 ALI2|AMIGO|AMIGO-1 adhesion molecule with Ig like domain 1 protein-coding 165.25-14 chr10 37369253 37369437 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 60159 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 270-31 chr21 20006560 20006889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106969 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 154.75-87 chr22 28520038 28520330 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 60315 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 163-87 chr5 4719836 4720097 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -53515 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 250-16 chr16 84506412 84506685 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1889 NM_020947 57707 Hs.288274 NM_020947 ENSG00000140950 MEAK7 KIAA1609|TLDC1|mEAK-7 MTOR associated protein, eak-7 homolog protein-coding 129.75-169 chr7 28653468 28653642 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -32578 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 203-71 chr4 77008608 77008898 + 1.25 NA intron (NM_001306147, intron 5 of 11) intron (NM_001306147, intron 5 of 11) 59001 NM_018243 55752 Hs.128199 NM_018243 ENSG00000138758 SEPTIN11 SEPT11 septin 11 protein-coding 222.5-17 chr10 64741522 64741785 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -83875 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 233-55 chr7 1386102 1386329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73255 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 181.25-130 chr8 126445082 126445376 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 113249 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 158-126 chr7 39615389 39615556 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -8100 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 275-32 chr4 53258635 53259026 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) L1PB1|LINE|L1 107231 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 135.75-200 chr8 108977173 108977295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109394 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 138.5-103 chr2 50919494 50919698 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330081, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001330081, exon 6 of 6) 112536 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 196.25-69 chr2 122717507 122717810 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 355823 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 379.25-7 chr18 31083678 31084048 + 1.25 NA intron (NM_004949, intron 7 of 16) intron (NM_004949, intron 7 of 16) -17725 NR_110785 101927698 Hs.579538 NR_110785 ENSG00000265888 DSCAS - DSC1/DSC2 antisense RNA ncRNA 175-21 chr11 46789761 46789991 + 1.25 NA intron (NM_001008938, intron 15 of 43) intron (NM_001008938, intron 15 of 43) -27377 NR_003056 692108 Hs.693252 NR_003056 ENSG00000212135 SNORD67 HBII-166 small nucleolar RNA, C/D box 67 snoRNA 126.5-24 chr10 17212624 17212777 + 1.25 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -10629 NM_001351220 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 233-64 chr8 137659004 137659438 + 1.25 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -245633 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 344-25 chr7 34150730 34151288 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 15 of 15) intron (NM_133468, intron 15 of 15) 245470 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 252-10 chr10 75911527 75911829 + 1.25 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 128917 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 175.25-32 chr12 240167 240326 + 1.25 NA intron (NM_001190997, intron 2 of 12) AluSx3|SINE|Alu 17053 NR_120482 102723544 Hs.669733 NR_120482 ENSG00000255746 LOC102723544 - uncharacterized LOC102723544 ncRNA 211.25-66 chr4 59764537 59764753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 751072 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 166.75-10 chr1 234417079 234417229 + 1.25 NA intron (NM_005646, intron 22 of 29) intron (NM_005646, intron 22 of 29) 43453 NM_001301733 388753 Hs.23198 NM_001012985 ENSG00000168275 COA6 C1orf31|CEMCOX4 cytochrome c oxidase assembly factor 6 protein-coding 378.5-16 chr6 75206026 75206628 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_004370) promoter-TSS (NM_004370) -274 NM_080645 1303 Hs.101302 NM_004370 ENSG00000111799 COL12A1 BA209D8.1|BTHLM2|COL12A1L|DJ234P15.1|EDSMYP|UCMD2 collagen type XII alpha 1 chain protein-coding 167.5-59 chr14 65733853 65734050 + 1.25 NA intron (NM_004480, intron 9 of 9) intron (NM_004480, intron 9 of 9) 262849 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 248-14 chr12 60010575 60010912 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 321373 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 185-31 chr17 67461607 67461876 + 1.25 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu -9748 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 308.75-40 chr8 120446501 120447061 + 1.25 NA intron (NM_022045, intron 2 of 21) intron (NM_022045, intron 2 of 21) 1362 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 132-20 chr10 76869746 76869870 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001014797, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001014797, exon 29 of 29) -18236 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 332.5-25 chr6 86917234 86917707 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20058 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 294.25-33 chr7 92733334 92733617 + 1.25 NA intron (NM_001259, intron 3 of 7) intron (NM_001259, intron 3 of 7) 100484 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 141.25-37 chr12 39780875 39781037 + 1.25 NA intron (NM_052885, intron 7 of 9) intron (NM_052885, intron 7 of 9) 154773 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 211.5-29 chr11 83366632 83366828 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80323 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 251-7 chr1 156654325 156654730 + 1.25 NA intron (NM_021948, intron 8 of 13) intron (NM_021948, intron 8 of 13) 12410 NM_198427 63827 Hs.516904 NM_021948 ENSG00000132692 BCAN BEHAB|CSPG7 brevican protein-coding 310.5-26 chr3 98450895 98451331 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -18367 NM_001004736 26339 Hs.621533 NM_001004736 ENSG00000232382 OR5K1 HSHTPCRX10|HTPCRX10|OR3-8 olfactory receptor family 5 subfamily K member 1 protein-coding 139.25-124 chr3 121970340 121970529 + 1.25 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 51813 NM_001199800 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 150.5-180 chr5 157130646 157130812 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 12046 NM_001100816 9443 Hs.279902 NM_004270 ENSG00000155868 MED7 ARC34|CRSP33|CRSP9 mediator complex subunit 7 protein-coding 247.75-21 chr15 68522978 68523328 + 1.25 NA intron (NM_001324014, intron 1 of 12) L1MEg|LINE|L1 4780 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 209-39 chr19 35470627 35470816 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19743 NM_001244847 388533 Hs.112457 NM_207392 ENSG00000188508 KRTDAP KDAP|UNQ467 keratinocyte differentiation associated protein protein-coding 118.5-219 chr8 101850740 101850888 + 1.25 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -59845 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 269.25-40 chr5 68127851 68128136 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -61883 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 204.5-92 chr3 78991601 78991927 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) 27695 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 173.5-166 chr8 111724586 111724878 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 348093 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 257-5 chr1 190584087 190584300 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -40697 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 225-75 chr7 95276458 95276674 + 1.25 NA intron (NM_001166160, intron 16 of 19) intron (NM_001166160, intron 16 of 19) 47966 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 209.5-13 chr10 76698924 76699127 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -189019 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 207-13 chr11 26045625 26045889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -143366 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 171.5-4 chr1 92741160 92741581 + 1.25 NA intron (NM_001308248, intron 1 of 18) intron (NM_001308248, intron 1 of 18) 43738 NM_001350198 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 131-111 chr21 26871208 26871367 + 1.25 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -25878 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 197.25-67 chr3 9489225 9489535 + 1.25 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 64442 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 208-12 chr11 78210606 78210923 + 1.25 NA intron (NM_020798, intron 10 of 10) intron (NM_020798, intron 10 of 10) 21845 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 305-3 chr10 16031523 16031790 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -171123 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 197.75-56 chr3 110190883 110191047 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 588137 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 115-159 chr6 130583166 130583335 + 1.25 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 146133 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 279.75-8 chr11 54939895 54940197 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 233214 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 259 chr1 107873723 107874133 + 1.25 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) intron (NM_006113, intron 2 of 26) -23295 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 302.5-35 chr5 39934534 39934921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117564 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 193.25-55 chr2 75585923 75586345 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -16415 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 321.75-2 chr10 54503335 54503694 + 1.25 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) intron (NR_134503, intron 1 of 5) 17284 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 196.5-45 chr13 70323017 70323217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -214624 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 221.25-75 chr5 180378709 180379157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25597 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 127.5-40 chr11 9768515 9768685 + 1.25 NA intron (NR_036485, intron 1 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -9067 NR_033972 440028 Hs.677541 NR_033972 ENSG00000245522 LINC02709 - long intergenic non-protein coding RNA 2709 ncRNA 341.5-32 chr6 71361883 71362253 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14963 NR_029598 407032 NR_029598 ENSG00000199094 MIR30C2 MIRN30C2|mir-30c-2 microRNA 30c-2 ncRNA 255.25-2 chr1 200103457 200103770 + 1.25 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 60788 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 490.75-3 chr3 103334891 103335524 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 188909 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 179.75-90 chr4 107023654 107023900 + 1.25 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) L1MC2|LINE|L1 12536 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 182-104 chr8 77955997 77956360 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 505481 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 214-60 chr7 90746905 90747218 + 1.25 NA intron (NM_001287137, intron 2 of 12) MER58B|DNA|hAT-Charlie 37245 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 257.25-33 chr3 128646992 128647357 + 1.25 NA intron (NM_002950, intron 1 of 9) intron (NM_002950, intron 1 of 9) 3644 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 185.5-140 chr6 12283023 12283280 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7210 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 302.5-17 chr2 35195884 35196296 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -275315 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 198.75-42 chr2 63741334 63741567 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99514 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 239.75-4 chr1 152053188 152053410 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16295 NM_005620 6282 Hs.417004 NM_005620 ENSG00000163191 S100A11 HEL-S-43|MLN70|S100C S100 calcium binding protein A11 protein-coding 181-74 chr3 145625496 145625671 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 443602 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 217.5-38 chr13 81845671 81845962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -618833 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 220.25-85 chrX 68045443 68045714 + 1.25 NA 3' UTR (NM_002547, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_002547, exon 25 of 25) 387917 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 159.75-121 chr4 182915949 182916136 + 1.25 NA intron (NM_001351747, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 1211 NM_001351743 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 191.5-149 chr8 121915001 121915186 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -273653 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 222.75-24 chr10 89968541 89968747 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -11271 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 196.25-17 chr11 24503005 24503211 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 6055 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 323.75-6 chr10 53481918 53482458 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -710488 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 156-83 chr2 62057609 62057885 + 1.25 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu -138368 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 205.25-63 chr21 43869142 43869445 + 1.25 NA intron (NM_001369878, intron 1 of 8) intron (NM_001369878, intron 1 of 8) 4070 NM_001369881 56894 Hs.248785 NM_020132 ENSG00000160216 AGPAT3 1-AGPAT 3|LPAAT-GAMMA1|LPAAT3 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 protein-coding 131.25-80 chr17 62593508 62593732 + 1.25 NA intron (NM_001284363, intron 14 of 19) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -34050 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 313.5-30 chr5 62518760 62519252 + 1.25 NA intron (NM_016338, intron 20 of 29) L2a|LINE|L2 -59729 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 342.25-7 chr15 27516169 27516571 + 1.25 NA intron (NM_033223, intron 6 of 9) intron (NM_033223, intron 6 of 9) -355051 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 300.5-47 chr7 30627531 30627868 + 1.25 NA intron (NM_002047, intron 13 of 16) intron (NM_002047, intron 13 of 16) 32821 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 135-161 chr6 146213421 146213668 + 1.25 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 184346 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 163.75-11 chr1 119357992 119358298 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10640 NM_001005783 51179 Hs.659767 NM_016527 ENSG00000116882 HAO2 GIG16|HAOX2 hydroxyacid oxidase 2 protein-coding 166.75-15 chr10 54184936 54185134 + 1.25 NA intron (NM_001354411, intron 13 of 34) intron (NM_001354411, intron 13 of 34) -301195 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 285.5-64 chr9 23954731 23954982 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -104255 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 175-51 chr17 48576478 48576626 + 1.25 NA 3' UTR (NM_024015, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_024015, exon 2 of 2) -1455 NM_001330323 3213 Hs.654560 NM_002146 ENSG00000120093 HOXB3 HOX2|HOX2G|Hox-2.7 homeobox B3 protein-coding 117.75-80 chr17 27159662 27159827 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -70503 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 125.25-75 chr15 101384037 101384332 + 1.25 NA 3' UTR (NM_138322, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_138322, exon 10 of 10) 49747 NR_132373 105371027 NR_132373 ENSG00000259764 PCSK6-AS1 - PCSK6 antisense RNA 1 ncRNA 183.75-74 chr3 65378829 65379133 + 1.25 NA intron (NM_004742, intron 18 of 22) intron (NM_004742, intron 18 of 22) -514835 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 166.75-134 chr7 81722926 81723132 + 1.25 NA intron (NM_001010932, intron 9 of 17) intron (NM_001010932, intron 9 of 17) -31623 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 183-60 chr20 2459434 2459629 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 3516 NR_003684 100113378 NR_003684 SNORD119 - small nucleolar RNA, C/D box 119 snoRNA 212.25-34 chr16 24992462 24992776 + 1.25 NA intron (NM_001006634, intron 1 of 19) AluSc|SINE|Alu 22750 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 218.5-54 chr2 66075491 66075872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 282647 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 251.5-28 chr16 11736939 11737230 + 1.25 NA intron (NR_136673, intron 1 of 9) intron (NR_136673, intron 1 of 9) 5773 NM_001303447 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 222.5-83 chr5 7377949 7378174 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18077 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 196.75-98 chr7 33679675 33680124 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -225016 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 352-16 chr9 80243260 80243803 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 268508 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 223.5-12 chr1 240134939 240135140 + 1.25 NA intron (NM_020066, intron 2 of 17) intron (NM_020066, intron 2 of 17) 43156 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 168-24 chr11 24126143 24126400 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -370782 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 224.5-89 chr5 115724329 115724636 + 1.25 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -51830 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 146.75-116 chr4 101343954 101344165 + 1.25 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 3467 NM_001130692 5530 Hs.435512 NM_000944 ENSG00000138814 PPP3CA ACCIID|CALN|CALNA|CALNA1|CCN1|CNA1|IECEE|IECEE1|PPP2B protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha protein-coding 308.5-35 chr7 52660282 52660834 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -375075 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 215.75-26 chr12 18169530 18169722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79433 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 146-133 chr9 14124421 14124632 + 1.25 NA intron (NR_161383, intron 6 of 7) intron (NR_161383, intron 6 of 7) 56276 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 196.75-62 chr2 121353944 121354197 + 1.25 NA intron (NM_015282, intron 36 of 38) AluJo|SINE|Alu -68868 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 196.25-116 chr8 56819443 56819645 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 174323 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 222-66 chr5 111597799 111598003 + 1.25 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -85304 NM_001308057 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 222-17 chr11 27308917 27309282 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54116 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 137.5-189 chr5 37631254 37631477 + 1.25 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 203457 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 123.75-4 chr1 49264880 49265007 + 1.25 NA intron (NR_125988, intron 1 of 3) intron (NR_125988, intron 1 of 3) 7532 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 154-5 chr1 78157679 78157946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71787 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 167-108 chr7 79863293 79863434 + 1.25 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 -271468 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 279.5-62 chr7 111307889 111308211 + 1.25 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 216923 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 127.5-65 chr13 84367090 84367253 + 1.25 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) intron (NR_046871, intron 3 of 6) 226569 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 194-61 chr4 32882443 32882674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 531520 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 216.75-40 chr2 105776517 105776795 + 1.25 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) 31593 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 295.25 chr1 50802039 50802430 + 1.25 NA intron (NM_007051, intron 2 of 18) AluSp|SINE|Alu 158033 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 186.75-75 chr3 152632118 152632408 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -202868 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 245.25-71 chr8 105606235 105606522 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 286835 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 502.25-2 chr1 215559677 215560343 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7294 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 271.25-34 chr3 72395760 72395994 + 1.25 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 50746 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 336.25-13 chr4 44020444 44020936 + 1.25 NA non-coding (NR_131959, exon 2 of 2) non-coding (NR_131959, exon 2 of 2) 3628 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 421.5-2 chr10 17726171 17726679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25776 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 190.25-51 chr17 53038529 53038821 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 53170 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 150.5-236 chr9 126672200 126672358 + 1.25 NA intron (NM_001174146, intron 2 of 7) intron (NM_001174146, intron 2 of 7) 57836 NM_001174146 4010 Hs.129133 NM_002316 ENSG00000136944 LMX1B LMX1.2|NPS1 LIM homeobox transcription factor 1 beta protein-coding 246.75-54 chr5 106946401 106946692 + 1.25 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 64468 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 401.75 chr10 80795346 80795713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 145732 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 184.25-15 chr1 241761361 241761535 + 1.25 NA intron (NM_001367482, intron 15 of 27) L1MC5a|LINE|L1 -86743 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 152.5-100 chr2 223614708 223614873 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12429 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 304-4 chr10 67876175 67876477 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8330 NM_012238 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 284-7 chr11 71561206 71561498 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -4211 NM_001012710 387273 Hs.661887 NM_001012710 ENSG00000204572 KRTAP5-10 KRTAP5.10 keratin associated protein 5-10 protein-coding 286.75-29 chr3 64995050 64995382 + 1.25 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 -307216 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 301.75-16 chr16 10298964 10299414 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86872 NR_147927 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 217.75-49 chr3 57682368 57682555 + 1.25 NA intron (NM_152678, intron 1 of 19) intron (NM_152678, intron 1 of 19) 10616 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 244.5-71 chr4 30639036 30639261 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -81221 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 237-52 chr5 171198430 171198793 + 1.25 NA intron (NM_022897, intron 18 of 27) MER5A|DNA|hAT-Charlie -110637 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 128.75-59 chr15 40429231 40429375 + 1.25 NA intron (NR_148925, intron 13 of 13) intron (NR_148925, intron 13 of 13) -10454 NM_001301132 22893 Hs.22109 NM_014952 ENSG00000140320 BAHD1 - bromo adjacent homology domain containing 1 protein-coding 226-70 chr8 122802246 122802473 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 20704 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 336.25-18 chr8 132092862 132093195 + 1.25 NA intron (NM_001145095, intron 6 of 15) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 12237 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 146.75-72 chr2 35862467 35862599 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 391128 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 269-17 chr14 45572440 45572868 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 142948 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 225.25-69 chr5 155824809 155825133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -501786 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 366-9 chr18 13928402 13928919 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12953 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 234.5-28 chr15 38059346 38059587 + 1.25 NA intron (NR_120330, intron 2 of 3) intron (NR_120330, intron 2 of 3) 13524 NR_147201 107984773 Hs.285193 NR_147199 ENSG00000236914 LINC01852 - long intergenic non-protein coding RNA 1852 ncRNA 204.5-138 chr9 23581182 23581550 + 1.25 NA intron (NR_121602, intron 11 of 27) L3b|LINE|CR1 91033 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 141.25-185 chr8 134814752 134814911 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9886 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 181.75-83 chr3 110003756 110003961 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 401030 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 227.75-61 chr4 162958468 162958743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 135023 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 126-26 chr10 85638375 85638502 + 1.25 NA intron (NM_017551, intron 13 of 15) L1ME2|LINE|L1 60707 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 296.75-23 chr3 157097685 157098123 + 1.25 NA intron (NR_034008, intron 1 of 2) intron (NR_034008, intron 1 of 2) 8023 NR_034008 100498859 Hs.633655 NR_034008 ENSG00000241135 LINC00881 - long intergenic non-protein coding RNA 881 ncRNA 252.25-25 chr18 1799544 1799925 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -440105 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 289.75-34 chrX 70956288 70956717 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -25406 NM_032803 84889 Hs.175220 NM_032803 ENSG00000165349 SLC7A3 ATRC3|CAT-3|CAT3 solute carrier family 7 member 3 protein-coding 136.5-222 chr8 54045059 54045350 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22756 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 145.25-65 chr19 19195347 19195484 + 1.25 NA intron (NM_001370237, intron 2 of 9) AluSx|SINE|Alu 2480 NM_001370234 8625 Hs.153629 NM_003721 ENSG00000064490 RFXANK ANKRA1|BLS|F14150_1|RFX-B regulatory factor X associated ankyrin containing protein protein-coding 262.75-59 chr9 134247730 134248144 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 47460 NR_146518 105376310 Hs.573484 NR_146518 ENSG00000223729 LINC02247 - long intergenic non-protein coding RNA 2247 ncRNA 113-119 chr3 82601233 82601338 + 1.25 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 615143 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 203.75-15 chr10 124838557 124838863 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 36891 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 114-15 chr10 25944692 25944864 + 1.25 NA intron (NM_001368265, intron 2 of 7) L1MB3|LINE|L1 10549 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 254.25-51 chr5 25559573 25559941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 368804 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 199.5-124 chr6 11556892 11557095 + 1.25 NA intron (NM_001100829, intron 1 of 2) L1MCc|LINE|L1 19244 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 197.25-45 chr18 78434172 78434375 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -440546 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 191-62 chr4 87083696 87083974 + 1.25 NA intron (NM_005935, intron 3 of 19) AluJb|SINE|Alu 76834 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 325.5-14 chr18 6493804 6494153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17438 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 190.75-10 chr10 82156772 82157080 + 1.25 NA intron (NR_163251, intron 2 of 9) intron (NR_163251, intron 2 of 9) 75994 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 167-19 chr10 67354228 67354405 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 49094 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 252-57 chr5 130840013 130840533 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 324983 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 232.5-15 chr12 46020478 46020729 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -30029 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 235.75-57 chr5 31003553 31003773 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -190023 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 197.25-82 chr5 43105785 43106060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14992 NM_001330709 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 138.75-60 chr15 97018016 97018271 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 234708 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 233.5-65 chr21 25316016 25316373 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 115507 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 288-36 chr3 197564836 197565083 + 1.25 NA intron (NM_203315, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu 8364 NM_203315 622 Hs.274539 NM_004051 ENSG00000161267 BDH1 BDH|SDR9C1 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 1 protein-coding 258.25-29 chr2 190739256 190739540 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 80240 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 173.75-100 chr20 41187217 41187453 + 1.25 NA intron (NM_015035, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu 18312 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 191.75-34 chr14 29771791 29772151 + 1.25 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 155125 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 173-97 chr4 100058474 100058634 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108060 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 248.5-48 chr2 36367222 36367525 + 1.25 NA intron (NM_016441, intron 1 of 16) intron (NM_016441, intron 1 of 16) 11595 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 494.25-3 chr16 8423757 8424452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 165734 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 220.5-118 chr7 82162707 82163082 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 4 of 38) intron (NM_000722, intron 4 of 38) 153717 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 207.25-15 chr12 63781963 63782162 + 1.25 NA intron (NM_014254, intron 2 of 5) intron (NM_014254, intron 2 of 5) 1936 NM_001278237 10329 Hs.216386 NM_014254 ENSG00000118600 RXYLT1 HP10481|MDDGA10|TMEM5 ribitol xylosyltransferase 1 protein-coding 237.75-25 chr16 63325825 63326168 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -1289558 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 147.5-6 chr1 29915576 29915798 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 121925 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 242-23 chr16 73865321 73865517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 350102 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 341-22 chr7 14086253 14086982 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -95192 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 144.5-114 chr2 155448949 155449230 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 750394 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 273.5-22 chr14 59497896 59498284 + 1.25 NA intron (NM_016475, intron 4 of 6) L1ME4a|LINE|L1 13573 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 207.75-30 chr13 93161947 93162126 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -64771 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 176.5-127 chr3 136072633 136072871 + 1.25 NA intron (NM_181897, intron 5 of 12) intron (NM_181897, intron 5 of 12) 50010 NM_181897 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 132.75-123 chr3 30182953 30183139 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -248890 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 215.5-47 chr2 14014742 14014951 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 386112 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 169.75-108 chr3 127720407 127720588 + 1.25 NA intron (NM_001003794, intron 5 of 7) intron (NM_001003794, intron 5 of 7) 47545 NM_172027 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 488.75-2 chr21 29158079 29158859 + 1.25 NA intron (NM_001286620, intron 3 of 4) intron (NM_001286620, intron 3 of 4) 12892 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 295-23 chr20 62785814 62786072 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9087 NR_046225 100652730 Hs.254951 NR_046224 LINC00659 - long intergenic non-protein coding RNA 659 ncRNA 265.75-47 chr3 39916905 39917433 + 1.25 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 107509 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 269-51 chr9 30635374 30635684 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -227075 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 171.75-103 chr4 87792998 87793165 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -6473 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 219-91 chr8 58488869 58489314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11072 NM_000780 1581 Hs.1644 NM_000780 ENSG00000167910 CYP7A1 CP7A|CYP7|CYPVII cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 protein-coding 279.75 chr1 87873829 87874102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -502310 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 226.5-66 chr4 30825292 30825641 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 105097 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 270-52 chr7 135451753 135452127 + 1.25 NA intron (NM_013316, intron 1 of 10) intron (NM_013316, intron 1 of 10) 58162 NM_001190847 4850 Hs.490224 NM_013316 ENSG00000080802 CNOT4 CLONE243|NOT4|NOT4H CCR4-NOT transcription complex subunit 4 protein-coding 164-74 chr3 30676196 30676359 + 1.25 NA intron (NM_001024847, intron 6 of 7) L1MC4a|LINE|L1 69676 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 208.5-112 chr5 108489191 108489428 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -107211 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 263.75-7 chr11 82235479 82235870 + 1.25 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 168239 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 154.25-7 chr1 114375921 114376190 + 1.25 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 135148 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 253.5-18 chr12 27630600 27630935 + 1.25 NA intron (NM_001198915, intron 2 of 26) L1PB3|LINE|L1 -65680 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 224.75-70 chr8 71386484 71386790 + 1.25 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) intron (NM_001370336, intron 2 of 17) -24568 NM_001288574 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 299-8 chr11 12977904 12978189 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 11502 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 462.5-4 chr9 25708801 25709419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30252 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 321.5-36 chr8 113914841 113915165 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -478064 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 246.5-61 chr4 108106225 108106457 + 1.25 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 60456 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 241.5-23 chr14 68230563 68230836 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 398088 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 182-98 chr6 123824630 123824861 + 1.25 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L1PA8|LINE|L1 20880 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 266.25-7 chr11 106771032 106771390 + 1.25 NA intron (NM_001256424, intron 6 of 8) intron (NM_001256424, intron 6 of 8) 247265 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 282-29 chr2 122499593 122499942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 573714 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 271-31 chr3 15471463 15471808 + 1.25 NA intron (NM_080539, intron 9 of 15) intron (NM_080539, intron 9 of 15) 24673 NR_036232 100422868 NR_036232 ENSG00000263573 MIR4270 - microRNA 4270 ncRNA 301.75-36 chr7 81922922 81923178 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86127 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 130.5-25 chr1 217386804 217387014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 244181 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 275.5-23 chr15 62437944 62438212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 95049 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 290.75-24 chr2 19154835 19155161 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -128027 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 338.5-19 chr3 5240890 5241235 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9193 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 491.75-3 chr5 30344327 30344949 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 464078 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 224.5-22 chr10 123126852 123127152 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -8968 NM_001105574 340784 Hs.531194 NM_001105574 ENSG00000188620 HMX3 NKX-5.1|NKX5.1|Nkx5-1 H6 family homeobox 3 protein-coding 165.75-5 chr1 76360512 76360744 + 1.25 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 285882 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 247.5-4 chr10 31426789 31427297 + 1.25 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -27288 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 394-10 chr3 153441117 153441444 + 1.25 NA intron (NR_146713, intron 5 of 6) MER103C|DNA|hAT-Charlie -43215 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 141-77 chr2 101907395 101907526 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -76005 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 247.25-10 chr12 21933557 21933769 + 1.25 NA intron (NM_005691, intron 2 of 37) intron (NM_005691, intron 2 of 37) 3031 NM_020297 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 239.5-41 chr18 61098414 61098638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -234904 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 214.75-55 chr3 100830391 100830702 + 1.25 NA intron (NM_001349330, intron 27 of 61) intron (NM_001349330, intron 27 of 61) 121004 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 133-178 chr8 128525707 128525910 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 38871 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 247.25-51 chr5 133683019 133683430 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70683 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 122.75-168 chr5 121638058 121638214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -213746 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 186.25-85 chr4 163538470 163538763 + 1.25 NA intron (NM_017923, intron 3 of 3) intron (NM_017923, intron 3 of 3) 43926 NM_018352 55319 Hs.267446 NM_018352 ENSG00000198498 TMA16 C4orf43 translation machinery associated 16 homolog protein-coding 233.75-4 chr1 67256605 67256935 + 1.25 NA intron (NM_144701, intron 10 of 10) intron (NM_144701, intron 10 of 10) -50594 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 197.5-92 chr3 24096146 24096450 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 6949 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 194.75-52 chr2 58797256 58797543 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 276646 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 237.75-19 chr14 87368687 87369026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 286438 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 132.75-109 chr2 231779887 231780128 + 1.25 NA intron (NR_110994, intron 1 of 1) intron (NR_110994, intron 1 of 1) 1275 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 367.25-6 chr20 37958369 37958822 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 55468 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 331.75-24 chr7 29906997 29907580 + 1.25 NA intron (NM_001080529, intron 8 of 8) L1MB3|LINE|L1 82513 NM_014766 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 340.5-10 chr12 53941293 53941879 + 1.25 NA intron (NM_017410, intron 1 of 1) (ACAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1943 NR_047507 100874366 Hs.547385 NR_047507 ENSG00000249641 HOXC13-AS HOXC-AS5 HOXC13 antisense RNA ncRNA 201.75-103 chr8 118833861 118834071 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 117919 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 134.5-144 chr3 181206990 181207212 + 1.25 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -24636 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 125-161 chr8 111765066 111765229 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 388508 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 284.5-31 chr2 73277576 73278176 + 1.25 NA intron (NM_001080410, intron 2 of 16) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 6602 NM_001371389 126-7 chr1 110873234 110873394 + 1.25 NA intron (NM_001040033, intron 2 of 8) intron (NM_001040033, intron 2 of 8) 166 NM_000560 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 169.25-3 chr1 85897957 85898249 + 1.25 NA intron (NR_146344, intron 28 of 58) intron (NR_146344, intron 28 of 58) -189670 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 260.5-19 chr16 46811428 46811749 + 1.25 NA intron (NM_001001436, intron 2 of 3) L1MC5|LINE|L1 19460 NR_145837 388272 Hs.406551 NM_001001436 ENSG00000155330 C16orf87 - chromosome 16 open reading frame 87 protein-coding 235.75-39 chr2 190339508 190339802 + 1.25 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger -3934 NM_001128928 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 146.75-112 chr4 59854474 59854688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 841008 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 176.25-127 chr7 46760593 46760860 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63604 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 193.25-120 chr9 30939511 30939843 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 441813 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 224.25-75 chr5 8432635 8433003 + 1.25 NA intron (NR_039984, intron 2 of 5) AluYa5|SINE|Alu 24745 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 184.75-58 chr20 8194809 8195142 + 1.25 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -53729 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 309.75-30 chr4 97066825 97067163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -299932 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 272.5-42 chr20 24653580 24654041 + 1.25 NA intron (NM_024893, intron 3 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 183849 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 150.75-33 chr11 22357298 22357452 + 1.25 NA intron (NM_020346, intron 3 of 11) intron (NM_020346, intron 3 of 11) 18994 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 189-66 chr2 211452486 211452705 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) intron (NM_001042599, intron 20 of 26) 835024 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 353-8 chr2 115186001 115186447 + 1.25 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 24069 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 340.75-29 chr9 94104762 94105130 + 1.25 NA intron (NM_152422, intron 8 of 8) intron (NM_152422, intron 8 of 8) 20482 NM_001253829 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 204.5-13 chr10 73595605 73595799 + 1.25 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) intron (NM_001350995, intron 1 of 21) -4360 NR_146997 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 248.25-47 chr3 96077735 96078169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -282012 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 221.75-46 chr4 16045774 16046160 + 1.25 NA intron (NM_001371408, intron 2 of 24) intron (NM_001371408, intron 2 of 24) 30151 NM_001145851 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 274.75-47 chr6 130217351 130217717 + 1.25 NA intron (NM_001017373, intron 1 of 11) intron (NM_001017373, intron 1 of 11) -1649 NM_001277185 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 192.25-20 chr12 122803462 122803680 + 1.25 NA intron (NR_027918, intron 9 of 12) intron (NR_027918, intron 9 of 12) 28999 NR_027918 84660 Hs.592008 NM_032573 ENSG00000130783 CCDC62 CT109|ERAP75|TSP-NY coiled-coil domain containing 62 protein-coding 164.5-223 chr9 100595559 100595979 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17690 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 244.25-7 chr11 9990911 9991165 + 1.25 NA intron (NM_030962, intron 12 of 39) intron (NM_030962, intron 12 of 39) 151896 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 238.25-91 chr9 81681489 81681707 + 1.25 NA intron (NM_005077, intron 4 of 19) intron (NM_005077, intron 4 of 19) 7937 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 225.25-38 chr2 24626026 24626244 + 1.25 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) L1MC5a|LINE|L1 41658 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 129.5-211 chr7 36803269 36803438 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -78804 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 217.5-59 chr2 29308402 29308709 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 8 of 28) intron (NM_004304, intron 8 of 28) -84655 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 145-84 chr2 185834980 185835381 + 1.25 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -35029 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 143.5-95 chr18 12568656 12568815 + 1.25 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) L2c|LINE|L2 87997 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 165.75-174 chrX 135019100 135019277 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3354 NM_001078173 441518 Hs.378813 NM_001078173 ENSG00000212747 RTL8B CXX1c|FAM127C|MAR8B|SIRH4 retrotransposon Gag like 8B protein-coding 128-42 chr14 53399830 53399995 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 246558 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 222 chr1 42193888 42194286 + 1.25 NA intron (NM_001198850, intron 8 of 12) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -29342 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 277.75-24 chr5 11742591 11742932 + 1.25 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) -153695 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 113.25-168 chr8 70604626 70604804 + 1.25 NA intron (NM_001317804, intron 2 of 11) intron (NM_001317804, intron 2 of 11) 2954 NM_001317805 23471 Hs.491988 NM_014294 ENSG00000067167 TRAM1 PNAS8|TRAM|TRAMP translocation associated membrane protein 1 protein-coding 203.75-7 chr1 226244420 226244713 + 1.25 NA intron (NM_001366237, intron 10 of 13) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 20902 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 167-67 chr2 214136597 214136752 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 13 of 14) intron (NR_047660, intron 13 of 14) -274380 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 201.75-49 chr2 127767057 127767236 + 1.25 NA intron (NM_001006622, intron 4 of 5) intron (NM_001006622, intron 4 of 5) 44025 NM_001006623 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 198.25-68 chr3 103912686 103912963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -388708 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 265.75-66 chr7 47957386 47957678 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9041 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 194.5-63 chr2 24260224 24260403 + 1.25 NA intron (NM_001348182, intron 21 of 38) intron (NM_001348182, intron 21 of 38) 85260 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 242.5-21 chr11 70881528 70881854 + 1.25 NA intron (NM_012309, intron 10 of 24) intron (NM_012309, intron 10 of 24) -9323 NR_037437 100500844 NR_037437 ENSG00000263744 MIR3664 mir-3664 microRNA 3664 ncRNA 280.75-30 chr3 148500949 148501403 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -196695 NM_004835 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 204.25-101 chr6 163735065 163735324 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63710 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 213.25-28 chr2 17725388 17725619 + 1.25 NA intron (NM_024624, intron 7 of 26) intron (NM_024624, intron 7 of 26) 28307 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 311.75-10 chr18 8134894 8135293 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 13 of 30) intron (NM_002845, intron 13 of 30) 231941 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 307-26 chr4 40015986 40016273 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -38173 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 239.5-64 chr6 37941581 37941897 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 122012 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 311.75-12 chr2 8438838 8439096 + 1.25 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -110548 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 192-53 chr18 2456481 2456660 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 114935 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 237.75-30 chr17 78764272 78764605 + 1.25 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) AluSc|SINE|Alu 17770 NM_001365039 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 342.75-8 chr12 44192139 44192590 + 1.25 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) intron (NM_001286213, intron 3 of 6) 356283 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 133.25-129 chr3 21120321 21120456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -285338 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 135-185 chr8 106432724 106432909 + 1.25 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) L2a|LINE|L2 -15108 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 236.25-42 chr2 35402445 35402739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68813 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 252-35 chr2 66036638 66037005 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 321507 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 180.75-37 chr14 50838259 50838585 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -7301 NM_182944 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 355-16 chr6 39008432 39008922 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 87 of 91) intron (NM_001371, intron 87 of 91) -40104 NR_136562 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 131.75-133 chr3 24414853 24414992 + 1.25 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -79165 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 256.75-28 chr21 16140042 16140261 + 1.25 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) intron (NR_111005, intron 1 of 6) -41247 NR_136551 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 229-67 chr6 51357125 51357378 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -264619 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 144-98 chr5 25741805 25741992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 550945 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 238-55 chr5 84287946 84288217 + 1.25 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) L2-1_AMi|LINE|L2 96786 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 152.25-67 chr17 68501667 68501894 + 1.25 NA intron (NM_001278433, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 -10000 NM_212471 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 178.75-14 chr10 118553905 118554090 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 41651 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 293.5-29 chr3 97271838 97272137 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L1MA9|LINE|L1 -167620 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 172.25-113 chr5 112550521 112550680 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77836 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 376.75-16 chr5 29747221 29747743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -133078 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 342.75-9 chr12 105435283 105435886 + 1.25 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 104893 NM_001145199 387882 Hs.368938 NM_207376 ENSG00000235162 C12orf75 AGD3|OCC-1|OCC1 chromosome 12 open reading frame 75 protein-coding 212.25-24 chr12 117513236 117513508 + 1.25 NA intron (NM_173598, intron 14 of 19) intron (NM_173598, intron 14 of 19) -151570 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 203-4 chr1 52757296 52757720 + 1.25 NA intron (NM_024646, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu 31055 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 171-132 chr8 131273688 131274140 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -233005 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 162.25-6 chr1 71954053 71954358 + 1.25 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -117193 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 230.5-64 chr2 154495078 154495452 + 1.25 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -37827 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 307.5-14 chr14 59580238 59580673 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -3643 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 288.75-35 chr22 24447461 24447905 + 1.25 NA intron (NR_028484, intron 3 of 6) L3|LINE|CR1 15564 NM_001278497 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 235-65 chr7 8199815 8200185 + 1.25 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) L1MA2|LINE|L1 62052 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 310.75-19 chr2 5171050 5171335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -514970 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 309.25-22 chr5 31290952 31291378 + 1.25 NA intron (NM_001362435, intron 2 of 10) intron (NM_001362435, intron 2 of 10) 97479 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 182-108 chr8 134268641 134268885 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -329308 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 204.75-124 chr9 27794651 27794824 + 1.25 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -220871 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 161.5-163 chr6 41084011 41084248 + 1.25 NA exon (NM_002505, exon 4 of 10) exon (NM_002505, exon 4 of 10) 11155 NM_021705 4800 Hs.10441 NM_002505 ENSG00000001167 NFYA CBF-A|CBF-B|HAP2|NF-YA nuclear transcription factor Y subunit alpha protein-coding 179.75-138 chr8 130640135 130640329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -196558 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 219.5-36 chr13 37499075 37499389 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -14448 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 180-5 chr1 112349323 112349538 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -46784 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 191.5-88 chr21 23000366 23000730 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78736 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 117.5-24 chr1 244637912 244638019 + 1.25 NA intron (NM_001130957, intron 21 of 21) L2c|LINE|L2 -15083 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 441-3 chr10 64596239 64596945 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -228936 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 252.5-79 chr8 67510901 67511363 + 1.25 NA intron (NM_020361, intron 4 of 10) intron (NM_020361, intron 4 of 10) 167298 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 192.25-81 chr4 73181093 73181271 + 1.25 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 41875 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 203-52 chr2 65625589 65625851 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -193121 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 150.75-60 chr14 68206332 68206538 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MC4|LINE|L1 382843 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 186.75-50 chr2 45974384 45974572 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) intron (NM_005400, intron 2 of 14) 322803 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 207-88 chr8 99632383 99632675 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -95668 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 168.5-75 chr19 35898331 35898630 + 1.25 NA exon (NM_032721, exon 3 of 12) exon (NM_032721, exon 3 of 12) 1257 NM_001321831 84807 Hs.466531 NM_032721 ENSG00000167604 NFKBID IkBNS|IkappaBNS|TA-NFKBH NFKB inhibitor delta protein-coding 269 chr1 62306792 62307134 + 1.25 NA intron (NM_181712, intron 1 of 9) intron (NM_181712, intron 1 of 9) 12471 NM_001320269 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 197.25-44 chr18 71572561 71572725 + 1.25 NA intron (NR_038326, intron 1 of 4) intron (NR_038326, intron 1 of 4) 6313 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 336-30 chr9 27384994 27385569 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -88131 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 312.5 chr1 43745331 43745802 + 1.25 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -18223 NR_125986 101929592 NR_125986 ENSG00000229444 LOC101929592 - uncharacterized LOC101929592 ncRNA 186.25-113 chr7 79241589 79241891 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) LTR8B|LTR|ERV1 -211217 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 172.25-47 chr16 76852848 76853017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16004 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 126.75-124 chr2 215552512 215552630 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 98864 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 227.75-16 chr11 115391200 115391482 + 1.25 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -5415 NR_135103 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 233.25-59 chr5 59231386 59231706 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 44569 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 146-58 chr19 17599073 17599248 + 1.25 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 43511 NM_024656 79709 Hs.418795 NM_024656 ENSG00000130309 COLGALT1 BSVD3|ColGalT 1|GLT25D1 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 protein-coding 256.75-40 chr8 85571637 85571937 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83889 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 142.25-70 chr17 66246667 66246841 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -17339 NM_000042 350 Hs.445358 NM_000042 ENSG00000091583 APOH B2G1|B2GP1|BG apolipoprotein H protein-coding 140-82 chr2 186938008 186938247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88957 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 130.5-256 chr9 79706906 79707036 + 1.25 NA intron (NM_001351547, intron 10 of 18) intron (NM_001351547, intron 10 of 18) -117559 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 169.25-113 chr7 68047269 68047484 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 27123 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 235.5-78 chr7 71325926 71326199 + 1.25 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) intron (NM_022479, intron 1 of 10) -18292 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 275.25-27 chr3 36993223 36993682 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_014805) promoter-TSS (NM_014805) 102 NM_001258273 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 228.75-44 chr2 115597115 115597372 + 1.25 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) LTR49-int|LTR|ERV1 253428 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 134.5-16 chr1 212125116 212125278 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 47584 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 299.25-2 chr1 100181459 100182026 + 1.25 NA Intergenic AluYd8|SINE|Alu -3469 NM_001256386 127495 Hs.44277 NM_144620 ENSG00000122477 LRRC39 - leucine rich repeat containing 39 protein-coding 238-44 chr3 71396401 71396688 + 1.25 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) -91773 NM_001244812 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 172.25-40 chr14 87796892 87797086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141695 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 136.5-188 chr5 121515285 121515516 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 192850 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 116.25-103 chr2 45670531 45670756 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 18968 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 213.25-46 chr3 191353749 191353980 + 1.25 NA intron (NM_178335, intron 1 of 11) intron (NM_178335, intron 1 of 11) -23328 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 217.75-70 chr8 28366149 28366344 + 1.25 NA intron (NM_018660, intron 1 of 9) intron (NM_018660, intron 1 of 9) 20214 NM_018660 55893 Hs.435535 NM_018660 ENSG00000186918 ZNF395 HDBP-2|HDBP2|HDRF-2|PBF|PRF-1|PRF1|Si-1-8-14 zinc finger protein 395 protein-coding 265.75-2 chr10 19792128 19792360 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -24188 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 218-63 chr7 39821522 39821789 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88087 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 279.75-47 chr5 164113761 164114159 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 353442 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 255.75-41 chr5 94288096 94288407 + 1.25 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -176552 NM_001163417 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 311.5-10 chr14 73849270 73849672 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2360 NM_001371334 339-35 chr8 137250442 137250747 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 162994 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 127.5-63 chr13 21816393 21816713 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 61607 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 327-28 chr7 8771717 8772281 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 338390 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 152.25-127 chr5 50893945 50894162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76134 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 263.75-13 chr14 71424637 71424849 + 1.25 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) L1MB3|LINE|L1 -14196 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 137.75-133 chr3 74021718 74021953 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 212591 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 324-23 chr5 31298602 31299101 + 1.25 NA intron (NM_001362435, intron 4 of 10) intron (NM_001362435, intron 4 of 10) 105165 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 179.25-95 chr21 41598041 41598304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -81130 NR_024367 54090 Hs.570442 NR_024367 LINC00111 C21orf21|NCRNA00111 long intergenic non-protein coding RNA 111 ncRNA 203-66 chr3 179879033 179879220 + 1.25 NA intron (NM_001349404, intron 1 of 10) intron (NM_001349404, intron 1 of 10) -19068 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 222-59 chr4 85886310 85886684 + 1.25 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) -43519 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 201.5-46 chr13 39386160 39386377 + 1.25 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) intron (NM_005780, intron 2 of 3) 216925 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 175-109 chr6 49364790 49365179 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 98269 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 295.5-29 chr2 148711347 148711746 + 1.25 NA intron (NM_015630, intron 2 of 13) L1MCa|LINE|L1 66795 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 234.75-65 chr5 179960383 179960764 + 1.25 NA intron (NM_001280801, intron 7 of 7) intron (NM_001280801, intron 7 of 7) -52676 NM_198868 23061 Hs.155829 NM_015043 ENSG00000197226 TBC1D9B GRAMD9B TBC1 domain family member 9B protein-coding 201.25-4 chr1 36494646 36494830 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -11424 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 201.5-19 chr10 29578840 29579084 + 1.25 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) intron (NM_001323599, intron 3 of 38) 23384 NR_030634 100126327 NR_030634 ENSG00000216035 MIR938 MIRN938|hsa-mir-938 microRNA 938 ncRNA 120.25-39 chr11 46734023 46734158 + 1.25 NA intron (NM_000506, intron 12 of 13) intron (NM_000506, intron 12 of 13) 14877 NM_001311257 2147 Hs.655207 NM_000506 ENSG00000180210 F2 PT|RPRGL2|THPH1 coagulation factor II, thrombin protein-coding 194.5-126 chr6 41116094 41116288 + 1.25 NA intron (NR_026938, intron 6 of 22) intron (NR_026938, intron 6 of 22) 15157 NR_026938 221442 Hs.374076 NM_001010871 ENSG00000161912 ADCY10P1 - ADCY10 pseudogene 1 pseudo 377.25-3 chr10 109672228 109672655 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 250805 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 368.75-11 chr5 72914387 72914787 + 1.25 NA TTS (NM_002270) TTS (NM_002270) 35996 NR_039968 100616152 NR_039968 ENSG00000263593 MIR4804 - microRNA 4804 ncRNA 234.75-12 chr10 91206619 91206999 + 1.25 NA intron (NM_001257101, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -13342 NM_001256549 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 283.5-14 chr12 77700944 77701285 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -129780 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 249-40 chr5 133002281 133002637 + 1.25 NA intron (NR_131767, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 24090 NM_001300822 54819 Hs.29700 NM_017665 ENSG00000155329 ZCCHC10 - zinc finger CCHC-type containing 10 protein-coding 239.75-51 chr4 30629384 30629676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90839 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 351-19 chr4 108208625 108209049 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36717 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 164-25 chr12 16841778 16841933 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -146892 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 276.75-48 chr7 47624374 47624642 + 1.25 NA intron (NR_108090, intron 2 of 3) intron (NR_108090, intron 2 of 3) 2569 NR_108090 101929086 Hs.563487 NR_108090 ENSG00000236078 LINC01447 - long intergenic non-protein coding RNA 1447 ncRNA 184.25-46 chr17 74003622 74003949 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -175248 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 412.5-8 chr3 176367791 176368276 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 123482 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 217.5-7 chr1 158433690 158433939 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12948 NM_001004476 391107 Hs.626815 NM_001004476 ENSG00000180708 OR10K2 OR1-4 olfactory receptor family 10 subfamily K member 2 protein-coding 281-9 chr13 79045901 79046171 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -205986 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 308.25-26 chr4 94851152 94851632 + 1.25 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) intron (NM_001203, intron 1 of 12) 93437 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 139-135 chr7 10768944 10769150 + 1.25 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 10897 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 215-70 chr7 125156843 125157097 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27599 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 277.25-39 chr5 87769574 87769845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 107667 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 119.25-222 chr9 84757396 84757554 + 1.25 NA intron (NM_001018064, intron 12 of 17) intron (NM_001018064, intron 12 of 17) 51574 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 241.25-4 chr1 54658264 54658564 + 1.25 NA intron (NM_001039464, intron 3 of 23) L1M4|LINE|L1 16628 NM_001039464 374977 Hs.412482 NM_198547 ENSG00000184313 MROH7 C1orf175|HEATR8 maestro heat like repeat family member 7 protein-coding 185.5-100 chr3 31358582 31358802 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -174233 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 184.75-9 chr10 22421969 22422289 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 15800 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 270.5-18 chr14 89219955 89220179 + 1.25 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 197166 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 191.5-100 chr3 126366414 126366654 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9126 NM_014079 28999 Hs.272215 NM_014079 ENSG00000163884 KLF15 KKLF Kruppel like factor 15 protein-coding 239.5-46 chr3 39332228 39332478 + 1.25 NA exon (NM_005201, exon 2 of 2) exon (NM_005201, exon 2 of 2) 2644 NM_005201 1237 Hs.113222 NM_005201 ENSG00000179934 CCR8 CC-CKR-8|CCR-8|CDw198|CKRL1|CMKBR8|CMKBRL2|CY6|GPRCY6|TER1 C-C motif chemokine receptor 8 protein-coding 204-29 chr2 18981233 18981487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 45611 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 322-18 chr21 18415173 18415502 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -11552 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 288.5-16 chr16 22203998 22204456 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2051 NM_013302 29904 Hs.498892 NM_013302 ENSG00000103319 EEF2K CaMKIII|HSU93850|eEF-2K eukaryotic elongation factor 2 kinase protein-coding 236.5-73 chr5 36948828 36949159 + 1.25 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 72224 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 185-36 chr2 7204920 7205133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -127146 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 279-48 chr8 55131177 55131578 + 1.25 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 29349 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 131.5-20 chr1 224793700 224793957 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -135826 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 149.25-94 chr2 192994363 192994563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 244618 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 167-107 chr7 51888277 51888422 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -495093 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 246-73 chr9 125588741 125589068 + 1.25 NA intron (NM_001006619, intron 4 of 10) L2b|LINE|L2 118304 NM_001006618 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 208-60 chr4 33504798 33505083 + 1.25 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 534953 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 290-28 chr2 162038072 162038453 + 1.25 NA intron (NM_001935, intron 8 of 25) intron (NM_001935, intron 8 of 25) 35953 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 242.5-11 chr10 19535800 19536112 + 1.25 NA intron (NM_001142308, intron 32 of 39) intron (NM_001142308, intron 32 of 39) 192594 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 303.5-33 chr4 72770321 72770935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -201407 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 289-47 chr8 116367721 116368042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42822 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 253-55 chr9 95133042 95133332 + 1.25 NA intron (NM_001243744, intron 8 of 13) intron (NM_001243744, intron 8 of 13) -47093 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 113-95 chr2 122005789 122005912 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 250199 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 115.5-214 chr6 50700565 50700711 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12906 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 245-28 chr2 6675690 6675962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25307 NR_110497 102800314 Hs.258100 NR_110497 ENSG00000236172 MIR7515HG - MIR7515 host gene ncRNA 139.25-206 chr9 25437502 25437786 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 241214 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 349-3 chr10 31027068 31027387 + 1.25 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) L1PA5|LINE|L1 4710 NR_026560 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 174-96 chr8 32510124 32510345 + 1.25 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu -37976 NM_001160005 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 175.75-15 chr10 15151970 15152164 + 1.25 NA intron (NM_001308295, intron 1 of 12) intron (NM_001308295, intron 1 of 12) 3280 NR_036506 100192204 Hs.714691 NR_036506 ENSG00000206448 PPIAP30 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 30 pseudo 128.75-100 chr2 122171081 122171263 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 415521 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 159-103 chr7 72029636 72029886 + 1.25 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) MER21C|LTR|ERVL 307630 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 147-61 chr18 11519364 11519599 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29433 NR_110778 101927433 Hs.331210 NR_110778 ENSG00000267252 LINC01255 - long intergenic non-protein coding RNA 1255 ncRNA 224.25-24 chr12 91816054 91816295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 325539 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 268.25-37 chr4 98372741 98373061 + 1.25 NA intron (NM_001100430, intron 4 of 12) AluJr4|SINE|Alu 111517 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 289.75-9 chr12 95101382 95101821 + 1.25 NA intron (NM_018351, intron 14 of 20) intron (NM_018351, intron 14 of 20) -27983 NM_001032287 7181 Hs.108301 NM_003297 ENSG00000120798 NR2C1 TR2 nuclear receptor subfamily 2 group C member 1 protein-coding 253.5-6 chr1 179804735 179805182 + 1.25 NA TTS (NR_162130) TTS (NR_162130) 1034 NR_162130 113219451 NR_162130 MIR12116 - microRNA 12116 ncRNA 129-8 chr1 113031448 113031641 + 1.25 NA intron (NR_103777, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 41558 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 264.5-39 chr4 37528429 37528833 + 1.25 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) intron (NM_001104629, intron 1 of 3) -55602 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 444.75-8 chr8 120733677 120734201 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 -27314 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 135-160 chr6 135887609 135887759 + 1.25 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) intron (NM_018945, intron 1 of 12) 35983 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 265.25-5 chr10 22218901 22219238 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -9086 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 164.75-17 chr10 48432452 48432641 + 1.25 NA intron (NM_001323331, intron 12 of 12) intron (NM_001323331, intron 12 of 12) 30934 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 416.75-3 chr13 24151532 24151954 + 1.25 NA intron (NM_001286792, intron 3 of 14) MIR|SINE|MIR -8977 NM_153023 221178 Hs.434298 NM_153023 ENSG00000182957 SPATA13 ARHGEF29|ASEF2 spermatogenesis associated 13 protein-coding 129.5-193 chr5 164614811 164615012 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 144632 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 219.5-40 chr14 48678938 48679256 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -884083 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 292.75-9 chr12 119713817 119714100 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_031589) promoter-TSS (NR_031589) -234 NR_031589 100302274 NR_031589 ENSG00000283768 MIR1178 MIRN1178|hsa-mir-1178 microRNA 1178 ncRNA 151.25-166 chr7 6048040 6048260 + 1.25 NA intron (NM_001134335, intron 4 of 14) L1MB7|LINE|L1 11025 NM_014413 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 182.25-52 chr18 3664989 3665205 + 1.25 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 61360 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 203-42 chr17 62825043 62825255 + 1.25 NA intron (NR_135634, intron 1 of 1) intron (NR_135634, intron 1 of 1) 16647 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 194.5-166 chr9 84257189 84257517 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 83405 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 257-60 chr9 103019779 103020025 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 24569 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 165.75-160 chr7 95089742 95089980 + 1.25 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 179963 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 308.75-29 chr5 34948052 34948336 + 1.25 NA intron (NM_001012339, intron 9 of 11) L1MC4a|LINE|L1 18601 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 204.5-103 chr4 174807050 174807314 + 1.25 NA intron (NM_006529, intron 1 of 9) intron (NM_006529, intron 1 of 9) 22065 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 207-21 chr12 16666503 16666754 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -58414 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 164.75-146 chr8 105622019 105622201 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 302567 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 176.25-86 chr22 28400483 28400718 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -59269 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 350.75-5 chr20 52163226 52163727 + 1.25 NA intron (NM_199427, intron 4 of 8) intron (NM_199427, intron 4 of 8) 28303 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 281.75-35 chr5 32726993 32727301 + 1.25 NA intron (NM_001363652, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 15826 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 173-2 chr1 84582014 84582244 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7689 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 156-81 chr2 58054732 58054954 + 1.25 NA intron (NM_001130483, intron 2 of 13) intron (NM_001130483, intron 2 of 13) 8131 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 147.25-62 chr2 142219900 142220097 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -88297 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 222.5-79 chr4 85943037 85943252 + 1.25 NA intron (NM_031305, intron 2 of 6) L1ME4c|LINE|L1 13128 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 303.5-27 chr2 225079532 225079971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37283 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 213.75-107 chr9 74291815 74292087 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79580 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 169.5-105 chr3 38701741 38701937 + 1.25 NA exon (NM_001293306, exon 26 of 27) exon (NM_001293306, exon 26 of 27) -52152 NM_001354701 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 159.75-20 chr10 73174453 73174695 + 1.25 NA intron (NM_173348, intron 1 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 6455 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 242.75-77 chr9 35039749 35040083 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1179 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 227.75-72 chr6 127521345 127521681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2489 NM_001012279 387104 Hs.319247 NM_001012279 ENSG00000255330 SOGA3 C6orf174|dJ403A15.3 SOGA family member 3 protein-coding 205.25-107 chr8 123996866 123997220 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 12 of 40) L1M1|LINE|L1 43739 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 193.75-65 chr2 116731251 116731462 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1083335 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 213.75-54 chr2 135522376 135522734 + 1.25 NA intron (NM_032143, intron 1 of 20) AluSx|SINE|Alu 8030 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 195.5-141 chr6 162130850 162131021 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) -596197 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 296.25-28 chr5 154102460 154103016 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 63771 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 217.25-84 chr8 128329366 128329815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179474 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 234.5-72 chr4 107750829 107751219 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30790 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 362.75-10 chr5 15045556 15045970 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -173985 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 234.75-32 chr18 77764280 77764540 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 229317 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 231.5-42 chr2 38590439 38590720 + 1.25 NA intron (NM_138394, intron 2 of 12) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 12349 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 363-6 chr2 50389210 50389768 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -41733 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 128.75-47 chr12 112803375 112803565 + 1.25 NA intron (NM_001347955, intron 2 of 20) MIRb|SINE|MIR 11722 NR_145126 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 148.75-43 chr12 79531679 79531941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 112553 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 243.5-13 chr1 210567942 210568157 + 1.25 NA intron (NM_001122834, intron 9 of 11) MER21B|LTR|ERVL 238683 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 203-10 chr10 31989372 31989613 + 1.25 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -60616 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 166.5-163 chr5 86246151 86246305 + 1.25 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -36216 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 119-108 chr21 45604090 45604265 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 10523 NR_146912 105372840 Hs.406003 NR_146912 ENSG00000233922 LINC01694 - long intergenic non-protein coding RNA 1694 ncRNA 196-59 chr21 32119948 32120162 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33760 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 197.5-94 chr3 42808749 42809007 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001296) promoter-TSS (NM_001296) -567 NM_001296 1238 Hs.146346 NM_001296 ENSG00000144648 ACKR2 CCBP2|CCR10|CCR9|CMKBR9|D6|hD6 atypical chemokine receptor 2 protein-coding 199.75-66 chr3 178310467 178310762 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -108587 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 143.25-76 chr18 32082183 32082314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9626 NM_016271 51444 Hs.302408 NM_016271 ENSG00000134758 RNF138 HSD-4|NARF|STRIN|hNARF ring finger protein 138 protein-coding 214.75-90 chr9 35227171 35227402 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) intron (NM_006377, intron 1 of 38) 65277 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 216-84 chrX 132568239 132568545 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -78357 NM_001170704 55796 Hs.105134 NM_018388 ENSG00000076770 MBNL3 CHCR|MBLX|MBLX39|MBXL muscleblind like splicing regulator 3 protein-coding 226-57 chr5 141211530 141211807 + 1.25 NA 3' UTR (NM_018932, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_018932, exon 1 of 1) -2251 NM_018933 56123 Hs.283803 NM_018933 ENSG00000187372 PCDHB13 PCDH-BETA13 protocadherin beta 13 protein-coding 145-37 chr12 72555345 72555634 + 1.25 NA intron (NM_013381, intron 7 of 18) intron (NM_013381, intron 7 of 18) -281980 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 250.75-11 chr14 47995483 47995836 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -200645 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 182-72 chr3 29772637 29772932 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 161372 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 187.5-159 chr7 85298750 85298978 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -122258 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 141.75-142 chr5 120713998 120714132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182601 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 250.75-41 chr3 168376431 168377029 + 1.25 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) MIRb|SINE|MIR 127208 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 172.5-35 chr10 117678394 117678636 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -133447 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 144.5-232 chr9 31240380 31240564 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 141018 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 228.25-59 chr4 101999728 102000014 + 1.25 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) L2c|LINE|L2 186029 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 281.5 chr1 203354899 203355311 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3983 NR_103757 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 291.75-34 chr4 84614311 84614628 + 1.25 NA intron (NM_001263, intron 3 of 12) L1M5|LINE|L1 31342 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 199 chr1 51670133 51670544 + 1.25 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) intron (NM_148906, intron 2 of 22) 53246 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 216.25-95 chr7 77282677 77282979 + 1.25 NA intron (NM_020879, intron 15 of 18) intron (NM_020879, intron 15 of 18) -83009 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 205.25-90 chr5 129059076 129059415 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -35504 NM_016048 51015 Hs.483296 NM_016048 ENSG00000066583 ISOC1 CGI-111 isochorismatase domain containing 1 protein-coding 128.75-85 chr18 13920439 13920577 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4801 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 233.25-34 chr2 29066378 29066742 + 1.25 NA intron (NM_001029883, intron 1 of 1) intron (NM_001029883, intron 1 of 1) 7963 NM_001029883 388939 Hs.354243 NM_001029883 ENSG00000179270 PCARE C2orf71|RP54 photoreceptor cilium actin regulator protein-coding 245.75-55 chr7 37984700 37985161 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 63611 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 116.5-90 chr17 49017476 49017660 + 1.25 NA intron (NM_001160423, intron 2 of 12) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 20183 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 242-5 chr1 111049254 111049494 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -85430 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 246.25-53 chr5 92329891 92330261 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -946759 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 268.25-6 chr11 119718304 119718786 + 1.25 NA intron (NM_203285, intron 1 of 7) intron (NM_203285, intron 1 of 7) 10655 NM_203285 5818 Hs.334846 NM_002855 ENSG00000110400 NECTIN1 CD111|CLPED1|ED4|HIgR|HV1S|HVEC|OFC7|PRR|PRR1|PVRL1|PVRR|PVRR1|SK-12|nectin-1 nectin cell adhesion molecule 1 protein-coding 172.75-132 chr8 120665805 120666011 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -95345 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 227-11 chr12 18773560 18773803 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 35562 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 217.25-54 chr3 96091574 96091798 + 1.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -268278 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 180.5-96 chr3 77354736 77354937 + 1.25 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) L2|LINE|L2 256824 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 205-20 chr14 49468397 49468762 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 117801 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 329.25-3 chr10 88904073 88904482 + 1.25 NA intron (NM_020799, intron 2 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 24032 NM_020799 57559 Hs.16229 NM_020799 ENSG00000138134 STAMBPL1 ALMalpha|AMSH-FP|AMSH-LP|bA399O19.2 STAM binding protein like 1 protein-coding 125-12 chr1 190029244 190029453 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 446662 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 138-51 chr16 61388772 61388942 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -333091 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 146.5-137 chr3 31537664 31537818 + 1.25 NA intron (NM_178862, intron 1 of 15) intron (NM_178862, intron 1 of 15) 4816 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 343.75-17 chrX 43414738 43415189 + 1.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 237969 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 144.75-113 chr3 177906053 177906289 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 89306 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 163.75-18 chr10 35471507 35471785 + 1.25 NA intron (NM_001282853, intron 2 of 10) intron (NM_001282853, intron 2 of 10) -133695 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 240-46 chr5 5255439 5255810 + 1.25 NA intron (NM_139056, intron 17 of 22) LTR33B|LTR|ERVL 115294 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 204.5-46 chr16 50218684 50218999 + 1.25 NA intron (NM_001365324, intron 5 of 11) L3b|LINE|CR1 -47710 NM_001114 113 Hs.513578 NM_001114 ENSG00000121281 ADCY7 AC7 adenylate cyclase 7 protein-coding 171.75-23 chr11 30047651 30047801 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -30696 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 285-35 chr5 7652601 7653146 + 1.25 NA intron (NM_020546, intron 4 of 24) intron (NM_020546, intron 4 of 24) 198260 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 178.25-51 chr17 67456905 67457093 + 1.25 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) L1MEd|LINE|L1 -14490 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 282.75-6 chr10 115111894 115112206 + 1.25 NA intron (NR_074088, intron 2 of 9) L1MA7|LINE|L1 18685 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 203-105 chr9 34704406 34704597 + 1.25 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 5635 NM_002989 6366 Hs.57907 NM_002989 ENSG00000137077 CCL21 6Ckine|CKb9|ECL|SCYA21|SLC|TCA4 C-C motif chemokine ligand 21 protein-coding 173-90 chr3 177343884 177344103 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49551 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 307.25-16 chr2 111075345 111075783 + 1.25 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1MD2|LINE|L1 40024 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 192.25-29 chr16 14144457 14144686 + 1.25 NA intron (NM_001308142, intron 3 of 16) L1MA8|LINE|L1 -42115 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 192.5-45 chr15 87600209 87600402 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 23376 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 126.75-65 chr14 79653464 79653706 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) L2|LINE|L2 374205 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 292-21 chr18 3700985 3701254 + 1.25 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) AluJr4|SINE|Alu 97382 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 339.5-5 chr1 228169917 228170205 + 1.25 NA intron (NM_001010867, intron 1 of 2) AluSg|SINE|Alu 4257 NM_001010867 200205 Hs.237017 NM_001010867 ENSG00000181873 IBA57 C1orf69|MMDS3|SPG74 iron-sulfur cluster assembly factor IBA57 protein-coding 222.5-61 chr20 4942420 4942624 + 1.25 NA intron (NM_005116, intron 2 of 16) intron (NM_005116, intron 2 of 16) 58988 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 129.75-69 chr16 25657957 25658132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33915 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 247-9 chr10 119147362 119147728 + 1.25 NA intron (NM_213649, intron 12 of 13) MIR3|SINE|MIR 18147 NR_110305 119559 Hs.655168 NM_178867 ENSG00000183605 SFXN4 BCRM1|COXPD18|SLC56A4 sideroflexin 4 protein-coding 181-72 chr3 108013039 108013308 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 77915 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 178.25-62 chr2 61382273 61382564 + 1.25 NA intron (NM_014709, intron 6 of 79) L2a|LINE|L2 34959 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 280.25-32 chr2 197679692 197680008 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -4263 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 254-44 chr7 135113312 135113641 + 1.25 NA intron (NM_001305630, intron 2 of 2) intron (NM_001305630, intron 2 of 2) -34596 NM_018295 55281 Hs.521213 NM_018295 ENSG00000146859 TMEM140 - transmembrane protein 140 protein-coding 137.5-242 chr9 106877565 106877690 + 1.25 NA intron (NM_001347997, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 14461 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 140.75-154 chr5 109721397 109721583 + 1.25 NA intron (NM_002372, intron 3 of 21) MER53|DNA|hAT 32124 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 162.25-28 chr11 50239590 50239817 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 58759 NR_003034 441601 Hs.144683 NR_003034 ENSG00000255042 LOC441601 - septin 7 pseudogene pseudo 292.75-36 chr9 83474787 83475194 + 1.25 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) L1MEg|LINE|L1 -7248 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 199-86 chr8 108582129 108582334 + 1.25 NA Intergenic ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 138607 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 164.25-47 chr15 70141965 70142190 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44160 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 132.25-87 chr19 16919071 16919274 + 1.25 NA intron (NM_015692, intron 27 of 41) AluSx1|SINE|Alu -22225 NR_147452 27151 Hs.631644 NM_015692 ENSG00000160111 CPAMD8 ASGD8|K-CAP|VIP C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8 protein-coding 138.25-127 chr3 192837523 192837691 + 1.25 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) intron (NM_178496, intron 1 of 1) 80249 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 461.5-8 chr7 30181853 30182544 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47212 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 204.75-4 chr1 48325169 48325485 + 1.25 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) intron (NM_001286238, intron 11 of 12) 102611 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 128-76 chr2 108927446 108927650 + 1.25 NA intron (NM_022336, intron 4 of 11) intron (NM_022336, intron 4 of 11) 61672 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 210.75-103 chr9 69216798 69217001 + 1.25 NA intron (NM_001369870, intron 4 of 23) intron (NM_001369870, intron 4 of 23) 11744 NM_001170416 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 286.5-26 chr14 71983893 71984138 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L2c|LINE|L2 50488 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 241-4 chr10 43014219 43014554 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 16823 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 257.75-43 chr5 115906895 115907252 + 1.25 NA intron (NM_001318093, intron 6 of 6) intron (NM_001318093, intron 6 of 6) -49498 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 263-11 chr11 115882482 115882835 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -122458 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 182.25-34 chr13 105099769 105099951 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -366007 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 280-31 chr2 207660426 207660718 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1812 NR_135566 102724714 Hs.443475 NR_135566 ENSG00000224137 LINC01857 - long intergenic non-protein coding RNA 1857 ncRNA 260.25-25 chr2 151837995 151838297 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330113, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001330113, exon 11 of 11) -9725 NM_177985 26225 Hs.470233 NM_012097 ENSG00000162980 ARL5A ARFLP5|ARL5 ADP ribosylation factor like GTPase 5A protein-coding 204-90 chr9 105724808 105725055 + 1.25 NA intron (NM_018112, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 30390 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 132.25-145 chr4 184119632 184119831 + 1.25 NA intron (NM_153343, intron 3 of 7) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 98142 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 178-110 chr9 106820362 106820629 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42671 NM_001347997 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 187-38 chr2 17579928 17580207 + 1.25 NA intron (NM_001366806, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 39371 NM_001366805 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 135.5-185 chr7 43025442 43025575 + 1.25 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -87139 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 237.25-39 chr18 9328727 9328951 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5934 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 264.25-22 chr18 70609630 70609938 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41170 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 255.25-54 chr8 107055141 107055517 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 281186 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 227.25-44 chr2 56392537 56392762 + 1.25 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -206879 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 141.5-192 chr6 43157616 43157828 + 1.25 NA intron (NM_152882, intron 16 of 18) AluJr|SINE|Alu -13547 NM_003131 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 188.75-10 chr10 22014152 22014465 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -10578 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 246.75-75 chr8 119877612 119877933 + 1.25 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 4050 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 271.5-2 chr1 64790366 64790666 + 1.25 NA intron (NM_001366165, intron 5 of 11) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 45441 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 183.5-64 chr2 59077271 59077526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -140310 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 182.75-35 chr12 29365946 29366128 + 1.25 NA intron (NM_016570, intron 5 of 13) intron (NM_016570, intron 5 of 13) 15135 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 232.25-50 chr4 58722320 58722605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186134 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 271-11 chr13 113611876 113612161 + 1.25 NA intron (NM_007111, intron 3 of 11) intron (NM_007111, intron 3 of 11) 27265 NM_007111 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 308-20 chr2 232913112 232913805 + 1.25 NA intron (NM_001114090, intron 3 of 12) L1MD|LINE|L1 14693 NM_001114090 25791 Hs.97316 NM_019850 ENSG00000066248 NGEF ARHGEF27|EPHEXIN neuronal guanine nucleotide exchange factor protein-coding 176-28 chr16 62149751 62150098 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -113486 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 209.25-3 chr1 32090256 32090517 + 1.25 NA intron (NM_018056, intron 5 of 8) intron (NM_018056, intron 5 of 8) 3437 NR_049850 100847018 NR_049850 ENSG00000266203 MIR5585 - microRNA 5585 ncRNA 141.5-122 chr2 228592878 228593052 + 1.25 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) intron (NR_151716, intron 1 of 3) 18430 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 152-42 chr12 79318858 79319061 + 1.25 NA intron (NM_001291901, intron 7 of 9) intron (NM_001291901, intron 7 of 9) -100298 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 165.75-83 chr2 103929089 103929485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 479045 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 221.75-13 chr10 100008134 100008484 + 1.25 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) intron (NM_015221, intron 1 of 16) 1638 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 250.75-73 chrX 84485539 84485935 + 1.25 NA intron (NM_144657, intron 1 of 9) L1PA17|LINE|L1 16716 NM_144657 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 128.75-163 chr6 48432001 48432165 + 1.25 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR -363394 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 243.75-82 chr8 123804778 123805054 + 1.25 NA intron (NM_144963, intron 18 of 23) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 36477 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 155-7 chr1 198060179 198060539 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96639 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 263.25-55 chr8 83083080 83083394 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 171133 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 236.5-89 chr8 63681081 63681570 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -88105 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 170-96 chr8 63471544 63471703 + 1.25 NA intron (NR_125825, intron 2 of 3) intron (NR_125825, intron 2 of 3) 5774 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 170-65 chr3 176460580 176460857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54385 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 375.75-18 chr8 120666596 120666954 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -94478 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 225.75-21 chr12 63127176 63127494 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 25475 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 159.75-40 chr14 46059237 46059502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4790 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 331-27 chr5 92940711 92941138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 630419 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 251.25-25 chr2 28922826 28923112 + 1.25 NA exon (NM_015131, exon 7 of 18) exon (NM_015131, exon 7 of 18) -4098 NR_002741 26796 NR_002741 ENSG00000265145 SNORD53 RNU53|SNORD53A|U53 small nucleolar RNA, C/D box 53 snoRNA 123-15 chr1 232874374 232874496 + 1.25 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 69543 NM_019090 54627 Hs.160373 NM_019090 ENSG00000212916 MAP10 KIAA1383|MTR120 microtubule associated protein 10 protein-coding 162.5-132 chr4 115755423 115755688 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -544170 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 126.25-144 chr5 12647184 12647360 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) intron (NR_033383, intron 2 of 3) -20587 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 133-95 chr2 241517312 241517428 + 1.25 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -7798 NM_001282305 10494 Hs.516807 NM_006374 ENSG00000115694 STK25 SOK1|YSK1 serine/threonine kinase 25 protein-coding 247.5-85 chr8 114933548 114933931 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 734274 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 227.75-86 chr9 38197950 38198259 + 1.25 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -128877 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 168-95 chr5 345993 346183 + 1.25 NA intron (NM_020731, intron 2 of 11) intron (NM_020731, intron 2 of 11) 41912 NM_020731 57491 Hs.50823 NM_020731 ENSG00000286169 AHRR AHH|AHHR|bHLHe77 aryl-hydrocarbon receptor repressor protein-coding 242.75-18 chr15 49893343 49893926 + 1.25 NA intron (NR_073597, intron 22 of 26) L1MB2|LINE|L1 219745 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 207.5-103 chr7 41847446 41847724 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -144495 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 213-31 chr14 96763418 96763672 + 1.25 NA intron (NR_146552, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 22354 NR_146552 105370646 NR_146552 ENSG00000258979 LINC02299 - long intergenic non-protein coding RNA 2299 ncRNA 394-11 chr4 30445887 30446668 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -274092 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 206-30 chr15 62091935 62092202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25091 NM_207322 145741 Hs.202656 NM_207322 ENSG00000198535 C2CD4A FAM148A|NLF1 C2 calcium dependent domain containing 4A protein-coding 269.75-38 chr3 86683173 86683465 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 201376 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 145-166 chr9 23830422 23830546 + 1.25 NA intron (NM_001351456, intron 2 of 8) intron (NM_001351456, intron 2 of 8) -4244 NM_001351461 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 294.5-24 chr2 198870363 198870774 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -495471 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 133.25-30 chr11 43696225 43696348 + 1.25 NA intron (NM_016142, intron 1 of 10) intron (NM_016142, intron 1 of 10) 15548 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 126.25-66 chr17 15336897 15337024 + 1.25 NA intron (NM_031898, intron 2 of 8) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 4637 NM_031898 64518 Hs.414648 NM_031898 ENSG00000125409 TEKT3 - tektin 3 protein-coding 280-34 chr22 28158336 28158709 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) L1MA2|LINE|L1 -237910 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 182.25-108 chr7 13434662 13435034 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 551666 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 232.25-26 chr15 65758660 65758897 + 1.25 NA intron (NM_005848, intron 2 of 31) intron (NM_005848, intron 2 of 31) 33515 NM_001320835 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 317.25-21 chr3 79573291 79573760 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 65638 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 197-12 chr12 95329126 95329339 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 19309 NR_037456 100500802 NR_037456 ENSG00000265917 MIR3685 - microRNA 3685 ncRNA 287-15 chr14 63239216 63239525 + 1.25 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 34927 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 242.75-36 chr20 52923382 52923595 + 1.25 NA Intergenic Eulor11|DNA|DNA -48870 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 231-58 chr4 44028550 44028756 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 11591 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 245.25-60 chr6 49491209 49491580 + 1.25 NA intron (NM_018132, intron 8 of 8) L1ME4b|LINE|L1 -8529 NM_001010904 389396 Hs.585172 NM_001010904 ENSG00000203972 GLYATL3 C6orf140|bA28H17.2 glycine-N-acyltransferase like 3 protein-coding 520.75 chr1 33504285 33504907 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 31951 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 260-27 chr4 64200189 64200571 + 1.25 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 209070 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 126.75-229 chr7 105438434 105438566 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -49110 NM_001350740 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 188.75-114 chr8 76306878 76307085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99673 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 130.5-237 chr8 27150445 27150581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101550 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 218.5-87 chr4 74231284 74231567 + 1.25 NA intron (NM_001144978, intron 6 of 7) intron (NM_001144978, intron 6 of 7) 73307 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 261.75-22 chr2 72417915 72418212 + 1.25 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) L1MEi|LINE|L1 -270201 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 255-19 chr16 83093806 83094215 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) intron (NM_001220489, intron 3 of 12) -103712 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 380.75-3 chr4 22413925 22414552 + 1.25 NA intron (NM_145290, intron 12 of 18) intron (NM_145290, intron 12 of 18) -74572 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 287-25 chr2 153445494 153445736 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 33147 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 126.5-178 chr4 98093085 98093217 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) intron (NM_174952, intron 5 of 10) 50325 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 382.5-17 chr7 105155769 105156233 + 1.25 NA intron (NM_182692, intron 7 of 15) intron (NM_182692, intron 7 of 15) 113076 NM_001350744 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 227.5-99 chr8 29668704 29669039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79238 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 173.25-125 chr8 85833958 85834161 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6117 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 339-33 chr8 17965977 17966441 + 1.25 NA exon (NM_001315508, exon 19 of 36) exon (NM_001315508, exon 19 of 36) 43221 NM_001352636 5108 Hs.491148 NM_006197 ENSG00000078674 PCM1 PTC4|RET/PCM-1 pericentriolar material 1 protein-coding 200.25-39 chr15 65497343 65497521 + 1.25 NA intron (NR_135485, intron 5 of 20) AluJb|SINE|Alu 19842 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 124.25-5 chr1 55326591 55326743 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 101026 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 189.25-21 chr12 2978209 2978544 + 1.25 NA intron (NM_201443, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 18441 NM_201443 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 189.25-106 chr6 69821980 69822340 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25150 NM_018368 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 168.25-149 chr9 75390433 75390609 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 302007 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 133.75-55 chr14 49633075 49633344 + 1.25 NA intron (NM_018139, intron 1 of 2) AluSx4|SINE|Alu 2021 NM_001083908 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 208.5-114 chr5 150769845 150770031 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -8008 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 149.5-212 chr8 128108656 128108849 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -41364 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 282.25-9 chr11 72331630 72331966 + 1.25 NA intron (NM_030813, intron 6 of 16) AluSx|SINE|Alu -87622 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 181.25-79 chr3 21791421 21791669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40335 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 260.25-49 chr7 80594168 80594593 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7827 NM_001371074 128.5-202 chr7 22068192 22068346 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122370 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 135.25-15 chr1 208872601 208872739 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -99784 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 249.75-44 chr3 94615023 94615274 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -323115 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 136.75-30 chr10 81084129 81084293 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 434414 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 116-122 chr5 33967407 33967533 + 1.25 NA intron (NM_001012509, intron 2 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 17223 NM_001297417 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 272.5-52 chr4 65778525 65778828 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -108181 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 127.5-155 chr3 131302820 131303102 + 1.25 NA intron (NM_001353043, intron 17 of 17) L1PA15|LINE|L1 -58884 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 235.5-57 chr4 14501705 14501933 + 1.25 NA intron (NR_126435, intron 5 of 6) L1PA15|LINE|L1 386350 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 213.75-55 chr2 168996534 168996921 + 1.25 NA intron (NM_003742, intron 5 of 27) intron (NM_003742, intron 5 of 27) 34597 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 173.5-134 chr5 162058198 162058422 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -9332 NM_198903 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 198-27 chr15 81727697 81727955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 318192 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 127.75-97 chr2 66499613 66499903 + 1.25 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -59428 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 144-52 chr18 11728858 11729089 + 1.25 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) -22499 NM_001142339 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 356.75-15 chr7 41764554 41764933 + 1.25 NA intron (NR_027118, intron 2 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -61653 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 154.25-93 chr2 222507603 222507865 + 1.25 NA intron (NM_152386, intron 2 of 4) intron (NM_152386, intron 2 of 4) 83191 NM_152386 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 216.25-54 chr2 104060155 104060440 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 348035 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 173-46 chr14 69207929 69208213 + 1.25 NA intron (NM_001193360, intron 2 of 9) AluSq2|SINE|Alu 16305 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 267.75-45 chr5 58078890 58079156 + 1.25 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 43318 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 326.75-14 chr2 239046280 239046572 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 22488 NR_039642 100616397 NR_039642 ENSG00000266109 MIR4440 mir-4440 microRNA 4440 ncRNA 360.5-14 chr4 115504949 115505403 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -391556 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 213.75-102 chr7 50666534 50666752 + 1.25 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) intron (NM_001350816, intron 6 of 17) 38658 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 267-37 chr5 21819373 21819636 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) intron (NM_004061, intron 8 of 14) -64950 NR_132788 106635540 NR_132788 SNORA105B - small nucleolar RNA, H/ACA box 105B snoRNA 159-129 chr9 74637590 74637786 + 1.25 NA intron (NM_006914, intron 3 of 9) intron (NM_006914, intron 3 of 9) 22154 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 196-104 chrX 103279719 103279998 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -3108 NM_001012979 340543 Hs.403462 NM_001012979 ENSG00000204065 TCEAL5 WEX4 transcription elongation factor A like 5 protein-coding 346.25-8 chr19 29998593 29998954 + 1.25 NA intron (NM_001252641, intron 4 of 10) L1MB2|LINE|L1 56534 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 240.25-52 chr5 52703414 52703723 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84348 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 175.25-78 chr2 192403992 192404264 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -209195 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 158.25-117 chr6 24759782 24759936 + 1.25 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -15078 NM_001251989 51053 Hs.234896 NM_015895 ENSG00000112312 GMNN Gem|MGORS6 geminin DNA replication inhibitor protein-coding 312.25-17 chr2 241445781 241446284 + 1.25 NA intron (NM_014808, intron 13 of 26) intron (NM_014808, intron 13 of 26) -31873 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 121.75-22 chr11 92148181 92148364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76762 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 239.75-8 chr10 94094333 94094673 + 1.25 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) L2c|LINE|L2 5477 NM_001165979 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 387.75-2 chr10 48618933 48619421 + 1.25 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) L1M4|LINE|L1 -14046 NM_001347737 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 147.5-219 chr9 69656571 69656787 + 1.25 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) L1ME3|LINE|L1 15692 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 136-66 chr2 11630664 11630973 + 1.25 NA intron (NM_014668, intron 26 of 32) intron (NM_014668, intron 26 of 32) 39377 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 205-34 chr2 22309078 22309297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -227292 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 138.5-9 chr1 67256382 67256537 + 1.25 NA intron (NM_144701, intron 10 of 10) L2|LINE|L2 -50905 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 177.25-27 chr11 48196305 48196506 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -20405 NM_001005470 119765 Hs.553566 NM_001005470 ENSG00000175619 OR4B1 OR11-106|OST208 olfactory receptor family 4 subfamily B member 1 protein-coding 120-21 chr10 117430011 117430170 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -54650 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 183-47 chr18 71507155 71507408 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71675 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 152-41 chr12 60074263 60074553 + 1.25 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL 385038 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 115.25-29 chr10 78489616 78489746 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 222339 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 135.75-141 chr3 79661855 79662032 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 106055 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 258.25-6 chr1 197593859 197594130 + 1.25 NA intron (NM_144977, intron 14 of 15) intron (NM_144977, intron 14 of 15) 181486 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 160.75-156 chr9 28600416 28600663 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 118766 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 342.25-10 chr2 26012231 26012668 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21635 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 213-81 chr5 176991362 176991589 + 1.25 NA intron (NM_001199298, intron 1 of 14) intron (NM_001199298, intron 1 of 14) 14967 NM_016290 51720 Hs.232721 NM_016290 ENSG00000087206 UIMC1 RAP80|X2HRIP110 ubiquitin interaction motif containing 1 protein-coding 173.75-48 chr12 122511720 122511918 + 1.25 NA intron (NM_023012, intron 6 of 9) AluSg|SINE|Alu -10887 NM_001350935 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 122.75-137 chr3 134316099 134316300 + 1.25 NA intron (NR_146711, intron 1 of 1) intron (NR_146711, intron 1 of 1) 2623 NR_146711 105374119 NR_146711 ENSG00000240006 LINC02004 - long intergenic non-protein coding RNA 2004 ncRNA 234-23 chr2 129097397 129097701 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 176342 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 257-10 chr12 133028981 133029463 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 8000 NR_110091 101928597 Hs.638942 NR_110091 ENSG00000246394 ZNF84-DT - ZNF84 divergent transcript ncRNA 121.25-28 chr10 99899738 99899855 + 1.25 NA intron (NM_015221, intron 7 of 16) intron (NM_015221, intron 7 of 16) 14296 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 283.75-31 chr8 88502284 88502841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -175079 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 206.75-56 chr3 111387591 111387787 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -154508 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 157-101 chr5 152534992 152535162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129798 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 196.25-88 chr3 160189723 160190166 + 1.25 NA intron (NR_108088, intron 1 of 9) intron (NR_108088, intron 1 of 9) 17148 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 320.75-26 chr7 13281639 13282158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 594265 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 155.25-24 chr10 34144833 34145024 + 1.25 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -372248 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 156.75-94 chr2 155521978 155522284 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 732800 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 158.75-15 chr10 58977313 58977507 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -22108 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 274.75-32 chr20 19531735 19532073 + 1.25 NA intron (NM_020689, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR -247308 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 222-33 chr18 39603756 39603949 + 1.25 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) 18323 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 193.25-80 chr4 30409165 30409356 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -311109 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 390.5-16 chrX 113436915 113437326 + 1.25 NA intron (NR_110399, intron 3 of 3) L1MC1|LINE|L1 394393 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 244.5-23 chr12 38436002 38436251 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 119352 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 206.5-127 chr7 98056463 98056684 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50289 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 238.25-86 chr8 101873552 101873750 + 1.25 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) MER113A|DNA|hAT-Charlie -82682 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 150.25-102 chr3 98117572 98117910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14957 NM_001005338 26341 Hs.537383 NM_001005338 ENSG00000231192 OR5H1 HSHTPCRX14|HTPCRX14 olfactory receptor family 5 subfamily H member 1 protein-coding 206.25-8 chr1 98383902 98384159 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 173319 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 160.5-199 chr9 6596957 6597167 + 1.25 NA intron (NM_000170, intron 8 of 24) L1MB7|LINE|L1 48630 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 230.75-44 chr21 42847048 42847264 + 1.25 NA intron (NM_033661, intron 11 of 11) intron (NM_033661, intron 11 of 11) 32119 NM_001260477 10785 Hs.248815 NM_018669 ENSG00000160193 WDR4 GAMOS6|MIGSB|TRM82|TRMT82 WD repeat domain 4 protein-coding 385.5-2 chr10 18264346 18265032 + 1.25 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) L1ME3A|LINE|L1 3967 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 209.75-81 chr5 171208462 171208747 + 1.25 NA intron (NM_022897, intron 20 of 27) intron (NM_022897, intron 20 of 27) -100644 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 135-55 chr17 21019975 21020196 + 1.25 NA intron (NM_015276, intron 3 of 12) intron (NM_015276, intron 3 of 12) 22926 NM_015276 23326 Hs.462492 NM_015276 ENSG00000124422 USP22 USP3L ubiquitin specific peptidase 22 protein-coding 219-41 chr16 17890439 17890672 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -419595 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 190.5-47 chr14 71015049 71015326 + 1.25 NA intron (NM_014982, intron 11 of 35) L1MEc|LINE|L1 107728 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 206.25-25 chr11 33535791 33535997 + 1.25 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) intron (NM_012194, intron 1 of 20) 159786 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 303.5-20 chr2 31515652 31515968 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 65128 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 179-57 chr2 143173101 143173499 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 2 of 13) intron (NM_018460, intron 2 of 13) 43881 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 159.25-32 chr12 72025001 72025201 + 1.25 NA intron (NM_173353, intron 9 of 10) intron (NM_173353, intron 9 of 10) 86256 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 188-41 chr20 12253072 12253367 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 335326 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 240-23 chr16 75047253 75047539 + 1.25 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) AluJr4|SINE|Alu 48372 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 191-55 chr4 24119610 24119861 + 1.25 NA intron (NR_148982, intron 1 of 13) intron (NR_148982, intron 1 of 13) -229688 NR_148984 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 279.25-5 chr1 187236665 187237047 + 1.25 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 144014 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 205.5-129 chr6 153641278 153641511 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -369102 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 317-15 chr2 56260448 56260978 + 1.25 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -74943 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 235.75-9 chr10 52937479 52937862 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -165970 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 330.25-8 chr17 79210184 79210549 + 1.25 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) L1ME4c|LINE|L1 135429 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 208.25-13 chr10 19780773 19780989 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35551 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 135.25-113 chr2 206944162 206944364 + 1.25 NA intron (NM_173077, intron 1 of 8) intron (NM_173077, intron 1 of 8) 4745 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 253.5-65 chr5 152491669 152491896 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -86503 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 229-31 chr2 35369727 35370079 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101502 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 157-52 chr2 60544389 60544659 + 1.25 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) 8974 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 149.5-115 chr21 28794348 28794478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 90954 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 158-43 chr12 120870676 120870820 + 1.25 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 33610 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 193-75 chr5 150078913 150079080 + 1.25 NA intron (NM_001288705, intron 3 of 20) L2a|LINE|L2 7644 NR_109969 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 162.5-37 chr12 58657375 58657637 + 1.25 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 65804 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 317-5 chr1 200569669 200570051 + 1.25 NA intron (NM_014875, intron 23 of 29) MIR3|SINE|MIR 48978 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 479.25-2 chr2 69689271 69689863 + 1.25 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) L1MC5|LINE|L1 45759 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 188.75-81 chr3 186679083 186679283 + 1.25 NA TTS (NM_000412) TTS (NM_000412) 13231 NM_000412 3273 Hs.1498 NM_000412 ENSG00000113905 HRG HPRG|HRGP|THPH11 histidine rich glycoprotein protein-coding 215-65 chr5 149072541 149072860 + 1.25 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) intron (NR_122044, intron 2 of 2) 9383 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 294-3 chr1 210938489 210938774 + 1.25 NA intron (NM_002238, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 194743 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 209.5-65 chr2 59638629 59638848 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 421030 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 121.5-156 chr20 49782176 49782333 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -30459 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 250-63 chr8 128039592 128040027 + 1.25 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 -9343 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 253.5-34 chr18 2316244 2316570 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 255098 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 269-31 chr21 30592071 30592560 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_181605) promoter-TSS (NM_181605) -125 NM_181605 337968 Hs.553691 NM_181605 ENSG00000212938 KRTAP6-3 KAP6.3 keratin associated protein 6-3 protein-coding 192.5-142 chr9 79956201 79956430 + 1.25 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) -18708 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 240.25-26 chr15 94762829 94763065 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92416 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 203.5-108 chr4 74485663 74486060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40725 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 331-9 chr12 42569263 42569641 + 1.25 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 20294 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 181.25-14 chr10 66504624 66504891 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -421279 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 245-34 chr20 59547814 59548115 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29545 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 129.5-108 chr2 23825881 23826043 + 1.25 NA intron (NR_125717, intron 15 of 28) intron (NR_125717, intron 15 of 28) 101161 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 171.5-119 chr4 102608945 102609134 + 1.25 NA intron (NM_003998, intron 19 of 23) AluJr|SINE|Alu -106553 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 189.75-126 chr8 123575072 123575346 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -34003 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 277-39 chr8 134434036 134434367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -163870 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 335.5 chr1 25478851 25479196 + 1.25 NA intron (NM_018202, intron 6 of 10) intron (NM_018202, intron 6 of 10) 48126 NM_018202 55219 Hs.189782 NM_018202 ENSG00000204178 MACO1 MACOILIN|TMEM57 macoilin 1 protein-coding 269-18 chr14 53455371 53455812 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 302237 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 158-93 chr22 21812119 21812256 + 1.25 NA intron (NM_002745, intron 1 of 8) L1MA7|LINE|L1 55493 NM_002745 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 188.75-122 chr9 36159537 36159785 + 1.25 NA intron (NM_001287013, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 -9727 NM_005893 881 Hs.115460 NM_005893 ENSG00000185972 CCIN BTBD20|KBTBD14 calicin protein-coding 224-61 chr8 38180632 38180839 + 1.25 NA intron (NM_001204878, intron 1 of 3) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 3880 NM_001204878 9530 Hs.194726 NM_004874 ENSG00000156735 BAG4 BAG-4|SODD BCL2 associated athanogene 4 protein-coding 277-15 chr16 74289158 74289445 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7513 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 231.75-4 chr1 119013213 119013547 + 1.25 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -11975 NR_135034 105378933 Hs.599652 NR_135034 ENSG00000226172 LOC105378933 - uncharacterized LOC105378933 ncRNA 255.75-27 chr2 168807526 168807798 + 1.25 NA intron (NM_052946, intron 1 of 14) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 5065 NM_052946 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 254.5-21 chr12 41591969 41592272 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154381 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 238.5-31 chr16 60307844 60308187 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 51778 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 202.5-79 chr2 136339685 136339949 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -221662 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 290-6 chr1 190912728 190913099 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 288023 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 302.75-26 chr5 145377338 145377807 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 457770 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 301.25-3 chr1 168065715 168065976 + 1.25 NA intron (NM_001017977, intron 16 of 18) intron (NM_001017977, intron 16 of 18) 67185 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 233-36 chr2 159298732 159299037 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12181 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 237.25-14 chr12 40695116 40695316 + 1.25 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) intron (NM_001256063, intron 1 of 15) 2774 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 149.25-38 chr12 130911600 130911745 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 39606 NM_006325 5901 Hs.10842 NM_006325 ENSG00000132341 RAN ARA24|Gsp1|TC4 RAN, member RAS oncogene family protein-coding 128.25-58 chr15 90420007 90420213 + 1.25 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) intron (NM_003870, intron 2 of 37) 31868 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 197.75-23 chr14 62756778 62757059 + 1.25 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) L1MA2|LINE|L1 288540 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 121.5-170 chr3 15590362 15590634 + 1.25 NA intron (NM_001284413, intron 3 of 15) intron (NM_001284413, intron 3 of 15) -10854 NM_001281723 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 378.25-2 chr1 194866226 194866747 + 1.25 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 1222229 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 183.5-161 chr9 30235724 30235933 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 172626 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 352-8 chr15 97983562 97983984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19265 NR_146564 105371008 NR_146563 LINC02251 - long intergenic non-protein coding RNA 2251 ncRNA 235.25-13 chr11 88216755 88217015 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40383 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 243.25-18 chr16 83984569 83984891 + 1.25 NA intron (NM_019065, intron 5 of 12) AluJb|SINE|Alu 16082 NM_001329749 54550 Hs.140950 NM_019065 ENSG00000103154 NECAB2 EFCBP2|stip-2 N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 protein-coding 211.75-103 chr9 74185369 74185606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186044 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 157.25-52 chr16 72496190 72496426 + 1.25 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) intron (NR_159371, intron 3 of 5) 168662 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 136.5-192 chr6 37324950 37325120 + 1.25 NA intron (NR_130108, intron 12 of 12) intron (NR_130108, intron 12 of 12) -28948 NM_003958 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 299.25-22 chr16 78370700 78371053 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 271222 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 120-79 chr18 72421848 72422024 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 122406 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 318.5-11 chr15 100264539 100264908 + 1.25 NA intron (NM_139057, intron 4 of 21) intron (NM_139057, intron 4 of 21) 77252 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 176-66 chr6 141313102 141313363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 629418 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 205-36 chr2 38291283 38291552 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85113 NM_001330460 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 292.25-42 chrX 64674457 64674798 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -279175 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 190.5-7 chr1 117965220 117965544 + 1.25 NA 3' UTR (NM_006784, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_006784, exon 27 of 27) 35643 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 257.5-12 chr11 16055486 16055797 + 1.25 NA intron (NM_033326, intron 10 of 15) intron (NM_033326, intron 10 of 15) -86020 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 183.25-32 chr14 36554754 36555011 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27732 NM_014360 26257 Hs.234763 NM_014360 ENSG00000136327 NKX2-8 NKX2.8|NKX2H|Nkx2-9 NK2 homeobox 8 protein-coding 227.25-40 chr2 28705153 28705380 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30939 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 345.25-10 chr2 24069824 24070345 + 1.25 NA intron (NM_016047, intron 2 of 3) intron (NM_016047, intron 2 of 3) 6242 NM_016047 51639 Hs.177861 NM_016047 ENSG00000115128 SF3B6 CGI-110|HSPC175|Ht006|P14|SAP14|SAP14a|SF3B14|SF3B14a splicing factor 3b subunit 6 protein-coding 206.75-62 chr4 40856336 40856543 + 1.25 NA intron (NM_001166051, intron 1 of 6) intron (NM_001166051, intron 1 of 6) 716 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 323.75-25 chr8 110432871 110433159 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -457244 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 170.5-163 chr6 130627358 130627560 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 190342 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 224.5-3 chr1 35764384 35764804 + 1.25 NA exon (NM_022111, exon 3 of 25) exon (NM_022111, exon 3 of 25) 5384 NM_022111 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 309.5-46 chr9 133984760 133985127 + 1.25 NA intron (NM_001134398, intron 1 of 29) MER33|DNA|hAT-Charlie 7381 NM_001134398 7410 Hs.369921 NM_003371 ENSG00000160293 VAV2 VAV-2 vav guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 158.5-55 chr13 71869032 71869204 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1914 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 236.75-4 chr1 104051003 104051488 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -21778 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 304.75-4 chr1 239971614 239972025 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -35705 NR_036695 645884 Hs.613280 NR_036695 RPS7P5 RPS7_2_183 ribosomal protein S7 pseudogene 5 pseudo 317.25-10 chr12 113008137 113008557 + 1.25 NA intron (NM_002535, intron 9 of 9) intron (NM_002535, intron 9 of 9) 29828 NM_016817 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 251-26 chr17 59350518 59350788 + 1.25 NA intron (NM_001005404, intron 1 of 4) intron (NM_001005404, intron 1 of 4) -15430 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 161.75-36 chr14 27150126 27150309 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 241575 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 257-16 chr14 78832661 78832982 + 1.25 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -367161 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 258.75-70 chr7 25661278 25661550 + 1.25 NA intron (NR_157815, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 1726 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 484-6 chr8 138334270 138334987 + 1.25 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) L1PA13|LINE|L1 162633 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 134.25-48 chr14 46304791 46304988 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MC5a|LINE|L1 -166470 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 182.75-84 chr3 192989725 192989970 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -71991 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 117.5-21 chr1 227616272 227616517 + 1.25 NA intron (NR_102302, intron 2 of 5) intron (NR_102302, intron 2 of 5) 52838 NM_001367910 339500 Hs.30323 NM_032755 ENSG00000181450 ZNF678 - zinc finger protein 678 protein-coding 143.25-59 chr15 93229066 93229216 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 23075 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 200.75-101 chr7 91739559 91739721 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 141062 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 149.25-24 chr11 7397394 7397628 + 1.25 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) L1MEc|LINE|L1 68324 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 145.5-3 chr1 26834619 26834792 + 1.25 NA intron (NM_032283, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 8017 NM_032283 84243 Hs.523710 NM_032283 ENSG00000204160 ZDHHC18 DHHC-18|DHHC18 zinc finger DHHC-type containing 18 protein-coding 215.25-99 chr7 21599096 21599381 + 1.25 NA intron (NM_001277115, intron 14 of 81) L1PA12|LINE|L1 56199 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 202.5-29 chr11 121866461 121866690 + 1.25 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 233269 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 186-12 chr10 112520963 112521143 + 1.25 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) intron (NM_001365712, intron 3 of 8) -73450 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 154.75-98 chr3 120707540 120707710 + 1.25 NA intron (NM_173825, intron 3 of 7) intron (NM_173825, intron 3 of 7) -25386 NM_000187 3081 Hs.368254 NM_000187 ENSG00000113924 HGD AKU|HGO homogentisate 1,2-dioxygenase protein-coding 121.75-68 chr18 74946616 74946823 + 1.25 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 258794 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 386.25-12 chr5 27676949 27677295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 204830 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 164.25-15 chr1 240098945 240099125 + 1.25 NA intron (NM_020066, intron 1 of 17) intron (NM_020066, intron 1 of 17) 7152 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 224.75-6 chr1 51485191 51485563 + 1.25 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 33889 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 162.5-176 chr8 109597860 109598108 + 1.25 NA intron (NM_001099754, intron 3 of 6) MER5A|DNA|hAT-Charlie 5475 NM_001363032 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 282.75-38 chr6 69138750 69139019 + 1.25 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) intron (NM_001704, intron 17 of 31) 503602 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 208-2 chr1 62420915 62421140 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15277 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 369.5-13 chr18 8400192 8400586 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 30 of 30) intron (NM_002845, intron 30 of 30) -33355 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 192-99 chr8 52561678 52561924 + 1.25 NA intron (NM_207413, intron 1 of 4) intron (NM_207413, intron 1 of 4) 3629 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 182.75-68 chr2 139269800 139269986 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 372569 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 309.75-16 chr18 9032781 9033120 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -69749 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 179.25-52 chr14 66908446 66908774 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MC3|LINE|L1 -280830 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 346-19 chr5 147133517 147133958 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -52217 NM_001271900 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 218.75-19 chr12 42416644 42416985 + 1.25 NA intron (NM_016488, intron 9 of 12) intron (NM_016488, intron 9 of 12) 66801 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 208.75-12 chr10 112419014 112419319 + 1.25 NA intron (NM_203379, intron 14 of 20) L1ME3G|LINE|L1 27748 NM_022494 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 112.25-90 chr2 14170087 14170223 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 230803 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 137.25-42 chr14 45728666 45728820 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13141 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 297.5-13 chr12 14087934 14088265 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -107743 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 317.5-9 chr16 48049783 48050098 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 84251 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 292.25-35 chr5 55479401 55479921 + 1.25 NA intron (NM_003711, intron 1 of 5) intron (NM_003711, intron 1 of 5) 29265 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 193-72 chr5 81972651 81972934 + 1.25 NA intron (NM_031482, intron 1 of 7) intron (NM_031482, intron 1 of 7) 769 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 244.75-24 chr17 60281748 60282101 + 1.25 NA intron (NM_032582, intron 5 of 33) MER5A|DNA|hAT-Charlie -50279 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 192-70 chr20 32934259 32934498 + 1.25 NA intron (NM_001143967, intron 22 of 26) L1MA8|LINE|L1 70055 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 209.25-29 chr14 52434858 52435146 + 1.25 NA intron (NM_001160047, intron 20 of 20) intron (NM_001160047, intron 20 of 20) 117503 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 161.75-131 chr8 139471261 139471458 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 231764 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 138.5-202 chr8 126696279 126696414 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -137868 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 151.5-113 chr3 6634546 6634948 + 1.25 NA intron (NR_110123, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 170702 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 197.5-157 chr8 63839983 63840168 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70645 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 275.5-56 chr5 177291812 177292122 + 1.25 NA exon (NM_022455, exon 22 of 23) exon (NM_022455, exon 22 of 23) 11752 NM_001031677 53917 Hs.16258 NM_130781 ENSG00000169228 RAB24 - RAB24, member RAS oncogene family protein-coding 141.75-139 chr5 62115794 62115965 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -190283 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 144.25-195 chr7 120666554 120666676 + 1.25 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 191529 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 183.25-34 chr14 51937994 51938226 + 1.25 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 -19539 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 204-87 chr9 36758914 36759168 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64558 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 240.5-102 chr8 3837446 3837771 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) intron (NM_033225, intron 5 of 69) -1109157 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 253.5-85 chrUn_KI270442v1 112910 113202 + 1.25 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 132.25-39 chr11 15928727 15929067 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40724 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 355-13 chr5 40721385 40721907 + 1.25 NA intron (NM_012382, intron 4 of 4) L1MB1|LINE|L1 34315 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 136.5-226 chr8 82420276 82420433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -491750 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 201.25-81 chr6 113604345 113604696 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 45555 NR_125844 101927686 Hs.402044 NR_125844 ENSG00000230943 LINC02541 - long intergenic non-protein coding RNA 2541 ncRNA 112.25-29 chr11 34867442 34867576 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -48621 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 207.25-60 chr3 104426077 104426391 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -902118 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 142.25-65 chr15 64412185 64412314 + 1.25 NA intron (NR_135855, intron 7 of 11) intron (NR_135855, intron 7 of 11) 24413 NM_001321924 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 135.5-50 chr13 62295927 62296197 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25243 NR_149075 106144607 Hs.562580 NR_149075 ENSG00000227611 LINC01074 - long intergenic non-protein coding RNA 1074 ncRNA 145.5-38 chr11 115496977 115497206 + 1.25 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 7324 NM_001098517 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 204-74 chr6 164898514 164898751 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76569 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 147.25-105 chr5 63521020 63521219 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 441173 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 361.5-2 chr11 13404248 13404948 + 1.25 NA intron (NM_032320, intron 7 of 8) intron (NM_032320, intron 7 of 8) 35681 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 246.25-40 chr20 35310204 35310534 + 1.25 NA intron (NM_199487, intron 7 of 8) AluSc|SINE|Alu -17944 NM_178468 128876 Hs.592149 NM_178468 ENSG00000125998 FAM83C C20orf128|dJ614O4.7 family with sequence similarity 83 member C protein-coding 185-15 chr12 55933822 55934102 + 1.25 NA intron (NM_201444, intron 1 of 23) MIRb|SINE|MIR -1872 NM_001351035 1606 Hs.524488 NM_001345 ENSG00000065357 DGKA DAGK|DAGK1|DGK-alpha diacylglycerol kinase alpha protein-coding 349.5-5 chr14 62417547 62418044 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -277822 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 141-112 chr4 53206400 53206584 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 159569 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 300.75-21 chr18 67132061 67132743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 50818 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 139-5 chr1 106716953 106717180 + 1.25 NA Intergenic (AATATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -101173 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 452.5-6 chrY 11294018 11294768 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1127197 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 196.5-106 chr3 95443583 95443800 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 239502 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 113.75-51 chr13 36203379 36203544 + 1.25 NA intron (NM_001198910, intron 6 of 15) intron (NM_001198910, intron 6 of 15) 11095 NM_017826 54937 Hs.124519 NM_017826 ENSG00000120669 SOHLH2 SOSF2|SPATA28|TEB1|bHLHe81 spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 protein-coding 231-12 chr11 78980167 78980367 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) MIR|SINE|MIR -405403 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 453.75-2 chr17 60041817 60042354 + 1.25 NA TTS (NR_039890) TTS (NR_039890) 1020 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 254-43 chr7 96814780 96815105 + 1.25 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -105051 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 211.5-20 chr10 97377053 97377292 + 1.25 NA intron (NM_001145114, intron 13 of 31) AluSx1|SINE|Alu 24168 NM_001284337 23223 Hs.434251 NM_015179 ENSG00000052749 RRP12 KIAA0690 ribosomal RNA processing 12 homolog protein-coding 186.25-28 chr14 40550897 40551165 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -403680 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 183.5-106 chr5 41245574 41245861 + 1.25 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) L1MEg|LINE|L1 15752 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 121.25-78 chr17 32707585 32707714 + 1.25 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) MER68|LTR|ERVL 169475 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 186.25-30 chr14 48437044 48437464 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -642240 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 174.5-168 chr7 10784719 10784944 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4887 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 288.25 chr1 50299347 50299608 + 1.25 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 123966 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 158-65 chr18 49597264 49597480 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001308006, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001308006, exon 9 of 9) 35315 NM_006033 9388 Hs.465102 NM_006033 ENSG00000101670 LIPG EDL|EL|PRO719 lipase G, endothelial type protein-coding 236.5-32 chr15 59650557 59650999 + 1.25 NA intron (NM_001320930, intron 3 of 5) intron (NM_001320930, intron 3 of 5) 6527 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 243.5 chr1 13752748 13753208 + 1.25 NA intron (NM_001135610, intron 6 of 7) intron (NM_001135610, intron 6 of 7) 3563 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 268-28 chr2 43040056 43040540 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_110585) promoter-TSS (NR_110585) -755 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 273.75-27 chr21 26001528 26001861 + 1.25 NA intron (NM_001204301, intron 6 of 16) AluSz6|SINE|Alu 138696 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 218.5-113 chr7 81545208 81545544 + 1.25 NA intron (NR_136264, intron 3 of 4) intron (NR_136264, intron 3 of 4) 16443 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 294.5-53 chrUn_KI270438v1 110231 110652 + 1.25 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 278.5-41 chr5 7906702 7907011 + 1.25 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 37708 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 292.25-2 chr1 66568880 66569309 + 1.25 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) intron (NM_001350218, intron 1 of 22) 34941 NM_001350217 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 167.5-158 chr6 54889920 54890170 + 1.25 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) intron (NM_001010872, intron 2 of 4) 43274 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 283-43 chr8 110077715 110078114 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -102143 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 230.5-49 chr16 82751970 82752322 + 1.25 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) intron (NM_001220488, intron 2 of 14) -21173 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 192.75-52 chr19 52577848 52578065 + 1.25 NA intron (NM_018260, intron 3 of 3) LTR13A|LTR|ERVK 7292 NM_001172655 55762 Hs.235167 NM_018260 ENSG00000167562 ZNF701 - zinc finger protein 701 protein-coding 196.75-48 chr17 66005406 66005788 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) intron (NM_001353129, intron 17 of 26) -179054 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 193.75-80 chr22 19291225 19291519 + 1.25 NA intron (NM_007098, intron 1 of 32) CpG 347 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 207.5-70 chr3 118869553 118869806 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58846 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 119.5-22 chr10 20612520 20612731 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 60655 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 206-55 chr4 32132862 32133160 + 1.25 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -110589 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 250.25-9 chr13 81451268 81451468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224385 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 288.5-46 chr8 60101596 60101839 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 179683 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 213.25-19 chr15 89112258 89112508 + 1.25 NA intron (NM_007011, intron 5 of 14) MER102c|DNA|hAT-Charlie 23927 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 170.75-51 chr17 58823300 58823663 + 1.25 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 67612 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 175-118 chr7 38059214 38059547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118865 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 216-79 chr8 117152269 117152627 + 1.25 NA intron (NM_173851, intron 2 of 7) intron (NM_173851, intron 2 of 7) 17453 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 161.5-189 chr8 131977562 131977820 + 1.25 NA intron (NR_136616, intron 12 of 23) intron (NR_136616, intron 12 of 23) 60918 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 160.75-98 chr3 26109577 26109809 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -235998 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 159-116 chr8 115344227 115344366 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 323717 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 183.5-2 chr1 57528328 57528524 + 1.25 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) L1MEg|LINE|L1 -103505 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 301.5-21 chr16 9181843 9182096 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 90325 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 194.25-121 chrX 50970990 50971220 + 1.25 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 60370 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 289.5-20 chr18 7408624 7408944 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 52222 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 233.75-83 chr9 88016755 88017187 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -42191 NM_001039803 23552 Hs.522274 NM_012119 ENSG00000156345 CDK20 CCRK|CDCH|P42|PNQALRE cyclin dependent kinase 20 protein-coding 266-31 chr3 123846951 123847294 + 1.25 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) MER2|DNA|TcMar-Tigger 37210 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 164.75-112 chr4 111297539 111297802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -437023 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 136.75-146 chr4 84226035 84226174 + 1.25 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) intron (NR_125909, intron 5 of 8) 73065 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 296.25-17 chr2 35569853 35570189 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 98616 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 194.5-153 chr8 61090646 61090859 + 1.25 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -123004 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 162.5-35 chr12 47760745 47760951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1968 NM_001098531 10411 Hs.8578 NM_006105 ENSG00000079337 RAPGEF3 CAMP-GEFI|EPAC|EPAC1|HSU79275|bcm910 Rap guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 178.5-25 chr11 63662686 63662977 + 1.25 NA intron (NM_001290048, intron 1 of 12) MER113B|DNA|hAT-Charlie 8545 NM_015459 25923 Hs.356719 NM_015459 ENSG00000184743 ATL3 HSN1F atlastin GTPase 3 protein-coding 219.25-70 chr6 141856925 141857189 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 231742 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 252.25-20 chr16 8772396 8772634 + 1.25 NA intron (NM_020686, intron 11 of 15) MIRb|SINE|MIR 25124 NM_015421 25880 Hs.513330 NM_015421 ENSG00000184857 TMEM186 C16orf51 transmembrane protein 186 protein-coding 177.75-59 chr18 68962658 68962891 + 1.25 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) intron (NM_001093729, intron 8 of 9) 164694 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 174.5-100 chr2 108201727 108201906 + 1.25 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) L1M1|LINE|L1 16025 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 271.75-50 chr9 30517391 30517784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109133 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 247-20 chr13 113926767 113927079 + 1.25 NA non-coding (NR_047495, exon 1 of 1) non-coding (NR_047495, exon 1 of 1) 2068 NR_047495 100861555 Hs.353773 NR_047495 ENSG00000260910 LINC00565 - long intergenic non-protein coding RNA 565 ncRNA 214.75-34 chr19 32448293 32448675 + 1.25 NA intron (NM_207325, intron 8 of 18) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 42359 NM_207325 147991 Hs.194392 NM_207325 ENSG00000178904 DPY19L3 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 3 protein-coding 249.75-8 chr1 99047506 99047726 + 1.25 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) intron (NR_033940, intron 1 of 2) -42755 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 154.25-151 chr7 3512615 3512865 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 211488 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 343.25-21 chr9 38698342 38698777 + 1.25 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack 77471 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 155.5-43 chr12 9990768 9990929 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 8452 NM_016509 51266 Hs.409794 NM_016509 ENSG00000165682 CLEC1B 1810061I13Rik|CLEC2|CLEC2B|PRO1384|QDED721 C-type lectin domain family 1 member B protein-coding 219.5-135 chr9 29895626 29895943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 512670 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 129.25-161 chr5 174914419 174914721 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81161 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 194-17 chr10 75344739 75345071 + 1.25 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) intron (NR_038226, intron 2 of 3) 48522 NR_038223 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 206-37 chr18 11763022 11763296 + 1.25 NA intron (NM_001369387, intron 4 of 11) L1MC4|LINE|L1 11074 NM_001369387 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 195.75-10 chr1 115332465 115332631 + 1.25 NA intron (NM_002506, intron 1 of 2) intron (NM_002506, intron 1 of 2) 5688 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 234.75-22 chr14 69021379 69021708 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 41861 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 262.75-11 chr12 11387947 11388384 + 1.25 NA intron (NM_001367912, intron 4 of 7) L1PB4|LINE|L1 7401 NM_001367912 5542 Hs.631726 NM_005039 ENSG00000251655 PRB1 PM|PMF|PMS|PRB1L|PRB1M proline rich protein BstNI subfamily 1 (gene/pseudogene) protein-coding 185.25-97 chr5 16169328 16169539 + 1.25 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 10358 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 309.5-25 chr2 240069433 240069862 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -23575 NM_173351 150681 Hs.626616 NM_173351 ENSG00000178586 OR6B3 OR6B3P|OR6B3Q olfactory receptor family 6 subfamily B member 3 protein-coding 243.75-36 chr17 29726023 29726345 + 1.25 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) L2c|LINE|L2 35248 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 138.5-12 chr1 101776076 101776197 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70944 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 214.25-20 chr12 46201105 46201481 + 1.25 NA intron (NM_030674, intron 12 of 16) intron (NM_030674, intron 12 of 16) 65223 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 441.25-6 chr6 45341407 45341937 + 1.25 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) intron (NM_001015051, intron 2 of 7) 13342 NR_103533 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 222.25-76 chr6 80402551 80402788 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 295998 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 467-6 chr4 31178381 31178919 + 1.25 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 7506 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 226.25-58 chr5 50896636 50896941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73399 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 195.75-94 chr5 74933748 74934039 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -66927 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 258.5-34 chr19 30454058 30454439 + 1.25 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 81864 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 282.5-33 chr2 136135219 136135718 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -17313 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 171.5-87 chr2 147942489 147942694 + 1.25 NA intron (NM_001190881, intron 7 of 10) L1MD|LINE|L1 78146 NM_181741 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 173.75-162 chrX 39251816 39252071 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 75419 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 221.5-6 chr10 27740121 27740380 + 1.25 NA intron (NM_001242702, intron 3 of 6) intron (NM_001242702, intron 3 of 6) -4365 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 235.75-3 chr1 168720888 168721170 + 1.25 NA intron (NM_001937, intron 1 of 3) intron (NM_001937, intron 1 of 3) 8177 NM_001937 1805 Hs.80552 NM_001937 ENSG00000143196 DPT TRAMP dermatopontin protein-coding 253.5-26 chr14 71058532 71058869 + 1.25 NA intron (NM_014982, intron 26 of 35) intron (NM_014982, intron 26 of 35) 151241 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 257.75-27 chr21 40180172 40180516 + 1.25 NA intron (NR_073202, intron 14 of 32) L3|LINE|CR1 32087 NR_039917 100616148 NR_039917 ENSG00000263973 MIR4760 - microRNA 4760 ncRNA 292-14 chr13 107593242 107593638 + 1.25 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -62192 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 137-105 chr3 118708825 118709108 + 1.25 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 67198 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 234.25-68 chr7 7883425 7883786 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85147 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 310.5-33 chr6 74004477 74005109 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64658 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 170.5-74 chr18 530797 531050 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15629 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 240.25-11 chr10 118366355 118366573 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9356 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 158.75 chr1 43279933 43280162 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 5534 NM_182517 149466 Hs.158963 NM_182517 ENSG00000253313 C1orf210 TEMP chromosome 1 open reading frame 210 protein-coding 180.75-33 chr13 61974120 61974564 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 55206 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 186.75-86 chr5 28923803 28924077 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -2930 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 311.5-21 chr3 7990466 7990909 + 1.25 NA intron (NR_110131, intron 2 of 3) intron (NR_110131, intron 2 of 3) 25620 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 235.5-72 chr5 164200333 164200713 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 266879 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 149.5-209 chr8 120355903 120356060 + 1.25 NA intron (NM_021110, intron 45 of 47) intron (NM_021110, intron 45 of 47) 89169 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 337.5 chr1 102639075 102639382 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 469268 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 317.5-15 chr2 56677956 56678398 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -492407 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 227.5-71 chr3 66433806 66434148 + 1.25 NA intron (NM_015541, intron 3 of 18) L1MD1|LINE|L1 66444 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 312.25-13 chr2 55778626 55779043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84990 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 325-22 chr8 134228414 134228820 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 342121 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 203.75-48 chr18 21427614 21427855 + 1.25 NA intron (NM_001142966, intron 7 of 32) L1M4|LINE|L1 172970 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 219.5-88 chr3 119366200 119366524 + 1.25 NA intron (NM_020754, intron 2 of 11) intron (NM_020754, intron 2 of 11) -43602 NR_046748 100874246 Hs.607097 NR_046748 ENSG00000241155 ARHGAP31-AS1 - ARHGAP31 antisense RNA 1 ncRNA 187.5-170 chr8 103382139 103382310 + 1.25 NA intron (NM_138455, intron 3 of 3) intron (NM_138455, intron 3 of 3) 9717 NM_001256099 115908 Hs.405614 NM_138455 ENSG00000164932 CTHRC1 - collagen triple helix repeat containing 1 protein-coding 252.5-20 chr12 19088491 19088752 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41112 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 188.5-26 chr12 23589398 23589669 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 12 of 17) intron (NM_152989, intron 12 of 17) -4947 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 318.5-25 chr21 18224843 18225300 + 1.25 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -19762 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 225-29 chr16 13864297 13864616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55701 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 195.25-26 chr13 19605448 19605813 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18512 NR_046988 100874136 NR_046988 LINC00350 - long intergenic non-protein coding RNA 350 ncRNA 202-81 chrX 49869560 49869879 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 9637 NR_026742 158572 Hs.408191 NM_001025449 ENSG00000234390 USP27X-AS1 - USP27X antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 257-19 chr16 8240424 8240873 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 349190 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 292.75-23 chr3 27158552 27158899 + 1.25 NA intron (NM_001304384, intron 10 of 16) intron (NM_001304384, intron 10 of 16) 57798 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 254.25-26 chr17 58679020 58679507 + 1.25 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 12792 NM_198393 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 201.75-99 chr8 36133165 36133444 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -422984 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 139.25-100 chr2 223591561 223591752 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 10705 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 252-50 chr4 61573296 61573583 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 371267 NM_001371342 196.25-78 chr22 34663861 34664199 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 333886 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 228.25-79 chr7 138017474 138017857 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -15579 NM_001253775 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 220-72 chr8 141623865 141624055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116730 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 288.75 chr1 28728547 28729069 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -7813 NM_001173128 51441 Hs.532286 NM_016258 ENSG00000198492 YTHDF2 CAHL|HGRG8|NY-REN-2 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2 protein-coding 290.75-44 chr5 43827782 43828111 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -224716 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 132-182 chr8 142574065 142574216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40339 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 262.5-64 chr5 132947310 132947557 + 1.25 NA intron (NM_014423, intron 1 of 20) intron (NM_014423, intron 1 of 20) 16201 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 150.5-238 chrX 147387389 147387548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -102740 NR_030240 574518 NR_030240 ENSG00000207867 MIR514A3 MIR514-3|MIRN514-3|hsa-mir-514a-3 microRNA 514a-3 ncRNA 185-71 chr5 113351826 113352033 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) intron (NM_001085377, intron 2 of 18) -56991 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 174-111 chrX 80685905 80686146 + 1.25 NA intron (NM_153252, intron 35 of 40) L1PA5|LINE|L1 123852 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 178.25-124 chr9 89133909 89134098 + 1.25 NA intron (NM_016848, intron 1 of 11) MER41-int|LTR|ERV1 44815 NM_016848 53358 Hs.292737 NM_016848 ENSG00000148082 SHC3 N-Shc|NSHC|RAI|SHCC SHC adaptor protein 3 protein-coding 125.75-197 chrX 43728253 43728367 + 1.25 NA exon (NM_000240, exon 6 of 15) exon (NM_000240, exon 6 of 15) 73403 NM_001270458 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 273-42 chr5 42849885 42850232 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37982 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 145.25-168 chr8 27032403 27032607 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 16458 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 158.75-134 chr5 18753552 18753722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 946363 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 146.25-125 chr6 116494722 116494934 + 1.25 NA TTS (NM_001139444) TTS (NM_001139444) -16811 NM_153711 254228 Hs.105081 NM_153711 ENSG00000178033 CALHM5 C6orf188|FAM26E|dJ493F7.3 calcium homeostasis modulator family member 5 protein-coding 216.5-34 chr14 83669774 83670162 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 1027336 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 166.75-121 chr5 148553072 148553340 + 1.25 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 83855 NM_001040173 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 162-7 chr1 175948446 175948677 + 1.25 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) intron (NM_022457, intron 18 of 19) 19918 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 212-4 chr1 178926115 178926445 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -55203 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 309.25-14 chr2 71531278 71531575 + 1.25 NA intron (NM_001130985, intron 14 of 54) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 64727 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 248-15 chr12 91022978 91023408 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18221 NM_004950 1833 Hs.435680 NM_004950 ENSG00000083782 EPYC DSPG3|PGLB|Pg-Lb|SLRR3B epiphycan protein-coding 348.25 chr1 197410822 197411146 + 1.25 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 142732 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 195-92 chr8 117261364 117261541 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126457 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 193.25-100 chr6 55979952 55980167 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104469 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 133.25-182 chr5 117468448 117468598 + 1.25 NA intron (NR_046089, intron 2 of 5) intron (NR_046089, intron 2 of 5) 53011 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 186.25-90 chr5 102908705 102908949 + 1.25 NA intron (NR_157231, intron 5 of 14) intron (NR_157231, intron 5 of 14) 43004 NM_138821 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 364 chr11 46977737 46978116 + 1.25 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) intron (NM_001278222, intron 1 of 7) 41165 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 309.5-18 chr16 61517063 61517385 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -461458 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 293-35 chr7 2130840 2131097 + 1.25 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) LTR24B|LTR|ERV1 -41916 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 147.5-137 chr3 6178088 6178275 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 627268 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 244-36 chr3 133055053 133055513 + 1.25 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) intron (NM_001136469, intron 2 of 5) 16995 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 166.75-115 chr5 66342120 66342309 + 1.25 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -132768 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 624.25 chr14 53667425 53668424 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 280560 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 192.5-122 chr7 89634636 89634925 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -484620 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 164.5-187 chr7 27755827 27756068 + 1.25 NA intron (NM_001362794, intron 2 of 16) intron (NM_001362794, intron 2 of 16) 15852 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 133.25-49 chr13 92432114 92432227 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -57993 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 238.75-48 chr5 89327676 89327981 + 1.25 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -423723 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 225.5-56 chr2 33582859 33583078 + 1.25 NA TTS (NM_001304538) TTS (NM_001304538) -13538 NR_146505 105374454 NR_146505 LOC105374454 - uncharacterized LOC105374454 ncRNA 254-25 chr2 134914406 134914757 + 1.25 NA intron (NR_036549, intron 1 of 4) L1MA1|LINE|L1 4025 NR_036549 100129961 Hs.729028 NR_036549 CCNT2-AS1 - CCNT2 antisense RNA 1 ncRNA 150.5-33 chr11 127946591 127946734 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -262104 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 361.75-3 chr10 126452368 126452737 + 1.25 NA intron (NR_148989, intron 5 of 6) intron (NR_148989, intron 5 of 6) 26622 NR_148989 728158 Hs.646701 NR_148989 LOC728158 - uncharacterized LOC728158 ncRNA 215.5-9 chr1 198298443 198298848 + 1.25 NA intron (NM_133494, intron 9 of 9) intron (NM_133494, intron 9 of 9) 141647 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 269.5-63 chr9 87569883 87570175 + 1.25 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) intron (NM_004938, intron 2 of 25) 16575 NR_146781 100506897 Hs.656160 NR_146781 ENSG00000236709 DAPK1-IT1 - DAPK1 intronic transcript 1 ncRNA 148-102 chr5 71696442 71696645 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22732 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 196-34 chr16 4245167 4245426 + 1.25 NA TTS (NR_039999) TTS (NR_039999) -3216 NM_001323668 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 222-62 chr5 13791904 13792210 + 1.25 NA exon (NM_001369, exon 50 of 79) exon (NM_001369, exon 50 of 79) 152423 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 329-36 chr7 41404235 41404534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -289535 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 204.5-126 chr7 126759473 126759783 + 1.25 NA intron (NM_001371088, intron 7 of 7) intron (NM_001371088, intron 7 of 7) 298556 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 165-32 chr12 89016289 89016457 + 1.25 NA intron (NR_038385, intron 1 of 2) L1MB5|LINE|L1 3319 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 170-75 chr5 14373351 14373722 + 1.25 NA intron (NM_007118, intron 18 of 56) L1MC5a|LINE|L1 -90447 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 156.75-14 chr1 227033248 227033468 + 1.25 NA exon (NM_001366010, exon 25 of 35) exon (NM_001366010, exon 25 of 35) 93064 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 167-85 chr4 57365235 57365390 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -60560 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 137-180 chr8 117252680 117252836 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 117763 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 218.75-23 chr15 69190260 69190512 + 1.25 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L1MEc|LINE|L1 29751 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 184-89 chr8 31531145 31531421 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -108469 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 296.75-10 chr15 37163691 37164163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62616 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 182-19 chr11 107068814 107069165 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -50513 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 332-18 chr22 25356559 25357027 + 1.25 NA intron (NM_182492, intron 2 of 3) intron (NM_182492, intron 2 of 3) 5764 NM_182492 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 194.5-48 chr16 75055019 75055266 + 1.25 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 56118 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 236-22 chr18 9260733 9261041 + 1.25 NA intron (NM_001204056, intron 8 of 11) L2c|LINE|L2 -73886 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 226.25-62 chr6 36691195 36691578 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -6440 NM_001257357 401258 Hs.485258 NM_207498 ENSG00000255587 RAB44 RASD3|RASL13|dJ431A14.3 RAB44, member RAS oncogene family protein-coding 119.25-62 chr15 57921489 57921628 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92465 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 447-4 chr18 14911626 14912352 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -34278 NR_104164 400644 Hs.514732 NR_104164 ENSG00000266554 LINC01443 - long intergenic non-protein coding RNA 1443 ncRNA 218.25-12 chr10 82909657 82909892 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -676854 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 222-67 chr5 124456518 124456743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18110 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 352.25 chr10 44509362 44509937 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124552 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 217-57 chr3 190782972 190783248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79584 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 266-6 chr10 35035804 35036227 + 1.25 NA intron (NM_003591, intron 9 of 20) L1ME3A|LINE|L1 38268 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 143.25-140 chr5 9776406 9776565 + 1.25 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L1MA3|LINE|L1 -77892 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 322.5-22 chr4 92097022 92097350 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 180116 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 366-14 chr5 5433872 5434285 + 1.25 NA intron (NM_015325, intron 1 of 18) L1M5|LINE|L1 11401 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 126.25-45 chr13 33869406 33869619 + 1.25 NA intron (NM_181558, intron 8 of 8) intron (NM_181558, intron 8 of 8) 51363 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 232.5-85 chr5 105813631 105813973 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 714328 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 280-5 chr1 167033699 167034125 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44632 NM_032858 84944 Hs.651245 NM_032858 ENSG00000143194 MAEL CT128|SPATA35 maelstrom spermatogenic transposon silencer protein-coding 165.75-123 chr4 114322113 114322327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -276182 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 205.75-95 chr9 85711641 85711937 + 1.25 NA intron (NM_001286717, intron 1 of 24) MER58B|DNA|hAT-Charlie 30240 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 287.5-44 chr4 64904833 64905255 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 99456 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 211.75-49 chr2 174738757 174738987 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19072 NR_002315 440926 Hs.533624 NR_002315 H3F3AP4 p13 H3 histone, family 3A, pseudogene 4 pseudo 221.5-98 chr8 71673557 71673870 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125619 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 365.5-5 chr16 73173726 73174320 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29576 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 354.25-10 chr3 52145195 52145604 + 1.25 NA intron (NM_015426, intron 6 of 10) intron (NM_015426, intron 6 of 10) 9024 NM_001161580 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 157.25-32 chr11 119209265 119209530 + 1.25 NA intron (NM_005188, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu 3121 NM_005188 867 Hs.504096 NM_005188 ENSG00000110395 CBL C-CBL|CBL2|FRA11B|NSLL|RNF55 Cbl proto-oncogene protein-coding 157.5-210 chr8 87572158 87572294 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 301789 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 241.75-16 chr11 104204334 104204599 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40319 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 328.25-10 chr17 49014708 49015213 + 1.25 NA intron (NM_001160423, intron 2 of 12) intron (NM_001160423, intron 2 of 12) 17575 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 160.75-85 chr2 203876145 203876404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8503 NM_001037631 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 240.75-27 chr14 70333431 70333709 + 1.25 NA intron (NM_001202549, intron 3 of 4) L1M1|LINE|L1 26113 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 421.25-6 chr18 79897904 79898265 + 1.25 NA intron (NM_012283, intron 1 of 1) L1M4b|LINE|L1 34416 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 364.25-22 chr3 100108035 100108669 + 1.25 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 6161 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 222.75-45 chr15 59145941 59146305 + 1.25 NA intron (NM_004998, intron 26 of 27) AluJo|SINE|Alu 25139 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 142-173 chr9 80620309 80620589 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 645426 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 299.25-13 chr13 60788075 60788671 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 115418 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 288.75-10 chr10 62998172 62998543 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -134890 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 242.5 chr1 11244418 11244766 + 1.25 NA intron (NM_004958, intron 8 of 57) AluSx|SINE|Alu 17959 NM_004958 2475 Hs.338207 NM_004958 ENSG00000198793 MTOR FRAP|FRAP1|FRAP2|RAFT1|RAPT1|SKS mechanistic target of rapamycin kinase protein-coding 325.25 chr11 91109737 91110263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -240798 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 327.75-9 chr14 38316213 38316644 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -60335 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 130.25-132 chr3 19301415 19301560 + 1.25 NA intron (NM_144633, intron 3 of 15) intron (NM_144633, intron 3 of 15) 13444 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 254.25-60 chr7 78007184 78007440 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 167182 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 254.75-36 chr4 17374431 17374849 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53758 NR_145770 109616994 NR_145770 ENSG00000206780 SNORA75B - small nucleolar RNA, H/ACA box 75B snoRNA 191.75-73 chr21 30382457 30382649 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7175 NR_036221 100422891 NR_036221 ENSG00000265007 MIR4327 - microRNA 4327 ncRNA 242-69 chr9 87743321 87743519 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17301 NM_001257972 1514 Hs.731507 NM_001912 ENSG00000135047 CTSL CATL|CTSL1|MEP cathepsin L protein-coding 278.75-7 chr13 20209163 20209555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16421 NM_004004 2706 Hs.524894 NM_004004 ENSG00000165474 GJB2 CX26|DFNA3|DFNA3A|DFNB1|DFNB1A|HID|KID|NSRD1|PPK gap junction protein beta 2 protein-coding 230-59 chr7 19317148 19317452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -171879 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 170-57 chr3 35523633 35523830 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -115794 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 258.25-64 chr9 119565833 119566174 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -196568 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 224.75-39 chr2 57383933 57384230 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -523570 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 363.75-13 chr3 55417236 55417686 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 63937 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 217.5-87 chr4 20387763 20388165 + 1.25 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) L1M4|LINE|L1 -4225 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 164.75-139 chr8 59190117 59190273 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70985 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 159.5-183 chr6 73406302 73406489 + 1.25 NA exon (NM_018665, exon 7 of 17) exon (NM_018665, exon 7 of 17) 11567 NM_018665 55510 Hs.125507 NM_018665 ENSG00000080007 DDX43 CT13|HAGE DEAD-box helicase 43 protein-coding 142.75-2 chr1 50838960 50839211 + 1.25 NA intron (NM_007051, intron 2 of 18) intron (NM_007051, intron 2 of 18) 121182 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 160.25-52 chr17 47175800 47175970 + 1.25 NA intron (NM_001256, intron 2 of 18) MIR|SINE|MIR 13410 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 316.25-18 chr5 119210278 119210732 + 1.25 NA intron (NM_001290321, intron 34 of 43) L1ME1|LINE|L1 55868 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 157-14 chr11 32883987 32884219 + 1.25 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -8708 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 124.5-91 chr18 70806640 70806929 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -155830 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 232-24 chr17 48211108 48211470 + 1.25 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -54778 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 308-2 chr1 104475327 104475804 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 402542 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 262-55 chr8 80688366 80688739 + 1.25 NA intron (NM_001033723, intron 3 of 8) intron (NM_001033723, intron 3 of 8) 185916 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 426.25-5 chr14 73451706 73452168 + 1.25 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 6643 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 223.5-25 chr11 70323597 70323812 + 1.25 NA intron (NR_045286, intron 2 of 28) L1M4b|LINE|L1 39749 NR_031624 100313770 NR_031624 ENSG00000221333 MIR548K MIRN548K microRNA 548k ncRNA 175.75-62 chr2 15505542 15505813 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 10 of 50) L1MC4|LINE|L1 55657 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 229.5-23 chr11 8462868 8463228 + 1.25 NA intron (NM_001352388, intron 6 of 14) intron (NM_001352388, intron 6 of 14) 130928 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 148.75-157 chr7 69602808 69602935 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 4396 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 402-13 chr7 113975453 113976073 + 1.25 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -56754 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 229.25-47 chr2 138831058 138831364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50821 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 164.25-123 chr4 171756927 171757144 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -56369 NM_001034845 442117 Hs.386236 NM_001034845 ENSG00000174473 GALNTL6 GALNACT20|GALNT17|GalNAc-T6L polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase like 6 protein-coding 393.5-8 chr2 53476135 53476500 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -291466 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 309.75-31 chr5 40145824 40146289 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93765 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 266.5-63 chr5 29330635 29330977 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 65170 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 155-64 chr2 82600659 82600848 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -256050 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 149.5-131 chr4 69085672 69085820 + 1.25 NA intron (NM_001349568, intron 1 of 6) L1M1|LINE|L1 -10728 NM_001330719 7364 Hs.654424 NM_001074 ENSG00000171234 UGT2B7 UDPGT 2B7|UDPGT 2B9|UDPGT2B7|UDPGTH2|UDPGTh-2|UGT2B9 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B7 protein-coding 117-97 chr2 149486988 149487092 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -100318 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 195.5-61 chr19 42389837 42390107 + 1.25 NA intron (NM_032488, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 325 NM_032488 84518 Hs.148590 NM_032488 ENSG00000105427 CNFN PLAC8L2 cornifelin protein-coding 274.75-22 chr2 16937600 16938036 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -271984 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 242.75-63 chr7 64711200 64711527 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001282359, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001282359, exon 4 of 4) 32299 NR_106898 102465505 NR_106898 ENSG00000275667 MIR6839 hsa-mir-6839 microRNA 6839 ncRNA 222.5-95 chr6 45480303 45480577 + 1.25 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 58165 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 287.75-3 chr1 161504029 161504378 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1254 NM_021642 2212 Hs.352642 NM_021642 ENSG00000143226 FCGR2A CD32|CD32A|CDw32|FCG2|FCGR2|FCGR2A1|FcGR|IGFR2 Fc fragment of IgG receptor IIa protein-coding 382.75-9 chr5 19297867 19298263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 588207 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 326-32 chr8 126765507 126765964 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -207257 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 130.25-38 chr11 28223778 28223922 + 1.25 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) L3b|LINE|CR1 115462 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 242.75-37 chr21 23096172 23096514 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17059 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 216.75-27 chr15 80102580 80102799 + 1.25 NA intron (NM_001242916, intron 2 of 6) intron (NM_001242916, intron 2 of 6) 4273 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 344.75 chr10 121762408 121762965 + 1.25 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) MER6A|DNA|TcMar-Tigger -164228 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 154-21 chr10 76529102 76529254 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) MIRc|SINE|MIR -358866 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 311.75-18 chr5 10864915 10865352 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -103899 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 285.75-24 chr2 144916494 144916742 + 1.25 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 248651 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 377.5-5 chr14 65662316 65662819 + 1.25 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) intron (NM_004480, intron 5 of 9) 191465 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 474.25-6 chr8 121973622 121974078 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -332410 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 143.25-159 chr6 78434741 78434929 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 104474 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 245.25-40 chr2 99028881 99029249 + 1.25 NA intron (NM_001349013, intron 13 of 16) intron (NM_001349013, intron 13 of 16) -92840 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 139.25-62 chr15 98862211 98862355 + 1.25 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 77857 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 116-42 chr14 19905777 19905909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14764 NM_001005483 79317 Hs.554585 NM_001005483 ENSG00000176281 OR4K5 OR14-16 olfactory receptor family 4 subfamily K member 5 protein-coding 217.75-63 chr5 167011225 167011460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61900 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 239-49 chr5 156213583 156213818 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -113057 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 235-12 chr11 34243871 34244140 + 1.25 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 114005 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 164.25-109 chr4 32588582 32588930 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 237718 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 184.25-96 chr5 13831319 13831483 + 1.25 NA intron (NM_001369, intron 35 of 78) intron (NM_001369, intron 35 of 78) 113079 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 152.75-124 chr4 128762760 128762900 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -46870 NM_024900 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 317.25-15 chr16 69925720 69926249 + 1.25 NA intron (NM_199424, intron 1 of 13) intron (NM_199424, intron 1 of 13) 945 NM_199424 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 168.25-80 chr2 149818828 149819026 + 1.25 NA intron (NR_145421, intron 2 of 4) intron (NR_145421, intron 2 of 4) 40264 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 182.5-104 chr3 107123299 107123591 + 1.25 NA intron (NR_028303, intron 2 of 3) intron (NR_028303, intron 2 of 3) 117193 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 168.5-63 chr17 29491629 29491784 + 1.25 NA intron (NM_025142, intron 9 of 17) intron (NM_025142, intron 9 of 17) 75331 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 226.25-50 chr3 173850348 173850693 + 1.25 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) 70276 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 191.5-113 chr4 107833145 107833349 + 1.25 NA intron (NM_001136258, intron 1 of 6) intron (NM_001136258, intron 1 of 6) 8682 NM_001136258 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 145.75-161 chr8 127786241 127786429 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -8198 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 205.5-112 chr5 30646939 30647188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -546623 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 296-8 chr11 10373497 10374003 + 1.25 NA intron (NR_103765, intron 2 of 3) intron (NR_103765, intron 2 of 3) 65437 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 257.5-76 chr8 118573874 118574299 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -46915 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-142 chr4 170523868 170524000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 219801 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 407.25-10 chr5 17122132 17122828 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 33512 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 239.25-61 chr4 35368217 35368577 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 875542 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 146-135 chr9 74661398 74661617 + 1.25 NA intron (NM_006914, intron 5 of 9) intron (NM_006914, intron 5 of 9) 45973 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 149.5-161 chr5 129977891 129978065 + 1.25 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 73513 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 223.5-35 chr13 70143278 70143630 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34961 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 192.75-63 chr2 191712203 191712399 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22120 NR_131917 105747689 Hs.104972 NR_131917 LOC105747689 - uncharacterized LOC105747689 ncRNA 219.75-76 chr7 33302529 33302859 + 1.25 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) L1MA3|LINE|L1 173130 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 216.25-47 chr18 1719242 1719581 + 1.25 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -359782 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 134-119 chr3 108424492 108424691 + 1.25 NA intron (NM_014981, intron 28 of 41) intron (NM_014981, intron 28 of 41) 104731 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 265.25-36 chr3 126693087 126693428 + 1.25 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 -10983 NM_001320610 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 210.75-62 chr3 138138835 138139032 + 1.25 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -6543 NM_016161 51146 Hs.278960 NM_016161 ENSG00000118017 A4GNT alpha4GnT alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 282.75 chr1 31758259 31758505 + 1.25 NA TTS (NR_036216) TTS (NR_036216) 353 NR_036216 100423028 NR_036216 ENSG00000266580 MIR4254 - microRNA 4254 ncRNA 232.75-51 chr4 111400150 111400393 + 1.25 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -539624 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 118.25-211 chr8 137854961 137855138 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 228496 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 174.75-70 chr20 38226630 38226930 + 1.25 NA intron (NM_001029864, intron 7 of 13) MIR3|SINE|MIR -33395 NR_104170 149684 Hs.628250 NR_104170 ENSG00000285347 LOC149684 - uncharacterized LOC149684 ncRNA 151-10 chr1 204136950 204137086 + 1.25 NA intron (NM_001297760, intron 6 of 7) intron (NM_001297760, intron 6 of 7) -4390 NR_123739 101929441 Hs.736889 NR_123739 ENSG00000230550 ERLNC1 ElncRNA1|TC0101441 estrogen receptor responsive lncRNA 1 ncRNA 139.75-184 chr9 3275934 3276097 + 1.25 NA intron (NM_134428, intron 9 of 17) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 94426 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 268.25-17 chr15 61326081 61326357 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96917 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 218.75-12 chr11 7145766 7145978 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56874 NM_014469 27288 Hs.121605 NM_014469 ENSG00000170748 RBMXL2 HNRNPG-T|HNRNPGT|HNRPGT RBMX like 2 protein-coding 154-98 chr3 150742847 150743050 + 1.25 NA intron (NM_005067, intron 1 of 1) intron (NM_005067, intron 1 of 1) -3963 NR_121657 101928105 NR_121657 LOC101928105 - uncharacterized LOC101928105 ncRNA 220.75-40 chr2 117960617 117960846 + 1.25 NA intron (NM_019044, intron 11 of 23) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 53339 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 192.25-102 chr8 55312567 55312815 + 1.25 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 142630 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 185.75-70 chr20 11357593 11357751 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84289 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 225.75-35 chr2 20692875 20693426 + 1.25 NA intron (NR_104233, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 26006 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 171.25-160 chrX 108054147 108054322 + 1.25 NA intron (NM_182607, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 9169 NM_182607 340547 Hs.177164 NM_182607 ENSG00000101842 VSIG1 1700062D20Rik|GPA34|dJ889N15.1 V-set and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 156.5-64 chr17 30840703 30840865 + 1.25 NA intron (NM_024857, intron 4 of 22) intron (NM_024857, intron 4 of 22) 8818 NM_024857 79915 Hs.528902 NM_024857 ENSG00000176208 ATAD5 C17orf41|ELG1|FRAG1 ATPase family AAA domain containing 5 protein-coding 164.75-88 chr21 25054934 25055166 + 1.25 NA intron (NR_046198, intron 3 of 3) intron (NR_046198, intron 3 of 3) 214500 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 125.5-38 chr11 10975719 10975849 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 117567 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 150-80 chr2 227807904 227808046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5867 NM_004591 6364 Hs.75498 NM_004591 ENSG00000115009 CCL20 CKb4|Exodus|LARC|MIP-3-alpha|MIP-3a|MIP3A|SCYA20|ST38 C-C motif chemokine ligand 20 protein-coding 444.75-7 chr4 47356165 47356880 + 1.25 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 107180 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 205.75-61 chr4 180738086 180738308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 420952 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 249.5-29 chr14 64582484 64582707 + 1.25 NA intron (NM_172365, intron 8 of 11) MER33|DNA|hAT-Charlie 32634 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 259-41 chr9 12026630 12026989 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -666576 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 222.75-27 chr12 6560520 6560723 + 1.25 NA intron (NM_001033714, intron 13 of 15) intron (NM_001033714, intron 13 of 15) -4538 NM_001193457 25900 Hs.15243 NM_015438 ENSG00000010295 IFFO1 HOM-TES-103|IFFO intermediate filament family orphan 1 protein-coding 160.75-153 chr8 129725848 129726183 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45776 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 312.25-23 chr6 110406320 110406630 + 1.25 NA intron (NM_003649, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 9100 NR_160546 8528 Hs.591348 NM_003649 ENSG00000203797 DDO DASOX|DDO-1|DDO-2 D-aspartate oxidase protein-coding 223-41 chr2 86537878 86538076 + 1.25 NA intron (NM_001005753, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 25466 NM_001005753 51652 Hs.591582 NM_016079 ENSG00000115561 CHMP3 CGI-149|NEDF|VPS24 charged multivesicular body protein 3 protein-coding 118-150 chr5 65255467 65255588 + 1.25 NA intron (NR_135689, intron 15 of 25) intron (NR_135689, intron 15 of 25) 226393 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 151.25-184 chr8 13980597 13980811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 351014 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 153-155 chr8 88991582 88991798 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -664207 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 264.25-30 chr2 138003324 138003710 + 1.25 NA intron (NM_006895, intron 4 of 5) intron (NM_006895, intron 4 of 5) 39044 NM_001024075 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 192.25-49 chr2 36988592 36988810 + 1.25 NA exon (NM_019024, exon 35 of 36) exon (NM_019024, exon 35 of 36) -22165 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 180.75-108 chr4 112334493 112334710 + 1.25 NA intron (NM_001102406, intron 2 of 15) intron (NM_001102406, intron 2 of 15) 37232 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 204.75-90 chr5 3594236 3594595 + 1.25 NA Intergenic CpG -1417 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 236.25-21 chr12 12015755 12016143 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33912 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 379.25-8 chr21 26444872 26445275 + 1.25 NA intron (NR_135515, intron 1 of 3) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 39130 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 251-19 chr13 69363139 69363382 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 140914 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 296.5-17 chr2 199491319 199491688 + 1.25 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? -20237 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 342.75-16 chr3 9659629 9660119 + 1.25 NA intron (NM_001077525, intron 2 of 18) intron (NM_001077525, intron 2 of 18) 10369 NM_022485 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 158-35 chr11 94714625 94714854 + 1.25 NA intron (NR_135096, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 25616 NR_135096 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 259.5-23 chr11 115625314 115625648 + 1.25 NA Intergenic UCON84|Unknown|Unknown 109281 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 417.25 chr1 99116545 99117151 + 1.25 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -111987 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 279.25-7 chr10 28598405 28598669 + 1.25 NA intron (NM_100264, intron 7 of 13) intron (NM_100264, intron 7 of 13) 65419 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 194-39 chr16 5586533 5586817 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 29575 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 320.5-6 chr10 53707802 53708259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -778200 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 182.25-79 chr3 94264251 94264571 + 1.25 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 201350 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 164-49 chr17 32724723 32724960 + 1.25 NA intron (NM_015194, intron 14 of 21) L1MEg|LINE|L1 152283 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 323.75-26 chr8 139317511 139317959 + 1.25 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 385388 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 231.5-16 chr11 87380796 87381059 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 338484 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 334-32 chr8 86648102 86648586 + 1.25 NA intron (NM_019098, intron 7 of 17) intron (NM_019098, intron 7 of 17) 95331 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 216.75-8 chr1 242761113 242761424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -236571 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 203-37 chr15 67802121 67802656 + 1.25 NA intron (NM_001206804, intron 21 of 21) intron (NM_001206804, intron 21 of 21) -23121 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 287 chr1 45669104 45669547 + 1.25 NA intron (NM_021639, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 17208 NM_021639 60313 Hs.238432 NM_021639 ENSG00000159592 GPBP1L1 SP192 GC-rich promoter binding protein 1 like 1 protein-coding 345-4 chr12 17045223 17045567 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56648 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 157.75-46 chr14 36325058 36325275 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -4490 NM_001144891 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 179.75-63 chr2 155755261 155755571 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 499515 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 314.75 chr10 70028096 70028591 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -24503 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 151-126 chr7 48112174 48112381 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 23012 NM_003364 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 287.5-51 chr8 85080072 85080632 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -26886 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 211.25-11 chr10 74565273 74565571 + 1.25 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) intron (NM_001369123, intron 7 of 9) -36098 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 216.25-65 chr22 30068591 30068806 + 1.25 NA intron (NR_110541, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 11559 NR_110541 101929664 Hs.592197 NR_110541 HORMAD2-AS1 MTMR3-AS1 HORMAD2 and MTMR3 antisense RNA 1 ncRNA 172.75-46 chr17 30060164 30060344 + 1.25 NA intron (NM_198529, intron 14 of 22) LTR101_Mam|LTR|ERVL -56553 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 166.25-23 chr10 58030995 58031141 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 236826 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 287.25-15 chr13 91406048 91406463 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 1 of 7) intron (NM_004466, intron 1 of 7) 7634 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 201.5-75 chr2 149222323 149222669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104322 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 230-19 chr14 53101868 53102243 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) intron (NM_030637, intron 2 of 11) 51268 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 223.75-34 chr17 53656164 53656517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166587 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 274-38 chr9 102107010 102107429 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -368639 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 162.5-135 chr5 20567598 20567857 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) LTR50|LTR|ERVL 7986 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 178.75-90 chr6 4810529 4810839 + 1.25 NA intron (NM_001368127, intron 1 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -25414 NM_001143970 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 257.5-77 chr8 130394842 130395196 + 1.25 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) intron (NM_001247996, intron 2 of 30) 48641 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 193.75-28 chr11 88452316 88452527 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -52155 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 118-148 chr5 53329894 53330019 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -150673 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 260.25-38 chr5 4822158 4822545 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 48870 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 273.75-42 chr8 78837412 78837767 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_157588) promoter-TSS (NR_157588) 60 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 348.25-4 chr10 63379883 63380449 + 1.25 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu -7118 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 126.25-137 chr4 121791253 121791472 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9961 NM_001034194 5393 Hs.91728 NM_005033 ENSG00000123737 EXOSC9 PCH1D|PM/Scl-75|PMSCL1|RRP45|Rrp45p|p5|p6 exosome component 9 protein-coding 115-188 chr8 132119369 132119503 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14171 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 251.75-27 chr15 91604046 91604347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 140857 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 228.75-8 chr1 245166055 245166387 + 1.25 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) intron (NM_018012, intron 2 of 14) 11236 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 207-34 chr16 4209709 4209975 + 1.25 NA intron (NM_001323668, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR 32238 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 216.25-64 chr22 28325622 28325912 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME1|LINE|L1 -134102 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 231.75-56 chr4 163482214 163482487 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -8596 NM_032136 84076 Hs.303923 NM_032136 ENSG00000151005 TKTL2 - transketolase like 2 protein-coding 123.25-145 chr4 37041406 37041564 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 39706 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 263.25-11 chr10 49803867 49804238 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -41673 NM_001347823 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 223-34 chr17 75348334 75348565 + 1.25 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) intron (NM_002086, intron 2 of 5) 57229 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 308.75-5 chr10 65329555 65329928 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -241684 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 381-8 chr17 59810782 59811427 + 1.25 NA intron (NM_001329400, intron 6 of 9) intron (NM_001329400, intron 6 of 9) -30162 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 291.75-13 chr14 44692422 44692934 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 106448 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 147.5-147 chr3 133046690 133046881 + 1.25 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) intron (NM_001136469, intron 2 of 5) 8497 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 157.75-162 chr7 73774249 73774471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4090 NM_001306 1365 Hs.647023 NM_001306 ENSG00000165215 CLDN3 C7orf1|CPE-R2|CPETR2|HRVP1|RVP1 claudin 3 protein-coding 194.25-122 chrX 57658992 57659164 + 1.25 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 21182 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 167.75-62 chr18 8080464 8080629 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 9 of 30) intron (NM_002845, intron 9 of 30) 286488 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 212.25-89 chr7 79575347 79575691 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 121559 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 121-157 chr5 55338011 55338136 + 1.25 NA intron (NM_015360, intron 5 of 26) L1ME1|LINE|L1 30084 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 425.25-5 chr5 115349387 115349770 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52924 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 343.5-16 chr4 68286294 68286672 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40789 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 296.5-32 chr5 158772725 158773074 + 1.25 NA intron (NM_001324107, intron 10 of 15) MIRb|SINE|MIR 325057 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 293-9 chr16 78604010 78604469 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 504585 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 169.5-164 chr7 103953288 103953539 + 1.25 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) intron (NM_005045, intron 1 of 64) 36103 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 270.25-15 chr12 11491845 11492161 + 1.25 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -5325 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 267.25-10 chr12 59189846 59190138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -269454 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 214.25-11 chr10 123701816 123701996 + 1.25 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 35551 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 205.5-36 chr13 101100882 101101079 + 1.25 NA intron (NM_001350749, intron 26 of 43) intron (NM_001350749, intron 26 of 43) -156616 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 222.5-49 chr2 66295152 66295359 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 63073 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 299.5-17 chr18 6682830 6683113 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46745 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 277.5-34 chr2 222098267 222098548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199740 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 233.5-33 chr13 92003421 92003696 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) intron (NM_004466, intron 6 of 7) 348649 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 201-86 chr9 36530991 36531249 + 1.25 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -41742 NM_001256693 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 124.75-125 chr2 223687740 223687946 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -85482 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 155.25-123 chr3 157322181 157322321 + 1.25 NA intron (NM_024621, intron 9 of 13) L1MB3|LINE|L1 -114599 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 203-50 chr2 60137263 60137525 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 245642 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 182.75-130 chr7 136550826 136551060 + 1.25 NA Intergenic FordPrefect_a|DNA|hAT-Tip100 -317709 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 310.25-19 chr5 144149356 144149685 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 21139 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 117.75-192 chr7 23055410 23055522 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41336 NM_032581 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 163.75-78 chr20 34181085 34181321 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68960 NM_001316364 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 215.5-78 chr4 89959868 89960316 + 1.25 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 65238 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 235.25-24 chr17 33791177 33791600 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -257628 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 281.25-36 chr4 176488996 176489376 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 169220 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 147-3 chr1 68018050 68018300 + 1.25 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 33456 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 323-23 chr7 10904619 10905078 + 1.25 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 35305 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 380.75-6 chr8 66810358 66810981 + 1.25 NA intron (NM_001204173, intron 6 of 18) AluSq2|SINE|Alu 35464 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 172.25-132 chr7 53204440 53204686 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168930 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 278.75-35 chr6 23939363 23939616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186726 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 172.75-16 chr10 89660399 89660615 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14935 NM_148977 53354 Hs.163555 NM_138316 ENSG00000152782 PANK1 PANK pantothenate kinase 1 protein-coding 233-4 chr1 55271407 55271701 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 45913 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 140.5-249 chr9 128120051 128120172 + 1.25 NA TTS (NM_025072) TTS (NM_025072) -1377 NR_033374 100289019 Hs.693796 NR_033374 SLC25A25-AS1 - SLC25A25 antisense RNA 1 ncRNA 277.25-42 chr7 3194563 3195044 + 1.25 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -36230 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 218.5-21 chr10 79216466 79216707 + 1.25 NA intron (NM_020338, intron 7 of 24) MIR|SINE|MIR -130883 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 196.75-90 chr5 169319160 169319398 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -18140 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 247.5-80 chr7 117243194 117243597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60714 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 148.5-93 chr2 24485420 24485615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5737 NM_001362950 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 212.5-76 chr4 2144737 2145150 + 1.25 NA intron (NM_181808, intron 16 of 25) L1ME3D|LINE|L1 85616 NM_178557 339983 Hs.318529 NM_178557 ENSG00000185818 NAT8L CML3|NACED|NAT8-LIKE N-acetyltransferase 8 like protein-coding 158-40 chr12 26212339 26212515 + 1.25 NA intron (NM_005086, intron 1 of 2) intron (NM_005086, intron 1 of 2) 16854 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 169.5-47 chr14 28500454 28500618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 264783 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 232.75-42 chr3 100033259 100033469 + 1.25 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) -68966 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 234.25-21 chr14 51698092 51698525 + 1.25 NA intron (NM_001042481, intron 4 of 14) intron (NM_001042481, intron 4 of 14) -18975 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 274.75-6 chr12 61175328 61175756 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1017297 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 235.75-34 chr2 58397462 58397794 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 121751 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 245-30 chr2 53775840 53776125 + 1.25 NA TTS (NM_001346127) TTS (NM_001346127) 8178 NM_001008708 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 135-112 chr3 98776460 98776634 + 1.25 NA intron (NM_001271147, intron 6 of 9) intron (NM_001271147, intron 6 of 9) 13240 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 185.75-6 chr1 119723055 119723276 + 1.25 NA intron (NM_006623, intron 2 of 11) LTR79|LTR|ERVL 11231 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 180.75-60 chr19 44190767 44191043 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -21623 NM_001289168 7770 Hs.298089 NM_182490 ENSG00000131115 ZNF227 - zinc finger protein 227 protein-coding 223.5-16 chr10 88670055 88670465 + 1.25 NA intron (NM_001198829, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 5818 NM_004190 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 340.75-15 chr2 205421516 205421916 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -260784 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 292.25-5 chr1 98409270 98409517 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 198682 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 228.5-57 chr2 64250580 64250840 + 1.25 NA intron (NR_120420, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 22309 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 267.5-18 chr12 78193254 78193629 + 1.25 NA intron (NM_001024383, intron 34 of 39) intron (NM_001024383, intron 34 of 39) 166305 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 230.25-56 chr3 34242510 34242820 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 444035 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 191-58 chr4 37588766 37589042 + 1.25 NA intron (NM_001104629, intron 3 of 3) intron (NM_001104629, intron 3 of 3) 4671 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 291-20 chr2 121179687 121180031 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 105343 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 324.5-12 chr16 10554268 10554823 + 1.25 NA intron (NM_001424, intron 1 of 4) intron (NM_001424, intron 1 of 4) 26053 NM_001424 2013 Hs.531561 NM_001424 ENSG00000213853 EMP2 XMP epithelial membrane protein 2 protein-coding 380-8 chr19 34008874 34009294 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -163420 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 130.25-224 chrX 40790083 40790212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43049 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 143.5-3 chr1 19779100 19779337 + 1.25 NA intron (NM_001349112, intron 3 of 14) intron (NM_001349112, intron 3 of 14) 20131 NM_001349115 255104 Hs.466729 NM_181719 ENSG00000162542 TMCO4 - transmembrane and coiled-coil domains 4 protein-coding 241.75-72 chr7 7186782 7187197 + 1.25 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 4374 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 213-13 chr10 103752704 103753145 + 1.25 NA intron (NR_038940, intron 2 of 2) intron (NR_038940, intron 2 of 2) 6145 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 164.75-3 chr1 54731013 54731247 + 1.25 NA intron (NM_001291333, intron 6 of 7) L2c|LINE|L2 15269 NM_004623 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 320.5-35 chr6 45879041 45879320 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58417 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 222.75-7 chr1 184415686 184416018 + 1.25 NA intron (NM_030806, intron 1 of 5) intron (NM_030806, intron 1 of 5) 28823 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 214.75-79 chr7 133850629 133850945 + 1.25 NA intron (NM_021807, intron 11 of 17) L3b|LINE|CR1 -25899 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 221.5-61 chr21 23117753 23118085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38635 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 292.5-29 chr2 18561275 18561640 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_020905) promoter-TSS (NM_020905) -804 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 207.75-78 chr3 103529659 103530004 + 1.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -5715 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 211.5-70 chr2 22743518 22743823 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 207191 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 167.5-13 chr1 169641700 169641938 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11695 NM_003005 6403 Hs.73800 NM_003005 ENSG00000174175 SELP CD62|CD62P|GMP140|GRMP|LECAM3|PADGEM|PSEL selectin P protein-coding 163.25-18 chr10 84006261 84006411 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -133173 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 203.5-20 chr10 24409369 24409704 + 1.25 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) L1ME1|LINE|L1 -39878 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 220.25-41 chr20 33340166 33340383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57060 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 254-39 chr5 163685375 163685700 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 179918 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 292.75-3 chr1 70100522 70100790 + 1.25 NA intron (NM_001350216, intron 24 of 25) intron (NM_001350216, intron 24 of 25) 104923 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 154.75-70 chr2 23759477 23759710 + 1.25 NA intron (NR_125717, intron 25 of 28) intron (NR_125717, intron 25 of 28) 167530 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 240-18 chr14 65243364 65243675 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21172 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 168.5-175 chr7 109765765 109765917 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 194372 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 208.75-37 chr2 53099808 53100038 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -397308 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 273.75-16 chr17 14514682 14515031 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 211116 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 137-97 chr22 28294987 28295104 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -164824 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 151.25-204 chrX 39857019 39857169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19533 NR_039763 100616251 NR_039763 ENSG00000263972 MIR1587 - microRNA 1587 ncRNA 325.5-12 chr16 60612904 60613266 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -253292 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 362.5-2 chr10 90078256 90078728 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -121119 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 154.25-113 chr4 1838011 1838165 + 1.25 NA intron (NM_012318, intron 3 of 13) intron (NM_012318, intron 3 of 13) 18068 NM_012318 3954 Hs.120165 NM_012318 ENSG00000168924 LETM1 SLC55A1 leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 protein-coding 136.25-156 chr5 154408696 154408837 + 1.25 NA intron (NM_198321, intron 8 of 11) intron (NM_198321, intron 8 of 11) 37056 NR_037897 386627 Hs.652021 NR_037897 SAP30L-AS1 GALNT10-AS1 SAP30L antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 398.75-5 chr3 80118551 80119006 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -350780 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 122.25-39 chr11 125672902 125673072 + 1.25 NA intron (NM_001612, intron 3 of 3) intron (NM_001612, intron 3 of 3) 7860 NM_020108 56 Hs.169222 NM_001612 ENSG00000134940 ACRV1 D11S4365|SP-10|SPACA2 acrosomal vesicle protein 1 protein-coding 306.25-30 chr4 79871297 79871676 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 44015 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 162-43 chr15 94388092 94388403 + 1.25 NA intron (NM_018349, intron 13 of 21) LTR86A1|LTR|ERVL 32317 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 135-148 chr5 126107569 126107794 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71896 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 295.25-20 chr4 15675543 15675957 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6077 NM_001145191 285550 Hs.399980 NM_001145191 ENSG00000237765 FAM200B C4orf53 family with sequence similarity 200 member B protein-coding 235.5-38 chr15 88000895 88001163 + 1.25 NA intron (NM_001007156, intron 14 of 15) L1MB7|LINE|L1 -54761 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 421-7 chr22 40623489 40623947 + 1.25 NA intron (NM_020831, intron 1 of 14) intron (NM_020831, intron 1 of 14) 13001 NM_001282661 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 157-109 chr6 135081775 135081960 + 1.25 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -27045 NM_001363686 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 220.5-29 chr14 65629100 65629391 + 1.25 NA intron (NM_004480, intron 4 of 9) intron (NM_004480, intron 4 of 9) 158143 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 327.5-2 chr1 95644241 95645058 + 1.25 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 134533 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 179-11 chr10 25086759 25087037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24619 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 181.25-131 chr8 130668304 130668548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224752 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 133.25-175 chr5 68776168 68776342 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 253672 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 221.75-28 chr15 69312086 69312578 + 1.25 NA intron (NM_017705, intron 1 of 8) intron (NM_017705, intron 1 of 8) -2071 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 392.25-7 chr18 33297200 33297607 + 1.25 NA intron (NM_001308126, intron 11 of 23) L1MA5A|LINE|L1 143168 NM_001371121 154.25-142 chr6 102529937 102530184 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1131075 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 211.5-123 chr5 17732502 17732823 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74612 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 220-48 chr4 150906135 150906578 + 1.25 NA exon (NM_001199282, exon 12 of 57) exon (NM_001199282, exon 12 of 57) 108911 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 173-14 chr10 28207738 28207917 + 1.25 NA intron (NR_134517, intron 2 of 16) intron (NR_134517, intron 2 of 16) 74296 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 153-51 chr16 24601958 24602101 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -8176 NM_001351850 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 143.5-182 chr5 169630468 169630676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6703 NR_156756 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 233.25-80 chr9 132889650 132890012 + 1.25 NA non-coding (NR_133631, exon 3 of 3) non-coding (NR_133631, exon 3 of 3) 10933 NM_001316897 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 182.5-16 chr1 227088268 227088609 + 1.25 NA intron (NM_001366019, intron 16 of 36) L1ME4c|LINE|L1 148144 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 361.25-2 chr1 188017383 188017783 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 573955 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 280.5-5 chr1 194943083 194943391 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 1145478 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 415.5-11 chr8 132503763 132504449 + 1.25 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -23011 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 133-87 chr2 134548097 134548281 + 1.25 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) MER33|DNA|hAT-Charlie 170811 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 185-66 chr5 27536493 27536802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64355 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 194-75 chr7 8447364 8447542 + 1.25 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 13844 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 270.25-3 chr1 178877827 178878080 + 1.25 NA intron (NM_152663, intron 9 of 19) intron (NM_152663, intron 9 of 19) -6876 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 261.25-31 chr4 55855034 55855603 + 1.25 NA intron (NM_001024924, intron 1 of 18) intron (NM_001024924, intron 1 of 18) 1668 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 341.25-22 chr6 20141972 20142339 + 1.25 NA intron (NM_001080480, intron 4 of 12) intron (NM_001080480, intron 4 of 12) 70314 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 200-89 chr7 129400936 129401197 + 1.25 NA intron (NM_001130720, intron 6 of 16) AluJb|SINE|Alu 25228 NM_001130722 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 166.75-82 chr20 33689902 33690071 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3601 NM_005225 1869 Hs.654393 NM_005225 ENSG00000101412 E2F1 E2F-1|RBAP1|RBBP3|RBP3 E2F transcription factor 1 protein-coding 234-60 chr7 26728913 26729185 + 1.25 NA intron (NM_003930, intron 6 of 12) intron (NM_003930, intron 6 of 12) 91178 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 381.25-5 chr16 80689146 80689566 + 1.25 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) intron (NM_152342, intron 1 of 6) 115242 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 138-146 chr6 128845732 128845886 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37329 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 304-22 chr2 61093141 61093439 + 1.25 NA intron (NM_001330434, intron 11 of 20) intron (NM_001330434, intron 11 of 20) 27081 NM_032506 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 214-58 chr6 150742887 150743220 + 1.25 NA intron (NM_001329803, intron 2 of 13) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 21954 NM_001329806 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 184.75-60 chr20 56727524 56727791 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 98351 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 145-137 chr6 44273461 44273646 + 1.25 NA intron (NM_001137560, intron 2 of 2) intron (NM_001137560, intron 2 of 2) 3103 NM_001137560 441151 Hs.632851 NM_001039704 ENSG00000178233 TMEM151B C6orf137|TMEM193|bA444E17.5 transmembrane protein 151B protein-coding 168-69 chr2 124695998 124696201 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 670812 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 189.5-5 chr1 74874885 74875059 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141564 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 170-71 chr4 87230508 87230749 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10010 NM_020803 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 159.25-89 chr3 112549969 112550148 + 1.25 NA intron (NM_001278712, intron 4 of 10) intron (NM_001278712, intron 4 of 10) -11262 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 286-2 chr1 188157184 188157544 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 713736 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 187.5-151 chr7 16951472 16951930 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69718 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 297-8 chr11 43463020 43463448 + 1.25 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) L1MC5|LINE|L1 -96422 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 208-75 chr7 7827261 7827436 + 1.25 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -108741 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 173.25-141 chr9 85595120 85595316 + 1.25 NA intron (NM_015239, intron 18 of 25) intron (NM_015239, intron 18 of 25) 146811 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 176.75-82 chr3 94831050 94831297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -107090 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 282-46 chr8 74559532 74559801 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11057 NR_049871 100847091 NR_049871 ENSG00000283505 MIR5681B - microRNA 5681b ncRNA 347-23 chr7 50563371 50563906 + 1.25 NA intron (NM_001082971, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 1767 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 177.5-79 chr2 75571789 75572122 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2236 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 236.5-67 chr4 46759139 46759465 + 1.25 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) L1M4c|LINE|L1 149943 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 271.5-12 chr11 44249321 44249752 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001178083, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001178083, exon 15 of 15) 60603 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 275.5-46 chr4 61174993 61175282 + 1.25 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -26093 NM_001371343 231-17 chr12 29602688 29602997 + 1.25 NA intron (NM_001367875, intron 9 of 19) L2c|LINE|L2 -103149 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 278.75-29 chr4 65311751 65312058 + 1.25 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -307404 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 115-122 chr4 72769972 72770155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -200842 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 373.25-16 chr7 42142246 42142595 + 1.25 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 94789 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 197.75-72 chr5 121315200 121315494 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -7203 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 196.75-89 chr5 82441717 82441877 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 162335 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 169.75-67 chr18 10137814 10138212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 223997 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 374-15 chr5 68423937 68424282 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 131532 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 216-20 chr15 71985154 71985385 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 11 of 41) L1ME3A|LINE|L1 -128989 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 306-27 chr4 85543443 85543741 + 1.25 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 68442 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 160.75-14 chr10 32282582 32282820 + 1.25 NA intron (NM_001272004, intron 10 of 13) intron (NM_001272004, intron 10 of 13) 64457 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 122.25-198 chr8 121018042 121018228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -206089 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 241.5-93 chr7 158202267 158202535 + 1.25 NA intron (NM_130843, intron 4 of 21) intron (NM_130843, intron 4 of 21) 330412 NR_030325 693180 NR_030325 ENSG00000207637 MIR595 MIRN595|hsa-mir-595 microRNA 595 ncRNA 247.5-67 chr5 56497981 56498208 + 1.25 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -16325 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 206.75-23 chr16 62009630 62009858 + 1.25 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 26694 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 304-33 chr8 85106813 85107220 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001349638) promoter-TSS (NM_001349638) -222 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 214.75-86 chr8 102223168 102223420 + 1.25 NA intron (NM_001172477, intron 5 of 8) intron (NM_001172477, intron 5 of 8) 15537 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 224.25-7 chr1 189454625 189454929 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1021233 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 222.75-102 chr8 129398812 129399228 + 1.25 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) intron (NR_130918, intron 1 of 2) 85122 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 262-22 chr17 68394071 68394512 + 1.25 NA intron (NM_001352899, intron 9 of 12) MER44C|DNA|TcMar-Tigger -19332 NM_001278433 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 320.5-12 chr14 74124175 74124477 + 1.25 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L1MB5|LINE|L1 39373 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 206.5-40 chr19 28559089 28559405 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MC1|LINE|L1 -47441 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 193.25-106 chr7 34037346 34037620 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 131944 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 176.75-23 chr12 22015041 22015494 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30907 NR_135117 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 303.5-8 chr12 15248382 15248936 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -27242 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 119-97 chr2 206063840 206064009 + 1.25 NA intron (NM_017759, intron 1 of 10) intron (NM_017759, intron 1 of 10) 22250 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 133.5-109 chr2 25538987 25539188 + 1.25 NA intron (NM_033147, intron 8 of 19) L1ME3D|LINE|L1 111135 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 141.5-68 chr16 67983149 67983377 + 1.25 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -2764 NM_001370198 64180 Hs.302028 NM_022357 ENSG00000141096 DPEP3 MBD3 dipeptidase 3 protein-coding 187-28 chr14 63366106 63366316 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -47276 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 118.5-233 chr8 141073986 141074128 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54532 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 131.75-103 chr19 50038379 50038648 + 1.25 NA intron (NM_015428, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 -12076 NR_027257 400710 Hs.628968 NR_027257 ENSG00000204666 LOC400710 - uncharacterized LOC400710 ncRNA 313.25-29 chr9 8742137 8742411 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) L1MA8|LINE|L1 -8328 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 147.5-91 chr2 19367507 19367666 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8963 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 199.5-71 chr2 28569258 28569568 + 1.25 NA intron (NR_138141, intron 1 of 35) L2c|LINE|L2 3056 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 202.75-95 chr5 153154761 153155185 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182624 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 225.25-47 chr2 223383449 223383699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 218787 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 179.5-87 chr2 16977591 16977813 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -311868 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 218.25-79 chr6 61718580 61718786 + 1.25 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) LTR33|LTR|ERVL 144553 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 115-173 chr7 84684929 84685045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 152511 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 199-28 chr17 52873672 52873890 + 1.25 NA intron (NR_146899, intron 1 of 2) intron (NR_146899, intron 1 of 2) 11660 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 163.25-125 chr6 85452066 85452298 + 1.25 NA intron (NM_002526, intron 1 of 8) intron (NM_002526, intron 1 of 8) 2099 NM_002526 4907 Hs.153952 NM_002526 ENSG00000135318 NT5E CALJA|CD73|E5NT|NT|NT5|NTE|eN|eNT 5'-nucleotidase ecto protein-coding 198-71 chr7 34788546 34788761 + 1.25 NA intron (NM_207172, intron 3 of 8) L1M1|LINE|L1 -30381 NR_033665 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 164.75-155 chr9 110804642 110804851 + 1.25 NA 3' UTR (NM_005592, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005592, exon 14 of 14) 76484 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 136.5-10 chr1 114888083 114888253 + 1.25 NA intron (NM_001282542, intron 15 of 30) intron (NM_001282542, intron 15 of 30) 33305 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 196.75-36 chr13 86985021 86985300 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73240 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 215.5-92 chr5 106152165 106152457 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 858703 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 210.75-92 chr7 80792185 80792423 + 1.25 NA intron (NM_006379, intron 11 of 17) intron (NM_006379, intron 11 of 17) 126747 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 203-34 chr14 68806902 68807169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10792 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 234.5-79 chr5 84174796 84175179 + 1.25 NA intron (NM_001278642, intron 3 of 9) intron (NM_001278642, intron 3 of 9) 209880 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 287.5-18 chr13 96641083 96641333 + 1.25 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1PA16|LINE|L1 213979 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 232.25-54 chr4 92437945 92438158 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 133652 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 207.5-49 chr2 28774219 28774564 + 1.25 NA intron (NM_206876, intron 2 of 8) intron (NM_206876, intron 2 of 8) 22561 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 208.25-7 chr1 176151404 176151638 + 1.25 NA intron (NM_001286644, intron 3 of 17) intron (NM_001286644, intron 3 of 17) 55723 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 202.75-41 chr15 96435844 96436149 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 102231 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 225-63 chr5 162975412 162975688 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -462021 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 270.75-29 chr2 166123742 166124025 + 1.25 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) intron (NR_110260, intron 2 of 11) 4137 NM_001353952 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 232.25-24 chr14 46319966 46320226 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -151263 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 186-18 chr11 82366361 82366556 + 1.25 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 37455 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 284.5-49 chr5 57113450 57113815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60316 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 240.5-84 chr5 19056477 19056893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 829587 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 147.5-180 chr5 150533483 150533680 + 1.25 NA intron (NM_001301063, intron 4 of 13) intron (NM_001301063, intron 4 of 13) 25450 NM_001543 3340 Hs.222055 NM_001543 ENSG00000070614 NDST1 HSST|MRT46|NST1 N-deacetylase and N-sulfotransferase 1 protein-coding 223-75 chr7 46486045 46486404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210898 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 210.5-76 chr20 52892822 52893120 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -79387 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 155.5-90 chr2 43516039 43516256 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) L2b|LINE|L2 79827 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 157.5-226 chr9 83195901 83196121 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71257 NM_001244962 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 281.5-25 chr2 43842534 43842927 + 1.25 NA intron (NM_001357321, intron 1 of 12) L1ME3E|LINE|L1 3759 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 252-72 chr8 53515498 53515813 + 1.25 NA non-coding (NR_149032, exon 2 of 2) non-coding (NR_149032, exon 2 of 2) 8310 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 332.5-12 chr2 148388728 148389017 + 1.25 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) L1PA17|LINE|L1 -255879 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 184.5-114 chr4 186799945 186800230 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76231 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 155-132 chr7 85269991 85270155 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -148142 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 190-55 chr4 116976536 116976865 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108876 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 175-35 chr14 25938004 25938195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 615331 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 324.75-18 chr2 42602411 42602872 + 1.25 NA intron (NM_001330443, intron 3 of 16) MER81|DNA|hAT-Blackjack 34009 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 252.5-66 chr5 53673414 53673738 + 1.25 NA intron (NR_134474, intron 5 of 5) MER92-int|LTR|ERV1 112937 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 230-12 chr10 92415504 92415904 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2957 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 227.75-9 chr10 64142359 64142549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -620564 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 145.75-33 chr13 95192381 95192519 + 1.25 NA intron (NM_001105515, intron 9 of 20) intron (NM_001105515, intron 9 of 20) -17894 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 170.75-152 chr9 113958550 113958875 + 1.25 NA intron (NM_001318042, intron 1 of 14) intron (NM_001318042, intron 1 of 14) 82403 NM_001318041 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 265.75-40 chr2 186573747 186574090 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16138 NM_001145000 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 158.75-167 chr9 28071248 28071437 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -497476 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 153-68 chr2 39079134 39079376 + 1.25 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) L1ME3D|LINE|L1 41208 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 188.75-121 chr9 29288578 29288851 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -75113 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 159.75-41 chr14 51888026 51888238 + 1.25 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) L1MA10|LINE|L1 27520 NM_001243774 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 364.25-25 chr8 71105438 71105883 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 251046 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 140.75-190 chr8 128259675 128259928 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109685 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 164.25-98 chr3 61269322 61269480 + 1.25 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -17940 NR_148921 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 149.25-177 chr8 64983751 64984065 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -185171 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 346-15 chr4 83575746 83576161 + 1.25 NA intron (NM_001256421, intron 3 of 12) L1ME3C|LINE|L1 39845 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 334.5-4 chr1 172338216 172338626 + 1.25 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) intron (NM_015569, intron 17 of 20) -82264 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 251-18 chr12 111638803 111639003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39227 NR_132311 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 159.5-147 chr3 86001939 86002113 + 1.25 NA intron (NM_001256502, intron 9 of 10) intron (NM_001256502, intron 9 of 10) -173976 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 292.5-16 chr13 75285514 75285810 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014832, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_014832, exon 21 of 21) 45074 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 194.75-12 chr10 61645829 61646193 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16918 NM_001366909 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 309-32 chr4 67694823 67695144 + 1.25 NA intron (NM_018227, intron 2 of 32) intron (NM_018227, intron 2 of 32) 6172 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 198.5-70 chr2 61826270 61826545 + 1.25 NA non-coding (NR_037710, exon 6 of 6) non-coding (NR_037710, exon 6 of 6) 27653 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 235.75-18 chr12 21324105 21324486 + 1.25 NA intron (NM_021094, intron 1 of 13) MER4B-int|LTR|ERV1 10622 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 131.75-141 chr3 111137948 111138101 + 1.25 NA TTS (NM_001243286) TTS (NM_001243286) 66208 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 273.25-13 chr12 61734931 61735260 + 1.25 NA intron (NM_178539, intron 4 of 4) intron (NM_178539, intron 4 of 4) 457744 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 279.25-20 chr2 15057925 15058378 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 425434 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 267.5-27 chr15 63490134 63490438 + 1.25 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -14225 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 308.75-22 chr2 23446741 23447076 + 1.25 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 61729 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 300.5-55 chr9 92839865 92840209 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 30426 NR_026868 138649 Hs.643597 NM_001010925 ENSG00000187984 ANKRD19P ANKRD19|bA526D8.2 ankyrin repeat domain 19, pseudogene pseudo 223.5-38 chr14 61495477 61495784 + 1.25 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) L2c|LINE|L2 74564 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 127.75-154 chr5 30222868 30223054 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 342401 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 384.75-7 chr2 99824555 99824935 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) 280838 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 211.5-11 chr1 240799764 240800089 + 1.25 NA intron (NM_001350116, intron 16 of 16) intron (NM_001350116, intron 16 of 16) -187771 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 121.75-102 chr20 50549878 50550018 + 1.25 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) -35838 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 201.25-53 chr20 63301663 63301926 + 1.25 NA intron (NM_020882, intron 3 of 35) L1MEd|LINE|L1 8608 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 231.25-58 chr4 35547973 35548282 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 695812 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 206.25-53 chr2 124827695 124827901 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) intron (NM_130773, intron 19 of 23) 802511 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 178-48 chr2 138774220 138774534 + 1.25 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 6013 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 141.75-164 chr7 100961061 100961197 + 1.25 NA intron (NM_005960, intron 3 of 11) intron (NM_005960, intron 3 of 11) -8494 NM_001164462 10071 Hs.489355 NM_001164462 ENSG00000205277 MUC12 MUC-11|MUC-12|MUC11 mucin 12, cell surface associated protein-coding 423.75-4 chr2 79492038 79492418 + 1.25 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? 8616 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 114.75-158 chr5 136558533 136558689 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -193135 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 229-19 chr16 26180039 26180287 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 154926 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 286.5-69 chr8 113535599 113535968 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -98844 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 209.25-61 chr2 148893855 148894028 + 1.25 NA intron (NM_004522, intron 1 of 25) intron (NM_004522, intron 1 of 25) 18714 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 185-47 chr2 176998030 176998406 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 214193 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 227-65 chr7 109600487 109600704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 359618 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 201.75-63 chr3 193922789 193923043 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71322 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 215-57 chr4 96022250 96022585 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 182324 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 112.25-105 chr2 171852654 171852826 + 1.25 NA intron (NR_047549, intron 3 of 16) intron (NR_047549, intron 3 of 16) 41504 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 227-62 chr7 4043813 4044042 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) intron (NM_152744, intron 17 of 44) -85758 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 179.5-117 chr3 20636351 20636616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 294015 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 263.25-19 chr14 63810007 63810337 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -42793 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 226.25-4 chr1 158202127 158202391 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 22312 NM_001766 912 Hs.1799 NM_001766 ENSG00000158473 CD1D CD1A|R3|R3G1 CD1d molecule protein-coding 271.25-8 chr10 48574483 48574854 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001347737, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001347737, exon 3 of 3) 30405 NM_001347735 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 220-44 chr3 191796863 191797110 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 335823 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 287.75-16 chr13 79872958 79873421 + 1.25 NA intron (NR_120413, intron 1 of 5) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 603 NR_120413 101927195 Hs.342412 NR_120413 ENSG00000229175 LINC00382 TCONS_00021500 long intergenic non-protein coding RNA 382 ncRNA 216-12 chr12 93503852 93504071 + 1.25 NA non-coding (NR_038159, exon 7 of 7) non-coding (NR_038159, exon 7 of 7) 36447 NR_038159 28977 Hs.199579 NM_014050 ENSG00000198015 MRPL42 HSPC204|L31MT|L42MT|MRP-L31|MRP-L42|MRP-S32|MRPL31|MRPS32|PTD007|RPML31|S32MT mitochondrial ribosomal protein L42 protein-coding 278.25-38 chr3 88629015 88629347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 290725 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 131.5-190 chr5 56641886 56642003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35688 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 259.5-88 chr7 48378495 48378728 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 35 of 61) intron (NM_152701, intron 35 of 61) 207153 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 319-40 chr9 93311054 93311522 + 1.25 NA intron (NM_006648, intron 27 of 28) L1MB3|LINE|L1 35015 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 229-39 chr2 184319379 184319707 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -59432 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 178-12 chr11 36626550 36626829 + 1.25 NA intron (NM_001276725, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -28410 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 182-48 chr17 58716134 58716380 + 1.25 NA intron (NM_058216, intron 5 of 8) intron (NM_058216, intron 5 of 8) 23655 NR_103872 5889 Hs.412587 NM_002876 ENSG00000108384 RAD51C BROVCA3|FANCO|R51H3|RAD51L2 RAD51 paralog C protein-coding 197.5-29 chr12 16117842 16118176 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 159676 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 489.75-2 chr4 32257250 32257839 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93494 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 231.25-17 chr14 78865025 78865249 + 1.25 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -334845 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 332.5-15 chr2 234128312 234128779 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 77843 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 214.5-52 chr2 35501246 35501584 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30010 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 234-62 chr7 46073842 46074129 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152713 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 196.5-46 chr13 89398891 89399121 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 101503 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 282.25-40 chrX 81930743 81931335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 728937 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 167.75-99 chr4 67383320 67383546 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 38567 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 248.75-42 chr3 125313468 125313780 + 1.25 NA exon (NM_021964, exon 4 of 9) exon (NM_021964, exon 4 of 9) 43656 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 190.5-146 chr7 64576349 64576646 + 1.25 NA intron (NR_077227, intron 1 of 2) MER57E3|LTR|ERV1 1802 NR_077227 100128885 Hs.586332 NR_077227 LOC100128885 - uncharacterized LOC100128885 ncRNA 414.75 chr1 204125470 204125946 + 1.25 NA intron (NM_005686, intron 13 of 13) intron (NM_005686, intron 13 of 13) -15700 NR_123739 101929441 Hs.736889 NR_123739 ENSG00000230550 ERLNC1 ElncRNA1|TC0101441 estrogen receptor responsive lncRNA 1 ncRNA 120.5-127 chr2 187944947 187945141 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 342647 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 126.75-241 chr8 90096921 90097061 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14112 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 212.5-87 chr5 105448425 105448608 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 349042 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 134.5-194 chr6 119777483 119777628 + 1.25 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) L1MEg2|LINE|L1 227747 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 148-77 chr22 48354468 48354634 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80187 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 218.25-8 chr10 24357163 24357409 + 1.25 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 81601 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 161-20 chr11 57971043 57971259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52730 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 175.25-39 chr12 62212519 62212697 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19769 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 248.75-56 chr6 167524494 167524754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51834 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 322.5-13 chr17 73138487 73139149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26192 NM_001050 6752 Hs.514451 NM_001050 ENSG00000180616 SSTR2 - somatostatin receptor 2 protein-coding 288-22 chr14 56939391 56939791 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 126433 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 246.75-41 chr3 73113989 73114379 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52525 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 152.25-123 chr4 172731838 172732014 + 1.25 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) L1MA4|LINE|L1 -5048 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-31 chr11 42983049 42983216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 286237 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 355.75-6 chr14 66052325 66052843 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -433787 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 302.75-18 chr4 4331856 4332172 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 41763 NR_138481 166793 Hs.419997 NM_145291 ENSG00000168826 ZBTB49 ZNF509 zinc finger and BTB domain containing 49 protein-coding 149-107 chr5 169855193 169855460 + 1.25 NA intron (NR_156756, intron 27 of 52) intron (NR_156756, intron 27 of 52) 125169 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 340-9 chr2 100069055 100069803 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) intron (NM_001025108, intron 2 of 23) 36154 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 187.75-43 chr18 2549896 2550214 + 1.25 NA intron (NM_022840, intron 5 of 8) intron (NM_022840, intron 5 of 8) 21450 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 156-22 chr10 90863862 90864027 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5905 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 192.5-118 chr6 165593884 165594128 + 1.25 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) intron (NM_006661, intron 1 of 22) 68094 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 136.5-65 chr14 21066210 21066432 + 1.25 NA intron (NM_001282211, intron 1 of 14) AluSc|SINE|Alu -3983 NM_001278530 55701 Hs.35125 NM_018071 ENSG00000165801 ARHGEF40 SOLO Rho guanine nucleotide exchange factor 40 protein-coding 141.25-147 chr5 167177547 167177704 + 1.25 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) -9224 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 116.25-87 chr18 1993928 1994052 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 577515 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 234.5-78 chr5 78967225 78967543 + 1.25 NA intron (NM_198709, intron 3 of 7) intron (NM_198709, intron 3 of 7) 17926 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 239-41 chr4 32824966 32825260 + 1.25 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 474075 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 162.75-153 chr9 73222739 73222983 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 70996 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 277.25-43 chr7 5599555 5599888 + 1.25 NA intron (NM_003088, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 6905 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 150.5-137 chr3 130293681 130293991 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51680 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 178.25-80 chr3 11668679 11669031 + 1.25 NA intron (NM_014667, intron 2 of 5) intron (NM_014667, intron 2 of 5) -24940 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 251.5-56 chr4 20180935 20181233 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70821 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 169.25-10 chr10 101899031 101899281 + 1.25 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) intron (NM_024541, intron 23 of 25) -55236 NM_173192 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 123.75-22 chr11 15801421 15801576 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 157613 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 311.75-11 chr19 46126825 46127169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2309 NM_207393 388555 Hs.365496 NM_207393 ENSG00000188624 IGFL3 UNQ483 IGF like family member 3 protein-coding 167.25-69 chr18 4007660 4007864 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 45409 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 207.25-98 chr8 122622409 122622660 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53890 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 189.25-71 chr22 26395674 26395993 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -33427 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 197.75-80 chr6 104917997 104918274 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 22392 NR_046407 100113403 Hs.649249 NR_046407 ENSG00000203809 LIN28B-AS1 C6orf220|LINC00577|dJ439I14.1 LIN28B antisense RNA 1 ncRNA 223.5-4 chr1 38697502 38697921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162061 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 173.25-104 chr5 161421963 161422211 + 1.25 NA intron (NM_000813, intron 5 of 9) L1M5|LINE|L1 126037 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 141.75-70 chr16 86192595 86192735 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3516 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 208.5-22 chr11 79298620 79298875 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) MIRb|SINE|MIR 103362 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 208.25-42 chr2 29870878 29871218 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 50538 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 284.25-12 chr15 61919465 61919892 + 1.25 NA intron (NM_001018088, intron 57 of 81) intron (NM_001018088, intron 57 of 81) 140769 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 282.25-38 chr9 86754035 86754381 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 193298 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 151.75-94 chr3 114864682 114864925 + 1.25 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) intron (NM_001348805, intron 4 of 10) -8230 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 315-16 chr3 79032189 79032566 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) -12918 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 182.5-154 chr7 49965391 49965604 + 1.25 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1MEc|LINE|L1 127749 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 158.25-5 chr1 116811501 116811719 + 1.25 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL 57180 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 191-71 chr6 154302060 154302294 + 1.25 NA intron (NM_015553, intron 1 of 11) intron (NM_015553, intron 1 of 11) 27904 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 172.25-78 chr21 19918411 19918658 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18779 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 220.75-23 chr13 37267487 37267859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -162009 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 204.75-115 chr7 95923409 95923608 + 1.25 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) MIRc|SINE|MIR 151002 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 330.25-17 chr5 39736142 39736458 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 215869 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 156.5-94 chr2 207218116 207218393 + 1.25 NA intron (NR_110283, intron 3 of 3) intron (NR_110283, intron 3 of 3) -21557 NR_146555 105373853 Hs.678559 NR_146555 ENSG00000229647 MYOSLID - myocardin-induced smooth muscle lncRNA, inducer of differentiation ncRNA 234.5-53 chr2 194380899 194381205 + 1.25 NA intron (NR_110222, intron 4 of 5) MER57-int|LTR|ERV1 36783 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 280.75-18 chr18 2768202 2768470 + 1.25 NA intron (NM_015295, intron 37 of 47) L1ME3G|LINE|L1 -78670 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 178-80 chr5 112416394 112416619 + 1.25 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) intron (NM_001347887, intron 1 of 23) 2771 NM_001347888 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 227-6 chr11 12967596 12967795 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21853 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 270.5-55 chr6 122274546 122274837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124860 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 256.75-39 chr8 62080091 62080411 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -168603 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 249.25-24 chr2 106938707 106938942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51715 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 189.25-113 chr7 55531587 55531799 + 1.25 NA intron (NM_030796, intron 1 of 4) intron (NM_030796, intron 1 of 4) -4813 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 147.5-74 chr15 92869744 92869971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12986 NR_037601 100507217 Hs.622504 NR_037600 LINC01578 - long intergenic non-protein coding RNA 1578 ncRNA 377.75-6 chr2 180194641 180195123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -187585 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 190.75-52 chr2 139456870 139457033 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 559627 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 311.25-6 chr11 104903226 104903611 + 1.25 NA non-coding (NR_034078, exon 4 of 5) non-coding (NR_034078, exon 4 of 5) -4748 NR_034070 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 137-158 chr7 24578715 24578897 + 1.25 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) intron (NM_001303037, intron 1 of 11) 5354 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 165.75-126 chr4 132409364 132409505 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -181655 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 128.25-160 chr5 58440231 58440362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19790 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 324-7 chr12 24420565 24420902 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) L1MC5|LINE|L1 141758 NM_152989 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 200-53 chr20 47412962 47413289 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_146496) promoter-TSS (NR_146496) -981 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 253.5-76 chr7 132744822 132745194 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -13962 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 391.5-16 chr7 139015127 139015518 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20720 NM_080660 92092 Hs.512833 NM_080660 ENSG00000146858 ZC3HAV1L C7orf39 zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1 like protein-coding 164.25-28 chr12 27699209 27699399 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 2857 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 148-75 chr22 23039530 23039672 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -30918 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 302-23 chr4 36819388 36819836 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -177712 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 273.5-68 chr6 43441712 43442141 + 1.25 NA exon (NM_001350518, exon 9 of 22) exon (NM_001350518, exon 9 of 22) 7384 NR_106894 102466746 NR_106894 ENSG00000276770 MIR6780B hsa-mir-6780b microRNA 6780b ncRNA 355.75-16 chr5 137435799 137436277 + 1.25 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 63288 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 129-165 chr7 40947918 40948121 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 31920 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 198.25-57 chr2 100030363 100030704 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) L1MC3|LINE|L1 75050 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 263-32 chr22 26807022 26807525 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52938 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 134.5-65 chr14 66160312 66160495 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -325968 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 218.25-55 chr3 112785444 112785776 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -16868 NR_149026 100129297 Hs.570655 NR_149026 CD200R1L-AS1 - CD200R1L antisense RNA 1 ncRNA 154.75-115 chr5 80732888 80733156 + 1.25 NA intron (NM_002439, intron 10 of 23) L1MB7|LINE|L1 -78039 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 157-82 chr4 48997766 48998027 + 1.25 NA intron (NM_001286791, intron 5 of 15) intron (NM_001286791, intron 5 of 15) 11254 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 317.5-4 chr12 67996880 67997349 + 1.25 NA intron (NR_104124, intron 2 of 4) L1MC4a|LINE|L1 7669 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 182.25-28 chr12 48741207 48741531 + 1.25 NA intron (NM_001351125, intron 2 of 4) L1MC4|LINE|L1 13934 NM_001351123 255411 Hs.404103 NM_001351123 ENSG00000257987 TEX49 LINC00935 testis expressed 49 protein-coding 166.5-9 chr1 71758131 71758298 + 1.25 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) intron (NM_173808, intron 3 of 6) 78798 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 348.5-21 chr7 36510378 36510769 + 1.25 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 89547 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 205.5-5 chr1 115933909 115934190 + 1.25 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) MER30|DNA|hAT-Charlie 14673 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 184.75-39 chr18 61007459 61007740 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -325831 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 255.25-20 chr2 3841058 3841382 + 1.25 NA intron (NM_001287444, intron 10 of 10) intron (NM_001287444, intron 10 of 10) 132812 NR_037881 100505964 Hs.190267 NR_037881 ENSG00000237401 LINC01304 - long intergenic non-protein coding RNA 1304 ncRNA 278.25-53 chr7 35560695 35561334 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 134121 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 170.25-145 chr7 83329473 83329655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166680 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 245.75-27 chr2 39271331 39271643 + 1.25 NA intron (NM_003618, intron 26 of 33) intron (NM_003618, intron 26 of 33) -27504 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 185.5-7 chr1 109650014 109650419 + 1.25 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 -5860 NR_024538 2948 Hs.348387 NM_000850 ENSG00000168765 GSTM4 GSTM4-4|GTM4 glutathione S-transferase mu 4 protein-coding 203.25-95 chr7 35383137 35383367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69397 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 175.25-4 chr1 82689560 82689729 + 1.25 NA Intergenic LTR27E|LTR|ERV1 -213539 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 393-16 chr8 9089176 9089618 + 1.25 NA intron (NM_001354638, intron 7 of 7) AluJr|SINE|Alu -30767 NR_145772 109616996 NR_145772 SNORD3I - small nucleolar RNA, C/D box 3I snoRNA 167-41 chr14 69156345 69156494 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3222 NM_001284206 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 161.5-101 chr2 121421874 121422309 + 1.25 NA intron (NM_015282, intron 22 of 38) intron (NM_015282, intron 22 of 38) -108789 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 287-8 chr10 114117790 114118047 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56261 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 370.5-15 chr4 34992503 34992936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -722972 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 216.25-90 chr6 35781340 35781633 + 1.25 NA intron (NM_001348773, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 467 NM_001348773 340204 Hs.131296 NM_001010886 ENSG00000204140 CLPSL1 C6orf127|ESP32|dJ510O8.6 colipase like 1 protein-coding 132.75-54 chr13 82138620 82138859 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -911756 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 392.75-4 chr13 78062564 78063013 + 1.25 NA intron (NR_047001, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 7933 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 249.25-38 chr4 184091436 184091715 + 1.25 NA intron (NM_153343, intron 7 of 7) intron (NM_153343, intron 7 of 7) 126298 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 155-126 chr6 152950100 152950398 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 32792 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 168.5-61 chr16 74975924 74976170 + 1.25 NA intron (NM_001324172, intron 1 of 13) intron (NM_001324172, intron 1 of 13) 9076 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 297.5-11 chr11 81854450 81854727 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 36248 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 282.75-2 chr1 66955386 66955619 + 1.25 NA intron (NM_001077700, intron 4 of 13) intron (NM_001077700, intron 4 of 13) 25246 NM_001077704 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 158.5-51 chr12 109356719 109356863 + 1.25 NA intron (NR_120462, intron 2 of 2) intron (NR_120462, intron 2 of 2) 2697 NR_120462 101928138 Hs.143843 NR_120462 ENSG00000256560 LINC01486 - long intergenic non-protein coding RNA 1486 ncRNA 138.75-183 chr7 107232542 107232736 + 1.25 NA intron (NM_181733, intron 17 of 20) intron (NM_181733, intron 17 of 20) 63636 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 211.25-50 chr21 31430675 31430990 + 1.25 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -86478 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 233.5-99 chr7 13637433 13637686 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 348955 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 142.75-11 chr1 180931533 180931719 + 1.25 NA intron (NM_020950, intron 4 of 8) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 18729 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 217.5 chr1 48859922 48860247 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) intron (NR_136623, intron 5 of 12) -83115 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 185.5-2 chr1 37706740 37706936 + 1.25 NA intron (NM_001256875, intron 8 of 9) intron (NM_001256875, intron 8 of 9) 14322 NM_018101 55143 Hs.524571 NM_018101 ENSG00000134690 CDCA8 BOR|BOREALIN|DasraB|MESRGP cell division cycle associated 8 protein-coding 194.75-21 chr12 60554063 60554255 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 864789 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 174.75-3 chr1 98204683 98204849 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -5945 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 209.75-70 chr4 106683676 106684009 + 1.25 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 250218 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 188.5-32 chr13 114194141 114194431 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -40559 NM_003903 8881 Hs.374127 NM_003903 ENSG00000130177 CDC16 ANAPC6|APC6|CDC16Hs|CUT9 cell division cycle 16 protein-coding 155.5-7 chr1 49829416 49829577 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 194458 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 292.5-7 chr1 218224675 218225153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60379 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 269.75-7 chr10 59463364 59463672 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100337 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 184.25-56 chr2 64150342 64150555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6028 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 127.25-155 chr5 16126776 16126921 + 1.25 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 52943 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 175.25-7 chr1 162927943 162928219 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59266 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 178-30 chr14 78774588 78774753 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) AluJr|SINE|Alu 370951 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 248.5-90 chr6 55354472 55354761 + 1.25 NA intron (NM_207410, intron 5 of 8) intron (NM_207410, intron 5 of 8) 27147 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 293-3 chr10 33176355 33176621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59681 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 216.5-62 chr2 181235753 181235995 + 1.25 NA intron (NR_130784, intron 2 of 4) intron (NR_130784, intron 2 of 4) 69778 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 153-64 chr19 29127608 29127805 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85445 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 142.25-38 chr12 13980243 13980434 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_000834) promoter-TSS (NM_000834) 18 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 213.5-83 chr3 142861817 142862105 + 1.25 NA intron (NM_013363, intron 2 of 8) HAL1|LINE|L1 27122 NM_013363 26577 Hs.8944 NM_013363 ENSG00000163710 PCOLCE2 PCPE2 procollagen C-endopeptidase enhancer 2 protein-coding 218.75-74 chr6 11194277 11194655 + 1.25 NA intron (NM_001271033, intron 1 of 5) intron (NM_001271033, intron 1 of 5) 38202 NM_006403 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 126.25-69 chr17 60488852 60488964 + 1.25 NA intron (NM_006380, intron 3 of 12) intron (NM_006380, intron 3 of 12) 37332 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 160.5-16 chr10 86502230 86502405 + 1.25 NA intron (NM_001318328, intron 2 of 18) L1ME4b|LINE|L1 19467 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 202.5-87 chr22 30577900 30578091 + 1.25 NA intron (NM_001243225, intron 14 of 14) intron (NM_001243225, intron 14 of 14) -3330 NM_001318104 9514 Hs.17958 NM_004861 ENSG00000128242 GAL3ST1 CST galactose-3-O-sulfotransferase 1 protein-coding 159-39 chr16 51287750 51287971 + 1.25 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -136588 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 295.5-5 chr1 158507216 158507667 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 27563 NM_001004472 343406 Hs.451913 NM_001004472 ENSG00000198965 OR10R2 OR1-8|OR10R2Q olfactory receptor family 10 subfamily R member 2 protein-coding 423.25 chr1 25709911 25710535 + 1.25 NA intron (NM_020379, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR -89970 NM_020451 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 305.75-24 chr6 64602135 64602722 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 24 of 43) intron (NM_001292009, intron 24 of 43) -698990 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 221.5-102 chr8 117107987 117108383 + 1.25 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -26810 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 220.25-37 chr2 176858466 176858759 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 220858 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 174-89 chr7 24636459 24636601 + 1.25 NA intron (NM_016447, intron 3 of 12) L1MA6|LINE|L1 63078 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 144.25-140 chr4 54898056 54898219 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 227458 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 139-14 chr10 48477480 48477783 + 1.25 NA intron (NR_144644, intron 3 of 8) L1ME3B|LINE|L1 16019 NM_001256026 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 249.25-7 chr13 78031635 78032019 + 1.25 NA intron (NR_047028, intron 3 of 5) intron (NR_047028, intron 3 of 5) 18944 NR_047028 100874175 Hs.130364 NR_047028 LINC00446 - long intergenic non-protein coding RNA 446 ncRNA 209.5-45 chr14 67380914 67381217 + 1.25 NA intron (NM_004094, intron 5 of 7) L1ME4b|LINE|L1 20737 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 468.5 chr1 202998751 202999195 + 1.25 NA intron (NR_036557, intron 1 of 4) intron (NR_036557, intron 1 of 4) 8292 NR_036557 100506747 Hs.642024 NR_036557 LOC100506747 - alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog pseudo 283.25-15 chr16 76046183 76046414 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -231103 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 327-10 chr15 50604741 50605190 + 1.25 NA exon (NM_001301212, exon 21 of 39) exon (NM_001301212, exon 21 of 39) -58299 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 168-134 chr9 87661880 87662065 + 1.25 NA intron (NM_004938, intron 18 of 25) L1PB4|LINE|L1 -64147 NM_001257973 1514 Hs.731507 NM_001912 ENSG00000135047 CTSL CATL|CTSL1|MEP cathepsin L protein-coding 227.5-12 chr10 33561699 33561984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210839 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 247-67 chrX 86880862 86881232 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 618079 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 210.75-2 chr1 38879264 38879564 + 1.25 NA intron (NM_030772, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 2173 NM_030772 81025 Hs.591506 NM_030772 ENSG00000131233 GJA9 CX58|CX59|GJA10 gap junction protein alpha 9 protein-coding 327.5-17 chr2 203953640 203954123 + 1.25 NA intron (NM_012092, intron 1 of 4) L1ME4c|LINE|L1 17133 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 198.5-144 chr8 88121295 88121517 + 1.25 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 206077 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 177-91 chr7 20290608 20290836 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5986 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 190-63 chr6 35890489 35890826 + 1.25 NA intron (NM_003137, intron 3 of 15) L1ME4a|LINE|L1 30441 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 182.5-166 chr8 101900597 101900874 + 1.25 NA intron (NM_001040624, intron 4 of 7) L1MD2|LINE|L1 -83697 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 197.75-74 chr6 3840558 3840845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8672 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 138.25-61 chr16 77051461 77051606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -139657 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 295.25-19 chr3 172300483 172300768 + 1.25 NA intron (NM_001135095, intron 9 of 25) intron (NM_001135095, intron 9 of 25) 147831 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 151.25-151 chr5 34557522 34557775 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98680 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 164.5-144 chr3 184259229 184259390 + 1.25 NA TTS (NM_032331) TTS (NM_032331) 2244 NM_033259 94032 Hs.585003 NM_033259 ENSG00000163888 CAMK2N2 CAM-KIIN|CAMKIIN calcium/calmodulin dependent protein kinase II inhibitor 2 protein-coding 269.5-28 chr2 103145655 103146188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -161492 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 151.75-83 chr21 26005961 26006182 + 1.25 NA intron (NM_001204301, intron 6 of 16) intron (NM_001204301, intron 6 of 16) 134319 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 136.25-44 chr12 88507757 88507913 + 1.25 NA intron (NM_003994, intron 5 of 8) intron (NM_003994, intron 5 of 8) 72636 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 124-132 chr5 36954584 36954700 + 1.25 NA intron (NM_015384, intron 2 of 45) intron (NM_015384, intron 2 of 45) 77873 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 196.75-67 chr20 48941191 48941435 + 1.25 NA intron (NM_006420, intron 2 of 38) intron (NM_006420, intron 2 of 38) 19602 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 226.75-12 chr11 107986617 107987145 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -22017 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 156.5-87 chr2 174604405 174604576 + 1.25 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 30115 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 129.25-21 chr10 73475468 73475699 + 1.25 NA intron (NM_001142353, intron 3 of 13) MIR|SINE|MIR -20169 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 137.5-92 chr17 30801719 30801996 + 1.25 NA intron (NR_073118, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 22835 NM_015986 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 243.75-15 chr12 18974448 18974721 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -155149 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 159.5-222 chr9 127646998 127647173 + 1.25 NA intron (NM_001032221, intron 1 of 18) AluSx1|SINE|Alu 34808 NM_003165 6812 Hs.288229 NM_003165 ENSG00000136854 STXBP1 MUNC18-1|NSEC1|P67|RBSEC1|UNC18 syntaxin binding protein 1 protein-coding 339-29 chr6 130351995 130352428 + 1.25 NA intron (NM_001258275, intron 1 of 13) L1PA4|LINE|L1 13657 NM_001258275 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 126.5-159 chr3 117683625 117683744 + 1.25 NA intron (NR_146652, intron 2 of 3) intron (NR_146652, intron 2 of 3) 7241 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 191.5-3 chr1 45942596 45942807 + 1.25 NA intron (NM_001324321, intron 3 of 28) MER34A|LTR|ERV1 78353 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 203.25-78 chr5 10348934 10349283 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4587 NM_001270661 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 162.5-17 chr10 66082157 66082309 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 14 of 17) L1MC4a|LINE|L1 510808 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 251.75-22 chr14 45336531 45336790 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -83458 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 201-39 chr18 7810642 7810867 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 243438 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 370-15 chr5 152401510 152401856 + 1.25 NA intron (NM_020167, intron 1 of 3) intron (NM_020167, intron 1 of 3) 3596 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 241-46 chr7 2820619 2820940 + 1.25 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu -5549 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 130.75-209 chrX 78873902 78874089 + 1.25 NA Intergenic Ricksha_a|DNA|MULE-MuDR 27254 NR_036258 100422932 NR_036258 ENSG00000283622 MIR4328 - microRNA 4328 ncRNA 158.5-57 chr14 21151043 21151258 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 4913 NM_001004731 390445 Hs.553768 NM_001004731 ENSG00000169327 OR5AU1 OR14-38 olfactory receptor family 5 subfamily AU member 1 protein-coding 322.75-11 chr2 234957742 234958049 + 1.25 NA intron (NM_014521, intron 1 of 5) intron (NM_014521, intron 1 of 5) 5878 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 168-61 chr18 6222976 6223189 + 1.25 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) intron (NM_001365769, intron 10 of 16) -33662 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 289-22 chr2 178297648 178297929 + 1.25 NA intron (NM_001201480, intron 2 of 25) intron (NM_001201480, intron 2 of 25) -22454 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 203.25-55 chr2 135485466 135485756 + 1.25 NA intron (NM_001286569, intron 2 of 21) intron (NM_001286569, intron 2 of 21) 44974 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 189-35 chr14 54812831 54813128 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58146 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 159.75-142 chr5 137854394 137854594 + 1.25 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -13362 NM_006790 9499 Hs.84665 NM_006790 ENSG00000120729 MYOT LGMD1|LGMD1A|MFM3|TTID|TTOD myotilin protein-coding 205-74 chr7 157687090 157687387 + 1.25 NA intron (NM_130843, intron 11 of 21) intron (NM_130843, intron 11 of 21) -112816 NR_029689 406945 NR_029689 ENSG00000207960 MIR153-2 MIRN153-2|mir-153-2 microRNA 153-2 ncRNA 147.5-126 chr21 14311458 14311676 + 1.25 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X 37768 NR_003088 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 258.25-41 chr4 150999075 150999306 + 1.25 NA intron (NM_001367550, intron 2 of 56) L1MEd|LINE|L1 16077 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 295.5-48 chr5 44432060 44432312 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -42766 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 166.5-184 chr6 154653538 154653800 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79709 NM_001286194 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 172.75-40 chr15 98751692 98751902 + 1.25 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -32629 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 168.25-106 chr4 45273122 45273360 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -546607 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 320.5-14 chr16 9773802 9774300 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 11 of 13) intron (NM_001134408, intron 11 of 13) -318546 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 186.75-70 chr3 107867338 107867664 + 1.25 NA intron (NR_024276, intron 3 of 7) L1MCb|LINE|L1 10567 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 158.5-175 chr7 18996349 18996506 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001321877, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001321877, exon 25 of 25) 121209 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 200.25-118 chr9 71926871 71927215 + 1.25 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) HAL1ME|LINE|L1 15404 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 158.75-88 chr2 103441570 103441717 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -457214 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 240.5-58 chr20 25342527 25342796 + 1.25 NA intron (NM_001042472, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 48174 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 173.75-9 chr1 115267124 115267341 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15802 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 224-34 chr3 111964979 111965307 + 1.25 NA intron (NM_001134437, intron 13 of 17) intron (NM_001134437, intron 13 of 17) -13883 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 159.75-134 chr5 72452241 72452391 + 1.25 NA intron (NM_152625, intron 3 of 4) intron (NM_152625, intron 3 of 4) 55094 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 176.5-147 chr6 21236522 21236704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 275279 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 114-144 chr6 56076901 56077118 + 1.25 NA intron (NM_030820, intron 18 of 29) L1MEd|LINE|L1 14653 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 246.75-33 chr2 108386554 108386841 + 1.25 NA intron (NM_001321770, intron 4 of 4) intron (NM_001321770, intron 4 of 4) 8743 NR_135776 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 190.75-82 chr5 13842466 13842867 + 1.25 NA intron (NM_001369, intron 32 of 78) intron (NM_001369, intron 32 of 78) 101814 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 223-8 chr10 35096217 35096442 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5715 NM_001198777 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 351.75 chr10 2746435 2746907 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -245209 NR_136146 105376351 Hs.343482 NR_136146 LINC02645 - long intergenic non-protein coding RNA 2645 ncRNA 202-69 chr7 136926396 136926673 + 1.25 NA intron (NR_046103, intron 2 of 3) intron (NR_046103, intron 2 of 3) 23367 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 337.5-29 chr8 11193032 11193616 + 1.25 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) 8042 NR_138152 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 136.25-137 chr4 186391558 186391766 + 1.25 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) intron (NR_033900, intron 1 of 3) 109396 NR_033900 285441 Hs.481369 NR_033900 ENSG00000251165 F11-AS1 - F11 antisense RNA 1 ncRNA 242.5-28 chr14 69536270 69536631 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38421 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 270.5-14 chr13 88289287 88289532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 146542 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 145.25-96 chr22 45777238 45777366 + 1.25 NA intron (NM_013236, intron 9 of 11) intron (NM_013236, intron 9 of 11) 16778 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 144.75-119 chr4 40392702 40392946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57491 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 128-79 chr2 118597553 118597712 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 5334 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 366.75-21 chr6 136382156 136382538 + 1.25 NA intron (NM_001198611, intron 5 of 16) intron (NM_001198611, intron 5 of 16) 84528 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 208-33 chr19 10113305 10113589 + 1.25 NA intron (NM_002566, intron 1 of 1) intron (NM_002566, intron 1 of 1) 1754 NM_002566 5032 Hs.14468 NM_002566 ENSG00000244165 P2RY11 P2Y11 purinergic receptor P2Y11 protein-coding 164.25-160 chr9 101688606 101688793 + 1.25 NA intron (NM_133445, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 49881 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 222.25-77 chr6 122644658 122644877 + 1.25 NA intron (NM_032471, intron 2 of 3) intron (NM_032471, intron 2 of 3) -7962 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 183.5-82 chr20 10268166 10268481 + 1.25 NA intron (NM_001322909, intron 2 of 8) intron (NM_001322909, intron 2 of 8) -48817 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 266.5-40 chr2 195211799 195212056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -445031 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 149.5-138 chr4 90447339 90447541 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 4 of 7) intron (NM_207491, intron 4 of 7) 212409 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 122-138 chr5 85190747 85190940 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -805963 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 168.75-146 chr8 76993360 76993593 + 1.25 NA intron (NM_001172086, intron 2 of 4) intron (NM_001172086, intron 2 of 4) 6602 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 185.75-114 chr7 23087273 23087611 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 18261 NR_046220 100775104 NR_046220 ENSG00000230658 KLHL7-DT KLHL7-AS1|PLATAK KLHL7 divergent transcript ncRNA 193.5-133 chr5 54551179 54551430 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33545 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 223.75-58 chr22 49984125 49984393 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 21393 NR_106879 102465493 NR_106879 ENSG00000276753 MIR6821 hsa-mir-6821 microRNA 6821 ncRNA 264.5-46 chr5 26802413 26802646 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 236057 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 199.5-138 chr7 38592956 38593149 + 1.25 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) intron (NM_001635, intron 1 of 20) 38321 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 277.5-29 chr19 46466738 46467004 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001103149, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001103149, exon 3 of 3) 4692 NM_001103149 55228 Hs.8395 NM_018215 ENSG00000182013 PNMA8A PNMAL1 PNMA family member 8A protein-coding 126.25-40 chr12 20645266 20645393 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 10 of 15) intron (NM_000921, intron 10 of 15) -50026 NM_001145945 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 389-7 chr18 52481048 52481402 + 1.25 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 141028 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 186.75-47 chr2 31152255 31152484 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13929 NM_001329095 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 249-9 chr12 27258449 27258752 + 1.25 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 14314 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 335.5-12 chr5 112240612 112241119 + 1.25 NA intron (NM_001347887, intron 9 of 23) intron (NM_001347887, intron 9 of 23) 12582 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 204.75-30 chr12 7047446 7047637 + 1.25 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -13177 NM_201442 716 Hs.458355 NM_001734 ENSG00000182326 C1S EDSPD2 complement C1s protein-coding 423.25-4 chr3 82433911 82434457 + 1.25 NA intron (NR_147146, intron 4 of 8) L1PA13|LINE|L1 448042 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 229.75-72 chr7 133908353 133908736 + 1.25 NA intron (NM_021807, intron 12 of 17) MIR|SINE|MIR -83656 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 209.25-8 chr1 113591881 113592177 + 1.25 NA intron (NM_001142782, intron 5 of 20) L1M3|LINE|L1 167126 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 237.25-4 chr1 70779901 70780263 + 1.25 NA intron (NR_125938, intron 6 of 6) intron (NR_125938, intron 6 of 6) 73629 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 193.5-23 chr11 48100542 48100849 + 1.25 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu 3913 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 178.25-76 chr21 29078583 29078818 + 1.25 NA intron (NM_001286622, intron 1 of 8) intron (NM_001286622, intron 1 of 8) 1586 NM_020152 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 201-54 chr3 196680865 196681138 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 31249 NM_032898 84984 Hs.282800 NM_032898 ENSG00000174007 CEP19 C3orf34|MOSPGF centrosomal protein 19 protein-coding 313.25 chr1 52033989 52034423 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_138417) promoter-TSS (NM_138417) -396 NM_138417 112970 Hs.476033 NM_138417 ENSG00000198841 KTI12 SBBI81|TOT4 KTI12 chromatin associated homolog protein-coding 161.75-64 chr2 99799702 99800084 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) L1ME1|LINE|L1 305690 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 161-28 chr13 20639092 20639321 + 1.25 NA intron (NR_148462, intron 19 of 28) HAL1|LINE|L1 -64137 NM_138284 53342 Hs.655142 NM_138284 ENSG00000172458 IL17D IL-17D interleukin 17D protein-coding 137-13 chr1 185294217 185294347 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 22961 NM_006469 10625 Hs.497183 NM_006469 ENSG00000116679 IVNS1ABP ARA3|FLARA3|HSPC068|KLHL39|ND1|NS-1|NS1-BP|NS1BP influenza virus NS1A binding protein protein-coding 215.25-35 chr17 44994618 44994876 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26444 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 181.5-169 chr9 100864786 100865087 + 1.25 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -163791 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 215.25-71 chr4 119482114 119482371 + 1.25 NA intron (NR_037630, intron 5 of 8) L1MC1|LINE|L1 27459 NR_037630 645513 Hs.677546 NR_037630 ENSG00000245958 LOC645513 - septin 7 pseudogene pseudo 317.5-11 chr18 4497233 4497695 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42157 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 304.5-13 chr16 62314193 62314669 + 1.25 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL -277993 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 188.5-100 chr3 49813205 49813411 + 1.25 NA exon (NM_003335, exon 3 of 24) exon (NM_003335, exon 3 of 24) 645 NM_003335 7318 Hs.16695 NM_003335 ENSG00000182179 UBA7 D8|UBA1B|UBE1L|UBE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 7 protein-coding 236.5-72 chr5 24207802 24208087 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 256596 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 190.75-30 chr14 60847238 60847610 + 1.25 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) L1M4|LINE|L1 112663 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 247.5-22 chr14 64389541 64390097 + 1.25 NA intron (NM_005956, intron 1 of 27) intron (NM_005956, intron 1 of 27) 1466 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 224.5-15 chr10 35305170 35305467 + 1.25 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) intron (NM_181698, intron 3 of 11) -31191 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 187.5-4 chr1 59022129 59022362 + 1.25 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 1769 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 196.5-156 chr7 39622489 39622748 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_005402) promoter-TSS (NM_005402) -954 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 334.75-20 chr3 110663908 110664446 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 405782 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 238-2 chr1 69692367 69692695 + 1.25 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) intron (NM_001370785, intron 2 of 26) 123190 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 301.25-23 chr4 25966200 25966500 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 52158 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 155.75-37 chr12 12003504 12003753 + 1.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -46233 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 241-23 chr19 29410332 29410670 + 1.25 NA intron (NR_040029, intron 3 of 9) intron (NR_040029, intron 3 of 9) 115251 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 172.5-9 chr1 112361451 112361695 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34641 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 188.5-150 chr8 86400663 86400862 + 1.25 NA intron (NM_007013, intron 7 of 24) intron (NM_007013, intron 7 of 24) 58215 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 271.25-45 chr9 106385443 106385779 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -215317 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 120-69 chr17 11196469 11196662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44648 NM_001173462 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 191.5-63 chr18 2410346 2410646 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 161009 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 309.75-28 chr4 31096291 31096639 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) X6B_LINE|LINE|CR1 -74679 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 218.25-31 chr15 71962609 71962931 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 13 of 41) MIRb|SINE|MIR -151488 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 304.5-39 chr8 115684146 115684518 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15357 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 150.5-226 chr8 131681072 131681234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -222940 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 198.5-65 chr2 15290944 15291313 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 41 of 50) intron (NR_052013, intron 41 of 50) 270206 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 291 chr1 31774434 31774718 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10236 NM_001294335 576 Hs.524138 NM_001294335 ENSG00000121753 ADGRB2 BAI2 adhesion G protein-coupled receptor B2 protein-coding 274.75-2 chr11 18342939 18343300 + 1.25 NA intron (NM_001142307, intron 8 of 15) AluSx|SINE|Alu 20552 NM_005316 2965 Hs.577202 NM_005316 ENSG00000110768 GTF2H1 BTF2|P62|TFB1|TFIIH general transcription factor IIH subunit 1 protein-coding 130.25-15 chr1 167268190 167268392 + 1.25 NA intron (NM_001365848, intron 2 of 17) intron (NM_001365848, intron 2 of 17) 47405 NR_037163 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 227.75-77 chr7 64609405 64609681 + 1.25 NA intron (NR_077227, intron 2 of 2) BSR/Beta|Satellite|Satellite 26933 NR_033245 641746 Hs.488363 NR_033245 LOC641746 - glycine cleavage system protein H (aminomethyl carrier) pseudogene pseudo 248-12 chr11 77458322 77458733 + 1.25 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 15536 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 165-138 chr8 70217528 70217861 + 1.25 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) intron (NM_001321711, intron 2 of 21) -146442 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 219.25 chr1 22508694 22509014 + 1.25 NA intron (NM_001083621, intron 9 of 18) intron (NM_001083621, intron 9 of 18) -54635 NM_020526 2046 Hs.283613 NM_020526 ENSG00000070886 EPHA8 EEK|EK3|HEK3 EPH receptor A8 protein-coding 293.75-45 chr8 119980290 119980749 + 1.25 NA intron (NM_022783, intron 4 of 8) AluSq2|SINE|Alu 106797 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 267.5-72 chr7 103968874 103969113 + 1.25 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) MIR|SINE|MIR 20523 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 207-56 chr3 21018078 21018380 + 1.25 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -387497 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 115.75-135 chr22 49900773 49900933 + 1.25 NA 3' UTR (NM_024105, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_024105, exon 10 of 10) 17585 NM_024105 79087 Hs.526711 NM_024105 ENSG00000182858 ALG12 CDG1G|ECM39|PP14673|hALG12 ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferase protein-coding 234.75-18 chr14 46074168 46074496 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 10173 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 170.25-90 chr21 32494238 32494489 + 1.25 NA intron (NR_104472, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 81657 NR_135467 59271 Hs.208358 NM_058187 ENSG00000166979 EVA1C B18|B19|C21orf63|C21orf64|FAM176C|PRED34|SUE21 eva-1 homolog C protein-coding 261-57 chr7 88219906 88220125 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_003130) promoter-TSS (NM_003130) 69 NM_001256891 6717 Hs.489040 NM_003130 ENSG00000075142 SRI CP-22|CP22|SCN|V19 sorcin protein-coding 234.75-39 chr2 105234205 105234508 + 1.25 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie -7387 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 163.25-139 chr8 50187356 50187557 + 1.25 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L1PA8|LINE|L1 23325 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 266.75-52 chr9 35940873 35941123 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 17156 NM_019897 56656 Hs.553540 NM_019897 ENSG00000278889 OR2S2 OR37A|OST715 olfactory receptor family 2 subfamily S member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 231.5-25 chr12 121134671 121135082 + 1.25 NA intron (NR_033953, intron 1 of 10) intron (NR_033953, intron 1 of 10) 2000 NR_033948 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 443.25-5 chr21 17828663 17829218 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9584 NM_001100420 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 250-41 chr4 60987773 60988116 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65325 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 251.25-29 chr2 121846812 121847180 + 1.25 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 91345 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 195.5-136 chr6 106778657 106778992 + 1.25 NA intron (NR_147986, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 -5301 NR_030314 693172 NR_030314 ENSG00000207577 MIR587 MIRN587|hsa-mir-587 microRNA 587 ncRNA 163.25-106 chr4 34093313 34093530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53528 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 113.25-122 chr4 89666069 89666226 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -170254 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 230.25-62 chr4 69711449 69711692 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49050 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 161.5-20 chr10 61975930 61976271 + 1.25 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) intron (NM_032199, intron 3 of 9) -73257 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 203.5-106 chr4 62412436 62412627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -250766 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 157.25-4 chr1 94320692 94320852 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73026 NM_001328665 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 152-140 chr7 11553353 11553565 + 1.25 NA intron (NM_015204, intron 4 of 26) intron (NM_015204, intron 4 of 26) 278739 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 176.25-59 chr2 4281578 4281938 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 307597 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 188.75-78 chr22 43892374 43892595 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_138814) promoter-TSS (NM_138814) -471 NM_001371410 293.5-7 chr10 97084187 97084615 + 1.25 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) intron (NM_003061, intron 4 of 36) -18355 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 246.75-19 chr15 88912196 88912534 + 1.25 NA intron (NM_001310320, intron 1 of 8) intron (NM_001310320, intron 1 of 8) 803 NM_001310321 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 338.25-18 chr3 1531261 1531699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 438456 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 186.25-42 chr17 43959987 43960153 + 1.25 NA intron (NM_004160, intron 2 of 6) intron (NM_004160, intron 2 of 6) -17594 NM_002722 5539 Hs.558368 NM_002722 ENSG00000108849 PPY PNP|PP pancreatic polypeptide protein-coding 210.5-53 chr17 60641171 60641505 + 1.25 NA intron (NM_003620, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 -36513 NM_017679 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 224-6 chr1 163764534 163764861 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -341506 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 121-48 chr12 46808760 46808901 + 1.25 NA intron (NM_018018, intron 1 of 16) intron (NM_018018, intron 1 of 16) 17167 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 342.25-11 chr2 65669701 65670114 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -237308 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 300.75-34 chr22 35018065 35018483 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20358 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 160.75-79 chr2 133863095 133863332 + 1.25 NA Intergenic LTR1F1|LTR|ERV1 -256722 NM_001371457 205-6 chr1 199018667 199018851 + 1.25 NA intron (NR_126351, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 205 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 217.5-99 chr5 64218299 64218558 + 1.25 NA TTS (NM_178532) TTS (NM_178532) 52585 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 272.25-55 chr7 31897188 31897495 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 173066 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 310.25-18 chr5 109597884 109598187 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91331 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 238-34 chr20 2586464 2586725 + 1.25 NA intron (NM_080751, intron 7 of 19) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 49987 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 279-10 chr12 69144099 69144394 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -95323 NM_001300947 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 194.75-23 chr13 69843771 69844042 + 1.25 NA intron (NM_001286725, intron 4 of 9) L1PA5|LINE|L1 -263307 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 131.75-34 chr10 98200558 98200704 + 1.25 NA intron (NM_001256620, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 65974 NM_001351016 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 215.25-66 chr3 193815593 193815797 + 1.25 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 28314 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 251-34 chr2 144718461 144718815 + 1.25 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 50671 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 190-15 chr13 48898200 48898498 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77563 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 186.25-37 chr15 82668284 82668627 + 1.25 NA intron (NM_001278512, intron 14 of 26) intron (NM_001278512, intron 14 of 26) -5780 NM_001348441 8120 Hs.199593 NM_004644 ENSG00000103723 AP3B2 EIEE48|NAPTB adaptor related protein complex 3 subunit beta 2 protein-coding 203.5-54 chr17 72448896 72449160 + 1.25 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) MER102a|DNA|hAT-Charlie 106217 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 124.75-53 chr12 24632680 24632834 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48589 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 269.75-25 chr17 51206928 51207212 + 1.25 NA intron (NM_017643, intron 6 of 16) intron (NM_017643, intron 6 of 16) 40348 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 198.5-95 chr3 72781452 72781685 + 1.25 NA intron (NM_018130, intron 10 of 10) intron (NM_018130, intron 10 of 10) 66877 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 432.25-6 chr6 129344224 129344760 + 1.25 NA intron (NM_000426, intron 30 of 64) L2|LINE|L2 365685 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 145-110 chr4 69548510 69548688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22585 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 153.75-34 chr12 121997712 121997890 + 1.25 NA intron (NM_144668, intron 19 of 21) AluSq2|SINE|Alu -24083 NM_020993 605 Hs.530970 NM_020993 ENSG00000110987 BCL7A BCL7 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7A protein-coding 174.5-182 chr8 29943512 29943778 + 1.25 NA intron (NR_024473, intron 2 of 2) intron (NR_024473, intron 2 of 2) 13703 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 177.5-102 chr20 113819 114012 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 26243 NM_153325 245938 Hs.380220 NM_153325 ENSG00000178591 DEFB125 DEFB-25 defensin beta 125 protein-coding 295.5-17 chr15 71014718 71015008 + 1.25 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) L1M5|LINE|L1 122420 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 134.25-166 chr6 158801557 158801724 + 1.25 NA intron (NM_003379, intron 1 of 12) intron (NM_003379, intron 1 of 12) -16339 NR_102425 101409257 Hs.571207 NR_102425 ENSG00000233893 EZR-AS1 - EZR antisense RNA 1 ncRNA 268-42 chr4 146700818 146701119 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 62075 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 281.5-52 chr7 91275471 91275798 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11201 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 200-26 chr14 41934719 41935044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 328025 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 182.5-91 chr20 20494944 20495109 + 1.25 NA intron (NM_020343, intron 36 of 39) intron (NM_020343, intron 36 of 39) 126922 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 186.5-96 chr3 186792551 186792747 + 1.25 NA intron (NM_181573, intron 6 of 10) intron (NM_181573, intron 6 of 10) 5036 NR_002588 619568 Hs.743897 NR_002588 ENSG00000263776 SNORA4 ACA4 small nucleolar RNA, H/ACA box 4 snoRNA 124.5-208 chr7 52498307 52498450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -537255 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 160.75-102 chr3 94776466 94776708 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -161676 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 309.75-25 chr3 78823824 78824192 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 195451 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 192-102 chr8 101962365 101962546 + 1.25 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) -21977 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 408.75-4 chr20 54326799 54327434 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 119029 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 186.5-139 chr8 128231034 128231349 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 81075 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 353-25 chr9 30199047 30199471 + 1.25 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 209195 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 248.25-60 chr6 119201878 119202110 + 1.25 NA intron (NM_005907, intron 7 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -52801 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 147.5-20 chr10 43013905 43014137 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 16458 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 164.5-225 chrX 34633634 34633800 + 1.25 NA intron (NM_031442, intron 2 of 2) intron (NM_031442, intron 2 of 2) 23568 NM_031442 83604 Hs.8769 NM_031442 ENSG00000147027 TMEM47 BCMP1|TM4SF10|VAB-9 transmembrane protein 47 protein-coding 232.5-97 chr7 62758256 62758586 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 545635 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 213.75-12 chr10 36594613 36594939 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -531081 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 238.75-24 chr16 3794995 3795237 + 1.25 NA intron (NM_004380, intron 3 of 30) intron (NM_004380, intron 3 of 30) -77592 NM_001272049 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 256-57 chr5 5287793 5288008 + 1.25 NA intron (NM_139056, intron 18 of 22) intron (NM_139056, intron 18 of 22) -134777 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 164-7 chr1 101183216 101183428 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53206 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 172.25-57 chr18 76242307 76242487 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 32887 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 215.5-3 chr1 43854853 43855137 + 1.25 NA intron (NM_001270466, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 16373 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 391-3 chr10 63093054 63093505 + 1.25 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -39968 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 379.75-7 chr2 125717168 125717764 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 400519 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 210.5-75 chr20 49817621 49817917 + 1.25 NA intron (NR_048539, intron 2 of 13) intron (NR_048539, intron 2 of 13) 4941 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 213-5 chr1 66729008 66729415 + 1.25 NA intron (NM_001350218, intron 17 of 22) intron (NM_001350218, intron 17 of 22) -23248 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 239.5-48 chr3 86100660 86100947 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -272753 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 126.25-174 chr6 36800076 36800269 + 1.25 NA intron (NM_020939, intron 3 of 20) intron (NM_020939, intron 3 of 20) 39272 NM_020939 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 199.25-87 chr6 164153783 164153993 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -482404 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 250-65 chr8 136601392 136601846 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 70821 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 153.5-20 chr10 59504258 59504462 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -141179 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 210-25 chr13 98627668 98628006 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 50582 NR_046542 100874069 Hs.594160 NR_046542 STK24-AS1 - STK24 antisense RNA 1 ncRNA 251.75-70 chr6 151418151 151418388 + 1.25 NA intron (NM_001271937, intron 8 of 10) AluJo|SINE|Alu -26710 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 212.25-23 chr12 114559536 114559764 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 124525 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 394-5 chr16 73033263 73033777 + 1.25 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) intron (NM_006885, intron 1 of 9) 14608 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 181.5-78 chr2 78329338 78329502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38689 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 166.75-26 chr11 85593564 85593761 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 33608 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 210.25-60 chr4 102446547 102446750 + 1.25 NA intron (NR_136202, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR -54711 NM_003998 4790 Hs.618430 NM_003998 ENSG00000109320 NFKB1 CVID12|EBP-1|KBF1|NF-kB1|NF-kappa-B1|NF-kappaB|NFKB-p105|NFKB-p50|NFkappaB|p105|p50 nuclear factor kappa B subunit 1 protein-coding 193.5-77 chr19 52030412 52030631 + 1.25 NA TTS (NM_014650) TTS (NM_014650) -2142 NM_025040 80110 Hs.292336 NM_025040 ENSG00000142556 ZNF614 - zinc finger protein 614 protein-coding 138-78 chr2 64903795 64903970 + 1.25 NA non-coding (NR_036586, exon 3 of 3) non-coding (NR_036586, exon 3 of 3) 28565 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 115.25-130 chr3 37472672 37472824 + 1.25 NA intron (NM_002207, intron 2 of 27) intron (NM_002207, intron 2 of 27) 20607 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 232.75-13 chr11 98674685 98674940 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -346137 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 607.75 chr12 11754597 11755583 + 1.25 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) (TGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 105236 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 297.5-6 chr10 15450022 15450429 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -78936 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 220.5-66 chr20 54403863 54404063 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -71630 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 295.25-9 chr17 70603460 70603962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 434176 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 167-95 chr5 125747077 125747260 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 253907 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 218-34 chr2 73555570 73555785 + 1.25 NA intron (NM_015120, intron 13 of 22) L1ME3C|LINE|L1 86745 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 126.75-222 chr7 12672610 12672853 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14096 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 332.5-6 chr14 71446562 71446855 + 1.25 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) L1ME4a|LINE|L1 7769 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 179-96 chrX 34442271 34442430 + 1.25 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 214935 NM_031442 83604 Hs.8769 NM_031442 ENSG00000147027 TMEM47 BCMP1|TM4SF10|VAB-9 transmembrane protein 47 protein-coding 131-187 chrX 45631694 45631842 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -99320 NR_102268 392452 Hs.745266 NR_102268 LOC392452 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 216.5-129 chr9 70195220 70195635 + 1.25 NA intron (NM_153267, intron 11 of 13) intron (NM_153267, intron 11 of 13) -19539 NR_040076 100507244 Hs.556816 NR_040076 ENSG00000204706 MAMDC2-AS1 - MAMDC2 antisense RNA 1 ncRNA 361-5 chr11 24289141 24289535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -207715 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 275.25-8 chr10 107430112 107430369 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -265534 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 341.5-22 chr3 196722468 196722875 + 1.25 NA intron (NM_017861, intron 3 of 5) intron (NM_017861, intron 3 of 5) 10294 NM_017861 54965 Hs.223296 NM_017861 ENSG00000163964 PIGX PIG-X phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class X protein-coding 303.5-54 chrX 63669536 63670024 + 1.25 NA TTS (NR_138419) TTS (NR_138419) 1722 NR_138419 100874355 Hs.671524 NR_138419 ENSG00000231729 ARHGEF9-IT1 - ARHGEF9 intronic transcript 1 ncRNA 206.75-84 chr7 42818524 42818877 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 93143 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 290.5-26 chr22 19394922 19395241 + 1.25 NA intron (NM_003325, intron 7 of 24) intron (NM_003325, intron 7 of 24) 36652 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 255.5-26 chr14 66321317 66321721 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -164852 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 312-33 chr9 71340430 71340686 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 106413 NM_001366143 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 149-60 chr2 108850898 108851181 + 1.25 NA intron (NM_001351549, intron 12 of 13) MER21A|LTR|ERVL 64268 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 159.5-201 chr8 29606197 29606393 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 141814 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 207.5-14 chr11 102147949 102148210 + 1.25 NA intron (NM_001130145, intron 2 of 8) intron (NM_001130145, intron 2 of 8) 35631 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 161.25-45 chr14 31381076 31381548 + 1.25 NA intron (NM_015473, intron 10 of 35) intron (NM_015473, intron 10 of 35) 39238 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 178.25-84 chr3 48218666 48219094 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4615 NM_004345 820 Hs.51120 NM_004345 ENSG00000164047 CAMP CAP-18|CAP18|CRAMP|FALL-39|FALL39|HSD26|LL37 cathelicidin antimicrobial peptide protein-coding 238.25-87 chr8 131194734 131194945 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -153930 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 160.25-70 chr2 51492378 51492665 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) L2b|LINE|L2 459920 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 181.5-81 chr2 90074752 90074944 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -436941 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 290.25-9 chr12 40522510 40522926 + 1.25 NA intron (NM_173600, intron 102 of 173) intron (NM_173600, intron 102 of 173) 129324 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 223-88 chr9 83798465 83798717 + 1.25 NA intron (NM_025211, intron 4 of 12) AluJo|SINE|Alu 19178 NM_025211 80318 Hs.522255 NM_025211 ENSG00000165113 GKAP1 FKSG21|GKAP42 G kinase anchoring protein 1 protein-coding 220-29 chr19 42008660 42008935 + 1.25 NA intron (NM_002088, intron 14 of 18) L1MEc|LINE|L1 -14567 NM_152296 478 Hs.515427 NM_152296 ENSG00000105409 ATP1A3 AHC2|ATP1A1|CAPOS|DYT12|RDP ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3 protein-coding 186.5-79 chr20 49687071 49687384 + 1.25 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) MER20|DNA|hAT-Charlie 26651 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 124-17 chr10 65265836 65266031 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -305492 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 329-32 chr5 124958012 124958511 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -78570 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 231-47 chr22 31357640 31357965 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 11043 NR_120386 54944 Hs.648259 NM_017834 LINC01521 - long intergenic non-protein coding RNA 1521 ncRNA 200.75-61 chr2 216128924 216129185 + 1.25 NA intron (NM_021141, intron 8 of 20) L2|LINE|L2 19706 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 280.5-60 chrX 40633756 40634082 + 1.25 NA intron (NM_144970, intron 5 of 6) intron (NM_144970, intron 5 of 6) 10353 NM_001195522 347411 Hs.128084 NM_001195522 ENSG00000238205 MPC1L SLC54A3 mitochondrial pyruvate carrier 1 like protein-coding 185-87 chr8 108247247 108247477 + 1.25 NA intron (NM_001568, intron 1 of 12) intron (NM_001568, intron 1 of 12) 1355 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 215-77 chr8 134941004 134941363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 91248 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 358-7 chr2 99714432 99714846 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 10 of 23) intron (NM_001025108, intron 10 of 23) -224622 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 323-19 chr5 4951183 4951657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82939 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 209.5-128 chr5 140910254 140910462 + 1.25 NA intron (NM_018904, intron 1 of 3) HERVL-int|LTR|ERVL -16359 NM_031882 56135 Hs.199343 NM_018898 ENSG00000248383 PCDHAC1 PCDH-ALPHA-C1 protocadherin alpha subfamily C, 1 protein-coding 214.25-7 chr1 180767270 180767569 + 1.25 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) intron (NR_137330, intron 2 of 12) 135397 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 163.5-103 chr2 187818971 187819212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -264586 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 396.25-3 chr11 54775255 54775769 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 68680 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 279.25-42 chr9 75981864 75982150 + 1.25 NA intron (NR_120409, intron 2 of 19) L1ME4b|LINE|L1 91334 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 290.25-27 chr5 131450191 131450470 + 1.25 NA intron (NM_001164388, intron 21 of 27) intron (NM_001164388, intron 21 of 27) 184899 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 245.5-43 chr21 16502773 16503040 + 1.25 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) intron (NR_136546, intron 2 of 2) -32666 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 232.5-113 chrX 14551895 14552273 + 1.25 NA intron (NM_001118886, intron 2 of 8) intron (NM_001118886, intron 2 of 8) 22548 NM_002063 2742 Hs.2700 NM_002063 ENSG00000101958 GLRA2 GLR glycine receptor alpha 2 protein-coding 240-30 chr2 191068873 191069114 + 1.25 NA intron (NM_003151, intron 6 of 23) L1ME4a|LINE|L1 47467 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 144.25-92 chr2 41597687 41597837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -279793 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 170.5-141 chr5 19403890 19404327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 482164 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 372.25-9 chr4 70152703 70153132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1320 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 355.75-18 chr8 60946330 60946806 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21180 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 116.25-66 chr14 53387187 53387339 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 233909 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 153.5-176 chr7 7562372 7562659 + 1.25 NA intron (NR_110084, intron 2 of 4) intron (NR_110084, intron 2 of 4) 3550 NR_110084 101927391 Hs.223837 NR_110084 LOC101927391 - uncharacterized LOC101927391 ncRNA 124.25-78 chr17 50851885 50852083 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14370 NM_001243885 10140 Hs.703321 NM_005749 ENSG00000141232 TOB1 APRO5|APRO6|PIG49|TOB|TROB|TROB1 transducer of ERBB2, 1 protein-coding 149-141 chr9 91396665 91396910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27045 NM_005384 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 244-55 chr7 41391875 41392277 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 290472 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 248-56 chr4 138086148 138086504 + 1.25 NA intron (NR_037866, intron 7 of 10) intron (NR_037866, intron 7 of 10) -2688 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 256.25-17 chr18 1570486 1570891 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -211059 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 200.25-101 chr7 79489057 79489329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35233 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 366.75-11 chr22 30847728 30848083 + 1.25 NA intron (NM_001282741, intron 1 of 12) L1MB8|LINE|L1 25389 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 120-187 chr8 79771486 79771590 + 1.25 NA intron (NR_110954, intron 5 of 5) intron (NR_110954, intron 5 of 5) 3396 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 262.25-12 chr12 94810835 94811173 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -23394 NR_030171 574449 NR_030171 ENSG00000283998 MIR492 MIRN492|hsa-mir-492 microRNA 492 ncRNA 429.75-3 chr2 8732038 8732586 + 1.25 NA intron (NM_001348732, intron 28 of 28) FLAM_A|SINE|Alu 50256 NM_002166 3398 Hs.180919 NM_002166 ENSG00000115738 ID2 GIG8|ID2A|ID2H|bHLHb26 inhibitor of DNA binding 2 protein-coding 365.75-18 chr8 124297581 124298063 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -50424 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 121.75-171 chr7 16544915 16545125 + 1.25 NA intron (NM_001195280, intron 3 of 8) intron (NM_001195280, intron 3 of 8) 18195 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 141.25-87 chr2 136538242 136538409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -227220 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 187-76 chr5 14823282 14823588 + 1.25 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) (TACAATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2577 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 223-30 chr16 71572821 71573149 + 1.25 NA TTS (NR_103852) TTS (NR_103852) 4107 NM_000353 6898 Hs.161640 NM_000353 ENSG00000198650 TAT - tyrosine aminotransferase protein-coding 376-7 chr16 56507393 56507766 + 1.25 NA intron (NM_031885, intron 5 of 16) intron (NM_031885, intron 5 of 16) 12445 NM_031885 583 Hs.333738 NM_031885 ENSG00000125124 BBS2 BBS|RP74 Bardet-Biedl syndrome 2 protein-coding 280-52 chr6 63291882 63292227 + 1.25 NA intron (NM_001143940, intron 2 of 4) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 27923 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 240.75-10 chr10 75005401 75005635 + 1.25 NA intron (NM_001370144, intron 11 of 15) intron (NM_001370144, intron 11 of 15) -16215 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 248-43 chr21 29488617 29488990 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -7244 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 233.75-18 chr12 53010780 53011076 + 1.25 NA intron (NM_001330654, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 4472 NM_001417 1975 Hs.648394 NM_001417 ENSG00000063046 EIF4B EIF-4B|PRO1843 eukaryotic translation initiation factor 4B protein-coding 181.25-2 chr1 45634171 45634441 + 1.25 NA intron (NM_021639, intron 8 of 12) intron (NM_021639, intron 8 of 12) -10252 NM_001114938 149483 Hs.18912 NM_152500 ENSG00000159588 CCDC17 - coiled-coil domain containing 17 protein-coding 201.25-89 chr7 77735806 77735974 + 1.25 NA intron (NM_198467, intron 1 of 7) intron (NM_198467, intron 1 of 7) -38545 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 438-4 chr4 143195516 143195945 + 1.25 NA exon (NM_001290325, exon 3 of 9) exon (NM_001290325, exon 3 of 9) 10813 NM_032557 84640 Hs.480848 NM_032557 ENSG00000170185 USP38 HP43.8KD ubiquitin specific peptidase 38 protein-coding 195-82 chr7 93056029 93056364 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 61783 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 222.75-23 chr10 83110679 83110921 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 566289 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 399.5-10 chrX 50960435 50960816 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 49890 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 243.75-13 chr11 43815636 43815984 + 1.25 NA intron (NM_016142, intron 5 of 10) intron (NM_016142, intron 5 of 10) -65021 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 208.25-51 chr2 237436523 237436971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22540 NM_057167 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 117.75-125 chr21 24144320 24144500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 176967 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 236.5-48 chr2 72365210 72365629 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) L1MEc|LINE|L1 -217557 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 119-138 chr4 130236526 130236676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -139760 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 175.25-126 chr6 101172977 101173245 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -225874 NM_175768 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 227-4 chr1 155473172 155473471 + 1.25 NA intron (NM_018489, intron 3 of 27) intron (NM_018489, intron 3 of 27) 40141 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 212.5-14 chr10 112560410 112560750 + 1.25 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) -73590 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 203.25-35 chr14 55868080 55868282 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -71507 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 196.75-64 chr2 186123334 186123591 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -37145 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 313.75-11 chr2 28002409 28002767 + 1.25 NA intron (NM_199193, intron 5 of 13) L1MEg|LINE|L1 6221 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 201.75-46 chr2 72450635 72450886 + 1.25 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -302898 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 155-51 chr17 62883350 62883583 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60749 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 193.75-129 chr9 105376529 105376836 + 1.25 NA intron (NM_001330731, intron 13 of 15) intron (NM_001330731, intron 13 of 15) -71352 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 247.75-39 chr3 162654920 162655251 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 648216 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 145-79 chr2 159571543 159571715 + 1.25 NA intron (NM_001329857, intron 1 of 36) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -43665 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 279.25-24 chr20 36633933 36634329 + 1.25 NA intron (NM_175077, intron 3 of 7) AluSq2|SINE|Alu 12065 NM_175077 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 240.5-74 chr4 53245373 53245633 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) L1PREC2|LINE|L1 120558 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 279.75-37 chr4 84633772 84634066 + 1.25 NA exon (NM_001263, exon 7 of 13) exon (NM_001263, exon 7 of 13) 50792 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 359.5-10 chr7 23624734 23625137 + 1.25 NA intron (NM_138771, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 27553 NM_138771 90693 Hs.232296 NM_138771 ENSG00000169193 CCDC126 - coiled-coil domain containing 126 protein-coding 303.75-37 chrX 75009161 75009505 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -83881 NM_001008537 340533 Hs.124128 NM_001008537 ENSG00000050030 NEXMIF KIAA2022|KIDLIA|MRX98|XPN neurite extension and migration factor protein-coding 146.5-194 chr6 155386349 155386510 + 1.25 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 69410 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 277-5 chr11 112626070 112626362 + 1.25 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -70414 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 193.5-76 chr19 18920694 18920871 + 1.25 NA intron (NM_019070, intron 2 of 12) MIRc|SINE|MIR 1067 NR_033677 54555 Hs.143187 NM_019070 ENSG00000105671 DDX49 Dbp8|R27090_2 DEAD-box helicase 49 protein-coding 259.75-56 chr8 131209125 131209423 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -168365 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 326-13 chr2 39906785 39907134 + 1.25 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -10675 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 223.5-3 chr1 37464965 37465347 + 1.25 NA intron (NR_038842, intron 1 of 2) MIR1_Amn|SINE|MIR 9287 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 137.5-194 chr5 94726011 94726186 + 1.25 NA intron (NM_001297777, intron 16 of 19) MIRc|SINE|MIR 107429 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 175-133 chr9 37653381 37653672 + 1.25 NA intron (NM_014907, intron 1 of 15) intron (NM_014907, intron 1 of 15) 2572 NM_014907 22844 Hs.163990 NM_014907 ENSG00000070601 FRMPD1 FRMD2 FERM and PDZ domain containing 1 protein-coding 192.25-42 chr2 6497655 6497827 + 1.25 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -122319 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 136.5-140 chr22 32450378 32450566 + 1.25 NA intron (NM_174932, intron 2 of 14) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 6914 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 166.75-9 chr1 231514047 231514189 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14535 NR_028397 100303453 Hs.13318 NR_028393 ENSG00000270106 TSNAX-DISC1 - TSNAX-DISC1 readthrough (NMD candidate) ncRNA 151.75-8 chr1 115611134 115611412 + 1.25 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -30697 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 235.25-39 chr20 34277608 34277965 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17421 NM_001672 434 Hs.659995 NM_001672 ENSG00000101440 ASIP AGSW|AGTI|AGTIL|ASP|SHEP9 agouti signaling protein protein-coding 418.5-8 chr20 51557345 51557935 + 1.25 NA intron (NM_001258292, intron 1 of 9) intron (NM_001258292, intron 1 of 9) 5199 NM_001136021 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 245.25-57 chr5 96228257 96228505 + 1.25 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 149243 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 149.25-45 chr14 48510565 48510701 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -715619 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 309-11 chr12 32769150 32769561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13458 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 229.5-44 chr15 61416819 61417159 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -187687 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 134-134 chr4 81923945 81924160 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 449939 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 276.5-58 chr6 49014035 49014442 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 449015 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 203.75-10 chr10 56925800 56926058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 378630 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 204-21 chr15 88778920 88779182 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -24385 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 125.25-34 chr11 12402243 12402422 + 1.25 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) LTR33|LTR|ERVL 24761 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 384.5-8 chr17 11643984 11644433 + 1.25 NA intron (NM_001372, intron 10 of 68) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 45738 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 335-9 chr17 80375049 80375406 + 1.25 NA intron (NM_001256071, intron 50 of 67) intron (NM_001256071, intron 50 of 67) -39940 NM_001352761 284131 Hs.389678 NM_173627 ENSG00000173818 ENDOV - endonuclease V protein-coding 260-19 chr2 231898444 231898713 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6280 NR_031717 100302126 NR_031717 ENSG00000222246 MIR1471 MIRN1471|hsa-mir-1471 microRNA 1471 ncRNA 330.5-12 chr15 94295299 94295728 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2688 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 188.5-160 chr8 129666613 129667004 + 1.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 13431 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 154.75-154 chr9 31521188 31521338 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -139773 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 137.5-244 chrM 1638 1834 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_137295) promoter-TSS (NR_137295) 65 NR_137295 148.5-173 chr4 88976023 88976232 + 1.25 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) intron (NM_014883, intron 4 of 23) 81058 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 180.5-166 chr9 118702900 118703133 + 1.25 NA intron (NR_151725, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 23345 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 220-57 chr7 33573717 33573978 + 1.25 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -331068 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 222-79 chr8 88839745 88840103 + 1.25 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR -512441 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 213.75-16 chr10 91015744 91016005 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -17292 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 192-76 chr3 179890505 179890767 + 1.25 NA intron (NM_001256753, intron 1 of 12) intron (NM_001256753, intron 1 of 12) -7558 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 154-92 chr3 81031714 81031931 + 1.25 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 37954 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 217.5-52 chr17 68440041 68440221 + 1.25 NA intron (NM_001320772, intron 3 of 11) intron (NM_001320772, intron 3 of 11) -15583 NR_030365 693220 NR_030365 ENSG00000207561 MIR635 MIRN635|hsa-mir-635 microRNA 635 ncRNA 196-52 chr2 119080158 119080405 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 78470 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 238.25-93 chr9 131433012 131433392 + 1.25 NA intron (NM_013318, intron 2 of 30) intron (NM_013318, intron 2 of 30) 3112 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 216-16 chr14 70413220 70413473 + 1.25 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 3744 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 176.25-55 chr18 49150800 49151221 + 1.25 NA intron (NM_001353210, intron 14 of 16) intron (NM_001353210, intron 14 of 16) -101242 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 165.75-127 chr4 158623787 158623940 + 1.25 NA intron (NM_001253733, intron 10 of 17) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 48024 NM_001008393 201725 Hs.380920 NM_001008393 ENSG00000205208 C4orf46 RCDG1 chromosome 4 open reading frame 46 protein-coding 289.25-17 chr20 9085124 9085459 + 1.25 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) intron (NM_001172646, intron 1 of 37) 16237 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 249-42 chr6 87186979 87187200 + 1.25 NA intron (NM_015021, intron 1 of 7) intron (NM_015021, intron 1 of 7) 31524 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 127.25-195 chr7 74687802 74687988 + 1.25 NA intron (NM_001163636, intron 1 of 33) intron (NM_001163636, intron 1 of 33) 30177 NM_001518 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 198.25-91 chr7 19214883 19215086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69563 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 144.5-231 chr9 27451407 27451617 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -72802 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 142-55 chr15 75590571 75590746 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11343 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 208.5-30 chr12 33139230 33139563 + 1.25 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -242550 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 167.25-30 chr12 127277838 127278114 + 1.25 NA intron (NR_146537, intron 2 of 3) intron (NR_146537, intron 2 of 3) 6307 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 148.25-121 chr5 63952326 63952556 + 1.25 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 9851 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 292.25-6 chr1 107470767 107471182 + 1.25 NA intron (NM_001113226, intron 6 of 6) intron (NM_001113226, intron 6 of 6) 217525 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 406.75-8 chr2 198629042 198629394 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -254121 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 162.75-24 chr12 14541416 14541646 + 1.25 NA intron (NM_024829, intron 3 of 10) intron (NM_024829, intron 3 of 10) -26201 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 303.25-19 chr3 83056473 83057159 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1070674 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 154.75-59 chr17 81030359 81030572 + 1.25 NA non-coding (NR_026857, exon 2 of 2) non-coding (NR_026857, exon 2 of 2) 4254 NR_026857 440465 Hs.448889 NM_001004336 ENSG00000226137 BAIAP2-DT BAIAP2-AS1|lnc-BAIAP2 BAIAP2 divergent transcript ncRNA 233-32 chr2 99876154 99876444 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) L2b|LINE|L2 229284 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 218.75-21 chr13 33546922 33547126 + 1.25 NA intron (NM_001243476, intron 3 of 17) intron (NM_001243476, intron 3 of 17) 129770 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 384-18 chr7 42958606 42959249 + 1.25 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 26551 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 318.25-4 chr11 39787891 39788417 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 504976 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 218.5-77 chr3 118435825 118436058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -205827 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 349.25-15 chr5 33286115 33286547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56596 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 198.75-71 chr4 156776985 156777243 + 1.25 NA intron (NM_016205, intron 3 of 5) intron (NM_016205, intron 3 of 5) 194685 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 203.25-17 chr11 4524356 4524688 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -20669 NM_001004137 119772 Hs.553567 NM_001004137 ENSG00000197790 OR52M1 OR11-11|OR52M1P|OR52M3P olfactory receptor family 52 subfamily M member 1 protein-coding 236.75 chr1 34908774 34909049 + 1.25 NA intron (NM_001080418, intron 1 of 11) intron (NM_001080418, intron 1 of 11) 20739 NM_001080418 58512 Hs.436393 NM_001080418 ENSG00000116544 DLGAP3 DAP3|SAPAP3 DLG associated protein 3 protein-coding 145-40 chr12 112649365 112649568 + 1.25 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) MIR3|SINE|MIR 45710 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 203-81 chr5 50161365 50161583 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 279814 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 263-3 chr1 89131732 89132078 + 1.25 NA 3' UTR (NM_207398, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_207398, exon 11 of 11) -5791 NM_004120 2634 Hs.386567 NM_004120 ENSG00000162645 GBP2 - guanylate binding protein 2 protein-coding 122-82 chr19 56299033 56299260 + 1.25 NA intron (NM_001354658, intron 8 of 10) AluJr|SINE|Alu 15418 NM_001322067 79149 Hs.177688 NM_024303 ENSG00000131848 ZSCAN5A ZNF495|ZSCAN5 zinc finger and SCAN domain containing 5A protein-coding 246.25-51 chr5 26804372 26804679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 234061 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 143.25-148 chr5 148100954 148101315 + 1.25 NA intron (NM_006846, intron 13 of 32) MIR|SINE|MIR 37154 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 388.75-2 chr12 6578424 6578919 + 1.25 NA intron (NM_001273, intron 34 of 39) intron (NM_001273, intron 34 of 39) 2938 NR_003012 677780 Hs.689692 NR_003012 ENSG00000251898 SCARNA11 ACA57 small Cajal body-specific RNA 11 ncRNA 220.75-66 chr7 42752952 42753214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46636 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 129-113 chr22 20134284 20134505 + 1.25 NA intron (NM_001185024, intron 1 of 10) intron (NM_001185024, intron 1 of 10) 2590 NM_013373 29801 Hs.63128 NM_013373 ENSG00000099904 ZDHHC8 DHHC8|ZDHHCL1|ZNF378 zinc finger DHHC-type containing 8 protein-coding 264-55 chr6 41031010 41031282 + 1.25 NA intron (NM_173561, intron 6 of 8) intron (NM_173561, intron 6 of 8) -7866 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 179-15 chr10 57263490 57263801 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40914 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 161.75-141 chrX 153639186 153639408 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3144 NM_001395 1852 Hs.144879 NM_001395 ENSG00000130829 DUSP9 MKP-4|MKP4 dual specificity phosphatase 9 protein-coding 194.25-54 chr2 47152742 47153035 + 1.25 NA intron (NM_001163561, intron 2 of 6) intron (NM_001163561, intron 2 of 6) 2420 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 287.5-16 chr13 23011884 23012229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95687 NR_138043 100996930 Hs.380803 NR_138043 LINC00621 - long intergenic non-protein coding RNA 621 ncRNA 186.75-121 chr9 114713377 114713589 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31394 NR_133056 100505478 Hs.200101 NM_001199233 ENSG00000230601 TEX48 - testis expressed 48 protein-coding 375.25-2 chr14 50132710 50133384 + 1.25 NA intron (NM_006939, intron 19 of 22) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -16475 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 204.25-58 chr2 101637159 101637397 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60425 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 120.25-121 chr22 25671757 25671912 + 1.25 NA intron (NM_001362778, intron 5 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie -70354 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 167.25-63 chr17 58998867 58999103 + 1.25 NA non-coding (NR_148347, exon 23 of 23) non-coding (NR_148347, exon 23 of 23) 107895 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 126.5-27 chr10 67519375 67519519 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -116037 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 200.75-85 chr5 68446983 68447229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154529 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 224.5-10 chr10 17236952 17237171 + 1.25 NA intron (NM_003380, intron 9 of 9) intron (NM_003380, intron 9 of 9) -7076 NR_108061 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 189.75-52 chr18 21562467 21562790 + 1.25 NA intron (NM_052911, intron 7 of 11) AluJb|SINE|Alu 38076 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 218.25-77 chr6 21163329 21163728 + 1.25 NA intron (NM_017774, intron 13 of 15) intron (NM_017774, intron 13 of 15) 348364 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 147.75-173 chrX 100012885 100013111 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 397275 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 116.25-173 chr5 24541525 24541688 + 1.25 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) intron (NM_001362460, intron 2 of 9) 103372 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 326-8 chr14 36050872 36051386 + 1.25 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -19298 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 206.75-87 chr7 96082612 96082928 + 1.25 NA intron (NM_001278422, intron 15 of 15) intron (NM_001278422, intron 15 of 15) 136986 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 232.25-58 chr4 185348102 185348386 + 1.25 NA intron (NM_001317781, intron 13 of 18) intron (NM_001317781, intron 13 of 18) 30754 NM_018409 55805 Hs.558513 NM_018409 ENSG00000109771 LRP2BP - LRP2 binding protein protein-coding 272.25-62 chr8 118978201 118978439 + 1.25 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 26057 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 206.25-21 chr10 96709872 96710265 + 1.25 NA intron (NM_152309, intron 1 of 16) intron (NM_152309, intron 1 of 16) 10446 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 158.25-97 chr3 197025144 197025388 + 1.25 NA intron (NM_005929, intron 3 of 15) MamGypLTR1c|LTR|Gypsy 4551 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 269-9 chr10 100209701 100209936 + 1.25 NA intron (NM_001278, intron 9 of 20) intron (NM_001278, intron 9 of 20) 19778 NM_001278 1147 Hs.198998 NM_001278 ENSG00000213341 CHUK IKBKA|IKK-alpha|IKK1|IKKA|NFKBIKA|TCF16 component of inhibitor of nuclear factor kappa B kinase complex protein-coding 120.5-219 chr7 116653048 116653159 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -19093 NM_001324401 4233 Hs.132966 NM_000245 ENSG00000105976 MET AUTS9|DFNB97|HGFR|RCCP2|c-Met MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 214-33 chr2 148754295 148754551 + 1.25 NA intron (NM_015630, intron 4 of 13) intron (NM_015630, intron 4 of 13) 109672 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 347-4 chr11 29610111 29610458 + 1.25 NA intron (NR_149107, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR -8518 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 260.75-59 chr7 37242437 37242752 + 1.25 NA intron (NM_001206480, intron 7 of 21) L1MEf|LINE|L1 111074 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 301.75-22 chr21 18920145 18920626 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160573 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 156-48 chr14 63704893 63705258 + 1.25 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 AluSz|SINE|Alu 22990 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 210.5-115 chr6 148864563 148864884 + 1.25 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 99961 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 165.5-179 chr7 44946069 44946250 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 32856 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 133.75-210 chrX 74622714 74622962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8214 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 219.5-123 chr7 56571639 56571972 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -33675 NR_108099 101928401 Hs.385614 NR_108099 ENSG00000233288 LOC101928401 - uncharacterized LOC101928401 ncRNA 180.5-159 chr8 128301591 128301747 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 151553 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 272-13 chr17_GL000205v2_random 16433 16723 + 1.25 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 41388 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 203.75-57 chr2 59442637 59442916 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 225068 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 190-2 chr1 32557856 32558025 + 1.25 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) MamRep605|LTR?|LTR? 18513 NM_001040441 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 176.5-120 chr3 81587864 81588118 + 1.25 NA intron (NM_000158, intron 9 of 15) intron (NM_000158, intron 9 of 15) 173654 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 201.75-53 chr20 12268329 12268663 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 350603 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 259.75-42 chr5 121448775 121449068 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 126371 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 218.25-75 chr5 128884760 128884986 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80254 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 270.75-48 chr7 55072762 55073101 + 1.25 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) -36908 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 205-64 chr5 147830974 147831169 + 1.25 NA intron (NM_001354966, intron 2 of 4) L1MD|LINE|L1 8160 NM_001354966 6690 Hs.407856 NM_003122 ENSG00000164266 SPINK1 PCTT|PSTI|Spink3|TATI|TCP serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 protein-coding 217.25-18 chr11 35906127 35906393 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37721 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 219.25-74 chr7 89549082 89549287 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -570216 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 213.75-72 chr4 32288955 32289323 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61899 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 173.75-77 chr18 12712854 12713094 + 1.25 NA intron (NM_147163, intron 3 of 6) intron (NM_147163, intron 3 of 6) 9932 NM_020232 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 173.5-138 chr6 17789114 17789314 + 1.25 NA intron (NM_001105567, intron 25 of 36) intron (NM_001105567, intron 25 of 36) 82171 NR_134618 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 148-92 chr4 90667063 90667350 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 6 of 7) MIR|SINE|MIR 432175 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 197-39 chr22 35003356 35003580 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5552 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 265.75-62 chr6 109354730 109355004 + 1.25 NA TTS (NR_152435) TTS (NR_152435) 26872 NM_001346500 8763 Hs.520313 NM_006016 ENSG00000135535 CD164 DFNA66|MGC-24|MGC-24v|MUC-24|endolyn CD164 molecule protein-coding 223-13 chr11 98750955 98751159 + 1.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -269892 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 202.25-23 chr14 52904803 52905028 + 1.25 NA intron (NM_006832, intron 3 of 14) AluSz|SINE|Alu 46135 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 243-23 chr15 44437894 44438100 + 1.25 NA intron (NM_016396, intron 1 of 12) AluY|SINE|Alu 10368 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 245-17 chr15 65515803 65516016 + 1.25 NA intron (NM_001320875, intron 1 of 20) intron (NM_001320875, intron 1 of 20) 1365 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 214-28 chr18 73552735 73552934 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 227893 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 230-74 chr9 82615147 82615465 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 447836 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 387.25-11 chr8 26669928 26670300 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 91709 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 256-56 chr4 123446823 123447262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47502 NM_005841 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 177.75-10 chr1 118493756 118494027 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -308663 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 194-62 chr4 45271952 45272245 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -545464 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 511.5-4 chr2 62172064 62172757 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -23705 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 211.25-83 chr7 62586145 62586363 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 717802 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 178.5-171 chr7 80742677 80742841 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001350120, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001350120, exon 18 of 18) 96106 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 231.25-74 chr8 122642318 122642635 + 1.25 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 51630 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 263.5-39 chr3 85884046 85884374 + 1.25 NA intron (NM_001256502, intron 4 of 10) intron (NM_001256502, intron 4 of 10) -56160 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 195.25-2 chr1 39350122 39350334 + 1.25 NA intron (NM_012090, intron 36 of 92) L2c|LINE|L2 -58845 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 270.5-22 chr16 62728288 62728663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -692037 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 134.5-227 chr8 114619624 114619973 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1048215 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 196.75-84 chr4 168283336 168283710 + 1.25 NA exon (NM_017631, exon 13 of 38) exon (NM_017631, exon 13 of 38) 35229 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 141.25-36 chr12 25686010 25686175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37514 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 180.5-31 chr13 69558329 69558594 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 336115 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 113.5-210 chr6 63869918 63870046 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 63146 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 251-25 chr16 82611414 82611866 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -15329 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 114-49 chr15 46122354 46122485 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 417224 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 146.5-31 chr10 65739039 65739269 + 1.25 NA intron (NR_120647, intron 5 of 5) intron (NR_120647, intron 5 of 5) 167729 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 384.5-11 chr3 172467589 172467922 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19299 NM_198407 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 180-17 chr11 80753674 80753886 + 1.25 NA intron (NR_120570, intron 2 of 2) intron (NR_120570, intron 2 of 2) 9023 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 189-37 chr14 65164500 65164795 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57700 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 292.5-40 chr5 4450083 4450539 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -323170 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 263.75-17 chr15 54656559 54656897 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -400019 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 244.5-22 chr12 37627575 37627896 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -689039 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 137.5-76 chr15 69014225 69014440 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001184779) promoter-TSS (NM_001184779) -363 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 190-89 chr9 100069765 100070106 + 1.25 NA intron (NM_015051, intron 1 of 11) intron (NM_015051, intron 1 of 11) 29065 NM_015051 23071 Hs.154023 NM_015051 ENSG00000023318 ERP44 PDIA10|TXNDC4 endoplasmic reticulum protein 44 protein-coding 233.75-29 chr15 66732644 66732863 + 1.25 NA intron (NR_027654, intron 4 of 4) L1MC3|LINE|L1 30517 NM_005585 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 288-20 chr14 41033521 41033838 + 1.25 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 78968 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 207.25-47 chr2 155111257 155111517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 412692 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 274.25-21 chr14 75016029 75016460 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001040108, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001040108, exon 13 of 13) 13323 NM_014239 8892 Hs.409137 NM_014239 ENSG00000119718 EIF2B2 EIF-2Bbeta|EIF2B eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta protein-coding 173.25-85 chr4 38887668 38887823 + 1.25 NA intron (NM_001350635, intron 2 of 8) MamRep1151|LTR?|LTR? 19713 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 233.25-68 chr8 77008022 77008347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7140 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 164.25-153 chr8 98824311 98824539 + 1.25 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) 1246 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 137.75-181 chr6 118393504 118393677 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -107783 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 240.25-22 chr14 56547469 56547784 + 1.25 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) -32172 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 178.5-103 chr3 24030636 24030798 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72530 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 212-27 chr15 64004248 64004635 + 1.25 NA intron (NM_014326, intron 2 of 11) intron (NM_014326, intron 2 of 11) 42044 NM_001363730 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 187.75-78 chr4 57932749 57932936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 506970 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 240.75-67 chr7 3515960 3516193 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 214824 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 526.25 chr11 9759490 9760173 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_033972) promoter-TSS (NR_033972) -298 NR_033972 440028 Hs.677541 NR_033972 ENSG00000245522 LINC02709 - long intergenic non-protein coding RNA 2709 ncRNA 276.25-10 chr13 83747981 83748368 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 134219 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 171.5-34 chr12 20739671 20739960 + 1.25 NA intron (NM_017435, intron 11 of 14) L2a|LINE|L2 44350 NM_001145944 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 196.75-101 chr7 68573557 68573811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 553431 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 469-3 chr8 85341904 85342392 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001164830) promoter-TSS (NM_001164830) -434 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 347.5-7 chr13 89078153 89078573 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -156928 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 272-7 chr11 88511036 88511347 + 1.25 NA intron (NM_000842, intron 8 of 8) intron (NM_000842, intron 8 of 8) 6615 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 204.25-82 chr4 104138851 104139096 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -351992 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 176.75-15 chr10 33191341 33191622 + 1.25 NA intron (NM_001244972, intron 13 of 16) intron (NM_001244972, intron 13 of 16) -74674 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 205.5-76 chr2 135371583 135371959 + 1.25 NA intron (NM_001286569, intron 3 of 21) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 158814 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 233.75-6 chr1 237478298 237478614 + 1.25 NA intron (NM_001035, intron 17 of 104) intron (NM_001035, intron 17 of 104) 7337 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 234-46 chr4 53773464 53773702 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77682 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 128.25-8 chr1 118459212 118459391 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -274073 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 156.25-116 chr5 29350461 29350718 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 45387 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 362.25-12 chr6 54870728 54871212 + 1.25 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) intron (NM_001010872, intron 2 of 4) 24199 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 234.5-101 chr8 128192137 128192411 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42158 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 185-69 chr5 74184365 74184622 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 123832 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 355.25-3 chr13 106856877 106857246 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203181 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 235-68 chr7 44986773 44987038 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_152597) promoter-TSS (NR_152597) -209 NR_152596 285958 Hs.25892 NR_003697 ENSG00000232956 SNHG15 C7orf40|Linc-Myo1g|MYO1GUT small nucleolar RNA host gene 15 ncRNA 123.75-98 chr2 184445018 184445143 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66105 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 279-26 chr3 73759561 73759960 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49484 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 207.75-101 chr5 128025585 128025903 + 1.25 NA intron (NR_152812, intron 4 of 4) MamRep1151|LTR?|LTR? 57431 NR_152813 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 212-88 chr9 70298304 70298494 + 1.25 NA intron (NM_015110, intron 9 of 24) intron (NM_015110, intron 9 of 24) 39421 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 210.25-72 chr7 41259137 41259333 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 157631 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 287.25-53 chr9 95240867 95241220 + 1.25 NA intron (NM_001243744, intron 3 of 13) MIR|SINE|MIR 76211 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 238.25-8 chr10 62709186 62709398 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95428 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 189-42 chr16 50487313 50487647 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -60916 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 501 chr2 75287395 75288073 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88214 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 238.25-69 chr5 90269627 90269855 + 1.25 NA intron (NR_120601, intron 1 of 5) intron (NR_120601, intron 1 of 5) 20330 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 112.25-13 chr1 234099908 234100056 + 1.25 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -114229 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 140.5-157 chr3 164791717 164791998 + 1.25 NA intron (NR_126405, intron 1 of 3) intron (NR_126405, intron 1 of 3) 39623 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 113-75 chr17 52444618 52444713 + 1.25 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 54143 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 160.5-209 chrX 66449618 66449848 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 166297 NM_001242310 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 258.25-52 chr6 166651257 166651483 + 1.25 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -24119 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 130.25-135 chr3 67699557 67699710 + 1.25 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) intron (NR_109992, intron 3 of 6) 44936 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 126.25-133 chr4 95055050 95055164 + 1.25 NA intron (NM_001256793, intron 1 of 10) intron (NM_001256793, intron 1 of 10) 3430 NM_001256793 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 214.25-53 chr22 40532976 40533210 + 1.25 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) intron (NM_020831, intron 3 of 14) 734 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 193.5-165 chr9 17310153 17310346 + 1.25 NA intron (NM_001365029, intron 8 of 25) L1ME3F|LINE|L1 175209 NM_001114395 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 188.75-86 chr5 32050803 32051090 + 1.25 NA intron (NM_178140, intron 8 of 24) MER3|DNA|hAT-Charlie -114787 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 209.25-9 chr1 164878523 164878736 + 1.25 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) intron (NM_001353131, intron 7 of 7) -103988 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 235.75-35 chr2 82253896 82254208 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -602751 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 165.25-12 chr10 19644980 19645156 + 1.25 NA intron (NM_001142308, intron 36 of 39) intron (NM_001142308, intron 36 of 39) 83482 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 259-8 chr10 23311907 23312138 + 1.25 NA intron (NM_001351306, intron 4 of 5) L1MC4|LINE|L1 -31935 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 196.5-34 chr11 88712269 88712501 + 1.25 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 207809 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 153.75-93 chr3 110578052 110578231 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 491818 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 297-5 chr1 235562685 235563164 + 1.25 NA intron (NM_004485, intron 2 of 2) L1MEg|LINE|L1 -58472 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 135.5-182 chr7 29266177 29266372 + 1.25 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -57304 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 341-12 chr17 65704580 65704888 + 1.25 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) intron (NR_126542, intron 2 of 5) 121717 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 271.25-10 chr11 23206780 23207003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 212299 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 114.75-211 chrX 102008396 102008576 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76459 NM_001011657 84460 Hs.496512 NM_001011657 ENSG00000166432 ZMAT1 - zinc finger matrin-type 1 protein-coding 266.25-22 chr2 45854840 45855241 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) intron (NM_005400, intron 2 of 14) 203365 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 118.75-36 chr11 77971589 77971706 + 1.25 NA intron (NM_033547, intron 4 of 22) AluSz|SINE|Alu 23021 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 238.25-74 chr6 16505549 16505894 + 1.25 NA intron (NM_000332, intron 6 of 8) intron (NM_000332, intron 6 of 8) 254463 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 146-20 chr11 42254678 42254834 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -1066 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 127-168 chr8 10319772 10319972 + 1.25 NA intron (NM_001199729, intron 5 of 6) intron (NM_001199729, intron 5 of 6) -154693 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 128.25-204 chr8 62313561 62313691 + 1.25 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 64772 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 185-94 chrX 101930907 101931066 + 1.25 NA intron (NM_001011657, intron 1 of 6) intron (NM_001011657, intron 1 of 6) 1041 NM_001282401 84460 Hs.496512 NM_001011657 ENSG00000166432 ZMAT1 - zinc finger matrin-type 1 protein-coding 224.25-53 chr22 24843597 24844041 + 1.25 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) MIRb|SINE|MIR 37598 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 269.5-38 chr4 40881028 40881471 + 1.25 NA intron (NM_173075, intron 11 of 16) intron (NM_173075, intron 11 of 16) -24057 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 127.75-94 chr2 49080156 49080322 + 1.25 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 20636 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 226.75-17 chr13 72039771 72040098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -172730 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 228.5-19 chr10 84140747 84141069 + 1.25 NA intron (NM_014394, intron 1 of 8) intron (NM_014394, intron 1 of 8) 1399 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 199.75-79 chr5 103702607 103702766 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -139897 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 287.25-33 chr3 98349117 98349479 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -4556 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 143.75-127 chr3 188242749 188242968 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 17453 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 355.75-7 chr17 71984467 71984915 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41288 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 162.5-50 chr14 50039201 50039414 + 1.25 NA intron (NR_131171, intron 5 of 8) intron (NR_131171, intron 5 of 8) -31787 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 237.25-10 chr10 42303267 42303557 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64633 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 151.25-122 chr3 63369143 63369478 + 1.25 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -74002 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 213.25-71 chrX 70597634 70597868 + 1.25 NA intron (NM_001003811, intron 25 of 30) L1MB8|LINE|L1 -141757 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 229.75-79 chr8 142139462 142139793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36712 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 340.5-12 chr14 45987497 45987882 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -76470 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 118-47 chr14 45400135 45400297 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -147014 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 279.75-43 chr5 111521723 111522045 + 1.25 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -9287 NM_001308057 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 246.75-84 chrX 91436655 91437037 + 1.25 NA 3' UTR (NM_080832, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_080832, exon 2 of 2) -1847 NR_110659 102724167 Hs.571694 NR_110659 ENSG00000234161 PABPC5-AS1 CXorf46 PABPC5 antisense RNA 1 ncRNA 287.25-31 chr22 25486093 25486419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30610 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 203-103 chr8 138479892 138480068 + 1.25 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 17281 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 138 chr1 77644860 77644993 + 1.25 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) intron (NM_001308237, intron 1 of 13) 37732 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 181.25-57 chr19 56888875 56889139 + 1.25 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 48105 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 310-9 chr15 68456441 68456727 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24421 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 117.75-30 chr11 5614704 5614936 + 1.25 NA intron (NM_001003819, intron 7 of 13) intron (NM_001003819, intron 7 of 13) -5124 NM_001003827 53840 Hs.729048 NM_021616 ENSG00000258659 TRIM34 IFP1|RNF21 tripartite motif containing 34 protein-coding 220-33 chr2 82924312 82924667 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 67686 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 216.75-49 chr3 18319230 18319624 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 105912 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 151.5-175 chr6 148869526 148869784 + 1.25 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 95029 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 401-16 chr7 41869082 41869688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166295 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 259-17 chr14 29907396 29907789 + 1.25 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 19504 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 157-31 chr14 82012956 82013110 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -269895 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 142-130 chr5 88386921 88387192 + 1.25 NA intron (NR_105019, intron 6 of 7) intron (NR_105019, intron 6 of 7) -5139 NR_105020 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 145.25-143 chr6 38898100 38898319 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 59 of 91) intron (NM_001371, intron 59 of 91) 54898 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 131-118 chr3 103152021 103152209 + 1.25 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 372001 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 226-9 chr11 91591334 91591601 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -633567 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 143.25-176 chr8 48786885 48787098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51680 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 115.5-57 chr14 19877284 19877427 + 1.25 NA TTS (NM_001005501) TTS (NM_001005501) 1087 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 241.5-85 chr6 143377589 143377950 + 1.25 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 64908 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 286-27 chr4 30429756 30430063 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -290460 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 192.5-80 chr2 220964877 220965137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 607297 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 155-47 chr15 64035349 64035491 + 1.25 NA intron (NM_014326, intron 2 of 11) intron (NM_014326, intron 2 of 11) 11065 NM_001363730 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 184.25-115 chr7 119554905 119555314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 352266 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 146.25-29 chr13 34433680 34433943 + 1.25 NA intron (NR_146542, intron 2 of 3) intron (NR_146542, intron 2 of 3) 85768 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 130.25-82 chr18 7384287 7384434 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76646 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 292.25-16 chr14 60662849 60663308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13601 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 216-30 chr17 63401428 63401761 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 18 of 25) intron (NM_025185, intron 18 of 25) 38673 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 291-10 chr12 52892399 52892907 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6331 NR_162090 113218482 NR_162090 MIR9898 - microRNA 9898 ncRNA 318.5-39 chr8 110368649 110369137 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -393122 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 245.5-6 chr10 22319318 22319690 + 1.25 NA intron (NM_001204062, intron 5 of 13) intron (NM_001204062, intron 5 of 13) -1595 NM_005180 648 Hs.380403 NM_005180 ENSG00000168283 BMI1 FLVI2/BMI1|PCGF4|RNF51|flvi-2/bmi-1 BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger protein-coding 188.75-110 chr7 92466840 92467029 + 1.25 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 4490 NM_014590 30816 NM_014590 ENSG00000242950 ERVW-1 ENV|ENVW|ERVWE1|HERV-7q|HERV-W-ENV|HERV7Q|HERVW|HERVWENV endogenous retrovirus group W member 1, envelope protein-coding 167.75-150 chr9 76013338 76013652 + 1.25 NA intron (NR_120409, intron 3 of 19) intron (NR_120409, intron 3 of 19) 122822 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 158.5-170 chr6 108028668 108028892 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 45961 NM_014028 28962 Hs.226780 NM_014028 ENSG00000081087 OSTM1 GIPN|GL|HSPC019|OPTB5 osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1 protein-coding 274-33 chr5 104926439 104926807 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -172851 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 279.75-15 chr15 60093343 60093776 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 89248 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 251.25-30 chr2 146608087 146608368 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21170 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 175.75-44 chr15 66436316 66436578 + 1.25 NA intron (NM_002755, intron 2 of 10) intron (NM_002755, intron 2 of 10) 49574 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 285.5-26 chr18 6403326 6403671 + 1.25 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) MER20B|DNA|hAT-Charlie 11413 NM_001365768 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 125.5-37 chr10 125177893 125178032 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16932 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 186.25-52 chr2 107966102 107966365 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -20291 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 200.25-26 chr12 43104243 43104465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50961 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 118-171 chr7 32880332 32880471 + 1.25 NA intron (NM_015483, intron 1 of 3) intron (NM_015483, intron 1 of 3) 11359 NM_015483 25948 Hs.372541 NM_015483 ENSG00000170852 KBTBD2 BKLHD1 kelch repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 222.75-22 chr10 77229760 77229987 + 1.25 NA intron (NM_001322838, intron 3 of 29) L1MB5|LINE|L1 89042 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 245-58 chr5 73930798 73931021 + 1.25 NA intron (NM_001080479, intron 36 of 36) HAL1|LINE|L1 117363 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 171.75-79 chr2 107975211 107975488 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -11175 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 317-26 chr4 72440024 72440599 + 1.25 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 128910 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 159.25-107 chr4 112949942 112950198 + 1.25 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) 89083 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 161-133 chr9 109658075 109658323 + 1.25 NA intron (NM_001037293, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 17411 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 283.5-36 chr22 23067500 23067832 + 1.25 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 -2853 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 182-115 chrX 50474794 50475052 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4098 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 261.25-52 chr8 120160395 120160931 + 1.25 NA intron (NM_021110, intron 3 of 47) intron (NM_021110, intron 3 of 47) 35561 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 273.5-57 chr5 14727354 14727751 + 1.25 NA intron (NM_054027, intron 8 of 11) intron (NM_054027, intron 8 of 11) 14858 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 199.5-104 chr3 123216826 123217032 + 1.25 NA intron (NM_012430, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 14986 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 130-77 chr2 151655625 151655768 + 1.25 NA intron (NM_001271208, intron 50 of 182) intron (NM_001271208, intron 50 of 182) 78780 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 227.5-76 chr4 31118310 31118521 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -52729 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 334.5-21 chr4 54236114 54236610 + 1.25 NA intron (NM_001347830, intron 1 of 22) intron (NM_001347830, intron 1 of 22) 2402 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 340.5-11 chr12 131872552 131872967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21863 NM_003565 8408 Hs.47061 NM_003565 ENSG00000177169 ULK1 ATG1|ATG1A|UNC51|Unc51.1|hATG1 unc-51 like autophagy activating kinase 1 protein-coding 213-49 chr2 176376112 176376393 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 106810 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 232-38 chr2 109349622 109349941 + 1.25 NA intron (NM_001099289, intron 2 of 9) intron (NM_001099289, intron 2 of 9) -36156 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 267.75-47 chr5 90198887 90199403 + 1.25 NA intron (NR_120601, intron 4 of 5) intron (NR_120601, intron 4 of 5) 90926 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 242-50 chr5 123670598 123670877 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 125320 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 202.25-73 chr5 159890396 159890687 + 1.25 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -19157 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 249-13 chr14 60196147 60196440 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -26429 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 168.25-145 chr8 138453206 138453370 + 1.25 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 43973 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 165.75-92 chr2 200760061 200760274 + 1.25 NA intron (NR_135012, intron 18 of 30) intron (NR_135012, intron 18 of 30) -24990 NR_037886 100507140 Hs.382116 NR_037886 ENSG00000237166 LINC01792 - long intergenic non-protein coding RNA 1792 ncRNA 189.75-109 chr6 166564593 166564744 + 1.25 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -19978 NM_001318938 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 144-2 chr1 40169107 40169248 + 1.25 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 7790 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 267.25-26 chr22 21774907 21775272 + 1.25 NA intron (NM_002745, intron 6 of 8) intron (NM_002745, intron 6 of 8) -39295 NR_130910 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 223.75-13 chr12 9595129 9595399 + 1.25 NA 3' UTR (NM_002258, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_002258, exon 6 of 6) 12652 NM_002258 3820 Hs.169824 NM_002258 ENSG00000111796 KLRB1 CD161|CLEC5B|NKR|NKR-P1|NKR-P1A|NKRP1A|hNKR-P1A killer cell lectin like receptor B1 protein-coding 201.25-88 chr7 31983436 31983827 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 86776 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 242.75-59 chr6 16188974 16189180 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47521 NR_039782 100616269 NR_039782 ENSG00000263712 MIR4639 - microRNA 4639 ncRNA 433-4 chr12 26593778 26594242 + 1.25 NA intron (NM_002223, intron 32 of 56) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 239184 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 148.75-88 chr2 135491108 135491549 + 1.25 NA intron (NM_001286569, intron 2 of 21) intron (NM_001286569, intron 2 of 21) 39257 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 216-33 chr18 4862900 4863085 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -218190 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 147.5-58 chr14 47477882 47478134 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MIR3|SINE|MIR -134762 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 202.75-65 chr20 31185050 31185257 + 1.25 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -72511 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 240.75-60 chr5 27255859 27256202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -216262 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 345.25-17 chr5 23109426 23109796 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -256267 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 210.5-49 chr16 77299198 77299525 + 1.25 NA intron (NM_199355, intron 17 of 22) intron (NM_199355, intron 17 of 22) 99953 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 229-27 chr19 50021883 50022186 + 1.25 NA intron (NM_016440, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 3338 NM_001308420 51231 Hs.443330 NM_016440 ENSG00000105053 VRK3 - VRK serine/threonine kinase 3 protein-coding 115.25-152 chr4 106765459 106765629 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 270769 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 264.5-26 chr17 28431962 28432334 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -25936 NM_080669 113235 Hs.446689 NM_080669 ENSG00000076351 SLC46A1 G21|HCP1|PCFT solute carrier family 46 member 1 protein-coding 234-54 chr5 36939401 36939660 + 1.25 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L1MD2|LINE|L1 62761 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 178.5-72 chr19 27994659 27994890 + 1.25 NA intron (NR_146733, intron 3 of 6) intron (NR_146733, intron 3 of 6) -200834 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 368-6 chr2 52278036 52278834 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 -92213 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 212-19 chr12 95283470 95283728 + 1.25 NA intron (NR_147922, intron 9 of 12) intron (NR_147922, intron 9 of 12) -24821 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 238-65 chr8 92165892 92166211 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -62666 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 170.5-194 chr8 122402276 122402526 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 166243 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 133-5 chr1 87154085 87154244 + 1.25 NA intron (NR_026989, intron 2 of 2) intron (NR_026989, intron 2 of 2) 22238 NR_026986 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 259.5-70 chr3 114845698 114846000 + 1.25 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) intron (NM_001348805, intron 4 of 10) -27184 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 208.25-15 chr10 60264046 60264275 + 1.25 NA intron (NM_001204403, intron 6 of 43) intron (NM_001204403, intron 6 of 43) -123144 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 377.5-10 chr2 76824308 76824717 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -161453 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 223.75-38 chr17 77364270 77364514 + 1.25 NA intron (NM_006640, intron 1 of 10) intron (NM_006640, intron 1 of 10) -8945 NM_001113493 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 125.25-100 chr2 98919299 98919451 + 1.25 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) intron (NM_207362, intron 1 of 9) 16850 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 262.5-36 chr2 83786380 83786724 + 1.25 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 263738 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 340-11 chr3 42151625 42152082 + 1.25 NA intron (NM_001349249, intron 1 of 14) intron (NM_001349249, intron 1 of 14) 2618 NM_001265609 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 191.5-77 chr2 127477675 127477990 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 48657 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 145.25-126 chr5 24294244 24294408 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 342978 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 262.25-15 chr14 49184484 49184953 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 401662 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 254-53 chr9 29078373 29078632 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 133797 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 251-44 chr5 4903371 4903706 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 130057 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 441-4 chr11 24578777 24579355 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 82013 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 204-72 chr6 105932906 105933207 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153280 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 190.75-12 chr10 108131785 108132061 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62630 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 350.25-29 chr7 29801791 29802181 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4568 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 332 chr10 91825971 91826558 + 1.25 NA intron (NM_025235, intron 7 of 26) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 27838 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 181.25-72 chr2 225622606 225622836 + 1.25 NA intron (NM_001371273, intron 5 of 7) AluSx1|SINE|Alu 221835 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 209-50 chr3 117835028 117835379 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -144278 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 139.5-120 chr21 30000235 30000443 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60287 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 183.75-2 chr1 94682586 94682819 + 1.25 NA intron (NR_160779, intron 2 of 5) L1MB8|LINE|L1 63198 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 338.5-30 chr6 117943035 117943637 + 1.25 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) 36072 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 278-21 chr3 65005475 65005776 + 1.25 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) intron (NR_038264, intron 4 of 5) -317625 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 219.25-36 chr2 122697096 122697318 + 1.25 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 376274 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 160.5-100 chr20 15029039 15029198 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -99600 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 165.25-63 chr2 36552907 36553192 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001042548, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001042548, exon 9 of 9) 45119 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 188.25-43 chr14 83081174 83081347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 438628 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 220.5-130 chr9 78951653 78951923 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 193878 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 215.25-8 chr10 92500309 92500515 + 1.25 NA intron (NR_136399, intron 11 of 25) L1MB2|LINE|L1 -2651 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 135.25-99 chr2 77949341 77949547 + 1.25 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 5582 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 150.75-136 chr4 20278951 20279130 + 1.25 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) 27135 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 250.5-7 chr10 10845510 10845995 + 1.25 NA intron (NM_001326327, intron 1 of 14) intron (NM_001326327, intron 1 of 14) 47027 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 253-39 chr5 13523409 13523784 + 1.25 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 420884 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 335.25-4 chr1 237174751 237175122 + 1.25 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) intron (NM_001035, intron 1 of 104) 132752 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 358.25-3 chr1 82563023 82563739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -339802 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 207-55 chr22 46097751 46098056 + 1.25 NA intron (NR_110479, intron 1 of 4) intron (NR_110479, intron 1 of 4) 6859 NR_037413 100500828 NR_037413 ENSG00000266533 MIR3619 - microRNA 3619 ncRNA 335.75-11 chr2 80242110 80242638 + 1.25 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 62378 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 402.5-11 chr9 110926552 110926906 + 1.25 NA intron (NM_001351417, intron 5 of 5) (CTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 110051 NM_001351420 1902 Hs.126667 NM_001401 ENSG00000198121 LPAR1 EDG2|GPR26|Gpcr26|LPA1|Mrec1.3|VZG1|edg-2|rec.1.3|vzg-1 lysophosphatidic acid receptor 1 protein-coding 314.25-14 chr2 63100521 63100795 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 18884 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 223-77 chr7 129150201 129150648 + 1.25 NA intron (NM_178562, intron 1 of 7) intron (NM_178562, intron 1 of 7) 5717 NM_178562 340348 Hs.27267 NM_178562 ENSG00000158457 TSPAN33 PEN|PEN.|TSPAN-33 tetraspanin 33 protein-coding 247.25-6 chr10 44820643 44820968 + 1.25 NA intron (NR_033842, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 -90511 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 144.5-25 chr10 14043773 14043974 + 1.25 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) AluJr4|SINE|Alu -30411 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 201.25-55 chr21 25552968 25553308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9007 NR_001458 114614 Hs.697120 NR_001458 ENSG00000234883 MIR155HG BIC|MIRHG2|NCRNA00172 MIR155 host gene ncRNA 128.75-61 chr15 54114390 54114560 + 1.25 NA intron (NM_001329919, intron 2 of 31) L1ME3Cz|LINE|L1 101827 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 312.25-22 chr5 112831440 112831736 + 1.25 NA intron (NM_001354895, intron 14 of 15) intron (NM_001354895, intron 14 of 15) -29600 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 130-123 chr5 29606769 29606929 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -210873 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 224-11 chr10 111959871 111960191 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 223734 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 132.5-24 chr1 192702407 192702572 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13839 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 203.25-75 chr4 84765646 84765906 + 1.25 NA intron (NM_014991, intron 32 of 67) intron (NM_014991, intron 32 of 67) 182649 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 274-4 chr1 197120776 197121134 + 1.25 NA intron (NM_001206846, intron 16 of 26) intron (NM_001206846, intron 16 of 26) 25714 NM_018136 259266 Hs.121028 NM_018136 ENSG00000066279 ASPM ASP|Calmbp1|MCPH5 abnormal spindle microtubule assembly protein-coding 273.25-8 chr10 82164689 82165100 + 1.25 NA intron (NR_163251, intron 2 of 9) intron (NR_163251, intron 2 of 9) 68026 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 237.25-19 chr12 85543307 85543595 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 263231 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 165-129 chr7 31527095 31527354 + 1.25 NA intron (NR_047565, intron 1 of 13) intron (NR_047565, intron 1 of 13) -2238 NM_001257968 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 244.75-48 chr5 125475589 125476048 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17443 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 327.25-14 chr4 74070380 74070681 + 1.25 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -15131 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 264.75-60 chr8 144563168 144563408 + 1.25 NA intron (NM_025251, intron 2 of 10) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -34177 NM_001001795 414919 Hs.105685 NM_001001795 ENSG00000213563 C8orf82 - chromosome 8 open reading frame 82 protein-coding 313.25-2 chr1 218886999 218887578 + 1.25 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 31223 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 271.25-29 chr2 201705206 201705465 + 1.25 NA intron (NM_020919, intron 30 of 33) intron (NM_020919, intron 30 of 33) -6691 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 183.5-166 chrX 51805549 51805742 + 1.25 NA intron (NM_001005332, intron 1 of 12) L1MC4|LINE|L1 2569 NM_001005332 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 311.25-18 chr5 72532607 72532967 + 1.25 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -24290 NR_105008 102503427 Hs.429280 NR_105008 LOC102503427 - uncharacterized LOC102503427 ncRNA 211.25-8 chr1 231981149 231981468 + 1.25 NA intron (NM_001164538, intron 10 of 10) intron (NM_001164538, intron 10 of 10) 55474 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 229.5-100 chr4 156486204 156486650 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 485372 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 140.5-234 chr8 112412319 112412442 + 1.25 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) intron (NM_052900, intron 31 of 68) -231113 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 283-7 chr1 211204558 211204909 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -54544 NM_001350069 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 168.5-21 chr1 241084536 241084718 + 1.25 NA intron (NM_001350116, intron 3 of 16) intron (NM_001350116, intron 3 of 16) -47645 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 264.25-20 chr18 10100684 10100907 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 186779 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 276-50 chr8 120662475 120662900 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) intron (NM_021021, intron 2 of 6) -98566 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 380-2 chr11 9282338 9283152 + 1.25 NA 3' UTR (NM_015012, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_015012, exon 7 of 7) -17395 NM_015213 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 260.5-24 chr18 75465682 75465908 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38092 NM_001037331 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 233.25-66 chr7 46506158 46506506 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 190790 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 220.75-7 chr1 109507106 109507340 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020703, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_020703, exon 2 of 2) 2504 NM_020703 57463 Hs.12264 NM_020703 ENSG00000181754 AMIGO1 ALI2|AMIGO|AMIGO-1 adhesion molecule with Ig like domain 1 protein-coding 512.75 chr8 104699401 104700015 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110684 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 176-71 chr7 111553707 111553932 + 1.25 NA intron (NM_001350959, intron 2 of 7) intron (NM_001350959, intron 2 of 7) 8472 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 176.5-129 chr4 27181670 27181887 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35701 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 384.5-6 chr14 95581425 95581960 + 1.25 NA non-coding (NR_146450, exon 3 of 3) non-coding (NR_146450, exon 3 of 3) 8130 NR_146450 100506999 Hs.112858 NR_146449 ENSG00000258390 LINC02318 - long intergenic non-protein coding RNA 2318 ncRNA 166.75-77 chr2 65091777 65091951 + 1.25 NA intron (NM_004161, intron 3 of 5) intron (NM_004161, intron 3 of 5) 35448 NM_001319101 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 247.25-33 chr2 129556071 129556421 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -282355 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 272.5-76 chr9 37092469 37092895 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12786 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 170.5-138 chr5 11068099 11068353 + 1.25 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) MER5B|DNA|hAT-Charlie -306992 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 446.5-5 chr5 4075376 4075866 + 1.25 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 479789 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 218.25-83 chr6 95525401 95525681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51910 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 248-68 chr7 15893517 15894008 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 205384 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 263.75 chr1 42009825 42010167 + 1.25 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 25938 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 196-35 chr16 67876946 67877219 + 1.25 NA intron (NM_014329, intron 4 of 28) intron (NM_014329, intron 4 of 28) 4030 NM_014329 23644 Hs.75682 NM_014329 ENSG00000038358 EDC4 GE1|Ge-1|HEDL5|HEDLS|RCD-8|RCD8 enhancer of mRNA decapping 4 protein-coding 212-7 chr1 224397758 224397950 + 1.25 NA TTS (NR_039896) TTS (NR_039896) 457 NR_039896 100616468 NR_039896 ENSG00000266618 MIR4742 mir-4742 microRNA 4742 ncRNA 208.5-43 chr15 62979861 62980074 + 1.25 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -62780 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 258.75-42 chr2 180114958 180115225 + 1.25 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -107794 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 148-109 chr5 120652814 120652985 + 1.25 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) L1MC3|LINE|L1 121435 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 223-66 chr5 76091362 76091595 + 1.25 NA intron (NM_014979, intron 1 of 12) intron (NM_014979, intron 1 of 12) 8095 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 377.75-8 chr4 33573436 33573829 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 466261 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 273.5-20 chr12 50538708 50538935 + 1.25 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) HAL1ME|LINE|L1 33836 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 197.75-58 chr4 57891211 57891403 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 465435 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 245.25-75 chr9 101578690 101578949 + 1.25 NA intron (NM_133445, intron 7 of 8) intron (NM_133445, intron 7 of 8) 16150 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 258-10 chr11 110611046 110611329 + 1.25 NA intron (NM_020809, intron 8 of 15) intron (NM_020809, intron 8 of 15) 100638 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 208-29 chr16 71169919 71170154 + 1.25 NA intron (NM_017558, intron 5 of 19) intron (NM_017558, intron 5 of 19) 60686 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 141.75-22 chr10 57658368 57658530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -353890 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 178-43 chr2 72185368 72185537 + 1.25 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -37590 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 194.5-11 chr1 233212890 233213172 + 1.25 NA intron (NM_014801, intron 12 of 33) L1MC3|LINE|L1 82694 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 217-34 chr2 110637080 110637300 + 1.25 NA TTS (NM_004336) TTS (NM_004336) 21059 NR_132975 106635550 NR_132975 SNORD132 - small nucleolar RNA, C/D box 132 snoRNA 374.5-7 chr15 74990357 74990957 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -4906 NM_001178111 192683 Hs.374180 NM_138967 ENSG00000198794 SCAMP5 - secretory carrier membrane protein 5 protein-coding 164.75-144 chr8 88878773 88878981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -551394 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 223-47 chr20 48135783 48136064 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -145806 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 195-100 chr9 125841974 125842202 + 1.25 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 93905 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 241.5-15 chr12 86214247 86214458 + 1.25 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 42039 NM_001351283 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 217.75-43 chr20 47335029 47335282 + 1.25 NA intron (NM_001281774, intron 3 of 23) AluJb|SINE|Alu 16653 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 271-38 chr5 26448515 26448870 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 589894 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 130.5-14 chr1 86928338 86928528 + 1.25 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) intron (NM_012262, intron 1 of 6) 13798 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 219.5-4 chr1 69741418 69741688 + 1.25 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) intron (NM_001366839, intron 3 of 25) 172212 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 190.5-48 chr14 101089801 101090077 + 1.25 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 20028 NR_047664 100507257 Hs.301755 NR_047664 ENSG00000223403 MEG9 LINC00584 maternally expressed 9 ncRNA 273.5-46 chr3 26648216 26648555 + 1.25 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) intron (NM_001317810, intron 2 of 2) 23718 NM_001317810 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 127-167 chr7 151351522 151351691 + 1.25 NA intron (NM_001363529, intron 4 of 14) MIRc|SINE|MIR 9794 NM_001363529 51667 Hs.647082 NM_016118 ENSG00000013374 NUB1 BS4|NUB1L|NYREN18 negative regulator of ubiquitin like proteins 1 protein-coding 225-42 chr2 202953675 202954053 + 1.25 NA intron (NR_136330, intron 5 of 14) intron (NR_136330, intron 5 of 14) 41589 NM_001352678 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 157.75-124 chr4 111882564 111882711 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -262817 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 176.75-100 chr5 107142841 107143199 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -132006 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 256.75-5 chr11 17977244 17977613 + 1.25 NA intron (NR_104040, intron 8 of 11) intron (NR_104040, intron 8 of 11) 35619 NM_012139 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 257.25-17 chr16 84702846 84703311 + 1.25 NA intron (NR_073577, intron 1 of 11) intron (NR_073577, intron 1 of 11) 3078 NR_073578 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 180.75-138 chr7 6053929 6054179 + 1.25 NA intron (NM_001134335, intron 2 of 14) L1MA3|LINE|L1 5121 NM_014413 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 210.5-59 chr2 17679241 17679658 + 1.25 NA intron (NM_024624, intron 23 of 26) intron (NM_024624, intron 23 of 26) 74361 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 209.5-100 chr4 34112224 34112449 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72443 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 239.5-74 chr8 24102204 24102500 + 1.25 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -191688 NR_130709 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 161.75-51 chr18 2531882 2532071 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 39529 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 153-89 chr21 28323551 28323829 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -95023 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 231-83 chr8 136701461 136701678 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1MEg|LINE|L1 170771 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 184.25-78 chr3 61752096 61752291 + 1.25 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 190622 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 209-73 chr8 135975783 135976103 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 518487 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 265-36 chr7 8008124 8008425 + 1.25 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) L1MA8|LINE|L1 39478 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 150-74 chr2 115035203 115035511 + 1.25 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -29216 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 239.5-37 chr17 64685823 64686138 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -23673 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 192.75-31 chr14 38455753 38455986 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199776 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 190.75-13 chr10 122214249 122214563 + 1.25 NA intron (NM_001291878, intron 4 of 16) intron (NM_001291878, intron 4 of 16) 50776 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 384-13 chr20 6562638 6563247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 136210 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 187.25-7 chr1 214046879 214047156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58484 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 297.5-12 chr11 110928420 110928819 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168699 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 293-4 chr10 62036626 62037294 + 1.25 NA intron (NM_032199, intron 4 of 9) intron (NM_032199, intron 4 of 9) -12397 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 161.5-136 chr3 78022016 78022248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26831 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 241.75-8 chr10 57104217 57104549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 200176 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 116.75-58 chr14 56539287 56539450 + 1.25 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 25037 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 214-26 chr18 6732979 6733316 + 1.25 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -3285 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 263.25-46 chr5 68824554 68824858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 205221 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 177-102 chr9 101943947 101944233 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -205510 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 134.25-46 chr14 41462947 41463123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -143821 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 184.75-54 chr2 84522394 84522679 + 1.25 NA intron (NM_001370, intron 2 of 76) L1PA11|LINE|L1 6081 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 387.25-10 chr3 52167354 52167694 + 1.25 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -13101 NM_001161581 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 224.75-32 chr15 97158168 97158381 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 363537 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 187.75-64 chr21 14235892 14236255 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19916 NR_135308 54033 Hs.283828 NM_144770 ENSG00000185272 RBM11 - RNA binding motif protein 11 protein-coding 265.75-50 chr3 79699442 79699805 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 68375 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 178.25-35 chr14 61203532 61203734 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77705 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 340-22 chr9 101516495 101517007 + 1.25 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger -17102 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 221.25-73 chr5 159530843 159531202 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -64746 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 216.25-8 chr1 235766311 235766616 + 1.25 NA intron (NM_000081, intron 20 of 52) intron (NM_000081, intron 20 of 52) 86597 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 296-2 chr1 112985087 112985420 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28838 NR_103744 100506392 Hs.418285 NR_103743 ENSG00000226419 SLC16A1-AS1 - SLC16A1 antisense RNA 1 ncRNA 343.25-8 chr2 48150327 48150796 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -164121 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 230.75-41 chr20 47503408 47503671 + 1.25 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) intron (NM_181659, intron 1 of 22) 1652 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 207.5-20 chr14 46712083 46712257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60389 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 223-36 chr19 27980982 27981205 + 1.25 NA intron (NR_146734, intron 6 of 7) intron (NR_146734, intron 6 of 7) -187153 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 172.75-131 chr8 118481195 118481544 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -139632 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 179-67 chr3 152123133 152123503 + 1.25 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy 82111 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 257-58 chr9 9229514 9229872 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 371675 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 202.25-11 chr10 23541908 23542193 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 102781 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 203.5-98 chr3 193867773 193868046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23900 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 160.25-79 chr2 198511447 198511625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136439 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 248.25-61 chr6 119764394 119764765 + 1.25 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 214771 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 125-91 chr21 35404220 35404455 + 1.25 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 176427 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 159.25-102 chr4 55545859 55546039 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001267843) promoter-TSS (NM_001267843) -17 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 358.25 chr1 53510042 53510506 + 1.25 NA intron (NM_147193, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR 50875 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 176.25-128 chr7 46874340 46874684 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -177390 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 192.25-114 chrX 28632498 28632689 + 1.25 NA intron (NM_014271, intron 1 of 10) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 45147 NM_014271 11141 Hs.658912 NM_014271 ENSG00000169306 IL1RAPL1 IL-1-RAPL-1|IL-1RAPL-1|IL1R8|IL1RAPL|IL1RAPL-1|MRX10|MRX21|MRX34|OPHN4|TIGIRR-2 interleukin 1 receptor accessory protein like 1 protein-coding 247-40 chr22 20553266 20553685 + 1.25 NA intron (NM_001293236, intron 4 of 15) intron (NM_001293236, intron 4 of 15) 45428 NM_001293237 51586 Hs.517421 NM_015889 ENSG00000099917 MED15 ARC105|CAG7A|CTG7A|PCQAP|TIG-1|TIG1|TNRC7 mediator complex subunit 15 protein-coding 191.5-147 chr8 75307918 75308095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29117 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 189.75-130 chr9 78637143 78637339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 340116 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 168-19 chr10 108070802 108071084 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1650 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 201.25-47 chr2 117050257 117050574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -764276 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 286-11 chr15 60179769 60180110 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 175628 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 163.25-46 chr14 72296469 72296606 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME2|LINE|L1 -220283 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 210.25-39 chr2 39267187 39267409 + 1.25 NA intron (NM_003618, intron 26 of 33) L1M5|LINE|L1 -23315 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 246.75-45 chr3 180615674 180616100 + 1.25 NA intron (NM_181426, intron 19 of 19) intron (NM_181426, intron 19 of 19) 13724 NM_001288582 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 300.5-3 chr1 40040798 40041156 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001350481, exon 1 of 13) 5' UTR (NM_001350481, exon 1 of 13) 126 NM_001350481 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 164.75-67 chr18 11359486 11359676 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94897 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 155.5-137 chr3 185223887 185224054 + 1.25 NA intron (NM_001966, intron 4 of 6) intron (NM_001966, intron 4 of 6) 29302 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 239.75-48 chr3 189710590 189710823 + 1.25 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) intron (NM_003722, intron 1 of 13) -78953 NM_001114980 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 168-53 chr15 92647139 92647361 + 1.25 NA intron (NM_207446, intron 1 of 2) intron (NM_207446, intron 1 of 2) 8525 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 300.75-5 chr10 75897359 75898004 + 1.25 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 114920 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 202.25-78 chr6 125966278 125966506 + 1.25 NA intron (NM_138571, intron 1 of 4) intron (NM_138571, intron 1 of 4) 9622 NM_138571 135114 Hs.72325 NM_138571 ENSG00000111911 HINT3 HINT4 histidine triad nucleotide binding protein 3 protein-coding 200-5 chr1 197225835 197226202 + 1.25 NA intron (NM_001257965, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 24514 NM_001257965 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 196.5-73 chr19 27922839 27923140 + 1.25 NA intron (NR_146733, intron 2 of 6) intron (NR_146733, intron 2 of 6) -129049 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 192-61 chr2 133219717 133219934 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -46370 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 388.5-13 chr3 115913722 115914441 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) -8955 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 133.75-116 chr20 51183698 51183823 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160653 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 156.75-34 chr11 61380945 61381073 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11351 NM_001330285 51259 Hs.26745 NM_016499 ENSG00000187049 TMEM216 HSPC244 transmembrane protein 216 protein-coding 186.75-90 chr5 94962013 94962185 + 1.25 NA intron (NM_001297777, intron 2 of 19) L1P5|LINE|L1 119767 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 122.75-48 chr14 51857730 51857897 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2799 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 253-40 chr5 42090160 42090391 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85070 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 135.75-7 chr1 80413229 80413523 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122379 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 185.25-80 chr3 25623956 25624180 + 1.25 NA intron (NM_001330700, intron 20 of 35) intron (NM_001330700, intron 20 of 35) 40304 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 232-33 chr2 53382548 53382836 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -385091 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 266.75-2 chr1 117411936 117412284 + 1.25 NA intron (NM_006699, intron 3 of 12) L1MDa|LINE|L1 44661 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 198-6 chr1 203113482 203113815 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14078 NM_000674 134 Hs.77867 NM_000674 ENSG00000163485 ADORA1 RDC7 adenosine A1 receptor protein-coding 279.75-21 chr2 84479061 84479486 + 1.25 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 -19993 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 182.5-117 chr4 55921890 55922061 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26970 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 176.25-57 chr19 3919674 3919976 + 1.25 NA intron (NM_033064, intron 11 of 12) intron (NM_033064, intron 11 of 12) -13278 NR_110316 27231 Hs.135458 NM_014446 ENSG00000077009 NMRK2 ITGB1BP3|MIBP|NRK2 nicotinamide riboside kinase 2 protein-coding 323-16 chr3 109064034 109064689 + 1.25 NA intron (NM_014429, intron 9 of 27) intron (NM_014429, intron 9 of 27) -37095 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 200.75-103 chr7 124658103 124658349 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 107566 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 232.25-10 chr11 19953001 19953346 + 1.25 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) intron (NM_182964, intron 10 of 37) -69383 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 246.75-26 chr18 9654942 9655286 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39850 NR_110774 101927323 Hs.151204 NR_110773 ENSG00000263627 PPP4R1-AS1 - PPP4R1 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-35 chr11 38099425 38099605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 160914 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 412.25-6 chr17 58780843 58781494 + 1.25 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 25299 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 192.75-107 chr5 113959794 113959972 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -402187 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 269.25-51 chr8 24404807 24405039 + 1.25 NA intron (NM_014479, intron 13 of 13) intron (NM_014479, intron 13 of 13) 20638 NR_156422 27299 Hs.521459 NM_014479 ENSG00000134028 ADAMDEC1 M12.219 ADAM like decysin 1 protein-coding 229-21 chr16 64590398 64590672 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 531528 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 167.5-122 chr4 35229500 35229901 + 1.25 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -959953 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 257-48 chr5 56573145 56573454 + 1.25 NA intron (NR_161255, intron 1 of 5) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 32957 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 164.5-182 chr6 129791106 129791341 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 70092 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 160.5-42 chr12 111767845 111768113 + 1.25 NA intron (NM_000690, intron 1 of 12) intron (NM_000690, intron 1 of 12) 1046 NM_001204889 217 Hs.604551 NM_000690 ENSG00000111275 ALDH2 ALDH-E2|ALDHI|ALDM aldehyde dehydrogenase 2 family member protein-coding 151.5-36 chr12 68592550 68592823 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -18213 NM_001251922 5908 Hs.369920 NM_015646 ENSG00000127314 RAP1B K-REV|RAL1B RAP1B, member of RAS oncogene family protein-coding 125-27 chr11 14115063 14115248 + 1.25 NA intron (NM_006108, intron 5 of 15) intron (NM_006108, intron 5 of 15) 152432 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 184-23 chr14 44726387 44726548 + 1.25 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 72659 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 309-12 chr13 69176717 69177161 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -45407 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 293.5-21 chr18 21297596 21298174 + 1.25 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 55643 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 167.25-119 chr4 115748338 115748576 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -551268 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 173.5-73 chr2 125256978 125257190 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 860901 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 216.5-81 chr3 129441990 129442283 + 1.25 NA intron (NM_052990, intron 1 of 26) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 1912 NM_052985 55764 Hs.655284 NM_018262 ENSG00000163913 IFT122 CED|CED1|SPG|WDR10|WDR10p|WDR140 intraflagellar transport 122 protein-coding 266.75-25 chr2 63120944 63121202 + 1.25 NA non-coding (NR_122106, exon 12 of 12) non-coding (NR_122106, exon 12 of 12) -1531 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 256.25-35 chr4 95214590 95215010 + 1.25 NA intron (NM_003728, intron 10 of 15) intron (NM_003728, intron 10 of 15) 123309 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 279-56 chr8 121589771 121590217 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -49352 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 152.5-32 chr12 31473799 31473928 + 1.25 NA intron (NM_001366891, intron 3 of 4) MER21-int|LTR|ERVL -104562 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 142.75-5 chr1 105338304 105338473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 280547 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 271.75-37 chr5 38710880 38711243 + 1.25 NA intron (NR_104631, intron 4 of 4) intron (NR_104631, intron 4 of 4) 9212 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 159.25-40 chr14 62283437 62283659 + 1.25 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -143575 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 155.75-172 chrX 103618161 103618419 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 10327 NM_032926 85012 Hs.311776 NM_032926 ENSG00000196507 TCEAL3 WEX8 transcription elongation factor A like 3 protein-coding 243.25-9 chr13 33177295 33177552 + 1.25 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) intron (NM_001243476, intron 5 of 17) 8668 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 125.25-199 chr7 156135811 156135972 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173259 NM_001291913 389602 Hs.583071 NM_001291913 LOC389602 - uncharacterized LOC389602 protein-coding 125.25-57 chr14 25940262 25940544 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 613027 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 147-63 chr18 77874333 77874485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 119318 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 120-154 chr5 159543875 159544023 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -77673 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 302.5-11 chr14 36991739 36992178 + 1.25 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -39567 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 348.25-6 chr15 42625743 42626283 + 1.25 NA intron (NM_020759, intron 3 of 32) AluSx1|SINE|Alu 50407 NM_020759 57519 Hs.122061 NM_020759 ENSG00000159433 STARD9 KIF16A StAR related lipid transfer domain containing 9 protein-coding 131.5-89 chr17 55683798 55683908 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39011 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 156-125 chr5 130026703 130026908 + 1.25 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 122340 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 248.75-9 chr11 102633210 102633613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8079 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 330.75-10 chr2 21659856 21660137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 50656 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 309.5-17 chr16 10105566 10105948 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu 76310 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 222.5-115 chr8 130572184 130572398 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -128617 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 220-56 chr7 17039500 17039800 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -157667 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 194.25-53 chr2 37347608 37347828 + 1.25 NA intron (NM_012413, intron 1 of 6) intron (NM_012413, intron 1 of 6) 3088 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 118.25-60 chr13 112875450 112875594 + 1.25 NA intron (NM_032189, intron 27 of 28) intron (NM_032189, intron 27 of 28) 93116 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 155.5-97 chr2 108385878 108386056 + 1.25 NA intron (NM_001321770, intron 3 of 4) intron (NM_001321770, intron 3 of 4) 8013 NR_135776 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 215.5-39 chr16 84973794 84974120 + 1.25 NA TTS (NM_017740) TTS (NM_017740) 37578 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 200.5-32 chr13 112720254 112720491 + 1.25 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) MER4D|LTR|ERV1 30043 NM_015205 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 185.25-84 chr3 120314562 120314858 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 34644 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 166-114 chr7 18306522 18306737 + 1.25 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) 16537 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 220.25-20 chr16 86859656 86860016 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137745 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 196-38 chr16 86051606 86051822 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 133367 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 184.5-39 chr13 112621368 112621520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25600 NM_207440 400165 Hs.591213 NM_207440 ATP11AUN C13orf35|SMABLO1 ATP11A upstream neighbor protein-coding 120.25-46 chr12 20853301 20853444 + 1.25 NA intron (NM_001349920, intron 1 of 13) L1M3|LINE|L1 30824 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 237.5-22 chr11 24764840 24765187 + 1.25 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 267960 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 223-72 chr6 77567429 77567809 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -82655 NM_001282136 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 266.25-11 chr12 66102027 66102328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28573 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 236.75-36 chr3 89171605 89171911 + 1.25 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 64137 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 119.75-180 chr6 41197327 41197481 + 1.25 NA intron (NM_024807, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 3745 NM_024807 79865 Hs.164797 NM_024807 ENSG00000112195 TREML2 C6orf76|TLT-2|TLT2|dJ238O23.1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 2 protein-coding 188.75-85 chr4 73816055 73816292 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20505 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 161.5-187 chr8 129257562 129257794 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16438 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 262.25-3 chr10 8943121 8943554 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 45348 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 210.25-63 chr5 13548662 13548864 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 395717 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 207.5-4 chr10 51535594 51535936 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) AluSx|SINE|Alu 163830 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 283.5-27 chr2 152614865 152615209 + 1.25 NA intron (NM_052905, intron 12 of 25) intron (NM_052905, intron 12 of 25) 102424 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 133.25-41 chr12 57332497 57332830 + 1.25 NA intron (NM_001351217, intron 1 of 21) intron (NM_001351217, intron 1 of 21) 9111 NM_001351215 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 346.25-9 chr2 33145374 33145782 + 1.25 NA intron (NM_206943, intron 5 of 33) intron (NM_206943, intron 5 of 33) 10981 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 377.5-16 chr5 86733104 86733596 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13468 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 175-78 chr20 48863000 48863317 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -35159 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 222.75-54 chr18 75342437 75342777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85096 NM_001303482 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 172.25-44 chr16 9263518 9263910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91874 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 308-19 chr2 167861495 167862045 + 1.25 NA intron (NM_020981, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 43098 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 133.25-11 chr1 215328991 215329153 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -238232 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 131.75-129 chr22 50379353 50379524 + 1.25 NA intron (NM_001242899, intron 2 of 22) AluJb|SINE|Alu -28004 NR_162128 113218480 NR_162128 MIR12114 - microRNA 12114 ncRNA 182.5-58 chr15 89872558 89872936 + 1.25 NA intron (NM_001199058, intron 7 of 9) MER70C|LTR|ERVL 11283 NR_049807 100846993 NR_049807 ENSG00000264796 MIR5009 - microRNA 5009 ncRNA 117.25-83 chr15 71129463 71129639 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11898 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 180.25-84 chr4 60240365 60240601 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -682136 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 163.25-57 chr18 396212 396400 + 1.25 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 104395 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 134.75-186 chr6 46695249 46695408 + 1.25 NA intron (NM_001010870, intron 1 of 3) intron (NM_001010870, intron 1 of 3) -7163 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 364.25-7 chr12 63226932 63227409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74360 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 274-7 chr11 56519265 56519534 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 23858 NM_001005245 219487 Hs.553632 NM_001005245 ENSG00000255223 OR5M11 OR11-199 olfactory receptor family 5 subfamily M member 11 protein-coding 147.75-134 chr6 53476893 53477023 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 68143 NM_001197115 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 190.5-79 chr2 108481985 108482145 + 1.25 NA intron (NR_028063, intron 9 of 21) intron (NR_028063, intron 9 of 21) 32859 NM_181453 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 208.75-5 chr1 167956854 167957246 + 1.25 NA intron (NM_001198957, intron 2 of 20) L1MEc|LINE|L1 -19978 NM_001143674 25874 Hs.517768 NM_015415 ENSG00000143158 MPC2 BRP44|SLC54A2 mitochondrial pyruvate carrier 2 protein-coding 251.5-3 chr1 155465450 155465693 + 1.25 NA intron (NM_018489, intron 3 of 27) intron (NM_018489, intron 3 of 27) 32391 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 177.5-86 chr2 151062548 151062868 + 1.25 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 199155 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 325-3 chr13 59579888 59580299 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -432625 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-125 chr20 38491430 38491527 + 1.25 NA intron (NM_001282917, intron 2 of 29) L3|LINE|CR1 18635 NM_001282917 57148 Hs.598850 NM_020336 ENSG00000170471 RALGAPB KIAA1219|RalGAPbeta Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit protein-coding 294-27 chr4 31274392 31274837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 103470 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 385.5-16 chr4 61710059 61710644 + 1.25 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 451414 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 226.75-73 chr8 59162368 59162651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43299 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 265.25-12 chr14 36921512 36921880 + 1.25 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) L1ME3A|LINE|L1 30695 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 126.5-109 chr2 42107620 42107758 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 59668 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 153-112 chr5 446742 446921 + 1.25 NA intron (NM_007277, intron 2 of 12) AluSx1|SINE|Alu 3655 NM_007277 11336 Hs.481464 NM_007277 ENSG00000180104 EXOC3 SEC6|SEC6L1|Sec6p exocyst complex component 3 protein-coding 286.75-15 chr14 94544818 94545235 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -16416 NM_001289032 5267 Hs.719893 NM_006215 ENSG00000100665 SERPINA4 KAL|KLST|KST|PI-4|PI4|kallistatin serpin family A member 4 protein-coding 157.5-34 chr11 23401558 23401713 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 17555 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 277-10 chr13 98299071 98299494 + 1.25 NA intron (NM_005766, intron 2 of 26) intron (NM_005766, intron 2 of 26) 90758 NR_036129 100422881 NR_036129 ENSG00000263399 MIR3170 mir-3170 microRNA 3170 ncRNA 229.5-55 chr19 5118836 5119137 + 1.25 NA intron (NM_015015, intron 10 of 22) intron (NM_015015, intron 10 of 22) 149873 NM_001370094 23030 Hs.654816 NM_015015 ENSG00000127663 KDM4B JMJD2B|TDRD14B lysine demethylase 4B protein-coding 392-10 chr4 26761432 26761940 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 98558 NR_134675 105374546 Hs.548859 NR_134673 STIM2-AS1 - STIM2 antisense RNA 1 ncRNA 204-6 chr11 38455112 38455438 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 191081 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 170.75-76 chr20 4674928 4675135 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11425 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 388.75-13 chr9 27866503 27867044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -292907 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 168.5-7 chr1 87789898 87790099 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -418343 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 284.75-12 chr14 58736021 58736508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92024 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 210.25-55 chr3 180875442 180875622 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5354 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 276.25-14 chr15 62862570 62862944 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 38800 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 259.25-4 chr1 167786211 167786593 + 1.25 NA intron (NM_003953, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 64420 NM_003953 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 199.25-48 chr18 9971957 9972167 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58046 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 250-9 chr14 27162870 27163095 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 254340 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 162.25-79 chr2 75830221 75830491 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -119441 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 114.25-167 chr6 54584236 54584340 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -262483 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 293.75-18 chr17 55483839 55484252 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62210 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 194.5-157 chr8 88949540 88949802 + 1.25 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -622188 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 366.25-12 chr4 78267891 78268481 + 1.25 NA intron (NM_001166133, intron 9 of 41) intron (NM_001166133, intron 9 of 41) -20799 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 169.75-50 chr14 83465930 83466183 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 823424 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 154.25-59 chr16 60782171 60782337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 273512 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 231-69 chr5 75121288 75121600 + 1.25 NA intron (NM_001164443, intron 16 of 24) L1PB4|LINE|L1 -68886 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 355.75-17 chr5 157010493 157010951 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -47496 NM_138379 91937 Hs.334907 NM_138379 ENSG00000145850 TIMD4 SMUCKLER|TIM4 T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 protein-coding 260.5-33 chr2 133687512 133687759 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -119172 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 153.25-135 chr8 98720092 98720286 + 1.25 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) intron (NM_006281, intron 4 of 10) 105482 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 214.5-46 chr19 53244905 53245190 + 1.25 NA intron (NM_001317998, intron 3 of 4) L1MA10|LINE|L1 9803 NM_001317998 342926 Hs.20506 NM_182609 ENSG00000197928 ZNF677 - zinc finger protein 677 protein-coding 207-2 chr1 94886292 94886589 + 1.25 NA intron (NM_001258340, intron 12 of 14) intron (NM_001258340, intron 12 of 14) 39368 NM_001286056 1266 Hs.483454 NM_001839 ENSG00000117519 CNN3 - calponin 3 protein-coding 219.5-114 chr6 70436276 70436571 + 1.25 NA intron (NM_020819, intron 3 of 20) intron (NM_020819, intron 3 of 20) -22465 NR_147708 105377849 Hs.669000 NR_147708 ENSG00000224349 LOC105377849 - uncharacterized LOC105377849 ncRNA 421.75-4 chr2 32606110 32606688 + 1.25 NA intron (NM_016252, intron 71 of 73) AluSx|SINE|Alu -21651 NM_017735 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 135.75-136 chr3 55107909 55108098 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -70169 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 251.5-83 chr7 92008030 92008319 + 1.25 NA intron (NM_147185, intron 8 of 49) AluSg|SINE|Alu 67299 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 427.75-3 chr7 111109921 111110299 + 1.25 NA intron (NM_001099658, intron 2 of 2) AluSx4|SINE|Alu 18983 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 243.75-61 chr4 44984217 44984657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -257803 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 181.5-119 chr4 60036554 60036755 + 1.25 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -885965 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 261.75-41 chr6 119916450 119916793 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -98558 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 203-89 chr6 56851390 56851620 + 1.25 NA exon (NM_001144769, exon 4 of 97) exon (NM_001144769, exon 4 of 97) 411 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 197.25-110 chrX 76853340 76853880 + 1.25 NA intron (NR_110403, intron 1 of 3) intron (NR_110403, intron 1 of 3) 65750 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 175.25-99 chr3 135674508 135674706 + 1.25 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy -291121 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 135.75-47 chr12 91239259 91239378 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -56501 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 252.5-62 chr4 52147615 52147966 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 96486 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 252.25-57 chr6 130133037 130133389 + 1.25 NA intron (NM_001007102, intron 19 of 21) intron (NM_001007102, intron 19 of 21) 82672 NM_001277185 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 243-14 chr11 37851811 37852077 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -86657 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 147.25-123 chr6 125907734 125907994 + 1.25 NA intron (NM_001199621, intron 9 of 14) intron (NM_001199621, intron 9 of 14) -11391 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 265.5-39 chr20 59650960 59651242 + 1.25 NA intron (NM_001281507, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 22492 NM_001281507 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 288-17 chr12 81605577 81605842 + 1.25 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -7338 NM_001220478 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 246 chr1 24574222 24574585 + 1.25 NA intron (NM_001010980, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 18316 NM_001010980 400746 Hs.200253 NM_001010980 ENSG00000184454 NCMAP C1orf130|MP11 non-compact myelin associated protein protein-coding 134-42 chr12 84536055 84536333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 376605 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 253.5-80 chr8 137145787 137146034 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 267678 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 326-25 chr5 54114300 54114739 + 1.25 NA intron (NM_019087, intron 3 of 4) intron (NM_019087, intron 3 of 4) -162920 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 230.75-35 chr2 121929101 121929455 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173627 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 270.5-63 chr8 123495048 123495404 + 1.25 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? 36917 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 174.75-41 chr17 29508485 29508647 + 1.25 NA intron (NM_025142, intron 14 of 17) intron (NM_025142, intron 14 of 17) 58471 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 142-126 chr5 44515457 44515644 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -5268 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 225.75 chr1 46315847 46316120 + 1.25 NA intron (NM_001297566, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 12285 NM_006004 7388 Hs.481571 NM_006004 ENSG00000173660 UQCRH QCR6|UQCR8 ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein protein-coding 166-104 chr5 151142953 151143226 + 1.25 NA intron (NM_001363114, intron 2 of 24) MIR3|SINE|MIR -1405 NM_001193544 309 Hs.412117 NM_001155 ENSG00000197043 ANXA6 ANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70 annexin A6 protein-coding 150.25-20 chr10 76574518 76574664 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -313453 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 159.25-36 chr13 94393927 94394089 + 1.25 NA intron (NM_005708, intron 7 of 8) intron (NM_005708, intron 7 of 8) 85674 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 260.75-46 chr4 36074841 36075217 + 1.25 NA intron (NR_146894, intron 31 of 32) intron (NR_146894, intron 31 of 32) 168910 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 128.5-120 chr20 7722810 7722991 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 217558 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 322.5-14 chr19 27635863 27636171 + 1.25 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -157414 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 283.75-3 chr10 28753915 28754327 + 1.25 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) intron (NR_120652, intron 2 of 3) 10471 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 417-10 chr4 117646178 117646776 + 1.25 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 -187924 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 260.5-35 chr2 189872213 189872576 + 1.25 NA intron (NM_000534, intron 11 of 12) intron (NM_000534, intron 11 of 12) 87944 NM_001321049 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 302.5-26 chr3 103795562 103795891 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -271610 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 275.25-21 chr2 155846514 155846790 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 408279 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 158.5-2 chr1 11780509 11780670 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_126000) promoter-TSS (NR_126000) -970 NR_126000 102724659 Hs.737635 NR_126000 ENSG00000177553 LOC102724659 - uncharacterized LOC102724659 ncRNA 148-137 chr9 29625101 29625232 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -411565 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 140.75-145 chr5 53915286 53915416 + 1.25 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 36248 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 205.5-130 chr6 156654156 156654365 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -123595 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 153.25-10 chr10 16486145 16486275 + 1.25 NA intron (NM_030664, intron 3 of 5) intron (NM_030664, intron 3 of 5) 35669 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 146-86 chr20 51834459 51834650 + 1.25 NA intron (NR_110016, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 28359 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 190-72 chr7 33598985 33599206 + 1.25 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -305820 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 203.75-99 chr7 41151158 41151373 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 49661 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 211.5-148 chr7 97251144 97251449 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 134703 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 147.5-17 chr10 30845800 30846135 + 1.25 NA intron (NM_001143766, intron 7 of 7) intron (NM_001143766, intron 7 of 7) 122748 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 182.25 chr1 86267521 86267869 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 89992 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 112.25-174 chr5 162678587 162678749 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 611026 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 314.75-6 chr14 68268602 68269099 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 359937 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 175.75-18 chr10 44082998 44083215 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 170704 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 284.5-29 chr2 27209434 27209739 + 1.25 NA intron (NR_028323, intron 2 of 16) intron (NR_028323, intron 2 of 16) -2445 NM_080592 51374 Hs.9527 NM_016085 ENSG00000138085 ATRAID APR--3|APR-3|APR3|C2orf28|HSPC013|PRO240|p18 all-trans retinoic acid induced differentiation factor protein-coding 330.25-4 chr10 76320220 76320713 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 537705 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 220-49 chr5 79280164 79280520 + 1.25 NA intron (NM_152405, intron 2 of 10) intron (NM_152405, intron 2 of 10) 44211 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 257.5-5 chr1 219279335 219279564 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104480 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 135.75-10 chr1 100120529 100120708 + 1.25 NA intron (NM_001304829, intron 4 of 15) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 12312 NM_001304829 163786 Hs.591447 NM_194292 ENSG00000156876 SASS6 MCPH14|SAS-6|SAS6 SAS-6 centriolar assembly protein protein-coding 184.75-34 chr17 47406828 47407026 + 1.25 NA intron (NM_001195192, intron 18 of 21) intron (NM_001195192, intron 18 of 21) 82972 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 235.25-67 chr9 108262564 108262959 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 593225 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 273.75-26 chr20 56497944 56498298 + 1.25 NA intron (NR_160308, intron 4 of 6) intron (NR_160308, intron 4 of 6) -26608 NM_001012971 200232 Hs.504907 NM_001012971 ENSG00000124103 FAM209A C20orf106|dJ1153D9.3 family with sequence similarity 209 member A protein-coding 164-123 chr6 146933283 146933541 + 1.25 NA intron (NR_034115, intron 7 of 10) intron (NR_034115, intron 7 of 10) -129588 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 209.25-44 chr18 2257188 2257365 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 314229 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 219.75-70 chr6 141170218 141170500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 486545 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 132.75-94 chr2 28533249 28533373 + 1.25 NA intron (NM_153021, intron 9 of 57) intron (NM_153021, intron 9 of 57) -33046 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 116.5-188 chr5 17985776 17985911 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 178569 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 219.25-40 chr2 174583301 174583618 + 1.25 NA intron (NM_001077269, intron 2 of 7) intron (NM_001077269, intron 2 of 7) -25387 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 411.75-9 chr9 14691100 14691524 + 1.25 NA intron (NR_148717, intron 1 of 11) intron (NR_148717, intron 1 of 11) 2120 NM_178566 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 344.5-8 chr13 87547116 87547680 + 1.25 NA intron (NR_033829, intron 1 of 5) intron (NR_033829, intron 1 of 5) 71342 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 184-19 chr12 1618413 1618659 + 1.25 NA intron (NM_030775, intron 1 of 4) intron (NM_030775, intron 1 of 4) 1480 NM_030775 81029 Hs.306051 NM_030775 ENSG00000111186 WNT5B - Wnt family member 5B protein-coding 239.75-33 chr19 32259622 32259951 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -85824 NM_001136156 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 202.75-91 chr5 96131937 96132239 + 1.25 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 52950 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 163-51 chr18 38285295 38285510 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 628267 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 364.25-12 chr14 68093977 68094321 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 270557 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 273-11 chr10 122226988 122227429 + 1.25 NA intron (NM_206862, intron 13 of 22) intron (NM_206862, intron 13 of 22) -44088 NM_001318189 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 310.75-3 chr10 11455747 11456279 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014688, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_014688, exon 15 of 15) 76267 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 222-80 chr8 90221013 90221234 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_051989) promoter-TSS (NR_051989) -365 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 196-14 chr11 36464915 36465166 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001160168, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001160168, exon 6 of 6) 45232 NM_145803 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 134.25-151 chr5 164841081 164841208 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 370865 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 122.25-35 chr11 111979444 111979650 + 1.25 NA intron (NM_033425, intron 1 of 15) intron (NM_033425, intron 1 of 15) 2238 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 270.25-34 chr4 100252815 100253129 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62504 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 182-16 chr10 116825345 116825591 + 1.25 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) AluSz|SINE|Alu 2100 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 162-112 chr8 41906442 41906650 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9805 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 139.25-104 chr20 56036438 56036626 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31013 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 251.75-31 chr18 12804559 12804793 + 1.25 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) L1MA6|LINE|L1 36286 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 129.25-198 chr8 75405172 75405275 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2426 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 239.25-87 chr7 149131790 149132030 + 1.25 NA intron (NM_020781, intron 2 of 6) intron (NM_020781, intron 2 of 6) 5502 NM_020781 57541 Hs.632032 NM_020781 ENSG00000197024 ZNF398 P51|P71|ZER6 zinc finger protein 398 protein-coding 135-16 chr10 71043774 71043971 + 1.25 NA Intergenic (TCTGCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 104819 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 290-36 chr3 197061355 197061799 + 1.25 NA intron (NM_001366216, intron 21 of 23) L1MC4a|LINE|L1 -31760 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 259.75-24 chr2 13125273 13125620 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118433 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 212.25-14 chr11 12054638 12054813 + 1.25 NA intron (NR_135109, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 23850 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 255.25-47 chr6 160433328 160433838 + 1.25 NA intron (NM_021977, intron 5 of 10) AluJo|SINE|Alu 77541 NR_028093 80350 Hs.654503 NM_024492 ENSG00000213071 LPAL2 APOA2|APOAL|APOARGC|apo(a)rg-C lipoprotein(a) like 2, pseudogene pseudo 279.75-16 chr17 47317646 47318062 + 1.25 NA intron (NR_110880, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu 5759 NR_110881 102724508 Hs.661005 NR_110880 ENSG00000263293 THCAT158 - thyroid cancer-associated transcript 158 ncRNA 158-102 chr3 133923716 133923902 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6003 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 213.5-115 chr7 33371644 33371970 + 1.25 NA intron (NM_198428, intron 17 of 22) intron (NM_198428, intron 17 of 22) 242243 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 256-13 chr15 34335197 34335533 + 1.25 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) 1479 NM_133647 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 167.5-71 chr16 86191348 86191557 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4729 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 270-38 chr3 120040687 120040926 + 1.25 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 43842 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 230.5-61 chr2 22277275 22277569 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -259057 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 141-71 chr2 29611548 29611806 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -136300 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 267.75-19 chr15 71713800 71714096 + 1.25 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -22409 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 250.5-24 chr14 20102634 20103057 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14623 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 287.75-24 chr18 1801186 1801640 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -441784 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 143.75-104 chr20 54196713 54196952 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11255 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 432.75 chr11 129261588 129261947 + 1.25 NA intron (NR_145484, intron 1 of 1) intron (NR_145484, intron 1 of 1) 21397 NR_145484 399975 NM_207431 LOC399975 - uncharacterized LOC399975 ncRNA 540.25 chr1 39809286 39809989 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 20661 NR_135805 101929536 Hs.552820 NR_135805 ENSG00000261798 LOC101929536 - uncharacterized LOC101929536 ncRNA 141-125 chr5 45773828 45774075 + 1.25 NA Intergenic (TTGTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -77571 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 263.75-52 chr8 135957395 135957680 + 1.25 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 500081 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 264-65 chr9 30382489 30382845 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 25787 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 217-25 chr15 76333060 76333317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3585 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 141.5-43 chr12 91005512 91005679 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_004950) promoter-TSS (NM_004950) -623 NM_004950 1833 Hs.435680 NM_004950 ENSG00000083782 EPYC DSPG3|PGLB|Pg-Lb|SLRR3B epiphycan protein-coding 244-46 chr5 110348283 110348509 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 165519 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 274.5-38 chr2 106768300 106768648 + 1.25 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 117554 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 204.25-4 chr1 188783978 188784234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1340478 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 172.75-52 chr18 12151723 12152066 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -48885 NR_049896 497259 Hs.451609 NR_049896 C18orf61 - uncharacterized LOC497259 ncRNA 155.25-125 chr3 195168331 195168518 + 1.25 NA intron (NM_152531, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 20553 NR_102711 101410543 Hs.658170 NR_102710 ENSG00000230266 XXYLT1-AS2 - XXYLT1 antisense RNA 2 ncRNA 243.5-44 chr20 36902643 36903061 + 1.25 NA intron (NM_015474, intron 13 of 15) AluSz|SINE|Alu 26714 NM_080628 140711 Hs.472630 NM_080628 ENSG00000101342 TLDC2 C20orf118 TBC/LysM-associated domain containing 2 protein-coding 209 chr1 55943951 55944163 + 1.25 NA intron (NR_147162, intron 1 of 2) LTR33|LTR|ERVL 906 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 121.75-174 chr7 29195793 29195905 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001348052) promoter-TSS (NM_001348052) -398 NM_001348052 54504 Hs.233389 NM_019029 ENSG00000106066 CPVL HVLP carboxypeptidase vitellogenic like protein-coding 211.5-125 chr5 66581168 66581362 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15128 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 264.75-40 chr4 185526906 185527203 + 1.25 NA intron (NM_001114107, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 8504 NM_001257963 27295 Hs.701364 NM_014476 ENSG00000154553 PDLIM3 ALP PDZ and LIM domain 3 protein-coding 175.75-79 chr21 15226083 15226288 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -161185 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 112.75-205 chr9 29236003 29236146 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22473 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 180-4 chr1 111007096 111007361 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -43284 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 196.75-56 chr2 55182294 55182530 + 1.25 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) intron (NR_148539, intron 1 of 3) -44581 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 222.25-24 chr16 72816505 72816790 + 1.25 NA intron (NM_001164766, intron 4 of 8) intron (NM_001164766, intron 4 of 8) -151677 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 204-11 chr12 109755932 109756299 + 1.25 NA intron (NM_032829, intron 2 of 2) L1M3|LINE|L1 17372 NR_026661 84983 Hs.675961 NM_032897 ENSG00000255650 FAM222A-AS1 - FAM222A antisense RNA 1 ncRNA 190.75-60 chr20 44997816 44998098 + 1.25 NA intron (NM_001352385, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR 31445 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 172.75-12 chr10 58250014 58250268 + 1.25 NA intron (NM_152230, intron 1 of 5) L1MA4|LINE|L1 17753 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 223.25-60 chr5 38539507 38539833 + 1.25 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) intron (NM_002310, intron 1 of 19) 16976 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 136.5-63 chr13 100692896 100693137 + 1.25 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -15309 NR_047687 100885778 Hs.602949 NR_047687 ENSG00000233009 NALCN-AS1 - NALCN antisense RNA 1 ncRNA 200.75-93 chr6 143312755 143313090 + 1.25 NA intron (NM_016108, intron 4 of 5) L1MA3|LINE|L1 129755 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 355.25-7 chr2 222347888 222348185 + 1.25 NA intron (NR_136642, intron 2 of 3) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 27375 NR_136639 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 189.25-103 chr6 44923099 44923410 + 1.25 NA intron (NM_001350324, intron 10 of 11) intron (NM_001350324, intron 10 of 11) 274516 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 250.75-55 chr5 73742993 73743314 + 1.25 NA intron (NM_001177693, intron 2 of 35) L1MEg|LINE|L1 -70393 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 229.5-38 chr14 49171460 49171781 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 414760 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 116-182 chr9 14025265 14025364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 97343 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 233.5-3 chr1 57794525 57794830 + 1.25 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 -65904 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 233.5 chr1 48338702 48338910 + 1.25 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1ME3A|LINE|L1 116090 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 134.25-112 chr3 60325593 60325822 + 1.25 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -244798 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 302.25-25 chr7 50936235 50936672 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -143000 NM_001371008 182.25-58 chr19 49863307 49863566 + 1.25 NA intron (NM_007254, intron 8 of 16) intron (NM_007254, intron 8 of 16) 4140 NM_007254 11284 Hs.78016 NM_007254 ENSG00000039650 PNKP AOA4|EIEE10|MCSZ|PNK polynucleotide kinase 3'-phosphatase protein-coding 150.75-71 chr16 8662175 8662311 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -12374 NM_020686 18 Hs.336768 NM_000663 ENSG00000183044 ABAT GABA-AT|GABAT|NPD009 4-aminobutyrate aminotransferase protein-coding 132.5-12 chr1 69111295 69111434 + 1.25 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) intron (NR_146608, intron 3 of 4) 55466 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 260.5-8 chr11 9011961 9012396 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -8177 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 226.75-29 chr18 75501677 75502023 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74147 NM_001037331 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 159.5-211 chr8 123789829 123789963 + 1.25 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) intron (NM_144963, intron 15 of 23) 21457 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 272.75-41 chr5 66285387 66285955 + 1.25 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -76225 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 312.25-19 chr3 84362766 84363039 + 1.25 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu 506673 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 243-59 chr5 78629703 78629958 + 1.25 NA intron (NM_005779, intron 2 of 4) intron (NM_005779, intron 2 of 4) 18942 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 243-49 chr3 196646386 196646621 + 1.25 NA intron (NM_198565, intron 1 of 2) intron (NM_198565, intron 1 of 2) 6809 NM_198565 375387 Hs.702186 NM_198565 ENSG00000174004 NRROS ELLP3030|GARPL1|LRRC33|UNQ3030 negative regulator of reactive oxygen species protein-coding 151.25-170 chr7 32922139 32922311 + 1.25 NA intron (NR_003500, intron 3 of 5) MER54B|LTR|ERVL 20945 NR_003500 441212 Hs.648086 NM_001039754 ENSG00000205763 RP9P - RP9 pseudogene pseudo 292.5-57 chr9 101953253 101953611 + 1.25 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -214852 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 195.25-67 chr4 52407682 52407888 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 248754 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 242.25-85 chr8 83281818 83282026 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -121836 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 305.25-10 chr11 82476581 82476877 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -72816 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 172.25-144 chr9 70577601 70577829 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) intron (NM_001366143, intron 21 of 25) -163058 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 212-77 chr7 34675032 34675321 + 1.25 NA intron (NM_207172, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 16937 NM_001300934 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 243.75-16 chr12 19487838 19488124 + 1.25 NA intron (NM_001114176, intron 3 of 8) intron (NM_001114176, intron 3 of 8) 47382 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 199.75-59 chr20 53372980 53373366 + 1.25 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -179597 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 202.5-80 chr2 152798407 152798763 + 1.25 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 79948 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 361-17 chr7 52250217 52250538 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -785256 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 305-26 chr3 94759837 94760281 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -178204 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 358.5-7 chr16 7825175 7825521 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 492503 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 191-85 chr8 131672496 131672751 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -231470 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 163.25-152 chr9 85053873 85054124 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 348097 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 229.5-85 chr3 32623519 32623806 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -52738 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 329.25-30 chr8 133953243 133953602 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 66926 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 173.75-53 chr14 48327063 48327229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -532132 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 272-18 chr2 208114029 208114273 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -4978 NR_038437 100507443 Hs.570295 NR_038437 LOC100507443 - uncharacterized LOC100507443 ncRNA 336.75-2 chr10 53825366 53825703 + 1.25 NA intron (NM_001142773, intron 30 of 31) intron (NM_001142773, intron 30 of 31) -660696 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 217.25-17 chr10 99115495 99115951 + 1.25 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 120152 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 223-9 chr10 57713751 57714003 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -409318 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 194.5-135 chr6 147504651 147504935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3897 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 159.25-148 chr8 82086873 82087181 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -244741 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 164.5-205 chr8 79198372 79198534 + 1.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -133735 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 129-55 chr13 43281847 43282146 + 1.25 NA intron (NM_001347966, intron 13 of 17) intron (NM_001347966, intron 13 of 17) -166856 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 194.5-168 chrX 40345344 40345552 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 82531 NR_110386 101927476 Hs.522607 NR_110386 ENSG00000236393 LOC101927476 - uncharacterized LOC101927476 ncRNA 376.25-12 chr2 210282994 210283370 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 20433 NM_079422 4632 Hs.187338 NM_079420 ENSG00000168530 MYL1 MLC1F|MLC3F|MYOFTA myosin light chain 1 protein-coding 384.75-8 chr2 178694809 178695375 + 1.25 NA intron (NM_001256850, intron 113 of 312) intron (NM_001256850, intron 113 of 312) -81834 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 206.5-75 chr3 152148914 152149187 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56379 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 181.25-64 chr2 72187767 72187927 + 1.25 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) MER52D|LTR|ERV1 -39985 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 351.75-7 chr13 112725763 112726188 + 1.25 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) 28756 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 173.25-18 chr10 101127827 101128021 + 1.25 NA intron (NR_130724, intron 1 of 2) intron (NR_130724, intron 1 of 2) 3222 NR_130723 100038246 Hs.368784 NM_001085398 ENSG00000236311 TLX1NB APT-B7|TD1|TDI TLX1 neighbor ncRNA 248.75-58 chr8 35731478 35731792 + 1.25 NA intron (NM_001322818, intron 11 of 16) intron (NM_001322818, intron 11 of 16) -21315 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 200-52 chr20 33914722 33914915 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -79093 NM_007367 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 160.25-42 chr14 85226747 85226999 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45059 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 281.75-33 chr5 5795114 5795439 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 372599 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 134-103 chr2 170681819 170682000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 32658 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 186.25-78 chr4 61284444 61284745 + 1.25 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 82422 NM_001371342 160.75-136 chr6 135671103 135671271 + 1.25 NA intron (NR_152842, intron 3 of 5) L1MB1|LINE|L1 173386 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 233.5-37 chr14 67019552 67019931 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -169699 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 204.75-86 chr4 96698426 96698620 + 1.25 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 387820 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 151.75-47 chr16 13007298 13007535 + 1.25 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 105818 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 209.25-31 chr14 101885767 101885989 + 1.25 NA intron (NM_001161725, intron 7 of 15) intron (NM_001161725, intron 7 of 15) 76015 NM_001352912 5527 Hs.368264 NM_002719 ENSG00000078304 PPP2R5C B56G|B56gamma|PR61G protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma protein-coding 221.5-42 chr2 36176079 36176302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179380 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 329.25-5 chr11 113561001 113561322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -85763 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 255.25-45 chr6 84369903 84370282 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104837 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 350.5-12 chr15 62034080 62034403 + 1.25 NA intron (NM_001018088, intron 4 of 81) L1ME4c|LINE|L1 26206 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 253-53 chr8 100420853 100421174 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 38250 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 283.5-49 chr6 67267464 67267721 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -787759 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 152-130 chr6 37034255 37034468 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 28706 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 287.5-35 chr2 156560473 156560875 + 1.25 NA intron (NM_000408, intron 9 of 16) intron (NM_000408, intron 9 of 16) 124295 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 356-3 chr16 64150182 64150729 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 971608 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 224.5-99 chr7 23865083 23865280 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154962 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 324.5-3 chr1 224055661 224056025 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -58268 NM_001136115 23219 Hs.64691 NM_015176 ENSG00000143756 FBXO28 CENP-30|Fbx28 F-box protein 28 protein-coding 233.25-70 chr8 103686313 103686558 + 1.25 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) L1ME1|LINE|L1 -132785 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 382-9 chr2 18191603 18192077 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 313173 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 118-88 chr2 127521340 127521477 + 1.25 NA intron (NM_017969, intron 2 of 13) L1ME4a|LINE|L1 5081 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 286.5-47 chr4 31619247 31619576 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 112867 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 153-107 chr4 104258496 104258680 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -232377 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 335.75-16 chr5 18181941 18182218 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 374805 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 189-24 chr11 68631563 68631853 + 1.25 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 -52836 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 171.75-5 chr1 107018338 107018632 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38189 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 230.25-34 chr19 14264606 14264833 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -58550 NM_001008701 22859 Hs.94229 NM_014921 ENSG00000072071 ADGRL1 CIRL1|CL1|LEC2|LPHN1 adhesion G protein-coupled receptor L1 protein-coding 127.5-213 chr6 96088241 96088369 + 1.25 NA intron (NM_006581, intron 1 of 2) L1MEc|LINE|L1 72331 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 167.75-14 chr1 193714115 193714322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 409473 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 261.25-9 chr14 65122857 65123107 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -20287 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 293.25-33 chr8 40787949 40788277 + 1.25 NA intron (NM_024645, intron 2 of 6) L1MC2|LINE|L1 109713 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 122-23 chr1 214396872 214397013 + 1.25 NA intron (NM_005401, intron 8 of 18) intron (NM_005401, intron 8 of 18) 115783 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 243.5-29 chr16 7683127 7683414 + 1.25 NA intron (NM_145892, intron 11 of 12) intron (NM_145892, intron 11 of 12) 350425 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 300-21 chr17 78055249 78055544 + 1.25 NA intron (NM_018996, intron 4 of 20) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 51159 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 118.5-153 chr4 136282156 136282317 + 1.25 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -368556 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 130-172 chr8 117390034 117390225 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -130584 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 137.25-24 chr11 19958923 19959105 + 1.25 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) intron (NM_182964, intron 10 of 37) -63542 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 262-65 chr9 31857588 31857966 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -476287 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 193.75-90 chr3 191561634 191561812 + 1.25 NA intron (NR_120606, intron 4 of 6) intron (NR_120606, intron 4 of 6) 100560 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 193.75-43 chr14 58961202 58961384 + 1.25 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) intron (NR_110547, intron 4 of 5) 133005 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 198.75-88 chr7 3484872 3485051 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MA4|LINE|L1 183709 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 356.25-8 chr19 50396086 50396550 + 1.25 NA intron (NR_046402, intron 1 of 25) AluSz|SINE|Alu -2534 NM_001308632 5424 Hs.279413 NM_002691 ENSG00000062822 POLD1 CDC2|CRCS10|MDPL|POLD DNA polymerase delta 1, catalytic subunit protein-coding 149-147 chrX 120776770 120776929 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 99076 NM_001145718 643311 Hs.729566 NM_001145718 ENSG00000236446 CT47B1 CT47.13|CT47A13 cancer/testis antigen family 47 member B1 protein-coding 258-43 chr4 72053972 72054222 + 1.25 NA intron (NM_053036, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 14965 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 303.25-9 chr12 122317760 122318037 + 1.25 NA intron (NM_198240, intron 16 of 23) intron (NM_198240, intron 16 of 23) -51404 NM_001351018 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 131.5-123 chr2 128707731 128707891 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -156789 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 152.25-78 chr2 12911483 12911679 + 1.25 NA Intergenic (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 95432 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 165.75-31 chr11 105025734 105025943 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001257118, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001257118, exon 9 of 9) -2670 NM_001136110 838 Hs.213327 NM_004347 ENSG00000137757 CASP5 ICE(rel)III|ICEREL-III|ICH-3 caspase 5 protein-coding 260.75-66 chr8 125121120 125121533 + 1.25 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) intron (NM_001349486, intron 3 of 7) 29466 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 137.25-119 chr5 18799175 18799368 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 991997 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 216.25-45 chr16 85330888 85331195 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -24716 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 251.5-37 chr2 150416718 150416971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70851 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 185.75-97 chr5 18603003 18603206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 795830 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 221.25-68 chr5 9798425 9798737 + 1.25 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) MIR3|SINE|MIR -55796 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 179.5-41 chr12 45316684 45316934 + 1.25 NA intron (NM_001025356, intron 2 of 19) intron (NM_001025356, intron 2 of 19) 24119 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 169.75-86 chr2 147900746 147900978 + 1.25 NA intron (NM_001278579, intron 5 of 11) intron (NM_001278579, intron 5 of 11) 55833 NM_001616 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 391.25-14 chr5 167155816 167156304 + 1.25 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) 12341 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 178-92 chr7 22949668 22949832 + 1.25 NA intron (NM_001363467, intron 10 of 11) intron (NM_001363467, intron 10 of 11) 64380 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 225.5-81 chr4 94960029 94960269 + 1.25 NA intron (NM_001203, intron 2 of 12) intron (NM_001203, intron 2 of 12) -36083 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 183-53 chr2 139244317 139244596 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 347132 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 272.25-5 chr10 115992475 115992860 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 202122 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 205-51 chr3 115127674 115127945 + 1.25 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) 19479 NM_015642 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 154.75-71 chr2 56861017 56861216 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -675346 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 297.5-17 chr14 62300212 62300540 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -160403 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 281.25-35 chr4 18862165 18862563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -840489 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 138.25-169 chr8 74831897 74832095 + 1.25 NA intron (NM_015886, intron 2 of 5) intron (NM_015886, intron 2 of 5) 7462 NM_001324403 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 126.25-118 chr3 103228334 103228473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 295713 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 265.25-7 chr11 36187099 36187530 + 1.25 NA intron (NM_001304264, intron 4 of 5) intron (NM_001304264, intron 4 of 5) 102110 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 149.5-211 chr8 123711079 123711378 + 1.25 NA intron (NM_001003954, intron 3 of 11) L2|LINE|L2 26165 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 124.75-2 chr1 68120633 68120807 + 1.25 NA intron (NR_040077, intron 7 of 9) intron (NR_040077, intron 7 of 9) 62890 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 162.25-143 chr6 89154833 89155114 + 1.25 NA intron (NM_001010853, intron 4 of 6) intron (NM_001010853, intron 4 of 6) 8918 NM_001010853 135293 Hs.356247 NM_001010853 ENSG00000146281 PM20D2 ACY1L2 peptidase M20 domain containing 2 protein-coding 145.25-53 chr17 42442979 42443110 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15834 NM_005177 535 Hs.463074 NM_005177 ENSG00000033627 ATP6V0A1 ATP6N1|ATP6N1A|Stv1|VPP1|Vph1|a1 ATPase H+ transporting V0 subunit a1 protein-coding 281.75-12 chr11 114460961 114461235 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 21631 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 167.75-38 chr12 67808066 67808297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78706 NR_110063 101927901 Hs.369609 NR_110063 ENSG00000255970 LINC02421 - long intergenic non-protein coding RNA 2421 ncRNA 187-61 chr3 109933966 109934304 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 331307 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 273-8 chr10 48383356 48383629 + 1.25 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -18120 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 149.75-132 chr5 129226653 129226815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129046 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 227.5 chr1 45715760 45716063 + 1.25 NA intron (NM_001145349, intron 7 of 9) intron (NM_001145349, intron 7 of 9) 27730 NM_016486 51249 Hs.699548 NM_016486 ENSG00000159596 TMEM69 C1orf154 transmembrane protein 69 protein-coding 218.5-92 chr4 152022946 152023183 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77689 NR_121628 100996286 Hs.322462 NR_121627 ENSG00000245954 LINC02273 - long intergenic non-protein coding RNA 2273 ncRNA 264.75-37 chr4 48110730 48110964 + 1.25 NA intron (NM_003328, intron 4 of 14) intron (NM_003328, intron 4 of 14) 23403 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 166-96 chr5 37479786 37480044 + 1.25 NA exon (NM_001345999, exon 7 of 17) exon (NM_001345999, exon 7 of 17) 100597 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 255-20 chr17 80003899 80004108 + 1.25 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu 31869 NM_019020 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 155-125 chr6 137912423 137912555 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 33311 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 298.5-40 chr8 63322466 63322736 + 1.25 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 -143248 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 266.25-51 chr9 6274964 6275267 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 26644 NM_001353802 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 127.75-101 chr2 82811648 82811784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45087 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 246-72 chr9 99849850 99850199 + 1.25 NA intron (NM_006981, intron 7 of 7) intron (NM_006981, intron 7 of 7) 28139 NM_006981 8013 Hs.279522 NM_006981 ENSG00000119508 NR4A3 CHN|CSMF|MINOR|NOR1|TEC nuclear receptor subfamily 4 group A member 3 protein-coding 289-31 chr5 35446959 35447279 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -170744 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 120-201 chr9 98842813 98842983 + 1.25 NA intron (NM_024642, intron 7 of 9) MER33|DNA|hAT-Charlie 35228 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 325.5-10 chr15 45486500 45487018 + 1.25 NA intron (NM_013309, intron 6 of 7) intron (NM_013309, intron 6 of 7) -24377 NR_022014 283651 Hs.574240 NM_173609 HMGN2P46 C15orf21|D-PCa-2 high mobility group nucleosomal binding domain 2 pseudogene 46 pseudo 222.5-52 chr2 106797419 106797706 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88466 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 271.75-3 chr10 5728289 5728720 + 1.25 NA intron (NM_017782, intron 10 of 20) AluSc8|SINE|Alu 43666 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 315.25-27 chr5 152784290 152784686 + 1.25 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) intron (NR_109877, intron 3 of 4) 187861 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 391.5-12 chr3 31457609 31458074 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -75084 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 336-26 chr8 46323231 46323549 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 294253 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 161-61 chr2 34734362 34734610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56929 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 239.5-8 chr10 16162897 16163195 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -273897 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 307.5-38 chr3 126122010 126122406 + 1.25 NA intron (NR_072979, intron 15 of 20) L1M4b|LINE|L1 18568 NR_046602 100874204 Hs.742339 NR_046602 ENSG00000250218 ALDH1L1-AS1 - ALDH1L1 antisense RNA 1 ncRNA 186-70 chr5 90220252 90220456 + 1.25 NA intron (NR_120601, intron 3 of 5) (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 69717 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 127.25-85 chr2 51405183 51405295 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) L1MC1|LINE|L1 372638 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 329.75-11 chr21 37301461 37301799 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33522 NM_001331022 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 169-23 chr13 44097378 44097550 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13085 NR_104065 101929212 Hs.534877 NR_104064 ENSG00000227258 SMIM2-AS1 C13orf44-AS1|C3orf81-AS1 SMIM2 antisense RNA 1 ncRNA 140.75-23 chr10 125930538 125930782 + 1.25 NA intron (NM_001363549, intron 1 of 10) L1ME3|LINE|L1 33854 NM_001363549 92565 Hs.352591 NM_145235 ENSG00000203780 FANK1 HSD13 fibronectin type III and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 187.25-73 chr3 32880422 32880747 + 1.25 NA intron (NM_001039111, intron 2 of 3) intron (NM_001039111, intron 2 of 3) 62587 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 116-168 chr8 79076992 79077119 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 239526 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 151.25-104 chr20 33188650 33188808 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4876 NR_026760 317716 Hs.434194 NM_173859 ENSG00000183566 BPIFA4P BASE BPI fold containing family A member 4, pseudogene pseudo 197.75-16 chr12 22684199 22684425 + 1.25 NA intron (NM_018638, intron 6 of 7) intron (NM_018638, intron 6 of 7) 59141 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 202.5-145 chr9 3324994 3325323 + 1.25 NA intron (NM_134428, intron 5 of 17) intron (NM_134428, intron 5 of 17) 70438 NM_002919 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 247-45 chr4 56905843 56906353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1802 NM_005612 5978 Hs.307836 NM_005612 ENSG00000084093 REST DFNA27|GINGF5|HGF5|NRSF|WT6|XBR RE1 silencing transcription factor protein-coding 203.25-60 chr20 7467916 7468128 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 96414 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 261.75-42 chr6 127119366 127119662 + 1.25 NA intron (NM_032784, intron 1 of 4) CpG 843 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 271.5-75 chr6 47807344 47807787 + 1.25 NA intron (NR_033806, intron 4 of 6) intron (NR_033806, intron 4 of 6) 20497 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 323-27 chr8 123856428 123856978 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 4716 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 354.25-7 chr20 17544585 17544961 + 1.25 NA intron (NM_001278606, intron 1 of 8) intron (NM_001278606, intron 1 of 8) -13394 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 275.5-16 chr12 86070058 86070291 + 1.25 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 186217 NM_001351283 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 165.25-61 chr19 27338486 27338780 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -454798 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 183.5-121 chr6 38611136 38611406 + 1.25 NA intron (NM_001099272, intron 1 of 10) intron (NM_001099272, intron 1 of 10) -15204 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 271.5-72 chr5 116190056 116190317 + 1.25 NA non-coding (NR_146218, exon 7 of 7) non-coding (NR_146218, exon 7 of 7) -65557 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 319-9 chr12 82297854 82298251 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60335 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 292.5-42 chr5 86794681 86794949 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47997 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 193.5-17 chr10 84317895 84318117 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10583 NM_001351290 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 201.5-18 chr10 14396866 14397150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13731 NR_036181 100422843 NR_036181 ENSG00000266321 MIR4293 - microRNA 4293 ncRNA 262.75-7 chr11 39151869 39152129 + 1.25 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 503141 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 129.5-56 chr12 47393915 47394102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21000 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 319-8 chr12 81534421 81534834 + 1.25 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) intron (NM_001220474, intron 2 of 30) -22236 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 183.5-165 chr9 134151252 134151417 + 1.25 NA intron (NM_052821, intron 7 of 12) intron (NM_052821, intron 7 of 12) 11542 NM_052821 11091 Hs.397638 NM_017588 ENSG00000196363 WDR5 BIG-3|CFAP89|SWD3 WD repeat domain 5 protein-coding 162-18 chr10 117190170 117190423 + 1.25 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -7193 NM_181840 338567 Hs.449650 NM_181840 ENSG00000186795 KCNK18 K2p18.1|MGR13|TRESK|TRESK-2|TRESK2|TRIK potassium two pore domain channel subfamily K member 18 protein-coding 233.75-5 chr1 78714923 78715298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65279 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 136-87 chr20 7212997 7213187 + 1.25 NA intron (NR_110609, intron 3 of 7) L1M4b|LINE|L1 41110 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 185.5-41 chr13 19849883 19850060 + 1.25 NA intron (NM_001142684, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu 13665 NM_001039649 9205 Hs.530988 NM_014242 ENSG00000132950 ZMYM5 HSPC050|MYM|ZNF198L1|ZNF237 zinc finger MYM-type containing 5 protein-coding 128.5-172 chr5 86338874 86339083 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 56534 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 326.5-20 chr4 95726539 95726871 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -113388 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 278.5-24 chr18 2471812 2472326 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 99436 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 236-61 chr6 37865985 37866291 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 46411 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 225.5-28 chr12 116225702 116225996 + 1.25 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) 51337 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 259.5-6 chr1 69949828 69950297 + 1.25 NA intron (NM_001370785, intron 8 of 26) intron (NM_001370785, intron 8 of 26) 30740 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 234.5-94 chr8 92684178 92684566 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28878 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 152.25-131 chr5 96297859 96298067 + 1.25 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 134196 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 233.75-55 chr4 96730755 96731107 + 1.25 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 420228 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 132-140 chr5 104673488 104673607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -425927 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 141.25-20 chr10 45657233 45657441 + 1.25 NA intron (NM_174890, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 15395 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 194.75-28 chr14 79077906 79078144 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -121957 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 214.25-45 chr2 125867704 125867926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 250170 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 170.5-190 chr8 117855282 117855456 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 65544 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 309-29 chr4 31751660 31752082 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 245327 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 122-90 chr2 44253983 44254201 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -21388 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 198.5-115 chr5 66793161 66793393 + 1.25 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) intron (NM_001290228, intron 3 of 4) -35496 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 262.75-52 chr8 53746894 53747116 + 1.25 NA intron (NM_213620, intron 12 of 13) intron (NM_213620, intron 12 of 13) 96037 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 325-20 chr6 113439112 113439516 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5867 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 237.5-62 chr3 96021613 96021960 + 1.25 NA Intergenic MamGypLTR2b|LTR|Gypsy -338178 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 199.75-64 chr3 70630495 70630714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -317966 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 306.25-19 chr2 60182734 60183039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 200150 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 148.25-19 chr10 22552099 22552259 + 1.25 NA intron (NM_005028, intron 6 of 9) intron (NM_005028, intron 6 of 9) -114250 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 151.75-67 chr2 135010896 135011056 + 1.25 NA intron (NM_001321177, intron 2 of 9) intron (NM_001321177, intron 2 of 9) 12673 NM_001321177 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 327.75-29 chr9 104010964 104011385 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11465 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 160.25-140 chr6 55812757 55812958 + 1.25 NA intron (NM_001329754, intron 2 of 5) intron (NM_001329754, intron 2 of 5) 62733 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 206.25-115 chrX 96402709 96403082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64993 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 210.75-84 chr5 155692366 155692667 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -634241 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 154.25-159 chr7 100960210 100960391 + 1.25 NA exon (NM_005960, exon 2 of 12) exon (NM_005960, exon 2 of 12) -9323 NM_001164462 10071 Hs.489355 NM_001164462 ENSG00000205277 MUC12 MUC-11|MUC-12|MUC11 mucin 12, cell surface associated protein-coding 261.5-37 chr20 46143004 46143311 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 24843 NM_001302753 958 Hs.472860 NM_001250 ENSG00000101017 CD40 Bp50|CDW40|TNFRSF5|p50 CD40 molecule protein-coding 162.75-27 chr12 58443693 58443907 + 1.25 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -147902 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 309.5-22 chr2 127344756 127345016 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1657 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 366-17 chr8 115770985 115771502 + 1.25 NA Intergenic CR1-L3A_Croc|LINE|CR1 -102268 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 168-30 chr11 122472729 122473216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50101 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 237-25 chr2 51867848 51868147 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -502651 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 256.5-40 chr20 51393439 51393717 + 1.25 NA intron (NM_001258295, intron 9 of 9) intron (NM_001258295, intron 9 of 9) 59399 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 165.5-116 chr3 115266920 115267177 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -119760 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 336-22 chr6 23382297 23382794 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -664621 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 181.25-115 chr6 121202968 121203146 + 1.25 NA intron (NR_104452, intron 23 of 35) intron (NR_104452, intron 23 of 35) 131423 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 159.25-57 chr18 49365300 49365512 + 1.25 NA intron (NM_001353210, intron 5 of 16) intron (NM_001353210, intron 5 of 16) 95239 NM_001353210 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 258-42 chr4 54697453 54697849 + 1.25 NA intron (NM_000222, intron 2 of 20) intron (NM_000222, intron 2 of 20) 39723 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 139.25-72 chr18 74922208 74922400 + 1.25 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 283209 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 162.25-67 chr17 32663436 32663608 + 1.25 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 176529 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 264.25-37 chr3 18887023 18887312 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -261343 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 459 chr15 57695269 57695993 + 1.25 NA intron (NR_104368, intron 12 of 13) intron (NR_104368, intron 12 of 13) -10890 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 195.25-13 chr1 192306186 192306480 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10659 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 211.5-36 chr12 33702295 33702484 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -262570 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 292.5-43 chr5 120764095 120764517 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 232842 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 235-75 chr9 3001082 3001399 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -157145 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 247.75-63 chr8 19288437 19288679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25012 NM_001174160 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 221.75-51 chr4 106528651 106529061 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 95232 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 497.25-5 chr8 112777807 112778698 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L1MC1|LINE|L1 134759 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 191.75-129 chr8 129754415 129754685 + 1.25 NA intron (NM_031415, intron 6 of 13) L1MA2|LINE|L1 32074 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 141.5-146 chr3 124492004 124492140 + 1.25 NA intron (NM_001024660, intron 31 of 59) intron (NM_001024660, intron 31 of 59) -92586 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 206-31 chr15 77372396 77372595 + 1.25 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 47609 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 292-4 chr10 33622725 33623101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149767 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 239-2 chr1 75850051 75850394 + 1.25 NA intron (NM_002440, intron 8 of 19) L1MEc|LINE|L1 53340 NM_002440 4438 Hs.216639 NM_002440 ENSG00000057468 MSH4 - mutS homolog 4 protein-coding 191.75-23 chr11 82699866 82700066 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 33898 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 112.5-247 chr9 98610482 98610587 + 1.25 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 98401 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 180.25-26 chr14 67804517 67804821 + 1.25 NA intron (NM_015346, intron 8 of 41) intron (NM_015346, intron 8 of 41) 11921 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 216.25-4 chr1 66834766 66834996 + 1.25 NA intron (NM_024763, intron 11 of 16) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -33622 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 154.75-108 chr4 66126357 66126659 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -150316 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 271-29 chr22 41719382 41719688 + 1.25 NA intron (NM_152513, intron 6 of 30) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 20032 NM_152513 150365 Hs.116419 NM_152513 ENSG00000167077 MEI1 HYDM3|SPATA38 meiotic double-stranded break formation protein 1 protein-coding 274.75-31 chr2 238112276 238112650 + 1.25 NA intron (NM_194312, intron 4 of 8) L1MEg|LINE|L1 12123 NM_194312 339768 Hs.127724 NM_194312 ENSG00000144488 ESPNL - espin like protein-coding 339.25-8 chr2 55478889 55479185 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40558 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 250.75-46 chr4 46621874 46622148 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -231883 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 136.75-16 chr1 232038852 232038994 + 1.25 NA non-coding (NR_028393, exon 16 of 16) non-coding (NR_028393, exon 16 of 16) 113089 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 227.5-16 chr10 91433946 91434155 + 1.25 NA intron (NM_182765, intron 2 of 20) intron (NM_182765, intron 2 of 20) 23765 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 136.75-137 chr3 180031099 180031216 + 1.25 NA intron (NM_016559, intron 1 of 14) intron (NM_016559, intron 1 of 14) 5780 NM_001349389 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 450-3 chr11 54548729 54549248 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 55010 NM_001004703 119749 Hs.553564 NM_001004703 ENSG00000185926 OR4C46 - olfactory receptor family 4 subfamily C member 46 protein-coding 175-106 chr5 124453944 124454139 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15521 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 243.25-45 chr6 55198020 55198301 + 1.25 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) intron (NM_001526, intron 2 of 7) 91700 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 188-8 chr10 91554048 91554547 + 1.25 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) MER1B|DNA|hAT-Charlie 57163 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 285-42 chr7 140822507 140822759 + 1.25 NA intron (NR_148928, intron 3 of 17) L1ME1|LINE|L1 102296 NR_148928 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 273.75-24 chr2 189787654 189787894 + 1.25 NA intron (NR_110332, intron 2 of 12) MIR|SINE|MIR 3324 NM_001321049 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 168.5-87 chr2 116328402 116328775 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 984773 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 165-104 chr4 41693164 41693316 + 1.25 NA intron (NM_001330786, intron 22 of 22) intron (NM_001330786, intron 22 of 22) 55730 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 262.75-18 chr15 63025085 63025361 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -17524 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 236.5-34 chr16 13764899 13765143 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -155136 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 148.25-86 chr22 30791705 30791913 + 1.25 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) intron (NM_001282740, intron 1 of 12) 27556 NM_001282740 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 246.25-64 chr7 49975292 49975644 + 1.25 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1PA15-16|LINE|L1 117778 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 180.5-8 chr10 19820068 19820303 + 1.25 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 3753 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 217.5-122 chr7 92396516 92396813 + 1.25 NA intron (NM_019004, intron 18 of 19) MIRb|SINE|MIR 40650 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 172.5-51 chr12 51114081 51114240 + 1.25 NA intron (NM_005653, intron 4 of 14) L1MB3|LINE|L1 -30564 NM_030809 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 225.25-4 chr1 87046644 87046892 + 1.25 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu -82997 NR_026988 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 164.75-131 chr7 28881637 28881769 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 76627 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 417.5-3 chr14 82825239 82825641 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 182808 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 254-42 chr7 96042049 96042424 + 1.25 NA intron (NM_004411, intron 14 of 16) L1MC5|LINE|L1 177520 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 251.5-46 chr20 18446375 18446640 + 1.25 NA intron (NM_001367611, intron 7 of 20) L1ME1|LINE|L1 20523 NM_001367612 55184 Hs.472225 NM_018152 ENSG00000089091 DZANK1 ANKRD64|C20orf12|C20orf84 double zinc ribbon and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 117-108 chr21 25018526 25018723 + 1.25 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 178074 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 216.5-92 chr5 45046210 45046509 + 1.25 NA Intergenic (ATATAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 237412 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 141.25-34 chr12 11616178 11616441 + 1.25 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -33545 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 195.25-61 chr3 25685602 25685805 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20764 NR_039644 100616477 NR_039644 ENSG00000283971 MIR4442 mir-4442 microRNA 4442 ncRNA 245.5-53 chr3 180572079 180572389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29929 NM_001042601 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 214.25-62 chr4 101951883 101952091 + 1.25 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 138145 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 138.75-155 chr5 131002219 131002382 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162956 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 119.75-160 chr4 101828677 101828829 + 1.25 NA intron (NM_001083907, intron 1 of 16) HAL1b|LINE|L1 14911 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 142.5-60 chr13 75637242 75637495 + 1.25 NA intron (NM_001306080, intron 1 of 30) intron (NM_001306080, intron 1 of 30) 1038 NM_001306080 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 236.5-61 chr3 75025622 75026085 + 1.25 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -188623 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 196-7 chr1 159402918 159403176 + 1.25 NA intron (NM_001363558, intron 1 of 3) L1MA1|LINE|L1 5577 NM_001363558 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 219-66 chr3 21960473 21960692 + 1.25 NA intron (NR_046876, intron 2 of 3) L1MA5|LINE|L1 3443 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 261-6 chr10 89689019 89689432 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 8703 NR_026835 283011 Hs.679445 NR_026835 FLJ37201 - tigger transposable element derived 2 pseudogene pseudo 199-59 chr4 34977611 34977877 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -707997 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 167.5-73 chr17 62336362 62336588 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -33743 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 147.25-15 chr10 36655604 36655754 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -470178 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 218.25-101 chr8 129459240 129459437 + 1.25 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 24804 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 176.75-132 chr9 9484369 9484611 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) L1ME3|LINE|L1 -314902 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 230.25-40 chr2 70239370 70239673 + 1.25 NA intron (NM_001351511, intron 1 of 12) intron (NM_001351511, intron 1 of 12) 9107 NR_147229 7072 Hs.413123 NM_022037 ENSG00000116001 TIA1 TIA-1|WDM TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein protein-coding 341.5-27 chr5 2234504 2234873 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 77513 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 133.75-166 chr5 170155325 170155558 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43700 NR_108022 100507267 Hs.634846 NR_108022 LINC01187 CTB-27N1.1|KIDR long intergenic non-protein coding RNA 1187 ncRNA 200.75-83 chr5 13219835 13220061 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -187062 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 156.25-63 chr2 33203967 33204204 + 1.25 NA intron (NM_206943, intron 7 of 33) intron (NM_206943, intron 7 of 33) 69488 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 123.5-221 chr9 93876202 93876428 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 56958 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 134-130 chr4 65405524 65405695 + 1.25 NA intron (NM_001281767, intron 7 of 16) intron (NM_001281767, intron 7 of 16) 263879 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 245-72 chr9 13260879 13261218 + 1.25 NA intron (NM_001330637, intron 1 of 46) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 18516 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 348.5-10 chr3 113362897 113363309 + 1.25 NA 3' UTR (NM_018338, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_018338, exon 21 of 21) -40895 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 230.25-32 chr17 65270101 65270412 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 132886 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 143-64 chr19 27661441 27661667 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -131877 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 163-116 chr8 4469088 4469318 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) intron (NM_033225, intron 2 of 69) 525711 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 214.5-76 chr3 31310558 31310836 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -148910 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 169-31 chr15 68121329 68121524 + 1.25 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) L1MEc|LINE|L1 66850 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 287-27 chr3 182879809 182880140 + 1.25 NA intron (NM_014616, intron 20 of 29) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger 86470 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 193.75-20 chr10 64317190 64317448 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -508209 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 149.5-164 chr5 170586672 170586879 + 1.25 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) intron (NM_001278339, intron 1 of 7) 82755 NM_001278339 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 120.25-156 chr4 160199221 160199369 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -421511 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 377.5-17 chr5 163202435 163202884 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -234912 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 209.25-118 chr9 23304453 23304710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 367818 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 282.75-16 chr17 59907591 59907835 + 1.25 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) AluJr|SINE|Alu 14592 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 284-28 chr2 154088065 154088392 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) intron (NM_052917, intron 3 of 12) 143834 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 258-44 chr4 85423614 85423857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51415 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 319.5-21 chr17 65802950 65803276 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 23338 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 165.25-42 chr14 63019581 63019740 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) L1ME2|LINE|L1 25798 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 174-92 chr7 49372256 49372456 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -401282 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 121.25-124 chr22 31259484 31259601 + 1.25 NA intron (NM_001031801, intron 3 of 14) MIR3|SINE|MIR 11158 NM_001031801 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 203-77 chr5 13385671 13385984 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -352941 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 259-2 chr1 113614017 113614359 + 1.25 NA intron (NM_001142782, intron 6 of 20) intron (NM_001142782, intron 6 of 20) 144967 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 118.5-133 chr3 132444669 132444938 + 1.25 NA intron (NM_001329126, intron 2 of 56) intron (NM_001329126, intron 2 of 56) 27301 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 467.75 chr10 96631762 96632220 + 1.25 NA intron (NM_152309, intron 8 of 16) L1MC4a|LINE|L1 -44979 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 363.75-2 chr11 76736331 76736820 + 1.25 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -14786 NR_024042 390226 Hs.440026 NR_024042 GUCY2EP GC-E|GCD|GUCY2E guanylate cyclase 2E, pseudogene pseudo 184.5-68 chr2 15059412 15059635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 426806 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 254-52 chr9 18478334 18478657 + 1.25 NA intron (NM_052866, intron 1 of 12) intron (NM_052866, intron 1 of 12) 4342 NM_052866 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 173.5-89 chr22 25703444 25703646 + 1.25 NA exon (NM_005160, exon 14 of 21) exon (NM_005160, exon 14 of 21) -38643 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 340.75-10 chr13 94309773 94310098 + 1.25 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) -121944 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 311.25-23 chr6 118666884 118667232 + 1.25 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 -15467 NM_206921 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 119.75-188 chr6 149217044 149217279 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_125861) promoter-TSS (NR_125861) -763 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 488.25-5 chr4 44795559 44796140 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -69215 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 188.5-128 chr5 173982417 173982607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6658 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 260.25-33 chr3 54861076 54861441 + 1.25 NA intron (NM_018398, intron 17 of 37) L2c|LINE|L2 39997 NR_046666 100874237 Hs.570583 NR_046666 ENSG00000243715 CACNA2D3-AS1 - CACNA2D3 antisense RNA 1 ncRNA 255-12 chr12 43108672 43109151 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46404 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 294.25-25 chr20 45619908 45620226 + 1.25 NA intron (NM_147198, intron 1 of 4) L1M4|LINE|L1 -9672 NM_080753 140832 Hs.199380 NM_080753 ENSG00000180305 WFDC10A C20orf146|WAP10|dJ688G8.3 WAP four-disulfide core domain 10A protein-coding 149.25-9 chr1 81818910 81819052 + 1.25 NA intron (NM_001366002, intron 2 of 20) intron (NM_001366002, intron 2 of 20) 16528 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 198-83 chr8 138016599 138016798 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 66847 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 265.5-30 chr17 45107027 45107417 + 1.25 NA 3' UTR (NM_021079, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_021079, exon 12 of 12) 7211 NR_106842 102465470 NR_106842 ENSG00000277249 MIR6784 hsa-mir-6784 microRNA 6784 ncRNA 156-69 chr18 11440586 11440789 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13791 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 264-23 chr18 50054445 50054721 + 1.25 NA intron (NM_001080467, intron 2 of 39) intron (NM_001080467, intron 2 of 39) 71980 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 262-49 chr6 157780139 157780482 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42936 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 128.5-161 chr4 96132973 96133123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -177655 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 272.5-51 chr4 60840744 60841018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -81738 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 224.25-33 chr16 62165187 62165468 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -128889 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 120.5-220 chr7 128667611 128667753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4584 NM_001128926 346653 Hs.445236 NM_001012454 ENSG00000205085 FAM71F2 FAM137B family with sequence similarity 71 member F2 protein-coding 208.25-71 chr5 79178732 79178919 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -57306 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 277-7 chr12 10737520 10737833 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -12558 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 149.25-5 chr1 37481715 37481839 + 1.25 NA exon (NM_025079, exon 4 of 6) exon (NM_025079, exon 4 of 6) 1547 NR_106790 102465438 NR_106790 ENSG00000283724 MIR6732 hsa-mir-6732 microRNA 6732 ncRNA 358-9 chr5 33426213 33426744 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -14218 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 310.75-24 chr3 126233576 126233865 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -52534 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 182.5-124 chr4 116845365 116845631 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 240078 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 223.75-9 chr11 56566729 56566968 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 10873 NM_001004741 390167 Hs.553750 NM_001004741 ENSG00000254834 OR5M10 OR11-207 olfactory receptor family 5 subfamily M member 10 protein-coding 140-6 chr1 103256380 103256495 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -147915 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 221-25 chr17 1863990 1864222 + 1.25 NA intron (NM_001355120, intron 5 of 16) intron (NM_001355120, intron 5 of 16) 34101 NM_001355121 6117 Hs.461925 NM_002945 ENSG00000132383 RPA1 HSSB|MST075|REPA1|RF-A|RP-A|RPA70 replication protein A1 protein-coding 141.25-8 chr1 70672858 70673109 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33470 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 204.25-65 chr20 49816674 49816867 + 1.25 NA intron (NR_048539, intron 2 of 13) AluY|SINE|Alu 3942 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 238.25-85 chr8 73980899 73981148 + 1.25 NA intron (NR_033334, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 4828 NM_017866 54968 Hs.106650 NM_017866 ENSG00000175606 TMEM70 MC5DN2 transmembrane protein 70 protein-coding 412-12 chr8 85532108 85532671 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67474 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-35 chr14 47274494 47274881 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) L1MB8|LINE|L1 68559 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 177-22 chr12 24619284 24619516 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35232 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 201.25-43 chr2 12443010 12443318 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 244034 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 261.25-33 chr4 73500802 73501551 + 1.25 NA intron (NM_001133, intron 12 of 14) intron (NM_001133, intron 12 of 14) -7627 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 217.25-92 chrX 68109176 68109415 + 1.25 NA intron (NM_002547, intron 18 of 24) L1MB7|LINE|L1 324200 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 199.5-164 chrX 94687453 94687660 + 1.25 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 375670 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 292-35 chr5 42545852 42546248 + 1.25 NA intron (NM_001242400, intron 2 of 10) intron (NM_001242400, intron 2 of 10) -1993 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 206.25-31 chr13 28509086 28509282 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14056 NM_001159920 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 408-3 chr14 19998461 19999089 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3287 NR_145508 390432 NM_001348271 ENSG00000196383 OR4Q2 OR4Q2P olfactory receptor family 4 subfamily Q member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 119.75-118 chr2 220610879 220611113 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -704431 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 208.25-81 chr7 31297792 31298056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42802 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 289.75-24 chr4 55871713 55871962 + 1.25 NA intron (NM_001024924, intron 7 of 18) intron (NM_001024924, intron 7 of 18) 18187 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 198.25-105 chr9 30694490 30694718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -286150 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 233.25-71 chr8 121175700 121176086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -363847 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 138-158 chr8 54755279 54755447 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139267 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 225.5-30 chr13 76227498 76227743 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -292488 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 187.25-49 chr19 12896666 12896876 + 1.25 NA intron (NR_102316, intron 8 of 11) intron (NR_102316, intron 8 of 11) 5611 NM_000159 2639 Hs.532699 NM_000159 ENSG00000105607 GCDH ACAD5|GCD glutaryl-CoA dehydrogenase protein-coding 267-53 chr8 81930595 81931084 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -88553 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 248.75-30 chr2 103655938 103656440 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -671760 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 159.25-68 chr2 39714501 39714736 + 1.25 NA intron (NM_152390, intron 3 of 3) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 48701 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 234-53 chr5 19312110 19312304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 574065 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 233.5-49 chr2 10700268 10700664 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10456 NR_144555 106479524 Hs.646340 NR_144555 ENSG00000243819 RN7SL832P - RNA, 7SL, cytoplasmic 832, pseudogene pseudo 164.5-131 chr3 39755978 39756162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52844 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 200.5-140 chr8 129609583 129609888 + 1.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -34717 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 305.5-8 chr10 82740403 82740773 + 1.25 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) AluSz|SINE|Alu -507668 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 261.75-5 chr11 26463369 26463631 + 1.25 NA intron (NM_031418, intron 4 of 26) MIRb|SINE|MIR -10402 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 340.5-30 chr5 159472795 159473287 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -6765 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 123-147 chr4 48621974 48622122 + 1.25 NA intron (NM_015030, intron 5 of 63) intron (NM_015030, intron 5 of 63) 131796 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 242.25-54 chr2 217086757 217087219 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -195745 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 333.75-11 chr18 7837514 7838055 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) L1MA2|LINE|L1 270468 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 250-58 chr7 129710449 129710766 + 1.25 NA intron (NM_005011, intron 7 of 10) intron (NM_005011, intron 7 of 10) 59885 NR_029614 406958 NR_029614 ENSG00000207990 MIR182 MIRN182|miRNA182|mir-182 microRNA 182 ncRNA 230-42 chr21 33530347 33530616 + 1.25 NA intron (NM_175085, intron 7 of 10) intron (NM_175085, intron 7 of 10) 11636 NM_175085 2618 Hs.473648 NM_000819 ENSG00000159131 GART AIRS|GARS|GARTF|PAIS|PGFT|PRGS phosphoribosylglycinamide formyltransferase, phosphoribosylglycinamide synthetase, phosphoribosylaminoimidazole synthetase protein-coding 213.75-103 chr7 51917396 51917811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -524347 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 216-23 chr16 60672700 60672999 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -313056 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 233.75-14 chr11 106513381 106513658 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 262112 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 263.75-58 chrX 57936075 57936467 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -25638 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 239.25-6 chr1 173484945 173485174 + 1.25 NA intron (NM_004905, intron 2 of 4) intron (NM_004905, intron 2 of 4) 7724 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 180-77 chr22 26049699 26049979 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -119623 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 456.75-2 chr1 180298110 180298599 + 1.25 NA intron (NM_032360, intron 7 of 7) intron (NM_032360, intron 7 of 7) -23673 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 180.75-101 chr4 30438238 30438625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -281938 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 235.75-26 chr14 66951986 66952287 + 1.25 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) L1MB5|LINE|L1 -237304 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 182.75-96 chr4 128725761 128725986 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83827 NM_024900 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 352.75-16 chr8 118475389 118475837 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR -145388 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 164.75-140 chr8 65982742 65982964 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32125 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 246.75-11 chr11 80958448 80958688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -195765 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 151.75-102 chr4 70313640 70313942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21190 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 129-186 chr8 134323164 134323315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -274832 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 336.75-19 chr8 54024350 54024987 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2220 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 181.25-16 chr10 119593058 119593448 + 1.25 NA intron (NM_001323964, intron 1 of 12) intron (NM_001323964, intron 1 of 12) 3776 NM_001323969 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 365.75-16 chr7 39581558 39582071 + 1.25 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 15410 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 178-54 chr20 45247401 45247578 + 1.25 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 7075 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 153.25-22 chr11 7234278 7234468 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_031683) promoter-TSS (NR_031683) -393 NR_031683 100313774 NR_031683 ENSG00000221703 MIR302E MIRN302E microRNA 302e ncRNA 210-44 chr19 41294828 41295114 + 1.25 NA intron (NM_144732, intron 10 of 14) MIRb|SINE|MIR -15201 NM_052848 90324 Hs.437497 NM_052848 ENSG00000142039 CCDC97 - coiled-coil domain containing 97 protein-coding 138.75-15 chr10 10187916 10188138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129305 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 188.75-6 chr1 102148510 102148928 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -151485 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 202.5-74 chr2 81722346 81722639 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -255546 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 331.25-25 chr9 31477767 31478293 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -96540 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 358-12 chr8 90424022 90424489 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 181808 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 182.75-19 chr10 5826344 5826604 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12925 NM_001115156 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 129-45 chr12 2964732 2964897 + 1.25 NA intron (NM_201443, intron 1 of 10) intron (NM_201443, intron 1 of 10) 4879 NM_201443 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 343.75-14 chr6 142398716 142398993 + 1.25 NA intron (NM_198569, intron 10 of 24) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 96847 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 206-56 chr4 100484757 100485061 + 1.25 NA intron (NM_001159694, intron 1 of 10) intron (NM_001159694, intron 1 of 10) 33113 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 265.75-26 chr17 75827068 75827484 + 1.25 NA TTS (NM_199242) TTS (NM_199242) 17441 NM_199242 201294 Hs.41045 NM_199242 ENSG00000092929 UNC13D FHL3|HLH3|HPLH3|Munc13-4 unc-13 homolog D protein-coding 292-19 chr17 62353203 62353663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16785 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 397.25-8 chr2 171166705 171167536 + 1.25 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) L1ME3B|LINE|L1 -6227 NM_012290 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 170.5-161 chr6 104511432 104511597 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 348032 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 362-5 chr16 57494043 57494541 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -7799 NM_018110 55715 Hs.279832 NM_018110 ENSG00000125170 DOK4 IRS-5|IRS5 docking protein 4 protein-coding 260.75-32 chr2 124132433 124132703 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 107281 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 214-43 chr3 79741064 79741265 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 26834 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 183.25-98 chr7 6520194 6520471 + 1.25 NA intron (NM_001145118, intron 7 of 21) intron (NM_001145118, intron 7 of 21) 31104 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 352.75-6 chr14 43823487 43823822 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 683629 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 122.75-142 chr3 189518524 189518699 + 1.25 NA Intergenic L1M2a1|LINE|L1 -78135 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 335-14 chr4 38163612 38164005 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 43854 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 122.25-167 chr6 163003849 163004038 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 50218 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 255.75-47 chr6 161643153 161643507 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 172353 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 166-97 chr5 53113531 53113717 + 1.25 NA intron (NR_034107, intron 2 of 2) intron (NR_034107, intron 2 of 2) 3782 NR_104654 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 159-34 chr13 109103716 109103863 + 1.25 NA intron (NM_015011, intron 28 of 34) intron (NM_015011, intron 28 of 34) 63514 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 281.5-37 chr4 85647811 85648138 + 1.25 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 -74494 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 127.75-134 chr3 135514986 135515261 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -450605 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 115-17 chr10 50949353 50949458 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41483 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 206-17 chr12 1135171 1135390 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) intron (NR_027948, intron 6 of 19) 107532 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 282-2 chr1 110798319 110798744 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72668 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 185-45 chr2 134478587 134478848 + 1.25 NA intron (NM_030923, intron 5 of 7) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 224645 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 255-52 chr5 113914621 113914871 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 401052 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 123.5-152 chr4 58098940 58099141 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 437288 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 252.5-61 chr4 47614108 47614398 + 1.25 NA intron (NM_006587, intron 19 of 21) AluSq2|SINE|Alu -38416 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 276-46 chr8 21259542 21259809 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -38564 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 298-29 chr7 29755933 29756279 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50448 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 235.5-67 chr5 39079872 39080181 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -5627 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 392.5-2 chr10 64946457 64947016 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22218 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 210.25-81 chr8 125952044 125952323 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_038447) promoter-TSS (NR_038447) -986 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 257.75-5 chr10 57552880 57553319 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -248540 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 280-55 chr7 27812023 27812421 + 1.25 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) L1ME1|LINE|L1 72127 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 355.25 chr1 178965589 178966006 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -60007 NM_001324310 9917 Hs.5737 NM_014864 ENSG00000116199 FAM20B gxk1 FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase protein-coding 385.75-4 chr14 103431050 103431369 + 1.25 NA intron (NM_001128920, intron 3 of 15) AluSx|SINE|Alu 45794 NM_001128918 4140 Hs.35828 NM_002376 ENSG00000075413 MARK3 CTAK1|KP78|PAR1A|Par-1a|VIPB microtubule affinity regulating kinase 3 protein-coding 230.5-70 chr2 229964250 229964536 + 1.25 NA intron (NM_174899, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 -41213 NM_001348335 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 120.75-50 chr15 59034661 59034879 + 1.25 NA intron (NM_001270529, intron 2 of 13) MIR3|SINE|MIR 46624 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 241.5-52 chr2 186086649 186086904 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_110218) promoter-TSS (NR_110218) -459 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 328-24 chr3 126449825 126450252 + 1.25 NA intron (NR_104249, intron 6 of 8) intron (NR_104249, intron 6 of 8) 25853 NR_104249 79364 Hs.440049 NM_025112 ENSG00000070476 ZXDC ZXDL ZXD family zinc finger C protein-coding 201.5-82 chr21 16066601 16066809 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3783 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 167.25-120 chr4 168520769 168521058 + 1.25 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) intron (NM_001166108, intron 2 of 21) 23861 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 148.5-211 chr7 46640853 46640981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56205 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 252.5-88 chr9 89082901 89083174 + 1.25 NA intron (NM_016848, intron 2 of 11) intron (NM_016848, intron 2 of 11) 91569 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 187.75-6 chr1 173740594 173740758 + 1.25 NA intron (NM_014458, intron 3 of 11) L1PB1|LINE|L1 25695 NM_014458 27252 Hs.495035 NM_014458 ENSG00000076321 KLHL20 KHLHX|KLEIP|KLHLX kelch like family member 20 protein-coding 237.5-21 chr11 12805508 12805756 + 1.25 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 131211 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 214.75-49 chr22 27771622 27771945 + 1.25 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 29973 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 315-12 chr16 87707606 87707920 + 1.25 NA TTS (NR_147833) TTS (NR_147833) 58223 NM_017566 54758 Hs.123450 NM_017566 ENSG00000104731 KLHDC4 - kelch domain containing 4 protein-coding 203.25-40 chr15 62996305 62996485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46352 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 206.25-34 chr14 23623806 23624070 + 1.25 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -6177 NM_001318835 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 441.25-9 chr7 49596728 49597541 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -176504 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 228.25-8 chr1 214215008 214215314 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -65998 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 284.25-25 chr4 122618174 122618551 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_104126) promoter-TSS (NR_104126) -621 NR_104126 100996941 Hs.439487 NR_104126 ENSG00000227145 IL21-AS1 - IL21 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-88 chr2 74503856 74504050 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001009812) promoter-TSS (NM_001009812) -637 NM_001009812 85474 Hs.516124 NM_001009812 ENSG00000179528 LBX2 LP3727 ladybird homeobox 2 protein-coding 239.75-44 chr3 41200555 41200897 + 1.25 NA intron (NM_001904, intron 1 of 14) intron (NM_001904, intron 1 of 14) 1221 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 222.75-71 chr3 65149336 65149636 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -461486 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 219.5-52 chr17 35078080 35078274 + 1.25 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 11049 NR_037713 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 241-42 chr5 159641437 159641688 + 1.25 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -175286 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 133.5-177 chr4 35008400 35008619 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -738762 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 160.5-31 chr11 128606348 128606552 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -18892 NM_001143820 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 296-39 chr6 51362262 51362741 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -259369 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 278.5-29 chr2 63166928 63167280 + 1.25 NA intron (NR_148704, intron 16 of 18) MER58A|DNA|hAT-Charlie -47562 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 182-61 chr2 127320420 127320657 + 1.25 NA intron (NM_006609, intron 11 of 15) L1MCc|LINE|L1 22691 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 327.25-8 chr2 2173626 2174033 + 1.25 NA intron (NM_015025, intron 2 of 24) intron (NM_015025, intron 2 of 24) -145403 NR_024468 730811 Hs.629472 NR_024468 ENSG00000225619 MYT1L-AS1 - MYT1L antisense RNA 1 ncRNA 117.25-56 chr12 81358706 81358844 + 1.25 NA intron (NM_001282536, intron 12 of 29) intron (NM_001282536, intron 12 of 29) 10594 NM_001220479 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 234.5-40 chr2 57875252 57875471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32290 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 195-90 chr8 76059336 76059568 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -347202 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 134-154 chr6 147263619 147263826 + 1.25 NA intron (NM_139244, intron 6 of 25) L2c|LINE|L2 -59108 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 233.25-5 chr10 6471402 6471845 + 1.25 NA intron (NM_001282644, intron 12 of 17) AluSz|SINE|Alu 108653 NM_001282644 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 344.5-30 chr7 15554293 15554626 + 1.25 NA intron (NM_001004320, intron 2 of 12) intron (NM_001004320, intron 2 of 12) 7556 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 256-11 chr14 29533702 29534028 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 393231 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 138.25-80 chr2 42746189 42746464 + 1.25 NA intron (NM_001330443, intron 16 of 16) intron (NM_001330443, intron 16 of 16) 17935 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 252-56 chr5 118834675 118835062 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -139718 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 333.5-6 chr14 51062460 51062960 + 1.25 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) L1MEf|LINE|L1 32994 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 253.25-39 chr22 27146896 27147162 + 1.25 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -40487 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 208-48 chr21 27575640 27575902 + 1.25 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -146608 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 148-115 chr6 159780032 159780168 + 1.25 NA TTS (NM_001303253) TTS (NM_001303253) 281 NR_002960 677806 Hs.689705 NR_002960 ENSG00000207392 SNORA20 ACA20 small nucleolar RNA, H/ACA box 20 snoRNA 350.25-19 chr2 178453010 178453574 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001369912) promoter-TSS (NM_001369912) 53 NM_001369912 494513 Hs.87734 NM_001042702 ENSG00000204311 PJVK DFNB59 pejvakin protein-coding 196.5-116 chr4 93245128 93245307 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) L2a|LINE|L2 -583536 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 170-88 chr6 155783716 155784059 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -162910 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 131-88 chr2 56520380 56520587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -334713 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 116.25-163 chr4 72032858 72032989 + 1.25 NA intron (NM_004885, intron 1 of 3) intron (NM_004885, intron 1 of 3) 1119 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 289.75-19 chr3 103870009 103870552 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -346164 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 199.5-136 chr7 31696007 31696326 + 1.25 NA intron (NM_006658, intron 3 of 4) intron (NM_006658, intron 3 of 4) 8951 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 191.5-87 chr21 18703350 18703575 + 1.25 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) intron (NR_109925, intron 2 of 3) -17298 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 181.5-142 chr6 87870115 87870475 + 1.25 NA intron (NR_110869, intron 2 of 4) intron (NR_110869, intron 2 of 4) 85435 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 283-24 chr2 154318147 154318577 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 9 of 12) intron (NM_052917, intron 9 of 12) 139076 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 266.25-19 chr17 61853228 61853595 + 1.25 NA intron (NM_032043, intron 4 of 19) L1ME3A|LINE|L1 10148 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 130.25-52 chr13 83845867 83846035 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36442 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 216-80 chr8 139818856 139819095 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) MER1A|DNA|hAT-Charlie -115852 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 304.75-22 chr4 30810116 30810431 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 89904 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 115.5-90 chr16 79196245 79196387 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 404421 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 206.75-80 chr6 101717326 101717526 + 1.25 NA intron (NM_001166247, intron 6 of 16) intron (NM_001166247, intron 6 of 16) 318441 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 262.25-42 chr6 61537762 61538056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36221 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 256-42 chr22 24971022 24971326 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -24479 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 205.25-98 chr7 17685005 17685481 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -126334 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 276.25-46 chr8 128208898 128209207 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58936 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 214-38 chr20 51268364 51268578 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 184506 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 216-44 chr2 125032004 125032358 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 1006894 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 190.75-29 chr14 51055359 51055608 + 1.25 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 40221 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 248.5-38 chr18 35399393 35399756 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -22237 NM_145756 252884 Hs.351005 NM_145756 ENSG00000186496 ZNF396 ZSCAN14 zinc finger protein 396 protein-coding 160.25-132 chr5 119015441 119015603 + 1.25 NA intron (NR_134250, intron 2 of 2) intron (NR_134250, intron 2 of 2) 22139 NR_134249 105379143 Hs.636285 NR_134249 ENSG00000249494 LOC105379143 - uncharacterized LOC105379143 ncRNA 262.25-33 chr4 49016892 49017270 + 1.25 NA intron (NM_001286791, intron 8 of 15) intron (NM_001286791, intron 8 of 15) 30439 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 267-48 chr7 35679165 35679533 + 1.25 NA intron (NM_022373, intron 2 of 8) intron (NM_022373, intron 2 of 8) 15786 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 236.25-40 chr2 33943055 33943317 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 3 of 5) MER3|DNA|hAT-Charlie -124040 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 231.25-60 chr4 65704958 65705509 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34738 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 118.5-31 chr11 7275318 7275455 + 1.25 NA intron (NM_175733, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 23482 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 200-97 chrX 16797822 16798067 + 1.25 NA intron (NM_001168683, intron 1 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 11478 NM_018360 55787 Hs.555961 NM_018360 ENSG00000086712 TXLNG CXorf15|ELRG|FIAT|LSR5|TXLNGX taxilin gamma protein-coding 306.25-32 chr4 113501179 113501601 + 1.25 NA intron (NM_001221, intron 13 of 18) intron (NM_001221, intron 13 of 18) 208551 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 308.25-31 chr7 3425421 3425864 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 124390 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 229.75-16 chr14 64999731 64999928 + 1.25 NA intron (NM_002028, intron 1 of 11) intron (NM_002028, intron 1 of 11) 12934 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 158.25-22 chr11 56073744 56073908 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19482 NM_001003750 120586 Hs.554524 NM_001003750 ENSG00000172154 OR8I2 OR11-170 olfactory receptor family 8 subfamily I member 2 protein-coding 276.5-11 chr10 88146109 88146456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 282657 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 132.25-73 chr16 85413359 85413563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -107136 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 118.75-3 chr1 42247467 42247612 + 1.25 NA intron (NM_001198850, intron 4 of 12) L1MA4A|LINE|L1 -82794 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 480.25-8 chr7 91087480 91088243 + 1.25 NA intron (NM_012395, intron 11 of 13) intron (NM_012395, intron 11 of 13) -176572 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 225-19 chr11 109149715 109150016 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -272325 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 213.5-66 chr2 199382018 199382314 + 1.25 NA intron (NM_001172509, intron 3 of 10) intron (NM_001172509, intron 3 of 10) 75773 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 301.5-38 chr6 74477540 74477883 + 1.25 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 408260 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 225-81 chr8 141992555 141992804 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -183660 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 295.25-3 chr10 76805099 76805384 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -82803 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-60 chr14 70591746 70592141 + 1.25 NA intron (NM_005466, intron 5 of 7) intron (NM_005466, intron 5 of 7) 8747 NM_001284209 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 305.5-18 chr2 43340847 43341128 + 1.25 NA intron (NR_144316, intron 29 of 36) intron (NR_144316, intron 29 of 36) 113776 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 187.25-35 chr15 89110635 89110795 + 1.25 NA intron (NM_007011, intron 5 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 22259 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 142.75-199 chr9 68741555 68741769 + 1.25 NA intron (NM_001278253, intron 1 of 13) intron (NM_001278253, intron 1 of 13) 36248 NM_001278253 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 137.5-14 chr1 183949645 183949930 + 1.25 NA intron (NM_015101, intron 8 of 11) L1M4|LINE|L1 87941 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 196.5-163 chr8 109411772 109412141 + 1.25 NA intron (NM_177531, intron 19 of 77) intron (NM_177531, intron 19 of 77) 49495 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 177.75-80 chr2 165390622 165390795 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001371247, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001371247, exon 27 of 27) -78990 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 226.75-35 chr2 76239657 76239988 + 1.25 NA Intergenic (TGTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -528907 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 114.25-85 chr2 10781777 10781887 + 1.25 NA intron (NM_001039362, intron 12 of 13) intron (NM_001039362, intron 12 of 13) 30953 NM_005742 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 362-8 chr2 41493151 41493549 + 1.25 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -384205 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 221-85 chr9 132643241 132643452 + 1.25 NA intron (NR_136309, intron 13 of 18) intron (NR_136309, intron 13 of 18) 19980 NM_001322343 64794 Hs.660767 NM_022779 ENSG00000125485 DDX31 PPP1R25 DEAD-box helicase 31 protein-coding 263.25-57 chr8 117087013 117087261 + 1.25 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -47858 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 164-118 chr6 119121588 119121819 + 1.25 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) 27490 NM_001288576 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 227-37 chr22 24352858 24353207 + 1.25 NA intron (NM_015330, intron 11 of 16) L1MC4a|LINE|L1 10924 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 246-30 chr2 45266956 45267231 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12152 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 211-49 chr5 10466747 10467086 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -11121 NR_106747 102465138 NR_106747 ENSG00000277073 MIR6131 hsa-mir-6131 microRNA 6131 ncRNA 198.75-25 chr13 57214235 57214437 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 47139 NM_001130407 729250 Hs.525056 NM_001130407 ENSG00000234278 PRR20E PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20C|PRR20D proline rich 20E protein-coding 212.75-4 chr1 48416767 48417097 + 1.25 NA intron (NM_019073, intron 3 of 12) L1ME3|LINE|L1 55272 NM_019073 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 284.5-32 chr2 115671370 115671655 + 1.25 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) MER3|DNA|hAT-Charlie 327697 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 242.75-74 chr8 130368684 130369131 + 1.25 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -72374 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 165-57 chr17 69932233 69932417 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29382 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 339-20 chr3 177484423 177484801 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 42691 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 215.75-82 chr5 157592192 157592454 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -16548 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 148.25-142 chr8 72526603 72526822 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10513 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 227.25-67 chr6 64537946 64538257 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 731265 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 218.75-70 chr5 52547286 52547512 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -240517 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 353.75-12 chr4 61301393 61301705 + 1.25 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 99377 NM_001371342 189.75-76 chr3 171756243 171756676 + 1.25 NA intron (NM_002662, intron 1 of 26) intron (NM_002662, intron 1 of 26) 54024 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 287.75-25 chr18 73138737 73138993 + 1.25 NA Intergenic (TAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 125633 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 204-57 chr4 80294039 80294262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25885 NM_001291812 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 201.25-30 chr13 22486871 22487056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 276678 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 222.75-74 chr4 74424678 74424970 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -20312 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 210.75-73 chr5 13494351 13494595 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 450007 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 178.75-120 chrX 139326746 139326963 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -119965 NR_028597 6719 Hs.730315 NR_028597 SRD5A1P1 SRD5AP1 steroid 5 alpha-reductase 1 pseudogene 1 pseudo 397-5 chr16 63270318 63270792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1234117 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 113.75-173 chr7 41996639 41996809 + 1.25 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) intron (NM_000168, intron 10 of 14) 240485 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 185.5-54 chr14 86646705 86646994 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -258929 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 334.75-26 chr8 132853388 132853763 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -13383 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 292.25-24 chr21 35209867 35210247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160759 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 297.75-9 chr14 76694360 76694894 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66841 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 203.25-83 chr5 54108608 54108797 + 1.25 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -157103 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 232.25-68 chr6 65186660 65186987 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -114595 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 383-21 chr9 28272322 28272850 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 446719 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 289.75-14 chr2 46261398 46261811 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -35803 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 201.5-17 chr1 244061470 244061743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8401 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 284.25-22 chr3 171905000 171905609 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4564 NR_046852 100874219 Hs.730556 NR_046852 ENSG00000234717 TMEM212-AS1 - TMEM212 antisense RNA 1 ncRNA 132.75-51 chr12 64789818 64789980 + 1.25 NA intron (NM_001330188, intron 3 of 13) MIRb|SINE|MIR 9144 NM_001330188 23329 Hs.192492 NM_015279 ENSG00000111490 TBC1D30 - TBC1 domain family member 30 protein-coding 300.25-22 chr4 42771674 42772050 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -114757 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 236.75-16 chr12 66048762 66049004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17817 NR_146530 105369810 NR_146530 ENSG00000256259 LINC02425 - long intergenic non-protein coding RNA 2425 ncRNA 287.5-42 chr3 108005875 108006217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85042 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 142.75-68 chr15 58761766 58761958 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 9112 NR_135474 101928725 Hs.572321 NR_135474 ENSG00000245975 LOC101928725 - uncharacterized LOC101928725 ncRNA 220.75-34 chr18 67672883 67673135 + 1.25 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 141813 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 143.25-126 chr3 146312102 146312343 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -61043 NM_001128306 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 201-87 chr9 71648175 71648437 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120207 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 336.75-18 chr6 131034741 131035096 + 1.25 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) -21309 NM_001350309 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 339.5-11 chr12 5753089 5753502 + 1.25 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) MER4C|LTR|ERV1 191964 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 154.25-107 chr3 96897674 96897865 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 83175 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 187.25-103 chr8 28580983 28581191 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -75905 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 126.5-177 chr4 97199826 97199969 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -167029 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 159.5-145 chr3 76246176 76246344 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -460711 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 115-110 chr3 107793181 107793337 + 1.25 NA intron (NM_001276286, intron 14 of 16) intron (NM_001276286, intron 14 of 16) 84809 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 338.25-20 chr3 98794649 98795301 + 1.25 NA TTS (NM_080927) TTS (NM_080927) 31668 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 208-54 chr3 55068957 55069172 + 1.25 NA intron (NM_018398, intron 35 of 37) L1ME3G|LINE|L1 -101962 NM_001304389 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 312.25-20 chr5 43823078 43823590 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -220104 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 175.25-101 chr4 22759516 22759752 + 1.25 NA intron (NR_102357, intron 4 of 4) intron (NR_102357, intron 4 of 4) 45545 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 398.5-16 chr6 56775127 56775604 + 1.25 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 68300 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 205.5-114 chr5 39058285 39058453 + 1.25 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 16030 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 189.5-146 chr8 88707905 88708092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -380515 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 127.25-104 chr20 13608893 13609076 + 1.25 NA intron (NM_001323604, intron 4 of 14) intron (NM_001323604, intron 4 of 14) 29948 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 155.75-107 chr3 120360822 120361169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11641 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 169.75-46 chr14 32847287 32847537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91467 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 126.25-212 chr8 130251684 130251917 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 44733 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 113.75-188 chr8 61245468 61245583 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -42445 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 244.25-24 chr20 38781626 38782255 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -23757 NM_015568 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 210.75-71 chr4 156523463 156523757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 448189 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 116.25-109 chr2 84627159 84627257 + 1.25 NA intron (NM_001370, intron 29 of 76) MER5A|DNA|hAT-Charlie 110753 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 252.5-87 chr9 76428467 76428892 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -12987 NM_001097634 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 143.5-85 chr16 62633793 62633942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -597429 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 202-40 chr20 52194217 52194596 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -2421 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 181.25-105 chr5 143410297 143410477 + 1.25 NA intron (NM_001018075, intron 1 of 8) intron (NM_001018075, intron 1 of 8) -5032 NM_001364180 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 203.25-20 chr11 26568412 26568678 + 1.25 NA intron (NM_001135091, intron 1 of 4) intron (NM_001135091, intron 1 of 4) 3718 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 126.75-72 chr15 52857577 52857771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67338 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 139.75-106 chr20 36935456 36935622 + 1.25 NA intron (NM_015474, intron 3 of 15) intron (NM_015474, intron 3 of 15) 16169 NM_001363729 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 306.5-35 chr7 31165099 31165614 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 112895 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 246.5-59 chr4 56497846 56498149 + 1.25 NA intron (NR_151856, intron 18 of 19) intron (NR_151856, intron 18 of 19) -7212 NM_206919 132946 Hs.444449 NM_206919 ENSG00000196503 ARL9 - ADP ribosylation factor like GTPase 9 protein-coding 269.5-2 chr1 75159119 75159479 + 1.25 NA intron (NM_001001933, intron 9 of 9) L1ME3A|LINE|L1 24911 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 187.25-13 chr10 74314784 74314992 + 1.25 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) intron (NM_001369124, intron 4 of 9) 138125 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 149-133 chr8 131030406 131030579 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 10417 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 278.25-14 chr12 90068450 90068692 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR 120878 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 121.75-44 chr14 38436848 38437096 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -180879 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 116.5-232 chr7 95573760 95573926 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 22673 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 177-17 chr11 29511477 29511655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82847 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 167.5-25 chr10 71096452 71096749 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -115970 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 222.25-39 chr2 221259230 221259582 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 312898 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 206.75-95 chr8 124080100 124080352 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 32 of 40) intron (NM_001039112, intron 32 of 40) -39444 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 428.75-7 chr5 123712672 123713436 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 167637 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 260.25-7 chr10 62940630 62940938 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -121617 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 244.75-59 chr8 140759302 140759548 + 1.25 NA intron (NR_148037, intron 19 of 34) AluJb|SINE|Alu -26772 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 462.25-2 chr2 80307329 80307954 + 1.25 NA intron (NM_001282600, intron 1 of 11) intron (NM_001282600, intron 1 of 11) 2536 NM_001320810 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 169.75-24 chr10 116369906 116370182 + 1.25 NA intron (NM_198515, intron 7 of 8) L1MC4a|LINE|L1 45596 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 151-22 chr11 105181312 105181519 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41646 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 133.25-208 chr7 118977884 118978003 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 753239 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 113.75-187 chr8 40639815 40639979 + 1.25 NA intron (NM_001135731, intron 4 of 5) intron (NM_001135731, intron 4 of 5) 257929 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 202-46 chr4 93996898 93997146 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168269 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 185.25-64 chr2 169640066 169640443 + 1.25 NA 3' UTR (NM_004792, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_004792, exon 14 of 14) 54151 NM_001085447 129881 Hs.370111 NM_001085447 ENSG00000154479 CCDC173 C2orf77 coiled-coil domain containing 173 protein-coding 207.5-32 chr16 63352695 63352990 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -1316404 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 214.5-137 chrX 77166997 77167376 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -152654 NR_110401 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 280.5 chr1 9742743 9743009 + 1.25 NA intron (NM_001009566, intron 9 of 18) AluSx|SINE|Alu 51409 NM_001350235 5293 Hs.518451 NM_005026 ENSG00000171608 PIK3CD APDS|IMD14|P110DELTA|PI3K|p110D phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta protein-coding 305.75-8 chr17 54667773 54668480 + 1.25 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -232565 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 372.5-16 chr5 54294686 54295347 + 1.25 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) intron (NM_019087, intron 1 of 4) 15557 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 216.75-6 chr1 170939260 170939442 + 1.25 NA intron (NM_001163629, intron 1 of 21) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 3817 NM_025063 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 261.5-19 chr15 58011960 58012177 + 1.25 NA intron (NM_170696, intron 3 of 11) intron (NM_170696, intron 3 of 11) 1955 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 375.25-7 chr6 11314921 11315383 + 1.25 NA intron (NR_073131, intron 1 of 9) intron (NR_073131, intron 1 of 9) 67196 NR_073131 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 274.25-8 chr10 84301390 84301729 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21579 NR_038220 170425 Hs.434131 NR_038220 ENSG00000229404 LINC00858 CRCAL-2 long intergenic non-protein coding RNA 858 ncRNA 214.5-114 chr6 169678084 169678283 + 1.25 NA intron (NM_182552, intron 2 of 25) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 23846 NM_001350623 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 220.75-32 chr17 66401736 66401986 + 1.25 NA intron (NR_110822, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 14993 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 221.25-27 chr14 60629482 60629812 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9569 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 219.5-6 chr1 111694344 111694570 + 1.25 NA intron (NM_001370216, intron 2 of 7) intron (NM_001370216, intron 2 of 7) 29663 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 236.25-63 chr4 79879079 79879345 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 51741 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 286-15 chr17 65780506 65780852 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) 45772 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 191-63 chr4 102059461 102059837 + 1.25 NA intron (NM_017935, intron 11 of 16) intron (NM_017935, intron 11 of 16) 245807 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 241.5-6 chr10 73619801 73620165 + 1.25 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) MIR3|SINE|MIR 5998 NM_001350995 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 116.25-216 chr7 111262430 111262563 + 1.25 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 171369 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 177.5-139 chr5 61075360 61075569 + 1.25 NA intron (NM_174889, intron 2 of 3) intron (NM_174889, intron 2 of 3) -86852 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-67 chr5 28410669 28410920 + 1.25 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -123129 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 242-48 chr5 104978789 104979186 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120487 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 356.75-6 chr17 63255689 63256038 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) L1MA4A|LINE|L1 184404 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 214.25-34 chr18 59780923 59781140 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -83608 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 361-16 chr7 28183238 28183871 + 1.25 NA intron (NR_034097, intron 1 of 3) intron (NR_034097, intron 1 of 3) -2759 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 400.5-15 chr8 87763188 87764111 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 110366 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 168-29 chr11 109306837 109307088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -115228 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 234-68 chr8 118601230 118601503 + 1.25 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) intron (NR_109794, intron 1 of 4) -19635 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 271-9 chr12 41228252 41228490 + 1.25 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 40051 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 291.25-4 chr11 98291178 98291530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -729595 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 200.5-112 chr5 98039692 98039950 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 121418 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 250.75-33 chr3 37138249 37138495 + 1.25 NA intron (NM_006309, intron 2 of 27) intron (NM_006309, intron 2 of 27) 36210 NM_006309 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 141.5-59 chr14 87938893 87939101 + 1.25 NA intron (NM_000153, intron 16 of 16) L1ME3G|LINE|L1 54185 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 266.75-29 chr20 6419350 6419713 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -7201 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 218-14 chr11 128256596 128256897 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 47980 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 169-114 chr9 105560551 105560715 + 1.25 NA intron (NM_001351498, intron 1 of 9) L1ME4a|LINE|L1 2502 NM_001198963 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 181.5-112 chr3 89690401 89690665 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 582912 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 209.25-97 chr5 178910408 178910756 + 1.25 NA intron (NM_030613, intron 1 of 4) intron (NM_030613, intron 1 of 4) 14669 NM_030613 80108 Hs.654533 NM_030613 ENSG00000198939 ZFP2 ZNF751|zfp-2 ZFP2 zinc finger protein protein-coding 119.25-41 chr11 110439176 110439292 + 1.25 NA intron (NM_004109, intron 2 of 3) AluSx3|SINE|Alu 9286 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 176.5 chr1 19275441 19275618 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -1407 NR_040288 246181 Hs.662342 NM_001145289 ENSG00000211454 AKR7L AFAR3|AFB1-AR 3|AFB1-AR3|AKR7A4 aldo-keto reductase family 7 like (gene/pseudogene) protein-coding 277.5-19 chr12 79795534 79795826 + 1.25 NA exon (NM_001143886, exon 18 of 25) exon (NM_001143886, exon 18 of 25) -104583 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 260.75-43 chr3 235267 235615 + 1.25 NA intron (NR_045572, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 37552 NR_045572 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 235-70 chr7 148111995 148112259 + 1.25 NA intron (NM_014141, intron 14 of 22) HAL1|LINE|L1 440448 NR_133929 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 198.5-114 chr5 45011157 45011352 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 202307 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 172-32 chr12 97036146 97036293 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 128753 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 131.25-161 chr5 30089747 30089905 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 209266 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 240-9 chr10 29116386 29116674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -172540 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 385.25-15 chrX 81932023 81932544 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 730181 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 241.5-107 chr9 128752765 128752996 + 1.25 NA intron (NM_006336, intron 4 of 15) intron (NM_006336, intron 4 of 15) 19047 NM_006336 10444 Hs.147950 NM_006336 ENSG00000160445 ZER1 C9orf60|ZYG|ZYG11BL zyg-11 related cell cycle regulator protein-coding 233.25-53 chr4 72601196 72601517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32135 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 211.5-64 chr18 50290784 50291096 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2618 NM_001101654 30827 Hs.180933 NM_014593 ENSG00000154832 CXXC1 2410002I16Rik|5830420C16Rik|CFP1|CGBP|HsT2645|PCCX1|PHF18|SPP1|ZCGPC1|hCGBP CXXC finger protein 1 protein-coding 277.5-12 chr10 91406455 91406718 + 1.25 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 -2649 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 316.25-4 chr10 53465065 53465508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -693586 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 174.75-72 chr21 28937981 28938214 + 1.25 NA intron (NM_015565, intron 25 of 29) L1MC4|LINE|L1 -52724 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 170.75-27 chr13 68217326 68217483 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 667921 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 202-62 chr6 120800577 120800855 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 533764 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 299.5 chr1 93290582 93290998 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 55021 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 130.25-177 chr6 116171409 116171597 + 1.25 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) -45371 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 116.25-249 chr9 129780313 129780480 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22747 NR_133948 27348 Hs.252682 NM_014506 ENSG00000136816 TOR1B DQ1 torsin family 1 member B protein-coding 150.75-74 chr16 82327564 82327722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157419 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 203-2 chr1 35440990 35441306 + 1.25 NA intron (NM_024874, intron 19 of 20) intron (NM_024874, intron 19 of 20) -75071 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 157.25-62 chr18 50032303 50032452 + 1.25 NA intron (NM_001080467, intron 4 of 39) L1MB8|LINE|L1 94186 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 237-10 chr11 58344574 58345035 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14265 NM_001005489 219965 NM_001005489 ENSG00000197786 OR5B17 OR11-237|OR5B20P olfactory receptor family 5 subfamily B member 17 protein-coding 379.25-16 chr9 27704151 27704591 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130505 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 356.75-18 chr9 38449232 38449637 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -24980 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 220.25-7 chr10 29529635 29530012 + 1.25 NA exon (NM_001323600, exon 11 of 37) exon (NM_001323600, exon 11 of 37) 15274 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 146.25-38 chr15 23528895 23529116 + 1.25 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 33126 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 227.5-78 chr4 48843868 48844105 + 1.25 NA intron (NM_001079839, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 12680 NM_001168254 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 155.75-113 chr3 185926158 185926301 + 1.25 NA intron (NM_001243879, intron 1 of 7) intron (NM_001243879, intron 1 of 7) 11785 NM_001243879 6434 Hs.533122 NM_004593 ENSG00000136527 TRA2B Htra2-beta|PPP1R156|SFRS10|SRFS10|TRA2-BETA|TRAN2B transformer 2 beta homolog protein-coding 243.25-3 chr10 12955982 12956258 + 1.25 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu 45593 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 355.5-12 chr17 51899867 51900210 + 1.25 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) L1PA15|LINE|L1 258676 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 204.5-72 chr2 222323927 222324353 + 1.25 NA intron (NR_136642, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 3479 NR_136639 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 150.75-149 chr5 44479789 44480018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30379 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 256.25-33 chr4 37719657 37720225 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -33565 NM_001085400 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 130.5-103 chr15 94529317 94529494 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173475 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 189.25-80 chr3 94812828 94813043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125328 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 133.75-196 chr8 133737083 133737378 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 40122 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 323.25-11 chr18 21651005 21651463 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001308256, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001308256, exon 7 of 7) 12980 NM_001308257 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 264.75-55 chr7 127771896 127772171 + 1.25 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) intron (NM_014390, intron 10 of 23) 119839 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 258.75-72 chr7 53848113 53848651 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -36451 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 258.75-40 chr2 133299540 133299871 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) AluSq2|SINE|Alu 33510 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 198.25-54 chr2 33328388 33328701 + 1.25 NA intron (NM_001166264, intron 20 of 28) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -89972 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 146.25-10 chr10 11219524 11219764 + 1.25 NA intron (NM_001025076, intron 3 of 13) intron (NM_001025076, intron 3 of 13) 54614 NM_001025076 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 169.25-6 chr1 150698231 150698395 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001199829, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001199829, exon 14 of 14) -1159 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 303.75-10 chr13 75811246 75811549 + 1.25 NA intron (NM_005358, intron 10 of 29) intron (NM_005358, intron 10 of 29) 50736 NM_015842 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 156.25-71 chr2 75185744 75185906 + 1.25 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 13695 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 248.5-71 chr4 43147293 43147574 + 1.25 NA Intergenic (TTCCTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 254167 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 129.25-116 chr22 28188127 28188324 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) HAL1|LINE|L1 -267613 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 193.5-26 chr12 1142466 1142756 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) L1ME4b|LINE|L1 114863 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 289.5-30 chr20 23470705 23471008 + 1.25 NA Intergenic HERVK9-int|LTR|ERVK -17980 NM_080830 140880 Hs.128100 NM_080830 ENSG00000125831 CST11 CST8L|CTES2|SC13|dJ322G13.6 cystatin 11 protein-coding 121.25-200 chr8 132642151 132642302 + 1.25 NA intron (NR_135908, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 33319 NM_001321963 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 253-8 chr11 59715476 59715771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1778 NM_001005324 390201 Hs.589001 NM_001005324 ENSG00000172289 OR10V1 OR11-256 olfactory receptor family 10 subfamily V member 1 protein-coding 190.25-75 chr20 34756074 34756314 + 1.25 NA intron (NM_001242539, intron 5 of 11) intron (NM_001242539, intron 5 of 11) 26210 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 323.75-4 chr1 79327238 79327604 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -320691 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 338-4 chr1 179893276 179893708 + 1.25 NA intron (NM_001267578, intron 3 of 9) AluSz|SINE|Alu 11450 NM_001267578 26092 Hs.496459 NM_015602 ENSG00000143337 TOR1AIP1 LAP1|LAP1B|LGMD2Y torsin 1A interacting protein 1 protein-coding 145.25-79 chr2 182952074 182952282 + 1.25 NA intron (NM_013436, intron 23 of 30) MIR3|SINE|MIR -85541 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 134-178 chr8 135694164 135694375 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 236813 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 175.5-155 chr8 29336664 29336866 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001394, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001394, exon 4 of 4) 12040 NM_057158 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 174.5-44 chr12 16359982 16360220 + 1.25 NA intron (NM_001267598, intron 3 of 3) intron (NM_001267598, intron 3 of 3) 6684 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 202-21 chr12 118873464 118873759 + 1.25 NA Intergenic (TTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -40075 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 144.75-122 chr4 76156098 76156301 + 1.25 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -7684 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 248.25-4 chr1 106852613 106853054 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 34594 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 187.5-135 chr5 66163870 66164073 + 1.25 NA intron (NM_139168, intron 7 of 12) Plat_L3|LINE|CR1 19136 NM_139168 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 244.5-37 chr17 43335551 43335856 + 1.25 NA Intergenic HERVK13-int|LTR|ERVK -35472 NR_002716 6066 NR_002716 ENSG00000274585 RNU2-1 RNU2|U2 RNA, U2 small nuclear 1 snRNA 417 chr1 80713541 80713874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72420 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 219.5-71 chr2 100173724 100174016 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31280 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 378.5-11 chr22 38489306 38489976 + 1.25 NA intron (NM_006386, intron 11 of 12) intron (NM_006386, intron 11 of 12) 16670 NM_001098504 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 206.5-124 chr7 89429653 89429852 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -634015 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 160.5-83 chr2 37935366 37935517 + 1.25 NA intron (NM_001170792, intron 2 of 10) intron (NM_001170792, intron 2 of 10) 6682 NM_001170792 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 330.75 chr1 42723670 42724061 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 16371 NM_148960 149461 Hs.496270 NM_148960 ENSG00000164007 CLDN19 HOMG5 claudin 19 protein-coding 215.25-30 chr14 56785721 56786007 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19803 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 173.75-110 chr3 121400953 121401165 + 1.25 NA intron (NM_001348343, intron 23 of 27) L1ME2|LINE|L1 144929 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 199.25-80 chr5 59342553 59342834 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 14277 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 249-52 chr8 114140218 114140763 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -703551 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 215-19 chr13 29686133 29686326 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 38536 NR_135320 102723345 Hs.121353 NR_135320 LOC102723345 - uncharacterized LOC102723345 ncRNA 138.5-114 chr20 32693435 32693647 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -19600 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 286.25-2 chr1 172112517 172112946 + 1.25 NA intron (NR_146559, intron 14 of 20) MIR|SINE|MIR -26077 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 177.5-59 chr17 60867566 60867745 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) L1M5|LINE|L1 189804 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 138-68 chr18 32775674 32775893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2760 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 144-123 chr7 102862536 102862692 + 1.25 NA intron (NR_105043, intron 17 of 20) intron (NR_105043, intron 17 of 20) -50386 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 249-11 chr13 93190841 93191082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35846 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 148.25-20 chr10 51383296 51383485 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR 83817 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 198.25-79 chr5 12425380 12425652 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149341 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 185.75-121 chr8 27155714 27155981 + 1.25 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 102557 NM_030795 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 210.25-30 chr17 72699787 72700071 + 1.25 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -59457 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 289-35 chr5 86441060 86441313 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 158742 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 201.75-35 chr14 59524129 59524405 + 1.25 NA intron (NM_001164399, intron 16 of 19) intron (NM_001164399, intron 16 of 19) 39750 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 263-10 chr11 75690933 75691314 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -22689 NM_033063 4135 Hs.585540 NM_033063 ENSG00000171533 MAP6 MAP6-N|MTAP6|N-STOP|STOP microtubule associated protein 6 protein-coding 260-36 chr6 110328233 110328530 + 1.25 NA intron (NM_001123364, intron 1 of 4) intron (NM_001123364, intron 1 of 4) 1677 NM_001354595 728464 Hs.634429 NM_001123364 ENSG00000053328 METTL24 C6orf186 methyltransferase like 24 protein-coding 163-61 chr2 137423116 137423378 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 14 of 27) L1MB8|LINE|L1 504685 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 124.5-75 chr16 11865482 11865759 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14078 NM_015659 26156 Hs.401842 NM_015659 ENSG00000171490 RSL1D1 CSIG|L12|PBK1|UTP30 ribosomal L1 domain containing 1 protein-coding 251-27 chr17 82765428 82765677 + 1.25 NA intron (NM_005993, intron 3 of 38) intron (NM_005993, intron 3 of 38) 13487 NM_005993 6904 Hs.464391 NM_005993 ENSG00000141556 TBCD PEBAT|SSD-1|tfcD tubulin folding cofactor D protein-coding 169.25-71 chr3 34789774 34789990 + 1.25 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 604141 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 223.75-84 chrX 94985941 94986270 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 77121 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 242.25-82 chr7 93597529 93597857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22963 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 273-59 chr8 139073759 139074165 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -159921 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 353-18 chr5 15230953 15231276 + 1.25 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) L1MB4|LINE|L1 35446 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 132.5-178 chr4 30807076 30807225 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 86781 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 424-10 chr7 80773538 80774039 + 1.25 NA intron (NM_006379, intron 12 of 17) L1MEf|LINE|L1 127135 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 185.75-47 chr14 85919240 85919570 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -15273 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 256.75-16 chr16 2943770 2944014 + 1.25 NA intron (NM_032296, intron 9 of 9) AluSx1|SINE|Alu -20383 NM_001253725 79412 Hs.661128 NM_024507 ENSG00000131650 KREMEN2 KRM2 kringle containing transmembrane protein 2 protein-coding 115.75-199 chr7 42159610 42159783 + 1.25 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 77513 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 361.25-8 chr3 99169599 99170099 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -268154 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 259.25-35 chr5 25582509 25582851 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 391727 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 323.5-19 chr3 114898704 114898991 + 1.25 NA intron (NM_001164343, intron 3 of 11) intron (NM_001164343, intron 3 of 11) 1778 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 171-83 chr20 56929868 56930089 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -283718 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-56 chr2 51204185 51204442 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 171712 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 162.75-113 chr5 27531311 27531587 + 1.25 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 59157 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 225.75-37 chr2 59055525 59055835 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 12 of 13) intron (NR_033873, intron 12 of 13) -162028 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 321.75-25 chr3 158418738 158419176 + 1.25 NA intron (NM_001271838, intron 6 of 9) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -107751 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 217.25-51 chr22 19343995 19344266 + 1.25 NA intron (NM_003325, intron 24 of 24) L1M3|LINE|L1 -52411 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 120-111 chr3 5184512 5184664 + 1.25 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -3119 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 188-45 chr3 97384531 97384759 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -54962 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 189-82 chr4 45440535 45440786 + 1.25 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 683394 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 164.5-46 chr13 58955638 58955896 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -722650 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 224.75-12 chr1 194626525 194626836 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 1321935 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 119-37 chr12 22132173 22132337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86037 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 303-9 chr14 57884954 57885383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19076 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 239.75-31 chr18 77390996 77391265 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 141282 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 184.5-86 chr20 28814368 28814549 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -211793 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 240.75-48 chr20 53009880 53010255 + 1.25 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 37709 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 288.75-22 chr17 59711836 59712173 + 1.25 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 4350 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 262-60 chr8 124752606 124752877 + 1.25 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -24234 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 377.75-13 chr7 97092590 97093170 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23713 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 279.5-16 chr12 58263394 58263781 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 175695 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 275-28 chr3 10678036 10678464 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51443 NR_046766 100874325 Hs.143004 NR_046766 ENSG00000224771 ATP2B2-IT2 - ATP2B2 intronic transcript 2 ncRNA 209.5-72 chr2 195965086 195965527 + 1.25 NA intron (NM_018897, intron 17 of 64) L1MA3|LINE|L1 103531 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 389.25-9 chr7 42930013 42930551 + 1.25 NA intron (NM_002787, intron 1 of 7) AluJo|SINE|Alu 1892 NM_002787 5683 Hs.333786 NM_002787 ENSG00000106588 PSMA2 HC3|MU|PMSA2|PSC2 proteasome subunit alpha 2 protein-coding 190.5-63 chr17 72785190 72785379 + 1.25 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -144812 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 330.75-7 chr12 22070496 22070917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24488 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 211.25-45 chr20 2248643 2249021 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 41904 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 223-61 chr5 7603453 7603642 + 1.25 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) intron (NM_020546, intron 3 of 24) 207409 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 173.75-131 chr6 36192248 36192440 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4400 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 159.75-130 chr5 38924353 38924615 + 1.25 NA exon (NM_001323505, exon 14 of 18) exon (NM_001323505, exon 14 of 18) 78472 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 140.25-76 chr18 5591456 5591650 + 1.25 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 37438 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 153.5-120 chr21 30596730 30596940 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 2039 NM_181604 337967 Hs.553690 NM_181604 ENSG00000186930 KRTAP6-2 KAP6.2 keratin associated protein 6-2 protein-coding 184.25-87 chr4 36535412 36535721 + 1.25 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) L1ME4b|LINE|L1 106334 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 221.5-36 chr18 2098775 2098978 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 472629 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 114.5-119 chr18 38100093 38100315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 443069 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 154.5-23 chr10 59925900 59926077 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -19432 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 248.75-27 chr17 72333948 72334246 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8714 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 164.75-26 chr11 36063539 36063779 + 1.25 NA non-coding (NR_135064, exon 2 of 2) non-coding (NR_135064, exon 2 of 2) 14242 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 116.5-7 chr1 75664074 75664249 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -47998 NM_001320283 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 113.5-140 chr20 38412220 38412348 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13046 NR_002910 26776 Hs.400876 NR_002910 ENSG00000235408 SNORA71B RNU71B|U71b small nucleolar RNA, H/ACA box 71B snoRNA 221.5-7 chr10 51437713 51438040 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) MER20|DNA|hAT-Charlie 138303 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 121.75-11 chr1 225076319 225076456 + 1.25 NA intron (NM_001367479, intron 17 of 85) L1M3e|LINE|L1 146712 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 134.75-146 chr3 101376092 101376210 + 1.25 NA intron (NM_001282803, intron 3 of 20) L1MB3|LINE|L1 -55576 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 331.5-19 chr21 24193736 24194030 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 127494 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 298.25-28 chr5 155725801 155726058 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -600828 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 291.75-32 chr4 55611602 55612128 + 1.25 NA intron (NM_001292045, intron 2 of 8) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -19620 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 227.75-44 chr2 211121248 211121497 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 503801 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 522-5 chr9 100605505 100606237 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27792 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 178.25-97 chr5 20350799 20351068 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 45382 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 314.75-13 chr22 31290646 31291080 + 1.25 NA intron (NM_001135911, intron 3 of 4) CpG 1625 NM_052880 113791 Hs.26670 NM_052880 ENSG00000100100 PIK3IP1 HGFL|TrIP|hHGFL(S) phosphoinositide-3-kinase interacting protein 1 protein-coding 311-11 chr14 54150066 54150407 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -193345 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 292.75-26 chr4 6936007 6936374 + 1.25 NA intron (NM_020773, intron 2 of 13) L1MC1|LINE|L1 -17976 NM_001330638 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 164.25-24 chr11 23482061 23482272 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62976 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 266-16 chr15 61674711 61675101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55012 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 172-5 chr1 49504875 49505154 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L1M1|LINE|L1 -32929 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 179.5-94 chr2 135788630 135788790 + 1.25 NA intron (NM_002299, intron 16 of 16) intron (NM_002299, intron 16 of 16) -31481 NR_045486 100507600 Hs.662020 NR_045486 ENSG00000226806 LOC100507600 - uncharacterized LOC100507600 ncRNA 193.75-16 chr10 34182291 34182517 + 1.25 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -409724 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 179-40 chr16 6486401 6486746 + 1.25 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -287236 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 170.25-105 chr4 30395766 30396078 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -324447 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 261-20 chr15 81275464 81276013 + 1.25 NA intron (NM_001352686, intron 6 of 18) intron (NM_001352686, intron 6 of 18) -21232 NM_004513 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 203.75-63 chr2 113281991 113282288 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3218 NM_003466 7849 Hs.469728 NM_003466 ENSG00000125618 PAX8 - paired box 8 protein-coding 227-17 chr13 97178160 97178458 + 1.25 NA intron (NR_125725, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 1313 NR_125725 103625683 Hs.679591 NR_125725 ENSG00000233124 LINC00456 - long intergenic non-protein coding RNA 456 ncRNA 112.25-23 chr10 89941343 89941454 + 1.25 NA intron (NR_110655, intron 3 of 3) MER21C|LTR|ERVL 15975 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 284.75-31 chr6 130660440 130660765 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166803 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 237.25-57 chr4 145838614 145838861 + 1.25 NA intron (NM_178835, intron 7 of 14) L1ME4a|LINE|L1 100086 NM_001306215 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 197.5-36 chr13 73507160 73507464 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -56932 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 265-22 chr20 34534879 34535291 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001319157, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001319157, exon 3 of 3) -11759 NM_181509 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 299.5-22 chr20 42164493 42164934 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 17 of 31) intron (NM_133170, intron 17 of 31) -520770 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 346.5-22 chr3 159774512 159775014 + 1.25 NA intron (NM_001197113, intron 5 of 10) intron (NM_001197113, intron 5 of 10) -6151 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 337-28 chr7 31939151 31939474 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 131095 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 238.25-27 chr18 2744797 2745080 + 1.25 NA intron (NM_015295, intron 29 of 47) AluSq|SINE|Alu 89051 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 137.5-176 chr4 85997758 85997975 + 1.25 NA intron (NM_031305, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu 67850 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 231.75-57 chr5 37128315 37128529 + 1.25 NA intron (NM_023073, intron 45 of 51) intron (NM_023073, intron 45 of 51) -120624 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 252.5-25 chr13 93152243 93152595 + 1.25 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -74388 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 320-24 chr22 32631341 32631631 + 1.25 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) 156249 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 196.75-112 chr8 141820518 141820755 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34323 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 200-49 chr2 222731826 222732146 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 60328 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 127.75-59 chr14 39516238 39516371 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -83804 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 336.5-29 chr8 123124149 123124548 + 1.25 NA intron (NM_001363149, intron 11 of 21) intron (NM_001363149, intron 11 of 21) 51099 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 180.25-60 chr20 10460662 10460951 + 1.25 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) intron (NM_001009608, intron 2 of 7) 25501 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 133-129 chr4 154050255 154050380 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -261234 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 277.75 chr1 87581660 87582123 + 1.25 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -210236 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 236.5-99 chr8 133010024 133010297 + 1.25 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) MIRc|SINE|MIR 36421 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 321.5-6 chr12 105667487 105667896 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36512 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 257.75-29 chr22 40626989 40627357 + 1.25 NA intron (NM_020831, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu 9546 NM_001282661 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 211.75-21 chr13 46669289 46669594 + 1.25 NA intron (NM_001164213, intron 3 of 18) intron (NM_001164213, intron 3 of 18) 116271 NM_001164213 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 260.25-45 chr6 160910255 160910715 + 1.25 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -81242 NM_006724 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 241.5-48 chr2 138078019 138078293 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23728 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 328.75-2 chr10 115023335 115023872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28946 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 227.5-35 chr14 97881437 97881782 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 96515 NR_152747 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 183.75-107 chr6 93269069 93269251 + 1.25 NA intron (NM_001288629, intron 7 of 16) intron (NM_001288629, intron 7 of 16) 150399 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 304.75-23 chr4 47501337 47501793 + 1.25 NA intron (NM_020453, intron 1 of 22) intron (NM_020453, intron 1 of 22) 16290 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 285.5-20 chr14 68469774 68470174 + 1.25 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 158813 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 207.75-127 chr8 91976419 91976657 + 1.25 NA intron (NM_004349, intron 8 of 10) intron (NM_004349, intron 8 of 10) 41142 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 208.25-33 chr16 75977055 75977413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -250744 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 204.75-33 chr13 54106690 54106974 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26039 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 312.5-28 chr5 25493063 25493455 + 1.25 NA Intergenic 5S|rRNA|rRNA 302306 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 374-4 chr13 32185788 32186195 + 1.25 NA intron (NM_023037, intron 26 of 60) intron (NM_023037, intron 26 of 60) 125963 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 188.75-19 chr12 2970335 2970581 + 1.25 NA intron (NM_201443, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 10523 NM_201443 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 149-63 chr2 190921055 190921262 + 1.25 NA exon (NM_001256310, exon 9 of 15) exon (NM_001256310, exon 9 of 15) 40337 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 164.75-153 chr9 27829944 27830297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -256254 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 190-61 chr5 105188665 105188954 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 89335 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 205.75-79 chr7 54107349 54107557 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -223244 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 324.75-23 chr4 93417489 93418047 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 8 of 14) L1ME3B|LINE|L1 -410985 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 159.75-102 chr3 44091588 44091811 + 1.25 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -22513 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 150.75-107 chr2 216551035 216551333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52340 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 225-71 chr7 21955190 21955708 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -9550 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 185.5-152 chr7 49505158 49505347 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -268386 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 177-87 chr6 135141525 135141760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39666 NM_001161659 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 123.75-164 chr6 133960628 133960736 + 1.25 NA intron (NM_004865, intron 1 of 6) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 7458 NM_004865 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 164-106 chr5 128105772 128106015 + 1.25 NA intron (NM_001046, intron 1 of 26) intron (NM_001046, intron 1 of 26) 22127 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 155-113 chr5 146149275 146149431 + 1.25 NA intron (NM_016460, intron 14 of 30) intron (NM_016460, intron 14 of 30) 33297 NM_020117 51520 Hs.432674 NM_016460 ENSG00000133706 LARS HSPC192|ILFS1|LARS1|LEURS|LEUS|LFIS|LRS|PIG44|RNTLS|hr025Cl leucyl-tRNA synthetase protein-coding 213.75-13 chr10 51628464 51628774 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 70976 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 267-6 chr10 5783574 5783907 + 1.25 NA intron (NM_001494, intron 6 of 10) L1PBa|LINE|L1 29694 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 161.25-37 chr12 51283407 51283622 + 1.25 NA intron (NM_001364779, intron 12 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -13099 NM_001031628 57228 Hs.652389 NM_001031628 ENSG00000170545 SMAGP hSMAGP small cell adhesion glycoprotein protein-coding 274.5-53 chr5 51188686 51188939 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 194520 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 378.5-9 chr20 37140095 37140807 + 1.25 NA intron (NM_152503, intron 12 of 24) AluSz6|SINE|Alu -38595 NM_001135771 6185 Hs.370895 NM_002951 ENSG00000118705 RPN2 RIBIIR|RPN-II|RPNII|SWP1 ribophorin II protein-coding 201.5-44 chr13 23430337 23430502 + 1.25 NA intron (NM_014363, intron 1 of 9) MER53|DNA|hAT 3283 NM_014363 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 121.5-51 chr11 117067563 117067744 + 1.25 NA intron (NM_001366687, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 30775 NM_001281749 23387 Hs.167451 NM_025164 ENSG00000160584 SIK3 L19|QSK|SEMDK|SIK-3 SIK family kinase 3 protein-coding 207-9 chr10 19845531 19845760 + 1.25 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) MER66B|LTR|ERV1 29213 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 154.5-138 chr4 57404319 57404501 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21462 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 464.5-5 chr6 157142849 157143547 + 1.25 NA intron (NM_020732, intron 8 of 19) intron (NM_020732, intron 8 of 19) 106771 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 201.25-76 chr5 151226355 151226597 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2384 NM_015621 26112 Hs.655336 NM_015621 ENSG00000198624 CCDC69 - coiled-coil domain containing 69 protein-coding 186.75-35 chr14 88925050 88925337 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 100542 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 427.75 chr2 142147962 142148359 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16459 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 395.5-21 chr8 124914861 124915303 + 1.25 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -26926 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 112.75-200 chr8 109505363 109505523 + 1.25 NA intron (NM_177531, intron 68 of 77) intron (NM_177531, intron 68 of 77) -34257 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 281-19 chr3 28173925 28174149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67582 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 157.75-138 chr5 89935494 89935699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81124 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 312.25-24 chr6 122309591 122310027 + 1.25 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -89742 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 446.75-4 chr13 32773774 32774383 + 1.25 NA intron (NM_015032, intron 34 of 34) AluSz|SINE|Alu 137574 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 280.25-46 chr6 68978006 68978264 + 1.25 NA intron (NM_001704, intron 10 of 31) intron (NM_001704, intron 10 of 31) 342853 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 152-124 chr5 42008289 42008511 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83119 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 420-6 chr17 51193820 51194309 + 1.25 NA intron (NM_017643, intron 13 of 16) intron (NM_017643, intron 13 of 16) 27342 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 334.25-11 chr17 69018175 69018553 + 1.25 NA TTS (NR_126414) TTS (NR_126414) 13650 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 235-61 chr6 9780396 9780781 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -623914 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 140.75-121 chr3 111133296 111133487 + 1.25 NA intron (NM_001243288, intron 5 of 8) intron (NM_001243288, intron 5 of 8) 61575 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 256-14 chr15 57387470 57387819 + 1.25 NA intron (NM_032866, intron 1 of 18) intron (NM_032866, intron 1 of 18) 11139 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 141.5-170 chr5 28562942 28563127 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -275369 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 329-5 chr1 169271958 169272339 + 1.25 NA intron (NR_104229, intron 7 of 12) (AATATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 95649 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 307.25-29 chr4 80777751 80778299 + 1.25 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -252683 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 321-27 chr6 155368363 155368869 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54132 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 237.5-52 chr2 117774524 117774900 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39979 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 232.75-21 chr14 45037177 45037521 + 1.25 NA intron (NR_131765, intron 11 of 19) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -46767 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 176.25-33 chr12 84140530 84140707 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 772181 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 169.5-51 chr14 65312073 65312311 + 1.25 NA Intergenic LTR86A1|LTR|ERVL 22991 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 333.75-2 chr10 65812967 65813464 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 241790 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 324.5-2 chr1 165184967 165185332 + 1.25 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 171092 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 299.75-3 chr1 205786523 205786959 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11259 NM_001135664 8934 Hs.115325 NM_003929 ENSG00000117280 RAB29 RAB7L|RAB7L1 RAB29, member RAS oncogene family protein-coding 394.25-2 chr10 76930028 76930385 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 23 of 28) L1MA9|LINE|L1 42162 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 241.5-31 chr18 5674604 5674837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45729 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 123-60 chr15 62663675 62663792 + 1.25 NA intron (NM_015059, intron 6 of 55) L1ME3Cz|LINE|L1 16422 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 192.25-89 chr5 125655913 125656175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162783 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 159.75-63 chr17 66491587 66491840 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -74859 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 259.75-11 chr12 22312972 22313271 + 1.25 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 21593 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 292.25-32 chr4 66634599 66635016 + 1.25 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 357983 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 245-69 chr8 104838096 104838511 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -249279 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 238.25-17 chr13 101538765 101539171 + 1.25 NA intron (NM_001271756, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 49016 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 208-6 chr1 212074380 212074661 + 1.25 NA intron (NM_001286229, intron 9 of 12) intron (NM_001286229, intron 9 of 12) -3093 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 318.25-13 chr6 45085760 45086059 + 1.25 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 111861 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 445.75-6 chr14 68646652 68647036 + 1.25 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -18057 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 242.5-4 chr1 165473850 165474244 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28692 NM_001256570 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 216-46 chr2 207321905 207322244 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -52650 NR_031633 100302130 NR_031633 ENSG00000221628 MIR1302-4 MIRN1302-4|hsa-mir-1302-4 microRNA 1302-4 ncRNA 210.5-104 chr5 117005523 117005797 + 1.25 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -243451 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 211-67 chr8 90693854 90694095 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -47891 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 145.75-127 chr5 91608207 91608357 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224965 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 119.75-130 chr21 31965408 31965535 + 1.25 NA intron (NM_014586, intron 5 of 10) intron (NM_014586, intron 5 of 10) 92451 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 161.75-124 chr8 93073194 93073424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43558 NR_107051 102467005 NR_107051 ENSG00000277063 MIR8084 hsa-mir-8084 microRNA 8084 ncRNA 334.5-6 chr16 10154799 10155227 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) MER103C|DNA|hAT-Charlie 27054 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 237.5-4 chr1 85659148 85659358 + 1.25 NA intron (NM_017953, intron 8 of 9) intron (NM_017953, intron 8 of 9) 49180 NM_001170670 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 267.25-5 chr10 50328653 50328923 + 1.25 NA intron (NM_147156, intron 7 of 10) intron (NM_147156, intron 7 of 10) -80178 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 182-15 chr10 113093487 113093756 + 1.25 NA intron (NM_001146283, intron 5 of 12) intron (NM_001146283, intron 5 of 12) -33012 NM_001349871 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 310.25-7 chr15 60835768 60836127 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 154378 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 242.5-66 chr5 36915785 36916017 + 1.25 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) Charlie11|DNA|hAT-Charlie 39132 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 132.5-139 chr20 37331575 37331704 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13046 NM_005417 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 190.25-61 chr2 19131423 19131597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104539 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 214-42 chr3 34936559 34936882 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1ME5|LINE|L1 457303 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 171.5-33 chr12 10708176 10708332 + 1.25 NA intron (NM_001145426, intron 5 of 8) intron (NM_001145426, intron 5 of 8) 15069 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 119-158 chr5 165176797 165176956 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 706597 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 166.75-143 chr8 124777995 124778182 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -43897 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 257.75-8 chr10 118181373 118181686 + 1.25 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -134588 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 154.75-95 chr3 114549001 114549210 + 1.25 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 75101 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 218-64 chr7 41765084 41765329 + 1.25 NA intron (NR_027118, intron 2 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -62116 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 160.5-40 chr12 76012365 76012550 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19319 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 127-77 chr17 2374213 2374338 + 1.25 NA intron (NM_001346700, intron 16 of 22) intron (NM_001346700, intron 16 of 22) 26785 NM_020310 4335 Hs.626579 NM_020310 ENSG00000070444 MNT MAD6|MXD6|ROX|bHLHd3 MAX network transcriptional repressor protein-coding 244.5-105 chr9 25703344 25703583 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24605 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 403.5-10 chr8 133049455 133050148 + 1.25 NA intron (NM_001045556, intron 5 of 8) MIR3|SINE|MIR -3220 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 201.5-111 chr5 112822756 112823057 + 1.25 NA intron (NM_001354895, intron 11 of 15) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -38282 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 166.25-64 chr17 76765604 76765804 + 1.25 NA intron (NR_148240, intron 9 of 13) AluJb|SINE|Alu 28203 NM_001242536 79157 Hs.73965 NM_024311 ENSG00000092931 MFSD11 ET major facilitator superfamily domain containing 11 protein-coding 229-53 chr3 116063799 116064226 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -158886 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 189.25-20 chr12 2200441 2200665 + 1.25 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 MER20|DNA|hAT-Charlie 22928 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 260.5-22 chr17 73907583 73907971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79240 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 207-71 chr6 55782396 55782632 + 1.25 NA intron (NM_001329754, intron 3 of 5) intron (NM_001329754, intron 3 of 5) 93076 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 207-59 chr3 49601655 49601952 + 1.25 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) intron (NM_003458, intron 1 of 11) 47326 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 221.75-25 chr14 69425364 69425646 + 1.25 NA intron (NM_001330185, intron 2 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 26813 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 119.5-67 chr13 34441634 34441778 + 1.25 NA intron (NR_047036, intron 2 of 2) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 93663 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 130.75-159 chr5 122424473 122424677 + 1.25 NA intron (NM_001308105, intron 3 of 8) intron (NM_001308105, intron 3 of 8) 33486 NM_001308105 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 127.5-91 chr15 77490524 77490677 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -34995 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 211.75-25 chr14 71437429 71437748 + 1.25 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) AluSz6|SINE|Alu -1351 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 195.5-59 chr18 76727286 76727669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37448 NR_122073 400661 Hs.514963 NR_122073 ENSG00000276397 LINC01879 - long intergenic non-protein coding RNA 1879 ncRNA 139.75-159 chr6 134911304 134911424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38737 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 284.5-22 chr16 65059909 65060192 + 1.25 NA intron (NM_001330576, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 62013 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 281.5-21 chr16 67835495 67835749 + 1.25 NA 5' UTR (NM_025082, exon 2 of 16) 5' UTR (NM_025082, exon 2 of 16) -6698 NM_020457 57215 Hs.632200 NM_020457 ENSG00000168286 THAP11 CTG-B43a|CTG-B45d|HRIHFB2206|RONIN THAP domain containing 11 protein-coding 172.25-5 chr1 110040101 110040238 + 1.25 NA intron (NR_073071, intron 6 of 21) AluSx1|SINE|Alu 5545 NM_033088 85369 Hs.584996 NM_033088 ENSG00000143093 STRIP1 FAM40A|FAR11A striatin interacting protein 1 protein-coding 254.25-30 chr19 38500486 38500749 + 1.25 NA exon (NM_000540, exon 46 of 106) exon (NM_000540, exon 46 of 106) 66917 NM_000540 6261 Hs.466664 NM_000540 ENSG00000196218 RYR1 CCO|MHS|MHS1|PPP1R137|RYDR|RYR|RYR-1|SKRR ryanodine receptor 1 protein-coding 210.5-113 chr6 69578505 69578724 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 217852 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 150-91 chr3 68032516 68032650 + 1.25 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 28336 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 132-177 chr8 102630574 102630778 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 23288 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 246.75-71 chr8 81287304 81287602 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6917 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 200.25 chr1 101102131 101102403 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76421 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 126.25-120 chr3 109966813 109966967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 364062 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 330.5-3 chr10 31033302 31033617 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1522 NM_001143767 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 155.5-143 chr4 49108403 49108604 + 1.25 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 121861 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 221.5-97 chr8 38411119 38411334 + 1.25 NA TTS (NM_023110) TTS (NM_023110) 24095 NM_001199660 137994 Hs.696457 NM_144652 ENSG00000165046 LETM2 SLC55A2 leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 2 protein-coding 234.75-78 chr7 91547102 91547321 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 282778 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 185.5-149 chr7 28615999 28616414 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) L1MC5|LINE|L1 -69927 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 272.25-6 chr10 125566491 125567029 + 1.25 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -7611 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 366.75-9 chr2 33322191 33322869 + 1.25 NA intron (NM_001166264, intron 20 of 28) intron (NM_001166264, intron 20 of 28) -95986 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 194.75-4 chr1 95530409 95530719 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 20448 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 175-48 chr16 61460657 61460834 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -404979 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 223-78 chr8 29967656 29967875 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -10417 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 329.25-29 chr8 128478010 128478549 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 86400 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 146.5-57 chr13 20764341 20764706 + 1.25 NA intron (NM_001318939, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 9435 NM_174928 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 188.75-77 chr22 40101936 40102113 + 1.25 NA intron (NM_001024843, intron 1 of 23) intron (NM_001024843, intron 1 of 23) 57207 NM_001024843 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 263.25-7 chr1 230022309 230022717 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19796 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 233.5-24 chr11 28854334 28854620 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -376929 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 316-11 chr14 60082739 60083044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9020 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 178.5-82 chr2 75303602 75303758 + 1.25 NA Intergenic (ATGTGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -104160 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 137.75-117 chr20 48167785 48168004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -177777 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 251.5-81 chr7 84614180 84614767 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81997 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 246-33 chr2 105151090 105151484 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7174 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 135.75-124 chr21 26517473 26517684 + 1.25 NA intron (NR_135516, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 55708 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 331.75-26 chr8 92527703 92528062 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 127612 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 258.5-12 chr11 90781156 90781451 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) MLT2E|LTR|ERVL 87899 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 227.5-44 chr17 76665114 76665388 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6677 NR_130916 105274304 Hs.572495 NR_130916 ENSG00000261335 LOC105274304 - uncharacterized LOC105274304 ncRNA 195.75-105 chr6 167886248 167886515 + 1.25 NA intron (NM_001207008, intron 6 of 31) intron (NM_001207008, intron 6 of 31) 58746 NM_001291964 4301 Hs.614974 NM_005936 ENSG00000130396 AFDN AF6|MLL-AF6|MLLT4|l-afadin afadin, adherens junction formation factor protein-coding 173.75-148 chr8 105614436 105614705 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 295027 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 396.75-5 chr7 88210358 88210685 + 1.25 NA intron (NM_198901, intron 4 of 7) intron (NM_198901, intron 4 of 7) -6139 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 276.25-38 chr7 1563945 1564318 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5901 NM_032302 84262 Hs.446311 NM_032302 ENSG00000157778 PSMG3 C7orf48|PAC3 proteasome assembly chaperone 3 protein-coding 229.75-80 chr9 97747528 97747805 + 1.25 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) intron (NR_147055, intron 5 of 10) -50257 NM_000380 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 183-16 chr12 47315613 47315790 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8302 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 170.5-122 chr3 120780766 120781051 + 1.25 NA intron (NM_005513, intron 4 of 4) intron (NM_005513, intron 4 of 4) 38164 NM_005513 2960 Hs.445272 NM_005513 ENSG00000153767 GTF2E1 FE|TF2E1|TFIIE-A general transcription factor IIE subunit 1 protein-coding 208.5-11 chr10 69599499 69599812 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -26233 NM_020999 50674 Hs.532682 NM_020999 ENSG00000122859 NEUROG3 Atoh5|Math4B|NGN-3|bHLHa7|ngn3 neurogenin 3 protein-coding 149.5-50 chr13 25045035 25045197 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51022 NM_030979 5042 Hs.458280 NM_030979 ENSG00000151846 PABPC3 PABP3|PABPL3|tPABP poly(A) binding protein cytoplasmic 3 protein-coding 250.75-9 chr12 64837984 64838260 + 1.25 NA intron (NM_001364838, intron 6 of 11) intron (NM_001364838, intron 6 of 11) 13475 NM_001364838 23329 Hs.192492 NM_015279 ENSG00000111490 TBC1D30 - TBC1 domain family member 30 protein-coding 253-29 chr22 29672698 29673019 + 1.25 NA intron (NR_156186, intron 12 of 16) AluSq2|SINE|Alu -47145 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 322-6 chr11 69500336 69500647 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14930 NR_120544 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 229.5-17 chr10 57973631 57974030 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 294064 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 217-46 chr22 27342063 27342357 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 31559 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 330.5-14 chr17 22428136 22428619 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 22358 NR_027084 284124 Hs.310247 NR_027084 ENSG00000276399 FLJ36000 - uncharacterized FLJ36000 ncRNA 346.25-12 chr3 30824585 30825058 + 1.25 NA intron (NM_207359, intron 11 of 14) L1ME3A|LINE|L1 69840 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 305.25-48 chr8 131660607 131661049 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -243265 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 192.75-66 chr2 211084748 211085017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 467311 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 267-14 chr11 99608425 99608837 + 1.25 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 52486 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 185.5-117 chr4 80693659 80693996 + 1.25 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -336881 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 365.25-2 chr1 94673231 94673630 + 1.25 NA intron (NR_160784, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 72470 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 223.5-109 chr6 69534308 69534560 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 262032 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 206.5-36 chr18 8954119 8954346 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -148467 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 173-79 chr21 30238667 30238898 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22685 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 234.5-59 chr3 7727507 7727735 + 1.25 NA intron (NM_181874, intron 10 of 10) intron (NM_181874, intron 10 of 10) -192337 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 115-21 chr10 80559243 80559372 + 1.25 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 18488 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 142.25-173 chr8 134204457 134204659 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 318062 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 137.75-196 chr7 46268565 46268749 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -347385 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 233.75-13 chr11 101791909 101792235 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -122938 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 172.75-105 chr5 143375483 143375676 + 1.25 NA intron (NR_157096, intron 1 of 7) intron (NR_157096, intron 1 of 7) 27704 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 303-26 chr5 155426595 155426918 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 413001 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 134.25-98 chr20 13715326 13715509 + 1.25 NA intron (NM_001276380, intron 13 of 13) intron (NM_001276380, intron 13 of 13) 69469 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 293.25-35 chr8 69422090 69422511 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 25944 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 260-12 chr18 6006086 6006367 + 1.25 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) intron (NR_158609, intron 15 of 17) -110272 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 246.75-18 chr15 63569563 63569777 + 1.25 NA intron (NM_001256702, intron 7 of 13) intron (NM_001256702, intron 7 of 13) -27717 NM_001367809 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 337.75-21 chr8 100076461 100076827 + 1.25 NA intron (NM_015668, intron 4 of 27) L1MEc|LINE|L1 28982 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 224.75-74 chr8 111379051 111379277 + 1.25 NA intron (NR_146282, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 2525 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 229.5-91 chr3 124853464 124853666 + 1.25 NA intron (NM_001354766, intron 3 of 13) intron (NM_001354766, intron 3 of 13) 33800 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 241.25-49 chr3 195277387 195277874 + 1.25 NA 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) -6471 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 138.5-217 chrX 82229367 82229623 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 1027393 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 129-173 chr8 19136538 19136706 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108900 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 242.75-54 chr4 163039216 163039580 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 54230 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 306.25-24 chr20 42977784 42978397 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 9347 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 236.5-100 chr8 134227074 134227420 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 340751 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 254.5-23 chr14 46580814 46581057 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70846 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 243.75-75 chr7 34109538 34109766 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) L2c|LINE|L2 204113 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 207.5-127 chr9 90252026 90252389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 181282 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 311.25-30 chr8 90466890 90467202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139017 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 181.75-16 chr10 64916097 64916319 + 1.25 NA intron (NR_134456, intron 1 of 1) L1M2|LINE|L1 8310 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 211.5-124 chr5 51029449 51029812 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59443 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 249-60 chrX 49796742 49797153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32313 NM_001318877 9506 Hs.441038 NM_007003 ENSG00000101951 PAGE4 CT16.7|GAGE-9|GAGEC1|JM-27|JM27|PAGE-1|PAGE-4 PAGE family member 4 protein-coding 200.5-89 chr3 74267997 74268232 + 1.25 NA intron (NM_020872, intron 19 of 21) intron (NM_020872, intron 19 of 21) 253026 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 236-19 chr14 86206204 86206525 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 271686 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 235-22 chr15 41529215 41529540 + 1.25 NA intron (NM_015540, intron 9 of 24) intron (NM_015540, intron 9 of 24) 14880 NM_015540 26015 Hs.371045 NM_015540 ENSG00000103932 RPAP1 - RNA polymerase II associated protein 1 protein-coding 223.5-84 chr3 181099492 181099808 + 1.25 NA intron (NR_075091, intron 2 of 7) intron (NR_075091, intron 2 of 7) 42970 NR_075091 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 167-58 chr2 65728114 65728319 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -295617 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 247.5-44 chr2 163894656 163894926 + 1.25 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -158783 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 249-24 chr2 151819922 151820195 + 1.25 NA intron (NM_177985, intron 1 of 5) intron (NM_177985, intron 1 of 5) 8363 NM_012097 26225 Hs.470233 NM_012097 ENSG00000162980 ARL5A ARFLP5|ARL5 ADP ribosylation factor like GTPase 5A protein-coding 297.25-14 chr2 101969124 101969499 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -14154 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 417-9 chr22 25329350 25329777 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 11306 NR_029395 91353 Hs.651077 NM_001013618 IGLL3P 16.1|IGLL3 immunoglobulin lambda like polypeptide 3, pseudogene pseudo 172.5-99 chr2 101159023 101159210 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 7456 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 212.75-88 chr6 74985762 74986081 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 142861 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 239.75-47 chr3 164507976 164508235 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 323375 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 257.75-28 chr22 26358272 26358561 + 1.25 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) MIR|SINE|MIR -70844 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 155.25-3 chr1 33399946 33400176 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -24468 NM_198040 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 272.75-43 chr6 36910046 36910342 + 1.25 NA intron (NM_152734, intron 3 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 24242 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 181-9 chr10 17127021 17127245 + 1.25 NA intron (NM_001081, intron 3 of 66) intron (NM_001081, intron 3 of 66) 2684 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 128.25-110 chr2 216868085 216868303 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_135525) promoter-TSS (NR_135525) -385 NR_135525 105373876 Hs.149762 NR_135525 ENSG00000237479 LOC105373876 - uncharacterized LOC105373876 ncRNA 338.25-27 chr7 62306441 62306822 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 997425 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 140.25-195 chr9 84832882 84833086 + 1.25 NA intron (NM_001018064, intron 12 of 17) intron (NM_001018064, intron 12 of 17) 127083 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 187-113 chrX 89554181 89554388 + 1.25 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -367624 NM_138960 90316 Hs.592220 NM_138960 ENSG00000153779 TGIF2LX TGIFLX TGFB induced factor homeobox 2 like X-linked protein-coding 193-29 chr16 9414518 9414777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30338 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 237.5-42 chr18 3424786 3425146 + 1.25 NA intron (NM_001278686, intron 2 of 3) MER21B|LTR|ERVL 12110 NM_001278686 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 260.75-21 chr19 15602333 15602641 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -12731 NM_007253 11283 Hs.268554 NM_007253 ENSG00000186526 CYP4F8 CPF8|CYPIVF8 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 8 protein-coding 197.25-5 chr1 119962850 119963044 + 1.25 NA intron (NM_001200001, intron 11 of 21) intron (NM_001200001, intron 11 of 21) -66432 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 281.5-6 chr10 60165332 60165717 + 1.25 NA intron (NM_001204404, intron 23 of 43) intron (NM_001204404, intron 23 of 43) -24508 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 140.75-118 chr21 18473282 18473447 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69579 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 268.25-47 chr8 129883613 129883855 + 1.25 NA intron (NM_001353307, intron 4 of 13) MIR|SINE|MIR 56077 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 264-28 chr19 51347060 51347474 + 1.25 NA intron (NM_001014763, intron 3 of 4) intron (NM_001014763, intron 3 of 4) -5143 NM_001163922 147645 Hs.293236 NM_001163922 ENSG00000186806 VSIG10L - V-set and immunoglobulin domain containing 10 like protein-coding 240-57 chr7 39656140 39656494 + 1.25 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) intron (NM_005402, intron 1 of 4) 32745 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 247.25-13 chr13 49083689 49084063 + 1.25 NA intron (NM_001079673, intron 3 of 25) L3|LINE|CR1 -26441 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 400.25-3 chr12 69975257 69975645 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 150224 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 190.25-46 chr16 49195215 49195442 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86510 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 576 chr19 34619779 34620460 + 1.25 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) LOR1-int|LTR|ERV1 -25534 NM_001025591 284402 Hs.656990 NM_001025591 ENSG00000205209 SCGB2B2 SCGB4A2|SCGBL secretoglobin family 2B member 2 protein-coding 325.75-15 chr2 215240280 215240574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71632 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 228.75-95 chr9 103387288 103387496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62359 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 314.25-19 chr3 63619126 63619579 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33323 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 303.25-12 chr14 70266906 70267326 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19315 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 112.75-171 chr5 149188880 149189053 + 1.25 NA intron (NM_001370418, intron 2 of 18) L1MB8|LINE|L1 47235 NM_001301028 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 230.25-37 chr2 38212897 38213158 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 81922 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 158-145 chr8 122592985 122593213 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24455 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 170.75-36 chr14 61020115 61020359 + 1.25 NA intron (NR_033344, intron 5 of 16) intron (NR_033344, intron 5 of 16) -38547 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 275.5 chr1 68551635 68552062 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -54766 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 308.5-7 chr11 124347044 124347353 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -27001 NM_001002918 283160 Hs.504212 NM_001002918 ENSG00000279116 OR8D2 JCG2 olfactory receptor family 8 subfamily D member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 206.75-100 chrX 39114032 39114271 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 213211 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 174.25-52 chr14 70413799 70413984 + 1.25 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) intron (NM_001202549, intron 1 of 4) 3199 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 226-24 chr15 81332645 81332971 + 1.25 NA exon (NM_001080532, exon 22 of 22) exon (NM_001080532, exon 22 of 22) 8475 NR_120365 101929655 Hs.696654 NR_120365 TMC3-AS1 - TMC3 antisense RNA 1 ncRNA 273.5-5 chr1 162413540 162413911 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -1589 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 205.25-65 chr3 9561144 9561408 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7454 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 193.75-83 chr3 33028319 33028594 + 1.25 NA intron (NM_001079811, intron 10 of 15) intron (NM_001079811, intron 10 of 15) 68376 NM_001079811 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 146.25-18 chr11 11113981 11114106 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 239207 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 347.5-22 chr9 94494897 94495241 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -59976 NR_121569 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 308.75-24 chr2 121977655 121978030 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 222191 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 334.25-10 chr16 74062847 74063369 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 152413 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 192.25-19 chr12 59298675 59298849 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -297267 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 275.5-32 chr2 231027379 231027646 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10011 NM_001144994 257407 Hs.526596 NM_001144994 ENSG00000204128 C2orf72 - chromosome 2 open reading frame 72 protein-coding 311.25-19 chr5 78139786 78140078 + 1.25 NA intron (NM_003664, intron 15 of 26) intron (NM_003664, intron 15 of 26) 154766 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 291.75-5 chr10 54883981 54884346 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -82872 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 179-27 chr12 6538823 6539076 + 1.25 NA TTS (NR_036467) TTS (NR_036467) 3685 NM_001256799 2597 Hs.544577 NM_002046 ENSG00000111640 GAPDH G3PD|GAPD|HEL-S-162eP glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase protein-coding 236.5-104 chr9 71557952 71558189 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -111099 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 247.5-49 chr20 46717057 46717346 + 1.25 NA intron (NM_030777, intron 1 of 4) L1MEi|LINE|L1 7552 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 163.5-139 chr4 31072016 31072245 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -99014 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 310-27 chr8 110568213 110568578 + 1.25 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 459038 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 330.5-11 chr15 39032801 39033471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -217533 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 125.25-11 chr1 118756504 118756618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 231782 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 311.25-8 chr18 71360998 71361292 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 217811 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 198-80 chr8 109326311 109326558 + 1.25 NA intron (NM_032869, intron 1 of 9) LTR83|LTR|ERVL 3499 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 320.5 chr1 68829788 68830324 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -225842 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 441-6 chr3 99582554 99583109 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -55763 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 464.25-5 chr4 142418478 142418980 + 1.25 NA intron (NM_001331040, intron 5 of 25) L2b|LINE|L2 427806 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 177.75-76 chr2 143696986 143697228 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 12 of 13) intron (NM_018460, intron 12 of 13) -239960 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 198.5-142 chr8 64000901 64001155 + 1.25 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) LTR18B|LTR|ERVL 231598 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 256-7 chr11 30595039 30595295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8814 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 205.25-64 chr22 26078742 26079021 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90581 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 291.75-28 chr3 84603926 84604306 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 265459 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 149.25-75 chr2 10633421 10633631 + 1.25 NA intron (NR_048552, intron 12 of 19) LTR37-int|LTR|ERV1 56449 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 210-43 chr19 8601878 8602111 + 1.25 NA intron (NM_030957, intron 5 of 25) intron (NM_030957, intron 5 of 25) 8721 NM_030957 81794 Hs.657508 NM_030957 ENSG00000142303 ADAMTS10 ADAM-TS10|ADAMTS-10|WMS|WMS1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 10 protein-coding 157.25-145 chr8 40187152 40187388 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33788 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 190.75-97 chr6 103415040 103415314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1444369 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 140.25-88 chr2 52451773 52451958 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 81217 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 189.5-113 chr5 150890662 150890980 + 1.25 NA intron (NM_001346557, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 14162 NM_001172832 91975 Hs.134885 NM_052860 ENSG00000145908 ZNF300 - zinc finger protein 300 protein-coding 245-50 chr4 79461243 79461467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31238 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 263.25-51 chr6 72576353 72576830 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -45252 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 196.75-32 chr12 126642874 126643183 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47290 NR_110034 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 225.5-42 chr16 19590814 19591185 + 1.25 NA intron (NM_001300743, intron 7 of 27) intron (NM_001300743, intron 7 of 27) 35296 NM_001365294 57020 Hs.654964 NM_020314 ENSG00000103544 VPS35L C16orf62 VPS35 endosomal protein sorting factor like protein-coding 223.25-36 chr2 81570521 81570797 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -103713 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 129.5-2 chr1 40042638 40042830 + 1.25 NA intron (NM_001350484, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 1883 NM_001350481 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 373.5-2 chr10 19377676 19378149 + 1.25 NA intron (NM_001142308, intron 26 of 39) intron (NM_001142308, intron 26 of 39) 329111 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 215-64 chr5 112835221 112835466 + 1.25 NA intron (NM_001354895, intron 15 of 15) intron (NM_001354895, intron 15 of 15) -25845 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 238.75-11 chr12 3599748 3600078 + 1.25 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -107094 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 113-46 chr11 105056093 105056205 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10814 NM_001017534 114769 Hs.348365 NM_052889 ENSG00000204397 CARD16 COP|COP1|PSEUDO-ICE caspase recruitment domain family member 16 protein-coding 144.25-84 chr18 65349383 65349559 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -400781 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 199-33 chr2 14602428 14602735 + 1.25 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -30136 NM_145175 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 269-19 chr14 57536776 57537013 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -43037 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 298.75-10 chr1 209030339 209030741 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58086 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 331.75-12 chr18 78062329 78062669 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -68772 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 150.5-166 chr5 18788959 18789243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 981827 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 112.25-154 chr4 67189786 67189888 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 232163 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 219.5-139 chr9 93728088 93728299 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91164 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 228.25-75 chr6 163771987 163772366 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -100692 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 324.25-14 chr8 123740345 123740672 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3115 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 218.25-82 chr6 66134150 66134480 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 346436 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 207.25-83 chr6 64985823 64986049 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -315482 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 156.25-84 chr20 8570046 8570199 + 1.25 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -261063 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 213.75-31 chr14 26915946 26916157 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 7409 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 229.5-108 chr5 112565103 112565434 + 1.25 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -63168 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 275.25-5 chr10 12586545 12586846 + 1.25 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) intron (NM_001351032, intron 4 of 11) 7942 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 205-17 chr13 86283333 86283590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -484042 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 139-102 chr4 88458842 88459069 + 1.25 NA intron (NM_016323, intron 1 of 22) intron (NM_016323, intron 1 of 22) 1836 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 221.5-52 chr2 184684791 184685103 + 1.25 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) MER52A|LTR|ERV1 86418 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 119-140 chr4 172994786 172994997 + 1.25 NA intron (NM_001034845, intron 10 of 12) intron (NM_001034845, intron 10 of 12) -173920 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 221-54 chr3 191291382 191291646 + 1.25 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) AluY|SINE|Alu -37880 NM_178335 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 362.5-18 chr4 48395102 48395495 + 1.25 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) intron (NM_020846, intron 6 of 7) 53769 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 352.75-15 chr8 89290483 89290864 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 467038 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 297.5-22 chr18 22794987 22795338 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -8325 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 273.5-30 chr2 30425265 30425492 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21868 NM_001304446 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 197.5-75 chr2 142969155 142969449 + 1.25 NA intron (NM_001199241, intron 9 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 91638 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 236.75-21 chr14 78528986 78529345 + 1.25 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 125446 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 300.5-54 chr9 86549460 86549800 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -195220 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 150-12 chr10 33907725 33907884 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -135124 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 279.5-63 chr8 77492627 77492916 + 1.25 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 42074 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 176.5-162 chr7 129017992 129018446 + 1.25 NA intron (NM_001191028, intron 1 of 21) intron (NM_001191028, intron 1 of 21) 36954 NM_001191028 23534 Hs.193613 NM_012470 ENSG00000064419 TNPO3 IPO12|LGMD1F|LGMDD2|MTR10A|TRN-SR|TRN-SR2|TRNSR transportin 3 protein-coding 133.25-43 chr12 90138096 90138232 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -155154 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 228.5-8 chr1 91822105 91822381 + 1.25 NA intron (NR_036634, intron 2 of 17) intron (NR_036634, intron 2 of 17) 63908 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 223-84 chr8 127569693 127569955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87685 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 271.5-5 chr1 165170741 165171177 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 185282 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 145.25-35 chr13 77518196 77518313 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -17420 NM_001160706 8796 Hs.534699 NM_003843 ENSG00000136155 SCEL - sciellin protein-coding 181.75-62 chr2 96712289 96712548 + 1.25 NA intron (NM_001322356, intron 3 of 6) intron (NM_001322356, intron 3 of 6) 27658 NM_030805 81562 Hs.655743 NM_030805 ENSG00000114988 LMAN2L MRT52|VIPL lectin, mannose binding 2 like protein-coding 146-101 chr4 139938795 139938987 + 1.25 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) intron (NM_018717, intron 1 of 4) -189124 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 322.25-14 chr3 123419338 123419826 + 1.25 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) intron (NM_183357, intron 1 of 20) -3240 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 279-44 chr7 51350619 51350941 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -33919 NM_001287436 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 126.5-188 chr5 63866243 63866362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 95990 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 240.5-73 chr4 52302958 52303287 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 251818 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 211-9 chr10 52158497 52158749 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 8 of 17) intron (NM_001098512, intron 8 of 17) 155505 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 246-59 chr7 86263740 86264026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -380026 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 140.5-122 chr2 170786343 170786554 + 1.25 NA intron (NM_001289947, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 2657 NM_001289947 285141 Hs.443729 NM_001289947 ENSG00000204334 ERICH2 - glutamate rich 2 protein-coding 127.75-159 chr5 102748254 102748374 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6469 NM_001319943 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 135.5-53 chr13 110986047 110986181 + 1.25 NA intron (NR_126378, intron 1 of 1) LTR24C|LTR|ERV1 20087 NR_126378 104355135 Hs.649708 NR_126378 LINC00431 - long intergenic non-protein coding RNA 431 ncRNA 144.5-160 chr4 129509131 129509280 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 262273 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 347.25 chr1 29937966 29938521 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 99369 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 149-32 chr14 54215376 54215575 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -181393 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 171.5-44 chr13 81976769 81976962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -749882 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 366.25-15 chr7 69329612 69330300 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 267668 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 298-8 chr14 82072198 82072625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -329273 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 142.25-143 chr6 95089149 95089421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 488166 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 191.5-90 chr21 28511029 28511319 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28144 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 272.25-10 chr12 41135842 41136088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52355 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 264.75-35 chr4 35262162 35262401 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 981658 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 145-159 chr8 133414411 133414750 + 1.25 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -117276 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 150-109 chr4 66355791 66355920 + 1.25 NA Intergenic UCON1|Unknown|Unknown 79031 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 140.25-180 chr7 96047641 96047930 + 1.25 NA intron (NM_004411, intron 14 of 16) L2|LINE|L2 171971 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 295-18 chr2 44980418 44980816 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28835 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 181.75-39 chr15 56817578 56817771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83588 NM_001288589 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 264.75-20 chr2 73053621 73054127 + 1.25 NA intron (NM_001330406, intron 2 of 14) intron (NM_001330406, intron 2 of 14) 5298 NM_001330411 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 207-60 chr3 132524625 132524919 + 1.25 NA intron (NM_001329126, intron 52 of 56) intron (NM_001329126, intron 52 of 56) -72498 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 155.75-58 chr15 96484642 96484832 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 150972 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 268.25-25 chr2 141986872 141987272 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 144629 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 198-85 chr9 24258119 24258390 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 287422 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 273.75-9 chr14 34384291 34384714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77738 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 205-4 chr1 183816819 183817114 + 1.25 NA intron (NM_001297671, intron 2 of 17) intron (NM_001297671, intron 2 of 17) 11846 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 153.75-27 chr11 115372045 115372192 + 1.25 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -24638 NR_135103 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 115-25 chr10 126401079 126401275 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -12700 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 194.5-116 chr5 36012692 36012928 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -11788 NM_001171873 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 165.75-43 chr12 116239624 116239908 + 1.25 NA intron (NM_015335, intron 1 of 30) intron (NM_015335, intron 1 of 30) 37420 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 210.5-72 chr20 21506448 21506670 + 1.25 NA Intergenic CpG 7505 NM_002509 4821 Hs.516922 NM_002509 ENSG00000125820 NKX2-2 NKX2.2|NKX2B NK2 homeobox 2 protein-coding 217.25-21 chr12 110995055 110995243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37331 NR_135001 105369980 Hs.564357 NR_135001 ENSG00000258240 LOC105369980 - uncharacterized LOC105369980 ncRNA 223-2 chr1 21741693 21742001 + 1.25 NA intron (NM_001350167, intron 8 of 26) AluJr|SINE|Alu 41302 NM_001350168 84196 Hs.467524 NM_032236 ENSG00000090686 USP48 RAP1GA1|USP31 ubiquitin specific peptidase 48 protein-coding 252.75-19 chr15 70228143 70228402 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -130355 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 283.75-7 chr13 60983426 60983865 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 216235 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 122.75-54 chr15 94704368 94704496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -150931 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 167.5-189 chr8 127740843 127741088 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001354870, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001354870, exon 3 of 3) 4734 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 240.75-66 chr6 56872374 56872668 + 1.25 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) FRAM|SINE|Alu -20605 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 305-34 chr8 78205975 78206290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -310208 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 251.25-63 chr8 138412179 138412531 + 1.25 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 84906 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 232.75-45 chr3 189974444 189974682 + 1.25 NA exon (NM_001134418, exon 9 of 15) exon (NM_001134418, exon 9 of 15) 144641 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 242-8 chr10 24640756 24641082 + 1.25 NA intron (NM_001367447, intron 4 of 24) L1ME3Cz|LINE|L1 -18076 NR_160024 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 122.5-212 chr7 78416283 78416464 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 6 of 20) intron (NM_001301128, intron 6 of 20) 69131 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 203.75-112 chr8 115153432 115153674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 514460 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 123.25-117 chr20 33574587 33574735 + 1.25 NA intron (NM_005093, intron 2 of 11) intron (NM_005093, intron 2 of 11) 12296 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 422.25-7 chr6 126814359 126814784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -304100 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 319.5-31 chr3 31796942 31797365 + 1.25 NA intron (NM_001174060, intron 3 of 10) AluSc5|SINE|Alu 92940 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 322.75-9 chr2 14005373 14005715 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 395414 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 223-62 chr5 24433971 24434222 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210882 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 133.5-214 chr5 101739579 101739771 + 1.25 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 556609 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 232.5-16 chr12 60702113 60702460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1012916 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 113.25-121 chr4 70905049 70905165 + 1.25 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) intron (NM_173468, intron 1 of 5) 2738 NM_001244767 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 249.25-17 chr18 2141771 2141993 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 429623 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 226.25-34 chr2 15153398 15153814 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 407728 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 292-27 chr22 28047654 28048207 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -127318 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 180.25-44 chr18 72250398 72250626 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 293830 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 190.25-111 chr6 137941816 137942156 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 3814 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 168.25-139 chr8 77400062 77400306 + 1.25 NA Intergenic (TATCAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50513 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 125.75-81 chr2 20735472 20735623 + 1.25 NA intron (NR_104233, intron 3 of 4) L1MD1|LINE|L1 68403 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 144-148 chr9 117146261 117146460 + 1.25 NA intron (NM_001365068, intron 3 of 22) intron (NM_001365068, intron 3 of 22) 34841 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 116.25-172 chr5 15904519 15904770 + 1.25 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -30538 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 148.25-67 chr2 18235393 18235672 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 325121 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 223-29 chr16 58094352 58094551 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 34930 NM_013242 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 274.5-56 chr5 128637571 128638025 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99553 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 129.5-168 chr4 37682897 37683025 + 1.25 NA intron (NM_001085400, intron 1 of 6) intron (NM_001085400, intron 1 of 6) 3415 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 141.75-43 chr12 17598831 17599052 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -9863 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 193-3 chr1 45324498 45324812 + 1.25 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -2240 NM_032756 84842 Hs.162717 NM_032756 ENSG00000186603 HPDL 4-HPPD-L|GLOXD1 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like protein-coding 215-53 chr3 114391209 114391509 + 1.25 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -7717 NM_001164342 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 245.5-41 chr20 24613022 24613236 + 1.25 NA intron (NM_024893, intron 3 of 3) intron (NM_024893, intron 3 of 3) 143168 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 140-172 chr9 23681323 23681585 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9055 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 319.75-4 chr11 69687015 69687520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11914 NM_153451 220064 Hs.667996 NM_153451 ENSG00000149716 LTO1 CIAB1|ORAOV1|TAOS1 LTO1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 272.25-48 chr5 114300752 114301216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61086 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 253-19 chr16 57184315 57184608 + 1.25 NA intron (NM_001354079, intron 1 of 8) intron (NM_001354079, intron 1 of 8) 1578 NM_001354084 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 246-50 chr5 72064079 72064390 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -43241 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 263.75-41 chr5 19910053 19910497 + 1.25 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) -24003 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 318.5-43 chr9 135129959 135130433 + 1.25 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 42528 NM_001282611 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 376-22 chr9 104080904 104081381 + 1.25 NA non-coding (NR_121580, exon 3 of 3) non-coding (NR_121580, exon 3 of 3) 11332 NR_121580 101928550 Hs.144722 NR_121580 ENSG00000270332 SMC2-AS1 - SMC2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 173.25-57 chr2 42044523 42044830 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3345 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 215.75-88 chr6 105706131 105706452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -303209 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 155-60 chr2 48363865 48364090 + 1.25 NA intron (NM_002158, intron 5 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 49295 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 182.25-21 chr11 54783047 54783276 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 76329 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 275.75-18 chr17 10939238 10939654 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101359 NM_001101387 644139 Hs.553909 NM_001101387 ENSG00000233670 PIRT - phosphoinositide interacting regulator of transient receptor potential channels protein-coding 310.25 chr1 172626453 172626840 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -32362 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 134.5-66 chr14 70272046 70272224 + 1.25 NA Intergenic Ricksha|DNA|MULE-MuDR -24334 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 280.25-24 chr17 40560250 40560497 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001301718) promoter-TSS (NM_001301718) 21 NM_001301718 1236 Hs.370036 NM_001838 ENSG00000126353 CCR7 BLR2|CC-CKR-7|CCR-7|CD197|CDw197|CMKBR7|EBI1 C-C motif chemokine receptor 7 protein-coding 261.75-45 chr7 30025800 30026081 + 1.25 NA intron (NR_046478, intron 1 of 4) intron (NR_046478, intron 1 of 4) 762 NR_046479 55033 Hs.390838 NM_017946 ENSG00000106080 FKBP14 EDSKMH|EDSKSCL2|FKBP22|IPBP12 FKBP prolyl isomerase 14 protein-coding 359-2 chr11 111708220 111708910 + 1.25 NA intron (NM_015191, intron 8 of 14) intron (NM_015191, intron 8 of 14) 57824 NM_001177562 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 331.75-15 chr2 123437777 123438139 + 1.25 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -364477 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 215-73 chr8 87645538 87645871 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 228311 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 150.5-37 chr12 20300933 20301089 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -68234 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 272.5-9 chr10 4739377 4739780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61508 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 187-46 chr2 189480675 189480949 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39338 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 187-75 chr4 178466180 178466450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -558379 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 328.25-5 chr12 61508794 61509242 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 683821 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 216-42 chr2 114468899 114469112 + 1.25 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 7428 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 136.25-57 chr14 50775761 50776003 + 1.25 NA intron (NM_016350, intron 7 of 28) intron (NM_016350, intron 7 of 28) -45915 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 166.5-143 chr4 43291028 43291301 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 201379 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 230.5-67 chr2 202742081 202742412 + 1.25 NA intron (NM_173511, intron 4 of 7) L1M5|LINE|L1 86988 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 169.5-55 chr14 83712733 83712880 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1070174 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 245.75-52 chr6 37812329 37812732 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7197 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 288.5-9 chr12 93273302 93273808 + 1.25 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) AluSx1|SINE|Alu 99189 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 251.75-37 chr2 68205231 68205570 + 1.25 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) AluSp|SINE|Alu 47132 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 289-43 chr7 39699368 39699735 + 1.25 NA intron (NM_005402, intron 4 of 4) L1ME4b|LINE|L1 -34017 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 145.25-61 chr18 44028592 44028791 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 503006 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 239-15 chr14 44972328 44972635 + 1.25 NA intron (NR_131765, intron 1 of 19) L1MC1|LINE|L1 10291 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 303.5-19 chr18 67698276 67698571 + 1.25 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) AluJr4|SINE|Alu 116399 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 174.75-94 chr4 106369408 106369701 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2119 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 139-79 chr2 114709505 114709648 + 1.25 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 123972 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 227.5-46 chr18 4764593 4764884 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -309431 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 285-14 chr14 66788583 66788993 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) AluSq2|SINE|Alu 281381 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 345.5 chr1 36776690 36777084 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 257628 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 223.75-65 chr4 75284507 75284831 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69407 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 240.5-51 chr2 43315626 43316111 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 31 of 37) intron (NM_001083953, intron 31 of 37) 88657 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 206.25-64 chr3 56482867 56483211 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14572 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 200.75-53 chr2 62307685 62307934 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92288 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 223.75-6 chr10 64867930 64868211 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42542 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 217.75-22 chr12 23287018 23287315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 111530 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 252.5-13 chr10 99226808 99227148 + 1.25 NA intron (NM_021828, intron 2 of 11) intron (NM_021828, intron 2 of 11) 8897 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 141-41 chr13 88565872 88566060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25137 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 272.25-17 chr15 79383454 79383718 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001301203, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001301203, exon 3 of 3) -48930 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 127.5-166 chr4 54499440 54499589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 107617 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 293.75-10 chr14 63428296 63428635 + 1.25 NA intron (NR_104104, intron 2 of 12) MER53|DNA|hAT 79773 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 169.25-24 chr13 75925628 75925883 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9377 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 151-86 chr3 96308535 96308698 + 1.25 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -51348 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 189-52 chr2 16579696 16580090 + 1.25 NA intron (NM_030797, intron 3 of 11) L1ME2|LINE|L1 85941 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 197.25-87 chr6 53936031 53936340 + 1.25 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) intron (NR_125842, intron 1 of 3) 6203 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 359.75-8 chr16 35738835 35739318 + 1.25 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 -7476 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 176.5-45 chr12 111548518 111548886 + 1.25 NA intron (NR_132311, intron 5 of 23) intron (NR_132311, intron 5 of 23) 50613 NM_002973 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 243.5-69 chr6 106567442 106567769 + 1.25 NA intron (NM_001371242, intron 21 of 21) intron (NM_001371242, intron 21 of 21) 55750 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 251-39 chr3 5010971 5011407 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31228 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 130.5-201 chr5 44795649 44795822 + 1.25 NA intron (NR_109863, intron 1 of 3) LTR22E|LTR|ERVK 13058 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 229.75-46 chr3 14825887 14826247 + 1.25 NA intron (NM_152536, intron 1 of 19) intron (NM_152536, intron 1 of 19) 7105 NM_001320276 152273 Hs.412406 NM_152536 ENSG00000154783 FGD5 ZFYVE23 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5 protein-coding 214 chr1 9487041 9487268 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52311 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 171.75-20 chr10 107577356 107577556 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -412750 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 232.75-4 chr1 239145202 239145504 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -241215 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 229.25-59 chr5 6158443 6158670 + 1.25 NA Intergenic MER6B|DNA|TcMar-Tigger 178736 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 253.25-23 chr16 17984263 17984632 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 348215 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 287.25-2 chr1 107462219 107462555 + 1.25 NA intron (NM_001113226, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 226112 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 132.5-198 chr5 82742495 82742676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -97570 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 367.75-12 chr7 11311949 11312589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 338397 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 207-92 chr8 121866574 121866764 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -225229 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 198.5-3 chr1 87003750 87003919 + 1.25 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 89199 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 295.5-9 chr11 10812007 10812365 + 1.25 NA intron (NR_120540, intron 2 of 2) intron (NR_120540, intron 2 of 2) 2889 NR_120540 101928053 Hs.637773 NR_120540 ENSG00000246308 LOC101928053 - uncharacterized LOC101928053 ncRNA 309-17 chr15 98463714 98464079 + 1.25 NA intron (NM_182562, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 -42898 NR_146567 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 140.75-181 chr8 100048708 100048893 + 1.25 NA intron (NM_015668, intron 10 of 27) L1MB2|LINE|L1 44218 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 325.25-27 chr7 24989591 24989992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9613 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 309.25-16 chr2 179033526 179033910 + 1.25 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 16419 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 333.5-13 chr4 163658243 163658547 + 1.25 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) L1PA10|LINE|L1 -44861 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 437.5-3 chr10 115732658 115733402 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) intron (NM_207303, intron 27 of 28) 461759 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 249.5-13 chr10 60540153 60540444 + 1.25 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 32658 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 182.75-21 chr10 22014631 22014807 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -10989 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 211.25-36 chr18 59870492 59870729 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -29386 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 203.25-105 chr8 69904768 69905025 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -69918 NM_030958 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 261.5-25 chr19 31811704 31812108 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -213956 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 166.75-87 chr21 32280829 32281063 + 1.25 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 -1897 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 304.75-12 chr15 91775033 91775337 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -78523 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 275-3 chr1 195690093 195690462 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 398438 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 331.25-6 chr2 15914971 15915509 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5159 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 250.25-6 chr12 24514800 24515167 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) L1PA13|LINE|L1 47508 NM_152989 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 193.25-86 chr5 2646383 2646646 + 1.25 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -66077 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 215.75-106 chr9 106114308 106114526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 419876 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 166.75-46 chr14 43532217 43532420 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 974965 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 159.75-70 chr2 18796644 18796936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -207210 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 123-173 chr7 70018336 70018444 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) MIR3|SINE|MIR 419915 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 289-17 chr16 50591481 50591888 + 1.25 NA intron (NM_033119, intron 3 of 9) intron (NM_033119, intron 3 of 9) 43288 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 226.75-30 chr2 15645281 15645641 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -45321 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 262-57 chr8 92376852 92377120 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -273601 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 152.25-128 chr5 67412031 67412207 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -215320 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 213.25-45 chr3 173094095 173094339 + 1.25 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) intron (NM_031955, intron 2 of 10) 47018 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 126.25-7 chr1 90809720 90809849 + 1.25 NA intron (NR_135038, intron 1 of 2) intron (NR_135038, intron 1 of 2) 26377 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 194.75-64 chr21 43191001 43191320 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20924 NM_001320719 102724652 Hs.184085 NM_001314050 ENSG00000276076 CRYAA2 CRYAA crystallin alpha A2 protein-coding 177.25-18 chr10 78913372 78913520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154002 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-74 chr18 69804087 69804240 + 1.25 NA intron (NM_152721, intron 7 of 7) intron (NM_152721, intron 7 of 7) 143710 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 136-18 chr10 85594375 85594495 + 1.25 NA intron (NR_038986, intron 2 of 2) intron (NR_038986, intron 2 of 2) 16704 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-45 chr12 48110712 48110848 + 1.25 NA intron (NM_001166686, intron 3 of 24) intron (NM_001166686, intron 3 of 24) 4664 NM_001354735 5213 Hs.75160 NM_000289 ENSG00000152556 PFKM ATP-PFK|GSD7|PFK-1|PFK-A|PFK1|PFKA|PFKX|PPP1R122 phosphofructokinase, muscle protein-coding 229.5-72 chr2 171200563 171200797 + 1.25 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) FAM|SINE|Alu 30613 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 166.5-39 chr11 58520788 58520997 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12787 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 220-68 chr8 112079708 112079999 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -563640 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 208.5-42 chr15 58825888 58826189 + 1.25 NA intron (NM_001040450, intron 5 of 8) intron (NM_001040450, intron 5 of 8) 54736 NM_001040450 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 190.5-122 chr5 66350698 66350870 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -141338 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 228.5-35 chr14 48184784 48185181 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -389968 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 141.5-188 chr5 148444733 148444932 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 60874 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 145.25-172 chr8 101984339 101984527 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_126152) promoter-TSS (NR_126152) 1 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 147.75-20 chr10 125726570 125726725 + 1.25 NA intron (NM_015608, intron 6 of 23) intron (NM_015608, intron 6 of 23) 6938 NR_110859 26098 Hs.468688 NM_015608 ENSG00000107938 EDRF1 C10orf137 erythroid differentiation regulatory factor 1 protein-coding 162.5-142 chr5 67838492 67838645 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 45355 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 115-18 chr10 57319553 57319668 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15051 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 149.5-96 chr2 102553778 102553945 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -65692 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 258.75-12 chr11 45948801 45949184 + 1.25 NA intron (NR_147890, intron 12 of 18) intron (NR_147890, intron 12 of 18) 26336 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 159.5-153 chr3 153493069 153493298 + 1.25 NA intron (NR_160966, intron 2 of 2) L1MA5A|LINE|L1 8688 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 224.5-74 chr3 111950554 111950783 + 1.25 NA intron (NM_001134437, intron 10 of 17) intron (NM_001134437, intron 10 of 17) -28358 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 180.5-121 chr5 45576526 45576848 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 119693 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 137.25-20 chr10 97109132 97109339 + 1.25 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) MIR|SINE|MIR 6479 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 127.25-57 chr14 41042293 41042446 + 1.25 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 87658 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 157.25-60 chr18 10097685 10097932 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 183792 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 258-59 chr9 35381938 35382208 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 19 of 38) intron (NM_006377, intron 19 of 38) -24682 NR_110320 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 137-50 chr14 73476659 73476810 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13092 NR_135251 101928143 Hs.654609 NR_135251 ENSG00000284930 LOC101928143 - uncharacterized LOC101928143 ncRNA 143.75-51 chr14 86893911 86894277 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11684 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 516.75-2 chr2 25093272 25093877 + 1.25 NA intron (NM_014971, intron 3 of 22) intron (NM_014971, intron 3 of 22) 51111 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 239-4 chr1 105780064 105780275 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -161234 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 272.5-36 chr2 144005709 144005955 + 1.25 NA TTS (NM_001354358) TTS (NM_001354358) 68765 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 167-110 chr7 131249173 131249422 + 1.25 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 78482 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 187.75-65 chr21 28618522 28618800 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79343 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 243.75-66 chr5 25454393 25454800 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 263643 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 292.25-13 chr12 29549017 29549400 + 1.25 NA intron (NM_001367875, intron 12 of 19) L1ME2|LINE|L1 -49515 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 133.25-220 chr9 29107191 29107345 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 105031 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 209.25-48 chr18 67406017 67406222 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110427 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 221.5-111 chrX 86741421 86741774 + 1.25 NA intron (NM_001139515, intron 7 of 11) intron (NM_001139515, intron 7 of 11) 478629 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 179.75-36 chr14 28726732 28726890 + 1.25 NA intron (NR_125758, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 38508 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 202.5-71 chr2 65681216 65681657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -248837 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 256.25-40 chr5 171116631 171117026 + 1.25 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) L1MA5A|LINE|L1 -192420 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 234-8 chr11 19359223 19359588 + 1.25 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 8681 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 317.75-12 chr14 44763220 44763613 + 1.25 NA non-coding (NR_146457, exon 5 of 5) non-coding (NR_146457, exon 5 of 5) 35710 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 178.5-122 chr4 57458383 57458644 + 1.25 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) L1PA10|LINE|L1 32641 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 358.25-18 chr7 107157602 107158113 + 1.25 NA intron (NM_002736, intron 10 of 10) intron (NM_002736, intron 10 of 10) -11104 NM_001244262 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 263-28 chr20 41926520 41926887 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -308326 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 366-15 chr5 113108682 113109087 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 6 of 18) intron (NM_001085377, intron 6 of 18) 132086 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 184.5-72 chr2 31444839 31445048 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -30201 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 354.75-2 chr10 91928136 91928448 + 1.25 NA intron (NM_003972, intron 1 of 37) intron (NM_003972, intron 1 of 37) 4522 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 135.5-75 chr17 30128904 30129093 + 1.25 NA intron (NM_032141, intron 2 of 6) AluJr4|SINE|Alu -11838 NR_036149 100423003 NR_036149 ENSG00000284399 MIR3184 - microRNA 3184 ncRNA 412.25-15 chr8 113254801 113255409 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 122047 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 184.5-141 chr7 83580910 83581161 + 1.25 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 60396 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 155.75-149 chr7 55104281 55104592 + 1.25 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR -5403 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 252.5-56 chr4 13440442 13440841 + 1.25 NA intron (NM_001017979, intron 4 of 6) intron (NM_001017979, intron 4 of 6) 43699 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 188.75-68 chr2 228364600 228364799 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -183012 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 243-12 chr11 13883692 13883929 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13194 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 339.25-24 chr8 102359948 102360233 + 1.25 NA exon (NM_015902, exon 5 of 59) exon (NM_015902, exon 5 of 59) 52599 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 326.25-30 chr7 47955120 47955670 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6904 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 231.25-43 chr2 200278881 200279153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26862 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 153.5-29 chr11 24565762 24566004 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 68830 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 197.25-64 chr21 42531419 42531697 + 1.25 NA intron (NM_001320537, intron 3 of 19) intron (NM_001320537, intron 3 of 19) 17706 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 254-35 chr4 136530665 136531054 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -617179 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 130.75-83 chr19 49455787 49455948 + 1.25 NA intron (NM_001145396, intron 1 of 15) intron (NM_001145396, intron 1 of 15) 2642 NM_153329 126133 Hs.719998 NM_153329 ENSG00000161618 ALDH16A1 - aldehyde dehydrogenase 16 family member A1 protein-coding 316-22 chr6 40974736 40974994 + 1.25 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) L1PREC2|LINE|L1 48415 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 276.75-55 chr9 116647424 116647825 + 1.25 NA intron (NM_014010, intron 16 of 21) intron (NM_014010, intron 16 of 21) 39591 NM_198186 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 175.75-80 chr21 29031569 29031771 + 1.25 NA intron (NM_001032410, intron 4 of 18) AluSz|SINE|Alu 7002 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 181-77 chr4 32804529 32804945 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 453699 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 322-4 chr10 88036463 88037036 + 1.25 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 173124 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 269-37 chr4 125678503 125678813 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 171399 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 300-10 chr10 87873539 87873877 + 1.25 NA intron (NM_001304717, intron 2 of 9) intron (NM_001304717, intron 2 of 9) 10083 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 242.25-43 chr18 72381766 72382087 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162416 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 152.75-95 chr2 240121384 240121580 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 14823 NM_001163424 150678 Hs.293884 NM_138336 ENSG00000172428 COPS9 CSNAP|MYEOV2 COP9 signalosome subunit 9 protein-coding 174.25-122 chr5 161900095 161900265 + 1.25 NA TTS (NM_001127648) TTS (NM_001127648) 49455 NM_001127648 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 160.25-94 chr3 72611348 72611530 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 52810 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 330.5-9 chr13 58297809 58298222 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64898 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 180.5-40 chr14 84530790 84530963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -741056 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 225-35 chr2 12177009 12177259 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) -21996 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 203.25-14 chr10 53076807 53077068 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -305237 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 271-24 chr2 37569034 37569363 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 103001 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 230-64 chr8 81150216 81150588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38334 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 188.25-88 chr5 15730436 15730626 + 1.25 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -115529 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 271.5-33 chr18 76520020 76520483 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8404 NR_015417 284276 Hs.390287 NR_015417 ENSG00000266256 LINC00908 - long intergenic non-protein coding RNA 908 ncRNA 418.25-9 chr4 29647321 29647863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 433300 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 236-54 chr5 43773431 43773662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -170316 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 332.25-6 chr12 50292173 50292496 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -8814 NM_016357 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 138.75-132 chr4 127348531 127348704 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -284340 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 215.25-43 chr2 24866885 24867149 + 1.25 NA intron (NM_001320613, intron 3 of 21) L1MEg|LINE|L1 53220 NM_001320613 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 164-58 chr2 52220599 52220845 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) MER51A|LTR|ERV1 -149926 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 217.75-58 chr5 24092531 24092740 + 1.25 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 141287 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 151.25-178 chr7 91108576 91108718 + 1.25 NA intron (NM_012395, intron 11 of 13) intron (NM_012395, intron 11 of 13) -155786 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 139.5-118 chr20 42903118 42903265 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) MIRb|SINE|MIR -65552 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 120-84 chr2 30869052 30869231 + 1.25 NA Intergenic (GGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -61695 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 181-101 chr7 18381947 18382096 + 1.25 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) 91929 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 120-42 chr14 53305714 53305884 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 152445 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 226.75-69 chr7 80878500 80878853 + 1.25 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 40375 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 347.5-20 chr8 102659732 102660143 + 1.25 NA intron (NR_160672, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 3689 NR_160673 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 192.5-4 chr1 78624491 78624784 + 1.25 NA intron (NM_006820, intron 1 of 8) L1M3|LINE|L1 4189 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 280.5-50 chr8 60739546 60740028 + 1.25 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) -1472 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 234.75-38 chr2 102025519 102025766 + 1.25 NA TTS (NM_001261419) TTS (NM_001261419) 26681 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 152.5-98 chr2 205857935 205858153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 175543 NM_201267 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 259.25-9 chr12 52321188 52321482 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_002282) promoter-TSS (NM_002282) 63 NM_002282 3889 Hs.720768 NM_002282 ENSG00000170523 KRT83 EKVP5|HB3|Hb-3|KRTHB3|MNLIX keratin 83 protein-coding 208-68 chr5 160282557 160282936 + 1.25 NA intron (NR_131769, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 29818 NM_024565 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 342.75-3 chr1 114567207 114567661 + 1.25 NA TTS (NM_005872) TTS (NM_005872) 14181 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 167.25-95 chr20 16958172 16958464 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 209965 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 209.75-100 chr8 101988248 101988503 + 1.25 NA intron (NR_126152, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 3943 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 240.5-45 chr18 3974240 3974455 + 1.25 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 11994 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 232.5-50 chr2 78351459 78351754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60875 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 227-47 chr3 193516714 193516960 + 1.25 NA intron (NM_032279, intron 1 of 29) intron (NM_032279, intron 1 of 29) -36376 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 168.75-119 chr6 39118582 39118755 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -3482 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 361 chr10 48456405 48456911 + 1.25 NA intron (NR_144646, intron 4 of 8) intron (NR_144646, intron 4 of 8) 36992 NM_001256026 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 205.5-158 chr8 136727759 136728055 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MER4B|LTR|ERV1 197109 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 183.75-23 chr10 119288433 119288593 + 1.25 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 80942 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 226-55 chr5 77152968 77153180 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -27230 NM_001349752 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 230.25-52 chr20 51596496 51596710 + 1.25 NA TTS (NM_006045) TTS (NM_006045) -33764 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 260.25-58 chr8 117294301 117294605 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 159458 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 346-10 chr16 79632592 79632879 + 1.25 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -31998 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 341.75-16 chr4 113756522 113756864 + 1.25 NA intron (NM_001321592, intron 2 of 2) intron (NM_001321592, intron 2 of 2) 5045 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 193.5-93 chr2 212433817 212434087 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) -7592 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 273.5-16 chr11 87175850 87176147 + 1.25 NA intron (NR_033149, intron 4 of 13) intron (NR_033149, intron 4 of 13) 138064 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 309-5 chr10 56065953 56066307 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 295129 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 154.75-120 chr5 150898341 150898561 + 1.25 NA exon (NM_001172832, exon 3 of 5) exon (NM_001172832, exon 3 of 5) 6532 NM_001172832 91975 Hs.134885 NM_052860 ENSG00000145908 ZNF300 - zinc finger protein 300 protein-coding 132-76 chr17_KI270729v1_random 22453 22619 + 1.25 NA NA (GAATG)n|Satellite|Satellite NA NA 335.75-14 chr3 163891624 163892214 + 1.25 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 279637 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 252.25-32 chr2 100378378 100378616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39171 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 114-34 chr12 7041724 7041884 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18914 NM_201442 716 Hs.458355 NM_001734 ENSG00000182326 C1S EDSPD2 complement C1s protein-coding 150.75-34 chr11 34722333 34722522 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 89861 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 253.75-59 chr7 46584003 46584371 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 112935 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 164.75-82 chr2 158164799 158165025 + 1.25 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -1738 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 275.5-8 chr10 56664796 56665181 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -303715 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 244.5-33 chr16 83847082 83847319 + 1.25 NA Intergenic MER91B|DNA|hAT-Tip100 39222 NM_001537 3281 Hs.250899 NM_001537 ENSG00000230989 HSBP1 NPC-A-13 heat shock factor binding protein 1 protein-coding 149.5-200 chr8 52935852 52936124 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3920 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 271.75-6 chr10 29231909 29232137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57047 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 254-7 chr10 67677755 67677991 + 1.25 NA intron (NM_013266, intron 1 of 17) intron (NM_013266, intron 1 of 17) -12188 NM_001127384 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 192.75-82 chr3 6989124 6989387 + 1.25 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -95238 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 229-51 chr3 84241280 84241500 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 628185 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 260.25-10 chr10 97748879 97749236 + 1.25 NA intron (NM_001002261, intron 4 of 11) MIR|SINE|MIR 10580 NM_001002261 118813 Hs.744075 NM_144588 ENSG00000155256 ZFYVE27 PROTRUDIN|SPG33 zinc finger FYVE-type containing 27 protein-coding 153-153 chr8 83645889 83646091 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 242232 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 169.75-88 chr2 192285595 192285863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90796 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 233.5-56 chr2 129630530 129630840 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 246806 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 347.75-10 chr4 147204681 147205044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139855 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 145-58 chr17 40054725 40054934 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001330211) promoter-TSS (NM_001330211) -421 NM_001330211 9862 Hs.462983 NM_014815 ENSG00000008838 MED24 ARC100|CRSP100|CRSP4|DRIP100|MED5|THRAP4|TRAP100 mediator complex subunit 24 protein-coding 250.75-16 chr15 38721752 38722161 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25358 NR_160786 165-148 chr8 127879519 127879678 + 1.25 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 69125 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 160.75-120 chr5 22261661 22261860 + 1.25 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -47910 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 333-3 chr1 89643734 89644067 + 1.25 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) intron (NM_032270, intron 1 of 2) 10780 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 239.75-55 chr5 14171016 14171246 + 1.25 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 27789 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 268.75-12 chr14 25213753 25214145 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -163652 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 187.5-28 chr11 33688971 33689361 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 11574 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 261.5-22 chr16 14141094 14141513 + 1.25 NA intron (NM_001308142, intron 3 of 16) intron (NM_001308142, intron 3 of 16) -45383 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 267.25-40 chr7 5181448 5181842 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8588 NM_015610 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 223.5-44 chr15 37843809 37844128 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -90639 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 240.25-17 chr12 27157667 27157913 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -75268 NM_001080406 728858 Hs.334003 NM_001080406 ENSG00000214700 C12orf71 - chromosome 12 open reading frame 71 protein-coding 211.75-83 chr5 176506450 176506654 + 1.25 NA intron (NM_014613, intron 10 of 10) intron (NM_014613, intron 10 of 10) 30850 NM_014901 22838 Hs.434888 NM_014901 ENSG00000146083 RNF44 - ring finger protein 44 protein-coding 243.5-74 chr7 46817996 46818277 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -121014 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 163.5-220 chrX 42221873 42222094 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -298429 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 136.5-17 chr1 232281284 232281487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 234223 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 227.25-60 chr4 61086455 61086687 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -57085 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 321.5-15 chr2 12161414 12161720 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) -37563 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 298.5-29 chr4 62798615 62798897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -636991 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 350.75-3 chr2 107822372 107822828 + 1.25 NA TTS (NR_126370) TTS (NR_126370) 4169 NR_024439 729121 Hs.386155 NR_024439 ENSG00000230651 RGPD4-AS1 - RGPD4 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 247.25 chr1 81929210 81929631 + 1.25 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 126967 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 180.25-116 chr8 83147709 83147984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 235742 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 253.25-28 chr2 33273119 33273436 + 1.25 NA intron (NM_206943, intron 15 of 33) intron (NM_206943, intron 15 of 33) 138680 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 199.5-19 chr10 74161722 74161961 + 1.25 NA intron (NM_001369123, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 10620 NM_001369123 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 295.5-13 chr14 37842204 37842612 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001310135, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_001310135, exon 33 of 33) 59716 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 289-27 chr3 31335955 31336198 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -174289 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 202.5-101 chr4 68251693 68252043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6174 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 236.5-96 chr8 111946605 111947017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 570172 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 266-34 chr4 37260911 37261200 + 1.25 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 16312 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 282-36 chr3 76856820 76857275 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -183052 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 252-43 chr3 82963196 82963546 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 977229 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 165.25-73 chr2 195684397 195684574 + 1.25 NA intron (NM_020342, intron 3 of 9) L2|LINE|L2 27259 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 292.75-33 chr7 93562748 93563059 + 1.25 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) -3093 NM_001164738 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 216-32 chr18 1875985 1876208 + 1.25 NA Intergenic LTR80A|LTR|ERVL -516467 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 265.25-58 chr9 90401441 90401738 + 1.25 NA intron (NR_109795, intron 1 of 2) L1MEc|LINE|L1 31900 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 128 chr1 49221111 49221246 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -36233 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 409.25-7 chr8 15682073 15682769 + 1.25 NA intron (NM_001356429, intron 6 of 10) L1PA17|LINE|L1 142158 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 250.75-64 chr7 50733103 50733374 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001001549) promoter-TSS (NM_001001549) -885 NM_001001549 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 340.25-17 chr7 47467645 47468126 + 1.25 NA intron (NM_022748, intron 4 of 30) intron (NM_022748, intron 4 of 30) -3082 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 148.5-108 chr2 135610829 135611047 + 1.25 NA intron (NM_001282799, intron 3 of 22) AluJo|SINE|Alu 24586 NM_001282800 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 368.75-5 chr16 8276651 8277171 + 1.25 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 312927 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 221.5-73 chr5 4799889 4800121 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26524 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 253-45 chr5 167535546 167535760 + 1.25 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -38006 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 195.5-89 chr21 25209367 25209623 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 222206 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 341.75-4 chr11 22194661 22195057 + 1.25 NA intron (NM_001142649, intron 1 of 21) L1MB7|LINE|L1 1683 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 278.75-6 chr12 7435081 7435527 + 1.25 NA intron (NM_001297650, intron 2 of 19) L1ME3F|LINE|L1 8881 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 151-12 chr1 217143342 217143508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5723 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 247.5-54 chr3 97828219 97828614 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 1 of 21) L1ME4b|LINE|L1 6405 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 152-46 chr13 83804018 83804213 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 78278 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 175.25-35 chr12 14914874 14915040 + 1.25 NA intron (NM_152321, intron 6 of 6) intron (NM_152321, intron 6 of 6) 14168 NM_001300784 121506 Hs.162143 NM_152321 ENSG00000139055 ERP27 C12orf46|PDIA8 endoplasmic reticulum protein 27 protein-coding 194-86 chr9 72761932 72762165 + 1.25 NA intron (NM_138691, intron 12 of 23) LTR16B1|LTR|ERVL 112061 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 400.75-6 chr4 30669223 30669664 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50926 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 169.75-146 chr7 85707237 85707467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 286230 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 258-54 chr7 113969125 113969476 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50291 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 145-89 chr20 41076338 41076519 + 1.25 NA intron (NM_003286, intron 4 of 20) intron (NM_003286, intron 4 of 20) 47606 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 186.5-19 chr10 83812171 83812393 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -135193 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 198-67 chr6 102846545 102846843 + 1.25 NA Intergenic (TTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1447709 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 255.75 chr1 36713984 36714397 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -230876 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 235.75-70 chr7 52007404 52007627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -614259 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 197.5-27 chr12 11970013 11970331 + 1.25 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -79689 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 212.75-39 chr15 95434474 95434720 + 1.25 NA intron (NR_027133, intron 1 of 5) intron (NR_027133, intron 1 of 5) 1504 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 311.75-23 chr7 127897267 127897563 + 1.25 NA intron (NM_014390, intron 13 of 23) intron (NM_014390, intron 13 of 23) -100094 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 230.5-98 chr5 113378664 113378965 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) intron (NM_001085377, intron 2 of 18) 56175 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 199-71 chr5 108322920 108323208 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) L1MA5|LINE|L1 59034 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 147.25-77 chr3 26626721 26626877 + 1.25 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) intron (NM_001317810, intron 2 of 2) 2132 NM_001317810 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 214.75-13 chr10 82148458 82148686 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 84348 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 281.75-6 chr1 186047466 186048005 + 1.25 NA intron (NM_031935, intron 41 of 106) MIR3|SINE|MIR -248538 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 148-138 chr9 32749454 32749637 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -33995 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 246-18 chr14 65698666 65698967 + 1.25 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) L2c|LINE|L2 227714 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 177-3 chr1 104543116 104543304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 470187 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 162-42 chr15 78516485 78516664 + 1.25 NA intron (NM_001083612, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 8997 NM_001013619 123688 Hs.307962 NM_001013619 ENSG00000188266 HYKK AGPHD1 hydroxylysine kinase protein-coding 136-162 chr8 134641434 134641632 + 1.25 NA intron (NM_020863, intron 2 of 15) intron (NM_020863, intron 2 of 15) 43462 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 229.5-95 chr3 189095662 189095883 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -76199 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 305.5-24 chr2 126234720 126235083 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116916 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 152.75-122 chr4 97611548 97611702 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 244699 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 211.75-7 chr1 108315325 108315638 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -71400 NM_001143989 148545 Hs.511849 NM_152488 ENSG00000196427 NBPF4 - NBPF member 4 protein-coding 152.75-123 chr4 111352531 111352783 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -492010 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 273-55 chr8 17863891 17864304 + 1.25 NA TTS (NM_004467) TTS (NM_004467) 31307 NM_201553 2267 Hs.491143 NM_004467 ENSG00000104760 FGL1 HFREP1|HP-041|HPS|LFIRE-1|LFIRE1 fibrinogen like 1 protein-coding 167.25-135 chr6 37210293 37210516 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40252 NM_001243186 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 150-25 chr11 113539307 113539502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64006 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 294.25-6 chr11 95885032 95885310 + 1.25 NA intron (NM_201278, intron 3 of 16) intron (NM_201278, intron 3 of 16) 38936 NM_001243571 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 303.75-20 chr2 134928410 134928672 + 1.25 NA intron (NR_135468, intron 2 of 9) AluSp|SINE|Alu 9719 NM_001320748 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 191.75-100 chr5 16248537 16248793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 68424 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 221-50 chr3 105349905 105350259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16631 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 474.75-4 chr4 94523263 94523837 + 1.25 NA intron (NM_001256428, intron 2 of 11) intron (NM_001256428, intron 2 of 11) 71608 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 196.75-40 chr15 43254062 43254411 + 1.25 NA intron (NM_004245, intron 3 of 11) L2b|LINE|L2 12692 NM_004245 9333 Hs.129719 NM_004245 ENSG00000104055 TGM5 PSS2|TGASE5|TGASEX|TGM6|TGMX|TGX transglutaminase 5 protein-coding 172.25-98 chr4 55222550 55222760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -97060 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 173.75-125 chr5 120610342 120610494 + 1.25 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) intron (NM_001308088, intron 1 of 3) 78954 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 377.75-2 chr12 11426168 11426821 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -30927 NM_006248 653247 Hs.654486 NM_006248 ENSG00000121335 PRB2 IB-9|PRPPRB1|Ps|cP7 proline rich protein BstNI subfamily 2 protein-coding 160.75-74 chr2 110968975 110969192 + 1.25 NA intron (NM_001371254, intron 13 of 18) L1MDb|LINE|L1 146505 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 247.75-57 chr6 114976633 114977173 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 666932 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 128.75-44 chr12 74298119 74298284 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5570 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 170.5-14 chr1 180408486 180408838 + 1.25 NA intron (NM_032360, intron 5 of 7) L1PA3|LINE|L1 29728 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 215.25-59 chr3 81885428 81885673 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100592 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 188.75-44 chr17 61761977 61762162 + 1.25 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) L1MA7|LINE|L1 101490 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 200.25-82 chr4 11763262 11763466 + 1.25 NA intron (NR_146995, intron 1 of 3) intron (NR_146995, intron 1 of 3) 6104 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 207-24 chr12 130642030 130642243 + 1.25 NA intron (NM_001351226, intron 1 of 21) intron (NM_001351226, intron 1 of 21) -8216 NM_001351228 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 213-67 chr3 194740844 194741149 + 1.25 NA intron (NR_037891, intron 1 of 3) intron (NR_037891, intron 1 of 3) 27713 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 159-29 chr12 55979219 55979504 + 1.25 NA intron (NM_002868, intron 1 of 5) intron (NM_002868, intron 1 of 5) 5283 NM_002868 5869 Hs.157659 NM_002868 ENSG00000111540 RAB5B - RAB5B, member RAS oncogene family protein-coding 300.25-16 chr21 31983188 31983561 + 1.25 NA intron (NM_014586, intron 7 of 10) intron (NM_014586, intron 7 of 10) 102921 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 149.5-20 chr10 17052174 17052423 + 1.25 NA intron (NM_001081, intron 22 of 66) L1ME2|LINE|L1 77519 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 309.5-26 chr20 31063705 31064217 + 1.25 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -193703 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 157.75-62 chr16 80264762 80264946 + 1.25 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -275880 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 242.75-9 chr10 29370318 29370555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39098 NR_110922 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 130-109 chr3 184962924 184963059 + 1.25 NA intron (NM_001009921, intron 36 of 46) L1ME3Cz|LINE|L1 150484 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 205.5-78 chr2 190458781 190459037 + 1.25 NA intron (NM_017694, intron 3 of 7) intron (NM_017694, intron 3 of 7) 50554 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 172-106 chr8 92290271 92290438 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186969 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 292-28 chr3 2897268 2897779 + 1.25 NA intron (NM_175613, intron 1 of 15) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 5308 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 210.75-104 chr9 105028543 105028879 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -100556 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 163.5-8 chr1 86114139 86114321 + 1.25 NA intron (NM_152890, intron 4 of 59) intron (NM_152890, intron 4 of 59) 42241 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 211-30 chr2 40044729 40044979 + 1.25 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 127220 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 181-109 chr8 97509282 97509625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62956 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 268-21 chr15 37289975 37290258 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -188805 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 213.5-21 chr10 126880310 126880538 + 1.25 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -24985 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 286.25-22 chr5 66790169 66790414 + 1.25 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) MIR3|SINE|MIR -38482 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 248.5-46 chr2 15927127 15927445 + 1.25 NA intron (NR_125783, intron 2 of 2) intron (NR_125783, intron 2 of 2) 6887 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 194.25-85 chr4 140506798 140507039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8625 NM_001277353 152586 Hs.189067 NM_001034840 ENSG00000205301 MGAT4D GnT1IP MGAT4 family member D protein-coding 159.75-178 chr8 137104689 137104860 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 308814 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 144-140 chr8 129505026 129505261 + 1.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1MDa|LINE|L1 -21001 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 280.5-62 chrX 98603548 98603863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1039170 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 299-5 chr10 24993125 24993406 + 1.25 NA intron (NR_072993, intron 1 of 2) intron (NR_072993, intron 1 of 2) 22893 NM_145010 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 387.25-5 chr2 43620489 43621005 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -16513 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 154.75-84 chr21 16499999 16500140 + 1.25 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) intron (NR_136546, intron 2 of 2) -35503 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 200.25-13 chr10 43950690 43950916 + 1.25 NA intron (NR_033846, intron 5 of 7) L1MB8|LINE|L1 38401 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 173.25-15 chr10 80329397 80329589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15252 NR_070308 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 134.25-21 chr11 44310888 44311084 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_021926) promoter-TSS (NM_021926) -847 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 186.5-66 chr2 69155235 69155527 + 1.25 NA intron (NM_032208, intron 13 of 17) intron (NM_032208, intron 13 of 17) 51699 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 265.5-11 chr10 121752993 121753310 + 1.25 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) L1MB8|LINE|L1 -154693 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 181.75-133 chr8 130494318 130494664 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -50817 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 204.5-27 chr13 32666306 32666627 + 1.25 NA intron (NM_015032, intron 6 of 34) L1MA4|LINE|L1 80014 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 117-135 chr4 71291875 71292130 + 1.25 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) L1MA3|LINE|L1 -47051 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 352.25-11 chr3 96344867 96345250 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14906 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 232-74 chr8 77598678 77598967 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 148125 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 212.75-94 chr7 79289511 79289844 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -163280 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 201.75-43 chr18 52723678 52723872 + 1.25 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 383578 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 278-6 chr11 77960678 77961063 + 1.25 NA intron (NM_033547, intron 5 of 22) intron (NM_033547, intron 5 of 22) 33798 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 305.25-44 chr6 120153553 120153970 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 138582 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 133.5-188 chr4 114826092 114826228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 169401 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 183.5-149 chr8 88942210 88942487 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -614865 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 190.5-113 chr4 72970386 72970718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 99164 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 360.5-16 chr5 44427835 44428264 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38629 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 177-34 chr15 55995052 55995239 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1533 NM_001329212 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 198-44 chr21 18991288 18991551 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -231607 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 190.75-6 chr1 219533383 219533631 + 1.25 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 23817 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-13 chr1 208540775 208541173 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -187714 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 202.75-64 chr20 19308360 19308633 + 1.25 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) intron (NM_020689, intron 2 of 16) -23900 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 261.5-63 chr7 71130197 71130447 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1822 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 299-14 chr17 44815331 44815820 + 1.25 NA intron (NM_001080383, intron 1 of 2) intron (NM_001080383, intron 1 of 2) 14712 NM_005497 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 127.25-207 chr8 92504089 92504276 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 151312 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 316.75 chr10 38131227 38131701 + 1.25 NA intron (NM_001324258, intron 6 of 6) L1MB4|LINE|L1 37127 NM_001324249 7587 Hs.292575 NM_003421 ENSG00000075407 ZNF37A KOX21|ZNF37 zinc finger protein 37A protein-coding 218.25-19 chr11 87036352 87036644 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1436 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 266.5-32 chr2 56505751 56506103 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -320157 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 191.5-139 chr7 90380210 90380536 + 1.25 NA intron (NM_001042717, intron 6 of 7) AluSx|SINE|Alu -15919 NR_102424 101409256 NR_102424 LOC101409256 - cell division cycle 42 pseudogene pseudo 199.5-73 chr2 39462342 39462755 + 1.25 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) intron (NR_037875, intron 3 of 5) 25132 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 204.75 chr1 6142344 6142627 + 1.25 NA exon (NM_015557, exon 14 of 42) exon (NM_015557, exon 14 of 42) 37836 NM_015557 26038 Hs.522898 NM_015557 ENSG00000116254 CHD5 CHD-5 chromodomain helicase DNA binding protein 5 protein-coding 218-39 chr2 195017373 195017655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 286919 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 216.75-47 chr22 25597504 25597725 + 1.25 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) L1MEf|LINE|L1 32939 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 160-18 chr11 29080639 29080968 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -513610 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 197.25-13 chr10 92252269 92252559 + 1.25 NA intron (NM_014912, intron 1 of 9) L1ME3A|LINE|L1 -9135 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 143.5-84 chr16 47670187 47670365 + 1.25 NA intron (NM_001031835, intron 27 of 31) L1M5|LINE|L1 -188305 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 313.75-25 chr9 35411684 35412209 + 1.25 NA intron (NR_003582, intron 2 of 10) intron (NR_003582, intron 2 of 10) 5191 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 177.5-184 chr9 85917934 85918180 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -23085 NM_001321881 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 387.75-7 chr17 56517609 56518277 + 1.25 NA TTS (NM_001365758) TTS (NM_001365758) -75756 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 161-60 chr2 23410584 23410740 + 1.25 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 25483 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 222-50 chr3 20518647 20518945 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 176328 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 280.5-14 chr14 87458505 87458752 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 196666 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 204-26 chr18 11833273 11833535 + 1.25 NA intron (NM_001369387, intron 5 of 11) intron (NM_001369387, intron 5 of 11) -18009 NM_020412 57132 Hs.656244 NM_020412 ENSG00000255112 CHMP1B C10orf2|C18-ORF2|C18orf2|CHMP1.5|Vps46-2|Vps46B|hVps46-2 charged multivesicular body protein 1B protein-coding 325.25-16 chr20 50107271 50107796 + 1.25 NA intron (NM_001257399, intron 1 of 4) intron (NM_001257399, intron 1 of 4) 5617 NM_001282577 7335 Hs.420529 NM_021988 ENSG00000244687 UBE2V1 CIR1|CROC-1|CROC1|UBE2V|UEV-1|UEV1|UEV1A ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 protein-coding 245-39 chr22 37161593 37161949 + 1.25 NA intron (NM_001346222, intron 1 of 9) intron (NM_001346222, intron 1 of 9) -11855 NM_000878 3560 Hs.474787 NM_000878 ENSG00000100385 IL2RB CD122|IL15RB|P70-75 interleukin 2 receptor subunit beta protein-coding 299-30 chr5 108973248 108973525 + 1.25 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) intron (NR_146155, intron 13 of 19) 48780 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 147.25-37 chr14 94592981 94593159 + 1.25 NA TTS (NM_000624) TTS (NM_000624) 11644 NM_000624 5104 Hs.159628 NM_000624 ENSG00000188488 SERPINA5 PAI-3|PAI3|PCI|PCI-B|PLANH3|PROCI serpin family A member 5 protein-coding 423.5-9 chr7 92963264 92963909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126959 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 315.75-8 chr14 75639489 75639775 + 1.25 NA intron (NM_017791, intron 6 of 9) intron (NM_017791, intron 6 of 9) 21244 NM_007176 11161 Hs.15106 NM_007176 ENSG00000133935 ERG28 C14orf1|NET51 ergosterol biosynthesis 28 homolog protein-coding 176-11 chr11 71267436 71267683 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42763 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 175.25-11 chr1 206999304 206999488 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -28771 NM_032029 83953 Hs.145519 NM_032029 ENSG00000162897 FCAMR CD351|FCA/MR|FKSG87 Fc fragment of IgA and IgM receptor protein-coding 133.5-27 chr10 29165951 29166120 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -123035 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 206.5-93 chr5 29405872 29406126 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -10023 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 259.75-58 chr9 84088377 84088740 + 1.25 NA intron (NR_110995, intron 7 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 25115 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 243.75-20 chr13 68280214 68280468 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 604984 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 195.25-96 chr8 122105634 122105812 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 462921 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 199.5-42 chr14 58747867 58748041 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -80334 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 247.75-34 chr21 17782705 17783043 + 1.25 NA intron (NR_038870, intron 2 of 2) intron (NR_038870, intron 2 of 2) 9635 NR_038871 246312 Hs.473425 NR_038870 ENSG00000240770 C21orf91-OT1 D21S2089E|NCRNA00285 C21orf91 overlapping transcript 1 ncRNA 135.5-194 chr7 141390103 141390244 + 1.25 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) intron (NM_001195278, intron 2 of 3) -161237 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 256.25-34 chr4 47191595 47191867 + 1.25 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 160164 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 136.75-18 chr1 236246226 236246419 + 1.25 NA intron (NM_019891, intron 5 of 15) AluJr|SINE|Alu 35636 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 158-22 chr10 54083509 54083647 + 1.25 NA intron (NM_001142765, intron 14 of 31) L1MB5|LINE|L1 -402652 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 255-5 chr11 16303455 16303877 + 1.25 NA intron (NM_033326, intron 3 of 15) L1MD|LINE|L1 52880 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 252-60 chr6 53375955 53376162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26879 NM_001242830 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 201.75-87 chr6 148321470 148321780 + 1.25 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) L2c|LINE|L2 -21213 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 295.25-12 chr2 145165836 145166244 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 498073 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 252-74 chr8 118396476 118396732 + 1.25 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR -224397 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 149.75-45 chr14 66033718 66033968 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -452528 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 199.5-117 chr5 35519695 35519874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98079 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 323.75-7 chr11 74378289 74378704 + 1.25 NA intron (NM_173582, intron 1 of 13) intron (NM_173582, intron 1 of 13) 19937 NM_173582 283209 Hs.26612 NM_173582 ENSG00000165434 PGM2L1 BM32A|PMMLP phosphoglucomutase 2 like 1 protein-coding 228.75-29 chr17 61644770 61645149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53740 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 171.25-93 chr22 45528805 45529049 + 1.25 NA intron (NM_006487, intron 4 of 14) MIR|SINE|MIR 26044 NM_001996 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 202.5-103 chr4 75600959 75601159 + 1.25 NA intron (NM_003948, intron 6 of 11) L1MC5|LINE|L1 29469 NM_001330724 8999 Hs.591698 NM_003948 ENSG00000138769 CDKL2 KKIAMRE|P56 cyclin dependent kinase like 2 protein-coding 422 chr1 63224386 63224939 + 1.25 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) AluSx1|SINE|Alu 92595 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 189.5-34 chr11 111908483 111908640 + 1.25 NA TTS (NM_001368246) TTS (NM_001368246) 2178 NM_001368246 1410 Hs.53454 NM_001885 ENSG00000109846 CRYAB CMD1II|CRYA2|CTPP2|CTRCT16|HEL-S-101|HSPB5|MFM2 crystallin alpha B protein-coding 232-50 chr22 42385681 42385901 + 1.25 NA intron (NM_145912, intron 5 of 5) intron (NM_145912, intron 5 of 5) -16583 NR_120597 102723775 Hs.335413 NR_120595 ENSG00000229891 LINC01315 C22orf32-1|lnc-C22orf32-1 long intergenic non-protein coding RNA 1315 ncRNA 138-174 chrX 109367778 109367941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 114227 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 234.75-91 chr9 118875042 118875357 + 1.25 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 195528 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 153.5-205 chr8 131528375 131528611 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -375600 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 331.75-14 chr2 80592688 80593049 + 1.25 NA intron (NM_001282599, intron 9 of 11) intron (NM_001282599, intron 9 of 11) 279489 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 189.25-112 chr7 52189956 52190185 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -796814 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 189.5-55 chr16 85670466 85670739 + 1.25 NA intron (NM_001278184, intron 13 of 14) L1M5|LINE|L1 18352 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 177-68 chr4 54377650 54377945 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44905 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 160-15 chr10 98263521 98263793 + 1.25 NA intron (NM_032211, intron 1 of 14) MIR3|SINE|MIR 4537 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 209.25-93 chr5 101727036 101727331 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 569101 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 293.5-35 chr5 80131743 80132030 + 1.25 NA intron (NR_126061, intron 11 of 13) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -48221 NR_109930 101929215 NR_109930 ENSG00000249825 CTD-2201I18.1 - uncharacterized LOC101929215 ncRNA 211.25-44 chr2 238357715 238358002 + 1.25 NA intron (NM_001139490, intron 13 of 14) intron (NM_001139490, intron 13 of 14) 37314 NM_001139490 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 241-50 chr7 92741585 92741968 + 1.25 NA intron (NM_001259, intron 3 of 7) intron (NM_001259, intron 3 of 7) 92183 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 191.5-41 chr14 83020010 83020219 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 377482 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 246.5-78 chr9 90109411 90109711 + 1.25 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -68062 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 317-27 chr4 91262009 91262328 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) MIR|SINE|MIR 1015134 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 248-36 chr2 76910896 76911303 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -74866 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 212.75-92 chr7 7236936 7237367 + 1.25 NA intron (NM_020156, intron 2 of 3) MER5C|DNA|hAT-Charlie -18003 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 370.25 chr10 71706775 71707192 + 1.25 NA exon (NM_001171931, exon 25 of 25) exon (NM_001171931, exon 25 of 25) 12795 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 244.5-76 chr5 20416949 20417174 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 111510 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-37 chr14 19957960 19958206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17436 NM_001005486 81127 Hs.554583 NM_001005486 ENSG00000169488 OR4K15 OR14-20|OR4K15Q olfactory receptor family 4 subfamily K member 15 protein-coding 126.25-29 chr11 42229272 42229486 + 1.25 NA intron (NR_038309, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 24311 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 210-62 chr22 20407738 20408024 + 1.25 NA non-coding (NR_046282, exon 6 of 6) non-coding (NR_046282, exon 6 of 6) 13730 NM_001256525 7625 Hs.517418 NM_003426 ENSG00000185252 ZNF74 COS52|ZFP520|ZNF520|hZNF7 zinc finger protein 74 protein-coding 181.25-113 chr6 100558997 100559237 + 1.25 NA intron (NM_006828, intron 36 of 41) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -95442 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 199.25-8 chr10 53461694 53461985 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -690139 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 158-15 chr1 174372748 174372973 + 1.25 NA intron (NM_001366445, intron 12 of 13) LTR37A|LTR|ERV1 -75104 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 203.5-138 chr8 90586133 90586463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19765 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 298.5-23 chr2 231468963 231469445 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -4720 NM_005381 4691 Hs.79110 NM_005381 ENSG00000115053 NCL C23|Nsr1 nucleolin protein-coding 242-41 chr4 36624551 36624860 + 1.25 NA intron (NR_149124, intron 1 of 4) intron (NR_149124, intron 1 of 4) 17195 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 163.75-72 chr2 105775053 105775250 + 1.25 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) 30088 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 228.25-89 chr9 68755045 68755272 + 1.25 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) intron (NM_003558, intron 2 of 15) -24907 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 205.75-60 chr4 143119057 143119349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65658 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 206.25-79 chr4 73429970 73430301 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6086 NM_001134 174 Hs.518808 NM_001134 ENSG00000081051 AFP AFPD|FETA|HPAFP alpha fetoprotein protein-coding 231.5-101 chr8 110688275 110688532 + 1.25 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 339030 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 165.5-181 chr7 92853990 92854227 + 1.25 NA intron (NR_110088, intron 1 of 1) intron (NR_110088, intron 1 of 1) -17481 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 113.75-214 chrX 103421836 103421944 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 44852 NM_014380 27018 Hs.448588 NM_014380 ENSG00000166681 BEX3 Bex|DXS6984E|HGR74|NADE|NGFRAP1 brain expressed X-linked 3 protein-coding 136.5-107 chr2 50096629 50096790 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) -122506 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 332.5-27 chr7 6303091 6303626 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -30734 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 256.25-13 chr15 70638826 70639112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3720 NR_126482 104548973 NR_126482 ENSG00000280515 SALRNA2 SAL-RNA2|XLOC_025931 senescence associated long non-coding RNA 2 ncRNA 207.5-113 chr8 73902743 73903029 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 23904 NR_147034 101926947 Hs.521636 NR_147034 LINC01617 C8orf23|NCRNA00249|XLOC_006844 long intergenic non-protein coding RNA 1617 ncRNA 370.25-5 chr21 27701780 27702220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20379 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 120-189 chr8 103790417 103790525 + 1.25 NA intron (NM_001348497, intron 3 of 22) L1MB7|LINE|L1 -28749 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 470-3 chr2 40887084 40887700 + 1.25 NA Intergenic AluYk3|SINE|Alu -374957 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 232.25-67 chr6 49198049 49198374 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 265042 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 300-35 chr7 67830326 67830684 + 1.25 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -189748 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 115-186 chr8 119935121 119935296 + 1.25 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) intron (NM_022783, intron 3 of 8) 61486 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 309-9 chr11 10568150 10568583 + 1.25 NA intron (NM_006691, intron 1 of 5) intron (NM_006691, intron 1 of 5) 299 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 263.5-52 chr5 51555355 51555623 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 172041 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 282.25-2 chr1 109951798 109952164 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32784 NM_001242673 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 198.5-146 chr8 92524585 92524802 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 130801 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 192.5-62 chr2 10457811 10458065 + 1.25 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 8210 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 241.25-66 chr7 120177223 120177436 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -95846 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 335.25-8 chr11 29751661 29751984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 133020 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 213.25-58 chr6 51013624 51013988 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 194935 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 287.75-52 chr8 138126386 138126644 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42970 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 122.25-12 chr1 182957241 182957409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4159 NM_001345928 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 288.75-24 chr18 6551007 6551378 + 1.25 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 39776 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 287-2 chr1 53241917 53242355 + 1.25 NA TTS (NM_017522) TTS (NM_017522) 3526 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 374-13 chr4 46119694 46120333 + 1.25 NA intron (NM_173536, intron 1 of 8) intron (NM_173536, intron 1 of 8) 4041 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 224.25-8 chr1 211362900 211363143 + 1.25 NA intron (NM_001319207, intron 7 of 10) L1ME4b|LINE|L1 16657 NM_145759 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 243.5-84 chr8 116760284 116760479 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4558 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 190.5-80 chr2 109140737 109141084 + 1.25 NA TTS (NR_036223) TTS (NR_036223) 678 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 162-84 chr4 53064283 53064567 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 202108 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 226.75-66 chr6 166716990 166717187 + 1.25 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -89837 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 122.25-100 chr2 160711577 160711774 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -217868 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 467.5-4 chr5 59501796 59502550 + 1.25 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 84325 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 251.5-48 chr20 47190142 47190357 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23282 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 262.25-44 chr6 135906887 135907247 + 1.25 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) L1MEb|LINE|L1 55366 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 308.5-24 chr3 109091729 109092012 + 1.25 NA intron (NM_014429, intron 8 of 27) intron (NM_014429, intron 8 of 27) -9586 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 381.5-11 chr9 94010920 94011451 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19628 NM_177995 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 259.25-44 chr7 104077005 104077397 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87543 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 241.75-68 chr6 67069439 67069765 + 1.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -985749 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 114-147 chr6 124053147 124053333 + 1.25 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) -229765 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 334-21 chr3 128262688 128263015 + 1.25 NA intron (NM_021937, intron 3 of 6) intron (NM_021937, intron 3 of 6) -108937 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 178.25-75 chr21 26514955 26515256 + 1.25 NA intron (NR_135516, intron 3 of 3) intron (NR_135516, intron 3 of 3) 58181 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 232.5-41 chr18 6526819 6527052 + 1.25 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 15519 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 295.75 chr1 178697445 178697728 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 19837 NR_039622 100616328 NR_039622 ENSG00000266417 MIR4424 - microRNA 4424 ncRNA 489.5-2 chr12 124206953 124207831 + 1.25 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -81772 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 198.5-89 chr20 16038138 16038403 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) L1MC5a|LINE|L1 -52388 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 307.5-44 chr5 181036597 181037091 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3422 NM_001308245 153579 Hs.546502 NM_152547 ENSG00000165810 BTNL9 BTN3|BTN8|VDLS1900 butyrophilin like 9 protein-coding 205.5-63 chr18 69719729 69719951 + 1.25 NA intron (NM_152721, intron 5 of 7) LTR8B|LTR|ERV1 228033 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 177.25-101 chr3 189448304 189448473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -148358 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 212.75-97 chr8 114093126 114093518 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -656383 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 128.75-134 chr4 30422385 30422507 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -297923 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 207.5-73 chr4 18647297 18647513 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -625530 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 326-19 chr20 34868328 34868954 + 1.25 NA intron (NM_178026, intron 1 of 14) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 4215 NM_178026 2686 Hs.433738 NM_178026 ENSG00000131067 GGT7 D20S101|GGT4|GGTL3|GGTL5 gamma-glutamyltransferase 7 protein-coding 149.75-107 chr22 26681598 26681726 + 1.25 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) intron (NR_110543, intron 1 of 5) 8819 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 167.5-20 chr10 7548770 7549036 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70770 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 206.5-134 chr8 84723940 84724122 + 1.25 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 18104 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 201.25-66 chr3 99023299 99023525 + 1.25 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -121717 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 389.5-4 chr15 59844461 59845026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -155423 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 249.5-72 chr4 110023391 110023654 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 110639 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 291.25-22 chr4 184940697 184941005 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -2411 NR_039660 100616111 NR_039660 ENSG00000263458 MIR4455 - microRNA 4455 ncRNA 329.25-22 chr5 50806790 50807078 + 1.25 NA intron (NM_024615, intron 14 of 25) intron (NM_024615, intron 14 of 25) 139520 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 291.5-8 chr11 20027663 20028110 + 1.25 NA intron (NM_001111019, intron 2 of 27) intron (NM_001111019, intron 2 of 27) 5330 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 187-97 chr8 67403847 67404058 + 1.25 NA intron (NR_136224, intron 1 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 60118 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 163.25-15 chr10 67461841 67462057 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -58539 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 371.75 chr1 67942012 67942440 + 1.25 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR -108759 NM_018841 55970 Hs.431101 NM_018841 ENSG00000172380 GNG12 - G protein subunit gamma 12 protein-coding 278-20 chr3 35964444 35964761 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 220126 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 199.5-121 chr5 101736245 101736447 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 559938 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 159.75-109 chr3 83752108 83752333 + 1.25 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 1117355 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 247.75-52 chr6 50652570 50652871 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60824 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 283-20 chr2 36061491 36061720 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 293965 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 267.5-19 chr12 126555424 126555701 + 1.25 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -106235 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 163-78 chr4 16235280 16235538 + 1.25 NA intron (NR_027697, intron 1 of 2) intron (NR_027697, intron 1 of 2) 8746 NR_027696 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 243 chr1 14235421 14235745 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 184390 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 213-62 chr3 40748117 40748354 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 223275 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 200.5-2 chr1 50484087 50484448 + 1.25 NA intron (NM_007051, intron 17 of 18) intron (NM_007051, intron 17 of 18) -60824 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 146.25-12 chr10 27514473 27514617 + 1.25 NA intron (NR_046172, intron 2 of 5) L1M7|LINE|L1 10241 NM_001256411 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 244.75-3 chr1 115078096 115078586 + 1.25 NA intron (NM_005725, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 11159 NM_001308315 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 198.5-72 chr2 64301750 64302010 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -38879 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 195.75-34 chr12 40873357 40873799 + 1.25 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) -34779 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 222.75-101 chr8 127096638 127097009 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14602 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 195-41 chr18 2874032 2874389 + 1.25 NA intron (NM_032048, intron 2 of 7) intron (NM_032048, intron 2 of 7) 27204 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 280-44 chr5 50872624 50873056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 97347 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 205.5-134 chr7 23260037 23260254 + 1.25 NA intron (NM_001005340, intron 5 of 10) intron (NM_001005340, intron 5 of 10) 13370 NM_001005340 10457 Hs.190495 NM_002510 ENSG00000136235 GPNMB HGFIN|NMB|PLCA3 glycoprotein nmb protein-coding 274.25-41 chr6 34782206 34782563 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -9699 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 186.75-57 chr2 162142654 162142825 + 1.25 NA TTS (NM_002054) TTS (NM_002054) 9508 NM_002054 2641 Hs.516494 NM_002054 ENSG00000115263 GCG GLP-1|GLP1|GLP2|GRPP glucagon protein-coding 309.25-2 chr1 65761397 65761710 + 1.25 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -30957 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 221.75-50 chr4 97209081 97209327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157722 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 241.5-22 chr14 53822587 53822916 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 125733 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 258.25-34 chr3 685952 686242 + 1.25 NA intron (NR_110118, intron 1 of 3) intron (NR_110118, intron 1 of 3) 93992 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 240.75-75 chr8 29761917 29762280 + 1.25 NA intron (NR_125815, intron 1 of 3) intron (NR_125815, intron 1 of 3) 13789 NR_125815 101929450 Hs.512440 NR_125814 ENSG00000253490 LINC02099 - long intergenic non-protein coding RNA 2099 ncRNA 296.75-7 chr11 121753434 121753794 + 1.25 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 301300 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 148.75-34 chr11 90542150 90542337 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 13614 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 217.25-57 chr4 38972610 38972950 + 1.25 NA intron (NM_024943, intron 5 of 6) L1ME4b|LINE|L1 59629 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 127.75-190 chr7 55868098 55868283 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5438 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 201.75-9 chr10 57203358 57203669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 101046 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 153.25-3 chr1 57664597 57664805 + 1.25 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) L1ME4a|LINE|L1 -195880 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 222-32 chr18 35195375 35195659 + 1.25 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -45517 NM_032347 84307 Hs.591061 NM_032347 ENSG00000186812 ZNF397 ZNF47|ZSCAN15 zinc finger protein 397 protein-coding 211-62 chr6 132947442 132947682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 130343 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 250-35 chr20 59651280 59651502 + 1.25 NA intron (NM_001281507, intron 1 of 12) intron (NM_001281507, intron 1 of 12) 22782 NM_001281507 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 140.25-200 chrX 66461305 66461505 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 154625 NM_001242310 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 278.25-48 chr5 76380365 76380609 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22798 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 196.25-64 chr2 99899293 99899531 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 206171 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 200.75-80 chr4 175271879 175272106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 353634 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 221-38 chr2 100261689 100262003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53592 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 166-41 chr16 31189860 31190072 + 1.25 NA intron (NM_004960, intron 10 of 14) intron (NM_004960, intron 10 of 14) 9856 NM_001170634 2521 Hs.46894 NM_004960 ENSG00000089280 FUS ALS6|ETM4|FUS1|HNRNPP2|POMP75|TLS FUS RNA binding protein protein-coding 192.25-2 chr1 28025367 28025819 + 1.25 NA intron (NM_001282561, intron 6 of 16) MIR|SINE|MIR 63017 NM_001990 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 216.25 chr1 5425458 5425647 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 437189 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 163.25-111 chr5 44563760 44564024 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -53610 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 248-73 chr7 125708307 125708654 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -444189 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 173.25-144 chrX 65682801 65683007 + 1.25 NA intron (NM_002444, intron 1 of 12) intron (NM_002444, intron 1 of 12) 15250 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 211-43 chr3 60148630 60148868 + 1.25 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -67840 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 230.5-37 chr14 75730214 75730464 + 1.25 NA intron (NM_015072, intron 12 of 31) intron (NM_015072, intron 12 of 31) 69093 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 253.5-58 chr5 4709140 4709561 + 1.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -64131 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 258.5-39 chr2 64786456 64787054 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 76876 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 266.5-5 chr1 217196336 217196671 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -58801 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 330.25-25 chr8 134449092 134449687 + 1.25 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -148682 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 204-9 chr11 106665706 106665893 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 352677 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 179-68 chr3 158824346 158824764 + 1.25 NA intron (NM_022736, intron 13 of 15) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 22501 NM_001289407 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 156-74 chr19 9492324 9492531 + 1.25 NA intron (NM_152476, intron 2 of 9) intron (NM_152476, intron 2 of 9) 6189 NM_152476 147741 Hs.631613 NM_152476 ENSG00000198028 ZNF560 - zinc finger protein 560 protein-coding 118.5-137 chr3 179855138 179855320 + 1.25 NA intron (NM_001349408, intron 8 of 14) intron (NM_001349408, intron 8 of 14) -42965 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 149.5-5 chr1 64672214 64672436 + 1.25 NA intron (NM_020925, intron 17 of 26) intron (NM_020925, intron 17 of 26) -72648 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 157.5-147 chr4 73564264 73564501 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 55579 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 114.75-25 chr10 81926732 81926832 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 49095 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 224.25-30 chr14 39397170 39397528 + 1.25 NA 3' UTR (NM_203301, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_203301, exon 4 of 4) 35151 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 188-73 chr7 106032354 106032617 + 1.25 NA exon (NM_001301161, exon 18 of 18) exon (NM_001301161, exon 18 of 18) 69221 NM_001301161 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 198.25-93 chr7 40946408 40946630 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 33420 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 159.25-128 chr6 69638204 69638409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 158160 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 217.75-9 chr10 18462123 18462347 + 1.25 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) intron (NM_201593, intron 3 of 13) 61660 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 144.25-116 chr20 46442944 46443078 + 1.25 NA intron (NR_146919, intron 3 of 3) L1MD1|LINE|L1 14632 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 137.5-6 chr1 63070101 63070315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57737 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 304.75-27 chr5 64028017 64028322 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -65877 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 434.5-3 chr14 44902126 44902646 + 1.25 NA intron (NM_001017923, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 5111 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 274.75-15 chr17 1252932 1253258 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -17469 NM_001164405 727857 Hs.723790 NM_001164405 ENSG00000205899 BHLHA9 BHLHF42|CCSPD basic helix-loop-helix family member a9 protein-coding 265.75-70 chr7 132747603 132747925 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11206 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 348.25-2 chr10 4397162 4397591 + 1.25 NA intron (NR_108054, intron 2 of 2) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -9093 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 275.5-42 chr3 79192952 79193350 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L2a|LINE|L2 -173692 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 201.5-35 chr11 109765331 109765509 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -327972 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 235-47 chr3 171343826 171344165 + 1.25 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) intron (NM_001161563, intron 2 of 31) 116410 NM_001161562 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 137.25-101 chr3 102645283 102645495 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210374 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 258.5-6 chr1 173402178 173402495 + 1.25 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) intron (NR_037845, intron 2 of 2) 59026 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 278.5-18 chr15 25526651 25526918 + 1.25 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -87728 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 256.75-22 chr2 58036877 58037164 + 1.25 NA intron (NM_001288838, intron 3 of 15) AluJb|SINE|Alu -9622 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 266-25 chr20 38025664 38026056 + 1.25 NA intron (NM_014657, intron 1 of 8) L1MDa|LINE|L1 7596 NM_014657 9675 Hs.655481 NM_014657 ENSG00000101407 TTI1 KIAA0406|smg-10 TELO2 interacting protein 1 protein-coding 133-148 chr6 5884806 5885087 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 119098 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 290.75-30 chr2 236625716 236626136 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56101 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 118.25-208 chr8 129100798 129100920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -134858 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 223.25-50 chr3 21610224 21610552 + 1.25 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 67599 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 325.5-18 chr2 116195089 116195456 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 851457 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 383.25-3 chr10 9542887 9543563 + 1.25 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -247632 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 303.75 chr1 41137487 41138027 + 1.25 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) LTR41|LTR|ERVL 23675 NR_135092 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 239.25-90 chr8 124313823 124314131 + 1.25 NA exon (NM_194291, exon 7 of 7) exon (NM_194291, exon 7 of 7) 58722 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 149-110 chr6 38604448 38604589 + 1.25 NA intron (NM_001099272, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 -8451 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 267.25-27 chr22 41707600 41707978 + 1.25 NA intron (NM_152513, intron 3 of 30) LTR50|LTR|ERVL 8286 NM_152513 150365 Hs.116419 NM_152513 ENSG00000167077 MEI1 HYDM3|SPATA38 meiotic double-stranded break formation protein 1 protein-coding 253-15 chr14 77162157 77162559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19440 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 320.5-23 chr2 167290400 167290844 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 103250 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 305.25-2 chr1 97662317 97662612 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) AluSc8|SINE|Alu -134457 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 186.5-142 chr9 124415889 124416133 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_002799) promoter-TSS (NM_002799) -569 NM_002799 5695 Hs.213470 NM_002799 ENSG00000136930 PSMB7 Z proteasome subunit beta 7 protein-coding 267.5-74 chr8 81342488 81342716 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 62066 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 156-97 chr21 35435880 35436214 + 1.25 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) L1MC5a|LINE|L1 144717 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 145.5-183 chr7 100517869 100517994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21272 NM_006076 3268 Hs.521083 NM_006076 ENSG00000106351 AGFG2 HRBL|RABR ArfGAP with FG repeats 2 protein-coding 228.25-6 chr1 200097026 200097276 + 1.25 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 54326 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 491 chr10 63137226 63137691 + 1.25 NA intron (NM_001282405, intron 1 of 2) intron (NM_001282405, intron 1 of 2) 4130 NM_030759 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 364-13 chr4 36967990 36968519 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -33525 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 262.75-15 chr14 60906576 60906995 + 1.25 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) MER97c|DNA|hAT-Tip100 74294 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 261.5-39 chr22 45400886 45401352 + 1.25 NA intron (NM_148674, intron 5 of 24) L1MC3|LINE|L1 12480 NM_001291501 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 238.5-82 chr6 150534421 150534751 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65299 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 207.25-107 chr9 132925102 132925381 + 1.25 NA intron (NM_001162427, intron 4 of 21) intron (NM_001162427, intron 4 of 21) 19375 NM_001362177 7248 Hs.370854 NM_000368 ENSG00000165699 TSC1 LAM|TSC TSC complex subunit 1 protein-coding 259.75-31 chr20 37680025 37680301 + 1.25 NA intron (NR_040021, intron 3 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 3253 NR_040021 100287792 Hs.517026 NM_001001690 ENSG00000204117 LOC100287792 - uncharacterized LOC100287792 ncRNA 377.5-18 chr7 7037307 7037883 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29450 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 146.75-61 chr17 28827339 28827481 + 1.25 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) intron (NM_001288635, intron 1 of 3) -14939 NM_001288634 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 133-150 chr6 54061800 54062004 + 1.25 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) -14308 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 234.25-83 chrX 81209444 81209809 + 1.25 NA intron (NM_003022, intron 1 of 3) intron (NM_003022, intron 1 of 3) 7524 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 172.5-104 chr2 180142026 180142196 + 1.25 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -134814 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 261.25-45 chr7 26482864 26483170 + 1.25 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) 55808 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 363.75-12 chr3 44520921 44521235 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10461 NM_001287349 285346 Hs.648974 NM_001287349 ENSG00000178917 ZNF852 - zinc finger protein 852 protein-coding 169-117 chrX 13561840 13561994 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7684 NM_001167890 25975 Hs.12844 NM_015507 ENSG00000198759 EGFL6 MAEG|W80 EGF like domain multiple 6 protein-coding 220.75-15 chr11 18504697 18504941 + 1.25 NA intron (NM_006292, intron 6 of 9) intron (NM_006292, intron 6 of 9) 22123 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 224.75-3 chr1 40289095 40289390 + 1.25 NA intron (NM_005857, intron 8 of 9) ERVL-E-int|LTR|ERVL 28044 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 113-53 chr12 55922860 55923035 + 1.25 NA intron (NM_032345, intron 1 of 2) AluSp|SINE|Alu 4178 NM_001143853 84305 Hs.505687 NM_032345 ENSG00000170473 PYM1 PYM|WIBG PYM homolog 1, exon junction complex associated factor protein-coding 183.5-104 chr4 145248922 145249225 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -68484 NM_001366057 54726 Hs.270851 NM_017493 ENSG00000164164 OTUD4 DUBA6|HIN1|HSHIN1 OTU deubiquitinase 4 protein-coding 149.75-16 chr10 114480244 114480388 + 1.25 NA intron (NM_001352440, intron 8 of 20) intron (NM_001352440, intron 8 of 20) 46597 NM_001322894 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 262.75-20 chr17 40745700 40746084 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 9439 NM_181534 147183 Hs.55412 NM_181534 ENSG00000204897 KRT25 ARWH3|KRT24IRS1|KRT25A keratin 25 protein-coding 226.25-2 chr1 31167987 31168192 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 71798 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 328-22 chr3 45900058 45900362 + 1.25 NA intron (NM_001256369, intron 3 of 3) intron (NM_001256369, intron 3 of 3) 13667 NM_006641 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 288-13 chr11 40244479 40244952 + 1.25 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) LTR49|LTR|ERV1 48415 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 179.25-51 chr14 57975003 57975299 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109059 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 185.75-118 chr7 41320394 41320695 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 218940 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 240.5-13 chr10 105492984 105493292 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 327195 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 177.75-50 chr15 94629832 94630021 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -225437 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 172.75-21 chr11 38479222 38479591 + 1.25 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 166950 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 221.25-28 chr14 64789181 64789490 + 1.25 NA intron (NM_001024858, intron 14 of 34) AluJb|SINE|Alu -3649 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 456.75-4 chr18 3270103 3271087 + 1.25 NA intron (NM_001144945, intron 1 of 3) intron (NM_001144945, intron 1 of 3) 7876 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 272.5 chr1 22358506 22358870 + 1.25 NA Intergenic MLT1K-int|LTR|ERVL-MaLR 92449 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 226.25-22 chr12 32741677 32742025 + 1.25 NA intron (NM_001330380, intron 17 of 18) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 14046 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 362.25-9 chr4 102176075 102176488 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 148031 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 274-20 chr2 64438884 64439130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15155 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 345-12 chr22 34905972 34906333 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 91764 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 202.75-22 chr12 16418130 16418392 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 64844 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 264.5-41 chr4 64977757 64978058 + 1.25 NA intron (NR_033976, intron 1 of 6) intron (NR_033976, intron 1 of 6) 26593 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 255.5-37 chr2 6478334 6478582 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103036 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 155.25-171 chr7 113411421 113411798 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -293027 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 336.5-17 chr3 55635762 55636132 + 1.25 NA intron (NR_132749, intron 16 of 17) AluSx|SINE|Alu 23522 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 196-10 chr1 213103906 213104141 + 1.25 NA intron (NM_001349671, intron 4 of 12) intron (NM_001349671, intron 4 of 12) 52782 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 269.75-50 chr6 158906836 158907118 + 1.25 NA intron (NR_160979, intron 2 of 2) L1ME3C|LINE|L1 18500 NR_160979 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 114.75-114 chr22 27560537 27560682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 241147 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 199-40 chr2 172390241 172390428 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37002 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 418.25-5 chr2 96714055 96714513 + 1.25 NA intron (NM_001322354, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 25792 NM_030805 81562 Hs.655743 NM_030805 ENSG00000114988 LMAN2L MRT52|VIPL lectin, mannose binding 2 like protein-coding 172.75-146 chrX 100775609 100775775 + 1.25 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -43571 NM_001370162 94121 Hs.592224 NM_080737 ENSG00000102362 SYTL4 SLP4 synaptotagmin like 4 protein-coding 117-116 chr3 29248901 29249043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 31967 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 128.5-93 chr18 30905333 30905497 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 137327 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 310-18 chr4 147033437 147033755 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87710 NM_031956 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 169.75-137 chr7 10724103 10724402 + 1.25 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 21576 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 306-26 chr4 74373659 74374273 + 1.25 NA intron (NM_001432, intron 1 of 4) intron (NM_001432, intron 1 of 4) 8821 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 388.5-9 chr2 60913619 60914097 + 1.25 NA intron (NM_002908, intron 4 of 10) L1MEg|LINE|L1 32284 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 146.5-168 chr5 53160534 53160748 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 50799 NR_104654 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 364.5-21 chr8 87317142 87317726 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) L1MEc|LINE|L1 451019 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 181.25-6 chr1 102813305 102813523 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 295082 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 147.25-113 chr6 415896 416235 + 1.25 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 24313 NR_046000 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 177-66 chr4 32102006 32102195 + 1.25 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -79678 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 152-153 chr8 137153462 137153603 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 260056 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 254.25-37 chr20 54260872 54261220 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 52959 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 342.75-4 chr1 178518023 178518391 + 1.25 NA intron (NM_001170724, intron 5 of 8) L1ME4a|LINE|L1 5098 NM_001170724 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 345.25-13 chr20 7378679 7378979 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 7221 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 171.5-145 chr8 60184106 60184294 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 97200 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 310.75-4 chr10 33045410 33045720 + 1.25 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 71242 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 339-34 chr8 82919794 82920291 + 1.25 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 7938 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 139.5-46 chr12 48074754 48074929 + 1.25 NA intron (NR_051992, intron 7 of 18) intron (NR_051992, intron 7 of 18) -30412 NM_001354742 5213 Hs.75160 NM_000289 ENSG00000152556 PFKM ATP-PFK|GSD7|PFK-1|PFK-A|PFK1|PFKA|PFKX|PPP1R122 phosphofructokinase, muscle protein-coding 222.5-60 chr2 230333732 230334117 + 1.25 NA intron (NM_001352892, intron 2 of 18) HAL1|LINE|L1 6753 NM_001308162 93349 Hs.589661 NM_138402 ENSG00000185404 SP140L - SP140 nuclear body protein like protein-coding 187.5-152 chr7 25814773 25815017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24776 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 250-70 chrX 155680680 155680985 + 1.25 NA intron (NM_001304990, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -67880 NM_001184797 55217 Hs.133321 NM_018196 ENSG00000185973 TMLHE AUTSX6|BBOX2|TMLD|TMLH|TMLHED|XAP130 trimethyllysine hydroxylase, epsilon protein-coding 349-12 chr5 35766883 35767329 + 1.25 NA intron (NM_024867, intron 26 of 36) intron (NM_024867, intron 26 of 36) -89785 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 311.75-22 chr7 85898861 85899291 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 477954 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 236.25-27 chr14 98837777 98838126 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126338 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 219.75-7 chr1 206625340 206625570 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10081 NM_003582 8444 Hs.164267 NM_003582 ENSG00000143479 DYRK3 DYRK5|RED|REDK|hYAK3-2 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 3 protein-coding 407.25-9 chr4 111857549 111858174 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -287593 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 213.5-93 chr4 121945172 121945373 + 1.25 NA intron (NM_001130698, intron 1 of 11) intron (NM_001130698, intron 1 of 11) 6788 NM_001366479 7222 Hs.150981 NM_003305 ENSG00000138741 TRPC3 SCA41|TRP3 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 protein-coding 193.25-68 chr3 14264390 14264702 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85729 NM_014463 27258 Hs.111632 NM_014463 ENSG00000170860 LSM3 SMX4|USS2|YLR438C LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 397.25-2 chr11 41591215 41591732 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -123095 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 220.5-19 chr12 42540901 42541223 + 1.25 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 48684 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 190.75-96 chr6 84728961 84729263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35486 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 146.75-115 chr4 74871494 74871701 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -61519 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 126.5-134 chr20 36213908 36214074 + 1.25 NA intron (NM_177996, intron 15 of 19) L1MC4a|LINE|L1 -22426 NM_015511 25980 Hs.11314 NM_015511 ENSG00000131043 AAR2 C20orf4|CGI-23 AAR2 splicing factor protein-coding 339.25-22 chr6 107736425 107736941 + 1.25 NA intron (NM_001286408, intron 4 of 6) intron (NM_001286408, intron 4 of 6) -4533 NM_001286409 256380 Hs.486109 NM_198081 ENSG00000146285 SCML4 dJ47M23.1 Scm polycomb group protein like 4 protein-coding 153-35 chr13 37291768 37291920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186180 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 200.5-123 chr6 42591541 42591732 + 1.25 NA intron (NM_015255, intron 2 of 46) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 27607 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 169.5-90 chr20 53966709 53966850 + 1.25 NA intron (NM_003657, intron 9 of 11) MER113|DNA|hAT-Charlie -91070 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 270.25-21 chr14 68723284 68723756 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70394 NM_004926 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 247.25-27 chr2 62936476 62936767 + 1.25 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 111090 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 263.5-17 chr15 27498664 27499045 + 1.25 NA intron (NM_033223, intron 6 of 9) intron (NM_033223, intron 6 of 9) -337535 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 352.25-4 chr14 40460022 40460706 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -494347 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 127.5-202 chr5 141334178 141334296 + 1.25 NA intron (NM_018912, intron 1 of 3) L1MEi|LINE|L1 3552 NM_031993 56114 Hs.368160 NM_018912 ENSG00000204956 PCDHGA1 PCDH-GAMMA-A1 protocadherin gamma subfamily A, 1 protein-coding 246.25-18 chr12 116948628 116949188 + 1.25 NA intron (NM_153348, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu 37952 NM_012174 26259 Hs.624537 NM_012174 ENSG00000174989 FBXW8 FBW6|FBW8|FBX29|FBXO29|FBXW6 F-box and WD repeat domain containing 8 protein-coding 122.75-185 chr7 51179066 51179236 + 1.25 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) LTR49-int|LTR|ERV1 137658 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 291.25-17 chr2 209478860 209479182 + 1.25 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 54974 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 230-7 chr10 47128384 47128633 + 1.25 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -171689 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 463 chr1 14324762 14325364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94910 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 282.75-36 chr5 148726797 148727155 + 1.25 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -72449 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 120.75-58 chr16 61487476 61487582 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -431763 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 185.75-82 chr22 23133259 23133673 + 1.25 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) L1ME3A|LINE|L1 8524 NM_014433 27156 Hs.526920 NM_014433 ENSG00000100218 RSPH14 RTDR1 radial spoke head 14 homolog protein-coding 433.25-3 chr2 221292985 221293481 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 279071 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 250.75-24 chr2 48124572 48124902 + 1.25 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -189945 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 200.25-52 chr19 27715274 27715572 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -78008 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 269-14 chr11 94463909 94464320 + 1.25 NA exon (NM_005590, exon 11 of 19) exon (NM_005590, exon 11 of 19) 2466 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 184.25-43 chr16 76886717 76886911 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17878 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 502.75 chr20 31052007 31052880 + 1.25 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -205221 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 139.75-118 chr3 10828637 10828935 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001317406, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001317406, exon 4 of 4) 12558 NM_014229 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 198.25-90 chr6 132343854 132344119 + 1.25 NA intron (NM_015529, intron 4 of 11) intron (NM_015529, intron 4 of 11) 57489 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 223.5-137 chr9 80966215 80966571 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 723142 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 201.75-66 chr4 69815918 69816297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44038 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 127.25-223 chrX 130347335 130347536 + 1.25 NA intron (NM_001282196, intron 4 of 10) intron (NM_001282196, intron 4 of 10) 7516 NR_104107 9016 Hs.194686 NM_003951 ENSG00000102078 SLC25A14 BMCP1|UCP5 solute carrier family 25 member 14 protein-coding 193.25-61 chr2 226521735 226521987 + 1.25 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 136932 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 165.25-30 chr11 113826419 113826672 + 1.25 NA intron (NM_001346268, intron 7 of 20) AluJb|SINE|Alu 46749 NM_001101389 644672 Hs.705360 NM_001101389 ENSG00000228607 CLDN25 - claudin 25 protein-coding 139-124 chr5 175268952 175269294 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 175059 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 146.75-4 chr1 80712422 80712631 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71239 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 277.75-16 chr2 138221868 138222247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120173 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 167-57 chr2 33862460 33862670 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 2 of 5) LOR1a|LTR|ERV1 -134348 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 307.5-43 chr4 132665831 132666182 + 1.25 NA intron (NR_126401, intron 3 of 3) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 74917 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 340-18 chr6 94270973 94271343 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 552855 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 159-40 chr16 64976278 64976493 + 1.25 NA intron (NM_001330576, intron 7 of 11) intron (NM_001330576, intron 7 of 11) 145678 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 265.25-34 chr3 78549587 78549981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 469675 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 193-50 chr3 11528113 11528350 + 1.25 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) intron (NM_001349238, intron 17 of 17) 40567 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 241-38 chr5 31337537 31337888 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 144026 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 225.75-47 chr2 206738434 206738656 + 1.25 NA intron (NR_104261, intron 9 of 9) intron (NR_104261, intron 9 of 9) -20149 NM_001093730 391475 Hs.640667 NM_001093730 ENSG00000232125 DYTN - dystrotelin protein-coding 206.5 chr1 27164684 27164875 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9654 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 302.5-3 chr10 74684935 74685343 + 1.25 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) intron (NM_001369124, intron 9 of 9) -140116 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 171.25-132 chr5 170727182 170727405 + 1.25 NA intron (NM_001278339, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 -45823 NR_136214 105377716 Hs.570880 NR_136214 ENSG00000253591 LOC105377716 - uncharacterized LOC105377716 ncRNA 219.5-93 chr4 114539008 114539269 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59264 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 235.75-61 chr5 175017467 175017819 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21912 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 119.25-133 chr3 113023970 113024112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4370 NM_001319112 25871 Hs.591288 NM_015412 ENSG00000163608 NEPRO C3orf17|NET17 nucleolus and neural progenitor protein protein-coding 226.75-61 chr5 11675725 11676058 + 1.25 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L1P2|LINE|L1 -86825 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 119-8 chr1 169570500 169570791 + 1.25 NA intron (NM_000130, intron 3 of 24) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 15886 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 180.25-86 chr4 121601454 121601723 + 1.25 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 95392 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 281.75-4 chr1 173012170 173012466 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38645 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 237.25-52 chr4 54281132 54281429 + 1.25 NA intron (NM_001347829, intron 16 of 22) intron (NM_001347829, intron 16 of 22) 47320 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 125.25-95 chr2 29988779 29988941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67274 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 205.25-71 chr3 124709115 124709402 + 1.25 NA intron (NM_007064, intron 24 of 26) HAL1|LINE|L1 -21108 NR_033434 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 166.75-4 chr1 94599455 94599679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 55865 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 178.25-98 chr5 29811962 29812389 + 1.25 NA Intergenic LTR55|LTR|ERVL? -68385 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 274.5-66 chr8 103235922 103236265 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62401 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 270-21 chr18 70847655 70847879 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -196813 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 200-7 chr1 228295239 228295482 + 1.25 NA intron (NM_052843, intron 43 of 80) L2b|LINE|L2 -81696 NR_073154 574407 Hs.650039 NM_001025495 ENSG00000162913 OBSCN-AS1 C1orf145 OBSCN antisense RNA 1 ncRNA 148-130 chr8 117845483 117845648 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 75348 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 186.75-101 chr7 2322086 2322297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7750 NM_013321 29886 Hs.584900 NM_013321 ENSG00000106266 SNX8 Mvp1 sorting nexin 8 protein-coding 223-79 chr8 79325147 79325332 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6949 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 154.75-48 chr16 7682370 7682548 + 1.25 NA intron (NM_145892, intron 11 of 12) intron (NM_145892, intron 11 of 12) 349614 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 133.5-159 chr3 51342266 51342431 + 1.25 NA intron (NM_004947, intron 38 of 52) intron (NM_004947, intron 38 of 52) -42943 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 169.75-18 chr10 74909427 74909683 + 1.25 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) -3231 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 154.75-100 chr3 122070802 122070970 + 1.25 NA intron (NM_001206925, intron 1 of 5) intron (NM_001206925, intron 1 of 5) -6963 NM_006889 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 146.5-171 chr5 61407582 61407752 + 1.25 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) L1ME4b|LINE|L1 75409 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 233.5-112 chr8 133171637 133171979 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19231 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 156.25-90 chr22 28073273 28073497 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -152773 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 145-140 chr6 137500584 137500804 + 1.25 NA Intergenic (ATTTTAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6300 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 344.75-9 chr4 38009407 38009985 + 1.25 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) 49298 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 174-66 chr3 187550614 187550937 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 103729 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 274-19 chr2 37355200 37355509 + 1.25 NA intron (NM_012413, intron 2 of 6) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 10724 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 251-15 chr10 95944703 95945009 + 1.25 NA intron (NM_001349008, intron 9 of 34) intron (NM_001349008, intron 9 of 34) 36891 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 218.25-46 chr2 195982281 195982506 + 1.25 NA intron (NM_018897, intron 15 of 64) L1MA3|LINE|L1 86444 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 261-50 chr6 38533970 38534357 + 1.25 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L1MA3|LINE|L1 52567 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 332.75-9 chr14 59807291 59807643 + 1.25 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 63309 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 213.5-9 chr1 198800715 198800997 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58126 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 143-137 chr7 141445836 141445990 + 1.25 NA intron (NM_001195278, intron 3 of 3) intron (NM_001195278, intron 3 of 3) -105497 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 169-90 chr6 85665795 85665964 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 11489 NR_002743 26799 NR_002743 SNORD50A RNU50|U50 small nucleolar RNA, C/D box 50A snoRNA 176.25-26 chr11 84378769 84378979 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) AluSc|SINE|Alu -61535 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 178.75-26 chr14 24244452 24244686 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -1895 NM_012461 26277 Hs.496191 NM_012461 ENSG00000092330 TINF2 DKCA3|TIN2 TERF1 interacting nuclear factor 2 protein-coding 118.75-138 chr4 97270802 97270913 + 1.25 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -96069 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 181.25-127 chr8 89615422 89615674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 142163 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 189.5-69 chr2 98864380 98864572 + 1.25 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 71749 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 207.75 chr1 36184581 36184887 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 28574 NM_001286365 55700 Hs.356096 NM_018067 ENSG00000116871 MAP7D1 PARCC1|RPRC1 MAP7 domain containing 1 protein-coding 167.75-63 chr18 14009000 14009224 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -93405 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 151.75-107 chr4 172998268 172998440 + 1.25 NA intron (NM_001034845, intron 10 of 12) intron (NM_001034845, intron 10 of 12) -170457 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 338-17 chr2 18509969 18510622 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 50358 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 114.5-133 chr2 56342398 56342566 + 1.25 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -156712 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 405-9 chr2 190328533 190329002 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -8941 NM_198047 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 204-17 chr15 51821343 51821552 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -8206 NM_014547 29766 Hs.4998 NM_014547 ENSG00000138594 TMOD3 UTMOD tropomodulin 3 protein-coding 133.75-3 chr1 60169079 60169274 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95406 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 205-67 chr6 56137632 56138082 + 1.25 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) X8_LINE|LINE|CR1 -46195 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 164-101 chr5 78314094 78314368 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -19476 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 126-65 chr15 85457391 85457500 + 1.25 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 76842 NM_006738 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 118.25-217 chr9 83006101 83006239 + 1.25 NA intron (NM_152573, intron 7 of 16) L2b|LINE|L2 56972 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 158.5-150 chr5 16532787 16532960 + 1.25 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -23875 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 355-5 chr11 9418360 9419002 + 1.25 NA intron (NM_006391, intron 6 of 24) intron (NM_006391, intron 6 of 24) -10085 NR_002962 677808 Hs.689720 NR_002962 ENSG00000201998 SNORA23 ACA23 small nucleolar RNA, H/ACA box 23 snoRNA 293.25-21 chr4 37127103 37127371 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 114754 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 179.25-18 chr10 55905608 55905776 + 1.25 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -277750 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 270.5-8 chr10 22373802 22374096 + 1.25 NA intron (NM_172242, intron 4 of 9) intron (NM_172242, intron 4 of 9) 28453 NM_012443 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 175.25-66 chr2 55191247 55191415 + 1.25 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu -40572 NM_001135592 6233 Hs.311640 NM_002954 ENSG00000143947 RPS27A CEP80|HEL112|S27A|UBA80|UBC|UBCEP1|UBCEP80 ribosomal protein S27a protein-coding 294.75-9 chr18 22462127 22462602 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -44449 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 173.75-37 chr11 105168115 105168322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28449 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 112.75-112 chr2 197409379 197409523 + 1.25 NA intron (NM_012433, intron 7 of 24) AluJr|SINE|Alu 25642 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 271-41 chr5 66171179 66171555 + 1.25 NA intron (NM_139168, intron 10 of 12) intron (NM_139168, intron 10 of 12) 26532 NM_139168 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 254.5-54 chr3 190651702 190652045 + 1.25 NA TTS (NM_001167928) TTS (NM_001167928) 137788 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 231-57 chr4 43291697 43291999 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 200695 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 388-6 chr2 136882543 136882971 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 117212 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 123-72 chr16 57708566 57708753 + 1.25 NA intron (NM_032269, intron 7 of 17) L1ME3A|LINE|L1 13853 NM_001289162 84229 Hs.513635 NM_032269 ENSG00000159625 DRC7 C16orf50|CCDC135|CFAP50|FAP50 dynein regulatory complex subunit 7 protein-coding 356.5-2 chr1 244364749 244365148 + 1.25 NA intron (NM_001276349, intron 2 of 3) LTR47A|LTR|ERVL 12313 NM_001012970 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 155.25-99 chr2 174208442 174208634 + 1.25 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) intron (NM_001011708, intron 3 of 9) 39994 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 147-56 chr17 77817534 77817661 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 66490 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 329-8 chr11 5602604 5603121 + 1.25 NA intron (NM_001198645, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 6225 NM_001198644 117854 Hs.729048 NM_058166 ENSG00000121236 TRIM6 RNF89 tripartite motif containing 6 protein-coding 250.25-20 chr18 7080560 7080801 + 1.25 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) L1ME2z|LINE|L1 37117 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 148.5-27 chr10 62235297 62235530 + 1.25 NA intron (NM_145307, intron 6 of 11) intron (NM_145307, intron 6 of 11) 33431 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 276-26 chr2 60798669 60799025 + 1.25 NA 3' UTR (NM_022894, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_022894, exon 22 of 22) 42579 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 521.25-3 chr7 81613181 81614056 + 1.25 NA intron (NR_126026, intron 2 of 8) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 12598 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 158.5-111 chr2 211616878 211617068 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 19 of 26) intron (NM_001042599, intron 19 of 26) 809387 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 171-62 chr19 55598256 55598501 + 1.25 NA intron (NM_032836, intron 1 of 2) intron (NM_032836, intron 1 of 2) 1139 NM_032836 84922 Hs.515617 NM_032836 ENSG00000179943 FIZ1 ZNF798 FLT3 interacting zinc finger 1 protein-coding 249.75-34 chr2 120489228 120489445 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -22987 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 155.5-15 chr1 171209698 171209861 + 1.25 NA non-coding (NR_160266, exon 8 of 9) non-coding (NR_160266, exon 8 of 9) 24479 NM_001301347 2327 Hs.144912 NM_001460 ENSG00000094963 FMO2 FMO1B1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 2 protein-coding 114-12 chr1 194025182 194025352 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 720522 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 207.5-92 chr5 164466703 164466924 + 1.25 NA intron (NR_105064, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 589 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 217.75-68 chr7 70261646 70261910 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 663303 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 150-7 chr1 92918265 92918500 + 1.25 NA intron (NM_001006605, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu -41232 NM_001252271 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 234.25-53 chr4 97502300 97502634 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 135541 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-55 chr2 18271187 18271411 + 1.25 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 289354 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 266.75-48 chr7 29822204 29822470 + 1.25 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) intron (NM_001080529, intron 1 of 8) 15783 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 139.75-94 chr2 44072922 44073107 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -77025 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 317.5-5 chr14 62718545 62719085 + 1.25 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) L1MB7|LINE|L1 326643 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 266.25 chr1 62405149 62405375 + 1.25 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -31042 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 134.25-39 chr12 126659740 126659913 + 1.25 NA intron (NR_110035, intron 1 of 1) intron (NR_110035, intron 1 of 1) 30492 NR_110034 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 167.25-5 chr1 76078189 76078465 + 1.25 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 3581 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 134.25-154 chr6 13917816 13917967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6555 NM_001165034 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 164-24 chr12 11434357 11434552 + 1.25 NA intron (NR_148969, intron 3 of 4) AluJo|SINE|Alu -38887 NM_006248 653247 Hs.654486 NM_006248 ENSG00000121335 PRB2 IB-9|PRPPRB1|Ps|cP7 proline rich protein BstNI subfamily 2 protein-coding 199.5-100 chr3 20239153 20239335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53011 NM_001012413 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 145.5-81 chr17 71828235 71828411 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 197656 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 199-73 chr5 145496854 145497067 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 338382 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 216.5-50 chr17 71165967 71166332 + 1.25 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 36030 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 449.75-5 chr4 93018669 93019146 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 714508 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 137.25-149 chr7 25550794 25550927 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 112280 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 229-18 chr15 61441557 61441890 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -212421 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 198.5-77 chr2 79915372 79915641 + 1.25 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -48923 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 179.75-105 chr5 95369940 95370182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21305 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 304.25-22 chr4 164057047 164057341 + 1.25 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) MER45C|DNA|hAT-Tip100 140517 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 175.5-25 chr10 97941104 97941280 + 1.25 NA intron (NM_001206528, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 -65295 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 279-36 chr5 54807672 54807923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63539 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 155.75-19 chr10 73828756 73828910 + 1.25 NA intron (NM_001367518, intron 13 of 20) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -17013 NR_160744 8509 Hs.654758 NM_003635 ENSG00000166507 NDST2 HSST2|N-HSST 2|NST2 N-deacetylase and N-sulfotransferase 2 protein-coding 250.5-107 chrX 23832368 23832616 + 1.25 NA TTS (NR_026545) TTS (NR_026545) 49334 NM_002970 6303 Hs.28491 NM_002970 ENSG00000130066 SAT1 DC21|KFSD|KFSDX|SAT|SSAT|SSAT-1 spermidine/spermine N1-acetyltransferase 1 protein-coding 222.75-14 chr10 12736174 12736394 + 1.25 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) intron (NM_001351032, intron 5 of 11) -10931 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 146.75-81 chr2 156066120 156066278 + 1.25 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 188732 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 211-25 chr17 48517744 48517954 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13162 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 254.75-32 chr3 67416192 67416547 + 1.25 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 190905 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 234.25-56 chr5 3869630 3869919 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 273942 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 288.75-32 chr2 173788036 173788534 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 175595 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 119.25-182 chr6 161723792 161724053 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 252945 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 196.75-87 chr5 33031368 33031610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 84046 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 325.25-6 chr14 55334843 55335271 + 1.25 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 62903 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 148.5-71 chr16 10175357 10175536 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) L1ME4a|LINE|L1 6621 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 230-2 chr1 102528949 102529210 + 1.25 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -531845 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 173-101 chr4 185201981 185202194 + 1.25 NA intron (NM_020827, intron 1 of 4) intron (NM_020827, intron 1 of 4) 1913 NM_001292033 57587 Hs.535734 NM_020827 ENSG00000164323 CFAP97 KIAA1430|hmw cilia and flagella associated protein 97 protein-coding 410.75 chr11 32097995 32098496 + 1.25 NA intron (NM_002901, intron 2 of 5) intron (NM_002901, intron 2 of 5) 7171 NM_002901 5954 Hs.97887 NM_002901 ENSG00000049449 RCN1 HEL-S-84|PIG20|RCAL|RCN reticulocalbin 1 protein-coding 212.25-32 chr15 76065837 76066126 + 1.25 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) intron (NM_152335, intron 1 of 10) 5996 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 175.25-79 chr2 210095212 210095441 + 1.25 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) L2c|LINE|L2 65404 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 217-80 chr9 26812438 26812646 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 80260 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 192.5-87 chr22 35499189 35499387 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -41206 NM_001366725 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 228.25-58 chr4 80700458 80700759 + 1.25 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -330100 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 177.75-85 chr2 219958185 219958387 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51721 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 238.75-10 chr11 106731654 106731871 + 1.25 NA intron (NM_000855, intron 6 of 7) L1PREC2|LINE|L1 286714 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 187.75-42 chr17 79851177 79851417 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11857 NM_003655 8535 Hs.405046 NM_003655 ENSG00000141582 CBX4 NBP16|PC2 chromobox 4 protein-coding 236.5-10 chr11 13452009 13452236 + 1.25 NA intron (NM_032320, intron 1 of 8) L1M4a1|LINE|L1 11175 NM_032320 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 179-95 chr9 105005838 105006005 + 1.25 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -77766 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 308-6 chr11 108048808 108049369 + 1.25 NA intron (NM_003478, intron 3 of 18) L1MB7|LINE|L1 40190 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 263-15 chr13 45243544 45243880 + 1.25 NA intron (NM_004128, intron 5 of 7) AluSx1|SINE|Alu -42667 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 282.25-29 chr5 65268782 65269243 + 1.25 NA intron (NR_135689, intron 13 of 25) intron (NR_135689, intron 13 of 25) 212908 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 332-21 chr5 46190626 46190936 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -494401 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 215-50 chr20 40564185 40564418 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 124935 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 216-25 chr16 77866990 77867193 + 1.25 NA intron (NM_020927, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 78527 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 207.5-115 chr8 78108554 78108891 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -407618 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 177.25-21 chr10 97891303 97891519 + 1.25 NA intron (NM_001206528, intron 11 of 14) L2c|LINE|L2 -15514 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 369.25-8 chr3 155683416 155683786 + 1.25 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) intron (NM_001349252, intron 2 of 24) -7258 NM_001130960 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 189.25-130 chr8 125079755 125079948 + 1.25 NA intron (NM_014846, intron 5 of 28) intron (NM_014846, intron 5 of 28) 11941 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 150.75-22 chr10 27448703 27448923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34445 NM_001034842 374308 Hs.631832 NM_001034842 ENSG00000182077 PTCHD3 PTR patched domain containing 3 protein-coding 235.25-32 chr2 51687849 51688080 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1MEg|LINE|L1 655363 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 190.5-125 chr5 92730573 92730866 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 840624 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 137-56 chr16 50761330 50761497 + 1.25 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) L1MB4|LINE|L1 19108 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 193.5-96 chr20 35507018 35507262 + 1.25 NA intron (NM_007186, intron 30 of 34) intron (NM_007186, intron 30 of 34) 22512 NM_001145350 140873 Hs.158680 NM_080828 ENSG00000125975 C20orf173 dJ477O4.4 chromosome 20 open reading frame 173 protein-coding 378.5-7 chr2 40774318 40774681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -262064 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 196.25-68 chr2 122079173 122079467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 323669 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 166.5-194 chr7 84776742 84776951 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 244370 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 133.5-36 chr10 81295153 81295318 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -579959 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 135.75-58 chr14 59525617 59525811 + 1.25 NA intron (NM_001164399, intron 15 of 19) MER2|DNA|TcMar-Tigger 41197 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 213-70 chr4 98069933 98070235 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1PA11|LINE|L1 73392 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 132-104 chr22 41660198 41660421 + 1.25 NA intron (NM_001288976, intron 11 of 12) intron (NM_001288976, intron 11 of 12) 28558 NM_001003796 4809 Hs.182255 NM_005008 ENSG00000100138 SNU13 15.5K|FA-1|FA1|NHP2L1|NHPX|OTK27|SNRNP15-5|SPAG12|SSFA1 small nuclear ribonucleoprotein 13 protein-coding 164-108 chr5 146923784 146923951 + 1.25 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L1PA13|LINE|L1 -4361 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 234.25-24 chr15 58539885 58540235 + 1.25 NA intron (NM_000236, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 -41325 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 130-184 chrX 122975110 122975297 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -209040 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 262.5-71 chr8 36293675 36294019 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -490527 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 396.75 chr20 53236840 53237299 + 1.25 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 51786 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 266.5-83 chrX 113289846 113290172 + 1.25 NA intron (NR_110399, intron 3 of 3) intron (NR_110399, intron 3 of 3) 247282 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 206.25-19 chr10 64989993 64990201 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -65579 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 260.75-3 chr1 214860516 214860760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -144904 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 369-4 chr13 91720546 91720959 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 322131 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 124.5-224 chr8 92343606 92343798 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -240317 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 256.5-65 chr6 53230075 53230445 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -46733 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 208.75-17 chr11 132150614 132150828 + 1.25 NA intron (NM_016522, intron 2 of 6) intron (NM_016522, intron 2 of 6) -133581 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 144.25-93 chr2 43569650 43569846 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 14 of 37) intron (NM_001083953, intron 14 of 37) 26226 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 137.5-128 chr2 133293155 133293320 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) 27042 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 121-144 chr4 96226791 96226935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83840 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 177.25-64 chr18 77932031 77932217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 61603 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 349-8 chr2 105335208 105335596 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2138 NM_001286537 79074 Hs.549577 NM_024093 ENSG00000135974 C2orf49 asw chromosome 2 open reading frame 49 protein-coding 270.5-62 chr8 102838211 102838451 + 1.25 NA intron (NM_001363013, intron 5 of 11) intron (NM_001363013, intron 5 of 11) 25832 NM_148174 51582 Hs.459106 NM_015878 ENSG00000155096 AZIN1 AZI|AZI1|AZIA1|OAZI|OAZIN|ODC1L antizyme inhibitor 1 protein-coding 242.75-60 chr7 26791224 26791509 + 1.25 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu 66357 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 185.25-4 chr1 96112283 96112598 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 120372 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 261.5-69 chr8 135180612 135181098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53276 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 123.5-93 chr2 36487397 36487648 + 1.25 NA intron (NM_016441, intron 7 of 16) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 110646 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 241.5-25 chr14 80894162 80894497 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 8 of 24) Charlie11|DNA|hAT-Charlie 47409 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 250-23 chr2 72181576 72181984 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 19 of 19) intron (NR_135774, intron 19 of 19) -33918 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 276.25-42 chr8 63605506 63605822 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139815 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 280-25 chr19 38024316 38024652 + 1.25 NA intron (NM_015073, intron 1 of 21) intron (NM_015073, intron 1 of 21) 117276 NM_015073 23094 Hs.655502 NM_015073 ENSG00000105738 SIPA1L3 CTRCT45|SPAL3|SPAR3 signal induced proliferation associated 1 like 3 protein-coding 137.5-118 chr2 62302886 62303061 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 87452 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 160.5-191 chr8 111999457 111999606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 622892 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 143.25-193 chr9 35471290 35471471 + 1.25 NA intron (NR_003581, intron 13 of 17) intron (NR_003581, intron 13 of 17) -18731 NM_014806 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 351.5-24 chr5 175674667 175675100 + 1.25 NA intron (NR_160284, intron 1 of 3) intron (NR_160284, intron 1 of 3) 16812 NM_001131055 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 338-14 chr16 10462103 10462478 + 1.25 NA intron (NM_001256160, intron 8 of 11) L1MEg|LINE|L1 65908 NR_149081 106144584 Hs.531561 NR_149081 ENSG00000260468 LINC01290 - long intergenic non-protein coding RNA 1290 ncRNA 156-61 chr17 11399797 11399940 + 1.25 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) intron (NM_001173462, intron 3 of 4) 158445 NM_001173461 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 233-20 chr14 71446979 71447454 + 1.25 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) intron (NM_001284247, intron 1 of 23) 8277 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 377.5-14 chr3 133972994 133973503 + 1.25 NA intron (NM_005630, intron 3 of 13) L1MEd|LINE|L1 -43436 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 224.75-10 chr1 85042740 85043031 + 1.25 NA intron (NM_018298, intron 2 of 12) intron (NM_018298, intron 2 of 12) 5615 NM_018298 55283 Hs.535239 NM_018298 ENSG00000055732 MCOLN3 TRP-ML3|TRPML3 mucolipin 3 protein-coding 300.5-2 chr1 35815799 35816275 + 1.25 NA intron (NM_017629, intron 1 of 17) intron (NM_017629, intron 1 of 17) 8021 NM_017629 192670 Hs.744858 NM_017629 ENSG00000134698 AGO4 EIF2C4 argonaute RISC component 4 protein-coding 276.5-20 chr13 49272761 49273010 + 1.25 NA intron (NR_036439, intron 4 of 8) intron (NR_036439, intron 4 of 8) 24960 NM_030911 81602 Hs.388220 NM_030911 ENSG00000102543 CDADC1 NYD-SP15|bA103J18.1 cytidine and dCMP deaminase domain containing 1 protein-coding 130-126 chr5 41326648 41326819 + 1.25 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 -65264 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 249.75-54 chr4 183528271 183528663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22385 NM_001291959 3622 Hs.107153 NM_001564 ENSG00000168556 ING2 ING1L|p33ING2 inhibitor of growth family member 2 protein-coding 177.25-41 chr13 47404109 47404421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -507189 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 231.5-73 chr4 61084808 61085004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58750 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 178.75-64 chr3 106081455 106081621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -212137 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 145.5-15 chr1 230202441 230202709 + 1.25 NA intron (NM_004481, intron 2 of 15) intron (NM_004481, intron 2 of 15) 135337 NM_004481 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 246.25-13 chr11 106359901 106360351 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108719 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 178-23 chr13 44089435 44089718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20973 NR_104065 101929212 Hs.534877 NR_104064 ENSG00000227258 SMIM2-AS1 C13orf44-AS1|C3orf81-AS1 SMIM2 antisense RNA 1 ncRNA 283-19 chr2 31487380 31487821 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -72858 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 278.75-4 chr11 31304219 31304616 + 1.25 NA intron (NM_181807, intron 6 of 8) intron (NM_181807, intron 6 of 8) 65322 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 252.75-58 chr5 33119755 33120178 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -109769 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 364.75-4 chr15 68105793 68106348 + 1.25 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 51494 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 197-30 chr2 98482125 98482315 + 1.25 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 36210 NM_001351428 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 177.5-106 chr22 20412554 20412758 + 1.25 NA Intergenic LTR31|LTR|ERV1 18505 NM_001256525 7625 Hs.517418 NM_003426 ENSG00000185252 ZNF74 COS52|ZFP520|ZNF520|hZNF7 zinc finger protein 74 protein-coding 154.25-138 chr6 43315454 43315624 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6713 NM_206922 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 155.25-151 chr6 51360858 51360988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -260947 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 161-102 chr5 148572911 148573050 + 1.25 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 64081 NM_001040173 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 284-32 chr3 30829615 30830072 + 1.25 NA intron (NM_207359, intron 11 of 14) L2a|LINE|L2 64818 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 136.5-215 chr8 13478401 13478588 + 1.25 NA intron (NM_024767, intron 2 of 4) intron (NM_024767, intron 2 of 4) 36357 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 186-22 chr13 26936536 26936850 + 1.25 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR -175907 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 236-11 chr11 43198661 43199024 + 1.25 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 70527 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 136.75-28 chr10 62453604 62453815 + 1.25 NA intron (NM_199451, intron 3 of 7) L1PB4|LINE|L1 -66739 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 386.75-5 chr3 136462853 136463306 + 1.25 NA intron (NM_005862, intron 13 of 33) intron (NM_005862, intron 13 of 33) 212739 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 217.5-119 chr7 84837769 84837996 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 284049 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 160.25-151 chr7 49400686 49400930 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -372830 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 115-15 chr10 27636629 27636798 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -107902 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 156-126 chr5 131531825 131532068 + 1.25 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 103283 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 240.5-65 chr3 74080422 74080703 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 271318 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 170.25-81 chr2 223433269 223433499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168977 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 306.25-7 chr1 244977364 244977734 + 1.25 NA intron (NR_026587, intron 1 of 5) intron (NR_026587, intron 1 of 5) -6680 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 290-18 chr15 69688242 69688527 + 1.25 NA intron (NR_126437, intron 5 of 5) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 96184 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 183.5-84 chr21 15677201 15677387 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52640 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 335.5-16 chr8 49332124 49332589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179824 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 117.75-26 chr10 61310019 61310206 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -142527 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 205.25-40 chr17 76086252 76086511 + 1.25 NA intron (NM_001145298, intron 12 of 18) intron (NM_001145298, intron 12 of 18) 7199 NM_180990 353174 Hs.714919 NM_180990 ENSG00000186919 ZACN L2|LGICZ|LGICZ1|ZAC|ZAC1 zinc activated ion channel protein-coding 241.5-79 chr5 12653365 12653676 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 -14339 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 189-88 chr5 20590976 20591185 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15367 NM_001349562 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 261-17 chr15 53556319 53556594 + 1.25 NA intron (NM_182758, intron 18 of 19) intron (NM_182758, intron 18 of 19) -15353 NM_001277176 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 134-135 chr4 87292389 87292552 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 8113 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 135.5-41 chr11 102882516 102882709 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -7630 NM_002426 4321 Hs.1695 NM_002426 ENSG00000262406 MMP12 HME|ME|MME|MMP-12 matrix metallopeptidase 12 protein-coding 229.75-47 chr3 30282851 30283183 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -235851 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 199.25-33 chr15 35757124 35757307 + 1.25 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) -169641 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 140.25-15 chr1 214187214 214187400 + 1.25 NA Intergenic CpG -93852 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 283.5-5 chr1 224870920 224871185 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -58602 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 208.5-6 chr10 7166273 7166527 + 1.25 NA intron (NM_001029880, intron 20 of 20) intron (NM_001029880, intron 20 of 20) 20384 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 145.75-44 chr15 52719826 52719992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41275 NR_104457 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 230.5-102 chr6 77232460 77232745 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 231420 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 135.25-134 chr3 180152672 180152799 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -115798 NM_016559 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 187-39 chr2 24199492 24199762 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 24574 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 359.75-7 chr15 99534580 99535012 + 1.25 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -30621 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 275-38 chr6 27415694 27416142 + 1.25 NA intron (NR_144688, intron 5 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 27200 NM_001076781 346157 Hs.651176 NM_001013719 ENSG00000124613 ZNF391 dJ153G14.3 zinc finger protein 391 protein-coding 165.75-144 chr6 25901311 25901534 + 1.25 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 24457 NM_001286125 10246 Hs.591802 NM_005835 ENSG00000112337 SLC17A2 NPT3 solute carrier family 17 member 2 protein-coding 284.25-15 chr2 60590019 60590346 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36528 NM_022893 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 154.25-43 chr14 28584597 28584763 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 180639 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 205.25-27 chr14 71728186 71728485 + 1.25 NA intron (NM_001354286, intron 20 of 24) intron (NM_001354286, intron 20 of 24) 142037 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 242-49 chr5 120496370 120496718 + 1.25 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) L1MD1|LINE|L1 30913 NM_001308087 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 182.75-27 chr10 59299659 59300025 + 1.25 NA intron (NM_001347852, intron 5 of 12) intron (NM_001347852, intron 5 of 12) 62707 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 174.5-70 chr15 27452326 27452576 + 1.25 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -291132 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 234-42 chr3 177650627 177650876 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 -166114 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 171.25-59 chr17 48231070 48231378 + 1.25 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) MER5B|DNA|hAT-Charlie -63123 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 147-135 chr7 95049416 95049570 + 1.25 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) L1MC1|LINE|L1 139595 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 192.25-9 chr10 11042774 11043007 + 1.25 NA intron (NM_001326345, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 24134 NM_001326345 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 379.5-14 chr3 189621817 189622397 + 1.25 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) intron (NM_001329964, intron 1 of 13) -9282 NM_001329144 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 264.5-12 chr11 19973286 19973581 + 1.25 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) intron (NM_182964, intron 10 of 37) -49123 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 282.25-34 chr7 4451013 4451455 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -231061 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 262.25-10 chr11 29463027 29463409 + 1.25 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 -131195 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 219.75-87 chr8 101144959 101145183 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 60602 NM_016096 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 173.75-90 chr2 136360856 136361029 + 1.25 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -242787 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 133.5-254 chr8 3688461 3688622 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 7 of 69) intron (NM_033225, intron 7 of 69) -960090 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 281.5-10 chr10 96104567 96104937 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -14517 NR_134320 728558 Hs.538374 NR_038444 ENSG00000226688 ENTPD1-AS1 - ENTPD1 antisense RNA 1 ncRNA 149.75-81 chr2 56625639 56625820 + 1.25 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -439959 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 162.75-49 chr17 59503792 59504015 + 1.25 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 22954 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 120-196 chr8 140323285 140323580 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) MER21B|LTR|ERVL 134312 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 353-4 chr14 62636098 62636599 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 409110 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 270.75-52 chr9 36403074 36403472 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2075 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 117-67 chr15 73123618 73123752 + 1.25 NA intron (NM_002499, intron 3 of 28) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 71201 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 155.25-157 chr6 129800472 129800665 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 60747 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 185-67 chr5 56335054 56335277 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -101835 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 148.75-104 chr22 26205007 26205161 + 1.25 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 35610 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 210.5-136 chr8 129094532 129094876 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -128703 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 289-41 chr6 122576728 122577073 + 1.25 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) intron (NM_001270393, intron 3 of 7) -33332 NM_032471 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 279.5-8 chr10 63776793 63777218 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -255115 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 193.75-60 chr2 30192968 30193251 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5675 NR_145719 109616960 NR_145719 ENSG00000207187 SNORA10B - small nucleolar RNA, H/ACA box 10B snoRNA 183-8 chr10 52853414 52853631 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -81822 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 273.75-35 chr5 92027179 92027545 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -644045 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 250.75-6 chr11 108668794 108669092 + 1.25 NA intron (NM_004398, intron 1 of 17) intron (NM_004398, intron 1 of 17) 3874 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 253-20 chr16 64557675 64557956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 564248 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 199.75-25 chr14 47515939 47516302 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 158834 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 159.75-69 chr2 16200440 16200682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 150134 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 326.5-33 chr9 113288717 113289222 + 1.25 NA intron (NR_136266, intron 10 of 13) L1ME2|LINE|L1 9896 NM_001371234 254 chr1 23705486 23705719 + 1.25 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 13796 NM_000975 6135 Hs.719951 NM_000975 ENSG00000142676 RPL11 DBA7|GIG34|L11|uL5 ribosomal protein L11 protein-coding 145.75-133 chr5 166063461 166063594 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 862843 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 220.5-93 chr4 161266933 161267129 + 1.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -755702 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 412.5 chr1 179030929 179031347 + 1.25 NA intron (NM_001324311, intron 1 of 7) intron (NM_001324311, intron 1 of 7) 5014 NM_001324311 9917 Hs.5737 NM_014864 ENSG00000116199 FAM20B gxk1 FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase protein-coding 243-60 chr5 152040922 152041269 + 1.25 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) L1ME3F|LINE|L1 82197 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 234.25-60 chr5 117147611 117147999 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -267707 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 213.5-22 chr11 10548366 10548615 + 1.25 NA intron (NR_034094, intron 1 of 2) intron (NR_034094, intron 1 of 2) 7254 NR_034093 100129827 Hs.246769 NR_034093 ENSG00000177112 MRVI1-AS1 - MRVI1 antisense RNA 1 ncRNA 440.75-3 chr3 56866750 56867190 + 1.25 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) intron (NM_001128615, intron 4 of 12) 49466 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 179-39 chr15 74427003 74427397 + 1.25 NA intron (NM_001146029, intron 1 of 12) intron (NM_001146029, intron 1 of 12) 6504 NM_001146030 8482 Hs.24640 NM_003612 ENSG00000138623 SEMA7A CD108|CDw108|H-SEMA-K1|H-Sema-L|JMH|SEMAK1|SEMAL semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group) protein-coding 263-34 chr3 52967597 52968186 + 1.25 NA intron (NM_016329, intron 2 of 20) L1MD2|LINE|L1 -70343 NM_198563 375346 Hs.744189 NM_198563 ENSG00000213533 STIMATE TMEM110 STIM activating enhancer protein-coding 223.75-8 chr11 46125757 46126103 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4945 NM_001352025 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 259.25-26 chr3 10905783 10906145 + 1.25 NA intron (NM_014229, intron 6 of 13) L2b|LINE|L2 -86770 NM_001348253 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 192.75-103 chr4 157339292 157339499 + 1.25 NA intron (NM_001083620, intron 11 of 15) intron (NM_001083620, intron 11 of 15) 118667 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 121.25-99 chr2 171978676 171978835 + 1.25 NA intron (NR_027862, intron 8 of 9) intron (NR_027862, intron 8 of 9) -21198 NM_199227 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 271.5-7 chr1 185492333 185492823 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 135910 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 216.75-61 chr5 37604318 37604642 + 1.25 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 225162 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 135-146 chr5 118780157 118780284 + 1.25 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 184032 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 228-23 chr12 78139909 78140197 + 1.25 NA intron (NM_001024383, intron 19 of 39) intron (NM_001024383, intron 19 of 39) 219693 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 410.75-3 chr2 25748777 25749544 + 1.25 NA intron (NM_001369346, intron 10 of 10) intron (NM_001369346, intron 10 of 10) 45531 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 192.25-50 chr2 54374450 54374721 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43701 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 190.25-109 chr6 130510644 130510809 + 1.25 NA Intergenic LTR1F2|LTR|ERV1 73609 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 265.75-68 chr7 52040962 52041289 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -647869 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 175.75-30 chr12 113419376 113419699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2843 NM_001304993 113675 Hs.337594 NM_138432 ENSG00000139410 SDSL SDH 2|SDS-RS1|TDH|cSDH serine dehydratase like protein-coding 281.5-32 chr2 227520117 227520638 + 1.25 NA intron (NM_004504, intron 3 of 12) intron (NM_004504, intron 3 of 12) 48205 NM_001135188 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 325.5-32 chr5 154828535 154829052 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_039667) promoter-TSS (NR_039667) -665 NR_039667 100616306 NR_039667 ENSG00000263361 MIR378H - microRNA 378h ncRNA 276-3 chr1 95508784 95509122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1163 NR_110622 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 166-38 chr15 61352297 61352550 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -123121 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 239.25-54 chr20 42392321 42392781 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) intron (NM_133170, intron 9 of 31) -292932 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 327.75-7 chr11 68582882 68583306 + 1.25 NA non-coding (NR_147966, exon 16 of 26) non-coding (NR_147966, exon 16 of 26) -101450 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 166-86 chr3 187485873 187486054 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 38917 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 412.25-8 chr2 57440438 57441385 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -466740 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 262.25-18 chr16 48151697 48151934 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5045 NM_033226 94160 Hs.410111 NM_033226 ENSG00000140798 ABCC12 MRP9 ATP binding cassette subfamily C member 12 protein-coding 214-5 chr1 188983313 188983493 + 1.25 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 1492607 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 122.75-108 chr20 35047993 35048144 + 1.25 NA intron (NM_199368, intron 6 of 18) L1ME3F|LINE|L1 44739 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 164-65 chr20 55687767 55687951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -260662 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 210.75-6 chr1 159366283 159366585 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31031 NM_001363557 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 344.5-26 chr6 63517204 63517589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54616 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 210.5-64 chr2 99978877 99979050 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 126620 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 227.75-54 chr3 192366532 192366760 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L3b|LINE|CR1 42403 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 113.75-167 chr6 89825816 89825917 + 1.25 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 -4034 NM_012115 9994 Hs.558218 NM_012115 ENSG00000118412 CASP8AP2 CED-4|FLASH|RIP25 caspase 8 associated protein 2 protein-coding 148.75-27 chr10 105558038 105558400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 262114 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 187.75-2 chr1 55217294 55217568 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_146283) promoter-TSS (NR_146283) -430 NR_146283 109729135 Hs.122852 NR_146283 ENSG00000231090 MIR4422HG - MIR4422 host gene ncRNA 173-73 chr2 200150429 200150638 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -155346 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 238.25-24 chr17 55271260 55271602 + 1.25 NA intron (NM_001330375, intron 2 of 3) intron (NM_001330375, intron 2 of 3) 5209 NM_001330375 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 133.75-203 chr9 85550290 85550575 + 1.25 NA intron (NM_015239, intron 25 of 25) intron (NM_015239, intron 25 of 25) 191597 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 148.75-28 chr10 106561354 106561538 + 1.25 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 421281 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 317.75 chr1 35846742 35847171 + 1.25 NA intron (NR_146062, intron 15 of 19) FLAM_A|SINE|Alu -22852 NM_001317123 26523 Hs.22867 NM_012199 ENSG00000092847 AGO1 EIF2C|EIF2C1|GERP95|Q99|hAgo1 argonaute RISC component 1 protein-coding 315-22 chr6 140827324 140827705 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 143700 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 210.75-8 chr1 188300508 188300738 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 856995 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 128-169 chr8 138490603 138490709 + 1.25 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 6605 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 251.75-35 chr2 54187976 54188297 + 1.25 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 64853 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 221.5-109 chr9 97364796 97365091 + 1.25 NA intron (NM_020893, intron 29 of 36) L2b|LINE|L2 -1262 NR_031637 100302223 NR_031637 ENSG00000221269 MIR1302-8 MIRN1302-8|hsa-mir-1302-8 microRNA 1302-8 ncRNA 228.25-52 chr4 2962086 2962339 + 1.25 NA intron (NM_001291979, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 1194 NM_001291979 8602 Hs.627133 NM_003703 ENSG00000087269 NOP14 C4orf9|NOL14|RES4-25|RES425|UTP2 NOP14 nucleolar protein protein-coding 142-49 chr14 55564937 55565148 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 15050 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 132.25-108 chr2 213909893 213910037 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 10 of 14) intron (NR_047660, intron 10 of 14) 151898 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 142-87 chr2 104503676 104503837 + 1.25 NA intron (NR_110113, intron 2 of 5) intron (NR_110113, intron 2 of 5) 6753 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 306-42 chrX 152003654 152003929 + 1.25 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -29115 NM_004961 2564 Hs.22785 NM_004961 ENSG00000102287 GABRE - gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit protein-coding 277-29 chr5 109204318 109204647 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 121887 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 143.5-48 chr12 131703435 131703615 + 1.25 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -7565 NM_004592 6433 Hs.308171 NM_004592 ENSG00000061936 SFSWAP SFRS8|SWAP splicing factor SWAP protein-coding 305.75-3 chr11 80457291 80457589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 305363 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 293.5-10 chr12 112026013 112026461 + 1.25 NA TTS (NM_024953) TTS (NM_024953) 11478 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 187.5-75 chr18 7356017 7356350 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104823 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 202.25-79 chr6 142690593 142690827 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -52821 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 225.75-65 chr5 103952186 103952478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -389543 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 174.25-48 chr14 45744242 45744490 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28764 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 273.25-31 chr5 136163142 136163492 + 1.25 NA exon (NM_005903, exon 5 of 8) exon (NM_005903, exon 5 of 8) -28427 NR_026763 9597 Hs.59666 NM_022001 ENSG00000164621 SMAD5-AS1 DAMS|SMAD5AS|SMAD5OS SMAD5 antisense RNA 1 ncRNA 223.25-76 chr8 85614801 85615070 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40741 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 175.75-118 chr7 21997004 21997260 + 1.25 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -51233 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 154.25-105 chr3 65958000 65958174 + 1.25 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -3529 NR_145422 151877 Hs.476636 NR_145422 ENSG00000272610 MAGI1-IT1 - MAGI1 intronic transcript 1 ncRNA 276.5-15 chr11 95240709 95240987 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8373 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 534-4 chr17 53305387 53306199 + 1.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 320288 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 283-4 chr1 73812228 73812477 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137673 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 193.75-56 chr17 74077095 74077272 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -126495 NM_000999 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 201.75-38 chr16 9509049 9509315 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -53677 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 162.5-78 chr2 17976371 17976525 + 1.25 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 97781 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 146-47 chr15 97765870 97766020 + 1.25 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 108484 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 200.75-96 chr7 21055995 21056228 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 220680 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 269.25-5 chr10 55893578 55893859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -265776 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 274.25-33 chr3 181446429 181446766 + 1.25 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -4111 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 304.75-13 chr17 30428541 30428869 + 1.25 NA intron (NM_001304, intron 7 of 20) L1MB8|LINE|L1 48227 NM_001199775 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 199.25-79 chr5 50935199 50935542 + 1.25 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 34817 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 184-36 chr17 33148059 33148342 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 144788 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 201-61 chr4 146676651 146676837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37851 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 127.75-120 chr20 52929338 52929538 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42920 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 153.25-87 chr3 22465677 22465816 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 508607 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 271-13 chr15 96092030 96092290 + 1.25 NA intron (NR_158193, intron 6 of 7) intron (NR_158193, intron 6 of 7) 35681 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 149-142 chr9 99507372 99507684 + 1.25 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -132271 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 310-17 chr3 128609004 128609313 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33072 NR_125802 23434 Hs.194283 NM_007354 ENSG00000198685 LINC01565 C3orf27|GR6 long intergenic non-protein coding RNA 1565 ncRNA 243.25-14 chr15 82186553 82186847 + 1.25 NA intron (NM_001040610, intron 13 of 17) intron (NM_001040610, intron 13 of 17) 75828 NM_001322845 79631 Hs.459114 NM_024580 ENSG00000140598 EFL1 EFTUD1|FAM42A|HsT19294|RIA1|SDS2 elongation factor like GTPase 1 protein-coding 175.75-69 chr2 77999314 77999492 + 1.25 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1ME2|LINE|L1 -44377 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 198.25-38 chr16 9314648 9314873 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40828 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 296.75-12 chr15 63004222 63004495 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38389 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 226.5-103 chr8 116885685 116885962 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -10957 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 205.25-68 chr3 64365684 64365868 + 1.25 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -97603 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 231.75-9 chr10 89066822 89067230 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3615 NR_039827 100616192 NR_039827 ENSG00000265375 MIR4679-2 - microRNA 4679-2 ncRNA 252.25-35 chr2 167942714 167943065 + 1.25 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -1745 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 142.25-20 chr10 65014347 65014547 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -89929 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 166.75-106 chr4 102313643 102313829 + 1.25 NA intron (NM_022154, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 10576 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 312.75-8 chr14 40241745 40242009 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -712834 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 262.75-22 chr18 1708113 1708499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -348677 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 218.5-42 chr16 6343407 6343675 + 1.25 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) (TTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 323838 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 233.75-59 chr5 6428283 6428503 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20466 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 238.75-38 chr3 171738085 171738302 + 1.25 NA intron (NM_002662, intron 1 of 26) intron (NM_002662, intron 1 of 26) 72290 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 202-67 chr7 95127520 95127749 + 1.25 NA intron (NM_017650, intron 4 of 15) L1PA16|LINE|L1 196898 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 191-74 chr7 43645303 43645536 + 1.25 NA intron (NM_018224, intron 3 of 5) intron (NM_018224, intron 3 of 5) 62311 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 208.75-29 chr15 72049509 72049824 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) MER1B|DNA|hAT-Charlie -64592 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 191.75-80 chr3 56357999 56358334 + 1.25 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) MIRb|SINE|MIR 110301 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 366-7 chr12 64333355 64333831 + 1.25 NA intron (NM_001099676, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 57165 NM_001099676 115749 Hs.535190 NM_001099676 ENSG00000185306 C12orf56 - chromosome 12 open reading frame 56 protein-coding 175.5-98 chr2 194145283 194145460 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -198898 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 136.25-143 chr5 25697824 25697995 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 506956 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 175.5-157 chr8 53516717 53516923 + 1.25 NA non-coding (NR_149032, exon 2 of 2) non-coding (NR_149032, exon 2 of 2) 7145 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 137.75-66 chr15 23580083 23580199 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 14467 NM_005664 7681 Hs.72964 NM_005664 ENSG00000179455 MKRN3 CPPB2|D15S9|RNF63|ZFP127|ZNF127 makorin ring finger protein 3 protein-coding 274.25-16 chr13 19698813 19699172 + 1.25 NA intron (NR_044998, intron 6 of 7) intron (NR_044998, intron 6 of 7) 65333 NM_017520 54737 Hs.269654 NM_017520 ENSG00000196199 MPHOSPH8 HSMPP8|TWA3|mpp8 M-phase phosphoprotein 8 protein-coding 158.25-153 chr9 14696573 14696756 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3118 NR_148714 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 225.75-43 chr2 151444543 151444846 + 1.25 NA intron (NM_001177665, intron 17 of 33) intron (NM_001177665, intron 17 of 33) 34792 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 178.75-100 chr7 95673130 95673378 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -76738 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 143.75-108 chr22 47779310 47779504 + 1.25 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 147733 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 277-28 chr5 67311924 67312379 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -115352 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 219.5-16 chr10 62533714 62534032 + 1.25 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 13425 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 185-52 chr22 40282508 40282722 + 1.25 NA intron (NM_001162501, intron 11 of 22) intron (NM_001162501, intron 11 of 22) -63885 NM_000026 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 136.25-22 chr10 85526768 85526956 + 1.25 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -50869 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 317.5-34 chr8 86037630 86038119 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 31794 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 262.25-28 chr22 26158706 26158994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10612 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 187-35 chr18 61349812 61350149 + 1.25 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 16550 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 294.25-19 chr2 20611979 20612548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19715 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 262.5-39 chr2 147619390 147619647 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224999 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 241.25-51 chr4 91843880 91844220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 433252 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 260.75-16 chr15 89473044 89473404 + 1.25 NA intron (NM_001321041, intron 9 of 10) L2b|LINE|L2 23359 NR_110261 51458 Hs.459284 NM_016321 ENSG00000140519 RHCG C15orf6|PDRC2|RHGK|SLC42A3 Rh family C glycoprotein protein-coding 165-16 chr10 86383942 86384173 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -17262 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 178-38 chr18 60607340 60607539 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -234664 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 340-16 chr5 149678474 149678885 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51631 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 148.5-207 chr7 29488935 29489232 + 1.25 NA intron (NM_001293081, intron 1 of 6) intron (NM_001293081, intron 1 of 6) 5267 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 221.75-45 chr3 153176649 153176896 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 14546 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 270.25-6 chr1 217941244 217941574 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 48509 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 179.25-142 chr8 69627304 69627493 + 1.25 NA intron (NR_156414, intron 15 of 20) intron (NR_156414, intron 15 of 20) 34498 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 207.75-65 chr20 50271156 50271419 + 1.25 NA intron (NM_001278655, intron 1 of 3) intron (NM_001278655, intron 1 of 3) 3801 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 156-133 chr6 119366761 119366922 + 1.25 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -17080 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 253.75-49 chr5 104259916 104260339 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -697338 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 203.25-15 chr10 65322678 65322886 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -248643 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 252.5-14 chr10 110290029 110290287 + 1.25 NA TTS (NM_005871) TTS (NM_005871) 14762 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 313-9 chr14 55843508 55844036 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -47098 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 224-63 chr8 114757135 114757487 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 910702 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 248.5-72 chr4 60250225 60250610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -672202 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 165.25-77 chr20 34920168 34920397 + 1.25 NA intron (NM_001076552, intron 9 of 18) intron (NM_001076552, intron 9 of 18) 35353 NM_001322495 2937 Hs.82327 NM_000178 ENSG00000100983 GSS GSHS|HEL-S-64p|HEL-S-88n glutathione synthetase protein-coding 158.5-83 chr18 2141069 2141265 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 430338 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 195.25-88 chr8 24991316 24991497 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -34537 NM_006158 4747 Hs.521461 NM_006158 ENSG00000277586 NEFL CMT1F|CMT2E|CMTDIG|NF-L|NF68|NFL|PPP1R110 neurofilament light protein-coding 172-19 chr11 66067448 66067680 + 1.25 NA intron (NM_006842, intron 19 of 21) intron (NM_006842, intron 19 of 21) -2708 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 152.75-111 chr3 148968905 148969175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22368 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 138.75-115 chr3 5879206 5879404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -629050 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 183.5-95 chr3 178943544 178943837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83285 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 180.25-11 chr11 71916262 71916479 + 1.25 NA intron (NR_029192, intron 5 of 6) intron (NR_029192, intron 5 of 6) 12077 NR_029192 100133315 Hs.150324 NR_029192 LOC100133315 - transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2-like pseudo 156.5-86 chr2 142446537 142446815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -314975 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 283.25-32 chr4 31440545 31440990 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65777 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 376.25-18 chr9 27916473 27917158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -342949 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 215-82 chr9 114142514 114142828 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12866 NM_032888 85301 Hs.494892 NM_032161 ENSG00000196739 COL27A1 STLS collagen type XXVII alpha 1 chain protein-coding 279.5-19 chr14 70360496 70360853 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001204090) promoter-TSS (NM_001204090) -991 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 366.25-4 chr11 54877320 54877761 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 170708 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 305.25-17 chr15 85340764 85341165 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39632 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 244.5-24 chr12 107056227 107056791 + 1.25 NA intron (NM_004075, intron 1 of 12) MER30|DNA|hAT-Charlie 37040 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 245.5-83 chr8 135806165 135806437 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 348845 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 181-44 chr18 54651728 54651963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60686 NM_173629 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 254.5-77 chr8 85045007 85045419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62025 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 200.5-38 chr14 62925602 62925839 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 119738 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 280-57 chr7 36981369 36981829 + 1.25 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 3513 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 225-23 chr12 55956378 55956657 + 1.25 NA intron (NM_001200053, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR 9545 NM_001320122 6490 Hs.95972 NM_006928 ENSG00000185664 PMEL D12S53E|ME20|ME20-M|ME20M|P1|P100|PMEL17|SI|SIL|SILV|gp100 premelanosome protein protein-coding 165.75-152 chr7 4965702 4965963 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6645 NM_198403 221938 Hs.558694 NM_198403 ENSG00000136297 MMD2 PAQR10 monocyte to macrophage differentiation associated 2 protein-coding 204.75-85 chr4 91651741 91652032 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 625416 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 184.25-111 chr6 155178760 155179034 + 1.25 NA intron (NM_012454, intron 9 of 25) intron (NM_012454, intron 9 of 25) -38069 NM_001010927 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 136.5-36 chr11 10695920 10696189 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -2066 NM_130385 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 172-48 chr19 41196056 41196254 + 1.25 NA intron (NM_030622, intron 2 of 8) L2b|LINE|L2 2936 NM_030622 29785 Hs.98370 NM_030622 ENSG00000167600 CYP2S1 CYPIIS1 cytochrome P450 family 2 subfamily S member 1 protein-coding 309.25-30 chrX 45731479 45731831 + 1.25 NA non-coding (NR_102268, exon 1 of 1) non-coding (NR_102268, exon 1 of 1) 567 NR_102268 392452 Hs.745266 NR_102268 LOC392452 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 194-24 chr11 31121836 31122021 + 1.25 NA intron (NM_001367979, intron 11 of 38) intron (NM_001367979, intron 11 of 38) -129242 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 227-54 chr5 155829424 155829661 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -497215 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 303.5-29 chr3 34911136 34911415 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 482748 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 143.5-204 chr8 26975853 26976010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73032 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 164-133 chr8 30348292 30348457 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -36127 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 247-26 chr18 6769602 6769870 + 1.25 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -39874 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 246.25-11 chr11 86301802 86302034 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_016401) promoter-TSS (NM_016401) -322 NM_001322404 51501 Hs.283322 NM_016401 ENSG00000149196 HIKESHI C11orf73|HLD13|HSPC138|HSPC179|L7RN6|OPI10 heat shock protein nuclear import factor hikeshi protein-coding 119-185 chr7 68450524 68450687 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 430352 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 212.25-108 chrX 108092423 108092648 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_170750) promoter-TSS (NM_170750) 757 NM_052936 115201 Hs.8763 NM_052936 ENSG00000101844 ATG4A APG4A|AUTL2 autophagy related 4A cysteine peptidase protein-coding 155.5-117 chr22 29263804 29264034 + 1.25 NA exon (NM_012265, exon 4 of 7) exon (NM_012265, exon 4 of 7) 4062 NR_138044 25807 Hs.106730 NM_012265 ENSG00000100263 RHBDD3 C22orf3|HS984G1A|PTAG rhomboid domain containing 3 protein-coding 296.5-39 chr7 121599199 121599508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -202985 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 240.75-52 chr3 47243087 47243508 + 1.25 NA non-coding (NR_033373, exon 7 of 7) non-coding (NR_033373, exon 7 of 7) 7312 NR_145712 109617025 NR_145712 SNORD13J - small nucleolar RNA, C/D box 13J snoRNA 412.25-3 chr10 64431457 64432161 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -393719 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 196.5-133 chr5 125216721 125217045 + 1.25 NA intron (NR_109882, intron 4 of 5) L1MB2|LINE|L1 180052 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 131 chr1 45864503 45864829 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001324321, exon 1 of 29) 5' UTR (NM_001324321, exon 1 of 29) 318 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 234.25-51 chr4 69027507 69027884 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7299 NM_001144767 7365 Hs.201634 NM_001075 ENSG00000109181 UGT2B10 UDPGT2B10 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B10 protein-coding 146.75-119 chr5 20397530 20397697 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 92062 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 312.25-12 chr2 6111152 6111445 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129320 NR_026833 400940 Hs.378814 NM_207479 LOC400940 - uncharacterized LOC400940 ncRNA 284-26 chr2 78817921 78818460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -207512 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 182.25-116 chr7 158773191 158773478 + 1.25 NA intron (NM_020728, intron 7 of 21) intron (NM_020728, intron 7 of 21) 56175 NM_001367773 57488 Hs.490795 NM_020728 ENSG00000117868 ESYT2 CHR2SYT|E-Syt2|FAM62B extended synaptotagmin 2 protein-coding 231.75-45 chr22 32450885 32451215 + 1.25 NA intron (NM_174932, intron 2 of 14) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 6336 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 237.5-2 chr1 43821107 43821419 + 1.25 NA intron (NM_001270460, intron 4 of 10) intron (NM_001270460, intron 4 of 10) -17359 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 201.75-16 chr10 130549745 130550021 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 412785 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 282-35 chr3 5203622 5203915 + 1.25 NA intron (NM_014674, intron 5 of 11) AluJb|SINE|Alu 16061 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 203-91 chr6 126707258 126707613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 222804 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 243-48 chr3 87317689 87318137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41329 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 273.25-11 chr12 9753208 9753512 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001781, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001781, exon 5 of 5) 7541 NM_001781 969 Hs.208854 NM_001781 ENSG00000110848 CD69 AIM|BL-AC/P26|CLEC2C|EA1|GP32/28|MLR-3 CD69 molecule protein-coding 230.25-18 chr11 85673215 85673486 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -8221 NR_028025 58487 Hs.535319 NM_021212 ENSG00000137504 CREBZF SMILE|ZF CREB/ATF bZIP transcription factor protein-coding 315.25-14 chr19 27680009 27680354 + 1.25 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -113250 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 184.75-43 chr19 38265712 38265992 + 1.25 NA intron (NM_001166103, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 1279 NM_021102 10653 Hs.31439 NM_021102 ENSG00000167642 SPINT2 DIAR3|HAI-2|HAI2|Kop|PB serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2 protein-coding 135.25-103 chr2 142878520 142878671 + 1.25 NA intron (NM_001032998, intron 1 of 11) intron (NM_001032998, intron 1 of 11) 931 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 206.75-76 chr6 25832156 25832534 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_005074) promoter-TSS (NM_005074) -293 NM_005074 6568 Hs.205816 NM_005074 ENSG00000124568 SLC17A1 NAPI-1|NPT-1|NPT1 solute carrier family 17 member 1 protein-coding 188.75-92 chr5 111345637 111345823 + 1.25 NA intron (NM_001323376, intron 2 of 8) intron (NM_001323376, intron 2 of 8) 121346 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 224.25-73 chr4 154316861 154317121 + 1.25 NA intron (NM_001358235, intron 9 of 19) intron (NM_001358235, intron 9 of 19) 174808 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 240.75-53 chr3 89099076 89099340 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8413 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 221-51 chr3 122929608 122929933 + 1.25 NA intron (NR_046079, intron 5 of 22) intron (NR_046079, intron 5 of 22) 43257 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 131.25-173 chr6 48456264 48456459 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -387672 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 225.25-94 chrX 151942290 151942574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16226 NR_029638 407009 NR_029638 ENSG00000284363 MIR224 MIRN224|miRNA224 microRNA 224 ncRNA 306 chr1 190923602 190924118 + 1.25 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR 298970 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 281-4 chr1 248318921 248319272 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 5472 NM_001004691 391196 Hs.530570 NM_001004691 ENSG00000177186 OR2M7 OR1-58 olfactory receptor family 2 subfamily M member 7 protein-coding 198.75-18 chr12 39085178 39085446 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -179721 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 319-29 chr4 113218103 113218405 + 1.25 NA intron (NM_001354275, intron 5 of 43) intron (NM_001354275, intron 5 of 43) 65972 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 365.5-14 chr5 128582565 128583198 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -44636 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 219-67 chr3 35376603 35376999 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 17222 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 219.5-23 chr11 100773443 100773622 + 1.25 NA intron (NM_001367945, intron 2 of 25) intron (NM_001367945, intron 2 of 25) -85577 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 238.5 chr1 40326586 40326917 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -9465 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 270-44 chr5 24745420 24745795 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94976 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 196.5-85 chr2 126414728 126414985 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -241079 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 218.75-10 chr10 98163604 98163830 + 1.25 NA intron (NM_001256621, intron 3 of 7) intron (NM_001256621, intron 3 of 7) 29060 NM_001351016 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 266.25-40 chr6 90235134 90235549 + 1.25 NA intron (NM_001170794, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 61502 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 343-16 chr2 109630823 109631118 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 16606 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 227.5-63 chr21 28844668 28844998 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 40534 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 221.25-74 chr5 168248998 168249325 + 1.25 NA intron (NM_001368145, intron 25 of 26) intron (NM_001368145, intron 25 of 26) -16789 NR_109894 101927862 Hs.659376 NR_109894 ENSG00000253978 CTB-178M22.2 - uncharacterized LOC101927862 ncRNA 281.75-21 chr17 20126361 20126634 + 1.25 NA intron (NM_001033553, intron 3 of 14) intron (NM_001033553, intron 3 of 14) -29575 NM_001033554 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 228.75-49 chr21 23054351 23054741 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -24738 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 246.25-48 chr4 31187726 31188024 + 1.25 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 16731 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 211.75-87 chr6 109147323 109147530 + 1.25 NA intron (NM_001350663, intron 2 of 9) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 18122 NM_173830 285753 Hs.632616 NM_173830 ENSG00000183137 CEP57L1 C6orf182|bA487F23.2|cep57R centrosomal protein 57 like 1 protein-coding 259.25-8 chr12 22295106 22295454 + 1.25 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) MER34|LTR|ERV1 39434 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 195.75-128 chr9 91296092 91296337 + 1.25 NA intron (NM_001698, intron 5 of 9) intron (NM_001698, intron 5 of 9) 65710 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 139.5-51 chr12 105278252 105278418 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -42105 NM_001251904 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 197-21 chr15 78538235 78538654 + 1.25 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -1961 NM_001330673 5685 Hs.251531 NM_002789 ENSG00000041357 PSMA4 HC9|HsT17706|PSC9 proteasome subunit alpha 4 protein-coding 160.75-47 chr14 87634182 87634378 + 1.25 NA TTS (NR_146551) TTS (NR_146551) 21014 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 287.25-5 chr1 189498463 189498777 + 1.25 NA Intergenic (TGTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 977390 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 143.5-75 chr15 35200346 35200485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36911 NR_003144 723972 Hs.631698 NR_003144 ENSG00000259516 ANP32AP1 - acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A pseudogene 1 pseudo 260.5-32 chr2 116692627 116692856 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1121950 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 281.5-45 chr5 148796986 148797465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29368 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 214-54 chr5 171679963 171680210 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105786 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 172.5-34 chr10 116026005 116026153 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 168710 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 252.5-12 chr10 77364931 77365180 + 1.25 NA intron (NR_126365, intron 3 of 5) intron (NR_126365, intron 3 of 5) 14183 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 237.5-9 chr1 207880988 207881298 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001025109, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001025109, exon 8 of 8) 29982 NM_001025109 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 132.25-188 chr8 142932365 142932549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14614 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 347.25-3 chr14 42812651 42813130 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 1206034 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 253-16 chr14 87987876 87988188 + 1.25 NA intron (NM_000153, intron 3 of 16) intron (NM_000153, intron 3 of 16) 5150 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 212.25-26 chr14 64426031 64426303 + 1.25 NA exon (NM_001364837, exon 11 of 27) exon (NM_001364837, exon 11 of 27) 37814 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 321.5-18 chr2 79397618 79398012 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 103029 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 289.75-8 chr12 25088687 25089011 + 1.25 NA intron (NR_159367, intron 10 of 19) MIR|SINE|MIR 36143 NM_001204126 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 284.75-15 chr18 29814038 29814452 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -484665 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 198.5-19 chr10 70306815 70306997 + 1.25 NA intron (NM_018205, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 -22902 NM_022146 64106 Hs.302026 NM_022146 ENSG00000148734 NPFFR1 GPR147|NPFF1|NPFF1R1|OT7T022 neuropeptide FF receptor 1 protein-coding 299.5-43 chr8 30163202 30163554 + 1.25 NA intron (NM_006571, intron 1 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 7009 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 131.5-213 chr7 18267726 18267896 + 1.25 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) L1MA8|LINE|L1 -22281 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 155.5-4 chr1 31599829 31600093 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -17739 NM_001525 3061 Hs.388226 NM_001525 ENSG00000121764 HCRTR1 OX1R hypocretin receptor 1 protein-coding 217.25-43 chr2 130934062 130934382 + 1.25 NA intron (NM_001367493, intron 3 of 13) L1MB5|LINE|L1 97308 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 343.25-15 chr6 52933006 52933401 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23505 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 200.5-109 chr5 22611565 22611741 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 241691 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 156.75-82 chr2 40415200 40415426 + 1.25 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 14991 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 148.75-138 chr5 118338411 118338592 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 55927 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 187.5-49 chr13 82179600 82179896 + 1.25 NA Intergenic MER92A|LTR|ERV1 -952765 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 354-20 chr4 89275229 89275651 + 1.25 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) intron (NM_198281, intron 1 of 1) 32360 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 118.5-232 chr8 135980519 135980721 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 523164 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 290.75-48 chr8 56443470 56443752 + 1.25 NA intron (NM_001135690, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 -2196 NR_125813 101929415 Hs.701520 NR_125813 ENSG00000254254 LOC101929415 - uncharacterized LOC101929415 ncRNA 262.25-5 chr10 64024415 64024651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -502643 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 212-51 chr21 45794955 45795142 + 1.25 NA intron (NM_001348243, intron 3 of 15) intron (NM_001348243, intron 3 of 15) 41371 NR_038876 100129027 Hs.689591 NR_038876 ENSG00000205424 LOC100129027 - uncharacterized LOC100129027 ncRNA 156-111 chr4 158339201 158339409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 128819 NM_018342 55314 Hs.176227 NM_018342 ENSG00000164124 TMEM144 - transmembrane protein 144 protein-coding 140.25-65 chr16 74311799 74312001 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15086 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 175.5-175 chr8 133389503 133389666 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -92280 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 204.5-106 chr5 59268232 59268547 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 7726 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 121.5-10 chr1 83766037 83766275 + 1.25 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 94390 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 281.75-43 chr8 48706591 48707014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28466 NR_157027 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 226.5-26 chr15 61055642 61055968 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 173497 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 209.25-121 chr9 112967765 112967977 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44321 NM_001101338 169834 Hs.192877 NM_001101338 ENSG00000285447 ZNF883 - zinc finger protein 883 protein-coding 219.25-81 chr9 70364303 70364550 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 50231 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 315-4 chr1 104353258 104353632 + 1.25 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 280422 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 301.5-13 chr10 93967497 93968002 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -5834 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 139-55 chr17 76510482 76510610 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9119 NM_024599 79651 Hs.464157 NM_024599 ENSG00000129667 RHBDF2 RHBDL5|RHBDL6|TEC|TOC|TOCG|iRhom2 rhomboid 5 homolog 2 protein-coding 191.75-14 chr10 43571123 43571491 + 1.25 NA intron (NM_001324353, intron 2 of 4) intron (NM_001324353, intron 2 of 4) -2848 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 286.25-11 chr15 95630184 95630553 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 197275 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 116.5-12 chr1 184078520 184078673 + 1.25 NA intron (NM_001363643, intron 3 of 3) intron (NM_001363643, intron 3 of 3) 26866 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 322-13 chr16 59578860 59579221 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 176151 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 264-45 chr3 175975628 175975947 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199454 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 218.75-42 chr2 215359872 215360109 + 1.25 NA TTS (NM_001365518) TTS (NM_001365518) 47931 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 191.75-61 chr2 40956148 40956438 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -443858 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 194.5-55 chr18 13559059 13559306 + 1.25 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -51932 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 317-19 chr22 41352429 41352835 + 1.25 NA intron (NM_017590, intron 17 of 22) AluSx3|SINE|Alu -14701 NM_001145398 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 189-80 chr3 196554477 196554686 + 1.25 NA exon (NM_001345906, exon 4 of 4) exon (NM_001345906, exon 4 of 4) 13973 NM_001345918 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 240.25-38 chr20 1168688 1168985 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001323407, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001323407, exon 7 of 7) 15637 NM_018354 55321 Hs.516834 NM_018354 ENSG00000125895 TMEM74B C20orf46 transmembrane protein 74B protein-coding 285.25-11 chr18 381880 382257 + 1.25 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) -114021 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 305-16 chr18 78181902 78182253 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -188350 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 234-13 chr14 66888608 66889028 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MB4|LINE|L1 -300622 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 198.25-81 chr5 24544173 24544351 + 1.25 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) AluSc|SINE|Alu 100716 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 147-145 chr8 87947552 87947758 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -73640 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 233.75-37 chr2 77188795 77189134 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2|LINE|L2 202999 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 323.75-22 chr7 39620621 39621181 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -2671 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 189-67 chr2 217339159 217339341 + 1.25 NA intron (NR_133642, intron 5 of 5) intron (NR_133642, intron 5 of 5) 56517 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 290.25-19 chr20 36055921 36056289 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5145 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 182.75-32 chr11 98166971 98167151 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -853888 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 237.5-65 chr4 33489418 33489687 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 550341 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 361.5-3 chr11 86810245 86810560 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001293180, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001293180, exon 2 of 2) 9860 NR_120592 11098 Hs.25338 NM_007173 ENSG00000150687 PRSS23 SIG13|SPUVE|ZSIG13 serine protease 23 protein-coding 232.25-60 chr5 26553207 26553490 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 485238 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 236-20 chr15 61337949 61338281 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -108813 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 221.5-103 chr8 128304656 128304913 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 154668 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 151.5-172 chr6 118609443 118609569 + 1.25 NA intron (NM_001042475, intron 2 of 12) (TTTTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 42085 NM_001042475 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 268-52 chr7 7529837 7530196 + 1.25 NA intron (NM_001037763, intron 3 of 34) intron (NM_001037763, intron 3 of 34) 5857 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 227.75 chr1 26785807 26786044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2038 NM_017837 55650 Hs.259605 NM_017837 ENSG00000060642 PIGV GPI-MT-II|HPMRS1|PIG-V phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V protein-coding 198-87 chr9 103245104 103245394 + 1.25 NA intron (NR_121578, intron 6 of 9) intron (NR_121578, intron 6 of 9) 79784 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 158-142 chr8 118048977 118049145 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 62758 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 186-60 chr3 97830515 97830771 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 1 of 21) HAL1|LINE|L1 8632 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 208-59 chr4 8516823 8517134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63259 NR_045511 27201 Hs.740355 NM_080819 ENSG00000155269 GPR78 - G protein-coupled receptor 78 protein-coding 250.25-40 chr5 17740746 17741133 + 1.25 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -66335 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 155.75-146 chr7 47709649 47709840 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51732 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 241.75-63 chr5 104584982 104585357 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -514305 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 592.75 chr6 63742229 63742842 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 41 of 43) intron (NM_001292009, intron 41 of 43) -64301 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 289.25-10 chr17 56871895 56872263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12834 NR_027025 246754 Hs.720736 NR_027025 MTVR2 - mouse mammary tumor virus receptor homolog 2 pseudo 186.75-40 chr17 51049861 51050086 + 1.25 NA intron (NM_001130527, intron 3 of 29) intron (NM_001130527, intron 3 of 29) -3095 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 204-20 chr15 80524280 80524540 + 1.25 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L1ME4a|LINE|L1 38534 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 194.25-15 chr10 119691858 119692262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33987 NM_001243195 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 184.25-77 chr3 44273134 44273451 + 1.25 NA intron (NM_001145030, intron 8 of 19) intron (NM_001145030, intron 8 of 19) 31406 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 208.25-23 chr12 43427237 43427594 + 1.25 NA exon (NM_025003, exon 27 of 39) exon (NM_025003, exon 27 of 39) 124788 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 191.25-31 chr14 54332559 54332828 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64175 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 131.75-187 chr6 67821345 67821636 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -233861 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 258-16 chr14 67859623 67859958 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 4 of 10) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 36198 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 307.25-20 chr21 15942437 15942777 + 1.25 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -127881 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 131.25-86 chr18 34595827 34596015 + 1.25 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) intron (NM_001198939, intron 1 of 21) 2586 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 181.75-95 chr4 60439826 60440010 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -482701 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 293.25-32 chr8 27214913 27215390 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 43253 NM_030795 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 261-21 chr15 85822872 85823285 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2557 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 221.25-41 chr2 122802648 122802911 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 270702 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 302.5-42 chr7 21442177 21442494 + 1.25 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 14252 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 150.25-137 chr6 163249440 163249575 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) -57505 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 143.25-142 chr5 45040515 45040665 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 231643 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 267.25 chr1 79527610 79528133 + 1.25 NA Intergenic Tigger11a|DNA|TcMar-Tigger -521141 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 277-22 chr2 212137483 212137811 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) L1PA13|LINE|L1 288713 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 147-50 chr17 19418561 19418757 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 7427 NM_007148 7732 Hs.189482 NM_007148 ENSG00000128482 RNF112 BFP|ZNF179 ring finger protein 112 protein-coding 221.5-46 chr2 78945108 78945449 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -80424 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 172.75-103 chr5 120419255 120419502 + 1.25 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -44900 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 173.75-102 chr22 27710835 27710995 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 90841 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 255-11 chr12 42374889 42375220 + 1.25 NA exon (NM_001364824, exon 4 of 9) exon (NM_001364824, exon 4 of 9) 43256 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 320.5-17 chr18 5707619 5708202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40909 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 376.75-13 chr4 40719773 40720250 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29944 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 230-16 chr13 23004259 23004566 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -88043 NR_138043 100996930 Hs.380803 NR_138043 LINC00621 - long intergenic non-protein coding RNA 621 ncRNA 222-3 chr1 104194168 104194507 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 121314 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 223.75-50 chr2 197489898 197490157 + 1.25 NA intron (NM_199440, intron 8 of 11) intron (NM_199440, intron 8 of 11) -3124 NR_132788 106635540 NR_132788 SNORA105B - small nucleolar RNA, H/ACA box 105B snoRNA 222.5-111 chr8 102184141 102184412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54555 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 189.5-153 chr8 127852608 127853031 + 1.25 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 56857 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 293.25-27 chr6 47632264 47632584 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24048 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 378-10 chr3 103774144 103774685 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -250298 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 242.75-50 chr4 81600905 81601166 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129128 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 200.5-55 chr17 56984194 56984401 + 1.25 NA intron (NM_021626, intron 2 of 12) intron (NM_021626, intron 2 of 12) 6190 NM_021626 59342 Hs.514950 NM_021626 ENSG00000121064 SCPEP1 HSCP1|RISC serine carboxypeptidase 1 protein-coding 276.5-54 chr5 43038222 43038477 + 1.25 NA TTS (NM_001014279) TTS (NM_001014279) 1996 NM_001014279 389289 Hs.529385 NM_001014279 ENSG00000177721 ANXA2R AX2R|AXIIR|C5orf39 annexin A2 receptor protein-coding 214.5-90 chr4 84320259 84320554 + 1.25 NA Intergenic UCON28b|Unknown|Unknown -21237 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 299-27 chr3 178582490 178582771 + 1.25 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 23780 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 195.5-108 chr4 122863163 122863507 + 1.25 NA intron (NM_001361665, intron 1 of 2) HAL1M8|LINE|L1 36504 NM_001361665 2247 Hs.284244 NM_002006 ENSG00000138685 FGF2 BFGF|FGF-2|FGFB|HBGF-2 fibroblast growth factor 2 protein-coding 197-15 chr13 62170997 62171248 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -41160 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 197.5-48 chr16 25551640 25551916 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -140181 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 185.5-18 chr10 84770157 84770324 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 345071 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 213.75-24 chr11 118084909 118085195 + 1.25 NA intron (NM_001173552, intron 1 of 11) intron (NM_001173552, intron 1 of 11) 1911 NM_001354434 100526771 Hs.627426 NM_001354434 SMIM35 TMPRSS4-AS1 small integral membrane protein 35 protein-coding 366.25-13 chr6 62299334 62299689 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13284 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 127.25-40 chr12 12147133 12147267 + 1.25 NA intron (NM_002336, intron 15 of 22).2 intron (NM_002336, intron 15 of 22).2 35248 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 211.5-21 chr10 113398533 113398825 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152152 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 215.75-62 chr3 61422992 61423281 + 1.25 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -138435 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 272-26 chr3 112921198 112921579 + 1.25 NA 3' UTR (NM_170780, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_170780, exon 7 of 7) 53715 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 300.25-30 chr9 33028337 33028758 + 1.25 NA intron (NM_001539, intron 3 of 8) intron (NM_001539, intron 3 of 8) 3274 NM_001539 3301 Hs.445203 NM_001539 ENSG00000086061 DNAJA1 DJ-2|DjA1|HDJ2|HSDJ|HSJ-2|HSJ2|HSPF4|NEDD7|hDJ-2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 protein-coding 180.75-97 chr3 165749821 165749977 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 87524 NR_137636 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 211.75-105 chrX 79780248 79780537 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -234361 NM_001109878 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 376-4 chr14 56305249 56305707 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 187067 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 131.75-121 chr21 28336054 28336236 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -107478 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 354.5-4 chr12 20299233 20299574 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -69842 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 114.25-194 chr8 112819814 112819965 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 10 of 66) intron (NM_001363185, intron 10 of 66) 176396 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 280.5-4 chr1 95107861 95108146 + 1.25 NA intron (NM_001199679, intron 1 of 6) L1ME4b|LINE|L1 -9352 NM_152487 148534 Hs.483512 NM_152487 ENSG00000152078 TLCD4 TMEM56 TLC domain containing 4 protein-coding 310-14 chr2 185071315 185071668 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 95581 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 159.75-144 chr5 161391240 161391488 + 1.25 NA intron (NM_000813, intron 6 of 9) intron (NM_000813, intron 6 of 9) 156760 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 279-25 chr3 47796978 47797264 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -5788 NR_075079 22907 Hs.517948 NM_014966 ENSG00000132153 DHX30 DDX30|NEDMIAL|RETCOR DExH-box helicase 30 protein-coding 136-44 chr15 57774172 57774398 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 67571 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 136.25-194 chr9 77659149 77659285 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10895 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 333.5-18 chr7 40817327 40817841 + 1.25 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 162355 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 265-21 chr20 9248848 9249104 + 1.25 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 31586 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 281.5-56 chr9 28125599 28125922 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -551894 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 215-52 chr3 59307221 59307577 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -257367 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 171-47 chr16 5434874 5435074 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 181276 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 224-65 chr9 33849811 33849997 + 1.25 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 32744 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 292.5-15 chr12 69824884 69825395 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_182530) promoter-TSS (NM_182530) -88 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 221.75-54 chr4 115948083 115948322 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -351523 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 352.5-30 chr7 136427017 136427454 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -441417 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 162-41 chr14 80330306 80330494 + 1.25 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) L1MEc|LINE|L1 -99343 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 273.75-3 chr1 206527995 206528364 + 1.25 NA intron (NM_182664, intron 1 of 4) L1MC1|LINE|L1 20648 NM_182664 83593 Hs.497579 NM_031437 ENSG00000266094 RASSF5 Maxp1|NORE1|NORE1A|NORE1B|RAPL|RASSF3 Ras association domain family member 5 protein-coding 267-36 chr4 162623034 162623481 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -459223 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 239-58 chr8 28874478 28874685 + 1.25 NA intron (NM_001145159, intron 1 of 15) AluY|SINE|Alu 15334 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 168.25-126 chr6 148835026 148835211 + 1.25 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 88088 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 158.75-165 chr8 135762945 135763134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 305583 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 201.5-61 chr15 93299883 93300162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93956 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 227.5-25 chr12 70236689 70236976 + 1.25 NA intron (NR_120461, intron 3 of 4) intron (NR_120461, intron 3 of 4) -6198 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 284-41 chr5 164277988 164278215 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 189301 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 267.5-70 chr7 80603091 80603470 + 1.25 NA intron (NM_001371080, intron 1 of 10) intron (NM_001371080, intron 1 of 10) 1073 NM_001289911 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 135.75-156 chr4 36946014 36946140 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55702 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 198.25-22 chr11 79924083 79924373 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -483198 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 142.75-27 chr10 106434303 106434424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 294198 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 234.75-14 chr12 21218969 21219274 + 1.25 NA intron (NM_006446, intron 12 of 14) L2a|LINE|L2 87927 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 233.75-71 chr6 128804659 128804895 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78361 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 157.5-205 chr8 74837956 74838168 + 1.25 NA intron (NM_015886, intron 2 of 5) MamRep1151|LTR?|LTR? 13528 NM_001324403 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 199.25-92 chr7 93732381 93732658 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 15591 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 270.25-39 chr5 33333350 33333633 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 103756 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 122.75-12 chr1 116366087 116366352 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7025 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 228-16 chr11 104696391 104696660 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87223 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 277.5-24 chr15 53863492 53863832 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100784 NR_102334 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 187.5-93 chr2 151335811 151335996 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -21689 NM_007115 7130 Hs.437322 NM_007115 ENSG00000123610 TNFAIP6 TSG-6|TSG6 TNF alpha induced protein 6 protein-coding 282.5-42 chr3 83237825 83238236 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1251888 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 142.75-12 chr1 191416453 191416617 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -188037 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 215-54 chr3 161821173 161821361 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 324459 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 195.75-20 chr10 29980635 29980810 + 1.25 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 78864 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 151.25-192 chr8 120097084 120097224 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -27948 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 142-4 chr1 78033873 78034012 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11028 NM_001304725 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 216-63 chr5 23623962 23624244 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 116448 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 199.25-25 chr12 122311846 122312315 + 1.25 NA intron (NM_198240, intron 17 of 23) intron (NM_198240, intron 17 of 23) -45586 NM_001351018 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 124.25-172 chr5 167701125 167701299 + 1.25 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -53717 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 305.5-35 chr5 121954610 121955043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7149 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 177-75 chr4 95827455 95827693 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12519 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 303.5-28 chr22 32809713 32810041 + 1.25 NA intron (NM_000362, intron 1 of 4) intron (NM_000362, intron 1 of 4) 9061 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 280.25-44 chr5 111844848 111845270 + 1.25 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) L1M3c|LINE|L1 -67449 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 351.5-5 chr11 88036528 88037083 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 138638 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 190.25-113 chr6 161339740 161340058 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -65838 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 256.75-19 chr17 53226843 53227069 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 241451 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 194.5-52 chr18 2076135 2076475 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 495200 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 272-31 chr6 1418315 1418813 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28153 NR_106778 102466720 NR_106778 ENSG00000275859 MIR6720 hsa-mir-6720|mir-6720 microRNA 6720 ncRNA 155.25-62 chr14 68695395 68695546 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66683 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 177.5-94 chr2 195130865 195131088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 400381 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 286.5-16 chr11 108507067 108507372 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001144763, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001144763, exon 6 of 6) -8835 NM_153705 143888 Hs.83286 NM_153705 ENSG00000178202 POGLUT3 KDELC2 protein O-glucosyltransferase 3 protein-coding 134.75-151 chr3 165921226 165921403 + 1.25 NA Intergenic LTR14A|LTR|ERVK -83891 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 140-68 chr19 29259445 29259682 + 1.25 NA Intergenic (TGTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46412 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 253-22 chr17 80231909 80232138 + 1.25 NA intron (NM_001166348, intron 6 of 16) L1MEc|LINE|L1 11596 NM_173626 284129 Hs.4866 NM_173626 ENSG00000181045 SLC26A11 - solute carrier family 26 member 11 protein-coding 295-13 chr17 29550872 29551286 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020791, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_020791, exon 20 of 20) 15958 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 239.75-56 chr5 25972751 25973280 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 782062 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 185.25-81 chr3 63168628 63168897 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 66074 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 169.75-49 chr14 77309008 77309319 + 1.25 NA intron (NM_013382, intron 2 of 20) L1ME4b|LINE|L1 11719 NM_013382 29954 Hs.132989 NM_013382 ENSG00000009830 POMT2 LGMD2N|LGMDR14|MDDGA2|MDDGB2|MDDGC2 protein O-mannosyltransferase 2 protein-coding 210.75-69 chr4 120611709 120612053 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 310985 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 176.75-110 chr6 138204978 138205203 + 1.25 NA intron (NM_020340, intron 2 of 33) intron (NM_020340, intron 2 of 33) 13400 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 207.75-91 chr4 95101797 95102212 + 1.25 NA intron (NM_001256794, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 10513 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 264-14 chr12 16018631 16018879 + 1.25 NA intron (NM_015954, intron 6 of 8) intron (NM_015954, intron 6 of 8) 107423 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 177.25-149 chrX 75201378 75201546 + 1.25 NA intron (NM_001363821, intron 3 of 9) L2c|LINE|L2 45093 NM_001363821 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 388-2 chr14 88328066 88328535 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -1388 NM_021161 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 124-113 chr3 97860560 97860707 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 2 of 21) L2a|LINE|L2 38622 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 229.75-35 chr2 118198860 118199258 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12673 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 235.5-9 chr10 58445113 58445369 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 59831 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 203.75-54 chr2 37357667 37357947 + 1.25 NA intron (NM_012413, intron 2 of 6) intron (NM_012413, intron 2 of 6) 13177 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 194.75-90 chr7 121651446 121651726 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -221575 NM_001206839 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 126.25-96 chr2 232067534 232067666 + 1.25 NA intron (NR_046477, intron 5 of 18) L1ME1|LINE|L1 -105053 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 220.5-81 chr3 179558919 179559215 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3813 NM_177989 86 Hs.435326 NM_004301 ENSG00000136518 ACTL6A ACTL6|ARPN-BETA|Arp4|BAF53A|INO80K actin like 6A protein-coding 184-78 chr5 164576053 164576271 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 105883 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 179.25-154 chrX 63981921 63982157 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -195952 NR_031567 100302115 NR_031567 ENSG00000222532 MIR1468 MIRN1468|hsa-mir-1468|mir-1468 microRNA 1468 ncRNA 239.75-66 chr6 63990148 63990392 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 34 of 43) L1M4c|LINE|L1 183434 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 198.5-62 chr19 31028797 31029032 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -138596 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 167.5-175 chr7 27773027 27773231 + 1.25 NA intron (NM_001362794, intron 5 of 16) MIR|SINE|MIR 33034 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 178.5-121 chr4 47525595 47525867 + 1.25 NA intron (NM_020453, intron 5 of 22) intron (NM_020453, intron 5 of 22) 40456 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 148.25-75 chr2 190881860 190882089 + 1.25 NA intron (NM_014905, intron 1 of 17) intron (NM_014905, intron 1 of 17) 1153 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 216-74 chr7 37537512 37537891 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88375 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 126.75-90 chr17 56256237 56256363 + 1.25 NA intron (NM_001370326, intron 3 of 20) intron (NM_001370326, intron 3 of 20) 102825 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 543 chr12 8688450 8689330 + 1.25 NA intron (NR_123740, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 7213 NM_001352267 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 191-27 chr15 58270116 58270470 + 1.25 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL 131912 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 156.75-158 chr7 80706053 80706217 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 59482 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 253-38 chr5 8554147 8554475 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93386 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 140.25-154 chr5 136396715 136396893 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -31328 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 333.75-20 chr4 74634143 74634619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 160142 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 320.25-12 chr15 77300576 77301031 + 1.25 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -75399 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 229.5-86 chr3 89512030 89512232 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 404510 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 271.25-24 chr14 46934221 46934699 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 9 of 16) intron (NM_001113498, intron 9 of 16) -282679 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 326-11 chr16 74791188 74791678 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -16613 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 182.5-20 chr10 68105623 68105867 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001256267) promoter-TSS (NM_001256267) -262 NR_045662 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 214-35 chr2 167979535 167979763 + 1.25 NA intron (NM_013233, intron 16 of 17) intron (NM_013233, intron 16 of 17) -38505 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 256-74 chr8 131471601 131472037 + 1.25 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -430910 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 168.25-107 chr4 52776734 52776951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13152 NR_040106 152578 Hs.383806 NR_040106 ENSG00000250302 LINC01618 - long intergenic non-protein coding RNA 1618 ncRNA 211.25-12 chr11 73912177 73912531 + 1.25 NA intron (NM_001267803, intron 8 of 12) L2b|LINE|L2 23573 NM_001363556 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 199.5-45 chr14 75828765 75829020 + 1.25 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) intron (NM_015072, intron 28 of 31) 153103 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 113.75-49 chr13 21623573 21623737 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19485 NM_152726 221154 Hs.412103 NM_152726 ENSG00000165487 MICU2 1110008L20Rik|EFHA1 mitochondrial calcium uptake 2 protein-coding 169.5-125 chr4 69641105 69641320 + 1.25 NA intron (NM_001252274, intron 2 of 6) intron (NM_001252274, intron 2 of 6) -1570 NM_001301233 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 192-59 chr2 114684077 114684354 + 1.25 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 149333 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 265.75-31 chr2 29966124 29966354 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44653 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 309-21 chr18 74405214 74405592 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -4045 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 222.5-74 chr4 52290554 52290872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 239409 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 279.5-38 chr3 35352971 35353417 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 40829 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 397.25-4 chr2 28264140 28264566 + 1.25 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) intron (NM_199193, intron 11 of 13) 46106 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 244.5-40 chr17 65939028 65939383 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) L1MA7|LINE|L1 -112662 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 137.25-77 chr2 119790591 119790760 + 1.25 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) L1MB3|LINE|L1 30753 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 273-53 chr7 44716549 44716847 + 1.25 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -31868 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 144-113 chr6 138195650 138195996 + 1.25 NA intron (NM_020340, intron 2 of 33) intron (NM_020340, intron 2 of 33) 22667 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 248-63 chr6 76713630 76713928 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -120156 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 242.25-16 chr11 66749812 66750192 + 1.25 NA intron (NM_024650, intron 2 of 16) intron (NM_024650, intron 2 of 16) 5233 NM_001302084 79703 Hs.292088 NM_024650 ENSG00000173715 C11orf80 HYDM4|TOP6BL|TOPOVIBL chromosome 11 open reading frame 80 protein-coding 200-39 chr18 7171045 7171400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53425 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 497.75 chr10 53402164 53402991 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -630877 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 285.75-10 chr12 115114499 115114979 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -430564 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 294.25-34 chr8 106319155 106319516 + 1.25 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 49157 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 263.75-43 chr5 134091825 134092193 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22672 NM_003202 6932 Hs.573153 NM_003202 ENSG00000081059 TCF7 TCF-1 transcription factor 7 protein-coding 240.5-96 chr7 1694503 1694845 + 1.25 NA intron (NM_001128636, intron 1 of 2) intron (NM_001128636, intron 1 of 2) 6555 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 357.25-18 chr9 33838351 33838672 + 1.25 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) intron (NM_017811, intron 1 of 4) 21351 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 329.5-6 chr19 31585955 31586450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1987 NM_001278577 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 198-45 chr21 20239766 20240102 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 18751 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 286.25-8 chr12 6998217 6998493 + 1.25 NA TTS (NR_135131) TTS (NR_135131) 20121 NM_005768 10162 Hs.655248 NM_005768 ENSG00000111684 LPCAT3 C3F|LPCAT|LPLAT 5|LPSAT|MBOAT5|OACT5|nessy lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 protein-coding 200-84 chr7 27347269 27347777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100294 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 309.75-10 chr13 107634813 107635175 + 1.25 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -103746 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 194.5-33 chr13 20881659 20881945 + 1.25 NA intron (NM_022459, intron 1 of 22) intron (NM_022459, intron 1 of 22) 20972 NM_022459 64328 Hs.507452 NM_022459 ENSG00000132953 XPO4 exp4 exportin 4 protein-coding 175.25-55 chr16 20853939 20854209 + 1.25 NA TTS (NM_173475) TTS (NM_173475) -45808 NM_001369632 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 217.75-52 chr4 54630239 54630550 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23263 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 266.25-50 chr8 141283701 141283949 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29196 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 229.75-27 chr16 73203860 73204098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59532 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 191.25-28 chr13 102722661 102722919 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -28269 NM_001010977 196541 Hs.508623 NM_001010977 ENSG00000139780 METTL21C C13orf39 methyltransferase like 21C protein-coding 300.5-40 chr5 148869849 148870188 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 43425 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 290-53 chrX 31318048 31318439 + 1.25 NA intron (NM_000109, intron 62 of 78) intron (NM_000109, intron 62 of 78) -51289 NM_004019 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 280.5-33 chr3 30869644 30870067 + 1.25 NA intron (NM_207359, intron 1 of 14) intron (NM_207359, intron 1 of 14) 24806 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 209.5-50 chr15 88947478 88947695 + 1.25 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -34207 NM_001310319 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 183-79 chr3 174615647 174615842 + 1.25 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -243590 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 123-50 chr14 54660060 54660245 + 1.25 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 92540 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 382-15 chr3 29244697 29245200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35991 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 391-7 chr15 79622593 79623168 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 190364 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 255-41 chr3 181047847 181048196 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -8659 NR_075092 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 202.75-26 chr12 70196957 70197249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45927 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 156.5-165 chr6 118974791 118974958 + 1.25 NA intron (NM_024581, intron 13 of 17) intron (NM_024581, intron 13 of 17) -39712 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 230.75-66 chr6 119060120 119060350 + 1.25 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) 8908 NR_030315 693128 NR_030315 ENSG00000207982 MIR548B MIRN548B microRNA 548b ncRNA 170.75-53 chr17 78698481 78698665 + 1.25 NA intron (NM_001365041, intron 8 of 12) intron (NM_001365041, intron 8 of 12) 18459 NM_001292019 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 255.75-39 chr5 43577280 43577562 + 1.25 NA intron (NR_073113, intron 2 of 2) LTR49-int|LTR|ERV1 -20002 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 202.5-76 chr2 105257506 105257724 + 1.25 NA intron (NM_001328646, intron 11 of 11) L1MB3|LINE|L1 15872 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 218-51 chr4 107077488 107077948 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41405 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 321.25-5 chr1 160453821 160454337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53515 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 261-13 chr11 43513365 43513689 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46129 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 205.75-92 chr9 32273050 32273299 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -111429 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 254.75-60 chrX 93308860 93309080 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 364608 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 306.25-11 chr12 21667868 21668302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10230 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 191-64 chr4 114370992 114371320 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -227246 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 316.25-5 chr10 61027604 61028010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11532 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 460.75-3 chr3 1987022 1987515 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -111535 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 258.75-41 chr2 170176834 170177196 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1132 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 168.25-144 chr8 134372293 134372564 + 1.25 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -225643 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 269.25-19 chr17 50925260 50925558 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57431 NM_001243877 10140 Hs.703321 NM_005749 ENSG00000141232 TOB1 APRO5|APRO6|PIG49|TOB|TROB|TROB1 transducer of ERBB2, 1 protein-coding 204.25-18 chr11 23579250 23579525 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160197 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 254.75-9 chr11 105312276 105312678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -172708 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 159.25-4 chr1 103911143 103911353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 161407 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 220.5 chr1 39476717 39477046 + 1.25 NA intron (NM_012090, intron 90 of 92) AluSq10|SINE|Alu -14755 NM_181809 353500 Hs.472497 NM_181809 ENSG00000183682 BMP8A - bone morphogenetic protein 8a protein-coding 189.75-42 chr15 67212431 67212670 + 1.25 NA intron (NM_001271885, intron 5 of 9) intron (NM_001271885, intron 5 of 9) 42111 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 174.75-20 chr11 104819892 104820187 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 78631 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 119.25-4 chr1 62153338 62153471 + 1.25 NA exon (NM_001350145, exon 43 of 44) exon (NM_001350145, exon 43 of 44) -41445 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 235.75-84 chr9 83412602 83412827 + 1.25 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 55028 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 290-33 chr21 29403332 29403716 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 31023 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 178.5-136 chr5 32881142 32881423 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -66161 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 214.5-124 chr8 83520397 83520670 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 116775 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 156.5-204 chr9 74706182 74706421 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 90767 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 267-57 chr8 136396703 136397105 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -133894 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 181.5-57 chr17 33837580 33837781 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -303920 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 227.25-36 chr18 9236764 9236982 + 1.25 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) L1MEj|LINE|L1 -97900 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 219.5-51 chr17 31357746 31358001 + 1.25 NA intron (NM_001042492, intron 54 of 57) intron (NM_001042492, intron 54 of 57) -33802 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 150.25-162 chr9 87832029 87832257 + 1.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -12602 NR_033405 1518 Hs.726015 NR_033405 CTSLP8 CTSL1P8 cathepsin L pseudogene 8 pseudo 118-104 chr20 40685914 40686102 + 1.25 NA 3' UTR (NM_005461, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_005461, exon 1 of 1) 3228 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 421-5 chr2 105161455 105161961 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 17595 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 219.5-42 chr14 67710754 67710953 + 1.25 NA intron (NM_152443, intron 1 of 8) MER4-int|LTR|ERV1 8967 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 222.75-29 chr12 67202882 67203203 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -66316 NM_001329676 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 155-133 chr7 93931784 93932019 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10166 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 175.75-119 chr7 30466105 30466266 + 1.25 NA intron (NM_006092, intron 1 of 13) intron (NM_006092, intron 1 of 13) 12599 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 188.25-67 chr22 17898258 17898452 + 1.25 NA intron (NM_001122731, intron 6 of 19) intron (NM_001122731, intron 6 of 19) 8531 NM_001136004 57553 Hs.528024 NM_015241 ENSG00000243156 MICAL3 MICAL-3 microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 protein-coding 122.25-142 chr4 93096065 93096209 + 1.25 NA intron (NM_001510, intron 3 of 15) L1ME2|LINE|L1 -732616 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 157-34 chr15 63639795 63639993 + 1.25 NA intron (NM_003922, intron 61 of 77) intron (NM_003922, intron 61 of 77) -39067 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 214.25-56 chr3 122502483 122502729 + 1.25 NA intron (NR_026698, intron 1 of 14) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 12333 NM_002264 3836 Hs.161008 NM_002264 ENSG00000114030 KPNA1 IPOA5|NPI-1|RCH2|SRP1 karyopherin subunit alpha 1 protein-coding 349.5-19 chr4 141625595 141626007 + 1.25 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 -10782 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 129.25-138 chr4 31802805 31802953 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -194500 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 122.25-207 chr9 72274327 72274458 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31044 NR_110952 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 202.25-76 chr6 94358723 94358984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 640550 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 319.25-8 chr18 42552115 42552445 + 1.25 NA intron (NR_046174, intron 6 of 9) intron (NR_046174, intron 6 of 9) 365612 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 133.5-179 chr4 41670069 41670215 + 1.25 NA intron (NM_001330786, intron 13 of 22) intron (NM_001330786, intron 13 of 22) 57240 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 120.5-55 chr12 68224455 68224592 + 1.25 NA intron (NM_018402, intron 3 of 4) intron (NM_018402, intron 3 of 4) 1287 NM_018402 55801 Hs.272350 NM_018402 ENSG00000111536 IL26 AK155|IL-26 interleukin 26 protein-coding 207-94 chr8 144217972 144218228 + 1.25 NA intron (NM_001288814, intron 11 of 41) intron (NM_001288814, intron 11 of 41) 44637 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 196.25-105 chr6 42396603 42396938 + 1.25 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) intron (NM_001297573, intron 2 of 17) 55281 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 196-65 chr3 83265588 83265923 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 1279613 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 151-48 chr17 58918399 58918698 + 1.25 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluSx3|SINE|Alu 162679 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 193.75-18 chr10 54051818 54052036 + 1.25 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -434303 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 270.25-14 chr11 112321629 112321960 + 1.25 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 51045 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 218.25-59 chr4 42864663 42864885 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28492 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 118.75-161 chr5 152398089 152398267 + 1.25 NA intron (NM_020167, intron 1 of 3) intron (NM_020167, intron 1 of 3) 7101 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 155.25-130 chr4 46547035 46547230 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -157004 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 208.5-7 chr10 28312539 28312884 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9647 NR_134517 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 271.5-69 chr5 83784115 83784538 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63471 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 209.25-70 chr21 29002157 29002466 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9434 NM_001320766 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 245-14 chr14 43323068 43323303 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 1184098 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 265-18 chr19 19247922 19248252 + 1.25 NA intron (NM_004386, intron 13 of 14) AluJb|SINE|Alu 14717 NM_023002 404037 Hs.367829 NM_023002 ENSG00000187664 HAPLN4 BRAL2 hyaluronan and proteoglycan link protein 4 protein-coding 253.75-47 chr5 19296644 19296986 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 589457 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 297-44 chr7 103994286 103994691 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4830 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 151-36 chr14 74754647 74754862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8562 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 150-119 chr5 123266759 123266889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 156768 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 172-76 chr3 185517267 185517541 + 1.25 NA intron (NM_139248, intron 6 of 9) intron (NM_139248, intron 6 of 9) -18369 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 206.75-65 chr4 112929464 112929692 + 1.25 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) 68591 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 193.25-25 chr11 126917434 126917670 + 1.25 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -23194 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 170.75-104 chr5 37944743 37944959 + 1.25 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3640 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 259.25-24 chr21 33557898 33558156 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001291411, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001291411, exon 5 of 5) 7365 NR_106756 102465248 NR_106756 ENSG00000284448 MIR6501 hsa-mir-6501|mir-6501 microRNA 6501 ncRNA 295.25-28 chr6 138918178 138918498 + 1.25 NA intron (NM_001128617, intron 11 of 18) MER2|DNA|TcMar-Tigger 69923 NM_001128617 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 189-15 chr1 212266399 212266673 + 1.25 NA intron (NR_125984, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 18485 NR_125984 101929541 Hs.632493 NR_125982 ENSG00000226251 LINC02608 - long intergenic non-protein coding RNA 2608 ncRNA 259.5-57 chr2 68395237 68395488 + 1.25 NA intron (NM_002664, intron 8 of 8) intron (NM_002664, intron 8 of 8) 30080 NM_002664 5341 Hs.468840 NM_002664 ENSG00000115956 PLEK P47 pleckstrin protein-coding 218.5-108 chr6 92105440 92105674 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -415129 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 394.75-5 chr20 42511796 42512216 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) L1ME4b|LINE|L1 -173477 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 210.25-32 chr17 78534180 78534406 + 1.25 NA intron (NM_173628, intron 19 of 80) intron (NM_173628, intron 19 of 80) 43101 NM_173628 8632 Hs.375975 NM_003727 ENSG00000187775 DNAH17 DNAHL1|DNEL2 dynein axonemal heavy chain 17 protein-coding 206.25-68 chr3 142470299 142470591 + 1.25 NA intron (NM_001354579, intron 35 of 45) intron (NM_001354579, intron 35 of 45) -22383 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 173.75-4 chr1 58950260 58950547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70073 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 193.75-110 chr7 14455480 14455715 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 385853 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 122.5-105 chr2 33095570 33095685 + 1.25 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) L1MEf|LINE|L1 -38970 NM_001166264 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 155.75-66 chr17 42120242 42120398 + 1.25 NA exon (NM_021078, exon 3 of 18) exon (NM_021078, exon 3 of 18) 1047 NM_021078 2648 Hs.463045 NM_021078 ENSG00000108773 KAT2A GCN5|GCN5L2|PCAF-b|hGCN5 lysine acetyltransferase 2A protein-coding 212-66 chr5 13823902 13824133 + 1.25 NA intron (NM_001369, intron 39 of 78) intron (NM_001369, intron 39 of 78) 120463 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 162.25-15 chr10 16117042 16117182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -256579 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 286.25-5 chr11 30510426 30510828 + 1.25 NA intron (NM_001584, intron 2 of 5) intron (NM_001584, intron 2 of 5) 69866 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 300.5-42 chr6 49464246 49464510 + 1.25 NA intron (NM_018132, intron 1 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 1008 NM_018132 55166 Hs.88663 NM_018132 ENSG00000031691 CENPQ C6orf139|CENP-Q centromere protein Q protein-coding 151.75-148 chr8 50016121 50016287 + 1.25 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 104797 NR_135794 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 300.75-45 chr8 81545832 81546204 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14628 NM_001105281 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 158.75-18 chr10 68943693 68943879 + 1.25 NA intron (NM_024045, intron 14 of 14) AluJr4|SINE|Alu -12384 NM_004728 9188 Hs.223141 NM_004728 ENSG00000165732 DDX21 GUA|GURDB|RH-II/GU|RH-II/GuA DExD-box helicase 21 protein-coding 287.25-16 chr13 94628579 94628849 + 1.25 NA 3' UTR (NM_180989, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_180989, exon 9 of 9) 26857 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 165.25-58 chr18 830881 831086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18741 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 174.5-42 chr11 133769028 133769315 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 41205 NR_120444 646522 Hs.560000 NR_120444 ENSG00000255258 LINC02743 - long intergenic non-protein coding RNA 2743 ncRNA 362-11 chr4 30469572 30470011 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -250578 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 202.5-23 chr10 120659943 120660247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62146 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 179.25-156 chrX 146538000 146538245 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -271649 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 360.75-5 chr2 11649560 11649901 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20465 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 211-15 chr12 26337017 26337348 + 1.25 NA 3' UTR (NM_002223, exon 57 of 57) 3' UTR (NM_002223, exon 57 of 57) 141609 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 234.75-63 chr5 62511448 62511755 + 1.25 NA intron (NM_016338, intron 19 of 29) intron (NM_016338, intron 19 of 29) -67134 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 157.25-14 chr10 50882581 50882857 + 1.25 NA intron (NM_001198818, intron 1 of 13) intron (NM_001198818, intron 1 of 13) 2908 NM_001370131 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 316-16 chr17 60812212 60812687 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 134598 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 211.25-5 chr1 93603965 93604361 + 1.25 NA intron (NM_001261409, intron 3 of 11) intron (NM_001261409, intron 3 of 11) 9934 NM_001261410 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 184.75-31 chr14 88593840 88594048 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_207662) promoter-TSS (NM_207662) -476 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 240.25-67 chr8 31631083 31631424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8499 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 274-10 chr12 110990268 110990621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32626 NR_135001 105369980 Hs.564357 NR_135001 ENSG00000258240 LOC105369980 - uncharacterized LOC105369980 ncRNA 241.25-69 chr8 68809883 68810228 + 1.25 NA intron (NR_146187, intron 12 of 13) MER52A|LTR|ERV1 294135 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 420.25-5 chr21 27602858 27603461 + 1.25 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -119220 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 179-54 chr2 66541317 66541476 + 1.25 NA intron (NM_002398, intron 8 of 12) intron (NM_002398, intron 8 of 12) -32634 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 264-40 chr2 228049143 228049499 + 1.25 NA intron (NM_030623, intron 3 of 10) intron (NM_030623, intron 3 of 10) 132324 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 150.5-30 chr11 78192893 78193070 + 1.25 NA intron (NM_020798, intron 1 of 10) intron (NM_020798, intron 1 of 10) 4062 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 245.25-14 chr12 13071717 13072102 + 1.25 NA intron (NM_020853, intron 10 of 12) intron (NM_020853, intron 10 of 12) 23766 NM_001368007 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 214.75-9 chr10 16952393 16952654 + 1.25 NA intron (NM_001081, intron 32 of 66) intron (NM_001081, intron 32 of 66) -135069 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 222.75-81 chr6 39521571 39521852 + 1.25 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) intron (NM_001289021, intron 12 of 21) -90321 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 167-100 chr6 62322373 62322627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36273 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 219-42 chr17 15211295 15211770 + 1.25 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 40164 NR_039884 100616125 NR_039884 ENSG00000265110 MIR4731 - microRNA 4731 ncRNA 137.75-45 chr12 80954466 80954651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16643 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 210.75-39 chr2 100120232 100120450 + 1.25 NA intron (NM_002285, intron 1 of 23) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -14758 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 265.75-67 chr7 50911132 50911476 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -117851 NM_001371008 187.25-54 chr2 27484945 27485329 + 1.25 NA intron (NM_015662, intron 2 of 47) intron (NM_015662, intron 2 of 47) 4606 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 142.25-92 chr2 156023682 156023811 + 1.25 NA intron (NR_110249, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 231185 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 172-68 chr22 29732944 29733186 + 1.25 NA intron (NM_001318129, intron 5 of 5) MIR3|SINE|MIR 13062 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 169-83 chr6 13259056 13259399 + 1.25 NA intron (NM_001322308, intron 9 of 13) intron (NM_001322308, intron 9 of 13) 24215 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 186.25-83 chr4 142771936 142772108 + 1.25 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) L2a|LINE|L2 74513 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 251.75-59 chr4 65391993 65392350 + 1.25 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 277317 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 145-136 chr6 38356907 38357139 + 1.25 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) HAL1|LINE|L1 -124573 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 329-3 chr1 64006178 64006586 + 1.25 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 105823 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 220.25-59 chr4 168464398 168464721 + 1.25 NA intron (NM_001345927, intron 4 of 37) FLAM_C|SINE|Alu 15933 NM_001291510 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 292.5-11 chr11 83862233 83862624 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) L1MA3|LINE|L1 -180003 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 135-8 chr10 19044164 19044287 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4576 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 351.5-20 chr21 30415750 30416078 + 1.25 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 10012 NM_181622 337960 Hs.553687 NM_181622 ENSG00000240432 KRTAP13-3 KAP13.3 keratin associated protein 13-3 protein-coding 218-58 chr5 109465951 109466126 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -56064 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 264-3 chr1 110318682 110318940 + 1.25 NA non-coding (NR_036595, exon 2 of 4) non-coding (NR_036595, exon 2 of 4) 20360 NR_036595 440600 Hs.649375 NR_036595 ENSG00000227963 RBM15-AS1 AS-RBM15 RBM15 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-90 chr22 19325224 19325458 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -33622 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 225.25-12 chr11 23779975 23780191 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -360893 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 174.75-109 chr6 161919536 161919875 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 448728 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 198.5-156 chr9 22424329 22424497 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22411 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 248-29 chr17 63931376 63931696 + 1.25 NA intron (NM_001329050, intron 1 of 4) intron (NM_001329050, intron 1 of 4) 795 NM_000626 974 Hs.89575 NM_000626 ENSG00000007312 CD79B AGM6|B29|IGB CD79b molecule protein-coding 197.25-21 chr12 46801017 46801274 + 1.25 NA intron (NM_001143824, intron 1 of 15) intron (NM_001143824, intron 1 of 15) 24852 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 212.5-7 chr1 231720477 231720655 + 1.25 NA intron (NM_001164544, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 93751 NM_001164544 27185 Hs.13318 NM_018662 ENSG00000162946 DISC1 C1orf136|SCZD9 DISC1 scaffold protein protein-coding 201.25-14 chr10 43934972 43935226 + 1.25 NA intron (NR_033846, intron 2 of 7) L1MEg|LINE|L1 22697 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 133.5-282 chr9 95540288 95540601 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23387 NM_001083602 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 155.5-76 chr17 70798098 70798271 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 403995 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 255.5-38 chr2 17845742 17846071 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29446 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 210.75-74 chr5 20067125 20067361 + 1.25 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) MER2|DNA|TcMar-Tigger -79043 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 247.5-34 chr18 55652002 55652347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16217 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 204.5-87 chr3 33311419 33311638 + 1.25 NA intron (NR_146129, intron 4 of 15) L1M1|LINE|L1 34086 NM_001349324 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 209.5-109 chr4 124968193 124968597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -255663 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 221.5-4 chr10 8155437 8155788 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 100924 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 199.5-122 chr5 121111776 121111997 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -210664 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 238.25-89 chr9 25739785 25740037 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -40145 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 123.5-108 chr2 125321182 125321475 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 796657 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 141.25-119 chr4 35219306 35219452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -949632 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 177-41 chr2 28654521 28654791 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 81549 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 310-12 chr2 163533668 163534158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 202095 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 176.25-116 chr5 114661547 114661749 + 1.25 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) AluSx|SINE|Alu 85607 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 405.5-15 chr8 100140360 100140847 + 1.25 NA intron (NR_036491, intron 2 of 4) intron (NR_036491, intron 2 of 4) 5214 NR_036491 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 342.5-15 chr2 15393333 15393792 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 28 of 50) L1ME1|LINE|L1 167772 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 237-74 chr9 122730356 122730652 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 6514 NM_001005235 254973 Hs.626838 NM_001005235 ENSG00000136939 OR1L4 OR1L5|OR9-29|OR9-E|OST046 olfactory receptor family 1 subfamily L member 4 protein-coding 280-9 chr10 64144263 64144696 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -622589 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 261.25-12 chr16 58550275 58550513 + 1.25 NA intron (NM_206999, intron 24 of 30) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -1761 NR_002978 677827 Hs.688592 NR_002978 ENSG00000207493 SNORA46 ACA46 small nucleolar RNA, H/ACA box 46 snoRNA 118.25-33 chr11 244467 244635 + 1.25 NA intron (NM_002817, intron 5 of 12) intron (NM_002817, intron 5 of 12) 7575 NM_175932 5719 Hs.134688 NM_002817 ENSG00000185627 PSMD13 HSPC027|Rpn9|S11|p40.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 13 protein-coding 240.5 chr1 44629756 44630167 + 1.25 NA intron (NM_001319957, intron 4 of 13) L2c|LINE|L2 41095 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 261.75-16 chr16 19437668 19437908 + 1.25 NA intron (NM_001261841, intron 2 of 21) intron (NM_001261841, intron 2 of 21) -18673 NM_024780 79838 Hs.115838 NM_024780 ENSG00000103534 TMC5 - transmembrane channel like 5 protein-coding 169.75-138 chr7 27592230 27592425 + 1.25 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L2b|LINE|L2 -23647 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 218-37 chr2 134892824 134893098 + 1.25 NA intron (NR_036549, intron 1 of 4) intron (NR_036549, intron 1 of 4) 25645 NR_036549 100129961 Hs.729028 NR_036549 CCNT2-AS1 - CCNT2 antisense RNA 1 ncRNA 195-91 chr8 104065452 104065725 + 1.25 NA intron (NM_001348499, intron 19 of 23) intron (NM_001348499, intron 19 of 23) -157747 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 250.75-4 chr10 78542128 78542528 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 274986 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 172-58 chr2 213664089 213664296 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -93875 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 136-173 chr9 114547737 114547848 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39977 NM_004888 9550 Hs.388654 NM_004888 ENSG00000136888 ATP6V1G1 ATP6G|ATP6G1|ATP6GL|ATP6J|Vma10 ATPase H+ transporting V1 subunit G1 protein-coding 306.5-36 chr8 116478856 116479158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153948 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 223.75-74 chr6 56992104 56992351 + 1.25 NA intron (NM_001318539, intron 2 of 3) intron (NM_001318539, intron 2 of 3) 37120 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 208.75-77 chr7 3905059 3905369 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) L1MC4|LINE|L1 -224471 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 130.75-110 chr22 39751719 39751854 + 1.25 NA intron (NM_152512, intron 6 of 6) intron (NM_152512, intron 6 of 6) 141974 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 173.5-20 chr10 63921965 63922181 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -400183 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 137-33 chr11 60894326 60894476 + 1.25 NA intron (NM_014502, intron 15 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 12184 NM_014502 27339 Hs.502705 NM_014502 ENSG00000110107 PRPF19 NMP200|PRP19|PSO4|SNEV|UBOX4|hPSO4 pre-mRNA processing factor 19 protein-coding 150.75-196 chrUn_GL000216v2 1769 1957 + 1.25 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 332.75-3 chr10 32490791 32491165 + 1.25 NA intron (NR_109826, intron 9 of 16) intron (NR_109826, intron 9 of 16) 44838 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 235-16 chr13 48773658 48773950 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 119875 NM_001308476 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 208.25-87 chr7 144470601 144470767 + 1.25 NA intron (NM_001042482, intron 7 of 7) intron (NM_001042482, intron 7 of 7) -60457 NM_001080413 135935 Hs.558628 NM_001080413 ENSG00000106410 NOBOX OG-2|OG2|OG2X|POF5|TCAG_12042 NOBOX oogenesis homeobox protein-coding 362-7 chr19 28255267 28255897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -351106 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 223.75-79 chr7 84720053 84720281 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 187691 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 284-37 chr4 69469698 69470156 + 1.25 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 25978 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 224.5-102 chr7 112199873 112200211 + 1.25 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 6357 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 316.75-12 chr22 26486369 26486808 + 1.25 NA intron (NM_001013694, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 2711 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 130.5-213 chr6 63289876 63290021 + 1.25 NA intron (NM_001143940, intron 2 of 4) intron (NM_001143940, intron 2 of 4) 30029 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 247-34 chr2 122765625 122765982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 307678 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 309.75-17 chr18 37143772 37144062 + 1.25 NA intron (NR_136303, intron 8 of 13) L1MEf|LINE|L1 -130543 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 209.5-32 chr12 103069155 103069522 + 1.25 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -82504 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 176.5-18 chr10 52820145 52820411 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48578 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 166.25-37 chr11 112441610 112441766 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40544 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 191-21 chr12 102970573 102970888 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12289 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 228.75-84 chr8 104973936 104974177 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -344382 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 198.5-33 chr12 106423292 106423597 + 1.25 NA intron (NM_001160708, intron 12 of 27) MLT2B2|LTR|ERVL 65362 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 327.5-8 chr13 100654227 100654558 + 1.25 NA intron (NM_001079669, intron 5 of 17) intron (NM_001079669, intron 5 of 17) 20403 NM_001350574 84899 Hs.190983 NM_032813 ENSG00000125247 TMTC4 - transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 4 protein-coding 126.5-139 chr21 22523765 22523927 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 425229 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 178.25-64 chr2 86477750 86478061 + 1.25 NA exon (NM_001146688, exon 13 of 26) exon (NM_001146688, exon 13 of 26) 36444 NM_001146688 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 215.75-80 chr5 102123956 102124230 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 172191 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 397.5-6 chr2 106860486 106860915 + 1.25 NA intron (NM_032528, intron 1 of 5) intron (NM_032528, intron 1 of 5) 25328 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 237.5-81 chr5 134572636 134572876 + 1.25 NA intron (NM_015288, intron 9 of 10) intron (NM_015288, intron 9 of 10) 46648 NM_015288 23338 Hs.732155 NM_015288 ENSG00000043143 JADE2 JADE-2|PHF15 jade family PHD finger 2 protein-coding 196.5-112 chr4 59684140 59684426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 670710 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 168.25-56 chr16 61935065 61935401 + 1.25 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 101205 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 121.5-255 chr8 131565487 131565695 + 1.25 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -338502 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 118-62 chr16 54012795 54012992 + 1.25 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -26500 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 212-90 chr9 129949241 129949630 + 1.25 NA intron (NM_001363755, intron 6 of 15) intron (NM_001363755, intron 6 of 15) 79830 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 302.25-26 chr7 54060639 54061039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -248908 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 176.5-176 chr8 128168884 128169138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18895 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 116.75-141 chr3 186405521 186405711 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -34729 NR_151709 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 248-16 chr12 127857841 127858243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23575 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 200.25-63 chr2 123010506 123010688 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 62884 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 151.25-112 chr21 25483528 25483698 + 1.25 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -51912 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 189-109 chr9 68744283 68744518 + 1.25 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) LTR78|LTR|ERV1 -35665 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 308.75-20 chr18 12616515 12616866 + 1.25 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 40042 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 202.5-104 chr4 102759564 102759788 + 1.25 NA intron (NM_005908, intron 1 of 16) intron (NM_005908, intron 1 of 16) 1292 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 199-90 chr8 139927579 139927845 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) L1ME1|LINE|L1 172823 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 232-77 chr8 139383837 139384082 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 319164 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 260.75-36 chr2 213296201 213296485 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 2 of 14) intron (NR_047660, intron 2 of 14) 11879 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 215.25-3 chr1 66239500 66239766 + 1.25 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -92475 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 243.25-8 chr12 125336660 125336900 + 1.25 NA intron (NM_052907, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 10164 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 334.75-3 chr1 113279468 113279837 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -73399 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 325.25-14 chr2 211243606 211243926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 626195 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 276-43 chr6 165549264 165549671 + 1.25 NA intron (NM_001130690, intron 1 of 21) AluSc8|SINE|Alu 112633 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 267.5-77 chr9 28129726 28130046 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -556020 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 269-32 chr3 3297490 3297729 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117892 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 238.5-7 chr1 191684889 191685139 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -456516 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 268-2 chr1 45891171 45891464 + 1.25 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) AluJb|SINE|Alu 26969 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 144.75-125 chr4 130881491 130881655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 505212 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 199.75-9 chr10 76171539 76171921 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 388969 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 276.5-10 chr10 68546247 68546596 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -13916 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 171.25-116 chr5 35621992 35622248 + 1.25 NA intron (NM_144722, intron 1 of 9) intron (NM_144722, intron 1 of 9) 4257 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 471.25 chr10 92838621 92839261 + 1.25 NA intron (NM_001319194, intron 2 of 22) AluSz|SINE|Alu 7833 NM_001319194 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 126.25-116 chr3 74417036 74417284 + 1.25 NA intron (NM_020872, intron 4 of 21) intron (NM_020872, intron 4 of 21) 103980 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 187.5-114 chr3 72326345 72326588 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 120157 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 347.5-21 chr8 106853716 106854224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83726 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 130-29 chr11 74034766 74034959 + 1.25 NA intron (NM_015531, intron 30 of 30) MIRb|SINE|MIR -25625 NM_022803 7352 Hs.101337 NM_003356 ENSG00000175564 UCP3 SLC25A9 uncoupling protein 3 protein-coding 199-7 chr1 234069722 234070080 + 1.25 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -144310 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 228.25-49 chr20 42436777 42437015 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) L1ME3F|LINE|L1 -248587 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 182.25-95 chr5 131548096 131548368 + 1.25 NA intron (NM_016340, intron 5 of 27) intron (NM_016340, intron 5 of 27) 86997 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 377.75-12 chr7 46717786 46718295 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -20918 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 241.25-37 chr2 158518008 158518256 + 1.25 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 61180 NM_001005476 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 151.5-18 chr10 92390240 92390452 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -28315 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 145.5-117 chr20 60749023 60749306 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 184602 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 262.5-26 chr16 62881051 62881338 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -844756 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 184.25-26 chr11 99987783 99988118 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 7 of 23) MIR|SINE|MIR 431805 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 235.25-31 chr2 31237479 31237868 + 1.25 NA intron (NM_014600, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 3521 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 204.5-121 chr7 46084351 46084631 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -163219 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 118.75-200 chr8 118382632 118382837 + 1.25 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -238267 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 344-23 chr6 137569574 137569957 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -75371 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 257-31 chr20 16901359 16901632 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 153142 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 219.5-118 chr7 3561744 3561993 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 260616 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 139.75-161 chr6 169269859 169269973 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15802 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 311-15 chr18 21759195 21759573 + 1.25 NA intron (NM_020774, intron 1 of 20) AluSg|SINE|Alu 18055 NM_020774 57534 Hs.140903 NM_020774 ENSG00000101752 MIB1 DIP-1|DIP1|LVNC7|MIB|ZZANK2|ZZZ6 mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 114.25-24 chr11 25029880 25030088 + 1.25 NA intron (NM_001009909, intron 9 of 11) intron (NM_001009909, intron 9 of 11) 532931 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 229.75-52 chr3 131033327 131033608 + 1.25 NA intron (NM_001353039, intron 3 of 16) intron (NM_001353039, intron 3 of 16) 5739 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 203-35 chr15 40534435 40534771 + 1.25 NA intron (NM_001289132, intron 3 of 3) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -2053 NR_002208 359821 Hs.678598 NR_002208 MRPL42P5 - mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 5 pseudo 209.5-81 chr20 50336632 50336815 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -15381 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 154.5-34 chr11 5394549 5394933 + 1.25 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) 5364 NM_001004756 390059 Hs.553731 NM_001004756 ENSG00000184698 OR51M1 HOR5'Beta7|OR11-40 olfactory receptor family 51 subfamily M member 1 protein-coding 263.25-3 chr1 85341327 85341671 + 1.25 NA intron (NM_001134445, intron 5 of 6) intron (NM_001134445, intron 5 of 6) 63007 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 231.75-29 chr18 3966290 3966612 + 1.25 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 4098 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 142.75-189 chr8 126104893 126105130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153814 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 121.25-70 chr15 81561519 81561700 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -187396 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 293.5-19 chr17 63135796 63136209 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 169767 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 191.5-136 chr7 49548816 49549092 + 1.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -224684 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 226-50 chr5 2582869 2583206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129554 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 278-37 chr7 103812046 103812400 + 1.25 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) intron (NM_005045, intron 3 of 64) 177293 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 239-3 chr1 93027340 93027710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51710 NM_001164393 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 196-102 chrX 22119941 22120118 + 1.25 NA intron (NM_001282754, intron 11 of 20) intron (NM_001282754, intron 11 of 20) 52954 NR_046639 100873942 Hs.633194 NR_046639 ENSG00000224204 PHEX-AS1 - PHEX antisense RNA 1 ncRNA 430.5 chr1 208949116 208949698 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -23047 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 434.75-4 chr16 62040630 62041211 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4482 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 260-30 chr5 26543664 26543923 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 494793 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 307.25-30 chr4 149877916 149878467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62348 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 330.75-22 chr6 162536007 162536548 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -190855 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 232.25-33 chr2 99910039 99910251 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 195438 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 146.5-200 chr7 19802275 19802492 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -28766 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 190.25-129 chr9 72505640 72505835 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16064 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 169.5-99 chr22 28576930 28577127 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MA3|LINE|L1 102837 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 277.75-4 chr12 105207430 105207840 + 1.25 NA intron (NM_001251904, intron 7 of 20) intron (NM_001251904, intron 7 of 20) 25770 NM_001251905 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 339-12 chr16 14183505 14184041 + 1.25 NA intron (NM_001308142, intron 3 of 16) intron (NM_001308142, intron 3 of 16) -2913 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 161.25-58 chr15 23671334 23671507 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15885 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 284.75-41 chr8 106568292 106568724 + 1.25 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -89300 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 210.75-48 chr2 218694777 218695091 + 1.25 NA intron (NM_001243313, intron 21 of 26) intron (NM_001243313, intron 21 of 26) -15901 NM_014640 9654 Hs.471405 NM_014640 ENSG00000135912 TTLL4 - tubulin tyrosine ligase like 4 protein-coding 193.75-14 chr10 11660244 11660441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48553 NR_125732 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 275.25-25 chr22 26592034 26592446 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2108 NM_001362922 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 187.25-23 chr12 24720753 24721093 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -136755 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 242.5-50 chr2 151458790 151459226 + 1.25 NA intron (NM_001177665, intron 24 of 33) intron (NM_001177665, intron 24 of 33) 49106 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 215.25-68 chr4 52114043 52114349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62892 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 327.25-18 chr5 29955345 29955657 + 1.25 NA Intergenic LTR86B2|LTR|ERVL 74941 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 430.75-12 chr5 50987852 50988272 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17875 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 237-75 chrX 142452077 142452453 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -246975 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 164.25-127 chr5 82005843 82005985 + 1.25 NA intron (NM_031482, intron 2 of 7) intron (NM_031482, intron 2 of 7) 33891 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 239.5-23 chr13 101682335 101682651 + 1.25 NA intron (NM_001271754, intron 6 of 10) intron (NM_001271754, intron 6 of 10) 192541 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 363.75-7 chr19 32116477 32116908 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -10776 NR_110694 101927411 Hs.515337 NR_110694 ENSG00000267204 LINC01782 - long intergenic non-protein coding RNA 1782 ncRNA 310.25-10 chr18 55775851 55776320 + 1.25 NA non-coding (NR_145453, exon 2 of 2) non-coding (NR_145453, exon 2 of 2) 4336 NR_145453 100132501 Hs.634003 NR_145452 LINC01415 TCONS_00026208 long intergenic non-protein coding RNA 1415 ncRNA 147-94 chr3 78187321 78187450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -138422 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 158.5-165 chr6 19729861 19730014 + 1.25 NA non-coding (NR_134651, exon 4 of 4) non-coding (NR_134651, exon 4 of 4) 74822 NR_134650 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 212.5-43 chr18 65910608 65910939 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 159761 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 241.25-56 chr5 59267014 59267284 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 8966 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 242.25-17 chr11 85963420 85963648 + 1.25 NA intron (NM_001008660, intron 19 of 19) intron (NM_001008660, intron 19 of 19) 105550 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 177.5-82 chr2 123345250 123345455 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -271871 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 171.25-88 chr21 30772617 30772827 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17294 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 336.25-17 chr7 3179935 3180317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21553 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 121.5-191 chr4 46053743 46053905 + 1.25 NA intron (NM_173536, intron 7 of 8) intron (NM_173536, intron 7 of 8) 70230 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 278.25-49 chr5 78276102 78276502 + 1.25 NA intron (NM_003664, intron 1 of 26) AluJr|SINE|Alu 18396 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 253.5-50 chr3 97651796 97652160 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) L1PA16|LINE|L1 -112543 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 284.75-33 chr6 132940659 132941028 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 123624 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 370-16 chr6 39372972 39373495 + 1.25 NA intron (NM_001289020, intron 15 of 21) intron (NM_001289020, intron 15 of 21) -50265 NM_001363784 83795 Hs.287765 NM_032115 ENSG00000095981 KCNK16 K2p16.1|TALK-1|TALK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 16 protein-coding 307.25-23 chr3 44679460 44679911 + 1.25 NA intron (NR_157564, intron 1 of 2) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 5968 NR_157564 112840933 NR_157564 ZKSCAN7-AS1 - ZKSCAN7 ZNF cluster antisense RNA 1 ncRNA 212-11 chr10 97269863 97270057 + 1.25 NA intron (NM_032900, intron 1 of 11) intron (NM_032900, intron 1 of 11) 697 NM_001256423 84986 Hs.80305 NM_032900 ENSG00000213390 ARHGAP19 - Rho GTPase activating protein 19 protein-coding 252.25-7 chr11 18106537 18106800 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_138421) promoter-TSS (NM_138421) -586 NM_138421 113174 Hs.591998 NM_138421 ENSG00000166788 SAAL1 SPACIA1 serum amyloid A like 1 protein-coding 226.5-41 chr2 33518352 33518705 + 1.25 NA intron (NM_015376, intron 3 of 16) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 4653 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 271.5-34 chr2 14575451 14575944 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -57020 NM_145175 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 274.25-27 chr2 76993203 76993437 + 1.25 NA intron (NR_110284, intron 3 of 3) L1PA16|LINE|L1 7355 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 191.75-43 chr16 10204923 10205140 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22123 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 128.75-175 chr6 102578850 102579092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1179986 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 285.75-16 chr18 13295976 13296392 + 1.25 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 18079 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 129-176 chr8 76214232 76214354 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -192361 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 178-99 chr8 48064383 48064562 + 1.25 NA 3' UTR (NM_003350, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_003350, exon 4 of 4) 56041 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 198.5-157 chr9 26755309 26755534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137381 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 223.25-28 chr18 65435153 65435333 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -315009 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 121-166 chr6 48299311 48299490 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -230711 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 142.25-26 chr11 28410631 28410859 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 66803 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 236.5-74 chr5 57689393 57689737 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38905 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 318-19 chr20 2432859 2433365 + 1.25 NA TTS (NM_001254734) TTS (NM_001254734) 29935 NR_003684 100113378 NR_003684 SNORD119 - small nucleolar RNA, C/D box 119 snoRNA 171.75-8 chr1 152955283 152955498 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -15258 NM_173080 163778 Hs.433629 NM_173080 ENSG00000184148 SPRR4 - small proline rich protein 4 protein-coding 189.75-100 chr6 51967317 51967537 + 1.25 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) intron (NM_138694, intron 35 of 66) 120186 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 137.25-128 chr5 57653325 57653462 + 1.25 NA intron (NR_104668, intron 1 of 2) intron (NR_104668, intron 1 of 2) 2733 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 140.25-163 chr6 43975081 43975227 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -25431 NR_160954 221416 Hs.531926 NM_153246 ENSG00000181577 C6orf223 - chromosome 6 open reading frame 223 ncRNA 174.75-114 chr7 39727069 39727230 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -6419 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 185-4 chr1 104674357 104674636 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 601473 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 167.5-127 chr4 100256367 100256561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65996 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 236-43 chr3 85735164 85735393 + 1.25 NA intron (NM_001256504, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 8796 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 127.25-116 chr3 23751406 23751556 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54474 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 240.5-38 chr16 68940845 68941138 + 1.25 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) MER101-int|LTR|ERV1 97460 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 301.5-3 chr1 117145421 117145934 + 1.25 NA intron (NM_024626, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu -23928 NM_001145635 80263 Hs.301526 NM_025188 ENSG00000134253 TRIM45 RNF99 tripartite motif containing 45 protein-coding 335.5-14 chr7 25591015 25591432 + 1.25 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 71917 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 144-40 chr14 92087716 92087886 + 1.25 NA intron (NR_028457, intron 5 of 11) L2|LINE|L2 18781 NM_001164776 4287 Hs.532632 NM_004993 ENSG00000066427 ATXN3 AT3|ATX3|JOS|MJD|MJD1|SCA3 ataxin 3 protein-coding 464.25-7 chr9 94096129 94096576 + 1.25 NA intron (NM_152422, intron 5 of 8) intron (NM_152422, intron 5 of 8) 11888 NM_001253829 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 195.5-42 chr14 85496666 85496999 + 1.25 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -33193 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 188-63 chr6 162052881 162053135 + 1.25 NA intron (NM_013988, intron 2 of 8) intron (NM_013988, intron 2 of 8) 582031 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 239-50 chr6 38094958 38095332 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 4 of 5) intron (NM_021943, intron 4 of 5) 275418 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 127.5-238 chr8 79963063 79963237 + 1.25 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 67109 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 140.5-32 chr11 47311882 47312037 + 1.25 NA intron (NM_130476, intron 26 of 32) intron (NM_130476, intron 26 of 32) -39849 NR_120569 101928943 Hs.664956 NR_120568 ENSG00000256746 LOC101928943 - uncharacterized LOC101928943 ncRNA 244.75-61 chr9 100019449 100019788 + 1.25 NA intron (NM_015051, intron 6 of 11) intron (NM_015051, intron 6 of 11) 79382 NM_015051 23071 Hs.154023 NM_015051 ENSG00000023318 ERP44 PDIA10|TXNDC4 endoplasmic reticulum protein 44 protein-coding 208.25-102 chr9 105415327 105415578 + 1.25 NA intron (NM_001330731, intron 15 of 15) intron (NM_001330731, intron 15 of 15) -32582 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 304.25 chr1 180355363 180355790 + 1.25 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) intron (NM_032360, intron 6 of 7) -80895 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-76 chr17 58051800 58051986 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 31311 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 240-22 chr16 73791360 73791723 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 404736 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 170.25-35 chr14 53772388 53772764 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 175908 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 172.75-70 chr20 15349066 15349235 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) intron (NM_001351663, intron 6 of 17) 152310 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 207.5-61 chr20 18330563 18330825 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 42167 NM_001352454 7692 Hs.472221 NM_003434 ENSG00000125846 ZNF133 ZNF150|pHZ-13|pHZ-66 zinc finger protein 133 protein-coding 254.5-80 chr8 130959258 130959676 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 2 of 17) intron (NM_001115, intron 2 of 17) 81442 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 208.25-74 chr6 47107009 47107291 + 1.25 NA Intergenic 5S|rRNA|rRNA -64818 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 266.5 chr1 37593303 37593647 + 1.25 NA intron (NM_013285, intron 2 of 15) intron (NM_013285, intron 2 of 15) 2462 NM_013285 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 359.5-12 chr7 47242678 47243126 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 221901 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 329.75-5 chr11 38966576 38967153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 318006 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 206-8 chr10 64379207 64379467 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -446191 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 240.5-56 chr2 219089798 219090187 + 1.25 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -29071 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 242.25-61 chr3 171750901 171751240 + 1.25 NA intron (NM_002662, intron 1 of 26) L1ME3Cz|LINE|L1 59413 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 186.75-73 chr3 133758557 133758927 + 1.25 NA intron (NM_001063, intron 8 of 16) L2a|LINE|L2 12349 NM_001354704 7018 Hs.518267 NM_001063 ENSG00000091513 TF HEL-S-71p|PRO1557|PRO2086|TFQTL1 transferrin protein-coding 273.25-35 chr6 117207627 117208012 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -57739 NM_153453 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 137.5-197 chr5 124165106 124165315 + 1.25 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 273310 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 255-30 chr2 172600565 172600837 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001278549, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001278549, exon 12 of 12) 44611 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 282.5-39 chr22 42813573 42814009 + 1.25 NA intron (NM_001142293, intron 10 of 14) intron (NM_001142293, intron 10 of 14) 43482 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 120-29 chr12 27795482 27795615 + 1.25 NA intron (NM_020782, intron 2 of 2) intron (NM_020782, intron 2 of 2) 15315 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 393.5-13 chr6 48589044 48589655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -520660 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 220.25-32 chr2 76076933 76077160 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -366131 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 131-58 chr14 99991638 99991767 + 1.25 NA intron (NM_001330221, intron 1 of 13) MER75|DNA|PiggyBac 20280 NM_001330221 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 265.75-14 chr14 25786761 25787076 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -736621 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 191-70 chr5 162249075 162249312 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 181551 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 305.25-33 chr3 97890843 97891205 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 10 of 21) intron (NM_153605, intron 10 of 21) 69013 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 219.75-30 chr18 70047082 70047347 + 1.25 NA intron (NM_001318520, intron 39 of 47) intron (NM_001318520, intron 39 of 47) -90415 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 269.25-10 chr14 22980219 22980499 + 1.25 NA intron (NM_001289097, intron 1 of 1) intron (NM_001289097, intron 1 of 1) 2192 NM_032876 84962 Hs.655832 NM_032876 ENSG00000129474 AJUBA JUB ajuba LIM protein protein-coding 212.75-15 chr11 69465602 69465905 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -19808 NR_120545 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 178-53 chr20 22006765 22006996 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47210 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 333-16 chr3 97266541 97267214 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -172730 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 205.5-4 chr1 58749845 58750020 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 34115 NM_002228 3725 Hs.696684 NM_002228 ENSG00000177606 JUN AP-1|AP1|c-Jun|p39 Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 255.5-16 chr11 84679430 84679794 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 41330 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 148.5-126 chr20 51130161 51130386 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -107166 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 216.5-22 chr12 60704591 60704856 + 1.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 1015353 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 274.5-51 chr5 40007606 40008048 + 1.25 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -44464 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 248.25-40 chr20 17724892 17725234 + 1.25 NA exon (NM_178477, exon 3 of 4) exon (NM_178477, exon 3 of 4) 25115 NM_001014977 140836 Hs.115366 NM_178477 ENSG00000125888 BANF2 BAF-L|BAF2|BAFL|C20orf179 barrier to autointegration factor 2 protein-coding 229.25-35 chr18 2331717 2332030 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 239632 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 163.25-84 chr21 46043559 46043793 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -54436 NM_058174 1292 Hs.420269 NM_001849 ENSG00000142173 COL6A2 BTHLM1|PP3610|UCMD1 collagen type VI alpha 2 chain protein-coding 121.75-115 chr3 58903121 58903282 + 1.25 NA intron (NR_147234, intron 5 of 10) L1MB5|LINE|L1 78730 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 247.5-55 chr3 99252330 99252822 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -350881 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 205-35 chr2 25642182 25642384 + 1.25 NA intron (NM_033147, intron 2 of 19) intron (NM_033147, intron 2 of 19) 7939 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 292.25-39 chr6 68187243 68187540 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 132040 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 383.25-22 chr5 98631153 98631490 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -137311 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 313.25-24 chr5 32768661 32769188 + 1.25 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) intron (NM_001364460, intron 2 of 6) 57603 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 266.5-13 chr12 6862099 6862500 + 1.25 NA intron (NM_001098536, intron 13 of 19) intron (NM_001098536, intron 13 of 19) -5121 NM_001159287 7167 Hs.524219 NM_000365 ENSG00000111669 TPI1 HEL-S-49|TIM|TPI|TPID triosephosphate isomerase 1 protein-coding 199-62 chr4 91738207 91738462 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 538968 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 171.75-19 chr10 100950587 100950824 + 1.25 NA exon (NM_001136123, exon 17 of 19) exon (NM_001136123, exon 17 of 19) -21824 NM_001203244 57715 Hs.591923 NM_017893 ENSG00000095539 SEMA4G - semaphorin 4G protein-coding 213.25-70 chr9 109168663 109168926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1503 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 157.25-22 chr11 27235404 27235659 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -15418 NR_125766 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-191 chr8 121608925 121609118 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30325 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 266.5-59 chr4 165598391 165598620 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -86134 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 289.25-3 chr1 223709784 223710058 + 1.25 NA intron (NM_001146068, intron 1 of 20) intron (NM_001146068, intron 1 of 20) -2618 NM_001748 824 Hs.350899 NM_001748 ENSG00000162909 CAPN2 CANP2|CANPL2|CANPml|mCANP calpain 2 protein-coding 298.25-27 chr5 129269940 129270377 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126989 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 132.75-175 chr7 42757760 42758063 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51464 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 174.75-138 chr9 36249808 36250046 + 1.25 NA intron (NM_001128227, intron 1 of 11) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 8521 NM_001190383 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 367.25-7 chr5 60562079 60562681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66094 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 310.5-12 chr14 50685879 50686198 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -17732 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 173.25-108 chr6 47135757 47136049 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93571 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 125.25-217 chr9 30219706 30219878 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 188662 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 216.5-57 chr2 48360460 48360671 + 1.25 NA intron (NM_002158, intron 4 of 6) intron (NM_002158, intron 4 of 6) 45883 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 234-36 chr3 19907318 19907708 + 1.25 NA intron (NM_001330688, intron 7 of 14) intron (NM_001330688, intron 7 of 14) 26704 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 287.25-14 chr11 90435208 90435701 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 120403 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 234.5-24 chr14 37023172 37023628 + 1.25 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -71009 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 293-13 chr2 107733852 107734280 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20046 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 217-2 chr1 176137451 176137734 + 1.25 NA intron (NM_022457, intron 6 of 19) MIR|SINE|MIR 69652 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 228.75-3 chr1 62584300 62584661 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001272002, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001272002, exon 16 of 16) -13040 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 497.5-5 chr7 16181645 16182223 + 1.25 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) intron (NM_001101426, intron 9 of 9) -28552 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 185.25-107 chr5 149764784 149765000 + 1.25 NA intron (NM_001172698, intron 1 of 10) intron (NM_001172698, intron 1 of 10) -7048 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 180.75-40 chr14 68733242 68733476 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60555 NM_004926 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 277.75-29 chr6 164906932 164907177 + 1.25 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -84991 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 260-2 chr1 93264699 93264933 + 1.25 NA exon (NM_206886, exon 27 of 28) exon (NM_206886, exon 27 of 28) 80995 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 196.5-123 chr5 40278972 40279174 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 226782 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 203.75-64 chr2 188372023 188372261 + 1.25 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 74650 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 371.25-17 chr8 126408496 126409006 + 1.25 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 83256 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 194.5-56 chr18 31302529 31302826 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -15483 NM_001942 1828 Hs.2633 NM_001942 ENSG00000134760 DSG1 CDHF4|DG1|DSG|EPKHE|EPKHIA|PPKS1|SPPK1 desmoglein 1 protein-coding 210.5-84 chr3 187117962 187118218 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21406 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 255-18 chr16 7490324 7490545 + 1.25 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 157589 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 221-18 chr12 113611161 113611380 + 1.25 NA Intergenic ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 139267 NR_126425 104355219 Hs.641707 NR_126425 LHX5-AS1 locus 4010|locus4010 LHX5 antisense RNA 1 ncRNA 201.25-33 chr15 20644777 20644963 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 82521 NR_027411 729786 Hs.592025 NR_027411 ENSG00000181984 GOLGA8CP GOLGA8C golgin A8 family member C, pseudogene pseudo 210.75-66 chr4 57476826 57477045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51063 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 128.25-219 chr9 36086959 36087128 + 1.25 NA TTS (NM_001316346) TTS (NM_001316346) -49493 NR_104640 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 218.75-16 chr11 116448595 116448795 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -190727 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 279.5-18 chr13 87889345 87889810 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79057 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 259.5-87 chr7 28670305 28670717 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -15622 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 162.25-122 chr4 169562022 169562326 + 1.25 NA exon (NM_001199398, exon 13 of 35) exon (NM_001199398, exon 13 of 35) 50409 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 302.75-8 chr15 59937046 59937319 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67129 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 137.75-12 chr1 189841040 189841171 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 634905 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 211.25-30 chr16 20632440 20632651 + 1.25 NA intron (NR_134918, intron 8 of 10) L1MB4|LINE|L1 -56178 NM_001105069 348158 Hs.298252 NM_182617 ENSG00000066813 ACSM2B ACSM2|HXMA|HYST1046 acyl-CoA synthetase medium chain family member 2B protein-coding 263.75-26 chr2 29749773 29750018 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 171691 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 157-84 chr4 69776135 69776491 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15693 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 176.25-75 chr2 185298618 185298856 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -131665 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 312.5-36 chr8 117727370 117727745 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 193356 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 274-16 chr16 9656015 9656453 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -200729 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 191.75-5 chr1 116404184 116404382 + 1.25 NA TTS (NR_024124) TTS (NR_024124) 14276 NR_024126 84852 Hs.664752 NM_032766 ENSG00000203865 ATP1A1-AS1 ATP1A1OS|C1orf203 ATP1A1 antisense RNA 1 ncRNA 272.5-23 chr13 92470017 92470403 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -19953 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 234.75-4 chr1 84113663 84114073 + 1.25 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 -30403 NM_182948 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 137.25-47 chr14 80792657 80792953 + 1.25 NA non-coding (NR_157142, exon 14 of 25) non-coding (NR_157142, exon 14 of 25) 148933 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 210.5-12 chr1 240748004 240748331 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -136012 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 214.25-78 chr8 13394345 13394651 + 1.25 NA intron (NM_024767, intron 3 of 4) intron (NM_024767, intron 3 of 4) -117714 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 137.5-19 chr1 214365780 214365922 + 1.25 NA intron (NM_005401, intron 17 of 18) intron (NM_005401, intron 17 of 18) 84692 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 173.75 chr1 8485405 8485608 + 1.25 NA intron (NM_001042681, intron 10 of 22) L1ME1|LINE|L1 9407 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 168.75-156 chr8 123773706 123773860 + 1.25 NA intron (NM_144963, intron 1 of 23) intron (NM_144963, intron 1 of 23) 5344 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 238-49 chr3 147506681 147506931 + 1.25 NA intron (NR_121655, intron 1 of 2) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 85479 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 349.25-7 chr20 19122211 19122722 + 1.25 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -90176 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 260-33 chr5 75210537 75210748 + 1.25 NA intron (NM_001164443, intron 4 of 24) intron (NM_001164443, intron 4 of 24) 26236 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 190.75-19 chr12 23737982 23738196 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 8 of 17) L2a|LINE|L2 -153503 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 190.5-17 chr10 99332086 99332266 + 1.25 NA intron (NM_020348, intron 1 of 10) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 2820 NM_020348 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 187.5-51 chr13 89178031 89178307 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57122 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 154.25-145 chr6 119411223 119411388 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -61544 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 196.5-28 chr11 29592116 29592302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2204 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 201.25-13 chr10 42977664 42977836 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 3757 NR_126352 104266963 Hs.559152 NR_126352 ENSG00000229630 LINC01264 - long intergenic non-protein coding RNA 1264 ncRNA 277.25-48 chr9 28916500 28916907 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) MER4D1|LTR|ERV1 -27748 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 218.5-83 chr4 47874845 47875182 + 1.25 NA intron (NR_103795, intron 19 of 23) intron (NR_103795, intron 19 of 23) -36907 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 119-74 chr18 78338014 78338149 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -344354 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 236.75-68 chrX 41844418 41844741 + 1.25 NA intron (NM_003688, intron 2 of 26) L1MB7|LINE|L1 78455 NM_001126055 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 247.25-18 chr14 79368311 79368812 + 1.25 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 89181 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 289.25 chr1 116937269 116937642 + 1.25 NA intron (NM_020440, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 27539 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 263.5-14 chr13 78071871 78072177 + 1.25 NA intron (NR_047001, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 17169 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 231.75-46 chr3 29419650 29419997 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 138511 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 155.75-42 chr12 65311008 65311182 + 1.25 NA intron (NM_001031679, intron 2 of 6) intron (NM_001031679, intron 2 of 6) 32108 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 310.25-12 chr19 41113863 41114182 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_000774) promoter-TSS (NM_000774) -410 NM_000774 1572 Hs.558318 NM_000774 ENSG00000197446 CYP2F1 C2F1|CYP2F|CYPIIF1 cytochrome P450 family 2 subfamily F member 1 protein-coding 266-20 chr17 52349330 52349738 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40988 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 157-75 chr3 47584161 47584402 + 1.25 NA TTS (NM_003074) TTS (NM_003074) -4041 NM_001206945 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 249.5-88 chr7 48316005 48316250 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 26 of 61) intron (NM_152701, intron 26 of 61) 144669 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 182-4 chr1 40715698 40715968 + 1.25 NA intron (NM_001142590, intron 3 of 14) intron (NM_001142590, intron 3 of 14) 6467 NM_001308115 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 153-81 chr2 224678579 224678784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93284 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 337.75-14 chr3 140313013 140313429 + 1.25 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 195568 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 210-90 chr7 34520494 34520802 + 1.25 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) MER45C|DNA|hAT-Tip100 -137570 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 129.25-23 chr10 83997572 83997875 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141786 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 155.25-132 chr4 62223038 62223305 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61406 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-30 chr12 27211489 27211664 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -32710 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 168-74 chr20 1201381 1201612 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -1958 NM_001009612 400831 Hs.148503 NM_001009612 ENSG00000215595 C20orf202 - chromosome 20 open reading frame 202 protein-coding 142.75-180 chr7 103812667 103812823 + 1.25 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) intron (NM_005045, intron 3 of 64) 176771 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 287.75-33 chr20 57683871 57684230 + 1.25 NA intron (NM_199171, intron 1 of 3) intron (NM_199171, intron 1 of 3) 6636 NM_001255976 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 339.5-19 chr4 30769491 30769935 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 49344 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 147.5-77 chr16 4732355 4732510 + 1.25 NA intron (NM_001308089, intron 1 of 16) intron (NM_001308089, intron 1 of 16) 1839 NM_133450 124401 Hs.654859 NM_133450 ENSG00000168096 ANKS3 - ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 228.5-43 chr17 52435532 52435914 + 1.25 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 45201 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 362.5-14 chr3 95505419 95505923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 177522 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 138.5-138 chr3 116437487 116437730 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 7879 NM_002338 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 146.5-190 chr6 119633872 119634020 + 1.25 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 84138 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 319.25-10 chr20 58686163 58686440 + 1.25 NA intron (NR_037945, intron 8 of 22) MER45A|DNA|hAT-Tip100 -2830 NM_001204873 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 130-79 chr2 162225534 162225702 + 1.25 NA intron (NM_004460, intron 3 of 25) intron (NM_004460, intron 3 of 25) 17827 NM_001291807 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 234.5-69 chr4 37011940 37012299 + 1.25 NA intron (NR_134669, intron 1 of 1) L1MA1|LINE|L1 10340 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 137-15 chr1 207780421 207780574 + 1.25 NA intron (NM_172352, intron 7 of 11) L1MB4|LINE|L1 21442 NR_029832 407026 NR_029832 ENSG00000284214 MIR29C MIRN29C|miRNA29C|mir-29c microRNA 29c ncRNA 204-63 chr5 30223837 30224095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 343406 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 249.25-30 chr21 26524437 26524672 + 1.25 NA intron (NR_135515, intron 2 of 3) intron (NR_135515, intron 2 of 3) 48732 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 209.25-60 chr2 124007868 124008079 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17201 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 250.25-8 chr13 34991229 34991517 + 1.25 NA intron (NM_015678, intron 1 of 57) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 49086 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 297.75-36 chr5 129598395 129598898 + 1.25 NA intron (NM_133638, intron 8 of 22) L1MA8|LINE|L1 -137957 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 303 chr1 42108282 42108621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44959 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 253.5-25 chr14 69130283 69130676 + 1.25 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 22120 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 244.5-34 chr17 17708875 17709098 + 1.25 NA intron (NM_030665, intron 1 of 5) intron (NM_030665, intron 1 of 5) 27528 NM_030665 10743 Hs.655395 NM_030665 ENSG00000108557 RAI1 SMCR|SMS retinoic acid induced 1 protein-coding 227.75-69 chr5 148092442 148092715 + 1.25 NA intron (NM_006846, intron 8 of 32) intron (NM_006846, intron 8 of 32) 28598 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 161.5-57 chr14 59885763 59885976 + 1.25 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -15093 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 228.25-50 chr22 23128695 23129058 + 1.25 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 13114 NM_014433 27156 Hs.526920 NM_014433 ENSG00000100218 RSPH14 RTDR1 radial spoke head 14 homolog protein-coding 250.75-62 chr7 19591264 19591669 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 113970 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 154.25-134 chr5 131867219 131867416 + 1.25 NA intron (NM_001303622, intron 9 of 12) L1MC1|LINE|L1 -70300 NM_133372 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 390-12 chr6 12637017 12637548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51878 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 192-68 chr20 12222216 12222452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 304441 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 464 chr12 41646878 41647261 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117120 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 248.75-52 chr5 39715547 39715821 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 195253 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 158.75-24 chr10 121957648 121957954 + 1.25 NA intron (NM_001167865, intron 10 of 10) intron (NM_001167865, intron 10 of 10) 17416 NM_001167865 54780 Hs.258798 NM_017615 ENSG00000107672 NSMCE4A C10orf86|NS4EA|NSE4A NSE4 homolog A, SMC5-SMC6 complex component protein-coding 202.5-52 chr15 72449066 72449262 + 1.25 NA intron (NR_135678, intron 1 of 3) L1MD2|LINE|L1 25075 NR_135678 105370888 Hs.540241 NR_135678 ENSG00000261423 TMEM202-AS1 - TMEM202 antisense RNA 1 ncRNA 330.75-15 chr20 19256207 19256567 + 1.25 NA intron (NR_024564, intron 6 of 7) L1MB8|LINE|L1 28209 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 181.5-105 chr3 34293629 34293830 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 495099 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 320.5-34 chr5 141132515 141132787 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -2555 NM_015669 26167 Hs.119693 NM_015669 ENSG00000113209 PCDHB5 PCDH-BETA5 protocadherin beta 5 protein-coding 289.5-46 chr7 38819992 38820480 + 1.25 NA intron (NM_014396, intron 6 of 28) L2c|LINE|L2 88955 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 228.5-30 chr12 71565211 71565425 + 1.25 NA intron (NR_110596, intron 8 of 19) MIRb|SINE|MIR 98530 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 226.25-43 chr21 32851457 32851799 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37925 NM_001162496 56245 Hs.517235 NM_019596 ENSG00000205929 C21orf62 B37|C21orf120|PRED81 chromosome 21 open reading frame 62 protein-coding 298.25-21 chr3 46093933 46094398 + 1.25 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -66682 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 181.25-12 chr10 27870009 27870258 + 1.25 NA intron (NM_001290021, intron 10 of 13) intron (NM_001290021, intron 10 of 13) 111738 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 179-53 chr2 66080217 66080427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 278006 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 257.25-21 chr2 56878520 56878934 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -692957 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 308.25-12 chr17 65577637 65578200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16270 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 240-53 chr5 162175709 162176141 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 108283 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 180-6 chr1 213920242 213920478 + 1.25 NA intron (NR_037850, intron 2 of 5) intron (NR_037850, intron 2 of 5) -4389 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 171.75-43 chr14 72726166 72726440 + 1.25 NA intron (NM_001280544, intron 4 of 9) intron (NM_001280544, intron 4 of 9) 166346 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 188.25-87 chr5 7520135 7520422 + 1.25 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 124140 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 240.75-44 chr2 88313531 88313933 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 138961 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 185.75-99 chr5 43543834 43544036 + 1.25 NA intron (NM_006451, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu 13142 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 154.75-45 chr15 53305110 53305288 + 1.25 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 188834 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 267.5-9 chr10 12933772 12934039 + 1.25 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) L1MCa|LINE|L1 67808 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 255.75-22 chr18 46203605 46203918 + 1.25 NA intron (NM_001008239, intron 1 of 3) AluSz6|SINE|Alu 29727 NM_145055 147339 Hs.116486 NM_145055 ENSG00000152242 C18orf25 ARKL1|Ark2N|RNF111L1 chromosome 18 open reading frame 25 protein-coding 216.25-79 chr4 115306999 115307275 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -193517 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 131.5-98 chr19 2857182 2857362 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001172775, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001172775, exon 4 of 4) -10063 NM_001300843 80032 Hs.287433 NM_024967 ENSG00000172000 ZNF556 - zinc finger protein 556 protein-coding 157.5-73 chr16 47624527 47624700 + 1.25 NA intron (NM_001031835, intron 15 of 31) intron (NM_001031835, intron 15 of 31) 163282 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 261-15 chr13 104711433 104711861 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -754220 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 171.5-157 chr8 129231573 129231931 + 1.25 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 9488 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 255-23 chr2 15224229 15224794 + 1.25 NA intron (NM_015909, intron 47 of 51) intron (NM_015909, intron 47 of 51) 336823 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 147-53 chr17 66015800 66015996 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 16 of 26) L1M6|LINE|L1 175994 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 170-70 chr4 72383830 72383998 + 1.25 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) L1MEf|LINE|L1 185307 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 115-163 chr6 162947093 162947253 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) L1MA4|LINE|L1 106988 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 160.5-173 chr7 71214335 71214751 + 1.25 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) intron (NM_022479, intron 1 of 10) 82399 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 231.25-76 chr8 138189007 138189503 + 1.25 NA intron (NM_015912, intron 9 of 19) LTR1D1|LTR|ERV1 -105710 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 196.5-75 chr2 5909179 5909400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23398 NR_026832 150622 Hs.560891 NR_026832 SILC1 LINC01105 sciatic injury induced lincRNA upregulator of SOX11 ncRNA 123.25-85 chr18 11663235 11663459 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8406 NR_106975 102465690 NR_106975 ENSG00000283492 MIR7153 hsa-mir-7153|mir-7153 microRNA 7153 ncRNA 222.5-36 chr16 11708518 11708767 + 1.25 NA intron (NM_001303447, intron 5 of 12) intron (NM_001303447, intron 5 of 12) 34215 NM_001303447 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 199.75-44 chr2 37396045 37396239 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51512 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 119-182 chr7 30621765 30621927 + 1.25 NA intron (NM_002047, intron 11 of 16) intron (NM_002047, intron 11 of 16) 26968 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 275.75-16 chr15 87093435 87093759 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105171 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 308.25-30 chr6 167160234 167160577 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2574 NM_005299 2853 Hs.248124 NM_005299 ENSG00000120436 GPR31 12-HETER|HETER|HETER1 G protein-coupled receptor 31 protein-coding 160-83 chr5 23010990 23011325 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -157813 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 307.25-27 chr4 12297534 12297898 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74265 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 184-45 chr2 156684651 156684922 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 248407 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 225.5 chr1 48675909 48676341 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 6 of 12) intron (NM_001323575, intron 6 of 12) 100766 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 154.25-81 chr2 71953005 71953206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 194757 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 298.75-19 chr16 79013126 79013457 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 587446 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 249.25-37 chr4 144298857 144299373 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -158397 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 195.5-28 chr12 19001608 19001947 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -127956 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 159.5-7 chr1 163831128 163831350 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -408048 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 256-75 chr9 27175978 27176231 + 1.25 NA intron (NM_001290077, intron 6 of 21) intron (NM_001290077, intron 6 of 21) 66963 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 385.75-2 chr14 46807878 46808431 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -156373 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 232.5-6 chr1 164924351 164924652 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149860 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 195-9 chr10 27950854 27951048 + 1.25 NA intron (NM_001290021, intron 3 of 13) L1ME3G|LINE|L1 30920 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 235.25-65 chr8 130536488 130536805 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92972 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 366.5-22 chr9 75975580 75975932 + 1.25 NA intron (NR_120409, intron 2 of 19) intron (NR_120409, intron 2 of 19) 85083 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 185.25-50 chr18 10936958 10937233 + 1.25 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) -177446 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 247.5-27 chr15 81396626 81396859 + 1.25 NA intron (NR_120365, intron 6 of 6) L1MD|LINE|L1 -22529 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 195.25-62 chr3 26299552 26299946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -323057 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 172.75-95 chr5 57894516 57894683 + 1.25 NA intron (NR_109900, intron 2 of 2) intron (NR_109900, intron 2 of 2) 4563 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 199.75-12 chr11 5607540 5607712 + 1.25 NA intron (NM_001003818, intron 4 of 7) intron (NM_001003818, intron 4 of 7) 10989 NM_001198644 117854 Hs.729048 NM_058166 ENSG00000121236 TRIM6 RNF89 tripartite motif containing 6 protein-coding 216.25-17 chr11 18876618 18876860 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 58263 NM_147199 259249 Hs.711459 NM_147199 ENSG00000170255 MRGPRX1 GPCR|MGRG2|MRGX1|SNSR4 MAS related GPR family member X1 protein-coding 215.75-108 chrX 98025064 98025269 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -460631 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 281.5-27 chr2 53156897 53157439 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -454553 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 228.5-107 chr9 32376917 32377180 + 1.25 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -7555 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 202-11 chr10 59943511 59943809 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17253 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 253.25-10 chr11 7573331 7573601 + 1.25 NA intron (NM_003621, intron 3 of 23) MER58B|DNA|hAT-Charlie -3301 NM_001351861 8495 Hs.655714 NM_003621 ENSG00000166387 PPFIBP2 Cclp1 PPFIA binding protein 2 protein-coding 120-105 chr21 27757520 27757639 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 35200 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 294.5-8 chr11 78054701 78055100 + 1.25 NA intron (NM_001203262, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu -8709 NM_001282406 65987 Hs.709780 NM_023930 ENSG00000151364 KCTD14 - potassium channel tetramerization domain containing 14 protein-coding 239-59 chr8 110076152 110076404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100507 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 211.25-71 chr5 24571055 24571347 + 1.25 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) intron (NM_001362460, intron 2 of 9) 73777 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 271.5-3 chr1 67089339 67089750 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35396 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 359.75-18 chr6 40158423 40158811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 197389 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 171.25-40 chr13 27242187 27242339 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5006 NR_120429 102723332 Hs.133166 NR_120429 LINC00412 - long intergenic non-protein coding RNA 412 ncRNA 131.25-170 chr5 152452236 152452581 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -47129 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 137.75-150 chr4 48173140 48173397 + 1.25 NA intron (NM_003215, intron 3 of 17) intron (NM_003215, intron 3 of 17) -39018 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 409.75-6 chr5 85887105 85887525 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -395129 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 267.5-33 chr17 65982619 65983216 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) L1MB5|LINE|L1 -156374 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 140.25-74 chr17 70023036 70023217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28145 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 451.75 chr8 107153520 107154122 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 182694 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 199-69 chr5 84631921 84632344 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -247252 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 121.75-203 chrX 64720519 64720702 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 255840 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 159.25-45 chr15 87219603 87219753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -231252 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 205.5-151 chr8 112673247 112673531 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 14 of 66) intron (NM_001363185, intron 14 of 66) 29896 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 346-13 chr3 5533469 5533846 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -283402 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 373.25-3 chr10 32909466 32909832 + 1.25 NA intron (NM_002211, intron 14 of 15) L1M5|LINE|L1 -8177 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 229.75-39 chr20 9942939 9943238 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -43245 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 167-96 chr6 16482163 16482374 + 1.25 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) L2a|LINE|L2 243681 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 172.25-23 chr11 26696720 26696951 + 1.25 NA intron (NM_178498, intron 8 of 14) intron (NM_178498, intron 8 of 14) 25225 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 185.25-110 chr5 173231638 173231880 + 1.25 NA TTS (NM_004387) TTS (NM_004387) 3447 NM_001166175 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 191.25-19 chr11 90670106 90670286 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR -114339 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 351-11 chr2 32557198 32557598 + 1.25 NA TTS (NR_125793) TTS (NR_125793) 17420 NR_125793 103752586 Hs.666092 NR_125793 ENSG00000279897 BIRC6-AS2 linc-birc6|megamind BIRC6 antisense RNA 2 ncRNA 159-9 chr10 14335323 14335568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4521 NM_018027 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 176.75-36 chr14 55863523 55863801 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -66988 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 268.75-33 chr4 125069408 125069820 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -246798 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 326.25-19 chr2 54164343 54164801 + 1.25 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) X7B_LINE|LINE|CR1 41289 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 219.75-12 chr10 91542461 91542745 + 1.25 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) intron (NR_024467, intron 1 of 4) 68857 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 164.25-131 chr5 136539603 136539875 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -174263 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 290.75-40 chr4 32816625 32817044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 465796 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 227.25-74 chr7 80719137 80719468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72649 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 123.25-147 chr4 61625926 61626100 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 423841 NM_001371342 235-37 chr21 20638069 20638451 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 164848 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 286.25-30 chr8 106876640 106876973 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -106562 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 209.75-27 chr14 61995416 61995728 + 1.25 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) intron (NM_001367657, intron 3 of 6) 67877 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 218.75-69 chr5 39770235 39770490 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 249931 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 249.25-21 chr2 65330895 65331152 + 1.25 NA intron (NM_001128210, intron 4 of 5) intron (NM_001128210, intron 4 of 5) 35755 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 222.5-97 chr6 69701899 69702272 + 1.25 NA intron (NM_001367272, intron 9 of 15) intron (NM_001367272, intron 9 of 15) 94381 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 153.75-50 chr16 2707624 2707811 + 1.25 NA 3' UTR (NM_018992, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_018992, exon 6 of 6) 12507 NM_031948 83886 Hs.332878 NM_031948 ENSG00000172382 PRSS27 CAPH2|MPN serine protease 27 protein-coding 254.25-62 chr7 93098983 93099601 + 1.25 NA TTS (NM_001193307) TTS (NM_001193307) 18687 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 180-23 chr12 106860122 106860410 + 1.25 NA intron (NR_147137, intron 7 of 10) intron (NR_147137, intron 7 of 10) -85435 NR_040246 100287944 Hs.742087 NR_040246 ENSG00000257545 LOC100287944 - uncharacterized LOC100287944 ncRNA 152-44 chr13 59031683 59031832 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -798640 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 127.25-11 chr1 247897697 247897856 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 2189 NM_001001957 343171 Hs.269151 NM_001001957 ENSG00000238243 OR2W3 OR2W3P|OR2W8P|OST718 olfactory receptor family 2 subfamily W member 3 protein-coding 237-56 chr6 72206434 72206635 + 1.25 NA intron (NM_014989, intron 6 of 33) L1MEi|LINE|L1 -6359 NM_001350455 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 158.25-102 chr4 61359965 61360253 + 1.25 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 157937 NM_001371342 233.75-46 chr22 26070968 26071291 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98333 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 214.25-51 chr21 23934141 23934353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 387130 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 184.75-87 chr6 117553347 117553509 + 1.25 NA intron (NM_173674, intron 14 of 14) intron (NM_173674, intron 14 of 14) 49083 NM_001017408 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 294.25-7 chr11 112982883 112983217 + 1.25 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -19590 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 180-99 chr5 41334450 41334724 + 1.25 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) (TTAGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -73118 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 268-6 chr1 149942207 149942486 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020205, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_020205, exon 12 of 12) -5467 NM_001145862 10903 Hs.425144 NM_006697 ENSG00000014914 MTMR11 CRA myotubularin related protein 11 protein-coding 163.75-53 chr16 71728740 71729010 + 1.25 NA TTS (NM_001030007) TTS (NM_001030007) -4174 NM_015020 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 144.5-8 chr1 82648403 82648591 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -254686 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 169.75-45 chr13 106283467 106283643 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -93009 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 348.25-12 chr9 123083944 123084378 + 1.25 NA intron (NM_012197, intron 19 of 25) MIRc|SINE|MIR 27482 NR_030331 693185 NR_030331 ENSG00000283941 MIR600 MIRN600|hsa-mir-600 microRNA 600 ncRNA 213.75-65 chr3 22196276 22196506 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 239252 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 229.75-7 chr10 44213484 44213901 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79058 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 202.25-6 chr1 105942440 105942762 + 1.25 NA intron (NR_146609, intron 5 of 5) L1PB1|LINE|L1 85652 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 188-24 chr14 60673354 60673671 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -24035 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 230.5-9 chr1 214800597 214800940 + 1.25 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 197573 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 145.5-134 chr3 105530459 105530634 + 1.25 NA intron (NM_001243280, intron 3 of 14) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 163637 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 142.5-55 chr12 121368595 121368786 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14481 NM_001137559 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 208-69 chr6 21472608 21472989 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 39094 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 126.75-111 chr2 100124494 100124624 + 1.25 NA intron (NM_002285, intron 1 of 23) L1MEi|LINE|L1 18031 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 120.5-96 chr17 30316388 30316607 + 1.25 NA 3' UTR (NM_206832, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_206832, exon 7 of 7) 17560 NM_206832 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 326.75-6 chr14 51163965 51164248 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -68402 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 381.5-5 chr5 58940380 58940701 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 59358 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 258.5-33 chr18 34434297 34434674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58805 NM_032975 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 168.75-106 chr4 152442122 152442344 + 1.25 NA intron (NM_001349798, intron 2 of 13) intron (NM_001349798, intron 2 of 13) 47183 NR_036092 100422896 NR_036092 ENSG00000264678 MIR3140 mir-3140 microRNA 3140 ncRNA 447.5-6 chr6 143050446 143051297 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8492 NM_001286587 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 138.5-106 chr2 68903467 68903617 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -32145 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 219.25-12 chr10 35231385 35231863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15401 NM_181698 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 453.75-8 chr5 29465785 29466321 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -70077 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 120.25-149 chr4 60264980 60265336 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -657461 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 178.75-93 chr6 73124037 73124233 + 1.25 NA intron (NM_001160130, intron 8 of 12) intron (NM_001160130, intron 8 of 12) 19379 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 131-182 chr9 35018074 35018274 + 1.25 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -22921 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 144.75-85 chr2 63862842 63862997 + 1.25 NA intron (NM_001001521, intron 3 of 9) intron (NM_001001521, intron 3 of 9) 21039 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 236.5-58 chr3 31043950 31044319 + 1.25 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 117653 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 209.25-6 chr1 78405494 78405689 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -85383 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 229-20 chr16 55403085 55403322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59094 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 211.5-103 chr3 131802642 131802871 + 1.25 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) 183175 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 290-48 chr8 86968686 86969064 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MER4A|LTR|ERV1 102460 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 164-110 chr5 171655842 171656107 + 1.25 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -129898 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 231-35 chr17 28312712 28312965 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -5456 NR_028334 284085 Hs.371796 NM_173624 ENSG00000265480 KRT18P55 - keratin 18 pseudogene 55 pseudo 154-40 chr14 77145583 77145719 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3860 NM_174976 283576 Hs.525485 NM_174976 ENSG00000177108 ZDHHC22 C14orf59 zinc finger DHHC-type containing 22 protein-coding 355.5-6 chr10 83115008 83115556 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 561807 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 202.5-56 chr17 29419618 29419860 + 1.25 NA intron (NM_025142, intron 1 of 17) AluJo|SINE|Alu 28814 NM_025142 57551 Hs.597434 NM_020791 ENSG00000160551 TAOK1 KFC-B|MAP3K16|MARKK|PSK-2|PSK2|TAO1|hKFC-B|hTAOK1 TAO kinase 1 protein-coding 121.25-52 chr14 39726212 39726327 + 1.25 NA Intergenic (TTTCATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -293769 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 179-70 chr4 32613979 32614234 + 1.25 NA Intergenic MER72B|LTR|ERV1 263068 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 350.5-17 chr20 56482228 56482643 + 1.25 NA intron (NM_001283036, intron 4 of 8) MER2|DNA|TcMar-Tigger 13850 NM_001283037 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 296.75-16 chr2 44925389 44925638 + 1.25 NA intron (NR_147195, intron 1 of 1) intron (NR_147195, intron 1 of 1) 13375 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 114.25-200 chr8 142036221 142036388 + 1.25 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -140035 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 306.25-26 chr22 25196503 25197049 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001145206, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001145206, exon 11 of 11) -3082 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 245.75-32 chr20 52495297 52495638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125371 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 220.75-73 chr8 59272576 59272821 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 153488 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 367.5-7 chr10 11682786 11683290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59344 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 200-60 chr3 118535663 118535945 + 1.25 NA intron (NR_135547, intron 3 of 3) intron (NR_135547, intron 3 of 3) -105964 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 176.75-142 chrX 93386532 93386745 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 286940 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 198-24 chr14 53621757 53622042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 326585 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 287.5-55 chr8 141297032 141297594 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42684 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 177.75-90 chr20 34752353 34752584 + 1.25 NA intron (NM_001242539, intron 6 of 11) L2a|LINE|L2 29936 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 370.5-5 chr13 63675873 63676321 + 1.25 NA intron (NR_047011, intron 3 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -61338 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 243.25-41 chr5 18445983 18446263 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 638849 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 122-195 chr9 29109160 29109350 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) UCON76|Unknown|Unknown 103044 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 291.5-25 chr20 18307491 18307874 + 1.25 NA intron (NM_001352450, intron 8 of 9) L1MEf|LINE|L1 19155 NM_001352454 7692 Hs.472221 NM_003434 ENSG00000125846 ZNF133 ZNF150|pHZ-13|pHZ-66 zinc finger protein 133 protein-coding 357.5-18 chr6 44494765 44495314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56842 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 355.5-14 chr18 6401788 6402277 + 1.25 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 12879 NM_001365768 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 152-24 chr10 108319838 108320018 + 1.25 NA Intergenic LTR69|LTR|ERVL -250635 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 203.75-6 chr1 202574676 202574887 + 1.25 NA intron (NM_002481, intron 23 of 23) intron (NM_002481, intron 23 of 23) 34667 NM_001197131 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 250.75-59 chr5 170565079 170565573 + 1.25 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) intron (NM_001278339, intron 1 of 7) 61306 NM_001278339 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 291.5-36 chr5 32625054 32625555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39747 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 178.25-2 chr1 63738777 63739058 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -35100 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 217.5-83 chr3 168402719 168402978 + 1.25 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -149006 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 185.75-57 chr19 39157476 39157816 + 1.25 NA intron (NM_001014834, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 31860 NM_001014831 10298 Hs.20447 NM_005884 ENSG00000130669 PAK4 - p21 (RAC1) activated kinase 4 protein-coding 218-53 chr4 124811770 124812004 + 1.25 NA Intergenic MER11A|LTR|ERVK -99155 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 216.5-47 chr17 45303606 45303935 + 1.25 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) AluY|SINE|Alu 13250 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 117.25-198 chr7 46341902 46342074 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 355134 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 184.75-56 chr2 122099712 122099936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 344173 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 130.5-185 chr4 31731607 31731854 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 225186 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 389 chr10 44500360 44500772 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -115469 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 377-4 chr2 47391925 47392400 + 1.25 NA Intergenic LTR1C1|LTR|ERV1 -10905 NM_000251 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 391.25-8 chr12 51421498 51421900 + 1.25 NA intron (NM_001258401, intron 1 of 24) intron (NM_001258401, intron 1 of 24) -3132 NR_047672 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 229.75-60 chr5 51646044 51646322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 262735 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 217.5-46 chr14 94954617 94955039 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 178675 NM_001195573 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 165.75-40 chr12 60461570 60461750 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 772290 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 175.75-129 chr9 83354788 83355124 + 1.25 NA intron (NM_001244960, intron 3 of 13) intron (NM_001244960, intron 3 of 13) -22995 NM_001244961 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 184.25-52 chr19 33397887 33398209 + 1.25 NA intron (NM_001166056, intron 10 of 12) intron (NM_001166056, intron 10 of 12) 23524 NM_001252296 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 155-122 chr6 89551412 89551620 + 1.25 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) intron (NM_001242809, intron 1 of 15) -10802 NM_001242811 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 161.75-82 chr22 45249272 45249606 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8670 NM_001009880 23313 Hs.592207 NM_015264 ENSG00000100364 KIAA0930 C22orf9|LSC3 KIAA0930 protein-coding 236-14 chr12 18479579 18479945 + 1.25 NA intron (NM_001288774, intron 18 of 32) intron (NM_001288774, intron 18 of 32) 218222 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 265.25-46 chr6 52952473 52952966 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 42565 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 182-70 chr21 32159364 32159699 + 1.25 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -73236 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 195.25-3 chr1 40183553 40183776 + 1.25 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 22277 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 267-22 chr18 55810618 55810883 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29025 NR_145452 100132501 Hs.634003 NR_145452 LINC01415 TCONS_00026208 long intergenic non-protein coding RNA 1415 ncRNA 132.25-170 chr6 133903327 133903438 + 1.25 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 14260 NM_003206 6943 Hs.78061 NM_003206 ENSG00000118526 TCF21 POD1|bHLHa23 transcription factor 21 protein-coding 190-81 chr8 123775419 123775624 + 1.25 NA intron (NM_144963, intron 3 of 23) intron (NM_144963, intron 3 of 23) 7082 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 200.75-100 chr7 88636786 88636988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122813 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 207.75-7 chr1 113650405 113650704 + 1.25 NA intron (NM_001142782, intron 13 of 20) intron (NM_001142782, intron 13 of 20) 108601 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 373.25-2 chr1 225784712 225785097 + 1.25 NA intron (NM_003133, intron 2 of 2) intron (NM_003133, intron 2 of 2) 7091 NM_001130440 6726 Hs.511425 NM_003133 ENSG00000143742 SRP9 ALURBP signal recognition particle 9 protein-coding 235.25-68 chrX 46503069 46503336 + 1.25 NA intron (NM_001190417, intron 5 of 5) L1MEi|LINE|L1 42219 NM_001146291 641339 Hs.636105 NM_001039891 ENSG00000251192 ZNF674 MRX92|ZNF673B zinc finger protein 674 protein-coding 226.25-37 chr2 124835150 124835444 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) intron (NM_130773, intron 19 of 23) 810010 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 252-68 chr8 13557862 13558182 + 1.25 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) MER65C|LTR|ERV1 -8847 NM_001007090 157773 Hs.104941 NM_001007090 ENSG00000164743 C8orf48 - chromosome 8 open reading frame 48 protein-coding 306.75-2 chr10 54548245 54548613 + 1.25 NA intron (NM_001142771, intron 2 of 34) intron (NM_001142771, intron 2 of 34) 59528 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 130.25-96 chr2 61339575 61339813 + 1.25 NA intron (NM_014709, intron 16 of 79) intron (NM_014709, intron 16 of 79) 77683 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 169.5-78 chr2 152555183 152555468 + 1.25 NA intron (NM_052905, intron 4 of 25) intron (NM_052905, intron 4 of 25) 162136 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 235-34 chr2 203293620 203293910 + 1.25 NA intron (NM_177538, intron 11 of 12) L1PB1|LINE|L1 -34474 NM_001282932 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 170-13 chr10 114286695 114286849 + 1.25 NA intron (NM_001272046, intron 11 of 13) MIR|SINE|MIR 47158 NM_001320804 340706 Hs.197741 NM_198496 ENSG00000165816 VWA2 AMACO|CCSP-2|CCSP2|NET42 von Willebrand factor A domain containing 2 protein-coding 206.5-126 chr7 96296184 96296485 + 1.25 NA intron (NM_001160210, intron 2 of 17) intron (NM_001160210, intron 2 of 17) 25764 NM_014251 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 254-6 chr10 64374583 64375114 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -450680 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 297-34 chr4 31494097 31494338 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -12327 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 300.75-42 chr7 33813010 33813271 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -91775 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 328.5-6 chr11 110765336 110765831 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -52394 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 265.25-51 chr7 7179152 7179704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3187 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 182.25-3 chr1 116756459 116756787 + 1.25 NA intron (NM_001328609, intron 2 of 4) L1MB8|LINE|L1 2193 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 199.75-55 chr20 22246010 22246291 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36651 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 181.25-61 chr2 52941315 52941486 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -238785 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 202.25-72 chr5 149770296 149770473 + 1.25 NA intron (NM_001172698, intron 1 of 10) intron (NM_001172698, intron 1 of 10) -1556 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 245.75-21 chr16 19969498 19969857 + 1.25 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 -84043 NM_001304771 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 336.25-10 chr18 43958943 43959415 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 572518 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 253.5-64 chr5 124694341 124694578 + 1.25 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) intron (NM_020747, intron 2 of 8) 50653 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 292.5-20 chr14 61983561 61984032 + 1.25 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) AluJr4|SINE|Alu 56101 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 114.75-84 chr2 37589754 37589920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82362 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 217.25-23 chr13 101734415 101734699 + 1.25 NA intron (NM_175929, intron 3 of 4) intron (NM_175929, intron 3 of 4) 182088 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 114-23 chr10 99096256 99096395 + 1.25 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 139550 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 224.5-65 chr2 193378598 193378967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 628937 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 119-132 chr4 64154415 64154572 + 1.25 NA Intergenic (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 254957 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 201.75-14 chr10 84749753 84750010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 324712 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 194.5-34 chr13 55538427 55538604 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 364061 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 253.75-67 chrX 14632573 14632819 + 1.25 NA intron (NM_002063, intron 7 of 8) intron (NM_002063, intron 7 of 8) 103160 NM_002063 2742 Hs.2700 NM_002063 ENSG00000101958 GLRA2 GLR glycine receptor alpha 2 protein-coding 199.25-14 chr11 46605848 46606209 + 1.25 NA intron (NM_173811, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 11199 NM_173811 283254 Hs.714463 NM_173811 ENSG00000180423 HARBI1 C11orf77 harbinger transposase derived 1 protein-coding 246.75-46 chr3 188627381 188627794 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) L1PA15|LINE|L1 -58921 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 195-53 chr20 50254019 50254394 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13280 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 380-19 chr6 63615377 63615835 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -20196 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 124-107 chr22 23018436 23018578 + 1.25 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -52012 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 155.5-196 chr7 42110702 42110956 + 1.25 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 126380 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 266.5-49 chr3 31279737 31280012 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118087 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 151.75-108 chr4 177327784 177327949 + 1.25 NA intron (NM_018248, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 17992 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 417-13 chr8 122902039 122902818 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 120773 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 228.25-27 chr14 51408043 51408325 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11049 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 166.75-102 chr4 62509819 62509997 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -348143 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 261.5-34 chr20 19230872 19231251 + 1.25 NA intron (NM_020689, intron 1 of 16) intron (NM_020689, intron 1 of 16) 18419 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 308.25-10 chr13 106058030 106058347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -318376 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 265.75-23 chr16 87996803 87997028 + 1.25 NA intron (NM_017869, intron 4 of 11) intron (NM_017869, intron 4 of 11) 26897 NM_001173543 54971 Hs.461705 NM_017869 ENSG00000172530 BANP BEND1|SMAR1|SMARBP1 BTG3 associated nuclear protein protein-coding 136.25-72 chr16 54374646 54374816 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4032 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 205.5-79 chr2 190619351 190619758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29341 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 182.75-143 chrX 23547714 23547892 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -119690 NM_006406 10549 Hs.83383 NM_006406 ENSG00000123131 PRDX4 AOE37-2|AOE372|HEL-S-97n|PRX-4 peroxiredoxin 4 protein-coding 152.75-87 chr2 153288293 153288557 + 1.25 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 190337 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 143-155 chr9 28107297 28107489 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -533527 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 182.75-11 chr1 167878615 167878934 + 1.25 NA intron (NM_018417, intron 11 of 32) intron (NM_018417, intron 11 of 32) 35360 NM_001167749 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 270.25-7 chr10 12699893 12700223 + 1.25 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 25295 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 263.25-27 chr19 27885889 27886304 + 1.25 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 -92156 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 208.5-34 chr14 42301611 42301904 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 694901 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 157.25-13 chr10 43334907 43335051 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -36657 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 160.25-120 chr5 13345700 13345844 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -312886 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 233.25-10 chr11 4726150 4726458 + 1.25 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu -28451 NM_030774 81285 Hs.501758 NM_030774 ENSG00000167332 OR51E2 HPRAJ|OR51E3P|OR52A2|PSGR olfactory receptor family 51 subfamily E member 2 protein-coding 288-42 chr7 29501098 29501425 + 1.25 NA intron (NM_001293077, intron 3 of 4) intron (NM_001293077, intron 3 of 4) 17445 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 245.25-77 chrX 131456654 131456993 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -87251 NM_001004486 347468 Hs.553711 NM_001004486 ENSG00000171054 OR13H1 ORX1 olfactory receptor family 13 subfamily H member 1 protein-coding 360.5-8 chr17 14877797 14878240 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -136787 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 145-94 chr3 2444507 2444634 + 1.25 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) L2a|LINE|L2 205741 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 126-103 chr2 146217380 146217555 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -369590 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 143.25-112 chr22 47272233 47272424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73243 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 139.5-74 chr15 92422224 92422420 + 1.25 NA intron (NM_001330416, intron 1 of 4) intron (NM_001330416, intron 1 of 4) 28435 NM_001330416 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 170.75-153 chr9 114239379 114239731 + 1.25 NA intron (NM_032888, intron 19 of 60) L3|LINE|CR1 30121 NR_030255 619556 NR_030255 ENSG00000207726 MIR455 MIRN455|hsa-mir-455|mir-455 microRNA 455 ncRNA 393-5 chr14 57990301 57990748 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124432 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 191.25-75 chr4 44026044 44026356 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9138 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 255.25-3 chr1 209023300 209023588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 50990 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 190-64 chr6 36179388 36179711 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17195 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 238-47 chr3 101680524 101680813 + 1.25 NA TTS (NM_000986) TTS (NM_000986) -3536 NM_014415 27107 Hs.655286 NM_014415 ENSG00000066422 ZBTB11 MRT69|ZNF-U69274|ZNF913 zinc finger and BTB domain containing 11 protein-coding 226-34 chr18 58164761 58165089 + 1.25 NA intron (NM_001144965, intron 1 of 30) intron (NM_001144965, intron 1 of 30) 15605 NM_001144969 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 212.25-16 chr11 60297362 60297699 + 1.25 NA intron (NM_024021, intron 4 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 16864 NM_024021 51338 Hs.325960 NM_024021 ENSG00000110079 MS4A4A 4SPAN1|CD20-L1|CD20L1|HDCME31P|MS4A4|MS4A7 membrane spanning 4-domains A4A protein-coding 276-29 chr2 215955155 215955482 + 1.25 NA intron (NM_018000, intron 2 of 4) intron (NM_018000, intron 2 of 4) 58233 NM_018000 55686 Hs.620391 NM_018000 ENSG00000118242 MREG DSU|WDT2 melanoregulin protein-coding 194-66 chr4 165374914 165375148 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -3977 NM_001873 1363 Hs.75360 NM_001873 ENSG00000109472 CPE CPH carboxypeptidase E protein-coding 240.25-25 chr15 76032071 76032368 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19795 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 364-15 chr5 133774554 133774951 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -138925 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 205-80 chr9 78507938 78508238 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210963 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 158.5-129 chr3 54193779 54193953 + 1.25 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) MIRb|SINE|MIR 71314 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 170.5-46 chr12 59321662 59321870 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -274263 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 214.75-43 chr2 206603802 206604109 + 1.25 NA intron (NM_003812, intron 24 of 25) intron (NM_003812, intron 24 of 25) -40272 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 143.75-29 chr10 120260162 120260368 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 94958 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 119-26 chr11 34642903 34643018 + 1.25 NA intron (NM_012153, intron 2 of 8) intron (NM_012153, intron 2 of 8) 10394 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 278.5-10 chr11 83278088 83278417 + 1.25 NA intron (NM_001286120, intron 1 of 6) intron (NM_001286120, intron 1 of 6) 8155 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 196.5-172 chr9 22854337 22854534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 208235 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 204.5-86 chr3 26021472 26021889 + 1.25 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -147985 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 243.25-15 chr15 97864769 97865078 + 1.25 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) intron (NR_024172, intron 1 of 2) 9506 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 246.75-35 chr2 114054560 114054859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74725 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 133.25-213 chr8 117240753 117240954 + 1.25 NA Intergenic (TATATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 105858 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 143-143 chr8 79883543 79883747 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11908 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 211.5-77 chr2 72088372 72088596 + 1.25 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 59378 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 142-109 chr3 123469808 123470011 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21364 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 257.75-26 chr2 239653769 239654026 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -108963 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 343.25-7 chr18 4203779 4204237 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -60594 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 206.5-30 chr15 55531699 55531932 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -23581 NM_001033560 161582 Hs.126403 NM_130810 ENSG00000256061 DNAAF4 CILD25|DYX1|DYX1C1|DYXC1|EKN1|RD dynein axonemal assembly factor 4 protein-coding 171.75-27 chr11 102445373 102445543 + 1.25 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) intron (NM_052932, intron 2 of 4) 7307 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 221.75-5 chr1 92595587 92595896 + 1.25 NA intron (NM_001350198, intron 18 of 19) intron (NM_001350198, intron 18 of 19) -108816 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 158.5-206 chrX 128800757 128800977 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 722623 NM_001282875 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 321-18 chr3 115294483 115294815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -147361 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 131-6 chr1 163511411 163511638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88333 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 216.25-40 chr15 81474843 81475102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100759 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 268.5-14 chr12 68756651 68757067 + 1.25 NA intron (NM_018656, intron 3 of 4) AluY|SINE|Alu 10683 NM_001354997 55508 Hs.506011 NM_018656 ENSG00000175782 SLC35E3 BLOV1 solute carrier family 35 member E3 protein-coding 190.5-50 chr15 63475361 63475659 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -29001 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 289.75-18 chr3 95821193 95821472 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -138139 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 242.75-52 chr4 112671261 112671481 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21320 NR_146092 109864269 Hs.642978 NR_146092 ENSG00000249532 MIR302CHG - miR-302/367 cluster host gene ncRNA 121.75-135 chr4 136178344 136178463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -264723 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 150.25-72 chr2 11740742 11740871 + 1.25 NA intron (NM_001261427, intron 1 of 20) intron (NM_001261427, intron 1 of 20) -5826 NM_001349199 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 188.25-48 chr15 58609954 58610190 + 1.25 NA intron (NM_001320570, intron 13 of 14) intron (NM_001320570, intron 13 of 14) 83535 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 124-104 chr21 15711107 15711281 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -18740 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 140.25-172 chr6 148173998 148174139 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98260 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 198.75-65 chr3 197949926 197950164 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001316311) promoter-TSS (NM_001316311) -120 NM_001323027 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 352-7 chr15 81378266 81378677 + 1.25 NA intron (NR_120365, intron 5 of 6) intron (NR_120365, intron 5 of 6) -4258 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 192-93 chr7 43471542 43471837 + 1.25 NA intron (NM_001287059, intron 14 of 27) intron (NM_001287059, intron 14 of 27) 50853 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 231.5-67 chr3 175767509 175767875 + 1.25 NA intron (NM_207015, intron 13 of 13) intron (NM_207015, intron 13 of 13) 8641 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-26 chr12 58493089 58493576 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -98370 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 223.75-82 chr8 131446274 131446758 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -405607 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 123.5-21 chr1 246269616 246269735 + 1.25 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) AluJb|SINE|Alu 147737 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 157.5-142 chr3 149036516 149036760 + 1.25 NA intron (NM_001318935, intron 23 of 25) FLAM_A|SINE|Alu 45230 NM_001184720 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 293.25-22 chr4 73197968 73198366 + 1.25 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 24890 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 238.5-20 chr12 23474116 23474339 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 110359 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 142.25-49 chr13 76054079 76054255 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -119035 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 367-11 chr3 96521572 96522085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 161864 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 177.75-137 chr8 88420919 88421148 + 1.25 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -93550 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 170.25-155 chr8 87826227 87826430 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47687 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 132.75-168 chr6 131042505 131042641 + 1.25 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) 20672 NM_001431 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 197-48 chr4 108702604 108702838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52122 NM_021227 58505 Hs.445803 NM_021227 ENSG00000198856 OSTC DC2 oligosaccharyltransferase complex non-catalytic subunit protein-coding 256.5-26 chr17 65644525 65644893 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) HAL1b|LINE|L1 -83061 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 168-64 chr2 39433936 39434140 + 1.25 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) MIRb|SINE|MIR 3247 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 157.5-215 chr8 106356436 106356607 + 1.25 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 86343 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 305.75-19 chr3 83705098 83705560 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1164246 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 479.5-2 chr8 82248510 82249040 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -406489 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 176.75-18 chr11 27081036 27081252 + 1.25 NA intron (NR_125767, intron 3 of 4) intron (NR_125767, intron 3 of 4) 40329 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 317.5-22 chr3 63747656 63748223 + 1.25 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie -71360 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 120.5-88 chr16 22646723 22646873 + 1.25 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 101100 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 262.75-29 chr2 111698112 111698409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72874 NR_039928 100616370 NR_039928 ENSG00000264793 MIR4771-1 - microRNA 4771-1 ncRNA 159.25-56 chr18 10389711 10389857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24586 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 441-5 chr14 71756503 71756895 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 170401 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 233.25-75 chr9 25262033 25262394 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 416645 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 281.5-23 chr2 12327896 12328388 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 129012 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 271-7 chr11 106020367 106020706 + 1.25 NA intron (NM_001318750, intron 1 of 2) intron (NM_001318750, intron 1 of 2) 1704 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 181.5-59 chr17 41856174 41856341 + 1.25 NA intron (NM_018143, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 9166 NM_018143 55175 Hs.13268 NM_018143 ENSG00000178502 KLHL11 - kelch like family member 11 protein-coding 132.75-143 chr4 115205553 115205677 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91995 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 310-8 chr15 48236572 48237017 + 1.25 NA intron (NM_001184832, intron 9 of 26) intron (NM_001184832, intron 9 of 26) 30492 NM_001184832 6557 Hs.123116 NM_000338 ENSG00000074803 SLC12A1 BSC1|NKCC2 solute carrier family 12 member 1 protein-coding 264.5-16 chr13 74579183 74579465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26481 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 190.25-74 chr20 31509543 31509783 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4747 NM_178580 81502 Hs.373741 NM_030789 ENSG00000101294 HM13 H13|IMP1|IMPAS|IMPAS-1|MSTP086|PSENL3|PSL3|SPP|SPPL1 histocompatibility minor 13 protein-coding 235.25-5 chr1 168034890 168035348 + 1.25 NA intron (NM_001198956, intron 12 of 21) intron (NM_001198956, intron 12 of 21) 36459 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 122-177 chr7 141557971 141558125 + 1.25 NA intron (NM_018238, intron 2 of 15) L1MB2|LINE|L1 6638 NM_018238 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 214-10 chr11 29618907 29619111 + 1.25 NA intron (NR_149106, intron 1 of 2) L1ME3|LINE|L1 207 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 159.25-159 chr9 27044533 27044769 + 1.25 NA intron (NM_025103, intron 13 of 19) intron (NM_025103, intron 13 of 19) -38979 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 271-17 chr16 78844203 78844476 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 744685 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 348.75-5 chr14 62490867 62491207 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -351064 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 113.75-72 chr15 76932450 76932545 + 1.25 NA intron (NM_001271837, intron 2 of 7) intron (NM_001271837, intron 2 of 7) 748 NM_001271837 5955 Hs.79088 NM_002902 ENSG00000117906 RCN2 E6BP|ERC-55|ERC55|TCBP49 reticulocalbin 2 protein-coding 148.5-114 chr2 174141762 174141995 + 1.25 NA exon (NM_001328688, exon 5 of 11) exon (NM_001328688, exon 5 of 11) 106654 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 182.75-123 chr7 23810647 23810843 + 1.25 NA intron (NM_001260505, intron 22 of 22) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 100526 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 234-31 chr2 230589276 230589635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 111074 NR_040038 151475 Hs.528154 NR_040038 ENSG00000226125 LINC01907 - long intergenic non-protein coding RNA 1907 ncRNA 172.5-10 chr1 114499077 114499240 + 1.25 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) HAL1|LINE|L1 12045 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 219.75-47 chr20 43762484 43762815 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -35647 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 268.5-15 chr12 113303505 113303762 + 1.25 NA intron (NM_001358345, intron 15 of 15) intron (NM_001358345, intron 15 of 15) 12110 NR_106820 102465457 NR_106820 ENSG00000274822 MIR6762 hsa-mir-6762 microRNA 6762 ncRNA 178.5-167 chr7 39171629 39171869 + 1.25 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) 157385 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 203-63 chr3 55540288 55540557 + 1.25 NA intron (NM_015576, intron 16 of 16) intron (NM_015576, intron 16 of 16) -52780 NM_003392 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 229-57 chr4 105243201 105243529 + 1.25 NA TTS (NM_017628) TTS (NM_017628) 96680 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 233-25 chr16 69042529 69042823 + 1.25 NA intron (NM_024562, intron 17 of 17) intron (NM_024562, intron 17 of 17) -62977 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 148.5-101 chr2 60541821 60542156 + 1.25 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) 11510 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 117.75-189 chr7 6427864 6428003 + 1.25 NA intron (NM_001142936, intron 4 of 12) L1MC4|LINE|L1 20021 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 318.5-24 chr20 48334546 48334934 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -25171 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 235-26 chr15 90618335 90618633 + 1.25 NA intron (NM_001042574, intron 8 of 14) intron (NM_001042574, intron 8 of 14) -41750 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 291.75-15 chr14 60807127 60807395 + 1.25 NA intron (NM_001177963, intron 3 of 6) intron (NM_001177963, intron 3 of 6) 72500 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 193.5-116 chr4 42251928 42252133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99375 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 234.75-11 chr10 44019024 44019308 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 106764 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 240.25-74 chrX 64696453 64696724 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 279862 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 204-36 chr2 115386176 115386546 + 1.25 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) MER34A1|LTR|ERV1 42546 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 328.25-13 chr8 50415299 50415922 + 1.25 NA intron (NR_135795, intron 4 of 18) intron (NR_135795, intron 4 of 18) 251479 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 125.25-168 chr6 27978285 27978450 + 1.25 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 21126 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 173.5-173 chr8 141177705 141177860 + 1.25 NA intron (NM_001362798, intron 15 of 21) MER58A|DNA|hAT-Charlie 49193 NM_001352890 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 274-31 chr4 53104192 53104561 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) L1MC3|LINE|L1 242059 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 161-92 chr5 46271797 46271937 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -575487 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 133-130 chr4 154823926 154824121 + 1.25 NA intron (NM_001277171, intron 5 of 5) intron (NM_001277171, intron 5 of 5) 42518 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 114.75-40 chr11 116664504 116664676 + 1.25 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 25168 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 166.75-116 chr5 82201557 82201747 + 1.25 NA intron (NM_031482, intron 5 of 7) L1MEd|LINE|L1 76702 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 171.75-35 chr13 54076582 54076795 + 1.25 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 56183 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 331.75-23 chr6 74693161 74693616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 435394 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 232.25-14 chr11 101948457 101948735 + 1.25 NA intron (NM_020802, intron 4 of 10) intron (NM_020802, intron 4 of 10) -32074 NM_178127 253935 Hs.318370 NM_178127 ENSG00000187151 ANGPTL5 - angiopoietin like 5 protein-coding 198.75-83 chr6 39055027 39055323 + 1.25 NA intron (NR_136563, intron 1 of 13) intron (NR_136563, intron 1 of 13) 6394 NM_002062 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 261-18 chr15 58887195 58887548 + 1.25 NA non-coding (NR_135043, exon 16 of 19) non-coding (NR_135043, exon 16 of 19) 46308 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 123.25-157 chr5 20343437 20343590 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) MER52-int|LTR|ERV1 37962 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-102 chr9 26728019 26728211 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 164687 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 258.75-57 chr5 26958569 26958900 + 1.25 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) intron (NM_016279, intron 2 of 11) 79852 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 153.25-144 chr9 26805378 26805516 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 87355 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 155.25-191 chr9 136793743 136793873 + 1.25 NA TTS (NM_032928) TTS (NM_032928) 2464 NM_032928 85014 Hs.356744 NM_032928 ENSG00000244187 TMEM141 - transmembrane protein 141 protein-coding 224.5-86 chr5 2091241 2091512 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 204045 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 251.75-14 chr11 47803278 47803587 + 1.25 NA intron (NM_015231, intron 22 of 35) intron (NM_015231, intron 22 of 35) -36091 NM_001318339 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 116.75-93 chr2 42670197 42670379 + 1.25 NA intron (NM_001330444, intron 8 of 15) intron (NM_001330444, intron 8 of 15) 93973 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 351.25-2 chr11 123954607 123954992 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -10961 NM_001005187 219874 Hs.553638 NM_001005187 ENSG00000181499 OR6T1 OR11-277 olfactory receptor family 6 subfamily T member 1 protein-coding 140.5-69 chr14 78690402 78690671 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 6 of 20) L2c|LINE|L2 286817 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 211.25-73 chr5 67532610 67532941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 114014 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 301.25-30 chr8 124500576 124501029 + 1.25 NA intron (NM_001146160, intron 7 of 9) intron (NM_001146160, intron 7 of 9) 7774 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 311-29 chr8 78827254 78827689 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -10058 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 334.75-7 chr12 12286846 12287181 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19969 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 441.25-3 chr12 44693145 44693640 + 1.25 NA intron (NM_006159, intron 13 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 182269 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 293-33 chr6 74817592 74817850 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 311061 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 242.25-32 chr15 94261989 94262333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36040 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 198.5-32 chr12 100178051 100178281 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4823 NR_024261 55592 Hs.524660 NM_017600 ENSG00000238105 GOLGA2P5 GOLGA2B|GOLGA2L1 GOLGA2 pseudogene 5 pseudo 355.25-9 chr4 77366359 77366742 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -145203 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 208.5-27 chr12 15619301 15619498 + 1.25 NA TTS (NM_004447) TTS (NM_004447) 72788 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 139.25-55 chr14 78027006 78027136 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -143302 NR_158973 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 239-43 chr5 17868860 17869113 + 1.25 NA intron (NR_134286, intron 4 of 7) L1MA2|LINE|L1 61712 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 112.75-136 chr3 103665312 103665404 + 1.25 NA Intergenic (CTTCTAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -141242 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 225-62 chr5 108327595 108327791 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 54405 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 267.25-24 chr20 38958029 38958405 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4127 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 187.5-158 chr7 50134069 50134287 + 1.25 NA exon (NM_001161834, exon 4 of 9) exon (NM_001161834, exon 4 of 9) 38092 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 117.25-203 chr7 112762875 112762985 + 1.25 NA non-coding (NR_109840, exon 4 of 4) non-coding (NR_109840, exon 4 of 4) 27463 NM_022484 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 294-7 chr12 49026258 49026723 + 1.25 NA exon (NM_003482, exon 48 of 54) exon (NM_003482, exon 48 of 54) -7714 NM_001206709 5571 Hs.530862 NM_002733 ENSG00000181929 PRKAG1 AMPKG protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 1 protein-coding 205-23 chr14_GL000225v1_random 92657 92957 + 1.25 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 140-152 chr6 93592585 93592778 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -111336 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 149.25-28 chr11 30126151 30126332 + 1.25 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -104773 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 159.5-170 chr5 26431898 26432104 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 606585 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 280.5-45 chr6 44143904 44144355 + 1.25 NA intron (NM_001318792, intron 10 of 23) intron (NM_001318792, intron 10 of 23) -14691 NM_007058 11131 Hs.225953 NM_007058 ENSG00000137225 CAPN11 calpain11 calpain 11 protein-coding 206.75-46 chr20 41335727 41335993 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -4961 NR_126051 64900 Hs.25897 NM_022896 ENSG00000132793 LPIN3 LIPN3L|SMP2 lipin 3 protein-coding 422.5-9 chr17 43500162 43500573 + 1.25 NA intron (NR_136228, intron 11 of 23) AluSx|SINE|Alu 16392 NM_001302623 1659 Hs.463105 NM_004941 ENSG00000067596 DHX8 DDX8|Dhr2|HRH1|PRP22|PRPF22 DEAH-box helicase 8 protein-coding 183.5-135 chr7 47466668 47466914 + 1.25 NA intron (NM_022748, intron 4 of 30) L1MC5|LINE|L1 -1988 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 140-25 chr11 46543609 46543899 + 1.25 NA intron (NM_001267782, intron 6 of 19) intron (NM_001267782, intron 6 of 19) 43690 NR_160027 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 192.75-68 chr2 225363417 225363716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36144 NM_001371273 163.25-126 chr6 144714153 144714387 + 1.25 NA intron (NM_007124, intron 52 of 73) intron (NM_007124, intron 52 of 73) 308615 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 292.5-28 chr18 70978845 70979216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -328076 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 142.5-193 chr6 129116404 129116616 + 1.25 NA intron (NM_000426, intron 4 of 64) intron (NM_000426, intron 4 of 64) 233369 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 271.75-48 chr8 130888909 130889161 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 7 of 17) intron (NM_001115, intron 7 of 17) 151874 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 171-19 chr11 32324098 32324295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76204 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 220 chr1 30923624 30923925 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12002 NR_033295 692235 NR_033295 SNORD103B U103B small nucleolar RNA, C/D box 103B snoRNA 275.25-11 chr11 62676641 62676933 + 1.25 NA exon (NM_015853, exon 8 of 8) exon (NM_015853, exon 8 of 8) 2286 NM_015853 51035 Hs.351296 NM_015853 ENSG00000162191 UBXN1 2B28|SAKS1|UBXD10 UBX domain protein 1 protein-coding 164-88 chr4 38901103 38901319 + 1.25 NA intron (NM_001330764, intron 3 of 13) intron (NM_001330764, intron 3 of 13) 33179 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 162.5-61 chr17 10404943 10405104 + 1.25 NA intron (NM_002472, intron 21 of 39) intron (NM_002472, intron 21 of 39) 16927 NM_002472 4626 Hs.700484 NM_002472 ENSG00000133020 MYH8 DA7|MyHC-peri|MyHC-pn|gtMHC-F myosin heavy chain 8 protein-coding 198.5-128 chr6 136710434 136710715 + 1.25 NA intron (NM_005923, intron 2 of 29) intron (NM_005923, intron 2 of 29) -73473 NR_134635 101928429 Hs.672896 NR_134635 LOC101928429 - uncharacterized LOC101928429 ncRNA 200-61 chr4 2849911 2850114 + 1.25 NA intron (NM_001286645, intron 1 of 17) L1MB7|LINE|L1 5862 NM_001354755 118 Hs.183706 NM_001119 ENSG00000087274 ADD1 ADDA adducin 1 protein-coding 353.25-7 chr17 54868441 54868893 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32024 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 286.75-39 chr5 123361018 123361303 + 1.25 NA intron (NM_153223, intron 19 of 20) intron (NM_153223, intron 19 of 20) 62432 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 203.75-42 chr16 56708708 56708955 + 1.25 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -21298 NM_014669 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 201.75-83 chr6 76036452 76036761 + 1.25 NA intron (NM_001282368, intron 1 of 15) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 36056 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 250.5-40 chr2 28582711 28583005 + 1.25 NA intron (NR_138141, intron 5 of 35) intron (NR_138141, intron 5 of 35) 16501 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 373.25-8 chr2 10321324 10321887 + 1.25 NA intron (NM_134421, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 -8558 NM_001258357 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 186.25-80 chr4 102248380 102248605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 75820 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 200.75-87 chr5 129684139 129684404 + 1.25 NA exon (NM_133638, exon 18 of 23) exon (NM_133638, exon 18 of 23) -63823 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 265.5-65 chr9 21773789 21774088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28698 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 155.25-110 chr21 28893803 28894004 + 1.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -8530 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 229.5-47 chr16 12840149 12840421 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -36398 NM_001099455 55313 Hs.460002 NM_018340 ENSG00000103381 CPPED1 CSTP1 calcineurin like phosphoesterase domain containing 1 protein-coding 167-74 chr22 41512758 41512920 + 1.25 NA intron (NM_001098, intron 4 of 17) intron (NM_001098, intron 4 of 17) 31631 NM_001018050 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 308-13 chr16 86156992 86157412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38979 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 329-16 chr2 58184044 58184572 + 1.25 NA intron (NR_156742, intron 3 of 9) intron (NR_156742, intron 3 of 9) 57072 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 276.5-30 chr2 39052404 39052646 + 1.25 NA intron (NM_005633, intron 5 of 22) L1ME1|LINE|L1 67938 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 168.5-112 chr3 46631283 46631536 + 1.25 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 18884 NM_001195442 100132146 Hs.679623 NM_001195442 ENSG00000283473 FAM240A - family with sequence similarity 240 member A protein-coding 229.5-34 chr12 64306457 64306857 + 1.25 NA intron (NM_001099676, intron 3 of 10) AluSz6|SINE|Alu 84101 NM_001099676 115749 Hs.535190 NM_001099676 ENSG00000185306 C12orf56 - chromosome 12 open reading frame 56 protein-coding 285.25-37 chr8 53498681 53499142 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 25054 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 173-15 chr10 61357257 61357439 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95291 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 164.5-74 chr15 95467104 95467349 + 1.25 NA intron (NR_027133, intron 3 of 5) intron (NR_027133, intron 3 of 5) 34133 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 203-70 chr4 74494523 74494738 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 49494 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 191.5-43 chr15 46591153 46591372 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -592827 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 231.25-12 chr12 80581717 80581975 + 1.25 NA intron (NM_001145026, intron 25 of 44) L1ME4b|LINE|L1 -125788 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 218.25 chr1 42256358 42256606 + 1.25 NA intron (NM_001198850, intron 4 of 12) L1ME2|LINE|L1 78473 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 152.25-126 chr5 25622663 25622861 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 431809 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 269.5-23 chr18 21128332 21128657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16681 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 220.5-98 chr5 66911108 66911443 + 1.25 NA intron (NM_001164664, intron 4 of 28) intron (NM_001164664, intron 4 of 28) -47798 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 288-51 chrX 38444604 38444912 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 92154 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 189-39 chr14 84620185 84620358 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -651661 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 161.5-172 chr7 46866378 46866531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -169332 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 232.5-9 chr10 28161451 28161752 + 1.25 NA intron (NR_134518, intron 2 of 16) intron (NR_134518, intron 2 of 16) -88223 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 308.75-11 chr12 26426096 26426468 + 1.25 NA intron (NM_002223, intron 49 of 56) intron (NM_002223, intron 49 of 56) 230709 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 267.25-47 chr8 141953343 141953734 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -167225 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 328-16 chr2 173088142 173088554 + 1.25 NA intron (NM_133646, intron 1 of 11) HAL1|LINE|L1 12502 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 216.25-21 chr11 115854781 115855105 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -94743 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 194.25-51 chr18 35224483 35224689 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -16448 NM_032347 84307 Hs.591061 NM_032347 ENSG00000186812 ZNF397 ZNF47|ZSCAN15 zinc finger protein 397 protein-coding 140.25-146 chr5 28080740 28080934 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 206828 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 329.75-7 chr12 131836172 131836559 + 1.25 NA intron (NM_016155, intron 1 of 9) intron (NM_016155, intron 1 of 9) 7972 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 148-52 chr19 30195459 30195746 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -176782 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 156-34 chr12 76548133 76548479 + 1.25 NA intron (NM_001319652, intron 1 of 25) HAL1ME|LINE|L1 11465 NM_001319653 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 226.75-10 chr11 6165243 6165483 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 4963 NM_001004052 255725 Hs.690457 NM_001004052 ENSG00000255307 OR52B2 OR11-70 olfactory receptor family 52 subfamily B member 2 protein-coding 155.25-122 chr3 145662172 145662339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 406930 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 226.5-2 chr1 79153177 79153513 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -146615 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 133-38 chr13 84080229 84080454 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60261 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 165.5-5 chr1 93897481 93897762 + 1.25 NA intron (NM_001308253, intron 3 of 5) intron (NM_001308253, intron 3 of 5) 11809 NM_002061 2730 Hs.315562 NM_002061 ENSG00000023909 GCLM GLCLR glutamate-cysteine ligase modifier subunit protein-coding 171-64 chr2 65143085 65143248 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -12865 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 178.5-180 chr8 81236193 81236358 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44261 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 185.25-36 chr15 69415540 69415748 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_132970) promoter-TSS (NR_132970) -615 NR_132969 145694 Hs.147229 NR_132969 ENSG00000259426 LOC145694 - uncharacterized LOC145694 ncRNA 308.25-6 chr11 14959685 14960012 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12438 NM_001033952 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 174.5-6 chr1 86992748 86992964 + 1.25 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) MER39|LTR|ERV1 78221 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 200.25-77 chr3 117104548 117104773 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 183229 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 170-87 chr6 61810729 61810961 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) intron (NR_146874, intron 6 of 13) 236715 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 185.5-13 chr1 218789918 218790141 + 1.25 NA intron (NR_031644, intron 5 of 6) AluSg7|SINE|Alu 128482 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 129.5-131 chr2 133040312 133040485 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 124841 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 231-24 chr14 53844671 53845003 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 103647 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 120-95 chr2 143300568 143300851 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 171290 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 132-141 chr5 122830329 122830483 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001278199, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001278199, exon 15 of 15) -15043 NR_146145 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 188-32 chr2 7330721 7330890 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90456 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 146.5-203 chr7 33276101 33276298 + 1.25 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 146635 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 270.5-56 chr6 125576360 125576868 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -97739 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 221.25-64 chr4 81152213 81152426 + 1.25 NA intron (NM_006259, intron 7 of 18) intron (NM_006259, intron 7 of 18) 1838 NM_001282482 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 182.25-107 chr6 161638088 161638367 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) AluSx|SINE|Alu 167250 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 238.75-17 chr14 44978727 44979016 + 1.25 NA intron (NR_131765, intron 1 of 19) FLAM_A|SINE|Alu 16681 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 285.5-47 chr4 53484155 53484595 + 1.25 NA intron (NM_001126328, intron 6 of 10) AluSx1|SINE|Alu -15702 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 174-34 chr16 208590 208810 + 1.25 NA intron (NM_001330420, intron 3 of 9) intron (NM_001330420, intron 3 of 9) 20749 NM_018032 55692 Hs.16803 NM_018032 ENSG00000007392 LUC7L LUC7B1|Luc7|SR+89|hLuc7B1 LUC7 like protein-coding 210-24 chr13 53381725 53381977 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -229951 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 285.25-2 chr1 230813745 230813997 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 42136 NM_001136495 84886 Hs.520494 NM_032800 ENSG00000119280 C1orf198 - chromosome 1 open reading frame 198 protein-coding 232-42 chr2 203506878 203507137 + 1.25 NA intron (NM_001329728, intron 1 of 15) AluSq2|SINE|Alu 28294 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 364-2 chr12 17429652 17430150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 159177 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 270-22 chr19 27896457 27896801 + 1.25 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) intron (NR_146734, intron 1 of 7) -102689 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 263.75-48 chr8 11302378 11302829 + 1.25 NA intron (NM_015458, intron 3 of 9).2 L1MEd|LINE|L1 17787 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 309.5-9 chr10 108958003 108958427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -888922 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 209.75-11 chr10 91914069 91914387 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -4742 NM_152429 143282 Hs.466120 NM_152429 ENSG00000174721 FGFBP3 C10orf13|FGF-BP3 fibroblast growth factor binding protein 3 protein-coding 260.25-50 chr7 96672286 96672615 + 1.25 NA intron (NR_163952, intron 2 of 6) intron (NR_163952, intron 2 of 6) -8112 NR_038948 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 168.75-9 chr1 86491991 86492255 + 1.25 NA intron (NM_001285, intron 9 of 13) intron (NM_001285, intron 9 of 13) 23196 NM_001285 1179 Hs.194659 NM_001285 ENSG00000016490 CLCA1 CACC|CACC1|CLCRG1|CaCC-1|GOB5|hCLCA1|hCaCC-1 chloride channel accessory 1 protein-coding 255-36 chr3 107706070 107706366 + 1.25 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) AluSc|SINE|Alu 171850 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 227.75-80 chr7 143490309 143490545 + 1.25 NA intron (NR_033897, intron 2 of 4) intron (NR_033897, intron 2 of 4) 12554 NM_176883 259287 Hs.650648 NM_176883 ENSG00000221855 TAS2R41 T2R41|T2R59 taste 2 receptor member 41 protein-coding 232-13 chr13 113352650 113352957 + 1.25 NA intron (NR_120385, intron 1 of 1) intron (NR_120385, intron 1 of 1) 1130 NR_046541 100874068 Hs.661837 NR_046541 GRTP1-AS1 - GRTP1 antisense RNA 1 ncRNA 239.25-67 chr4 142537004 142537376 + 1.25 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 309345 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 208.25-70 chr5 44499843 44500039 + 1.25 NA intron (NR_131946, intron 2 of 2) intron (NR_131946, intron 2 of 2) 10341 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 132-78 chr18 35169401 35169531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71568 NM_032347 84307 Hs.591061 NM_032347 ENSG00000186812 ZNF397 ZNF47|ZSCAN15 zinc finger protein 397 protein-coding 178-98 chr8 18680299 18680718 + 1.25 NA intron (NM_015310, intron 9 of 15) intron (NM_015310, intron 9 of 15) 128359 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 223-39 chr2 59365940 59366176 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 148350 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 132-135 chr5 33196149 33196290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33516 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 219.5-73 chr2 189347013 189347520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -94167 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 320.5-46 chr8 137798222 137798866 + 1.25 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 285001 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 184-98 chr8 139392798 139392981 + 1.25 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 310234 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 178.75-86 chr5 84209724 84209958 + 1.25 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) intron (NM_001278642, intron 2 of 9) 175026 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 352 chr1 10868876 10869266 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -72425 NM_017766 54897 Hs.439894 NM_017766 ENSG00000130940 CASZ1 CAS11|CST|SRG|ZNF693|dJ734G22.1 castor zinc finger 1 protein-coding 252-15 chr11 108214203 108214471 + 1.25 NA intron (NM_001321307, intron 1 of 17) L1MB7|LINE|L1 8301 NM_002519 4863 Hs.171061 NM_002519 ENSG00000149308 NPAT E14|E14/NPAT|p220 nuclear protein, coactivator of histone transcription protein-coding 176.5-143 chr5 68557556 68557781 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 265091 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 363-26 chr9 28080985 28081372 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) MER20|DNA|hAT-Charlie -507312 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 287.25-22 chr15 68348024 68348366 + 1.25 NA intron (NM_001004439, intron 10 of 29) intron (NM_001004439, intron 10 of 29) 70450 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 242.25-70 chr5 62719265 62719661 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 140644 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 283-31 chr4 74367688 74368085 + 1.25 NA intron (NM_001432, intron 1 of 4) intron (NM_001432, intron 1 of 4) 2741 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 180.25-103 chr6 46254302 46254522 + 1.25 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 -21912 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 269-39 chr5 24514780 24515043 + 1.25 NA intron (NM_001362460, intron 5 of 9) L1M5|LINE|L1 130067 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 188.5-161 chr8 131655503 131655694 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -248495 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 127-163 chr7 82085641 82085880 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 6 of 38) intron (NM_000722, intron 6 of 38) 76583 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 279.5-33 chr20 50898621 50899091 + 1.25 NA intron (NM_001282532, intron 3 of 3) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 10935 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 157.25-130 chr6 110250756 110250894 + 1.25 NA intron (NM_001123364, intron 4 of 4) intron (NM_001123364, intron 4 of 4) 70398 NM_015891 51362 Hs.428147 NM_015891 ENSG00000168438 CDC40 EHB3|PRP17|PRPF17 cell division cycle 40 protein-coding 176-50 chr3 177516451 177516662 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 74635 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 192-23 chr11 10125386 10125621 + 1.25 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) intron (NM_030962, intron 2 of 39) 168704 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 176.75-93 chr4 85591351 85591583 + 1.25 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) 116317 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 425-10 chr7 24962906 24963527 + 1.25 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) 16962 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 239-8 chr10 11136815 11137170 + 1.25 NA intron (NM_001326345, intron 1 of 13) intron (NM_001326345, intron 1 of 13) -27889 NM_001326347 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 253.75-25 chr2 169172596 169172984 + 1.25 NA intron (NM_004525, intron 57 of 78) intron (NM_004525, intron 57 of 78) 91683 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 318-14 chr19 29047554 29047984 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 45214 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 339-4 chr12 12668652 12669216 + 1.25 NA intron (NM_006143, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 27249 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 223.5-114 chr7 6054453 6054745 + 1.25 NA exon (NM_014413, exon 2 of 15) exon (NM_014413, exon 2 of 15) 4576 NM_014413 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 164.75-34 chr11 112449919 112450145 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -32200 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 252.25-8 chr11 83549670 83549910 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) MIR3|SINE|MIR 132635 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 166-23 chr11 84554312 84554462 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2a|LINE|L2 166555 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 219.75-62 chr5 43141101 43141303 + 1.25 NA intron (NM_003432, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 19637 NM_001330716 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 309-27 chr3 138538370 138538664 + 1.25 NA intron (NM_001288967, intron 2 of 13) L1MA4|LINE|L1 53439 NM_001320600 80321 Hs.531962 NM_024491 ENSG00000114107 CEP70 BITE centrosomal protein 70 protein-coding 156-42 chr14 43480979 43481137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1026225 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 125.5-49 chr12 3911903 3912059 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -38533 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 349.25-4 chr14 62108943 62109449 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) -8161 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 280.75-42 chr8 118751455 118751854 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -129691 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 336.5-3 chr10 30505568 30505986 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71131 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 134-104 chr2 182486161 182486333 + 1.25 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) L1MB7|LINE|L1 36279 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 307.5-36 chr3 89444765 89445118 + 1.25 NA intron (NM_005233, intron 13 of 16) intron (NM_005233, intron 13 of 16) 337320 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 115.25-155 chr4 152556498 152556640 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 20141 NR_039658 100616193 NR_039658 ENSG00000283792 MIR4453 - microRNA 4453 ncRNA 146.5-67 chr14 98457261 98457504 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -254231 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 173.25-130 chr8 126389627 126389796 + 1.25 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 64216 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 260.75-10 chr12 129175288 129175676 + 1.25 NA intron (NM_133448, intron 5 of 8) intron (NM_133448, intron 5 of 8) -33119 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 358.5-5 chr13 109273079 109273605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106039 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 127-100 chr2 84155564 84155735 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -135033 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 157.25-159 chr9 73141035 73141290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10703 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 223.75-68 chr5 87380890 87381096 + 1.25 NA intron (NM_022650, intron 20 of 24) intron (NM_022650, intron 20 of 24) 31911 NM_001199189 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 175.75-20 chr10 73789047 73789325 + 1.25 NA non-coding (NR_160292, exon 3 of 27) non-coding (NR_160292, exon 3 of 27) 3562 NM_015037 23053 Hs.65135 NM_015037 ENSG00000214655 ZSWIM8 KIAA0913 zinc finger SWIM-type containing 8 protein-coding 224-36 chr3 172657562 172657884 + 1.25 NA intron (NM_001146276, intron 1 of 4) intron (NM_001146276, intron 1 of 4) 53344 NM_001146276 57552 Hs.444099 NM_020792 ENSG00000144959 NCEH1 AADACL1|NCEH neutral cholesterol ester hydrolase 1 protein-coding 278.25-39 chr3 132368999 132369392 + 1.25 NA TTS (NM_001134194) TTS (NM_001134194) -48307 NM_015268 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 143.5-107 chr2 23868156 23868335 + 1.25 NA intron (NR_125717, intron 9 of 28) intron (NR_125717, intron 9 of 28) 58878 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 127-178 chr8 123935732 123935923 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 83840 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 160.5-172 chr7 41296951 41297136 + 1.25 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 195439 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 245.5-10 chr10 92230572 92230829 + 1.25 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) intron (NM_001178137, intron 2 of 9) 12579 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 202.5-66 chr2 13983173 13983370 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 417687 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 298.25-16 chr2 197684475 197684814 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9057 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 256.5-31 chr2 99109979 99110264 + 1.25 NA intron (NM_001349012, intron 3 of 18) AluSx3|SINE|Alu 31059 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 194.5-123 chr5 163487033 163487240 + 1.25 NA intron (NM_012484, intron 16 of 17) L1MB8|LINE|L1 6922 NR_109892 101927813 Hs.726818 NR_109892 HMMR-AS1 - HMMR antisense RNA 1 ncRNA 201-52 chr3 56624269 56624560 + 1.25 NA intron (NM_001365638, intron 22 of 22) intron (NM_001365638, intron 22 of 22) 39632 NM_015224 23272 Hs.116877 NM_015224 ENSG00000163946 TASOR C3orf63|FAM208A|RAP140|TASOR1|se89-1 transcription activation suppressor protein-coding 300.75 chr1 74010970 74011310 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 187036 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 265.25-48 chr6 162074715 162075072 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 603916 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 310.75-6 chr10 84319208 84319678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9146 NM_001351290 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 128.75-207 chr8 122929074 122929299 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 96586 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 176.75-87 chr3 189043254 189043451 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -95713 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 168-36 chr12 28446951 28447129 + 1.25 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) L1M5|LINE|L1 -256302 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 226.25-47 chr3 81762939 81763415 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1532 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 255-16 chr15 71093543 71093778 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47789 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 176.5-170 chr8 112115770 112116032 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -527592 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 238.25-15 chr12 82780798 82781106 + 1.25 NA intron (NM_001320321, intron 1 of 10) intron (NM_001320321, intron 1 of 10) 93797 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 144-37 chr14 58722710 58722954 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83995 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 154.25-124 chr5 26146289 26146481 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 892201 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 180.25-50 chr2 28868365 28868582 + 1.25 NA intron (NM_017910, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 1836 NM_017910 55006 Hs.468026 NM_017910 ENSG00000171103 TRMT61B - tRNA methyltransferase 61B protein-coding 276.5-61 chr7 16129647 16129942 + 1.25 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) intron (NM_001101426, intron 9 of 9) -80692 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 210.5-69 chr2 186050321 186050582 + 1.25 NA intron (NR_110218, intron 3 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 35866 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 126.25-71 chr17 80080889 80081064 + 1.25 NA intron (NM_017950, intron 10 of 19) L1MA4|LINE|L1 -17852 NR_039607 100616121 NR_039607 ENSG00000265561 MIR1268B - microRNA 1268b ncRNA 251-55 chr7 106486212 106486530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 174787 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 132-17 chr10 57066475 57066613 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 238015 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 172.5-146 chr4 100711444 100711625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36421 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 198.5-67 chr2 34178978 34179224 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 111875 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 170.75-148 chr9 35266032 35266189 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) MIR3|SINE|MIR -75786 NM_001371188 202.75-79 chr3 163501081 163501353 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -197916 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 212.75-19 chr11 130339937 130340168 + 1.25 NA intron (NR_148980, intron 1 of 6) intron (NR_148980, intron 1 of 6) 25059 NR_148980 646383 Hs.155288 NM_001039787 ENSG00000175773 ZBTB44-DT - ZBTB44 divergent transcript ncRNA 238-59 chr5 170868873 170869095 + 1.25 NA intron (NM_022897, intron 1 of 27) intron (NM_022897, intron 1 of 27) 6966 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 284-31 chr22 25049189 25049590 + 1.25 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 21415 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 143-148 chr8 113371430 113371639 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 5618 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 210.5-138 chr8 138558156 138558489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60592 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 220.75-16 chr11 30477359 30477574 + 1.25 NA intron (NM_001584, intron 3 of 5) L1ME3D|LINE|L1 103027 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 175.75-75 chr2 194264321 194264522 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79848 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 156.5-99 chr21 29018536 29018885 + 1.25 NA intron (NM_001320724, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 639 NM_016940 10069 Hs.713123 NM_016940 ENSG00000156253 RWDD2B C21orf6|GL011 RWD domain containing 2B protein-coding 310.5-22 chr20 44946191 44946674 + 1.25 NA intron (NM_006809, intron 5 of 6) intron (NM_006809, intron 5 of 6) 13965 NM_006809 10953 Hs.517066 NM_006809 ENSG00000025772 TOMM34 HTOM34P|TOM34|URCC3 translocase of outer mitochondrial membrane 34 protein-coding 332.75-22 chr7 125785112 125785426 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -520978 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 139.25-174 chr7 37979047 37979200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57804 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 177.5-30 chr12 1023346 1023656 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 1 of 19) L2c|LINE|L2 -4247 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 159-123 chr8 136629066 136629233 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 98351 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 307.75 chr1 67582256 67582674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -102736 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 212 chr1 88831520 88831755 + 1.25 NA intron (NM_006256, intron 19 of 21) intron (NM_006256, intron 19 of 21) 59930 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 186.25-40 chr16 8277545 8277828 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 312152 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 200.75-67 chr3 79398831 79399053 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -12785 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 212.5-102 chr7 20673018 20673322 + 1.25 NA intron (NM_178559, intron 5 of 18) L1ME1|LINE|L1 25840 NM_178559 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 138.75-150 chr5 77074522 77074689 + 1.25 NA 3' UTR (NM_032367, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_032367, exon 3 of 3) 5966 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 199.75-33 chr16 55318822 55319114 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5591 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 171-63 chr2 50000003 50000368 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -25982 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 248.75-14 chr12 43634848 43635315 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -82878 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 181.25-135 chr8 138724957 138725286 + 1.25 NA intron (NM_152888, intron 24 of 64) intron (NM_152888, intron 24 of 64) 188920 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 192-43 chr14 59147630 59147892 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -40906 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 258.75-73 chr7 104124699 104125050 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83139 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 294.25-9 chr12 10709018 10709385 + 1.25 NA intron (NM_001145426, intron 5 of 8) intron (NM_001145426, intron 5 of 8) 14122 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 255.75-17 chr17 73242703 73243067 + 1.25 NA intron (NM_001100622, intron 4 of 5) intron (NM_001100622, intron 4 of 5) 10224 NM_001351265 55028 Hs.12929 NM_017941 ENSG00000141219 C17orf80 HLC-8|MIG3|SPEP1 chromosome 17 open reading frame 80 protein-coding 298.25-15 chr2 175641562 175641834 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 360569 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 153.25-46 chr15 58852451 58852684 + 1.25 NA intron (NM_001040453, intron 8 of 8) MIRb|SINE|MIR 81112 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 256-22 chr18 21124979 21125220 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -13286 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 196-12 chr10 29932965 29933227 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 126490 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 376.5-5 chr15 86073641 86074130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5735 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 210.5-109 chr6 43840948 43841167 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 11276 NR_149142 285857 Hs.582798 NR_149142 ENSG00000283215 LINC02537 - long intergenic non-protein coding RNA 2537 ncRNA 240.75-3 chr1 225602205 225602407 + 1.25 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) L1ME3A|LINE|L1 50817 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 150.75-147 chr4 186304292 186304465 + 1.25 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) MER58A|DNA|hAT-Charlie 38189 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 184-8 chr10 14652078 14652333 + 1.25 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -47804 NM_001282696 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 183.5-48 chr15 64251411 64251614 + 1.25 NA exon (NM_001329605, exon 4 of 13) exon (NM_001329605, exon 4 of 13) -88357 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 255-24 chr2 54650550 54650876 + 1.25 NA intron (NM_178313, intron 25 of 30) MER58A|DNA|hAT-Charlie -74299 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 222.5-101 chr7 20595964 20596177 + 1.25 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -19597 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 194.75-65 chr22 19319317 19319566 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -27722 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 404.5-5 chr20 31556781 31557398 + 1.25 NA intron (NM_178580, intron 8 of 12) MIRb|SINE|MIR 16174 NR_046853 100874042 Hs.373741 NR_046853 ENSG00000230613 HM13-AS1 - HM13 antisense RNA 1 ncRNA 239.75-65 chr6 63791946 63792151 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 37 of 43) L2|LINE|L2 -14788 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 208.5-152 chr9 109263849 109264117 + 1.25 NA intron (NM_019114, intron 5 of 25) intron (NM_019114, intron 5 of 25) 56981 NM_019114 54566 Hs.591901 NM_018424 ENSG00000095203 EPB41L4B CG1|EHM2 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B protein-coding 223.25-39 chr2 139059333 139059573 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162129 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 330.75-25 chr8 136259792 136260085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -270860 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 180.25-18 chr13 92387750 92387940 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR -35638 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 255.25-53 chr8 85864607 85864959 + 1.25 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -36841 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 371.75-13 chr3 177634161 177634609 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) intron (NR_047568, intron 3 of 3) -182480 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 149.5-69 chr16 65730635 65730826 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -154430 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 361.5-17 chr5 126827218 126827731 + 1.25 NA intron (NR_134488, intron 10 of 11) AluSx|SINE|Alu 50338 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 196.75-116 chr9 103933223 103933517 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -66339 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 198.5-105 chr4 83855406 83855718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 319454 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 157.5-129 chr3 14439609 14439975 + 1.25 NA intron (NM_001134367, intron 2 of 14) intron (NM_001134367, intron 2 of 14) 37186 NR_103507 6533 Hs.529488 NM_003043 ENSG00000131389 SLC6A6 TAUT solute carrier family 6 member 6 protein-coding 191.75-97 chr5 3142103 3142337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35615 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 119.25-174 chr6 65171746 65171901 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -129595 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 252.25-42 chr4 45874056 45874463 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 249795 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 170-46 chr2 179537831 179538070 + 1.25 NA intron (NR_104234, intron 4 of 12) intron (NR_104234, intron 4 of 12) 24638 NR_148055 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 193.75-45 chr14 64967727 64967923 + 1.25 NA intron (NM_001330182, intron 1 of 7) intron (NM_001330182, intron 1 of 7) 4511 NM_198686 376267 Hs.512492 NM_198686 ENSG00000139998 RAB15 - RAB15, member RAS oncogene family protein-coding 249.5-54 chr2 196585876 196586165 + 1.25 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) 6963 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 145.25-156 chr7 19381502 19381758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -236209 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 181.75-115 chr7 26202687 26202968 + 1.25 NA intron (NM_016587, intron 1 of 5) intron (NM_016587, intron 1 of 5) 1082 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 224.5-94 chr6 135808137 135808419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43423 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 181-14 chr11 50537001 50537211 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 127959 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 341.25-21 chr4 94075641 94076150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 131661 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 148.5-72 chr16 23705268 23705465 + 1.25 NA intron (NM_001308220, intron 7 of 20) intron (NM_001308220, intron 7 of 20) 7856 NM_033266 10595 Hs.592041 NM_033266 ENSG00000134398 ERN2 IRE1-BETA|IRE1b|IRE2p|hIRE2p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 2 protein-coding 204.25-25 chr12 26716165 26716351 + 1.25 NA intron (NM_002223, intron 5 of 56) intron (NM_002223, intron 5 of 56) 116936 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 307.25-26 chr3 148988224 148988502 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -3045 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 354-5 chr10 50600478 50600913 + 1.25 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) intron (NM_147156, intron 1 of 10) 23261 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 113.5-215 chr6 154619679 154619874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109091 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 233.25-35 chr2 105481317 105481675 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -42983 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 268.25-21 chr18 75890381 75890640 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -178107 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 307.25-14 chr18 45775984 45776564 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49321 NM_001146037 6563 Hs.101307 NM_015865 ENSG00000141469 SLC14A1 HUT11|HsT1341|JK|RACH1|RACH2|UT-B1|UT1|UTE solute carrier family 14 member 1 (Kidd blood group) protein-coding 194.5-84 chr20 58395392 58395625 + 1.25 NA intron (NR_036633, intron 1 of 3) intron (NR_036633, intron 1 of 3) 6279 NM_001195677 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 186.5-85 chr22 44009296 44009464 + 1.25 NA intron (NM_001003828, intron 2 of 13) intron (NM_001003828, intron 2 of 13) 10169 NM_001003828 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 143.5-88 chr16 79040824 79041014 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 559818 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 218.75-46 chr20 56030638 56030909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25254 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 132.75-85 chr18 21328464 21328617 + 1.25 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 86298 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 164.5-175 chr6 74352388 74352642 + 1.25 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 283064 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 204.75-107 chr6 164628698 164629003 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 193213 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 274.75 chr1 86729795 86730183 + 1.25 NA intron (NM_001206651, intron 6 of 9) intron (NM_001206651, intron 6 of 9) 25413 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 248.5-99 chr8 38983749 38984160 + 1.25 NA intron (NM_153692, intron 8 of 8) (TTATTAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9726 NM_153692 203100 Hs.661014 NM_153692 ENSG00000169495 HTRA4 - HtrA serine peptidase 4 protein-coding 136.75-73 chr17 31907652 31907924 + 1.25 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -6080 NM_018428 55813 Hs.589862 NM_018428 ENSG00000108651 UTP6 C17orf40|HCA66 UTP6 small subunit processome component protein-coding 194.5-17 chr10 71109525 71109712 + 1.25 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -102952 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 237-62 chr7 46645336 46645590 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 51659 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 136.25-200 chr9 129625546 129625692 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001286803) promoter-TSS (NM_001286803) -534 NM_001286800 28989 Hs.744027 NM_014064 ENSG00000148335 NTMT1 AD-003|C9orf32|HOMT1A|METTL11A|NRMT|NRMT1|NTM1A N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 protein-coding 191.5-47 chr15 64218130 64218461 + 1.25 NA intron (NM_001329607, intron 4 of 11) intron (NM_001329607, intron 4 of 11) -55140 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 159.5-167 chr4 127705673 127705910 + 1.25 NA exon (NM_015693, exon 11 of 16) exon (NM_015693, exon 11 of 16) -24609 NM_031291 83447 Hs.149030 NM_031291 ENSG00000151475 SLC25A31 AAC4|ANT 4|ANT4|SFEC35kDa solute carrier family 25 member 31 protein-coding 187.25-79 chr4 44445119 44445501 + 1.25 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 3499 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 271.75-20 chr2 116485426 116485821 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 1141808 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 228.75-90 chr8 135143869 135144065 + 1.25 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -90164 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 152-135 chr6 81487840 81488042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 264740 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 117.25-204 chr7 113280151 113280286 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -161636 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 174.5-68 chr14 88825157 88825351 + 1.25 NA intron (NR_159362, intron 1 of 14) intron (NR_159362, intron 1 of 14) 603 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 226.25-67 chr7 49333288 49333480 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 408837 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 206.25-103 chr7 37552714 37553030 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103546 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 254.75-47 chr6 135346586 135346797 + 1.25 NA intron (NM_017651, intron 23 of 27) intron (NM_017651, intron 23 of 27) 107531 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 264.25-9 chr11 92538110 92538349 + 1.25 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 186133 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 341.5 chr11 35303864 35304269 + 1.25 NA intron (NM_001252652, intron 6 of 11) intron (NM_001252652, intron 6 of 11) 115492 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 202-60 chr6 64743838 64744062 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -557468 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 319.5-16 chr14 46714936 46715311 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63342 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 328.5-36 chrX 24087846 24088411 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 33172 NM_001415 1968 Hs.539684 NM_001415 ENSG00000130741 EIF2S3 EIF2|EIF2G|EIF2gamma|MEHMO|MRXSBRK|eIF-2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma protein-coding 188-52 chr4 121169269 121169442 + 1.25 NA intron (NM_001128843, intron 3 of 12) L2a|LINE|L2 -5034 NM_024873 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 202.5-91 chr3 32305896 32306156 + 1.25 NA intron (NM_001320308, intron 1 of 2) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 67346 NM_178868 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 136-168 chr9 35259448 35259673 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) L2c|LINE|L2 -82336 NM_001371188 128-170 chr9 2500851 2500988 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -120868 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 209.75-41 chr18 72256871 72257071 + 1.25 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 287371 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 209.25-89 chr4 186125012 186125310 + 1.25 NA intron (NM_001367768, intron 1 of 13) intron (NM_001367768, intron 1 of 13) -19126 NM_001006655 25854 Hs.744961 NM_015398 ENSG00000109794 FAM149A MST119|MSTP119 family with sequence similarity 149 member A protein-coding 270.5-15 chr13 105343053 105343389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122646 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 210.5-61 chr2 26188833 26189168 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001191033, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001191033, exon 6 of 6) 8284 NM_001191033 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 165.25-43 chr14 72232935 72233148 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -283779 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 237-63 chr7 47615585 47615844 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6225 NR_108090 101929086 Hs.563487 NR_108090 ENSG00000236078 LINC01447 - long intergenic non-protein coding RNA 1447 ncRNA 264.75-19 chr2 48484024 48484326 + 1.25 NA intron (NR_024188, intron 13 of 21) LTR47B4|LTR|ERVL 43406 NM_001193475 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 179.5-162 chr6 149801547 149801864 + 1.25 NA intron (NM_001360452, intron 6 of 7) AluSx1|SINE|Alu 51964 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 195.75-119 chr8 124172989 124173167 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1556 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 360.75-13 chr5 111081839 111082194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8642 NM_138551 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 154.5-152 chr5 127667789 127667919 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14839 NM_001127385 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 145-39 chr12 98684904 98685051 + 1.25 NA intron (NM_001160, intron 15 of 25) intron (NM_001160, intron 15 of 25) 39677 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 332.25-13 chr15 94554003 94554375 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 198259 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 247-12 chr12 17928160 17928510 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 161858 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 145.5-46 chr12 44715854 44715998 + 1.25 NA intron (NM_006159, intron 10 of 20) intron (NM_006159, intron 10 of 20) 159735 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 193.75-66 chr2 134566676 134567006 + 1.25 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) L1ME3G|LINE|L1 152159 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 210.25-27 chr16 13156133 13156364 + 1.25 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 254650 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 146-22 chr11 79719419 79719573 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -278466 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 253.5-49 chr3 70417368 70417676 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -104884 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 408-7 chr17 78666327 78666841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34527 NR_110848 101928710 Hs.464224 NR_110848 ENSG00000267123 SCAT1 LINC02081|XLOC_012582 S-phase cancer associated transcript 1 ncRNA 140-132 chr4 171152687 171152833 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -33424 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 147.75-170 chr9 34738954 34739184 + 1.25 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -9581 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 440-7 chr20 36015088 36015513 + 1.25 NA intron (NR_130714, intron 8 of 8) L1M2|LINE|L1 35660 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 131.5-83 chr16 62528858 62529015 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -492498 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 291-9 chr12 47492402 47492743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77564 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 126.25-208 chr8 119861414 119861627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5626 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 227-68 chr8 73534846 73535123 + 1.25 NA intron (NM_001164382, intron 11 of 13) intron (NM_001164382, intron 11 of 13) 114910 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 398.25-5 chr11 123607110 123607553 + 1.25 NA intron (NM_020716, intron 10 of 19) intron (NM_020716, intron 10 of 19) 47069 NM_001286564 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 154.25-50 chr14 75403980 75404205 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23632 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 123.25-87 chr18 44442482 44442664 + 1.25 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) L1ME3D|LINE|L1 89124 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 187.5-134 chr5 35565989 35566179 + 1.25 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -51779 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 299.5-5 chr11 82467066 82467344 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63292 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 119.5-218 chr7 82062325 82062514 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 9 of 38) L2c|LINE|L2 53242 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 358-14 chr9 22600733 22601108 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45280 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 170.25-64 chr2 21808287 21808609 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -97796 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 305.25-38 chr4 107137120 107137627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101060 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 246.5-38 chr19 36033460 36033759 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001199570) promoter-TSS (NM_001199570) -736 NM_015526 25999 Hs.466539 NM_015526 ENSG00000105270 CLIP3 CLIPR-59|CLIPR59|RSNL1 CAP-Gly domain containing linker protein 3 protein-coding 157.25-162 chrUn_KI270336v1 497 689 + 1.25 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 130.25-67 chr15 61930138 61930323 + 1.25 NA intron (NM_001018088, intron 50 of 81) intron (NM_001018088, intron 50 of 81) 130217 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 225-32 chr16 80471659 80472020 + 1.25 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1ME3A|LINE|L1 -68895 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 220.5-50 chr2 102159694 102159886 + 1.25 NA intron (NM_001320978, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 5849 NM_001320983 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 118.5-91 chr2 31977348 31977489 + 1.25 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 33246 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 301.5-11 chr10 61687941 61688463 + 1.25 NA intron (NM_173554, intron 3 of 6) intron (NM_173554, intron 3 of 6) 25241 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 168.75-143 chr8 52825389 52825590 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -111023 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 230.75-58 chr5 91946996 91947247 + 1.25 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -563804 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 254-47 chr8 124917598 124918020 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24199 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 328-13 chr2 38849617 38850090 + 1.25 NA intron (NM_001329963, intron 9 of 23) L2a|LINE|L2 26081 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 289.25-18 chr21 29694570 29694994 + 1.25 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -53393 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 147.5-22 chr10 56345886 56346048 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15292 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 131.25-133 chr3 65145160 65145335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -457247 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 173.75-139 chr6 154808404 154808681 + 1.25 NA intron (NM_014892, intron 10 of 19) MER30|DNA|hAT-Charlie -44818 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 351-8 chr15 75539364 75539724 + 1.25 NA intron (NM_002833, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu 39771 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 116.75-110 chr20 48303066 48303241 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -56758 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 299.75-7 chr12 60744394 60744926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1055290 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 162.75-83 chr20 15918144 15918386 + 1.25 NA intron (NR_130924, intron 1 of 1) intron (NR_130924, intron 1 of 1) 5049 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 248-60 chr5 103346712 103347084 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 87474 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 152.5-143 chr4 166476150 166476352 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 603014 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 183.5-56 chr18 3519873 3520112 + 1.25 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) L1PA8|LINE|L1 53742 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 263.75-38 chr4 14041452 14041767 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70359 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 270.5-60 chr8 10603734 10604157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51198 NM_178857 94137 Hs.33538 NM_178857 ENSG00000183638 RP1L1 DCDC4B RP1 like 1 protein-coding 157.5-234 chrX 71568399 71568543 + 1.25 NA intron (NM_181672, intron 21 of 21) L1ME3G|LINE|L1 -9553 NM_052957 93953 Hs.135167 NM_052957 ENSG00000147174 GCNA ACRC|NAAR1 germ cell nuclear acidic peptidase protein-coding 118.75-105 chr2 121765835 121765963 + 1.25 NA non-coding (NR_048556, exon 5 of 5) non-coding (NR_048556, exon 5 of 5) 10248 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 144.5-30 chr10 68078434 68078665 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3266 NM_015601 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 186-52 chr20 17736558 17736734 + 1.25 NA TTS (NM_178477) TTS (NM_178477) 36698 NM_001014977 140836 Hs.115366 NM_178477 ENSG00000125888 BANF2 BAF-L|BAF2|BAFL|C20orf179 barrier to autointegration factor 2 protein-coding 299.25-16 chr14 42416950 42417435 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 810336 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 426-10 chr22 27074478 27075219 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14330 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 183-112 chr8 85207487 85207834 + 1.25 NA intron (NM_001083588, intron 5 of 7) intron (NM_001083588, intron 5 of 7) 12714 NM_001099673 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 208.25-49 chr2 224717075 224717253 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -131767 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 241-31 chr3 35305615 35305864 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 88284 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 264-39 chr2 218626480 218627020 + 1.25 NA intron (NM_032726, intron 6 of 15) intron (NM_032726, intron 6 of 15) 18851 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 304.25-5 chr10 114563885 114564380 + 1.25 NA intron (NM_001352440, intron 4 of 20) intron (NM_001352440, intron 4 of 20) -37219 NM_001322899 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 552 chr14 53524829 53525563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 371842 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 231.75-36 chr2 62299526 62300102 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 84293 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 139.25-109 chr22 19485584 19485732 + 1.25 NA intron (NM_001369291, intron 5 of 18) intron (NM_001369291, intron 5 of 18) 5738 NR_161281 8318 Hs.474217 NM_003504 ENSG00000093009 CDC45 CDC45L|CDC45L2|MGORS7|PORC-PI-1 cell division cycle 45 protein-coding 131.25-68 chr15 35571995 35572275 + 1.25 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 25940 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 250-43 chr5 29907704 29907975 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27279 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 137.5-126 chr2 116628250 116628425 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -1186354 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 236.25-5 chr1 98917376 98917735 + 1.25 NA intron (NM_001037317, intron 4 of 5) intron (NM_001037317, intron 4 of 5) -86721 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 127-37 chr11 113427613 113427834 + 1.25 NA intron (NM_016574, intron 1 of 6) intron (NM_016574, intron 1 of 6) 22365 NR_036183 100422855 NR_036183 ENSG00000265140 MIR4301 - microRNA 4301 ncRNA 284.5-46 chr5 8672354 8672738 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -167186 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 192.75-80 chr22 41807198 41807450 + 1.25 NA intron (NM_024821, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 6645 NM_024821 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 136-72 chr2 75939505 75939629 + 1.25 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -228652 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 217.25-64 chr5 28693388 28693667 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -233343 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 232.25-9 chr10 90881089 90881358 + 1.25 NA intron (NM_006413, intron 5 of 10) MIRc|SINE|MIR 9249 NM_001104546 10556 Hs.139120 NM_006413 ENSG00000148688 RPP30 TSG15 ribonuclease P/MRP subunit p30 protein-coding 302.75-21 chr4 149101425 149101854 + 1.25 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 -52656 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 304.5-36 chr7 46672934 46673203 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24054 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 119.5-86 chr15 65229204 65229385 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17821 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 257.5-14 chr11 22221554 22221787 + 1.25 NA intron (NM_001142649, intron 5 of 21) L2a|LINE|L2 28494 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 268.25-9 chr12 129849318 129849651 + 1.25 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) intron (NM_133448, intron 1 of 8) 54541 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 240-44 chr4 124657206 124657605 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 55327 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 173-45 chr14 63134299 63134580 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -70004 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 180-38 chr15 37143124 37143339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41920 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 228-5 chr1 199497499 199497795 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 349049 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 180.5-114 chr4 84889565 84889784 + 1.25 NA intron (NM_014991, intron 3 of 67) MIRc|SINE|MIR -75942 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 228.75-10 chr10 107815776 107815978 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 253416 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 221.75-37 chr2 102314722 102315032 + 1.25 NA intron (NM_001282408, intron 1 of 6) MER83|LTR|ERV1 3314 NM_016232 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 240.25-30 chr18 67012389 67012668 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69056 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 177.25-26 chr11 47381507 47381737 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -3075 NM_003120 6688 Hs.502511 NM_003120 ENSG00000066336 SPI1 OF|PU.1|SFPI1|SPI-1|SPI-A Spi-1 proto-oncogene protein-coding 428.75-5 chr14 43484386 43484818 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1022681 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 270.25-9 chr10 67589787 67590167 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) intron (NM_001127384, intron 3 of 17) 75683 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 207.25-10 chr10 123619855 123620091 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46382 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 224.75-68 chr8 66746987 66747509 + 1.25 NA intron (NM_001033578, intron 1 of 16) intron (NM_001033578, intron 1 of 16) 20786 NR_002734 26255 Hs.647156 NR_002734 ENSG00000213005 PTTG3P PTTG3|rcPTTG1 pituitary tumor-transforming 3, pseudogene pseudo 265.75-60 chr6 43633667 43634036 + 1.25 NA intron (NM_001003690, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu -1989 NM_014628 9587 Hs.122346 NM_014628 ENSG00000124688 MAD2L1BP CMT2 MAD2L1 binding protein protein-coding 255.75-35 chr4 181217753 181218123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47091 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 239.25-35 chr17 32432268 32432624 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12064 NM_002815 5717 Hs.443379 NM_002815 ENSG00000108671 PSMD11 Rpn6|S9|p44.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 11 protein-coding 116-26 chr11 61362374 61362560 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001161454) promoter-TSS (NM_001161454) 93 NM_016464 51524 Hs.406530 NM_016464 ENSG00000149483 TMEM138 HSPC196 transmembrane protein 138 protein-coding 237-71 chr8 116406464 116406829 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -81587 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 270.75-43 chr5 95428545 95428795 + 1.25 NA exon (NM_152548, exon 6 of 10) exon (NM_152548, exon 6 of 10) 37304 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 168.25-155 chrX 54671302 54671456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126876 NM_198510 347365 Hs.454272 NM_198510 ENSG00000102313 ITIH6 ITIH5L|UNQ6369|dJ14O9.1 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family member 6 protein-coding 154.25-82 chr2 83036247 83036429 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179535 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 130.75-11 chr1 207224756 207224881 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -96860 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 357-9 chr2 47625089 47625550 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -54988 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 266-54 chrX 84509272 84509529 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -6947 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 173.75-108 chr3 102480347 102480542 + 1.25 NA TTS (NM_001329788) TTS (NM_001329788) 45429 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 217-28 chr18 2775425 2775731 + 1.25 NA intron (NM_015295, intron 41 of 47) intron (NM_015295, intron 41 of 47) -71428 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 200.25-8 chr1 186490598 186490774 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29572 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 236.75-25 chr2 10766702 10766949 + 1.25 NA intron (NM_001039362, intron 5 of 13) (GTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 45195 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 135.5-42 chr11 107548606 107548783 + 1.25 NA intron (NM_138775, intron 7 of 11) intron (NM_138775, intron 7 of 11) 17041 NM_001301010 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 264.25-23 chr18 80010314 80010663 + 1.25 NA intron (NM_001305564, intron 1 of 2) LTR25|LTR|ERV1 -21925 NR_131177 10907 Hs.465498 NM_006701 ENSG00000141759 TXNL4A BMKS|DIB1|DIM1|SNRNP15|TXNL4|U5-15kD thioredoxin like 4A protein-coding 353.25-16 chr3 94394170 94394851 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 331449 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 282.75-12 chr13 81377038 81377481 + 1.25 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -150276 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 307-22 chr3 86526293 86526720 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 44563 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 194-8 chr1 105117754 105118048 + 1.25 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 501034 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 287-42 chr9 84750643 84751156 + 1.25 NA intron (NM_001018064, intron 11 of 17) intron (NM_001018064, intron 11 of 17) 44998 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 210.5-88 chr4 73725231 73725465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15221 NM_001354840 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 172.5-76 chr15 91605192 91605477 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 141995 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 197-50 chr4 176051552 176051755 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14188 NM_001350727 116966 Hs.532056 NM_170710 ENSG00000150627 WDR17 - WD repeat domain 17 protein-coding 178-58 chr22 37270770 37270970 + 1.25 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -11638 NM_013385 27128 Hs.170944 NM_013385 ENSG00000100055 CYTH4 CYT4|DJ63G5.1|PSCD4|cytohesin-4 cytohesin 4 protein-coding 229-22 chr16 71851614 71851979 + 1.25 NA exon (NM_001137675, exon 3 of 3) exon (NM_001137675, exon 3 of 3) 5820 NM_001137675 342371 Hs.743239 NM_001137675 ENSG00000224470 ATXN1L BOAT|BOAT1 ataxin 1 like protein-coding 214.5-28 chr12 111238707 111239041 + 1.25 NA intron (NM_015267, intron 3 of 21) AluSz6|SINE|Alu -65268 NR_106818 102465455 NR_106818 ENSG00000273700 MIR6760 hsa-mir-6760 microRNA 6760 ncRNA 136.75-80 chr17 78740119 78740245 + 1.25 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu -3280 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 146.25-106 chr4 25551445 25551582 + 1.25 NA intron (NR_134641, intron 2 of 3) intron (NR_134641, intron 2 of 3) 17833 NR_134641 101929161 Hs.125638 NR_134641 LOC101929161 - uncharacterized LOC101929161 ncRNA 159.5-48 chr13 50782934 50783124 + 1.25 NA intron (NM_198989, intron 1 of 1) LTR16E1|LTR|ERVL -24826 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 141.25-137 chr5 78371174 78371305 + 1.25 NA intron (NM_001290229, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 10622 NM_004866 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 127-60 chr14 60221503 60221635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24181 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 233.25-58 chr5 55129906 55130116 + 1.25 NA intron (NM_001145734, intron 6 of 10) L1MEf|LINE|L1 27365 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 252.25-41 chr4 42763036 42763275 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -106050 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 233.75-76 chr7 112495327 112495640 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14492 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 212.25-87 chr7 53963434 53963710 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -151641 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 271-45 chr6 166453617 166454025 + 1.25 NA intron (NM_001006932, intron 13 of 21) L1PB4|LINE|L1 11562 NR_046793 100874353 Hs.675698 NR_046793 ENSG00000232082 RPS6KA2-IT1 - RPS6KA2 intronic transcript 1 ncRNA 241.5-50 chr2 172896814 172897133 + 1.25 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) intron (NM_001282899, intron 1 of 27) -31232 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 239.5-29 chr14 70270864 70271388 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23325 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 328.75-10 chr2 205311699 205312253 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -370524 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 161.75-46 chr16 60357001 60357163 + 1.25 NA TTS (NM_001282301) TTS (NM_001282301) 2711 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 217-83 chr9 104291632 104291873 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21523 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 187.5-9 chr1 119745926 119746101 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 22919 NM_001166107 3158 Hs.59889 NM_005518 ENSG00000134240 HMGCS2 - 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 protein-coding 249.5-95 chr8 102652329 102652692 + 1.25 NA intron (NM_005655, intron 1 of 3) intron (NM_005655, intron 1 of 3) 1454 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 247.5-46 chr2 194218581 194218890 + 1.25 NA Intergenic LTR86A2|LTR|ERVL -125534 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 222-26 chr14 86605577 86605965 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -300007 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 130-115 chr4 53412885 53413142 + 1.25 NA intron (NM_001134938, intron 8 of 14) L1MC4|LINE|L1 35360 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 136.5-79 chr15 73880946 73881092 + 1.25 NA intron (NM_001286434, intron 1 of 9) intron (NM_001286434, intron 1 of 9) 7455 NM_001286434 161514 Hs.124512 NM_153356 ENSG00000167139 TBC1D21 MgcRabGAP TBC1 domain family member 21 protein-coding 306.25 chr1 42768549 42768980 + 1.25 NA intron (NM_024097, intron 2 of 4) intron (NM_024097, intron 2 of 4) 1515 NR_040733 79078 Hs.148845 NM_024097 ENSG00000164008 C1orf50 - chromosome 1 open reading frame 50 protein-coding 224.5-111 chr8 125017544 125017811 + 1.25 NA intron (NM_003129, intron 7 of 10) intron (NM_003129, intron 7 of 10) 19172 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 216.75-52 chr3 194995159 194995493 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99262 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 338.75 chr10 17831212 17831684 + 1.25 NA intron (NM_002438, intron 3 of 29) intron (NM_002438, intron 3 of 29) -13659 NR_030167 574445 NR_030167 ENSG00000207938 MIR511 MIR511-1|MIR511-2|MIRN511-1|MIRN511-2|hsa-mir-511|hsa-mir-511-2|mir-511 microRNA 511 ncRNA 266.25-42 chr7 19711391 19711746 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2531 NM_001002926 221830 Hs.353035 NM_001002926 ENSG00000105849 TWISTNB - TWIST neighbor protein-coding 199-91 chr9 27930597 27930901 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -356883 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 132.25-28 chr10 22131875 22132073 + 1.25 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 78009 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 235.75-32 chr17 60917555 60917775 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) AluSx1|SINE|Alu 239814 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 280.25-21 chr15 65885553 65885974 + 1.25 NA intron (NM_004663, intron 4 of 4) LTR29|LTR|ERV1 16272 NM_001206836 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 236.5-13 chr11 44312157 44312375 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2127 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 170.75-87 chr3 84956313 84956539 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2563 NM_001167675 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 313-15 chr20 58266548 58266962 + 1.25 NA intron (NR_003505, intron 4 of 16) intron (NR_003505, intron 4 of 16) -38102 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 221-53 chr3 189393561 189393967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153170 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 171.25-51 chr15 90936478 90936740 + 1.25 NA intron (NM_001323621, intron 4 of 19) L1ME3G|LINE|L1 1324 NM_018671 55898 Hs.389461 NM_017979 ENSG00000140553 UNC45A GC-UNC45|GCUNC-45|GCUNC45|IRO039700|SMAP-1|SMAP1|UNC-45A unc-45 myosin chaperone A protein-coding 114.5-127 chr2 24502955 24503082 + 1.25 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) L2c|LINE|L2 11141 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 192.75-96 chr4 31695250 31695476 + 1.25 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 188819 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 269.75-47 chr6 3792957 3793216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41074 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 293.75-5 chr11 85941428 85941786 + 1.25 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 86506 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 153-102 chr3 181413798 181414164 + 1.25 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 28505 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 193.25-116 chr8 83220464 83220744 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -183154 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 263-45 chr6 89439224 89439611 + 1.25 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) intron (NM_001242809, intron 1 of 15) 6239 NM_001242813 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 114-110 chr4 47781101 47781288 + 1.25 NA intron (NM_001278585, intron 2 of 19) L1MB7|LINE|L1 -50151 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 290.75-51 chr8 114944430 114944767 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 723415 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 156.25-93 chr3 16145582 16145765 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29007 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 124.5-103 chr2 45916469 45916588 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 264853 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 266.75-53 chr9 96045694 96046112 + 1.25 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -19936 NR_033838 158435 Hs.652615 NR_033838 LOC158435 - uncharacterized LOC158435 ncRNA 153.75-103 chr4 72036679 72036869 + 1.25 NA intron (NM_004885, intron 1 of 3) intron (NM_004885, intron 1 of 3) -2358 NM_053036 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 290.75-25 chr2 21437074 21437542 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 273344 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 382.25-13 chr7 37428287 37428655 + 1.25 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) 20481 NM_014800 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 161-110 chr6 154045814 154045955 + 1.25 NA intron (NM_001285522, intron 1 of 1) LTR16E2|LTR|ERVL 6473 NM_001008505 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 202-57 chr5 149526563 149526846 + 1.25 NA intron (NM_001271742, intron 1 of 9) intron (NM_001271742, intron 1 of 9) 23661 NM_001271742 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 237.25-44 chr2 73428390 73428674 + 1.25 NA intron (NM_015120, intron 6 of 22) intron (NM_015120, intron 6 of 22) -28571 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 204.25-48 chr2 11067522 11067790 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64520 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 140.5-52 chr13 34064014 34064231 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 245973 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 292.25-19 chr2 88113270 88113745 + 1.25 NA TTS (NM_198274) TTS (NM_198274) 14555 NM_001443 2168 Hs.380135 NM_001443 ENSG00000163586 FABP1 FABPL|L-FABP fatty acid binding protein 1 protein-coding 189.75-55 chr2 17292088 17292333 + 1.25 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 226230 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 133-97 chr20 36681111 36681431 + 1.25 NA intron (NM_032013, intron 7 of 15) intron (NM_032013, intron 7 of 15) -35075 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 144.25-153 chr5 1719300 1719492 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10528 NR_036240 100422966 NR_036240 ENSG00000263746 MIR4277 - microRNA 4277 ncRNA 201.5-47 chr13 71458358 71458604 + 1.25 NA intron (NM_080759, intron 10 of 10) intron (NM_080759, intron 10 of 10) 408711 NM_080760 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 285.5-10 chr11 81745548 81745882 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 145121 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 207.75-11 chr1 211347575 211347886 + 1.25 NA intron (NM_145759, intron 1 of 10) intron (NM_145759, intron 1 of 10) 1366 NM_145759 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 208.25-24 chr12 89258246 89258540 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 94108 NM_022652 1848 Hs.298654 NM_001946 ENSG00000139318 DUSP6 HH19|MKP3|PYST1 dual specificity phosphatase 6 protein-coding 507.5-2 chr8 123891258 123892359 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) LOR1-int|LTR|ERV1 39821 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 176.5-131 chr4 33270433 33270653 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 769350 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 219.5-120 chr7 26513801 26514226 + 1.25 NA intron (NR_148500, intron 5 of 5) intron (NR_148500, intron 5 of 5) 24812 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 265.25-25 chr2 98736653 98736867 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5628 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 160.75-123 chr5 65821722 65821924 + 1.25 NA intron (NM_020726, intron 12 of 12) intron (NM_020726, intron 12 of 12) 99618 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 143-140 chr8 28894910 28895152 + 1.25 NA intron (NM_024567, intron 2 of 10) intron (NM_024567, intron 2 of 10) 3717 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 330.25 chr1 8965929 8966462 + 1.25 NA intron (NM_001270501, intron 4 of 6) AluSx|SINE|Alu 20327 NM_001215 765 Hs.100322 NM_001215 ENSG00000131686 CA6 CA-VI|GUSTIN carbonic anhydrase 6 protein-coding 341.25-26 chr8 79567646 79568161 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -43214 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 295.25-14 chr2 210076928 210077350 + 1.25 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) intron (NM_001307976, intron 5 of 13) 47217 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 275-45 chr9 92039365 92039624 + 1.25 NA intron (NM_001368273, intron 13 of 15) AluYj4|SINE|Alu 75919 NM_001281303 10558 Hs.90458 NM_006415 ENSG00000090054 SPTLC1 HSAN1|HSN1|LBC1|LCB1|SPT1|SPTI serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 protein-coding 151.75-65 chr2 78342898 78343046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52241 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 251.5-27 chr15 68030188 68030554 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23808 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 164.75-18 chr10 82468623 82468791 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -235787 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 292.75 chr1 37441799 37442192 + 1.25 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 32448 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 228-31 chr15 56292967 56293252 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -48027 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 200-83 chr7 18625007 18625429 + 1.25 NA intron (NM_001321893, intron 7 of 11) intron (NM_001321893, intron 7 of 11) 115948 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 242.25-75 chr6 53770931 53771313 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23883 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 222-44 chr2 214551726 214552175 + 1.25 NA intron (NR_159945, intron 4 of 4) intron (NR_159945, intron 4 of 4) 41768 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 225.5-43 chr16 56461134 56461432 + 1.25 NA intron (NM_001324363, intron 3 of 11) MER21C|LTR|ERVL 9199 NM_001324358 55239 Hs.231883 NM_018233 ENSG00000087263 OGFOD1 TPA1 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1 protein-coding 142.75-97 chr2 69635849 69635990 + 1.25 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) L1MB3|LINE|L1 7820 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 265.25-13 chr14 63759832 63760146 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31924 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 161.75-114 chr7 11319763 11320029 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 346024 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 213-85 chr7 1148065 1148257 + 1.25 NA TTS (NM_001365383) TTS (NM_001365383) -9904 NM_001350968 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 150.25-45 chr13 29255550 29255970 + 1.25 NA intron (NM_001033602, intron 3 of 13) intron (NM_001033602, intron 3 of 13) -172900 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 261.5-9 chr12 13085255 13085511 + 1.25 NA intron (NM_001206845, intron 4 of 4) intron (NM_001206845, intron 4 of 4) 10292 NM_001368007 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 164.25-6 chr1 81707007 81707292 + 1.25 NA intron (NM_001297704, intron 1 of 20) intron (NM_001297704, intron 1 of 20) 7379 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 134.75-70 chr14 75609275 75609525 + 1.25 NA intron (NM_001195283, intron 1 of 9) intron (NM_001195283, intron 1 of 9) 3860 NM_001195283 55640 Hs.509966 NM_017791 ENSG00000119686 FLVCR2 C14orf58|CCT|EPV|FLVCRL14q|MFSD7C|PVHH|SLC49A2 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family member 2 protein-coding 352.5-4 chr11 47871036 47871518 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -22733 NM_001318399 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 314.25-9 chr15 72192290 72192541 + 1.25 NA intron (NM_001012642, intron 1 of 11) intron (NM_001012642, intron 1 of 11) 5372 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 140.5-134 chr20 45783873 45784003 + 1.25 NA intron (NM_080614, intron 4 of 6) intron (NM_080614, intron 4 of 6) 7945 NM_080614 140686 Hs.419126 NM_080614 ENSG00000124116 WFDC3 WAP14|dJ447F3.3 WAP four-disulfide core domain 3 protein-coding 207.25-14 chr12 886295 886622 + 1.25 NA intron (NM_001184985, intron 19 of 27) intron (NM_001184985, intron 19 of 27) 46618 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 232.5-14 chr12 1157370 1157653 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) L1PB|LINE|L1 129763 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 127.5-29 chr10 35284121 35284260 + 1.25 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) L2|LINE|L2 37165 NM_181698 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 390.5-11 chr5 896289 896809 + 1.25 NA intron (NM_001166260, intron 2 of 8) intron (NM_001166260, intron 2 of 8) 3665 NM_001166260 9319 Hs.436187 NM_004237 ENSG00000071539 TRIP13 16E1BP|MVA3 thyroid hormone receptor interactor 13 protein-coding 215-7 chr1 76283553 76283773 + 1.25 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 208917 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 231-34 chr16 82679439 82679775 + 1.25 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) intron (NM_001220488, intron 2 of 14) -9324 NR_107025 102465863 NR_107025 ENSG00000277387 MIR8058 hsa-mir-8058 microRNA 8058 ncRNA 264.5-50 chr5 92712242 92712603 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 858921 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 277.5-15 chr12 14624263 14624660 + 1.25 NA intron (NM_004963, intron 21 of 26) (AATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -56578 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 376.5-16 chr5 146164020 146164657 + 1.25 NA exon (NM_001317964, exon 5 of 31) exon (NM_001317964, exon 5 of 31) 18312 NM_020117 51520 Hs.432674 NM_016460 ENSG00000133706 LARS HSPC192|ILFS1|LARS1|LEURS|LEUS|LFIS|LRS|PIG44|RNTLS|hr025Cl leucyl-tRNA synthetase protein-coding 289.75-26 chr5 45701078 45701524 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4921 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 268-45 chr5 97157954 97158298 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -15515 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 269-8 chr10 78216556 78216877 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -31909 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 301.75-2 chr10 64729382 64729757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95959 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 384-10 chr2 29492057 29492554 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) -16928 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 167.75-102 chr4 103934848 103935139 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -215008 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 237.5-99 chr8 80963283 80963570 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88645 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 129.5-122 chr2 72607437 72607588 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 218521 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 131.5-144 chr22 25000921 25001160 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -26934 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 146.5-144 chr3 163390337 163390478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87106 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 171.5-132 chr6 141981271 141981458 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 107435 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 214.25-26 chr15 85506537 85506811 + 1.25 NA intron (NM_007200, intron 2 of 36) L2a|LINE|L2 -113276 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 286.5-72 chr9 94296509 94296861 + 1.25 NA intron (NM_194320, intron 4 of 4) L1ME1|LINE|L1 31959 NM_017561 54754 Hs.648183 NM_017561 ENSG00000130950 NUTM2F FAM22F|NUTMF NUT family member 2F protein-coding 208-35 chr2 17416478 17416773 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 101815 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 194.5-88 chr3 63602598 63602843 + 1.25 NA intron (NM_001130003, intron 4 of 5) L1PA15|LINE|L1 -49955 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 319.75-11 chr18 12548902 12549239 + 1.25 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 107662 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 210.5-21 chr10 117410098 117410339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34778 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 286-38 chr9 101548215 101548621 + 1.25 NA intron (NM_019592, intron 9 of 19) L1MA9|LINE|L1 14565 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 183.75-105 chr6 27861899 27862109 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3325 NM_003511 8332 Hs.233568 NM_003511 ENSG00000276903 HIST1H2AL H2A.i|H2A/i|H2AFI|dJ193B12.9 histone cluster 1 H2A family member l protein-coding 318-30 chr4 72689435 72689787 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120390 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 420.25-11 chr5 82666643 82667012 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -173328 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 134.25-186 chr8 77019893 77020178 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -18991 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 200.25-58 chr2 26629988 26630255 + 1.25 NA intron (NM_001029881, intron 2 of 6) intron (NM_001029881, intron 2 of 6) 11245 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 233-26 chr17 42679215 42679512 + 1.25 NA 3' UTR (NM_016602, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_016602, exon 2 of 2) -2369 NR_073573 79990 Hs.632251 NM_024927 ENSG00000068137 PLEKHH3 - pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3 protein-coding 252.5-68 chr5 146277871 146278232 + 1.25 NA intron (NM_018989, intron 19 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -60788 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 124.25-125 chr3 6899179 6899386 + 1.25 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -5265 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 329 chr1 23157087 23157601 + 1.25 NA intron (NM_033631, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 11512 NM_033631 7798 Hs.257900 NM_033631 ENSG00000169641 LUZP1 LUZP leucine zipper protein 1 protein-coding 130.5-152 chr20 60384652 60384771 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 76237 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 257.5-67 chr7 7690436 7690793 + 1.25 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) intron (NM_002947, intron 2 of 7) 27993 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 227.25-26 chr14 55038241 55038431 + 1.25 NA intron (NM_199421, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 11100 NM_199421 122809 Hs.744302 NM_080867 ENSG00000180008 SOCS4 SOCS7 suppressor of cytokine signaling 4 protein-coding 135.25-201 chr8 122944007 122944151 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 81693 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 256-54 chr4 79921299 79921666 + 1.25 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 94011 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 180.75-111 chr5 24280377 24280621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 329151 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 171.5 chr1 13547187 13547401 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33291 NM_001010847 126755 Hs.657356 NM_001010847 ENSG00000162494 LRRC38 - leucine rich repeat containing 38 protein-coding 152-116 chr4 103703201 103703417 + 1.25 NA intron (NM_001059, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 16676 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 216.25-10 chr10 25066877 25067064 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -4691 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 181-18 chr12 14608774 14609035 + 1.25 NA intron (NR_120465, intron 2 of 5) L1M1|LINE|L1 -41021 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 302.25-31 chr9 21804133 21804592 + 1.25 NA intron (NM_002451, intron 1 of 7) intron (NM_002451, intron 1 of 7) 1726 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 147-75 chr2 104120920 104121152 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 287296 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 227-70 chr9 27567333 27567737 + 1.25 NA intron (NM_145005, intron 1 of 4) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 5946 NM_018325 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 332.25-17 chr2 62260376 62260872 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 45103 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 305.75-21 chr5 74413044 74413561 + 1.25 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 90816 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 276.75-13 chr16 51085483 51085945 + 1.25 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 64883 NM_001127892 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 299-29 chr5 54787059 54787467 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -43005 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 163-29 chr12 37679367 37679547 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -637317 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 123.75-25 chr11 60424190 60424373 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -5291 NM_023945 64232 Hs.178066 NM_023945 ENSG00000166930 MS4A5 CD20-L2|CD20L2|TETM4 membrane spanning 4-domains A5 protein-coding 331-12 chr14 58448338 58448830 + 1.25 NA intron (NM_001329944, intron 7 of 31) intron (NM_001329944, intron 7 of 31) 8903 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 164.25-19 chr10 81990692 81990886 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 113102 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 187.25-47 chr18 74696970 74697231 + 1.25 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) intron (NM_001146190, intron 2 of 3) 66137 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 195.25-74 chr5 92281161 92281458 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -897992 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 418.75-5 chr8 98597557 98598028 + 1.25 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 170834 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 365-16 chr7 27798974 27799351 + 1.25 NA intron (NM_001362794, intron 12 of 16) L1ME2|LINE|L1 59067 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 160.25-144 chr6 154036282 154036666 + 1.25 NA intron (NM_001145280, intron 1 of 3) intron (NM_001145280, intron 1 of 3) -2628 NM_001285523 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 128.5-158 chr4 53039668 53039864 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 177449 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 200.75-94 chr6 152749056 152749266 + 1.25 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1636 NM_194435 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 229.75-77 chr8 116656345 116656666 + 1.25 NA intron (NM_003756, intron 4 of 7) intron (NM_003756, intron 4 of 7) 4405 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 152-57 chr15 88427216 88427635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39963 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 351.75-25 chr8 73095932 73096315 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2951 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 180.5-101 chr3 130968166 130968349 + 1.25 NA intron (NM_001001485, intron 16 of 27) intron (NM_001001485, intron 16 of 27) 58597 NR_110229 28990 Hs.100878 NM_014065 ENSG00000034533 ASTE1 HT001 asteroid homolog 1 protein-coding 186.5-132 chr8 57095439 57095708 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101706 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 332.5-21 chr5 19064862 19065308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 821187 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 117.5-60 chr14 56787666 56787789 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17940 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 189.25-43 chr16 83094547 83094724 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) LTR16|LTR|ERVL -104337 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 210.75-102 chr9 35371840 35372350 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 12 of 38) AluSx3|SINE|Alu 30199 NM_001371187 135.5-2 chr1 26450510 26450805 + 1.25 NA intron (NM_205861, intron 6 of 8) L2|LINE|L2 16880 NR_125953 101928324 Hs.663256 NR_125952 LOC101928324 - uncharacterized LOC101928324 ncRNA 205.25-108 chr9 33885806 33886203 + 1.25 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 48360 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 305.75-10 chr19 19520437 19520723 + 1.25 NA intron (NM_015965, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 4355 NM_015965 51079 Hs.534453 NM_015965 ENSG00000186010 NDUFA13 B16.6|CDA016|CGI-39|GRIM-19|GRIM19|MC1DN28 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13 protein-coding 294.75-4 chr11 70709134 70709497 + 1.25 NA intron (NM_012309, intron 13 of 24) intron (NM_012309, intron 13 of 24) -47474 NM_133266 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 244-21 chr19 9258626 9259064 + 1.25 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 7801 NM_001079935 26648 Hs.129832 NM_001079935 ENSG00000237521 OR7E24 HSHT2|OR19-8|OR7E24P|OR7E24Q olfactory receptor family 7 subfamily E member 24 protein-coding 247.25-53 chr6 144251985 144252221 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39634 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 135.75-80 chr17 74141155 74141309 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -62446 NM_000999 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 259.75-5 chr11 31435292 31435712 + 1.25 NA intron (NM_001304274, intron 4 of 5) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 65642 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 258.5-31 chr18 4178806 4179075 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -85662 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 440-13 chr8 104599036 104599571 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10279 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 203.75-78 chr4 42721784 42722080 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64827 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 438.75-4 chr15 50311478 50311882 + 1.25 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -42494 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-67 chr14 58087579 58087721 + 1.25 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) intron (NM_001001872, intron 5 of 7) 64563 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 222.75-67 chr20 32227616 32227887 + 1.25 NA intron (NM_015352, intron 4 of 6) L2c|LINE|L2 -10044 NR_031726 100302183 NR_031726 ENSG00000284125 MIR1825 MIRN1825|hsa-mir-1825 microRNA 1825 ncRNA 162.5-55 chr14 79704082 79704362 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 18 of 20) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 424842 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 279.75-61 chr9 106035371 106035653 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 340971 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 277.5-77 chr9 73221208 73221569 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69523 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 195-77 chr7 36677444 36677973 + 1.25 NA intron (NM_001177507, intron 1 of 19) L1MB7|LINE|L1 46786 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 252.5-23 chr12 130992194 130992423 + 1.25 NA exon (NM_001330497, exon 9 of 26) exon (NM_001330497, exon 9 of 26) 1668 NR_131951 105755954 Hs.677534 NR_131950 ADGRD1-AS1 LACAT8 ADGRD1 antisense RNA 1 ncRNA 426-3 chr10 29403323 29403986 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5880 NR_110922 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 209.25-18 chr11 32551610 32551879 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32087 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 288.25-32 chrX 82756012 82756322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -752123 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 166-27 chr13 93286359 93286564 + 1.25 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 59654 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 205-32 chr2 12679919 12680183 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36821 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 354.75 chr1 233586110 233586619 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -27742 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 247.25-41 chr3 102490240 102490554 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 55382 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 140-93 chr21 27131304 27131521 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -164324 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 131-65 chr16 76957730 76957900 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 88879 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 184.25-72 chr21 22592816 22592978 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -486387 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 252.25-58 chr6 157859523 157859837 + 1.25 NA intron (NM_016224, intron 1 of 17) L1ME4b|LINE|L1 36434 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 191.25-94 chr7 47339594 47339910 + 1.25 NA intron (NM_022748, intron 20 of 30) L1MDa|LINE|L1 125051 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 216-43 chr2 115905298 115905500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 561584 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 130.5-166 chr3 88036128 88036251 + 1.25 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 22807 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 334.25-2 chr1 109764210 109764642 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_139053) promoter-TSS (NM_139053) -503 NM_024526 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 173.25-99 chr5 76507697 76507985 + 1.25 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) AluSx3|SINE|Alu -39568 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 197.75-55 chr3 59525383 59525624 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 132994 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 251.5-47 chr20 45102327 45102546 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -1309 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 157-79 chr3 189232143 189232347 + 1.25 NA intron (NM_198485, intron 3 of 5) intron (NM_198485, intron 3 of 5) 8349 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 159.25-37 chr14 48452530 48452772 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -657637 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 138.5-62 chr14 72684728 72684903 + 1.25 NA intron (NM_001280544, intron 7 of 9) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 167995 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 227.5-9 chr10 23898292 23898523 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 203680 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 368.5-11 chr3 104958211 104958624 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -408296 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 142.5-240 chr9 93276423 93276680 + 1.25 NA intron (NM_001282394, intron 19 of 29) L1ME1|LINE|L1 69752 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 230.75-76 chr8 136797748 136797990 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 267071 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 299.25-5 chr1 217814942 217815228 + 1.25 NA intron (NM_138796, intron 9 of 10) intron (NM_138796, intron 9 of 10) -29965 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 207.75-32 chr14 46142557 46142796 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 78517 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 227.75-74 chr6 169559872 169560288 + 1.25 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) THE1A|LTR|ERVL-MaLR 141949 NM_001350623 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 258.5-42 chr21 25980520 25980916 + 1.25 NA intron (NM_001136131, intron 7 of 15) intron (NM_001136131, intron 7 of 15) 159672 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 304.75-8 chr12 15042342 15042811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40743 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 155.5-205 chr8 88866876 88867059 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -539484 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 142-101 chr3 19473939 19474182 + 1.25 NA intron (NM_144633, intron 11 of 15) intron (NM_144633, intron 11 of 15) -159129 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 235.25-47 chr4 13323517 13323771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 160696 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 285-31 chr3 132157172 132157588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117774 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 142.25-25 chr10 125343251 125343467 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -182329 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 600 chr10 78117805 78118826 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 84452 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 197.75-86 chr8 51590241 51590741 + 1.25 NA intron (NM_144651, intron 3 of 22) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 218954 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 216.25-96 chr7 91485384 91485615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 221066 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 356.75-10 chr4 36643495 36643916 + 1.25 NA Intergenic LTR86A1|LTR|ERVL -1805 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 301-13 chr2 183273450 183273811 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 149187 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 303.75-23 chr3 119778909 119779236 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1412 NM_003889 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 201.5-58 chr15 63491790 63492013 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12610 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 471.5-3 chr10 62535649 62536134 + 1.25 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) L1PA15|LINE|L1 15443 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 335.25-26 chr4 52485250 52485653 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 171088 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 195.25-22 chr12 53608780 53609031 + 1.25 NA intron (NR_073163, intron 1 of 12) intron (NR_073163, intron 1 of 12) 17085 NM_001366556 11016 Hs.12286 NM_006856 ENSG00000170653 ATF7 ATFA activating transcription factor 7 protein-coding 122-38 chr11 31043894 31044061 + 1.25 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -51291 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 267.25-30 chr4 125354726 125355087 + 1.25 NA intron (NM_001291303, intron 1 of 16) intron (NM_001291303, intron 1 of 16) 38494 NM_001291285 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 319.25-7 chr18 38364421 38364860 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 707505 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 314.5-3 chr11 34722741 34723068 + 1.25 NA Intergenic (AATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 90338 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 219-72 chr3 101664908 101665347 + 1.25 NA exon (NM_014415, exon 4 of 11) exon (NM_014415, exon 4 of 11) -11303 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 304.25-19 chr4 61158901 61159378 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15483 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 246-10 chr12 44781360 44781844 + 1.25 NA intron (NM_006159, intron 4 of 20) L1MDa|LINE|L1 94059 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 264.75-49 chr6 150402653 150402947 + 1.25 NA non-coding (NR_134655, exon 6 of 6) non-coding (NR_134655, exon 6 of 6) 33788 NM_001318495 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 185.75-59 chr2 64602141 64602581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4951 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 196-44 chr18 65528839 65529079 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -221293 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 233-49 chr4 75541063 75541401 + 1.25 NA intron (NR_133920, intron 2 of 4) L1ME3G|LINE|L1 -14816 NM_001257072 152816 Hs.24510 NM_178497 ENSG00000174792 ODAPH AI2A4|C4orf26 odontogenesis associated phosphoprotein protein-coding 204.5-47 chr17 54217062 54217311 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 394259 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 205.5-65 chr19 420502 420753 + 1.25 NA intron (NM_012435, intron 11 of 12) intron (NM_012435, intron 11 of 12) -11480 NM_001136263 126567 Hs.223770 NM_001136263 ENSG00000183186 C2CD4C FAM148C|KIAA1957|NLF3 C2 calcium dependent domain containing 4C protein-coding 175-7 chr1 205462418 205462625 + 1.25 NA intron (NR_148934, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -6435 NR_103783 101669762 Hs.666219 NR_103783 BLACAT1 LINC00912|linc-UBC1|onco-lncRNA-30 bladder cancer associated transcript 1 ncRNA 140.5-117 chr2 133825878 133826087 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -257519 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 236-38 chr22 37693705 37693920 + 1.25 NA TTS (NM_024313) TTS (NM_024313) -3236 NM_001039141 11078 Hs.533030 NM_007032 ENSG00000100106 TRIOBP DFNB28|HRIHFB2122|TAP68|TARA|dJ37E16.4 TRIO and F-actin binding protein protein-coding 275.5-25 chr16 73002947 73003216 + 1.25 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) L1ME4a|LINE|L1 45047 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 376.5-18 chr7 69488220 69488704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109162 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 117.25-192 chr6 143967303 143967479 + 1.25 NA intron (NM_001289039, intron 2 of 4) intron (NM_001289039, intron 2 of 4) -1913 NM_001317156 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 382-17 chr3 146683487 146683826 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -77440 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 402.75-2 chr2 153544155 153544762 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65696 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 236.5-33 chr15 60906655 60907016 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 225266 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 186-63 chr4 59150883 59151058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137397 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 280.5-22 chr2 44758128 44758436 + 1.25 NA intron (NM_024766, intron 9 of 10) intron (NM_024766, intron 9 of 10) 180606 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 150.75-101 chr2 117886731 117886970 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53119 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 211.5-88 chr20 18362238 18362526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16667 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 291.5-43 chr6 38929022 38929472 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 73 of 91) intron (NM_001371, intron 73 of 91) 23860 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 362.75-8 chr3 68639828 68640162 + 1.25 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 139358 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 122-144 chr5 141992423 141992615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20508 NM_005471 10007 Hs.633853 NM_005471 ENSG00000113552 GNPDA1 GNP1|GNPDA|GNPI|GPI|HLN glucosamine-6-phosphate deaminase 1 protein-coding 286.75-5 chr1 199530932 199531358 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 382547 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 221.5-72 chr5 2871010 2871278 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46710 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 283-3 chr1 63488626 63488861 + 1.25 NA intron (NM_001347145, intron 3 of 7) L1ME3B|LINE|L1 34530 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 234.25-15 chr11 42807491 42807708 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 461770 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 285.5-8 chr10 92362427 92362877 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -56009 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 219.5-105 chr5 101407139 101407442 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -504008 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 165-31 chr12 80541352 80541603 + 1.25 NA intron (NM_001145026, intron 20 of 44) intron (NM_001145026, intron 20 of 44) 97242 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 203.75-3 chr1 118764433 118764670 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 223792 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 141.75-63 chr15 76156509 76156748 + 1.25 NA exon (NM_152335, exon 4 of 11) exon (NM_152335, exon 4 of 11) 24858 NR_120360 101929439 Hs.631721 NR_120360 ENSG00000259422 LOC101929439 - uncharacterized LOC101929439 ncRNA 138.75-97 chr2 158654171 158654409 + 1.25 NA intron (NM_001005476, intron 11 of 20) intron (NM_001005476, intron 11 of 20) 80712 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 156.25-32 chr12 4699957 4700206 + 1.25 NA TTS (NR_110112) TTS (NR_110112) 20021 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 185-22 chr14 63043341 63043543 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) intron (NM_139318, intron 1 of 10) 2016 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 297.25-4 chr11 100566050 100566392 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -121067 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 204.75-23 chr11 21056124 21056375 + 1.25 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 386663 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 191.5-32 chr13 22202145 22202537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7944 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 204.5-9 chr10 32223613 32223936 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 123384 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 215.5-72 chr3 188782286 188782635 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR 93679 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 292.5-19 chr14 60634317 60634772 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4672 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 238-4 chr1 97808987 97809339 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) L2|LINE|L2 12242 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 130.75-176 chr7 34102585 34102748 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) intron (NM_133468, intron 14 of 15) 197127 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 189.25-38 chr15 34148538 34148776 + 1.25 NA exon (NM_024713, exon 5 of 10) exon (NM_024713, exon 5 of 10) 46574 NM_152595 161779 Hs.156317 NM_152595 ENSG00000182405 PGBD4 - piggyBac transposable element derived 4 protein-coding 234.25-32 chr2 23651086 23651443 + 1.25 NA intron (NM_052920, intron 5 of 13) intron (NM_052920, intron 5 of 13) 266085 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 272.25-35 chr3 103317699 103317959 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 206287 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 204-35 chr2 102176819 102177156 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001320984, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001320984, exon 10 of 10) -9986 NM_001351448 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 210.75-3 chr1 39953352 39953637 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1618 NM_001287808 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 214.5-5 chr1 172585336 172585754 + 1.25 NA intron (NM_014283, intron 16 of 23) intron (NM_014283, intron 16 of 23) 52395 NM_001282750 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 232.25-55 chr4 103588304 103588577 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001059, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001059, exon 5 of 5) 131545 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 170.75-106 chr5 71675509 71675695 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -43673 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 240.5-53 chr2 162890738 162891065 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52134 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 207-68 chr6 38745772 38746128 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 7 of 91) L1MC4a|LINE|L1 30639 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 165.75-161 chr7 97428104 97428381 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -303844 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 227-67 chr8 67318831 67319074 + 1.25 NA intron (NM_006421, intron 1 of 38) AluJo|SINE|Alu 24829 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 279.5-9 chr10 86679648 86680033 + 1.25 NA intron (NM_001368066, intron 3 of 14) intron (NM_001368066, intron 3 of 14) 11276 NM_001080116 11155 Hs.657271 NM_007078 ENSG00000122367 LDB3 CMD1C|CMH24|CMPD3|CYPHER|LDB3Z1|LDB3Z4|LVNC3|MFM4|ORACLE|PDLIM6|ZASP LIM domain binding 3 protein-coding 218.75-65 chr4 101888815 101889004 + 1.25 NA intron (NM_017935, intron 5 of 16) intron (NM_017935, intron 5 of 16) 75067 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 133.5-262 chr8 73173575 73173721 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80476 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 207.75-94 chr4 162595347 162595547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -431413 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 261.5-45 chr4 32392005 32392378 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 41153 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 235.75-54 chr4 90197396 90197590 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) L1MA2|LINE|L1 -37538 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 310.5-32 chr6 27977121 27977463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20051 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 151.5-3 chr1 58436086 58436311 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 110528 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 146.5-46 chr11 86478724 86478951 + 1.25 NA intron (NM_001014811, intron 6 of 13) intron (NM_001014811, intron 6 of 13) 103950 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 328.75-12 chr3 22868649 22868923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 333792 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 179.75-29 chr12 18357963 18358214 + 1.25 NA intron (NM_004570, intron 11 of 31) L1MB1|LINE|L1 96548 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 236.25-80 chr7 53568093 53568387 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 243691 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 131.5-58 chr14 58323123 58323327 + 1.25 NA intron (NM_002892, intron 7 of 23) intron (NM_002892, intron 7 of 23) 24670 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 193-55 chr3 74539022 74539197 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17969 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 207-3 chr1 115310054 115310261 + 1.25 NA intron (NM_002506, intron 1 of 2) L1ME4c|LINE|L1 27123 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 232-57 chr4 36578130 36578520 + 1.25 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) L1MA9|LINE|L1 63575 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 265.75-38 chr2 170465896 170466185 + 1.25 NA intron (NM_001083615, intron 24 of 33) intron (NM_001083615, intron 24 of 33) -115097 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 164-115 chr6 73727673 73727815 + 1.25 NA intron (NM_001159588, intron 3 of 31) intron (NM_001159588, intron 3 of 31) 31541 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 226.5-68 chr4 45826453 45826710 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 297473 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 171-18 chr11 27316679 27316922 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 46415 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 487-6 chr5 45559757 45560220 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 136392 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 227.75-75 chr7 31957294 31957574 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 112973 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 296.25 chr1 230414162 230414439 + 1.25 NA intron (NM_001258311, intron 1 of 6) intron (NM_001258311, intron 1 of 6) 12032 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 168.25-24 chr11 37248237 37248403 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -650041 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 293-28 chr4 31908360 31908887 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88756 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 211-21 chr14 105490830 105491152 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001134875) promoter-TSS (NM_001134875) -255 NM_001367178 283643 Hs.720306 NM_173608 ENSG00000185347 TEDC1 C14orf80 tubulin epsilon and delta complex 1 protein-coding 159.5-173 chr5 41854061 41854280 + 1.25 NA intron (NR_157114, intron 3 of 15) intron (NR_157114, intron 3 of 15) -10513 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 190.5-126 chr5 113040956 113041188 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 17 of 18) intron (NM_001085377, intron 17 of 18) 64274 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 143-156 chr9 29612745 29612954 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -399248 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 215.25-40 chr18 60645432 60645776 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -272829 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 256.5-61 chr5 98915963 98916271 + 1.25 NA intron (NM_001364113, intron 2 of 36) AluSq|SINE|Alu 10417 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 210.5-6 chr1 103226739 103227077 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118386 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 204.25-49 chr2 13111164 13111463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104300 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 248.25-67 chr7 114731443 114731856 + 1.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 78304 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 241.75-49 chr3 8556463 8556769 + 1.25 NA intron (NM_014583, intron 4 of 5) intron (NM_014583, intron 4 of 5) -15166 NR_024065 29931 Hs.433151 NM_013343 LINC00312 ERR-10|ERR10|LMCD1DN|LOH3CR2A|NAG-7|NAG7|NCRNA00312 long intergenic non-protein coding RNA 312 ncRNA 208-37 chr2 32579293 32579470 + 1.25 NA intron (NM_016252, intron 66 of 73) intron (NM_016252, intron 66 of 73) -4563 NR_125793 103752586 Hs.666092 NR_125793 ENSG00000279897 BIRC6-AS2 linc-birc6|megamind BIRC6 antisense RNA 2 ncRNA 136.75-123 chr3 4795630 4795781 + 1.25 NA intron (NM_001168272, intron 52 of 60) intron (NM_001168272, intron 52 of 60) -44115 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 260-45 chr8 113945738 113946074 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -508967 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 254-23 chr2 101349131 101349605 + 1.25 NA 3' UTR (NM_153836, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_153836, exon 4 of 4) 38135 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 169.25-131 chr9 85737416 85737692 + 1.25 NA intron (NM_015239, intron 1 of 25) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 4475 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 169.75-126 chr5 76997392 76997553 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -32932 NM_018046 55109 Hs.634849 NM_018046 ENSG00000164252 AGGF1 GPATC7|GPATCH7|HSU84971|HUS84971|VG5Q angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 protein-coding 212.25-75 chr5 78920081 78920307 + 1.25 NA intron (NM_198709, intron 5 of 7) L1ME4b|LINE|L1 65116 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 264-6 chr10 19246326 19246722 + 1.25 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) intron (NM_001142308, intron 18 of 39) 197723 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 183-49 chr2 16544740 16544991 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120969 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 272.5-72 chr8 131448239 131448590 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -407505 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 243.75-78 chr8 84541794 84542127 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1M8|LINE|L1 126476 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 256-72 chr8 126525138 126525500 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 33159 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 121-129 chr3 94895944 94896092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42245 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 137-88 chr20 14735829 14736047 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) L1MB5|LINE|L1 181554 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 313-21 chr7 39380277 39380572 + 1.25 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) intron (NM_001370959, intron 5 of 9) 25922 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 242.25-49 chr2 112542141 112542421 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_136321) promoter-TSS (NR_136321) -69 NR_136321 105373562 Hs.599548 NR_136321 LOC105373562 - uncharacterized LOC105373562 ncRNA 294.5-31 chr3 189175394 189175774 + 1.25 NA intron (NM_198485, intron 1 of 5) intron (NM_198485, intron 1 of 5) 3613 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 385.75 chr12 96284746 96285216 + 1.25 NA intron (NM_002595, intron 13 of 16) intron (NM_002595, intron 13 of 16) 29483 NM_001303511 2004 Hs.46523 NM_005230 ENSG00000111145 ELK3 ERP|NET|SAP-2|SAP2 ETS transcription factor ELK3 protein-coding 267.75-8 chr11 30525148 30525445 + 1.25 NA intron (NM_001584, intron 2 of 5) intron (NM_001584, intron 2 of 5) 55197 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 212.5-25 chr13 73009891 73010080 + 1.25 NA intron (NR_146206, intron 16 of 16) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -44991 NM_001286818 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 317.5-23 chr3 170461253 170461740 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020949, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_020949, exon 8 of 8) -5789 NR_135555 101928583 Hs.407600 NR_135555 ENSG00000285051 SLC7A14-AS1 - SLC7A14 antisense RNA 1 ncRNA 258-57 chr8 117488329 117488667 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -32215 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 116.75-44 chr12 7988686 7988844 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -43951 NM_018416 55810 Hs.120844 NM_018416 ENSG00000065970 FOXJ2 FHX forkhead box J2 protein-coding 119.5-208 chr7 27831409 27831585 + 1.25 NA 3' UTR (NM_175061, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_175061, exon 5 of 5) 91402 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 232.25-47 chr3 146990267 146990678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 68549 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 200-14 chr10 70549600 70549929 + 1.25 NA intron (NM_014431, intron 18 of 19) intron (NM_014431, intron 18 of 19) 52977 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 300.5-53 chr8 128407702 128408120 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 6 of 7) intron (NR_121672, intron 6 of 7) 156768 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 248.75-59 chr8 58737261 58737565 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77560 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 158.5-114 chr20 35196374 35196590 + 1.25 NA intron (NM_001355008, intron 4 of 14) L1MEf|LINE|L1 24410 NM_006404 10544 Hs.647450 NM_006404 ENSG00000101000 PROCR CCCA|CCD41|EPCR protein C receptor protein-coding 177-72 chr4 70007557 70007760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11692 NM_003154 6779 Hs.654495 NM_003154 ENSG00000126549 STATH STR statherin protein-coding 187-110 chr9 101608997 101609175 + 1.25 NA intron (NM_133445, intron 6 of 8) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -14117 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 243.5-16 chr10 43521676 43522134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 46554 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 314.25-18 chr22 32917336 32917799 + 1.25 NA intron (NM_003490, intron 4 of 13) intron (NM_003490, intron 4 of 13) 89254 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 215-11 chr10 92850841 92851114 + 1.25 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) L1M4|LINE|L1 2457 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 201-25 chr12 116569209 116569546 + 1.25 NA intron (NM_001085481, intron 1 of 1) intron (NM_001085481, intron 1 of 1) 9996 NM_001085481 643246 Hs.356061 NM_001085481 ENSG00000258102 MAP1LC3B2 ATG8G microtubule associated protein 1 light chain 3 beta 2 protein-coding 129.75-151 chr5 98654643 98654819 + 1.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -113901 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 121.25-51 chr14 36202321 36202497 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -25758 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 159-92 chr6 1161122 1161292 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -59875 NR_027115 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 241.5-34 chr2 12323606 12323888 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 124617 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 164-86 chr4 1811050 1811311 + 1.25 NA TTS (NM_012318) TTS (NM_012318) 17868 NM_000142 2261 Hs.1420 NM_000142 ENSG00000068078 FGFR3 ACH|CD333|CEK2|HSFGFR3EX|JTK4 fibroblast growth factor receptor 3 protein-coding 266-3 chr1 224330064 224330351 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001243146) promoter-TSS (NM_001243146) -18 NM_001243146 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 185.5-158 chr8 46044656 46044919 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 572856 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 237.25-34 chr16 8341815 8342161 + 1.25 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 247850 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 141-107 chr3 123982556 123982697 + 1.25 NA intron (NR_133917, intron 1 of 2) intron (NR_133917, intron 1 of 2) 8726 NM_017578 54763 Hs.567516 NM_017578 ENSG00000065371 ROPN1 CT91|ODF6|RHPNAP1|ROPN1A|ropporin rhophilin associated tail protein 1 protein-coding 265-7 chr10 103263677 103263900 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13350 NM_032727 9118 Hs.500916 NM_032727 ENSG00000148798 INA NEF5|NF-66|TXBP-1 internexin neuronal intermediate filament protein alpha protein-coding 223.5-82 chr3 100615365 100615675 + 1.25 NA intron (NM_032787, intron 1 of 15) intron (NM_032787, intron 1 of 15) 5919 NM_032787 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 199-56 chr3 156154079 156154502 + 1.25 NA intron (NM_003471, intron 1 of 13) intron (NM_003471, intron 1 of 13) 11328 NM_003471 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 182.5-62 chr16 87728173 87728533 + 1.25 NA intron (NM_001184856, intron 5 of 10) intron (NM_001184856, intron 5 of 10) 37633 NM_017566 54758 Hs.123450 NM_017566 ENSG00000104731 KLHDC4 - kelch domain containing 4 protein-coding 203.75-24 chr12 65605003 65605248 + 1.25 NA intron (NR_146529, intron 1 of 2) intron (NR_146529, intron 1 of 2) 2256 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 246.5-4 chr1 198868302 198868682 + 1.25 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) -9339 NR_029626 406995 NR_029626 ENSG00000207759 MIR181A1 MIR213|MIRN181A1|MIRN213|hsa-mir-181a-1|mir-181a-1|mir-213 microRNA 181a-1 ncRNA 166.5-214 chrX 44679035 44679259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136288 NM_173794 139341 Hs.7549 NM_173794 ENSG00000069509 FUNDC1 - FUN14 domain containing 1 protein-coding 320-3 chr1 239009978 239010368 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -376395 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 320.25-20 chr5 60549213 60549495 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -53068 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 272.5-33 chr2 50600847 50601214 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 95232 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 244.5-96 chr8 117176486 117176703 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001172813, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001172813, exon 11 of 11) 41599 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 198.25-35 chr15 67767503 67767931 + 1.25 NA intron (NM_001206804, intron 19 of 21) intron (NM_001206804, intron 19 of 21) -57792 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 165.25-116 chr5 35347276 35347476 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116889 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 207-76 chr6 169694197 169694387 + 1.25 NA intron (NR_146876, intron 1 of 15) AluSq2|SINE|Alu 7737 NM_001350623 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 348-14 chr3 82579544 82579910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 593585 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 226.5-78 chr5 22304828 22305151 + 1.25 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -91139 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 173-102 chr4 188941419 188941686 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 164895 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 278-15 chr18 11686923 11687382 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2112 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 189.25-132 chr8 134401249 134401457 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -196718 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 202-55 chr5 100423391 100423578 + 1.25 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -35230 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 274.5-46 chr3 171178392 171178799 + 1.25 NA intron (NM_001161563, intron 7 of 31) intron (NM_001161563, intron 7 of 31) -71836 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 283.5-47 chr6 37987828 37988216 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 168295 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 133.75-109 chr2 213285192 213285443 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 1 of 14) intron (NR_047660, intron 1 of 14) 853 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 151.5-108 chr22 39857703 39857942 + 1.25 NA intron (NM_152512, intron 3 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 35938 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 351.75-16 chr4 54055895 54056434 + 1.25 NA intron (NM_012110, intron 1 of 5) intron (NM_012110, intron 1 of 5) 8441 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 219-94 chr8 112572321 112572531 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 22 of 66) intron (NM_001363185, intron 22 of 66) -71067 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 140.75-191 chr8 139852613 139852848 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -149607 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 313.75-4 chr12 50145373 50145735 + 1.25 NA intron (NM_001331069, intron 1 of 11) intron (NM_001331069, intron 1 of 11) 21815 NM_001331073 91012 Hs.270525 NM_147190 ENSG00000139624 CERS5 LASS5|Trh4 ceramide synthase 5 protein-coding 161.25-158 chr7 14208560 14208769 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -217239 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 291-11 chr12 112292382 112292681 + 1.25 NA intron (NM_001109662, intron 7 of 75) L2a|LINE|L2 89900 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 163.5-162 chr5 81396302 81396478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2256 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 165.5-46 chr14 64385829 64386093 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2392 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 396.25-11 chr3 11494591 11495117 + 1.25 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) AluSg|SINE|Alu 73944 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 150.5-101 chr2 150139303 150139534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 117589 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 242.75-66 chr8 57381937 57382209 + 1.25 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 38286 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 220.5-6 chr1 115825884 115826081 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 14721 NM_001111061 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 264.75-27 chr22 24510092 24510530 + 1.25 NA intron (NM_016327, intron 3 of 9) L1MB3|LINE|L1 14979 NM_016327 51733 Hs.731656 NM_016327 ENSG00000100024 UPB1 BUP1 beta-ureidopropionase 1 protein-coding 233.25-56 chr4 117614517 117614942 + 1.25 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) L1MA8|LINE|L1 186331 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 290.25-26 chr5 126811013 126811475 + 1.25 NA intron (NR_134488, intron 4 of 11) intron (NR_134488, intron 4 of 11) 34108 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 239.75-19 chr14 50872826 50873071 + 1.25 NA intron (NM_181814, intron 1 of 10) intron (NM_181814, intron 1 of 10) 788 NM_181814 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 338.5-12 chr19 51930783 51931148 + 1.25 NA intron (NM_024840, intron 3 of 5) L1MB8|LINE|L1 3493 NM_001031721 79898 Hs.183390 NM_024840 ENSG00000176024 ZNF613 - zinc finger protein 613 protein-coding 158-89 chr20 60646483 60646632 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81995 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 214.75-22 chr14 48705867 48706113 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 880390 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 122.25-115 chr22 33439750 33439899 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) L2|LINE|L2 -3155 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 171-55 chr17 72405135 72405411 + 1.25 NA intron (NR_036488, intron 3 of 3) intron (NR_036488, intron 3 of 3) 62462 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 265.25-53 chr7 84671538 84671829 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139207 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 161.75-41 chr14 73420277 73420484 + 1.25 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 38200 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 220.5-88 chr4 72910476 72910845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 159056 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 303-15 chr18 34584236 34584633 + 1.25 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) HAL1|LINE|L1 -8901 NM_001198938 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 339-6 chr12 48659457 48659941 + 1.25 NA intron (NM_017822, intron 8 of 9) L1MB7|LINE|L1 -2917 NR_002950 677793 Hs.689723 NR_002950 ENSG00000206612 SNORA2A ACA2A small nucleolar RNA, H/ACA box 2A snoRNA 331-28 chr6 112088852 112089378 + 1.25 NA intron (NM_001033564, intron 1 of 3) intron (NM_001033564, intron 1 of 3) 1524 NM_001033564 619208 Hs.591340 NM_001033564 ENSG00000203778 FAM229B C6orf225 family with sequence similarity 229 member B protein-coding 263-7 chr10 116511117 116511822 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -34462 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 222-46 chr20 62931415 62931923 + 1.25 NA intron (NM_022105, intron 1 of 5) intron (NM_022105, intron 1 of 5) -5118 NM_080796 11083 Hs.517172 NM_022105 ENSG00000101191 DIDO1 BYE1|C20orf158|DATF-1|DATF1|DIDO2|DIDO3|DIO-1|DIO1|dJ885L7.8 death inducer-obliterator 1 protein-coding 127.5-247 chr8 128540161 128540336 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 24431 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 321.5-23 chr3 79800265 79800573 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -32421 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 177.75-61 chr2 19401948 19402178 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43440 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 226.75-47 chr22 27952793 27953047 + 1.25 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MC|LINE|L1 -32308 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 233.25-65 chr7 25898095 25898394 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51742 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 211.25-89 chr8 31284984 31285227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -251749 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 228.25-20 chr13 64081875 64082274 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -6063 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 237-20 chr16 63774016 63774331 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1347890 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 258.5-27 chr16 80393485 80393756 + 1.25 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1MC5|LINE|L1 -147114 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 167.25-60 chr16 85684751 85685027 + 1.25 NA intron (NM_016095, intron 2 of 4) AluSx1|SINE|Alu 4065 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 142.75-152 chr5 17983689 17983983 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 176562 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 248.5-107 chr9 29774649 29774856 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -561151 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 217.5-133 chr9 80958084 80958322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 731332 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 228.25-45 chr2 67407487 67407713 + 1.25 NA intron (NM_019002, intron 5 of 5) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 10267 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 459.5-8 chr6 52719466 52719978 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 25437 NR_033760 730152 Hs.739662 NR_033760 GSTA7P GSTAP2|GSTAP6 glutathione S-transferase alpha 7, pseudogene pseudo 155.75-170 chr9 78125309 78125554 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -93620 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 152-82 chr2 42095733 42095904 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47797 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 226-22 chr15 43108588 43108892 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2702 NM_174916 197131 Hs.591121 NM_174916 ENSG00000159459 UBR1 JBS ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 protein-coding 149-111 chr6 39733611 39733807 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8286 NM_001351503 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 158.25-53 chr19 23999930 24000183 + 1.25 NA Intergenic LSU-rRNA_Hsa|rRNA|rRNA -33349 NM_001278661 9534 Hs.434406 NM_004876 ENSG00000213096 ZNF254 BMZF-5|HD-ZNF1|ZNF539|ZNF91L zinc finger protein 254 protein-coding 240.75-61 chr5 36060902 36061201 + 1.25 NA intron (NM_001168316, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 5831 NM_001168316 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 238.25-76 chr6 144164174 144164536 + 1.25 NA intron (NM_003764, intron 1 of 1) intron (NM_003764, intron 1 of 1) 13838 NM_003764 8676 Hs.118958 NM_003764 ENSG00000135604 STX11 FHL4|HLH4|HPLH4 syntaxin 11 protein-coding 286.5-2 chr1 55963090 55963415 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 18165 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 217.75-54 chr4 79837117 79837486 + 1.25 NA intron (NR_026555, intron 1 of 1) L1MB8|LINE|L1 9830 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 167-76 chr3 43731424 43731744 + 1.25 NA intron (NM_001355186, intron 7 of 7) AluSp|SINE|Alu -39990 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 281-22 chr4 32159801 32160153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -137555 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 261.5-61 chr7 25977298 25977797 + 1.25 NA Intergenic AluYk3|SINE|Alu -27561 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 187.25-15 chr10 94028355 94028569 + 1.25 NA intron (NM_001288989, intron 1 of 32) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 34531 NM_001288989 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 165.25-7 chr1 160564906 160565096 + 1.25 NA intron (NM_001184882, intron 1 of 5) L1MD2|LINE|L1 14495 NM_001184881 8832 Hs.398093 NM_003874 ENSG00000066294 CD84 LY9B|SLAMF5|hCD84|mCD84 CD84 molecule protein-coding 248-42 chr21 27010550 27010785 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43579 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 190-7 chr1 223750249 223750427 + 1.25 NA intron (NM_001146068, intron 6 of 20) L1MC4|LINE|L1 37799 NM_001748 824 Hs.350899 NM_001748 ENSG00000162909 CAPN2 CANP2|CANPL2|CANPml|mCANP calpain 2 protein-coding 289-14 chr13 66913404 66913772 + 1.25 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) -63801 NR_046636 100874086 Hs.577908 NR_046636 ENSG00000225263 PCDH9-AS3 - PCDH9 antisense RNA 3 ncRNA 267.75-67 chr9 98859160 98859458 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 51639 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 207.75-105 chr5 178169326 178169520 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -15463 NM_001034833 55651 Hs.744074 NM_017838 ENSG00000145912 NHP2 DKCB2|NHP2P|NOLA2 NHP2 ribonucleoprotein protein-coding 218.75-20 chr12 108249593 108249840 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014653, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_014653, exon 9 of 9) 70946 NM_001142345 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 142.25-62 chr15 55966461 55966642 + 1.25 NA intron (NM_001329212, intron 1 of 28) intron (NM_001329212, intron 1 of 28) 27061 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 298-23 chr5 12779125 12779477 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 111442 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 189-44 chr17 18969213 18969374 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001039999, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001039999, exon 6 of 6) 17128 NM_152351 125206 Hs.462418 NM_152351 ENSG00000154025 SLC5A10 SGLT-5|SGLT5 solute carrier family 5 member 10 protein-coding 292.25-12 chr12 26595336 26595577 + 1.25 NA intron (NM_002223, intron 32 of 56) intron (NM_002223, intron 32 of 56) 237738 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 217.25-41 chr2 82055749 82056083 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -588970 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 310.25-17 chr5 88515631 88515937 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76694 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 188.5-25 chr12 23180364 23180594 + 1.25 NA intron (NR_120471, intron 1 of 4) intron (NR_120471, intron 1 of 4) 4843 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 220.25-80 chr9 4197722 4198055 + 1.25 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) L1PA16|LINE|L1 -45705 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 195.75-37 chr12 92182921 92183156 + 1.25 NA intron (NR_135036, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 36953 NR_135037 101928617 Hs.434392 NR_135036 LOC101928617 - uncharacterized LOC101928617 ncRNA 219-92 chr8 87890818 87891090 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16939 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 181-35 chr16 11753398 11753655 + 1.25 NA intron (NM_014153, intron 21 of 22) AluJr|SINE|Alu -10669 NR_136673 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 153.75-129 chr6 55903339 55903582 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27870 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 238-31 chr2 192888990 192889216 + 1.25 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 139258 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 275.5-22 chr14 88572037 88572310 + 1.25 NA exon (NM_001326296, exon 5 of 16) exon (NM_001326296, exon 5 of 16) 8826 NM_207661 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 228.5-86 chr5 148102013 148102365 + 1.25 NA intron (NM_006846, intron 15 of 32) L1MA7|LINE|L1 38209 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 212-78 chr7 46106433 46106780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -185334 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 206-14 chr11 4451186 4451473 + 1.25 NA TTS (NM_001005172) TTS (NM_001005172) 2034 NM_001005172 119774 Hs.553568 NM_001005172 ENSG00000181963 OR52K2 OR11-7 olfactory receptor family 52 subfamily K member 2 protein-coding 341.5-34 chr7 28210129 28210949 + 1.25 NA intron (NR_034097, intron 2 of 3) intron (NR_034097, intron 2 of 3) -29744 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 130.25-107 chr2 183772369 183772525 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -606528 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 280.75-16 chr16 55564152 55564446 + 1.25 NA intron (NM_017839, intron 11 of 13) L1MB3|LINE|L1 -2385 NM_032330 84290 Hs.660027 NM_032330 ENSG00000256812 CAPNS2 CSS2 calpain small subunit 2 protein-coding 233.5-27 chr12 1904524 1904807 + 1.25 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 L1M4c|LINE|L1 13987 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 292.75-30 chr6 23718762 23719045 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -407312 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 306.25-17 chr16 88286641 88286985 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92532 NR_110944 101928880 Hs.634835 NR_110944 ENSG00000260420 LINC02182 LA16c-444G7.2 long intergenic non-protein coding RNA 2182 ncRNA 244.25-21 chr2 75413943 75414187 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110003 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 350.25-22 chr3 128661208 128661702 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10637 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 239.25-18 chr12 64219389 64219721 + 1.25 NA intron (NM_001300941, intron 1 of 2) intron (NM_001300941, intron 1 of 2) 2741 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 233-15 chr14 26561829 26562107 + 1.25 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) -8538 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 121-116 chr20 59482155 59482342 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -95261 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 258.75-14 chr11 69404513 69404753 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -21022 NM_001319657 102724265 Hs.448669 NM_001319657 LOC102724265 - uncharacterized LOC102724265 protein-coding 175.75-51 chr17 60820387 60820552 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) LTR33|LTR|ERVL 142618 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 184-21 chr12 39035333 39035603 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129877 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 253.75-5 chr11 105664802 105665144 + 1.25 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 54267 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 135.5-100 chr2 63886015 63886213 + 1.25 NA intron (NM_001001521, intron 6 of 9) intron (NM_001001521, intron 6 of 9) 44234 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 239.25-7 chr10 61001874 61002218 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001350907) promoter-TSS (NM_001350907) -606 NM_001350902 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 208.75-86 chr8 133656364 133656789 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27490 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 316-4 chr10 73185712 73186200 + 1.25 NA intron (NM_173348, intron 3 of 13) L1ME2|LINE|L1 17837 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 151.5-163 chr5 147839516 147839671 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_003122) promoter-TSS (NM_003122) -362 NM_003122 6690 Hs.407856 NM_003122 ENSG00000164266 SPINK1 PCTT|PSTI|Spink3|TATI|TCP serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 protein-coding 181.5-122 chr4 75908806 75909077 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6489 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 197.25-73 chr3 122891652 122891929 + 1.25 NA non-coding (NR_024618, exon 1 of 1) non-coding (NR_024618, exon 1 of 1) 5277 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 206.75-10 chr11 26305468 26305718 + 1.25 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) -17586 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 286.25-20 chr3 48069041 48069505 + 1.25 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) intron (NM_002375, intron 1 of 18) 19575 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 284-47 chr8 76297196 76297588 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -109262 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 151-21 chr11 103424875 103425033 + 1.25 NA intron (NM_001377, intron 84 of 88) AluJo|SINE|Alu 315528 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 159-62 chr3 8360145 8360354 + 1.25 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 141409 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-132 chr4 43257869 43258151 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 234533 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 213.25-29 chr2 26749219 26749459 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14945 NM_017877 54978 Hs.1594 NM_017877 ENSG00000213699 SLC35F6 ANT2BP|C2orf18|TANGO9 solute carrier family 35 member F6 protein-coding 358.25-10 chr19 29041100 29041482 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38736 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 321.25-20 chr6 63018818 63019345 + 1.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 300896 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 176.25-114 chr5 72363692 72363928 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001284403, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001284403, exon 7 of 7) 43437 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 180.75-65 chr2 61853246 61853596 + 1.25 NA intron (NR_037710, intron 1 of 5) intron (NR_037710, intron 1 of 5) 639 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 208.75-15 chr11 29738378 29738682 + 1.25 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 119728 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 184.25-53 chr2 2619803 2620040 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -288646 NM_001329851 23040 Hs.434418 NM_015025 ENSG00000186487 MYT1L MRD39|NZF1|ZC2H2C2|ZC2HC4B|myT1-L myelin transcription factor 1 like protein-coding 229.5-122 chr7 9476560 9476748 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157616 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 124.75-213 chr9 36399441 36399619 + 1.25 NA intron (NM_194330, intron 1 of 11) intron (NM_194330, intron 1 of 11) 739 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 192-39 chr13 83317565 83317841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 564690 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 273.5-64 chr5 113571728 113572007 + 1.25 NA intron (NM_001345975, intron 22 of 28) L1PA11|LINE|L1 58173 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 163-63 chr20 62101620 62102035 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -20648 NM_144703 149986 Hs.105379 NM_144703 ENSG00000149657 LSM14B C20orf40|FAM61B|FT005|LSM13|RAP55B|bA11M20.3 LSM family member 14B protein-coding 209.5-51 chr16 48359937 48360140 + 1.25 NA TTS (NM_001006610) TTS (NM_001006610) 5849 NM_001006610 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 211.75-30 chr16 74849002 74849269 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -74315 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 143.25-39 chr12 111114333 111114512 + 1.25 NA intron (NM_001370598, intron 1 of 21) L1ME1|LINE|L1 14418 NM_001370598 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 141.25-73 chr18 21367436 21367637 + 1.25 NA intron (NM_001142966, intron 2 of 32) intron (NM_001142966, intron 2 of 32) 125294 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 135-193 chr9 29108289 29108527 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 103891 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 251.75-52 chr3 79907820 79908278 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -140051 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 193.5-134 chr5 76346689 76346882 + 1.25 NA intron (NM_001297716, intron 12 of 12) intron (NM_001297716, intron 12 of 12) -56500 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 183.25-111 chr8 58721776 58722003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62036 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 277.75-2 chr10 68089688 68090035 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14578 NM_015601 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 112.75-30 chr10 120736014 120736136 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 115104 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 204.5-130 chr8 74115039 74115226 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 123740 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 341.25-8 chr12 17959995 17960331 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 130030 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 124.75-49 chr12 9882410 9882546 + 1.25 NA intron (NM_001190765, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 989 NM_001190765 100431172 Hs.725113 NM_001190765 ENSG00000256797 KLRF2 NKp65 killer cell lectin like receptor F2 protein-coding 173-29 chr12 2872053 2872388 + 1.25 NA exon (NM_021953, exon 3 of 9) exon (NM_021953, exon 3 of 9) -4045 NR_046433 83695 Hs.198853 NM_001252499 ENSG00000171792 RHNO1 C12orf32|HKMT1188|RHINO RAD9-HUS1-RAD1 interacting nuclear orphan 1 protein-coding 190.75-84 chr5 44578663 44578898 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68498 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 254.75-34 chr3 88154594 88154861 + 1.25 NA intron (NM_173824, intron 2 of 2) intron (NM_173824, intron 2 of 2) 4768 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 217.25-63 chr5 19255015 19255338 + 1.25 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 631096 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 143.75-93 chr2 101627368 101627534 + 1.25 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -70252 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 155.5-23 chr10 57641596 57641897 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -337187 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 236.75-61 chr8 105640279 105640563 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 320878 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 164-22 chr11 86277395 86277621 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_106813) promoter-TSS (NR_106813) -825 NR_106813 102465452 NR_106813 ENSG00000283744 MIR6755 hsa-mir-6755 microRNA 6755 ncRNA 434.75-2 chr11 41049267 41049872 + 1.25 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 410067 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 260.75-5 chr11 15748671 15748898 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 104899 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 174.5-187 chr8 105416746 105416952 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 97306 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 313.25-11 chr15 57576560 57576870 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15189 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 253.25-27 chr18 77284834 77285282 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 35210 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 130.5-244 chr8 100532152 100532271 + 1.25 NA intron (NM_001270377, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 27548 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 204.5-44 chr15 100541598 100541898 + 1.25 NA intron (NM_178842, intron 1 of 12) intron (NM_178842, intron 1 of 12) 2538 NM_001290342 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 232.25-4 chr1 104276745 104277112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203905 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 227-38 chr22 26823347 26823631 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -36722 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 294.75-39 chr8 78536417 78536766 + 1.25 NA intron (NR_125389, intron 2 of 2) intron (NR_125389, intron 2 of 2) 20251 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 213-86 chr7 22222477 22222650 + 1.25 NA intron (NM_012294, intron 8 of 25) L2a|LINE|L2 -27753 NM_001367602 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 291.25-3 chr10 118211898 118212329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 130211 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 518.5-2 chr8 120605105 120605659 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -155871 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 296.25-18 chr2 45760317 45760631 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 108799 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 214-41 chr3 6147290 6147527 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 658041 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 154.75-105 chr3 186823894 186824145 + 1.25 NA intron (NR_125409, intron 2 of 3) intron (NR_125409, intron 2 of 3) 1502 NR_125409 102724699 Hs.518476 NR_125409 ENSG00000232233 LINC02043 - long intergenic non-protein coding RNA 2043 ncRNA 135.25-192 chr7 101082234 101082470 + 1.25 NA Intergenic LTR61|LTR|ERV1 -3129 NM_030961 81844 Hs.521092 NM_030961 ENSG00000169871 TRIM56 RNF109 tripartite motif containing 56 protein-coding 283.5-39 chr3 7241866 7242322 + 1.25 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) 293190 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 252.5-17 chr11 82262927 82263214 + 1.25 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 140843 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 218.75-94 chrX 23497796 23498018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 163058 NM_173495 139411 Hs.319503 NM_173495 ENSG00000165186 PTCHD1 AUTSX4 patched domain containing 1 protein-coding 292-43 chr8 13335669 13336259 + 1.25 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -59180 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 226.75-78 chr8 137691132 137691349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -277652 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 228.5-90 chr6 131832014 131832366 + 1.25 NA intron (NM_006208, intron 1 of 24) intron (NM_006208, intron 1 of 24) 24170 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 307.5-34 chr3 52099951 52100421 + 1.25 NA intron (NM_015426, intron 9 of 10) intron (NM_015426, intron 9 of 10) -35074 NR_027331 100128378 Hs.640106 NM_001123039 LINC00696 C3orf74 long intergenic non-protein coding RNA 696 ncRNA 242.25-29 chr14 79121800 79122230 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -77967 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 157.5-130 chr3 25102495 25102716 + 1.25 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -238197 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 186-57 chr21 34986499 34986750 + 1.25 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 52802 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 191-67 chr5 32766570 32766955 + 1.25 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) intron (NM_001364460, intron 2 of 6) 55441 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 198.5-21 chr10 117294166 117294373 + 1.25 NA intron (NM_173791, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 53155 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 136-20 chr10 119817882 119818145 + 1.25 NA intron (NM_014937, intron 15 of 19) intron (NM_014937, intron 15 of 19) -1244 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 148.5-34 chr11 9735807 9736065 + 1.25 NA intron (NM_015055, intron 7 of 11) L1M4b|LINE|L1 -22357 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 317-22 chr3 169543296 169543841 + 1.25 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) AluJr4|SINE|Alu 95701 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 122.25-152 chr5 60382305 60382537 + 1.25 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) -9758 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 227.25-45 chr2 57255633 57255923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -651873 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 261.25-13 chr18 7582046 7582562 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 14988 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 208.75-45 chr20 19134588 19134942 + 1.25 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -77877 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 297-3 chr1 208925462 208925839 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -46804 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 184-5 chr1 157719178 157719386 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -18513 NM_001320333 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 168.75-32 chr12 1965355 1965573 + 1.25 NA intron (NR_135060, intron 6 of 10) intron (NR_135060, intron 6 of 10) -28888 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 338-25 chr4 61813481 61813895 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) intron (NM_001371343, intron 8 of 23) 348077 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-103 chr4 61795591 61795795 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) intron (NM_001371343, intron 8 of 23) 366072 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-85 chr18 60729990 60730153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -357296 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 206.5-96 chr5 45263874 45264211 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 7 of 7) AluY|SINE|Alu 432338 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 264.25-45 chr6 17087570 17087854 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14546 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 127.5-162 chr4 23010252 23010361 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 296217 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 240.5-111 chrX 102136453 102136715 + 1.25 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 5897 NM_001006938 158931 Hs.447815 NM_001006938 ENSG00000204071 TCEAL6 Tceal3|WEX2 transcription elongation factor A like 6 protein-coding 158.75-110 chr3 36008827 36009019 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 264447 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 137.75-54 chr13 112528072 112528233 + 1.25 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) intron (NM_006322, intron 11 of 21) 60001 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 226-8 chr11 13589325 13589515 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -79248 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 392-19 chr9 32738545 32739007 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44764 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 114.75-26 chr10 82315926 82316088 + 1.25 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -83087 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 311 chr1 204165772 204166098 + 1.25 NA intron (NM_000537, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 402 NM_000537 5972 Hs.3210 NM_000537 ENSG00000143839 REN HNFJ2 renin protein-coding 184-63 chr4 71903674 71903846 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98240 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 245-53 chr4 118892662 118892916 + 1.25 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 3935 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 299.5-44 chr8 65790351 65790892 + 1.25 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) intron (NM_001242318, intron 1 of 12) -1564 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 377.5-12 chr2 212210085 212210674 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 215981 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 229.75-15 chr14 45377360 45377661 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124308 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 262.5-54 chr4 44764467 44764708 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -37953 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 198.5-30 chr12 60498527 60498766 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 809276 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 252.5-26 chr14 48761968 48762191 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 824301 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 332.5-26 chr6 127236204 127236621 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -30270 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 163.5-167 chr5 136328977 136329191 + 1.25 NA intron (NM_020389, intron 2 of 11) intron (NM_020389, intron 2 of 11) -27228 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 285.75-33 chr4 59501589 59502269 + 1.25 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 488356 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 125.75-136 chr4 31977254 31977421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20042 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 186.25-4 chr1 86859840 86860057 + 1.25 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 54178 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 248.25-5 chr1 193726079 193726441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 421515 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 348-9 chr13 46319166 46319646 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -21562 NR_047493 100861554 Hs.90866 NR_047493 ENSG00000261097 LINC00563 - long intergenic non-protein coding RNA 563 ncRNA 297-7 chr10 90885706 90886099 + 1.25 NA intron (NM_006413, intron 6 of 10) intron (NM_006413, intron 6 of 10) 13928 NM_001104546 10556 Hs.139120 NM_006413 ENSG00000148688 RPP30 TSG15 ribonuclease P/MRP subunit p30 protein-coding 187-52 chr20 42631184 42631468 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -54157 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 338.5-27 chr6 46918044 46918408 + 1.25 NA intron (NM_015234, intron 1 of 20) L2b|LINE|L2 3712 NM_001098518 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 143.75-14 chr10 51834998 51835254 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -135531 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 233.5-34 chr14 46466372 46466595 + 1.25 NA intron (NR_102701, intron 5 of 5) L1PA13|LINE|L1 -4876 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 192.5-11 chr10 3923455 3923687 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67589 NR_106726 102464829 NR_106726 ENSG00000274809 MIR6078 hsa-mir-6078 microRNA 6078 ncRNA 172.75-65 chr2 129074624 129074824 + 1.25 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 199167 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 456.25-3 chr2 109311937 109312569 + 1.25 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 1372 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 177.75-45 chr14 68411557 68411718 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) intron (NM_133509, intron 9 of 10) 217150 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 304-25 chr3 108849276 108849640 + 1.25 NA intron (NM_001317747, intron 4 of 4) intron (NM_001317747, intron 4 of 4) 26672 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 213.25-10 chr11 10376162 10376425 + 1.25 NA intron (NR_103765, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 67980 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 278.25-41 chr4 59315481 59315752 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 302043 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 134.75-97 chr18 70556559 70556711 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94319 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 263.5-13 chr12 56714040 56714500 + 1.25 NA intron (NM_001320194, intron 4 of 6) L1PB1|LINE|L1 11029 NM_001320194 4666 Hs.505735 NM_005594 ENSG00000196531 NACA HSD48|NAC-alpha|NACA1|skNAC nascent polypeptide associated complex subunit alpha protein-coding 342.5-21 chr4 8481798 8482240 + 1.25 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 41222 NM_001350233 152992 Hs.566191 NM_024950 ENSG00000155275 TRMT44 C4orf23|METTL19|TRM44 tRNA methyltransferase 44 homolog protein-coding 175-91 chr4 177617395 177617670 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -111225 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 536.75 chr12 126065619 126066549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29908 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 213.5-86 chr4 33097823 33098103 + 1.25 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 746925 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 221.75-88 chr8 132625170 132625446 + 1.25 NA exon (NM_001321963, exon 6 of 12) exon (NM_001321963, exon 6 of 12) 50237 NM_001321963 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 219.5-125 chr7 140185514 140185726 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 8359 NR_024451 100134229 Hs.634333 NR_024451 ENSG00000260231 KDM7A-DT JHDM1D-AS1 KDM7A divergent transcript ncRNA 166-32 chr14 73717467 73717676 + 1.25 NA 3' UTR (NM_194278, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_194278, exon 12 of 12) -3187 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 128-122 chr5 29257799 29257982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 114387 NR_130777 101929660 Hs.171348 NR_130777 LINC02109 - long intergenic non-protein coding RNA 2109 ncRNA 155.75-116 chr4 30334545 30334707 + 1.25 NA Intergenic Tigger17|DNA|TcMar-Tigger -385743 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 475.25-3 chr2 181882229 181883024 + 1.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -9104 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 214.75-8 chr10 9844713 9844937 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -213897 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 224.25-17 chr10 126402681 126403033 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -14380 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 199.75-81 chr6 40815859 40816117 + 1.25 NA Intergenic SVA_B|Retroposon|SVA 207292 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 202-51 chr4 170731617 170731946 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 11954 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 165.5-162 chr6 54156047 54156262 + 1.25 NA intron (NM_001281746, intron 5 of 11) intron (NM_001281746, intron 5 of 11) 44711 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 238.5-89 chr8 36146477 36146695 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -436266 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 342.75-21 chr5 83640968 83641302 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001884, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001884, exon 5 of 5) -78821 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 305.5-29 chr3 88936551 88937093 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -170799 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 137-8 chr1 97616185 97616356 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -180651 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 284.5-41 chr3 179426755 179427272 + 1.25 NA intron (NM_021629, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 24457 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 125-153 chr7 124105770 124105981 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -72808 NM_001136002 730130 Hs.450249 NM_001136002 ENSG00000234224 TMEM229A - transmembrane protein 229A protein-coding 173.75-24 chr10 72658939 72659157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32857 NM_006077 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 244.5-47 chr2 40876087 40876562 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -363889 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 268.5-49 chr5 146904608 146904908 + 1.25 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) intron (NM_001271900, intron 2 of 10) 14748 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 356.25-9 chr2 190037194 190037610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25327 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 240.5-29 chr14 62888929 62889220 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 156384 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 280.5-17 chr16 69662084 69662373 + 1.25 NA intron (NM_173215, intron 7 of 13) intron (NM_173215, intron 7 of 13) 46447 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 199.75-60 chr3 18610163 18610601 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -164790 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 215.75-6 chr1 98279789 98280099 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 69233 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 175-40 chr14 88237545 88237759 + 1.25 NA intron (NM_138317, intron 3 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 33259 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 292.25-26 chr22 26723911 26724336 + 1.25 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 51280 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 186.5-95 chr3 122618925 122619209 + 1.25 NA intron (NM_152615, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 3452 NM_001308321 165631 Hs.120250 NM_152615 ENSG00000173200 PARP15 ARTD7|BAL3|pART7 poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 protein-coding 254.5-24 chr14 57759443 57759821 + 1.25 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1MB1|LINE|L1 105367 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 197.75-85 chr8 38742237 38742476 + 1.25 NA non-coding (NR_148052, exon 3 of 4) non-coding (NR_148052, exon 3 of 4) 13774 NR_148050 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 343-30 chr7 110601007 110601638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -489684 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 181.25-21 chr12 5518828 5519066 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 24815 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 154.25-175 chr8 139992276 139992456 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 108169 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 300.75-22 chr18 79535679 79535966 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -43460 NR_148949 284240 Hs.448912 NR_148949 LOC284240 - uncharacterized LOC284240 ncRNA 176-44 chr3 94256238 94256528 + 1.25 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL 193322 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 193-46 chr21 27153230 27153474 + 1.25 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -186264 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 398.25-3 chr10 6523731 6524403 + 1.25 NA intron (NM_001323265, intron 1 of 17) intron (NM_001323265, intron 1 of 17) 56209 NM_001282644 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 216.5-132 chr9 95281247 95281578 + 1.25 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) L1M1|LINE|L1 35842 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 247.5-6 chr10 52475406 52475792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5066 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 116.25-2 chr1 18141516 18141692 + 1.25 NA intron (NM_032880, intron 1 of 9) MIR1_Amn|SINE|MIR 33806 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 273.75-29 chr3 178447436 178447719 + 1.25 NA intron (NR_046786, intron 1 of 2) intron (NR_046786, intron 1 of 2) 28376 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 258-62 chrX 66751323 66751632 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -112179 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 182.75-140 chr9 16513864 16514029 + 1.25 NA intron (NM_001317939, intron 4 of 6) intron (NM_001317939, intron 4 of 6) -212868 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-156 chr6 41967086 41967229 + 1.25 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) intron (NM_001136017, intron 1 of 4) -25309 NM_001287427 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 208.25-78 chr6 159283236 159283425 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100201 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 311.75-8 chr12 125625862 125626219 + 1.25 NA intron (NM_001286219, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 3588 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 199.75-7 chr10 72721306 72721504 + 1.25 NA TTS (NR_039823) TTS (NR_039823) 376 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 150-82 chr20 40445292 40445480 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 243850 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 330-2 chr1 119292655 119293000 + 1.25 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -35425 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 212-9 chr10 33533889 33534158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199118 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 314.25-12 chr19 17384160 17384500 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6988 NM_031310 83483 Hs.107125 NM_031310 ENSG00000130300 PLVAP DIAR10|FELS|PV-1|PV1|gp68 plasmalemma vesicle associated protein protein-coding 275.25-31 chr5 9533367 9533888 + 1.25 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) 12448 NM_003966 9037 Hs.27621 NM_003966 ENSG00000112902 SEMA5A SEMAF|semF semaphorin 5A protein-coding 307-24 chr3 105380433 105380892 + 1.25 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 13753 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 185.75-126 chr8 118185982 118186162 + 1.25 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) MER103C|DNA|hAT-Charlie -74253 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 177.25-10 chr10 4369786 4369955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14376 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 169.75-101 chr3 34858602 34858770 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 535337 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 185.25-92 chr4 103935767 103935973 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -215885 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 196.75-54 chr2 46481486 46481695 + 1.25 NA intron (NM_001145051, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 2025 NM_001145051 388946 Hs.733348 NM_001145051 ENSG00000284701 TMEM247 - transmembrane protein 247 protein-coding 122-37 chr11 3940861 3941012 + 1.25 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 84874 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 234-71 chr9 35787139 35787448 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5116 NM_003995 4882 Hs.78518 NM_000907 ENSG00000159899 NPR2 AMDM|ANPRB|ANPb|ECDM|GUC2B|GUCY2B|NPRB|NPRBi|SNSK natriuretic peptide receptor 2 protein-coding 221.75-59 chr5 60017319 60017529 + 1.25 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L1PA10|LINE|L1 -123698 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 236.75-60 chr8 85634108 85634518 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21363 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 210.75-15 chr10 112626256 112626494 + 1.25 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) -7795 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 259.75-28 chr2 114796270 114796623 + 1.25 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 37102 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 248.25-38 chr2 200422917 200423226 + 1.25 NA intron (NM_001100424, intron 6 of 11) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 86997 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 168.75-42 chr14 55179670 55179827 + 1.25 NA intron (NM_001146015, intron 6 of 19) intron (NM_001146015, intron 6 of 19) 11837 NM_014750 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 142.25-101 chr21 30057307 30057615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109344 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 173.5-82 chr20 918063 918349 + 1.25 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -1872 NM_015985 51378 Hs.278973 NM_015985 ENSG00000101280 ANGPT4 ANG3|ANG4 angiopoietin 4 protein-coding 160.75-132 chr6 49173476 49173684 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 289673 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 250.25-16 chr17 55183709 55184009 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -81101 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 182-18 chr11 18022367 18022532 + 1.25 NA intron (NM_004179, intron 9 of 9) intron (NM_004179, intron 9 of 9) -9287 NR_104041 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 378.25-3 chr10 32615196 32615725 + 1.25 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1PB4|LINE|L1 169320 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 229.75-59 chr5 46401358 46401665 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -705131 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 168.5-130 chr4 57229342 57229565 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -119068 NM_001553 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 133-152 chr6 90740662 90740843 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -153680 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 185-10 chr10 82160407 82160713 + 1.25 NA intron (NR_163251, intron 2 of 9) AluSz6|SINE|Alu 72360 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 171.75-74 chr2 55577461 55577598 + 1.25 NA intron (NM_020463, intron 9 of 14) intron (NM_020463, intron 9 of 14) 40093 NM_020463 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 224.75-73 chr8 102839935 102840271 + 1.25 NA intron (NM_015878, intron 4 of 12) intron (NM_015878, intron 4 of 12) 24060 NM_148174 51582 Hs.459106 NM_015878 ENSG00000155096 AZIN1 AZI|AZI1|AZIA1|OAZI|OAZIN|ODC1L antizyme inhibitor 1 protein-coding 313.75-7 chr17 53367674 53368256 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 382460 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 254.75-22 chr2 109441776 109442013 + 1.25 NA intron (NM_001099289, intron 7 of 9) L1MEc|LINE|L1 -128269 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 168.25-108 chr4 91645981 91646121 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 631251 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 170.5-134 chr4 97587037 97587263 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) L2a|LINE|L2 220224 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 226.25-6 chr1 179260716 179261133 + 1.25 NA Intergenic X6B_LINE|LINE|CR1 -31240 NM_001136001 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 228.25-41 chr2 37366362 37366681 + 1.25 NA intron (NM_012413, intron 3 of 6) intron (NM_012413, intron 3 of 6) 21891 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 203-68 chr4 13095800 13096131 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 388375 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 164.75-55 chr15 68478295 68478545 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -39953 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 207.5-64 chr22 39892512 39892875 + 1.25 NA intron (NM_152512, intron 1 of 6) intron (NM_152512, intron 1 of 6) 1067 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 291-12 chr13 53368354 53368818 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -216686 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 167.75-78 chr2 180048861 180049089 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41678 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 201.5-52 chr14 40370073 40370405 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -584472 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 355-15 chr6 2426641 2427086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 181110 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 241.75-13 chr11 61471631 61471861 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9374 NM_001170753 220004 Hs.729003 NM_145017 ENSG00000162148 PPP1R32 C11orf66|IIIG9 protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 protein-coding 187.5-30 chr11 42018641 42019058 + 1.25 NA intron (NR_135065, intron 8 of 9) intron (NR_135065, intron 8 of 9) 66609 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 218.25-20 chr11 90705269 90705493 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -149524 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 409.75 chr1 15557483 15558031 + 1.25 NA intron (NR_109898, intron 7 of 14) AluJb|SINE|Alu 15591 NR_135613 107397391 NR_135613 ENSG00000251866 SCARNA21B - small Cajal body-specific RNA 21B ncRNA 124.5-22 chr10 33875525 33875712 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -102938 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 171.75-54 chr16 12410511 12410791 + 1.25 NA intron (NM_032167, intron 18 of 20) AluJr|SINE|Alu -309670 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 169.25-41 chr17 68995333 68995616 + 1.25 NA intron (NM_080283, intron 26 of 38) L2|LINE|L2 -9240 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 227-45 chr3 175758738 175759025 + 1.25 NA intron (NM_207015, intron 13 of 13) intron (NM_207015, intron 13 of 13) 17452 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 196-70 chr4 26205843 26206129 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -113724 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 367-14 chr4 101166654 101167134 + 1.25 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) intron (NM_001130691, intron 2 of 12) 73978 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 195.25-49 chr2 53199207 53199508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -496742 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 245.5-82 chr8 130941136 130941438 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 4 of 17) L2b|LINE|L2 99622 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 163-111 chr7 42890610 42890918 + 1.25 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 21079 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 377.25-11 chr3 183271787 183272194 + 1.25 NA 3' UTR (NM_032047, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_032047, exon 2 of 2) 18737 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 197.25-7 chr1 210352016 210352216 + 1.25 NA intron (NM_001122834, intron 2 of 11) MIRc|SINE|MIR 22750 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 240.25-60 chr7 16981167 16981505 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99353 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 265.75-73 chr8 81102550 81102913 + 1.25 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) intron (NM_018440, intron 1 of 8) 9337 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 299-4 chr1 182982316 182982788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29386 NM_001345928 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 187.75-56 chr2 203052539 203052801 + 1.25 NA intron (NM_001114132, intron 4 of 54) AluJb|SINE|Alu 37791 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 123.25-165 chr5 99767569 99767712 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 233650 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 160.25-37 chr14 51996241 51996461 + 1.25 NA intron (NM_016039, intron 3 of 7) intron (NM_016039, intron 3 of 7) 6805 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 266.5-74 chr8 78857824 78858056 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 20411 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 239.25-80 chr6 144343764 144343988 + 1.25 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) 52139 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 225.25-52 chr22 27616891 27617240 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 184691 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 166.25-11 chr1 102414422 102414808 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -417381 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 242.75-38 chr21 31348318 31348548 + 1.25 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -4079 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 148.5-237 chr8 132973798 132973957 + 1.25 NA intron (NM_003235, intron 34 of 47) intron (NM_003235, intron 34 of 47) 72704 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 289.5-23 chr2 55962627 55962906 + 1.25 NA TTS (NR_126406) TTS (NR_126406) 20310 NR_029630 406999 NR_029630 ENSG00000207548 MIR217 MIRN217|mir-217 microRNA 217 ncRNA 277.75-13 chr17 70777297 70777793 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 424634 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 154-89 chr3 27165513 27165691 + 1.25 NA intron (NM_001304384, intron 8 of 16) intron (NM_001304384, intron 8 of 16) 50921 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 437.5-4 chr19 50159294 50159725 + 1.25 NA exon (NM_152358, exon 3 of 7) exon (NM_152358, exon 3 of 7) 3772 NM_001321449 126123 Hs.414175 NM_152358 ENSG00000161652 IZUMO2 C19orf41|PLAL6978|PRO21961|SCRL IZUMO family member 2 protein-coding 251-6 chr1 151943259 151943549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33893 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 183.75-92 chr5 9630920 9631168 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_019599) promoter-TSS (NM_019599) -693 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 205-39 chr2 80969781 80970129 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 496991 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 159.75-93 chr20 13267015 13267368 + 1.25 NA intron (NM_080826, intron 1 of 5) intron (NM_080826, intron 1 of 5) -27504 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 173.75-56 chr14 82967148 82967328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 324606 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 205.25-34 chr16 62062513 62062686 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26161 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 165.5-132 chr4 103289502 103289716 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -91266 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 170.25-142 chr6 164515599 164515793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 306367 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 167.75-82 chr20 7381386 7381678 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 9924 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 211-19 chr14 66933348 66933684 + 1.25 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) intron (NM_020806, intron 8 of 22) -255924 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 157.25-129 chr6 99049238 99049418 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -75281 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 196-75 chr5 7352549 7352826 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4710 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 168.5-141 chr5 6643184 6643370 + 1.25 NA intron (NM_001324322, intron 1 of 3) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 9837 NM_001324323 6715 Hs.552 NM_001047 ENSG00000145545 SRD5A1 S5AR 1 steroid 5 alpha-reductase 1 protein-coding 325.5-20 chr2 168115183 168115481 + 1.25 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) intron (NM_013233, intron 10 of 17) 132263 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 173.75-13 chr1 157526934 157527132 + 1.25 NA intron (NM_001195388, intron 9 of 16) intron (NM_001195388, intron 9 of 16) 25482 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 448-3 chr7 30847379 30847933 + 1.25 NA intron (NR_037598, intron 11 of 19) MIR|SINE|MIR -64038 NM_198098 358 Hs.76152 NM_000385 ENSG00000240583 AQP1 AQP-CHIP|CHIP28|CO aquaporin 1 (Colton blood group) protein-coding 211.25-65 chr4 46600694 46601037 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -210737 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 216.25-60 chr21 22479466 22479767 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 380999 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 166.75-110 chr5 27005931 27006137 + 1.25 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) L1PA14|LINE|L1 32552 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 232.75-65 chr8 105141774 105142212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -176445 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 154.75-157 chr9 103508595 103508915 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -183722 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 211.5-50 chr14 62390723 62390913 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -250845 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 301.75-9 chr12 48372255 48372740 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -21251 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 149-99 chr5 42273136 42273304 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -97875 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 547.5 chr11 82505919 82506628 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -102360 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 155-82 chr22 48107518 48107893 + 1.25 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -166659 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 167.5-123 chr4 35236960 35237121 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -967293 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 204.75-100 chr6 55385876 55386186 + 1.25 NA intron (NM_207410, intron 6 of 8) intron (NM_207410, intron 6 of 8) 58562 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 180.75-70 chr2 165705195 165705377 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 88961 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 194.75-54 chr2 63365335 63365582 + 1.25 NA intron (NM_001354045, intron 12 of 12) MIRc|SINE|MIR 72549 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 263.75-2 chr1 211027903 211028248 + 1.25 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) L1MD1|LINE|L1 105299 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 311.25-20 chr5 108610659 108611149 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 117357 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 113-76 chr18 8396421 8396585 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 30 of 30) intron (NM_002845, intron 30 of 30) -29469 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 243.75-6 chr10 14923636 14923852 + 1.25 NA intron (NR_146960, intron 10 of 13) intron (NR_146960, intron 10 of 13) 30352 NM_001350965 64421 Hs.655932 NM_022487 ENSG00000152457 DCLRE1C A-SCID|DCLREC1C|RS-SCID|SCIDA|SNM1C DNA cross-link repair 1C protein-coding 389.25-2 chr10 76058114 76058644 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 4 of 6) intron (NM_001305581, intron 4 of 6) 275618 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 136.75-23 chr10 28091471 28091718 + 1.25 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -18216 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 332.5-16 chr20 38037855 38038194 + 1.25 NA intron (NM_021215, intron 1 of 6) intron (NM_021215, intron 1 of 6) 4278 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 242.5-84 chr8 111610317 111610563 + 1.25 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu 233801 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 152.25-42 chr12 115598026 115598164 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 550559 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 338-20 chr21 29072958 29073490 + 1.25 NA intron (NM_001282907, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR 424 NM_006585 10694 Hs.125113 NM_006585 ENSG00000156261 CCT8 C21orf112|Cctq|D21S246|PRED71 chaperonin containing TCP1 subunit 8 protein-coding 257.75-12 chr13 78328789 78329041 + 1.25 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -267207 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 361-14 chr2 75869766 75870115 + 1.25 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -159025 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 185.25-43 chr16 72014039 72014223 + 1.25 NA intron (NM_001361, intron 2 of 8) intron (NM_001361, intron 2 of 8) 5387 NM_001361 1723 Hs.654427 NM_001361 ENSG00000102967 DHODH DHOdehase|POADS|URA1 dihydroorotate dehydrogenase (quinone) protein-coding 175.75-117 chr7 9487634 9487831 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -146538 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 135.5-96 chr2 12811107 12811382 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 73877 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 181-37 chr17 27799203 27799461 + 1.25 NA intron (NM_000625, intron 1 of 26) intron (NM_000625, intron 1 of 26) 1197 NM_000625 4843 Hs.709191 NM_000625 ENSG00000007171 NOS2 HEP-NOS|INOS|NOS|NOS2A nitric oxide synthase 2 protein-coding 121.5-33 chr10 96331583 96331740 + 1.25 NA intron (NM_004088, intron 8 of 10) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 25498 NM_001284326 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 181.5-94 chr20 5624258 5624485 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13365 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 158.25-21 chr11 46478838 46479004 + 1.25 NA intron (NM_001267782, intron 13 of 19) AluJb|SINE|Alu -27032 NR_036117 100422827 NR_036117 ENSG00000265014 MIR3160-1 mir-3160-1 microRNA 3160-1 ncRNA 118-143 chr5 29806517 29806704 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -73950 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 154.25-149 chr6 145525022 145525213 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 161760 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 205-55 chr4 70401795 70402015 + 1.25 NA intron (NM_001302807, intron 3 of 3) (GCTGTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3965 NM_001302807 58503 Hs.661425 NM_021225 ENSG00000171199 OPRPN BPLP|PRL1|PROL1|opiorphin opiorphin prepropeptide protein-coding 281.5-26 chr2 48784214 48784557 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -28661 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 137.25-67 chr2 53653061 53653176 + 1.25 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -114665 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 163.75-29 chr11 80808051 80808280 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -45362 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 173.75-84 chr2 54984089 54984362 + 1.25 NA intron (NM_020532, intron 4 of 8) intron (NM_020532, intron 4 of 8) 26047 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 274.5-42 chr22 27774475 27774843 + 1.25 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 27097 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 188-86 chr8 139985242 139985415 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 115207 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 210.25-76 chr8 5194193 5194430 + 1.25 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -199397 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 256.75-26 chr20 10478123 10478336 + 1.25 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) intron (NM_001009608, intron 2 of 7) 42924 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 344.5-10 chr2 170458106 170458523 + 1.25 NA intron (NM_001083615, intron 23 of 33) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -107371 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 293.75 chr1 7300521 7300869 + 1.25 NA intron (NM_001349608, intron 4 of 21) intron (NM_001349608, intron 4 of 21) 89059 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 125-39 chr14 43725478 43725684 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 781702 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 199.5-145 chr8 87587707 87587906 + 1.25 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 286209 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 329-17 chr2 63477315 63477670 + 1.25 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) intron (NR_148704, intron 7 of 18) -39485 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 176.25-96 chr3 111167152 111167335 + 1.25 NA intron (NM_001243288, intron 7 of 8) intron (NM_001243288, intron 7 of 8) 95427 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 236.5-95 chr8 102187889 102188112 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 50831 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 262.5-38 chr2 123250959 123251339 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -177668 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 179.5-42 chr12 51705010 51705209 + 1.25 NA intron (NM_001369788, intron 9 of 25) intron (NM_001369788, intron 9 of 25) 113873 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 325.25-20 chr3 89523243 89523697 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 415849 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 195.75-18 chr10 21165164 21165361 + 1.25 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -8728 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 221.75-72 chr7 67777048 67777245 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -243107 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 147.75-140 chr7 7919453 7919679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49186 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 278-30 chr5 51381468 51381955 + 1.25 NA intron (NR_046243, intron 1 of 1) intron (NR_046243, intron 1 of 1) 1621 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 274.75-4 chr11 95623596 95624026 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 165971 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 413.25-5 chr20 59368138 59368614 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 67765 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 244.5-52 chr2 102539277 102539590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66207 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 161-93 chr5 58545814 58546064 + 1.25 NA intron (NR_109904, intron 3 of 3) L1MB4|LINE|L1 12304 NR_109904 101928600 Hs.694699 NR_109904 ENSG00000250127 LINC02108 - long intergenic non-protein coding RNA 2108 ncRNA 250.5-102 chr9 81123312 81123596 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 566081 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 320.25-3 chr10 51157706 51158136 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) L1MA5A|LINE|L1 83434 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 229.5-97 chr4 36998669 36998911 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2989 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 144.5-172 chr5 42224527 42224753 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -49295 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 210-66 chr3 87023231 87023431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32182 NM_001320493 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 334.75-19 chr3 17365344 17365890 + 1.25 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 334403 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 272.75-26 chr2 152966924 152967208 + 1.25 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 248429 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 198.75-38 chr17 55147913 55148238 + 1.25 NA intron (NM_178509, intron 17 of 17) intron (NM_178509, intron 17 of 17) -116885 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 169.25-35 chr15 70312909 70313086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 192931 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 212.25-4 chr1 154138693 154138951 + 1.25 NA intron (NM_001159484, intron 5 of 37) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 16294 NM_001159484 91181 Hs.67639 NM_207308 ENSG00000143552 NUP210L - nucleoporin 210 like protein-coding 238.25-23 chr16 25631621 25631831 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -60233 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 250.25-42 chr5 102435369 102435707 + 1.25 NA intron (NM_173488, intron 7 of 13) HERVL40-int|LTR|ERVL 63463 NM_001308014 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 267-26 chr2 63057429 63057724 + 1.25 NA non-coding (NR_130153, exon 5 of 5) non-coding (NR_130153, exon 5 of 5) 6746 NR_130153 5013 Hs.734360 NM_014562 ENSG00000115507 OTX1 - orthodenticle homeobox 1 protein-coding 143.5-231 chr9 104733429 104733709 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14114 NM_001329570 25934 Hs.530275 NM_015469 ENSG00000136783 NIPSNAP3A HSPC299|NIPSNAP4|TASSC nipsnap homolog 3A protein-coding 127.5-14 chr1 98148469 98148627 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -62163 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 159.25-87 chr3 88978964 88979161 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -128559 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 431-8 chr3 158667646 158668242 + 1.25 NA intron (NM_020169, intron 4 of 5) intron (NM_020169, intron 4 of 5) 4704 NM_020169 56925 Hs.478067 NM_020169 ENSG00000079257 LXN ECI|TCI latexin protein-coding 270.25-25 chr17 80780329 80780617 + 1.25 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 25159 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 247-16 chr12 58139351 58139594 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 51580 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 186-90 chr7 82667882 82668074 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -224022 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 376.25-5 chr10 63567465 63568025 + 1.25 NA intron (NM_001001330, intron 2 of 7) intron (NM_001001330, intron 2 of 7) -45855 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 213.75-35 chr14 61650799 61651005 + 1.25 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -44611 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 135.5-23 chr10 33591420 33591531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 181205 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 188-2 chr1 109548394 109548703 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_006496) promoter-TSS (NM_006496) -67 NM_006496 2773 Hs.73799 NM_006496 ENSG00000065135 GNAI3 87U6|ARCND1 G protein subunit alpha i3 protein-coding 291.75-10 chr12 129189021 129189323 + 1.25 NA intron (NM_133448, intron 5 of 8) intron (NM_133448, intron 5 of 8) -19429 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 267.25-32 chr5 30681080 30681473 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -512410 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 170.25-125 chr5 42427852 42428106 + 1.25 NA intron (NM_001242401, intron 1 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 2998 NM_001242401 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 206-70 chr7 62891299 62891594 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 412610 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 183.75-103 chr5 177212153 177212329 + 1.25 NA intron (NM_172349, intron 6 of 23) intron (NM_172349, intron 6 of 23) 78012 NM_001365684 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 162-96 chr5 147816041 147816265 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 23078 NM_001354966 6690 Hs.407856 NM_003122 ENSG00000164266 SPINK1 PCTT|PSTI|Spink3|TATI|TCP serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 protein-coding 217.25-71 chr5 126255598 126255932 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 29410 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 340.5-3 chr1 159726168 159726658 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11824 NM_000567 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 328.5-25 chr3 112720441 112720755 + 1.25 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -16491 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 157.25-100 chr3 164774069 164774274 + 1.25 NA intron (NR_126405, intron 1 of 3) intron (NR_126405, intron 1 of 3) 57309 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 238.75-20 chr15 43380967 43381225 + 1.25 NA intron (NM_014444, intron 6 of 17) AluJo|SINE|Alu 9995 NM_001286414 27229 Hs.584887 NM_014444 ENSG00000137822 TUBGCP4 76P|GCP-4|GCP4|Grip76|MCCRP3 tubulin gamma complex associated protein 4 protein-coding 269.25-13 chr15 57684325 57684912 + 1.25 NA non-coding (NR_104367, exon 13 of 16) non-coding (NR_104367, exon 13 of 16) -21903 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 258.5-36 chr19 43418682 43418945 + 1.25 NA TTS (NM_001130011) TTS (NM_001130011) 3923 NM_001130011 83639 Hs.97978 NM_031451 ENSG00000131126 TEX101 CT131|GTPR867|NYD-SP8|PRO1884|SGRG|SPATA44|TES101RP testis expressed 101 protein-coding 145.25-81 chr2 197673939 197674199 + 1.25 NA intron (NM_144629, intron 1 of 8) intron (NM_144629, intron 1 of 8) 1518 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 226.25-64 chr6 144518933 144519151 + 1.25 NA intron (NM_007124, intron 38 of 73) MER5B|DNA|hAT-Charlie 113387 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 298-18 chr3 85196962 85197300 + 1.25 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -134867 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 169.75-14 chr10 52270021 52270236 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 10 of 17) intron (NM_001098512, intron 10 of 17) 44000 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 329.25-20 chr3 106998763 106999041 + 1.25 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 241736 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 247-66 chr9 88996241 88996464 + 1.25 NA TTS (NM_001142413) TTS (NM_001142413) 4884 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 185-40 chr2 17331052 17331310 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 187259 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 160.5-196 chr8 129785922 129786108 + 1.25 NA 5' UTR (NM_031415, exon 1 of 14) 5' UTR (NM_031415, exon 1 of 14) 609 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 283.75-24 chr4 52951075 52951334 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 88887 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 190.25-72 chr20 5196728 5196979 + 1.25 NA 3' UTR (NM_003818, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_003818, exon 13 of 13) 69845 NM_003818 8760 Hs.126857 NM_003818 ENSG00000101290 CDS2 - CDP-diacylglycerol synthase 2 protein-coding 215.75-87 chr6 90312184 90312606 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_039671) promoter-TSS (NR_039671) -347 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 207.25-38 chr2 61337672 61338094 + 1.25 NA intron (NM_014709, intron 18 of 79) intron (NM_014709, intron 18 of 79) 79494 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 168.5-158 chr6 56998261 56998442 + 1.25 NA intron (NM_152731, intron 3 of 6) MamRep1527|LTR|LTR 43244 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 186-83 chr6 162483865 162484114 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) L1ME4b|LINE|L1 -243143 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 164.5-40 chr12 62757214 62757423 + 1.25 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) intron (NM_020700, intron 4 of 9) 153632 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 188.75-29 chr14 94776140 94776340 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5598 NR_144432 108868751 NR_144432 GSC-DT DIGIT GSC divergent transcript ncRNA 255.5-41 chr2 44276107 44276452 + 1.25 NA intron (NM_000341, intron 1 of 9) intron (NM_000341, intron 1 of 9) 799 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 280.75-33 chr4 103647631 103647959 + 1.25 NA intron (NM_001059, intron 3 of 4) intron (NM_001059, intron 3 of 4) 72190 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 363.75-14 chr4 123585202 123585723 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64529 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 126.75-58 chr14 60766782 60766989 + 1.25 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 32124 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 410-7 chr2 60893628 60894223 + 1.25 NA intron (NM_002908, intron 2 of 10) intron (NM_002908, intron 2 of 10) 12351 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 221.75-90 chr9 100633399 100633611 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 55426 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 121-201 chrX 50873318 50873513 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37320 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 229.25-49 chr2 183023608 183024031 + 1.25 NA exon (NM_205842, exon 3 of 32) exon (NM_205842, exon 3 of 32) 14638 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 215.5-46 chr19 28245196 28245452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -361364 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 293.25-17 chr21 17426254 17426518 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12504 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 178.5-71 chr18 11317762 11317965 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136615 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 170.5-136 chr4 151336929 151337129 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 59856 NM_183375 345062 Hs.651266 NM_183375 ENSG00000189099 PRSS48 ESSPL serine protease 48 protein-coding 169-4 chr10 9140331 9140539 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -135178 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 291.25-27 chr6 64366991 64367282 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 560300 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 356.5-18 chr5 32430241 32430701 + 1.25 NA intron (NM_016107, intron 2 of 19) L1ME3A|LINE|L1 14269 NM_016107 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 213.5-65 chr2 180793614 180793869 + 1.25 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) L1MA2|LINE|L1 101637 NR_104319 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 121.5-226 chr6 75777876 75778052 + 1.25 NA intron (NM_001368139, intron 2 of 9) intron (NM_001368139, intron 2 of 9) 28725 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 128.25-28 chr12 1623516 1623695 + 1.25 NA intron (NM_030775, intron 1 of 4) intron (NM_030775, intron 1 of 4) -5626 NM_032642 81029 Hs.306051 NM_030775 ENSG00000111186 WNT5B - Wnt family member 5B protein-coding 257.5-20 chr14 47495902 47496319 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -152864 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 128.75-52 chr13 38933574 38933753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57168 NM_145286 161003 Hs.327794 NM_145286 ENSG00000133115 STOML3 Epb7.2l|SRO stomatin like 3 protein-coding 204.75-49 chr17 29835813 29836058 + 1.25 NA intron (NM_033389, intron 1 of 14) AluY|SINE|Alu -74503 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 217.25-14 chr10 64413204 64413546 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -412153 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 365.75-4 chr11 68104384 68104773 + 1.25 NA intron (NM_001277, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 16810 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 261-67 chr8 132707699 132708009 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32309 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 309.25-7 chr12 27390987 27391662 + 1.25 NA intron (NR_109975, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 55310 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 332.25-34 chrX 54595430 54595759 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 65375 NM_001184819 54552 Hs.654677 NM_019067 ENSG00000130119 GNL3L GNL3B G protein nucleolar 3 like protein-coding 174.25-130 chr6 155843399 155843649 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -103273 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 241.25-36 chr2 137123993 137124354 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) intron (NM_001316349, intron 5 of 27) 358628 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 241.25-31 chr2 28924933 28925304 + 1.25 NA exon (NM_015131, exon 8 of 18) exon (NM_015131, exon 8 of 18) -1949 NR_002741 26796 NR_002741 ENSG00000265145 SNORD53 RNU53|SNORD53A|U53 small nucleolar RNA, C/D box 53 snoRNA 128.75-7 chr1 86086071 86086239 + 1.25 NA intron (NM_152890, intron 7 of 59) intron (NM_152890, intron 7 of 59) 70316 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 190-33 chr2 120361625 120361835 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15594 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 233.25-30 chr16 69891923 69892176 + 1.25 NA intron (NM_001270453, intron 5 of 20) L2b|LINE|L2 -32990 NM_199424 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 216.75-50 chr3 26404160 26404403 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -218525 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 267-27 chr2 79735402 79735832 + 1.25 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -86258 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 134-8 chr1 102212368 102212513 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -215206 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 193-47 chr21 27263587 27263988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -296699 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 172.25-100 chr4 64102705 64103017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 306589 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 129.75-107 chr20 9734623 9734796 + 1.25 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) intron (NM_177990, intron 1 of 9) 104367 NM_020341 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 142.25-122 chr4 73468016 73468167 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -13654 NM_001133 173 Hs.168718 NM_001133 ENSG00000079557 AFM ALB2|ALBA|ALF afamin protein-coding 150.75-102 chr2 127793988 127794192 + 1.25 NA intron (NM_001006622, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 17081 NM_001006623 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 205.5-9 chr1 210389965 210390230 + 1.25 NA intron (NM_001170564, intron 4 of 9).2 L1ME3Cz|LINE|L1 60731 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 329-29 chr4 161107303 161107940 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -915112 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 165.75-13 chr10 27945913 27946133 + 1.25 NA intron (NM_001290021, intron 3 of 13) intron (NM_001290021, intron 3 of 13) 35848 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 238.25-5 chr1 218508795 218509061 + 1.25 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -1167 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 254.25-15 chr11 99099624 99099940 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) MIR|SINE|MIR 78833 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 318-17 chr2 154205799 154206321 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 4 of 12) AluY|SINE|Alu 251378 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 246.25-37 chr2 152664987 152665287 + 1.25 NA intron (NM_001365601, intron 15 of 24) intron (NM_001365601, intron 15 of 24) 52324 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 188.75-15 chr11 39160340 39160530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 511577 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 209.5-17 chr11 12266039 12266290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20736 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 136.5-127 chr2 239200440 239200596 + 1.25 NA intron (NM_006037, intron 3 of 26) intron (NM_006037, intron 3 of 26) -5061 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 250-59 chr8 39077902 39078261 + 1.25 NA intron (NR_027639, intron 16 of 19) intron (NR_027639, intron 16 of 19) -29448 NM_001313994 203102 Hs.521545 NM_145004 ENSG00000197140 ADAM32 - ADAM metallopeptidase domain 32 protein-coding 178.5-53 chr15 66694637 66694838 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7499 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 348.25-10 chr4 46601083 46601643 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -211235 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 156.5-8 chr1 184128041 184128314 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 76447 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 159.75-37 chr14 32958933 32959179 + 1.25 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) MER30|DNA|hAT-Charlie 20177 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 267.25-38 chr6 169080651 169080915 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 12997 NR_134619 102724357 Hs.129310 NR_134619 ENSG00000234519 LOC102724357 - uncharacterized LOC102724357 ncRNA 156.25-105 chr3 187931635 187931855 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44662 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 254.25-19 chr12 57786168 57786506 + 1.25 NA intron (NM_001172697, intron 3 of 5) intron (NM_001172697, intron 3 of 5) 3550 NM_001172695 10102 Hs.632704 NM_005726 ENSG00000123297 TSFM EFTS|EFTSMT Ts translation elongation factor, mitochondrial protein-coding 137-75 chr2 51631568 51631783 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 599074 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 195-29 chr14 82774168 82774413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 131658 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 187-8 chr1 222688398 222688687 + 1.25 NA intron (NM_022831, intron 4 of 9) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 23949 NM_022831 64853 Hs.156625 NM_022831 ENSG00000186063 AIDA C1orf80 axin interactor, dorsalization associated protein-coding 267.25-28 chr3 196760513 196760848 + 1.25 NA intron (NM_002577, intron 1 of 14) intron (NM_002577, intron 1 of 14) 20823 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 181.75-47 chr17 59322579 59322837 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8947 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 184-14 chr11 30698809 30699026 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -112564 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 238-9 chr10 68124055 68124310 + 1.25 NA intron (NR_045663, intron 2 of 17) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 14694 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 177.75-124 chr6 55064424 55064651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41923 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 241.75-24 chr14 46885834 46886184 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) LTR40a|LTR|ERVL -234228 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 134.75-141 chr3 60191192 60191412 + 1.25 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -110393 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 227.25-5 chr1 67094383 67094736 + 1.25 NA intron (NM_001276352, intron 8 of 8) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -40411 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 272.75-13 chr15 100039796 100040121 + 1.25 NA intron (NM_139057, intron 18 of 21) L1MB8|LINE|L1 232935 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 207.25-43 chr2 122436102 122436324 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 637268 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 174.25-74 chr2 12602798 12602964 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -113991 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 170.5-35 chr11 42252272 42252540 + 1.25 NA intron (NR_038309, intron 1 of 5) intron (NR_038309, intron 1 of 5) 1284 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 164.75-66 chr18 8728323 8728511 + 1.25 NA intron (NM_015210, intron 4 of 16) L1MEd|LINE|L1 11036 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 324.75-19 chr3 55739778 55740079 + 1.25 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) L1PA7|LINE|L1 -80459 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 156.5-202 chr9 32941556 32941809 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59894 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 125-121 chr5 5220578 5220791 + 1.25 NA intron (NM_139056, intron 10 of 22) MIRb|SINE|MIR 80354 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 278-16 chr19 28887108 28887777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77689 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 280.25-39 chr4 30599293 30599610 + 1.25 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -120918 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 156.5-142 chr5 15895332 15895503 + 1.25 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -39765 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 185.5-42 chr13 109375056 109375313 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25512 NR_126361 104326054 Hs.569298 NR_126361 ENSG00000229792 LINC00399 TCONS_00021596 long intergenic non-protein coding RNA 399 ncRNA 210.25-10 chr10 68858663 68858887 + 1.25 NA intron (NM_152709, intron 1 of 3) intron (NM_152709, intron 1 of 3) 31238 NM_001130160 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 191-17 chr12 43498280 43498473 + 1.25 NA intron (NM_025003, intron 4 of 38) intron (NM_025003, intron 4 of 38) 53827 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 179.25-23 chr10 83619094 83619301 + 1.25 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 57892 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 203-65 chr3 87348017 87348360 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71604 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 211.75-99 chr8 119717771 119718025 + 1.25 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -44508 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 292.25-41 chr8 120835774 120836120 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -23901 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 433.75 chr1 42955871 42956312 + 1.25 NA intron (NM_006516, intron 1 of 9) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 2777 NM_006516 6513 Hs.473721 NM_006516 ENSG00000117394 SLC2A1 CSE|DYT17|DYT18|DYT9|EIG12|GLUT|GLUT-1|GLUT1|GLUT1DS|HTLVR|PED|SDCHCN solute carrier family 2 member 1 protein-coding 134.75-227 chr8 132616639 132616846 + 1.25 NA intron (NR_135913, intron 6 of 10) LTR10G|LTR|ERV1 -55263 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 218.75-40 chr2 190490122 190490360 + 1.25 NA intron (NM_017694, intron 6 of 7) intron (NM_017694, intron 6 of 7) 44481 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 278.75-11 chr16 72853160 72853484 + 1.25 NA intron (NM_001164766, intron 3 of 8) intron (NM_001164766, intron 3 of 8) -188352 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 149.5-85 chr19 45237483 45237746 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3403 NM_138568 90332 Hs.337557 NM_138568 ENSG00000283632 EXOC3L2 XTP7 exocyst complex component 3 like 2 protein-coding 310.5-30 chr5 91951030 91951374 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -567885 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 265.25-37 chr4 33001057 33001536 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 650258 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 212.75-53 chr2 213730228 213730623 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -27642 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 320-18 chr2 119163812 119164490 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -5400 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 197.25-15 chr10 126263842 126264075 + 1.25 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) intron (NM_001288974, intron 3 of 18) 124519 NM_001288974 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 313.75-10 chr2 8362454 8363156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34386 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 313-10 chr16 48033460 48033930 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 68006 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 286.75-28 chr3 39866843 39867095 + 1.25 NA intron (NM_001284424, intron 1 of 15) L1MA9|LINE|L1 57309 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 114.5-72 chr12 69119640 69119760 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -119869 NM_001300947 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 154.25-114 chr4 55424739 55424908 + 1.25 NA intron (NR_073070, intron 6 of 6) intron (NR_073070, intron 6 of 6) 28866 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 295-3 chr10 12839237 12839589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -114060 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 218.25-51 chr22 19892461 19892775 + 1.25 NA intron (NR_147957, intron 10 of 16) intron (NR_147957, intron 10 of 16) -37744 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 228-61 chr4 114394062 114394333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204205 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 241.75-37 chr19 28306247 28306509 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -300310 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 176.5-35 chr12 17162347 17162635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173744 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 198.5-9 chr1 239809829 239810186 + 1.25 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) 89865 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 273.25-14 chr15 59422065 59422419 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15944 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 130.75-130 chr4 7176915 7177080 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15541 NM_020777 57537 Hs.479099 NM_020777 ENSG00000184985 SORCS2 - sortilin related VPS10 domain containing receptor 2 protein-coding 157.75-91 chr2 151255795 151256022 + 1.25 NA intron (NM_198557, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 5955 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 238.25-65 chr5 36772658 36773038 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 103846 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 245.25-17 chr13 87073193 87073549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 161451 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 256.25-36 chr5 6796189 6796484 + 1.25 NA non-coding (NR_146281, exon 1 of 2) non-coding (NR_146281, exon 1 of 2) 456 NR_146281 109729133 Hs.582455 NR_146281 ENSG00000251365 LINC02236 - long intergenic non-protein coding RNA 2236 ncRNA 282.75-29 chr3 197263667 197264072 + 1.25 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) 30079 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 197-53 chr5 165617315 165617703 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1147230 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 246.25-31 chr2 88143830 88144208 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15957 NM_001443 2168 Hs.380135 NM_001443 ENSG00000163586 FABP1 FABPL|L-FABP fatty acid binding protein 1 protein-coding 183.5-139 chr7 73803177 73803370 + 1.25 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -27590 NM_001305 1364 Hs.647036 NM_001305 ENSG00000189143 CLDN4 CPE-R|CPER|CPETR|CPETR1|WBSCR8|hCPE-R claudin 4 protein-coding 224.25-20 chr11 70925526 70925805 + 1.25 NA intron (NM_012309, intron 9 of 24) intron (NM_012309, intron 9 of 24) -53297 NR_037437 100500844 NR_037437 ENSG00000263744 MIR3664 mir-3664 microRNA 3664 ncRNA 420.75-7 chr16 26488463 26488851 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 463420 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 256.25-23 chr2 154564210 154564612 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -106973 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 128.75-128 chr3 177767731 177768059 + 1.25 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -48970 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 578 chr1 150021504 150022305 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11178 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 116.75-124 chr3 54128460 54128570 + 1.25 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 5963 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 162.75-130 chr7 22936073 22936290 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001363466, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001363466, exon 12 of 12) 77949 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 253.25-60 chr8 41158822 41159167 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 112149 NR_049801 100847068 NR_049801 ENSG00000263372 MIR548AO - microRNA 548ao ncRNA 385-14 chr3 10075824 10076348 + 1.25 NA intron (NM_001018115, intron 29 of 43) intron (NM_001018115, intron 29 of 43) 32169 NM_001164839 115795 Hs.190413 NM_173472 ENSG00000163705 FANCD2OS C3orf24 FANCD2 opposite strand protein-coding 132-43 chr13 19919895 19920079 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -37419 NM_001353159 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 230.5-19 chr11 17653875 17654166 + 1.25 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 42919 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 139.75-83 chr18 34095636 34095799 + 1.25 NA intron (NM_001353232, intron 4 of 9) intron (NM_001353232, intron 4 of 9) -47105 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 195.25-43 chr17 60950489 60950726 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) L1MC5a|LINE|L1 272756 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 318.25-6 chr19 27649743 27650281 + 1.25 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -143419 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 208.25-100 chr9 38471874 38472203 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -47584 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 317.75-18 chr2 49864991 49865380 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109018 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 218.25-10 chr10 49681168 49681422 + 1.25 NA intron (NM_182554, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 1644 NM_182554 282966 Hs.131287 NM_182554 ENSG00000178645 C10orf53 - chromosome 10 open reading frame 53 protein-coding 221.5-108 chr9 30008391 30008667 + 1.25 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 399925 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 181.75-20 chr10 115194087 115194276 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MA3|LINE|L1 100816 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 282.5-25 chr18 22988852 22989203 + 1.25 NA intron (NM_002894, intron 8 of 18) intron (NM_002894, intron 8 of 18) 55151 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 611.25 chr10 77724464 77725200 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -87024 NM_001271521 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 327.75-19 chr5 16854459 16854820 + 1.25 NA intron (NM_012334, intron 2 of 40) L1MB8|LINE|L1 81649 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 321.25-23 chr8 94816897 94817226 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6226 NM_017864 55656 Hs.727669 NM_017864 ENSG00000164941 INTS8 C8orf52|INT8 integrator complex subunit 8 protein-coding 295.25-22 chr4 65683530 65683832 + 1.25 NA intron (NR_034138, intron 3 of 3) HAL1|LINE|L1 -13186 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 139-26 chr12 12094713 12094895 + 1.25 NA exon (NM_138723, exon 5 of 6) exon (NM_138723, exon 5 of 6) -17148 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 321.5-10 chr18 22755238 22755878 + 1.25 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) L1MA8|LINE|L1 31279 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 397.75-7 chr5 160212414 160212946 + 1.25 NA intron (NM_001040442, intron 1 of 5) AluY|SINE|Alu 13639 NM_001040442 2172 Hs.519719 NM_001445 ENSG00000170231 FABP6 I-15P|I-BABP|I-BALB|I-BAP|ILBP|ILBP3|ILLBP fatty acid binding protein 6 protein-coding 368.5-9 chr20 47739383 47739914 + 1.25 NA intron (NM_198596, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 46416 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 182-81 chr4 59762711 59762951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 749258 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 247.25-58 chr8 64797390 64797751 + 1.25 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) intron (NM_004820, intron 1 of 5) 1167 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 279-47 chr7 108924085 108924410 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -39660 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 237-13 chr12 3628834 3629070 + 1.25 NA intron (NM_001144958, intron 15 of 19) intron (NM_001144958, intron 15 of 19) 124157 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 202.75-108 chr8 101281909 101282186 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -75983 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 418.75-4 chr5 135341579 135342083 + 1.25 NA intron (NR_161235, intron 5 of 5) intron (NR_161235, intron 5 of 5) 57407 NM_138609 9555 Hs.420272 NM_004893 ENSG00000113648 H2AFY H2A.y|H2A/y|H2AF12M|MACROH2A1.1|mH2A1|macroH2A1.2 H2A histone family member Y protein-coding 170.75-9 chr1 239443118 239443416 + 1.25 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) intron (NM_001347716, intron 1 of 7) 56699 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 171.25-44 chr14 68451054 68451279 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) intron (NM_133509, intron 9 of 10) 177621 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 209.25-69 chr21 21800710 21800978 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53859 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 315.5-4 chr12 10281109 10281595 + 1.25 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -23094 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 241-2 chr1 187284609 187284950 + 1.25 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) -158849 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 166.25-75 chr2 50886319 50886811 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 145567 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 227.75-51 chr3 130244048 130244369 + 1.25 NA intron (NR_027898, intron 12 of 22) intron (NR_027898, intron 12 of 22) 31388 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 123.75-201 chr9 88818984 88819183 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73178 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 304.5-33 chr6 124567372 124567768 + 1.25 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 284565 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 228.25-32 chr16 76207084 76207287 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70216 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 321.75-29 chr6 28252923 28253315 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_019110) promoter-TSS (NM_019110) -850 NM_019110 387032 Hs.44720 NM_019110 ENSG00000187626 ZKSCAN4 P1P373C6|ZNF307|ZNF427|ZSCAN36 zinc finger with KRAB and SCAN domains 4 protein-coding 165-36 chr14 20437893 20438169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1865 NM_001365790 123103 Hs.556014 NM_001109997 ENSG00000185271 KLHL33 - kelch like family member 33 protein-coding 186-68 chr5 30523689 30524128 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 643348 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 172.5-15 chr1 180162017 180162190 + 1.25 NA intron (NM_002826, intron 1 of 11) MER31-int|LTR|ERV1 7234 NM_002826 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 167.25-8 chr1 86130082 86130300 + 1.25 NA intron (NM_152890, intron 2 of 59) L1M8|LINE|L1 26280 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 127-144 chr5 149135250 149135415 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -6115 NM_014945 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 175-113 chr6 108575830 108576077 + 1.25 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) intron (NM_201559, intron 2 of 3) 15036 NM_001455 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 171.75-107 chr4 159972314 159972511 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -194628 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 354.5-3 chr10 11919153 11919559 + 1.25 NA TTS (NM_015542) TTS (NM_015542) -24646 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 168-20 chr10 124026630 124026877 + 1.25 NA intron (NM_014863, intron 5 of 5) intron (NM_014863, intron 5 of 5) 65653 NM_014863 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 255.5-17 chr12 10014078 10014607 + 1.25 NA intron (NM_001319241, intron 2 of 5) intron (NM_001319241, intron 2 of 5) 3715 NM_001129998 387837 Hs.127937 NM_205852 ENSG00000256660 CLEC12B UNQ5782 C-type lectin domain family 12 member B protein-coding 170-81 chr5 115889569 115889708 + 1.25 NA intron (NM_001364122, intron 3 of 3) L1ME3A|LINE|L1 47151 NR_157087 1176 Hs.406191 NM_001284 ENSG00000177879 AP3S1 CLAPS3|Sigma3A adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1 protein-coding 293.25-14 chr2 25626010 25626385 + 1.25 NA intron (NM_033147, intron 4 of 19) intron (NM_033147, intron 4 of 19) 24025 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 125.25-222 chrX 108898159 108898355 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 161717 NR_110652 101928358 Hs.722300 NR_110652 ENSG00000237863 LOC101928358 - uncharacterized LOC101928358 ncRNA 151-131 chr7 87371223 87371386 + 1.25 NA intron (NM_021151, intron 7 of 17) intron (NM_021151, intron 7 of 17) 25640 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 211-44 chr4 32559651 32559841 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 208708 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 244.75-30 chr2 79128765 79129076 + 1.25 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 8432 NM_002909 5967 Hs.49407 NM_002909 ENSG00000115386 REG1A ICRF|P19|PSP|PSPS|PSPS1|PTP|REG regenerating family member 1 alpha protein-coding 166-54 chr19 638818 638992 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001300812) promoter-TSS (NM_001300812) -990 NM_001300812 27006 Hs.248087 NM_020637 ENSG00000070388 FGF22 - fibroblast growth factor 22 protein-coding 181-113 chr8 120341504 120341679 + 1.25 NA intron (NM_021110, intron 43 of 47) MIR3|SINE|MIR 103559 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 123.25-201 chr8 87927483 87927607 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -53530 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 225.25-58 chr4 30851593 30851805 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 131330 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 237.75-63 chr5 40802860 40803069 + 1.25 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -4769 NM_001355034 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 257.5-13 chr11 19905627 19906011 + 1.25 NA intron (NM_182964, intron 6 of 37) intron (NM_182964, intron 6 of 37) -116737 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 147.75-85 chr20 34514791 34515084 + 1.25 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -1447 NM_014183 83658 Hs.593920 NM_014183 ENSG00000125971 DYNLRB1 BITH|BLP|DNCL2A|DNLC2A|ROBLD1 dynein light chain roadblock-type 1 protein-coding 384.5-4 chr12 129756460 129757110 + 1.25 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) intron (NM_133448, intron 1 of 8) 147240 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 341.75-9 chr15 52631380 52631832 + 1.25 NA intron (NM_019600, intron 2 of 12) intron (NM_019600, intron 2 of 12) 20434 NM_001286495 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 516-2 chr14 41866642 41867177 + 1.25 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) intron (NM_001330106, intron 2 of 4) 260053 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 198.75-17 chr11 83540868 83541236 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 20 of 27) intron (NM_001142699, intron 20 of 27) 141373 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 339.75-15 chr17 71829071 71829424 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 196732 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 158.5-50 chr12 91625152 91625321 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -442419 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 144.25-201 chr8 79950236 79950453 + 1.25 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) MER105|DNA|hAT-Charlie -78607 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 310.75-7 chr10 96001323 96001709 + 1.25 NA intron (NM_001159747, intron 2 of 11) intron (NM_001159747, intron 2 of 11) 1425 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 215.5-85 chr5 27619877 27620234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 147763 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 143.25-30 chr11 102998859 102999080 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43237 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 184.5-112 chr4 111355664 111355951 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -495160 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 277.5-74 chr8 82084544 82084990 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -242481 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 392-8 chr3 28563144 28563831 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -11791 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 274-28 chr3 169169705 169169982 + 1.25 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -22372 NM_001164000 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 136.75-14 chr1 208257183 208257302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12858 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 298-5 chr10 131992074 131992464 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -10256 NM_004052 664 Hs.144873 NM_004052 ENSG00000176171 BNIP3 NIP3 BCL2 interacting protein 3 protein-coding 181.5-93 chr2 212502439 212502611 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR 36103 NM_001042599 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 234.5-83 chr6 161445150 161445583 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) intron (NM_004562, intron 9 of 11) -25611 NR_134594 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 228.25-60 chr4 112890158 112890463 + 1.25 NA intron (NM_001354271, intron 1 of 42) intron (NM_001354271, intron 1 of 42) 29323 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 115.75-207 chr8 17329014 17329171 + 1.25 NA intron (NM_004686, intron 7 of 13) intron (NM_004686, intron 7 of 13) 82134 NM_001363173 137492 Hs.343873 NM_152415 ENSG00000155975 VPS37A HCRP1|PQBP2|SPG53 VPS37A subunit of ESCRT-I protein-coding 327.25-15 chr4 75082110 75082529 + 1.25 NA non-coding (NR_149051, exon 2 of 2) non-coding (NR_149051, exon 2 of 2) 2389 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 270.5-16 chr14 59721884 59722265 + 1.25 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) -75054 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 411-7 chr4 96504300 96504839 + 1.25 NA intron (NR_147149, intron 2 of 3) intron (NR_147149, intron 2 of 3) 193866 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 185.25-112 chr6 83884695 83885135 + 1.25 NA intron (NM_016230, intron 2 of 15) intron (NM_016230, intron 2 of 15) 25226 NM_016230 51167 Hs.5741 NM_016230 ENSG00000065615 CYB5R4 NCB5OR|cb5/cb5R|dJ676J13.1 cytochrome b5 reductase 4 protein-coding 253.75-54 chr6 123614530 123614811 + 1.25 NA intron (NM_001256020, intron 1 of 8) L1MA5|LINE|L1 22280 NM_001251987 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 147.5-133 chr22 25162786 25162987 + 1.25 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) MER58A|DNA|hAT-Charlie -36972 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 227.5-49 chr2 14708105 14708453 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 75562 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 255.75-23 chr19 27973850 27974110 + 1.25 NA intron (NR_146734, intron 6 of 7) intron (NR_146734, intron 6 of 7) -180040 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 261.5-7 chr11 96337794 96338057 + 1.25 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR -3513 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 167-60 chr2 107638224 107638431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108908 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 264.25-27 chr2 19801446 19801915 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67174 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 249-43 chr6 119637387 119637638 + 1.25 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 87704 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 227.25-28 chr14 70326622 70326924 + 1.25 NA intron (NM_016468, intron 3 of 3) intron (NM_016468, intron 3 of 3) 32910 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 204.25-6 chr1 209123179 209123469 + 1.25 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 150870 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 174-10 chr10 108571480 108571662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -502278 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 170.5-205 chrX 43588261 43588467 + 1.25 NA Intergenic LTR65|LTR|ERV1 -66543 NM_000240 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 216.25-7 chr1 196538736 196538958 + 1.25 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 43634 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 347.75-9 chr4 17202463 17202858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16603 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 147.5-176 chr5 107585740 107585997 + 1.25 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 85069 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 177.75-14 chr1 204455823 204456256 + 1.25 NA exon (NM_002646, exon 12 of 34) exon (NM_002646, exon 12 of 34) 34307 NM_002646 5287 Hs.497487 NM_002646 ENSG00000133056 PIK3C2B C2-PI3K phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta protein-coding 322-23 chr8 80369722 80370021 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -115722 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 235-6 chr1 198889104 198889527 + 1.25 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) -30162 NR_029626 406995 NR_029626 ENSG00000207759 MIR181A1 MIR213|MIRN181A1|MIRN213|hsa-mir-181a-1|mir-181a-1|mir-213 microRNA 181a-1 ncRNA 166-50 chr18 4236076 4236266 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR -28431 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 190.5-135 chr6 49243967 49244224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 219158 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 262-64 chr9 28140150 28140674 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -566546 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 304.75-28 chr5 127316391 127316920 + 1.25 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) intron (NM_001308119, intron 2 of 14) 25859 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 209.75-66 chr4 21182882 21183132 + 1.25 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) L1MA8|LINE|L1 120899 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 115.75-102 chr2 66712951 66713181 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9839 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 372.25-5 chr17 59552507 59553079 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12817 NM_001166301 79665 Hs.29403 NM_024612 ENSG00000108406 DHX40 ARG147|DDX40|PAD DEAH-box helicase 40 protein-coding 278.25-34 chr2 187295817 187296127 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 152280 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 295.25-24 chr5 40187372 40187816 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 135303 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 183.5-37 chr12 65440316 65440593 + 1.25 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) intron (NM_001031679, intron 5 of 6) 116857 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 226.5-77 chr4 181471565 181471798 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -206652 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 149.25-195 chr9 95105601 95105838 + 1.25 NA intron (NM_001243743, intron 14 of 14) L1MB4|LINE|L1 -19625 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 177-97 chr8 114830402 114830709 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 837458 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 187.25-106 chr8 73376469 73376766 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20156 NR_125388 101926926 Hs.640090 NR_125388 ENSG00000250295 RDH10-AS1 - RDH10 antisense RNA 1 ncRNA 324.75-8 chr12 28893247 28893662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -255824 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 182.5-32 chr11 91713270 91713535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -511632 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 162.25-162 chr8 140850617 140850955 + 1.25 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -118133 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 194.5-3 chr1 152285705 152285949 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -27632 NR_103778 339400 Hs.23783 NR_103778 ENSG00000237975 FLG-AS1 - FLG antisense RNA 1 ncRNA 236.25-68 chr5 23452049 23452330 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -55420 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 146.75-148 chr7 12740777 12740943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53227 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 128.25-13 chr1 242666503 242666679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141894 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 212.25-76 chr5 110460031 110460248 + 1.25 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1MC4|LINE|L1 53776 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 225.5-22 chr11 76423617 76423959 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21230 NM_001300942 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 229-33 chr2 54403604 54403829 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52611 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 236.25-17 chr11 43420958 43421252 + 1.25 NA intron (NM_018259, intron 16 of 23) L2a|LINE|L2 62185 NM_018259 55761 Hs.191186 NM_018259 ENSG00000052841 TTC17 - tetratricopeptide repeat domain 17 protein-coding 191.75-18 chr10 77563951 77564243 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 73711 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 266.75-19 chr2 20744899 20745368 + 1.25 NA intron (NM_021925, intron 4 of 6) L1M5|LINE|L1 77968 NM_001282724 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 173-12 chr10 22190085 22190261 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 19810 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 168.5-136 chr4 103822929 103823122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103040 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 126.5-206 chr6 69045224 69045371 + 1.25 NA intron (NM_001704, intron 13 of 31) intron (NM_001704, intron 13 of 31) 410015 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 129.75-87 chr2 15167723 15167974 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 50 of 50) intron (NR_052013, intron 50 of 50) 393486 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 125.25-155 chr5 31797222 31797359 + 1.25 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 138869 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 162.5-125 chr4 47022351 47022528 + 1.25 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -9128 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 194.5-83 chr20 48913644 48913881 + 1.25 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -7949 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 164.75-107 chr4 65007291 65007457 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2874 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 171.25-29 chr11 100217326 100217472 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 14 of 23) intron (NM_001243270, intron 14 of 23) -469889 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 155.5-47 chr13 41012379 41012610 + 1.25 NA intron (NM_001370329, intron 1 of 9) L1ME3C|LINE|L1 6822 NM_172373 1997 Hs.135646 NM_172373 ENSG00000120690 ELF1 EFTUD1|RIA1 E74 like ETS transcription factor 1 protein-coding 195.25-47 chr2 30036661 30036960 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110197 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 214.75-25 chr14 66694547 66694762 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) L1MC1|LINE|L1 187247 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 389-9 chr2 53073094 53073873 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -370868 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 252-44 chr3 97847770 97848018 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 2 of 21) intron (NM_153605, intron 2 of 21) 25883 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 194-13 chr1 217753229 217753442 + 1.25 NA intron (NM_138796, intron 6 of 10) intron (NM_138796, intron 6 of 10) 31785 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-86 chr20 62185535 62185824 + 1.25 NA intron (NM_015666, intron 1 of 6) MER3|DNA|hAT-Charlie 2654 NM_015666 26164 Hs.340636 NM_015666 ENSG00000101181 MTG2 GTPBP5|ObgH1|dJ1005F21.2 mitochondrial ribosome associated GTPase 2 protein-coding 289.25-27 chr7 145770958 145771378 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -935115 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 140.5-80 chr16 75922749 75923106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -196437 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 267.5-52 chr4 59536832 59537345 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 523515 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 238-22 chr17 70146440 70146794 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 22785 NR_036534 400617 Hs.225661 NR_036534 ENSG00000267365 KCNJ2-AS1 - KCNJ2 antisense RNA 1 ncRNA 298.25-2 chr1 153950868 153951206 + 1.25 NA intron (NM_181715, intron 11 of 13) MIRb|SINE|MIR -4319 NM_014856 9909 Hs.744878 NM_014856 ENSG00000198837 DENND4B KIAA0476 DENN domain containing 4B protein-coding 215.25-101 chr7 31993379 31993639 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 76898 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 337.25-16 chr8 117840375 117840835 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) AluSq2|SINE|Alu 80308 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 188.5-28 chr12 43019622 43019869 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -135570 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 329.75-16 chr5 87628952 87629433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32850 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 249.5-5 chr1 60995404 60995840 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24846 NR_110618 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 147.5-142 chr3 53581262 53581463 + 1.25 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) L1ME4a|LINE|L1 86751 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 224-31 chr21 19206863 19207175 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -447207 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 157.25-87 chr20 33872072 33872249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60812 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 321.25-13 chr2 64349971 64350541 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9408 NR_106995 102465833 NR_106995 ENSG00000264297 MIR4433B hsa-mir-4433b microRNA 4433b ncRNA 238.75-44 chr5 3625108 3625362 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 29403 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 204.5-63 chr2 64484461 64484700 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1773 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 416.25-6 chr16 61879298 61880023 + 1.25 NA intron (NM_001796, intron 3 of 11) intron (NM_001796, intron 3 of 11) 156778 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 420.5-4 chr14 51179452 51180106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60468 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 217-47 chr22 33634811 33635032 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 3 of 14) AluSg4|SINE|Alu 69999 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 162.25-37 chr12 75074481 75074849 + 1.25 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 135083 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 135.25-56 chr12 115493430 115493681 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 655099 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 151.25-168 chr7 14783284 14783478 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 58069 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 208-70 chr6 52427098 52427335 + 1.25 NA intron (NR_033327, intron 2 of 9) L2c|LINE|L2 6208 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 219.5-86 chr3 77903796 77903994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 145068 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 222.25-48 chr3 138277532 138277754 + 1.25 NA intron (NM_001282342, intron 16 of 19) L1MA10|LINE|L1 52208 NM_001349018 347736 Hs.660992 NM_178130 ENSG00000181322 NME9 NM23-H9|TXL-2|TXL2|TXNDC6 NME/NM23 family member 9 protein-coding 267-9 chr10 49261538 49261878 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37185 NR_108038 100506769 Hs.562293 NR_108038 C10orf71-AS1 - C10orf71 antisense RNA 1 ncRNA 132.25-80 chr17 70927106 70927313 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 274970 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 203.25-61 chr20 62613184 62613520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29151 NM_016354 28231 Hs.235782 NM_016354 ENSG00000101187 SLCO4A1 OATP-E|OATP1|OATP4A1|OATPE|OATPRP1|POAT|SLC21A12 solute carrier organic anion transporter family member 4A1 protein-coding 280-15 chr12 31649228 31649676 + 1.25 NA intron (NM_001135864, intron 1 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 2292 NM_001135864 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 112.5-199 chr5 144009567 144009681 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 161035 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 225.75-32 chr18 3153686 3153892 + 1.25 NA intron (NM_019856, intron 11 of 36) intron (NM_019856, intron 11 of 36) 66179 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 200.5-139 chr8 129447414 129447722 + 1.25 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 36574 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 213.75-43 chr17 70786073 70786400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 415943 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 200-28 chr14 63331250 63331508 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12444 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 119.75-114 chr2 169909959 169910115 + 1.25 NA intron (NM_172070, intron 10 of 38) L2a|LINE|L2 82529 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 209-9 chr10 84709833 84710004 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 284749 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 259.5-55 chr2 65527698 65527971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95235 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 189.75-51 chr17 59682386 59682646 + 1.25 NA intron (NM_001288653, intron 22 of 31) intron (NM_001288653, intron 22 of 31) 25082 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 233.25-33 chr19 47800812 47801217 + 1.25 NA TTS (NM_198479) TTS (NM_198479) 2590 NM_198479 284355 Hs.629812 NM_198479 ENSG00000178928 TPRX1 TPRX tetrapeptide repeat homeobox 1 protein-coding 253.75-66 chr9 111683938 111684299 + 1.25 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 22513 NM_001017998 2790 Hs.534196 NM_001017998 ENSG00000242616 GNG10 - G protein subunit gamma 10 protein-coding 271-34 chr4 58214449 58214748 + 1.25 NA Intergenic LTR1B1|LTR|ERV1 321730 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 222.75-94 chr8 77145139 77145344 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -144197 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 218.75-60 chr4 1976183 1976427 + 1.25 NA intron (NM_001042424, intron 20 of 21) intron (NM_001042424, intron 20 of 21) 1669 NR_003004 677770 Hs.676951 NR_003004 ENSG00000249784 SCARNA22 ACA11 small Cajal body-specific RNA 22 ncRNA 215.5-8 chr1 179642831 179643050 + 1.25 NA intron (NM_001199091, intron 11 of 16) L1M4a1|LINE|L1 36713 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 141.25-42 chr13 74833013 74833188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 280257 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 133-166 chr8 19919369 19919597 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -19770 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 210.25-31 chr17 77965163 77965499 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38906 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 131.25-76 chr16 89556497 89556635 + 1.25 NA intron (NM_001363850, intron 17 of 17) intron (NM_001363850, intron 17 of 17) -4091 NM_001243131 6137 Hs.410817 NM_000977 ENSG00000167526 RPL13 BBC1|D16S444E|D16S44E|L13 ribosomal protein L13 protein-coding 189-93 chr6 83817223 83817441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35934 NM_001009994 134701 Hs.149454 NM_001009994 ENSG00000203877 RIPPLY2 C6orf159|SCDO6|dJ237I15.1 ripply transcriptional repressor 2 protein-coding 172-73 chr3 98342658 98342831 + 1.25 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 -11110 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 213-36 chr16 62950511 62950727 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -914181 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 211.75-102 chr9 32996088 32996391 + 1.25 NA intron (NR_160921, intron 1 of 7) intron (NR_160921, intron 1 of 7) 5337 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 398.5-3 chr13 20260237 20260725 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -28086 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 330.25-2 chr10 33986108 33986481 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -213614 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 147.25-152 chr8 134998759 134998928 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 148908 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 254.25-27 chr18 334770 335036 + 1.25 NA exon (NM_130386, exon 6 of 10) exon (NM_130386, exon 6 of 10) -66856 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 205.5-8 chr1 194487667 194487946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1183061 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 207.25-52 chr21 30721768 30721988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3101 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 447.75-4 chr6 135640507 135641172 + 1.25 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 143038 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 178.5-162 chr7 748813 749038 + 1.25 NA intron (NR_075098, intron 4 of 12) intron (NR_075098, intron 4 of 12) -21249 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 127.75-198 chr8 80340950 80341096 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 99634 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 236.75-53 chr7 42375923 42376201 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -138853 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 180.25-31 chr16 12403385 12403585 + 1.25 NA exon (NM_032167, exon 18 of 21) exon (NM_032167, exon 18 of 21) -316836 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 377.75-5 chr2 29458346 29458713 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) 16848 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 236.25-71 chr5 91450303 91450662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67165 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 163-55 chr2 27746955 27747090 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -24695 NM_145330 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 169.75-17 chr10 71339104 71339289 + 1.25 NA intron (NR_033414, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 19937 NM_018344 55315 Hs.438419 NM_018344 ENSG00000198246 SLC29A3 ENT3|HCLAP|HJCD|PHID solute carrier family 29 member 3 protein-coding 227.75-8 chr10 61829127 61829432 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72420 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 236.75-41 chr4 135510116 135510315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 377878 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 218-40 chr20 45863349 45863625 + 1.25 NA intron (NM_080752, intron 1 of 1) intron (NM_080752, intron 1 of 1) 5873 NM_080752 140831 Hs.292135 NM_080752 ENSG00000132801 ZSWIM3 C20orf164|PPP1R174 zinc finger SWIM-type containing 3 protein-coding 162.5-62 chr17 42662203 42662347 + 1.25 NA intron (NM_001320509, intron 5 of 11) AluJo|SINE|Alu 2991 NM_016437 27175 Hs.279669 NM_016437 ENSG00000037042 TUBG2 - tubulin gamma 2 protein-coding 159.25-20 chr10 115623835 115624010 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) ORSL|DNA|hAT-Tip100 530557 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 171-100 chr4 34512600 34512814 + 1.25 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -242960 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 139.5-194 chr7 27660039 27660382 + 1.25 NA intron (NM_152740, intron 1 of 7) intron (NM_152740, intron 1 of 7) 2673 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 193.75-126 chr9 4996446 4996787 + 1.25 NA intron (NM_004972, intron 2 of 24) intron (NM_004972, intron 2 of 24) 11371 NM_004972 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 316.25-9 chr2 39351710 39352062 + 1.25 NA intron (NM_003618, intron 3 of 33) AluSx3|SINE|Alu 85399 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 241.75-31 chr16 61309376 61309743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -253793 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 203-55 chr2 214410929 214411208 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001345929) promoter-TSS (NM_001345929) 14 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 368.25-7 chr17 46926364 46926807 + 1.25 NA intron (NM_001363851, intron 1 of 5) intron (NM_001363851, intron 1 of 5) 3425 NR_148350 9570 Hs.463278 NM_004287 ENSG00000108433 GOSR2 Bos1|EPM6|GS27 golgi SNAP receptor complex member 2 protein-coding 198.5-40 chr14 43867929 43868250 + 1.25 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy 639194 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 259-27 chr3 66178867 66179086 + 1.25 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 -41766 NM_001164796 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 140.75-161 chr6 38107667 38107869 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 4 of 5) AluJb|SINE|Alu 288041 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 140-78 chr2 126413147 126413351 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -242686 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 236.25-83 chr7 116585046 116585258 + 1.25 NA intron (NR_120506, intron 2 of 4) intron (NR_120506, intron 2 of 4) 29668 NR_120506 100996266 Hs.552122 NR_120506 LINC01510 - long intergenic non-protein coding RNA 1510 ncRNA 172.25-108 chr5 39739974 39740228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 219670 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 269.5-41 chr4 135303638 135304066 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -180293 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 145.25-6 chr1 80039717 80039909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -495942 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 341.75-12 chr2 67106882 67107268 + 1.25 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) intron (NR_110564, intron 1 of 4) 20629 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 123.25-195 chr8 3167944 3168212 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 37 of 69) intron (NM_033225, intron 37 of 69) -439627 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 263.25-41 chr4 168433486 168433821 + 1.25 NA intron (NM_001345927, intron 10 of 37) intron (NM_001345927, intron 10 of 37) 46839 NM_001291510 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 273.25-33 chr6 42326196 42326550 + 1.25 NA intron (NM_001297573, intron 3 of 17) intron (NM_001297573, intron 3 of 17) -108512 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 266-47 chr8 22712029 22712370 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18719 NM_004430 1960 Hs.534313 NM_004430 ENSG00000179388 EGR3 EGR-3|PILOT early growth response 3 protein-coding 171.25-122 chr5 91725337 91725493 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -342098 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 188-16 chr11 115714207 115714420 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 20449 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 193.75-128 chr9 32049246 32049451 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -335255 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 226.25-28 chr15 71501413 71501627 + 1.25 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -45716 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 249.75-28 chr17 57857939 57858342 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8096 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 232.25-89 chrX 100230883 100231404 + 1.25 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 179130 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 210.5-51 chr16 87267400 87267639 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24933 NR_104667 101928682 Hs.149004 NR_104667 ENSG00000261697 LOC101928682 - uncharacterized LOC101928682 ncRNA 239.5-38 chr17 66544550 66544902 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) AluSx|SINE|Alu -127872 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 335.75-17 chr5 29613519 29613947 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -217757 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 138.25-23 chr10 107911743 107911934 + 1.25 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 157455 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 177.25-52 chr15 94203916 94204200 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -94143 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 219.25-71 chr7 5063602 5063951 + 1.25 NA exon (NM_021163, exon 5 of 5) exon (NM_021163, exon 5 of 5) -8284 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 134.75-32 chr10 94261281 94261422 + 1.25 NA intron (NM_001165979, intron 12 of 31) L1MC2|LINE|L1 25719 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-138 chr7 86057084 86057324 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -586705 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 344-16 chr3 146527696 146528080 + 1.25 NA intron (NM_001363874, intron 2 of 6) intron (NM_001363874, intron 2 of 6) 16667 NM_001363872 5359 Hs.130759 NM_021105 ENSG00000188313 PLSCR1 MMTRA1B phospholipid scramblase 1 protein-coding 221.75-30 chr16 87413248 87413574 + 1.25 NA intron (NM_015144, intron 10 of 12) CpG-10074 21075 NM_022818 81631 Hs.356061 NM_022818 ENSG00000140941 MAP1LC3B ATG8F|LC3B|MAP1A/1BLC3|MAP1LC3B-a microtubule associated protein 1 light chain 3 beta protein-coding 220.75-4 chr1 75470168 75470433 + 1.25 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) intron (NM_001320285, intron 2 of 25) 140814 NM_001130058 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 318.25-12 chr6 37824408 37824754 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 4854 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 270.25-5 chr1 199101872 199102222 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -46551 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 221.25-69 chr5 34955145 34955636 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001348420, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001348420, exon 12 of 12) 25797 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 171.5-77 chr2 64827660 64827938 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35832 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 205.25-104 chr8 73432862 73433098 + 1.25 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 12906 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 214-4 chr1 152927434 152927661 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19002 NM_005547 3713 Hs.516439 NM_005547 ENSG00000163207 IVL - involucrin protein-coding 164.75-29 chr11 68420812 68421042 + 1.25 NA intron (NM_002335, intron 13 of 22) intron (NM_002335, intron 13 of 22) -39825 NM_001352361 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 268.75-6 chr12 42500806 42501458 + 1.25 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -17122 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 140.75-59 chr15 74399094 74399253 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 12259 NR_106941 102465530 NR_106941 ENSG00000277391 MIR6881 hsa-mir-6881 microRNA 6881 ncRNA 158-81 chr2 183480548 183480830 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 356246 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 424.25-3 chr14 67386423 67386852 + 1.25 NA TTS (NM_004094) TTS (NM_004094) 25528 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 125-25 chr10 91922333 91922458 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1375 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 330-27 chr8 39967813 39968129 + 1.25 NA intron (NM_194294, intron 3 of 10) L1MC3|LINE|L1 33016 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 142.25-152 chr7 9004117 9004324 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 570611 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 243.5-85 chr8 117537671 117537976 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001363182, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001363182, exon 4 of 4) 17110 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 223.5-85 chr3 182333251 182333577 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 152948 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 175-131 chr8 107200813 107200977 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 135620 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 321.75-36 chr8 124725831 124726140 + 1.25 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) intron (NM_001282971, intron 1 of 14) 2488 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 195.5-95 chr3 28055500 28055673 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186033 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 303.5-25 chr2 168787126 168787473 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_045786) promoter-TSS (NR_045786) 760 NM_001171631 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 545.5 chr4 46683379 46683998 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 225557 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 144.5-181 chr5 133482289 133482414 + 1.25 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -54645 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 244.5-95 chr8 109381458 109381668 + 1.25 NA intron (NM_177531, intron 3 of 77) intron (NM_177531, intron 3 of 77) 19102 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 173.25-29 chr12 116405813 116406016 + 1.25 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger 22404 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 283.25-40 chr9 7271141 7271577 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 514009 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 176.5-46 chr12 117407677 117407909 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45991 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 211.25-19 chr13 73614565 73614934 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 50505 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 254.25-31 chr19 50302546 50302967 + 1.25 NA intron (NM_024729, intron 38 of 40) AluSp|SINE|Alu 26621 NM_004977 3748 Hs.467146 NM_004977 ENSG00000131398 KCNC3 KSHIIID|KV3.3|SCA13 potassium voltage-gated channel subfamily C member 3 protein-coding 159.25-122 chr5 151380044 151380238 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -32582 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 211.75-14 chr12 1301295 1301547 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) L1PA13|LINE|L1 -199070 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 147.75-115 chr4 34337390 34337583 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -67739 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 270.25-33 chr3 111903839 111904107 + 1.25 NA intron (NM_001134437, intron 3 of 17) intron (NM_001134437, intron 3 of 17) 44146 NM_001134439 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 157.75-95 chr2 209521839 209521991 + 1.25 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -57421 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 560-2 chr8 130061377 130062504 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 27 of 29) MIR|SINE|MIR 22828 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 406.5 chr1 58047232 58047906 + 1.25 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 186988 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 190.5-118 chr4 97212644 97212845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -154182 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 294.25-37 chr9 34272154 34272602 + 1.25 NA intron (NM_194313, intron 6 of 12) intron (NM_194313, intron 6 of 12) 56890 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 134.75-202 chr7 89531838 89532052 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -587455 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 140.25-11 chr1 116995752 116995946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5901 NM_004258 9398 Hs.654598 NM_004258 ENSG00000134256 CD101 EWI-101|IGSF2|V7 CD101 molecule protein-coding 160-73 chr4 33821139 33821379 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 218634 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 276.75-4 chr10 9003678 9004018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105859 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 178.5-142 chr5 81292379 81292619 + 1.25 NA intron (NR_034122, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 9070 NR_034122 100131067 Hs.655855 NR_034121 ENSG00000247572 CKMT2-AS1 - CKMT2 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-100 chr2 81073788 81074156 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 392974 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 215.5-23 chr12 30810260 30810598 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 14748 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 348.25-3 chr10 39185865 39186330 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 489501 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 254.25-18 chr12 49846093 49846361 + 1.25 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -3121 NM_181708 144233 Hs.142736 NM_181708 ENSG00000186666 BCDIN3D - BCDIN3 domain containing RNA methyltransferase protein-coding 117.75-43 chr12 56851744 56852003 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 82535 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 179-31 chr13 110026672 110026840 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26529 NR_126387 104355146 Hs.508690 NR_126387 ENSG00000231428 LINC00396 - long intergenic non-protein coding RNA 396 ncRNA 260.75-58 chr7 34685106 34685518 + 1.25 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) intron (NM_001300934, intron 2 of 6) 27073 NM_001300934 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 438-3 chr4 43835264 43836015 + 1.25 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -181222 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 281.5-46 chr5 161160758 161161063 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -222284 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 128-40 chr14 40671238 40671355 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -283415 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 291.75-33 chr4 66305410 66305859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28810 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 186.25-82 chr4 115413309 115413529 + 1.25 NA Intergenic MER101B|LTR|ERV1 -299799 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 311-22 chr20 35088246 35088740 + 1.25 NA intron (NM_199368, intron 1 of 18) L2c|LINE|L2 4314 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 209.75-71 chr4 180757701 180757960 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 401319 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 167.25-29 chr12 124554174 124554434 + 1.25 NA intron (NM_001077261, intron 1 of 47) intron (NM_001077261, intron 1 of 47) 13308 NM_006312 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 288.5-42 chr7 27588314 27588863 + 1.25 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) AluJr4|SINE|Alu -27386 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 249.5-10 chr10 20613327 20613948 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 61667 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 293.75-26 chr20 7339210 7339553 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8052 NR_110610 101929312 Hs.559354 NR_110610 LINC01706 - long intergenic non-protein coding RNA 1706 ncRNA 157.75-61 chr16 78901708 78901937 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 698915 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 145.5-77 chr17 2443233 2443364 + 1.25 NA intron (NM_024086, intron 6 of 9) L1MD|LINE|L1 -27862 NR_028335 284009 Hs.632244 NM_001025459 LOC284009 - uncharacterized LOC284009 ncRNA 262.5-45 chr3 35810518 35810814 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 66190 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 186.5-29 chr12 4177137 4177512 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -96438 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 245.75-3 chr1 192251207 192251447 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -65665 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 367.5-8 chr10 32329535 32330076 + 1.25 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) intron (NM_001282391, intron 1 of 13) 17353 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 261.75-39 chr5 121291949 121292194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30479 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 250.25-31 chr3 17079773 17080035 + 1.25 NA intron (NM_015184, intron 5 of 5) intron (NM_015184, intron 5 of 5) 146708 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 144-15 chr1 221176080 221176295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 160109 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 354-8 chr14 60154986 60155572 + 1.25 NA intron (NM_016029, intron 2 of 6) AluSx|SINE|Alu 10119 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 190.5-55 chr15 98352059 98352318 + 1.25 NA intron (NR_146567, intron 1 of 2) intron (NR_146567, intron 1 of 2) -20630 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 471.25-2 chr8 142855733 142856519 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 21325 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 178.25-67 chr2 217873488 217873712 + 1.25 NA intron (NM_001308023, intron 15 of 29) LTR78|LTR|ERV1 27028 NR_106867 102465485 NR_106867 ENSG00000275458 MIR6809 hsa-mir-6809 microRNA 6809 ncRNA 177.5-175 chr8 119435851 119436106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19532 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 262.75-34 chr3 85384105 85384489 + 1.25 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -1413 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 192-16 chr10 66859024 66859279 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -66885 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 280.25-55 chrX 151579629 151579874 + 1.25 NA intron (NM_173493, intron 1 of 15) intron (NM_173493, intron 1 of 15) 16076 NM_173493 139135 Hs.160594 NM_173493 ENSG00000166049 PASD1 CT63|CT64|OXTES1 PAS domain containing repressor 1 protein-coding 182.75-107 chr5 102150944 102151370 + 1.25 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 145127 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 252.75-6 chr10 62773226 62773592 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31311 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 229.75-68 chr7 30279442 30279765 + 1.25 NA intron (NR_136267, intron 1 of 3) intron (NR_136267, intron 1 of 3) -4994 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 245.75-26 chr2 26861898 26862328 + 1.25 NA intron (NM_001253724, intron 1 of 12) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 13689 NM_001253724 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 187.25-75 chr3 148184936 148185199 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95824 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 179-51 chr2 26127907 26128140 + 1.25 NA intron (NM_016131, intron 5 of 5) intron (NM_016131, intron 5 of 5) -45065 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 182.25-2 chr1 101985549 101985857 + 1.25 NA intron (NR_110210, intron 1 of 7) intron (NR_110210, intron 1 of 7) 11531 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 150-79 chr2 223139587 223139811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 87769 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 130.5-38 chr10 54093328 54093567 + 1.25 NA intron (NM_001354411, intron 16 of 34) intron (NM_001354411, intron 16 of 34) -392783 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 227-20 chr14 48159776 48160297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -365022 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 123-161 chr5 118918982 118919128 + 1.25 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -55531 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 177.5-141 chr5 65493377 65493616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11576 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 225.5-92 chr5 76794900 76795137 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -24012 NM_005242 2150 Hs.744181 NM_005242 ENSG00000164251 F2RL1 GPR11|PAR2 F2R like trypsin receptor 1 protein-coding 129.25-19 chr10 56721538 56721681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -360336 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 237-2 chr1 62369830 62370196 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -50579 NM_181712 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 261-12 chr11 36366372 36366750 + 1.25 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) intron (NM_001160167, intron 1 of 8) -9424 NM_024841 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 222.5-5 chr1 86640611 86640831 + 1.25 NA intron (NR_024604, intron 5 of 14) intron (NR_024604, intron 5 of 14) 6445 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 210.75-47 chr2 187804621 187804893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -250252 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 127-36 chr11 110879669 110879781 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -166536 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 114.75-122 chr3 64060930 64061112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6943 NR_045697 100652759 Hs.731187 NR_045697 ENSG00000241111 PRICKLE2-AS1 - PRICKLE2 antisense RNA 1 ncRNA 306.75 chr1 187192546 187192861 + 1.25 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) 99861 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 219.75-53 chr4 47429079 47429318 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 34504 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 319.5-20 chr16 11584887 11585357 + 1.25 NA intron (NR_024320, intron 1 of 3) AluSz6|SINE|Alu 1251 NM_004862 9516 Hs.459940 NM_004862 ENSG00000189067 LITAF PIG7|SIMPLE|TP53I7 lipopolysaccharide induced TNF factor protein-coding 220.5-116 chr7 37680632 37680937 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -2982 NM_181791 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 208.75-46 chr20 40056744 40057012 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52417 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 238.75-50 chr5 100532449 100532908 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2696 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 249.5-35 chr16 47094978 47095330 + 1.25 NA intron (NM_001201477, intron 7 of 8) intron (NM_001201477, intron 7 of 8) 48791 NM_018092 81831 Hs.645802 NM_018092 ENSG00000171208 NETO2 BTCL2|NEOT2 neuropilin and tolloid like 2 protein-coding 201.75-45 chr2 50334361 50334702 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 13223 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 134.75-12 chr1 118043984 118044104 + 1.25 NA intron (NM_206996, intron 20 of 48) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 114305 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 213.75-64 chr3 2572975 2573270 + 1.25 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MIRb|SINE|MIR -319093 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 275.5-41 chr3 69138179 69138443 + 1.25 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -15716 NM_001304418 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 293.25-7 chr15 97460383 97460779 + 1.25 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 61230 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 165-43 chr15 63588478 63588711 + 1.25 NA non-coding (NR_034080, exon 3 of 3) non-coding (NR_034080, exon 3 of 3) -8793 NM_001367809 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 130.5-206 chr5 59910891 59911025 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) LTR8|LTR|ERV1 -17232 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 259-37 chr7 127449194 127449426 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -27573 NR_110024 100506682 Hs.148450 NR_110024 ENSG00000226770 LOC100506682 - uncharacterized LOC100506682 ncRNA 273.75-13 chr15 75970609 75970873 + 1.25 NA intron (NM_138573, intron 3 of 5) intron (NM_138573, intron 3 of 5) 41683 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 269.75-35 chr20 10876030 10876415 + 1.25 NA non-coding (NR_109866, exon 7 of 7) non-coding (NR_109866, exon 7 of 7) 33050 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 514.25 chr2 43382873 43383388 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) L1M5|LINE|L1 155919 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 259.25-12 chr15 41772646 41772987 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1668 NR_049762 23005 Hs.513661 NM_014994 ENSG00000137802 MAPKBP1 JNKBP-1|JNKBP1|NPHP20 mitogen-activated protein kinase binding protein 1 protein-coding 179.25-117 chr5 42470532 42470892 + 1.25 NA intron (NM_001242401, intron 1 of 10) intron (NM_001242401, intron 1 of 10) 45731 NM_001242401 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 264.5-4 chr1 212452352 212452676 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 19594 NR_026598 29937 Hs.461787 NM_013349 ENSG00000117691 NENF CIR2|SCIRP10|SPUF neudesin neurotrophic factor protein-coding 207.5-123 chr8 128980309 128980500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14403 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 324.25-13 chr5 60005099 60005378 + 1.25 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L1MA9|LINE|L1 -111512 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 225.75-16 chr10 110383216 110383542 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78459 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 306.5-30 chr6 97710503 97710893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -313833 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 263.5-58 chr6 49302034 49302615 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 160929 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 250-20 chr2 36467894 36468207 + 1.25 NA intron (NM_016441, intron 5 of 16) intron (NM_016441, intron 5 of 16) 112272 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 166-115 chr7 21645705 21645988 + 1.25 NA intron (NM_001277115, intron 28 of 81) L1M5|LINE|L1 102807 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 130.75-198 chr8 127284491 127284630 + 1.25 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 39923 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 135.5-171 chr6 56358416 56358560 + 1.25 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) 35640 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 200.75-45 chr2 11650815 11651037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19269 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 218-28 chr18 62093150 62093348 + 1.25 NA intron (NM_176787, intron 23 of 30) intron (NM_176787, intron 23 of 30) 93807 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 125.5-10 chr1 114506632 114506810 + 1.25 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) intron (NM_015906, intron 1 of 19) 4482 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 165-136 chr8 38451324 38451475 + 1.25 NA intron (NM_001174064, intron 2 of 18) intron (NM_001174064, intron 2 of 18) 16325 NM_001174065 2260 Hs.264887 NM_015850 ENSG00000077782 FGFR1 BFGFR|CD331|CEK|ECCL|FGFBR|FGFR-1|FLG|FLT-2|FLT2|HBGFR|HH2|HRTFDS|KAL2|N-SAM|OGD|bFGF-R-1 fibroblast growth factor receptor 1 protein-coding 254.75-16 chr16 7127043 7127353 + 1.25 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -205647 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 282.75-9 chr11 111459958 111460385 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41985 NR_046085 100132078 Hs.672662 NR_046085 ENSG00000255428 LOC100132078 - uncharacterized LOC100132078 ncRNA 264.5-30 chr18 11672028 11672336 + 1.25 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -17082 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 298.5-17 chr2 120534303 120534620 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68112 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 163.5-109 chr20 7521461 7521750 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149997 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 167.25-70 chr18 8385471 8385620 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 28 of 30) L2a|LINE|L2 -18511 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 300.75-27 chr2 138863879 138864157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33306 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 161.5-140 chr3 174404718 174404925 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -454513 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 150.75-53 chr13 63703317 63703538 + 1.25 NA intron (NR_047011, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu -34008 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 225.75-20 chr11 99950347 99950605 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 6 of 23) AluY|SINE|Alu 394331 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 244.25-8 chr11 107812768 107813061 + 1.25 NA intron (NM_017515, intron 2 of 7) intron (NM_017515, intron 2 of 7) 45873 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 179.25-26 chr10 121699093 121699257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100717 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 172.75-80 chr3 12741551 12741770 + 1.25 NA intron (NM_018306, intron 5 of 11) intron (NM_018306, intron 5 of 11) 17599 NM_001284408 55287 Hs.475502 NM_018306 ENSG00000088726 TMEM40 - transmembrane protein 40 protein-coding 377.5-8 chr18 78847465 78847971 + 1.25 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -132557 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 233-37 chr2 215473788 215474000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20187 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 228.75-52 chr22 49793655 49793841 + 1.25 NA intron (NM_001349942, intron 7 of 12) intron (NM_001349942, intron 7 of 12) 30583 NM_001349940 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 190.25-90 chr4 58214002 58214225 + 1.25 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 322215 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 143.5-33 chr11 74013663 74013848 + 1.25 NA intron (NM_001286577, intron 32 of 32) MIRc|SINE|MIR -4518 NM_022803 7352 Hs.101337 NM_003356 ENSG00000175564 UCP3 SLC25A9 uncoupling protein 3 protein-coding 377.5-15 chr3 154545589 154546159 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -115684 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 125.25-17 chr1 221643821 221643955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93012 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 160-75 chr4 45256021 45256159 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -529456 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 274.75-17 chr17 57413993 57414212 + 1.25 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) L2a|LINE|L2 109495 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 330.5-13 chr16 3779310 3779799 + 1.25 NA intron (NM_004380, intron 8 of 30) intron (NM_004380, intron 8 of 30) -62030 NM_001272049 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 368-15 chr8 137597080 137597533 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -183718 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 269-26 chr18 44018757 44019150 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 512744 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 251.25-27 chr2 47800421 47800654 + 1.25 NA exon (NM_001281492, exon 2 of 8) exon (NM_001281492, exon 2 of 8) 16582 NM_001281494 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 203.75-9 chr10 56511252 56511603 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -150154 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 171.25-94 chr3 21884467 21884707 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -72552 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 145.75-120 chr5 27343990 27344136 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -128229 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 327.5-15 chr2 52895382 52895955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -193053 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 224.75-14 chr10 32156321 32156556 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -100013 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 230.25-47 chr2 180993028 180993390 + 1.25 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) intron (NM_001278555, intron 3 of 5) 12085 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 229-55 chr3 157379358 157379605 + 1.25 NA intron (NM_024621, intron 7 of 13) intron (NM_024621, intron 7 of 13) -57369 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 176.5-130 chr4 32659084 32659349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 308178 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 129.25-44 chr14 26649826 26650038 + 1.25 NA intron (NR_147061, intron 2 of 6) intron (NR_147061, intron 2 of 6) 51285 NR_147061 102725045 Hs.143441 NR_147061 LINC02588 C14orf22|NOVA1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2588 ncRNA 148.75-158 chr7 82287118 82287290 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 156573 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 145.25-165 chr7 89711381 89711543 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -407938 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 219.25-32 chr2 71490528 71490802 + 1.25 NA intron (NM_001130985, intron 3 of 54) L1ME4b|LINE|L1 23966 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 144-60 chr2 126903233 126903373 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 4413 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 169.5-173 chr8 105627379 105627592 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 307942 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 340-8 chr17 57410090 57410429 + 1.25 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 113338 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 299.5-29 chr4 76320489 76320822 + 1.25 NA intron (NM_001042784, intron 23 of 23) L1PB1|LINE|L1 14629 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 248.5-18 chr12 50567541 50567880 + 1.25 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) AluSx1|SINE|Alu 62725 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 141.75-110 chr21 25409890 25410077 + 1.25 NA intron (NR_024027, intron 4 of 4) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 21718 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 150.75 chr1 17419652 17419820 + 1.25 NA intron (NM_001136204, intron 6 of 11).2 CpG 18800 NM_001136204 55920 Hs.380857 NM_018715 ENSG00000179051 RCC2 TD-60 regulator of chromosome condensation 2 protein-coding 147.25-108 chr5 107728860 107729008 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57997 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 212.5-2 chr1 18897452 18897687 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_031622) promoter-TSS (NR_031622) -421 NR_031622 100302276 NR_031622 ENSG00000221662 MIR1290 MIRN1290|hsa-mir-1290 microRNA 1290 ncRNA 388.5-7 chr17 58803673 58804242 + 1.25 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluJr4|SINE|Alu 48088 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 195.75-4 chr1 36799511 36799763 + 1.25 NA 3' UTR (NM_000831, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_000831, exon 16 of 16) 234878 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 244.5-68 chr3 108992225 108992502 + 1.25 NA intron (NM_014429, intron 21 of 27) intron (NM_014429, intron 21 of 27) -38484 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 131.25-148 chr3 142897814 142898058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8853 NM_013363 26577 Hs.8944 NM_013363 ENSG00000163710 PCOLCE2 PCPE2 procollagen C-endopeptidase enhancer 2 protein-coding 137-99 chr3 12971193 12971357 + 1.25 NA intron (NM_001134382, intron 1 of 13) intron (NM_001134382, intron 1 of 13) -3545 NM_014869 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 179.75-8 chr1 169956410 169956848 + 1.25 NA intron (NM_014970, intron 18 of 19) AluJr|SINE|Alu -62670 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 275-16 chr16 74076144 74076409 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 139245 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 271-26 chr2 181006471 181006928 + 1.25 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) MER53|DNA|hAT 25575 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 225.5-33 chr14 50064852 50065274 + 1.25 NA intron (NR_131171, intron 2 of 8) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 39980 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 238.25-29 chr18 77102343 77102679 + 1.25 NA intron (NM_001025100, intron 2 of 3) intron (NM_001025100, intron 2 of 3) 30272 NM_001025101 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 315.25-8 chr14 42674229 42674610 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 1067563 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 190.25-87 chr3 114656913 114657209 + 1.25 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) L1ME2|LINE|L1 -32116 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 171.25-57 chr17 14908089 14908249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106636 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 158.75-154 chr7 96702577 96702826 + 1.25 NA intron (NR_163953, intron 1 of 5) L1MC4|LINE|L1 7145 NR_163953 213.25-15 chr14 51733913 51734210 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16778 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 337-3 chr10 20926401 20926798 + 1.25 NA intron (NM_001173484, intron 4 of 6) intron (NM_001173484, intron 4 of 6) -28997 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 256.25-21 chr2 43892208 43892469 + 1.25 NA intron (NM_133259, intron 36 of 37) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 53367 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 197.25-12 chr10 74872454 74872660 + 1.25 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) AluJb|SINE|Alu -40229 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 455 chr2 119309992 119310661 + 1.25 NA intron (NM_001322332, intron 4 of 4) intron (NM_001322332, intron 4 of 4) 56416 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 362-16 chr5 154918751 154919222 + 1.25 NA intron (NM_015465, intron 11 of 27) AluSz6|SINE|Alu 19225 NM_015465 25929 Hs.483921 NM_015465 ENSG00000082516 GEMIN5 GEMIN-5 gem nuclear organelle associated protein 5 protein-coding 121.5-182 chr3 109004127 109004404 + 1.25 NA intron (NM_014429, intron 20 of 27) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -50386 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 146-26 chr12 26224476 26224670 + 1.25 NA intron (NM_005086, intron 2 of 2) intron (NM_005086, intron 2 of 2) 29000 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 319.25-3 chr11 86363260 86363736 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -11238 NM_021827 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 207.5-102 chr7 30134160 30134387 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_152793) promoter-TSS (NM_152793) -713 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 245.5-65 chr6 35361694 35362178 + 1.25 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) intron (NM_001171819, intron 2 of 6) 19378 NM_177435 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 162.25-168 chrX 34221463 34221627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -89215 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 175.25-95 chr3 49330520 49330669 + 1.25 NA intron (NM_199443, intron 2 of 20) AluY|SINE|Alu 9459 NM_001251877 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 137.75-51 chr13 48524289 48524498 + 1.25 NA intron (NM_001352424, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 8687 NM_001352425 1102 Hs.652712 NM_001268 ENSG00000136161 RCBTB2 CHC1L|RLG RCC1 and BTB domain containing protein 2 protein-coding 259.25-53 chrX 68204464 68204728 + 1.25 NA intron (NM_002547, intron 10 of 24) intron (NM_002547, intron 10 of 24) 228899 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 177.25-77 chr20 7293084 7293327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14227 NR_135005 101929288 Hs.738005 NR_135005 ENSG00000261249 LINC01751 - long intergenic non-protein coding RNA 1751 ncRNA 146.75-17 chr10 50423054 50423194 + 1.25 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) intron (NM_147156, intron 6 of 10) -174514 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 216-9 chr11 46772297 46772560 + 1.25 NA intron (NM_001008938, intron 24 of 43) L1MD2|LINE|L1 -9929 NR_003056 692108 Hs.693252 NR_003056 ENSG00000212135 SNORD67 HBII-166 small nucleolar RNA, C/D box 67 snoRNA 251.75-4 chr1 113804745 113805069 + 1.25 NA intron (NR_130896, intron 1 of 7) intron (NR_130896, intron 1 of 7) 7569 NR_130896 54665 Hs.486285 NM_018364 ENSG00000081019 RSBN1 KDM9|ROSBIN round spermatid basic protein 1 protein-coding 293.5-36 chr5 143029538 143029855 + 1.25 NA intron (NR_146198, intron 12 of 22) AluJr4|SINE|Alu -160786 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 237-57 chr6 88348907 88349282 + 1.25 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -181745 NM_001370546 1268 Hs.75110 NM_016083 ENSG00000118432 CNR1 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR cannabinoid receptor 1 protein-coding 188-14 chr11 87872861 87873229 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -153634 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 181.5-76 chr2 67523188 67523410 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 125966 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 263-24 chr17 70869771 70870109 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 332239 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 221.5-86 chr7 16450895 16451242 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14670 NM_015464 25928 Hs.648106 NM_015464 ENSG00000171243 SOSTDC1 CDA019|DAND7|ECTODIN|USAG1 sclerostin domain containing 1 protein-coding 308.75-32 chr6 54139623 54140045 + 1.25 NA intron (NM_001281746, intron 4 of 11) intron (NM_001281746, intron 4 of 11) 28391 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 207.75-53 chr2 34916918 34917169 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 239486 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 191.5-7 chr1 71979213 71979475 + 1.25 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) L1PREC2|LINE|L1 -142332 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 297.75-51 chr8 104100354 104100784 + 1.25 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -122766 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 234.25-77 chr7 158650372 158650694 + 1.25 NA intron (NM_001281932, intron 25 of 28) intron (NM_001281932, intron 25 of 28) 54271 NM_017760 54892 Hs.18616 NM_017760 ENSG00000146918 NCAPG2 3KS|CAP-G2|CAPG2|LUZP5|MTB|hCAP-G2 non-SMC condensin II complex subunit G2 protein-coding 226.75 chr1 58363667 58363988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -113280 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 197.25-6 chr1 184296072 184296282 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90852 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 242.75-47 chr4 49089459 49089685 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 102930 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 185.75-63 chr2 107607747 107607994 + 1.25 NA Intergenic MER51B|LTR|ERV1 78451 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 274.75-7 chr12 124904256 124904575 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10235 NM_021009 7316 Hs.520348 NM_021009 ENSG00000150991 UBC HMG20 ubiquitin C protein-coding 201.75-51 chr2 177684186 177684436 + 1.25 NA intron (NM_001077197, intron 16 of 20) MER96B|DNA|hAT-Tip100 10989 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 150.75-11 chr1 100312770 100313017 + 1.25 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 31652 NR_030279 693138 NR_030279 ENSG00000207750 MIR553 MIRN553|hsa-mir-553 microRNA 553 ncRNA 177.75-129 chr7 94113899 94114093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109641 NR_133908 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 164.5-45 chr13 55483835 55484284 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 309605 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 140.5-96 chr19 31408929 31409116 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59586 NR_138034 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 149.5-152 chr5 57466121 57466502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16500 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 353.5-13 chr3 181768702 181769175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57013 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 252.75-10 chr11 81671275 81671521 + 1.25 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 219438 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 327.75-24 chr6 62539372 62539846 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -253382 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 127.25-20 chr10 55460134 55460344 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -138803 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 231.75-21 chr14 38039042 38039465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -137129 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 283-28 chr3 102984483 102984738 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 539506 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 390.5-10 chr4 150411993 150412374 + 1.25 NA intron (NM_001367550, intron 47 of 56) intron (NM_001367550, intron 47 of 56) -166906 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 159.25-112 chr5 12571431 12571611 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3336 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 127.25-213 chr8 133141482 133141623 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -38950 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 196.75-15 chr10 77429263 77429525 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MER20|DNA|hAT-Charlie 78522 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 255.25-44 chr6 18724053 18724520 + 1.25 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 152502 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 165-45 chr15 71994953 71995123 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 9 of 41) intron (NM_006901, intron 9 of 41) -119220 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 212.75-90 chr6 130606472 130606694 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 169466 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 314.25-10 chr15 85884885 85885173 + 1.25 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 59394 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 187.75-35 chr16 73167979 73168248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23666 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 159.25-51 chr17 58390132 58390305 + 1.25 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) intron (NM_001305544, intron 2 of 9) 12503 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 117.5-114 chr2 135874281 135874418 + 1.25 NA intron (NM_005915, intron 1 of 16) intron (NM_005915, intron 1 of 16) 2094 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 229.5-81 chr21 28216267 28216594 + 1.25 NA intron (NR_126012, intron 2 of 5) intron (NR_126012, intron 2 of 5) 12237 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 274.5-20 chr14 45609244 45609566 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 106197 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 263.25-45 chr5 59244206 59244443 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) AluSg|SINE|Alu 31791 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 210-47 chr2 34758329 34758515 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80865 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 279.5-26 chr19 58348341 58348722 + 1.25 NA intron (NM_130786, intron 6 of 7) intron (NM_130786, intron 6 of 7) -3439 NR_015380 503538 Hs.709582 NR_015380 ENSG00000268895 A1BG-AS1 A1BG-AS|A1BGAS|NCRNA00181 A1BG antisense RNA 1 ncRNA 302.25-7 chr12 14029852 14030142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49641 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 174-56 chr20 5577563 5577861 + 1.25 NA intron (NM_019593, intron 8 of 19) intron (NM_019593, intron 8 of 19) 33294 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 221.25-87 chr8 31446863 31447155 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -192743 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 167-42 chr14 73995022 73995280 + 1.25 NA intron (NM_001249, intron 3 of 15) AluSz6|SINE|Alu 24137 NM_001321985 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 254.5-35 chr18 29964269 29964559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -334496 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 220.25-40 chr20 8474936 8475256 + 1.25 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) 226392 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 219.5-20 chr11 55540931 55541121 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -13243 NM_001001920 81309 NM_001001920 ENSG00000181939 OR4C15 OR11-127|OR11-134 olfactory receptor family 4 subfamily C member 15 protein-coding 339.25-12 chr2 147959473 147959797 + 1.25 NA intron (NM_001190881, intron 1 of 10) intron (NM_001190881, intron 1 of 10) 61102 NM_181741 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 209.25-39 chr16 82179391 82179919 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9431 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 138-95 chr22 28099540 28099698 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 9 of 22) intron (NM_001145418, intron 9 of 22) -179007 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 312.75-31 chr8 103842123 103842610 + 1.25 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 23146 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 247.5-18 chr13 74159071 74159488 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25350 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 220-18 chr14 33528981 33529294 + 1.25 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -179800 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 227-48 chr4 64390041 64390250 + 1.25 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) intron (NM_001363796, intron 1 of 11) 19305 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 221.25-22 chr13 23602088 23602292 + 1.25 NA intron (NM_001354985, intron 3 of 8) L1MC1|LINE|L1 22830 NM_001354985 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 179.75-30 chr12 22155498 22155694 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 109378 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 173.75-8 chr1 108887493 108887676 + 1.25 NA intron (NM_013296, intron 2 of 14) intron (NM_013296, intron 2 of 14) 10599 NM_001321039 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 126-51 chr14 47338946 47339090 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 4228 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 179.5-156 chr6 55187010 55187172 + 1.25 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) LTR84b|LTR|ERVL 80631 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 131.5-240 chr8 126449107 126449236 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 109307 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 225.25-29 chr17 60326753 60327212 + 1.25 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) L1MA5|LINE|L1 65151 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 146-19 chr11 41999316 41999481 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86060 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 237.5-84 chr6 17878490 17878725 + 1.25 NA intron (NM_001105567, intron 3 of 36) intron (NM_001105567, intron 3 of 36) 109028 NM_001243423 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 295.5-59 chr6 146896865 146897289 + 1.25 NA intron (NR_034115, intron 7 of 10) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -93253 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 160.25-169 chr9 90172644 90172873 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -131259 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 252.5 chr1 33315587 33315924 + 1.25 NA intron (NM_001080438, intron 1 of 4) L1ME4c|LINE|L1 5343 NM_001080438 127550 NM_001080438 ENSG00000184389 A3GALT2 A3GALT2P|IGB3S|IGBS3S alpha 1,3-galactosyltransferase 2 protein-coding 209.75-97 chr8 20508779 20509101 + 1.25 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger 105986 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 161.5-12 chr1 195837544 195837710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 251088 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 160-65 chr3 72411948 72412177 + 1.25 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 34561 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 198.75-98 chr9 76902439 76902728 + 1.25 NA intron (NM_001308048, intron 1 of 17) intron (NM_001308048, intron 1 of 17) 3504 NR_131751 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 262-15 chr12 123126219 123126587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15914 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 256-15 chr15 65290676 65291039 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -3974 NM_001316943 54956 Hs.30634 NM_017851 ENSG00000138617 PARP16 ARTD15|C15orf30|pART15 poly(ADP-ribose) polymerase family member 16 protein-coding 186.75-45 chr2 29992442 29992690 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70980 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 239-13 chr12 28976829 28977198 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -172265 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 228.75-59 chr4 106732041 106732290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 298541 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 172.25-92 chr3 100029016 100029254 + 1.25 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) FLAM_A|SINE|Alu -64737 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 424-8 chr4 107682126 107682582 + 1.25 NA intron (NM_005443, intron 4 of 11) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 37880 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 163-127 chr9 115089950 115090155 + 1.25 NA intron (NM_002160, intron 2 of 27) intron (NM_002160, intron 2 of 27) 28105 NM_002160 3371 Hs.143250 NM_002160 ENSG00000041982 TNC 150-225|DFNA56|GMEM|GP|HXB|JI|TN|TN-C tenascin C protein-coding 202-25 chr16 80178210 80178495 + 1.25 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -362382 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 171.25-53 chr15 97655680 97655883 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95083 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 223.75-78 chr7 81203542 81203749 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -281256 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 195.25-63 chr3 107423096 107423386 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -7689 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 285.5-14 chr12 127264356 127264719 + 1.25 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL 19746 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 143.25-180 chr8 81872862 81873094 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30692 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 153.75-26 chr11 96579113 96579293 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70778 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 235.5-96 chrX 82987528 82987797 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -520628 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 188.5-39 chr14 61487342 61487627 + 1.25 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 82710 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 161-39 chr14 55821955 55822110 + 1.25 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -25358 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 352.5-3 chr11 41354930 41355232 + 1.25 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L1P4e|LINE|L1 104555 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 209.75-68 chr4 53922021 53922217 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 65163 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 256.5-84 chr9 37547085 37547530 + 1.25 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) L1ME2z|LINE|L1 29073 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 139-32 chr13 59157480 59157714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -855121 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 296.25-21 chr20 43094455 43094766 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) AluSp|SINE|Alu 95296 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 137.5-177 chr4 87648295 87648550 + 1.25 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -1858 NM_004407 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 220.25-22 chr17 49666816 49667032 + 1.25 NA intron (NM_001007229, intron 1 of 10) AluSq2|SINE|Alu 11173 NM_001007228 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 296.25-31 chr7 119683259 119683609 + 1.25 NA intron (NR_131960, intron 4 of 4) intron (NR_131960, intron 4 of 4) 223941 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 188.75-106 chr7 39603414 39603697 + 1.25 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) -20017 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 149-8 chr1 199979247 199979471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48351 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 229.25-40 chr19 47286243 47286448 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 11460 NM_178511 255783 Hs.128690 NM_178511 ENSG00000257704 INAFM1 PRR24 InaF motif containing 1 protein-coding 151.5-59 chr15 63537201 63537402 + 1.25 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) intron (NM_006537, intron 3 of 14) 32708 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 196-85 chr6 103237448 103237605 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 1622020 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 184.5-127 chr5 149215421 149215627 + 1.25 NA intron (NM_001370418, intron 6 of 18) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -56314 NM_001323063 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 205.5-90 chr3 8555507 8555834 + 1.25 NA intron (NM_014583, intron 4 of 5) intron (NM_014583, intron 4 of 5) -16112 NR_024065 29931 Hs.433151 NM_013343 LINC00312 ERR-10|ERR10|LMCD1DN|LOH3CR2A|NAG-7|NAG7|NCRNA00312 long intergenic non-protein coding RNA 312 ncRNA 203.5-146 chrX 94455441 94455610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 607701 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 300-16 chr15 25757033 25757467 + 1.25 NA intron (NM_024490, intron 2 of 20) MER101-int|LTR|ERV1 91575 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 314.5-18 chr3 111806983 111807378 + 1.25 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR -52000 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 132-10 chr1 197157333 197157529 + 1.25 NA non-coding (NR_135153, exon 11 of 11) non-coding (NR_135153, exon 11 of 11) -10737 NM_001206846 259266 Hs.121028 NM_018136 ENSG00000066279 ASPM ASP|Calmbp1|MCPH5 abnormal spindle microtubule assembly protein-coding 259.75-19 chr14 72841767 72842174 + 1.25 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) AluJr4|SINE|Alu 50679 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 192.75-71 chr20 19914071 19914265 + 1.25 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) intron (NM_001242581, intron 2 of 11) 24602 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 185.5-169 chr9 29197137 29197434 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 15014 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 168.75-29 chr11 94751080 94751277 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -10823 NR_135094 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 305.5-10 chr11 40350449 40350885 + 1.25 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1MA3|LINE|L1 -57537 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 185.75-49 chr15 78581509 78581723 + 1.25 NA intron (NM_001307945, intron 2 of 5) L1ME4a|LINE|L1 16096 NM_001307945 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 355.75-13 chr5 18797923 18798498 + 1.25 NA Intergenic LTR9B|LTR|ERV1 990936 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 268-29 chr2 78307649 78307966 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17076 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 206.5-23 chr13 109107976 109108415 + 1.25 NA intron (NM_015011, intron 28 of 34) intron (NM_015011, intron 28 of 34) 59108 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 179.5-171 chr7 81758363 81758607 + 1.25 NA intron (NM_001010933, intron 3 of 7) intron (NM_001010933, intron 3 of 7) 11562 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 308.5-10 chr16 20310122 20310567 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001502, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001502, exon 11 of 11) 17169 NM_001007240 2813 Hs.53985 NM_001502 ENSG00000169347 GP2 ZAP75 glycoprotein 2 protein-coding 224-38 chr4 56476913 56477251 + 1.25 NA intron (NM_001267722, intron 6 of 16) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 9465 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 388-16 chr9 71948976 71949537 + 1.25 NA intron (NM_001365057, intron 2 of 2) intron (NM_001365057, intron 2 of 2) 37617 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 169.75-119 chr4 112980014 112980194 + 1.25 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) MER52A|LTR|ERV1 -69310 NM_001354246 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 240-33 chr3 2538296 2538582 + 1.25 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) 299610 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 179.5-175 chr7 113698575 113698874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 220285 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 210.75-13 chr10 57683499 57683806 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -379093 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 214-69 chr8 142100249 142100480 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -75975 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 219.5-91 chr4 84020350 84020608 + 1.25 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) MER4D0|LTR|ERV1 278690 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 267.25-44 chr8 83684503 83684799 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 280893 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 233.75-38 chr2 102137130 102137381 + 1.25 NA intron (NM_001320980, intron 1 of 11) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -4536 NM_001320981 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 155-65 chr2 107724756 107725082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29193 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 237.75-67 chr5 83985744 83986149 + 1.25 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) intron (NM_001278642, intron 8 of 9) -265091 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 152.75-17 chr10 10018648 10018812 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -39992 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 170-94 chr7 130988222 130988393 + 1.25 NA intron (NR_109855, intron 2 of 4) intron (NR_109855, intron 2 of 4) 74843 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 175.25-109 chr4 126489640 126489901 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 982511 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 312-25 chr4 176775652 176775960 + 1.25 NA intron (NM_005429, intron 1 of 6) intron (NM_005429, intron 1 of 6) 17116 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 158-84 chr20 20569973 20570180 + 1.25 NA intron (NM_020343, intron 23 of 39) intron (NM_020343, intron 23 of 39) 142568 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 276.75-38 chr4 114098650 114098986 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -119171 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 204.75-54 chr18 53246272 53246502 + 1.25 NA intron (NM_005215, intron 12 of 28) intron (NM_005215, intron 12 of 28) 9286 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 127.75-88 chr19 37412242 37412378 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330482, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001330482, exon 5 of 5) 41211 NM_032453 84503 Hs.590940 NM_032453 ENSG00000189164 ZNF527 - zinc finger protein 527 protein-coding 168-85 chr3 104173687 104173903 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -649679 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 221.75-82 chr8 110273743 110274046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -298123 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 335.25-30 chr7 88900566 88901073 + 1.25 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -105082 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 183.25-44 chr17 63134198 63134436 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 168082 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 232.5-107 chr8 126919428 126919754 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -93563 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 262.5-12 chr12 65281471 65281931 + 1.25 NA intron (NM_001193461, intron 1 of 6) intron (NM_001193461, intron 1 of 6) 2714 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 329.25-14 chr2 7887200 7887747 + 1.25 NA intron (NR_110256, intron 5 of 5) intron (NR_110256, intron 5 of 5) 12182 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 288.5-43 chr7 27872944 27873427 + 1.25 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) intron (NM_175061, intron 3 of 4) 133090 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 214.25-24 chr14 68273527 68273814 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 355117 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 426.25-10 chr7 143431768 143432442 + 1.25 NA intron (NR_033897, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 -11348 NM_177437 338398 Hs.688222 NM_177437 ENSG00000185899 TAS2R60 T2R56|T2R60 taste 2 receptor member 60 protein-coding 149.25-108 chr22 39405218 39405391 + 1.25 NA intron (NM_153497, intron 1 of 10) intron (NM_153497, intron 1 of 10) 5524 NM_006116 10454 Hs.507681 NM_006116 ENSG00000100324 TAB1 3'-Tab1|MAP3K7IP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 protein-coding 147.25-101 chr4 173683114 173683344 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 152771 NR_003679 79804 Hs.61435 NR_003679 ENSG00000237125 HAND2-AS1 DEIN|NBLA00301|UPH HAND2 antisense RNA 1 ncRNA 236-10 chr11 25711149 25711450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -477824 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 211.5-69 chr2 22053734 22054096 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -343263 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 195.25-25 chr12 89280468 89280649 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71943 NM_022652 1848 Hs.298654 NM_001946 ENSG00000139318 DUSP6 HH19|MKP3|PYST1 dual specificity phosphatase 6 protein-coding 190-12 chr10 99918022 99918237 + 1.25 NA intron (NM_015221, intron 4 of 16) intron (NM_015221, intron 4 of 16) -4037 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 119.5-25 chr10 50985333 50985496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5474 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 237-14 chr12 9825560 9826045 + 1.25 NA intron (NR_159359, intron 1 of 5) L1PA13|LINE|L1 -1679 NM_001291823 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 266-38 chr5 20370055 20370607 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 64780 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 211.75-75 chr5 79244319 79244556 + 1.25 NA intron (NM_152405, intron 1 of 10) intron (NM_152405, intron 1 of 10) 8306 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 189.25-126 chr8 112923168 112923399 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 7 of 66) L2a|LINE|L2 279790 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 261.25-32 chr4 58545469 58545834 + 1.25 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -9323 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 274-27 chr3 100181287 100181548 + 1.25 NA 3' UTR (NM_032359, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_032359, exon 10 of 10) -4407 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 223.75-11 chr11 122227933 122228210 + 1.25 NA intron (NR_137180, intron 2 of 4) intron (NR_137180, intron 2 of 4) -24962 NR_137181 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 196-72 chr4 94011086 94011360 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182470 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 406.5-4 chr2 57706105 57706760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -201219 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 436.25-3 chr2 123620762 123621569 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 404009 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 122.25-44 chr12 56818015 56818223 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54795 NM_003725 8630 Hs.524513 NM_003725 ENSG00000025423 HSD17B6 HSE|RODH|SDR9C6 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 6 protein-coding 260.75-67 chr9 34122869 34123401 + 1.25 NA intron (NM_015397, intron 2 of 8) intron (NM_015397, intron 2 of 8) 3563 NM_015397 25853 Hs.493750 NM_015397 ENSG00000198876 DCAF12 CT102|KIAA1892|TCC52|WDR40A DDB1 and CUL4 associated factor 12 protein-coding 158-5 chr1 42141802 42141979 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11520 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 119.5-145 chr22 48075394 48075512 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -198911 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 241.5-9 chr11 133423186 133423575 + 1.25 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) 109121 NM_001012393 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 252-14 chr11 81178305 81178650 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -415674 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 174-40 chr17 28534877 28535236 + 1.25 NA exon (NM_003593, exon 7 of 8) exon (NM_003593, exon 7 of 8) 11115 NM_003593 8456 Hs.58611 NM_003593 ENSG00000109101 FOXN1 FKHL20|RONU|WHN forkhead box N1 protein-coding 153.25-39 chr14 53548994 53549195 + 1.25 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 395740 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 140.5-82 chr17 39350755 39350932 + 1.25 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) MER5A|DNA|hAT-Charlie 50783 NM_032875 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 172.25-81 chr21 26928865 26929042 + 1.25 NA intron (NM_007038, intron 7 of 7) intron (NM_007038, intron 7 of 7) -25008 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 291.5-32 chr3 122112195 122112603 + 1.25 NA intron (NM_001206925, intron 4 of 5) AluSc|SINE|Alu 34550 NM_176892 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 185.25-67 chr2 197384232 197384583 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 50686 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 133.75-100 chr2 109517242 109517404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 96344 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 227.75-85 chr8 133308279 133308511 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -11091 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 422.25-3 chr21 22914205 22914602 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -164881 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 159.25-136 chr7 32870976 32871197 + 1.25 NA intron (NM_015483, intron 3 of 3) intron (NM_015483, intron 3 of 3) 20674 NM_015483 25948 Hs.372541 NM_015483 ENSG00000170852 KBTBD2 BKLHD1 kelch repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 168.75-112 chr5 89595539 89595744 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 421079 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 207.75-108 chr6 39696607 39696877 + 1.25 NA intron (NM_001351503, intron 3 of 3) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28666 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 323.25-31 chr9 132274962 132275408 + 1.25 NA intron (NM_001351527, intron 23 of 25) intron (NM_001351527, intron 23 of 25) 79671 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 224.75-23 chr12 59774714 59774982 + 1.25 NA exon (NM_001270622, exon 5 of 6) exon (NM_001270622, exon 5 of 6) 85478 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 255.75-29 chr20 42408784 42409311 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -276436 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 225.75-53 chr3 97140805 97141139 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1PA15-16|LINE|L1 -298635 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 300-41 chr8 87697941 87698382 + 1.25 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 175854 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 241-28 chr2 234320223 234320550 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 134209 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 263.75-24 chr19 47403767 47404172 + 1.25 NA intron (NM_001346148, intron 12 of 12) AluJo|SINE|Alu 15558 NM_001009813 56917 Hs.380923 NM_020160 ENSG00000105419 MEIS3 MRG2 Meis homeobox 3 protein-coding 222.5-16 chr10 45660715 45661015 + 1.25 NA intron (NM_174890, intron 2 of 9) L1MCa|LINE|L1 11867 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 160-7 chr1 101785108 101785328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 61862 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 138-73 chr2 13204501 13204661 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -197568 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 291.25-6 chr12 114124905 114125214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 116711 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 174.5-181 chr8 26331761 26331968 + 1.25 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) intron (NM_001177591, intron 2 of 9) 38648 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 166-42 chr16 63014073 63014322 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -977759 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 251.5-62 chr5 12977159 12977526 + 1.25 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 55544 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 218-6 chr1 172004678 172004865 + 1.25 NA intron (NM_001278252, intron 4 of 14) L2|LINE|L2 -134037 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 138.25-48 chr14 47063954 47064076 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 279231 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 177.75-123 chr6 53143017 53143177 + 1.25 NA intron (NM_003643, intron 2 of 5) intron (NM_003643, intron 2 of 5) 5744 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 142.75-176 chr7 92321733 92321892 + 1.25 NA intron (NM_019004, intron 4 of 19) intron (NM_019004, intron 4 of 19) -75712 NM_001350679 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 198.75-75 chr5 20445673 20445930 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 129912 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 271.75-4 chr10 16146642 16146966 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -286271 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 216-26 chr16 86127745 86128017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68300 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 254.75-48 chr6 136817176 136817402 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5303 NM_000288 5191 Hs.280932 NM_000288 ENSG00000112357 PEX7 PBD9B|PTS2R|RCDP1|RD peroxisomal biogenesis factor 7 protein-coding 316.75-3 chr11 55922737 55923020 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8296 NM_001001960 390148 Hs.554526 NM_001001960 ENSG00000187612 OR5W2 OR5W2P|OR5W3P olfactory receptor family 5 subfamily W member 2 protein-coding 327.75-13 chr2 185231921 185232429 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65103 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 187.25-108 chr8 91244178 91244435 + 1.25 NA intron (NM_001282357, intron 2 of 18) intron (NM_001282357, intron 2 of 18) -5013 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 245.5-60 chr5 94057353 94057694 + 1.25 NA intron (NM_001163418, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 54140 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 232.25-52 chr4 64824772 64825144 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 179542 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 300.25-8 chr13 110427854 110428279 + 1.25 NA intron (NM_001846, intron 6 of 47) intron (NM_001846, intron 6 of 47) 35221 NM_001267044 100129836 Hs.640035 NM_001267044 COL4A2-AS2 - COL4A2 antisense 2 protein-coding 183-13 chr11 45004851 45005068 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 31057 NR_026681 221122 Hs.551656 NR_026681 ENSG00000254654 LINC02685 - long intergenic non-protein coding RNA 2685 ncRNA 252.25-16 chr13 102610004 102610328 + 1.25 NA intron (NM_001330588, intron 2 of 29) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 13180 NM_003291 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 236.5-56 chr21 30180881 30181158 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14214 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 262-50 chr7 4045085 4045473 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) AluJo|SINE|Alu -84406 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 252-77 chr9 81457183 81457698 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 232095 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 115-155 chr6 63382277 63382378 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62344 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 236.5-8 chr10 85998651 85998854 + 1.25 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) L1MEf|LINE|L1 266036 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 299.5-24 chr22 41498974 41499244 + 1.25 NA intron (NM_001098, intron 1 of 17) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 29992 NM_001098 50 Hs.643610 NM_001098 ENSG00000100412 ACO2 ACONM|HEL-S-284|ICRD|OCA8|OPA9 aconitase 2 protein-coding 401-13 chr4 48428750 48429276 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -54330 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 315.5-5 chr13 55241224 55241714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 67015 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 116.5-17 chr1 234075447 234075605 + 1.25 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -138685 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 138.5-89 chr18 53129818 53129951 + 1.25 NA intron (NM_005215, intron 7 of 28) L1ME2|LINE|L1 -107217 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 144.5-217 chr8 85409525 85409802 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -29196 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 156.75-29 chr10 124865986 124866138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64243 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 229-25 chr18 53914735 53914984 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 307553 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 296-37 chr5 172518419 172518672 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 40469 NR_146726 105377728 Hs.131465 NR_146726 LINC01944 CTB-54I1.1 long intergenic non-protein coding RNA 1944 ncRNA 211.25-63 chr3 188192185 188192378 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 13738 NR_024413 401105 Hs.679026 NM_207488 ENSG00000279891 FLJ42393 AVPC1948 uncharacterized LOC401105 ncRNA 250.75-36 chr3 53380027 53380427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32684 NM_001290206 55802 Hs.476353 NM_018403 ENSG00000272886 DCP1A HSA275986|Nbla00360|SMAD4IP1|SMIF decapping mRNA 1A protein-coding 181.25-70 chr2 191144368 191144643 + 1.25 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) L2c|LINE|L2 6489 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 362-17 chr7 109248293 109248718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -363918 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 217-68 chr5 12635590 12635911 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) intron (NR_033383, intron 2 of 3) -32109 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 240.75-9 chr10 56278487 56278939 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82546 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 254.75-20 chr2 84809226 84809563 + 1.25 NA intron (NM_001370, intron 72 of 76) intron (NM_001370, intron 72 of 76) 71690 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 203.75-101 chr7 51968309 51968523 + 1.25 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -575160 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 332.75-19 chr5 151740919 151741454 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17445 NM_004045 475 Hs.125213 NM_004045 ENSG00000177556 ATOX1 ATX1|HAH1 antioxidant 1 copper chaperone protein-coding 426.25 chr12 122266575 122267099 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_022916) promoter-TSS (NM_022916) -343 NM_001351018 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 278.5-6 chr1 188081564 188081982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 638145 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 363.5-16 chr3 182078336 182078757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126182 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 285.5-55 chr7 55236556 55236838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18938 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 258.75-51 chr3 98714981 98715232 + 1.25 NA intron (NR_046683, intron 4 of 4) intron (NR_046683, intron 4 of 4) -17130 NM_001271142 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 257.5-11 chr10 124376395 124376619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42416 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 465.25-2 chr14 52097007 52097478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28183 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 229.75-25 chr16 8713760 8714121 + 1.25 NA intron (NM_000663, intron 1 of 15) intron (NM_000663, intron 1 of 15) 971 NM_000663 18 Hs.336768 NM_000663 ENSG00000183044 ABAT GABA-AT|GABAT|NPD009 4-aminobutyrate aminotransferase protein-coding 195.25-18 chr10 65216807 65217182 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -292476 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 167.75-71 chr2 65608383 65608602 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -175893 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 158.75-153 chr7 48346923 48347084 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 29 of 61) intron (NM_152701, intron 29 of 61) 175545 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 269.5-3 chr1 79649172 79649555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -642633 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 263.5-48 chr4 132920429 132920678 + 1.25 NA Intergenic MER68-int|LTR|ERVL 228563 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 140-73 chr2 71881478 71881619 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 266314 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 125.75-18 chr10 4418661 4418935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12329 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 263-23 chr17 57701042 57701327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44115 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 228-25 chr13 91929955 91930338 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) MER45A|DNA|hAT-Tip100 422061 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 315-7 chr14 38338585 38338940 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82669 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 211.25-59 chr3 71506182 71506504 + 1.25 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) MIR|SINE|MIR 35746 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 128.5-185 chr6 40048345 40048460 + 1.25 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -113940 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 186.5-107 chr5 65511899 65512244 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -30151 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 252.75-62 chr6 49896059 49896311 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -19089 NM_001205220 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 265.75-20 chr14 69225197 69225609 + 1.25 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) intron (NR_034165, intron 4 of 10) 33637 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 318.5-10 chr15 67654295 67654833 + 1.25 NA intron (NM_001206804, intron 11 of 21) L1MB7|LINE|L1 105470 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 297.25-17 chr20 33087367 33087723 + 1.25 NA intron (NM_182519, intron 5 of 15) L1ME4b|LINE|L1 6033 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 265.75-18 chr14 65498605 65499015 + 1.25 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 27708 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 169.5-46 chr13 113119763 113120015 + 1.25 NA non-coding (NR_051961, exon 7 of 7) non-coding (NR_051961, exon 7 of 7) -2910 NM_000504 2159 Hs.361463 NM_000504 ENSG00000126218 F10 FX|FXA coagulation factor X protein-coding 120.25-111 chr20 42545636 42545783 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -139774 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 234.25-84 chrX 124206766 124207083 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -125736 NM_001355534 100132015 NM_001355534 ENSG00000282419 TEX13D - TEX13 family member D protein-coding 148.25-71 chr2 67985426 67985630 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 77476 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 239.75-22 chr14 73709479 73709701 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 4794 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 199.25-55 chr2 46031188 46031506 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) intron (NM_005400, intron 10 of 14) -266060 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 176.75-137 chr9 98498813 98499114 + 1.25 NA intron (NM_005458, intron 3 of 18) MIRc|SINE|MIR 209972 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 272.5-70 chr8 84030258 84030676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152320 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 152.5-54 chr15 60654316 60654553 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -26904 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 247-59 chr8 85371844 85372074 + 1.25 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 6154 NM_001128829 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 194.75-98 chr9 25055464 25055758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -509714 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 406.5-2 chr10 49141681 49142282 + 1.25 NA intron (NR_038973, intron 3 of 5) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -7961 NM_001164484 170370 Hs.646291 NM_001164484 ENSG00000172538 FAM170B C10orf73 family with sequence similarity 170 member B protein-coding 118-58 chr15 53760721 53760847 + 1.25 NA intron (NR_102334, intron 1 of 19) intron (NR_102334, intron 1 of 19) -1121 NM_182758 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 364.25-18 chr17 64379206 64379704 + 1.25 NA intron (NM_000442, intron 2 of 15) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 11405 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 255 chr1 39321476 39321826 + 1.25 NA intron (NM_012090, intron 30 of 92) L2|LINE|L2 -87422 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 173-48 chr15 60189593 60189802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 185386 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 144.75-8 chr1 108591918 108592123 + 1.25 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 31920 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 266.5-28 chr19 37600433 37600674 + 1.25 NA intron (NM_001172226, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 5677 NM_001172225 163255 Hs.728927 NM_152606 ENSG00000171817 ZNF540 Nbla10512 zinc finger protein 540 protein-coding 214.75-42 chr2 176217043 176217377 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28252 NR_033979 401022 Hs.98661 NR_033979 ENSG00000224189 HAGLR HOXD-AS1|MIR7704HG|Mdgt HOXD antisense growth-associated long non-coding RNA ncRNA 235.5-47 chr2 66466663 66466906 + 1.25 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -26454 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 245.25-44 chr2 202393148 202393379 + 1.25 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) intron (NM_001204, intron 1 of 12) 16936 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 258.75-50 chr3 83127255 83127562 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 1141266 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 266.5-6 chr10 10157438 10157780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 98887 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 336.5-8 chr12 23420204 23420801 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 164084 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 246.25-72 chr9 83173137 83173392 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 94004 NM_001244962 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 177-38 chr18 39983681 39983875 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -82508 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 140.25-13 chr1 189788621 189788827 + 1.25 NA Intergenic Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 687286 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 172.5-19 chr1 191797800 191798045 + 1.25 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -360540 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 162-19 chr10 119594573 119594815 + 1.25 NA intron (NM_001323970, intron 1 of 12) AluSc|SINE|Alu 2335 NM_001323969 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 299.25-33 chr3 18745067 18745549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -299716 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 189.25-102 chr6 35090895 35091068 + 1.25 NA 3' UTR (NM_015245, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_015245, exon 24 of 24) 50358 NM_001366325 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 151.5-62 chr16 57787312 57787494 + 1.25 NA intron (NM_001318711, intron 2 of 19) intron (NM_001318711, intron 2 of 19) -5034 NM_001318713 3801 Hs.23131 NM_005550 ENSG00000140859 KIFC3 - kinesin family member C3 protein-coding 120.5-152 chr3 178612014 178612258 + 1.25 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) L1MA1|LINE|L1 53286 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 153.25-19 chr10 106240942 106241198 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 100905 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 256-71 chr8 118740169 118740551 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -118397 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 172.75-72 chr21 24001298 24001464 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 319996 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 222.75-46 chr16 23829613 23829994 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -6180 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 339.5-32 chr7 108429334 108429779 + 1.25 NA intron (NM_001371132, intron 1 of 30) intron (NM_001371132, intron 1 of 30) 26841 NM_001193583 4897 Hs.21422 NM_005010 ENSG00000091129 NRCAM - neuronal cell adhesion molecule protein-coding 140.5-170 chr4 124592546 124592688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34183 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 149.25-161 chr6 155681772 155681920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 167002 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 343.75-12 chr3 168318371 168318840 + 1.25 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) AluSq4|SINE|Alu 69083 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 174.25-26 chr11 84192806 84192986 + 1.25 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 80384 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 159.75-84 chr2 113758429 113758601 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1873 NM_001330316 80255 Hs.355655 NM_025181 ENSG00000115084 SLC35F5 - solute carrier family 35 member F5 protein-coding 173.25-90 chr4 102980743 102980945 + 1.25 NA intron (NR_047513, intron 3 of 10) L1MC1|LINE|L1 38861 NR_047513 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 201-72 chr7 117131519 117131764 + 1.25 NA intron (NR_002331, intron 2 of 5) intron (NR_002331, intron 2 of 5) 13951 NR_002331 93654 Hs.628891 NR_002331 ENSG00000226367 ST7-AS2 ST7AS2|ST7OT2 ST7 antisense RNA 2 ncRNA 251.75-43 chr20 46431861 46432226 + 1.25 NA intron (NR_146919, intron 2 of 3) L1MEj|LINE|L1 -24992 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 231-3 chr1 96384718 96385059 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -10763 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 317.25-14 chr15 95599496 95599866 + 1.25 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 166588 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 200-67 chr4 111920794 111921060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224527 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 183.25-69 chr22 43645936 43646124 + 1.25 NA intron (NM_198856, intron 15 of 29) intron (NM_198856, intron 15 of 29) 129776 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 144.5-180 chr5 132934436 132934590 + 1.25 NA exon (NM_014423, exon 3 of 21) exon (NM_014423, exon 3 of 21) 29121 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 123.25-103 chr2 78601771 78601978 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 56343 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 238-61 chr6 48910739 48910929 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 552419 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 517.25 chr17 67721308 67721923 + 1.25 NA intron (NM_001303272, intron 4 of 16) intron (NM_001303272, intron 4 of 16) 3679 NM_015462 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 291.5-26 chr20 53153170 53153621 + 1.25 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -31888 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 177.75-78 chr2 161828753 161829026 + 1.25 NA intron (NM_001354443, intron 4 of 25) intron (NM_001354443, intron 4 of 25) 204473 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 163.5-65 chr16 20347448 20347623 + 1.25 NA intron (NM_001008389, intron 4 of 10) intron (NM_001008389, intron 4 of 10) 5180 NM_001278614 7369 Hs.654425 NM_003361 ENSG00000169344 UMOD ADMCKD2|FJHN|HNFJ|HNFJ1|MCKD2|THGP|THP uromodulin protein-coding 241.75-21 chr13 43098888 43099193 + 1.25 NA intron (NM_013238, intron 5 of 5) L1M4b|LINE|L1 -14125 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 248.25-27 chr16 65395888 65396134 + 1.25 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 180289 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 170.75-21 chr11 104062902 104063065 + 1.25 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 26343 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 389-5 chr14 47489231 47489795 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -146267 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 206.75-75 chr6 10476232 10476460 + 1.25 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 36629 NR_049872 100846998 NR_049872 ENSG00000263705 MIR5689 - microRNA 5689 ncRNA 199.75-49 chr2 125053364 125053648 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1028219 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 169.5-35 chr12 47278209 47278409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29090 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 194.5-6 chr1 172512475 172512762 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19731 NM_016227 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 184.25-7 chr1 152009381 152009613 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -8781 NR_103561 441908 Hs.656557 NR_103561 NBPF18P - NBPF member 18, pseudogene pseudo 317-17 chr20 38942569 38942842 + 1.25 NA intron (NM_030919, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 16288 NM_030919 81610 Hs.726442 NM_030919 ENSG00000101447 FAM83D C20orf129|CHICA|dJ616B8.3 family with sequence similarity 83 member D protein-coding 233.5-63 chr20 53661098 53661301 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52845 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 233-33 chr2 116669604 116669816 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -1144981 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 324.75-24 chr5 55980119 55980398 + 1.25 NA intron (NR_157112, intron 2 of 17) intron (NR_157112, intron 2 of 17) 14705 NR_157112 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 137.5-112 chr2 37297957 37298084 + 1.25 NA intron (NM_005813, intron 1 of 17) L1MC3|LINE|L1 19064 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 198-36 chr18 69427978 69428229 + 1.25 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 27215 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 242-44 chr5 36526218 36526449 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -80022 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 277.25-38 chr5 77889332 77889801 + 1.25 NA intron (NR_105012, intron 1 of 1) intron (NR_105012, intron 1 of 1) 4910 NR_105012 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 216-58 chr3 179586575 179586814 + 1.25 NA intron (NM_004301, intron 13 of 13) intron (NM_004301, intron 13 of 13) 17944 NM_020409 57129 Hs.283734 NM_020409 ENSG00000136522 MRPL47 CGI-204|L47mt|MRP-L47|NCM1 mitochondrial ribosomal protein L47 protein-coding 203.5-67 chr2 41529979 41530192 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -347470 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 222.25-11 chr11 35731814 35732114 + 1.25 NA intron (NM_017583, intron 3 of 4) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 69189 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 300.25-11 chr16 26565063 26565423 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -501684 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 262.5-6 chr1 118252402 118252736 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67341 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 318.25-14 chr6 73020191 73020794 + 1.25 NA intron (NM_001160132, intron 2 of 13) MER21B|LTR|ERVL -52739 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 236.5-27 chr14 63920039 63920443 + 1.25 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) L2c|LINE|L2 67237 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 202.5-107 chr4 132768233 132768426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 177240 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 195.75-14 chr1 223878312 223878616 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -32492 NM_005426 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 181.5-145 chr7 7165399 7165743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17044 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 121-46 chr11 134245163 134245346 + 1.25 NA intron (NM_052875, intron 5 of 5) intron (NM_052875, intron 5 of 5) 8098 NM_199297 29087 Hs.13645 NM_014174 ENSG00000151500 THYN1 HSPC144|MDS012|MY105|THY28|THY28KD thymocyte nuclear protein 1 protein-coding 336.5-24 chr5 74288348 74288728 + 1.25 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 19787 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 136.25-91 chr2 18047026 18047239 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168465 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 292-13 chr12 119448715 119448983 + 1.25 NA intron (NM_178499, intron 2 of 13) intron (NM_178499, intron 2 of 13) 114120 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 179.25-84 chr2 212984784 212985036 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -58574 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 168.5-183 chr8 88415367 88415601 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88001 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 217.25-55 chr3 99000104 99000550 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -98632 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 215.25-91 chr6 2062265 2062558 + 1.25 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) intron (NM_001253846, intron 4 of 10) 113580 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 245.25-51 chr4 17018266 17018637 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -119642 NM_001304435 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 230.5-14 chr10 50605932 50606470 + 1.25 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 17755 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 223-82 chr8 118747699 118748058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125915 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 240.75-62 chr5 39794026 39794392 + 1.25 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -258082 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 279.5-4 chr1 166519158 166519421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29250 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 289-6 chr10 59428021 59428309 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64984 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 270-24 chr2 51564629 51564859 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1MEc|LINE|L1 532143 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 369.5-11 chr16 63782388 63783013 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1339363 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 211.5-3 chr1 80794020 80794330 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 152888 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 154-129 chr8 124351641 124351774 + 1.25 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 20992 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 221.75-91 chrX 74480786 74481040 + 1.25 NA intron (NM_006517, intron 1 of 5) L1MB8|LINE|L1 59420 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 116.5-65 chr14 38456653 38456797 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -200632 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 265.75-63 chr6 113823024 113823414 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34126 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 252-16 chr12 782006 782253 + 1.25 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) intron (NM_001184985, intron 1 of 27) 29206 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 222.5-106 chr8 78977639 78977961 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 140271 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 322-10 chr15 77276818 77277228 + 1.25 NA intron (NM_024776, intron 3 of 7) L1MDa|LINE|L1 -51619 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 203.75-118 chr9 13563845 13564105 + 1.25 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -132646 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 243.25-11 chr14 53105142 53105411 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) L1MC5a|LINE|L1 48047 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 452.75-4 chr5 174288926 174289365 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -47209 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 320.25-23 chr6 148788790 148789173 + 1.25 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 41951 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 236.25-35 chr17 34176789 34177127 + 1.25 NA intron (NR_110748, intron 4 of 5) intron (NR_110748, intron 4 of 5) 6674 NR_110748 101927239 Hs.603592 NR_110748 ENSG00000261156 LINC01989 - long intergenic non-protein coding RNA 1989 ncRNA 230.25-78 chr8 81525943 81526266 + 1.25 NA intron (NR_144370, intron 3 of 3) intron (NR_144370, intron 3 of 3) 5286 NR_144370 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 201.75-93 chr7 38949815 38949994 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -28005 NM_001370959 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 181.5-165 chr9 33016332 33016603 + 1.25 NA intron (NM_001368996, intron 1 of 7) intron (NM_001368996, intron 1 of 7) 8653 NR_160926 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 247.75-15 chr14 56638204 56638538 + 1.25 NA intron (NM_017799, intron 15 of 15) MIR3|SINE|MIR 58573 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 401.25-12 chr6 56670959 56671509 + 1.25 NA intron (NM_001144770, intron 6 of 94) intron (NM_001144770, intron 6 of 94) -28345 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 219.25-77 chr8 69079045 69079283 + 1.25 NA intron (NR_039986, intron 1 of 4) intron (NR_039986, intron 1 of 4) 25026 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 198-4 chr1 79277871 79278170 + 1.25 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -271290 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 175-31 chr12 27335291 27335494 + 1.25 NA intron (NM_001248003, intron 1 of 14) intron (NM_001248003, intron 1 of 14) 2556 NM_001248003 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 217.25-91 chrX 21832944 21833379 + 1.25 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -6456 NM_015884 51360 Hs.443490 NM_015884 ENSG00000012174 MBTPS2 BRESEK|IFAP|KFSD|KFSDX|OI19|OLMSX|S2P membrane bound transcription factor peptidase, site 2 protein-coding 239.5-81 chr8 117907287 117907506 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 13517 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 228.25-24 chr14 45016769 45017177 + 1.25 NA intron (NM_001308120, intron 7 of 19) intron (NM_001308120, intron 7 of 19) 54783 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 206.75-18 chr12 42769188 42769421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77088 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 298-17 chr21 29439512 29439981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -56301 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 212.25-6 chr1 197603757 197603947 + 1.25 NA intron (NR_125340, intron 12 of 19) intron (NR_125340, intron 12 of 19) 171628 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 212.75-34 chr14 67788659 67789153 + 1.25 NA intron (NM_015346, intron 16 of 41) intron (NM_015346, intron 16 of 41) 27684 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 477.75-3 chr15 24084389 24085104 + 1.25 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 85202 NR_152824 791115 Hs.560378 NR_026647 ENSG00000260551 PWRN2 NCRNA00199 Prader-Willi region non-protein coding RNA 2 ncRNA 233-35 chr2 124384021 124384345 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) L1M4|LINE|L1 358896 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 194-50 chr20 11908125 11908290 + 1.25 NA intron (NM_001282550, intron 1 of 4) intron (NM_001282550, intron 1 of 4) -9658 NM_001282551 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 273.25-10 chr11 84788495 84788826 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -67718 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 222.5-3 chr1 49597002 49597284 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) intron (NR_136623, intron 2 of 12) -125058 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 190.5-155 chr8 41265509 41265708 + 1.25 NA intron (NM_003012, intron 2 of 2) intron (NM_003012, intron 2 of 2) 5535 NR_049801 100847068 NR_049801 ENSG00000263372 MIR548AO - microRNA 548ao ncRNA 223-44 chr2 157620298 157620583 + 1.25 NA intron (NM_145259, intron 1 of 8) intron (NM_145259, intron 1 of 8) 8424 NM_145259 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 128.75-182 chr7 48127657 48127765 + 1.25 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 38446 NM_003364 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 285.75-34 chr4 75018879 75019349 + 1.25 NA intron (NM_015393, intron 2 of 3) intron (NM_015393, intron 2 of 3) -48752 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 372.5-3 chr10 56305278 56305743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 55749 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 270.75-14 chr14 54179641 54180034 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -217031 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 336.5-18 chr3 94137378 94137697 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74476 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 271.25-39 chr7 24169549 24170013 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -114409 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 238.75-13 chr12 41327043 41327425 + 1.25 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -110505 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 253.5-3 chr1 85731599 85732092 + 1.25 NA intron (NM_152890, intron 59 of 59) L2c|LINE|L2 -23412 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 226-48 chr4 90239255 90239506 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) intron (NM_207491, intron 1 of 7) 4349 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 209.5-39 chr14 26159122 26159455 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 394142 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 225.75-3 chr1 78880866 78881220 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 125687 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 216-70 chr6 42532324 42532520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31600 NM_001363705 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 209.5-103 chr4 66677816 66678058 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 401113 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 260.75-23 chr2 12617656 12617993 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99048 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 219.25-62 chr5 96700515 96700739 + 1.25 NA intron (NM_001330629, intron 3 of 30) intron (NM_001330629, intron 3 of 30) -2033 NM_001042443 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 152.5-121 chr3 108312548 108312765 + 1.25 NA intron (NM_001282557, intron 1 of 9) LTR16A1|LTR|ERVL 871 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 113-169 chr7 112891311 112891497 + 1.25 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) intron (NM_152556, intron 3 of 4) 48471 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 214.75-2 chr1 77673479 77673668 + 1.25 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 9085 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 137.5-2 chr1 15438949 15439113 + 1.25 NA intron (NM_007272, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 588 NM_007272 11330 Hs.631869 NM_007272 ENSG00000162438 CTRC CLCR|ELA4 chymotrypsin C protein-coding 142.5-53 chr12 114199656 114199811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42037 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 199.25-97 chr8 84564449 84564662 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 -141372 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 198.5-14 chr10 32376860 32377028 + 1.25 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) intron (NM_001282391, intron 1 of 13) 1825 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 301-28 chr7 107031276 107031702 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13216 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 235.5-62 chr5 9468705 9469198 + 1.25 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -42382 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 188.75-59 chr2 128077985 128078154 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13131 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 207.25-68 chr4 121816904 121817100 + 1.25 NA TTS (NM_001034194) TTS (NM_001034194) 6881 NM_001237 890 Hs.58974 NM_001237 ENSG00000145386 CCNA2 CCN1|CCNA cyclin A2 protein-coding 183-84 chr4 65113364 65113686 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -109025 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 189.5-137 chr7 92504418 92504658 + 1.25 NA intron (NM_001282677, intron 11 of 22) intron (NM_001282677, intron 11 of 22) 23982 NM_000466 5189 Hs.164682 NM_000466 ENSG00000127980 PEX1 HMLR1|PBD1A|PBD1B|ZWS|ZWS1 peroxisomal biogenesis factor 1 protein-coding 139.75-130 chr4 31679811 31680014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173368 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 281.25-15 chr14 20137964 20138289 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5610 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 265.5-8 chr10 63751767 63752004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -229995 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 196.75-85 chr5 13693411 13693770 + 1.25 NA intron (NM_001369, intron 78 of 78) MER20|DNA|hAT-Charlie 250890 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 208.5-71 chr2 59281924 59282169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64338 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 360.75 chr1 163176837 163177350 + 1.25 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) LTR82A|LTR|ERVL 15418 NR_110699 101928404 Hs.683933 NR_110699 ENSG00000232892 LOC101928404 - uncharacterized LOC101928404 ncRNA 152.75-117 chr3 192722163 192722299 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 5310 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 267.75-26 chr2 34446953 34447270 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -230446 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 226.25-19 chr11 84590589 84590848 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 130224 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 303.5-23 chr2 114757825 114758449 + 1.25 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 75411 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 315-15 chr2 212956582 212956927 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30418 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 196-37 chr16 79414870 79415048 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 185778 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 235-28 chr16 54466078 54466279 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95479 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 223-73 chr6 123329856 123330081 + 1.25 NA intron (NM_006073, intron 23 of 40) intron (NM_006073, intron 23 of 40) -109636 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 379.75-11 chr8 75586308 75586902 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46637 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 307-14 chr16 75204428 75204826 + 1.25 NA intron (NM_001025200, intron 6 of 6) intron (NM_001025200, intron 6 of 6) 2534 NM_001025200 440387 Hs.610926 NM_001025200 ENSG00000168928 CTRB2 - chymotrypsinogen B2 protein-coding 306-4 chr11 90487353 90488071 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 68145 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 251.75-13 chr11 32782513 32782993 + 1.25 NA intron (NM_001008391, intron 1 of 17) HAL1|LINE|L1 11905 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 248.25-52 chr4 181508662 181508977 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -243790 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 312.75-6 chr12 70328985 70329319 + 1.25 NA intron (NM_001199302, intron 5 of 16) intron (NM_001199302, intron 5 of 16) -37138 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 132.75-130 chr3 183948357 183948502 + 1.25 NA intron (NM_001320032, intron 22 of 29) intron (NM_001320032, intron 22 of 29) -57909 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 308-25 chr5 12615063 12615468 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) MLT1F2-int|LTR|ERVL-MaLR 40408 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 218.25-54 chr3 88967798 88968132 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -139656 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 409-3 chr14 56964585 56965302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 151785 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 167.5-185 chr8 117915514 117915906 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) AluSz6|SINE|Alu 5203 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 208.5-126 chr7 16212483 16212783 + 1.25 NA intron (NR_038946, intron 1 of 4) intron (NR_038946, intron 1 of 4) 2147 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 120.5-233 chr8 126273087 126273279 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -52312 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 224.5-12 chr10 23253151 23253444 + 1.25 NA intron (NM_001365862, intron 10 of 15) L2|LINE|L2 60985 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 161.5-42 chr12 40753176 40753409 + 1.25 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) intron (NM_001256063, intron 1 of 15) 60850 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 281-6 chr10 107043620 107043993 + 1.25 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 120900 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 139-76 chr2 78222308 78222420 + 1.25 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 68367 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 343.25-6 chr14 59196817 59197116 + 1.25 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) AluY|SINE|Alu 8299 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 268.75-35 chr5 14816226 14816487 + 1.25 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 9656 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 191.25-90 chr6 61223792 61224065 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -350202 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 147.5-201 chr7 93637613 93637836 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -62994 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 146.75-84 chr2 193599866 193600058 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -744307 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 168.5-165 chr7 15672779 15673047 + 1.25 NA intron (NR_134258, intron 1 of 3) AluSc8|SINE|Alu 4966 NR_134258 105375166 Hs.658822 NR_134258 ENSG00000237070 LOC105375166 - uncharacterized LOC105375166 ncRNA 337.25-8 chr17 65811194 65811534 + 1.25 NA intron (NR_126542, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 15087 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 228-55 chr4 30666169 30666536 + 1.25 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -54017 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 368.75-8 chr3 101065659 101066123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72401 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 407-3 chr10 70071830 70072545 + 1.25 NA intron (NM_018649, intron 1 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 19341 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 236.5-40 chr18 3764418 3764706 + 1.25 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) L3|LINE|CR1 80796 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 169.75-98 chr22 25783143 25783310 + 1.25 NA intron (NM_001318245, intron 10 of 43) MIRb|SINE|MIR 41038 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 201.75-107 chr9 34265186 34265488 + 1.25 NA intron (NM_194313, intron 8 of 12) AluJr|SINE|Alu 63931 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 225.75-61 chr5 13126433 13126790 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -93725 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 218.75-47 chr21 17848351 17848570 + 1.25 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -29104 NM_001100420 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 142-15 chr10 26290326 26290677 + 1.25 NA intron (NM_000818, intron 13 of 16) intron (NM_000818, intron 13 of 16) 73727 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 212.75-107 chrX 121048031 121048497 + 1.25 NA exon (NM_012084, exon 1 of 1) exon (NM_012084, exon 1 of 1) 654 NM_012084 2747 Hs.368538 NM_012084 ENSG00000182890 GLUD2 GDH2|GLUDP1 glutamate dehydrogenase 2 protein-coding 164.5-218 chr8 142513194 142513360 + 1.25 NA intron (NM_001702, intron 18 of 30) intron (NM_001702, intron 18 of 30) 63628 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 191.5-65 chr18 13340494 13340669 + 1.25 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 62476 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 317.75-2 chr1 114264196 114264654 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -110556 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 248.5-10 chr10 69273875 69274226 + 1.25 NA intron (NM_001322365, intron 2 of 22) L1MEg|LINE|L1 4050 NM_001322364 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 168.25-101 chr3 107032056 107032336 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 208442 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 126.75-54 chr14 48889089 48889201 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 697235 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 258-39 chr3 194373499 194373816 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -3914 NM_001135057 131578 Hs.288467 NM_130830 ENSG00000172061 LRRC15 LIB leucine rich repeat containing 15 protein-coding 247.5-78 chr7 47800842 47801173 + 1.25 NA intron (NM_138295, intron 53 of 56) intron (NM_138295, intron 53 of 56) 5716 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 304-14 chr13 52801003 52801346 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -8876 NR_031582 100313778 NR_031582 ENSG00000211579 MIR759 hsa-mir-759 microRNA 759 ncRNA 288.5-4 chr10 44605096 44605590 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -220246 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 146-134 chr9 30847822 30848065 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -439489 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 283.75-25 chr4 64296232 64296526 + 1.25 NA intron (NM_001363796, intron 8 of 11) intron (NM_001363796, intron 8 of 11) 113071 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 245.25-73 chr8 131399561 131399802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -358772 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 219.5-59 chr2 6947642 6948050 + 1.25 NA intron (NM_001349186, intron 2 of 7) MIR1_Amn|SINE|MIR 14762 NM_001349183 9781 Hs.22146 NM_014746 ENSG00000151692 RNF144A RNF144|UBCE7IP4|hUIP4 ring finger protein 144A protein-coding 135.5-99 chr2 60729975 60730144 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26209 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 134-56 chr14 69704307 69704438 + 1.25 NA intron (NM_014734, intron 3 of 5) intron (NM_014734, intron 3 of 5) -62770 NM_001039465 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 278.5-5 chr1 168655742 168656031 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73320 NM_001937 1805 Hs.80552 NM_001937 ENSG00000143196 DPT TRAMP dermatopontin protein-coding 199.5-105 chr3 132711041 132711294 + 1.25 NA intron (NR_037804, intron 6 of 44) intron (NR_037804, intron 6 of 44) -10583 NR_152743 348808 Hs.586111 NR_002811 ENSG00000248724 NPHP3-AS1 NCRNA00119 NPHP3 antisense RNA 1 ncRNA 138.25-107 chr22 33812396 33812559 + 1.25 NA intron (NM_001362953, intron 1 of 14) intron (NM_001362953, intron 1 of 14) 87491 NR_038949 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 271.25-30 chr20 10652049 10652277 + 1.25 NA exon (NM_000214, exon 7 of 26) exon (NM_000214, exon 7 of 26) -2468 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 163.25-28 chr11 131334716 131334964 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35775 NM_001352005 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 224-22 chr16 62321913 62322123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -285580 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 231-85 chrX 69150989 69151189 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 14364 NM_145119 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 178.75-102 chr8 12788748 12788914 + 1.25 NA intron (NR_152742, intron 1 of 4) intron (NR_152742, intron 1 of 4) -5409 NR_102423 101409254 Hs.571476 NR_102423 ENSG00000255494 LINC00681 - long intergenic non-protein coding RNA 681 ncRNA 117.5-103 chr2 60826338 60826440 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54925 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 183-24 chr14 47336175 47336490 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 6914 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 282.75-20 chr2 171279603 171279883 + 1.25 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -48450 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 272-37 chr7 53065281 53065650 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29832 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 339-18 chr2 134249290 134249738 + 1.25 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) L1MB8|LINE|L1 -4558 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 250.75-52 chr4 116869418 116869695 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 216020 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 250-56 chr7 89861288 89861581 + 1.25 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -257966 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 140.75-178 chr8 82180426 82180598 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -338226 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 336.75-13 chr2 195282001 195282323 + 1.25 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -374796 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 151-5 chr1 80203566 80203694 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -332125 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 173.5-64 chr2 46868931 46869098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41150 NR_024452 100134259 Hs.114449 NR_024452 ENSG00000239332 LINC01119 - long intergenic non-protein coding RNA 1119 ncRNA 297.5-8 chr10 84037397 84037773 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101924 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 211.25-54 chr22 45077808 45078020 + 1.25 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -67909 NM_138415 112885 Hs.254097 NM_138415 ENSG00000056487 PHF21B BHC80L|PHF4 PHD finger protein 21B protein-coding 293.25-36 chr8 78377043 78377315 + 1.25 NA Intergenic LTR18B|LTR|ERVL -139161 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 335.75-4 chr1 163660674 163661113 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -237702 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 297.5-33 chr21 16117024 16117645 + 1.25 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) intron (NR_111005, intron 1 of 6) 46220 NR_111005 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 236.25-32 chr16 7333202 7333533 + 1.25 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 522 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 201-20 chr12 832351 832549 + 1.25 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) intron (NM_001184985, intron 4 of 27) 79527 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 177.5-187 chrX 139711721 139712022 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3649 NM_001099855 4168 Hs.387262 NM_005369 ENSG00000101977 MCF2 ARHGEF21|DBL MCF.2 cell line derived transforming sequence protein-coding 154.75-147 chr8 131671259 131671449 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -232739 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 325.25-8 chr2 12021494 12021907 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) 14584 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 154.5-102 chr2 122504740 122505002 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 568610 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 313.75-19 chr6 44099714 44100225 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25317 NR_125864 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 318.5-30 chr3 194289661 194290020 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 22964 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 286.25-9 chr13 92737407 92737905 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -16042 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 217.5-49 chr16 79031906 79032128 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 568720 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 177.5-104 chr21 20746017 20746184 + 1.25 NA intron (NR_109787, intron 6 of 6) intron (NR_109787, intron 6 of 6) 57008 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 258-24 chr2 133394309 133394731 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 128325 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 254.5-55 chr4 23654996 23655304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 226142 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 215.25-75 chr5 15037745 15038150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166169 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 296.25-3 chr11 10441165 10441614 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8932 NM_001172431 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 150.75-126 chr3 36172399 36172754 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -207911 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 274-29 chr3 183385497 183385838 + 1.25 NA intron (NM_015078, intron 2 of 29) intron (NM_015078, intron 2 of 29) 42602 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 143.25-78 chr19 37025564 37025682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52599 NM_001329520 147923 Hs.444992 NM_144689 ENSG00000197050 ZNF420 APAK zinc finger protein 420 protein-coding 246-66 chr8 125634000 125634227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 201904 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 200.5-79 chr21 26825423 26825713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19841 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 265.75-25 chr17 67764118 67764453 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 23615 NR_003706 100124536 Hs.693446 NR_003706 ENSG00000200394 SNORA38B - small nucleolar RNA, H/ACA box 38B snoRNA 183.75-101 chr5 129516458 129516702 + 1.25 NA intron (NM_133638, intron 3 of 22) L1MA1|LINE|L1 -55891 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-180 chr7 11382231 11382359 + 1.25 NA intron (NM_015204, intron 23 of 26) intron (NM_015204, intron 23 of 26) 408423 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 140.5-107 chr2 50284796 50285007 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MER6|DNA|TcMar-Tigger 62853 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 195-5 chr1 186202892 186203081 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93287 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 216.25-89 chr6 5232481 5232768 + 1.25 NA intron (NM_020408, intron 1 of 2) intron (NM_020408, intron 1 of 2) 28326 NR_104417 57128 Hs.387755 NM_020408 ENSG00000214113 LYRM4 C6orf149|CGI-203|COXPD19|ISD11 LYR motif containing 4 protein-coding 356.25-16 chr7 16033576 16034097 + 1.25 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -176650 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 142-16 chr10 51166404 51166614 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 92022 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 207.25-67 chr4 101832121 101832349 + 1.25 NA intron (NM_017935, intron 2 of 16) L1M7|LINE|L1 18393 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 211.25-32 chr16 62377679 62377959 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -341381 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 197.25-90 chr6 127415325 127415649 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43902 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 250.5-30 chr15 26605365 26605879 + 1.25 NA intron (NM_001191320, intron 2 of 6) L1MA2|LINE|L1 23468 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 193.75-99 chr5 46234812 46235068 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -538560 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 334-28 chr5 119425860 119426315 + 1.25 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -26410 NM_001199291 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 264.5-68 chrX 75883841 75884247 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -98790 NM_138703 139599 Hs.356869 NM_138703 ENSG00000186675 MAGEE2 HCA3 MAGE family member E2 protein-coding 290.75-46 chr6 131214340 131214749 + 1.25 NA intron (NM_016377, intron 6 of 7) intron (NM_016377, intron 6 of 7) -35860 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 134-54 chr14 61744174 61744322 + 1.25 NA intron (NM_181054, intron 12 of 13) intron (NM_181054, intron 12 of 13) 4841 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 118.75-154 chr5 85992463 85992584 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -289921 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 169.25-8 chr1 235776415 235776644 + 1.25 NA intron (NM_000081, intron 17 of 52) intron (NM_000081, intron 17 of 52) 76531 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 113-162 chr6 106495067 106495221 + 1.25 NA intron (NM_001371242, intron 2 of 21) intron (NM_001371242, intron 2 of 21) -16711 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 245.75-51 chr5 162116845 162117095 + 1.25 NA intron (NM_198904, intron 6 of 9) intron (NM_198904, intron 6 of 9) 49328 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 258.75-15 chr11 80829222 80829549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66582 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 313.5-9 chr14 35198456 35198876 + 1.25 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) intron (NM_014672, intron 5 of 7) 76114 NM_001256681 9692 Hs.458487 NM_014672 ENSG00000100890 PRORP KIAA0391|MRPP3 protein only RNase P catalytic subunit protein-coding 170.25-7 chr1 191285610 191285819 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -57216 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 119-191 chr8 32933387 32933517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 211617 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 145.25-57 chr18 2623524 2623888 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 31689 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 124.5-164 chr5 55363194 55363415 + 1.25 NA intron (NM_015360, intron 15 of 26) intron (NM_015360, intron 15 of 26) 55315 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 220.5-101 chr5 106659145 106659360 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 351762 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 175.5-136 chr5 61000290 61000522 + 1.25 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) 55201 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 421.5-10 chr4 86897340 86898081 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5288 NM_001369888 132989 Hs.339646 NM_144645 ENSG00000163633 C4orf36 - chromosome 4 open reading frame 36 protein-coding 258.5-71 chr8 113562936 113563569 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126313 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 182.25-41 chr15 44165006 44165203 + 1.25 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 29342 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 233-63 chr8 125915173 125915440 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 35891 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 142.75-170 chr6 135915102 135915416 + 1.25 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 63558 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 334.25 chr1 44393454 44394079 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -11394 NM_001319956 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 162.25-140 chr6 52996450 52996722 + 1.25 NA TTS (NR_001445) TTS (NR_001445) 966 NR_001445 125050 NR_001445 ENSG00000202198 RN7SK 7SK RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein snRNA 139.75-46 chr14 47601422 47601611 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 73438 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 268-3 chr1 49713283 49713598 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -241355 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 234.5-54 chr2 200942450 200942758 + 1.25 NA intron (NR_033915, intron 6 of 16) intron (NR_033915, intron 6 of 16) 21056 NR_033915 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 147.25-116 chr6 18166054 18166290 + 1.25 NA intron (NM_001364614, intron 5 of 21) intron (NM_001364614, intron 5 of 21) 10750 NM_153042 221656 Hs.709336 NM_153042 ENSG00000165097 KDM1B AOF1|C6orf193|LSD2 lysine demethylase 1B protein-coding 190.75-91 chr6 2321096 2321383 + 1.25 NA intron (NR_046229, intron 3 of 6) intron (NR_046229, intron 3 of 6) 75486 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 193-19 chr14 42599112 42599326 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 992363 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 275.25-51 chr9 35441781 35442139 + 1.25 NA intron (NR_003581, intron 6 of 17) intron (NR_003581, intron 6 of 17) 35205 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 258.25-47 chr5 133204696 133205072 + 1.25 NA intron (NM_015082, intron 14 of 15) L1M5|LINE|L1 152871 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 308-27 chr5 136510811 136511113 + 1.25 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 -145486 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 293-21 chr3 82488163 82488620 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 502249 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 176.75-127 chr8 127459542 127459803 + 1.25 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) L1M8|LINE|L1 22467 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 328.75-11 chr22 24082147 24082673 + 1.25 NA intron (NM_012295, intron 19 of 36) intron (NM_012295, intron 19 of 36) 71040 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 179.5-134 chr4 57986871 57987234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 549276 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 193.25-11 chr10 43737844 43738014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40896 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 162-15 chr10 73300174 73300339 + 1.25 NA intron (NM_001367801, intron 13 of 27) intron (NM_001367801, intron 13 of 27) 47515 NR_134459 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 155.75-38 chr12 26746952 26747146 + 1.25 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) intron (NM_002223, intron 2 of 56) 86145 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 486.25-2 chr18 2529013 2529673 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42162 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 240.5-83 chr5 9456204 9456569 + 1.25 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -54947 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 139.5-103 chr2 133133668 133133856 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) MIRc|SINE|MIR -132433 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 121-44 chr11 86350809 86350963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23850 NM_021827 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 279.75-35 chr3 185263425 185263752 + 1.25 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -9539 NM_001966 1962 Hs.429879 NM_001966 ENSG00000113790 EHHADH ECHD|FRTS3|L-PBE|LBFP|LBP|PBFE enoyl-CoA hydratase and 3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase protein-coding 197.5-124 chr5 85989132 85989351 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -293203 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 269.25-44 chr5 158991342 158991655 + 1.25 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 106458 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 288.25-14 chr2 192078424 192078705 + 1.25 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 116369 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 154-28 chr11 55096863 55097091 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -165178 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 167.5-145 chr5 60428973 60429128 + 1.25 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) -56387 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 265.75-30 chr2 15087491 15087769 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 454913 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 132-23 chr10 118661518 118661748 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -65985 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 296.75-28 chr5 35968372 35968810 + 1.25 NA intron (NM_001171873, intron 3 of 5) intron (NM_001171873, intron 3 of 5) 22799 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 199.5-97 chr21 32077708 32077949 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 8467 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 207.25-49 chr2 195821479 195821710 + 1.25 NA intron (NM_018897, intron 49 of 64) LTR47A|LTR|ERVL 164368 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 206.5-81 chr4 74224663 74225039 + 1.25 NA intron (NM_001144978, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 66733 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 283.5-22 chr19 32008144 32008590 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17495 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 362.5-7 chr14 75379977 75380285 + 1.25 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -47593 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 116.5-240 chr8 22531752 22531847 + 1.25 NA intron (NM_001243974, intron 11 of 14) intron (NM_001243974, intron 11 of 14) -20128 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 202.25-32 chr18 5548014 5548250 + 1.25 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) intron (NM_001281535, intron 3 of 21) -3793 NM_001330557 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 302.75-28 chr7 62771243 62771513 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 532678 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 286-7 chr11 98758800 98759116 + 1.25 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -261991 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 318.5-23 chr2 220432533 220432792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -526097 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 257.5-46 chr3 31131987 31132271 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29658 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 163-125 chr9 30673272 30673484 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -264924 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 304.5-29 chr5 100887542 100887979 + 1.25 NA intron (NM_005668, intron 2 of 4) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 15522 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 186.25-89 chr5 62405629 62405903 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1861 NM_001348076 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 121.5-49 chr11 100181848 100181962 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) L1ME1|LINE|L1 -505383 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 358.5-12 chr2 50998661 50999195 + 1.25 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 33204 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 256.25-5 chr10 83216058 83216270 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 460925 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 134-141 chr5 33320332 33320478 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 90670 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 382.5-12 chr2 189913632 189914055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129393 NM_001321049 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 253.25-2 chr1 84046693 84046975 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -31141 NM_002731 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 176.75-57 chr2 13480271 13480502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -473373 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 299-36 chr9 28126673 28126995 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -552968 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 248.25-39 chr2 226357053 226357304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 214384 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 287.5-9 chr10 117055295 117055571 + 1.25 NA intron (NM_001258300, intron 1 of 17) L1MB5|LINE|L1 -49856 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 176.5-101 chr2 175826621 175826826 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 175544 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 224.25-92 chr7 22848561 22848750 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -5585 NR_146320 109729180 Hs.553139 NR_146320 SNHG26 - small nucleolar RNA host gene 26 ncRNA 198.75-2 chr1 42973705 42973914 + 1.25 NA intron (NR_033967, intron 2 of 3) intron (NR_033967, intron 2 of 3) 14760 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 196.75-7 chr1 110860737 110861163 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -10249 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 163.5-164 chr5 92189885 92190149 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -806700 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 189.25-66 chr20 42012865 42013233 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -394672 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 188.25-53 chr18 1973610 1973898 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 597751 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 144.5-229 chr8 133510080 133510324 + 1.25 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) intron (NM_003033, intron 2 of 8) 61685 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 317.75-17 chr17 61977043 61977441 + 1.25 NA intron (NM_005121, intron 16 of 29) L2a|LINE|L2 -49260 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 147.5-92 chr2 21595502 21595786 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 115008 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 113.25-183 chr9 8870459 8870569 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) intron (NM_002839, intron 11 of 45) 12496 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 156-166 chr9 94072305 94072577 + 1.25 NA intron (NM_177995, intron 2 of 9) L1MC4|LINE|L1 -11988 NM_152422 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 195.5-16 chr10 85369286 85369549 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 63355 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 357.5-11 chr2 16508115 16508538 + 1.25 NA Intergenic CpG 157508 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 172.5-71 chr14 85251486 85251731 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20324 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 176.75-114 chr7 71030917 71031164 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -101104 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 226.75-7 chr10 60563339 60563597 + 1.25 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 9488 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 266.25-48 chr8 89270833 89271095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 486747 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 188.25-95 chr5 111136055 111136507 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44109 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 309.25-25 chr5 109186665 109187050 + 1.25 NA intron (NR_146155, intron 19 of 19) intron (NR_146155, intron 19 of 19) 139512 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 193.75-47 chr14 75420985 75421224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6620 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 131.5-199 chr6 34774898 34775083 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -17093 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 165-44 chr15 63702208 63702407 + 1.25 NA intron (NM_003922, intron 25 of 77) intron (NM_003922, intron 25 of 77) -101480 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-35 chr10 116571500 116571670 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -19374 NM_006229 5407 Hs.73923 NM_006229 ENSG00000187021 PNLIPRP1 PLRP1 pancreatic lipase related protein 1 protein-coding 330.25-11 chr2 108691826 108692206 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13415 NR_149074 106182118 Hs.613268 NR_149074 ENSG00000228763 LIMS1-AS1 - LIMS1 antisense RNA 1 ncRNA 237.5-48 chr2 76082606 76082872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -371824 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 251.75-53 chr3 99482007 99482404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -156389 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 242-34 chr21 15766633 15766943 + 1.25 NA intron (NM_001352561, intron 3 of 23) intron (NM_001352561, intron 3 of 23) 36806 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 172.75-24 chr11 108323301 108323457 + 1.25 NA intron (NM_001351834, intron 46 of 63) L1MA4|LINE|L1 99850 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 252.5-3 chr1 157942655 157943085 + 1.25 NA intron (NR_135760, intron 2 of 3) intron (NR_135760, intron 2 of 3) 16903 NR_135760 105371458 Hs.591494 NR_135760 ENSG00000236957 LOC105371458 - uncharacterized LOC105371458 ncRNA 156.25-153 chr9 14087788 14087949 + 1.25 NA non-coding (NR_161382, exon 8 of 8) non-coding (NR_161382, exon 8 of 8) 92934 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 287.75-31 chr2 157792902 157793427 + 1.25 NA intron (NM_001111067, intron 3 of 10) intron (NM_001111067, intron 3 of 10) 45466 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 217-36 chr2 119911123 119911318 + 1.25 NA intron (NM_002830, intron 10 of 26) L1ME1|LINE|L1 -101857 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 196.25-47 chr17 55578831 55579107 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 143895 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 161.5-83 chr19 12491192 12491448 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6504 NM_152601 163051 Hs.631623 NM_152601 ENSG00000242852 ZNF709 - zinc finger protein 709 protein-coding 155.25-51 chr12 133032331 133032491 + 1.25 NA TTS (NR_110091) TTS (NR_110091) 4811 NR_110091 101928597 Hs.638942 NR_110091 ENSG00000246394 ZNF84-DT - ZNF84 divergent transcript ncRNA 205.25-37 chr17 45010013 45010194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41529 NM_001128631 79877 Hs.463148 NM_024819 ENSG00000172992 DCAKD - dephospho-CoA kinase domain containing protein-coding 114.75-144 chr4 125283677 125283803 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32672 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 257-37 chr3 133188551 133188796 + 1.25 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 63852 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 321.5-40 chr9 79620506 79621049 + 1.25 NA intron (NM_001351563, intron 5 of 17) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 47600 NM_001351546 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 197-2 chr1 177864458 177864753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105317 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 288.75-16 chr12 118792896 118793320 + 1.25 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -31429 NR_134998 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 119-203 chr8 131987784 131987909 + 1.25 NA intron (NR_136616, intron 18 of 23) intron (NR_136616, intron 18 of 23) 71073 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 265-4 chr10 56118840 56119251 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 242214 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 133.25-36 chr12 1143863 1144151 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) L1M5|LINE|L1 116259 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 338.25-11 chr14 47718760 47719227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42111 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 247.25-54 chr6 159000895 159001267 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_031924) promoter-TSS (NM_031924) -879 NM_031924 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 260.5-2 chr1 79089376 79089691 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82803 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 253-10 chr11 93335533 93335822 + 1.25 NA intron (NM_181645, intron 2 of 13) L1M5|LINE|L1 4960 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 273.25-19 chr2 127135153 127135458 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28151 NM_139345 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 316-20 chr22 26789907 26790466 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -70025 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 212-49 chr21 15948310 15948562 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122052 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 240.25-44 chr3 73401393 73401677 + 1.25 NA intron (NM_001303139, intron 2 of 7) intron (NM_001303139, intron 2 of 7) 32460 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 255.25-24 chr2 137126489 137126789 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 361094 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 312.5-44 chr9 102110225 102110731 + 1.25 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -371898 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 216.25-82 chr4 185153197 185153487 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 10076 NM_001151 291 Hs.246506 NM_001151 ENSG00000151729 SLC25A4 AAC1|ANT|ANT 1|ANT1|MTDPS12|MTDPS12A|PEO2|PEO3|PEOA2|T1 solute carrier family 25 member 4 protein-coding 190.75-27 chr14 33927356 33927560 + 1.25 NA intron (NM_001308103, intron 3 of 4) AluSc|SINE|Alu 23616 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 128.5-173 chr5 125601959 125602070 + 1.25 NA non-coding (NR_109887, exon 4 of 4) non-coding (NR_109887, exon 4 of 4) 108753 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 214.75-41 chr2 108046500 108046841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6085 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 119.5-247 chr8 134257827 134258029 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -340143 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 203.75-115 chr8 126242659 126242952 + 1.25 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -82690 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 163-89 chr5 13373471 13373679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -340689 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 260.5-6 chr10 101450270 101450626 + 1.25 NA intron (NM_001256856, intron 2 of 13) intron (NM_001256856, intron 2 of 13) 96283 NM_003939 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 121-34 chr11 22579874 22580058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 45875 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 246.75-40 chr3 59136331 59136613 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -86440 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 132.75-110 chr20 6948218 6948352 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 180599 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 165.75-94 chr2 230517097 230517339 + 1.25 NA TTS (NM_003113) TTS (NM_003113) 100462 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 222.5-31 chr13 97860321 97860538 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -93246 NM_002271 3843 Hs.712598 NM_002271 ENSG00000065150 IPO5 IMB3|KPNB3|Pse1|RANBP5|imp5 importin 5 protein-coding 273-4 chr1 217721641 217722110 + 1.25 NA intron (NM_138796, intron 5 of 10) intron (NM_138796, intron 5 of 10) 63245 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 195.5-124 chr5 145630767 145630983 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 204467 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 183.5-162 chr9 33274965 33275151 + 1.25 NA intron (NM_001195536, intron 5 of 6) intron (NM_001195536, intron 5 of 6) 10009 NM_016410 51510 Hs.635313 NM_016410 ENSG00000086065 CHMP5 C9orf83|CGI-34|HSPC177|PNAS-2|SNF7DC2|Vps60 charged multivesicular body protein 5 protein-coding 191.5-140 chr7 90688267 90688463 + 1.25 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -21033 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 277.5-5 chr10 22997848 22998406 + 1.25 NA intron (NM_001282745, intron 10 of 18) intron (NM_001282745, intron 10 of 18) 70074 NM_001282746 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 172-59 chr2 223317243 223317514 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 265448 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 187.5-177 chr8 138910982 138911314 + 1.25 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) L3|LINE|CR1 2893 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 283.25-5 chr1 181380485 181380798 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -102876 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 136.5-230 chr8 97267996 97268183 + 1.25 NA intron (NR_125390, intron 2 of 2) L1MC5a|LINE|L1 9839 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 188.5-20 chr11 59997235 59997406 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26483 NM_001368161 107987155 NM_001368161 ENSG00000255393 OOSP4B - oocyte secreted protein family member 4B protein-coding 307-35 chr8 128245128 128245598 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 95247 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 187-22 chr11 27869749 27869946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -147817 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 237-24 chr2 31160153 31160450 + 1.25 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -21861 NM_001329095 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 229-24 chr18 10112099 10112426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 198246 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 458-2 chr14 53979176 53979817 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22605 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 207.25-79 chr5 170269242 170269598 + 1.25 NA intron (NM_005565, intron 7 of 20) intron (NM_005565, intron 7 of 20) 28357 NM_005565 3937 Hs.304475 NM_005565 ENSG00000043462 LCP2 SLP-76|SLP76 lymphocyte cytosolic protein 2 protein-coding 174.75-54 chr2 43290895 43291146 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 34 of 37) intron (NM_001083953, intron 34 of 37) 63809 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 245.25-34 chr2 28761242 28761550 + 1.25 NA intron (NM_206876, intron 2 of 8) intron (NM_206876, intron 2 of 8) 9566 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 148.25-148 chr8 122181169 122181404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 387358 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 208-36 chr2 21606262 21606745 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104149 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 349-5 chr12 9377769 9378218 + 1.25 NA intron (NR_120479, intron 2 of 3) MER2|DNA|TcMar-Tigger 3429 NR_120481 101928030 Hs.201719 NR_120481 LOC101928030 - uncharacterized LOC101928030 ncRNA 339-11 chr14 83028767 83029299 + 1.25 NA Intergenic Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 386401 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 167-109 chr7 81493693 81493945 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 68000 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 255.5-81 chr8 17563515 17563825 + 1.25 NA exon (NM_001008539, exon 11 of 12) exon (NM_001008539, exon 11 of 12) -12763 NM_006207 5157 Hs.458573 NM_006207 ENSG00000104213 PDGFRL PDGRL|PRLTS platelet derived growth factor receptor like protein-coding 204.75-68 chr20 47259438 47259754 + 1.25 NA intron (NM_001281784, intron 11 of 20) L2a|LINE|L2 -58906 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 150.75-197 chrX 84514418 84514590 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -12051 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 274-11 chr14 37730499 37730806 + 1.25 NA intron (NM_001310135, intron 9 of 32) L1MEd|LINE|L1 -41731 NM_001368142 319089 Hs.659936 NM_001007795 ENSG00000139865 TTC6 C14orf25|NCRNA00291 tetratricopeptide repeat domain 6 protein-coding 248-71 chr7 90965132 90965407 + 1.25 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) LTR33|LTR|ERVL 255453 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 269-5 chr1 168065301 168065608 + 1.25 NA intron (NM_001017977, intron 15 of 18) intron (NM_001017977, intron 15 of 18) 66794 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 285.25-19 chr3 27119012 27119400 + 1.25 NA intron (NM_001304384, intron 14 of 16) MIR|SINE|MIR 97317 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 287.5-3 chr1 91434783 91435186 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -30147 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 188.75-37 chr16 69561566 69561729 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 4221 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 192.75-57 chr2 58150940 58151180 + 1.25 NA intron (NM_001130482, intron 12 of 12) L1ME2|LINE|L1 90320 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 222.5-96 chr6 63750797 63750982 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 41 of 43) L1M3d|LINE|L1 -55947 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 277.75-28 chr6 108131316 108131701 + 1.25 NA intron (NR_145458, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 7875 NR_145458 100287366 Hs.221513 NR_145458 ENSG00000225174 OSTM1-AS1 - OSTM1 antisense RNA 1 ncRNA 244-57 chr8 74258696 74259042 + 1.25 NA intron (NM_020647, intron 3 of 5) intron (NM_020647, intron 3 of 5) 62492 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 165.25-98 chr3 194153449 194153715 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17434 NM_005524 3280 Hs.250666 NM_005524 ENSG00000114315 HES1 HES-1|HHL|HRY|bHLHb39 hes family bHLH transcription factor 1 protein-coding 128.25-24 chr11 99819413 99819525 + 1.25 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 263324 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 188-71 chr7 98379652 98379819 + 1.25 NA intron (NM_018842, intron 1 of 13) L1MB8|LINE|L1 21355 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 204.75-16 chr10 65651719 65651950 + 1.25 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) L1MA5A|LINE|L1 80409 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 226-73 chr9 8971923 8972158 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) intron (NM_002839, intron 11 of 45) 114022 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 312-28 chr6 48668411 48668799 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -599916 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 336.75-14 chr4 57141869 57142231 + 1.25 NA intron (NR_034081, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 -31665 NM_001553 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 163.5-2 chr1 40257259 40257460 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_005857) promoter-TSS (NM_005857) -877 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 291.75-42 chr8 131069082 131069579 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -28421 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 143.25-177 chr8 59310420 59310585 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 191292 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 141.5-230 chr8 83379301 83379462 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24377 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 257.75-36 chr4 174076967 174077359 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 143235 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 342.25-8 chr16 49611020 49611512 + 1.25 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) L1MD1|LINE|L1 53058 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 241.25-48 chr3 111465667 111466080 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76324 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 196.75-75 chr3 113040775 113040971 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21202 NM_001319112 25871 Hs.591288 NM_015412 ENSG00000163608 NEPRO C3orf17|NET17 nucleolus and neural progenitor protein protein-coding 128-136 chr6 70407844 70408005 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5480 NM_001331000 57579 Hs.211700 NM_020819 ENSG00000082269 FAM135A KIAA1411 family with sequence similarity 135 member A protein-coding 356.75-5 chr11 112199775 112200268 + 1.25 NA intron (NM_031938, intron 6 of 11) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 23655 NM_001256400 83875 Hs.728325 NM_031938 ENSG00000197580 BCO2 B-DIOX-II|BCDO2 beta-carotene oxygenase 2 protein-coding 197.5-46 chr16 22711506 22711729 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -102545 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 163.75-130 chr8 127948897 127949178 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_103558) promoter-TSS (NR_103558) -314 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 243.75-5 chr1 207858895 207859167 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36328 NR_135299 100128537 Hs.445414 NR_135298 MIR29B2CHG C1orf132 MIR29B2 and MIR29C host gene ncRNA 214-68 chr8 135508972 135509171 + 1.25 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) intron (NM_006558, intron 1 of 8) 51615 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 139.25-191 chr8 30154247 30154457 + 1.25 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -2017 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 285-6 chr11 58738500 58738780 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -6666 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 189-57 chr2 41797563 41797919 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -79814 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 160-63 chr21 23118610 23118831 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39436 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 266.25-17 chr16 10966942 10967433 + 1.25 NA intron (NM_015226, intron 3 of 22) intron (NM_015226, intron 3 of 22) 22623 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 158-114 chr5 154844735 154844958 + 1.25 NA intron (NM_032385, intron 1 of 8) intron (NM_032385, intron 1 of 8) 5757 NM_032385 10826 Hs.519694 NM_016348 ENSG00000170271 FAXDC2 C5orf4 fatty acid hydroxylase domain containing 2 protein-coding 354.75-14 chr3 126610655 126610975 + 1.25 NA intron (NM_001173513, intron 13 of 14) intron (NM_001173513, intron 13 of 14) 44309 NM_052883 114112 Hs.477475 NM_052883 ENSG00000197763 TXNRD3 TGR|TR2|TR2IT1|TRXR3|TXNRD3IT1|TXNRD3NB|TXNRD3NT1 thioredoxin reductase 3 protein-coding 272-16 chr2 146398603 146398838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -188337 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 355.75-4 chr14 25316349 25316775 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -266265 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 170-21 chr11 102751293 102751547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26466 NM_001304441 4317 Hs.161839 NM_002424 ENSG00000118113 MMP8 CLG1|HNC|MMP-8|PMNL-CL matrix metallopeptidase 8 protein-coding 223.25-51 chr3 107750663 107750937 + 1.25 NA intron (NM_001276286, intron 9 of 16) intron (NM_001276286, intron 9 of 16) 127268 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 250-53 chr7 11724121 11724356 + 1.25 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 107960 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 165.5-39 chr13 96296949 96297108 + 1.25 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 -130201 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 335.5-3 chr14 50505057 50505384 + 1.25 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) intron (NM_198794, intron 2 of 31) 27349 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 492-4 chr6 167710889 167711556 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27435 NR_117092 441178 Hs.628956 NM_001025489 ENSG00000203688 LINC02487 - long intergenic non-protein coding RNA 2487 ncRNA 143.5-77 chr15 59971673 59971858 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -32546 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 200.75-57 chr2 107259503 107259784 + 1.25 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 89882 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 354.25-14 chr6 20784590 20785131 + 1.25 NA intron (NM_017774, intron 8 of 15) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 250403 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 299.25-24 chr2 5546615 5546972 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 144325 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 250.75-45 chr4 45674641 45674906 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 449281 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 165.25-41 chr14 56150267 56150472 + 1.25 NA intron (NM_021255, intron 1 of 5) intron (NM_021255, intron 1 of 5) 31958 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 339-13 chr16 50804904 50805406 + 1.25 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -1517 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 160.5-148 chr5 27022143 27022363 + 1.25 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) intron (NM_016279, intron 1 of 11) 16333 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 297-17 chr14 74748494 74748988 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -14575 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 161.5-149 chr4 114057828 114058183 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -78358 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 228.5-78 chr4 53430132 53430477 + 1.25 NA intron (NM_001134938, intron 10 of 14) intron (NM_001134938, intron 10 of 14) 52651 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 166.5-18 chr1 222392174 222392425 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 155805 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 443.25-2 chr18 2955179 2955627 + 1.25 NA intron (NM_014646, intron 2 of 19) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -8780 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 150.5-90 chr2 67566079 67566344 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 168878 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 245.25-11 chr11 43468516 43468932 + 1.25 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) AluJr|SINE|Alu -90932 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 217.5-66 chr2 186021543 186021868 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 64612 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 221.5-23 chr14 21450020 21450327 + 1.25 NA intron (NM_001170629, intron 1 of 37) intron (NM_001170629, intron 1 of 37) 5950 NM_001170629 57680 Hs.530698 NM_020920 ENSG00000100888 CHD8 AUTS18|HELSNF1 chromodomain helicase DNA binding protein 8 protein-coding 409.5-3 chr10 107555418 107556110 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -391058 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 152-128 chr5 132899564 132899791 + 1.25 NA intron (NM_014423, intron 7 of 20) intron (NM_014423, intron 7 of 20) 26009 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 304.5-11 chr15 70544533 70544934 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -38805 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 149-101 chr5 56741039 56741192 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 31756 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 113.25-182 chr9 8741298 8741460 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) intron (NM_002839, intron 11 of 45) -7433 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 177-73 chr4 75888407 75888614 + 1.25 NA intron (NM_006239, intron 5 of 16) intron (NM_006239, intron 5 of 16) 13942 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 242.5-87 chr8 137851087 137851541 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 232231 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 392.25-5 chr13 105472418 105472988 + 1.25 NA intron (NM_172370, intron 3 of 4) intron (NM_172370, intron 3 of 4) 6487 NM_001161812 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 137.25-111 chr4 78923882 78924022 + 1.25 NA intron (NR_146465, intron 4 of 6) intron (NR_146465, intron 4 of 6) 15486 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 200.5-115 chr5 106348982 106349271 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 661888 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 126.5-66 chr14 59634709 59634812 + 1.25 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L2c|LINE|L2 -3946 NM_206852 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 219.75-75 chr7 26891105 26891321 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26623 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 230.25-12 chr10 91391548 91391908 + 1.25 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) intron (NR_024467, intron 3 of 4) -17507 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 185.75-110 chr6 160943115 160943337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48501 NM_006724 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 274.5-63 chr7 127925309 127925610 + 1.25 NA intron (NM_014390, intron 14 of 23) intron (NM_014390, intron 14 of 23) -72050 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 252.75-11 chr11 84457659 84458070 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -140525 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 301-17 chr3 66940255 66940534 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -57913 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 310.75-31 chr8 79411707 79412077 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79704 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 266.75-49 chr7 81266076 81266542 + 1.25 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 295510 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 252.5-53 chr3 12632878 12633093 + 1.25 NA intron (NM_001354691, intron 1 of 16) intron (NM_001354691, intron 1 of 16) 30523 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 146.5-136 chr22 48693973 48694225 + 1.25 NA intron (NM_001082967, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR -86196 NR_039761 100616415 NR_039761 ENSG00000266887 MIR4535 - microRNA 4535 ncRNA 183-31 chr14 86546999 86547223 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -358667 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 172-21 chr11 100553954 100554377 + 1.25 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -133123 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 379.25-10 chr3 73254997 73255524 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 178735 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 290-51 chr9 71067268 71067550 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 54212 NM_001366150 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 328.75-14 chr3 113907858 113908319 + 1.25 NA intron (NM_001172105, intron 3 of 12) intron (NM_001172105, intron 3 of 12) 10588 NM_001172105 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 143.25-51 chr14 88680043 88680230 + 1.25 NA intron (NM_183387, intron 21 of 42) intron (NM_183387, intron 21 of 42) 85716 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 237.25-28 chr14 72889961 72890232 + 1.25 NA intron (NM_001280543, intron 1 of 10) intron (NM_001280543, intron 1 of 10) 2553 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 222.75-72 chr3 181289678 181290053 + 1.25 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) MIRb|SINE|MIR 58128 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 339.25-17 chr4 144905005 144905486 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 192137 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 223.5-118 chr7 85636834 85637085 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 215837 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 138-34 chr13 54542952 54543070 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -230963 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 279.75-58 chr8 130999141 130999581 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 41548 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 214.75-47 chr21 18836538 18836774 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -76844 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 228-46 chr21 30445522 30445789 + 1.25 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 5376 NM_181623 254950 Hs.553654 NM_181623 ENSG00000186970 KRTAP15-1 KAP15.1 keratin associated protein 15-1 protein-coding 181.25-136 chr8 144218324 144218612 + 1.25 NA intron (NM_001288814, intron 11 of 41) intron (NM_001288814, intron 11 of 41) 44269 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 269-33 chr3 18307103 18307414 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 118081 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 210-60 chr21 14278481 14278675 + 1.25 NA intron (NR_003087, intron 1 of 5) intron (NR_003087, intron 1 of 5) 4779 NR_003088 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 154-60 chr2 18277875 18278114 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 282659 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 227.25-8 chr1 210528976 210529257 + 1.25 NA intron (NM_001122834, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 199750 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 248-45 chr3 23672367 23672708 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -133418 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 116.25-147 chr3 130958384 130958508 + 1.25 NA intron (NM_001001485, intron 11 of 27) intron (NM_001001485, intron 11 of 27) 63856 NM_001001486 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 167.75-73 chr2 79360599 79360813 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 140138 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 166.25-132 chr6 34775931 34776254 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15991 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 151.5-177 chr7 17302127 17302296 + 1.25 NA intron (NM_001621, intron 1 of 10) intron (NM_001621, intron 1 of 10) 3559 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 171-65 chr2 66380517 66380696 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2700 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 162-104 chr7 7888149 7888314 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 80521 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 142.75-81 chr17 61208056 61208243 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 159555 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 257-14 chr14 62827549 62827915 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) L1MC4|LINE|L1 217726 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 181.25-29 chr14 48841116 48841314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 745165 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 232-40 chr2 126276716 126277171 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -158958 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 138.5-40 chr12 5631291 5631459 + 1.25 NA intron (NM_001278596, intron 17 of 25) L2a|LINE|L2 137243 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 221-33 chr2 46425412 46425959 + 1.25 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -3505 NR_103805 101805491 Hs.304781 NR_103805 ENSG00000187600 LINC02583 - long intergenic non-protein coding RNA 2583 ncRNA 258.75-21 chr14 28597770 28598107 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 167381 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 236-21 chr15 81885608 81885863 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 160283 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 247.5-47 chr2 201462071 201462338 + 1.25 NA intron (NM_018571, intron 3 of 11) L1MA3|LINE|L1 10464 NM_001206864 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 201.75-75 chr5 91200380 91200714 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 113855 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 118.25-167 chr6 39859367 39859497 + 1.25 NA intron (NM_015345, intron 2 of 24) intron (NM_015345, intron 2 of 24) 37948 NR_125831 100505635 Hs.668513 NR_125831 ENSG00000235033 LOC100505635 - uncharacterized LOC100505635 ncRNA 244.5-19 chr11 106817069 106817381 + 1.25 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) intron (NM_001256424, intron 4 of 8) 201251 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 194.75-50 chr2 20727084 20727352 + 1.25 NA intron (NR_104233, intron 3 of 4) AluJr|SINE|Alu 60074 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 324.75-16 chr19 37462653 37463078 + 1.25 NA intron (NM_001330482, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 4579 NM_001330482 148266 Hs.511848 NM_152484 ENSG00000196437 ZNF569 ZAP1|ZNF zinc finger protein 569 protein-coding 175.75-74 chr2 192118952 192119179 + 1.25 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 75868 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 135.75-154 chr4 13371871 13372035 + 1.25 NA intron (NM_001159601, intron 6 of 7) intron (NM_001159601, intron 6 of 7) 112387 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 161.25-190 chrX 81500563 81500749 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 298554 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 179.5-73 chr17 63212290 63212556 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) intron (NM_025185, intron 6 of 25) 227844 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 203-49 chr2 53431290 53431616 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -336330 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 121.25-195 chr8 80596187 80596348 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 110041 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 211-52 chr5 82992657 82993083 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71467 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 165.25-74 chr2 201918030 201918266 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 111569 NM_001366386 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 221-3 chr1 147163921 147164336 + 1.25 NA intron (NR_103870, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 8342 NR_103870 5565 Hs.50732 NM_005399 ENSG00000131791 PRKAB2 - protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 2 protein-coding 223.25-31 chr2 20155429 20155737 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 69547 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 170-44 chr2 36852388 36852553 + 1.25 NA intron (NM_003162, intron 15 of 17) L1MC4|LINE|L1 114066 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 267.75-30 chr2 164178477 164178760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 389877 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 377.25-16 chr6 150289283 150290197 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79272 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 243.5-33 chr17 72216056 72216378 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 95197 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 161.75-42 chr15 47569528 47569761 + 1.25 NA intron (NM_001198999, intron 3 of 19) intron (NM_001198999, intron 3 of 19) -147861 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 256-5 chr10 23999787 24000005 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) AluJo|SINE|Alu -208895 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 178-112 chr9 133195313 133195506 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 13841 NM_001288987 29989 Hs.449629 NM_014581 ENSG00000171102 OBP2B LCN14|OBPIIb odorant binding protein 2B protein-coding 293.25-16 chr2 165520005 165520262 + 1.25 NA intron (NM_001172173, intron 3 of 6) intron (NM_001172173, intron 3 of 6) 50435 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 256.75-17 chr16 11976016 11976297 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_032167) promoter-TSS (NM_032167) -578 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 214.25-12 chr11 50483921 50484194 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 74910 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 192-27 chr11 57573507 57573813 + 1.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -5330 NM_198183 9246 Hs.425777 NM_004223 ENSG00000156587 UBE2L6 RIG-B|UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 L6 protein-coding 241.25-20 chr13 84955175 84955517 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 171692 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 174.25-82 chr2 215563973 215564238 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 110398 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 236.75-55 chr7 83371685 83372025 + 1.25 NA intron (NM_001178129, intron 16 of 16) intron (NM_001178129, intron 16 of 16) -208971 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 289.75-33 chr9 81562743 81563205 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126561 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 221-24 chr16 79799837 79800078 + 1.25 NA TTS (NR_104661) TTS (NR_104661) 4708 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 200.75-13 chr10 103112694 103113002 + 1.25 NA intron (NM_001351176, intron 2 of 17) intron (NM_001351176, intron 2 of 17) 40973 NM_001351191 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 191.5-19 chr11 2658704 2658950 + 1.25 NA non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) 41171 NR_002728 10984 Hs.604823 NR_002728 ENSG00000269821 KCNQ1OT1 KCNQ1-AS2|KCNQ10T1|Kncq1|KvDMR1|KvLQT1-AS|LIT1|NCRNA00012 KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1 ncRNA 223.75-63 chr3 121422945 121423207 + 1.25 NA non-coding (NR_145516, exon 29 of 29) non-coding (NR_145516, exon 29 of 29) 122912 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 219.5-117 chr6 163081890 163082159 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 3 of 4) L1MC|LINE|L1 -27863 NR_110871 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 179.5-184 chr8 119472309 119472581 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 55999 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 345.75-5 chr18 265955 266481 + 1.25 NA intron (NM_005131, intron 1 of 20) intron (NM_005131, intron 1 of 20) 1829 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 252.5-84 chr8 130261335 130261930 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 34901 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 355-20 chr8 103937210 103937779 + 1.25 NA intron (NR_145711, intron 10 of 21) L2b|LINE|L2 118274 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 205.25-44 chr18 70450371 70450583 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65886 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 120.25-6 chr1 67939445 67939607 + 1.25 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) intron (NR_040077, intron 1 of 9) -106059 NM_018841 55970 Hs.431101 NM_018841 ENSG00000172380 GNG12 - G protein subunit gamma 12 protein-coding 182.25-47 chr16 49288195 49288535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6527 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 133.5-48 chr11 19377428 19377559 + 1.25 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 26769 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 393.75-10 chr7 7474800 7475313 + 1.25 NA intron (NM_001037763, intron 14 of 34) intron (NM_001037763, intron 14 of 34) 60817 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 215.5-28 chr13 109339463 109339650 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -61140 NR_126361 104326054 Hs.569298 NR_126361 ENSG00000229792 LINC00399 TCONS_00021596 long intergenic non-protein coding RNA 399 ncRNA 176.75-85 chr3 164865332 164865492 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33932 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 385.25-12 chr7 53602384 53602841 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 209319 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 333-11 chr2 64099395 64099943 + 1.25 NA intron (NM_020651, intron 4 of 6) intron (NM_020651, intron 4 of 6) 44751 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 210.75-50 chr20 40048030 40048360 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43734 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 260.5-52 chr6 44951125 44951507 + 1.25 NA intron (NR_146635, intron 9 of 12) intron (NR_146635, intron 9 of 12) 246454 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 292.5-48 chr8 29635011 29635434 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 112887 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 174-48 chr18 38214727 38214963 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 557710 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 270.75-53 chr9 69864567 69864867 + 1.25 NA intron (NM_001308084, intron 4 of 4) intron (NM_001308084, intron 4 of 4) 43900 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 298.5-38 chr8 26698005 26698329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 119762 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 284.5-67 chr8 133368986 133369261 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71819 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 236.5-101 chr8 136056783 136057040 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -473887 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 233.5-114 chr9 14858346 14858597 + 1.25 NA intron (NR_163241, intron 4 of 7) AluJr|SINE|Alu 51957 NR_163240 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 114.75-149 chr5 25634706 25634825 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 443812 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 192.75-116 chr7 26676339 26676573 + 1.25 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) intron (NM_003930, intron 11 of 12) 38585 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 258-53 chr7 91579473 91579774 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 301079 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 192.5-13 chr10 36326920 36327194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 548755 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 256.25-22 chr2 46744969 46745244 + 1.25 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 45811 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 190.5-89 chr20 61186008 61186244 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66135 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 280.25-17 chr12 102067094 102067399 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5122 NM_001301107 51019 Hs.405692 NM_016053 ENSG00000120860 WASHC3 CCDC53|CGI-116 WASH complex subunit 3 protein-coding 297.25-12 chr17 12869696 12870050 + 1.25 NA intron (NM_001321164, intron 1 of 20) intron (NM_001321164, intron 1 of 20) 47469 NR_039747 100616494 NR_039747 ENSG00000265503 MIR1269B - microRNA 1269b ncRNA 143-9 chr10 63861436 63861653 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -339654 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 241.75-74 chr8 77933896 77934142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 483322 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 220-69 chr8 116134220 116134530 + 1.25 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 190684 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 194.25-44 chr16 82807401 82807647 + 1.25 NA intron (NR_110938, intron 1 of 2) intron (NR_110938, intron 1 of 2) 34205 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 299.75-9 chr14 65600230 65600550 + 1.25 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 129288 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 148.25-84 chr20 51313063 51313215 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139838 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 181.5-60 chr17 62748769 62748942 + 1.25 NA intron (NM_001288779, intron 4 of 11) intron (NM_001288779, intron 4 of 11) 42649 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 113.5-208 chr6 56764545 56764701 + 1.25 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) L2c|LINE|L2 79042 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 143-22 chr11 100461944 100462120 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -225256 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 190.25-93 chr4 75288297 75288568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65644 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 311.25-33 chr8 129877853 129878191 + 1.25 NA intron (NM_001353278, intron 4 of 13) intron (NM_001353278, intron 4 of 13) 61789 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 226-65 chr7 54926467 54926730 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -92419 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 120.25-60 chr14 45404338 45404562 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -151248 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 256.5-52 chr4 95490988 95491292 + 1.25 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 57833 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 242.5-17 chr10 70416928 70417160 + 1.25 NA intron (NM_004096, intron 1 of 2) L1MB8|LINE|L1 12899 NM_004096 1979 Hs.621200 NM_004096 ENSG00000148730 EIF4EBP2 4EBP2|PHASII eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 protein-coding 347-19 chr4 54549488 54549966 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57404 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 123.75-78 chr17 70527480 70527597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 358003 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 195.75-83 chr4 60254042 60254277 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -668460 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 265.25-45 chr6 45763077 45763421 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 174348 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 195.75-113 chr7 77935604 77935829 + 1.25 NA intron (NM_001366082, intron 10 of 11) intron (NM_001366082, intron 10 of 11) 95586 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 261.75-8 chr12 10247190 10247492 + 1.25 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) intron (NM_001351060, intron 2 of 8) 8380 NM_001351060 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 209.25-5 chr1 46098181 46098391 + 1.25 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 32387 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 330-19 chr4 33409805 33410170 + 1.25 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 629906 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 233 chr1 15531017 15531315 + 1.25 NA intron (NR_109898, intron 2 of 14) intron (NR_109898, intron 2 of 14) 4318 NM_015291 23341 Hs.655410 NM_015291 ENSG00000116138 DNAJC16 - DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C16 protein-coding 212.5-92 chr6 38224097 38224268 + 1.25 NA intron (NM_052893, intron 10 of 11) AluSz6|SINE|Alu -257414 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 250.75-72 chr9 29185631 29185842 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 26563 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 244.5-53 chr2 117312813 117313132 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -501719 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 206-59 chr5 42796752 42796953 + 1.25 NA exon (NM_001134848, exon 7 of 9) exon (NM_001134848, exon 7 of 9) 15040 NM_005410 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 131.25-196 chr8 53859468 53859639 + 1.25 NA intron (NM_001286674, intron 1 of 2) intron (NM_001286674, intron 1 of 2) 7758 NM_170587 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 245.75-14 chr12 39005981 39006288 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -100543 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 176.25-34 chr12 84820195 84820559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92422 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 192.75-28 chr13 42994786 42995093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2698 NM_001330543 94240 Hs.546467 NM_033255 ENSG00000133106 EPSTI1 BRESI1 epithelial stromal interaction 1 protein-coding 252.75-55 chr4 186318056 186318418 + 1.25 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) L1MC2|LINE|L1 52048 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 305.25-25 chr2 125084993 125085277 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 1032850 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 179.75-13 chr10 16204980 16205186 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -231860 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 245.25-21 chr14 63500076 63500414 + 1.25 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 7993 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 179-29 chr12 89575222 89575515 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49106 NM_001199782 100528030 Hs.25130 NM_001199781 ENSG00000259075 POC1B-GALNT4 GALNT4|GalNAc-T4 POC1B-GALNT4 readthrough protein-coding 118.5-200 chr7 79160245 79160352 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) MER4B-int|LTR|ERV1 151310 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 251.75-41 chr2 152668479 152668824 + 1.25 NA intron (NM_001365601, intron 15 of 24) MIR|SINE|MIR 48810 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 121.5-194 chr4 81572350 81572472 + 1.25 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -100504 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 120-58 chr16 9354764 9354977 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_135195) promoter-TSS (NR_135195) -718 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 162-65 chr2 165183352 165183573 + 1.25 NA intron (NM_006922, intron 2 of 27) intron (NM_006922, intron 2 of 27) 20588 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 208.75 chr1 77852391 77852617 + 1.25 NA intron (NM_198549, intron 8 of 15) intron (NM_198549, intron 8 of 15) -36011 NM_001172309 91624 Hs.612385 NM_144573 ENSG00000162614 NEXN CMH20|NELIN nexilin F-actin binding protein protein-coding 184-40 chr2 45458348 45458536 + 1.25 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) 152825 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 238.75-40 chr4 45708888 45709185 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 415018 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 171.5-5 chr1 204075634 204075779 + 1.25 NA intron (NM_005686, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 2591 NM_005686 9580 Hs.201671 NM_005686 ENSG00000143842 SOX13 ICA12|Sox-13 SRY-box transcription factor 13 protein-coding 122-94 chr2 82327929 82328085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -528796 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 174.5-3 chr1 35170019 35170311 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22980 NM_005066 6421 Hs.355934 NM_005066 ENSG00000116560 SFPQ POMP100|PPP1R140|PSF splicing factor proline and glutamine rich protein-coding 280.75-8 chr10 87096443 87096861 + 1.25 NA intron (NM_001330112, intron 1 of 9) intron (NM_001330112, intron 1 of 9) 1446 NM_019054 54537 Hs.500419 NM_019054 ENSG00000122376 SHLD2 FAM35A|FAM35A1|RINN2|bA163M19.1 shieldin complex subunit 2 protein-coding 321.75-24 chr3 138658927 138659273 + 1.25 NA intron (NM_006219, intron 21 of 23) MER20|DNA|hAT-Charlie 48521 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 137-177 chr8 112160010 112160197 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -483390 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 268.25-41 chr5 151350758 151351049 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3344 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 345.75 chr1 76377725 76378025 + 1.25 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 303129 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 192-69 chr20 22909764 22909928 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -125574 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 165-22 chr11 13717871 13718141 + 1.25 NA intron (NM_032228, intron 9 of 11) MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR 49338 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 230.5-63 chr2 119534762 119534981 + 1.25 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -9561 NR_073133 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 258.75-30 chr17 45291967 45292330 + 1.25 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) intron (NM_003954, intron 1 of 15) 24872 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 214.25-25 chr14 102899290 102899663 + 1.25 NA intron (NM_145725, intron 10 of 11) intron (NM_145725, intron 10 of 11) -23180 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 183.5-18 chr10 43692636 43692848 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43861 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 210.5-77 chr21 14181429 14181617 + 1.25 NA intron (NM_198996, intron 4 of 9) intron (NM_198996, intron 4 of 9) 25426 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 329-26 chr4 61648882 61649445 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 446991 NM_001371342 239.5-7 chr10 15806305 15806558 + 1.25 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) intron (NM_024948, intron 10 of 14) 54076 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 203.25-2 chr1 62590301 62590478 + 1.25 NA intron (NM_001367561, intron 14 of 49) L2c|LINE|L2 -7131 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 202-48 chr4 111206658 111206869 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -346116 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 211.5-78 chr2 98801381 98801678 + 1.25 NA intron (NM_207362, intron 7 of 9) intron (NM_207362, intron 7 of 9) -29631 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 216-64 chr5 67281099 67281483 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84492 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 227.5-11 chr10 32300532 32300921 + 1.25 NA intron (NM_001272004, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu 46432 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 176.25-10 chr1 208451239 208451603 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -207037 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 167.25-155 chr8 116238374 116238709 + 1.25 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 86518 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 164.75-74 chr2 63433044 63433263 + 1.25 NA intron (NR_148704, intron 10 of 18) X7B_LINE|LINE|CR1 4854 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 307-12 chr14 70171106 70171622 + 1.25 NA intron (NM_033262, intron 1 of 7) intron (NM_033262, intron 1 of 7) -15744 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 202.75-87 chr5 15405186 15405540 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -94817 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 206.25-15 chr10 33015554 33015793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57443 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 328-28 chr5 21231448 21231901 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -227806 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 185.5-144 chr6 108877648 108878039 + 1.25 NA intron (NM_001286609, intron 4 of 16) intron (NM_001286609, intron 4 of 16) 29421 NM_032131 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 277.75-38 chr9 106449957 106450275 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -150812 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 272.25-60 chr8 89741355 89741774 + 1.25 NA intron (NR_125822, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 16147 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 227.5-110 chr8 123369609 123369804 + 1.25 NA intron (NM_014109, intron 7 of 27) intron (NM_014109, intron 7 of 27) -21576 NR_030382 693130 NR_030382 ENSG00000283172 MIR548D1 MIRN548D1 microRNA 548d-1 ncRNA 239.5-28 chr14 64218288 64218586 + 1.25 NA exon (NM_182914, exon 109 of 116) exon (NM_182914, exon 109 of 116) 2483 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 223.5-58 chr2 18663946 18664277 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74531 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 399.25-3 chr12 71959951 71960355 + 1.25 NA intron (NM_173353, intron 5 of 10) intron (NM_173353, intron 5 of 10) 21308 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 260-20 chr20 57504781 57505195 + 1.25 NA intron (NM_001269054, intron 7 of 8) LTR39|LTR|ERV1 19879 NR_072975 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 306-21 chr3 28945182 28945738 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 335479 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 324.75-5 chr10 18923117 18923530 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -125478 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 259.5-34 chr14 84877066 84877368 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -394715 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 267-20 chr17 79759353 79759732 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18606 NM_005189 84733 Hs.368410 NM_005189 ENSG00000173894 CBX2 CDCA6|M33|SRXY5 chromobox 2 protein-coding 270.5-50 chr5 27356078 27356435 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116036 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 274.5-60 chr6 75019670 75019999 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 108948 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 254.75-21 chr2 88907365 88907828 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 95226 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 171.5-117 chr4 73352514 73352871 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -51595 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 191.5-96 chr3 46407734 46407966 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_125406) promoter-TSS (NR_125406) 235 NM_001130910 9034 Hs.535713 NM_003965 ENSG00000121797 CCRL2 ACKR5|CKRX|CRAM|CRAM-A|CRAM-B|HCR C-C motif chemokine receptor like 2 protein-coding 208.75-50 chr22 25018606 25018987 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -9178 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 271.25-40 chr7 27373412 27373802 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -126378 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 401.75-7 chr4 30495039 30495722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224989 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 235.25-36 chr2 212829988 212830261 + 1.25 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 34793 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 313.75-18 chr5 45711832 45712108 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15590 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 176.75-11 chr1 217970205 217970475 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -73165 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 344.75-14 chr6 55593709 55594107 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14694 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 154.5-72 chr16 10500992 10501215 + 1.25 NA Intergenic LTR19A|LTR|ERV1 27095 NR_149081 106144584 Hs.531561 NR_149081 ENSG00000260468 LINC01290 - long intergenic non-protein coding RNA 1290 ncRNA 146.25-103 chr3 136932541 136932701 + 1.25 NA intron (NM_001190796, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 2119 NM_001190796 4690 Hs.126889 NM_006153 ENSG00000158092 NCK1 NCK|NCKalpha|nck-1 NCK adaptor protein 1 protein-coding 124.5-176 chr5 129927722 129927975 + 1.25 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 23383 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 274.75-21 chr2 10077954 10078448 + 1.25 NA intron (NM_001037160, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 2210 NM_001037160 192668 Hs.27092 NM_001037160 ENSG00000205795 CYS1 - cystin 1 protein-coding 124-47 chr14 73489817 73489998 + 1.25 NA intron (NM_001220484, intron 17 of 17) intron (NM_001220484, intron 17 of 17) -1026 NM_024644 79697 Hs.509916 NM_024644 ENSG00000170468 RIOX1 C14orf169|JMJD9|MAPJD|NO66|ROX|URLC2|hsNO66 ribosomal oxygenase 1 protein-coding 296-40 chr7 6437259 6437706 + 1.25 NA intron (NM_001142936, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu 10472 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 219.25-69 chr6 118876621 118876893 + 1.25 NA intron (NM_017696, intron 6 of 11) L1M3de|LINE|L1 -17395 NM_014034 25842 Hs.292316 NM_014034 ENSG00000111875 ASF1A CGI-98|CIA|HSPC146 anti-silencing function 1A histone chaperone protein-coding 294.5-45 chr6 35473741 35474230 + 1.25 NA 3' UTR (NM_003214, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_003214, exon 13 of 13) 3477 NR_106961 102465668 NR_106961 ENSG00000276712 MIR7111 hsa-mir-7111 microRNA 7111 ncRNA 406-6 chr3 2948454 2948829 + 1.25 NA intron (NM_175607, intron 13 of 24) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 56426 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 338.75-16 chr22 27958654 27959224 + 1.25 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MD|LINE|L1 -38327 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 205.25-109 chr9 77281603 77281797 + 1.25 NA intron (NM_001018038, intron 27 of 68) intron (NM_001018038, intron 27 of 68) -103783 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 215.25-49 chr2 162137771 162137995 + 1.25 NA intron (NR_110255, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 14364 NM_002054 2641 Hs.516494 NM_002054 ENSG00000115263 GCG GLP-1|GLP1|GLP2|GRPP glucagon protein-coding 267-23 chr2 11193581 11194022 + 1.25 NA exon (NM_004850, exon 30 of 33) exon (NM_004850, exon 30 of 33) 38334 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 241.75-48 chr22 49275201 49275469 + 1.25 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 268131 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 152.25-97 chr20 60294396 60294617 + 1.25 NA intron (NR_046099, intron 3 of 4) L3|LINE|CR1 -13968 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 292.75-12 chr18 78373714 78374059 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -380159 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 220.75-77 chr8 92181357 92181730 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -78158 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 112.25-20 chr10 67202097 67202256 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 6 of 17) intron (NM_001127384, intron 6 of 17) 189910 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 167.25-61 chr16 86372800 86372950 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27196 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 148.5-87 chr17 62886899 62887093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57219 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 503.25-4 chr8 138331304 138331981 + 1.25 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) intron (NM_015912, intron 2 of 19) 165619 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 358.25-2 chr1 61339196 61339569 + 1.25 NA intron (NM_001134673, intron 4 of 10) intron (NM_001134673, intron 4 of 10) -85864 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 146.75-11 chr1 208773141 208773326 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 44545 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 145.25-120 chr4 115564378 115564525 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -450831 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 207.75-70 chr3 39535596 39535856 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 33660 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 223.5-14 chr10 33641634 33641881 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 130923 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 337.25-9 chr2 19138894 19139309 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -112130 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 251-42 chr4 123268241 123268574 + 1.25 NA intron (NM_001345856, intron 15 of 15) HAL1|LINE|L1 -128388 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 280-6 chr1 229578099 229578362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19523 NM_012089 23456 Hs.17614 NM_012089 ENSG00000135776 ABCB10 EST20237|M-ABC2|MTABC2 ATP binding cassette subfamily B member 10 protein-coding 249.25-16 chr17 58967232 58967510 + 1.25 NA intron (NM_014906, intron 3 of 6) L1ME4a|LINE|L1 139509 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 256.5-5 chr10 7901250 7901857 + 1.25 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 83048 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 227.75-13 chr10 115928947 115929291 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) intron (NM_207303, intron 28 of 28) 265670 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 205.25-67 chr3 62837606 62837897 + 1.25 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) MIRb|SINE|MIR 37665 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 206.5-144 chr9 29638079 29638337 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -424607 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 182-109 chr8 140266034 140266345 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 15 of 22) AluSz|SINE|Alu -165654 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 212-39 chr2 84236709 84236951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53852 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 241.25-22 chr14 64995633 64995951 + 1.25 NA intron (NM_002028, intron 1 of 11) (TGTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8897 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 185-39 chr2 11889680 11890010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52859 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 243.5-12 chr1 200812752 200812967 + 1.25 NA intron (NM_001297707, intron 3 of 17) L2a|LINE|L2 -60122 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 115.5-33 chr11 122476528 122476693 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53739 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 194.25-92 chr5 27914727 27914956 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 372824 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 191.75-115 chr7 46604633 46604972 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92320 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 112.5-172 chr3 88264583 88264683 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73823 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 320-8 chr11 77339781 77340154 + 1.25 NA intron (NM_001128620, intron 11 of 15) L2|LINE|L2 -38301 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 244.5-107 chr9 86914410 86914902 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 32850 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 461.5-2 chr10 77119722 77120324 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 6 of 28) intron (NM_001271519, intron 6 of 28) -20808 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 209.25-106 chr7 33074727 33074996 + 1.25 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -12064 NM_001002009 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 141-121 chr5 11086871 11087038 + 1.25 NA intron (NM_001364128, intron 12 of 19) intron (NM_001364128, intron 12 of 19) -325720 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 156.75-170 chr9 68435215 68435373 + 1.25 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) L1MB8|LINE|L1 -77428 NR_015423 572558 Hs.552819 NR_015423 ENSG00000224958 PGM5-AS1 FAM233A PGM5 antisense RNA 1 ncRNA 236-13 chr12 12514838 12515049 + 1.25 NA intron (NM_030640, intron 3 of 6).2 AluJo|SINE|Alu 47920 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 214-53 chr5 122980144 122980442 + 1.25 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) intron (NM_014035, intron 3 of 6) 56432 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 165.75-66 chr18 14062296 14062513 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70031 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 278-26 chr5 14036908 14037209 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92578 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 193-26 chr15 61185156 61185470 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 43989 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 216.25-56 chr2 217416041 217416237 + 1.25 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) L1ME1|LINE|L1 133406 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 195.75-72 chr3 31660036 31660305 + 1.25 NA TTS (NM_017784) TTS (NM_017784) -44043 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 236.75-64 chr8 140859668 140860009 + 1.25 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -127185 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 277-11 chr14 46657712 46657987 + 1.25 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -6068 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 306.75-19 chr5 160562929 160563379 + 1.25 NA TTS (NM_001366655) TTS (NM_001366655) 77802 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 116-162 chr8 12964437 12964562 + 1.25 NA intron (NM_020844, intron 1 of 4) intron (NM_020844, intron 1 of 4) 18826 NM_020844 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 367.5-12 chr18 48422335 48422751 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -9958 NM_001371287 264-27 chr19 46679346 46679751 + 1.25 NA intron (NM_016457, intron 15 of 17) MIRb|SINE|MIR 18070 NR_040041 100506068 Hs.434327 NR_040041 ENSG00000245598 DACT3-AS1 - DACT3 antisense RNA 1 ncRNA 305-2 chr10 4365451 4365795 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -18623 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 232.25-21 chr14 43244165 43244513 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 1262944 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 213.25-67 chr9 25368145 25368342 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 310615 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 252.5-60 chr4 44437998 44438502 + 1.25 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 10559 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 120-181 chr7 102890816 102890920 + 1.25 NA intron (NR_105043, intron 12 of 20) intron (NR_105043, intron 12 of 20) -22132 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 152-25 chr10 110655344 110655556 + 1.25 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 11114 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 213-82 chr6 123114764 123115014 + 1.25 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 118654 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 227.75-66 chr5 40791604 40791848 + 1.25 NA intron (NM_001355028, intron 1 of 9) intron (NM_001355028, intron 1 of 9) 6451 NM_001355036 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 294-29 chr6 72742973 72743334 + 1.25 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 112658 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 188-40 chr2 124875834 124876105 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 21 of 23) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 850682 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 238-45 chr3 88242289 88242645 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92508 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 194-57 chr3 132718337 132718522 + 1.25 NA intron (NR_037804, intron 3 of 44) intron (NR_037804, intron 3 of 44) -3321 NR_152743 348808 Hs.586111 NR_002811 ENSG00000248724 NPHP3-AS1 NCRNA00119 NPHP3 antisense RNA 1 ncRNA 260.5-21 chr17 73067321 73067547 + 1.25 NA intron (NM_001352692, intron 3 of 9) intron (NM_001352692, intron 3 of 9) 25254 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 348.25-11 chr7 107411837 107412365 + 1.25 NA intron (NM_181733, intron 7 of 20) MIR|SINE|MIR -57956 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 315.25-2 chr1 180285115 180285401 + 1.25 NA Intergenic MER104|DNA|TcMar-Tc2 -10577 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-157 chr5 16162064 16162219 + 1.25 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 17650 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 213.75-20 chr11 77555636 77555843 + 1.25 NA Intergenic MER84-int|LTR|ERV1 -15350 NR_130930 646029 Hs.609654 NM_001039908 LOC646029 - uncharacterized LOC646029 ncRNA 358.5-3 chr11 133137681 133138373 + 1.25 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -194259 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 309.75-7 chr12 15298786 15299147 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -23542 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 114-138 chr5 127240894 127240998 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49818 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 159.5-51 chr14 23855299 23855547 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -98347 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 189-25 chr11 111159043 111159210 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -61808 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 225.25-26 chr16 59644100 59644316 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 110983 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 251-59 chr8 107270826 107271152 + 1.25 NA intron (NM_001199859, intron 7 of 8) intron (NM_001199859, intron 7 of 8) 65526 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 212.25-65 chr4 40615283 40615544 + 1.25 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 14451 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 119.5-162 chr4 2481334 2481470 + 1.25 NA intron (NM_001185009, intron 2 of 8) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 11949 NM_001185009 6047 Hs.66394 NM_002938 ENSG00000063978 RNF4 RES4-26|SLX5|SNURF ring finger protein 4 protein-coding 263.25-34 chr3 97341580 97342103 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -97766 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 175-34 chr14 20633436 20633722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8112 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 177.25-51 chr15 91373162 91373397 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90060 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 201.25-3 chr1 32630929 32631236 + 1.25 NA intron (NM_001366268, intron 4 of 6) AluJo|SINE|Alu 19468 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 248-54 chr4 10470184 10470439 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -12885 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 209.5-41 chr14 45879505 45879729 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -164015 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 268.75-26 chr22 33299785 33300021 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 12 of 14) intron (NM_133642, intron 12 of 14) 136766 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 185.75-43 chr14 57245646 57245874 + 1.25 NA intron (NM_006544, intron 3 of 17) intron (NM_006544, intron 3 of 17) 23145 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 155-146 chr8 127655273 127655435 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 78613 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 174-72 chr4 154286652 154286844 + 1.25 NA intron (NM_001358235, intron 13 of 19) L1MA3|LINE|L1 205051 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 220.25-65 chr5 179296825 179297131 + 1.25 NA intron (NM_014244, intron 2 of 21) intron (NM_014244, intron 2 of 21) 48483 NM_014244 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 219.5-101 chr5 63502838 63503124 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 459311 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 138.25-86 chr2 104451644 104451768 + 1.25 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) intron (NR_015399, intron 1 of 3) 17359 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 234.5-30 chr15 79419247 79419552 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13117 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 137.25-161 chr8 64966306 64966497 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -167664 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 145.5-188 chr8 19404993 19405224 + 1.25 NA non-coding (NR_148901, exon 10 of 10) non-coding (NR_148901, exon 10 of 10) 91132 NM_001174159 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 351.5-16 chr2 77107564 77108137 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 121885 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 311-30 chr8 86652217 86652502 + 1.25 NA intron (NM_019098, intron 7 of 17) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 91316 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 128.5-129 chr21 23993619 23993754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 327691 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 173.5-127 chr5 60146320 60146587 + 1.25 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) 226210 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 122.25-164 chr6 126186740 126186945 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152947 NM_001012507 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 230.5-89 chr4 81092749 81093019 + 1.25 NA intron (NM_006259, intron 17 of 18) L2a|LINE|L2 61273 NM_001282482 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 138.25-92 chr2 183066008 183066163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12662 NM_001142314 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 136-158 chr8 130841215 130841390 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 11 of 17) intron (NM_001115, intron 11 of 17) 199607 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 138-10 chr10 68392509 68392711 + 1.25 NA intron (NR_103476, intron 7 of 18) intron (NR_103476, intron 7 of 18) 14579 NM_017987 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 229.75-43 chr21 27572378 27572659 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149861 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 287.75-27 chr2 53611159 53611401 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -156503 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 351.75-13 chr2 71765046 71765562 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 298605 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 178.75-110 chr8 99534777 99534942 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) intron (NM_017890, intron 30 of 61) 1871 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 299.75-18 chr20 59913112 59913611 + 1.25 NA intron (NM_014258, intron 12 of 44) intron (NM_014258, intron 12 of 44) 20276 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 164.75-20 chr10 89754298 89754443 + 1.25 NA intron (NM_016195, intron 25 of 32) intron (NM_016195, intron 25 of 32) 52780 NM_001284259 9585 Hs.240 NM_016195 ENSG00000138182 KIF20B CT90|KRMP1|MPHOSPH1|MPP-1|MPP1 kinesin family member 20B protein-coding 324.5-40 chrX 88833355 88833872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86388 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 204-16 chr14 80276287 80276520 + 1.25 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -45346 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 337.5-8 chr11 109580987 109581540 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 159073 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 249.5-36 chr17 34690649 34690953 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 110052 NM_001304438 124842 Hs.310482 NM_207313 ENSG00000181291 TMEM132E DFNB99 transmembrane protein 132E protein-coding 161.75-62 chr2 62776605 62776842 + 1.25 NA intron (NM_001142615, intron 5 of 22) intron (NM_001142615, intron 5 of 22) 69826 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 296-34 chr4 87204529 87204903 + 1.25 NA intron (NM_001292006, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 15552 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 205.25-14 chr12 14977147 14977418 + 1.25 NA intron (NM_006205, intron 1 of 3) intron (NM_006205, intron 1 of 3) 4240 NM_006205 5149 Hs.54471 NM_006205 ENSG00000139053 PDE6H ACHM6|RCD3 phosphodiesterase 6H protein-coding 232.75-31 chr2 36172462 36172673 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 183003 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 258.75-28 chr16 26433335 26433555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 408208 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 228-63 chr5 23355271 23355516 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -152216 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 142.5-141 chr3 114466492 114466616 + 1.25 NA intron (NR_121661, intron 1 of 2) intron (NR_121661, intron 1 of 2) 12961 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 207.5-72 chr3 193288972 193289286 + 1.25 NA intron (NM_198505, intron 26 of 29) intron (NM_198505, intron 26 of 29) -18115 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 211.75-84 chr6 47912300 47912538 + 1.25 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 125351 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 253.75-28 chr20 41745452 41745707 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -127202 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 210.25-15 chr12 3871988 3872185 + 1.25 NA intron (NM_001286522, intron 1 of 7) MER39|LTR|ERV1 1313 NM_001286522 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 191.25-112 chr8 130834727 130835128 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 12 of 17) L1ME3Cz|LINE|L1 205982 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 203.75-79 chr4 45746455 45746937 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 377358 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 274-12 chr14 45383705 45384088 + 1.25 NA Intergenic LTR1F|LTR|ERV1 -130694 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 143.5-223 chr8 139816140 139816384 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -113139 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 199.25-51 chr19 31095193 31095409 + 1.25 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -72209 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 313.5-20 chr2 40988831 40989150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -476555 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 240.75-39 chr2 16767191 16767415 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -101469 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 140-173 chr9 24211092 24211229 + 1.25 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL 334516 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 308-24 chr4 94318220 94318596 + 1.25 NA intron (NM_014485, intron 2 of 5) L1MA5|LINE|L1 24428 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 291-29 chr6 92186254 92186523 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -495960 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 153.75-77 chr20 42311051 42311236 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 12 of 31) L2a|LINE|L2 -374340 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 139-12 chr10 22735049 22735242 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -20567 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 131.5-186 chr4 180233569 180233740 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 925495 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 148-111 chr6 34956020 34956175 + 1.25 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) HAL1|LINE|L1 66842 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 212.25-101 chr8 138398362 138398618 + 1.25 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 98771 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 163.75-40 chr13 28199403 28199568 + 1.25 NA intron (NM_175854, intron 5 of 18) intron (NM_175854, intron 5 of 18) -60311 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 338.25-2 chr1 233703904 233704507 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80053 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 158-75 chr2 63851437 63851751 + 1.25 NA intron (NM_006759, intron 1 of 9) intron (NM_006759, intron 1 of 9) 9714 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 198.75-63 chr3 170954751 170955036 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -46256 NM_020390 56648 Hs.164144 NM_020390 ENSG00000163577 EIF5A2 EIF-5A2|eIF5AII eukaryotic translation initiation factor 5A2 protein-coding 353.5-7 chr14 65960791 65961234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 489910 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 187.75-52 chr2 167130197 167130575 + 1.25 NA intron (NR_046665, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 10569 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-68 chr2 36768723 36768907 + 1.25 NA intron (NM_001177969, intron 7 of 14) intron (NM_001177969, intron 7 of 14) 72108 NM_001177970 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 138.25-60 chr16 71563536 71563668 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1414 NR_103852 100132529 Hs.710296 NR_103851 ENSG00000260886 TAT-AS1 - TAT antisense RNA 1 ncRNA 122.25-160 chr6 103345856 103345967 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 1513635 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 283.75-10 chr16 55395773 55396039 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 66391 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 288.5-29 chr3 119976221 119976655 + 1.25 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) L1MB7|LINE|L1 108210 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 445.5-9 chr9 87327490 87328188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -169389 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 236.75-10 chr10 43070806 43071130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6059 NM_020630 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 178.25-37 chr14 84971196 84971549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -300560 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 150.5-21 chr10 97097432 97097565 + 1.25 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) intron (NM_003061, intron 4 of 36) -5258 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 197.5-136 chr6 139425590 139425915 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 48844 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 143.75-160 chr6 96595900 96596056 + 1.25 NA intron (NM_020482, intron 2 of 6) L1MEd|LINE|L1 32853 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 263.5-51 chr5 44285095 44285410 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -103480 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 258-51 chr7 79850701 79851004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -283979 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 317.5-30 chr7 40083871 40084202 + 1.25 NA intron (NM_003718, intron 11 of 13) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 50586 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 193.25-7 chr1 221267598 221267865 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 68565 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 210.25-64 chr5 19614760 19615100 + 1.25 NA intron (NM_001349559, intron 5 of 12) AluSc8|SINE|Alu 271342 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 165.75-101 chr21 15580531 15580797 + 1.25 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -149270 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 225-44 chr2 226859056 226859309 + 1.25 NA intron (NM_001167608, intron 3 of 8) MER2|DNA|TcMar-Tigger 23128 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 174-55 chr2 233954153 233954550 + 1.25 NA intron (NM_024080, intron 10 of 25) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 36978 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 158.75-160 chr8 98316990 98317141 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -22830 NM_024759 79815 Hs.309489 NM_024759 ENSG00000104361 NIPAL2 NPAL2 NIPA like domain containing 2 protein-coding 201.75-42 chr17 79563649 79563901 + 1.25 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 47276 NM_001350451 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 227.5-50 chr2 28416309 28416601 + 1.25 NA 3' UTR (NM_005253, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_005253, exon 4 of 4) -21783 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 123.25-16 chr1 213939350 213939490 + 1.25 NA intron (NR_037850, intron 2 of 5) L1MEg|LINE|L1 14671 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 176.75-106 chr6 62658661 62658855 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -372531 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 286-20 chr2 63634260 63634612 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 45285 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 223.25-46 chr20 57916329 57916539 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -87470 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 262-28 chr2 77640007 77640458 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -117799 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 231.75-77 chr9 71975087 71975408 + 1.25 NA intron (NM_001365053, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu 63608 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 233.5-36 chr14 55774219 55774746 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 8237 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 209.5-91 chr3 30723340 30723698 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 116918 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 261.5-15 chr13 82724161 82724500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1158063 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 286.25-15 chr2 64846000 64846279 + 1.25 NA TTS (NR_110224) TTS (NR_110224) 17492 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 185.75-4 chr1 40126668 40126943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29335 NM_000310 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 263-48 chr7 7947675 7947921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20954 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 235.5-46 chr2 41445128 41445509 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -432237 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 186.5-52 chr17 61260872 61261063 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 106737 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 378.75-6 chr12 1516861 1517185 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 15169 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 141.25-152 chr6 39525030 39525154 + 1.25 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) intron (NM_001289021, intron 12 of 21) -93702 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 230-22 chr15 63765420 63765693 + 1.25 NA intron (NM_003922, intron 2 of 77) MER4B|LTR|ERV1 68392 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 209.5-59 chr2 14684068 14684314 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 51474 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 177.75-71 chr2 85155895 85156175 + 1.25 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) 22643 NM_031283 83439 Hs.516297 NM_031283 ENSG00000152284 TCF7L1 TCF-3|TCF3 transcription factor 7 like 1 protein-coding 298.25-4 chr10 83143824 83144101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 533127 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 200.75-10 chr1 226249356 226249547 + 1.25 NA intron (NM_001366237, intron 10 of 13) MIR3|SINE|MIR 25787 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 265.25-41 chr5 37196798 37197084 + 1.25 NA intron (NM_023073, intron 20 of 51) AluSx1|SINE|Alu -52105 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 170.75-84 chr22 37280058 37280219 + 1.25 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -2370 NM_013385 27128 Hs.170944 NM_013385 ENSG00000100055 CYTH4 CYT4|DJ63G5.1|PSCD4|cytohesin-4 cytohesin 4 protein-coding 280-28 chr2 116707422 116707802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1107079 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 228.5-22 chr11 26585039 26585352 + 1.25 NA intron (NM_031418, intron 14 of 26) intron (NM_031418, intron 14 of 26) -12932 NM_001135091 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 169.25-117 chr8 19367842 19368083 + 1.25 NA intron (NR_156444, intron 7 of 8) L1MA4|LINE|L1 53986 NM_001174159 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 286.5-55 chr6 46565859 46566188 + 1.25 NA intron (NM_016593, intron 10 of 11) intron (NM_016593, intron 10 of 11) -73956 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 232.25-28 chr16 22120135 22120360 + 1.25 NA intron (NM_173615, intron 12 of 33) MER113|DNA|hAT-Charlie 27706 NM_173615 146177 Hs.10697 NM_173615 ENSG00000175267 VWA3A - von Willebrand factor A domain containing 3A protein-coding 243-50 chr4 52708272 52708578 + 1.25 NA Intergenic (TCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3969 NR_024031 57291 Hs.744077 NR_024031 ENSG00000226950 DANCR AGU2|ANCR|KIAA0114|SNHG13|lncRNA-ANCR differentiation antagonizing non-protein coding RNA ncRNA 207.5-36 chr17 47930988 47931176 + 1.25 NA intron (NR_103857, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 10322 NR_103857 100506325 Hs.656008 NR_103856 ENSG00000234494 SP2-AS1 - SP2 antisense RNA 1 ncRNA 214.5-94 chr4 120001498 120001788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62103 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 166.25-144 chr8 132291910 132292110 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 155252 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 263.75-44 chr5 146903150 146903520 + 1.25 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 16171 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 210.5-56 chr18 62528656 62528882 + 1.25 NA intron (NR_126534, intron 1 of 14) intron (NR_126534, intron 1 of 14) 5744 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 125.75-98 chr2 125962571 125962677 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 155361 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 256.5-53 chr4 135266315 135266580 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -142888 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 192-31 chr11 102364783 102365214 + 1.25 NA intron (NM_001256163, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 17624 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 201.25-16 chr10 108158670 108158857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -89470 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 156.75-71 chr17 75628774 75629060 + 1.25 NA intron (NM_004259, intron 16 of 19) intron (NM_004259, intron 16 of 19) -4517 NM_001162995 643008 Hs.528605 NM_001162995 ENSG00000204323 SMIM5 C17orf109|PP12104 small integral membrane protein 5 protein-coding 276.5-31 chr2 46988548 46988881 + 1.25 NA intron (NM_001288951, intron 5 of 20) intron (NM_001288951, intron 5 of 20) -46859 NM_001171508 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 274.75-5 chr11 130923432 130923683 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7070 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 265.25-28 chr20 52397031 52397408 + 1.25 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -205234 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 184.75-41 chr19 33572124 33572339 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -49722 NM_001127895 64377 Hs.165724 NM_022467 ENSG00000124302 CHST8 GALNAC4ST1|GalNAc4ST|PSS3 carbohydrate sulfotransferase 8 protein-coding 327.5-31 chr8 116102977 116103392 + 1.25 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 221875 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 227.75-59 chr4 128380248 128380521 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47632 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 179-34 chr14 63926502 63926795 + 1.25 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) intron (NM_015180, intron 2 of 114) 73644 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 289.5-19 chr17 66589586 66589963 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -172920 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 187.25-96 chr7 46512986 46513274 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 183992 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 146.25-127 chr6 129726416 129726578 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16320 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 187-21 chr11 15959790 15959995 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9729 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 172.5-157 chr5 95275058 95275215 + 1.25 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) intron (NM_024717, intron 1 of 22) 9439 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 188.75-33 chr15 61642254 61642468 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -87557 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 187-23 chr12 27460005 27460346 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6635 NM_001145010 341346 Hs.282121 NM_001145010 ENSG00000165935 SMCO2 C12orf70 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2 protein-coding 313.25-8 chr12 46274566 46275029 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5754 NM_001278387 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 195-98 chr9 34806973 34807254 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 31473 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 144.75-195 chr9 128228597 128228767 + 1.25 NA intron (NM_001288739, intron 10 of 21) L1ME4c|LINE|L1 16148 NR_029619 406978 NR_029619 ENSG00000207581 MIR199B MIRN199B|mir-199b microRNA 199b ncRNA 212.25-95 chr8 80030043 80030266 + 1.25 NA exon (NM_014018, exon 1 of 3) exon (NM_014018, exon 1 of 3) 105 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 125-123 chr5 13011415 13011573 + 1.25 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 21392 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 292.25-25 chr22 25192659 25193006 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001145206, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001145206, exon 11 of 11) -7026 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 196.75-102 chr7 80727354 80727563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80805 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 266.25-5 chr11 29963033 29963390 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19182 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 163-115 chr7 139589778 139590040 + 1.25 NA intron (NM_001113239, intron 12 of 14) intron (NM_001113239, intron 12 of 14) 66224 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 407-11 chr5 54523039 54523603 + 1.25 NA intron (NM_001145427, intron 1 of 1) intron (NM_001145427, intron 1 of 1) 5562 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 159-76 chr4 60188474 60188669 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -734048 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 206-25 chr14 57403772 57404011 + 1.25 NA intron (NM_001011713, intron 4 of 4) intron (NM_001011713, intron 4 of 4) 13305 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 196.25-107 chr6 68080127 68080297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24861 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 295.25-2 chr1 220439176 220439495 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88801 NM_018650 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 155.75-124 chr4 124651181 124651420 + 1.25 NA Intergenic LTR12D|LTR|ERV1 61432 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 201.25-17 chr10 108676159 108676342 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -606957 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 204-41 chr2 239631212 239631458 + 1.25 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -131525 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 145-24 chr10 44910066 44910220 + 1.25 NA intron (NR_033842, intron 2 of 7) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -1173 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 242.25-25 chr14 46778401 46778708 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -126773 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 225-67 chr6 128734808 128735100 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -148184 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 134.75-193 chr7 35826713 35826867 + 1.25 NA intron (NM_001788, intron 1 of 12) intron (NM_001788, intron 1 of 12) 25571 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 220.75-70 chr7 99200193 99200431 + 1.25 NA intron (NM_001145715, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 7177 NM_001145715 402569 Hs.253050 NM_001145715 ENSG00000185467 KPNA7 IPOA8 karyopherin subunit alpha 7 protein-coding 125.5-116 chr18 6995754 6995889 + 1.25 NA intron (NM_005559, intron 33 of 62) intron (NM_005559, intron 33 of 62) 41144 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 233.25-40 chr20 55026775 55027145 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -396083 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 146.75-31 chr12 29263496 29263620 + 1.25 NA intron (NM_001271784, intron 1 of 10) L1MA3|LINE|L1 39892 NM_001271784 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 249-47 chr7 94572166 94572433 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 62490 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 241.25-41 chr22 26316982 26317209 + 1.25 NA intron (NM_001184776, intron 9 of 14) L2b|LINE|L2 -112165 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 133.75-106 chr2 154073858 154074024 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 129547 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 294.75-12 chr2 20930364 20930808 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -107456 NM_001282721 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 231.75-12 chr11 77214165 77214521 + 1.25 NA intron (NM_001127180, intron 48 of 48) intron (NM_001127180, intron 48 of 48) 86097 NM_000260 4647 Hs.370421 NM_000260 ENSG00000137474 MYO7A DFNA11|DFNB2|MYOVIIA|MYU7A|NSRD2|USH1B myosin VIIA protein-coding 226.5-38 chr2 13143404 13143688 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -136533 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 214-49 chr5 16000005 16000191 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 64916 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 292-23 chr19 27361486 27361986 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -431695 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 161.75-65 chr2 115229586 115229805 + 1.25 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) (CTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 67540 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 146.5-91 chr18 48038737 48039076 + 1.25 NA intron (NM_001371287, intron 5 of 5) intron (NM_001371287, intron 5 of 5) 98242 NM_001039360 201501 Hs.515388 NM_001039360 ENSG00000184828 ZBTB7C APM-1|APM1|ZBTB36|ZNF857C zinc finger and BTB domain containing 7C protein-coding 265.75-56 chr4 160836726 160836996 + 1.25 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -1059077 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 332.75-2 chr10 13861004 13861463 + 1.25 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 110663 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 233.5-100 chr7 21378156 21378411 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -49800 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 159.25-153 chr8 112705004 112705193 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L2b|LINE|L2 61605 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 183.75-79 chr3 179574472 179574756 + 1.25 NA intron (NM_004301, intron 5 of 13) (TTTTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11688 NM_004301 86 Hs.435326 NM_004301 ENSG00000136518 ACTL6A ACTL6|ARPN-BETA|Arp4|BAF53A|INO80K actin like 6A protein-coding 216.75-62 chr5 98501402 98501588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -267137 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 202-3 chr1 73964535 73964950 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 233434 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 285.25-28 chr5 24664462 24664941 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -19723 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 270.75-26 chr2 64793035 64793304 + 1.25 NA Intergenic (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 70462 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 209.5-88 chr22 48363159 48363499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88965 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 197.5-62 chr2 4299964 4300166 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 325904 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 185.75-78 chr20 57192515 57192687 + 1.25 NA intron (NM_001719, intron 3 of 6) intron (NM_001719, intron 3 of 6) -21095 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 169.75-114 chr4 69473079 69473254 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 22739 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 312.25-21 chr5 97734286 97734781 + 1.25 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -106225 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 153.5-177 chr7 14457368 14457584 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 383974 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 180.5-133 chr6 150718292 150718475 + 1.25 NA intron (NM_001329800, intron 1 of 15) intron (NM_001329800, intron 1 of 15) -2716 NM_001329801 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 208.75-66 chr5 87750005 87750228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88074 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 222.5-26 chr12 59184277 59184590 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -263895 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 144.25-68 chr16 2335134 2335266 + 1.25 NA intron (NM_001089, intron 1 of 32) intron (NM_001089, intron 1 of 32) 5528 NM_001089 21 Hs.26630 NM_001089 ENSG00000167972 ABCA3 ABC-C|ABC3|EST111653|LBM180|SMDP3 ATP binding cassette subfamily A member 3 protein-coding 197.75-28 chr16 51022468 51022657 + 1.25 NA intron (NR_110913, intron 2 of 2) intron (NR_110913, intron 2 of 2) 4804 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 267.5-56 chr4 168681576 168681952 + 1.25 NA intron (NM_001166108, intron 4 of 21) AluJb|SINE|Alu 50186 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 304.5-18 chr2 20565042 20565427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27314 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 248.25-11 chr11 87972071 87972310 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203253 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 182.25-112 chr7 42569314 42569597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 136992 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 321.5-25 chr3 163365800 163366356 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -62777 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 130.25-123 chr22 23056529 23056647 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -13931 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 290.75-11 chr13 60974584 60975035 + 1.25 NA Intergenic LTR35B|LTR|ERV1 225071 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 249-4 chr10 82677341 82677754 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -444627 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 182.25-110 chr7 24895545 24895778 + 1.25 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) -3040 NM_145320 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 188.75-11 chr10 62242501 62242693 + 1.25 NA intron (NM_001282941, intron 3 of 4) L1M6|LINE|L1 26247 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 323.75 chr1 9284212 9284761 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8408 NM_025106 80176 Hs.8261 NM_025106 ENSG00000171621 SPSB1 SSB-1|SSB1 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 protein-coding 143.25-167 chr7 9308230 9308418 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -325946 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 167.75-89 chr20 55991153 55991434 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14226 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 340.75 chr1 31332843 31333148 + 1.25 NA intron (NM_001282571, intron 3 of 6) L1ME4a|LINE|L1 36013 NM_016505 51538 Hs.524094 NM_016505 ENSG00000121766 ZCCHC17 HSPC251|PS1D|pNO40 zinc finger CCHC-type containing 17 protein-coding 244.5-101 chr8 130545549 130545897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -102049 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 247.25-62 chr9 91668241 91668595 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -32073 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 188.25-123 chr8 127484117 127484298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2068 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 168-40 chr12 65586373 65586584 + 1.25 NA intron (NR_120434, intron 3 of 4) intron (NR_120434, intron 3 of 4) -16391 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 361-4 chr11 12970077 12970555 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 19232 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 234.5-92 chr8 30637923 30638236 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001206847) promoter-TSS (NM_001206847) -501 NM_001206847 100507341 Hs.659493 NM_001206847 ENSG00000253457 SMIM18 - small integral membrane protein 18 protein-coding 190.25-53 chr17 72813425 72813678 + 1.25 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -173079 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 180-45 chr17 32191977 32192201 + 1.25 NA intron (NM_001033566, intron 8 of 19) intron (NM_001033566, intron 8 of 19) -40518 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 148.5-231 chr8 124780211 124780418 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41671 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 117.25-223 chr9 96457885 96458054 + 1.25 NA intron (NM_014282, intron 1 of 7) intron (NM_014282, intron 1 of 7) 7800 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 244.25-18 chr18 6966828 6967052 + 1.25 NA intron (NM_005559, intron 48 of 62) intron (NM_005559, intron 48 of 62) 12263 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 166.5-61 chr14 55668625 55668818 + 1.25 NA intron (NR_073129, intron 35 of 45) L1MC5|LINE|L1 88514 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 177.5-14 chr10 55211510 55211767 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -387404 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 273.75-45 chr8 144167725 144168147 + 1.25 NA intron (NM_001099281, intron 2 of 11) intron (NM_001099281, intron 2 of 11) 19291 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 126.75-62 chr14 71651998 71652138 + 1.25 NA intron (NM_001354286, intron 9 of 24) intron (NM_001354286, intron 9 of 24) 65770 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 160.25-114 chr4 103457999 103458258 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33086 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 255.25-55 chr8 111341928 111342217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34567 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 290.25-31 chr7 20796679 20796926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9916 NM_182700 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 177.5-39 chr13 41123626 41124069 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 8955 NM_152903 89890 Hs.534040 NM_152903 ENSG00000165572 KBTBD6 - kelch repeat and BTB domain containing 6 protein-coding 127.75-167 chr6 28370723 28370901 + 1.25 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 11793 NR_160527 9753 Hs.134816 NM_014724 ENSG00000158691 ZSCAN12 ZFP96|ZNF29K1|ZNF305|ZNF96|dJ29K1.2 zinc finger and SCAN domain containing 12 protein-coding 172.25-39 chr14 78997390 78997559 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -202508 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 231.75-61 chr5 51077464 51077965 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -107527 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 252.5-5 chr1 234101228 234101513 + 1.25 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -112841 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 136.75-65 chr15 71992517 71992659 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 10 of 41) intron (NM_006901, intron 10 of 41) -121670 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 168-50 chr14 72099664 72099955 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) (TAGTAGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 166282 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 190.75-51 chr2 81405844 81406046 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 61001 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 335.75 chr1 52042085 52042435 + 1.25 NA intron (NM_015913, intron 1 of 6) intron (NM_015913, intron 1 of 6) -8450 NM_138417 112970 Hs.476033 NM_138417 ENSG00000198841 KTI12 SBBI81|TOT4 KTI12 chromatin associated homolog protein-coding 124.5-96 chr2 4974210 4974465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -318115 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 174-35 chr16 47737376 47737528 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -121129 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 229.75-66 chr6 160136906 160137283 + 1.25 NA intron (NM_153187, intron 6 of 9) intron (NM_153187, intron 6 of 9) 15263 NM_153187 6580 Hs.117367 NM_003057 ENSG00000175003 SLC22A1 HOCT1|OCT1|oct1_cds solute carrier family 22 member 1 protein-coding 333-6 chr11 106994297 106994748 + 1.25 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) L3b|LINE|CR1 23954 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 355.75-2 chr12 29532959 29533388 + 1.25 NA intron (NM_001367875, intron 13 of 19) intron (NM_001367875, intron 13 of 19) -33480 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 184.5-21 chr10 68173477 68173978 + 1.25 NA intron (NR_045663, intron 9 of 17) AluJb|SINE|Alu 58386 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 247.25-38 chr22 20905436 20905812 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11783 NM_005207 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 182-14 chr10 107346889 107347100 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -182288 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 427.25-6 chr8 14649022 14649592 + 1.25 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 204203 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 160.5-24 chr11 37701659 37701913 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -236815 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 376.75-12 chr3 121497603 121497993 + 1.25 NA intron (NM_199420, intron 13 of 29) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 48190 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 269-29 chr2 123863004 123863335 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 162005 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 255.25-16 chr15 76841363 76841651 + 1.25 NA intron (NR_148227, intron 5 of 32) AluSz|SINE|Alu 20437 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 190.25-69 chr2 152252911 152253131 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -77258 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 257.75-10 chr11 101389752 101390229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129915 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 163.75-82 chr20 55271635 55271931 + 1.25 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -151260 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 141.5-36 chr12 24038632 24038809 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -87688 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 193.5-18 chr10 89517437 89517731 + 1.25 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) AluJr4|SINE|Alu 18010 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 223.5-117 chr7 42774650 42774951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68353 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 182-50 chr17 71939128 71939291 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 86770 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 244.5-89 chr7 52999688 52999999 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35790 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 188.5-163 chr8 141284691 141284901 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30167 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 184.25-16 chr10 17941524 17941800 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10177 NM_001282734 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 215.25-20 chr12 49316905 49317127 + 1.25 NA intron (NR_120449, intron 2 of 7) AluSx3|SINE|Alu -6239 NM_001100620 10024 Hs.524399 NM_005480 ENSG00000135451 TROAP TASTIN trophinin associated protein protein-coding 229.5-76 chr20 3345948 3346315 + 1.25 NA intron (NM_001009984, intron 8 of 36) L1MC4a|LINE|L1 61531 NM_001009984 25943 Hs.516853 NM_001009984 ENSG00000088854 C20orf194 - chromosome 20 open reading frame 194 protein-coding 223-69 chr5 127455924 127456249 + 1.25 NA intron (NM_001256545, intron 24 of 24) intron (NM_001256545, intron 24 of 24) -61554 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 230.5-21 chr11 43479129 43479445 + 1.25 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) intron (NM_018259, intron 21 of 23) -80369 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 336.5-10 chr14 60609881 60610349 + 1.25 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -29101 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 136.5-219 chr8 33824630 33824833 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -224625 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 214.25-35 chr18 77009037 77009297 + 1.25 NA intron (NM_001025090, intron 1 of 5) intron (NM_001025090, intron 1 of 5) 7888 NM_001025081 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 122.5-25 chr10 56658567 56658718 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -297369 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 112.25-121 chr3 23737711 23737880 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -68160 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 391.25-6 chr11 58267551 58268035 + 1.25 NA exon (NM_207374, exon 1 of 1) exon (NM_207374, exon 1 of 1) 467 NM_207374 81341 Hs.531507 NM_207374 ENSG00000172772 OR10W1 OR10W1P|OR10W1Q|OR11-236|UNQ6469 olfactory receptor family 10 subfamily W member 1 protein-coding 129-181 chr8 108673208 108673384 + 1.25 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 114298 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 285.75-18 chr2 55342301 55342660 + 1.25 NA intron (NM_001254943, intron 12 of 33) MIR|SINE|MIR 60161 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 150.75-132 chr3 163588064 163588303 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -284882 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 342.75-28 chr8 80723717 80724031 + 1.25 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 150594 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 200.5-90 chr3 78594155 78594428 + 1.25 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 425168 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 143-119 chr5 104415971 104416214 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -683382 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 212.25-102 chr9 12514368 12514679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -178862 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 174.75-136 chr9 27130009 27130266 + 1.25 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) L1MD|LINE|L1 20996 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 206-72 chr7 96694153 96694345 + 1.25 NA intron (NM_006304, intron 2 of 2) L1MB5|LINE|L1 15597 NR_163953 189.75-10 chr10 63052786 63052992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80358 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 401.5-14 chr5 51476339 51476694 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 93068 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 245.75-2 chr1 74437641 74438019 + 1.25 NA intron (NM_015978, intron 19 of 24) MER5B|DNA|hAT-Charlie 45610 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 237.75-29 chr17 68765661 68766064 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 137708 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 172.75-121 chr7 151686311 151686532 + 1.25 NA intron (NM_016203, intron 3 of 15) intron (NM_016203, intron 3 of 15) 49842 NM_001363698 51422 Hs.647072 NM_016203 ENSG00000106617 PRKAG2 AAKG|AAKG2|CMH6|H91620p|WPWS protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 2 protein-coding 504-6 chr8 101975449 101976167 + 1.25 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) -8624 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 137.75-135 chr3 81743283 81743540 + 1.25 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18234 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 137-78 chr2 67895051 67895248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69587 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 139.25-38 chr12 40688628 40688876 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3687 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 298-22 chr4 77999422 77999831 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57697 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 156.75-31 chr11 4371393 4371603 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -3112 NM_001005161 143496 Hs.447463 NM_001005161 ENSG00000221996 OR52B4 OR11-3 olfactory receptor family 52 subfamily B member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 133.75-201 chr9 74677191 74677365 + 1.25 NA intron (NM_006914, intron 9 of 9) intron (NM_006914, intron 9 of 9) 61744 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 269-28 chr2 43950351 43950669 + 1.25 NA intron (NM_133259, intron 15 of 37) intron (NM_133259, intron 15 of 37) 45479 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 291.25-16 chr2 82649554 82649882 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -207085 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 227-40 chr22 40072240 40072523 + 1.25 NA intron (NM_001024843, intron 1 of 23) intron (NM_001024843, intron 1 of 23) 27564 NM_001024843 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 267.75-63 chr8 144930307 144930653 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001029976, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001029976, exon 4 of 4) 20400 NM_001029976 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 171.5-55 chr16 74575349 74575550 + 1.25 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) MER104|DNA|TcMar-Tc2 31665 NM_012201 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 247.5-26 chr15 43972003 43972322 + 1.25 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -93991 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 294.25-31 chr6 144701842 144702207 + 1.25 NA intron (NM_007124, intron 52 of 73) intron (NM_007124, intron 52 of 73) 296369 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 247.5-14 chr12 8090505 8090762 + 1.25 NA intron (NR_024260, intron 3 of 6) AluSq2|SINE|Alu 8359 NM_015509 25977 Hs.555927 NM_015509 ENSG00000089818 NECAP1 EIEE21 NECAP endocytosis associated 1 protein-coding 150.5-123 chr22 26473889 26474102 + 1.25 NA intron (NR_146315, intron 4 of 14) L1ME2z|LINE|L1 5493 NR_073136 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 208.5-144 chr8 122654720 122654954 + 1.25 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 39269 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 264-61 chr8 32452929 32453213 + 1.25 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 12325 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 209.75-85 chr6 138152812 138153058 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -9004 NM_020340 57221 Hs.194408 NM_020340 ENSG00000112379 ARFGEF3 A7322|BIG3|C6orf92|KIAA1244|PPP1R33|dJ171N11.1 ARFGEF family member 3 protein-coding 230.75-29 chr17 67557673 67557933 + 1.25 NA intron (NM_181671, intron 4 of 9) intron (NM_181671, intron 4 of 9) -86218 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 222.75-30 chr12 74163785 74164144 + 1.25 NA intron (NR_038300, intron 4 of 6) intron (NR_038300, intron 4 of 6) 128667 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 159.25-15 chr10 17372591 17372780 + 1.25 NA intron (NM_001004470, intron 3 of 7) intron (NM_001004470, intron 3 of 7) -14251 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 193.25-69 chr3 34763536 34763844 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 630333 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 145.75-12 chr10 21658436 21658665 + 1.25 NA intron (NM_001195626, intron 9 of 22) L1ME1|LINE|L1 124378 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 179.25-147 chr8 133197943 133198162 + 1.25 NA intron (NM_001204870, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR 7013 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 146-24 chr12 1397613 1397865 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 16 of 19) L1MC5a|LINE|L1 -102752 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 219.5-49 chr16 82285854 82286180 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -115793 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 195.25-89 chr8 32940525 32940739 + 1.25 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 218797 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 313.5-33 chr7 47167237 47167636 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 297367 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 241.25-15 chr12 9931772 9932024 + 1.25 NA intron (NM_207375, intron 1 of 4) intron (NM_207375, intron 1 of 4) 472 NM_001130711 387836 Hs.527665 NM_207375 ENSG00000188393 CLEC2A INPE5792|KACL|PILAR|UNQ5792 C-type lectin domain family 2 member A protein-coding 154.25-150 chr6 152626905 152627097 + 1.25 NA intron (NM_182961, intron 3 of 145) intron (NM_182961, intron 3 of 145) 9850 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 168.25-110 chr4 171331779 171331992 + 1.25 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 145701 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 275.75-27 chr20 41822349 41822753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204174 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 227.75-14 chr11 20245212 20245595 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84928 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 250.25-23 chr2 57426320 57426619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -481182 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 180.75-30 chr12 79813195 79813359 + 1.25 NA intron (NM_001244990, intron 10 of 24) intron (NM_001244990, intron 10 of 24) 100634 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 240.5-3 chr1 94060156 94060437 + 1.25 NA intron (NM_000350, intron 14 of 49) intron (NM_000350, intron 14 of 49) 60852 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 144.25-102 chr2 149476322 149476489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110953 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 352.75-8 chr2 49259395 49259914 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -105127 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 202.5-132 chr7 14091592 14091824 + 1.25 NA Intergenic Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger -100283 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 179-63 chr22 22928002 22928249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40309 NM_001178126 100423062 Hs.449574 NM_001178126 ENSG00000254709 IGLL5 IGL|IGLV|VL-MAR immunoglobulin lambda like polypeptide 5 protein-coding 204.25-94 chr5 117385254 117385538 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -30116 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 162-80 chr3 186729965 186730205 + 1.25 NA intron (NM_001102416, intron 5 of 9) intron (NM_001102416, intron 5 of 9) 12726 NM_000893 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 227.25-84 chr8 136407824 136408037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122868 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 179.75-24 chr11 37869909 37870227 + 1.25 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger -68533 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 213-24 chr12 48024220 48024522 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -19895 NM_001844 1280 Hs.408182 NM_001844 ENSG00000139219 COL2A1 ANFH|AOM|COL11A3|SEDC|STL1 collagen type II alpha 1 chain protein-coding 233.25-2 chr1 49810523 49810900 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) intron (NM_001323575, intron 2 of 12) 213243 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 224-21 chr15 68051662 68052031 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -2333 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 254.75-33 chr3 84443999 84444263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 425444 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 356.25-17 chr7 28530823 28531230 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) 95411 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 180.75-36 chr14 38172080 38172312 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -35708 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 233.5-57 chr2 130815813 130816090 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -20963 NM_001367493 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 287-18 chr19 6955536 6956010 + 1.25 NA intron (NR_024075, intron 14 of 15) MIRb|SINE|MIR 35073 NR_024075 326342 Hs.688043 NM_001080498 ENSG00000268758 ADGRE4P EMR4|EMR4P|FIRE|GPR127|PGR16 adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene pseudo 193.5-159 chr8 15190818 15191095 + 1.25 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 47475 NM_001322881 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 292.25-3 chr1 70640847 70641270 + 1.25 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -65395 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 135.5-35 chr11 46217412 46217545 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 45523 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 180-119 chrX 23153670 23153916 + 1.25 NA intron (NR_073010, intron 2 of 11) AluY|SINE|Alu 139353 NR_073010 100873065 Hs.628459 NR_046436 PTCHD1-AS DDX53-AS1|PTCHD1AS1|PTCHD1AS2 PTCHD1 antisense RNA (head to head) ncRNA 185.75-8 chr1 180225008 180225172 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5174 NM_033343 89884 Hs.658487 NM_033343 ENSG00000121454 LHX4 CPHD4 LIM homeobox 4 protein-coding 379-6 chr3 28127952 28128309 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -113489 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 319-33 chr6 38659907 38660340 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -20194 NM_001099272 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 206.5-27 chr14 61993845 61994069 + 1.25 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 66262 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 233.25-50 chr4 2223169 2223390 + 1.25 NA intron (NM_181808, intron 3 of 25) MER1B|DNA|hAT-Charlie 18842 NM_001303143 79441 Hs.665869 NM_024511 ENSG00000214367 HAUS3 C4orf15|IT1|dgt3 HAUS augmin like complex subunit 3 protein-coding 268-33 chr2 223875519 223875988 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020830, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_020830, exon 12 of 12) -38171 NM_001039569 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 371-6 chr11 89219981 89220636 + 1.25 NA intron (NM_000372, intron 2 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 42433 NM_000372 7299 Hs.503555 NM_000372 ENSG00000077498 TYR ATN|CMM8|OCA1|OCA1A|OCAIA|SHEP3 tyrosinase protein-coding 477.75-4 chr18 9290674 9291400 + 1.25 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -43736 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 152.5-195 chr8 122321094 122321256 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 247469 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 122.75-39 chr12 77532183 77532330 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -298638 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 211.75-38 chr18 22451361 22451655 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -33593 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 144-49 chr17 77644585 77644920 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 83807 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 118.5-196 chr7 69937911 69938026 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 339493 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 204.5-67 chr2 77982978 77983230 + 1.25 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1PA15|LINE|L1 -28078 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 143.75-169 chr7 14928307 14928439 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 1 of 24) intron (NM_001350717, intron 1 of 24) -24717 NM_001350712 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 406.75-10 chr4 58969408 58969936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14610 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 171.25-151 chr8 115773260 115773454 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104382 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 173.5-122 chr5 9139380 9139612 + 1.25 NA intron (NM_003966, intron 12 of 22) intron (NM_003966, intron 12 of 22) -85601 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 141.75-116 chr3 68114567 68114829 + 1.25 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L1ME3B|LINE|L1 110451 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 196.5-166 chr8 112799548 112799773 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 156167 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 128.25-7 chr1 64582751 64583043 + 1.25 NA intron (NM_020925, intron 3 of 26) MIRc|SINE|MIR 3050 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 332-24 chr8 9794715 9795171 + 1.25 NA Intergenic (AAGACAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 53271 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 233-54 chr6 106298670 106299017 + 1.25 NA intron (NR_104403, intron 1 of 4) intron (NR_104403, intron 1 of 4) 17423 NR_104403 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 131.5-246 chr9 31357101 31357301 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24289 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 232.5-72 chr3 110336889 110337166 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 732932 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-161 chr8 64863440 64863710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64838 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 306.5-37 chr8 123745221 123745613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8024 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 146.75-103 chr3 103632247 103632389 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -108202 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 164.25-40 chr14 67296226 67296415 + 1.25 NA intron (NM_001256550, intron 4 of 14) AluY|SINE|Alu 54885 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 151.25-79 chr2 22224830 22225121 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -311504 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 267.75-7 chr11 24666839 24667089 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 169911 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 207.25-42 chr2 99042882 99043189 + 1.25 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) intron (NR_146001, intron 15 of 18) 98145 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 352.75-11 chr2 194290563 194290987 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53494 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 385.25-11 chr7 41563397 41563968 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130237 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 137.75-168 chr5 133734499 133734649 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -122033 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 216-65 chr5 107433105 107433288 + 1.25 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 237741 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 301.5-5 chr1 167588108 167588440 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -34512 NM_003851 8804 Hs.5710 NM_003851 ENSG00000143162 CREG1 CREG cellular repressor of E1A stimulated genes 1 protein-coding 252-36 chr2 120880129 120880407 + 1.25 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) intron (NM_005270, intron 2 of 13) 87987 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 275.75-14 chr13 88415186 88415487 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -125493 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 133.5-170 chr3 188940430 188940739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7055 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 207.5-23 chr14 77584646 77584943 + 1.25 NA intron (NM_004863, intron 2 of 11) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31973 NM_004863 9517 Hs.435661 NM_004863 ENSG00000100596 SPTLC2 HSN1C|LCB2|LCB2A|NSAN1C|SPT2|hLCB2a serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 protein-coding 212-50 chr21 17850385 17850622 + 1.25 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -31147 NM_001100420 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 240.5-41 chr17 63077363 63077795 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) L1MEj|LINE|L1 111344 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 163.25-45 chr14 64072985 64073217 + 1.25 NA intron (NM_015180, intron 52 of 114) MER21C|LTR|ERVL 22024 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 174-37 chr16 69612215 69612404 + 1.25 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) intron (NM_138714, intron 2 of 15) 46343 NM_006599 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 168.5-113 chr3 56529854 56530244 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -27107 NR_148376 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 287.25-41 chr5 123730064 123730536 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 184883 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 177-65 chr3 123647812 123648039 + 1.25 NA intron (NM_001321309, intron 25 of 32) intron (NM_001321309, intron 25 of 32) -27377 NM_053031 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 153.25-146 chr9 87358336 87358688 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -138716 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 277-23 chr2 234683334 234683765 + 1.25 NA intron (NR_132376, intron 1 of 2) intron (NR_132376, intron 1 of 2) 881 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 343.5-17 chr4 76362516 76362825 + 1.25 NA intron (NM_001042784, intron 11 of 23) intron (NM_001042784, intron 11 of 23) 44635 NM_001042784 339965 Hs.529680 NM_178555 ENSG00000163749 CCDC158 - coiled-coil domain containing 158 protein-coding 230.25-83 chr8 119588807 119589170 + 1.25 NA intron (NM_001330600, intron 13 of 25) MIRb|SINE|MIR 4020 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 226.5-72 chr4 101930112 101930319 + 1.25 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) L2b|LINE|L2 116373 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 231.5-48 chr2 119967802 119968065 + 1.25 NA exon (NM_002830, exon 26 of 27) exon (NM_002830, exon 26 of 27) -45144 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 217-84 chrX 21162666 21162920 + 1.25 NA Intergenic Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -211625 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 226.75-82 chr9 98187760 98188034 + 1.25 NA intron (NM_052820, intron 1 of 11) intron (NM_052820, intron 1 of 11) 4740 NM_052820 7464 Hs.113094 NM_003389 ENSG00000106789 CORO2A CLIPINB|IR10|WDR2 coronin 2A protein-coding 236.25-10 chr10 29213384 29213665 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -75546 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 221.5-80 chr6 37778724 37778936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40897 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 239.75-78 chr8 139486589 139486861 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 216398 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 384.5-12 chr4 7230996 7231491 + 1.25 NA intron (NM_020777, intron 1 of 26) MLT2B4|LTR|ERVL 38705 NM_020777 57537 Hs.479099 NM_020777 ENSG00000184985 SORCS2 - sortilin related VPS10 domain containing receptor 2 protein-coding 262.25-11 chr11 39019642 39020054 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 370990 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 261.75 chr1 222552527 222552985 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4652 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 117.5-122 chr20 1856746 1856981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37304 NM_001330728 140885 Hs.581021 NM_080792 ENSG00000198053 SIRPA BIT|CD172A|MFR|MYD-1|P84|PTPNS1|SHPS1|SIRP signal regulatory protein alpha protein-coding 273-24 chr14 87677217 87677638 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -22133 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 156-23 chr11 12417561 12417803 + 1.25 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) intron (NM_018222, intron 1 of 12) 40111 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 280.5-20 chr18 64474076 64474466 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -214216 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 342.25-19 chr8 89774454 89774962 + 1.25 NA intron (NM_003821, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 16892 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 176.25-52 chr17 71560480 71560820 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -358471 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 254.25-2 chr1 83896387 83896691 + 1.25 NA intron (NM_001350215, intron 17 of 19) intron (NM_001350215, intron 17 of 19) -35543 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 129-56 chr13 79454007 79454150 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -27046 NM_019080 54602 Hs.525093 NM_019080 ENSG00000102471 NDFIP2 N4WBP5A Nedd4 family interacting protein 2 protein-coding 176.5-95 chr2 102787575 102787840 + 1.25 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) intron (NM_001321346, intron 3 of 3) 25676 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 218.75-62 chr4 47855704 47855942 + 1.25 NA intron (NR_103795, intron 20 of 23) intron (NR_103795, intron 20 of 23) -17717 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 330-10 chr15 78567770 78568378 + 1.25 NA intron (NM_001307945, intron 1 of 5) intron (NM_001307945, intron 1 of 5) 2554 NM_001307945 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 150.75-127 chr3 40318553 40318740 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 8939 NM_005875 10289 Hs.315230 NM_005875 ENSG00000114784 EIF1B GC20 eukaryotic translation initiation factor 1B protein-coding 482.5-4 chr2 37339289 37339837 + 1.25 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -5067 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 237-67 chr8 31594780 31595099 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44813 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 195-54 chr20 55837194 55837463 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 168191 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 192.75-42 chr16 83425049 83425365 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -83139 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 398.25-12 chr8 132569801 132570305 + 1.25 NA TTS (NM_001321963) TTS (NM_001321963) -8574 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 231-51 chr3 97556396 97556746 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 11 of 17) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 116964 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 294.25-30 chr5 98649863 98650220 + 1.25 NA Intergenic (CACACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -118591 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 194.5-38 chr14 60013482 60013712 + 1.25 NA intron (NR_075071, intron 23 of 32) L1MDa|LINE|L1 -78314 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 236.75-12 chr10 77707617 77707939 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -69970 NM_001271521 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 167.25-26 chr12 60871175 60871419 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 1181927 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 236.5-70 chr4 132973162 132973495 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 175788 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 252-32 chr17 72823591 72823902 + 1.25 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -183274 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 241.25-2 chr1 41281829 41282051 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -39634 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 380.25 chr12 63046812 63047229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105790 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 138-17 chr11 22624090 22624367 + 1.25 NA 3' UTR (NM_022725, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_022725, exon 1 of 1) 1613 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 207.75-3 chr1 73594595 73594953 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79905 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 215.5-102 chr7 90990721 90990995 + 1.25 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) intron (NM_012395, intron 9 of 13) -273575 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 253.75 chr10 11504638 11504965 + 1.25 NA intron (NM_014688, intron 6 of 14) intron (NM_014688, intron 6 of 14) 27479 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 304.75-7 chr11 85489433 85489702 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) L1M2|LINE|L1 137703 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 300.5-32 chr3 110042505 110042912 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 439880 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 142-118 chr4 16462564 16462721 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 235979 NR_027696 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 131.25-87 chr18 43433405 43433575 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -156000 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 117.5-79 chr17 10628104 10628262 + 1.25 NA TTS (NM_002470) TTS (NM_002470) 29126 NM_002470 4621 Hs.440895 NM_002470 ENSG00000109063 MYH3 CPSKF1A|CPSKF1B|DA2A|DA2B|DA2B3|DA8|HEMHC|MYHC-EMB|MYHSE1|SMHCE myosin heavy chain 3 protein-coding 205.25-8 chr10 91829999 91830252 + 1.25 NA intron (NM_025235, intron 9 of 26) intron (NM_025235, intron 9 of 26) 31699 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 249.25-9 chr14 47625197 47625555 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 49578 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 231-70 chr5 118865224 118865571 + 1.25 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) intron (NM_001308081, intron 4 of 5) -109189 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 320-12 chr14 66439338 66439754 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -46825 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 248.75-10 chr12 2190479 2190893 + 1.25 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 L2c|LINE|L2 32795 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 134-39 chr12 59160294 59160519 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -239868 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 140.5-238 chr8 127684469 127684680 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49393 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 134.75-52 chr12 40100166 40100364 + 1.25 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) intron (NM_052885, intron 1 of 9) 5816 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 126.25-36 chr12 3899915 3900086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26552 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 234.5-15 chr11 118737843 118738089 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 52982 NM_001257191 1656 Hs.408461 NM_004397 ENSG00000110367 DDX6 HLR2|P54|RCK DEAD-box helicase 6 protein-coding 271.5-80 chr7 98123732 98124094 + 1.25 NA intron (NM_014916, intron 1 of 13) HAL1|LINE|L1 17051 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 149.25-31 chr11 95994886 95995060 + 1.25 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -70766 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 327.75-15 chr21 21305674 21306003 + 1.25 NA intron (NM_001352592, intron 6 of 18) L1ME1|LINE|L1 158676 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 112.5-77 chr14 86561355 86561472 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -344365 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 262-34 chr2 241468709 241469157 + 1.25 NA intron (NM_014808, intron 18 of 26) intron (NM_014808, intron 18 of 26) -8972 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 214.75-58 chr4 10027090 10027302 + 1.25 NA intron (NM_001001290, intron 1 of 12) L1MB5|LINE|L1 -5699 NM_020041 56606 Hs.444612 NM_020041 ENSG00000109667 SLC2A9 GLUT9|GLUTX|UAQTL2|URATv1 solute carrier family 2 member 9 protein-coding 272-2 chr1 22727097 22727382 + 1.25 NA intron (NM_004442, intron 1 of 15) intron (NM_004442, intron 1 of 15) 7722 NR_039832 100616391 NR_039832 ENSG00000265422 MIR4684 - microRNA 4684 ncRNA 161.25-162 chr7 71611446 71611610 + 1.25 NA intron (NM_022479, intron 6 of 10) intron (NM_022479, intron 6 of 10) -303758 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 214.5-81 chr3 129834567 129834849 + 1.25 NA intron (NM_001128224, intron 1 of 5) intron (NM_001128224, intron 1 of 5) -40096 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 192.75-43 chr17 8542923 8543293 + 1.25 NA intron (NM_001256012, intron 13 of 42) intron (NM_001256012, intron 13 of 42) 87617 NM_001256012 4628 Hs.16355 NM_005964 ENSG00000133026 MYH10 NMMHC-IIB|NMMHCB myosin heavy chain 10 protein-coding 139.5-47 chr12 61952443 61952610 + 1.25 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 240313 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 302.5-33 chr5 18612191 18612496 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 805069 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 292.75-10 chr16 54020103 54020429 + 1.25 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) -19127 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 219.5-111 chr6 56499809 56500253 + 1.25 NA intron (NM_001144770, intron 72 of 94) intron (NM_001144770, intron 72 of 94) -105903 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 364-10 chr2 155833210 155833887 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 421383 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 164.25-63 chr2 29560836 29561013 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -85547 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 420.25-2 chr13 114173458 114173950 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41081 NM_007368 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 278.25-26 chr2 54980961 54981205 + 1.25 NA intron (NM_020532, intron 5 of 8) intron (NM_020532, intron 5 of 8) 29189 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 217.5-17 chr10 90043681 90043880 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -86407 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 195.75-21 chr10 39109877 39110077 + 1.25 NA Intergenic HERVKC4-int|LTR|ERVK 413381 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 205.25-81 chr4 111878335 111878636 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -266969 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 232.25-18 chr13 53595860 53596072 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -219453 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 361.75-8 chr14 72246403 72246904 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) AluSx1|SINE|Alu -270167 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 244.25-56 chr9 72705825 72706193 + 1.25 NA intron (NM_138691, intron 8 of 23) intron (NM_138691, intron 8 of 23) 168100 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 278.25-60 chr9 623486 623835 + 1.25 NA intron (NM_001256877, intron 2 of 12) L1MA9|LINE|L1 -63107 NM_001354335 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 221.75-29 chr16 83714763 83715064 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 9 of 12) intron (NM_001220489, intron 9 of 12) 89063 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 116-169 chr8 99264467 99264586 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) HAL1|LINE|L1 251260 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 163.25-130 chr7 31250588 31250762 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 90051 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 158.5-12 chr1 200553550 200553751 + 1.25 NA exon (NM_001305792, exon 28 of 28) exon (NM_001305792, exon 28 of 28) 65188 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 156-114 chr5 13765468 13765923 + 1.25 NA intron (NM_001369, intron 59 of 78) intron (NM_001369, intron 59 of 78) 178785 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 232-2 chr1 66899077 66899468 + 1.25 NA intron (NM_024763, intron 2 of 16) L1MB7|LINE|L1 25584 NM_207014 79819 Hs.49421 NM_024763 ENSG00000152763 WDR78 DIC4 WD repeat domain 78 protein-coding 201.75-39 chr17 34197206 34197389 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -13665 NR_110748 101927239 Hs.603592 NR_110748 ENSG00000261156 LINC01989 - long intergenic non-protein coding RNA 1989 ncRNA 182.5-31 chr11 65339348 65339661 + 1.25 NA intron (NM_001330308, intron 1 of 11) intron (NM_001330308, intron 1 of 11) 5652 NM_001330308 5977 Hs.13495 NM_006268 ENSG00000133884 DPF2 CSS7|REQ|UBID4|ubi-d4 double PHD fingers 2 protein-coding 227.5-111 chr8 135735721 135735984 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 278396 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 155.5-164 chr5 40950547 40950688 + 1.25 NA intron (NM_000587, intron 9 of 17) intron (NM_000587, intron 9 of 17) 41120 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 151.5-10 chr1 208932628 208932846 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39717 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 468.5-2 chr10 5081133 5081719 + 1.25 NA intron (NM_001253908, intron 1 of 8) intron (NM_001253908, intron 1 of 8) -12988 NM_003739 8644 Hs.78183 NM_003739 ENSG00000196139 AKR1C3 DD3|DDX|HA1753|HAKRB|HAKRe|HSD17B5|PGFS|hluPGFS aldo-keto reductase family 1 member C3 protein-coding 187.5-91 chr2 81929920 81930184 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -463106 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 159-35 chr14 45013650 45013862 + 1.25 NA intron (NM_001308120, intron 7 of 19) intron (NM_001308120, intron 7 of 19) 51566 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 199-15 chr10 93752962 93753195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4731 NM_001308276 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 177-2 chr1 81771535 81771782 + 1.25 NA intron (NM_001366008, intron 4 of 26) L1MEd|LINE|L1 -28718 NM_001366005 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 223-26 chr14 66812932 66813167 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 305642 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 286.5-22 chr14 51115711 51116030 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -20166 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 209.5-7 chr1 168165934 168166120 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12935 NM_152902 261726 Hs.209431 NM_152902 ENSG00000143155 TIPRL TIP|TIP41|TIPRL1 TOR signaling pathway regulator protein-coding 223.5-107 chr6 56418321 56418599 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24332 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 220.75-49 chr3 28512589 28513160 + 1.25 NA intron (NM_001040432, intron 6 of 9) intron (NM_001040432, intron 6 of 9) -62404 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 156.25-72 chr2 79380018 79380279 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120696 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 244.25-6 chr10 120002010 120002264 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43624 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 189-94 chr6 145525361 145525611 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 161391 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 165.25-122 chr5 173774628 173774831 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16213 NR_108028 101928154 Hs.366725 NR_108028 LINC01485 - long intergenic non-protein coding RNA 1485 ncRNA 229.5-106 chr5 34595105 34595419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61066 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 218.75-4 chr1 200860470 200860652 + 1.25 NA 3' UTR (NM_203459, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_203459, exon 17 of 17) -12420 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 264.5-52 chr5 162015776 162016134 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -14759 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 344.25-17 chr8 123725540 123725920 + 1.25 NA intron (NM_004306, intron 1 of 10) intron (NM_004306, intron 1 of 10) 11663 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 170.5-68 chr15 58911681 58911935 + 1.25 NA intron (NR_135042, intron 4 of 18) intron (NR_135042, intron 4 of 18) 21871 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 302.25-22 chr5 76373961 76374247 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -29181 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 246.25-61 chr7 16663671 16663997 + 1.25 NA intron (NM_001362717, intron 1 of 11) intron (NM_001362717, intron 1 of 11) 2620 NM_001362717 28969 Hs.487635 NM_014038 ENSG00000136261 BZW2 HSPC028|MST017|MSTP017 basic leucine zipper and W2 domains 2 protein-coding 149.75-25 chr11 76775265 76775465 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -6948 NM_001258210 25987 Hs.8361 NM_015516 ENSG00000182704 TSKU E2IG4|LRRC54|TSK tsukushi, small leucine rich proteoglycan protein-coding 288.25-15 chr2 193840122 193840380 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -504018 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 208-32 chr18 602634 603083 + 1.25 NA intron (NM_014410, intron 1 of 8) intron (NM_014410, intron 1 of 8) 5860 NM_001289036 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 153.25-33 chr13 73838120 73838253 + 1.25 NA intron (NM_007249, intron 4 of 7) intron (NM_007249, intron 4 of 7) 273942 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 290.25-5 chr1 234551089 234551472 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19501 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 504.5-2 chr14_GL000225v1_random 127232 127751 + 1.25 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 196-69 chr4 11913891 11914213 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 130874 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 163.5-156 chr5 27193718 27193928 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -155237 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 163.75-26 chr11 57563398 57563700 + 1.25 NA intron (NM_198183, intron 1 of 3) L1M1|LINE|L1 4123 NM_004223 9246 Hs.425777 NM_004223 ENSG00000156587 UBE2L6 RIG-B|UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 L6 protein-coding 133.5-218 chr5 126124717 126125026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54706 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 287.5-39 chr22 36939680 36940205 + 1.25 NA 3' UTR (NM_000395, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_000395, exon 14 of 14) -25306 NR_038954 100506241 Hs.640023 NR_038954 ENSG00000215403 LL22NC01-81G9.3 - uncharacterized protein FLJ39582-like ncRNA 218.25-89 chr7 22863641 22863913 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7164 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 124.75-70 chr14 21230790 21230922 + 1.25 NA intron (NM_004500, intron 4 of 8) intron (NM_004500, intron 4 of 8) -23956 NR_038971 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 178.25-30 chr14 39987418 39987681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -555049 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 217.25-73 chr6 119742370 119742691 + 1.25 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 192722 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 298.75-16 chr14 74644317 74644639 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32241 NM_000428 4053 Hs.512776 NM_000428 ENSG00000119681 LTBP2 C14orf141|GLC3D|LTBP3|MSPKA|MSTP031|WMS3 latent transforming growth factor beta binding protein 2 protein-coding 284.25-30 chr7 95713549 95713946 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -58759 NM_004411 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 302.75-17 chr3 128950136 128950507 + 1.25 NA intron (NM_001348520, intron 8 of 14) HAL1|LINE|L1 41576 NM_001348523 57501 Hs.518247 NM_020741 ENSG00000114656 KIAA1257 - KIAA1257 protein-coding 136.25-113 chr21 34979350 34979574 + 1.25 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) intron (NM_001754, intron 2 of 8) 59964 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 225.75-48 chr2 209121236 209121445 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -302707 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 125.75-193 chr9 34789203 34789431 + 1.25 NA Intergenic LTR60B|LTR|ERV1 49269 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 220.75-35 chr18 68048386 68048635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -233688 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 203.5-131 chr7 80380381 80380660 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6081 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 236.5-16 chr12 60657729 60658061 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 968525 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 233.25-52 chr4 37685903 37686124 + 1.25 NA intron (NM_001085400, intron 1 of 6) CpG 363 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 174.25-90 chr21 28919173 28919407 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -33917 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 181-23 chr13 47504421 47504667 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 428078 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 201.75-36 chr14 81635389 81635581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12424 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 159.25-109 chr4 124567283 124567549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8982 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 201.5-63 chr17 39418357 39418654 + 1.25 NA intron (NM_004774, intron 14 of 16) AluJo|SINE|Alu -15949 NM_001370208 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 166-81 chr3 9972656 9972788 + 1.25 NA intron (NM_018447, intron 6 of 8) AluSz|SINE|Alu -14171 NR_103821 442075 Hs.690469 NM_001013730 EMC3-AS1 - EMC3 antisense RNA 1 ncRNA 166.25-138 chr7 34805226 34805555 + 1.25 NA intron (NM_207172, intron 3 of 8) L1MC2|LINE|L1 28941 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 160-48 chr19 32596605 32597008 + 1.25 NA TTS (NM_032139) TTS (NM_032139) 11663 NR_145718 109616972 NR_145718 ENSG00000201388 SNORA68B - small nucleolar RNA, H/ACA box 68B snoRNA 192.75-25 chr12 46568026 46568241 + 1.25 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) L1MA5A|LINE|L1 184026 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 201-67 chr6 64060457 64060772 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) intron (NM_001292009, intron 33 of 43) 253778 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 157.75-132 chr5 36822691 36822951 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 53873 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 208.75-55 chr3 114089850 114090036 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33206 NM_001256835 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 454.25-6 chr6 54411677 54412187 + 1.25 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 103491 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 205-3 chr1 63902818 63903073 + 1.25 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 128928 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 337.75-2 chr1 167755466 167755812 + 1.25 NA intron (NM_024569, intron 1 of 4) intron (NM_024569, intron 1 of 4) 33657 NM_003953 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 138.75-197 chr8 117854720 117854925 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 66091 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 215.5-83 chr4 178025197 178025581 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -117453 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 427-9 chrX 12371773 12372295 + 1.25 NA intron (NM_001368402, intron 2 of 17) intron (NM_001368402, intron 2 of 17) -126646 NM_001368400 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 344-3 chr1 217899642 217900005 + 1.25 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) intron (NR_048550, intron 1 of 3) 6923 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 116.5-204 chr5 142763547 142763682 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6763 NM_015071 23092 Hs.654668 NM_015071 ENSG00000145819 ARHGAP26 GRAF|GRAF1|OPHN1L|OPHN1L1 Rho GTPase activating protein 26 protein-coding 173.75-17 chr1 205737707 205737884 + 1.25 NA intron (NM_022731, intron 1 of 6) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 12387 NM_022731 64710 Hs.213061 NM_022731 ENSG00000069275 NUCKS1 JC7|NUCKS nuclear casein kinase and cyclin dependent kinase substrate 1 protein-coding 246.75-68 chr7 122352808 122353089 + 1.25 NA intron (NM_001167940, intron 27 of 29) intron (NM_001167940, intron 27 of 29) -48198 NM_001024613 389549 Hs.553970 NM_001024613 ENSG00000128610 FEZF1 FEZ|HH22|ZNF312B FEZ family zinc finger 1 protein-coding 216.5-28 chr14 41490918 41491185 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -115805 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 332.25-5 chr11 131796113 131796449 + 1.25 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) LTR50|LTR|ERVL -113643 NR_147850 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 280-29 chr2 189381770 189382213 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59442 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 138.5-28 chr10 110319564 110319807 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14765 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 251.5-64 chr5 28648407 28648688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -278323 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 305.25-3 chr1 109592883 109593231 + 1.25 NA 3' UTR (NM_006496, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_006496, exon 9 of 9) -5836 NR_029583 406974 NR_029583 ENSG00000284443 MIR197 MIRN197|miR-197|miRNA197 microRNA 197 ncRNA 342.75-7 chr10 76759657 76760018 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -128207 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 159.25-166 chrX 96861898 96862039 + 1.25 NA intron (NM_007309, intron 4 of 26) L2b|LINE|L2 -21940 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 338.75-9 chr15 82153825 82154250 + 1.25 NA intron (NM_001040610, intron 15 of 17) intron (NM_001040610, intron 15 of 17) 65443 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 339-17 chr2 115105937 115106310 + 1.25 NA intron (NM_001178037, intron 1 of 25) intron (NM_001178037, intron 1 of 25) 41550 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 246.75-58 chr6 41315754 41316082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19690 NM_004828 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 179.75-145 chrX 109661152 109661454 + 1.25 NA intron (NM_004458, intron 14 of 15) intron (NM_004458, intron 14 of 15) -36131 NM_012282 23630 Hs.522753 NM_012282 ENSG00000176076 KCNE5 KCNE1L potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 5 protein-coding 182.75-34 chr11 123339140 123339352 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -19176 NM_001367419 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 198.25-49 chr18 38422908 38423126 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 765882 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 221.25-36 chr2 46715541 46715738 + 1.25 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 16344 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 180.25-122 chr8 133817516 133817840 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40326 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 246.75-6 chr1 213293937 213294249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 242852 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 169.75-80 chr2 84944727 84944938 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -26329 NM_020122 56888 Hs.654968 NM_020122 ENSG00000176407 KCMF1 DEBT91|FIGC|PCMF|ZZZ1 potassium channel modulatory factor 1 protein-coding 275.5-13 chr11 98385510 98385753 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -635318 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 172.75-97 chr5 62793372 62793582 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 214658 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 156.75-52 chr14 23815068 23815241 + 1.25 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -138616 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 344.25-18 chr8 130410250 130410540 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) intron (NM_001362925, intron 1 of 29) 33265 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 289.5-9 chr11 96943643 96943966 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 435379 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 196.75 chr1 7168860 7169116 + 1.25 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) L1M5|LINE|L1 220766 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 215.25-48 chr2 132405517 132405757 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -11168 NM_001508 2863 Hs.432395 NM_001508 ENSG00000183840 GPR39 - G protein-coupled receptor 39 protein-coding 196.25-10 chr10 15071505 15071806 + 1.25 NA intron (NR_144471, intron 2 of 7) intron (NR_144471, intron 2 of 7) 17121 NR_144471 108949267 Hs.723069 NR_144471 ACBD7-DCLRE1CP1 - ACBD7-DCLRE1CP1 readthrough ncRNA 217.5-67 chr2 187325517 187325757 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 122615 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 233-30 chr2 55014965 55015175 + 1.25 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) -4798 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 232-35 chr2 74518001 74518298 + 1.25 NA TTS (NM_133637) TTS (NM_133637) 3699 NM_016170 3196 Hs.168586 NM_016170 ENSG00000115297 TLX2 HOX11L1|NCX T cell leukemia homeobox 2 protein-coding 199-10 chr10 46530344 46530539 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 25630 NM_014696 9721 Hs.523375 NM_014696 ENSG00000204175 GPRIN2 GRIN2|KIAA0514 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 protein-coding 277-19 chr2 17522193 17522565 + 1.25 NA intron (NM_001321233, intron 1 of 6) intron (NM_001321233, intron 1 of 6) -3939 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 194.75-51 chr2 51142804 51142992 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 110297 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 198.25-96 chr7 93977680 93977977 + 1.25 NA intron (NR_133909, intron 3 of 4) intron (NR_133909, intron 3 of 4) 26527 NM_001317739 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 192.75-23 chr12 14274934 14275319 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -90506 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 532 chr2 156908831 156909653 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -348463 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 198.5-56 chr16 47154418 47154659 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001305002, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001305002, exon 18 of 18) 10470 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 129.5-202 chr6 88916889 88917006 + 1.25 NA intron (NM_001286428, intron 3 of 13) LTR47A|LTR|ERVL 46671 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 279.5-65 chr8 82846468 82846871 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65435 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 228.5-27 chr12 18751214 18751431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13203 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 259.5-22 chr11 97383635 97383892 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 875338 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 206-65 chr5 168307323 168307567 + 1.25 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) intron (NM_001161661, intron 1 of 22) 15800 NM_015238 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 170.25-75 chr2 159226903 159227114 + 1.25 NA intron (NM_001350065, intron 25 of 27) intron (NM_001350065, intron 25 of 27) 40173 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 202.25-38 chr2 64732170 64732449 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78396 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 224.5-9 chr10 5109117 5109308 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 14798 NM_001253909 8644 Hs.78183 NM_003739 ENSG00000196139 AKR1C3 DD3|DDX|HA1753|HAKRB|HAKRe|HSD17B5|PGFS|hluPGFS aldo-keto reductase family 1 member C3 protein-coding 251-23 chr14 60165787 60166102 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001322281) promoter-TSS (NM_001322281) -451 NM_001322282 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 153.5-77 chr17 54169426 54169673 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 346622 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 221.25-85 chr7 90843878 90844105 + 1.25 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) intron (NM_012395, intron 4 of 13) 134175 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 316.5-17 chr2 116623374 116623733 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1191138 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 153.75-138 chr7 12179248 12179451 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -31945 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 350.25-4 chr10 92613141 92613444 + 1.25 NA intron (NM_004523, intron 7 of 21) intron (NM_004523, intron 7 of 21) 20162 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 119.75-135 chr22 35369420 35369527 + 1.25 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -11623 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 199-76 chr6 109320352 109320630 + 1.25 NA intron (NR_152435, intron 35 of 45) AluJr4|SINE|Alu 61248 NM_001346500 8763 Hs.520313 NM_006016 ENSG00000135535 CD164 DFNA66|MGC-24|MGC-24v|MUC-24|endolyn CD164 molecule protein-coding 179.5-68 chr15 99199433 99199610 + 1.25 NA intron (NR_109947, intron 8 of 12) MLT2C2|LTR|ERVL 50060 NR_109947 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 240.25-71 chr8 117349346 117349677 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -171202 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 278.25-7 chr11 36193073 36193308 + 1.25 NA intron (NM_001304264, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 96234 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 151.75-124 chr6 18527748 18528114 + 1.25 NA intron (NR_149116, intron 1 of 7) intron (NR_149116, intron 1 of 7) 5184 NR_149116 105374956 Hs.561599 NR_149116 MIR548A1HG - MIR548A1 host gene ncRNA 278.5-53 chr7 84415595 84416011 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116673 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 128-137 chr6 73537840 73538000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16888 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 131.75-205 chr7 94268038 94268171 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 124088 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 268.25-46 chr8 118962326 118962866 + 1.25 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L1MA10|LINE|L1 10333 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 130.5-248 chr8 130915683 130915865 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) intron (NM_001115, intron 5 of 17) 125135 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 253-47 chr6 65701418 65701816 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) L2a|LINE|L2 5608 NM_001292009 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 256.25-48 chr8 92009176 92009383 + 1.25 NA intron (NM_004349, intron 4 of 10) intron (NM_004349, intron 4 of 10) 8401 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 255.25-30 chr20 58939520 58939873 + 1.25 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -41560 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 243.25-40 chr5 7351747 7351970 + 1.25 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 -3881 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 298.5-11 chr18 1005479 1005779 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -77636 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 232-9 chr10 78862567 78862887 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 204721 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 306.25-3 chr1 76686865 76687447 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92111 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 189.75-40 chr15 64947287 64947528 + 1.25 NA exon (NM_182703, exon 13 of 15) exon (NM_182703, exon 13 of 15) 35505 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 202-37 chr2 186351156 186351438 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -134963 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 261.25-42 chr6 52023018 52023304 + 1.25 NA intron (NM_138694, intron 32 of 66) intron (NM_138694, intron 32 of 66) 64452 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 182.75-42 chr13 23744273 23744476 + 1.25 NA intron (NM_005932, intron 18 of 18) intron (NM_005932, intron 18 of 18) -144494 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 321-34 chr9 19532935 19533222 + 1.25 NA intron (NM_020344, intron 7 of 9) intron (NM_020344, intron 7 of 9) 124069 NM_001010887 340485 Hs.41379 NM_001010887 ENSG00000177076 ACER2 ALKCDase2|ASAH3L alkaline ceramidase 2 protein-coding 170.75-45 chr16 11252506 11252755 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 3552 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 244.75-33 chr21 20019715 20019910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120057 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 119.5-153 chr3 102931440 102931535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 496472 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 219.75-32 chr2 37473999 37474246 + 1.25 NA Intergenic LTR90A|LTR|LTR 129492 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 264.75-61 chr9 21390940 21391248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5696 NM_000605 3440 Hs.211575 NM_000605 ENSG00000188379 IFNA2 IFN-alphaA|IFNA|IFNA2B|INFA2 interferon alpha 2 protein-coding 197.5-141 chr7 17034225 17034422 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152340 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 117.25-2 chr1 35472162 35472271 + 1.25 NA intron (NM_024874, intron 5 of 20) intron (NM_024874, intron 5 of 20) 85187 NM_024874 79932 Hs.456507 NM_024874 ENSG00000142687 KIAA0319L AAVR|AAVRL KIAA0319 like protein-coding 163.5-66 chr16 26126644 26126877 + 1.25 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) MER20|DNA|hAT-Charlie 101523 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 254.75-45 chr5 174221513 174222115 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -114540 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 239.25-77 chr6 47705898 47706470 + 1.25 NA intron (NM_153838, intron 1 of 9) intron (NM_153838, intron 1 of 9) 7604 NM_153838 221393 Hs.150131 NM_153838 ENSG00000153294 ADGRF4 GPR115|PGR18 adhesion G protein-coupled receptor F4 protein-coding 260.5-15 chr14 71413884 71414168 + 1.25 NA intron (NM_001354286, intron 3 of 24) intron (NM_001354286, intron 3 of 24) 15689 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 232.5-78 chr4 102800395 102800740 + 1.25 NA TTS (NR_125932) TTS (NR_125932) 23530 NR_125932 102723704 Hs.638374 NR_125932 LOC102723704 - uncharacterized LOC102723704 ncRNA 142.5-168 chr5 45461545 45461765 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 234725 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 144.75-194 chr9 76764144 76764284 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_015342) promoter-TSS (NR_015342) -222 NR_015342 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 206.25-13 chr10 18251243 18251610 + 1.25 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) AluSx1|SINE|Alu -9296 NM_000724 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 119.75-95 chr2 30674172 30674271 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 133225 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 289.5-12 chr14 36858854 36859307 + 1.25 NA intron (NM_001171170, intron 2 of 10) intron (NM_001171170, intron 2 of 10) 93311 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 318.5-27 chr3 38014260 38014588 + 1.25 NA intron (NM_006225, intron 3 of 14) Alu|SINE|Alu 10096 NM_001130964 5333 Hs.80776 NM_006225 ENSG00000187091 PLCD1 NDNC3|PLC-III phospholipase C delta 1 protein-coding 237.75-12 chr12 43672655 43673044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85941 NM_031292 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 180.5-150 chr8 65401849 65402138 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 160673 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 284-3 chr1 238979587 238979838 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -406856 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 256-59 chr5 63860536 63860817 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 101616 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 311.5-2 chr1 116016532 116016879 + 1.25 NA intron (NM_018420, intron 2 of 11) L2b|LINE|L2 -39429 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 196.25-23 chr12 23085801 23085992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -89740 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 225.75-66 chr5 108940848 108941125 + 1.25 NA intron (NM_001308031, intron 1 of 10) intron (NM_001308031, intron 1 of 10) 16380 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 282-25 chr2 20549343 20549716 + 1.25 NA Intergenic MamRep1894|DNA|hAT 43019 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 347.25-18 chr5 78063835 78064531 + 1.25 NA intron (NM_003664, intron 22 of 26) intron (NM_003664, intron 22 of 26) 105936 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 189.25-41 chr15 60825026 60825314 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 143601 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 303.5-18 chr18 60056293 60056881 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 156591 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 266.75-22 chr2 44505456 44505817 + 1.25 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 143689 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 258.5-63 chr6 38317870 38318283 + 1.25 NA intron (NM_052893, intron 8 of 11) AluSx|SINE|Alu -163520 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 290.25-22 chr3 10681789 10682200 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -55187 NR_046766 100874325 Hs.143004 NR_046766 ENSG00000224771 ATP2B2-IT2 - ATP2B2 intronic transcript 2 ncRNA 342.25-5 chr14 45901413 45902002 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -162452 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 399.25-2 chr12 16322214 16322588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24741 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 263.25-8 chr10 504594 504832 + 1.25 NA intron (NM_014974, intron 1 of 36) intron (NM_014974, intron 1 of 36) -123851 NR_147612 101930421 Hs.654707 NR_147612 ENSG00000225140 LOC101930421 - uncharacterized LOC101930421 ncRNA 382.5-6 chr10 63406057 63406566 + 1.25 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L3|LINE|CR1 -24264 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 175-13 chr10 58250442 58250783 + 1.25 NA intron (NM_152230, intron 1 of 5) L1MA4|LINE|L1 17282 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 163.25-133 chr7 96248762 96248977 + 1.25 NA intron (NM_001160210, intron 3 of 17) intron (NM_001160210, intron 3 of 17) -29113 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 261-30 chr20 34502044 34502484 + 1.25 NA intron (NM_001257137, intron 24 of 25) FAM|SINE|Alu -14120 NM_014183 83658 Hs.593920 NM_014183 ENSG00000125971 DYNLRB1 BITH|BLP|DNCL2A|DNLC2A|ROBLD1 dynein light chain roadblock-type 1 protein-coding 184.25-54 chr2 31119114 31119300 + 1.25 NA intron (NM_001329096, intron 2 of 16) L1ME3G|LINE|L1 10433 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 272.25-20 chr16 82614900 82615211 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11914 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 181-29 chr14 73293796 73294179 + 1.25 NA intron (NM_001005743, intron 7 of 12) L1MEb|LINE|L1 -47986 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 225-64 chr6 21178263 21178538 + 1.25 NA intron (NM_017774, intron 13 of 15) intron (NM_017774, intron 13 of 15) 333492 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 335-11 chr21 30920714 30921094 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39324 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 133.25-111 chr2 183798843 183798993 + 1.25 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -580057 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 163.25-87 chr2_KI270716v1_random 3 234 + 1.25 NA NA Intergenic NA NA 414.75-2 chr10 36517846 36518448 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -607710 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 150-105 chr4 48974215 48974463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11936 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 275.25-19 chr2 56240416 56240914 + 1.25 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) L1MB7|LINE|L1 -54895 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 150-143 chr8 30711179 30711356 + 1.25 NA intron (NM_000637, intron 2 of 12) intron (NM_000637, intron 2 of 12) 16579 NM_000637 2936 Hs.271510 NM_000637 ENSG00000104687 GSR GR|HEL-75|HEL-S-122m glutathione-disulfide reductase protein-coding 179.25-22 chr10 61086615 61086982 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 70523 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 169.75-154 chr8 115152372 115152520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 515567 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 158.75-84 chr2 42438280 42438456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 55614 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 220-30 chr2 14281105 14281391 + 1.25 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 119710 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 344.75-15 chr6 88628837 88629322 + 1.25 NA intron (NM_001286428, intron 12 of 13) intron (NM_001286428, intron 12 of 13) -89710 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 163-86 chr4 144627617 144627850 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18286 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 243.5-90 chr9 80480298 80480590 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 505421 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 255.5-75 chr6 144909039 144909338 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 503533 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 160.75-77 chr2 127457472 127457675 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -33955 NR_039944 100616187 NR_039944 ENSG00000264075 MIR4783 - microRNA 4783 ncRNA 187.5-179 chr9 73082877 73083074 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -68890 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 267-49 chr7 77857983 77858262 + 1.25 NA intron (NM_001366089, intron 2 of 18) intron (NM_001366089, intron 2 of 18) 17992 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 131.5-63 chr14 70622604 70622744 + 1.25 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) L1M4|LINE|L1 18624 NR_110071 101928075 Hs.737532 NR_110071 ENSG00000245466 LOC101928075 - uncharacterized LOC101928075 ncRNA 324.5-28 chr6 142365148 142365793 + 1.25 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) L2a|LINE|L2 63463 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 211.25-64 chr4 43750714 43751017 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -258322 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 320-6 chr10 54514109 54514382 + 1.25 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) intron (NR_134503, intron 1 of 5) 28015 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 209.25-71 chr22 24032610 24032860 + 1.25 NA intron (NM_001199281, intron 1 of 36) intron (NM_001199281, intron 1 of 36) 21365 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 221.75-80 chr8 81125583 81125790 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -13618 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 176.5-155 chr7 54210232 54210465 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -120349 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 246.25-73 chr9 84746159 84746508 + 1.25 NA intron (NM_001018064, intron 11 of 17) MER58B|DNA|hAT-Charlie 40432 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 249.5-20 chr11 78956986 78957396 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) intron (NM_001098816, intron 6 of 33) -382327 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 223-10 chr10 80310555 80310755 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -20997 NM_000429 4143 Hs.282670 NM_000429 ENSG00000151224 MAT1A MAT|MATA1|SAMS|SAMS1 methionine adenosyltransferase 1A protein-coding 215.25-25 chr13 48200305 48200609 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -32749 NM_021999 9445 Hs.643683 NM_021999 ENSG00000136156 ITM2B ABRI|BRI|BRI2|BRICD2B|E25B|E3-16|FBD|RDGCA|imBRI2 integral membrane protein 2B protein-coding 305-13 chr16 50052554 50052901 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -13243 NM_001329729 55027 Hs.733027 NM_017939 ENSG00000155393 HEATR3 SYO1 HEAT repeat containing 3 protein-coding 171-109 chr5 68742567 68742783 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 287252 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 271.25-36 chr5 175477824 175478224 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_022754) promoter-TSS (NM_022754) -536 NM_001322981 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 118.5-221 chr8 106504745 106504908 + 1.25 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 56902 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 253.75-36 chr3 9098572 9098823 + 1.25 NA intron (NM_014850, intron 3 of 21) MIR|SINE|MIR -93796 NR_121664 101927416 Hs.475364 NR_121663 ENSG00000228723 SRGAP3-AS2 - SRGAP3 antisense RNA 2 ncRNA 213.75-29 chr12 122086418 122086601 + 1.25 NA intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 7753 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 215-4 chr1 57414061 57414349 + 1.25 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 8907 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 174.5-57 chr14 23799773 23799941 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -153913 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 214.5-54 chr2 38553870 38554116 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -38253 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 238.25-61 chr4 126042289 126042774 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 535272 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 136.75-200 chr8 132343380 132343563 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 103791 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 164.5-68 chr14 98418513 98418748 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -292983 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 247.25-32 chr2 125503482 125503793 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 614348 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 228.25-35 chr17 40163113 40163318 + 1.25 NA intron (NM_007359, intron 6 of 13) AluSz6|SINE|Alu 1282 NR_106926 102466986 NR_106926 ENSG00000284144 MIR6866 hsa-mir-6866 microRNA 6866 ncRNA 231-84 chr8 140579801 140580048 + 1.25 NA intron (NM_001164623, intron 2 of 17) intron (NM_001164623, intron 2 of 17) 55709 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 338.5-34 chr7 81641975 81642312 + 1.25 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) HAL1ME|LINE|L1 -15927 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 216.5-94 chr5 67038626 67039116 + 1.25 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 34216 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 136.5-236 chr8 129184181 129184298 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 57001 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 156.5-11 chr1 211019349 211019806 + 1.25 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) intron (NM_002238, intron 5 of 10) 113797 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 238.25-30 chr2 7113978 7114326 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -36272 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 318.25-17 chr7 51038600 51038962 + 1.25 NA intron (NM_015198, intron 8 of 12) intron (NM_015198, intron 8 of 12) -245328 NM_001371008 216.25-57 chr2 219075405 219075628 + 1.25 NA 3' UTR (NM_024782, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_024782, exon 8 of 8) -14595 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 285.5-31 chr2 30494098 30494624 + 1.25 NA intron (NM_001304445, intron 3 of 7) intron (NM_001304445, intron 3 of 7) 47115 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 372-12 chr2 223117153 223117524 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65408 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 115.25-196 chr8 20085478 20085620 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 97587 NM_001142324 6570 Hs.158322 NM_003053 ENSG00000036565 SLC18A1 CGAT|VAT1|VMAT1 solute carrier family 18 member A1 protein-coding 205.25-61 chr2 225227708 225227956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -171878 NM_001371273 265.75-61 chr6 52706806 52707090 + 1.25 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 35835 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 242.25-84 chr8 60456586 60456963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42956 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 212-30 chr17 52795943 52796272 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -66014 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 198-37 chr2 6886177 6886506 + 1.25 NA intron (NM_080657, intron 2 of 5) intron (NM_080657, intron 2 of 5) 8564 NM_080657 91543 Hs.17518 NM_080657 ENSG00000134321 RSAD2 2510004L01Rik|cig33|cig5|vig1 radical S-adenosyl methionine domain containing 2 protein-coding 259.5-71 chr3 121946476 121946787 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52230 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 117-87 chr2 54849161 54849335 + 1.25 NA intron (NM_001039753, intron 8 of 40) L1MA4|LINE|L1 124236 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 400.5-13 chr6 46441827 46442380 + 1.25 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) 49220 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 196.5-30 chr11 70874414 70874631 + 1.25 NA intron (NM_012309, intron 10 of 24) MER97a|DNA|hAT-Tip100 -2154 NR_037437 100500844 NR_037437 ENSG00000263744 MIR3664 mir-3664 microRNA 3664 ncRNA 196.5-27 chr11 22041813 22042073 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -151142 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 158.75-133 chr5 16366213 16366359 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74816 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 227.5-18 chr11 23727254 23727529 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -308201 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 281.75-3 chr1 115935365 115935686 + 1.25 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) LTR67B|LTR|ERVL 16149 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 257-35 chr3 51434119 51434492 + 1.25 NA intron (NR_146065, intron 8 of 25) AluJr|SINE|Alu 43020 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 133.25-106 chr2 158494905 158495180 + 1.25 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) AluSx3|SINE|Alu 38090 NM_001005476 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 134.25-24 chr11 68934375 68934530 + 1.25 NA intron (NM_002180, intron 10 of 14) intron (NM_002180, intron 10 of 14) 30601 NM_002180 3508 Hs.503048 NM_002180 ENSG00000132740 IGHMBP2 CATF1|CMT2S|HCSA|HMN6|SMARD1|SMUBP2|ZFAND7 immunoglobulin mu DNA binding protein 2 protein-coding 263-40 chr5 25782894 25783290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 592139 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 204.75-94 chr5 118536464 118536713 + 1.25 NA intron (NR_104610, intron 1 of 9) intron (NR_104610, intron 1 of 9) 25529 NR_104610 101927280 Hs.543951 NR_104610 LINC02208 HRAT56 long intergenic non-protein coding RNA 2208 ncRNA 217.5-35 chr12 54853220 54853672 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1070 NM_058173 118430 Hs.348419 NM_058173 ENSG00000172551 MUCL1 SBEM mucin like 1 protein-coding 183-61 chr21 15439519 15439845 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -290252 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 225.25-89 chr8 137494525 137494778 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -81063 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 240.75-15 chr11 105771333 105771615 + 1.25 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 160768 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 176-59 chr5 20257021 20257196 + 1.25 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) intron (NM_001349556, intron 1 of 13) -48443 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 146-136 chr9 88258587 88258788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120206 NM_001350978 645961 Hs.632070 NM_001166137 SPATA31C2 FAM75C2 SPATA31 subfamily C member 2 protein-coding 176-72 chr8 63789892 63790130 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 20581 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 135-134 chr4 168560554 168560732 + 1.25 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) intron (NM_001166108, intron 2 of 21) 63591 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 171.75-133 chr7 87178655 87178868 + 1.25 NA intron (NR_024550, intron 7 of 17) L1ME3Cz|LINE|L1 26207 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 180.5-51 chr15 71556273 71556439 + 1.25 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) L1ME3F|LINE|L1 9120 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 267.75-44 chr5 5880111 5880487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 456993 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 370-2 chr1 22918192 22918764 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001309193, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001309193, exon 17 of 17) 54388 NM_001289974 646262 NM_001289974 ENSG00000215906 LACTBL1 - lactamase beta like 1 protein-coding 204-85 chr9 9442482 9442839 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -356732 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 261.5-70 chr9 71020426 71020823 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L1ME3A|LINE|L1 100997 NM_001366150 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 238.25-58 chr4 97260700 97261045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106054 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 269.75-16 chr13 89256935 89257171 + 1.25 NA intron (NR_047025, intron 1 of 3) intron (NR_047025, intron 1 of 3) -20163 NR_131229 105616982 Hs.564527 NR_131229 ENSG00000232225 LINC01047 - long intergenic non-protein coding RNA 1047 ncRNA 242.5-34 chr17 47894479 47894825 + 1.25 NA intron (NR_135480, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 1164 NR_135480 102724532 Hs.729067 NR_135480 ENSG00000264920 LOC102724532 - uncharacterized LOC102724532 ncRNA 172-72 chr3 89667729 89667904 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 560195 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 139-93 chr3 4209061 4209176 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94186 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 206-41 chr19 30327251 30327553 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44982 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 212-55 chr3 84082565 84082796 + 1.25 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 786895 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 209.75-15 chr10 122213573 122213826 + 1.25 NA intron (NM_001291878, intron 4 of 16) intron (NM_001291878, intron 4 of 16) 50069 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 184.25-132 chr9 96832941 96833200 + 1.25 NA intron (NM_001346995, intron 2 of 3) L1MDa|LINE|L1 21444 NM_001346995 158431 Hs.30567 NM_001001662 ENSG00000196597 ZNF782 - zinc finger protein 782 protein-coding 336-28 chr8 86675397 86675725 + 1.25 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) AluJr|SINE|Alu 68114 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 151-59 chr2 54660217 54660431 + 1.25 NA 3' UTR (NM_178313, exon 31 of 31) 3' UTR (NM_178313, exon 31 of 31) -64688 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 142.5-96 chr18 52217071 52217195 + 1.25 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -123064 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 342-16 chr9 71258630 71259210 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L1PA7|LINE|L1 -137299 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 237.75-72 chr5 145231050 145231308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 604163 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 115.25-59 chr14 52264735 52264841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2910 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 129.5-53 chr12 41358346 41358518 + 1.25 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -79307 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 241.25-7 chr1 172868504 172868747 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182338 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 324.75-4 chr1 205414566 205415086 + 1.25 NA intron (NR_037583, intron 2 of 3) AluJr4|SINE|Alu 7230 NR_037583 93273 Hs.655520 NM_001001552 ENSG00000186007 LEMD1 CT50|LEMP-1 LEM domain containing 1 protein-coding 156.25-7 chr1 178143109 178143350 + 1.25 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 49125 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 209.5-57 chr18 31188180 31188395 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25431 NM_024421 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 362.75-3 chr10 32933727 32934173 + 1.25 NA intron (NM_002211, intron 2 of 15) L1ME4a|LINE|L1 1608 NM_033668 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 211.75-41 chr2 13065415 13065641 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -58515 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 242.5-31 chr15 63544324 63544578 + 1.25 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) LTR38B|LTR|ERV1 39858 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 221.25-83 chr7 50204941 50205146 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99021 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 196.25-121 chr9 72424356 72424618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59279 NM_001102421 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 161.75-8 chr1 184661061 184661250 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93703 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 186.75-91 chr5 112728972 112729240 + 1.25 NA intron (NM_001354902, intron 1 of 14) intron (NM_001354902, intron 1 of 14) -8779 NM_000038 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 139-125 chr5 180225056 180225219 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -15926 NM_175062 255426 Hs.190559 NM_175062 ENSG00000146090 RASGEF1C - RasGEF domain family member 1C protein-coding 188.25-38 chr14 35245824 35246094 + 1.25 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) HAL1|LINE|L1 -32599 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 129.5-31 chr10 107069068 107069401 + 1.25 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 95472 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 126.5-40 chr11 86983937 86984106 + 1.25 NA intron (NR_038905, intron 2 of 2) intron (NR_038905, intron 2 of 2) 28400 NR_038905 100506368 Hs.559920 NR_038905 ENSG00000246523 FZD4-DT - FZD4 divergent transcript ncRNA 272-21 chr21 26981469 26981857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14575 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 171-41 chr15 56405500 56405787 + 1.25 NA intron (NM_198524, intron 9 of 12) intron (NM_198524, intron 9 of 12) 40219 NM_198524 374618 Hs.511476 NM_198524 ENSG00000151575 TEX9 - testis expressed 9 protein-coding 215.5-32 chr14 62123169 62123409 + 1.25 NA intron (NR_015358, intron 2 of 3) intron (NR_015358, intron 2 of 3) 5932 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 145.25-135 chr5 96788633 96788876 + 1.25 NA intron (NM_001198541, intron 10 of 18) intron (NM_001198541, intron 10 of 18) 19191 NM_001040458 51752 Hs.666524 NM_016442 ENSG00000164307 ERAP1 A-LAP|ALAP|APPILS|ARTS-1|ARTS1|ERAAP|ERAAP1|PILS-AP|PILSAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 protein-coding 214.5-109 chr6 54206397 54206637 + 1.25 NA intron (NM_138569, intron 10 of 12) intron (NM_138569, intron 10 of 12) 95074 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 138.5-141 chr3 192863219 192863399 + 1.25 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 54547 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 273.75-18 chr2 47665961 47666245 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95772 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 305.25-22 chr2 65874023 65874626 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -441725 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 174.75-129 chr8 120046411 120046670 + 1.25 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) L1MB8|LINE|L1 -78562 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 153-152 chr8 81339591 81339755 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59137 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 260.5-31 chr2 100639582 100639862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35983 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 210-6 chr1 80406572 80406809 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129065 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 286.25-33 chr8 121929682 121930048 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -288425 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 136.75-206 chr9 90594482 90594681 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -11835 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 325.75-5 chr10 67083534 67083834 + 1.25 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) intron (NR_111909, intron 2 of 2) 71418 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 145-35 chr12 22714460 22714715 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 89416 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 153.25-117 chr6 138560283 138560500 + 1.25 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) intron (NM_020464, intron 1 of 6) 12178 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 120-2 chr1 59165758 59165921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19032 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 183.25-107 chr7 93061533 93061800 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 56313 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 137.25-168 chr8 100065097 100065212 + 1.25 NA intron (NM_015668, intron 7 of 27) intron (NM_015668, intron 7 of 27) 40472 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 310.75-12 chr14 43572718 43573172 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 934338 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 222-13 chr10 96034799 96035132 + 1.25 NA intron (NR_134320, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -8618 NM_001134376 54619 Hs.596479 NM_019084 ENSG00000107443 CCNJ bA690P14.1 cyclin J protein-coding 167-81 chr3 191065066 191065249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -134084 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 171-70 chr2 88623361 88623604 + 1.25 NA intron (NM_004836, intron 1 of 16) intron (NM_004836, intron 1 of 16) 1447 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 128.25-10 chr1 161266349 161266504 + 1.25 NA intron (NM_001102566, intron 1 of 2) intron (NM_001102566, intron 1 of 2) 7681 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 194.5-130 chr6 75756046 75756315 + 1.25 NA intron (NM_001300899, intron 1 of 32) FLAM_A|SINE|Alu 6941 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 366.75-18 chr4 57862364 57862847 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 436733 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 191-18 chr12 48700514 48700688 + 1.25 NA intron (NM_001240, intron 4 of 8) intron (NM_001240, intron 4 of 8) 16106 NM_001240 904 Hs.92308 NM_001240 ENSG00000129315 CCNT1 CCNT|CYCT1|HIVE1 cyclin T1 protein-coding 273-17 chr13 85655237 85655479 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 144061 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 249.25-2 chr1 236330685 236331011 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -48890 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 269.25-9 chr13 25352212 25352446 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -19645 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 294-32 chr8 131598506 131599063 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -305309 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 208.25-48 chr2 191476989 191477247 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -200954 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 176.5-37 chr12 22877456 22877669 + 1.25 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 252391 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 190.5-22 chr11 22559030 22559262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66695 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 193.75-33 chr12 1115783 1116213 + 1.25 NA exon (NM_178039, exon 6 of 18) exon (NM_178039, exon 6 of 18) 88250 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 366.5-8 chr2 63685600 63686168 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 96733 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 177.25-11 chr10 5811122 5811324 + 1.25 NA intron (NM_001494, intron 1 of 10) intron (NM_001494, intron 1 of 10) 2211 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 269.75-42 chr4 73993250 73993574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5222 NM_002704 5473 Hs.2164 NM_002704 ENSG00000163736 PPBP B-TG1|Beta-TG|CTAP-III|CTAP3|CTAPIII|CXCL7|LA-PF4|LDGF|MDGF|NAP-2|PBP|SCYB7|TC1|TC2|TGB|TGB1|THBGB|THBGB1 pro-platelet basic protein protein-coding 154.25-91 chr2 186335500 186335757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -150632 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 133.5-93 chr15 96857348 96857565 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 74021 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 248-77 chrX 96047480 96047752 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 290286 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 167.5-128 chr4 112166348 112166579 + 1.25 NA intron (NM_152400, intron 1 of 1) intron (NM_152400, intron 1 of 1) 21009 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 177.5-37 chr12 127794899 127795216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86560 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 279-7 chr11 8969368 8969786 + 1.25 NA intron (NR_073431, intron 4 of 4) L1MA7|LINE|L1 -4566 NM_001286095 56674 Hs.501853 NM_020644 ENSG00000175348 TMEM9B C11orf15 TMEM9 domain family member B protein-coding 248.75-20 chr14 42757792 42758014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1151047 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 170.5-117 chr3 44702055 44702304 + 1.25 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -10464 NM_001134440 91392 Hs.224843 NM_033210 ENSG00000196653 ZNF502 - zinc finger protein 502 protein-coding 237.5-73 chr4 107190958 107191257 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -154794 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 225.25-36 chr18 78150339 78150565 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -156725 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 209-41 chr2 185951969 185952163 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 134251 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 125.25-44 chr12 16732441 16732559 + 1.25 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -124286 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 126.5-228 chr7 90659583 90659748 + 1.25 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -49733 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 169.25-57 chr2 153144379 153144605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 334270 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 194.5-69 chr2 75285178 75285441 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -85789 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 346-18 chr5 107319911 107320232 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -309057 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 410.5-14 chrX 77380972 77381473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66167 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 326.25-14 chr16 8914739 8915054 + 1.25 NA intron (NM_001286458, intron 11 of 31) AluJo|SINE|Alu 21743 NM_001286458 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 253.5-71 chr7 28228686 28228943 + 1.25 NA intron (NR_034097, intron 3 of 3) intron (NR_034097, intron 3 of 3) -48019 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 149.5-177 chr6 106956669 106956892 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17259 NM_001291739 100133941 Hs.644105 NM_013230 ENSG00000272398 CD24 CD24A CD24 molecule protein-coding 216-68 chr5 163140275 163140523 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -297172 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 309.5-2 chr1 109393360 109393835 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001205228) promoter-TSS (NM_001205228) -240 NM_001205228 6272 Hs.485195 NM_002959 ENSG00000134243 SORT1 Gp95|LDLCQ6|NT3|NTR3 sortilin 1 protein-coding 196-43 chr18 7431543 7431801 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29334 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 163.75-107 chr5 107007816 107008012 + 1.25 NA intron (NR_104671, intron 1 of 3) intron (NR_104671, intron 1 of 3) 3100 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 218.25-62 chr4 56920388 56920597 + 1.25 NA intron (NM_001193508, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu 11579 NM_001193508 5978 Hs.307836 NM_005612 ENSG00000084093 REST DFNA27|GINGF5|HGF5|NRSF|WT6|XBR RE1 silencing transcription factor protein-coding 209-68 chr7 110724661 110724904 + 1.25 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -366224 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 251.75-9 chr10 31236013 31236483 + 1.25 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) L1MA5|LINE|L1 48365 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 133.5-203 chr5 42181469 42181663 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -6221 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 182.75-30 chr11 70046435 70046625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17394 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 294.25-26 chr22 24420701 24421118 + 1.25 NA intron (NR_103546, intron 18 of 19) intron (NR_103546, intron 18 of 19) -2688 NM_001278500 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 181.75-68 chr2 171028619 171028781 + 1.25 NA intron (NM_001136555, intron 9 of 18) L2a|LINE|L2 38273 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 222.5-113 chr8 121922455 121922728 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -281151 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 202-61 chr6 107453617 107453850 + 1.25 NA intron (NM_020381, intron 1 of 7) intron (NM_020381, intron 1 of 7) 5831 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 203.5-53 chr17 63667160 63667470 + 1.25 NA intron (NM_203351, intron 7 of 16) L3|LINE|CR1 32810 NM_030576 80774 Hs.591166 NM_030576 ENSG00000136490 LIMD2 - LIM domain containing 2 protein-coding 129.75-35 chr11 35984124 35984256 + 1.25 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) intron (NM_001304264, intron 1 of 5) -25908 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 187.75-55 chr2 201546081 201546325 + 1.25 NA intron (NM_001168221, intron 10 of 15) intron (NM_001168221, intron 10 of 15) 72975 NM_152525 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 249.5-80 chr5 123965969 123966412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 420773 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 165.5-55 chr15 69230811 69231152 + 1.25 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) intron (NM_001324092, intron 2 of 3) -67931 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 182.5-178 chr9 118917013 118917306 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 237488 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 122-188 chr8 115720043 115720157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51125 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 247.5-94 chrX 125738378 125738591 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -371278 NR_110409 101928495 Hs.545998 NR_110409 ENSG00000237208 LOC101928495 - uncharacterized LOC101928495 ncRNA 123.25-131 chr3 73623058 73623207 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_046681) promoter-TSS (NR_046681) -436 NR_046681 101927249 Hs.733334 NR_046681 PDZRN3-AS1 - PDZRN3 antisense RNA 1 ncRNA 221.5-44 chr2 61726450 61726924 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 127373 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 248.75-47 chr4 43607580 43607888 + 1.25 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -115191 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 351.25-9 chr21 30284540 30285056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1848 NM_001085455 643803 Hs.580883 NM_001085455 ENSG00000188694 KRTAP24-1 KAP24.1 keratin associated protein 24-1 protein-coding 199.75-86 chr8 3576224 3576521 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 9 of 69) intron (NM_033225, intron 9 of 69) -847921 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 275.25-43 chr8 65444598 65445284 + 1.25 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 117725 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 138-77 chr2 63838942 63839112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1937 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 314-15 chr3 111697167 111697671 + 1.25 NA intron (NM_001185106, intron 1 of 4) intron (NM_001185106, intron 1 of 4) -19986 NR_046733 100874115 Hs.626740 NR_046733 PLCXD2-AS1 - PLCXD2 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-23 chr1 238113377 238113531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -222532 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 181.25-39 chr15 94014932 94015205 + 1.25 NA intron (NR_120320, intron 2 of 8) intron (NR_120320, intron 2 of 8) 92870 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 203-28 chr12 25184004 25184304 + 1.25 NA intron (NR_147909, intron 1 of 14) L1MB8|LINE|L1 11006 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 241.25-35 chr2 128235275 128235569 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83446 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 203-31 chr14 22739257 22739493 + 1.25 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -27313 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 243.5-43 chr20 6165337 6165630 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -41939 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 131.5-234 chr8 104935445 104935612 + 1.25 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -346504 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 247.25-37 chr20 52274901 52275223 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -83077 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 295.25-31 chr7 111937435 111937777 + 1.25 NA intron (NM_001363540, intron 11 of 52) intron (NM_001363540, intron 11 of 52) 129101 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 316.5-25 chr20 36608846 36609163 + 1.25 NA intron (NR_026562, intron 3 of 4) intron (NR_026562, intron 3 of 4) 3225 NM_001199534 55969 Hs.584985 NM_018840 ENSG00000101084 RAB5IF C20orf24|PNAS-11|RIP5 RAB5 interacting factor protein-coding 184.25-51 chr19 16957973 16958183 + 1.25 NA intron (NM_015692, intron 18 of 41) intron (NM_015692, intron 18 of 41) -61131 NR_147452 27151 Hs.631644 NM_015692 ENSG00000160111 CPAMD8 ASGD8|K-CAP|VIP C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8 protein-coding 287-41 chr8 129778893 129779368 + 1.25 NA intron (NM_031415, intron 1 of 13) L1PA13|LINE|L1 7494 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 257-29 chr2 224835509 224835785 + 1.25 NA intron (NM_001290263, intron 25 of 55) MIR3|SINE|MIR 111402 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 131.25-63 chr14 72634539 72634674 + 1.25 NA intron (NM_001280542, intron 8 of 10) intron (NM_001280542, intron 8 of 10) 117786 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 208.25-103 chrX 83922292 83922520 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 61260 NM_021118 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 113.25-19 chr10 102970341 102970461 + 1.25 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) MER58B|DNA|hAT-Charlie -52066 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 251.75-15 chr11 94674423 94674696 + 1.25 NA intron (NR_135096, intron 4 of 6) intron (NR_135096, intron 4 of 6) 65796 NR_135096 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 190.75-8 chr10 20203222 20203412 + 1.25 NA intron (NM_032812, intron 9 of 13) AluJb|SINE|Alu -348653 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 246.5-11 chr10 78308815 78309056 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 41593 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 153.25-75 chr2 202350550 202350767 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25669 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 262.25-34 chr4 119316257 119316505 + 1.25 NA TTS (NM_000134) TTS (NM_000134) 5757 NM_000134 2169 Hs.282265 NM_000134 ENSG00000145384 FABP2 FABPI|I-FABP fatty acid binding protein 2 protein-coding 290.75-31 chr20 50488379 50488772 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21746 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 290.75-50 chr8 101245545 101245823 + 1.25 NA Intergenic MER68B|LTR|ERVL -39620 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 259-31 chr3 188536557 188536995 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 4 of 9) intron (NM_001167672, intron 4 of 9) 31890 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 235-53 chr4 144895143 144895476 + 1.25 NA Intergenic LTR31|LTR|ERV1 202073 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 193-49 chr3 2043306 2043714 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -55293 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 245.25-52 chr4 61229382 61229592 + 1.25 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 27315 NM_001371342 278-7 chr11 102707257 102707598 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -1658 NM_022122 64066 Hs.534479 NM_022122 ENSG00000137675 MMP27 MMP-27 matrix metallopeptidase 27 protein-coding 184.25-8 chr1 153081111 153081313 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -9601 NM_001017418 6701 Hs.568239 NM_001017418 ENSG00000196805 SPRR2B - small proline rich protein 2B protein-coding 159.5-141 chr3 35553695 35553862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -85747 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 274.25-20 chr14 50450523 50450860 + 1.25 NA intron (NM_198794, intron 14 of 31) intron (NM_198794, intron 14 of 31) -53393 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 113.75-133 chr3 162162607 162162734 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 665862 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 375.5-14 chr2 136757875 136758208 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7504 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 253.75-20 chr2 37542195 37542467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129868 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 254-36 chr4 173006917 173007142 + 1.25 NA intron (NM_001034845, intron 10 of 12) intron (NM_001034845, intron 10 of 12) -161782 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 277.5-65 chr5 123507227 123507630 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4671 NM_001031812 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 245-62 chr6 73478498 73478713 + 1.25 NA intron (NM_133645, intron 4 of 12) AluSx1|SINE|Alu 16868 NM_012123 25821 Hs.347614 NM_012123 ENSG00000135297 MTO1 CGI-02|COXPD10 mitochondrial tRNA translation optimization 1 protein-coding 353.5-2 chr10 91916704 91917517 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -6660 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 162.25-149 chr7 9724294 9724550 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 90152 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 168.5-107 chr22 46688049 46688352 + 1.25 NA intron (NM_022766, intron 12 of 12) AluSq2|SINE|Alu 50052 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 276.5-48 chr4 112488334 112488739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26843 NR_161159 105377372 NR_161159 LOC105377372 - uncharacterized LOC105377372 ncRNA 208.25-52 chr2 237824361 237824644 + 1.25 NA intron (NM_001080504, intron 10 of 15) intron (NM_001080504, intron 10 of 15) 25757 NM_001080504 375316 Hs.607265 NM_198852 ENSG00000177483 RBM44 - RNA binding motif protein 44 protein-coding 137.5-212 chr6 138536399 138536597 + 1.25 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) intron (NM_020464, intron 1 of 6) 36071 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 314.5-19 chr3 124151333 124151654 + 1.25 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) L1ME3A|LINE|L1 18564 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 232.5-20 chr13 93136497 93136721 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -90198 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 327.25-26 chr7 69457569 69458140 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 139770 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 250-26 chr2 120843774 120844084 + 1.25 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) AluSz|SINE|Alu 51648 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 163.5-122 chr3 2680298 2680524 + 1.25 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) L1ME4a|LINE|L1 -211804 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 125.25-192 chr7 50059935 50060116 + 1.25 NA intron (NM_007009, intron 3 of 7) L1P4e|LINE|L1 33221 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 183.5-40 chr14 43458494 43458645 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 1048714 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 157.25-110 chr4 154226789 154227001 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 264904 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 148.25-74 chr2 181138205 181138407 + 1.25 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 14469 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 151.75-147 chr8 46133525 46133714 + 1.25 NA Intergenic GSAT|Satellite|centr 484024 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 233.75-62 chr5 84085000 84085301 + 1.25 NA intron (NM_001278642, intron 5 of 9) L1P3|LINE|L1 299717 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 219.25-59 chr5 12802709 12802905 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) AluSg|SINE|Alu 134948 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 347 chr1 98130794 98131196 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79716 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 181.75-92 chr4 27440791 27441026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 223429 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 404.75-5 chr4 54338049 54338636 + 1.25 NA intron (NR_147160, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 5450 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 130.75-79 chr18 40553573 40553679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 487340 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 141-35 chr12 48502102 48502276 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 19691 NM_152319 121273 Hs.98202 NM_152319 ENSG00000177627 C12orf54 HSD-29|HSD-30 chromosome 12 open reading frame 54 protein-coding 267.5-47 chr22 43200152 43200542 + 1.25 NA 3' UTR (NM_173050, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_173050, exon 22 of 22) -12327 NR_134632 105373051 Hs.629290 NR_134632 ENSG00000236272 LOC105373051 - uncharacterized LOC105373051 ncRNA 130-141 chr6 117240468 117240631 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -25009 NM_153453 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 229-14 chr12 38851575 38851764 + 1.25 NA intron (NM_153634, intron 3 of 19) L2c|LINE|L2 53922 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 185.5-167 chr8 133380829 133381000 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -83610 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 283-47 chr8 127220610 127220877 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1475 NR_108049 100507056 Hs.343864 NR_108049 CCAT1 CARLO5|CARLo-5|onco-lncRNA-40 colon cancer associated transcript 1 ncRNA 191.5-107 chr4 53267212 53267410 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 98750 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 378-5 chr13 51749792 51750314 + 1.25 NA intron (NM_052950, intron 7 of 11) LTR37-int|LTR|ERV1 54109 NM_024705 79758 Hs.266728 NM_024705 ENSG00000102796 DHRS12 SDR40C1 dehydrogenase/reductase 12 protein-coding 204-44 chr20 52969308 52969604 + 1.25 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -2902 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 265.25-8 chr11 46043339 46043688 + 1.25 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 77306 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 252.75-26 chr2 28074013 28074596 + 1.25 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) MER20|DNA|hAT-Charlie 77937 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 165.75-105 chr21 43033821 43034202 + 1.25 NA TTS (NM_001320694) TTS (NM_001320694) 34393 NM_001321072 875 Hs.533013 NM_000071 ENSG00000160200 CBS CBSL|HIP4 cystathionine-beta-synthase protein-coding 124.25-85 chr18 65064323 65064575 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -685803 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 190.5-150 chr7 101574157 101574380 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -5262 NR_103748 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 215.5-7 chr1 167274410 167274610 + 1.25 NA intron (NM_001365848, intron 2 of 17) intron (NM_001365848, intron 2 of 17) 53624 NR_037163 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 141.5-196 chr6 62084635 62084783 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 201516 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 136.75-174 chr6 151891818 151891996 + 1.25 NA intron (NM_001122741, intron 4 of 8) intron (NM_001122741, intron 4 of 8) 82800 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 202-53 chr5 90084526 90084876 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -67981 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 207.75-107 chr6 16511075 16511369 + 1.25 NA intron (NM_000332, intron 6 of 8) intron (NM_000332, intron 6 of 8) 248962 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 243-20 chr14 57716683 57716982 + 1.25 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1MA5|LINE|L1 148167 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 236.25-29 chr15 78503540 78503844 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3872 NM_001083612 123688 Hs.307962 NM_001013619 ENSG00000188266 HYKK AGPHD1 hydroxylysine kinase protein-coding 291.75-21 chr2 129080268 129080636 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 193439 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 243.5-22 chr11 104667849 104668193 + 1.25 NA Intergenic UCON18|Unknown|Unknown -58719 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 222.5-27 chr12 85300369 85300677 + 1.25 NA intron (NM_006982, intron 3 of 3) intron (NM_006982, intron 3 of 3) 20303 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 201-26 chr14 28526746 28526933 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 238480 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 171-91 chr3 86662208 86662366 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 180344 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 329.5-12 chr2 188348397 188348858 + 1.25 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) Charlie14a|DNA|hAT-Charlie 51135 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 161.25-157 chr7 13648516 13648717 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 337898 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 266.25-16 chr15 89609276 89609613 + 1.25 NA intron (NM_001308025, intron 15 of 21) L1M4|LINE|L1 33857 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 193-14 chr11 55974826 55975113 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6506 NM_001005491 282770 Hs.554525 NM_001005491 ENSG00000174970 OR10AG1 OR11-160 olfactory receptor family 10 subfamily AG member 1 protein-coding 137.75-98 chr2 68435609 68435865 + 1.25 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 31557 NM_001024680 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 237.25-75 chr8 85298995 85299321 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 42556 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 339-28 chr6 98120844 98121269 + 1.25 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 96525 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 135.75-169 chr5 27389316 27389516 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82876 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 188.5-103 chr3 106487906 106488198 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -618651 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 276.75-17 chr18 73710223 73710811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 385576 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 268.75-39 chr5 166615076 166615498 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 311083 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 245.75-43 chr4 83861104 83861310 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 325099 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 293.75-22 chr2 133984951 133985336 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -134792 NM_001371457 350.25-20 chr2 185335145 185335610 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -168305 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 265.25-39 chr4 48718486 48718705 + 1.25 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) intron (NM_015030, intron 1 of 63) 61704 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 266.5-79 chr8 121690191 121690569 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -48940 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 126-24 chr10 80734102 80734266 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 84387 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 165.25-40 chr14 35484727 35484876 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49363 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 117-162 chr6 149982369 149982467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18475 NM_001317089 80329 Hs.653255 NM_025218 ENSG00000111981 ULBP1 N2DL-1|NKG2DL1|RAET1I UL16 binding protein 1 protein-coding 151.25-39 chr12 41815737 41815920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51639 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 220.25-74 chr8 75633377 75633810 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 93625 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 114.5-233 chr6 166334054 166334224 + 1.25 NA intron (NR_130113, intron 1 of 6) intron (NR_130113, intron 1 of 6) 8406 NR_130113 113402 Hs.487143 NM_145169 ENSG00000198818 SFT2D1 C6orf83|pRGR1 SFT2 domain containing 1 protein-coding 230.25-38 chr2 45386770 45387065 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -131976 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 142-23 chr10 112773305 112773463 + 1.25 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) -50112 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 206.5-78 chr4 30784866 30785098 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 64613 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 129.5-215 chr7 70173802 70173973 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 575412 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 298.25-17 chr2 229180459 229180929 + 1.25 NA intron (NM_001100818, intron 1 of 2) HERVK-int|LTR|ERVK 51398 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 156.25-56 chr18 27954996 27955226 + 1.25 NA intron (NM_001308176, intron 14 of 14) intron (NM_001308176, intron 14 of 14) 81530 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 186.75-111 chr8 90570022 90570355 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35875 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 254-46 chr8 113201884 113202230 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 175095 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 166.75-95 chr3 134981750 134981955 + 1.25 NA intron (NM_004441, intron 3 of 15) intron (NM_004441, intron 3 of 15) 186592 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 332.5 chr1 165377161 165377502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20616 NM_177398 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 303-18 chr2 132856936 132857379 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -58400 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-79 chr17 21366658 21366850 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9603 NM_021012 3768 Hs.200629 NM_021012 ENSG00000184185 KCNJ12 IRK-2|IRK2|KCNJN1|Kir2.2|Kir2.2v|hIRK|hIRK1|hkir2.2x|kcnj12x potassium voltage-gated channel subfamily J member 12 protein-coding 124.75-121 chr2 176245609 176245801 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23737 NM_001006635 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 171.75-57 chr17 14057756 14058040 + 1.25 NA intron (NR_049718, intron 1 of 2) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 11560 NR_049718 100874058 Hs.720411 NR_049718 ENSG00000236088 COX10-AS1 COX10-AS|COX10AS COX10 antisense RNA 1 ncRNA 206.25-75 chr4 46910209 46910458 + 1.25 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -1088 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 194-87 chr9 98427795 98428029 + 1.25 NA intron (NM_005458, intron 7 of 18) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -172263 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 184.25-90 chr4 52358057 52358304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 298359 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 296.75-38 chr9 80614225 80614744 + 1.25 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac 639461 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 230.25-48 chr2 209064791 209064985 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -359159 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 514-3 chr8 112551112 112551823 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 24 of 66) intron (NM_001363185, intron 24 of 66) -92026 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 164.5-101 chr2 133500780 133500984 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 67581 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 118.5-195 chr7 67835684 67835848 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -184487 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 140-129 chr4 114684445 114684644 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 27785 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 168.5-3 chr1 64587630 64587831 + 1.25 NA intron (NM_020925, intron 3 of 26) intron (NM_020925, intron 3 of 26) 7883 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 203.25-49 chr2 7651533 7651717 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 230364 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 145.25-171 chr8 88872831 88873051 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -545458 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 218-42 chr21 36839633 36839870 + 1.25 NA intron (NM_001352515, intron 6 of 10) intron (NM_001352515, intron 6 of 10) 122607 NM_001352518 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 178-36 chr17 71258317 71258507 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -56233 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 112.5-69 chr13 106207505 106207686 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -168969 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 308.75-18 chr16 76027510 76027966 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -249663 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 165-17 chr10 92229406 92229633 + 1.25 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) intron (NM_001178137, intron 2 of 9) 13760 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 147-90 chr3 15628211 15628444 + 1.25 NA intron (NM_001281725, intron 1 of 3) intron (NM_001281725, intron 1 of 3) 26358 NM_001281725 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 172.25-88 chr3 67589452 67589700 + 1.25 NA intron (NM_001177599, intron 2 of 10) intron (NM_001177599, intron 2 of 10) 65038 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 266.75-24 chr2 56698173 56698648 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -512640 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 362.75-2 chr1 210812828 210813182 + 1.25 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) MIR|SINE|MIR 320369 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 390.5-15 chr8 136550257 136550633 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 19647 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 262-66 chrX 93342735 93342946 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 330738 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 287.25-42 chr6 122835492 122835829 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 46402 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 118.5-102 chr2 104829558 104829787 + 1.25 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) intron (NR_037883, intron 1 of 3) 21804 NR_131235 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 112.25-53 chr14 28897832 28898023 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -112140 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 137.5-209 chr6 119283090 119283269 + 1.25 NA intron (NM_005907, intron 5 of 12) intron (NM_005907, intron 5 of 12) 66582 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 129-188 chr9 23278517 23278688 + 1.25 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 393797 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 282.5-67 chr9 35251300 35251717 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 6 of 38) AluSx1|SINE|Alu 89499 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 225.75-56 chr3 163275411 163275728 + 1.25 NA intron (NR_033945, intron 2 of 6) intron (NR_033945, intron 2 of 6) 27732 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 152-154 chr9 11651480 11651663 + 1.25 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 1038365 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 236-28 chr2 11751473 11751885 + 1.25 NA intron (NM_001349205, intron 1 of 21) AluY|SINE|Alu 3146 NM_001349205 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 185.5-125 chr5 16372384 16372658 + 1.25 NA TTS (NR_104625) TTS (NR_104625) 68581 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 200-35 chr15 97273987 97274203 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 247716 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 185.25-91 chr4 98558972 98559155 + 1.25 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) intron (NM_005723, intron 1 of 7) 99548 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 181.25-50 chr17 75134053 75134355 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -2409 NM_001252377 30833 Hs.67201 NM_014595 ENSG00000125458 NT5C DNT|DNT1|HEL74|P5N2|PN-I|PN-II|UMPH2|cdN|dNT-1 5', 3'-nucleotidase, cytosolic protein-coding 229.25-75 chr7 22275460 22275810 + 1.25 NA intron (NM_012294, intron 6 of 25) intron (NM_012294, intron 6 of 25) -80825 NM_001367602 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 152-105 chr3 149021233 149021616 + 1.25 NA intron (NM_001184721, intron 5 of 5) intron (NM_001184721, intron 5 of 5) 30016 NM_001184720 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 230.75-16 chr12 9165936 9166170 + 1.25 NA exon (NM_002864, exon 18 of 36) exon (NM_002864, exon 18 of 36) 42342 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 151-85 chr3 66637708 66637911 + 1.25 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 100527 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 323.25-2 chr1 157687077 157687400 + 1.25 NA intron (NM_052939, intron 10 of 14) L1PA16|LINE|L1 13531 NR_135216 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 247-42 chr3 5391440 5391835 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141382 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 189.5-127 chr7 15784198 15784393 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 95917 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 231-39 chr2 72637511 72637734 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) AluSz6|SINE|Alu 188411 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 283.25-10 chr11 35781593 35781968 + 1.25 NA intron (NM_017583, intron 4 of 4) intron (NM_017583, intron 4 of 4) 119005 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 382-19 chr5 22113306 22113838 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 4 of 14) MER4E1|LTR|ERV1 -28780 NR_003921 5369 Hs.247975 NM_031887 ENSG00000168967 PMCHL1 - pro-melanin concentrating hormone like 1 (pseudogene) pseudo 206-81 chr9 97774188 97774480 + 1.25 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) intron (NR_147055, intron 5 of 10) -76925 NM_000380 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 330.25-10 chr19 28358373 28358714 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -248145 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 266.75-45 chr6 71374517 71374811 + 1.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 2367 NR_029598 407032 NR_029598 ENSG00000199094 MIR30C2 MIRN30C2|mir-30c-2 microRNA 30c-2 ncRNA 249.75-23 chr15 64077588 64078010 + 1.25 NA intron (NM_001014812, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 16039 NM_032231 84191 Hs.439548 NM_032231 ENSG00000166797 CIAO2A CIA2A|FAM96A cytosolic iron-sulfur assembly component 2A protein-coding 252.75-31 chr2 82233370 82233621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -623308 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 271.5-36 chr2 57505253 57505553 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -402248 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 132.75-56 chr13 99571214 99571445 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5783 NR_126390 104355149 Hs.639387 NR_126390 LINC01039 - long intergenic non-protein coding RNA 1039 ncRNA 182.5-6 chr1 150098392 150098592 + 1.25 NA intron (NM_007259, intron 13 of 14) intron (NM_007259, intron 13 of 14) 30716 NM_001279354 11311 Hs.443750 NM_007259 ENSG00000136631 VPS45 H1|H1VPS45|SCN5|VPS45A|VPS45B|VPS54A|VSP45|VSP45A vacuolar protein sorting 45 homolog protein-coding 260-10 chr15 67716630 67716907 + 1.25 NA intron (NM_002757, intron 16 of 20) intron (NM_002757, intron 16 of 20) -108741 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 122-19 chr1 193816700 193816914 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 512062 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 262.25-24 chr2 203101648 203102011 + 1.25 NA intron (NM_001114132, intron 11 of 54) AluSz|SINE|Alu 86950 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 165.5-8 chr1 166469143 166469314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20811 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 221-74 chr7 81415041 81415288 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 146655 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 142-9 chr1 196403684 196403877 + 1.25 NA intron (NM_001287820, intron 12 of 26) intron (NM_001287820, intron 12 of 26) 178701 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 292.5-26 chr16 67554406 67554716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7748 NR_158165 107984813 Hs.385760 NR_158165 LOC107984813 - uncharacterized LOC107984813 ncRNA 309.5-20 chr2 46467950 46468351 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11415 NM_001145051 388946 Hs.733348 NM_001145051 ENSG00000284701 TMEM247 - transmembrane protein 247 protein-coding 220.25-38 chr2 189275708 189275943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96064 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 265.75-5 chr10 71119108 71119495 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -93269 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 286.25-16 chr2 100004957 100005301 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 100454 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 236-6 chr1 218694388 218694616 + 1.25 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 184407 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 206.25-47 chr2 20175872 20176133 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 49128 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 126.5-239 chr8 80503351 80503497 + 1.25 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 17198 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 203.5-28 chr11 23061571 23061858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -201240 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 222.25-73 chr5 109851118 109851383 + 1.25 NA intron (NM_002372, intron 19 of 21) intron (NM_002372, intron 19 of 21) -31932 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 210.25 chr1 18234834 18235061 + 1.25 NA intron (NM_032880, intron 2 of 9) intron (NM_032880, intron 2 of 9) 127149 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 122.25-211 chr9 108384076 108384220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 471838 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 276-23 chr17 69929370 69929861 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32092 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 326-22 chr4 104715595 104715980 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -220893 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 232.5-30 chr15 54612191 54612624 + 1.25 NA intron (NM_001329919, intron 29 of 31) intron (NM_001329919, intron 29 of 31) -444340 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 339-8 chr14 23809204 23809670 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -144333 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 355.75-11 chr3 101042681 101043222 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -49461 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 130.75-166 chr6 53878951 53879169 + 1.25 NA exon (NM_018214, exon 3 of 14) exon (NM_018214, exon 3 of 14) -50922 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 124.75-176 chr5 166807654 166807877 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 118605 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 190.5-143 chr7 24372413 24372699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88366 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 266.75-16 chr19 10941273 10941581 + 1.25 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 12616 NM_138358 90580 Hs.164026 NM_138358 ENSG00000142444 TIMM29 C19orf52|TIM29 translocase of inner mitochondrial membrane 29 protein-coding 179.75-37 chr14 53124525 53124834 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 28644 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 278-34 chr7 38749100 38749438 + 1.25 NA intron (NM_014396, intron 22 of 28) intron (NM_014396, intron 22 of 28) -62180 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 146-49 chr16 77460237 77460472 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -25320 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 226.5-70 chr4 73142883 73143069 + 1.25 NA intron (NM_032217, intron 11 of 33) L1MC5|LINE|L1 -73217 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 203.75-86 chr5 53648035 53648284 + 1.25 NA intron (NM_001318051, intron 3 of 3) intron (NM_001318051, intron 3 of 3) 87520 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 173.75-143 chr7 116429149 116429555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70386 NM_001206747 858 Hs.212332 NM_001233 ENSG00000105971 CAV2 CAV caveolin 2 protein-coding 125.5-47 chr11 122471979 122472216 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -49226 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 226-51 chr5 14435472 14435859 + 1.25 NA intron (NM_007118, intron 34 of 56) L1MC4a|LINE|L1 -28318 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 162.5-192 chr9 89827604 89827856 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -141686 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 271.5-15 chr11 129554623 129554953 + 1.25 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 62481 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 391.25-15 chr6 37663100 37663576 + 1.25 NA intron (NM_153487, intron 2 of 16) intron (NM_153487, intron 2 of 16) 34545 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 147.75-113 chr4 7646662 7646838 + 1.25 NA intron (NM_020777, intron 4 of 26) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -107340 NR_026892 84740 Hs.663029 NM_032654 ENSG00000272620 AFAP1-AS1 AFAP1-AS|AFAP1AS AFAP1 antisense RNA 1 ncRNA 113-44 chr11 98304902 98305056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -715970 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 285.75-9 chr12 15019258 15019540 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 17566 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 143.75-49 chr14 63406909 63407130 + 1.25 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) L3|LINE|CR1 -88084 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 343.5-20 chr6 127208045 127208356 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58482 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 162.25-18 chr10 63792337 63792571 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -270564 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 212.5-79 chr4 60527402 60527713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -395062 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 243.5-86 chr8 125474548 125474979 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 42554 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 150.5-103 chr2 163459062 163459217 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 276869 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 225.5-106 chr8 120516209 120516461 + 1.25 NA intron (NM_022045, intron 18 of 21) intron (NM_022045, intron 18 of 21) 70916 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 118.25-164 chr5 160829160 160829290 + 1.25 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) intron (NM_001366652, intron 1 of 24) 22986 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 130-92 chr20 32350015 32350130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8272 NM_015338 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 163.75-73 chr2 122987269 122987529 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86082 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 301-4 chr14 55678501 55679181 + 1.25 NA intron (NR_073129, intron 43 of 45) MER1B|DNA|hAT-Charlie -87404 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 191.75-116 chr7 49391143 49391365 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -382384 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 123.25-122 chr20 60016359 60016544 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 20077 NM_001348204 60437 Hs.729046 NM_021810 ENSG00000124215 CDH26 VR20 cadherin 26 protein-coding 177-59 chr3 4500171 4500386 + 1.25 NA intron (NM_001168272, intron 2 of 60) AluJo|SINE|Alu 6930 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 290-2 chr1 45019734 45020184 + 1.25 NA intron (NM_020883, intron 13 of 13) intron (NM_020883, intron 13 of 13) 7705 NR_036510 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 338.75-2 chr10 36190608 36190960 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 412482 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 218.25-13 chr10 88940497 88940829 + 1.25 NA TTS (NR_125373) TTS (NR_125373) 7979 NR_125373 100132116 NR_125373 ENSG00000180139 ACTA2-AS1 UC001kfo|ZXF1|uc001kfo.1 ACTA2 antisense RNA 1 ncRNA 338.5-10 chr17 31600231 31600793 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 25101 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 216-10 chr12 24262518 24262723 + 1.25 NA intron (NM_001261414, intron 4 of 16) intron (NM_001261414, intron 4 of 16) 39349 NR_120473 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 248.25-8 chr10 61092829 61093125 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76702 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 142-106 chr3 106571380 106571542 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 669177 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 158.75-68 chr16 82516288 82516463 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -110594 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 358.75-12 chr5 118136415 118137026 + 1.25 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 -145854 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 211.25-97 chr8 119924265 119924526 + 1.25 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 50673 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 258.25-49 chr6 16029042 16029264 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99933 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 287-9 chr11 86452127 86452596 + 1.25 NA intron (NM_001014811, intron 7 of 13) ERVL-E-int|LTR|ERVL 77474 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 325.5-23 chr3 9222501 9222820 + 1.25 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) intron (NM_014850, intron 1 of 21) 5765 NR_103443 100288831 Hs.694646 NR_103443 ENSG00000227929 SRGAP3-AS3 - SRGAP3 antisense RNA 3 ncRNA 230.5-8 chr1 147838749 147839017 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -63912 NM_005267 2703 Hs.632441 NM_005267 ENSG00000121634 GJA8 CAE|CAE1|CTRCT1|CX50|CZP1|MP70 gap junction protein alpha 8 protein-coding 228-56 chr4 36811262 36811638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -169550 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 205.75-89 chr8 142972133 142972465 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -23529 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 244-39 chr4 65347677 65347934 + 1.25 NA intron (NM_001281767, intron 15 of 16) intron (NM_001281767, intron 15 of 16) 321683 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 120.75-65 chr18 9078095 9078201 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24551 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 173-133 chr7 42527604 42527974 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 178658 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 250.25-4 chr11 68719574 68719897 + 1.25 NA intron (NM_004923, intron 6 of 9) intron (NM_004923, intron 6 of 9) 31785 NM_001039656 9633 Hs.145932 NM_004923 ENSG00000132749 TESMIN CXCDC2|MTL5|MTLT testis expressed metallothionein like protein protein-coding 220.5-97 chr5 59744855 59745144 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 23849 NM_001364602 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 234.5-88 chr7 47646111 47646308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9035 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 215-72 chr8 86601455 86601733 + 1.25 NA intron (NM_019098, intron 15 of 17) intron (NM_019098, intron 15 of 17) 87159 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 174.25-141 chr8 72273385 72273593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21855 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 181-21 chr12 83036506 83036709 + 1.25 NA intron (NM_152588, intron 9 of 11) MIRc|SINE|MIR 349452 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 231-53 chr3 174595531 174595754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -263692 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 195-87 chr7 132793423 132793620 + 1.25 NA intron (NR_133671, intron 10 of 10) intron (NR_133671, intron 10 of 10) 34551 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 195-97 chr9 8161717 8161943 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -362052 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 238.75-2 chr10 30176288 30176590 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -35413 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 173.25-42 chr15 63130129 63130313 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001288585, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001288585, exon 5 of 5) 8360 NM_001288585 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 211.75-31 chr17 53404098 53404268 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 418678 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 316-9 chr12 127059535 127059860 + 1.25 NA intron (NR_104646, intron 1 of 6) intron (NR_104646, intron 1 of 6) 700 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 176.5-92 chr2 88307203 88307571 + 1.25 NA Intergenic U13_|snRNA|snRNA 134248 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 280.25-28 chr2 72509127 72509440 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 11 of 19) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 316750 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 275.5-53 chr5 34721195 34721686 + 1.25 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 33881 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 319.75-8 chr15 97298028 97298360 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 223617 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 215.5-100 chr7 77850690 77850913 + 1.25 NA intron (NM_001366085, intron 2 of 10) L1MA3|LINE|L1 10671 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 200-79 chr6 72617978 72618221 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3744 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 119.75-82 chr18 1847076 1847207 + 1.25 NA Intergenic (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -487512 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 368.5-2 chr10 8881816 8882245 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15959 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 154.5-85 chr18 58272253 58272470 + 1.25 NA intron (NM_001144965, intron 5 of 30) AluJb|SINE|Alu 50790 NM_001144966 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 196.25-4 chr1 164919825 164920064 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -145303 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 129.75-88 chr2 17220336 17220561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 297992 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 231-23 chr14 53569861 53570102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 378503 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 304.25-16 chr22 29319547 29319822 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3987 NM_006477 10633 Hs.73088 NM_006477 ENSG00000100276 RASL10A RRP22 RAS like family 10 member A protein-coding 185.25-14 chr11 37950897 37951141 + 1.25 NA intron (NR_135110, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 12418 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 176-68 chr7 7099854 7100132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3207 NR_034022 100131257 Hs.551110 NR_034022 LOC100131257 - zinc finger protein 655 pseudogene pseudo 211.75-48 chr2 119333618 119333838 + 1.25 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) L1MC4|LINE|L1 33014 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 285.25-15 chr2 162759718 162760013 + 1.25 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -9071 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 239.25-12 chr11 76971038 76971481 + 1.25 NA intron (NM_001300954, intron 3 of 10) LTR49|LTR|ERV1 -63139 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 305.5-14 chr15 70903305 70903668 + 1.25 NA intron (NM_017691, intron 4 of 15) intron (NM_017691, intron 4 of 15) 11043 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 227.5-34 chr14 88422514 88422836 + 1.25 NA intron (NM_001040428, intron 4 of 10) intron (NM_001040428, intron 4 of 10) 37018 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 125.25-209 chr8 121168910 121169075 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -356946 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 286.75-45 chr9 89489161 89489708 + 1.25 NA intron (NM_001371194, intron 1 of 15) L1MB5|LINE|L1 6222 NM_001371195 151-24 chr11 127054405 127054612 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -12494 NR_120578 101929473 Hs.737523 NR_120578 ENSG00000255087 LOC101929473 - uncharacterized LOC101929473 ncRNA 293.75-16 chr17 42633442 42633722 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 23899 NM_001070 7283 Hs.279669 NM_001070 ENSG00000131462 TUBG1 CDCBM4|GCP-1|TUBG|TUBGCP1 tubulin gamma 1 protein-coding 370.25-4 chr2 11818332 11818916 + 1.25 NA intron (NM_001349203, intron 18 of 20) L1M5|LINE|L1 18362 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 145.5-114 chr20 20167279 20167448 + 1.25 NA intron (NM_015585, intron 12 of 26) intron (NM_015585, intron 12 of 26) 110717 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 121.25-33 chr11 65702092 65702216 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -10098 NM_182710 10524 Hs.397010 NM_006388 ENSG00000172977 KAT5 ESA1|HTATIP|HTATIP1|PLIP|TIP|TIP60|ZC2HC5|cPLA2 lysine acetyltransferase 5 protein-coding 156-39 chr13 109071906 109072078 + 1.25 NA intron (NM_015011, intron 27 of 34) intron (NM_015011, intron 27 of 34) 95311 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 171.5-43 chr13 45203751 45203948 + 1.25 NA intron (NM_004128, intron 4 of 7) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -2804 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 126.5-3 chr1 25047328 25047549 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 23935 NR_039623 100616365 NR_039623 ENSG00000264371 MIR4425 - microRNA 4425 ncRNA 325.75-10 chr18 64129441 64129756 + 1.25 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) 19428 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 180.25-123 chr8 135603365 135603677 + 1.25 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 146065 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 214.5-123 chr8 53154595 53154962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 96859 NM_000912 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 469 chr2 73178816 73179350 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -23491 NM_001134462 344022 Hs.694384 NM_001134462 ENSG00000214513 NOTO - notochord homeobox protein-coding 263.75-37 chr3 108109026 108109345 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -15879 NR_110030 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 128.75-4 chr1 77380309 77380504 + 1.25 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR 97319 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 191.5-148 chr8 84736694 84736944 + 1.25 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 30892 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 177.75-9 chr1 109849870 109850060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60884 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 251.25-19 chr15 99364534 99364917 + 1.25 NA intron (NR_135755, intron 8 of 8) MIR|SINE|MIR 107200 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 234.5-23 chr14 20629389 20629722 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 12136 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 189-75 chr3 36269995 36270262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110359 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 247-2 chr1 77363875 77364115 + 1.25 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) L2a|LINE|L2 80908 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 234.25-31 chr2 21673902 21674152 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36625 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 243.25-27 chr22 22864862 22865172 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -21250 NR_049835 100847006 NR_049835 ENSG00000264824 MIR5571 - microRNA 5571 ncRNA 244.75-9 chr10 105031566 105031856 + 1.25 NA intron (NM_014978, intron 4 of 26) L3|LINE|CR1 -365495 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 273-20 chr14 41589639 41589982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17046 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 223.5-46 chr15 76835220 76835535 + 1.25 NA intron (NR_148227, intron 5 of 32) L1PA15|LINE|L1 26567 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 240.25-35 chr2 186083896 186084251 + 1.25 NA intron (NR_110218, intron 1 of 5) intron (NR_110218, intron 1 of 5) 2244 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 287.25-52 chr8 127065247 127065728 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14387 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 189.75-81 chr4 42298387 42298682 + 1.25 NA TTS (NR_134668) TTS (NR_134668) 92734 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 178.5-86 chr2 173536910 173537156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182161 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 140.25-30 chr11 17874565 17874746 + 1.25 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 138392 NM_012139 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 279.25-27 chr3 173758109 173758464 + 1.25 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 162510 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 264.25-41 chr5 19664067 19664385 + 1.25 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 222046 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 226-63 chr7 38543499 38543732 + 1.25 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR 87758 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 149-24 chr12 125539936 125540183 + 1.25 NA intron (NM_052907, intron 4 of 8) L1M5|LINE|L1 -82393 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 170.25-77 chr2 166927884 166928126 + 1.25 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 39518 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 153.75-84 chr22 28343143 28343362 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSx1|SINE|Alu -116617 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 254.25-29 chr18 70196635 70196866 + 1.25 NA intron (NM_001318520, intron 6 of 47) intron (NM_001318520, intron 6 of 47) 8937 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 399.75-11 chr5 84438739 84439233 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -54106 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 235.5-42 chr18 7487731 7488175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26947 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 418-5 chr6 131294016 131294354 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 43781 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 222-23 chr14 65927391 65927702 + 1.25 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 456444 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 163-49 chr18 3556628 3556837 + 1.25 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) L1MC1|LINE|L1 -37382 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 161.75-40 chr14 69725054 69725240 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -41995 NM_001039465 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 151.75-131 chr6 131635922 131636115 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1284 NM_005021 5169 Hs.486489 NM_005021 ENSG00000154269 ENPP3 B10|CD203c|NPP3|PD-IBETA|PDNP3 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3 protein-coding 222.5-68 chr3 113267568 113267823 + 1.25 NA intron (NM_001301861, intron 4 of 19) intron (NM_001301861, intron 4 of 19) 55579 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 158.5-181 chr7 51954692 51954847 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -561513 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 237.75-17 chr14 58385149 58385475 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10618 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 259.75-61 chrX 68284812 68285242 + 1.25 NA intron (NM_002547, intron 3 of 24) L1M4|LINE|L1 148468 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 190.75-58 chr20 6978197 6978413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 210619 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 152-98 chr22 35268266 35268411 + 1.25 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) intron (NM_001003681, intron 5 of 10) 10845 NM_001362972 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 151.5-179 chr7 22714526 22714693 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12591 NM_000600 3569 Hs.654458 NM_000600 ENSG00000136244 IL6 BSF-2|BSF2|CDF|HGF|HSF|IFN-beta-2|IFNB2|IL-6 interleukin 6 protein-coding 313.5-12 chr15 53468443 53468759 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 72251 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 308.75-14 chr14 49060341 49060841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 525789 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 173.5-36 chr13 40950109 40950304 + 1.25 NA intron (NM_001370329, intron 5 of 9) intron (NM_001370329, intron 5 of 9) -28432 NR_003365 283507 Hs.442781 NR_003365 ENSG00000239827 SUGT1P3 SUGT1L1 SUGT1 pseudogene 3 pseudo 329.75-2 chr1 200810039 200810421 + 1.25 NA intron (NM_001297707, intron 3 of 17) intron (NM_001297707, intron 3 of 17) -62751 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 340.75-26 chr9 26633935 26634446 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 258612 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 149.75-11 chr10 34310016 34310270 + 1.25 NA intron (NM_001184790, intron 18 of 22) intron (NM_001184790, intron 18 of 22) 505153 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 332.5-17 chr21 27792860 27793318 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 70710 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 326.75-17 chr5 68632935 68633345 + 1.25 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 340563 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 342.75-24 chr6 51739484 51739812 + 1.25 NA intron (NM_170724, intron 60 of 60) L2a|LINE|L2 117778 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 170.25-159 chr9 38274702 38274970 + 1.25 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -117866 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 387.5-3 chr10 115433145 115433697 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) intron (NM_207303, intron 21 of 28) 340056 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 143.75-86 chr2 54941932 54942098 + 1.25 NA intron (NM_001039753, intron 27 of 40) intron (NM_001039753, intron 27 of 40) 68257 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 223-51 chr22 46362006 46362353 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014246, exon 35 of 35) 3' UTR (NM_014246, exon 35 of 35) 26465 NM_001282782 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 201-3 chr1 85435081 85435386 + 1.25 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) HY1|scRNA|scRNA 29926 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 230.25-41 chr2 74469854 74470223 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 2642 NM_053050 116540 Hs.534527 NM_053050 ENSG00000204822 MRPL53 L53MT mitochondrial ribosomal protein L53 protein-coding 276.25-24 chr19 46150546 46150916 + 1.25 NA intron (NM_001002915, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 2493 NM_001135113 147920 Hs.99376 NM_001002915 ENSG00000204866 IGFL2 UNQ645|VPRI645 IGF like family member 2 protein-coding 254.75-10 chr13 72812812 72813215 + 1.25 NA intron (NR_146206, intron 5 of 16) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 30880 NR_146206 10464 Hs.441926 NM_006346 ENSG00000083535 PIBF1 C13orf24|CEP90|JBTS33|PIBF progesterone immunomodulatory binding factor 1 protein-coding 305.5-15 chr15 72027404 72027787 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 4 of 41) intron (NM_006901, intron 4 of 41) -86663 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 209.75-5 chr1 222911917 222912119 + 1.25 NA intron (NM_001350630, intron 2 of 8) intron (NM_001350630, intron 2 of 8) -16406 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 422.75-3 chr3 66278640 66279163 + 1.25 NA intron (NM_001350992, intron 4 of 8) HAL1ME|LINE|L1 57898 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 248-61 chr6 40702124 40702490 + 1.25 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -114943 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 233.25-55 chr4 98739860 98740092 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 81074 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 224.5-19 chr10 81014813 81015240 + 1.25 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 365229 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 306.25-35 chr8 80496205 80496752 + 1.25 NA intron (NM_001105539, intron 1 of 5) intron (NM_001105539, intron 1 of 5) 10252 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 211.25-24 chr14 62313314 62313576 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -173472 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 205.25-82 chr5 45376832 45377129 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 319400 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 156.75-27 chr10 106302274 106302411 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162177 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 129-106 chr2 234393709 234393896 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60793 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 138.25-159 chr7 32533224 32533443 + 1.25 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) intron (NM_015060, intron 1 of 15) 37844 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 135.5-216 chr9 100165129 100165323 + 1.25 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) L1MA3|LINE|L1 65983 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 254.75-46 chr6 46500133 46500516 + 1.25 NA intron (NR_125837, intron 1 of 2) MER90a|LTR|ERV1 -8257 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 312-15 chr2 96181736 96182401 + 1.25 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -26348 NR_046322 285033 Hs.58648 NM_001037228 STARD7-AS1 - STARD7 antisense RNA 1 ncRNA 236.25-52 chr21 22345206 22345463 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 246717 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 311.25-32 chr8 106747026 106747286 + 1.25 NA intron (NM_181354, intron 13 of 13) MIRb|SINE|MIR 21049 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 308.25-27 chr4 121373796 121374182 + 1.25 NA intron (NM_198179, intron 1 of 5) intron (NM_198179, intron 1 of 5) 7029 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 200.25-121 chr9 100566370 100566600 + 1.25 NA intron (NM_001198812, intron 8 of 9) L2a|LINE|L2 -11594 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 200.5-138 chr8 118316839 118317036 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) FLAM_C|SINE|Alu -205118 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 197.25-58 chr20 40032650 40033042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28385 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 140.5-162 chr3 182300453 182300649 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 185811 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 269.5-59 chr8 89184848 89185131 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 572722 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 119.5-16 chr1 203896139 203896280 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 34362 NM_001328638 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 235.75-28 chr15 88730274 88730624 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72987 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 318.75-16 chr4 85609916 85610196 + 1.25 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -112412 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 185.25-41 chr15 93280148 93280468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74242 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 257.5-62 chr5 125167878 125168350 + 1.25 NA intron (NR_109882, intron 3 of 5) intron (NR_109882, intron 3 of 5) 131283 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 229.25-9 chr10 86118287 86118633 + 1.25 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) L1PB1|LINE|L1 146328 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 359-13 chr6 65143547 65144052 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L2c|LINE|L2 -157619 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 225.25-20 chr14 61724762 61725058 + 1.25 NA intron (NM_181054, intron 4 of 13) intron (NM_181054, intron 4 of 13) 24179 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 250.75-53 chr4 139076181 139076422 + 1.25 NA intron (NM_001371336, intron 4 of 8) intron (NM_001371336, intron 4 of 8) 7923 NM_001276458 1998 Hs.634040 NM_006874 ENSG00000109381 ELF2 EU32|NERF|NERF-1A|NERF-1B|NERF-1a,b|NERF-2 E74 like ETS transcription factor 2 protein-coding 355.5-20 chr4 73929823 73930191 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 52020 NM_002619 5196 Hs.81564 NM_002619 ENSG00000163737 PF4 CXCL4|PF-4|SCYB4 platelet factor 4 protein-coding 285.25-10 chr17 75966573 75966868 + 1.25 NA intron (NM_004035, intron 2 of 13) AluSx3|SINE|Alu 12446 NM_007292 51 Hs.464137 NM_004035 ENSG00000161533 ACOX1 ACOX|PALMCOX|SCOX acyl-CoA oxidase 1 protein-coding 324.75-10 chr14 31377559 31377851 + 1.25 NA intron (NM_015473, intron 11 of 35) AluJb|SINE|Alu 42845 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 444.75-6 chr3 150344500 150345198 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -21102 NR_110187 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 240.75-20 chr13 42028402 42028649 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11511 NM_001204504 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 239-35 chr3 4572411 4572671 + 1.25 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 79193 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 191.5-135 chr7 5094648 5094918 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 22723 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 156.75-68 chr17 61104207 61104375 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 263413 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 322-8 chr14 73496411 73496868 + 1.25 NA exon (NM_203309, exon 14 of 17) exon (NM_203309, exon 14 of 17) 5706 NM_024644 79697 Hs.509916 NM_024644 ENSG00000170468 RIOX1 C14orf169|JMJD9|MAPJD|NO66|ROX|URLC2|hsNO66 ribosomal oxygenase 1 protein-coding 288.5-26 chr20 21269323 21269663 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -33838 NM_012255 22803 Hs.255932 NM_012255 ENSG00000088930 XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 protein-coding 377.75-7 chr3 197052586 197053211 + 1.25 NA intron (NM_001366216, intron 22 of 23) L1MC5|LINE|L1 -23081 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 239.25-49 chr2 102457583 102457843 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -15513 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 210.75-21 chr12 63413310 63413528 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 255074 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 133.5-34 chr10 75032426 75032575 + 1.25 NA 3' UTR (NM_012330, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_012330, exon 18 of 18) 10767 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 300-34 chr7 51876565 51876960 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -483506 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 198.5-36 chr13 94453137 94453394 + 1.25 NA intron (NM_001129889, intron 6 of 9) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 26417 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 132.25-165 chr6 27547188 27547316 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74134 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 209.75-105 chr9 30115177 30115456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 293138 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 261.75-2 chr10 16102893 16103249 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -242538 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 217.75-11 chr10 31149872 31150174 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -37860 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 178.5-102 chr3 14488759 14488946 + 1.25 NA TTS (NM_001080423) TTS (NM_001080423) 51490 NM_001080423 80852 Hs.517819 NM_001080423 ENSG00000144596 GRIP2 - glutamate receptor interacting protein 2 protein-coding 206.25-18 chr10 63680097 63680396 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -158356 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 357.25-17 chr8 124329333 124329823 + 1.25 NA intron (NM_194291, intron 2 of 6) intron (NM_194291, intron 2 of 6) 43121 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 243.5-11 chr1 187676282 187676580 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 232803 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 132.25-48 chr12 40358028 40358199 + 1.25 NA intron (NM_198578, intron 46 of 50) L1MA4A|LINE|L1 -35281 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 126.75-66 chr14 97174436 97174635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19678 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 288.5-40 chr6 72325690 72325994 + 1.25 NA intron (NM_001350466, intron 19 of 24) intron (NM_001350466, intron 19 of 24) -40904 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 208-24 chr14 88361024 88361415 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24425 NM_001040428 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 244-30 chr2 211727035 211727375 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 5 of 26) MIR|SINE|MIR 699155 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 255.5-3 chr1 51982673 51982960 + 1.25 NA intron (NM_002867, intron 1 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 7884 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 152.5-135 chr4 70645209 70645450 + 1.25 NA 3' UTR (NM_031889, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_031889, exon 9 of 9) 7618 NM_001368133 10117 Hs.667018 NM_031889 ENSG00000132464 ENAM ADAI|AI1C|AIH2 enamelin protein-coding 184.25-34 chr12 111466674 111466954 + 1.25 NA intron (NR_132311, intron 19 of 23) intron (NR_132311, intron 19 of 23) 31952 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 186.5-27 chr11 113088153 113088357 + 1.25 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -124795 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 259.75-34 chr22 47311191 47311502 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34225 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 217-32 chr2 72494051 72494420 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 15 of 19) intron (NR_135774, intron 15 of 19) 331798 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 223.5-123 chr7 105892164 105892400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15697 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 208-7 chr10 56141929 56142229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 219180 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 174-31 chr15 61615355 61615675 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -114403 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 325.75-25 chr5 30807200 30807609 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -386282 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 371.25-14 chr5 62387607 62388148 + 1.25 NA TTS (NM_004520) TTS (NM_004520) 16028 NM_001348077 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 124.25-93 chr2 30653015 30653175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154351 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 133.75-117 chr20 53756135 53756298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 119493 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 129-100 chr2 191718433 191718677 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 28374 NR_131917 105747689 Hs.104972 NR_131917 LOC105747689 - uncharacterized LOC105747689 ncRNA 218.5-23 chr10 108615137 108615463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -546007 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 165.75-158 chr7 81683659 81683880 + 1.25 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) intron (NR_126025, intron 1 of 10) 7637 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 179.75-71 chr3 25721854 25722097 + 1.25 NA intron (NM_018297, intron 10 of 11) AluSz|SINE|Alu -57036 NR_039644 100616477 NR_039644 ENSG00000283971 MIR4442 mir-4442 microRNA 4442 ncRNA 186.75-79 chr4 96386317 96386614 + 1.25 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) intron (NR_147149, intron 1 of 3) 75762 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 215-3 chr1 47636319 47636554 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199119 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 159.75-50 chr14 87243537 87243758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 337869 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 214-72 chr9 85620737 85620960 + 1.25 NA intron (NM_015239, intron 15 of 25) intron (NM_015239, intron 15 of 25) 121181 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 135.25-136 chr4 44280027 44280231 + 1.25 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 168680 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 170.75-94 chr4 36116074 36116272 + 1.25 NA intron (NR_146894, intron 25 of 32) intron (NR_146894, intron 25 of 32) 127766 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 270.5-49 chr4 113845812 113846094 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84026 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 236.5-71 chr5 23418461 23418830 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -88964 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 180.75-52 chr17 55856663 55856870 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 105661 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 150.5-44 chr13 75056990 75057155 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 183309 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 192-96 chr7 108233778 108234027 + 1.25 NA intron (NM_001371137, intron 5 of 25) MIR3|SINE|MIR 9483 NM_001371182 183.75-133 chrX 74229500 74229691 + 1.25 NA intron (NR_028379, intron 5 of 6) L1MB7|LINE|L1 -10977 NR_030620 100126317 NR_030620 ENSG00000212027 MIR374B MIRN374B|mir-374b microRNA 374b ncRNA 312.75-18 chr2 212699256 212699746 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95830 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 162.5-171 chr8 78625576 78625807 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -40398 NM_001362969 51101 Hs.271876 NM_016010 ENSG00000104427 ZC2HC1A C8orf70|CGI-62|FAM164A zinc finger C2HC-type containing 1A protein-coding 283.5-54 chr8 87928376 87928751 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54548 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 333.75 chr1 241232632 241233014 + 1.25 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) L1M4|LINE|L1 100551 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 171.25-70 chr19 37775467 37775677 + 1.25 NA intron (NM_001172690, intron 1 of 4) intron (NM_001172690, intron 1 of 4) 4018 NM_001172690 126231 Hs.531262 NM_152360 ENSG00000189144 ZNF573 - zinc finger protein 573 protein-coding 204.25-60 chr2 202449783 202449972 + 1.25 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu 73550 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 281.5-50 chr7 37051742 37052132 + 1.25 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) intron (NM_001206480, intron 15 of 21) 54141 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 273.25-12 chr12 32604648 32604878 + 1.25 NA intron (NM_001370297, intron 5 of 14) L1M4a1|LINE|L1 70470 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 384.5-5 chr14 53095668 53096284 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) intron (NM_030637, intron 2 of 11) 57347 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 260.5-30 chr2 79606860 79607194 + 1.25 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) L1MC4|LINE|L1 42332 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 384.25-15 chr5 106964109 106964605 + 1.25 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 46657 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 173.75-89 chr2 135864386 135864880 + 1.25 NA intron (NM_005915, intron 7 of 16) L1MB4|LINE|L1 11810 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 250.5-61 chr3 86272520 86272955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -209206 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 207-52 chr21 30475601 30475831 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 4651 NM_181607 337882 Hs.61552 NM_181607 ENSG00000184351 KRTAP19-1 KAP19.1 keratin associated protein 19-1 protein-coding 211.75-29 chr16 69129981 69130302 + 1.25 NA intron (NM_001002847, intron 1 of 2) intron (NM_001002847, intron 1 of 2) 2018 NM_001040146 54921 Hs.85962 NM_017804 ENSG00000168802 CHTF8 CTF8|DERPC chromosome transmission fidelity factor 8 protein-coding 278.75-36 chr6 67433832 67434152 + 1.25 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -621359 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 220.5-105 chr6 43624424 43624736 + 1.25 NA exon (NM_001286216, exon 7 of 12) exon (NM_001286216, exon 7 of 12) 2773 NM_001286216 54676 Hs.485449 NM_019096 ENSG00000172432 GTPBP2 JABELS GTP binding protein 2 protein-coding 237.25-70 chr7 141614502 141614816 + 1.25 NA intron (NM_018238, intron 7 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 63249 NM_018238 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 128.25-157 chr5 36473689 36473937 + 1.25 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -132542 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 284.75-29 chr5 131535088 131535606 + 1.25 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 99882 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 122.25-102 chr2 169698763 169699071 + 1.25 NA intron (NM_001199288, intron 3 of 3) intron (NM_001199288, intron 3 of 3) 4448 NM_001008489 493911 Hs.745233 NM_001008489 ENSG00000144362 PHOSPHO2 - phosphatase, orphan 2 protein-coding 213-9 chr1 164715069 164715392 + 1.25 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 59411 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 146.25-161 chr9 30206492 30206662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 201877 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 155.75-55 chr15 54402037 54402240 + 1.25 NA intron (NM_001329919, intron 17 of 31) intron (NM_001329919, intron 17 of 31) 389490 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 188-35 chr2 61009493 61009764 + 1.25 NA intron (NM_144709, intron 2 of 17) intron (NM_144709, intron 2 of 17) 7584 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 213.75-89 chr5 43925605 43925868 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -322506 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 452.25 chr10 118013155 118013720 + 1.25 NA intron (NM_014904, intron 4 of 4) intron (NM_014904, intron 4 of 4) -33384 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 207.25-34 chr19 34305879 34306105 + 1.25 NA intron (NM_014686, intron 2 of 13) intron (NM_014686, intron 2 of 13) 51438 NM_014686 9710 Hs.330073 NM_014686 ENSG00000166398 KIAA0355 - KIAA0355 protein-coding 232.25-43 chr22 38163081 38163664 + 1.25 NA intron (NM_001349869, intron 2 of 16) intron (NM_001349869, intron 2 of 16) 18458 NM_003560 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 213.25-13 chr14 22552070 22552317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 4869 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 263.75-30 chr2 176211858 176212129 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23035 NR_033979 401022 Hs.98661 NR_033979 ENSG00000224189 HAGLR HOXD-AS1|MIR7704HG|Mdgt HOXD antisense growth-associated long non-coding RNA ncRNA 208-34 chr2 13028078 13028506 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21279 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 299.5-32 chr5 53345720 53346080 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -134729 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 154.5-8 chr1 95821394 95821604 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -170569 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 189.75-67 chr21 26021249 26021476 + 1.25 NA intron (NM_001204301, intron 6 of 16) intron (NM_001204301, intron 6 of 16) 119028 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 204-48 chr22 27346898 27347073 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36334 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 322 chr1 41108949 41109589 + 1.25 NA intron (NM_001172222, intron 4 of 10) MIRb|SINE|MIR 52163 NR_135092 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 202-76 chr8 127282245 127282493 + 1.25 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 37732 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 219-43 chr17 29788439 29788874 + 1.25 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -27224 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 283.75-21 chr21 29668408 29668800 + 1.25 NA intron (NM_000830, intron 4 of 16) MIRb|SINE|MIR 72564 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 163.25-150 chr9 27999405 27999696 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -425684 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 209.75-12 chr10 99507493 99507873 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23494 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 231.25-6 chr10 20492207 20492487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59623 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 173-10 chr1 223354627 223354962 + 1.25 NA intron (NM_017982, intron 2 of 8) intron (NM_017982, intron 2 of 8) 9382 NM_017982 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 191.5-145 chr8 25519606 25519793 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 60466 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 170.5-200 chr9 27726004 27726200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152236 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 210-57 chr2 189453208 189453479 + 1.25 NA intron (NM_001303096, intron 5 of 21) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 11869 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 302.75-16 chr3 29896069 29896349 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 8 of 13) intron (NM_001003792, intron 8 of 13) 37947 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 323.25-8 chr13 59541387 59541829 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -471110 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 206.75-5 chr1 97601758 97602226 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -194929 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 252.5-50 chr21 44569086 44569305 + 1.25 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) intron (NM_144991, intron 1 of 11) -4534 NM_198687 386672 Hs.567901 NM_198687 ENSG00000215454 KRTAP10-4 KAP10.4|KAP18-4|KRTAP10.4|KRTAP18-4|KRTAP18.4 keratin associated protein 10-4 protein-coding 172.25-36 chr14 64841578 64841810 + 1.25 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) intron (NM_001355436, intron 1 of 35) -18314 NM_001024858 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 125.75-134 chr4 30707512 30707638 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -12794 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 201.75-33 chr14 49762571 49762888 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -5424 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 218.5-41 chr16 5435548 5435817 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 180568 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 275.25-28 chr3 74219258 74219489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 301767 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 287.25-45 chr8 24952818 24953334 + 1.25 NA TTS (NR_106900) TTS (NR_106900) 791 NR_106900 102465506 NR_106900 ENSG00000283327 MIR6841 hsa-mir-6841 microRNA 6841 ncRNA 273.5-25 chr16 262336 262579 + 1.25 NA exon (NM_001284497, exon 8 of 13) exon (NM_001284497, exon 8 of 13) 13487 NM_003834 8786 Hs.65756 NM_003834 ENSG00000076344 RGS11 RS11 regulator of G protein signaling 11 protein-coding 167.25-158 chr8 130736630 130736814 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -293048 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 278.75-26 chr4 38947837 38948243 + 1.25 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 80008 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 365.75-2 chr10 95668349 95668885 + 1.25 NA intron (NM_015631, intron 13 of 13) HAL1|LINE|L1 -11906 NM_001323415 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 222-7 chr1 166526384 166526691 + 1.25 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -36498 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 317-31 chr7 113716636 113717067 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 202158 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 274.75-41 chr5 74154116 74154426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154054 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 175.5-173 chr8 129082109 129082347 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -116227 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 281.5-19 chr15 43195081 43195495 + 1.25 NA non-coding (NR_045998, exon 10 of 10) non-coding (NR_045998, exon 10 of 10) 9885 NR_027514 23582 Hs.36794 NM_012142 ENSG00000166946 CCNDBP1 DIP1|GCIP|HHM cyclin D1 binding protein 1 protein-coding 173.75-19 chr10 12596596 12596773 + 1.25 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) MER5A|DNA|hAT-Charlie 17931 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 223.25-73 chr7 125940839 125941076 + 1.25 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -676666 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 172-2 chr1 22458160 22458385 + 1.25 NA intron (NM_001083621, intron 2 of 18) L2|LINE|L2 6421 NM_014870 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 124.25-8 chr1 76659099 76659240 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120098 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 229.75-28 chr16 75817363 75817663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91023 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 150-34 chr13 91823047 91823222 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 5 of 7) intron (NM_004466, intron 5 of 7) 424513 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 222.5-56 chr2 181261361 181261692 + 1.25 NA intron (NR_130784, intron 2 of 4) L1MD|LINE|L1 44126 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 137.25-35 chr12 61843168 61843460 + 1.25 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) intron (NM_178539, intron 2 of 4) 349525 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 334.75-13 chr2 65136566 65136910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6437 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 183-87 chr5 40196748 40196990 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 144578 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 290.25 chr1 75094655 75095098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33558 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 131.75-145 chr4 30366296 30366478 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -353982 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 253.25-52 chr4 116139664 116140042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -159872 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 146.5-161 chr4 169560682 169560926 + 1.25 NA intron (NM_001199399, intron 15 of 32) MIRc|SINE|MIR 51779 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 133.75-5 chr1 80250169 80250311 + 1.25 NA Intergenic LTR22C0|LTR|ERVK -285515 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 196.75-39 chr14 66957361 66957686 + 1.25 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) L1MB5|LINE|L1 -231917 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 195.75-49 chr16 9835239 9835578 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 7 of 13) intron (NM_001134408, intron 7 of 13) 346659 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 177-50 chr2 195945770 195945931 + 1.25 NA intron (NM_018897, intron 19 of 64) intron (NM_018897, intron 19 of 64) 122987 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 159-80 chr4 91232396 91232644 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 997489 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 299-33 chr7 130501381 130501749 + 1.25 NA intron (NM_177524, intron 9 of 11) intron (NM_177524, intron 9 of 11) 5454 NR_029899 442904 NR_029899 ENSG00000199043 MIR335 MIRN335|hsa-mir-335|miRNA335|mir-335 microRNA 335 ncRNA 141.25-189 chr9 30345530 30345670 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 62854 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 204-70 chr6 23022509 23022799 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -304730 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 183.75-87 chr4 101641195 101641362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149329 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 175.25-152 chr9 87036854 87037146 + 1.25 NA intron (NR_027471, intron 1 of 1) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 5126 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 290.75-29 chr2 214528226 214528557 + 1.25 NA intron (NR_047698, intron 2 of 3) L3|LINE|CR1 18209 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 313.25-28 chr7 82012418 82012750 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 14 of 38) intron (NM_000722, intron 14 of 38) 3407 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 169.25-5 chr1 115732272 115732515 + 1.25 NA intron (NM_001232, intron 5 of 10) intron (NM_001232, intron 5 of 10) 36412 NM_001232 845 Hs.57975 NM_001232 ENSG00000118729 CASQ2 PDIB2 calsequestrin 2 protein-coding 190.75-22 chr12 65438670 65438927 + 1.25 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) L1MEj|LINE|L1 118513 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 209.5-20 chr11 36202273 36202603 + 1.25 NA intron (NM_001304264, intron 4 of 5) intron (NM_001304264, intron 4 of 5) 86986 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 211.25-31 chr16 60647253 60647484 + 1.25 NA Intergenic (ATGTACATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -287575 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 260.75-55 chr6 105559947 105560232 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157007 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 176.5-186 chr9 15872665 15872961 + 1.25 NA intron (NM_001355547, intron 22 of 24) intron (NM_001355547, intron 22 of 24) 308835 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 157-46 chr18 22504079 22504281 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86265 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 243-38 chr2 170111756 170112172 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -66183 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 113-79 chr18 52070073 52070217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -270052 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 145-116 chr5 6687881 6688160 + 1.25 NA intron (NR_103771, intron 2 of 2) intron (NR_103771, intron 2 of 2) 19691 NR_103771 100505625 Hs.550028 NR_103771 ENSG00000248677 LINC02102 - long intergenic non-protein coding RNA 2102 ncRNA 384.75-4 chr12 58510557 58511054 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -80897 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 243.25-10 chr14 20210922 20211175 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12662 NM_001004480 122748 Hs.553575 NM_001004480 ENSG00000176219 OR11H6 - olfactory receptor family 11 subfamily H member 6 protein-coding 200.5-128 chr7 87118902 87119123 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 33305 NR_136252 101927420 Hs.633960 NR_136252 ENSG00000224046 LOC101927420 - uncharacterized LOC101927420 ncRNA 164.5-125 chr22 25833604 25833745 + 1.25 NA intron (NM_032608, intron 16 of 43) MIRb|SINE|MIR 91486 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 360.25-16 chr6 150837178 150837676 + 1.25 NA intron (NM_001329803, intron 13 of 13) intron (NM_001329803, intron 13 of 13) -28252 NR_146719 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 217.75-5 chr1 88654440 88654759 + 1.25 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) intron (NR_110682, intron 1 of 3) -29545 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 136.25-159 chr5 171914295 171914514 + 1.25 NA exon (NM_033644, exon 2 of 13) exon (NM_033644, exon 2 of 13) 92469 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 184.75-67 chr3 64388627 64388943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120612 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 207.5-93 chr5 175481597 175481794 + 1.25 NA intron (NM_001322982, intron 1 of 10) intron (NM_001322982, intron 1 of 10) 3135 NM_001322980 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 143.25-48 chr14 69780510 69780662 + 1.25 NA intron (NM_003049, intron 2 of 4) intron (NM_003049, intron 2 of 4) -12873 NR_029378 100289511 Hs.729250 NR_029378 LOC100289511 - uncharacterized LOC100289511 ncRNA 192.75-18 chr11 27504009 27504399 + 1.25 NA intron (NM_018362, intron 1 of 4) intron (NM_018362, intron 1 of 4) 2565 NM_018362 55327 Hs.91393 NM_018362 ENSG00000148943 LIN7C LIN-7-C|LIN-7C|MALS-3|MALS3|VELI3 lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component protein-coding 201-63 chr5 106924614 106924839 + 1.25 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 86288 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 238.25-38 chr2 101995089 101995421 + 1.25 NA intron (NM_004633, intron 1 of 8) MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 3295 NM_004633 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 246-69 chr9 6242408 6242674 + 1.25 NA intron (NM_001199641, intron 2 of 4) MER75|DNA|PiggyBac 5460 NM_001314045 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 276.25 chr1 31117761 31118125 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -52226 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 215.25-27 chr13 112954397 112954605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14137 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 266.25-12 chr12 128328851 128329215 + 1.25 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 34941 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 162-105 chr7 11376010 11376189 + 1.25 NA intron (NM_015204, intron 26 of 26) intron (NM_015204, intron 26 of 26) 402227 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 275.5-37 chr22 34907633 34908053 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 90073 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 210.5-10 chr1 198224785 198225032 + 1.25 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 67910 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 261.5-23 chr16 74649151 74649440 + 1.25 NA intron (NM_001370539, intron 2 of 11) intron (NM_001370539, intron 2 of 11) 17582 NM_001370534 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 150.5-233 chr9 68459261 68459440 + 1.25 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) L1ME3A|LINE|L1 81517 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 242-15 chr12 1331931 1332193 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) HAL1ME|LINE|L1 -168429 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 228.25-14 chr10 102538001 102538345 + 1.25 NA intron (NM_001178133, intron 2 of 10) intron (NM_001178133, intron 2 of 10) 34201 NM_001178133 51684 Hs.404089 NM_016169 ENSG00000107882 SUFU JBTS32|PRO1280|SUFUH|SUFUXL SUFU negative regulator of hedgehog signaling protein-coding 198.5-27 chr12 32969775 32970042 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -73062 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 258.25-23 chr16 10065812 10066109 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 116107 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 118-199 chr9 5571974 5572109 + 1.25 NA TTS (NM_025239) TTS (NM_025239) -57066 NM_001135920 57589 Hs.211520 NM_020829 ENSG00000107036 RIC1 CIP150|KIAA1432|bA207C16.1 RIC1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1 protein-coding 333-20 chr5 66718116 66718499 + 1.25 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) -110466 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 162-123 chr8 133967098 133967273 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80689 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 431.25-3 chr11 83880909 83881492 + 1.25 NA intron (NM_001142700, intron 7 of 19) L3|LINE|CR1 -198775 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 310.75-11 chr13 39844293 39844738 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -180380 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 180.75-124 chr6 45805471 45805621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 132051 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 257.25-40 chr5 18806067 18806739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 999129 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 270-40 chr4 66035716 66035998 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -240967 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 429-5 chr5 65719635 65720059 + 1.25 NA intron (NM_019072, intron 2 of 10) intron (NM_019072, intron 2 of 10) 2262 NM_019072 54557 Hs.482301 NM_019072 ENSG00000197860 SGTB SGT2 small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta protein-coding 306.5-5 chr10 74536863 74537285 + 1.25 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) L1MB4|LINE|L1 -7750 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 182.5-183 chrX 154475284 154475443 + 1.25 NA 3' UTR (NM_017514, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_017514, exon 33 of 33) 3894 NM_006014 8270 Hs.444619 NM_006014 ENSG00000196976 LAGE3 CVG5|DXS9879E|DXS9951E|ESO3|GAMOS2|ITBA2|Pcc1 L antigen family member 3 protein-coding 272.25 chr1 207170636 207170977 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66573 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 202-74 chr8 107636830 107637065 + 1.25 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -139029 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 271-5 chr10 109164408 109164832 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 758626 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 153-40 chr14 55993537 55993746 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -124770 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 266.75-33 chr3 116707327 116707591 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2329 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 238.25-18 chr13 112059918 112060320 + 1.25 NA intron (NR_120392, intron 1 of 3) intron (NR_120392, intron 1 of 3) -7030 NM_005986 6656 NM_005986 ENSG00000182968 SOX1 - SRY-box transcription factor 1 protein-coding 121.75-32 chr12 40396911 40397063 + 1.25 NA intron (NM_173600, intron 1 of 173) intron (NM_173600, intron 1 of 173) 3593 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 225.75-46 chr2 202203976 202204252 + 1.25 NA intron (NM_001277372, intron 23 of 23) AluJb|SINE|Alu 34483 NM_001371392 201-47 chr2 182096921 182097148 + 1.25 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) LTR82B|LTR|ERVL 111181 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 195.5-71 chr2 77445803 77446084 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 76433 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 142.5-161 chr4 185567275 185567615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31887 NM_001257962 27295 Hs.701364 NM_014476 ENSG00000154553 PDLIM3 ALP PDZ and LIM domain 3 protein-coding 154.75-11 chr10 69198312 69198485 + 1.25 NA exon (NM_001301683, exon 10 of 16) exon (NM_001301683, exon 10 of 16) 18164 NM_001323584 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 208-53 chr3 9624841 9625143 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -24513 NM_001077525 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 173.75-111 chr3 182235578 182235796 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 250675 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 186.75-34 chr14 80561013 80561294 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 20 of 24) intron (NM_152446, intron 20 of 24) -330096 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 283 chr1 53908441 53908908 + 1.25 NA intron (NR_136692, intron 3 of 3) intron (NR_136692, intron 3 of 3) 14487 NM_001324316 1733 Hs.251415 NM_000792 ENSG00000211452 DIO1 5DI|TXDI1 iodothyronine deiodinase 1 protein-coding 270.25-30 chr2 118342045 118342341 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -155807 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 254-17 chr16 19526158 19526380 + 1.25 NA intron (NM_014711, intron 2 of 14) intron (NM_014711, intron 2 of 14) 2327 NM_001323571 9738 Hs.279912 NM_014711 ENSG00000103540 CCP110 CP110|Cep110 centriolar coiled-coil protein 110 protein-coding 184.25-103 chr5 111259840 111260024 + 1.25 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 35548 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 220.75-9 chr10 56295948 56296267 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65152 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 126.5-186 chr5 36553662 36553818 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -52615 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 241.25-29 chr2 23447679 23448001 + 1.25 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 62661 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 248-6 chr10 60506126 60506473 + 1.25 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 66657 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 227.75-76 chr7 49124717 49124933 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 200278 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 214.75-5 chr1 117557156 117557483 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 48451 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 310.5-23 chr3 19898192 19898458 + 1.25 NA intron (NM_001330688, intron 10 of 14) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 35892 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 266-36 chr5 12374631 12374876 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -200104 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 226.75-57 chr4 41509950 41510174 + 1.25 NA intron (NM_001289122, intron 2 of 25) intron (NM_001289122, intron 2 of 25) -28095 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 231-75 chr7 33934703 33934937 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 3 of 15) intron (NM_133468, intron 3 of 15) 29281 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 181.25-128 chr8 89888042 89888498 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -13598 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 251.25-7 chr10 34816527 34816859 + 1.25 NA TTS (NR_108043) TTS (NR_108043) 925 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 186.25-91 chr5 110878436 110878617 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 139519 NM_138773 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 133.75-157 chr4 161547948 161548074 + 1.25 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) L1MEg|LINE|L1 -474722 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 146.25-142 chr7 135120027 135120241 + 1.25 NA intron (NM_001345851, intron 10 of 10) L1MD1|LINE|L1 -27938 NM_018295 55281 Hs.521213 NM_018295 ENSG00000146859 TMEM140 - transmembrane protein 140 protein-coding 237.25-12 chr11 70585264 70585553 + 1.25 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) intron (NM_133266, intron 2 of 10) -45686 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 289.25-16 chr2 78502494 78502830 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -42869 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 260.25-5 chr10 21374391 21374729 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1610 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 156-130 chr6 64224767 64224949 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 418022 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 176.25-118 chr5 173218669 173218884 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16430 NM_001166175 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 190.5-56 chr16 7056775 7057103 + 1.25 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) MIR|SINE|MIR -275906 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 165.25-20 chr10 106149674 106149883 + 1.25 NA intron (NR_134330, intron 1 of 4) intron (NR_134330, intron 1 of 4) 9613 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 296.75-19 chr2 107685406 107685697 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68561 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 447.75-3 chr5 150886498 150887219 + 1.25 NA intron (NM_001346557, intron 3 of 3) L1PREC2|LINE|L1 18125 NM_001172832 91975 Hs.134885 NM_052860 ENSG00000145908 ZNF300 - zinc finger protein 300 protein-coding 143.75-57 chr15 72148604 72148879 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30338 NM_001172111 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 428.75-11 chr9 73032939 73033487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80160 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 205.5-161 chr9 94525653 94525914 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29262 NR_121569 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 364.5-12 chr3 108890331 108890722 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 63320 NM_001363884 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 246.75 chr1 14087300 14087534 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 332556 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 228.5-53 chr2 46258082 46258485 + 1.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -39124 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 187-59 chr22 36891609 36891782 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -21252 NR_147197 107985578 Hs.474781 NR_147197 ENSG00000183822 NCF4-AS1 - NCF4 antisense RNA 1 ncRNA 164.25-164 chrX 69577043 69577185 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -38999 NM_001005610 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 171-59 chr18 1447534 1447772 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -88024 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 203.75-19 chr11 83472751 83472952 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 22 of 27) intron (NM_001142699, intron 22 of 27) -186444 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 170-38 chr17 39292167 39292363 + 1.25 NA intron (NM_001370208, intron 6 of 14) L1MEc|LINE|L1 -5135 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 277.25-5 chr1 232034248 232034572 + 1.25 NA intron (NM_001164537, intron 13 of 13) intron (NM_001164537, intron 13 of 13) 108576 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 196.5-13 chr1 223467700 223468016 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 74443 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 328.25-9 chr16 49235263 49235771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 46321 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 199.75-51 chr2 135562921 135563183 + 1.25 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) intron (NM_001282799, intron 1 of 22) -23300 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 192-48 chr15 58047152 58047388 + 1.25 NA intron (NM_170696, intron 1 of 11) intron (NM_170696, intron 1 of 11) -17955 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 205.75-53 chr4 69882149 69882409 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22134 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 239.25-71 chr5 79078970 79079365 + 1.25 NA intron (NM_001178005, intron 2 of 6) intron (NM_001178005, intron 2 of 6) 9400 NM_001178005 23743 Hs.114172 NM_017614 ENSG00000132840 BHMT2 - betaine--homocysteine S-methyltransferase 2 protein-coding 175.75-28 chr12 53442042 53442270 + 1.25 NA intron (NM_018457, intron 1 of 3) intron (NM_018457, intron 1 of 3) 422 NM_018457 54458 Hs.744894 NM_018457 ENSG00000205352 PRR13 TXR1 proline rich 13 protein-coding 189.25-98 chr5 105183626 105183836 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 84257 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 307-2 chr1 18704016 18704437 + 1.25 NA intron (NM_001135254, intron 7 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie 73380 NM_013945 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 263.5-55 chr5 112389312 112389573 + 1.25 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) LTR54|LTR|ERV1 29835 NM_001347888 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 339.5-8 chr11 84752230 84752779 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -31562 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 262-35 chr22 26986155 26986526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74178 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 336.75-20 chr8 124126170 124126648 + 1.25 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) intron (NR_103547, intron 1 of 4) 45113 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 291.75-30 chr3 98973641 98973935 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -72093 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 246.75-43 chr3 119758181 119758646 + 1.25 NA intron (NM_033364, intron 17 of 17) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -22071 NM_003889 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 150.5-146 chr4 54866796 54866942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 208941 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 121-15 chr1 246453357 246453539 + 1.25 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) L1M2|LINE|L1 -36036 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 143.75-58 chr15 77172164 77172302 + 1.25 NA intron (NM_024776, intron 5 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 53171 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 312.25-15 chr2 109197106 109197376 + 1.25 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -55653 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 213.5-39 chr14 75118157 75118374 + 1.25 NA intron (NM_033116, intron 5 of 21) intron (NM_033116, intron 5 of 21) 8783 NM_001329237 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 240-7 chr1 187749812 187750032 + 1.25 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL 306294 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 256-6 chr10 51963139 51963452 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -263700 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 149-40 chr15 71730801 71730992 + 1.25 NA intron (NM_001286429, intron 3 of 11) intron (NM_001286429, intron 3 of 11) -39357 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 229-16 chr14 43111237 43111460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1395935 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 381.5-3 chr2 204200157 204200577 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 263619 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 173.75-101 chr20 49218711 49218973 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001348187) promoter-TSS (NM_001348187) -453 NM_017895 55661 Hs.65234 NM_017895 ENSG00000124228 DDX27 DRS1|Drs1p|HSPC259|PP3241|RHLP|dJ686N3.1 DEAD-box helicase 27 protein-coding 376-18 chr6 131751071 131751609 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -40323 NM_001145659 643854 Hs.632613 NM_001145659 ENSG00000236761 CTAGE9 - CTAGE family member 9 protein-coding 215.75-103 chr9 31235499 31235693 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 145894 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 195.25-95 chr8 116055374 116055680 + 1.25 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) AluSc|SINE|Alu 269532 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 277-20 chr2 41305012 41305377 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -572361 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 150.25-36 chr12 12138629 12138773 + 1.25 NA intron (NM_002336, intron 15 of 22).2 intron (NM_002336, intron 15 of 22).2 26749 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 361.75-12 chr2 12482833 12483292 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) AluSx|SINE|Alu -233810 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 190-14 chr12 67623595 67623812 + 1.25 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -25042 NM_006482 8445 Hs.173135 NM_003583 ENSG00000127334 DYRK2 - dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 2 protein-coding 133.75-159 chr5 31251297 31251583 + 1.25 NA intron (NM_001362435, intron 1 of 10) intron (NM_001362435, intron 1 of 10) 57754 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 155.25-98 chr2 135544160 135544369 + 1.25 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) intron (NM_001282799, intron 1 of 22) 12780 NM_001282799 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 177.5-171 chr8 78303799 78304019 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -212431 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 207-67 chr5 87985404 87985664 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 283311 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 374-10 chr3 85279164 85279904 + 1.25 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -106176 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 192.75-87 chr3 96316628 96316847 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -43227 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 133-59 chr15 80548597 80548709 + 1.25 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L1MC4a|LINE|L1 14291 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 265.25-56 chr9 32105433 32105784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -278995 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 214.75-29 chr15 92258840 92259142 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -134890 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 229.25-50 chr20 6936146 6936383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168578 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 231-54 chr3 174640243 174640642 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -218892 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 213.75-74 chr4 36110344 36110629 + 1.25 NA intron (NR_146894, intron 26 of 32) intron (NR_146894, intron 26 of 32) 133453 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 293.75-2 chr1 190800779 190801060 + 1.25 NA non-coding (NR_033922, exon 5 of 5) non-coding (NR_033922, exon 5 of 5) 176029 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 169.75-117 chr4 99178807 99178991 + 1.25 NA intron (NR_037884, intron 3 of 9) L1PB3|LINE|L1 -17252 NR_028270 359806 Hs.537400 NR_028270 PCNAP1 p1PCNA proliferating cell nuclear antigen pseudogene 1 pseudo 201-27 chr14 31163207 31163511 + 1.25 NA intron (NM_015382, intron 10 of 42) AluJo|SINE|Alu 44434 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 145.25-138 chr5 148618862 148619028 + 1.25 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) intron (NM_001040172, intron 1 of 5) 18116 NM_001040173 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 257.5-50 chr3 109698791 109699331 + 1.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 96233 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 262.5-11 chr12 20967541 20967922 + 1.25 NA intron (NM_001371097, intron 13 of 15) LTR57-int|LTR|ERVL -47965 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 307.75-18 chr4 82444801 82445286 + 1.25 NA intron (NM_021204, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 14453 NM_001292017 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 324.25-2 chr12 101617649 101617991 + 1.25 NA intron (NM_206821, intron 3 of 28) intron (NM_206821, intron 3 of 28) 22849 NM_002465 4604 Hs.654589 NM_002465 ENSG00000196091 MYBPC1 LCCS4|MYBPCC|MYBPCS myosin binding protein C, slow type protein-coding 315.5-2 chr10 57060357 57060643 + 1.25 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 244059 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 350.75-4 chr2 168704100 168704460 + 1.25 NA intron (NM_001256126, intron 6 of 10) intron (NM_001256126, intron 6 of 10) 82149 NR_045787 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 210-56 chr2 187468877 187469140 + 1.25 NA intron (NM_006287, intron 6 of 7) intron (NM_006287, intron 6 of 7) -20756 NM_005795 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 281-5 chr10 26568478 26568903 + 1.25 NA TTS (NM_019043) TTS (NM_019043) 10617 NR_134472 101929117 Hs.127031 NR_134472 LOC101929117 - uncharacterized LOC101929117 ncRNA 289.5-10 chr12 112070146 112070476 + 1.25 NA intron (NM_024953, intron 10 of 23) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -32596 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 208.75-3 chr1 113606942 113607190 + 1.25 NA intron (NM_001142782, intron 6 of 20) intron (NM_001142782, intron 6 of 20) 152089 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 208.5-5 chr1 170146238 170146554 + 1.25 NA intron (NM_001136107, intron 1 of 3) intron (NM_001136107, intron 1 of 3) 349 NM_001136107 149281 Hs.553612 NM_001136107 ENSG00000203740 METTL11B C1orf184|HOMT1B|NTM1B methyltransferase like 11B protein-coding 232-52 chr3 30745498 30745977 + 1.25 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 139136 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 226-29 chr17 54498426 54498755 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -402101 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 145.5-184 chr7 105699899 105700188 + 1.25 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) intron (NM_020725, intron 3 of 11) -20881 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 118.5-139 chr3 189241492 189241611 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_046722) promoter-TSS (NR_046722) -957 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 280.75-36 chr5 132168315 132168690 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -16374 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 185.5-12 chr1 217459470 217459872 + 1.25 NA intron (NM_018040, intron 8 of 9) intron (NM_018040, intron 8 of 9) 171419 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 173-126 chr6 147626547 147626697 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 117932 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 217.5-15 chr10 79341235 79341465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6119 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 170.25-86 chr20 49707397 49707753 + 1.25 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) intron (NM_004776, intron 1 of 8) 6303 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 231-36 chr17 59296719 59297283 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34654 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 272.25-43 chr4 60863830 60864163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58623 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 207.5-67 chr3 76153400 76153688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -367995 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 263-33 chr22 50411095 50411428 + 1.25 NA intron (NM_001242899, intron 4 of 22) AluSz6|SINE|Alu 3819 NR_162128 113218480 NR_162128 MIR12114 - microRNA 12114 ncRNA 280.25-11 chr10 117435369 117435714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60101 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 168.75-13 chr1 198209919 198210161 + 1.25 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) AluSx|SINE|Alu 53042 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 132.25-186 chr8 127850991 127851128 + 1.25 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 55097 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 145.25-167 chr7 146322763 146322997 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -451391 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 180-2 chr1 86496525 86496766 + 1.25 NA intron (NM_001285, intron 12 of 13) intron (NM_001285, intron 12 of 13) 27718 NM_001285 1179 Hs.194659 NM_001285 ENSG00000016490 CLCA1 CACC|CACC1|CLCRG1|CaCC-1|GOB5|hCLCA1|hCaCC-1 chloride channel accessory 1 protein-coding 415.25-5 chr5 93935145 93935774 + 1.25 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 176204 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 218-44 chr3 11694238 11694619 + 1.25 NA intron (NM_001284390, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 26111 NM_014667 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 240.25-6 chr1 227609326 227609732 + 1.25 NA intron (NR_102302, intron 2 of 5) L1PA13|LINE|L1 45973 NM_001367910 339500 Hs.30323 NM_032755 ENSG00000181450 ZNF678 - zinc finger protein 678 protein-coding 205-10 chr10 24378577 24379014 + 1.25 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) -70619 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 128.5-217 chr8 5077339 5077458 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -82484 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 345-11 chr20 31983212 31983500 + 1.25 NA intron (NM_001011718, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 15205 NM_001011718 343702 Hs.666444 NM_001011718 ENSG00000260903 XKR7 C20orf159|dJ310O13.4 XK related 7 protein-coding 388.5-2 chr11 112296023 112296571 + 1.25 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 25548 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 209.5-8 chr1 174085722 174086002 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 73425 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 315.75-24 chr6 89307383 89307712 + 1.25 NA intron (NM_002043, intron 1 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 7752 NM_002043 2570 Hs.379330 NM_002043 ENSG00000111886 GABRR2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho2 subunit protein-coding 235-59 chr5 41601735 41602193 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -91363 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 242.5-40 chr18 4000719 4001085 + 1.25 NA intron (NR_102696, intron 4 of 4) L1M8|LINE|L1 38549 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 241.25-21 chr14 52056191 52056497 + 1.25 NA intron (NM_007361, intron 3 of 21) intron (NM_007361, intron 3 of 21) 12715 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 294.5-12 chr12 118054823 118055087 + 1.25 NA intron (NM_001278557, intron 1 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 6256 NM_018639 55884 Hs.506985 NM_018639 ENSG00000176871 WSB2 SBA2 WD repeat and SOCS box containing 2 protein-coding 232-28 chr2 10104986 10105209 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -17471 NM_001165931 6241 Hs.226390 NM_001034 ENSG00000171848 RRM2 R2|RR2|RR2M ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 protein-coding 138.5-185 chr7 83082758 83082899 + 1.25 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) L1M5|LINE|L1 80056 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 412.25-4 chr10 77591830 77592386 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) L2a|LINE|L2 45700 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 213.75-62 chr21 33298692 33298953 + 1.25 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -26148 NM_000629 3454 Hs.529400 NM_000629 ENSG00000142166 IFNAR1 AVP|IFN-alpha-REC|IFNAR|IFNBR|IFRC interferon alpha and beta receptor subunit 1 protein-coding 121.75-35 chr12 94083942 94084188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64512 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 273-25 chr16 4708585 4708924 + 1.25 NA intron (NR_040252, intron 6 of 16) AluSc8|SINE|Alu 15036 NM_001370587 84309 Hs.513315 NM_032349 ENSG00000168101 NUDT16L1 SDOS|TIRR nudix hydrolase 16 like 1 protein-coding 168-102 chr5 51338892 51339055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44359 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 301.5-25 chr2 56103929 56104329 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13747 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 291.75-20 chr2 105166920 105167282 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22988 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 245.75-15 chr12 55803117 55803362 + 1.25 NA intron (NM_033082, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 14485 NM_033082 84324 Hs.505676 NM_033082 ENSG00000205323 SARNP CIP29|HCC1|HSPC316|THO1 SAP domain containing ribonucleoprotein protein-coding 228.75-73 chr7 46787066 46787439 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -90130 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 309.25-13 chr2 24311831 24312137 + 1.25 NA intron (NM_001348182, intron 5 of 38) MER94|DNA|hAT-Blackjack 48552 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 140.75-28 chr11 95652660 95652774 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137065 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 246.75-74 chr8 113913095 113913439 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -476328 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 117.75-16 chr1 201545818 201546058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26034 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 274.25-25 chr2 21750049 21750522 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -39633 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 208.25-84 chr7 95823396 95823642 + 1.25 NA intron (NM_001135557, intron 4 of 15) intron (NM_001135557, intron 4 of 15) 51013 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 328.75-20 chr8 86335623 86336029 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6721 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 188.75-51 chr2 15340333 15340490 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 35 of 50) L2a|LINE|L2 220923 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 297-37 chr5 37969602 37969869 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21244 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 176.5-114 chr22 22990834 22991060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79572 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 191.5-117 chr5 31053194 31053452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -140363 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 258.5-67 chr6 157798466 157798835 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -24596 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 445.25-3 chr2 50705654 50706207 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -9668 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 166-13 chr10 44515268 44515532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130303 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 179-93 chr9 74358709 74358941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12706 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 364.5-20 chr8 77829167 77829561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 378667 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 128.75-124 chr3 99084416 99084522 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182774 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 155.25-129 chr4 43443917 43444106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 48532 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 135.5-45 chr12 16368268 16368411 + 1.25 NA intron (NM_001267598, intron 3 of 3) intron (NM_001267598, intron 3 of 3) 14922 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 147-140 chr8 58416801 58416970 + 1.25 NA exon (NM_001330535, exon 2 of 6) exon (NM_001330535, exon 2 of 6) 5524 NM_001077619 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 375.5-21 chr9 29784606 29785022 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -571213 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 176-17 chr12 33921922 33922291 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -100390 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 242.5-10 chr10 9692989 9693359 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -365548 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 130.75-77 chr18 3545984 3546165 + 1.25 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) L1MB5|LINE|L1 -48040 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 229.75-38 chr20 6394420 6394655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32195 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 202.5-17 chr10 66084812 66085020 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 14 of 17) intron (NM_001127384, intron 14 of 17) 513491 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 374.75-14 chr6 138178656 138179091 + 1.25 NA intron (NM_020340, intron 2 of 33) intron (NM_020340, intron 2 of 33) 16934 NM_020340 57221 Hs.194408 NM_020340 ENSG00000112379 ARFGEF3 A7322|BIG3|C6orf92|KIAA1244|PPP1R33|dJ171N11.1 ARFGEF family member 3 protein-coding 224.75-15 chr10 72826416 72826636 + 1.25 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) -67213 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 206-5 chr1 210254119 210254363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20356 NR_024337 574036 Hs.446946 NR_024337 ENSG00000203706 SERTAD4-AS1 C1orf133 SERTAD4 antisense RNA 1 ncRNA 168.5-203 chr9 103785438 103785764 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -214108 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 191-61 chr4 74228393 74228657 + 1.25 NA intron (NM_001144978, intron 6 of 7) intron (NM_001144978, intron 6 of 7) 70407 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 197.25-75 chr3 186635375 186635803 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4810 NM_014375 26998 Hs.81073 NM_014375 ENSG00000090512 FETUB 16G2|Gugu|IRL685 fetuin B protein-coding 290-19 chr16 57537839 57538093 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1395 NM_033212 92922 Hs.644611 NM_033212 ENSG00000135736 CCDC102A - coiled-coil domain containing 102A protein-coding 184.25-110 chr6 153306229 153306457 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -175061 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 172.75-79 chr3 5233425 5233697 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 16694 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 197-54 chr5 167722378 167722579 + 1.25 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) (TAGATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32451 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 215.75-4 chr1 76448826 76449096 + 1.25 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) AluSg|SINE|Alu 330306 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 219.25-63 chr5 141290900 141291194 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 13002 NM_031947 83884 Hs.97647 NM_031947 ENSG00000120329 SLC25A2 ORC2|ORNT2 solute carrier family 25 member 2 protein-coding 149-53 chr2 50168427 50168601 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 179240 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 168.25-63 chr18 2398993 2399250 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 172384 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 289.75-5 chr10 67241219 67241534 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) AluSx|SINE|Alu 162034 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 159.25-120 chr5 81929648 81929932 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42233 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 149-89 chr4 36337632 36337809 + 1.25 NA intron (NM_001170700, intron 8 of 9) intron (NM_001170700, intron 8 of 9) 56104 NM_001170700 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 170.5-59 chr14 45679548 45679857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35900 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 147.25-18 chr10 99229630 99229833 + 1.25 NA intron (NM_021828, intron 2 of 11) intron (NM_021828, intron 2 of 11) 6144 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 152-148 chr8 38697929 38698112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30166 NR_148048 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 273-3 chr1 204534413 204534699 + 1.25 NA intron (NM_001278518, intron 5 of 6) AluJb|SINE|Alu 18150 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 301.75-30 chr5 131480173 131480612 + 1.25 NA intron (NM_016340, intron 15 of 27) intron (NM_016340, intron 15 of 27) 154837 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 344.5-25 chr6 38737267 38737813 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 5 of 91) intron (NM_001371, intron 5 of 91) 22229 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 217-29 chr18 74653673 74653888 + 1.25 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) intron (NM_001146190, intron 2 of 3) 22817 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 310.5-44 chr9 92498132 92498614 + 1.25 NA intron (NM_001197295, intron 9 of 9) L1PA4|LINE|L1 -15867 NM_001193335 54829 Hs.435655 NM_017680 ENSG00000106819 ASPN OS3|PLAP-1|PLAP1|SLRR1C asporin protein-coding 178.75-7 chr1 237753879 237754226 + 1.25 NA intron (NM_001035, intron 80 of 104) intron (NM_001035, intron 80 of 104) -108123 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 273.5-75 chr7 118144385 118144789 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39577 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 171.75-32 chr12 9935178 9935423 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2930 NM_207375 387836 Hs.527665 NM_207375 ENSG00000188393 CLEC2A INPE5792|KACL|PILAR|UNQ5792 C-type lectin domain family 2 member A protein-coding 178-21 chr12 124016701 124016941 + 1.25 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) intron (NM_001347902, intron 2 of 4) 43606 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 179.75-38 chr14 58315830 58316021 + 1.25 NA intron (NM_002892, intron 5 of 23) intron (NM_002892, intron 5 of 23) 17370 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 335.25-22 chr21 38339303 38339765 + 1.25 NA intron (NR_110545, intron 1 of 5) MER41D|LTR|ERV1 6542 NR_110545 102724678 Hs.635675 NR_110545 LINC01423 - long intergenic non-protein coding RNA 1423 ncRNA 150.75-44 chr12 7888822 7889052 + 1.25 NA intron (NM_001286237, intron 1 of 9) intron (NM_001286237, intron 1 of 9) 2259 NM_001286237 144195 Hs.655169 NM_153449 ENSG00000173262 SLC2A14 GLUT14|SLC2A3P3 solute carrier family 2 member 14 protein-coding 131.5-221 chr7 93186266 93186535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33171 NM_198151 253012 Hs.443169 NM_198151 ENSG00000188175 HEPACAM2 MIKI HEPACAM family member 2 protein-coding 184.75-52 chr2 63916259 63916490 + 1.25 NA intron (NM_001005739, intron 16 of 22) intron (NM_001005739, intron 16 of 22) 74494 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 219.25-79 chr8 99738482 99738676 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 39 of 61) intron (NM_017890, intron 39 of 61) 155128 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 234.5-107 chrY 11293541 11293920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1127860 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 145.75-157 chr8 31161442 31161622 + 1.25 NA intron (NM_000553, intron 33 of 34) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -128176 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 330.25-9 chr18 66499219 66499547 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 104707 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 217.25-77 chr7 30158947 30159210 + 1.25 NA 3' UTR (NM_152793, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_152793, exon 3 of 3) 24092 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 122-109 chr20 31693576 31693705 + 1.25 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu -27867 NR_131907 103021294 NR_131907 ENSG00000281376 ABALON INXS apoptotic BCL2L1-antisense long non-coding RNA ncRNA 253-3 chr1 169567059 169567428 + 1.25 NA intron (NM_000130, intron 3 of 24) L1PA2|LINE|L1 19288 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 325.75-16 chr2 216092475 216092793 + 1.25 NA intron (NM_001142310, intron 2 of 3) intron (NM_001142310, intron 2 of 3) 10715 NM_138390 92691 Hs.334916 NM_138390 ENSG00000163449 TMEM169 - transmembrane protein 169 protein-coding 169.75-135 chr6 162811542 162811820 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) L1MD1|LINE|L1 83711 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 327.75-10 chr15 71013026 71013483 + 1.25 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) L2c|LINE|L2 120811 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 349.5-21 chr8 78899820 78900218 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 62490 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 287.5-33 chr2 84939845 84940306 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31086 NM_020122 56888 Hs.654968 NM_020122 ENSG00000176407 KCMF1 DEBT91|FIGC|PCMF|ZZZ1 potassium channel modulatory factor 1 protein-coding 293.75-7 chr11 121244291 121244948 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48152 NM_006918 6309 Hs.287749 NM_006918 ENSG00000109929 SC5D ERG3|S5DES|SC5DL sterol-C5-desaturase protein-coding 275-7 chr10 47437650 47438002 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -23351 NR_134499 105378292 Hs.131331 NR_134499 LOC105378292 - uncharacterized LOC105378292 ncRNA 145-75 chr2 94966703 94966850 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -19434 NR_037597 442028 Hs.611545 NR_037597 ENSG00000259848 LOC442028 - uncharacterized LOC442028 ncRNA 351.25-10 chr3 25305172 25305585 + 1.25 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) intron (NM_001290216, intron 4 of 10) -35424 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 260.75-25 chr2 18334936 18335396 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 225487 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 158-10 chr1 151416258 151416470 + 1.25 NA intron (NM_001194938, intron 9 of 17) AluSz6|SINE|Alu 16791 NM_002796 5692 Hs.89545 NM_002796 ENSG00000159377 PSMB4 HN3|HsN3|PRAAS3|PROS-26|PROS26 proteasome subunit beta 4 protein-coding 128.5-89 chr18 2466053 2466206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105376 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 257.75-50 chr8 89565674 89565982 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 191883 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 333.75-13 chr2 199148081 199148476 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 309661 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 243.25-4 chr10 70092987 70093355 + 1.25 NA intron (NM_018649, intron 4 of 8) intron (NM_018649, intron 4 of 8) 39654 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 273.5-82 chr9 92436290 92436515 + 1.25 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) L1MD1|LINE|L1 -11848 NM_005014 4958 Hs.94070 NM_005014 ENSG00000127083 OMD OSAD|SLRR2C osteomodulin protein-coding 314.75-3 chr10 118268122 118268627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73950 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 268-35 chr21 10728389 10728768 + 1.25 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 207064 NM_199259 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 309.5-8 chr10 32031284 32031590 + 1.25 NA intron (NM_004521, intron 13 of 25) L2b|LINE|L2 24988 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 230.75-5 chr1 155186060 155186409 + 1.25 NA intron (NM_001018017, intron 7 of 7) intron (NM_001018017, intron 7 of 7) 6675 NM_002456 4582 Hs.89603 NM_002456 ENSG00000185499 MUC1 ADMCKD|ADMCKD1|CA 15-3|CD227|EMA|H23AG|KL-6|MAM6|MCD|MCKD|MCKD1|MUC-1|MUC-1/SEC|MUC-1/X|MUC1/ZD|PEM|PEMT|PUM mucin 1, cell surface associated protein-coding 132.75-22 chr10 30844303 30844464 + 1.25 NA TTS (NM_001143769) TTS (NM_001143769) 121164 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 660.75 chr11 82852313 82853280 + 1.25 NA intron (NM_199418, intron 4 of 9) intron (NM_199418, intron 4 of 9) 47634 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 175-39 chr14 87119230 87119590 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 213632 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 234.5-17 chr12 7957906 7958243 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -21887 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 129.5-183 chr5 62257997 62258202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48063 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 160.75-23 chr10 125448100 125448313 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -126165 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 218.75-67 chr5 14160779 14161063 + 1.25 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) AluSz|SINE|Alu 17579 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 287.75-21 chr16 50958516 50958924 + 1.25 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -59038 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 302.5-22 chr2 181473945 181474343 + 1.25 NA intron (NM_000885, intron 2 of 27) intron (NM_000885, intron 2 of 27) 16758 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 228.25-87 chr8 136760008 136760360 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 229386 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 220-76 chr9 35746863 35747117 + 1.25 NA intron (NM_020944, intron 1 of 16) intron (NM_020944, intron 1 of 16) 2238 NM_001330660 57704 Hs.443134 NM_020944 ENSG00000070610 GBA2 AD035|NLGase|SPG46 glucosylceramidase beta 2 protein-coding 248.75-49 chr4 73172273 73172551 + 1.25 NA intron (NM_032217, intron 2 of 33) L1MA2|LINE|L1 50645 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 193.5 chr1 14214118 14214564 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 205632 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 141.25-160 chr6 108665388 108665627 + 1.25 NA intron (NM_201559, intron 3 of 3) intron (NM_201559, intron 3 of 3) -86147 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 316.5-16 chr18 6065920 6066405 + 1.25 NA intron (NM_173464, intron 16 of 19) L1PB2|LINE|L1 -170208 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 234.25-30 chr18 48604897 48605096 + 1.25 NA intron (NM_001142397, intron 2 of 12).2 L1MB8|LINE|L1 -65604 NR_039897 100616366 NR_039897 ENSG00000266276 MIR4743 - microRNA 4743 ncRNA 274-13 chr14 61275945 61276309 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5211 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 256-10 chr12 131146064 131146408 + 1.25 NA Intergenic (TTTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18775 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 316.75-13 chr3 112095191 112095458 + 1.25 NA intron (NM_024616, intron 2 of 5) intron (NM_024616, intron 2 of 5) 8989 NM_024616 79669 Hs.434247 NM_024616 ENSG00000114529 C3orf52 TTMP chromosome 3 open reading frame 52 protein-coding 130.75-93 chr2 122914180 122914312 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 159235 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 321.75-11 chr15 101165390 101165856 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 86425 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 211-2 chr1 153912024 153912272 + 1.25 NA intron (NM_020699, intron 1 of 10) intron (NM_020699, intron 1 of 10) 10824 NM_020699 57459 Hs.4779 NM_020699 ENSG00000143614 GATAD2B MRD18|P66beta|p68 GATA zinc finger domain containing 2B protein-coding 202.75-72 chr3 79424039 79424378 + 1.25 NA intron (NR_110133, intron 1 of 2) intron (NR_110133, intron 1 of 2) 12481 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 202.75-19 chr11 102207072 102207289 + 1.25 NA intron (NM_001282100, intron 5 of 7) intron (NM_001282100, intron 5 of 7) 94732 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 138.75-173 chr7 26603639 26603848 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34128 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 121.75-172 chr7 23526930 23527102 + 1.25 NA intron (NM_001282757, intron 1 of 8) intron (NM_001282757, intron 1 of 8) 4965 NM_001362760 29896 Hs.445652 NM_013293 ENSG00000164548 TRA2A AWMS1|HSU53209 transformer 2 alpha homolog protein-coding 189.25-129 chr8 123077115 123077381 + 1.25 NA exon (NM_001145088, exon 2 of 20) exon (NM_001145088, exon 2 of 20) 3999 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 179.25-2 chr1 40407582 40407745 + 1.25 NA intron (NM_022733, intron 2 of 9) intron (NM_022733, intron 2 of 9) 10863 NM_001198980 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 260.75-6 chr11 84854431 84854675 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 68868 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 123.25-182 chr7 4150532 4150643 + 1.25 NA intron (NM_001079653, intron 4 of 19) intron (NM_001079653, intron 4 of 19) -15750 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 215.5-41 chr17 44173229 44173590 + 1.25 NA intron (NM_080863, intron 2 of 4) intron (NM_080863, intron 2 of 4) 2705 NM_080863 92591 Hs.534517 NM_080863 ENSG00000161664 ASB16 - ankyrin repeat and SOCS box containing 16 protein-coding 201.25-49 chr2 220012574 220012780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106112 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 180.25-55 chr2 162841527 162841834 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2913 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 189.25-57 chr2 49974046 49974199 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001320156) promoter-TSS (NM_001320156) 81 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 174.5-46 chr12 38252356 38252545 + 1.25 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -64324 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 231.5-66 chr3 119998853 119999094 + 1.25 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) intron (NM_002093, intron 2 of 11) 85675 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 121.5-77 chr14 63090505 63090742 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45165 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 239.75-7 chr10 73493500 73493740 + 1.25 NA intron (NM_001289969, intron 1 of 12) intron (NM_001289969, intron 1 of 12) -2132 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 238.5-30 chr15 97124769 97125065 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 341482 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 236-70 chr9 72749068 72749481 + 1.25 NA intron (NM_138691, intron 10 of 23) intron (NM_138691, intron 10 of 23) 124835 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 154.25-78 chr2 64480139 64480407 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -6080 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 190-46 chr3 171703695 171704024 + 1.25 NA intron (NM_002662, intron 11 of 26) L1MD2|LINE|L1 106624 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 211-34 chr2 120065630 120065895 + 1.25 NA intron (NM_001330307, intron 3 of 16) AluSx1|SINE|Alu 52685 NM_001330310 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 171-116 chr6 17758839 17759067 + 1.25 NA TTS (NM_001105568) TTS (NM_001105568) 51910 NR_134618 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 193.5-131 chr5 37263627 37263859 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -14315 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 281.75-25 chr2 34227874 34228320 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) MLT2D|LTR|ERVL 160871 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 121.5-141 chr2 126271899 126272044 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -153986 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 130.5-231 chr7 103996214 103996439 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -6668 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 247.75-24 chr16 73868712 73869007 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 346662 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 177.75-111 chr5 50692899 50693086 + 1.25 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 25578 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 118.75-178 chr7 26079925 26080078 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72197 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 313.25-17 chr22 34914818 34915310 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 82852 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 200.5-114 chr5 102710273 102710621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38983 NR_103756 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 151.25-195 chr8 131228960 131229144 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -188143 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 224-13 chr11 14884927 14885273 + 1.25 NA intron (NM_024514, intron 2 of 4) intron (NM_024514, intron 2 of 4) 7105 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 203.25-52 chr2 77304958 77305283 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 217256 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 316.5-32 chr5 44334107 44334450 + 1.25 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -54454 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 195-48 chr2 196200377 196200685 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001304840, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001304840, exon 27 of 27) -28953 NM_004226 9262 Hs.88297 NM_004226 ENSG00000081320 STK17B DRAK2 serine/threonine kinase 17b protein-coding 213-78 chr5 67022996 67023235 + 1.25 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 18460 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 129.25-88 chr2 46247990 46248190 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -49317 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 179.75-28 chr12 7452778 7452948 + 1.25 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -8678 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 262-46 chr5 174134918 174135165 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 89335 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 186.25-88 chr5 19286347 19286636 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 599781 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 201.25-69 chr4 41281566 41281777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24743 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 129.5-43 chr11 87490863 87490978 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 228491 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 139.75-98 chr2 95168507 95168696 + 1.25 NA intron (NM_001291604, intron 1 of 2) intron (NM_001291604, intron 1 of 2) 2792 NM_001291605 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 119.75-185 chr6 127040506 127040668 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -78084 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 155.5-179 chr6 9786545 9786688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -617886 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 179.25-4 chr1 50732496 50732778 + 1.25 NA intron (NM_007051, intron 6 of 18) L1MEi|LINE|L1 227630 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 144.5-202 chr7 83649038 83649167 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_012431) promoter-TSS (NM_012431) 37 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 219.5-30 chr12 59229935 59230194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -309526 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 318.25-7 chr2 187580792 187581388 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26585 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 188.75-12 chr10 84073737 84074004 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -65639 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 200.75-5 chr1 94247216 94247459 + 1.25 NA intron (NM_001328664, intron 1 of 22) intron (NM_001328664, intron 1 of 22) 409 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 252.75-35 chr20 13090613 13090984 + 1.25 NA intron (NM_001349945, intron 5 of 12) L1ME3A|LINE|L1 81826 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 262.75-58 chr9 30451147 30451549 + 1.25 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -42894 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 236.25-75 chr6 18831585 18831821 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 259919 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 276.75-2 chr1 111585808 111586173 + 1.25 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -21987 NM_001081976 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 160-66 chr3 94173276 94173450 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 110302 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 222-22 chr13 91690659 91690865 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 292141 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 165-114 chr5 126017745 126017910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -161750 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 215.5-94 chr5 180924119 180924313 + 1.25 NA intron (NM_001159710, intron 2 of 6) intron (NM_001159710, intron 2 of 6) 14652 NM_001159710 79908 Hs.189109 NM_024850 ENSG00000113303 BTNL8 BTN9.2 butyrophilin like 8 protein-coding 166-65 chr2 121598556 121598791 + 1.25 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) MIRb|SINE|MIR 50789 NM_001207051 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 290.75-41 chr4 38070138 38070655 + 1.25 NA intron (NM_001253912, intron 14 of 20) intron (NM_001253912, intron 14 of 20) -39785 NM_001253913 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 282-54 chr9 86800758 86801222 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 146516 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 221-62 chr4 130836848 130837085 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 460605 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 128.75-114 chr21 28626833 28627011 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 87604 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 291.75-44 chr9 28097840 28098160 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -524134 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 237.25-78 chr9 70317337 70317656 + 1.25 NA intron (NM_015110, intron 13 of 24) intron (NM_015110, intron 13 of 24) 58518 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 165.25-152 chr9 108220163 108220407 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 635701 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 229.25-79 chr7 51194188 51194404 + 1.25 NA intron (NM_015198, intron 2 of 12) L1PA13|LINE|L1 122513 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 172.25-26 chr11 59623369 59623674 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7747 NM_002556 5007 Hs.597091 NM_002556 ENSG00000110048 OSBP OSBP1 oxysterol binding protein protein-coding 208.25-75 chr6 68926441 68926681 + 1.25 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 291279 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 275.25-4 chr1 242232273 242232529 + 1.25 NA intron (NM_001320272, intron 5 of 10) intron (NM_001320272, intron 5 of 10) 217067 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 413-2 chr10 51168567 51168997 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 94295 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 302.75-25 chr5 143596707 143597149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82932 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 193-89 chr8 86767130 86767322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23551 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 268-22 chr15 67604310 67604895 + 1.25 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) MIR|SINE|MIR 55508 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 171-33 chr13 86709192 86709336 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -202656 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 277.5-52 chr4 36275044 36275438 + 1.25 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 -6375 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 237.25-64 chr5 144679875 144680323 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 474708 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 280-46 chr5 86878358 86878750 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 131736 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 213.5-52 chr17 76158201 76158528 + 1.25 NA intron (NM_052916, intron 13 of 18) intron (NM_052916, intron 13 of 18) -17119 NM_001454 2302 Hs.651204 NM_001454 ENSG00000129654 FOXJ1 FKHL13|HFH-4|HFH4 forkhead box J1 protein-coding 131.75-43 chr11 115808701 115808840 + 1.25 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -48570 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 152.25-139 chr6 64037181 64037468 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) intron (NM_001292009, intron 33 of 43) 230488 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 276.25-11 chr14 53140998 53141325 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) L1MCc|LINE|L1 12162 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 272-38 chr7 92080677 92080973 + 1.25 NA intron (NM_147185, intron 31 of 49) MER57D|LTR|ERV1 53652 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 382.75-4 chr2 183054684 183055140 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16455 NM_013436 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 259.25-48 chr8 88748628 88748912 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -421287 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 234-20 chr2 100828063 100828303 + 1.25 NA intron (NM_002518, intron 1 of 20) L1PA16|LINE|L1 8044 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 278.5-58 chr8 102236773 102237148 + 1.25 NA intron (NM_015713, intron 1 of 8) intron (NM_015713, intron 1 of 8) 1871 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 135.25-176 chr6 34795873 34795997 + 1.25 NA intron (NM_017754, intron 1 of 20) intron (NM_017754, intron 1 of 20) 3852 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 127.25-97 chr2 180476279 180476452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -215739 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 262.75-48 chr7 48506681 48506923 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 49 of 61) intron (NM_152701, intron 49 of 61) 335344 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 170.25-102 chr3 192183792 192183966 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) -54751 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 244.75-58 chr7 94204533 94204808 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 187522 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 139-24 chr11 8403175 8403291 + 1.25 NA intron (NM_001352399, intron 11 of 11) CR1_Mam|LINE|CR1 -134446 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 244.5-70 chr3 114307161 114307429 + 1.25 NA intron (NM_173799, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 9274 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 179.5-157 chr6 99888772 99888936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105184 NR_038384 728012 Hs.434366 NR_038384 ENSG00000229315 MCHR2-AS1 - MCHR2 antisense RNA 1 ncRNA 145.25-113 chr4 53120785 53120934 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) L3b|LINE|CR1 245202 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 226.5-86 chr6 152634866 152635239 + 1.25 NA intron (NM_182961, intron 2 of 145) intron (NM_182961, intron 2 of 145) 1799 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 162.5-145 chr5 148247977 148248152 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 9539 NM_001363511 105378220 Hs.534838 NM_001363511 ENSG00000248109 MARCOL - MARCO like protein-coding 276-30 chr20 44936300 44936749 + 1.25 NA intron (NM_001124756, intron 11 of 14) intron (NM_001124756, intron 11 of 14) 4962 NR_134985 80336 Hs.641481 NM_001124756 ENSG00000101104 PABPC1L C20orf119|EPAB|PABPC1L1|dJ1069P2.3 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like protein-coding 119.5-227 chr8 36167110 36167273 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -456871 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 225 chr1 80650758 80651205 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9694 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 146.5-93 chr18 73810606 73810738 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 337162 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 191.25-43 chr18 6613026 6613370 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 101782 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 147-14 chr1 217453322 217453516 + 1.25 NA intron (NM_018040, intron 8 of 9) intron (NM_018040, intron 8 of 9) 177671 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 215.5-61 chr20 36025301 36025700 + 1.25 NA intron (NM_001365709, intron 11 of 11) AluJr|SINE|Alu 25460 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 297.5-48 chr6 48714545 48715021 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -646094 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 134.5-93 chr2 11039347 11039504 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 92751 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 223.75-56 chr20 48053206 48053434 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -63203 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 164.25-34 chr12 127889420 127889617 + 1.25 NA intron (NR_126452, intron 3 of 3) intron (NR_126452, intron 3 of 3) 7901 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 174-110 chr9 134797916 134798188 + 1.25 NA intron (NM_001278074, intron 36 of 65) MIR|SINE|MIR 51317 NR_039691 100616333 NR_039691 ENSG00000264744 MIR3689C - microRNA 3689c ncRNA 220.5-21 chr13 61477022 61477326 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49228 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 119.5-251 chr9 33888889 33889074 + 1.25 NA intron (NM_017811, intron 2 of 4) intron (NM_017811, intron 2 of 4) 45383 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 343.5-15 chr4 54568332 54568693 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38619 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 316.5-9 chr10 123231471 123231815 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 77241 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 179-50 chr2 15352616 15352783 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 34 of 50) MER50|LTR|ERV1 208635 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 243-7 chr10 11992378 11992669 + 1.25 NA intron (NM_080599, intron 8 of 21) intron (NM_080599, intron 8 of 21) 50286 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 150.25-125 chr5 131018510 131018701 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 146651 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 285-23 chr2 116609154 116609477 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1205376 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 133-94 chr2 237225854 237226079 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 140077 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 334-29 chr6 165650699 165651127 + 1.25 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) AluSc|SINE|Alu 11187 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 176.75-26 chr12 93817724 93817883 + 1.25 NA intron (NM_001320100, intron 2 of 2) intron (NM_001320100, intron 2 of 2) -79980 NR_110092 101928731 Hs.659971 NR_110092 ENSG00000258274 LOC101928731 - uncharacterized LOC101928731 ncRNA 318-23 chr21 43304920 43305403 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26878 NR_103713 100126693 Hs.473952 NR_103713 LINC00322 C21orf136|NCRNA00322 long intergenic non-protein coding RNA 322 ncRNA 131.75-20 chr1 234124071 234124182 + 1.25 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -90085 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 192.5-19 chr10 84325532 84325727 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2960 NM_001351290 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 189-71 chr20 37855562 37855803 + 1.25 NA intron (NM_001281495, intron 14 of 16) intron (NM_001281495, intron 14 of 16) -47445 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 228.25-13 chr10 91593803 91594178 + 1.25 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 17470 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 257.5-54 chr4 99203771 99203995 + 1.25 NA non-coding (NR_132990, exon 7 of 7) non-coding (NR_132990, exon 7 of 7) 15363 NM_000672 130 Hs.586161 NM_000672 ENSG00000172955 ADH6 ADH-5 alcohol dehydrogenase 6 (class V) protein-coding 359.5-11 chr7 25600605 25601115 + 1.25 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 62280 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 335.75-3 chr1 102985541 102985950 + 1.25 NA intron (NM_001854, intron 30 of 66) intron (NM_001854, intron 30 of 66) 122751 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 150.75-41 chr11 90440375 90440591 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) ERVL-E-int|LTR|ERVL 115374 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 260.75-31 chr2 117574617 117575046 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -239860 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 271.25-28 chr2 62934085 62934310 + 1.25 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) L1ME3B|LINE|L1 113514 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 156-47 chr14 61503030 61503178 + 1.25 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 67090 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 157.75-23 chr10 96111663 96111869 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -17949 NR_138482 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 172-80 chr4 48469529 48469792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13683 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 266.25-25 chr2 74187755 74188124 + 1.25 NA Intergenic LTR27C|LTR|ERV1 -9060 NM_001317110 55233 Hs.602092 NM_018221 ENSG00000114978 MOB1A C2orf6|MATS1|MOB1|MOBK1B|MOBKL1B|Mob4B MOB kinase activator 1A protein-coding 202-58 chr5 152183060 152183363 + 1.25 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 222068 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 179.25-36 chr11 108879732 108880020 + 1.25 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) intron (NM_004398, intron 16 of 17) 214807 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 159.5-45 chr12 73543589 73543849 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 384529 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 281-40 chr8 53255465 53255809 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3940 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 238-25 chr2 72674162 72674389 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 151758 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 358.75-3 chr10 24070029 24070537 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) L1MEd|LINE|L1 -138508 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 217.25-30 chr15 83127663 83128127 + 1.25 NA 3' UTR (NM_016073, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_016073, exon 6 of 6) 20250 NM_001353879 53346 Hs.513094 NM_023003 ENSG00000136404 TM6SF1 - transmembrane 6 superfamily member 1 protein-coding 132-82 chr19 29773074 29773202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38853 NM_001322262 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 218-15 chr12 6571243 6571702 + 1.25 NA intron (NM_001273, intron 38 of 39) intron (NM_001273, intron 38 of 39) -3181 NM_001258310 4839 Hs.534334 NM_006170 ENSG00000111641 NOP2 NOL1|NOP120|NSUN1|p120 NOP2 nucleolar protein protein-coding 267.25-35 chr6 69916241 69916519 + 1.25 NA intron (NM_001858, intron 4 of 50) intron (NM_001858, intron 4 of 50) 49824 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 202-14 chr10 114847162 114847387 + 1.25 NA intron (NM_001135051, intron 12 of 16) AluSx1|SINE|Alu 25494 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 190.5-144 chr7 31054022 31054320 + 1.25 NA intron (NM_001199637, intron 1 of 13) intron (NM_001199637, intron 1 of 13) 1710 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 298.75-30 chr6 86326767 86327054 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -610618 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 185.25-85 chr3 122340162 122340368 + 1.25 NA intron (NM_005213, intron 2 of 2) intron (NM_005213, intron 2 of 2) 15017 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 212.5-85 chr5 67712126 67712416 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -65482 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 226.25-3 chr1 76554874 76555185 + 1.25 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) intron (NM_001349109, intron 3 of 3) 224238 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 212.5-9 chr10 18439903 18440095 + 1.25 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 39424 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 238.25-64 chr5 32131018 32131399 + 1.25 NA intron (NM_022130, intron 3 of 3) intron (NM_022130, intron 3 of 3) 43111 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 271.25-44 chr9 83600602 83600978 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22259 NM_001256915 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 236.5-39 chr17 82353302 82353710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5741 NM_207459 400629 Hs.231897 NM_207459 ENSG00000182459 TEX19 - testis expressed 19 protein-coding 145-77 chr2 128479468 128479605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160668 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 172.75-85 chr3 113957181 113957475 + 1.25 NA intron (NR_135271, intron 4 of 6) intron (NR_135271, intron 4 of 6) 9315 NM_001320468 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 265.75-55 chr4 139400505 139400870 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53354 NR_159963 107984036 Hs.605782 NR_159963 LOC107984036 - uncharacterized LOC107984036 ncRNA 144.25-53 chr13 104148473 104148805 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 723439 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 350.25-18 chr2 166712271 166712689 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -176007 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 378-17 chr6 45195680 45196099 + 1.25 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 1881 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 243.75-56 chr3 109815819 109816122 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 213142 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 341.75-11 chr16 21305795 21306160 + 1.25 NA intron (NR_026675, intron 1 of 2) L1ME2|LINE|L1 -2915 NM_001888 1428 Hs.924 NM_001888 ENSG00000103316 CRYM DFNA40|THBP crystallin mu protein-coding 326-2 chr1 232827127 232827424 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 22383 NM_019090 54627 Hs.160373 NM_019090 ENSG00000212916 MAP10 KIAA1383|MTR120 microtubule associated protein 10 protein-coding 300.25-20 chr3 162587896 162588254 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 715226 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 175.5-152 chr7 143204985 143205237 + 1.25 NA intron (NM_001130026, intron 8 of 10) intron (NM_001130026, intron 8 of 10) -16926 NM_176882 259286 Hs.352241 NM_176882 ENSG00000221937 TAS2R40 GPR60|T2R40|T2R58 taste 2 receptor member 40 protein-coding 308-15 chr18 59223141 59223537 + 1.25 NA intron (NM_001012512, intron 1 of 2) intron (NM_001012512, intron 1 of 2) 3181 NM_002091 2922 Hs.153444 NM_002091 ENSG00000134443 GRP BN|GRP-10|preproGRP|proGRP gastrin releasing peptide protein-coding 225.25-86 chr8 118129772 118129967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18050 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 236.5-20 chr13 38118675 38118914 + 1.25 NA intron (NR_047500, intron 1 of 5) L1MEd|LINE|L1 24438 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 282-45 chr7 158897359 158897800 + 1.25 NA intron (NM_001350914, intron 8 of 24) L1MC1|LINE|L1 41021 NM_001350915 55112 Hs.389945 NM_018051 ENSG00000126870 WDR60 FAP163|SRPS6|SRTD8 WD repeat domain 60 protein-coding 218.25-73 chr5 116841522 116841752 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -79428 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 256-17 chr15 84648082 84648459 + 1.25 NA intron (NR_130947, intron 3 of 6) intron (NR_130947, intron 3 of 6) 5976 NR_130944 84942 Hs.745027 NM_032856 ENSG00000177082 WDR73 GAMOS|GAMOS1|HSPC264 WD repeat domain 73 protein-coding 202-70 chr8 50654929 50655250 + 1.25 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) intron (NR_135797, intron 15 of 20) 490958 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 458-4 chr2 153566475 153567207 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88079 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 321.5-3 chr10 65736387 65737060 + 1.25 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 165298 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 233-18 chr14 68535641 68535928 + 1.25 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 93003 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 205.5-39 chr14 32861244 32861488 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77513 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 179.75-50 chr19 35516856 35517092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3325 NM_001190348 93099 Hs.417795 NM_033317 ENSG00000161249 DMKN UNQ729|ZD52F10 dermokine protein-coding 259.5-51 chr2 5114540 5114908 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -458502 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 127.75-151 chr4 127802491 127802630 + 1.25 NA intron (NM_001317383, intron 5 of 17) intron (NM_001317383, intron 5 of 17) 19037 NM_001317382 22824 Hs.135554 NM_014278 ENSG00000164070 HSPA4L APG-1|HSPH3|Osp94 heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like protein-coding 240.75-35 chr17 73529466 73529823 + 1.25 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 15961 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 222.25-40 chr2 230887515 230887807 + 1.25 NA intron (NR_038238, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 1115 NR_038238 151484 Hs.559309 NR_038238 ENSG00000232520 LOC151484 - uncharacterized LOC151484 ncRNA 114.75-51 chr14 56615392 56615522 + 1.25 NA intron (NM_017799, intron 7 of 15) intron (NM_017799, intron 7 of 15) 35659 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 204.25-72 chr3 181864629 181864825 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87637 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 393.25-3 chr17 71227310 71227804 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25378 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 118.75-119 chr21 44403529 44403674 + 1.25 NA intron (NM_003307, intron 16 of 31) intron (NM_003307, intron 16 of 31) -21928 NM_001320352 7226 Hs.369759 NM_003307 ENSG00000142185 TRPM2 EREG1|KNP3|LTRPC2|LTrpC-2|NUDT9H|NUDT9L1|TRPC7 transient receptor potential cation channel subfamily M member 2 protein-coding 295.75-11 chr2 12546246 12546498 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -170500 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 228.75-63 chr5 20638843 20639073 + 1.25 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) L1MA4A|LINE|L1 -23423 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 200.75-72 chr4 46280298 46280526 + 1.25 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) L2a|LINE|L2 108967 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 139.75-8 chr1 177090078 177090340 + 1.25 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) -60764 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 241.25-67 chr8 26533063 26533283 + 1.25 NA intron (NM_001197293, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 19142 NM_001197293 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 230.25-6 chr1 174707250 174707604 + 1.25 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) 6432 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 221.5-70 chr4 93509551 93509820 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 11 of 14) intron (NM_001286838, intron 11 of 14) -319068 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 203.75-74 chr3 177548905 177549130 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 2 of 3) intron (NR_047568, intron 2 of 3) 107096 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 234.75-48 chr3 27595087 27595396 + 1.25 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -110857 NR_135541 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 238.75-54 chr6 45395263 45395613 + 1.25 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) intron (NM_001015051, intron 2 of 7) -17504 NM_001350325 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 199.25-76 chr5 24158922 24159229 + 1.25 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) L1MA2|LINE|L1 207727 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 218-38 chr2 159332836 159333019 + 1.25 NA intron (NM_001329858, intron 33 of 36) intron (NM_001329858, intron 33 of 36) -46224 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 294.5-38 chr4 128907685 128908138 + 1.25 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 96067 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 234.25-72 chr7 72014936 72015387 + 1.25 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 322230 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 311-16 chr2 25790596 25791184 + 1.25 NA intron (NM_001369347, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu 3801 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 242.75-26 chr2 26758674 26758990 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5452 NM_017877 54978 Hs.1594 NM_017877 ENSG00000213699 SLC35F6 ANT2BP|C2orf18|TANGO9 solute carrier family 35 member F6 protein-coding 315.25-5 chr11 59399146 59399566 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23597 NM_001001954 219981 Hs.553648 NM_001001954 ENSG00000172324 OR5A2 - olfactory receptor family 5 subfamily A member 2 protein-coding 157.75-189 chrX 77462694 77462848 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 15382 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 255.25-7 chr10 17335631 17335932 + 1.25 NA intron (NM_001004470, intron 4 of 7) intron (NM_001004470, intron 4 of 7) -51155 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 195.5-121 chr5 113265768 113266100 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 29004 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 192.75-133 chrX 151528709 151528941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13274 NR_135614 105377213 Hs.147790 NR_135614 ENSG00000214915 LOC105377213 - uncharacterized LOC105377213 ncRNA 127.25-41 chr12 13302134 13302278 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 74539 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 222.25-31 chr2 35190145 35190380 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -281143 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 314.25-3 chr10 13331996 13332594 + 1.25 NA intron (NM_001195602, intron 4 of 7) L1MB7|LINE|L1 15998 NM_001195604 22929 Hs.124027 NM_012247 ENSG00000086475 SEPHS1 SELD|SPS|SPS1 selenophosphate synthetase 1 protein-coding 208.75-19 chr12 29959463 29959716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -174830 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 220.25-63 chr5 160024170 160024459 + 1.25 NA intron (NM_003314, intron 2 of 7) L1MC4a|LINE|L1 15175 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 154.75-35 chr13 92731066 92731449 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -9643 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 232.5-19 chr13 48930738 48931202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44942 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 254.5-2 chr1 44872824 44873075 + 1.25 NA intron (NM_020365, intron 10 of 11) intron (NM_020365, intron 10 of 11) -29696 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 151.25-55 chr14 59121728 59122037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66785 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 286.5-38 chr21 18866448 18867013 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -106918 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 193.5-6 chr1 80581350 80581523 + 1.25 NA intron (NR_125940, intron 2 of 3) intron (NR_125940, intron 2 of 3) 45681 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 327.25-3 chr10 114844358 114844731 + 1.25 NA intron (NM_001135051, intron 7 of 16) intron (NM_001135051, intron 7 of 16) 22764 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 218-5 chr1 163102441 163102696 + 1.25 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 30663 NM_001113380 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 164.25-84 chr20 39621218 39621398 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -383153 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 265.25-55 chr8 131501708 131501961 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -402259 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 238-69 chrX 48802769 48803048 + 1.25 NA exon (NM_006044, exon 3 of 29) exon (NM_006044, exon 3 of 29) 245 NR_135591 10013 Hs.6764 NM_006044 ENSG00000094631 HDAC6 CPBHM|HD6|JM21|PPP1R90 histone deacetylase 6 protein-coding 207.25-74 chr5 113878102 113878445 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 364579 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 185.75-94 chr4 134901026 134901196 + 1.25 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 222448 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 128-105 chr3 118997259 118997374 + 1.25 NA intron (NM_001353319, intron 1 of 7) intron (NM_001353319, intron 1 of 7) 37530 NM_001353318 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 278.5-60 chr8 133340064 133340713 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -43084 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 220.75-13 chr10 76741373 76741596 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -146560 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 117-95 chr2 131546847 131547073 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19072 NM_001349047 90557 Hs.351461 NM_138770 ENSG00000163040 CCDC74A - coiled-coil domain containing 74A protein-coding 165.5-133 chr4 103624597 103624962 + 1.25 NA intron (NM_001059, intron 3 of 4) intron (NM_001059, intron 3 of 4) 95206 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 260-38 chr7 6360924 6361507 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12248 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 143.75-142 chr5 53466282 53466504 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -14236 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 357.5-3 chr12 129254928 129255360 + 1.25 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 46543 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 126-16 chr10 30924533 30924688 + 1.25 NA intron (NM_001143771, intron 2 of 7) LOR1b|LTR|ERV1 74907 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 144.75-91 chr2 134083695 134083870 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36153 NM_001371457 119.25-54 chr14 53503205 53503318 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 349907 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 147.75-120 chr4 110991083 110991225 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130507 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 308-26 chr5 37433705 37434238 + 1.25 NA intron (NM_001345998, intron 5 of 17) intron (NM_001345998, intron 5 of 17) 54653 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 147.5-160 chr4 31950886 31951106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46383 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 166.5-196 chr7 132732201 132732478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26631 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 280.5-10 chr13 85948418 85948839 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -149209 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 142.75-16 chr1 239865231 239865418 + 1.25 NA intron (NM_001347716, intron 7 of 7) L1MC4a|LINE|L1 34548 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 144-50 chr18 2605959 2606217 + 1.25 NA intron (NM_006101, intron 13 of 16) intron (NM_006101, intron 13 of 16) 34531 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 263.5-12 chr12 51058158 51058558 + 1.25 NA intron (NR_147112, intron 4 of 4) intron (NR_147112, intron 4 of 4) 10031 NR_147105 25875 Hs.655272 NM_015416 ENSG00000050426 LETMD1 1110019O13Rik|HCCR|HCCR-1|HCCR-2|HCCR1|HCCR2|HCRR-2|SLC55A3 LETM1 domain containing 1 protein-coding 177.5-137 chr5 30365768 30365974 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 485311 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 157-112 chr7 24507734 24507999 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -65586 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 154-85 chr21 30777179 30777532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21927 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 207.5-43 chr18 65764309 65764645 + 1.25 NA intron (NM_001362438, intron 2 of 11) intron (NM_001362438, intron 2 of 11) 13465 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 175-36 chr14 56959831 56960117 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 146816 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 300.5-8 chr10 43134919 43135395 + 1.25 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -3288 NR_135077 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 141.25-90 chr2 166764141 166764305 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -124264 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 433.75-2 chr1 115048707 115049223 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001308315, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001308315, exon 7 of 7) 15019 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 134.25-137 chr5 25582117 25582262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 391236 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 127.5-86 chr15 39090564 39090694 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160040 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 350.25-7 chr11 74867318 74867817 + 1.25 NA intron (NM_001270381, intron 8 of 15) L1PA14|LINE|L1 81524 NM_182969 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 134.75-82 chr16 78812889 78813035 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 713308 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 143.75-10 chr1 238670773 238670911 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -184825 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 265.5 chr1 72702793 72703147 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -420431 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 183-114 chr8 120129037 120129227 + 1.25 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) L2c|LINE|L2 4030 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 229.25-63 chr5 45489553 45489818 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 206695 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 249-36 chr4 147675127 147675638 + 1.25 NA intron (NM_001350144, intron 1 of 10) intron (NM_001350144, intron 1 of 10) 8781 NM_138364 90826 Hs.591692 NM_138364 ENSG00000164169 PRMT9 PRMT10 protein arginine methyltransferase 9 protein-coding 135.75-205 chr8 136539664 136539792 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 8930 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 309.5-11 chr11 102639622 102639896 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14427 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 226.5-79 chr5 67109174 67109433 + 1.25 NA intron (NM_001297651, intron 7 of 25) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 87496 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 234.25-52 chr4 95735072 95735353 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -104881 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 199.5-151 chr8 123589909 123590211 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48854 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 242.5-23 chr11 107717089 107717418 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5197 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 198-84 chr8 140563623 140563833 + 1.25 NA intron (NM_001164623, intron 3 of 17) intron (NM_001164623, intron 3 of 17) 51732 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 215-37 chr17 75184449 75184676 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1603 NM_001005849 6613 Hs.380973 NM_006937 ENSG00000188612 SUMO2 HSMT3|SMT3B|SMT3H2|SUMO3|Smt3A small ubiquitin like modifier 2 protein-coding 342.25-14 chr20 15020077 15020477 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -90759 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 160-34 chr14 63044499 63044719 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) intron (NM_139318, intron 1 of 10) 849 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 166-132 chr9 79421174 79421401 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -150486 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 608.25-2 chr6 39622334 39623225 + 1.25 NA intron (NM_001289020, intron 5 of 21) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 102629 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 180.75-3 chr1 78721590 78721824 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71876 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 336-31 chr9 28075355 28075757 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1ME3E|LINE|L1 -501690 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 208-81 chr8 116527736 116528089 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124188 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 146-82 chr20 38117862 38118130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47274 NM_004613 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 159.25-101 chr4 42940559 42940764 + 1.25 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) intron (NM_001080476, intron 1 of 3) 47395 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 222.75-47 chr16 68816675 68816903 + 1.25 NA intron (NM_001317186, intron 10 of 14) intron (NM_001317186, intron 10 of 14) -26742 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 171.25-128 chr5 124095931 124096219 + 1.25 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1PB1|LINE|L1 342445 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 125-167 chr9 37398959 37399087 + 1.25 NA Intergenic Kanga1d|DNA|TcMar-Tc2 -23673 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 225.25-85 chr8 112638697 112639125 + 1.25 NA exon (NM_198124, exon 22 of 72) exon (NM_198124, exon 22 of 72) -4582 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 169.75-164 chr9 36590407 36590589 + 1.25 NA intron (NM_001256688, intron 4 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 17603 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 133.5-68 chr12 114962656 114962840 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -278573 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 157.5-221 chr9 34869675 34869884 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25985 NM_001309427 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 130.5-254 chr9 74370944 74371082 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_121182) promoter-TSS (NR_121182) -518 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 235.25-21 chr14 53398435 53398786 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 245256 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 527.25-3 chr7 7878578 7879239 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001302348, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001302348, exon 4 of 4) 89844 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 447.75-2 chr18 1976670 1977186 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 594577 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 254-28 chr2 189097767 189098081 + 1.25 NA intron (NM_000393, intron 5 of 53) intron (NM_000393, intron 5 of 53) 35187 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 213.75-25 chr11 119539815 119540011 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -114928 NM_001311162 7070 Hs.644697 NM_006288 ENSG00000154096 THY1 CD90|CDw90 Thy-1 cell surface antigen protein-coding 216.25-92 chr6 162271396 162271704 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) AluSz|SINE|Alu -455582 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 218.5-30 chr12 8768395 8768628 + 1.25 NA intron (NR_147950, intron 5 of 8) L1M5|LINE|L1 -54110 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 234.5-25 chr14 40702092 40702441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -252445 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 200.75-54 chr2 78041224 78041458 + 1.25 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -47389 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 143.75-187 chr8 91411635 91411817 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162407 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 280-54 chr7 27566809 27567077 + 1.25 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1ME1|LINE|L1 -49031 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 118-44 chr14 41073123 41073300 + 1.25 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 118500 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 210.75-30 chr16 28138034 28138356 + 1.25 NA intron (NM_001270940, intron 10 of 24) intron (NM_001270940, intron 10 of 24) 73770 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 176.75-75 chr20 62918876 62919176 + 1.25 NA intron (NM_022105, intron 1 of 5) intron (NM_022105, intron 1 of 5) 7479 NM_001193369 11083 Hs.517172 NM_022105 ENSG00000101191 DIDO1 BYE1|C20orf158|DATF-1|DATF1|DIDO2|DIDO3|DIO-1|DIO1|dJ885L7.8 death inducer-obliterator 1 protein-coding 197.5-69 chr2 99488338 99488579 + 1.25 NA intron (NR_135652, intron 1 of 21) intron (NR_135652, intron 1 of 21) 1559 NR_135650 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 247.75-44 chr4 114143613 114144010 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -164164 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 123.25-5 chr1 53086273 53086463 + 1.25 NA TTS (NM_001199081) TTS (NM_001199081) 24155 NM_001199080 127435 Hs.586141 NM_153703 ENSG00000174348 PODN PCAN|SLRR5A podocan protein-coding 155.5-50 chr14 49549895 49550052 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 36407 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 280.5-47 chr6 55559114 55559389 + 1.25 NA intron (NR_109867, intron 1 of 3) intron (NR_109867, intron 1 of 3) 19963 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 194-3 chr1 76154126 76154406 + 1.25 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 79520 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 179.5-56 chr14 33692918 33693195 + 1.25 NA intron (NM_001165893, intron 5 of 10) intron (NM_001165893, intron 5 of 10) -15881 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 290.5 chr1 106487330 106487592 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -330778 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 252.5-49 chr21 28354993 28355406 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126532 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 319.5-15 chr13 104480858 104481427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -984725 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 350.5-23 chr9 76465873 76466506 + 1.25 NA intron (NM_001490, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 7007 NM_001490 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 160.75-3 chr1 43883739 43884037 + 1.25 NA intron (NR_073018, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 45266 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 127.75-168 chr6 38524164 38524318 + 1.25 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L3b|LINE|CR1 42645 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 124-82 chr2 40314679 40314869 + 1.25 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) L1ME1|LINE|L1 115530 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 164.5-84 chr18 22496399 22496565 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -78567 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 176.75-42 chr14 85815112 85815303 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -119471 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 192-42 chr14 32377984 32378223 + 1.25 NA intron (NM_004274, intron 1 of 13) intron (NM_004274, intron 1 of 13) 48805 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 130.5-243 chr8 84445204 84445362 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 29799 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 122.75-107 chr20 8980009 8980184 + 1.25 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -88958 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 223-76 chr7 105365387 105365722 + 1.25 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) AluJo|SINE|Alu 23367 NM_182692 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 247-7 chr10 66897780 66898067 + 1.25 NA intron (NR_111911, intron 5 of 6) L1MC5a|LINE|L1 -28113 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 128.75-165 chr6 51827390 51827543 + 1.25 NA intron (NM_138694, intron 52 of 66) MIRb|SINE|MIR 205596 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 182.25-97 chr5 166566478 166566676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 359793 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 172.75-93 chr5 19847751 19847938 + 1.25 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 38428 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 173.25-32 chr13 82441210 82441485 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1214364 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 217.75-2 chr1 60049608 60049905 + 1.25 NA intron (NM_152377, intron 3 of 11) L1MC5a|LINE|L1 24014 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 119-88 chr2 103249195 103249316 + 1.25 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -264826 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 228-57 chr4 42002748 42002961 + 1.25 NA intron (NM_006345, intron 2 of 17) L1PA16|LINE|L1 12324 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 243.25-35 chr4 32677989 32678302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 327107 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 200.25-15 chr10 55181775 55181964 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -380578 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 315.25-6 chr12 46150773 46151171 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 115544 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 370.75-2 chr14 87250342 87250832 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 344809 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 342.25-12 chr2 66875398 66875995 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28740 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 274.75-36 chr4 19978573 19979020 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -273109 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 265-24 chr21 28912018 28912476 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -26874 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 298-7 chr14 73456830 73457152 + 1.25 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 1589 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 263.75-33 chr22 25053245 25053579 + 1.25 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 25438 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 243-35 chr2 143447226 143447669 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 318028 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 184.25-47 chr18 2439598 2439907 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 131753 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 120.75-36 chr14 35931444 35931576 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105172 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 399.25 chr11 103887450 103887872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37755 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 193.25-31 chr14 52224915 52225168 + 1.25 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -42657 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 239.75-43 chr22 30764191 30764499 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001282740) promoter-TSS (NM_001282740) 92 NM_001282740 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 192.25-91 chr5 152939114 152939351 + 1.25 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 33117 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 390.75-12 chrX 84182821 84183274 + 1.25 NA intron (NM_014496, intron 1 of 21) intron (NM_014496, intron 1 of 21) 4888 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 162-102 chr6 142074085 142074247 + 1.25 NA TTS (NM_002511) TTS (NM_002511) 14633 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 232.75-41 chr3 40605889 40606196 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81082 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 258-7 chr10 66968358 66968653 + 1.25 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) intron (NM_178011, intron 2 of 2) 42469 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 253.25-13 chr11 67389229 67389595 + 1.25 NA intron (NR_024469, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 -2574 NM_004584 5883 Hs.655354 NM_004584 ENSG00000172613 RAD9A RAD9 RAD9 checkpoint clamp component A protein-coding 166.25-152 chr9 121435701 121435859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64247 NR_003191 2681 Hs.97469 NR_003191 ENSG00000204136 GGTA1P GGTA|GGTA1|GLYT2|a1/3GTP glycoprotein alpha-galactosyltransferase 1, pseudogene pseudo 221.75-75 chr8 40185370 40185652 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 32029 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 211.75-80 chr5 132787753 132787989 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10002 NM_001098813 23176 Hs.522057 NM_015146 ENSG00000164402 SEPTIN8 SEP2|SEPT8 septin 8 protein-coding 187.5-19 chr10 53356931 53357134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -585332 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 376-5 chr14 66742022 66742424 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 234816 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 147-124 chr6 105490801 105490966 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -87801 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 178.25-5 chr1 112377552 112377758 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -18559 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 180.25-21 chr13 112634834 112635040 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12107 NM_207440 400165 Hs.591213 NM_207440 ATP11AUN C13orf35|SMABLO1 ATP11A upstream neighbor protein-coding 170.5-88 chr2 23023925 23024139 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -361147 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 149-79 chr3 100891595 100891766 + 1.25 NA intron (NM_001349332, intron 4 of 35) L3|LINE|CR1 101810 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 288.25-9 chr14 46939339 46939718 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 9 of 16) intron (NM_001113498, intron 9 of 16) -287747 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 172.75-45 chr17 6918129 6918483 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24529 NR_120453 245 Hs.378695 NR_002710 ENSG00000262943 ALOX12P2 ALOX12E arachidonate 12-lipoxygenase pseudogene 2 pseudo 145.5-75 chr16 79506289 79506465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94360 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 371.25-18 chr9 30290434 30290923 + 1.25 NA Intergenic (CTTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 117776 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 240.5-19 chr12 54825450 54825786 + 1.25 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -28898 NM_058173 118430 Hs.348419 NM_058173 ENSG00000172551 MUCL1 SBEM mucin like 1 protein-coding 244.5-79 chr5 68711981 68712317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 317778 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 209.5-38 chr14 20479677 20479947 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10433 NM_000270 4860 Hs.75514 NM_000270 ENSG00000198805 PNP NP|PRO1837|PUNP purine nucleoside phosphorylase protein-coding 199.5-108 chr4 20231997 20232281 + 1.25 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -19766 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 334.75-15 chr2 222160942 222161446 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136953 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 196-101 chr9 25597878 25598060 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 80889 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 202.5-12 chr10 14586738 14587056 + 1.25 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -14522 NM_001282700 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 240.25-3 chr1 168490063 168490404 + 1.25 NA intron (NR_125956, intron 2 of 4) intron (NR_125956, intron 2 of 4) 5411 NR_125956 101928565 Hs.563806 NR_125956 ENSG00000228697 LOC101928565 - uncharacterized LOC101928565 ncRNA 158.5-29 chr10 84805213 84805541 + 1.25 NA Intergenic (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 380208 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 376.75-5 chr15 23525264 23525810 + 1.25 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 36594 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 140.5-36 chr11 82569701 82569881 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 164073 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 216-83 chr9 100874302 100874586 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -154283 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 189-95 chr6 149077664 149077935 + 1.25 NA TTS (NM_005715) TTS (NM_005715) -45138 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 196.25-119 chr9 25343743 25343993 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 334990 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 446-2 chr10 67807169 67807687 + 1.25 NA intron (NM_021800, intron 3 of 4) intron (NM_021800, intron 3 of 4) 30751 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 284.5-60 chr7 63081087 63081639 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 222693 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 331.75-10 chr15 95518229 95518618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85330 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 363.25-2 chr11 81223373 81223935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -460851 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 216.75-66 chr5 166451971 166452417 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 474176 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 252.5-57 chr4 35795648 35795901 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 448165 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 149.25-125 chr3 188205561 188205833 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 1 of 9) intron (NM_001167672, intron 1 of 9) -7236 NM_005578 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 305.75-11 chr2 32376835 32377206 + 1.25 NA intron (NM_016252, intron 1 of 73) intron (NM_016252, intron 1 of 73) 19992 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 259.25-29 chr4 32628155 32628384 + 1.25 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 277231 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 152.5-75 chr18 48305988 48306169 + 1.25 NA intron (NM_001371290, intron 5 of 9) intron (NM_001371290, intron 5 of 9) 53777 NM_001350280 84322 Hs.334493 NM_032362 C18orf12 HEIL1|HsT2508 chromosome 18 open reading frame 12 protein-coding 152-122 chr5 13206323 13206632 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -173591 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 290.25-38 chr9 28929641 28930132 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -40931 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 178.75-52 chr2 227933874 227934131 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62371 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 306-28 chr4 98359307 98359733 + 1.25 NA intron (NM_001100430, intron 4 of 12) intron (NM_001100430, intron 4 of 12) 98136 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 286.75-8 chr11 12672586 12672985 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -1636 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 150-72 chr2 71957152 71957325 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 190624 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 299.25-42 chr6 65144219 65144601 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -157008 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 166-100 chr5 72827572 72827796 + 1.25 NA intron (NM_001364292, intron 1 of 24) L2a|LINE|L2 11023 NM_001364295 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 209.5-9 chr1 206826905 206827173 + 1.25 NA intron (NM_153758, intron 2 of 6) intron (NM_153758, intron 2 of 6) -1838 NM_013371 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 319-4 chr11 83401826 83402411 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -115711 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 319-21 chr21 20641880 20642371 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 160983 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 121.25-87 chr2 13336880 13337053 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -329953 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 174-7 chr10 22098331 22098730 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -94800 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 192.25-61 chr2 198469890 198470110 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -94903 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 250-36 chr3 9877887 9878220 + 1.25 NA intron (NM_001199551, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 759 NM_001199623 63924 Hs.567562 NM_022094 ENSG00000187288 CIDEC CIDE-3|CIDE3|FPLD5|FSP27 cell death inducing DFFA like effector c protein-coding 264.5-9 chr10 67956549 67956903 + 1.25 NA intron (NM_001278185, intron 18 of 23) intron (NM_001278185, intron 18 of 23) 54157 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 244.5-46 chr2 39005444 39005700 + 1.25 NA intron (NM_005633, intron 17 of 22) intron (NM_005633, intron 17 of 22) -45228 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 155.5-189 chr6 161503630 161503802 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 32739 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 246-54 chr6 104063969 104064345 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 795389 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 209.5-43 chr14 57444658 57444922 + 1.25 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 49067 NM_001283057 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 229-65 chr5 62790192 62790397 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 211475 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 338-28 chr6 45913313 45913836 + 1.25 NA intron (NM_001256023, intron 5 of 5) intron (NM_001256023, intron 5 of 5) 24023 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 153.75-68 chr2 169690185 169690345 + 1.25 NA intron (NM_001085447, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 4140 NM_001085447 129881 Hs.370111 NM_001085447 ENSG00000154479 CCDC173 C2orf77 coiled-coil domain containing 173 protein-coding 226-20 chr14 75138416 75138732 + 1.25 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) intron (NM_006827, intron 3 of 4) -11526 NM_001329238 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 130-22 chr11 6163132 6163236 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 7142 NM_001004052 255725 Hs.690457 NM_001004052 ENSG00000255307 OR52B2 OR11-70 olfactory receptor family 52 subfamily B member 2 protein-coding 322.5-8 chr11 126773810 126774265 + 1.25 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) 117951 NR_120533 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 216.25-14 chr10 108146141 108146388 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -76971 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 244.25-31 chr3 66805691 66805973 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67496 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 149.5-53 chr14 31525356 31525547 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -35953 NR_120408 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 214-46 chr3 173309329 173309593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86491 NM_001365924 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 323.25-30 chr8 134824493 134824815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13415 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 276.5-33 chr2 104525464 104525865 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15155 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 178.5-188 chr8 133276870 133277116 + 1.25 NA intron (NM_001258432, intron 1 of 13) L1MB3|LINE|L1 20259 NM_001135242 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 237.75-68 chr5 97549748 97549942 + 1.25 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) intron (NR_105028, intron 2 of 3) 45149 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 236.25-58 chr3 54762637 54762976 + 1.25 NA intron (NM_018398, intron 12 of 37) intron (NM_018398, intron 12 of 37) -122949 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 233.5-43 chr18 2191595 2191873 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 379771 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 251.25-61 chr8 128519450 128519865 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 45022 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 139.5-19 chr10 94539239 94539495 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -6400 NM_001289070 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 247.75-50 chr5 150311729 150311976 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8947 NM_001012301 340075 Hs.591252 NM_001012301 ENSG00000183876 ARSI ASI|SPG66 arylsulfatase family member I protein-coding 169.5-155 chr6 106280453 106280597 + 1.25 NA intron (NR_104402, intron 3 of 5) intron (NR_104402, intron 3 of 5) 35741 NR_104403 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 198-52 chr3 153493453 153493659 + 1.25 NA intron (NR_160966, intron 2 of 2) MLT2A2|LTR|ERVL 9061 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 148.75-166 chr8 70476871 70477040 + 1.25 NA intron (NR_110653, intron 1 of 3) intron (NR_110653, intron 1 of 3) 5821 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 230.25-33 chr18 66401479 66401730 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 202486 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 164-80 chr3 106421905 106422132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -552617 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 250.5-2 chr1 105354841 105355195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 263917 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 292-11 chr12 57594162 57594465 + 1.25 NA intron (NM_024779, intron 2 of 9) intron (NM_024779, intron 2 of 9) 3121 NM_001146258 79837 Hs.745011 NM_024779 ENSG00000166908 PIP4K2C PIP5K2C phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 gamma protein-coding 199-57 chr3 193570045 193570365 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15310 NM_032279 84239 Hs.674423 NM_032279 ENSG00000127249 ATP13A4 - ATPase 13A4 protein-coding 357.75-15 chr6 139313967 139314447 + 1.25 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -22209 NM_153235 167838 Hs.535820 NM_153235 ENSG00000164440 TXLNB C6orf198|LST001|MDP77|dJ522B19.2 taxilin beta protein-coding 372-11 chr19 56676406 56676831 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4861 NM_001005850 90485 Hs.458438 NM_001005850 ENSG00000127903 ZNF835 BC37295_3 zinc finger protein 835 protein-coding 242.25-12 chr10 53488878 53489172 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -717325 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 192-6 chr1 106598811 106599098 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -219285 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 234-3 chr1 195085243 195085486 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1003351 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 163.5-81 chr18 64958702 64958895 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -698743 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 133-164 chr7 116583010 116583199 + 1.25 NA intron (NR_120506, intron 2 of 4) intron (NR_120506, intron 2 of 4) 31716 NR_120506 100996266 Hs.552122 NR_120506 LINC01510 - long intergenic non-protein coding RNA 1510 ncRNA 142.25-157 chr7 34676556 34676827 + 1.25 NA intron (NM_207172, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 18452 NM_001300934 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 173.75-5 chr1 86799203 86799396 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94723 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 266.25-41 chr6 163165336 163165587 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) 26541 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 186-13 chr10 118372394 118372597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15387 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 255.25-38 chr4 113208958 113209258 + 1.25 NA intron (NM_001354275, intron 5 of 43) LTR49|LTR|ERV1 56826 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 421-3 chr12 1758348 1758880 + 1.25 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -61653 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 116.75-52 chr13 91421104 91421303 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 1 of 7) intron (NM_004466, intron 1 of 7) 22582 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 324.25 chr12 91606169 91606730 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -423632 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 172.5-139 chr4 44676764 44677221 + 1.25 NA Intergenic MER67A|LTR|ERV1 -1403 NM_001345869 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 232.25-39 chr21 17869992 17870350 + 1.25 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) ERVL-int|LTR|ERVL 15437 NR_024354 54075 Hs.404306 NR_024354 CHODL-AS1 C21orf39|NCRNA00157 CHODL antisense RNA 1 ncRNA 194.25-34 chr14 80391002 80391277 + 1.25 NA intron (NR_038355, intron 5 of 8) intron (NR_038355, intron 5 of 8) -160082 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 148.25-56 chr17 75484372 75484527 + 1.25 NA intron (NM_001321148, intron 1 of 30) AluJb|SINE|Alu 7912 NM_001321148 9772 Hs.514474 NM_014738 ENSG00000177728 TMEM94 IDDCDF|KIAA0195 transmembrane protein 94 protein-coding 212.5-75 chr3 177072061 177072239 + 1.25 NA intron (NM_024665, intron 2 of 15) intron (NM_024665, intron 2 of 15) 124328 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 200-76 chr5 164207939 164208199 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 259333 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 177.75-28 chr12 43103390 43103550 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -51845 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 142.75-143 chr4 67025215 67025384 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 396701 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 363.25-4 chr14 57239957 57240785 + 1.25 NA intron (NM_006544, intron 4 of 17) AluSp|SINE|Alu 28534 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 229.75-53 chr3 149056426 149056732 + 1.25 NA intron (NM_001318935, intron 13 of 25) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -29753 NR_046648 100873945 Hs.742423 NR_046648 ENSG00000239718 HLTF-AS1 - HLTF antisense RNA 1 ncRNA 295-10 chr14 20669483 20669867 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -14502 NM_001145 283 Hs.283749 NM_001145 ENSG00000214274 ANG ALS9|HEL168|RAA1|RNASE4|RNASE5 angiogenin protein-coding 174.25-78 chr2 44959896 44960100 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18120 NR_103786 100506108 Hs.503113 NR_103785 ENSG00000236502 SIX3-AS1 SIX3OS SIX3 antisense RNA 1 ncRNA 117.75-117 chr2 231920975 231921113 + 1.25 NA TTS (NM_024409) TTS (NM_024409) 5352 NM_024409 4880 Hs.247916 NM_024409 ENSG00000163273 NPPC CNP|CNP2 natriuretic peptide C protein-coding 169.75-87 chr2 184359382 184359663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19453 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 202.25-20 chr13 62341758 62342009 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18226 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 263.75-22 chr18 913586 913823 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8338 NM_001117 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 210.25-46 chr2 187809627 187809861 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -255239 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 227-41 chr3 55737916 55738276 + 1.25 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) LTR40a|LTR|ERVL -78627 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 167.75-97 chr4 54121140 54121521 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 21167 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 223.75-28 chr15 57594579 57594860 + 1.25 NA intron (NM_001018100, intron 1 of 12) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 2815 NR_104371 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 134-118 chr3 105611055 105611247 + 1.25 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 244242 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 165.75-39 chr12 47267784 47267974 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39520 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 448 chr10 75503558 75504309 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -48525 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 121.5-238 chr7 50112315 50112450 + 1.25 NA intron (NM_001161834, intron 2 of 8) MER20|DNA|hAT-Charlie 16296 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 325.25-23 chr5 53091484 53091983 + 1.25 NA non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) 18024 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 213.5-16 chr1 246951201 246951418 + 1.25 NA intron (NR_037892, intron 5 of 5) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -19361 NR_136586 25909 Hs.300887 NM_015446 ENSG00000153207 AHCTF1 ELYS|MST108|MSTP108|TMBS62 AT-hook containing transcription factor 1 protein-coding 171.5-37 chr12 41278468 41278673 + 1.25 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) LTR78|LTR|ERV1 90250 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 229.25-25 chr14 58986813 58987225 + 1.25 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) intron (NR_110547, intron 4 of 5) 158731 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 234.25-2 chr1 66224032 66224309 + 1.25 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 -107938 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 137.25-80 chr2 171201144 171201436 + 1.25 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) intron (NM_001136554, intron 1 of 20) 30003 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 224.25-54 chr3 48217702 48217920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5684 NM_004345 820 Hs.51120 NM_004345 ENSG00000164047 CAMP CAP-18|CAP18|CRAMP|FALL-39|FALL39|HSD26|LL37 cathelicidin antimicrobial peptide protein-coding 250.25-50 chr9 31788826 31789142 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -407494 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 269.25-32 chr3 99745977 99746281 + 1.25 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) intron (NM_001850, intron 3 of 4) -71733 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 187.75-50 chr2 107758614 107759032 + 1.25 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 4711 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 252.25-60 chr7 48790242 48790561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -134146 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 115-23 chr10 101595108 101595224 + 1.25 NA intron (NM_001329742, intron 2 of 5) intron (NM_001329742, intron 2 of 5) -6251 NR_036114 100422900 NR_036114 ENSG00000263436 MIR3158-1 mir-3158-1 microRNA 3158-1 ncRNA 239.75-64 chr6 55961424 55961763 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -86003 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 194.5-30 chr12 40078434 40078687 + 1.25 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) L1PA15|LINE|L1 27521 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 132.75-148 chr5 12297545 12297759 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -277205 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 123.75-95 chr2 144730456 144730672 + 1.25 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 62597 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 173.75-144 chr7 157987380 157987566 + 1.25 NA intron (NM_130843, intron 10 of 21) intron (NM_130843, intron 10 of 21) 132888 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 272-35 chr6 134025934 134026162 + 1.25 NA intron (NM_145176, intron 2 of 4) intron (NM_145176, intron 2 of 4) 26576 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 163.5-198 chr8 11713691 11713932 + 1.25 NA intron (NM_002052, intron 2 of 6) intron (NM_002052, intron 2 of 6) 5955 NM_001308093 2626 Hs.243987 NM_002052 ENSG00000136574 GATA4 ASD2|TACHD|TOF|VSD1 GATA binding protein 4 protein-coding 309-23 chr20 40608639 40608898 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 80468 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 240-32 chr22 19346071 19346537 + 1.25 NA intron (NM_003325, intron 24 of 24) FLAM_C|SINE|Alu -54585 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 281-36 chr6 99850029 99850296 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -143876 NR_038384 728012 Hs.434366 NR_038384 ENSG00000229315 MCHR2-AS1 - MCHR2 antisense RNA 1 ncRNA 147.5-51 chr12 70934615 70934924 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14031 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 241.25-25 chr16 50826882 50827156 + 1.25 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 20347 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 314-25 chr8 110035312 110035873 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -59821 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 287.25-19 chr14 70379057 70379538 + 1.25 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) intron (NM_001202549, intron 2 of 4) -19614 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 333-14 chr3 59648557 59648972 + 1.25 NA intron (NR_149028, intron 1 of 3) L1M2|LINE|L1 9733 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 468.5-5 chr8 115560573 115561213 + 1.25 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 107120 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 230.25-76 chr7 120535060 120535293 + 1.25 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 262001 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 227.25-83 chr8 127392062 127392412 + 1.25 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -8162 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 343.25-22 chr9 134338465 134338922 + 1.25 NA intron (NM_002957, intron 1 of 9) intron (NM_002957, intron 1 of 9) 12238 NM_002957 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 225.75-2 chr1 49749273 49749552 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) L1MC|LINE|L1 274542 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 181.25-120 chr7 14618597 14618798 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 14 of 24) intron (NM_001350717, intron 14 of 24) 222753 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 208.75-13 chr10 127472488 127472819 + 1.25 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -76696 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 135-28 chr12 7711187 7711395 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_199286) promoter-TSS (NM_199286) -142 NM_199286 359787 Hs.131358 NM_199286 ENSG00000187569 DPPA3 Pgc7|STELLA developmental pluripotency associated 3 protein-coding 265.25-43 chr5 159744764 159745130 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 126437 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 240.5-36 chr16 52398622 52398855 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 140174 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 371-4 chr10 112744107 112744569 + 1.25 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) -79158 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 235.5-94 chr9 107254396 107254711 + 1.25 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -28726 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 136.75-15 chr1 214983523 214983740 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21911 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 216.25-37 chr15 64446795 64447193 + 1.25 NA intron (NM_001321924, intron 12 of 12) AluY|SINE|Alu -52426 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 177.25-42 chr14 46094395 46094571 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 30324 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 185-96 chrX 117219383 117219649 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -401656 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 221-26 chr17 39786809 39787034 + 1.25 NA intron (NM_001284514, intron 6 of 8) intron (NM_001284514, intron 6 of 8) -8696 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 149-92 chr4 75344765 75345130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9129 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 277-41 chr9 32455200 32455572 + 1.25 NA TTS (NM_001362840) TTS (NM_001362840) 70743 NM_002197 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 234-45 chr4 48953978 48954207 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -32183 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 253.5-59 chr5 27722920 27723155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 250745 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 230.25-44 chr2 119277667 119277868 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -28696 NR_046721 100874111 Hs.704682 NR_046721 ENSG00000229867 STEAP3-AS1 - STEAP3 antisense RNA 1 ncRNA 148.75-36 chr12 8501303 8501509 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12097 NM_080387 338339 Hs.351811 NM_080387 ENSG00000166527 CLEC4D CD368|CLEC-6|CLEC6|CLECSF8|Dectin-3|MCL|MPCL C-type lectin domain family 4 member D protein-coding 221.75-62 chr5 137646660 137646964 + 1.25 NA TTS (NR_030588) TTS (NR_030588) 837 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 282-4 chr10 124571404 124571912 + 1.25 NA intron (NM_022126, intron 6 of 6) intron (NM_022126, intron 6 of 6) 109835 NM_001318331 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 160.75-30 chr12 33458756 33458940 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19029 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 226-23 chr15 53143410 53143766 + 1.25 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 27223 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 336.25 chr1 117949473 117949786 + 1.25 NA intron (NM_006784, intron 13 of 26) intron (NM_006784, intron 13 of 26) 19890 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 179.75-19 chr10 116421175 116421365 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6577 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 334.25-20 chr6 20383499 20383909 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -18175 NM_001949 1871 Hs.269408 NM_001949 ENSG00000112242 E2F3 E2F-3 E2F transcription factor 3 protein-coding 208.75-48 chr20 45076878 45077133 + 1.25 NA 3' UTR (NM_006282, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_006282, exon 11 of 11) 24122 NM_002251 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 112.25-61 chr14 56483536 56483823 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30652 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 144.25-174 chr6 146225466 146225794 + 1.25 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 196432 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 223.5-98 chr5 92254924 92255455 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -871872 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 117.25-12 chr1 113952094 113952330 + 1.25 NA intron (NM_198269, intron 1 of 14) AluSx1|SINE|Alu 1067 NM_198269 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 216.5-23 chr12 110917183 110917505 + 1.25 NA intron (NM_000432, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 3256 NM_000432 4633 Hs.75535 NM_000432 ENSG00000111245 MYL2 CMH10|MLC-2s/v|MLC2 myosin light chain 2 protein-coding 309.75-5 chr10 68863843 68864099 + 1.25 NA intron (NM_152709, intron 1 of 3) AluYk2|SINE|Alu 36434 NM_001130160 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 130.75-38 chr12 18211945 18212167 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -49484 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 189.75-24 chr13 29115270 29115429 + 1.25 NA intron (NM_001033602, intron 3 of 13) intron (NM_001033602, intron 3 of 13) 90892 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 175-28 chr12 11469623 11469834 + 1.25 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) L1PA14|LINE|L1 16950 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 338-19 chr2 132630870 132631341 + 1.25 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 39100 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 182-73 chr3 69841989 69842373 + 1.25 NA intron (NM_001354608, intron 2 of 10) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -24043 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 188.25-119 chr8 117239970 117240416 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105198 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 299.75-4 chr1 211008728 211009165 + 1.25 NA intron (NM_002238, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 124428 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 265.75-46 chr3 31322328 31322600 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160677 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 344.75-11 chr4 102546196 102546638 + 1.25 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) intron (NM_003998, intron 5 of 23) -43931 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 165.5-206 chr9 73445871 73446068 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 294104 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 122.5-127 chr2 232080513 232080692 + 1.25 NA intron (NR_046477, intron 5 of 18) intron (NR_046477, intron 5 of 18) -92051 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 242-66 chr8 122828981 122829250 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 47460 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 221-67 chr5 157288992 157289266 + 1.25 NA intron (NM_001291721, intron 3 of 29) MIRc|SINE|MIR 19805 NM_014376 26999 Hs.519702 NM_014376 ENSG00000055163 CYFIP2 EIEE65|PIR121 cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 protein-coding 328-5 chr13 108275552 108276055 + 1.25 NA intron (NM_001145645, intron 2 of 4) L1MD3|LINE|L1 6174 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 336-17 chr4 139204187 139204568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27159 NM_001331036 1998 Hs.634040 NM_006874 ENSG00000109381 ELF2 EU32|NERF|NERF-1A|NERF-1B|NERF-1a,b|NERF-2 E74 like ETS transcription factor 2 protein-coding 279.5-37 chr3 15225944 15226578 + 1.25 NA intron (NM_014296, intron 6 of 20) AluSx1|SINE|Alu 20015 NM_014296 23473 Hs.595234 NM_014296 ENSG00000131375 CAPN7 CALPAIN7|PALBH calpain 7 protein-coding 249.5-87 chr6 105770337 105770614 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -315861 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 143.75-95 chr2 116632658 116632897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1181914 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 294.25-32 chr7 26240284 26240717 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 38755 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 136-62 chr18 60809986 60810178 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -437307 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 149.75-88 chr2 122958389 122958643 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 114965 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 247.25-44 chr3 170944559 170944840 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -36062 NM_020390 56648 Hs.164144 NM_020390 ENSG00000163577 EIF5A2 EIF-5A2|eIF5AII eukaryotic translation initiation factor 5A2 protein-coding 225.5-101 chr8 41336966 41337264 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -27642 NM_003012 6422 Hs.213424 NM_003012 ENSG00000104332 SFRP1 FRP|FRP-1|FRP1|FrzA|SARP2 secreted frizzled related protein 1 protein-coding 189.5-41 chr14 47982096 47982361 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -187214 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 408.25-3 chr12 128777227 128777627 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 46531 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 370.5-17 chr5 68304838 68305187 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12435 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 221.25-7 chr1 206075768 206076099 + 1.25 NA intron (NM_001007544, intron 1 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -7662 NM_001369490 440712 Hs.662248 NM_001007544 ENSG00000263961 RHEX C1orf186 regulator of hemoglobinization and erythroid cell expansion protein-coding 226-69 chr8 117356459 117356707 + 1.25 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -164130 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 151.5-116 chr3 51168826 51168961 + 1.25 NA intron (NM_004947, intron 12 of 52) L1PREC2|LINE|L1 -216398 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 157-56 chr2 79373506 79373858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 127162 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 162.75-84 chr20 24601206 24601473 + 1.25 NA intron (NM_024893, intron 3 of 3) L1MEg|LINE|L1 131378 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 182.75-39 chr12 45930638 45930804 + 1.25 NA intron (NM_004719, intron 10 of 14) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 59853 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 196.75-49 chr18 62746773 62747029 + 1.25 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) L1MEd|LINE|L1 31360 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 239-52 chr6 67051762 67052006 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -1003467 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 175-73 chr2 162265985 162266297 + 1.25 NA TTS (NM_022168) TTS (NM_022168) -22696 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 275.25-35 chr5 137720876 137721191 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001257194, exon 1 of 15) 5' UTR (NM_001257194, exon 1 of 15) 277 NM_001257194 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 139.75-127 chr3 182925589 182925770 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 54859 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 359.75-10 chr18 72073120 72073596 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -291132 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 389.75 chr12 118312698 118313314 + 1.25 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 46699 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 223-67 chr5 109304818 109305143 + 1.25 NA intron (NR_149040, intron 3 of 3) intron (NR_149040, intron 3 of 3) 21389 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 143.75-50 chr14 67030373 67030493 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 9 of 21) L2c|LINE|L2 -159007 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 311.75-20 chr7 36260468 36260983 + 1.25 NA intron (NM_030636, intron 3 of 7) intron (NM_030636, intron 3 of 7) 106515 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 146.25-81 chr2 180073278 180073543 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66113 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 112.75-61 chr14 59769893 59770024 + 1.25 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 100818 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 166.25-33 chr11 79429571 79429911 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) -7515 NR_049841 100847000 NR_049841 ENSG00000266570 MIR5579 - microRNA 5579 ncRNA 213.5-49 chr17 7137399 7137651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22714 NM_080912 433 Hs.654440 NM_001181 ENSG00000161944 ASGR2 ASGP-R2|ASGPR2|CLEC4H2|HBXBP|HL-2 asialoglycoprotein receptor 2 protein-coding 209-43 chr2 215682138 215682367 + 1.25 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 -35791 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 167-17 chr10 36359155 36359304 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 580927 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 303.75-34 chr8 38703066 38703404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24951 NR_148048 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 281.25-33 chr3 182677625 182677956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -115714 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 286.75-34 chr4 83345153 83345541 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -10194 NM_001166498 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 135-93 chr20 44892929 44893096 + 1.25 NA intron (NM_003404, intron 2 of 6) intron (NM_003404, intron 2 of 6) 7307 NM_139323 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 321.75-5 chr12 13771542 13771924 + 1.25 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 208623 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 196.5-37 chr11 105165614 105165904 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25990 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 124.5-174 chr5 128593301 128593598 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55204 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 189.25-96 chr5 43173152 43173669 + 1.25 NA exon (NM_001330717, exon 7 of 8) exon (NM_001330717, exon 7 of 8) -18815 NM_153361 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 248.5-68 chr3 185725902 185726240 + 1.25 NA intron (NR_126326, intron 5 of 7) intron (NR_126326, intron 5 of 7) 12819 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 253-27 chr2 223684126 223684367 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -81885 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 283.75-22 chr22 26840452 26840719 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -19626 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 123.75-18 chr10 82581959 82582108 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -349113 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 197.5-132 chr5 164223331 164223649 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 243912 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 131.5-80 chr15 94598604 94598810 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 242777 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 128.25-113 chr20 38515184 38515354 + 1.25 NA intron (NM_001282917, intron 6 of 29) intron (NM_001282917, intron 6 of 29) -1294 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 301.75-31 chr6 54726203 54726465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120437 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 157.25-89 chr21 20809287 20809499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6285 NR_109787 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 210.75-75 chr5 27436915 27437188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35241 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 239.5-45 chr21 16594179 16594477 + 1.25 NA intron (NR_136548, intron 2 of 3) intron (NR_136548, intron 2 of 3) 4091 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 427.5 chr1 116192980 116193644 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81557 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 231.5-102 chr8 128553471 128553781 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 11053 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 133.5-8 chr1 79409967 79410083 + 1.25 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -403295 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 180.75-56 chr18 22977482 22977731 + 1.25 NA intron (NM_002894, intron 6 of 18) L3b|LINE|CR1 43730 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 271.75-12 chr14 102576005 102576355 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16469 NM_015156 23186 Hs.510521 NM_015156 ENSG00000089902 RCOR1 COREST|RCOR REST corepressor 1 protein-coding 240.5-101 chr7 89291887 89292208 + 1.25 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) L1M1|LINE|L1 -496310 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 206.5-35 chr18 7673839 7674155 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) L2|LINE|L2 106681 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 296.75-36 chr8 141887402 141887707 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -101241 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 422-12 chr7 87058744 87059372 + 1.25 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) intron (NM_001142749, intron 1 of 21) 596 NM_001142749 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 241.25-5 chr1 86650128 86650458 + 1.25 NA non-coding (NR_024604, exon 14 of 15) non-coding (NR_024604, exon 14 of 15) 16017 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 325.5-25 chr3 120864568 120865025 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28439 NR_135570 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 163-97 chr5 78026932 78027158 + 1.25 NA intron (NM_003664, intron 24 of 26) L1ME3Cz|LINE|L1 68798 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 395.5-7 chr14 72520982 72521478 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 15 of 16) L1MC5|LINE|L1 4410 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 341.75-10 chr16 8051248 8051875 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 538277 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 165-123 chr6 160973633 160973794 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18014 NM_006724 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 243-5 chr1 224736882 224737172 + 1.25 NA intron (NM_001322303, intron 5 of 5) intron (NM_001322303, intron 5 of 5) 120710 NM_152495 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 186.75-100 chr6 135949272 135949458 + 1.25 NA intron (NM_018945, intron 2 of 12) intron (NM_018945, intron 2 of 12) 97664 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 127.75-211 chr9 108133492 108133620 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -643787 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 228.75-13 chr12 69570699 69571068 + 1.25 NA intron (NM_001278354, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR -13840 NR_037476 100500868 NR_037476 ENSG00000283677 MIR3913-2 mir-3913-2 microRNA 3913-2 ncRNA 152.5-165 chr6 45792060 45792210 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 145462 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 310-4 chr12 3895969 3896248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22660 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 144.25-39 chr11 32954823 32954983 + 1.25 NA intron (NM_001076786, intron 5 of 12) intron (NM_001076786, intron 5 of 12) -60975 NM_001077242 91614 Hs.280990 NM_139160 ENSG00000121690 DEPDC7 TR2|dJ85M6.4 DEP domain containing 7 protein-coding 142.5-169 chr5 60605852 60606071 + 1.25 NA intron (NM_001145208, intron 7 of 9) intron (NM_001145208, intron 7 of 9) 94205 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 221.25-52 chr3 106570707 106570998 + 1.25 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL 669786 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 193.75-115 chr8 28324321 28324568 + 1.25 NA intron (NM_006228, intron 1 of 3) intron (NM_006228, intron 1 of 3) 7176 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 179.5-130 chr3 167611765 167611980 + 1.25 NA intron (NM_001366158, intron 2 of 15) L1M1|LINE|L1 42070 NM_001348952 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 316.5-33 chr6 65498288 65498700 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) 81310 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 185.75-112 chr7 7020181 7020414 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 46748 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 300.75-44 chr7 131659848 131660233 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -103412 NM_005397 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 266.25-18 chr17 59849553 59849921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8471 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 152.75-36 chr11 81068088 81068262 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -305372 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 225.5-7 chr1 156606927 156607133 + 1.25 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -5543 NM_182679 54865 Hs.193832 NM_015590 ENSG00000160818 GPATCH4 GPATC4 G-patch domain containing 4 protein-coding 210.25-90 chr9 123371630 123372004 + 1.25 NA intron (NM_173689, intron 8 of 12) intron (NM_173689, intron 8 of 12) 3038 NR_104603 286204 Hs.568340 NM_173689 ENSG00000148204 CRB2 FSGS9|VMCKD crumbs cell polarity complex component 2 protein-coding 233.25-17 chr11 81754115 81754349 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 136604 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 193.75-106 chr6 39624815 39625098 + 1.25 NA intron (NM_001289020, intron 5 of 21) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 100452 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 249-41 chr6 17804360 17804659 + 1.25 NA exon (NM_022113, exon 20 of 39) exon (NM_022113, exon 20 of 39) 97466 NR_134618 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 193.75-91 chr4 45355067 45355278 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -628538 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 260.5-69 chr9 97806354 97806743 + 1.25 NA intron (NR_147055, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 46532 NR_147055 101928337 NR_147055 ENSG00000236130 PTCSC2 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 2 ncRNA 157.5-213 chr8 99632163 99632331 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -95386 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 120.75-16 chr10 66533251 66533414 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -392704 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 144.75-130 chr5 8522819 8522953 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 61961 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 206.25-104 chr7 43562106 43562429 + 1.25 NA 3' UTR (NM_015052, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_015052, exon 30 of 30) -20841 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 195-99 chr9 69224631 69224953 + 1.25 NA intron (NM_001369870, intron 6 of 23) L1MC4|LINE|L1 19637 NM_001170416 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 128-84 chr2 181618871 181619060 + 1.25 NA intron (NR_027690, intron 1 of 11) intron (NR_027690, intron 1 of 11) 38140 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 176-24 chr14 97392228 97392465 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -66470 NR_110166 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 337-4 chr10 49782070 49782670 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19991 NM_001347823 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 300.5-50 chr8 92485652 92486049 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 169644 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 143.5-104 chr2 12477810 12477947 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -238994 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 283.5-48 chr6 65527390 65527768 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) ERVL-E-int|LTR|ERVL 52225 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 218.75-8 chr10 73134817 73135112 + 1.25 NA intron (NM_007265, intron 13 of 13) intron (NM_007265, intron 13 of 13) -8757 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 349.75-11 chr2 221551969 221552314 + 1.25 NA intron (NM_001363748, intron 3 of 17) intron (NM_001363748, intron 3 of 17) 20163 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 158.75-135 chr5 22541765 22541914 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) MIR3|SINE|MIR 311505 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 235.75-49 chr4 31090685 31090919 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -80342 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 187-103 chr8 126056856 126057144 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105803 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 119.25-13 chr1 167625295 167625439 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4826 NM_001322923 92241 Hs.493867 NM_052862 ENSG00000198771 RCSD1 CAPZIP|MK2S4 RCSD domain containing 1 protein-coding 239.5-47 chr3 50489205 50489537 + 1.25 NA intron (NM_001291101, intron 1 of 37) intron (NM_001291101, intron 1 of 37) 14263 NM_001174051 9254 Hs.476273 NM_006030 ENSG00000007402 CACNA2D2 CACNA2D calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 2 protein-coding 260-7 chr14 33727770 33728017 + 1.25 NA intron (NM_001165893, intron 5 of 10) intron (NM_001165893, intron 5 of 10) 18956 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 221.5-24 chr14 25006148 25006470 + 1.25 NA intron (NM_001351940, intron 1 of 6) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 42691 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 382-6 chr12 63117322 63117791 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 35254 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 144-5 chr1 85847946 85848186 + 1.25 NA intron (NM_152890, intron 38 of 59) (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -139633 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 164.25-74 chr2 162056237 162056561 + 1.25 NA intron (NM_001935, intron 2 of 25) intron (NM_001935, intron 2 of 25) 17816 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 420.25-10 chr5 28944929 28945322 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18255 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 154-57 chr19 47428202 47428423 + 1.25 NA 3' UTR (NM_015063, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_015063, exon 10 of 10) -6079 NM_001346148 56917 Hs.380923 NM_020160 ENSG00000105419 MEIS3 MRG2 Meis homeobox 3 protein-coding 192-81 chr4 156008101 156008278 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54323 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 121-199 chr9 87539005 87539193 + 1.25 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) intron (NM_004938, intron 2 of 25) -14355 NR_146781 100506897 Hs.656160 NR_146781 ENSG00000236709 DAPK1-IT1 - DAPK1 intronic transcript 1 ncRNA 158-86 chr20 49190658 49190805 + 1.25 NA intron (NM_001319135, intron 1 of 14) intron (NM_001319135, intron 1 of 14) -2361 NM_001322928 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 272.75-36 chr4 86396272 86396531 + 1.25 NA intron (NM_002753, intron 1 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie -25534 NM_001318068 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 124-174 chr8 134520730 134520869 + 1.25 NA intron (NM_020863, intron 13 of 15) intron (NM_020863, intron 13 of 15) -77272 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 140.5-133 chr20 43072590 43072707 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) 103905 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 271.75-14 chr16 56722141 56722367 + 1.25 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -7875 NM_014669 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 164-37 chr14 72551117 72551374 + 1.25 NA intron (NM_001370277, intron 19 of 19) intron (NM_001370277, intron 19 of 19) 34425 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 134-166 chr7 143198863 143199061 + 1.25 NA intron (NM_001130026, intron 8 of 10) HAL1ME|LINE|L1 15543 NM_176881 259285 Hs.553660 NM_176881 ENSG00000236398 TAS2R39 T2R39|T2R57 taste 2 receptor member 39 protein-coding 155.75-27 chr11 27480790 27480958 + 1.25 NA intron (NR_131170, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu -8084 NM_018490 55366 Hs.502176 NM_018490 ENSG00000205213 LGR4 BNMD17|GPR48 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4 protein-coding 288.25-5 chr12 39519677 39520071 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -76754 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 273.5-56 chr4 185085145 185085674 + 1.25 NA intron (NR_147059, intron 5 of 8) intron (NR_147059, intron 5 of 8) 33513 NR_147059 101928877 Hs.246506 NR_147059 ENSG00000250754 LINC02436 - long intergenic non-protein coding RNA 2436 ncRNA 445.25-6 chr5 14765622 14766188 + 1.25 NA intron (NM_054027, intron 2 of 11) intron (NM_054027, intron 2 of 11) 53211 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 134-66 chr16 20068960 20069150 + 1.25 NA intron (NM_001002911, intron 1 of 1) L1MD|LINE|L1 4723 NM_001318483 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 176-13 chr12 1900074 1900353 + 1.25 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 AluJr|SINE|Alu 18439 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 251.75-60 chr4 91200192 91200577 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 965353 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 115-38 chr12 17745412 17745611 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72212 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 233.5-61 chr20 11527927 11528189 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -254675 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 201.5-9 chr1 89782668 89782995 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38201 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 180.25-66 chr21 29129908 29130152 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001371372) promoter-TSS (NM_001371372) -614 NM_001371373 288.75-18 chr14 47088480 47088814 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 254599 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 298.5-33 chr6 88719209 88719482 + 1.25 NA intron (NM_001286428, intron 11 of 13) intron (NM_001286428, intron 11 of 13) -179976 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 115.5-85 chr16 35726619 35726777 + 1.25 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -19854 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 360-11 chr4 93718973 93719398 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -109568 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 153.5-125 chr22 33061995 33062227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3730 NM_003490 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 197.75-75 chr6 41411151 41411412 + 1.25 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu 75673 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 323.25-6 chr11 24578289 24578728 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) L1PA16|LINE|L1 81455 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 134.75-3 chr1 32371958 32372126 + 1.25 NA intron (NR_125352, intron 9 of 11) MER5A|DNA|hAT-Charlie 9503 NM_052841 81629 Hs.512763 NM_052841 ENSG00000162526 TSSK3 SPOGA3|STK22C|STK22D|TSK3 testis specific serine kinase 3 protein-coding 323.75-2 chr1 65275161 65275537 + 1.25 NA intron (NM_014787, intron 1 of 18) L1MEg|LINE|L1 10600 NM_014787 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 289.5-26 chr2 143493480 143493728 + 1.25 NA intron (NM_018460, intron 9 of 13) intron (NM_018460, intron 9 of 13) 364185 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 313-17 chr4 66975613 66976037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 446175 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 165.5-160 chr6 52488194 52488419 + 1.25 NA intron (NR_033327, intron 8 of 9) intron (NR_033327, intron 8 of 9) 67298 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 264.25-33 chr20 54099152 54099412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28517 NM_003657 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 131.75-78 chr15 101620317 101620437 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6038 NR_147041 101927505 Hs.578394 NR_147041 LINC02348 - long intergenic non-protein coding RNA 2348 ncRNA 290.75-39 chr3 143585904 143586306 + 1.25 NA intron (NM_173653, intron 6 of 15) intron (NM_173653, intron 6 of 15) 243859 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 196.5-63 chr17 7855403 7855626 + 1.25 NA TTS (NM_001348716) TTS (NM_001348716) 448 NM_001319941 92162 Hs.389669 NM_203411 ENSG00000167874 TMEM88 - transmembrane protein 88 protein-coding 226-30 chr17 63028669 63028882 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) MER34|LTR|ERV1 62540 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 175.75-56 chr18 3147201 3147571 + 1.25 NA intron (NM_019856, intron 13 of 36) L1ME1|LINE|L1 72582 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 228.25-83 chr8 115828251 115828507 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -159404 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 236.25-74 chr5 175786525 175786757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9892 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 284-10 chr13 104420943 104421280 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 995911 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 212.5-29 chr14 70587105 70587412 + 1.25 NA intron (NM_001284210, intron 5 of 6) MER68B|LTR|ERVL 13432 NM_001284209 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 269.75-3 chr1 163063525 163063809 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4939 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 213.5-85 chr4 18195741 18195968 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -173979 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 177.75-3 chr1 59626727 59627054 + 1.25 NA intron (NM_001350794, intron 10 of 14) L1MC4a|LINE|L1 106406 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 172.5-77 chr16 51812068 51812389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 49709 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 190.75-70 chr4 30410445 30410765 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -309764 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 115.75-112 chr2 135840987 135841183 + 1.25 NA intron (NM_005915, intron 16 of 16) intron (NM_005915, intron 16 of 16) -3901 NM_002299 3938 Hs.551506 NM_002299 ENSG00000115850 LCT LAC|LPH|LPH1 lactase protein-coding 259.5-43 chr16 27924101 27924472 + 1.25 NA intron (NM_001109763, intron 2 of 6) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -36129 NM_144675 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 315.75 chr1 77173755 77174185 + 1.25 NA intron (NM_005482, intron 3 of 10) MER57-int|LTR|ERV1 45460 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 155.25-74 chr16 58859515 58859739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125311 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 299.25-9 chr10 60719729 60720045 + 1.25 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) 13641 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 121.25-41 chr12 15084433 15084592 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67411 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 208.75-27 chr14 65690385 65690630 + 1.25 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) L1MC2|LINE|L1 219405 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 220-39 chr3 43564813 43565101 + 1.25 NA intron (NM_001346463, intron 8 of 12) intron (NM_001346463, intron 8 of 12) 56969 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 254-18 chr16 66052137 66052505 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -314370 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 217-11 chr10 72732299 72732575 + 1.25 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 11408 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 126.25-84 chr2 56596700 56596874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -411017 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 128.25-54 chr15 35903403 35903558 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -23376 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 112.5-245 chr9 84609595 84609763 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -58779 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 428.75-4 chr14 42756041 42756427 + 1.25 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 1149378 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 176-78 chr8 139228738 139228943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -314799 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 207.75-102 chr5 128491772 128492036 + 1.25 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) intron (NM_001999, intron 5 of 64) 46341 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 140.75-96 chr2 133678295 133678484 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109926 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 232.5-69 chr3 87219968 87220285 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6151 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 292.25-17 chr15 81463984 81464238 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -89898 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 183.75-98 chr5 90131223 90131511 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -114647 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 286.25-35 chr9 100157717 100158017 + 1.25 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) intron (NR_134606, intron 3 of 16) 58624 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 253.75-6 chr12 11510219 11510589 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23726 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 177.25-119 chr5 76251687 76251978 + 1.25 NA intron (NM_014979, intron 4 of 12) intron (NM_014979, intron 4 of 12) -151453 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 135-6 chr1 99942399 99942526 + 1.25 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 -27534 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 254.75-2 chr1 179733401 179733677 + 1.25 NA intron (NM_001329716, intron 1 of 6) intron (NM_001329716, intron 1 of 6) 3351 NM_001329716 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 201.25-8 chr1 222828873 222829128 + 1.25 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) intron (NM_032890, intron 1 of 9) 13961 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 190.5-42 chr13 94399396 94399670 + 1.25 NA intron (NM_005708, intron 8 of 8) intron (NM_005708, intron 8 of 8) 80149 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 174.75-32 chr14 45559685 45559954 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 155783 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 406-3 chr14 64169447 64169879 + 1.25 NA intron (NM_015180, intron 93 of 114) intron (NM_015180, intron 93 of 114) -44481 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 143.75-81 chr19 57293355 57293580 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330622, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001330622, exon 3 of 3) 12982 NM_006635 10794 Hs.99971 NM_006635 ENSG00000197714 ZNF460 HZF8|ZNF272 zinc finger protein 460 protein-coding 162-3 chr1 80491170 80491343 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44499 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 167-2 chr1 27819826 27820036 + 1.25 NA intron (NM_177424, intron 8 of 8) intron (NM_177424, intron 8 of 8) -10851 NM_002713 5511 Hs.533474 NM_002713 ENSG00000117751 PPP1R8 ARD-1|ARD1|NIPP-1|NIPP1|PRO2047 protein phosphatase 1 regulatory subunit 8 protein-coding 129.5-62 chr14 37577253 37577410 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 17918 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 208.5-86 chr3 79990381 79990632 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -222508 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 143.25-53 chr14 94467010 94467160 + 1.25 NA intron (NM_001284276, intron 4 of 5) intron (NM_001284276, intron 4 of 5) 9112 NM_001042518 327657 Hs.317970 NM_175739 ENSG00000170054 SERPINA9 GCET1|SERPINA11|SERPINA11b serpin family A member 9 protein-coding 147-93 chr3 41116671 41116839 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82750 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 138.25-122 chr3 127250933 127251069 + 1.25 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL 37045 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 192.75-89 chr3 118314848 118315223 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -326733 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 172.75-7 chr1 177782569 177782877 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82199 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 128.5-194 chr6 100647758 100647916 + 1.25 NA intron (NM_006828, intron 20 of 41) intron (NM_006828, intron 20 of 41) -184162 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 287.25-50 chr8 92588152 92588529 + 1.25 NA intron (NR_125827, intron 3 of 4) intron (NR_125827, intron 3 of 4) 67154 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 236-50 chr4 88099802 88100085 + 1.25 NA intron (NM_001257386, intron 11 of 15) intron (NM_001257386, intron 11 of 15) 58696 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 320.5-48 chr8 140409021 140409372 + 1.25 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) L1MC4|LINE|L1 48548 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 149-54 chr2 72350499 72350811 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) intron (NR_135774, intron 17 of 19) -202793 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 169.5-178 chr8 137673104 137673344 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -259636 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 229-35 chr2 75552585 75552895 + 1.25 NA intron (NM_001369524, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 8199 NM_001369525 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 171.5-68 chr19 38571944 38572208 + 1.25 NA exon (NM_000540, exon 95 of 106) exon (NM_000540, exon 95 of 106) -24271 NR_134907 105372397 Hs.570011 NR_134907 ENSG00000267291 LOC105372397 - uncharacterized LOC105372397 ncRNA 130.25-188 chr7 55324647 55324767 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -40741 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 419-11 chr7 112608392 112608885 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9427 NR_110159 100996249 Hs.561749 NR_110159 LOC100996249 - uncharacterized LOC100996249 ncRNA 276-56 chr9 37749401 37749720 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4243 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 144.5-192 chr6 136080069 136080234 + 1.25 NA intron (NM_018945, intron 2 of 12) intron (NM_018945, intron 2 of 12) -7324 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 147.25-38 chr15 57448591 57448931 + 1.25 NA intron (NM_032866, intron 4 of 18) L1ME3|LINE|L1 72256 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 246.5-69 chr7 53112673 53113070 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77238 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 224.5-96 chr6 148605420 148605700 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 96409 NM_001346509 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 221-29 chr17 69787366 69787707 + 1.25 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -174171 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 200.75-56 chr2 106129594 106129840 + 1.25 NA exon (NM_001253875, exon 7 of 15) exon (NM_001253875, exon 7 of 15) 9164 NM_001253876 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 305.75-22 chr6 34026001 34026352 + 1.25 NA intron (NM_000841, intron 10 of 10) intron (NM_000841, intron 10 of 10) -26125 NR_031681 100302123 NR_031681 ENSG00000221697 MIR1275 MIRN1275|hsa-mir-1275|mir-1275 microRNA 1275 ncRNA 226-3 chr1 106170722 106170923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -142569 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 114.5-38 chr10 63491440 63491597 + 1.25 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -25541 NM_032776 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 204.5-81 chr22 27970685 27970967 + 1.25 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1ME2|LINE|L1 -50214 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 170.5-62 chr14 56066311 56066588 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -51962 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 186.25-25 chr12 47948508 47948675 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14956 NM_024056 79022 Hs.596726 NM_024056 ENSG00000134291 TMEM106C - transmembrane protein 106C protein-coding 200-74 chr5 127661615 127661876 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8730 NM_001127385 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 182.5-38 chr12 33092024 33092176 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -195254 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 218.75-79 chr6 108662824 108663059 + 1.25 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) intron (NM_201559, intron 2 of 3) -88713 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 241-3 chr1 229272071 229272405 + 1.25 NA intron (NM_001271998, intron 1 of 5) intron (NM_001271998, intron 1 of 5) -1084 NR_149313 105373159 NR_149312 LOC105373159 - uncharacterized LOC105373159 ncRNA 243.75-26 chr15 46182956 46183376 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 477971 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 189.5 chr1 31769713 31769947 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5490 NM_001294335 576 Hs.524138 NM_001294335 ENSG00000121753 ADGRB2 BAI2 adhesion G protein-coupled receptor B2 protein-coding 234.5-100 chr8 127181870 127182244 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 15570 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 195.25-90 chr8 38302690 38302971 + 1.25 NA intron (NM_023034, intron 14 of 23) AluJr|SINE|Alu -33598 NM_001354454 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 132-77 chr18 479838 480130 + 1.25 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 20717 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 256.5-76 chr8 52073643 52073900 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -120591 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 161.75-60 chr2 45086376 45086587 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -77029 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 340.5-5 chr10 15439176 15439826 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68212 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 141.25-84 chr2 101758312 101758447 + 1.25 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) MER8|DNA|TcMar-Tigger 60672 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 142.5-68 chr15 63754349 63754590 + 1.25 NA intron (NM_003922, intron 7 of 77) intron (NM_003922, intron 7 of 77) 79479 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 279.75-40 chr4 115527565 115527962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -414143 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 432 chr12 4551809 4552298 + 1.25 NA intron (NM_006479, intron 6 of 8) L1ME4a|LINE|L1 -10155 NM_001371301 128.5-188 chr6 52142966 52143153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1290 NR_029713 406989 NR_029713 ENSG00000207604 MIR206 MIRN206|miRNA206|mir-206 microRNA 206 ncRNA 262.75-13 chr12 110727351 110727709 + 1.25 NA intron (NM_002710, intron 3 of 6) intron (NM_002710, intron 3 of 6) 15361 NM_001244974 5501 Hs.79081 NM_002710 ENSG00000186298 PPP1CC PP-1G|PP1C|PPP1G protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma protein-coding 119.75-72 chr16 82354742 82354852 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -184573 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 186.25-101 chr6 62130793 62131011 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 155323 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 206.75-79 chr6 100820472 100820710 + 1.25 NA intron (NM_006828, intron 4 of 41) L1MB7|LINE|L1 60738 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 361-12 chr16 83017686 83018102 + 1.25 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) -27596 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 145.25-55 chr17 52104201 52104430 + 1.25 NA intron (NM_001082533, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 54399 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 191-48 chr20 61440229 61440579 + 1.25 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -59017 NM_001252338 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 254.25-23 chr14 55505821 55506173 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65452 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 141.75-124 chr3 197917558 197917735 + 1.25 NA intron (NM_001323030, intron 7 of 7) intron (NM_001323030, intron 7 of 7) 32279 NM_001134435 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 229.25-34 chr17 62839739 62840073 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 31404 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 247.5-39 chr2 98661511 98661841 + 1.25 NA intron (NM_001160154, intron 2 of 12) intron (NM_001160154, intron 2 of 12) 1797 NM_001160154 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 191.5-50 chr16 7721909 7722149 + 1.25 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 389184 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 168-43 chr13 85540424 85540614 + 1.25 NA intron (NR_046989, intron 2 of 3) intron (NR_046989, intron 2 of 3) 176916 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 184-85 chr7 38490250 38490542 + 1.25 NA intron (NM_001635, intron 5 of 20) intron (NM_001635, intron 5 of 20) 140977 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 189-6 chr1 85405239 85405420 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001330655) promoter-TSS (NM_001330655) -823 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 245-49 chr4 69028194 69028482 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7942 NM_001144767 7365 Hs.201634 NM_001075 ENSG00000109181 UGT2B10 UDPGT2B10 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B10 protein-coding 227.75-33 chr2 49696644 49697070 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 277346 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 474.25-5 chr7 30748707 30749396 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3084 NM_006774 11185 Hs.632629 NM_006774 ENSG00000241644 INMT TEMT indolethylamine N-methyltransferase protein-coding 322.5-25 chr4 136388148 136388503 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -474645 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 313.25-3 chr10 120510062 120510651 + 1.25 NA intron (NM_001318169, intron 2 of 2) intron (NM_001318169, intron 2 of 2) 53402 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 300-6 chr10 44423567 44423950 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -38661 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 234.75-58 chr4 37397494 37397716 + 1.25 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -56320 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 315.5 chr1 189574602 189575031 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 901194 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 179.5-128 chr3 146900310 146900518 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21509 NR_135561 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 161-33 chr13 108443781 108443952 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -152039 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 272.75-24 chr2 119553799 119554209 + 1.25 NA intron (NR_073132, intron 3 of 24) intron (NR_073132, intron 3 of 24) 9555 NR_073132 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 288-23 chr15 26425514 26425781 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 203443 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 134.5-98 chr2 81778440 81778599 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -311573 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 193.25-6 chr1 198119213 198119430 + 1.25 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -37677 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 221.75-17 chr12 29995673 29996055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -211105 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 223.5-67 chr2 226198178 226198451 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 55520 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 521.5 chr4 32243522 32244377 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -107089 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 153.75-2 chr1 45171042 45171197 + 1.25 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 35486 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 191.25 chr1 56102920 56103076 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 157911 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 233.75-66 chr6 22950285 22950573 + 1.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -232505 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 153.75-29 chr12 27415450 27415594 + 1.25 NA intron (NM_001248003, intron 12 of 14) intron (NM_001248003, intron 12 of 14) 31112 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 287.25-29 chr2 238751611 238752020 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 96092 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 123-144 chr4 32673383 32673504 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 322405 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 215.5-105 chr8 78028117 78028404 + 1.25 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -488080 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 226-71 chr8 131720653 131720955 + 1.25 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -183289 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 204-58 chr4 84349526 84349851 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -50519 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 152.75-161 chr9 77124506 77124862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52761 NM_015186 23230 Hs.459790 NM_015186 ENSG00000197969 VPS13A CHAC|CHOREIN vacuolar protein sorting 13 homolog A protein-coding 207.75-9 chr1 181013005 181013277 + 1.25 NA intron (NM_005819, intron 1 of 7) intron (NM_005819, intron 1 of 7) 9729 NM_005819 10228 Hs.518417 NM_005819 ENSG00000135823 STX6 - syntaxin 6 protein-coding 298.25-30 chr7 26499437 26499707 + 1.25 NA non-coding (NR_148504, exon 8 of 8) non-coding (NR_148504, exon 8 of 8) 39253 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 133-171 chr8 78894053 78894237 + 1.25 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 56616 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 224.75-65 chr7 26174797 26175062 + 1.25 NA intron (NM_004289, intron 1 of 3) intron (NM_004289, intron 1 of 3) 22731 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 237.75-65 chr5 73656405 73656675 + 1.25 NA intron (NM_001177693, intron 1 of 35) L2b|LINE|L2 30382 NM_001177693 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 372.5-22 chr8 47472003 47472508 + 1.25 NA intron (NM_001080394, intron 8 of 19) intron (NM_001080394, intron 8 of 19) -181833 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 367.5-18 chr6 127633473 127633906 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56515 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 180.5-11 chr10 36764835 36765045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -360917 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 214-40 chr22 23092812 23093103 + 1.25 NA intron (NM_002073, intron 1 of 2) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 22438 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 140.25-166 chr6 104205213 104205375 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 654252 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 216.25-102 chr9 81854015 81854227 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -59316 NR_026851 347127 Hs.215235 NM_198509 ENSG00000240632 SPATA31D5P FAM75D5|FAM75D5P SPATA31 subfamily D member 5, pseudogene pseudo 284.75-39 chr7 131161962 131162190 + 1.25 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) AluSz|SINE|Alu 51982 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 176-73 chr8 106580064 106580270 + 1.25 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) L1MB2|LINE|L1 -77641 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 142-33 chr11 85845960 85846276 + 1.25 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -8983 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 228.75-14 chr12 119316222 119316433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12947 NR_024246 144742 Hs.524782 NR_024246 ENSG00000281196 LINC00934 - long intergenic non-protein coding RNA 934 ncRNA 292-6 chr11 6267474 6267910 + 1.25 NA intron (NM_001318029, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 7854 NM_001318029 887 Hs.203 NM_176875 ENSG00000110148 CCKBR CCK-B|CCK2R|GASR cholecystokinin B receptor protein-coding 152.75-80 chr2 10930002 10930211 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 18172 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 159-82 chr4 189006740 189007046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 230236 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 194.5-91 chr3 88972024 88972475 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -135372 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 313.25-5 chr11 91243582 91243898 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -374538 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 138-168 chr8 136970635 136970858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 439948 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 280.25-12 chr10 130143942 130144252 + 1.25 NA intron (NM_006541, intron 1 of 10) intron (NM_006541, intron 1 of 10) 7688 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 268.75-10 chr13 58688754 58689125 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -455822 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 234.75-70 chr6 150952932 150953267 + 1.25 NA intron (NM_001350486, intron 16 of 27) intron (NM_001350486, intron 16 of 27) -53909 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 156-167 chr9 107343701 107343941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59052 NM_001244713 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 298.75-4 chr1 48569024 48569527 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 11 of 12) L2b|LINE|L2 -97067 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 269.75-55 chr8 87127142 87127553 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1ME1|LINE|L1 260932 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 270-20 chr17 62348594 62348937 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -21453 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 227.75-22 chr14 26806140 26806514 + 1.25 NA non-coding (NR_147061, exon 7 of 7) non-coding (NR_147061, exon 7 of 7) -3021 NR_110556 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 270.25-36 chr5 10560604 10561082 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3227 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 284.5-9 chr11 105487951 105488225 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -121985 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 263-38 chr5 2105746 2105981 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 206338 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 160.25-143 chr6 114128875 114129071 + 1.25 NA intron (NR_125845, intron 6 of 9) intron (NR_125845, intron 6 of 9) -66096 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 342-15 chr8 133783952 133784336 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -6792 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 306.5-11 chr12 39615032 39615318 + 1.25 NA intron (NM_005164, intron 2 of 9) intron (NM_005164, intron 2 of 9) 4628 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 245-66 chr7 116852151 116852619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10202 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 164-26 chr12 40875483 40875758 + 1.25 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) L1MD1|LINE|L1 -32737 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 250-25 chr2 117472073 117472433 + 1.25 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -342438 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 232.75 chr1 48055048 48055426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57852 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 249.5-33 chr15 64126466 64126749 + 1.25 NA intron (NM_003099, intron 6 of 14) AluSc|SINE|Alu -25124 NR_073534 79856 Hs.744250 NM_024798 ENSG00000157734 SNX22 - sorting nexin 22 protein-coding 136.5-125 chr2 201025309 201025563 + 1.25 NA intron (NM_001321624, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 46235 NM_173822 285172 Hs.24701 NM_173822 ENSG00000155744 FAM126B HYCC2 family with sequence similarity 126 member B protein-coding 237.75-15 chr13 37100047 37100346 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5468 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 179.25-43 chr12 50289184 50289435 + 1.25 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -5789 NM_016357 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 134-76 chr17 80147169 80147309 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_014740) promoter-TSS (NM_014740) -111 NM_014740 9775 Hs.389649 NM_014740 ENSG00000141543 EIF4A3 DDX48|Fal1|MUK34|NMP265|NUK34|RCPS|eIF-4A-III|eIF4A-III|eIF4AIII eukaryotic translation initiation factor 4A3 protein-coding 192.5-145 chr9 122178414 122178653 + 1.25 NA intron (NM_001286828, intron 3 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 18625 NM_198469 254956 Hs.71428 NM_198469 ENSG00000185681 MORN5 C9orf113|C9orf18 MORN repeat containing 5 protein-coding 293-36 chr7 7606292 7606616 + 1.25 NA intron (NM_001370078, intron 8 of 8) intron (NM_001370078, intron 8 of 8) -34298 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 164.75-126 chr6 72617520 72617806 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4180 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 123-153 chr4 179419362 179419606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1511548 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 319.5-18 chr14 79710122 79710634 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 18 of 20) intron (NR_073547, intron 18 of 20) 430998 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 169.5-92 chr21 16541992 16542146 + 1.25 NA intron (NR_136547, intron 2 of 2) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 2241 NR_029480 406885 NR_029480 ENSG00000199030 MIRLET7C LET7C|MIRNLET7C|hsa-let-7c|let-7c microRNA let-7c ncRNA 278-39 chr9 95844657 95845162 + 1.25 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) intron (NR_023390, intron 2 of 2) -30782 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 181.5-14 chr10 72700527 72700737 + 1.25 NA intron (NM_001270680, intron 1 of 7) intron (NM_001270680, intron 1 of 7) 8013 NM_001270680 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 185.75-113 chr7 15287719 15287986 + 1.25 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) intron (NM_001004320, intron 12 of 12) 274163 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 112.25-196 chr7 19563506 19563706 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 141830 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 234.25-70 chr7 33709114 33709355 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -195681 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 133.25-59 chr15 69386656 69386828 + 1.25 NA intron (NM_001104554, intron 5 of 8) intron (NM_001104554, intron 5 of 8) -27607 NR_160296 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 268.25-20 chr18 9360806 9361130 + 1.25 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) HAL1|LINE|L1 26195 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 259-28 chr3 68319646 68319889 + 1.25 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) -180870 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 218.5-74 chr3 35385766 35386080 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) L1MEh|LINE|L1 8100 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 181.25-86 chr3 128088860 128089026 + 1.25 NA intron (NM_003707, intron 8 of 10) intron (NM_003707, intron 8 of 10) 13133 NR_046645 100874089 Hs.581603 NR_046645 ENSG00000239608 RUVBL1-AS1 - RUVBL1 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-194 chr6 57054308 57054489 + 1.25 NA exon (NM_001286274, exon 3 of 3) exon (NM_001286274, exon 3 of 3) 7651 NM_001286276 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 144.25-125 chr3 10850042 10850263 + 1.25 NA intron (NM_014229, intron 5 of 13) intron (NM_014229, intron 5 of 13) 33924 NM_014229 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 185.75-86 chr3 29824373 29824669 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 109635 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 202.5-142 chr8 79917019 79917377 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -45461 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 275.5-65 chr8 68610535 68610772 + 1.25 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) intron (NR_146186, intron 7 of 12) -279162 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-162 chr6 108705905 108706101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45651 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 217-9 chr10 66156118 66156464 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MD1|LINE|L1 584866 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 294-26 chr4 25177160 25177462 + 1.25 NA intron (NR_037934, intron 1 of 1) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 16639 NR_037934 285540 Hs.732278 NR_037934 SEPSECS-AS1 - SEPSECS antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 177.75-44 chr14 63691154 63691424 + 1.25 NA intron (NM_030791, intron 2 of 2).2 intron (NM_030791, intron 2 of 2).2 36776 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 339-26 chr6 6128883 6129316 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40235 NR_049863 100847034 NR_049863 ENSG00000283616 MIR5683 - microRNA 5683 ncRNA 307-13 chr16 66518369 66518929 + 1.25 NA intron (NR_073520, intron 5 of 8) L1ME4a|LINE|L1 31473 NR_073520 7084 Hs.512619 NM_004614 ENSG00000166548 TK2 MTDPS2|MTTK|PEOB3|SCA31 thymidine kinase 2 protein-coding 170-25 chr13 92161401 92161835 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 190589 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 206.75-15 chr12 31653908 31654174 + 1.25 NA intron (NM_001135864, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 -5162 NM_173802 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 185-85 chr8 37262896 37263062 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 230934 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 216.25-94 chr7 77249672 77250000 + 1.25 NA intron (NM_020879, intron 4 of 18) L1MCa|LINE|L1 -50017 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 169.5-40 chr12 101632903 101633119 + 1.25 NA intron (NM_206821, intron 6 of 28) AluSz6|SINE|Alu 38040 NM_002465 4604 Hs.654589 NM_002465 ENSG00000196091 MYBPC1 LCCS4|MYBPCC|MYBPCS myosin binding protein C, slow type protein-coding 251 chr1 9730832 9731121 + 1.25 NA intron (NM_001009566, intron 18 of 18) intron (NM_001009566, intron 18 of 18) 39509 NM_001350235 5293 Hs.518451 NM_005026 ENSG00000171608 PIK3CD APDS|IMD14|P110DELTA|PI3K|p110D phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta protein-coding 381.25-3 chr14 74466014 74466474 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13960 NR_039858 100616211 NR_039858 ENSG00000283944 MIR4709 mir-4709 microRNA 4709 ncRNA 235.5-45 chr2 29346135 29346386 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 5 of 28) MIRc|SINE|MIR -122360 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 147.25-157 chr9 36770203 36770327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53334 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 296-21 chr2 45622192 45622506 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -11082 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 148.75-115 chr3 171778503 171778723 + 1.25 NA intron (NM_002662, intron 1 of 26) L2a|LINE|L2 31870 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 188-13 chr11 75432847 75433094 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2341 NM_001039548 283212 Hs.292451 NM_173583 ENSG00000149243 KLHL35 - kelch like family member 35 protein-coding 157.75-93 chr2 169644206 169644370 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 50117 NM_001085447 129881 Hs.370111 NM_001085447 ENSG00000154479 CCDC173 C2orf77 coiled-coil domain containing 173 protein-coding 151-123 chr6 156391522 156391777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12899 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 200.75-30 chr14 69996088 69996330 + 1.25 NA intron (NM_001034852, intron 7 of 11) (ATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18076 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 118-183 chr8 81162028 81162171 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50031 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 257.75-39 chr5 32571242 32571473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14200 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 220.5-82 chr3 188180077 188180320 + 1.25 NA non-coding (NR_024413, exon 1 of 1) non-coding (NR_024413, exon 1 of 1) 1655 NR_024413 401105 Hs.679026 NM_207488 ENSG00000279891 FLJ42393 AVPC1948 uncharacterized LOC401105 ncRNA 312.5-4 chr10 43565959 43566445 + 1.25 NA intron (NM_001099283, intron 1 of 1) intron (NM_001099283, intron 1 of 1) 2257 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 258-15 chr14 66478033 66478349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8180 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 187-78 chr5 31160318 31160601 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -33227 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 235.75 chr1 61296253 61296591 + 1.25 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) intron (NM_001134673, intron 3 of 10) -42904 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 209-51 chr3 167576934 167577187 + 1.25 NA intron (NM_001348951, intron 7 of 18) intron (NM_001348951, intron 7 of 18) 76882 NM_001348952 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 257-13 chr14 46672773 46673070 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21140 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 118.5-122 chr3 6200552 6200739 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 604804 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 145-108 chr4 55336532 55336859 + 1.25 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -9547 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 236.25-19 chr11 121472569 121472819 + 1.25 NA intron (NM_003105, intron 2 of 47) intron (NM_003105, intron 2 of 47) 20380 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 171-115 chr5 160732032 160732254 + 1.25 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) L1MEf|LINE|L1 -46752 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 224.5-11 chr10 17858935 17859377 + 1.25 NA intron (NM_002438, intron 9 of 29) L1MEi|LINE|L1 14049 NR_030167 574445 NR_030167 ENSG00000207938 MIR511 MIR511-1|MIR511-2|MIRN511-1|MIRN511-2|hsa-mir-511|hsa-mir-511-2|mir-511 microRNA 511 ncRNA 248-55 chr4 90415175 90415511 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 4 of 7) intron (NM_207491, intron 4 of 7) 180312 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 202-22 chr12 133148139 133148416 + 1.25 NA intron (NM_015394, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 17650 NM_015394 7556 Hs.573983 NM_015394 ENSG00000256223 ZNF10 KOX1 zinc finger protein 10 protein-coding 238.5-95 chr9 398901 399191 + 1.25 NA intron (NM_001193536, intron 24 of 46) MIR1_Amn|SINE|MIR -71245 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 236-30 chr2 64458995 64459235 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014181, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014181, exon 5 of 5) 4953 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 271.5-70 chr5 108325737 108326263 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 56098 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 117.5-137 chr22 40127899 40128035 + 1.25 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) intron (NM_001024843, intron 3 of 23) -49958 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 164-53 chr18 6836592 6836849 + 1.25 NA intron (NM_001010000, intron 1 of 16) MER54A|LTR|ERVL 2235 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 350.5-6 chr1 180739434 180739800 + 1.25 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) L1MEf|LINE|L1 107595 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 165.75-170 chr8 129811345 129811521 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -24809 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 221.5-79 chr6 36873988 36874319 + 1.25 NA intron (NM_001286636, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 650 NM_016059 51645 Hs.27693 NM_016059 ENSG00000137168 PPIL1 CGI-124|CYPL1|PPIase|hCyPX peptidylprolyl isomerase like 1 protein-coding 138.25-151 chr6 125816209 125816501 + 1.25 NA intron (NM_001199621, intron 2 of 14) MIRb|SINE|MIR 2503 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 371-19 chr5 94694576 94695123 + 1.25 NA exon (NM_032290, exon 21 of 21) exon (NM_032290, exon 21 of 21) 76180 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 151.75-10 chr1 162480639 162480878 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -16416 NM_001184763 127933 Hs.127310 NM_144624 ENSG00000152332 UHMK1 KIS|KIST|P-CIP2 U2AF homology motif kinase 1 protein-coding 307.25-7 chr12 46149963 46150319 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 116375 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 180-32 chr14 52899578 52899857 + 1.25 NA intron (NM_006832, intron 3 of 14) intron (NM_006832, intron 3 of 14) 51333 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 307.25-19 chr2 125585129 125585485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 532678 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 270-54 chr8 100050228 100050571 + 1.25 NA intron (NM_015668, intron 10 of 27) MER5B|DNA|hAT-Charlie 45817 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 291.5-2 chr1 20287906 20288542 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2651 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 234-22 chr2 126936481 126936871 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37786 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 229.75-31 chr2 12670078 12670284 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46691 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 223.25-22 chr15 71045502 71045839 + 1.25 NA intron (NM_017691, intron 15 of 15) intron (NM_017691, intron 15 of 15) -95779 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 158.25-135 chr7 42710513 42710681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4150 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 170.5-120 chr3 85589271 85589498 + 1.25 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 84325 NM_001256502 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 264.5-23 chr16 60998199 60998573 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 57380 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 196-97 chr8 108476356 108476570 + 1.25 NA intron (NR_138033, intron 7 of 9) intron (NR_138033, intron 7 of 9) 32839 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 147.75-99 chr3 33560700 33560879 + 1.25 NA intron (NM_001365634, intron 25 of 35) intron (NM_001365634, intron 25 of 35) 98890 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 301.5-19 chr15 78563879 78564182 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1490 NM_000745 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 210.75-105 chrX 34586081 34586267 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71111 NM_031442 83604 Hs.8769 NM_031442 ENSG00000147027 TMEM47 BCMP1|TM4SF10|VAB-9 transmembrane protein 47 protein-coding 149.25-121 chr3 158998171 158998299 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71017 NM_001042705 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 200.5-43 chr14 97512585 97512807 + 1.25 NA intron (NR_110166, intron 2 of 4) intron (NR_110166, intron 2 of 4) 53880 NR_110165 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 199-63 chr4 95088224 95088504 + 1.25 NA intron (NM_001256793, intron 1 of 10) intron (NM_001256793, intron 1 of 10) -3127 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 151.25-194 chr8 125973152 125973350 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -22054 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 182.75-83 chr3 188972757 188972966 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25222 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 179.5-142 chr5 19130949 19131218 + 1.25 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 755189 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 350.25-15 chr18 12809927 12810405 + 1.25 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) AluSz|SINE|Alu 30796 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 185.5-19 chr10 100942407 100942625 + 1.25 NA intron (NM_018121, intron 11 of 19) intron (NM_018121, intron 11 of 19) 29553 NM_001136123 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 288-26 chr2 49847953 49848236 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 126109 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 195-25 chr14 61619517 61619744 + 1.25 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -48977 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 206-35 chr17 69810936 69811167 + 1.25 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) (ATAATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -150656 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 226.25-74 chr8 129897624 129897864 + 1.25 NA intron (NM_001353243, intron 3 of 13) FLAM_C|SINE|Alu 42067 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 177.25-47 chr14 80568957 80569143 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 20 of 24) UCON60|Unknown|Unknown -337993 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 221.5-9 chr10 58842969 58843179 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 128059 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 246.5-76 chr8 122897268 122897541 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 115749 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 194.75-95 chr8 86485771 86485985 + 1.25 NA intron (NM_016033, intron 4 of 9) intron (NM_016033, intron 4 of 9) 22808 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 182.25-87 chr4 172130886 172131275 + 1.25 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -317473 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 162.25-19 chr10 75044169 75044404 + 1.25 NA intron (NM_001003892, intron 1 of 2) intron (NM_001003892, intron 1 of 2) 14297 NM_001003892 338599 Hs.535090 NM_001003892 ENSG00000188716 DUPD1 DUSP27|FMDSP dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 protein-coding 252 chr1 68427838 68428139 + 1.25 NA TTS (NM_000329) TTS (NM_000329) 21966 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 411.75-7 chr4 170087153 170087681 + 1.25 NA intron (NM_182662, intron 3 of 13) intron (NM_182662, intron 3 of 13) 2539 NM_016228 51166 Hs.529735 NM_016228 ENSG00000109576 AADAT KAT2|KATII|KYAT2 aminoadipate aminotransferase protein-coding 319.25-5 chr14 70616405 70616824 + 1.25 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) L1MA6|LINE|L1 -15924 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 193.75-98 chr5 34959894 34960137 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 30422 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 181.5-43 chr14 77079356 77079605 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3289 NR_110553 102724190 Hs.562528 NR_110553 ENSG00000258819 LINC02289 - long intergenic non-protein coding RNA 2289 ncRNA 279.75-33 chr3 57119793 57120054 + 1.25 NA intron (NM_001318864, intron 3 of 13) MER102c|DNA|hAT-Charlie -40655 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 112.25-132 chr3 112412718 112412878 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 79642 NM_005944 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 265.5-64 chr8 140057860 140058210 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 42500 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 263.25-26 chr18 12702988 12703391 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_073537) promoter-TSS (NR_073537) 147 NM_020232 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 239-48 chr5 151598072 151598359 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29271 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 188.75-7 chr1 171505194 171505393 + 1.25 NA intron (NM_015172, intron 1 of 33) AluSp|SINE|Alu 19763 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 161.5-111 chr2 209260218 209260400 + 1.25 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -163738 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 233-29 chr2 41188129 41188412 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -675835 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 367.25-8 chr7 1909449 1909845 + 1.25 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) intron (NM_001013837, intron 17 of 18) 30924 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 258.25-42 chr5 26713505 26713793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 324937 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 220-26 chr18 6911674 6911911 + 1.25 NA intron (NM_001010000, intron 16 of 16) intron (NM_001010000, intron 16 of 16) 18077 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 219-2 chr1 60613220 60613459 + 1.25 NA intron (NR_146508, intron 1 of 7) L1MA7|LINE|L1 9346 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 253.25-17 chr12 23704445 23704761 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) intron (NM_152989, intron 9 of 17) -120017 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 218-57 chr5 91271113 91271343 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43174 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 143.75-16 chr10 58847214 58847389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 132286 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 214.25-57 chr3 125246524 125246770 + 1.25 NA intron (NM_001348434, intron 6 of 7) intron (NM_001348434, intron 6 of 7) -33882 NM_024628 84561 Hs.658514 NM_024628 ENSG00000221955 SLC12A8 CCC9 solute carrier family 12 member 8 protein-coding 280-14 chr12 7965120 7965602 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29174 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 129-37 chr11 75507270 75507501 + 1.25 NA intron (NM_030792, intron 1 of 16) MIR3|SINE|MIR 18188 NM_001351168 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 219.75-55 chr4 92378190 92378387 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 73889 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 350-17 chr5 126967135 126967530 + 1.25 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) L1MC5a|LINE|L1 63226 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 223.5-68 chr2 229039774 229040085 + 1.25 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) L1MC4|LINE|L1 192163 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 231.5-95 chr7 92240391 92240662 + 1.25 NA intron (NM_001013406, intron 4 of 16) intron (NM_001013406, intron 4 of 16) -5448 NM_019004 54467 Hs.83293 NM_019004 ENSG00000001629 ANKIB1 - ankyrin repeat and IBR domain containing 1 protein-coding 183.75-59 chr2 168148395 168148746 + 1.25 NA intron (NM_013233, intron 5 of 17) intron (NM_013233, intron 5 of 17) 99025 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 142.5-105 chr2 53723291 53723513 + 1.25 NA intron (NM_001201965, intron 4 of 8) L1PB1|LINE|L1 -44381 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 224.5-23 chr11 17332839 17333046 + 1.25 NA TTS (NM_005013) TTS (NM_005013) -18858 NM_001202439 374383 Hs.146274 NM_001009913 ENSG00000188211 NCR3LG1 B7-H6|B7H6|DKFZp686O24166 natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 protein-coding 199-92 chr9 87183582 87183782 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35038 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 286.75-20 chr2 63367358 63367632 + 1.25 NA intron (NM_001354045, intron 12 of 12) L1M5|LINE|L1 70512 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 201.75-114 chrX 88441640 88441917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -305447 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 330-16 chr2 204601127 204601665 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 55921 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 466.5-6 chr3 47360203 47360822 + 1.25 NA Intergenic LTR10F|LTR|ERV1 -20509 NM_015466 25930 Hs.25524 NM_015466 ENSG00000076201 PTPN23 HD-PTP|HDPTP|PTP-TD14 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 23 protein-coding 171-7 chr1 95607301 95607468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 97268 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 258.25-17 chr12 113726626 113726902 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 46919 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 236.25-77 chr6 75749381 75749773 + 1.25 NA intron (NM_001300899, intron 1 of 32) intron (NM_001300899, intron 1 of 32) 338 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 179.75-27 chr11 105686105 105686307 + 1.25 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) L1PA16|LINE|L1 75500 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 272.25-40 chr4 34291652 34291993 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -22075 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 164.75-10 chr1 155429079 155429243 + 1.25 NA intron (NM_018489, intron 5 of 27) L1ME3B|LINE|L1 -4019 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 147.5-53 chr12 85472127 85472272 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 191979 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 281.25-37 chr5 125785385 125785638 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 292250 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 293.25-42 chr9 131505811 131506317 + 1.25 NA intron (NM_001353198, intron 2 of 19) intron (NM_001353198, intron 2 of 19) 3146 NM_001353195 10585 Hs.522449 NM_007171 ENSG00000130714 POMT1 LGMD2K|LGMDR11|MDDGA1|MDDGB1|MDDGC1|RT protein O-mannosyltransferase 1 protein-coding 280-47 chr5 87895168 87895571 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 233327 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 230.75-17 chr12 19794472 19794763 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -220068 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 141.75-10 chr1 154856184 154856336 + 1.25 NA intron (NM_001204087, intron 1 of 8) intron (NM_001204087, intron 1 of 8) 3616 NM_170782 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 128-113 chr4 65006428 65006567 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1997 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 223.5-139 chrX 45770527 45770767 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23523 NR_029636 407007 NR_029636 ENSG00000207725 MIR222 MIRN222|miRNA222|mir-222 microRNA 222 ncRNA 229-43 chr20 46840846 46841064 + 1.25 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -53669 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 331.25-19 chr7 50482163 50482618 + 1.25 NA intron (NM_001242888, intron 7 of 12) L1M5|LINE|L1 -31984 NM_001287495 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 281.75-17 chr14 43474556 43474807 + 1.25 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 1032602 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 139-142 chr7 70001114 70001247 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) AluJb|SINE|Alu 402705 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 239.25-40 chr18 8749708 8750027 + 1.25 NA intron (NM_015210, intron 4 of 16) MIRb|SINE|MIR 32486 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 398-3 chr15 64713969 64714484 + 1.25 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -10945 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 274.5-3 chr1 160308535 160308836 + 1.25 NA intron (NM_001098398, intron 13 of 32) UCON29|DNA|PiggyBac? -8580 NR_002190 474338 Hs.621179 NR_002190 SUMO1P3 - SUMO1 pseudogene 3 pseudo 200.5-68 chr2 103149561 103149944 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -165323 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 276.75-6 chr12 45358093 45358492 + 1.25 NA intron (NM_001025356, intron 8 of 19) intron (NM_001025356, intron 8 of 19) 65602 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 205-49 chr3 40377834 40378193 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -9171 NM_001291961 956 Hs.441145 NM_001248 ENSG00000168032 ENTPD3 CD39L3|HB6|NTPDase-3 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 protein-coding 275.25-23 chr20 24051019 24051254 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62357 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 235-51 chr4 97980081 97980431 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 6 of 10) MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR 163220 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 238.75-70 chrX 70544982 70545248 + 1.25 NA intron (NM_001003811, intron 29 of 30) AluSz|SINE|Alu -89121 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-84 chr7 2750887 2751356 + 1.25 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 12019 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 343.25-18 chr8 84738672 84739165 + 1.25 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 32991 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 205.75-52 chr4 67789743 67789940 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33755 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 246.75-15 chr13 60066216 60066594 + 1.25 NA intron (NM_001258367, intron 2 of 25) intron (NM_001258367, intron 2 of 25) 53102 NR_051994 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 156.75-59 chr14 80499193 80499422 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 24 of 24) intron (NM_152446, intron 24 of 24) -268250 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 173-31 chr12 10114105 10114358 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -15246 NM_001297749 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 309.75-20 chr2 103116864 103117275 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -132640 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 142.75-94 chr2 38046180 38046361 + 1.25 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) L1MB7|LINE|L1 -9929 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 345.25-8 chr14 50734414 50734740 + 1.25 NA intron (NM_016350, intron 27 of 28) intron (NM_016350, intron 27 of 28) -66271 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 380.25-8 chr8 85603748 85604723 + 1.25 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 51441 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 295.5-40 chr4 84805889 84806150 + 1.25 NA intron (NM_014991, intron 15 of 67) intron (NM_014991, intron 15 of 67) -159597 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 189-36 chr14 59088327 59088640 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100184 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 290-13 chr12 69823608 69823895 + 1.25 NA TTS (NM_001024647) TTS (NM_001024647) -1476 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 181.5-167 chr9 83633587 83633784 + 1.25 NA intron (NM_001001551, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 10542 NM_001351535 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 302.75-2 chr11 24063925 24064568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -432807 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 290.5-29 chr4 31852547 31852825 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -144693 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 381.25-2 chr10 77618493 77619040 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 19042 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 198.5-137 chr7 138257332 138257655 + 1.25 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 133735 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 216.75-24 chr14 54433707 54434022 + 1.25 NA intron (NM_005776, intron 2 of 4) intron (NM_005776, intron 2 of 4) 7510 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 143-100 chr4 13001095 13001230 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 483178 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 125.75-100 chr2 136421960 136422086 + 1.25 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -303868 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 179-24 chr11 76231210 76231498 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24852 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 140.75-194 chr9 9285529 9285682 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) L2c|LINE|L2 427587 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 198.75-96 chr8 78954150 78954484 + 1.25 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 116788 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 188.75-111 chr8 48559309 48559550 + 1.25 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) L1MD2|LINE|L1 7862 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 241-26 chr2 116289066 116289465 + 1.25 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 945450 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 235-27 chr16 8267073 8267286 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 322659 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 287.5-2 chr1 51397384 51397943 + 1.25 NA intron (NM_001159969, intron 8 of 12) intron (NM_001159969, intron 8 of 12) 24432 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 156.75-121 chr4 65170514 65170800 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166157 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 152-129 chr6 13222445 13222619 + 1.25 NA intron (NM_001322308, intron 7 of 13) intron (NM_001322308, intron 7 of 13) 60910 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 160.75-143 chr7 28626711 28626899 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -59328 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 132.25-118 chr22 34953480 34953738 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 44307 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 284.25-16 chr2 138201619 138201951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 99901 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 349.5-11 chr20 45012836 45013209 + 1.25 NA intron (NM_001352385, intron 9 of 11) AluJo|SINE|Alu 46510 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 229-11 chr11 70735250 70735448 + 1.25 NA intron (NM_012309, intron 13 of 24) intron (NM_012309, intron 13 of 24) -73508 NM_133266 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 185.5-106 chr3 76132603 76132828 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -347166 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 125-116 chr4 76376949 76377087 + 1.25 NA intron (NM_001042784, intron 8 of 23) intron (NM_001042784, intron 8 of 23) 30287 NM_001042784 339965 Hs.529680 NM_178555 ENSG00000163749 CCDC158 - coiled-coil domain containing 158 protein-coding 222.25-21 chr14 71017206 71017545 + 1.25 NA intron (NM_014982, intron 11 of 35) L1MEc|LINE|L1 109916 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 331.5-5 chr10 100356056 100356524 + 1.25 NA intron (NM_005063, intron 4 of 5) AluJr|SINE|Alu 9057 NM_005063 6319 Hs.558396 NM_005063 ENSG00000099194 SCD FADS5|MSTP008|SCD1|SCDOS|hSCD1 stearoyl-CoA desaturase protein-coding 224-58 chr7 126755139 126755371 + 1.25 NA intron (NM_001371088, intron 7 of 7) intron (NM_001371088, intron 7 of 7) 302929 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 130-86 chr2 233935637 233935764 + 1.25 NA intron (NM_024080, intron 3 of 25) intron (NM_024080, intron 3 of 25) 18327 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 156.75-92 chr2 147375307 147375438 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -469145 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 135-66 chr18 29579532 29579675 + 1.25 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -719307 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 188.25-98 chr5 155456840 155457010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 443170 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 195.25-70 chr4 103341447 103341627 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -83505 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 181.5-28 chr12 4055947 4056161 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182606 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 152.25-144 chr7 13175112 13175335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 487590 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 140-178 chr9 107616651 107616818 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126965 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 217.75-62 chr5 151600330 151600617 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -31529 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 185-63 chr4 166589486 166589701 + 1.25 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 644833 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 281.5-41 chr5 35729016 35729352 + 1.25 NA intron (NM_024867, intron 21 of 36) LTR33|LTR|ERVL 111321 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 376-13 chr2 112824430 112824899 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12115 NM_000576 3553 Hs.126256 NM_000576 ENSG00000125538 IL1B IL-1|IL1-BETA|IL1F2 interleukin 1 beta protein-coding 293.5-24 chr2 11694322 11694654 + 1.25 NA intron (NM_001349207, intron 1 of 20) intron (NM_001349207, intron 1 of 20) 16944 NM_001261428 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 224.75-13 chr10 20109369 20109555 + 1.25 NA intron (NM_032812, intron 4 of 13) intron (NM_032812, intron 4 of 13) 293030 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 246-5 chr10 66197507 66197889 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L3|LINE|CR1 626273 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 162-93 chr5 121769218 121769373 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -82587 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 476.5-2 chr19 50262544 50263267 + 1.25 NA intron (NM_024729, intron 19 of 40) intron (NM_024729, intron 19 of 40) 59277 NM_024729 79784 Hs.467142 NM_024729 ENSG00000105357 MYH14 DFNA4|DFNA4A|FP17425|MHC16|MYH17|NMHC II-C|NMHC-II-C|PNMHH|myosin myosin heavy chain 14 protein-coding 154.25-39 chr13 65375220 65375531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -490672 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 331.25-10 chr20 58115437 58115835 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35266 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 170.75-137 chr8 106600101 106600375 + 1.25 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -57570 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 330.5-29 chr7 18798319 18798604 + 1.25 NA intron (NM_058176, intron 16 of 22) L1M4|LINE|L1 289191 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 130-94 chr21 23861746 23861933 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 459538 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 278.25-33 chr2 176243280 176243622 + 1.25 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -25991 NM_001006635 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 146.5-43 chr11 69118638 69118852 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35569 NR_036122 100422846 NR_036122 ENSG00000265539 MIR3164 - microRNA 3164 ncRNA 285.25-9 chr15 96518475 96519067 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 185006 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 188.75-61 chr2 144738334 144738649 + 1.25 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 70524 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 284.25-28 chr5 170655168 170655709 + 1.25 NA intron (NR_136214, intron 4 of 5) intron (NR_136214, intron 4 of 5) 26032 NR_136214 105377716 Hs.570880 NR_136214 ENSG00000253591 LOC105377716 - uncharacterized LOC105377716 ncRNA 152.75-105 chr3 33865750 33865932 + 1.25 NA intron (NM_001162429, intron 17 of 17) intron (NM_001162429, intron 17 of 17) 67211 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 207-87 chr8 91489720 91490102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 240592 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 190-87 chr9 75653072 75653348 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -237434 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 208-44 chr2 182795066 182795319 + 1.25 NA TTS (NM_018981) TTS (NM_018981) 71445 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 184.75-46 chr2 15369522 15369726 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 31 of 50) intron (NR_052013, intron 31 of 50) 191710 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 372-18 chr8 83152595 83153069 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 240728 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 436.75-5 chr22 28007222 28007737 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 14 of 22) intron (NM_001145418, intron 14 of 22) -86867 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 195-85 chr7 113443788 113444054 + 1.25 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -325339 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 292-5 chr10 72090404 72090796 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1568 NM_001134434 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 345.5-5 chr10 98209316 98209795 + 1.25 NA exon (NM_001351011, exon 6 of 11) exon (NM_001351011, exon 6 of 11) 58639 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 259.5-45 chr16 59036187 59036494 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -302024 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 266.75-3 chr1 150858167 150858505 + 1.25 NA intron (NM_001350225, intron 2 of 21) intron (NM_001350225, intron 2 of 21) 18263 NM_001197325 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 179.5-191 chr9 31047085 31047353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 334271 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 321.5-12 chr18 74399621 74399942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9667 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 269.25-48 chr6 149134786 149135071 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82996 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 162.25-72 chr2 23093340 23093527 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -291746 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 168.5-170 chr7 39054903 39055282 + 1.25 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) intron (NM_007252, intron 2 of 10) -41525 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 262.25-47 chr8 122323767 122324140 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 244691 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 172-101 chr7 97106638 97106966 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9791 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 134.25-156 chr6 46892293 46892402 + 1.25 NA intron (NM_001098518, intron 3 of 20) intron (NM_001098518, intron 3 of 20) -11124 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 163.5-136 chr3 185001131 185001369 + 1.25 NA intron (NM_001009921, intron 44 of 46) MER21B|LTR|ERVL 151810 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 197.5-57 chr18 2848713 2848896 + 1.25 NA intron (NM_032048, intron 2 of 7) intron (NM_032048, intron 2 of 7) 1798 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 120.5-124 chr2 139250807 139250960 + 1.25 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 353559 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 410.25-2 chr14 42915718 42916128 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 1309067 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 190.75-72 chr4 45240932 45241193 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -514428 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 197.5-142 chr7 24463089 24463487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -110164 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 278.75-18 chr2 30087070 30087452 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -59746 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 136-145 chr8 68920002 68920124 + 1.25 NA intron (NR_039986, intron 4 of 4) intron (NR_039986, intron 4 of 4) 184127 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 313.75-14 chr3 34671516 34671802 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 722364 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 325.75-13 chr2 64714757 64715165 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -61048 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 301.25-28 chr8 51605764 51606090 + 1.25 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 203518 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 212.75-102 chr9 100153559 100153820 + 1.25 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 54446 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 301.75-21 chr2 215530781 215531238 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77302 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 263.25-28 chr2 80441050 80441344 + 1.25 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 127818 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 210-84 chr6 102684362 102684587 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 1285489 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 171.5-100 chr3 31229892 31230065 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -68191 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 112.25-145 chr4 30529100 30529213 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -191213 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 203.25-7 chr1 94468079 94468295 + 1.25 NA intron (NM_002858, intron 4 of 22) L2c|LINE|L2 49798 NM_002858 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 347-10 chr15 97739917 97740489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 134226 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 260.75-40 chr22 30097097 30097388 + 1.25 NA intron (NM_001329457, intron 3 of 11) Charlie14a|DNA|hAT-Charlie 16778 NM_152510 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 255.75-43 chr5 145776546 145776858 + 1.25 NA intron (NM_205846, intron 5 of 6) intron (NM_205846, intron 5 of 6) 58640 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 250.75-28 chr2 218840798 218841076 + 1.25 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu -9134 NM_017431 53632 Hs.591634 NM_017431 ENSG00000115592 PRKAG3 AMPKG3 protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 3 protein-coding 211.75-98 chr8 118461750 118461972 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -159140 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 211.25-94 chr8 79183510 79183757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -148555 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 300.25-9 chr14 65094329 65094725 + 1.25 NA TTS (NR_045122) TTS (NR_045122) 4609 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 211.5-121 chr4 188237627 188237992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 98368 NM_178556 339976 Hs.348618 NM_178556 ENSG00000184108 TRIML1 RNF209 tripartite motif family like 1 protein-coding 141.5-120 chr2 201366783 201367079 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -9533 NM_139163 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 263.25-16 chr12 42297079 42297473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26583 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 265.5-66 chr9 84229412 84229857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 111124 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 184.5-80 chr2 174951485 174951721 + 1.25 NA intron (NM_001025201, intron 3 of 12) intron (NM_001025201, intron 3 of 12) 53650 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 288.25-16 chr2 205544883 205545225 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) intron (NM_205863, intron 20 of 21) -137446 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 114-5 chr1 53288510 53288665 + 1.25 NA intron (NM_004631, intron 3 of 18) intron (NM_004631, intron 3 of 18) 39483 NM_001018054 7804 Hs.280387 NM_004631 ENSG00000157193 LRP8 APOER2|HSZ75190|LRP-8|MCI1 LDL receptor related protein 8 protein-coding 231.25-22 chr15 65728970 65729259 + 1.25 NA exon (NM_001144823, exon 11 of 33) exon (NM_001144823, exon 11 of 33) -9782 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 281.25-47 chr8 122233531 122233795 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 334981 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 162-45 chr16 53248117 53248371 + 1.25 NA intron (NM_001352157, intron 15 of 37) AluY|SINE|Alu 39793 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 255-9 chr12 24280642 24280972 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 57536 NR_120473 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 180.5-79 chr2 227154576 227154809 + 1.25 NA intron (NM_000092, intron 1 of 47) intron (NM_000092, intron 1 of 47) 9867 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 351.75-18 chr5 103501804 103502172 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 39997 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 224.25-21 chr12 3469319 3469578 + 1.25 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 -21755 NM_019854 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 317-7 chr10 62200704 62201235 + 1.25 NA intron (NM_145307, intron 10 of 11) (TTAATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 67875 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 293.75-4 chr11 30917415 30917868 + 1.25 NA intron (NM_001367979, intron 25 of 38) intron (NM_001367979, intron 25 of 38) 75045 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 134.25-102 chr21 23346116 23346328 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 38613 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 248-52 chr3 191343566 191343936 + 1.25 NA intron (NM_178335, intron 1 of 11) intron (NM_178335, intron 1 of 11) -13215 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 299.25-46 chr7 91911087 91911437 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29600 NM_147185 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 277.25-30 chr3 115376115 115376444 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -228991 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 231.25-52 chr3 16207641 16208053 + 1.25 NA intron (NM_001319051, intron 3 of 9) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -8929 NM_001319052 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 164.25-87 chr20 59254578 59254835 + 1.25 NA exon (NM_178457, exon 5 of 5) exon (NM_178457, exon 5 of 5) -45905 NM_207032 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 303.25-8 chr12 115466638 115467014 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 681828 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 354.5-14 chr4 95476692 95477119 + 1.25 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR 72068 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 130.5-55 chr11 24643601 24643772 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 146633 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 345.25-11 chr2 126735201 126735619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 79252 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 359.75-12 chr2 111047541 111048022 + 1.25 NA intron (NM_001371254, intron 16 of 18) intron (NM_001371254, intron 16 of 18) 67807 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 188.5-37 chr14 52533766 52534031 + 1.25 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) MER76|LTR|ERVL 18607 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 192.5-90 chr3 40198880 40199105 + 1.25 NA intron (NM_001284424, intron 10 of 15) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 98981 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 291-25 chr3 97858367 97858680 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 2 of 21) L1M2|LINE|L1 36512 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 150-98 chr3 127527303 127527438 + 1.25 NA intron (NR_125397, intron 5 of 6) LTR16|LTR|ERVL 10410 NR_125397 101927149 Hs.407798 NR_125397 ENSG00000239921 LINC01471 - long intergenic non-protein coding RNA 1471 ncRNA 396.75-4 chr4 160913561 160914159 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1108873 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 172.5-11 chr1 117484775 117484962 + 1.25 NA intron (NM_006699, intron 8 of 12) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 117419 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 285.5-29 chr19 57174810 57175103 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -7471 NM_001012729 503835 Hs.585857 NM_001012729 ENSG00000258873 DUXA - double homeobox A protein-coding 282-14 chr13 56518951 56519400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -621743 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 131.75-196 chr7 8961753 8962044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 528289 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 374.25-3 chr14 101034743 101035314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1273 NR_030175 574453 NR_030175 ENSG00000207743 MIR495 MIRN495|hsa-mir-495|mir-495 microRNA 495 ncRNA 278.25-16 chr13 68810595 68810857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74599 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 258.75-6 chr10 36208417 36208807 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 430310 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 145.75-111 chr4 46060879 46061055 + 1.25 NA intron (NM_173536, intron 5 of 8) intron (NM_173536, intron 5 of 8) 63087 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 225.5-60 chr2 177967945 177968198 + 1.25 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) MIR|SINE|MIR -45234 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 203.75-25 chr12 67929634 67929814 + 1.25 NA intron (NR_120456, intron 1 of 2) intron (NR_120456, intron 1 of 2) 489 NR_120456 101927922 Hs.450769 NR_120456 ENSG00000255772 LINC01479 HRAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1479 ncRNA 183.25-40 chr16 48274267 48274493 + 1.25 NA intron (NM_031490, intron 7 of 14) intron (NM_031490, intron 7 of 14) -26841 NM_001370497 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 229-54 chr3 145689365 145689715 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 379645 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 146.25-101 chr3 103641612 103641830 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117605 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 239.75-63 chr6 54348514 54348908 + 1.25 NA intron (NM_014464, intron 6 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 40270 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 119.5-205 chr7 1392050 1392159 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 67366 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 212.25-11 chr10 100059108 100059329 + 1.25 NA intron (NM_001308, intron 5 of 8) L1MB3|LINE|L1 22651 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 179.25-106 chr3 109968026 109968230 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 365300 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 180.75-81 chr22 24393909 24394128 + 1.25 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) L1ME1|LINE|L1 -29579 NM_001278500 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 116.25-225 chr8 61357136 61357314 + 1.25 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) intron (NM_173519, intron 2 of 5) 69255 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 207.75-123 chr7 117321185 117321391 + 1.25 NA intron (NM_003391, intron 1 of 4) intron (NM_003391, intron 1 of 4) 1770 NR_024047 7472 Hs.567356 NM_003391 ENSG00000105989 WNT2 INT1L1|IRP Wnt family member 2 protein-coding 328-17 chr2 216086668 216086970 + 1.25 NA intron (NM_001142310, intron 2 of 3) intron (NM_001142310, intron 2 of 3) 4900 NM_138390 92691 Hs.334916 NM_138390 ENSG00000163449 TMEM169 - transmembrane protein 169 protein-coding 236.75-7 chr1 190677488 190677753 + 1.25 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 52730 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 163.5-29 chr10 107968479 107968640 + 1.25 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 100734 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 259.5-92 chr8 65303688 65303984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -123496 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 336.5-11 chr14 74900665 74901251 + 1.25 NA intron (NR_045209, intron 12 of 13) AluJr|SINE|Alu 19042 NR_045209 1743 Hs.525459 NM_001933 ENSG00000119689 DLST DLTS dihydrolipoamide S-succinyltransferase protein-coding 243.5-36 chr2 37989089 37989419 + 1.25 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) MIR|SINE|MIR 38790 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 398.75-3 chr18 22634369 22635022 + 1.25 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 152142 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 341-5 chr10 48655491 48655999 + 1.25 NA non-coding (NR_045675, exon 1 of 11) non-coding (NR_045675, exon 1 of 11) 520 NM_001347736 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 313-5 chr11 97720193 97720680 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 1212011 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 208.5-102 chr4 153464405 153464756 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1766 NM_015196 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 143.5-42 chr12 32734390 32734599 + 1.25 NA intron (NM_001330380, intron 14 of 18) intron (NM_001330380, intron 14 of 18) 21403 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 224.75-35 chr16 63239453 63239693 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1203135 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 288-27 chr20 18097663 18097978 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -38632 NM_001303462 58495 Hs.661013 NM_021220 ENSG00000125850 OVOL2 CHED|CHED1|CHED2|EUROIMAGE566589|PPCD1|ZNF339 ovo like zinc finger 2 protein-coding 292.25-23 chr21 35123371 35123770 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -74272 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 316.75-22 chr8 104602768 104603258 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13989 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 168-55 chr16 54889719 54889910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38964 NM_001308963 643911 Hs.237396 NM_001308963 CRNDE CRNDEP|LINC00180|NCRNA00180|PNAS-108|lincIRX5 colorectal neoplasia differentially expressed protein-coding 181.75-61 chr2 53134333 53134533 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -431818 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 237.25-8 chr1 233230064 233230370 + 1.25 NA intron (NM_014801, intron 9 of 33) intron (NM_014801, intron 9 of 33) 65508 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 131-146 chr6 150091372 150091483 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22306 NM_024518 79465 Hs.15422 NM_024518 ENSG00000131019 ULBP3 N2DL-3|NKG2DL3|RAET1N UL16 binding protein 3 protein-coding 190.5-27 chr11 82033269 82033453 + 1.25 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -142525 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 137.5-221 chr7 36978015 36978282 + 1.25 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) MIRc|SINE|MIR 6964 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 209.5-16 chr10 118104947 118105160 + 1.25 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -58112 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 228-50 chr3 52327356 52327742 + 1.25 NA intron (NM_015512, intron 5 of 77) intron (NM_015512, intron 5 of 77) 11230 NM_015512 25981 Hs.655469 NM_015512 ENSG00000114841 DNAH1 CILD37|DNAHC1|HDHC7|HL-11|HL11|HSRF-1|SPGF18|XLHSRF-1 dynein axonemal heavy chain 1 protein-coding 164-111 chr6 38708796 38709062 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5784 NM_006708 2739 Hs.268849 NM_006708 ENSG00000124767 GLO1 GLOD1|GLYI|HEL-S-74 glyoxalase I protein-coding 224.5-104 chr8 54815451 54815757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 199508 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 170.25-89 chr21 19299534 19299863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -539886 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 268.5-25 chr17 33816414 33816724 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR -282809 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 177.75-77 chr2 158899187 158899413 + 1.25 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -69334 NM_001350065 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 347.75-14 chr8 15141084 15141438 + 1.25 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 97170 NM_001322881 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 254.25-49 chr4 106794563 106794853 + 1.25 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 241605 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 257.75-22 chr2 74911588 74912141 + 1.25 NA intron (NR_125792, intron 1 of 4) intron (NR_125792, intron 1 of 4) 2733 NR_125792 102724515 Hs.708649 NR_125792 ENSG00000204792 LINC01291 - long intergenic non-protein coding RNA 1291 ncRNA 162.75-56 chr18 2270332 2270505 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 301087 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 165.25-95 chr3 160954462 160954694 + 1.25 NA intron (NM_001317912, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu 83980 NR_134243 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 215-74 chr8 118998124 118998432 + 1.25 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 46015 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 229.25-69 chr6 78627426 78627745 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -88276 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 155-78 chr20 54624844 54625079 + 1.25 NA intron (NM_018431, intron 6 of 7) intron (NM_018431, intron 6 of 7) 149368 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 305.25-37 chr4 31943507 31943890 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -53681 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 351.5-25 chr6 140959590 140960121 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 276041 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 150.75-29 chr10 77608747 77608974 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) L1MA8|LINE|L1 28948 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 205-5 chr1 192613064 192613386 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -22922 NM_144766 6003 Hs.497220 NM_002927 ENSG00000127074 RGS13 - regulator of G protein signaling 13 protein-coding 300.25-13 chr19 42243574 42243843 + 1.25 NA Intergenic X9_LINE|LINE|L1 -1106 NM_019884 2931 Hs.466828 NM_019884 ENSG00000105723 GSK3A - glycogen synthase kinase 3 alpha protein-coding 204-64 chr5 79684929 79685338 + 1.25 NA intron (NM_001349553, intron 16 of 16) intron (NM_001349553, intron 16 of 16) -4703 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 208-63 chr4 152516386 152516752 + 1.25 NA intron (NM_001349798, intron 2 of 13) intron (NM_001349798, intron 2 of 13) 18464 NM_033632 55294 Hs.561245 NM_018315 ENSG00000109670 FBXW7 AGO|CDC4|FBW6|FBW7|FBX30|FBXO30|FBXW6|SEL-10|SEL10|hAgo|hCdc4 F-box and WD repeat domain containing 7 protein-coding 180.5-111 chr4 36138870 36139085 + 1.25 NA intron (NR_146894, intron 19 of 32) L1ME2|LINE|L1 104962 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 193.5-162 chr8 68008235 68008402 + 1.25 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) L1M5|LINE|L1 56272 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 230-47 chr4 63757780 63758021 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 651550 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 230.75-50 chr4 64466763 64466972 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57407 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 192-41 chr14 29146261 29146527 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -360607 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 164.5-70 chr15 51692119 51692392 + 1.25 NA exon (NM_001165257, exon 6 of 11) exon (NM_001165257, exon 6 of 11) 10752 NM_013243 29106 Hs.232618 NM_013243 ENSG00000104112 SCG3 SGIII secretogranin III protein-coding 273.5-12 chr10 86671556 86671933 + 1.25 NA intron (NM_001368066, intron 2 of 14) intron (NM_001368066, intron 2 of 14) 3180 NM_001080116 11155 Hs.657271 NM_007078 ENSG00000122367 LDB3 CMD1C|CMH24|CMPD3|CYPHER|LDB3Z1|LDB3Z4|LVNC3|MFM4|ORACLE|PDLIM6|ZASP LIM domain binding 3 protein-coding 233.25-62 chr6 3902242 3902523 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 53009 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 226.25-5 chr1 166636090 166636376 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32317 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 148.75-64 chr16 8389055 8389275 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 200673 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 171.25-58 chr17 33947822 33948036 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 208877 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 133.25-187 chr6 124431449 124431633 + 1.25 NA intron (NM_153355, intron 3 of 5) MER106B|DNA|hAT-Charlie 148536 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 189-50 chr19 49993103 49993415 + 1.25 NA intron (NM_016440, intron 9 of 14) intron (NM_016440, intron 9 of 14) 23595 NM_001348364 400709 Hs.568076 NM_001348364 SIGLEC16 SIGLECP16|Siglec-P16 sialic acid binding Ig like lectin 16 (gene/pseudogene) protein-coding 349.25-6 chr2 57452653 57453091 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -454779 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 277.75-7 chr15 80103234 80103548 + 1.25 NA intron (NM_001242916, intron 2 of 6) intron (NM_001242916, intron 2 of 6) 4975 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 228.5-55 chr2 51063466 51063775 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 31019 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 128.5-140 chr3 55406258 55406436 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 75051 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 166.25-79 chr2 98494402 98494583 + 1.25 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) L1M4b|LINE|L1 48482 NM_001351428 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 354.75-17 chr5 120730676 120731162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 199455 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 296.5-24 chr3 95855831 95856119 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -172782 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 231.75-25 chr14 59567373 59567592 + 1.25 NA intron (NM_001164399, intron 4 of 19) intron (NM_001164399, intron 4 of 19) 9330 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 285.25-26 chr4 175563078 175563537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 224369 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 205.25-43 chr18 66116382 66116592 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 365475 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 263.25-2 chr1 66666828 66667173 + 1.25 NA intron (NM_001350218, intron 7 of 22) intron (NM_001350218, intron 7 of 22) 38560 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 175.25-36 chr12 27549475 27549725 + 1.25 NA intron (NM_003622, intron 1 of 29) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 25394 NM_003622 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 184-7 chr10 14574073 14574337 + 1.25 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -1830 NM_001282700 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 190.25-37 chr14 55578895 55579111 + 1.25 NA intron (NR_027123, intron 1 of 2) intron (NR_027123, intron 1 of 2) 1089 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-69 chr14 54848409 54848504 + 1.25 NA intron (NM_001024071, intron 3 of 5) intron (NM_001024071, intron 3 of 5) 29737 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 260.75-44 chr3 47805723 47805949 + 1.25 NA intron (NM_001330990, intron 2 of 22) AluSx1|SINE|Alu 2698 NM_138615 22907 Hs.517948 NM_014966 ENSG00000132153 DHX30 DDX30|NEDMIAL|RETCOR DExH-box helicase 30 protein-coding 228.5-20 chr10 113607149 113607567 + 1.25 NA intron (NM_001322945, intron 31 of 40) AluSx1|SINE|Alu 54305 NM_004132 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 218.75-71 chr5 57479841 57480105 + 1.25 NA TTS (NM_001017992) TTS (NM_001017992) 2838 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 157.5-157 chr5 18664080 18664383 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 856957 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 220.75-51 chr3 88167947 88168248 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 18138 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 387.75-10 chr2 135267672 135268128 + 1.25 NA intron (NM_001286569, intron 12 of 21) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 131272 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 237.5-27 chr13 41204365 41204669 + 1.25 NA intron (NR_120423, intron 3 of 3) MER67B|LTR|ERV1 -9948 NM_032138 84078 Hs.63841 NM_032138 ENSG00000120696 KBTBD7 - kelch repeat and BTB domain containing 7 protein-coding 266.5-65 chr5 154148596 154149102 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -41884 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 246.25-69 chr8 123120415 123120931 + 1.25 NA intron (NM_001363149, intron 11 of 21) AluSx|SINE|Alu 47424 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 204-59 chr4 141339266 141339478 + 1.25 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -6755 NR_121625 100507639 Hs.535010 NR_121625 LINC02432 - long intergenic non-protein coding RNA 2432 ncRNA 178.25-79 chr22 37477813 37477987 + 1.25 NA intron (NR_029413, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 8484 NM_002405 4242 Hs.517603 NM_002405 ENSG00000100060 MFNG - MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 260.25-27 chr20 39178035 39178351 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 46555 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 207.5-86 chr5 82900251 82900575 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40577 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 122.25-47 chr12 101789335 101789491 + 1.25 NA intron (NM_024312, intron 3 of 20) intron (NM_024312, intron 3 of 20) 41546 NM_024312 79158 Hs.46850 NM_024312 ENSG00000111670 GNPTAB GNPTA|ICD N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta protein-coding 258.25-22 chr14 75009286 75009666 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014239, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_014239, exon 8 of 8) 6555 NM_014239 8892 Hs.409137 NM_014239 ENSG00000119718 EIF2B2 EIF-2Bbeta|EIF2B eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta protein-coding 377-11 chr3 81807078 81807554 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45671 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 164.75-65 chr17 69630617 69630865 + 1.25 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MC4|LINE|L1 36754 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 345.25-15 chr3 122191509 122192082 + 1.25 NA intron (NM_001178065, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 7468 NM_001178065 846 Hs.435615 NM_000388 ENSG00000036828 CASR CAR|EIG8|FHH|FIH|GPRC2A|HHC|HHC1|HYPOC1|NSHPT|PCAR1|hCasR calcium sensing receptor protein-coding 139-7 chr1 112538122 112538417 + 1.25 NA intron (NM_017744, intron 14 of 14) intron (NM_017744, intron 14 of 14) 29304 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 228.25-40 chr19 29989656 29990005 + 1.25 NA intron (NM_001252641, intron 4 of 10) L1MB8|LINE|L1 47591 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 301.75-8 chr12 39519059 39519367 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -76093 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 186.75-37 chr15 88163836 88164075 + 1.25 NA intron (NM_001007156, intron 5 of 15) intron (NM_001007156, intron 5 of 15) 42019 NM_001320135 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 294.25-22 chr2 68857691 68858244 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13430 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 212-23 chr14 69140704 69140971 + 1.25 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 11762 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 241.25-10 chr1 232152305 232152705 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 226671 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 218.25-84 chr6 105597703 105597889 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -194714 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 160.25-71 chr2 57484619 57484844 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -422920 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 126.75-134 chr20 44556625 44556811 + 1.25 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) intron (NM_007066, intron 1 of 3) 24843 NM_007066 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 144.5-119 chr20 11900310 11900463 + 1.25 NA intron (NM_001282550, intron 1 of 4) intron (NM_001282550, intron 1 of 4) 7893 NM_001282550 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 269.25-6 chr11 42765388 42765627 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 503862 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 161-58 chr18 66044502 66044749 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 293613 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 308-28 chr6 152463345 152463682 + 1.25 NA exon (NM_033071, exon 19 of 146) exon (NM_033071, exon 19 of 146) 82983 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 245.25-19 chr14 46276844 46277242 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -194316 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 150.75-51 chr13 42019978 42020103 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19996 NM_001204504 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 197.25-81 chr4 180437012 180437270 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 722008 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 220-63 chr8 76435869 76436147 + 1.25 NA intron (NR_105006, intron 2 of 5) intron (NR_105006, intron 2 of 5) 29354 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 394.5-12 chr7 91473063 91473563 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 208880 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 137-117 chr4 34364928 34365135 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95284 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 228.25-47 chr2 221715983 221716246 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141912 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 440.25-4 chr4 115463550 115464189 + 1.25 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -350249 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 256-38 chr20 37841499 37841795 + 1.25 NA intron (NM_001281495, intron 13 of 16) intron (NM_001281495, intron 13 of 16) -61480 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 235.75-53 chr4 62704489 62704700 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -542829 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 292.5-12 chr11 97085177 97085534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 576930 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 173.5-11 chr1 178871815 178871953 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_004673) promoter-TSS (NM_004673) -807 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 172-63 chr20 31973461 31973636 + 1.25 NA intron (NM_001011718, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 5397 NM_001011718 343702 Hs.666444 NM_001011718 ENSG00000260903 XKR7 C20orf159|dJ310O13.4 XK related 7 protein-coding 114-78 chr2 99653061 99653232 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 11 of 23) intron (NM_001025108, intron 11 of 23) -163129 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 250-39 chr3 186572355 186572650 + 1.25 NA intron (NM_016306, intron 2 of 9) AluSx|SINE|Alu 1826 NM_016306 51726 Hs.317192 NM_016306 ENSG00000090520 DNAJB11 ABBP-2|ABBP2|DJ9|Dj-9|EDJ|ERdj3|ERj3|ERj3p|PKD6|PRO1080|UNQ537 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11 protein-coding 280-42 chr5 23699304 23699578 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 191786 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 217-23 chr14 71519148 71519461 + 1.25 NA intron (NM_001354286, intron 4 of 24) AluJb|SINE|Alu 31443 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 304.75-3 chr1 216255928 216256376 + 1.25 NA intron (NM_206933, intron 11 of 71) L1MEc|LINE|L1 167244 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 235.5-24 chr11 73145246 73145475 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3042 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 294.75-2 chr11 46013008 46013429 + 1.25 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 90562 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 159.5-9 chr1 176622185 176622442 + 1.25 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 159138 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 229.25-60 chr5 19974231 19974494 + 1.25 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) AluSz|SINE|Alu 13838 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 182.25-29 chr12 82452003 82452170 + 1.25 NA intron (NM_001347934, intron 9 of 12) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -93281 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 302.25-10 chr14 56562252 56562639 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -17353 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 164-95 chr5 18685769 18685980 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 878600 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 197.5-77 chr2 160492405 160492705 + 1.25 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 1252 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 125-33 chr12 22097833 22097954 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 51675 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 278.5-26 chr19 9495146 9495585 + 1.25 NA intron (NM_152476, intron 2 of 9) intron (NM_152476, intron 2 of 9) 3251 NM_152476 147741 Hs.631613 NM_152476 ENSG00000198028 ZNF560 - zinc finger protein 560 protein-coding 151-111 chr5 113696057 113696230 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182449 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 155.5-16 chr1 184016776 184016969 + 1.25 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 20856 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 292.75-21 chr22 27237142 27237432 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12608 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 128.75-202 chr8 104197937 104198078 + 1.25 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) MER101-int|LTR|ERV1 -25328 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 115.25-67 chr14 74875127 74875275 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6715 NM_001933 1743 Hs.525459 NM_001933 ENSG00000119689 DLST DLTS dihydrolipoamide S-succinyltransferase protein-coding 230-21 chr15 50189857 50190215 + 1.25 NA intron (NM_001159629, intron 1 of 8) intron (NM_001159629, intron 1 of 8) 7840 NM_001159629 11001 Hs.11729 NM_003645 ENSG00000140284 SLC27A2 ACSVL1|FACVL1|FATP2|HsT17226|VLACS|VLCS|hFACVL1 solute carrier family 27 member 2 protein-coding 140.25-153 chr5 131329994 131330130 + 1.25 NA intron (NM_020240, intron 2 of 5) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 66053 NM_020240 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 326.5-21 chr4 109747688 109748193 + 1.25 NA intron (NM_001331035, intron 9 of 11) MER1B|DNA|hAT-Charlie -17870 NM_030821 81579 Hs.389452 NM_030821 ENSG00000123739 PLA2G12A GXII|PLA2G12|ROSSY phospholipase A2 group XIIA protein-coding 225.25-75 chr7 26389396 26389680 + 1.25 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -9031 NR_148499 441204 Hs.587432 NR_015364 ENSG00000214870 LOC441204 - uncharacterized LOC441204 ncRNA 216.75-18 chr11 108099170 108099456 + 1.25 NA intron (NM_003478, intron 18 of 18) intron (NM_003478, intron 18 of 18) -22254 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 196.5-171 chr8 138226869 138227161 + 1.25 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) intron (NM_015912, intron 7 of 19) -143470 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 159-78 chr4 71850060 71850321 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -44670 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 249.25-5 chr11 108493910 108494188 + 1.25 NA intron (NM_001363502, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 4335 NM_001363503 143888 Hs.83286 NM_153705 ENSG00000178202 POGLUT3 KDELC2 protein O-glucosyltransferase 3 protein-coding 199-60 chr4 39939751 39940186 + 1.25 NA intron (NM_001100399, intron 2 of 32) intron (NM_001100399, intron 2 of 32) 37943 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 261-72 chrX 89030147 89030376 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 283036 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 326.25-28 chr7 20854398 20854741 + 1.25 NA intron (NR_126381, intron 1 of 5) intron (NR_126381, intron 1 of 5) 19138 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 220.25-48 chr3 98026085 98026396 + 1.25 NA intron (NM_001105580, intron 2 of 9) intron (NM_001105580, intron 2 of 9) 9064 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 233.75-52 chr3 168707675 168707954 + 1.25 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) intron (NR_021485, intron 5 of 15) 155960 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 259.5-94 chr8 80090295 80090640 + 1.25 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) -9636 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 177.5-31 chr12 1157747 1158035 + 1.25 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) L3|LINE|CR1 130143 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 185-80 chr7 67658182 67658383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 322306 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 265.5-29 chr16 83018486 83018769 + 1.25 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -28329 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 145.5-14 chr1 184053601 184053810 + 1.25 NA intron (NR_125335, intron 1 of 5) intron (NR_125335, intron 1 of 5) 1975 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 294.75-33 chr6 44499417 44499916 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 52215 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 378-2 chr11 33816623 33817138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42181 NR_120550 101928440 Hs.202343 NR_120550 ENSG00000254508 FBXO3-DT FBXO3-AS1 FBXO3 divergent transcript ncRNA 228.25-46 chr2 213734257 213734481 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -23698 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 234.75-23 chr14 100910164 100910597 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_029863) promoter-TSS (NR_029863) -759 NR_029863 442915 NR_029863 ENSG00000199005 MIR370 MIRN370|hsa-mir-370|mir-370 microRNA 370 ncRNA 164.75-12 chr1 202802203 202802440 + 1.25 NA intron (NM_001314042, intron 1 of 27) intron (NM_001314042, intron 1 of 27) 7149 NM_001347591 10765 Hs.18891 NM_006618 ENSG00000117139 KDM5B CT31|JARID1B|MRT65|PLU-1|PLU1|PPP1R98|PUT1|RBBP2H1A|RBP2-H1 lysine demethylase 5B protein-coding 239.25-47 chr2 56945563 56945899 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -759961 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 159.75-25 chr11 29339937 29340111 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -254389 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 291.5 chr1 17753236 17753682 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1874 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 202.25-4 chr1 56803921 56804163 + 1.25 NA intron (NM_001004303, intron 1 of 19) intron (NM_001004303, intron 1 of 19) 15362 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 234.25-39 chr2 204165215 204165644 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 228681 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 247.75-26 chr17 63481640 63482021 + 1.25 NA intron (NM_000789, intron 7 of 24) intron (NM_000789, intron 7 of 24) -3016 NM_152830 1636 Hs.298469 NM_000789 ENSG00000159640 ACE ACE1|CD143|DCP|DCP1 angiotensin I converting enzyme protein-coding 200.75-102 chr7 112926319 112926565 + 1.25 NA intron (NM_152556, intron 1 of 4) intron (NM_152556, intron 1 of 4) 13433 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 154.5-155 chr6 38781442 38781692 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 15 of 91) intron (NM_001371, intron 15 of 91) 66256 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 172.5-36 chr11 5340163 5340358 + 1.25 NA TTS (NR_038321) TTS (NR_038321) -11248 NM_001004750 390058 Hs.553730 NM_001004750 ENSG00000176239 OR51B6 HOR5'Beta6 olfactory receptor family 51 subfamily B member 6 protein-coding 328.5-12 chr14 69894960 69895384 + 1.25 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 15756 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 149.5-78 chr18 3320564 3320684 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29935 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 128.75-187 chr7 87651724 87651903 + 1.25 NA intron (NM_001134406, intron 2 of 9) intron (NM_001134406, intron 2 of 9) 23415 NM_138290 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 194.25-63 chr2 166545928 166546158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59072 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 268.25 chr1 151413267 151413498 + 1.25 NA intron (NM_001194938, intron 9 of 17) AluJr|SINE|Alu 13809 NM_002796 5692 Hs.89545 NM_002796 ENSG00000159377 PSMB4 HN3|HsN3|PRAAS3|PROS-26|PROS26 proteasome subunit beta 4 protein-coding 372.25-12 chr7 18492823 18493231 + 1.25 NA intron (NM_001204144, intron 3 of 12) intron (NM_001204144, intron 3 of 12) -2683 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 154.75-134 chr7 49770581 49770753 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2971 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 286.75-9 chr11 45949234 45949473 + 1.25 NA intron (NR_147890, intron 12 of 18) intron (NR_147890, intron 12 of 18) 26697 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 427.25-2 chr2 44269788 44270499 + 1.25 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -5337 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 245.75-68 chr9 134473319 134473582 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 66890 NM_001291921 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 164.5-77 chr16 74578928 74579369 + 1.25 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) AluJo|SINE|Alu 27966 NM_012201 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 157.5-133 chr3 82067067 82067280 + 1.25 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 81031 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 281-10 chr15 63945055 63945358 + 1.25 NA intron (NM_014326, intron 4 of 11) intron (NM_014326, intron 4 of 11) 16932 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 175-69 chr2 98610730 98610961 + 1.25 NA exon (NM_001330353, exon 3 of 6) exon (NM_001330353, exon 3 of 6) 2256 NM_001330353 25972 Hs.13370 NM_014044 ENSG00000115446 UNC50 GMH1|HSD23|PDLs22|UNCL|URP unc-50 inner nuclear membrane RNA binding protein protein-coding 227.25-22 chr12 60769946 60770257 + 1.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 1080731 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 235.75-78 chr8 81606199 81606436 + 1.25 NA non-coding (NR_146081, exon 8 of 8) non-coding (NR_146081, exon 8 of 8) 24960 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 298.25-29 chr5 160799909 160800233 + 1.25 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 52140 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 245.25-72 chr8 127357659 127357865 + 1.25 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -42637 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 118.25-213 chr9 9028246 9028413 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 10 of 45) intron (NM_002839, intron 10 of 45) 170311 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 198.25-101 chr8 122185708 122185877 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 382852 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 201.5-54 chr14 63265577 63265889 + 1.25 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) MER4D|LTR|ERV1 53202 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 248.25-57 chr5 114969495 114969848 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -196258 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 174.25-140 chr8 70186277 70186614 + 1.25 NA intron (NM_001321711, intron 4 of 21) intron (NM_001321711, intron 4 of 21) -115193 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 324.25-6 chr17 79498055 79498421 + 1.25 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) intron (NM_001350451, intron 1 of 14) 17910 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 321.25-12 chr17 78490802 78491238 + 1.25 NA intron (NM_173628, intron 43 of 80) intron (NM_173628, intron 43 of 80) 6110 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-63 chr14 75691947 75692128 + 1.25 NA intron (NM_015072, intron 6 of 31) intron (NM_015072, intron 6 of 31) 30791 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 138-37 chr14 43430735 43430968 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1076432 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 428.5-6 chr4 74309655 74310206 + 1.25 NA intron (NR_073114, intron 2 of 5) intron (NR_073114, intron 2 of 5) 1460 NR_073117 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 253.25-45 chr3 99381986 99382313 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -256445 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 227.75-30 chr2 34334198 34334400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 267073 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 297.25-25 chr5 122506836 122507217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27939 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 223-43 chr2 153736045 153736299 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -135750 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 321.25-10 chr15 61879166 61879518 + 1.25 NA intron (NM_001018088, intron 73 of 81) intron (NM_001018088, intron 73 of 81) 149424 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 221-8 chr10 26467380 26467658 + 1.25 NA intron (NM_019043, intron 2 of 14) AluJr|SINE|Alu 29178 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 269.25-4 chr1 109565986 109566373 + 1.25 NA intron (NM_006496, intron 1 of 8) intron (NM_006496, intron 1 of 8) 17564 NM_006496 2773 Hs.73799 NM_006496 ENSG00000065135 GNAI3 87U6|ARCND1 G protein subunit alpha i3 protein-coding 311-5 chr10 61020174 61020575 + 1.25 NA intron (NR_108052, intron 1 of 1) intron (NR_108052, intron 1 of 1) 4099 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 180-69 chr2 210421978 210422178 + 1.25 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) intron (NR_110606, intron 1 of 4) 54627 NM_001136574 10314 Hs.13351 NM_006055 ENSG00000115365 LANCL1 GPR69A|p40 LanC like 1 protein-coding 186-65 chr4 81057490 81057671 + 1.25 NA TTS (NM_001201) TTS (NM_001201) 26872 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 189-21 chr10 90602233 90602503 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61563 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 129.5-155 chr3 47605382 47605499 + 1.25 NA intron (NM_003074, intron 26 of 27) L1ME3A|LINE|L1 -25200 NM_001206945 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 256-67 chr7 111237014 111237395 + 1.25 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 146077 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 181.5-35 chr12 93578169 93578426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5622 NM_001270471 8835 Hs.485572 NM_003877 ENSG00000120833 SOCS2 CIS2|Cish2|SOCS-2|SSI-2|SSI2|STATI2 suppressor of cytokine signaling 2 protein-coding 247-63 chr8 129943335 129943571 + 1.25 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) AluSz|SINE|Alu -3642 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 207.25-84 chr6 70008460 70008683 + 1.25 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) L1M5|LINE|L1 142015 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 224.25-67 chr4 83357080 83357394 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -22084 NM_001166498 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 135-156 chr6 61193307 61193482 + 1.25 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -380736 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 267-25 chr2 54687574 54687801 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -37325 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 216.25-67 chr3 12436876 12437156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47416 NM_001145394 80746 Hs.335550 NM_025265 ENSG00000154743 TSEN2 PCH2B|SEN2|SEN2L tRNA splicing endonuclease subunit 2 protein-coding 242-12 chr10 118986695 118987191 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -42771 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 383-8 chr18 9690341 9690776 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17743 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 461.75-5 chr7 4093563 4094235 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 22 of 44) intron (NM_152744, intron 22 of 44) -35786 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 210.75-44 chr2 141630100 141630306 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 501498 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 302.75-27 chr6 39583243 39583515 + 1.25 NA intron (NM_001289020, intron 9 of 21) intron (NM_001289020, intron 9 of 21) 142029 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 243-70 chr7 44805662 44805997 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 9148 NM_001300981 5478 Hs.356331 NM_021130 ENSG00000196262 PPIA CYPA|CYPH|HEL-S-69p peptidylprolyl isomerase A protein-coding 262.75-49 chr7 132808071 132808342 + 1.25 NA intron (NM_001317177, intron 7 of 8) intron (NM_001317177, intron 7 of 8) 49236 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 278.5-28 chr2 50160952 50161226 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 186665 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 253.75-52 chr6 61632136 61632401 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 13 of 13) intron (NR_146874, intron 13 of 13) 58138 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 124-111 chr3 35794928 35795045 + 1.25 NA TTS (NM_001267619) TTS (NM_001267619) 50510 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 136.25-142 chr5 25130141 25130368 + 1.25 NA intron (NR_147006, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 60402 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 197.5-78 chr2 160514469 160514688 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -20771 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 174.25-125 chr6 87027391 87027677 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 67572 NM_000735 1081 Hs.119689 NM_000735 ENSG00000135346 CGA CG-ALPHA|FSHA|GPA1|GPHA1|GPHa|HCG|LHA|TSHA glycoprotein hormones, alpha polypeptide protein-coding 301.5-33 chr22 46809891 46810154 + 1.25 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) intron (NM_001284305, intron 4 of 12) 36095 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 207.75-129 chr8 120806613 120806806 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR 5337 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 113.5-35 chr10 73781435 73781607 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_203298) promoter-TSS (NM_203298) -527 NM_203298 118487 Hs.181174 NM_203298 ENSG00000172586 CHCHD1 C10orf34|C2360|MRP-S37 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 protein-coding 279.5-42 chr3 152335755 152336112 + 1.25 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) 5057 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 179-83 chr7 14718056 14718292 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 6 of 24) intron (NM_001350717, intron 6 of 24) 123276 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 210.5-102 chr5 99118217 99118498 + 1.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -188643 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 134.25-95 chr2 225613475 225613609 + 1.25 NA intron (NM_001371273, intron 5 of 7) MLT2B3|LTR|ERVL 212656 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 174.75-27 chr12 90601983 90602155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 308751 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 178.75-19 chr12 41126633 41126896 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -61556 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 167.25-44 chr14 61533693 61533882 + 1.25 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) MIR|SINE|MIR 36407 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 216.25-99 chr8 134482658 134482920 + 1.25 NA intron (NM_001174158, intron 13 of 13) intron (NM_001174158, intron 13 of 13) -115282 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 114.75-130 chr3 142998178 142998352 + 1.25 NA intron (NR_125393, intron 3 of 4) MER102a|DNA|hAT-Charlie 3202 NR_034032 100289361 Hs.599649 NR_034032 ENSG00000268129 LOC100289361 - uncharacterized LOC100289361 ncRNA 178-107 chr9 87015714 87015896 + 1.25 NA intron (NR_027471, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 26321 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 182.5-138 chr5 161228313 161228496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -289778 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 294.75 chr1 229220580 229221100 + 1.25 NA Intergenic (TACCATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46039 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 450-8 chr3 196691048 196691593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20930 NM_032898 84984 Hs.282800 NM_032898 ENSG00000174007 CEP19 C3orf34|MOSPGF centrosomal protein 19 protein-coding 321.5-5 chr12 11472773 11473187 + 1.25 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) L1MB2|LINE|L1 13698 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 245-45 chr4 38943734 38944063 + 1.25 NA non-coding (NR_033290, exon 13 of 13) non-coding (NR_033290, exon 13 of 13) 75866 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 120.25-160 chr5 55265899 55266035 + 1.25 NA intron (NR_144323, intron 23 of 26) intron (NR_144323, intron 23 of 26) -32250 NR_125346 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 318-5 chr10 36096819 36097225 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 318720 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 264.25-14 chr14 42548949 42549318 + 1.25 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 942277 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 370.5-14 chr3 96912214 96912703 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) L2c|LINE|L2 97864 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 130.75-139 chr4 49153150 49153325 + 1.25 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 166595 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 179.25-138 chr7 77947065 77947305 + 1.25 NA intron (NM_001366081, intron 14 of 16) L1ME3Cz|LINE|L1 107055 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 126-186 chr9 114106033 114106176 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -7047 NM_138424 113220 Hs.28149 NM_138424 ENSG00000136883 KIF12 - kinesin family member 12 protein-coding 314.75-10 chr2 196784404 196784679 + 1.25 NA intron (NM_012086, intron 8 of 17) intron (NM_012086, intron 8 of 17) 15142 NM_012086 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 223.25-77 chr8 96643130 96643387 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1984 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 172.75-144 chrX 39161479 39161744 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 165751 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 202-72 chr8 61002790 61002965 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35129 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 118-105 chr21 27211800 27212083 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -244853 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 360-7 chr18 7265265 7265743 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 34400 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 206.5-41 chr2 11898885 11899208 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62060 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 389.5-10 chr2 64157383 64157744 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13143 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 170.25-65 chr2 26239304 26239523 + 1.25 NA intron (NM_000182, intron 1 of 19) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 5219 NM_000182 3030 Hs.516032 NM_000182 ENSG00000084754 HADHA ECHA|GBP|HADH|LCEH|LCHAD|MTPA|TP-ALPHA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha protein-coding 275-46 chrX 79429829 79430082 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -62403 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 238.5-29 chr15 77689203 77689575 + 1.25 NA intron (NM_001301194, intron 2 of 3) intron (NM_001301194, intron 2 of 3) 6759 NM_001301200 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 149.25-120 chr3 136192926 136193090 + 1.25 NA intron (NM_018133, intron 1 of 1) intron (NM_018133, intron 1 of 1) 1460 NM_001145417 55167 Hs.18631 NM_018133 ENSG00000174579 MSL2 MSL-2|MSL2L1|RNF184 MSL complex subunit 2 protein-coding 186.5-118 chr6 54049888 54050158 + 1.25 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) -2429 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 230.25-23 chr12 78001810 78002236 + 1.25 NA intron (NM_001024383, intron 7 of 39) intron (NM_001024383, intron 7 of 39) 171129 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 128.5-101 chr2 6880018 6880194 + 1.25 NA intron (NM_080657, intron 1 of 5) intron (NM_080657, intron 1 of 5) 2329 NM_080657 91543 Hs.17518 NM_080657 ENSG00000134321 RSAD2 2510004L01Rik|cig33|cig5|vig1 radical S-adenosyl methionine domain containing 2 protein-coding 210.5-57 chr18 71037471 71037788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -386675 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 222.75-26 chr11 90895281 90895637 + 1.25 NA intron (NR_104190, intron 6 of 6) intron (NR_104190, intron 6 of 6) -26257 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 187.25-84 chr4 136642230 136642471 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -551406 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 132-100 chr22 19324245 19324377 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -32592 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 247-14 chr12 44654930 44655157 + 1.25 NA intron (NM_006159, intron 14 of 20) intron (NM_006159, intron 14 of 20) 220618 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 168-9 chr1 209736470 209736726 + 1.25 NA intron (NR_134510, intron 1 of 2) intron (NR_134510, intron 1 of 2) 5964 NR_134510 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-179 chr8 118295847 118296058 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -184133 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 127.5-260 chr9 116380217 116380426 + 1.25 NA intron (NM_002581, intron 20 of 21) (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20285 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 354.75-22 chr8 89825073 89825578 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 67509 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 123-139 chr3 189893010 189893253 + 1.25 NA intron (NM_003722, intron 13 of 13) intron (NM_003722, intron 13 of 13) 63209 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 176.5-151 chr6 130622891 130623063 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 185860 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 304.5-17 chr2 9811522 9811871 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -31746 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 273.25-22 chr3 12522670 12523182 + 1.25 NA intron (NM_025265, intron 8 of 11) intron (NM_025265, intron 8 of 11) 22538 NM_001195279 100129480 Hs.572974 NM_001195279 ENSG00000225526 MKRN2OS C3orf83|MKRN2-AS1 MKRN2 opposite strand protein-coding 284.75-45 chrX 46142640 46142972 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 184868 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 292.5-25 chr16 47527509 47527790 + 1.25 NA intron (NM_001031835, intron 7 of 31) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 66318 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 146.25-16 chr10 84518438 84518590 + 1.25 NA TTS (NM_001284243) TTS (NM_001284243) 93345 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 134-46 chr13 41955382 41955506 + 1.25 NA intron (NM_001009814, intron 1 of 25) MER57A-int|LTR|ERV1 5641 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 234.5-9 chr10 43818390 43818657 + 1.25 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -26783 NR_033923 414260 Hs.351856 NR_033923 ENSG00000226808 LINC00619 C10orf136|bA168P8.1 long intergenic non-protein coding RNA 619 ncRNA 220-12 chr10 115145519 115145809 + 1.25 NA intron (NM_001276282, intron 5 of 7) intron (NM_001276282, intron 5 of 7) 52299 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 182.5-96 chr22 46408238 46408395 + 1.25 NA intron (NM_014246, intron 9 of 34) intron (NM_014246, intron 9 of 34) 72602 NM_001282782 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 118-70 chr18 2560257 2560439 + 1.25 NA intron (NM_022840, intron 3 of 8) intron (NM_022840, intron 3 of 8) 11157 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 275.75-26 chr2 217585893 217586238 + 1.25 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) intron (NR_026597, intron 2 of 12) 170528 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 207.25-89 chr7 52310854 52311062 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -724675 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 283.5-10 chr11 45858723 45858977 + 1.25 NA exon (NM_021117, exon 3 of 12) exon (NM_021117, exon 3 of 12) 11375 NM_021117 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 201-69 chr7 49119230 49119664 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 194900 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 161.75-86 chr3 96610272 96610446 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204235 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 206.5-118 chr7 28231511 28231874 + 1.25 NA intron (NR_034097, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 -50897 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 140.25-124 chr3 189420390 189420749 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -176177 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 222.75-35 chr14 23647421 23647671 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11182 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 179.5-166 chr7 38590830 38591003 + 1.25 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 40457 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 208.5-29 chr12 32844127 32844412 + 1.25 NA intron (NM_004572, intron 5 of 13) L3|LINE|CR1 52577 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 216.25-63 chr22 27513728 27514182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203304 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 232.5-100 chr8 81220423 81220635 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -60007 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 159.75-143 chr5 146325848 146326182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12824 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 321.25-8 chr13 58580703 58581076 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -347772 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 256.25-12 chr14 25589389 25589761 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -539278 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 236.75-37 chr3 95887503 95887754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204435 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 124-182 chrX 47489139 47489260 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -5930 NM_001324148 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 317.75-11 chr14 43132131 43132454 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1374991 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 167.5-200 chr9 103603028 103603380 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -278171 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 251.75-19 chr12 79004553 79004871 + 1.25 NA intron (NM_001291901, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR -40980 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 131.25-91 chr19 15056619 15056793 + 1.25 NA 3' UTR (NM_012114, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_012114, exon 7 of 7) 7226 NM_012114 23581 Hs.466057 NM_012114 ENSG00000105141 CASP14 ARCI12 caspase 14 protein-coding 233.75-2 chr1 32333628 32333878 + 1.25 NA TTS (NR_052852) TTS (NR_052852) 2480 NM_023009 65108 Hs.75061 NM_023009 ENSG00000175130 MARCKSL1 F52|MACMARCKS|MLP|MLP1|MRP MARCKS like 1 protein-coding 206.5-15 chr12 248652 248903 + 1.25 NA intron (NM_016615, intron 2 of 14) L1ME2z|LINE|L1 8522 NR_120482 102723544 Hs.669733 NR_120482 ENSG00000255746 LOC102723544 - uncharacterized LOC102723544 ncRNA 162.25-107 chr3 184153709 184153922 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1562 NM_004423 1857 Hs.388116 NM_004423 ENSG00000161202 DVL3 DRS3 dishevelled segment polarity protein 3 protein-coding 202-15 chr11 86960488 86960793 + 1.25 NA intron (NR_038905, intron 2 of 2) intron (NR_038905, intron 2 of 2) 5019 NR_038905 100506368 Hs.559920 NR_038905 ENSG00000246523 FZD4-DT - FZD4 divergent transcript ncRNA 355-9 chr2 204836335 204836994 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) AluSx|SINE|Alu 291189 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 204.25-44 chr17 14537834 14538122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 234238 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 300.75-31 chr2 181951230 181951600 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2826 NR_048567 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 278.25-4 chr10 10244171 10244473 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 185600 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 265.5-35 chr2 118386375 118386669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -200136 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 129.75-132 chr4 83855899 83856067 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 319875 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 150.5-81 chr19 43831025 43831203 + 1.25 NA intron (NM_001297752, intron 3 of 5) intron (NM_001297752, intron 3 of 5) 3793 NM_181845 284349 Hs.652513 NM_181845 ENSG00000167637 ZNF283 HZF19|HZF41 zinc finger protein 283 protein-coding 191.5-54 chr16 73447930 73448263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 61291 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 141-2 chr1 60690481 60690676 + 1.25 NA intron (NR_110628, intron 4 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -67893 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 243.25-50 chr7 2852117 2852427 + 1.25 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -7964 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 150.5-31 chr11 82220718 82220865 + 1.25 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 183122 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 133.75-46 chr13 67372880 67372998 + 1.25 NA intron (NR_130792, intron 1 of 2) intron (NR_130792, intron 1 of 2) 552 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 187-98 chr8 76122346 76122517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -284223 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 233-11 chr11 124199289 124199500 + 1.25 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 14178 NM_001355213 26497 Hs.538726 NM_001355213 ENSG00000197309 OR10D3 HTPCRX09|OR10D3P olfactory receptor family 10 subfamily D member 3 (putative) protein-coding 145.5-55 chr13 88335890 88336093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 193124 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 214-45 chr3 168923379 168923593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21541 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 316.5-6 chr1 199180238 199180639 + 1.25 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 31840 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 258.75-34 chr2 31905560 31905929 + 1.25 NA intron (NM_001137602, intron 4 of 7) intron (NM_001137602, intron 4 of 7) -101764 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 233-48 chr4 31044546 31044842 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -126450 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 151-9 chr1 201589535 201589802 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -58654 NM_020443 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 113.75-196 chr8 120983575 120983733 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -171608 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 216-21 chr15 81384637 81384844 + 1.25 NA intron (NR_120365, intron 6 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -10527 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 252.75-23 chr17 80775427 80775849 + 1.25 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 29994 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 189-16 chr1 231177421 231177809 + 1.25 NA intron (NM_001300889, intron 3 of 11) intron (NM_001300889, intron 3 of 11) 10012 NM_001256615 149373 Hs.632505 NM_001256615 ENSG00000235710 LOC149373 - uncharacterized LOC149373 protein-coding 187.5-165 chr8 73526441 73526831 + 1.25 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) L3|LINE|CR1 106562 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-139 chr6 116699946 116700144 + 1.25 NA intron (NM_001366310, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 18834 NM_001366304 3841 Hs.182971 NM_002269 ENSG00000196911 KPNA5 IPOA6|SRP6 karyopherin subunit alpha 5 protein-coding 336.25-22 chrX 14943471 14943899 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 58394 NM_001177475 158747 Hs.744919 NM_152581 ENSG00000130150 MOSPD2 - motile sperm domain containing 2 protein-coding 297-46 chrX 107456626 107457224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65525 NM_032428 84443 Hs.496546 NM_032428 ENSG00000147234 FRMPD3 - FERM and PDZ domain containing 3 protein-coding 139.75-23 chr10 130272680 130272889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 136375 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 145.25-2 chr1 28232322 28232630 + 1.25 NA intron (NR_159454, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 553 NM_014280 22826 Hs.433540 NM_014280 ENSG00000126698 DNAJC8 HSPC331|SPF31 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C8 protein-coding 204.5-40 chr15 60668674 60668886 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -12789 NR_120319 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 244.25-17 chr14 68883827 68884079 + 1.25 NA intron (NM_001102, intron 14 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -87710 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 257.5-78 chr8 135711822 135712236 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 254573 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 136.25-181 chr7 114522732 114522930 + 1.25 NA intron (NR_033767, intron 2 of 17) intron (NR_033767, intron 2 of 17) 96329 NM_148899 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 146-79 chr20 25249334 25249535 + 1.25 NA intron (NM_002862, intron 1 of 19) intron (NM_002862, intron 1 of 19) 1349 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 236.25-6 chr1 209731315 209731790 + 1.25 NA intron (NM_181755, intron 5 of 6) intron (NM_181755, intron 5 of 6) -7427 NR_134509 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 147.75-79 chr2 184465801 184465952 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86901 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 204-13 chr14 30850630 30851038 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23701 NM_001347720 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 121.5-258 chr8 141757335 141757438 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28927 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 121.5-188 chr4 29651677 29651850 + 1.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 437471 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 134-164 chr7 82717984 82718223 + 1.25 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 -274147 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 245.5-77 chr7 149108489 149108704 + 1.25 NA intron (NM_001001661, intron 3 of 3) intron (NM_001001661, intron 3 of 3) 17728 NM_001001661 155054 Hs.31743 NM_001001661 ENSG00000204947 ZNF425 - zinc finger protein 425 protein-coding 175-23 chr11 55541910 55542201 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -12214 NM_001001920 81309 NM_001001920 ENSG00000181939 OR4C15 OR11-127|OR11-134 olfactory receptor family 4 subfamily C member 15 protein-coding 258.75-7 chr10 46559492 46559989 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -3669 NM_014696 9721 Hs.523375 NM_014696 ENSG00000204175 GPRIN2 GRIN2|KIAA0514 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 protein-coding 239.5-53 chr4 34935273 34935636 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -665707 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 214.5-55 chr2 47999462 47999793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -93834 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 244.75-57 chr7 92906656 92907060 + 1.25 NA intron (NR_110086, intron 4 of 4) L1ME3A|LINE|L1 -70231 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 198.75-5 chr1 111795519 111795785 + 1.25 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 39751 NM_007204 11218 Hs.591405 NM_007204 ENSG00000064703 DDX20 DP103|GEMIN3 DEAD-box helicase 20 protein-coding 117.25-142 chr3 119243773 119243949 + 1.25 NA intron (NR_046574, intron 3 of 3) intron (NR_046574, intron 3 of 3) -2983 NM_003778 8702 Hs.13225 NM_003778 ENSG00000121578 B4GALT4 B4Gal-T4|beta4Gal-T4 beta-1,4-galactosyltransferase 4 protein-coding 245.75-13 chr12 29746726 29747075 + 1.25 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) L2a|LINE|L2 37042 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 422.75-2 chr22 19349904 19350421 + 1.25 NA intron (NM_003325, intron 24 of 24) L2a|LINE|L2 -58443 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 170.5-124 chr3 142074420 142074606 + 1.25 NA intron (NM_001178138, intron 3 of 13) AluJr|SINE|Alu -45887 NM_001178142 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 210.75-51 chr20 51746202 51746634 + 1.25 NA intron (NM_006045, intron 1 of 27) AluSx|SINE|Alu 21972 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 228-17 chr12 2337124 2337455 + 1.25 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 67513 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 339.5-20 chr4 34359385 34359923 + 1.25 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -89907 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 288.75-5 chr1 93040440 93040862 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -38584 NM_001164393 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 161.75-31 chr12 5055255 5055577 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11537 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 313.25-23 chr4 181758403 181758673 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71435 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 238.25-4 chr1 211192478 211192880 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -58531 NM_172362 3756 Hs.553187 NM_002238 ENSG00000143473 KCNH1 EAG|EAG1|Kv10.1|TMBTS|ZLS1|h-eag|hEAG1 potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 protein-coding 220-9 chr10 44499512 44499845 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -114581 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 197.25-93 chr7 3753481 3753818 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -376036 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 231.5-74 chr4 64830514 64830833 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173827 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 359.5 chr10 88823013 88823389 + 1.25 NA intron (NM_144590, intron 5 of 5) intron (NM_144590, intron 5 of 5) 20471 NM_001128215 340654 Hs.55118 NM_001128215 ENSG00000173239 LIPM LIPL3|bA304I5.1 lipase family member M protein-coding 212-14 chr11 81165346 81165573 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -402656 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 189.75-131 chr9 88822789 88823023 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77001 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 234-61 chr7 32254783 32255036 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 44419 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 147-11 chr1 104728886 104729065 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 655952 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 243.25-12 chr14 72816568 72816899 + 1.25 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 75916 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 212.25-37 chr18 6699419 6699710 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30152 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 251.75-42 chr2 182663875 182664087 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -52276 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 192.25-38 chr18 50644450 50644711 + 1.25 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) intron (NM_001292039, intron 1 of 4) 84493 NM_001292040 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 135.25-209 chr9 99480564 99480688 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105369 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 191-81 chr8 88095177 88095452 + 1.25 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) intron (NM_005941, intron 6 of 9) -221299 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 271.75-45 chr8 101088224 101088562 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36339 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 153.75-42 chr14 87074559 87074747 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168875 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 185.25-12 chr11 23812865 23813055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -393770 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 208-15 chr12 23778526 23778803 + 1.25 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 171006 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 304.5-30 chr5 124395048 124395379 + 1.25 NA intron (NR_125774, intron 3 of 5) intron (NR_125774, intron 3 of 5) 43307 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 141.5-175 chr5 55339892 55340145 + 1.25 NA exon (NM_015360, exon 6 of 27) exon (NM_015360, exon 6 of 27) 32029 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 209.75-43 chr19 36230637 36230965 + 1.25 NA intron (NM_001099639, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 15127 NM_001366188 147929 Hs.596338 NM_152477 ENSG00000196357 ZNF565 - zinc finger protein 565 protein-coding 242.5-81 chr7 131216839 131217150 + 1.25 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 106900 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 247-56 chr7 29426385 29426611 + 1.25 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -53214 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 210.75-81 chr5 108501060 108501237 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -119050 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 165-145 chr8 92224029 92224231 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120745 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 321.75-38 chrX 85219154 85219448 + 1.25 NA TTS (NR_110651) TTS (NR_110651) 8595 NR_110651 101928128 Hs.636014 NR_110651 LOC101928128 - uncharacterized LOC101928128 ncRNA 182.75-124 chr7 68548184 68548610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 528144 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 149.75-93 chr2 176910054 176910252 + 1.25 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 272399 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 223-19 chr12 30011012 30011303 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -226398 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 302-16 chr2 49320035 49320317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -165649 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 211-48 chr4 112165776 112166045 + 1.25 NA intron (NM_152400, intron 1 of 1) L1MA2|LINE|L1 20456 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 192-4 chr1 61496383 61496652 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157725 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 158-122 chr6 125339956 125340217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38119 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 310.5-17 chr2 38124483 38125003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6362 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-5 chr1 66262103 66262304 + 1.25 NA intron (NM_001037340, intron 4 of 14) intron (NM_001037340, intron 4 of 14) -69905 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 207.25-97 chr8 115677550 115677802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8701 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 192.75-29 chr13 60922276 60922587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 249476 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 203.5-85 chr21 32161226 32161514 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -75075 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 338.25-13 chr16 80264152 80264590 + 1.25 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -276363 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 145.75-90 chr2 230018959 230019089 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 49900 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 191.75-62 chr2 41366707 41366962 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -510721 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 278.5-52 chr7 80060869 80061160 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -73817 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 190.25-56 chr18 32256357 32256603 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 66441 NM_001308171 4225 Hs.194777 NM_005925 ENSG00000141434 MEP1B - meprin A subunit beta protein-coding 159.5 chr1 44097810 44098007 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -20913 NM_173484 128209 Hs.567674 NM_173484 ENSG00000171872 KLF17 ZNF393|Zfp393 Kruppel like factor 17 protein-coding 164.75-123 chr6 42173204 42173494 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001319062, exon 2 of 5) 5' UTR (NM_001319062, exon 2 of 5) 17943 NM_001370581 114841037 Hs.92858 NM_001370581 LOC114841037 - Uncharacterized protein 114841037 protein-coding 163.25-2 chr1 34834830 34834970 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 24145 NM_001164824 113444 Hs.27160 NM_138428 ENSG00000163866 SMIM12 C1orf212 small integral membrane protein 12 protein-coding 171-40 chr15 35805325 35805568 + 1.25 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 -121410 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 185.75-24 chr11 69371233 69371531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54273 NM_001319657 102724265 Hs.448669 NM_001319657 LOC102724265 - uncharacterized LOC102724265 protein-coding 243.75-46 chr20 38842452 38842754 + 1.25 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 36906 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 160.25-72 chr2 60090038 60090315 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 292860 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 140.25-141 chr4 177587590 177587822 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -141051 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 286.75-41 chr8 52454122 52454396 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -44380 NM_001352837 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 257-2 chr1 111829964 111830322 + 1.25 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 26762 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 146-110 chr5 168302817 168303010 + 1.25 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) MER5A|DNA|hAT-Charlie 11268 NM_015238 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 225-18 chr11 102308971 102309384 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8307 NM_001165 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 169.75-130 chr5 113453564 113453772 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) -18679 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 176.5-115 chr22 47870986 47871167 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 239402 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 161.75-94 chr3 197160830 197161040 + 1.25 NA intron (NM_001366204, intron 5 of 24) intron (NM_001366204, intron 5 of 24) 22937 NM_001366222 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 274.25-12 chr11 109462923 109463299 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 40921 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 268.75-22 chr20 48553769 48554114 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 194030 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 257.5-81 chr9 92043112 92043388 + 1.25 NA intron (NM_001368273, intron 13 of 15) L2-3_Crp|LINE|L2 72163 NM_001281303 10558 Hs.90458 NM_006415 ENSG00000090054 SPTLC1 HSAN1|HSN1|LBC1|LCB1|SPT1|SPTI serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 protein-coding 399-7 chr6 126953180 126953785 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -165189 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 469.75-4 chr7 97293962 97294629 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 177702 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 184.75-88 chr6 124254903 124255135 + 1.25 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -27986 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 237.5-74 chr5 7888935 7889247 + 1.25 NA intron (NR_157171, intron 7 of 13) intron (NR_157171, intron 7 of 13) 19943 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 178.75-29 chr14 60107670 60107879 + 1.25 NA exon (NM_001330177, exon 2 of 11) exon (NM_001330177, exon 2 of 11) 15851 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 234.25-65 chr6 46038981 46039251 + 1.25 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) -23227 NM_001256023 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 262.75-23 chr18 13772534 13772852 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 46020 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 174.75-10 chr1 235825725 235825932 + 1.25 NA TTS (NR_102436) TTS (NR_102436) 27232 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 161-46 chr15 91644541 91644706 + 1.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 181284 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 254.25-59 chr7 62647818 62648175 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 656060 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 169-75 chr5 38943254 38943485 + 1.25 NA intron (NM_001285439, intron 37 of 38) intron (NM_001285439, intron 37 of 38) 97357 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 268.5-46 chr5 61151621 61151900 + 1.25 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu -10556 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 207.75-77 chr3 98700433 98700803 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -31618 NM_001271142 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 177-53 chr20 38440574 38440730 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5275 NR_152763 388796 Hs.400876 NR_015366 ENSG00000196756 SNHG17 - small nucleolar RNA host gene 17 ncRNA 193.25-121 chr9 118462986 118463206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -216575 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 151.5-33 chr12 15072486 15072704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70762 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 155.75-24 chr10 106827241 106827484 + 1.25 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) MIR1_Amn|SINE|MIR 337344 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 149.75-72 chr2 17476381 17476569 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41965 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 245.25-23 chr15 67433922 67434245 + 1.25 NA intron (NR_040052, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 86890 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 388.25-10 chr9 31749037 31749549 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -367803 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 224.75-44 chr21 24936595 24936885 + 1.25 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 96190 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 170.5-195 chr8 125697394 125697727 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 253637 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 245-27 chr19 28616967 28617277 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10434 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 244.75-15 chr11 116656419 116656793 + 1.25 NA intron (NR_135069, intron 2 of 2) L1MC|LINE|L1 17184 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 289.75-22 chr4 37020643 37021044 + 1.25 NA TTS (NR_134669) TTS (NR_134669) 19064 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 157.5-21 chr10 44463007 44463152 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -77982 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 438.5-7 chr20 1540105 1540529 + 1.25 NA intron (NM_178460, intron 2 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 17388 NM_178460 128646 Hs.729560 NM_178460 ENSG00000125900 SIRPD PTPNS1L2|dJ576H24.4 signal regulatory protein delta protein-coding 127.25-15 chr10 21978319 21978650 + 1.25 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 25246 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 190-43 chr3 75075168 75075387 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -139199 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 194-67 chr5 44132769 44133034 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -255831 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 198-90 chrX 46731923 46732254 + 1.25 NA intron (NM_001257291, intron 1 of 16) AluSq2|SINE|Alu 27030 NM_001257291 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 136.5-159 chr4 30402256 30402454 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -318014 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 277-24 chr20 58331251 58331517 + 1.25 NA intron (NM_020673, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 21669 NM_020673 57403 Hs.529044 NM_020673 ENSG00000124209 RAB22A - RAB22A, member RAS oncogene family protein-coding 191.5-75 chr2 63473918 63474133 + 1.25 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) MIR|SINE|MIR -36018 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 242.5-83 chr8 80882105 80882588 + 1.25 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -7565 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 164.25-159 chr9 16398527 16398752 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -122326 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 285.25-3 chr10 56301701 56302106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59356 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 119.75-143 chr3 99596698 99596805 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41843 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 139.5-37 chr12 3701038 3701199 + 1.25 NA intron (NM_001144958, intron 3 of 19) L1ME1|LINE|L1 51991 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 333.25-15 chr6 23457584 23457878 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -668484 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 140-136 chr5 74474529 74474746 + 1.25 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 62339 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 163.75-85 chr21 29726409 29726611 + 1.25 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -21665 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 188.75-80 chr3 185588770 185589037 + 1.25 NA intron (NM_021627, intron 1 of 16) intron (NM_021627, intron 1 of 16) 2608 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 219.25-21 chr12 33839063 33839374 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -183278 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 112.25-210 chr8 55755666 55755789 + 1.25 NA intron (NM_001286661, intron 2 of 4) intron (NM_001286661, intron 2 of 4) 17651 NM_001363176 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 148.75-98 chr20 8825668 8825859 + 1.25 NA intron (NM_182734, intron 32 of 32) L2b|LINE|L2 -5422 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 297-42 chr7 4229082 4229403 + 1.25 NA intron (NM_001079653, intron 14 of 19) intron (NM_001079653, intron 14 of 19) -94405 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 380-7 chr17 44646443 44647031 + 1.25 NA intron (NR_110661, intron 2 of 2) intron (NR_110661, intron 2 of 2) 3612 NR_110661 101927017 Hs.560554 NR_110661 ENSG00000266979 LINC01180 - long intergenic non-protein coding RNA 1180 ncRNA 215-46 chr2 159161944 159162151 + 1.25 NA intron (NM_001350063, intron 6 of 24) intron (NM_001350063, intron 6 of 24) -24788 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 126.25-156 chr5 59021552 59021721 + 1.25 NA intron (NM_006203, intron 6 of 14) MIRb|SINE|MIR 17840 NM_001197221 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 281.75-16 chr14 16093305 16093702 + 1.25 NA Intergenic SAR|Satellite|Satellite -2507614 NM_001013354 440153 Hs.534880 NM_001013354 ENSG00000257115 OR11H12 - olfactory receptor family 11 subfamily H member 12 protein-coding 115.5-112 chr2 5475735 5475989 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 215256 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 235.75-80 chr8 125041056 125041377 + 1.25 NA intron (NM_014846, intron 23 of 28) intron (NM_014846, intron 23 of 28) 42711 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 263.75-9 chr12 17512340 17512622 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76597 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 205.75-77 chr7 14749034 14749264 + 1.25 NA intron (NM_001350724, intron 3 of 24) intron (NM_001350724, intron 3 of 24) 92301 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 176-47 chr3 107656878 107657132 + 1.25 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) intron (NM_001276286, intron 3 of 16) 134043 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 137-163 chr7 51205901 51206048 + 1.25 NA intron (NM_015198, intron 2 of 12) L1MA9|LINE|L1 110835 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 227.25-13 chr10 82214855 82215144 + 1.25 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 17921 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 302.25-18 chr3 133251035 133251298 + 1.25 NA intron (NR_110812, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 5955 NR_110812 101927455 Hs.570550 NR_110812 ENSG00000251011 TMEM108-AS1 - TMEM108 antisense RNA 1 ncRNA 241-29 chr3 18170777 18171036 + 1.25 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) L1ME3E|LINE|L1 208354 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 320.5-30 chr3 149358674 149359113 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 18756 NM_014220 4071 Hs.351316 NM_014220 ENSG00000169908 TM4SF1 H-L6|L6|M3S1|TAAL6 transmembrane 4 L six family member 1 protein-coding 297.5-18 chr14 70356613 70357069 + 1.25 NA intron (NM_001202548, intron 3 of 5) L1M4|LINE|L1 2842 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 113.75-168 chr6 111876901 111877071 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -3534 NM_002037 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 155.75-82 chr2 78529129 78529413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16260 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 189.5-157 chr9 24164667 24164839 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -314152 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 135.25-74 chr17 27523225 27523338 + 1.25 NA intron (NM_014238, intron 2 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 51317 NM_014238 8844 Hs.133534 NM_014238 ENSG00000141068 KSR1 KSR|RSU2 kinase suppressor of ras 1 protein-coding 274.5-39 chr21 21026105 21026531 + 1.25 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 27909 NM_004540 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 230.75-63 chr6 47650908 47651172 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -5432 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 202.75-35 chr14 59568321 59568551 + 1.25 NA intron (NM_001164399, intron 3 of 19) intron (NM_001164399, intron 3 of 19) 8376 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 270-37 chr3 101397908 101398235 + 1.25 NA intron (NM_001282803, intron 3 of 20) intron (NM_001282803, intron 3 of 20) -77496 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 211.5-56 chr16 62447573 62447856 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -411276 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 170.25-40 chr14 102433445 102433627 + 1.25 NA intron (NM_014844, intron 8 of 19) AluSq2|SINE|Alu 70595 NM_001172631 9895 Hs.195667 NM_014844 ENSG00000196663 TECPR2 KIAA0329|SPG49 tectonin beta-propeller repeat containing 2 protein-coding 147.5-56 chr13 96499974 96500170 + 1.25 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 72843 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 239.5-78 chr8 65764413 65764722 + 1.25 NA intron (NM_001242318, intron 3 of 12) intron (NM_001242318, intron 3 of 12) 24490 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 269-49 chr8 126483681 126484051 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 74612 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 281.75-34 chr5 23218998 23219250 + 1.25 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -288485 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 112.25-70 chr15 80302979 80303223 + 1.25 NA intron (NR_033833, intron 1 of 2) L1M1|LINE|L1 38704 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 358.5-22 chr9 84606733 84607169 + 1.25 NA Intergenic (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -61507 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 240.5-16 chr11 86177146 86177431 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -67096 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 236.25-84 chr8 73825653 73825979 + 1.25 NA intron (NM_018299, intron 2 of 5) intron (NM_018299, intron 2 of 5) 53046 NR_073121 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 354-12 chr17 58029567 58029908 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22391 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 232.75-38 chr22 28410250 28410649 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -49420 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 133.25-87 chr19 16555767 16555941 + 1.25 NA intron (NM_024881, intron 4 of 5) intron (NM_024881, intron 4 of 5) -13417 NM_006387 10523 Hs.740364 NM_006387 ENSG00000085872 CHERP DAN16|SCAF6|SRA1 calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein protein-coding 260-37 chr6 155481133 155481398 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25426 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 156.5-40 chr12 58645501 58645694 + 1.25 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 53895 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 172.25-31 chr12 123143476 123143642 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33070 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 191-7 chr10 72471876 72472188 + 1.25 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) 51954 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 115.25-87 chr19 15498025 15498139 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10443 NM_173483 126410 Hs.156452 NM_173483 ENSG00000171954 CYP4F22 ARCI5|INLNE|LI3 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 22 protein-coding 457.5-4 chr7 111921842 111922536 + 1.25 NA intron (NM_001363540, intron 12 of 52) intron (NM_001363540, intron 12 of 52) 113684 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 167-12 chr1 179607925 179608259 + 1.25 NA intron (NM_001199092, intron 1 of 13) L1PB1|LINE|L1 1865 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 230-31 chr2 15904568 15904757 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -15737 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 156-92 chr2 231206594 231206793 + 1.25 NA intron (NM_001352757, intron 2 of 19) L1ME4a|LINE|L1 8062 NR_148040 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 249-39 chr5 27421508 27421921 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -50578 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 204.5-79 chr22 20471893 20472255 + 1.25 NA intron (NM_032775, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 23721 NR_033825 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 196-88 chr7 33443561 33443768 + 1.25 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 314100 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 147.25-14 chr10 18541387 18541604 + 1.25 NA 3' UTR (NM_201572, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_201572, exon 14 of 14) 110092 NM_001351117 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 266-8 chr12 106406549 106406930 + 1.25 NA intron (NM_001160708, intron 11 of 27) intron (NM_001160708, intron 11 of 27) 48657 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 472.75-3 chr14 73186534 73187325 + 1.25 NA intron (NM_000021, intron 6 of 11) intron (NM_000021, intron 6 of 11) 50422 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 245.5-8 chr10 88876710 88877027 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3377 NM_020799 57559 Hs.16229 NM_020799 ENSG00000138134 STAMBPL1 ALMalpha|AMSH-FP|AMSH-LP|bA399O19.2 STAM binding protein like 1 protein-coding 165.5-197 chr8 80836089 80836328 + 1.25 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 38260 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 194.5-163 chr9 5824298 5824531 + 1.25 NA intron (NM_024896, intron 3 of 14) AluSq4|SINE|Alu 8703 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 208.25-58 chr22 34991135 34991406 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 6646 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 215-22 chr14 79843040 79843230 + 1.25 NA intron (NM_138970, intron 5 of 5) L1MA9|LINE|L1 -368284 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 223.25-67 chr7 12222851 12223165 + 1.25 NA intron (NM_001134232, intron 3 of 7) intron (NM_001134232, intron 3 of 7) 11714 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 274-17 chr17 73565788 73566170 + 1.25 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) AluSc|SINE|Alu 52296 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 275.5-63 chr7 81341977 81342581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 219540 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 167-8 chr1 114623079 114623403 + 1.25 NA intron (NM_001256404, intron 5 of 20) intron (NM_001256404, intron 5 of 20) -41626 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 150.5-38 chr12 27734633 27734843 + 1.25 NA intron (NM_001190864, intron 5 of 6) MER103C|DNA|hAT-Charlie 23906 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 150.75-17 chr1 174170013 174170246 + 1.25 NA intron (NM_001366445, intron 1 of 13) intron (NM_001366445, intron 1 of 13) 10609 NM_001366445 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 162.75-112 chr5 14177417 14177671 + 1.25 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 34202 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 340.5-27 chr5 94439382 94439793 + 1.25 NA intron (NM_001145678, intron 14 of 20) intron (NM_001145678, intron 14 of 20) 179017 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 296.25-15 chr17 35089416 35089728 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_037713) promoter-TSS (NR_037713) -346 NR_037713 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 174-52 chr2 151272742 151272906 + 1.25 NA intron (NM_004688, intron 6 of 7) L1MB3|LINE|L1 -10961 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 162-75 chr21 31644027 31644247 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15485 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 225.25 chr1 31460662 31460914 + 1.25 NA Intergenic HERVIP10F-int|LTR|ERV1 -39297 NR_034112 149086 Hs.729905 NR_034112 ENSG00000260386 LDC1P LINC01225 leucine decarboxylase 1, pseudogene pseudo 157.75-165 chr7 136072839 136073009 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95565 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 206.75-7 chr10 65556927 65557228 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -14348 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 132.75-10 chr1 104690535 104690687 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 617588 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 143.25-117 chr3 61550260 61550460 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -11211 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 173.5-49 chr15 100449276 100449481 + 1.25 NA intron (NM_001290341, intron 13 of 13) L1MA4A|LINE|L1 76439 NR_120374 102723320 Hs.416099 NR_120374 CERS3-AS1 - CERS3 antisense RNA 1 ncRNA 299.25-32 chr3 18280948 18281220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 144255 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 227.5-84 chr5 43639258 43639648 + 1.25 NA intron (NM_012343, intron 7 of 21) intron (NM_012343, intron 7 of 21) -36223 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 235.5-83 chr8 52130125 52130314 + 1.25 NA intron (NM_014682, intron 22 of 25) intron (NM_014682, intron 22 of 25) -64143 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 487-3 chr2 78718182 78718713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 172916 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 199-89 chr8 137481735 137481957 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -68258 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 282.5-66 chr8 105763355 105763807 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 296922 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 405.25-14 chr8 13010310 13010743 + 1.25 NA intron (NM_020844, intron 3 of 4) intron (NM_020844, intron 3 of 4) -1738 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 261.5-13 chr13 27877207 27877443 + 1.25 NA intron (NR_047484, intron 1 of 4) L1MD2|LINE|L1 39966 NR_047484 100861550 Hs.416201 NR_047484 PLUT HI-LNC71|PDX1-AS1|PLUTO PDX1 associated lncRNA, upregulator of transcription ncRNA 195.5-25 chr11 80295776 80296055 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 466888 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 171.5-124 chr5 51675325 51675553 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 291991 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 166.75-33 chr12 55522999 55523184 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28136 NM_001005494 341418 Hs.495021 NM_001005494 ENSG00000179626 OR6C4 OR12-10 olfactory receptor family 6 subfamily C member 4 protein-coding 215.5-109 chr8 117189101 117189340 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 54225 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 221.25-54 chr3 156991741 156992029 + 1.25 NA intron (NM_001004316, intron 7 of 12) L1MEb|LINE|L1 -89956 NR_135546 105374177 Hs.634263 NR_135546 ENSG00000241544 LINC02029 - long intergenic non-protein coding RNA 2029 ncRNA 258.5-53 chr4 58015004 58015413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 521120 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 206.75-40 chr2 153112706 153113013 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 365903 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 186.25-108 chr6 165072951 165073263 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 236498 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 410.5-11 chr6 37729704 37730071 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -32004 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 497.25-3 chr4 59140999 59141716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 127784 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 365.75-8 chr19 27616204 27616590 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -177034 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 246.5-44 chr2 145852255 145852502 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -734679 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 279.25-29 chr4 48157894 48158162 + 1.25 NA intron (NM_003215, intron 8 of 17) intron (NM_003215, intron 8 of 17) -23778 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 131.75-52 chr12 56697700 56697808 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9346 NM_001282604 10728 Hs.50425 NM_006601 ENSG00000110958 PTGES3 P23|TEBP|cPGES prostaglandin E synthase 3 protein-coding 146-108 chr5 66519396 66519610 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -7899 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 306.5-32 chr6 129016896 129017259 + 1.25 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 133936 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 278.75-20 chr2 47207717 47207979 + 1.25 NA intron (NR_110208, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -30912 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 118.25-218 chr9 88854222 88854410 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -108411 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 244.25-54 chr8 134976128 134976412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126335 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 217-38 chr2 164629116 164629366 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -7759 NM_004490 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 136.5-117 chr2 126420223 126420371 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -235638 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 182-77 chr4 39847314 39847495 + 1.25 NA intron (NM_001100399, intron 28 of 32) AluJb|SINE|Alu 130507 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 399.75 chr1 9488454 9488920 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -50778 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 156.25-30 chr11 125038641 125038820 + 1.25 NA intron (NM_025004, intron 14 of 15) intron (NM_025004, intron 14 of 15) -24575 NM_198277 219855 Hs.352661 NM_198277 ENSG00000134955 SLC37A2 pp11662 solute carrier family 37 member 2 protein-coding 198.5-7 chr1 215057618 215058043 + 1.25 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR -24907 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 234-12 chr12 41895866 41896114 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 131801 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 216.75-35 chr2 13156320 13156532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149413 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 173.75-51 chr14 28754252 28754473 + 1.25 NA intron (NR_125758, intron 2 of 6) intron (NR_125758, intron 2 of 6) 10957 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-8 chr1 49346950 49347149 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MER41C|LTR|ERV1 89638 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 435.25-3 chr22 25756447 25757484 + 1.25 NA intron (NM_001318245, intron 1 of 43) AluSz6|SINE|Alu 14777 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 147-117 chr5 153923362 153923497 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -24442 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 237.75-80 chr8 69681831 69682108 + 1.25 NA intron (NM_001146009, intron 5 of 7) intron (NM_001146009, intron 5 of 7) 89069 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 294-24 chr3 97438952 97439245 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001278300) promoter-TSS (NM_001278300) -509 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 208.5-63 chr19 17030575 17030905 + 1.25 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -3930 NM_015692 27151 Hs.631644 NM_015692 ENSG00000160111 CPAMD8 ASGD8|K-CAP|VIP C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8 protein-coding 270.5-59 chr7 71121606 71121939 + 1.25 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? -10372 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 231.5-98 chr8 48843257 48843561 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 78020 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 215.5-86 chr5 35689579 35689918 + 1.25 NA intron (NM_024867, intron 10 of 36) L1PA16|LINE|L1 71885 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 271.75-43 chr7 28984839 28985126 + 1.25 NA intron (NR_038965, intron 1 of 4) intron (NR_038965, intron 1 of 4) 5015 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 245-13 chr12 59117673 59117932 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -197264 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 259-10 chr10 73575620 73575936 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_152586) promoter-TSS (NM_152586) -103 NM_152586 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 218.25-43 chr2 125669609 125669902 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 448230 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 202-73 chr8 78433915 78434083 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82341 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 185.75-64 chr2 116703941 116704167 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1110637 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 235-56 chr5 27959758 27959998 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 327787 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 145.75-25 chr12 22291801 22292137 + 1.25 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) intron (NM_003034, intron 1 of 4) 42745 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 205.25-4 chr1 192596504 192596776 + 1.25 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 20867 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 214-61 chr7 93838533 93838732 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52121 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 168-121 chr8 37005582 37005734 + 1.25 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 221284 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 217.25-72 chr6 8620392 8620710 + 1.25 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) intron (NR_038980, intron 3 of 4) -31658 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 246.5-28 chr15 61313528 61313815 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -84369 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 241.25-50 chr4 20650936 20651192 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -45218 NR_133933 133015 Hs.479298 NM_145048 ENSG00000163138 PACRGL C4orf28 parkin coregulated like protein-coding 352.25-5 chr14 61950605 61951012 + 1.25 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) intron (NM_001367663, intron 1 of 7) 23113 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 153.5-99 chr2 57513199 57513449 + 1.25 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -394327 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 217.75-44 chr20 50672446 50672718 + 1.25 NA intron (NM_001290268, intron 1 of 21) intron (NM_001290268, intron 1 of 21) 18960 NM_001290268 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 228-85 chr8 120429141 120429475 + 1.25 NA intron (NM_014078, intron 3 of 6) L1PA13|LINE|L1 15842 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 302-31 chr7 118609463 118609771 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 384913 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 180.25-75 chr3 104428744 104429056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -904784 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 144.75-94 chr2 163840041 163840335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104180 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 233.75-11 chr11 73442516 73442741 + 1.25 NA intron (NM_001286051, intron 2 of 5) L1M4|LINE|L1 65960 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 124.25-144 chr4 27029588 27029704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168805 NM_020860 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 207.5-53 chr2 66691212 66691489 + 1.25 NA intron (NR_110156, intron 4 of 5) intron (NR_110156, intron 4 of 5) 11877 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 194-7 chr1 101835029 101835297 + 1.25 NA intron (NM_001288821, intron 2 of 5) intron (NM_001288821, intron 2 of 5) 11917 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 116-36 chr12 59768330 59768557 + 1.25 NA intron (NR_073055, intron 4 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 79073 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 246-32 chr2 56126667 56127054 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36478 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 228.25-77 chr7 28879879 28880169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 78306 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 350.25-9 chr12 75824839 75825266 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 206724 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 196-21 chr12 110245304 110245496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35847 NM_170665 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 259.25-6 chr11 103398756 103399071 + 1.25 NA intron (NM_001377, intron 83 of 88) intron (NM_001377, intron 83 of 88) 289487 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 245.25-25 chr15 71851600 71851974 + 1.25 NA intron (NM_006901, intron 36 of 41) intron (NM_006901, intron 36 of 41) 41233 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 183-83 chr4 47634814 47635004 + 1.25 NA intron (NM_006587, intron 16 of 21) intron (NM_006587, intron 16 of 21) -17760 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 114.25-67 chr16 27323979 27324127 + 1.25 NA intron (NM_001257997, intron 1 of 9) intron (NM_001257997, intron 1 of 9) 10079 NM_001257407 3566 Hs.513457 NM_000418 ENSG00000077238 IL4R CD124|IL-4RA|IL4RA interleukin 4 receptor protein-coding 277.5-31 chr2 63917793 63918136 + 1.25 NA intron (NM_001005739, intron 15 of 22) MIR|SINE|MIR 76084 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 149-58 chr2 98046680 98046859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40398 NR_144297 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 241.25 chr1 11680231 11680580 + 1.25 NA exon (NM_006341, exon 3 of 9) exon (NM_006341, exon 3 of 9) 743 NM_006341 10459 Hs.19400 NM_006341 ENSG00000116670 MAD2L2 FANCV|MAD2B|POLZ2|REV7 mitotic arrest deficient 2 like 2 protein-coding 349.75-9 chr2 169897618 169898231 + 1.25 NA intron (NM_172070, intron 8 of 38) MIRb|SINE|MIR 70416 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 292.75-38 chrX 85437388 85437930 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57994 NM_001307940 79983 Hs.267038 NM_024921 ENSG00000124429 POF1B POF|POF2B POF1B actin binding protein protein-coding 167.75-74 chr2 81999810 82000069 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -532993 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 559.75 chr10 23366665 23367512 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22291 NM_153714 256815 Hs.132442 NM_153714 ENSG00000179133 C10orf67 C10orf115|LINC01552 chromosome 10 open reading frame 67 protein-coding 159.25-2 chr1 69633974 69634134 + 1.25 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 64713 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 237.25-25 chr14 64374314 64374604 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13894 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 145.75-22 chr11 33881589 33881872 + 1.25 NA intron (NM_005574, intron 2 of 5) intron (NM_005574, intron 2 of 5) 10346 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 171.75-37 chr13 87174890 87175226 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 263138 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 210.25-52 chr3 99608247 99608645 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -30148 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 187.75-76 chr4 39991689 39992006 + 1.25 NA Intergenic AluYk11|SINE|Alu -13891 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 244.25-9 chr12 871412 871741 + 1.25 NA intron (NM_014823, intron 9 of 25) intron (NM_014823, intron 9 of 25) 61500 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 138.75-88 chr2 50887722 50887931 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 144306 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 248.25-59 chr6 51916290 51916799 + 1.25 NA intron (NM_138694, intron 37 of 66) intron (NM_138694, intron 37 of 66) 171069 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 306.5-8 chr11 66219145 66219659 + 1.25 NA intron (NM_018026, intron 7 of 23) intron (NM_018026, intron 7 of 23) -37892 NM_001134775 64837 Hs.280792 NM_022822 ENSG00000174996 KLC2 - kinesin light chain 2 protein-coding 242-28 chr2 64496850 64497258 + 1.25 NA intron (NR_147011, intron 2 of 2) intron (NR_147011, intron 2 of 2) 10701 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 195.5-120 chr5 97181854 97182067 + 1.25 NA intron (NM_018343, intron 1 of 9) intron (NM_018343, intron 1 of 9) 1287 NM_001159749 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 269.5-17 chr14 75684758 75685036 + 1.25 NA intron (NM_015072, intron 5 of 31) L1ME3A|LINE|L1 23651 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 283.5-29 chr2 174420536 174420794 + 1.25 NA intron (NM_024583, intron 5 of 7) L1MEg|LINE|L1 24935 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 368-13 chr7 36563816 36564263 + 1.25 NA intron (NM_001177507, intron 12 of 19) intron (NM_001177507, intron 12 of 19) 36081 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 239.75-72 chr7 158164845 158165085 + 1.25 NA intron (NM_130843, intron 6 of 21) intron (NM_130843, intron 6 of 21) 310380 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 200.25-107 chr8 25438286 25438529 + 1.25 NA intron (NM_017634, intron 6 of 11) intron (NM_017634, intron 6 of 11) -13367 NM_000825 2796 Hs.82963 NM_000825 ENSG00000147437 GNRH1 GNRH|GRH|LHRH|LNRH gonadotropin releasing hormone 1 protein-coding 127.75-152 chr4 180612427 180612561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 546655 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 287.75-48 chr8 119331865 119332251 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 6887 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 163.5-159 chr5 53624496 53624654 + 1.25 NA intron (NR_134474, intron 3 of 5) L1MB3|LINE|L1 63936 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 290.5-28 chr3 78321431 78321920 + 1.25 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 -272712 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 281.25-24 chr2 119424858 119425200 + 1.25 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -6825 NM_183240 140738 Hs.26216 NM_183240 ENSG00000171227 TMEM37 PR|PR1 transmembrane protein 37 protein-coding 253.5-45 chr2 207114518 207114831 + 1.25 NA intron (NR_073108, intron 3 of 4) intron (NR_073108, intron 3 of 4) -4601 NR_036227 100423036 NR_036227 ENSG00000253008 MIR2355 mir-2355 microRNA 2355 ncRNA 207.25-81 chr5 179638626 179638887 + 1.25 NA intron (NR_131066, intron 3 of 5) intron (NR_131066, intron 3 of 5) -3972 NM_001364226 3187 Hs.604001 NM_005520 ENSG00000169045 HNRNPH1 HNRPH|HNRPH1|hnRNPH heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 protein-coding 277.25 chr1 49305258 49305645 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MER8|DNA|TcMar-Tigger 48040 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 138.5-94 chr19 55262127 55262246 + 1.25 NA TTS (NM_001130106) TTS (NM_001130106) -3169 NM_014931 22870 Hs.515610 NM_014931 ENSG00000105063 PPP6R1 KIAA1115|PP6R1|SAP190|SAPS1 protein phosphatase 6 regulatory subunit 1 protein-coding 123.75-96 chr2 165222158 165222298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17186 NM_001040143 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 207.5-58 chr2 217628309 217628510 + 1.25 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 128184 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 312-26 chr5 60608540 60608888 + 1.25 NA intron (NM_001145208, intron 7 of 9) intron (NM_001145208, intron 7 of 9) 91452 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 347-9 chr14 63729958 63730553 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -2190 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 307.25-13 chr17 28139443 28139767 + 1.25 NA intron (NM_016231, intron 3 of 10) L2b|LINE|L2 -86958 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 259-22 chr2 193702453 193702678 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -641704 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 213.5-44 chr16 27835507 27835864 + 1.25 NA intron (NM_001109763, intron 4 of 6) L1MD1|LINE|L1 52472 NM_144675 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 175.75-25 chr12 19087140 19087306 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42510 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 234.75-24 chr15 39696346 39696700 + 1.25 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) L1ME4a|LINE|L1 86318 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 220.5-9 chr10 104114899 104115176 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7021 NM_145247 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 279.25-37 chr6 107268323 107268583 + 1.25 NA intron (NM_020381, intron 3 of 7) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -152938 NM_001367314 57673 Hs.418045 NM_001080450 ENSG00000178409 BEND3 KIAA1553 BEN domain containing 3 protein-coding 185.25-30 chr14 64863428 64863677 + 1.25 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) L2c|LINE|L2 16355 NM_001355436 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 202.75-86 chr4 122373056 122373453 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5757 NM_139243 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 214.5-97 chr5 16205546 16205815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25439 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 175.25-125 chr6 52684948 52685131 + 1.25 NA intron (NM_014051, intron 4 of 4) L1ME4a|LINE|L1 13926 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 175.75-109 chr5 180531943 180532191 + 1.25 NA intron (NR_163438, intron 2 of 10) intron (NR_163438, intron 2 of 10) -9587 NM_001370474 57472 Hs.608380 NM_015455 ENSG00000113300 CNOT6 CCR4|Ccr4a CCR4-NOT transcription complex subunit 6 protein-coding 119.25-90 chr2 27692527 27692639 + 1.25 NA intron (NM_018158, intron 12 of 13) L1PBa|LINE|L1 23149 NR_135200 100129995 Hs.515878 NR_135200 ENSG00000205334 LINC01460 - long intergenic non-protein coding RNA 1460 ncRNA 232-44 chr2 231773765 231774059 + 1.25 NA intron (NM_002601, intron 1 of 4) intron (NM_002601, intron 1 of 4) 7370 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 144.25-94 chr2 44822031 44822185 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 116780 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 205.5-141 chr7 106501475 106501708 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 159567 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 152.25-95 chr20 45180797 45180985 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5989 NM_002638 5266 Hs.112341 NM_002638 ENSG00000124102 PI3 ESI|SKALP|WAP3|WFDC14|cementoin peptidase inhibitor 3 protein-coding 132.5-17 chr1 165310791 165311032 + 1.25 NA intron (NM_177398, intron 3 of 8) intron (NM_177398, intron 3 of 8) 45330 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 153.5-122 chr22 25186162 25186380 + 1.25 NA intron (NM_001145206, intron 9 of 10) intron (NM_001145206, intron 9 of 10) -13587 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 217-65 chr4 148488373 148488687 + 1.25 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -43832 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 160.75-13 chr10 24192759 24193009 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) AluJo|SINE|Alu -15907 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 120-164 chr6 117905823 117905988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1359 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 559.25 chr12 20537675 20538548 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -33753 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 198.75-59 chr22 49578127 49578380 + 1.25 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 -34787 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 211.5-57 chr16 62952920 62953250 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -916647 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 250.75-20 chr18 63564070 63564452 + 1.25 NA intron (NM_001307928, intron 5 of 6) intron (NM_001307928, intron 5 of 6) 8101 NM_080474 89777 Hs.348541 NM_080474 ENSG00000166634 SERPINB12 YUKOPIN serpin family B member 12 protein-coding 244-51 chr6 137144845 137145095 + 1.25 NA 3' UTR (NM_052962, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_052962, exon 7 of 7) 28674 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 144-36 chr14 53072778 53072986 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 5 of 11) intron (NM_030637, intron 5 of 11) 80441 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 136.25-18 chr10 70876120 70876316 + 1.25 NA intron (NM_003901, intron 13 of 14) intron (NM_003901, intron 13 of 14) 11663 NM_001289797 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 164.5-37 chr12 42435069 42435234 + 1.25 NA intron (NM_016488, intron 9 of 12) intron (NM_016488, intron 9 of 12) 48464 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 175-127 chr8 34029317 34029484 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -429294 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 371.75-5 chr11 79367929 79368448 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) L2b|LINE|L2 33921 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 232.25-77 chr8 63743774 63744026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25530 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 326.75-9 chr14 83261100 83261569 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 618702 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 267.25-25 chr20 52490257 52490625 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -130397 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 210-77 chr5 90601882 90602084 + 1.25 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) intron (NR_003149, intron 1 of 89) 43186 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 314.5-11 chr2 83693166 83693547 + 1.25 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 170542 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 197-24 chr16 28945295 28945584 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -5558 NM_032815 84901 Hs.513470 NM_032815 ENSG00000176953 NFATC2IP ESC2|NIP45|RAD60 nuclear factor of activated T cells 2 interacting protein protein-coding 264.25-19 chr17 63363854 63364246 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 13 of 25) intron (NM_025185, intron 13 of 25) 76217 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 156-153 chr8 83909737 83909951 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -272943 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 226-67 chr8 49981670 49982079 + 1.25 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 70467 NR_135794 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 214.5-10 chr10 16247036 16247323 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -189764 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 231.5-26 chr14 46655650 46655969 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4028 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 355-6 chr13 81782154 81782627 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -555407 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 301.5-28 chr2 123119182 123119698 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -45959 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 182.75-22 chr10 24721044 24721315 + 1.25 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) intron (NM_001367447, intron 2 of 24) 1569 NM_001367453 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 272.25-63 chr8 121755374 121755801 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -114147 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 174.5-136 chr4 79337217 79337441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11268 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 384.75-10 chr3 89244437 89244816 + 1.25 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 137005 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 216.75-31 chr17 70583644 70583894 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 414234 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 175.25-113 chr5 38761398 38761631 + 1.25 NA intron (NR_109951, intron 2 of 3) intron (NR_109951, intron 2 of 3) -41241 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 154-81 chr20 36033205 36033396 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17660 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 296-44 chr8 110317732 110318249 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -342219 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 171-90 chr3 49007564 49007847 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001320547) promoter-TSS (NM_001320547) 100 NM_001320547 11180 Hs.654815 NM_018031 ENSG00000178252 WDR6 - WD repeat domain 6 protein-coding 178.75-105 chr8 71734360 71734629 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -108629 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 141.25-106 chr3 28884579 28884791 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 309407 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 148.25-93 chr3 59519906 59520097 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 138496 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 251.5-73 chr6 111169683 111170248 + 1.25 NA intron (NM_018593, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 56131 NR_145796 109623478 NR_145796 SNORD166 - small nucleolar RNA, C/D box 166 snoRNA 245.75-41 chr4 37675893 37676111 + 1.25 NA intron (NM_001085400, intron 1 of 6) intron (NM_001085400, intron 1 of 6) 10374 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 276.75-26 chr2 116754642 116755000 + 1.25 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -1059870 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 260.5-7 chr10 109123696 109124089 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 799354 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 212.25-8 chr10 18135558 18135779 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4756 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 163.5-125 chr3 55831557 55831735 + 1.25 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) L1PA4|LINE|L1 20948 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 133.5-136 chr20 38036799 38036991 + 1.25 NA intron (NM_021215, intron 1 of 6) MER3|DNA|hAT-Charlie 3149 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 126-78 chr18 3049393 3049507 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37503 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 226.25-42 chr21 22630481 22630678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -448705 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 216.25-69 chr3 101062252 101062461 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -68866 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 223.25-25 chr17 59247245 59247477 + 1.25 NA intron (NM_182569, intron 3 of 9) L1MC1|LINE|L1 26850 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 236-72 chrX 76308014 76308284 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -119561 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 374.75-8 chr3 120409105 120409548 + 1.25 NA intron (NM_007085, intron 6 of 10) intron (NM_007085, intron 6 of 10) -13597 NR_029584 406975 NR_029584 ENSG00000284121 MIR198 MIRN198|miR-198 microRNA 198 ncRNA 130.75-95 chr2 124728851 124729090 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 703683 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 136.25-8 chr1 158799179 158799306 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21607 NM_001005278 81442 Hs.554487 NM_001005278 ENSG00000188340 OR6N2 OR1-23 olfactory receptor family 6 subfamily N member 2 protein-coding 377.25-9 chr20 48392181 48392624 + 1.25 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 32491 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 168.75-116 chr5 161985706 161985888 + 1.25 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 15399 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 266.75-36 chr4 56388706 56389119 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -1404 NM_001286669 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 195.5-40 chr14 70414660 70414943 + 1.25 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) L3|LINE|CR1 2289 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 301.25-5 chr10 68098879 68099242 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6947 NR_045662 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 174.5-69 chr14 92557229 92557468 + 1.25 NA intron (NM_024832, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR -18886 NM_001319987 79890 Hs.326822 NM_024832 ENSG00000100599 RIN3 - Ras and Rab interactor 3 protein-coding 408-9 chr2 72709070 72709578 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 116709 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 182-54 chr2 8870812 8871119 + 1.25 NA intron (NR_135606, intron 8 of 12) intron (NR_135606, intron 8 of 12) -33352 NM_020738 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 131.5 chr1 14518594 14518799 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -79989 NM_201628 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 208.5-83 chr21 16565260 16565646 + 1.25 NA intron (NR_136547, intron 2 of 2) intron (NR_136547, intron 2 of 2) -23145 NR_136549 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 169.75-165 chr9 74986147 74986407 + 1.25 NA intron (NR_135282, intron 5 of 6) intron (NR_135282, intron 5 of 6) 33312 NR_121183 101927380 Hs.257556 NR_121183 CARNMT1-AS1 C9orf41-AS1 CARNMT1 antisense RNA 1 ncRNA 150.5-43 chr13 68352833 68352994 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 532412 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 163.25-59 chr2 17758904 17759193 + 1.25 NA intron (NM_001130009, intron 1 of 13) intron (NM_001130009, intron 1 of 13) 4910 NM_001130009 348654 Hs.467793 NM_182625 ENSG00000178295 GEN1 Gen GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease protein-coding 238-37 chr20 44457637 44457841 + 1.25 NA intron (NR_132343, intron 2 of 2) intron (NR_132343, intron 2 of 2) -7182 NR_109893 101927242 Hs.143307 NR_109893 ENSG00000168746 LINC01430 - long intergenic non-protein coding RNA 1430 ncRNA 169.25-106 chr7 24683360 24683555 + 1.25 NA intron (NM_016447, intron 12 of 12) L1MC5a|LINE|L1 74007 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 189-74 chr22 44588426 44588662 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 19204 NR_028409 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 258.5-11 chr11 81624570 81624934 + 1.25 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 266084 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 355.5-11 chr16 66443099 66443518 + 1.25 NA intron (NM_001178020, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 16013 NM_001178020 146227 Hs.97805 NM_001136106 ENSG00000166546 BEAN1 BEAN|SCA31 brain expressed associated with NEDD4 1 protein-coding 252.5-22 chr12 84129495 84129931 + 1.25 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 783086 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 361.75-16 chr6 161961679 161962013 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 490869 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 196.25-111 chr7 1776826 1777155 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -34680 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 203-21 chr11 32821233 32821458 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8582 NM_024081 79056 Hs.471695 NM_024081 ENSG00000135378 PRRG4 PRGP4|TMG4 proline rich and Gla domain 4 protein-coding 195.25-12 chr1 190952633 190952889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 275737 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 310.5-34 chr6 149451913 149452356 + 1.25 NA intron (NM_207360, intron 5 of 5) intron (NM_207360, intron 5 of 5) 32880 NM_207360 340152 Hs.632618 NM_207360 ENSG00000178199 ZC3H12D C6orf95|MCPIP4|TFL|dJ281H8.1|p34 zinc finger CCCH-type containing 12D protein-coding 157.75-54 chr15 65586073 65586310 + 1.25 NA intron (NR_045106, intron 9 of 11) intron (NR_045106, intron 9 of 11) 24940 NR_045901 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 161-63 chr2 76088222 76088412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -377402 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 193.5-49 chr14 69063124 69063296 + 1.25 NA intron (NM_003861, intron 7 of 8) intron (NM_003861, intron 7 of 8) 83528 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 249.25-22 chr2 69206006 69206391 + 1.25 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 102516 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 151.75-117 chr5 129569922 129570094 + 1.25 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) L1ME1|LINE|L1 -109319 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 192-29 chr11 90244882 90245172 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -6205 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 192.75-67 chr2 221393072 221393323 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 179107 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 287.25-26 chr2 102783087 102783479 + 1.25 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) intron (NM_001321346, intron 3 of 3) 21252 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 373.25-17 chr8 92576816 92577259 + 1.25 NA intron (NR_125827, intron 3 of 4) L1ME3A|LINE|L1 78457 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 220.75-37 chr19 44000826 44001208 + 1.25 NA intron (NR_110727, intron 1 of 2) intron (NR_110727, intron 1 of 2) 1853 NR_110727 101928063 Hs.502127 NR_110727 ENSG00000266921 LOC101928063 - uncharacterized LOC101928063 ncRNA 206.25-39 chr14 73158593 73158885 + 1.25 NA intron (NM_000021, intron 3 of 11) AluJr|SINE|Alu 22232 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 239.25-46 chr2 51366924 51367276 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 334499 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 290.75-8 chr10 114710669 114710981 + 1.25 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) -25822 NM_001322882 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 118.25-6 chr1 53127606 53127700 + 1.25 NA intron (NR_109858, intron 2 of 10) intron (NR_109858, intron 2 of 10) 14985 NM_001287595 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 247.75-42 chr4 72095825 72096225 + 1.25 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 56893 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 206.25-87 chr5 128660372 128660639 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -122260 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 256.25-26 chr22 45666452 45666832 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5156 NM_001167621 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 145.5-129 chr3 33982617 33982808 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 184082 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 122.25-4 chr1 105407558 105407728 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 211292 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 279.5-29 chr2 115110964 115111386 + 1.25 NA intron (NM_001178037, intron 1 of 25) intron (NM_001178037, intron 1 of 25) 46602 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 216.75-25 chr14 72049814 72050001 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 116380 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 167.5-22 chr10 31860574 31860749 + 1.25 NA intron (NM_001270696, intron 4 of 17) intron (NM_001270696, intron 4 of 17) 48265 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 155-91 chr4 32854940 32855113 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 503988 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 217.75-14 chr10 53601563 53601869 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -830016 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 154-3 chr1 62784625 62784860 + 1.25 NA intron (NM_032852, intron 1 of 10) intron (NM_032852, intron 1 of 10) 610 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 217-31 chr2 57314109 57314371 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -593411 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 197.5-41 chr14 103645322 103645592 + 1.25 NA intron (NM_182923, intron 1 of 14) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 16269 NM_005552 3831 Hs.20107 NM_005552 ENSG00000126214 KLC1 KLC|KNS2|KNS2A kinesin light chain 1 protein-coding 228.75-55 chr4 25268398 25268636 + 1.25 NA non-coding (NR_144633, exon 8 of 10) non-coding (NR_144633, exon 8 of 10) 34484 NM_018323 55300 Hs.191701 NM_018323 ENSG00000038210 PI4K2B PI4KIIB|PIK42B phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta protein-coding 291.75-11 chr13 73262130 73262422 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 203271 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 266.75-30 chr20 62314375 62314663 + 1.25 NA intron (NM_005560, intron 61 of 79) intron (NM_005560, intron 61 of 79) 11522 NM_007002 11047 Hs.90107 NM_007002 ENSG00000130706 ADRM1 ARM-1|ARM1|GP110 adhesion regulating molecule 1 protein-coding 305-27 chr3 137087881 137088306 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 130110 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 351-14 chr3 179794236 179794584 + 1.25 NA TTS (NM_001349395) TTS (NM_001349395) -103784 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 245.5-84 chr8 140866343 140866845 + 1.25 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) MIR|SINE|MIR -133941 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 145-49 chr15 59950078 59950319 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -54113 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 378.5-20 chr8 96436377 96436772 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -49136 NR_125828 102724804 Hs.571415 NR_125828 ENSG00000253105 LOC102724804 - uncharacterized LOC102724804 ncRNA 149.5-195 chr7 138936975 138937133 + 1.25 NA intron (NM_020910, intron 1 of 19) L2b|LINE|L2 44335 NM_001164665 57670 Hs.605380 NM_020910 ENSG00000122778 KIAA1549 - KIAA1549 protein-coding 163.5-69 chr16 66212947 66213150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153643 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 248.75-55 chr6 142769189 142769523 + 1.25 NA intron (NM_006734, intron 5 of 9) intron (NM_006734, intron 5 of 9) -131467 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 299.75-26 chrX 44643453 44643748 + 1.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -100741 NM_173794 139341 Hs.7549 NM_173794 ENSG00000069509 FUNDC1 - FUN14 domain containing 1 protein-coding 200.75-15 chr11 24905654 24905915 + 1.25 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 408731 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 350-16 chr5 118640390 118640796 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 44405 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 291.5-6 chr1 208037900 208038194 + 1.25 NA intron (NM_025179, intron 26 of 31) intron (NM_025179, intron 26 of 31) -126922 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 227-18 chr14 23658873 23659220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22682 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 165.75-8 chr1 163195905 163196223 + 1.25 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 6852 NM_003617 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 336-5 chr11 113444264 113444828 + 1.25 NA intron (NM_016574, intron 1 of 6) intron (NM_016574, intron 1 of 6) 5542 NR_036183 100422855 NR_036183 ENSG00000265140 MIR4301 - microRNA 4301 ncRNA 205.75-28 chr15 93072924 93073164 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001166286, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_001166286, exon 1 of 3) 112 NM_001166286 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 166.75-114 chr5 64280001 64280218 + 1.25 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) L1PA13|LINE|L1 114266 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 167.5-108 chr21 28877962 28878207 + 1.25 NA intron (NM_013240, intron 5 of 5) intron (NM_013240, intron 5 of 5) 7283 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 242.5-25 chr12 7748459 7748681 + 1.25 NA intron (NM_203503, intron 1 of 5) intron (NM_203503, intron 1 of 5) 971 NM_130441 170482 Hs.351812 NM_130441 ENSG00000198178 CLEC4C BDCA2|CD303|CLECSF11|CLECSF7|DLEC|HECL|PRO34150 C-type lectin domain family 4 member C protein-coding 346.25-19 chr8 122375451 122375923 + 1.25 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 192957 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 234.75-10 chr10 43734170 43734395 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 44543 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 265.75-16 chr14 54056181 54056489 + 1.25 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -99444 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 186.5-112 chr5 150491188 150491431 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5317 NR_105061 102546298 Hs.570892 NR_105061 ENSG00000254333 NDST1-AS1 - NDST1 antisense RNA 1 ncRNA 130-167 chr8 93132719 93132881 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 34050 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 141-150 chr7 91416906 91417102 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 152571 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 210.5-15 chr10 60050492 60050769 + 1.25 NA intron (NM_001204403, intron 42 of 43) intron (NM_001204403, intron 42 of 43) -89717 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 176.5-86 chr2 32680525 32680774 + 1.25 NA intron (NM_017735, intron 9 of 19) L2|LINE|L2 45394 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 169.5-37 chr12 60754562 60754738 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1065280 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 115-3 chr1 64217873 64218025 + 1.25 NA intron (NR_158768, intron 6 of 9) intron (NR_158768, intron 6 of 9) 14326 NM_001366234 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 174.25-36 chr12 47386724 47387020 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22603 NR_039715 100616478 NR_039715 ENSG00000264906 MIR4494 - microRNA 4494 ncRNA 209.5-145 chr8 116772461 116772639 + 1.25 NA 3' UTR (NM_032334, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_032334, exon 3 of 3) 6026 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 202.75-75 chr3 132830345 132830632 + 1.25 NA intron (NR_002811, intron 9 of 10) AluJb|SINE|Alu -108029 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 266-28 chr3 44276738 44277101 + 1.25 NA intron (NM_001145030, intron 8 of 19) AluSc|SINE|Alu 35033 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 208.5-103 chr4 156098106 156098472 + 1.25 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -144423 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 202.5-115 chr5 53471895 53472148 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8608 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 253.5-54 chr3 193473207 193473510 + 1.25 NA intron (NM_032279, intron 8 of 29) L1MC4|LINE|L1 -79855 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 409.75-9 chr9 90933894 90934355 + 1.25 NA Intergenic MER97b|DNA|hAT-Tip100 106704 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 133-154 chr7 35796396 35796618 + 1.25 NA intron (NR_120512, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 4118 NR_120511 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 158-140 chr8 101548380 101548551 + 1.25 NA intron (NM_024915, intron 2 of 15) intron (NM_024915, intron 2 of 15) 56026 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 181.5-120 chr4 60243002 60243157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -679540 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 232.25-86 chr9 3716886 3717159 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 48936 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 148-15 chr11 97254756 97254892 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 746399 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 265.25-57 chr9 76088357 76088640 + 1.25 NA intron (NR_120409, intron 7 of 19) intron (NR_120409, intron 7 of 19) 197825 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 430-5 chr15 63380283 63380945 + 1.25 NA intron (NR_135511, intron 1 of 9) intron (NR_135511, intron 1 of 9) 1232 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 337.25-12 chr3 132740468 132740860 + 1.25 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18205 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 147.75-135 chr6 84635719 84635946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53626 NR_125877 102724201 Hs.667523 NR_125875 ENSG00000228290 TBX18-AS1 - TBX18 antisense RNA 1 ncRNA 176.75-58 chr2 29436945 29437194 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) 38308 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 119-31 chr11 113548023 113548199 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -72713 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 130.5-210 chr5 169947798 169948005 + 1.25 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) intron (NM_001346304, intron 1 of 3) 32594 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 174.75-142 chr9 93757327 93757582 + 1.25 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -61903 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 150.25-103 chr3 98728396 98728566 + 1.25 NA intron (NR_046683, intron 1 of 4) L1M2|LINE|L1 -3755 NM_001271142 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 318-12 chr18 2614342 2614988 + 1.25 NA intron (NM_006101, intron 16 of 16) intron (NM_006101, intron 16 of 16) 40730 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 304.5 chr1 86940081 86940392 + 1.25 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 25601 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 336.25-12 chr2 112318822 112319232 + 1.25 NA intron (NM_198581, intron 7 of 11) L1MC5a|LINE|L1 43430 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 339.25-21 chr5 107375081 107375520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 295637 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 371.5-13 chr5 165924952 165925487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1001151 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 236.75-39 chr4 101128962 101129190 + 1.25 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) L1PA7|LINE|L1 111796 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 228.5 chr1 11270018 11270452 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2963 NM_001330350 29914 Hs.522933 NM_013319 ENSG00000120942 UBIAD1 SCCD|TERE1 UbiA prenyltransferase domain containing 1 protein-coding 159.5-192 chr7 15900791 15900994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 212514 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 246.5-53 chr3 21895397 21895601 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -61640 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 256.25-4 chr10 32643135 32643682 + 1.25 NA intron (NM_001321115, intron 21 of 43) L1M5|LINE|L1 197268 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 161.5-45 chr12 61132418 61132750 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 1060255 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 214.5-119 chr7 79868944 79869195 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -265762 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 161.5-146 chr4 73433300 73433629 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2757 NM_001134 174 Hs.518808 NM_001134 ENSG00000081051 AFP AFPD|FETA|HPAFP alpha fetoprotein protein-coding 190.75-62 chr3 40666626 40666778 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 141742 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 198.75-77 chr5 104235523 104235755 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -672850 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 130.5-200 chr5 39523914 39524082 + 1.25 NA intron (NR_104632, intron 2 of 2) intron (NR_104632, intron 2 of 2) 3567 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 223-58 chr4 87136977 87137302 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001313959, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001313959, exon 20 of 20) 83129 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 143.5-82 chr16 9893139 9893356 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) L1ME4a|LINE|L1 288820 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 269.25-62 chrX 54307592 54307807 + 1.25 NA intron (NM_001002838, intron 5 of 22) intron (NM_001002838, intron 5 of 22) 50306 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 190.25-110 chr6 132674981 132675254 + 1.25 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -29091 NM_138327 134864 Hs.375030 NM_138327 ENSG00000146399 TAAR1 TA1|TAR1|TRAR1 trace amine associated receptor 1 protein-coding 255-34 chr3 52136248 52136519 + 1.25 NA intron (NM_015426, intron 7 of 10) intron (NM_015426, intron 7 of 10) 18040 NM_001161580 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 189.25-8 chr1 244321594 244321842 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -30917 NM_001276349 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 116.75-15 chr1 201243282 201243467 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -40078 NM_000299 5317 Hs.497350 NM_000299 ENSG00000081277 PKP1 B6P plakophilin 1 protein-coding 166.5-177 chr6 116803965 116804180 + 1.25 NA intron (NM_001286354, intron 3 of 5) intron (NM_001286354, intron 3 of 5) 24985 NM_001286354 222545 Hs.266745 NM_148963 ENSG00000173612 GPRC6A GPCR|bA86F4.3 G protein-coupled receptor class C group 6 member A protein-coding 185.5-83 chr2 138073903 138074112 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27877 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 202.5-109 chr5 7521606 7521827 + 1.25 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) intron (NM_020546, intron 3 of 24) 125578 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 366.75-13 chr3 43159922 43160254 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54009 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 319-10 chr12 112355475 112355861 + 1.25 NA intron (NM_001109662, intron 1 of 75) AluSx|SINE|Alu 26763 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 191-76 chr8 54325179 54325448 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -5373 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 293.75-19 chr17 70725836 70726387 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 476068 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 138.75-26 chr11 8394258 8394425 + 1.25 NA intron (NM_001352399, intron 11 of 11) intron (NM_001352399, intron 11 of 11) -125554 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 280-32 chr2 227453714 227454173 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -18189 NR_049888 100847081 NR_049888 ENSG00000284092 MIR5703 mir-5703 microRNA 5703 ncRNA 248-21 chr14 44787171 44787596 + 1.25 NA intron (NR_146457, intron 2 of 4) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 11743 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 169-13 chr11 21350845 21351005 + 1.25 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 681339 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 166.25-123 chr5 30093594 30093954 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 213214 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 116.75-106 chr2 237140660 237140807 + 1.25 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 54844 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 226-46 chr3 175406893 175407314 + 1.25 NA intron (NM_207015, intron 5 of 13) AluSx|SINE|Alu 37563 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 157.25-93 chr3 85846992 85847234 + 1.25 NA intron (NM_001256502, intron 3 of 10) intron (NM_001256502, intron 3 of 10) -19063 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 221.25-80 chr6 149187160 149187471 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -30609 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 258.75-43 chr2 197816270 197816743 + 1.25 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11913 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 373.75-3 chr12 65519490 65520032 + 1.25 NA intron (NR_120431, intron 2 of 3) L1PA10|LINE|L1 37550 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 281.25-10 chr11 26728110 26728352 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6171 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 330.25-23 chr7 83495330 83495802 + 1.25 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 145865 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 272-20 chr21 18275174 18275480 + 1.25 NA exon (NM_002772, exon 24 of 25) exon (NM_002772, exon 24 of 25) 29452 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 275.75-35 chr4 48387150 48387588 + 1.25 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) intron (NM_020846, intron 6 of 7) 45840 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 239.25-72 chr5 80899956 80900381 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60195 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 265-31 chr4 121458864 121459234 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78031 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 268.5-8 chr10 59576968 59577213 + 1.25 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 132801 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 116.5-260 chr8 143329761 143329913 + 1.25 NA intron (NM_052963, intron 2 of 13) intron (NM_052963, intron 2 of 13) 5043 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 342.5-20 chr22 24719446 24719931 + 1.25 NA intron (NM_001008496, intron 20 of 20) intron (NM_001008496, intron 20 of 20) -44813 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 284.5-10 chr13 48085759 48086134 + 1.25 NA intron (NM_014166, intron 3 of 6) intron (NM_014166, intron 3 of 6) 8809 NR_046511 100873965 Hs.616241 NR_046511 ENSG00000229111 MED4-AS1 MED4-AS MED4 antisense RNA 1 ncRNA 182.5-139 chr6 41917652 41917892 + 1.25 NA intron (NR_131160, intron 1 of 2) MER113|DNA|hAT-Charlie 3171 NM_001305456 9477 Hs.278434 NM_004275 ENSG00000124641 MED20 PRO0213|SRB2|TRFP mediator complex subunit 20 protein-coding 398.75-4 chr2 219989505 219990254 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83314 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 188-79 chr8 87754988 87755203 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 118920 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 188-36 chr2 64540274 64540647 + 1.25 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) intron (NM_001002243, intron 1 of 8) 14947 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 292-34 chr5 37576183 37576458 + 1.25 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) L2a|LINE|L2 197002 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 326-24 chr5 45769130 45769529 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72949 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 283.5-41 chr3 25643566 25643918 + 1.25 NA exon (NM_001068, exon 3 of 36) exon (NM_001068, exon 3 of 36) 20630 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 220-41 chr3 107647179 107647608 + 1.25 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) intron (NM_001276286, intron 3 of 16) 124431 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 331.5-25 chr6 154249546 154249847 + 1.25 NA intron (NM_001130699, intron 4 of 12) intron (NM_001130699, intron 4 of 12) 80385 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 270.5-24 chr16 81560492 81560927 + 1.25 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 26807 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 184.75-25 chr13 38504942 38505182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62662 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 138.5-143 chr4 33263128 33263291 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 776684 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 143.5-166 chr4 130462819 130462990 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 86543 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 156.75-70 chr17 68053196 68053358 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17317 NM_001320611 3838 Hs.594238 NM_002266 ENSG00000182481 KPNA2 IPOA1|QIP2|RCH1|SRP1-alpha|SRP1alpha karyopherin subunit alpha 2 protein-coding 128.5-42 chr11 82872252 82872375 + 1.25 NA intron (NM_005040, intron 1 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 28117 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 176.5-76 chr18 66421746 66422103 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182166 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 148.75-150 chr6 165402018 165402176 + 1.25 NA intron (NM_006661, intron 14 of 22) MIRb|SINE|MIR -92492 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 124.25-158 chr5 22600714 22600854 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 252560 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 245-61 chr6 45704451 45704674 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 233035 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 254.5-20 chr12 30700664 30701026 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4976 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 222.75-63 chr2 98834450 98834746 + 1.25 NA intron (NM_207362, intron 3 of 9) L1MC5a|LINE|L1 -62700 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 193.5-153 chr7 66898372 66898628 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -5620 NR_136637 644794 Hs.552124 NR_136637 LINC02604 lncHERG long intergenic non-protein coding RNA 2604 ncRNA 350.25-3 chr10 27130133 27130542 + 1.25 NA intron (NM_139312, intron 9 of 19) L2a|LINE|L2 24047 NM_014263 10730 Hs.74647 NM_014263 ENSG00000136758 YME1L1 FTSH|MEG4|OPA11|PAMP|YME1L YME1 like 1 ATPase protein-coding 117.5-102 chr2 58669199 58669380 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) L1MEd|LINE|L1 148536 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 156.75-81 chr2 35783934 35784109 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 312616 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 307-6 chr10 35133134 35133515 + 1.25 NA intron (NM_183060, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu -4458 NM_183011 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 238-40 chr22 28895892 28896241 + 1.25 NA intron (NM_001206998, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 12494 NM_001206998 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 139.25-47 chr14 41524042 41524220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -82725 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 172.5-59 chr13 50029896 50030209 + 1.25 NA intron (NR_152566, intron 8 of 13) intron (NR_152566, intron 8 of 13) 14608 NM_199464 283518 Hs.660161 NM_173605 ENSG00000198553 KCNRG DLTET potassium channel regulator protein-coding 212.25-103 chr9 28855535 28855908 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 7985 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 143-142 chr8 72514563 72514758 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -22565 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 207.5-71 chr3 175931670 175931863 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -155433 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 217-35 chr2 115765982 115766277 + 1.25 NA intron (NM_001321912, intron 13 of 25) L2a|LINE|L2 422314 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 198-58 chr4 89294258 89294460 + 1.25 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) FLAM_C|SINE|Alu 13441 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 173.25-122 chr8 3593692 3593916 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 8 of 69) intron (NM_033225, intron 8 of 69) -865353 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 121.75-69 chr19 383449 383581 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7489 NM_016585 51298 Hs.250002 NM_016585 ENSG00000105549 THEG CT56|THEG1 theg spermatid protein protein-coding 233.75-32 chr17 50374651 50374938 + 1.25 NA intron (NM_152463, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 1565 NM_152463 146956 Hs.514330 NM_152463 ENSG00000154920 EME1 MMS4L|SLX2A essential meiotic structure-specific endonuclease 1 protein-coding 137.5-187 chr5 30289576 30289792 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 409124 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 258-28 chr2 228745600 228745838 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -134324 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 208.25-2 chr1 49528851 49529214 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 -56947 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 208.75-61 chr4 106896466 106896778 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 139691 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 233.25-25 chr14 49614945 49615169 + 1.25 NA TTS (NM_203467) TTS (NM_203467) 5569 NM_001001 6166 Hs.444749 NM_001001 ENSG00000165502 RPL36AL RPL36A ribosomal protein L36a like protein-coding 141.25-102 chr22 31428858 31429102 + 1.25 NA intron (NM_004147, intron 8 of 8) L1MC4a|LINE|L1 29376 NM_004147 4733 Hs.115242 NM_004147 ENSG00000185721 DRG1 NEDD3 developmentally regulated GTP binding protein 1 protein-coding 182.25-131 chr9 72661618 72661825 + 1.25 NA intron (NM_138691, intron 5 of 23) intron (NM_138691, intron 5 of 23) 139920 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 198.25-92 chr7 29262260 29262547 + 1.25 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -53433 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 191.75-54 chr18 67812803 67813210 + 1.25 NA intron (NR_146471, intron 1 of 1) L1MB5|LINE|L1 1816 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 281.5-43 chr5 86163998 86164268 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -118311 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 316-18 chr18 69994069 69994595 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37533 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 140-83 chr2 227847175 227847485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24046 NM_001330004 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 189.75-21 chr12 30152918 30153145 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -368272 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 237-47 chr5 135686283 135686597 + 1.25 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 -32505 NR_027127 340074 Hs.434633 NR_027127 ENSG00000251045 SLC25A48-AS1 LINC01959 SLC25A48 antisense RNA 1 ncRNA 241.75-39 chr2 59890043 59890298 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 492866 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 342.75-19 chr4 91928673 91929087 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 348422 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 305.75-9 chr17 76596623 76597044 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10973 NM_006456 10610 Hs.592105 NM_006456 ENSG00000070731 ST6GALNAC2 SAITL1|SIAT7|SIAT7B|SIATL1|ST6GalNAII|STHM ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 164.5-103 chr2 149922325 149922474 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -63208 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 145-11 chr1 168433175 168433363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10613 NR_037851 100505918 Hs.568494 NR_037851 LOC100505918 - uncharacterized LOC100505918 ncRNA 281.25-6 chr10 32750352 32750833 + 1.25 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) LTR33|LTR|ERVL 150880 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 170.75-47 chr16 79069751 79070053 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 530835 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 188.25-16 chr11 8502011 8502236 + 1.25 NA intron (NM_001352388, intron 1 of 14) L1MB7|LINE|L1 91853 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 299.5-35 chr6 81041977 81042248 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 710569 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 193.5-137 chr5 148873692 148873925 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47215 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 191.5-55 chr16 89981042 89981245 + 1.25 NA intron (NR_003228, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu -8311 NM_145039 92806 Hs.513832 NM_145039 ENSG00000177946 CENPBD1 - CENPB DNA-binding domain containing 1 protein-coding 125-10 chr1 105430932 105431207 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 187866 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 231-5 chr1 209933896 209934254 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4099 NR_027459 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 192.75-85 chr3 65750507 65750755 + 1.25 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie -143185 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 355.5-2 chr1 187787768 187788065 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 344288 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 175-101 chr5 87845343 87845543 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 183401 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 239.25-36 chr17 51070499 51070847 + 1.25 NA intron (NM_001130527, intron 2 of 29) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -23795 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 163-68 chr3 8411535 8411761 + 1.25 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 90010 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 265.5-18 chr13 86117597 86117905 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -318332 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 209-71 chr8 85916439 85916630 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88592 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 217-77 chr7 13342750 13342990 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 643644 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 112.25-104 chr2 166166851 166167005 + 1.25 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17767 NM_001353950 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 323.25-15 chr3 30010356 30010713 + 1.25 NA TTS (NM_001177711) TTS (NM_001177711) -76378 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 249.25-51 chr7 123474518 123474849 + 1.25 NA intron (NR_104245, intron 7 of 11) intron (NR_104245, intron 7 of 11) 58265 NR_104244 154865 Hs.159650 NM_178827 ENSG00000164675 IQUB - IQ motif and ubiquitin domain containing protein-coding 247-27 chr2 7057228 7057453 + 1.25 NA intron (NM_001349181, intron 8 of 9) intron (NM_001349181, intron 8 of 9) 20540 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 129.75-189 chr8 134991027 134991173 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 141165 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 209.25-113 chr8 130285892 130286103 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 10536 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 173-87 chr3 88157784 88158017 + 1.25 NA TTS (NM_173824) TTS (NM_173824) 7941 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 187-101 chr8 112767452 112767612 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) MIR|SINE|MIR 124039 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 258.25-9 chr10 39499028 39499377 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 802606 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 170.75-96 chr4 56412605 56412781 + 1.25 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 22922 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 340.25-13 chr4 66920045 66920535 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 501710 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 204.5-77 chr21 27484003 27484290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -238233 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 175-6 chr1 159167825 159168032 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3687 NM_001127173 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 276-54 chr9 27550033 27550524 + 1.25 NA intron (NM_001256054, intron 9 of 10) intron (NM_001256054, intron 9 of 10) -20464 NM_024761 79817 Hs.369022 NM_024761 ENSG00000120162 MOB3B C9orf35|MOB1D|MOBKL2B MOB kinase activator 3B protein-coding 145.75-23 chr11 34912143 34912295 + 1.25 NA intron (NM_015957, intron 1 of 6) intron (NM_015957, intron 1 of 6) -3911 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 244-19 chr17 59329014 59329246 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2525 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 271.5-94 chr8 140409417 140409720 + 1.25 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) L1MC4|LINE|L1 48176 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 140-50 chr15 98121534 98121803 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32915 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 195.25 chr1 11156840 11157052 + 1.25 NA intron (NM_004958, intron 30 of 57) intron (NM_004958, intron 30 of 57) 13048 NR_046600 100873935 Hs.679133 NR_046600 ENSG00000225602 MTOR-AS1 - MTOR antisense RNA 1 ncRNA 324.75-25 chr5 56955872 56956259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3935 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 158-129 chr7 70756645 70756796 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 6 of 18) MER20B|DNA|hAT-Charlie -375424 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 283.25-6 chr1 217398842 217399108 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 232115 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 182.5-174 chr9 33890475 33890646 + 1.25 NA intron (NM_017811, intron 2 of 4) AluSx1|SINE|Alu 43804 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 144.25-24 chr10 34133125 34133403 + 1.25 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) LTR1F1|LTR|ERV1 -360584 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 168.25-84 chr2 167688038 167688194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130556 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 244.25-12 chr12 126844463 126844708 + 1.25 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 30105 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 252.5-80 chr8 84126861 84127162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55776 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 157-78 chr3 121280016 121280200 + 1.25 NA intron (NM_001348345, intron 19 of 26) intron (NM_001348345, intron 19 of 26) 230468 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 157.75-18 chr10 81047218 81047385 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 397504 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 171-67 chr2 73523915 73524298 + 1.25 NA intron (NM_015120, intron 11 of 22) L1M5|LINE|L1 67003 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 331.75-25 chr7 127745838 127746184 + 1.25 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) intron (NM_014390, intron 10 of 23) 93817 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 255.25-19 chr19 37589278 37589650 + 1.25 NA intron (NM_016536, intron 1 of 3) L1MC5a|LINE|L1 5282 NM_001321272 51276 Hs.590944 NM_016536 ENSG00000180479 ZNF571 HSPC059 zinc finger protein 571 protein-coding 255-22 chr19 50743654 50744037 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 20481 NM_002975 6320 Hs.512680 NM_002975 ENSG00000105472 CLEC11A CLECSF3|LSLCL|P47|SCGF C-type lectin domain containing 11A protein-coding 144.75-35 chr11 114484771 114484903 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 45370 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 286.25-27 chr7 109034511 109034841 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -150089 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 129.25-167 chr6 64365469 64365604 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 558700 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 248-37 chr2 137268800 137269316 + 1.25 NA intron (NM_001316349, intron 10 of 27) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 503513 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 141.75-154 chr6 121093919 121094113 + 1.25 NA intron (NR_104452, intron 34 of 35) intron (NR_104452, intron 34 of 35) 240464 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 132 chr1 43045294 43045495 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 86345 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 148.5-17 chr1 206001291 206001588 + 1.25 NA intron (NM_001164522, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 1956 NM_001304839 338382 Hs.534612 NM_177403 ENSG00000276600 RAB7B RAB7 RAB7B, member RAS oncogene family protein-coding 204.25-78 chr4 61928360 61928568 + 1.25 NA intron (NM_001322246, intron 12 of 25) intron (NM_001322246, intron 12 of 25) 233301 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 123.75-160 chr6 103926293 103926437 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 933181 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 261.25-30 chr4 21292805 21293145 + 1.25 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 10931 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 224.5-59 chr2 50428111 50428461 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) AluJr|SINE|Alu -80530 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 197.5-71 chr2 103532325 103532562 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -548014 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 232.5-88 chr5 173965148 173965410 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23891 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 244.5-16 chr10 103595546 103595805 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014631, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_014631, exon 14 of 14) -78233 NR_120676 102724341 Hs.599425 NR_120675 ENSG00000235470 NEURL1-AS1 - NEURL1 antisense RNA 1 ncRNA 168.25-116 chr5 75919547 75919699 + 1.25 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -163760 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 230.25-65 chr4 141727045 141727301 + 1.25 NA intron (NR_037840, intron 5 of 7) L1MC2|LINE|L1 90590 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 209.5-75 chr2 223859067 223859346 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21624 NM_001039569 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 200.75-113 chr9 73911930 73912268 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -459432 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 388-13 chr8 81400871 81401455 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 46276 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 144-41 chr15 33949331 33949478 + 1.25 NA intron (NM_020371, intron 2 of 5) L1MA4|LINE|L1 -19093 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 151.5-158 chr5 121265818 121266028 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -56627 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 193.75-5 chr1 72518378 72518607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -235953 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 233.25-64 chr6 76806280 76806572 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -212803 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 353-16 chr20 54048124 54048446 + 1.25 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) intron (NM_001366297, intron 3 of 8) 10735 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 147.5-32 chr11 28585931 28586144 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -108489 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 370.25-13 chr8 29540912 29541410 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -190477 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 303.25-2 chr1 57952364 57952622 + 1.25 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) intron (NM_021080, intron 1 of 16) 91912 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 243-21 chr14 67257548 67258026 + 1.25 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) HAL1|LINE|L1 16352 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 253.5-15 chr11 99958274 99958491 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 7 of 23) L2|LINE|L2 402237 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 118.25-62 chr14 29884278 29884441 + 1.25 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 42737 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 275-6 chr10 43660376 43660808 + 1.25 NA intron (NR_038867, intron 1 of 4) intron (NR_038867, intron 1 of 4) -11711 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 233-21 chr14 96632564 96632842 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -108488 NR_146552 105370646 NR_146552 ENSG00000258979 LINC02299 - long intergenic non-protein coding RNA 2299 ncRNA 165-124 chr6 161558244 161558415 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 8 of 11) AluJr|SINE|Alu 87352 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 295.25-15 chr20 20689354 20689698 + 1.25 NA intron (NM_020343, intron 1 of 39) AluSc|SINE|Alu 23118 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 124-114 chr3 123853346 123853522 + 1.25 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 30898 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 166-103 chr5 115316669 115317040 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20200 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 257.75-49 chr8 52910649 52910895 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29136 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 423.25-3 chr15 77231838 77232250 + 1.25 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) -6640 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 342.75-2 chr1 64157523 64157930 + 1.25 NA intron (NM_005012, intron 7 of 8) L2c|LINE|L2 -43935 NR_110665 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 157-45 chr17 70190526 70190710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21083 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 337-10 chr14 59587689 59588205 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11135 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 196.75-12 chr10 22165735 22165988 + 1.25 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL 44122 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 181.5-87 chr2 150905751 150905968 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 276962 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 356.75-9 chr20 47944568 47945096 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38394 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 176.5-135 chr4 69603051 69603385 + 1.25 NA intron (NM_001301239, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 36424 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 290.75-13 chr14 53032470 53032951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -81613 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 264.5-29 chr18 11180989 11181364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32414 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 169-95 chr7 13774001 13774252 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 212388 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 395.25-6 chr2 121793239 121793801 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 37869 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 176.5-136 chr4 87568702 87568979 + 1.25 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -39337 NM_004684 8404 Hs.62886 NM_004684 ENSG00000152583 SPARCL1 MAST 9|MAST9|PIG33|SC1 SPARC like 1 protein-coding 300.5-34 chr4 61465079 61465348 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 263041 NM_001371342 191-80 chr8 87279909 87280182 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) intron (NM_173538, intron 6 of 10) 413630 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 123-188 chr8 109287543 109287793 + 1.25 NA intron (NM_032869, intron 5 of 9) L1PA16|LINE|L1 42265 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 290-34 chr3 34160289 34160723 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 361876 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 330.75-9 chr18 40936426 40936703 + 1.25 NA Intergenic Eulor11|DNA|DNA 584113 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 118.25-3 chr1 28945617 28945745 + 1.25 NA intron (NM_001166006, intron 1 of 14) intron (NM_001166006, intron 1 of 14) 31105 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 151-124 chr7 30092857 30093062 + 1.25 NA intron (NM_001350973, intron 13 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -42027 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 441.5-4 chr12 64062618 64063182 + 1.25 NA intron (NM_001346201, intron 6 of 21) L1MB8|LINE|L1 159396 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 139.75-174 chr8 86096836 86097032 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -1976 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 314-5 chr10 111057171 111057516 + 1.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -19686 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 124.25-30 chr11 54781290 54781415 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 74520 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 154.5-133 chr3 178161592 178161741 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -257535 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 221.25-17 chr12 20165687 20165929 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -37907 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 173.25-68 chr21 33762987 33763187 + 1.25 NA intron (NM_001001132, intron 9 of 29) L1MC5|LINE|L1 120586 NM_001001132 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 272.5-30 chr16 65198922 65199367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22571 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 427.25-5 chr5 6262767 6263425 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 74196 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 187.75-114 chr8 77159139 77159368 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -158209 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 189.25-29 chr13 83870333 83870613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11920 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 282.75-18 chr19 40630898 40631270 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 29715 NM_001042545 8425 Hs.466766 NM_003573 ENSG00000090006 LTBP4 ARCL1C|LTBP-4|LTBP4L|LTBP4S latent transforming growth factor beta binding protein 4 protein-coding 191-46 chr20 31233279 31233582 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24234 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 190.5-21 chr11 21422721 21423041 + 1.25 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L1M4c|LINE|L1 753295 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 197-56 chr5 170927342 170927642 + 1.25 NA intron (NM_022897, intron 12 of 27) L1ME4b|LINE|L1 65474 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 230.5-26 chr12 9584326 9584665 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23421 NM_002258 3820 Hs.169824 NM_002258 ENSG00000111796 KLRB1 CD161|CLEC5B|NKR|NKR-P1|NKR-P1A|NKRP1A|hNKR-P1A killer cell lectin like receptor B1 protein-coding 301.75-20 chr2 175567812 175568170 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -386281 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 310.25-9 chr17 74723906 74724234 + 1.25 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) MER4A1|LTR|ERV1 -11147 NM_001289082 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 204.25-8 chr10 55447112 55447366 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) HAL1|LINE|L1 -151803 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 235-74 chr8 137678596 137678811 + 1.25 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -265115 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 253.5-40 chr2 62999476 62999764 + 1.25 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) L1MB5|LINE|L1 48091 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 207.5-111 chr8 65834083 65834320 + 1.25 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 7863 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 124.75-43 chr11 48044996 48045133 + 1.25 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) -51718 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 215.5-108 chr8 110623658 110623993 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 403608 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 290.25-21 chr22 17382014 17382565 + 1.25 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) intron (NM_001290047, intron 1 of 18) 12829 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 280.25-4 chr1 210058378 210058990 + 1.25 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) intron (NM_153262, intron 4 of 7) 120467 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 141-132 chr5 108220433 108220553 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 5 of 8) L1MEc|LINE|L1 161605 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 267-45 chr7 6153375 6153648 + 1.25 NA intron (NM_032172, intron 14 of 17) intron (NM_032172, intron 14 of 17) 18626 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 262.75-35 chr3 95620756 95621125 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62253 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 190.25-83 chr3 30554882 30555116 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36131 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 181.25-104 chr5 131685039 131685195 + 1.25 NA intron (NM_133372, intron 11 of 17) AluJr4|SINE|Alu -49888 NM_001164386 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 330.75-11 chr2 40612652 40613014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100398 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 179.5-40 chr12 43071573 43071840 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83609 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 154.75-7 chr1 196499604 196499764 + 1.25 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) L1M6|LINE|L1 82797 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 255.25-42 chr5 144241497 144241817 + 1.25 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 36266 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 206-51 chr3 29819442 29819761 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) L1M5|LINE|L1 114555 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-143 chr8 58353866 58354149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57257 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 225.25-3 chr1 78722067 78722440 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72422 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 236-18 chr14 74040265 74040552 + 1.25 NA intron (NM_025057, intron 4 of 11) intron (NM_025057, intron 4 of 11) 21059 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 442.75-5 chr17 57540049 57540527 + 1.25 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) intron (NM_001322250, intron 7 of 13) -16691 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 122.25-46 chr12 80755531 80755670 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7554 NR_120469 101928420 Hs.739989 NR_120468 ENSG00000257741 LINC01490 - long intergenic non-protein coding RNA 1490 ncRNA 202.25-8 chr1 115084045 115084228 + 1.25 NA intron (NM_005725, intron 1 of 7) intron (NM_005725, intron 1 of 7) 5364 NM_001308315 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 245-32 chr2 99050497 99050736 + 1.25 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1MA9|LINE|L1 90564 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 187-81 chr5 149817423 149817785 + 1.25 NA intron (NM_001172699, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 45664 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 262.75-27 chr2 97723097 97723448 + 1.25 NA intron (NM_001079, intron 2 of 13) intron (NM_001079, intron 2 of 13) 9704 NM_001079 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 272.5-8 chr1 239689160 239689457 + 1.25 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) 29811 NR_103776 100506915 Hs.667175 NR_103776 ENSG00000233355 CHRM3-AS2 - CHRM3 antisense RNA 2 ncRNA 184.5-74 chr2 72558398 72558572 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) intron (NR_135774, intron 8 of 19) 267548 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 423.5-11 chr8 60322696 60323235 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41565 NM_004056 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 237.25-42 chr2 25831783 25832078 + 1.25 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) L1MD2|LINE|L1 -1029 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 315.5-12 chr2 137714585 137714959 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 213160 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 160.75-134 chr6 63220834 63221166 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 98977 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 357-19 chr8 77230011 77230523 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -220430 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 452-5 chr8 92789004 92789535 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -3209 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 248.5-100 chr8 64906960 64907320 + 1.25 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -108403 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 245-47 chr4 48657016 48657346 + 1.25 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) AluJr|SINE|Alu 123118 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 259-11 chr10 88456329 88456717 + 1.25 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) MIR3|SINE|MIR 126795 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 382-23 chr8 88418545 88418880 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -91229 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 179.75-128 chr8 17760937 17761229 + 1.25 NA intron (NM_001363061, intron 1 of 14) intron (NM_001363061, intron 1 of 14) -38508 NM_001166393 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 255.5-59 chr3 197120442 197120811 + 1.25 NA intron (NM_001366216, intron 10 of 23) intron (NM_001366216, intron 10 of 23) 63246 NM_001366222 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 259.25-28 chr3 103768145 103768532 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -244222 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 173.75-127 chr5 128828284 128828512 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136729 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 257.75-16 chr15 54126077 54126416 + 1.25 NA intron (NM_001329919, intron 2 of 31) L1MDa|LINE|L1 113598 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 132-169 chr8 17106650 17106783 + 1.25 NA intron (NR_146233, intron 12 of 15) intron (NR_146233, intron 12 of 15) -49766 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 198.5-57 chr17 9025230 9025659 + 1.25 NA intron (NM_004822, intron 2 of 6) intron (NM_004822, intron 2 of 6) 3934 NM_004822 9423 Hs.660885 NM_004822 ENSG00000065320 NTN1 MRMV4|NTN1L netrin 1 protein-coding 342.5-22 chr5 85827767 85828259 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -454431 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 152.5-102 chr20 50099138 50099316 + 1.25 NA intron (NM_001282579, intron 1 of 4) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 13923 NM_001282577 7335 Hs.420529 NM_021988 ENSG00000244687 UBE2V1 CIR1|CROC-1|CROC1|UBE2V|UEV-1|UEV1|UEV1A ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 protein-coding 316.25-2 chr1 170876010 170876440 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59246 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 293.75-38 chr5 28127627 28127982 + 1.25 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 159861 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 145.5-132 chr3 98579916 98580078 + 1.25 NA 3' UTR (NM_000097, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_000097, exon 7 of 7) 13614 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 170-27 chr14 26843878 26844139 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21888 NR_110033 101927062 NR_110033 ENSG00000257845 LINC02294 - long intergenic non-protein coding RNA 2294 ncRNA 170.5-51 chr13 54623836 54624082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -311911 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 241.25-24 chr15 55846411 55846753 + 1.25 NA intron (NM_198400, intron 11 of 21) intron (NM_198400, intron 11 of 21) 70549 NM_198400 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 214.25-28 chr16 68571742 68571985 + 1.25 NA intron (NM_001305204, intron 4 of 4) intron (NM_001305204, intron 4 of 4) 32572 NR_130976 146198 Hs.461074 NM_133458 ENSG00000184939 ZFP90 FIK|NK10|ZNF756|zfp-90 ZFP90 zinc finger protein protein-coding 219.5-35 chr13 37240146 37240459 + 1.25 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -134638 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 150-39 chr14 56614417 56614652 + 1.25 NA intron (NM_017799, intron 7 of 15) intron (NM_017799, intron 7 of 15) 34736 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 235-29 chr16 81519126 81519421 + 1.25 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) AluJb|SINE|Alu -14629 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 234.25-19 chr13 78286795 78286990 + 1.25 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) L1MEd|LINE|L1 232037 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-70 chr2 63262059 63262251 + 1.25 NA intron (NR_148704, intron 14 of 18) L1M5|LINE|L1 -142613 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 284.75 chr1 78824946 78825324 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 175304 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 206.25-76 chr4 52282727 52283189 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 231654 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 200.75-21 chr12 1705605 1705895 + 1.25 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 14680 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 252-66 chr7 82233666 82233981 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 209954 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 156-109 chr4 80535867 80536121 + 1.25 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 200274 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 199.25-58 chr2 100290451 100290662 + 1.25 NA intron (NM_198461, intron 9 of 11) intron (NM_198461, intron 9 of 11) 32177 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 113-9 chr1 174367010 174367130 + 1.25 NA intron (NM_001366445, intron 11 of 13) intron (NM_001366445, intron 11 of 13) -80894 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 238.5-87 chr7 21964839 21965159 + 1.25 NA Intergenic LTR1F1|LTR|ERV1 -19100 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 280.25 chr1 76000837 76001224 + 1.25 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -10294 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 282.25-6 chr10 73050445 73050784 + 1.25 NA intron (NM_001017962, intron 7 of 14) AluSg|SINE|Alu 46360 NM_001142596 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 147.75-70 chr2 98233476 98233622 + 1.25 NA intron (NR_144297, intron 16 of 18) intron (NR_144297, intron 16 of 18) 84016 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 181-114 chr9 69974624 69974785 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68877 NM_001347990 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 143.25-22 chr10 109391778 109391952 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 531381 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 131.5-94 chr18 33017196 33017387 + 1.25 NA intron (NM_001308126, intron 21 of 23) L1MB7|LINE|L1 -244268 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 217.75-79 chr9 36630310 36630593 + 1.25 NA intron (NM_001256691, intron 7 of 15) intron (NM_001256691, intron 7 of 15) 57556 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 179.25-72 chr19 46071523 46071719 + 1.25 NA intron (NR_163177, intron 1 of 5) intron (NR_163177, intron 1 of 5) 6008 NR_163177 444882 Hs.531310 NM_001002923 ENSG00000204869 IGFL4 - IGF like family member 4 protein-coding 241.5-30 chr18 4984538 4984925 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -96451 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 146.75-175 chr9 26098696 26098826 + 1.25 NA intron (NM_001004352, intron 3 of 6) intron (NM_001004352, intron 3 of 6) 32086 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 179.5-23 chr10 63691697 63691898 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -169907 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 129.25-80 chr19 30690192 30690364 + 1.25 NA intron (NM_001352260, intron 5 of 5) intron (NM_001352260, intron 5 of 5) 317894 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 227.5-96 chr7 99113795 99114083 + 1.25 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) L1M4|LINE|L1 30169 NM_020429 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 160-87 chr5 54915488 54915637 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70031 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 183-103 chr6 162381239 162381450 + 1.25 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -345788 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 134.5-198 chr6 152159259 152159466 + 1.25 NA intron (NM_182961, intron 131 of 145) MIRb|SINE|MIR 8925 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 225-34 chr18 13074854 13075144 + 1.25 NA intron (NM_032142, intron 30 of 44) MIRb|SINE|MIR 83637 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 149.5-106 chr2 208295000 208295258 + 1.25 NA intron (NM_001178000, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 28862 NM_152671 200576 Hs.744997 NM_015040 ENSG00000115020 PIKFYVE CFD|FAB1|HEL37|PIP5K|PIP5K3|ZFYVE29 phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing protein-coding 201-41 chr2 38568585 38568859 + 1.25 NA intron (NM_138394, intron 10 of 12) intron (NM_138394, intron 10 of 12) 34206 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 202-27 chr17 35271941 35272263 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330183, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001330183, exon 4 of 4) 29030 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 117-145 chr5 54529836 54529988 + 1.25 NA intron (NM_001145427, intron 1 of 1) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 12153 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 227.75-83 chr8 120933976 120934330 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -122107 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 179.75-98 chr5 38108023 38108276 + 1.25 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -40331 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 376-17 chr20 19967702 19968060 + 1.25 NA intron (NM_001242581, intron 6 of 11) MIRb|SINE|MIR -49409 NM_181528 51126 Hs.368783 NM_016100 ENSG00000173418 NAA20 NAT3|NAT3P|NAT5|NAT5P|dJ1002M8.1 N(alpha)-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit protein-coding 274.25-53 chr9 108961597 108961982 + 1.25 NA intron (NM_003798, intron 11 of 18) intron (NM_003798, intron 11 of 18) 27389 NM_017832 54942 Hs.29276 NM_017832 ENSG00000119328 ABITRAM C9orf6|CG-8|FAM206A|Simiate actin binding transcription modulator protein-coding 513.5 chr14 64586457 64587274 + 1.25 NA exon (NM_172365, exon 9 of 12) exon (NM_172365, exon 9 of 12) 36904 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 312.25-16 chr2 120076071 120076353 + 1.25 NA intron (NM_001330307, intron 7 of 16) intron (NM_001330307, intron 7 of 16) 63135 NM_001330310 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 205.25-35 chr16 72292423 72292616 + 1.25 NA intron (NR_126330, intron 9 of 13) intron (NR_126330, intron 9 of 13) -120069 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 177.5-178 chr8 140572029 140572230 + 1.25 NA intron (NM_001164623, intron 3 of 17) intron (NM_001164623, intron 3 of 17) 60133 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 280.75-11 chr11 103187764 103188076 + 1.25 NA intron (NM_001377, intron 43 of 88) intron (NM_001377, intron 43 of 88) 78494 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 136.75-77 chr17 67188011 67188242 + 1.25 NA intron (NM_001330447, intron 12 of 32) intron (NM_001330447, intron 12 of 32) -56650 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 221.25-46 chr21 27040490 27040782 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -73548 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 184-17 chr11 111502922 111503227 + 1.25 NA intron (NM_001367974, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 -7528 NR_147706 728196 Hs.363156 NR_147706 ENSG00000286028 LOC728196 - uncharacterized LOC728196 ncRNA 190.25-92 chr4 74082294 74082519 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16789 NM_002089 2920 Hs.75765 NM_002089 ENSG00000081041 CXCL2 CINC-2a|GRO2|GROb|MGSA-b|MIP-2a|MIP2|MIP2A|SCYB2 C-X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 296.75-11 chr15 51013145 51013454 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24189 NR_146310 109729174 NR_146310 ENSG00000259240 MIR4713HG - MIR4713 host gene ncRNA 129.25-27 chr10 120530389 120530519 + 1.25 NA intron (NM_001030059, intron 5 of 6) L1ME2z|LINE|L1 -67495 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 324-3 chr10 72732873 72733289 + 1.25 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) MIRb|SINE|MIR 12052 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 330-32 chr9 37568895 37569352 + 1.25 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) L1ME3|LINE|L1 7257 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 234.5-13 chr11 86014697 86015072 + 1.25 NA exon (NM_001206947, exon 5 of 19) exon (NM_001206947, exon 5 of 19) 54200 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 324.5-9 chr14 71786459 71786960 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -145462 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 198.75-81 chr6 19504477 19504671 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 54753 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 154.75-137 chr7 78022825 78023075 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 20 of 20) intron (NM_001301128, intron 20 of 20) 182820 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 275.75-41 chr7 92137806 92138197 + 1.25 NA intron (NR_122110, intron 1 of 2) LTR8|LTR|ERV1 -3256 NM_001146152 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 162-122 chr8 127697647 127697825 + 1.25 NA Intergenic MER125|DNA|DNA 36231 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 236.75-23 chr16 10074719 10075044 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) L1MB7|LINE|L1 107186 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 170.75-33 chr14 55131470 55131710 + 1.25 NA intron (NM_002306, intron 1 of 5) intron (NM_002306, intron 1 of 5) 2338 NM_002306 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 208.25-17 chr10 126169920 126170178 + 1.25 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) intron (NM_001288974, intron 3 of 18) -196776 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 276.5-38 chr20 4127631 4128080 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -20924 NM_001270691 54498 Hs.433337 NM_175839 ENSG00000088826 SMOX C20orf16|PAO|PAO-1|PAO1|PAOH|PAOH1|SMO spermine oxidase protein-coding 250.5-77 chr5 117442632 117442989 + 1.25 NA intron (NR_046089, intron 2 of 5) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 27298 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 340.75-30 chr9 101406508 101406858 + 1.25 NA intron (NM_197977, intron 3 of 3) intron (NM_197977, intron 3 of 3) 7829 NM_001278240 7743 Hs.50123 NM_003452 ENSG00000136870 ZNF189 - zinc finger protein 189 protein-coding 204.25-68 chr3 36969919 36970241 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23051 NM_014805 9852 Hs.28020 NM_014805 ENSG00000178567 EPM2AIP1 - EPM2A interacting protein 1 protein-coding 148-134 chr8 129174254 129174436 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 66895 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 127.25-132 chr3 178745078 178745210 + 1.25 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 115261 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-80 chr17 28309003 28309250 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1744 NR_028334 284085 Hs.371796 NM_173624 ENSG00000265480 KRT18P55 - keratin 18 pseudogene 55 pseudo 226.25-25 chr12 133059072 133059359 + 1.25 NA 3' UTR (NM_003428, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_003428, exon 5 of 5) -20988 NM_001300778 7699 Hs.181552 NM_003440 ENSG00000196387 ZNF140 pHZ-39 zinc finger protein 140 protein-coding 251-29 chr2 21503568 21503936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 206900 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 230.25-10 chr10 11828219 11828453 + 1.25 NA intron (NM_153256, intron 1 of 3) intron (NM_153256, intron 1 of 3) 4980 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 120-194 chr8 129375910 129376074 + 1.25 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 108150 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 232.75-3 chr1 150680342 150680626 + 1.25 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) intron (NM_018178, intron 2 of 4) 16670 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 240.75-33 chr17 63152884 63153348 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 186881 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 171.25-84 chr2 231322397 231322645 + 1.25 NA intron (NM_001352759, intron 19 of 19) intron (NM_001352759, intron 19 of 19) -40187 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 325.25-4 chr13 46663147 46663504 + 1.25 NA intron (NM_001164213, intron 2 of 18) intron (NM_001164213, intron 2 of 18) 110155 NM_001164213 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 327.5-21 chr3 159372032 159372483 + 1.25 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 89611 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 243.25-23 chr2 66215500 66215801 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 142678 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 230-56 chr6 88375000 88375240 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 164249 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 284.25-2 chr1 64141794 64142459 + 1.25 NA intron (NM_005012, intron 6 of 8) intron (NM_005012, intron 6 of 8) -28335 NR_110665 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 296-28 chr2 203473410 203473765 + 1.25 NA intron (NM_001329728, intron 5 of 15) intron (NM_001329728, intron 5 of 15) 61714 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 112.5-138 chr2 202647078 202647228 + 1.25 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) Charlie6|DNA|hAT-Charlie 12184 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 146.75-16 chr10 47057409 47057550 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 145757 NM_001320683 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 201.25-21 chr11 63442250 63442684 + 1.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 48700 NM_054108 117245 Hs.410316 NM_054108 ENSG00000168004 PLAAT5 HRASLS5|HRLP5|HRSL5|PLAAT-5|RLP1|iNAT phospholipase A and acyltransferase 5 protein-coding 192.5-34 chr12 114909776 114909967 + 1.25 NA Intergenic (TTCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -225696 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 189-27 chr12 2727185 2727384 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36127 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 230-70 chr8 130207992 130208212 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) L1MD2|LINE|L1 88431 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 277-16 chr17 48879816 48880290 + 1.25 NA intron (NR_135674, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu -12734 NM_001002027 516 Hs.80986 NM_005175 ENSG00000159199 ATP5MC1 ATP5A|ATP5G|ATP5G1 ATP synthase membrane subunit c locus 1 protein-coding 265.25-29 chr20 55339763 55340069 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -83127 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 296.75-22 chr3 155836844 155837171 + 1.25 NA intron (NM_001363883, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 17399 NM_001363883 9197 Hs.478031 NM_004733 ENSG00000169359 SLC33A1 ACATN|AT-1|AT1|CCHLND|SPG42 solute carrier family 33 member 1 protein-coding 170.75-139 chr8 110279181 110279430 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -303534 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 378.25-4 chr19 13612198 13612870 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -106055 NM_000068 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 115.5-163 chr3 66361988 66362096 + 1.25 NA intron (NM_001350992, intron 5 of 8) L1ME1|LINE|L1 138379 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 230-38 chr20 16577097 16577342 + 1.25 NA Intergenic (GTTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3771 NM_024704 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 293.75-33 chr3 112643724 112644133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2785 NM_199511 151887 Hs.477128 NM_199511 ENSG00000091986 CCDC80 CL2|DRO1|SSG1|URB|okuribin coiled-coil domain containing 80 protein-coding 162.75-116 chr5 66176670 66176966 + 1.25 NA intron (NM_001323533, intron 10 of 10) L1MC5|LINE|L1 31983 NM_139168 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 294.5-16 chr16 12517976 12518271 + 1.25 NA intron (NM_032167, intron 19 of 20) intron (NM_032167, intron 19 of 20) -202198 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 150.5-164 chr5 15041852 15042156 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -170226 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 222.5-45 chr19_KI270866v1_alt 41543 42055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27867 NM_001289789 2821 Hs.466471 NM_000175 ENSG00000105220 GPI AMF|GNPI|NLK|PGI|PHI|SA-36|SA36 glucose-6-phosphate isomerase protein-coding 430.5-9 chr5 42447794 42448383 + 1.25 NA intron (NM_001242401, intron 1 of 10) L1PB1|LINE|L1 23107 NM_001242401 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 270.5-70 chr9 124368034 124368292 + 1.25 NA intron (NM_002799, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR 14690 NR_027406 100129034 Hs.654980 NR_027406 LOC100129034 - uncharacterized LOC100129034 ncRNA 160.5-54 chr14 56049369 56049593 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -68930 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 158.25-155 chr9 74885305 74885499 + 1.25 NA intron (NM_017662, intron 1 of 38) HAL1|LINE|L1 1945 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 187.5-12 chr1 216983422 216983707 + 1.25 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) intron (NM_001134285, intron 1 of 8) -43891 NM_001243512 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 181.5-21 chr11 61069163 61069433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24665 NM_001346456 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 242.75-57 chr5 88036564 88036888 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 232119 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 383-17 chr7 92965820 92966171 + 1.25 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -129368 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 230.25-51 chr20 35371014 35371310 + 1.25 NA intron (NM_001184977, intron 3 of 7) intron (NM_001184977, intron 3 of 7) 40811 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 169.5-153 chr6 91712395 91712651 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22095 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 193 chr1 43962776 43963100 + 1.25 NA intron (NM_014652, intron 14 of 19) L2c|LINE|L2 -7072 NM_001319167 1802 Hs.632398 NM_001384 ENSG00000132768 DPH2 DPH2L2 diphthamide biosynthesis 2 protein-coding 201-73 chr8 25163991 25164163 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20612 NM_024940 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 275-8 chr11 112511188 112511623 + 1.25 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) intron (NR_120559, intron 2 of 2) 27060 NR_120560 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 207.75-37 chr15 59076571 59076757 + 1.25 NA intron (NM_001270529, intron 7 of 13) AluJr|SINE|Alu -28482 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 171.75-117 chr5 152099287 152099552 + 1.25 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 140521 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 398.5-14 chr4 66899808 66900485 + 1.25 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 521854 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 192.5-32 chr12 8466974 8467171 + 1.25 NA intron (NM_001007033, intron 4 of 5) L1MB2|LINE|L1 11110 NM_001007033 93978 Hs.591147 NM_001007033 ENSG00000205846 CLEC6A CLEC4N|CLECSF10|dectin-2 C-type lectin domain containing 6A protein-coding 126.5-89 chr16 73528085 73528265 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 141370 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 204-37 chr2 116196505 116196723 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 852799 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 222.5-120 chrX 101743824 101744033 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -84078 NM_001282231 9823 Hs.48924 NM_014782 ENSG00000184867 ARMCX2 ALEX2|GASP9 armadillo repeat containing X-linked 2 protein-coding 176.25-54 chr18 22221183 22221437 + 1.25 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 51873 NM_005257 2627 Hs.514746 NM_005257 ENSG00000141448 GATA6 - GATA binding protein 6 protein-coding 283.75-19 chr2 121250132 121250419 + 1.25 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) intron (NM_014553, intron 2 of 14) 34927 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 321.25-7 chr11 24467402 24468100 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -29302 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 195.75-84 chr4 94247045 94247272 + 1.25 NA intron (NM_001128429, intron 6 of 23) ERVL-E-int|LTR|ERVL -6151 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 226.75-8 chr10 71886816 71887189 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -35751 NM_001042466 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 169.5-114 chr3 99240336 99240583 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -338764 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 193.75-9 chr1 114927819 114928077 + 1.25 NA intron (NM_001282542, intron 23 of 30) AluJb|SINE|Alu 73085 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 158-151 chr9 23950412 23950619 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -99914 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 392.25-2 chr11 15227441 15227962 + 1.25 NA intron (NM_001042536, intron 9 of 12) intron (NM_001042536, intron 9 of 12) 78599 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 247.5-72 chr6 53314179 53314491 + 1.25 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) intron (NM_001242830, intron 1 of 6) 23282 NR_046241 647190 Hs.520189 NR_046241 RPS16P5 RPS16_3_702 ribosomal protein S16 pseudogene 5 pseudo 334-27 chr5 102146721 102147109 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 149369 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 146-44 chr15 86440735 86440966 + 1.25 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -123882 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-223 chr7 28773313 28773499 + 1.25 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 87273 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 140.75-156 chr5 127718261 127718435 + 1.25 NA intron (NM_001317938, intron 2 of 6) intron (NM_001317938, intron 2 of 6) 14959 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 210.5-132 chr8 102368652 102368999 + 1.25 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) intron (NM_001282873, intron 1 of 58) 43864 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 167-54 chr18 3336907 3337069 + 1.25 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 13571 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 167.25-86 chr2 124645312 124645532 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 12 of 23) AluJr4|SINE|Alu 620135 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 191.75-120 chr7 86084581 86084833 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -559202 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 151.25-133 chr3 185277835 185278000 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5024 NR_038322 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 234.75-51 chr3 90356565 90356786 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1249054 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 161-50 chr16 81636992 81637187 + 1.25 NA intron (NM_030629, intron 3 of 20) AluSq|SINE|Alu 25741 NR_106759 102465251 NR_106759 ENSG00000275109 MIR6504 hsa-mir-6504 microRNA 6504 ncRNA 262.75-9 chr11 99873525 99873901 + 1.25 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) L1PB4|LINE|L1 317568 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 248.5-51 chr2 70990519 70990884 + 1.25 NA intron (NM_144582, intron 3 of 5) intron (NM_144582, intron 3 of 5) 4172 NM_144582 113419 Hs.516087 NM_144582 ENSG00000144043 TEX261 TEG-261 testis expressed 261 protein-coding 165.25-128 chr6 137607595 137607841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57928 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 325.75-7 chr12 89958450 89958916 + 1.25 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 10990 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 296.75-8 chr12 9915506 9915899 + 1.25 NA intron (NM_001130711, intron 4 of 4) L1PA8|LINE|L1 16668 NM_001130711 387836 Hs.527665 NM_207375 ENSG00000188393 CLEC2A INPE5792|KACL|PILAR|UNQ5792 C-type lectin domain family 2 member A protein-coding 257.5-80 chr8 140878473 140878833 + 1.25 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) intron (NM_001352737, intron 3 of 32) 122351 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 240-59 chr7 78574067 78574312 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 226947 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 220.25-6 chr10 27643910 27644242 + 1.25 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -100539 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 221.25-56 chr3 189649181 189649477 + 1.25 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L1PA13|LINE|L1 17940 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 210.75-17 chr11 60594761 60595083 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -20829 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 289-3 chr10 15699373 15699650 + 1.25 NA intron (NM_001291494, intron 2 of 28) L1ME3Cz|LINE|L1 20411 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 155.25-115 chr3 46760803 46761004 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -4048 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 252.25-47 chr5 31270092 31270446 + 1.25 NA intron (NM_001362435, intron 2 of 10) MER119|DNA|hAT-Charlie 76583 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 172.5-197 chr8 52547402 52547653 + 1.25 NA intron (NM_207413, intron 1 of 4) intron (NM_207413, intron 1 of 4) 17903 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 211.75-95 chr8 99444444 99444644 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 23 of 61) intron (NM_017890, intron 23 of 61) 92186 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 348.25-7 chr15 68090277 68090598 + 1.25 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 35861 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 315.25-12 chr18 55652645 55652990 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16860 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 217.5-125 chr8 87472906 87473331 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 400897 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 198-20 chr13 104693295 104693597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -772421 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 116.25-149 chr3 133708046 133708240 + 1.25 NA intron (NM_001354703, intron 4 of 22) intron (NM_001354703, intron 4 of 22) -38250 NM_001063 7018 Hs.518267 NM_001063 ENSG00000091513 TF HEL-S-71p|PRO1557|PRO2086|TFQTL1 transferrin protein-coding 236-59 chr5 168181207 168181471 + 1.25 NA intron (NM_001368145, intron 12 of 26) intron (NM_001368145, intron 12 of 26) 15494 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 155-147 chr8 129235351 129235497 + 1.25 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) MamRep564|Unknown|Unknown 5816 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 179.25-148 chr8 136792742 136792911 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 3 of 5) AluJo|SINE|Alu 262028 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 169.5-167 chr7 145524911 145525139 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -688972 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 229.25-87 chr9 36729704 36729952 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 93771 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 144.75-27 chr11 23508809 23508991 + 1.25 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -89710 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 169.75-89 chr2 212216723 212216898 + 1.25 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 209550 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 131.5-84 chr16 89660655 89660776 + 1.25 NA non-coding (NR_073516, exon 2 of 2) non-coding (NR_073516, exon 2 of 2) 2647 NR_073516 124045 Hs.655171 NM_153025 ENSG00000167523 SPATA33 C16orf55 spermatogenesis associated 33 protein-coding 127.5-37 chr10 127237812 127237921 + 1.25 NA intron (NM_001290223, intron 27 of 51) intron (NM_001290223, intron 27 of 51) -41275 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 206-36 chr18 11320643 11320884 + 1.25 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -133715 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 184-88 chr7 87109632 87109781 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 42611 NR_136252 101927420 Hs.633960 NR_136252 ENSG00000224046 LOC101927420 - uncharacterized LOC101927420 ncRNA 260.5-14 chr14 59169637 59169919 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -18889 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 147.5-136 chr22 32015435 32015623 + 1.25 NA intron (NR_149128, intron 4 of 4) intron (NR_149128, intron 4 of 4) -27732 NM_000343 6523 Hs.1964 NM_000343 ENSG00000100170 SLC5A1 D22S675|NAGT|SGLT1 solute carrier family 5 member 1 protein-coding 373.5-17 chr5 38405821 38406164 + 1.25 NA intron (NM_182798, intron 1 of 16) L1ME3E|LINE|L1 2451 NM_182798 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 199-93 chr9 129446102 129446396 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -42411 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 449 chr2 189927120 189928216 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 135061 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 164-39 chr15 43419685 43419851 + 1.25 NA intron (NM_001355001, intron 22 of 28) L1MD3|LINE|L1 48667 NM_001286414 27229 Hs.584887 NM_014444 ENSG00000137822 TUBGCP4 76P|GCP-4|GCP4|Grip76|MCCRP3 tubulin gamma complex associated protein 4 protein-coding 241.25-40 chr20 58796895 58797133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20680 NR_029844 407022 NR_029844 ENSG00000284040 MIR296 MIRN296|miRNA296|mir-296 microRNA 296 ncRNA 229.75-37 chr2 143916694 143916966 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -20237 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 142.75-64 chr15 36075837 36075995 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149060 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 120.75-82 chr2 159859641 159859878 + 1.25 NA intron (NM_002349, intron 15 of 34) MIR|SINE|MIR 44997 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 224-12 chr10 118226600 118226812 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 115618 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 216.75-16 chr10 107743862 107744270 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 325227 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 129.25-112 chr21 16644359 16644595 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 54240 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 171.75-22 chr10 129468770 129469072 + 1.25 NA intron (NM_002412, intron 1 of 4) intron (NM_002412, intron 1 of 4) 1680 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 134.75-207 chr7 127856654 127856784 + 1.25 NA intron (NM_014390, intron 12 of 23) intron (NM_014390, intron 12 of 23) -140790 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 252-27 chr16 3847047 3847334 + 1.25 NA intron (NM_004380, intron 2 of 30) L1ME4b|LINE|L1 32930 NM_001079846 1387 Hs.459759 NM_004380 ENSG00000005339 CREBBP CBP|KAT3A|MKHK1|RSTS|RSTS1 CREB binding protein protein-coding 232.25-30 chr18 66404403 66404639 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 199569 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 268-65 chr9 135289985 135290353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53080 NM_173520 157927 Hs.559511 NM_173520 C9orf62 - chromosome 9 open reading frame 62 protein-coding 209-25 chr15 37028925 37029184 + 1.25 NA intron (NM_172316, intron 8 of 12) intron (NM_172316, intron 8 of 12) -56153 NR_107030 102466875 NR_107030 ENSG00000277202 MIR8063 hsa-mir-8063 microRNA 8063 ncRNA 172.75-74 chr21 31945140 31945338 + 1.25 NA intron (NM_014586, intron 3 of 10) intron (NM_014586, intron 3 of 10) 72219 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 138.75-135 chr5 11148433 11148643 + 1.25 NA intron (NM_001288715, intron 11 of 20) intron (NM_001288715, intron 11 of 20) -387304 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 190.75-48 chr2 14297859 14298082 + 1.25 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) intron (NR_103814, intron 2 of 3) 102988 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 253-34 chr4 10469025 10469351 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -11762 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 240.75-26 chr14 66126982 66127370 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -359195 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 168.25-135 chr7 43374975 43375183 + 1.25 NA intron (NM_001287059, intron 5 of 27) intron (NM_001287059, intron 5 of 27) 147463 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 226.75-43 chr20 54996807 54997096 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -426092 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 227-14 chr12 43357520 43357737 + 1.25 NA intron (NM_025003, intron 37 of 38) intron (NM_025003, intron 37 of 38) 194575 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 229.5-116 chr6 107362836 107363246 + 1.25 NA intron (NM_020381, intron 1 of 7) L1M4a2|LINE|L1 96523 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 250.25-46 chr8 123476938 123477216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 55066 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 119-52 chr15 34016458 34016630 + 1.25 NA intron (NM_020371, intron 1 of 5) intron (NM_020371, intron 1 of 5) 22660 NM_020371 57099 Hs.555966 NM_020371 ENSG00000169857 AVEN PDCD12 apoptosis and caspase activation inhibitor protein-coding 295.75-16 chr2 195701049 195701319 + 1.25 NA intron (NM_020342, intron 3 of 9) L1M4c|LINE|L1 43958 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 242.5-19 chr10 121172889 121173238 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 321701 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 164.5-49 chr13 94617489 94617712 + 1.25 NA intron (NM_180989, intron 3 of 8) intron (NM_180989, intron 3 of 8) 15743 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 269.25-33 chr3 192648654 192648979 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 78725 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 143.25-149 chr5 151897782 151897901 + 1.25 NA intron (NM_000171, intron 1 of 8) (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 27010 NM_001146040 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 236-31 chr2 66287381 66287595 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 70840 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 270-5 chr1 223277147 223277664 + 1.25 NA intron (NM_017982, intron 3 of 8) intron (NM_017982, intron 3 of 8) 86771 NM_017982 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 277.75-37 chr9 83034258 83034623 + 1.25 NA intron (NM_152573, intron 1 of 16) intron (NM_152573, intron 1 of 16) 28702 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 213.75-100 chr6 165583578 165583843 + 1.25 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 78390 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 152.75-159 chr9 29407335 29407722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -193927 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 147.5-204 chr7 151061761 151061938 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001199694) promoter-TSS (NM_001199694) -698 NM_001199693 6522 Hs.647069 NM_003040 ENSG00000164889 SLC4A2 AE2|BND3L|EPB3L1|HKB3|NBND3 solute carrier family 4 member 2 protein-coding 234.5-36 chr18 76011749 76012010 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -111119 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 197-6 chr10 133216618 133216848 + 1.25 NA intron (NM_152643, intron 26 of 29) intron (NM_152643, intron 26 of 29) -13484 NM_003577 8433 Hs.458406 NM_003577 ENSG00000171794 UTF1 - undifferentiated embryonic cell transcription factor 1 protein-coding 214.25-66 chr5 39785267 39785779 + 1.25 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 265092 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 113.5-121 chr2 54946289 54946480 + 1.25 NA intron (NM_001039753, intron 27 of 40) intron (NM_001039753, intron 27 of 40) 63888 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 233-56 chr7 27283547 27283826 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -36457 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 168.25-7 chr1 174750921 174751130 + 1.25 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) -48713 NM_001330989 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 127.5-182 chr5 19883656 19883867 + 1.25 NA intron (NM_001291957, intron 1 of 12) intron (NM_001291957, intron 1 of 12) 2511 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 245.25-53 chr4 63200105 63200471 + 1.25 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -1038523 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 296.5-14 chr17 51247090 51247761 + 1.25 NA intron (NM_017643, intron 2 of 16) L1MC4|LINE|L1 12624 NM_017643 54799 Hs.656803 NM_017643 ENSG00000011258 MBTD1 SA49P01 mbt domain containing 1 protein-coding 396-12 chr5 65594715 65595317 + 1.25 NA intron (NM_001656, intron 9 of 10) intron (NM_001656, intron 9 of 10) 29317 NM_033228 373 Hs.792 NM_001656 ENSG00000113595 TRIM23 ARD1|ARFD1|RNF46 tripartite motif containing 23 protein-coding 128-51 chr15 79896191 79896295 + 1.25 NA intron (NM_001199760, intron 2 of 3) intron (NM_001199760, intron 2 of 3) 754 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 157.5-185 chr7 15951740 15952045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -258594 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 191-47 chr20 46345164 46345405 + 1.25 NA TTS (NM_001281457) TTS (NM_001281457) 19141 NM_173179 51006 Hs.593344 NM_015945 ENSG00000080189 SLC35C2 BA394O2.1|C20orf5|CGI-15|OVCOV1 solute carrier family 35 member C2 protein-coding 301-16 chr20 49768327 49768704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44198 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 199-79 chr7 28381748 28381932 + 1.25 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) MLT2B5|LTR|ERVL -30678 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 160.75-69 chr2 47983887 47984197 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -78249 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 138.25-47 chr14 37122685 37122801 + 1.25 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -49283 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 371.75-3 chr10 20328624 20329071 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -223123 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 276.25-5 chr10 68329280 68329705 + 1.25 NA intron (NM_001033083, intron 1 of 8) intron (NM_001033083, intron 1 of 8) -2201 NM_001322438 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 154-90 chr3 32717772 32718041 + 1.25 NA intron (NR_046352, intron 6 of 16) intron (NR_046352, intron 6 of 16) 22365 NM_001256742 25904 Hs.444851 NM_015442 ENSG00000182973 CNOT10 - CCR4-NOT transcription complex subunit 10 protein-coding 354-17 chr3 79679947 79680378 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 87836 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 189.5-16 chr1 219213905 219214160 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 39063 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 290.75-6 chr10 75607766 75608112 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -39570 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 221.25-62 chr4 55183329 55183721 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -57930 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 142-148 chr7 35643025 35643230 + 1.25 NA intron (NM_022373, intron 5 of 8) intron (NM_022373, intron 5 of 8) 52008 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 179.5-24 chr10 64013837 64014101 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -492079 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 240.25-42 chr20 60344132 60344515 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 35849 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 231.5-61 chr3 32823055 32823358 + 1.25 NA intron (NM_001039111, intron 1 of 3) intron (NM_001039111, intron 1 of 3) 5209 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 161.75-26 chr10 90239849 90240035 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -282569 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 292.5-24 chr15 76566964 76567245 + 1.25 NA intron (NR_148227, intron 23 of 32) L1ME3B|LINE|L1 -19543 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 322.5-4 chr10 82272286 82272796 + 1.25 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -39621 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 196-67 chr3 122887979 122888144 + 1.25 NA non-coding (NR_024618, exon 1 of 1) non-coding (NR_024618, exon 1 of 1) 1548 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 277.25-17 chr18 3388551 3388917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23193 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 134.75-160 chr4 71598893 71599122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 185072 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 137-150 chr6 49955508 49955663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6141 NR_163261 403339 Hs.745543 NM_001166478 ENSG00000214643 DEFB133 - defensin beta 133 pseudo 253-33 chr3 197704982 197705367 + 1.25 NA exon (NM_014687, exon 3 of 20) exon (NM_014687, exon 3 of 20) -30598 NR_030627 100126321 NR_030627 ENSG00000284146 MIR922 MIRN922|hsa-mir-922 microRNA 922 ncRNA 119.25-12 chr1 159118440 159118628 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -41633 NM_001348247 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 280.5-48 chr7 66620581 66620948 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -8117 NM_001167961 154881 Hs.546627 NM_153033 ENSG00000243335 KCTD7 CLN14|EPM3 potassium channel tetramerization domain containing 7 protein-coding 247-53 chr6 140401881 140402209 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 196793 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 292.25-8 chr1 196667165 196667674 + 1.25 NA intron (NM_001014975, intron 1 of 9) L1MEg|LINE|L1 15541 NM_000186 3075 Hs.363396 NM_000186 ENSG00000000971 CFH AHUS1|AMBP1|ARMD4|ARMS1|CFHL3|FH|FHL1|HF|HF1|HF2|HUS complement factor H protein-coding 211.5-133 chr6 98682239 98682456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149353 NR_148381 105447646 Hs.211213 NR_148381 PNKY - long intergenic non-protein coding RNA PNKY ncRNA 239.5-26 chr14 57127838 57128236 + 1.25 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 140868 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 237.5-36 chr15 88592762 88592974 + 1.25 NA intron (NR_120370, intron 2 of 2) L1MB7|LINE|L1 11735 NR_120369 101929743 Hs.558810 NR_120369 ENSG00000249487 LINC01586 - long intergenic non-protein coding RNA 1586 ncRNA 214-57 chr6 62269685 62269942 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) L1ME2|LINE|L1 16412 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 369-10 chr21 15399856 15400376 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -329818 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 267-47 chr7 34045965 34046309 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 140598 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 206.25-46 chr19 8535155 8535466 + 1.25 NA intron (NM_012335, intron 19 of 27) intron (NM_012335, intron 19 of 27) -21143 NM_001146175 84330 Hs.515114 NM_032370 ENSG00000133250 ZNF414 ZFP414 zinc finger protein 414 protein-coding 158.5-40 chr11 59199262 59199429 + 1.25 NA intron (NM_015177, intron 7 of 8) MIR|SINE|MIR 13582 NM_001039396 219972 Hs.744920 NM_001039396 ENSG00000197629 MPEG1 MPG1|MPS1|Mpg-1|P-2 macrophage expressed 1 protein-coding 209.25-14 chr10 72760367 72760638 + 1.25 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) MIRc|SINE|MIR 39473 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 115.25-56 chr14 47263361 47263546 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 79793 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 124.25-2 chr1 23046480 23046700 + 1.25 NA intron (NM_001009999, intron 3 of 20) intron (NM_001009999, intron 3 of 20) 2285 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 339-5 chr12 31977988 31978385 + 1.25 NA intron (NM_018169, intron 3 of 5) intron (NM_018169, intron 3 of 5) 18771 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 137.75-212 chr8 126695262 126695424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136865 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 117-165 chr6 163240875 163241012 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) -48941 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 183.75-104 chr6 6958135 6958414 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149469 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 178.75-107 chr8 83478530 83478689 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74851 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 183.25-27 chr12 113653746 113654150 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 119735 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 126-132 chr4 150329748 150329897 + 1.25 NA intron (NM_001367550, intron 48 of 56) intron (NM_001367550, intron 48 of 56) -249267 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 339.5-34 chr8 118893145 118893830 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 58398 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 177.25-76 chr2 234471092 234471303 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16602 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 289-19 chr17 69965884 69966254 + 1.25 NA intron (NR_110875, intron 2 of 4) MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR 4362 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 131.5-61 chr14 62701952 62702229 + 1.25 NA 3' UTR (NM_172375, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_172375, exon 10 of 10) 343368 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 196.5-94 chr21 25864646 25864982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129160 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 271-14 chr16 54324522 54324921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37934 NM_024336 79191 Hs.499205 NM_024336 ENSG00000177508 IRX3 IRX-1|IRXB1 iroquois homeobox 3 protein-coding 192.25-3 chr1 28354309 28354613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15279 NM_001350159 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 282-49 chr8 91983558 91983991 + 1.25 NA intron (NM_004349, intron 8 of 10) intron (NM_004349, intron 8 of 10) 33906 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 167.25-142 chr7 34115711 34116025 + 1.25 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) L1MB8|LINE|L1 210329 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 271.5-38 chr2 125017008 125017481 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 991957 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 214-39 chr21 33345894 33346179 + 1.25 NA intron (NM_000629, intron 6 of 10) AluJb|SINE|Alu 21066 NM_000629 3454 Hs.529400 NM_000629 ENSG00000142166 IFNAR1 AVP|IFN-alpha-REC|IFNAR|IFNBR|IFRC interferon alpha and beta receptor subunit 1 protein-coding 306-22 chr3 42361649 42362141 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 48715 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 181-33 chr15 87709010 87709234 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 132193 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 152.75-38 chr11 101554045 101554222 + 1.25 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) L2c|LINE|L2 29874 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 179 chr1 11312166 11312449 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39109 NM_013319 29914 Hs.522933 NM_013319 ENSG00000120942 UBIAD1 SCCD|TERE1 UbiA prenyltransferase domain containing 1 protein-coding 117.5-72 chr15 96263464 96263613 + 1.25 NA intron (NR_125738, intron 2 of 4) intron (NR_125738, intron 2 of 4) -62508 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 155.25-53 chr13 86122226 86122477 + 1.25 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -322932 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 278-9 chr12 89330254 89330555 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22097 NM_022652 1848 Hs.298654 NM_001946 ENSG00000139318 DUSP6 HH19|MKP3|PYST1 dual specificity phosphatase 6 protein-coding 250.25-49 chr9 22678039 22678421 + 1.25 NA intron (NR_038977, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 32030 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 244.25 chr1 71190345 71190680 + 1.25 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 109188 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 138.75-174 chr7 39958493 39958714 + 1.25 NA intron (NM_003718, intron 1 of 13) L1ME4a|LINE|L1 8243 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 196-9 chr1 204667380 204667583 + 1.25 NA intron (NM_201630, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 18257 NM_201630 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 272.25-64 chr9 32171331 32171635 + 1.25 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -213120 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 370.5-10 chr15 64020083 64020864 + 1.25 NA intron (NM_014326, intron 2 of 11) intron (NM_014326, intron 2 of 11) 26012 NM_001363730 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 166-9 chr10 32294243 32294463 + 1.25 NA intron (NM_001272004, intron 2 of 13) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 52805 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 334-9 chr13 104031467 104031792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 606429 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 210.25-7 chr1 237727939 237728181 + 1.25 NA intron (NM_001035, intron 76 of 104) L2a|LINE|L2 -134115 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 201-88 chr9 103257278 103257545 + 1.25 NA intron (NR_121578, intron 6 of 9) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 67622 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 250.75-31 chr22 28399503 28399979 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -60128 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 511.75-4 chr9 28225255 28225903 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 493726 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 196.25-11 chr10 33699986 33700286 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 72544 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 303-17 chr2 46215142 46215563 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -82055 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 151-99 chr4 66747164 66747339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 470427 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 192.25-80 chr4 62276341 62276643 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -114727 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 336.5-28 chr8 92043232 92043720 + 1.25 NA intron (NM_001198633, intron 1 of 10) intron (NM_001198633, intron 1 of 10) 19158 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 338.5-6 chr13 92232609 92232942 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 119432 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 171.25-137 chr6 124174179 124174333 + 1.25 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) L3|LINE|CR1 -108749 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 425.5-4 chr14 48148154 48148752 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -353439 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 147-110 chr5 66790674 66790859 + 1.25 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) intron (NM_001290228, intron 3 of 4) -38007 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 216.5-71 chr3 17659965 17660186 + 1.25 NA intron (NM_001349076, intron 1 of 22) intron (NM_001349076, intron 1 of 22) 39945 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 295.25-16 chr21 17532869 17533147 + 1.25 NA intron (NM_001207066, intron 1 of 7) intron (NM_001207066, intron 1 of 7) 19965 NM_001207064 1525 Hs.627078 NM_001338 ENSG00000154639 CXADR CAR|CAR4/6|HCAR CXADR Ig-like cell adhesion molecule protein-coding 121.25-6 chr1 93133915 93134050 + 1.25 NA intron (NM_007358, intron 13 of 14) intron (NM_007358, intron 13 of 14) 46431 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 268-23 chr15 70390143 70390417 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 115648 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 260-5 chr10 29472661 29472925 + 1.25 NA intron (NM_001323599, intron 31 of 38) intron (NM_001323599, intron 31 of 38) 62550 NR_110928 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 145.25-58 chr18 8693416 8693668 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14079 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 263.5-3 chr10 12338662 12338977 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10728 NM_153498 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 228-28 chr14 71111172 71111526 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001308160, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_001308160, exon 34 of 34) 203890 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 145.25-141 chr5 167117636 167117839 + 1.25 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) MER20|DNA|hAT-Charlie 44495 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 283.5-4 chr1 187469323 187469716 + 1.25 NA intron (NR_132374, intron 1 of 2) MER4A1|LTR|ERV1 25891 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 259.75-43 chr5 155889304 155889607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -437302 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 175.5-145 chr7 35583267 35583529 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 111737 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 217-79 chr7 117203961 117204481 + 1.25 NA intron (NR_002332, intron 8 of 8) intron (NR_002332, intron 8 of 8) 21540 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 244.5-13 chr10 22043879 22044092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40255 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 158.25-19 chr11 24596009 24596171 + 1.25 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 99037 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 286.25-29 chr8 105799790 105800097 + 1.25 NA intron (NM_001362837, intron 7 of 7) intron (NM_001362837, intron 7 of 7) 260560 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 166-22 chr11 60410067 60410297 + 1.25 NA intron (NR_049734, intron 6 of 6) L1MA6|LINE|L1 13723 NR_049732 84689 Hs.709736 NM_032597 ENSG00000166928 MS4A14 MS4A16|NYD-SP21 membrane spanning 4-domains A14 protein-coding 259.25-46 chr8 58537971 58538285 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14796 NM_001348340 6386 Hs.200804 NM_005625 ENSG00000137575 SDCBP MDA-9|MDA9|ST1|SYCL|TACIP18 syndecan binding protein protein-coding 239.25-69 chr5 32465317 32465618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20727 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 168-72 chr2 220522210 220522429 + 1.25 NA Intergenic MamRep1894|DNA|hAT -615754 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 178.5-119 chr4 39732850 39733149 + 1.25 NA intron (NM_001111113, intron 1 of 4) intron (NM_001111113, intron 1 of 4) 34863 NM_001111113 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 217.5-138 chrX 116095266 116095550 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -75336 NM_000686 186 Hs.405348 NM_000686 ENSG00000180772 AGTR2 AT2|ATGR2|MRX88 angiotensin II receptor type 2 protein-coding 297.25-10 chr16 75170409 75170705 + 1.25 NA 3' UTR (NM_153688, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_153688, exon 4 of 4) 21506 NM_001318475 162239 Hs.388813 NM_153688 ENSG00000184517 ZFP1 ZNF475 ZFP1 zinc finger protein protein-coding 237.75-78 chr7 112392466 112392736 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -30543 NM_001197080 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 179-20 chr10 112761411 112761574 + 1.25 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) -62004 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 191-60 chr4 68191752 68191964 + 1.25 NA intron (NR_104048, intron 2 of 9) intron (NR_104048, intron 2 of 9) 9566 NR_015446 100130017 Hs.582037 NR_015446 ENSG00000250426 FTLP10 - ferritin light chain pseudogene 10 pseudo 132-151 chr6 120883887 120884027 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 450523 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 354.5-9 chr14 62954201 62954781 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) intron (NM_139318, intron 6 of 10) 90967 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 115.75-87 chr18 10528256 10528382 + 1.25 NA intron (NM_003826, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 2292 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 272-34 chr6 125265072 125265297 + 1.25 NA TTS (NM_001300994) TTS (NM_001300994) 36783 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 314.75-21 chr9 27961253 27961562 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) L2|LINE|L2 -387541 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 161.5-198 chr9 36217962 36218159 + 1.25 NA intron (NM_005476, intron 11 of 11) intron (NM_005476, intron 11 of 11) 27139 NM_001311204 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 358.25-21 chr9 103410606 103410995 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -85767 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 198.5-26 chr12 8866686 8866923 + 1.25 NA intron (NM_001282424, intron 18 of 24) LTR83|LTR|ERVL 21800 NM_001282424 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 232-67 chr6 114228140 114228535 + 1.25 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) intron (NR_125845, intron 8 of 9) -165460 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 282.5-17 chr15 33016084 33016363 + 1.25 NA intron (NM_001277313, intron 6 of 20) intron (NM_001277313, intron 6 of 20) 51951 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 297.75-37 chr6 26015147 26015647 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 2415 NM_005325 3024 Hs.150206 NM_005325 ENSG00000124610 HIST1H1A H1.1|H1A|H1F1|HIST1 histone cluster 1 H1 family member a protein-coding 284-39 chr5 11798982 11799242 + 1.25 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) MIRc|SINE|MIR 105334 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 254.75-19 chr2 36224301 36224577 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 131131 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 273.75-6 chr11 92574964 92575363 + 1.25 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 223067 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 231.5-85 chr5 151437974 151438252 + 1.25 NA intron (NM_001308151, intron 1 of 8) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 1067 NM_001308151 206358 Hs.269004 NM_078483 ENSG00000123643 SLC36A1 Dct1|LYAAT1|PAT1|TRAMD3 solute carrier family 36 member 1 protein-coding 331.25-16 chr6 34646006 34646316 + 1.25 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 -49993 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 206-4 chr1 166202838 166203212 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -36270 NM_001017961 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 160.25-66 chr2 13113866 13114048 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -106944 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 167.25-137 chr6 85506723 85506943 + 1.25 NA intron (NM_001350538, intron 28 of 28) intron (NM_001350538, intron 28 of 28) 56750 NM_002526 4907 Hs.153952 NM_002526 ENSG00000135318 NT5E CALJA|CD73|E5NT|NT|NT5|NTE|eN|eNT 5'-nucleotidase ecto protein-coding 206.25-58 chr20 50741090 50741347 + 1.25 NA intron (NM_032521, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 9638 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 129.75-41 chr11 98926806 98926941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -94076 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 293.25-20 chr4 35566766 35567072 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 677020 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 191-23 chr13 52669515 52669687 + 1.25 NA intron (NM_001130912, intron 11 of 13) intron (NM_001130912, intron 11 of 13) 16765 NM_006704 10910 Hs.281902 NM_006704 ENSG00000165416 SUGT1 SGT1 SGT1 homolog, MIS12 kinetochore complex assembly cochaperone protein-coding 286.5-52 chr4 187537086 187537490 + 1.25 NA intron (NR_110436, intron 2 of 2) L1MC1|LINE|L1 -31675 NR_038931 339975 Hs.639361 NR_038931 LOC339975 - uncharacterized LOC339975 ncRNA 132.5-175 chr3 186040650 186040830 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 68349 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 179.5-99 chr2 192155602 192155787 + 1.25 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 39239 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 185-56 chr3 62365607 62365982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7756 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 211.75-12 chr11 43007262 43007589 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 261944 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 265.25-33 chr22 27329707 27330080 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19242 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 202.5-45 chr14 78451989 78452294 + 1.25 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 48422 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 166.5-71 chr15 89255770 89256083 + 1.25 NA intron (NM_001113378, intron 2 of 37) MIRb|SINE|MIR 11947 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 252.75-59 chr5 143045246 143045522 + 1.25 NA intron (NR_146198, intron 14 of 22) intron (NR_146198, intron 14 of 22) -147116 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 164.5-191 chr7 83386768 83387097 + 1.25 NA intron (NM_001178129, intron 15 of 16) intron (NM_001178129, intron 15 of 16) -224048 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 247-13 chr12 40122234 40122684 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16378 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 206.25-88 chr5 131463788 131464060 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001164390, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001164390, exon 18 of 18) 171305 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 151.25-29 chr11 43293342 43293486 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -18582 NM_001243747 8539 Hs.435771 NM_006595 ENSG00000166181 API5 AAC-11|AAC11 apoptosis inhibitor 5 protein-coding 343.5-7 chr12 40863235 40863739 + 1.25 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) 35549 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 280.75-38 chr7 108999828 109000133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -115393 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 386.5-10 chr2 63448990 63449567 + 1.25 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) intron (NR_148704, intron 7 of 18) -11271 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 202.5-123 chr5 132742748 132742973 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -4566 NM_001287253 645121 Hs.522057 NM_001039780 ENSG00000205089 CCNI2 - cyclin I family member 2 protein-coding 238.75-58 chr7 26758397 26758745 + 1.25 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 99152 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 264-43 chr3 35791259 35791514 + 1.25 NA intron (NM_016300, intron 18 of 19) intron (NM_016300, intron 18 of 19) 46910 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 131.75-199 chr7 40057865 40058048 + 1.25 NA intron (NM_003718, intron 7 of 13) intron (NM_003718, intron 7 of 13) 76666 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 238-53 chr4 104772088 104772310 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -277305 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 199.25-105 chr9 36661542 36661910 + 1.25 NA intron (NM_001256691, intron 11 of 15) AluY|SINE|Alu 88831 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 115.75-186 chr6 53939002 53939319 + 1.25 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) intron (NR_125842, intron 1 of 3) 9178 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 246.25-10 chr11 81411381 81411667 + 1.25 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 479312 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 184-22 chr12 121334556 121334724 + 1.25 NA intron (NM_001137559, intron 7 of 16) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 17771 NM_016237 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 159.5-150 chr3 117928942 117929149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -238120 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 172.25-146 chr9 120807393 120807653 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 14027 NR_027442 100288842 Hs.706815 NR_027442 B3GNT10 - UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 10 (putative) pseudo 452.25-3 chr2 123533512 123534135 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -460342 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 235.75-58 chr5 52897229 52897559 + 1.25 NA intron (NM_181501, intron 9 of 28) intron (NM_181501, intron 9 of 28) -91958 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 244.75-5 chr1 180357068 180357367 + 1.25 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR 81173 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 127.5-257 chr9 27935044 27935216 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -361264 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 170.5-84 chr2 4031211 4031471 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 57180 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 204.5-62 chr2 43355714 43355905 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) L1MC5|LINE|L1 128598 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 118.75-72 chr16 73139844 73139958 + 1.25 NA intron (NM_207385, intron 2 of 3) intron (NM_207385, intron 2 of 3) 4546 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 113-51 chr12 30815423 30815634 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 19847 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 153.25-72 chr2 164434076 164434268 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 134323 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 206.75-86 chr7 82688363 82688529 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -244490 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 170.25-45 chr15 89039744 89039980 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -48594 NM_007011 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 167.75-131 chr7 39068631 39068828 + 1.25 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) intron (NM_007252, intron 2 of 10) -55162 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 255-68 chrX 93158194 93158579 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -333483 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 169.25-97 chr5 79844729 79845048 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91691 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 149.75-131 chr5 116964741 116964877 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -202600 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 173-57 chr18 74108840 74109113 + 1.25 NA intron (NM_001142958, intron 8 of 9) L1MCa|LINE|L1 38858 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 161-13 chr10 55515247 55515526 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -83656 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 153.25-65 chr2 40743986 40744252 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -231684 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 237.5-25 chr12 15786773 15787088 + 1.25 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 2458 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 354.75-3 chr10 114016252 114016732 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27374 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 227.75-53 chr3 187959501 187959757 + 1.25 NA intron (NR_135538, intron 2 of 2) intron (NR_135538, intron 2 of 2) 16778 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 144.25-172 chr6 81242056 81242282 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 510512 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 178.75-53 chr20 56259284 56259612 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10716 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 176.5-153 chr7 32153628 32153807 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -82281 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 241-51 chr7 137574836 137575041 + 1.25 NA intron (NM_001321710, intron 17 of 32) intron (NM_001321710, intron 17 of 32) -231205 NM_002825 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 159.25-154 chr8 120080000 120080236 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44984 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 191-43 chr2 197457089 197457417 + 1.25 NA intron (NM_001320820, intron 1 of 4) MER1B|DNA|hAT-Charlie 3489 NM_001320819 80219 Hs.606592 NM_025147 ENSG00000115520 COQ10B - coenzyme Q10B protein-coding 175.25-118 chr5 67710642 67710788 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -63926 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 196.5-70 chr18 9379470 9379732 + 1.25 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) L1PREC2|LINE|L1 44828 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 332.5-28 chr7 70715584 70715888 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 6 of 18) AluSz|SINE|Alu -416408 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 238.75-35 chr22 34930771 34931160 + 1.25 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 66951 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 254-32 chr3 62802336 62802576 + 1.25 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) L2c|LINE|L2 72960 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 173.75-130 chr6 34945069 34945214 + 1.25 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 55886 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 258.75-36 chr2 39091996 39092311 + 1.25 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 28310 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 198-26 chr15 64992660 64992945 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -2888 NM_016630 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 206-82 chr9 112184798 112185077 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -9640 NM_001282640 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 161.75-128 chr8 131140114 131140374 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99335 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 208.5-108 chr5 67259895 67260242 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63269 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 173.5-46 chr15 70990756 70990964 + 1.25 NA intron (NM_017691, intron 11 of 15) intron (NM_017691, intron 11 of 15) 98417 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 301.5-36 chr3 81999669 82000070 + 1.25 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 13727 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 295.75-17 chr2 222334801 222335158 + 1.25 NA intron (NR_136642, intron 1 of 3) L1M2|LINE|L1 14318 NR_136639 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 363-5 chr15 69269920 69270332 + 1.25 NA 3' UTR (NM_015554, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_015554, exon 5 of 5) -28786 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 153-5 chr1 172781831 172782006 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 122815 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 186-66 chr4 93331576 93331927 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -497002 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 152.25-55 chr14 80434602 80434871 + 1.25 NA intron (NR_038355, intron 8 of 8) L1M1|LINE|L1 -203679 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 402-3 chr10 74054097 74054560 + 1.25 NA intron (NM_014000, intron 2 of 21) L1M5|LINE|L1 56212 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 202.75-69 chr22 24856277 24856497 + 1.25 NA intron (NM_001098498, intron 8 of 23) MIR|SINE|MIR 50166 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 121.25-62 chr14 84613978 84614142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -657872 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 299.5-16 chr16 6622664 6623019 + 1.25 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -150968 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 245.25-27 chr17 81537986 81538329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9780 NM_001077182 25794 Hs.118555 NM_012418 ENSG00000186765 FSCN2 RFSN|RP30 fascin actin-bundling protein 2, retinal protein-coding 251-28 chr18 2673163 2673486 + 1.25 NA exon (NM_015295, exon 4 of 48) exon (NM_015295, exon 4 of 48) 17437 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 224.5-29 chr12 6039093 6039293 + 1.25 NA TTS (NR_145989) TTS (NR_145989) 990 NR_145989 109729112 NR_145989 SNORA120 - small nucleolar RNA, H/ACA box 120 snoRNA 208.75-80 chr8 74742350 74742652 + 1.25 NA intron (NR_033830, intron 4 of 5) intron (NR_033830, intron 4 of 5) 36808 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 274.5-7 chr10 66841162 66841416 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -84747 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 163.75-21 chr10 73260539 73260799 + 1.25 NA intron (NM_001367801, intron 26 of 27) L1ME1|LINE|L1 7928 NR_134459 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 192.25-71 chr22 36086599 36086814 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -57882 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 475-4 chr4 48474081 48474769 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8918 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 175.25-50 chr15 64984535 64984712 + 1.25 NA intron (NM_001127890, intron 1 of 7) AluJo|SINE|Alu 4847 NM_001127889 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 132.5-63 chr14 24651862 24652111 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -17796 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 183.5-14 chr1 225986552 225986778 + 1.25 NA intron (NM_152608, intron 6 of 6) intron (NM_152608, intron 6 of 6) 12678 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 237-61 chr7 26388113 26388411 + 1.25 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -10307 NR_148499 441204 Hs.587432 NR_015364 ENSG00000214870 LOC441204 - uncharacterized LOC441204 ncRNA 131-33 chr11 110817050 110817295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103983 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 204-39 chr2 190448650 190448832 + 1.25 NA intron (NM_017694, intron 3 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 40386 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 147.25-44 chr16 49476390 49476600 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42090 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 226-32 chr17 68026385 68026809 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -9138 NM_002266 3838 Hs.594238 NM_002266 ENSG00000182481 KPNA2 IPOA1|QIP2|RCH1|SRP1-alpha|SRP1alpha karyopherin subunit alpha 2 protein-coding 192.75-79 chr22 34718376 34718667 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 279395 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 246.25-26 chr17 68735046 68735428 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 107083 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 253.5-52 chr3 130648334 130648661 + 1.25 NA intron (NM_001102608, intron 31 of 35) MIR|SINE|MIR 88163 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 137.75-160 chr5 10878227 10878416 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -117087 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 189-91 chr5 90564265 90564515 + 1.25 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) intron (NR_003149, intron 1 of 89) 5593 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 176.5-118 chr3 41181662 41181879 + 1.25 NA Intergenic Helitron3Na_Mam|RC|Helitron -17735 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 155.25-83 chr17 61014132 61014351 + 1.25 NA intron (NM_001353144, intron 16 of 25) intron (NM_001353144, intron 16 of 25) 336390 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 331.5-21 chr5 4350412 4350709 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -422921 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 297.5-27 chr2 117219008 117219318 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -595528 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 219-96 chr9 24742363 24742627 + 1.25 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -196598 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 282.5-46 chr4 78519313 78519685 + 1.25 NA intron (NM_025074, intron 67 of 73) intron (NM_025074, intron 67 of 73) -32271 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 151.5-192 chr8 86808107 86808295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58214 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 152.25-53 chr14 65422478 65422649 + 1.25 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu 9833 NR_038170 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 272.5-15 chr11 98096020 98096335 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -924772 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 150.75-66 chr15 64107169 64107429 + 1.25 NA intron (NM_003099, intron 1 of 14) intron (NM_003099, intron 1 of 14) 11317 NM_001242933 6642 Hs.188634 NM_003099 ENSG00000028528 SNX1 HsT17379|VPS5 sorting nexin 1 protein-coding 352.25-8 chr2 28780267 28780805 + 1.25 NA intron (NM_206876, intron 4 of 8) intron (NM_206876, intron 4 of 8) 28706 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 195-45 chr2 121098926 121099159 + 1.25 NA Intergenic G-rich|Low_complexity|Low_complexity 186160 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 235.25-66 chr9 21100409 21100938 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -22731 NM_002176 3456 Hs.93177 NM_002176 ENSG00000171855 IFNB1 IFB|IFF|IFN-beta|IFNB interferon beta 1 protein-coding 213-96 chr8 90754330 90754563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37329 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 385.5-19 chr6 126393300 126393848 + 1.25 NA intron (NR_104462, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 53459 NR_104462 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 119-106 chr21 30823563 30823672 + 1.25 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 6142 NM_181606 337878 Hs.407656 NM_181606 ENSG00000274749 KRTAP7-1 KAP7.1 keratin associated protein 7-1 (gene/pseudogene) protein-coding 256-39 chr21 23368791 23369101 + 1.25 NA intron (NR_040254, intron 3 of 4) intron (NR_040254, intron 3 of 4) 15889 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 166.5-158 chr5 24368387 24368602 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 276484 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 193.5-8 chr1 90344566 90344845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -313045 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 185.25-95 chr5 11603242 11603595 + 1.25 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -14352 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 187.25-59 chr2 153900538 153900787 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 1 of 12) intron (NM_052917, intron 1 of 12) 28740 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 172.5-111 chr20 13839315 13839593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54426 NR_029377 79133 Hs.472165 NM_024120 ENSG00000101247 NDUFAF5 C20orf7|MC1DN16|bA526K24.2|dJ842G6.1 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5 protein-coding 391.25 chr1 26130760 26131318 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 19215 NM_152835 149420 Hs.468801 NM_152835 ENSG00000175087 PDIK1L CLIK1L|STK35L2 PDLIM1 interacting kinase 1 like protein-coding 255.75-42 chr5 102093563 102093917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 202544 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 231.75-2 chr1 60473877 60474280 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 148607 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 218.25-64 chr4 165625068 165625334 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -59438 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 454.25-3 chr20 7142796 7143223 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 111193 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 159.5-52 chr14 45107558 45107735 + 1.25 NA intron (NM_017922, intron 6 of 13) intron (NM_017922, intron 6 of 13) -3229 NR_003691 100113389 Hs.712501 NR_003691 ENSG00000239043 SNORD127 - small nucleolar RNA, C/D box 127 snoRNA 266.5-77 chr8 118907822 118908119 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43915 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 264-38 chr2 188336709 188336948 + 1.25 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 39336 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 266.5-55 chr4 93869100 93869603 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40598 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 123.75-83 chr18 75412991 75413149 + 1.25 NA intron (NM_001037331, intron 2 of 2) intron (NM_001037331, intron 2 of 2) 14633 NM_001303482 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 334.5-25 chr5 16537227 16537541 + 1.25 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -28386 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 161.5-178 chr7 134883416 134883555 + 1.25 NA intron (NM_033157, intron 3 of 14) intron (NM_033157, intron 3 of 14) -7915 NM_033139 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 198.5-96 chr3 80807192 80807367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36575 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 227-23 chr14 68330772 68330989 + 1.25 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 297907 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 152.5-2 chr1 36034663 36034900 + 1.25 NA intron (NM_177422, intron 11 of 16) intron (NM_177422, intron 11 of 16) -49313 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 113.75-203 chr8 140527178 140527356 + 1.25 NA 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 15271 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 393.5-16 chr8 120659519 120659924 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -101532 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 341.5-12 chr18 2899125 2899515 + 1.25 NA intron (NM_032048, intron 4 of 7) intron (NM_032048, intron 4 of 7) 47303 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 278.25-25 chr2 52689171 52689699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13180 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 179.5-144 chr5 25791904 25792169 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 601083 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 210.5-42 chr15 59595067 59595397 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16551 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 218.25-68 chr5 59382435 59382782 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -25638 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 138.5-42 chr12 20421830 20421961 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 52650 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 163-118 chr8 86661129 86661548 + 1.25 NA intron (NM_019098, intron 6 of 17) intron (NM_019098, intron 6 of 17) 82337 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 146.75-2 chr1 70769286 70769412 + 1.25 NA intron (NR_125938, intron 5 of 6) L1PA14|LINE|L1 62896 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 309.75-2 chr1 185901755 185902111 + 1.25 NA intron (NM_031935, intron 4 of 106) intron (NM_031935, intron 4 of 106) 167542 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 183-68 chr3 85991901 85992300 + 1.25 NA intron (NM_001256502, intron 9 of 10) intron (NM_001256502, intron 9 of 10) -164050 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 209-3 chr1 97178667 97178938 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 82879 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 143.25-131 chr4 33695502 33695676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 344304 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 188-76 chr8 74276890 74277093 + 1.25 NA intron (NM_020647, intron 2 of 5) intron (NM_020647, intron 2 of 5) 44370 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 339.25-2 chr10 20491227 20491862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60426 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 220.5-128 chr9 4943644 4943865 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41332 NM_001322194 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 163-30 chr12 65147058 65147223 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22443 NM_001167614 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 171.75-96 chr22 26715018 26715320 + 1.25 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) intron (NR_110543, intron 1 of 5) 42326 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 209.25-55 chr2 43502872 43503105 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 24 of 37) L1ME3C|LINE|L1 92986 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 304.75-30 chr6 54719718 54720018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126903 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 358-6 chr17 65645611 65645921 + 1.25 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) intron (NM_001353129, intron 24 of 26) -84118 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 160.25-40 chr14 63268337 63268543 + 1.25 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 50495 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 187.25-19 chr11 35265317 35265777 + 1.25 NA exon (NM_004171, exon 10 of 11) exon (NM_004171, exon 10 of 11) 102597 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 340.5-19 chr22 16846319 16846661 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 19016 NR_003607 27437 Hs.143955 NR_003607 ENSG00000229027 HSFY1P1 CECR8|HSFYL1|HSFYP1|NCRNA00016 HSFY1 pseudogene 1 pseudo 212-71 chr6 101017803 101018122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136590 NM_001284271 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 270.5-37 chr3 4993521 4993839 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -13719 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 543.75 chr2 184364868 184365676 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13703 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 377.75-10 chr5 125512488 125512980 + 1.25 NA intron (NR_109887, intron 2 of 3) (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19473 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 392-6 chr2 191367927 191368542 + 1.25 NA intron (NM_012223, intron 11 of 28) intron (NM_012223, intron 11 of 28) 122830 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 157.25 chr1 36223353 36223517 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1008 NM_005119 9967 Hs.744057 NM_005119 ENSG00000054118 THRAP3 BCLAF2|TRAP150 thyroid hormone receptor associated protein 3 protein-coding 149-87 chr4 30164910 30165045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -555392 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 250.75-44 chr4 38267371 38267705 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -99376 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 247.5-45 chr2 193220410 193220843 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 470781 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 234.25-20 chr14 43029752 43030058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1423049 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 273-12 chr11 34190429 34190815 + 1.25 NA intron (NM_145804, intron 3 of 16) intron (NM_145804, intron 3 of 16) 84993 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 147.25-154 chr9 4308730 4308876 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8735 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 440.5 chr1 112060835 112061419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70591 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 225.75-33 chr18 21958636 21958934 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -127379 NR_110369 102723167 Hs.658808 NR_110369 ENSG00000265142 MIR133A1HG MIR1-2HG MIR133A1 host gene ncRNA 280.5-11 chr13 92461146 92461521 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) L2a|LINE|L2 -28830 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 117.5-245 chrX 85632625 85632779 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -203078 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 129-97 chr2 175818018 175818178 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 184169 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 205.25-99 chr7 28484808 28485002 + 1.25 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) intron (NM_004904, intron 1 of 10) 49290 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 338-10 chr14 51078792 51079091 + 1.25 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) L1MA9|LINE|L1 16763 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 167.75-16 chr1 234935178 234935336 + 1.25 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 28742 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 213.75-109 chr9 105207920 105208147 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36572 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 231-9 chr10 88582683 88583276 + 1.25 NA intron (NM_018363, intron 1 of 6) CpG 339 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 140.5-146 chr3 24586026 24586251 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90430 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 238.75-63 chr8 92531555 92531780 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 123827 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 170.5-113 chr22 32779515 32779792 + 1.25 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR -21163 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 287.25-8 chr10 55068262 55068598 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MA4A|LINE|L1 -267139 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 156.75-16 chr10 7517726 7517908 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 101856 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 184.5-156 chr8 97828056 97828214 + 1.25 NA intron (NM_018407, intron 6 of 6) HERVH-int|LTR|ERV1 -40929 NM_030583 4147 Hs.189445 NM_002380 ENSG00000132561 MATN2 - matrilin 2 protein-coding 180.75-73 chr2 219967503 219967653 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -61013 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 203-87 chr5 122894824 122895221 + 1.25 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 49409 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 473.75-3 chr8 83406541 83407227 + 1.25 NA intron (NR_122034, intron 1 of 1) LTR37-int|LTR|ERV1 3126 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 247.5-17 chr13 61951576 61951836 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77842 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 186.25-26 chr12 106481841 106482031 + 1.25 NA intron (NM_001160708, intron 23 of 27) intron (NM_001160708, intron 23 of 27) -100971 NM_213594 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 211.5-2 chr1 79975542 79975837 + 1.25 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -560066 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 324.5-23 chr3 148331032 148331457 + 1.25 NA intron (NR_146712, intron 3 of 4) intron (NR_146712, intron 3 of 4) 50353 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 124.5-31 chr11 29238396 29238551 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -355940 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 164.5-10 chr1 151595603 151595772 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -16363 NM_030918 81609 Hs.192326 NM_030918 ENSG00000143376 SNX27 MRT1|MY014 sorting nexin 27 protein-coding 140.75-112 chr20 40203118 40203337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 198766 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 311-3 chr10 22933334 22933689 + 1.25 NA intron (NM_001282747, intron 2 of 15) intron (NM_001282747, intron 2 of 15) 5458 NM_001282746 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 218.25-49 chr2 227073764 227073985 + 1.25 NA intron (NM_000092, intron 25 of 47) L1PB3|LINE|L1 90685 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 180-53 chr18 63094092 63094249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 225210 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 171.25-12 chr10 22920448 22920713 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -7444 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 198.75-53 chr2 216729286 216729464 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -33826 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 292.75-25 chr3 119276675 119276921 + 1.25 NA intron (NR_046574, intron 3 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -17585 NM_020754 57514 Hs.668218 NM_020754 ENSG00000031081 ARHGAP31 AOS1|CDGAP Rho GTPase activating protein 31 protein-coding 189-98 chr7 13740699 13740944 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 245693 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 190-42 chr3 56852784 56853037 + 1.25 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) intron (NM_001128615, intron 4 of 12) -50961 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 150-89 chr3 44472204 44472356 + 1.25 NA intron (NM_181489, intron 1 of 7) intron (NM_181489, intron 1 of 7) 5390 NM_181489 353274 Hs.250481 NM_181489 ENSG00000185219 ZNF445 ZKSCAN15|ZNF168|ZSCAN47 zinc finger protein 445 protein-coding 225.75-13 chr10 57904465 57904734 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 363295 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 264-17 chr15 34275342 34275702 + 1.25 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) 43298 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 228-47 chr22 31031816 31032051 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -49385 NM_006932 6525 Hs.149098 NM_006932 ENSG00000183963 SMTN - smoothelin protein-coding 212.25-44 chr2 98890355 98890698 + 1.25 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) L1M4|LINE|L1 45699 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 139-120 chr5 121686968 121687103 + 1.25 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -164847 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 183.75-26 chr12 3918957 3919195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45628 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 133.75-80 chr17 68966780 68966965 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -11480 NM_001288985 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 176.25-60 chr2 15798404 15798614 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 107727 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 365.75-6 chr15 40576587 40577047 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 7518 NM_152260 27079 Hs.173311 NM_152260 ENSG00000166133 RPUSD2 C15orf19|C18B11|PUS9 RNA pseudouridine synthase domain containing 2 protein-coding 115-158 chr6 118983337 118983497 + 1.25 NA intron (NM_024581, intron 9 of 17) intron (NM_024581, intron 9 of 17) -48255 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 436.25-6 chr5 7911782 7912340 + 1.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 42913 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 123.5-3 chr1 36037962 36038080 + 1.25 NA intron (NM_177422, intron 12 of 16) intron (NM_177422, intron 12 of 16) -46073 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 276.5-22 chr14 48722950 48723379 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 863216 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 207-50 chr2 237633520 237633746 + 1.25 NA intron (NM_001137550, intron 1 of 23) intron (NM_001137550, intron 1 of 23) 6046 NM_001137550 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 134.5-222 chr8 83394821 83395042 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -8827 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 212.75-81 chr5 127359515 127359810 + 1.25 NA intron (NM_001308121, intron 4 of 13) L1ME1|LINE|L1 68866 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 165-112 chr5 34795877 34796101 + 1.25 NA exon (NM_001145522, exon 4 of 17) exon (NM_001145522, exon 4 of 17) -43175 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 170.5-44 chr12 16120875 16121102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 156697 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 291-22 chr22 26579345 26579683 + 1.25 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) intron (NM_001362923, intron 1 of 7) 10618 NM_001362923 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 144.75-167 chr7 104826630 104826853 + 1.25 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) -22649 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 291.75-23 chr2 135912144 135912492 + 1.25 NA intron (NM_001293312, intron 12 of 14) intron (NM_001293312, intron 12 of 14) -35875 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 379.25-13 chr5 40714240 40714948 + 1.25 NA 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 34679 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 124.25-202 chr8 100300793 100300925 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001353837, exon 1 of 10) 5' UTR (NM_001353837, exon 1 of 10) 1334 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 212.5-4 chr1 91527532 91527767 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26541 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 312-11 chr12 107203694 107203997 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -110296 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 238.5-83 chr6 161304803 161305118 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30899 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 282-53 chr9 32785332 32785657 + 1.25 NA 3' UTR (NM_212558, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_212558, exon 2 of 2) 1954 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 183.75-61 chr2 195293247 195293433 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -363618 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 161.75-78 chr21 27524690 27524889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -197590 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 217.5-37 chr12 131310067 131310270 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -12196 NR_135045 107161159 Hs.730119 NR_135045 ENSG00000248703 LINC02415 - long intergenic non-protein coding RNA 2415 ncRNA 217.75-67 chr7 68549919 68550172 + 1.25 NA Intergenic (CATGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 529792 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 159.5-61 chr15 66807059 66807266 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 104926 NM_005585 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 235.5-55 chr3 3739396 3739690 + 1.25 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) intron (NR_149025, intron 5 of 5) -59888 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 207.5-44 chr18 77360511 77360738 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 110776 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 238.5-25 chr14 55146118 55146433 + 1.25 NA TTS (NM_002306) TTS (NM_002306) 9292 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 241.75-35 chr18 40087721 40088020 + 1.25 NA intron (NR_110791, intron 3 of 3) intron (NR_110791, intron 3 of 3) 21584 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 117.25-25 chr10 26410285 26410465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27966 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 158.5-104 chr2 147929224 147929420 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001616, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001616, exon 11 of 11) 84293 NM_001616 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 268.5-47 chr5 95526885 95527244 + 1.25 NA intron (NM_014639, intron 13 of 42) L1MC5|LINE|L1 27941 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 263-44 chr6 72920359 72920631 + 1.25 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 47258 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 149-68 chr20 42964666 42964840 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) -3990 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 282.25-23 chr3 41708052 41708491 + 1.25 NA intron (NR_136342, intron 24 of 34) L1MA8|LINE|L1 253832 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 328.5-8 chr12 5903194 5903529 + 1.25 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) MIRb|SINE|MIR 41898 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 170.25-5 chr1 74259851 74260033 + 1.25 NA intron (NM_015978, intron 4 of 24) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 24555 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 214.75-92 chrX 16308288 16308590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 140958 NM_001277307 645864 Hs.632792 NM_001277307 ENSG00000182798 MAGEB17 - MAGE family member B17 protein-coding 152.25-58 chr15 27820706 27820898 + 1.25 NA intron (NM_001300984, intron 22 of 22) intron (NM_001300984, intron 22 of 22) 278513 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 172.25-69 chr2 130986654 130986858 + 1.25 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) intron (NM_001367493, intron 4 of 13) 106406 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 288-24 chr15 67949057 67949481 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -104910 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 274.25-44 chr6 69760231 69760624 + 1.25 NA intron (NM_001367272, intron 3 of 15) L1ME3E|LINE|L1 36039 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 196-66 chr3 96499975 96500329 + 1.25 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 140188 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 238.25-75 chr6 84217031 84217299 + 1.25 NA intron (NM_014895, intron 3 of 26) L2a|LINE|L2 10478 NM_001286206 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 265-34 chr5 114041002 114041453 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -320843 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 129-152 chr6 40351485 40351605 + 1.25 NA intron (NR_038887, intron 1 of 2) intron (NR_038887, intron 1 of 2) 4461 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 250.5-39 chr2 25184299 25184792 + 1.25 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 -15694 NM_001035256 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 141.25-83 chr2 100368377 100368533 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -45722 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 263-14 chr13 27578838 27579195 + 1.25 NA intron (NM_153371, intron 2 of 9) intron (NM_153371, intron 2 of 9) 41513 NM_153371 222484 Hs.132359 NM_153371 ENSG00000139517 LNX2 PDZRN1 ligand of numb-protein X 2 protein-coding 230-5 chr1 222948904 222949141 + 1.25 NA intron (NM_001369594, intron 2 of 7) intron (NM_001369594, intron 2 of 7) 20598 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 174.25-86 chr20 55981608 55981889 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 23771 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 148.75-168 chr8 77894083 77894246 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 443467 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 145-5 chr1 53890782 53891029 + 1.25 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -1108 NR_135075 54432 Hs.11923 NM_018982 ENSG00000058799 YIPF1 DJ167A19.1|FinGER1 Yip1 domain family member 1 protein-coding 243.75-55 chr3 72536457 72536782 + 1.25 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -89996 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 511.75 chr1 178019709 178020252 + 1.25 NA intron (NR_151484, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 17996 NR_151492 111240474 NM_001356505 CRYZL2P-SEC16B - CRYZL2P-SEC16B readthrough protein-coding 213-41 chr2 14669423 14669733 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36861 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 268.75-44 chr8 88778538 88778879 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -451225 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 216-34 chr18 14045164 14045521 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 87093 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 160.5-17 chr10 90561467 90561702 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20779 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 142-175 chr9 107477984 107478287 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11550 NR_121581 101928720 Hs.125496 NR_121581 LINC01509 PRCAT37 long intergenic non-protein coding RNA 1509 ncRNA 405.5-9 chr3 85998704 85999350 + 1.25 NA intron (NM_001256502, intron 9 of 10) intron (NM_001256502, intron 9 of 10) -170977 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 145-129 chr5 132213237 132213439 + 1.25 NA intron (NM_001365681, intron 5 of 13) L2|LINE|L2 4580 NR_106888 102465498 NR_106888 ENSG00000283678 MIR6830 hsa-mir-6830 microRNA 6830 ncRNA 183.75-69 chr3 1780159 1780468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -318490 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 269.75-58 chr9 136727753 136728210 + 1.25 NA non-coding (NR_024542, exon 1 of 4) non-coding (NR_024542, exon 1 of 4) 203 NR_024542 84973 Hs.495480 NR_003672 ENSG00000233016 SNHG7 NCRNA00061 small nucleolar RNA host gene 7 ncRNA 194.25-98 chr5 175602288 175602503 + 1.25 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -55676 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 397.25-14 chr8 127632531 127633011 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 101196 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 158-153 chr9 83727156 83727475 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 18984 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 236.25-4 chr1 86123403 86123737 + 1.25 NA intron (NM_152890, intron 3 of 59) intron (NM_152890, intron 3 of 59) 32901 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 206-20 chr13 23859638 23859883 + 1.25 NA intron (NM_005932, intron 9 of 18) MIR|SINE|MIR -29108 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 148-42 chr17 43203357 43203626 + 1.25 NA intron (NM_005899, intron 19 of 20) intron (NM_005899, intron 19 of 20) -8384 NM_001291588 113277 Hs.536474 NM_145041 ENSG00000184988 TMEM106A - transmembrane protein 106A protein-coding 269.5-16 chr14 74481378 74481688 + 1.25 NA intron (NM_001363688, intron 3 of 3) intron (NM_001363688, intron 3 of 3) -1329 NR_039858 100616211 NR_039858 ENSG00000283944 MIR4709 mir-4709 microRNA 4709 ncRNA 386.75-2 chr16 48389242 48389767 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -4091 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 320.25-26 chr8 21978200 21978520 + 1.25 NA intron (NM_015024, intron 8 of 27) intron (NM_015024, intron 8 of 27) -45774 NM_001286680 10361 Hs.131055 NM_182795 ENSG00000158806 NPM2 - nucleophosmin/nucleoplasmin 2 protein-coding 272-17 chr2 189135172 189135579 + 1.25 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) -2264 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 217-55 chr3 179298914 179299139 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -24005 NM_001303425 51193 Hs.632578 NM_016331 ENSG00000121864 ZNF639 ANC-2H01|ANC_2H01|ZASC1 zinc finger protein 639 protein-coding 260.25-23 chr2 103751064 103751352 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 657124 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 179-59 chr2 149347270 149347455 + 1.25 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 16775 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 258.25-2 chr1 25442141 25442353 + 1.25 NA intron (NM_018202, intron 1 of 10) intron (NM_018202, intron 1 of 10) 11350 NM_018202 55219 Hs.189782 NM_018202 ENSG00000204178 MACO1 MACOILIN|TMEM57 macoilin 1 protein-coding 127.25-37 chr11 112999442 112999583 + 1.25 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -36052 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 226.75-70 chr7 112534194 112534469 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 53340 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 226.25-48 chr3 89795385 89795674 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 687908 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 280-11 chr11 15005748 15006101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33573 NR_125898 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 163.25-10 chr1 222684597 222684759 + 1.25 NA intron (NM_022831, intron 6 of 9) intron (NM_022831, intron 6 of 9) 27813 NM_022831 64853 Hs.156625 NM_022831 ENSG00000186063 AIDA C1orf80 axin interactor, dorsalization associated protein-coding 201.5-112 chr5 170842670 170842976 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19195 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 161-62 chr2 64810462 64810618 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 53091 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 131.25-7 chr1 70050504 70050615 + 1.25 NA intron (NM_001370785, intron 22 of 26) intron (NM_001370785, intron 22 of 26) 131237 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 207.5-25 chr15 51884789 51884999 + 1.25 NA intron (NM_014547, intron 3 of 9) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 39226 NR_109775 100422556 Hs.664788 NR_109775 LOC100422556 - LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component pseudogene pseudo 236.25-31 chr16 7058437 7058652 + 1.25 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) MIR|SINE|MIR -274301 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 327-18 chr2 185210660 185211095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43805 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 276.5-45 chr3 128885728 128886039 + 1.25 NA intron (NM_014049, intron 2 of 17) AluSx1|SINE|Alu 6263 NM_014049 28976 Hs.567482 NM_014049 ENSG00000177646 ACAD9 MC1DN20|NPD002 acyl-CoA dehydrogenase family member 9 protein-coding 135-117 chr3 180575794 180575981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26276 NM_001042601 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 132.75-71 chr15 76350765 76350947 + 1.25 NA intron (NR_148227, intron 32 of 32) intron (NR_148227, intron 32 of 32) 14083 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 119.5-175 chr5 31170612 31170753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23004 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 163.5-222 chrX 45319935 45320137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -119160 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 142.75-61 chr14 57087979 57088197 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 180817 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 313.5-37 chr8 58561312 58561737 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001330537, exon 2 of 10) 5' UTR (NM_001330537, exon 2 of 10) 8263 NM_005625 6386 Hs.200804 NM_005625 ENSG00000137575 SDCBP MDA-9|MDA9|ST1|SYCL|TACIP18 syndecan binding protein protein-coding 265-41 chr8 119070748 119071111 + 1.25 NA intron (NM_006438, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR -2147 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 301.25-22 chr3 139206389 139206853 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26901 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 176.25-148 chr9 103796096 103796320 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -203501 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 143-23 chr11 114777121 114777280 + 1.25 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 98673 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 159-15 chr10 73056065 73056256 + 1.25 NA intron (NM_001017962, intron 5 of 14) intron (NM_001017962, intron 5 of 14) 40814 NM_001142596 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 230.75-7 chr10 51203203 51203521 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -96211 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 144.75-86 chr2 72078520 72078714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69245 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 191.5-102 chr3 162367100 162367279 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 870381 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 116.5-207 chr5 169361909 169362011 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60821 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 305-30 chr5 53310547 53311069 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -169821 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 262-48 chr6 147116550 147116880 + 1.25 NA intron (NR_034115, intron 4 of 10) MIRb|SINE|MIR -42210 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 287.5-40 chr3 21092330 21092638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -313242 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 258-8 chr10 75498408 75498771 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) CR1-L3A_Croc|LINE|CR1 -53869 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 341.25-11 chr17 33373041 33373357 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -80211 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 174.5-152 chr5 107832980 107833175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -162140 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 284.75-24 chr3 64617718 64618095 + 1.25 NA intron (NM_001318781, intron 18 of 38) intron (NM_001318781, intron 18 of 38) 56560 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 238.25-44 chr20 47393175 47393492 + 1.25 NA intron (NR_146496, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu 18061 NR_146495 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 464-2 chr2 98085419 98086025 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1445 NR_144297 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 149.25-36 chr12 93586268 93586474 + 1.25 NA Intergenic Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 13696 NM_001270471 8835 Hs.485572 NM_003877 ENSG00000120833 SOCS2 CIS2|Cish2|SOCS-2|SSI-2|SSI2|STATI2 suppressor of cytokine signaling 2 protein-coding 211.75-85 chr6 51636541 51636735 + 1.25 NA intron (NM_138694, intron 64 of 66) intron (NM_138694, intron 64 of 66) 14768 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 224.25-83 chr6 38956698 38956971 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 81 of 91) L1MA6|LINE|L1 -3727 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 315.5-3 chr11 105174864 105175217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35271 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 263.75-49 chr8 21795503 21795939 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6846 NM_001165039 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 351.25-6 chr15 55400523 55400845 + 1.25 NA intron (NR_037923, intron 8 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 7675 NM_020739 9236 Hs.285051 NM_004748 ENSG00000260916 CCPG1 CPR8 cell cycle progression 1 protein-coding 114.5-219 chr5 120252221 120252410 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -211963 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 311.5-23 chr4 12649302 12649746 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 426073 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 244-23 chr2 82296864 82297137 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -559803 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 142-92 chr2 208944199 208944392 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 401653 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 310.75-29 chr7 88074461 88074939 + 1.25 NA intron (NM_001324421, intron 3 of 28) intron (NM_001324421, intron 3 of 28) 140449 NM_021722 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 248.5-15 chr12 12461359 12461748 + 1.25 NA intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 101310 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 227.75-3 chr1 100548468 100548786 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10488 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 182.5-137 chr5 160556414 160556561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 71135 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 129-160 chr7 7893888 7894125 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 74746 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 236.75-24 chr17 6386745 6387007 + 1.25 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 48245 NM_001033054 23746 Hs.279887 NM_014336 ENSG00000129221 AIPL1 AIPL2|LCA4 aryl hydrocarbon receptor interacting protein like 1 protein-coding 269.25-7 chr12 20407031 20407291 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 37916 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 176.5-74 chr18 10785361 10785557 + 1.25 NA intron (NM_022068, intron 16 of 51) L2a|LINE|L2 -25810 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 207-84 chr7 71550936 71551208 + 1.25 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) L1MEg|LINE|L1 -243302 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 267-59 chrX 70851085 70851478 + 1.25 NA intron (NM_001003811, intron 8 of 30) L1MB8|LINE|L1 -4986 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 220.75-43 chr2 160006738 160007075 + 1.25 NA intron (NM_001007267, intron 10 of 26) intron (NM_001007267, intron 10 of 26) 55709 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 221.25-57 chr3 191731347 191731551 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 270286 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 264-29 chr2 24475331 24475926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15626 NM_001362950 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 191.75-72 chr20 45687671 45687979 + 1.25 NA intron (NM_172006, intron 2 of 3) L1PA10|LINE|L1 -14213 NM_172005 164237 Hs.406733 NM_172005 ENSG00000168634 WFDC13 C20orf138|WAP13|dJ601O1.3 WAP four-disulfide core domain 13 protein-coding 223.75-48 chr2 144482505 144482882 + 1.25 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -36921 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 290.75-15 chr15 33719969 33720334 + 1.25 NA intron (NM_001243996, intron 43 of 102) intron (NM_001243996, intron 43 of 102) -248346 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 303.75-36 chr9 27670279 27670717 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96632 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 122.25-114 chr22 27906626 27906755 + 1.25 NA intron (NM_001284278, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 12524 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 224-28 chr2 37064049 37064264 + 1.25 NA intron (NM_019024, intron 10 of 35) intron (NM_019024, intron 10 of 35) 20216 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 116-186 chrX 81788991 81789158 + 1.25 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 586972 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 200-20 chr12 14531017 14531232 + 1.25 NA intron (NM_024829, intron 6 of 10) FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -36608 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 130.75-22 chr10 115268640 115268877 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 13 of 28) intron (NM_207303, intron 13 of 28) 175393 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 168.75-34 chr12 43448177 43448401 + 1.25 NA intron (NM_025003, intron 14 of 38) L1PREC2|LINE|L1 103914 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 182.25-113 chr7 71015069 71015426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116897 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 255.25-22 chr2 110130402 110130806 + 1.25 NA intron (NM_207181, intron 17 of 19) intron (NM_207181, intron 17 of 19) -14038 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 124-87 chr2 123963281 123963388 + 1.25 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 61840 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 149.5-37 chr10 126794745 126794917 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -110578 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 180.25-56 chr2 206990559 206990775 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 51149 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 288.75-41 chr6 129621946 129622219 + 1.25 NA intron (NM_033515, intron 5 of 14) L2b|LINE|L2 88095 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 315-23 chr7 43561264 43561605 + 1.25 NA intron (NM_001287059, intron 27 of 27) intron (NM_001287059, intron 27 of 27) -21674 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 154.75-17 chr11 29168891 29169121 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -425407 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 197.5-153 chr8 18858617 18858819 + 1.25 NA intron (NM_015310, intron 4 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 28339 NM_001362819 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 396.5 chr1 94818910 94819382 + 1.25 NA intron (NR_160783, intron 1 of 3) L1MEh|LINE|L1 1086 NR_160779 101928079 Hs.596857 NR_104131 ENSG00000224081 SLC44A3-AS1 LINC01057|XLOC_000303 SLC44A3 antisense RNA 1 ncRNA 213.25-66 chr8 94083190 94083522 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 125199 NM_004063 1015 Hs.591853 NM_004063 ENSG00000079112 CDH17 CDH16|HPT-1|HPT1 cadherin 17 protein-coding 333-10 chr2 53595085 53595594 + 1.25 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -172444 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 159.25-30 chr12 20517395 20517630 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -54352 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 118.25-96 chr2 24396992 24397146 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -36533 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 222.25-87 chr8 32587357 32587716 + 1.25 NA intron (NM_013960, intron 1 of 12) intron (NM_013960, intron 1 of 12) -8290 NM_001322201 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 185.75-13 chr10 30056654 30056846 + 1.25 NA intron (NM_001350021, intron 1 of 4) intron (NM_001350021, intron 1 of 4) 2836 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 197-29 chr2 50172048 50172265 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 175598 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 121-27 chr10 65322472 65322626 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -248876 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 123-64 chr15 74224285 74224413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11977 NM_025055 80125 Hs.383206 NM_025055 ENSG00000140481 CCDC33 CT61|HP11097 coiled-coil domain containing 33 protein-coding 275.5-50 chr4 143320675 143320929 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16074 NM_002039 2549 Hs.80720 NM_002039 ENSG00000109458 GAB1 DFNB26 GRB2 associated binding protein 1 protein-coding 187-72 chr4 133908614 133908783 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 293091 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 363.25-6 chr2 233134883 233135334 + 1.25 NA intron (NM_001017915, intron 5 of 26).2 intron (NM_001017915, intron 5 of 26).2 74766 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 241.25-44 chr22 47659806 47660118 + 1.25 NA intron (NR_122046, intron 2 of 8) intron (NR_122046, intron 2 of 8) 28288 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 155.25-140 chr5 58250280 58250453 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -128025 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 183.5-85 chr21 34043246 34043420 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -30245 NM_006933 6526 Hs.302742 NM_006933 ENSG00000198743 SLC5A3 BCW2|SMIT|SMIT1|SMIT2 solute carrier family 5 member 3 protein-coding 161.25-59 chr15 61877007 61877285 + 1.25 NA intron (NM_001018088, intron 74 of 81) intron (NM_001018088, intron 74 of 81) 147228 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 167.5-169 chr6 134862184 134862392 + 1.25 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 87813 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 209.5-127 chr5 126899676 126899981 + 1.25 NA intron (NM_178450, intron 3 of 4) L1MC1|LINE|L1 122692 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 151.75-49 chr16 58426095 58426306 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33729 NM_001126130 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 329-22 chr3 55468883 55469328 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001256105, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001256105, exon 5 of 5) 12293 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 268-56 chr7 89483312 89483589 + 1.25 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -635950 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 395.5-10 chr17 53468921 53469364 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -353785 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 300-23 chr2 672970 673448 + 1.25 NA intron (NM_001352680, intron 3 of 5) intron (NM_001352680, intron 3 of 5) 3495 NM_001352681 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 346-12 chr21 22026384 22026928 + 1.25 NA intron (NR_109959, intron 4 of 5) intron (NR_109959, intron 4 of 5) 71803 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 165.25-142 chr8 122814225 122814428 + 1.25 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 32671 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 214.5-67 chr20 5410153 5410364 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 35490 NR_038240 100507629 Hs.121383 NR_038239 ENSG00000226995 LINC00658 - long intergenic non-protein coding RNA 658 ncRNA 153.25-100 chr5 12436286 12436505 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -138462 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 289-20 chr2 17521119 17521558 + 1.25 NA intron (NM_001321233, intron 1 of 6) intron (NM_001321233, intron 1 of 6) -2898 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 269.5-32 chr2 213062827 213063145 + 1.25 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) intron (NM_001371277, intron 3 of 6) 87451 NM_001371275 150.25-74 chr2 33939282 33939454 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 3 of 5) intron (NR_126403, intron 3 of 5) -127858 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 149.75-78 chr2 44545352 44545593 + 1.25 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 183525 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 322.5-30 chr6 13969721 13970106 + 1.25 NA intron (NM_001165032, intron 2 of 3) intron (NM_001165032, intron 2 of 3) 44720 NM_001165033 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 241.75-33 chr17 62023984 62024191 + 1.25 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) AluSx|SINE|Alu 41191 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 165.5-152 chr5 131084620 131084899 + 1.25 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 80497 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 221-37 chr2 70327500 70327794 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -25580 NM_001329753 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 143.75-195 chr9 27489833 27490077 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) intron (NM_024761, intron 1 of 3) -34359 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 402.25-2 chr16 51964433 51965026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109206 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 251-35 chr20 39095892 39096194 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 128705 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 256.75-37 chr7 55256612 55256998 + 1.25 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -1170 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 196.5-39 chr12 3858232 3858487 + 1.25 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 15040 NM_001286522 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 179.5-140 chr4 123091426 123091679 + 1.25 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) intron (NM_001345856, intron 14 of 15) 168474 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 179.25-56 chr15 95748513 95748717 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 315522 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 149-10 chr10 15823881 15824114 + 1.25 NA intron (NM_024948, intron 8 of 14) L1MA4A|LINE|L1 36510 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 326.25-7 chr12 15248971 15249365 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -27751 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 329-10 chr11 44736958 44737453 + 1.25 NA intron (NM_130783, intron 1 of 9) intron (NM_130783, intron 1 of 9) 10243 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 271.75-24 chr20 50441310 50441656 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68838 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 113-7 chr1 152164423 152164537 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5252 NM_001122965 126638 Hs.376144 NM_152364 ENSG00000215853 RPTN - repetin protein-coding 203-92 chr7 23893084 23893324 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 182985 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 184.5-6 chr1 102244957 102245237 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -247863 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 239.75-75 chr8 124983887 124984125 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 10711 NM_152412 137209 Hs.175350 NM_152412 ENSG00000180938 ZNF572 - zinc finger protein 572 protein-coding 126.75-205 chr5 147388965 147389089 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64665 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 188.25-63 chr20 4008132 4008309 + 1.25 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 7338 NM_001134337 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 320-15 chr2 17863296 17863659 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14370 NM_001282428 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 139-94 chr3 31831685 31832108 + 1.25 NA intron (NM_017784, intron 3 of 11) L1ME4b|LINE|L1 127683 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 207-7 chr1 222559444 222559717 + 1.25 NA intron (NM_001201536, intron 10 of 11) intron (NM_001201536, intron 10 of 11) -11476 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 134.25-132 chr4 133653205 133653510 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 504063 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 380-10 chr2 128180408 128180926 + 1.25 NA intron (NR_027671, intron 35 of 40) intron (NR_027671, intron 35 of 40) 89467 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 196.25-45 chr16 72643339 72643538 + 1.25 NA intron (NR_159372, intron 1 of 7) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 21532 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 298.25-9 chr14 51644596 51645003 + 1.25 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 6945 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 297.5-31 chr2 222488577 222488858 + 1.25 NA intron (NM_152386, intron 2 of 4) intron (NM_152386, intron 2 of 4) 64174 NM_152386 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 200-86 chr7 93573062 93573271 + 1.25 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) 1558 NM_001742 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 405.25-9 chr3 106901387 106901803 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 339043 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 253.75-51 chr5 148916651 148916967 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 90216 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 342.5-19 chr22 19380626 19381159 + 1.25 NA intron (NM_003325, intron 13 of 24) AluSx|SINE|Alu 50841 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 333-17 chr3 98756626 98757123 + 1.25 NA intron (NM_001323366, intron 2 of 11) intron (NM_001323366, intron 2 of 11) -6433 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 126-116 chr3 61636275 61636469 + 1.25 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) L1MB8|LINE|L1 74801 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 295-21 chr2 170397477 170397804 + 1.25 NA intron (NM_001083615, intron 16 of 33) MER21C|LTR|ERVL -46697 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 229.75-36 chr2 139653992 139654431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 756887 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 176.25-119 chr6 48458089 48458269 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -389490 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 150-63 chr17 72400747 72400955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 58040 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 202-13 chr10 87711837 87712054 + 1.25 NA intron (NM_001015880, intron 2 of 12) intron (NM_001015880, intron 2 of 12) 52067 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 154.25-122 chr5 3467778 3467982 + 1.25 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 15064 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 374.5-17 chr8 139860005 139860474 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -157116 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 227.75-4 chr1 105360715 105360987 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 258084 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 215.75-7 chr1 105363536 105363820 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 255257 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 322.75-6 chr17 20246645 20247005 + 1.25 NA intron (NM_001033553, intron 8 of 14) intron (NM_001033553, intron 8 of 14) -74349 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 257-21 chr19 48234891 48235214 + 1.25 NA intron (NM_001351788, intron 3 of 10) intron (NM_001351788, intron 3 of 10) 6011 NR_033679 22900 Hs.68846 NM_014959 ENSG00000105483 CARD8 CARDINAL|DACAR|DAKAR|NDPP|NDPP1|TUCAN caspase recruitment domain family member 8 protein-coding 176-76 chr8 132236648 132236851 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -131484 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 279.5-68 chr8 116521747 116522081 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130186 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 305-4 chr10 67383265 67383791 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 19882 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 235.5-95 chrX 82348138 82348573 + 1.25 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 1146253 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 239.5-16 chr11 94557923 94558137 + 1.25 NA intron (NR_135094, intron 3 of 3) intron (NR_135094, intron 3 of 3) -9338 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 403 chr1 119312012 119312429 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16032 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 168.25-10 chr1 214908220 214908511 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -97177 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 244-8 chr11 111538148 111538371 + 1.25 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -2021 NM_001318799 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 202.75-29 chr12 107958429 107958685 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54786 NR_037629 728739 Hs.741995 NR_037629 LOC728739 - programmed cell death 2 pseudogene pseudo 291-18 chr18 12150601 12151092 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -49933 NR_049896 497259 Hs.451609 NR_049896 C18orf61 - uncharacterized LOC497259 ncRNA 165.25-92 chr3 135545368 135545594 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -420247 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 322-3 chr10 59063633 59064072 + 1.25 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 64334 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 223.75-76 chr6 119558063 119558307 + 1.25 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 8377 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 301.75-32 chr6 74315154 74315442 + 1.25 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 245847 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 340.25-22 chr9 27046647 27047218 + 1.25 NA intron (NM_025103, intron 14 of 19) AluSc|SINE|Alu -41260 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 368.5-17 chr7 54354982 54355548 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24568 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 228.5-29 chr12 46518855 46519103 + 1.25 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) intron (NR_125380, intron 3 of 3) 134872 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 178-44 chr2 85432741 85432957 + 1.25 NA intron (NM_201594, intron 12 of 20) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 13918 NM_201594 284948 Hs.209542 NM_198482 ENSG00000152292 SH2D6 - SH2 domain containing 6 protein-coding 299.5-31 chr5 39357560 39357816 + 1.25 NA intron (NM_001737, intron 1 of 10) intron (NM_001737, intron 1 of 10) 6807 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 258.75-26 chr15 90758954 90759286 + 1.25 NA intron (NM_001287246, intron 6 of 22) intron (NM_001287246, intron 6 of 22) 41774 NM_000057 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 223.25-20 chr14 56534302 56534602 + 1.25 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 20121 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 199.25-90 chr7 18650473 18650710 + 1.25 NA intron (NM_058176, intron 10 of 22) intron (NM_058176, intron 10 of 22) 141321 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 241.5-60 chr20 42356189 42356574 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) intron (NM_133170, intron 9 of 31) -329102 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 118.25-27 chr10 28074028 28074185 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_132973) promoter-TSS (NR_132973) -728 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 233.25-19 chr12 64103765 64103970 + 1.25 NA intron (NM_001346201, intron 15 of 21) intron (NM_001346201, intron 15 of 21) 118429 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 249.5-6 chr1 71867913 71868227 + 1.25 NA intron (NM_173808, intron 2 of 6) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -31058 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 298.5-36 chr7 68922062 68922392 + 1.25 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 675397 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 240.5-62 chr3 24372668 24373127 + 1.25 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -121190 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 222.75-99 chr8 120384785 120385061 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 60227 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 221-47 chr3 25999388 25999787 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -125892 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 157.75-156 chr6 149952630 149952820 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10711 NM_025217 80328 Hs.656778 NM_025217 ENSG00000131015 ULBP2 ALCAN-alpha|N2DL2|NKG2DL2|RAET1H|RAET1L UL16 binding protein 2 protein-coding 373.5-9 chr2 175880455 175880842 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 121619 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 190.25-85 chr3 107645768 107646043 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001142568, exon 3 of 18) 5' UTR (NM_001142568, exon 3 of 18) 122943 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 123-19 chr10 17316941 17317052 + 1.25 NA non-coding (NR_144322, exon 7 of 7) non-coding (NR_144322, exon 7 of 7) -69940 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 191.5-93 chr22 22671255 22671504 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25067 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 266-32 chr3 167213790 167214139 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 166319 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 451 chr11 63895945 63896616 + 1.25 NA intron (NM_001163296, intron 3 of 16) intron (NM_001163296, intron 3 of 16) 7743 NM_017490 2011 Hs.567261 NM_004954 ENSG00000072518 MARK2 EMK-1|EMK1|PAR-1|Par-1b|Par1b microtubule affinity regulating kinase 2 protein-coding 323.75-17 chr4 148659544 148659979 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -215063 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 176-82 chrX 18584895 18585057 + 1.25 NA intron (NM_001037343, intron 9 of 21) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 87127 NM_000330 6247 Hs.715725 NM_000330 ENSG00000102104 RS1 RS|XLRS1 retinoschisin 1 protein-coding 255.75-57 chrX 17611559 17611880 + 1.25 NA intron (NM_198270, intron 1 of 7) intron (NM_198270, intron 1 of 7) -23781 NM_001136024 4810 Hs.201623 NM_198270 ENSG00000188158 NHS CTRCT40|CXN|SCML1 NHS actin remodeling regulator protein-coding 272.25-11 chr12 70209365 70209665 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -33515 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 430.75-2 chr11 112013504 112013930 + 1.25 NA intron (NM_001037954, intron 17 of 19) L2c|LINE|L2 -11097 NM_001931 1737 Hs.335551 NM_001931 ENSG00000150768 DLAT DLTA|E2|PDC-E2|PDCE2 dihydrolipoamide S-acetyltransferase protein-coding 282.5-11 chr11 60682630 60682995 + 1.25 NA intron (NR_026946, intron 6 of 6) L1M4|LINE|L1 -16800 NM_031457 83661 Hs.150878 NM_031457 ENSG00000166959 MS4A8 4SPAN4|CD20L5|MS4A4|MS4A8B membrane spanning 4-domains A8 protein-coding 250.5-26 chr14 41403020 41403325 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -203684 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 251.25-3 chr1 100317629 100318023 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -27189 NM_001319211 8556 Hs.127411 NM_003672 ENSG00000079335 CDC14A DFNB105|DFNB32|DFNB35|cdc14|hCDC14 cell division cycle 14A protein-coding 184.25-61 chr2 151548928 151549122 + 1.25 NA intron (NM_001271208, intron 130 of 182) intron (NM_001271208, intron 130 of 182) 139123 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 134-186 chr9 92963983 92964226 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001369951) promoter-TSS (NM_001369951) 97 NM_001369951 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 255.25-4 chr1 216288292 216288506 + 1.25 NA intron (NM_206933, intron 11 of 71) intron (NM_206933, intron 11 of 71) 134997 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 209.75-93 chr7 123618005 123618270 + 1.25 NA intron (NM_080928, intron 5 of 9) intron (NM_080928, intron 5 of 9) 6820 NR_111922 102724555 Hs.83916 NR_111922 ENSG00000230442 LOC102724555 - uncharacterized LOC102724555 ncRNA 244.25-42 chr6 14057309 14057624 + 1.25 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -59790 NM_001251901 9308 Hs.595133 NM_004233 ENSG00000112149 CD83 BL11|HB15 CD83 molecule protein-coding 281.5-5 chr10 57952393 57952804 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 315296 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 298-19 chr3 162792649 162793024 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 510465 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 191-66 chr5 22557521 22557820 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 295674 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 249.5-12 chr10 36015965 36016228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 237794 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 226.75-81 chr9 33421347 33421639 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18811 NM_001318158 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 258-2 chr1 56485982 56486260 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 71158 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 190.5-82 chr2 228774914 228775161 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -163642 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 139.25-158 chr5 164069609 164069897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 397649 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 174.5-190 chr8 117268821 117269095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 133963 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 350.25-11 chr14 25273093 25273559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -223029 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 151.25-136 chr4 21015760 21015958 + 1.25 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -31850 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 224-56 chr7 46263176 46263433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -342032 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 291.25-20 chr3 116292494 116292912 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -67321 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 206-11 chr10 102192312 102192659 + 1.25 NA Intergenic L1M2b|LINE|L1 -33814 NM_152310 83401 Hs.302130 NM_152310 ENSG00000119915 ELOVL3 CIG-30|CIG30 ELOVL fatty acid elongase 3 protein-coding 139.25-147 chr5 39679774 39679933 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 159422 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 238.25-2 chr1 112020483 112020921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30166 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 258.25-4 chr1 190250825 190251099 + 1.25 NA intron (NM_199051, intron 4 of 7) AluJr|SINE|Alu 225048 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 198-34 chr18 7564074 7564336 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -3111 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 233-24 chr15 69418447 69418756 + 1.25 NA intron (NM_138555, intron 3 of 22) L2a|LINE|L2 -3572 NR_132969 145694 Hs.147229 NR_132969 ENSG00000259426 LOC145694 - uncharacterized LOC145694 ncRNA 262.25-4 chr10 23469673 23470037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30586 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 207-46 chr2 194529328 194529710 + 1.25 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 185250 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 127.25-107 chr20 37256058 37256247 + 1.25 NA intron (NM_021081, intron 2 of 3) intron (NM_021081, intron 2 of 3) 756 NM_001184731 2691 Hs.37023 NM_021081 ENSG00000118702 GHRH GHRF|GRF|INN growth hormone releasing hormone protein-coding 194.5-159 chr8 118465443 118465753 + 1.25 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -155403 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 267.5-76 chr8 132469497 132469891 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 11401 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 126-109 chr20 48414690 48414852 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54860 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 192.5-84 chr21 14702614 14702807 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59603 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 234.25-6 chr1 176126109 176126459 + 1.25 NA intron (NM_022457, intron 8 of 19) L1MA2|LINE|L1 80960 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 214.25-50 chr21 19587337 19587603 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 312285 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 274-36 chr8 54738984 54739243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 123017 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 501.5 chr1 101613611 101614165 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 233192 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 157.25-73 chr2 46092544 46092742 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -204764 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 252.25-3 chr1 221632169 221632465 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 104583 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 191.5-34 chr14 33402029 33402290 + 1.25 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -306778 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 240.5-46 chr19 33593759 33594105 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -28021 NM_001127895 64377 Hs.165724 NM_022467 ENSG00000124302 CHST8 GALNAC4ST1|GalNAc4ST|PSS3 carbohydrate sulfotransferase 8 protein-coding 158.75-175 chrX 69683674 69683873 + 1.25 NA intron (NM_001005613, intron 2 of 2) intron (NM_001005613, intron 2 of 2) 67660 NM_001005609 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 238.5-66 chr5 22811616 22811870 + 1.25 NA intron (NM_001364105, intron 1 of 15) intron (NM_001364105, intron 1 of 15) 41601 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 129.5-14 chr1 209633896 209634061 + 1.25 NA intron (NM_001017402, intron 5 of 21) intron (NM_001017402, intron 5 of 21) -10468 NR_036213 100422894 NR_036213 ENSG00000283876 MIR4260 - microRNA 4260 ncRNA 210.5-82 chr22 36005688 36005863 + 1.25 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) 22762 NM_001349999 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 163.5-34 chr11 98166741 98166885 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -854136 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 174-16 chr11 45490267 45490478 + 1.25 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 118975 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 240-43 chr4 57184591 57184979 + 1.25 NA intron (NR_034081, intron 1 of 4) intron (NR_034081, intron 1 of 4) -74400 NM_001553 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 201-23 chr12 21764295 21764571 + 1.25 NA TTS (NM_004982) TTS (NM_004982) 10273 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 278.5-37 chr21 30399895 30400120 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3976 NM_181599 140258 Hs.407653 NM_181599 ENSG00000198390 KRTAP13-1 KAP13.1|KRTAP13.1 keratin associated protein 13-1 protein-coding 239.25-91 chr9 107040740 107041096 + 1.25 NA intron (NR_126029, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 62070 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 154.25-53 chr14 81676537 81676689 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53552 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 173.25-120 chr7 98862938 98863242 + 1.25 NA intron (NM_001134451, intron 1 of 6) intron (NM_001134451, intron 1 of 6) 6924 NM_001134451 222865 Hs.270753 NM_152913 ENSG00000166448 TMEM130 - transmembrane protein 130 protein-coding 338.5-8 chr15 91913548 91913881 + 1.25 NA intron (NR_135775, intron 1 of 10) intron (NR_135775, intron 1 of 10) 59410 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 134.5-179 chr5 97060530 97060688 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 82002 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 156.25-139 chr7 37261831 37262072 + 1.25 NA intron (NM_001206480, intron 5 of 21) intron (NM_001206480, intron 5 of 21) 91717 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 287.5-13 chr11 109925639 109926030 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -167558 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 312.5-31 chr7 2224842 2225151 + 1.25 NA intron (NM_001304524, intron 1 of 16) intron (NM_001304524, intron 1 of 16) 7949 NM_001013837 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 254.25-21 chr14 50966346 50966602 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -21991 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 213-42 chr2 48866585 48866908 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -111022 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 329.25-4 chr11 61273469 61273891 + 1.25 NA intron (NM_152718, intron 12 of 19) intron (NM_152718, intron 12 of 19) 21636 NM_152718 220001 Hs.60640 NM_152718 ENSG00000167992 VWCE URG11|VWC1 von Willebrand factor C and EGF domains protein-coding 155.5-165 chr5 42585326 42585631 + 1.25 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 19614 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 149-95 chr4 128889768 128889972 + 1.25 NA intron (NM_144643, intron 19 of 20) intron (NM_144643, intron 19 of 20) 78026 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 441.25-4 chr16 7843988 7844711 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 511504 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 160.5-182 chr8 48292534 48292743 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -258929 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 275.75-9 chr12 80555527 80555933 + 1.25 NA intron (NM_001145026, intron 25 of 44) intron (NM_001145026, intron 25 of 44) 111495 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 231.25-38 chr2 66596882 66597128 + 1.25 NA intron (NR_110156, intron 1 of 5) intron (NR_110156, intron 1 of 5) 22975 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 263.25-15 chr12 34471069 34471460 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 448768 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 192.25-52 chr2 63894171 63894507 + 1.25 NA intron (NM_001005739, intron 22 of 22) L1ME3Cz|LINE|L1 52459 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 177.5-87 chr2 158918791 158918963 + 1.25 NA Intergenic LTR31|LTR|ERV1 -49757 NM_001350065 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 157.5-40 chr11 111539377 111539594 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001318799) promoter-TSS (NM_001318799) -795 NM_001318799 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 170.25-48 chr16 8010359 8010605 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 579356 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 195.25-76 chr5 109379362 109379589 + 1.25 NA intron (NM_014819, intron 3 of 9) intron (NM_014819, intron 3 of 9) 30499 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 216.25-58 chr20 45744427 45744659 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22196 NM_178455 391253 Hs.677891 NM_178455 ENSG00000149651 SPINT4 C20orf137|SPINT3|dJ601O1.1 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 protein-coding 192-8 chr1 117878801 117879037 + 1.25 NA intron (NM_001135589, intron 12 of 12) MIR|SINE|MIR 50702 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 296.75-27 chr5 32917982 32918255 + 1.25 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -29325 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 298-31 chr8 53123285 53123575 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 128207 NM_000912 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 251.75-67 chr5 148370211 148370451 + 1.25 NA intron (NR_105057, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 13519 NR_105057 102546294 Hs.660461 NR_105057 ENSG00000247199 LOC102546294 - uncharacterized LOC102546294 ncRNA 123.5-116 chr20 4776935 4777094 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -36346 NR_024268 149830 Hs.126516 NM_177549 ENSG00000180259 PRNT M8 prion locus lncRNA, testis expressed ncRNA 395-3 chr10 29837603 29838198 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100964 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 264.5-40 chr4 46480539 46480779 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90531 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 190.5-74 chr2 50917439 50917623 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330081, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001330081, exon 6 of 6) 114601 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 244.5-6 chr1 167059064 167059283 + 1.25 NA intron (NM_005814, intron 4 of 6) intron (NM_005814, intron 4 of 6) 31204 NM_005814 10223 Hs.651244 NM_005814 ENSG00000143167 GPA33 A33 glycoprotein A33 protein-coding 126.75-221 chr7 5061954 5062175 + 1.25 NA intron (NM_001204513, intron 4 of 5) intron (NM_001204513, intron 4 of 5) -9996 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 124.25-184 chr7 36674915 36675071 + 1.25 NA intron (NM_001177507, intron 1 of 19) AluSq2|SINE|Alu 49501 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 169-88 chr6 73464223 73464457 + 1.25 NA intron (NM_133645, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 2603 NM_012123 25821 Hs.347614 NM_012123 ENSG00000135297 MTO1 CGI-02|COXPD10 mitochondrial tRNA translation optimization 1 protein-coding 188-34 chr2 45284824 45285072 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30007 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 134.25-139 chr5 41715326 41715492 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 128248 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 250-3 chr1 158539905 158540356 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 7975 NM_001005189 391112 Hs.553780 NM_001005189 ENSG00000197532 OR6Y1 OR1-11|OR6Y2 olfactory receptor family 6 subfamily Y member 1 protein-coding 231.25-47 chr20 33574123 33574341 + 1.25 NA exon (NM_005093, exon 2 of 12) exon (NM_005093, exon 2 of 12) 11867 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 309.25-26 chr8 47356298 47356614 + 1.25 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) intron (NR_104581, intron 5 of 16) 95518 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 134.75-100 chr19 41431868 41431975 + 1.25 NA non-coding (NR_030765, exon 6 of 6) non-coding (NR_030765, exon 6 of 6) -3191 NM_198540 374907 Hs.441681 NM_198540 ENSG00000177191 B3GNT8 B3GALT7|BGALT15|beta3Gn-T8 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 8 protein-coding 170.75-120 chr6 142586660 142587035 + 1.25 NA intron (NR_027312, intron 1 of 2) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 50989 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 242.75-79 chrX 93999123 93999449 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 325080 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 204.75-114 chr7 91601181 91601478 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 279373 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 243.25-7 chr12 100356894 100357147 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_139319) promoter-TSS (NM_139319) -54 NM_001145288 246213 Hs.116871 NM_139319 ENSG00000179520 SLC17A8 DFNA25|VGLUT3 solute carrier family 17 member 8 protein-coding 188.25-7 chr10 9346569 9346748 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -51065 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 157-68 chr20 5322745 5322942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6111 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 249.5-62 chr3 42061728 42061974 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25349 NM_001349245 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 269.75-6 chr10 34444779 34445259 + 1.25 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) intron (NM_001184791, intron 4 of 20) 370277 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 226.25-54 chr4 71342254 71342496 + 1.25 NA intron (NM_003759, intron 1 of 22) intron (NM_003759, intron 1 of 22) 3322 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 182.5-149 chr7 2690755 2690999 + 1.25 NA intron (NM_001321766, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 2675 NM_001321766 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 155.75-71 chr18 60974469 60974683 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -358854 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 158.75-115 chr3 105446241 105446383 + 1.25 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) L1MA6|LINE|L1 79403 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 242-35 chr22 41836168 41836579 + 1.25 NA intron (NR_103834, intron 1 of 21) intron (NR_103834, intron 1 of 21) -1708 NR_157279 112637020 NR_157279 SREBF2-AS1 821D11.7|RP5 SREBF2 antisense RNA 1 ncRNA 268.75-43 chr8 68899574 68899998 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 204404 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 244.5-38 chr17 58609948 58610248 + 1.25 NA intron (NM_031272, intron 10 of 31) intron (NM_031272, intron 10 of 31) -65770 NM_001368771 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 313.25-21 chr4 60641282 60641672 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -281142 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 207.75-132 chr9 38409003 38409221 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001007563, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001007563, exon 5 of 5) 15342 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 194-28 chr12 43762794 43762999 + 1.25 NA intron (NM_001351339, intron 2 of 13) intron (NM_001351339, intron 2 of 13) 3952 NM_001351343 51135 Hs.138499 NM_016123 ENSG00000198001 IRAK4 IPD1|IRAK-4|NY-REN-64|REN64 interleukin 1 receptor associated kinase 4 protein-coding 250-14 chr15 76409389 76409625 + 1.25 NA intron (NR_148227, intron 27 of 32) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72734 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 337.75-7 chr12 74328639 74328997 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36187 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 345.5-24 chr5 102494414 102494755 + 1.25 NA intron (NM_173488, intron 1 of 13) L1ME1|LINE|L1 4417 NM_001308014 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 192-65 chr2 202763271 202763582 + 1.25 NA intron (NM_173511, intron 7 of 7) intron (NM_173511, intron 7 of 7) 65808 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 295.75-30 chr7 7355784 7356043 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 100759 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 483.5-4 chr2 122011429 122012095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 256111 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 173.5-157 chr8 31092553 31092811 + 1.25 NA intron (NM_000553, intron 16 of 34) L1ME2z|LINE|L1 -59326 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 139.75-20 chr10 99097026 99097142 + 1.25 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 138791 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 212.75-82 chr5 139967423 139967697 + 1.25 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 75739 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 272.5-56 chr5 108798879 108799187 + 1.25 NA intron (NM_001308028, intron 3 of 17) intron (NM_001308028, intron 3 of 17) 50085 NM_001308028 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 149.5-18 chr1 246023253 246023483 + 1.25 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 394044 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 270.5-38 chr3 6681250 6681571 + 1.25 NA intron (NR_110123, intron 2 of 3) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 124039 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 250-66 chr9 103040290 103040573 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 45098 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 279-5 chr1 190301197 190301687 + 1.25 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) L1MDa|LINE|L1 174568 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 235.25-62 chr8 18390898 18391104 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_000015) promoter-TSS (NM_000015) -281 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 136.25-176 chr7 33320411 33320699 + 1.25 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) L1MA3|LINE|L1 190991 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 300.25-2 chr1 156268551 156268954 + 1.25 NA intron (NM_015327, intron 7 of 21) MIRb|SINE|MIR 14073 NM_015327 23381 Hs.516837 NM_015327 ENSG00000198952 SMG5 EST1B|LPTS-RP1|LPTSRP1|SMG-5 SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 226.25-76 chr9 27077128 27077425 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -31865 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 118.75-98 chr2 73080057 73080180 + 1.25 NA exon (NM_001371272, exon 4 of 6) exon (NM_001371272, exon 4 of 6) -8282 NM_001330400 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 245-6 chr10 19611170 19611505 + 1.25 NA intron (NM_001142308, intron 35 of 39) intron (NM_001142308, intron 35 of 39) 117213 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 241-12 chr12 116771101 116771454 + 1.25 NA intron (NM_001109903, intron 6 of 11) AluJb|SINE|Alu 32962 NM_032814 84900 Hs.437195 NM_032814 ENSG00000135119 RNFT2 TMEM118 ring finger protein, transmembrane 2 protein-coding 299.25-37 chr4 91718837 91719265 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 558251 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 144.25-112 chr2 235160991 235161165 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 133343 NM_001371306 182.25-50 chr17 65090538 65090738 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10174 NR_110801 100507002 Hs.729924 NR_110801 LOC100507002 - uncharacterized LOC100507002 ncRNA 119-15 chr10 59377372 59377530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14270 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 220.5-103 chr5 121804243 121804552 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -47485 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 320.5-19 chr18 77844392 77844929 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 149067 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 277.75-23 chr3 89154951 89155370 + 1.25 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 47539 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 231.25-39 chr2 71203795 71204045 + 1.25 NA intron (NM_020459, intron 1 of 3) intron (NM_020459, intron 1 of 3) 23183 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 134.75-157 chr4 48458433 48458615 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -24819 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 224-26 chr18 50848380 50848699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23159 NM_001369510 83876 Hs.30495 NM_031939 ENSG00000134042 MRO B29|C18orf3 maestro protein-coding 147.5-151 chr3 191570021 191570256 + 1.25 NA intron (NR_120606, intron 5 of 6) L1M5|LINE|L1 108975 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 254-31 chr3 21572761 21573188 + 1.25 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 30185 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 194.5-158 chr8 115832623 115832935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -163804 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 262-30 chr2 88911007 88911275 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 98771 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 160-21 chr12 10114599 10114807 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 15496 NM_197954 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 291.25-2 chr10 99317173 99317465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11780 NM_001345889 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 218.5-52 chr2 26098744 26098994 + 1.25 NA intron (NM_016131, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 64785 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 180.75-63 chr2 42370790 42371029 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -1952 NM_001319037 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 194.5-85 chr21 18148060 18148347 + 1.25 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -96630 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 173.75-28 chr10 94497025 94497193 + 1.25 NA exon (NM_015188, exon 5 of 13) exon (NM_015188, exon 5 of 13) -48658 NM_001289070 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 240.75-78 chr8 138089421 138089633 + 1.25 NA Intergenic (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -5982 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 362.5-10 chr2 28302613 28302940 + 1.25 NA intron (NM_001261840, intron 11 of 11) L1ME2|LINE|L1 7683 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 184.5-120 chr5 73719509 73719774 + 1.25 NA intron (NM_001177693, intron 2 of 35) LTR81B|LTR|Gypsy 93483 NM_001177693 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 174.25-28 chr11 108513461 108513689 + 1.25 NA exon (NM_001144763, exon 6 of 6) exon (NM_001144763, exon 6 of 6) -15191 NM_153705 143888 Hs.83286 NM_153705 ENSG00000178202 POGLUT3 KDELC2 protein O-glucosyltransferase 3 protein-coding 282-40 chr5 36308792 36309221 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7104 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 229.25-72 chr7 1362868 1363254 + 1.25 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 96409 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 196-24 chr14 46417299 46417459 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MB1|LINE|L1 -53980 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 129-35 chr11 39628376 39628480 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 664702 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 300.75-46 chr8 84624482 84624893 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -81240 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 244.75-49 chr5 133033506 133033864 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7136 NR_125337 54819 Hs.29700 NM_017665 ENSG00000155329 ZCCHC10 - zinc finger CCHC-type containing 10 protein-coding 229.75-26 chr16 58165926 58166168 + 1.25 NA intron (NM_001896, intron 9 of 11) intron (NM_001896, intron 9 of 11) 32059 NM_001896 1459 Hs.82201 NM_001896 ENSG00000070770 CSNK2A2 CK2A2|CK2alpha'|CSNK2A1 casein kinase 2 alpha 2 protein-coding 237.75-71 chr5 119251329 119251878 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17156 NM_001077654 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 215.25-61 chr3 97133447 97133726 + 1.25 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -306021 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 494.25-4 chr18 22136397 22137103 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 32218 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 268-10 chr10 48694299 48694618 + 1.25 NA intron (NM_020945, intron 1 of 61) intron (NM_020945, intron 1 of 61) 8995 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 194.5-113 chr4 156660680 156660918 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 311000 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 185.25-20 chr12 80472668 80472890 + 1.25 NA intron (NM_001145026, intron 8 of 44) intron (NM_001145026, intron 8 of 44) 28544 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 219.5-108 chr6 20547990 20548239 + 1.25 NA intron (NM_017774, intron 3 of 15) intron (NM_017774, intron 3 of 15) 13657 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 130.75-137 chr4 46829643 46829783 + 1.25 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 79532 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 240.75-19 chr13 38803890 38804203 + 1.25 NA intron (NM_207361, intron 6 of 23) intron (NM_207361, intron 6 of 23) 23545 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 256.75-33 chr5 160439986 160440356 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 18261 NM_001282383 9232 Hs.350966 NM_004219 ENSG00000164611 PTTG1 EAP1|HPTTG|PTTG|TUTR1 PTTG1 regulator of sister chromatid separation, securin protein-coding 292.25-36 chr5 102375359 102375613 + 1.25 NA intron (NM_173488, intron 12 of 13) L1ME2z|LINE|L1 -79202 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 317.25-32 chr9 14956105 14956460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -37045 NR_003920 389705 Hs.431257 NR_003920 LOC389705 - histone PARylation factor 1 pseudogene pseudo 336.75-5 chr14 25735995 25736386 + 1.25 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -685893 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 287.75-37 chr3 125026537 125027079 + 1.25 NA intron (NM_020733, intron 3 of 16) AluSx1|SINE|Alu 29189 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 204.75-34 chr14 33723688 33723964 + 1.25 NA intron (NM_001165893, intron 5 of 10) intron (NM_001165893, intron 5 of 10) 14889 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 191-57 chr4 35478295 35478477 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 765553 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 233-16 chr14 49736787 49737046 + 1.25 NA intron (NM_172193, intron 10 of 12) intron (NM_172193, intron 10 of 12) -31237 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 171.5-131 chr6 117062335 117062565 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 185208 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 236.75-57 chr8 12837444 12837763 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -26125 NR_152742 340357 Hs.434302 NR_015383 ENSG00000254813 LOC340357 - uncharacterized LOC340357 ncRNA 154.25-88 chr2 153456973 153457161 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21695 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 144.75-192 chr9 27313536 27313690 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16463 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 268.5-66 chr9 105364760 105364991 + 1.25 NA intron (NM_001330731, intron 10 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 -83159 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 293.5-23 chr19 19590155 19590424 + 1.25 NA intron (NR_038198, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 28398 NR_038198 80714 Hs.466257 NM_025245 ENSG00000105717 PBX4 - PBX homeobox 4 protein-coding 272.25-4 chr10 82263931 82264288 + 1.25 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) L2b|LINE|L2 -31189 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-120 chr4 163592991 163593183 + 1.25 NA intron (NM_017923, intron 1 of 3) intron (NM_017923, intron 1 of 3) 20447 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 177.75-32 chr13 27330722 27331037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59702 NM_001331126 387496 Hs.192131 NM_206827 ENSG00000122035 RASL11A - RAS like family 11 member A protein-coding 324.25-8 chr2 122061121 122061547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 305683 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 285.5-16 chr14 27945641 27945917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -272558 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 185.75-38 chr13 92424358 92424558 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -65705 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 204.75-122 chr8 139151707 139152148 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -237886 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 178.5-14 chr10 49522146 49522395 + 1.25 NA intron (NM_001277058, intron 5 of 5) intron (NM_001277058, intron 5 of 5) 2011 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 263.5-50 chr5 30660794 30661034 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -532772 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 120-67 chr16 79717305 79717448 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53095 NR_104660 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 322-21 chr4 98745569 98745937 + 1.25 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 86851 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 188.75-56 chr2 60916508 60916824 + 1.25 NA intron (NM_002908, intron 4 of 10) intron (NM_002908, intron 4 of 10) 35092 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 467.75-2 chr14 23625943 23626622 + 1.25 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -3833 NM_001318835 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 263.25-54 chr8 60712194 60712613 + 1.25 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) -28856 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 421.5-12 chr7 17459451 17459826 + 1.25 NA intron (NR_110015, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 84721 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 159.5-11 chr1 191617908 191618118 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -389515 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 209.75-6 chr1 226420199 226420626 + 1.25 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -12319 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 405.75-3 chr12 6733479 6734082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9493 NM_001164093 50813 Hs.530823 NM_016319 ENSG00000111652 COPS7A CSN7|CSN7A|SGN7a COP9 signalosome subunit 7A protein-coding 143-60 chr18 22162145 22162345 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6723 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165-68 chr2 74802952 74803302 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -29528 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 225.5-65 chr20 39569757 39570024 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -345142 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 273.75-5 chr10 117441331 117441720 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66085 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 342.25-9 chr18 3846352 3846910 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) L1MB7|LINE|L1 -1273 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 163.25-97 chr3 101897532 101897704 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -43241 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 230.75-77 chr9 2430931 2431189 + 1.25 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -190727 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 142-60 chr16 11677179 11677347 + 1.25 NA 3' UTR (NM_003498, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_003498, exon 2 of 2) 8808 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 305-33 chr7 129332431 129332812 + 1.25 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) intron (NM_001130720, intron 1 of 16) -35759 NM_001130723 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 311.25-29 chr8 87836604 87837112 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 37157 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 232-34 chr2 72070904 72071350 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 76735 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 136-75 chr2 108191556 108191761 + 1.25 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 26183 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 252.25-37 chr3 31310912 31311292 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149315 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 256.5-69 chr7 7652129 7652528 + 1.25 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) intron (NM_002947, intron 4 of 7) 11576 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 154-104 chr5 23007786 23007965 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -154531 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 116-18 chr10 64513247 64513375 + 1.25 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -312217 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 304.75-18 chr2 154574788 154575135 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117523 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 295.25-27 chr5 116714571 116714922 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47463 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 139.75-162 chr7 41817283 41817504 + 1.25 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -114303 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 217.25-83 chr8 112244001 112244233 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 61 of 66) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -399376 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 227.25-32 chr17 55701943 55702203 + 1.25 NA Intergenic LTR12_|LTR|ERV1 20791 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 401.75-13 chr6 165792898 165793367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130852 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 209-16 chr13 56105823 56106080 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 931497 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 311-2 chr10 17698462 17698744 + 1.25 NA intron (NM_001324284, intron 9 of 14) intron (NM_001324284, intron 9 of 14) -53598 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 123.5-172 chr5 129977509 129977669 + 1.25 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 73124 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 221.25-24 chr13 92965147 92965656 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79940 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 148.25-91 chr3 29154327 29154499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126526 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 180.75-94 chr3 112013696 112013963 + 1.25 NA TTS (NM_001008273) TTS (NM_001008273) 14669 NM_001008273 29114 Hs.169330 NM_013259 ENSG00000144834 TAGLN3 NP22|NP24|NP25 transgelin 3 protein-coding 157.5-31 chr10 107795840 107796056 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 273345 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 250-60 chr8 86975129 86975570 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA7|LINE|L1 108934 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 203-51 chr2 62747867 62748172 + 1.25 NA intron (NM_001142615, intron 3 of 22) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 41122 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 292.5-37 chr3 151855558 151855942 + 1.25 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu -17893 NM_033050 56670 Hs.133181 NM_033050 ENSG00000198829 SUCNR1 GPR91 succinate receptor 1 protein-coding 181-62 chr2 226468037 226468218 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 190666 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 128.25-37 chr12 56777711 56777947 + 1.25 NA intron (NM_003725, intron 2 of 4) FLAM_C|SINE|Alu 14505 NM_003725 8630 Hs.524513 NM_003725 ENSG00000025423 HSD17B6 HSE|RODH|SDR9C6 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 6 protein-coding 248.5-95 chr7 71477279 71477572 + 1.25 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) intron (NM_022479, intron 5 of 10) -169655 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 270.25-31 chr22 33497707 33498023 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -61196 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 136-50 chr16 74720901 74721132 + 1.25 NA intron (NM_024306, intron 4 of 6) L1MB8|LINE|L1 -20154 NM_152649 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 129.5-163 chr3 188173935 188174184 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 -4484 NR_024413 401105 Hs.679026 NM_207488 ENSG00000279891 FLJ42393 AVPC1948 uncharacterized LOC401105 ncRNA 171.5-110 chr3 177906442 177906692 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 89702 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 248-31 chr17 69435919 69436176 + 1.25 NA intron (NM_002758, intron 1 of 11) intron (NM_002758, intron 1 of 11) 21350 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 215.75-15 chr10 80507961 80508208 + 1.25 NA intron (NM_030927, intron 4 of 8) intron (NM_030927, intron 4 of 8) 27858 NR_120661 101929574 Hs.593663 NR_120661 ENSG00000226659 LOC101929574 - uncharacterized LOC101929574 ncRNA 274.25-6 chr10 82226087 82226472 + 1.25 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 6641 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 270.5-9 chr10 87920434 87920705 + 1.25 NA intron (NM_001304718, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 56944 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 249-45 chr7 34197137 34197450 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 291754 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 211.5-153 chr8 51613854 51614131 + 1.25 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) intron (NM_144651, intron 2 of 22) 195453 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 166.5-46 chr12 12141828 12142241 + 1.25 NA intron (NM_002336, intron 15 of 22).2 HAL1|LINE|L1 30082 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 240.25-56 chr6 18680217 18680531 + 1.25 NA intron (NR_149116, intron 6 of 7) L1MC1|LINE|L1 108590 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 283.25-33 chr4 180122101 180122531 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1036833 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 162.25-141 chr6 53160544 53160724 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -11793 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 134.75-122 chr2 211392243 211392439 + 1.25 NA intron (NM_005235, intron 25 of 27) intron (NM_005235, intron 25 of 27) 774770 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 259.25-40 chr7 14622839 14623306 + 1.25 NA intron (NM_001350717, intron 13 of 24) L2a|LINE|L2 218378 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 234-40 chr3 133036589 133036892 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -1548 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 414.25 chr1 62162406 62162760 + 1.25 NA 3' UTR (NM_176877, exon 43 of 43) 3' UTR (NM_176877, exon 43 of 43) -32266 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 248.5-61 chr22 27069750 27070038 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9376 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 238-33 chr2 209278144 209278419 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -145766 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 263.75-15 chr14 87270096 87270469 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 364504 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 122.75-150 chr4 89400399 89400551 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92675 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 224.5-103 chr7 136509160 136509413 + 1.25 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 -359366 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 122.75-146 chr4 60035926 60036124 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -886594 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 135-43 chr14 57610340 57610571 + 1.25 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -116598 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 260.75-12 chr13 75307621 75307964 + 1.25 NA intron (NM_001286658, intron 13 of 19) intron (NM_001286658, intron 13 of 19) 67204 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 299.25-12 chr13 31891440 31891706 + 1.25 NA intron (NR_027062, intron 1 of 3) intron (NR_027062, intron 1 of 3) 44790 NR_027062 196549 Hs.507667 NM_145293 EEF1DP3 - eukaryotic translation elongation factor 1 delta pseudogene 3 pseudo 151.5-48 chr14 57481244 57481506 + 1.25 NA intron (NM_001283060, intron 4 of 5) intron (NM_001283060, intron 4 of 5) 12482 NM_001283057 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 196.25-114 chr7 90445280 90445575 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24212 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 301-12 chr2 101449069 101449404 + 1.25 NA intron (NM_001367509, intron 4 of 13) intron (NM_001367509, intron 4 of 13) 25876 NM_001367510 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 166.75-55 chr16 12446080 12446313 + 1.25 NA intron (NM_032167, intron 18 of 20) AluSz|SINE|Alu -274125 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 302-15 chr19 13496118 13496831 + 1.25 NA intron (NM_023035, intron 1 of 46) intron (NM_023035, intron 1 of 46) 9986 NM_001127221 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 212-64 chr4 108496171 108496475 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -60910 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 357.75-9 chr2 52712288 52712919 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9988 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 150-149 chr8 136615236 136615403 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 84521 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 182-62 chr2 139126997 139127183 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 229766 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 326.25-29 chr7 42857549 42858088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54025 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 274.75-29 chr2 165428759 165429038 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -40800 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 303.5 chr1 36048705 36049119 + 1.25 NA intron (NM_177422, intron 15 of 16) AluJo|SINE|Alu -35182 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 332.25-7 chr14 20998457 20998861 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001256588) promoter-TSS (NM_001256588) 504 NR_110139 101929718 Hs.706252 NR_110139 ENSG00000258471 LOC101929718 - uncharacterized LOC101929718 ncRNA 308.25-33 chr8 9354200 9354658 + 1.25 NA Intergenic MER58D|DNA|hAT-Charlie 29378 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 177.75-107 chr4 101698780 101699050 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -91692 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 193.75-58 chr18 30326314 30326484 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27489 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 205.75-93 chr9 75215989 75216209 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 127585 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 285.25-38 chr8 84634895 84635160 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -70900 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 231-79 chr8 31182688 31183016 + 1.25 NA Intergenic MamGypLTR2b|LTR|Gypsy -149496 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 168.25-39 chr14 47279476 47279762 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 63627 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 229.5-138 chr8 141708808 141709188 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 77315 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 200.25-10 chr10 4423328 4423543 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16966 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 189.25-12 chr10 109939597 109939805 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16148 NM_001167604 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 243.75-72 chr6 35030505 35030949 + 1.25 NA intron (NM_015245, intron 11 of 23) L3|LINE|CR1 110612 NM_001366325 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 279.5-46 chr4 43362404 43362726 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129978 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 189.75-16 chr10 121813358 121813577 + 1.25 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) intron (NM_001001976, intron 10 of 11) 114564 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 213-23 chr12 39892625 39892867 + 1.25 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 213335 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 184.5-64 chr18 66319263 66319478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 284720 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 161-35 chr14 45707307 45707522 + 1.25 NA intron (NR_146547, intron 1 of 1) intron (NR_146547, intron 1 of 1) 8188 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 250.75-42 chr3 178294405 178294788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124605 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 322.5-15 chr19 31925245 31925712 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -100384 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 218-11 chr10 573309 573519 + 1.25 NA intron (NM_014974, intron 1 of 36) intron (NM_014974, intron 1 of 36) -55150 NR_147612 101930421 Hs.654707 NR_147612 ENSG00000225140 LOC101930421 - uncharacterized LOC101930421 ncRNA 195-59 chr22 31597176 31597414 + 1.25 NA intron (NM_001007467, intron 15 of 32) intron (NM_001007467, intron 15 of 32) 24236 NR_106959 102465666 NR_106959 ENSG00000284082 MIR7109 hsa-mir-7109 microRNA 7109 ncRNA 174.75 chr1 21535815 21536067 + 1.25 NA intron (NM_001177520, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR -15329 NM_001369803 249 Hs.75431 NM_000478 ENSG00000162551 ALPL AP-TNAP|APTNAP|HOPS|TNALP|TNAP|TNSALP alkaline phosphatase, biomineralization associated protein-coding 317-25 chr4 48138070 48138494 + 1.25 NA intron (NM_003215, intron 17 of 17) intron (NM_003215, intron 17 of 17) -4032 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 210.25-3 chr1 53778641 53778905 + 1.25 NA intron (NR_033142, intron 15 of 16) intron (NR_033142, intron 15 of 16) -39609 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 212.75-54 chr20 9438818 9439152 + 1.25 NA intron (NM_000933, intron 26 of 35) intron (NM_000933, intron 26 of 35) -75373 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 203.25-30 chr12 49710226 49710459 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2937 NM_198900 91010 Hs.179838 NM_175736 ENSG00000161791 FMNL3 FHOD3|FRL2|WBP-3|WBP3 formin like 3 protein-coding 127.5-84 chr15 23552398 23552724 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 9570 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 169-92 chr6 121867493 121867695 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 431948 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 216-5 chr1 190856244 190856506 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 231485 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 228.5-9 chr1 104225738 104226041 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 152866 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 209.25-34 chr15 90750009 90750308 + 1.25 NA intron (NM_001287246, intron 4 of 22) intron (NM_001287246, intron 4 of 22) 32812 NM_000057 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 184.5-92 chr21 30999445 30999631 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38938 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 212-84 chr8 117891222 117891549 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 29528 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 237.5-70 chr4 88021182 88021486 + 1.25 NA intron (NR_156488, intron 2 of 13) intron (NR_156488, intron 2 of 13) 13699 NM_000297 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 379.75-8 chr22 40788289 40788752 + 1.25 NA intron (NR_104235, intron 5 of 10) AluSg|SINE|Alu 25438 NR_039923 100616283 NR_039923 ENSG00000266594 MIR4766 mir-4766 microRNA 4766 ncRNA 210-73 chr5 17992648 17992956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 185528 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 296.5-13 chr16 82406666 82406997 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -220138 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 251.5-17 chr12 6207139 6207435 + 1.25 NA intron (NM_001769, intron 1 of 7) intron (NM_001769, intron 1 of 7) 6887 NM_001769 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 193-78 chr6 56639686 56639903 + 1.25 NA intron (NM_001144770, intron 16 of 94) intron (NM_001144770, intron 16 of 94) 3095 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 252-47 chr3 127510375 127510658 + 1.25 NA intron (NR_125397, intron 5 of 6) intron (NR_125397, intron 5 of 6) 27264 NR_125397 101927149 Hs.407798 NR_125397 ENSG00000239921 LINC01471 - long intergenic non-protein coding RNA 1471 ncRNA 349.25-18 chr8 26949819 26950214 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -82738 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 149.75-126 chr5 54554398 54554517 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36698 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 392.25-12 chr5 68845584 68846063 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 184104 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 151.75-158 chr8 145067499 145067647 + 1.25 NA Intergenic LTR65|LTR|ERV1 15106 NM_023080 65265 Hs.169615 NM_023080 ENSG00000182307 C8orf33 - chromosome 8 open reading frame 33 protein-coding 396.25-13 chr5 67834158 67834687 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 41209 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 309.5-16 chr14 69286484 69286858 + 1.25 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) L1ME2z|LINE|L1 26513 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 460.75-8 chr8 127245169 127245671 + 1.25 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 783 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 199.5-142 chr8 32405394 32405750 + 1.25 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -35174 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 347.5-11 chr2 82429392 82429897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -427159 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 154.75-73 chr2 86380200 86380443 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -42238 NM_001164730 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 129.75-198 chr9 133637532 133637757 + 1.25 NA intron (NM_000787, intron 1 of 11) intron (NM_000787, intron 1 of 11) 1281 NM_000787 1621 Hs.591890 NM_000787 ENSG00000123454 DBH DBM|ORTHYP1 dopamine beta-hydroxylase protein-coding 220.5-115 chr7 31173290 31173626 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 120997 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 281.75-7 chr1 207309579 207309874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11952 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 241.75-14 chr11 70129008 70129323 + 1.25 NA intron (NM_018043, intron 10 of 25) intron (NM_018043, intron 10 of 25) 43755 NR_030691 55107 Hs.503074 NM_018043 ENSG00000131620 ANO1 DOG1|ORAOV2|TAOS2|TMEM16A anoctamin 1 protein-coding 196.75-52 chr19 48218405 48218611 + 1.25 NA intron (NR_147707, intron 8 of 10) AluSq|SINE|Alu 22555 NR_033679 22900 Hs.68846 NM_014959 ENSG00000105483 CARD8 CARDINAL|DACAR|DAKAR|NDPP|NDPP1|TUCAN caspase recruitment domain family member 8 protein-coding 294.25 chr1 79422761 79423059 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -416180 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 228-76 chr8 78386630 78386917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -129567 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 184.25-20 chr10 98067198 98067426 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -36484 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 222-42 chr2 134326187 134326555 + 1.25 NA intron (NM_001371457, intron 5 of 16) L1MC5|LINE|L1 72299 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 520.5-2 chr7 135666323 135666873 + 1.25 NA intron (NM_001130929, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 4084 NM_001130929 647087 Hs.200022 NM_001130929 ENSG00000243317 STMP1 C7orf73|PL-5283 short transmembrane mitochondrial protein 1 protein-coding 313.25-27 chr7 51867491 51867854 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -474416 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 218.25-60 chr4 48844652 48845014 + 1.25 NA intron (NM_001079839, intron 4 of 8) MER2|DNA|TcMar-Tigger 13527 NM_001168254 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 283.5 chr1 67330048 67330391 + 1.25 NA intron (NM_001319233, intron 7 of 15) intron (NM_001319233, intron 7 of 15) 22855 NM_001319233 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 371.5-8 chr21 29948926 29949472 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -9147 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 328.5-10 chr12 38387957 38388456 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 71432 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 309.75-27 chr3 96635073 96635378 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -179369 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 176.5-189 chr9 72433925 72434214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68861 NM_001102421 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 232.25-83 chr8 121289951 121290217 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -349262 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 225.75-50 chr21 31057045 31057269 + 1.25 NA Intergenic LTR86A1|LTR|ERVL -18681 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 320.5-53 chrX 24963749 24964347 + 1.25 NA intron (NM_016937, intron 36 of 36) intron (NM_016937, intron 36 of 36) 51917 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 233.75-7 chr10 61262286 61262482 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -190255 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 161-115 chr8 24625083 24625261 + 1.25 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -76554 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 133.25-181 chr5 115828743 115828922 + 1.25 NA non-coding (NR_033363, exon 5 of 5) non-coding (NR_033363, exon 5 of 5) -12173 NR_136619 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 139.75-49 chr14 55860655 55860818 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -64062 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 207.25-66 chr4 93302658 93302859 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -525995 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 185.5-147 chr6 147803554 147803765 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 294969 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 291.5-5 chr1 163109910 163110382 + 1.25 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 38241 NM_001113380 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 219-17 chr11 81504155 81504367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 386575 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 228.25-44 chr2 59867970 59868158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 514972 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 265.75-71 chr7 137326162 137326436 + 1.25 NA intron (NM_001321387, intron 1 of 4) intron (NM_001321387, intron 1 of 4) 17434 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 184-57 chr3 142465091 142465322 + 1.25 NA exon (NM_001184, exon 41 of 47) exon (NM_001184, exon 41 of 47) -17144 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 168.75-14 chr1 202815777 202815980 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4379 NR_038135 641515 Hs.23459 NR_038135 ENSG00000184774 MGAT4EP - MGAT4 family member E, pseudogene pseudo 144-107 chr5 158909417 158909611 + 1.25 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) X6B_LINE|LINE|CR1 188442 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 181.75-17 chr10 81747513 81747834 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -127521 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 200-8 chr1 232603571 232603859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -88107 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 204 chr1 25492240 25492433 + 1.25 NA intron (NM_018202, intron 10 of 10) L2a|LINE|L2 -51249 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 197.25-16 chr11 7004875 7005111 + 1.25 NA intron (NM_013249, intron 1 of 2) L1ME3G|LINE|L1 15353 NM_001354833 7761 Hs.445849 NM_013249 ENSG00000149050 ZNF214 BAZ-1|BAZ1 zinc finger protein 214 protein-coding 188.75-30 chr14 102513803 102514031 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4141 NM_001348651 122416 Hs.432945 NM_152326 ENSG00000156381 ANKRD9 - ankyrin repeat domain 9 protein-coding 202.5-93 chr3 70668267 70668470 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -355730 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 135.5 chr1 18961100 18961307 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -4527 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 204.25-29 chr12 59404328 59404497 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -191617 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 164-68 chr21 35092305 35092497 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -43103 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 321.75-23 chr3 68288197 68288639 + 1.25 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) -212219 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 322.5 chr1 74531432 74531815 + 1.25 NA intron (NM_015978, intron 23 of 24) intron (NM_015978, intron 23 of 24) -19009 NM_001364666 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 252-39 chr2 222278355 222278634 + 1.25 NA intron (NM_181457, intron 4 of 7) intron (NM_181457, intron 4 of 7) -19653 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 200-77 chr5 178658270 178658587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -31378 NM_020666 57396 Hs.406557 NM_020666 ENSG00000113240 CLK4 - CDC like kinase 4 protein-coding 236.5-12 chr11 29382458 29382795 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -211787 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 206-7 chr10 35814192 35814427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36007 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 202-31 chr2 34778055 34778312 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 100626 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 222.75-96 chr8 84445755 84446046 + 1.25 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 30416 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 283.75-34 chr9 83987929 83988351 + 1.25 NA intron (NM_024945, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 7335 NM_024945 80010 Hs.726327 NM_024945 ENSG00000178966 RMI1 BLAP75|C9orf76|FAAP75 RecQ mediated genome instability 1 protein-coding 306.5-41 chrX 49892763 49893206 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 13500 NM_001145073 389856 Hs.143587 NM_001145073 ENSG00000273820 USP27X MRX105|USP22L|USP27 ubiquitin specific peptidase 27 X-linked protein-coding 252.75-39 chr21 32239508 32239864 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39363 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 185-82 chr7 122057978 122058209 + 1.25 NA intron (NM_001206839, intron 26 of 28) L1ME3D|LINE|L1 86156 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 218.5-81 chr4 29192984 29193376 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21112 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 229-42 chr20 31055456 31055826 + 1.25 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -202023 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 202.25-3 chr1 49491318 49491681 + 1.25 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) intron (NR_136623, intron 2 of 12) -19414 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 228.5-101 chr8 52295204 52295499 + 1.25 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) -40859 NM_001352841 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 140.5-30 chr11 37515522 37515729 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -422976 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 299.5-41 chr7 50038308 50038665 + 1.25 NA intron (NM_001159878, intron 4 of 7) L1PA10|LINE|L1 54760 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 263.25-14 chr11 114360612 114361117 + 1.25 NA non-coding (NR_120567, exon 3 of 3) non-coding (NR_120567, exon 3 of 3) 19175 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 399-6 chr6 77019241 77019590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -425792 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 251.5-16 chr11 78371545 78371838 + 1.25 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -29811 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 114-120 chr5 7104770 7104908 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 164515 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 161-71 chr20 52985854 52986060 + 1.25 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) MER113|DNA|hAT-Charlie 13599 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 231-2 chr1 69624178 69624394 + 1.25 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) L1ME3B|LINE|L1 54945 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 261.75-48 chr7 97164831 97165175 + 1.25 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) intron (NM_020186, intron 1 of 1) 48410 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 293.75-20 chr2 17416081 17416366 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 102217 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 195.75-36 chr12 77987165 77987384 + 1.25 NA intron (NM_001024383, intron 5 of 39) MIRb|SINE|MIR 156380 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 130.75-203 chr9 96738034 96738181 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 12286 NR_026792 441455 Hs.229613 NR_026792 LOC441455 - makorin ring finger protein 1 pseudogene pseudo 243-31 chr18 35928371 35928575 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 5669 NR_037497 100500864 NR_037497 ENSG00000265641 MIR3929 - microRNA 3929 ncRNA 435.5-6 chr2 126294698 126295184 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -176956 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 175.5-174 chr8 130645390 130645633 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -201837 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 349.25-20 chr9 28363537 28363958 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 355558 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 221.25-55 chr3 172378094 172378359 + 1.25 NA intron (NM_001135095, intron 23 of 25) intron (NM_001135095, intron 23 of 25) 70230 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 206.25-28 chr12 74850101 74850306 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 312368 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 272.75-34 chr4 15663452 15663884 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8256 NM_001193535 26234 Hs.643433 NM_012161 ENSG00000118564 FBXL5 FBL4|FBL5|FLR1 F-box and leucine rich repeat protein 5 protein-coding 439.5-14 chr4 71181329 71182004 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5593 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 223.25 chr1 14037089 14037341 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 287800 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 180.25-48 chr2 12267579 12267766 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 68542 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 241.25-61 chr7 20775847 20776079 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10923 NM_198956 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 392.5-11 chr8 125879272 125879821 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 71651 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 124.5-47 chr12 43331257 43331371 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 175999 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 161.25-107 chr20 46642401 46642665 + 1.25 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) intron (NM_001193340, intron 2 of 12) 8926 NM_001193339 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 283.75-27 chr5 92505720 92506130 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 1065418 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 381-15 chr3 81698627 81699169 + 1.25 NA intron (NM_000158, intron 2 of 15) intron (NM_000158, intron 2 of 15) 62747 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 121.25-182 chr6 142134899 142135126 + 1.25 NA TTS (NM_001358410) TTS (NM_001358410) 1853 NM_001358410 100126572 NM_001358410 ENSG00000203733 GJE1 CX23 gap junction protein epsilon 1 protein-coding 182.5-48 chr14 56101868 56102045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16455 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 229.25-77 chr7 34820362 34820691 + 1.25 NA intron (NM_207172, intron 4 of 8) MER4E|LTR|ERV1 13805 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 273.75-20 chr2 149340674 149340954 + 1.25 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 10227 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 193.25-62 chr2 229828587 229828759 + 1.25 NA intron (NM_001348330, intron 8 of 41) AluSx|SINE|Alu 93006 NM_001348334 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 374-8 chr2 49278501 49278925 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -124186 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 248-44 chr22 27584158 27584491 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 217432 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 259.5-41 chr15 78081591 78081928 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4048 NM_015079 23102 Hs.567426 NM_015079 ENSG00000167202 TBC1D2B - TBC1 domain family member 2B protein-coding 281.25-11 chr11 110367026 110367283 + 1.25 NA intron (NR_135100, intron 2 of 3) intron (NR_135100, intron 2 of 3) 12040 NR_135100 105369486 Hs.611557 NR_135100 LINC02732 - long intergenic non-protein coding RNA 2732 ncRNA 128.25-20 chr10 124238889 124239111 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -145402 NM_001270765 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 318.5-19 chr2 46414731 46415033 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14308 NR_103805 101805491 Hs.304781 NR_103805 ENSG00000187600 LINC02583 - long intergenic non-protein coding RNA 2583 ncRNA 188.25-75 chr3 100403521 100403700 + 1.25 NA intron (NM_001085451, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 2071 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 154.75-76 chr2 107051364 107051557 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -164351 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 228.75-48 chr20 54626936 54627234 + 1.25 NA intron (NM_018431, intron 6 of 7) L1ME4b|LINE|L1 151492 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 235.5-48 chr2 101207578 101207790 + 1.25 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -45202 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 337.5-24 chr5 78774185 78774574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125607 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 266.25-4 chr10 32620878 32621183 + 1.25 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) intron (NM_001321115, intron 19 of 43) 174890 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 123.25-25 chr10 85461316 85461468 + 1.25 NA intron (NR_120671, intron 3 of 5) L1ME3D|LINE|L1 11800 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 145.25-142 chr6 18568878 18569064 + 1.25 NA intron (NR_149116, intron 3 of 7) FRAM|SINE|Alu -2813 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 200-64 chr4 44853711 44853883 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -127163 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 203-59 chr21 28904010 28904195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18729 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 117.5-211 chr7 3428060 3428225 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 126890 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 295.25-10 chr2 102256627 102256913 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54732 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 201 chr1 19834785 19834977 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19598 NM_019062 54546 Hs.124835 NM_019062 ENSG00000178828 RNF186 - ring finger protein 186 protein-coding 437.25-6 chr7 55011859 55012504 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6836 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 179.5-36 chr12 3184741 3184939 + 1.25 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) intron (NM_006675, intron 2 of 8) 107461 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 563.25 chr4 75210727 75211693 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -126502 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 369.5-14 chr18 42627185 42627600 + 1.25 NA intron (NR_046174, intron 7 of 9) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 440724 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 266.25-14 chr14 48363834 48364082 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -568944 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 272.75-14 chr16 69299510 69299802 + 1.25 NA exon (NM_006750, exon 6 of 7) exon (NM_006750, exon 6 of 7) -11694 NM_013245 27183 Hs.128420 NM_013245 ENSG00000132612 VPS4A SKD1|SKD1A|SKD2|VPS4|VPS4-1 vacuolar protein sorting 4 homolog A protein-coding 217.25-40 chr2 49394407 49394851 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -240102 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 182.5-145 chr6 120116134 120116420 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 101098 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 226-5 chr10 70899847 70900094 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -11405 NM_000281 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 172.75-73 chr21 24601342 24601683 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 172772 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 163.75 chr1 35364857 35365039 + 1.25 NA intron (NM_001350139, intron 6 of 30) intron (NM_001350139, intron 6 of 30) 1129 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 327.25-2 chr10 35177474 35177939 + 1.25 NA intron (NM_001267567, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 2113 NM_001267567 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 202.25-67 chr5 72839352 72839544 + 1.25 NA intron (NM_001364292, intron 1 of 24) intron (NM_001364292, intron 1 of 24) -8691 NM_153188 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 267.75-36 chr22 25784030 25784368 + 1.25 NA intron (NM_001318245, intron 10 of 43) L2b|LINE|L2 42011 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 300-13 chr12 33622198 33622621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182590 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 177.5-73 chr2 13335711 13335902 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -328793 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 204.25-13 chr10 96909811 96910106 + 1.25 NA intron (NM_001170766, intron 4 of 8) intron (NM_001170766, intron 4 of 8) 77013 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 246.25-33 chr2 107991938 107992224 + 1.25 NA intron (NM_021815, intron 2 of 8) intron (NM_021815, intron 2 of 8) 5557 NM_001305007 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 177.5-28 chr11 113861175 113861358 + 1.25 NA intron (NM_020886, intron 1 of 24) intron (NM_020886, intron 1 of 24) 14306 NM_001346273 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 208-11 chr11 28725608 28725847 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -248179 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 333.5-24 chr9 72892400 72892829 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18505 NR_121180 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 190.75-16 chr11 46611923 46612289 + 1.25 NA intron (NM_173811, intron 2 of 2) intron (NM_173811, intron 2 of 2) 5121 NM_173811 283254 Hs.714463 NM_173811 ENSG00000180423 HARBI1 C11orf77 harbinger transposase derived 1 protein-coding 221.25-97 chr9 70920051 70920329 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -51138 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 202.25-40 chr2 137703390 137703700 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 224387 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 170-77 chr5 27062247 27062478 + 1.25 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -23776 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 194.25-94 chr5 119679701 119680006 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 50294 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 257.5-22 chr14 79376965 79377351 + 1.25 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 97778 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 188.25-44 chr14 83779820 83779981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1137268 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 336.75-16 chr5 95319584 95320184 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35309 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 280.75-5 chr1 218932314 218932555 + 1.25 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu -13923 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 224.25-13 chr10 51108958 51109222 + 1.25 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) L1ME1|LINE|L1 34603 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 123.5-175 chr5 135767774 135767935 + 1.25 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) SATR1|Satellite|Satellite 35221 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 202.75-34 chr14 57094093 57094298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 174710 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 358.25-15 chr3 4660626 4661096 + 1.25 NA intron (NM_001168272, intron 12 of 60) intron (NM_001168272, intron 12 of 60) 90729 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 229.5-52 chr17 62889254 62889470 + 1.25 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -54853 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 362.25-16 chr8 115689620 115690019 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20844 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 123.25-162 chr5 66281111 66281297 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71758 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 190-62 chr5 128099594 128099769 + 1.25 NA intron (NM_001046, intron 1 of 26) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 15915 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 218.75-24 chr15 99774913 99775236 + 1.25 NA Intergenic (TTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31853 NR_003260 196968 Hs.567763 NM_194295 ENSG00000182397 DNM1P46 C15orf51|DNM1DN14.2|DNM1DN14@ dynamin 1 pseudogene 46 pseudo 140.5-45 chr12 8056676 8056951 + 1.25 NA TTS (NM_001326475) TTS (NM_001326475) 9546 NM_001326477 719 Hs.504656 NM_004054 ENSG00000171860 C3AR1 AZ3B|C3AR|HNFAG09 complement C3a receptor 1 protein-coding 278.25-27 chr2 70344188 70344512 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -42283 NM_001329753 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 243-62 chr6 51119700 51120055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 301006 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 115.25-119 chr21 18228175 18228299 + 1.25 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -16596 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 214.75-93 chrX 97084279 97084479 + 1.25 NA intron (NM_007309, intron 19 of 26) intron (NM_007309, intron 19 of 26) 200471 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 197.5-143 chr7 26337234 26337542 + 1.25 NA intron (NM_001318199, intron 1 of 6) L1MB2|LINE|L1 -23496 NM_001199837 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 128.25-175 chr6 72172247 72172361 + 1.25 NA intron (NM_014989, intron 4 of 33) (ATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -40589 NM_001350455 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 136.5-183 chr5 84577865 84578059 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -193082 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 193-33 chr17 60408160 60408596 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14111 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 180.25-24 chr14 47169994 47170220 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 173139 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 268.75-8 chr12 127070539 127071023 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10384 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 205-63 chr5 105276510 105276827 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 177194 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 251.25-5 chr1 106701412 106702022 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116522 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 230.5-126 chrX 134236373 134236696 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001353453) promoter-TSS (NM_001353453) -679 NM_001101357 347475 Hs.679431 NM_001101357 ENSG00000203952 CCDC160 - coiled-coil domain containing 160 protein-coding 153.25-139 chr8 112842069 112842237 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 9 of 66) intron (NM_001363185, intron 9 of 66) 198660 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 435.25-7 chr8 126657124 126657982 + 1.25 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -99075 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 197.75-32 chr18 3710426 3710608 + 1.25 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 106780 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 189.75-111 chr7 40844866 40845055 + 1.25 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 134979 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 115-99 chr20 54676984 54677122 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 201460 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 180-62 chr2 99934510 99934763 + 1.25 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 170947 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 223.5-52 chr18 11020680 11020917 + 1.25 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 127964 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 164-50 chr17 35177623 35177767 + 1.25 NA intron (NM_001033576, intron 17 of 19) intron (NM_001033576, intron 17 of 19) 16698 NM_152462 146861 Hs.514814 NM_152462 ENSG00000164729 SLC35G3 AMAC1|TMEM21A solute carrier family 35 member G3 protein-coding 116.25-133 chr3 12721039 12721191 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 38144 NM_001284408 55287 Hs.475502 NM_018306 ENSG00000088726 TMEM40 - transmembrane protein 40 protein-coding 179.5-150 chr5 73960113 73960289 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 146655 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 275.75-43 chr8 96584647 96585038 + 1.25 NA intron (NM_002998, intron 1 of 4) intron (NM_002998, intron 1 of 4) -60400 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 224.5-41 chr14 67592523 67592789 + 1.25 NA exon (NM_001363694, exon 3 of 4) exon (NM_001363694, exon 3 of 4) 7612 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 170.25-157 chr8 133929414 133929699 + 1.25 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 43060 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 213.75-96 chr6 110902831 110903111 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 28187 NR_109768 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 145.25-21 chr11 81184279 81184492 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -421582 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 194.5-104 chr4 64161462 64161984 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 247727 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 308.75-34 chr6 135543313 135543610 + 1.25 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) L1PA14|LINE|L1 45660 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 294.25-3 chr1 218127934 218128290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 84607 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 271.25 chr1 23442615 23442907 + 1.25 NA intron (NM_001143778, intron 4 of 23).2 L2b|LINE|L2 -18013 NM_003196 6920 Hs.446354 NM_003196 ENSG00000204219 TCEA3 TFIIS|TFIIS.H transcription elongation factor A3 protein-coding 298.75-39 chr9 95510163 95510648 + 1.25 NA intron (NM_001083603, intron 1 of 23) CpG-28534 -1856 NM_000264 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 209.75-16 chr11 94026405 94026735 + 1.25 NA intron (NM_001098672, intron 1 of 19) intron (NM_001098672, intron 1 of 19) 5216 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 149.25-54 chr15 57186747 57186875 + 1.25 NA intron (NM_001322154, intron 6 of 20) L1MB5|LINE|L1 -32619 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 314.75-17 chr6 19550278 19550683 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 100659 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 233.5-51 chr2 19054432 19054695 + 1.25 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -27592 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 192.5-47 chr16 10789268 10789488 + 1.25 NA intron (NM_001318873, intron 2 of 7) MER4E1|LTR|ERV1 29416 NR_134904 780776 Hs.371576 NM_001079512 ENSG00000166676 TVP23A FAM18A|YDR084C trans-golgi network vesicle protein 23 homolog A protein-coding 153.5-134 chr3 132578679 132578864 + 1.25 NA intron (NM_032169, intron 15 of 19) intron (NM_032169, intron 15 of 19) -18499 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 272.5-61 chr6 141563642 141563878 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 525039 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 296-23 chr2 53885828 53886112 + 1.25 NA intron (NM_014614, intron 40 of 46) L1MB4|LINE|L1 -25937 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 170.5-115 chr3 25251522 25251776 + 1.25 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) L1MB8|LINE|L1 -89153 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 245-68 chr8 98847749 98848015 + 1.25 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) -22194 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 148-27 chr14 56617144 56617395 + 1.25 NA exon (NM_017799, exon 9 of 16) exon (NM_017799, exon 9 of 16) 37471 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 388.75-9 chr5 39955343 39955825 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -96707 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 308.75-33 chr6 55933909 55934225 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58477 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 192.75-24 chr12 15553104 15553413 + 1.25 NA intron (NM_030671, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 6647 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 258.25-39 chr4 71503963 71504211 + 1.25 NA intron (NM_003759, intron 13 of 22) L1M2|LINE|L1 165034 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 253.75-12 chr16 67314527 67314775 + 1.25 NA intron (NM_001100915, intron 2 of 15) AluJb|SINE|Alu 12090 NM_001100915 146212 Hs.299127 NM_001100915 ENSG00000168676 KCTD19 - potassium channel tetramerization domain containing 19 protein-coding 166.75-17 chr10 80810072 80810237 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 160357 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 371.25-8 chr2 9447859 9448413 + 1.25 NA intron (NM_016207, intron 10 of 17) intron (NM_016207, intron 10 of 17) 24482 NM_016207 51692 Hs.515972 NM_016207 ENSG00000119203 CPSF3 CPSF-73|CPSF73 cleavage and polyadenylation specific factor 3 protein-coding 156-12 chr1 192025962 192026115 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -132424 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 207-54 chr22 26288370 26288647 + 1.25 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 119034 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 260.75-28 chr2 107732750 107733188 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -21143 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 383.25-7 chr18 67188542 67189200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 107287 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 173.5-76 chr2 154410150 154410349 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 11 of 12) intron (NM_052917, intron 11 of 12) 47189 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 226.25-8 chr10 28288639 28289001 + 1.25 NA TTS (NR_107053) TTS (NR_107053) 530 NR_107053 102465880 NR_107053 ENSG00000275036 MIR8086 hsa-mir-8086 microRNA 8086 ncRNA 231.5-88 chr6 106658681 106659030 + 1.25 NA intron (NM_018292, intron 9 of 10) L1MEc|LINE|L1 -28364 NM_001318746 84816 Hs.155839 NM_032730 ENSG00000130347 RTN4IP1 NIMP|OPA10 reticulon 4 interacting protein 1 protein-coding 186.5-146 chrX 88497108 88497326 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -250008 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 164.5-106 chr2 167411994 167412212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 224731 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 226.75-44 chr21 30735517 30735835 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 11583 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 177-94 chr7 130738798 130739066 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -4899 NM_138693 136259 Hs.125240 NM_138693 ENSG00000266265 KLF14 BTEB5 Kruppel like factor 14 protein-coding 228.25-3 chr1 44619510 44619708 + 1.25 NA intron (NM_001319957, intron 2 of 13) intron (NM_001319957, intron 2 of 13) 51447 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 126-55 chr14 67748693 67748848 + 1.25 NA intron (NM_015346, intron 41 of 41) intron (NM_015346, intron 41 of 41) 46884 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 285.75-11 chr14 58522808 58523180 + 1.25 NA intron (NM_001329945, intron 29 of 29) intron (NM_001329945, intron 29 of 29) 83313 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 291.5-40 chr5 94401359 94401848 + 1.25 NA intron (NM_001145678, intron 16 of 20) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 217001 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 271.5-30 chr17 52752028 52752263 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -109976 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 202.5-60 chr17 60439484 60439762 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 17134 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 126.75-187 chr5 21099949 21100083 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -359464 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 247-62 chr8 119622779 119622986 + 1.25 NA intron (NM_001330600, intron 3 of 25) L2a|LINE|L2 15957 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 121.75-144 chr5 30236390 30236566 + 1.25 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 355918 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 337.5-10 chr12 103977871 103978254 + 1.25 NA intron (NM_003211, intron 2 of 9) AluSz6|SINE|Alu 12190 NM_003211 6996 Hs.584809 NM_003211 ENSG00000139372 TDG hTDG thymine DNA glycosylase protein-coding 245.25-37 chr2 46531751 46531968 + 1.25 NA intron (NM_001371282, intron 3 of 4) L1MB5|LINE|L1 -10631 NM_012249 23433 Hs.709193 NM_012249 ENSG00000119729 RHOQ ARHQ|HEL-S-42|RASL7A|TC10|TC10A ras homolog family member Q protein-coding 297.25-6 chr12 85773994 85774371 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62227 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 115-27 chr11 11698715 11698926 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -42098 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 207.75-99 chr5 51662324 51662638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 279033 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 340.75-6 chr11 104404903 104405202 + 1.25 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 204250 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 113.25-146 chr6 42353876 42354024 + 1.25 NA intron (NM_001297573, intron 3 of 17) L1ME4a|LINE|L1 98101 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 241-10 chr11 103491576 103491879 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -358179 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 274-23 chr2 221143176 221143499 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 428967 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 248.5-81 chr5 42343788 42344020 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -79535 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 196.5-25 chr10 114807235 114807497 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -14414 NM_020940 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 148-62 chr2 164528517 164528683 + 1.25 NA intron (NM_004490, intron 3 of 13) intron (NM_004490, intron 3 of 13) 39895 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 298.75-35 chr8 107988885 107989337 + 1.25 NA exon (NM_001317942, exon 2 of 5) exon (NM_001317942, exon 2 of 5) 92828 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 224-27 chr2 17536901 17537179 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2932 NM_001366803 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 164.5-150 chr4 115303000 115303237 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -189498 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 322.75-4 chr11 18059535 18060165 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19062 NM_004179 7166 Hs.591999 NM_004179 ENSG00000129167 TPH1 TPRH|TRPH tryptophan hydroxylase 1 protein-coding 491.5-2 chr18 6875309 6875956 + 1.25 NA intron (NM_001010000, intron 8 of 16) MIR|SINE|MIR 41147 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 128.5-233 chr9 28678765 28678986 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) L2b|LINE|L2 40430 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 275-17 chr18 559684 560032 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20522 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 302.25-24 chr6 80763339 80763833 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 656915 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 120.5-70 chr14 38259095 38259202 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3055 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 235.75-12 chr10 99487931 99488347 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43038 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 189.25-108 chr6 156994767 156994943 + 1.25 NA intron (NM_020732, intron 5 of 19) intron (NM_020732, intron 5 of 19) -41572 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 240-64 chr8 61307127 61307394 + 1.25 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) intron (NM_173519, intron 2 of 5) 19290 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 213.75-61 chr21 26007680 26007991 + 1.25 NA intron (NM_001204301, intron 6 of 16) intron (NM_001204301, intron 6 of 16) 132555 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 190-10 chr10 16286045 16286227 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -150807 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 170.25-54 chr16 78337784 78338093 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 238284 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 123.75-183 chr8 57840219 57840329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94125 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 148.5-132 chr22 25678562 25678775 + 1.25 NA intron (NM_001362778, intron 7 of 19) intron (NM_001362778, intron 7 of 19) -63520 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 159.5-109 chr2 110153540 110153765 + 1.25 NA intron (NM_207181, intron 11 of 19) L1MDa|LINE|L1 -37086 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 193.75-107 chr6 45058183 45058405 + 1.25 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 139476 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 141.75-78 chr18 6253649 6253831 + 1.25 NA intron (NR_158611, intron 4 of 16) intron (NR_158611, intron 4 of 16) -3004 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 296-16 chr14 58963958 58964370 + 1.25 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) intron (NR_110547, intron 4 of 5) 135876 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 285.75-8 chr12 7937943 7938200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1884 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 221.75-77 chr8 73514667 73515080 + 1.25 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) L1MC1|LINE|L1 94799 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 226.25-38 chr2 127408279 127408619 + 1.25 NA Intergenic CpG -9971 NM_000312 5624 Hs.224698 NM_000312 ENSG00000115718 PROC APC|PC|PROC1|THPH3|THPH4 protein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIa protein-coding 301.5-23 chr17 31711127 31711533 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 135919 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 265.75-15 chr14 52037217 52037527 + 1.25 NA intron (NM_007361, intron 9 of 21) L1PA4|LINE|L1 31687 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 191.25-104 chr8 87588423 87588842 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 285383 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 116.25-239 chr8 139520658 139520817 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 182386 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 209.75-26 chr14 60184713 60184941 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -14963 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 287.75-26 chr2 20870759 20871182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47840 NM_001282721 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 246.25-62 chr7 36698800 36699190 + 1.25 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) L1MA4|LINE|L1 25499 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 251.75-63 chr5 22481454 22481825 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) L1MA10|LINE|L1 -267789 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 192-57 chr2 76157013 76157259 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -446221 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 208.5-110 chr5 75748649 75748894 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -31334 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 180.25-29 chr15 69662711 69662913 + 1.25 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) intron (NR_126437, intron 3 of 5) 70612 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 326.75-22 chr9 11938087 11938438 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -755123 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 235-14 chr11 123535048 123535275 + 1.25 NA intron (NM_020716, intron 1 of 19) intron (NM_020716, intron 1 of 19) 9535 NM_020716 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 131.75-226 chr9 87780685 87780815 + 1.25 NA intron (NR_027917, intron 3 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 7835 NR_027917 392360 Hs.690450 NM_001023564 ENSG00000188029 CTSL3P CTSL3|HCTSL-s cathepsin L family member 3, pseudogene pseudo 225.75-75 chr8 64497820 64498112 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 79297 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 128.25-223 chr9 108611197 108611379 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 244698 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 224.25-66 chr4 60370714 60370935 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -551795 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 238.75-6 chr10 95284636 95284894 + 1.25 NA intron (NM_020992, intron 1 of 6) intron (NM_020992, intron 1 of 6) 6238 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 282-34 chr3 4763303 4763573 + 1.25 NA intron (NM_001168272, intron 43 of 60) intron (NM_001168272, intron 43 of 60) -11848 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 159.75-26 chr11 33095183 33095395 + 1.25 NA intron (NM_001326, intron 15 of 20) AluJr4|SINE|Alu 19139 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 230.75-65 chr6 93440980 93441324 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -21570 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 315.25-32 chr7 53481748 53482068 + 1.25 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 330023 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 287.5-5 chr1 245037290 245037720 + 1.25 NA intron (NM_032328, intron 3 of 7) L1M5|LINE|L1 -66636 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 155.25-42 chr11 104264540 104264714 + 1.25 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -100480 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 165.5-85 chr2 141627028 141627277 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L1MC1|LINE|L1 504549 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 151-118 chr6 90850865 90851103 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -263912 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 178.75-77 chr4 130198765 130199051 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -177453 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 150.5-202 chr7 27426694 27426858 + 1.25 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -179547 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 244.25-43 chr6 112353638 112353871 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 6424 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 248.5-89 chr6 52454891 52455264 + 1.25 NA intron (NR_033327, intron 4 of 9) AluJb|SINE|Alu 34069 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 190.25-128 chr9 32470042 32470324 + 1.25 NA intron (NM_014314, intron 14 of 17) intron (NM_014314, intron 14 of 17) 56013 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 231.25 chr1 40563765 40564011 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 32251 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 178.5-38 chr13 21880536 21880776 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2496 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 221-36 chr2 58332882 58333082 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57105 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 229.25-27 chr14 66536097 66536361 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) AluJo|SINE|Alu 28822 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 173.5-169 chr8 119490281 119490547 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73968 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 142.5-231 chr8 132215242 132215388 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) -110050 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 170.75-150 chr9 37548371 37548563 + 1.25 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) L1ME2z|LINE|L1 27913 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 280.5-19 chr18 64065856 64066255 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -38036 NR_033881 284294 Hs.385642 NR_033881 ENSG00000267134 LINC01924 - long intergenic non-protein coding RNA 1924 ncRNA 160-46 chr18 9640198 9640517 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 25093 NR_110774 101927323 Hs.151204 NR_110773 ENSG00000263627 PPP4R1-AS1 - PPP4R1 antisense RNA 1 ncRNA 203.75-38 chr15 77375517 77375831 + 1.25 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 44430 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 187.75-88 chr5 92106776 92107001 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -723571 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 257.5-79 chr8 140143225 140143621 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -42888 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 189.25-46 chr17 56164619 56164825 + 1.25 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) intron (NM_153228, intron 1 of 16) 11247 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 261.5-4 chr10 88170648 88171065 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 307231 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 115.25-86 chr18 7456911 7457120 + 1.25 NA intron (NM_001364581, intron 1 of 1) intron (NM_001364581, intron 1 of 1) 3991 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 231.5-18 chr11 112387225 112387441 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94899 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 349.75 chr1 113504360 113505004 + 1.25 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 114167 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 121.25-165 chr5 77231093 77231222 + 1.25 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 20477 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 238.5-8 chr1 198320600 198320844 + 1.25 NA 3' UTR (NM_133494, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_133494, exon 10 of 10) 163724 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 208.25-79 chr6 162919760 162920000 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 134281 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 282.5-29 chr2 102542888 102543413 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69924 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 254.5-53 chr3 138664255 138664703 + 1.25 NA intron (NM_006219, intron 20 of 23) intron (NM_006219, intron 20 of 23) 43142 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 147.75-163 chr8 141962724 141962860 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -176479 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 304-20 chr19 1532721 1533184 + 1.25 NA intron (NM_001243079, intron 12 of 13) AluY|SINE|Alu 8875 NM_001243079 126520 Hs.195352 NM_001011716 ENSG00000185988 PLK5 PLK-5|PLK5P|SgK384ps polo like kinase 5 protein-coding 248-7 chr10 63420818 63421035 + 1.25 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L1MEg|LINE|L1 -9649 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 160.25-89 chr3 21582295 21582755 + 1.25 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) intron (NM_024697, intron 2 of 7) 39736 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 175-92 chr5 3935225 3935478 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 339519 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 143.75-129 chr4 32394320 32394536 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 43390 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 160.75-125 chr5 110677359 110677593 + 1.25 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 49195 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 204.25-32 chr12 111330163 111330416 + 1.25 NA intron (NM_015267, intron 18 of 21) intron (NM_015267, intron 18 of 21) 26147 NR_106818 102465455 NR_106818 ENSG00000273700 MIR6760 hsa-mir-6760 microRNA 6760 ncRNA 219.5-63 chr2 35340334 35340532 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -130972 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 196.5-121 chr5 21782612 21782864 + 1.25 NA intron (NM_004061, intron 11 of 14) intron (NM_004061, intron 11 of 14) -101716 NR_132788 106635540 NR_132788 SNORA105B - small nucleolar RNA, H/ACA box 105B snoRNA 142.25 chr1 19104104 19104248 + 1.25 NA exon (NM_020765, exon 87 of 106) exon (NM_020765, exon 87 of 106) 106090 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 212.25-30 chr15 60669895 60670189 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -11527 NR_120319 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 194.75-16 chr10 112074737 112074909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 108942 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 246.75-67 chr7 52906163 52906568 + 1.25 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -129268 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 257.5-3 chr1 165661556 165661894 + 1.25 NA TTS (NM_000696) TTS (NM_000696) 30491 NM_004528 4259 Hs.191734 NM_004528 ENSG00000143198 MGST3 GST-III microsomal glutathione S-transferase 3 protein-coding 260.5-51 chr5 117872313 117872729 + 1.25 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) MER89|LTR|ERV1 142160 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 200-70 chr5 16527366 16527639 + 1.25 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -18504 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 165-90 chr3 37608227 37608489 + 1.25 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) intron (NM_002207, intron 15 of 27) 156217 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 227.5-8 chr1 246228485 246228747 + 1.25 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 188796 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 204.75-11 chr1 195856445 195856800 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 232093 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 290.25-32 chr7 47779937 47780349 + 1.25 NA intron (NM_138295, intron 56 of 56) L1MD1|LINE|L1 -15148 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 347.75-6 chr20 52777578 52777977 + 1.25 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 156939 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 131-143 chr6 63187191 63187363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 132700 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 162.5-153 chr6 63178362 63178556 + 1.25 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL 141518 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 325 chr1 159969223 159969719 + 1.25 NA intron (NR_038849, intron 1 of 2) intron (NR_038849, intron 1 of 2) 8247 NR_038849 100505633 Hs.445045 NR_038849 ENSG00000224259 LINC01133 - long intergenic non-protein coding RNA 1133 ncRNA 174-79 chr5 155090266 155090435 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 76595 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 295.25-13 chr2 189532037 189532358 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 48614 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 196.5-104 chr3 87382574 87382888 + 1.25 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -106147 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 369-3 chr13 75086540 75086914 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 153654 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 180.5-91 chr3 16960765 16960921 + 1.25 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 27647 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 232.75-64 chr8 89045450 89045696 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 712138 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 286.75-6 chr10 66167309 66167658 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 596058 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 144.75-101 chr20 47476525 47476683 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -25283 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 229.75-8 chr10 47169195 47169430 + 1.25 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -130885 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 133.5-130 chr2 201824117 201824268 + 1.25 NA intron (NM_001366386, intron 6 of 13) intron (NM_001366386, intron 6 of 13) 17613 NM_001366386 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 447.25-2 chr5 175704643 175705226 + 1.25 NA intron (NR_160284, intron 3 of 3) L1MB3|LINE|L1 46863 NM_001131055 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 192.75-22 chr12 11808432 11808782 + 1.25 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 158753 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 335-16 chr5 145853197 145853540 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -18026 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 289.5-33 chr3 48175526 48175795 + 1.25 NA intron (NM_201567, intron 7 of 13) intron (NM_201567, intron 7 of 13) 12757 NM_001789 993 Hs.437705 NM_001789 ENSG00000164045 CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25A protein-coding 326.5 chr1 117551368 117551740 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54216 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 337-32 chr8 142982689 142983002 + 1.25 NA intron (NR_026913, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu -12983 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 176.75-38 chr14 60744850 60745182 + 1.25 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 10255 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 241-18 chr15 94273714 94273942 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24373 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 180.75-23 chr11 82602355 82602624 + 1.25 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 131375 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 204.5-115 chr6 121741105 121741354 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 305583 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 270.5-58 chr7 67682163 67682404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -337970 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 447 chr1 216244933 216245420 + 1.25 NA intron (NM_206933, intron 13 of 71) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 172711 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 133.25-34 chr11 113764550 113764684 + 1.25 NA intron (NM_004724, intron 2 of 15) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 9075 NM_004724 9183 Hs.503886 NM_004724 ENSG00000086827 ZW10 HZW10|KNTC1AP zw10 kinetochore protein protein-coding 128.5-103 chr2 30677401 30677505 + 1.25 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 129993 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 245.5-69 chr6 50442857 50443214 + 1.25 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -270509 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 257-32 chr22 24526175 24526618 + 1.25 NA 3' UTR (NM_016327, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_016327, exon 10 of 10) 28742 NM_001284254 83606 Hs.9850 NM_031444 ENSG00000138867 GUCD1 C22orf13|LLN4 guanylyl cyclase domain containing 1 protein-coding 275.25-39 chr6 131315415 131315706 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65156 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 134.75-37 chr10 130912525 130912716 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 50048 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 262.25-49 chr8 135311888 135312122 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 77874 NR_120396 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 380.75-7 chr8 100084587 100085073 + 1.25 NA intron (NM_015668, intron 3 of 27) L2c|LINE|L2 20796 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 259.75-6 chr11 57701811 57702135 + 1.25 NA TTS (NM_015457) TTS (NM_015457) 10242 NR_157587 219541 Hs.43619 NM_153450 ENSG00000156603 MED19 DT2P1G7|LCMR1|MED19AS mediator complex subunit 19 protein-coding 292-32 chr3 126087574 126087914 + 1.25 NA intron (NM_001164475, intron 1 of 9) MER4B-int|LTR|ERV1 -3453 NM_017836 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 269-43 chr7 32152207 32152559 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -80947 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 161.75-127 chr8 128314955 128315162 + 1.25 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 164942 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 317.75-4 chr10 9888290 9888663 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -170246 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 301-26 chr7 7840123 7840510 + 1.25 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) MER5B|DNA|hAT-Charlie -121709 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 294.75-41 chr9 34434273 34434770 + 1.25 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 24049 NM_147202 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 373.25 chr1 69400953 69401454 + 1.25 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -32052 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 155.5-34 chr10 124945601 124945745 + 1.25 NA intron (NM_017580, intron 1 of 8) intron (NM_017580, intron 1 of 8) 3550 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 157.75-87 chr2 66941051 66941252 + 1.25 NA intron (NR_110169, intron 3 of 4) intron (NR_110169, intron 3 of 4) -18661 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 131.25-216 chr9 75530653 75530771 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -359932 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 268-14 chr11 118618691 118619054 + 1.25 NA intron (NM_015157, intron 5 of 23) intron (NM_015157, intron 5 of 23) 11257 NM_001144758 23187 Hs.504062 NM_015157 ENSG00000019144 PHLDB1 LL5A pleckstrin homology like domain family B member 1 protein-coding 191.75-105 chr5 126230806 126231082 + 1.25 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 51367 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 345.25-21 chr6 53790239 53790649 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4561 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 280.5-55 chr8 116895318 116895655 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -20620 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 234.75-43 chr21 26784336 26784690 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60896 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 135-199 chr9 86670932 86671094 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 276493 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 266.25-49 chr8 129921258 129921569 + 1.25 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) intron (NM_001353256, intron 2 of 13) 18398 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 213.5-132 chrX 148682709 148683003 + 1.25 NA intron (NM_001169124, intron 3 of 19) intron (NM_001169124, intron 3 of 19) -36235 NM_001170628 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 178.5-66 chr17 62067533 62067802 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2389 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 245-18 chr15 94885701 94885916 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 30445 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 197.25-94 chr7 27421898 27422127 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -174783 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 268-7 chr1 166165029 166165374 + 1.25 NA intron (NR_163271, intron 1 of 2) CpG 1554 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 255.5-48 chr20 38381072 38381325 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 34716 NM_004139 3929 Hs.154078 NM_004139 ENSG00000129988 LBP BPIFD2 lipopolysaccharide binding protein protein-coding 139.75-58 chr15 55059297 55059470 + 1.25 NA intron (NR_135679, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 2636 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 136-137 chr7 91308842 91309214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44595 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 128.5-118 chr2 191535173 191535324 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -142824 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 231.25-46 chr20 16077215 16077540 + 1.25 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -91495 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 303.75-21 chr20 24475115 24475376 + 1.25 NA intron (NR_147606, intron 1 of 4) intron (NR_147606, intron 1 of 4) 5284 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 177-15 chr10 110064214 110064362 + 1.25 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) L1ME3A|LINE|L1 -55907 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 388.75-11 chr8 132390255 132390985 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 56642 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 202.75-62 chr2 207927061 207927417 + 1.25 NA intron (NM_001080475, intron 5 of 7) intron (NM_001080475, intron 5 of 7) 98288 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 238.75-43 chr4 163270120 163270468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62302 NM_000909 4886 Hs.519057 NM_000909 ENSG00000164128 NPY1R NPY1-R|NPYR neuropeptide Y receptor Y1 protein-coding 179.75-40 chr14 61244337 61244568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 36886 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 130.75-16 chr10 24776853 24777050 + 1.25 NA Intergenic Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger -53064 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 336-25 chr7 77809018 77809538 + 1.25 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 10307 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 205.75-10 chr11 76843317 76843644 + 1.25 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -17438 NM_001300954 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 274.5-29 chr2 6742333 6742666 + 1.25 NA intron (NR_038369, intron 1 of 5) intron (NR_038369, intron 1 of 5) 27812 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 264-21 chr17 77372305 77372685 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001113493) promoter-TSS (NM_001113493) -842 NM_001113493 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 126.5-255 chr8 137051021 137051228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 362464 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 271.5-32 chr18 6405595 6406003 + 1.25 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 9112 NM_001365768 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 307.25-22 chr3 1782069 1782620 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -316459 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 178.75-80 chr5 3272422 3272716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94734 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 272.75-8 chr12 20204294 20204638 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76565 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 309 chr1 47200444 47200717 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -10544 NM_005764 10158 Hs.431099 NM_005764 ENSG00000162366 PDZK1IP1 DD96|MAP17|SPAP PDZK1 interacting protein 1 protein-coding 160.5-195 chr8 123494735 123494898 + 1.25 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? 37327 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 221.5-84 chr6 62074531 62074862 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 211529 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 445.75-5 chr13 50257271 50258022 + 1.25 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) L1ME3A|LINE|L1 85628 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 222.25-19 chr14 57892006 57892307 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26064 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 401.75-4 chr2 171141665 171142110 + 1.25 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) L1MEg|LINE|L1 19006 NM_012290 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 246.75-27 chr18 50577531 50577991 + 1.25 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) intron (NM_001292039, intron 1 of 4) 17674 NM_001292040 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 143.75-102 chr20 245762 245955 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -11866 NM_207469 400830 Hs.516819 NM_207469 ENSG00000186458 DEFB132 BD-32|DEFB-32|DEFB32|HEL-75|KFLL827|UNQ827 defensin beta 132 protein-coding 159.5-128 chr21 14913454 14913712 + 1.25 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) intron (NR_146322, intron 1 of 3) 5085 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 194.5-124 chr6 34864565 34865014 + 1.25 NA intron (NM_017754, intron 15 of 20) AluSx1|SINE|Alu 23253 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 148.5-192 chr5 167513169 167513353 + 1.25 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -60398 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 231.75-60 chr5 45409410 45409613 + 1.25 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 286869 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 371.75-16 chr6 168971127 168971858 + 1.25 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -7110 NR_136250 105378146 Hs.343631 NR_136248 LOC105378146 - uncharacterized LOC105378146 ncRNA 204.25-70 chr3 131122269 131122515 + 1.25 NA intron (NM_001353036, intron 5 of 14) intron (NM_001353036, intron 5 of 14) 94664 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 283.25-14 chr15 56539571 56539915 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74606 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 120.25-27 chr10 50510579 50510768 + 1.25 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) L1MC4a|LINE|L1 113283 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 211-55 chr5 120640830 120641021 + 1.25 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) intron (NM_001308088, intron 3 of 3) 109461 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 158-8 chr1 84035624 84035792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36576 NM_001350215 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 201.25-34 chr15 56617875 56618145 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 116076 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 329.5-21 chr5 66800487 66801056 + 1.25 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) intron (NM_001290228, intron 3 of 4) -28002 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 209.5-35 chr13 31159790 31159977 + 1.25 NA intron (NM_001286505, intron 1 of 15) intron (NM_001286505, intron 1 of 15) 2021 NM_006644 10808 Hs.743267 NM_006644 ENSG00000120694 HSPH1 HSP105|HSP105A|HSP105B|NY-CO-25 heat shock protein family H (Hsp110) member 1 protein-coding 125.75-58 chr15 61560595 61560799 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -169221 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 183.75-42 chr15 69197888 69198245 + 1.25 NA intron (NM_001324094, intron 2 of 5) intron (NM_001324094, intron 2 of 5) 37431 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 135-191 chr9 9792166 9792301 + 1.25 NA intron (NM_002839, intron 5 of 45) intron (NM_002839, intron 5 of 45) -7159 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 239.25 chr1 22629870 22630252 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3305 NR_106742 102466615 NR_106742 ENSG00000276835 MIR6127 hsa-mir-6127 microRNA 6127 ncRNA 117.25-93 chr17 70833186 70833314 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 368929 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 192.5-96 chr4 30466653 30466910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -253588 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 276.25-41 chr7 108932359 108932710 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47947 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 237.5-12 chr10 5787552 5787993 + 1.25 NA intron (NM_001115156, intron 3 of 9) intron (NM_001115156, intron 3 of 9) 25662 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 236.5-43 chr19 29208459 29208794 + 1.25 NA intron (NM_006003, intron 1 of 1) intron (NM_006003, intron 1 of 1) 4525 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 147.5-191 chr7 7093867 7094071 + 1.25 NA non-coding (NR_034022, exon 1 of 1) non-coding (NR_034022, exon 1 of 1) 2817 NR_034022 100131257 Hs.551110 NR_034022 LOC100131257 - zinc finger protein 655 pseudogene pseudo 257-15 chr14 64904784 64905201 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9369 NM_001204064 91612 Hs.731537 NM_145165 ENSG00000258289 CHURC1 C14orf52|My015|chch churchill domain containing 1 protein-coding 130.75-75 chr18 381612 381832 + 1.25 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) L1MC4a|LINE|L1 -113675 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 236.25 chr1 10487049 10487258 + 1.25 NA intron (NM_004565, intron 1 of 8) L1ME2|LINE|L1 12203 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 137.25-73 chr2 98883439 98883604 + 1.25 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) intron (NM_207362, intron 1 of 9) 52704 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 160.25-34 chr14 34783337 34783601 + 1.25 NA intron (NM_013448, intron 15 of 26) AluSz6|SINE|Alu -68646 NR_028130 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 175.5-54 chr15 27009365 27009536 + 1.25 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) intron (NM_001270873, intron 2 of 5) 38269 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 129.5-247 chrX 64421882 64422069 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26523 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 258-52 chr7 83164634 83165018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1942 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 164-59 chr2 184988787 184988967 + 1.25 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 178195 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 288.25-2 chr1 246738991 246739488 + 1.25 NA intron (NM_016002, intron 3 of 11) L1MC3|LINE|L1 14830 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 147.5-143 chr3 71444433 71444587 + 1.25 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) 97579 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 128.5-98 chr19 13033888 13034105 + 1.25 NA intron (NM_001365984, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR 9217 NM_001365984 4784 Hs.257970 NM_002501 ENSG00000008441 NFIX CTF|MRSHSS|NF-I/X|NF1-X|NF1A|SOTOS2 nuclear factor I X protein-coding 150.25-63 chr16 63546559 63546780 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -1510231 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 141.25-113 chr3 112713648 112713852 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -23339 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 146.25-126 chr6 126648187 126648344 + 1.25 NA Intergenic LTR65|LTR|ERV1 163634 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 301-19 chr4 36951666 36952089 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -49902 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 220.5-45 chr2 66707564 66707889 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4499 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 264-42 chr22 24686796 24687041 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27771 NR_024593 646074 Hs.531306 NM_001025230 POM121L10P - POM121 transmembrane nucleoporin like 10, pseudogene pseudo 186-32 chr16 78012073 78012353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10335 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 265.75-27 chr18 3202934 3203266 + 1.25 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) L1M4a2|LINE|L1 16868 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 156.5-157 chr5 151735727 151735916 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22810 NM_004045 475 Hs.125213 NM_004045 ENSG00000177556 ATOX1 ATX1|HAH1 antioxidant 1 copper chaperone protein-coding 221.5-83 chr6 55286930 55287243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40383 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 253.75-48 chr5 85429551 85429866 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -852736 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 126.75-28 chr11 42239238 42239439 + 1.25 NA intron (NR_038309, intron 3 of 5) intron (NR_038309, intron 3 of 5) 14352 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 259.25-25 chr22 50096805 50097087 + 1.25 NA intron (NM_018995, intron 2 of 26) L1MB5|LINE|L1 6690 NM_001164105 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 273-52 chr7 42639009 42639258 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 67314 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 211.75-17 chr12 60495713 60496041 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 806507 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 364-16 chr6 28325084 28325592 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001243241, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001243241, exon 4 of 4) 10796 NM_001243243 64288 Hs.656413 NM_030899 ENSG00000235109 ZSCAN31 ZNF20-Lp|ZNF310P|ZNF323 zinc finger and SCAN domain containing 31 protein-coding 198.25-40 chr16 31875842 31876048 + 1.25 NA intron (NM_001265588, intron 2 of 4) intron (NM_001265588, intron 2 of 4) 2138 NM_001265588 10308 Hs.460645 NM_003414 ENSG00000185947 ZNF267 HZF2 zinc finger protein 267 protein-coding 183.75-43 chr16 21042302 21042559 + 1.25 NA intron (NM_001347886, intron 31 of 61) intron (NM_001347886, intron 31 of 61) 108416 NM_001347886 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 370-8 chr18 47296250 47296739 + 1.25 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 10770 NR_147192 110175910 Hs.639112 NR_147192 ENSG00000267761 MIR4527HG - MIR4527 host gene ncRNA 184.25-22 chr11 45807154 45807346 + 1.25 NA intron (NM_001145265, intron 2 of 2) MER3|DNA|hAT-Charlie 2160 NM_018389 55343 Hs.12211 NM_018389 ENSG00000181830 SLC35C1 CDG2C|FUCT1 solute carrier family 35 member C1 protein-coding 283.5-28 chr2 158001444 158001787 + 1.25 NA intron (NM_001135098, intron 1 of 8) LTR33|LTR|ERVL 6436 NM_001135098 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 174.5-130 chr3 194522430 194522607 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 35378 NR_033929 401106 Hs.407087 NR_033929 LINC00884 - long intergenic non-protein coding RNA 884 ncRNA 150.75-144 chr4 101238278 101238455 + 1.25 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 2506 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 236-52 chr4_GL000008v2_random 2010 2255 + 1.25 NA Intergenic SVA_A|Retroposon|SVA 176039 NR_046228 100874392 Hs.648245 NR_046228 ANKRD20A12P - ankyrin repeat domain 20 family member A12, pseudogene pseudo 300.5-27 chr2 181823620 181823947 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -67947 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 315.25-3 chr10 5386546 5387087 + 1.25 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 18012 NM_001171864 79861 Hs.163079 NM_024803 ENSG00000178462 TUBAL3 - tubulin alpha like 3 protein-coding 128-25 chr11 58134963 58135174 + 1.25 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -15624 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 157.25-83 chr2 166209250 166209535 + 1.25 NA intron (NM_001365536, intron 24 of 26) L1M4|LINE|L1 -60231 NM_001353950 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 215.75-86 chr6 71191070 71191361 + 1.25 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -97596 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 260.25-30 chr20 58321541 58322125 + 1.25 NA intron (NM_020673, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 12118 NM_020673 57403 Hs.529044 NM_020673 ENSG00000124209 RAB22A - RAB22A, member RAS oncogene family protein-coding 138-117 chr4 82927476 82927647 + 1.25 NA non-coding (NR_110254, exon 13 of 13) non-coding (NR_110254, exon 13 of 13) -26645 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 238-17 chr14 65315841 65316150 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 19188 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 170.75-130 chr8 27620294 27620728 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -5811 NM_001831 1191 Hs.436657 NM_001831 ENSG00000120885 CLU AAG4|APO-J|APOJ|CLI|CLU1|CLU2|KUB1|NA1/NA2|SGP-2|SGP2|SP-40|TRPM-2|TRPM2 clusterin protein-coding 122-166 chr7 36211502 36211626 + 1.25 NA intron (NM_030636, intron 2 of 7) L1ME4a|LINE|L1 58310 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 249.75-58 chr7 48696588 48696963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -227772 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 296-3 chr10 32618619 32619228 + 1.25 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1PB4|LINE|L1 172783 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 222-88 chr9 85147920 85148228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 442173 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 276.75-24 chr2 62422118 62422369 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 83952 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 223.75-25 chr14 81003839 81004212 + 1.25 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) MER112|DNA|hAT-Charlie 48404 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 151.25-12 chr10 7282425 7282585 + 1.25 NA intron (NM_001029880, intron 6 of 20) intron (NM_001029880, intron 6 of 20) -95721 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 122.25-65 chr14 100630785 100631058 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -26347 NR_024096 283601 Hs.379802 NM_001007560 ENSG00000196273 LINC00523 C14orf70 long intergenic non-protein coding RNA 523 ncRNA 148-106 chr5 96863418 96863612 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12424 NM_001329229 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 199.25-4 chr1 190196893 190197173 + 1.25 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 278977 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 168-38 chr12 53596688 53596845 + 1.25 NA intron (NR_073163, intron 2 of 12) intron (NR_073163, intron 2 of 12) 29224 NM_001366556 11016 Hs.12286 NM_006856 ENSG00000170653 ATF7 ATFA activating transcription factor 7 protein-coding 231.25-54 chr3 172421952 172422149 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 26406 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 222.75-104 chr9 77078588 77079004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59141 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 230.25-43 chr2 102653036 102653270 + 1.25 NA intron (NM_003048, intron 1 of 11) intron (NM_003048, intron 1 of 11) 33600 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 353.25-26 chr9 24878985 24879285 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -333238 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 140.75-34 chr12 13675078 13675257 + 1.25 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) MIR|SINE|MIR -298422 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 205.75-45 chr3 104920305 104920552 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -446285 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 275.75-8 chr12 20354875 20355302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14157 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 303.75-18 chr2 64552822 64553235 + 1.25 NA exon (NM_203437, exon 2 of 10) exon (NM_203437, exon 2 of 10) 27515 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 150.5-104 chr2 168599027 168599344 + 1.25 NA intron (NM_001256126, intron 3 of 10) intron (NM_001256126, intron 3 of 10) 16242 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 149-97 chr4 143631816 143632063 + 1.25 NA intron (NM_001168235, intron 2 of 7) intron (NM_001168235, intron 2 of 7) 68736 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 190.5-109 chr4 39879671 39879952 + 1.25 NA exon (NM_001100399, exon 18 of 33) exon (NM_001100399, exon 18 of 33) 98100 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 120.25-59 chr14 43085294 43085464 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 1421904 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 257.25-14 chr14 49507601 49507926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 78617 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 306-12 chr17 71014278 71014601 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 187740 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 242.5-38 chr17 71476018 71476349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -274004 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 186.5-116 chr5 176452571 176452922 + 1.25 NA intron (NM_014613, intron 1 of 10) intron (NM_014613, intron 1 of 10) 4361 NM_014613 23197 Hs.484242 NM_014613 ENSG00000113194 FAF2 ETEA|UBXD8|UBXN3B Fas associated factor family member 2 protein-coding 433.25-2 chr17 72231260 72231682 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 110451 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 271.75-29 chr3 131936665 131936976 + 1.25 NA intron (NM_001289112, intron 1 of 15) L1M7|LINE|L1 49111 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 233-31 chr2 62056777 62057168 + 1.25 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) Charlie3|DNA|hAT-Charlie -139143 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 167-61 chr2 118597210 118597408 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 5657 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 200-16 chr11 36237958 36238145 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 51373 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 198.75-52 chr2 201411434 201411648 + 1.25 NA intron (NM_015049, intron 2 of 15) intron (NM_015049, intron 2 of 15) 39917 NM_015049 66008 Hs.152774 NM_015049 ENSG00000115993 TRAK2 ALS2CR3|CALS-C|GRIF-1|GRIF1|MILT2|OIP98 trafficking kinesin protein 2 protein-coding 112.5-103 chr19 34896010 34896146 + 1.25 NA intron (NR_046222, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 2865 NR_046222 100652909 Hs.374015 NR_046222 ENSG00000271649 LINC00904 - long intergenic non-protein coding RNA 904 ncRNA 168.25-122 chr6 50925801 50925976 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 107017 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 237.75 chr1 75813290 75813511 + 1.25 NA intron (NM_002440, intron 4 of 19) MIR|SINE|MIR 16518 NM_002440 4438 Hs.216639 NM_002440 ENSG00000057468 MSH4 - mutS homolog 4 protein-coding 180.75-47 chr16 73832822 73833345 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 382438 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 193.25-88 chr5 16058167 16058419 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 121498 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 227.75-71 chr6 61559502 61559799 + 1.25 NA intron (NR_146870, intron 14 of 15) L1M1|LINE|L1 -14480 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 197.5-154 chr8 37586767 37587081 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65538 NR_121621 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 376.75-17 chr7 50861604 50862108 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68403 NM_001371008 178.25-66 chr2 122905682 122905946 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 167667 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 187-4 chr1 196053948 196054174 + 1.25 NA intron (NR_146895, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 34654 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 155-55 chr2 7924331 7924672 + 1.25 NA intron (NR_015405, intron 2 of 2) LTR16A1|LTR|ERVL -24846 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 151-127 chr7 51066113 51066246 + 1.25 NA intron (NM_001346444, intron 7 of 7) intron (NM_001346444, intron 7 of 7) 250630 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 250.5-71 chr5 4919161 4919415 + 1.25 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 -115071 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 167-62 chr2 121734131 121734327 + 1.25 NA intron (NM_032390, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu 2646 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 228.25-33 chr16 77187627 77187839 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -3457 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 123-78 chr16 81636642 81636753 + 1.25 NA intron (NM_030629, intron 3 of 20) intron (NM_030629, intron 3 of 20) 25349 NR_106759 102465251 NR_106759 ENSG00000275109 MIR6504 hsa-mir-6504 microRNA 6504 ncRNA 274.25-31 chr3 115558430 115558787 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64902 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 166-111 chr6 124647111 124647293 + 1.25 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 -315343 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 175.25-72 chr2 110940210 110940495 + 1.25 NA intron (NM_001142807, intron 12 of 17) intron (NM_001142807, intron 12 of 17) 175236 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 541.5-6 chr9 37334746 37335395 + 1.25 NA intron (NR_110317, intron 5 of 7) intron (NR_110317, intron 5 of 7) -87626 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 145-4 chr1 42407222 42407404 + 1.25 NA intron (NM_173642, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 26521 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 130-2 chr1 32508104 32508253 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -31249 NM_001291496 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 286.25 chr1 73644095 73644679 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -30292 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 298-20 chr3 164660105 164660512 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 171172 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 142-66 chr17 31868664 31868803 + 1.25 NA intron (NM_018428, intron 16 of 18) L1M5|LINE|L1 -9489 NM_018405 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 157.5-47 chr12 53691260 53691441 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -15020 NM_001369755 517 Hs.524464 NM_005176 ENSG00000135390 ATP5MC2 ATP5A|ATP5G2 ATP synthase membrane subunit c locus 2 protein-coding 259-32 chr4 31745974 31746315 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 239600 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 210-61 chr21 16448280 16448504 + 1.25 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) L1MC4a|LINE|L1 28097 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 122-58 chr14 72581125 72581339 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64412 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 120.75-74 chr19 52033415 52033548 + 1.25 NA 3' UTR (NM_014650, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014650, exon 5 of 5) -5102 NM_025040 80110 Hs.292336 NM_025040 ENSG00000142556 ZNF614 - zinc finger protein 614 protein-coding 160.25-101 chr3 121924788 121925046 + 1.25 NA intron (NM_021082, intron 12 of 21) intron (NM_021082, intron 12 of 21) 30516 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 182.25-39 chr14 58195048 58195302 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -4974 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 198-69 chr6 160027584 160027758 + 1.25 NA intron (NM_000876, intron 6 of 47) intron (NM_000876, intron 6 of 47) -20007 NR_047511 100271873 Hs.742166 NR_047511 ENSG00000268257 AIRN AIR|IGF2R-AS|IGF2R-AS1|IGF2RAS|NCRNA00088 antisense of IGF2R non-protein coding RNA ncRNA 216.25-88 chr5 122536026 122536363 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 48406 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 120.25-150 chr4 62274990 62275192 + 1.25 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -113326 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 190.5-16 chr10 70470333 70470591 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -8305 NM_014431 27143 Hs.202351 NM_014431 ENSG00000107719 PALD1 KIAA1274|PALD phosphatase domain containing paladin 1 protein-coding 165.75-12 chr10 18572822 18573059 + 1.25 NA intron (NM_182543, intron 8 of 10) (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 78647 NM_001351117 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 282.75-42 chr9 27080163 27080510 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28805 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 154.25-32 chr12 350901 351042 + 1.25 NA intron (NM_001042603, intron 9 of 27) intron (NM_001042603, intron 9 of 27) 38349 NM_001042603 5927 Hs.76272 NM_005056 ENSG00000073614 KDM5A RBBP-2|RBBP2|RBP2 lysine demethylase 5A protein-coding 163.5-27 chr10 90805705 90806034 + 1.25 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) MER4B-int|LTR|ERV1 52170 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 115-29 chr11 39473518 39473659 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 819542 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 249.25-18 chr18 11295145 11295625 + 1.25 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -146623 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 191.25-79 chr4 113054486 113054694 + 1.25 NA intron (NM_001354232, intron 1 of 46) intron (NM_001354232, intron 1 of 46) 4937 NM_001148 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 194-45 chr2 42467907 42468229 + 1.25 NA intron (NM_172344, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 25914 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 170-12 chr10 74916318 74916501 + 1.25 NA intron (NR_134476, intron 1 of 1) intron (NR_134476, intron 1 of 1) 3623 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 253.25-58 chr6 164484583 164485001 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 337271 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 127-92 chr19 8219197 8219336 + 1.25 NA intron (NM_024552, intron 2 of 11) intron (NM_024552, intron 2 of 11) 9896 NM_024552 79603 Hs.515111 NM_024552 ENSG00000090661 CERS4 LASS4|Trh1 ceramide synthase 4 protein-coding 258.5-58 chr5 15545822 15546060 + 1.25 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) MER33|DNA|hAT-Charlie 44503 NM_001278317 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 206.5-48 chr2 55488396 55488636 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -31079 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 182.25-133 chr9 95614433 95614714 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -97516 NM_001083602 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 329.25-17 chr2 203922427 203922884 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14093 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 212.25-17 chr11 71409846 71410105 + 1.25 NA intron (NR_038862, intron 2 of 2) L1M2|LINE|L1 13379 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 174.25-147 chr8 125080596 125080816 + 1.25 NA intron (NM_014846, intron 5 of 28) intron (NM_014846, intron 5 of 28) 11086 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 224-4 chr1 67770114 67770302 + 1.25 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) LTR78|LTR|ERV1 -62080 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 388.5-4 chr13 95844942 95845459 + 1.25 NA intron (NM_020121, intron 36 of 38) SVA_B|Retroposon|SVA 168061 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 199.75-75 chr4 184168928 184169227 + 1.25 NA intron (NM_153343, intron 1 of 7) intron (NM_153343, intron 1 of 7) 48796 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 143.25-67 chr17 10291979 10292158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80938 NM_003802 8735 Hs.711142 NM_003802 ENSG00000006788 MYH13 MyHC-IIL|MyHC-eo myosin heavy chain 13 protein-coding 154.75-104 chr3 184733483 184733681 + 1.25 NA intron (NR_160768, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu 21339 NR_160768 107986163 NR_160768 LOC107986163 - uncharacterized LOC107986163 ncRNA 120.5-217 chr7 86111930 86112051 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -531919 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 241.75-50 chr3 29734096 29734314 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) L1MA5|LINE|L1 199951 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 183.25-18 chr10 117698491 117698732 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153543 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 217.25-87 chr9 14818948 14819273 + 1.25 NA intron (NR_163239, intron 15 of 37) intron (NR_163239, intron 15 of 37) -38679 NM_001370061 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 261.5-73 chrX 97366097 97366439 + 1.25 NA intron (NM_007309, intron 24 of 26) (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 198267 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 202.75-102 chr6 122187419 122187639 + 1.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -212022 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 252.75-80 chrX 120716653 120716903 + 1.25 NA Intergenic LTR16D1|LTR|ERVL -86628 NM_152692 29071 Hs.643920 NM_152692 ENSG00000171155 C1GALT1C1 C1GALT2|C38H2-L1|COSMC|HSPC067|MST143|TNPS C1GALT1 specific chaperone 1 protein-coding 273.5-58 chr5 16965450 16965760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29317 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 316.25-7 chr16 87449039 87449505 + 1.25 NA intron (NM_015144, intron 2 of 12) intron (NM_015144, intron 2 of 12) 42582 NM_015144 23174 Hs.156231 NM_015144 ENSG00000140948 ZCCHC14 BDG-29|BDG29 zinc finger CCHC-type containing 14 protein-coding 269.5-54 chr7 41709214 41709467 + 1.25 NA intron (NR_027118, intron 1 of 3) intron (NR_027118, intron 1 of 3) -6250 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 330.5-25 chr5 126124294 126124570 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55145 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 189.5-10 chr1 119945383 119945739 + 1.25 NA intron (NM_001200001, intron 17 of 21) L1MEc|LINE|L1 -49046 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 284-8 chr12 34423849 34424362 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 401609 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 193-42 chr2 124325155 124325394 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 299987 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 237.5-71 chr4 89385136 89385383 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -77459 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 386.5-8 chr14 44947038 44947964 + 1.25 NA intron (NM_017658, intron 1 of 4) intron (NM_017658, intron 1 of 4) 13984 NM_001308112 54813 Hs.550906 NM_017658 ENSG00000179454 KLHL28 BTBD5 kelch like family member 28 protein-coding 318-6 chr12 42864266 42864560 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 172197 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 206-46 chr20 17606928 17607115 + 1.25 NA intron (NM_001011546, intron 4 of 4) intron (NM_001011546, intron 4 of 4) 36946 NM_006870 11034 Hs.304192 NM_006870 ENSG00000125868 DSTN ACTDP|ADF|HEL32|bA462D18.2 destrin, actin depolymerizing factor protein-coding 213.25-51 chr4 137232662 137232938 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20001 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 210.5-9 chr1 182352572 182352807 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38628 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 282.5-41 chr3 79271897 79272200 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -139679 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 209.5-29 chr12 56126675 56126892 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001303124, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001303124, exon 3 of 3) -1419 NM_015292 23344 Hs.632729 NM_015292 ENSG00000139641 ESYT1 FAM62A|MBC2 extended synaptotagmin 1 protein-coding 243.75-69 chr5 104847007 104847345 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -252298 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 267.75-27 chr2 42984850 42985381 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 54428 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 327-26 chr6 80508412 80508847 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 401958 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 151.75-156 chr8 130666272 130666481 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -222702 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 317.5-6 chr15 49859081 49859511 + 1.25 NA non-coding (NR_073598, exon 29 of 29) non-coding (NR_073598, exon 29 of 29) 238248 NM_001144955 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 166-98 chr5 57080253 57080500 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -93572 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 184-83 chr6 168268150 168268377 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 25325 NR_110870 101929420 Hs.571211 NR_110870 ENSG00000234647 LOC101929420 - uncharacterized LOC101929420 ncRNA 250-8 chr12 51336659 51337162 + 1.25 NA intron (NM_001971, intron 6 of 7) L2c|LINE|L2 9769 NM_001971 1990 Hs.348395 NM_001971 ENSG00000139610 CELA1 ELA1 chymotrypsin like elastase 1 protein-coding 215.75-85 chr6 49155930 49156156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 307210 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 223.75-70 chr5 119964085 119964559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 334763 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 306.5-12 chr14 24903870 24904258 + 1.25 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) intron (NM_001351943, intron 3 of 6) 144936 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 286.5-43 chr3 89954277 89954615 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 846825 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 295.5-21 chr18 35484633 35485059 + 1.25 NA intron (NM_194281, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 12762 NM_001308064 125476 Hs.464903 NM_194281 ENSG00000153391 INO80C C18orf37|IES6|hIes6 INO80 complex subunit C protein-coding 261.75-18 chr18 4591173 4591497 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -136028 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 133.5-144 chr21 26139733 26139899 + 1.25 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) AluSc|SINE|Alu 574 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 238.75-4 chr10 52979624 52980031 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -208127 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 336.5-26 chr6 88458708 88459130 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80450 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 128.5-135 chr22 27856080 27856213 + 1.25 NA intron (NM_001284278, intron 10 of 11) intron (NM_001284278, intron 10 of 11) -54390 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 261.75-56 chrX 70555005 70555369 + 1.25 NA intron (NM_001003811, intron 26 of 30) intron (NM_001003811, intron 26 of 30) -99193 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-63 chr16 47346545 47346686 + 1.25 NA intron (NM_030790, intron 8 of 17) L1MA6|LINE|L1 114448 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 250.25-43 chr7 158037740 158038138 + 1.25 NA intron (NM_130843, intron 10 of 21) L1M5|LINE|L1 183354 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 167.25-96 chr20 17263733 17263976 + 1.25 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 36814 NM_002594 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 305-5 chr10 73287893 73288289 + 1.25 NA intron (NM_001367801, intron 20 of 27) AluSx1|SINE|Alu 35350 NR_134459 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 305.25-18 chr16 82221333 82221792 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -51338 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 268-16 chr12 25798908 25799240 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 75005 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 236-7 chr10 98417533 98417837 + 1.25 NA exon (NM_001322477, exon 20 of 20) exon (NM_001322477, exon 20 of 20) -2503 NM_032709 84795 Hs.238303 NM_032709 ENSG00000119943 PYROXD2 C10orf33|FP3420|YUEF pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 protein-coding 120.75-173 chr9 20763346 20763479 + 1.25 NA intron (NM_017794, intron 8 of 45) FAM|SINE|Alu -23515 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 293-22 chr3 89978617 89978994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 871184 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 516.75-3 chr2 109463420 109464068 + 1.25 NA intron (NM_001099289, intron 8 of 9) intron (NM_001099289, intron 8 of 9) 149923 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 173-35 chr12 48048037 48048226 + 1.25 NA intron (NR_051992, intron 15 of 18) intron (NR_051992, intron 15 of 18) -43655 NM_001844 1280 Hs.408182 NM_001844 ENSG00000139219 COL2A1 ANFH|AOM|COL11A3|SEDC|STL1 collagen type II alpha 1 chain protein-coding 248.75-53 chr5 174741199 174741550 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10360 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 220.5-95 chr5 12751964 12752197 + 1.25 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 84221 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 115.75-68 chr14 100957110 100957266 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_003198) promoter-TSS (NR_003198) 22 NR_003198 767582 NR_003198 ENSG00000201263 SNORD114-6 14q(II-6) small nucleolar RNA, C/D box 114-6 snoRNA 189.25-92 chr4 90719591 90719793 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 6 of 7) L1MC3|LINE|L1 484661 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 285.25-41 chr8 131225515 131226025 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -184861 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 131.5-151 chr3 48343290 48343424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15016 NM_001080525 646424 Hs.257687 NM_001080525 ENSG00000229453 SPINK8 - serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (putative) protein-coding 211.75-53 chr20 20871826 20872095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -159316 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 277.75-32 chr7 80601900 80602249 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001001547) promoter-TSS (NM_001001547) -133 NM_001371074 252.5-81 chr8 100366440 100366792 + 1.25 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -16147 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 230.25-68 chr5 62267908 62268256 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38080 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 231.25-66 chr6 49647529 49647723 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10752 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 153-96 chr3 105348817 105349011 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17799 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 174.75-9 chr1 221113749 221113955 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 222444 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 270.25-50 chrX 139405632 139405908 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -41049 NR_028597 6719 Hs.730315 NR_028597 SRD5A1P1 SRD5AP1 steroid 5 alpha-reductase 1 pseudogene 1 pseudo 147-60 chr18 11274901 11275112 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -126244 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 235-20 chr14 85478277 85478628 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -51573 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 164.75-32 chr11 103851709 103851931 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1914 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 375.25-3 chr2 118366987 118367607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -180911 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 312.75-19 chr2 233291469 233291876 + 1.25 NA intron (NM_030803, intron 14 of 17).2 intron (NM_030803, intron 14 of 17).2 2996 NR_003006 677772 Hs.689637 NR_003006 ENSG00000251791 SCARNA6 U88 small Cajal body-specific RNA 6 ncRNA 232-60 chr4 108355613 108355819 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 183596 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 229-47 chr3 1593267 1593567 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 500393 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 263.25-63 chrX 16975828 16976166 + 1.25 NA intron (NM_001080975, intron 1 of 17) L1MB4|LINE|L1 29339 NM_001080975 9185 Hs.186810 NM_004726 ENSG00000169891 REPS2 POB1 RALBP1 associated Eps domain containing 2 protein-coding 305-32 chr6 121229810 121230075 + 1.25 NA intron (NR_104452, intron 20 of 35) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 104538 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 239-56 chr7 84681119 84681455 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 148811 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 295.5-62 chr8 127078978 127079364 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_109833) promoter-TSS (NR_109833) -703 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 162.25-148 chr6 169402980 169403132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -148942 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 179.5-170 chr7 67787672 67787817 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -232509 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 166.25-43 chr14 51561530 51561744 + 1.25 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) intron (NR_047477, intron 2 of 3) 38315 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 179.75-124 chr7 40720381 40720603 + 1.25 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 259447 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 185.25-8 chr10 51533629 51533900 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 165831 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 264-57 chr6 50190563 50190808 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -140756 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 275.5-55 chr5 153521163 153521578 + 1.25 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) intron (NM_001258020, intron 3 of 16) 29198 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 200.75-74 chr4 67648902 67649225 + 1.25 NA intron (NM_018227, intron 14 of 32) intron (NM_018227, intron 14 of 32) 52092 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 114-151 chr7 24319742 24319853 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 35607 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 175-16 chr10 62317665 62317858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48917 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 366.25-11 chr3 190234023 190234690 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88090 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 194.5-98 chr3 196234867 196235112 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001312673, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001312673, exon 9 of 9) 18455 NM_152672 200931 Hs.630585 NM_152672 ENSG00000163959 SLC51A OSTA|OSTalpha solute carrier family 51 alpha subunit protein-coding 246-62 chr8 60526419 60526732 + 1.25 NA intron (NM_001242644, intron 1 of 6) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 9588 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 270.5-46 chr3 188458990 188459286 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) intron (NM_001167672, intron 2 of 9) 109528 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 297.75-19 chr2 189153560 189154001 + 1.25 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) -20669 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 380-17 chr5 5068912 5069483 + 1.25 NA TTS (NR_134266) TTS (NR_134266) 9114 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 165-122 chr6 142458810 142459062 + 1.25 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 156929 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 178.25-11 chr10 90349232 90349491 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 191444 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 136-9 chr1 232538897 232539138 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23409 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 174.5-196 chr9 92025242 92025543 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -75164 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 212-48 chr20 39841093 39841328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -163251 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 202.75-9 chr1 222282042 222282389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 265889 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 291.5-10 chr11 108736770 108737150 + 1.25 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 71891 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 178.5-161 chr6 160650660 160650837 + 1.25 NA intron (NM_005577, intron 1 of 38) intron (NM_005577, intron 1 of 38) 13511 NM_005577 4018 Hs.520120 NM_005577 ENSG00000198670 LPA AK38|APOA|LP lipoprotein(a) protein-coding 167.75-68 chr2 14562769 14562994 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69836 NM_145175 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 212.5-36 chr16 24881171 24881432 + 1.25 NA intron (NR_147940, intron 7 of 14) AluSx1|SINE|Alu 35070 NM_052944 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 248-62 chr6 55784041 55784463 + 1.25 NA intron (NM_001329754, intron 3 of 5) intron (NM_001329754, intron 3 of 5) 91338 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 182.25-62 chr2 44212499 44212655 + 1.25 NA intron (NM_177969, intron 2 of 4) L1MEg|LINE|L1 43702 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 219-40 chr15 96386441 96386960 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 52935 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 160.75-10 chr1 213828404 213828567 + 1.25 NA intron (NR_037850, intron 5 of 5) intron (NR_037850, intron 5 of 5) -96264 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 146.75-111 chr4 57948183 57948335 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 522387 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 159.75-65 chr18 63460480 63460682 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16377 NM_002639 5268 Hs.55279 NM_002639 ENSG00000206075 SERPINB5 PI5|maspin serpin family B member 5 protein-coding 179.5-179 chr8 76804377 76804642 + 1.25 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -121234 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 236.5-103 chr9 35524083 35524326 + 1.25 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu -14428 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 273-58 chr8 136587589 136587808 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1ME3F|LINE|L1 56900 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 163.25-151 chr9 79291311 79291457 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -145718 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 188.5-97 chr3 9504447 9504640 + 1.25 NA intron (NM_198560, intron 3 of 3) L1ME3F|LINE|L1 49279 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 266.25-46 chr8 75060890 75061265 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 60922 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 180.25-69 chr3 36788984 36789147 + 1.25 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 33435 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 190.25-11 chr1 224232888 224233170 + 1.25 NA intron (NM_002533, intron 21 of 22) intron (NM_002533, intron 21 of 22) 13416 NR_110668 101927164 Hs.710128 NR_110668 ENSG00000237101 LOC101927164 - uncharacterized LOC101927164 ncRNA 197.25-32 chr15 63430434 63430729 + 1.25 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu 40351 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 187-15 chr10 56809965 56810181 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -448800 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 125.5-246 chr8 40293077 40293333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 50158 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 193.25-119 chr8 137764749 137765190 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 318576 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 120.25-183 chr6 57068608 57068744 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21354 NM_015555 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 265.5-23 chr14 57162837 57163088 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105943 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 135-200 chr9 121709639 121709785 + 1.25 NA intron (NM_032552, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR -33073 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 223-32 chr17 66343724 66343992 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 41245 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 274-35 chr7 41148277 41148572 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 46820 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 242.5-29 chr14 89152914 89153179 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 264187 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 134.75-229 chr8 133951371 133951573 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 64976 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 191.25-84 chr5 31112678 31112943 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80876 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 191.25-82 chr5 6057044 6057324 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 280108 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 146-10 chr1 217923218 217923376 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 30397 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 226-12 chr12 31407478 31407818 + 1.25 NA intron (NM_144973, intron 14 of 20) intron (NM_144973, intron 14 of 20) -38347 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 338.25-31 chr8 122100402 122100788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -459155 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 215.25-10 chr10 123409797 123410010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 255501 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 165.5-176 chr7 19443695 19443885 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 261646 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 195.25-21 chr12 727423 727613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25061 NM_018979 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 127.75-15 chr1 81318014 81318197 + 1.25 NA intron (NM_001366008, intron 1 of 26) intron (NM_001366008, intron 1 of 26) 11710 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 176-19 chr12 104331345 104331542 + 1.25 NA intron (NM_001093771, intron 13 of 16) intron (NM_001093771, intron 13 of 16) 27704 NM_001008394 493861 Hs.659857 NM_001008394 ENSG00000255150 EID3 NS4EB|NSE4B|NSMCE4B EP300 interacting inhibitor of differentiation 3 protein-coding 202.25-54 chr3 164236219 164236462 + 1.25 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -64784 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 202-32 chr2 80498073 80498297 + 1.25 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 184806 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 270.5-6 chr10 16652614 16652939 + 1.25 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) AluJb|SINE|Alu -130897 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 143.25-162 chr6 153327232 153327440 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -196054 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 177.25-2 chr1 74127914 74128150 + 1.25 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) L1MA3|LINE|L1 70144 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 199.75-74 chr4 164594121 164594383 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -159879 NM_001352885 100505989 Hs.328236 NM_001352885 ENSG00000248771 SMIM31 LINC01207 small integral membrane protein 31 protein-coding 126.25-124 chr3 159986200 159986381 + 1.25 NA intron (NR_108088, intron 9 of 9) AluJr|SINE|Alu -2545 NM_000882 3592 Hs.673 NM_000882 ENSG00000168811 IL12A CLMF|IL-12A|NFSK|NKSF1|P35 interleukin 12A protein-coding 192.5-18 chr10 78357420 78357729 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 90232 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 167.25-130 chr5 115562806 115563009 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18132 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 260-26 chr4 46799732 46800042 + 1.25 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) L1PA15|LINE|L1 109358 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 262.25-9 chr11 27453424 27453810 + 1.25 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 -18114 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 171.25-77 chr2 88668350 88668518 + 1.25 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -23239 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 264-51 chr5 97079439 97079718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 63033 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 204.75-125 chr9 32362197 32362503 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -22253 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 209.75-109 chr9 88673711 88673980 + 1.25 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 72060 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 315.25-21 chr22 33715641 33715937 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) intron (NM_133642, intron 2 of 14) -9197 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 267-29 chr20 15026051 15026428 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -96721 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 293-16 chr20 49010707 49011118 + 1.25 NA intron (NM_006420, intron 27 of 38) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 35144 NR_110624 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 216.75-30 chr17 60712915 60713197 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) LTR48B|LTR|ERV1 35205 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 225.25-80 chr7 86711059 86711465 + 1.25 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 67348 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 369-11 chr3 124761033 124761752 + 1.25 NA TTS (NM_001354765) TTS (NM_001354765) 28953 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 156.75-128 chr4 177833793 177834013 + 1.25 NA intron (NR_108092, intron 1 of 1) intron (NR_108092, intron 1 of 1) 74033 NR_108093 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 239-5 chr1 114545908 114546227 + 1.25 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -34864 NM_015906 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 149.5-55 chr14 37416204 37416388 + 1.25 NA intron (NM_138731, intron 11 of 13) intron (NM_138731, intron 11 of 13) 178953 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 125.75-99 chr2 129444232 129444398 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -170424 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 346.5-28 chr7 32280209 32280585 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 18931 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 273-9 chr10 49478605 49479059 + 1.25 NA intron (NM_001346440, intron 10 of 20) intron (NM_001346440, intron 10 of 20) 45449 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 217-64 chr4 148370051 148370309 + 1.25 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 72234 NR_148974 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 244.75-26 chr19 28567191 28567433 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L2c|LINE|L2 -39376 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 237.25-62 chr5 76677826 76678113 + 1.25 NA intron (NM_006633, intron 28 of 35) intron (NM_006633, intron 28 of 35) -34434 NR_028375 100302746 NR_028375 NCRUPAR NCRNA00193|ncR-uPAR non-protein coding RNA, upstream of F2R/PAR1 ncRNA 221.75-43 chr22 28394941 28395181 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -64808 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 192.5-15 chr10 53423658 53423957 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -652107 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 152.75-148 chr8 84892096 84892351 + 1.25 NA intron (NM_001287244, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 186296 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 396-8 chr2 176192838 176193290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4106 NR_033979 401022 Hs.98661 NR_033979 ENSG00000224189 HAGLR HOXD-AS1|MIR7704HG|Mdgt HOXD antisense growth-associated long non-coding RNA ncRNA 318.75-2 chr11 10989301 10989776 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 131321 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 213.75-87 chr5 35805619 35805857 + 1.25 NA intron (NM_024867, intron 34 of 36) L1ME4a|LINE|L1 -51153 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 268.25-27 chr20 445264 445549 + 1.25 NA intron (NR_111901, intron 2 of 9) intron (NR_111901, intron 2 of 9) 17127 NR_111901 128637 Hs.590876 NM_144628 ENSG00000125875 TBC1D20 C20orf140|WARBM4 TBC1 domain family member 20 protein-coding 215-41 chr2 70340196 70340558 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38310 NM_001329753 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 276.5-19 chr12 114360944 114361356 + 1.25 NA intron (NM_000192, intron 8 of 8) intron (NM_000192, intron 8 of 8) 44994 NM_181486 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 279.75-27 chr2 184884807 184885064 + 1.25 NA intron (NM_194250, intron 2 of 3) L1PA15|LINE|L1 282137 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 242.25-35 chr16 78863666 78863990 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 736909 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 127.5-177 chr4 104952275 104952471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -193502 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 154.25-38 chr12 129290530 129290769 + 1.25 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) L1ME3G|LINE|L1 82048 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 272.75-32 chr3 64689931 64690217 + 1.25 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) intron (NR_038264, intron 1 of 5) -2074 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 221.75-73 chr7 106035701 106036038 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001301161, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001301161, exon 18 of 18) 72605 NM_001301161 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 217.75-64 chr6 21290030 21290284 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 221735 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 251.75-72 chr7 13826211 13826487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 160165 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 201.75-89 chr6 159821487 159821732 + 1.25 NA TTS (NM_001271862) TTS (NM_001271862) 21333 NM_001271862 154197 Hs.349077 NM_173516 ENSG00000146453 PNLDC1 HsPNLDC1 PARN like, ribonuclease domain containing 1 protein-coding 274.25-5 chr1 177957040 177957461 + 1.25 NA intron (NR_151492, intron 19 of 22) L1ME4a|LINE|L1 12672 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 215-39 chr2 9661151 9661524 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30340 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 161.25-21 chr10 114377281 114377510 + 1.25 NA intron (NM_001351073, intron 1 of 19) intron (NM_001351073, intron 1 of 19) 27107 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 233.75-16 chr11 112442528 112442746 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39595 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 277-3 chr11 37468903 37469209 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -469545 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 293-34 chr6 89656864 89657170 + 1.25 NA intron (NM_014611, intron 90 of 101) intron (NM_014611, intron 90 of 101) -18270 NM_020466 57226 Hs.177275 NM_020466 ENSG00000083099 LYRM2 DJ122O8.2 LYR motif containing 2 protein-coding 502.25 chr1 92267038 92267767 + 1.25 NA intron (NR_135089, intron 11 of 17) MER3|DNA|hAT-Charlie 31585 NM_053274 11146 Hs.49105 NM_007070 ENSG00000174842 GLMN FAP|FAP48|FAP68|FKBPAP|GLML|GVM|VMGLOM glomulin, FKBP associated protein protein-coding 302.75-20 chr4 148917664 148917950 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 24571 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 116-64 chr17 41807812 41807922 + 1.25 NA exon (NM_006455, exon 5 of 8) exon (NM_006455, exon 5 of 8) 4082 NM_006455 10609 Hs.446459 NM_006455 ENSG00000141696 P3H4 LEPREL4|NO55|NOL55|SC65 prolyl 3-hydroxylase family member 4 (non-enzymatic) protein-coding 215.5-62 chr20 59389070 59389279 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88563 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 183.75-81 chr3 182680936 182681154 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -112459 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 193.75-108 chr6 157363111 157363504 + 1.25 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -17883 NM_024630 79683 Hs.596214 NM_024630 ENSG00000175048 ZDHHC14 NEW1CP zinc finger DHHC-type containing 14 protein-coding 240-50 chr5 53833252 53833534 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -13711 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 258.25-55 chr7 67808112 67808329 + 1.25 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -212033 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 231.5-56 chr20 14859052 14859398 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) L1PB2|LINE|L1 70293 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 260.75-62 chr8 64210403 64210806 + 1.25 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 157954 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 368.25-6 chr15 56665442 56665817 + 1.25 NA intron (NM_001002843, intron 15 of 20) intron (NM_001002843, intron 15 of 20) 68457 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 394.75-4 chr2 188511756 188512418 + 1.25 NA intron (NM_001252669, intron 4 of 8) intron (NM_001252669, intron 4 of 8) 214595 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 198.25-87 chr6 49944901 49945176 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 4406 NR_163261 403339 Hs.745543 NM_001166478 ENSG00000214643 DEFB133 - defensin beta 133 pseudo 234.25-47 chr3 93962963 93963204 + 1.25 NA intron (NM_001314077, intron 1 of 15) ERVL-E-int|LTR|ERVL 10998 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 123.75-152 chr5 157165895 157166054 + 1.25 NA exon (NM_130899, exon 1 of 2) exon (NM_130899, exon 1 of 2) 290 NM_130899 153745 Hs.666099 NM_130899 ENSG00000170613 FAM71B - family with sequence similarity 71 member B protein-coding 222-53 chr3 79552142 79552498 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 44433 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 164.25-158 chr8 135413512 135413685 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43858 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 136.5-2 chr1 35832959 35833078 + 1.25 NA intron (NR_146062, intron 11 of 19) AluSc8|SINE|Alu 25002 NM_017629 192670 Hs.744858 NM_017629 ENSG00000134698 AGO4 EIF2C4 argonaute RISC component 4 protein-coding 125.25-69 chr15 61426347 61426487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -197115 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 270.25-44 chr7 7154943 7155225 + 1.25 NA Intergenic (TCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27531 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 273.5-53 chr4 31099425 31099808 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR -71528 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 168.25-109 chr4 116587994 116588162 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 288353 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 184.75-21 chr12 58887621 58887865 + 1.25 NA intron (NM_153377, intron 8 of 18) intron (NM_153377, intron 8 of 18) 31803 NM_001136051 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 180.5-116 chr4 121827958 121828181 + 1.25 NA 3' UTR (NM_018190, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_018190, exon 18 of 18) -4186 NM_001237 890 Hs.58974 NM_001237 ENSG00000145386 CCNA2 CCN1|CCNA cyclin A2 protein-coding 217.25-61 chr4 154858193 154858491 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76837 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 358.5-9 chr16 53322468 53322799 + 1.25 NA intron (NM_001352157, intron 37 of 37) intron (NM_001352157, intron 37 of 37) 48579 NM_001347693 643802 Hs.451336 NM_001207030 LOC643802 - u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein MPP10-like protein-coding 285.25-24 chr4 43701680 43702231 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -209412 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 155-109 chr5 73263104 73263323 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61252 NR_134291 340090 Hs.434311 NR_134291 LOC340090 - uncharacterized LOC340090 ncRNA 339.25-26 chr8 140976354 140976728 + 1.25 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) intron (NM_001352719, intron 1 of 32) 24463 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 255-35 chr3 66849429 66849811 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -111284 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 162-14 chr10 54646046 54646282 + 1.25 NA intron (NR_134503, intron 4 of 5) intron (NR_134503, intron 4 of 5) -38207 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 300.5-30 chr21 22823002 22823361 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -256103 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 232.5-108 chr8 130981104 130981471 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 2 of 17) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 59622 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 212.75-100 chr8 132732952 132733374 + 1.25 NA intron (NM_144649, intron 5 of 9) intron (NM_144649, intron 5 of 9) 27419 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 283.5-8 chr11 16718994 16719235 + 1.25 NA intron (NM_001367872, intron 1 of 16) LTR37A|LTR|ERV1 19363 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 231.5-108 chrX 22615327 22615532 + 1.25 NA intron (NR_073010, intron 4 of 11) intron (NR_073010, intron 4 of 11) 342516 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 199.5-76 chr2 55071658 55071924 + 1.25 NA intron (NM_001321904, intron 2 of 9) intron (NM_001321904, intron 2 of 9) -20519 NM_001321859 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 195-70 chr5 129419708 129419886 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -22650 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 177.25-53 chr15 101018978 101019259 + 1.25 NA intron (NM_024652, intron 12 of 33) intron (NM_024652, intron 12 of 33) 99761 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 348.5-20 chr6 41263546 41263865 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 14328 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 186-93 chr8 138697816 138698030 + 1.25 NA intron (NM_152888, intron 32 of 64) intron (NM_152888, intron 32 of 64) -200193 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 116.25-13 chr1 225574063 225574162 + 1.25 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) intron (NM_001008493, intron 1 of 14) 79011 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 354-2 chr1 41119679 41120046 + 1.25 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 41570 NR_135092 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 115.25-181 chr7 24688665 24688784 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001303037, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001303037, exon 12 of 12) 68740 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 273.5-63 chr5 92306458 92306723 + 1.25 NA Intergenic MER104|DNA|TcMar-Tc2 -923273 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 171.25-2 chr1 84048044 84048210 + 1.25 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -29848 NM_002731 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 217.25-48 chr2 232130833 232131149 + 1.25 NA TTS (NM_001257282) TTS (NM_001257282) -41662 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 164.75-9 chr1 117792041 117792222 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 137490 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 195-35 chr16 83771784 83772038 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 10 of 12) intron (NM_001220489, intron 10 of 12) 32065 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 166-58 chr2 24476004 24476163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15171 NM_001362950 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 137-136 chr5 45775917 45776056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79606 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 167.25-105 chr3 61244909 61245193 + 1.25 NA intron (NM_001320900, intron 1 of 9) intron (NM_001320900, intron 1 of 9) 6401 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 239.25-51 chr2 146882499 146882733 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 295559 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 250.5-25 chr14 26051083 26051422 + 1.25 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu 502178 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 245.25-29 chr18 51529763 51529964 + 1.25 NA intron (NR_040074, intron 1 of 2) L1ME3F|LINE|L1 137821 NR_040074 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 253.25-9 chr11 6435329 6435706 + 1.25 NA intron (NM_000613, intron 7 of 9) AluJb|SINE|Alu 5470 NM_000613 3263 Hs.426485 NM_000613 ENSG00000110169 HPX HX hemopexin protein-coding 225.5-16 chr10 120213284 120213530 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 141816 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 213.25-22 chr16 25196102 25196463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20665 NM_001169 343 Hs.176658 NM_001169 ENSG00000103375 AQP8 AQP-8 aquaporin 8 protein-coding 141-45 chr14 55764246 55764396 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -1924 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 152-19 chr1 220821326 220821500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2858 NR_157260 106481171 NR_157260 RNU6ATAC35P - RNA, U6atac small nuclear 35, pseudogene pseudo 286.5-31 chr18 73805469 73805772 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 342214 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 202.75-61 chr2 198577866 198578307 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -202989 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 298-35 chr9 37592433 37592989 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001134484) promoter-TSS (NM_001134484) -72 NM_001134485 401505 Hs.130774 NM_001001790 ENSG00000175768 TOMM5 C9orf105|Tom5|bA613M10.3 translocase of outer mitochondrial membrane 5 protein-coding 122.75-65 chr17 44499980 44500184 + 1.25 NA intron (NM_001002909, intron 1 of 7) intron (NM_001002909, intron 1 of 7) 3324 NM_001304942 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 254-24 chr2 114831093 114831574 + 1.25 NA intron (NR_132105, intron 1 of 1) intron (NR_132105, intron 1 of 1) 2215 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 242.75-58 chr5 106144312 106144574 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 866571 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 241.5-68 chr3 108986124 108986398 + 1.25 NA intron (NM_014429, intron 22 of 27) intron (NM_014429, intron 22 of 27) -32382 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 208.5-10 chr10 61751770 61752099 + 1.25 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) intron (NM_173554, intron 4 of 6) 88973 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 119.75-47 chr12 62762533 62762684 + 1.25 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) LTR32|LTR|ERVL 158922 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 401.5-10 chr21 24178477 24179060 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 142609 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 328.25-6 chr13 96620434 96620742 + 1.25 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 193359 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 244.25-37 chr4 154474477 154474725 + 1.25 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) LTR16|LTR|ERVL 17198 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 168.75-81 chr20 36152863 36153094 + 1.25 NA intron (NR_147703, intron 2 of 3) intron (NR_147703, intron 2 of 3) -1762 NM_012156 2036 Hs.437422 NM_012156 ENSG00000088367 EPB41L1 4.1N|MRD11 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1 protein-coding 195.5-86 chr20 18390770 18391012 + 1.25 NA intron (NM_001367611, intron 17 of 20) intron (NM_001367611, intron 17 of 20) 11842 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 387-12 chr6 65205387 65206035 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L1PA15-16|LINE|L1 -95707 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 182-75 chr3 171719723 171720066 + 1.25 NA intron (NM_002662, intron 8 of 26) intron (NM_002662, intron 8 of 26) 90589 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 275.5-17 chr12 127905305 127905604 + 1.25 NA intron (NR_126452, intron 3 of 3) L1PB4|LINE|L1 -9956 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 203.5-117 chr6 19478397 19478712 + 1.25 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 28733 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 281-41 chr8 80462759 80463114 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22657 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 167.25-78 chr2 58940971 58941386 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) AluJb|SINE|Alu -276530 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 222-9 chr10 15672128 15672423 + 1.25 NA intron (NM_003638, intron 7 of 29) intron (NM_003638, intron 7 of 29) 47647 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 170-34 chr14 94785410 94785592 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14859 NR_144432 108868751 NR_144432 GSC-DT DIGIT GSC divergent transcript ncRNA 140.5-124 chr2 206764347 206764536 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001136194) promoter-TSS (NM_001136194) 887 NM_001039845 130752 Hs.147816 NM_206892 ENSG00000138400 MDH1B RP11-95H11 malate dehydrogenase 1B protein-coding 212.5-34 chr15 72150742 72150951 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 32443 NM_001172111 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 421-4 chr17 70831783 70832177 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 370199 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 197.5 chr1 51403735 51403984 + 1.25 NA intron (NM_001159969, intron 4 of 12) L2|LINE|L2 18236 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 160.75-36 chr13 35759766 35759958 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62135 NR_132115 100507114 Hs.236298 NR_132115 ENSG00000236036 LINC00445 - long intergenic non-protein coding RNA 445 ncRNA 113.5-132 chr2 199089194 199089316 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 368684 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 267.75-58 chr8 79893661 79894017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22102 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 135-135 chr5 10752825 10753103 + 1.25 NA intron (NM_004394, intron 1 of 3) intron (NM_004394, intron 1 of 3) 8270 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 339-7 chr13 92967575 92968039 + 1.25 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR -77534 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 336-29 chr8 107137649 107137950 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 198716 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 206.25-112 chr9 32477017 32477207 + 1.25 NA exon (NM_014314, exon 13 of 18) exon (NM_014314, exon 13 of 18) 49084 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 139.75-142 chr4 188981633 188981820 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 205069 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 174-5 chr1 218317220 218317384 + 1.25 NA intron (NM_016052, intron 4 of 4) intron (NM_016052, intron 4 of 4) -27982 NM_001135599 7042 Hs.133379 NM_003238 ENSG00000092969 TGFB2 G-TSF|LDS4|TGF-beta2 transforming growth factor beta 2 protein-coding 178.5-177 chr8 59051590 59051811 + 1.25 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 67447 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 342.25 chr1 112117264 112117699 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126945 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 189.25-63 chr2 217203660 217203909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -78949 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 227.25-42 chr2 49444151 49444345 + 1.25 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -289721 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 151.5-37 chr12 101373582 101373793 + 1.25 NA exon (NM_014503, exon 54 of 62) exon (NM_014503, exon 54 of 62) 34085 NM_001177 400 Hs.372616 NM_001177 ENSG00000120805 ARL1 ARFL1 ADP ribosylation factor like GTPase 1 protein-coding 126.75-144 chr22 35405954 35406068 + 1.25 NA intron (NM_006739, intron 4 of 16) AluSx1|SINE|Alu 5871 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 374.5-12 chr5 90728981 90729546 + 1.25 NA intron (NR_003149, intron 49 of 89) intron (NR_003149, intron 49 of 89) 170466 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 221.5-51 chr2 153875641 153876058 + 1.25 NA intron (NM_052917, intron 1 of 12) intron (NM_052917, intron 1 of 12) 3927 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 419.25-7 chr6 42638497 42638930 + 1.25 NA intron (NM_015255, intron 15 of 46) intron (NM_015255, intron 15 of 46) 74684 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 298-11 chr17 60579035 60579396 + 1.25 NA intron (NR_126009, intron 3 of 3) intron (NR_126009, intron 3 of 3) 14669 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 130.25-142 chr3 142413934 142414086 + 1.25 NA intron (NM_019001, intron 14 of 41) intron (NM_019001, intron 14 of 41) 34027 NM_019001 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 272.25-31 chr22 33284529 33284888 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 12 of 14) AluSc8|SINE|Alu 151961 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 252.75-30 chr2 74838781 74839094 + 1.25 NA intron (NM_000189, intron 1 of 17) intron (NM_000189, intron 1 of 17) 6282 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 154.75-101 chr3 160848369 160848543 + 1.25 NA intron (NM_001317911, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 6307 NM_001317912 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 275.75-21 chr2 16388139 16388391 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 277569 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 203-44 chr19 19133828 19134095 + 1.25 NA intron (NM_017814, intron 2 of 11) AluJb|SINE|Alu 4517 NM_017814 54929 Hs.631629 NM_017814 ENSG00000064545 TMEM161A AROS-29 transmembrane protein 161A protein-coding 156.5-201 chr9 4336702 4336921 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36743 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 240.75-54 chr3 165274241 165274439 + 1.25 NA intron (NR_125764, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 67380 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 146.75-42 chr14 62230730 62230904 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -90844 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 216.5-70 chr3 17336157 17336623 + 1.25 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 363630 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 246.25-50 chr4 80949266 80949560 + 1.25 NA intron (NM_152770, intron 5 of 5) intron (NM_152770, intron 5 of 5) -81295 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 167-47 chr16 35347569 35347719 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15772 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 297.5-23 chr2 25852394 25852802 + 1.25 NA intron (NM_018263, intron 1 of 11) L2|LINE|L2 -21697 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 236.25-44 chr2 59705618 59705990 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 488096 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 325.25-2 chr11 100956514 100956972 + 1.25 NA intron (NM_001367945, intron 14 of 25) intron (NM_001367945, intron 14 of 25) 22469 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 213.25-56 chr5 174657937 174658295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66466 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 266.25-39 chr6 53198026 53198476 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49410 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 137.5-149 chr21 32722964 32723200 + 1.25 NA intron (NM_203446, intron 2 of 32) intron (NM_203446, intron 2 of 32) 4839 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 140-32 chr12 59526392 59526515 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69576 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 181-97 chr6 84168538 84168737 + 1.25 NA intron (NM_001286206, intron 18 of 26) MER20B|DNA|hAT-Charlie 59006 NM_001286206 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 232.75-40 chr3 974406 974632 + 1.25 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -118505 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 240-65 chr8 122142920 122143153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 425608 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 243-10 chr10 91662815 91663038 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -29855 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 142.75-92 chr2 13666637 13666794 + 1.25 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -659702 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 624.5 chr20 31939730 31940740 + 1.25 NA intron (NR_148013, intron 14 of 16) L1ME4a|LINE|L1 11811 NM_030815 81572 Hs.435755 NM_030815 ENSG00000088356 PDRG1 C20orf126|PDRG p53 and DNA damage regulated 1 protein-coding 327.5-11 chr14 84674628 84675003 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -597117 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 353.5-23 chr9 89927042 89927397 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42197 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 299-23 chr22 26885292 26885904 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -17694 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 215.5-49 chr2 78908547 78908796 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117031 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 320.25-13 chr16 80505214 80505506 + 1.25 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -35374 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 240-6 chr1 182264361 182264653 + 1.25 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 49554 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 179.5-148 chr5 58296936 58297141 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 163048 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 270-26 chr2 121580719 121581108 + 1.25 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) intron (NM_015282, intron 2 of 38) 50033 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 262-13 chr12 43723101 43723476 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001098614, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001098614, exon 9 of 9) 35502 NM_031292 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 139.75-173 chr8 30865033 30865229 + 1.25 NA intron (NR_146525, intron 4 of 6) L1M1|LINE|L1 23575 NR_146525 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 209.25-94 chr5 109905928 109906221 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22892 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 329-15 chr17 33386019 33386330 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 -93186 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 164.5-215 chr8 130623901 130624046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -180299 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 264.5-61 chr8 71872649 71872992 + 1.25 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) L1MA4A|LINE|L1 -28324 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 273.25-25 chr4 111135502 111135798 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -275003 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 198-40 chr2 96405401 96405624 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69746 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 291.25-29 chr7 12198545 12198879 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12582 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 177.25 chr1 14837652 14837920 + 1.25 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu -86343 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 227.75-38 chr2 85860413 85860768 + 1.25 NA intron (NM_001354224, intron 3 of 7) intron (NM_001354224, intron 3 of 7) -6415 NM_001354247 8869 Hs.415117 NM_003896 ENSG00000115525 ST3GAL5 SATI|SIAT9|SIATGM3S|SPDRS|ST3Gal V|ST3GalV ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5 protein-coding 152.5-31 chr12 28852221 28852422 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -296957 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 189.25-50 chr18 13430520 13430738 + 1.25 NA intron (NM_181482, intron 3 of 5) L1ME3A|LINE|L1 -3095 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 267.5-41 chr2 217662050 217662341 + 1.25 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 94398 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 138-140 chr6 75249804 75250012 + 1.25 NA intron (NM_001865, intron 1 of 4) intron (NM_001865, intron 1 of 4) 390 NM_001366292 1347 Hs.70312 NM_001865 ENSG00000112695 COX7A2 COX7AL|COX7AL1|COXVIIAL|COXVIIa-L|VIIAL cytochrome c oxidase subunit 7A2 protein-coding 200.75-71 chr4 38720466 38720768 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -55989 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 186.25-121 chr8 117967276 117967459 + 1.25 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -46454 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 187.25-105 chr8 66822884 66823080 + 1.25 NA intron (NM_001204173, intron 8 of 18) intron (NM_001204173, intron 8 of 18) 47777 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 171.25-45 chr14 73614406 73614664 + 1.25 NA intron (NM_001365788, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 2018 NM_001365788 641372 Hs.122038 NM_001037162 ENSG00000205669 ACOT6 C14orf42|c14_5530 acyl-CoA thioesterase 6 protein-coding 184.75-105 chr8 70716757 70716953 + 1.25 NA intron (NM_001287259, intron 5 of 5) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 47516 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 189-63 chr2 168810973 168811149 + 1.25 NA intron (NM_052946, intron 1 of 14) intron (NM_052946, intron 1 of 14) 8464 NM_052946 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 255.5-24 chr14 42656913 42657142 + 1.25 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 1050171 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 173.5-152 chr7 78079346 78079707 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 19 of 20) intron (NM_001301128, intron 19 of 20) 239396 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 323-7 chr14 52471860 52472178 + 1.25 NA intron (NM_001160047, intron 14 of 20) intron (NM_001160047, intron 14 of 20) 80486 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 245.75-67 chr9 107054904 107055142 + 1.25 NA intron (NR_126029, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 47965 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 180.5-35 chr14 28589722 28589989 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 175464 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 242.75-5 chr1 203338707 203338954 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 12292 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 127.25-62 chr15 61826008 61826162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 96167 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 158-25 chr10 99657186 99657535 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2149 NM_020354 57089 Hs.28326 NM_020354 ENSG00000198018 ENTPD7 LALP1 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 protein-coding 188.5-18 chr11 21434170 21434461 + 1.25 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L1MA5|LINE|L1 -758770 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 280.75 chr1 22077049 22077413 + 1.25 NA intron (NM_001039802, intron 2 of 6) intron (NM_001039802, intron 2 of 6) 24522 NM_001791 998 Hs.467637 NM_001791 ENSG00000070831 CDC42 CDC42Hs|G25K|TKS cell division cycle 42 protein-coding 303.25-4 chr11 28462590 28462903 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14802 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 126-72 chr16 82626698 82626968 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001257) promoter-TSS (NM_001257) -136 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 231.25-80 chrX 101020951 101021280 + 1.25 NA exon (NM_024917, exon 10 of 14) exon (NM_024917, exon 10 of 14) 30996 NM_024917 79979 Hs.496501 NM_024917 ENSG00000188917 TRMT2B CXorf34|dJ341D10.3 tRNA methyltransferase 2 homolog B protein-coding 243.75-31 chr16 4160253 4160640 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -44004 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 189.5-148 chr8 109661407 109661655 + 1.25 NA intron (NM_001099743, intron 1 of 7) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -12628 NM_001099748 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 314.25-24 chr7 117843049 117843422 + 1.25 NA intron (NM_001363351, intron 2 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger 28985 NM_001363349 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 258-22 chr2 12778161 12778473 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40950 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 206.5-7 chr10 22844845 22845057 + 1.25 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -83073 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 361.25-5 chr2 44480074 44480534 + 1.25 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118357 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 265.75-42 chr2 212898012 212898429 + 1.25 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -28037 NR_039935 100616267 NR_039935 ENSG00000266354 MIR4776-1 mir-4776-1 microRNA 4776-1 ncRNA 113.25-136 chr5 67753129 67753281 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -40008 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 198.75-70 chr4 149183300 149183483 + 1.25 NA intron (NR_125887, intron 2 of 12) L1ME4a|LINE|L1 29096 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 259.75-4 chr10 120511054 120511409 + 1.25 NA intron (NM_001318169, intron 2 of 2) intron (NM_001318169, intron 2 of 2) 54277 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 247.75-30 chr19 27883029 27883408 + 1.25 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -89278 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 279-32 chr4 90295266 90295542 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) L1ME3G|LINE|L1 60373 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 163-44 chr16 35575163 35575374 + 1.25 NA Intergenic CpG -68098 NR_034018 100130700 Hs.97712 NR_034018 TP53TG3HP - TP53 target 3 family member H, pseudogene pseudo 129-171 chr7 64715414 64715565 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 36425 NR_106898 102465505 NR_106898 ENSG00000275667 MIR6839 hsa-mir-6839 microRNA 6839 ncRNA 191-78 chr8 77305616 77305855 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -144962 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 112.25-22 chr10 81985986 81986136 + 1.25 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) Charlie9|DNA|hAT-Charlie 108374 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 220-19 chr14 40207209 40207453 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -747380 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 252.25-39 chr3 165889011 165889317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51741 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 252-7 chr1 208565706 208566206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -162732 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 367-13 chr3 189531597 189531999 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -64948 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 205.25-62 chr20 58720802 58720999 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 28100 NM_024663 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 165.75-114 chr3 134637709 134638071 + 1.25 NA intron (NM_001350860, intron 1 of 7) intron (NM_001350860, intron 1 of 7) 13128 NM_001366276 339855 Hs.146730 NM_178554 ENSG00000174611 KY MFM7 kyphoscoliosis peptidase protein-coding 204.5-97 chr3 183859538 183859808 + 1.25 NA intron (NM_001324437, intron 4 of 7) intron (NM_001324437, intron 4 of 7) 25207 NM_001037639 55486 Hs.478469 NM_018622 ENSG00000175193 PARL PRO2207|PSARL|PSARL1|PSENIP2|RHBDS1 presenilin associated rhomboid like protein-coding 385.75-7 chr16 63285681 63286169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1249487 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 156.25-79 chr2 208265552 208265760 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_015040) promoter-TSS (NM_015040) -599 NM_015040 200576 Hs.744997 NM_015040 ENSG00000115020 PIKFYVE CFD|FAB1|HEL37|PIP5K|PIP5K3|ZFYVE29 phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing protein-coding 239-55 chr7 43492551 43492854 + 1.25 NA intron (NM_001287059, intron 16 of 27) intron (NM_001287059, intron 16 of 27) 29840 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 323.25-23 chr6 34677282 34677691 + 1.25 NA intron (NM_022758, intron 1 of 3) intron (NM_022758, intron 1 of 3) -18668 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 207.75-25 chr12 9237417 9237691 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1997 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 203.75-11 chr10 70448521 70448692 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001329906) promoter-TSS (NM_001329906) -658 NM_001329906 4838 Hs.370414 NM_018055 ENSG00000156574 NODAL HTX5 nodal growth differentiation factor protein-coding 199.75-48 chr2 112253875 112254051 + 1.25 NA intron (NM_032494, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 1079 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 132.25-169 chr6 131218145 131218336 + 1.25 NA intron (NM_016377, intron 6 of 7) L1ME3G|LINE|L1 -32164 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 323.5-26 chr6 120702059 120702379 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 632261 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 355-2 chr1 104672467 104672955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 599688 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 296.5-21 chr20 59205721 59206116 + 1.25 NA intron (NM_178457, intron 2 of 4) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 14898 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 238-57 chr5 127161863 127162118 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -88498 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 383.5-5 chr12 48365298 48365664 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -14235 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 173.75-163 chrX 65124043 65124247 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -89404 NM_001178032 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 167-64 chr2 144971927 144972278 + 1.25 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 304135 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 185.5-112 chr3 132623778 132623968 + 1.25 NA intron (NR_037804, intron 34 of 44) HAL1ME|LINE|L1 23736 NM_178445 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 164-128 chr7 85489627 85489842 + 1.25 NA TTS (NR_134240) TTS (NR_134240) 68612 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 301.5-2 chr1 40246710 40247052 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1056 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 121.5-73 chr13 113478163 113478412 + 1.25 NA intron (NM_001014283, intron 3 of 6) L1ME3B|LINE|L1 12424 NM_001014283 55208 Hs.682987 NM_018185 ENSG00000150401 DCUN1D2 C13orf17 defective in cullin neddylation 1 domain containing 2 protein-coding 236.25-91 chr9 29049072 29049502 + 1.25 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MA1|LINE|L1 -160332 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 262.5-58 chr4 146279825 146280055 + 1.25 NA intron (NM_001029998, intron 10 of 11) intron (NM_001029998, intron 10 of 11) 65402 NM_001354631 345051 Hs.170876 NM_001354631 ENSG00000250673 REELD1 - reeler domain containing 1 protein-coding 209.25-116 chr8 144884182 144884363 + 1.25 NA intron (NM_001363105, intron 4 of 4) AluSx3|SINE|Alu 16033 NM_001363103 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 300.5-45 chr7 27714305 27714689 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -24876 NM_001206901 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 225.5-96 chr6 74925155 74925526 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203442 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 297.25-26 chr5 141969385 141969773 + 1.25 NA intron (NM_183401, intron 1 of 8) intron (NM_183401, intron 1 of 8) 474 NM_183398 9604 Hs.483616 NM_004290 ENSG00000013561 RNF14 ARA54|HFB30|HRIHFB2038|TRIAD2 ring finger protein 14 protein-coding 183.25-22 chr11 67193826 67194061 + 1.25 NA intron (NR_027473, intron 5 of 20) AluJr|SINE|Alu -46071 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 257-30 chr20 6798398 6798775 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30900 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 138.5-86 chr18 8892461 8892622 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 175160 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 256.75-4 chr10 52562449 52562837 + 1.25 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) -92110 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 464.75 chr17 81576297 81577136 + 1.25 NA intron (NM_001369698, intron 12 of 16) L1M2|LINE|L1 717 NR_130139 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 183.25-82 chr5 41579755 41579998 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -69275 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 215.75-97 chr8 76485809 76486061 + 1.25 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) intron (NR_105006, intron 3 of 5) 79281 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 229.75-32 chr2 76957235 76957578 + 1.25 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MB1|LINE|L1 -28559 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 360.25 chr1 38927595 38928049 + 1.25 NA intron (NM_017821, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 1697 NM_001304746 54933 Hs.524626 NM_017821 ENSG00000158315 RHBDL2 RRP2 rhomboid like 2 protein-coding 327.5-22 chr4 56484486 56484914 + 1.25 NA intron (NR_151856, intron 9 of 19) intron (NR_151856, intron 9 of 19) 17083 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 170.75-28 chr13 73610193 73610459 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 46082 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 159.5-142 chr3 44976734 44977090 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_146163) promoter-TSS (NR_146163) 663 NR_023353 23016 Hs.719958 NM_015004 ENSG00000075914 EXOSC7 EAP1|RRP42|Rrp42p|hRrp42p|p8 exosome component 7 protein-coding 181.75-93 chr4 32975742 32975904 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 624785 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 198.75-46 chr2 107361273 107361489 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11856 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 270-50 chr7 108956311 108956691 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71914 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 157.75-81 chr2 33859588 33859758 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 2 of 5) intron (NR_126403, intron 2 of 5) -131456 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 174.5-151 chr5 107705354 107705621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -34550 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 140-175 chr9 28042401 28042597 + 1.25 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -468633 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 232.5-64 chr22 19619184 19619483 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52494 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 278.75-33 chr6 8528429 8528680 + 1.25 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) intron (NR_038980, intron 2 of 4) 92931 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 221.5-101 chr8 116293438 116293629 + 1.25 NA intron (NR_046215, intron 1 of 13) intron (NR_046215, intron 1 of 13) 31526 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 169.5-120 chr4 40026180 40026521 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -30500 NM_018177 55728 Hs.391463 NM_018177 ENSG00000078177 N4BP2 B3BP NEDD4 binding protein 2 protein-coding 230.75-51 chr4 91194899 91195184 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 960010 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 189.75-73 chr3 85256197 85256403 + 1.25 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -129410 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 205-66 chr5 175607250 175607532 + 1.25 NA Intergenic MER97b|DNA|hAT-Tip100 -50680 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 119.75-195 chr8 47527342 47527472 + 1.25 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) L1MC2|LINE|L1 -126681 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 210.75-36 chr2 23212819 23213134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -172203 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 378.25-5 chr20 14043155 14043582 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) MER21A|LTR|ERVL 47852 NM_001351661 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 347.5-14 chr3 26075908 26076388 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -202453 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 458.5-4 chr2 38925170 38925719 + 1.25 NA intron (NM_001145451, intron 2 of 15) intron (NM_001145451, intron 2 of 15) 6081 NM_001145451 100271715 Hs.99841 NM_001145451 ENSG00000214694 ARHGEF33 - Rho guanine nucleotide exchange factor 33 protein-coding 176.5-166 chr8 50553172 50553368 + 1.25 NA intron (NR_135795, intron 12 of 18) intron (NR_135795, intron 12 of 18) 389139 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 228-24 chr12 113883847 113884098 + 1.25 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) L1MC4|LINE|L1 82353 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 132-136 chr5 66177886 66178027 + 1.25 NA intron (NM_139168, intron 12 of 12) intron (NM_139168, intron 12 of 12) 31490 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 134.25-164 chr6 148933425 148933598 + 1.25 NA intron (NM_005715, intron 2 of 7) intron (NM_005715, intron 2 of 7) 31173 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 136.5-94 chr18 31225904 31226025 + 1.25 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -63108 NM_024421 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 177.75-69 chr2 68940033 68940264 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 12745 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 136-148 chr8 74660492 74660665 + 1.25 NA intron (NR_033830, intron 2 of 5) intron (NR_033830, intron 2 of 5) -45115 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 232.5-62 chr21 24949712 24949983 + 1.25 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 109297 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 201.5-53 chr14 55281727 55281899 + 1.25 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 9659 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 229.75-62 chr5 76869972 76870381 + 1.25 NA 5' UTR (NM_130772, exon 2 of 5) 5' UTR (NM_130772, exon 2 of 5) 20162 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 206.5-147 chr9 104247119 104247362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22989 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 225.75-7 chr1 173490860 173491219 + 1.25 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 13704 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 330.25-24 chr7 87444721 87445287 + 1.25 NA intron (NM_018849, intron 9 of 27) intron (NM_018849, intron 9 of 27) 30676 NM_000443 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 332.75-17 chr3 117729926 117730302 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39189 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 218.5-73 chr3 12645428 12645663 + 1.25 NA intron (NM_001354691, intron 1 of 16) intron (NM_001354691, intron 1 of 16) 17963 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 125.75-146 chr5 17147939 17148069 + 1.25 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) intron (NR_027253, intron 2 of 2) 7988 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 171.75-137 chr8 47172898 47173123 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -16297 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 218-4 chr1 156416805 156417010 + 1.25 NA intron (NM_006365, intron 2 of 6) intron (NM_006365, intron 2 of 6) 3522 NR_029691 407046 NR_029691 ENSG00000207933 MIR9-1 MIRN9-1|hsa-mir-9-1|miRNA9-1|mir-9-1 microRNA 9-1 ncRNA 193.75-71 chr2 199422017 199422323 + 1.25 NA intron (NR_134967, intron 3 of 4) L1ME4a|LINE|L1 35769 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 180.5-60 chr17 64101491 64101672 + 1.25 NA intron (NM_001433, intron 1 of 21) intron (NM_001433, intron 1 of 21) 28563 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 309.25-8 chr13 50488811 50489189 + 1.25 NA intron (NR_109974, intron 4 of 6) L1MA10|LINE|L1 38449 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-156 chr3 193216584 193216770 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -24545 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 328.75-3 chr14 53565680 53566137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 382576 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 414-12 chr3 101814765 101815469 + 1.25 NA intron (NM_001348997, intron 6 of 6) intron (NM_001348997, intron 6 of 6) -12873 NM_001005474 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 183-59 chr2 241405288 241405527 + 1.25 NA intron (NM_014808, intron 4 of 26) intron (NM_014808, intron 4 of 26) 49122 NM_001282984 9855 Hs.726316 NM_014808 ENSG00000006607 FARP2 FIR|FRG|PLEKHC3 FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 protein-coding 128-39 chr13 108027003 108027163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -159587 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 198.75-85 chr6 53299200 53299467 + 1.25 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) intron (NM_001242830, intron 1 of 6) 22340 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 145.25-80 chr2 183155819 183156060 + 1.25 NA intron (NM_138285, intron 5 of 8) intron (NM_138285, intron 5 of 8) 31496 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 152-79 chr2 31907211 31907386 + 1.25 NA intron (NM_001137602, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 -103318 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 316.5-42 chr8 132179670 132180018 + 1.25 NA intron (NM_001204824, intron 4 of 14) MIRb|SINE|MIR -74579 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 251.5-36 chr2 125661150 125661452 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 456684 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 467.25-6 chr7 36879851 36880462 + 1.25 NA intron (NR_038120, intron 2 of 5) intron (NR_038120, intron 2 of 5) 39276 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 413.25 chr10 60973158 60973777 + 1.25 NA intron (NM_001350906, intron 2 of 12) intron (NM_001350906, intron 2 of 12) 27530 NM_001350903 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 230.5-113 chr8 99133953 99134305 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 8 of 61) intron (NM_017890, intron 8 of 61) 120863 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 194.5-2 chr1 89844395 89844560 + 1.25 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 22538 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 185.5-157 chr8 42052523 42052795 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_006766) promoter-TSS (NM_006766) -672 NM_006766 7994 Hs.491577 NM_006766 ENSG00000083168 KAT6A MOZ|MRD32|MYST-3|MYST3|RUNXBP2|ZC2HC6A|ZNF220 lysine acetyltransferase 6A protein-coding 256-33 chr2 121713761 121714046 + 1.25 NA intron (NR_037857, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 22972 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 176.5-88 chr2 41190763 41190981 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -678437 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 170.75-99 chr4 72701093 72701337 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -131994 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 172-98 chr6 56887691 56887987 + 1.25 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -35923 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 275-15 chr16 61956905 61957300 + 1.25 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 79336 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 215-59 chr4 169477040 169477294 + 1.25 NA exon (NM_001199398, exon 25 of 35) exon (NM_001199398, exon 25 of 35) 135416 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 239-63 chr9 97396219 97396515 + 1.25 NA intron (NR_026847, intron 1 of 5) intron (NR_026847, intron 1 of 5) 324 NR_026847 286359 Hs.132262 NM_182600 LOC286359 - uncharacterized LOC286359 ncRNA 351.25-15 chr8 101334931 101335454 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -33701 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 187.25-62 chr2 188213943 188214158 + 1.25 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 73641 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 153-60 chr17 55409786 55409987 + 1.25 NA intron (NM_012329, intron 3 of 6) intron (NM_012329, intron 3 of 6) 11949 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 286.25-10 chr14 47468141 47468453 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -125051 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 187.25-53 chr2 23444964 23445240 + 1.25 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) MER6B|DNA|TcMar-Tigger 59923 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 255-38 chr3 115709352 115709665 + 1.25 NA intron (NM_002045, intron 2 of 2) intron (NM_002045, intron 2 of 2) 85998 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 259.75-39 chr4 70707608 70708077 + 1.25 NA intron (NM_001130709, intron 1 of 11) intron (NM_001130709, intron 1 of 11) 2905 NM_001130709 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 188.25-2 chr1 173492701 173493045 + 1.25 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 15538 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 285.5-3 chr1 224883891 224884296 + 1.25 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -45561 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 222-70 chr6 40729715 40729920 + 1.25 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -142453 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 229.25-30 chr15 57995802 57996015 + 1.25 NA intron (NM_170696, intron 4 of 11) intron (NM_170696, intron 4 of 11) 18115 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 259.75-52 chr8 67274422 67274781 + 1.25 NA intron (NM_006421, intron 9 of 38) intron (NM_006421, intron 9 of 38) 69180 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 226.5-42 chr2 44860826 44861117 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 77917 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 246.25-21 chr14 88783710 88784091 + 1.25 NA intron (NM_183387, intron 1 of 42) L1MA2|LINE|L1 9053 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 155.25-138 chr5 37671074 37671237 + 1.25 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 163667 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 260-4 chr1 236613419 236613680 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -9033 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 198.25-26 chr12 32127175 32127447 + 1.25 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) L1M5|LINE|L1 20464 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 180.75-6 chr1 106000494 106000689 + 1.25 NA intron (NR_146609, intron 3 of 5) intron (NR_146609, intron 3 of 5) 27662 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 200.5-31 chr13 108273502 108273843 + 1.25 NA intron (NM_001145645, intron 2 of 4) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 4043 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 202.25-39 chr2 67512704 67513163 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 115600 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 117.75-119 chr20 630016 630138 + 1.25 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -19811 NM_004609 6939 Hs.437 NM_004609 ENSG00000125878 TCF15 EC2|PARAXIS|bHLHa40 transcription factor 15 protein-coding 144-34 chr13 70277656 70277863 + 1.25 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL -169266 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 234.5-57 chr20 43118740 43119011 + 1.25 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) 71031 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 174.75-14 chr10 82280586 82280737 + 1.25 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -47741 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 261-9 chr11 16917249 16917765 + 1.25 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 8515 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 228.75-74 chr7 48550601 48550919 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) (TCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -373787 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 235.25-4 chr1 117747535 117747849 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 141644 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 182.5-77 chr2 53432831 53432999 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -334868 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 234.25-5 chr1 114951484 114951789 + 1.25 NA intron (NM_001282541, intron 27 of 31) L1MD1|LINE|L1 -78188 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 147-160 chr9 115307727 115307898 + 1.25 NA intron (NR_163556, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR 165994 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 264.75-10 chr12 37276351 37276579 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1040309 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 262.5-48 chr3 123263671 123263985 + 1.25 NA intron (NM_012430, intron 6 of 6) L1MD1|LINE|L1 61885 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 141.5-66 chr15 99938999 99939178 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 132065 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 186.75-112 chr8 116000524 116000796 + 1.25 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 324399 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 260.75-37 chr2 219322733 219323149 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10236 NM_001007089 389075 Hs.290551 NM_001007089 ENSG00000182698 RESP18 - regulated endocrine specific protein 18 protein-coding 159-95 chr6 54855372 54855541 + 1.25 NA intron (NM_001010872, intron 1 of 4) intron (NM_001010872, intron 1 of 4) 8685 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 297.75-42 chr6 95008842 95009199 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 568431 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 297.25-7 chr14 71934395 71934752 + 1.25 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) intron (NM_001370288, intron 1 of 16) 1046 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 272.25-44 chr5 56890309 56890598 + 1.25 NA intron (NM_005921, intron 19 of 19) L1MC|LINE|L1 -18807 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 121-41 chr11 71085097 71085244 + 1.25 NA intron (NM_012309, intron 7 of 24) intron (NM_012309, intron 7 of 24) 139626 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 212-6 chr1 218125852 218126051 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82446 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 189.25-105 chr6 61946304 61946491 + 1.25 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) intron (NR_146874, intron 4 of 13) 339828 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 202-68 chr7 110806421 110806693 + 1.25 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -284449 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 314.75-16 chr5 58522015 58522597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7803 NR_039639 100616339 NR_039639 ENSG00000265699 MIR548AE2 - microRNA 548ae-2 ncRNA 244-13 chr12 113385074 113385339 + 1.25 NA intron (NM_173542, intron 8 of 11) intron (NM_173542, intron 8 of 11) 18681 NM_006843 10993 Hs.439023 NM_006843 ENSG00000135094 SDS SDH serine dehydratase protein-coding 146.5-25 chr10 16552143 16552376 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30380 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 155.25-52 chr13 67747855 67748099 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 375590 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 225-56 chr5 32449906 32450267 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5346 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 138.25-32 chr11 73735999 73736142 + 1.25 NA intron (NM_198896, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 24023 NM_001243719 5870 Hs.503222 NM_002869 ENSG00000175582 RAB6A RAB6 RAB6A, member RAS oncogene family protein-coding 182.5-29 chr11 38749700 38749952 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 100968 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 171.75-132 chr7 53186585 53186848 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 151083 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 270.75-18 chr15 47680231 47680624 + 1.25 NA intron (NM_001198999, intron 4 of 19) intron (NM_001198999, intron 4 of 19) -37078 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 135.25-17 chr1 216079548 216079688 + 1.25 NA intron (NR_125992, intron 2 of 2) intron (NR_125992, intron 2 of 2) 7153 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 236.75-62 chr8 118426467 118426832 + 1.25 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -194352 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 238.25-54 chr4 34172890 34173118 + 1.25 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) intron (NR_147184, intron 2 of 3) 96743 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 174.25 chr1 17302838 17303084 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5236 NM_012387 23569 Hs.522969 NM_012387 ENSG00000159339 PADI4 PAD|PAD4|PADI5|PDI4|PDI5 peptidyl arginine deiminase 4 protein-coding 268.75-4 chr11 21754870 21755175 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -438063 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 156.75-172 chr9 115394157 115394332 + 1.25 NA intron (NR_163556, intron 5 of 7) intron (NR_163556, intron 5 of 7) 252426 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 302-6 chr11 9885914 9886238 + 1.25 NA intron (NM_030962, intron 17 of 39) intron (NM_030962, intron 17 of 39) 46934 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 192.25-27 chr14 46404749 46405045 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -66462 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 152.5-95 chr2 176694565 176694734 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 56895 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 196-31 chr15 55329397 55329672 + 1.25 NA intron (NM_004855, intron 4 of 11) intron (NM_004855, intron 4 of 11) 10312 NM_004855 9488 Hs.612814 NM_004855 ENSG00000069943 PIGB GPI-MT-III|PIG-B phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class B protein-coding 255-10 chr12 34546979 34547292 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 524639 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 368.25-21 chr8 124671672 124672195 + 1.25 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 56540 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 137.25-123 chr5 31463469 31463645 + 1.25 NA intron (NM_013235, intron 19 of 34) intron (NM_013235, intron 19 of 34) 68536 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 131.25-103 chr2 81173047 81173187 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 293829 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 301-15 chr20 32042385 32042692 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9704 NM_001172132 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 315.5-17 chr4 30788490 30788961 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 68356 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 242.75-12 chr12 40173975 40174308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17902 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 184.75-65 chr3 41855399 41855641 + 1.25 NA intron (NR_136342, intron 16 of 34) intron (NR_136342, intron 16 of 34) 106583 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 307.75-12 chr2 129163450 129163743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 110295 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 183-82 chr4 29850827 29851028 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 636635 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 138.25-20 chr10 97521406 97521686 + 1.25 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) intron (NM_024954, intron 1 of 2) 22622 NM_024954 80019 Hs.500724 NM_024954 ENSG00000165886 UBTD1 - ubiquitin domain containing 1 protein-coding 208-13 chr11 82783512 82783949 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -49866 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 356-15 chr9 25215885 25216348 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 462742 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 183.75-71 chr3 48011015 48011366 + 1.25 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) intron (NM_002375, intron 1 of 18) 77658 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 133.75-127 chr3 27785669 27785875 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11816 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 126.25-142 chr5 9432900 9433099 + 1.25 NA intron (NM_003966, intron 2 of 22) intron (NM_003966, intron 2 of 22) -78334 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 242.75-29 chr2 59955927 59956319 + 1.25 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 426913 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 186.75-28 chr13 96742859 96743107 + 1.25 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 241189 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 343.75-10 chr3 54454689 54455324 + 1.25 NA intron (NM_018398, intron 4 of 37) L1MA5|LINE|L1 184851 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 263.25-39 chr4 93696175 93696490 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -132421 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 169-50 chr2 112972225 112972386 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -5701 NM_001278568 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 244.5-7 chr1 178424039 178424375 + 1.25 NA intron (NM_004841, intron 3 of 15) intron (NM_004841, intron 3 of 15) 82756 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 334-20 chr3 112245013 112245391 + 1.25 NA intron (NM_001320531, intron 9 of 27).2 L1ME2|LINE|L1 49014 NM_183061 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 254.5-31 chr17 43730564 43731093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27963 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 312-8 chr10 114648634 114648979 + 1.25 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) 9469 NM_002313 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 147.25-4 chr1 76093014 76093226 + 1.25 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 18374 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 282.5-53 chr5 155830507 155830928 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -496040 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 337-9 chr13 34080292 34080786 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 262390 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 250.25-38 chr4 53400176 53400420 + 1.25 NA intron (NM_001134938, intron 8 of 14) intron (NM_001134938, intron 8 of 14) 22645 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 232-41 chr2 147948685 147948906 + 1.25 NA intron (NM_001190881, intron 5 of 10) intron (NM_001190881, intron 5 of 10) 71942 NM_181741 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 358.5-11 chr2 34177582 34178081 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 110605 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 207.25-61 chr3 106627612 106628122 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 612771 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 171.5-167 chr9 78194794 78195058 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -41149 NM_001349840 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 243.75-34 chr16 77169195 77169529 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21828 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 251.25-53 chr7 52871859 52872245 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -163581 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 159.25-13 chr10 12196915 12197103 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001321647) promoter-TSS (NM_001321647) 821 NM_006023 8872 Hs.412842 NM_006023 ENSG00000151465 CDC123 C10orf7|D123 cell division cycle 123 protein-coding 315.25-35 chr9 29564491 29565064 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -351176 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 319.5-30 chr3 24149539 24149975 + 1.25 NA intron (NM_001354708, intron 5 of 9) intron (NM_001354708, intron 5 of 9) -1567 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 233.25-39 chr2 223269572 223269787 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 217749 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 189.75-83 chr4 47043151 47043469 + 1.25 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 11743 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 165.5-191 chr8 58871419 58871632 + 1.25 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) L1MC3|LINE|L1 -211672 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 276-13 chr11 83868754 83869068 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) intron (NM_001142699, intron 16 of 27) -186486 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 135.75-137 chr3 60846316 60846503 + 1.25 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) intron (NM_001320900, intron 4 of 9) -228539 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 141.75-97 chr2 105560509 105560758 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 49926 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 153.5-51 chr13 112564061 112564234 + 1.25 NA intron (NM_006322, intron 3 of 21) intron (NM_006322, intron 3 of 21) 24006 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 192-15 chr10 52285663 52285880 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 14 of 17) intron (NM_001098512, intron 14 of 17) 28357 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 263-21 chr16 58348215 58348619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44054 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 178.5-88 chr2 185341712 185341924 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -174746 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 187.25-104 chr8 60973446 60973698 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -5824 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 204.5-10 chr10 49818966 49819152 + 1.25 NA non-coding (NR_130169, exon 17 of 17) non-coding (NR_130169, exon 17 of 17) -56680 NM_001347823 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 194.5-74 chr2 147236233 147236411 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -608195 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 200.75-107 chr8 104725623 104725964 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -136769 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 224.5-66 chr2 204031839 204032064 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 95203 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 222-27 chr15 96507172 96507512 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 173577 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 170-99 chr8 132414164 132414408 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 32976 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 138-69 chr18 58381701 58381954 + 1.25 NA intron (NM_001144965, intron 24 of 30) intron (NM_001144965, intron 24 of 30) -69247 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 158-139 chr8 100127372 100127566 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 18348 NR_036491 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 260 chr1 30952010 30952377 + 1.25 NA intron (NM_001020658, intron 16 of 21) intron (NM_001020658, intron 16 of 21) -2988 NR_033295 692235 NR_033295 SNORD103B U103B small nucleolar RNA, C/D box 103B snoRNA 193.25-83 chr4 128188568 128188826 + 1.25 NA intron (NR_146772, intron 14 of 19) L1MA4|LINE|L1 99116 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 172.75-77 chr22 40280109 40280322 + 1.25 NA intron (NM_015088, intron 9 of 20) intron (NM_015088, intron 9 of 20) -66285 NM_000026 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 157-24 chr12 87313109 87313355 + 1.25 NA Intergenic (ATTTTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17507 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 166.25-74 chr2 17833538 17833953 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17285 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 219.25-19 chr10 111998007 111998205 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 185659 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 292.5-41 chr5 41251863 41252199 + 1.25 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) intron (NM_001115131, intron 1 of 17) 9438 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 163-53 chr2 13224107 13224434 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -217257 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 297.75-18 chr2 171061561 171062074 + 1.25 NA intron (NM_012290, intron 3 of 20) MER58B|DNA|hAT-Charlie 5156 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 161.75-108 chr5 146662274 146662425 + 1.25 NA intron (NM_181678, intron 6 of 10) intron (NM_181678, intron 6 of 10) -146236 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 202.5-68 chr2 50604746 50605057 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) MER105|DNA|DNA 91361 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 210-32 chr15 93536280 93536659 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -320091 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 190.5-142 chr7 24323792 24323997 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39704 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 280.75-28 chr3 45055050 45055399 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 25081 NM_001308394 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 197.5-58 chr18 55881390 55881709 + 1.25 NA TTS (NR_110755) TTS (NR_110755) 38650 NR_110755 101927273 Hs.434335 NR_110755 ENSG00000260930 LINC01416 - long intergenic non-protein coding RNA 1416 ncRNA 201.5-129 chr8 108067366 108067584 + 1.25 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L1MC5a|LINE|L1 14464 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 229.25-78 chr7 46318739 46318956 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 378275 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 143.5-151 chr3 147222957 147223100 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 169402 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 217.5-65 chr2 162997617 162997837 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -158960 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 173-27 chr11 114401854 114402188 + 1.25 NA intron (NM_001286046, intron 2 of 4) intron (NM_001286046, intron 2 of 4) 1355 NM_001286046 10179 Hs.7527 NM_016090 ENSG00000076053 RBM7 - RNA binding motif protein 7 protein-coding 220.5-25 chr14 54466328 54466591 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22521 NM_004124 2764 Hs.151413 NM_004124 ENSG00000197045 GMFB GMF glia maturation factor beta protein-coding 169.5-29 chr11 116886143 116886365 + 1.25 NA intron (NM_001366686, intron 6 of 24) intron (NM_001366686, intron 6 of 24) -48304 NM_001318021 335 Hs.93194 NM_000039 ENSG00000118137 APOA1 apo(a) apolipoprotein A1 protein-coding 184.5-78 chr2 128136251 128136564 + 1.25 NA intron (NR_027671, intron 15 of 40) L1MC2|LINE|L1 45207 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 152-136 chr6 124870228 124870365 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92249 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 195.75-117 chr8 99681276 99681535 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 35 of 61) intron (NM_017890, intron 35 of 61) -144544 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 171.5-142 chr7 127722081 127722258 + 1.25 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) intron (NM_014390, intron 10 of 23) 69975 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 221.25-10 chr1 245097817 245098141 + 1.25 NA intron (NM_001143943, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -57006 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 139.75-141 chr4 154767635 154767799 + 1.25 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -13555 NM_001277171 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 206.25-94 chr6 66681723 66681999 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 893982 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 474.25-3 chr5 100324968 100325607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62967 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 310-11 chr2 122524549 122525018 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 548698 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 249-17 chr17 5108383 5108755 + 1.25 NA intron (NM_001320955, intron 3 of 3) intron (NM_001320955, intron 3 of 3) -3366 NR_135657 101928000 Hs.660048 NR_135657 ENSG00000234327 LOC101928000 - uncharacterized LOC101928000 ncRNA 128.5-133 chr22 25222811 25222963 + 1.25 NA intron (NM_000496, intron 2 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 3248 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 276-22 chr16 83230903 83231290 + 1.25 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) intron (NM_001220489, intron 4 of 12) -240798 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 119-14 chr10 25082550 25082771 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20381 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 245.25-30 chr18 69324720 69325245 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -75906 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 215-9 chr1 220715588 220715929 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 25395 NM_024709 79762 Hs.519839 NM_024709 ENSG00000162817 C1orf115 - chromosome 1 open reading frame 115 protein-coding 219.75-22 chr15 101319674 101319934 + 1.25 NA intron (NM_002570, intron 18 of 21) MER21C|LTR|ERVL -10500 NR_045387 100507472 Hs.498494 NR_045387 LOC100507472 - uncharacterized LOC100507472 ncRNA 347-26 chr9 85323343 85323660 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 418528 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 168.75-111 chr5 85187661 85187839 + 1.25 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -802870 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 169.25-109 chr7 48212668 48212861 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 3 of 61) L1ME1|LINE|L1 41306 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 324.75-13 chr15 26885523 26885964 + 1.25 NA intron (NM_001165037, intron 6 of 10) intron (NM_001165037, intron 6 of 10) 18617 NM_001165037 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 161.5-58 chr14 63004007 63004149 + 1.25 NA intron (NM_139318, intron 3 of 10) intron (NM_139318, intron 3 of 10) 41380 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 192.5-55 chr17 67428487 67428746 + 1.25 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -42873 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 128.25-67 chr16 71673872 71674010 + 1.25 NA intron (NM_015020, intron 9 of 18) intron (NM_015020, intron 9 of 18) 24760 NR_033337 100379141 Hs.725116 NR_033337 ENSG00000263666 SNORA70D U70D small nucleolar RNA, H/ACA box 70D snoRNA 245.5-38 chr2 169325115 169325378 + 1.25 NA intron (NM_004525, intron 1 of 78) intron (NM_004525, intron 1 of 78) 37288 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 188.75-63 chr2 176562493 176562863 + 1.25 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 38374 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 291.75-12 chr13 105358723 105359044 + 1.25 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -106984 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 203.5-13 chr1 169142818 169143040 + 1.25 NA intron (NR_104229, intron 12 of 12) intron (NR_104229, intron 12 of 12) 36239 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 199-35 chr2 30679892 30680195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 127403 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 269.75-22 chr15 51961425 51961794 + 1.25 NA intron (NM_001323904, intron 3 of 11) AluSz6|SINE|Alu 10169 NM_001323904 123169 Hs.567662 NM_138792 ENSG00000166477 LEO1 RDL LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 255.75-13 chr14 66558272 66558530 + 1.25 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 50994 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 208-55 chr3 73580009 73580196 + 1.25 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) -10587 NM_001303139 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 208.5-74 chr2 134050628 134050923 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -69160 NM_001371457 234.25-10 chr10 46080826 46081163 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28501 NR_126580 653268 Hs.447454 NM_001077685 AGAP7P AGAP-7|AGAP7|CTGLF4|bA109G10.1 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 7, pseudogene pseudo 414.5-8 chr8 136832535 136833185 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1MA9|LINE|L1 302062 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 117-10 chr10 9002977 9003132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 105065 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 142.25-95 chr2 207532654 207532992 + 1.25 NA intron (NR_163946, intron 1 of 8) AluSq|SINE|Alu 2861 NR_163946 203.75-83 chr5 15070306 15070500 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 196157 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 201.25-91 chr8 108742738 108743095 + 1.25 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 44678 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 293-19 chr3 24102126 24102464 + 1.25 NA intron (NR_026834, intron 1 of 1) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 952 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 151.5-117 chr3 56823859 56824126 + 1.25 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22043 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 176.5-188 chr9 30006643 30006809 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 401728 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 179.75-11 chr10 6456469 6456703 + 1.25 NA intron (NM_001282644, intron 15 of 17) intron (NM_001282644, intron 15 of 17) 106270 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 320.75-17 chr3 86908792 86909142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82182 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 201.75-97 chr7 115691235 115691471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109912 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 140.75-42 chr13 33738677 33738801 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -61945 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 254.5-45 chr2 203236094 203236495 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2147 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 188.5-4 chr1 87159121 87159392 + 1.25 NA intron (NR_026989, intron 2 of 2) LTR16A|LTR|ERVL 27330 NR_026986 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 193.5-95 chr20 1033338 1033507 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -31111 NM_001029871 343637 Hs.444980 NM_001029871 ENSG00000101282 RSPO4 C20orf182|CRISTIN4 R-spondin 4 protein-coding 239.5-3 chr1 79612282 79612571 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -605696 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 158-104 chr3 172634220 172634427 + 1.25 NA intron (NM_001146276, intron 4 of 4) intron (NM_001146276, intron 4 of 4) -38716 NR_146714 105374219 Hs.186269 NR_146714 ENSG00000223387 LINC02068 - long intergenic non-protein coding RNA 2068 ncRNA 283-32 chr4 75205962 75206431 + 1.25 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -121488 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 131.25-189 chr7 48951430 48951606 + 1.25 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 26971 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 236.25-53 chr21 22883141 22883442 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -195993 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 166.5-119 chr20 41927970 41928230 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -309723 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 177.5-182 chr9 69991163 69991410 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52295 NM_001347990 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 173.75-116 chr4 36630891 36631178 + 1.25 NA intron (NR_149124, intron 1 of 4) intron (NR_149124, intron 1 of 4) 10866 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 227.5-58 chr2 159760606 159760896 + 1.25 NA intron (NM_001282805, intron 9 of 11) intron (NM_001282805, intron 9 of 11) 26787 NM_001282807 64844 Hs.529272 NM_022826 ENSG00000136536 MARCH7 AXO|AXOT|MARCH-VII|RNF177 membrane associated ring-CH-type finger 7 protein-coding 287-43 chr9 100033405 100033835 + 1.25 NA intron (NM_015051, intron 4 of 11) MER41-int|LTR|ERV1 65380 NM_015051 23071 Hs.154023 NM_015051 ENSG00000023318 ERP44 PDIA10|TXNDC4 endoplasmic reticulum protein 44 protein-coding 173.5-131 chr5 98444476 98444703 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -283350 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 211.5-111 chr4 9898683 9898884 + 1.25 NA intron (NM_001001290, intron 9 of 12) intron (NM_001001290, intron 9 of 12) 117149 NM_000798 1816 Hs.380681 NM_000798 ENSG00000169676 DRD5 DBDR|DRD1B|DRD1L2 dopamine receptor D5 protein-coding 180.5-106 chr3 193088589 193088795 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -152530 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 229.5-48 chr17 5935568 5935761 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -134950 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 175.5-91 chr2 125419874 125420127 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 697985 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 378.5-18 chr8 32206647 32207055 + 1.25 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1PB4|LINE|L1 180633 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 134-156 chr6 154043596 154043789 + 1.25 NA intron (NM_001285522, intron 1 of 1) intron (NM_001285522, intron 1 of 1) 4281 NM_001008505 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 131.75-128 chr22 44438892 44438999 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4382 NR_109966 101927526 Hs.339290 NR_109966 ENSG00000232655 LINC01656 - long intergenic non-protein coding RNA 1656 ncRNA 144.25-52 chr13 95205033 95205274 + 1.25 NA intron (NM_001105515, intron 8 of 20) intron (NM_001105515, intron 8 of 20) -5191 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 167.25-76 chr2 30114467 30114655 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -32446 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 192.5-9 chr1 217375906 217376107 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -238304 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 130-140 chr6 113562559 113562749 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 87421 NR_125844 101927686 Hs.402044 NR_125844 ENSG00000230943 LINC02541 - long intergenic non-protein coding RNA 2541 ncRNA 233.75-23 chr14 23393548 23393776 + 1.25 NA intron (NM_002471, intron 22 of 38) intron (NM_002471, intron 22 of 38) -4996 NR_029595 406990 NR_029595 ENSG00000199157 MIR208A MIR208|MIRN208|MIRN208A|hsa-mir-208a|miRNA208 microRNA 208a ncRNA 212.25-78 chr5 163223843 163224161 + 1.25 NA Intergenic LTR43B|LTR|ERV1 -213569 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 219-98 chr9 85211277 85211552 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 505513 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 175-9 chr1 238231832 238232111 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 254046 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 227.25-48 chr2 171337563 171337943 + 1.25 NA intron (NM_001321158, intron 3 of 8) intron (NM_001321158, intron 3 of 8) 96237 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 218.75-78 chr6 85552370 85552552 + 1.25 NA intron (NM_001350547, intron 6 of 27) LTR39|LTR|ERV1 41397 NM_153816 57231 Hs.485871 NM_020468 ENSG00000135317 SNX14 RGS-PX2|SCAR20 sorting nexin 14 protein-coding 360.75-7 chr21 45652887 45653420 + 1.25 NA intron (NM_001348240, intron 1 of 16) L1ME4a|LINE|L1 9428 NM_001348238 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 195.75-43 chr14 48378841 48379039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -583926 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 251.25-51 chr7 27819867 27820375 + 1.25 NA intron (NM_001362794, intron 15 of 16) intron (NM_001362794, intron 15 of 16) 80026 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 159.5-116 chr2 179763741 179764026 + 1.25 NA intron (NM_001352809, intron 3 of 10) L1MDa|LINE|L1 -17373 NM_001113397 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 230.75-55 chr5 11146089 11146528 + 1.25 NA intron (NM_001288715, intron 11 of 20) intron (NM_001288715, intron 11 of 20) -385074 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 164.5-188 chr7 30617114 30617379 + 1.25 NA exon (NM_001316772, exon 10 of 17) exon (NM_001316772, exon 10 of 17) 22368 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 218.5-25 chr11 20169705 20169985 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -9370 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 210-36 chr17 48156911 48157213 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_031607) promoter-TSS (NR_031607) -551 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 247.5-9 chr10 66298476 66298691 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -627453 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 331-8 chr11 132589315 132589731 + 1.25 NA intron (NM_002545, intron 2 of 6) L2c|LINE|L2 305221 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 262-40 chr3 178918953 178919218 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -58680 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 254.5-66 chr6 126531073 126531463 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 46637 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 145.25-136 chr5 108723047 108723212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5132 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 228.5-93 chr7 1994955 1995190 + 1.25 NA intron (NM_001013837, intron 14 of 18) intron (NM_001013837, intron 14 of 18) -54501 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 273.5-48 chr3 76670471 76670770 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -369479 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 172.5-98 chr2 82497169 82497398 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -359520 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 130.75-149 chr4 121822070 121822300 + 1.25 NA intron (NM_001237, intron 2 of 7) intron (NM_001237, intron 2 of 7) 1698 NM_001237 890 Hs.58974 NM_001237 ENSG00000145386 CCNA2 CCN1|CCNA cyclin A2 protein-coding 238.75-25 chr16 52801472 52801854 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -194688 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 348.5-25 chrX 66987064 66987432 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -347950 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 174-80 chr6 38143663 38143832 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 5 of 5) intron (NM_021943, intron 5 of 5) 324020 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 237.75-37 chr2 40573436 40573707 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -61136 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 178-101 chr8 69440910 69441152 + 1.25 NA intron (NR_110433, intron 2 of 3) L1MB5|LINE|L1 7213 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 150.5-111 chr2 215868954 215869224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25553 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 134-176 chr8 130734391 130734525 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -290784 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 174.5-92 chr19 46530635 46530983 + 1.25 NA intron (NM_001370550, intron 1 of 2) intron (NM_001370550, intron 1 of 2) -34942 NM_020709 57469 Hs.7193 NM_020709 ENSG00000204851 PNMA8B PNMAL2 PNMA family member 8B protein-coding 324.5-27 chr5 41279932 41280317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18655 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 215.5-34 chr14 88541750 88542088 + 1.25 NA intron (NM_007039, intron 2 of 18) intron (NM_007039, intron 2 of 18) 13088 NM_007039 11099 Hs.437040 NM_007039 ENSG00000070778 PTPN21 PTPD1|PTPRL10 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 21 protein-coding 242-29 chr2 123050672 123051007 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 22642 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 336.5 chr1 77798697 77798994 + 1.25 NA intron (NM_198549, intron 2 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 19040 NM_001363583 374986 Hs.437755 NM_198549 ENSG00000180488 MIGA1 FAM73A mitoguardin 1 protein-coding 134.5-248 chrX 53474829 53475013 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40545 NM_001037811 3028 Hs.171280 NM_004493 ENSG00000072506 HSD17B10 17b-HSD10|ABAD|CAMR|DUPXp11.22|ERAB|HADH2|HCD2|HSD10MD|MHBD|MRPP2|MRX17|MRX31|MRXS10|SCHAD|SDR5C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 10 protein-coding 248.5-94 chr7 8308279 8308614 + 1.25 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 -45834 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 277.25-49 chr9 73091196 73091421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60557 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 177.5-103 chr20 53284256 53284480 + 1.25 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 99085 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 178.5-186 chr8 122705307 122705557 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11326 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 187-92 chr7 80350364 80350757 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23879 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 128.5-50 chr12 58447674 58447836 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -143947 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 170-104 chr9 71420032 71420209 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 26851 NM_001366143 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 135.75-11 chr1 119966065 119966211 + 1.25 NA intron (NM_001200001, intron 9 of 21) intron (NM_001200001, intron 9 of 21) -69623 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 218.5-115 chr8 9860409 9860716 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42767 NR_024281 157627 Hs.12513 NR_024281 ENSG00000253230 LINC00599 Rncr3 long intergenic non-protein coding RNA 599 ncRNA 217.5-139 chrX 142046254 142046467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 142466 NM_005462 9947 Hs.132194 NM_005462 ENSG00000155495 MAGEC1 CT7|CT7.1 MAGE family member C1 protein-coding 220.75-24 chr13 76162256 76162451 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -227221 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 290.75-14 chr14 57200151 57200736 + 1.25 NA TTS (NM_006544) TTS (NM_006544) 68462 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 125.75-89 chr2 64180250 64180416 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 25152 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 187.5-34 chr11 77321023 77321204 + 1.25 NA TTS (NM_002576) TTS (NM_002576) -19447 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 173.5-50 chr16 56630427 56630584 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2154 NM_176870 4499 Hs.647370 NM_176870 ENSG00000205364 MT1M MT-1M|MT-IM|MT1|MT1K metallothionein 1M protein-coding 211.25-7 chr1 196295899 196296164 + 1.25 NA intron (NM_001287820, intron 20 of 26) intron (NM_001287820, intron 20 of 26) -207316 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 231.5-52 chr2 171008662 171008961 + 1.25 NA intron (NM_001136555, intron 12 of 18) intron (NM_001136555, intron 12 of 18) 58162 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 171-139 chrX 77747674 77747859 + 1.25 NA intron (NM_000489, intron 1 of 34) intron (NM_000489, intron 1 of 34) 38450 NM_000489 546 Hs.533526 NM_000489 ENSG00000085224 ATRX JMS|MRX52|RAD54|RAD54L|XH2|XNP|ZNF-HX ATRX chromatin remodeler protein-coding 242.75-22 chr17 68293329 68293708 + 1.25 NA intron (NM_001352902, intron 1 of 12) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1383 NM_001352901 22901 Hs.437249 NM_014960 ENSG00000141337 ARSG USH4 arylsulfatase G protein-coding 206.5-4 chr1 218286495 218286676 + 1.25 NA intron (NM_016052, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 1292 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 211-20 chr14 98532603 98532834 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -178895 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 124.5-133 chr21 30701126 30701259 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 17585 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 416-3 chr13 113462080 113462534 + 1.25 NA intron (NM_001014283, intron 4 of 6) AluSp|SINE|Alu -8819 NM_138430 113622 Hs.98669 NM_138430 ENSG00000153531 ADPRHL1 ARH2 ADP-ribosylhydrolase like 1 protein-coding 189.25-68 chr21 15327977 15328313 + 1.25 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -263145 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 322.25 chr1 199288383 199288875 + 1.25 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 140031 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 258.25-44 chr5 41865553 41865928 + 1.25 NA intron (NR_157114, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR -4290 NR_046635 100874002 Hs.375537 NR_046635 ENSG00000248668 OXCT1-AS1 - OXCT1 antisense RNA 1 ncRNA 221 chr1 91064109 91064407 + 1.25 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -42003 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 135-120 chr4 29807123 29807482 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 593010 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 194-11 chr1 196532415 196532660 + 1.25 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 49944 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 200.25-98 chr6 166191173 166191381 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22608 NM_003181 6862 Hs.389457 NM_003181 ENSG00000164458 TBXT SAVA|T|TFT T-box transcription factor T protein-coding 248.5-31 chr15 67711383 67711678 + 1.25 NA intron (NM_002757, intron 16 of 20) intron (NM_002757, intron 16 of 20) -113979 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 243.5-5 chr1 91679921 91680190 + 1.25 NA TTS (NM_003243) TTS (NM_003243) 178947 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 276.25-16 chr15 67640863 67641273 + 1.25 NA intron (NM_001206804, intron 9 of 21) intron (NM_001206804, intron 9 of 21) 91974 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 222.75-21 chr10 76168025 76168276 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 385389 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 257.75-24 chr2 214202652 214202988 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -208234 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 245.75-7 chr11 78345363 78345850 + 1.25 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) intron (NM_080491, intron 1 of 9) -3726 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 170-51 chr20 11014490 11014695 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11952 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 275.5-60 chr7 20430581 20430910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98983 NR_110119 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 187-44 chr2 118807311 118807552 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 40752 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 320.25-34 chr9 23926439 23926899 + 1.25 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -76068 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 160.25-80 chr20 36109330 36109467 + 1.25 NA intron (NM_001258329, intron 1 of 22) MIRb|SINE|MIR 16688 NM_001258329 2036 Hs.437422 NM_012156 ENSG00000088367 EPB41L1 4.1N|MRD11 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1 protein-coding 313.75-12 chr20 3605765 3606221 + 1.25 NA intron (NM_001323332, intron 24 of 25) intron (NM_001323332, intron 24 of 25) 57406 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 200.25-25 chr12 16583144 16583374 + 1.25 NA intron (NR_045014, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 22120 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 174.25-93 chr22 34148380 34148601 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -225602 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 173.25-55 chr2 19652777 19653031 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -215950 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 214.25-21 chr13 43766114 43766409 + 1.25 NA intron (NM_001347966, intron 1 of 17) intron (NM_001347966, intron 1 of 17) 20711 NR_145132 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 184.75-20 chr11 118731917 118732224 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -52420 NM_007180 11181 Hs.129712 NM_007180 ENSG00000118094 TREH TRE|TREA|TREHD trehalase protein-coding 179.5-34 chr11 46235264 46235440 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -42310 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 375-11 chr4 32395103 32395593 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44310 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 217.25-69 chr5 113211425 113211664 + 1.25 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) LTR82B|LTR|ERVL 83394 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 183-93 chr5 152996523 152996779 + 1.25 NA Intergenic Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -24302 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 242.25-63 chr4 30782825 30783110 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MER39|LTR|ERV1 62598 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 274-39 chrX 83706093 83706331 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -154914 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 203.5-52 chr17 62921684 62921958 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22394 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 165.25-47 chr15 86998110 86998303 + 1.25 NA intron (NM_152336, intron 24 of 24) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -9780 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 175.75-45 chr15 97002455 97002718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 219151 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 210-39 chr17 65381627 65381955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -75750 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 161-85 chr5 2797613 2797887 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 45619 NM_001294337 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 140-121 chr4 34314575 34314782 + 1.25 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -44931 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 122.5-171 chr4 160590258 160590443 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -812566 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 253.25-66 chr9 24455944 24456311 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 89549 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 179.5-177 chr8 30074624 30074790 + 1.25 NA intron (NM_016127, intron 1 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 8357 NM_016127 51669 Hs.521487 NM_016127 ENSG00000133872 SARAF FOAP-7|HSPC035|TMEM66|XTP3 store-operated calcium entry associated regulatory factor protein-coding 266-11 chr14 66303374 66303746 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -182811 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 213.75-11 chr10 14711917 14712135 + 1.25 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) 62871 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 181.75-107 chr5 27962712 27962873 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 324873 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 240.25-66 chr7 140118896 140119214 + 1.25 NA intron (NM_030647, intron 9 of 19) intron (NM_030647, intron 9 of 19) -55334 NR_130117 64761 Hs.12646 NM_022750 ENSG00000059378 PARP12 ARTD12|MST109|MSTP109|ZC3H1|ZC3HDC1 poly(ADP-ribose) polymerase family member 12 protein-coding 314.5-8 chr18 61703232 61703535 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -44793 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 137.25-79 chr2 167056379 167056526 + 1.25 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 84503 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 165-86 chr22 28617395 28617657 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 62339 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 146.5-22 chr1 232438310 232438541 + 1.25 NA intron (NM_020808, intron 13 of 20) intron (NM_020808, intron 13 of 20) 77183 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 272-12 chr16 71285712 71286107 + 1.25 NA exon (NM_001099642, exon 3 of 3) exon (NM_001099642, exon 3 of 3) 3493 NM_001099642 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 334.25-5 chr11 69536805 69537163 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 51423 NR_120544 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 197-41 chr3 19084631 19084876 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -63757 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 282.5-31 chr2 121260803 121261132 + 1.25 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) intron (NM_014553, intron 2 of 14) 24235 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 364.25-24 chr6 64854727 64855075 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -446517 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 138.75-36 chr12 17928626 17928763 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 161499 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 222.25-90 chr8 136326291 136326606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204350 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 145.25-10 chr1 203492669 203492870 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1384 NM_014359 26254 Hs.632468 NM_014359 ENSG00000188770 OPTC OPT opticin protein-coding 249-53 chr8 123140880 123141221 + 1.25 NA intron (NM_001363155, intron 17 of 19) intron (NM_001363155, intron 17 of 19) -37997 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 184.25-80 chr3 73410467 73410869 + 1.25 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) 23327 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 242.5-35 chr17 55535656 55535879 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -113932 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 229.25-57 chr4 40903691 40904008 + 1.25 NA intron (NM_173075, intron 9 of 16) intron (NM_173075, intron 9 of 16) -46657 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 153.5-108 chr2 168234798 168234981 + 1.25 NA intron (NM_013233, intron 1 of 17) FLAM_C|SINE|Alu 12706 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 257-38 chr3 179529907 179530165 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -32844 NM_177989 86 Hs.435326 NM_004301 ENSG00000136518 ACTL6A ACTL6|ARPN-BETA|Arp4|BAF53A|INO80K actin like 6A protein-coding 195.5-116 chr5 41990355 41990607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 65200 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 306.25-12 chr12 29818241 29818529 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33626 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 227.25-78 chr8 69210750 69211021 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -106695 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 297.25-11 chr16 77243897 77244285 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44683 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 280-26 chr2 21485521 21485838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 224973 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 263-55 chrX 78621793 78622198 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 37333 NM_152694 203430 Hs.134873 NM_152694 ENSG00000179300 RTL3 Mar3|Mart3|SIRH9|ZCCHC5|ZHC5 retrotransposon Gag like 3 protein-coding 210.25-69 chr6 126140515 126140868 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154151 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 263.5-4 chr10 28017926 28018156 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18962 NM_018076 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 187-31 chr15 101685161 101685422 + 1.25 NA intron (NM_152334, intron 11 of 18) LTR106_Mam|LTR|LTR -32900 NM_001308026 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 219.75-46 chr2 219339072 219339434 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -6076 NM_001007089 389075 Hs.290551 NM_001007089 ENSG00000182698 RESP18 - regulated endocrine specific protein 18 protein-coding 232.25-13 chr11 92584999 92585318 + 1.25 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 233062 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 137-176 chr8 110385099 110385236 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -409396 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 160-32 chr14 58501447 58501700 + 1.25 NA intron (NM_001329944, intron 27 of 31) intron (NM_001329944, intron 27 of 31) 61892 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 120.25-159 chr5 40767764 40767907 + 1.25 NA TTS (NM_001355034) TTS (NM_001355034) -11874 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 371.75-17 chr8 96280695 96281212 + 1.25 NA intron (NM_001290225, intron 2 of 10) intron (NM_001290225, intron 2 of 10) 19051 NM_014754 9791 Hs.292579 NM_014754 ENSG00000156471 PTDSS1 LMHD|PSS1|PSSA phosphatidylserine synthase 1 protein-coding 316.25-14 chr3 98049478 98049893 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -14381 NR_047685 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 235.25-37 chr20 14633367 14633607 + 1.25 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) intron (NM_001351663, intron 4 of 17) 79103 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 203.5-4 chr1 49138035 49138455 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -119166 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 259.75-41 chr4 141154763 141155010 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -21417 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 373.75-12 chr7 54771131 54771834 + 1.25 NA intron (NR_110040, intron 1 of 2) L1ME2|LINE|L1 12169 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 315-6 chr13 30266858 30267151 + 1.25 NA intron (NM_032116, intron 3 of 10) intron (NM_032116, intron 3 of 10) 40007 NM_001014380 84056 Hs.243596 NM_032116 ENSG00000102781 KATNAL1 - katanin catalytic subunit A1 like 1 protein-coding 177.75-144 chr8 133468112 133468284 + 1.25 NA intron (NM_003033, intron 4 of 8) L1MB4|LINE|L1 103689 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 174.5-86 chr18 12849542 12849726 + 1.25 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) L1M5|LINE|L1 -8672 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 119.25-193 chr7 77969133 77969303 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 129088 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 172.5-37 chr11 20484135 20484326 + 1.25 NA intron (NM_005788, intron 13 of 15) L2c|LINE|L2 96514 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 243.75-28 chr15 59448689 59448976 + 1.25 NA intron (NM_152450, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 10646 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 237.75-54 chr3 197177683 197177947 + 1.25 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) intron (NM_001290983, intron 5 of 25) 6057 NM_001366222 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 309-19 chr18 13856859 13857353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 32957 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 169.75-147 chr7 88791486 88791737 + 1.25 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) 4126 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 222.75-60 chr2 49836158 49836394 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 137927 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 235.25-69 chrX 100663824 100664172 + 1.25 NA intron (NM_014467, intron 4 of 10) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 19799 NM_014467 27286 Hs.306339 NM_014467 ENSG00000102359 SRPX2 BPP|CBPS|PMGX|RESDX|SRPUL sushi repeat containing protein X-linked 2 protein-coding 248.5-66 chr3 84256888 84257158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 612552 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 238.5-79 chr6 49120139 49120471 + 1.25 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 342948 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 282.5-68 chr9 94965163 94965460 + 1.25 NA intron (NM_032823, intron 7 of 14) intron (NM_032823, intron 7 of 14) -19757 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 168-92 chr4 145941339 145941610 + 1.25 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -2651 NM_178835 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 205-18 chr13 107010532 107010769 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 310313 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 219.5-19 chr10 94727652 94727895 + 1.25 NA intron (NM_000772, intron 7 of 8) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -34908 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 205.75-63 chr5 24302155 24302444 + 1.25 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 342679 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 179-3 chr1 71925788 71926038 + 1.25 NA intron (NM_173808, intron 2 of 6) intron (NM_173808, intron 2 of 6) -88901 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 206.25-91 chr6 1237761 1237944 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74246 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 334.75-21 chr3 123794972 123795420 + 1.25 NA intron (NM_001321309, intron 3 of 32) intron (NM_001321309, intron 3 of 32) 89136 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 146.5-44 chr11 73888816 73888979 + 1.25 NA 5' UTR (NM_001363556, exon 1 of 10) 5' UTR (NM_001363556, exon 1 of 10) 116 NM_001363556 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 374.75-9 chr3 153574555 153575120 + 1.25 NA intron (NR_146713, intron 4 of 6) intron (NR_146713, intron 4 of 6) 90342 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 266.75-18 chr2 10732393 10732650 + 1.25 NA intron (NM_001039362, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu 10891 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 396.25-6 chr18 14093843 14094435 + 1.25 NA intron (NR_033354, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 38296 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 202.75-98 chr6 35185694 35185986 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28116 NM_001303136 222663 Hs.12923 NM_152753 ENSG00000146197 SCUBE3 CEGF3 signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 protein-coding 173-43 chr14 38398055 38398243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -142056 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 263.5-33 chr2 88499838 88500252 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24604 NM_152670 200523 Hs.132104 NM_152670 ENSG00000172073 TEX37 C2orf51|TSC21 testis expressed 37 protein-coding 341.25-24 chr7 54337398 54338001 + 1.25 NA intron (NR_120516, intron 1 of 2) L1MCa|LINE|L1 7002 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 228-29 chr14 74286010 74286317 + 1.25 NA non-coding (NR_003256, exon 18 of 18) non-coding (NR_003256, exon 18 of 18) 16771 NM_001353607 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 125.25-185 chr7 24824738 24824883 + 1.25 NA intron (NR_104111, intron 15 of 21) L2a|LINE|L2 -66871 NM_004403 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 164.25-17 chr10 17077194 17077384 + 1.25 NA intron (NM_001081, intron 17 of 66) intron (NM_001081, intron 17 of 66) 52528 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 182.5-64 chr17 40004390 40004628 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10931 NM_172219 1440 Hs.2233 NM_000759 ENSG00000108342 CSF3 C17orf33|CSF3OS|GCSF colony stimulating factor 3 protein-coding 251-21 chr14 25212328 25212536 + 1.25 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -162135 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 425.5-5 chr4 61470392 61470970 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 268509 NM_001371342 445.75-9 chr8 130698060 130698605 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -254658 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 291.75-3 chr10 34773325 34773663 + 1.25 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) L1ME4c|LINE|L1 41802 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 264.75-3 chr1 162740780 162741160 + 1.25 NA intron (NM_006182, intron 3 of 17) intron (NM_006182, intron 3 of 17) -49732 NM_001304512 51478 Hs.492925 NM_016371 ENSG00000132196 HSD17B7 PRAP|SDR37C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 7 protein-coding 345.5-12 chr14 58136696 58137109 + 1.25 NA intron (NM_001320173, intron 2 of 4) intron (NM_001320173, intron 2 of 4) 15311 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 267-15 chr12 5263675 5264015 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -20694 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 210-95 chr8 55267692 55267955 + 1.25 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 165795 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 213-43 chr2 65904599 65904874 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 453592 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 316.75-15 chr5 53932773 53933226 + 1.25 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) 18600 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 251.5-72 chr5 176598157 176598411 + 1.25 NA exon (NM_052899, exon 2 of 2) exon (NM_052899, exon 2 of 2) 11872 NM_052899 114787 Hs.150549 NM_052899 ENSG00000169258 GPRIN1 GRIN1 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 1 protein-coding 143.25-116 chr3 58254994 58255217 + 1.25 NA intron (NM_001320126, intron 2 of 9) intron (NM_001320126, intron 2 of 9) 17313 NM_001320126 57406 Hs.476454 NM_020676 ENSG00000163686 ABHD6 - abhydrolase domain containing 6 protein-coding 144-44 chr15 85467898 85468105 + 1.25 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 87398 NM_006738 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 300.25-24 chr5 43233664 43234113 + 1.25 NA intron (NR_072980, intron 1 of 3) intron (NR_072980, intron 1 of 3) 41036 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 174.75-12 chr10 53599937 53600189 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -828363 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 193.75-38 chr12 120941121 120941363 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 31050 NR_024345 283460 Hs.612351 NR_024345 ENSG00000241388 HNF1A-AS1 C12orf27|HAS1|NCRNA00262 HNF1A antisense RNA 1 ncRNA 235.25-20 chr14 46791974 46792339 + 1.25 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -140375 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 117.5-56 chr14 49184243 49184431 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 402043 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 199.5-131 chr6 139720359 139720682 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -50553 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 168.75-26 chr11 57109283 57109553 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71884 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 161.25-176 chr8 127718928 127719284 + 1.25 NA intron (NR_117102, intron 1 of 3) intron (NR_117102, intron 1 of 3) 14861 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 198.5-121 chr6 17853769 17854026 + 1.25 NA intron (NM_001105567, intron 6 of 36) (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 133738 NM_001243423 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 195.25-102 chr9 75380272 75380574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 291909 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 211.75-34 chr18 7080898 7081170 + 1.25 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) L1P4|LINE|L1 36763 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 128.75-90 chr2 19033208 19033357 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6311 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 190.25-118 chr7 64780902 64781122 + 1.25 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -13416 NM_001271637 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 428-3 chr21 18354240 18354740 + 1.25 NA intron (NM_002772, intron 8 of 24) intron (NM_002772, intron 8 of 24) 49295 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 127.25-23 chr10 63251475 63251711 + 1.25 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 17630 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 169-61 chr3 105032005 105032196 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -334613 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 172.5-81 chr16 75805683 75806014 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -79358 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 339-27 chr6 42621899 42622220 + 1.25 NA intron (NM_001363705, intron 11 of 46) AluSx1|SINE|Alu 58030 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 217.5-129 chr8 131382437 131382715 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -341667 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 168.25-95 chr3 41170461 41170704 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -28923 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 239.25-59 chr3 121234659 121235027 + 1.25 NA intron (NM_001348343, intron 12 of 27) intron (NM_001348343, intron 12 of 27) 185203 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 205.5-50 chr16 62564847 62565147 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -528559 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 182.25-109 chr7 20065083 20065411 + 1.25 NA intron (NR_110114, intron 1 of 5) intron (NR_110114, intron 1 of 5) 75179 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 146.25-72 chr2 129879246 129879438 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1851 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 191.75-15 chr10 47022860 47023057 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 111236 NM_001320683 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 204-31 chr2 40356095 40356265 + 1.25 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) L2b|LINE|L2 74124 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 170.25-152 chr8 75316828 75317030 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38040 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 298.75-27 chr5 28295316 28295684 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7835 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 278.25-64 chrX 96752498 96752857 + 1.25 NA intron (NM_007309, intron 3 of 26) L2c|LINE|L2 67835 NM_006729 1730 Hs.226483 NM_006729 ENSG00000147202 DIAPH2 DIA|DIA2|DRF2|POF|POF2|POF2A diaphanous related formin 2 protein-coding 136.75-113 chr2 231761984 231762156 + 1.25 NA intron (NM_002601, intron 1 of 4) intron (NM_002601, intron 1 of 4) 19212 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 224-53 chr7 1574493 1574779 + 1.25 NA intron (NR_021487, intron 1 of 5) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 4563 NR_021487 114796 Hs.436146 NR_021487 ENSG00000230487 PSMG3-AS1 - PSMG3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 258.75-29 chr17 27325871 27326311 + 1.25 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 31977 NM_015626 26118 Hs.446017 NM_015626 ENSG00000109046 WSB1 SWIP1|WSB-1 WD repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 207.25-13 chr11 131796663 131796904 + 1.25 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -113141 NR_147850 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 120.75-117 chr3 188254461 188254640 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 29145 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 192.75-62 chr2 167140923 167141101 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_046665) promoter-TSS (NR_046665) -57 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 179-56 chr2 135934672 135934969 + 1.25 NA intron (NM_001293312, intron 4 of 14) AluSg|SINE|Alu -50356 NR_110200 101928243 Hs.602178 NR_110199 ENSG00000231890 DARS-AS1 - DARS antisense RNA 1 ncRNA 154.5-104 chr2 136159412 136159576 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -41339 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 156.75-65 chr16 55386575 55386767 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62112 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 223.75-24 chr14 79730807 79731044 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 18 of 20) MIR3|SINE|MIR 451545 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 165.25-75 chr2 204145839 204146053 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 209198 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 210.5-65 chr2 101602071 101602371 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95482 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 241.5-53 chr2 212722626 212723018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72509 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 168-11 chr10 12033245 12033401 + 1.25 NA intron (NM_080599, intron 2 of 21) AluJb|SINE|Alu 9486 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 339.5-27 chr5 118001841 118002372 + 1.25 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 271745 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 114.75-6 chr1 73091302 73091460 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -214789 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 261-37 chr3 104490982 104491362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -875541 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 181.75-122 chr7 113899775 113900017 + 1.25 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 19113 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 128.5-23 chr10 33099166 33099268 + 1.25 NA intron (NR_160030, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 17590 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 287.75-22 chr16 52500928 52501299 + 1.25 NA intron (NM_001080430, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 46030 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 263.75-10 chr14 24149509 24149875 + 1.25 NA intron (NM_001310332, intron 6 of 20) intron (NM_001310332, intron 6 of 20) 2194 NM_017999 55072 Hs.375217 NM_017999 ENSG00000092098 RNF31 HOIP|Paul|ZIBRA ring finger protein 31 protein-coding 175.5-140 chr6 43631272 43631469 + 1.25 NA intron (NM_001003690, intron 1 of 3) intron (NM_001003690, intron 1 of 3) 1828 NM_001003690 9587 Hs.122346 NM_014628 ENSG00000124688 MAD2L1BP CMT2 MAD2L1 binding protein protein-coding 324-5 chr11 32969196 32969554 + 1.25 NA intron (NM_001076786, intron 10 of 12) intron (NM_001076786, intron 10 of 12) -46503 NM_001077242 91614 Hs.280990 NM_139160 ENSG00000121690 DEPDC7 TR2|dJ85M6.4 DEP domain containing 7 protein-coding 146-75 chr2 185326304 185326470 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -159315 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 207.5 chr1 34725723 34725917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29227 NM_005268 2709 Hs.198249 NM_005268 ENSG00000189280 GJB5 CX31.1 gap junction protein beta 5 protein-coding 206.25-17 chr10 57849989 57850226 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 417787 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 225-6 chr1 223229064 223229422 + 1.25 NA exon (NM_017982, exon 6 of 9) exon (NM_017982, exon 6 of 9) -85995 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 151-133 chr8 108751569 108751797 + 1.25 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 35911 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 300.25-21 chr3 177737572 177737999 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 -79080 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 200.5-134 chr8 58856974 58857201 + 1.25 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 -197234 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 231.5-50 chr2 130843413 130843620 + 1.25 NA intron (NM_001367493, intron 1 of 13) intron (NM_001367493, intron 1 of 13) 6602 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 248.75-5 chr10 58841214 58841568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 126376 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 250-33 chr2 234062653 234062950 + 1.25 NA intron (NM_006944, intron 4 of 7) intron (NM_006944, intron 4 of 7) 12099 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 207.25-41 chr2 79279692 79280033 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -120109 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 124.75-87 chr15 72466231 72466387 + 1.25 NA intron (NR_135678, intron 1 of 3) intron (NR_135678, intron 1 of 3) 7930 NR_135678 105370888 Hs.540241 NR_135678 ENSG00000261423 TMEM202-AS1 - TMEM202 antisense RNA 1 ncRNA 140-57 chr17 17164563 17164741 + 1.25 NA exon (NM_001364716, exon 16 of 24) exon (NM_001364716, exon 16 of 24) 41681 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 406.75-11 chr7 37787982 37788388 + 1.25 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -60412 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 236.75-49 chr6 141474540 141474841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 614109 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 223.75-42 chr19 34634602 34634894 + 1.25 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) intron (NR_027620, intron 1 of 3) -11125 NR_045208 100130342 Hs.679909 NR_045208 SCGB2B3P C2B|SCGB4A3P secretoglobin family 2B member 3, pseudogene pseudo 193-34 chr18 27717406 27717621 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 319128 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 157.25-21 chr11 20243195 20243350 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -82797 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 228.5-51 chr2 23935046 23935254 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -5313 NM_181713 165324 Hs.591576 NM_181713 ENSG00000173960 UBXN2A UBXD4 UBX domain protein 2A protein-coding 135.5-206 chr8 131732023 131732216 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -171974 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 318.5-13 chr17 62719975 62720245 + 1.25 NA intron (NM_001288780, intron 9 of 10) L1MCa|LINE|L1 13904 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 164-75 chr3 31038125 31038426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 123512 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 212.25-58 chr3 102035970 102036422 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 95337 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 165.5-186 chr7 125439917 125440218 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -175776 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 124.75-166 chr4 180959619 180959733 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 199473 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 265-20 chr2 142203558 142203920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -72038 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 175.25-105 chr4 61565947 61566178 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 363890 NM_001371342 185.75-120 chr7 81786237 81786405 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16274 NM_001010932 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 143.5-43 chr12 39089900 39090014 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -184366 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 419-12 chr8 137840531 137841360 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 242600 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 379.25 chr1 84874214 84874592 + 1.25 NA intron (NM_012152, intron 1 of 2) intron (NM_012152, intron 1 of 2) 18803 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 277.5-56 chr4 85336725 85337181 + 1.25 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -138197 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 222.25-69 chr5 81040912 81041131 + 1.25 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -80114 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 361.75-18 chr9 30569522 30570046 + 1.25 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -161330 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 155.75-90 chr20 6813317 6813518 + 1.25 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 45731 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 296 chr1 51495900 51496374 + 1.25 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) MIR|SINE|MIR 23129 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 151.25-206 chrX 45386091 45386478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -119104 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 196-33 chr15 80023603 80023807 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -35863 NM_001242911 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 342.5-6 chr10 115792295 115792782 + 1.25 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) intron (NM_207303, intron 27 of 28) 402251 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 130.5-233 chr7 113111615 113111740 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6877 NM_001352688 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 137.5-214 chr6 148730433 148730620 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16504 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 440.5-9 chr2 171456192 171457062 + 1.25 NA intron (NM_001164821, intron 6 of 11) L1PA12|LINE|L1 -21824 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 192-44 chr14 68937636 68937867 + 1.25 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) intron (NM_001102, intron 1 of 20) 41551 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 170.75-4 chr1 75060356 75060814 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -67849 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 195.5-45 chr15 33469647 33469840 + 1.25 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 158776 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 203.25-57 chr2 186447564 186447851 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -38553 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 236.5-64 chr3 154040705 154040942 + 1.25 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) L1MB2|LINE|L1 -80180 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 300.75-36 chr4 117200438 117200702 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -114994 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 217.5-22 chr11 39335191 39335407 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 686441 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 231.25-4 chr1 220422524 220422841 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -105454 NM_018650 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 177.75 chr1 32636160 32636454 + 1.25 NA intron (NM_001366257, intron 1 of 6) LTR8|LTR|ERV1 14243 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 179.25-92 chr20 38680811 38680989 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43586 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 244-54 chr7 40220684 40221119 + 1.25 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 85925 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 218.25-102 chr8 130850258 130850492 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) intron (NM_001115, intron 9 of 17) 190534 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 243.75-27 chr15 56737945 56738267 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -4020 NM_001288589 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 182-26 chr12 114851531 114851950 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -167565 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 135.75-72 chr16 18962807 18963029 + 1.25 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -21016 NR_136733 79905 Hs.187377 NM_024847 ENSG00000170537 TMC7 - transmembrane channel like 7 protein-coding 210.5-39 chr14 81978742 81979061 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -235763 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 249.5-40 chr17 78065177 78065505 + 1.25 NA intron (NM_018996, intron 5 of 20) AluJb|SINE|Alu 46458 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 267.75-38 chr3 100437755 100438274 + 1.25 NA intron (NM_001085451, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 36475 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 161.25-67 chr16 58777515 58777653 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -43268 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 226-38 chr2 64017494 64017733 + 1.25 NA intron (NM_001005739, intron 1 of 22) intron (NM_001005739, intron 1 of 22) 1815 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 325.75-27 chr6 74308459 74309129 + 1.25 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 239343 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 220-40 chr3 88449289 88449603 + 1.25 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) intron (NM_001368168, intron 2 of 2) 110990 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 406.75 chr1 32684512 32685234 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001135255, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001135255, exon 12 of 12) 17897 NM_030786 81493 Hs.712631 NM_030786 ENSG00000162520 SYNC SYNC1|SYNCOILIN syncoilin, intermediate filament protein protein-coding 201.5-128 chr8 100452792 100453076 + 1.25 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 70171 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 114.25-146 chr5 18866583 18866705 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1019628 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 276.5-55 chr5 59566875 59567144 + 1.25 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 19489 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 223.25-58 chr4 171780116 171780337 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33178 NM_001034845 442117 Hs.386236 NM_001034845 ENSG00000174473 GALNTL6 GALNACT20|GALNT17|GalNAc-T6L polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase like 6 protein-coding 220-37 chr21 29603509 29603750 + 1.25 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) intron (NM_000830, intron 7 of 16) 7589 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 317-12 chr14 76729143 76729492 + 1.25 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 -32151 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 313.25-15 chr22 28382931 28383290 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 -76759 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 262.25-55 chr9 131300307 131300646 + 1.25 NA intron (NM_032728, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 10753 NM_032728 84814 Hs.134292 NM_032728 ENSG00000160539 PLPP7 C9orf67|NET39|PPAPDC3 phospholipid phosphatase 7 (inactive) protein-coding 228.25-68 chr5 58058891 58059210 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 63291 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 185.5-8 chr1 159251221 159251420 + 1.25 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -38394 NM_002001 2205 Hs.897 NM_002001 ENSG00000179639 FCER1A FCE1A|FcERI Fc fragment of IgE receptor Ia protein-coding 253.25-40 chr3 18115374 18115628 + 1.25 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) L1ME1|LINE|L1 152949 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 200.5-11 chr1 158806267 158806500 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24968 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 158.5-173 chr6 126878895 126879081 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -239683 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 216.25-76 chr4 44556928 44557232 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 94561 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 287.75-44 chr6 169959159 169959510 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3289 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 289.5-11 chr14 31502992 31503270 + 1.25 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -15092 NM_001197184 2856 Hs.727479 NM_001197184 ENSG00000214943 GPR33 - G protein-coupled receptor 33 (gene/pseudogene) protein-coding 192.25-110 chr9 80634999 80635220 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 660086 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 151.25-124 chr3 68331228 68331432 + 1.25 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L1MB5|LINE|L1 -169307 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 185.5-20 chr10 108825768 108825991 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -756586 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 373.75-2 chr12 58351391 58351893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -240060 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 234-63 chr7 70898406 70898597 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -233643 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 155.25-131 chr4 48587914 48588107 + 1.25 NA intron (NM_015030, intron 18 of 63) Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger 97758 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 195.5-115 chr5 25292646 25292863 + 1.25 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) intron (NR_136209, intron 1 of 3) 101801 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 295-31 chr8 140783681 140784078 + 1.25 NA intron (NR_148036, intron 14 of 34) AluSx|SINE|Alu -51226 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 223.25-53 chr3 113255458 113255695 + 1.25 NA intron (NM_001301861, intron 4 of 19) intron (NM_001301861, intron 4 of 19) 43460 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 169-66 chr4 40202327 40202607 + 1.25 NA intron (NM_001278362, intron 2 of 3) intron (NM_001278362, intron 2 of 3) 5436 NM_004310 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 234-55 chr5 74647861 74648265 + 1.25 NA intron (NM_001292004, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR -6639 NM_003633 8507 Hs.104925 NM_003633 ENSG00000171617 ENC1 CCL28|ENC-1|KLHL35|KLHL37|NRPB|PIG10|TP53I10 ectodermal-neural cortex 1 protein-coding 177.5-161 chr7 49791042 49791258 + 1.25 NA intron (NR_136188, intron 1 of 3) intron (NR_136188, intron 1 of 3) 15817 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 226.5-102 chr8 99975678 99975863 + 1.25 NA intron (NM_015668, intron 23 of 27) AluJo|SINE|Alu -28812 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 241.75-3 chr10 16936515 16936801 + 1.25 NA intron (NM_001081, intron 39 of 66) intron (NM_001081, intron 39 of 66) -119204 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 261-58 chr7 117672696 117673231 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -108287 NR_149084 111082987 Hs.583149 NR_149084 ENSG00000232661 CFTR-AS1 BGas CFTR antisense RNA 1 ncRNA 184.75-77 chr4 141558849 141559199 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -77559 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 338.25-16 chr21 29924792 29925176 + 1.25 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 15012 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 208-3 chr1 174279112 174279449 + 1.25 NA intron (NM_001366445, intron 10 of 13) intron (NM_001366445, intron 10 of 13) 4180 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 123.5-145 chr3 177581918 177582068 + 1.25 NA intron (NR_047568, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 140072 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 155.5-144 chr4 72128582 72128865 + 1.25 NA exon (NM_004885, exon 2 of 4) exon (NM_004885, exon 2 of 4) 89591 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 334.5-27 chr6 125411075 125411402 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109271 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 246.5-67 chr7 46600941 46601289 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 96007 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 160.75-55 chr16 82554856 82555105 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71989 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 254-49 chr8 131645126 131645641 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -258710 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 198.5-63 chr19 48292853 48293128 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21703 NM_001369812 163071 Hs.511883 NM_153608 ENSG00000178150 ZNF114 - zinc finger protein 114 protein-coding 316-27 chr7 14147431 14147923 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001350716, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001350716, exon 25 of 25) -156252 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 257-55 chr8 123512635 123513089 + 1.25 NA intron (NM_001242463, intron 4 of 6) intron (NM_001242463, intron 4 of 6) 19281 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 296-18 chr18 1648744 1649162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -289324 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 215.75-53 chr2 149112727 149113022 + 1.25 NA intron (NM_001317004, intron 1 of 6) intron (NM_001317004, intron 1 of 6) -5300 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 125.25-113 chr2 172308824 172308967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118441 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 341.75-3 chr1 222840980 222841476 + 1.25 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) intron (NM_032890, intron 1 of 9) 26189 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 256-76 chr9 29973083 29973467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 435179 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 120.5-190 chr5 163076224 163076347 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -361286 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 181-64 chr21 28975630 28975852 + 1.25 NA intron (NM_015565, intron 6 of 29) L1ME1|LINE|L1 17136 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 224.25-86 chr6 163763854 163764227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92556 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 295.5-25 chr2 46713916 46714289 + 1.25 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 14807 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 159.25-25 chr11 112076424 112076745 + 1.25 NA intron (NR_103469, intron 2 of 5) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 2285 NM_001301021 55216 Hs.195060 NM_018195 ENSG00000150776 NKAPD1 C11orf57 NKAP domain containing 1 protein-coding 245.5-71 chr7 11125904 11126380 + 1.25 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) intron (NR_033436, intron 16 of 16) 152270 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 243.25-32 chr3 94539987 94540372 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -398084 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 319.25-6 chr18 13765096 13765581 + 1.25 NA TTS (NM_001308263) TTS (NM_001308263) 38665 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 247-38 chr20 36989921 36990184 + 1.25 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -38209 NM_015474 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 161.25-122 chr3 60362784 60362941 + 1.25 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 255008 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 178.75-62 chr3 96537606 96537844 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 177761 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 267-41 chr6 13268564 13268914 + 1.25 NA intron (NM_001318809, intron 8 of 8) intron (NM_001318809, intron 8 of 8) 14703 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 507.25-3 chr19 29030452 29031534 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 28438 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 185.5-53 chr14 77104139 77104429 + 1.25 NA intron (NM_033426, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 6026 NM_033426 85457 Hs.709066 NM_033426 ENSG00000198894 CIPC KIAA1737 CLOCK interacting pacemaker protein-coding 159.5-17 chr10 13254354 13254519 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -20062 NM_001303119 221044 Hs.112998 NM_145314 ENSG00000165623 UCMA C10orf49|GRP|GRP/UCMA upper zone of growth plate and cartilage matrix associated protein-coding 209.5-5 chr1 118218215 118218387 + 1.25 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -33073 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 251.5-63 chr5 18063988 18064312 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 256876 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 405.25-11 chr4 171343132 171343574 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 157169 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 165.75-93 chr2 202387009 202387177 + 1.25 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 10766 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 471.5-4 chr10 69766277 69766982 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35277 NM_080802 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 215.25-79 chr5 43444270 43444653 + 1.25 NA 3' UTR (NM_022483, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_022483, exon 3 of 3) -32070 NM_148672 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 176.75-46 chr15 73479984 73480209 + 1.25 NA intron (NM_001348772, intron 2 of 4) L1MA9|LINE|L1 36932 NM_001348772 283677 Hs.743574 NM_001042367 ENSG00000183324 REC114 C15orf60|CT147 REC114 meiotic recombination protein protein-coding 331-26 chr5 46166219 46166601 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -470030 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 375.75-10 chr2 72620307 72620648 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1PA16|LINE|L1 205556 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 258-35 chr3 53002820 53003216 + 1.25 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) AluSz|SINE|Alu 43055 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 249.5-47 chr2 20495474 20495792 + 1.25 NA intron (NR_157978, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 5891 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 208.5-75 chr2 147351901 147352230 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -492452 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 196-63 chr3 71986452 71986759 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 113850 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 137-30 chr10 124266476 124266635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 152368 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 220-60 chr7 103813373 103813714 + 1.25 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 175973 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 221.75-41 chr2 206189670 206190125 + 1.25 NA intron (NM_001098199, intron 2 of 2) intron (NM_001098199, intron 2 of 2) -13479 NR_104359 101669764 Hs.574781 NR_104359 GPR1-AS GPR1-AS1|GPR1AS GPR1 antisense RNA ncRNA 361.75-11 chr18 865751 866071 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -38960 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 268.5-13 chr12 40696749 40697142 + 1.25 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1ME4c|LINE|L1 4503 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 239.5-36 chr17 8813575 8813970 + 1.25 NA intron (NM_001010855, intron 18 of 19) L1PA15-16|LINE|L1 -14407 NM_152599 162387 Hs.213603 NM_152599 ENSG00000185156 MFSD6L - major facilitator superfamily domain containing 6 like protein-coding 206.25-51 chr2 42582761 42583023 + 1.25 NA intron (NM_001330443, intron 3 of 16) intron (NM_001330443, intron 3 of 16) 14260 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 223.5-121 chr7 96105910 96106143 + 1.25 NA intron (NM_001278422, intron 15 of 15) L1M4|LINE|L1 113730 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 257.5-41 chr20 37899124 37899538 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3796 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 237-29 chr2 153735531 153735928 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -136193 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 251.5-61 chr5 11076378 11076709 + 1.25 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) intron (NM_001288715, intron 15 of 20) -315309 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 230.75-22 chr14 54315792 54316042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80951 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 171.5-35 chr12 23134137 23134371 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41382 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 285.5-36 chr22 31821500 31821875 + 1.25 NA intron (NR_146296, intron 23 of 42) intron (NR_146296, intron 23 of 42) 67664 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 292.25-18 chr15 86193344 86193693 + 1.25 NA intron (NM_152336, intron 5 of 24) intron (NM_152336, intron 5 of 24) -76801 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 177.75-136 chr8 54686468 54686652 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70464 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 178-4 chr1 233399728 233400066 + 1.25 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 72173 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 139.25-107 chr21 19360044 19360162 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 539652 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 122-89 chr2 43083684 43083819 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 18694 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 262.5-57 chr4 73688966 73689336 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -51418 NM_001354840 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 184-96 chr8 124157144 124157480 + 1.25 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 14210 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 182.75-37 chr12 32886919 32887153 + 1.25 NA intron (NM_001005242, intron 1 of 12) intron (NM_001005242, intron 1 of 12) 9810 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 184.25-67 chr2 207131906 207132180 + 1.25 NA intron (NM_001270943, intron 1 of 3) intron (NM_001270943, intron 1 of 3) 2094 NM_001270944 8609 Hs.59908 NM_003709 ENSG00000118263 KLF7 UKLF Kruppel like factor 7 protein-coding 322.25-5 chr16 77493753 77494039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58862 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 220-14 chr11 81891074 81891285 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_036186) promoter-TSS (NR_036186) -343 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 229.75-4 chr1 79449682 79449981 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -443101 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 229.5-135 chr8 132785350 132785564 + 1.25 NA intron (NM_198513, intron 2 of 7) intron (NM_198513, intron 2 of 7) 10069 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 262 chr1 11026053 11026498 + 1.25 NA TTS (NM_007375) TTS (NM_007375) 13653 NM_007375 23435 Hs.300624 NM_007375 ENSG00000120948 TARDBP ALS10|TDP-43 TAR DNA binding protein protein-coding 209.5-133 chr6 71423108 71423416 + 1.25 NA intron (NR_121615, intron 1 of 7) intron (NR_121615, intron 1 of 7) 2235 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 345.75-4 chr17 63659918 63660213 + 1.25 NA intron (NM_203351, intron 6 of 16) MER5C|DNA|hAT-Charlie 37648 NM_203351 4215 Hs.29282 NM_002401 ENSG00000198909 MAP3K3 MAPKKK3|MEKK3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 protein-coding 116.75-43 chr11 123935675 123935801 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -3879 NM_001001965 219875 Hs.553639 NM_001001965 ENSG00000171014 OR4D5 OR11-276 olfactory receptor family 4 subfamily D member 5 protein-coding 113.5-153 chr3 13039588 13039701 + 1.25 NA intron (NM_001134382, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 33785 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 203-15 chr10 87698154 87698444 + 1.25 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) intron (NM_001015880, intron 1 of 12) 38421 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 267.5-38 chr2 166796391 166796792 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91896 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 195.5-161 chr8 128465207 128465420 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 99366 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 195.5-168 chr9 135451124 135451327 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21024 NR_038969 100506599 Hs.561897 NR_038969 ENSG00000225361 PPP1R26-AS1 - PPP1R26 antisense RNA 1 ncRNA 146.5-148 chr4 22739650 22739910 + 1.25 NA intron (NR_102356, intron 2 of 2) intron (NR_102356, intron 2 of 2) 25691 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 173.75-64 chr16 4717715 4717902 + 1.25 NA intron (NR_040252, intron 5 of 16) AluSx|SINE|Alu 16463 NM_133450 124401 Hs.654859 NM_133450 ENSG00000168096 ANKS3 - ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 182.75-99 chr5 17172122 17172356 + 1.25 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) L1MC5a|LINE|L1 -16247 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 209.75-108 chr9 84725489 84725681 + 1.25 NA intron (NM_001369546, intron 8 of 12) intron (NM_001369546, intron 8 of 12) 19684 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 253.75-41 chr3 185357641 185357962 + 1.25 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) -5335 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 215.25-72 chr4 159783716 159784124 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6136 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 117.75-3 chr1 43717057 43717238 + 1.25 NA intron (NR_125986, intron 3 of 3) intron (NR_125986, intron 3 of 3) 9611 NM_174963 6487 Hs.597915 NM_006279 ENSG00000126091 ST3GAL3 EIEE15|MRT12|SIAT6|ST3GALII|ST3Gal III|ST3GalIII|ST3N ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 3 protein-coding 304.25-20 chr4 63852132 63852386 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 557191 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 119-101 chr20 31535823 31536005 + 1.25 NA intron (NM_178580, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 21472 NM_178582 81502 Hs.373741 NM_030789 ENSG00000101294 HM13 H13|IMP1|IMPAS|IMPAS-1|MSTP086|PSENL3|PSL3|SPP|SPPL1 histocompatibility minor 13 protein-coding 230.25-24 chr14 31781152 31781617 + 1.25 NA intron (NM_001201574, intron 1 of 5) MER101-int|LTR|ERV1 66815 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 523.25 chr3 88611576 88612384 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 273524 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 181.75-85 chr3 132655900 132656103 + 1.25 NA intron (NM_198329, intron 1 of 11) intron (NM_198329, intron 1 of 11) 1555 NM_198329 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 239-27 chr2 76636165 76636471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -349647 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 154.25-19 chr10 107962413 107962584 + 1.25 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) L1MB1|LINE|L1 106795 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 272.5-12 chr11 24939398 24939729 + 1.25 NA intron (NM_001009909, intron 7 of 11) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 442510 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 255.5-64 chr5 4104782 4105138 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 509128 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 272.25-24 chr2 8847433 8847855 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10031 NM_020738 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 179.25-79 chr2 148869855 148870052 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -5274 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 141-157 chr8 122178383 122178549 + 1.25 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 390178 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 182-6 chr1 71016821 71017010 + 1.25 NA intron (NM_198719, intron 1 of 3) intron (NM_198719, intron 1 of 3) -29591 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 198-81 chr8 118171204 118171524 + 1.25 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) L1MB8|LINE|L1 -59545 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 205-72 chr7 122226060 122226349 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77454 NR_036484 154860 Hs.664204 NR_036484 ENSG00000230316 FEZF1-AS1 - FEZF1 antisense RNA 1 ncRNA 220-52 chr6 52913586 52913845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4017 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 182.75-94 chr4 110912858 110913050 + 1.25 NA Intergenic (ATGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -52307 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 207-93 chr8 135551945 135552156 + 1.25 NA intron (NM_006558, intron 4 of 8) L1M4a2|LINE|L1 94594 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 186.25-8 chr1 171548685 171548910 + 1.25 NA intron (NM_015172, intron 17 of 33) intron (NM_015172, intron 17 of 33) 63267 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 286.5-19 chr12 18411179 18411534 + 1.25 NA intron (NM_001288774, intron 16 of 32) MIR3|SINE|MIR 149816 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 143.75-75 chr18 51928481 51928678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -411618 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 478.25 chr17 59642114 59642720 + 1.25 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) intron (NM_001288653, intron 1 of 31) 22522 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 237.25-47 chr3 43052790 43053068 + 1.25 NA intron (NM_001129908, intron 2 of 4) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 53150 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 156.5-140 chr4 160498543 160498772 + 1.25 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -720873 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 148.5-240 chr9 13435395 13435559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4148 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 298.25-3 chr10 50295805 50296092 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -47338 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 223.25-15 chr13 59193392 59193804 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -819120 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 252.25-46 chr5 16113141 16113411 + 1.25 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 66515 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 243.5-55 chr4 35280148 35280485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 963623 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 130-122 chr5 13975389 13975613 + 1.25 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -31021 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 134.5-32 chr10 95797072 95797273 + 1.25 NA intron (NR_038444, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 41009 NM_001164183 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 177.5-23 chr11 54752917 54753139 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 46196 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 439.25 chr1 175922155 175922822 + 1.25 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 45145 NR_125964 101928751 NR_125964 ENSG00000224718 LINC01657 - long intergenic non-protein coding RNA 1657 ncRNA 161.25-187 chrX 38609901 38610100 + 1.25 NA intron (NM_004615, intron 1 of 7) intron (NM_004615, intron 1 of 7) 48522 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 185.25-90 chr4 92524466 92524623 + 1.25 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 220145 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 194-70 chr5 132966921 132967270 + 1.25 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -3461 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 263.5-61 chr7 41461760 41461992 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -232043 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 258.75-23 chr14 88140722 88140989 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -114543 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 232-62 chr4 167190396 167190658 + 1.25 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) L1MA9|LINE|L1 43899 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 148.75-112 chr3 119068457 119068659 + 1.25 NA intron (NM_152538, intron 3 of 8) intron (NM_152538, intron 3 of 8) -33712 NM_001353326 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 221.25-77 chr6 96041259 96041615 + 1.25 NA intron (NM_006581, intron 1 of 2) intron (NM_006581, intron 1 of 2) 25463 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 281.75-23 chr17 76071674 76071991 + 1.25 NA intron (NM_014230, intron 1 of 15) intron (NM_014230, intron 1 of 15) 685 NM_014230 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 219.25-82 chrX 69593557 69593837 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -22416 NM_001005610 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 250.75 chr1 20706953 20707549 + 1.25 NA intron (NM_001122819, intron 4 of 14) L1ME4c|LINE|L1 10756 NM_001122819 57576 Hs.130411 NM_020816 ENSG00000117245 KIF17 KIF17B|KIF3X|KLP-2|OSM-3 kinesin family member 17 protein-coding 133.75-60 chr14 58941765 58941916 + 1.25 NA intron (NR_110547, intron 3 of 5) intron (NR_110547, intron 3 of 5) 113552 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 136-60 chr18 36505480 36505652 + 1.25 NA intron (NM_001281740, intron 4 of 28) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 157852 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 276-18 chr12 76231107 76231334 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -28663 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 200-65 chr4 49646052 49646348 + 1.25 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 659558 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 264-15 chr14 38699212 38699488 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -183246 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 300.25-31 chr9 115827741 115828071 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -83667 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 270.25-32 chr22 39419226 39419646 + 1.25 NA intron (NM_153497, intron 6 of 10) intron (NM_153497, intron 6 of 10) -12724 NR_040535 100506472 Hs.729080 NR_040535 LOC100506472 - uncharacterized LOC100506472 ncRNA 176.5-121 chr3 88164079 88164257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14209 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 251-30 chr2 33451522 33451749 + 1.25 NA intron (NM_170672, intron 2 of 18) L1MA8|LINE|L1 -6420 NM_001349979 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 232-75 chr8 124213995 124214237 + 1.25 NA intron (NR_125420, intron 1 of 2) intron (NR_125420, intron 1 of 2) 33282 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 175.5-104 chr21 24249100 24249338 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72158 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 180-31 chr14 52202336 52202577 + 1.25 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -65242 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 274.25-9 chr10 91461970 91462306 + 1.25 NA exon (NM_001348365, exon 5 of 21) exon (NM_001348365, exon 5 of 21) 51853 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 263.25-12 chr10 58344589 58344987 + 1.25 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) intron (NM_003338, intron 1 of 6) 9782 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 145.25-105 chr3 118044239 118044466 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -353427 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 261-45 chr5 55443521 55443930 + 1.25 NA intron (NR_103485, intron 4 of 6) intron (NR_103485, intron 4 of 6) 65201 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 259.25-38 chr6 47053238 47053533 + 1.25 NA Intergenic Ricksha|DNA|MULE-MuDR -11053 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 192.75-30 chr14 34170055 34170329 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -219118 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 276-37 chr5 25853738 25854049 + 1.25 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 662940 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 238.25-32 chr2 22253789 22254056 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -282557 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 246-56 chr7 4501981 4502326 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -180142 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 218.25-5 chr1 97368235 97368433 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 16 of 22) MIRc|SINE|MIR 272411 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 301-21 chr4 105179999 105180265 + 1.25 NA intron (NR_126420, intron 2 of 5) intron (NR_126420, intron 2 of 5) 33447 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 255.25-41 chr5 87681331 87681705 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19476 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 260.75-50 chr5 16264265 16264509 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 84146 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 150.5-55 chr14 89265727 89265873 + 1.25 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 151433 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 236 chr1 60228418 60228847 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -154862 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 178-60 chr3 43883889 43884098 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -192399 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 262.5-61 chr5 24004496 24004762 + 1.25 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 53281 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 214.5-134 chr9 104323777 104324005 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 53662 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 222.75-62 chr2 98793691 98793993 + 1.25 NA TTS (NM_207362) TTS (NM_207362) -21944 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 132-58 chr15 63716946 63717064 + 1.25 NA intron (NM_003922, intron 21 of 77) intron (NM_003922, intron 21 of 77) -116178 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 133.25-20 chr10 41903406 41903616 + 1.25 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 464534 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 266.25-35 chr5 25693202 25693484 + 1.25 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 502390 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 205.5-149 chr8 107841549 107841798 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 240266 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 271.5-50 chr21 30048959 30049320 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -109087 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 180.25-115 chr8 62185200 62185430 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63539 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 442.5-2 chr17 71242615 71243093 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40675 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 153-140 chr7 37777744 37777938 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -70756 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 229.25-81 chr8 78034654 78034880 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -481573 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 348.25-8 chr2 22314479 22314876 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -221802 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 271.25-21 chr13 31358787 31359151 + 1.25 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 158994 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 297-26 chr2 12438226 12438697 + 1.25 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 239331 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 218.25-24 chr13 68076535 68076778 + 1.25 NA Intergenic (ATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 704269 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 152.5-126 chr3 192081053 192081308 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157450 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-124 chr5 177589525 177589802 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2540 NM_017510 54732 Hs.279929 NM_017510 ENSG00000184840 TMED9 GMP25|HSGP25L2G|p24a2|p24alpha2|p25 transmembrane p24 trafficking protein 9 protein-coding 165.75-115 chr3 163873768 163873957 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 297694 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 311.5-26 chr5 64882160 64882798 + 1.25 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 113549 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 182.75-78 chr20 58753155 58753461 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20117 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 156-79 chr2 25322267 25322443 + 1.25 NA intron (NR_135490, intron 1 of 23) MIR3|SINE|MIR 6366 NR_031570 100302246 NR_031570 ENSG00000221445 MIR1301 MIRN1301|hsa-mir-1301|mir-1301 microRNA 1301 ncRNA 477.75 chr10 26096736 26097494 + 1.25 NA intron (NM_017433, intron 17 of 34) L1MB8|LINE|L1 -119192 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 374.75-15 chr8 124813882 124814649 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -7720 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 258.25-18 chr13 112684355 112684796 + 1.25 NA TTS (NM_207440) TTS (NM_207440) -5754 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 325.5-28 chr4 39984975 39985381 + 1.25 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -7222 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 207.5-68 chr3 82594756 82595032 + 1.25 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 608752 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 188.5-92 chr22 25822069 25822325 + 1.25 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) L2a|LINE|L2 80009 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 123.75-45 chr12 121682467 121682616 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9897 NM_001363685 283385 Hs.434154 NM_173855 ENSG00000139714 MORN3 - MORN repeat containing 3 protein-coding 285-17 chr17 64209977 64210360 + 1.25 NA intron (NM_018469, intron 2 of 11) intron (NM_018469, intron 2 of 11) 20566 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 207.25-28 chr16 74880936 74881178 + 1.25 NA intron (NM_030581, intron 25 of 25) intron (NM_030581, intron 25 of 25) 104066 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 124-165 chr8 80419861 80419976 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -65675 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 131.25-116 chr2 223246229 223246421 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 194395 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 115.25-122 chr21 31885219 31885335 + 1.25 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) intron (NM_014586, intron 1 of 10) 12257 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 214.5-40 chr16 49163600 49163958 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 118059 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 134.75-14 chr1 164319707 164319881 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -239566 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 150.5-134 chr3 119557113 119557324 + 1.25 NA intron (NM_005191, intron 2 of 6) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 2396 NM_005191 941 Hs.838 NM_005191 ENSG00000121594 CD80 B7|B7-1|B7.1|BB1|CD28LG|CD28LG1|LAB7 CD80 molecule protein-coding 196.5-158 chr7 52226822 52227073 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -808686 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 151-26 chr12 32292540 32292852 + 1.25 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) -106862 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 285.5-32 chr2 48986545 48986948 + 1.25 NA intron (NM_181446, intron 5 of 8) intron (NM_181446, intron 5 of 8) -72857 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 181.5-67 chr2 22371766 22371923 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -164635 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 112.5-136 chr2 190359846 190360035 + 1.25 NA intron (NM_001128928, intron 2 of 6) intron (NM_001128928, intron 2 of 6) 16351 NM_002194 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 347-13 chr2 30590619 30591062 + 1.25 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 143594 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 144.75-175 chr8 84873083 84873241 + 1.25 NA intron (NM_001287244, intron 5 of 7) intron (NM_001287244, intron 5 of 7) 167235 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 204.75-10 chr1 184033518 184033807 + 1.25 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) intron (NM_001303421, intron 1 of 11) 4066 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 261-36 chr3 87335861 87336290 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59491 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 327.75-4 chr10 18411045 18411431 + 1.25 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) intron (NM_201593, intron 3 of 13) 10663 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 161.5-2 chr1 22105059 22105240 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 37948 NM_030761 54361 Hs.25766 NM_030761 ENSG00000162552 WNT4 SERKAL|WNT-4 Wnt family member 4 protein-coding 154.75-27 chr12 42310425 42310678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13308 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 220.25-11 chr11 15962303 15962654 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7143 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 307.5-32 chr22 39784986 39785386 + 1.25 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) L1MEd|LINE|L1 108574 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 192.25 chr1 27057207 27057566 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -44536 NM_052943 115572 Hs.632378 NM_052943 ENSG00000158246 TENT5B FAM46B terminal nucleotidyltransferase 5B protein-coding 254.5-65 chr6 85634343 85634670 + 1.25 NA intron (NM_001159676, intron 5 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 6945 NM_001159676 10492 Hs.571177 NM_006372 ENSG00000135316 SYNCRIP GRY-RBP|GRYRBP|HNRNPQ|HNRPQ1|NSAP1|PP68|hnRNP-Q synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein protein-coding 276.25-44 chr8 82725446 82725677 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186543 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 153.25-81 chr22 25125126 25125328 + 1.25 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) MIRc|SINE|MIR -12535 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 250.5-100 chr8 132385376 132385806 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 61671 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 205.25-11 chr11 76035658 76035980 + 1.25 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) intron (NM_003369, intron 12 of 14) 170683 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 174.5-40 chr11 106722072 106722317 + 1.25 NA intron (NM_000855, intron 6 of 7) intron (NM_000855, intron 6 of 7) 296282 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 422-7 chr21 29956967 29957590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17226 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 250.75-54 chr4 153072125 153072514 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -80015 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 185-58 chr3 112881763 112881963 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -35913 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 264-34 chr2 69581996 69582557 + 1.25 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 61463 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 189.75-118 chr7 116280777 116281055 + 1.25 NA intron (NR_130923, intron 2 of 2) intron (NR_130923, intron 2 of 2) 5748 NR_130921 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 373.5-15 chr3 117829254 117829611 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -138507 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 219-33 chr14 37898599 37898917 + 1.25 NA non-coding (NR_135286, exon 2 of 2) non-coding (NR_135286, exon 2 of 2) 3366 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 276-32 chr3 188509079 188509374 + 1.25 NA intron (NM_001167672, intron 3 of 9) intron (NM_001167672, intron 3 of 9) 59440 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 157.5-53 chr14 37418088 37418235 + 1.25 NA intron (NM_138731, intron 11 of 13) intron (NM_138731, intron 11 of 13) 177088 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 189-69 chr2 227815527 227815824 + 1.25 NA intron (NM_004591, intron 2 of 3) intron (NM_004591, intron 2 of 3) 1833 NM_001130046 6364 Hs.75498 NM_004591 ENSG00000115009 CCL20 CKb4|Exodus|LARC|MIP-3-alpha|MIP-3a|MIP3A|SCYA20|ST38 C-C motif chemokine ligand 20 protein-coding 223.25-29 chr2 10235457 10235801 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42958 NR_036222 100422929 NR_036222 ENSG00000265418 MIR4261 - microRNA 4261 ncRNA 310-22 chr5 160627972 160628417 + 1.25 NA intron (NM_001366652, intron 12 of 24) LTR86A1|LTR|ERVL 57197 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 162-39 chr14 64760586 64760837 + 1.25 NA intron (NM_001024858, intron 31 of 34) MIRb|SINE|MIR 24975 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 268.75-20 chr20 10290592 10291003 + 1.25 NA intron (NM_001322907, intron 6 of 9) intron (NM_001322907, intron 6 of 9) -71291 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 215.75-16 chr10 111766383 111766791 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 417178 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 172.75-32 chr14 26995720 26995940 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 87188 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 139-112 chr5 28606289 28606432 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -318695 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 202.75-36 chr14 61706072 61706381 + 1.25 NA intron (NM_001243084, intron 1 of 14) intron (NM_001243084, intron 1 of 14) 8604 NM_001243084 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 281.25-18 chr16 65741379 65741669 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -165224 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 379-8 chr5 45808839 45809408 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -112743 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 178.75-21 chr12 60672728 60673079 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 983533 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 133.25-223 chr9 75566508 75566617 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -324082 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 207.75-5 chr1 84349524 84349844 + 1.25 NA exon (NM_001010971, exon 4 of 4) exon (NM_001010971, exon 4 of 4) 35117 NR_003927 391051 Hs.647646 NR_003927 UOX UOXP|URICASE urate oxidase (pseudogene) pseudo 173.25-26 chr12 47224285 47224516 + 1.25 NA intron (NM_138371, intron 3 of 3) intron (NM_138371, intron 3 of 3) -7957 NR_026544 100233209 Hs.657722 NR_026544 ENSG00000247774 PCED1B-AS1 - PCED1B antisense RNA 1 ncRNA 302.25 chr1 240165648 240166133 + 1.25 NA intron (NM_020066, intron 2 of 17) intron (NM_020066, intron 2 of 17) 74007 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 138.25-35 chr12 3832307 3832475 + 1.25 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) intron (NM_020367, intron 1 of 7) 41008 NM_001286522 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 165-131 chr7 82279911 82280117 + 1.25 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 163763 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 127.75-32 chr10 80806974 80807124 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 157252 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 229.5-16 chr10 57947636 57947965 + 1.25 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 320094 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 237.75-38 chr2 74323337 74323622 + 1.25 NA intron (NM_133478, intron 5 of 30) HAL1|LINE|L1 -8454 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 213.75-67 chr3 81903762 81904085 + 1.25 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -82219 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 273.75-51 chrX 125166505 125166838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153200 NM_001195272 100129520 NM_001195272 ENSG00000282815 TEX13C - TEX13 family member C protein-coding 215.25-9 chr10 122296105 122296409 + 1.25 NA intron (NM_001318189, intron 7 of 15) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 24961 NM_144587 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 363-3 chr12 42075350 42075811 + 1.25 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 69294 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 224.25-88 chr7 7494886 7495256 + 1.25 NA intron (NM_001037763, intron 11 of 34) MER33|DNA|hAT-Charlie 40802 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 230-45 chr3 42759471 42759710 + 1.25 NA intron (NM_144719, intron 1 of 15) L1ME1|LINE|L1 -11022 NR_122070 729083 Hs.713395 NR_122070 ENSG00000225611 LINC02158 - long intergenic non-protein coding RNA 2158 ncRNA 246.25-54 chr5 108280417 108280785 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) L1PB4|LINE|L1 101497 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 270.5-51 chr5 37947363 37947588 + 1.25 NA Intergenic (ATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1016 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 205.5-105 chr4 43225117 43225383 + 1.25 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 267293 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 283.5-33 chr2 233225129 233225424 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26295 NM_198890 55054 Hs.529322 NM_017974 ENSG00000085978 ATG16L1 APG16L|ATG16A|ATG16L|IBD10|WDR30 autophagy related 16 like 1 protein-coding 225.75-73 chr8 4616317 4616633 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) intron (NM_033225, intron 2 of 69) 378439 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 161.75-110 chr5 152737631 152737823 + 1.25 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 234622 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 239.25-76 chr6 35866103 35866392 + 1.25 NA intron (NM_003137, intron 12 of 15) L1PB4|LINE|L1 54851 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 187.25-69 chr22 45214446 45214626 + 1.25 NA intron (NM_001009880, intron 1 of 9) L1ME2z|LINE|L1 -2070 NM_015264 23313 Hs.592207 NM_015264 ENSG00000100364 KIAA0930 C22orf9|LSC3 KIAA0930 protein-coding 316.25-17 chr4 34095508 34095895 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -55808 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 341-28 chrX 118860083 118860560 + 1.25 NA intron (NR_110393, intron 6 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 20765 NR_110393 101928287 Hs.496647 NR_110393 ENSG00000203650 LINC01285 - long intergenic non-protein coding RNA 1285 ncRNA 130.75-72 chr17 66503870 66504037 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -87099 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 192.25-77 chr3 164395511 164395931 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -224165 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 237.75-74 chr6 48577499 48578037 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -509079 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 123.5-194 chr6 164556487 164556686 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 265477 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 335-5 chr10 117051332 117051726 + 1.25 NA intron (NM_001258300, intron 1 of 17) L1MB5|LINE|L1 -45952 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 210.25-56 chr4 31696663 31696950 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 190262 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 167.5-69 chr16 35514949 35515130 + 1.25 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -7869 NR_034018 100130700 Hs.97712 NR_034018 TP53TG3HP - TP53 target 3 family member H, pseudogene pseudo 113.75-151 chr5 33652251 33652384 + 1.25 NA intron (NM_001324512, intron 7 of 21) L1PB4|LINE|L1 211541 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 246.5-36 chr19 9436480 9437073 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1198 NM_001271314 10781 Hs.656185 NM_006631 ENSG00000174652 ZNF266 HZF1 zinc finger protein 266 protein-coding 175.75-10 chr1 165962649 165962892 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 54849 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 123.25-61 chr15 50024348 50024517 + 1.25 NA intron (NR_073596, intron 6 of 27) intron (NR_073596, intron 6 of 27) 88947 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 157.75-170 chr8 91084966 91085108 + 1.25 NA 3' UTR (NM_016023, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_016023, exon 7 of 7) 14693 NM_001286745 51633 Hs.30532 NM_016023 ENSG00000155100 OTUD6B CGI-77|DUBA-5|DUBA5|IDDFSDA OTU domain containing 6B protein-coding 152.25-120 chr4 167768658 167768822 + 1.25 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -323797 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 320.25-5 chr10 103004842 103005189 + 1.25 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -86680 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 117-71 chr17 56904953 56905114 + 1.25 NA intron (NM_005082, intron 2 of 8) L1ME3C|LINE|L1 9016 NM_005082 7706 Hs.528952 NM_005082 ENSG00000121060 TRIM25 EFP|RNF147|Z147|ZNF147 tripartite motif containing 25 protein-coding 238.25-28 chr18 14080630 14080889 + 1.25 NA intron (NR_033354, intron 3 of 5) L1MC1|LINE|L1 51676 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 204.75-60 chr2 44127139 44127468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -41500 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 345.5-13 chr14 70741938 70742347 + 1.25 NA intron (NM_033141, intron 6 of 12) intron (NM_033141, intron 6 of 12) 41310 NM_001284231 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 274.75-33 chr3 16335941 16336321 + 1.25 NA intron (NM_015150, intron 7 of 9) intron (NM_015150, intron 7 of 9) 70919 NM_001352982 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 194.75-9 chr1 208009099 208009358 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98103 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 336.75-11 chr2 20319005 20319350 + 1.25 NA intron (NM_001282790, intron 1 of 18) intron (NM_001282790, intron 1 of 18) 8209 NM_001282791 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 185.75 chr1 24808972 24809218 + 1.25 NA intron (NM_013943, intron 2 of 5) intron (NM_013943, intron 2 of 5) 63648 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 233.75-35 chr19 28102284 28102610 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -308507 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 181.25-65 chr2 128456193 128456469 + 1.25 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -137463 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 357.75-10 chr2 133152857 133153420 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) L1MC2|LINE|L1 -113057 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 321-16 chr3 22415157 22415678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 458278 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 251.25-41 chr4 72240899 72241328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 201981 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 169.75-123 chr5 56804289 56804526 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -11142 NM_005921 4214 Hs.653654 NM_005921 ENSG00000095015 MAP3K1 MAPKKK1|MEKK|MEKK 1|MEKK1|SRXY6 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1 protein-coding 304-15 chr14 48986187 48986799 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 599887 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 233-65 chrX 155110232 155110421 + 1.25 NA intron (NM_024332, intron 8 of 11) L1MC4|LINE|L1 38906 NM_001242640 79184 Hs.558537 NM_024332 ENSG00000185515 BRCC3 BRCC36|C6.1A|CXorf53 BRCA1/BRCA2-containing complex subunit 3 protein-coding 148.75-61 chr15 68688748 68688908 + 1.25 NA intron (NM_006091, intron 2 of 11) L1ME4a|LINE|L1 47325 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 177.25-31 chr11 96338240 96338427 + 1.25 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -3105 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 135.75-57 chr14 57309092 57309228 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 40189 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 195.75-35 chr12 57271585 57271801 + 1.25 NA intron (NM_001351218, intron 13 of 22) intron (NM_001351218, intron 13 of 22) -20506 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 265.75-29 chr18 61346558 61346805 + 1.25 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 13251 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 248.75-48 chr4 60538295 60538679 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -384132 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 158.25-63 chr2 107755128 107755412 + 1.25 NA intron (NR_126370, intron 1 of 4) intron (NR_126370, intron 1 of 4) 1158 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 144.5-116 chr2 177701371 177701578 + 1.25 NA intron (NR_136171, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 28152 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 259.75-26 chr2 69332290 69332661 + 1.25 NA intron (NM_002056, intron 14 of 18) AluSq2|SINE|Alu 54752 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 134.75-102 chr19 49435772 49435879 + 1.25 NA intron (NM_020309, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu 5702 NM_020309 57030 Hs.375616 NM_020309 ENSG00000104888 SLC17A7 BNPI|VGLUT1 solute carrier family 17 member 7 protein-coding 286.25-7 chr11 82761065 82761580 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -27458 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 196.25-103 chr6 37828246 37828500 + 1.25 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 8646 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 178.25-92 chr4 64679916 64680092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -270544 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 216.25-41 chr15 93935904 93936312 + 1.25 NA intron (NR_120320, intron 8 of 8) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 35407 NR_120322 101927129 Hs.652658 NR_120322 ENSG00000258785 LINC01580 - long intergenic non-protein coding RNA 1580 ncRNA 286.25-34 chr8 129763876 129764298 + 1.25 NA intron (NM_031415, intron 4 of 13) HAL1|LINE|L1 22537 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 322-25 chr8 133607955 133608387 + 1.25 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -36284 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 163-27 chr12 9871634 9871819 + 1.25 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -1867 NM_005127 9976 Hs.85201 NM_005127 ENSG00000110852 CLEC2B AICL|CLECSF2|HP10085|IFNRG1 C-type lectin domain family 2 member B protein-coding 191.75-106 chr5 127388185 127388482 + 1.25 NA intron (NM_001308121, intron 5 of 13) AluJb|SINE|Alu 97537 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 258.5-62 chr5 161004890 161005214 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66426 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 446.25-5 chr7 49785889 49786334 + 1.25 NA intron (NR_136188, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 10778 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 260-40 chr7 24962612 24962842 + 1.25 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 17451 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 250.75-13 chr14 59754126 59754620 + 1.25 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) -107353 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 163.75-64 chr2 42299847 42300268 + 1.25 NA intron (NM_001145076, intron 12 of 21) L1MB7|LINE|L1 59981 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 193.5-167 chr9 35215669 35215967 + 1.25 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) intron (NM_006377, intron 1 of 38) 53809 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 250.5-21 chr12 37985898 37986348 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -330651 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 267.25-9 chr11 103624008 103624242 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -225781 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 326-14 chr2 50997428 50997887 + 1.25 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) AluJr4|SINE|Alu 34475 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 151.75-162 chr9 27439005 27439132 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR -85246 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 206.75-33 chr19 42048454 42048774 + 1.25 NA intron (NM_002088, intron 10 of 18) AluY|SINE|Alu 17191 NM_002088 2901 Hs.367799 NM_002088 ENSG00000105737 GRIK5 EAA2|GRIK2|GluK5|KA2 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 5 protein-coding 237-16 chr14 53112307 53112590 + 1.25 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 40875 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 211.25-82 chr7 33244905 33245241 + 1.25 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) intron (NM_198428, intron 5 of 22) 115509 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 232-65 chr5 125813902 125814190 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 320785 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 234.75-50 chr3 63225399 63225668 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -52775 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 197.25-48 chr2 23771248 23771472 + 1.25 NA intron (NR_125717, intron 23 of 28) L1ME1|LINE|L1 155763 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 194.75-69 chr3 110565819 110566092 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 504004 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-24 chr11 55456423 55456624 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 88639 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 180.75-18 chr10 88284781 88284926 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001031709, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001031709, exon 7 of 7) 298465 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 316.5-40 chr8 114452527 114452862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1015755 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 223.5-11 chr1 213164844 213165089 + 1.25 NA intron (NM_001136138, intron 5 of 13) intron (NM_001136138, intron 5 of 13) 113725 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 158.5-107 chr2 159662861 159663134 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -46396 NM_001289975 29994 Hs.470369 NM_013450 ENSG00000123636 BAZ2B WALp4 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B protein-coding 302-3 chr10 67987632 67988172 + 1.25 NA intron (NM_001278185, intron 15 of 23) intron (NM_001278185, intron 15 of 23) 22981 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 363.5-3 chr10 101563894 101564409 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 24106 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 241.5-65 chr3 82838595 82838934 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 852622 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 203.75-18 chr11 66140050 66140336 + 1.25 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 69921 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 258.5-16 chr12 71568139 71568371 + 1.25 NA intron (NR_110596, intron 12 of 19) MIR|SINE|MIR 95593 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 160.5-129 chr3 176847225 176847369 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30296 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 158.75-151 chr7 31441948 31442314 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71940 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 147.75-157 chr8 118763948 118764172 + 1.25 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -142097 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 114.75-27 chr10 107749333 107749465 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 319894 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 353.25-15 chr3 34910377 34910804 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 483433 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 125.75-96 chr2 114596286 114596458 + 1.25 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 134795 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 162-49 chr17 29192745 29192909 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12429 NM_203318 399687 Hs.462590 NM_078471 ENSG00000196535 MYO18A MAJN|MYSPDZ|SP-R210|SPR210 myosin XVIIIA protein-coding 269.75-33 chr2 219835485 219835797 + 1.25 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 69248 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 274.25-46 chr7 10103918 10104316 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 469847 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 258-61 chr9 78727537 78727867 + 1.25 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 417964 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 221.5-66 chr4 72372 72581 + 1.25 NA intron (NM_182524, intron 3 of 3) intron (NM_182524, intron 3 of 3) 19155 NM_182524 152687 Hs.709469 NM_182524 ENSG00000272602 ZNF595 - zinc finger protein 595 protein-coding 244.5-92 chr7 130325829 130326251 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18776 NM_001127442 93979 Hs.567642 NM_080385 ENSG00000158525 CPA5 - carboxypeptidase A5 protein-coding 213.5-92 chr4 104769647 104769890 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -274874 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 259.75-59 chr9 97995306 97995627 + 1.25 NA intron (NM_006401, intron 2 of 6) intron (NM_006401, intron 2 of 6) 12125 NM_006401 10541 Hs.730654 NM_006401 ENSG00000136938 ANP32B APRIL|PHAPI2|SSP29 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member B protein-coding 415.5-7 chr5 101359660 101360150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -456623 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 209.5-90 chr3 18775214 18775477 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -329753 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 221.5-31 chr15 82976242 82976441 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9869 NM_031452 83640 Hs.80624 NM_031452 ENSG00000169612 RAMAC C15orf18|FAM103A1|HsT19360|RAM|RAMMET RNA guanine-7 methyltransferase activating subunit protein-coding 171.75-64 chr18 30017632 30017858 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -281165 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 352.5-18 chr4 48424961 48425463 + 1.25 NA 3' UTR (NM_020846, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_020846, exon 8 of 8) -58131 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 169.25-70 chr21 34084105 34084274 + 1.25 NA intron (NM_032476, intron 1 of 2) intron (NM_032476, intron 1 of 2) 10611 NM_032476 64968 Hs.302742 NM_032476 ENSG00000243927 MRPS6 C21orf101|MRP-S6|RPMS6|S6mt mitochondrial ribosomal protein S6 protein-coding 423.5-8 chr6 85648187 85648552 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -5447 NM_001159673 10492 Hs.571177 NM_006372 ENSG00000135316 SYNCRIP GRY-RBP|GRYRBP|HNRNPQ|HNRPQ1|NSAP1|PP68|hnRNP-Q synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein protein-coding 243.25-46 chr6 56568507 56568799 + 1.25 NA intron (NM_001144770, intron 46 of 94) intron (NM_001144770, intron 46 of 94) 74236 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 181.5-72 chr2 37130291 37130605 + 1.25 NA intron (NM_002759, intron 10 of 16) HERVFH19-int|LTR|ERV1 17374 NM_001135652 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 225.5-77 chr4 35532183 35532494 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 711601 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 448.25 chr5 17973434 17973893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 166389 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 253-35 chr4 32808668 32809006 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 457799 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 149.75-124 chr5 8494768 8495015 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 33966 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 169.25-75 chr3 116187334 116187577 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -172569 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 241.25-54 chr5 46070482 46070760 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -374241 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 217-6 chr10 13550629 13550925 + 1.25 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -21763 NM_001369863 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 226.5-82 chr5 179485801 179486007 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 30807 NR_149047 100128340 Hs.710582 NR_149047 LOC100128340 - uncharacterized LOC100128340 ncRNA 336.75-4 chr12 92398048 92398417 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23299 NR_027933 574028 Hs.730377 NM_001025233 ENSG00000257127 CLLU1 - chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1 ncRNA 172.25-71 chr2 163354720 163354918 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 381189 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 135.5-48 chr13 27424770 27424935 + 1.25 NA exon (NM_002097, exon 1 of 9) exon (NM_002097, exon 1 of 9) 233 NM_002097 2971 Hs.445977 NM_002097 ENSG00000122034 GTF3A AP2|TFIIIA general transcription factor IIIA protein-coding 257.25-20 chr18 28916414 28916685 + 1.25 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -739419 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 220.5-123 chr8 86446158 86446361 + 1.25 NA intron (NM_007013, intron 18 of 24) AluSx|SINE|Alu 62427 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 210.25-40 chr2 51964914 51965123 + 1.25 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -405630 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 117.5-39 chr11 43905581 43905821 + 1.25 NA intron (NM_139178, intron 8 of 9) intron (NM_139178, intron 8 of 9) 8398 NR_026952 729799 Hs.368920 NR_026952 ENSG00000213693 SEC14L1P1 - SEC14 like 1 pseudogene 1 pseudo 166.75-52 chr14 80507183 80507365 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 23 of 24) intron (NM_152446, intron 23 of 24) -276217 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 125-24 chr10 83029498 83029620 + 1.25 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 647530 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 292.25 chr1 17420716 17421138 + 1.25 NA intron (NM_001136204, intron 5 of 11).2 intron (NM_001136204, intron 5 of 11).2 17609 NM_001136204 55920 Hs.380857 NM_018715 ENSG00000179051 RCC2 TD-60 regulator of chromosome condensation 2 protein-coding 129.25-69 chr17 71489403 71489583 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -287314 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 221.75-31 chr18 22694953 22695243 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 91739 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 203-23 chr11 47820228 47820519 + 1.25 NA intron (NM_015231, intron 9 of 35) intron (NM_015231, intron 9 of 35) 27977 NR_134636 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 254-27 chr2 188081062 188081380 + 1.25 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 206470 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 187.5-58 chr14 70703639 70703876 + 1.25 NA non-coding (NR_125769, exon 3 of 4) non-coding (NR_125769, exon 3 of 4) 5059 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 125.25-164 chr5 156603039 156603363 + 1.25 NA intron (NM_001128209, intron 5 of 7) L1MA6|LINE|L1 -247094 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 328-34 chr8 124939229 124939565 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2611 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 286.75-19 chr2 52660081 52660466 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 42342 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 215.25-54 chr22 25004380 25004566 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -23501 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 184-103 chr9 37494362 37494604 + 1.25 NA intron (NM_001282766, intron 7 of 12) AluJo|SINE|Alu 8535 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 356-8 chr6 54502425 54502749 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 194146 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 279.5-44 chr3 156818876 156819272 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -2012 NR_038387 730091 Hs.659905 NR_038387 ENSG00000240875 LINC00886 - long intergenic non-protein coding RNA 886 ncRNA 228.5-70 chr3 9957285 9957506 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -4980 NM_001318871 285368 Hs.598147 NM_207351 ENSG00000163704 PRRT3 - proline rich transmembrane protein 3 protein-coding 158.75-119 chr3 188633542 188633747 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) intron (NM_005578, intron 6 of 10) -55137 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 335.25-10 chr12 43505572 43505874 + 1.25 NA intron (NM_025003, intron 3 of 38) L1MB2|LINE|L1 46480 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 322.75-7 chr17 68945027 68945524 + 1.25 NA intron (NM_001288986, intron 1 of 38) L1M5|LINE|L1 10117 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 204-80 chr8 102559468 102559726 + 1.25 NA intron (NM_024410, intron 1 of 1) intron (NM_024410, intron 1 of 1) 8008 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 174.25-15 chr10 22381936 22382147 + 1.25 NA intron (NM_172242, intron 4 of 9) intron (NM_172242, intron 4 of 9) 36545 NM_012443 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 212.25-13 chr11 3968113 3968348 + 1.25 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) intron (NM_001277962, intron 2 of 12) 112168 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 285.5-19 chr14 61821818 61822142 + 1.25 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) MLT2B3|LTR|ERVL 9277 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 195-27 chr14 67387559 67387753 + 1.25 NA intron (NM_016445, intron 8 of 8) intron (NM_016445, intron 8 of 8) 24509 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 177-85 chr6 49496186 49496359 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3651 NM_001010904 389396 Hs.585172 NM_001010904 ENSG00000203972 GLYATL3 C6orf140|bA28H17.2 glycine-N-acyltransferase like 3 protein-coding 207.5-66 chr3 41000968 41001226 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -198408 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 195-40 chr17 62335490 62335705 + 1.25 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -34621 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 269-34 chr4 60254725 60255021 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -667746 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 284.75-10 chr12 130625902 130626280 + 1.25 NA intron (NM_001351226, intron 2 of 21) intron (NM_001351226, intron 2 of 21) 2365 NM_015347 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 216.5-90 chr5 26154191 26154539 + 1.25 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 884221 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 357-17 chr7 32553297 32553979 + 1.25 NA intron (NM_015060, intron 6 of 15) intron (NM_015060, intron 6 of 15) 58149 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 238.75-46 chr5 58435745 58436091 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 24168 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 240.25-28 chr18 38264818 38265031 + 1.25 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR 607789 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 213.25 chr1 67654600 67654855 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30474 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 238-46 chr3 98839075 98839556 + 1.25 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) L1PREC2|LINE|L1 62380 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 155.25-10 chr1 111518618 111518815 + 1.25 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) intron (NM_001081976, intron 1 of 5) -14595 NM_000677 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 227.25-59 chr4 59454991 59455305 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 441575 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 210-76 chr5 68805748 68806081 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 224013 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 236.5-23 chr14 35110160 35110522 + 1.25 NA intron (NM_017917, intron 3 of 12) intron (NM_017917, intron 3 of 12) 12201 NM_001305155 55012 Hs.530712 NM_017917 ENSG00000092020 PPP2R3C C14orf10|G4-1|G5pr|GDRM|SPGF36 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''gamma protein-coding 208.25-21 chr12 23445503 23445822 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 138924 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 135-80 chr2 110159884 110160032 + 1.25 NA intron (NM_207181, intron 11 of 19) L1M5|LINE|L1 -43392 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 259.75-29 chr2 166244340 166244547 + 1.25 NA intron (NM_001365536, intron 18 of 26) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -95282 NM_001353950 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 212-67 chr5 20436259 20436581 + 1.25 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 130869 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 167.25-49 chr14 85128703 85128893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -143134 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 186.75-49 chr2 42364676 42364969 + 1.25 NA intron (NM_001319036, intron 1 of 3) intron (NM_001319036, intron 1 of 3) -3579 NM_001319040 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 409.25-6 chr4 117873835 117874399 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39716 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 202.5-33 chr12 76951987 76952283 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -73116 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 151.25-188 chr8 91963542 91963739 + 1.25 NA intron (NM_004349, intron 10 of 10) intron (NM_004349, intron 10 of 10) 54040 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 128.75-180 chr7 22050357 22050464 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104511 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 197.75-91 chr8 85483557 85483780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18753 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 234.75-56 chr4 5110787 5111174 + 1.25 NA intron (NM_001306082, intron 1 of 12) L1PA17|LINE|L1 59500 NM_001345969 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 258.75-61 chr5 112233080 112233416 + 1.25 NA intron (NR_110559, intron 1 of 3) L1ME3B|LINE|L1 4965 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 180.25-93 chr5 40424327 40424483 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -255510 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 214-22 chr14 82158435 82158638 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -415398 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 158.75-78 chr19 30056159 30056296 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 113988 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 175.25-29 chr11 111136853 111137071 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -39644 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 177-44 chr2 70154043 70154206 + 1.25 NA intron (NR_145968, intron 9 of 10) L1M6|LINE|L1 -28808 NR_024444 100133985 Hs.135528 NR_024444 ENSG00000231327 LINC01816 - long intergenic non-protein coding RNA 1816 ncRNA 287.75-23 chr17 63078065 63078404 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) L1MD2|LINE|L1 111999 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 194.75-61 chr2 237481912 237482175 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4367 NM_001281474 79083 Hs.102406 NM_024101 ENSG00000115648 MLPH SLAC2-A melanophilin protein-coding 134.5-174 chr5 78110315 78110485 + 1.25 NA intron (NM_003664, intron 19 of 26) intron (NM_003664, intron 19 of 26) 152153 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 354.25-13 chr5 130171236 130171677 + 1.25 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 266991 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 142.25-23 chr10 94885803 94886001 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -52756 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 164.75-89 chr21 33582976 33583325 + 1.25 NA intron (NM_017613, intron 5 of 9) AluY|SINE|Alu 5534 NM_017613 29980 Hs.436341 NM_017613 ENSG00000159147 DONSON B17|C21orf60|MIMIS|MISSLA downstream neighbor of SON protein-coding 207.25-32 chr17 57522398 57522858 + 1.25 NA non-coding (NR_110808, exon 3 of 3) non-coding (NR_110808, exon 3 of 3) 969 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 374-5 chr14 45000182 45000930 + 1.25 NA intron (NR_131765, intron 3 of 19) L1MA4|LINE|L1 38366 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 182.75-111 chr5 146994109 146994392 + 1.25 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) MIRc|SINE|MIR 61887 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 185.5-98 chr21 18477818 18478058 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -74153 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 167.25-17 chr10 83997174 83997335 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -142255 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 248.25-78 chr9 3876779 3877063 + 1.25 NA intron (NM_001042413, intron 8 of 10) MIR|SINE|MIR -21725 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 305.5-27 chr20 21676451 21677034 + 1.25 NA intron (NR_109878, intron 1 of 4) intron (NR_109878, intron 1 of 4) 26843 NR_109878 101929608 Hs.694665 NR_109878 ENSG00000280350 LINC01726 - long intergenic non-protein coding RNA 1726 ncRNA 200.75-48 chr2 29378093 29378363 + 1.25 NA intron (NM_004304, intron 5 of 28) intron (NM_004304, intron 5 of 28) 97149 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 154.25-116 chr4 70821047 70821285 + 1.25 NA intron (NM_001098477, intron 9 of 9) AluSp|SINE|Alu 18337 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 223.25-35 chr2 69319250 69319496 + 1.25 NA TTS (NM_001244710) TTS (NM_001244710) 67854 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 257.25-10 chr12 119886982 119887522 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9932 NM_001206999 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 204-82 chr8 114717753 114717992 + 1.25 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 950141 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 129.25-72 chr18 4226237 4226396 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L1MA3|LINE|L1 -38286 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 213-8 chr1 154890952 154891155 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20772 NM_002249 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 174.75-105 chr6 38687553 38687803 + 1.25 NA intron (NM_006708, intron 1 of 5) intron (NM_006708, intron 1 of 5) 15467 NM_006708 2739 Hs.268849 NM_006708 ENSG00000124767 GLO1 GLOD1|GLYI|HEL-S-74 glyoxalase I protein-coding 167-27 chr11 37769649 37769820 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -168867 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 141.25-41 chr13 57252604 57252753 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85481 NM_001130407 729250 Hs.525056 NM_001130407 ENSG00000234278 PRR20E PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20C|PRR20D proline rich 20E protein-coding 176.5-4 chr1 64749402 64749653 + 1.25 NA intron (NM_001366165, intron 1 of 11) intron (NM_001366165, intron 1 of 11) 4452 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 236-67 chr7 55458212 55458429 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 68560 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 134.75-201 chr7 77768947 77769081 + 1.25 NA intron (NM_198467, intron 5 of 7) intron (NM_198467, intron 5 of 7) 29420 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 233-22 chr15 54940109 54940466 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -116460 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 305.25-13 chr14 43846876 43847155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 660268 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 325-16 chr3 99096115 99096537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -194631 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 353.5-14 chr4 32175100 32175666 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -152961 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 254-21 chr19 29007382 29007805 + 1.25 NA intron (NR_040036, intron 3 of 4) intron (NR_040036, intron 3 of 4) 5038 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 227.5-77 chr4 39289377 39289640 + 1.25 NA intron (NM_001204747, intron 24 of 24) intron (NM_001204747, intron 24 of 24) 76854 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 256.75-43 chr8 109865188 109865531 + 1.25 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 110412 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 244.75-56 chr7 69586061 69586351 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 11418 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 309.5-19 chr17 55724649 55725214 + 1.25 NA intron (NM_001099640, intron 2 of 3) intron (NM_001099640, intron 2 of 3) -2067 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 174-104 chr8 137966382 137966547 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 117081 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 195.75-13 chr1 219632981 219633240 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19965 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 277-34 chr7 88049657 88050084 + 1.25 NA intron (NM_001324421, intron 3 of 28) intron (NM_001324421, intron 3 of 28) 115619 NM_021722 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 214.25-69 chr5 120007313 120007563 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 377879 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 311.25-12 chr2 184103841 184104372 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -274869 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 219.75-56 chr4 107632071 107632345 + 1.25 NA intron (NM_005443, intron 10 of 11) L1ME3A|LINE|L1 88026 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 185.75-83 chr22 29811754 29812039 + 1.25 NA intron (NM_001369943, intron 6 of 17) intron (NM_001369943, intron 6 of 17) 26378 NM_001369931 84164 Hs.731754 NM_032204 ENSG00000100325 ASCC2 ASC1p100|p100 activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 protein-coding 364.25-10 chr14 29234142 29234607 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -448587 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 422.25 chr14 38934831 38935235 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -18151 NR_039982 283547 Hs.675941 NR_039982 ENSG00000259070 LINC00639 - long intergenic non-protein coding RNA 639 ncRNA 351.5-4 chr11 83873405 83873730 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -191142 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 492.25-5 chr5 10200692 10201182 + 1.25 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 48951 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 151.75-143 chr7 89577573 89577706 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -541761 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 257.5-24 chr15 76100777 76101037 + 1.25 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) intron (NM_152335, intron 1 of 10) 40922 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 290.75-26 chr2 44273327 44273605 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2014 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 274.25-23 chr15 76971471 76971781 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23054 NM_001321137 9051 Hs.129758 NM_003978 ENSG00000140368 PSTPIP1 CD2BP1|CD2BP1L|CD2BP1S|H-PIP|PAPAS|PSTPIP proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 1 protein-coding 285.75-26 chr2 166962232 166962540 + 1.25 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 73899 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 152.25-30 chr11 41061156 41061341 + 1.25 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 398388 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 141.75-172 chr8 129120180 129120441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120930 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 313.25-7 chr12 19778924 19779234 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -235606 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 170.25-25 chr12 20377905 20378169 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 8792 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 202.5-110 chr5 20592258 20592487 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16659 NM_001349562 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 172.75-3 chr1 74108803 74109023 + 1.25 NA intron (NM_001105659, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 89263 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 142.25-57 chr14 59262392 59262517 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_014992) promoter-TSS (NM_014992) -987 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 185.25-125 chr8 116349063 116349319 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24132 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 153.5-5 chr1 92996711 92996885 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35276 NM_001252269 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 325.5-2 chr1 98163410 98163874 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -47069 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 275.5-61 chr7 22745393 22745762 + 1.25 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -17957 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 266.75-17 chr19 31724251 31724519 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 132104 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 176-46 chr3 98127590 98127786 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -5010 NM_001005338 26341 Hs.537383 NM_001005338 ENSG00000231192 OR5H1 HSHTPCRX14|HTPCRX14 olfactory receptor family 5 subfamily H member 1 protein-coding 504.75 chr12 17323633 17324099 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 265212 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 336-4 chr10 120852600 120853054 + 1.25 NA intron (NM_018117, intron 2 of 28) intron (NM_018117, intron 2 of 28) 1465 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 203.5-110 chr4 110232544 110232859 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34086 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 184.75-15 chr11 64782095 64782350 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3378 NM_201995 7536 Hs.502829 NM_004630 ENSG00000168066 SF1 BBP|D11S636|MBBP|ZCCHC25|ZFM1|ZNF162 splicing factor 1 protein-coding 149.5-14 chr1 225305824 225305987 + 1.25 NA intron (NM_001367479, intron 58 of 85) intron (NM_001367479, intron 58 of 85) 122133 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 205.75-15 chr12 13755150 13755463 + 1.25 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 225050 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 161.25-83 chr19 56276133 56276306 + 1.25 NA intron (NM_001354658, intron 2 of 10) intron (NM_001354658, intron 2 of 10) 3471 NM_001354658 100506374 Hs.631532 NM_001354658 ENSG00000267710 EDDM13 - epididymal protein 13 protein-coding 132.5-206 chr6 26406523 26406640 + 1.25 NA intron (NM_001145008, intron 3 of 9) intron (NM_001145008, intron 3 of 9) 4306 NM_194441 11119 Hs.191510 NM_007048 ENSG00000026950 BTN3A1 BT3.1|BTF5|BTN3.1|CD277 butyrophilin subfamily 3 member A1 protein-coding 183.25-117 chr8 139134517 139134725 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -220580 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 385.5-18 chr6 34629840 34630259 + 1.25 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -66105 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 260-15 chr2 50080308 50080650 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -106276 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 150.25-119 chr5 15000243 15000399 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -128543 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 166.75-144 chr8 144622604 144622766 + 1.25 NA intron (NM_001308208, intron 1 of 10) intron (NM_001308208, intron 1 of 10) -9182 NM_001308207 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 285.5-17 chr14 31115144 31115710 + 1.25 NA intron (NM_015382, intron 30 of 42) MIR|SINE|MIR 88784 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 443.75-6 chr8 64953225 64953602 + 1.25 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -154676 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 183-41 chr17 35452131 35452324 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3461 NM_144682 146857 Hs.462833 NM_144682 ENSG00000154760 SLFN13 SLFN10|hSLFN13 schlafen family member 13 protein-coding 216.25-61 chr21 23201582 23201811 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 122412 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 271-15 chr16 61088123 61088427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32509 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 285.25-36 chr8 26909390 26909743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42288 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 216.5-46 chr17 43010323 43010664 + 1.25 NA intron (NM_005533, intron 1 of 6) MER102c|DNA|hAT-Charlie 3709 NM_001330230 3430 Hs.632258 NM_005533 ENSG00000068079 IFI35 IFP35 interferon induced protein 35 protein-coding 428 chr12 83656487 83656931 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 969554 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 125.75-110 chr20 22392509 22392653 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28062 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 226.75-52 chr3 109353014 109353266 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15568 NM_001348929 55211 Hs.317659 NM_018189 ENSG00000121570 DPPA4 2410091M23Rik developmental pluripotency associated 4 protein-coding 161-55 chr17 77570781 77570945 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 23922 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 174.75-65 chr2 120114844 120115058 + 1.25 NA intron (NM_001330310, intron 16 of 24) L1MB7|LINE|L1 101874 NM_001330310 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 153.5-118 chr20 62128846 62128994 + 1.25 NA intron (NM_144703, intron 3 of 8) intron (NM_144703, intron 3 of 8) 6445 NM_144703 149986 Hs.105379 NM_144703 ENSG00000149657 LSM14B C20orf40|FAM61B|FT005|LSM13|RAP55B|bA11M20.3 LSM family member 14B protein-coding 214.25-74 chr6 134108784 134109087 + 1.25 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 8745 NR_037938 387065 Hs.571061 NR_037938 HMGA1P7 HMGA1L7 high mobility group AT-hook 1 pseudogene 7 pseudo 389-19 chr7 82779053 82779546 + 1.25 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) L1M5|LINE|L1 -335343 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 121.5-262 chr9 79986978 79987315 + 1.25 NA intron (NR_121212, intron 2 of 4) intron (NR_121212, intron 2 of 4) 12123 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 200.5-48 chr16 75678470 75678730 + 1.25 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 22861 NM_001351308 100033411 NM_001351307 ENSG00000282757 DUXB - double homeobox B protein-coding 277-9 chr12 80484764 80485087 + 1.25 NA intron (NM_001145026, intron 9 of 44) intron (NM_001145026, intron 9 of 44) 40690 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 233.75-42 chr2 173435315 173435669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80620 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 166-57 chr2 11613302 11613569 + 1.25 NA intron (NM_014668, intron 19 of 32) MIR|SINE|MIR 56760 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 298-21 chr4 77235570 77235943 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 78549 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 148.75-127 chr4 168090893 168091036 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1573 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 159-73 chr4 32104947 32105147 + 1.25 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -82625 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 300-43 chr8 126963071 126963461 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -49888 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 242.25-59 chr3 107254686 107255111 + 1.25 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) intron (NR_028302, intron 1 of 3) 14206 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 180.25-108 chr6 129688356 129688542 + 1.25 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) intron (NM_033515, intron 1 of 14) 21728 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 193-80 chr6 94804578 94804885 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 772720 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 123.5-49 chr12 41355519 41355718 + 1.25 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -82121 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 209-44 chr20 11531579 11531814 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -258313 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 142-64 chr16 86876476 86876648 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 154471 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 274.5-14 chr12 21475464 21475838 + 1.25 NA intron (NM_002907, intron 9 of 14) intron (NM_002907, intron 9 of 14) 25984 NM_002907 5965 Hs.235069 NM_002907 ENSG00000004700 RECQL RECQL1|RecQ1 RecQ like helicase protein-coding 350.5-10 chr12 9095241 9095720 + 1.25 NA intron (NM_000014, intron 16 of 35) intron (NM_000014, intron 16 of 35) 20749 NM_001347424 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 284.25 chr1 51426517 51426761 + 1.25 NA intron (NM_001981, intron 12 of 24) MLT2D|LTR|ERVL -4544 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 371.25-6 chr17 73013997 73014485 + 1.25 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 78447 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 170.75-131 chr8 65941184 65941432 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73670 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 162-77 chr3 103368906 103369157 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 155085 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 238-43 chr3 17200891 17201155 + 1.25 NA intron (NM_014744, intron 18 of 21) intron (NM_014744, intron 18 of 21) 267827 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 323-9 chr15 87636559 87636987 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 59844 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 261.25-29 chr3 154090171 154090421 + 1.25 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) intron (NR_037901, intron 2 of 3) -30707 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 144.25-164 chr5 168670758 168670993 + 1.25 NA intron (NM_003062, intron 34 of 35) MER91A|DNA|hAT-Tip100 -36052 NR_130737 101927969 Hs.661903 NR_130737 LOC101927969 - uncharacterized LOC101927969 ncRNA 168.75-16 chr10 13074776 13075001 + 1.25 NA intron (NM_001282658, intron 3 of 6) intron (NM_001282658, intron 3 of 6) 25101 NM_001282658 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 196.25-18 chr11 39956318 39956504 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 336719 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 391.5-18 chr8 120957456 120957980 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -145672 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 151.25-105 chr20 34392612 34392806 + 1.25 NA intron (NM_001257137, intron 2 of 25) AluJb|SINE|Alu 29436 NM_001324197 83737 Hs.632272 NM_031483 ENSG00000078747 ITCH ADMFD|AIF4|AIP4|NAPP1 itchy E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 121-62 chr14 60456073 60456232 + 1.25 NA intron (NM_174978, intron 15 of 17) intron (NM_174978, intron 15 of 17) 29911 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 231-86 chrX 127438550 127438748 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 613754 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 448-2 chr22 35992015 35992673 + 1.25 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) -30714 NM_001349992 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 208.75-16 chr11 104755931 104756157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 142626 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 257.25-4 chr10 15844991 15845215 + 1.25 NA intron (NM_024948, intron 2 of 14) intron (NM_024948, intron 2 of 14) 15404 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 217-69 chr5 73061319 73061555 + 1.25 NA intron (NM_001146032, intron 16 of 24) intron (NM_001146032, intron 16 of 24) -59138 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 144.75-28 chr11 32885863 32886078 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6841 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 184.5-126 chr5 133647653 133648010 + 1.25 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -35290 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 200-69 chr5 15137398 15137734 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 128994 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 200.25-32 chr13 96194456 96194648 + 1.25 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 103713 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 212-86 chr9 27355870 27356052 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) intron (NM_024761, intron 3 of 3) -58811 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 184.75-23 chr12 80935706 80936023 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_030349) promoter-TSS (NR_030349) -31 NR_030349 693203 NR_030349 ENSG00000208022 MIR618 MIRN618|hsa-mir-618|mir-618 microRNA 618 ncRNA 325-21 chr6 125513744 125514304 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -160329 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 304.25-8 chr14 46019541 46019855 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44461 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 228-52 chr3 53702408 53702644 + 1.25 NA intron (NM_000720, intron 8 of 48) intron (NM_000720, intron 8 of 48) 143893 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 307.5-20 chr16 24536738 24537239 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2578 NM_006910 5930 Hs.188553 NM_006910 ENSG00000122257 RBBP6 MY038|P2P-R|PACT|RBQ-1|SNAMA RB binding protein 6, ubiquitin ligase protein-coding 329.25-15 chr2 40021410 40021874 + 1.25 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 104008 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 255.75-54 chr9 15640728 15640951 + 1.25 NA intron (NM_001355547, intron 6 of 24) intron (NM_001355547, intron 6 of 24) 76861 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 214.5-104 chr5 111270373 111270618 + 1.25 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 46111 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 185.25-21 chr12 98340282 98340525 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 116742 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 131.25-217 chr9 76925943 76926186 + 1.25 NA Intergenic (TTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19950 NM_015225 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 184.5-51 chr16 8023105 8023317 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 566627 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 180.25-59 chr20 1234558 1234759 + 1.25 NA intron (NM_001136566, intron 5 of 13) intron (NM_001136566, intron 5 of 13) 8538 NM_001136566 642636 Hs.713451 NM_001136566 ENSG00000244588 RAD21L1 RAD21L|dJ545L17.2 RAD21 cohesin complex component like 1 protein-coding 270-42 chr4 141130165 141130429 + 1.25 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) intron (NM_020724, intron 1 of 6) 3172 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 170.75-151 chr9 99497278 99497592 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -122178 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 249.5-34 chr15 84919887 84920280 + 1.25 NA intron (NM_001287761, intron 9 of 14) L3|LINE|CR1 35421 NM_201651 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 401.5-19 chr7 25847921 25848455 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58069 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 368.25-16 chr7 130457427 130458036 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16521 NM_001257159 95681 Hs.368315 NM_018718 ENSG00000106477 CEP41 JBTS15|TSGA14 centrosomal protein 41 protein-coding 243.75-73 chr7 3023115 3023337 + 1.25 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) intron (NM_001324281, intron 1 of 25) 20641 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 175-99 chr5 64508336 64508578 + 1.25 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) intron (NM_001029875, intron 2 of 5) 2442 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 133.25-142 chr3 176126270 176126394 + 1.25 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -118219 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 252.75-50 chr4 10166017 10166488 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49453 NM_005112 9948 Hs.128548 NM_005112 ENSG00000071127 WDR1 AIP1|HEL-S-52|NORI-1 WD repeat domain 1 protein-coding 410.5-13 chr6 112848101 112848589 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 501015 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 118.25-160 chr5 114266818 114267062 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95130 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 185.5-46 chr14 52760247 52760485 + 1.25 NA intron (NM_001130701, intron 10 of 11) intron (NM_001130701, intron 10 of 11) 30200 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 236.25-92 chr9 85709863 85710057 + 1.25 NA intron (NM_001286717, intron 1 of 24) intron (NM_001286717, intron 1 of 24) 32069 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 319-3 chr10 23850441 23850786 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 155886 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 157.5-113 chr2 194270306 194270516 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73858 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 136.75-45 chr12 7100300 7100436 + 1.25 NA intron (NM_001297642, intron 3 of 5) L1ME4b|LINE|L1 -7923 NM_001733 715 Hs.524224 NM_001733 ENSG00000159403 C1R EDSPD1 complement C1r protein-coding 178-47 chr2 123795458 123795685 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 229603 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 207.5-37 chr17 55575023 55575220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 147743 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 134.25-50 chr14 48088171 48088367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -293255 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 352.25-20 chr8 126789575 126789970 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -223382 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 225.75-44 chr2 176183092 176183379 + 1.25 NA intron (NR_110465, intron 1 of 3) intron (NR_110465, intron 1 of 3) 5034 NR_110461 401022 Hs.98661 NR_033979 ENSG00000224189 HAGLR HOXD-AS1|MIR7704HG|Mdgt HOXD antisense growth-associated long non-coding RNA ncRNA 288.25-13 chr18 73407854 73408298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 83135 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 206.75-83 chr7 39987547 39987791 + 1.25 NA exon (NM_031267, exon 2 of 14) exon (NM_031267, exon 2 of 14) 37309 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 187-80 chr5 116908855 116909168 + 1.25 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -146802 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 226.75-19 chr14 62255309 62255551 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -115457 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 238-21 chr17 62941491 62941814 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -2563 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 274.25-22 chr15 38685143 38685471 + 1.25 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -11291 NR_160786 215-25 chr15 59357652 59357838 + 1.25 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu 15126 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 420.25-9 chr4 146040251 146041033 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81271 NR_038331 100505545 Hs.122199 NR_038331 ENSG00000248809 LINC01095 - long intergenic non-protein coding RNA 1095 ncRNA 324.5-29 chr6 146024674 146024987 + 1.25 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -2877 NM_001278065 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 249.25-42 chr5 63343748 63344133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 618352 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 286.75-40 chr6 73177785 73178047 + 1.25 NA intron (NM_001160132, intron 11 of 13) intron (NM_001160132, intron 11 of 13) -34402 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 219.75-64 chr5 81467392 81467795 + 1.25 NA intron (NM_001256734, intron 7 of 15) intron (NM_001256734, intron 7 of 15) -73459 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 180.25-96 chr5 79433395 79433672 + 1.25 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 80303 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 254.5-56 chr4 77912464 77912780 + 1.25 NA intron (NM_020236, intron 7 of 8) L1ME1|LINE|L1 49792 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 348.75-10 chr2 70382330 70382701 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80448 NM_001329753 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 210-7 chr1 161716575 161716925 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -4794 NM_001002901 127943 Hs.517422 NM_001002901 ENSG00000162746 FCRLB FCRL2|FCRLM2|FCRLY|FREB-2|FREB2|FcRY Fc receptor like B protein-coding 296.5-2 chr1 160092416 160092735 + 1.25 NA exon (NM_052868, exon 5 of 7) exon (NM_052868, exon 5 of 7) 6044 NM_001320247 93185 Hs.332012 NM_052868 ENSG00000162729 IGSF8 CD316|CD81P3|EWI-2|EWI2|KCT-4|LIR-D1|PGRL immunoglobulin superfamily member 8 protein-coding 258.75-38 chr2 113898367 113898673 + 1.25 NA intron (NM_001277140, intron 1 of 11) intron (NM_001277140, intron 1 of 11) -7528 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 183.5-36 chr12 28121668 28121872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68686 NM_001352081 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 164.25-61 chr19 49084977 49085190 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_003089) promoter-TSS (NM_003089) -368 NM_003089 6625 Hs.467097 NM_003089 ENSG00000104852 SNRNP70 RNPU1Z|RPU1|SNRP70|Snp1|U1-70K|U170K|U1AP|U1RNP small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70 protein-coding 134.25-65 chr18 4245214 4245339 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -19326 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 217.5-31 chr12 15230633 15230878 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -9338 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 206.75-61 chr4 40462531 40462902 + 1.25 NA intron (NM_001098634, intron 3 of 6) intron (NM_001098634, intron 3 of 6) 39403 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 134-57 chr14 70049117 70049269 + 1.25 NA intron (NM_033262, intron 6 of 7) intron (NM_033262, intron 6 of 7) 31024 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 215.75-71 chr4 95043782 95044120 + 1.25 NA intron (NM_001256792, intron 1 of 10) intron (NM_001256792, intron 1 of 10) -7726 NM_001256793 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 120.5-60 chr12 113054466 113054657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3296 NM_004416 1840 Hs.372152 NM_004416 ENSG00000135144 DTX1 RNF140|hDx-1 deltex E3 ubiquitin ligase 1 protein-coding 219-30 chr13 55718866 55719121 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 544539 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 283.5-18 chr14 50183700 50184118 + 1.25 NA intron (NM_006939, intron 5 of 22) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 47669 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 250.75-47 chr4 53809419 53809729 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 113673 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 245.75-28 chr2 43559101 43559452 + 1.25 NA intron (NM_001083953, intron 16 of 37) intron (NM_001083953, intron 16 of 37) 36698 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 148.5-111 chr2 150404458 150404775 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 83079 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 243.75-12 chr11 33132828 33133309 + 1.25 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 28412 NM_001326 1479 Hs.44402 NM_001326 ENSG00000176102 CSTF3 CSTF-77 cleavage stimulation factor subunit 3 protein-coding 223.25-17 chr14 45002989 45003253 + 1.25 NA intron (NR_131765, intron 3 of 19) intron (NR_131765, intron 3 of 19) 40931 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 218.25-74 chr5 120562015 120562243 + 1.25 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) L1MA2|LINE|L1 30665 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 279.75-10 chr11 74037915 74038435 + 1.25 NA intron (NM_001286577, intron 29 of 32) L2c|LINE|L2 -28938 NM_022803 7352 Hs.101337 NM_003356 ENSG00000175564 UCP3 SLC25A9 uncoupling protein 3 protein-coding 160-81 chr4 134982553 134982838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 140864 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 133.25-97 chr2 78512272 78512428 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33181 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 134.75-185 chr6 45078795 45078953 + 1.25 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) L1M2|LINE|L1 118896 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 269.75-11 chr10 74601111 74601407 + 1.25 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) intron (NM_001369124, intron 8 of 9) -71935 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 192-87 chr6 17001787 17002000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100365 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 178-11 chr11 20260093 20260465 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -99804 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 159.25-142 chr8 5751148 5751401 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 655274 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 191.5-84 chr20 22595213 22595530 + 1.25 NA intron (NR_109883, intron 1 of 2) intron (NR_109883, intron 1 of 2) -9881 NM_153675 3170 Hs.155651 NM_021784 ENSG00000125798 FOXA2 HNF3B|TCF3B forkhead box A2 protein-coding 220.75-12 chr10 72763913 72764214 + 1.25 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 43034 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 166.5-139 chr3 190188749 190189150 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66512 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 187.5-11 chr1 184672100 184672300 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 82658 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 263-50 chr8 24954466 24954723 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_106900) promoter-TSS (NR_106900) -727 NR_106900 102465506 NR_106900 ENSG00000283327 MIR6841 hsa-mir-6841 microRNA 6841 ncRNA 247.75-49 chr5 137620314 137620616 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001257194, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001257194, exon 15 of 15) 27184 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 132.75-199 chr9 32826108 32826310 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42669 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 368-16 chr9 94985404 94985930 + 1.25 NA intron (NM_032823, intron 9 of 14) intron (NM_032823, intron 9 of 14) -40113 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 309.25-6 chr11 86041619 86041933 + 1.25 NA intron (NM_001206947, intron 1 of 18) intron (NM_001206947, intron 1 of 18) 27308 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 163.25-25 chr11 101614177 101614375 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30269 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 389.25-6 chr3 161640395 161640943 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 143861 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 195.75-90 chr4 185676695 185676950 + 1.25 NA intron (NM_001145672, intron 4 of 20) intron (NM_001145672, intron 4 of 20) -19853 NM_001145674 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 140.5-19 chr10 109385835 109385983 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 537337 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 196-19 chr12 18255732 18255948 + 1.25 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -5700 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 286.75-4 chr1 85350247 85350593 + 1.25 NA exon (NM_001330655, exon 4 of 6) exon (NM_001330655, exon 4 of 6) 54086 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 172.75-59 chr2 44158248 44158522 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10418 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 247.25-60 chr8 125942675 125943085 + 1.25 NA non-coding (NR_038446, exon 2 of 2) non-coding (NR_038446, exon 2 of 2) 8317 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 128-82 chr2 139937902 139938069 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 648700 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 145.25-151 chr6 155739203 155739359 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -207516 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 191.75-111 chr6 52349084 52349354 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12932 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 181.5-95 chr20 13590545 13590736 + 1.25 NA intron (NM_017714, intron 4 of 13) AluSg|SINE|Alu 48292 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 181.75-40 chr15 65676193 65676359 + 1.25 NA intron (NM_005848, intron 23 of 31) L1MC4a|LINE|L1 20660 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 241.75-34 chr17 74622690 74623072 + 1.25 NA intron (NM_181449, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 857 NM_181449 342510 Hs.158954 NM_181449 ENSG00000186407 CD300E CD300LE|CLM-2|CLM2|CMRF35-A5|IREM-2|IREM2|PIgR-2|PIgR2 CD300e molecule protein-coding 184-11 chr11 20686499 20686783 + 1.25 NA intron (NM_201551, intron 2 of 18) MER57B2|LTR|ERV1 17055 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 237.25-53 chr4 64365016 64365280 + 1.25 NA intron (NM_001363796, intron 2 of 11) L1PA15|LINE|L1 44302 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 133.25-156 chr4 103990201 103990477 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -270354 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 113.25-151 chr6 138985956 138986133 + 1.25 NA intron (NM_031922, intron 1 of 19) intron (NM_031922, intron 1 of 19) 2217 NM_001128617 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 172.25-50 chr17 50232655 50232874 + 1.25 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 18070 NR_110806 101927230 Hs.514326 NR_110806 LINC01969 - long intergenic non-protein coding RNA 1969 ncRNA 130.25-69 chr15 70671368 70671551 + 1.25 NA intron (NM_018003, intron 14 of 18) intron (NM_018003, intron 14 of 18) 30823 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 211-12 chr11 97454601 97454823 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 946287 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 156.5-113 chr3 31262570 31262817 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -100906 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 209.25-95 chr5 131903903 131904139 + 1.25 NA intron (NM_001303622, intron 8 of 12) L1PA15|LINE|L1 41642 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 115.25-223 chr9 72805065 72805205 + 1.25 NA intron (NM_138691, intron 17 of 23) intron (NM_138691, intron 17 of 23) 68974 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 136.5-47 chr11 84450451 84450647 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -133210 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 212-8 chr10 31413314 31413593 + 1.25 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -13698 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 191.25-57 chr2 112570259 112570443 + 1.25 NA intron (NM_019014, intron 12 of 14) L1MEf|LINE|L1 -14096 NR_163920 183.75-102 chr5 161257207 161257527 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 290757 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 340.5-8 chr11 91202435 91202719 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -333375 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 277.75-17 chr2 237949615 237949864 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17206 NR_103498 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 206.25-27 chr12 45181653 45181841 + 1.25 NA intron (NR_037144, intron 1 of 2) intron (NR_037144, intron 1 of 2) 34259 NR_037144 51054 Hs.233495 NM_015899 ENSG00000134297 PLEKHA8P1 FAPP-2|FAPP2|PLEKHA8|PLEKHA9|hFAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 pseudogene 1 pseudo 284.75-27 chr5 16408867 16409129 + 1.25 NA intron (NR_104625, intron 7 of 8) intron (NR_104625, intron 7 of 8) 32104 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 198.25-13 chr10 81189315 81189572 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 539646 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 204.25-111 chr7 80028192 80028421 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -106525 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 138.75-87 chr2 46592717 46593054 + 1.25 NA intron (NM_173074, intron 4 of 6) L1ME4b|LINE|L1 -12647 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 201-5 chr1 108899753 108900225 + 1.25 NA intron (NM_013296, intron 7 of 14) intron (NM_013296, intron 7 of 14) 23004 NM_001321039 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 258-30 chr20 51926244 51926494 + 1.25 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -63456 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 129.5-214 chr7 49912559 49912828 + 1.25 NA 3' UTR (NM_198570, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_198570, exon 4 of 4) 137360 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 259.25-33 chr4 130672069 130672312 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 295829 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 210.25-5 chr1 166603961 166604181 + 1.25 NA intron (NR_002925, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 155 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 149.25-12 chr1 114424164 114424332 + 1.25 NA intron (NM_015906, intron 10 of 19) intron (NM_015906, intron 10 of 19) 86955 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 142.25-80 chr2 14384422 14384535 + 1.25 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) intron (NR_103814, intron 1 of 3) 16480 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 180.25-107 chr6 125474965 125475139 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -173085 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 373-10 chr4 56222068 56222487 + 1.25 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) L1PB3|LINE|L1 52082 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 218-36 chr2 115796589 115796804 + 1.25 NA intron (NM_001321912, intron 20 of 25) intron (NM_001321912, intron 20 of 25) 452881 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 127.25-201 chr7 132966031 132966158 + 1.25 NA intron (NM_001317177, intron 4 of 8) intron (NM_001317177, intron 4 of 8) 68821 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 185.75-111 chr7 6611650 6611881 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -3845 NM_001353546 54753 Hs.592170 NM_017560 ENSG00000236609 ZNF853 - zinc finger protein 853 protein-coding 216.75-87 chrX 102495924 102496135 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20710 NM_021992 11013 Hs.56145 NM_021992 ENSG00000158164 TMSB15A TMSB15|TMSB15B|TMSL8|TMSNB|Tb15|TbNB thymosin beta 15a protein-coding 112.25-185 chr6 66557868 66558008 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 770059 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 264-67 chr9 102112458 102112689 + 1.25 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -373993 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 147-81 chr2 161165542 161165773 + 1.25 NA intron (NM_001199135, intron 1 of 7) intron (NM_001199135, intron 1 of 7) 5229 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 255.75-46 chr6 112846256 112846588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 499092 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 133.25-138 chr3 112430193 112430341 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 69205 NM_181780 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 261-71 chrX 80133548 80133802 + 1.25 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 110615 NM_001303475 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 222.5-105 chr8 71863823 71864312 + 1.25 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) intron (NR_033651, intron 1 of 2) -19571 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 193-51 chr3 23234847 23235168 + 1.25 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 31680 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 285.75-41 chr9 36266818 36267199 + 1.25 NA intron (NM_001128227, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu -8560 NM_005476 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 279.5-27 chr2 47170534 47170922 + 1.25 NA intron (NM_001305625, intron 2 of 5) intron (NM_001305625, intron 2 of 5) 3479 NM_001305626 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 205.5-12 chr10 61849034 61849273 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52546 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 155.5-155 chr4 173901602 173901872 + 1.25 NA intron (NR_146487, intron 1 of 2) intron (NR_146487, intron 1 of 2) 4464 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 157.5-198 chr7 125726244 125726456 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -462059 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 250.5-48 chr2 99138355 99138682 + 1.25 NA intron (NM_001349013, intron 1 of 16) intron (NM_001349013, intron 1 of 16) 2662 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 426.75-8 chr4 90495048 90495723 + 1.25 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) intron (NM_207491, intron 5 of 7) 260354 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 176.5-34 chr12 5991537 5991806 + 1.25 NA intron (NM_000552, intron 38 of 51) MIRb|SINE|MIR -45439 NM_001278597 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 222.5-78 chr4 82905435 82905672 + 1.25 NA intron (NM_024672, intron 2 of 4) intron (NM_024672, intron 2 of 4) -4637 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 120-133 chr4 46634408 46634560 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -244356 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 265.5-25 chr14 71826852 71827089 + 1.25 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -105201 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 209.25-47 chr18 61462971 61463371 + 1.25 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 129741 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 247.75-59 chr6 159336410 159336690 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46981 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 148.25-40 chr14 58962988 58963108 + 1.25 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) intron (NR_110547, intron 4 of 5) 134760 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 222.5-6 chr1 98653035 98653334 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8537 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 341.75-13 chr20 32816693 32817232 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2992 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 175.75-91 chr4 77161687 77161952 + 1.25 NA intron (NM_004354, intron 6 of 7) intron (NM_004354, intron 6 of 7) 4612 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 162.75-39 chr15 81898871 81899179 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 146993 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 272.25-3 chr10 73295666 73295997 + 1.25 NA intron (NM_001367801, intron 16 of 27) L2c|LINE|L2 43090 NR_134459 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 191.25-60 chr2 162645507 162645689 + 1.25 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -123338 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 157.75-103 chr22 19716680 19716855 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_037611) promoter-TSS (NR_037611) -453 NR_037611 100526833 Hs.283743 NR_037611 ENSG00000284874 SEPT5-GP1BB GP1BB|GPIb-beta|GPIbB SEPT5-GP1BB readthrough ncRNA 253 chr1 111495733 111496075 + 1.25 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) L1PREC2|LINE|L1 7729 NM_001302678 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 231.25-27 chr18 3030346 3030608 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -18530 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 225.25-71 chr6 95188528 95188800 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 388787 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 225.25-18 chr13 92208916 92209254 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 143122 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 396.75-3 chr4 118014738 118015080 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -18413 NR_146513 9348 Hs.480596 NM_004784 ENSG00000164100 NDST3 HSST3 N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 protein-coding 124-74 chr18 40705692 40705967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 639543 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 196.5-50 chr14 62608354 62608804 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 436879 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 297.5-47 chr5 114677559 114678000 + 1.25 NA intron (NR_130785, intron 1 of 12) intron (NR_130785, intron 1 of 12) 95634 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 359-11 chr4 60165944 60166635 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -756330 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 165-134 chr7 110840464 110840715 + 1.25 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -250417 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 215.5-19 chr11 45948460 45948679 + 1.25 NA intron (NR_147890, intron 13 of 18) intron (NR_147890, intron 13 of 18) 25913 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 266.5-73 chr8 77816423 77816729 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 365879 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 235.5-5 chr1 84854157 84854767 + 1.25 NA intron (NM_012152, intron 2 of 2) intron (NM_012152, intron 2 of 2) 38744 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 130.5-182 chr4 27082077 27082269 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -135306 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 204.25-92 chr5 96963847 96964120 + 1.25 NA intron (NM_175920, intron 1 of 17) L1MA6|LINE|L1 5550 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 140.25-69 chr17 33103256 33103485 + 1.25 NA intron (NM_183377, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 110519 NM_001317225 124912 Hs.434112 NM_173847 ENSG00000141316 SPACA3 ALLP17|CT54|LYC3|LYZC|LYZL3|SLLP1 sperm acrosome associated 3 protein-coding 288.75-38 chr6 74838614 74838895 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 290028 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 255-62 chr8 98361364 98361585 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 32264 NR_162095 113218497 NR_162095 MIR9903 - microRNA 9903 ncRNA 362.5-20 chr4 115961389 115961760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -338151 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 125.75-151 chr5 36583948 36584118 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22322 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 223.75-60 chr3 42931962 42932295 + 1.25 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -4214 NM_001205272 100506243 Hs.720172 NM_015673 ENSG00000240747 KRBOX1 - KRAB box domain containing 1 protein-coding 283.75-12 chr18 1647075 1647438 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -287627 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 200.25-93 chr5 161198935 161199207 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -260445 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 146.25-66 chr2 42760842 42761000 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 3340 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 182.5-116 chr4 43904282 43904540 + 1.25 NA Intergenic HUERS-P2-int|LTR|ERV1 -112450 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 205.75-19 chr14 49411341 49411534 + 1.25 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 174943 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 287-11 chr13 69953413 69953842 + 1.25 NA intron (NM_001286725, intron 2 of 9) intron (NM_001286725, intron 2 of 9) -153586 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 149.25-95 chr2 197075339 197075587 + 1.25 NA intron (NR_160034, intron 16 of 28) intron (NR_160034, intron 16 of 28) -122528 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 318.25-19 chr8 77166463 77166882 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -165628 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 164.75-78 chr2 136371647 136371861 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -253599 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 168.5-152 chr5 112005421 112005658 + 1.25 NA intron (NR_046678, intron 3 of 3) intron (NR_046678, intron 3 of 3) -28607 NM_001142475 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 266.5-51 chr3 71607410 71607719 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -23575 NM_001012505 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 200.25-28 chr12 59584643 59584863 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -11276 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 181.25-54 chr18 12053751 12053988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39974 NM_001277333 342850 Hs.448906 NM_001277333 ENSG00000181626 ANKRD62 DKFZp779B1634 ankyrin repeat domain 62 protein-coding 238-29 chr2 184111681 184111968 + 1.25 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL -267151 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 296.75-18 chr2 80041903 80042217 + 1.25 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) AluSz|SINE|Alu -175477 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 349.25-10 chr3 26608196 26608624 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14396 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 125.5-229 chr7 31997018 31997199 + 1.25 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 73299 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 206.75-30 chr18 39510360 39510601 + 1.25 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 111695 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 287-31 chr5 73579419 73579719 + 1.25 NA intron (NM_001284431, intron 11 of 11) intron (NM_001284431, intron 11 of 11) 13826 NM_032175 84135 Hs.406703 NM_032175 ENSG00000164338 UTP15 NET21 UTP15 small subunit processome component protein-coding 177.5-167 chr8 48213874 48214094 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 205553 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 426-13 chr8 82175841 82176265 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -333767 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 243.25-24 chr2 70949478 70949939 + 1.25 NA intron (NM_001692, intron 2 of 13) L1ME4b|LINE|L1 -1097 NR_110273 101927750 Hs.676120 NR_110273 ENSG00000239322 ATP6V1B1-AS1 - ATP6V1B1 antisense RNA 1 ncRNA 291-32 chr8 35259128 35259522 + 1.25 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) 23850 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 231.25-28 chr18 45333362 45333712 + 1.25 NA intron (NM_001371319, intron 4 of 23) intron (NM_001371319, intron 4 of 23) 120542 NM_001242692 8170 Hs.710927 NM_007163 ENSG00000132874 SLC14A2 HUT2|UT-A2|UT2|UTA|UTR|hUT-A6 solute carrier family 14 member 2 protein-coding 215-75 chr8 122486961 122487324 + 1.25 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 81502 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 217-61 chr4 70598720 70598991 + 1.25 NA intron (NM_016519, intron 4 of 12) AluSx1|SINE|Alu 6599 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 162.25-80 chr2 105073210 105073407 + 1.25 NA intron (NM_182640, intron 4 of 10) intron (NM_182640, intron 4 of 10) 29636 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 276.5-40 chr20 52642825 52643171 + 1.25 NA intron (NR_110038, intron 2 of 2) intron (NR_110038, intron 2 of 2) 22160 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 134-48 chr13 81316024 81316271 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -89164 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 221.25-34 chr16 78520143 78520456 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 420645 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 133-60 chr15 88986616 88986774 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -73316 NM_001310319 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 248.75-50 chr4 76638924 76639387 + 1.25 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 63604 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 301.25-11 chr14 58083398 58083773 + 1.25 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) AluSz6|SINE|Alu 68628 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 158-150 chr8 132354727 132354987 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 92405 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 268.5-2 chr1 56584117 56584426 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4708 NM_003713 8613 Hs.405156 NM_003713 ENSG00000162407 PLPP3 Dri42|LPP3|PAP2B|PPAP2B|VCIP phospholipid phosphatase 3 protein-coding 225.25-56 chr3 182088201 182088397 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 135935 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 115.25-18 chr1 195566807 195566960 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 521832 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 167-45 chr15 69783126 69783379 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -51982 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 243.5-76 chr7 92276448 92276719 + 1.25 NA intron (NM_019004, intron 1 of 19) intron (NM_019004, intron 1 of 19) -30483 NM_001350679 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 305.75-23 chr6 51240792 51241066 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -380941 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 186.5-24 chr11 42830654 42830894 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 438595 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 154-22 chr10 78196460 78196735 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52028 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 117.5-47 chr11 108198876 108199039 + 1.25 NA intron (NM_001321307, intron 1 of 17) LTR27E|LTR|ERV1 23681 NM_002519 4863 Hs.171061 NM_002519 ENSG00000149308 NPAT E14|E14/NPAT|p220 nuclear protein, coactivator of histone transcription protein-coding 231.25-63 chr4 155596402 155596739 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70140 NM_001130687 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 146.75-101 chr3 55853362 55853556 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_037502) promoter-TSS (NR_037502) -865 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 299.25-48 chr8 55031572 55031824 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -70330 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 244.75-19 chr14 39493889 39494174 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61531 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 208.25-14 chr10 21326858 21327146 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 45948 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 276-55 chr9 37313946 37314237 + 1.25 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -108605 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 363-20 chr7 16333924 16334372 + 1.25 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) L1M1|LINE|L1 87390 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 221.25-29 chr15 67061304 67061591 + 1.25 NA intron (NR_135686, intron 1 of 5) AluSp|SINE|Alu 2735 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 176.25-25 chr11 83903787 83904068 + 1.25 NA intron (NM_001142700, intron 7 of 19) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -221502 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 283.25-29 chr3 79638318 79638659 + 1.25 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) AluSx|SINE|Alu 129510 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 288.5-54 chr9 130690605 130691140 + 1.25 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -2888 NM_001282708 23404 Hs.654643 NM_014285 ENSG00000130713 EXOSC2 RRP4|Rrp4p|SHRF|hRrp4p|p7 exosome component 2 protein-coding 260.25-15 chr13 103243143 103243431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -176870 NM_000452 6555 Hs.194783 NM_000452 ENSG00000125255 SLC10A2 ASBT|IBAT|ISBT|NTCP2|PBAM solute carrier family 10 member 2 protein-coding 158.25-75 chr20 25255466 25255707 + 1.25 NA intron (NM_002862, intron 1 of 19) intron (NM_002862, intron 1 of 19) 7501 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 148.25-73 chr2 134463508 134463718 + 1.25 NA intron (NM_030923, intron 6 of 7) intron (NM_030923, intron 6 of 7) 209541 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 211-41 chr3 47670820 47671110 + 1.25 NA intron (NM_003074, intron 18 of 27) AluSz|SINE|Alu -9271 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 231.75-76 chr8 132398070 132398316 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 49069 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 199-87 chr8 110987321 110987610 + 1.25 NA intron (NR_125416, intron 4 of 4) intron (NR_125416, intron 4 of 4) 39968 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 156-168 chrX 81040501 81040668 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 161329 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 189.75-77 chr4 30709264 30709579 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -10948 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 181-55 chr2 132983607 132983822 + 1.25 NA intron (NM_207481, intron 7 of 17) intron (NM_207481, intron 7 of 17) 68157 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 278.25-21 chr17 66312353 66312915 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 10021 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 214.25-86 chr9 31543673 31543980 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -162336 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 235.75-74 chr7 158611992 158612220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20490 NR_049893 100847032 NR_049893 ENSG00000265598 MIR5707 - microRNA 5707 ncRNA 234-48 chr4 98547578 98547904 + 1.25 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 110870 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 242.75-42 chr3 69971336 69971606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28273 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 240-62 chr7 145207336 145207567 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -371398 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 291-2 chr1 115349040 115349398 + 1.25 NA intron (NR_157569, intron 1 of 1) intron (NR_157569, intron 1 of 1) -10983 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 269.5-26 chr2 63837313 63837640 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3488 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 176.25-22 chr11 38000979 38001153 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 62465 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 124.5-132 chr21 29512369 29512518 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16396 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 209.25-112 chr8 101125141 101125453 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 73243 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 241.5-82 chr6 119470155 119470541 + 1.25 NA intron (NR_046100, intron 2 of 5) L1ME3A|LINE|L1 20954 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 298-16 chr2 167724687 167725036 + 1.25 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -93811 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 214.5-23 chr12 16683806 16684092 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -75735 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 215.5-90 chr5 82895435 82895632 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35697 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 177.25-12 chr10 6096588 6096784 + 1.25 NA intron (NM_001145547, intron 1 of 11) intron (NM_001145547, intron 1 of 11) 7340 NM_001145547 84991 Hs.498548 NM_032905 ENSG00000134453 RBM17 SPF45 RNA binding motif protein 17 protein-coding 231.25-34 chr2 50406846 50407260 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -59297 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 140.75-78 chr19 40727288 40727460 + 1.25 NA intron (NM_025194, intron 2 of 6) intron (NM_025194, intron 2 of 6) 10262 NM_025194 80271 Hs.515415 NM_025194 ENSG00000086544 ITPKC IP3-3KC|IP3KC inositol-trisphosphate 3-kinase C protein-coding 158.75-171 chr9 35958097 35958244 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_019897) promoter-TSS (NM_019897) -16 NM_019897 56656 Hs.553540 NM_019897 ENSG00000278889 OR2S2 OR37A|OST715 olfactory receptor family 2 subfamily S member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 164.5-93 chr2 47370616 47370932 + 1.25 NA intron (NM_002354, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu 1626 NM_002354 4072 Hs.542050 NM_002354 ENSG00000119888 EPCAM DIAR5|EGP-2|EGP314|EGP40|ESA|HNPCC8|KS1/4|KSA|M4S1|MIC18|MK-1|TACSTD1|TROP1 epithelial cell adhesion molecule protein-coding 307.75-5 chr16 86247518 86247885 + 1.25 NA intron (NR_104139, intron 3 of 5) intron (NR_104139, intron 3 of 5) 38546 NR_104139 101154687 Hs.640512 NR_104139 LINC01081 TCONS00024764|TCONS_00024764 long intergenic non-protein coding RNA 1081 ncRNA 184.5-30 chr11 102750459 102750636 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -25593 NM_001304441 4317 Hs.161839 NM_002424 ENSG00000118113 MMP8 CLG1|HNC|MMP-8|PMNL-CL matrix metallopeptidase 8 protein-coding 311-32 chr8 136093222 136093669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -437353 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 294.5-7 chr11 26747799 26748195 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25937 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 260.25-46 chr7 7727244 7727624 + 1.25 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) HERVL-int|LTR|ERVL -8827 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 245-63 chr6 77455440 77455784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 8410 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 290.25-33 chr7 55277668 55278153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22275 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 183-21 chr13 65878848 65879029 + 1.25 NA TTS (NR_132362) TTS (NR_132362) 12891 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 191.25-26 chr12 82720104 82720368 + 1.25 NA intron (NM_001320321, intron 1 of 10) L1MB8|LINE|L1 33081 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 320-9 chr11 84742053 84742532 + 1.25 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1M2c|LINE|L1 -21350 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 163.75-37 chr12 93170520 93170719 + 1.25 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) intron (NR_040096, intron 3 of 4) -3747 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 292-18 chr17 58715536 58715801 + 1.25 NA intron (NM_058216, intron 5 of 8) L1MB7|LINE|L1 23066 NR_103872 5889 Hs.412587 NM_002876 ENSG00000108384 RAD51C BROVCA3|FANCO|R51H3|RAD51L2 RAD51 paralog C protein-coding 186.5-135 chr8 81262712 81262962 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17699 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 215.5-17 chr10 118320400 118320613 + 1.25 NA intron (NM_022063, intron 7 of 8) intron (NM_022063, intron 7 of 8) 21818 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 183.5-157 chr8 139545243 139545444 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 157780 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 175.75-82 chr22 33563203 33563363 + 1.25 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -126614 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 129.25-222 chrX 45792749 45792894 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -45697 NR_029636 407007 NR_029636 ENSG00000207725 MIR222 MIRN222|miRNA222|mir-222 microRNA 222 ncRNA 244.25-44 chr7 3771795 3772097 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MB3|LINE|L1 -357739 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 126-155 chr6 51163815 51164158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 345115 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 342.75 chr1 44268597 44269088 + 1.25 NA intron (NM_001301698, intron 6 of 7) intron (NM_001301698, intron 6 of 7) -16283 NR_132966 106635545 NR_132966 SNORA110 - small nucleolar RNA, H/ACA box 110 snoRNA 256.25-56 chr9 128479758 128480032 + 1.25 NA intron (NM_153433, intron 8 of 20) L1MB5|LINE|L1 22988 NM_153437 4957 Hs.129055 NM_002540 ENSG00000136811 ODF2 CT134|ODF2/1|ODF2/2|ODF84 outer dense fiber of sperm tails 2 protein-coding 240.25-14 chr12 10699372 10699691 + 1.25 NA 3' UTR (NM_003651, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_003651, exon 10 of 10) 23792 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 358.75-11 chr4 60957973 60958387 + 1.25 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 35561 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 270.75-2 chr1 190172366 190172760 + 1.25 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) intron (NM_199051, intron 6 of 7) 303447 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 296-7 chr10 121600555 121600909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2274 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 157.75-16 chr10 78236922 78237274 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11527 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 182.5-73 chr18 69693453 69693654 + 1.25 NA intron (NM_152721, intron 4 of 7) intron (NM_152721, intron 4 of 7) 223622 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 249.5-52 chr2 153476688 153476991 + 1.25 NA TTS (NM_019845) TTS (NM_019845) 1923 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 139.25-48 chr14 54210243 54210367 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -186563 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 248.5-7 chr10 42976366 42976680 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 4984 NR_126352 104266963 Hs.559152 NR_126352 ENSG00000229630 LINC01264 - long intergenic non-protein coding RNA 1264 ncRNA 391-4 chr11 45321857 45322498 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33194 NR_120558 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 136-35 chr13 23800924 23801144 + 1.25 NA intron (NM_005932, intron 16 of 18) intron (NM_005932, intron 16 of 18) -87834 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 165.25-69 chr2 114878996 114879198 + 1.25 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -45549 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 275.75-46 chr8 135097653 135097987 + 1.25 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -136311 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 275-26 chr21 30054813 30055304 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 111747 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 208.5-64 chr19 27560864 27561217 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -232391 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 185.75-5 chr1 90978401 90978602 + 1.25 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) intron (NM_201269, intron 2 of 5) 43007 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 295.75-26 chr6 95105713 95106086 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 471552 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 136.5-242 chrX 150209959 150210165 + 1.25 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -17942 NR_031748 100313839 NR_031748 ENSG00000252454 MIR2114 - microRNA 2114 ncRNA 290.5-33 chr4 144297727 144297985 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -157138 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 284.75-40 chr8 47595625 47595893 + 1.25 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) intron (NM_001352958, intron 10 of 21) -58329 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 264.25-28 chr2 100507307 100507639 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 36991 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 130.5-259 chrX 42515300 42515519 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 262754 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 261.25-26 chr3 4107996 4108351 + 1.25 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -195131 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 367-4 chr16 47290663 47291007 + 1.25 NA intron (NM_030790, intron 10 of 17) L1MA5|LINE|L1 146767 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 392.5-5 chr16 54575440 54575806 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -204924 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 137.5-43 chr11 83786573 83786850 + 1.25 NA exon (NM_001142700, exon 10 of 20) exon (NM_001142700, exon 10 of 20) -104286 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 191.75-69 chr2 142074044 142074224 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 57567 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 124.75-173 chr5 98595704 98595828 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -172866 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 233.25-18 chr12 49207889 49208204 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -18722 NM_001270400 7846 Hs.654422 NM_006009 ENSG00000167552 TUBA1A B-ALPHA-1|LIS3|TUBA3 tubulin alpha 1a protein-coding 260.25-26 chr2 192442389 192442777 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -247650 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 271.5-42 chr2 174385816 174386091 + 1.25 NA intron (NM_004882, intron 2 of 9) L1MB4|LINE|L1 9759 NM_004882 9541 Hs.632531 NM_004882 ENSG00000138433 CIR1 CIR corepressor interacting with RBPJ, 1 protein-coding 171.75-24 chr11 45749616 45749764 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -21742 NR_027134 374387 Hs.632142 NM_199137 ENSG00000205106 LINC02716 DKFZp779M0652 long intergenic non-protein coding RNA 2716 ncRNA 281.5-8 chr10 89986095 89986336 + 1.25 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -28842 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 209.75-72 chr5 27360217 27360463 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -111952 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 354.75-23 chr8 105098594 105099077 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -219603 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 171.25-145 chr7 93990225 93990473 + 1.25 NA intron (NR_133909, intron 3 of 4) intron (NR_133909, intron 3 of 4) 14006 NM_001317739 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 227.75-62 chr5 4757428 4757767 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -15884 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 307.75-16 chr4 60072390 60072789 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -850030 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 299-26 chr3 87785046 87785356 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7505 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 152.75-15 chr1 238973447 238973607 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -413041 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 426.25-9 chr7 7340281 7340865 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85419 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 195-65 chr3 87297377 87297788 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20998 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 289-26 chr3 21506112 21506668 + 1.25 NA intron (NM_024697, intron 4 of 7) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -36399 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 179.25-122 chr5 114133158 114133433 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -228775 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 208.25-98 chr9 31669573 31669760 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -288176 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 230-62 chr7 126321705 126321944 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 736360 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 151 chr1 9148632 9148979 + 1.25 NA non-coding (NR_132742, exon 2 of 2) non-coding (NR_132742, exon 2 of 2) 2972 NR_029610 407040 NR_029610 ENSG00000284357 MIR34A MIRN34A|miRNA34A|mir-34|mir-34a microRNA 34a ncRNA 310.75-8 chr12 13099243 13099626 + 1.25 NA intron (NM_001080555, intron 1 of 6) intron (NM_001080555, intron 1 of 6) -3759 NM_001206845 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 368.5-15 chr5 172987210 172987625 + 1.25 NA intron (NM_003945, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 3646 NM_003945 8992 Hs.484188 NM_003945 ENSG00000113732 ATP6V0E1 ATP6H|ATP6V0E|M9.2|Vma21|Vma21p ATPase H+ transporting V0 subunit e1 protein-coding 188.75-31 chr15 56692731 56693004 + 1.25 NA intron (NM_001002843, intron 6 of 20) intron (NM_001002843, intron 6 of 20) 41219 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 369.75-6 chr13 39138132 39138455 + 1.25 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 99837 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 223-89 chrX 111144085 111144322 + 1.25 NA intron (NR_136748, intron 3 of 15) intron (NR_136748, intron 3 of 15) 21126 NM_001128172 5063 Hs.593599 NM_002578 ENSG00000077264 PAK3 ARA|MRX30|MRX47|OPHN3|PAK-3|PAK3beta|bPAK|beta-PAK p21 (RAC1) activated kinase 3 protein-coding 219.25-13 chr10 36035856 36036183 + 1.25 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 257717 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 207.25-99 chr8 125927939 125928141 + 1.25 NA intron (NR_038447, intron 3 of 3) intron (NR_038447, intron 3 of 3) 23157 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 206.75-60 chr4 30646547 30646881 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73655 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 240-16 chr12 107167249 107167840 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -73995 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 130.75-120 chr3 123183668 123183862 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18178 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 255.25-37 chr4 88219262 88219544 + 1.25 NA intron (NM_001348985, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 12223 NM_001257386 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 204-69 chr6 18277272 18277591 + 1.25 NA Intergenic CpG -12901 NM_003472 7913 Hs.484813 NM_003472 ENSG00000124795 DEK D6S231E DEK proto-oncogene protein-coding 298-2 chr1 248204031 248204442 + 1.25 NA TTS (NM_001004689) TTS (NM_001004689) 1168 NM_001004689 127062 Hs.553581 NM_001004689 ENSG00000228198 OR2M3 OR1-54|OR2M3P|OR2M6|OST003 olfactory receptor family 2 subfamily M member 3 protein-coding 360.25-14 chr6 109115254 109115741 + 1.25 NA intron (NM_001083535, intron 3 of 12) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -13807 NM_173830 285753 Hs.632616 NM_173830 ENSG00000183137 CEP57L1 C6orf182|bA487F23.2|cep57R centrosomal protein 57 like 1 protein-coding 152.75-31 chr11 27416119 27416293 + 1.25 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) intron (NM_018490, intron 1 of 17) -52958 NM_080654 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 324-31 chr8 126004016 126004478 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -53050 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 339.25-3 chr11 106760600 106761027 + 1.25 NA intron (NM_001256424, intron 6 of 8) intron (NM_001256424, intron 6 of 8) 257663 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 170.5-45 chr12 40423252 40423408 + 1.25 NA intron (NM_173600, intron 17 of 173) L1MA9|LINE|L1 29936 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 350.5-2 chr1 111732985 111733516 + 1.25 NA intron (NM_198926, intron 1 of 1) intron (NM_198926, intron 1 of 1) 6145 NM_019099 55924 Hs.193406 NM_019099 ENSG00000197852 INKA2 C1orf183|FAM212B inka box actin regulator 2 protein-coding 294-13 chr16 9892389 9892857 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) intron (NM_001134408, intron 3 of 13) 289444 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 269.75-45 chr5 103188549 103188816 + 1.25 NA intron (NM_001345871, intron 27 of 29) intron (NM_001345871, intron 27 of 29) 68381 NM_001345871 23262 Hs.212046 NM_015216 ENSG00000145725 PPIP5K2 CFAP160|DFNB100|HISPPD1|IP7K2|VIP2 diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 protein-coding 351.25-8 chr2 216839006 216839416 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20853 NM_003284 7141 Hs.3017 NM_003284 ENSG00000118245 TNP1 TP1 transition protein 1 protein-coding 165-9 chr1 214698890 214699062 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 95781 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 228.5-76 chr4 42238016 42238228 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -85467 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 190-8 chr1 238776995 238777193 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -291077 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 174-3 chr1 150012544 150012713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1902 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 237.5-63 chr3 170605168 170605407 + 1.25 NA intron (NR_135556, intron 2 of 5) L1ME5|LINE|L1 -19212 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 155-50 chr17 60422975 60423184 + 1.25 NA intron (NM_181707, intron 1 of 5) intron (NM_181707, intron 1 of 5) 590 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 247.75-62 chr7 98026937 98027286 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -37007 NM_006188 4951 Hs.510456 NM_006188 ENSG00000135175 OCM2 OCM|OM oncomodulin 2 protein-coding 210-55 chr2 139675069 139675348 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 777884 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 320.75-18 chr3 126575596 126575922 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -16827 NM_152533 152065 Hs.178210 NM_152533 ENSG00000180697 C3orf22 - chromosome 3 open reading frame 22 protein-coding 315.25-7 chr12 118802639 118802907 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 30763 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 113.75-45 chr12 25021322 25021465 + 1.25 NA intron (NM_001321724, intron 8 of 17) intron (NM_001321724, intron 8 of 17) 23818 NM_001321724 645177 Hs.569157 NM_001321724 LOC645177 - uncharacterized LOC645177 protein-coding 158.25-136 chr7 54425272 54425448 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 94663 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 211-54 chr5 106765443 106765782 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 245402 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 246.75-44 chr3 162036443 162036755 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 539791 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 197.5-54 chr16 89287783 89288043 + 1.25 NA intron (NR_045839, intron 9 of 9) intron (NR_045839, intron 9 of 9) -8215 NR_136339 105371414 Hs.657381 NR_136339 ENSG00000260279 LOC105371414 - uncharacterized LOC105371414 ncRNA 190.25-7 chr1 158376881 158377108 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 22472 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 248.75-33 chr2 158142641 158142909 + 1.25 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -23875 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 197.5-47 chr16 23844405 23844598 + 1.25 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) (CATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8518 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 133.25-173 chr5 61562018 61562226 + 1.25 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -75638 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 192-37 chr12 91715913 91716162 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 425676 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 223-14 chr11 110282484 110282761 + 1.25 NA intron (NM_001260493, intron 1 of 15) L1M5|LINE|L1 14090 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 240.75-29 chr15 99836455 99836773 + 1.25 NA intron (NR_135737, intron 3 of 4) AluSc|SINE|Alu 29591 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 145.25-128 chr5 33182227 33182434 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -47405 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 320.5-49 chr9 5152644 5153142 + 1.25 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 32746 NM_007179 11172 Hs.632648 NM_007179 ENSG00000120210 INSL6 RIF1 insulin like 6 protein-coding 298-3 chr10 64625634 64625969 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -199727 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 348-21 chr8 139944544 139944986 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) L1MEb|LINE|L1 155770 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 192.5-35 chr13 59191463 59191789 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -821092 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-138 chr22 49796276 49796431 + 1.25 NA intron (NM_001349942, intron 6 of 12) AluSz|SINE|Alu 27978 NM_001349940 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 299.5-9 chr12 99836413 99836874 + 1.25 NA intron (NM_152788, intron 1 of 25) intron (NM_152788, intron 1 of 25) 148011 NM_001352186 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 203.5-81 chr20 10724289 10724549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28671 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 211.75-93 chr8 89000849 89001197 + 1.25 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -673540 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 157.25-94 chr3 96263224 96263395 + 1.25 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -96655 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 403-9 chr6 65946419 65946796 + 1.25 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 158728 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 250-37 chr3 10570481 10570762 + 1.25 NA intron (NM_001353564, intron 1 of 20) intron (NM_001353564, intron 1 of 20) 49340 NM_001353564 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 213.25-62 chr7 45473158 45473554 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -100784 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 309.5-34 chr4 168406183 168406514 + 1.25 NA intron (NM_001345927, intron 23 of 37) intron (NM_001345927, intron 23 of 37) 74144 NM_001291510 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 269.25-59 chr9 87282152 87282469 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 133666 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 334.25-21 chr8 116628260 116628772 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -23584 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 487 chr1 61771226 61771747 + 1.25 NA exon (NM_176877, exon 6 of 43) exon (NM_176877, exon 6 of 43) 29006 NM_001350145 10207 Hs.478125 NM_005799 ENSG00000132849 PATJ Cipp|INADL|InaD-like|hINADL PATJ crumbs cell polarity complex component protein-coding 240-29 chr2 172668214 172668629 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -67424 NM_007023 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 209-65 chr7 81416109 81416313 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 145608 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 236-62 chr6 101359224 101359559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39594 NM_175768 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 217.75-46 chr22 25805779 25806120 + 1.25 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) L2b|LINE|L2 63761 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 133.5-269 chr8 122555921 122556117 + 1.25 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 12625 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 151-138 chr9 27050133 27050396 + 1.25 NA intron (NM_025103, intron 16 of 19) AluJb|SINE|Alu -44592 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 408.25-7 chr8 4799848 4800298 + 1.25 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 194841 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 362.25-10 chr4 106461931 106462359 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 28521 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 163.25-11 chr10 3280908 3281176 + 1.25 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -37653 NR_131187 105376360 Hs.212226 NR_131187 LOC105376360 - uncharacterized LOC105376360 ncRNA 223-59 chr4 91207739 91208064 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PREC2|LINE|L1 972870 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 202.5-14 chr10 29448051 29448238 + 1.25 NA intron (NR_110927, intron 2 of 2) intron (NR_110927, intron 2 of 2) 37901 NR_110928 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 143.25-55 chr15 67050938 67051179 + 1.25 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) intron (NR_135686, intron 2 of 5) 13124 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 247.75-53 chr6 64361333 64361612 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 554636 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 218.25-45 chr2 189010402 189010595 + 1.25 NA intron (NM_000090, intron 49 of 50) intron (NM_000090, intron 49 of 50) 14868 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 212-37 chr2 70432075 70432426 + 1.25 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 49390 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 249.75-24 chr16 12767793 12768217 + 1.25 NA intron (NM_018340, intron 2 of 3) intron (NM_018340, intron 2 of 3) 35882 NM_018340 55313 Hs.460002 NM_018340 ENSG00000103381 CPPED1 CSTP1 calcineurin like phosphoesterase domain containing 1 protein-coding 263.25-62 chr9 84235634 84235921 + 1.25 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 104981 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 220.75-80 chrX 10201566 10201780 + 1.25 NA intron (NM_001830, intron 6 of 12) intron (NM_001830, intron 6 of 12) 44698 NM_001830 1183 Hs.495674 NM_001830 ENSG00000073464 CLCN4 CLC4|ClC-4|ClC-4A|MRX15|MRX49|MRXSRC chloride voltage-gated channel 4 protein-coding 182-80 chr4 59681636 59681933 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 668211 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 291-7 chr11 97818569 97819004 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1202163 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 313.25-22 chr4 112067507 112067951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77725 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 250.75-68 chr8 86987704 86987946 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1PA16|LINE|L1 121410 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 173.75-16 chr1 192775359 192775625 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33547 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 235-63 chr6 78232612 78233095 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 306456 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 200.25-49 chr18 36352598 36352910 + 1.25 NA intron (NM_001281740, intron 1 of 28) intron (NM_001281740, intron 1 of 28) 55041 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 136.75-143 chr4 61124873 61125072 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -18684 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 199.25-26 chr12 126067526 126067775 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28342 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 192-66 chr20 260006 260317 + 1.25 NA 3' UTR (NM_207469, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_207469, exon 2 of 2) 2437 NM_207469 400830 Hs.516819 NM_207469 ENSG00000186458 DEFB132 BD-32|DEFB-32|DEFB32|HEL-75|KFLL827|UNQ827 defensin beta 132 protein-coding 273-48 chr7 6033466 6033770 + 1.25 NA intron (NM_001271700, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu 2242 NM_001271700 100310846 Hs.744468 NM_001271700 ENSG00000157999 ANKRD61 - ankyrin repeat domain 61 protein-coding 212.5-117 chr8 73188653 73188933 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 70709 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 201.75-55 chr22 31814463 31814791 + 1.25 NA intron (NR_146296, intron 20 of 42) L1MC5a|LINE|L1 60604 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 186.75-67 chr22 26301527 26301731 + 1.25 NA intron (NM_001184776, intron 5 of 14) intron (NM_001184776, intron 5 of 14) -127631 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 216.75-64 chr5 111482234 111482538 + 1.25 NA intron (NM_001744, intron 9 of 10) intron (NM_001744, intron 9 of 10) -29840 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 179.25-100 chr3 70012882 70013106 + 1.25 NA intron (NR_110000, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 13250 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 280-20 chr16 23605014 23605398 + 1.25 NA intron (NM_024675, intron 12 of 12) intron (NM_024675, intron 12 of 12) -8890 NM_005003 4706 Hs.189716 NM_005003 ENSG00000004779 NDUFAB1 ACP|ACP1|FASN2A|SDAP NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit AB1 protein-coding 258-9 chr11 83969298 83969652 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 12 of 27) intron (NM_001142699, intron 12 of 27) -287050 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 161-120 chr8 120592635 120592846 + 1.25 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 147321 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 164.5-165 chr5 107413062 107413255 + 1.25 NA intron (NM_001962, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 257779 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 130-131 chr5 118600177 118600385 + 1.25 NA intron (NR_104998, intron 1 of 4) intron (NR_104998, intron 1 of 4) 4093 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 356-14 chr8 130730060 130730397 + 1.25 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -286554 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 184-95 chr8 120379064 120379367 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 65935 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 334-26 chr5 82884548 82884888 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24882 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 156.75-77 chr18 63578806 63579040 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8377 NM_001307923 5275 Hs.241407 NM_012397 ENSG00000197641 SERPINB13 HSHUR7SEQ|HUR7|PI13|headpin serpin family B member 13 protein-coding 213.75-34 chr14 60541501 60541783 + 1.25 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 32496 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 285.75-40 chr7 113047868 113048233 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 38288 NM_001146266 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 156.25-9 chr1 207399999 207400257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54172 NM_001006658 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 279.5-64 chr8 79047885 79048328 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 210577 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 131.25-153 chr4 14055024 14055265 + 1.25 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -56824 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 245-40 chr3 95218323 95218556 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 280176 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 188.75-91 chr5 104701267 104701468 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -398107 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 269.5-56 chr7 77672670 77673040 + 1.25 NA intron (NR_134251, intron 2 of 3) Plat_L3|LINE|CR1 23410 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 173.25-131 chr8 130469853 130470129 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26317 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 264.5-48 chr5 41466009 41466310 + 1.25 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) intron (NM_001005473, intron 1 of 2) 44442 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 136.75-39 chr11 34563846 34563985 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50121 NM_001422 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 263.25-37 chr3 189977337 189977742 + 1.25 NA intron (NM_018192, intron 8 of 14) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 143358 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 166-64 chr2 104711856 104712074 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 45754 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 260.25-4 chr10 11709430 11709839 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32748 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 247.25-28 chr2 80576621 80576903 + 1.25 NA intron (NM_001282599, intron 7 of 11) AluSx|SINE|Alu 263383 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 187.75-26 chr13 39960624 39961066 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -220964 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 240.5-63 chr3 51691969 51692281 + 1.25 NA intron (NR_024012, intron 2 of 3) intron (NR_024012, intron 2 of 3) -14943 NR_146059 2912 Hs.121510 NM_000839 ENSG00000164082 GRM2 GLUR2|GPRC1B|MGLUR2|mGlu2 glutamate metabotropic receptor 2 protein-coding 173-124 chr6 127353115 127353303 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -9600 NM_018479 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 183.5-132 chr7 11725643 11725808 + 1.25 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 106473 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 225.25-50 chr20 52000011 52000340 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 105309 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 284.75-3 chr10 24003425 24003713 + 1.25 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) -205222 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 137-107 chr3 122599890 122600021 + 1.25 NA intron (NM_001113523, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR -15660 NM_152615 165631 Hs.120250 NM_152615 ENSG00000173200 PARP15 ARTD7|BAL3|pART7 poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 protein-coding 195.75-99 chr5 169629326 169629550 + 1.25 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -7837 NR_156756 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 138-30 chr12 107313033 107313267 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5284 NM_001018072 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 276-53 chr8 129140518 129141042 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 100460 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 144.25-173 chr6 112947284 112947485 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 486063 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 315-18 chr4 74515033 74515294 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 70027 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 173.25-49 chr17 78314367 78314597 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35990 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 267.25-41 chr7 51343863 51344244 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -27192 NM_001287436 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 155.25-162 chr7 46696511 46696640 + 1.25 NA intron (NR_134575, intron 1 of 2) L1MC2|LINE|L1 547 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 220-42 chr3 120023727 120023948 + 1.25 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 60811 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 256.75-11 chr14 56237477 56237854 + 1.25 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 119254 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 216.75-23 chr14 46315549 46315813 + 1.25 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MCc|LINE|L1 -155678 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 226.75-40 chr20 6671327 6671619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64663 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 230.5-122 chr9 86787431 86787746 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 159918 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 284.75-18 chr2 112463644 112463922 + 1.25 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -18373 NM_153712 150465 Hs.358997 NM_153712 ENSG00000114999 TTL - tubulin tyrosine ligase protein-coding 209.75-25 chr14 51713646 51713981 + 1.25 NA intron (NM_001042481, intron 10 of 14) intron (NM_001042481, intron 10 of 14) -3470 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 281-18 chr22 46174237 46174491 + 1.25 NA intron (NM_001001928, intron 2 of 7) L1MC4|LINE|L1 23569 NM_001362873 5465 Hs.103110 NM_005036 ENSG00000186951 PPARA NR1C1|PPAR|PPARalpha|hPPAR peroxisome proliferator activated receptor alpha protein-coding 255.5-34 chr18 642266 642635 + 1.25 NA intron (NM_199167, intron 7 of 8) AluSz|SINE|Alu -15203 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 146.5-8 chr1 69688804 69688982 + 1.25 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) intron (NM_001370785, intron 2 of 26) 119552 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 169.75-55 chr16 9695567 9695744 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -240150 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 271.5-67 chr5 32746300 32746634 + 1.25 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) intron (NM_001364460, intron 2 of 6) 35146 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 153.25-132 chr8 81249353 81249578 + 1.25 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -31071 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 248.5-97 chr7 86046405 86046758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -597328 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 226.5-75 chr4 122382099 122382473 + 1.25 NA intron (NM_001159285, intron 3 of 11) intron (NM_001159285, intron 3 of 11) 2768 NM_001159295 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 147.75-146 chr7 86896210 86896380 + 1.25 NA intron (NM_001291991, intron 18 of 20) Charlie9|DNA|hAT-Charlie 69604 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 275-29 chr3 108456686 108457076 + 1.25 NA exon (NM_014981, exon 20 of 42) exon (NM_014981, exon 20 of 42) 72441 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 202.75-67 chr21 28811999 28812291 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73222 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 282-12 chr12 64399006 64399282 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5248 NM_007235 11260 Hs.85951 NM_007235 ENSG00000184575 XPOT XPO3 exportin for tRNA protein-coding 190.25-105 chr6 49666239 49666400 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -29445 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 216-22 chr15 84698002 84698204 + 1.25 NA intron (NM_014300, intron 1 of 5) intron (NM_014300, intron 1 of 5) 18036 NM_014300 23478 Hs.9534 NM_014300 ENSG00000140612 SEC11A 1810012E07Rik|SEC11L1|SPC18|SPCS4A|sid2895 SEC11 homolog A, signal peptidase complex subunit protein-coding 308.25-3 chr10 63679601 63680057 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -157939 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 232.75-44 chr3 188331065 188331456 + 1.25 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 105855 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 226-35 chr2 21775120 21775351 + 1.25 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -64583 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 328.5-14 chr15 41278774 41279102 + 1.25 NA intron (NM_007236, intron 6 of 6) AluSg|SINE|Alu -5052 NR_152822 729082 Hs.380164 NR_026757 ENSG00000247556 OIP5-AS1 cyrano|linc-OIP5 OIP5 antisense RNA 1 ncRNA 196.5-108 chr3 142565758 142565929 + 1.25 NA intron (NM_001354579, intron 3 of 45) intron (NM_001354579, intron 3 of 45) 12890 NM_001184 545 Hs.271791 NM_001184 ENSG00000175054 ATR FCTCS|FRP1|MEC1|SCKL|SCKL1 ATR serine/threonine kinase protein-coding 395.75 chr10 26326080 26326624 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 109578 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 152.75-23 chr10 78963399 78963607 + 1.25 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) intron (NR_015429, intron 3 of 7) 103945 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 297.75-56 chrX 71682458 71682893 + 1.25 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -14521 NR_034004 100132741 Hs.742520 NR_034004 LOC100132741 - uncharacterized LOC100132741 ncRNA 252-40 chr20 25664751 25665045 + 1.25 NA intron (NR_126465, intron 2 of 3) L1MA4|LINE|L1 22041 NM_001290261 26152 Hs.61881 NM_015655 ENSG00000130684 ZNF337 - zinc finger protein 337 protein-coding 216.25-27 chr12 76937231 76937459 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -58326 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 212.75-37 chr15 65480290 65480567 + 1.25 NA intron (NR_135485, intron 9 of 20) intron (NR_135485, intron 9 of 20) 36846 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 138-100 chr3 29551223 29551406 + 1.25 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) intron (NM_001003792, intron 3 of 13) 270002 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 160.75-33 chr12 49590020 49590180 + 1.25 NA intron (NR_027450, intron 5 of 6) intron (NR_027450, intron 5 of 6) 15539 NM_032130 84070 Hs.524406 NM_032130 ENSG00000135436 FAM186B C12orf25 family with sequence similarity 186 member B protein-coding 384.75-13 chr7 90769790 90770285 + 1.25 NA intron (NM_012395, intron 3 of 13) intron (NM_012395, intron 3 of 13) 60221 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 136-101 chr3 35110837 35110991 + 1.25 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1MEf|LINE|L1 283109 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 352.5-27 chr6 63437809 63438226 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118034 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 227-64 chr7 24312687 24312958 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 28632 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 155.5-33 chr10 107990271 107990413 + 1.25 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) L1ME3A|LINE|L1 78951 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 211.5-40 chr12 86763031 86763213 + 1.25 NA intron (NM_001351286, intron 1 of 7) intron (NM_001351286, intron 1 of 7) -17973 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 176.25-7 chr1 170066985 170067208 + 1.25 NA intron (NM_014970, intron 1 of 19) L1MEg|LINE|L1 1819 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 183-17 chr12 65003316 65003606 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11170 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 156-150 chr8 66155319 66155567 + 1.25 NA intron (NM_184085, intron 9 of 9) intron (NM_184085, intron 9 of 9) 23021 NM_000756 1392 Hs.75294 NM_000756 ENSG00000147571 CRH CRF|CRH1 corticotropin releasing hormone protein-coding 211.75-81 chr5 140750990 140751247 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 24959 NR_026705 56662 NR_026705 ENSG00000202515 VTRNA1-3 HVG3|VAULTRC3|VR3|hvg-3 vault RNA 1-3 ncRNA 166-40 chr16 8456233 8456492 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 133476 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 324-11 chr2 57142781 57143142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -764690 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 137-104 chr3 114613333 114613453 + 1.25 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) 10813 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 161.5-73 chr16 20268019 20268200 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 59404 NM_001007240 2813 Hs.53985 NM_001502 ENSG00000169347 GP2 ZAP75 glycoprotein 2 protein-coding 140.75-94 chr2 128807146 128807266 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -57394 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 199.5-107 chr3 167600406 167600592 + 1.25 NA intron (NM_001348951, intron 7 of 18) L1MA3|LINE|L1 53443 NM_001348952 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 196.5-177 chr9 98328506 98328867 + 1.25 NA intron (NM_005458, intron 13 of 18) intron (NM_005458, intron 13 of 18) -73037 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 155.5-28 chr10 77001012 77001257 + 1.25 NA intron (NM_001322838, intron 19 of 29) intron (NM_001322838, intron 19 of 29) 113090 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 141-105 chr3 95080994 95081158 + 1.25 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 142813 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 140-124 chr4 47935115 47935269 + 1.25 NA TTS (NM_001142564) TTS (NM_001142564) -20525 NR_103795 152518 Hs.646325 NM_152995 ENSG00000170448 NFXL1 CDZFP|HOZFP|OZFP|URCC5 nuclear transcription factor, X-box binding like 1 protein-coding 164.25-147 chr7 31091813 31092013 + 1.25 NA intron (NM_001199637, intron 10 of 13) intron (NM_001199637, intron 10 of 13) 39452 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 376.75-7 chr2 103771288 103771804 + 1.25 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 636786 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 281.75-32 chr4 55594861 55595261 + 1.25 NA TTS (NM_001292045) TTS (NM_001292045) -2816 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 268.75-42 chr7 64847013 64847310 + 1.25 NA intron (NR_160269, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 52733 NM_001271640 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 242-18 chr13 92267295 92267554 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) L2|LINE|L2 84783 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 153.75-82 chr21 29314828 29315079 + 1.25 NA intron (NR_027655, intron 1 of 7) intron (NR_027655, intron 1 of 7) 9749 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 308-14 chr17 43210360 43210882 + 1.25 NA TTS (NM_001291571) TTS (NM_001291571) -1254 NM_001291588 113277 Hs.536474 NM_145041 ENSG00000184988 TMEM106A - transmembrane protein 106A protein-coding 261.75-20 chr2 41524333 41524726 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -353026 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 145.75-48 chr15 97217680 97217843 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 304050 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 305.75-30 chrX 102120125 102120579 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -5327 NM_080390 140597 Hs.401835 NM_080390 ENSG00000184905 TCEAL2 MY0876G05|WEX1|my048 transcription elongation factor A like 2 protein-coding 235.5-79 chr7 78065357 78065580 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 20 of 20) intron (NM_001301128, intron 20 of 20) 225338 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 251-31 chr2 88859132 88859445 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 46918 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 234-43 chr4 43867494 43867897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -149166 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 248-3 chr1 227121181 227121562 + 1.25 NA intron (NM_001366019, intron 11 of 36) intron (NM_001366019, intron 11 of 36) 181077 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 227-30 chr19 51573924 51574187 + 1.25 NA non-coding (NR_136208, exon 2 of 2) non-coding (NR_136208, exon 2 of 2) 2772 NR_136208 7728 Hs.119014 NM_007147 ENSG00000105497 ZNF175 OTK18 zinc finger protein 175 protein-coding 166.25-135 chr6 135073321 135073543 + 1.25 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -18610 NM_001363686 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 218.75-27 chr17 61322365 61322641 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 45201 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 174.25-55 chr15 53022026 53022269 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -94218 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 183.25-2 chr1 31220843 31221117 + 1.25 NA intron (NM_024522, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 18907 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 150.5-14 chr10 4641318 4641488 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14753 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 317.5 chr10 17255932 17256467 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26214 NR_108061 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 363.75-16 chr5 180670479 180670808 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13453 NR_146728 105377765 Hs.131536 NR_146728 LINC02222 - long intergenic non-protein coding RNA 2222 ncRNA 243.75-53 chr3 33757061 33757271 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -38912 NM_001365629 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 313.25-4 chr11 80824802 80825275 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -62235 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 173-60 chr19 48131371 48131587 + 1.25 NA intron (NR_135500, intron 18 of 27) AluSx1|SINE|Alu -20627 NM_001159323 8605 Hs.631562 NM_003706 ENSG00000105499 PLA2G4C CPLA2-gamma phospholipase A2 group IVC protein-coding 288.25-4 chr11 109479115 109479551 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 57143 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 308-30 chr8 11271902 11272470 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12630 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 329-18 chr2 83133040 83133520 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 276477 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 112.75 chr1 12270426 12270529 + 1.25 NA intron (NM_015378, intron 16 of 69) AluSz|SINE|Alu 40447 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 179.5-97 chr2 167527256 167527493 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -291298 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 189.25-3 chr1 61130374 61130545 + 1.25 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 47898 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 224-23 chr17 6235925 6236137 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 165417 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 296-36 chr4 147869251 147869856 + 1.25 NA intron (NM_024605, intron 7 of 22) intron (NM_024605, intron 7 of 22) 86958 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 156.25-101 chr3 148925256 148925407 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60035 NM_001870 1359 Hs.646 NM_001870 ENSG00000163751 CPA3 MC-CPA carboxypeptidase A3 protein-coding 253.75-40 chr3 182674984 182675224 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -118400 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 178.75-33 chr14 80802985 80803332 + 1.25 NA intron (NM_152446, intron 13 of 24) L2c|LINE|L2 138580 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 210.25-70 chr6 130616437 130616880 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179541 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 207.25-80 chr5 172428613 172429009 + 1.25 NA intron (NM_001017995, intron 1 of 12) L1MC5a|LINE|L1 25712 NM_001308175 285590 Hs.285666 NM_001017995 ENSG00000174705 SH3PXD2B FAD49|FTHS|HOFI|KIAA1295|TKS4|TSK4 SH3 and PX domains 2B protein-coding 228.5-42 chr17 29413570 29413839 + 1.25 NA intron (NM_025142, intron 1 of 17) L1MB5|LINE|L1 22779 NM_025142 57551 Hs.597434 NM_020791 ENSG00000160551 TAOK1 KFC-B|MAP3K16|MARKK|PSK-2|PSK2|TAO1|hKFC-B|hTAOK1 TAO kinase 1 protein-coding 224.25-51 chr21 25709137 25709365 + 1.25 NA intron (NR_072999, intron 7 of 9) MER58D|DNA|hAT-Charlie -25721 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 281.75-45 chrX 83452588 83452939 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55527 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 223.5-88 chr4 72227568 72227773 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 188538 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 341.25-10 chr14 44949661 44949959 + 1.25 NA intron (NM_017658, intron 1 of 4) L3|LINE|CR1 11675 NM_001308112 54813 Hs.550906 NM_017658 ENSG00000179454 KLHL28 BTBD5 kelch like family member 28 protein-coding 350.75-6 chr20 56310261 56310782 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48453 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 256.25-49 chr8 98398668 98399143 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5167 NR_162095 113218497 NR_162095 MIR9903 - microRNA 9903 ncRNA 132.5-58 chr12 127329647 127329864 + 1.25 NA intron (NR_110057, intron 2 of 2) intron (NR_110057, intron 2 of 2) 10317 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 260-29 chr4 160556887 160557209 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -779264 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 191-3 chr1 155397680 155397906 + 1.25 NA intron (NM_018489, intron 6 of 27) AluSx1|SINE|Alu -35387 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 203-100 chr8 85438499 85438732 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_005181) promoter-TSS (NM_005181) -244 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 230.75-33 chr2 20690907 20691157 + 1.25 NA intron (NR_104233, intron 4 of 4) intron (NR_104233, intron 4 of 4) 23888 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 268.25-33 chr3 136396986 136397288 + 1.25 NA intron (NM_005862, intron 22 of 33) intron (NM_005862, intron 22 of 33) 146797 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 170.25-30 chr13 95124770 95125022 + 1.25 NA intron (NM_001105515, intron 19 of 20) AluSx|SINE|Alu -85448 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 244.5-49 chr2 56815136 56815381 + 1.25 NA Intergenic (TATATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -629488 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 147.75-34 chr13 84395306 84395513 + 1.25 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) L1MA4|LINE|L1 254807 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 218.25-105 chr9 27399187 27399429 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -102158 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 263.25-56 chr8 104825324 104825637 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -236456 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 202.25-31 chr17 78299118 78299311 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20722 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 183.25-99 chr7 11923669 11923910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91591 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 381-12 chr2 63980475 63981059 + 1.25 NA intron (NM_001005739, intron 3 of 22) intron (NM_001005739, intron 3 of 22) 38661 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 271-50 chr8 125911283 125911773 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 39669 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 257-12 chr13 114271103 114271375 + 1.25 NA intron (NM_001330104, intron 16 of 16) intron (NM_001330104, intron 16 of 16) -2589 NR_039724 100616227 NR_039724 ENSG00000265450 MIR4502 - microRNA 4502 ncRNA 129.75-90 chr2 38308957 38309109 + 1.25 NA intron (NM_001135673, intron 9 of 12) intron (NM_001135673, intron 9 of 12) 67497 NM_001330460 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 253.5-47 chr22 39901079 39901364 + 1.25 NA 5' UTR (NM_004810, exon 1 of 8) 5' UTR (NM_004810, exon 1 of 8) 137 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 332.5-10 chr2 47556994 47557381 + 1.25 NA intron (NM_022055, intron 1 of 1) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 13144 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 144-48 chr17 74624258 74624444 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_181449) promoter-TSS (NM_181449) -613 NM_181449 342510 Hs.158954 NM_181449 ENSG00000186407 CD300E CD300LE|CLM-2|CLM2|CMRF35-A5|IREM-2|IREM2|PIgR-2|PIgR2 CD300e molecule protein-coding 160-120 chrX 44513385 44513562 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 29386 NM_173794 139341 Hs.7549 NM_173794 ENSG00000069509 FUNDC1 - FUN14 domain containing 1 protein-coding 245-56 chr5 25843031 25843368 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 652246 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 219-36 chr15 58682369 58682634 + 1.25 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) intron (NM_001320570, intron 2 of 14) 11106 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 237-26 chr2 67901598 67901855 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -76164 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 208.75-53 chr3 98472852 98473024 + 1.25 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 3458 NM_001004736 26339 Hs.621533 NM_001004736 ENSG00000232382 OR5K1 HSHTPCRX10|HTPCRX10|OR3-8 olfactory receptor family 5 subfamily K member 1 protein-coding 256.75-34 chr6 145376151 145376415 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 310594 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 275.75-29 chr21 28981460 28981766 + 1.25 NA intron (NM_015565, intron 5 of 29) intron (NM_015565, intron 5 of 29) 11264 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 192.25-63 chr2 211334034 211334218 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 716555 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 199.25-29 chr14 28922875 28923057 + 1.25 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -137179 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 316.5-23 chr2 220013272 220013665 + 1.25 NA Intergenic MER91B|DNA|hAT-Tip100 -106903 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 285-46 chr8 142383372 142383678 + 1.25 NA intron (NM_001366903, intron 1 of 9) intron (NM_001366903, intron 1 of 9) 19657 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 295.5-24 chr2 30762900 30763293 + 1.25 NA exon (NM_144575, exon 7 of 23) exon (NM_144575, exon 7 of 23) 44350 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 228-49 chr3 36694562 36694845 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 45158 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 221-48 chr3 72130426 72130683 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -20703 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 238.5-51 chr21 24840962 24841223 + 1.25 NA intron (NR_046198, intron 1 of 3) intron (NR_046198, intron 1 of 3) 542 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 246.75-21 chr16 10460001 10460312 + 1.25 NA intron (NM_001256160, intron 8 of 11) L1ME3B|LINE|L1 68042 NR_149081 106144584 Hs.531561 NR_149081 ENSG00000260468 LINC01290 - long intergenic non-protein coding RNA 1290 ncRNA 188.5-121 chr5 9905094 9905374 + 1.25 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -1410 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 268-50 chr6 138922047 138922358 + 1.25 NA intron (NM_001128617, intron 9 of 18) intron (NM_001128617, intron 9 of 18) 66059 NM_001128617 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 182.5-97 chr22 50270650 50271019 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_110887) promoter-TSS (NR_110887) -454 NR_110887 5600 Hs.57732 NM_002751 ENSG00000185386 MAPK11 P38B|P38BETA2|PRKM11|SAPK2|SAPK2B|p38-2|p38Beta mitogen-activated protein kinase 11 protein-coding 221.75-26 chr14 71445065 71445380 + 1.25 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) intron (NM_001284247, intron 1 of 23) 6283 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 396.75-2 chr3 110388742 110389300 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 680938 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 211.25-17 chr12 101684822 101685001 + 1.25 NA intron (NM_206821, intron 28 of 28) intron (NM_206821, intron 28 of 28) -12729 NM_020244 56994 Hs.293077 NM_020244 ENSG00000111666 CHPT1 CPT|CPT1 choline phosphotransferase 1 protein-coding 194.75-84 chr6 136111329 136111551 + 1.25 NA intron (NM_018945, intron 3 of 12) intron (NM_018945, intron 3 of 12) -38613 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 131.25-155 chr4 53051852 53052040 + 1.25 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 189629 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 281.25-34 chr4 17757366 17757738 + 1.25 NA intron (NM_015688, intron 1 of 17) L1MC5|LINE|L1 24069 NM_015688 27146 Hs.744951 NM_015688 ENSG00000047662 FAM184B - family with sequence similarity 184 member B protein-coding 202.25-63 chr4 176084579 176084889 + 1.25 NA intron (NM_181265, intron 1 of 28) L1ME3A|LINE|L1 18893 NM_181265 116966 Hs.532056 NM_170710 ENSG00000150627 WDR17 - WD repeat domain 17 protein-coding 143-26 chr12 38440811 38440988 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 124125 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 327-23 chr3 173536467 173536806 + 1.25 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) -47798 NM_001365933 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 217.5-10 chr1 223536361 223536554 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129244 NM_001143962 388743 Hs.291487 NM_001143962 ENSG00000203697 CAPN8 nCL-2 calpain 8 protein-coding 209-32 chr18 8019315 8019579 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 347587 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 239.75-17 chr13 47988769 47989055 + 1.25 NA exon (NM_003850, exon 3 of 11) exon (NM_003850, exon 3 of 11) 12414 NM_003850 8803 Hs.743361 NM_003850 ENSG00000136143 SUCLA2 A-BETA|A-SCS|MTDPS5|SCS-betaA succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit protein-coding 273.25-20 chr20 43462526 43462943 + 1.25 NA non-coding (NR_034009, exon 7 of 7) non-coding (NR_034009, exon 7 of 7) 4838 NR_034009 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 309.75-39 chr9 119057294 119057737 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 311920 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 170.25-135 chr6 17071057 17071359 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -31050 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 262-11 chr11 116600291 116600654 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38950 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 244.5-4 chr1 150483209 150483525 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4052 NM_001271896 80222 Hs.288974 NM_025150 ENSG00000143374 TARS2 COXPD21|TARSL1|thrRS threonyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 258-11 chr12 23160181 23160551 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -15270 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 296.75-32 chr7 70683154 70683569 + 1.25 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -448783 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 282.5-23 chr18 12289486 12290024 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17914 NM_001303524 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 183.5-136 chr7 51660322 51660617 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -267213 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 171-119 chr6 53121549 53121829 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27152 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 255.25-8 chr10 64516702 64517091 + 1.25 NA Intergenic MER92C|LTR|ERV1 -308632 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 180.75-157 chr9 105362662 105362906 + 1.25 NA intron (NM_001330731, intron 8 of 15) intron (NM_001330731, intron 8 of 15) -85250 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 170-37 chr16 83214343 83214512 + 1.25 NA intron (NM_001220490, intron 3 of 12) AluSx|SINE|Alu -224129 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 142.75-166 chr6 41095429 41095594 + 1.25 NA intron (NM_021705, intron 8 of 8) AluJb|SINE|Alu 2276 NM_001329690 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 201.5-91 chr3 148202740 148203105 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -77969 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 185.25-118 chr7 95995778 95995997 + 1.25 NA intron (NM_004411, intron 9 of 16) intron (NM_004411, intron 9 of 16) 223381 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 202.5-65 chr19 6642322 6642616 + 1.25 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy 27689 NM_172014 8740 Hs.129708 NM_003807 ENSG00000125735 TNFSF14 CD258|HVEML|LIGHT|LTg TNF superfamily member 14 protein-coding 298.5-25 chr21 28912530 28912797 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -27290 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 196-81 chr5 174478268 174478451 + 1.25 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) L1M4|LINE|L1 142005 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 124.75-129 chr20 34814444 34814567 + 1.25 NA intron (NM_001318240, intron 1 of 15) intron (NM_001318240, intron 1 of 15) 7134 NM_001318240 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 269.5-47 chr6 45818219 45818568 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 119204 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 241.5-64 chr3 81250706 81251002 + 1.25 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 256986 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 281-3 chr1 117348781 117349222 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18448 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 366.75-19 chr5 89663503 89664114 + 1.25 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 352912 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 192-86 chr5 21038296 21038583 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -421041 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 188.75-39 chr16 74893868 74894082 + 1.25 NA intron (NM_030581, intron 18 of 25) intron (NM_030581, intron 18 of 25) 91148 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 168-127 chr8 113495391 113495630 + 1.25 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -58571 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 135-128 chr4 111162731 111162854 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -302145 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 151.5-24 chr11 36919367 36919587 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -321198 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 550.5-3 chr5 63998820 63999440 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -36838 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 253.75-24 chr2 84252134 84252514 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38358 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 173-110 chr5 78210914 78211116 + 1.25 NA intron (NM_003664, intron 7 of 26) intron (NM_003664, intron 7 of 26) 83683 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 124.25-187 chr7 71896219 71896382 + 1.25 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 441091 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 296.75-37 chr9 71906298 71906815 + 1.25 NA intron (NM_001025780, intron 1 of 3) AluJr4|SINE|Alu 4689 NM_016014 51104 Hs.380389 NM_016014 ENSG00000107362 ABHD17B C9orf77|CGI-67|FAM108B1 abhydrolase domain containing 17B protein-coding 148.5-196 chr6 64646851 64647046 + 1.25 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -654470 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 132-93 chr2 118000915 118001043 + 1.25 NA intron (NM_019044, intron 3 of 23) intron (NM_019044, intron 3 of 23) 13091 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 278-29 chr5 42811377 42811832 + 1.25 NA intron (NM_001093726, intron 1 of 5) intron (NM_001093726, intron 1 of 5) 288 NM_005410 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 272.25-65 chr9 80036624 80036934 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 61756 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 213-61 chr3 19640966 19641139 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 293165 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 365-13 chr3 141033750 141034106 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -17419 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 229.5-105 chr5 9832706 9832966 + 1.25 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) MER4A1_|LTR|ERV1 -21541 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 186-30 chr14 72728812 72729003 + 1.25 NA intron (NM_001280544, intron 4 of 9) L2a|LINE|L2 163742 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 241.75-66 chr5 164868169 164868646 + 1.25 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 398128 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 171-136 chr9 97879607 97879859 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 26507 NM_004473 2304 NM_004473 ENSG00000178919 FOXE1 FKHL15|FOXE2|HFKH4|HFKL5|NMTC4|TITF2|TTF-2|TTF2 forkhead box E1 protein-coding 224.75-30 chr14 61925217 61925501 + 1.25 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) intron (NM_001367661, intron 2 of 8) -2336 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 256-32 chr2 120211469 120211697 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11817 NM_024121 79134 Hs.376722 NM_024121 ENSG00000226479 TMEM185B FAM11B transmembrane protein 185B protein-coding 490.5-3 chr5 100526666 100527383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8350 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 153.25-56 chr18 3953220 3953388 + 1.25 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) L1PB4|LINE|L1 -9049 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 300.5-10 chr11 37095963 37096434 + 1.25 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -497919 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 177.75-143 chr8 129296016 129296174 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -54855 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 196.25-76 chr22 30845271 30845639 + 1.25 NA intron (NM_001282741, intron 1 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22939 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 221.75-27 chr15 39392708 39392956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 142163 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 194.75-30 chr15 57630527 57630808 + 1.25 NA intron (NM_001018100, intron 6 of 12) intron (NM_001018100, intron 6 of 12) 38763 NR_104371 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 200.5-85 chr3 16305427 16305744 + 1.25 NA 3' UTR (NM_138381, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_138381, exon 9 of 9) 40373 NM_001352982 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 193.75-30 chr11 112423973 112424220 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58136 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 421.5-11 chr5 75337925 75338438 + 1.25 NA intron (NM_001130996, intron 1 of 18) intron (NM_001130996, intron 1 of 18) 961 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 130-60 chr18 12434889 12435000 + 1.25 NA intron (NR_136514, intron 1 of 5) intron (NR_136514, intron 1 of 5) 2170 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 186.75-117 chr8 135076113 135076321 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -157914 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 245.75-45 chr5 1959421 1959655 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72207 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 174.5-66 chr14 73590824 73591113 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_152331) promoter-TSS (NM_152331) -738 NM_152331 122970 Hs.49433 NM_152331 ENSG00000177465 ACOT4 PTE-Ib|PTE1B|PTE2B acyl-CoA thioesterase 4 protein-coding 238-42 chr22 50371207 50371544 + 1.25 NA intron (NM_001242899, intron 1 of 22) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 28048 NM_001242898 9701 Hs.449098 NM_014678 ENSG00000100239 PPP6R2 KIAA0685|PP6R2|SAP190|SAPS2 protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 protein-coding 298.75-18 chr16 53871411 53871692 + 1.25 NA intron (NR_156761, intron 3 of 4) intron (NR_156761, intron 3 of 4) 167395 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 387.5-7 chr2 26588061 26588542 + 1.25 NA intron (NM_001029881, intron 4 of 6) intron (NM_001029881, intron 4 of 6) 25714 NM_001322426 339778 Hs.407083 NM_001105519 ENSG00000173557 C2orf70 - chromosome 2 open reading frame 70 protein-coding 247.75-4 chr11 101595630 101595857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11736 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 124.5-140 chr3 53401141 53401303 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -53679 NM_001290206 55802 Hs.476353 NM_018403 ENSG00000272886 DCP1A HSA275986|Nbla00360|SMAD4IP1|SMIF decapping mRNA 1A protein-coding 121.5-263 chr9 83995772 83995925 + 1.25 NA intron (NM_001358293, intron 2 of 3) L1MEi|LINE|L1 15043 NM_024945 80010 Hs.726327 NM_024945 ENSG00000178966 RMI1 BLAP75|C9orf76|FAAP75 RecQ mediated genome instability 1 protein-coding 208.5-40 chr15 37562104 37562301 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -372405 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 339.75-17 chr18 7130687 7131005 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13049 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 329.25-28 chr8 113332320 113332799 + 1.25 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) L1MB7|LINE|L1 44593 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 162.5-147 chr5 174067874 174068081 + 1.25 NA intron (NM_015980, intron 3 of 4) intron (NM_015980, intron 3 of 4) 22271 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 259-6 chr1 213415433 213415718 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 364334 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 176.25-77 chr2 188372726 188373026 + 1.25 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 75384 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 274-25 chr22 16032355 16032603 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -211595 NR_133911 106480334 Hs.643607 NR_133911 ENSG00000232775 BMS1P22 - BMS1 pseudogene 22 pseudo 149.75-178 chrX 129576290 129576497 + 1.25 NA exon (NM_001587, exon 18 of 23) exon (NM_001587, exon 18 of 23) 36134 NM_001318784 4952 Hs.126357 NM_000276 ENSG00000122126 OCRL INPP5F|LOCR|NPHL2|OCRL-1|OCRL1 OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase protein-coding 382.5-19 chr9 129090385 129090892 + 1.25 NA TTS (NM_020438) TTS (NM_020438) 9527 NR_072983 57171 Hs.21701 NM_020438 ENSG00000167130 DOLPP1 LSFR2 dolichyldiphosphatase 1 protein-coding 289.25-29 chr8 48481997 48482254 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -69442 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 155.25-96 chr2 125765454 125765864 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 352326 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 135.75-52 chr13 113264457 113264785 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001278513, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001278513, exon 20 of 20) 1701 NR_107042 102465874 NR_107042 ENSG00000277942 MIR8075 hsa-mir-8075 microRNA 8075 ncRNA 141.5-136 chr22 41008187 41008323 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 56877 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 219.5-134 chr8 141895643 141896023 + 1.25 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -109520 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 163.25-86 chr22 42780753 42781145 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -59648 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 235.25-15 chr12 24942809 24943161 + 1.25 NA intron (NM_001178091, intron 1 of 9) intron (NM_001178091, intron 1 of 9) 6116 NM_001178092 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 375.25 chr11 60634895 60635579 + 1.25 NA intron (NR_026946, intron 3 of 6) AluSz6|SINE|Alu 19486 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 152.75-158 chr9 29346299 29346618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -132857 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 168.5-100 chr20 214107 214293 + 1.25 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -13058 NM_080831 140881 Hs.112087 NM_080831 ENSG00000125903 DEFB129 C20orf87|DEFB-29|DEFB29|bA530N10.3|hBD-29 defensin beta 129 protein-coding 191.75-47 chr17 60132493 60132793 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17330 NR_137422 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 241.5-63 chr3 33093498 33093710 + 1.25 NA exon (NM_001136238, exon 2 of 2) exon (NM_001136238, exon 2 of 2) 3228 NM_001079811 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 361.5-8 chr15 71526148 71526623 + 1.25 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -20851 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 280-50 chr5 158290842 158291238 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 118733 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 238-50 chr4 58066098 58066401 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 470079 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 241.5-70 chr3 124443119 124443510 + 1.25 NA intron (NM_001024660, intron 19 of 59) intron (NM_001024660, intron 19 of 59) 68982 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 258-60 chr9 70458982 70459369 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -44518 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 284.5-8 chr11 47473669 47473981 + 1.25 NA intron (NM_198700, intron 11 of 13) L1ME1|LINE|L1 15199 NM_001025596 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 152-144 chr7 118041936 118042128 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -142132 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 228.25-31 chr16 63574017 63574227 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1537684 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 311.5-22 chr3 39287065 39287408 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -5501 NM_001171174 1524 Hs.78913 NM_001337 ENSG00000168329 CX3CR1 CCRL1|CMKBRL1|CMKDR1|GPR13|GPRV28|V28 C-X3-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 390-15 chr8 129500808 129501209 + 1.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -16866 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 383.5-2 chr10 61880540 61880897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -20981 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 208-9 chr10 74766558 74766832 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -58560 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 181.75-72 chr21 25956122 25956397 + 1.25 NA intron (NM_001136131, intron 9 of 15) intron (NM_001136131, intron 9 of 15) 184131 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 126.75-128 chr20 4117016 4117146 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -31698 NM_001270691 54498 Hs.433337 NM_175839 ENSG00000088826 SMOX C20orf16|PAO|PAO-1|PAO1|PAOH|PAOH1|SMO spermine oxidase protein-coding 255.5-88 chr9 3930524 3930856 + 1.25 NA intron (NM_001042413, intron 6 of 10) intron (NM_001042413, intron 6 of 10) 32044 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-30 chr11 21383449 21383729 + 1.25 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L2c|LINE|L2 714003 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 222.75-12 chr1 246187724 246188019 + 1.25 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 229541 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 273.5-40 chr22 24706407 24706806 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -47459 NR_024593 646074 Hs.531306 NM_001025230 POM121L10P - POM121 transmembrane nucleoporin like 10, pseudogene pseudo 185.5-24 chr11 68862540 68862803 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -20740 NM_001031847 1374 Hs.503043 NM_001876 ENSG00000110090 CPT1A CPT1|CPT1-L|L-CPT1 carnitine palmitoyltransferase 1A protein-coding 307.5-21 chr17 74158188 74158660 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45254 NM_000999 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 241-13 chr13 46405710 46405973 + 1.25 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 -15799 NM_001286761 80183 Hs.98117 NM_025113 ENSG00000102445 RUBCNL C13orf18|KIAA0226L|PACER rubicon like autophagy enhancer protein-coding 161.25-177 chr8 130307418 130307676 + 1.25 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -11014 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 178.25-47 chr17 5476088 5476393 + 1.25 NA intron (NR_130906, intron 5 of 5) intron (NR_130906, intron 5 of 5) 7148 NR_135644 105371506 Hs.242774 NR_135644 ENSG00000262099 LOC105371506 - uncharacterized LOC105371506 ncRNA 243.75-74 chr7 13376528 13376911 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 609795 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 113.25-64 chr16 52105138 52105229 + 1.25 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19902 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 149.75-56 chr16 9944953 9945253 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) FLAM_C|SINE|Alu 236964 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 179-97 chrX 57380466 57380670 + 1.25 NA intron (NR_148564, intron 6 of 11) L2|LINE|L2 93714 NR_148564 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 162.5-39 chr12 62559286 62559548 + 1.25 NA intron (NM_001278469, intron 25 of 35) AluJo|SINE|Alu 44017 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 207.25-9 chr10 67965009 67965245 + 1.25 NA intron (NM_001278185, intron 16 of 23) L2a|LINE|L2 45756 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 319.5-17 chr14 67309505 67309953 + 1.25 NA intron (NM_001256550, intron 8 of 14) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 50075 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 238.25-6 chr1 222750678 222751044 + 1.25 NA TTS (NR_136691) TTS (NR_136691) 11177 NM_001324080 400823 Hs.697608 NM_207468 ENSG00000197520 FAM177B - family with sequence similarity 177 member B protein-coding 115.75-20 chr10 66677187 66677465 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) MER5C|DNA|hAT-Charlie -248710 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 225.5-80 chr4 76576602 76576870 + 1.25 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) L1MA2|LINE|L1 1185 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 138.25-59 chr16 64810749 64810945 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 311216 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 173.25-30 chr13 30067501 30067757 + 1.25 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 41246 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 169.25-127 chr8 137972435 137972784 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 110936 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 380.5-6 chr17 71952737 71953323 + 1.25 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 72949 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 267.25-20 chr2 172994813 172995111 + 1.25 NA intron (NM_001282901, intron 9 of 24) intron (NM_001282901, intron 9 of 24) 66757 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 250.75-22 chr2 14487342 14487649 + 1.25 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -86537 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 147-149 chr8 124292414 124292669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -45143 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 114.25-40 chr12 71110673 71110813 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 47066 NM_001369760 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 302-21 chr3 177865281 177865552 + 1.25 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 48551 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 118.75-127 chr3 83924170 83924348 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 945316 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 260.75-41 chr22 39519059 39519376 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1342 NM_001675 468 Hs.496487 NM_001675 ENSG00000128272 ATF4 CREB-2|CREB2|TAXREB67|TXREB activating transcription factor 4 protein-coding 195-16 chr10 88288035 88288390 + 1.25 NA intron (NM_001031709, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 295106 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 160-38 chr15 85980732 85980980 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -98764 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 129.75-161 chr6 87915189 87915347 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 130408 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 210.25-8 chr10 4411195 4411395 + 1.25 NA TTS (NR_108054) TTS (NR_108054) 4826 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 355.75-15 chr5 108474104 108474484 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -92196 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 196.5-162 chr8 104609091 104609265 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -20154 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 282-24 chr19 34067770 34068139 + 1.25 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -104550 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 130.75-102 chr2 199980320 199980518 + 1.25 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -24928 NM_001039693 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 133.5-126 chr2 145995418 145995580 + 1.25 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -591558 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 137-55 chr15 61117195 61117405 + 1.25 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 112002 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 197.25-86 chr5 175339962 175340235 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 104084 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 137.75-97 chr2 68378218 68378423 + 1.25 NA intron (NM_002664, intron 1 of 8) intron (NM_002664, intron 1 of 8) 13038 NM_002664 5341 Hs.468840 NM_002664 ENSG00000115956 PLEK P47 pleckstrin protein-coding 220.75-75 chr8 76229016 76229286 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -177503 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 176.25-88 chr3 4665420 4665722 + 1.25 NA intron (NM_001168272, intron 16 of 60) intron (NM_001168272, intron 16 of 60) 86019 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 318-33 chr5 79777102 79777610 + 1.25 NA intron (NM_153610, intron 9 of 12) L1ME4b|LINE|L1 87520 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 317.75-23 chr4 67964353 67964888 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1127 NM_182606 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 174.75-17 chr11 22225871 22226170 + 1.25 NA exon (NM_213599, exon 6 of 22) exon (NM_213599, exon 6 of 22) 32844 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 408.5-7 chr4 39876616 39877034 + 1.25 NA intron (NM_001100399, intron 19 of 32) intron (NM_001100399, intron 19 of 32) 101086 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 335-15 chr5 103456950 103457376 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 84822 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 159.75-32 chr12 79819258 79819452 + 1.25 NA intron (NM_001244990, intron 9 of 24) intron (NM_001244990, intron 9 of 24) 94556 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 186.5-93 chr3 76254306 76254477 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -468842 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 274.25-14 chr12 105655725 105656086 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -48298 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 190-22 chr17 17697804 17698074 + 1.25 NA intron (NM_030665, intron 1 of 5) intron (NM_030665, intron 1 of 5) 16481 NM_030665 10743 Hs.655395 NM_030665 ENSG00000108557 RAI1 SMCR|SMS retinoic acid induced 1 protein-coding 369-7 chr18 12983368 12983808 + 1.25 NA intron (NM_031216, intron 7 of 8) intron (NM_031216, intron 7 of 8) -7774 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 205.5-70 chr2 76672124 76672436 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -313685 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 162.25-69 chr18 51087070 51087303 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 56973 NM_005359 4089 Hs.75862 NM_005359 ENSG00000141646 SMAD4 DPC4|JIP|MADH4|MYHRS SMAD family member 4 protein-coding 228-65 chr5 143117441 143117753 + 1.25 NA intron (NR_146198, intron 17 of 22) intron (NR_146198, intron 17 of 22) -74903 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 120.5-185 chr5 103917326 103917497 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -354622 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 466.75-2 chr2 58729359 58729849 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 208851 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 155.75-31 chr11 56615654 56615796 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2223 NM_001004740 390168 Hs.553751 NM_001004740 ENSG00000255012 OR5M1 OR11-208|OST050 olfactory receptor family 5 subfamily M member 1 protein-coding 116-71 chr17 72535760 72535898 + 1.25 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 56975 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 192-13 chr1 235028779 235029084 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 40887 NR_027454 731656 Hs.702477 NR_027454 LINC01348 - long intergenic non-protein coding RNA 1348 ncRNA 256.25-44 chr7 23342954 23343398 + 1.25 NA intron (NM_006547, intron 9 of 14) intron (NM_006547, intron 9 of 14) 43837 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 147-102 chr4 81050044 81050241 + 1.25 NA intron (NM_001201, intron 2 of 2) intron (NM_001201, intron 2 of 2) 19434 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 122.75-78 chr18 12632007 12632125 + 1.25 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 24666 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 163.75-103 chr4 29927373 29927559 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 713174 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 295-8 chr12 67331245 67331648 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62088 NM_001329675 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 218-45 chr3 67739587 67739823 + 1.25 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) L1MA5|LINE|L1 85008 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 172.25-20 chr10 84424721 84425097 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001284243) promoter-TSS (NM_001284243) -30 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 157.75-50 chr15 32949491 32949622 + 1.25 NA intron (NM_001277313, intron 9 of 20) L1PA13|LINE|L1 118618 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 120.5-183 chr5 59874467 59874623 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 19181 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 182.5-30 chr11 63426347 63426497 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 56637 NM_080866 114571 Hs.502772 NM_080866 ENSG00000149742 SLC22A9 HOAT4|OAT4|OAT7|UST3H|ust3 solute carrier family 22 member 9 protein-coding 333-9 chr14 58380401 58380827 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -15316 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 204.75-6 chr1 116002119 116002381 + 1.25 NA intron (NM_018420, intron 2 of 11) L1M1|LINE|L1 -24974 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 149.25-78 chr2 32524894 32525042 + 1.25 NA exon (NM_016252, exon 58 of 74) exon (NM_016252, exon 58 of 74) -7185 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 200.75-116 chr9 119436054 119436333 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -66758 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 175.75-66 chr2 49747785 49747970 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 226326 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 280-49 chr5 121318532 121318923 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3823 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 261.25-10 chr15 95956383 95956681 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 171309 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 193.75-15 chr10 33382984 33383298 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48236 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 249.5-21 chr12 13666611 13666848 + 1.25 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) intron (NM_000834, intron 4 of 12) -289984 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 247.25-9 chr12 5662465 5662780 + 1.25 NA intron (NM_001278596, intron 15 of 25) intron (NM_001278596, intron 15 of 25) 168490 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 287.25-13 chr11 46066106 46066402 + 1.25 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) L1ME3A|LINE|L1 54565 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 248.5-56 chr2 174176191 174176489 + 1.25 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) intron (NM_001011708, intron 3 of 9) 72192 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 173.5-2 chr1 10274245 10274578 + 1.25 NA intron (NM_001365951, intron 10 of 48) intron (NM_001365951, intron 10 of 48) -24555 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 157.75-166 chr8 56567904 56568085 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -8171 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 207.75-88 chr4 47337459 47337647 + 1.25 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 126149 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 267.75-57 chr8 71693813 71694288 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -145956 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 223.5-29 chr11 115055811 115056222 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -277561 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 256-26 chr2 24966012 24966364 + 1.25 NA intron (NM_016544, intron 2 of 6) intron (NM_016544, intron 2 of 6) 5767 NM_016544 51277 Hs.434993 NM_016544 ENSG00000115137 DNAJC27 RBJ|RabJS DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C27 protein-coding 301-29 chr8 54428511 54428876 + 1.25 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -29242 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 332.75-12 chr2 130349322 130349730 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -6530 NM_001142370 26469 Hs.516390 NM_014369 ENSG00000072135 PTPN18 BDP1|PTP-HSCF protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18 protein-coding 134.25-133 chr4 148878032 148878338 + 1.25 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 64193 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 216.75-15 chr10 107652004 107652199 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 417192 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 262.5-63 chr5 62350989 62351254 + 1.25 NA intron (NM_001098511, intron 4 of 20) AluSx|SINE|Alu 44959 NM_001098511 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 213-38 chr17 61807136 61807368 + 1.25 NA intron (NM_032043, intron 7 of 19) intron (NM_032043, intron 7 of 19) 56307 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 266.75-23 chr2 50045346 50045684 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) AluSx4|SINE|Alu -71312 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 359 chr10 51465043 51465525 + 1.25 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 165711 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 238-41 chr22 33792733 33792962 + 1.25 NA intron (NM_001362953, intron 1 of 14) intron (NM_001362953, intron 1 of 14) 67861 NR_038949 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 331.25-22 chr8 108057130 108057484 + 1.25 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L1ME4a|LINE|L1 24632 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 165.75-91 chr2 193808793 193809123 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -535311 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 134-94 chr2 105512151 105512414 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -73769 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 167.75-144 chr8 124590681 124590843 + 1.25 NA intron (NM_001282971, intron 4 of 14) intron (NM_001282971, intron 4 of 14) 51639 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 159.25-116 chr5 51996436 51996581 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -11523 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 156.5-109 chr3 6971513 6971797 + 1.25 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -77638 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 208.75-73 chr6 35296046 35296266 + 1.25 NA TTS (NM_003427) TTS (NM_003427) -1662 NM_022047 50619 Hs.15476 NM_022047 ENSG00000023892 DEF6 IBP|SLAT|SWAP70L DEF6 guanine nucleotide exchange factor protein-coding 212-62 chr4 37265811 37265994 + 1.25 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 21159 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 123-191 chr8 128319638 128319931 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 169668 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 256.75-29 chr3 76886561 76886846 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -153396 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 231.75-49 chr3 98288658 98288965 + 1.25 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 5923 NM_001005482 79310 Hs.554711 NM_001005482 ENSG00000197938 OR5H2 OR3-10 olfactory receptor family 5 subfamily H member 2 protein-coding 257.75-40 chr5 50805962 50806334 + 1.25 NA intron (NM_024615, intron 14 of 25) MIR|SINE|MIR 138734 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 253.75-9 chr13 109252180 109252592 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -85083 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 198.25-98 chr8 79118063 79118295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -214009 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 293-6 chr12 50888646 50889168 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -36108 NM_014033 25840 Hs.711113 NM_014033 ENSG00000185432 METTL7A AAM-B|AAMB methyltransferase like 7A protein-coding 407.25-13 chr6 63642025 63642966 + 1.25 NA intron (NM_001290260, intron 1 of 3) intron (NM_001290260, intron 1 of 3) -4031 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 189.5-71 chr2 124658735 124658895 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 633528 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 253-31 chr3 6571095 6571424 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 234190 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 265.5-67 chrX 144939203 144939476 + 1.25 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -308164 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 230.5-92 chr4 159924285 159924557 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -146637 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 121-24 chr10 55129760 55129896 + 1.25 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L2a|LINE|L2 -328537 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 145.75-27 chr12 60768373 60768495 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1079064 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 289.25-6 chr12 28516773 28517137 + 1.25 NA intron (NM_001352082, intron 13 of 13) intron (NM_001352082, intron 13 of 13) -326217 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 307-11 chr13 23208142 23208463 + 1.25 NA intron (NM_000231, intron 2 of 7) intron (NM_000231, intron 2 of 7) 27381 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 322.25-4 chr16 75695262 75695867 + 1.25 NA intron (NM_001351308, intron 2 of 2) MER20|DNA|hAT-Charlie 5897 NM_001351308 100033411 NM_001351307 ENSG00000282757 DUXB - double homeobox B protein-coding 193.25-92 chr5 41147986 41148211 + 1.25 NA intron (NM_000065, intron 17 of 17) L1ME4a|LINE|L1 65434 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 328.5-5 chr10 73210902 73211213 + 1.25 NA intron (NM_173348, intron 7 of 13) MER21C|LTR|ERVL 36198 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 303-8 chr14 55666082 55666329 + 1.25 NA intron (NR_073129, intron 34 of 45) intron (NR_073129, intron 34 of 45) 85998 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 271.25-26 chr17 73507487 73507889 + 1.25 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) MIRb|SINE|MIR -5995 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 289.75-17 chr3 64620604 64620862 + 1.25 NA intron (NM_001318781, intron 18 of 38) intron (NM_001318781, intron 18 of 38) 59387 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 244-25 chr2 116858693 116859018 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -955836 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 181.75-5 chr1 70260497 70260665 + 1.25 NA 3' UTR (NM_030816, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_030816, exon 13 of 13) 39201 NM_001350613 9295 Hs.479693 NM_004768 ENSG00000116754 SRSF11 NET2|SFRS11|dJ677H15.2|p54 serine and arginine rich splicing factor 11 protein-coding 216-39 chr2 56236628 56236915 + 1.25 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -51001 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 329.25-2 chr10 49498672 49499110 + 1.25 NA intron (NM_001346440, intron 7 of 20) intron (NM_001346440, intron 7 of 20) 25390 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 305.75-17 chr3 63763142 63763653 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -55902 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 270.5-35 chr20 59884095 59884319 + 1.25 NA intron (NM_014258, intron 26 of 44) intron (NM_014258, intron 26 of 44) 49430 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 250.25-34 chr3 103584004 103584257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60014 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 276.5 chr1 47577461 47577764 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -140295 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 162.5-100 chr20 49581875 49582036 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -13818 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 127-112 chr3 21682564 21682763 + 1.25 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 68547 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 148.75-80 chr2 44387598 44387861 + 1.25 NA intron (NM_024766, intron 2 of 10) L1PB1|LINE|L1 25782 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 278.75-16 chr19 28708037 28708448 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 19452 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 301-10 chr19 2863964 2864404 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3151 NM_001300843 80032 Hs.287433 NM_024967 ENSG00000172000 ZNF556 - zinc finger protein 556 protein-coding 295.5-47 chr5 11172138 11172531 + 1.25 NA intron (NM_001288715, intron 10 of 20) intron (NM_001288715, intron 10 of 20) -411100 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 175.5-73 chr17 28911207 28911380 + 1.25 NA TTS (NM_020889) TTS (NM_020889) -8214 NM_144683 147015 Hs.631760 NM_144683 ENSG00000167536 DHRS13 SDR7C5 dehydrogenase/reductase 13 protein-coding 264-19 chr16 3615725 3616101 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4307 NM_032444 84464 Hs.143681 NM_032444 ENSG00000188827 SLX4 BTBD12|FANCP|MUS312 SLX4 structure-specific endonuclease subunit protein-coding 112.75-179 chr6 81498302 81498454 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 254303 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 184-37 chr17 66513875 66514163 + 1.25 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -97165 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 228.25-81 chr8 74377675 74378033 + 1.25 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) L1ME1|LINE|L1 27451 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 209-28 chr17 3142568 3142922 + 1.25 NA intron (NR_147912, intron 3 of 3) L1PA7|LINE|L1 -15194 NM_003555 8390 Hs.248183 NM_003555 ENSG00000183024 OR1G1 OR17-130|OR17-209|OR1G2 olfactory receptor family 1 subfamily G member 1 protein-coding 323.5-15 chr2 73325312 73325785 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32000 NM_001965 1961 Hs.3052 NM_001965 ENSG00000135625 EGR4 AT133|NGFI-C|NGFIC|PAT133 early growth response 4 protein-coding 197.5-90 chr3 17165728 17166107 + 1.25 NA intron (NM_014744, intron 21 of 21) intron (NM_014744, intron 21 of 21) 232721 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 134-9 chr1 158536147 158536312 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11876 NM_001005189 391112 Hs.553780 NM_001005189 ENSG00000197532 OR6Y1 OR1-11|OR6Y2 olfactory receptor family 6 subfamily Y member 1 protein-coding 183.25-4 chr1 115977514 115977899 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_125970) promoter-TSS (NR_125970) -430 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 316.5-22 chr2 196899351 196899750 + 1.25 NA intron (NM_001321099, intron 6 of 27) intron (NM_001321099, intron 6 of 27) 27157 NM_001321100 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 284.75-44 chr9 127380261 127380592 + 1.25 NA intron (NR_104591, intron 22 of 26) L1MB7|LINE|L1 -16712 NM_001271712 29988 Hs.179522 NM_014580 ENSG00000136856 SLC2A8 GLUT8|GLUTX1 solute carrier family 2 member 8 protein-coding 304.75-14 chr17 32702261 32702605 + 1.25 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 174691 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 168.5-79 chr2 42508836 42509017 + 1.25 NA intron (NM_001282755, intron 2 of 17) L1MC1|LINE|L1 14357 NM_001282755 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 240.75-17 chr12 47802722 47803073 + 1.25 NA intron (NM_015401, intron 1 of 25) intron (NM_015401, intron 1 of 25) 17006 NR_160435 51564 Hs.200063 NM_015401 ENSG00000061273 HDAC7 HD7|HD7A|HDAC7A histone deacetylase 7 protein-coding 270.75-32 chr3 40349888 40350197 + 1.25 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -37142 NM_001291961 956 Hs.441145 NM_001248 ENSG00000168032 ENTPD3 CD39L3|HB6|NTPDase-3 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 protein-coding 150.75-58 chr14 49628180 49628412 + 1.25 NA intron (NM_018139, intron 1 of 2) intron (NM_018139, intron 1 of 2) 6934 NM_001083908 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 210-75 chr5 65549442 65549810 + 1.25 NA intron (NM_001349369, intron 5 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 13542 NM_022145 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 401.25-10 chr4 36109603 36110138 + 1.25 NA intron (NR_146894, intron 26 of 32) L1HS|LINE|L1 134069 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 182.25-67 chr2 205549788 205550042 + 1.25 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) L1MC1|LINE|L1 -132585 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 264-9 chr10 120906230 120906702 + 1.25 NA intron (NM_018117, intron 27 of 28) L1ME3Cz|LINE|L1 55104 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 125.25-56 chr13 82860847 82861026 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1021457 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 152-27 chr10 121035914 121036131 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 184660 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 273-51 chr7 40573661 40574102 + 1.25 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 406058 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 130.5-215 chr6 133332498 133332714 + 1.25 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) AluSc8|SINE|Alu 91107 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 323.75-18 chr5 10452380 10452704 + 1.25 NA intron (NM_001201466, intron 4 of 5) AluSx|SINE|Alu 10663 NM_001201466 83853 Hs.381089 NM_031916 ENSG00000145491 ROPN1L ASP|RSPH11 rhophilin associated tail protein 1 like protein-coding 210.75-78 chr5 58808846 58809136 + 1.25 NA intron (NM_138453, intron 3 of 4) intron (NM_138453, intron 3 of 4) 190907 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 245.5-30 chr18 72241378 72241713 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 302797 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 323.75-9 chr14 79516028 79516313 + 1.25 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 236790 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 232.25-73 chr7 11695848 11696055 + 1.25 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L2b|LINE|L2 136247 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 245.75-24 chr18 62034166 62034473 + 1.25 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -141312 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 149.75-22 chr11 34875358 34875576 + 1.25 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -40663 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 246-25 chr17 70609959 70610406 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 440647 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 234.5-103 chr8 139953731 139954055 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) L1ME1|LINE|L1 146642 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 205.25-106 chr8 121813308 121813536 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -171982 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 156.5-117 chr3 79860038 79860251 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -92146 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 160-94 chr5 150725684 150725912 + 1.25 NA intron (NM_001135643, intron 9 of 13) intron (NM_001135643, intron 9 of 13) -24736 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 290-37 chr4 74274580 74274925 + 1.25 NA intron (NR_147097, intron 8 of 9) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -33718 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 317-8 chr10 103009922 103010211 + 1.25 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) -91731 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 322.5-27 chr5 44946091 44946595 + 1.25 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 137396 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 225.25-79 chr7 86702175 86702434 + 1.25 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 58390 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 213.75-108 chr9 100808454 100808679 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -220161 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 246.25-52 chr5 67559365 67559591 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 87311 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 225-9 chr10 9280637 9280962 + 1.25 NA intron (NR_108039, intron 1 of 1) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 5186 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 291-23 chr3 19648673 19649060 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 285351 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 137.25-40 chr14 35905669 35905815 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 79404 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 217.75-4 chr1 84463368 84463657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15754 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 126-131 chr4 145025915 145026094 + 1.25 NA intron (NM_001256710, intron 4 of 5) HAL1|LINE|L1 71378 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 161.5-99 chr2 104890742 104890891 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18221 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 130-44 chr14 69212067 69212220 + 1.25 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) AluSx1|SINE|Alu 20377 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 352.5-13 chr20 22288857 22289514 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6384 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 154.25-187 chr9 104171315 104171504 + 1.25 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 76782 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 117.5-144 chr3 116407472 116407625 + 1.25 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) 37939 NM_002338 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 297.25-27 chr8 134985145 134985488 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 135381 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 184.25-23 chr11 58714895 58715135 + 1.25 NA intron (NM_201648, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 16928 NM_201648 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 267.5-2 chr1 48566062 48566462 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 11 of 12) intron (NM_001323575, intron 11 of 12) -94054 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 134.75-174 chr5 91336820 91336968 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22492 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 182.75-64 chr2 21473101 21473383 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 237410 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 205.5-99 chr3 177136871 177137065 + 1.25 NA intron (NM_001321194, intron 1 of 16) intron (NM_001321194, intron 1 of 16) 59510 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 249-55 chr8 132421861 132422340 + 1.25 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 25162 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 298.25-5 chr11 24975342 24975588 + 1.25 NA intron (NM_001009909, intron 7 of 11) intron (NM_001009909, intron 7 of 11) 478412 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 267.75-59 chr8 114569939 114570349 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 1097869 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 232.5-84 chr5 73265809 73266262 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64074 NR_134291 340090 Hs.434311 NR_134291 LOC340090 - uncharacterized LOC340090 ncRNA 142.25-66 chr15 91443811 91443981 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -19443 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 165.75-27 chr11 46176653 46176854 + 1.25 NA non-coding (NR_120565, exon 3 of 3) non-coding (NR_120565, exon 3 of 3) 4798 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 284.25-20 chr3 1221252 1221723 + 1.25 NA intron (NM_001289080, intron 3 of 22) intron (NM_001289080, intron 3 of 22) 128463 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 251-54 chr7 48208713 48209108 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 3 of 61) L1MA4|LINE|L1 37452 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 145.25-130 chr5 40468331 40468478 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -211511 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 139-127 chr6 45093210 45093328 + 1.25 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 104501 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 204.25-99 chr6 125362171 125362427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60332 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 180.25-9 chr11 28568770 28568941 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91307 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 178.25-82 chr3 41434283 41434562 + 1.25 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) intron (NR_136342, intron 32 of 34) 234917 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 167.25-10 chr1 217888580 217888756 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4232 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 172-13 chr1 227147871 227148052 + 1.25 NA intron (NM_001366019, intron 6 of 36) intron (NM_001366019, intron 6 of 36) 170531 NM_001366011 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 198.75-66 chr4 5496865 5497172 + 1.25 NA intron (NM_001306082, intron 12 of 12) intron (NM_001306082, intron 12 of 12) -27551 NR_126519 10141 Hs.177972 NM_005750 ENSG00000082929 LINC01587 C4orf6|aC1 long intergenic non-protein coding RNA 1587 ncRNA 156.75-41 chr12 46405551 46405788 + 1.25 NA intron (NR_125381, intron 2 of 2) intron (NR_125381, intron 2 of 2) 21562 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 184-77 chr5 159648634 159648910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182496 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 362-2 chr10 73406459 73406972 + 1.25 NA intron (NM_004034, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 7343 NM_001320879 310 Hs.631827 NM_001156 ENSG00000138279 ANXA7 ANX7|SNX|SYNEXIN annexin A7 protein-coding 185.25-75 chr21 16283545 16283953 + 1.25 NA TTS (NR_145757) TTS (NR_145757) 1019 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 134-13 chr1 244173203 244173362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 120077 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 209.25-103 chr6 144491948 144492136 + 1.25 NA intron (NM_007124, intron 31 of 73) L1PA17|LINE|L1 86387 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 263.75-3 chr1 242610299 242610539 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -85722 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 226.75-67 chr7 41099328 41099549 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2166 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 173-95 chr4 71362112 71362283 + 1.25 NA intron (NM_003759, intron 3 of 22) intron (NM_003759, intron 3 of 22) 23144 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 258.5-14 chr12 30610146 30610458 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 66942 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 209.5-150 chr9 31062401 31062704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 318938 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 205.75-49 chr3 192749631 192749921 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -22235 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 169.5-145 chr5 146023665 146023860 + 1.25 NA intron (NM_152550, intron 5 of 9) L1MB7|LINE|L1 81815 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 331.5-20 chr3 95487620 95487994 + 1.25 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 195386 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 219-35 chr14 83838551 83838979 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1196133 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 127.5-255 chr8 138568503 138568613 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -70828 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 202.5-15 chr10 30913084 30913360 + 1.25 NA intron (NM_182755, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 86295 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 124.5-87 chr18 12950039 12950150 + 1.25 NA intron (NM_031216, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 2083 NM_001013437 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 253.25-14 chr11 100950243 100950527 + 1.25 NA intron (NM_001367945, intron 14 of 25) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16111 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 205.75-64 chr5 55065083 55065336 + 1.25 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -37437 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 153.5-2 chr1 33753245 33753415 + 1.25 NA intron (NM_052896, intron 13 of 69) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -107145 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 158.5-151 chr5 24710502 24710669 + 1.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -65607 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 232-61 chr4 124998506 124999027 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -286034 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 149.75-21 chr11 28717260 28717466 + 1.25 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -239815 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 367.75-8 chr2 105049256 105049874 + 1.25 NA intron (NM_182640, intron 2 of 10) intron (NM_182640, intron 2 of 10) -11069 NR_110603 102724691 Hs.606390 NR_110603 ENSG00000224509 LOC102724691 - uncharacterized LOC102724691 ncRNA 170.5-9 chr1 81163993 81164200 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -142096 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 181-88 chr5 126237819 126238008 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47262 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 125.75-44 chr12 111843411 111843525 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_015404) promoter-TSS (NR_015404) -463 NR_015404 51275 Hs.333120 NR_015404 ENSG00000234608 MAPKAPK5-AS1 C12orf47 MAPKAPK5 antisense RNA 1 ncRNA 157.75-88 chr2 82651432 82651705 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -205235 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 218.5-102 chr5 108227473 108227796 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 154464 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 259.25-47 chr8 79165481 79165844 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -166526 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 123.5-164 chr5 74841702 74841871 + 1.25 NA intron (NM_015566, intron 1 of 12) intron (NM_015566, intron 1 of 12) -24107 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 144.5-67 chr14 73899736 73899977 + 1.25 NA intron (NR_040251, intron 5 of 11) intron (NR_040251, intron 5 of 11) 12997 NM_001242926 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 183.75-67 chr21 30763485 30763639 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8134 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 150-113 chr4 157360160 157360299 + 1.25 NA intron (NM_001083620, intron 13 of 15) intron (NM_001083620, intron 13 of 15) 139501 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 112.75-41 chr12 88650066 88650169 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -69644 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 139-49 chr16 63087578 63087782 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1051242 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 216.25-52 chr2 70422100 70422335 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 59423 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 334.25-16 chr2 199811969 199812264 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001363886, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001363886, exon 5 of 5) 39057 NM_001350854 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 214-74 chrX 45705077 45705360 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -25870 NR_102268 392452 Hs.745266 NR_102268 LOC392452 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 113.75-182 chr7 108310628 108310748 + 1.25 NA intron (NM_001371126, intron 3 of 32) intron (NM_001371126, intron 3 of 32) 17838 NM_001371179 140.75-11 chr1 205715560 205715855 + 1.25 NA 3' UTR (NM_022731, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_022731, exon 7 of 7) 34475 NM_022731 64710 Hs.213061 NM_022731 ENSG00000069275 NUCKS1 JC7|NUCKS nuclear casein kinase and cyclin dependent kinase substrate 1 protein-coding 154.5-125 chr3 50016318 50016483 + 1.25 NA intron (NM_001349194, intron 3 of 17) L1MA7|LINE|L1 -72519 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 171.25-41 chr13 65451022 65451274 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -414899 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 508.75 chr1 171009500 171010159 + 1.25 NA intron (NM_001163629, intron 15 of 21) L1MC5a|LINE|L1 74295 NM_025063 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 261.25-16 chr2 69455614 69456120 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18239 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 224.25-52 chr21 42890757 42890992 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2435 NM_001001503 4731 Hs.473937 NM_021075 ENSG00000160194 NDUFV3 CI-10k|CI-9KD NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit V3 protein-coding 199-85 chr8 105253896 105254232 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -64374 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 430.5-4 chr2 75826023 75826651 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -115422 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 242.75-61 chr7 39091473 39091749 + 1.25 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -78044 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 201.75-85 chr6 119107797 119108007 + 1.25 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) MER65D|LTR|ERV1 -29238 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 205.75-16 chr12 72429715 72429896 + 1.25 NA intron (NM_013381, intron 3 of 18) L1MB8|LINE|L1 -156296 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 260.5-12 chr13 48572698 48573252 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 7926 NR_051983 100129597 Hs.175225 NR_051983 ENSG00000233610 LINC00462 - long intergenic non-protein coding RNA 462 ncRNA 202.75-83 chr4 57810253 57810483 + 1.25 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 384496 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 159.25-143 chr8 10480514 10480759 + 1.25 NA intron (NR_120604, intron 4 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 6071 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 251-4 chr1 85360649 85360945 + 1.25 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 43709 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 172-43 chr17 33370175 33370418 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -77308 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 196.75-82 chr4 83126593 83126835 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -11985 NM_016619 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 173.5-155 chr8 21246910 21247102 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51233 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 161.75-5 chr1 88659087 88659269 + 1.25 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -24966 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 171.75-99 chr4 20955521 20955796 + 1.25 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 28351 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 242-53 chr6 117298290 117298632 + 1.25 NA intron (NM_002944, intron 42 of 42) intron (NM_002944, intron 42 of 42) 32903 NM_182645 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 250.25-17 chr17 59088932 59089227 + 1.25 NA intron (NR_148346, intron 3 of 23) AluJb|SINE|Alu 17801 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 196.75-109 chr8 129662965 129663227 + 1.25 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 17143 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 410-6 chr2 58429876 58430471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -90580 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 206.25-114 chrX 87005644 87005928 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -512016 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 238-14 chr12 79985429 79985658 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50088 NM_001143885 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 299.5-15 chr15 25652484 25652983 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 196092 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 117.5-104 chr2 65602449 65602630 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -169940 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 121.25-148 chr4 97990910 97991141 + 1.25 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1PB1|LINE|L1 152451 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 281.75-39 chr7 11041332 11041744 + 1.25 NA intron (NR_033436, intron 11 of 16) intron (NR_033436, intron 11 of 16) 67666 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 303.75-15 chr17 43821353 43821733 + 1.25 NA intron (NM_001932, intron 10 of 19) intron (NM_001932, intron 10 of 19) 11651 NR_148342 4356 Hs.396566 NM_001932 ENSG00000161647 MPP3 DLG3 membrane palmitoylated protein 3 protein-coding 231.25-65 chr5 53586804 53587263 + 1.25 NA intron (NR_134475, intron 2 of 5) AluSq2|SINE|Alu 26394 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 139.5-89 chr18 34519643 34519800 + 1.25 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 26409 NM_001198945 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 179.75-14 chr10 24849140 24849399 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001282786, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001282786, exon 8 of 8) 103337 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 192.25-44 chr2 10578611 10578848 + 1.25 NA intron (NR_048552, intron 18 of 19) intron (NR_048552, intron 18 of 19) 111246 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 136.25-101 chr2 200963547 200963720 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_006190) promoter-TSS (NM_006190) 27 NR_033915 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 237.75-16 chr14 52515519 52515881 + 1.25 NA intron (NM_001160047, intron 7 of 20) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 36805 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 275-41 chr7 87516186 87516454 + 1.25 NA intron (NM_001348944, intron 26 of 29) intron (NM_001348944, intron 26 of 29) -40617 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 277.25-7 chr10 114346417 114346855 + 1.25 NA intron (NM_001001936, intron 1 of 18) intron (NM_001001936, intron 1 of 18) 57866 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 152-62 chr17 6968575 6968779 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -27372 NM_000697 239 Hs.654431 NM_000697 ENSG00000108839 ALOX12 12-LOX|12S-LOX|LOG12 arachidonate 12-lipoxygenase, 12S type protein-coding 264.25-43 chr5 101760005 101760416 + 1.25 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 536074 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 235.5-58 chr4 91429991 91430276 + 1.25 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 847169 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 201.25-70 chr4 113712492 113712838 + 1.25 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) intron (NM_001321585, intron 2 of 19) 49073 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 277.75-14 chr2 74104186 74104500 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001366022, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001366022, exon 11 of 11) 43569 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 171.5-57 chr17 10586831 10587029 + 1.25 NA intron (NR_125367, intron 3 of 10) L1MC3|LINE|L1 -37272 NM_017534 4620 Hs.667534 NM_017534 ENSG00000125414 MYH2 IBM3|MYH2A|MYHSA2|MYHas8|MYPOP|MyHC-2A|MyHC-IIa myosin heavy chain 2 protein-coding 199-47 chr21 22550072 22550343 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 451590 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 187.5-108 chr21 29748491 29748694 + 1.25 NA intron (NR_027021, intron 1 of 4) intron (NR_027021, intron 1 of 4) 417 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 276.25-30 chr3 124522327 124522611 + 1.25 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) intron (NM_001024660, intron 33 of 59) -62189 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 295.25-36 chr8 133971792 133972132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 85466 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 325.25-10 chr2 112604322 112604750 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 19682 NM_001304354 84269 Hs.375707 NM_032309 ENSG00000125611 CHCHD5 C2orf9|CHTM1|MIC14|MIX14 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 protein-coding 188.25-91 chr5 58453389 58453604 + 1.25 NA TTS (NM_001252226) TTS (NM_001252226) 6590 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 156-41 chr14 41060662 41060881 + 1.25 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 106060 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 130.75-42 chr12 77995825 77995929 + 1.25 NA intron (NM_001024383, intron 6 of 39) intron (NM_001024383, intron 6 of 39) 164983 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 253.75-34 chr22 37287863 37288260 + 1.25 NA intron (NM_013385, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu 5553 NM_001318024 27128 Hs.170944 NM_013385 ENSG00000100055 CYTH4 CYT4|DJ63G5.1|PSCD4|cytohesin-4 cytohesin 4 protein-coding 318.75-11 chr2 108885296 108885776 + 1.25 NA TTS (NR_147236) TTS (NR_147236) 98765 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 237.5-64 chr3 170825062 170825396 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44966 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 371.25-13 chr4 69793599 69794034 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -33196 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 149.25-131 chr4 79924755 79924958 + 1.25 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 97385 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 306.5-18 chr15 95381241 95381510 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51718 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 330.25-22 chr7 79384796 79385342 + 1.25 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -67888 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 181.5-96 chr20 32507524 32507715 + 1.25 NA intron (NM_001256798, intron 4 of 10) intron (NM_001256798, intron 4 of 10) -2340 NR_110619 101929698 Hs.638392 NR_110619 ENSG00000277301 LOC101929698 - uncharacterized LOC101929698 ncRNA 163.5-56 chr14 85404229 85404390 + 1.25 NA intron (NR_102738, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 10394 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 250-46 chr5 58471090 58471392 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -11102 NM_001252226 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 250.75-7 chr12 5162252 5162598 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 80726 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 117-178 chr8 49438331 49438496 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 73767 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 262.25-14 chr14 34257599 34258011 + 1.25 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 204435 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 250.5-79 chr6 12158312 12158695 + 1.25 NA intron (NM_002114, intron 7 of 8) L1MEc|LINE|L1 -131858 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 169.75-43 chr13 89890796 89890946 + 1.25 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 228846 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 229.5-87 chr3 115200073 115200448 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -52972 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 337.75 chr1 62405949 62406499 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -30080 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 166.5-102 chr2 65674924 65675179 + 1.25 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -242452 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 315.5-15 chr3 105948096 105948568 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -78931 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 353-9 chr2 140297456 140297819 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 84 of 90) L2|LINE|L2 289048 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 247.25-46 chr4 74338857 74339382 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26026 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 235-60 chr5 130095031 130095663 + 1.25 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L1MC4a|LINE|L1 190882 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 264.75-46 chr6 72595111 72595446 + 1.25 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -26565 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 126.25-136 chr4 121508664 121508947 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -127787 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 186.75-106 chr7 93260361 93260570 + 1.25 NA intron (NM_001257998, intron 10 of 28) intron (NM_001257998, intron 10 of 28) 28099 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 187.5-31 chr11 46586110 46586551 + 1.25 NA intron (NM_001267782, intron 1 of 19) AluSz6|SINE|Alu 1114 NR_160027 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 268.5-17 chr14 25652117 25652742 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -602132 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 231.25-24 chr15 95537126 95537431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104185 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 280-63 chr9 98445050 98445357 + 1.25 NA intron (NM_005458, intron 7 of 18) intron (NM_005458, intron 7 of 18) -189554 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 161-123 chr8 128486638 128486869 + 1.25 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 77926 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 372-2 chr11 8532777 8533259 + 1.25 NA intron (NM_001352388, intron 1 of 14) intron (NM_001352388, intron 1 of 14) 60958 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 210-70 chr4 40326097 40326374 + 1.25 NA intron (NR_121640, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu -9098 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 166.25-22 chr10 5127915 5128160 + 1.25 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 33623 NM_001253909 8644 Hs.78183 NM_003739 ENSG00000196139 AKR1C3 DD3|DDX|HA1753|HAKRB|HAKRe|HSD17B5|PGFS|hluPGFS aldo-keto reductase family 1 member C3 protein-coding 162.5-137 chr5 30632738 30633146 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -560744 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 216.75-77 chr8 101832461 101832658 + 1.25 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -41590 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 222.5-98 chr6 103785198 103785530 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1074182 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 158.25-91 chr3 109682271 109682675 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 79645 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 179.25-136 chr7 41456737 41456945 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -237078 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 169.75-33 chr12 15307870 15308095 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -14526 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 268.5-18 chr14 51566586 51566890 + 1.25 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 33214 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 280.75-10 chr11 81943679 81944020 + 1.25 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -53013 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 161-81 chr4 75345363 75345579 + 1.25 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -8605 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 329.5-11 chr2 78913231 78913787 + 1.25 NA Intergenic MER135|DNA|DNA -112193 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 171.75-97 chr3 28238653 28238965 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -2810 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 251-48 chr6 156752961 156753386 + 1.25 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -24682 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 136-174 chrX 5781003 5781189 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -445262 NR_136577 105373156 Hs.21107 NR_136577 LOC105373156 - uncharacterized LOC105373156 ncRNA 193.75-10 chr1 115222581 115222772 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -60358 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 196-11 chr1 237184505 237184740 + 1.25 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) intron (NM_001035, intron 1 of 104) 142438 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 147-25 chr13 67516294 67516479 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 143999 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 246-27 chr19 6756309 6756704 + 1.25 NA intron (NM_005490, intron 4 of 9) L1PA8A|LINE|L1 10929 NM_005490 10045 Hs.439645 NM_005490 ENSG00000125731 SH2D3A NSP1 SH2 domain containing 3A protein-coding 193.5-169 chr9 88454121 88454327 + 1.25 NA intron (NM_006717, intron 3 of 5) intron (NM_006717, intron 3 of 5) 65780 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 221.5-65 chr3 179796877 179797165 + 1.25 NA non-coding (NR_146167, exon 14 of 14) non-coding (NR_146167, exon 14 of 14) -101173 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 158.5-138 chr4 5432201 5432393 + 1.25 NA intron (NM_001306082, intron 7 of 12) L2b|LINE|L2 -92272 NR_126519 10141 Hs.177972 NM_005750 ENSG00000082929 LINC01587 C4orf6|aC1 long intergenic non-protein coding RNA 1587 ncRNA 225.5-90 chr5 59577891 59578248 + 1.25 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 8429 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 241.75-77 chr8 104520407 104520660 + 1.25 NA intron (NM_001135703, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 -36068 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 291.75-6 chr10 85419451 85419715 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13189 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 282.5-28 chr2 61919235 61919628 + 1.25 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 13789 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 297.75-5 chr13 49966045 49966385 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -29714 NM_001127482 57213 Hs.44235 NM_020456 ENSG00000123178 SPRYD7 C13orf1|CLLD6 SPRY domain containing 7 protein-coding 277.5-72 chr8 30443192 30443464 + 1.25 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -57927 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 321-6 chr12 46557251 46557595 + 1.25 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) intron (NR_125380, intron 3 of 3) 173316 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 162-20 chr11 6065811 6065978 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -38153 NM_001001917 120796 Hs.553543 NM_001001917 ENSG00000180934 OR56A1 OR11-75 olfactory receptor family 56 subfamily A member 1 protein-coding 190.25-39 chr14 77453946 77454240 + 1.25 NA exon (NM_022067, exon 3 of 21) exon (NM_022067, exon 3 of 21) 3508 NM_001193316 63894 Hs.16157 NM_022067 ENSG00000151445 VIPAS39 C14orf133|SPE-39|SPE39|VIPAR|VPS16B|hSPE-39 VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog protein-coding 133.75-191 chr8 99159498 99159682 + 1.25 NA intron (NM_017890, intron 15 of 61) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 146324 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 226-49 chr4 138554579 138554777 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 244967 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 172.25-94 chr3 179575399 179575714 + 1.25 NA intron (NM_004301, intron 5 of 13) L2b|LINE|L2 12630 NM_004301 86 Hs.435326 NM_004301 ENSG00000136518 ACTL6A ACTL6|ARPN-BETA|Arp4|BAF53A|INO80K actin like 6A protein-coding 234.5-41 chr2 64192579 64192806 + 1.25 NA intron (NR_033837, intron 3 of 5) intron (NR_033837, intron 3 of 5) 12793 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 235-36 chr20 55953345 55953628 + 1.25 NA Intergenic MER85|DNA|PiggyBac 52033 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 209.75-92 chr7 113846674 113847033 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 72156 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 124.75-164 chr4 161724000 161724099 + 1.25 NA intron (NM_001128428, intron 6 of 14) intron (NM_001128428, intron 6 of 14) -298684 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 154.5-200 chr8 145068482 145068635 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 16091 NM_023080 65265 Hs.169615 NM_023080 ENSG00000182307 C8orf33 - chromosome 8 open reading frame 33 protein-coding 312.5-21 chr22 31351406 31351852 + 1.25 NA TTS (NR_120386) TTS (NR_120386) 4870 NR_120386 54944 Hs.648259 NM_017834 LINC01521 - long intergenic non-protein coding RNA 1521 ncRNA 245-12 chr12 10279099 10279421 + 1.25 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) L1PA15|LINE|L1 -25186 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 147.25-153 chr8 137921090 137921278 + 1.25 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 162361 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 300.75-37 chr5 12317252 12317657 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -257403 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 158-144 chr8 122474354 122474498 + 1.25 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) MER57E1|LTR|ERV1 94218 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 178.75-112 chr8 118992273 118992451 + 1.25 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 40099 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 362.25-14 chr8 9049221 9049564 + 1.25 NA TTS (NR_039804) TTS (NR_039804) 947 NR_039804 100616350 NR_039804 ENSG00000263407 MIR4660 - microRNA 4660 ncRNA 320.75-6 chr11 105254514 105254893 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -114934 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 178-52 chr20 19481849 19482072 + 1.25 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 -197364 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 318.5-4 chr10 100813378 100813707 + 1.25 NA intron (NM_003988, intron 7 of 10) L1MEd|LINE|L1 67831 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 487.25-2 chr8 70479973 70480507 + 1.25 NA intron (NR_110653, intron 2 of 3) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 9106 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 166-126 chr8 82195980 82196242 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -353825 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 267.25-36 chr6 85422804 85423104 + 1.25 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -18152 NR_134633 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 290.75-16 chr15 71780357 71780790 + 1.25 NA 3' UTR (NM_024817, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_024817, exon 17 of 17) -29981 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 206.5-104 chr5 168976483 168976779 + 1.25 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) -36596 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 319.25 chr1 113188720 113189190 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 17298 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 319.25-15 chr6 49536119 49536392 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14413 NR_146860 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 222.5-112 chr8 121389763 121390024 + 1.25 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -249453 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 209.25-7 chr1 84925135 84925624 + 1.25 NA TTS (NM_001330647) TTS (NM_001330647) -32173 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 220-47 chr4 140910755 140911234 + 1.25 NA intron (NM_020724, intron 6 of 6) intron (NM_020724, intron 6 of 6) -154609 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 147.75-42 chr14 78512075 78512336 + 1.25 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 108486 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 297-23 chr19 48008989 48009311 + 1.25 NA intron (NM_022142, intron 2 of 6) AluSq2|SINE|Alu 14518 NM_022142 64100 Hs.104894 NM_022142 ENSG00000169393 ELSPBP1 E12|EDDM12|EL149|HE12 epididymal sperm binding protein 1 protein-coding 163.25-35 chr12 107501785 107501931 + 1.25 NA intron (NM_001347944, intron 1 of 14) intron (NM_001347944, intron 1 of 14) -79016 NM_001017523 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 194.25-69 chr22 26963189 26963457 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 60031 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 216.25-30 chr14 19881692 19881920 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5538 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 190.25-107 chr6 70141968 70142282 + 1.25 NA intron (NM_001858, intron 22 of 50) intron (NM_001858, intron 22 of 50) 141072 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 206.75-26 chr17 61862396 61862888 + 1.25 NA intron (NM_032043, intron 1 of 19) intron (NM_032043, intron 1 of 19) 917 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 244.5-58 chr2 217092533 217092845 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -190044 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 171.75-75 chr2 58785508 58785664 + 1.25 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 264833 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 194-4 chr1 86944246 86944427 + 1.25 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) intron (NM_012262, intron 1 of 6) 29701 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 195.25-75 chr5 107937338 107937633 + 1.25 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -266548 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 172.75-27 chr12 38876809 38876968 + 1.25 NA intron (NM_153634, intron 1 of 19) intron (NM_153634, intron 1 of 19) 28703 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 119-24 chr11 16111399 16111636 + 1.25 NA intron (NM_033326, intron 7 of 15) intron (NM_033326, intron 7 of 15) -141896 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 296.25-12 chr15 89129509 89130264 + 1.25 NA intron (NM_007011, intron 7 of 14) intron (NM_007011, intron 7 of 14) 41430 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 146.75-170 chr8 135707153 135707431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 249836 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 193.75-48 chr14 79875687 79875981 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -335585 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 165.25-124 chr6 38449379 38449530 + 1.25 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L1MA8|LINE|L1 -32142 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 347.25-19 chr5 86011896 86012386 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -270303 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 198.75-41 chr2 50743951 50744136 + 1.25 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -47781 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 127.5-172 chr4 72707540 72707701 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -138399 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 141.5-14 chr1 195374896 195375057 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 713739 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 216.75-68 chr6 38777925 38778486 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 12 of 91) MER33|DNA|hAT-Charlie 62894 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 117-123 chr3 116680579 116680800 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -29099 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 238.25-73 chr5 164641616 164641868 + 1.25 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 171463 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 135.75-201 chr8 113639831 113640014 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -202983 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 357-6 chr16 66650861 66651288 + 1.25 NA intron (NM_181521, intron 1 of 3) intron (NM_181521, intron 1 of 3) 45669 NM_178818 146223 Hs.643961 NM_178818 ENSG00000183723 CMTM4 CKLFSF4 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4 protein-coding 267.25-37 chr6 143916622 143916901 + 1.25 NA intron (NM_001013623, intron 6 of 7) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 44649 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 128.75-28 chr11 11617118 11617254 + 1.25 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 4819 NM_001363464 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 225.25-77 chr7 34334452 34334664 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -323660 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 139.75-33 chr12 17327888 17328070 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 261099 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 154.25-25 chr11 80875817 80875989 + 1.25 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -113100 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 176.25-101 chr4 76827812 76828127 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 70175 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 230-52 chr5 153669845 153670105 + 1.25 NA intron (NM_000827, intron 5 of 15) MER5A|DNA|hAT-Charlie 177803 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 220-67 chr8 103690943 103691185 + 1.25 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) L1MA8|LINE|L1 -128156 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 215.5-36 chr15 62009790 62010003 + 1.25 NA intron (NM_001018088, intron 13 of 81) intron (NM_001018088, intron 13 of 81) 50551 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 193.25-49 chr2 46562064 46562416 + 1.25 NA intron (NM_012249, intron 2 of 4) intron (NM_012249, intron 2 of 4) 17998 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 196.5-65 chr17 35273002 35273250 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001330183, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001330183, exon 4 of 4) 30054 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 293.25-28 chr6 94860302 94860573 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 717014 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 225-10 chr10 13339123 13339450 + 1.25 NA intron (NM_001195602, intron 1 of 7) intron (NM_001195602, intron 1 of 7) 9007 NM_001195604 22929 Hs.124027 NM_012247 ENSG00000086475 SEPHS1 SELD|SPS|SPS1 selenophosphate synthetase 1 protein-coding 155-4 chr1 112798248 112798386 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 52326 NR_103746 100996702 Hs.632431 NR_103746 ENSG00000215866 LINC01356 - long intergenic non-protein coding RNA 1356 ncRNA 155.75-8 chr1 56521938 56522160 + 1.25 NA intron (NM_003713, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 57514 NM_003713 8613 Hs.405156 NM_003713 ENSG00000162407 PLPP3 Dri42|LPP3|PAP2B|PPAP2B|VCIP phospholipid phosphatase 3 protein-coding 121.75-108 chr21 25691020 25691235 + 1.25 NA intron (NR_072999, intron 3 of 9) intron (NR_072999, intron 3 of 9) -43845 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 234.25-66 chr6 123921731 123922011 + 1.25 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) AluYc|SINE|Alu 118006 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 116.5-265 chr9 83991498 83991765 + 1.25 NA intron (NM_001358293, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 10826 NM_024945 80010 Hs.726327 NM_024945 ENSG00000178966 RMI1 BLAP75|C9orf76|FAAP75 RecQ mediated genome instability 1 protein-coding 219.25-50 chr3 119052011 119052368 + 1.25 NA intron (NM_152538, intron 3 of 8) L1PB1|LINE|L1 -17343 NM_001353326 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 323-12 chr18 73906009 73906370 + 1.25 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 241645 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 164.5-179 chr6 106837957 106838094 + 1.25 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -50484 NR_033557 100422737 Hs.634681 NR_015365 ENSG00000235142 LINC02532 - long intergenic non-protein coding RNA 2532 ncRNA 317.25-5 chr11 6761910 6762212 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6896 NM_001004490 338755 Hs.534614 NM_001004490 ENSG00000188124 OR2AG2 OR11-76|OR2AG2P olfactory receptor family 2 subfamily AG member 2 protein-coding 177.25-69 chr2 37380382 37380589 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 35855 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 285-34 chr4 75174908 75175446 + 1.25 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -90469 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 293.5-2 chr1 113172384 113172762 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 33680 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 190.75-7 chr1 222070386 222070616 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -91981 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 252.25-63 chr8 123520440 123520765 + 1.25 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) intron (NM_148177, intron 1 of 5) 11541 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 245.75-30 chr2 183340836 183341206 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 216578 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 190.75-87 chr5 78484958 78485170 + 1.25 NA TTS (NM_005779) TTS (NM_005779) 124447 NM_004866 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 137-156 chr6 146559670 146559783 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 15893 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 166.75-49 chr14 73148278 73148496 + 1.25 NA intron (NM_000021, intron 3 of 11) intron (NM_000021, intron 3 of 11) 11880 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 159-104 chr7 101228331 101228588 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 9343 NM_014343 24146 Hs.38738 NM_014343 ENSG00000106404 CLDN15 - claudin 15 protein-coding 134.25-126 chr4 11479079 11479293 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50292 NM_005114 9957 Hs.507348 NM_005114 ENSG00000002587 HS3ST1 3OST|3OST1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 protein-coding 163.25-7 chr1 80649129 80649321 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7938 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 147.25-27 chr12 28632362 28632698 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -441792 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 129-147 chr6 3525393 3525553 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -68914 NM_015482 63027 Hs.713588 NM_015482 ENSG00000137266 SLC22A23 C6orf85 solute carrier family 22 member 23 protein-coding 342.75-11 chr14 42826743 42827200 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 1220115 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 188.75-123 chrX 40611382 40611650 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12050 NM_001195522 347411 Hs.128084 NM_001195522 ENSG00000238205 MPC1L SLC54A3 mitochondrial pyruvate carrier 1 like protein-coding 405.5-11 chr5 71885165 71885618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 166116 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 224.25-85 chr6 99149887 99150082 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 25375 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 194-79 chr7 105420853 105421106 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -31589 NM_001350740 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 249.5-37 chr17 42656065 42656365 + 1.25 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -3069 NM_001320509 27175 Hs.279669 NM_016437 ENSG00000037042 TUBG2 - tubulin gamma 2 protein-coding 153.75-98 chr3 191207837 191208131 + 1.25 NA intron (NM_198184, intron 1 of 4) intron (NM_198184, intron 1 of 4) 8743 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 269.25 chr1 51426952 51427214 + 1.25 NA intron (NM_001981, intron 12 of 24) MIRb|SINE|MIR -4988 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 192-64 chr2 181101123 181101406 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -22573 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 122.75-110 chr20 55602995 55603111 + 1.25 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -175856 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 262.5-13 chr13 92832389 92832609 + 1.25 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -110885 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 179.75-143 chrX 51455233 51455440 + 1.25 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 41256 NM_018159 55190 Hs.200016 NM_018159 ENSG00000196368 NUDT11 APS1|ASP1|DIPP3b|DIPP3beta|hDIPP3beta nudix hydrolase 11 protein-coding 186.25-112 chr7 55314851 55315106 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50470 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 329.5-2 chr10 16412066 16412508 + 1.25 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -24656 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 154.5-60 chr14 47548949 47549105 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L1M4|LINE|L1 125927 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 147.25-61 chr2 118936194 118936430 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -5857 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 244 chr1 85608115 85608539 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 27566 NM_001554 3491 Hs.8867 NM_001554 ENSG00000142871 CCN1 CYR61|GIG1|IGFBP10 cellular communication network factor 1 protein-coding 124.5-21 chr10 19929728 19929835 + 1.25 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 113349 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 352.25-19 chr8 123995905 123996315 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 12 of 40) L1M1|LINE|L1 44672 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 167.75-66 chr19 17905240 17905480 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27655 NM_001136203 115098 Hs.100043 NM_138442 ENSG00000007080 CCDC124 - coiled-coil domain containing 124 protein-coding 219.75-9 chr10 17293688 17293916 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -63817 NR_108061 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 204.5-82 chr22 30216075 30216270 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23022 NR_149070 110806283 NR_149070 ENSG00000232530 LIF-AS1 Lnc-LIF-AS LIF antisense RNA 1 ncRNA 239.75-79 chr9 12487380 12487646 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -205872 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 266.25-30 chr22 50592273 50592509 + 1.25 NA intron (NR_110536, intron 3 of 3) L1MEd|LINE|L1 -8402 NM_012324 23542 Hs.558180 NM_012324 ENSG00000008735 MAPK8IP2 IB-2|IB2|JIP2|PRKM8IPL mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 2 protein-coding 204-33 chr2 75815700 75815870 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -104870 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 211.5-10 chr1 197869759 197869998 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32752 NM_001024594 388722 Hs.61329 NM_001024594 ENSG00000203724 C1orf53 - chromosome 1 open reading frame 53 protein-coding 126.5-143 chr22 27528782 27528956 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 218218 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 129-26 chr10 77980672 77980780 + 1.25 NA intron (NM_007055, intron 29 of 30) L1ME4a|LINE|L1 48789 NM_007055 11128 Hs.436896 NM_007055 ENSG00000148606 POLR3A ADDH|HLD7|RPC1|RPC155|WDRTS|hRPC155 RNA polymerase III subunit A protein-coding 158.5-105 chr2 150474076 150474337 + 1.25 NA intron (NM_005168, intron 4 of 5) intron (NM_005168, intron 4 of 5) 13489 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 164-82 chr3 131769921 131770194 + 1.25 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) 215874 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 138.5-212 chr9 82898740 82898963 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 164291 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 241.75-45 chr21 18357549 18357843 + 1.25 NA intron (NM_002772, intron 8 of 24) intron (NM_002772, intron 8 of 24) 46089 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 303.75-33 chr7 104431658 104431926 + 1.25 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1MEh|LINE|L1 103136 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 129-104 chr2 214213740 214213869 + 1.25 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -197250 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 202-2 chr1 51092909 51093162 + 1.25 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -9193 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 280.25-3 chr1 111376086 111376390 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 13613 NR_029429 441897 Hs.568387 NR_029429 ENSG00000227179 PGCP1 - progastricsin pseudogene 1 pseudo 202.5-108 chr4 174494492 174494665 + 1.25 NA intron (NM_001256307, intron 4 of 5) intron (NM_001256307, intron 4 of 5) 27910 NM_000860 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 167.25-108 chr3 103649929 103650200 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -125948 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 360.5-7 chr14 101091369 101091774 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 21660 NR_047664 100507257 Hs.301755 NR_047664 ENSG00000223403 MEG9 LINC00584 maternally expressed 9 ncRNA 422.5-3 chr10 113953512 113954266 + 1.25 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -89977 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 170.25-120 chr4 134604787 134605023 + 1.25 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 181037 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 295.5-56 chr6 117895880 117896178 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11235 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 285-32 chr3 165620604 165621038 + 1.25 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 216602 NR_137636 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 314.25-2 chr1 69895258 69895691 + 1.25 NA intron (NM_001370785, intron 7 of 26) L1MA10|LINE|L1 -23848 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 201.5-28 chr10 68130658 68130853 + 1.25 NA intron (NR_045663, intron 2 of 17) L1ME3E|LINE|L1 21267 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 282.75-31 chr4 60677965 60678328 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -244473 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 249.75-47 chr4 37721573 37721788 + 1.25 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -35304 NM_001085400 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 297.5-43 chr4 57629636 57630017 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 203954 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 206.5-85 chr4 119892584 119892804 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -46846 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 167.5-23 chr10 44671286 44671663 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -239842 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 222.5-44 chr18 63347007 63347248 + 1.25 NA intron (NM_002035, intron 6 of 9) intron (NM_002035, intron 6 of 9) 20079 NM_002035 2531 Hs.74050 NM_002035 ENSG00000119537 KDSR DHSR|EKVP4|FVT1|SDR35C1 3-ketodihydrosphingosine reductase protein-coding 244-2 chr1 104273870 104274196 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 201010 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 238.5-98 chr9 38637156 38637346 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 16163 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 216.5-101 chr6 72916693 72916947 + 1.25 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 50933 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 164-18 chr11 47605915 47606210 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11651 NM_031909 114900 Hs.662633 NM_031909 ENSG00000172247 C1QTNF4 CTRP4|ZACRP4 C1q and TNF related 4 protein-coding 179.25-16 chr10 35386894 35387166 + 1.25 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) intron (NM_001282852, intron 1 of 8) 50156 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 237.5-19 chr10 94536707 94537209 + 1.25 NA TTS (NM_015188) TTS (NM_015188) -8809 NM_001289070 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 230-20 chr14 60192577 60193073 + 1.25 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -22961 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 234.75-76 chr7 51712916 51713176 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -319790 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 186.75-26 chr13 56108906 56109345 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 934671 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 276.25-19 chr16 60648812 60649245 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -289235 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 137.5-28 chr10 59520426 59520559 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -157311 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 164-99 chr5 52718244 52718638 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -69475 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 278.75-30 chr4 98744590 98744844 + 1.25 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 85815 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 259.5-32 chr14 69228394 69228675 + 1.25 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) intron (NR_034165, intron 4 of 10) -31624 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 247.25-11 chr12 42342948 42343212 + 1.25 NA intron (NM_001364830, intron 2 of 6) intron (NM_001364830, intron 2 of 6) 11282 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 179.75-16 chr10 64911992 64912169 + 1.25 NA intron (NR_134456, intron 1 of 1) intron (NR_134456, intron 1 of 1) 12438 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 233.5-110 chr8 129024975 129025300 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -59136 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 323.5-6 chr10 119929277 119929618 + 1.25 NA intron (NM_007190, intron 13 of 18) AluSc8|SINE|Alu -29066 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 112.5-10 chr1 158845806 158845917 + 1.25 NA exon (NM_002432, exon 5 of 7) exon (NM_002432, exon 5 of 7) 14510 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 215.5-16 chr10 87632915 87633137 + 1.25 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -26852 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 209.25-74 chr3 17947540 17947728 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -14918 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 362.5-16 chr3 132644962 132645464 + 1.25 NA intron (NM_032169, intron 1 of 19) intron (NM_032169, intron 1 of 19) -9233 NM_198329 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 114.25-53 chr14 43717805 43718046 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 789358 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 243-25 chr16 9623835 9624097 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -168461 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 133.5-3 chr1 40675004 40675146 + 1.25 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9393 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 218.5-122 chr8 108930061 108930458 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -142665 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 332-17 chr21 14190804 14191143 + 1.25 NA intron (NM_001303000, intron 1 of 9) intron (NM_001303000, intron 1 of 9) 15976 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 157-121 chr8 136977285 136977537 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 436177 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 217.5-77 chr22 20609118 20609434 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -80279 NR_024592 266697 Hs.558711 NR_024592 POM121L4P - POM121 transmembrane nucleoporin like 4, pseudogene pseudo 239.25-60 chr3 145221784 145222131 + 1.25 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 847228 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 253.25-19 chr12 82188801 82189128 + 1.25 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 169423 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 160.5-20 chr11 25767724 25767863 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -421330 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 231.75-52 chr4 61891680 61891979 + 1.25 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 269936 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 188.75-108 chr7 48373204 48373442 + 1.25 NA intron (NM_152701, intron 33 of 61) intron (NM_152701, intron 33 of 61) 201865 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 312.5-8 chr13 89940175 89940642 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179309 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 251.75-62 chr4 130470058 130470340 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 93838 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 273.5-31 chr2 36788435 36788889 + 1.25 NA intron (NM_001177969, intron 11 of 14) intron (NM_001177969, intron 11 of 14) 91955 NM_001177970 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 204.25-97 chr6 100275878 100276103 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 187685 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 114.75-109 chr20 54550900 54551071 + 1.25 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) L1MD1|LINE|L1 75392 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 144.25-66 chr15 79159422 79159608 + 1.25 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -50273 NR_029705 406960 NR_029705 ENSG00000207695 MIR184 EDICT|MIRN184|miR-184 microRNA 184 ncRNA 205.25-79 chr4 74489125 74489362 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44107 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 168.75-132 chr7 27804157 27804463 + 1.25 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) L1MC4a|LINE|L1 64215 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 286.75-38 chr5 92756463 92756808 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 814708 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-51 chr2 24631034 24631208 + 1.25 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) intron (NM_001362950, intron 3 of 23) 46644 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 332-23 chr7 27590591 27590895 + 1.25 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -25231 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 257.25-23 chr2 74887603 74887890 + 1.25 NA intron (NM_000189, intron 15 of 17) intron (NM_000189, intron 15 of 17) -21385 NR_125792 102724515 Hs.708649 NR_125792 ENSG00000204792 LINC01291 - long intergenic non-protein coding RNA 1291 ncRNA 200.25-31 chr13 34754130 34754395 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -113577 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 165.75-169 chr8 128011632 128011802 + 1.25 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) L3|LINE|CR1 2819 NR_031611 100302170 NR_031611 ENSG00000283200 MIR1206 MIRN1206|hsa-mir-1206 microRNA 1206 ncRNA 148.25-118 chr5 2842834 2842982 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -74946 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 295-24 chr22 45588847 45589118 + 1.25 NA intron (NM_006486, intron 16 of 16) intron (NM_006486, intron 16 of 16) 16665 NR_131244 100506737 Hs.517692 NR_131244 ENSG00000238120 LINC01589 TCONS_00029353 long intergenic non-protein coding RNA 1589 ncRNA 163.75-9 chr1 115049514 115049672 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001308315, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001308315, exon 7 of 7) 15647 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 115.75-36 chr11 130043601 130043758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26215 NM_001328686 334 Hs.370247 NM_001642 ENSG00000084234 APLP2 APLP-2|APPH|APPL2|CDEBP amyloid beta precursor like protein 2 protein-coding 235-2 chr1 30886195 30886516 + 1.25 NA intron (NM_014654, intron 1 of 4) intron (NM_014654, intron 1 of 4) 22403 NM_014654 9672 Hs.158287 NM_014654 ENSG00000162512 SDC3 SDCN|SYND3 syndecan 3 protein-coding 125.75-108 chr2 208941788 208941958 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 399231 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 131-148 chr6 155563135 155563282 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 48364 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 176.5-173 chr8 120875472 120875711 + 1.25 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -63545 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 350.5-21 chr5 10136291 10136898 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 113294 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 207.25-63 chr4 30840252 30840478 + 1.25 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 119996 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 235.75-46 chr3 68068221 68068449 + 1.25 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) 64088 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 201-68 chr6 69312674 69312982 + 1.25 NA intron (NM_001704, intron 20 of 31) intron (NM_001704, intron 20 of 31) 483638 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 315.75-26 chr8 105994729 105995146 + 1.25 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 65566 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 344.25-14 chr5 88218303 88218742 + 1.25 NA intron (NM_001349407, intron 5 of 14) AluJb|SINE|Alu 50323 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 300.75-16 chr15 57575742 57576248 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15909 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 256.25-7 chr11 115344556 115344860 + 1.25 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 11131 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 163.5-161 chr5 77370573 77370862 + 1.25 NA intron (NM_001029854, intron 9 of 20) L1ME2z|LINE|L1 121599 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 176-83 chrX 39098047 39098265 + 1.25 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 229206 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 175.25-120 chr5 113961120 113961370 + 1.25 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -400825 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 226.75-41 chr20 52257670 52258127 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -65913 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 168.5-111 chr3 42024921 42025055 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -62212 NM_001349245 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 215.25-113 chr8 136795266 136795540 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 3 of 5) intron (NR_147196, intron 3 of 5) 264605 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 207-72 chr6 61888732 61889051 + 1.25 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 314761 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 258.75-66 chr7 2787275 2787559 + 1.25 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 -24277 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 266.25-9 chr11 128013403 128013726 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -195202 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 206.5-86 chr4 123158959 123159307 + 1.25 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) intron (NM_001345856, intron 14 of 15) 236055 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 171.75-46 chr14 85521261 85521460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -8665 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 211.5-61 chr18 2642060 2642371 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13180 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 446-3 chr14 81376088 81376522 + 1.25 NA intron (NM_001366850, intron 4 of 7) L1ME3B|LINE|L1 51470 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 284.75-16 chr18 56284070 56284348 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -92947 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 390.75-6 chr4 38201601 38202085 + 1.25 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 81889 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 364.25-5 chr11 117938717 117939134 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9472 NM_001206790 84000 Hs.266308 NM_032046 ENSG00000137747 TMPRSS13 MSP|MSPL|MSPS|TMPRSS11 transmembrane serine protease 13 protein-coding 233.5-28 chr12 13019453 13019842 + 1.25 NA intron (NR_149067, intron 2 of 2) L1M7|LINE|L1 19205 NR_002774 93164 Hs.593282 NR_002774 ENSG00000183935 HTR7P1 HTR7P 5-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 pseudo 211.75-39 chr18 38502493 38502847 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 845535 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 246-58 chr7 49881701 49881937 + 1.25 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) intron (NR_136188, intron 2 of 3) 106486 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 221-81 chr8 136369750 136370042 + 1.25 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -160902 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 486 chr1 118716294 118716857 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 271768 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 216.5-107 chr7 54360488 54360775 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 29934 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 152.25-143 chr7 6232121 6232424 + 1.25 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 40352 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 257.75-18 chr17 67269310 67269609 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -24263 NM_014877 9931 Hs.370140 NM_014877 ENSG00000198265 HELZ DHRC|DRHC|HUMORF5 helicase with zinc finger protein-coding 371.25-3 chr10 115959123 115959579 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 235438 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 196-78 chr5 51382491 51382732 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_002202) promoter-TSS (NM_002202) 721 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 116.5-110 chr2 46087862 46088010 + 1.25 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -209471 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 242.75-14 chr12 123787566 123787782 + 1.25 NA intron (NM_207437, intron 9 of 77) CpG 25179 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 215-81 chr9 90486775 90486997 + 1.25 NA intron (NR_034157, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 -53397 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 166.5-58 chr14 40151450 40151754 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -719102 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 196.5-58 chr16 7024554 7024729 + 1.25 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 250832 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 113.5-90 chr15 92405228 92405400 + 1.25 NA intron (NM_001330416, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 11427 NM_001330416 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 158.75-16 chr10 64103482 64103694 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -581698 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 183.5-60 chr2 32961575 32961764 + 1.25 NA intron (NM_206943, intron 2 of 33) AluSq2|SINE|Alu 14716 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 140.25-63 chr16 56188383 56188600 + 1.25 NA intron (NR_027078, intron 1 of 4) intron (NR_027078, intron 1 of 4) 2603 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 225.25-14 chr11 115237351 115237726 + 1.25 NA intron (NM_001098517, intron 3 of 8) intron (NM_001098517, intron 3 of 8) -96039 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 240-38 chr3 119878746 119879174 + 1.25 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) L1ME1|LINE|L1 96250 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 241-60 chr9 77542137 77542366 + 1.25 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) L1MA4A|LINE|L1 94602 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 172.25-122 chr6 57077116 57077272 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -12836 NM_015555 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 162.75-147 chr8 119630849 119631049 + 1.25 NA intron (NM_001330600, intron 2 of 25) AluSq2|SINE|Alu 7890 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 302.75-10 chr15 63626867 63627305 + 1.25 NA intron (NM_003922, intron 70 of 77) intron (NM_003922, intron 70 of 77) -26259 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 394.75-3 chr18 8064484 8065160 + 1.25 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 302212 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 189.75-48 chr16 62410910 62411158 + 1.25 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -374596 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 441-8 chr3 190839195 190839794 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 23200 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 188.25-3 chr1 181120235 181120434 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 31634 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 128.75-12 chr1 204201342 204201507 + 1.25 NA intron (NM_198447, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -4933 NM_002256 3814 Hs.95008 NM_002256 ENSG00000170498 KISS1 HH13|KiSS-1 KiSS-1 metastasis suppressor protein-coding 183-4 chr1 109507831 109508092 + 1.25 NA exon (NM_020703, exon 2 of 2) exon (NM_020703, exon 2 of 2) 1766 NM_020703 57463 Hs.12264 NM_020703 ENSG00000181754 AMIGO1 ALI2|AMIGO|AMIGO-1 adhesion molecule with Ig like domain 1 protein-coding 223.25-43 chr20 3822415 3822737 + 1.25 NA intron (NM_018347, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 2029 NM_001204447 55317 Hs.104806 NM_018347 ENSG00000125843 AP5S1 C20orf29 adaptor related protein complex 5 subunit sigma 1 protein-coding 216.5-26 chr13 60917219 60917468 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 244388 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 219.5-115 chr6 82386144 82386337 + 1.25 NA Intergenic UCON77|Unknown|Unknown 21996 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 188.5-45 chr15 70952248 70952432 + 1.25 NA intron (NM_017691, intron 8 of 15) L1PA16|LINE|L1 59897 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 175.75-133 chrX 144930475 144930664 + 1.25 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -316934 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 196.25-67 chr2 109642111 109642431 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 27907 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 219.75-52 chr4 45238815 45239032 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -512289 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 160-71 chr4 30617773 30618038 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -102464 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 223.75-49 chr2 177005727 177006019 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 206538 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 240.5-21 chr13 89583589 89583952 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -19357 NR_046991 100874139 Hs.742173 NR_046991 LINC00353 - long intergenic non-protein coding RNA 353 ncRNA 173-127 chr6 156060641 156060785 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 113916 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 214.75-23 chr14 55248765 55248955 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22561 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 307-4 chr1 162003854 162004281 + 1.25 NA intron (NM_001347700, intron 4 of 7) intron (NM_001347700, intron 4 of 7) 20398 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 200.5-130 chr7 90322678 90323189 + 1.25 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -12290 NR_110085 101927446 Hs.734999 NR_110085 ENSG00000105793 LOC101927446 - uncharacterized LOC101927446 ncRNA 150.25-132 chr6 109235352 109235561 + 1.25 NA intron (NR_152435, intron 14 of 45) L2b|LINE|L2 69625 NR_152435 221262 Hs.373914 NM_173671 ENSG00000203799 CCDC162P C6orf183|C6orf184|C6orf185|CCDC162 coiled-coil domain containing 162, pseudogene pseudo 298.25-31 chr7 28797508 28797764 + 1.25 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 111503 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 233.5-59 chr2 142277768 142278133 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -146249 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 274.75-3 chr11 19081055 19081341 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -20481 NM_054030 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 177.25-19 chr10 88261257 88261493 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 321943 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 216-31 chr17 67701672 67701867 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16064 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 376-2 chr10 114651976 114652365 + 1.25 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) 6105 NM_002313 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 146.25-162 chr9 31603761 31603916 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -222348 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 352.75-7 chr17 16430286 16430737 + 1.25 NA intron (NM_016113, intron 10 of 14) AluSx3|SINE|Alu -8476 NR_027162 125144 Hs.368934 NM_152350 ENSG00000175061 SNHG29 C17orf45|C17orf76-AS1|FAM211A-AS1|LRRC75A-AS1|NCRNA00188|TSAP19 small nucleolar RNA host gene 29 ncRNA 194.75-37 chr17 70089318 70089540 + 1.25 NA intron (NM_001270422, intron 1 of 5) intron (NM_001270422, intron 1 of 5) 14204 NM_018658 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 238.25 chr1 38122271 38122670 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 33239 NR_037432 100500801 NR_037432 ENSG00000265596 MIR3659 mir-3659 microRNA 3659 ncRNA 191.25-76 chr4 56256022 56256238 + 1.25 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 85935 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 176.25-129 chr7 52264697 52264909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -770830 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 323.75-12 chr2 57117338 57117784 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -790090 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 421.75 chr1 83792816 83793328 + 1.25 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 67474 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 208.25-41 chr19 29062152 29062434 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 59738 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 363-21 chr7 27878818 27879173 + 1.25 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) intron (NM_175061, intron 3 of 4) 138900 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 138.25-56 chr15 94503465 94503625 + 1.25 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 147615 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 155.75-63 chr16 77679926 77680152 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -42453 NM_001243660 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 122.75-109 chr20 38517129 38517292 + 1.25 NA TTS (NR_039605) TTS (NR_039605) 647 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 164.75-152 chr9 26100015 26100282 + 1.25 NA intron (NM_001004352, intron 3 of 6) intron (NM_001004352, intron 3 of 6) 33473 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 233-27 chr17 64491253 64491572 + 1.25 NA intron (NM_007215, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu 5642 NM_007215 11232 Hs.437009 NM_007215 ENSG00000256525 POLG2 HP55|MTPOLB|PEOA4|POLB|POLG-BETA|POLGB DNA polymerase gamma 2, accessory subunit protein-coding 180.25-61 chr20 10947649 10947936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -38520 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 238.5-71 chr5 118680032 118680394 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 84025 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 180.5-43 chr15 26267165 26267329 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 151434 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 277.5-23 chr14 69308955 69309215 + 1.25 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) L1M5|LINE|L1 48927 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 244.75-45 chr5 31142977 31143265 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50565 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 169.5-133 chr5 31809691 31809884 + 1.25 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) 126372 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 147.25-124 chr6 137677303 137677555 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 11783 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 258-4 chr1 220784560 220784826 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001331042, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001331042, exon 5 of 5) -2220 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 317.25-22 chr3 192532746 192533225 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 17963 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 254.25-25 chr17 40296480 40296710 + 1.25 NA intron (NM_001254, intron 8 of 11) intron (NM_001254, intron 8 of 11) 8716 NM_001254 990 Hs.405958 NM_001254 ENSG00000094804 CDC6 CDC18L|HsCDC18|HsCDC6|MGORS5 cell division cycle 6 protein-coding 272.25-32 chr3 12199057 12199283 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40258 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 200.75-26 chr13 26062937 26063127 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3510 NR_146971 107984009 NR_146971 LINC00415 - long intergenic non-protein coding RNA 415 ncRNA 325.75-8 chr15 49993436 49993755 + 1.25 NA intron (NR_073597, intron 9 of 26) intron (NR_073597, intron 9 of 26) 119784 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 130.75-151 chr4 133943744 133943917 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 257959 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 291.75 chr1 30347167 30347499 + 1.25 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -309721 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 201-11 chr10 56258690 56258969 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 102430 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 204.25-36 chr14 51340841 51341035 + 1.25 NA intron (NR_038358, intron 1 of 4) intron (NR_038358, intron 1 of 4) 7545 NR_038358 283553 Hs.325752 NR_038358 ENSG00000258479 LINC00640 - long intergenic non-protein coding RNA 640 ncRNA 162.5-170 chr8 57073353 57073534 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -79576 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 189.5-57 chr17 33201500 33201787 + 1.25 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MER66A|LTR|ERV1 91345 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 147.5-69 chr15 44176771 44176929 + 1.25 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) L1ME1|LINE|L1 17596 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 360-9 chr2 179436226 179436701 + 1.25 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 126125 NR_148055 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 215.75-92 chr7 31295320 31295658 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 45237 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 180.25-72 chr3 95247309 95247474 + 1.25 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 309128 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 249.5-96 chr8 122119800 122120162 + 1.25 NA Intergenic (AATAGTTGGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 448663 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 243.25-55 chr8 77629632 77630125 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 179181 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 113.25-140 chr5 114900200 114900300 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -126837 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 197.75-38 chr2 5310349 5310613 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 380637 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 177-42 chr2 34322784 34322947 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 255639 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 141.5-127 chr21 20396450 20396734 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -137907 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 345.25-24 chr8 119060162 119060610 + 1.25 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) HAL1|LINE|L1 -6861 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 349-9 chr3 194999007 194999368 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -95401 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-165 chr7 52958650 52958859 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -76879 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 275-23 chr2 78664066 78664449 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 118726 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 120.25-117 chr21 19496472 19496619 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 403210 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 167.25-82 chr2 102311386 102311537 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_016232) promoter-TSS (NM_016232) -41 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 223.75-7 chr10 112884028 112884371 + 1.25 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 60703 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 418.25-3 chr10 77444139 77444597 + 1.25 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 93496 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 294-28 chr4 39529623 39529909 + 1.25 NA intron (NR_047679, intron 1 of 4) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 1927 NR_047679 100885776 Hs.640769 NR_047679 ENSG00000249348 UGDH-AS1 - UGDH antisense RNA 1 ncRNA 322-11 chr15 96641586 96642045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 139839 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 179.5-35 chr11 110877311 110877581 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -164257 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 203.25-79 chr5 18495442 18495678 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 688286 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 258.75-65 chr6 162766966 162767272 + 1.25 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 39149 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 267-52 chr8 30389594 30389999 + 1.25 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 -4395 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 246.25-63 chr7 45875630 45876152 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12597 NM_000596 3484 Hs.642938 NM_000596 ENSG00000146678 IGFBP1 AFBP|IBP1|IGF-BP25|PP12|hIGFBP-1 insulin like growth factor binding protein 1 protein-coding 229.75-10 chr11 40843356 40843563 + 1.25 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -550329 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 228.75-12 chr12 6444679 6444914 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001242) promoter-TSS (NM_001242) -89 NM_001242 939 Hs.355307 NM_001242 ENSG00000139193 CD27 S152|S152. LPFS2|T14|TNFRSF7|Tp55 CD27 molecule protein-coding 252-12 chr11 6505668 6505897 + 1.25 NA intron (NM_144666, intron 4 of 42) intron (NM_144666, intron 4 of 42) 8486 NM_144666 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 183.5-116 chr5 77162048 77162310 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18125 NM_001349752 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 268.75-2 chr1 191960110 191960472 + 1.25 NA Intergenic (GTGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -198171 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 192.25-5 chr1 173634425 173634624 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001195190) promoter-TSS (NM_001195190) -814 NM_001195190 730159 Hs.647757 NM_001195190 ENSG00000232113 TEX50 - testis expressed 50 protein-coding 197.75-34 chr18 10033344 10033561 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 119436 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 184.5-71 chr2 25816732 25817013 + 1.25 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) AluSx1|SINE|Alu 14029 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 275.25-20 chr2 140771946 140772220 + 1.25 NA intron (NM_018557, intron 33 of 90) intron (NM_018557, intron 33 of 90) -185398 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 148.5-81 chr17 28126693 28126894 + 1.25 NA intron (NM_016231, intron 2 of 10) intron (NM_016231, intron 2 of 10) 84116 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 234.5-80 chr5 93198178 93198541 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 372984 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 397-12 chr5 53983029 53983829 + 1.25 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -31830 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 234.75 chr1 14566139 14566431 + 1.25 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -32400 NM_201628 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 179-16 chr10 59973225 59973608 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -12503 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 265.5-37 chr2 169318837 169319190 + 1.25 NA intron (NM_004525, intron 2 of 78) intron (NM_004525, intron 2 of 78) 43521 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 232.75-58 chr6 25083681 25083979 + 1.25 NA intron (NR_002174, intron 12 of 12) intron (NR_002174, intron 12 of 12) -41542 NM_001286446 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 281.75-30 chr22 36628270 36628580 + 1.25 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) intron (NM_006078, intron 1 of 3) 74433 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 214.5-130 chr8 123866019 123866210 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) L1PA2|LINE|L1 14127 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 238-10 chr10 111110101 111110543 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -3969 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 180.5-33 chr13 100963743 100963894 + 1.25 NA intron (NR_047687, intron 2 of 7) L1MB8|LINE|L1 -19454 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 157.5-66 chr15 59794575 59794804 + 1.25 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -105369 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 237.75-75 chr6 53320049 53320348 + 1.25 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) AluSz6|SINE|Alu 17419 NR_046241 647190 Hs.520189 NR_046241 RPS16P5 RPS16_3_702 ribosomal protein S16 pseudogene 5 pseudo 196.5-92 chr20 51426785 51426997 + 1.25 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) intron (NM_012340, intron 9 of 10) 26086 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 295-5 chr10 61341293 61341607 + 1.25 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -111189 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 144.75-144 chr6 35545988 35546180 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -33188 NM_001289395 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 273.25-17 chr2 106540367 106540615 + 1.25 NA intron (NM_001368307, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 53127 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 219-95 chr8 141330107 141330460 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -10266 NR_024441 731779 Hs.586414 NR_024441 ENSG00000253595 LINC01300 - long intergenic non-protein coding RNA 1300 ncRNA 183-63 chr21 42099080 42099384 + 1.25 NA intron (NM_001004416, intron 7 of 22) intron (NM_001004416, intron 7 of 22) 9302 NR_027243 150147 Hs.558646 NM_152507 ENSG00000184385 UMODL1-AS1 C21orf128 UMODL1 antisense RNA 1 ncRNA 144.25-58 chr14 66463000 66463214 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23264 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 261.25-51 chr8 59223055 59223353 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 103994 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 146.25-25 chr12 45893899 45894243 + 1.25 NA TTS (NM_001347839) TTS (NM_001347839) 96503 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 168.5-135 chr4 103104785 103105006 + 1.25 NA TTS (NM_001286734) TTS (NM_001286734) -5061 NM_020139 56898 Hs.124696 NM_020139 ENSG00000164039 BDH2 DHRS6|EFA6R|PRO20933|SDR15C1|UCPA-OR|UNQ6308 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 2 protein-coding 275-18 chr18 2341856 2342087 + 1.25 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 229534 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 256-53 chr4 74012279 74012679 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13802 NM_002994 6374 Hs.89714 NM_002994 ENSG00000163735 CXCL5 ENA-78|SCYB5 C-X-C motif chemokine ligand 5 protein-coding 219.5-72 chr2 123480900 123481405 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -407671 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 222.75-4 chr1 159673347 159673636 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 41098 NM_001329058 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 231-50 chr3 70500225 70500464 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -187706 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 114-6 chr1 55162387 55162503 + 1.25 NA intron (NM_015306, intron 7 of 67) L1MD|LINE|L1 52919 NM_015306 23358 Hs.477009 NM_015306 ENSG00000162402 USP24 - ubiquitin specific peptidase 24 protein-coding 262-25 chr19 1087067 1087450 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001316324, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001316324, exon 8 of 8) 8117 NM_002695 5434 Hs.24301 NM_002695 ENSG00000099817 POLR2E RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5 RNA polymerase II subunit E protein-coding 264.5-53 chr6 129476128 129476614 + 1.25 NA intron (NM_000426, intron 53 of 64) intron (NM_000426, intron 53 of 64) 233806 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 174.25-37 chr12 53754601 53754954 + 1.25 NA intron (NR_104332, intron 2 of 2) intron (NR_104332, intron 2 of 2) 2257 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 295-16 chr19 46580829 46581110 + 1.25 NA intron (NM_001370550, intron 1 of 2) L1MA8|LINE|L1 19947 NM_001370550 100506012 Hs.671661 NM_001205281 ENSG00000230510 PPP5D1 - PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 protein-coding 179.25-37 chr11 111815085 111815254 + 1.25 NA intron (NR_147984, intron 13 of 15) intron (NR_147984, intron 13 of 15) -48780 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 231.75-37 chr2 76343454 76343790 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -632707 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 164.25-68 chr2 68757764 68757983 + 1.25 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 -17037 NM_014882 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 179-12 chr10 26842741 26842976 + 1.25 NA intron (NM_001178116, intron 1 of 11) AluSc|SINE|Alu 18229 NM_001348032 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 274.25-37 chr5 127274679 127275018 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15916 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 209.75-48 chr2 34114832 34115309 + 1.25 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 47844 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 251.75-79 chr9 31617403 31617663 + 1.25 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -236043 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 132-166 chr7 94347445 94347615 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 44662 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-8 chr1 235277088 235277295 + 1.25 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu 50296 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 250.25-39 chr4 69602595 69602932 + 1.25 NA intron (NM_001301239, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 36879 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 163.5-207 chr8 80572073 80572252 + 1.25 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 85936 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 132.75-188 chr8 90155962 90156135 + 1.25 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -65440 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 337.5-7 chr11 22304536 22304929 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -33649 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 177-95 chr8 72590405 72590636 + 1.25 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 53295 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 408-5 chr14 70012933 70013448 + 1.25 NA intron (NM_001034852, intron 9 of 11) intron (NM_001034852, intron 9 of 11) 35057 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 142-36 chr12 19881204 19881383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -133392 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 246-67 chr8 137681016 137681494 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -267667 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 184.75-61 chr22 48646715 48646996 + 1.25 NA intron (NM_001082967, intron 2 of 3) intron (NM_001082967, intron 2 of 3) 70515 NM_015381 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 235-45 chr3 94368856 94369142 + 1.25 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 305938 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 247.5-40 chr2 100421029 100421269 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -3481 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 384.25-2 chr1 107021759 107022277 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -34656 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 159-63 chr3 36154621 36154778 + 1.25 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -225788 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 250.25-52 chr9 103707966 103708178 + 1.25 NA Intergenic MLT1E1A-int|LTR|ERVL-MaLR -291637 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 169.75-92 chr20 31553950 31554138 + 1.25 NA intron (NM_178580, intron 7 of 12) intron (NM_178580, intron 7 of 12) 19219 NR_046853 100874042 Hs.373741 NR_046853 ENSG00000230613 HM13-AS1 - HM13 antisense RNA 1 ncRNA 219.5-81 chr22 28262228 28262504 + 1.25 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -197503 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 275-13 chr15 76377237 76377487 + 1.25 NA intron (NR_148227, intron 29 of 32) intron (NR_148227, intron 29 of 32) 40589 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 254.75-17 chr16 68507873 68508602 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -30976 NM_001305204 146198 Hs.461074 NM_133458 ENSG00000184939 ZFP90 FIK|NK10|ZNF756|zfp-90 ZFP90 zinc finger protein protein-coding 269.5-44 chr5 91007562 91007853 + 1.25 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 306695 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 173.75-18 chr1 237677496 237677639 + 1.25 NA intron (NM_001035, intron 60 of 104) intron (NM_001035, intron 60 of 104) -184608 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 189-7 chr1 92269687 92269895 + 1.25 NA intron (NR_135089, intron 8 of 17) intron (NR_135089, intron 8 of 17) 29196 NM_053274 11146 Hs.49105 NM_007070 ENSG00000174842 GLMN FAP|FAP48|FAP68|FKBPAP|GLML|GVM|VMGLOM glomulin, FKBP associated protein protein-coding 251-60 chr8 136227556 136227872 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -303084 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 215.5-40 chr17 29896675 29896882 + 1.25 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) intron (NM_001282129, intron 1 of 15) -33125 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 196.75-73 chr3 94514095 94514357 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -424037 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 153-41 chr14 58760751 58760942 + 1.25 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -67442 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 130.25-206 chr8 125462333 125462488 + 1.25 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 30201 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 242.5-62 chr4 157114686 157114894 + 1.25 NA intron (NM_000824, intron 2 of 9) L1MC3|LINE|L1 38387 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 296-6 chr10 96740433 96740856 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9622 NR_026712 728658 Hs.645344 NR_026712 ENSG00000236552 RPL13AP5 RPL13A_8_1086|bA196N24.2 ribosomal protein L13a pseudogene 5 pseudo 333 chr1 7098671 7098968 + 1.25 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) intron (NM_001349608, intron 3 of 21) 290935 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 322.25-18 chr6 151658694 151659001 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31649 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 160.25-122 chr5 26406892 26407158 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 631561 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 154.25-144 chr6 118960363 118960572 + 1.25 NA intron (NM_024581, intron 17 of 17) intron (NM_024581, intron 17 of 17) -25305 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 214.5-103 chr5 101622985 101623203 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 673190 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 316.25-13 chr3 97864697 97865059 + 1.25 NA intron (NM_153605, intron 3 of 21) intron (NM_153605, intron 3 of 21) 42867 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 391.25-4 chr1 236247100 236247749 + 1.25 NA intron (NM_019891, intron 5 of 15) L2a|LINE|L2 34534 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 218.5-117 chr8 24796552 24796785 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -117093 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 249.25-26 chr2 173839637 173839901 + 1.25 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 124111 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 285 chr1 79007624 79007973 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -1068 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 283.25-42 chr9 31521534 31521770 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -140162 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 287.25-49 chr8 87711781 87712045 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 162102 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 238.25-78 chr7 3825754 3825971 + 1.25 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -303823 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 112.75-134 chr3 28393174 28393335 + 1.25 NA intron (NM_001040432, intron 2 of 9) L1MA9|LINE|L1 44105 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 237-53 chr5 179578860 179579156 + 1.25 NA intron (NM_001040452, intron 6 of 17) L1ME4b|LINE|L1 19277 NM_001040452 80230 Hs.306769 NM_025158 ENSG00000176783 RUFY1 RABIP4|ZFYVE12 RUN and FYVE domain containing 1 protein-coding 189.75-29 chr13 113573687 113573992 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -10849 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 188.5-133 chr6 119978641 119978942 + 1.25 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -36388 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 271.25-42 chr8 128243687 128243924 + 1.25 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 93689 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 148.75-75 chr18 48438058 48438314 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -25601 NM_001371287 255-8 chr11 113904562 113904861 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_006028) promoter-TSS (NM_006028) -85 NM_006028 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 166.75-105 chr4 99910384 99910578 + 1.25 NA intron (NM_001031723, intron 3 of 7) intron (NM_001031723, intron 3 of 7) -15935 NM_001243736 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 149-121 chr7 53583966 53584131 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 227883 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 245-10 chr11 22459654 22459937 + 1.25 NA intron (NR_120583, intron 3 of 3) intron (NR_120583, intron 3 of 3) 32224 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 230.5-71 chr20 20653966 20654199 + 1.25 NA intron (NM_020343, intron 3 of 39) intron (NM_020343, intron 3 of 39) 58562 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 381.25 chr1 14092687 14093043 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 327108 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 231.5-51 chr2 164732152 164732363 + 1.25 NA intron (NM_001365670, intron 3 of 13) intron (NM_001365670, intron 3 of 13) -44480 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 272.75-5 chr11 68641751 68642153 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -42592 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 207.25-40 chr2 71460966 71461182 + 1.25 NA intron (NM_003494, intron 1 of 54) intron (NM_003494, intron 1 of 54) -5625 NM_001130984 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 217.25-90 chr9 109074700 109074991 + 1.25 NA intron (NM_032012, intron 8 of 17) HAL1b|LINE|L1 -28547 NR_029506 407036 NR_029506 ENSG00000207698 MIR32 MIRN32|hsa-mir-32|miR-32|miRNA32 microRNA 32 ncRNA 143-39 chr14 68505052 68505283 + 1.25 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 123620 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 233.75-25 chr15 27500989 27501446 + 1.25 NA intron (NM_033223, intron 6 of 9) AluY|SINE|Alu -339898 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-16 chr11 59248186 59248580 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35456 NM_001039396 219972 Hs.744920 NM_001039396 ENSG00000197629 MPEG1 MPG1|MPS1|Mpg-1|P-2 macrophage expressed 1 protein-coding 252.5-43 chr2 119645619 119645883 + 1.25 NA intron (NR_073132, intron 22 of 24) intron (NR_073132, intron 22 of 24) -33416 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 229.75-64 chr6 6042510 6042722 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35011 NM_001278710 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 151.5-184 chr7 108015705 108015954 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -12668 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 162.25-136 chr5 145610057 145610244 + 1.25 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 225192 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 256-31 chr2 120089534 120089870 + 1.25 NA intron (NM_001330307, intron 11 of 16) L1ME4c|LINE|L1 76625 NM_001330310 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 250-29 chr2 134771573 134771859 + 1.25 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -52716 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 242.25-67 chr4 74810315 74810662 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15965 NM_001316963 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 236.25-18 chr11 85470533 85470852 + 1.25 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) AluSz|SINE|Alu 156578 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 290-20 chr16 78225378 78225725 + 1.25 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 125897 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 150.5-98 chr2 128742539 128742715 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -121973 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 180.5-44 chr15 26681026 26681206 + 1.25 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 35649 NM_001191320 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 357.25-19 chrX 82181862 82182355 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 980006 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 211.75-22 chr13 49286190 49286427 + 1.25 NA intron (NM_001193478, intron 9 of 9) intron (NM_001193478, intron 9 of 9) 38383 NM_030911 81602 Hs.388220 NM_030911 ENSG00000102543 CDADC1 NYD-SP15|bA103J18.1 cytidine and dCMP deaminase domain containing 1 protein-coding 123.75-40 chr12 48849168 48849350 + 1.25 NA intron (NM_004818, intron 1 of 16) AluSz6|SINE|Alu 2904 NM_004818 9416 Hs.130098 NM_004818 ENSG00000174243 DDX23 PRPF28|SNRNP100|U5-100K|U5-100KD|prp28 DEAD-box helicase 23 protein-coding 190.25-32 chr13 20851003 20851213 + 1.25 NA intron (NM_022459, intron 4 of 22) intron (NM_022459, intron 4 of 22) 51666 NM_022459 64328 Hs.507452 NM_022459 ENSG00000132953 XPO4 exp4 exportin 4 protein-coding 179-14 chr10 35768870 35769090 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -9322 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 227.25-37 chr19 31795970 31796189 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 203798 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 378.25 chr1 49944511 49944835 + 1.25 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) L1PB1|LINE|L1 79281 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 226-31 chr17 63030775 63031203 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) intron (NM_025185, intron 2 of 25) 64754 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 298.25-7 chr12 13916271 13916550 + 1.25 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 63946 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 161.5-176 chr7 83739599 83739736 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -90528 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 255.5-53 chr3 10359136 10359349 + 1.25 NA intron (NM_001001331, intron 13 of 22) MER5B|DNA|hAT-Charlie 29013 NR_036084 100422933 NR_036084 ENSG00000264534 MIR378B - microRNA 378b ncRNA 215.75-100 chr8 130846108 130846414 + 1.25 NA intron (NM_001115, intron 11 of 17) intron (NM_001115, intron 11 of 17) 194648 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 140-28 chr11 103135336 103135548 + 1.25 NA intron (NM_001377, intron 15 of 88) intron (NM_001377, intron 15 of 88) 26016 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 201.5-73 chr2 132926340 132926634 + 1.25 NA intron (NR_135572, intron 1 of 1) L1PB4|LINE|L1 10930 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 335.5-18 chrX 53184699 53185006 + 1.25 NA intron (NR_148673, intron 25 of 26) ERVL-E-int|LTR|ERVL 10636 NR_106955 102465539 NR_106955 ENSG00000276575 MIR6895 hsa-mir-6895 microRNA 6895 ncRNA 204.25-110 chr7 61833539 61833749 + 1.25 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1470412 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 202-43 chr3 102211568 102211791 + 1.25 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 47974 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 162.5-77 chr2 1147421 1147840 + 1.25 NA intron (NM_018968, intron 6 of 16) MLT2A2|LTR|ERVL -196238 NR_136151 101060391 Hs.120377 NR_136151 SNTG2-AS1 - SNTG2 antisense RNA 1 ncRNA 217.75-21 chr12 20525159 20525399 + 1.25 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR -46585 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 188.75-13 chr11 36562770 36562976 + 1.25 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -5140 NM_000448 5896 Hs.73958 NM_000448 ENSG00000166349 RAG1 RAG-1|RNF74 recombination activating 1 protein-coding 330-8 chr14 65024986 65025424 + 1.25 NA intron (NM_002028, intron 4 of 11) intron (NM_002028, intron 4 of 11) -19483 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 234-39 chr3 109751859 109752100 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 149151 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 224.75-5 chr1 45682017 45682265 + 1.25 NA intron (NM_021639, intron 2 of 12) intron (NM_021639, intron 2 of 12) 4392 NM_021639 60313 Hs.238432 NM_021639 ENSG00000159592 GPBP1L1 SP192 GC-rich promoter binding protein 1 like 1 protein-coding 190.5-167 chr9 70984691 70984874 + 1.25 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -115730 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 193-64 chr4 74175745 74175989 + 1.25 NA intron (NM_001144978, intron 3 of 7) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 17749 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 217-74 chr6 115816806 115817182 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -173159 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 282.25-19 chr20 6563741 6564165 + 1.25 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 137221 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 298.25-12 chr18 3283071 3283477 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20555 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 182.75-137 chr8 120467867 120468137 + 1.25 NA intron (NM_022045, intron 10 of 21) intron (NM_022045, intron 10 of 21) 22583 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 240.5-40 chr17 51202861 51203181 + 1.25 NA intron (NM_017643, intron 9 of 16) intron (NM_017643, intron 9 of 16) 36299 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 128.25-122 chr22 45893829 45894105 + 1.25 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 83195 NM_058238 7477 Hs.512714 NM_058238 ENSG00000188064 WNT7B - Wnt family member 7B protein-coding 140.5-213 chr7 31582859 31583066 + 1.25 NA intron (NM_194300, intron 7 of 12) intron (NM_194300, intron 7 of 12) 29960 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 240.5-110 chrX 84241701 84242007 + 1.25 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -16026 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 361.5-29 chr8 140192374 140192776 + 1.25 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -92040 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 258.75 chr1 78860561 78860936 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 145982 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 326.25-20 chr2 100141648 100142149 + 1.25 NA intron (NM_002285, intron 1 of 23) intron (NM_002285, intron 1 of 23) 692 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 360.25-7 chr18 2086092 2086590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 485164 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 187.75-98 chr6 9848605 9848897 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -555751 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 262.25-7 chr10 121482535 121482834 + 1.25 NA intron (NM_001144919, intron 16 of 16) intron (NM_001144919, intron 16 of 16) 48630 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 240-5 chr1 119632407 119632646 + 1.25 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) intron (NM_001080470, intron 1 of 2) 15740 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 148-89 chr3 194637520 194637708 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4195 NM_138399 93109 Hs.478729 NM_138399 ENSG00000145014 TMEM44 - transmembrane protein 44 protein-coding 242.5-20 chr11 39435293 39435500 + 1.25 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 786538 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 289.25-20 chr3 35801949 35802197 + 1.25 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 57597 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 311.5-14 chr2 27227624 27228122 + 1.25 NA intron (NM_001306079, intron 14 of 42) intron (NM_001306079, intron 14 of 42) 10483 NM_001306079 790 Hs.377010 NM_004341 ENSG00000084774 CAD CDG1Z|EIEE50|GATD4 carbamoyl-phosphate synthetase 2, aspartate transcarbamylase, and dihydroorotase protein-coding 162.5-38 chr12 62253843 62254197 + 1.25 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -6320 NM_001351162 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 181-61 chr2 222783317 222783604 + 1.25 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -77576 NM_001354158 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 171.75-106 chr4 159593964 159594132 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 183736 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 126.75-11 chr1 229961798 229961967 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -40835 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 240.25-55 chr5 144251422 144251781 + 1.25 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 46210 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 269.5-4 chr1 195393764 195394118 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 694774 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 212-75 chr7 27412663 27412910 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -165557 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 124.25-191 chr7 107472660 107472840 + 1.25 NA intron (NM_005295, intron 2 of 2).2 intron (NM_005295, intron 2 of 2).2 2693 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 140.25-189 chr8 123874592 123874761 + 1.25 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) L2a|LINE|L2 22689 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 237-51 chr5 168563250 168563697 + 1.25 NA intron (NM_024594, intron 4 of 6) L1MC5a|LINE|L1 -2500 NR_029520 406895 NR_029520 ENSG00000199035 MIR103A1 MIR103-1|MIRN103-1|mir-103a-1 microRNA 103a-1 ncRNA 250-42 chr4 83731575 83731886 + 1.25 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 195622 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 229.25-21 chr12 132111104 132111455 + 1.25 NA intron (NR_003290, intron 4 of 9) AluSz6|SINE|Alu 26996 NR_003290 347918 Hs.122115 NM_182613 ENSG00000185684 EP400P1 EP400NL EP400 pseudogene 1 pseudo 184.75-36 chr17 68652968 68653178 + 1.25 NA intron (NR_110825, intron 2 of 4) intron (NR_110825, intron 2 of 4) 24919 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 234.25-71 chr7 40080723 40081069 + 1.25 NA intron (NM_003718, intron 11 of 13) L1MC4|LINE|L1 53726 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 218.5-46 chr17 67700750 67701124 + 1.25 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -16896 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 137-113 chr3 196755237 196755346 + 1.25 NA intron (NM_002577, intron 1 of 14) L1ME3G|LINE|L1 15434 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 191.25-38 chr16 54393958 54394208 + 1.25 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -23384 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 182-43 chr16 73611810 73611991 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 225095 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 198.25-18 chr10 114042741 114043028 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_000684) promoter-TSS (NM_000684) -982 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 308.5-36 chr8 35499562 35500076 + 1.25 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) -44573 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 207.75-109 chr6 46280924 46281247 + 1.25 NA intron (NR_125838, intron 1 of 3) intron (NR_125838, intron 1 of 3) 4761 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 146.75-180 chrX 87456619 87456804 + 1.25 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -61091 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 146.75-25 chr11 75882644 75882829 + 1.25 NA intron (NM_003369, intron 4 of 14) L1MA8|LINE|L1 67526 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 174.25-56 chr15 59100111 59100295 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -4943 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 187.75-12 chr10 67164421 67164637 + 1.25 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) L1MD2|LINE|L1 152263 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 303.5-36 chr5 126861439 126861743 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 84455 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 150.5-11 chr1 211251322 211251515 + 1.25 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7859 NM_001350069 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 211-56 chr5 132816935 132817183 + 1.25 NA TTS (NM_175873) TTS (NM_175873) 3757 NM_175873 134548 Hs.13308 NM_175873 ENSG00000198944 SOWAHA ANKRD43 sosondowah ankyrin repeat domain family member A protein-coding 253-18 chr16 9914322 9914671 + 1.25 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 267571 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 114.5-125 chr2 15369230 15369414 + 1.25 NA intron (NR_052013, intron 31 of 50) intron (NR_052013, intron 31 of 50) 192012 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 227-2 chr1 42451082 42451411 + 1.25 NA intron (NM_032257, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 4776 NM_032257 84217 Hs.294009 NM_032257 ENSG00000066185 ZMYND12 - zinc finger MYND-type containing 12 protein-coding 272.75-44 chr6 106911000 106911412 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 62833 NM_001291739 100133941 Hs.644105 NM_013230 ENSG00000272398 CD24 CD24A CD24 molecule protein-coding 270-23 chr2 25882026 25882385 + 1.25 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -3718 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 270.25 chr1 62852842 62853162 + 1.25 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) HAL1|LINE|L1 68870 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 351.5-31 chr8 142391879 142392250 + 1.25 NA intron (NM_001366903, intron 1 of 9) AluSq2|SINE|Alu 11118 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 270.25-40 chr5 53332754 53333313 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -147596 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 146.75-51 chr15 57139765 57139952 + 1.25 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -79572 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 219.25-61 chr5 65830150 65830475 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96242 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 212.5-86 chr5 100711747 100712010 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 104687 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 168-75 chr20 13394453 13394716 + 1.25 NA intron (NM_017714, intron 13 of 13) AluY|SINE|Alu -154897 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-81 chr2 176616140 176616412 + 1.25 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -15224 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 407.5-9 chr4 164727122 164727580 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -26780 NM_001352885 100505989 Hs.328236 NM_001352885 ENSG00000248771 SMIM31 LINC01207 small integral membrane protein 31 protein-coding 149-88 chr4 31075850 31076149 + 1.25 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -95145 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 353.25-9 chr17 77575262 77575787 + 1.25 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 28583 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 361.75-2 chr1 186167936 186168541 + 1.25 NA intron (NM_031935, intron 100 of 106) intron (NM_031935, intron 100 of 106) -128035 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 329.25-26 chr7 141890440 141890926 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -28193 NM_001001656 130075 Hs.690171 NM_001001656 ENSG00000258083 OR9A4 - olfactory receptor family 9 subfamily A member 4 protein-coding 333-28 chrX 7272184 7272504 + 1.25 NA intron (NM_001320753, intron 5 of 9) intron (NM_001320753, intron 5 of 9) 19871 NM_001320754 412 Hs.522578 NM_000351 ENSG00000101846 STS ARSC|ARSC1|ASC|ES|SSDD|XLI steroid sulfatase protein-coding 157-17 chr11 78900184 78900477 + 1.25 NA intron (NM_001098816, intron 7 of 33) MIR|SINE|MIR -325466 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 292.75-2 chr1 63555464 63556013 + 1.25 NA intron (NM_032437, intron 9 of 13) AluJr|SINE|Alu 6758 NR_002771 79469 Hs.659291 NR_002771 DLEU2L BCMSUNL deleted in lymphocytic leukemia 2 like ncRNA 384-23 chr9 122183607 122184397 + 1.25 NA intron (NM_001286828, intron 3 of 3) intron (NM_001286828, intron 3 of 3) 24094 NM_198469 254956 Hs.71428 NM_198469 ENSG00000185681 MORN5 C9orf113|C9orf18 MORN repeat containing 5 protein-coding 353.5-12 chr3 103319849 103320219 + 1.25 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 204082 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 208.75-34 chr18 25532669 25533063 + 1.25 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -180700 NM_001308225 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 212.25-61 chr4 30527587 30527787 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -192682 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 201.5-59 chr15 63856880 63857201 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13979 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 326.75-20 chr8 82744900 82745229 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -167040 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 232.25-79 chr8 90011534 90011878 + 1.25 NA intron (NM_001330575, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 10229 NM_001359 1666 Hs.492212 NM_001359 ENSG00000104325 DECR1 DECR|NADPH|SDR18C1 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 protein-coding 210-82 chr6 69460938 69461265 + 1.25 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 335365 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 240.25-58 chr6 163792987 163793375 + 1.25 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 -121697 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 142.5-24 chr1 244370934 244371208 + 1.25 NA intron (NM_001276349, intron 2 of 3) intron (NM_001276349, intron 2 of 3) 18436 NM_001012970 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 169-37 chr17 63016579 63016896 + 1.25 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 50502 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 156.75-152 chr6 158569210 158569441 + 1.25 NA intron (NM_020823, intron 1 of 16) intron (NM_020823, intron 1 of 16) 32889 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 144-59 chr2 123564456 123564606 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 460643 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 383.5-12 chr7 36046511 36047155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48477 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 308-31 chr9 71932873 71933292 + 1.25 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) L1M4c|LINE|L1 21443 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 208-76 chr7 26284855 26285096 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6903 NM_001362754 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 227-34 chr2 182211842 182212166 + 1.25 NA intron (NM_005019, intron 7 of 14) L1MC1|LINE|L1 30059 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 293.75-29 chr21 14499553 14499951 + 1.25 NA intron (NM_022136, intron 6 of 7) intron (NM_022136, intron 6 of 7) 46563 NM_022136 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 231.75-15 chr11 102215934 102216336 + 1.25 NA intron (NM_001130145, intron 6 of 8) intron (NM_001130145, intron 6 of 8) -101349 NM_001165 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 288.75-7 chr10 35780986 35781384 + 1.25 NA intron (NR_110138, intron 1 of 2) intron (NR_110138, intron 1 of 2) 2883 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 184.25-25 chr11 93572219 93572393 + 1.25 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -28915 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 150.5-224 chr8 112036725 112036951 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -606655 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 214.25-16 chr12 4154922 4155118 + 1.25 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -118742 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 153-20 chr11 38553353 38553569 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 92895 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 300.5-13 chr14 50386285 50386594 + 1.25 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) AluJr|SINE|Alu 10442 NM_004196 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 225.25-30 chr17 61131198 61131523 + 1.25 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 236344 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 172.25-65 chr2 79489559 79489856 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 11137 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 194.5-31 chr12 43196056 43196294 + 1.25 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 40860 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 130-99 chr22 48111892 48112113 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -162362 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 286.5-66 chr8 6358465 6358770 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 47931 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 162.5-12 chr10 30898726 30898996 + 1.25 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) intron (NM_001143766, intron 5 of 7) 100656 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 201.75-101 chr8 87367138 87367412 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 10 of 10) LTR78|LTR|ERV1 500860 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 236.75-56 chr8 8382352 8382689 + 1.25 NA intron (NR_163138, intron 1 of 6) intron (NR_163138, intron 1 of 6) 3724 NM_001369759 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 144.75-153 chr7 12464965 12465115 + 1.25 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -31389 NR_136261 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 182.5-148 chr6 137109485 137109736 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 64034 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 154.5-128 chr3 114841328 114841579 + 1.25 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) L2b|LINE|L2 -31580 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 268.5-19 chr14 56400609 56400929 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -113562 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 252-4 chr1 169818369 169818622 + 1.25 NA intron (NM_001320047, intron 9 of 24) HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 23455 NM_001366772 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 273-46 chr5 154025369 154025747 + 1.25 NA intron (NM_001317993, intron 9 of 14) intron (NM_001317993, intron 9 of 14) 13352 NM_001317995 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 278-18 chr2 77652789 77653209 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130566 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 338.5-21 chr3 108711045 108711350 + 1.25 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 46086 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 239.5-43 chr2 225663253 225663666 + 1.25 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) intron (NM_001371273, intron 7 of 7) 262573 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 312-17 chr2 148396600 148396871 + 1.25 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) LTR33|LTR|ERVL -248016 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 391-5 chr11 60258864 60259478 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -16034 NM_001351235 643680 Hs.559934 NM_001351235 MS4A4E - membrane spanning 4-domains A4E protein-coding 205.75-55 chr4 86467194 86467375 + 1.25 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -14089 NM_002753 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 146.75-126 chr5 68469574 68469716 + 1.25 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 177068 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 189.5-2 chr1 33512255 33512472 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 39718 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 354.25-11 chr3 78294591 78294926 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -245795 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 228.5-88 chr6 50053734 50054035 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -3955 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 173.75-96 chr20 10866951 10867155 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 42219 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 220.5-36 chr17 68637824 68638052 + 1.25 NA intron (NR_110825, intron 1 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 9784 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 167.75-69 chr2 56350619 56350890 + 1.25 NA intron (NM_001348515, intron 3 of 3) intron (NM_001348515, intron 3 of 3) -164984 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 251.75-18 chr12 31785676 31785975 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 6473 NM_001013699 440093 Hs.448697 NM_001013699 ENSG00000188375 H3F3C H3.5 H3 histone family member 3C protein-coding 204.25-80 chr4 70353565 70354039 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -6958 NM_012390 26952 Hs.701334 NM_012390 ENSG00000109208 SMR3A P-B1|PBI|PRL5|PROL5 submaxillary gland androgen regulated protein 3A protein-coding 124.5-193 chr6 88790896 88791070 + 1.25 NA intron (NM_001286428, intron 10 of 13) intron (NM_001286428, intron 10 of 13) 172635 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 218.5-17 chr1 202291433 202291674 + 1.25 NA intron (NM_001017403, intron 6 of 17) L2b|LINE|L2 50383 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 231.25-14 chr13 77430394 77430727 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -103466 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 194.5-37 chr14 54929810 54930084 + 1.25 NA Intergenic (TTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27121 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 176.25-16 chr10 33653482 33653704 + 1.25 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 119087 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 304.75-21 chr3 65349883 65350309 + 1.25 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -543720 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 276-45 chr7 50496964 50497361 + 1.25 NA intron (NM_001242888, intron 6 of 12) intron (NM_001242888, intron 6 of 12) -34597 NR_033845 100129427 Hs.680434 NR_033845 ENSG00000226122 DDC-AS1 - DDC antisense RNA 1 ncRNA 228.75-45 chr2 138341366 138341780 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -160197 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 208.5-88 chr3 111658724 111659004 + 1.25 NA intron (NR_134917, intron 14 of 14) L1PA16|LINE|L1 -15812 NM_001185106 257068 Hs.477114 NM_153268 ENSG00000240891 PLCXD2 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 2 protein-coding 182.75-71 chr2 173220680 173220875 + 1.25 NA intron (NM_016653, intron 11 of 19) intron (NM_016653, intron 11 of 19) 61259 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-98 chr4 10676365 10676621 + 1.25 NA intron (NM_052964, intron 1 of 18) intron (NM_052964, intron 1 of 18) 8275 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 370-4 chr1 247247085 247247619 + 1.25 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -8720 NR_160309 317705 Hs.553686 NM_173858 ENSG00000197617 VN1R5 V1RL5 vomeronasal 1 receptor 5 (gene/pseudogene) protein-coding 285-2 chr1 97195773 97196168 + 1.25 NA intron (NM_000110, intron 19 of 22) intron (NM_000110, intron 19 of 22) 100047 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 285.75 chr1 50999276 50999571 + 1.25 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 29178 NM_078626 1031 Hs.525324 NM_001262 ENSG00000123080 CDKN2C INK4C|p18|p18-INK4C cyclin dependent kinase inhibitor 2C protein-coding 257-23 chr2 59346755 59347126 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 129232 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 234-47 chr4 95545527 95545841 + 1.25 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 3289 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 414.5-4 chr22 38215424 38215925 + 1.25 NA 3' UTR (NM_012323, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_012323, exon 3 of 3) 9046 NR_132774 106635525 NR_132774 SNORA92 - small nucleolar RNA, H/ACA box 92 snoRNA 172.5-132 chr3 177273159 177273389 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -21168 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 269.25-58 chr9 77035987 77036219 + 1.25 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 16448 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 186.75-38 chr15 88488424 88488665 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20836 NM_022839 64963 Hs.111286 NM_022839 ENSG00000181991 MRPS11 HCC-2|MRP-S11|S11mt mitochondrial ribosomal protein S11 protein-coding 143-81 chr20 51982923 51983058 + 1.25 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -120077 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 164.5-134 chr3 79807339 79807643 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -39493 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 305.75-13 chr2 197889267 197889694 + 1.25 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 84887 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 122.25-121 chr3 17869326 17869450 + 1.25 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -93164 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 223.25-16 chr14 19989302 19989694 + 1.25 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -12564 NR_145508 390432 NM_001348271 ENSG00000196383 OR4Q2 OR4Q2P olfactory receptor family 4 subfamily Q member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 183-97 chr6 26245440 26245603 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1456 NM_003547 8369 Hs.553507 NM_003547 ENSG00000275663 HIST1H4G H4/l|H4FL histone cluster 1 H4 family member g protein-coding 117.5-234 chr8 83048150 83048257 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 136099 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 218.75-29 chr19 28569967 28570208 + 1.25 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -36601 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 248.75-12 chr12 16552209 16552530 + 1.25 NA intron (NM_001001395, intron 3 of 3) intron (NM_001001395, intron 3 of 3) 53010 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 218.5-16 chr1 193592317 193592656 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 287741 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 183-96 chr6 8462508 8462796 + 1.25 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 27029 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 261.25-39 chr5 30336489 30336787 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 456078 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 172.5-64 chr14 46725680 46725838 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -73978 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 241-8 chr10 113012290 113012516 + 1.25 NA intron (NM_001367943, intron 4 of 14) intron (NM_001367943, intron 4 of 14) -32952 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 296.75-41 chrX 54509311 54509704 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -13273 NM_004463 2245 Hs.709201 NM_004463 ENSG00000102302 FGD1 AAS|FGDY|MRXS16|ZFYVE3 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1 protein-coding 190-34 chr2 156595269 156595471 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 158991 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 168.5-177 chr7 134395970 134396180 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 63025 NM_001628 231 Hs.521212 NM_001628 ENSG00000085662 AKR1B1 ADR|ALDR1|ALR2|AR aldo-keto reductase family 1 member B protein-coding 209.5-10 chr1 242022436 242022666 + 1.25 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -23453 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 129.75-182 chr8 87146421 87146647 + 1.25 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 280119 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 116-90 chr2 194003742 194003909 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -340444 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 283.25-2 chr1 77858575 77858816 + 1.25 NA intron (NM_198549, intron 8 of 15) AluJb|SINE|Alu -29820 NM_001172309 91624 Hs.612385 NM_144573 ENSG00000162614 NEXN CMH20|NELIN nexilin F-actin binding protein protein-coding 426.25-3 chr14 70209354 70210022 + 1.25 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -20618 NM_033262 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 181.25-28 chr13 91079181 91079441 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 10306 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 120-179 chr7 95687027 95687165 + 1.25 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -85410 NM_004411 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 131-39 chr12 42549485 42549696 + 1.25 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 40156 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 127-59 chr14 59444971 59445166 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 20312 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 326-12 chr19 30356415 30356758 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -15798 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 230.25-50 chr20 5889177 5889379 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -22232 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 206-9 chr10 69915295 69915472 + 1.25 NA intron (NM_080801, intron 16 of 38) intron (NM_080801, intron 16 of 38) 113477 NM_001320951 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 243-80 chrX 46761757 46762128 + 1.25 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2824 NM_032591 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 210.25-42 chr2 72601447 72601695 + 1.25 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MC2|LINE|L1 224462 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 215-12 chr10 95351723 95352094 + 1.25 NA intron (NM_001034955, intron 22 of 30) intron (NM_001034955, intron 22 of 30) -60905 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 363.5-24 chr8 142703631 142703988 + 1.25 NA non-coding (NR_038925, exon 3 of 3) non-coding (NR_038925, exon 3 of 3) 3698 NM_001160355 54742 Hs.69517 NM_017527 ENSG00000160886 LY6K CT97|HSJ001348|URLC10|ly-6K lymphocyte antigen 6 family member K protein-coding 292.5-39 chr4 169619685 169620115 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_001243372) promoter-TSS (NM_001243372) -678 NM_001829 1182 Hs.481186 NM_001829 ENSG00000109572 CLCN3 CLC3|ClC-3 chloride voltage-gated channel 3 protein-coding 189.5-85 chr21 27232630 27232828 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -265641 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 342.25-18 chr8 84924167 84924579 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -182865 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 252.25-31 chr2 96407903 96408227 + 1.25 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 72299 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 152.25-163 chr8 135746594 135746792 + 1.25 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 289237 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 198.5-161 chr9 37682367 37682657 + 1.25 NA intron (NM_001371223, intron 1 of 15) MIR1_Amn|SINE|MIR 14503 NM_001371223 315.75-21 chr5 83305078 83305586 + 1.25 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) MER103C|DNA|hAT-Charlie -166342 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 319.75-2 chr10 72393675 72394027 + 1.25 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) AluSc5|SINE|Alu -38932 NR_157570 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 168-101 chr5 38581688 38581942 + 1.25 NA intron (NR_103554, intron 1 of 8) intron (NR_103554, intron 1 of 8) 13590 NM_002310 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 115.75-39 chr12 14763449 14763620 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 7597 NM_175054 121504 Hs.745457 NM_175054 ENSG00000197837 HIST4H4 H4/p histone cluster 4 H4 protein-coding 248.75-31 chr2 124822420 124822859 + 1.25 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) intron (NM_130773, intron 19 of 23) 797352 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 241.75-9 chr10 102133030 102133334 + 1.25 NA exon (NM_001288727, exon 1 of 12) exon (NM_001288727, exon 1 of 12) 142 NM_015062 23082 Hs.533551 NM_015062 ENSG00000148840 PPRC1 PRC PPARG related coactivator 1 protein-coding 155.5-162 chr5 28340182 28340321 + 1.25 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -52586 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 217-5 chr1 229098465 229098825 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76156 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 285.25-33 chr7 49067713 49068004 + 1.25 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 143311 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 254.75-26 chr2 172673737 172674073 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -61940 NM_007023 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 188.5-149 chr8 80722917 80723204 + 1.25 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 151408 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 370-9 chr2 108986815 108987314 + 1.25 NA intron (NM_022336, intron 1 of 11) intron (NM_022336, intron 1 of 11) 2156 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 252-71 chr8 48175427 48175782 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 167173 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 254.25-13 chr10 125397073 125397383 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -177143 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 192.25-109 chr9 33342657 33342873 + 1.25 NA exon (NM_001318758, exon 13 of 24) exon (NM_001318758, exon 13 of 24) 52249 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 210.75-10 chr1 215632000 215632248 + 1.25 NA intron (NM_206933, intron 70 of 71) AluYc|SINE|Alu 64820 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 331.75-4 chr10 35690134 35690506 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -48886 NM_031866 8325 Hs.302634 NM_031866 ENSG00000177283 FZD8 FZ-8|hFZ8 frizzled class receptor 8 protein-coding 180.75-80 chr20 63682789 63683025 + 1.25 NA intron (NR_037882, intron 14 of 37) intron (NR_037882, intron 14 of 37) -13745 NM_003823 8771 Hs.434878 NM_003823 ENSG00000243509 TNFRSF6B DCR3|DJ583P15.1.1|M68|M68E|TR6 TNF receptor superfamily member 6b protein-coding 216 chr1 69741013 69741244 + 1.25 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) L2c|LINE|L2 171787 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 344-19 chr5 41634998 41635384 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -124590 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 249.5-63 chr3 47611931 47612252 + 1.25 NA intron (NM_003074, intron 25 of 27) intron (NM_003074, intron 25 of 27) -31851 NM_001206945 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 266.5-44 chr20 33977520 33977866 + 1.25 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -16218 NM_007367 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 216.25-3 chr1 41982599 41982882 + 1.25 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) intron (NR_038261, intron 1 of 3) 53194 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 161.25-149 chr6 38894087 38894355 + 1.25 NA intron (NM_001371, intron 57 of 91) intron (NM_001371, intron 57 of 91) 58886 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 195.25-11 chr1 176476204 176476383 + 1.25 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) intron (NM_021936, intron 1 of 4) 13118 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 190.5-115 chr4 78782812 78783023 + 1.25 NA intron (NM_017593, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 6539 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 223.5-103 chr5 133128642 133128844 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 76730 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 172-31 chr12 73991455 73991771 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 301018 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 268.5-32 chr2 194149765 194150171 + 1.25 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -194301 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 145.75-143 chr7 6254254 6254552 + 1.25 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) L1MC4|LINE|L1 18221 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 172.25-70 chr2 132470182 132470329 + 1.25 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 36544 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 238-67 chr8 134292193 134292446 + 1.25 NA Intergenic L2|LINE|L2 -305752 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 205.5-113 chr5 37753676 37754002 + 1.25 NA TTS (NM_001345999) TTS (NM_001345999) 80983 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 367-12 chr3 117740702 117741251 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -50051 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 204.5-20 chr11 85986601 85986779 + 1.25 NA intron (NM_001008660, intron 12 of 19) intron (NM_001008660, intron 12 of 19) 82394 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 182.75-77 chr20 54589507 54589741 + 1.25 NA intron (NM_018431, intron 4 of 7) intron (NM_018431, intron 4 of 7) 114031 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 149.5-146 chr5 3609874 3610141 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 14175 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 219.5-89 chr3 190574263 190574545 + 1.25 NA intron (NR_157352, intron 3 of 10) intron (NR_157352, intron 3 of 10) 60319 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 231-60 chr4 60949319 60949669 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 26875 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 167.75-105 chr4 135996293 135996572 + 1.25 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -82752 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 354.75-7 chr15 53552712 53553024 + 1.25 NA intron (NM_182758, intron 18 of 19) intron (NM_182758, intron 18 of 19) -11765 NM_001277176 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 144.5-27 chr10 24650084 24650237 + 1.25 NA intron (NM_001367450, intron 5 of 27) L1M4a2|LINE|L1 -27317 NR_160024 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 181.75-21 chr11 6653436 6653653 + 1.25 NA intron (NM_003737, intron 1 of 20) intron (NM_003737, intron 1 of 20) 2265 NM_003737 8642 Hs.199850 NM_003737 ENSG00000166341 DCHS1 CDH19|CDH25|CDHR6|FIB1|MVP2|PCDH16|VMLDS1 dachsous cadherin-related 1 protein-coding 128.25-206 chr8 77768374 77768494 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 317737 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 231-14 chr12 16803065 16803264 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -185583 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 228.75-5 chr1 194799026 194799238 + 1.25 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 1289583 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 230.25-54 chr22 42818744 42819122 + 1.25 NA intron (NM_001142293, intron 8 of 14) AluSx1|SINE|Alu 38340 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 240.5-76 chr4 65662309 65662639 + 1.25 NA intron (NM_001281767, intron 1 of 16) intron (NM_001281767, intron 1 of 16) 7014 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 190.25-78 chr20 57231028 57231278 + 1.25 NA intron (NM_001719, intron 1 of 6) L1ME3A|LINE|L1 17457 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 241.25-23 chr14 65734938 65735289 + 1.25 NA intron (NM_004480, intron 9 of 9) intron (NM_004480, intron 9 of 9) 264011 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 375.25-5 chr4 140929156 140929495 + 1.25 NA intron (NM_020724, intron 4 of 6) intron (NM_020724, intron 4 of 6) -172940 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 250-19 chr17 80030230 80030549 + 1.25 NA intron (NM_019020, intron 1 of 11) intron (NM_019020, intron 1 of 11) 5483 NM_019020 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 133.5-171 chr3 192325286 192325471 + 1.25 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) 83671 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 122.5-87 chr18 1188382 1188515 + 1.25 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 171181 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 206.25-32 chr13 48136739 48136981 + 1.25 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -41719 NM_001270629 29079 Hs.181112 NM_014166 ENSG00000136146 MED4 ARC36|DRIP36|HSPC126|TRAP36|VDRIP mediator complex subunit 4 protein-coding 169-106 chr8 113835636 113835843 + 1.25 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -398800 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 308.25-18 chr2 223889914 223890172 + 1.25 NA intron (NM_020830, intron 8 of 11) MIRb|SINE|MIR -52461 NM_001039569 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 229-36 chr2 151984508 151984757 + 1.25 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) -10654 NM_001005747 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 257-53 chr7 41469756 41470046 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -224018 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 316.75-16 chr5 59726730 59727228 + 1.25 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) L2c|LINE|L2 -23276 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 352.25-3 chr11 8552549 8552941 + 1.25 NA intron (NM_030906, intron 1 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 41231 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 194.5-44 chr15 81964540 81964815 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 81341 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 142.75-30 chr11 9460835 9461020 + 1.25 NA promoter-TSS (NR_036539) promoter-TSS (NR_036539) -38 NM_001282656 7702 Hs.523471 NM_003442 ENSG00000166478 ZNF143 SBF|STAF|pHZ-1 zinc finger protein 143 protein-coding 225.25-23 chr14 84621813 84622253 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -649899 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 129-58 chr14 43238895 43239023 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 1268324 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 265.5-6 chr10 7978195 7978518 + 1.25 NA intron (NM_031923, intron 4 of 6) intron (NM_031923, intron 4 of 6) 74135 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 155.25-2 chr1 30669463 30669699 + 1.25 NA Intergenic LTR75_1|LTR|ERV1 -49191 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-33 chr14 46046062 46046449 + 1.25 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -17904 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 234-64 chr7 112582896 112583157 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -35039 NR_110159 100996249 Hs.561749 NR_110159 LOC100996249 - uncharacterized LOC100996249 ncRNA 137-135 chr5 27764086 27764297 + 1.25 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 291899 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 256.25-42 chr6 51664059 51664440 + 1.25 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) intron (NM_138694, intron 60 of 66) 42379 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 417-11 chr5 33605238 33605721 + 1.25 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) L1MEi|LINE|L1 164703 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 198-66 chr5 169174852 169175105 + 1.25 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) 88716 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 201.75-78 chr5 145785039 145785328 + 1.25 NA intron (NM_205846, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR 50159 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 324.5-39 chr9 27457610 27458146 + 1.25 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) intron (NM_024761, intron 1 of 3) -66436 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 128-175 chr9 72701852 72702071 + 1.25 NA intron (NM_138691, intron 8 of 23) intron (NM_138691, intron 8 of 23) 172148 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 145.25-82 chr2 207435452 207435582 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -94445 NM_001371427 204.25-37 chr14 51592047 51592316 + 1.25 NA intron (NR_047477, intron 1 of 3) intron (NR_047477, intron 1 of 3) 7771 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 118-139 chr5 14780645 14780742 + 1.25 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 45319 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 314-4 chr10 49082517 49083029 + 1.25 NA intron (NM_001031746, intron 3 of 7) intron (NM_001031746, intron 3 of 7) 32749 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 306-10 chr17 13676656 13677102 + 1.25 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -74950 NM_006042 9955 Hs.462270 NM_006042 ENSG00000153976 HS3ST3A1 3-OST-3A|3OST3A1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3A1 protein-coding 267.75-5 chr10 76506851 76507139 + 1.25 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1MA4|LINE|L1 -381049 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-104 chr21 42367286 42367516 + 1.25 NA promoter-TSS (NM_003225) promoter-TSS (NM_003225) -866 NM_003225 7031 Hs.162807 NM_003225 ENSG00000160182 TFF1 BCEI|D21S21|HP1.A|HPS2|pNR-2|pS2 trefoil factor 1 protein-coding 157.75-31 chr11 80795603 80795961 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -32979 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 262-23 chr18 10746858 10747117 + 1.25 NA intron (NM_022068, intron 28 of 51) L2c|LINE|L2 12662 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 159-4 chr1 179932539 179932832 + 1.25 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -22125 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 194-25 chr11 38563158 38563331 + 1.25 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 83112 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 330.75-16 chr21 14788219 14788737 + 1.25 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 130190 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 226.5-64 chr3 115144127 115144395 + 1.25 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) 3027 NM_015642 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 189-3 chr1 28099479 28099797 + 1.25 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11001 NM_001282562 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 409.5-4 chr11 47842160 47842683 + 1.25 NA intron (NM_001318399, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 5929 NR_134636 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 203.5-43 chr14 69561741 69561960 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 13021 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 205.25-72 chr3 133623643 133623976 + 1.25 NA intron (NM_001363889, intron 17 of 27) intron (NM_001363889, intron 17 of 27) 38132 NM_007027 11073 Hs.593379 NM_007027 ENSG00000163781 TOPBP1 Dpb11|TOP2BP1 DNA topoisomerase II binding protein 1 protein-coding 172-108 chr8 109188872 109189017 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 102316 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 203.5-49 chr16 61598251 61598467 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 438079 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 187.5-120 chr3 163199771 163200004 + 1.25 NA intron (NR_033945, intron 3 of 6) intron (NR_033945, intron 3 of 6) 103414 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 230.25-45 chr2 151497728 151498187 + 1.25 NA intron (NM_001271208, intron 171 of 182) intron (NM_001271208, intron 171 of 182) 88055 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 185.5-84 chr2 169259819 169260082 + 1.25 NA intron (NM_004525, intron 16 of 78) intron (NM_004525, intron 16 of 78) 102584 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 230.75-3 chr1 108695513 108695810 + 1.25 NA intron (NM_001349758, intron 2 of 7) intron (NM_001349758, intron 2 of 7) 3351 NM_001349763 55119 Hs.342307 NM_018061 ENSG00000134186 PRPF38B NET1 pre-mRNA processing factor 38B protein-coding 196.25-117 chr9 6497320 6497535 + 1.25 NA intron (NM_152896, intron 11 of 15) intron (NM_152896, intron 11 of 15) 84228 NM_152896 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 289-16 chr15 68762279 68762606 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 39483 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 311.5-33 chr8 85924181 85924630 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -96463 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 201.75-110 chr9 82411312 82411618 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 422693 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 164.5-24 chr10 86959651 86959920 + 1.25 NA intron (NM_003087, intron 2 of 4) intron (NM_003087, intron 2 of 4) 1186 NM_003087 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 212.75-58 chr20 61872930 61873122 + 1.25 NA intron (NM_001252339, intron 5 of 14) intron (NM_001252339, intron 5 of 14) 80636 NR_031658 100302168 NR_031658 ENSG00000284193 MIR1257 MIRN1257|hsa-mir-1257 microRNA 1257 ncRNA 378.75 chr1 150958446 150958874 + 1.25 NA intron (NM_001366417, intron 14 of 21) intron (NM_001366417, intron 14 of 21) 16175 NM_022075 29956 Hs.744017 NM_013384 ENSG00000143418 CERS2 L3|LASS2|SP260|TMSG1 ceramide synthase 2 protein-coding 152.25-34 chr11 112600695 112600848 + 1.25 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -44969 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 497.25-2 chr14 62684962 62685545 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 360205 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 244.75-43 chr4 157760475 157760778 + 1.25 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 188136 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 196.25-13 chr10 83137188 83137436 + 1.25 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 539777 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 236.5-76 chr5 129885848 129886133 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -18475 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 131.75-198 chr7 12478447 12478590 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -17911 NR_136261 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 179.75-97 chr5 15039725 15039959 + 1.25 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -168064 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 230.25-71 chr7 11896473 11896740 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -64408 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 150.5-143 chr4 40111702 40112035 + 1.25 NA intron (NM_001318359, intron 6 of 18) AluSz|SINE|Alu -54669 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 207-90 chr8 115706847 115707080 + 1.25 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -37988 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 213.75-49 chr2 6206814 6207142 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 168444 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 172.75-126 chr8 81456196 81456512 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 5169 NM_001080526 646480 Hs.653176 NM_001080526 ENSG00000205186 FABP9 PERF|PERF15|T-FABP|TLBP fatty acid binding protein 9 protein-coding 216-38 chr2 47208080 47208369 + 1.25 NA intron (NR_110208, intron 3 of 4) intron (NR_110208, intron 3 of 4) -31288 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 235.75-40 chr2 240192341 240192628 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -51826 NM_148961 150677 Hs.148586 NM_148961 ENSG00000178602 OTOS OTOSP otospiralin protein-coding 123-178 chr8 6551627 6551767 + 1.25 NA intron (NM_001147, intron 1 of 8) intron (NM_001147, intron 1 of 8) 11548 NM_001118887 285 Hs.583870 NM_001147 ENSG00000091879 ANGPT2 AGPT2|ANG2 angiopoietin 2 protein-coding 246.5-23 chr14 47602349 47602556 + 1.25 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 72502 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 174.5-141 chr5 4155993 4156199 + 1.25 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 560264 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 248.75-16 chr12 70790198 70790458 + 1.25 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 -1408 NM_001207015 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 180.75-141 chr7 54109122 54109332 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -221470 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 208.5-60 chr18 72813289 72813737 + 1.25 NA intron (NM_001354018, intron 4 of 11) L1MEd|LINE|L1 39869 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 182.5-84 chr2 186753732 186753982 + 1.25 NA intron (NM_177454, intron 5 of 7) intron (NM_177454, intron 5 of 7) 59797 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 132.5-78 chr15 43430756 43430929 + 1.25 NA intron (NM_001355001, intron 18 of 28) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 59741 NM_001286414 27229 Hs.584887 NM_014444 ENSG00000137822 TUBGCP4 76P|GCP-4|GCP4|Grip76|MCCRP3 tubulin gamma complex associated protein 4 protein-coding 306-11 chr17 56516442 56516831 + 1.25 NA 3' UTR (NM_001365758, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001365758, exon 21 of 21) -77063 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 266.75-47 chr6 140366046 140366448 + 1.25 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 160995 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 166.75-8 chr1 205571085 205571301 + 1.25 NA intron (NM_181644, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR -1888 NR_027086 284578 Hs.537020 NR_027086 MFSD4A-AS1 - MFSD4A antisense RNA 1 ncRNA 217.75-25 chr13 42692673 42692971 + 1.25 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -88728 NM_182508 144809 Hs.16970 NM_182508 ENSG00000179813 FAM216B C13orf30 family with sequence similarity 216 member B protein-coding 144-12 chr1 195537989 195538151 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 550645 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 256.25-20 chr2 43651651 43651994 + 1.25 NA intron (NM_172069, intron 2 of 29) MIRc|SINE|MIR 14562 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 270.5-48 chr4 96974498 96974879 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -392238 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 190-84 chr8 136883902 136884079 + 1.25 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 353192 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 269.25-56 chr9 25024888 25025176 + 1.25 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -479135 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 169.25-81 chr4 43623265 43623427 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -130803 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 240.25 chr1 60159719 60160048 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -86113 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 208.5-49 chr16 55308099 55308281 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -16369 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 134.5-99 chr2 103030853 103031087 + 1.25 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -46541 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 124-60 chr17 15958718 15958832 + 1.25 NA intron (NM_000676, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 13858 NM_000676 136 Hs.167046 NM_000676 ENSG00000170425 ADORA2B ADORA2 adenosine A2b receptor protein-coding 297.25-22 chr5 28623714 28624036 + 1.25 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -302995 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 203.5-143 chr9 18424692 18424977 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -49319 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 229.75-82 chrX 62920065 62920297 + 1.25 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 431151 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 319.75-19 chr6 120339117 120339472 + 1.25 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 324115 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 200.75-44 chr18 40078993 40079386 + 1.25 NA intron (NR_110791, intron 2 of 3) intron (NR_110791, intron 2 of 3) 12903 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 249.25-41 chr5 60691497 60691992 + 1.25 NA intron (NM_001145208, intron 1 of 9) L1ME3A|LINE|L1 8422 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 263.5-8 chr10 125319733 125319956 + 1.25 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -158814 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 292.5-17 chr14 31872770 31873062 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -71937 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 188.75-67 chr2 225117445 225117694 + 1.25 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -75101 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 216.75-17 chr11 28754844 28755072 + 1.25 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -277410 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 371-9 chr14 27632322 27632700 + 1.25 NA TTS (NR_130461) TTS (NR_130461) 767 NR_130461 100422830 NR_130461 ENSG00000264657 MIR3171 - microRNA 3171 ncRNA 241.75-29 chr15 96968719 96968982 + 1.25 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 185415 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 283.75-23 chr3 119438591 119438944 + 1.25 NA intron (NM_018266, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 24848 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 306.25-13 chr12 108590759 108591065 + 1.25 NA 3' UTR (NM_181724, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_181724, exon 2 of 2) 7172 NM_181724 338773 Hs.449718 NM_181724 ENSG00000183160 TMEM119 OBIF transmembrane protein 119 protein-coding 270-51 chr7 111003106 111003357 + 1.25 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) -87775 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 237-12 chr11 98280619 98280998 + 1.25 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -740141 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 182-45 chr17 11648832 11649258 + 1.25 NA intron (NM_001372, intron 12 of 68) AluSp|SINE|Alu 50575 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 246.25-36 chr2 142289725 142290030 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -158176 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 226.75-59 chr4 70157456 70157714 + 1.25 NA intron (NM_214711, intron 2 of 4) AluSc|SINE|Alu 3348 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 137.75-74 chr15 67846962 67847249 + 1.25 NA Intergenic Intergenic -7060 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 164.75-76 chr2 108879696 108879896 + 1.25 NA intron (NM_001351557, intron 11 of 12) intron (NM_001351557, intron 11 of 12) 93025 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 327-4 chr10 57161183 57161673 + 1.25 NA Intergenic Intergenic 143131 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 153.75-101 chr4 45897782 45897999 + 1.25 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 226164 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 221.25-13 chr10 83507153 83507616 + 1 NA Intergenic Intergenic 169705 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 156.25-13 chr1 227315686 227316031 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) intron (NM_001366019, intron 1 of 36) 2634 NM_001366011 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 155.75-155 chr7 113370532 113370806 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -252087 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 174.25-65 chr16 47343384 47343681 + 1 NA intron (NM_030790, intron 8 of 17) L1MB4|LINE|L1 117531 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 144.5-2 chr1 20342546 20342788 + 1 NA intron (NM_001039500, intron 15 of 21) intron (NM_001039500, intron 15 of 21) 51792 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 135.25-9 chr1 112666102 112666394 + 1 NA intron (NM_006135, intron 7 of 9) intron (NM_006135, intron 7 of 9) -8064 NM_020963 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 226.5-37 chr19 38106598 38106934 + 1 NA intron (NM_015073, intron 7 of 21) intron (NM_015073, intron 7 of 21) -56330 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 149.25-118 chr3 126929276 126929536 + 1 NA intron (NM_032343, intron 6 of 7) L3|LINE|CR1 -59188 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 219.5-92 chr4 105670244 105670634 + 1 NA intron (NM_001242729, intron 13 of 13) L1MB7|LINE|L1 38250 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 218.5-45 chr17 62075476 62075903 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -10411 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 281.5-15 chr13 67408473 67408898 + 1 NA Intergenic Intergenic 36298 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 307.5-15 chr15 33960972 33961429 + 1 NA intron (NM_020371, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu -7297 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 170.5-119 chr3 84779986 84780208 + 1 NA intron (NR_033860, intron 10 of 20) L1MB7|LINE|L1 89478 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 115.25-49 chr12 61865637 61865906 + 1 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) intron (NM_178539, intron 2 of 4) 327068 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 113.25-7 chr1 103257483 103257774 + 1 NA Intergenic Intergenic -149106 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 219.75-66 chr5 155602663 155603162 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 589157 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 193.25-72 chr3 87923279 87923621 + 1 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) L1MA5|LINE|L1 -59126 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 138.75-126 chr4 46250099 46250371 + 1 NA 3' UTR (NM_001330690, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001330690, exon 11 of 11) -126181 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 133.25-151 chr4 65983407 65983689 + 1 NA Intergenic Intergenic -293276 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 220.75-57 chr5 76272094 76272461 + 1 NA intron (NM_014979, intron 4 of 12) intron (NM_014979, intron 4 of 12) -131008 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 185.75-91 chr4 70805911 70806339 + 1 NA intron (NM_001037442, intron 17 of 17) intron (NM_001037442, intron 17 of 17) 33378 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 193.5-127 chr5 11491065 11491370 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 97700 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 243.5-64 chr5 65250534 65250799 + 1 NA intron (NR_135689, intron 15 of 25) intron (NR_135689, intron 15 of 25) 231254 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 173.5-34 chr12 62740643 62740892 + 1 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) MER45A|DNA|hAT-Tip100 137081 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 162.25-38 chr12 115510646 115510825 + 1 NA Intergenic Intergenic 637919 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 149.5-170 chr6 47825300 47825562 + 1 NA non-coding (NR_033806, exon 7 of 7) non-coding (NR_033806, exon 7 of 7) 38363 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 157.5-208 chr8 82984106 82984359 + 1 NA Intergenic Intergenic 72128 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 271.25-27 chr19 7228565 7228898 + 1 NA intron (NM_001079817, intron 2 of 20) intron (NM_001079817, intron 2 of 20) 65683 NM_000208 3643 Hs.465744 NM_000208 ENSG00000171105 INSR CD220|HHF5 insulin receptor protein-coding 190.25-125 chr8 135160552 135160771 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -73470 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 162.25-153 chr8 4442272 4442506 + 1 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) intron (NM_033225, intron 2 of 69) 552525 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 151.5-137 chr4 41044077 41044275 + 1 NA intron (NM_001330658, intron 3 of 15) HAL1M8|LINE|L1 170366 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 273.5-83 chr9 100937187 100937591 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -91338 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 134.5-234 chr8 132591663 132591884 + 1 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) intron (NR_135913, intron 9 of 10) -30294 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 159.5-155 chr3 192521069 192521406 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L1MC4a|LINE|L1 6215 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 216.5-27 chr14 25219735 25220117 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -169629 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 244.75-23 chr17 40111622 40112099 + 1 NA Intergenic Intergenic -10111 NM_001012241 339287 Hs.532786 NM_001012241 ENSG00000188895 MSL1 MSL-1 MSL complex subunit 1 protein-coding 131.5-92 chr18 3080616 3080889 + 1 NA intron (NM_019856, intron 32 of 36) intron (NM_019856, intron 32 of 36) -68805 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 172.75-83 chr3 100099062 100099350 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 15307 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 163.25-98 chr3 107737235 107737616 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 7 of 16) intron (NM_001276286, intron 7 of 16) 140643 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 136.75-179 chr7 8468670 8468897 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 35174 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 151.5-161 chr5 133422812 133423100 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 4750 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 136.5-81 chr15 81361656 81361846 + 1 NA intron (NM_001080532, intron 4 of 21) intron (NM_001080532, intron 4 of 21) 12462 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 323.25-24 chr6 63153584 63153986 + 1 NA Intergenic Intergenic 166192 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 199.25-100 chr8 135137670 135137952 + 1 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -96320 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 170.5-19 chr1 214111174 214111516 + 1 NA Intergenic Intergenic 122812 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 133.25-72 chr16 80849864 80850036 + 1 NA intron (NR_131948, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 42646 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 140.5-46 chr12 32300926 32301197 + 1 NA intron (NR_148725, intron 3 of 9) intron (NR_148725, intron 3 of 9) -98497 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 142.75-204 chrUn_GL000216v2 66297 66521 + 1 NA NA (TTCCATTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 114.5-110 chr16 83400445 83400586 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -107831 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 128.5-213 chr7 97025416 97025651 + 1 NA promoter-TSS (NM_005221) promoter-TSS (NM_005221) -702 NM_005221 1749 Hs.99348 NM_005221 ENSG00000105880 DLX5 SHFM1D distal-less homeobox 5 protein-coding 204.5-94 chr3 131657908 131658192 + 1 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -155079 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 114.75-197 chr8 131440541 131440716 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -399719 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 184.25-38 chr14 64275040 64275335 + 1 NA intron (NR_073497, intron 1 of 6) L1MA3|LINE|L1 7888 NM_001271876 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 284.5-40 chr3 55155967 55156517 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21930 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 225.25-35 chr18 1429717 1430020 + 1 NA Intergenic Intergenic -70239 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 150.75-110 chr2 229657744 229657918 + 1 NA intron (NM_139072, intron 1 of 12) intron (NM_139072, intron 1 of 12) 56724 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 219.5-47 chr16 61476591 61476955 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -421007 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 131.25-117 chr2 224099895 224100218 + 1 NA Intergenic Intergenic -60737 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 126.25-148 chr5 23777175 23777444 + 1 NA Intergenic Intergenic -174039 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 232.25-38 chr20 54646361 54646820 + 1 NA intron (NM_018431, intron 7 of 7) MER113A|DNA|hAT-Charlie 170997 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 161.75-105 chr5 65361245 65361530 + 1 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) intron (NR_135689, intron 7 of 25) 120533 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 166.75-97 chr3 179595927 179596115 + 1 NA intron (NM_020409, intron 4 of 6) intron (NM_020409, intron 4 of 6) 8617 NM_020409 57129 Hs.283734 NM_020409 ENSG00000136522 MRPL47 CGI-204|L47mt|MRP-L47|NCM1 mitochondrial ribosomal protein L47 protein-coding 152.5-167 chr6 74069093 74069283 + 1 NA promoter-TSS (NR_110856) promoter-TSS (NR_110856) -263 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 438.5-3 chr14 42495839 42496795 + 1 NA Intergenic Intergenic 889461 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 236.25-90 chr9 26998495 26999106 + 1 NA intron (NM_022901, intron 2 of 4) AluSx1|SINE|Alu 6872 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 198.5-25 chr12 6787016 6787224 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -2408 NM_001195015 920 Hs.631659 NM_000616 ENSG00000010610 CD4 CD4mut CD4 molecule protein-coding 173.25-111 chr6 146728157 146728477 + 1 NA intron (NM_024694, intron 19 of 35) intron (NM_024694, intron 19 of 35) 75507 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 155.25-104 chr2 211013976 211014239 + 1 NA Intergenic Intergenic 396536 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 233.5-17 chr1 221818882 221819399 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 21526 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 114.5-246 chr7 103641660 103641840 + 1 NA intron (NM_005045, intron 16 of 64) intron (NM_005045, intron 16 of 64) -195543 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 130.5-186 chr4 38112312 38112558 + 1 NA intron (NM_001253914, intron 1 of 5) intron (NM_001253914, intron 1 of 5) 533 NM_001253914 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 190.75-25 chr13 55508604 55508828 + 1 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 334262 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 133.5-230 chr6 50513743 50513960 + 1 NA Intergenic Intergenic -199693 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 159.75-42 chr14 60653223 60653538 + 1 NA Intergenic Intergenic -3903 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 146.5-95 chr19 29586960 29587242 + 1 NA Intergenic Intergenic -19182 NM_006627 10775 Hs.412870 NM_006627 ENSG00000105171 POP4 RPP29 POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 147.25-114 chr6 15391667 15391831 + 1 NA intron (NM_004973, intron 2 of 17) intron (NM_004973, intron 2 of 17) 142894 NM_001267040 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 211.75-59 chr3 9688349 9688628 + 1 NA intron (NM_001077525, intron 14 of 18) intron (NM_001077525, intron 14 of 18) -15345 NM_153635 151835 Hs.121335 NM_153635 ENSG00000144550 CPNE9 - copine family member 9 protein-coding 116.5-192 chr5 29697861 29698137 + 1 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -182561 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 114.75-124 chr3 85351244 85351438 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -34369 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 152.25-114 chr4 67225949 67226163 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 195944 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 157.5-161 chr5 45183986 45184186 + 1 NA Intergenic Intergenic 375139 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 180.75-135 chr6 158522445 158522783 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -13822 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 221.25-98 chrX 82368133 82368472 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -1139988 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 182.75-108 chr5 106533442 106533686 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 477450 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 129.5-241 chr9 91158320 91158511 + 1 NA intron (NR_135306, intron 2 of 2) intron (NR_135306, intron 2 of 2) 39353 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 217.5-29 chr11 133583394 133583711 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -51051 NM_001319104 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 241.5-47 chr2 125490036 125490431 + 1 NA Intergenic Intergenic 627752 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 261.5-55 chr5 164891737 164892194 + 1 NA Intergenic Intergenic 421686 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 305.75-14 chr2 228978556 228979081 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 253274 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 172.75-104 chr5 131246363 131246646 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -17505 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 177.5-163 chr7 82383803 82384087 + 1 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 59832 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 252.5-35 chr18 50971005 50971366 + 1 NA intron (NM_018696, intron 1 of 3) L1ME3G|LINE|L1 3145 NM_018696 55520 Hs.657360 NM_018696 ENSG00000141642 ELAC1 D29 elaC ribonuclease Z 1 protein-coding 246.75-83 chr9 86325308 86325685 + 1 NA exon (NM_024617, exon 12 of 27) exon (NM_024617, exon 12 of 27) 28914 NM_001330718 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 235.25-34 chr2 72475206 72475512 + 1 NA intron (NM_001321730, intron 16 of 21) L1M2|LINE|L1 -327497 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 210.5-67 chr2 112803007 112803270 + 1 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -17740 NM_000575 3552 Hs.1722 NM_000575 ENSG00000115008 IL1A IL-1A|IL1|IL1-ALPHA|IL1F1 interleukin 1 alpha protein-coding 222.5-63 chr21 33751436 33751788 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 6 of 29) intron (NM_001001132, intron 6 of 29) 109111 NM_001001132 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 331.25-18 chr6 160814562 160815052 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 112614 NM_001168338 5340 Hs.143436 NM_000301 ENSG00000122194 PLG - plasminogen protein-coding 238.5-14 chr10 95175711 95176090 + 1 NA Intergenic Intergenic -18300 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 219.5-100 chr5 39410633 39410955 + 1 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) intron (NM_001343, intron 1 of 14) 14186 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 170.5-60 chr14 53806000 53806265 + 1 NA Intergenic Intergenic 142352 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 159.75-129 chr5 37323525 37323760 + 1 NA intron (NM_001278312, intron 20 of 33) (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47464 NM_153485 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 207.25-18 chr13 73957228 73957550 + 1 NA intron (NM_007249, intron 2 of 7) intron (NM_007249, intron 2 of 7) 176540 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 189.25-85 chr3 180252932 180253190 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -161112 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 199.75-61 chr3 59884517 59884973 + 1 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) 196164 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 218.5-10 chr1 104628531 104628929 + 1 NA Intergenic Intergenic 555707 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 153.5-110 chr2 178393210 178393440 + 1 NA intron (NM_001201480, intron 24 of 25) intron (NM_001201480, intron 24 of 25) -20334 NR_110206 101927027 Hs.715694 NR_110204 ENSG00000223960 CHROMR CHROME|PRKRA-AS1 cholesterol induced regulator of metabolism RNA ncRNA 272.5-6 chr1 201777082 201777476 + 1 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) HAL1|LINE|L1 -31332 NR_031599 100302158 NR_031599 ENSG00000221028 MIR1231 MIRN1231|hsa-mir-1231 microRNA 1231 ncRNA 211.75-73 chr5 37246977 37247323 + 1 NA intron (NM_023073, intron 2 of 51) intron (NM_023073, intron 2 of 51) -1896 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 152.25-84 chr2 66369995 66370280 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11809 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 189.25-55 chr2 30339182 30339515 + 1 NA Intergenic Intergenic -7298 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 197.5-113 chr4 129209420 129209757 + 1 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 113436 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 155.5-147 chr4 88511446 88511712 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 12197 NM_032906 100996939 Hs.26136 NM_032906 ENSG00000145337 PYURF PREY PIGY upstream reading frame protein-coding 126.75-244 chr8 105086004 105086261 + 1 NA Intergenic Intergenic -232306 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 205.5-124 chr6 47693026 47693493 + 1 NA intron (NM_153839, intron 9 of 10) intron (NM_153839, intron 9 of 10) -5321 NM_001347855 221393 Hs.150131 NM_153838 ENSG00000153294 ADGRF4 GPR115|PGR18 adhesion G protein-coupled receptor F4 protein-coding 154.5-113 chr20 4556282 4556608 + 1 NA Intergenic Intergenic -130011 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 210.25-38 chr2 25252435 25252792 + 1 NA promoter-TSS (NM_153759) promoter-TSS (NM_153759) -298 NM_153759 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 166.25-90 chr2 228195901 228196127 + 1 NA Intergenic Intergenic -14327 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 235.75-50 chr4 44771326 44771611 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -44834 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 119.5-142 chr22 37254171 37254420 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10026 NM_002872 5880 Hs.517601 NM_002872 ENSG00000128340 RAC2 EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 Rac family small GTPase 2 protein-coding 253.5-81 chr9 19428226 19428563 + 1 NA intron (NM_001010887, intron 3 of 5) AluSq2|SINE|Alu 19385 NM_001010887 340485 Hs.41379 NM_001010887 ENSG00000177076 ACER2 ALKCDase2|ASAH3L alkaline ceramidase 2 protein-coding 203.5-55 chr17 78337677 78338002 + 1 NA Intergenic Intergenic 22240 NM_003955 9021 Hs.527973 NM_003955 ENSG00000184557 SOCS3 ATOD4|CIS3|Cish3|SOCS-3|SSI-3|SSI3 suppressor of cytokine signaling 3 protein-coding 164.5-164 chr5 82647865 82648155 + 1 NA Intergenic Intergenic -192145 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 180.25-82 chr4 35362768 35363033 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 881039 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 152.5-138 chr4 95318797 95319054 + 1 NA intron (NM_003728, intron 2 of 15) intron (NM_003728, intron 2 of 15) 227434 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 148.75-86 chr2 105393007 105393280 + 1 NA intron (NM_201555, intron 2 of 7) intron (NM_201555, intron 2 of 7) 5908 NM_001318895 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 227.25-29 chr15 44402704 44403126 + 1 NA exon (NM_138423, exon 9 of 10) exon (NM_138423, exon 9 of 10) -24714 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 131.5-187 chr5 34964711 34964912 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 35218 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 207.5-50 chr2 37477288 37477576 + 1 NA Intergenic Intergenic 132802 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 175.5-85 chr2 37854660 37854849 + 1 NA intron (NR_110012, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 21109 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 183.5-144 chr7 131444804 131445095 + 1 NA intron (NM_001321316, intron 11 of 17) intron (NM_001321316, intron 11 of 17) 111679 NM_001018111 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 117.5-153 chr4 11506230 11506519 + 1 NA Intergenic Intergenic -77480 NM_005114 9957 Hs.507348 NM_005114 ENSG00000002587 HS3ST1 3OST|3OST1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 protein-coding 246.75-39 chr22 25857420 25858017 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) AluSx|SINE|Alu 115530 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 209.25-88 chr4 161906196 161906678 + 1 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) intron (NM_001128428, intron 4 of 14) -116296 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 121.5-2 chr1 35575544 35575728 + 1 NA intron (NM_178548, intron 3 of 6) intron (NM_178548, intron 3 of 6) 2322 NM_178548 339488 Hs.567844 NM_178548 ENSG00000116819 TFAP2E AP2E transcription factor AP-2 epsilon protein-coding 197.75-15 chr12 10115805 10116083 + 1 NA TTS (NM_022570) TTS (NM_022570) 14255 NM_197954 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 242.5-36 chr17 63168264 63168739 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 202266 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 298.25-20 chr22 28581641 28581974 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 98058 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 230.25-53 chr21 14559190 14559457 + 1 NA intron (NM_001256370, intron 2 of 8) intron (NM_001256370, intron 2 of 8) -12963 NM_001286523 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 212.5-41 chr18 22009562 22009809 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 159283 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 441.75 chr2 70883971 70884584 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3594 NR_126384 104355141 Hs.291539 NR_126384 ENSG00000237751 LINC01143 - long intergenic non-protein coding RNA 1143 ncRNA 187.5-63 chr15 62931594 62931951 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 107815 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 170.75-75 chr2 238068441 238068707 + 1 NA intron (NM_016510, intron 3 of 11) intron (NM_016510, intron 3 of 11) 7573 NM_016510 51540 Hs.731909 NM_016510 ENSG00000132330 SCLY SCL|hSCL selenocysteine lyase protein-coding 168.25-92 chr21 16852268 16852504 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 262149 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 161.5-109 chr2 198266366 198266674 + 1 NA Intergenic Intergenic 108577 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 250.75-2 chr10 62240328 62240831 + 1 NA intron (NM_001282941, intron 4 of 4) intron (NM_001282941, intron 4 of 4) 28265 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 235.25-58 chr7 17677302 17677603 + 1 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -118543 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 150.75-114 chr20 37306208 37306411 + 1 NA intron (NM_022077, intron 3 of 3) intron (NM_022077, intron 3 of 3) 16654 NM_001369743 63905 Hs.6126 NM_022077 ENSG00000101363 MANBAL - mannosidase beta like protein-coding 203.5-25 chr10 86332235 86332502 + 1 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) LTR16A|LTR|ERVL 34427 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 214.5-48 chr2 14994190 14994553 + 1 NA Intergenic Intergenic 361654 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 162.75-45 chr16 52603829 52604077 + 1 NA intron (NR_033920, intron 1 of 3) intron (NR_033920, intron 1 of 3) 3022 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 184.5-87 chr20 38330291 38330571 + 1 NA intron (NM_001725, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR -16051 NM_004139 3929 Hs.154078 NM_004139 ENSG00000129988 LBP BPIFD2 lipopolysaccharide binding protein protein-coding 209.5-86 chr21 32394866 32395172 + 1 NA Intergenic Intergenic 1886 NR_026845 84996 Hs.58149 NM_032910 ENSG00000256073 URB1-AS1 C21orf119|PRED84 URB1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 162.5-23 chr10 101516070 101516332 + 1 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) MIRb|SINE|MIR 72056 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 134.5-237 chr9 26388037 26388269 + 1 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 321478 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 152.5-76 chr19 2154796 2155042 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3353 NM_003938 8943 Hs.512815 NM_003938 ENSG00000065000 AP3D1 ADTD|HPS10|hBLVR adaptor related protein complex 3 subunit delta 1 protein-coding 187.25-27 chr13 98274822 98275260 + 1 NA intron (NM_005766, intron 2 of 26) intron (NM_005766, intron 2 of 26) 66517 NR_036129 100422881 NR_036129 ENSG00000263399 MIR3170 mir-3170 microRNA 3170 ncRNA 229.25-73 chr7 4104043 4104474 + 1 NA intron (NM_152744, intron 22 of 44) AluJb|SINE|Alu -25427 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 207.5-109 chr8 50069885 50070192 + 1 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) -94093 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 275.25-41 chr7 10939763 10940250 + 1 NA intron (NM_002489, intron 1 of 3) intron (NM_002489, intron 1 of 3) 147 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 168.5-70 chr18 1813705 1813994 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -454220 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 252.75-64 chr6 134424678 134424969 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12893 NR_038217 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 205.5-22 chr11 90959387 90959704 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -90343 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 190.25-8 chr1 168222033 168222481 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -3747 NM_199344 375035 Hs.645435 NM_199344 ENSG00000213064 SFT2D2 UNQ512|dJ747L4.C1.2 SFT2 domain containing 2 protein-coding 176.5-40 chr12 60904452 60904726 + 1 NA Intergenic Intergenic 1215219 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 113.5-131 chr2 195577827 195578052 + 1 NA Intergenic Intergenic -79019 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 142.25-63 chr15 62745003 62745220 + 1 NA intron (NM_015059, intron 29 of 55) intron (NM_015059, intron 29 of 55) -78846 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 191.75-28 chr12 25510470 25510925 + 1 NA intron (NM_152590, intron 7 of 8) intron (NM_152590, intron 7 of 8) 42586 NM_001256266 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 179.25-97 chr3 19086109 19086605 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -62153 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 214.5-113 chr6 165481992 165482327 + 1 NA intron (NM_006661, intron 4 of 22) intron (NM_006661, intron 4 of 22) -172554 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 275.5-51 chr4 181745409 181745699 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 84419 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 123.75-87 chr19 41752547 41752766 + 1 NA Intergenic Intergenic -2874 NM_002483 4680 Hs.466814 NM_002483 ENSG00000086548 CEACAM6 CD66c|CEAL|NCA carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 6 protein-coding 241.75-30 chr16 55459890 55460356 + 1 NA intron (NR_147198, intron 1 of 6) intron (NR_147198, intron 1 of 6) 2174 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-114 chr22 45859288 45859445 + 1 NA Intergenic Intergenic 98842 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 162.5-169 chr8 54832711 54833045 + 1 NA Intergenic Intergenic 216782 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 161.75-56 chr2 16703726 16703930 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37994 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 173.75-61 chr15 62472733 62473223 + 1 NA Intergenic Intergenic 129949 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 195.5-128 chr5 169215827 169216182 + 1 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) MIR|SINE|MIR 47690 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 387.25-4 chr18 5657252 5657902 + 1 NA Intergenic Intergenic -28586 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 130.75-21 chr10 95867020 95867222 + 1 NA 3' UTR (NM_001312654, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001312654, exon 10 of 10) -40844 NM_001130446 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 123.25-141 chr3 158030280 158030438 + 1 NA Intergenic Intergenic 75804 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 134.5-225 chr8 96466981 96467139 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -26753 NM_002998 6383 Hs.1501 NM_002998 ENSG00000169439 SDC2 CD362|HSPG|HSPG1|SYND2 syndecan 2 protein-coding 134.25-7 chr1 94364309 94364459 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -53993 NM_001122674 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 146.5-41 chr11 48224795 48224943 + 1 NA Intergenic Intergenic 8059 NM_001005470 119765 Hs.553566 NM_001005470 ENSG00000175619 OR4B1 OR11-106|OST208 olfactory receptor family 4 subfamily B member 1 protein-coding 250.25-53 chr9 107516074 107516546 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -26541 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 152.5-183 chr8 42807114 42807351 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 36093 NM_018105 55145 Hs.7432 NM_018105 ENSG00000131931 THAP1 DYT6 THAP domain containing 1 protein-coding 167.5-33 chr11 26399473 26399682 + 1 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR 67447 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 289.25-5 chr11 66200601 66201137 + 1 NA intron (NM_018026, intron 2 of 23) L1MA3|LINE|L1 -56425 NM_001134775 64837 Hs.280792 NM_022822 ENSG00000174996 KLC2 - kinesin light chain 2 protein-coding 203.25-86 chr5 104270474 104270712 + 1 NA Intergenic Intergenic -707804 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 148.5-63 chr14 61486286 61486538 + 1 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 83782 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 164.5-18 chr10 41881811 41882136 + 1 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 486072 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 216.75-46 chr20 8887439 8887734 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 56401 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 196.75-106 chr8 117002056 117002384 + 1 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 51245 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 140.5-175 chr5 10244720 10244882 + 1 NA intron (NR_047670, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 5087 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 137.25-129 chr5 63951434 63951593 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 10779 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 151.5-196 chr8 126587022 126587232 + 1 NA Intergenic Intergenic -28649 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 168.5-84 chr2 102045246 102045499 + 1 NA Intergenic Intergenic -25018 NM_001288706 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 116.5-238 chr7 125361551 125361684 + 1 NA intron (NR_110188, intron 7 of 8) intron (NR_110188, intron 7 of 8) -97326 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 123.25-150 chr4 112125216 112125429 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -20132 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 312.75-30 chr7 106124273 106124861 + 1 NA Intergenic Intergenic -11991 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 209.5-2 chr1 45538415 45538748 + 1 NA Intergenic Intergenic -12202 NM_001202413 10327 Hs.474584 NM_006066 ENSG00000117448 AKR1A1 ALDR1|ALR|ARM|DD3|HEL-S-6 aldo-keto reductase family 1 member A1 protein-coding 151.75-116 chr5 125490738 125490984 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2400 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 118.25-199 chr8 100971984 100972141 + 1 NA Intergenic Intergenic -18680 NM_003406 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 125.5-187 chr4 54997462 54997753 + 1 NA Intergenic Intergenic 127988 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 160.75-112 chr4 94640225 94640634 + 1 NA exon (NM_001256425, exon 8 of 12) exon (NM_001256425, exon 8 of 12) 117104 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 287.25-51 chr8 120511822 120512166 + 1 NA intron (NM_022045, intron 17 of 21) intron (NM_022045, intron 17 of 21) 66575 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 135.25-92 chr2 38833593 38833899 + 1 NA intron (NM_001329963, intron 13 of 23) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 42188 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 142.25-172 chr8 129486496 129486843 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -2527 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 121.5-92 chr15 88286582 88286746 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -29925 NM_002530 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 182.5-15 chr1 224952062 224952379 + 1 NA intron (NM_001349912, intron 1 of 5) intron (NM_001349912, intron 1 of 5) 22545 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 194.75-8 chr1 176628343 176628591 + 1 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) intron (NM_021936, intron 3 of 4) 165292 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 254.5-28 chr16 75768221 75768618 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -41929 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 270.5-42 chr3 93961575 93961929 + 1 NA intron (NM_001314077, intron 1 of 15) intron (NM_001314077, intron 1 of 15) 12329 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 116.5-28 chr10 97918355 97918528 + 1 NA intron (NM_001206528, intron 4 of 14) intron (NM_001206528, intron 4 of 14) -42544 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 128.5-31 chr10 87936337 87936512 + 1 NA intron (NM_001304717, intron 6 of 9) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 72799 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 154.5-195 chr8 132655592 132655793 + 1 NA intron (NR_135912, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 19853 NM_001321963 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 474.5-6 chrX 100874041 100874830 + 1 NA promoter-TSS (NM_013955) promoter-TSS (NM_013955) -76 NM_013955 27035 Hs.592227 NM_007052 ENSG00000007952 NOX1 GP91-2|MOX1|NOH-1|NOH1 NADPH oxidase 1 protein-coding 222.25-54 chr4 30386596 30387051 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -333546 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 393.5 chr1 42802503 42803105 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -14318 NM_001017922 114625 Hs.439437 NM_018538 ENSG00000164010 ERMAP BTN5|PRO2801|RD|SC erythroblast membrane associated protein (Scianna blood group) protein-coding 193.75-32 chr11 116492612 116492819 + 1 NA Intergenic Intergenic -146707 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 150.25-168 chrX 58105798 58106096 + 1 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -195314 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 143.5-165 chr4 122879319 122879507 + 1 NA intron (NM_001361665, intron 2 of 2) intron (NM_001361665, intron 2 of 2) 43184 NM_007083 11162 Hs.558459 NM_007083 ENSG00000170917 NUDT6 ASFGF2|FGF-AS|FGF2AS|GFG-1|GFG1 nudix hydrolase 6 protein-coding 225.5-14 chr10 32166001 32166437 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -109794 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 185.5-47 chr14 53515092 53515435 + 1 NA Intergenic Intergenic 361909 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 203.75-88 chr5 100227262 100227652 + 1 NA Intergenic Intergenic 160797 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 273.25-15 chr17 72153519 72153966 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 32722 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 184.5-118 chr5 35164179 35164497 + 1 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 -46216 NM_001204317 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 267.75-24 chr18 12275114 12275421 + 1 NA intron (NM_001279, intron 4 of 4) AluSx1|SINE|Alu 20906 NM_001279 1149 Hs.249129 NM_001279 ENSG00000176194 CIDEA CIDE-A cell death inducing DFFA like effector a protein-coding 175.5-169 chr8 125009882 125010127 + 1 NA intron (NM_003129, intron 6 of 10) MIRb|SINE|MIR 11499 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 184.25-84 chr3 178967745 178968136 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 103869 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 155.75-44 chr12 111905135 111905316 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 6162 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 256.5-27 chr17 76858031 76858460 + 1 NA intron (NR_135284, intron 1 of 1) MER4B|LTR|ERV1 2079 NR_135283 283994 Hs.645372 NR_135283 ENSG00000267535 LINC00868 C17orf52 long intergenic non-protein coding RNA 868 ncRNA 150.5-215 chr8 63840219 63840423 + 1 NA Intergenic Intergenic 70891 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 142.5-118 chr2 185175282 185175562 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -8350 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 163.5-141 chr4 43107590 43107806 + 1 NA Intergenic Intergenic 214432 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 146.5-159 chr4 160395723 160395915 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -618035 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 141.5-126 chr20 55133857 55134105 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -289062 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 239.5-56 chr4 110869651 110870016 + 1 NA Intergenic Intergenic -9186 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 320.25-9 chr12 123578396 123578795 + 1 NA Intergenic Intergenic 5732 NR_110049 101927415 Hs.636524 NR_110049 TMED2-DT - TMED2 divergent transcript ncRNA 115.75-21 chr10 88804850 88805068 + 1 NA intron (NM_001128215, intron 1 of 8) MER66C|LTR|ERV1 2229 NM_001128215 340654 Hs.55118 NM_001128215 ENSG00000173239 LIPM LIPL3|bA304I5.1 lipase family member M protein-coding 205.5-125 chr6 63015174 63015535 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 304623 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 126.5-99 chr18 37674087 37674402 + 1 NA Intergenic Intergenic 17109 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 220.5-27 chr14 59504969 59505382 + 1 NA 3' UTR (NM_001098625, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001098625, exon 7 of 7) 20658 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 179.5-180 chr8 76848017 76848286 + 1 NA intron (NM_024721, intron 6 of 10) intron (NM_024721, intron 6 of 10) 118699 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 136.25-122 chr3 80042383 80042658 + 1 NA Intergenic Intergenic -274522 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 167.25-123 chr5 17188159 17188366 + 1 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -28561 NM_001271606 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 189.25-134 chr9 13780555 13781092 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -147148 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 147.75-158 chr8 120300703 120301005 + 1 NA intron (NM_021110, intron 36 of 47) intron (NM_021110, intron 36 of 47) 144296 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 231.75-69 chr7 46067893 46068183 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -146766 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 182.5-147 chr6 129494007 129494294 + 1 NA intron (NM_000426, intron 58 of 64) intron (NM_000426, intron 58 of 64) 216027 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 259.75-60 chrX 50518197 50518698 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -47622 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 202.5-37 chr13 86475957 86476244 + 1 NA Intergenic Intergenic -435820 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 233.75-81 chr8 144979114 144979536 + 1 NA intron (NR_023392, intron 4 of 4) intron (NR_023392, intron 4 of 4) -15540 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 173.75-99 chr20 37831253 37831426 + 1 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -71788 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 163.75-108 chr5 120888640 120888890 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 357301 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 226.75-38 chr2 225077784 225078042 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -35445 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 233.75-33 chr17 69657378 69657655 + 1 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 63529 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 192.75-10 chr10 10597576 10597894 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 135185 NM_001326317 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 161.25-53 chr14 67983672 67983933 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 160210 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 195.5-152 chr7 85207565 85207806 + 1 NA Intergenic Intergenic -85754 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 114.25-41 chr12 76205432 76205615 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -54360 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 271.5-9 chr1 215474707 215475236 + 1 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -92333 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 260.5-4 chr10 67706178 67706558 + 1 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 -10173 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 187.25-31 chr14 81789107 81789618 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -46224 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 158.25-127 chr6 169379889 169380172 + 1 NA Intergenic Intergenic -125916 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 151.5-205 chr9 79410522 79410709 + 1 NA Intergenic Intergenic -161158 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 194.25-113 chr8 89387110 89387550 + 1 NA Intergenic Intergenic 370381 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 143.75-185 chr8 78943686 78944008 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 106318 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 121.5-5 chr1 52533018 52533157 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 20003 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 127.75-11 chr1 47613615 47614026 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -176503 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 238.25-59 chr4 109902906 109903325 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9768 NM_001178130 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 201.75-34 chr14 50484183 50484489 + 1 NA intron (NM_198794, intron 5 of 31) intron (NM_198794, intron 5 of 31) 48233 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 120.5-203 chr6 126831533 126831713 + 1 NA Intergenic Intergenic -287048 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 237.5-82 chr5 160764642 160764975 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) L1PB1|LINE|L1 -79417 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 161.5-100 chr2 105555521 105555775 + 1 NA Intergenic Intergenic 54911 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 149.5-158 chr5 126794479 126794758 + 1 NA intron (NR_134488, intron 1 of 11) intron (NR_134488, intron 1 of 11) 17482 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 113.75-210 chrX 49214189 49214483 + 1 NA intron (NM_001256790, intron 29 of 47) intron (NM_001256790, intron 29 of 47) -14134 NM_003179 6855 Hs.632804 NM_003179 ENSG00000102003 SYP MRX96|MRXSYP synaptophysin protein-coding 133.25-39 chr12 23165083 23165256 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -10467 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 200.75-97 chr7 24974900 24975275 + 1 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) 5091 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 247.75-9 chr13 90977354 90977757 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -50958 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 242.25-44 chr19 46294786 46295129 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2085 NM_152795 64344 Hs.420830 NM_022462 ENSG00000124440 HIF3A HIF-3A|HIF3-alpha-1|IPAS|MOP7|PASD7|bHLHe17 hypoxia inducible factor 3 subunit alpha protein-coding 297.5-30 chr2 161235847 161236343 + 1 NA 3' UTR (NM_004180, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_004180, exon 8 of 8) -8644 NR_110164 100996579 Hs.660929 NR_110163 ENSG00000227403 LINC01806 - long intergenic non-protein coding RNA 1806 ncRNA 350.75 chr14 76737714 76738305 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -23459 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 318.25-18 chr7 76323372 76323750 + 1 NA Intergenic Intergenic 20888 NM_001540 3315 Hs.520973 NM_001540 ENSG00000106211 HSPB1 CMT2F|HEL-S-102|HMN2B|HS.76067|HSP27|HSP28|Hsp25|SRP27 heat shock protein family B (small) member 1 protein-coding 165.75-15 chr10 51694608 51694898 + 1 NA TTS (NM_015235) TTS (NM_015235) 4842 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 173.5-72 chr2 105301771 105301982 + 1 NA intron (NM_001142621, intron 2 of 11) FAM|SINE|Alu 27780 NR_137328 9392 Hs.446350 NM_004257 ENSG00000135966 TGFBRAP1 TRAP-1|TRAP1|VPS3 transforming growth factor beta receptor associated protein 1 protein-coding 265.25-40 chr4 134722532 134723033 + 1 NA Intergenic Intergenic 298914 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 114.5-223 chr5 168951628 168951777 + 1 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) -61525 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 138.75-116 chr3 34739869 34740260 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 653959 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 297.5-34 chr22 28572588 28573144 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 106999 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 163.75-77 chr20 14010002 14010236 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) L1PA11|LINE|L1 14603 NM_001351661 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 282.5-62 chr8 42504039 42504520 + 1 NA intron (NM_006749, intron 1 of 10) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -3048 NM_001257180 6575 Hs.653173 NM_006749 ENSG00000168575 SLC20A2 GLVR-2|GLVR2|IBGC1|IBGC3|MLVAR|PIT-2|PIT2|RAM1|Ram-1 solute carrier family 20 member 2 protein-coding 196.5-146 chr6 125402341 125402563 + 1 NA Intergenic Intergenic -100485 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 189.5-121 chr6 100457022 100457320 + 1 NA intron (NM_005068, intron 1 of 10) intron (NM_005068, intron 1 of 10) 6504 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 212.5-17 chr11 28244252 28244491 + 1 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) intron (NM_001113528, intron 4 of 6) 135983 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 114.25-212 chrX 87067779 87067920 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -449953 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 299.25-40 chr5 64612454 64612814 + 1 NA TTS (NM_001029875) TTS (NM_001029875) 36984 NM_001271891 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 114.5-197 chr4 126394259 126394448 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 887094 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 152.25-23 chr10 73504269 73504535 + 1 NA intron (NR_132104, intron 4 of 4) intron (NR_132104, intron 4 of 4) -8378 NM_021132 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 270.5-36 chr22 28714946 28715372 + 1 NA intron (NM_001349956, intron 4 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 26661 NM_001257387 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 215.75-109 chrX 132652053 132652275 + 1 NA intron (NM_147175, intron 3 of 3) intron (NM_147175, intron 3 of 3) -15478 NR_046691 100874102 Hs.619341 NR_046691 ENSG00000235849 HS6ST2-AS1 - HS6ST2 antisense RNA 1 ncRNA 215.5-5 chr1 86945469 86945928 + 1 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) intron (NM_012262, intron 1 of 6) 31063 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 161.75-115 chr7 21878401 21878562 + 1 NA intron (NM_001277115, intron 74 of 81) intron (NM_001277115, intron 74 of 81) 67418 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 419.75-3 chr17 56438389 56439069 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 8 of 20) intron (NM_001370326, intron 8 of 20) -154970 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 178.25-57 chr18 63383866 63384138 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -16796 NM_002035 2531 Hs.74050 NM_002035 ENSG00000119537 KDSR DHSR|EKVP4|FVT1|SDR35C1 3-ketodihydrosphingosine reductase protein-coding 157.5-8 chr1 73114316 73114598 + 1 NA Intergenic Intergenic -191713 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 214.5-39 chr16 2844513 2844776 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -1893 NR_026864 124221 Hs.434388 NM_178453 ENSG00000172460 PRSS30P Disp|TMPRSS8|TMPRSS8P serine protease 30, pseudogene pseudo 247.75-16 chr14 58820530 58821099 + 1 NA Intergenic Intergenic -7474 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 121.5-87 chr15 65805317 65805457 + 1 NA Intergenic Intergenic -13094 NM_001144823 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 144.25-8 chr1 70458100 70458340 + 1 NA Intergenic Intergenic 46952 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 188.5-139 chr7 41161034 41161267 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 59546 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 148.75-176 chr9 14323737 14324047 + 1 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) -1505 NR_161383 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 204.5-17 chr11 21710138 21710426 + 1 NA Intergenic Intergenic -482803 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 197.5-49 chr16 27830876 27831154 + 1 NA intron (NM_001109763, intron 4 of 6) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 57142 NM_144675 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 167.5-142 chr5 45023286 45023477 + 1 NA Intergenic Intergenic 214434 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 140.75-36 chr12 25797714 25797974 + 1 NA Intergenic Intergenic 76235 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 223.75-41 chr19 3934038 3934409 + 1 NA intron (NM_170678, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu 1120 NM_001289117 27231 Hs.135458 NM_014446 ENSG00000077009 NMRK2 ITGB1BP3|MIBP|NRK2 nicotinamide riboside kinase 2 protein-coding 117.5-232 chr8 72977033 72977232 + 1 NA Intergenic Intergenic -31732 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 214.25-42 chr2 75624096 75624355 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -22558 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 251.75-5 chr1 116083161 116083675 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -28337 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 254.5-72 chr7 109108722 109109115 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -224331 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 189.25-124 chr8 104225737 104225977 + 1 NA intron (NM_001282882, intron 1 of 5) intron (NM_001282882, intron 1 of 5) 2522 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 196.25-16 chr10 119870366 119870656 + 1 NA intron (NM_001256379, intron 1 of 15) intron (NM_001256379, intron 1 of 15) 2372 NM_024834 79892 Hs.124246 NM_024834 ENSG00000197771 MCMBP C10orf119|MCM-BP minichromosome maintenance complex binding protein protein-coding 238.5-39 chr2 12409598 12410051 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 210694 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 137.75-162 chr5 26738085 26738377 + 1 NA Intergenic Intergenic 300355 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 232.5-110 chr9 98963686 98964005 + 1 NA intron (NM_001855, intron 2 of 41) L2a|LINE|L2 19938 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 153.5-157 chr5 53676934 53677135 + 1 NA intron (NR_134474, intron 5 of 5) intron (NR_134474, intron 5 of 5) 116395 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 159.5-139 chr3 4480211 4480516 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12800 NR_108075 100996539 Hs.190365 NR_108075 ITPR1-DT ITPR1-AS1 ITPR1 divergent transcript ncRNA 160.5-171 chr7 39970185 39970376 + 1 NA intron (NM_003718, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 19920 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 152.5-145 chr4 182569668 182569845 + 1 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 326354 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 242.5-44 chr2 61500493 61500857 + 1 NA intron (NM_003400, intron 6 of 24) AluSz|SINE|Alu -29588 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 138.25-174 chr8 136512135 136512337 + 1 NA Intergenic Intergenic -18562 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 305.5-33 chr5 56952967 56953370 + 1 NA Intergenic Intergenic -1038 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 230.75-68 chr7 81621028 81621368 + 1 NA intron (NR_126026, intron 2 of 8) L3|LINE|CR1 5018 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 393.75-8 chr4 55441024 55441647 + 1 NA intron (NM_004898, intron 21 of 22) L1PB3|LINE|L1 45378 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 195.5-68 chr2 48288856 48289347 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -25581 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 140.5-37 chr11 84212378 84212571 + 1 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 60806 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 157.75-40 chr13 114172470 114172699 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -39961 NM_007368 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 123.75-155 chr6 44226086 44226283 + 1 NA intron (NM_001078175, intron 2 of 13) intron (NM_001078175, intron 2 of 13) 2589 NM_001078175 2030 Hs.25450 NM_004955 ENSG00000112759 SLC29A1 ENT1 solute carrier family 29 member 1 (Augustine blood group) protein-coding 180.75-78 chr20 32054018 32054329 + 1 NA intron (NM_001172131, intron 1 of 12) L1ME3Cz|LINE|L1 1931 NM_002110 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 171.5-63 chr18 2515353 2515682 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 55988 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 157.25-150 chr8 86666346 86666519 + 1 NA intron (NM_019098, intron 6 of 17) MIRb|SINE|MIR 77243 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 197.75-17 chr12 55822961 55823314 + 1 NA exon (NM_032364, exon 4 of 7) exon (NM_032364, exon 4 of 7) 5096 NM_014182 29095 Hs.534450 NM_014182 ENSG00000123353 ORMDL2 HSPC160|MST095|MSTP095|adoplin-2 ORMDL sphingolipid biosynthesis regulator 2 protein-coding 254.5-79 chr8 87839484 87839810 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 34368 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 113.5-202 chr5 121018346 121018550 + 1 NA Intergenic Intergenic -304102 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 135.25-105 chr2 143399153 143399513 + 1 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 269914 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 201.5-126 chr8 82594878 82595445 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -316943 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 253.5-68 chr6 91562870 91563234 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 41392 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 119.5-230 chr8 58433827 58434079 + 1 NA intron (NM_001077619, intron 4 of 7) intron (NM_001077619, intron 4 of 7) 22592 NM_001077619 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 238.75-62 chr8 76021712 76022248 + 1 NA Intergenic Intergenic -384674 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 154.25-12 chr1 187115759 187116012 + 1 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) 23043 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 162.5-131 chr4 74805442 74805725 + 1 NA Intergenic Intergenic -11060 NM_001316963 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 139.5-78 chr16 77466257 77466535 + 1 NA Intergenic Intergenic -31362 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 153.25-141 chr8 123019232 123019523 + 1 NA intron (NM_024295, intron 6 of 7) intron (NM_024295, intron 6 of 7) 6395 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 169.25-86 chr4 78546186 78546552 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -5401 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 174.75-74 chr3 4083345 4083541 + 1 NA Intergenic Intergenic -219861 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 290.25-20 chr20 56934234 56934880 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -279139 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 190.5-34 chr12 31919010 31919346 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -31975 NR_135029 105369723 Hs.736954 NR_135029 ENSG00000255760 LINC02422 - long intergenic non-protein coding RNA 2422 ncRNA 169.75-57 chr16 53863405 53863691 + 1 NA intron (NR_156761, intron 3 of 4) intron (NR_156761, intron 3 of 4) 159392 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 180.25-43 chr18 6210479 6210844 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 12 of 16) intron (NM_001365769, intron 12 of 16) -46083 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 147.75-38 chr14 68897095 68897261 + 1 NA intron (NM_001102, intron 8 of 20) AluSx|SINE|Alu 82124 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 147.5-157 chr4 31611000 31611355 + 1 NA Intergenic Intergenic 104633 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 270.5-69 chr9 30038688 30039084 + 1 NA Intergenic Intergenic 369568 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 207.75-45 chr18 30613802 30614214 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 315098 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 255.5-35 chr18 2519441 2519938 + 1 NA Intergenic Intergenic 51816 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 238.5-28 chr15 33777163 33777466 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 64 of 102) intron (NM_001243996, intron 64 of 102) -191183 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 200.5-15 chr10 44549960 44550197 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -164981 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 136.25-133 chr4 119122667 119122858 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13022 NM_016599 51778 Hs.732122 NM_016599 ENSG00000172399 MYOZ2 C4orf5|CMH16|CS-1|FATZ-2 myozenin 2 protein-coding 177.5-19 chr10 115726469 115726698 + 1 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 468206 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 212.75-40 chr16 6824717 6824948 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 51023 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 130.25-37 chr11 8342715 8343019 + 1 NA Intergenic Intergenic -74080 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 163.5-19 chr10 33353124 33353309 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -18311 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 230.75-28 chr17 61950882 61951148 + 1 NA intron (NM_005121, intron 27 of 29) intron (NM_005121, intron 27 of 29) -23033 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 147.5-102 chr2 98275037 98275255 + 1 NA intron (NM_001345864, intron 16 of 21) L2a|LINE|L2 -71009 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 165.75-82 chr2 75903863 75904277 + 1 NA Intergenic Intergenic -193155 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 242.5-14 chr10 25344527 25344896 + 1 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -168435 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 257.5-32 chr2 36449436 36449896 + 1 NA intron (NM_016441, intron 4 of 16) L3|LINE|CR1 93888 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 191.5-48 chr15 75949611 75949960 + 1 NA intron (NM_138573, intron 5 of 5) L1MB7|LINE|L1 45907 NR_037623 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 134.75-25 chr10 37931129 37931322 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 44755 NR_138069 219749 Hs.499429 NM_145011 ENSG00000175395 ZNF25 KOX19|Zfp9 zinc finger protein 25 protein-coding 307.75-3 chr14 24844520 24845190 + 1 NA intron (NM_001351943, intron 5 of 6) intron (NM_001351943, intron 5 of 6) 204145 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 135.25-63 chr14 54416034 54416215 + 1 NA intron (NM_001330173, intron 6 of 8) intron (NM_001330173, intron 6 of 8) 19117 NM_005192 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 304.75-2 chr1 208846769 208847341 + 1 NA Intergenic Intergenic 118367 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 157.5-11 chr1 101265014 101265291 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 28403 NM_001400 1901 Hs.154210 NM_001400 ENSG00000170989 S1PR1 CD363|CHEDG1|D1S3362|ECGF1|EDG-1|EDG1|S1P1 sphingosine-1-phosphate receptor 1 protein-coding 211.75-20 chr13 31369994 31370250 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 170147 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 144.5-87 chr17 81562651 81562928 + 1 NA intron (NM_001369698, intron 16 of 16) AluJb|SINE|Alu 3813 NR_130140 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 211.5-150 chr8 13172273 13172579 + 1 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) intron (NM_001348082, intron 5 of 16) -39137 NM_001348084 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 163.25-53 chr17 59248333 59248530 + 1 NA intron (NM_182569, intron 3 of 9) (TAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 27920 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 145.5-62 chr14 49002382 49002554 + 1 NA Intergenic Intergenic 583912 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 170.5-85 chr2 15284703 15285001 + 1 NA intron (NR_052013, intron 42 of 50) intron (NR_052013, intron 42 of 50) 276482 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 149.5-220 chr9 86013425 86013614 + 1 NA intron (NM_024635, intron 16 of 22) intron (NM_024635, intron 16 of 22) 71990 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 136.75-149 chr4 169894248 169894503 + 1 NA Intergenic Intergenic 81527 NR_037878 100506085 Hs.649173 NR_037878 ENSG00000248319 LINC02275 - long intergenic non-protein coding RNA 2275 ncRNA 197.75-73 chr5 151629860 151630273 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46879 NR_109873 101927096 Hs.571023 NR_109873 ENSG00000249035 CLMAT3 CTB-113P19.1|SPARC-AS1 colorectal liver metastasis associated transcript 3 ncRNA 391.75-5 chr4 47663582 47664304 + 1 NA intron (NM_006587, intron 11 of 21) intron (NM_006587, intron 11 of 21) 11274 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 280.25-15 chr12 13162703 13163340 + 1 NA Intergenic Intergenic -33705 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 182.5-142 chr6 99616051 99616448 + 1 NA TTS (NM_021620) TTS (NM_021620) 9475 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 278.5-48 chr6 82775811 82776272 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 289800 NM_001350603 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 168.25-64 chr2 578562 578841 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 20500 NR_136168 105373352 NR_136168 LOC105373352 - uncharacterized LOC105373352 ncRNA 207.25-85 chr6 109128688 109129024 + 1 NA promoter-TSS (NM_173830) promoter-TSS (NM_173830) -448 NM_173830 285753 Hs.632616 NM_173830 ENSG00000183137 CEP57L1 C6orf182|bA487F23.2|cep57R centrosomal protein 57 like 1 protein-coding 132.75-41 chr11 106557359 106557506 + 1 NA Intergenic Intergenic 306025 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 206.25-61 chr22 24772278 24772574 + 1 NA intron (NR_045648, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR 2294 NR_045648 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 131.5-211 chr7 7787204 7787411 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -68700 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 255.75-15 chr15 92933315 92933778 + 1 NA intron (NM_001042572, intron 5 of 12) intron (NM_001042572, intron 5 of 12) 29147 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 295.5-8 chr10 104106071 104106510 + 1 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -15768 NM_145247 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 305.5-3 chr1 173136447 173137013 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 68802 NM_001297562 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 168.75-65 chr17 63165776 63166102 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 199704 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 207.25-71 chr5 42401525 42402102 + 1 NA Intergenic Intergenic -21626 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 215.75-13 chr10 56495462 56495701 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -134308 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 195.75-38 chr12 122898748 122899144 + 1 NA Intergenic Intergenic -2822 NM_024667 79720 Hs.507162 NM_024667 ENSG00000139722 VPS37B - VPS37B subunit of ESCRT-I protein-coding 308.5-23 chr3 88065169 88065534 + 1 NA intron (NM_001366093, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 6096 NM_001350135 55279 Hs.591650 NM_018293 ENSG00000175105 ZNF654 - zinc finger protein 654 protein-coding 121.5-253 chr8 126255073 126255294 + 1 NA Intergenic Intergenic -70312 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 163.5-189 chr7 36418524 36418813 + 1 NA intron (NM_018685, intron 9 of 23) intron (NM_018685, intron 9 of 23) -28311 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 191.5-128 chr6 50520849 50521101 + 1 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -192569 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 118.5-166 chr5 82822414 82822627 + 1 NA Intergenic Intergenic -17635 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 282.25-4 chr1 238247273 238247801 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 238480 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 126.5-69 chr14 62901232 62901386 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) L1PA16|LINE|L1 144149 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 117.25-18 chr1 198812659 198812867 + 1 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 46219 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 253.5-38 chr2 49854083 49854575 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 119874 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 213.5-3 chr1 46785039 46785448 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -13803 NR_135003 1580 Hs.436317 NM_000779 ENSG00000142973 CYP4B1 CYPIVB1|P-450HP cytochrome P450 family 4 subfamily B member 1 protein-coding 219.5-144 chrX 144785693 144786067 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -461623 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 151.25-70 chr18 1124957 1125255 + 1 NA Intergenic Intergenic -197113 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 176.5-20 chr10 62191160 62191372 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 77578 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 183.75-119 chr7 84138787 84139170 + 1 NA intron (NM_006080, intron 1 of 16) intron (NM_006080, intron 1 of 16) 55811 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 243.75-25 chr14 98221194 98221474 + 1 NA Intergenic Intergenic -243210 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 116.5-80 chr15 85917537 85917834 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 92050 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 143.5-83 chr16 26659919 26660080 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -406928 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 351.5-22 chr3 47895332 47895846 + 1 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 46034 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 210.5-36 chr14 45522670 45522937 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 192799 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 130.5-43 chr10 68188764 68188950 + 1 NA intron (NR_045662, intron 12 of 19) intron (NR_045662, intron 12 of 19) 43256 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 135.75-2 chr1 18811356 18811520 + 1 NA Intergenic Intergenic 48223 NM_152232 80834 Hs.553548 NM_152232 ENSG00000179002 TAS1R2 GPR71|T1R2|TR2 taste 1 receptor member 2 protein-coding 194.75-19 chr11 114216143 114216339 + 1 NA intron (NM_006006, intron 4 of 6) intron (NM_006006, intron 4 of 6) -79572 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 272.75-4 chr10 63556097 63556516 + 1 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu -34416 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 163.5-200 chr8 38550296 38550533 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -21752 NM_001369355 389649 Hs.546586 NM_207412 ENSG00000196166 C8orf86 - chromosome 8 open reading frame 86 protein-coding 181.75-138 chr9 13658721 13658944 + 1 NA Intergenic Intergenic -227503 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 228.75-18 chr14 50825068 50825313 + 1 NA intron (NM_016350, intron 2 of 28) intron (NM_016350, intron 2 of 28) 3393 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 168.5-162 chr6 154039795 154040025 + 1 NA intron (NM_001285522, intron 1 of 1) intron (NM_001285522, intron 1 of 1) 499 NM_001008505 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 149.25-107 chr22 34500696 34501021 + 1 NA Intergenic Intergenic 497058 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 159.25-114 chr5 21212976 21213204 + 1 NA Intergenic Intergenic -246390 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 193.75-8 chr1 114501935 114502208 + 1 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) intron (NM_015906, intron 1 of 19) 9132 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 155.75-98 chr22 27515793 27516150 + 1 NA Intergenic Intergenic 205320 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 151.25-38 chr12 23158394 23158573 + 1 NA Intergenic Intergenic -17153 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 196.5-35 chr11 99597528 99597850 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 41544 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 128.5-160 chr4 63793073 63793266 + 1 NA Intergenic Intergenic 616281 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 206.25-73 chr4 30347965 30348307 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -372233 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 131.75-102 chr19 37160702 37160856 + 1 NA intron (NM_001288800, intron 2 of 4) L1MD|LINE|L1 11657 NM_199126 199704 Hs.659236 NM_152655 ENSG00000196967 ZNF585A - zinc finger protein 585A protein-coding 237.25-40 chr18 79878560 79878879 + 1 NA intron (NM_012283, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 15051 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 247.75-28 chr18 38947551 38948004 + 1 NA Intergenic Intergenic 674398 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 214.5-4 chr1 112136053 112136552 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 145766 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 147.5-150 chr3 170070821 170071036 + 1 NA intron (NM_014373, intron 2 of 3) L1ME2|LINE|L1 32933 NM_014373 26996 Hs.231320 NM_014373 ENSG00000173890 GPR160 GPCR1|GPCR150 G protein-coupled receptor 160 protein-coding 223.25-71 chr7 99477927 99478343 + 1 NA intron (NM_001351002, intron 2 of 5) MER6B|DNA|TcMar-Tigger 5243 NM_001351000 285989 Hs.440384 NM_213603 ENSG00000198556 ZNF789 - zinc finger protein 789 protein-coding 219.75-34 chr2 39505759 39506314 + 1 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 68620 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 163.5-87 chr2 38610673 38610899 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -7750 NM_001142650 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 276.5-34 chr2 115166410 115166845 + 1 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 4472 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 236.5-44 chr2 26974885 26975340 + 1 NA intron (NM_012326, intron 1 of 6) intron (NM_012326, intron 1 of 6) 4475 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 151.5-55 chr14 91403085 91403377 + 1 NA intron (NM_001080414, intron 3 of 29) intron (NM_001080414, intron 3 of 29) 14589 NM_001080414 440193 Hs.525536 NM_001080414 ENSG00000015133 CCDC88C DAPLE|HKRP2|HYC1|KIAA1509|SCA40 coiled-coil domain containing 88C protein-coding 321.75-32 chr8 85898874 85899208 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -71099 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 144.25-177 chr6 157293958 157294109 + 1 NA intron (NM_018452, intron 3 of 3) intron (NM_018452, intron 3 of 3) 30226 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 142.5-22 chr1 234777499 234777710 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -17548 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 213.75-70 chr3 193398198 193398515 + 1 NA TTS (NM_032279) TTS (NM_032279) -19603 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 170.5-137 chr4 174436221 174436422 + 1 NA Intergenic Intergenic 12526 NR_036236 100423042 NR_036236 ENSG00000265846 MIR4276 - microRNA 4276 ncRNA 256.5-59 chr5 40713876 40714165 + 1 NA 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 34105 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 184.75-108 chr8 116491640 116491861 + 1 NA Intergenic Intergenic -160350 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 158.5-71 chr15 58526100 58526281 + 1 NA intron (NM_000236, intron 1 of 8) intron (NM_000236, intron 1 of 8) -27455 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 231.5-76 chr4 128857346 128857743 + 1 NA intron (NM_001287442, intron 8 of 10) intron (NM_001287442, intron 8 of 10) 45700 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 193.5-97 chr20 49145970 49146191 + 1 NA intron (NM_004602, intron 5 of 13) AluSz|SINE|Alu 42290 NM_017452 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 179.5-200 chr9 134532486 134532762 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -109181 NM_000093 1289 Hs.210283 NM_000093 ENSG00000130635 COL5A1 EDSC|EDSCL1 collagen type V alpha 1 chain protein-coding 194.5-133 chr6 141315262 141315842 + 1 NA Intergenic Intergenic 631738 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 151.75-155 chr8 116011282 116011596 + 1 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 313620 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 129.25-221 chrX 45191221 45191391 + 1 NA intron (NM_024689, intron 2 of 2) intron (NM_024689, intron 2 of 2) 9570 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 288.5 chr1 44472538 44473025 + 1 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 48780 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 267.25-7 chr10 62142742 62143070 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 93549 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 267.25-21 chr2 182850504 182850913 + 1 NA intron (NM_001463, intron 2 of 5) L1MA4|LINE|L1 15929 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 121.5-175 chr3 54262365 54262606 + 1 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 139933 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 119.5-8 chr1 63390235 63390446 + 1 NA intron (NM_013339, intron 2 of 14) L1MA3|LINE|L1 22713 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 304.5-5 chr10 65295860 65296175 + 1 NA Intergenic Intergenic -275408 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 156.5-80 chr2 60817793 60817967 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 61612 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 255.5-9 chr1 184358232 184358520 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -28653 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 230.25-66 chr4 162871907 162872285 + 1 NA Intergenic Intergenic 221532 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 231.75-66 chr6 158468703 158469145 + 1 NA intron (NM_020245, intron 6 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -67512 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 300.25-27 chr8 88989250 88989676 + 1 NA Intergenic Intergenic -661980 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 214.75-87 chr8 105619018 105619315 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 299623 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 208.5-116 chr6 1666307 1666572 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 9 of 10) intron (NM_001253846, intron 9 of 10) 56524 NM_001453 2296 Hs.348883 NM_001453 ENSG00000054598 FOXC1 ARA|ASGD3|FKHL7|FREAC-3|FREAC3|IGDA|IHG1|IRID1|RIEG3 forkhead box C1 protein-coding 185.25-19 chr12 40232583 40232976 + 1 NA intron (NM_198578, intron 3 of 50) intron (NM_198578, intron 3 of 50) 7782 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 330.75-21 chr6 149661636 149662412 + 1 NA non-coding (NR_073033, exon 9 of 9) non-coding (NR_073033, exon 9 of 9) -13220 NM_001204076 11104 Hs.450175 NM_007044 ENSG00000186625 KATNA1 - katanin catalytic subunit A1 protein-coding 190.5-9 chr1 224521824 224522180 + 1 NA intron (NM_001322304, intron 2 of 6) MLT1K-int|LTR|ERVL-MaLR 87153 NM_001322304 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 136.25-78 chr17 42800770 42801019 + 1 NA intron (NM_173478, intron 1 of 6) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2033 NM_001330222 124817 Hs.12272 NM_173478 ENSG00000176563 CNTD1 CNTD|COSA1 cyclin N-terminal domain containing 1 protein-coding 150.5-94 chr2 102459291 102459477 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13842 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 167.5-18 chr1 235893477 235893740 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -9895 NR_102436 1130 Hs.532411 NM_000081 ENSG00000143669 LYST CHS|CHS1 lysosomal trafficking regulator protein-coding 147.75-74 chr2 133241133 133241382 + 1 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -24938 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 194.5-141 chr7 42261608 42261858 + 1 NA Intergenic Intergenic -24524 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 126.5-16 chr1 188943719 188943939 + 1 NA Intergenic Intergenic 1500201 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 180.5-54 chr16 34594862 34595091 + 1 NA Intergenic Intergenic -213496 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 142.25-51 chr13 108908135 108908600 + 1 NA intron (NM_015011, intron 15 of 34) intron (NM_015011, intron 15 of 34) 258936 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 224.25-47 chr2 186505035 186505331 + 1 NA intron (NM_018471, intron 6 of 9) intron (NM_018471, intron 6 of 9) 18923 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 146.75-30 chr11 114220131 114220367 + 1 NA intron (NM_006006, intron 4 of 6) intron (NM_006006, intron 4 of 6) -75564 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 157.5-178 chr6 82347650 82347817 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15473 NM_006670 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 193.25-98 chr5 174835337 174835560 + 1 NA Intergenic Intergenic 83714 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 270.25-26 chr18 3312413 3313061 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 37822 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 156.25-28 chr11 58737612 58737885 + 1 NA Intergenic Intergenic -5774 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 128.5-94 chr18 55151143 55151372 + 1 NA Intergenic Intergenic -26951 NR_110743 101927229 Hs.638474 NR_110743 ENSG00000267013 LINC01929 - long intergenic non-protein coding RNA 1929 ncRNA 132.5-188 chr4 162504477 162504663 + 1 NA Intergenic Intergenic -340536 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 124.5-19 chr1 217234180 217234378 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -96577 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 225.75-19 chr11 99716709 99717041 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 160730 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 223.5-91 chr4 149195481 149195766 + 1 NA intron (NR_125887, intron 2 of 12) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 41328 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 224.75-40 chr2 81545039 81545571 + 1 NA Intergenic Intergenic -78359 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 134.5-18 chr1 228961453 228961681 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 213234 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 221.5-69 chr4 37993398 37993644 + 1 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) 33123 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 324.5-4 chr10 53556182 53556771 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -784776 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 127.75-131 chr3 117262337 117262633 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 341054 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 215.5-56 chr2 207595044 207595356 + 1 NA intron (NM_001330133, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 29788 NM_145280 151194 Hs.664764 NM_145280 ENSG00000144401 METTL21A FAM119A|HCA557b|HSPA-KMT methyltransferase like 21A protein-coding 116.25-146 chr3 126272723 126272846 + 1 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 84624 NM_014079 28999 Hs.272215 NM_014079 ENSG00000163884 KLF15 KKLF Kruppel like factor 15 protein-coding 185.25-39 chr15 77686667 77686918 + 1 NA intron (NM_001301194, intron 2 of 3) intron (NM_001301194, intron 2 of 3) 9356 NM_001301200 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 184.5-157 chr8 106735060 106735512 + 1 NA intron (NM_001198535, intron 1 of 5) intron (NM_001198535, intron 1 of 5) 9179 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 256.25-28 chr3 96381786 96382266 + 1 NA Intergenic Intergenic 22062 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 176.5-91 chr2 76329894 76330149 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -619106 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 172.5-50 chr12 44497928 44498197 + 1 NA Intergenic Intergenic 377599 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 254.5-36 chr18 76909826 76910209 + 1 NA intron (NM_001306089, intron 14 of 30) intron (NM_001306089, intron 14 of 30) 85857 NM_007345 7776 Hs.719137 NM_007345 ENSG00000130856 ZNF236 ZNF236A|ZNF236B zinc finger protein 236 protein-coding 115.5-117 chr2 50309225 50309446 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 38419 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 112.5-163 chr22 50094783 50095019 + 1 NA intron (NM_018995, intron 2 of 26) MER3|DNA|hAT-Charlie 4645 NM_001164105 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 249.5-60 chr22 28339990 28340414 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MIR3|SINE|MIR -119667 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 195.5-77 chr2 144867119 144867420 + 1 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu 199302 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 259.75-35 chr3 59963297 59963639 + 1 NA intron (NM_001320901, intron 5 of 6) (GA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 117441 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 159.5-189 chr7 4023050 4023452 + 1 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) intron (NM_152744, intron 17 of 44) -106434 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 145.5-153 chr4 177567300 177567470 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -124882 NR_033655 175 Hs.207776 NM_000027 ENSG00000038002 AGA AGU|ASRG|GA aspartylglucosaminidase protein-coding 143.25-68 chr17 46961260 46961641 + 1 NA intron (NM_001321133, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu -11567 NR_049812 100847067 NR_049812 ENSG00000264999 MIR5089 - microRNA 5089 ncRNA 246.5-35 chr18 39330752 39331169 + 1 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) intron (NR_024391, intron 3 of 3) 291215 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 137.75-185 chr6 162202189 162202355 + 1 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) intron (NM_004562, intron 3 of 11) -524860 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 182.5-71 chr18 22266364 22266663 + 1 NA Intergenic Intergenic 97076 NM_005257 2627 Hs.514746 NM_005257 ENSG00000141448 GATA6 - GATA binding protein 6 protein-coding 157.75-2 chr1 72973481 72973707 + 1 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -332576 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 195.25-93 chr8 80684138 80684346 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 4 of 8) intron (NM_001033723, intron 4 of 8) 190226 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 140.5-152 chr3 82386253 82386523 + 1 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 400246 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 210.75-22 chr13 92504901 92505288 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) (TTAACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 14931 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 182.75-129 chr7 131265480 131265815 + 1 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 62132 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 161.5-122 chr21 30318906 30319147 + 1 NA TTS (NM_203405) TTS (NM_203405) 1289 NM_203405 388818 Hs.28704 NM_203405 ENSG00000197683 KRTAP26-1 - keratin associated protein 26-1 protein-coding 156.75-113 chr3 99813123 99813279 + 1 NA Intergenic Intergenic -4661 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 223.5-30 chr11 133427277 133427535 + 1 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) 105095 NM_001012393 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 512.5-4 chr8 120345864 120346864 + 1 NA intron (NM_021110, intron 45 of 47) intron (NM_021110, intron 45 of 47) 98786 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 176.75-102 chr5 128441986 128442291 + 1 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) intron (NM_001999, intron 7 of 64) 96107 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 167.5-183 chr8 90939683 90939974 + 1 NA intron (NM_022351, intron 9 of 12) intron (NM_022351, intron 9 of 12) 45249 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 196.5-150 chr7 2401367 2401750 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2053 NM_018641 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 144.5-103 chr2 44277290 44277465 + 1 NA intron (NM_000341, intron 1 of 9) AluSp|SINE|Alu 1897 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 488.5-2 chr2 238235536 238236073 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 4118 NR_026923 643387 Hs.598359 NR_026923 LOC643387 - TAR DNA binding protein pseudogene pseudo 221.5-95 chr7 99303156 99303397 + 1 NA Intergenic Intergenic -22597 NM_001190996 10552 Hs.124126 NM_006409 ENSG00000241685 ARPC1A Arc40|HEL-68|HEL-S-307|SOP2Hs|SOP2L actin related protein 2/3 complex subunit 1A protein-coding 214.75-71 chr6 55260109 55260470 + 1 NA intron (NM_001526, intron 4 of 7) intron (NM_001526, intron 4 of 7) -67180 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 240.75-72 chr7 104888545 104889048 + 1 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) 37849 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 328.75-21 chr8 105222948 105223305 + 1 NA Intergenic Intergenic -95312 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 197.5-171 chr9 37326048 37326377 + 1 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -96484 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 228.75-19 chr14 64623055 64623480 + 1 NA Intergenic Intergenic 73306 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 323.5-9 chr13 78302380 78303014 + 1 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) 247842 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 259.5-72 chr3 164909049 164909546 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -77817 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 258.25-57 chr7 91329668 91330037 + 1 NA Intergenic Intergenic 65419 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 121.25-192 chr8 28239901 28240123 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -77256 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 157.25-61 chr18 13038002 13038233 + 1 NA intron (NM_032142, intron 12 of 44) FLAM_C|SINE|Alu 46755 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 142.5-2 chr1 16414155 16414378 + 1 NA intron (NM_001353349, intron 2 of 10) AluSz6|SINE|Alu 23158 NR_148413 374955 Hs.705501 NM_198546 ENSG00000187144 SPATA21 spergen-2|spergen2 spermatogenesis associated 21 protein-coding 121.5-108 chr17 60283887 60284031 + 1 NA intron (NM_032582, intron 5 of 33) L2c|LINE|L2 -52314 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 298.25-22 chr3 89126832 89127376 + 1 NA intron (NM_182644, intron 1 of 6) intron (NM_182644, intron 1 of 6) 19483 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 146.25-160 chr8 137453847 137454074 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40372 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 266.5-24 chr16 2258329 2258747 + 1 NA intron (NM_006711, intron 6 of 7) AluSx1|SINE|Alu -6951 NM_001919 1632 Hs.403436 NM_001919 ENSG00000167969 ECI1 DCI enoyl-CoA delta isomerase 1 protein-coding 221.75-24 chr14 69397208 69397508 + 1 NA intron (NM_004450, intron 1 of 3) intron (NM_004450, intron 1 of 3) 941 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 175.25-38 chr12 42006484 42006821 + 1 NA Intergenic Intergenic 138222 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 168.5 chr1 10328586 10328843 + 1 NA intron (NM_001365951, intron 27 of 48) intron (NM_001365951, intron 27 of 48) 29748 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 232.25-84 chr8 127788573 127789057 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5718 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 275.5-58 chr6 139743982 139744415 + 1 NA Intergenic Intergenic -26875 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 178.5-156 chr6 56889591 56889824 + 1 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -37791 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 230.5-46 chr16 58990929 58991334 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -256815 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 141.25-125 chr4 116291863 116292071 + 1 NA Intergenic Intergenic -7758 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 150.25-2 chr1 36120967 36121250 + 1 NA intron (NM_005202, intron 1 of 3) intron (NM_005202, intron 1 of 3) 4114 NM_005202 1296 Hs.353001 NM_005202 ENSG00000171812 COL8A2 FECD|FECD1|PPCD|PPCD2 collagen type VIII alpha 2 chain protein-coding 266.5-54 chr4 91136048 91136385 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 901185 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 203.25-87 chr5 124120556 124120870 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1PA16|LINE|L1 317807 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 213.75-21 chr11 79460174 79460602 + 1 NA Intergenic Intergenic -19358 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 201.75-69 chr4 174551272 174551715 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -28595 NM_001256307 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 133.5-122 chr2 113723208 113723376 + 1 NA intron (NM_001330315, intron 13 of 16) intron (NM_001330315, intron 13 of 16) -1924 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 178.5-81 chr2 72396866 72397141 + 1 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -249141 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 126.5-200 chr5 152220182 152220364 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 185006 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 237.75-83 chr9 5510955 5511357 + 1 NA intron (NM_025239, intron 1 of 6) intron (NM_025239, intron 1 of 6) 625 NM_025239 80380 Hs.532279 NM_025239 ENSG00000197646 PDCD1LG2 B7DC|Btdc|CD273|PD-L2|PDCD1L2|PDL2|bA574F11.2 programmed cell death 1 ligand 2 protein-coding 281.75-36 chr6 50267595 50268004 + 1 NA Intergenic Intergenic -217870 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 369.5-10 chr16 12346766 12347245 + 1 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) 370271 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 167.5-89 chr2 63168206 63168546 + 1 NA intron (NR_148704, intron 16 of 18) L1MC4|LINE|L1 -48834 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 156.75-161 chr8 26521752 26521985 + 1 NA intron (NM_001197293, intron 1 of 13) L1MB5|LINE|L1 7837 NM_001197293 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 138.5-3 chr1 37237878 37238179 + 1 NA Intergenic Intergenic 76465 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 194.25-115 chr8 99582067 99582410 + 1 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) HAL1|LINE|L1 -45377 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 114.25-165 chr6 46077804 46077998 + 1 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) 2447 NM_001114086 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 152.25-149 chr7 108648574 108648759 + 1 NA Intergenic Intergenic 78792 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 152.5-12 chr10 13341601 13341882 + 1 NA intron (NM_001195602, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 6552 NM_001195604 22929 Hs.124027 NM_012247 ENSG00000086475 SEPHS1 SELD|SPS|SPS1 selenophosphate synthetase 1 protein-coding 248.75-19 chr13 91567109 91567544 + 1 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 168705 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 161.25-180 chr9 35545921 35546203 + 1 NA intron (NM_001135999, intron 1 of 11) intron (NM_001135999, intron 1 of 11) 7430 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 234.75-21 chr14 64934488 64935021 + 1 NA 3' UTR (NM_145165, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_145165, exon 4 of 4) 7991 NR_046321 2877 Hs.2704 NM_002083 ENSG00000176153 GPX2 GI-GPx|GPRP|GPRP-2|GPx-2|GPx-GI|GSHPX-GI|GSHPx-2 glutathione peroxidase 2 protein-coding 164.5-7 chr1 58839816 58840006 + 1 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 54760 NR_034014 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 115.5-4 chr1 68901478 68901652 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -154333 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 158.5-16 chr10 10606031 10606294 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 143612 NM_001326317 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 309.5-39 chr6 120454688 120455074 + 1 NA Intergenic Intergenic 439702 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 126.5-62 chr14 54287764 54287933 + 1 NA Intergenic Intergenic -109020 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 137.75-124 chr22 27223098 27223297 + 1 NA intron (NM_001350812, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 1482 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 112.25-191 chr6 141013890 141014153 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 330207 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 218.5-72 chr3 4093853 4094163 + 1 NA Intergenic Intergenic -209296 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 113.75-80 chr17 60250284 60250553 + 1 NA intron (NM_032582, intron 11 of 33) intron (NM_032582, intron 11 of 33) -18773 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 192.75-11 chr10 18106250 18106520 + 1 NA Intergenic Intergenic -34039 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 190.5-71 chr19 20626503 20626811 + 1 NA intron (NM_001076675, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 34914 NM_001076675 199777 Hs.657001 NM_145297 ENSG00000188171 ZNF626 - zinc finger protein 626 protein-coding 197.25-17 chr11 77591961 77592327 + 1 NA intron (NM_001363477, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 2191 NM_173039 282679 Hs.503345 NM_173039 ENSG00000178301 AQP11 AQPX1 aquaporin 11 protein-coding 227.25-20 chr11 106458693 106458977 + 1 NA Intergenic Intergenic 207428 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 189.5-133 chr7 53465847 53466215 + 1 NA Intergenic Intergenic 345900 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 115.5-76 chr15 62971177 62971431 + 1 NA Intergenic Intergenic -71443 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 191.75-94 chr4 128552142 128552360 + 1 NA Intergenic Intergenic 124235 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 253.75-3 chr11 97015736 97016192 + 1 NA Intergenic Intergenic 507539 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 285.25-25 chr4 111784683 111785154 + 1 NA Intergenic Intergenic -360536 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 187.5-99 chr2 229463072 229463414 + 1 NA intron (NM_139072, intron 7 of 12) L2b|LINE|L2 -191956 NM_001100818 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 196.5-53 chr14 87401475 87401744 + 1 NA Intergenic Intergenic 253685 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 219.25-8 chr1 230020249 230020563 + 1 NA Intergenic Intergenic 17689 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 165.25-15 chr10 44824100 44824366 + 1 NA intron (NR_033842, intron 6 of 7) MIR|SINE|MIR -87083 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 298.5-13 chr2 45552173 45552518 + 1 NA intron (NM_018079, intron 11 of 20) intron (NM_018079, intron 11 of 20) 58922 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 187.75-45 chr2 16252514 16252823 + 1 NA Intergenic Intergenic 202241 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 184.5-63 chr18 10503244 10503571 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -22620 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 115.5-110 chr19 51853956 51854079 + 1 NA TTS (NM_001370457) TTS (NM_001370457) 33919 NM_001135590 84765 Hs.723015 NM_032679 ENSG00000161551 ZNF577 - zinc finger protein 577 protein-coding 179.75-51 chr19 35701135 35701492 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3245 NM_001316903 27033 Hs.99430 NM_014383 ENSG00000011590 ZBTB32 FAXF|FAZF|Rog|TZFP|ZNF538 zinc finger and BTB domain containing 32 protein-coding 133.5-52 chr11 41001979 41002177 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 457558 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 189.75-94 chr5 161317828 161318132 + 1 NA intron (NM_000813, intron 9 of 9) intron (NM_000813, intron 9 of 9) 230144 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 114.75-19 chr1 212004486 212004689 + 1 NA intron (NM_015434, intron 7 of 19) L1MEd|LINE|L1 -30966 NM_001286229 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 206.25-38 chr14 60680928 60681185 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -31579 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 122.5-234 chr9 95117255 95117434 + 1 NA exon (NM_000136, exon 11 of 15) exon (NM_000136, exon 11 of 15) -31250 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 175.5-188 chrX 73902920 73903113 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -41308 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 133.25-112 chr2 186615485 186615723 + 1 NA intron (NM_001145000, intron 2 of 27) L1MB7|LINE|L1 15399 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 169.5-64 chr17 70205651 70205930 + 1 NA Intergenic Intergenic 36255 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 142.75-124 chr3 28999528 28999705 + 1 NA Intergenic Intergenic 281323 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 215.25-11 chr10 124782709 124783101 + 1 NA intron (NM_212554, intron 3 of 6) L1ME3|LINE|L1 8982 NM_001304467 399818 Hs.720819 NM_212554 ENSG00000203791 EEF1AKMT2 C10orf138|Efm4|METTL10 EEF1A lysine methyltransferase 2 protein-coding 160.25-133 chr5 124180638 124180882 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 257760 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 277.5-6 chr10 27720699 27721206 + 1 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) intron (NM_001242702, intron 5 of 6) -23663 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 189.5-162 chr9 82245298 82245598 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 256676 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 201.5-125 chr8 69640548 69640800 + 1 NA intron (NR_156414, intron 19 of 20) intron (NR_156414, intron 19 of 20) 47774 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 252.5-72 chr6 88941033 88941406 + 1 NA intron (NM_001286426, intron 1 of 14) intron (NM_001286426, intron 1 of 14) 22399 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 113.5-180 chr4 71607566 71607792 + 1 NA Intergenic Intergenic 176400 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 133.5-13 chr1 165233659 165233870 + 1 NA intron (NM_177398, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 122477 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 202.75-10 chr10 24109930 24110418 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -98617 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 202.75-54 chr2 20347068 20347462 + 1 NA intron (NM_001352920, intron 1 of 19) intron (NM_001352920, intron 1 of 19) 3579 NM_015317 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 139.75-186 chr9 34281798 34282013 + 1 NA intron (NM_194313, intron 6 of 12) MER5B|DNA|hAT-Charlie 47363 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 176.5-154 chr7 52971837 52972040 + 1 NA Intergenic Intergenic -63695 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 197.5-167 chr9 28233379 28233757 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 485737 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 171.75-92 chr21 28205011 28205522 + 1 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) intron (NR_126012, intron 3 of 5) 23401 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 154.5-10 chr1 98185410 98185616 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -25198 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 228.5-98 chr7 93252532 93252810 + 1 NA exon (NM_017667, exon 3 of 28) exon (NM_017667, exon 3 of 28) 20305 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 134.75-153 chr3 194099143 194099362 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28282 NR_136179 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 262.75-53 chr8 82523938 82524260 + 1 NA Intergenic Intergenic -388005 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 124.25-206 chr8 119831057 119831313 + 1 NA intron (NM_003184, intron 2 of 25) intron (NM_003184, intron 2 of 25) 1656 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 176.5-161 chr7 125317368 125317672 + 1 NA intron (NR_110188, intron 3 of 8) intron (NR_110188, intron 3 of 8) -53229 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 130.75-200 chr9 73268463 73268778 + 1 NA Intergenic Intergenic 116755 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 137.5-18 chr1 213898801 213898985 + 1 NA intron (NR_037850, intron 2 of 5) intron (NR_037850, intron 2 of 5) -25856 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 118.5-26 chr10 95142010 95142261 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -52065 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 128.75-41 chr12 38576556 38576771 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 259889 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 272.5-11 chr10 30170228 30170545 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -41466 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 249.5-92 chr8 78292758 78293195 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -223364 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 173.5-77 chr2 189171151 189171479 + 1 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) L2|LINE|L2 8446 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 253.75-39 chr3 179854647 179854974 + 1 NA intron (NM_001349408, intron 8 of 14) L2a|LINE|L2 -43384 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 201.5-42 chr12 77645636 77646065 + 1 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -185044 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 169.75-95 chr20 54757811 54758186 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 282405 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 163.5-82 chr18 68550504 68550732 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 164490 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 162.5-151 chr6 48662431 48662699 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -593876 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 206.25 chr1 31174609 31175016 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 65075 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 158.5-56 chr14 20132604 20132777 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -11046 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 173.5-113 chr4 55652406 55652631 + 1 NA Intergenic Intergenic -15725 NR_120489 10874 Hs.418367 NM_006681 ENSG00000109255 NMU - neuromedin U protein-coding 308.5-2 chr1 212079727 212080146 + 1 NA intron (NM_001286229, intron 10 of 12) intron (NM_001286229, intron 10 of 12) 2323 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 124.25-12 chr1 113860550 113860824 + 1 NA intron (NM_012411, intron 1 of 18) intron (NM_012411, intron 1 of 18) 4052 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-171 chr6 145930162 145930443 + 1 NA intron (NM_001370328, intron 16 of 31) L1MEc|LINE|L1 33795 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 143.5-87 chr16 70804360 70804597 + 1 NA 3' UTR (NM_001270974, exon 86 of 86) 3' UTR (NM_001270974, exon 86 of 86) -3320 NM_001351157 55697 Hs.445061 NM_018052 ENSG00000103043 VAC14 ArPIKfyve|TAX1BP2|TRX VAC14 component of PIKFYVE complex protein-coding 308.75-23 chr2 102752260 102752847 + 1 NA intron (NM_001321346, intron 1 of 3) intron (NM_001321346, intron 1 of 3) -9478 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 212.75-87 chr6 73422942 73423253 + 1 NA TTS (NM_138441) TTS (NM_138441) 28269 NM_018665 55510 Hs.125507 NM_018665 ENSG00000080007 DDX43 CT13|HAGE DEAD-box helicase 43 protein-coding 191.5-42 chr15 27515560 27515911 + 1 NA intron (NM_033223, intron 6 of 9) intron (NM_033223, intron 6 of 9) -354416 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 116.5-162 chr3 113925826 113926021 + 1 NA intron (NM_001172105, intron 5 of 12) L1HS|LINE|L1 -21978 NM_001363952 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 253.5-41 chr2 67415409 67415749 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 18246 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 129.25-75 chr18 31595801 31595962 + 1 NA intron (NM_000371, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 4114 NM_000371 7276 Hs.427202 NM_000371 ENSG00000118271 TTR ATTR|CTS|CTS1|HEL111|HsT2651|PALB|TBPA transthyretin protein-coding 192.75-119 chr7 52953320 52953646 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -82150 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 219.75-80 chr7 87432975 87433370 + 1 NA intron (NM_018849, intron 14 of 27) L1M5|LINE|L1 42508 NM_000443 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 120.5-37 chr11 43916801 43916952 + 1 NA non-coding (NR_038907, exon 4 of 6) non-coding (NR_038907, exon 4 of 6) 4068 NR_038907 100507300 Hs.664588 NR_038907 ENSG00000244926 ALKBH3-AS1 - ALKBH3 antisense RNA 1 ncRNA 231.5-70 chr4 42681426 42681792 + 1 NA Intergenic Intergenic -24504 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 134.75-180 chr5 122133252 122133390 + 1 NA intron (NM_207317, intron 1 of 1) intron (NM_207317, intron 1 of 1) 3775 NM_207317 133923 Hs.729673 NM_207317 ENSG00000164185 ZNF474 - zinc finger protein 474 protein-coding 132.5-100 chr18 66985038 66985230 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -96450 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 242.5-86 chr8 129136498 129136894 + 1 NA Intergenic Intergenic 104544 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 243.75-17 chr12 23084255 23084714 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -91152 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 220.75-18 chr11 113300630 113300937 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -13800 NR_147891 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 171.75-76 chr2 76057245 76057489 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -346452 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 199.75-54 chr20 14191164 14191488 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR 146286 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 154.5-161 chr6 96394389 96394630 + 1 NA Intergenic Intergenic -127297 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 184.5-75 chr2 80493422 80493741 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) L3|LINE|CR1 180202 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 128.5-201 chr7 11979062 11979315 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -146990 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 167.25-34 chr14 32972493 32972788 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) intron (NM_001165893, intron 1 of 10) 33761 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 223.75-39 chr18 4309314 4309603 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 44856 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 128.5-171 chr5 68466129 68466371 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 173673 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 222.5-81 chr4 128966304 128966740 + 1 NA intron (NM_144643, intron 10 of 20) L1M4a2|LINE|L1 127017 NM_001300898 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 286.75-2 chr1 45867799 45868165 + 1 NA intron (NM_001324321, intron 1 of 28) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 3634 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 246.25-57 chr6 99516895 99517330 + 1 NA Intergenic Intergenic -1623 NM_032929 85015 Hs.143410 NM_032929 ENSG00000123552 USP45 - ubiquitin specific peptidase 45 protein-coding 165.75-109 chr22 47219206 47219577 + 1 NA Intergenic AluYh3a3|SINE|Alu -126180 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 166.5-89 chr19 31037314 31037620 + 1 NA Intergenic Intergenic -130043 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 136.5-103 chr2 37543030 37543203 + 1 NA Intergenic Intergenic 129083 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 225.25-93 chrX 43099656 43099907 + 1 NA Intergenic Intergenic -77213 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 162.25-76 chr2 44068704 44068939 + 1 NA Intergenic Intergenic -72832 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 277.25-41 chr6 145808877 145809283 + 1 NA intron (NM_001348092, intron 1 of 2) intron (NM_001348092, intron 1 of 2) 5715 NM_032145 84085 Hs.421095 NM_032145 ENSG00000118496 FBXO30 Fbx30 F-box protein 30 protein-coding 167.5-78 chr18 12933300 12933567 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -14551 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 220.25-73 chr8 60231552 60231935 + 1 NA intron (NM_001321839, intron 3 of 7) intron (NM_001321839, intron 3 of 7) 49657 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 204.75-78 chr3 188110410 188110680 + 1 NA Intergenic Intergenic -43353 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 252.25-55 chr6 90331515 90331995 + 1 NA Intergenic FordPrefect_a|DNA|hAT-Tip100 19013 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 153.5-155 chr5 34665292 34665497 + 1 NA intron (NM_001145520, intron 1 of 17) intron (NM_001145520, intron 1 of 17) 8903 NM_001145520 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 188.5-157 chr8 128253760 128254132 + 1 NA Intergenic Intergenic 103830 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 267.5-11 chr10 74789256 74789703 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -35776 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 127.75-109 chr2 161602936 161603110 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -21312 NM_001354450 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 239.75-34 chr2 127668961 127669465 + 1 NA intron (NM_001161404, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 -4620 NM_017980 55679 Hs.469881 NM_017980 ENSG00000072163 LIMS2 LGMD2W|MDRCMTT|PINCH-2|PINCH2 LIM zinc finger domain containing 2 protein-coding 165.25-49 chr16 6527063 6527250 + 1 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) L1ME4b|LINE|L1 -246653 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 120.25-26 chr10 48203315 48203580 + 1 NA intron (NM_001018071, intron 14 of 28) Charlie17|DNA|hAT-Charlie -28304 NM_001042512 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 119.25-211 chr8 131055722 131055875 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -14889 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 298.25-24 chr3 184818572 184819102 + 1 NA intron (NM_001349295, intron 1 of 46) intron (NM_001349295, intron 1 of 46) 6330 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 191.5-83 chr2 235992831 235993096 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 13 of 17) intron (NM_001037131, intron 13 of 17) 175423 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 113.5-193 chr5 54871516 54871715 + 1 NA Intergenic Intergenic 113978 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 162.25-99 chr20 63014950 63015184 + 1 NA intron (NR_033370, intron 1 of 4) intron (NR_033370, intron 1 of 4) 5684 NR_033370 63930 Hs.640084 NR_033370 ENSG00000272259 LINC01749 - long intergenic non-protein coding RNA 1749 ncRNA 164.75-99 chr3 81740144 81740479 + 1 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) intron (NM_000158, intron 1 of 15) 21334 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 122.5-5 chr1 67646466 67646661 + 1 NA Intergenic Intergenic -38638 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 209.75-14 chr10 121794992 121795284 + 1 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) AluSz6|SINE|Alu 132893 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 187.5-154 chr7 33283193 33283507 + 1 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) HAL1b|LINE|L1 153786 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 114.75-55 chr14 84496632 84496958 + 1 NA Intergenic Intergenic -775137 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 196.5-11 chr1 179580901 179581113 + 1 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -5055 NM_014625 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 134.75-13 chr1 154743324 154743560 + 1 NA intron (NM_001204087, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 -115445 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 201.5-57 chr15 39624588 39624966 + 1 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 43698 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 145.25-140 chr5 165974561 165974718 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 951731 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 156.25-44 chr14 84150973 84151269 + 1 NA Intergenic Intergenic -1120811 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 179.5-92 chr2 99764953 99765174 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) -275046 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 217.5-55 chr18 30154370 30154779 + 1 NA Intergenic Intergenic -144336 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 250.75-14 chr14 80871581 80871904 + 1 NA intron (NM_152446, intron 8 of 24) intron (NM_152446, intron 8 of 24) 69996 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 117.25-181 chr6 39643817 39644107 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) L1MB7|LINE|L1 81446 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 164.75-106 chr4 63977187 63977442 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 432136 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 148.75-137 chr5 117102559 117102842 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -312812 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 217.5-70 chr20 12367358 12367641 + 1 NA Intergenic Intergenic 449606 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 208.25-64 chr4 41150930 41151231 + 1 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) MER104|DNA|TcMar-Tc2 63462 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 118.25-198 chr8 89775437 89775694 + 1 NA intron (NM_003821, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 17749 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 243.5-31 chr17 19975119 19975548 + 1 NA intron (NM_007202, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 2495 NM_007202 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 173.5-21 chr10 72947284 72947552 + 1 NA intron (NM_001318124, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 7388 NM_001318125 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 133.25-89 chr2 14212960 14213155 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 187901 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 224.25-36 chr16 87820900 87821175 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 13623 NR_106833 102465464 NR_106833 ENSG00000278598 MIR6775 hsa-mir-6775 microRNA 6775 ncRNA 242.75-23 chr18 3824384 3824840 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 20746 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 204.25-57 chr2 96718788 96719077 + 1 NA intron (NM_001322354, intron 3 of 7) intron (NM_001322354, intron 3 of 7) 21144 NM_030805 81562 Hs.655743 NM_030805 ENSG00000114988 LMAN2L MRT52|VIPL lectin, mannose binding 2 like protein-coding 164.75-51 chr15 43070798 43071037 + 1 NA exon (NM_174916, exon 5 of 47) exon (NM_174916, exon 5 of 47) 35121 NM_174916 197131 Hs.591121 NM_174916 ENSG00000159459 UBR1 JBS ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 protein-coding 245.5-64 chr5 140917361 140917850 + 1 NA intron (NM_018904, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 -9112 NM_031882 56135 Hs.199343 NM_018898 ENSG00000248383 PCDHAC1 PCDH-ALPHA-C1 protocadherin alpha subfamily C, 1 protein-coding 164.75-147 chr8 114915543 114915754 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 752365 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 177.25-94 chr3 66920134 66920430 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -78025 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 146.25-2 chr1 73646268 73646606 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -28242 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 196.25-75 chr21 29914533 29914835 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 25312 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 220.5-57 chr2 190194368 190194786 + 1 NA intron (NM_032321, intron 1 of 1) L1MC1|LINE|L1 13714 NM_032321 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 175.5-55 chr15 39472589 39472985 + 1 NA Intergenic Intergenic -108292 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 277.25-21 chr2 18370185 18370578 + 1 NA Intergenic Intergenic 190272 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 176.75-9 chr1 162508877 162509154 + 1 NA intron (NM_144624, intron 4 of 6) AluJr|SINE|Alu 11197 NM_175866 127933 Hs.127310 NM_144624 ENSG00000152332 UHMK1 KIS|KIST|P-CIP2 U2AF homology motif kinase 1 protein-coding 264.25-7 chr10 92882157 92882726 + 1 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) AluSq|SINE|Alu 33921 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 184.5-168 chr9 83271693 83271906 + 1 NA intron (NM_001244960, intron 13 of 13) intron (NM_001244960, intron 13 of 13) -4531 NM_001244962 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 122.5-29 chr10 108175316 108175491 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -106110 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 168.5-103 chr20 36159363 36159634 + 1 NA intron (NM_012156, intron 1 of 21) intron (NM_012156, intron 1 of 21) -3738 NR_147703 100130373 Hs.570339 NR_147703 LOC100130373 - uncharacterized LOC100130373 ncRNA 123.25-29 chr11 10681903 10682205 + 1 NA intron (NM_130385, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR 11520 NM_001100167 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 224.5-17 chr10 53536432 53536821 + 1 NA Intergenic Intergenic -764926 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 208.5-148 chr9 21598667 21598919 + 1 NA Intergenic Intergenic -38995 NR_152878 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 123.5-10 chr1 188588010 188588164 + 1 NA Intergenic Intergenic 1144459 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 176.5-65 chr15 95741752 95742059 + 1 NA Intergenic Intergenic 308812 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 287.25-48 chr8 86573170 86573606 + 1 NA TTS (NM_019098) TTS (NM_019098) 58953 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 434.5 chr1 17808662 17809191 + 1 NA intron (NM_030812, intron 1 of 2) intron (NM_030812, intron 1 of 2) 53593 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 223.25-55 chr4 30072114 30072505 + 1 NA Intergenic Intergenic -648060 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 276.25-23 chr18 2983490 2983906 + 1 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie 28249 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 157.5-156 chr5 5925393 5925688 + 1 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? 411752 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 173.25-94 chr5 10400195 10400410 + 1 NA intron (NM_001270660, intron 9 of 24) L1MC5a|LINE|L1 -2062 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 188.5-14 chr10 67667334 67667608 + 1 NA intron (NM_013266, intron 1 of 17) intron (NM_013266, intron 1 of 17) -1786 NM_001127384 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 120.25-154 chr4 80330462 80330748 + 1 NA Intergenic Intergenic -5115 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 205.5-62 chr18 66999646 66999876 + 1 NA Intergenic Intergenic -81823 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 178.5-78 chr2 53039298 53039536 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -336802 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 159.75-61 chr17 61594183 61594374 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3059 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 193.25-115 chr8 48170042 48170516 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 161848 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 149.5-97 chr2 106989372 106989781 + 1 NA Intergenic Intergenic -102467 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 206.5-12 chr11 64511208 64511529 + 1 NA Intergenic Intergenic -44573 NM_018484 55867 Hs.220844 NM_018484 ENSG00000168065 SLC22A11 OAT4|hOAT4 solute carrier family 22 member 11 protein-coding 139.5-141 chr3 174413185 174413410 + 1 NA Intergenic Intergenic -446037 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 134.5-120 chr22 22850779 22850954 + 1 NA Intergenic Intergenic 28090 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 133.5-245 chr7 37311749 37312009 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 4 of 21) intron (NM_001206480, intron 4 of 21) 41789 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 196.75-94 chr6 119656857 119657084 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) LTR79|LTR|ERVL 107162 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 130.5-2 chr1 31751849 31752106 + 1 NA intron (NM_001294335, intron 4 of 32) MIRb|SINE|MIR 6758 NR_036216 100423028 NR_036216 ENSG00000266580 MIR4254 - microRNA 4254 ncRNA 214.25-72 chr6 76164976 76165283 + 1 NA Intergenic Intergenic -92451 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 192.5-105 chr5 7044461 7044781 + 1 NA Intergenic Intergenic -216700 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 266.25-15 chr15 85633968 85634527 + 1 NA intron (NM_001270546, intron 1 of 28) intron (NM_001270546, intron 1 of 28) 14297 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 180.5-70 chr2 52807348 52807701 + 1 NA Intergenic Intergenic -104909 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 256.5-24 chr17 33315960 33316436 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 -23210 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 188.5-64 chr2 33755836 33756193 + 1 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -27797 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 281.25-8 chr10 54052441 54052733 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -433643 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 254.25-32 chr2 39181563 39182070 + 1 NA intron (NM_001009565, intron 7 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 47772 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 299.25 chr1 59857831 59858178 + 1 NA intron (NM_015888, intron 12 of 21) MIRb|SINE|MIR 43055 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 210.5-54 chr17 65399635 65399906 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -57771 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 128.5-100 chr2 1715712 1715912 + 1 NA intron (NM_012293, intron 1 of 22) intron (NM_012293, intron 1 of 22) 28703 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 183.75-106 chr6 57153098 57153376 + 1 NA intron (NM_015555, intron 11 of 13) L1MEd|LINE|L1 18976 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 155.25-26 chr10 68267764 68268013 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -35775 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 237.25-60 chr5 68899642 68899931 + 1 NA Intergenic Intergenic 130141 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 191.5-153 chr9 36670810 36671073 + 1 NA intron (NM_001256691, intron 13 of 15) intron (NM_001256691, intron 13 of 15) 98046 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 177.25-74 chr2 188640750 188640936 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 149280 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 278.25-24 chr2 39016100 39016480 + 1 NA intron (NM_005633, intron 10 of 22) intron (NM_005633, intron 10 of 22) -55946 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 184.5-95 chr22 36969690 36969900 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 4547 NR_038954 100506241 Hs.640023 NR_038954 ENSG00000215403 LL22NC01-81G9.3 - uncharacterized protein FLJ39582-like ncRNA 176.5-28 chr11 41291575 41291816 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 167941 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 224.5-67 chr2 223168230 223168533 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 116451 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 148.5-172 chr4 88877454 88877706 + 1 NA intron (NM_014883, intron 6 of 23) intron (NM_014883, intron 6 of 23) -54219 NM_001015045 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 325.5-7 chr12 87538707 87539160 + 1 NA Intergenic Intergenic 208194 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 180.5-88 chr22 27104485 27104667 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -44058 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 240.5-8 chr10 55689293 55689690 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -61549 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 151.25-74 chr18 55212816 55213167 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -88685 NR_110743 101927229 Hs.638474 NR_110743 ENSG00000267013 LINC01929 - long intergenic non-protein coding RNA 1929 ncRNA 208.75-67 chr5 101983289 101983546 + 1 NA Intergenic Intergenic 312867 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 126.25-193 chr8 9712454 9712625 + 1 NA intron (NM_003747, intron 11 of 26) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -29133 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 150.5-176 chr5 119464037 119464207 + 1 NA intron (NM_000414, intron 2 of 23) L1MA5|LINE|L1 11625 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 265.25-15 chr15 60274362 60274639 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 123486 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 159.5-58 chr15 26280422 26280624 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 164710 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 206.5-62 chr2 199324613 199325064 + 1 NA intron (NM_001172509, intron 8 of 10) intron (NM_001172509, intron 8 of 10) 133101 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 189.75-87 chr4 139299688 139299908 + 1 NA intron (NM_001184989, intron 1 of 5) intron (NM_001184989, intron 1 of 5) 1412 NM_001184986 4717 Hs.84549 NM_002494 ENSG00000109390 NDUFC1 KFYI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C1 protein-coding 222.25-89 chr8 118180871 118181248 + 1 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) FLAM_C|SINE|Alu -69240 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 142.5-202 chr7 15034221 15034538 + 1 NA Intergenic Intergenic -59521 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 350.25-26 chr4 97651120 97651743 + 1 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 284505 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 172.5-168 chr6 68135542 68135804 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 80322 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 211.25-69 chr5 4956616 4957005 + 1 NA Intergenic Intergenic -77549 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 118.5-60 chr15 63249043 63249357 + 1 NA intron (NM_016530, intron 2 of 7) intron (NM_016530, intron 2 of 7) -28350 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 340.25-20 chr8 138246517 138246936 + 1 NA intron (NM_015912, intron 6 of 19) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -163181 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 204.5-100 chr4 64696979 64697312 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -287685 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 161.75-16 chr10 35209403 35209585 + 1 NA 3' UTR (NM_001267569, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001267569, exon 4 of 4) 13592 NM_182724 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 184.75-98 chr7 93916882 93917221 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4684 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 197.5-173 chr9 99059156 99059428 + 1 NA intron (NM_001855, intron 35 of 41) MIRb|SINE|MIR -45821 NM_001306210 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 188.75-50 chr2 5013610 5013907 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -357536 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 112.5-225 chr7 107571047 107571214 + 1 NA intron (NM_001371364, intron 3 of 14).2 intron (NM_001371364, intron 3 of 14).2 -6616 NM_001161520 10466 Hs.239631 NM_006348 ENSG00000164597 COG5 CDG2I|GOLTC1|GTC90 component of oligomeric golgi complex 5 protein-coding 115.5-255 chr9 106694656 106694816 + 1 NA Intergenic Intergenic 78678 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 173.25-116 chr7 49928623 49928840 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 153398 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 161.25-110 chr22 32390982 32391182 + 1 NA intron (NM_014306, intron 11 of 11) AluJr4|SINE|Alu 14418 NR_038918 339666 Hs.654761 NR_038918 ENSG00000230736 LOC339666 - uncharacterized LOC339666 ncRNA 332.5-5 chr11 118870180 118870697 + 1 NA Intergenic Intergenic -13454 NM_001716 643 Hs.113916 NM_001716 ENSG00000160683 CXCR5 BLR1|CD185|MDR15 C-X-C motif chemokine receptor 5 protein-coding 163.5-62 chr15 100688353 100688630 + 1 NA Intergenic Intergenic 85902 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 170.5-18 chr1 199006988 199007196 + 1 NA intron (NR_110525, intron 2 of 2) intron (NR_110525, intron 2 of 2) -9041 NR_126351 104266961 Hs.576501 NR_126351 ENSG00000235492 LINC01221 TCONS_00000366 long intergenic non-protein coding RNA 1221 ncRNA 287.25-25 chr18 78038747 78039369 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -45331 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 201.5 chr1 31022152 31022426 + 1 NA intron (NM_001020658, intron 3 of 21) intron (NM_001020658, intron 3 of 21) 43428 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 318.5-14 chr2 21994960 21995543 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -284599 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 172.5-100 chr2 120578833 120579154 + 1 NA Intergenic Intergenic -112644 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 187.25-100 chr8 20233906 20234142 + 1 NA Intergenic Intergenic 36643 NM_001693 526 Hs.295917 NM_001693 ENSG00000147416 ATP6V1B2 ATP6B1B2|ATP6B2|DOOD|HO57|VATB|VPP3|Vma2|ZLS2 ATPase H+ transporting V1 subunit B2 protein-coding 212.75-46 chr18 13964397 13964871 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -48927 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 220.25-21 chr17 6171016 6171414 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 100601 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 124.5-34 chr11 68007677 68007837 + 1 NA promoter-TSS (NM_001161473) promoter-TSS (NM_001161473) -790 NM_001161473 221 Hs.523841 NM_000694 ENSG00000006534 ALDH3B1 ALDH4|ALDH7 aldehyde dehydrogenase 3 family member B1 protein-coding 324.5-24 chr3 184024693 184025112 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -6642 NM_182537 200909 Hs.448004 NM_182537 ENSG00000186090 HTR3D 5HT3D 5-hydroxytryptamine receptor 3D protein-coding 336.5-16 chr21 30793116 30793666 + 1 NA Intergenic Intergenic 19883 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 210.25-33 chr18 3382220 3382671 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -29482 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 241.75-32 chr17 60901606 60902204 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) intron (NM_001330413, intron 10 of 25) 224054 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 143.5-103 chr19 42286409 42286586 + 1 NA intron (NM_015125, intron 1 of 19) intron (NM_015125, intron 1 of 19) 1832 NM_015125 23152 Hs.388236 NM_015125 ENSG00000079432 CIC MRD45 capicua transcriptional repressor protein-coding 119.5-50 chr11 98293374 98293531 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -727497 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 215.25-34 chr15 56706041 56706494 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 2 of 20) AluSx1|SINE|Alu 27819 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 172.25-79 chr21 23583472 23583675 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -198738 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 229.75-24 chr15 81475730 81476062 + 1 NA Intergenic Intergenic -101683 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 169.5-6 chr1 157069876 157070148 + 1 NA Intergenic Intergenic -24270 NM_014784 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 282.5-21 chr17 61546394 61546895 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 44575 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 272.5-19 chr12 46360752 46361292 + 1 NA 3' UTR (NM_018976, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_018976, exon 16 of 16) 11751 NM_018976 54407 Hs.221847 NM_018976 ENSG00000134294 SLC38A2 ATA2|PRO1068|SAT2|SNAT2 solute carrier family 38 member 2 protein-coding 132.75-187 chr8 85097005 85097268 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -10102 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 156.5-56 chr14 87001444 87001658 + 1 NA Intergenic Intergenic 95773 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 132.75-171 chr6 156188441 156188645 + 1 NA Intergenic Intergenic -190207 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 215.75-64 chr3 149876094 149876423 + 1 NA intron (NM_183383, intron 3 of 8) intron (NM_183383, intron 3 of 8) 63570 NM_007282 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 118.75-16 chr1 230177192 230177426 + 1 NA intron (NM_004481, intron 1 of 15) intron (NM_004481, intron 1 of 15) 110071 NM_004481 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 182.25-118 chr8 57773224 57773521 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 27223 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 241.75-44 chr20 59908821 59909109 + 1 NA intron (NM_014258, intron 14 of 44) intron (NM_014258, intron 14 of 44) 24672 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 251.75-2 chr1 39621519 39621825 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 17971 NM_014571 26508 Hs.472566 NM_014571 ENSG00000163909 HEYL HESR3|HEY3|HRT3|bHLHb33 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif like protein-coding 184.5-144 chr7 94639115 94639366 + 1 NA intron (NM_001346717, intron 1 of 9) intron (NM_001346717, intron 1 of 9) 16893 NM_001362807 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 155.25-106 chr20 37763777 37764044 + 1 NA intron (NM_001281495, intron 6 of 16) L2c|LINE|L2 69880 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 185.75-104 chr6 56174753 56175064 + 1 NA intron (NM_030820, intron 3 of 29) L1MB1|LINE|L1 72672 NM_001318751 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 148.5-134 chr22 29775534 29775854 + 1 NA Intergenic Intergenic 8325 NM_001003684 29796 Hs.284292 NM_013387 ENSG00000184076 UQCR10 HSPC051|HSPC119|HSPC151|QCR9|UCCR7.2|UCRC ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X protein-coding 160.5-94 chr2 202721485 202721667 + 1 NA intron (NM_173511, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 86607 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 202.75-74 chr3 120595777 120596069 + 1 NA promoter-TSS (NM_001168331) promoter-TSS (NM_001168331) -413 NM_001168331 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 155.5-96 chr2 82440058 82440239 + 1 NA Intergenic Intergenic -416655 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 127.75-145 chr4 78377047 78377251 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 26 of 41) intron (NM_001166133, intron 26 of 41) 88164 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 236.5-38 chr17 70071308 70071661 + 1 NA Intergenic Intergenic -3741 NM_001270422 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 272.25-19 chr16 20947121 20947531 + 1 NA intron (NM_001347886, intron 57 of 61) MER21A|LTR|ERVL 46064 NR_161432 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 173.5-123 chr5 24668190 24668455 + 1 NA Intergenic Intergenic -23344 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 179.5-176 chr8 13137679 13138129 + 1 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) intron (NM_001348082, intron 5 of 16) -4615 NM_001348084 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 158.5-134 chr3 162535156 162535471 + 1 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 767988 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 206.5-3 chr1 115952134 115952537 + 1 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) AluSq2|SINE|Alu -24178 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 179.75-133 chr8 121562444 121562827 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -76711 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 178.25-91 chr4 61493568 61493950 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 291587 NM_001371342 240.5-34 chr15 86690474 86690806 + 1 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -242240 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 206.5-94 chr5 32483270 32483518 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -38654 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 138.25-87 chr2 118439926 118440175 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 162916 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 201.25-48 chr2 165391631 165392102 + 1 NA 3' UTR (NM_001371247, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001371247, exon 27 of 27) -77832 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 172.5-79 chr16 59730620 59730915 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 24424 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 127.75-83 chr18 6130891 6131091 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) intron (NM_001365769, intron 14 of 16) -125753 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 143.5-32 chr11 16527859 16528021 + 1 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -51552 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 183.25-5 chr1 178371569 178371829 + 1 NA intron (NM_004841, intron 1 of 15) intron (NM_004841, intron 1 of 15) 30248 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 162.25-66 chr17 14793657 14793827 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -221063 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 169.5-95 chr22 19358711 19359032 + 1 NA intron (NM_003325, intron 18 of 24) intron (NM_003325, intron 18 of 24) -67152 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 195.75-97 chr5 129570840 129571043 + 1 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) L1ME1|LINE|L1 -110252 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 294.5-19 chr2 6179096 6179557 + 1 NA Intergenic Intergenic 196096 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 141.5-99 chr2 73593276 73593489 + 1 NA intron (NM_015120, intron 16 of 22) intron (NM_015120, intron 16 of 22) 49040 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 194.5-67 chr2 63346629 63346929 + 1 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) L1MEc|LINE|L1 91228 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 199.75-21 chr12 115165278 115165717 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -481322 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 206.25-80 chr4 105560064 105560331 + 1 NA intron (NM_001242729, intron 1 of 13) intron (NM_001242729, intron 1 of 13) -1394 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 148.5-190 chr5 147909064 147909309 + 1 NA Intergenic Intergenic -2648 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 205.5-159 chr9 75587581 75587986 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -302861 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 183.5-94 chr3 175137980 175138258 + 1 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) -22877 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 263.75-4 chr10 23498810 23499331 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 59801 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 183.75-62 chr2 227753883 227754198 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -36012 NM_001371413 132.25-136 chr3 185513483 185513639 + 1 NA intron (NM_139248, intron 8 of 9) L1MB2|LINE|L1 -14526 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 163.25-69 chr2 157007361 157007682 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -250184 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 177.5-8 chr1 117751748 117752143 + 1 NA Intergenic Intergenic 145897 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 287.75-47 chr8 106607396 106607950 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -50135 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 123.5-74 chr16 62200062 62200387 + 1 NA Intergenic Intergenic -163786 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 127.75-26 chr10 22562519 22562817 + 1 NA intron (NM_005028, intron 6 of 9) intron (NM_005028, intron 6 of 9) -124739 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 132.75-176 chr7 45396002 45396290 + 1 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -177994 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 211.5-19 chr10 92460256 92460645 + 1 NA intron (NR_136399, intron 23 of 25) intron (NR_136399, intron 23 of 25) 37311 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 222.25-12 chr11 128123864 128124411 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -84629 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 125.5-121 chr2 21887551 21887779 + 1 NA Intergenic Intergenic -177013 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 114.5-22 chr1 185873707 185873972 + 1 NA intron (NM_031935, intron 4 of 106) intron (NM_031935, intron 4 of 106) 139448 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 351.25-17 chrX 152880267 152880801 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -33908 NM_001178110 7739 Hs.16622 NM_007150 ENSG00000147394 ZNF185 SCELL zinc finger protein 185 with LIM domain protein-coding 235.75-14 chr11 40826397 40826793 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -533465 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 186.5-121 chr6 88763374 88763888 + 1 NA intron (NM_001286428, intron 11 of 13) ERVL-E-int|LTR|ERVL 199987 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 184.5-50 chr15 95614131 95614419 + 1 NA Intergenic Intergenic 181182 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 219.5-82 chr22 30388849 30389096 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1561 NM_001017981 200312 Hs.592194 NM_001017981 ENSG00000099999 RNF215 - ring finger protein 215 protein-coding 158.75-12 chr1 234832402 234832611 + 1 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -72450 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 259.5-91 chr7 92999341 92999718 + 1 NA Intergenic Intergenic 118450 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 118.5-125 chr3 65325979 65326191 + 1 NA Intergenic Intergenic -567731 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 265.75-69 chr7 78712427 78712754 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -296398 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 130.5-49 chr10 93964227 93964418 + 1 NA Intergenic Intergenic -2407 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 151.5-21 chr10 114996699 114996883 + 1 NA TTS (NR_120677) TTS (NR_120677) 2134 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 239.75-36 chr2 185454626 185454866 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 283973 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 222.5-18 chr10 75838506 75838897 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 55940 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 138.5-22 chr1 228909759 228910024 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 174412 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 280.75-14 chr15 55959595 55960080 + 1 NA intron (NM_001329212, intron 2 of 28) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 33775 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 135.75-105 chr2 123575846 123576059 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 449222 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 115.75-235 chrX 63427154 63427331 + 1 NA non-coding (NR_015353, exon 4 of 4) non-coding (NR_015353, exon 4 of 4) -75910 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 245.5-54 chr4 62584211 62584477 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -422579 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 143.25-46 chr14 49744491 49744659 + 1 NA intron (NM_172193, intron 12 of 12) MER2|DNA|TcMar-Tigger -23578 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 299.5-4 chr11 27163300 27163749 + 1 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 55244 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 113.5-184 chr4 90327151 90327322 + 1 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) intron (NM_207491, intron 3 of 7) 92205 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 169.5-19 chr10 103472919 103473179 + 1 NA 3' UTR (NM_001129742, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001129742, exon 3 of 3) 6191 NM_001129742 119395 Hs.364624 NM_182494 ENSG00000183128 CALHM3 FAM26A|bA225H22.7 calcium homeostasis modulator 3 protein-coding 186.5-106 chr5 34796291 34796567 + 1 NA intron (NM_015577, intron 4 of 17) intron (NM_015577, intron 4 of 17) -42735 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 273.5-81 chr9 90014166 90014564 + 1 NA Intergenic Intergenic 9170 NR_036253 100422963 NR_036253 ENSG00000263967 MIR4290 - microRNA 4290 ncRNA 191.25-65 chr21 24729995 24730231 + 1 NA Intergenic Intergenic -110437 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 244.25-23 chr20 28814726 28815202 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -212299 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 170.5-43 chr11 130760988 130761297 + 1 NA Intergenic Intergenic 88186 NM_001271983 283171 Hs.376151 NM_001271983 C11orf44 - chromosome 11 open reading frame 44 protein-coding 192.5-77 chr2 190945558 190946154 + 1 NA intron (NM_014905, intron 14 of 17) intron (NM_014905, intron 14 of 17) 65035 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 227.5-3 chr1 186303775 186304224 + 1 NA intron (NM_001127710, intron 3 of 9) intron (NM_001127710, intron 3 of 9) 7726 NM_001127708 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 229.5-78 chr20 18011355 18011827 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 42573 NM_001310339 92667 Hs.320823 NM_052865 ENSG00000125871 MGME1 C20orf72|DDK1|MTDPS11|bA504H3.4 mitochondrial genome maintenance exonuclease 1 protein-coding 283.25-16 chr16 80304184 80304826 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -236229 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 240.5-86 chr5 131013462 131013718 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 151666 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 176.5-36 chr12 21871146 21871361 + 1 NA intron (NM_005691, intron 16 of 37) intron (NM_005691, intron 16 of 37) 65441 NM_020297 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 203.25-64 chr22 42267795 42268214 + 1 NA intron (NM_005650, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu -1749 NR_036498 388906 Hs.730075 NR_036498 OGFRP1 - opioid growth factor receptor pseudogene 1 pseudo 163.5-9 chr1 91774908 91775090 + 1 NA intron (NR_036634, intron 4 of 17) MIR3|SINE|MIR 111152 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 114.5-271 chr8 142897390 142897552 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -17651 NM_001026213 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 222.75-18 chr10 51188232 51188495 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -111210 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 205.75-5 chr1 230207401 230207854 + 1 NA intron (NM_004481, intron 3 of 15) AluJr|SINE|Alu 140389 NM_004481 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 183.25-13 chr10 76126593 76127014 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 344042 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 172.5-194 chr8 8510449 8510739 + 1 NA Intergenic Intergenic -124155 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 169.75-78 chr2 72485713 72485937 + 1 NA intron (NR_135774, intron 16 of 19) intron (NR_135774, intron 16 of 19) -337963 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 207.75-59 chr2 136902692 136903120 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 137361 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 204.5-99 chr4 53288408 53288858 + 1 NA intron (NM_152540, intron 3 of 8) L1M2a|LINE|L1 77428 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 232.25-12 chr11 57796539 57796774 + 1 NA exon (NM_001206885, exon 6 of 20) exon (NM_001206885, exon 6 of 20) 34854 NM_001206884 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 163.25-49 chr16 64677321 64677592 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 444607 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 122.5-169 chr4 102037150 102037390 + 1 NA intron (NM_017935, intron 10 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie 223428 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 155.5-150 chr4 105191846 105192114 + 1 NA intron (NM_001127208, intron 2 of 10) intron (NM_001127208, intron 2 of 10) 45295 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 129.25-106 chr2 234307640 234307940 + 1 NA Intergenic Intergenic 146805 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 127.75-76 chr16 80367988 80368200 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -172640 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 312.75-25 chr4 60199065 60199591 + 1 NA Intergenic Intergenic -723291 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 133.5-65 chr12 53483804 53483965 + 1 NA intron (NM_006301, intron 9 of 14) intron (NM_006301, intron 9 of 14) 15574 NM_001193511 7786 Hs.713539 NM_006301 ENSG00000139625 MAP3K12 DLK|MEKK12|MUK|ZPK|ZPKP1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 12 protein-coding 242.25-30 chr14 79493179 79493709 + 1 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 214064 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 123.5-95 chr2 60759738 60759916 + 1 NA intron (NM_022894, intron 1 of 21) intron (NM_022894, intron 1 of 21) 3559 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 226.75-49 chr3 5881536 5881863 + 1 NA Intergenic Intergenic -631444 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 234.5-4 chr1 157720551 157720928 + 1 NA Intergenic Intergenic -19970 NM_001320333 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 241.25-73 chrX 12881189 12881492 + 1 NA intron (NM_016562, intron 2 of 2) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 14268 NM_016562 51284 Hs.659215 NM_016562 ENSG00000196664 TLR7 TLR7-like toll like receptor 7 protein-coding 316.5-24 chr2 234397392 234397916 + 1 NA Intergenic Intergenic 56941 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 243.5-81 chr8 79541394 79541694 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -69573 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 342.75-12 chr14 59906850 59907302 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12637 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 183.5-99 chr4 63303136 63303461 + 1 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 1106152 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 181.5-68 chr2 22968926 22969234 + 1 NA Intergenic Intergenic -416099 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 229.75-81 chr9 102727196 102727470 + 1 NA Intergenic Intergenic 207696 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 114.25-127 chr3 98676398 98676581 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -55747 NM_001271142 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 186.25-127 chr9 123631865 123632128 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 8 of 18) intron (NM_001352968, intron 8 of 18) -146374 NR_106972 102465688 NR_106972 ENSG00000274932 MIR7150 hsa-mir-7150 microRNA 7150 ncRNA 143.5-224 chr9 6410545 6410859 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -2449 NR_046386 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 386.75-7 chr5 74080715 74081563 + 1 NA Intergenic Intergenic 227186 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 214.5-47 chr2 6500121 6500426 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -124851 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 147.5-213 chr8 125091525 125091683 + 1 NA promoter-TSS (NM_001349485) promoter-TSS (NM_001349485) 188 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 211.25-93 chr8 73424337 73424759 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) L1MC2|LINE|L1 4474 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 159.5-74 chr17 2246148 2246406 + 1 NA intron (NM_017575, intron 8 of 18) intron (NM_017575, intron 8 of 18) -9430 NM_001256828 23293 Hs.448342 NM_017575 ENSG00000070366 SMG6 C17orf31|EST1A|SMG-6|hSMG5/7a SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 225.25-66 chr5 138170153 138170599 + 1 NA exon (NM_001300962, exon 6 of 20) exon (NM_001300962, exon 6 of 20) 8254 NM_001300961 10902 Hs.519337 NM_006696 ENSG00000112983 BRD8 SMAP|SMAP2|p120 bromodomain containing 8 protein-coding 210.5-8 chr1 168879806 168880019 + 1 NA Intergenic Intergenic 92971 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 181.75-14 chr10 26823089 26823296 + 1 NA exon (NM_001348034, exon 2 of 11) exon (NM_001348034, exon 2 of 11) 37895 NM_001348032 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 172.75-128 chr8 101069297 101069558 + 1 NA intron (NR_033962, intron 2 of 2) intron (NR_033962, intron 2 of 2) 17373 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 115.25-143 chr4 44136902 44137172 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 119975 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 292.75-4 chr1 70440441 70440938 + 1 NA TTS (NM_153742) TTS (NM_153742) 29421 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 135.25-147 chr4 100611778 100611993 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 63228 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 227.5-27 chr13 83361891 83362210 + 1 NA Intergenic Intergenic 520343 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 154.5-101 chr2 104103290 104103542 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 304916 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 234.5-56 chr20 20446924 20447268 + 1 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 78992 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 193.25-48 chr2 44697906 44698135 + 1 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) HAL1|LINE|L1 240868 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 220.5-132 chrX 96183492 96183860 + 1 NA Intergenic Intergenic 154226 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 199.5-149 chr8 113532432 113532685 + 1 NA Intergenic Intergenic -95619 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 255.25-27 chr2 231276991 231277441 + 1 NA intron (NM_001352757, intron 14 of 19) intron (NM_001352757, intron 14 of 19) 78585 NR_148040 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 173.5-130 chr5 67996388 67996595 + 1 NA Intergenic Intergenic -193385 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 291.5-49 chr8 43437464 43437970 + 1 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 145275 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 176.5-146 chr5 155489951 155490325 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 476383 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 177.75-33 chr13 51279091 51279414 + 1 NA intron (NM_001242312, intron 3 of 3) intron (NM_001242312, intron 3 of 3) 56854 NM_001242312 220108 Hs.71913 NM_145019 ENSG00000150510 FAM124A - family with sequence similarity 124 member A protein-coding 164.5-107 chr2 168128128 168128446 + 1 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) intron (NM_013233, intron 10 of 17) 119308 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 238.5-55 chr3 53969861 53970238 + 1 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -78190 NM_021237 58515 Hs.58471 NM_021237 ENSG00000113811 SELENOK HSPC030|HSPC297|SELK selenoprotein K protein-coding 127.5-15 chr1 165459168 165459318 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -13888 NM_001256570 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 215.5-33 chr14 70166197 70166465 + 1 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -20777 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 223.5-78 chr3 33634076 33634346 + 1 NA intron (NM_015097, intron 8 of 38) intron (NM_015097, intron 8 of 38) 25468 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 183.25-73 chr3 125077762 125078029 + 1 NA Intergenic Intergenic -21898 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 159.5-27 chr10 120076311 120076602 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 117943 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 177.5-113 chr3 67553750 67554006 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 2 of 10) MamRep1151|LTR?|LTR? 100736 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 135.5-12 chr1 171295327 171295544 + 1 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -18748 NM_002022 2329 Hs.386502 NM_002022 ENSG00000076258 FMO4 FMO2 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 4 protein-coding 134.5-94 chr2 12517222 12517447 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -199538 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 198.5-135 chr7 95224706 95225040 + 1 NA intron (NM_001166160, intron 7 of 19) intron (NM_001166160, intron 7 of 19) 99659 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 247.5-5 chr10 33976502 33976792 + 1 NA Intergenic Intergenic -203967 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 119.75-110 chr2 122515395 122515619 + 1 NA Intergenic Intergenic 557974 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 141.5-10 chr1 158755364 158755570 + 1 NA exon (NM_001005184, exon 1 of 1) exon (NM_001005184, exon 1 of 1) 651 NM_001005184 128371 Hs.553591 NM_001005184 ENSG00000180433 OR6K6 OR1-21 olfactory receptor family 6 subfamily K member 6 protein-coding 161.5-48 chr12 101575813 101576119 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -18965 NM_206821 4604 Hs.654589 NM_002465 ENSG00000196091 MYBPC1 LCCS4|MYBPCC|MYBPCS myosin binding protein C, slow type protein-coding 123.5-111 chr2 179820815 179820972 + 1 NA intron (NR_148056, intron 1 of 9) intron (NR_148056, intron 1 of 9) 40015 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 194.25-47 chr17 62797436 62797669 + 1 NA intron (NM_001288780, intron 3 of 10) intron (NM_001288780, intron 3 of 10) 9088 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 237.25-6 chr1 114745767 114746049 + 1 NA intron (NM_001130523, intron 2 of 19) intron (NM_001130523, intron 2 of 19) 12076 NM_001242892 7812 Hs.69855 NM_007158 ENSG00000009307 CSDE1 D1S155E|UNR cold shock domain containing E1 protein-coding 171.75-108 chr5 3377298 3377533 + 1 NA Intergenic Intergenic -75401 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 168.5-24 chr10 13948979 13949265 + 1 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) 22774 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 162.5-177 chr8 110315885 110316154 + 1 NA Intergenic Intergenic -340248 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 204.5-129 chr8 70943600 70943852 + 1 NA Intergenic Intergenic 274387 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 275.75-38 chr5 104489249 104489564 + 1 NA Intergenic Intergenic -610068 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 196.5-41 chr12 23020729 23020955 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -154794 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 120.5-218 chr7 102913184 102913356 + 1 NA intron (NR_105043, intron 11 of 20) intron (NR_105043, intron 11 of 20) 270 NM_005824 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 121.5-89 chr15 79001679 79001924 + 1 NA intron (NM_001145648, intron 15 of 26) intron (NM_001145648, intron 15 of 26) 3859 NM_153815 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 176.25-147 chr9 94756481 94756882 + 1 NA intron (NM_001193331, intron 1 of 7) LTR79|LTR|ERVL -2968 NM_001193329 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 190.5-110 chr4 57937943 57938207 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 512203 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 223.5-116 chr7 34441014 34441351 + 1 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 -217036 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 240.25-34 chr2 129132013 129132331 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 141719 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 251.25-16 chr14 62453052 62453463 + 1 NA Intergenic Intergenic -313284 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 138.25-25 chr11 4510026 4510337 + 1 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 21302 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 152.5-38 chr12 103567015 103567283 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 19355 NR_110103 101929084 Hs.440981 NR_110103 ENSG00000257762 LINC02401 - long intergenic non-protein coding RNA 2401 ncRNA 177.75-100 chr3 24607038 24607261 + 1 NA Intergenic Intergenic -111441 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 126.75-160 chr3 183019960 183020239 + 1 NA intron (NR_120639, intron 14 of 15) intron (NR_120639, intron 14 of 15) -34181 NM_001308101 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 121.75-109 chr21 32329091 32329299 + 1 NA intron (NM_014825, intron 30 of 38) AluJr4|SINE|Alu 37382 NM_001285394 56246 Hs.584940 NM_178817 ENSG00000170262 MRAP B27|C21orf61|FALP|FGD2|GCCD2 melanocortin 2 receptor accessory protein protein-coding 120.5-239 chr9 80177930 80178146 + 1 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 203015 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 328.75-9 chr2 168634542 168635144 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) LTR50|LTR|ERVL 51900 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 266.5-72 chr8 47288858 47289139 + 1 NA intron (NM_001352947, intron 4 of 19) intron (NM_001352947, intron 4 of 19) 28060 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 122.5-54 chr13 109850416 109850608 + 1 NA Intergenic Intergenic -63929 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 140.5-126 chr2 217331471 217331701 + 1 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) intron (NR_026597, intron 8 of 12) 48853 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 254.5-18 chr12 1949971 1950362 + 1 NA intron (NR_135060, intron 8 of 10) intron (NR_135060, intron 8 of 10) -13590 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 186.5-91 chr3 63434244 63434548 + 1 NA intron (NR_046677, intron 2 of 4) MIRc|SINE|MIR -8916 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 136.5-149 chr3 87697615 87697799 + 1 NA Intergenic Intergenic -94999 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 265.75-9 chr11 81232911 81233213 + 1 NA Intergenic Intergenic -470259 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 225.25-84 chr8 112345820 112346148 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 37 of 66) intron (NM_001363185, intron 37 of 66) -297509 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 113.5-168 chr3 197073742 197073944 + 1 NA intron (NM_001366207, intron 18 of 24) L3|LINE|CR1 -44026 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 208.5-123 chr6 145481496 145481763 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 205248 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 209.75-35 chr16 86617135 86617417 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 38767 NM_005250 2300 Hs.533830 NM_005250 ENSG00000176678 FOXL1 FKH6|FKHL11|FREAC7 forkhead box L1 protein-coding 198.25-17 chr10 111051981 111052259 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -24909 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 170.75-102 chr4 170470040 170470235 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 243546 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 254.75-39 chr4 152225624 152225989 + 1 NA Intergenic Intergenic -111849 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 297.5-32 chr21 16091577 16092384 + 1 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 20866 NR_111005 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 145.25-162 chr7 45606668 45606836 + 1 NA intron (NM_001281768, intron 3 of 9) intron (NM_001281768, intron 3 of 9) 32384 NM_021116 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 297.75-10 chr15 52978638 52979292 + 1 NA Intergenic Intergenic -137400 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 156.5-51 chr14 36884647 36884891 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) L1MA7|LINE|L1 67622 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 175.5-62 chr15 67893844 67894020 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -53887 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 155.75-125 chr4 126375587 126375808 + 1 NA Intergenic Intergenic 868438 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 237.25-43 chr2 38204129 38204538 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 73228 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 267.5-36 chr18 34634871 34635319 + 1 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) L1MA8|LINE|L1 41760 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 142.5-138 chr22 26481587 26481905 + 1 NA exon (NM_001349898, exon 3 of 15) exon (NM_001349898, exon 3 of 15) 2037 NR_146315 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 115.5-82 chr15 99677684 99677873 + 1 NA intron (NM_001352615, intron 9 of 12) L1ME3B|LINE|L1 44800 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 114.25-69 chr16 82016055 82016224 + 1 NA Intergenic Intergenic -4669 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 191.5-74 chr2 58542410 58542602 + 1 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 21753 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 203.5-93 chr3 118330101 118330430 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -311503 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 120.5-50 chr12 13949016 13949183 + 1 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 31257 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 131.25-37 chr12 5768117 5768377 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) intron (NM_001278596, intron 10 of 25) 177012 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 201.5-137 chr9 115866742 115867145 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 58264 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 384.25-6 chr17 73350519 73351029 + 1 NA exon (NM_001144952, exon 42 of 45) exon (NM_001144952, exon 42 of 45) -38773 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 287.75-42 chr6 63237020 63237467 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 82734 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 132.5-203 chr5 129925688 129925896 + 1 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 21327 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 146.5-28 chr10 56462093 56462306 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -100926 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 187.25-5 chr1 107261686 107261940 + 1 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu 113744 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 156.75-115 chr3 111608554 111608813 + 1 NA intron (NR_134917, intron 8 of 14) intron (NR_134917, intron 8 of 14) -13337 NM_024508 79413 Hs.136912 NM_024508 ENSG00000177494 ZBED2 - zinc finger BED-type containing 2 protein-coding 161.75-66 chr2 127021112 127021322 + 1 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 60848 NM_001320634 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 168.25-112 chr5 4345982 4346166 + 1 NA Intergenic Intergenic -427407 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 238.5-38 chr19 35748137 35748537 + 1 NA promoter-TSS (NM_019104) promoter-TSS (NM_019104) -239 NM_019104 55957 Hs.529100 NM_019104 ENSG00000267796 LIN37 F25965|ZK418.4|lin-37 lin-37 DREAM MuvB core complex component protein-coding 206.75-6 chr10 9778878 9779287 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -279640 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 159.75-174 chr8 117728844 117729220 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 191881 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 204.5-60 chr2 30066137 30066488 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -80695 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 173.5-140 chr6 45451826 45452000 + 1 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 29638 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 149.25-13 chr1 152229340 152229567 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5257 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 185.5-99 chr22 25149655 25150137 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L2c|LINE|L2 -37204 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 250.5-88 chr7 31045210 31045640 + 1 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -6883 NM_001199637 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 117.25-176 chr5 147279313 147279613 + 1 NA intron (NM_001112724, intron 4 of 12) MER41E|LTR|ERV1 44437 NM_001287740 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 207.5-112 chr8 73088797 73089297 + 1 NA intron (NM_153225, intron 1 of 4) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 4125 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 234.5-8 chr10 34392655 34393055 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 7 of 22) intron (NM_001184789, intron 7 of 22) 422441 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 113.75-64 chr14 74967944 74968089 + 1 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -12252 NM_001207012 5228 Hs.252820 NM_002632 ENSG00000119630 PGF D12S1900|PGFL|PIGF|PLGF|PlGF-2|SHGC-10760 placental growth factor protein-coding 271.5-64 chr5 20105263 20105614 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -117238 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 126.75-133 chr20 42865732 42865879 + 1 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) -102938 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 159.5-104 chr2 77875778 77876009 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -40041 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 127.75-193 chr7 124808727 124808971 + 1 NA Intergenic Intergenic -18039 NM_001024603 154872 Hs.444163 NM_001024603 ENSG00000275356 C7orf77 - chromosome 7 open reading frame 77 protein-coding 122.5-11 chr1 111106417 111106631 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -32859 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 115.5-194 chr4 172059554 172059717 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -246028 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 408.5-9 chr6 155144378 155145084 + 1 NA exon (NM_012454, exon 5 of 26) exon (NM_012454, exon 5 of 26) 54442 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 143.75-174 chr7 80148312 80148557 + 1 NA intron (NM_001256414, intron 1 of 7) intron (NM_001256414, intron 1 of 7) 12650 NM_001256414 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 149.5-87 chr2 4392467 4392685 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 263646 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 274.75-40 chr5 28471207 28471641 + 1 NA Intergenic Intergenic -183759 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 311.75-14 chr20 47057367 47057928 + 1 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) intron (NM_172110, intron 5 of 13) -109320 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 169.25-87 chr4 80137906 80138188 + 1 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -47223 NM_020226 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 154.5-15 chr1 176344671 176344998 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -118341 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 119.25-123 chr3 19081742 19081874 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -66702 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 217.5-24 chr11 47241692 47241985 + 1 NA intron (NM_001302492, intron 9 of 9) L2a|LINE|L2 -6462 NM_001251935 10062 Hs.438863 NM_005693 ENSG00000025434 NR1H3 LXR-a|LXRA|RLD-1 nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 protein-coding 210.5-63 chr2 70326210 70326543 + 1 NA Intergenic Intergenic -24309 NM_001329753 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 227.25 chr1 23362617 23362897 + 1 NA exon (NM_001077195, exon 4 of 4) exon (NM_001077195, exon 4 of 4) 5629 NM_030634 80818 Hs.293798 NM_030634 ENSG00000125945 ZNF436 ZNF|Zfp46 zinc finger protein 436 protein-coding 211.25-92 chr8 70231482 70231765 + 1 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) intron (NM_001321711, intron 2 of 21) -160371 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 235.5-36 chr15 27113712 27114060 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) L1MC5|LINE|L1 47433 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-130 chr5 118654510 118654911 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 58522 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 204.5-25 chr12 45190789 45191044 + 1 NA intron (NR_037144, intron 1 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 25090 NR_037144 51054 Hs.233495 NM_015899 ENSG00000134297 PLEKHA8P1 FAPP-2|FAPP2|PLEKHA8|PLEKHA9|hFAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 pseudogene 1 pseudo 151.75-68 chr2 163386530 163386771 + 1 NA Intergenic Intergenic 349358 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 196.75-34 chr13 73343756 73344071 + 1 NA Intergenic Intergenic -220331 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 140.5-42 chr11 109017487 109017718 + 1 NA Intergenic Intergenic 352533 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 184.75-109 chr8 128410689 128411021 + 1 NA intron (NR_121672, intron 6 of 7) intron (NR_121672, intron 6 of 7) 153824 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 232.5-7 chr1 176511877 176512183 + 1 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 48855 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 163.75-95 chr3 124677648 124677929 + 1 NA intron (NM_007064, intron 16 of 26) intron (NM_007064, intron 16 of 26) -52578 NR_033434 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 324.5-20 chr3 15675803 15676344 + 1 NA intron (NM_001349280, intron 25 of 26) intron (NM_001349280, intron 25 of 26) 21298 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 202.5-117 chr5 87274451 87274747 + 1 NA intron (NM_022650, intron 1 of 24) intron (NM_022650, intron 1 of 24) 5675 NM_022650 5921 Hs.664080 NM_002890 ENSG00000145715 RASA1 CM-AVM|CMAVM|CMAVM1|GAP|PKWS|RASA|RASGAP|p120|p120GAP|p120RASGAP RAS p21 protein activator 1 protein-coding 172.75-15 chr10 73206373 73206758 + 1 NA intron (NM_173348, intron 5 of 13) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 38446 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 181.5-101 chr22 46879710 46879973 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 5 of 12) intron (NM_001284305, intron 5 of 12) 36201 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 167.5-48 chr12 45777637 45777810 + 1 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) intron (NM_152641, intron 3 of 20) 48014 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 263.5-70 chrX 57242634 57243121 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -43800 NM_001353840 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 158.5-190 chr8 84925833 84926078 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -181283 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 124.25-81 chr17 75177256 75177499 + 1 NA intron (NM_006937, intron 2 of 3) AluSc8|SINE|Alu 5582 NM_006937 6613 Hs.380973 NM_006937 ENSG00000188612 SUMO2 HSMT3|SMT3B|SMT3H2|SUMO3|Smt3A small ubiquitin like modifier 2 protein-coding 175.25-139 chr8 57976589 57976957 + 1 NA Intergenic Intergenic -1585 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 134.75-73 chr15 38462940 38463237 + 1 NA intron (NM_173611, intron 1 of 7) intron (NM_173611, intron 1 of 7) 8961 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 134.5-185 chr5 168439148 168439379 + 1 NA intron (NM_001161661, intron 15 of 22) L1MC5a|LINE|L1 -47208 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 216.5-131 chr9 94284380 94284799 + 1 NA intron (NM_194320, intron 2 of 4) L1M4|LINE|L1 -25278 NR_160773 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 179.25-152 chr9 85059502 85059821 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 353760 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 192.75-105 chr5 80970884 80971149 + 1 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -10109 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 318.75-17 chr5 36120836 36121380 + 1 NA intron (NM_001007527, intron 9 of 17) L2a|LINE|L2 26880 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 226.25-53 chr4 54375372 54375639 + 1 NA Intergenic Intergenic 42613 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 208.75-25 chr14 29873569 29874015 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 53304 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 129.5-251 chrX 155002086 155002408 + 1 NA intron (NM_000132, intron 1 of 25) L1MB2|LINE|L1 20476 NM_000132 2157 Hs.632836 NM_000132 ENSG00000185010 F8 AHF|DXS1253E|F8B|F8C|FVIII|HEMA coagulation factor VIII protein-coding 176.5-27 chr11 24143757 24143945 + 1 NA Intergenic Intergenic -353202 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 182.75-114 chr5 158789096 158789390 + 1 NA intron (NM_001324107, intron 9 of 15) intron (NM_001324107, intron 9 of 15) 308713 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 185.5-65 chr16 68962405 68962649 + 1 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) intron (NM_024562, intron 14 of 17) 118996 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 193.5-57 chr16 35295394 35295661 + 1 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -67889 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 133.5-80 chr14 64702072 64702329 + 1 NA Intergenic Intergenic -2224 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 304.75-16 chr19 49716419 49716914 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 25550 NR_108072 126129 Hs.112195 NM_152359 ENSG00000169169 CPT1C CATL1|CPT1-B|CPT1P|CPTI-B|CPTIC|SPG73 carnitine palmitoyltransferase 1C protein-coding 331.75-22 chr5 164053458 164053809 + 1 NA Intergenic Intergenic 413769 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 183.25-93 chr6 95019244 95019597 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 558031 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 189.75-27 chr13 70557430 70557758 + 1 NA Intergenic Intergenic -449101 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 284.75-21 chr2 230151311 230151716 + 1 NA Intergenic Intergenic 68471 NM_004509 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 128.5-132 chr22 18120778 18120943 + 1 NA intron (NM_018943, intron 1 of 4) intron (NM_018943, intron 1 of 4) 10051 NM_018943 51807 Hs.137400 NM_018943 ENSG00000183785 TUBA8 CDCBM8|TUBAL2 tubulin alpha 8 protein-coding 219.5-121 chr7 34067044 34067475 + 1 NA intron (NM_133468, intron 12 of 15) intron (NM_133468, intron 12 of 15) 161720 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 134.25-4 chr1 42052766 42053052 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -16975 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 211.5-12 chr1 241540327 241540727 + 1 NA intron (NM_003679, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 8149 NM_003679 8564 Hs.731056 NM_003679 ENSG00000117009 KMO dJ317G22.1 kynurenine 3-monooxygenase protein-coding 239.5-67 chr6 139766343 139766747 + 1 NA Intergenic Intergenic -4528 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 141.75-165 chr7 110232367 110232541 + 1 NA Intergenic Intergenic -272241 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 224.25-15 chr10 79072981 79073389 + 1 NA intron (NM_020338, intron 1 of 24) MIRc|SINE|MIR 4219 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 214.5-25 chr12 60440210 60440533 + 1 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 751001 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 124.5-55 chr13 55911698 55911886 + 1 NA Intergenic Intergenic 737338 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 130.5-16 chr1 117460406 117460747 + 1 NA exon (NM_006699, exon 7 of 13) exon (NM_006699, exon 7 of 13) 93127 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 142.5-34 chr10 110981395 110981552 + 1 NA intron (NM_001269039, intron 2 of 7) L1MEc|LINE|L1 -7453 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 245.5-85 chr9 20910747 20911240 + 1 NA intron (NM_017794, intron 24 of 45) intron (NM_017794, intron 24 of 45) 120647 NM_001321883 401494 Hs.716678 NM_001010915 ENSG00000188921 HACD4 PTPLAD2 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 protein-coding 240.25-64 chr7 82840595 82840947 + 1 NA intron (NM_033026, intron 14 of 24) intron (NM_033026, intron 14 of 24) 322113 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 153.5-218 chrX 78813834 78814089 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 66241 NM_005296 2846 Hs.522701 NM_005296 ENSG00000147145 LPAR4 GPR23|LPA4|P2RY9|P2Y5-LIKE|P2Y9 lysophosphatidic acid receptor 4 protein-coding 207.75-47 chr19 29142120 29142584 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 70799 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 173.75-23 chr10 41860680 41861194 + 1 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 507108 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 144.5-188 chr6 56773901 56774076 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) AluSz|SINE|Alu 69677 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 168.25-93 chr21 27553917 27554226 + 1 NA Intergenic Intergenic -168308 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 181.5-117 chr4 28015492 28015769 + 1 NA Intergenic Intergenic 798151 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 113.5-84 chr15 61017054 61017275 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 212138 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 121.25-183 chr6 145817588 145817789 + 1 NA intron (NR_038245, intron 1 of 2) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 2812 NR_038244 100507557 Hs.124537 NR_038244 ENSG00000235652 LOC100507557 - uncharacterized LOC100507557 ncRNA 151.5-132 chr3 161214656 161214850 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -6537 NM_001320227 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 131.75-193 chr6 139064292 139064515 + 1 NA Intergenic Intergenic 35658 NM_021243 58527 Hs.600861 NM_021243 ENSG00000146386 ABRACL C6orf115|Costars|HSPC280|PRO2013 ABRA C-terminal like protein-coding 244.5-112 chrX 65982551 65982966 + 1 NA Intergenic Intergenic -36112 NR_029637 407008 NR_029637 ENSG00000284567 MIR223 MIRN223|miRNA223|mir-223 microRNA 223 ncRNA 169.75-48 chr14 51595728 51596015 + 1 NA intron (NR_047477, intron 1 of 3) intron (NR_047477, intron 1 of 3) 4081 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 159.25-151 chr8 99542600 99542906 + 1 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) MIR|SINE|MIR -5892 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 285.5 chr1 112692044 112692459 + 1 NA intron (NM_001321324, intron 6 of 20) AluJb|SINE|Alu 14805 NM_001042679 389 Hs.502659 NM_175744 ENSG00000155366 RHOC ARH9|ARHC|H9|RHOH9 ras homolog family member C protein-coding 196.25-96 chr4 177326878 177327266 + 1 NA intron (NM_018248, intron 2 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 17198 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 149.5-49 chr12 115919890 115920079 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 228670 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 173.5-47 chr15 77413787 77414036 + 1 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) AluJo|SINE|Alu 6193 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 280.5-53 chr8 104958109 104958701 + 1 NA Intergenic Intergenic -360033 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 153.5-121 chr22 20634898 20635142 + 1 NA Intergenic Intergenic -54535 NR_024592 266697 Hs.558711 NR_024592 POM121L4P - POM121 transmembrane nucleoporin like 4, pseudogene pseudo 123.5-30 chr10 84005205 84005370 + 1 NA Intergenic Intergenic -134222 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 158.5-33 chr11 6675098 6675391 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 8096 NM_022061 63875 Hs.523456 NM_022061 ENSG00000158042 MRPL17 L17mt|LIP2|MRP-L17|MRP-L26|RPL17L|RPML26 mitochondrial ribosomal protein L17 protein-coding 228.25-15 chr11 86214758 86215199 + 1 NA Intergenic Intergenic -29406 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 127.75-149 chr4 124237139 124237346 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 321192 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 183.5-49 chr15 64941683 64942079 + 1 NA intron (NM_182703, intron 9 of 14) intron (NM_182703, intron 9 of 14) 29979 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 189.5-145 chr8 79524542 79524841 + 1 NA Intergenic Intergenic -86426 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 161.75-17 chr10 47144149 47144466 + 1 NA Intergenic Intergenic -155890 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 122.25-163 chr6 126176161 126176417 + 1 NA Intergenic Intergenic -163500 NM_001012507 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 170.25-61 chr18 68893272 68893551 + 1 NA intron (NM_001093729, intron 7 of 9) intron (NM_001093729, intron 7 of 9) 95331 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 162.75-16 chr10 65201617 65201860 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -277220 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 162.75-38 chr15 63913193 63913431 + 1 NA intron (NM_014326, intron 9 of 11) L1MB7|LINE|L1 -14962 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 224.25-26 chr12 112998164 112998500 + 1 NA exon (NM_016817, exon 5 of 11) exon (NM_016817, exon 5 of 11) 19813 NM_016817 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 116.25-211 chr7 39079835 39079972 + 1 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) intron (NM_007252, intron 2 of 10) -66336 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 267.75-11 chr12 53534318 53534708 + 1 NA exon (NM_001366559, exon 6 of 13) exon (NM_001366559, exon 6 of 13) 20529 NR_046221 100652999 Hs.633602 NR_046221 ENSG00000257550 LOC100652999 - uncharacterized LOC100652999 ncRNA 157.5-141 chr3 137536025 137536252 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -228177 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 131.5-25 chr10 56705532 56705702 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -344344 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 187.5-118 chr3 106343220 106343673 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -474045 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 186.75-3 chr1 84305034 84305319 + 1 NA intron (NM_001134663, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 2525 NM_001134664 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 232.25-46 chr3 106942756 106943079 + 1 NA Intergenic Intergenic 297721 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 170.5-157 chr6 47077792 47078023 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -35575 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 313.75-24 chr8 133747845 133748327 + 1 NA Intergenic Intergenic 29266 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 207.75-13 chr10 6175758 6176209 + 1 NA intron (NM_001282630, intron 1 of 14) L1ME3|LINE|L1 -23721 NR_039698 100628560 NR_039698 ENSG00000283634 MIR3155B hsa-mir-3155b microRNA 3155b ncRNA 339.25-4 chr12 15998704 15999476 + 1 NA intron (NM_015954, intron 6 of 8) intron (NM_015954, intron 6 of 8) 87758 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 204.5-64 chr2 70787932 70788260 + 1 NA intron (NM_001004311, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 2547 NM_001004311 344018 Hs.407636 NM_001004311 ENSG00000183733 FIGLA BHLHC8|FIGALPHA|POF6 folliculogenesis specific bHLH transcription factor protein-coding 166.25-127 chr5 66517455 66517900 + 1 NA Intergenic Intergenic -6073 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 164.5-30 chr11 98848987 98849309 + 1 NA Intergenic MER61C|LTR|ERV1 -171801 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 283.5-34 chr21 14393637 14394106 + 1 NA Intergenic Intergenic -10725 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 171.75-42 chr14 69029056 69029277 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 49484 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 267.5-15 chr12 13838675 13839235 + 1 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 141401 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 224.75-55 chr5 27618073 27618481 + 1 NA Intergenic Intergenic 145985 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 243.5-2 chr1 18637670 18637966 + 1 NA intron (NM_001135254, intron 4 of 8) CpG 6972 NM_013945 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 132.75-124 chr3 36392681 36392980 + 1 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 12343 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 245.25-61 chr6 67234581 67234968 + 1 NA Intergenic Intergenic -820577 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 216.5-29 chr14 42219343 42219683 + 1 NA Intergenic Intergenic 612657 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 148.5-221 chr8 59680199 59680437 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 561108 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 215.5-24 chr12 43442483 43442918 + 1 NA intron (NM_025003, intron 16 of 38) intron (NM_025003, intron 16 of 38) 109503 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 119.5-149 chr3 34029563 34029754 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 231028 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 178.5-130 chr4 153068812 153069024 + 1 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -83416 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 121.5-219 chr6 38983317 38983460 + 1 NA intron (NM_001371, intron 85 of 91) intron (NM_001371, intron 85 of 91) -30281 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 201.25-67 chr3 158081234 158081762 + 1 NA Intergenic Intergenic 24665 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 137.75-99 chr2 75270919 75271115 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -71497 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 179.5-110 chr21 26796455 26796969 + 1 NA Intergenic Intergenic 48697 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 180.25-126 chr9 3103306 3103544 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -78164 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 135.5-129 chr22 28117197 28117460 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -196716 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 171.25-152 chr8 119185799 119186051 + 1 NA Intergenic Intergenic -22438 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 127.75-170 chr6 42968804 42968987 + 1 NA non-coding (NR_133009, exon 6 of 15) non-coding (NR_133009, exon 6 of 15) 8141 NM_001318865 27232 Hs.144914 NM_018960 ENSG00000124713 GNMT HEL-S-182mP glycine N-methyltransferase protein-coding 175.25-115 chr5 58490575 58490932 + 1 NA promoter-TSS (NM_001304431) promoter-TSS (NM_001304431) -682 NM_001304428 202309 Hs.547697 NM_152687 ENSG00000175857 GAPT C5orf29 GRB2 binding adaptor protein, transmembrane protein-coding 251.25-4 chr1 105068458 105068764 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 550324 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 174.75-98 chr5 36763738 36764005 + 1 NA Intergenic Intergenic 112823 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 155.5-63 chr16 13668623 13668818 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -251437 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 256.25-14 chr15 93113843 93114363 + 1 NA Intergenic Alu|SINE|Alu -24892 NM_020211 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 244.25-58 chrX 147418687 147418973 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -134102 NR_030240 574518 NR_030240 ENSG00000207867 MIR514A3 MIR514-3|MIRN514-3|hsa-mir-514a-3 microRNA 514a-3 ncRNA 184.25-106 chr6 37790369 37790768 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29159 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 221.5-20 chr13 64260551 64260963 + 1 NA Intergenic Intergenic -184746 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 178.5-74 chr2 15159018 15159325 + 1 NA Intergenic Intergenic 402163 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 203.25-59 chr20 4849422 4849829 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -26017 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 193.5-160 chr8 26318435 26318836 + 1 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) L1MC5a|LINE|L1 25419 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 213.5-130 chr9 79027162 79027544 + 1 NA Intergenic Intergenic 118313 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 145.5-41 chr12 9122893 9123246 + 1 NA Intergenic Intergenic -6840 NM_001347423 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 212.5-78 chr4 13988405 13988653 + 1 NA Intergenic Intergenic -123439 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 164.75-101 chr3 106118947 106119212 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -249678 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 186.75-31 chr14 50171729 50171969 + 1 NA intron (NM_006939, intron 8 of 22) L1M5|LINE|L1 -55277 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 161.5-96 chr2 48291724 48292050 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -22795 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 218.75-7 chr10 44573125 44573590 + 1 NA Intergenic Intergenic -188260 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 262.75-3 chr10 24418553 24418859 + 1 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) intron (NM_019590, intron 3 of 20) -30708 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 184.25-102 chr5 107864536 107864856 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 8 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -193759 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 151.75-77 chr20 25267421 25267730 + 1 NA intron (NM_002862, intron 2 of 19) AluJb|SINE|Alu 19490 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 126.25-203 chr8 82316317 82316551 + 1 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -474148 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 231.5-100 chr8 110624151 110624440 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 403138 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 133.25-136 chr3 99286623 99286950 + 1 NA Intergenic Intergenic -351808 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 154.25-129 chr5 55875024 55875189 + 1 NA intron (NM_001297572, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 21784 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 217.5-92 chr4 118335225 118335502 + 1 NA intron (NM_003619, intron 3 of 12) intron (NM_003619, intron 3 of 12) 17640 NM_003619 8492 Hs.445857 NM_003619 ENSG00000164099 PRSS12 BSSP-3|BSSP3|MRT1 serine protease 12 protein-coding 145.25-95 chr22 37811544 37811752 + 1 NA intron (NM_014291, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 3743 NM_014291 23464 Hs.54609 NM_014291 ENSG00000100116 GCAT KBL glycine C-acetyltransferase protein-coding 204.5-61 chr2 33186089 33186456 + 1 NA intron (NM_206943, intron 5 of 33) L1MA2|LINE|L1 51675 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 115.5-229 chr7 45264497 45264673 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 106794 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 137.75-73 chr15 59848442 59848617 + 1 NA Intergenic Intergenic -155782 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 145.25-127 chr5 25647448 25647602 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 456572 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 229.75-83 chrX 73691874 73692412 + 1 NA Intergenic Intergenic -100062 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 191.75 chr1 55600790 55600994 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 344071 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 165.5-147 chr5 23683689 23683935 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 176157 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 137.5-120 chr2 80582644 80582823 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 8 of 11) intron (NM_001282599, intron 8 of 11) 269354 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 297.5-46 chr5 68331285 68331656 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 38893 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 234.75-28 chr16 63128101 63128437 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -1091831 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 178.5 chr1 9610818 9611138 + 1 NA intron (NM_001130924, intron 9 of 10) intron (NM_001130924, intron 9 of 10) 22067 NM_001010866 199953 Hs.632365 NM_001010866 ENSG00000188807 TMEM201 Ima1|NET5|SAMP1 transmembrane protein 201 protein-coding 188.25-47 chr15 56181133 56181533 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) L2a|LINE|L2 8599 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 206.5-31 chr15 78176490 78176846 + 1 NA intron (NM_015162, intron 11 of 13) AluJb|SINE|Alu 27306 NM_005530 3419 Hs.591110 NM_005530 ENSG00000166411 IDH3A - isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 alpha protein-coding 118.5-84 chr2 8071124 8071286 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) L1M|LINE|L1 -94391 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 135.25-118 chr20 54538918 54539117 + 1 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) AluSx4|SINE|Alu 63424 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 118.75-24 chr10 83069473 83069603 + 1 NA Intergenic Intergenic 607551 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 122.75-138 chr3 142662572 142662706 + 1 NA intron (NM_001172312, intron 1 of 15) L1ME4a|LINE|L1 5742 NM_001172312 5357 Hs.203637 NM_002670 ENSG00000120756 PLS1 - plastin 1 protein-coding 193.5-102 chr22 36961955 36962187 + 1 NA Intergenic Intergenic -3177 NR_038954 100506241 Hs.640023 NR_038954 ENSG00000215403 LL22NC01-81G9.3 - uncharacterized protein FLJ39582-like ncRNA 178.5-84 chr2 77049255 77049592 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MA5|LINE|L1 63458 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 170.5-10 chr1 108944220 108944463 + 1 NA intron (NM_001048210, intron 4 of 11) AluJr4|SINE|Alu 6107 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 248.5-88 chr6 27821742 27822106 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -2201 NM_021968 8363 Hs.278483 NM_021968 ENSG00000197238 HIST1H4J H4/e|H4F2iv|H4FE|dJ160A22.2 histone cluster 1 H4 family member j protein-coding 164.75-44 chr14 21720349 21720578 + 1 NA Intergenic Intergenic -49446 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 200.75-49 chr2 34529504 34529804 + 1 NA Intergenic Intergenic -147903 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 204.5-85 chr3 25034642 25035086 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 205541 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 218.25-88 chr7 6610841 6611189 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -4595 NM_001353546 54753 Hs.592170 NM_017560 ENSG00000236609 ZNF853 - zinc finger protein 853 protein-coding 251.75-30 chr17 66218951 66219402 + 1 NA intron (NM_000042, intron 5 of 7) L1MC4|LINE|L1 10239 NM_000042 350 Hs.445358 NM_000042 ENSG00000091583 APOH B2G1|B2GP1|BG apolipoprotein H protein-coding 204.5-75 chr20 57878048 57878378 + 1 NA Intergenic Intergenic -125691 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 205.5-17 chr10 127009601 127009974 + 1 NA intron (NM_001380, intron 11 of 51) intron (NM_001380, intron 11 of 51) 104378 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 176.25-38 chr13 73937471 73937662 + 1 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 196363 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 146.5-94 chr19 19433418 19433692 + 1 NA intron (NM_001359631, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 -1508 NR_030370 693225 NR_030370 ENSG00000207821 MIR640 MIRN640|hsa-mir-640 microRNA 640 ncRNA 124.75-33 chr10 87810565 87810791 + 1 NA intron (NM_001321967, intron 2 of 9) L1ME3B|LINE|L1 7553 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 269.5-53 chr7 38475022 38475418 + 1 NA intron (NM_001635, intron 7 of 20) MER3|DNA|hAT-Charlie 133643 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 312.75-15 chr2 163993124 163993525 + 1 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -257316 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 176.5-33 chr12 2891189 2891589 + 1 NA intron (NM_003324, intron 1 of 10) CpG 498 NM_001160408 7289 Hs.655333 NM_003324 ENSG00000078246 TULP3 TUBL3 TUB like protein 3 protein-coding 212.75-61 chr21 43666486 43666829 + 1 NA intron (NM_015056, intron 1 of 15) AluSg4|SINE|Alu 7097 NM_015056 23076 Hs.565725 NM_015056 ENSG00000160208 RRP1B KIAA0179|NNP1L|Nnp1|PPP1R136|RRP1 ribosomal RNA processing 1B protein-coding 220.5-127 chr9 3732007 3732348 + 1 NA Intergenic Intergenic 64091 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 266.5-39 chr2 178443486 178443955 + 1 NA intron (NM_001139517, intron 3 of 6) intron (NM_001139517, intron 3 of 6) 6908 NM_001139518 8575 Hs.570274 NM_003690 ENSG00000180228 PRKRA DYT16|HSD14|PACT|RAX protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2 protein-coding 213.25-54 chr5 107043334 107043785 + 1 NA Intergenic Intergenic -32545 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 217.25-66 chr5 88641561 88641996 + 1 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 25161 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 162.5-11 chr10 10818854 10819074 + 1 NA intron (NM_001326327, intron 1 of 14) intron (NM_001326327, intron 1 of 14) 20239 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 169.5-118 chr4 20373576 20373842 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) L2a|LINE|L2 -18480 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 123.25-180 chr6 169716017 169716152 + 1 NA exon (NM_133325, exon 5 of 12) exon (NM_133325, exon 5 of 12) 7926 NM_133325 55274 Hs.435933 NM_018288 ENSG00000130024 PHF10 BAF45A|XAP135 PHD finger protein 10 protein-coding 180.5-21 chr11 109238492 109238810 + 1 NA Intergenic Intergenic -183539 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 321.75-21 chr22 26765191 26765738 + 1 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 92621 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 245.5-15 chr12 69811351 69811622 + 1 NA intron (NM_175625, intron 8 of 9) intron (NM_175625, intron 8 of 9) -13741 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 156.5-83 chr2 108119516 108119716 + 1 NA Intergenic Intergenic -66861 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 279.5-66 chr8 85591681 85592071 + 1 NA Intergenic Intergenic 63800 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 203.25-13 chr10 43034767 43035017 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 37329 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 170.5-55 chr14 27479201 27479570 + 1 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -133203 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 220.25-24 chr17 66356096 66356543 + 1 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 53706 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 151.75-127 chr6 105073577 105073894 + 1 NA intron (NM_001004317, intron 3 of 3) intron (NM_001004317, intron 3 of 3) 62611 NM_147147 11149 Hs.221660 NM_007073 ENSG00000112276 BVES CARICK|HBVES|LGMD2X|LGMDR25|POP1|POPDC1 blood vessel epicardial substance protein-coding 146.25-80 chr2 177531640 177531900 + 1 NA intron (NM_003659, intron 19 of 19) L1MD1|LINE|L1 21026 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 212.25-12 chr10 126364986 126365287 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) intron (NM_001288974, intron 1 of 18) 23341 NM_001288974 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 362.5-4 chr11 60600728 60601226 + 1 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -14774 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 152.75-143 chr7 129438914 129439233 + 1 NA intron (NM_020704, intron 1 of 20) MER21C|LTR|ERVL 4641 NM_001134336 57464 Hs.489988 NM_020704 ENSG00000128578 STRIP2 FAM40B|FAR11B striatin interacting protein 2 protein-coding 190.5-152 chr7 118294874 118295090 + 1 NA Intergenic Intergenic 70278 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 347.25-23 chr7 35688239 35688982 + 1 NA intron (NM_022373, intron 2 of 8) intron (NM_022373, intron 2 of 8) 6525 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 315.25-28 chr6 53134444 53135351 + 1 NA intron (NM_003643, intron 2 of 5) intron (NM_003643, intron 2 of 5) 13944 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 180.25-73 chr3 99505364 99505647 + 1 NA Intergenic Intergenic -133089 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 355.25-13 chr6 7953980 7954684 + 1 NA intron (NR_037616, intron 4 of 12) intron (NR_037616, intron 4 of 12) -31770 NR_027712 206426 Hs.676966 NR_027712 PIP5K1P1 - phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 pseudogene 1 pseudo 150.5-23 chr10 118880469 118880670 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -125599 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 372.5-24 chr8 124779521 124780108 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -42171 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 198.25-34 chr15 25820777 25820984 + 1 NA intron (NM_024490, intron 1 of 20) intron (NM_024490, intron 1 of 20) 27945 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 199.25-54 chr2 40943479 40943836 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -431222 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 270.75-31 chr20 15640676 15641274 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 282339 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 137.75-32 chr10 123855818 123856041 + 1 NA intron (NM_198148, intron 3 of 13) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 35878 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 155.75-7 chr1 55148460 55148673 + 1 NA exon (NM_015306, exon 17 of 68) exon (NM_015306, exon 17 of 68) 66798 NM_015306 23358 Hs.477009 NM_015306 ENSG00000162402 USP24 - ubiquitin specific peptidase 24 protein-coding 148.75-68 chr16 84701758 84701956 + 1 NA intron (NR_073577, intron 1 of 11) intron (NR_073577, intron 1 of 11) 1857 NR_073578 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 178.5-110 chr3 122918159 122918505 + 1 NA intron (NR_046079, intron 12 of 22) MER5B|DNA|hAT-Charlie 31819 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 130.5-230 chr7 87488114 87488300 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -12504 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 218.5-105 chr6 988892 989219 + 1 NA intron (NR_027116, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 112277 NR_027116 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 143.5-23 chr10 48534757 48534941 + 1 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) intron (NR_144642, intron 3 of 9) -23260 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 153.5-75 chr17 44804433 44804669 + 1 NA 3' UTR (NM_005497, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_005497, exon 3 of 3) 25736 NM_005497 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 244.5-102 chr8 132487503 132487818 + 1 NA Intergenic Intergenic -6565 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 213.75-66 chr3 42994667 42995133 + 1 NA intron (NM_001129908, intron 1 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie 15589 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 209.75-90 chr7 30919842 30920266 + 1 NA intron (NM_198098, intron 1 of 3) intron (NM_198098, intron 1 of 3) 8201 NM_001329872 358 Hs.76152 NM_000385 ENSG00000240583 AQP1 AQP-CHIP|CHIP28|CO aquaporin 1 (Colton blood group) protein-coding 136.75-172 chr6 138035371 138035584 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 71942 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 282.25-3 chr1 180042738 180043151 + 1 NA intron (NM_014810, intron 19 of 37) MIR3|SINE|MIR 88134 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 115.75-29 chr11 77450551 77450717 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 23429 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 135.5-179 chr7 11224644 11224882 + 1 NA Intergenic Intergenic 250891 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 115.75-16 chr10 46061796 46061934 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -15596 NM_002443 4477 Hs.255462 NM_002443 ENSG00000263639 MSMB HPC13|IGBF|MSP|MSPB|PN44|PRPS|PSP|PSP-94|PSP57|PSP94 microseminoprotein beta protein-coding 129.25-183 chr7 37208533 37208685 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 145059 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 201.25-7 chr1 200258725 200259008 + 1 NA Intergenic Intergenic 114926 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 200.75-99 chr7 47437836 47438132 + 1 NA intron (NM_022748, intron 6 of 30) intron (NM_022748, intron 6 of 30) 26819 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 279.75-44 chr5 116663716 116664062 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -89066 NM_020796 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 245.75-65 chr8 144245457 144245866 + 1 NA intron (NM_001288814, intron 27 of 41) AluJo|SINE|Alu 17076 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 275.25-18 chr2 24156270 24156761 + 1 NA intron (NM_001145710, intron 7 of 10) AluSq2|SINE|Alu -18538 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 217.5-120 chr7 90323284 90323541 + 1 NA Intergenic Intergenic -11811 NR_110085 101927446 Hs.734999 NR_110085 ENSG00000105793 LOC101927446 - uncharacterized LOC101927446 ncRNA 213.5-11 chr1 225509376 225509792 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 10 of 14) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -80729 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 120.5-191 chr5 174785990 174786166 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 34344 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 225.75-9 chr1 235568349 235568735 + 1 NA intron (NM_004485, intron 2 of 2) intron (NM_004485, intron 2 of 2) -64090 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 244.75-37 chr22 45688424 45688834 + 1 NA intron (NM_001167621, intron 1 of 10) intron (NM_001167621, intron 1 of 10) 16795 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 121.5-20 chr1 215467997 215468170 + 1 NA Intergenic Intergenic -99221 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 156.75-98 chr2 170944237 170944536 + 1 NA intron (NM_015530, intron 1 of 9) intron (NM_015530, intron 1 of 9) 15133 NM_015530 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 129.25-190 chr7 106462508 106462714 + 1 NA Intergenic Intergenic -177628 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 185.5-97 chr20 56446124 56446364 + 1 NA intron (NM_001164116, intron 4 of 6) intron (NM_001164116, intron 4 of 6) -22341 NM_001283036 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 244.75-7 chr10 30078902 30079198 + 1 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) -19464 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 210.5-87 chr4 59473141 59473415 + 1 NA Intergenic Intergenic 459705 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 243.5-71 chr7 27890440 27890915 + 1 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 150582 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 371.5-17 chr9 123192307 123193066 + 1 NA intron (NR_033234, intron 1 of 18) intron (NR_033234, intron 1 of 18) 75900 NR_033234 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 183.5-25 chr10 103677211 103677472 + 1 NA intron (NM_014631, intron 6 of 13) intron (NM_014631, intron 6 of 13) 874 NM_001365079 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 137.25-170 chr8 105578444 105578667 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 259012 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 242.25-14 chr10 89344410 89344701 + 1 NA Intergenic Intergenic 12026 NM_001031683 3437 Hs.47338 NM_001549 ENSG00000119917 IFIT3 CIG-49|GARG-49|IFI60|IFIT4|IRG2|ISG60|P60|RIG-G|cig41 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 protein-coding 121.5-224 chr6 71083692 71083840 + 1 NA Intergenic Intergenic -126706 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 192.5-72 chr2 145411578 145411796 + 1 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA 743720 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 145.75-158 chr8 47219673 47219823 + 1 NA Intergenic Intergenic 30441 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 152.5 chr1 28055787 28055963 + 1 NA intron (NM_001282562, intron 2 of 16) intron (NM_001282562, intron 2 of 16) 32735 NM_001990 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 268.25-30 chr22 19857053 19857588 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2446 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 179.5-91 chr2 53804932 53805206 + 1 NA intron (NM_001127398, intron 8 of 12) AluSx1|SINE|Alu 18025 NM_015701 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 260.5-50 chr5 56876908 56877370 + 1 NA intron (NM_005921, intron 10 of 19) MER103C|DNA|hAT-Charlie -32121 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 262.5-40 chr2 187280360 187280874 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 167635 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 195.5-125 chr5 146925696 146926021 + 1 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L1M4a2|LINE|L1 -6352 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 125.25-140 chr4 6097664 6097800 + 1 NA intron (NM_001306134, intron 2 of 11) intron (NM_001306134, intron 2 of 11) -79186 NM_001364690 389197 Hs.479065 NM_207405 ENSG00000181215 C4orf50 - chromosome 4 open reading frame 50 protein-coding 156.75-133 chr5 44888226 44888474 + 1 NA Intergenic Intergenic 79403 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 138.5-93 chr19 51538609 51538906 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -7087 NM_001177549 946 Hs.720304 NM_001245 ENSG00000105492 SIGLEC6 CD327|CD33L|CD33L1|CD33L2|CDW327|OBBP1 sialic acid binding Ig like lectin 6 protein-coding 129.5-157 chr3 81474551 81474795 + 1 NA Intergenic Intergenic 286972 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 219.5-5 chr1 106785409 106785655 + 1 NA Intergenic Intergenic -32707 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 213.25-37 chr22 22097459 22097874 + 1 NA Intergenic Intergenic -53732 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 213.25-41 chr3 9134548 9134992 + 1 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) intron (NM_014850, intron 1 of 21) -57723 NR_121664 101927416 Hs.475364 NR_121663 ENSG00000228723 SRGAP3-AS2 - SRGAP3 antisense RNA 2 ncRNA 152.5-164 chr6 42214593 42214797 + 1 NA intron (NM_018141, intron 1 of 6) intron (NM_018141, intron 1 of 6) 3166 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 231.5-60 chr3 1443040 1443460 + 1 NA Intergenic Intergenic 350226 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 120.5-216 chr7 44045431 44045618 + 1 NA intron (NM_001284313, intron 1 of 10) intron (NM_001284313, intron 1 of 10) 822 NM_001014436 28988 Hs.436500 NM_014063 ENSG00000136279 DBNL ABP1|HIP-55|HIP55|SH3P7 drebrin like protein-coding 124.5-115 chr2 200133415 200133596 + 1 NA Intergenic Intergenic -172374 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 147.75-105 chr3 77743714 77744051 + 1 NA Intergenic Intergenic 305081 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 292.5-22 chr15 60227611 60228032 + 1 NA Intergenic Intergenic 170165 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 132.75-180 chr7 95872948 95873172 + 1 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) intron (NM_004411, intron 6 of 16) 100554 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 193.75-111 chr7 16396836 16397253 + 1 NA intron (NM_001101426, intron 2 of 9) intron (NM_001101426, intron 2 of 9) 24494 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 151.75-150 chr8 80060279 80060491 + 1 NA intron (NR_105034, intron 1 of 4) L1MB5|LINE|L1 20445 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 124.25-97 chr2 55173948 55174180 + 1 NA non-coding (NR_148538, exon 6 of 6) non-coding (NR_148538, exon 6 of 6) -36233 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 114.5-147 chr2 172380346 172380481 + 1 NA Intergenic Intergenic -46923 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 181.25-58 chr2 15655141 15655349 + 1 NA Intergenic Intergenic -35537 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 195.75-5 chr1 38748812 38749063 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 110835 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 144.75-108 chr3 18400920 18401291 + 1 NA intron (NM_001131010, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 24234 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 156.75-57 chr14 50174826 50175153 + 1 NA intron (NM_006939, intron 7 of 22) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 56589 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 255.5-10 chr10 33980577 33980875 + 1 NA Intergenic Intergenic -208046 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 131.25-84 chr18 8604308 8604562 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -5010 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 416.25-9 chr2 50619071 50619762 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 76846 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 320.5-51 chr9 82784977 82785376 + 1 NA Intergenic Intergenic 277966 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 239.75-61 chr5 157115558 157115972 + 1 NA Intergenic Intergenic -6721 NM_032782 84868 Hs.710500 NM_032782 ENSG00000135077 HAVCR2 CD366|HAVcr-2|KIM-3|SPTCL|TIM3|TIMD-3|TIMD3|Tim-3 hepatitis A virus cellular receptor 2 protein-coding 126.5-142 chr22 24979593 24979834 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -33018 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 220.75-61 chr6 49319685 49320102 + 1 NA Intergenic Intergenic 143360 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 165.5-114 chr3 97111926 97112185 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 297461 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 175.5-77 chr18 6128037 6128332 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) HAL1|LINE|L1 -128560 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 216.25-87 chr5 113301738 113302014 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) L2a|LINE|L2 -6938 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 291.5-39 chr5 90257660 90257951 + 1 NA intron (NR_120601, intron 3 of 5) intron (NR_120601, intron 3 of 5) 32266 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 257.5-64 chr6 73926886 73927450 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -142283 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 231.5-107 chr9 98461366 98461725 + 1 NA intron (NM_005458, intron 6 of 18) L1MEg|LINE|L1 -205896 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 271.5-86 chr8 106042161 106042568 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 18139 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-131 chr3 30763159 30763363 + 1 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) AluY|SINE|Alu 131400 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 170.5-204 chr9 100819598 100819899 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -208979 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 231.5-12 chr10 105734133 105734495 + 1 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) LTR23|LTR|ERV1 86019 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 178.75-72 chr4 59640035 59640394 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 626641 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 194.75-56 chr2 75583498 75583871 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -13965 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 236.5-46 chr2 51672151 51672570 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 639759 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 207.5-78 chr4 114380759 114380998 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -217524 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 178.75-103 chr8 59530098 59530509 + 1 NA Intergenic Intergenic 411093 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 161.5-165 chr6 54058864 54059034 + 1 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) -11355 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 168.75-124 chr6 101469556 101469886 + 1 NA intron (NM_001166247, intron 1 of 16) LTR78B|LTR|ERV1 70736 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 210.25-89 chr9 76678430 76678671 + 1 NA intron (NM_001308048, intron 9 of 17) AluY|SINE|Alu 13865 NM_001308049 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 153.5-136 chr3 186078232 186078399 + 1 NA intron (NM_004454, intron 7 of 12) intron (NM_004454, intron 7 of 12) 30774 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 148.75-30 chr10 120188345 120188577 + 1 NA Intergenic Intergenic 166762 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 195.5-18 chr10 124944171 124944578 + 1 NA intron (NM_017580, intron 1 of 8) intron (NM_017580, intron 1 of 8) 2251 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 178.75-63 chr3 102897409 102897633 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 462506 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 242.75-64 chr7 87487212 87487631 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -11718 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 276.5-57 chr5 180808549 180808991 + 1 NA non-coding (NR_157151, exon 2 of 3) non-coding (NR_157151, exon 2 of 3) 1047 NM_001114618 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 122.5-216 chr7 115967964 115968254 + 1 NA intron (NM_001018058, intron 2 of 6) intron (NM_001018058, intron 2 of 6) 204 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 185.5-92 chr20 47029784 47030126 + 1 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) MER58A|DNA|hAT-Charlie 135112 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 168.75-21 chr10 85176255 85176460 + 1 NA Intergenic Intergenic 22548 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 150.75-171 chr7 87529386 87529616 + 1 NA intron (NM_001348944, intron 23 of 29) intron (NM_001348944, intron 23 of 29) -53798 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 235.75-44 chr22 35270945 35271470 + 1 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) AluJr4|SINE|Alu 13714 NM_001362972 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 179.75-123 chr7 8268139 8268493 + 1 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -5704 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 279.25-26 chr3 47931489 47932027 + 1 NA intron (NM_002375, intron 3 of 18) AluJb|SINE|Alu 82203 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 217.25-44 chr2 138452794 138453061 + 1 NA Intergenic Intergenic -48843 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 293.75-44 chr8 8787192 8787550 + 1 NA intron (NM_004225, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu 85434 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 197.25-42 chr18 13342545 13343061 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 64698 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 133.25-134 chr3 62763827 62764167 + 1 NA intron (NM_003716, intron 2 of 29) intron (NM_003716, intron 2 of 29) 111419 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 302.25-2 chr10 44169916 44170271 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -122657 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 238.25-46 chr3 28936099 28936393 + 1 NA Intergenic Intergenic 344693 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 132.75-19 chr1 240594876 240595232 + 1 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) intron (NM_022469, intron 1 of 1) 17101 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 325.5-31 chr5 123971676 123972165 + 1 NA Intergenic Intergenic 426503 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 141.5-45 chr12 111870969 111871250 + 1 NA exon (NM_139078, exon 7 of 14) exon (NM_139078, exon 7 of 14) -27954 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 191.5-101 chr3 151944679 151945024 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -16676 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-191 chr9 95213166 95213473 + 1 NA intron (NM_001243744, intron 4 of 13) L1ME1|LINE|L1 103935 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 162.5-144 chr5 112624870 112625075 + 1 NA Intergenic Intergenic -3464 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 210.5-126 chr8 22601482 22601743 + 1 NA intron (NM_001198827, intron 2 of 5) intron (NM_001198827, intron 2 of 5) 2011 NM_001198827 541565 Hs.743508 NM_173686 ENSG00000241852 C8orf58 - chromosome 8 open reading frame 58 protein-coding 223.75-51 chr2 227008360 227008623 + 1 NA intron (NM_000092, intron 46 of 47) intron (NM_000092, intron 46 of 47) 156068 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 122.5-177 chr5 12230377 12230617 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -326051 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 172.5-84 chr17 69080759 69081062 + 1 NA intron (NM_080284, intron 37 of 38) intron (NM_080284, intron 37 of 38) -18632 NR_049834 100847008 NR_049834 ENSG00000265331 MIR4524B - microRNA 4524b ncRNA 118.75-143 chr5 8135180 8135361 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 266122 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 300.5-25 chr2 88056643 88056990 + 1 NA Intergenic PrimLTR79|LTR|ERV1 -1033 NM_001304526 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 217.5-48 chr16 66039689 66039923 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -326885 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 208.25-9 chr1 190420992 190421456 + 1 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 54786 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 327.25-10 chr20 51303633 51304074 + 1 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 149124 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 159.25-133 chr6 162972818 162973093 + 1 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 81206 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 245.5 chr1 42662854 42663168 + 1 NA intron (NM_006347, intron 5 of 9) intron (NM_006347, intron 5 of 9) 4588 NM_006347 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 179.5-137 chr4 79095091 79095335 + 1 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 123465 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 183.75-4 chr1 111551789 111552129 + 1 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 9950 NM_001370216 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 118.5-82 chr19 29961453 29961659 + 1 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 19317 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 159.75-7 chr1 157771174 157771433 + 1 NA intron (NM_001159488, intron 2 of 8) intron (NM_001159488, intron 2 of 8) 5829 NR_125358 79368 Hs.437393 NM_030764 ENSG00000132704 FCRL2 CD307b|FCRH2|IFGP4|IRTA4|SPAP1|SPAP1A|SPAP1B|SPAP1C Fc receptor like 2 protein-coding 203.5-102 chr4 35556194 35556620 + 1 NA Intergenic Intergenic 687532 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 146.5-117 chr2 193459580 193459774 + 1 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 709832 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 198.75-16 chr11 72259537 72259897 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -15541 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 161.75-120 chr8 17098250 17098515 + 1 NA intron (NR_146233, intron 9 of 15) intron (NR_146233, intron 9 of 15) -58100 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 142.75-42 chr12 6398699 6398919 + 1 NA Intergenic Intergenic 14647 NM_002342 4055 Hs.1116 NM_002342 ENSG00000111321 LTBR D12S370|LT-BETA-R|TNF-R-III|TNFCR|TNFR-RP|TNFR2-RP|TNFR3|TNFRSF3 lymphotoxin beta receptor protein-coding 254.25-61 chr7 85116377 85116739 + 1 NA intron (NM_152754, intron 1 of 16) L1MEf|LINE|L1 5373 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 134.25-142 chr5 63349666 63349832 + 1 NA Intergenic Intergenic 612543 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 231.75-71 chr8 81083679 81084053 + 1 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 28202 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 121.5-84 chr15 48599213 48599434 + 1 NA intron (NM_000138, intron 5 of 65) L1ME4a|LINE|L1 46465 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 242.5-2 chr1 107930523 107930828 + 1 NA intron (NM_006113, intron 1 of 26) L1MC5a|LINE|L1 33452 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 327.5-30 chr8 72834299 72834953 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 102581 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 121.5-26 chr10 31219967 31220151 + 1 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) L1MEd|LINE|L1 32176 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 192.5-109 chr5 141401779 141402100 + 1 NA intron (NM_018925, intron 1 of 3) intron (NM_018925, intron 1 of 3) -1014 NM_018921 56107 Hs.368160 NM_018921 ENSG00000261934 PCDHGA9 PCDH-GAMMA-A9 protocadherin gamma subfamily A, 9 protein-coding 234.5-74 chr5 29994569 29994911 + 1 NA Intergenic Intergenic 114180 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 210.25-71 chr7 31657658 31658099 + 1 NA intron (NM_001257968, intron 14 of 14) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -29139 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 201.25-42 chr2 11194390 11194687 + 1 NA intron (NM_001321643, intron 28 of 32) intron (NM_001321643, intron 28 of 32) 39071 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 203.5-94 chr3 129696737 129697030 + 1 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -8151 NM_015008 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 118.25-46 chr11 113552532 113552676 + 1 NA Intergenic Intergenic -77206 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 353.75-7 chr17 58627944 58628545 + 1 NA intron (NM_031272, intron 3 of 31) L1ME4a|LINE|L1 63811 NM_198393 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 205.25-91 chr5 129635582 129636012 + 1 NA intron (NM_133638, intron 10 of 22) L1PA13|LINE|L1 -112297 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 296.5-27 chr4 65383911 65384366 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 285350 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 230.75-73 chr8 121797248 121797613 + 1 NA Intergenic Intergenic -155990 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 151.5-123 chr3 111285242 111285501 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 213555 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 289.25-8 chr15 89778731 89779157 + 1 NA TTS (NM_001039958) TTS (NM_001039958) 2612 NM_001039958 145873 Hs.37311 NM_001039958 ENSG00000188095 MESP2 SCDO2|bHLHc6 mesoderm posterior bHLH transcription factor 2 protein-coding 185.5-59 chr15 68741646 68741940 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 60132 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 138.25-173 chr8 136313659 136313830 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -217054 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 159.75-95 chr20 56590835 56591198 + 1 NA intron (NR_136537, intron 4 of 5) intron (NR_136537, intron 4 of 5) 13453 NR_136537 105372682 Hs.517135 NR_136537 ENSG00000225657 LINC01716 - long intergenic non-protein coding RNA 1716 ncRNA 278.5-15 chr14 77044678 77045204 + 1 NA intron (NR_110554, intron 1 of 3) intron (NR_110554, intron 1 of 3) 3892 NR_110554 283575 Hs.651736 NR_110554 ENSG00000246548 LINC02288 - long intergenic non-protein coding RNA 2288 ncRNA 114.5-91 chr14 61073272 61073549 + 1 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -91720 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 161.5-177 chr7 106613466 106613714 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 47568 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 204.5-143 chrX 68683710 68684064 + 1 NA intron (NM_014725, intron 2 of 13) intron (NM_014725, intron 2 of 13) -9752 NM_001142504 9754 Hs.95140 NM_014725 ENSG00000130052 STARD8 ARHGAP38|DLC3|STARTGAP3 StAR related lipid transfer domain containing 8 protein-coding 336.25-5 chr14 57359709 57360466 + 1 NA Intergenic Intergenic -30499 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 122.25-70 chr17 19476944 19477160 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -56802 NM_018242 55244 Hs.232054 NM_018242 ENSG00000142494 SLC47A1 MATE1 solute carrier family 47 member 1 protein-coding 164.5-109 chr2 206972117 206972491 + 1 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner 32786 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 205.25-21 chr13 28859661 28859922 + 1 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) 39452 NM_001366650 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 132.5-15 chr1 83119588 83119785 + 1 NA intron (NR_147074, intron 9 of 10) L2|LINE|L2 -133478 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 157.5-170 chr5 176824516 176824807 + 1 NA intron (NM_133369, intron 1 of 14) intron (NM_133369, intron 1 of 14) 14102 NM_133369 90249 Hs.33191 NM_133369 ENSG00000113763 UNC5A UNC5H1 unc-5 netrin receptor A protein-coding 284.75-8 chr11 111979747 111980261 + 1 NA intron (NM_033425, intron 1 of 15) intron (NM_033425, intron 1 of 15) 2695 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 200.25-66 chr2 173879746 173880252 + 1 NA Intergenic Intergenic 83881 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 115.25-83 chr17 75367805 75368031 + 1 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) AluSz6|SINE|Alu 37760 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 148.5-246 chr9 72331051 72331334 + 1 NA intron (NR_110952, intron 3 of 4) intron (NR_110952, intron 3 of 4) 25756 NR_110953 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 188.25-37 chr14 23751405 23751715 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 115196 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 273.5-26 chr17 72608966 72609410 + 1 NA intron (NR_033876, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu -16384 NR_152516 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 112.75-108 chr2 175195066 175195276 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13461 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 192.5-23 chr10 123631185 123631450 + 1 NA Intergenic Intergenic -35038 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 201.5-2 chr1 40094614 40094934 + 1 NA intron (NM_001363695, intron 1 of 7) intron (NM_001363695, intron 1 of 7) 2478 NM_001363695 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 279.75-51 chr7 35380283 35380677 + 1 NA Intergenic Intergenic 66625 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 120.25-191 chr7 8267330 8267501 + 1 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -4803 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 156.75-90 chr2 140267774 140268028 + 1 NA intron (NM_018557, intron 86 of 90) intron (NM_018557, intron 86 of 90) 318784 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 257.25-47 chr6 56047882 56048364 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 43539 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 254.75-7 chr11 47394497 47394792 + 1 NA Intergenic Intergenic -6326 NR_039707 100616222 NR_039707 ENSG00000264583 MIR4487 mir-4487 microRNA 4487 ncRNA 208.25-69 chr4 118935619 118935848 + 1 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 46879 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 145.5-72 chr15 74441339 74441561 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7492 NM_001146029 8482 Hs.24640 NM_003612 ENSG00000138623 SEMA7A CD108|CDw108|H-SEMA-K1|H-Sema-L|JMH|SEMAK1|SEMAL semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group) protein-coding 206.5-113 chr6 141114301 141114576 + 1 NA Intergenic Intergenic 430624 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 138.75-114 chr3 4778479 4778756 + 1 NA intron (NM_001168272, intron 47 of 60) intron (NM_001168272, intron 47 of 60) -27027 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 132.5-201 chr5 117520766 117520991 + 1 NA intron (NR_046089, intron 3 of 5) L1ME2|LINE|L1 105366 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 115.5-37 chr12 26410553 26410696 + 1 NA intron (NM_002223, intron 52 of 56) L3|LINE|CR1 215051 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 233.25-42 chr22 24968799 24969274 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22341 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 176.75-129 chr8 135027384 135027642 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 177578 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 203.25-104 chr8 68361301 68361731 + 1 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) intron (NR_146187, intron 1 of 13) -30025 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-17 chr11 35275035 35275305 + 1 NA intron (NM_001252652, intron 10 of 11) intron (NM_001252652, intron 10 of 11) 112220 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 308.5-20 chr21 37800774 37801219 + 1 NA intron (NM_002240, intron 2 of 3) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 115461 NM_002240 3763 Hs.626242 NM_002240 ENSG00000157542 KCNJ6 BIR1|GIRK-2|GIRK2|KATP-2|KATP2|KCNJ7|KIR3.2|KPLBS|hiGIRK2 potassium voltage-gated channel subfamily J member 6 protein-coding 201.25-9 chr1 232710558 232710803 + 1 NA Intergenic Intergenic -7391 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 192.25-115 chrX 71043741 71043954 + 1 NA Intergenic Intergenic 24487 NM_013346 29934 Hs.260750 NM_013346 ENSG00000147164 SNX12 - sorting nexin 12 protein-coding 148.75-96 chr2 236936619 236936854 + 1 NA Intergenic Intergenic 119431 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 308.25-7 chr11 25838099 25838455 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -350846 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 188.75-119 chr9 12522528 12522880 + 1 NA Intergenic Intergenic -170681 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 131.5-122 chr2 127750023 127750246 + 1 NA intron (NM_001006623, intron 7 of 7) AluJb|SINE|Alu 48637 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 143.5-219 chr8 124279959 124280268 + 1 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie -32715 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 319.5-39 chr8 122187465 122187854 + 1 NA Intergenic Intergenic 380985 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 212.75-77 chr5 3082097 3082512 + 1 NA Intergenic Intergenic -95531 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 214.5-120 chr7 123976879 123977306 + 1 NA Intergenic Intergenic -17530 NR_133947 105375483 Hs.435972 NR_133947 ENSG00000241345 LOC105375483 - uncharacterized LOC105375483 ncRNA 141.25-96 chr20 7916662 7916938 + 1 NA intron (NM_017545, intron 2 of 7) L3|LINE|CR1 23658 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 156.25-48 chr16 8294737 8295007 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 294966 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 173.25-38 chr14 94643867 94644213 + 1 NA intron (NR_015340, intron 3 of 4) intron (NR_015340, intron 3 of 4) 3315 NR_015340 388007 Hs.527795 NR_015340 ENSG00000187483 SERPINA13P SERPINA13|UNQ6121 serpin family A member 13, pseudogene pseudo 196.75-71 chr3 23716290 23716504 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -89558 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 136.5-142 chr22 40366727 40366919 + 1 NA TTS (NM_001123378) TTS (NM_001123378) -3771 NM_001350040 27352 Hs.474914 NM_015705 ENSG00000100359 SGSM3 CIP85|MAP|RABGAP5|RUSC3|RUTBC3|RabGAP-5|rabGAPLP small G protein signaling modulator 3 protein-coding 187.75-115 chr8 80625259 80625550 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 139178 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 148.5-219 chr8 15357488 15357781 + 1 NA Intergenic Intergenic -119203 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 200.25-72 chr20 59591280 59591732 + 1 NA intron (NM_001199505, intron 1 of 12) intron (NM_001199505, intron 1 of 12) -13034 NM_080672 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 311.5-4 chr10 29984228 29984635 + 1 NA Intergenic Intergenic 75155 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 170.25-73 chr2 139153133 139153405 + 1 NA Intergenic Intergenic 255945 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 235.5-93 chr9 79391940 79392227 + 1 NA Intergenic Intergenic -179690 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 234.25-54 chr4 157674134 157674371 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 101762 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 151.75-84 chr22 24813712 24814030 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 7650 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 192.75-21 chr11 84361878 84362266 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) L1MEf|LINE|L1 -44733 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 202.5-49 chr15 54130989 54131433 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 2 of 31) intron (NM_001329919, intron 2 of 31) 118563 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 172.5-204 chr8 130742113 130742577 + 1 NA Intergenic Intergenic 298564 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 178.5-160 chr6 138267578 138267794 + 1 NA intron (NM_020340, intron 12 of 33) intron (NM_020340, intron 12 of 33) -49196 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 198.5-66 chr2 29654728 29655005 + 1 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -179489 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 196.5-134 chr5 132300305 132300597 + 1 NA intron (NM_003059, intron 1 of 9) L1MC4a|LINE|L1 6057 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 176.5-15 chr10 43860126 43860378 + 1 NA non-coding (NR_038268, exon 1 of 5) non-coding (NR_038268, exon 1 of 5) 841 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 159.5-176 chr5 145959989 145960266 + 1 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) AluJo|SINE|Alu 23549 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 163.5-76 chr18 6413050 6413323 + 1 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 1725 NM_001365768 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 157.5-212 chr8 92495485 92495793 + 1 NA Intergenic Intergenic 159855 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 176.5-184 chr9 11446887 11447152 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 833813 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 173.5-162 chr8 75387895 75388090 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -19657 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 218.5-98 chr5 32920909 32921366 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -26306 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 145.5-40 chr12 5830401 5830635 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 5 of 25) intron (NM_001278596, intron 5 of 25) 114741 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 229.75-22 chr15 61387017 61387287 + 1 NA Intergenic Intergenic -157850 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 174.25-50 chr14 61978941 61979184 + 1 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) intron (NM_001367657, intron 3 of 6) 51367 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 162.25-98 chr20 62447647 62447947 + 1 NA Intergenic Intergenic -20258 NM_080833 140893 Hs.180374 NM_080833 ENSG00000130701 RBBP8NL C20orf151 RBBP8 N-terminal like protein-coding 141.5-48 chr13 38481082 38481267 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -86550 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 237.75-14 chr12 115149318 115149627 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -465297 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 213.25-64 chr8 43879178 43879563 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 586928 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 156.5-62 chr16 47191714 47192039 + 1 NA intron (NM_030790, intron 14 of 17) AluJo|SINE|Alu 47808 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 255.5-57 chr3 106774567 106775038 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 465836 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 284.75-6 chr10 73795409 73795742 + 1 NA TTS (NR_038357) TTS (NR_038357) 5824 NR_038357 100507331 Hs.631828 NR_038357 ENSG00000272589 ZSWIM8-AS1 - ZSWIM8 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-74 chr3 111840682 111841080 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) -18299 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 117.25-212 chr8 121200288 121200428 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -388312 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 303.5-22 chr2 69023318 69023841 + 1 NA intron (NM_032208, intron 1 of 17) intron (NM_032208, intron 1 of 17) 10435 NM_032208 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 123.75-168 chr7 7189267 7189409 + 1 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) L1ME3G|LINE|L1 6723 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 139.5-4 chr1 167684899 167685186 + 1 NA intron (NM_001322924, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -36940 NM_001146191 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 159.75-115 chr4 18623357 18623734 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -601670 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 156.25-39 chr14 54483897 54484125 + 1 NA intron (NM_004124, intron 1 of 6) intron (NM_004124, intron 1 of 6) 4969 NM_004124 2764 Hs.151413 NM_004124 ENSG00000197045 GMFB GMF glia maturation factor beta protein-coding 173.25-115 chr7 42424194 42424441 + 1 NA Intergenic Intergenic -187108 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 187.5-106 chr21 18393299 18393614 + 1 NA intron (NM_002772, intron 3 of 24) intron (NM_002772, intron 3 of 24) 10329 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 154.5-37 chr11 62419440 62419682 + 1 NA intron (NM_003357, intron 1 of 2) intron (NM_003357, intron 1 of 2) 528 NM_003357 7356 Hs.523732 NM_003357 ENSG00000149021 SCGB1A1 CC10|CC16|CCPBP|CCSP|UGB|UP-1|UP1 secretoglobin family 1A member 1 protein-coding 259.5-8 chr1 87197610 87198066 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -14831 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 236.75-59 chr8 83181604 83181985 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -221964 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 252.5-15 chr11 18238188 18238527 + 1 NA 3' UTR (NM_001127380, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001127380, exon 4 of 4) -1555 NM_006512 6291 Hs.1955 NM_006512 ENSG00000148965 SAA4 C-SAA|CSAA serum amyloid A4, constitutive protein-coding 247.75-32 chr2 125608844 125609110 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 509008 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 156.75-144 chr6 49548877 49549194 + 1 NA Intergenic Intergenic -1633 NR_146860 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 221.5-53 chr2 186207029 186207368 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -120881 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 118.5-208 chr8 24346400 24346585 + 1 NA intron (NR_130710, intron 18 of 22) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -37793 NM_001145271 27299 Hs.521459 NM_014479 ENSG00000134028 ADAMDEC1 M12.219 ADAM like decysin 1 protein-coding 172.75-44 chr16 23457580 23457832 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -4517 NM_153603 91949 Hs.185807 NM_153603 ENSG00000168434 COG7 CDG2E component of oligomeric golgi complex 7 protein-coding 131.25-154 chr4 32592233 32592498 + 1 NA Intergenic Intergenic 241327 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 122.5-142 chr22 27219175 27219316 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 5434 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 317.75-29 chr9 93847356 93847906 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 28274 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 177.5-54 chr15 79367038 79367349 + 1 NA intron (NM_001330376, intron 2 of 2) intron (NM_001330376, intron 2 of 2) 56081 NM_001301203 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 320.25-32 chr8 137758955 137759394 + 1 NA Intergenic Intergenic 324371 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 146.75-163 chr8 113316868 113317045 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 60196 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 295.5-15 chr14 60507425 60507857 + 1 NA Intergenic Intergenic -1505 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 215.25-47 chr2 66885769 66886035 + 1 NA Intergenic UCON72|Unknown|Unknown -18534 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 275.5-4 chr1 217224848 217225151 + 1 NA Intergenic Intergenic -87297 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 230.5-100 chr5 164010454 164010963 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 456694 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 116.5-6 chr1 75122709 75122907 + 1 NA Intergenic Intergenic -5626 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 112.25-157 chr4 163139181 163139342 + 1 NA intron (NM_138386, intron 5 of 7) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 27629 NM_138386 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 168.5-115 chr3 88039083 88039357 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 19776 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 331.25 chr1 164468827 164469214 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -90340 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 186.5-76 chr20 21339401 21339680 + 1 NA intron (NM_001317960, intron 14 of 29) intron (NM_001317960, intron 14 of 29) 36042 NM_001317960 22803 Hs.255932 NM_012255 ENSG00000088930 XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 protein-coding 161.25-42 chr12 129617963 129618159 + 1 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 285964 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 217.25-12 chr10 58576399 58576641 + 1 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 63648 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 209.5-149 chr9 27271526 27272139 + 1 NA intron (NR_026679, intron 9 of 16) intron (NR_026679, intron 9 of 16) 10961 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 321.5-8 chr17 11807236 11807714 + 1 NA intron (NM_001372, intron 43 of 68) intron (NM_001372, intron 43 of 68) -75427 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 231.5-96 chr7 92732551 92732829 + 1 NA intron (NM_001259, intron 3 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 101269 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 258.75-78 chrX 70636495 70636974 + 1 NA intron (NM_001003811, intron 18 of 30) L1M3e|LINE|L1 -180740 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 199.75-19 chr12 16354634 16354884 + 1 NA intron (NR_048547, intron 2 of 2) intron (NR_048547, intron 2 of 2) 1342 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 131.5-148 chr3 24796984 24797208 + 1 NA Intergenic Intergenic -32227 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 199.25-35 chr15 64522569 64522944 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 23336 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 212.5-13 chr10 91397979 91398369 + 1 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) L1MA9|LINE|L1 -11061 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 238.5-49 chr20 16002121 16002561 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -16459 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 149.75-135 chr5 161445710 161446066 + 1 NA intron (NM_000813, intron 5 of 9) MER4B|LTR|ERV1 102236 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 383.5-3 chr11 79483939 79484328 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -43103 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 165.5-137 chr4 117748782 117749051 + 1 NA Intergenic Intergenic -85485 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 262.75-2 chr1 233832179 233832612 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -72281 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 171.5-112 chr3 188491581 188491859 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 3 of 9) intron (NM_001167672, intron 3 of 9) 76946 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 275.75-44 chr8 116352440 116352959 + 1 NA Intergenic Intergenic -27640 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 138.75-84 chr2 34731732 34731956 + 1 NA Intergenic Intergenic 54287 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 210.5-16 chr10 76233612 76233906 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 450998 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 237.5-101 chr8 130071746 130072171 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 27 of 29) MER21A|LTR|ERVL 12810 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 121.75-48 chr14 98069319 98069520 + 1 NA Intergenic Intergenic -91295 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 237.5-68 chr4 67627201 67627609 + 1 NA intron (NM_018227, intron 27 of 32) intron (NM_018227, intron 27 of 32) 68678 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 163.5-85 chr19 19107429 19107714 + 1 NA intron (NM_178526, intron 6 of 7) AluSx|SINE|Alu 30907 NM_017814 54929 Hs.631629 NM_017814 ENSG00000064545 TMEM161A AROS-29 transmembrane protein 161A protein-coding 182.5-11 chr1 194847320 194847608 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 1241251 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 259.5-36 chr15 56640966 56641428 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 19 of 20) intron (NM_001002843, intron 19 of 20) 92889 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 243.75-42 chr2 191625537 191625852 + 1 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -52378 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 158.5-174 chr7 14486884 14487192 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) intron (NM_001350717, intron 19 of 24) 354412 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 258.75-67 chr7 3288373 3288805 + 1 NA Intergenic Intergenic -12663 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 435.5 chr10 67836775 67837476 + 1 NA intron (NM_021800, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 1054 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 165.5-195 chr8 71106739 71107239 + 1 NA Intergenic MER127|DNA|TcMar-Tigger 249717 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 292.5-34 chr20 3174889 3175223 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -1507 NM_001365618 9762 Hs.90232 NM_014731 ENSG00000088899 LZTS3 PROSAPIP1 leucine zipper tumor suppressor family member 3 protein-coding 149.75-34 chr12 97192147 97192520 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -270443 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 144.5-176 chr5 114647094 114647299 + 1 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) L1P4|LINE|L1 71155 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 204.25-91 chr5 56028721 56029155 + 1 NA Intergenic Intergenic 33771 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 238.5-96 chr9 21613448 21613889 + 1 NA Intergenic Intergenic -53870 NR_152878 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 126.5-241 chr8 87483695 87483842 + 1 NA Intergenic Intergenic 390247 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 300.75-40 chr6 119129416 119130058 + 1 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) 19456 NM_001288576 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 143.5-218 chr8 123647504 123647703 + 1 NA intron (NM_001081675, intron 2 of 3) intron (NM_001081675, intron 2 of 3) 6198 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 205.75-17 chr13 108073476 108073779 + 1 NA Intergenic Intergenic 141155 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 198.5-85 chr2 206300907 206301157 + 1 NA intron (NM_001369654, intron 5 of 5) L1ME3G|LINE|L1 26022 NM_001285549 57683 Hs.110489 NM_020923 ENSG00000204186 ZDBF2 Slx9 zinc finger DBF-type containing 2 protein-coding 152.5-181 chr7 113771018 113771204 + 1 NA Intergenic Intergenic 147898 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 174.75-48 chr18 62721536 62721780 + 1 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) intron (NM_194449, intron 1 of 16) 6117 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 194.25-95 chr5 130485152 130485479 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 580850 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 254.5-10 chr10 32082574 32082870 + 1 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 -26297 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 150.5-59 chr15 87266381 87266723 + 1 NA Intergenic Intergenic -278126 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 218.5-114 chr7 112991521 112992002 + 1 NA intron (NR_110162, intron 1 of 5) intron (NR_110162, intron 1 of 5) 3882 NR_110162 101928036 Hs.120006 NR_110162 ENSG00000234520 HRAT17 - heart tissue-associated transcript 17 ncRNA 203.25-12 chr10 4393414 4393744 + 1 NA intron (NR_108054, intron 2 of 2) intron (NR_108054, intron 2 of 2) 9333 NR_108054 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 261.5-65 chr8 30254737 30255109 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 98554 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 117.25-120 chr2 126349499 126349776 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -231652 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 271.75-30 chr3 142170606 142170926 + 1 NA intron (NM_001039547, intron 14 of 15) intron (NM_001039547, intron 14 of 15) -21222 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 157.25-97 chr3 148990856 148991220 + 1 NA promoter-TSS (NM_001184721) promoter-TSS (NM_001184721) -370 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 205.5-119 chr5 155255093 155255407 + 1 NA Intergenic Intergenic 241495 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 276.5-47 chr4 97277028 97277388 + 1 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 -89718 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 127.5-214 chr6 120324421 120324630 + 1 NA Intergenic LTR16D1|LTR|ERVL 309346 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 204.25 chr1 16457198 16457591 + 1 NA intron (NM_018090, intron 7 of 7) AluSq|SINE|Alu -3554 NR_147210 107984921 Hs.528312 NR_147210 ENSG00000226029 LINC01772 - long intergenic non-protein coding RNA 1772 ncRNA 151.5-134 chr3 182735760 182736034 + 1 NA Intergenic Intergenic -57607 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 112.5-198 chr5 142745010 142745142 + 1 NA promoter-TSS (NR_110558) promoter-TSS (NR_110558) -524 NR_110558 101926975 Hs.638583 NR_110558 ENSG00000236714 LINC01844 - long intergenic non-protein coding RNA 1844 ncRNA 230.5-105 chr7 90715137 90715467 + 1 NA intron (NM_001287136, intron 1 of 13) intron (NM_001287136, intron 1 of 13) 5486 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 216.75 chr1 54881765 54882052 + 1 NA intron (NM_014762, intron 2 of 8) L1PA13|LINE|L1 5287 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 153.5-192 chr8 39942638 39942819 + 1 NA intron (NM_194294, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 7773 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 134.75-16 chr1 174115847 174116172 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 43278 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 166.25-45 chr14 57327060 57327329 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 58223 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 167.75-60 chr18 2085787 2085977 + 1 NA Intergenic Intergenic 485623 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 150.5-15 chr10 15093816 15094037 + 1 NA Intergenic Intergenic -3254 NM_001265601 10557 Hs.94986 NM_006414 ENSG00000152464 RPP38 - ribonuclease P/MRP subunit p38 protein-coding 337.5-2 chr1 153924165 153924800 + 1 NA Intergenic Intergenic -1510 NM_020699 57459 Hs.4779 NM_020699 ENSG00000143614 GATAD2B MRD18|P66beta|p68 GATA zinc finger domain containing 2B protein-coding 164.25-23 chr10 121337034 121337392 + 1 NA Intergenic Intergenic 194101 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 227.5-79 chr4 56748217 56748503 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -66654 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 207.75-106 chr6 12811084 12811336 + 1 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) 92511 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 201.75-88 chr6 152980437 152980853 + 1 NA intron (NM_001142522, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 2396 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 244.25-25 chr20 49722408 49722698 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8675 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 225.75-41 chr2 134621935 134622208 + 1 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 96929 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 152.25-14 chr10 18428118 18428444 + 1 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) L1MEd|LINE|L1 27706 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 211.5-9 chr1 166939692 166940030 + 1 NA intron (NM_199351, intron 3 of 9) intron (NM_199351, intron 3 of 9) 35679 NM_199351 387597 Hs.444835 NM_199351 ENSG00000143195 ILDR2 C1orf32|dJ782G3.1 immunoglobulin like domain containing receptor 2 protein-coding 123.5-11 chr1 191757194 191757417 + 1 NA Intergenic Intergenic -401157 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 173.75-94 chr2 221692247 221692438 + 1 NA Intergenic Intergenic -118140 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 118.75-184 chr7 84739487 84739812 + 1 NA Intergenic Intergenic 207173 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 114.5-215 chr5 84422504 84422689 + 1 NA Intergenic Intergenic -37716 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 125.5-156 chr21 34302546 34302720 + 1 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -61391 NM_172201 9992 Hs.551521 NM_172201 ENSG00000159197 KCNE2 ATFB4|LQT5|LQT6|MIRP1 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 2 protein-coding 124.25-98 chr2 86254506 86254687 + 1 NA intron (NM_001371279, intron 4 of 8) intron (NM_001371279, intron 4 of 8) 55139 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 169.25-76 chr3 130948314 130948557 + 1 NA intron (NM_001001485, intron 8 of 27) L1MB8|LINE|L1 53845 NM_001001486 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 221.5-106 chr8 138265367 138265671 + 1 NA intron (NM_015912, intron 4 of 19) intron (NM_015912, intron 4 of 19) -181974 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 113.5-12 chr1 156727737 156727946 + 1 NA promoter-TSS (NM_001142560) promoter-TSS (NM_001142560) 598 NM_001303095 81875 Hs.301904 NM_030980 ENSG00000143319 ISG20L2 HSD38 interferon stimulated exonuclease gene 20 like 2 protein-coding 216.5-53 chr18 46898145 46898485 + 1 NA intron (NM_001324053, intron 3 of 15) AluSz6|SINE|Alu 19192 NM_001354033 9063 Hs.57769 NM_004671 ENSG00000078043 PIAS2 ARIP3|DIP|MIZ1|PIASX|SIZ2|ZMIZ4 protein inhibitor of activated STAT 2 protein-coding 149.75-55 chr16 9917306 9917697 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) MIRb|SINE|MIR 264566 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 209.5-112 chr4 173031987 173032303 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 12 of 12) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -136666 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 267.75-48 chr6 64368302 64368786 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) L1PA15|LINE|L1 561708 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 324.5-17 chr2 99320263 99320714 + 1 NA intron (NM_005783, intron 4 of 4) L1MC4|LINE|L1 -15713 NM_001371380 190.25-119 chr8 40982261 40982662 + 1 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -84635 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 122.25-72 chr17 56757364 56757545 + 1 NA Intergenic Intergenic 76466 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 138.5-175 chr6 133466960 133467281 + 1 NA intron (NM_172103, intron 9 of 18) L2b|LINE|L2 225621 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 205.5-54 chr17 51292508 51292842 + 1 NA intron (NM_016001, intron 11 of 13) intron (NM_016001, intron 11 of 13) 32129 NM_016001 51096 Hs.709327 NM_016001 ENSG00000011260 UTP18 CGI-48|WDR50 UTP18 small subunit processome component protein-coding 206.5-5 chr1 218718233 218718478 + 1 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 200156 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 156.75-102 chr2 241314869 241315152 + 1 NA promoter-TSS (NM_001349309) promoter-TSS (NM_001349309) -177 NM_001349306 4735 Hs.721234 NM_004404 ENSG00000168385 SEPTIN2 DIFF6|NEDD-5|NEDD5|Pnutl3|SEPT2|hNedd5 septin 2 protein-coding 187.75-99 chr6 41711032 41711457 + 1 NA intron (NM_001167827, intron 1 of 8) intron (NM_001167827, intron 1 of 8) 22366 NR_162107 113218489 NR_162107 MIR10398 - microRNA 10398 ncRNA 153.5-33 chr11 44052956 44053278 + 1 NA intron (NM_001031854, intron 7 of 13) intron (NM_001031854, intron 7 of 13) 5136 NM_001031854 390110 Hs.558851 NM_001031854 ENSG00000205126 ACCSL - 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) like protein-coding 190.75-111 chr8 123228472 123228677 + 1 NA intron (NM_001204180, intron 5 of 5) AluSp|SINE|Alu -12711 NR_039808 100616260 NR_039808 ENSG00000266324 MIR4663 - microRNA 4663 ncRNA 189.25-36 chr14 68837410 68837660 + 1 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -41292 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 127.25-203 chr8 15655834 15656051 + 1 NA intron (NM_001356429, intron 3 of 10) intron (NM_001356429, intron 3 of 10) 115679 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 325.75-30 chr9 15561538 15562177 + 1 NA intron (NM_001348002, intron 1 of 26) intron (NM_001348002, intron 1 of 26) -2121 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 235.75-15 chr11 83331051 83331384 + 1 NA Intergenic Intergenic -44810 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 150.5-107 chr2 183907641 183907826 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -471242 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 152.5-14 chr10 37327250 37327541 + 1 NA intron (NR_104061, intron 3 of 4) intron (NR_104061, intron 3 of 4) 18209 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 220.5-114 chr7 25277128 25277486 + 1 NA Intergenic Intergenic -48821 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 133.5-88 chr15 39724805 39724998 + 1 NA intron (NM_152597, intron 9 of 11) intron (NM_152597, intron 9 of 11) 57940 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 223.25-44 chr20 31183968 31184377 + 1 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -73492 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 158.25-47 chr16 80923215 80923423 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -30723 NR_131948 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 174.25-135 chr7 99641399 99641667 + 1 NA intron (NM_001350985, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 24587 NM_001350985 221785 Hs.446297 NM_145115 ENSG00000197037 ZSCAN25 ZNF498 zinc finger and SCAN domain containing 25 protein-coding 227.5-19 chr11 28576109 28576446 + 1 NA Intergenic Intergenic -98729 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 144.5-88 chr18 8989318 8989539 + 1 NA Intergenic Intergenic -113271 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 200.75-27 chr13 109898310 109898785 + 1 NA Intergenic Intergenic -111964 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 200.75-28 chr14 20148657 20148913 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 5049 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 116.75-131 chr3 118178470 118178652 + 1 NA Intergenic Intergenic -463207 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 168.25-119 chr5 124367145 124367316 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1MB8|LINE|L1 71290 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 246.75-34 chr2 110860777 110861178 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 128404 NM_001371254 134.75-22 chr10 28383692 28383888 + 1 NA Intergenic Intergenic -80726 NR_134517 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 170.25-101 chr3 190512438 190512732 + 1 NA Intergenic Intergenic -1500 NR_157352 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 306.5-40 chr9 104737183 104737676 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10254 NM_001329570 25934 Hs.530275 NM_015469 ENSG00000136783 NIPSNAP3A HSPC299|NIPSNAP4|TASSC nipsnap homolog 3A protein-coding 187.5-129 chr4 108199769 108200281 + 1 NA Intergenic Intergenic 27905 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-179 chr5 139519478 139519655 + 1 NA Intergenic Intergenic -36808 NM_001367258 340061 Hs.379754 NM_198282 ENSG00000184584 TMEM173 ERIS|MITA|MPYS|NET23|SAVI|STING|STING-beta|hMITA|hSTING transmembrane protein 173 protein-coding 177.5-119 chr3 182913826 182914029 + 1 NA exon (NM_014616, exon 29 of 30) exon (NM_014616, exon 29 of 30) 66611 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 189.5-139 chr7 106535806 106536061 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 125225 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 176.5-142 chr5 61670237 61670703 + 1 NA intron (NR_109910, intron 6 of 7) intron (NR_109910, intron 6 of 7) 27962 NR_109910 101928651 Hs.662309 NR_109910 ENSG00000248529 LOC101928651 - uncharacterized LOC101928651 ncRNA 471.5-9 chr9 98011762 98012532 + 1 NA intron (NM_006401, intron 5 of 6) intron (NM_006401, intron 5 of 6) 28806 NM_006401 10541 Hs.730654 NM_006401 ENSG00000136938 ANP32B APRIL|PHAPI2|SSP29 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member B protein-coding 197.25-108 chrX 47140725 47141061 + 1 NA Intergenic Intergenic 4317 NM_001135998 54539 Hs.521969 NM_019056 ENSG00000147123 NDUFB11 CI-ESSS|ESSS|MC1DN30|NP17.3|Np15|P17.3 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B11 protein-coding 142.5-98 chr18 74395180 74395495 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -14111 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 127.75-4 chr1 27380368 27380578 + 1 NA intron (NM_207397, intron 4 of 4) MIR3|SINE|MIR 2860 NM_207397 388611 Hs.664836 NM_207397 ENSG00000174950 CD164L2 EAPG6122|UNQ6122 CD164 molecule like 2 protein-coding 172.5-91 chr2 41261789 41262110 + 1 NA Intergenic Intergenic -615606 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 203.25-45 chr18 2099717 2099963 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 471665 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 166.5-42 chr11 82946084 82946445 + 1 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -44524 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 251.5-34 chr2 58721534 58721970 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 200999 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 361.5-19 chr6 46977607 46978091 + 1 NA Intergenic Intergenic -22910 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 233.75-40 chr2 133239021 133239416 + 1 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -26977 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 153.75-154 chr9 20670833 20670997 + 1 NA intron (NM_017794, intron 2 of 45) intron (NM_017794, intron 2 of 45) 12606 NM_017794 54914 Hs.136247 NM_017794 ENSG00000188352 FOCAD KIAA1797 focadhesin protein-coding 227.75-21 chr13 67502226 67502805 + 1 NA Intergenic Intergenic 130128 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 134.75-149 chr3 121205710 121205974 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 9 of 27) intron (NM_001348343, intron 9 of 27) 156202 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 290.5-17 chr17 60321941 60322513 + 1 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) FLAM_A|SINE|Alu 69906 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 185.75-62 chr2 98152310 98152530 + 1 NA intron (NM_001345864, intron 1 of 21) intron (NM_001345864, intron 1 of 21) 2887 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 232.5-81 chr5 11943358 11943733 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -39099 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 201.75-41 chr17 73405476 73405809 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 18 of 44) MER2|DNA|TcMar-Tigger -93641 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 239.25-52 chr2 159411558 159411843 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 13 of 36) intron (NM_001329858, intron 13 of 36) -124997 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 171.5-149 chr8 79806913 79807207 + 1 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) AluSg|SINE|Alu 38918 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 138.5-21 chr1 227258748 227258950 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) intron (NM_001366019, intron 1 of 36) 59643 NM_001366011 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 246.25-34 chr2 118022849 118023218 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -8963 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 182.25-32 chr13 44915072 44915461 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 74205 NM_012345 26747 Hs.525006 NM_012345 ENSG00000083635 NUFIP1 NUFIP|bA540M5.1 nuclear FMR1 interacting protein 1 protein-coding 160.5-198 chr8 132971143 132971380 + 1 NA intron (NM_003235, intron 32 of 47) intron (NM_003235, intron 32 of 47) 75320 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 123.25-218 chrX 49979864 49980188 + 1 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) intron (NM_001127899, intron 3 of 14) -23122 NR_030241 693124 NR_030241 ENSG00000207758 MIR532 MIRN532|hsa-mir-532|mir-532 microRNA 532 ncRNA 120.25 chr1 38161917 38162145 + 1 NA Intergenic Intergenic 52736 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 293.5-9 chr12 30651583 30651945 + 1 NA intron (NM_006390, intron 19 of 24) intron (NM_006390, intron 19 of 24) 25480 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 232.25-3 chr1 74064951 74065309 + 1 NA intron (NM_001105659, intron 6 of 7) L3|LINE|CR1 133046 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 299.75-13 chr2 41325928 41326435 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -551374 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 114.25-7 chr1 166660322 166660499 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 56494 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 119.5-13 chr1 115081344 115081573 + 1 NA intron (NM_005725, intron 1 of 7) intron (NM_005725, intron 1 of 7) 8042 NM_001308315 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 263.75-19 chr15 78172124 78172415 + 1 NA TTS (NM_005530) TTS (NM_005530) 22907 NM_005530 3419 Hs.591110 NM_005530 ENSG00000166411 IDH3A - isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 alpha protein-coding 216.5-127 chr9 20841244 20841579 + 1 NA intron (NM_017794, intron 17 of 45) L1M1|LINE|L1 54484 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 138.25-124 chr3 142998852 142999031 + 1 NA intron (NR_125393, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 2526 NR_034032 100289361 Hs.599649 NR_034032 ENSG00000268129 LOC100289361 - uncharacterized LOC100289361 ncRNA 148.25-107 chr4 64954152 64954445 + 1 NA intron (NR_033976, intron 2 of 6) MER61-int|LTR|ERV1 50202 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 249.5-77 chr5 37136699 37137063 + 1 NA intron (NM_023073, intron 45 of 51) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -112165 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 294.5-2 chr1 76694309 76694836 + 1 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 84695 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 156.5-207 chr9 86940268 86940499 + 1 NA Intergenic Intergenic 7123 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 206.75-17 chr12 41749521 41749860 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -14499 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 220.5-133 chrX 98463048 98463432 + 1 NA Intergenic Intergenic -898705 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 236.25-64 chr4 163168475 163168850 + 1 NA Intergenic Intergenic -1772 NM_001128931 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 114.5-208 chr5 43461891 43462030 + 1 NA intron (NM_022483, intron 1 of 2) L1MA1|LINE|L1 21905 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 207.75-104 chr5 163765412 163765775 + 1 NA Intergenic Intergenic 259974 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 165.75-121 chr4 108282054 108282248 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 110031 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-146 chr8 83317150 83317363 + 1 NA Intergenic Intergenic -86502 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 142.5-163 chr5 3689268 3689488 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 93546 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 220.75-20 chr12 15781375 15781749 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR 7826 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 213.5-68 chr20 7959078 7959417 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18789 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 158.25-87 chr3 58055381 58055653 + 1 NA intron (NM_001164318, intron 1 of 45) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 47095 NM_001164319 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 161.5-63 chr15 62929378 62929690 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 105577 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 133.5-193 chr4 165337446 165337754 + 1 NA intron (NM_006745, intron 2 of 5) intron (NM_006745, intron 2 of 5) 9931 NM_006745 6307 Hs.105269 NM_006745 ENSG00000052802 MSMO1 DESP4|ERG25|MCCPD|SC4MOL methylsterol monooxygenase 1 protein-coding 163.25-138 chr8 42073595 42073900 + 1 NA intron (NR_136589, intron 1 of 1) L1MC4|LINE|L1 -21760 NM_006766 7994 Hs.491577 NM_006766 ENSG00000083168 KAT6A MOZ|MRD32|MYST-3|MYST3|RUNXBP2|ZC2HC6A|ZNF220 lysine acetyltransferase 6A protein-coding 158.25-104 chr4 103256515 103256861 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -58345 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 266.5-68 chr6 113770324 113770638 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -86864 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 137.5-141 chr20 49088923 49089142 + 1 NA intron (NM_001362762, intron 17 of 24) intron (NM_001362762, intron 17 of 24) 42720 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 230.5-68 chr2 206315596 206315855 + 1 NA Intergenic Intergenic 40715 NM_001285549 57683 Hs.110489 NM_020923 ENSG00000204186 ZDBF2 Slx9 zinc finger DBF-type containing 2 protein-coding 249.75-27 chr17 48292472 48292777 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -1723 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 179.75-44 chr14 68138292 68138716 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 314912 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 140.5-58 chr13 91309563 91309723 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -38177 NR_027349 407975 Hs.24115 NR_027349 ENSG00000215417 MIR17HG C13orf25|FGLDS2|LINC00048|MIHG1|MIRH1|MIRHG1|NCRNA00048|miR-17-92 miR-17-92a-1 cluster host gene ncRNA 311.5-8 chr13 113196249 113196639 + 1 NA intron (NM_001320656, intron 4 of 14) intron (NM_001320656, intron 4 of 14) -11749 NM_001278513 8451 Hs.339735 NM_003589 ENSG00000139842 CUL4A - cullin 4A protein-coding 244.5 chr1 17031526 17031843 + 1 NA intron (NM_003000, intron 3 of 7) intron (NM_003000, intron 3 of 7) -19756 NM_001141974 23400 Hs.128866 NM_022089 ENSG00000159363 ATP13A2 CLN12|HSA9947|KRPPD|PARK9|SPG78 ATPase cation transporting 13A2 protein-coding 222.5-32 chr14 61303958 61304404 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17262 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 182.75-97 chr4 130663943 130664156 + 1 NA Intergenic Intergenic 287688 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 282.25-16 chr2 193186678 193187129 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 437058 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 235.5-86 chr8 68254139 68254573 + 1 NA Intergenic Intergenic -76017 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 232.5-39 chr17 70582072 70582492 + 1 NA Intergenic Intergenic 412747 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 194.25-68 chr21 27598137 27598356 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -124133 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 314.25-11 chr18 481570 481907 + 1 NA intron (NM_130386, intron 1 of 9) intron (NM_130386, intron 1 of 9) 18963 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 173.75-153 chr8 123166297 123166542 + 1 NA Intergenic Intergenic -12628 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 202.5-112 chr5 31875819 31876029 + 1 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) L1M5|LINE|L1 60235 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 115.5-48 chr12 129730106 129730262 + 1 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) intron (NM_133448, intron 1 of 8) 173841 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 152.75-112 chr3 169995451 169995763 + 1 NA 3' UTR (NM_003262, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_003262, exon 8 of 8) 28800 NM_003262 7095 Hs.744859 NM_003262 ENSG00000008952 SEC62 Dtrp1|HTP1|TLOC1|TP-1 SEC62 homolog, preprotein translocation factor protein-coding 124.25-117 chr20 47533665 47533944 + 1 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 31917 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 148.5-96 chr2 43773356 43773649 + 1 NA promoter-TSS (NM_001193464) promoter-TSS (NM_001193464) -537 NM_001348912 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 148.5-245 chr9 32236181 32236395 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -148315 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 208.25-96 chr9 26036215 26036449 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -30343 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 150.5-154 chr4 103312963 103313256 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -111933 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 300.75-14 chr14 88234909 88235316 + 1 NA intron (NM_138317, intron 3 of 6) L1M7|LINE|L1 35799 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 145.5-6 chr1 45496163 45496442 + 1 NA intron (NR_152412, intron 2 of 3) intron (NR_152412, intron 2 of 3) 3771 NR_152411 126661 Hs.461300 NM_001102601 ENSG00000280670 CCDC163 C1orf231|CCDC163P coiled-coil domain containing 163 protein-coding 293.75-28 chr20 62020626 62021147 + 1 NA intron (NM_003185, intron 1 of 14) HAL1|LINE|L1 -43916 NR_130463 100422838 NR_130463 ENSG00000265306 MIR3195 - microRNA 3195 ncRNA 112.5-57 chr12 80882770 80882997 + 1 NA intron (NR_136887, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR -50254 NR_030348 693202 NR_030348 ENSG00000207763 MIR617 MIRN617|hsa-mir-617 microRNA 617 ncRNA 184.5-116 chr5 9344937 9345263 + 1 NA intron (NM_003966, intron 3 of 22) intron (NM_003966, intron 3 of 22) -166233 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 219.5-140 chr9 98783254 98783620 + 1 NA intron (NM_173551, intron 4 of 14) intron (NM_173551, intron 4 of 14) 13118 NM_173551 203286 Hs.406890 NM_173551 ENSG00000165138 ANKS6 ANKRD14|NPHP16|PKDR1|SAMD6 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 protein-coding 162.25-26 chr11 27983467 27983716 + 1 NA Intergenic Intergenic -73224 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 140.5-197 chr6 80545057 80545231 + 1 NA Intergenic Intergenic 438473 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 210.25-73 chr7 92264293 92264538 + 1 NA intron (NM_019004, intron 1 of 19) AluSz6|SINE|Alu -18315 NM_001350679 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 263.5-35 chr20 35046215 35046629 + 1 NA intron (NM_199368, intron 6 of 18) intron (NM_199368, intron 6 of 18) 46385 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 251.75-50 chr3 13517140 13517760 + 1 NA Intergenic Intergenic -31675 NM_001004019 2199 Hs.198862 NM_001998 ENSG00000163520 FBLN2 - fibulin 2 protein-coding 193.25-67 chr22 36004317 36004537 + 1 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) 24110 NM_001349999 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 194.25-14 chr10 117975815 117976020 + 1 NA Intergenic Intergenic -70904 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 303.25-22 chr4 32935393 32935806 + 1 NA Intergenic Intergenic 584561 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 173.75-132 chr6 45086513 45086862 + 1 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 111083 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 252.5-90 chrX 73534330 73534830 + 1 NA intron (NR_029423, intron 1 of 1) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 28505 NR_029423 139201 Hs.586477 NR_029423 ENSG00000269904 MAP2K4P1 - mitogen-activated protein kinase kinase 4 pseudogene 1 pseudo 308.25-36 chr8 126115186 126115773 + 1 NA Intergenic Intergenic -164282 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 130.25-84 chr18 13679063 13679310 + 1 NA intron (NM_152352, intron 2 of 3) intron (NM_152352, intron 2 of 3) 37428 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 197.75-78 chr6 79181639 79181970 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -51870 NR_040671 100288198 Hs.586270 NR_040671 ENSG00000270362 HMGN3-AS1 - HMGN3 antisense RNA 1 ncRNA 119.25-52 chr13 96433614 96433743 + 1 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) AluSq2|SINE|Alu 6449 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 161.5-123 chr21 43597574 43597798 + 1 NA intron (NM_007031, intron 7 of 8) AluJr4|SINE|Alu 12303 NR_106718 102464825 NR_106718 ENSG00000278433 MIR6070 hsa-mir-6070 microRNA 6070 ncRNA 142.75-125 chr3 38672940 38673192 + 1 NA Intergenic Intergenic -23379 NM_001354701 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 293.75-15 chr16 9923655 9924032 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) L1MEc|LINE|L1 258224 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 330.25-26 chr9 110976799 110977235 + 1 NA intron (NM_001351397, intron 1 of 4) intron (NM_001351397, intron 1 of 4) 59763 NM_001351420 1902 Hs.126667 NM_001401 ENSG00000198121 LPAR1 EDG2|GPR26|Gpcr26|LPA1|Mrec1.3|VZG1|edg-2|rec.1.3|vzg-1 lysophosphatidic acid receptor 1 protein-coding 121.5-119 chr18 66939526 66939707 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -141968 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 329.75-19 chr8 91054892 91055307 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14240 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 254.5-49 chr21 35390146 35390841 + 1 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 190271 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 195.5-109 chr4 153586977 153587300 + 1 NA intron (NM_001131007, intron 14 of 34) intron (NM_001131007, intron 14 of 34) -53030 NR_134873 100419170 Hs.382102 NR_134873 ENSG00000250771 LOC100419170 - toll like receptor 2 pseudogene pseudo 158.25-115 chr5 129973569 129973931 + 1 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 69285 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 246.25-58 chr6 126341348 126341733 + 1 NA intron (NM_001286524, intron 1 of 2) intron (NM_001286524, intron 1 of 2) 1425 NR_104462 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 141.5-91 chr2 1771641 1771841 + 1 NA Intergenic Intergenic -27226 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 173.25-37 chr14 71627958 71628189 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 8 of 24) FLAM_C|SINE|Alu 41775 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 261.25-5 chr11 102421442 102421857 + 1 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) intron (NM_052932, intron 2 of 4) 31116 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 231.25-70 chr6 124818917 124819480 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 6 of 6) intron (NM_001040214, intron 6 of 6) -143347 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 148.5-74 chr16 56655248 56655478 + 1 NA Intergenic Intergenic -2580 NM_001301272 4494 Hs.513626 NM_005949 ENSG00000198417 MT1F MT1 metallothionein 1F protein-coding 153.5-47 chr13 81459285 81459535 + 1 NA Intergenic Intergenic -232427 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 160.5-22 chr11 27913368 27913602 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -143330 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 141.75-100 chr2 118785567 118785782 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 62509 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 158.75-141 chr5 123194476 123194919 + 1 NA TTS (NM_001136239) TTS (NM_001136239) -104381 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 226.5-55 chr22 27178534 27178882 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -8808 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 139.5-112 chr2 218542089 218542297 + 1 NA intron (NM_020935, intron 8 of 25) LTR16A2|LTR|ERVL 26158 NM_020935 57695 Hs.166068 NM_020935 ENSG00000135913 USP37 - ubiquitin specific peptidase 37 protein-coding 129.25-15 chr10 34493236 34493490 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 321933 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 224.5-85 chr4 121078846 121079328 + 1 NA Intergenic Intergenic -6552 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 299.75-14 chr2 128057893 128058219 + 1 NA Intergenic Charlie9|DNA|hAT-Charlie -29997 NM_001330299 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 232.25-48 chr4 36530961 36531215 + 1 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) intron (NR_149124, intron 3 of 4) -104660 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 255.5-19 chr12 31826043 31826543 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -33995 NM_001013699 440093 Hs.448697 NM_001013699 ENSG00000188375 H3F3C H3.5 H3 histone family member 3C protein-coding 275.75-4 chr10 64267944 64268558 + 1 NA Intergenic Intergenic -557277 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 413.25-2 chr13 79348823 79349492 + 1 NA intron (NM_022118, intron 13 of 20) L1MA8|LINE|L1 57064 NM_001286631 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 124.5-196 chr6 138361145 138361336 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -16403 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 121.5-102 chr16 77470178 77470322 + 1 NA Intergenic Intergenic -35216 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 213.75-73 chr4 33129835 33130126 + 1 NA Intergenic Intergenic 778942 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 162.75-79 chr2 193104113 193104341 + 1 NA Intergenic Intergenic 354382 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 242.75-40 chr22 27562560 27562918 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 239017 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 173.25-50 chr18 3029428 3029740 + 1 NA Intergenic Intergenic -17637 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 118.25-115 chr20 33073070 33073200 + 1 NA intron (NM_182658, intron 14 of 14) MER117|DNA|hAT-Charlie -8377 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 177.5-55 chr15 99393504 99393764 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 136109 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 250.5-78 chr5 122811435 122811895 + 1 NA intron (NM_003100, intron 7 of 14) AluSc|SINE|Alu -33784 NR_146145 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 461.5-7 chr5 84369459 84370131 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 15072 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 229.25-52 chr3 60389955 60390314 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 227736 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 181.25-10 chr1 179700798 179701052 + 1 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -26851 NM_001329713 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 326.5-14 chr16 64811771 64812233 + 1 NA Intergenic Intergenic 310061 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 259.5-19 chr11 24368645 24369039 + 1 NA Intergenic Intergenic -128211 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 228.25-17 chr12 115254146 115254588 + 1 NA Intergenic Intergenic -570192 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 200.5-39 chr14 67129120 67129394 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 16 of 21) intron (NM_001024218, intron 16 of 21) -60183 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 165.5-155 chr5 155959497 155959763 + 1 NA Intergenic Intergenic -367127 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 153.75-97 chr3 181488929 181489245 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -46601 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 254.75-30 chr21 27737435 27738004 + 1 NA intron (NR_024357, intron 1 of 3) MER8|DNA|TcMar-Tigger 15340 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 175.25-28 chr11 109944302 109944621 + 1 NA Intergenic Intergenic -148931 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 168.75-15 chr1 208087725 208088150 + 1 NA intron (NM_025179, intron 9 of 31) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 156447 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 157.25-5 chr1 101352705 101353023 + 1 NA intron (NR_126402, intron 4 of 4) intron (NR_126402, intron 4 of 4) 29027 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 264.5-5 chr10 10764483 10764949 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 2 of 14) intron (NM_001326317, intron 2 of 14) 30198 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 207.25-55 chr22 25770027 25770344 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 5 of 43) intron (NM_001318245, intron 5 of 43) 27997 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 148.5-156 chr3 138702612 138702824 + 1 NA intron (NM_001256045, intron 1 of 12) intron (NM_001256045, intron 1 of 12) 4903 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 144.75-174 chr8 83729617 83729781 + 1 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 325941 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 242.5-33 chr16 55472717 55473133 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5905 NM_001302508 4313 Hs.513617 NM_004530 ENSG00000087245 MMP2 CLG4|CLG4A|MMP-2|MMP-II|MONA|TBE-1 matrix metallopeptidase 2 protein-coding 347.5-9 chr16 5617640 5618053 + 1 NA Intergenic Intergenic -1596 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 218.5-28 chr11 87709269 87709548 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 10003 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 209.5-120 chr5 59168331 59168732 + 1 NA intron (NM_001364602, intron 5 of 5) intron (NM_001364602, intron 5 of 5) 107584 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 223.25-12 chr12 27038356 27038770 + 1 NA Intergenic Intergenic 16005 NM_004264 9412 Hs.286145 NM_004264 ENSG00000152944 MED21 SRB7|SURB7|hSrb7 mediator complex subunit 21 protein-coding 285.5-59 chr8 62012619 62013011 + 1 NA Intergenic Intergenic 122976 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 145.75-20 chr11 17567467 17567644 + 1 NA intron (NM_001277269, intron 14 of 54) AluJo|SINE|Alu 20182 NM_001277269 340990 Hs.688380 NM_198497 ENSG00000188162 OTOG DFNB18B|MLEMP|OTGN otogelin protein-coding 191.5-122 chr5 156323511 156323733 + 1 NA Intergenic Intergenic -3135 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 139.5-79 chr17 26869441 26869594 + 1 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 219724 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 220.5-11 chr10 107643284 107643749 + 1 NA Intergenic Intergenic 425777 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 167.25-43 chr14 59181977 59182199 + 1 NA Intergenic Intergenic -6579 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 318.5-2 chr1 161914068 161914654 + 1 NA intron (NM_007348, intron 15 of 15) L2a|LINE|L2 110104 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 135.25-143 chr4 62028188 62028407 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 20 of 23) intron (NM_001371343, intron 20 of 23) 133468 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 166.5-28 chr10 25681324 25681555 + 1 NA intron (NR_108069, intron 3 of 3) intron (NR_108069, intron 3 of 3) 29727 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 135.5-191 chr7 81850089 81850351 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -80173 NM_001010932 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 340.75-17 chr4 64364090 64364565 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 2 of 11) L1PA15|LINE|L1 45123 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 170.5-178 chr7 98300525 98300783 + 1 NA intron (NM_018842, intron 12 of 13) intron (NM_018842, intron 12 of 13) 18968 NM_015379 25798 Hs.567438 NM_015379 ENSG00000164713 BRI3 I3 brain protein I3 protein-coding 152.5-132 chr4 52877252 52877532 + 1 NA intron (NM_152540, intron 8 of 8) intron (NM_152540, intron 8 of 8) 15075 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 203.5-18 chr10 17707511 17707819 + 1 NA intron (NM_001324284, intron 13 of 14) intron (NM_001324284, intron 13 of 14) -44536 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 201.25-19 chr11 12455031 12455322 + 1 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) L1MC5|LINE|L1 77605 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 303.5-49 chr8 26385903 26386378 + 1 NA intron (NM_004331, intron 1 of 5) intron (NM_004331, intron 1 of 5) 3086 NM_004331 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 201.5-27 chr10 67538512 67538904 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 4 of 17) intron (NM_001127384, intron 4 of 17) 126952 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 136.75-133 chr3 139127985 139128174 + 1 NA Intergenic Intergenic 23894 NR_026783 60467 Hs.512673 NM_021812 ENSG00000232416 BPESC1 NCRNA00187 blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis candidate 1 ncRNA 155.25-188 chr9 111649984 111650170 + 1 NA intron (NM_001015882, intron 3 of 3) intron (NM_001015882, intron 3 of 3) -11528 NM_001198664 2790 Hs.534196 NM_001017998 ENSG00000242616 GNG10 - G protein subunit gamma 10 protein-coding 138.75-120 chr3 149962171 149962395 + 1 NA TTS (NM_183381) TTS (NM_183381) 8612 NM_053024 5217 Hs.91747 NM_002628 ENSG00000070087 PFN2 D3S1319E|PFL profilin 2 protein-coding 166.75-133 chr7 78971157 78971447 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -37686 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 179.25-70 chr18 76738388 76738586 + 1 NA Intergenic Intergenic 48458 NR_122073 400661 Hs.514963 NR_122073 ENSG00000276397 LINC01879 - long intergenic non-protein coding RNA 1879 ncRNA 215.5-68 chr3 55096105 55096497 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -81871 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 248.75-24 chr14 72761480 72762059 + 1 NA intron (NM_001280544, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 130880 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 121.75-76 chr2 28530350 28530482 + 1 NA intron (NM_001170585, intron 8 of 56) MIRb|SINE|MIR 34345 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 204.5-104 chr5 23911906 23912153 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -39319 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 231.25-26 chr16 87280350 87280676 + 1 NA intron (NR_104667, intron 3 of 4) L1MC4|LINE|L1 11939 NR_104667 101928682 Hs.149004 NR_104667 ENSG00000261697 LOC101928682 - uncharacterized LOC101928682 ncRNA 229.5-26 chr11 57750405 57750676 + 1 NA intron (NM_001145101, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu 1241 NM_001145101 643376 Hs.606355 NM_001145101 ENSG00000233436 BTBD18 - BTB domain containing 18 protein-coding 196.25-60 chr2 50250698 50250937 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) L1PA10|LINE|L1 96937 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 250.25-26 chr2 95217417 95217994 + 1 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 51896 NM_001291605 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 160.25-68 chr2 45346815 45347287 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -92110 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 216.5-52 chr18 21025622 21025876 + 1 NA intron (NM_005406, intron 10 of 32) intron (NM_005406, intron 10 of 32) 86064 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 248.5-78 chr4 183157185 183157635 + 1 NA intron (NM_024949, intron 1 of 22) L1MC4|LINE|L1 58153 NM_024949 80014 Hs.333179 NM_024949 ENSG00000151718 WWC2 BOMB WW and C2 domain containing 2 protein-coding 198.75-32 chr16 75576714 75576959 + 1 NA intron (NM_007285, intron 3 of 3) intron (NM_007285, intron 3 of 3) 10457 NM_007285 11345 Hs.461379 NM_007285 ENSG00000034713 GABARAPL2 ATG8|ATG8C|GATE-16|GATE16|GEF-2|GEF2 GABA type A receptor associated protein like 2 protein-coding 169.5-117 chr3 192988582 192988921 + 1 NA Intergenic Intergenic -70895 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 227.75-35 chr2 73406791 73407029 + 1 NA intron (NM_015120, intron 1 of 22) AluSz|SINE|Alu 21152 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 189.25-69 chr21 28279597 28279941 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -51102 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 130.25-11 chr1 155355654 155355867 + 1 NA intron (NM_018489, intron 15 of 27) intron (NM_018489, intron 15 of 27) -9315 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 164.75-105 chr4 35888005 35888278 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 355798 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 151.5-128 chr3 127286608 127286921 + 1 NA intron (NM_001362810, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 1282 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 121.25-24 chr10 81684896 81685183 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -190155 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 149.5-7 chr1 114465477 114465677 + 1 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) FLAM_C|SINE|Alu 45626 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 184.5-2 chr1 10232580 10232828 + 1 NA intron (NM_001365953, intron 2 of 20) intron (NM_001365953, intron 2 of 20) 1940 NM_001365953 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 247.75-23 chr16 19245991 19246251 + 1 NA intron (NM_001308157, intron 7 of 7) AluSx1|SINE|Alu -39610 NM_001256720 728276 Hs.632180 NM_001256720 ENSG00000261210 CLEC19A - C-type lectin domain containing 19A protein-coding 308.75-9 chr11 99472536 99473059 + 1 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -83348 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 185.75-71 chr20 22882104 22882462 + 1 NA Intergenic Intergenic -153137 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 266.5-31 chr2 34530432 34530893 + 1 NA Intergenic Intergenic -146895 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 217.25-82 chr8 99719792 99720118 + 1 NA intron (NM_017890, intron 37 of 61) intron (NM_017890, intron 37 of 61) 173752 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 156.75-11 chr1 157131087 157131279 + 1 NA intron (NM_001145312, intron 4 of 4) intron (NM_001145312, intron 4 of 4) 2821 NR_001560 360155 Hs.491808 NR_001560 ENSG00000235700 CYCSP52 HC6|HCP2 CYCS pseudogene 52 pseudo 147.75-43 chr15 25553426 25553599 + 1 NA Intergenic Intergenic -114456 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 163.75-114 chr6 65183130 65183400 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -118153 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 199.5-23 chr11 82032457 82032823 + 1 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) LTR50|LTR|ERVL -141804 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 188.75-88 chr5 43685907 43686163 + 1 NA intron (NM_012343, intron 19 of 21) intron (NM_012343, intron 19 of 21) -82805 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 323.5-28 chr7 5428019 5428642 + 1 NA 5' UTR (NM_001354886, exon 1 of 1) 5' UTR (NM_001354886, exon 1 of 1) 597 NM_001354886 100129484 Hs.147507 NM_001354886 LOC100129484 - uncharacterized LOC100129484 protein-coding 345.75-12 chr8 66459758 66460241 + 1 NA intron (NM_144650, intron 12 of 13) intron (NM_144650, intron 12 of 13) 27495 NM_144650 137872 Hs.720023 NM_144650 ENSG00000147576 ADHFE1 ADH8|HMFT2263|HOT alcohol dehydrogenase iron containing 1 protein-coding 126.5-244 chr8 92681034 92681257 + 1 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -25651 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 210.75-35 chr2 23011028 23011323 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -374004 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 280.25-29 chr2 157619284 157619789 + 1 NA intron (NM_145259, intron 1 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie 9328 NM_145259 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 207.5-24 chr14 84891663 84891981 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -380110 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 203.25-73 chr4 41739013 41739372 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 9778 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 191.75-135 chrX 85775517 85775817 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -60113 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 140.75-49 chr14 31031313 31031490 + 1 NA intron (NM_001254728, intron 1 of 5) intron (NM_001254728, intron 1 of 5) 4758 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 209.25-42 chr17 60752505 60752956 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) L1M5|LINE|L1 74879 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 129.25-118 chr22 44742092 44742292 + 1 NA intron (NM_181334, intron 4 of 14) G-rich|Low_complexity|Low_complexity -10366 NM_001017526 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 199.25-42 chr16 66380767 66381236 + 1 NA intron (NM_001795, intron 2 of 11) intron (NM_001795, intron 2 of 11) 14310 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 255.75-16 chr17 60963899 60964408 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) L1MA4|LINE|L1 286302 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 245.25-10 chr11 18498618 18499189 + 1 NA intron (NM_006292, intron 7 of 9) L2-1_AMi|LINE|L2 28039 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 187.5-46 chr12 128336592 128336831 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 42619 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 324.5-11 chr15 63688917 63689441 + 1 NA intron (NM_003922, intron 33 of 77) intron (NM_003922, intron 33 of 77) -88352 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-17 chr10 65323662 65323885 + 1 NA Intergenic LTR27D|LTR|ERV1 -247652 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 165.75-149 chr6 116525500 116525892 + 1 NA TTS (NM_153711) TTS (NM_153711) -3347 NM_001256889 221301 Hs.350750 NM_153036 ENSG00000164451 CALHM4 C6orf78|FAM26D calcium homeostasis modulator family member 4 protein-coding 312.25-2 chr10 82935765 82936111 + 1 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) L1ME3A|LINE|L1 -703018 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 256.75-27 chr20 50525660 50525963 + 1 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) 15428 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 227.5-2 chr1 158646620 158646857 + 1 NA intron (NM_003126, intron 27 of 51) intron (NM_003126, intron 27 of 51) 39977 NM_003126 6708 Hs.119825 NM_003126 ENSG00000163554 SPTA1 EL2|HPP|HS3|SPH3|SPTA spectrin alpha, erythrocytic 1 protein-coding 162.25-47 chr14 40556528 40556851 + 1 NA Intergenic Intergenic -398022 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 217.5-73 chr21 29545850 29546134 + 1 NA intron (NM_001330993, intron 15 of 16) MamGypLTR2c|LTR|Gypsy 49945 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 181.25-110 chr6 55079888 55080388 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -26322 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 232.75-62 chr7 40607855 40608175 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 371924 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 152.75-83 chr2 72546460 72546802 + 1 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) intron (NR_135774, intron 8 of 19) 279402 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 180.75-107 chr4 103398733 103398955 + 1 NA Intergenic LTR59|LTR|ERV1 -26198 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 267.5-57 chr5 28105748 28106248 + 1 NA Intergenic Intergenic 181667 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 155.5-48 chr13 63324960 63325186 + 1 NA intron (NR_126409, intron 2 of 6) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 3021 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 132.5-158 chr3 32175082 32175245 + 1 NA Intergenic Intergenic -63516 NM_001320308 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 178.5-166 chr7 37387101 37387433 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -33599 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 225.5-85 chr4 181187210 181187680 + 1 NA Intergenic Intergenic -28296 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 222.75-37 chr14 56393608 56393896 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -120579 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 125.5-261 chr8 128263895 128264051 + 1 NA Intergenic Intergenic 113857 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 133.75-137 chr3 110955045 110955217 + 1 NA Intergenic Intergenic 114828 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 168.5-122 chr3 140963299 140963548 + 1 NA intron (NM_001104647, intron 4 of 6) intron (NM_001104647, intron 4 of 6) 21587 NM_018155 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 136.5-25 chr10 57297791 57298016 + 1 NA Intergenic Intergenic 6656 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 188.75-79 chr3 107708210 107708461 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) intron (NM_001276286, intron 3 of 16) 169733 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 141.5-187 chr5 148074538 148074749 + 1 NA intron (NM_006846, intron 4 of 32) intron (NM_006846, intron 4 of 32) 10663 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 140.75-5 chr1 108195391 108195682 + 1 NA intron (NM_013386, intron 1 of 9).2 intron (NM_013386, intron 1 of 9).2 -2701 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 119.5-88 chr15 81084135 81084280 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -50063 NM_001353365 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 283.25-12 chr13 87350464 87350879 + 1 NA Intergenic Intergenic 268069 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 138.75-86 chr2 45904461 45904689 + 1 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) intron (NM_005400, intron 2 of 14) 252900 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 156.25-165 chrX 152891753 152891991 + 1 NA Intergenic Intergenic -22570 NM_001178110 7739 Hs.16622 NM_007150 ENSG00000147394 ZNF185 SCELL zinc finger protein 185 with LIM domain protein-coding 186.75-72 chr3 130617781 130618095 + 1 NA intron (NM_001102608, intron 22 of 35) intron (NM_001102608, intron 22 of 35) 57604 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 161.5-107 chr2 182471140 182471437 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -44240 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 164.5-202 chr8 66777805 66778017 + 1 NA intron (NM_013257, intron 1 of 16) intron (NM_013257, intron 1 of 16) 2706 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 149.75-149 chr6 132279786 132279963 + 1 NA Intergenic Intergenic 121601 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 190.25-13 chr10 33229175 33229548 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 105306 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 113.25-99 chr20 48319732 48319875 + 1 NA Intergenic Intergenic -40108 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 258.5-64 chr6 41362125 41362506 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 26707 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 188.5-29 chr12 55634194 55634507 + 1 NA Intergenic Intergenic -2542 NM_206899 121130 Hs.554551 NM_206899 ENSG00000175398 OR10P1 OR10P1P|OR10P2P|OR10P3P|OR12-7|OST701 olfactory receptor family 10 subfamily P member 1 protein-coding 209.75-110 chr9 90528474 90528700 + 1 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) L1PA16|LINE|L1 54159 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 184.25-35 chr13 42016621 42017021 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -23215 NM_001204504 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 223.5-93 chr4 164467050 164467432 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -83986 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 237.25-22 chr14 32151126 32151540 + 1 NA intron (NM_001030055, intron 5 of 6) intron (NM_001030055, intron 5 of 6) -50712 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 163.5-5 chr1 54295126 54295367 + 1 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) intron (NM_001009955, intron 4 of 16) 58803 NR_103541 619518 Hs.591438 NM_001034847 ENSG00000198711 SSBP3-AS1 C1orf191|MST128|MSTP128 SSBP3 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-48 chr12 29355412 29355669 + 1 NA intron (NM_016570, intron 8 of 13) intron (NM_016570, intron 8 of 13) 25632 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 184.5-133 chr6 96397214 96397404 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -124497 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 169.75-144 chr7 61773676 61773963 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1530237 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 129.25-102 chr2 202420829 202421080 + 1 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) intron (NM_001204, intron 1 of 12) 44627 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 114.5-276 chr9 34365730 34365904 + 1 NA TTS (NM_020702) TTS (NM_020702) 11081 NM_020702 57462 Hs.522083 NM_020702 ENSG00000164976 MYORG IBGC7|KIAA1161|NET37 myogenesis regulating glycosidase (putative) protein-coding 233.75-44 chr20 36627822 36628225 + 1 NA intron (NM_175077, intron 5 of 7) intron (NM_175077, intron 5 of 7) 18173 NM_175077 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 286.75-42 chr8 82862594 82862942 + 1 NA Intergenic MER54B|LTR|ERVL -49336 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 193.5-108 chr3 97206830 97207219 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -232583 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 383.75 chr10 72784503 72785007 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 63726 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 181.25-34 chr14 82039642 82039826 + 1 NA Intergenic Intergenic -296596 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 113.75-9 chr1 113645352 113645553 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 11 of 20) intron (NM_001142782, intron 11 of 20) 113703 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 177.5-181 chr9 34972195 34972464 + 1 NA intron (NM_015297, intron 2 of 7) intron (NM_015297, intron 2 of 7) 14044 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 184.5-33 chr12 2089085 2089295 + 1 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 35905 NM_001167624 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 200.5-57 chr18 2891495 2891821 + 1 NA exon (NM_032048, exon 4 of 8) exon (NM_032048, exon 4 of 8) 44652 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 160.5-59 chr14 81052523 81052843 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) L1MA7|LINE|L1 97062 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 151.5-26 chr11 62318730 62318950 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18608 NM_025080 80150 Hs.535326 NM_025080 ENSG00000162174 ASRGL1 ALP|ALP1|CRASH asparaginase like 1 protein-coding 196.25-57 chr2 21237825 21238109 + 1 NA Intergenic Intergenic 113981 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 133.25-13 chr10 3392297 3392474 + 1 NA intron (NR_131187, intron 1 of 1) intron (NR_131187, intron 1 of 1) 73690 NR_131187 105376360 Hs.212226 NR_131187 LOC105376360 - uncharacterized LOC105376360 ncRNA 112.75-65 chr14 82934635 82934785 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 292078 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 201.5-65 chr18 1721378 1721698 + 1 NA Intergenic Intergenic -361909 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 130.75-205 chr9 105719819 105719999 + 1 NA intron (NM_018112, intron 2 of 5) intron (NM_018112, intron 2 of 5) 25368 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 218.75-54 chr3 62808044 62808296 + 1 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) AluSx3|SINE|Alu 67246 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 219.25-56 chr4 86643665 86643908 + 1 NA intron (NM_080685, intron 2 of 47) MIR3|SINE|MIR 49471 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 178.5-115 chr3 193983687 193983890 + 1 NA intron (NR_033944, intron 1 of 2) intron (NR_033944, intron 1 of 2) 10450 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 172.75-56 chr18 67138711 67138978 + 1 NA Intergenic Intergenic 57260 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 243.5-89 chr8 142646557 142646958 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 8161 NR_134305 101928087 Hs.126101 NR_134305 ENSG00000277332 LOC101928087 - uncharacterized LOC101928087 ncRNA 264.25-17 chr17 52661761 52662091 + 1 NA Intergenic Intergenic -200195 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 194.5-127 chr6 45521924 45522207 + 1 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) L3|LINE|CR1 99790 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 172.5-128 chr3 113808634 113808904 + 1 NA intron (NM_001690, intron 14 of 14) intron (NM_001690, intron 14 of 14) -30019 NM_017577 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 262.75-8 chr11 39630093 39630480 + 1 NA Intergenic Intergenic 662844 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 192.5-95 chr4 17636613 17636951 + 1 NA intron (NM_015688, intron 14 of 17) intron (NM_015688, intron 14 of 17) 22141 NM_025205 80306 Hs.731966 NM_025205 ENSG00000118579 MED28 1500003D12Rik|EG1|magicin mediator complex subunit 28 protein-coding 207.5-129 chrX 129199003 129199262 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 324358 NM_001282875 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 164.5-170 chr5 169932336 169932582 + 1 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) intron (NM_001346304, intron 1 of 3) 48036 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 141.25-38 chr12 58831624 58831864 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -50028 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 258.25-58 chr7 109068821 109069108 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -184377 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 135.75-96 chr2 65843598 65843753 + 1 NA Intergenic Intergenic -411076 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 200.5-49 chr16 75772842 75773087 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -46474 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 118.5-203 chr7 124121283 124121511 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -88330 NM_001136002 730130 Hs.450249 NM_001136002 ENSG00000234224 TMEM229A - transmembrane protein 229A protein-coding 162.25-97 chr20 47938790 47939069 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -44297 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 120.5-225 chr8 81604992 81605218 + 1 NA non-coding (NR_146081, exon 8 of 8) non-coding (NR_146081, exon 8 of 8) 26172 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 176.25-14 chr10 19942463 19942664 + 1 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 126131 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 119.5-83 chr14 83173411 83173602 + 1 NA Intergenic Intergenic 530874 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 251.5-91 chr8 138987969 138988367 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -74127 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 150.75-133 chr3 170768114 170768344 + 1 NA Intergenic Intergenic 101966 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 152.75-106 chr3 58742498 58742684 + 1 NA intron (NM_001351530, intron 15 of 15) intron (NM_001351530, intron 15 of 15) -75817 NM_138805 131177 Hs.61265 NM_138805 ENSG00000198643 FAM3D EF7|OIT1 family with sequence similarity 3 member D protein-coding 146.5-53 chr12 74950617 74950959 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 258960 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 203.5-112 chr5 56739749 56739991 + 1 NA Intergenic Intergenic 33001 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 185.5-39 chr12 117468918 117469253 + 1 NA intron (NM_173598, intron 19 of 19) intron (NM_173598, intron 19 of 19) -107283 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 193.25-122 chr9 137226665 137226892 + 1 NA promoter-TSS (NM_001190228) promoter-TSS (NM_001190228) -788 NM_001190228 643596 Hs.730186 NM_001190228 ENSG00000233198 RNF224 - ring finger protein 224 protein-coding 186.5-70 chr2 182495827 182496097 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 26564 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 232.5-34 chr16 47425458 47425898 + 1 NA intron (NM_030790, intron 6 of 17) AluSz|SINE|Alu 35385 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 259.5-80 chr5 122487292 122487708 + 1 NA Intergenic Intergenic -8413 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 209.5-49 chr15 83178806 83179088 + 1 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) LTR53|LTR|ERVL 28876 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 240.5-11 chr10 98041716 98042371 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11215 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 239.25-89 chr8 121153945 121154305 + 1 NA Intergenic Intergenic -342079 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 259.5-28 chr12 120584049 120584370 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2807 NM_015918 51367 Hs.279913 NM_015918 ENSG00000167272 POP5 HSPC004|RPP2|RPP20|hPop5 POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 192.25-58 chr2 124487803 124488103 + 1 NA intron (NM_001367498, intron 7 of 23) intron (NM_001367498, intron 7 of 23) 462666 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 188.5-152 chr8 106620808 106621008 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -36900 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 117.5-94 chr18 74433545 74433673 + 1 NA Intergenic Intergenic 23659 NM_001044369 125704 Hs.371690 NM_001044369 ENSG00000187773 DIPK1C C18orf51|FAM69C divergent protein kinase domain 1C protein-coding 119.25-176 chr6 82892654 82892837 + 1 NA non-coding (NR_146808, exon 11 of 11) non-coding (NR_146808, exon 11 of 11) 173096 NM_001350603 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 114.25-90 chr2 43858701 43858953 + 1 NA intron (NM_001357321, intron 6 of 12) intron (NM_001357321, intron 6 of 12) 19856 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 228.5-4 chr1 54058102 54058488 + 1 NA intron (NR_130900, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 4216 NR_039942 100616315 NR_039942 ENSG00000283749 MIR4781 mir-4781 microRNA 4781 ncRNA 148.75-8 chr1 113400112 113400395 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 9738 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 153.25-142 chr8 132708248 132708588 + 1 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -32873 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 121.75-145 chr5 30346923 30347113 + 1 NA Intergenic Intergenic 466458 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 137.5-168 chr4 12745273 12745520 + 1 NA Intergenic Intergenic 521945 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 114.75-3 chr1 50747855 50748031 + 1 NA intron (NM_007051, intron 4 of 18) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 212324 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 315.5-11 chr2 127387095 127387510 + 1 NA Intergenic CpG -31118 NM_000312 5624 Hs.224698 NM_000312 ENSG00000115718 PROC APC|PC|PROC1|THPH3|THPH4 protein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIa protein-coding 211.5-105 chr3 140886114 140886413 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -55573 NM_001104647 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 193.5-117 chr4 44760560 44760770 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -34031 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 310.75-17 chr18 3902863 3903471 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 17814 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 216.25-46 chr16 87399494 87399898 + 1 NA intron (NM_022818, intron 2 of 3) intron (NM_022818, intron 2 of 3) 7360 NM_022818 81631 Hs.356061 NM_022818 ENSG00000140941 MAP1LC3B ATG8F|LC3B|MAP1A/1BLC3|MAP1LC3B-a microtubule associated protein 1 light chain 3 beta protein-coding 133.5-183 chr4 67202619 67202805 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 219288 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 176.5-175 chr8 125621780 125622061 + 1 NA Intergenic Intergenic 189711 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 166.25-117 chr5 7332242 7332439 + 1 NA Intergenic Intergenic 15637 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 163.25-5 chr1 56409707 56409870 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5175 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 147.75-118 chr4 57688155 57688351 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 262381 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 181.5-141 chr6 75288352 75288584 + 1 NA intron (NR_040081, intron 1 of 2) AluSx3|SINE|Alu 3454 NR_040081 100506804 Hs.743708 NR_040081 LOC100506804 - uncharacterized LOC100506804 ncRNA 229.5-134 chr8 130145571 130145998 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 14 of 29) MIR|SINE|MIR -61016 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 220.5-58 chr2 196270893 196271140 + 1 NA intron (NM_020760, intron 17 of 28) intron (NM_020760, intron 17 of 28) 10992 NR_110225 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 243.5-30 chr16 84648910 84649377 + 1 NA intron (NM_001303451, intron 1 of 3) intron (NM_001303451, intron 1 of 3) 632 NM_001303451 79786 Hs.222731 NM_024731 ENSG00000135686 KLHL36 C16orf44 kelch like family member 36 protein-coding 197.75-21 chr14 21718613 21718884 + 1 NA Intergenic Intergenic -47731 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 163.25-99 chr3 114653115 114653389 + 1 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) L1ME2|LINE|L1 -28307 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 284.5-16 chr14 60031014 60031615 + 1 NA intron (NR_075071, intron 28 of 32) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -60597 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 149.25-159 chr6 153624886 153625090 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -385508 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 162.75-61 chr18 60084248 60084556 + 1 NA Intergenic Intergenic 184406 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 183.25-104 chr7 54946859 54947147 + 1 NA Intergenic Intergenic -72014 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 125.25-110 chr2 161409077 161409330 + 1 NA intron (NM_005805, intron 11 of 11) intron (NM_005805, intron 11 of 11) -7094 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 151.5-126 chr3 123186078 123186331 + 1 NA Intergenic Intergenic -15739 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 183.5-143 chr7 131297790 131298018 + 1 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 29875 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 146.75-15 chr10 44701233 44701454 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -209973 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 227.75-55 chr4 17117612 17118024 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 68239 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 249.5-18 chr11 20380050 20380479 + 1 NA intron (NM_001098521, intron 4 of 5) MER68|LTR|ERVL -7266 NM_001145166 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 202.25-85 chr7 11440115 11440383 + 1 NA intron (NM_015204, intron 13 of 26) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 391949 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 288.75-42 chr7 82036472 82036798 + 1 NA intron (NM_000722, intron 11 of 38) L2b|LINE|L2 27458 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 153.5-67 chr15 60986585 60986855 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 242582 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 204.5-54 chr18 66537463 66537721 + 1 NA intron (NM_001271028, intron 7 of 9) L1MC4a|LINE|L1 66498 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 167.5-99 chr2 147607025 147607275 + 1 NA Intergenic Intergenic -237367 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 357.75-11 chr20 32833945 32834636 + 1 NA intron (NM_012325, intron 3 of 6) AluJo|SINE|Alu 14336 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 123.5-156 chr5 5458241 5458433 + 1 NA intron (NM_015325, intron 12 of 18) L2a|LINE|L2 35660 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 190.5-163 chr8 119299600 119300054 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -25344 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 133.5-21 chr1 222310505 222310722 + 1 NA Intergenic Intergenic 237491 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 250.5-98 chr8 87981334 87981716 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -107510 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 261.25-48 chr8 50806547 50806977 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 642631 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 163.5-49 chr14 22228273 22228590 + 1 NA Intergenic Intergenic 204322 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 324.75-32 chr8 91246580 91246953 + 1 NA intron (NM_001282357, intron 2 of 18) intron (NM_001282357, intron 2 of 18) -2553 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 141.25-165 chr7 6227428 6227601 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) L1M4|LINE|L1 45110 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 181.75-30 chr12 53414007 53414273 + 1 NA 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) -9715 NM_001164690 269 Hs.659889 NM_020547 ENSG00000135409 AMHR2 AMHR|MISR2|MISRII|MRII anti-Mullerian hormone receptor type 2 protein-coding 184.5-139 chr7 42948848 42949072 + 1 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 16584 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 135.75-89 chr2 12917198 12917368 + 1 NA Intergenic Intergenic 89730 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 159.25-76 chr20 44213334 44213574 + 1 NA intron (NR_038337, intron 1 of 2) intron (NR_038337, intron 1 of 2) 2368 NR_038337 100505783 Hs.159049 NR_038337 ENSG00000223891 OSER1-DT OSER1-AS1 OSER1 divergent transcript ncRNA 131.75-25 chr10 18412473 18412714 + 1 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) L2|LINE|L2 12018 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 172.5-61 chr13 86598862 86599205 + 1 NA Intergenic Intergenic -312887 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 159.5-80 chr17 61150722 61150966 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 216860 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 217.75-28 chr16 25041327 25041569 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 9707 NR_038379 554206 Hs.552959 NR_038379 ENSG00000262587 LOC554206 - leucine carboxyl methyltransferase 1 pseudogene pseudo 318.25-5 chr11 84919573 84920169 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 3550 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 215.25-52 chr20 42557713 42558031 + 1 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -127611 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 240.5-107 chr9 117042231 117042612 + 1 NA intron (NM_014010, intron 4 of 21) intron (NM_014010, intron 4 of 21) 138780 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 152.25-2 chr1 73375507 73375704 + 1 NA Intergenic Intergenic 69435 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 228.25-74 chr6 147284035 147284376 + 1 NA intron (NM_139244, intron 8 of 25) intron (NM_139244, intron 8 of 25) -79591 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 366.25-6 chr15 59679307 59679941 + 1 NA exon (NM_001368061, exon 4 of 8) exon (NM_001368061, exon 4 of 8) 9302 NM_001320675 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 194.25-99 chr6 6202238 6202468 + 1 NA intron (NM_000129, intron 8 of 14) intron (NM_000129, intron 8 of 14) -32918 NR_107007 102466866 NR_107007 ENSG00000263572 MIR7853 hsa-mir-7853 microRNA 7853 ncRNA 162.5-172 chr8 82795293 82795561 + 1 NA Intergenic Intergenic -116677 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 131.75-161 chr5 9047887 9048168 + 1 NA intron (NM_003966, intron 21 of 22) intron (NM_003966, intron 21 of 22) 5868 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 116.5-258 chr8 137682608 137682800 + 1 NA Intergenic Intergenic -269116 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 149.5-105 chr2 206939893 206940154 + 1 NA intron (NM_173077, intron 1 of 8) intron (NM_173077, intron 1 of 8) 505 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 203.5-72 chr2 108188640 108188982 + 1 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) L1ME3A|LINE|L1 29030 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 215.75-81 chr5 153563630 153563885 + 1 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) intron (NM_001258020, intron 3 of 16) 71585 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 136.25-150 chr5 91047242 91047453 + 1 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) MLT2A2|LTR|ERVL 267055 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 255.25-57 chr9 31735576 31736159 + 1 NA Intergenic Intergenic -354377 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 216.75-75 chr7 24967662 24968015 + 1 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) L2|LINE|L2 12340 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 145.5-68 chr14 73339592 73339825 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) intron (NM_001005743, intron 4 of 12) -93707 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 190.5-148 chr7 88284529 88284811 + 1 NA intron (NM_024636, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 22224 NM_024636 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 212.75-27 chr12 114255773 114256201 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -14217 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 191.5-17 chr10 85097289 85097521 + 1 NA Intergenic Intergenic 101500 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 259.5-64 chr22 32860593 32861068 + 1 NA 3' UTR (NM_000362, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_000362, exon 5 of 5) 60014 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 146.75-29 chr11 113509433 113509647 + 1 NA Intergenic Intergenic -34142 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 194.5-60 chr18 79188325 79188542 + 1 NA intron (NR_148360, intron 8 of 31) intron (NR_148360, intron 8 of 31) 119039 NM_198531 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 116.75-166 chr5 105132032 105132149 + 1 NA Intergenic Intergenic 32616 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 177.5-46 chr14 60409450 60409746 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 76465 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 176.5-150 chr6 72774480 72774747 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) L1ME3A|LINE|L1 144118 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 261.25-40 chr5 100196270 100196878 + 1 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie 191680 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 116.75-175 chr6 149206534 149206793 + 1 NA Intergenic Intergenic -11261 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 119.5-136 chr20 15927558 15927703 + 1 NA intron (NR_130924, intron 1 of 1) intron (NR_130924, intron 1 of 1) -4316 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 195.25-5 chr1 78184491 78184806 + 1 NA Intergenic Intergenic -44951 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 202.75-92 chr5 112121952 112122333 + 1 NA Intergenic Intergenic -38384 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 121.5-134 chr2 88074028 88074234 + 1 NA intron (NM_001330364, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 6306 NM_001330364 150572 Hs.516176 NM_198274 ENSG00000115593 SMYD1 BOP|KMT3D|ZMYND18|ZMYND22 SET and MYND domain containing 1 protein-coding 182.5-176 chr9 73962222 73962474 + 1 NA Intergenic Intergenic -409183 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 136.5-71 chr14 61845982 61846188 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1MA2|LINE|L1 33382 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 167.25-150 chr8 84288639 84289089 + 1 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 104198 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 254.25-7 chr10 14450686 14450978 + 1 NA Intergenic Intergenic 14256 NR_031668 100302116 NR_031668 ENSG00000221371 MIR1265 MIRN1265|hsa-mir-1265 microRNA 1265 ncRNA 237.75-20 chr15 59439832 59440226 + 1 NA intron (NM_152450, intron 1 of 8) intron (NM_152450, intron 1 of 8) 1843 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 187.5-161 chr8 19475747 19476071 + 1 NA intron (NM_001130518, intron 4 of 9) MIR3|SINE|MIR 126636 NM_001354491 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 128.5-243 chrX 67186363 67186562 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -357559 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 149.25-179 chr8 73472240 73472422 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 52257 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 284.5-55 chr6 143383211 143383714 + 1 NA Intergenic Intergenic 59215 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 280.5-25 chr2 133542211 133542629 + 1 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 26043 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 138.75-102 chr2 235609011 235609281 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -91225 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 157.25-58 chr17 68625660 68625863 + 1 NA Intergenic MER104|DNA|TcMar-Tc2 -2393 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 222.5-91 chr5 172625232 172625666 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15814 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 137.5-96 chr17 59411398 59411555 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 45393 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 144.25-149 chr4 117898733 117898895 + 1 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 64413 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 160.25-128 chr5 96152938 96153277 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 73969 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 213.75-26 chr12 61456822 61457297 + 1 NA Intergenic Intergenic 735780 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 238.5-4 chr1 115314156 115314513 + 1 NA intron (NM_002506, intron 1 of 2) intron (NM_002506, intron 1 of 2) 23902 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 146.5-215 chr7 133660041 133660398 + 1 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 164669 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 200.25-27 chr12 43490550 43490876 + 1 NA intron (NM_025003, intron 6 of 38) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 61490 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 198.25-89 chr6 73079508 73079881 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 5 of 13) intron (NM_001160132, intron 5 of 13) 63820 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 362.5-24 chr7 127339862 127340296 + 1 NA Intergenic Intergenic 52629 NM_176814 168850 Hs.159006 NM_176814 ENSG00000048405 ZNF800 - zinc finger protein 800 protein-coding 151.25-78 chr19 56779700 56780139 + 1 NA intron (NR_163143, intron 11 of 12) intron (NR_163143, intron 11 of 12) 14597 NR_110744 101929059 Hs.607132 NR_110744 ENSG00000286125 ZIM2-AS1 ZIM2as ZIM2 antisense RNA 1 ncRNA 153.5-165 chr5 145245643 145245824 + 1 NA Intergenic Intergenic 589609 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 134.5-9 chr1 77517802 77517955 + 1 NA intron (NM_012093, intron 10 of 13) L1MC4|LINE|L1 164780 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 162.5-122 chr4 33965824 33966072 + 1 NA intron (NR_125902, intron 3 of 4) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 73945 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 152.25-100 chr3 3300397 3300602 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -120782 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 203.5-90 chr3 42569594 42569984 + 1 NA intron (NM_001201572, intron 1 of 6) intron (NM_001201572, intron 1 of 6) -12051 NM_016305 51188 Hs.534454 NM_016305 ENSG00000008324 SS18L2 KIAA-iso SS18 like 2 protein-coding 119.75-46 chr12 59743853 59744031 + 1 NA intron (NR_073056, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 54572 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 117.75-4 chr1 58413403 58413773 + 1 NA Intergenic Intergenic 133138 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 178.75-89 chr5 148450568 148450850 + 1 NA TTS (NM_199453) TTS (NM_199453) 66751 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 169.75-59 chr16 84111577 84111874 + 1 NA intron (NM_003791, intron 1 of 22) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 5217 NM_003791 8720 Hs.75890 NM_003791 ENSG00000140943 MBTPS1 PCSK8|S1P|SEDKF|SKI-1 membrane bound transcription factor peptidase, site 1 protein-coding 136.75-34 chr10 90489663 90489936 + 1 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) intron (NR_110657, intron 2 of 6) 51006 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 141.5-73 chr17 28622698 28622911 + 1 NA intron (NM_001363826, intron 25 of 37) AluSg|SINE|Alu -8619 NM_001174103 124923 Hs.729077 NM_144610 ENSG00000167524 RSKR SGK494 ribosomal protein S6 kinase related protein-coding 136.5-205 chr7 3226586 3226842 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -68141 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 183.5-122 chr6 42778114 42778472 + 1 NA intron (NM_001318819, intron 1 of 13) intron (NM_001318819, intron 1 of 13) -5203 NR_134654 401261 Hs.656652 NM_001004322 LOC401261 - uncharacterized LOC401261 ncRNA 121.5-98 chr16 61386887 61387039 + 1 NA Intergenic Intergenic -331197 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 154.5-185 chr8 82712335 82712517 + 1 NA Intergenic Intergenic -199678 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 191.5-141 chr7 111844042 111844324 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 25 of 52) AluSx1|SINE|Alu 35678 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 253.5-24 chr14 67626756 67627123 + 1 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 7019 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 161.5-25 chr10 110849585 110849793 + 1 NA Intergenic Intergenic 21215 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 315.25-4 chr10 86712487 86713040 + 1 NA intron (NM_001368066, intron 10 of 14) MER33|DNA|hAT-Charlie -43876 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 146.5-66 chr14 89172166 89172429 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 6 of 6) FLAM_A|SINE|Alu 244936 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 220.5-108 chr6 83408843 83409085 + 1 NA intron (NM_002395, intron 1 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 22087 NM_002395 4199 Hs.21160 NM_002395 ENSG00000065833 ME1 HUMNDME|MES malic enzyme 1 protein-coding 208.5-104 chr5 3065089 3065300 + 1 NA Intergenic Intergenic -112641 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 303.75-32 chr6 153996373 153996800 + 1 NA Intergenic Intergenic -13910 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 184.5-84 chr2 226020862 226021180 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -121773 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 291.75-19 chr19 52416448 52416938 + 1 NA exon (NM_032423, exon 7 of 7) exon (NM_032423, exon 7 of 7) -12455 NM_001291368 147658 Hs.447583 NM_182512 ENSG00000198633 ZNF534 KRBO3 zinc finger protein 534 protein-coding 173.75-34 chr11 82092183 82092527 + 1 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) intron (NR_120571, intron 5 of 7) -201519 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 154.75-156 chr9 100097077 100097319 + 1 NA intron (NM_015051, intron 1 of 11) intron (NM_015051, intron 1 of 11) 1802 NM_015051 23071 Hs.154023 NM_015051 ENSG00000023318 ERP44 PDIA10|TXNDC4 endoplasmic reticulum protein 44 protein-coding 288.5-52 chr9 35366243 35366797 + 1 NA intron (NM_001371187, intron 3 of 32) intron (NM_001371187, intron 3 of 32) 24624 NM_001371187 120.75-103 chr22 42076715 42076864 + 1 NA intron (NM_001002034, intron 2 of 2) intron (NM_001002034, intron 2 of 2) 2541 NM_001002034 150368 Hs.368312 NM_001002034 ENSG00000177096 PHETA2 FAM109B|IPIP27B|Ses2 PH domain containing endocytic trafficking adaptor 2 protein-coding 163.5-135 chr3 176045958 176046275 + 1 NA Intergenic Intergenic -198435 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 209.5-134 chr6 141305281 141305605 + 1 NA Intergenic Intergenic 621629 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 196.5-43 chr12 126595784 126596143 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 94355 NR_110034 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 265.25-17 chr15 70048250 70048765 + 1 NA 3' UTR (NM_001105192, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001105192, exon 20 of 20) 30961 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 143.5-37 chr11 128836339 128836511 + 1 NA 3' UTR (NM_000220, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_000220, exon 2 of 2) 6044 NM_000220 3758 Hs.527830 NM_000220 ENSG00000151704 KCNJ1 KIR1.1|ROMK|ROMK1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 1 protein-coding 207.25-8 chr10 17980682 17980928 + 1 NA intron (NM_001282734, intron 4 of 11) intron (NM_001282734, intron 4 of 11) 28887 NM_001145195 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 195.5-10 chr1 231330950 231331266 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 6744 NM_175876 149371 Hs.356198 NM_175876 ENSG00000116903 EXOC8 EXO84|Exo84p|SEC84 exocyst complex component 8 protein-coding 194.25-77 chr3 158333936 158334149 + 1 NA intron (NM_001271838, intron 5 of 9) intron (NM_001271838, intron 5 of 9) -192666 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 148.75-155 chr7 29044849 29045131 + 1 NA intron (NM_001371256, intron 15 of 16) intron (NM_001371256, intron 15 of 16) 65023 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 255.5-63 chr4 175869778 175870169 + 1 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR -56859 NM_201591 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 207.5-104 chr7 97349349 97349629 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 232896 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 171.5-70 chr19 49459088 49459434 + 1 NA intron (NM_001145396, intron 3 of 15) intron (NM_001145396, intron 3 of 15) 6036 NM_153329 126133 Hs.719998 NM_153329 ENSG00000161618 ALDH16A1 - aldehyde dehydrogenase 16 family member A1 protein-coding 158.25-112 chr5 60467456 60467689 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) -20141 NR_024617 25859 Hs.146312 NM_001039499 ENSG00000152931 PART1 NCRNA00206 prostate androgen-regulated transcript 1 ncRNA 195.5-126 chr5 153904804 153905100 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -5965 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 139.25-26 chr10 121503856 121504105 + 1 NA intron (NM_001144917, intron 7 of 15) intron (NM_001144917, intron 7 of 15) 27334 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 138.25-126 chr3 167939961 167940232 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 44148 NR_145443 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 162.25-101 chr21 30770041 30770407 + 1 NA Intergenic Intergenic -14796 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 153.5-203 chr8 121687885 121688177 + 1 NA Intergenic Intergenic -46591 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 220.5-32 chr15 91360817 91361168 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -102347 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 185.75-34 chr12 112007790 112008020 + 1 NA intron (NM_001193453, intron 1 of 9) intron (NM_001193453, intron 1 of 9) 5260 NM_001193531 89894 Hs.506815 NM_138341 ENSG00000198270 TMEM116 - transmembrane protein 116 protein-coding 113.5-112 chr19 46658420 46658585 + 1 NA intron (NM_145056, intron 1 of 3) intron (NM_145056, intron 1 of 3) -1862 NR_040042 100506068 Hs.434327 NR_040041 ENSG00000245598 DACT3-AS1 - DACT3 antisense RNA 1 ncRNA 143.5-71 chr14 70370266 70370461 + 1 NA 3' UTR (NM_018373, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_018373, exon 4 of 4) -10680 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 208.75-10 chr10 75968105 75968558 + 1 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 185570 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 136.5-74 chr14 95105454 95105698 + 1 NA intron (NM_001291628, intron 19 of 26) intron (NM_001291628, intron 19 of 26) 27927 NM_001195573 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 218.75-38 chr2 146635705 146636062 + 1 NA Intergenic Intergenic 48826 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 276.75-51 chr8 25553989 25554426 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 94974 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 193.5-168 chr9 73195293 73195589 + 1 NA Intergenic Intergenic 43576 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 214.25-39 chr2 32452683 32453182 + 1 NA intron (NM_016252, intron 22 of 73) L2b|LINE|L2 -79221 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 154.5-124 chr3 29481457 29481729 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 2 of 13) intron (NM_001003792, intron 2 of 13) 200281 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 144.25-203 chr8 105225722 105226010 + 1 NA Intergenic Intergenic -92572 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 112.75-17 chr1 239737089 239737283 + 1 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) -18067 NR_103776 100506915 Hs.667175 NR_103776 ENSG00000233355 CHRM3-AS2 - CHRM3 antisense RNA 2 ncRNA 239.5-2 chr1 69137037 69137312 + 1 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) intron (NR_146608, intron 3 of 4) 81276 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 157.5-24 chr10 67878269 67878471 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6286 NM_012238 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 148.5-251 chrX 104139894 104140063 + 1 NA intron (NM_001012755, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR -15346 NR_039980 286437 Hs.656786 NR_039980 LOC286437 - uncharacterized LOC286437 ncRNA 145.75-142 chr7 3399890 3400089 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1M4|LINE|L1 98737 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 302.25-30 chr8 121105790 121106378 + 1 NA Intergenic Intergenic -294038 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 216.5-65 chr2 204936967 204937222 + 1 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 391619 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 225.75-40 chr2 78426178 78426650 + 1 NA Intergenic Intergenic -119117 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 304.25-23 chr5 5982056 5982484 + 1 NA Intergenic Intergenic 355022 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 119.5-65 chr12 61028375 61028575 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 1164364 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 212.5-125 chr9 30090290 30090597 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 318011 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 144.5-52 chr12 126611719 126611979 + 1 NA Intergenic Intergenic 78469 NR_110034 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 145.5-149 chr4 104427183 104427424 + 1 NA Intergenic Intergenic -63662 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 202.75-112 chr9 15336432 15336740 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -29226 NM_001168340 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 195.25-100 chr9 27747721 27748101 + 1 NA Intergenic Intergenic -174045 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 132.25-189 chr9 1039282 1039430 + 1 NA Intergenic Intergenic -8787 NR_110643 102800446 Hs.171043 NR_110643 LINC01230 TCONS_00015639|linc-DMRT2|lnc-DRMT2 long intergenic non-protein coding RNA 1230 ncRNA 138.75-41 chr12 94468298 94468501 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -7945 NM_001368037 51134 Hs.279209 NM_016122 ENSG00000173588 CEP83 CCDC41|NPHP18|NY-REN-58 centrosomal protein 83 protein-coding 365.5 chr1 26039298 26039903 + 1 NA intron (NM_032513, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 6518 NM_032513 7780 Hs.143545 NM_032513 ENSG00000158014 SLC30A2 PP12488|TNZD|ZNT2|ZnT-2 solute carrier family 30 member 2 protein-coding 173.5-10 chr1 169951269 169951629 + 1 NA intron (NM_014970, intron 19 of 19) intron (NM_014970, intron 19 of 19) -57490 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 163.5-20 chr10 55310436 55310694 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -288477 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 256.5-20 chr14 75938133 75938794 + 1 NA intron (NM_015072, intron 31 of 31) intron (NM_015072, intron 31 of 31) 43532 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 201.5-41 chr12 75683394 75683759 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -171967 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 164.25-162 chr9 124869932 124870152 + 1 NA intron (NM_030978, intron 3 of 5) intron (NM_030978, intron 3 of 5) 7912 NM_030978 81873 Hs.132499 NM_030978 ENSG00000136950 ARPC5L ARC16-2 actin related protein 2/3 complex subunit 5 like protein-coding 141.5-110 chr2 160546825 160546993 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -53102 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 244.5-45 chr2 33048447 33048814 + 1 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) -85967 NM_001166264 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 180.75-115 chr5 77800358 77800623 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -24129 NM_004607 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 242.5-67 chr5 115693307 115693790 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -20896 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 163.25-104 chr3 192222537 192222731 + 1 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) -15996 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 170.75-127 chr7 114072948 114073243 + 1 NA Intergenic Intergenic -13232 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 220.25-35 chr2 152532860 152533319 + 1 NA intron (NM_052905, intron 2 of 25) L1M5|LINE|L1 184372 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 160.25-91 chr3 28353285 28353723 + 1 NA intron (NM_001324170, intron 1 of 6) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 4355 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 179.25-67 chr18 22898112 22898345 + 1 NA Intergenic Intergenic -35100 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 239.5-85 chr8 141957766 141958369 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -171754 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 126.25-221 chr9 91303845 91304106 + 1 NA intron (NM_001306190, intron 3 of 8) intron (NM_001306190, intron 3 of 8) 57949 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 138.5-4 chr1 39353477 39353679 + 1 NA intron (NM_012090, intron 38 of 92) L2c|LINE|L2 -55495 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 198.5-53 chr15 97952086 97952451 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8435 NM_183376 91947 Hs.6093 NM_183376 ENSG00000140450 ARRDC4 - arrestin domain containing 4 protein-coding 130.25-23 chr1 231332430 231332725 + 1 NA TTS (NM_175876) TTS (NM_175876) 5275 NM_175876 149371 Hs.356198 NM_175876 ENSG00000116903 EXOC8 EXO84|Exo84p|SEC84 exocyst complex component 8 protein-coding 214.25-23 chr13 87295898 87296161 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 322711 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 190.75-54 chr2 154828039 154828283 + 1 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron 129466 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 215.25-95 chr6 147570004 147570243 + 1 NA TTS (NM_001030060) TTS (NM_001030060) 61433 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 227.25-82 chr8 110006798 110007111 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -31183 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 155.25-75 chr16 71285066 71285302 + 1 NA exon (NM_001099642, exon 3 of 3) exon (NM_001099642, exon 3 of 3) 4218 NM_001099642 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 171.25-52 chr15 92715356 92715753 + 1 NA Intergenic Intergenic -59779 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 158.25-82 chr22 31838016 31838420 + 1 NA intron (NR_146296, intron 26 of 42) L1MC|LINE|L1 84195 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 219.5-127 chr8 121023471 121023801 + 1 NA Intergenic Intergenic -211590 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 125.5-235 chr7 78999752 78999881 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -9172 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 229.75-19 chr14 80135402 80135749 + 1 NA Intergenic Intergenic -75844 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 219.5-80 chr22 19379768 19380279 + 1 NA intron (NM_003325, intron 13 of 24) AluSc|SINE|Alu 51710 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 149.75-127 chr5 63944455 63944711 + 1 NA Intergenic Intergenic 17709 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 203.5-120 chr6 66030581 66030897 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 242860 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 177.5-173 chr8 114792754 114793088 + 1 NA Intergenic Intergenic 875092 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 157.75-89 chr2 141584812 141585063 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L1MB2|LINE|L1 546764 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 143.25-50 chr14 80951156 80951486 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -4300 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 162.75-151 chr9 30731292 30731584 + 1 NA Intergenic Intergenic -322984 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 140.5-62 chr14 58384133 58384389 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11669 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 195.5-127 chr5 165891163 165891401 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 1035088 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 120.75-40 chr14 51538026 51538202 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) L1MC1|LINE|L1 48986 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 251.5-87 chr8 106452005 106452293 + 1 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 4225 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 244.25-46 chr7 50545904 50546293 + 1 NA intron (NM_001082971, intron 1 of 14) intron (NM_001082971, intron 1 of 14) 14339 NR_033845 100129427 Hs.680434 NR_033845 ENSG00000226122 DDC-AS1 - DDC antisense RNA 1 ncRNA 155.5-122 chr3 31434600 31434783 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -98234 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 262.25-53 chr9 29588637 29588981 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -375208 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 254.5-32 chr17 79646127 79646679 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -35352 NM_001350453 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 196.5-170 chr8 138107764 138108104 + 1 NA Intergenic Intergenic -24389 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 116.5-31 chr10 118306396 118306576 + 1 NA 3' UTR (NM_001134672, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001134672, exon 8 of 8) 35838 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 129.5-233 chr8 135346817 135347012 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -110542 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 144.5-207 chr7 100969849 100970095 + 1 NA intron (NM_001164462, intron 1 of 11) intron (NM_001164462, intron 1 of 11) 349 NM_001164462 10071 Hs.489355 NM_001164462 ENSG00000205277 MUC12 MUC-11|MUC-12|MUC11 mucin 12, cell surface associated protein-coding 226.5-20 chr13 79505910 79506314 + 1 NA intron (NM_019080, intron 1 of 7) intron (NM_019080, intron 1 of 7) -24881 NR_046685 100874208 Hs.602801 NR_046685 ENSG00000232132 NDFIP2-AS1 - NDFIP2 antisense RNA 1 ncRNA 165.25-22 chr11 11785183 11785386 + 1 NA Intergenic Intergenic -2062 NR_107037 102465870 NR_107037 ENSG00000278529 MIR8070 hsa-mir-8070 microRNA 8070 ncRNA 120.5-86 chr16 13576240 13576382 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -343846 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 173.5-149 chr7 9507862 9508078 + 1 NA Intergenic Intergenic -126300 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 188.5-34 chr14 37528990 37529206 + 1 NA intron (NM_138731, intron 13 of 13) intron (NM_138731, intron 13 of 13) 66151 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 177.75-35 chr13 105640476 105640735 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -66225 NR_120418 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 465.75-6 chr8 16880266 16881292 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 121566 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 372.75-2 chr1 47770190 47770794 + 1 NA intron (NM_001194986, intron 6 of 6) intron (NM_001194986, intron 6 of 6) 226893 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 183.25-64 chr2 229071393 229071836 + 1 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) intron (NM_001330157, intron 1 of 1) 160478 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 141.5-211 chr7 85401002 85401169 + 1 NA Intergenic Intergenic -20037 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 165.5-184 chr7 107039724 107040024 + 1 NA Intergenic Intergenic -4831 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 217.75-50 chr3 197753995 197754261 + 1 NA intron (NR_027840, intron 1 of 8) intron (NR_027840, intron 1 of 8) 3881 NR_027840 84248 Hs.277533 NM_032288 ENSG00000122068 FYTTD1 UIF forty-two-three domain containing 1 protein-coding 172.5-192 chr7 89439426 89439702 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -643827 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 315.25-33 chr8 106642754 106643266 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) L3|LINE|CR1 -14798 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 162.5-91 chr2 171042730 171043153 + 1 NA intron (NM_001136555, intron 9 of 18) intron (NM_001136555, intron 9 of 18) 24032 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 160.25-49 chr16 53115562 53115747 + 1 NA intron (NM_025134, intron 1 of 38) intron (NM_025134, intron 1 of 38) -15358 NM_001352127 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 247.25-4 chr10 20796653 20797090 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 5 of 6) intron (NM_001173484, intron 5 of 6) 100731 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 121.75-164 chr6 118995111 118995262 + 1 NA intron (NM_024581, intron 9 of 17) AluJb|SINE|Alu -60024 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 171.25-48 chr15 60590688 60590904 + 1 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) 1730 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 173.25-102 chr5 122774105 122774287 + 1 NA promoter-TSS (NM_001278199) promoter-TSS (NM_001278199) -800 NM_001278199 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 278.25-61 chr9 99049206 99049558 + 1 NA intron (NM_001855, intron 28 of 41) MIRc|SINE|MIR -55731 NM_001306210 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 126.5-263 chr9 34700704 34700943 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 9313 NM_002989 6366 Hs.57907 NM_002989 ENSG00000137077 CCL21 6Ckine|CKb9|ECL|SCYA21|SLC|TCA4 C-C motif chemokine ligand 21 protein-coding 216.5-30 chr14 54633763 54634393 + 1 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 66466 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 177.75-42 chr14 54833557 54833876 + 1 NA Intergenic Intergenic 44477 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 223.5-59 chr2 77859002 77859282 + 1 NA intron (NR_110288, intron 2 of 3) LTR56|LTR|ERV1 -56792 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 286.5-7 chr1 173209638 173210123 + 1 NA Intergenic Intergenic -2549 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 175.25-19 chr10 76303477 76303652 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 520803 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 252.25-26 chr18 54143611 54144004 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 78605 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 137.5-87 chr16 75997094 75997372 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -270743 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 159.5-90 chr19 34124661 34124962 + 1 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 -47693 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 194.25-11 chr10 81677405 81677685 + 1 NA Intergenic Intergenic -197649 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 163.5-140 chr4 40133097 40133286 + 1 NA intron (NM_001318359, intron 14 of 18) intron (NM_001318359, intron 14 of 18) -57889 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 164.5-173 chr6 9430019 9430285 + 1 NA Intergenic Intergenic 777943 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 143.25-151 chr5 171412486 171412649 + 1 NA Intergenic Intergenic -7080 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 243.5-63 chr5 57896202 57896583 + 1 NA non-coding (NR_109900, exon 1 of 3) non-coding (NR_109900, exon 1 of 3) 2770 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 224.25-6 chr1 168012967 168013314 + 1 NA intron (NR_146230, intron 10 of 17) intron (NR_146230, intron 10 of 17) 14480 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 148.25-76 chr2 200481073 200481250 + 1 NA 3' UTR (NM_001282735, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001282735, exon 13 of 13) 28907 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 185.75-10 chr1 195043603 195043909 + 1 NA Intergenic Intergenic 1044959 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 172.25-58 chr19 43994520 43994719 + 1 NA intron (NM_003445, intron 4 of 4) MER77B|LTR|ERVL 8251 NR_110727 101928063 Hs.502127 NR_110727 ENSG00000266921 LOC101928063 - uncharacterized LOC101928063 ncRNA 166.25-76 chr2 56462971 56463308 + 1 NA Intergenic Intergenic -277369 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 213.75-85 chr5 6794842 6795101 + 1 NA promoter-TSS (NR_146281) promoter-TSS (NR_146281) -909 NR_146281 109729133 Hs.582455 NR_146281 ENSG00000251365 LINC02236 - long intergenic non-protein coding RNA 2236 ncRNA 151.25-77 chr19 38032231 38032499 + 1 NA intron (NM_015073, intron 2 of 21) intron (NM_015073, intron 2 of 21) 125157 NM_015073 23094 Hs.655502 NM_015073 ENSG00000105738 SIPA1L3 CTRCT45|SPAL3|SPAR3 signal induced proliferation associated 1 like 3 protein-coding 151.25-210 chrX 155609706 155609940 + 1 NA intron (NM_018196, intron 1 of 7) L1MB8|LINE|L1 -2742 NM_001304990 10251 Hs.381912 NM_005840 ENSG00000168939 SPRY3 spry-3 sprouty RTK signaling antagonist 3 protein-coding 172.75-89 chr3 163376725 163377019 + 1 NA Intergenic Intergenic -73571 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 136.5-145 chr3 33562613 33562795 + 1 NA intron (NM_001365632, intron 26 of 37) intron (NM_001365632, intron 26 of 37) 96975 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 227.75-47 chr20 17470710 17471042 + 1 NA intron (NM_002594, intron 11 of 11) intron (NM_002594, intron 11 of 11) 60503 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 200.5-26 chr12 58300967 58301433 + 1 NA Intergenic Intergenic 213308 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 209.75-69 chr4 76124609 76124875 + 1 NA non-coding (NR_103780, exon 8 of 11) non-coding (NR_103780, exon 8 of 11) 23655 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 168.5-73 chr18 80110071 80110268 + 1 NA intron (NM_014913, intron 1 of 3) intron (NM_014913, intron 1 of 3) 907 NM_014913 22850 Hs.131915 NM_014913 ENSG00000101544 ADNP2 ZNF508 ADNP homeobox 2 protein-coding 133.25-157 chr4 115147315 115147515 + 1 NA Intergenic Intergenic -33795 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 225.5-21 chr11 68950243 68950529 + 1 NA Intergenic Intergenic 30600 NM_198923 116512 Hs.527802 NM_198923 ENSG00000172938 MRGPRD MRGD|TGR7 MAS related GPR family member D protein-coding 280.75-21 chr19 35508340 35508864 + 1 NA intron (NM_001190348, intron 7 of 12) intron (NM_001190348, intron 7 of 12) 1868 NM_001126059 93099 Hs.417795 NM_033317 ENSG00000161249 DMKN UNQ729|ZD52F10 dermokine protein-coding 161.25-109 chr22 26822663 26822926 + 1 NA Intergenic Intergenic -37417 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 214.75-61 chr4 61152319 61152635 + 1 NA intron (NR_147148, intron 3 of 3) intron (NR_147148, intron 3 of 3) 8821 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 169.25-82 chr4 47593139 47593401 + 1 NA TTS (NM_001278585) TTS (NM_001278585) -59399 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 139.25-203 chr8 137943525 137943763 + 1 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 139901 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 209.25-85 chr4 76318353 76318677 + 1 NA intron (NM_001042784, intron 23 of 23) L1PB1|LINE|L1 12489 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 199.5-87 chr2 135318302 135318636 + 1 NA intron (NM_001286569, intron 6 of 21) L1ME3G|LINE|L1 181841 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 116.75-200 chr8 104476072 104476287 + 1 NA Intergenic Intergenic 8286 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 180.5-13 chr10 62204745 62205134 + 1 NA exon (NM_145307, exon 10 of 12) exon (NM_145307, exon 10 of 12) 63905 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 123.25-56 chr14 48648781 48649061 + 1 NA Intergenic Intergenic -853907 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 183.5-17 chr10 34355960 34356192 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 13 of 22) intron (NM_001184789, intron 13 of 22) 459220 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 135.5-91 chr18 68560303 68560492 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 154711 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 223.5-72 chr22 25158126 25158398 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -41596 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 168.75-22 chr10 94093221 94093597 + 1 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) intron (NM_001165979, intron 1 of 31) 4383 NM_001165979 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 208.5-120 chr6 72612237 72612532 + 1 NA Intergenic Intergenic -9459 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 204.5-51 chr18 36138455 36138819 + 1 NA intron (NM_001242879, intron 4 of 18) intron (NM_001242879, intron 4 of 18) 8738 NM_001242877 55250 Hs.8739 NM_018255 ENSG00000134759 ELP2 MRT58|SHINC-2|STATIP1|StIP elongator acetyltransferase complex subunit 2 protein-coding 225.5-82 chr4 101763013 101763371 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -27415 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 279.25-35 chr6 69657439 69658012 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 138741 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 199.5-140 chr7 44548647 44548875 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -7431 NM_001300967 29881 Hs.567486 NM_013389 ENSG00000015520 NPC1L1 LDLCQ7|NPC11L1|SLC65A2 NPC1 like intracellular cholesterol transporter 1 protein-coding 199.5-111 chr4 124980410 124980714 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -267830 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 274.5-12 chr11 78836433 78836728 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 12 of 33) intron (NM_001098816, intron 12 of 33) -261716 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 299.25-20 chr16 7135694 7136291 + 1 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -196853 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 130.5-10 chr1 67297476 67297614 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -9819 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 219.5-2 chr1 38308007 38308387 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -93430 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 303.25-5 chr11 76536710 76537232 + 1 NA intron (NM_001300942, intron 16 of 21) intron (NM_001300942, intron 16 of 21) 91946 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 217.5-69 chr2 230069068 230069352 + 1 NA promoter-TSS (NM_152527) promoter-TSS (NM_152527) -286 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 123.75-112 chr22 47127137 47127304 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 12 of 12) AluSx|SINE|Alu -211178 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 267.75-32 chr2 204336391 204336691 + 1 NA Intergenic Intergenic -208934 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 132.75-28 chr10 94414290 94414439 + 1 NA intron (NM_015188, intron 1 of 12) intron (NM_015188, intron 1 of 12) 11823 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 140.5-200 chr6 114057552 114057915 + 1 NA exon (NM_153612, exon 2 of 2) exon (NM_153612, exon 2 of 2) 5144 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 244.25-27 chr21 28722922 28723426 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 162193 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 151.75-23 chr10 93515995 93516450 + 1 NA intron (NM_018131, intron 5 of 8) intron (NM_018131, intron 5 of 8) 19610 NM_001127182 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 211.5-30 chr11 112818901 112819343 + 1 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -142298 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 366.5-6 chr14 69241076 69241973 + 1 NA non-coding (NR_034164, exon 11 of 11) non-coding (NR_034164, exon 11 of 11) -18634 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 175.75-33 chr13 90000678 90000885 + 1 NA Intergenic LTR26D|LTR|ERV1 118936 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 203.75-111 chr8 103507736 103508019 + 1 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -5967 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 170.5-76 chr18 62510858 62511127 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -12033 NM_017742 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 267.25-6 chr10 54509394 54509863 + 1 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 23398 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 244.5-87 chr7 22387490 22387864 + 1 NA Intergenic Intergenic -30523 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 251.75-46 chr21 31679754 31680122 + 1 NA intron (NM_020706, intron 19 of 19) intron (NM_020706, intron 19 of 19) 20316 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 156.5-155 chr5 119969204 119969419 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 339752 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 253.25-50 chr4 30324145 30324417 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -396088 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 150.5-26 chr11 21175231 21175439 + 1 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) intron (NM_201551, intron 13 of 18) 505749 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 208.5-24 chr11 85793399 85793877 + 1 NA intron (NM_001365826, intron 1 of 18) intron (NM_001365826, intron 1 of 18) 17503 NM_206927 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 201.25-44 chr2 24262986 24263233 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 19 of 38) intron (NM_001348182, intron 19 of 38) 88056 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 162.5-51 chr14 52401035 52401417 + 1 NA Intergenic Intergenic 86914 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 138.75-12 chr1 194050879 194051076 + 1 NA Intergenic Intergenic 746232 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 173.75-75 chr18 3132574 3133025 + 1 NA intron (NM_019856, intron 16 of 36) intron (NM_019856, intron 16 of 36) 87169 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 115.25-164 chr5 63193839 63194158 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 615179 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 191.5-121 chr5 78014457 78014785 + 1 NA intron (NM_003664, intron 26 of 26) intron (NM_003664, intron 26 of 26) 56374 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 191.75-51 chr18 5336015 5336244 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -39076 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 166.25-27 chr10 91527769 91528031 + 1 NA intron (NR_024467, intron 2 of 4) intron (NR_024467, intron 2 of 4) 83560 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 189.75-11 chr10 75118283 75118672 + 1 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 6821 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 262.75-26 chr2 88428816 88429258 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 23656 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 211.5-42 chr13 35139811 35140142 + 1 NA intron (NM_015678, intron 17 of 57) intron (NM_015678, intron 17 of 57) 197689 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 155.25-11 chr1 112122721 112122993 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 132321 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 214.5-83 chr3 185699170 185699502 + 1 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) -13916 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 247.25-31 chr2 122476914 122477316 + 1 NA Intergenic Intergenic 596366 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 140.75-53 chr14 84492930 84493106 + 1 NA Intergenic Intergenic -778914 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 123.25-51 chr13 59771620 59771831 + 1 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) MIR|SINE|MIR -240993 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 201.25-74 chr5 55344868 55345270 + 1 NA intron (NM_015360, intron 9 of 26) intron (NM_015360, intron 9 of 26) 37080 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 304.75-9 chr14 25836652 25837038 + 1 NA Intergenic Intergenic 716585 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 263.25-30 chr20 16991753 16992181 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -234140 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 132.25-128 chr3 96250709 96250989 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -109115 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 220.5-102 chr5 120034304 120034716 + 1 NA Intergenic Intergenic 404951 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 123.25-119 chr20 39883365 39883626 + 1 NA Intergenic Intergenic -120966 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 146.75-143 chr6 133291716 133292016 + 1 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 50367 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 213.5-36 chr14 57288228 57288621 + 1 NA intron (NR_026895, intron 6 of 6) intron (NR_026895, intron 6 of 6) 19453 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 158.75-162 chr8 102028350 102028579 + 1 NA intron (NM_001040630, intron 1 of 5) intron (NM_001040630, intron 1 of 5) 44032 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 134.75-124 chr2 224754864 224755167 + 1 NA Intergenic Intergenic -169618 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 214.5-43 chr17 60753166 60753574 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) AluY|SINE|Alu 75519 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 143.75-139 chr5 5683215 5683444 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 260652 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 186.75-36 chr15 33660616 33660844 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 34 of 102) intron (NM_001243996, intron 34 of 102) -307767 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 148.75-4 chr1 92062993 92063174 + 1 NA exon (NM_173567, exon 7 of 7) exon (NM_173567, exon 7 of 7) 12389 NM_001287737 646817 NM_001287737 ENSG00000230667 SETSIP SETP18 SET like protein protein-coding 126.5-246 chr8 106537986 106538169 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 90153 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 133.75-24 chr10 73518576 73518849 + 1 NA intron (NR_146997, intron 17 of 21) intron (NR_146997, intron 17 of 21) -22688 NM_021132 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 433.5-2 chr11 229103 229817 + 1 NA intron (NR_163397, intron 4 of 7) AluSc|SINE|Alu 6882 NR_163401 23410 Hs.716456 NM_012239 ENSG00000142082 SIRT3 SIR2L3 sirtuin 3 protein-coding 129.5-167 chr4 35672518 35672665 + 1 NA Intergenic Intergenic 571348 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 171.5-46 chr14 68937339 68937581 + 1 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) MIRc|SINE|MIR 41842 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 287.75-28 chr2 105511255 105511742 + 1 NA Intergenic Intergenic -72985 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 216.5-13 chr11 107353740 107354162 + 1 NA intron (NM_152434, intron 12 of 17) MIR|SINE|MIR 103895 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 284.75-13 chr15 61086931 61087408 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) AluJr4|SINE|Alu 142133 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 167.75-117 chr5 151353555 151353808 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6122 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 191.25-95 chr7 48962027 48962353 + 1 NA Intergenic Intergenic 37643 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 261.5-53 chr5 27279501 27279791 + 1 NA Intergenic Intergenic -192646 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 172.5-102 chr2 155338820 155339056 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 640243 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 148.25-124 chr5 82631561 82631815 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -208467 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 178.5-144 chr5 113063380 113063635 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 14 of 18) intron (NM_001085377, intron 14 of 18) 86709 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 313.5-22 chr2 145055881 145056333 + 1 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) AluJo|SINE|Alu 388140 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 122.5-134 chr20 55649200 55649396 + 1 NA Intergenic Intergenic -222101 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 178.5-35 chr12 58160815 58161174 + 1 NA Intergenic Intergenic 73102 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 171.25-92 chr22 42767798 42768166 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -46681 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 132.5-104 chr19 52075345 52075723 + 1 NA intron (NM_001369830, intron 2 of 2) intron (NM_001369830, intron 2 of 2) 18737 NM_001369825 284371 Hs.665751 NM_001136499 ENSG00000197608 ZNF841 - zinc finger protein 841 protein-coding 271.75-9 chr14 48493732 48494170 + 1 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -698937 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 260.75-18 chr17 73604459 73604735 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 39848 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 210.5-44 chr16 8536350 8536638 + 1 NA intron (NR_110736, intron 3 of 3) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 53344 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 233.5-26 chr11 113162106 113162633 + 1 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 111532 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 156.25-109 chr4 36773878 36774132 + 1 NA Intergenic Intergenic -132105 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 147.25-130 chr7 45245546 45245860 + 1 NA Intergenic Intergenic 87912 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 159.75-71 chr2 22730263 22730550 + 1 NA Intergenic Intergenic 193927 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 124.5-110 chr2 133158585 133158793 + 1 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) intron (NM_207481, intron 5 of 17) -107506 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 247.75-17 chr14 73276500 73276775 + 1 NA exon (NM_001320114, exon 12 of 12) exon (NM_001320114, exon 12 of 12) -30636 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 192.5-20 chr10 89674932 89675293 + 1 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 22816 NR_026835 283011 Hs.679445 NR_026835 FLJ37201 - tigger transposable element derived 2 pseudogene pseudo 239.5-79 chr8 82702736 82703077 + 1 NA Intergenic Intergenic -209198 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 136.25-155 chr5 148414314 148414543 + 1 NA intron (NM_001271723, intron 10 of 20) intron (NM_001271723, intron 10 of 20) 30470 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 311.25-31 chr8 105490372 105491081 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 171183 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 230.5-106 chr7 91484538 91484807 + 1 NA Intergenic Intergenic 220239 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 122.5-63 chr14 61486980 61487244 + 1 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 83082 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 235.5-43 chr19 56063592 56064128 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -2824 NR_110741 101928886 Hs.434652 NR_110741 ENSG00000267522 LINC01864 - long intergenic non-protein coding RNA 1864 ncRNA 122.25 chr1 17179135 17179417 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -10513 NR_148993 400743 Hs.522935 NR_148993 ENSG00000204362 LINC02783 - long intergenic non-protein coding RNA 2783 ncRNA 212.5-16 chr11 12700969 12701344 + 1 NA intron (NM_021961, intron 2 of 12) intron (NM_021961, intron 2 of 12) 26735 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 143.5-189 chr6 78704145 78704395 + 1 NA Intergenic Intergenic -163281 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 178.75-25 chr13 98546618 98546880 + 1 NA intron (NM_001032296, intron 1 of 10) intron (NM_001032296, intron 1 of 10) -24624 NM_003576 8428 Hs.508514 NM_003576 ENSG00000102572 STK24 HEL-S-95|MST3|MST3B|STE20|STK3 serine/threonine kinase 24 protein-coding 155.5-93 chr2 63848682 63848961 + 1 NA intron (NM_006759, intron 1 of 9) intron (NM_006759, intron 1 of 9) 6941 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 181.75-125 chr8 98702952 98703286 + 1 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 122552 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 146.75-142 chr6 132292049 132292271 + 1 NA Intergenic Intergenic 109315 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 140.75-136 chr4 74444589 74444873 + 1 NA promoter-TSS (NM_001657) promoter-TSS (NM_001657) -405 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 112.75-163 chr5 74931509 74931692 + 1 NA Intergenic Intergenic -64634 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 223.5-47 chr15 89628066 89628594 + 1 NA TTS (NM_152259) TTS (NM_152259) 27137 NM_198525 374654 Hs.513134 NM_198525 ENSG00000166813 KIF7 ACLS|AGBK|HLS2|JBTS12|UNQ340 kinesin family member 7 protein-coding 251.25-45 chr6 54649665 54650096 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -196891 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 147.5-131 chr22 24462759 24462979 + 1 NA intron (NR_028483, intron 3 of 7) MIRc|SINE|MIR 30750 NM_001278497 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 128.5-227 chr8 116428379 116428652 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -103456 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 129.75-104 chr2 228296409 228296558 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -114796 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 120.25-72 chr17 7967511 7967656 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -35087 NM_000180 3000 Hs.592109 NM_000180 ENSG00000132518 GUCY2D CACD1|CORD5|CORD6|CYGD|GUC1A4|GUC2D|LCA|LCA1|RCD2|RETGC-1|ROS-GC1|ROSGC|retGC guanylate cyclase 2D, retinal protein-coding 200.75-110 chr9 2715108 2715491 + 1 NA Intergenic Intergenic -2211 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 152.5-26 chr11 79793842 79794226 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -353004 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 195.5-155 chr7 125618613 125619109 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -354570 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 196.5-88 chr2 194779106 194779347 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 48631 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 115.5-89 chr16 75975475 75975679 + 1 NA Intergenic Intergenic -249087 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 156.5-43 chr12 84950259 84950594 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -37597 NM_018057 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 314.5-20 chr4 30600411 30600997 + 1 NA Intergenic Intergenic -119665 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 286.5-65 chr7 89998247 89998668 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) -120943 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 179.25-116 chr5 37858023 37858331 + 1 NA intron (NR_103441, intron 1 of 3) intron (NR_103441, intron 1 of 3) 17739 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 237.5-78 chr5 78787376 78787894 + 1 NA intron (NM_000046, intron 6 of 7) intron (NM_000046, intron 6 of 7) -138863 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 130.5-32 chr10 36646182 36646367 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -479583 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 216.5-116 chr8 72705941 72706295 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -25927 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 119.5-116 chr2 41372409 41372646 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -505028 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 172.5-110 chr20 8943743 8944072 + 1 NA Intergenic Intergenic 112722 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 178.5-112 chr3 184074219 184074515 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21320 NM_130770 170572 Hs.632579 NM_130770 ENSG00000178084 HTR3C - 5-hydroxytryptamine receptor 3C protein-coding 155.5-6 chr1 42278183 42278476 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 3 of 12) intron (NM_001198850, intron 3 of 12) 56626 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 166.75-63 chr17 82010077 82010371 + 1 NA intron (NR_045351, intron 8 of 14) intron (NR_045351, intron 8 of 14) 12654 NM_001271007 201254 Hs.37616 NM_144998 ENSG00000169689 CENPX CENP-X|D9|FAAP10|MHF2|STRA13 centromere protein X protein-coding 162.5-45 chr13 77320980 77321269 + 1 NA intron (NM_015057, intron 1 of 82) intron (NM_015057, intron 1 of 82) 5970 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 136.5-24 chr10 52044279 52044443 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) 269767 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 283.25-37 chr5 176746066 176746738 + 1 NA Intergenic Intergenic 3197 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 147.5-94 chr2 41300212 41300503 + 1 NA Intergenic Intergenic -577198 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 182.25-132 chr9 90188279 90188540 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -146910 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 179.5-187 chr8 132354034 132354302 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 93094 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 256.5-81 chr8 139731901 139732402 + 1 NA exon (NM_031466, exon 22 of 23) exon (NM_031466, exon 22 of 23) -29028 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 311.25 chr1 59101670 59102198 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 44873 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 196.75-83 chr4 114024016 114024384 + 1 NA Intergenic Intergenic -44553 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 192.75-84 chr3 53108757 53109110 + 1 NA intron (NM_052859, intron 7 of 12) AluSq2|SINE|Alu 21502 NM_052859 91869 Hs.631910 NM_052859 ENSG00000163933 RFT1 CDG1N RFT1 homolog protein-coding 285.25-6 chr14 41198708 41199109 + 1 NA Intergenic Intergenic 244197 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 165.75-148 chr6 114670561 114670791 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -607799 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 180.5-117 chr5 8719082 8719360 + 1 NA Intergenic Intergenic -120511 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 176.25-91 chr3 15456804 15457187 + 1 NA intron (NM_080539, intron 12 of 15) AluSz|SINE|Alu 29397 NM_033083 85403 Hs.716733 NM_033083 ENSG00000144597 EAF1 - ELL associated factor 1 protein-coding 208.25-20 chr11 132772275 132772770 + 1 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) intron (NM_001319104, intron 1 of 6) 171115 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 263.25-38 chr4 84227153 84227498 + 1 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) MER5A|DNA|hAT-Charlie 71844 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 127.5-185 chr5 29389886 29390088 + 1 NA intron (NR_104628, intron 1 of 4) intron (NR_104628, intron 1 of 4) 5989 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 183.5-113 chr5 61041096 61041365 + 1 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) 96025 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 192.75-55 chr2 24684315 24684555 + 1 NA intron (NM_001362950, intron 8 of 23) intron (NM_001362950, intron 8 of 23) 99958 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 124.5-207 chr7 45285573 45285813 + 1 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 127902 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 200.5-51 chr17 27169630 27169936 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -80542 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 153.5-86 chr18 13267691 13267928 + 1 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) -10296 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 183.5-32 chr11 101733367 101733690 + 1 NA Intergenic Intergenic -149521 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 260.75-7 chr12 29179332 29179816 + 1 NA intron (NM_001271783, intron 1 of 11) intron (NM_001271783, intron 1 of 11) 30296 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 121.25-88 chr2 28010844 28010995 + 1 NA intron (NM_199193, intron 5 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 14552 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 213.5-109 chr6 127026758 127027030 + 1 NA Intergenic Intergenic -91777 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 249.5-68 chr3 191400375 191400768 + 1 NA Intergenic Intergenic -24953 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 155.25-178 chr8 83295103 83295327 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -108543 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 165.5-136 chr4 109463058 109463334 + 1 NA exon (NM_001318085, exon 2 of 24) exon (NM_001318085, exon 2 of 24) -25502 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 192.75-114 chr6 127549954 127550193 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -27101 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 205.75-48 chr3 128794066 128794313 + 1 NA intron (NM_004637, intron 1 of 5) (CTGTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -52619 NR_162138 113219457 NR_162138 MIR12124 - microRNA 12124 ncRNA 139.5-11 chr1 238962413 238962640 + 1 NA Intergenic Intergenic -424042 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 121.5-36 chr10 115945795 115946011 + 1 NA 3' UTR (NM_207303, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_207303, exon 29 of 29) 248886 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 265.75-54 chr4 102397373 102397778 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -52093 NM_001135146 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 501.25-4 chr8 77336698 77337878 + 1 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -113409 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 168.5-201 chr9 81571204 81571436 + 1 NA Intergenic Intergenic 118215 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 196.25-92 chr4 47883721 47884090 + 1 NA intron (NR_103795, intron 15 of 23) intron (NR_103795, intron 15 of 23) -30322 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 155.75-171 chr9 131127748 131128015 + 1 NA intron (NM_001318324, intron 2 of 35) intron (NM_001318324, intron 2 of 35) 2295 NM_001318324 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 231.75-26 chr15 81970121 81970362 + 1 NA Intergenic Intergenic 75777 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 248.5-19 chr12 116052182 116052642 + 1 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) intron (NM_015335, intron 4 of 30) 96242 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 178.75-39 chr17 54538719 54539068 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -361798 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 185.25-101 chr5 75649513 75649800 + 1 NA intron (NM_001276713, intron 7 of 13) L2a|LINE|L2 38180 NM_001276713 728780 Hs.370455 NM_001271529 ENSG00000189045 ANKDD1B - ankyrin repeat and death domain containing 1B protein-coding 201.75-22 chr12 50188001 50188480 + 1 NA intron (NM_001243775, intron 3 of 4) intron (NM_001243775, intron 3 of 4) 13293 NM_001243775 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 161.5-43 chr12 45326608 45326852 + 1 NA intron (NM_001025356, intron 2 of 19) intron (NM_001025356, intron 2 of 19) 34040 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 157.5-110 chr2 162355423 162355684 + 1 NA intron (NM_001330271, intron 3 of 7) intron (NM_001330271, intron 3 of 7) 11185 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 370.75-3 chr17 49630397 49631109 + 1 NA intron (NM_001007228, intron 1 of 9) intron (NM_001007228, intron 1 of 9) -4164 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 227.5-59 chr20 22361070 22361337 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 59440 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 149.5-44 chr11 99995432 99995684 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 7 of 23) intron (NM_001243270, intron 7 of 23) 439413 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 143.5-94 chr18 9467675 9467916 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -7718 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 260.5-42 chr4 42207035 42207408 + 1 NA Intergenic Intergenic -54566 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 167.25-103 chr3 971444 971630 + 1 NA Intergenic Intergenic -121487 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 127.5-171 chr4 67623665 67623827 + 1 NA intron (NM_018227, intron 30 of 32) L1MC5a|LINE|L1 65019 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 221.75-9 chr1 157387392 157387773 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 164933 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 113.5-32 chr10 31991188 31991397 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -62416 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 353.5-17 chr6 51377206 51377674 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -244430 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 275.75-34 chr4 30369561 30370150 + 1 NA Intergenic Intergenic -350514 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 199.75-47 chr2 78849425 78849659 + 1 NA Intergenic Intergenic -176160 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 169.5-130 chr4 173971033 173971312 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 73899 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 120.5-28 chr10 88847830 88847981 + 1 NA intron (NM_144590, intron 1 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 3939 NM_144590 118932 Hs.217484 NM_144590 ENSG00000152766 ANKRD22 - ankyrin repeat domain 22 protein-coding 136.75-41 chr11 81804487 81804674 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 86256 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 122.75-10 chr1 97638877 97639178 + 1 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -157894 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 309.25-3 chr1 113428802 113429129 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 38450 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 163.5-35 chr11 127405856 127406133 + 1 NA Intergenic Intergenic 134924 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 222.5-57 chr2 182420111 182420489 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) L5|LINE|RTE-X 6748 NM_001363871 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 139.5-220 chr8 120703876 120704045 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR -57293 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 118.75-186 chr7 95888772 95888998 + 1 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) intron (NM_004411, intron 6 of 16) 116379 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 132.25-185 chr8 126133827 126134112 + 1 NA Intergenic Intergenic -182772 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 119.75-162 chr4 137693991 137694125 + 1 NA Intergenic Intergenic 148327 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 288.75-3 chr1 64502019 64502334 + 1 NA intron (NM_020925, intron 1 of 26) intron (NM_020925, intron 1 of 26) -3738 NM_001293274 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 224.75-8 chr1 74113580 74113901 + 1 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) L1M4b|LINE|L1 84436 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 161.5-190 chr8 133682510 133682792 + 1 NA intron (NR_134462, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 1415 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 357.5-8 chr14 73714884 73715571 + 1 NA promoter-TSS (NM_006029) promoter-TSS (NM_006029) -843 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 147.5-141 chr3 51676500 51676750 + 1 NA intron (NM_001243727, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 4998 NR_103463 51368 Hs.517864 NM_015926 ENSG00000164081 TEX264 ZSIG11 testis expressed 264, ER-phagy receptor protein-coding 236.75-38 chr4 78914981 78915296 + 1 NA non-coding (NR_146462, exon 7 of 7) non-coding (NR_146462, exon 7 of 7) 24300 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 194.25-97 chr5 174377012 174377525 + 1 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) intron (NR_125806, intron 1 of 5) 40914 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 315.75-3 chr12 28909190 28909634 + 1 NA Intergenic Intergenic -239866 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 210.5-85 chr4 1755435 1755867 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 34130 NM_006342 10460 Hs.104019 NM_006342 ENSG00000013810 TACC3 ERIC-1|ERIC1 transforming acidic coiled-coil containing protein 3 protein-coding 189.5-76 chr2 181337547 181337902 + 1 NA intron (NR_130784, intron 3 of 4) intron (NR_130784, intron 3 of 4) -32072 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 181.25-96 chr5 17452710 17452926 + 1 NA intron (NR_134270, intron 1 of 2) intron (NR_134270, intron 1 of 2) 8808 NR_134270 102723526 NR_134270 ENSG00000249662 LINC02218 - long intergenic non-protein coding RNA 2218 ncRNA 163.75-100 chr4 1940809 1941004 + 1 NA 3' UTR (NM_007331, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_007331, exon 11 of 11) -33730 NR_003004 677770 Hs.676951 NR_003004 ENSG00000249784 SCARNA22 ACA11 small Cajal body-specific RNA 22 ncRNA 209.75-104 chr9 24318587 24318851 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 226957 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 209.75-87 chr7 3543566 3543820 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 242441 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 146.5-78 chr16 59579488 59579673 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 175611 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 243.5-91 chr9 87344193 87344672 + 1 NA Intergenic Intergenic -152796 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 224.5-14 chr10 31329177 31329594 + 1 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) L1ME2|LINE|L1 7725 NM_001323676 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 197.5-127 chr5 108641264 108641592 + 1 NA Intergenic Intergenic 86833 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 328.75-18 chr6 141134445 141135023 + 1 NA Intergenic Intergenic 450920 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 140.5-160 chr3 176319940 176320118 + 1 NA Intergenic Intergenic 75478 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 149.5-81 chr18 43866349 43866743 + 1 NA Intergenic Intergenic -589056 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 148.5-241 chr9 28173093 28173330 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 546094 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 140.5-135 chr20 47618627 47618804 + 1 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) intron (NM_181659, intron 2 of 22) 116828 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 158.75-113 chr3 80019679 80019873 + 1 NA Intergenic Intergenic -251778 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 299.5-26 chr3 34672459 34672836 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 721376 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 156.5-184 chr8 16414625 16414826 + 1 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -221934 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 148.5-184 chr5 52884744 52885066 + 1 NA intron (NM_181501, intron 7 of 28) MER21C|LTR|ERVL 96989 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 180.75-28 chr12 44406195 44406481 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 469323 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 120.25-77 chr18 13719136 13719361 + 1 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) intron (NM_001098801, intron 1 of 4) 7310 NM_001098801 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 218.5-34 chr12 110699748 110700170 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -10182 NM_001040107 84329 Hs.211511 NM_032369 ENSG00000122986 HVCN1 HV1|VSOP hydrogen voltage gated channel 1 protein-coding 169.75-29 chr11 77017086 77017278 + 1 NA intron (NM_001300953, intron 8 of 9) L1M3|LINE|L1 -17216 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 175.75-130 chr9 117517716 117518048 + 1 NA Intergenic Intergenic -102825 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 214.75-28 chr15 64444133 64444470 + 1 NA intron (NM_001321924, intron 11 of 12) intron (NM_001321924, intron 11 of 12) -55119 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 128.5-112 chr2 106294318 106294573 + 1 NA Intergenic Intergenic -75300 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 113.5-249 chr9 94274229 94274454 + 1 NA intron (NM_194320, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 -15030 NR_160773 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 161.25-26 chr11 80088156 80088461 + 1 NA Intergenic Intergenic -647278 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 186.75-80 chr4 110500247 110500546 + 1 NA intron (NM_001977, intron 3 of 19) intron (NM_001977, intron 3 of 19) 24241 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 222.25-85 chr8 26261423 26261856 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -29869 NM_002717 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 255.5-74 chr6 144592500 144592891 + 1 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) L1ME4a|LINE|L1 187040 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 136.5-69 chr14 59427903 59428106 + 1 NA Intergenic Intergenic 37376 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 179.25-112 chr4 60902195 60902428 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -20308 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 114.75-39 chr11 116150637 116150922 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -390579 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 166.75-123 chr6 47581157 47581382 + 1 NA intron (NM_012120, intron 10 of 17) intron (NM_012120, intron 10 of 17) -75203 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 117.5-143 chr3 111335789 111335986 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -206310 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 306.25-14 chr12 115016057 115016452 + 1 NA Intergenic Intergenic -332079 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 168.75-77 chr2 199301531 199301809 + 1 NA intron (NM_001172509, intron 10 of 10) intron (NM_001172509, intron 10 of 10) 156269 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 273.5-13 chr11 47843497 47844028 + 1 NA intron (NM_001318399, intron 2 of 2) MER20|DNA|hAT-Charlie 4588 NR_134636 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 223.5-31 chr12 22696215 22696562 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 71217 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 153.75-19 chr10 56877860 56878032 + 1 NA Intergenic Intergenic 426613 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 208.75-44 chr20 15743419 15743727 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) L2b|LINE|L2 179741 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 196.5-16 chr10 27611910 27612218 + 1 NA Intergenic Intergenic 107760 NM_001256411 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 167.5-39 chr11 77355562 77355814 + 1 NA exon (NM_002576, exon 7 of 15) exon (NM_002576, exon 7 of 15) -54022 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 130.5-158 chr22 23704686 23704831 + 1 NA intron (NR_024448, intron 6 of 11) L1MA5|LINE|L1 8342 NM_001329425 266747 Hs.658997 NM_153615 ENSG00000159496 RGL4 Rgr ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 4 protein-coding 124.5-152 chr4 73786031 73786261 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 45577 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 181.5-32 chr12 38596936 38597208 + 1 NA Intergenic Intergenic 280298 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 233.75-8 chr10 65236705 65237171 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -312420 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 218.75-15 chr11 107559333 107559697 + 1 NA intron (NM_138775, intron 2 of 11) intron (NM_138775, intron 2 of 11) 6220 NM_001301010 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 165.5-175 chr7 19334208 19334378 + 1 NA Intergenic Intergenic -188872 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 168.75-93 chr3 57951565 57951790 + 1 NA Intergenic Intergenic -56745 NM_001164317 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 250.75-58 chr5 169838239 169838523 + 1 NA intron (NR_156756, intron 26 of 52) MIR|SINE|MIR 142114 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 146.75-44 chr14 65695022 65695254 + 1 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) L1MC2|LINE|L1 224036 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 229.25-53 chr3 88367318 88367791 + 1 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) intron (NM_001368167, intron 2 of 2) 29098 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 189.75-125 chr8 106409506 106409764 + 1 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) intron (NM_018002, intron 2 of 15) -38289 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 131.25-183 chr7 2092625 2092842 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) L1MC3|LINE|L1 -3681 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 332.5-14 chr2 205534272 205534967 + 1 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) AluSx1|SINE|Alu -147881 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 252.5-59 chr4 41296760 41297226 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 40065 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 231.5-53 chr2 178599382 178599826 + 1 NA exon (NM_133432, exon 118 of 192) exon (NM_133432, exon 118 of 192) 76413 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 214.5-125 chr8 86765711 86766083 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -22222 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 330.5-23 chr5 15836585 15837267 + 1 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -98256 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 193.25-78 chr4 12527529 12527812 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 304219 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 187.5-88 chr2 60001679 60002002 + 1 NA Intergenic Intergenic 381196 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 222.5-76 chr4 65932818 65933227 + 1 NA Intergenic Intergenic -262527 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 193.5-107 chr3 58972453 58972686 + 1 NA intron (NR_110820, intron 2 of 2) intron (NR_110820, intron 2 of 2) 77456 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 184.75-112 chr8 141204566 141204882 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 23850 NM_001286648 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 112.5-196 chr5 131563023 131563211 + 1 NA intron (NM_016340, intron 4 of 27) intron (NM_016340, intron 4 of 27) 72112 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 126.75-142 chr21 27290728 27290968 + 1 NA Intergenic Intergenic -323760 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 175.25-27 chr11 87856671 87856969 + 1 NA Intergenic Intergenic -137409 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 132.25-111 chr20 14899805 14900072 + 1 NA intron (NR_037841, intron 1 of 2) intron (NR_037841, intron 1 of 2) 29580 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 144.75-100 chr20 44540432 44540644 + 1 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) intron (NM_007066, intron 1 of 3) 8663 NM_007066 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 171.5-136 chr7 16269750 16270219 + 1 NA non-coding (NR_038946, exon 5 of 5) non-coding (NR_038946, exon 5 of 5) 59498 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 190.25-2 chr1 77538430 77538875 + 1 NA intron (NM_012093, intron 13 of 13) AluSx|SINE|Alu 144006 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 127.5-173 chr4 76131567 76131791 + 1 NA intron (NM_017426, intron 6 of 11) intron (NM_017426, intron 6 of 11) 16718 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 171.5-102 chr3 54488299 54488509 + 1 NA intron (NM_018398, intron 4 of 37) intron (NM_018398, intron 4 of 37) 151453 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 237.25-27 chr14 66945093 66945356 + 1 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) MER61B|LTR|ERV1 -244216 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 154.75-132 chr7 26141282 26141523 + 1 NA Intergenic Intergenic -10796 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 383.25-2 chr1 205608296 205609058 + 1 NA 3' UTR (NM_001973, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001973, exon 5 of 5) 24195 NM_001973 2005 Hs.497520 NM_001973 ENSG00000158711 ELK4 SAP1 ETS transcription factor ELK4 protein-coding 217.5-4 chr1 78013461 78013717 + 1 NA exon (NM_001317099, exon 3 of 4) exon (NM_001317099, exon 3 of 4) 8650 NM_007034 11080 Hs.13852 NM_007034 ENSG00000162616 DNAJB4 DNAJW|DjB4|HLJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B4 protein-coding 193.75-85 chr3 79976371 79976836 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -208605 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 178.5-21 chr11 26751017 26751198 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -29047 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 164.25-13 chr1 207891861 207892193 + 1 NA intron (NM_001025109, intron 4 of 7) intron (NM_001025109, intron 4 of 7) 19098 NM_001025109 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 184.5-90 chr21 19005661 19005978 + 1 NA Intergenic Intergenic -246007 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 220.5-72 chr3 41637277 41637528 + 1 NA intron (NR_136342, intron 28 of 34) L1MA8|LINE|L1 324701 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 223.75-81 chr8 126899586 126899891 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -113416 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 172.5-60 chr13 73927149 73927469 + 1 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 206620 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 266.5-26 chr18 10084008 10084288 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 170132 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 250.75-8 chr12 20646572 20646963 + 1 NA exon (NM_001244683, exon 11 of 15) exon (NM_001244683, exon 11 of 15) -48588 NM_001145945 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 158.75-7 chr1 118807264 118807580 + 1 NA Intergenic Intergenic 180921 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 123.5-168 chr5 110714740 110714883 + 1 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 11860 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 341.5-28 chr5 24479213 24479681 + 1 NA Intergenic Intergenic 165531 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 162.25-105 chr3 63616017 63616218 + 1 NA 3' UTR (NM_144642, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_144642, exon 5 of 5) -36558 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 154.25-160 chr7 101987371 101987557 + 1 NA intron (NM_001202544, intron 2 of 21) intron (NM_001202544, intron 2 of 21) 169838 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 147.25-82 chr3 63797483 63797751 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -21682 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 192.75-60 chr2 107756534 107756749 + 1 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 2529 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 221.25-19 chr12 42945549 42945908 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -209587 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 151.25-91 chr2 127478805 127479120 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 47527 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 154.5-54 chr13 39685784 39686198 + 1 NA intron (NM_001145079, intron 8 of 18) intron (NM_001145079, intron 8 of 18) -21856 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 121.5-146 chr2 172733611 172733849 + 1 NA intron (NR_026995, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR -2115 NM_007023 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 126.5-46 chr12 14101209 14101384 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -120940 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 260.25-41 chr5 174073739 174074246 + 1 NA intron (NM_015980, intron 3 of 4) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 28286 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 473.25-2 chr13 33845256 33846071 + 1 NA intron (NM_181558, intron 8 of 8) L1M1|LINE|L1 27514 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 224.5-54 chr18 48306841 48307175 + 1 NA intron (NM_001371290, intron 5 of 9) intron (NM_001371290, intron 5 of 9) 54707 NM_001350280 84322 Hs.334493 NM_032362 C18orf12 HEIL1|HsT2508 chromosome 18 open reading frame 12 protein-coding 186.5-38 chr14 52355205 52355467 + 1 NA Intergenic Intergenic 41024 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 165.5-84 chr2 134279426 134279748 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 3 of 16) intron (NM_001371457, intron 3 of 16) 25515 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 139.75-18 chr10 81322380 81322604 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -552702 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 164.5-145 chr3 189715071 189715283 + 1 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -74482 NM_001114980 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 283.5-24 chr2 46767471 46767827 + 1 NA Intergenic Intergenic -49019 NR_034099 388948 Hs.728895 NR_034099 ENSG00000222005 LINC01118 - long intergenic non-protein coding RNA 1118 ncRNA 160.25-121 chr5 14673956 14674213 + 1 NA intron (NM_138348, intron 2 of 6) intron (NM_138348, intron 2 of 6) 9366 NM_138348 90268 Hs.406335 NM_138348 ENSG00000154124 OTULIN AIPDS|FAM105B|GUM OTU deubiquitinase with linear linkage specificity protein-coding 124.5-149 chr4 55470068 55470332 + 1 NA intron (NM_004898, intron 8 of 22) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 74243 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 483.25-5 chr20 14111705 14112412 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1MA2|LINE|L1 116542 NM_001351661 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 221.5-18 chr12 103508607 103508882 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 12704 NR_135004 105369945 Hs.742785 NR_135004 LOC105369945 - uncharacterized LOC105369945 ncRNA 145.5-152 chr4 171733736 171733904 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -79584 NM_001034845 442117 Hs.386236 NM_001034845 ENSG00000174473 GALNTL6 GALNACT20|GALNT17|GalNAc-T6L polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase like 6 protein-coding 155.5-163 chr5 40235737 40235945 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 183550 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 200.5-129 chr7 89332048 89332444 + 1 NA intron (NM_181646, intron 3 of 3) intron (NM_181646, intron 3 of 3) -536509 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 214.5-100 chr5 37515956 37516274 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 8 of 17) intron (NM_001345998, intron 8 of 17) 136797 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 193.25-89 chr5 32838308 32838544 + 1 NA Intergenic Intergenic -109017 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 284.75-19 chr2 139427912 139428509 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 530886 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 139.5-15 chr10 81103468 81103704 + 1 NA Intergenic Intergenic 453789 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 130.25-210 chr8 133451054 133451319 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 120701 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 246.5-6 chr10 7744080 7744459 + 1 NA exon (NM_002216, exon 18 of 21) exon (NM_002216, exon 18 of 21) 40953 NM_002216 3698 Hs.75285 NM_002216 ENSG00000151655 ITIH2 H2P|SHAP inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 2 protein-coding 276.25-17 chr15 85064627 85065048 + 1 NA intron (NM_001243137, intron 2 of 21) AluJb|SINE|Alu 82863 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 132.25-9 chr1 92087824 92088105 + 1 NA intron (NM_183242, intron 1 of 8) intron (NM_183242, intron 1 of 8) 7619 NM_183242 284697 Hs.676102 NM_183242 ENSG00000189195 BTBD8 - BTB domain containing 8 protein-coding 294.75-30 chr5 76020132 76020619 + 1 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR -63008 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 122.25-3 chr1 74861381 74861635 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -128100 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 309.5-47 chrX 51230454 51230935 + 1 NA Intergenic Intergenic -59273 NR_110382 101926971 Hs.657995 NR_110382 ENSG00000230317 LINC01284 - long intergenic non-protein coding RNA 1284 ncRNA 118.75-83 chr18 27696955 27697091 + 1 NA Intergenic Intergenic 339618 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 168.5-62 chr16 76664543 76664867 + 1 NA Intergenic Intergenic 29707 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 208.5-25 chr11 97108050 97108312 + 1 NA Intergenic Intergenic 599756 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 136.5-41 chr11 31752003 31752252 + 1 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) L1MD|LINE|L1 48534 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 341.25-13 chr17 59679245 59679616 + 1 NA exon (NM_004859, exon 18 of 32) exon (NM_004859, exon 18 of 32) 28168 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 204.25-71 chr3 169101821 169102043 + 1 NA intron (NM_001163999, intron 9 of 14) intron (NM_001163999, intron 9 of 14) 43591 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 223.75-35 chr17 59385767 59386039 + 1 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 19820 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 150.5-56 chr14 102321449 102321648 + 1 NA intron (NM_018335, intron 1 of 7) intron (NM_018335, intron 1 of 7) 1802 NM_018335 55778 Hs.743359 NM_018335 ENSG00000022976 ZNF839 C14orf131 zinc finger protein 839 protein-coding 180.5-17 chr11 54859486 54859682 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 152752 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 252.75-17 chr14 54274860 54275274 + 1 NA Intergenic Intergenic -121801 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 229.75-57 chr4 170457127 170457480 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 230712 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 205.5-102 chr4 14726992 14727359 + 1 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) intron (NR_126435, intron 2 of 6) 160994 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 115.5-170 chr3 110874764 110874929 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 195113 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 179.5-113 chr22 19335371 19335604 + 1 NA intron (NM_003325, intron 24 of 24) AluSz6|SINE|Alu -43768 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 236.25-39 chr2 26678489 26678891 + 1 NA Intergenic Intergenic -14032 NM_002246 3777 Hs.24040 NM_002246 ENSG00000171303 KCNK3 K2p3.1|OAT1|PPH4|TASK|TASK-1|TBAK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 3 protein-coding 176.5-113 chr21 34846067 34846342 + 1 NA intron (NM_001001890, intron 3 of 5) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 42495 NM_001122607 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 168.25-47 chr15 53492528 53492762 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 48207 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 154.5-93 chr2 44196359 44196590 + 1 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) L1MC3|LINE|L1 27599 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 238.5-6 chr1 185213040 185213383 + 1 NA intron (NM_017673, intron 13 of 18) intron (NM_017673, intron 13 of 18) 56044 NM_017673 54823 Hs.134183 NM_017673 ENSG00000116668 SWT1 C1orf26|HsSwt1 SWT1 RNA endoribonuclease homolog protein-coding 179.5-193 chr9 38654571 38654842 + 1 NA Intergenic Intergenic 33618 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 120.5-117 chr2 80507691 80507894 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 194413 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 113.75-148 chr5 16877778 16877964 + 1 NA intron (NM_012334, intron 1 of 40) intron (NM_012334, intron 1 of 40) 58417 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 212.75-59 chr21 21271249 21271507 + 1 NA intron (NM_001352592, intron 2 of 18) L2b|LINE|L2 124216 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 184.75-78 chr4 184772682 184773075 + 1 NA intron (NM_001995, intron 10 of 20) intron (NM_001995, intron 10 of 20) 26168 NR_003542 643036 Hs.689630 NR_003542 ENSG00000249138 SLED1 - proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 pseudogene pseudo 180.75-44 chr15 57149469 57149890 + 1 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -69751 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 273.75-7 chr12 70144769 70145094 + 1 NA Intergenic Intergenic -98099 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 159.5-158 chr4 16842617 16842833 + 1 NA intron (NM_001304435, intron 1 of 7) intron (NM_001304435, intron 1 of 7) 55920 NM_001304434 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 195.5-92 chr22 41152502 41152735 + 1 NA intron (NM_001429, intron 16 of 30) intron (NM_001429, intron 16 of 30) 44883 NR_110514 101927279 Hs.517517 NR_110514 EP300-AS1 - EP300 antisense RNA 1 ncRNA 202.5-99 chr4 34168806 34169309 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) AluSg4|SINE|Alu 100690 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 203.5-14 chr1 180746710 180747184 + 1 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) intron (NR_137330, intron 2 of 12) 114925 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 240.75 chr1 193969382 193969784 + 1 NA Intergenic Intergenic 664838 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 192.5-60 chr19 30352872 30353250 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -19323 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 174.25-77 chr2 44283452 44283832 + 1 NA intron (NM_000341, intron 3 of 9) intron (NM_000341, intron 3 of 9) 8162 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 177.5-27 chr11 101288483 101288829 + 1 NA Intergenic LTR38A1|LTR|ERV1 -158843 NM_000926 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 129.5-162 chr3 126342219 126342422 + 1 NA TTS (NM_014079) TTS (NM_014079) 15088 NM_014079 28999 Hs.272215 NM_014079 ENSG00000163884 KLF15 KKLF Kruppel like factor 15 protein-coding 115.5-196 chr5 7253025 7253248 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 16218 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 146.5-198 chr7 12156509 12156674 + 1 NA Intergenic Intergenic -54703 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 268.5-68 chrX 7539957 7540384 + 1 NA Intergenic Intergenic 287697 NM_001320754 412 Hs.522578 NM_000351 ENSG00000101846 STS ARSC|ARSC1|ASC|ES|SSDD|XLI steroid sulfatase protein-coding 247.25-12 chr12 130072076 130072369 + 1 NA intron (NR_146538, intron 1 of 1) intron (NR_146538, intron 1 of 1) 887 NR_146538 105370078 NR_146538 LINC02419 - long intergenic non-protein coding RNA 2419 ncRNA 247.5-8 chr10 61309493 61309967 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -142909 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 202.5-125 chr5 175126652 175127158 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -131174 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 189.5-105 chr5 44382087 44382306 + 1 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -6536 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-143 chr21 21665841 21666099 + 1 NA Intergenic Intergenic 71349 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 122.5-123 chr2 206086519 206086711 + 1 NA promoter-TSS (NM_017759) promoter-TSS (NM_017759) -441 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 254.25-53 chr5 75754162 75754749 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37018 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 152.5-79 chr2 17634988 17635205 + 1 NA intron (NM_001366805, intron 2 of 2) intron (NM_001366805, intron 2 of 2) 94400 NM_001366805 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 217.5-60 chr2 29375129 29375462 + 1 NA intron (NM_004304, intron 5 of 28) intron (NM_004304, intron 5 of 28) 100082 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 383.75-2 chr11 92301180 92301968 + 1 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) intron (NM_001367949, intron 1 of 27) -50522 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 263.75-27 chr2 50031141 50031629 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -57182 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 182.75-72 chr2 194066217 194066456 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -277933 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 150.5-222 chr8 109657070 109657371 + 1 NA intron (NM_001099743, intron 1 of 7) intron (NM_001099743, intron 1 of 7) -8317 NM_001099748 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 144.25-7 chr1 70062586 70062846 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 23 of 26) intron (NM_001370785, intron 23 of 26) 142863 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 126.5-35 chr11 45625866 45626021 + 1 NA Intergenic Intergenic 39679 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 179.5-155 chr6 46174378 46174647 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3502 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 128.75-200 chr8 103871286 103871545 + 1 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 52195 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 171.75-14 chr10 27488866 27489079 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -15202 NM_001256412 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 202.5-13 chr10 27571005 27571340 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 66868 NM_001256411 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 173.25-3 chr1 71657822 71658280 + 1 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 178961 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 194.75-59 chr2 159966264 159966502 + 1 NA intron (NM_001007267, intron 20 of 26) L1MB2|LINE|L1 -61627 NM_001198759 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 150.5-80 chr19 35339384 35339645 + 1 NA intron (NM_001278417, intron 5 of 12) AluJb|SINE|Alu -5999 NR_049828 100847070 NR_049828 ENSG00000284034 MIR5196 mir-5196 microRNA 5196 ncRNA 475.75 chr1 81255172 81255848 + 1 NA Intergenic Intergenic -50682 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 137.75-79 chr15 94872873 94873045 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 17596 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 213.75-48 chr2 3944472 3945039 + 1 NA Intergenic Intergenic 29277 NR_037881 100505964 Hs.190267 NR_037881 ENSG00000237401 LINC01304 - long intergenic non-protein coding RNA 1304 ncRNA 139.25-29 chr11 46064517 46064751 + 1 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 56185 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 114.5-240 chr7 43072377 43072518 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -40200 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 434.75-7 chr6 134454432 134455038 + 1 NA intron (NR_125852, intron 2 of 4) intron (NR_125852, intron 2 of 4) 16345 NR_038219 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 154.5-182 chr8 51516994 51517314 + 1 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) intron (NM_144651, intron 4 of 22) 292291 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 178.5-16 chr10 114054596 114054858 + 1 NA Intergenic Intergenic 10861 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 165.25-78 chr20 57088216 57088483 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -125347 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 134.5-156 chr4 71280667 71280939 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) L1MD2|LINE|L1 -58250 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 128.5-83 chr16 75562660 75562862 + 1 NA Intergenic Intergenic -3618 NM_007285 11345 Hs.461379 NM_007285 ENSG00000034713 GABARAPL2 ATG8|ATG8C|GATE-16|GATE16|GEF-2|GEF2 GABA type A receptor associated protein like 2 protein-coding 140.5-55 chr13 73899580 73899820 + 1 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) MLT2B2|LTR|ERVL 234229 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 156.75-54 chr14 29661012 29661329 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 4 of 18) intron (NM_001330069, intron 4 of 18) 265926 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 176.75-73 chr20 42536346 42536553 + 1 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -149034 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 120.5-108 chr2 20766330 20766643 + 1 NA intron (NM_021925, intron 4 of 6) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 56615 NM_001282724 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 151.25-157 chr5 123473234 123473422 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -38771 NM_001031812 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 221.5-85 chr6 113463783 113464232 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -30560 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 160.5-184 chr8 61704993 61705355 + 1 NA intron (NM_001164755, intron 1 of 12) L1PA15|LINE|L1 9418 NM_004318 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 172.75-35 chr14 82399697 82399973 + 1 NA Intergenic Intergenic -242797 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 181.5-7 chr1 197934873 197935158 + 1 NA 3' UTR (NM_020204, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_020204, exon 5 of 5) 17643 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 146.25-70 chr2 103436522 103436839 + 1 NA Intergenic Intergenic -452251 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 322.5-23 chr4 93664696 93665143 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -163834 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 178.5-172 chr7 88584359 88584604 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -175219 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 171.5-90 chr2 176599483 176599816 + 1 NA Intergenic Intergenic 1403 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 181.5-88 chr2 166377029 166377302 + 1 NA Intergenic Intergenic -1178 NM_002977 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 214.25-82 chr8 117661174 117661637 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 140692 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 174.5-185 chr8 98877764 98878125 + 1 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) MIR3|SINE|MIR -52256 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 235.25-12 chr11 81597972 81598381 + 1 NA Intergenic Intergenic 292660 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 249.5-56 chr20 292487 293046 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -1988 NM_080571 140680 Hs.348112 NM_080571 ENSG00000196476 C20orf96 dJ1103G7.2 chromosome 20 open reading frame 96 protein-coding 187.75-62 chr20 50712395 50712605 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -19080 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 249.5-76 chr5 14954537 14955018 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -82999 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 117.25-27 chr10 62070179 62070423 + 1 NA intron (NM_001244638, intron 5 of 6) intron (NM_001244638, intron 5 of 6) 20944 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 274.25-45 chr7 3460531 3460866 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 159446 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 374.5-15 chr7 81749998 81750714 + 1 NA TTS (NM_001010934) TTS (NM_001010934) 19691 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 218.5-59 chr2 138620806 138621054 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 119160 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 236.25-2 chr1 59446794 59447060 + 1 NA intron (NM_001350794, intron 5 of 14) intron (NM_001350794, intron 5 of 14) -68703 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 122.25-131 chr3 151403111 151403299 + 1 NA intron (NM_053002, intron 37 of 42) intron (NM_053002, intron 37 of 42) -18393 NM_022788 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 185.75-87 chr3 95531693 95532030 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 151332 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 271.5-48 chr20 42965923 42966372 + 1 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) -2596 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 249.75-60 chr8 73703063 73703351 + 1 NA intron (NM_001164385, intron 1 of 9) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 43633 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 212.5-26 chr13 86847912 86848345 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -63792 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 205.5-136 chr7 31852133 31852419 + 1 NA intron (NM_001191059, intron 8 of 18) L1M6|LINE|L1 165061 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 250.5-105 chr9 130943930 130944244 + 1 NA Intergenic Intergenic -4840 NM_032843 84929 Hs.133205 NM_032843 ENSG00000130720 FIBCD1 - fibrinogen C domain containing 1 protein-coding 133.5-23 chr1 234327340 234327549 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 20977 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 254.5-5 chr1 101172559 101172905 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 63796 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 237.5-26 chr12 26661807 26662173 + 1 NA intron (NM_002223, intron 15 of 56) intron (NM_002223, intron 15 of 56) 171204 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 146.5-82 chr17 59401599 59401823 + 1 NA TTS (NM_001005404) TTS (NM_001005404) 35628 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 261.5-51 chr5 18857492 18857822 + 1 NA Intergenic Intergenic 1028615 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 130.75-148 chr4 102555589 102555758 + 1 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) L2a|LINE|L2 -53187 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 126.25-17 chr10 51703693 51703888 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie -4195 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 191.75-130 chr9 20604432 20604889 + 1 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) 17278 NM_001286691 4300 Hs.317248 NM_004529 ENSG00000171843 MLLT3 AF9|YEATS3 MLLT3 super elongation complex subunit protein-coding 240.75-18 chr12 130476383 130476721 + 1 NA intron (NM_001351233, intron 5 of 15) L2b|LINE|L2 138665 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 200.25-111 chr8 82992091 82992439 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 80161 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 208.5-35 chr14 51537436 51537886 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) L1MC1|LINE|L1 48533 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 223.5-37 chr14 48269140 48269579 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -474345 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 190.25-36 chr14 54652810 54653039 + 1 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 85312 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 133.5-49 chr11 28055529 28055776 + 1 NA intron (NM_031217, intron 13 of 16) L1MEg|LINE|L1 -1163 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 193.5-104 chr3 9420921 9421218 + 1 NA intron (NM_001080517, intron 1 of 22) MIRc|SINE|MIR 23369 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 264.5-66 chr9 132047583 132048004 + 1 NA intron (NM_001253881, intron 2 of 6) L1ME4a|LINE|L1 32074 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 244.5-9 chr1 197989954 197990398 + 1 NA Intergenic Intergenic 72804 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 276.75-35 chr4 19441093 19441560 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -810579 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 192.75-99 chr4 83841628 83841997 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 305704 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 299.25-3 chr1 111695339 111695799 + 1 NA intron (NM_001370216, intron 3 of 7) intron (NM_001370216, intron 3 of 7) 30775 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 231.25-3 chr1 117257569 117257958 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -37703 NR_126408 104355292 Hs.576446 NR_126408 ENSG00000235202 LINC01525 lnc-MAN1A2-1 long intergenic non-protein coding RNA 1525 ncRNA 234.5-63 chr3 120338152 120338584 + 1 NA intron (NM_001099678, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 10986 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 158.75-159 chr8 85264343 85264568 + 1 NA intron (NM_198584, intron 3 of 6) intron (NM_198584, intron 3 of 6) 18997 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 120.25-176 chr5 154451711 154451902 + 1 NA intron (NM_024632, intron 2 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie 5809 NR_024084 79685 Hs.592566 NM_024632 ENSG00000164576 SAP30L NS4ATP2 SAP30 like protein-coding 156.25-61 chr2 11535214 11535592 + 1 NA intron (NM_014668, intron 1 of 32) (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1358 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 228.5-50 chr2 11475491 11475929 + 1 NA Intergenic Intergenic -9533 NM_001278275 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 175.5-116 chr3 42064467 42064708 + 1 NA Intergenic Intergenic -22613 NM_001349245 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 243.25-44 chr6 50388500 50388874 + 1 NA Intergenic Intergenic -324857 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 250.5 chr1 5320191 5320554 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 542369 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 490.5-2 chr5 68509841 68510489 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 217588 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 285.5-48 chr4 54623744 54624238 + 1 NA Intergenic Intergenic -16860 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 289.75-3 chr10 4770784 4771257 + 1 NA Intergenic Intergenic -55157 NR_073126 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 308.25-23 chr4 57976456 57976787 + 1 NA Intergenic Intergenic 550749 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 274.25-48 chr8 60845561 60846022 + 1 NA intron (NM_017780, intron 23 of 37) L1MB4|LINE|L1 104532 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 129.5-154 chr3 45389648 45389895 + 1 NA intron (NM_001368263, intron 1 of 20) intron (NM_001368263, intron 1 of 20) 1195 NM_001368263 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 146.25-94 chr22 30674689 30674857 + 1 NA Intergenic Intergenic -6898 NM_152511 150290 Hs.517544 NM_152511 ENSG00000167065 DUSP18 DSP18|DUSP20|LMWDSP20 dual specificity phosphatase 18 protein-coding 312.5-22 chr3 38663449 38663814 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -13944 NM_001354701 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 174.5-112 chr21 29708226 29708535 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -39795 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 136.25-51 chr14 26282562 26282791 + 1 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 270754 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 131.5-103 chr2 19776998 19777154 + 1 NA Intergenic Intergenic -91778 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 182.75-33 chr11 102079987 102080271 + 1 NA intron (NM_032930, intron 5 of 6) AluJr|SINE|Alu -30318 NM_001195044 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 123.5-76 chr17 18281241 18281446 + 1 NA intron (NM_004618, intron 16 of 18) intron (NM_004618, intron 16 of 18) 20233 NM_148886 125170 Hs.655555 NM_139162 ENSG00000177427 MIEF2 MID49|SMCR7 mitochondrial elongation factor 2 protein-coding 217.75-72 chr8 68298667 68298961 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -31559 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 198.25-31 chr14 51440392 51440605 + 1 NA Intergenic Intergenic -43363 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 286.5-60 chr7 36752004 36752669 + 1 NA Intergenic Intergenic -27787 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 113.5-214 chr6 145641170 145641397 + 1 NA intron (NM_001368131, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 45594 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 121.75-55 chr15 100831673 100831873 + 1 NA Intergenic Intergenic -17979 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 179.5-74 chr17 64327340 64327638 + 1 NA intron (NM_000442, intron 15 of 15) MIRc|SINE|MIR 63371 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 178.5-32 chr12 332640 332941 + 1 NA intron (NM_001042603, intron 12 of 27) intron (NM_001042603, intron 12 of 27) 56530 NM_001042603 5927 Hs.76272 NM_005056 ENSG00000073614 KDM5A RBBP-2|RBBP2|RBP2 lysine demethylase 5A protein-coding 195.25-48 chr2 30461350 30461706 + 1 NA intron (NM_182551, intron 2 of 6) FLAM_A|SINE|Alu 14282 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 136.25-27 chr11 14700604 14700764 + 1 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) intron (NM_000922, intron 1 of 15) 56880 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 126.5-68 chr14 62400523 62400737 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -260657 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 249.5-65 chr3 63115614 63115863 + 1 NA intron (NR_027104, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 13050 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 239.75-5 chr10 25183097 25183405 + 1 NA intron (NM_020752, intron 1 of 10) intron (NM_020752, intron 1 of 10) -6975 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 196.5-40 chr12 15965172 15965443 + 1 NA intron (NM_001300779, intron 5 of 7) L1PA10|LINE|L1 53975 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 204.5-39 chr15 56184066 56184311 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) AluSp|SINE|Alu 5744 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 144.5-154 chr4 100707238 100707393 + 1 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -32202 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 193.5-146 chr7 12914067 12914366 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 226583 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 191.75-98 chr5 8952905 8953293 + 1 NA Intergenic Intergenic 100796 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 202.75-5 chr1 113717163 113717483 + 1 NA intron (NM_001323043, intron 7 of 18) L1M1|LINE|L1 41832 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 312.5-5 chr10 100311678 100312251 + 1 NA intron (NM_016112, intron 2 of 15) intron (NM_016112, intron 2 of 15) 18264 NM_001253837 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 221.25-5 chr1 118895138 118895563 + 1 NA intron (NM_152380, intron 7 of 7) intron (NM_152380, intron 7 of 7) 92993 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 156.25-41 chr14 59775544 59775832 + 1 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 95088 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 136.25-95 chr2 142256458 142256669 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -124862 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 193.5-36 chr12 116013898 116014188 + 1 NA intron (NM_015335, intron 8 of 30) intron (NM_015335, intron 8 of 30) 134611 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 167.75-84 chr20 22488314 22488579 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -67803 NR_027089 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 147.75-167 chr9 8646668 8646926 + 1 NA intron (NM_130392, intron 1 of 30) intron (NM_130392, intron 1 of 30) 87149 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 199.25-74 chr4 147662131 147662536 + 1 NA intron (NM_001350144, intron 4 of 10) L1ME3A|LINE|L1 21830 NM_138364 90826 Hs.591692 NM_138364 ENSG00000164169 PRMT9 PRMT10 protein arginine methyltransferase 9 protein-coding 148.5-222 chr8 68153365 68153607 + 1 NA intron (NM_024870, intron 34 of 39) intron (NM_024870, intron 34 of 39) -176887 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 178.75-57 chr22 36691740 36691959 + 1 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) intron (NM_006078, intron 1 of 3) 11009 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 148.5-180 chr5 27598990 27599179 + 1 NA Intergenic Intergenic 126792 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 153.5-216 chr9 83568898 83569133 + 1 NA Intergenic Intergenic -30614 NM_174938 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 203.5-84 chr21 21093056 21093340 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) -53964 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 252.5-18 chr11 110833259 110833664 + 1 NA Intergenic Intergenic -120272 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 121.25-118 chr20 57124617 57124859 + 1 NA Intergenic Intergenic -88958 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 410.5-5 chr15 57392708 57393243 + 1 NA intron (NM_032866, intron 1 of 18) intron (NM_032866, intron 1 of 18) 16470 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 225.75-34 chr2 10313984 10314292 + 1 NA intron (NM_134421, intron 1 of 5) AluSg|SINE|Alu 10438 NM_134421 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 347.25-13 chr3 90306347 90306912 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1199008 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 126.5-144 chr22 32036811 32036973 + 1 NA intron (NR_149128, intron 4 of 4) L1MB3|LINE|L1 -6369 NM_000343 6523 Hs.1964 NM_000343 ENSG00000100170 SLC5A1 D22S675|NAGT|SGLT1 solute carrier family 5 member 1 protein-coding 148.5-146 chr3 58979249 58979506 + 1 NA intron (NR_110820, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 70648 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 152.25-12 chr10 11481043 11481336 + 1 NA intron (NM_014688, intron 14 of 14) intron (NM_014688, intron 14 of 14) 51091 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 228.5-17 chr10 60260496 60260738 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 8 of 43) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -119601 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 212.75-10 chr10 53193224 53193580 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -421702 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 172.5-212 chr9 9332827 9333155 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) -466401 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 214.25-52 chr22 40118367 40118647 + 1 NA intron (NM_001024843, intron 2 of 23) MIRb|SINE|MIR -59418 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 231.5-105 chr9 70469797 70470092 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -55287 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 199.5-85 chr2 117613716 117614109 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -200779 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 297.75-54 chr9 113382717 113383061 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5903 NM_001304509 81932 Hs.7739 NM_031219 ENSG00000119431 HDHD3 2810435D12Rik|C9orf158 haloacid dehalogenase like hydrolase domain containing 3 protein-coding 188.5-77 chr2 117645940 117646304 + 1 NA Intergenic Intergenic -168569 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 166.5-126 chr3 2192872 2193081 + 1 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -45853 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 200.25-61 chr2 79617651 79617973 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) intron (NM_001282598, intron 1 of 17) 31547 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 116.5-10 chr1 109468736 109468904 + 1 NA intron (NM_001040709, intron 2 of 5) intron (NM_001040709, intron 2 of 5) 2274 NM_001040709 284612 Hs.528366 NM_001006603 ENSG00000143028 SYPL2 MG29 synaptophysin like 2 protein-coding 255.25-14 chr14 48041635 48041930 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -246768 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 117.5-157 chr4 38373530 38373657 + 1 NA intron (NR_149123, intron 1 of 1) intron (NR_149123, intron 1 of 1) 6679 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 193.5-5 chr1 78596183 78596648 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -24033 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 271.5-27 chr16 47510870 47511312 + 1 NA intron (NM_001031835, intron 5 of 31) intron (NM_001031835, intron 5 of 31) 49760 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 180.25-112 chr7 40525106 40525441 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 390297 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 127.5-112 chr2 51333233 51333479 + 1 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu 300755 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 173.75-47 chr12 114188760 114189032 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 52874 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 262.75-51 chr8 52108811 52109081 + 1 NA Intergenic Intergenic -85416 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 158.75-49 chr13 81450817 81451046 + 1 NA Intergenic Intergenic -223948 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 151.25-171 chr7 39572642 39573043 + 1 NA TTS (NM_020192) TTS (NM_020192) 6438 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 151.25-176 chr7 56664096 56664268 + 1 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -126052 NR_108099 101928401 Hs.385614 NR_108099 ENSG00000233288 LOC101928401 - uncharacterized LOC101928401 ncRNA 264.75-15 chr16 63110396 63110796 + 1 NA Intergenic Intergenic -1074158 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 182.25-36 chr14 50904295 50904712 + 1 NA TTS (NM_001163940) TTS (NM_001163940) 32343 NM_181814 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 141.25-111 chr3 101843468 101843758 + 1 NA intron (NM_001005474, intron 2 of 12) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -5901 NM_031419 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 151.75-126 chr6 98981911 98982091 + 1 NA Intergenic Intergenic -33995 NM_012160 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 179.75-20 chr10 122978422 122978641 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -1870 NM_153336 118672 Hs.281004 NM_153336 ENSG00000179988 PSTK C10orf89 phosphoseryl-tRNA kinase protein-coding 258.75-11 chr11 27934385 27934798 + 1 NA Intergenic Intergenic -122224 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 198.75-76 chr5 26795974 26796340 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 242429 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 317.25-26 chr5 44703540 44704189 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 104929 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 160.75-49 chr15 27043409 27043698 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) LTR54|LTR|ERV1 72372 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 126.5-137 chr20 54944843 54944984 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 469320 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 135.25-36 chr10 122328258 122328482 + 1 NA intron (NM_001318189, intron 10 of 15) intron (NM_001318189, intron 10 of 15) -46338 NM_001330178 59338 Hs.643512 NM_021622 ENSG00000107679 PLEKHA1 TAPP1 pleckstrin homology domain containing A1 protein-coding 120.75-175 chr9 32502848 32503129 + 1 NA intron (NM_014314, intron 1 of 17) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 23208 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 344.25-13 chr3 99749250 99749683 + 1 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -68396 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 172.5-53 chr12 66426139 66426371 + 1 NA intron (NM_001366722, intron 14 of 24) HAL1|LINE|L1 123710 NR_135080 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 260.5-29 chr2 77514792 77515147 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 7407 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 227.5-48 chr19 43662329 43662618 + 1 NA intron (NM_001005376, intron 3 of 6) AluSq2|SINE|Alu 7696 NM_001301037 5329 Hs.466871 NM_002659 ENSG00000011422 PLAUR CD87|U-PAR|UPAR|URKR plasminogen activator, urokinase receptor protein-coding 183.75-21 chr10 108850145 108850387 + 1 NA Intergenic Intergenic -780973 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 225.75-74 chr8 20109387 20109816 + 1 NA Intergenic Intergenic 73535 NM_001142324 6570 Hs.158322 NM_003053 ENSG00000036565 SLC18A1 CGAT|VAT1|VMAT1 solute carrier family 18 member A1 protein-coding 232.5-80 chr4 124809556 124809961 + 1 NA Intergenic Intergenic -97026 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 201.5-78 chr2 229009567 229009872 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 222373 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 154.75-91 chr3 99618893 99619142 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19577 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 189.5-81 chr20 40936151 40936477 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -44399 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 243.75-40 chr2 61893656 61894014 + 1 NA intron (NM_001321781, intron 1 of 2) intron (NM_001321781, intron 1 of 2) 5112 NM_001321782 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 247.75-29 chr18 55793125 55793489 + 1 NA Intergenic Intergenic -11582 NR_145452 100132501 Hs.634003 NR_145452 LINC01415 TCONS_00026208 long intergenic non-protein coding RNA 1415 ncRNA 222.25-71 chr5 99545897 99546215 + 1 NA intron (NR_110562, intron 2 of 3) L1PREC2|LINE|L1 12066 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 172.5-159 chr5 114965048 114965281 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -191751 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 211.5-27 chr11 80095745 80096033 + 1 NA Intergenic Intergenic -654859 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 206.5-120 chr7 39293554 39293782 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 35466 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 241.75-53 chr3 111563789 111564314 + 1 NA intron (NM_001318889, intron 2 of 7) L1M8|LINE|L1 21854 NM_198196 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 359.75-21 chr8 57562372 57563148 + 1 NA Intergenic Intergenic -183389 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 271.75-32 chr3 151220010 151220335 + 1 NA intron (NM_014879, intron 1 of 2) MER20|DNA|hAT-Charlie -16956 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 160.25-163 chr8 137474809 137474995 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -61314 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 234.5-51 chr2 182004508 182005003 + 1 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 18902 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 174.25-8 chr1 101923690 101924042 + 1 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 51854 NR_033424 94236 Hs.606193 NR_033424 DNAJA1P5 HEJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 pseudogene 5 pseudo 140.25-53 chr15 68093810 68093978 + 1 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 39318 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 274.25-24 chr16 75706666 75707039 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5391 NM_001351307 100033411 NM_001351307 ENSG00000282757 DUXB - double homeobox B protein-coding 153.75-100 chr4 40100468 40100839 + 1 NA intron (NM_001318359, intron 4 of 18) AluJb|SINE|Alu -43454 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 209.25-46 chr18 26156397 26156646 + 1 NA intron (NM_144662, intron 3 of 6) L1MA5|LINE|L1 22652 NM_001308188 143471 Hs.464813 NM_144662 ENSG00000154611 PSMA8 PSMA7L proteasome subunit alpha 8 protein-coding 170.25-56 chr17 47907146 47907473 + 1 NA intron (NR_103856, intron 2 of 2) intron (NR_103856, intron 2 of 2) 11073 NM_003110 6668 Hs.514276 NM_003110 ENSG00000167182 SP2 - Sp2 transcription factor protein-coding 172.5-3 chr1 27413092 27413483 + 1 NA intron (NM_006990, intron 6 of 8) intron (NM_006990, intron 6 of 8) 20665 NM_005281 2827 Hs.66542 NM_005281 ENSG00000181773 GPR3 ACCA G protein-coupled receptor 3 protein-coding 205.5-148 chr8 90177970 90178377 + 1 NA Intergenic Intergenic -43315 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 186.75-29 chr14 20000550 20000791 + 1 NA Intergenic Intergenic -1392 NR_145508 390432 NM_001348271 ENSG00000196383 OR4Q2 OR4Q2P olfactory receptor family 4 subfamily Q member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 289.25-28 chr8 16194825 16195401 + 1 NA Intergenic Intergenic -2322 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 166.25-155 chrX 103312568 103312770 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -1679 NM_032621 84707 Hs.398989 NM_032621 ENSG00000133134 BEX2 BEX1|DJ79P11.1 brain expressed X-linked 2 protein-coding 133.75-12 chr1 235374183 235374426 + 1 NA intron (NM_001079515, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 6877 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 143.5-79 chr15 69178009 69178200 + 1 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 17469 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 176.75-125 chr8 102165064 102165392 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 39796 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 116.75-62 chr14 100779571 100779687 + 1 NA Intergenic Intergenic -34862 NR_039729 100616495 NR_039729 ENSG00000266461 MIR2392 - microRNA 2392 ncRNA 159.5-181 chr6 56447683 56447994 + 1 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -53710 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 139.25-205 chr9 14302424 14302595 + 1 NA intron (NR_161383, intron 1 of 7) intron (NR_161383, intron 1 of 7) -2245 NM_001369479 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 120.25-217 chr8 129603502 129603760 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -28613 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 125.75-198 chrX 44186297 44186579 + 1 NA intron (NM_025184, intron 11 of 14) intron (NM_025184, intron 11 of 14) 157234 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 130.75-210 chrX 100605507 100605818 + 1 NA Intergenic Intergenic 20726 NM_022144 64102 Hs.132957 NM_022144 ENSG00000000005 TNMD BRICD4|CHM1L|TEM tenomodulin protein-coding 166.5-201 chr8 95461233 95461524 + 1 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) intron (NR_038207, intron 2 of 2) -192177 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 140.25-116 chr3 29737959 29738109 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 196122 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 227.75-87 chr9 90885275 90885657 + 1 NA intron (NM_001174167, intron 11 of 13) L1M2|LINE|L1 58046 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 131.5-127 chr2 182845631 182845875 + 1 NA intron (NM_001463, intron 2 of 5) intron (NM_001463, intron 2 of 5) 20884 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 179.5-57 chr14 56653089 56653374 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 73433 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 121.25-134 chr3 100374416 100374609 + 1 NA intron (NM_014820, intron 7 of 11) intron (NM_014820, intron 7 of 11) 26577 NM_014820 9868 Hs.227253 NM_014820 ENSG00000154174 TOMM70 TOMM70A|Tom70 translocase of outer mitochondrial membrane 70 protein-coding 260.25-17 chr15 64406634 64406966 + 1 NA intron (NM_001321924, intron 6 of 12) intron (NM_001321924, intron 6 of 12) 18964 NM_001321924 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 134.5-183 chr5 152674230 152674393 + 1 NA intron (NR_109877, intron 4 of 4) L3|LINE|CR1 -269032 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 152.5-80 chr2 18864669 18864907 + 1 NA Intergenic Intergenic 162183 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 143.75-28 chr10 119113708 119113887 + 1 NA intron (NM_001303113, intron 3 of 7) intron (NM_001303113, intron 3 of 7) 9684 NM_001303111 404636 Hs.434241 NM_207009 ENSG00000119979 DENND10 FAM45A DENN domain containing 10 protein-coding 240.5-26 chr14 54717235 54717544 + 1 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu -37444 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 116.5-122 chr2 102188092 102188288 + 1 NA intron (NM_001351449, intron 2 of 10) intron (NM_001351449, intron 2 of 10) 876 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 190.75-106 chr8 27783971 27784267 + 1 NA intron (NM_001017420, intron 5 of 10) intron (NM_001017420, intron 5 of 10) 9565 NM_001017420 157570 Hs.99480 NM_001017420 ENSG00000171320 ESCO2 2410004I17Rik|EFO2|EFO2p|RBS|hEFO2 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 protein-coding 229.25-33 chr17 39380041 39380487 + 1 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 21362 NM_032875 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 191.25-69 chr3 99077918 99078217 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -176372 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 139.75-48 chr14 51306479 51306676 + 1 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 21808 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 184.5-22 chr10 83084134 83084501 + 1 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 592772 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 122.75-18 chr1 215271270 215271431 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 188613 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 139.75-92 chr2 26996842 26997022 + 1 NA intron (NR_149018, intron 1 of 5) intron (NR_149018, intron 1 of 5) 17656 NR_149018 100129724 Hs.666730 NR_149018 ENSG00000205500 LOC100129724 - uncharacterized LOC100129724 ncRNA 182.5-49 chr14 56282310 56282562 + 1 NA intron (NM_021255, intron 3 of 5) intron (NM_021255, intron 3 of 5) 164025 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 116.5-97 chr18 6543458 6543736 + 1 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 32181 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 117.25-13 chr1 154232457 154232601 + 1 NA intron (NM_001127320, intron 4 of 24) intron (NM_001127320, intron 4 of 24) 11574 NM_014847 9898 Hs.490551 NM_014847 ENSG00000143569 UBAP2L NICE-4|NICE4 ubiquitin associated protein 2 like protein-coding 175.5-69 chr16 78176980 78177155 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 77413 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 163.75-111 chr5 146116344 146116552 + 1 NA intron (NM_016460, intron 30 of 30) intron (NM_016460, intron 30 of 30) -10871 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 157.75-59 chr16 51659532 51659826 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -102840 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 375.5-4 chr15 59856602 59857172 + 1 NA Intergenic Intergenic -147424 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 344.5-20 chr4 136094134 136094702 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -180738 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 212.5-68 chr3 16072039 16072344 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -102489 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 242.75-31 chr2 103926551 103926847 + 1 NA Intergenic Intergenic 481633 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 185.25-127 chr8 136154975 136155256 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -375683 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 270.5-29 chr2 43361593 43362052 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 134611 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 122.5-72 chr15 62026378 62026534 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 6 of 81) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 33991 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 198.5-61 chr19 2443927 2444401 + 1 NA intron (NM_032737, intron 2 of 11) intron (NM_032737, intron 2 of 11) -9164 NR_106958 102466806 NR_106958 ENSG00000283728 MIR7108 hsa-mir-7108 microRNA 7108 ncRNA 205.5-87 chr20 57967538 57967850 + 1 NA Intergenic Intergenic -36210 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 233.75-67 chr6 37648511 37648863 + 1 NA intron (NM_153487, intron 9 of 16) CpG 49196 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 159.25 chr1 42030616 42030824 + 1 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) intron (NR_038261, intron 1 of 3) 5214 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 210.5-78 chr21 33570142 33570355 + 1 NA intron (NM_001291412, intron 7 of 10) intron (NM_001291412, intron 7 of 10) 18436 NM_017613 29980 Hs.436341 NM_017613 ENSG00000159147 DONSON B17|C21orf60|MIMIS|MISSLA downstream neighbor of SON protein-coding 135.5-13 chr1 180781992 180782132 + 1 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) intron (NR_137330, intron 2 of 12) -130835 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 210.5-74 chr20 47702892 47703308 + 1 NA intron (NM_198596, intron 3 of 20) AluSx3|SINE|Alu 82964 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 350.5-5 chr1 173928422 173928979 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11322 NM_000488 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 131.5-43 chr12 33113494 33113667 + 1 NA Intergenic Intergenic -216734 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 227.5-88 chr6 35575148 35575418 + 1 NA 3' UTR (NM_004117, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004117, exon 11 of 11) -62387 NM_001289395 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 135.5-87 chr18 22494520 22494795 + 1 NA Intergenic Intergenic -76742 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 204.75-48 chr16 70562270 70562632 + 1 NA intron (NM_012426, intron 17 of 25) intron (NM_012426, intron 17 of 25) -17444 NM_152456 146433 Hs.461214 NM_152456 ENSG00000157368 IL34 C16orf77|IL-34 interleukin 34 protein-coding 146.5-108 chr2 115809606 115809814 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 20 of 25) intron (NM_001321912, intron 20 of 25) 465895 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 295.25-6 chr11 35674400 35674943 + 1 NA intron (NM_017583, intron 1 of 4) intron (NM_017583, intron 1 of 4) 11896 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 119.5-52 chr11 105722767 105722929 + 1 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 112142 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 115.5-176 chr3 127743605 127743768 + 1 NA intron (NM_001003794, intron 3 of 7) intron (NM_001003794, intron 3 of 7) 70734 NM_172027 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 336.75-8 chr16 12998744 12999441 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 97494 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 285.25-43 chr9 90568121 90568551 + 1 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) intron (NR_034157, intron 1 of 5) 14410 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 161.25-131 chr4 38826109 38826293 + 1 NA 3' UTR (NM_006068, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_006068, exon 2 of 2) -21410 NM_003263 7096 Hs.621817 NM_003263 ENSG00000174125 TLR1 CD281|TIL|TIL. LPRS5|rsc786 toll like receptor 1 protein-coding 155.75-13 chr1 222868282 222868465 + 1 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) L1ME4b|LINE|L1 53334 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 147.75-36 chr14 43632498 43632692 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 874688 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 120.5-227 chr8 92668455 92668693 + 1 NA Intergenic Intergenic -13080 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 131.5-202 chr6 46955223 46955419 + 1 NA promoter-TSS (NM_015234) promoter-TSS (NM_015234) -382 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 134.5-228 chr8 119491344 119491549 + 1 NA Intergenic Intergenic 75000 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 165.5-65 chr17 65740093 65740373 + 1 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) intron (NR_126542, intron 2 of 5) 86218 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 264.5-18 chr14 23711498 23712007 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 75388 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 319.5-4 chr10 53074554 53075180 + 1 NA Intergenic Intergenic -303167 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 197.5-134 chr6 68843713 68843968 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L1MA3|LINE|L1 208558 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 117.5-2 chr1 39300905 39301071 + 1 NA intron (NM_012090, intron 21 of 92) AluSz|SINE|Alu -108085 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 205.25-96 chr7 3770192 3770505 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MD2|LINE|L1 -359337 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 175.5-123 chr3 136706297 136706728 + 1 NA intron (NM_005862, intron 1 of 33) L1MB5|LINE|L1 45866 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 128.5-115 chr2 159750599 159750742 + 1 NA intron (NM_001282805, intron 7 of 11) intron (NM_001282805, intron 7 of 11) 16706 NM_001282807 64844 Hs.529272 NM_022826 ENSG00000136536 MARCH7 AXO|AXOT|MARCH-VII|RNF177 membrane associated ring-CH-type finger 7 protein-coding 301.25-21 chr3 85268240 85268607 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -117287 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 161.5-131 chr3 54716274 54716532 + 1 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) MER4C|LTR|ERV1 -76546 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 264.25-12 chr12 89740470 89740799 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -31268 NM_001366528 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 372.5-11 chr2 40901210 40901859 + 1 NA Intergenic Intergenic -389099 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 123.75-49 chr13 46698683 46698906 + 1 NA intron (NM_001164213, intron 9 of 18) L1MB2|LINE|L1 98367 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 154.5-203 chr9 85739026 85739220 + 1 NA intron (NM_015239, intron 1 of 25) MIR|SINE|MIR 2906 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 117.25-149 chr3 186237424 186237682 + 1 NA intron (NM_001346, intron 20 of 24) MIRb|SINE|MIR 124681 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 202.75-40 chr15 62656523 62656761 + 1 NA intron (NM_015059, intron 5 of 55) (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9331 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 129.5-110 chr2 36190508 36190743 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 164945 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 158.5-11 chr1 190037234 190037703 + 1 NA Intergenic LTR68|LTR|ERV1 438542 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 162.25-55 chr15 58387185 58387531 + 1 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -44633 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 124.75-175 chr5 158163769 158164031 + 1 NA Intergenic Intergenic 245873 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 240.5-23 chr14 38505798 38506077 + 1 NA Intergenic Intergenic -249844 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 210.75 chr1 19437089 19437320 + 1 NA intron (NM_001206540, intron 1 of 9) intron (NM_001206540, intron 1 of 9) 47091 NM_001282162 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 217.5-21 chr11 32859987 32860293 + 1 NA Intergenic Intergenic 30213 NM_024081 79056 Hs.471695 NM_024081 ENSG00000135378 PRRG4 PRGP4|TMG4 proline rich and Gla domain 4 protein-coding 338.75-3 chr10 83830613 83831172 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -153803 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 225.25-6 chr10 18071109 18071367 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -60676 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 208.5-90 chr3 129539310 129539831 + 1 NA Intergenic Intergenic -3644 NM_153833 132243 Hs.97358 NM_153833 ENSG00000178804 H1FOO H1.8|H1oo|osH1 H1 histone family member O oocyte specific protein-coding 177.5-50 chr15 62682809 62683224 + 1 NA intron (NM_015059, intron 8 of 55) intron (NM_015059, intron 8 of 55) 35705 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 122.75-162 chr5 68883891 68884177 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 145893 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 309.25-11 chr15 89187506 89188048 + 1 NA intron (NM_007011, intron 11 of 14) intron (NM_007011, intron 11 of 14) 33802 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 127.5-249 chr8 133430406 133430586 + 1 NA Intergenic Intergenic -133192 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 240.5-85 chr5 125860101 125860519 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -319267 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 184.5-56 chr16 84168332 84168657 + 1 NA intron (NM_001318756, intron 3 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 9454 NM_001318756 123872 Hs.310164 NM_178452 ENSG00000154099 DNAAF1 CILD13|LRRC50|ODA7|swt dynein axonemal assembly factor 1 protein-coding 271.25-38 chr6 38901865 38902151 + 1 NA intron (NM_001371, intron 61 of 91) MER102b|DNA|hAT-Charlie 51099 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 154.25-181 chr9 35426292 35426478 + 1 NA intron (NR_003582, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 19630 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 159.5-168 chr4 138024699 138024976 + 1 NA Intergenic Intergenic -64177 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 294.5-46 chr6 36524574 36525196 + 1 NA intron (NM_007271, intron 3 of 13) intron (NM_007271, intron 3 of 13) 22594 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 252.5-71 chr6 72400792 72401159 + 1 NA 3' UTR (NM_001168407, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001168407, exon 25 of 25) 34229 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 173.25-91 chr4 107253682 107253960 + 1 NA Intergenic Intergenic -217508 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 308.5-22 chr3 60373270 60373767 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 244352 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 209.5-102 chr4 63212130 63212389 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1050494 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 286.25-24 chr6 66318105 66318538 + 1 NA Intergenic Intergenic 530442 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 329.5 chr1 161200091 161200557 + 1 NA intron (NM_004550, intron 1 of 14) intron (NM_004550, intron 1 of 14) 1009 NM_004550 4720 Hs.173611 NM_004550 ENSG00000158864 NDUFS2 CI-49|MC1DN6 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2 protein-coding 157.75-171 chr8 113989995 113990188 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -553152 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 260.75-56 chr6 143333320 143333739 + 1 NA intron (NM_001366346, intron 5 of 5) intron (NM_001366346, intron 5 of 5) 109148 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 161.5-51 chr13 83456986 83457187 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 425307 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 259.5-69 chr3 101620703 101621204 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 46773 NM_020357 57092 Hs.732633 NM_020357 ENSG00000081154 PCNP - PEST proteolytic signal containing nuclear protein protein-coding 194.75-80 chr5 100963571 100963808 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -60407 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 272.5-21 chr12 90360915 90361300 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 67789 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 145.25-123 chr4 179704901 179705275 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 1454061 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 156.5-45 chr12 90967679 90967925 + 1 NA intron (NM_004950, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu -12626 NR_130711 196477 Hs.128574 NM_152638 ENSG00000197651 CCER1 C12orf12 coiled-coil glutamate rich protein 1 protein-coding 170.5-162 chr6 126251791 126252191 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -87798 NM_001012507 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 219.5-9 chr1 208530991 208531309 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -197538 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 119.75-74 chr17 31626948 31627168 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 51647 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 221.75-3 chr1 58810002 58810425 + 1 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 25062 NR_034014 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 218.25-6 chr1 225456787 225457359 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -28218 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 211.25-87 chr7 103998717 103998961 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -9181 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 143.5-98 chr18 67172112 67172318 + 1 NA Intergenic Intergenic 90631 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 117.5-106 chr2 80154083 80154227 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 150597 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 139.75-11 chr1 217983878 217984148 + 1 NA Intergenic Intergenic -59492 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 250.25-48 chr8 136530891 136531315 + 1 NA intron (NR_147196, intron 1 of 5) ERVL-E-int|LTR|ERVL 305 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 191.25-33 chr14 63657790 63658035 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16041 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 166.5-93 chr19 52316041 52316322 + 1 NA intron (NM_144684, intron 4 of 4) (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19012 NM_001297625 147657 Hs.729317 NM_144684 ENSG00000198464 ZNF480 - zinc finger protein 480 protein-coding 226.75-51 chr3 104434751 104435039 + 1 NA Intergenic Intergenic -910779 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 181.25-117 chr6 129466388 129466682 + 1 NA intron (NM_000426, intron 51 of 64) intron (NM_000426, intron 51 of 64) 243642 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 189.5-45 chr14 69195892 69196207 + 1 NA intron (NM_001193363, intron 1 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 4283 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 205.5-29 chr12 55332965 55333243 + 1 NA TTS (NM_054104) TTS (NM_054104) 1403 NM_054104 254786 Hs.553653 NM_054104 ENSG00000205329 OR6C3 OST709 olfactory receptor family 6 subfamily C member 3 protein-coding 211.5-137 chr6 166287838 166288271 + 1 NA Intergenic Intergenic 20338 NM_175922 285800 Hs.731862 NM_175922 ENSG00000176381 PRR18 - proline rich 18 protein-coding 202.5-6 chr1 117790609 117790951 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 138841 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 229.5-12 chr1 221141962 221142248 + 1 NA Intergenic Intergenic 194191 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 143.5-208 chr8 58946365 58946627 + 1 NA intron (NM_014729, intron 2 of 8) intron (NM_014729, intron 2 of 8) 172651 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 156.75-120 chr4 52663421 52663602 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 4105 NR_125363 643783 Hs.631514 NR_125363 ENSG00000248866 USP46-AS1 - USP46 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-205 chr5 123486129 123486342 + 1 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -25864 NM_001031812 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 209.5-131 chr6 50166033 50166266 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -116220 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 202.5-134 chr7 31841095 31841541 + 1 NA intron (NM_001191059, intron 10 of 18) L1ME2|LINE|L1 154103 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 190.75-71 chr4 43379777 43380133 + 1 NA Intergenic Intergenic 112588 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 118.25-138 chr4 49154144 49154287 + 1 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 167573 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 221.5-71 chr4 117526798 117527223 + 1 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 98612 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 274.5-57 chr5 160508351 160508659 + 1 NA Intergenic Intergenic 23153 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 113.5-176 chr4 61183398 61183607 + 1 NA Intergenic Intergenic -17728 NM_001371343 120.5-240 chr9 92184500 92184678 + 1 NA 3' UTR (NM_001350291, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001350291, exon 4 of 4) 6567 NM_001350291 138652 Hs.742918 NM_001350291 PRSS47 - serine protease 47 protein-coding 118.25-214 chr9 33474862 33475078 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -1027 NM_139235 65083 Hs.493709 NM_022917 ENSG00000165271 NOL6 NRAP|UTP22|bA311H10.1 nucleolar protein 6 protein-coding 229.25-18 chr12 45635978 45636441 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 91712 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 207.25-44 chr2 123545800 123546180 + 1 NA Intergenic Intergenic -472509 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 202.75-49 chr18 9912656 9912956 + 1 NA Intergenic Intergenic -1210 NM_194434 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 215.25-85 chr5 108958539 108958829 + 1 NA intron (NR_146155, intron 12 of 19) intron (NR_146155, intron 12 of 19) 34078 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 261.75-54 chr8 125401127 125401609 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -28990 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 173.25-106 chr6 17695030 17695272 + 1 NA intron (NM_005124, intron 1 of 21) intron (NM_005124, intron 1 of 21) -10979 NR_134616 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 257.25-5 chr10 22505827 22506227 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -68098 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 283.5-20 chr16 74686403 74686768 + 1 NA intron (NM_152649, intron 4 of 10) AluY|SINE|Alu 14277 NM_001142497 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 114.25-189 chr8 77588925 77589157 + 1 NA Intergenic Intergenic 138344 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 212.75-51 chr2 112681008 112681270 + 1 NA Intergenic Intergenic 35200 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 167.25-81 chr2 73500723 73500974 + 1 NA intron (NM_015120, intron 10 of 22) L1MD2|LINE|L1 43745 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 141.75-56 chr14 53386008 53386272 + 1 NA Intergenic Intergenic 232786 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 308.25-19 chr22 25818203 25818600 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) intron (NM_001318245, intron 12 of 43) 76213 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 161.5-15 chr1 222433527 222433793 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 114444 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 130.5-141 chr2 153473767 153473963 + 1 NA Intergenic Intergenic 4897 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 191.75-70 chr2 155639268 155639563 + 1 NA Intergenic Intergenic 615516 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 189.5-48 chr15 59711207 59711570 + 1 NA Intergenic Intergenic -22068 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 143.5-178 chr5 140263177 140263357 + 1 NA intron (NM_002622, intron 3 of 3) LTR79|LTR|ERVL 39834 NM_002622 5201 Hs.483564 NM_002622 ENSG00000113068 PFDN1 PDF|PFD1 prefoldin subunit 1 protein-coding 139.5-136 chr3 97824538 97824772 + 1 NA intron (NM_153605, intron 1 of 21) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 2644 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 234.25-25 chr16 8306162 8306521 + 1 NA Intergenic Intergenic 283497 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 274.75-10 chr13 110409092 110409574 + 1 NA intron (NM_001846, intron 4 of 47) intron (NM_001846, intron 4 of 47) 53954 NM_001267044 100129836 Hs.640035 NM_001267044 COL4A2-AS2 - COL4A2 antisense 2 protein-coding 122.5-17 chr1 247407993 247408180 + 1 NA Intergenic Intergenic -8070 NM_001079821 114548 Hs.159483 NM_004895 ENSG00000162711 NLRP3 AGTAVPRL|AII|AVP|C1orf7|CIAS1|CLR1.1|DFNA34|FCAS|FCAS1|FCU|KEFH|MWS|NALP3|PYPAF1 NLR family pyrin domain containing 3 protein-coding 205.75-39 chr2 122740926 122741179 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 332429 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 205.5-140 chr7 78236614 78237189 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 10 of 20) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -110341 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 199.75-13 chr11 31521042 31521282 + 1 NA intron (NM_001288725, intron 2 of 10) intron (NM_001288725, intron 2 of 10) 11395 NM_001288726 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 213.5-74 chr3 5394810 5395094 + 1 NA Intergenic Intergenic -144697 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 283.5-15 chr12 101090801 101091206 + 1 NA intron (NM_001286616, intron 16 of 26) intron (NM_001286616, intron 16 of 26) -47555 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 194.75-18 chr11 107036923 107037347 + 1 NA Intergenic Intergenic -18659 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 202.75-53 chr2 11170162 11170492 + 1 NA intron (NM_001282711, intron 4 of 5) L2|LINE|L2 14860 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 265.5-9 chr10 66478925 66479363 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) L1M5|LINE|L1 -446892 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 210.75-9 chr1 200306191 200306512 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 67441 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 173.5-147 chr6 154064665 154065016 + 1 NA intron (NM_001285522, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 -21667 NM_001145287 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 290.5-2 chr1 161283875 161284213 + 1 NA intron (NM_001102566, intron 2 of 2) intron (NM_001102566, intron 2 of 2) 25299 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 224.75-52 chr4 90296046 90296323 + 1 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) intron (NM_207491, intron 1 of 7) 61153 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 189.25-17 chr11 84739005 84739264 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1ME1|LINE|L1 -18192 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 431.25-2 chr11 29258022 29258653 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -336076 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 198.75-47 chr2 114967223 114967486 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L2a|LINE|L2 -97219 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 175.25-48 chr14 74795552 74795787 + 1 NA intron (NM_019589, intron 4 of 20) intron (NM_019589, intron 4 of 20) 32353 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 139.5-225 chr8 134419668 134419954 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -178260 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 154.25-132 chr5 117397526 117397710 + 1 NA Intergenic Intergenic -17894 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 221.5-110 chrX 54318402 54318672 + 1 NA intron (NM_001002838, intron 2 of 22) AluJo|SINE|Alu 39468 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 205.5-27 chr12 20530939 20531215 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -40787 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 296.25-26 chr5 67873982 67874515 + 1 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 81035 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 123.75-16 chr10 70653154 70653347 + 1 NA Intergenic Intergenic -19256 NM_080722 140766 Hs.352156 NM_080722 ENSG00000138316 ADAMTS14 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 14 protein-coding 195.5-69 chr2 67928784 67929091 + 1 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -103375 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 155.5-99 chr2 138216836 138217021 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 115044 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 208.5-21 chr11 74819091 74819540 + 1 NA intron (NM_001098638, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR 70466 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 117.5-164 chr4 121402315 121402549 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -21414 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 302.5-7 chr11 29347279 29347796 + 1 NA Intergenic Intergenic -246876 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 173.25-96 chr5 17791685 17792109 + 1 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -15377 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 124.75-211 chr9 22203913 22204174 + 1 NA Intergenic Intergenic -194730 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 303.25-3 chr10 49346932 49347526 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 48059 NM_001135196 118461 Hs.585480 NM_199459 ENSG00000177354 C10orf71 CEFIP chromosome 10 open reading frame 71 protein-coding 127.25-168 chr5 65088756 65088937 + 1 NA Intergenic Intergenic 319916 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 187.5-168 chr8 80238139 80238420 + 1 NA Intergenic Intergenic -3110 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 265.25-22 chr18 6283383 6283969 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) MIRb|SINE|MIR 26932 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 260.75-53 chr6 7849042 7849394 + 1 NA intron (NM_001718, intron 2 of 6) intron (NM_001718, intron 2 of 6) 60859 NM_001145549 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 156.5-114 chr3 65517867 65518053 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -375856 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 192.25-4 chr1 166458152 166458380 + 1 NA Intergenic Intergenic 31773 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 161.5-102 chr2 127472133 127472401 + 1 NA Intergenic U4|snRNA|snRNA -48649 NR_039944 100616187 NR_039944 ENSG00000264075 MIR4783 - microRNA 4783 ncRNA 160.25-51 chr16 83461319 83461683 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) L3|LINE|CR1 -46845 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 189.25-45 chr17 39780156 39780355 + 1 NA intron (NM_001284514, intron 6 of 8) AluJr4|SINE|Alu -2030 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 229.25-15 chr12 13653655 13654013 + 1 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) intron (NM_000834, intron 4 of 12) -277089 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 173.5-28 chr11 15131456 15131761 + 1 NA intron (NM_001042536, intron 1 of 12) L1MEd|LINE|L1 16685 NM_001042536 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 134.5-137 chr3 133800947 133801186 + 1 NA intron (NM_021203, intron 1 of 7) intron (NM_021203, intron 1 of 7) -4749 NR_163491 58477 Hs.12152 NM_021203 ENSG00000144867 SRPRB APMCF1|SR-beta SRP receptor subunit beta protein-coding 159.5-196 chr7 91383024 91383301 + 1 NA Intergenic Intergenic 118729 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 126.5-197 chr5 130790353 130790539 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 374810 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 122.5-226 chr8 105491130 105491323 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 171683 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 112.5-39 chr11 105353575 105353750 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -213893 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 201.5-7 chr1 63046281 63046564 + 1 NA Intergenic Intergenic -33951 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 112.25-160 chr5 16326798 16327094 + 1 NA Intergenic Intergenic 114156 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 194.25-89 chr5 19911542 19911824 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -25411 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 155.25-112 chr22 28619412 28619751 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 60284 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 174.5-183 chr8 55815502 55815768 + 1 NA intron (NM_001317902, intron 10 of 10) intron (NM_001317902, intron 10 of 10) 42189 NM_001317902 96764 Hs.335068 NM_024831 ENSG00000137574 TGS1 NCOA6IP|PIMT|PIPMT trimethylguanosine synthase 1 protein-coding 125.25-31 chr10 115331320 115331477 + 1 NA intron (NM_207303, intron 18 of 28) L1MA6|LINE|L1 238033 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 186.75-96 chr6 51369113 51369334 + 1 NA Intergenic Intergenic -252647 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 186.5-86 chr3 3230320 3230563 + 1 NA Intergenic Intergenic -50724 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 171.5-93 chr20 62956734 62956939 + 1 NA exon (NM_022082, exon 2 of 13) exon (NM_022082, exon 2 of 13) 4127 NM_001302643 63910 Hs.512686 NM_022082 ENSG00000101194 SLC17A9 C20orf59|POROK8|VNUT solute carrier family 17 member 9 protein-coding 159.5-23 chr10 69149258 69149431 + 1 NA intron (NM_001318944, intron 3 of 9) L1MC4|LINE|L1 25166 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 280.75-3 chr1 77935225 77935705 + 1 NA intron (NM_001172309, intron 9 of 11) intron (NM_001172309, intron 9 of 11) 43607 NR_146539 8880 Hs.567380 NM_003902 ENSG00000162613 FUBP1 FBP|FUBP|hDH V far upstream element binding protein 1 protein-coding 231.5-94 chr7 87664878 87665262 + 1 NA intron (NM_001134406, intron 2 of 9) L1MA9|LINE|L1 36672 NM_138290 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 238.75-60 chr7 79005651 79006069 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -3128 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 182.5-135 chr5 113462968 113463275 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) L2b|LINE|L2 25332 NM_001085377 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 209.5-82 chr20 57668283 57668754 + 1 NA intron (NM_199171, intron 1 of 3) intron (NM_199171, intron 1 of 3) 22168 NM_001255976 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 117.5-116 chr2 152259461 152259637 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -75625 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 280.75-39 chr8 10838267 10839004 + 1 NA intron (NM_001284356, intron 1 of 5) MIR3|SINE|MIR 1240 NM_017884 54984 Hs.490991 NM_017884 ENSG00000254093 PINX1 Gno1|LPTL|LPTS|Pxr1 PIN2 (TERF1) interacting telomerase inhibitor 1 protein-coding 207.25-5 chr1 213801017 213801435 + 1 NA Intergenic Intergenic -123523 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 384.25-11 chr3 48166098 48166747 + 1 NA intron (NM_201567, intron 9 of 13) MIR|SINE|MIR 21995 NM_001789 993 Hs.437705 NM_001789 ENSG00000164045 CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25A protein-coding 143.75-189 chr8 113976228 113976445 + 1 NA Intergenic Intergenic -539397 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 214.5-45 chr18 11404773 11405132 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -49526 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 146.5-175 chr5 86818680 86818973 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 72008 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 113.5-25 chr1 216118362 216118555 + 1 NA intron (NM_206933, intron 21 of 71) intron (NM_206933, intron 21 of 71) 45993 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 205.25-50 chr2 71370582 71370882 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 8 of 27) L1MA2|LINE|L1 38950 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 207.75-2 chr1 48697169 48697405 + 1 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) intron (NR_136623, intron 5 of 12) 79604 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 314.75-18 chr7 48725804 48726305 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -198493 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 275.5-70 chr8 142606512 142606815 + 1 NA Intergenic Intergenic 7816 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 253.25-15 chr11 114480286 114480584 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 40968 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 162.5-30 chr12 1709477 1709688 + 1 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 18512 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 119.5-243 chr8 121885201 121885403 + 1 NA Intergenic Intergenic -243862 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 187.75-38 chr17 54020024 54020280 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 197225 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 132.5-111 chr2 35134387 35134601 + 1 NA Intergenic Intergenic -336911 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 163.75-98 chr3 184146851 184147215 + 1 NA Intergenic Intergenic -8344 NM_004423 1857 Hs.388116 NM_004423 ENSG00000161202 DVL3 DRS3 dishevelled segment polarity protein 3 protein-coding 277.5-8 chr10 63666608 63667009 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -144918 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 151.5-27 chr11 95160306 95160491 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 9859 NR_110303 101929295 Hs.735838 NR_110303 ENSG00000245552 LOC101929295 - uncharacterized LOC101929295 ncRNA 270.75-46 chr6 56037055 56037423 + 1 NA Intergenic Intergenic 54423 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 257.5-74 chr7 68653518 68653831 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 633421 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 184.75-57 chr2 209143382 209143746 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -280483 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 197.25-55 chr2 144421798 144422201 + 1 NA intron (NM_001171653, intron 3 of 8) intron (NM_001171653, intron 3 of 8) -88930 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 256.5-34 chr2 134195023 134195343 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -58889 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 373.75-13 chr8 87427492 87428043 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 446248 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 262.5-67 chr7 39805801 39806137 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 72401 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 297.5-7 chr10 52576640 52577010 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) -106292 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 214.5-31 chr14 48847106 48847599 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 739028 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 159.75-82 chr2 103621125 103621407 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -636837 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 177.5-155 chr6 148787730 148787931 + 1 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 40800 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 153.75-72 chr2 190309702 190309886 + 1 NA intron (NM_198047, intron 2 of 12) AluY|SINE|Alu 10032 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 248.75-7 chr10 104899530 104899955 + 1 NA intron (NM_014978, intron 2 of 26) intron (NM_014978, intron 2 of 26) -233526 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 257.5-34 chr2 130338387 130338671 + 1 NA non-coding (NR_104471, exon 6 of 6) non-coding (NR_104471, exon 6 of 6) 3579 NM_001321119 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 157.25-147 chr8 74349620 74349939 + 1 NA promoter-TSS (NM_001362931) promoter-TSS (NM_001362931) -604 NM_001362930 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 186.75-92 chr5 139050092 139050466 + 1 NA intron (NM_022464, intron 4 of 9) intron (NM_022464, intron 4 of 9) 148089 NM_001037633 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 190.25-86 chr3 110290415 110290659 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 687709 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 194.75-63 chr21 28810756 28811125 + 1 NA Intergenic Intergenic 74427 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 146.5-174 chr5 75137415 75137614 + 1 NA intron (NM_001164443, intron 16 of 24) intron (NM_001164443, intron 16 of 24) -84956 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 119.25-195 chr7 85080328 85080523 + 1 NA intron (NM_152754, intron 3 of 16) intron (NM_152754, intron 3 of 16) 41506 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 240.5-87 chr5 139946451 139946855 + 1 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) L1M4|LINE|L1 96646 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 211.25-46 chr20 7799383 7799660 + 1 NA Intergenic Intergenic 140937 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 184.5-25 chr11 41762347 41762655 + 1 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 47933 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 129.5-5 chr1 63563370 63563514 + 1 NA intron (NM_032437, intron 11 of 13) intron (NM_032437, intron 11 of 13) 14462 NR_002771 79469 Hs.659291 NR_002771 DLEU2L BCMSUNL deleted in lymphocytic leukemia 2 like ncRNA 122.5-104 chr2 31704273 31704433 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 99627 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 270.25-19 chr14 21810094 21810600 + 1 NA Intergenic Intergenic -139330 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 213.5-91 chr4 88637931 88638186 + 1 NA intron (NM_001318505, intron 3 of 8) L1PA8|LINE|L1 45578 NM_001318505 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 261.75-43 chr6 130416166 130416652 + 1 NA intron (NM_001258277, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 -4687 NM_001258278 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 179.5-147 chr5 50266382 50266732 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 174731 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 357.75-4 chr1 200654171 200654748 + 1 NA intron (NM_001031725, intron 4 of 7) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 12292 NM_001320182 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 151.25-97 chr2 199013726 199013903 + 1 NA Intergenic Intergenic 444125 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 124.75-65 chr12 116044364 116044637 + 1 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) intron (NM_015335, intron 4 of 30) 104154 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 125.5-173 chr3 68525057 68525302 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 3 of 4) intron (NM_001252216, intron 3 of 4) 24542 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 270.5-20 chr15 49423606 49424013 + 1 NA intron (NM_002009, intron 1 of 3) intron (NM_002009, intron 1 of 3) 567 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 167.25-139 chr7 16530458 16530777 + 1 NA intron (NM_001195280, intron 1 of 8) L1MC4a|LINE|L1 3792 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 142.75-62 chr14 66809426 66809603 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 302107 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 246.75-64 chr7 30468931 30469223 + 1 NA intron (NM_006092, intron 1 of 13) intron (NM_006092, intron 1 of 13) 9707 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 160.75-122 chr5 58586992 58587463 + 1 NA intron (NM_138453, intron 1 of 4) intron (NM_138453, intron 1 of 4) 4152 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 151.25-42 chr12 94782212 94782426 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -52079 NR_030171 574449 NR_030171 ENSG00000283998 MIR492 MIRN492|hsa-mir-492 microRNA 492 ncRNA 124.5-147 chr4 30478585 30478721 + 1 NA Intergenic Intergenic -241716 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 211.5-144 chr7 42812795 42813191 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 98850 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 243.5-60 chr5 3968169 3968527 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 372516 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 194.5-50 chr17 14118185 14118499 + 1 NA intron (NM_001303, intron 4 of 6) L1M6|LINE|L1 48838 NM_001303 1352 Hs.462278 NM_001303 ENSG00000006695 COX10 - cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10 protein-coding 233.5-48 chr19 50746609 50746924 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 23402 NM_002975 6320 Hs.512680 NM_002975 ENSG00000105472 CLEC11A CLECSF3|LSLCL|P47|SCGF C-type lectin domain containing 11A protein-coding 122.5-228 chr8 114228653 114228858 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -791816 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 129.5-51 chr12 19685048 19685265 + 1 NA Intergenic Intergenic 244557 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 343.5-18 chr6 17792882 17793355 + 1 NA intron (NM_001105566, intron 25 of 37) AluSz6|SINE|Alu 86075 NR_134618 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 370.5-21 chr8 139101219 139101767 + 1 NA Intergenic Intergenic -187452 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 158.75-56 chr14 63419969 63420239 + 1 NA intron (NR_104104, intron 3 of 12) intron (NR_104104, intron 3 of 12) 88134 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 146.5-237 chrX 78768124 78768409 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 20546 NM_005296 2846 Hs.522701 NM_005296 ENSG00000147145 LPAR4 GPR23|LPA4|P2RY9|P2Y5-LIKE|P2Y9 lysophosphatidic acid receptor 4 protein-coding 137.5-173 chr4 60694830 60694994 + 1 NA Intergenic Intergenic -227707 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 200.5-113 chr5 100513157 100513398 + 1 NA Intergenic Intergenic -22097 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 114.25-25 chr11 26495992 26496263 + 1 NA intron (NM_001313727, intron 1 of 23) intron (NM_001313727, intron 1 of 23) 22225 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 266.5-14 chr12 25803896 25804329 + 1 NA Intergenic Intergenic 69967 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 184.75-11 chr10 98752490 98752823 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) HAL1ME|LINE|L1 171912 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 131.75-218 chr8 117516126 117516339 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4481 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 139.5-97 chr2 66013450 66013612 + 1 NA Intergenic Intergenic 344797 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 130.5-174 chr3 128441237 128441476 + 1 NA Intergenic Intergenic -22238 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 215.25-103 chr7 116366640 116366989 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -80087 NR_130922 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 198.75-99 chr9 92441180 92441631 + 1 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) L1MC5|LINE|L1 -16851 NM_005014 4958 Hs.94070 NM_005014 ENSG00000127083 OMD OSAD|SLRR2C osteomodulin protein-coding 172.25-18 chr10 59391507 59391854 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -28499 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 234.5-14 chr11 114815037 114815317 + 1 NA Intergenic Intergenic 136650 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 138.75-91 chr2 78562272 78562556 + 1 NA intron (NR_136312, intron 3 of 3) intron (NR_136312, intron 3 of 3) 16883 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 260.5-45 chr4 142688652 142689058 + 1 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) LTR8|LTR|ERV1 157680 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 180.25-27 chr14 71247677 71248067 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -72604 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 227.75-6 chr1 113395030 113395328 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 4664 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 137.5-124 chr2 101781859 101782020 + 1 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 84232 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 171.25-67 chr19 7583444 7583808 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12237 NM_001080429 57662 Hs.17686 NM_020902 ENSG00000076826 CAMSAP3 KIAA1543|NEZHA|PPP1R80 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 3 protein-coding 169.5-159 chr7 35584164 35584396 + 1 NA Intergenic Intergenic 110855 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 197.5-18 chr11 24260639 24260980 + 1 NA Intergenic Intergenic -236244 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 139.5-106 chr2 147327504 147327767 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -516882 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 212.5-10 chr10 43028255 43028560 + 1 NA Intergenic Intergenic 30844 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 124.75-214 chr9 78957609 78957871 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 187926 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 123.75-184 chr8 69510907 69511182 + 1 NA intron (NR_156414, intron 2 of 20) intron (NR_156414, intron 2 of 20) 18197 NR_156415 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 202.25-43 chr20 34805391 34805633 + 1 NA intron (NM_014071, intron 1 of 14) L1MA5|LINE|L1 16127 NM_001318240 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 133.5-273 chr8 140964612 140964762 + 1 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) AluJb|SINE|Alu 36317 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 173.5-43 chr15 56395425 56395611 + 1 NA intron (NM_198524, intron 9 of 12) L1MB8|LINE|L1 30094 NM_198524 374618 Hs.511476 NM_198524 ENSG00000151575 TEX9 - testis expressed 9 protein-coding 193.5-72 chr18 5075023 5075505 + 1 NA Intergenic Intergenic -5918 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 121.75-176 chr7 34768009 34768185 + 1 NA intron (NR_015356, intron 2 of 4) L1MA5A|LINE|L1 -9825 NR_033665 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 210.5-25 chr12 56525177 56525453 + 1 NA intron (NM_002898, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 3495 NM_002898 5939 Hs.505729 NM_002898 ENSG00000076067 RBMS2 SCR3 RNA binding motif single stranded interacting protein 2 protein-coding 214.5-62 chr2 141669654 141669893 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 461928 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 177.25-55 chr17 14983135 14983424 + 1 NA Intergenic Intergenic -31526 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 138.75-146 chr5 56099836 56099995 + 1 NA 3' UTR (NM_024669, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_024669, exon 12 of 12) 104748 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 221.5-49 chr2 136194333 136194622 + 1 NA Intergenic Helitron2Na_Mam|RC?|Helitron? -76322 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 184.5-14 chr1 175109598 175110068 + 1 NA intron (NM_022093, intron 9 of 18) L1PB3|LINE|L1 42000 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 264.75-5 chr1 192178448 192178769 + 1 NA intron (NM_130782, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 20146 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 210.75-25 chr14 50780631 50781142 + 1 NA intron (NM_016350, intron 5 of 28) intron (NM_016350, intron 5 of 28) -40911 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 305.75-16 chr3 10983461 10984067 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -8970 NM_001348253 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 147.5-26 chr10 82451972 82452262 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -219197 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 217.5-6 chr1 155736578 155736996 + 1 NA intron (NM_001199850, intron 10 of 11) intron (NM_001199850, intron 10 of 11) -8981 NR_024117 100129405 Hs.656361 NR_024117 MSTO2P MSTO2 misato family member 2, pseudogene pseudo 115.5-51 chr13 74131178 74131325 + 1 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) intron (NM_007249, intron 1 of 7) 2678 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 128.75-199 chr8 103176027 103176280 + 1 NA intron (NM_001024372, intron 1 of 1) intron (NM_001024372, intron 1 of 1) -4013 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 163.75-122 chr7 79344237 79344401 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 -108638 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 266.75-27 chr2 121143098 121143427 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 141940 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 157.25-96 chr3 107738060 107738281 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 7 of 16) intron (NM_001276286, intron 7 of 16) 139898 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 185.5-37 chr12 103712660 103713065 + 1 NA intron (NM_017564, intron 41 of 68) intron (NM_017564, intron 41 of 68) 125589 NM_017564 55576 Hs.408249 NM_017564 ENSG00000136011 STAB2 FEEL2|FELE-2|FELL2|FEX2|HARE|SCARH1 stabilin 2 protein-coding 156.5-68 chr18 75932889 75933145 + 1 NA Intergenic Intergenic -189981 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 155.5-121 chr3 28330733 28331083 + 1 NA TTS (NM_001134433) TTS (NM_001134433) -17813 NM_001040432 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 154.5-167 chr6 152556540 152556852 + 1 NA intron (NM_182961, intron 3 of 145) L1M4c|LINE|L1 80155 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 191.75-114 chr7 6351298 6351504 + 1 NA Intergenic Intergenic -2434 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 230.25-46 chr2 160875401 160875796 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -261357 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 114.5-54 chr11 89486085 89486277 + 1 NA intron (NM_001291929, intron 1 of 16) intron (NM_001291929, intron 1 of 16) 4579 NM_001291929 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 162.25-110 chr4 19231940 19232156 + 1 NA Intergenic Intergenic -1019857 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 150.75-6 chr1 36896737 36896946 + 1 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) L1MA2|LINE|L1 137674 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 135.25-27 chr10 61247630 61247818 + 1 NA Intergenic Intergenic -204915 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-35 chr11 123400662 123401108 + 1 NA intron (NM_001367419, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR -19373 NR_039714 100616319 NR_039714 ENSG00000265357 MIR4493 - microRNA 4493 ncRNA 126.25-155 chr5 53074329 53074515 + 1 NA non-coding (NR_073107, exon 20 of 29) non-coding (NR_073107, exon 20 of 29) 35335 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 193.5-128 chr5 13783410 13783748 + 1 NA intron (NM_001369, intron 52 of 78) intron (NM_001369, intron 52 of 78) 160901 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 159.5-25 chr10 113907967 113908312 + 1 NA intron (NM_198514, intron 10 of 10) L2c|LINE|L2 53478 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 300.75-4 chr1 219362449 219362991 + 1 NA Intergenic Intergenic 187751 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 191.5-26 chr11 122870726 122871066 + 1 NA intron (NM_019604, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu 8565 NM_001304782 56253 Hs.159523 NM_019604 ENSG00000109943 CRTAM CD355 cytotoxic and regulatory T cell molecule protein-coding 118.5-116 chr20 59144813 59144994 + 1 NA Intergenic Intergenic -46117 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 127.5-16 chr1 188732401 188732592 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 1288868 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 274.25-26 chr2 23958024 23958429 + 1 NA intron (NM_181713, intron 1 of 6) intron (NM_181713, intron 1 of 6) 17763 NM_181713 165324 Hs.591576 NM_181713 ENSG00000173960 UBXN2A UBXD4 UBX domain protein 2A protein-coding 233.75-41 chr2 137732174 137732490 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 195600 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 149.75-171 chr8 127855528 127855768 + 1 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 59686 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 258.5-52 chr3 191422694 191422998 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -2678 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 161.5-49 chr13 22475035 22475236 + 1 NA Intergenic Intergenic 264850 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 131.75-224 chr9 73961144 73961393 + 1 NA Intergenic Intergenic -410263 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 141.5-208 chr7 28255974 28256224 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -43222 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 227.25-10 chr1 224560639 224561070 + 1 NA intron (NR_136295, intron 2 of 7) MER1A|DNA|hAT-Charlie -55463 NM_001322305 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 309.5-36 chr5 83298356 83298936 + 1 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) L1MEd|LINE|L1 -173028 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 121.5-174 chr3 35981328 35981665 + 1 NA Intergenic Intergenic 237020 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 166.25-88 chr2 212493877 212494148 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) (ATTCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 44616 NM_001042599 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 144.75-150 chr6 149272106 149272287 + 1 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) intron (NM_001292035, intron 2 of 6) -14645 NR_149096 105378049 Hs.615624 NR_149096 ENSG00000225924 TAB2-AS1 - TAB2 antisense RNA 1 ncRNA 193.5-141 chr6 47729545 47730087 + 1 NA Intergenic Intergenic 31236 NM_153838 221393 Hs.150131 NM_153838 ENSG00000153294 ADGRF4 GPR115|PGR18 adhesion G protein-coupled receptor F4 protein-coding 344.5-4 chr10 78792419 78792841 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 274818 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 347.75-11 chr5 180003048 180003746 + 1 NA intron (NM_001280801, intron 3 of 7) intron (NM_001280801, intron 3 of 7) 12000 NR_029885 442908 NR_029885 ENSG00000198995 MIR340 MIRN340|hsa-mir-340|mir-340 microRNA 340 ncRNA 191.5-64 chr18 11728452 11728781 + 1 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) -22856 NM_001142339 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 171.5-25 chr11 93448810 93449134 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 94419 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 128.5-154 chr3 134122713 134122918 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -65167 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 282.25-27 chr5 32679407 32679845 + 1 NA Intergenic Intergenic -11246 NM_001364458 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 148.5-85 chr17 47167529 47167714 + 1 NA intron (NR_148340, intron 2 of 16) MER21B|LTR|ERVL 21674 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 158.75-143 chr5 161355449 161355690 + 1 NA intron (NM_000813, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 192555 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 240.5-43 chr17 76326462 76326925 + 1 NA intron (NM_001366236, intron 7 of 9) L1MC4|LINE|L1 -19013 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 120.5-159 chr4 53847656 53847891 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 139509 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 134.5-176 chr5 86649127 86649311 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 28713 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 249.75-20 chr14 84707055 84707481 + 1 NA Intergenic Intergenic -564664 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 280.5-59 chrX 33844743 33845274 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 287322 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 321.75-34 chr8 103359224 103359746 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -12053 NM_138455 115908 Hs.405614 NM_138455 ENSG00000164932 CTHRC1 - collagen triple helix repeat containing 1 protein-coding 185.5-63 chr16 7700737 7701099 + 1 NA intron (NM_145893, intron 12 of 13) intron (NM_145893, intron 12 of 13) 368073 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 172.5-177 chr7 7871267 7871489 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) 97374 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 124.5-118 chr2 236536949 236537255 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29567 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 253.5-39 chr2 57883563 57883967 + 1 NA Intergenic Intergenic -23886 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 206.5-145 chr9 29971944 29972292 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 436336 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 218.75-73 chr5 163129614 163130000 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -307764 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 197.25-107 chr9 97327445 97327885 + 1 NA intron (NM_001348010, intron 16 of 20) MIRb|SINE|MIR 20006 NM_020893 100499483 Hs.435629 NM_020893 ENSG00000197816 CCDC180 C9orf174 coiled-coil domain containing 180 protein-coding 139.75-158 chr6 107780259 107780462 + 1 NA intron (NM_198081, intron 1 of 7) intron (NM_198081, intron 1 of 7) 43953 NM_001286408 256380 Hs.486109 NM_198081 ENSG00000146285 SCML4 dJ47M23.1 Scm polycomb group protein like 4 protein-coding 142.5-188 chr6 71205388 71205622 + 1 NA Intergenic Intergenic -83306 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 205.25-83 chr5 56642209 56642437 + 1 NA Intergenic Intergenic -36067 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 215.25-84 chr5 101860690 101861047 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 435416 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 167.5-92 chr2 104988777 104989114 + 1 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) intron (NR_110603, intron 1 of 2) -49124 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 124.25-96 chr2 52211706 52211952 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 -158819 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 158.5-9 chr1 182675347 182675544 + 1 NA Intergenic Intergenic -2513 NM_001102450 85397 Hs.20982 NM_033345 ENSG00000135824 RGS8 - regulator of G protein signaling 8 protein-coding 180.25-28 chr14 73613236 73613428 + 1 NA intron (NM_001365788, intron 1 of 2) intron (NM_001365788, intron 1 of 2) 815 NM_001365788 641372 Hs.122038 NM_001037162 ENSG00000205669 ACOT6 C14orf42|c14_5530 acyl-CoA thioesterase 6 protein-coding 263.75-14 chr14 82891681 82892002 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 249209 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 161.5-94 chr2 35469559 35469796 + 1 NA Intergenic Intergenic -1728 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 120.25-62 chr14 59974079 59974284 + 1 NA intron (NR_075071, intron 12 of 32) intron (NR_075071, intron 12 of 32) 54468 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 153.5-21 chr10 60485434 60485605 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 87437 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 223.25-4 chr1 88893672 88894000 + 1 NA Intergenic Intergenic -2269 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 124.5-14 chr1 150291083 150291277 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2662 NM_031901 54460 Hs.405880 NM_018997 ENSG00000266472 MRPS21 MDS016|MRP-S21|RPMS21 mitochondrial ribosomal protein S21 protein-coding 247.75-43 chr4 77883480 77883931 + 1 NA intron (NM_020236, intron 3 of 8) AluJb|SINE|Alu 20875 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 260.5-67 chr8 126613492 126613970 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -55253 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 134.5-52 chr13 78504871 78505075 + 1 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -91149 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 121.25-12 chr1 198842185 198842482 + 1 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) 16649 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 264.25-40 chr4 90185540 90185980 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) -49271 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 164.75-145 chr8 102568003 102568367 + 1 NA Intergenic Intergenic 16596 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 377.25-5 chr14 61823609 61824214 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) 11208 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 243.75-45 chr2 237955518 237955887 + 1 NA Intergenic CpG -11243 NR_103498 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 141.75-79 chr18 10359473 10359649 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 54809 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 171.5-74 chr2 54985727 54985938 + 1 NA intron (NM_020532, intron 4 of 8) intron (NM_020532, intron 4 of 8) 24440 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 301.75-25 chr3 159753921 159754265 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 14519 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 283.5-61 chr9 73145838 73146182 + 1 NA Intergenic Intergenic -5855 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 190.5-35 chr12 58715252 58715676 + 1 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 66252 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 148.5-162 chr4 35821077 35821262 + 1 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 422770 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 140.5-103 chr2 31241842 31241988 + 1 NA intron (NM_014600, intron 1 of 5) intron (NM_014600, intron 1 of 5) 7763 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 232.5-52 chr2 101837977 101838454 + 1 NA intron (NM_145686, intron 9 of 30) MER5A|DNA|hAT-Charlie 140508 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 208.5-28 chr12 22073594 22073825 + 1 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 27491 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 112.75-15 chr1 214163310 214163505 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -117752 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 119.5-161 chr3 190445991 190446146 + 1 NA intron (NM_207316, intron 2 of 4) intron (NM_207316, intron 2 of 4) 3808 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 210.5-114 chr6 129163337 129163676 + 1 NA intron (NM_000426, intron 8 of 64) AluSx1|SINE|Alu 280365 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 115.5-193 chr4 168964314 168964496 + 1 NA Intergenic Intergenic 45850 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 178.25-65 chr2 112627311 112627633 + 1 NA Intergenic Intergenic 16708 NR_033871 400999 Hs.585221 NR_033871 FLJ42351 - uncharacterized LOC400999 ncRNA 258.75-5 chr10 18305149 18305491 + 1 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) -35389 NM_201590 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 161.5-31 chr11 31965866 31966148 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 75311 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 335.5-6 chr2 51193856 51194277 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1PA11|LINE|L1 161465 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 295.75-14 chr2 163485248 163485765 + 1 NA Intergenic Intergenic 250502 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 260.75-13 chr14 52149075 52149423 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -80190 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 144.75-83 chr2 38226598 38226835 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 95611 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 113.5-88 chr15 69495455 69495627 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 42723 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 371.5-15 chr6 131846667 131847347 + 1 NA intron (NM_006208, intron 1 of 24) MIR3|SINE|MIR 38987 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 185.5-154 chr7 81535631 81535836 + 1 NA intron (NR_136264, intron 3 of 4) LTR1F2|LTR|ERV1 26086 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 122.5-220 chr8 75974197 75974434 + 1 NA Intergenic Intergenic -432339 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 223.75-44 chr2 49703919 49704201 + 1 NA Intergenic Intergenic 270143 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 229.25-41 chr2 30822082 30822348 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -14769 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 181.75-141 chr9 101856379 101856604 + 1 NA Intergenic Intergenic -117911 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 172.25-129 chr6 163649476 163649665 + 1 NA Intergenic Intergenic 21914 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 187.25-61 chr2 160359597 160359836 + 1 NA intron (NM_002897, intron 2 of 13) intron (NM_002897, intron 2 of 13) 48166 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 173.5-39 chr14 49283955 49284327 + 1 NA Intergenic Intergenic 302239 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 366.5-7 chr15 79520040 79520748 + 1 NA Intergenic Intergenic 87878 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 138.75-157 chr5 133348138 133348303 + 1 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 79486 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 238.25-81 chr7 42530628 42530886 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 175690 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 216.25-38 chr15 71915136 71915352 + 1 NA intron (NM_006901, intron 19 of 41) intron (NM_006901, intron 19 of 41) 104690 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 247.5-82 chr8 50805848 50806249 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 641917 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 115.75-172 chr5 118140660 118140824 + 1 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 -141832 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 246.75-3 chr1 46080369 46080696 + 1 NA intron (NM_001328653, intron 1 of 8) FRAM|SINE|Alu 50141 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 182.75-49 chr15 55805241 55805626 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -62281 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 218.5-97 chr5 30157494 30157767 + 1 NA Intergenic Intergenic 277070 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 213.75-4 chr1 75563573 75563985 + 1 NA intron (NM_152697, intron 1 of 23) intron (NM_152697, intron 1 of 23) 47335 NM_001130058 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 191.25-118 chrX 64877750 64878261 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 98445 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 114.25-106 chr2 175943501 175943635 + 1 NA intron (NM_001305009, intron 9 of 13) L1MEc|LINE|L1 58699 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 173.25-2 chr1 62736278 62736451 + 1 NA Intergenic Intergenic -47742 NM_178221 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 142.25-7 chr1 192749262 192749429 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 33017 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 170.5-123 chr3 130370127 130370450 + 1 NA intron (NM_001278298, intron 1 of 40) intron (NM_001278298, intron 1 of 40) 24772 NM_001278298 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 167.75-54 chr16 72724828 72725138 + 1 NA Intergenic Intergenic -60013 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 204.25-112 chr7 82032548 82032773 + 1 NA intron (NM_000722, intron 12 of 38) intron (NM_000722, intron 12 of 38) 23483 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 144.5-59 chr14 45469087 45469335 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -216009 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 315.5-7 chr15 47120860 47121350 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -62984 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 211.5-79 chr2 100240424 100240673 + 1 NA intron (NR_103730, intron 1 of 2) intron (NR_103730, intron 1 of 2) 32294 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 350.75-14 chr8 137704835 137705490 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -291574 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 245.5-24 chr14 71691350 71691695 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 14 of 24) AluJr|SINE|Alu 105224 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 224.5-32 chr14 24105540 24105963 + 1 NA intron (NM_006177, intron 1 of 3).2 AluSx1|SINE|Alu -8946 NM_001163484 80344 Hs.525251 NM_025230 ENSG00000100897 DCAF11 GL014|PRO2389|WDR23 DDB1 and CUL4 associated factor 11 protein-coding 173.5-14 chr1 242077452 242077688 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -78472 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 236.25-81 chr7 95816350 95816713 + 1 NA intron (NM_001135557, intron 4 of 15) intron (NM_001135557, intron 4 of 15) 44025 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 233.25-79 chr9 96466314 96466808 + 1 NA intron (NM_014282, intron 4 of 7) intron (NM_014282, intron 4 of 7) 16392 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 147.5-159 chr4 31901457 31901715 + 1 NA Intergenic Intergenic -95793 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 130.75-195 chr8 119050631 119050828 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -16518 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 222.5-70 chr3 185484693 185485016 + 1 NA 3' UTR (NM_001242314, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001242314, exon 15 of 15) 14181 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 189.5-17 chr1 230301777 230302002 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 124443 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 247.75-54 chr6 89151859 89152268 + 1 NA intron (NM_001010853, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 6008 NM_001010853 135293 Hs.356247 NM_001010853 ENSG00000146281 PM20D2 ACY1L2 peptidase M20 domain containing 2 protein-coding 223.5-90 chr4 94347471 94347838 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4818 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 246.25-25 chr17 35255603 35255987 + 1 NA intron (NM_144975, intron 1 of 4) L1ME3D|LINE|L1 12723 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 171.25-134 chr6 55386626 55386917 + 1 NA intron (NM_207410, intron 6 of 8) intron (NM_207410, intron 6 of 8) 59302 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 181.25-119 chr6 157349991 157350275 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -25874 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 155.5-67 chr17 43757343 43757676 + 1 NA intron (NM_025237, intron 1 of 1) intron (NM_025237, intron 1 of 1) 1282 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 221.75-6 chr1 92941820 92942235 + 1 NA intron (NM_001006605, intron 1 of 4) intron (NM_001006605, intron 1 of 4) 19435 NM_001006605 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 150.5-45 chr13 99283071 99283273 + 1 NA intron (NR_026644, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 24227 NM_004951 1880 Hs.784 NM_004951 ENSG00000169508 GPR183 EBI2|hEBI2 G protein-coupled receptor 183 protein-coding 149.25-37 chr12 122119832 122120122 + 1 NA intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 41221 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 126.25-101 chr20 56789372 56789570 + 1 NA Intergenic Intergenic 160165 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 112.5-180 chr4 65282105 65282242 + 1 NA Intergenic Intergenic -277673 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 253.5-53 chr3 141581979 141582520 + 1 NA intron (NM_006506, intron 17 of 23) intron (NM_006506, intron 17 of 23) -80950 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 202.25-59 chr4 100788201 100788500 + 1 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -113237 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 257.25-54 chr7 106749280 106749802 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -88383 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 209.5-42 chr14 46649555 46649883 + 1 NA Intergenic Intergenic 2062 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 147.5-103 chr2 104739768 104740054 + 1 NA Intergenic Intergenic 17808 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 167.75-27 chr10 106349166 106349435 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 209135 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 160.5-189 chr8 91554976 91555211 + 1 NA Intergenic Intergenic 305774 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 209.5-77 chr20 2004367 2004643 + 1 NA intron (NR_134520, intron 3 of 3) intron (NR_134520, intron 3 of 3) -10220 NM_001190899 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 162.75-137 chr7 109610951 109611303 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 349086 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 195.25-86 chr7 111999874 112000119 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 3 of 52) intron (NM_001363540, intron 3 of 52) 191491 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 301.25-25 chr5 81014685 81015276 + 1 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) AluJb|SINE|Alu -54073 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 201.75-13 chr10 84371710 84372080 + 1 NA exon (NM_001284240, exon 2 of 10) exon (NM_001284240, exon 2 of 10) 43306 NM_018999 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 117.5-218 chr7 38000649 38000807 + 1 NA Intergenic Intergenic 79409 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 197.75-68 chr5 50178206 50178437 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 262967 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 181.5-85 chr2 125210486 125210835 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 907325 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 148.25-92 chr3 31600664 31600979 + 1 NA intron (NM_178862, intron 5 of 15) intron (NM_178862, intron 5 of 15) 67896 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 147.75-127 chr5 57291170 57291348 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 77185 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 219.75-17 chr12 28316977 28317224 + 1 NA intron (NM_001352084, intron 6 of 11) HAL1M8|LINE|L1 -126362 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 215.5-35 chr15 60405106 60405344 + 1 NA Intergenic Intergenic -7239 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 160.5-152 chr5 138539732 138539937 + 1 NA intron (NM_001291975, intron 2 of 11) intron (NM_001291975, intron 2 of 11) 1877 NM_001282185 2107 Hs.483494 NM_004730 ENSG00000120705 ETF1 D5S1995|ERF|ERF1|RF1|SUP45L1|TB3-1 eukaryotic translation termination factor 1 protein-coding 221.25-67 chr5 4690868 4691126 + 1 NA Intergenic Intergenic -82484 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 223.75-5 chr1 216508855 216509251 + 1 NA intron (NM_001243518, intron 7 of 7) intron (NM_001243518, intron 7 of 7) -85605 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 138.5-173 chr6 88428678 88428887 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 110587 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 131.75-74 chr15 35168337 35168498 + 1 NA Intergenic Intergenic -68909 NR_003144 723972 Hs.631698 NR_003144 ENSG00000259516 ANP32AP1 - acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A pseudogene 1 pseudo 190.75-20 chr12 41321811 41322018 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -115825 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 173.5-55 chr17 59061691 59061998 + 1 NA intron (NR_148346, intron 11 of 23) intron (NR_148346, intron 11 of 23) 45036 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 177.5-165 chr8 14677815 14678168 + 1 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) L1MC1|LINE|L1 175519 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 219.25-23 chr13 113100089 113100357 + 1 NA TTS (NM_001112732) TTS (NM_001112732) -5565 NM_000131 2155 Hs.36989 NM_000131 ENSG00000057593 F7 SPCA coagulation factor VII protein-coding 214.5-49 chr2 15394587 15394829 + 1 NA intron (NR_052013, intron 27 of 50) intron (NR_052013, intron 27 of 50) 166626 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 294.25-8 chr12 1743873 1744324 + 1 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 53028 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 123.75-3 chr1 24157091 24157331 + 1 NA exon (NM_170743, exon 7 of 7) exon (NM_170743, exon 7 of 7) -14071 NM_021258 58985 Hs.110915 NM_021258 ENSG00000142677 IL22RA1 CRF2-9|IL22R|IL22R1 interleukin 22 receptor subunit alpha 1 protein-coding 164.5-201 chr8 52424696 52424910 + 1 NA Intergenic Intergenic -14924 NM_001352837 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 206.5-50 chr2 74074843 74075091 + 1 NA intron (NM_001287491, intron 5 of 11) AluY|SINE|Alu 72275 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 321.75-30 chr6 34320725 34321057 + 1 NA intron (NM_001202470, intron 6 of 8) intron (NM_001202470, intron 6 of 8) 71778 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 187.25-41 chr17 58282810 58283305 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2122 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 135.5-72 chr16 60459640 60459838 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -99946 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 205.5-143 chr8 26798982 26799244 + 1 NA intron (NM_001322504, intron 1 of 1) intron (NM_001322504, intron 1 of 1) 66542 NM_033303 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 276.75-40 chr5 64584432 64584823 + 1 NA intron (NM_001271891, intron 1 of 3) intron (NM_001271891, intron 1 of 3) 8977 NM_001271891 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 197.5-8 chr1 179161550 179161994 + 1 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -18696 NM_001136000 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 369.5-15 chr2 33414411 33415119 + 1 NA Intergenic Intergenic -3751 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 207.25-96 chr8 101494159 101494504 + 1 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) intron (NM_001330593, intron 1 of 15) 1892 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 188.5-130 chr6 35780136 35780362 + 1 NA promoter-TSS (NM_001010886) promoter-TSS (NM_001010886) -770 NM_001010886 340204 Hs.131296 NM_001010886 ENSG00000204140 CLPSL1 C6orf127|ESP32|dJ510O8.6 colipase like 1 protein-coding 205.75-84 chr8 102487444 102487873 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -63931 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 320.5-52 chr9 117494472 117494850 + 1 NA Intergenic Intergenic -79604 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 241.5-24 chr14 68979897 68980413 + 1 NA promoter-TSS (NM_001130004) promoter-TSS (NM_001130004) 473 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 193.5-139 chr5 167842998 167843373 + 1 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 88256 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 239.5-27 chr14 62922693 62923062 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) L1MA9|LINE|L1 122581 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 180.25-41 chr17 79474804 79475180 + 1 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 41156 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 171.25-46 chr14 75808195 75808568 + 1 NA intron (NM_015072, intron 27 of 31) intron (NM_015072, intron 27 of 31) 147135 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 117.5-112 chr2 125666290 125666472 + 1 NA Intergenic Intergenic 451604 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 119.5-87 chr15 70327797 70327955 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 178052 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 211.25-47 chr20 31424490 31424743 + 1 NA intron (NR_045677, intron 2 of 2) MIR3|SINE|MIR 4564 NR_045677 245935 Hs.526624 NR_002577 ENSG00000204547 DEFB122 DEFB-22|DEFB122P|DEFB22 defensin beta 122 (pseudogene) pseudo 203.25-4 chr1 70787124 70787463 + 1 NA TTS (NR_125938) TTS (NR_125938) 80840 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 134.75-93 chr18 2990050 2990261 + 1 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) L1MB4|LINE|L1 21792 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 148.5-131 chr22 20466997 20467216 + 1 NA intron (NR_033825, intron 2 of 5) LTR42|LTR|ERVL 28689 NR_033825 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 298.75-26 chr4 14736541 14736977 + 1 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) L1PREC2|LINE|L1 151410 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 173.75-29 chr10 108966009 108966313 + 1 NA Intergenic Intergenic -896868 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 164.5-161 chr5 41671955 41672227 + 1 NA Intergenic Intergenic -161490 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 165.25-144 chr8 141103124 141103316 + 1 NA Intergenic Intergenic -25369 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 242.75-33 chr2 139772279 139772543 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 814274 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 179.25-35 chr11 90988513 90988791 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -119450 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 164.75-49 chr14 58849397 58849776 + 1 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 21298 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 170.5-189 chr8 112021623 112021894 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -621735 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 218.25-32 chr16 58587460 58587787 + 1 NA intron (NM_206999, intron 4 of 30) intron (NM_206999, intron 4 of 30) -27692 NR_002980 677830 Hs.677515 NR_002980 ENSG00000281910 SNORA50A ACA50|SNORA50|SNORA76A small nucleolar RNA, H/ACA box 50A snoRNA 212.25-31 chr15 63722296 63722666 + 1 NA intron (NM_003922, intron 19 of 77) MER44D|DNA|TcMar-Tigger 111467 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 216.75-29 chr17 13679617 13679988 + 1 NA Intergenic Intergenic -77873 NM_006042 9955 Hs.462270 NM_006042 ENSG00000153976 HS3ST3A1 3-OST-3A|3OST3A1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3A1 protein-coding 150.5-86 chr2 35970437 35970765 + 1 NA Intergenic Intergenic 384969 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 263.75-16 chr15 33865063 33865378 + 1 NA exon (NM_001036, exon 104 of 104) exon (NM_001036, exon 104 of 104) -103277 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 113.5-9 chr1 102041170 102041463 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -44082 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 129.5-119 chr2 67958626 67958815 + 1 NA Intergenic MER70B|LTR|ERVL 104284 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 313.5-39 chr8 144261265 144261677 + 1 NA TTS (NM_015201) TTS (NM_015201) 1266 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 198.75-89 chr7 27128453 27128744 + 1 NA TTS (NM_002141) TTS (NM_002141) -1578 NM_153631 3200 Hs.659337 NM_030661 ENSG00000105997 HOXA3 HOX1|HOX1E homeobox A3 protein-coding 123.25-124 chr21 30134358 30134523 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 32365 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 328.5-26 chr4 69788286 69788822 + 1 NA Intergenic Intergenic -27934 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 189.5-62 chr18 10817282 10817510 + 1 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) intron (NM_022068, intron 7 of 51) -57747 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 237.5-59 chr20 23644506 23644834 + 1 NA Intergenic Intergenic -6715 NM_000099 1471 Hs.304682 NM_000099 ENSG00000101439 CST3 ARMD11|HEL-S-2 cystatin C protein-coding 209.75-89 chr7 18228554 18228873 + 1 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -61379 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 186.25-44 chr17 54847618 54847942 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -52911 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 272.5-22 chr13 61540680 61541096 + 1 NA Intergenic Intergenic -112942 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 170.5-25 chr10 56763588 56763859 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -402450 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 197.75-8 chr10 87554956 87555230 + 1 NA Intergenic Intergenic 47260 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 125.5-51 chr12 15420906 15421092 + 1 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1MC5a|LINE|L1 98491 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 306.75-22 chr6 113083388 113084115 + 1 NA Intergenic Intergenic 349696 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 129.25-215 chr9 27875134 27875348 + 1 NA Intergenic Intergenic -301375 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 246.5-21 chr14 25842770 25843130 + 1 NA Intergenic Intergenic 710480 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 287.5-22 chr15 63236584 63237030 + 1 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 -40743 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 207.25-26 chr15 49268094 49268367 + 1 NA intron (NM_001289030, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 97983 NR_147895 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 124.5-175 chr5 129488493 129488753 + 1 NA intron (NM_133638, intron 2 of 22) intron (NM_133638, intron 2 of 22) -27934 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-100 chr22 48012555 48012901 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -261636 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 203.75-59 chr2 76264799 76265116 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -554042 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 174.25-80 chr2 117675114 117675314 + 1 NA Intergenic Intergenic -139477 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 200.5-108 chr5 13204744 13205079 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -172025 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 200.75-82 chr5 11052366 11052776 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) MER110A|LTR|ERV1 -291337 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 156.5-91 chr2 191170237 191170520 + 1 NA Intergenic Intergenic -18782 NM_001243835 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 233.5-23 chr11 26846306 26846655 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -124420 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 150.25-84 chr2 195908427 195908690 + 1 NA intron (NM_018897, intron 25 of 64) L1MA4A|LINE|L1 160279 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 123.5-154 chr4 126496012 126496219 + 1 NA Intergenic Intergenic 988856 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 178.75-111 chr8 103653251 103653511 + 1 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) intron (NM_001348488, intron 3 of 25) -151471 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 245.75-35 chr3 7948425 7948844 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 67673 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 167.5-30 chr10 131421427 131421663 + 1 NA Intergenic Intergenic -109824 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 161.5-133 chr3 68856962 68857217 + 1 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) intron (NM_001005527, intron 3 of 5) 75458 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 284.5-3 chr1 173362167 173362630 + 1 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) intron (NR_037845, intron 2 of 2) 98964 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 231.75-30 chr18 77922858 77923199 + 1 NA Intergenic Intergenic 70699 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 279.5-56 chr6 27268665 27269124 + 1 NA Intergenic Intergenic 21193 NM_005865 10279 Hs.274407 NM_005865 ENSG00000112812 PRSS16 TSSP serine protease 16 protein-coding 129.25-134 chr3 178354097 178354376 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -64965 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 138.75-67 chr16 70282605 70282814 + 1 NA exon (NM_001605, exon 2 of 21) exon (NM_001605, exon 2 of 21) 6800 NM_001605 16 Hs.315137 NM_001605 ENSG00000090861 AARS CMT2N|EIEE29 alanyl-tRNA synthetase protein-coding 132.75-88 chr18 69520412 69520726 + 1 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 50638 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 188.25 chr1 70019110 70019349 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 15 of 26) intron (NM_001370785, intron 15 of 26) 99907 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 170.75-112 chr5 158330294 158330550 + 1 NA intron (NR_109888, intron 5 of 6) L1MC2|LINE|L1 79351 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 222.5-29 chr13 51100673 51100942 + 1 NA intron (NR_102432, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 10421 NM_001351589 647166 Hs.195052 NM_001351589 ENSG00000226792 C13orf42 LINC00371|LINC00372 chromosome 13 open reading frame 42 protein-coding 143.5-66 chr14 57318377 57318596 + 1 NA Intergenic Intergenic 49515 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 176.5-93 chr2 89846459 89846702 + 1 NA Intergenic Intergenic -208673 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 158.5-18 chr10 35326252 35326508 + 1 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) intron (NM_181698, intron 3 of 11) -10129 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 198.75-82 chr6 23618534 23618965 + 1 NA Intergenic Intergenic -507466 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 193.5-60 chr16 61644398 61644637 + 1 NA Intergenic Intergenic 391921 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 157.25-57 chr17 59037624 59037893 + 1 NA intron (NR_148346, intron 17 of 23) L1MC3|LINE|L1 69122 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 219.5-13 chr1 246330679 246330952 + 1 NA intron (NM_022743, intron 3 of 11) intron (NM_022743, intron 3 of 11) 86597 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 223.25-2 chr1 69285428 69285852 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -147615 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 150.25-104 chr3 109899509 109899748 + 1 NA Intergenic Intergenic 296800 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 121.5-195 chr4 83512057 83512250 + 1 NA Intergenic Intergenic -23761 NM_001256422 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 201.25-29 chr12 112954029 112954467 + 1 NA intron (NM_006187, intron 7 of 15) L1PA5|LINE|L1 15774 NM_006187 4940 Hs.528634 NM_006187 ENSG00000111331 OAS3 p100|p100OAS 2'-5'-oligoadenylate synthetase 3 protein-coding 270.5-19 chr15 26018770 26019199 + 1 NA intron (NR_040082, intron 2 of 4) MER57A1|LTR|ERV1 -96829 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 161.25-133 chr4 62133127 62133435 + 1 NA intron (NR_110595, intron 3 of 7) L1MA9|LINE|L1 28484 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 127.5-18 chr1 207627907 207628098 + 1 NA intron (NM_000573, intron 37 of 38) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -17131 NM_175710 1379 Hs.628568 NM_175710 ENSG00000197721 CR1L - complement C3b/C4b receptor 1 like protein-coding 299.25-6 chr1 237232486 237232982 + 1 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) MER21B|LTR|ERVL 190550 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 119.5-39 chr10 116789573 116789765 + 1 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) L1ME4b|LINE|L1 37899 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 144.5-151 chr4 90257648 90257880 + 1 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) MLT2B1|LTR|ERVL 22733 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 166.75-22 chr11 31831411 31831751 + 1 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) ORSL-2a|DNA|hAT-Tip100 5014 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 153.5-207 chr8 136846717 136847010 + 1 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1PA16|LINE|L1 316065 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 148.25-97 chr3 121693603 121693834 + 1 NA intron (NM_001256486, intron 13 of 21) intron (NM_001256486, intron 13 of 21) -32815 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 152.75-100 chr21 29867406 29867603 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 72492 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 165.25-121 chr5 123553202 123553518 + 1 NA intron (NM_001044723, intron 2 of 12) intron (NM_001044723, intron 2 of 12) 7943 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 235.75-38 chr2 189667681 189668126 + 1 NA exon (NM_001353497, exon 4 of 5) exon (NM_001353497, exon 4 of 5) 6444 NM_019048 54529 Hs.101364 NM_019048 ENSG00000138381 ASNSD1 NBLA00058|NS3TP1 asparagine synthetase domain containing 1 protein-coding 132.25-177 chr7 132965091 132965404 + 1 NA intron (NM_001317177, intron 4 of 8) intron (NM_001317177, intron 4 of 8) 69668 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 125.25-102 chr2 101351271 101351444 + 1 NA intron (NM_153836, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 36146 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 173.5-16 chr10 30144450 30144692 + 1 NA Intergenic Intergenic -29077 NM_001350021 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 196.5-19 chr10 55415723 55416007 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -183177 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 205.5-117 chr5 98525458 98525805 + 1 NA Intergenic Intergenic -243001 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 115.25-111 chr2 179020812 179021003 + 1 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 29230 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 202.75-80 chr3 188403647 188403927 + 1 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 164879 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 221.75-86 chr8 122625340 122625747 + 1 NA Intergenic Intergenic -56899 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 187.5-38 chr12 15406942 15407248 + 1 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 84587 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 244.5-91 chr7 96801818 96802159 + 1 NA Intergenic Intergenic -92097 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 178.5-141 chr5 77710445 77710768 + 1 NA intron (NM_004607, intron 1 of 3) MER102b|DNA|hAT-Charlie 65733 NM_001297738 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 163.25-75 chr2 223513308 223513547 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 88934 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 176.25-23 chr11 38058034 38058305 + 1 NA Intergenic Intergenic 119568 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 140.5-15 chr10 48679648 48679831 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5134 NM_001370153 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 116.5-66 chr14 46551930 46552107 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 80659 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 213.5-70 chr20 51081468 51081736 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -58495 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 281.5-54 chr8 139839262 139839670 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -136343 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 158.25-100 chr4 30471001 30471181 + 1 NA Intergenic Intergenic -249278 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 140.5-72 chr14 96911359 96911638 + 1 NA Intergenic Intergenic -32081 NR_104113 145249 Hs.592323 NR_104113 ENSG00000225163 LINC00618 C14orf63 long intergenic non-protein coding RNA 618 ncRNA 241.5-5 chr10 15799631 15800029 + 1 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) intron (NM_024948, intron 10 of 14) 60677 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 256.5-71 chr7 46788209 46788700 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -91332 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 234.5-29 chr15 64569262 64569682 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 70052 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 138.25-62 chr16 87610415 87610757 + 1 NA intron (NM_020655, intron 1 of 4) intron (NM_020655, intron 1 of 4) 8078 NM_020655 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 122.5-67 chr14 75381012 75381200 + 1 NA Intergenic Intergenic -46618 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 169.25-45 chr18 45102280 45102671 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -65488 NM_001371319 207.75-34 chr14 51505387 51505788 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 16459 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 221.25-14 chr10 106729357 106729733 + 1 NA intron (NM_001206569, intron 6 of 25) intron (NM_001206569, intron 6 of 25) 435161 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 203.5-75 chr2 172780162 172780451 + 1 NA intron (NM_007023, intron 1 of 30) MER34A1|LTR|ERV1 -41281 NM_001100397 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 184.5-60 chr17 79300656 79300884 + 1 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) intron (NM_001082575, intron 3 of 14) 215378 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 285.5-60 chr8 79830988 79831373 + 1 NA intron (NR_110954, intron 2 of 5) intron (NR_110954, intron 2 of 5) 40557 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 269.5-46 chr6 25356201 25356617 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 2 of 36) intron (NM_001173977, intron 2 of 36) 77035 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 179.25-77 chr2 80706098 80706391 + 1 NA Intergenic Intergenic 392865 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 232.25-5 chr1 172599422 172599692 + 1 NA intron (NM_014283, intron 19 of 23) L3|LINE|CR1 -59451 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 138.25-123 chr3 131349776 131350106 + 1 NA 3' UTR (NM_001353038, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001353038, exon 19 of 19) -11904 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 241.75-60 chr5 35227082 35227385 + 1 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) 3254 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 165.25-32 chr12 5608547 5608850 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 20 of 25) intron (NM_001278596, intron 20 of 25) 114566 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 176.5-182 chr8 138524190 138524489 + 1 NA Intergenic Intergenic -26609 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 118.5-236 chr9 29262608 29262838 + 1 NA Intergenic Intergenic -49122 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 112.75-138 chr3 124040180 124040369 + 1 NA Intergenic Intergenic -48104 NM_001317775 54763 Hs.567516 NM_017578 ENSG00000065371 ROPN1 CT91|ODF6|RHPNAP1|ROPN1A|ropporin rhophilin associated tail protein 1 protein-coding 234.75-27 chr15 95663048 95663538 + 1 NA Intergenic Intergenic 230200 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 149.5-40 chr11 2544350 2544704 + 1 NA intron (NM_181798, intron 2 of 15) L1ME1|LINE|L1 83073 NM_181798 3784 Hs.95162 NM_000218 ENSG00000053918 KCNQ1 ATFB1|ATFB3|JLNS1|KCNA8|KCNA9|KVLQT1|Kv1.9|Kv7.1|LQT|LQT1|RWS|SQT2|WRS potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1 protein-coding 112.5-170 chr3 73831891 73832065 + 1 NA intron (NR_146637, intron 2 of 3) intron (NR_146637, intron 2 of 3) 22734 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 276.25-26 chr2 44476717 44477107 + 1 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR 114965 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 259.75-50 chr8 6731456 6731978 + 1 NA intron (NM_018361, intron 3 of 7) intron (NM_018361, intron 3 of 7) -13447 NR_039803 100616348 NR_039803 ENSG00000266038 MIR4659A mir-4659a microRNA 4659a ncRNA 258.75-69 chr7 8109654 8110035 + 1 NA Intergenic Intergenic 141048 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 190.5-170 chrX 53687007 53687224 + 1 NA promoter-TSS (NM_031407) promoter-TSS (NM_031407) -396 NM_031407 10075 Hs.136905 NM_031407 ENSG00000086758 HUWE1 ARF-BP1|HECTH9|HSPC272|Ib772|LASU1|MRXST|MULE|URE-B1|UREB1 HECT, UBA and WWE domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 165.5-100 chr20 32348065 32348306 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -10159 NM_015338 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 138.75-161 chr6 17033471 17033728 + 1 NA Intergenic Intergenic -68659 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 171.75-141 chr8 124860625 124860839 + 1 NA Intergenic Intergenic -38674 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 197.25-74 chr3 176960122 176960348 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -143234 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 140.25-149 chr5 61557320 61557498 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -80351 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 152.5-84 chr2 50077762 50078038 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -103697 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 135.25-67 chr15 53582715 53582872 + 1 NA intron (NM_182758, intron 18 of 19) intron (NM_182758, intron 18 of 19) -41690 NM_001277176 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 158.75-55 chr14 62730397 62730752 + 1 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) intron (NM_172375, intron 9 of 9) 314884 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 217.75-8 chr1 219272788 219273171 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 98010 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 123.5-191 chr6 148074430 148074610 + 1 NA Intergenic Intergenic -197808 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 310.25-23 chr6 105101447 105102264 + 1 NA intron (NM_147147, intron 7 of 7) intron (NM_147147, intron 7 of 7) 34491 NM_147147 11149 Hs.221660 NM_007073 ENSG00000112276 BVES CARICK|HBVES|LGMD2X|LGMDR25|POP1|POPDC1 blood vessel epicardial substance protein-coding 127.25-209 chr8 110714415 110714693 + 1 NA Intergenic Intergenic 312879 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 266.75-6 chr11 107140049 107140553 + 1 NA Intergenic Intergenic -121825 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 135.75-98 chr2 101405538 101405726 + 1 NA intron (NM_001367510, intron 9 of 10) intron (NM_001367510, intron 9 of 10) -18129 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 177.5-92 chr2 184613385 184613683 + 1 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 15005 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 256.5-56 chr5 21434240 21434665 + 1 NA Intergenic Intergenic -25028 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 273.5-39 chr21 39131729 39132327 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 51423 NM_003720 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 174.5-172 chr7 35338307 35338521 + 1 NA intron (NR_038864, intron 1 of 2) intron (NR_038864, intron 1 of 2) 24559 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 338.5-33 chr7 49899153 49899596 + 1 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 124041 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 166.5-4 chr1 33722631 33722819 + 1 NA intron (NM_052896, intron 19 of 69) L1ME4a|LINE|L1 -137750 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 240.5-33 chr15 67856591 67856883 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16692 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 164.25-42 chr14 102889514 102889705 + 1 NA exon (NM_003300, exon 7 of 11) exon (NM_003300, exon 7 of 11) -33047 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 350.5-13 chr19 46331712 46332151 + 1 NA intron (NM_152795, intron 13 of 14) intron (NM_152795, intron 13 of 14) -15156 NM_001204284 5536 Hs.654604 NM_006247 ENSG00000011485 PPP5C PP5|PPP5|PPT protein phosphatase 5 catalytic subunit protein-coding 236.25-56 chr3 7516935 7517254 + 1 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) intron (NM_000844, intron 7 of 9) 18190 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 456.5-2 chr10 85122423 85123207 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 76090 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 333.25-10 chr2 174688339 174688864 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5702 NM_001077269 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 191.5-13 chr1 189240268 189240596 + 1 NA Intergenic Intergenic 1235578 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 155.75-16 chr10 57712139 57712525 + 1 NA Intergenic Intergenic -407773 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 126.25-23 chr10 113701076 113701221 + 1 NA intron (NM_001227, intron 2 of 6) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -8197 NM_001267058 840 Hs.9216 NM_001227 ENSG00000165806 CASP7 CASP-7|CMH-1|ICE-LAP3|LICE2|MCH3 caspase 7 protein-coding 114.75-103 chr20 892299 892430 + 1 NA intron (NM_015985, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 23970 NM_001322809 51378 Hs.278973 NM_015985 ENSG00000101280 ANGPT4 ANG3|ANG4 angiopoietin 4 protein-coding 223.5-86 chr4 10273303 10273577 + 1 NA Intergenic Intergenic -156641 NM_005112 9948 Hs.128548 NM_005112 ENSG00000071127 WDR1 AIP1|HEL-S-52|NORI-1 WD repeat domain 1 protein-coding 264.25-44 chr5 108284728 108285073 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 97198 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 229.75 chr1 6117879 6118241 + 1 NA intron (NM_015557, intron 33 of 41) L1MB7|LINE|L1 62261 NM_015557 26038 Hs.522898 NM_015557 ENSG00000116254 CHD5 CHD-5 chromodomain helicase DNA binding protein 5 protein-coding 178.75-98 chr7 43030959 43031280 + 1 NA Intergenic Intergenic -81528 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 293.25-12 chr19 5288324 5288662 + 1 NA intron (NM_002850, intron 1 of 37) intron (NM_002850, intron 1 of 37) 52319 NM_130854 5802 Hs.744928 NM_002850 ENSG00000105426 PTPRS PTPSIGMA|R-PTP-S|R-PTP-sigma protein tyrosine phosphatase receptor type S protein-coding 116.5-177 chr4 55101247 55101454 + 1 NA intron (NM_002253, intron 15 of 29) intron (NM_002253, intron 15 of 29) 24245 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 170.75-5 chr1 86729266 86729679 + 1 NA intron (NM_001206651, intron 6 of 9) intron (NM_001206651, intron 6 of 9) 24896 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 162.5-85 chr2 130949131 130949425 + 1 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) intron (NM_001367493, intron 4 of 13) 112364 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 217.25-25 chr14 56258984 56259393 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 140777 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 196.5-24 chr10 69138017 69138405 + 1 NA intron (NM_001318944, intron 3 of 9) L1MB7|LINE|L1 14033 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 308.25-20 chr3 76212067 76212601 + 1 NA Intergenic Intergenic -426785 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 165.5-130 chr4 68113847 68114088 + 1 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) L1MD|LINE|L1 15902 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 171.75-45 chr14 78654350 78654541 + 1 NA intron (NR_073547, intron 6 of 20) intron (NR_073547, intron 6 of 20) 250726 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 192.5-137 chr8 139907741 139907962 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 20 of 22) intron (NM_001160372, intron 20 of 22) 192684 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 176.75-84 chr3 161798070 161798431 + 1 NA Intergenic Intergenic 301442 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 120.5-138 chr3 27779484 27779705 + 1 NA Intergenic Intergenic -17994 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 207.75-82 chr3 177476944 177477281 + 1 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) MER5B|DNA|hAT-Charlie 35191 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 163.5-12 chr1 168568479 168568781 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -7975 NM_002995 6375 Hs.546295 NM_002995 ENSG00000143184 XCL1 ATAC|LPTN|LTN|SCM-1|SCM-1a|SCM1|SCM1A|SCYC1 X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 119.25-112 chr20 42884003 42884169 + 1 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) LTR86A1|LTR|ERVL -84657 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 175.25-123 chr6 9667123 9667337 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -737272 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 197.5-85 chr20 21806125 21806430 + 1 NA Intergenic Intergenic 100613 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 153.75-134 chr6 128740176 128740479 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -142811 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 220.25-82 chr9 100308893 100309336 + 1 NA intron (NM_001161584, intron 12 of 14) intron (NM_001161584, intron 12 of 14) 43457 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 132.25-5 chr1 66235037 66235377 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 -96901 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 267.75-35 chr21 25494074 25494566 + 1 NA Intergenic Intergenic -62619 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 218.5-75 chr3 85584264 85584893 + 1 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 79519 NM_001256502 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 165.75-42 chr12 115408801 115409027 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -724739 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 128.5-45 chr11 111416348 111416611 + 1 NA non-coding (NR_046085, exon 1 of 4) non-coding (NR_046085, exon 1 of 4) 1707 NR_046085 100132078 Hs.672662 NR_046085 ENSG00000255428 LOC100132078 - uncharacterized LOC100132078 ncRNA 184.75-32 chr15 96131942 96132195 + 1 NA intron (NR_125738, intron 3 of 4) intron (NR_125738, intron 3 of 4) -4227 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 152.25-64 chr17 56736849 56737051 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 96970 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 275.25-50 chr9 32005749 32006112 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -378673 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 208.25-82 chr7 36921796 36922030 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) -2481 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 157.5-49 chr13 52086937 52087216 + 1 NA intron (NM_199289, intron 15 of 21) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -41819 NR_110306 101929657 Hs.637461 NR_110306 ENSG00000273523 LOC101929657 - uncharacterized LOC101929657 ncRNA 116.75-27 chr10 81302853 81303083 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -572226 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 123.5-163 chr5 59126206 59126581 + 1 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -86917 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 126.5-81 chr16 6708397 6708632 + 1 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) intron (NM_018723, intron 3 of 15) -65295 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 231.5-81 chr5 61877641 61878051 + 1 NA Intergenic Intergenic -142148 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 257.75-42 chr5 108029424 108029724 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 352524 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 126.5-249 chr8 113892558 113892704 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -455692 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 165.5-118 chr3 117995974 117996287 + 1 NA Intergenic Intergenic -305205 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 176.75-76 chr21 18004186 18004528 + 1 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) intron (NM_001204177, intron 1 of 4) 87017 NM_001204176 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 137.5-89 chr17 27378708 27378868 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -39217 NR_033892 440419 Hs.385755 NR_033892 ENSG00000266433 TBC1D3P5 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 5 pseudo 121.5-264 chr9 90366905 90367051 + 1 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 66511 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 147.5-76 chr15 97480430 97480702 + 1 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 41245 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 148.5-143 chr3 19825687 19825931 + 1 NA Intergenic Intergenic 108408 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 118.25-74 chr16 8000301 8000605 + 1 NA Intergenic Intergenic 589385 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 230.5-77 chr3 16277298 16277682 + 1 NA intron (NM_001352981, intron 5 of 10) intron (NM_001352981, intron 5 of 10) 12278 NM_001352982 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 136.5-232 chr8 116901060 116901365 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -26346 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 183.5-22 chr10 68226978 68227236 + 1 NA Intergenic Intergenic 5006 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 147.25-102 chr5 9591491 9591657 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 38777 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 237.5-45 chr18 71401892 71402171 + 1 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 176925 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 229.25-71 chr6 142731175 142731497 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -93447 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 357.25-13 chr7 27037070 27037502 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 58714 NM_153620 3198 Hs.67397 NM_005522 ENSG00000105991 HOXA1 BSAS|HOX1|HOX1F homeobox A1 protein-coding 162.75-58 chr18 13840604 13840837 + 1 NA Intergenic Intergenic 16571 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 209.25-11 chr1 186710947 186711295 + 1 NA Intergenic Intergenic 30467 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 174.5-88 chr18 45053871 45054091 + 1 NA intron (NM_015559, intron 5 of 5) intron (NM_015559, intron 5 of 5) -83815 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 125.5-29 chr10 66306846 66307026 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -619100 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 363.75-15 chr5 32255847 32256476 + 1 NA intron (NM_001294344, intron 7 of 13) intron (NM_001294344, intron 7 of 13) 56778 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 155.5-129 chr3 100163657 100163864 + 1 NA intron (NM_001167924, intron 4 of 9) intron (NM_001167924, intron 4 of 9) -22064 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 125.25-117 chr2 231226502 231226696 + 1 NA intron (NM_001352757, intron 6 of 19) intron (NM_001352757, intron 6 of 19) 27968 NR_148040 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 193.25-90 chr5 33797223 33797454 + 1 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) intron (NM_001324511, intron 2 of 2) 94652 NM_030955 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 263.25-53 chr7 114753553 114753848 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 100355 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 201.75-70 chr4 176561172 176561410 + 1 NA Intergenic Intergenic 231631 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 135.75-78 chr17 56592090 56592391 + 1 NA Intergenic Intergenic -1459 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 127.25-2 chr1 59366301 59366504 + 1 NA intron (NM_001350794, intron 4 of 14) intron (NM_001350794, intron 4 of 14) 56370 NM_001350794 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 252.5-45 chr2 162954262 162954718 + 1 NA Intergenic Intergenic -115723 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 202.25-13 chr10 72758834 72759129 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 37952 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 191.5-76 chr2 81220043 81220361 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 246744 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 313.75-17 chr3 179861451 179861918 + 1 NA intron (NR_146167, intron 6 of 13) intron (NR_146167, intron 6 of 13) -36510 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 158.75-99 chr20 8075013 8075305 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -55398 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 212.75-70 chr4 48893560 48893816 + 1 NA intron (NM_001014446, intron 5 of 6) intron (NM_001014446, intron 5 of 6) 13086 NM_001014446 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 285.5-65 chr9 27661833 27662228 + 1 NA Intergenic Intergenic -88164 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 232.5-63 chr21 27039341 27039652 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -72408 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 155.75-86 chr2 155778056 155778269 + 1 NA Intergenic Intergenic 476769 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 254.5-16 chr10 98827544 98827984 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 96804 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 135.5-144 chr4 31963936 31964114 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -33354 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 115.5-242 chr8 91837020 91837153 + 1 NA Intergenic Intergenic 180594 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 271.75-2 chr1 162309223 162309895 + 1 NA intron (NM_014697, intron 4 of 9) intron (NM_014697, intron 4 of 9) -32987 NR_030283 693141 NR_030283 ENSG00000207729 MIR556 MIRN556|hsa-mir-556|mir-556 microRNA 556 ncRNA 163.5-95 chr2 136026850 136027138 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -41310 NM_001293312 1615 Hs.503787 NM_001349 ENSG00000115866 DARS HBSL|aspRS aspartyl-tRNA synthetase protein-coding 196.25-46 chr16 81870123 81870395 + 1 NA intron (NM_002661, intron 6 of 32) MIRb|SINE|MIR 90968 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 154.5-81 chr17 61354085 61354309 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) MIRc|SINE|MIR 13507 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 192.5-41 chr14 60453971 60454202 + 1 NA intron (NM_174978, intron 16 of 17) intron (NM_174978, intron 16 of 17) 31977 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 125.75-199 chrX 52858264 52858451 + 1 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 8944 NM_130776 170626 Hs.43879 NM_130776 ENSG00000171402 XAGE3 CT12.3a|CT12.3b|GAGED4|PLAC6|XAGE-3|pp9012 X antigen family member 3 protein-coding 220.25-64 chr5 169240214 169240621 + 1 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) L1MC3|LINE|L1 23277 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 178.5-59 chr15 95584228 95584560 + 1 NA Intergenic Intergenic 151301 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 164.25-166 chrX 87380325 87380575 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -137352 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 238.5-5 chr1 167327680 167327977 + 1 NA intron (NR_037163, intron 2 of 16) MIR|SINE|MIR -1242 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 235.5-97 chrX 86339723 86340052 + 1 NA intron (NM_001139515, intron 1 of 11) intron (NM_001139515, intron 1 of 11) 76919 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 141.5-18 chr10 81444443 81444724 + 1 NA Intergenic MER61C|LTR|ERV1 -430611 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 193.75-112 chr7 19266830 19267053 + 1 NA Intergenic Intergenic -121520 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 140.5-20 chr10 110595782 110596106 + 1 NA intron (NM_005445, intron 18 of 28) intron (NM_005445, intron 18 of 28) 28253 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 132.25-139 chr4 32171524 32171716 + 1 NA Intergenic Intergenic -149198 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 144.5-224 chr8 116596540 116596726 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -55467 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 312.5-24 chr3 100795110 100795546 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 21 of 35) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 85786 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 216.5-2 chr1 86615724 86616069 + 1 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 -18380 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 146.5-207 chr7 47781650 47781921 + 1 NA intron (NM_138295, intron 56 of 56) L1MD1|LINE|L1 -13506 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 161.5-127 chr3 21842496 21842678 + 1 NA Intergenic Intergenic -91377 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 178.5-123 chr4 65539974 65540184 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 129409 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 146.75-36 chr13 39373679 39373893 + 1 NA intron (NM_005780, intron 3 of 3) L1PA16|LINE|L1 229407 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 281.5-22 chr19 44566403 44566840 + 1 NA Intergenic Intergenic -9704 NR_027754 388550 Hs.446909 NR_027754 ENSG00000230666 CEACAM22P - carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 22, pseudogene pseudo 183.75-8 chr1 176924707 176924924 + 1 NA intron (NM_207108, intron 16 of 21) intron (NM_207108, intron 16 of 21) 104630 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 155.75-99 chr3 12641317 12641496 + 1 NA intron (NM_001354691, intron 1 of 16) intron (NM_001354691, intron 1 of 16) 22102 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 180.25-77 chr3 141910849 141911191 + 1 NA intron (NM_001679, intron 3 of 6) HAL1ME|LINE|L1 34377 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 152.5-187 chr8 65882315 65882574 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -40380 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 212.75-31 chr14 46461032 46461397 + 1 NA intron (NR_102701, intron 5 of 5) L1MA5|LINE|L1 -10145 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 190.5 chr1 9049631 9049856 + 1 NA intron (NM_003039, intron 3 of 11) L1MC|LINE|L1 19892 NM_001328621 6518 Hs.530003 NM_003039 ENSG00000142583 SLC2A5 GLUT-5|GLUT5 solute carrier family 2 member 5 protein-coding 167.5-84 chr19 53816877 53817124 + 1 NA intron (NM_144687, intron 1 of 9) L1MB2|LINE|L1 7403 NM_144687 91662 Hs.631573 NM_033297 ENSG00000142405 NLRP12 CLR19.3|FCAS2|NALP12|PAN6|PYPAF7|RNO|RNO2 NLR family pyrin domain containing 12 protein-coding 238.75-71 chrX 107122318 107122861 + 1 NA TTS (NM_017681) TTS (NM_017681) -3767 NR_136729 55285 Hs.139053 NM_018301 ENSG00000089682 RBM41 - RNA binding motif protein 41 protein-coding 197.5-139 chr7 2756023 2756297 + 1 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 6980 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 143.5-217 chr8 123284973 123285281 + 1 NA Intergenic Intergenic -9586 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 138.75-94 chr2 126385579 126385748 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -267678 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 136.25-48 chr13 90190371 90190594 + 1 NA Intergenic Intergenic -40700 NR_030754 693207 NR_030754 ENSG00000283783 MIR622 MIRN622|hsa-mir-622 microRNA 622 ncRNA 184.75-44 chr2 5408079 5408353 + 1 NA Intergenic Intergenic 282902 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 144.25-206 chr8 116470126 116470372 + 1 NA Intergenic Intergenic -145190 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 201.25-94 chr9 28734456 28734722 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR -15284 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 166.5-107 chr2 100474349 100474631 + 1 NA intron (NM_001011717, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR 4008 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 174.5-150 chr5 96138688 96139066 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1MC3|LINE|L1 59739 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 127.75-195 chr8 26295547 26295692 + 1 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) intron (NM_001177591, intron 2 of 9) 2403 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 267.5-54 chr4 102710943 102711295 + 1 NA intron (NM_005908, intron 5 of 16) L1MA6|LINE|L1 49849 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 236.5-78 chr6 49447184 49447575 + 1 NA intron (NM_000255, intron 8 of 12) intron (NM_000255, intron 8 of 12) 15874 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 167.5-137 chr5 23158924 23159128 + 1 NA Intergenic Intergenic -305682 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 166.75-126 chr6 64833655 64833850 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -467666 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 226.75-32 chr2 50336652 50336972 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 10942 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 176.5-8 chr1 174732739 174732973 + 1 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) 31861 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 506.25 chr11 72423982 72425176 + 1 NA intron (NM_001258394, intron 2 of 17) AluSz|SINE|Alu 9952 NM_030813 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 155.5-12 chr1 88777247 88777516 + 1 NA intron (NM_006256, intron 6 of 21) L1M4|LINE|L1 -92177 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 220.25-60 chr4 178385759 178386048 + 1 NA Intergenic Intergenic -477967 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 152.75-101 chr22 24587574 24587887 + 1 NA intron (NM_207644, intron 3 of 3) intron (NM_207644, intron 3 of 3) 3980 NM_013430 2678 Hs.595809 NM_005265 ENSG00000100031 GGT1 CD224|D22S672|D22S732|GGT|GGT 1|GGTD|GTG gamma-glutamyltransferase 1 protein-coding 140.25-178 chr7 34378536 34378811 + 1 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) MER57A-int|LTR|ERV1 -279545 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 298.75-36 chr8 109869634 109870010 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 105949 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 138.5-201 chr8 125356830 125357007 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -73440 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 167.75-121 chr6 43896825 43897083 + 1 NA intron (NR_024478, intron 1 of 1) intron (NR_024478, intron 1 of 1) 5926 NR_024478 100132354 Hs.376232 NR_024478 LINC01512 HI-LNC77 long intergenic non-protein coding RNA 1512 ncRNA 123.5-2 chr1 30137846 30138080 + 1 NA Intergenic Intergenic -100351 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 168.5-118 chr3 100860962 100861207 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 12 of 35) intron (NM_001349332, intron 12 of 35) 132406 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 161.25-172 chr8 81805518 81805916 + 1 NA intron (NR_145472, intron 4 of 6) AluY|SINE|Alu 36468 NR_145474 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 178.25-71 chr2 239215228 239215629 + 1 NA intron (NM_006037, intron 3 of 26) intron (NM_006037, intron 3 of 26) -19971 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 191.5-112 chr4 96950257 96950562 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -416517 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-183 chr6 112628548 112628811 + 1 NA Intergenic Intergenic 281349 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 121.75-86 chr2 127135994 127136145 + 1 NA Intergenic Intergenic -28915 NM_139345 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 188.25-12 chr10 69585790 69586091 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -12518 NM_020999 50674 Hs.532682 NM_020999 ENSG00000122859 NEUROG3 Atoh5|Math4B|NGN-3|bHLHa7|ngn3 neurogenin 3 protein-coding 211.5-151 chr8 22542300 22542554 + 1 NA Intergenic Intergenic -9500 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 242.5-70 chr6 69572156 69572539 + 1 NA Intergenic Intergenic 224119 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 175.5-147 chr7 55622554 55622827 + 1 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -50188 NM_001321244 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 192.75-111 chr6 27974532 27974909 + 1 NA Intergenic Intergenic 17479 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 207.5-90 chr5 113357516 113358022 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) MER50|LTR|ERV1 -62831 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 207.75-60 chr2 141083501 141083742 + 1 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -496936 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 153.75-126 chr6 12298501 12298739 + 1 NA Intergenic Intergenic 8259 NM_001955 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 128.75-206 chr8 119731351 119731505 + 1 NA 3' UTR (NM_003184, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_003184, exon 26 of 26) -58038 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 211.25-41 chr2 108397421 108397643 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 19578 NR_135776 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 154.5-82 chr17 78744065 78744364 + 1 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 -7312 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 127.5-158 chr3 183202124 183202478 + 1 NA intron (NM_015078, intron 25 of 29) L1MB7|LINE|L1 -39567 NM_014398 27074 Hs.518448 NM_014398 ENSG00000078081 LAMP3 CD208|DC LAMP|DC-LAMP|DCLAMP|LAMP|LAMP-3|TSC403 lysosomal associated membrane protein 3 protein-coding 158.5-96 chr2 74565985 74566273 + 1 NA intron (NM_001321739, intron 7 of 10) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 11969 NM_001318867 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 223.75-36 chr17 60054012 60054456 + 1 NA intron (NM_022070, intron 14 of 19) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -11129 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 171.75-115 chr5 105009651 105009905 + 1 NA Intergenic Intergenic -89696 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 132.5-85 chr16 47092199 47092347 + 1 NA intron (NM_001201477, intron 7 of 8) MER68B|LTR|ERVL 51672 NM_018092 81831 Hs.645802 NM_018092 ENSG00000171208 NETO2 BTCL2|NEOT2 neuropilin and tolloid like 2 protein-coding 297.75-17 chr2 55241547 55242171 + 1 NA intron (NM_001005369, intron 14 of 16) intron (NM_001005369, intron 14 of 16) 7695 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 301.5-32 chr22 42783240 42783563 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -62100 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 178.25-95 chr4 79437411 79437743 + 1 NA Intergenic Intergenic -29349 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 151.75-25 chr10 103257836 103258026 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 12044 NM_001143909 729020 Hs.458437 NM_001143909 ENSG00000235376 RPEL1 - ribulose-5-phosphate-3-epimerase like 1 protein-coding 215.5-107 chr8 108602550 108603010 + 1 NA Intergenic Intergenic 159156 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 146.5-116 chr2 177620438 177620608 + 1 NA Intergenic Intergenic -1781 NM_152275 92104 Hs.128384 NM_152275 ENSG00000197557 TTC30A IFT70A|TTC30B tetratricopeptide repeat domain 30A protein-coding 278.5-54 chr7 152404636 152405163 + 1 NA intron (NM_170606, intron 1 of 58) AluJb|SINE|Alu 31104 NM_170606 58508 Hs.647120 NM_021230 ENSG00000055609 KMT2C HALR|KLEFS2|MLL3 lysine methyltransferase 2C protein-coding 208.5-9 chr10 61424911 61425254 + 1 NA intron (NR_134508, intron 4 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -27557 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 185.75-45 chr14 64791240 64791543 + 1 NA intron (NM_001024858, intron 14 of 34) AluSz6|SINE|Alu -5705 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 145.5-49 chr12 66941799 66942016 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -137638 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 180.75-117 chr5 103855698 103856120 + 1 NA Intergenic Intergenic -293120 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 189.75-57 chr2 28199169 28199376 + 1 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) Mam_R4|LINE|Dong-R4 7689 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 123.25-21 chr10 48936179 48936390 + 1 NA intron (NM_020945, intron 47 of 61) intron (NM_020945, intron 47 of 61) -22049 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 190.25-104 chr5 180068099 180068687 + 1 NA intron (NM_001280801, intron 1 of 7) intron (NM_001280801, intron 1 of 7) 3366 NM_018434 55819 Hs.484363 NM_018434 ENSG00000113269 RNF130 G1RZFP|GOLIATH|GP ring finger protein 130 protein-coding 168.5-41 chr11 97214426 97214811 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 706193 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 284.25-5 chr10 86391875 86392195 + 1 NA Intergenic Intergenic -25240 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 157.25-114 chr5 4117329 4117583 + 1 NA Intergenic Intergenic 521624 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 237.5-55 chr2 181673424 181673934 + 1 NA intron (NR_146175, intron 1 of 1) intron (NR_146175, intron 1 of 1) 6838 NR_146176 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 112.25-106 chr2 178843338 178843514 + 1 NA intron (NM_173648, intron 22 of 23) intron (NM_173648, intron 22 of 23) -36003 NM_003319 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 130.75-30 chr11 74206008 74206269 + 1 NA intron (NM_001271593, intron 3 of 13) intron (NM_001271593, intron 3 of 13) 34849 NM_016147 51400 Hs.503251 NM_016147 ENSG00000214517 PPME1 ABDH19|PME-1 protein phosphatase methylesterase 1 protein-coding 156.5-116 chr3 79456340 79456562 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 44724 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 180.5-86 chr21 46602094 46602378 + 1 NA intron (NM_006272, intron 2 of 2) intron (NM_006272, intron 2 of 2) 2846 NM_006272 6285 Hs.422181 NM_006272 ENSG00000160307 S100B NEF|S100|S100-B|S100beta S100 calcium binding protein B protein-coding 174.75-117 chr7 85307744 85307979 + 1 NA Intergenic Intergenic -113261 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 147.25-12 chr1 205643067 205643398 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -10360 NM_021795 2005 Hs.497520 NM_001973 ENSG00000158711 ELK4 SAP1 ETS transcription factor ELK4 protein-coding 152.25-36 chr12 1159359 1159637 + 1 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) MER1B|DNA|hAT-Charlie 131750 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 236.25-59 chr3 94433810 94434400 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 371044 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 338.5-4 chr1 221358983 221359482 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -22936 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 113.25-137 chr5 76011069 76011203 + 1 NA Intergenic Intergenic -72247 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 163.5-43 chr12 46707469 46707684 + 1 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? 118421 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 146.25-133 chr7 30325317 30325661 + 1 NA intron (NM_147128, intron 2 of 4) intron (NM_147128, intron 2 of 4) -35599 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 142.5-155 chr4 116611588 116611759 + 1 NA Intergenic Intergenic 311948 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 297.75-35 chr5 54052237 54052635 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) L1MC3|LINE|L1 -100837 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 269.75-15 chr10 126116881 126117334 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 6 of 18) intron (NM_001288974, intron 6 of 18) -143834 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 147.5-212 chr8 123913396 123913576 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 61499 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 167.75-95 chr4 25916004 25916484 + 1 NA intron (NM_001145432, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 2052 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 185.25-46 chr17 67187572 67187861 + 1 NA intron (NM_001330447, intron 12 of 32) intron (NM_001330447, intron 12 of 32) -57060 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 192.5-79 chr2 217885432 217885873 + 1 NA intron (NM_001308023, intron 12 of 29) intron (NM_001308023, intron 12 of 29) 14976 NR_106867 102465485 NR_106867 ENSG00000275458 MIR6809 hsa-mir-6809 microRNA 6809 ncRNA 248.25-26 chr16 62608182 62608578 + 1 NA Intergenic Intergenic -571942 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 204.75-87 chr4 124183073 124183316 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 375240 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 176.5-29 chr11 66381507 66381819 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9187 NM_001300869 3177 Hs.569017 NM_001532 ENSG00000174669 SLC29A2 DER12|ENT2|HNP36 solute carrier family 29 member 2 protein-coding 143.75-198 chr9 82146964 82147313 + 1 NA Intergenic Intergenic 158366 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 216.5-83 chr3 159464705 159464943 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 182178 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 175.5-181 chr9 120460092 120460367 + 1 NA intron (NR_073558, intron 19 of 37) MIR3|SINE|MIR 119938 NM_018249 55755 Hs.269560 NM_018249 ENSG00000136861 CDK5RAP2 C48|Cep215|MCPH3 CDK5 regulatory subunit associated protein 2 protein-coding 122.5-83 chr17 54872949 54873150 + 1 NA Intergenic Intergenic -27642 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 212.25-72 chr5 37733446 37733920 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 17 of 17) intron (NM_001345998, intron 17 of 17) 101139 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 217.25-65 chr5 86228651 86229063 + 1 NA Intergenic Intergenic -53587 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 176.75-59 chr2 48019186 48019433 + 1 NA Intergenic Intergenic -113516 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 139.25-25 chr10 116467768 116467928 + 1 NA intron (NM_001011709, intron 8 of 11) AluY|SINE|Alu 40001 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 183.25-102 chr7 33015884 33016076 + 1 NA intron (NM_001356996, intron 9 of 10) intron (NM_001356996, intron 9 of 10) 24926 NM_016489 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 146.25-61 chr18 73385511 73385701 + 1 NA Intergenic Intergenic 60665 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 283.75-28 chr5 122445714 122446176 + 1 NA intron (NR_131762, intron 7 of 9) MamGypLTR1a|LTR|Gypsy 33142 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 231.25-73 chr8 107686295 107686593 + 1 NA Intergenic Intergenic -188526 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 129.5-96 chr17 62723071 62723228 + 1 NA intron (NM_001288780, intron 8 of 10) intron (NM_001288780, intron 8 of 10) 16943 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 223.5-23 chr11 34047038 34047464 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -4480 NM_005898 4076 Hs.471818 NM_005898 ENSG00000135387 CAPRIN1 GPIAP1|GPIP137|GRIP137|M11S1|RNG105|p137GPI cell cycle associated protein 1 protein-coding 239.25-19 chr12 79914555 79915115 + 1 NA promoter-TSS (NM_001143886) promoter-TSS (NM_001143886) -924 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 298.5-31 chr5 22783133 22783658 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 69949 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 152.5-139 chr4 114765909 114766169 + 1 NA Intergenic Intergenic 109280 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 428.5-5 chr20 17305771 17306390 + 1 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) intron (NM_002594, intron 2 of 11) 79040 NM_002594 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 166.75-101 chr4 62325397 62325640 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -163753 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-117 chr22 19078085 19078240 + 1 NA intron (NR_033674, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 -29787 NR_024157 25786 Hs.720269 NR_024157 ENSG00000273311 DGCR11 DGS-D DiGeorge syndrome critical region gene 11 ncRNA 186.25-50 chr2 32141313 32141619 + 1 NA intron (NM_001363875, intron 11 of 15) L1M7|LINE|L1 -24375 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 271.5-99 chrX 50878504 50878849 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32059 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 119.5-259 chr9 132534954 132535215 + 1 NA intron (NM_207417, intron 4 of 6) L1MC5a|LINE|L1 -47522 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 205.75-29 chr16 58620094 58620598 + 1 NA intron (NM_206999, intron 1 of 30) intron (NM_206999, intron 1 of 30) 9480 NM_001265612 23019 Hs.460923 NM_016284 ENSG00000125107 CNOT1 AD-005|CDC39|NOT1|NOT1H CCR4-NOT transcription complex subunit 1 protein-coding 218.25-63 chr4 139806795 139807225 + 1 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 141191 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 239.75-29 chr17 50235162 50235721 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 20747 NR_110806 101927230 Hs.514326 NR_110806 LINC01969 - long intergenic non-protein coding RNA 1969 ncRNA 153.75-109 chr4 130263871 130264171 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -112340 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 237.75-76 chr6 54800981 54801269 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45646 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 152.75-144 chr8 13411316 13411511 + 1 NA intron (NM_024767, intron 2 of 4) L1MC1|LINE|L1 103438 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 155.75-80 chr2 67146924 67147148 + 1 NA intron (NR_038844, intron 5 of 7) intron (NR_038844, intron 5 of 7) 60590 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 198.75-35 chr17 10480641 10481031 + 1 NA intron (NR_125367, intron 2 of 10) L1MA9|LINE|L1 -11277 NM_017533 4622 Hs.711141 NM_017533 ENSG00000264424 MYH4 MYH2B|MyHC-2B|MyHC-IIb myosin heavy chain 4 protein-coding 148.25-128 chr5 113607779 113607987 + 1 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 94189 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 156.5-186 chr8 31673841 31674027 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 34182 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 172.25-142 chr8 137778493 137778785 + 1 NA Intergenic Intergenic 304906 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 198.5-132 chr7 33280299 33280594 + 1 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 150882 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 144.25-120 chr22 27509531 27509738 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 198983 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 171.25-73 chr2 48258464 48258687 + 1 NA Intergenic Intergenic -56107 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 133.5-257 chr8 38766920 38767121 + 1 NA intron (NM_001352804, intron 1 of 10) intron (NM_001352804, intron 1 of 10) 9745 NM_001352804 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 129.5-177 chr5 23836856 23837078 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -114381 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 138.5-150 chr5 7458762 7458970 + 1 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 62728 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 298.5-7 chr14 53922365 53922901 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 25851 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 147.25-89 chr3 130607604 130607916 + 1 NA intron (NM_001102608, intron 20 of 35) L1MEi|LINE|L1 47426 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 138.75-209 chr9 35851728 35851976 + 1 NA intron (NM_001042589, intron 11 of 13) intron (NM_001042589, intron 11 of 13) 18549 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 156.5-75 chr2 31716580 31716817 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 87282 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 184.5-9 chr1 115257363 115257614 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -25546 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 181.75-109 chr5 130380905 130381132 + 1 NA Intergenic Intergenic 476553 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 154.25-41 chr13 84708925 84709172 + 1 NA Intergenic Intergenic -74606 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 256.25-24 chr2 165358433 165358840 + 1 NA intron (NM_001040143, intron 18 of 27) intron (NM_001040143, intron 18 of 27) 64581 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 202.5-35 chr13 75734305 75734654 + 1 NA intron (NM_005358, intron 4 of 29) intron (NM_005358, intron 4 of 29) -25841 NM_001366633 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 161.75-81 chr22 26128830 26129028 + 1 NA Intergenic Intergenic -40533 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 259.5-85 chr6 155948589 155948912 + 1 NA Intergenic Intergenic 1953 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 149.5-92 chr2 62264655 62264904 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 49258 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 288.75-36 chr3 59160338 59160708 + 1 NA Intergenic Intergenic -110491 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 132.5-233 chr8 33077624 33077891 + 1 NA Intergenic X7B_LINE|LINE|CR1 355922 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 163.25-142 chr8 105948055 105948260 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 112346 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 189.75-104 chr6 129393774 129394098 + 1 NA intron (NM_000426, intron 37 of 64) intron (NM_000426, intron 37 of 64) 316241 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 157.75-174 chr8 119546194 119546372 + 1 NA Intergenic Intergenic 46725 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 150.25-68 chr17 70007760 70008059 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -43362 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 168.25-124 chr6 118723977 118724194 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -14010 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 254.5-75 chr8 47233099 47233558 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -27550 NM_001282919 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 144.25-168 chr6 63641608 63641855 + 1 NA intron (NM_001290260, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu -4795 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 167.25-129 chr5 108824375 108824702 + 1 NA intron (NM_001308028, intron 3 of 17) L1MA9|LINE|L1 75590 NM_001308028 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 318.75-23 chr9 77492153 77492496 + 1 NA intron (NR_121184, intron 2 of 4) L1M3f|LINE|L1 44675 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 156.75-42 chr12 66928457 66928623 + 1 NA Intergenic Intergenic -124271 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 188.5-165 chr9 2758339 2758636 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 40977 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 163.5-41 chr12 40812640 40812884 + 1 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1MA9|LINE|L1 -15176 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 168.75-97 chr3 142279974 142280270 + 1 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -54537 NM_001039547 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 237.5-31 chr14 69272401 69272694 + 1 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 12389 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 154.5-86 chr19 28873535 28873819 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -91454 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 206.25-109 chr8 108160571 108160874 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -77102 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 241.5-104 chr8 143283097 143283397 + 1 NA Intergenic Intergenic -1547 NR_120682 100507316 Hs.446671 NR_120682 ENSG00000253716 MINCR LINC01604 MYC-induced long non-coding RNA ncRNA 169.5-67 chr19 46099488 46099917 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -22073 NR_163175 444882 Hs.531310 NM_001002923 ENSG00000204869 IGFL4 - IGF like family member 4 protein-coding 369.5-22 chr3 182059385 182060293 + 1 NA Intergenic Intergenic 107475 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 229.5-96 chr3 190902739 190903193 + 1 NA Intergenic Intergenic 25036 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 242.5-79 chr7 81920881 81921174 + 1 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -88150 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 265.75 chr1 103274192 103274779 + 1 NA Intergenic Intergenic -165963 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 233.5-103 chr7 98763619 98763912 + 1 NA Intergenic Intergenic 106249 NM_001134451 222865 Hs.270753 NM_152913 ENSG00000166448 TMEM130 - transmembrane protein 130 protein-coding 236.5-2 chr1 35678901 35679234 + 1 NA Intergenic Intergenic -37541 NM_001199779 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 240.5-91 chr6 78982286 78982583 + 1 NA intron (NM_017934, intron 23 of 39) intron (NM_017934, intron 23 of 39) 95820 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 162.5-42 chr12 106552340 106552544 + 1 NA intron (NR_040246, intron 1 of 3) L1MA6|LINE|L1 -30465 NM_213594 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 170.25-150 chr8 69167044 69167394 + 1 NA Intergenic Intergenic -63029 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 171.75-113 chr5 61475447 61475869 + 1 NA intron (NM_020928, intron 2 of 13) intron (NM_020928, intron 2 of 13) 143400 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 221.5-94 chr7 96609107 96609608 + 1 NA intron (NR_163950, intron 3 of 6) intron (NR_163950, intron 3 of 6) 54981 NR_038948 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 181.25-124 chr8 53509923 53510305 + 1 NA Intergenic Intergenic 13851 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 142.25-104 chr22 32000392 32000552 + 1 NA intron (NR_149128, intron 4 of 4) MER31A|LTR|ERV1 29649 NR_149128 105372999 Hs.512525 NR_149128 LINC02558 - long intergenic non-protein coding RNA 2558 ncRNA 115.25-94 chr2 13192398 13192536 + 1 NA Intergenic Intergenic -185454 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 226.5-49 chr2 188480430 188480671 + 1 NA intron (NM_016315, intron 3 of 11) intron (NM_016315, intron 3 of 11) 183058 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 168.25-98 chr3 62290114 62290348 + 1 NA intron (NM_002841, intron 28 of 29) L1ME3G|LINE|L1 28716 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 152.75-139 chr6 145173573 145173733 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 513224 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 247.75-71 chr9 78490916 78491201 + 1 NA Intergenic Intergenic 193933 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 179.75-52 chr19 40827988 40828288 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17038 NR_144551 171523 Hs.656713 NR_144551 ENSG00000233622 CYP2T1P CYP2T2P cytochrome P450 family 2 subfamily T member 1, pseudogene pseudo 198.75-86 chr6 72486202 72486435 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 119572 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 145.25-185 chrX 151826904 151827075 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 84094 NR_136578 105373368 Hs.256904 NR_136578 MAGEA4-AS1 - MAGEA4 antisense RNA 1 ncRNA 173.25-10 chr1 195591373 195591598 + 1 NA Intergenic Intergenic 497230 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 135.5-183 chr7 39049164 39049345 + 1 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) L1MB8|LINE|L1 -35687 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 187.5-112 chr3 32055624 32055973 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -50713 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 140.25-135 chr4 107851508 107851811 + 1 NA intron (NM_001136258, intron 1 of 6) intron (NM_001136258, intron 1 of 6) 27094 NM_001136258 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 211.25-29 chr15 90650072 90650533 + 1 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) HAL1b|LINE|L1 -9932 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 138.5-68 chr15 67354272 67354478 + 1 NA intron (NM_001031715, intron 6 of 20) L1M5|LINE|L1 -99177 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 152.75-133 chr5 101026260 101026483 + 1 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -123089 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 204.25-81 chr4 78881963 78882243 + 1 NA intron (NM_198892, intron 14 of 15) intron (NM_198892, intron 14 of 15) 57335 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 151.75-73 chr2 229728214 229728493 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13798 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 189.25-97 chr5 103114542 103114923 + 1 NA intron (NR_134299, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 5406 NR_134299 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 130.5-214 chr6 125658149 125658352 + 1 NA Intergenic Intergenic -16103 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 128.5-128 chr21 20220201 20220362 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 38404 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 262.25-13 chr13 43594399 43594693 + 1 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 34931 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 165.5-128 chr4 60239411 60239706 + 1 NA Intergenic Intergenic -683061 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 234.5-21 chr12 108557833 108558222 + 1 NA intron (NM_014706, intron 1 of 18) AluJb|SINE|Alu 3146 NM_014706 9733 Hs.584842 NM_014706 ENSG00000075856 SART3 DSAP1|P100|RP11-13G14|TIP110|p110|p110(nrb) spliceosome associated factor 3, U4/U6 recycling protein protein-coding 197.75-7 chr10 85746745 85747047 + 1 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 169165 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 148.5-138 chr22 40616289 40616494 + 1 NA intron (NM_020831, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 20328 NM_001282661 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 219.25-31 chr2 39414905 39415292 + 1 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) intron (NM_003618, intron 1 of 33) 22187 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 204.25-102 chr6 166378904 166379146 + 1 NA intron (NR_073093, intron 1 of 4) L1MC5a|LINE|L1 3915 NM_016098 51660 Hs.172755 NM_016098 ENSG00000060762 MPC1 BRP44L|CGI-129|MPYCD|SLC54A1 mitochondrial pyruvate carrier 1 protein-coding 331.75-18 chr4 108909052 108909650 + 1 NA intron (NM_198721, intron 12 of 36) intron (NM_198721, intron 12 of 36) -146298 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 145.5-204 chrX 120502718 120502991 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -33505 NM_002294 3920 Hs.496684 NM_002294 ENSG00000005893 LAMP2 CD107b|LAMP-2|LAMPB|LGP-96|LGP110 lysosomal associated membrane protein 2 protein-coding 168.75-123 chr6 97742314 97742493 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -282128 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 267.25-13 chr14 73460782 73461314 + 1 NA non-coding (NR_135251, exon 3 of 3) non-coding (NR_135251, exon 3 of 3) -2468 NM_001320114 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 207.5-28 chr16 28266547 28266905 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25799 NM_001024401 388228 Hs.97837 NM_001024401 ENSG00000188322 SBK1 SBK SH3 domain binding kinase 1 protein-coding 144.5-98 chr2 30566955 30567217 + 1 NA intron (NM_182551, intron 5 of 6) intron (NM_182551, intron 5 of 6) 119840 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 203.5-12 chr1 166675848 166676178 + 1 NA Intergenic Intergenic 72097 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 210.5-2 chr1 40490708 40491129 + 1 NA intron (NM_001320178, intron 5 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 13628 NM_198494 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 137.75-188 chr7 8138747 8139016 + 1 NA exon (NM_001350821, exon 12 of 14) exon (NM_001350821, exon 12 of 14) 123171 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 243.5-77 chr7 118854255 118854609 + 1 NA Intergenic Intergenic 629728 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 266.5-2 chr1 40866795 40867175 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -4622 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 164.75-38 chr12 40766795 40767224 + 1 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 -60929 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 190.5-165 chr8 122842522 122842830 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 61021 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 210.75-40 chr2 109134061 109134313 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR -4068 NR_029193 100287216 Hs.171244 NR_029193 SH3RF3-AS1 - SH3RF3 antisense RNA 1 ncRNA 121.5-132 chr2 72595703 72595881 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) HAL1b|LINE|L1 230241 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 164.5-171 chr5 170778868 170779117 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4727 NM_001291985 2568 Hs.26225 NM_014211 ENSG00000094755 GABRP - gamma-aminobutyric acid type A receptor pi subunit protein-coding 137.25-141 chr6 77828751 77828926 + 1 NA intron (NM_001282136, intron 3 of 4) intron (NM_001282136, intron 3 of 4) 175799 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 163.75-5 chr1 69570120 69570320 + 1 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 879 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 115.75-109 chr2 114380113 114380269 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -62450 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 189.75-108 chr6 157944833 157945180 + 1 NA TTS (NM_016224) TTS (NM_016224) -36857 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 137.5-123 chr2 100075389 100075657 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) intron (NM_001025108, intron 2 of 23) 30060 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 150.5-51 chr14 67627276 67627505 + 1 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) intron (NM_001172, intron 2 of 7) 7470 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 396.5-12 chr8 133078217 133078829 + 1 NA intron (NM_001045556, intron 1 of 8) intron (NM_001045556, intron 1 of 8) -18169 NM_006748 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 231.5-106 chr9 78326117 78326664 + 1 NA intron (NM_021154, intron 7 of 7) intron (NM_021154, intron 7 of 7) 29265 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 159.25-140 chr7 81114213 81114636 + 1 NA Intergenic Intergenic -192035 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 312.5-29 chr5 133480870 133481202 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -53330 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 126.5-224 chr7 29571030 29571250 + 1 NA Intergenic Intergenic 5607 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 289.5-7 chr11 59827612 59828041 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -17048 NM_017840 54948 Hs.530734 NM_017840 ENSG00000166902 MRPL16 L16mt|MRP-L16|PNAS-111 mitochondrial ribosomal protein L16 protein-coding 251.25-11 chr11 84716035 84716302 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1MA9|LINE|L1 4774 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 146.75-37 chr13 49790964 49791247 + 1 NA intron (NM_002267, intron 1 of 16) intron (NM_002267, intron 1 of 16) 1577 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 169.25 chr1 55386891 55387204 + 1 NA Intergenic Intergenic 161406 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 283.25-17 chr17 77196148 77196469 + 1 NA exon (NM_001143998, exon 8 of 17) exon (NM_001143998, exon 8 of 17) 11095 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 152.75-77 chr19 9148930 9149185 + 1 NA intron (NR_102435, intron 1 of 6) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 8660 NR_102435 57693 Hs.465829 NM_020933 ENSG00000130803 ZNF317 - zinc finger protein 317 protein-coding 175.5-43 chr12 63454185 63454396 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 214203 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 273.25-28 chr5 7429808 7430205 + 1 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) L1MEc|LINE|L1 33868 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 140.25-115 chr3 24843195 24843470 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 14009 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 146.5-165 chr5 8314241 8314466 + 1 NA Intergenic Intergenic 143211 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 175.5-156 chr8 37428913 37429112 + 1 NA intron (NR_121620, intron 5 of 6) intron (NR_121620, intron 5 of 6) 64901 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 263.5-2 chr1 241865523 241866015 + 1 NA intron (NM_001319224, intron 9 of 14) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17038 NM_003686 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 265.25-21 chr18 1514351 1514746 + 1 NA Intergenic Intergenic -154919 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 324.75-3 chr1 200880299 200881000 + 1 NA Intergenic Intergenic 7668 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 123.5-212 chr8 132035729 132035887 + 1 NA intron (NM_001080399, intron 9 of 13) MIRb|SINE|MIR 23574 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 119.25-189 chr7 38895531 38895713 + 1 NA intron (NM_014396, intron 2 of 28) intron (NM_014396, intron 2 of 28) 13569 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 187.25-66 chr21 28931385 28931720 + 1 NA intron (NM_015565, intron 28 of 29) intron (NM_015565, intron 28 of 29) -46179 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 188.25-117 chr8 105724370 105724699 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 335969 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 156.25-147 chr8 83170261 83170508 + 1 NA Intergenic Intergenic -233374 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 283.5-7 chr10 89259253 89259678 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -7426 NM_001288979 3988 Hs.643030 NM_000235 ENSG00000107798 LIPA CESD|LAL lipase A, lysosomal acid type protein-coding 113.5-82 chr15 60149427 60149650 + 1 NA Intergenic Intergenic 145227 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 213.5-48 chr16 81861515 81861951 + 1 NA intron (NM_002661, intron 5 of 32) intron (NM_002661, intron 5 of 32) 82442 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 206.25-35 chr14 32655646 32655976 + 1 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) L2b|LINE|L2 -283068 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 230.5-17 chr10 112401867 112402150 + 1 NA intron (NM_203379, intron 3 of 20) AluJb|SINE|Alu 25810 NM_016234 51703 Hs.11638 NM_016234 ENSG00000197142 ACSL5 ACS2|ACS5|FACL5 acyl-CoA synthetase long chain family member 5 protein-coding 204.5-140 chr9 101497018 101497267 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -9969 NM_001303107 84302 Hs.388742 NM_032342 ENSG00000165152 TMEM246 C9orf125 transmembrane protein 246 protein-coding 155.25-50 chr12 128794018 128794333 + 1 NA 3' UTR (NM_145648, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_145648, exon 8 of 8) 29783 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 225.5-75 chr3 169732384 169732773 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 32482 NR_001566 7012 Hs.436182 NR_001566 ENSG00000277925 TERC DKCA1|PFBMFT2|SCARNA19|TR|TRC3|hTR telomerase RNA component ncRNA 206.5-33 chr16 52421076 52421415 + 1 NA Intergenic Intergenic 125898 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 149.5-68 chr15 101681066 101681285 + 1 NA intron (NM_152334, intron 12 of 18) L1M5|LINE|L1 -28784 NM_001308026 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 208.75-38 chr2 104260121 104260427 + 1 NA Intergenic Intergenic 148058 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 227.5-74 chr3 146081339 146081623 + 1 NA intron (NM_182943, intron 12 of 19) intron (NM_182943, intron 12 of 19) -12296 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 209.5-141 chr8 80429913 80430227 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -55523 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 234.25-27 chr17 66061616 66062101 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 11 of 26) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 130034 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 179.5-138 chr4 96252088 96252422 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -58448 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 248.5-35 chr17 35641533 35641918 + 1 NA intron (NM_001030006, intron 11 of 21) intron (NM_001030006, intron 11 of 21) 54403 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 130.5-15 chr1 89485320 89485559 + 1 NA Intergenic Intergenic -39390 NM_001134476 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 174.75-7 chr1 192812881 192813122 + 1 NA TTS (NM_002923) TTS (NM_002923) 3962 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 191.25-56 chr2 106012008 106012250 + 1 NA Intergenic Intergenic -53559 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 166.5-11 chr1 98270255 98270446 + 1 NA intron (NR_046088, intron 2 of 2) intron (NR_046088, intron 2 of 2) 59639 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 232.75-33 chr2 73252323 73252635 + 1 NA intron (NM_001009570, intron 6 of 6) intron (NM_001009570, intron 6 of 6) 18171 NM_006429 10574 Hs.368149 NM_006429 ENSG00000135624 CCT7 CCTETA|CCTH|NIP7-1|TCP1ETA chaperonin containing TCP1 subunit 7 protein-coding 155.75-106 chr3 115164199 115164364 + 1 NA Intergenic Intergenic -16993 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 366.25-17 chr9 105686861 105687420 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7401 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 229.5-80 chr20 47399123 47399642 + 1 NA intron (NR_146496, intron 1 of 2) (ATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12012 NR_146495 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 167.5-46 chr12 41831834 41832079 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 67767 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 189.5-15 chr1 199426550 199426759 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 278056 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 136.25-139 chr5 9199895 9200091 + 1 NA intron (NM_003966, intron 9 of 22) intron (NM_003966, intron 9 of 22) -146098 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 169.5-124 chr4 67878454 67878700 + 1 NA intron (NM_004262, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 5425 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 195.5-139 chr6 140698325 140698647 + 1 NA Intergenic Intergenic 14672 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 114.5-220 chr5 123349124 123349242 + 1 NA intron (NM_153223, intron 20 of 20) MIRb|SINE|MIR 74409 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 167.75-26 chr10 92819483 92819668 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7256 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 129.75-52 chr12 76452383 76452656 + 1 NA intron (NM_001319652, intron 5 of 25) L2a|LINE|L2 -29234 NM_001319655 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 162.5-70 chr18 6664168 6664468 + 1 NA Intergenic Intergenic -65398 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 197.5-88 chr22 26155333 26155711 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -13940 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 161.5-186 chr8 123566113 123566404 + 1 NA Intergenic Intergenic -25052 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 301.5-34 chr3 12226418 12227008 + 1 NA Intergenic Intergenic -60772 NM_001354666 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 172.25-116 chr5 141321938 141322155 + 1 NA Intergenic Intergenic -1262 NM_005642 6879 Hs.438838 NM_005642 ENSG00000178913 TAF7 TAF2F|TAFII55 TATA-box binding protein associated factor 7 protein-coding 401.5-6 chr17 71412762 71413458 + 1 NA Intergenic Intergenic -210931 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 294.25-10 chr12 25217467 25217888 + 1 NA intron (NM_001369786, intron 4 of 5) AluJo|SINE|Alu 22440 NM_001001660 144363 Hs.209151 NM_001001660 ENSG00000205707 ETFRF1 LYRM5 electron transfer flavoprotein regulatory factor 1 protein-coding 195.25-15 chr10 18822729 18823062 + 1 NA Intergenic Intergenic 163464 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 143.5-80 chr15 77428593 77428834 + 1 NA intron (NM_001304505, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu 7825 NM_001304504 10363 Hs.69594 NM_018200 ENSG00000140382 HMG20A HMGX1|HMGXB1 high mobility group 20A protein-coding 137.5-15 chr1 188108374 188108690 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 664904 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 300.75-6 chr10 91458254 91458590 + 1 NA intron (NM_182765, intron 2 of 20) L1MD1|LINE|L1 48137 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 292.5-47 chr7 98815772 98816234 + 1 NA Intergenic Intergenic 54011 NM_001134451 222865 Hs.270753 NM_152913 ENSG00000166448 TMEM130 - transmembrane protein 130 protein-coding 130.5-139 chr2 133773684 133773879 + 1 NA Intergenic Intergenic -205318 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 206.25-86 chr5 113991167 113991535 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -370719 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 172.75-60 chr2 68771426 68771698 + 1 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) intron (NM_001364821, intron 1 of 10) -3348 NM_014882 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 262.25-30 chr3 108573985 108574434 + 1 NA intron (NM_020890, intron 8 of 20) L1ME3A|LINE|L1 15229 NM_020890 57650 Hs.591308 NM_020890 ENSG00000163507 CIP2A KIAA1524|p90 cell proliferation regulating inhibitor of protein phosphatase 2A protein-coding 339.5-33 chr8 106647696 106648472 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -9724 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 137.75-3 chr1 63533207 63533511 + 1 NA intron (NM_032437, intron 4 of 13) intron (NM_032437, intron 4 of 13) 9834 NM_032437 84455 Hs.652324 NM_032437 ENSG00000203965 EFCAB7 - EF-hand calcium binding domain 7 protein-coding 205.5-16 chr10 109273142 109273430 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 649960 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 130.5-208 chr5 105495689 105495878 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 396309 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 167.75-114 chr5 65047821 65048215 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 279088 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 222.25-18 chr14 48358601 48358987 + 1 NA Intergenic Intergenic -563780 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 188.75-125 chrX 112622817 112623207 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 56926 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 146.5-123 chr2 237077400 237077640 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -7921 NM_198189 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 183.5-137 chr7 52536011 52536368 + 1 NA Intergenic Intergenic -499444 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 153.25-74 chr2 194112296 194112476 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -231883 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 227.25-79 chr8 84601900 84602187 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L2|LINE|L2 -103884 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 208.5-81 chr20 11940799 11941068 + 1 NA Intergenic Intergenic 23040 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 114.5-160 chr20 48534133 48534315 + 1 NA Intergenic Intergenic 174313 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 278.75 chr1 167748889 167749265 + 1 NA intron (NM_024569, intron 1 of 4) intron (NM_024569, intron 1 of 4) 27095 NM_003953 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 154.5-189 chr8 116906881 116907126 + 1 NA Intergenic Intergenic -31204 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 129.5-44 chr11 94987813 94988020 + 1 NA intron (NM_018039, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 14207 NM_018039 55693 Hs.503598 NM_018039 ENSG00000186280 KDM4D JMJD2D lysine demethylase 4D protein-coding 267.75-53 chr7 37365276 37365722 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) -11831 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 170.75 chr1 24910703 24910879 + 1 NA intron (NM_001320672, intron 5 of 6) L3|LINE|CR1 8625 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 186.25-57 chr2 213242009 213242343 + 1 NA Intergenic Intergenic 42033 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 151.5-28 chr11 99778855 99779031 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 222798 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 129.25-43 chr14 24642163 24642429 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -8106 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 166.75-12 chr10 19328784 19329009 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 23 of 39) intron (NM_001142308, intron 23 of 39) 280095 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 226.5-43 chr2 67598031 67598443 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 200904 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 148.5-232 chr8 126454070 126454354 + 1 NA Intergenic Intergenic 104266 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 136.25-96 chr2 145715333 145715590 + 1 NA Intergenic Intergenic -871596 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 228.25-90 chr9 90908144 90908430 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 80867 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 196.75-9 chr1 217864775 217865002 + 1 NA intron (NM_138796, intron 10 of 10) intron (NM_138796, intron 10 of 10) -28012 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 266.5-46 chr20 44758489 44759001 + 1 NA intron (NM_182970, intron 2 of 5) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -12518 NR_132377 106144538 Hs.255479 NR_132377 KCNK15-AS1 - KCNK15 and WISP2 antisense RNA 1 ncRNA 348.75-13 chr2 192391498 192391947 + 1 NA Intergenic Intergenic -196789 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 215.25-55 chr22 36089092 36089352 + 1 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -60398 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 157.75-128 chr4 176506266 176506578 + 1 NA Intergenic Intergenic 186456 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 120.5-173 chr5 4603756 4603963 + 1 NA Intergenic Intergenic -169622 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 193.75-49 chr14 88216544 88216799 + 1 NA intron (NM_138317, intron 4 of 6) intron (NM_138317, intron 4 of 6) 54240 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 120.25-151 chr4 71983935 71984081 + 1 NA Intergenic Intergenic -47796 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 235.25-2 chr1 86124836 86125191 + 1 NA non-coding (NR_146343, exon 3 of 60) non-coding (NR_146343, exon 3 of 60) 31458 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 243.5-24 chr12 15510887 15511332 + 1 NA intron (NM_030667, intron 7 of 26) intron (NM_030667, intron 7 of 26) -35502 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 258.25-61 chr8 55282528 55283096 + 1 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 172509 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 175.5-94 chr2 177777035 177777293 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 10 of 20) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 103842 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 146.25-68 chr2 64014243 64014455 + 1 NA intron (NM_001005739, intron 1 of 22) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 5079 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 136.75-151 chr5 8480987 8481303 + 1 NA Intergenic Intergenic 20220 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 144.75-29 chr11 62022008 62022322 + 1 NA Intergenic Intergenic -54531 NM_002032 2495 Hs.524910 NM_002032 ENSG00000167996 FTH1 FHC|FTH|FTHL6|HFE5|PIG15|PLIF ferritin heavy chain 1 protein-coding 176.25-71 chr2 124545146 124545362 + 1 NA intron (NM_130773, intron 10 of 23) intron (NM_130773, intron 10 of 23) 519967 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 156.5-50 chr14 32571586 32571821 + 1 NA intron (NM_004274, intron 4 of 13) intron (NM_004274, intron 4 of 13) 242405 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 236.5-15 chr12 4762330 4762718 + 1 NA intron (NM_017417, intron 7 of 10) intron (NM_017417, intron 7 of 10) 42124 NM_017417 26290 Hs.511985 NM_017417 ENSG00000130035 GALNT8 GALNAC-T8 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 8 protein-coding 237.5-17 chr10 57155478 57155774 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 148933 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 144.5-81 chr16 87202474 87202743 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -9507 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 140.5-193 chr6 41091770 41091986 + 1 NA intron (NM_021705, intron 6 of 8) L2a|LINE|L2 5909 NM_001329690 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 143.5-202 chr7 137986053 137986255 + 1 NA intron (NM_001253775, intron 1 of 3) intron (NM_001253775, intron 1 of 3) 15932 NM_194071 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 147.25-58 chr2 99280833 99281112 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 20225 NM_174898 129530 Hs.164589 NM_174898 ENSG00000144214 LYG1 SALW1939 lysozyme g1 protein-coding 198.25-59 chr2 139883202 139883633 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 703268 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 169.5-7 chr1 188623978 188624282 + 1 NA Intergenic Intergenic 1180502 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 139.5-124 chr22 26359640 26359852 + 1 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) AluJr|SINE|Alu -69514 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 275.5-38 chr3 14140079 14140457 + 1 NA intron (NM_024334, intron 11 of 11) intron (NM_024334, intron 11 of 11) 15328 NM_024334 79188 Hs.517817 NM_024334 ENSG00000170876 TMEM43 ARVC5|ARVD5|EDMD7|LUMA transmembrane protein 43 protein-coding 151.5-173 chr6 125263487 125263734 + 1 NA 3' UTR (NM_001300994, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001300994, exon 6 of 6) 38357 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 186.5-37 chr14 50837634 50838005 + 1 NA Intergenic Intergenic -6698 NM_182944 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 159.5-41 chr12 23453522 23453741 + 1 NA Intergenic Intergenic 130955 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 139.75-183 chr8 140380898 140381178 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) AluSz|SINE|Alu 76706 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 143.5-164 chr4 121482761 121482961 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -101843 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 268.75-17 chr2 153956697 153957224 + 1 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) MER66-int|LTR|ERV1 12566 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 178.5-80 chr2 67447971 67448171 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 50738 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 129.75-196 chr9 102352045 102352299 + 1 NA Intergenic Intergenic -167465 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 180.5-56 chr16 74256224 74256426 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -40489 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 202.75-88 chr5 26997060 26997375 + 1 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) intron (NM_016279, intron 1 of 11) 41369 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 219.5-85 chr3 40487084 40487303 + 1 NA exon (NM_001363277, exon 6 of 6) exon (NM_001363277, exon 6 of 6) 10071 NM_001145093 285267 Hs.407159 NM_173656 ENSG00000177873 ZNF619 - zinc finger protein 619 protein-coding 142.5-62 chr14 47216655 47216857 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 126490 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 303.5-2 chr1 46702337 46702833 + 1 NA intron (NM_014774, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR 16529 NM_014774 9813 Hs.707688 NM_014774 ENSG00000159658 EFCAB14 KIAA0494 EF-hand calcium binding domain 14 protein-coding 146.5-145 chr3 184333664 184333915 + 1 NA intron (NM_198244, intron 29 of 29) intron (NM_198244, intron 29 of 29) -2137 NM_001366134 131408 Hs.591307 NM_144635 ENSG00000175182 FAM131A C3orf40|FLAT715|PRO1378 family with sequence similarity 131 member A protein-coding 198.5-90 chr20 55561956 55562192 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -134877 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 251.75-25 chr14 71594271 71594567 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) intron (NM_001354286, intron 6 of 24) 8121 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 113.5-235 chr8 102229856 102229995 + 1 NA intron (NM_001172478, intron 1 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 8906 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 273.75-41 chr8 36678142 36678641 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -105983 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 180.5-25 chr12 29041046 29041394 + 1 NA Intergenic Intergenic -108058 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 125.5-61 chr12 121630647 121630848 + 1 NA intron (NM_032790, intron 2 of 2) intron (NM_032790, intron 2 of 2) 4197 NM_032790 84876 Hs.55148 NM_032790 ORAI1 CRACM1|IMD9|ORAT1|TAM2|TMEM142A ORAI calcium release-activated calcium modulator 1 protein-coding 122.5-217 chr7 149329383 149329695 + 1 NA Intergenic Intergenic 44258 NR_036573 155060 Hs.490512 NR_015357 ENSG00000244560 LOC155060 - AI894139 pseudogene pseudo 115.5-257 chrX 43197109 43197412 + 1 NA intron (NR_110387, intron 3 of 5) MER34|LTR|ERV1 20266 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 287.25-10 chr10 84478204 84478542 + 1 NA intron (NM_001284240, intron 9 of 9) intron (NM_001284240, intron 9 of 9) 53204 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 177.5-11 chr1 213222606 213222947 + 1 NA intron (NM_001349662, intron 9 of 15) intron (NM_001349662, intron 9 of 15) 171535 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 180.75-118 chr5 114288694 114288917 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -73265 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 176.5-159 chr7 95737471 95737755 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -34893 NM_004411 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 120.25-106 chr2 231769604 231769826 + 1 NA intron (NM_002601, intron 1 of 4) FRAM|SINE|Alu 11567 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 227.5-32 chr14 74779984 74780311 + 1 NA intron (NM_019589, intron 2 of 20) intron (NM_019589, intron 2 of 20) 16831 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 120.5-200 chr6 80637392 80637579 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 530814 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 247.5-83 chr8 77315280 77315646 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -135234 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 187.75-86 chr5 40773812 40774110 + 1 NA intron (NM_001355029, intron 2 of 7) HAL1|LINE|L1 -18000 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 227.75-19 chr13 24039200 24039704 + 1 NA intron (NM_001286792, intron 3 of 14) intron (NM_001286792, intron 3 of 14) 59650 NR_104595 221178 Hs.434298 NM_153023 ENSG00000182957 SPATA13 ARHGEF29|ASEF2 spermatogenesis associated 13 protein-coding 257.25-45 chr6 28095463 28095840 + 1 NA TTS (NR_024063) TTS (NR_024063) 4844 NR_024063 221584 Hs.634723 NR_024063 ZSCAN12P1 ZNF187p1|ZNF305P1|ZNF96L1|ZNF96P1|ZSCAN12L1|dJ313I6.7 zinc finger and SCAN domain containing 12 pseudogene 1 pseudo 224.5-58 chr2 43252841 43253148 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 36 of 37) intron (NM_001083953, intron 36 of 37) 25783 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 122.5-9 chr1 101398574 101398793 + 1 NA Intergenic Intergenic 74846 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 179.75-112 chr6 1339871 1340107 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 27891 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 175.5-57 chr15 52620375 52620654 + 1 NA intron (NM_019600, intron 2 of 12) intron (NM_019600, intron 2 of 12) 31526 NM_001286495 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 141.5-88 chr19 41740260 41740475 + 1 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -15163 NM_002483 4680 Hs.466814 NM_002483 ENSG00000086548 CEACAM6 CD66c|CEAL|NCA carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 6 protein-coding 188.25-10 chr10 60866536 60866744 + 1 NA Intergenic Intergenic 77545 NM_001242359 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 169.25-126 chr8 129165724 129166018 + 1 NA Intergenic Intergenic 75369 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 174.25-17 chr10 28586544 28586869 + 1 NA intron (NM_100486, intron 4 of 12) AluJr|SINE|Alu 53588 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 320.5-24 chr2 219129860 219130226 + 1 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) 30822 NM_024782 79840 Hs.225988 NM_024782 ENSG00000187736 NHEJ1 XLF non-homologous end joining factor 1 protein-coding 133.5-208 chr5 65806579 65806761 + 1 NA intron (NM_020726, intron 9 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 84465 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 141.5-20 chr11 3745139 3745416 + 1 NA intron (NR_157590, intron 11 of 31) intron (NR_157590, intron 11 of 31) 52269 NR_157591 4928 Hs.524750 NM_005387 ENSG00000110713 NUP98 ADIR2|NUP196|NUP96 nucleoporin 98 protein-coding 154.25-60 chr16 63513474 63513669 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -1477133 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 121.75-156 chr6 11508466 11508606 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29213 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 251.75-61 chr4 96309818 96310277 + 1 NA promoter-TSS (NR_147149) promoter-TSS (NR_147149) -656 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 247.25-63 chr9 131871940 131872439 + 1 NA intron (NM_001253881, intron 5 of 6) intron (NM_001253881, intron 5 of 6) -132245 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 179.75-108 chr5 127450003 127450298 + 1 NA intron (NM_001256545, intron 22 of 24) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -67490 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 218.25-26 chr14 50846403 50846743 + 1 NA Intergenic Intergenic -15452 NM_182944 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 239.25-37 chr17 72544608 72544898 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) L1PA3|LINE|L1 48051 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 281.75-22 chr17 55375334 55375781 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 46278 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 244.25-41 chr5 159220077 159220420 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7467 NR_134261 105377682 NR_134261 ENSG00000253315 LINC01932 - long intergenic non-protein coding RNA 1932 ncRNA 269.5-20 chr16 58256041 58256336 + 1 NA intron (NM_014157, intron 3 of 8) intron (NM_014157, intron 3 of 8) 6252 NM_001142302 29070 Hs.11614 NM_014157 ENSG00000103021 CCDC113 HSPC065 coiled-coil domain containing 113 protein-coding 193.75-3 chr1 66444559 66444871 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -88878 NM_001308203 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 403.5-6 chr4 64822801 64823576 + 1 NA Intergenic Intergenic 181312 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 117.5-242 chr9 31168851 31169077 + 1 NA Intergenic Intergenic 212526 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 194.75-49 chr2 15704658 15705060 + 1 NA intron (NR_110201, intron 4 of 5) intron (NR_110201, intron 4 of 5) 14077 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 146.5-156 chr4 88643713 88643923 + 1 NA intron (NM_001318505, intron 3 of 8) L1MEf|LINE|L1 51338 NM_001318505 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 146.75-20 chr10 98727031 98727260 + 1 NA intron (NM_001166245, intron 2 of 9) L1M4a2|LINE|L1 197423 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 233.5-60 chr2 232780207 232780672 + 1 NA intron (NM_001103147, intron 10 of 30) intron (NM_001103147, intron 10 of 30) -3874 NM_001172416 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 124.5-160 chr5 11652552 11652729 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -63574 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 152.5-200 chrX 134976111 134976329 + 1 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -14771 NM_001163438 644538 Hs.42239 NM_001163438 ENSG00000184785 SMIM10 CXorf69 small integral membrane protein 10 protein-coding 142.75-154 chr5 77371273 77371501 + 1 NA intron (NM_001029854, intron 9 of 20) L1ME2z|LINE|L1 120929 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 157.5-167 chr5 147487724 147488038 + 1 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 22187 NM_001197294 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 196.5-21 chr10 59167573 59167868 + 1 NA Intergenic Intergenic 8744 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 115.25-21 chr1 212185441 212185711 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 49160 NR_125982 101929541 Hs.632493 NR_125982 ENSG00000226251 LINC02608 - long intergenic non-protein coding RNA 2608 ncRNA 238.25-42 chr2 201396980 201397264 + 1 NA intron (NM_015049, intron 7 of 15) intron (NM_015049, intron 7 of 15) -39724 NM_139163 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 155.75-108 chr3 128681635 128681898 + 1 NA Intergenic Intergenic -30948 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 155.75-118 chr4 49091291 49091587 + 1 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 104797 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 235.5-51 chr2 201232894 201233189 + 1 NA promoter-TSS (NM_001080124) promoter-TSS (NM_001080124) -402 NM_001228 841 Hs.599762 NM_001228 ENSG00000064012 CASP8 ALPS2B|CAP4|Casp-8|FLICE|MACH|MCH5 caspase 8 protein-coding 222.75-78 chr5 37006258 37006710 + 1 NA exon (NM_133433, exon 17 of 47) exon (NM_133433, exon 17 of 47) 129715 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 208.75-69 chr5 126312800 126313060 + 1 NA Intergenic Intergenic -27755 NR_105039 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 124.5-111 chr2 161100295 161100495 + 1 NA Intergenic Intergenic -36560 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 165.75-140 chr5 157895561 157895884 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -36577 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 205.25-110 chr9 86861237 86861474 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 86151 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 112.75-70 chr15 62607794 62608041 + 1 NA Intergenic Intergenic 37264 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 115.25-198 chr8 36733288 36733567 + 1 NA Intergenic Intergenic -50947 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 149.5-185 chr7 48585528 48585742 + 1 NA intron (NM_152701, intron 56 of 61) intron (NM_152701, intron 56 of 61) -338912 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 179.5-72 chr17 60757646 60757992 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) L1MA4A|LINE|L1 79968 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 177.75-27 chr12 21984744 21985150 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -48253 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 238.25-49 chr3 126732892 126733406 + 1 NA exon (NM_001320610, exon 4 of 8) exon (NM_001320610, exon 4 of 8) 28909 NM_032343 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 155.5-194 chr7 36882558 36882813 + 1 NA intron (NR_038120, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 36747 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 195.75-47 chr15 92485184 92485440 + 1 NA intron (NR_161371, intron 2 of 2) intron (NR_161371, intron 2 of 2) 13635 NR_161371 145858 Hs.367879 NM_153040 C15orf32 - chromosome 15 open reading frame 32 ncRNA 130.25-155 chr4 168413675 168413918 + 1 NA intron (NM_001345927, intron 22 of 37) L1M1|LINE|L1 66696 NM_001291510 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 334.5-8 chr18 71326518 71327158 + 1 NA Intergenic MER74C|LTR|ERVL 252118 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 247.5-60 chr4 130750073 130750572 + 1 NA Intergenic Intergenic 373961 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 264.25-47 chr7 46665429 46665856 + 1 NA Intergenic Intergenic 31480 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 126.75-199 chr5 115612657 115612922 + 1 NA TTS (NM_181836) TTS (NM_181836) -10310 NM_021649 353376 Hs.718838 NM_021649 ENSG00000243414 TICAM2 MyD88-4|TICAM-2|TIRAP3|TIRP|TRAM toll like receptor adaptor molecule 2 protein-coding 213.25-57 chr6 8822867 8823133 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 170791 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 216.5-85 chr4 26797891 26798225 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 62186 NR_134675 105374546 Hs.548859 NR_134673 STIM2-AS1 - STIM2 antisense RNA 1 ncRNA 217.75-15 chr10 63203989 63204355 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 9 of 24) intron (NM_001322258, intron 9 of 24) 65051 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 162.25-108 chr3 194594944 194595163 + 1 NA intron (NM_138399, intron 9 of 10) intron (NM_138399, intron 9 of 10) 10785 NR_047575 100507297 Hs.586059 NR_047573 TMEM44-AS1 - TMEM44 antisense RNA 1 ncRNA 243.25-22 chr17 61811518 61811814 + 1 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) intron (NM_032043, intron 6 of 19) 51893 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 305.25-35 chr3 172137612 172138021 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 97285 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 183.5-83 chr20 23389544 23390014 + 1 NA intron (NM_001283026, intron 6 of 9) L1MB7|LINE|L1 25416 NM_001317019 64412 Hs.709462 NM_022482 ENSG00000125812 GZF1 JLSM|ZBTB23|ZNF336 GDNF inducible zinc finger protein 1 protein-coding 171.5-22 chr11 38675896 38676183 + 1 NA Intergenic Intergenic 27181 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 115.5-68 chr14 72534472 72534617 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 15 of 16) L1MA8|LINE|L1 17724 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 319.25-2 chr10 51970086 51970741 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) L1MC4|LINE|L1 -270818 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 119.5-203 chr6 154226044 154226231 + 1 NA intron (NM_015553, intron 5 of 11) L2c|LINE|L2 103944 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 132.75-186 chr8 70925834 70926087 + 1 NA Intergenic Intergenic 256621 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 284.75-22 chr22 40826877 40827455 + 1 NA exon (NM_001278589, exon 11 of 12) exon (NM_001278589, exon 11 of 12) -7767 NM_001282726 10478 Hs.474938 NM_006358 ENSG00000100372 SLC25A17 PMP34 solute carrier family 25 member 17 protein-coding 151.5-74 chr2 25827328 25827599 + 1 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) intron (NM_018263, intron 2 of 11) 3438 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 126.5-126 chr2 228226933 228227206 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -45382 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 184.5-4 chr1 63703450 63703661 + 1 NA Intergenic Intergenic -70462 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 144.5-140 chr4 19984376 19984603 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -267416 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 137.25-74 chr2 99620992 99621169 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 12 of 23) intron (NM_001025108, intron 12 of 23) -131063 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 146.75-160 chr8 105878396 105878572 + 1 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 182019 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 246.25-65 chr7 95848699 95848970 + 1 NA intron (NM_004411, intron 5 of 16) L1MA8|LINE|L1 76328 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 177.5-57 chr16 50034032 50034281 + 1 NA exon (NM_001281789, exon 5 of 6) exon (NM_001281789, exon 5 of 6) 8950 NR_104043 255919 Hs.59134 NM_153261 ENSG00000205423 CNEP1R1 C16orf69|NEP1-R1|NEP1R1|TMEM188|TMP125 CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 protein-coding 144.5-162 chr4 149861539 149861789 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -45821 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 139.25-37 chr12 20593058 20593287 + 1 NA intron (NM_001244683, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 21308 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 189.5-6 chr1 83873831 83874159 + 1 NA intron (NM_001350215, intron 19 of 19) L1MB4|LINE|L1 -12999 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 168.25-51 chr15 82671327 82671498 + 1 NA intron (NM_001278512, intron 14 of 26) L1MA3|LINE|L1 -8737 NM_001348441 8120 Hs.199593 NM_004644 ENSG00000103723 AP3B2 EIEE48|NAPTB adaptor related protein complex 3 subunit beta 2 protein-coding 211.75-43 chr2 41503700 41503924 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -373743 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 279.5-43 chr3 155067476 155067935 + 1 NA intron (NM_001354642, intron 1 of 22) L1ME1|LINE|L1 -11967 NM_000902 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 173.25-46 chr16 82867588 82867833 + 1 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) 94391 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 162.75-150 chr8 126531966 126532182 + 1 NA Intergenic Intergenic 26404 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 141.5-158 chr4 31815734 31815892 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -181566 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 224.5-56 chr2 8914343 8914574 + 1 NA intron (NR_135605, intron 1 of 11) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -76845 NM_020738 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 167.25-83 chr2 103025135 103025428 + 1 NA Intergenic Intergenic -40852 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 239.5-44 chr2 236144533 236144794 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 23723 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 209.5-143 chr8 88586010 88586361 + 1 NA Intergenic Intergenic -258702 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 287.75-20 chr15 68200196 68200545 + 1 NA intron (NM_001286694, intron 1 of 3) intron (NM_001286694, intron 1 of 3) 5740 NM_001286694 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 125.75-33 chr11 20556012 20556178 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -43305 NM_004211 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 112.75-211 chr9 108712407 108712534 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 143516 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 151.75-163 chr9 79614830 79615113 + 1 NA intron (NM_001351563, intron 5 of 17) L1MC|LINE|L1 41794 NM_001351546 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 170.75-125 chr7 33453716 33453933 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 324260 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 181.5-65 chr19 30342369 30342561 + 1 NA Intergenic Intergenic -29919 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 132.75-140 chr4 110187416 110187622 + 1 NA intron (NM_001130721, intron 2 of 4) AluSq|SINE|Alu 11096 NM_024090 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 124.75-68 chr13 32210524 32210733 + 1 NA intron (NM_023037, intron 33 of 60) intron (NM_023037, intron 33 of 60) 101326 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 160.75-90 chr20 50523380 50523599 + 1 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) 13106 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 209.75-52 chr2 116441056 116441482 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 1097454 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 181.25-92 chr4 98960175 98960467 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -29684 NM_001130679 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 180.5-34 chr14 21346423 21346804 + 1 NA intron (NM_020366, intron 22 of 23) MER53|DNA|hAT 37406 NM_007192 11198 Hs.213724 NM_007192 ENSG00000092201 SUPT16H CDC68|FACTP140|SPT16|SPT16/CDC68 SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit protein-coding 287.25-28 chr2 199171874 199172655 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 285675 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 204.75-81 chr4 69999035 69999298 + 1 NA intron (NM_001009181, intron 2 of 4).2 intron (NM_001009181, intron 2 of 4).2 3200 NM_003154 6779 Hs.654495 NM_003154 ENSG00000126549 STATH STR statherin protein-coding 239.25-27 chr14 48236656 48236943 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -441785 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 245.5-26 chr15 61542961 61543315 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -186780 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 140.5-235 chr8 114070405 114070630 + 1 NA Intergenic Intergenic -633578 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 162.5-105 chr22 38277239 38277555 + 1 NA Intergenic Intergenic -4387 NM_001195072 25829 Hs.182626 NM_012264 ENSG00000198792 TMEM184B C22orf5|FM08|HS5O6A|HSPC256 transmembrane protein 184B protein-coding 167.5-27 chr10 84918087 84918332 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 280696 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 263.25-32 chr21 18984634 18984923 + 1 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -224966 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 241.75-11 chr10 121326938 121327256 + 1 NA Intergenic Intergenic 204217 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 290.5-34 chr5 51473267 51473760 + 1 NA Intergenic Intergenic 90065 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 169.5-58 chr15 38741518 38741913 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 45117 NR_160786 229.5-74 chr2 192696228 192696695 + 1 NA Intergenic Intergenic -53384 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 192.5-3 chr1 73069980 73070211 + 1 NA Intergenic Intergenic -236075 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 131.75-100 chr18 56952102 56952286 + 1 NA intron (NM_015285, intron 25 of 27) intron (NM_015285, intron 25 of 27) 119925 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 135.5-158 chr5 21583703 21583923 + 1 NA intron (NR_027026, intron 4 of 4) intron (NR_027026, intron 4 of 4) 124333 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 208.25-97 chr9 31095071 31095461 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 286224 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 205.5-118 chr5 145715599 145715848 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 119619 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 124.5-60 chr14 45216915 45217130 + 1 NA exon (NM_018353, exon 13 of 17) exon (NM_018353, exon 13 of 17) 36180 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 217.5-56 chr18 33955682 33956030 + 1 NA intron (NM_001198546, intron 7 of 9) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 92756 NM_001353236 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 189.5-98 chr4 47014589 47014838 + 1 NA Intergenic Intergenic -16854 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 287.25-9 chr10 75210551 75211029 + 1 NA 5' UTR (NM_003375, exon 2 of 11) 5' UTR (NM_003375, exon 2 of 11) 636 NM_001324088 7417 Hs.355927 NM_003375 ENSG00000165637 VDAC2 POR voltage dependent anion channel 2 protein-coding 181.75-13 chr1 246984549 246984880 + 1 NA TTS (NM_020394) TTS (NM_020394) 23343 NR_037892 57116 Hs.669893 NM_020394 ENSG00000197472 ZNF695 SBZF3 zinc finger protein 695 protein-coding 212.5-47 chr2 81246868 81247113 + 1 NA Intergenic Intergenic 219956 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 224.25-41 chr2 32559402 32559751 + 1 NA intron (NR_125793, intron 1 of 1) intron (NR_125793, intron 1 of 1) 15242 NR_125793 103752586 Hs.666092 NR_125793 ENSG00000279897 BIRC6-AS2 linc-birc6|megamind BIRC6 antisense RNA 2 ncRNA 152.75-79 chr2 6730646 6730968 + 1 NA intron (NR_038369, intron 4 of 5) intron (NR_038369, intron 4 of 5) 39504 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 177.5-98 chr2 222029266 222029511 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -268759 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 261.75-33 chr4 115913072 115913540 + 1 NA Intergenic Intergenic -386419 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 155.75-143 chr6 151702397 151702593 + 1 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) intron (NM_001122742, intron 2 of 9) 11999 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 245.75-29 chr2 159786513 159786815 + 1 NA intron (NM_001198760, intron 33 of 37) intron (NM_001198760, intron 33 of 37) 11544 NM_014880 9936 Hs.130014 NM_014880 ENSG00000241399 CD302 BIMLEC|CLEC13A|DCL-1|DCL1 CD302 molecule protein-coding 112.25-24 chr10 94158217 94158404 + 1 NA intron (NM_001165979, intron 2 of 31) intron (NM_001165979, intron 2 of 31) -49516 NR_120616 101927049 Hs.144492 NR_120615 ENSG00000232913 PLCE1-AS2 - PLCE1 antisense RNA 2 ncRNA 259.5-42 chr16 26953510 26953965 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -113190 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 250.5-6 chr1 181100113 181100503 + 1 NA Intergenic Intergenic 11608 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 279.5-59 chr7 11640315 11640798 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 191642 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 121.5-270 chrX 99408748 99408936 + 1 NA Intergenic Intergenic 1001431 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 171.75-124 chr7 282558 282771 + 1 NA Intergenic Intergenic 90093 NM_020223 56975 Hs.134742 NM_020223 ENSG00000177706 FAM20C DMP-4|DMP4|G-CK|GEF-CK|RNS FAM20C golgi associated secretory pathway kinase protein-coding 234.75-72 chr7 10178397 10178930 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -524013 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 185.5-88 chr2 203184148 203184431 + 1 NA intron (NM_001114132, intron 43 of 54) AluSx1|SINE|Alu -54152 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 141.5-32 chr12 8903579 8903807 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10816 NM_004426 1911 Hs.744902 NM_004426 ENSG00000111752 PHC1 EDR1|HPH1|MCPH11|RAE28 polyhomeotic homolog 1 protein-coding 229.25-43 chr2 99160823 99161149 + 1 NA intron (NM_145198, intron 3 of 3) intron (NM_145198, intron 3 of 3) 5912 NM_001204830 51601 Hs.719172 NM_015929 ENSG00000144182 LIPT1 LIPT1D lipoyltransferase 1 protein-coding 163.5-133 chr3 167553978 167554251 + 1 NA intron (NM_001348951, intron 10 of 18) intron (NM_001348951, intron 10 of 18) -79982 NM_001012303 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 226.75-39 chr2 225944408 225944753 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -198214 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 169.75-140 chr7 33321422 33321786 + 1 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) L1MA3|LINE|L1 192040 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 157.5-164 chr5 103099496 103099680 + 1 NA intron (NM_017676, intron 4 of 7) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 20550 NR_134299 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 168.5-174 chr7 95553330 95553535 + 1 NA Intergenic Intergenic 43084 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 168.5-138 chr4 117035733 117035987 + 1 NA Intergenic Intergenic 49716 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 138.25-33 chr11 76832614 76832856 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -28183 NM_001300954 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 175.5-19 chr10 66013030 66013348 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) AluSq2|SINE|Alu 441764 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 219.25-46 chr22 36486678 36486935 + 1 NA TTS (NM_001102371) TTS (NM_001102371) -5166 NM_012473 25828 Hs.211929 NM_012473 ENSG00000100348 TXN2 COXPD29|MT-TRX|MTRX|TRX2|TXN thioredoxin 2 protein-coding 150.75-112 chr20 7056265 7056469 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 197835 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 263.25 chr1 26581132 26581567 + 1 NA Intergenic Intergenic 26807 NR_031740 100302190 NR_031740 ENSG00000238705 MIR1976 hsa-mir-1976 microRNA 1976 ncRNA 201.5-94 chr4 20205798 20206162 + 1 NA Intergenic AluYk11|SINE|Alu -45925 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 144.75-44 chr12 40970682 40970957 + 1 NA intron (NM_001843, intron 15 of 23) MIRb|SINE|MIR 62462 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 218.75-88 chr8 121235064 121235370 + 1 NA Intergenic Intergenic -404129 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-77 chr16 3071548 3071745 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 5862 NM_001012636 9235 Hs.943 NM_004221 ENSG00000008517 IL32 IL-32alpha|IL-32beta|IL-32delta|IL-32gamma|NK4|TAIF|TAIFa|TAIFb|TAIFc|TAIFd interleukin 32 protein-coding 194.25-42 chr16 71644593 71644894 + 1 NA TTS (NM_001289003) TTS (NM_001289003) 18559 NM_001017967 91862 Hs.513706 NM_052858 ENSG00000140832 MARVELD3 MARVD3|MRVLDC3 MARVEL domain containing 3 protein-coding 162.5-19 chr10 84428441 84428617 + 1 NA intron (NM_018999, intron 5 of 10) L1M4|LINE|L1 3360 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 115.75-15 chr10 44743866 44744094 + 1 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -167336 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 182.5-151 chr7 23662797 23663209 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -17196 NM_199136 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 114.5-71 chr12 66658380 66658609 + 1 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) AluYj4|SINE|Alu 20582 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 186.5-127 chr7 54622115 54622328 + 1 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie 65251 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 222.5-33 chr14 102931558 102931813 + 1 NA TTS (NM_030943) TTS (NM_030943) 9029 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 150.25-140 chr7 23527522 23527824 + 1 NA intron (NM_001282757, intron 1 of 8) intron (NM_001282757, intron 1 of 8) 4308 NM_001362760 29896 Hs.445652 NM_013293 ENSG00000164548 TRA2A AWMS1|HSU53209 transformer 2 alpha homolog protein-coding 113.5-18 chr1 172637942 172638098 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -20988 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 159.25-117 chr5 54171260 54171503 + 1 NA intron (NM_019087, intron 2 of 4) intron (NM_019087, intron 2 of 4) 139192 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 169.25-21 chr13 50445488 50445834 + 1 NA intron (NR_109974, intron 4 of 6) intron (NR_109974, intron 4 of 6) 81788 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 243.25-33 chr4 3456279 3456589 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -6872 NM_001363811 285489 Hs.122110 NM_173660 ENSG00000175920 DOK7 C4orf25|CMS10|CMS1B|FADS3 docking protein 7 protein-coding 170.5-34 chr11 40643783 40644017 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1MDa|LINE|L1 -350770 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 203.5-129 chr7 55978040 55978408 + 1 NA exon (NM_001483, exon 2 of 10) exon (NM_001483, exon 2 of 10) 13639 NM_001483 2631 Hs.591069 NM_001483 ENSG00000146729 NIPSNAP2 GBAS nipsnap homolog 2 protein-coding 140.5-251 chrX 47949279 47949546 + 1 NA Intergenic (AAAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 54577 NM_001007088 7569 Hs.189690 NM_006962 ENSG00000147118 ZNF182 HHZ150|KOX14|ZNF21|Zfp182 zinc finger protein 182 protein-coding 213.75-50 chr2 44358560 44358872 + 1 NA intron (NM_001171617, intron 1 of 13) intron (NM_001171617, intron 1 of 13) 1033 NM_001042385 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 113.5-104 chr18 7354588 7354843 + 1 NA Intergenic Intergenic 106291 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 162.25-13 chr1 229079755 229080095 + 1 NA Intergenic Intergenic 94876 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 248.5-77 chr4 168091780 168092162 + 1 NA promoter-TSS (NM_007193) promoter-TSS (NM_007193) -566 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 164.5-50 chr13 95800628 95800883 + 1 NA TTS (NM_020121) TTS (NM_020121) 123616 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 139.5-114 chr20 5280356 5280662 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 36223 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 145.75-61 chr17 28168401 28168800 + 1 NA exon (NM_016231, exon 6 of 11) exon (NM_016231, exon 6 of 11) -57963 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 147.5-113 chr2 170777332 170777617 + 1 NA intron (NR_110644, intron 4 of 4) intron (NR_110644, intron 4 of 4) -6317 NM_001289947 285141 Hs.443729 NM_001289947 ENSG00000204334 ERICH2 - glutamate rich 2 protein-coding 224.25-43 chr2 47538132 47538508 + 1 NA intron (NM_022055, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 10783 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 139.5-191 chr6 66204506 66204682 + 1 NA Intergenic Intergenic 416715 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 179.75-126 chr7 73361429 73361751 + 1 NA Intergenic Intergenic 33429 NM_001281304 8468 Hs.661266 NM_003602 ENSG00000077800 FKBP6 FKBP36 FKBP prolyl isomerase 6 protein-coding 157.5-229 chr9 106642890 106643120 + 1 NA intron (NR_104145, intron 3 of 6) LTR16B1|LTR|ERVL 26947 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 163.25-103 chr3 171917723 171918101 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -17172 NR_046852 100874219 Hs.730556 NR_046852 ENSG00000234717 TMEM212-AS1 - TMEM212 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-162 chrX 81857707 81857976 + 1 NA Intergenic Intergenic 655739 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 200.5-86 chr3 17473577 17473871 + 1 NA intron (NM_014744, intron 3 of 21) intron (NM_014744, intron 3 of 21) 226296 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 254.75-18 chr19 36475246 36475657 + 1 NA intron (NM_001145345, intron 2 of 4) intron (NM_001145345, intron 2 of 4) 13984 NM_032838 84924 Hs.533939 NM_032838 ENSG00000186017 ZNF566 - zinc finger protein 566 protein-coding 235.25-18 chr13 86439853 86440344 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -471822 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 174.25-40 chr12 112865448 112865700 + 1 NA intron (NR_145127, intron 6 of 22) intron (NR_145127, intron 6 of 22) -41203 NM_002534 4938 Hs.524760 NM_002534 ENSG00000089127 OAS1 E18/E16|IFI-4|OIAS|OIASI 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1 protein-coding 192.5-127 chr8 68327073 68327530 + 1 NA intron (NR_038877, intron 1 of 2) intron (NR_038877, intron 1 of 2) -3072 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 129.5-161 chr3 118229321 118229484 + 1 NA Intergenic Intergenic -412366 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 137.25-177 chr9 90508622 90508785 + 1 NA intron (NR_034157, intron 2 of 5) intron (NR_034157, intron 2 of 5) 74043 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 148.5-82 chr17 28922061 28922289 + 1 NA intron (NM_001033561, intron 4 of 14) AluJr|SINE|Alu -4100 NR_110803 101927018 Hs.665702 NR_110803 ENSG00000265845 LOC101927018 - uncharacterized LOC101927018 ncRNA 189.25-110 chr7 19016169 19016418 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 101343 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 391.75-7 chr7 18519521 18520232 + 1 NA intron (NM_001204147, intron 1 of 9) L1ME3G|LINE|L1 10606 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 197.5-43 chr15 85111664 85111889 + 1 NA intron (NM_001243137, intron 12 of 21) L1ME2|LINE|L1 123005 NR_158179 101929479 Hs.681665 NR_158179 LOC101929479 - golgin A2 pseudogene pseudo 135.5-128 chr21 45311349 45311617 + 1 NA Intergenic Intergenic 23431 NR_026943 642852 Hs.11637 NR_026943 ENSG00000223768 LINC00205 NCRNA00205 long intergenic non-protein coding RNA 205 ncRNA 155.5-214 chr9 28731216 28731540 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) L1MD2|LINE|L1 -12073 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 245.25-42 chr2 155863114 155863487 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 391631 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 113.25-48 chr14 70610351 70610650 + 1 NA non-coding (NR_110071, exon 3 of 3) non-coding (NR_110071, exon 3 of 3) -9810 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 186.25-74 chr3 131868837 131869057 + 1 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) 116984 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 169.5-113 chr3 84912444 84912764 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 30514 NR_147147 105377192 NR_147147 ENSG00000242339 LINC02025 - long intergenic non-protein coding RNA 2025 ncRNA 188.25-60 chr2 133359839 133360055 + 1 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 93752 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 129.75-83 chr18 49267037 49267176 + 1 NA intron (NM_001353210, intron 11 of 16) L1M5|LINE|L1 193539 NM_001353210 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 135.5-142 chr4 5917234 5917407 + 1 NA Intergenic Intergenic 6008 NR_039608 100616201 NR_039608 ENSG00000263631 MIR378D1 mir-378d-1 microRNA 378d-1 ncRNA 246.25-46 chr3 118926566 118926979 + 1 NA intron (NM_001353325, intron 4 of 7) intron (NM_001353325, intron 4 of 7) -16304 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 313.25-14 chr2 180342633 180343097 + 1 NA Intergenic Intergenic -335568 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 114.5-114 chr17 47185575 47185730 + 1 NA intron (NM_001256, intron 1 of 18) AluSz6|SINE|Alu 3643 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 285.25-35 chr8 15779736 15780199 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 239704 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 208.75-60 chr4 44433255 44433583 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) LTR80A|LTR|ERVL 15390 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 169.75-81 chr2 114417201 114417432 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -25325 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 177.5-52 chr15 69582297 69582604 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9750 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 238.75-18 chr14 54540949 54541302 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -26487 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 325.5-30 chr5 90944673 90945030 + 1 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) intron (NR_003149, intron 83 of 89) 369551 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 209.5-68 chr2 127793690 127793943 + 1 NA intron (NM_001006622, intron 1 of 5) intron (NM_001006622, intron 1 of 5) 17355 NM_001006623 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 127.75-86 chr18 12484110 12484317 + 1 NA intron (NM_020148, intron 8 of 15) intron (NM_020148, intron 8 of 15) 51439 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 237.75-52 chr3 167864951 167865316 + 1 NA Intergenic Intergenic -30815 NR_033843 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 221.75-71 chr7 28390572 28390894 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) -21785 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 199.5-120 chr5 67747736 67748048 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -45321 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 267.75-43 chr4 61319253 61319912 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 117410 NM_001371342 180.5-137 chr7 35641993 35642265 + 1 NA intron (NM_022373, intron 5 of 8) L1PREC2|LINE|L1 53006 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 144.75-2 chr1 43652940 43653242 + 1 NA intron (NM_014663, intron 1 of 21) (TTAATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2942 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 148.25-14 chr1 212141100 212141383 + 1 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 63628 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 153.75-30 chr12 53642396 53642626 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -16096 NM_001206682 11016 Hs.12286 NM_006856 ENSG00000170653 ATF7 ATFA activating transcription factor 7 protein-coding 390.75-11 chr9 27864726 27865410 + 1 NA Intergenic Intergenic -291202 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 140.5-212 chr7 30491421 30491575 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -12632 NM_001354849 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 236.25-37 chr18 67116134 67116622 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 34794 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 210.5-30 chr12 100852922 100853263 + 1 NA intron (NM_001286615, intron 1 of 27) L1ME4a|LINE|L1 -48554 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 254.75-31 chr3 55207774 55208212 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 29821 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 149.75-167 chr8 110123984 110124170 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -148306 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 167.25-159 chr8 130953885 130954156 + 1 NA intron (NM_001115, intron 2 of 17) intron (NM_001115, intron 2 of 17) 86889 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 205.5-57 chr17 71269044 71269310 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -66998 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 163.5-61 chr15 99585424 99585685 + 1 NA intron (NM_001352616, intron 1 of 10) intron (NM_001352616, intron 1 of 10) 19071 NM_001352616 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 144.75-171 chr8 60513676 60514070 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3037 NM_001242644 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 205.5-7 chr1 178184101 178184440 + 1 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1MC3|LINE|L1 90166 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 499.5 chr14 62222292 62223266 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -82806 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 185.75-3 chr1 29838247 29838693 + 1 NA Intergenic Intergenic 199142 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 148.5-3 chr1 47219557 47219822 + 1 NA 3' UTR (NM_001290405, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001290405, exon 5 of 5) 12026 NM_001287347 6886 Hs.705618 NM_003189 ENSG00000162367 TAL1 SCL|TCL5|bHLHa17|tal-1 TAL bHLH transcription factor 1, erythroid differentiation factor protein-coding 207.75-124 chr8 4208484 4208748 + 1 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 786298 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 179.5-52 chr13 46186026 46186319 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -3995 NM_002298 3936 Hs.381099 NM_002298 ENSG00000136167 LCP1 CP64|HEL-S-37|L-PLASTIN|LC64P|LPL|PLS2 lymphocyte cytosolic protein 1 protein-coding 236.25-62 chr4 56410235 56410568 + 1 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) intron (NR_156493, intron 1 of 10) -22893 NM_001286669 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 149.5-34 chr10 92470864 92471043 + 1 NA intron (NR_136399, intron 18 of 25) L1MC4a|LINE|L1 26808 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 182.25-18 chr10 104372359 104372627 + 1 NA intron (NM_001008723, intron 7 of 17) L2a|LINE|L2 18660 NM_001008723 159686 Hs.253576 NM_001008723 ENSG00000120051 CFAP58 C10orf80|CCDC147|bA127L20.4|bA127L20.5|bA554P13.1 cilia and flagella associated protein 58 protein-coding 118.5-184 chr7 22437704 22438011 + 1 NA TTS (NM_001164460) TTS (NM_001164460) 62425 NM_001164460 256227 Hs.729825 NM_207342 ENSG00000105889 STEAP1B - STEAP family member 1B protein-coding 173.5-102 chr3 131735608 131735829 + 1 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) -232747 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 259.75-37 chr3 125109055 125109507 + 1 NA intron (NM_001195483, intron 8 of 12) L2c|LINE|L2 42271 NR_049815 100847039 NR_049815 ENSG00000264986 MIR5092 - microRNA 5092 ncRNA 176.5-97 chr2 108397990 108398404 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 20243 NR_135776 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 168.25-140 chr8 78672440 78672619 + 1 NA intron (NM_001362969, intron 1 of 9) intron (NM_001362969, intron 1 of 9) 6440 NR_156423 51101 Hs.271876 NM_016010 ENSG00000104427 ZC2HC1A C8orf70|CGI-62|FAM164A zinc finger C2HC-type containing 1A protein-coding 166.25-102 chr3 89210939 89211294 + 1 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 103495 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 243.25-53 chr8 27832047 27832582 + 1 NA intron (NM_001278945, intron 2 of 7) L1MEc|LINE|L1 5503 NM_001363040 55872 Hs.104741 NM_018492 ENSG00000168078 PBK CT84|HEL164|Nori-3|SPK|TOPK PDZ binding kinase protein-coding 238.5-88 chr7 123804926 123805409 + 1 NA Intergenic Intergenic -8972 NR_002731 26062 Hs.381305 NR_002731 HYAL6P HYAL6|HYALP1 hyaluronidase 6, pseudogene pseudo 207.25-24 chr14 73222634 73222972 + 1 NA 3' UTR (NM_007318, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_007318, exon 12 of 12) -14703 NR_158678 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 252.5-34 chr18 13959280 13959721 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -43793 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 132.5-23 chr1 189102724 189102962 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 1373167 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 429.75 chr1 43023503 43024149 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 64777 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 219.5-53 chr17 45138100 45138452 + 1 NA intron (NM_001135707, intron 8 of 9) MIRc|SINE|MIR 2589 NM_024722 79777 Hs.110298 NM_024722 ENSG00000181513 ACBD4 HMFT0700 acyl-CoA binding domain containing 4 protein-coding 143.5-105 chr2 18759597 18759812 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -170124 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 150.75-113 chr20 18981731 18982018 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -151671 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 137.5-91 chr17 29749519 29749741 + 1 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 11802 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 204.25-63 chr20 23046133 23046400 + 1 NA 3' UTR (NM_000361, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_000361, exon 1 of 1) 3398 NM_000361 7056 Hs.2030 NM_000361 ENSG00000178726 THBD AHUS6|BDCA3|CD141|THPH12|THRM|TM thrombomodulin protein-coding 126.5-215 chr6 152509862 152510067 + 1 NA intron (NM_182961, intron 8 of 145) intron (NM_182961, intron 8 of 145) 126887 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 138.5-168 chr5 174688196 174688347 + 1 NA Intergenic Intergenic -36311 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 186.25-119 chr8 81751971 81752265 + 1 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) L1MD|LINE|L1 19670 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 157.5-134 chr3 96638158 96638389 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -176321 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 224.5-27 chr11 99823036 99823417 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 3 of 23) intron (NM_001243270, intron 3 of 23) 267081 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 167.5-7 chr1 79412184 79412387 + 1 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -405555 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 126.75-98 chr19 53843746 53843933 + 1 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -19436 NM_001277129 91662 Hs.631573 NM_033297 ENSG00000142405 NLRP12 CLR19.3|FCAS2|NALP12|PAN6|PYPAF7|RNO|RNO2 NLR family pyrin domain containing 12 protein-coding 144.25-80 chr18 6905829 6906050 + 1 NA intron (NM_001010000, intron 15 of 16) L1MD1|LINE|L1 23930 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 226.75-74 chr8 63744836 63745334 + 1 NA Intergenic Intergenic -24345 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 225.75-30 chr17 63041354 63041630 + 1 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) intron (NM_025185, intron 2 of 25) 75257 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 139.5-187 chr6 52257287 52257583 + 1 NA Intergenic Intergenic -12935 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 114.5-52 chr11 75970922 75971050 + 1 NA intron (NM_003369, intron 7 of 14) L1MC2|LINE|L1 155776 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 192.5-58 chr18 50244699 50244917 + 1 NA intron (NM_145020, intron 5 of 7) AluSz|SINE|Alu 21687 NM_145020 220136 Hs.658630 NM_145020 ENSG00000172361 CFAP53 CCDC11|HTX6 cilia and flagella associated protein 53 protein-coding 177.5-66 chr18 41708533 41708864 + 1 NA Intergenic Intergenic -188021 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 167.25-14 chr10 25868097 25868358 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 65483 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 227.75-65 chr5 38865120 38865618 + 1 NA intron (NM_003999, intron 1 of 17) L1MA4A|LINE|L1 19357 NM_001323505 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 211.5-35 chr12 19851585 19852053 + 1 NA Intergenic Intergenic -162866 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 205.25-15 chr12 16315458 16315938 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -31444 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 142.5-10 chr1 66032104 66032378 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) 18477 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 156.5-132 chr4 53432602 53432871 + 1 NA intron (NM_001134938, intron 10 of 14) MIR|SINE|MIR 55083 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 265.75-10 chr11 93397450 93397911 + 1 NA intron (NM_181645, intron 11 of 13) intron (NM_181645, intron 11 of 13) 66963 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 247.5-93 chrX 43365486 43365756 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 188627 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 241.25-19 chr13 47848122 47848555 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 84284 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 189.5-28 chr11 41461143 41461488 + 1 NA Intergenic Intergenic -1663 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 128.25-127 chr3 41770969 41771137 + 1 NA intron (NR_136342, intron 20 of 34) intron (NR_136342, intron 20 of 34) 191050 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 241.75-22 chr14 29308109 29308531 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -522533 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 179.75-116 chr6 52260000 52260222 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15611 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 143.5-51 chr13 67871116 67871359 + 1 NA Intergenic Intergenic 498850 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 203.75-119 chrX 81232678 81232951 + 1 NA intron (NM_003022, intron 1 of 3) intron (NM_003022, intron 1 of 3) 30712 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 179.75-92 chr4 175510373 175510587 + 1 NA Intergenic Intergenic 277196 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 199.5-144 chr8 78349908 78350296 + 1 NA Intergenic Intergenic -166238 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 152.75-46 chr12 127572831 127573113 + 1 NA Intergenic Intergenic 63495 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 136.5-193 chr6 49380412 49380595 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 82750 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 268.75-37 chr5 59380680 59381061 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie -23900 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 403.75 chr21 32311910 32312560 + 1 NA TTS (NM_178817) TTS (NM_178817) 20422 NM_001285394 56246 Hs.584940 NM_178817 ENSG00000170262 MRAP B27|C21orf61|FALP|FGD2|GCCD2 melanocortin 2 receptor accessory protein protein-coding 176.75-40 chr14 67625728 67625971 + 1 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 5929 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 200.5-106 chr5 5292724 5293050 + 1 NA intron (NM_139056, intron 18 of 22) intron (NM_139056, intron 18 of 22) -129790 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 165.25-66 chr2 59141834 59142061 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -75761 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 147.25-112 chr5 160753178 160753424 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) intron (NM_001366652, intron 2 of 24) -67910 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 144.5-137 chr3 160343942 160344204 + 1 NA intron (NM_001190242, intron 7 of 18) L1ME3G|LINE|L1 39693 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 398.5-17 chr7 40085151 40085747 + 1 NA intron (NM_003718, intron 11 of 13) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 49173 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 247.75-45 chr4 115429802 115430283 + 1 NA Intergenic Intergenic -316422 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 125.25-175 chr6 138381827 138382095 + 1 NA intron (NM_001368163, intron 1 of 1) intron (NM_001368163, intron 1 of 1) 4318 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 169.25-37 chr15 94669925 94670250 + 1 NA Intergenic Intergenic -185276 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 145.75-154 chr7 78399210 78399382 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 6 of 20) intron (NM_001301128, intron 6 of 20) 52054 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 230.5-50 chr17 30819834 30820152 + 1 NA intron (NM_015986, intron 1 of 7) intron (NM_015986, intron 1 of 7) 4699 NM_015986 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 240.5-59 chr20 51793627 51794111 + 1 NA intron (NM_001318031, intron 1 of 3) intron (NM_001318031, intron 1 of 3) 8652 NM_001318031 57167 Hs.517113 NM_020436 ENSG00000101115 SALL4 DRRS|HSAL4|ZNF797 spalt like transcription factor 4 protein-coding 168.25-128 chr6 164779339 164779533 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 42627 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 137.5-39 chr11 28325807 28326012 + 1 NA intron (NM_001113528, intron 6 of 6) L2c|LINE|L2 151639 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 178.75-37 chr17 40392105 40392324 + 1 NA intron (NM_001067, intron 31 of 34) intron (NM_001067, intron 31 of 34) 25682 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 159.75-122 chr5 3086643 3086843 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -91092 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 285.5-39 chr3 67057895 67058234 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 59757 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 178.75-38 chr17 42473464 42473775 + 1 NA intron (NM_005177, intron 5 of 20) intron (NM_005177, intron 5 of 20) 14741 NM_001130020 535 Hs.463074 NM_005177 ENSG00000033627 ATP6V0A1 ATP6N1|ATP6N1A|Stv1|VPP1|Vph1|a1 ATPase H+ transporting V0 subunit a1 protein-coding 228.25-61 chr4 149504324 149504727 + 1 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 311318 NM_001363507 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 191.75-4 chr1 105498957 105499389 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 119762 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 118.75-169 chr6 105788650 105788819 + 1 NA Intergenic Intergenic -297602 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 198.25-7 chr1 218149172 218149614 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 105888 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 299.5-39 chr7 38635319 38635638 + 1 NA Intergenic Intergenic -3911 NM_139316 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 179.25-107 chr3 182009954 182010165 + 1 NA non-coding (NR_104146, exon 8 of 8) non-coding (NR_104146, exon 8 of 8) 57695 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 204.5-78 chr21 29853177 29853472 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie 86672 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 296.5-34 chr6 166909120 166909656 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 5690 NR_046644 100861523 Hs.634640 NR_046644 RPS6KA2-AS1 - RPS6KA2 antisense RNA 1 ncRNA 271.75-28 chr3 107292943 107293323 + 1 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 52441 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 177.75-117 chr5 151119553 151119736 + 1 NA intron (NM_001193544, intron 16 of 24) intron (NM_001193544, intron 16 of 24) 22040 NM_001193544 309 Hs.412117 NM_001155 ENSG00000197043 ANXA6 ANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70 annexin A6 protein-coding 192.75-39 chr16 47952378 47952672 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -13164 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 202.25-10 chr1 234761525 234762098 + 1 NA Intergenic Intergenic -1755 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 170.5-104 chr2 222680681 222681104 + 1 NA intron (NM_058165, intron 1 of 5) intron (NM_058165, intron 1 of 5) 9234 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 255.5-89 chr9 30973158 30973588 + 1 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL 408117 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 123.75-135 chr4 67205652 67205859 + 1 NA Intergenic Intergenic 216245 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 114.5-190 chr4 89506250 89506443 + 1 NA Intergenic Intergenic -198546 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 246.75-23 chr17 60312343 60312702 + 1 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) AluJb|SINE|Alu 79611 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 167.5-180 chr7 118486082 118486392 + 1 NA Intergenic Intergenic 261533 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 146.75-94 chr22 32034392 32034610 + 1 NA intron (NR_149128, intron 4 of 4) intron (NR_149128, intron 4 of 4) -8760 NM_000343 6523 Hs.1964 NM_000343 ENSG00000100170 SLC5A1 D22S675|NAGT|SGLT1 solute carrier family 5 member 1 protein-coding 133.75-170 chr6 115790322 115790610 + 1 NA Intergenic Intergenic -146631 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 207.5-99 chr6 125079743 125080066 + 1 NA intron (NR_136734, intron 5 of 6) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -73869 NM_001003397 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 183.25-16 chr10 116389873 116390111 + 1 NA Intergenic Intergenic -37855 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 138.5-155 chr5 64305063 64305328 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 139352 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 180.5-82 chr21 15037152 15037492 + 1 NA intron (NM_003489, intron 2 of 3) intron (NM_003489, intron 2 of 3) 27678 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 116.25-138 chr3 52325712 52325837 + 1 NA intron (NM_015512, intron 3 of 77) intron (NM_015512, intron 3 of 77) 9455 NM_015512 25981 Hs.655469 NM_015512 ENSG00000114841 DNAH1 CILD37|DNAHC1|HDHC7|HL-11|HL11|HSRF-1|SPGF18|XLHSRF-1 dynein axonemal heavy chain 1 protein-coding 141.5-198 chr6 63938109 63938346 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 131391 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 183.5-160 chr9 26990604 26990904 + 1 NA intron (NM_001099224, intron 8 of 13) intron (NM_001099224, intron 8 of 13) 14918 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 327.75-25 chr7 30803964 30804358 + 1 NA intron (NR_037598, intron 7 of 19) intron (NR_037598, intron 7 of 19) 32744 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 170.75-8 chr1 225644973 225645146 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) intron (NM_001008493, intron 1 of 14) 8064 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 270.5-64 chr8 124809974 124810379 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11809 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 310.5-7 chr12 10509294 10509682 + 1 NA intron (NM_001357731, intron 1 of 1) intron (NM_001357731, intron 1 of 1) 3595 NM_001357734 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 257.5-26 chr16 17936979 17937286 + 1 NA Intergenic Intergenic 395530 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 245.25-66 chr7 8354312 8354769 + 1 NA Intergenic Intergenic -79069 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 200.75-12 chr10 72729352 72729611 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluSx|SINE|Alu 8452 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 230.5-80 chr3 99510418 99510687 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -128042 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 234.25-14 chr11 3912705 3913032 + 1 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 56806 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 162.75-43 chr15 87879710 87879889 + 1 NA intron (NM_002530, intron 18 of 18) intron (NM_002530, intron 18 of 18) 66469 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 184.75-47 chr2 28191123 28191532 + 1 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 15634 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 155.5-202 chr8 29891940 29892285 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -29401 NR_024473 286135 Hs.376840 NR_024473 ENSG00000253279 LINC02209 FAM183CP long intergenic non-protein coding RNA 2209 ncRNA 118.75-97 chr2 68423848 68424013 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 43364 NM_001024680 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 246.25-30 chr2 65558473 65558868 + 1 NA Intergenic Intergenic -126071 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 182.5-132 chr5 54762948 54763216 + 1 NA Intergenic Intergenic -18824 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 176.25-68 chr2 104764935 104765203 + 1 NA Intergenic Intergenic -7350 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 143.5-210 chr8 82871169 82871446 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -40797 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 127.75-158 chr5 82299276 82299472 + 1 NA intron (NM_001017971, intron 3 of 9) HAL1|LINE|L1 19912 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 146.75-91 chr21 22325701 22326029 + 1 NA Intergenic Intergenic 227248 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 242.5-37 chr17 63773695 63774114 + 1 NA promoter-TSS (NM_020198) promoter-TSS (NM_020198) -266 NM_203499 11325 Hs.702010 NM_007372 ENSG00000198231 DDX42 DDX42P|RHELP|RNAHP|SF3B8|SF3b125 DEAD-box helicase 42 protein-coding 264.5-67 chr9 133885078 133885405 + 1 NA intron (NM_001134398, intron 2 of 29) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 107083 NM_001134398 7410 Hs.369921 NM_003371 ENSG00000160293 VAV2 VAV-2 vav guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 273.5-70 chr6 49156836 49157342 + 1 NA Intergenic Intergenic 306164 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 167.75-49 chr14 71021342 71021522 + 1 NA intron (NM_014982, intron 12 of 35) L1PA7|LINE|L1 113973 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 180.25-79 chr3 171161151 171161557 + 1 NA intron (NM_001161563, intron 10 of 31) MIR3|SINE|MIR -54595 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 188.5-3 chr1 42224538 42224828 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 5 of 12) intron (NM_001198850, intron 5 of 12) -59938 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 160.25-27 chr12 81524999 81525189 + 1 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -12703 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 177.5-152 chr6 54423143 54423453 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 114857 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 216.5-17 chr11 132655962 132656456 + 1 NA intron (NM_002545, intron 2 of 6) intron (NM_002545, intron 2 of 6) 287428 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 295.75-24 chr5 132975556 132976074 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -12181 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 218.5-101 chr5 55998787 55999148 + 1 NA intron (NR_102755, intron 1 of 1) intron (NR_102755, intron 1 of 1) 3800 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 251.25-44 chr6 49579735 49580004 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 29201 NR_146864 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 171.75-78 chr2 96195073 96195406 + 1 NA intron (NM_020151, intron 2 of 7) intron (NM_020151, intron 2 of 7) -13177 NR_046322 285033 Hs.58648 NM_001037228 STARD7-AS1 - STARD7 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-156 chr4 172775039 172775157 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) -48220 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-27 chr11 103124669 103124915 + 1 NA intron (NM_001377, intron 11 of 88) intron (NM_001377, intron 11 of 88) 15366 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 180.5-143 chr7 87647596 87647819 + 1 NA intron (NM_138290, intron 1 of 11) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 19309 NM_138290 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 180.5-156 chr8 123271897 123272165 + 1 NA intron (NR_037873, intron 1 of 3) intron (NR_037873, intron 1 of 3) 2255 NM_001204180 100533106 Hs.707401 NM_001204180 ENSG00000259305 ZHX1-C8orf76 - ZHX1-C8orf76 readthrough protein-coding 178.5-146 chr5 116433413 116433683 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13950 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 215.75-50 chr2 75745719 75746129 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -35009 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 188.25-90 chr5 40711831 40712033 + 1 NA 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 32017 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 185.5-28 chr11 88334068 88334286 + 1 NA intron (NM_148170, intron 2 of 3) intron (NM_148170, intron 2 of 3) 3559 NM_148170 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 221.5-67 chr4 8359870 8360231 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 39874 NR_149125 105374374 Hs.145224 NR_149125 ENSG00000249145 LINC02517 - long intergenic non-protein coding RNA 2517 ncRNA 178.25-34 chr14 55204421 55204676 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -12963 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 163.25-114 chr5 58199379 58199577 + 1 NA Intergenic Intergenic -77137 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 176.75-74 chr20 47483135 47483437 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18601 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 129.5-146 chr22 27517626 27517781 + 1 NA Intergenic Intergenic 207052 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 168.5-49 chr12 130651612 130651794 + 1 NA intron (NM_001351226, intron 1 of 21) intron (NM_001351226, intron 1 of 21) -17783 NM_001351228 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 134.5-188 chr6 47627095 47627295 + 1 NA TTS (NM_012120) TTS (NM_012120) -29277 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 302.75-3 chr12 63042207 63042607 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -107257 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 181.25-30 chr14 68557282 68557530 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 71381 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 165.25-68 chr2 100312563 100312789 + 1 NA intron (NM_198461, intron 1 of 11) intron (NM_198461, intron 1 of 11) 10057 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 165.5-13 chr10 4363793 4364064 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -20318 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 119.75-205 chr8 138267826 138268079 + 1 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) intron (NM_015912, intron 3 of 19) -184407 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 171.75-131 chr7 51848915 51849112 + 1 NA Intergenic Intergenic -455757 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 153.75-122 chr5 158551284 158551576 + 1 NA Intergenic Intergenic -141657 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 132.5-249 chr8 135783589 135783747 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 326212 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 129.75-40 chr11 98563766 98563926 + 1 NA Intergenic Intergenic -457103 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 173.75-68 chr17 50499166 50499349 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -9182 NM_032133 84073 Hs.398196 NM_032133 ENSG00000136449 MYCBPAP AMAP-1|AMAP1 MYCBP associated protein protein-coding 186.5-45 chr16 8516182 8516402 + 1 NA Intergenic Intergenic 73546 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 170.25-164 chr9 99700028 99700222 + 1 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 119764 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 145.75-13 chr10 34712718 34712924 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) L1PA16|LINE|L1 102475 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 133.75-121 chr22 24142779 24143034 + 1 NA intron (NM_012295, intron 29 of 36) intron (NM_012295, intron 29 of 36) -38581 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 132.75-104 chr2 170898289 170898470 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -30098 NM_001201428 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 140.5-84 chr17 66716667 66716879 + 1 NA intron (NM_002737, intron 8 of 16) intron (NM_002737, intron 8 of 16) -70299 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 203.75-12 chr10 89981176 89981453 + 1 NA Intergenic Intergenic -23941 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 163.75-3 chr1 42874762 42875062 + 1 NA intron (NR_104171, intron 2 of 3) L1PA13|LINE|L1 17290 NR_104171 339539 Hs.434301 NR_104171 LOC339539 - uncharacterized LOC339539 ncRNA 274.25-18 chr14 27788754 27789071 + 1 NA Intergenic Intergenic -115691 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 113.25-188 chrX 64096567 64096779 + 1 NA Intergenic Intergenic 109035 NM_152424 139285 Hs.314225 NM_152424 ENSG00000184675 AMER1 FAM123B|OSCS|WTX APC membrane recruitment protein 1 protein-coding 126.5-157 chr3 111957444 111957786 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 12 of 17) intron (NM_001134437, intron 12 of 17) -21411 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 182.5-24 chr10 105824699 105824994 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -4513 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 157.75-77 chr18 59351148 59351339 + 1 NA intron (NM_005570, intron 5 of 12) intron (NM_005570, intron 5 of 12) 8022 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 238.5-18 chr11 81169039 81169368 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -406400 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 139.25-132 chr4 31979854 31980073 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -17416 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 257.25-38 chr4 114726680 114727074 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 70118 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 182.25-24 chr11 112411067 112411289 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -71054 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 206.75-38 chr2 123275970 123276400 + 1 NA Intergenic Intergenic -202704 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 118.75-111 chr2 171198263 171198410 + 1 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) intron (NM_001136554, intron 1 of 20) 32957 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 159.25-18 chr10 85065161 85065631 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 133509 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 179.25-42 chr12 26178795 26179205 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16336 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 159.5-122 chr20 10306021 10306267 + 1 NA exon (NM_130811, exon 8 of 8) exon (NM_130811, exon 8 of 8) -86638 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 215.5-51 chr2 81181388 81181865 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 285320 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 186.75-105 chr7 77354553 77354883 + 1 NA intron (NM_001350896, intron 16 of 29) intron (NM_001350896, intron 16 of 29) -60480 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 142.25-10 chr1 218868324 218868557 + 1 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 50071 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 139.25-108 chr21 32652529 32652707 + 1 NA intron (NM_203446, intron 22 of 32) intron (NM_203446, intron 22 of 32) -39747 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 232.5-13 chr11 123847027 123847460 + 1 NA Intergenic Intergenic 38427 NM_001013743 338661 Hs.98377 NM_001013743 ENSG00000204300 TMEM225 PMP22CD|PPP1R154|SPATA47 transmembrane protein 225 protein-coding 153.75-137 chr7 5691233 5691586 + 1 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) intron (NM_207111, intron 13 of 16) -10948 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 148.5-42 chr12 26658987 26659216 + 1 NA intron (NM_002223, intron 16 of 56) intron (NM_002223, intron 16 of 56) 174093 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 157.25-59 chr17 71317089 71317252 + 1 NA Intergenic Intergenic -114991 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 180.75-88 chr3 24982312 24982604 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 153135 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 146.75-66 chr18 10700269 10700496 + 1 NA intron (NM_022068, intron 39 of 51) intron (NM_022068, intron 39 of 51) 38449 NR_110777 101927410 Hs.436902 NR_110777 ENSG00000260779 LOC101927410 - uncharacterized LOC101927410 ncRNA 158.75-131 chr4 184553849 184554128 + 1 NA Intergenic Intergenic -16405 NR_147158 105377585 Hs.519127 NR_147158 ENSG00000271538 LINC02427 - long intergenic non-protein coding RNA 2427 ncRNA 223.75-10 chr11 81948871 81949171 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -58185 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 163.5-28 chr10 94471970 94472272 + 1 NA intron (NM_015188, intron 2 of 12) intron (NM_015188, intron 2 of 12) 69580 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 150.5-229 chr8 133997234 133997570 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 110906 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 178.5-178 chr8 63225854 63226101 + 1 NA Intergenic Intergenic 56974 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 125.5-138 chr2 194965439 194965724 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 234986 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 159.25-42 chr14 65384452 65384800 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25966 NM_004480 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 186.75-88 chr5 41184908 41185144 + 1 NA intron (NM_000065, intron 6 of 17) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 28506 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 286.5-57 chr6 117836572 117837134 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -70411 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 226.25-23 chr12 62897696 62897995 + 1 NA intron (NM_020700, intron 1 of 9) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 37305 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 167.25-122 chr5 15673915 15674299 + 1 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR -59105 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 211.5-170 chrX 95309901 95310207 + 1 NA Intergenic Intergenic -246828 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 205.75-81 chr8 88895021 88895313 + 1 NA Intergenic Intergenic -567684 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 160.5-149 chr5 85715672 85715949 + 1 NA Intergenic Intergenic -566634 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 114.5-129 chr2 29258317 29258582 + 1 NA intron (NM_004304, intron 11 of 28) HAL1M8|LINE|L1 -34549 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 123.5-216 chr8 140780063 140780271 + 1 NA intron (NR_148036, intron 14 of 34) L1MC5a|LINE|L1 -47514 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 206.5-63 chr2 208799765 208799971 + 1 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) intron (NR_136588, intron 3 of 5) 257226 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 133.75-47 chr13 76155633 76155896 + 1 NA Intergenic Intergenic -220632 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 275.5-20 chr14 68072802 68073330 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1PA15|LINE|L1 249474 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 264.75-56 chr7 133784987 133785457 + 1 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 39666 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 179.5-197 chr9 113724246 113724504 + 1 NA Intergenic Intergenic 130246 NM_001276262 5998 Hs.494875 NM_017790 ENSG00000138835 RGS3 C2PA|RGP3 regulator of G protein signaling 3 protein-coding 152.25-88 chr2 123530892 123531142 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -457536 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 400.25-5 chr4 75496898 75497570 + 1 NA intron (NR_037914, intron 3 of 8) MER57B2|LTR|ERV1 12062 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 181.75-76 chr3 44531090 44531426 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -20641 NM_001287349 285346 Hs.648974 NM_001287349 ENSG00000178917 ZNF852 - zinc finger protein 852 protein-coding 146.5-233 chr9 33971409 33971578 + 1 NA intron (NR_163243, intron 5 of 24) intron (NR_163243, intron 5 of 24) -18639 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 124.5-25 chr10 83758058 83758251 + 1 NA Intergenic L1M2b|LINE|L1 -81065 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 225.25-22 chr14 77418811 77419211 + 1 NA intron (NM_001113475, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 4045 NM_001113475 122945 Hs.97556 NM_138791 ENSG00000165555 NOXRED1 C14orf148 NADP dependent oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 233.25-3 chr1 88939582 88939955 + 1 NA intron (NM_001008661, intron 13 of 13) L1M7|LINE|L1 -48201 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 245.75-16 chr12 122216762 122217209 + 1 NA intron (NM_001278302, intron 2 of 4) intron (NM_001278302, intron 2 of 4) 8786 NM_001278304 56616 Hs.169611 NM_019887 ENSG00000184047 DIABLO DFNA64|SMAC diablo IAP-binding mitochondrial protein protein-coding 157.5-179 chr6 127334235 127334594 + 1 NA intron (NM_001002030, intron 1 of 5) intron (NM_001002030, intron 1 of 5) 7993 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 191.5-27 chr12 15704375 15704640 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) L1MB3|LINE|L1 84881 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 206.5-82 chr4 82047105 82047395 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 326741 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 248.75-35 chr2 203494861 203495150 + 1 NA intron (NM_001329728, intron 2 of 15) intron (NM_001329728, intron 2 of 15) 40296 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 177.75-101 chr3 56970217 56970488 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 2 of 12) intron (NM_001128615, intron 2 of 12) 30312 NR_046572 100874200 Hs.549631 NR_046572 ENSG00000240198 ARHGEF3-AS1 - ARHGEF3 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-193 chr5 124831670 124831843 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -86644 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 305.75-27 chr8 105436655 105437092 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 2 of 7) intron (NM_001362837, intron 2 of 7) 117330 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 164.75-94 chr3 1832819 1833057 + 1 NA Intergenic Intergenic -265865 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 116.75-161 chr5 16670700 16670937 + 1 NA exon (NM_012334, exon 39 of 41) exon (NM_012334, exon 39 of 41) -53760 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 174.5-165 chr6 146579431 146579882 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 19275 NR_125860 101928661 Hs.711833 NR_125860 ENSG00000237468 LOC101928661 - uncharacterized LOC101928661 ncRNA 179.5-104 chr20 24265318 24265543 + 1 NA Intergenic Intergenic 65663 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 129.5-20 chr10 58022563 58022908 + 1 NA Intergenic Intergenic 245159 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 216.75-69 chr6 43272866 43273114 + 1 NA intron (NM_032538, intron 13 of 14) intron (NM_032538, intron 13 of 14) -25270 NM_153320 10864 Hs.485438 NM_006672 ENSG00000137204 SLC22A7 NLT|OAT2|hOAT11 solute carrier family 22 member 7 protein-coding 149.5-90 chr2 52240953 52241156 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -129594 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 175.25-59 chr17 59004258 59004544 + 1 NA intron (NR_148346, intron 22 of 23) L1MEd|LINE|L1 102479 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 174.5-7 chr1 89787386 89787663 + 1 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -33508 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 200.25-96 chr6 125146011 125146272 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7632 NM_001003397 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 218.5-71 chr22 39345461 39345779 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -4329 NM_145731 9145 Hs.216226 NM_004711 ENSG00000100321 SYNGR1 - synaptogyrin 1 protein-coding 169.75-166 chr9 105235709 105235965 + 1 NA Intergenic Intergenic -8768 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 194.5-29 chr12 10320202 10320430 + 1 NA non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) 12446 NR_147039 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 190.5-136 chr6 54445500 54445759 + 1 NA Intergenic Intergenic 137188 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 159.25-83 chr3 69800804 69801009 + 1 NA intron (NM_001354607, intron 2 of 10) intron (NM_001354607, intron 2 of 10) 37095 NM_006722 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 233.5-107 chr8 85983539 85983959 + 1 NA Intergenic Intergenic 85919 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 128.25-90 chr2 24147211 24147437 + 1 NA intron (NM_001145710, intron 7 of 10) L1MCc|LINE|L1 23855 NM_001145710 375190 Hs.710370 NM_198553 ENSG00000219626 FAM228B - family with sequence similarity 228 member B protein-coding 164.25-66 chr2 50622848 50623062 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 6 of 22) intron (NM_001330093, intron 6 of 22) 73307 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 142.5-17 chr1 191101002 191101219 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 127388 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 163.25-113 chr5 55509527 55509705 + 1 NA promoter-TSS (NR_049869) promoter-TSS (NR_049869) -690 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 305.5-2 chr1 82513611 82514026 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -389365 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 188.75-21 chr13 50051237 50051552 + 1 NA intron (NR_152566, intron 5 of 13) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -2193 NR_029485 406948 NR_029485 ENSG00000283785 MIR15A MIRN15A|hsa-mir-15a|miRNA15A|mir-15a microRNA 15a ncRNA 187.25-50 chr19 38098002 38098386 + 1 NA intron (NM_015073, intron 4 of 21) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -64902 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 211.5-101 chr3 77485180 77485502 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 4 of 26) HAL1|LINE|L1 387329 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 175.5-21 chr10 67399001 67399215 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 4302 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 180.25-25 chr14 65052056 65052357 + 1 NA intron (NM_002028, intron 9 of 11) intron (NM_002028, intron 9 of 11) 7518 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 176.25-47 chr16 81660458 81660748 + 1 NA intron (NM_030629, intron 5 of 20) intron (NM_030629, intron 5 of 20) -4751 NR_045112 100129617 Hs.657151 NR_045112 LOC100129617 - uncharacterized LOC100129617 ncRNA 225.5-27 chr12 88689844 88690372 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -109635 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 119.5-174 chr5 10530756 10530952 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8770 NR_134289 389273 Hs.519206 NR_134289 ENSG00000249160 LINC02213 - long intergenic non-protein coding RNA 2213 ncRNA 249.25-34 chr4 76150324 76150818 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -2056 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 120.5-14 chr1 196316338 196316526 + 1 NA intron (NM_001287820, intron 18 of 26) intron (NM_001287820, intron 18 of 26) -227717 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 129.75-43 chr11 117827620 117827885 + 1 NA intron (NM_001204268, intron 6 of 10) intron (NM_001204268, intron 6 of 10) 337 NM_021603 486 Hs.731865 NM_001680 ENSG00000137731 FXYD2 ATP1G1|HOMG2 FXYD domain containing ion transport regulator 2 protein-coding 173.5-15 chr10 19415685 19416015 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 28 of 39) intron (NM_001142308, intron 28 of 39) 312700 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 184.25-57 chr2 71377488 71377786 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 8 of 27) intron (NM_001252613, intron 8 of 27) 45855 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 191.25-3 chr1 113820720 113820954 + 1 NA intron (NM_012411, intron 17 of 18) intron (NM_012411, intron 17 of 18) 8225 NR_125965 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 180.5-73 chr2 83359503 83359912 + 1 NA Intergenic Intergenic -163107 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 116.5-16 chr1 220117945 220118135 + 1 NA promoter-TSS (NR_029628) promoter-TSS (NR_029628) -78 NR_029628 406997 NR_029628 ENSG00000207590 MIR215 MIRN215|miRNA215|mir-215 microRNA 215 ncRNA 130.5-151 chr20 57060348 57060532 + 1 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -153256 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-196 chr8 82837188 82837329 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -74846 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 139.75-108 chr20 48011254 48011509 + 1 NA Intergenic Intergenic -21264 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 332.25-20 chr21 22357068 22357585 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 258709 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 215.25-78 chr5 30541651 30542040 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -651841 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 395.5-6 chr14 66610227 66610928 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 103170 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 163.25-143 chr8 120184418 120184713 + 1 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) MLT2B4|LTR|ERVL 59463 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 298.75-34 chr8 81625571 81626006 + 1 NA intron (NR_146081, intron 3 of 7) intron (NR_146081, intron 3 of 7) 5489 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 144.25-86 chr19 3109510 3109787 + 1 NA intron (NM_002067, intron 1 of 6) intron (NM_002067, intron 1 of 6) 15286 NM_002067 2767 Hs.650575 NM_002067 ENSG00000088256 GNA11 FBH|FBH2|FHH2|GNA-11|HHC2|HYPOC2 G protein subunit alpha 11 protein-coding 295.5-19 chr16 74239160 74239590 + 1 NA Intergenic Intergenic -23854 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 393.5-15 chr8 51219065 51219526 + 1 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 590150 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 223.5-6 chr1 63850736 63851099 + 1 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 76900 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 173.5-160 chr8 59373204 59373409 + 1 NA Intergenic Intergenic 254096 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 312.5-33 chr8 90110624 90111093 + 1 NA Intergenic Intergenic -27979 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 169.75-23 chr10 100333730 100333954 + 1 NA Intergenic Intergenic -3614 NM_016112 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 183.25-85 chr5 112315750 112315965 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) intron (NM_001347887, intron 1 of 23) 87574 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 135.75-37 chr11 45997047 45997283 + 1 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 74509 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 186.5-117 chr6 8784532 8784863 + 1 NA intron (NR_038980, intron 4 of 4) intron (NR_038980, intron 4 of 4) 132488 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 155.5-223 chr9 129904956 129905165 + 1 NA intron (NM_001363755, intron 12 of 15) intron (NM_001363755, intron 12 of 15) 35455 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 152.5-120 chr3 106961778 106962020 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 278739 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 127.25-82 chr2 10678831 10679198 + 1 NA intron (NR_048552, intron 2 of 19) AluJr4|SINE|Alu 10961 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 118.5-193 chr7 46461234 46461355 + 1 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 235828 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 312.75-14 chr2 26379911 26380463 + 1 NA intron (NR_137633, intron 6 of 9) L1MC5|LINE|L1 -21733 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 142.75-19 chr10 32367626 32367958 + 1 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) intron (NR_104163, intron 1 of 1) 10977 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 135.75-185 chr7 69229049 69229243 + 1 NA Intergenic Intergenic 368478 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 266.5-17 chr12 54686688 54687197 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -38577 NM_053283 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 230.75-4 chr1 151194407 151195011 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3843 NM_001135637 8394 Hs.655131 NM_003557 ENSG00000143398 PIP5K1A - phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 alpha protein-coding 157.5-154 chr4 138684721 138685107 + 1 NA Intergenic Intergenic 327732 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 228.25-9 chr1 225320656 225320939 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 61 of 85) intron (NM_001367479, intron 61 of 85) 107241 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 240.25-57 chr6 62046453 62046757 + 1 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 239620 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 180.75-45 chr15 95544124 95544462 + 1 NA Intergenic Intergenic 111200 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 245.25-68 chr7 13792810 13793110 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 193554 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 132.25-156 chr5 90715242 90715483 + 1 NA intron (NR_003149, intron 42 of 89) LTR16C|LTR|ERVL 156565 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 187.75-10 chr10 14439251 14439529 + 1 NA Intergenic Intergenic 2814 NR_031668 100302116 NR_031668 ENSG00000221371 MIR1265 MIRN1265|hsa-mir-1265 microRNA 1265 ncRNA 178.5-138 chr5 51486147 51486530 + 1 NA Intergenic Intergenic 102890 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 163.75-109 chr5 122567786 122568180 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 16617 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 112.75-86 chr19 37628204 37628480 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 27123 NM_001320670 22835 Hs.668737 NM_014898 ENSG00000120784 ZFP30 ZNF745 ZFP30 zinc finger protein protein-coding 291.75-16 chr14 68388469 68388951 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) L2a|LINE|L2 240077 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 178.5-8 chr1 233096960 233097270 + 1 NA intron (NM_014801, intron 21 of 33) intron (NM_014801, intron 21 of 33) 146273 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 126.5-269 chrX 7951283 7951429 + 1 NA Intergenic Intergenic -23617 NM_001172672 8228 Hs.264 NM_004650 ENSG00000006757 PNPLA4 DXS1283E|GS2|iPLA2eta patatin like phospholipase domain containing 4 protein-coding 185.5-87 chr2 197451004 197451385 + 1 NA Intergenic LTR12D|LTR|ERV1 -2229 NM_001320818 80219 Hs.606592 NM_025147 ENSG00000115520 COQ10B - coenzyme Q10B protein-coding 266.5-48 chr22 26933555 26934100 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 30535 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 117.5-38 chr11 35670599 35670781 + 1 NA intron (NM_017583, intron 1 of 4) L1MEf|LINE|L1 7915 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 138.5-136 chr3 113716137 113716367 + 1 NA TTS (NM_001308445) TTS (NM_001308445) -19606 NR_111981 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 232.25-7 chr10 12704921 12705241 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) intron (NM_001351032, intron 5 of 11) 20272 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 120.5-73 chr14 65195108 65195242 + 1 NA Intergenic Intergenic 27172 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 233.5-80 chr5 20017308 20017778 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -29343 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 132.25-126 chr3 47919591 47919978 + 1 NA intron (NM_002375, intron 5 of 18) intron (NM_002375, intron 5 of 18) 70229 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 123.25-35 chr11 36732057 36732228 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -133863 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 246.5-12 chr11 3943419 3943674 + 1 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) intron (NM_001277962, intron 1 of 12) 87484 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 187.5-84 chr2 40364110 40364375 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 66062 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 135.5-118 chr2 201673824 201673966 + 1 NA intron (NM_033066, intron 11 of 21) intron (NM_033066, intron 11 of 21) 24749 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 251.5-45 chr20 1563813 1564102 + 1 NA TTS (NM_001083910) TTS (NM_001083910) -6252 NM_178460 128646 Hs.729560 NM_178460 ENSG00000125900 SIRPD PTPNS1L2|dJ576H24.4 signal regulatory protein delta protein-coding 169.5-154 chr6 92978931 92979157 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 440515 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 168.25-76 chr2 121923344 121923611 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 167826 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 211.5-152 chr8 34385307 34385549 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -398493 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 164.5-69 chr14 101405533 101405773 + 1 NA TTS (NR_126006) TTS (NR_126006) 2269 NR_126006 338002 Hs.124848 NR_126006 ENSG00000259023 LINC00524 C14orf71 long intergenic non-protein coding RNA 524 ncRNA 202.75-73 chr3 98038126 98038355 + 1 NA Intergenic Intergenic -2936 NR_047685 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 178.5-26 chr11 64846654 64846939 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2143 NM_017525 55561 Hs.293590 NM_017525 ENSG00000171219 CDC42BPG DMPK2|HSMDPKIN|KAPPA-200|MRCKG|MRCKgamma CDC42 binding protein kinase gamma protein-coding 329.25-16 chr2 99506010 99506662 + 1 NA Intergenic Intergenic -16319 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 172.75-33 chr14 52141003 52141296 + 1 NA Intergenic Intergenic -72090 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 184.25-31 chr12 32195314 32195708 + 1 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) L1MA9|LINE|L1 88664 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 264.25-51 chr7 124154536 124154976 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -121689 NM_001136002 730130 Hs.450249 NM_001136002 ENSG00000234224 TMEM229A - transmembrane protein 229A protein-coding 179.75-65 chr20 37029722 37029942 + 1 NA intron (NM_002895, intron 16 of 21) L1MB3|LINE|L1 66165 NM_002895 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 154.5-174 chr7 90287139 90287375 + 1 NA intron (NM_001039706, intron 14 of 22) L1ME2|LINE|L1 42083 NM_001363438 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 142.75-141 chr4 52190728 52191085 + 1 NA Intergenic Intergenic 139602 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 289.25-15 chr2 58157713 58158224 + 1 NA intron (NM_001130483, intron 13 of 13) intron (NM_001130483, intron 13 of 13) 83412 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 345.25-14 chr21 31737592 31738020 + 1 NA Intergenic Intergenic -5688 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 179.5-118 chr3 22481777 22482115 + 1 NA Intergenic Intergenic 524807 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 200.5-42 chr14 73835855 73836194 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5889 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 113.5-158 chr3 64403868 64404026 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -135774 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 157.5-166 chr5 126551111 126551315 + 1 NA intron (NM_001202404, intron 12 of 15) AluJr4|SINE|Alu 44006 NM_001201377 501 Hs.483239 NM_001182 ENSG00000164904 ALDH7A1 ATQ1|EPD|PDE aldehyde dehydrogenase 7 family member A1 protein-coding 203.75-49 chr18 44227483 44227720 + 1 NA Intergenic Intergenic 304096 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 208.5-26 chr11 118096963 118097260 + 1 NA intron (NM_001290094, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 -10148 NM_001354434 100526771 Hs.627426 NM_001354434 SMIM35 TMPRSS4-AS1 small integral membrane protein 35 protein-coding 308.75-3 chr10 9319380 9319931 + 1 NA Intergenic Intergenic -24062 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 173.25-93 chr4 154003998 154004247 + 1 NA Intergenic Intergenic -215039 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 159.75-89 chr2 178240771 178240944 + 1 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) (TTACTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46345 NM_032523 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 152.5-69 chr17 56414951 56415231 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 8 of 20) L1MA2|LINE|L1 -178608 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 198.75-92 chr7 62723044 62723326 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 580871 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 181.75-128 chr8 106162244 106162494 + 1 NA Intergenic Intergenic -101866 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-179 chr8 4297553 4297780 + 1 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 697248 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 227.5-104 chr8 83192803 83193178 + 1 NA Intergenic Intergenic -210768 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 324.5-13 chr16 87262393 87262975 + 1 NA Intergenic Intergenic 29768 NR_104667 101928682 Hs.149004 NR_104667 ENSG00000261697 LOC101928682 - uncharacterized LOC101928682 ncRNA 131.75-26 chr10 29299125 29299302 + 1 NA intron (NM_032517, intron 3 of 4) MER1A|DNA|hAT-Charlie 10143 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 198.25-82 chr5 32153460 32153791 + 1 NA intron (NM_022130, intron 1 of 3) L1MC5a|LINE|L1 20694 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 194.25-123 chrX 57888065 57888351 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 22425 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 220.5-117 chr7 50104479 50104807 + 1 NA intron (NM_001161834, intron 2 of 8) LTR16A1|LTR|ERVL 8557 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 156.25-26 chr11 32612512 32612731 + 1 NA intron (NM_001008391, intron 16 of 17) AluJb|SINE|Alu 28790 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 154.25-190 chr9 130998756 130999029 + 1 NA Intergenic Intergenic -10282 NM_006059 10319 Hs.201805 NM_006059 ENSG00000050555 LAMC3 OCCM laminin subunit gamma 3 protein-coding 210.5-50 chr16 87180267 87180538 + 1 NA Intergenic Intergenic -31713 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 127.25-182 chr6 124936473 124936648 + 1 NA intron (NR_026876, intron 3 of 6) intron (NR_026876, intron 3 of 6) -25985 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 242.5-7 chr1 188249217 188249664 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 805812 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 223.5-81 chr3 47792779 47793130 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -9955 NR_075079 22907 Hs.517948 NM_014966 ENSG00000132153 DHX30 DDX30|NEDMIAL|RETCOR DExH-box helicase 30 protein-coding 209.25-35 chr15 95506600 95506890 + 1 NA non-coding (NR_027132, exon 7 of 7) non-coding (NR_027132, exon 7 of 7) 73652 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 116.75-79 chr18 4079831 4080067 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 117596 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 155.25-127 chr4 23151252 23151428 + 1 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 437251 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 114.5-73 chr12 72544640 72544813 + 1 NA intron (NM_013381, intron 7 of 18) intron (NM_013381, intron 7 of 18) -271217 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 247.5-71 chr6 36647786 36648213 + 1 NA Intergenic Intergenic -25487 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 209.25-37 chr16 11508775 11509103 + 1 NA intron (NM_001370704, intron 7 of 66) intron (NM_001370704, intron 7 of 66) 18308 NM_001370704 400499 Hs.459937 NM_001370704 ENSG00000188897 LOC400499 - putative uncharacterized protein LOC400499 protein-coding 219.25-41 chr2 222729170 222729475 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 57664 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 160.5-108 chr22 25670505 25670724 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 5 of 19) (CTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -71574 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 138.25-76 chr19 18599556 18599800 + 1 NA exon (NM_004750, exon 2 of 9) exon (NM_004750, exon 2 of 9) 7121 NM_004750 9244 Hs.114948 NM_004750 ENSG00000006016 CRLF1 CISS|CISS1|CLF|CLF-1|NR6|zcytor5 cytokine receptor like factor 1 protein-coding 452.5-2 chr1 201264064 201264780 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -19030 NM_000299 5317 Hs.497350 NM_000299 ENSG00000081277 PKP1 B6P plakophilin 1 protein-coding 174.25-83 chr2 227523089 227523467 + 1 NA intron (NM_004504, intron 3 of 12) intron (NM_004504, intron 3 of 12) 51106 NM_001135188 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 306.75-12 chr2 8172112 8172525 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) 156101 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 230.5-74 chr20 63556155 63556521 + 1 NA exon (NM_001319152, exon 2 of 2) exon (NM_001319152, exon 2 of 2) 2179 NM_001319152 79025 Hs.197755 NM_024059 ENSG00000125531 FNDC11 C20orf195 fibronectin type III domain containing 11 protein-coding 286.5-44 chr3 90685258 90685667 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1577841 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 137.5-8 chr1 101587661 101587892 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 259304 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 169.75-58 chr16 77100973 77101179 + 1 NA Intergenic Intergenic -90114 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 139.25-156 chr5 146301486 146301715 + 1 NA Intergenic Intergenic -37239 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 149.5-52 chr14 27007948 27008149 + 1 NA Intergenic Intergenic 99406 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 114.5-61 chr11 124012067 124012274 + 1 NA Intergenic Intergenic -3405 NM_001004462 390264 Hs.553760 NM_001004462 ENSG00000254737 OR10G4 OR11-278 olfactory receptor family 10 subfamily G member 4 protein-coding 249.25-39 chr5 7740299 7740765 + 1 NA intron (NM_020546, intron 14 of 24) intron (NM_020546, intron 14 of 24) 110601 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 206.75-98 chr9 113202526 113202833 + 1 NA intron (NM_015258, intron 5 of 27) intron (NM_015258, intron 5 of 27) 18598 NM_015258 23307 Hs.522351 NM_015258 ENSG00000119321 FKBP15 FKBP133|KIAA0674|PPP1R76 FKBP prolyl isomerase 15 protein-coding 211.5-135 chr6 111840053 111840311 + 1 NA intron (NM_153047, intron 2 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 32889 NM_153047 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 199.75-72 chr4 101209942 101210280 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 30761 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 253.75-35 chr22 41823324 41823684 + 1 NA intron (NM_024821, intron 6 of 6) AluSx1|SINE|Alu -9601 NR_103834 6721 Hs.443258 NM_004599 ENSG00000198911 SREBF2 SREBP-2|SREBP2|bHLHd2 sterol regulatory element binding transcription factor 2 protein-coding 114.25-195 chr8 121028161 121028292 + 1 NA Intergenic Intergenic -216180 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 208.75-6 chr1 231277700 231278191 + 1 NA TTS (NM_014236) TTS (NM_014236) 36733 NM_014236 8443 Hs.498028 NM_014236 ENSG00000116906 GNPAT DAP-AT|DAPAT|DHAPAT|RCDP2 glyceronephosphate O-acyltransferase protein-coding 154.75-46 chr15 84762463 84762816 + 1 NA intron (NM_014630, intron 1 of 10) intron (NM_014630, intron 1 of 10) 14047 NM_014630 9640 Hs.79347 NM_014630 ENSG00000166716 ZNF592 CAMOS|SCAR5 zinc finger protein 592 protein-coding 246.75-25 chr17 78522808 78523351 + 1 NA intron (NM_173628, intron 25 of 80) AluJo|SINE|Alu 38169 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 230.25-11 chr10 30970278 30970682 + 1 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR 29037 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 171.5-164 chr9 69004071 69004261 + 1 NA intron (NM_003558, intron 15 of 15) intron (NM_003558, intron 15 of 15) 9957 NM_002732 5568 Hs.158029 NM_002732 ENSG00000165059 PRKACG BDPLT19|KAPG|PKACg protein kinase cAMP-activated catalytic subunit gamma protein-coding 132.5-79 chr15 75385557 75385745 + 1 NA intron (NM_015477, intron 16 of 20) intron (NM_015477, intron 16 of 20) -17024 NM_001256494 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 199.75-83 chr6 117861190 117861462 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -45938 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 132.5-50 chr12 19980970 19981162 + 1 NA Intergenic Intergenic -33619 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 146.5-68 chr15 36367525 36367725 + 1 NA Intergenic Intergenic -212001 NM_001321758 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 131.5-48 chr12 123204897 123205087 + 1 NA intron (NR_103517, intron 9 of 23) intron (NR_103517, intron 9 of 23) 28149 NM_022782 10198 Hs.577404 NM_022782 ENSG00000051825 MPHOSPH9 MPP-9|MPP9 M-phase phosphoprotein 9 protein-coding 180.5-153 chr8 91985714 91986119 + 1 NA intron (NM_004349, intron 8 of 10) intron (NM_004349, intron 8 of 10) 31764 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 207.75-95 chr4 176144257 176144533 + 1 NA intron (NM_170710, intron 12 of 30) L2b|LINE|L2 51190 NM_144644 132851 Hs.481235 NM_144644 ENSG00000150628 SPATA4 SPEF1B|TSARG2 spermatogenesis associated 4 protein-coding 184.25-88 chr4 37927828 37928138 + 1 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) -32415 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 216.5-64 chr2 203797403 203797647 + 1 NA Intergenic Intergenic -70246 NM_005214 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 240.75-12 chr10 89299817 89300143 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -2066 NM_001547 3433 Hs.437609 NM_001547 ENSG00000119922 IFIT2 G10P2|GARG-39|IFI-54|IFI-54K|IFI54|IFIT-2|ISG-54 K|ISG-54K|ISG54|P54|cig42 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2 protein-coding 125.25-99 chr2 95169462 95169818 + 1 NA intron (NM_001291604, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 3831 NM_001291605 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 134.25-3 chr1 33797274 33797570 + 1 NA intron (NM_052896, intron 10 of 69) intron (NM_052896, intron 10 of 69) -63053 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 132.5-90 chr17 44630092 44630279 + 1 NA Intergenic Intergenic 20164 NR_110661 101927017 Hs.560554 NR_110661 ENSG00000266979 LINC01180 - long intergenic non-protein coding RNA 1180 ncRNA 197.5-64 chr2 21075098 21075347 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -31149 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 178.5-48 chr14 49661086 49661321 + 1 NA intron (NM_001348385, intron 10 of 18) MIRb|SINE|MIR -25973 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 175.5-122 chr3 127199691 127199937 + 1 NA Intergenic Intergenic 6683 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 237.5-35 chr15 63877819 63878288 + 1 NA Intergenic Intergenic -7034 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 141.5-83 chr18 66068152 66068330 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 317229 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 123.5-40 chr11 74205769 74205955 + 1 NA intron (NM_001271593, intron 3 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 34573 NM_016147 51400 Hs.503251 NM_016147 ENSG00000214517 PPME1 ABDH19|PME-1 protein phosphatase methylesterase 1 protein-coding 174.5-161 chr6 107257139 107257416 + 1 NA intron (NM_020381, intron 3 of 7) AluJr4|SINE|Alu -141762 NM_001367314 57673 Hs.418045 NM_001080450 ENSG00000178409 BEND3 KIAA1553 BEN domain containing 3 protein-coding 235.5-3 chr1 40100834 40101125 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3509 NM_000310 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 158.25-14 chr10 83794034 83794213 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -117034 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 353.75-18 chr8 108489241 108489719 + 1 NA TTS (NM_001329493) TTS (NM_001329493) 45856 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 295.75-22 chr4 124696406 124696732 + 1 NA intron (NM_001167882, intron 1 of 3) L1MEg2|LINE|L1 16163 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 124.25-25 chr10 59596403 59596648 + 1 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 113366 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 197.75-71 chr5 104011736 104012001 + 1 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -449079 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 228.25-57 chr4 66469476 66469768 + 1 NA Intergenic Intergenic 192798 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 167.5-9 chr1 101538590 101538896 + 1 NA Intergenic Intergenic 214906 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 159.75-3 chr1 39837468 39837800 + 1 NA TTS (NM_017646) TTS (NM_017646) 45870 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 181.75-55 chr2 5129066 5129402 + 1 NA Intergenic Intergenic -473012 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 243.75-50 chr22 24841393 24841652 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) L1MB2|LINE|L1 35301 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 218.75-26 chr17 60293294 60293745 + 1 NA intron (NM_032582, intron 4 of 33) intron (NM_032582, intron 4 of 33) -61874 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 143.5-153 chr3 181526592 181526841 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1M5|LINE|L1 -83618 NR_075090 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 186.5-131 chr8 6821852 6822078 + 1 NA exon (NM_001289973, exon 6 of 8) exon (NM_001289973, exon 6 of 8) 13559 NM_001289973 389610 Hs.558840 NM_207411 ENSG00000275591 XKR5 HARL2754|UNQ2754|XRG5A|XRG5BM XK related 5 protein-coding 200.5-121 chr5 156871501 156871853 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 21382 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 300.5-35 chr4 111863935 111864419 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -281277 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 148.5-157 chr3 142172775 142172975 + 1 NA intron (NM_001039547, intron 12 of 15) intron (NM_001039547, intron 12 of 15) -23331 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 196.5-137 chr6 22007280 22007494 + 1 NA intron (NR_015410, intron 6 of 11) MIR|SINE|MIR 139806 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 181.5-6 chr1 150692887 150693133 + 1 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) intron (NM_018178, intron 2 of 4) 4144 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 146.5-160 chr4 167967518 167967697 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -124930 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 160.5-97 chr2 210499368 210499656 + 1 NA intron (NM_001122633, intron 1 of 38) L1PA15-16|LINE|L1 -20206 NM_001369256 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 185.75-28 chr11 129660563 129660828 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -43426 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 175.5-5 chr1 110595536 110595815 + 1 NA 3' UTR (NM_004974, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_004974, exon 3 of 3) 10683 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 235.5-89 chr8 85220472 85220907 + 1 NA promoter-TSS (NM_001293320) promoter-TSS (NM_001293320) -267 NM_001099671 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 255.75-10 chr11 81129009 81129633 + 1 NA Intergenic Intergenic -366518 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 113.5-96 chr16 72215788 72215966 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -43427 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 307.5-19 chr16 11241371 11241788 + 1 NA Intergenic Intergenic 14603 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 169.5-144 chr5 124576509 124576852 + 1 NA Intergenic Intergenic -138160 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 314.5-9 chr19 33845539 33846138 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 48968 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 194.5-138 chr7 23273878 23274207 + 1 NA intron (NM_001005340, intron 10 of 10) intron (NM_001005340, intron 10 of 10) -25297 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 242.75-34 chr20 9406145 9406427 + 1 NA intron (NM_001172646, intron 20 of 37) intron (NM_001172646, intron 20 of 37) 98486 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 216.25-6 chr1 168187772 168188212 + 1 NA intron (NM_152902, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 9030 NM_001031800 261726 Hs.209431 NM_152902 ENSG00000143155 TIPRL TIP|TIP41|TIPRL1 TOR signaling pathway regulator protein-coding 317.5-10 chr17 62924351 62924844 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -19618 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 177.75-135 chr8 54462790 54462990 + 1 NA Intergenic Intergenic 4955 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 180.5-129 chr6 73394862 73395070 + 1 NA exon (NM_018665, exon 1 of 17) exon (NM_018665, exon 1 of 17) 138 NM_018665 55510 Hs.125507 NM_018665 ENSG00000080007 DDX43 CT13|HAGE DEAD-box helicase 43 protein-coding 418.5-4 chr14 83177563 83178237 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 535268 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 177.5-97 chr2 204611097 204611422 + 1 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 65784 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 128.5-208 chr7 51695169 51695319 + 1 NA Intergenic Intergenic -301988 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 164.5-31 chr11 99226254 99226505 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 205430 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 223.75-12 chr12 673363 673675 + 1 NA Intergenic Intergenic -10074 NM_016533 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 292.5-13 chr11 108453520 108453986 + 1 NA intron (NR_147053, intron 3 of 12) L1M2|LINE|L1 13776 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 174.5-85 chr17 78868560 78868896 + 1 NA intron (NM_003255, intron 3 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie -28201 NM_001321291 57602 Hs.464243 NM_025090 ENSG00000055483 USP36 DUB1 ubiquitin specific peptidase 36 protein-coding 144.5-31 chr10 70001515 70001719 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -51229 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 197.5-133 chr6 26384695 26385046 + 1 NA intron (NM_001197239, intron 2 of 5) intron (NM_001197239, intron 2 of 5) 1762 NM_181531 10385 Hs.373938 NM_006995 ENSG00000124508 BTN2A2 BT2.2|BTF2|BTN2.2 butyrophilin subfamily 2 member A2 protein-coding 280.75-31 chr3 191621558 191621910 + 1 NA Intergenic Intergenic 160571 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 112.5-133 chr2 183739587 183739757 + 1 NA Intergenic Intergenic 615229 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 177.5-120 chr3 184148812 184149140 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -6401 NM_004423 1857 Hs.388116 NM_004423 ENSG00000161202 DVL3 DRS3 dishevelled segment polarity protein 3 protein-coding 141.25-95 chr20 7666939 7667199 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 273389 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 163.25-20 chr10 90176778 90177158 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -219595 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 192.5-115 chr6 91200472 91200723 + 1 NA Intergenic Intergenic -321063 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 212.75-76 chr4 186218011 186218394 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -9305 NM_001318394 3818 Hs.237642 NM_000892 ENSG00000164344 KLKB1 KLK3|PKK|PKKD|PPK kallikrein B1 protein-coding 261.25-35 chr4 77477826 77478309 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -33686 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 122.5-176 chr5 11901535 11901733 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 2812 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 299.25-10 chr10 68705580 68705988 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -15455 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 194.5-27 chr11 125153182 125153515 + 1 NA Intergenic Intergenic 11261 NR_125759 103695364 Hs.576940 NR_125759 ENSG00000254880 PKNOX2-AS1 - PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165.5-172 chr6 155325290 155325540 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -10931 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 121.5-94 chr16 11018774 11018931 + 1 NA intron (NM_015226, intron 10 of 22) L2b|LINE|L2 74288 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 137.75-205 chr8 102552413 102552686 + 1 NA intron (NM_024410, intron 1 of 1) intron (NM_024410, intron 1 of 1) 960 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 243.5-57 chr4 70962762 70963165 + 1 NA intron (NM_173468, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu -30686 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 120.5-231 chr8 113558965 113559086 + 1 NA Intergenic Intergenic -122086 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 160.5-103 chr20 44442390 44442608 + 1 NA Intergenic Intergenic 8058 NR_109893 101927242 Hs.143307 NR_109893 ENSG00000168746 LINC01430 - long intergenic non-protein coding RNA 1430 ncRNA 167.75-122 chr6 64417486 64417675 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 28 of 43) intron (NM_001292009, intron 28 of 43) 610744 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 168.75-31 chr11 100335332 100335620 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 20 of 23) intron (NM_001243270, intron 20 of 23) -351812 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 180.5-49 chr15 66829908 66830233 + 1 NA Intergenic Intergenic 126445 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 384.5-15 chr5 55358042 55358685 + 1 NA intron (NM_015360, intron 14 of 26) intron (NM_015360, intron 14 of 26) 50374 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 156.75-26 chr10 91379759 91379941 + 1 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -29385 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 132.5-21 chr1 185140605 185140784 + 1 NA intron (NM_030934, intron 7 of 14) intron (NM_030934, intron 7 of 14) 16259 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 256.25-11 chr13 36251517 36251837 + 1 NA intron (NM_001144981, intron 6 of 7) intron (NM_001144981, intron 6 of 7) -37062 NM_001282147 54937 Hs.124519 NM_017826 ENSG00000120669 SOHLH2 SOSF2|SPATA28|TEB1|bHLHe81 spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 protein-coding 285.25-21 chr3 104552334 104552829 + 1 NA Intergenic Intergenic -814132 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 165.25-129 chr7 11747482 11747765 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L2c|LINE|L2 84575 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 205.25-47 chr19 56919977 56920201 + 1 NA Intergenic Intergenic 79187 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 184.25-123 chr8 117118962 117119327 + 1 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -15851 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 185.5-95 chr20 49711150 49711451 + 1 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) intron (NM_004776, intron 1 of 8) 2578 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 217.5-9 chr1 194800070 194800338 + 1 NA Intergenic Intergenic 1288511 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149.75-90 chr2 142303570 142303753 + 1 NA Intergenic Intergenic -171960 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 138.5-48 chr12 124553481 124553731 + 1 NA intron (NM_001077261, intron 1 of 47) intron (NM_001077261, intron 1 of 47) 14006 NM_006312 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 154.5-121 chr22 24972032 24972375 + 1 NA Intergenic Intergenic -25508 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 137.25-19 chr10 82516842 82517118 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -284060 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-11 chr10 14318435 14318600 + 1 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 12367 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 276.5-6 chr1 216513797 216514444 + 1 NA intron (NM_001243518, intron 7 of 7) intron (NM_001243518, intron 7 of 7) -90672 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 187.25-98 chr7 99586837 99587111 + 1 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -11293 NM_001195543 100289187 Hs.729333 NM_001195541 ENSG00000244219 TMEM225B GS1-259H13.2 transmembrane protein 225B protein-coding 126.75-172 chr4 63985848 63986005 + 1 NA Intergenic Intergenic 423524 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 166.5-56 chr13 41039068 41039251 + 1 NA intron (NM_001370329, intron 1 of 9) FLAM_C|SINE|Alu -19843 NM_001370332 1997 Hs.135646 NM_172373 ENSG00000120690 ELF1 EFTUD1|RIA1 E74 like ETS transcription factor 1 protein-coding 141.75-41 chr11 113945588 113945836 + 1 NA intron (NM_006028, intron 8 of 8) intron (NM_006028, intron 8 of 8) -29363 NR_046363 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 165.5-111 chr3 81534687 81534946 + 1 NA intron (NM_000158, intron 14 of 15) intron (NM_000158, intron 14 of 15) 226829 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 242.5-12 chr10 21378391 21378858 + 1 NA Intergenic Intergenic -5674 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 204.5-52 chr18 60859311 60859659 + 1 NA Intergenic Intergenic -473945 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 200.25-114 chr8 103019519 103019875 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -1386 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 195.5-67 chr2 40517754 40518028 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5456 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 113.5-86 chr15 66604424 66604580 + 1 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) intron (NR_110372, intron 1 of 4) 22312 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 127.25-123 chr3 72394818 72395042 + 1 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 51693 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 232.5-48 chr2 54837446 54837855 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 6 of 40) intron (NM_001039753, intron 6 of 40) 112638 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 206.5-26 chr14 54574639 54575009 + 1 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 7212 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 276.5-12 chr11 43638401 43638986 + 1 NA Intergenic Intergenic -42045 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 174.5-142 chr5 6614460 6614813 + 1 NA intron (NM_017755, intron 9 of 18) intron (NM_017755, intron 9 of 18) 18408 NM_017755 54888 Hs.481526 NM_017755 ENSG00000037474 NSUN2 MISU|MRT5|SAKI|TRM4 NOP2/Sun RNA methyltransferase 2 protein-coding 182.5-70 chr18 3544977 3545217 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) AluSx1|SINE|Alu -49017 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 205.25-66 chr3 53240426 53240686 + 1 NA intron (NM_001258028, intron 3 of 14) MIRb|SINE|MIR 15466 NM_001064 7086 Hs.89643 NM_001064 ENSG00000163931 TKT HEL-S-48|HEL107|SDDHD|TK|TKT1 transketolase protein-coding 136.5-160 chr4 30742281 30742468 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 22005 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 338.5-23 chr5 28805859 28806431 + 1 NA Intergenic Intergenic -120725 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 146.5-232 chr9 29283996 29284213 + 1 NA Intergenic Intergenic -70503 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 268.25-31 chr3 27683664 27684173 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 38405 NM_001278182 8320 Hs.591663 NM_005442 ENSG00000163508 EOMES TBR2 eomesodermin protein-coding 192.5-68 chr2 95569899 95570139 + 1 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -21982 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 216.5-69 chr22 48124105 48124505 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -150059 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 189.5-19 chr10 14538102 14538449 + 1 NA intron (NM_031453, intron 2 of 4) L1ME3A|LINE|L1 267 NM_001320740 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 241.75-42 chr2 163617185 163617644 + 1 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 118594 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 141.75-13 chr1 196267482 196267799 + 1 NA intron (NR_146058, intron 26 of 29) LTR53-int|LTR|ERVL -178925 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 173.25-143 chrX 52437664 52437914 + 1 NA Intergenic Intergenic -57879 NM_001097604 653067 Hs.112208 NM_020411 ENSG00000204382 XAGE1B CT12.1|CT12.1C|CT12.1D|CT12.1E|CT12.1b|CTP9|GAGED2|XAGE-1|XAGE1|XAGE1C|XAGE1D|XAGE1E X antigen family member 1B protein-coding 144.25-115 chr20 40344374 40344549 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 340000 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 134.5-148 chr4 12746748 12746941 + 1 NA Intergenic Intergenic 523393 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 217.5-76 chr22 20005087 20005321 + 1 NA intron (NM_001670, intron 2 of 19) L1MB2|LINE|L1 11619 NM_001670 421 Hs.713616 NM_001670 ENSG00000099889 ARVCF - ARVCF delta catenin family member protein-coding 237.25-23 chr14 57242908 57243198 + 1 NA intron (NM_006544, intron 4 of 17) L1PB2|LINE|L1 25852 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 182.25-40 chr14 74667056 74667238 + 1 NA intron (NM_001039479, intron 17 of 19) intron (NM_001039479, intron 17 of 19) 45933 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 140.75-13 chr1 229609653 229609989 + 1 NA intron (NM_001025247, intron 3 of 3) intron (NM_001025247, intron 3 of 3) 16226 NM_014409 27097 Hs.270621 NM_014409 ENSG00000135801 TAF5L PAF65B TATA-box binding protein associated factor 5 like protein-coding 265.75-48 chr3 52120953 52121428 + 1 NA intron (NM_015426, intron 9 of 10) MIRb|SINE|MIR 33233 NM_001161580 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 121.5 chr1 22462548 22462721 + 1 NA intron (NM_001083621, intron 2 of 18) MIR3|SINE|MIR 10783 NM_014870 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 257.25-60 chrX 38453989 38454370 + 1 NA Intergenic Intergenic 101575 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 243.5-83 chr8 94473529 94473925 + 1 NA intron (NM_012415, intron 1 of 14) intron (NM_012415, intron 1 of 14) 1388 NM_012415 25788 Hs.30561 NM_006550 ENSG00000197275 RAD54B RDH54 RAD54 homolog B protein-coding 332.25-22 chr3 70494993 70495424 + 1 NA Intergenic Intergenic -182570 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 270.75-36 chr4 79733003 79733678 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -94131 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 162.5-47 chr14 35271716 35271902 + 1 NA intron (NM_014672, intron 7 of 7) AluSz6|SINE|Alu -6749 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 163.5-46 chr12 118185596 118185841 + 1 NA intron (NM_001346490, intron 15 of 21) intron (NM_001346490, intron 15 of 21) 4817 NM_001346496 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 143.5-225 chr9 26555021 26555280 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 337652 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 218.5-5 chr1 58750118 58750429 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 33774 NM_002228 3725 Hs.696684 NM_002228 ENSG00000177606 JUN AP-1|AP1|c-Jun|p39 Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 137.75-211 chr8 126382112 126382385 + 1 NA Intergenic Intergenic 56753 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 280.75-4 chr1 84683477 84683959 + 1 NA intron (NM_014021, intron 1 of 14) intron (NM_014021, intron 1 of 14) 6743 NM_014021 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 199.5-57 chr16 88826373 88826882 + 1 NA intron (NM_001323544, intron 11 of 14) intron (NM_001323544, intron 11 of 14) -14699 NM_001030018 353 Hs.28914 NM_000485 ENSG00000198931 APRT AMP|APRTD adenine phosphoribosyltransferase protein-coding 246.5-70 chr7 71977964 71978355 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 359232 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 260.25-9 chr10 96631100 96631506 + 1 NA intron (NM_152309, intron 8 of 16) intron (NM_152309, intron 8 of 16) -44291 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 264.25-53 chr8 107834825 107835336 + 1 NA Intergenic Intergenic 246859 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 163.5-71 chr17 56323151 56323371 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 3 of 20) intron (NM_001370326, intron 3 of 20) 169786 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 144.5-78 chr16 56904943 56905126 + 1 NA TTS (NR_106923) TTS (NR_106923) 770 NR_106923 102466752 NR_106923 ENSG00000283471 MIR6863 hsa-mir-6863 microRNA 6863 ncRNA 282.5-38 chr20 61848457 61848840 + 1 NA intron (NM_001252339, intron 4 of 14) AluSx1|SINE|Alu 105014 NR_031658 100302168 NR_031658 ENSG00000284193 MIR1257 MIRN1257|hsa-mir-1257 microRNA 1257 ncRNA 191.5-23 chr11 75904958 75905267 + 1 NA intron (NM_003369, intron 5 of 14) intron (NM_003369, intron 5 of 14) 89902 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 282.5-49 chr4 103049057 103049398 + 1 NA intron (NM_001370207, intron 5 of 10) MIR|SINE|MIR 27534 NM_001300756 133308 Hs.546482 NM_178833 ENSG00000164038 SLC9B2 NHA2|NHE10|NHEDC2 solute carrier family 9 member B2 protein-coding 285.25-42 chr8 132927089 132927691 + 1 NA intron (NM_003235, intron 22 of 47) intron (NM_003235, intron 22 of 47) 60432 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 229.5-22 chr10 123447526 123447792 + 1 NA Intergenic Intergenic -218696 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 192.25-107 chr9 17478253 17478632 + 1 NA intron (NM_001365029, intron 23 of 25) L1MB1|LINE|L1 -100624 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 285.5-56 chr7 83278035 83278497 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -115382 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 204.25-24 chr12 20433448 20433690 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 64324 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 138.5-95 chr2 25095094 25095322 + 1 NA intron (NM_014971, intron 3 of 22) L1ME4a|LINE|L1 52745 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 201.5-79 chr20 12677555 12677794 + 1 NA Intergenic Intergenic 259289 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 165.5-44 chr14 53611168 53611421 + 1 NA Intergenic Intergenic 337190 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 112.75-103 chr2 140316488 140316662 + 1 NA intron (NM_018557, intron 82 of 90) intron (NM_018557, intron 82 of 90) 270110 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 288.5-8 chr11 98009757 98010130 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -1011006 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 211.5-67 chr2 12257719 12258099 + 1 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 58779 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 188.75-4 chr1 98401240 98401453 + 1 NA Intergenic Intergenic 190635 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 140.5-50 chr12 131460606 131460770 + 1 NA Intergenic Intergenic 113218 NR_103736 338797 Hs.592007 NM_001025466 LINC02370 - long intergenic non-protein coding RNA 2370 ncRNA 228.25-39 chr19 3952193 3952445 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 9193 NR_030367 693222 NR_030367 ENSG00000283928 MIR637 MIRN637|hsa-mir-637 microRNA 637 ncRNA 123.75-79 chr18 2424166 2424389 + 1 NA Intergenic Intergenic 147228 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 211.25-62 chr3 163255768 163256173 + 1 NA intron (NR_033945, intron 2 of 6) intron (NR_033945, intron 2 of 6) 47331 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 155.5-25 chr10 68384252 68384586 + 1 NA intron (NR_103476, intron 8 of 18) intron (NR_103476, intron 8 of 18) 22770 NM_017987 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 180.5-154 chr8 93463217 93463483 + 1 NA intron (NR_033858, intron 7 of 10) intron (NR_033858, intron 7 of 10) 237083 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 281.25-44 chr8 87435146 87435697 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 438594 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 177.25-36 chr11 123658825 123659051 + 1 NA Intergenic Intergenic -4331 NM_001040151 55800 Hs.4865 NM_018400 ENSG00000166257 SCN3B ATFB16|BRGDA7|HSA243396|SCNB3 sodium voltage-gated channel beta subunit 3 protein-coding 238.25-72 chr5 158859657 158860143 + 1 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) L2c|LINE|L2 238056 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 189.75-49 chr16 84903044 84903342 + 1 NA intron (NM_031476, intron 14 of 14) intron (NM_031476, intron 14 of 14) 83208 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 278.5-33 chr20 14381706 14382137 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -44254 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 240.75-21 chr14 26955115 26955390 + 1 NA Intergenic Intergenic 46610 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 165.25-145 chr9 1418538 1418800 + 1 NA Intergenic Intergenic 367182 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 234.5-82 chr6 68945634 68946012 + 1 NA intron (NM_001704, intron 6 of 31) intron (NM_001704, intron 6 of 31) 310541 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 121.75-85 chr2 123910281 123910572 + 1 NA Intergenic Intergenic 114748 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 139.5-204 chr7 109884904 109885323 + 1 NA Intergenic Intergenic 75100 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 280.5-6 chr1 211408804 211409228 + 1 NA intron (NR_026761, intron 4 of 5) L1MB7|LINE|L1 26261 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 157.5-37 chr11 41654621 41654852 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -59832 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 149.5-110 chr20 62054663 62054913 + 1 NA intron (NM_003185, intron 1 of 14) intron (NM_003185, intron 1 of 14) -10014 NR_130463 100422838 NR_130463 ENSG00000265306 MIR3195 - microRNA 3195 ncRNA 290.75-2 chr1 105893534 105893854 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 134559 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 239.75-53 chr4 90559879 90560243 + 1 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) intron (NM_207491, intron 5 of 7) 325030 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 247.25-49 chr5 67494263 67494699 + 1 NA Intergenic Intergenic 152308 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 208.5-46 chr15 100587694 100588035 + 1 NA intron (NR_148018, intron 1 of 6) MER51-int|LTR|ERV1 14320 NR_148017 55180 Hs.105633 NM_018148 ENSG00000140471 LINS1 LINS|MRT27|WINS1 lines homolog 1 protein-coding 178.5-10 chr10 16514654 16514997 + 1 NA intron (NM_001010908, intron 1 of 1) intron (NM_001010908, intron 1 of 1) 7054 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 248.25-71 chr8 80397995 80398699 + 1 NA Intergenic Intergenic -87246 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 170.5-103 chr2 195694680 195695060 + 1 NA intron (NM_020342, intron 3 of 9) MER61A|LTR|ERV1 37644 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 205.25-100 chr7 31037209 31037419 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -14994 NM_001199637 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 178.75-79 chr4 167815626 167816149 + 1 NA Intergenic Intergenic -276650 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 253.75-58 chr7 41014032 41014439 + 1 NA Intergenic Intergenic -34296 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 129.25-47 chr14 38137427 38137703 + 1 NA Intergenic Intergenic -70339 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 177.5-90 chr2 180102106 180102316 + 1 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -94914 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 169.5-81 chr2 174179912 174180192 + 1 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) intron (NM_001011708, intron 3 of 9) 68480 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 171.75-116 chr5 120507014 120507277 + 1 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) intron (NM_016644, intron 2 of 2) -24319 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 171.25-135 chr6 64881499 64881697 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) L2a|LINE|L2 -419820 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 238.75-37 chr3 116751745 116752058 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 42113 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 146.75-40 chr13 108168273 108168502 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 46395 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 142.5-211 chr7 95139148 95139372 + 1 NA intron (NM_017650, intron 4 of 15) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 185272 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 144.5-171 chr5 41601501 41601654 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -90976 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 170.5-155 chr6 36509155 36509414 + 1 NA intron (NM_007271, intron 7 of 13) MER52A|LTR|ERV1 38195 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 172.5-107 chr2 230370464 230370744 + 1 NA intron (NM_001352892, intron 5 of 18) intron (NM_001352892, intron 5 of 18) 43433 NM_001308162 93349 Hs.589661 NM_138402 ENSG00000185404 SP140L - SP140 nuclear body protein like protein-coding 219.5-8 chr1 179322667 179322987 + 1 NA intron (NM_001252511, intron 2 of 14) L1MB8|LINE|L1 29030 NR_045530 6646 Hs.445588 NM_003101 ENSG00000057252 SOAT1 ACACT|ACAT|ACAT-1|ACAT1|SOAT|STAT sterol O-acyltransferase 1 protein-coding 343.75-7 chr2 143421949 143422520 + 1 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 292815 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 129.5-70 chr14 89312583 89312825 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 104529 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 248.5-73 chr4 64850168 64850540 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 154146 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 184.5-117 chr5 31631478 31631748 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -7518 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 189.25-88 chr4 45133165 45133563 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -406730 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 310.5-14 chr17 50744214 50744600 + 1 NA intron (NM_006107, intron 6 of 10) intron (NM_006107, intron 6 of 10) 23111 NM_001358683 55018 Hs.389460 NM_017928 ENSG00000167117 ANKRD40CL C17orf73|LINC00483 ANKRD40 C-terminal like protein-coding 264.5-31 chr2 14790842 14791395 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 158401 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 219.5-55 chr18 48678151 48678580 + 1 NA intron (NM_014772, intron 6 of 11) intron (NM_014772, intron 6 of 11) 7765 NR_039897 100616366 NR_039897 ENSG00000266276 MIR4743 - microRNA 4743 ncRNA 184.5-54 chr16 80827874 80828119 + 1 NA TTS (NR_131947) TTS (NR_131947) -23398 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 226.5-9 chr10 53305178 53305427 + 1 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -533602 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 162.75-107 chr4 101070993 101071226 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 8 of 12) intron (NM_001130691, intron 8 of 12) 169763 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 126.75-255 chr9 107509902 107510243 + 1 NA Intergenic Intergenic -20303 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 142.25-85 chr2 50001602 50001856 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -27526 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 180.5-132 chr6 129101332 129101652 + 1 NA intron (NM_000426, intron 4 of 64) L1MEg|LINE|L1 218351 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 166.5-27 chr10 23577507 23577719 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -117114 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 292.5-51 chr8 58707739 58708209 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -48121 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 157.25-118 chr5 61666678 61667012 + 1 NA intron (NR_109910, intron 7 of 7) intron (NR_109910, intron 7 of 7) 29064 NR_126523 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 187.25-34 chr15 86839145 86839481 + 1 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) MamRep605|LTR?|LTR? -93567 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 209.75-38 chr18 4385059 4385606 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 69934 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 169.25-111 chr7 49876957 49877143 + 1 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) intron (NR_136188, intron 2 of 3) 101717 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 274.5-2 chr1 96269879 96270283 + 1 NA intron (NR_110693, intron 5 of 5) L1MC3|LINE|L1 104044 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 138.5-26 chr10 70130426 70130606 + 1 NA intron (NM_001198696, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 2309 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 218.25-109 chrX 71075621 71075950 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -2359 NM_001256185 29934 Hs.260750 NM_013346 ENSG00000147164 SNX12 - sorting nexin 12 protein-coding 123.5-12 chr1 192542529 192542734 + 1 NA Intergenic Intergenic -33142 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 191.5-144 chr8 22514840 22515192 + 1 NA intron (NM_005605, intron 6 of 13) L1MA3|LINE|L1 -36911 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 169.75-73 chr2 4435947 4436176 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 220161 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 185.25-120 chr7 120925394 120925621 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -25270 NM_019071 54556 Hs.489811 NM_019071 ENSG00000071243 ING3 Eaf4|ING2|MEAF4|p47ING3 inhibitor of growth family member 3 protein-coding 135.5-122 chr2 223970348 223970569 + 1 NA Intergenic Intergenic 12995 NM_022915 65080 Hs.203559 NM_022915 ENSG00000135900 MRPL44 COXPD16|L44MT|MRP-L44 mitochondrial ribosomal protein L44 protein-coding 157.5-193 chr7 47672897 47673209 + 1 NA Intergenic Intergenic 17809 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 300.5-17 chr14 88822084 88822592 + 1 NA Intergenic Intergenic -1815 NM_001288781 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 209.5-114 chr5 16027279 16027589 + 1 NA Intergenic Intergenic 92252 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 372.5-15 chr4 97289799 97290280 + 1 NA Intergenic Intergenic -76887 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-140 chr20 55722968 55723313 + 1 NA Intergenic Intergenic 282379 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 160.75-75 chr2 115508568 115508738 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 5 of 25) AluSc|SINE|Alu 164838 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 172.5-69 chr14 61877846 61878102 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) -49721 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 131.25-141 chr3 116982873 116983083 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 61547 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 155.5-116 chr22 27138086 27138283 + 1 NA Intergenic Intergenic -49332 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 154.75-150 chr8 137194914 137195154 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 218554 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 150.5-186 chr6 64906866 64907085 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 16 of 43) intron (NM_001292009, intron 16 of 43) -394443 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 189.5-125 chr6 170179497 170179796 + 1 NA Intergenic Intergenic 19004 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 178.75-20 chr12 53328416 53328685 + 1 NA exon (NM_001173467, exon 3 of 3) exon (NM_001173467, exon 3 of 3) -6940 NM_001173466 8086 Hs.369144 NM_015665 ENSG00000094914 AAAS AAA|AAASb|ADRACALA|ADRACALIN|ALADIN|GL003 aladin WD repeat nucleoporin protein-coding 279.75-60 chr9 82662779 82663138 + 1 NA Intergenic Intergenic 400184 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 219.5-102 chr5 83608659 83608903 + 1 NA Intergenic Intergenic -46467 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 261.75-57 chrX 93240527 93240874 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -415797 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 227.25-65 chr6 42626521 42626874 + 1 NA intron (NM_001363705, intron 11 of 46) L1MEg1|LINE|L1 62668 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 147.5-78 chr16 54499437 54499674 + 1 NA Intergenic Intergenic -128856 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 192.25-113 chr9 99614685 99615137 + 1 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 204978 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 164.75-79 chr2 136875491 136875849 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 110125 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 157.5-219 chr8 132166273 132166666 + 1 NA intron (NM_001204824, intron 8 of 14) intron (NM_001204824, intron 8 of 14) -61204 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 134.75-2 chr1 17498536 17498768 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -41046 NR_137288 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 181.75-59 chr2 38304284 38304552 + 1 NA intron (NM_001135673, intron 9 of 12) L1MA3|LINE|L1 72112 NM_001330460 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 161.75-39 chr14 61825353 61825708 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) AluJo|SINE|Alu 12827 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 137.25-88 chr22 27509027 27509351 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 198538 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 250.5-42 chr2 39312890 39313293 + 1 NA intron (NM_003618, intron 13 of 33) intron (NM_003618, intron 13 of 33) -69108 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 176.75-86 chr3 172854541 172854880 + 1 NA Intergenic Intergenic 103708 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 143.25-185 chr8 105756322 105756588 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 304048 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 269.25-24 chr2 50306101 50306566 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 41421 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 293.5-30 chr3 181393857 181394298 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1MA9|LINE|L1 48409 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 275.5-30 chr2 40241203 40241719 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) L1PA16|LINE|L1 188843 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 222.5-65 chr22 41968436 41968815 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363845) promoter-TSS (NM_001363845) -813 NM_001363845 55964 Hs.120483 NM_019106 ENSG00000100167 SEPTIN3 SEP3|SEPT3|bK250D10.3 septin 3 protein-coding 175.5-34 chr11 96980555 96980840 + 1 NA Intergenic Intergenic 472272 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 202.75-23 chr12 26632234 26632602 + 1 NA intron (NM_002223, intron 21 of 56) intron (NM_002223, intron 21 of 56) 200776 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 153.5-126 chr3 20911516 20911767 + 1 NA Intergenic Intergenic -494085 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 195.5-162 chr8 133807695 133808105 + 1 NA Intergenic Intergenic -30548 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 126.75-57 chr14 59260611 59260824 + 1 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) L1ME4a|LINE|L1 -2724 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 155.5-91 chr2 48105719 48105966 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -200049 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 211.75-76 chr5 84951691 84952055 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -566993 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 227.25-56 chr3 107285472 107285973 + 1 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 45030 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 345.25-20 chr5 120518030 120518581 + 1 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) intron (NM_016644, intron 2 of 2) -13159 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 190.5-65 chr18 3140467 3140712 + 1 NA intron (NM_019856, intron 14 of 36) intron (NM_019856, intron 14 of 36) 79379 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 284.5-65 chr8 87614182 87614769 + 1 NA Intergenic Intergenic 259540 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 297.75-46 chr7 106564447 106564903 + 1 NA Intergenic Intergenic 96483 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 226.5-92 chr7 40384547 40384853 + 1 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) AluSx1|SINE|Alu 249724 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 124.5-166 chr5 73052153 73052400 + 1 NA intron (NM_001146032, intron 11 of 24) intron (NM_001146032, intron 11 of 24) -68299 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 187.5-65 chr15 71441138 71441511 + 1 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -105912 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 137.5-182 chr5 16839558 16839704 + 1 NA intron (NM_012334, intron 2 of 40) AluJb|SINE|Alu 96657 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 182.75-65 chr2 26986758 26987215 + 1 NA intron (NR_149018, intron 3 of 5) intron (NR_149018, intron 3 of 5) 16349 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 241.25-72 chr8 139141293 139141650 + 1 NA Intergenic Intergenic -227430 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 307.5-46 chr7 97152763 97153266 + 1 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) LTR8|LTR|ERV1 36421 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 189.5-142 chr8 59629718 59630061 + 1 NA Intergenic Intergenic 510679 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 149.5-27 chr10 57557306 57557544 + 1 NA Intergenic Intergenic -252866 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 229.25-5 chr1 221791530 221791803 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 49000 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 153.25-120 chr7 3964021 3964243 + 1 NA intron (NM_152744, intron 9 of 44) Charlie17|DNA|hAT-Charlie -165553 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 214.5-19 chr11 42538430 42538834 + 1 NA Intergenic Intergenic -284942 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 257.75-6 chr10 106681633 106681911 + 1 NA intron (NM_001206569, intron 10 of 25) intron (NM_001206569, intron 10 of 25) 482934 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 119.5-186 chr5 124688999 124689155 + 1 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) L1MC1|LINE|L1 56035 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 245.5-80 chr8 106948685 106949197 + 1 NA Intergenic Intergenic -178697 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 205.5-95 chr3 90166125 90166417 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 1058650 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 205.25-112 chr9 122987381 122987655 + 1 NA intron (NM_012197, intron 4 of 25) L1ME4a|LINE|L1 -46125 NM_005294 2844 Hs.722039 NM_005294 ENSG00000011454 GPR21 - G protein-coupled receptor 21 protein-coding 185.75-103 chr6 50008331 50008586 + 1 NA TTS (NM_001037728) TTS (NM_001037728) 13523 NM_001037728 245913 Hs.571093 NM_001037497 ENSG00000203970 DEFB110 DEFB-10|DEFB-11|DEFB111 defensin beta 110 protein-coding 191.75-131 chr9 26810183 26810440 + 1 NA Intergenic Intergenic 82491 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 236.25-88 chr8 121004306 121004589 + 1 NA Intergenic Intergenic -192401 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 217.5-115 chr7 1752007 1752433 + 1 NA Intergenic Intergenic -9910 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 187.5-122 chr4 39301669 39301886 + 1 NA intron (NM_001204747, intron 19 of 24) AluJr|SINE|Alu 64585 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 252.5-2 chr1 114793148 114793684 + 1 NA Intergenic LTR38-int|LTR|ERV1 -12731 NR_049741 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 228.5-73 chr3 146086880 146087190 + 1 NA intron (NM_182943, intron 9 of 19) intron (NM_182943, intron 9 of 19) -17850 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 277.5-28 chr18 62317480 62317846 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -7624 NM_001270949 8792 Hs.204044 NM_003839 ENSG00000141655 TNFRSF11A CD265|FEO|LOH18CR1|ODFR|OFE|OPTB7|OSTS|PDB2|RANK|TRANCER TNF receptor superfamily member 11a protein-coding 233.25-15 chr11 54816850 54817219 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 110202 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 112.5-23 chr10 74648042 74648293 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) L1M4|LINE|L1 -118843 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 194.75-93 chr8 70816557 70816812 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 147345 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 289.5-5 chr1 217446642 217447114 + 1 NA intron (NM_018040, intron 9 of 9) intron (NM_018040, intron 9 of 9) 184212 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 113.5-24 chr1 204749176 204749292 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -63496 NM_006338 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 168.75-70 chr2 54766269 54766603 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) L1MC4|LINE|L1 41424 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 263.25-49 chr5 110409223 110409752 + 1 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 104428 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 299.5-11 chr12 113148171 113148763 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -1391 NM_001144872 387885 Hs.486856 NM_001144872 ENSG00000186710 CFAP73 CCDC42B|MIA2 cilia and flagella associated protein 73 protein-coding 126.5-247 chr8 107422652 107422911 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 75137 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 188.5-83 chr2 190953351 190953706 + 1 NA intron (NM_014905, intron 14 of 17) intron (NM_014905, intron 14 of 17) 60722 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 261.75-12 chr13 59409975 59410261 + 1 NA Intergenic Intergenic -602600 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 155.5-68 chr17 49217098 49217347 + 1 NA intron (NM_016428, intron 2 of 7) intron (NM_016428, intron 2 of 7) 6515 NM_016428 51225 Hs.130719 NM_016428 ENSG00000108798 ABI3 NESH|SSH3BP3 ABI family member 3 protein-coding 216.25-68 chr3 21114577 21114833 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -291021 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 239.5-87 chrX 54705929 54706310 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 92136 NM_198510 347365 Hs.454272 NM_198510 ENSG00000102313 ITIH6 ITIH5L|UNQ6369|dJ14O9.1 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family member 6 protein-coding 130.75-156 chr5 95727710 95727909 + 1 NA intron (NM_001349303, intron 1 of 8) intron (NM_001349303, intron 1 of 8) -3527 NM_014899 22836 Hs.445030 NM_014899 ENSG00000164292 RHOBTB3 - Rho related BTB domain containing 3 protein-coding 154.5-147 chr5 52149361 52149591 + 1 NA Intergenic Intergenic 141445 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 258.25-13 chr12 26696940 26697238 + 1 NA intron (NM_002223, intron 9 of 56) intron (NM_002223, intron 9 of 56) 136105 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 203.5-16 chr1 194795640 194795858 + 1 NA Intergenic Intergenic 1292966 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 204.5-53 chr18 63793275 63793626 + 1 NA intron (NM_001040147, intron 4 of 7) intron (NM_001040147, intron 4 of 7) 15673 NM_001261830 8710 Hs.138202 NM_003784 ENSG00000166396 SERPINB7 MEGSIN|PPKN|TP55 serpin family B member 7 protein-coding 163.25-101 chr3 160970398 160970588 + 1 NA intron (NM_001317912, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu 99895 NR_134243 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 214.25-44 chr2 121126963 121127332 + 1 NA Intergenic Intergenic 158055 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 160.75-65 chr2 16912584 16912932 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -246924 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 131.5-47 chr12 115534819 115534975 + 1 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 613757 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 115.25-191 chr7 94262828 94262985 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 129286 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-108 chr2 20946696 20946980 + 1 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 97235 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 171.5-81 chr2 81891280 81891598 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -424493 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 140.5-109 chr2 66694579 66694742 + 1 NA intron (NR_110156, intron 5 of 5) intron (NR_110156, intron 5 of 5) 8567 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 177.25-57 chr17 54248892 54249360 + 1 NA Intergenic (AATGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 426199 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 239.5-82 chr8 127798156 127798495 + 1 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu 2363 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 166.5-141 chr4 36472760 36473095 + 1 NA Intergenic Intergenic -46499 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 151.5-130 chr3 133961805 133961975 + 1 NA intron (NM_005630, intron 3 of 13) intron (NM_005630, intron 3 of 13) -32078 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 253.75-23 chr2 64802510 64802976 + 1 NA Intergenic (AAAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 60888 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 261.5-17 chr14 69022672 69022963 + 1 NA Intergenic Intergenic 43135 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 249.25-13 chr17 5459424 5459741 + 1 NA intron (NM_001199699, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu 9400 NM_020162 56919 Hs.250456 NM_020162 ENSG00000005100 DHX33 DDX33 DEAH-box helicase 33 protein-coding 142.5-127 chr21 16674310 16674586 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 84211 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 183.5-105 chr5 24404379 24404819 + 1 NA Intergenic Intergenic 240379 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 115.25-192 chr7 108055475 108055805 + 1 NA exon (NM_007356, exon 25 of 34) exon (NM_007356, exon 25 of 34) -52479 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 176.5-49 chr13 91115341 91115611 + 1 NA Intergenic Intergenic -25859 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 289.25-14 chr2 31353943 31354405 + 1 NA intron (NM_000379, intron 24 of 35) L1MDa|LINE|L1 60568 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 166.5-200 chr8 88841398 88841653 + 1 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR -514042 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 191.5-79 chr2 163727460 163727676 + 1 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 8440 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 118.5-16 chr10 18187538 18187744 + 1 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) 47217 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 234.5-95 chr8 96079476 96079896 + 1 NA Intergenic Intergenic 81120 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 146.25-71 chr2 115157718 115158011 + 1 NA intron (NR_036580, intron 1 of 2) intron (NR_036580, intron 1 of 2) 3479 NR_036580 389023 Hs.97540 NR_036580 ENSG00000235026 DPP10-AS1 - DPP10 antisense RNA 1 ncRNA 201.5-84 chr22 28120123 28120451 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -199675 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 156.5-111 chr3 23294429 23294684 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 91229 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 149.75-89 chr2 131095523 131095779 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2191 NM_001009993 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 132.5-166 chr3 103026268 103026522 + 1 NA Intergenic Intergenic 497721 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 340.25-3 chr10 103396920 103397289 + 1 NA promoter-TSS (NM_032747) promoter-TSS (NM_032747) 478 NM_014976 22984 Hs.239499 NM_014976 ENSG00000148843 PDCD11 ALG-4|ALG4|NFBP|RRP5 programmed cell death 11 protein-coding 204.75-97 chr5 128578017 128578425 + 1 NA Intergenic Intergenic -39976 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 137.75-43 chr12 73536075 73536404 + 1 NA Intergenic Intergenic 377049 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 228.75-17 chr14 44330417 44330713 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 176718 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 154.5-109 chr2 172808644 172808961 + 1 NA intron (NM_007023, intron 3 of 30) MIRb|SINE|MIR -12785 NM_001100397 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 236.25-55 chr22 29809300 29809648 + 1 NA intron (NM_001369943, intron 6 of 17) intron (NM_001369943, intron 6 of 17) 28800 NM_001369931 84164 Hs.731754 NM_032204 ENSG00000100325 ASCC2 ASC1p100|p100 activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 protein-coding 185.5-69 chr18 66813530 66813869 + 1 NA Intergenic Intergenic -209609 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 128.5-82 chr16 69523624 69523813 + 1 NA Intergenic Intergenic 42150 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 302.5-45 chr9 27495407 27495867 + 1 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) (AATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28677 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 157.75-123 chr4 108402244 108402410 + 1 NA Intergenic Intergenic -154906 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 198.5-141 chr8 40846564 40846875 + 1 NA intron (NM_024645, intron 1 of 6) intron (NM_024645, intron 1 of 6) 51107 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 251.5-23 chr13 79773929 79774259 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -30292 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 201.75-76 chr5 99972958 99973270 + 1 NA Intergenic Intergenic 415140 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 224.75-51 chr4 54656787 54657182 + 1 NA promoter-TSS (NM_001093772) promoter-TSS (NM_001093772) -944 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 185.75-23 chr11 36162886 36163148 + 1 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) intron (NM_001304263, intron 3 of 4) -85116 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 117.25-147 chr3 151387011 151387135 + 1 NA intron (NM_053002, intron 34 of 42) intron (NM_053002, intron 34 of 42) -2261 NM_022788 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 283.5-16 chr12 114994444 114995002 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -310548 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 135.75-161 chr4 66253351 66253589 + 1 NA Intergenic Intergenic -23354 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 352.75-5 chr12 2942386 2943099 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16655 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 170.75-43 chr15 98487995 98488474 + 1 NA intron (NM_182562, intron 2 of 6) intron (NM_182562, intron 2 of 6) 26102 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 224.75-43 chr21 15778809 15779223 + 1 NA intron (NM_001283042, intron 4 of 24) intron (NM_001283042, intron 4 of 24) 49034 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 318.5-44 chrX 53538509 53539269 + 1 NA exon (NM_031407, exon 76 of 84) exon (NM_031407, exon 76 of 84) 17452 NR_029513 407054 NR_029513 ENSG00000271886 MIR98 MIRLET7L|MIRN98|hsa-mir-98|miR-98 microRNA 98 ncRNA 218.25-16 chr11 33586863 33587437 + 1 NA intron (NM_012194, intron 11 of 20) MIR|SINE|MIR 113590 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 143.25-144 chr5 66849171 66849491 + 1 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) intron (NM_015183, intron 1 of 27) 20558 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 160.5-58 chr14 71089865 71090130 + 1 NA intron (NM_014982, intron 30 of 35) intron (NM_014982, intron 30 of 35) 182538 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 184.75-81 chr5 89123477 89123819 + 1 NA intron (NR_136221, intron 4 of 6) intron (NR_136221, intron 4 of 6) -219543 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 116.25-39 chr11 45027499 45027700 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 53697 NR_026681 221122 Hs.551656 NR_026681 ENSG00000254654 LINC02685 - long intergenic non-protein coding RNA 2685 ncRNA 250.5-13 chr11 60119318 60119827 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 30908 NM_000139 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 127.5-110 chr2 42282056 42282276 + 1 NA intron (NM_001145076, intron 6 of 21) L2b|LINE|L2 77872 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 281.75-10 chr10 68423817 68424498 + 1 NA intron (NM_001080449, intron 14 of 20) L1MDa|LINE|L1 -16863 NM_001278225 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 116.25-218 chr7 123876930 123877168 + 1 NA exon (NM_012269, exon 5 of 5) exon (NM_012269, exon 5 of 5) 31880 NM_012269 23553 Hs.28673 NM_012269 ENSG00000106302 HYAL4 CSHY|HYAL-4 hyaluronidase 4 protein-coding 112.75-95 chr2 89834356 89834527 + 1 NA Intergenic Intergenic -196534 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 182.5-130 chr5 43905405 43905706 + 1 NA Intergenic Intergenic -302325 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 171.25-120 chr5 79321679 79321970 + 1 NA 3' UTR (NM_152405, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_152405, exon 11 of 11) 85693 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 158.5-172 chr6 119919480 119919821 + 1 NA Intergenic Intergenic -95529 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 155.5-217 chr9 80713899 80714154 + 1 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 739003 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 193.5-114 chr4 40452671 40453072 + 1 NA intron (NM_001098634, intron 3 of 6) AluSg|SINE|Alu 49248 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 182.25-4 chr1 118888946 118889153 + 1 NA intron (NM_152380, intron 7 of 7) intron (NM_152380, intron 7 of 7) 99294 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 209.5-110 chr4 125800437 125800909 + 1 NA Intergenic Intergenic 293414 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 210.5-55 chr18 5672986 5673317 + 1 NA Intergenic Intergenic -44160 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 171.25-144 chr7 83498002 83498241 + 1 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 143310 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 202.75-71 chr22 30595006 30595401 + 1 NA intron (NM_001282327, intron 2 of 16) intron (NM_001282327, intron 2 of 16) -3293 NM_001243225 23481 Hs.517543 NM_014303 ENSG00000100029 PES1 NOP7|PES pescadillo ribosomal biogenesis factor 1 protein-coding 230.5-23 chr11 68944403 68944735 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 36417 NM_198923 116512 Hs.527802 NM_198923 ENSG00000172938 MRGPRD MRGD|TGR7 MAS related GPR family member D protein-coding 176.5-66 chr16 7892973 7893149 + 1 NA Intergenic Intergenic 560216 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 318.25-8 chr4 65597546 65598217 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 71607 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 175.25-93 chr3 40643788 40643991 + 1 NA Intergenic Intergenic 118929 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 127.25-90 chr2 80616143 80616398 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 11 of 11) intron (NM_001282599, intron 11 of 11) 302891 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 165.25-21 chr11 8777988 8778288 + 1 NA intron (NR_120590, intron 1 of 4) intron (NR_120590, intron 1 of 4) 9360 NR_120590 102724784 Hs.613276 NR_120590 LOC102724784 - uncharacterized LOC102724784 ncRNA 237.75-50 chr3 88993299 88993762 + 1 NA Intergenic Intergenic -114091 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 204.25-52 chr2 30265526 30265898 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 34178 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 183.5-126 chr6 112913479 112913775 + 1 NA Intergenic Intergenic 519820 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 231.25-55 chr3 178515694 178516135 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20522 NM_181361 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 234.75-15 chr12 25641957 25642340 + 1 NA intron (NM_001352232, intron 1 of 10) intron (NM_001352232, intron 1 of 10) 6430 NM_001352233 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 330.25-5 chr12 47125926 47126574 + 1 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 -46291 NM_001370299 347902 Hs.121520 NM_181847 ENSG00000139211 AMIGO2 ALI1|AMIGO-2|DEGA adhesion molecule with Ig like domain 2 protein-coding 371.25-2 chr10 69107734 69108271 + 1 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -16151 NM_001035260 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 207.5-83 chr5 40398603 40399075 + 1 NA Intergenic Intergenic -281076 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 199.5-64 chr18 52169117 52169392 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -170943 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 264.25-8 chr11 63463054 63463339 + 1 NA 3' UTR (NM_001146728, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001146728, exon 6 of 6) 27971 NM_054108 117245 Hs.410316 NM_054108 ENSG00000168004 PLAAT5 HRASLS5|HRLP5|HRSL5|PLAAT-5|RLP1|iNAT phospholipase A and acyltransferase 5 protein-coding 197.5-38 chr14 36910841 36911201 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) 41370 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 164.5-132 chr3 66738807 66739040 + 1 NA promoter-TSS (NR_135533) promoter-TSS (NR_135533) -587 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 149.75-169 chr8 125330651 125331016 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIR3|SINE|MIR -99525 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 124.5-151 chr4 72466091 72466286 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) L2a|LINE|L2 103033 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 167.5-52 chr12 106959342 106959575 + 1 NA intron (NM_001319663, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu 2673 NM_001319662 90488 Hs.257664 NM_152261 ENSG00000151135 TMEM263 C12orf23 transmembrane protein 263 protein-coding 166.75-56 chr16 46468921 46469126 + 1 NA TTS (NR_026556) TTS (NR_026556) 100074 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 189.25-25 chr12 69056627 69057046 + 1 NA Intergenic Intergenic -93596 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 215.5-25 chr12 111949308 111949625 + 1 NA intron (NM_138341, intron 3 of 9) MER101-int|LTR|ERV1 50403 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 124.25-32 chr11 78665571 78665753 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 32 of 33) MIRb|SINE|MIR -90798 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 159.5-146 chr3 77994091 77994347 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 54744 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 147.75-112 chr3 194426280 194426601 + 1 NA intron (NM_001367549, intron 29 of 33) intron (NM_001367549, intron 29 of 33) -27174 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 139.75-71 chr16 83068335 83068657 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) intron (NM_001220489, intron 3 of 12) -78198 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 213.25-20 chr15 89267916 89268375 + 1 NA intron (NM_001113378, intron 9 of 37) AluJb|SINE|Alu 24166 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 189.25-13 chr10 112195702 112195940 + 1 NA Intergenic Intergenic -12056 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 155.5-203 chr8 72592268 72592456 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 55137 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 196.25-34 chr14 45720547 45720867 + 1 NA Intergenic Intergenic -5105 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 209.5-97 chr3 184736354 184736639 + 1 NA intron (NR_160768, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 24253 NR_160768 107986163 NR_160768 LOC107986163 - uncharacterized LOC107986163 ncRNA 122.5-55 chr14 28226615 28226754 + 1 NA Intergenic Intergenic 538635 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 127.75-96 chr2 59849943 59850252 + 1 NA Intergenic Intergenic 532939 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 112.75-21 chr10 26195530 26195749 + 1 NA intron (NM_017433, intron 32 of 34) L2a|LINE|L2 -20668 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 163.75-28 chr11 77428005 77428370 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 45876 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 119.5-236 chr8 112966802 112967016 + 1 NA intron (NM_052900, intron 6 of 68) intron (NM_052900, intron 6 of 68) 323416 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 334.5-11 chr2 121300395 121300978 + 1 NA Intergenic Intergenic -15484 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 154.75-47 chr16 7495250 7495444 + 1 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) L1PA16|LINE|L1 162502 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 157.25-54 chr16 77962287 77962490 + 1 NA intron (NM_020927, intron 7 of 8) MER115|DNA|hAT-Tip100 -60160 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 205.5-18 chr11 34645080 34645338 + 1 NA intron (NM_012153, intron 2 of 8) intron (NM_012153, intron 2 of 8) 12643 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 141.25-142 chr5 117877150 117877368 + 1 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 146898 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 137.5-146 chr21 19559270 19559562 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 340339 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 182.5-100 chr3 43549380 43549621 + 1 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) intron (NM_001346464, intron 12 of 13) 72426 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 290.25-6 chr10 65763140 65763580 + 1 NA intron (NR_120647, intron 5 of 5) intron (NR_120647, intron 5 of 5) 191935 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 217.25-78 chr7 41322371 41322632 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 220897 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 164.5-195 chr7 93049198 93049378 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 68691 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 243.5-38 chr2 112659707 112660141 + 1 NA intron (NM_005415, intron 8 of 10) intron (NM_005415, intron 8 of 10) 13985 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 129.5-13 chr1 187443667 187443831 + 1 NA intron (NR_132374, intron 1 of 2) intron (NR_132374, intron 1 of 2) 121 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 188.75-94 chr6 19535034 19535262 + 1 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack 85327 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 143.5-191 chr6 140829515 140829705 + 1 NA Intergenic Intergenic 145796 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 147.25-33 chr14 47037079 47037289 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 7 of 16) intron (NM_001113498, intron 7 of 16) 306062 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 172.25-82 chr21 27270650 27270953 + 1 NA Intergenic Intergenic -303713 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 173.75-54 chr14 55180200 55180454 + 1 NA intron (NM_001146015, intron 6 of 19) L1ME4a|LINE|L1 11258 NM_014750 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 156.5-195 chr8 109475116 109475341 + 1 NA exon (NM_177531, exon 51 of 78) exon (NM_177531, exon 51 of 78) -64472 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 164.75-142 chr8 78102847 78103134 + 1 NA Intergenic Intergenic -413350 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 125.5-205 chr5 80967402 80967634 + 1 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -6611 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-137 chr4 48603686 48603876 + 1 NA intron (NM_015030, intron 11 of 63) L2a|LINE|L2 113529 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 146.75-179 chrX 50753808 50754015 + 1 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 60133 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 125.25-150 chr4 182699511 182699766 + 1 NA intron (NM_001080477, intron 12 of 27) intron (NM_001080477, intron 12 of 27) 217615 NM_001351743 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 139.5-39 chr12 11825301 11825565 + 1 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) HAL1M8|LINE|L1 175579 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 175.5-96 chr2 188940857 188941098 + 1 NA Intergenic Intergenic -33396 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 212.25-40 chr19 11751494 11751943 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -12772 NM_017507 55552 Hs.142167 NM_017507 ENSG00000197933 ZNF823 HSZFP36 zinc finger protein 823 protein-coding 143.25-103 chr20 44368350 44368563 + 1 NA intron (NM_175914, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 12655 NM_175914 3172 Hs.116462 NM_000457 ENSG00000101076 HNF4A FRTS4|HNF4|HNF4a7|HNF4a8|HNF4a9|HNF4alpha|MODY|MODY1|NR2A1|NR2A21|TCF|TCF14 hepatocyte nuclear factor 4 alpha protein-coding 189.5-116 chr5 160755063 160755286 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -69783 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 171.5-159 chr9 3718475 3718679 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 50491 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 170.75-40 chr14 81081144 81081359 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 3 of 8) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 121583 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 420.75-4 chr14 53874294 53875026 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 73824 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 188.25-114 chr8 72572910 72573196 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 35828 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 138.75-68 chr16 72457058 72457236 + 1 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) L1MA10|LINE|L1 207823 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 187.5-150 chr7 13725298 13725682 + 1 NA Intergenic Intergenic 261024 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 195.75-3 chr1 27158314 27158631 + 1 NA Intergenic Intergenic -3347 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 155.25-60 chr14 61471476 61471707 + 1 NA intron (NM_006255, intron 9 of 13) intron (NM_006255, intron 9 of 13) 98603 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 244.75-32 chr20 49798774 49799182 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -13735 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 279.5-28 chr2 53372301 53372856 + 1 NA Intergenic Intergenic -395205 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 254.5-8 chr1 116126710 116127101 + 1 NA intron (NM_152367, intron 4 of 6) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 15150 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 155.75-67 chr17 63851555 63851871 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -5303 NR_002947 146771 Hs.629177 NR_002947 ENSG00000240280 TCAM1P TCAM1 testicular cell adhesion molecule 1, pseudogene pseudo 211.5-168 chr9 113817758 113818173 + 1 NA Intergenic Intergenic -58317 NM_133374 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 269.25-55 chr8 144494797 144495092 + 1 NA intron (NM_001329444, intron 2 of 11) intron (NM_001329444, intron 2 of 11) -9196 NM_005309 2875 Hs.103502 NM_005309 ENSG00000167701 GPT AAT1|ALT1|GPT1 glutamic--pyruvic transaminase protein-coding 173.5-177 chrX 26463719 26464009 + 1 NA Intergenic Intergenic -94473 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 281.5-9 chr10 91488003 91488471 + 1 NA intron (NM_182765, intron 11 of 20) intron (NM_182765, intron 11 of 20) 77952 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 176.5-139 chr5 23491409 23491745 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -16032 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 226.75-6 chr10 58982058 58982334 + 1 NA Intergenic Intergenic -17322 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 142.75-167 chr6 43893390 43893569 + 1 NA intron (NR_024478, intron 1 of 1) intron (NR_024478, intron 1 of 1) 2451 NR_024478 100132354 Hs.376232 NR_024478 LINC01512 HI-LNC77 long intergenic non-protein coding RNA 1512 ncRNA 348.5-16 chr4 162660732 162661190 + 1 NA Intergenic Intergenic 432667 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 133.5-125 chr2 140323072 140323333 + 1 NA intron (NM_018557, intron 81 of 90) intron (NM_018557, intron 81 of 90) 263483 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 168.75-11 chr1 94573824 94574020 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 30220 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 157.75-26 chr11 11857840 11858045 + 1 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) MER51A|LTR|ERV1 16519 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 212.25-55 chr3 5477958 5478350 + 1 NA Intergenic Intergenic -227899 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 262.75-38 chr3 134300300 134300785 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -13034 NR_146711 105374119 NR_146711 ENSG00000240006 LINC02004 - long intergenic non-protein coding RNA 2004 ncRNA 215.25-58 chr3 9025044 9025315 + 1 NA intron (NM_014850, intron 14 of 21) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -61707 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 241.75-75 chr8 80967071 80967487 + 1 NA TTS (NM_018440) TTS (NM_018440) -92498 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 157.5-139 chr3 114500479 114500701 + 1 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 46997 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 200.75-51 chr2 56560482 56560715 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -374828 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 165.5-120 chr3 145343127 145343434 + 1 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 725905 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 271.5-31 chr17 66178841 66179168 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 2 of 26) L1MA3|LINE|L1 12888 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 158.5-160 chr5 136022291 136022560 + 1 NA Intergenic Intergenic -6563 NM_000358 7045 Hs.369397 NM_000358 ENSG00000120708 TGFBI BIGH3|CDB1|CDG2|CDGG1|CSD|CSD1|CSD2|CSD3|EBMD|LCD1 transforming growth factor beta induced protein-coding 112.25-5 chr1 77791800 77791916 + 1 NA intron (NM_198549, intron 2 of 15) AluSz|SINE|Alu 12053 NM_001363583 374986 Hs.437755 NM_198549 ENSG00000180488 MIGA1 FAM73A mitoguardin 1 protein-coding 121.25-83 chr17 63273824 63274026 + 1 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) MER5A|DNA|hAT-Charlie 166342 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 148.5-150 chr3 87534201 87534384 + 1 NA Intergenic Intergenic -257708 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 160.5-131 chr4 30783940 30784290 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 63746 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 113.25-14 chr1 219477426 219477613 + 1 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 79805 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 142.5-222 chr8 100323541 100323741 + 1 NA intron (NM_001280539, intron 1 of 10) intron (NM_001280539, intron 1 of 10) 12563 NM_001280539 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 204.75-103 chr6 139529325 139529566 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -54849 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 223.75-59 chr3 34801056 34801505 + 1 NA Intergenic Intergenic 592743 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 123.5-56 chr13 77621718 77621870 + 1 NA intron (NM_003843, intron 26 of 31) intron (NM_003843, intron 26 of 31) -15243 NR_126413 104355296 Hs.667682 NR_126412 ENSG00000224347 SCEL-AS1 - SCEL antisense RNA 1 ncRNA 160.5-13 chr10 43092191 43092510 + 1 NA intron (NM_020630, intron 1 of 18) L1MB3|LINE|L1 -12382 NM_001355216 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 144.5-58 chr14 22938203 22938521 + 1 NA intron (NR_110002, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 8753 NR_110002 101926933 Hs.727321 NR_110002 ENSG00000257285 LOC101926933 - uncharacterized LOC101926933 ncRNA 273.5-19 chr12 10219546 10219819 + 1 NA intron (NM_001363598, intron 2 of 2) AluSg|SINE|Alu 6805 NM_031412 23710 Hs.524250 NM_031412 ENSG00000139112 GABARAPL1 APG8-LIKE|APG8L|ATG8|ATG8B|ATG8L|GEC1 GABA type A receptor associated protein like 1 protein-coding 131.75-44 chr11 126280168 126280367 + 1 NA Intergenic Intergenic -2820 NM_001318777 114609 Hs.537126 NM_052887 ENSG00000150455 TIRAP BACTS1|Mal|MyD88-2|wyatt TIR domain containing adaptor protein protein-coding 218.25-37 chr2 5867341 5867604 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -54876 NR_146954 105373400 Hs.97467 NR_146954 ENSG00000237266 LINC01810 - long intergenic non-protein coding RNA 1810 ncRNA 167.25-151 chr8 104068086 104068385 + 1 NA intron (NM_001348499, intron 19 of 23) intron (NM_001348499, intron 19 of 23) -155100 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 165.5-135 chr4 109030231 109030551 + 1 NA intron (NM_198721, intron 4 of 36) intron (NM_198721, intron 4 of 36) -267338 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 170.5-198 chr9 9409625 9409870 + 1 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -389645 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 271.5-60 chr4 31522816 31523394 + 1 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1MA4|LINE|L1 16561 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 224.75-78 chr9 38649646 38650064 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 28767 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 165.5-29 chr12 11580374 11580613 + 1 NA Intergenic Intergenic 32463 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 135.5-116 chr2 191582290 191582476 + 1 NA Intergenic Intergenic -95689 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 198.5-73 chr2 67967867 67968187 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 94977 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 165.5-24 chr10 117926827 117927083 + 1 NA Intergenic Intergenic -119866 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 131.5-197 chr5 169560590 169560841 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -23058 NM_001329639 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 172.25-112 chr5 106675794 106675993 + 1 NA Intergenic Intergenic 335121 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 218.5-89 chr4 113823125 113823468 + 1 NA Intergenic Intergenic -61369 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 202.25-57 chr4 79073799 79074120 + 1 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) L1PA13|LINE|L1 102211 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 194.5-134 chr6 144830317 144830764 + 1 NA intron (NM_007124, intron 68 of 73) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 424885 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 203.5-104 chr4 37430235 37430597 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -23509 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 143.25-56 chr15 71484855 71485008 + 1 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -62305 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 204.75-123 chr9 26610546 26610869 + 1 NA Intergenic Intergenic 282095 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 242.25-2 chr1 36015670 36016145 + 1 NA intron (NM_177422, intron 9 of 16) MER57B2|LTR|ERV1 -68187 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 278.5-12 chr12 17413347 17413670 + 1 NA Intergenic Intergenic 175570 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 357.5-15 chr4 61184772 61185274 + 1 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -16207 NM_001371343 165.75-33 chr11 105993608 105993846 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 28513 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 512.5-3 chr5 38240285 38241225 + 1 NA Intergenic Intergenic -17804 NM_001205301 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 196.5-23 chr10 67262749 67262983 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 140544 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 229.5-94 chr3 187989855 187990302 + 1 NA Intergenic Intergenic -13671 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 245.25-13 chr11 102388510 102388971 + 1 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger 41366 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 273.5-27 chr18 2332618 2333118 + 1 NA Intergenic Intergenic 238637 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 160.75-20 chr10 78200646 78200836 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie -47884 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 189.5-47 chr15 36860532 36860850 + 1 NA Intergenic Intergenic 25842 NR_024264 145845 Hs.302693 NM_001101327 LOC145845 - uncharacterized LOC145845 ncRNA 140.5-47 chr12 39885542 39885765 + 1 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 220428 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 288.5-22 chr2 133391374 133391904 + 1 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) L2b|LINE|L2 125444 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 207.5-100 chr6 141810617 141810986 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 277998 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 197.75-41 chr2 82758242 82758489 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -98438 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 218.5-78 chr3 177200356 177200675 + 1 NA Intergenic Intergenic -3033 NM_001321194 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 202.25-93 chr8 122035327 122035670 + 1 NA Intergenic Intergenic -394058 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 244.5-3 chr1 109233102 109233577 + 1 NA intron (NM_006513, intron 6 of 10) intron (NM_006513, intron 6 of 10) -16200 NM_001408 1952 Hs.57652 NM_001408 ENSG00000143126 CELSR2 ADGRC2|CDHF10|EGFL2|Flamingo1|MEGF3 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 protein-coding 274.75-8 chr13 73669691 73670016 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 105609 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 292.5-55 chr9 31098558 31099026 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 282698 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 120.25-53 chr13 48910507 48910645 + 1 NA Intergenic Intergenic -65336 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 184.25-126 chr8 133392710 133393084 + 1 NA Intergenic Intergenic -95593 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 113.25-124 chr4 108098724 108098996 + 1 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 67937 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 206.75-4 chr1 53904212 53904549 + 1 NA intron (NM_001324316, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR 10193 NM_001324316 1733 Hs.251415 NM_000792 ENSG00000211452 DIO1 5DI|TXDI1 iodothyronine deiodinase 1 protein-coding 112.5-73 chr14 52600450 52600690 + 1 NA intron (NM_001099652, intron 3 of 6) FAM|SINE|Alu 47734 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 223.5-127 chr8 70340585 70340897 + 1 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) L1PA11|LINE|L1 62649 NM_001321707 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 261.25-8 chr14 60222144 60222623 + 1 NA Intergenic Intergenic -23367 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 175.25-151 chr9 70765245 70765443 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 7 of 25) AluSz|SINE|Alu 44740 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 182.5-129 chr5 23562749 23563081 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 55260 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 250.75-43 chr4 33687214 33687529 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 352522 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 151.75-14 chr1 194384836 194385165 + 1 NA Intergenic Intergenic 1080255 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 351.5-29 chr8 62425688 62426420 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 177200 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 305.5-4 chr1 190763084 190763600 + 1 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) intron (NR_033922, intron 2 of 4) 138452 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 386.5-2 chr10 32993010 32993591 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35070 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 234.75-86 chr8 121742935 121743501 + 1 NA Intergenic Intergenic -101778 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 221.5-54 chr20 5803853 5804190 + 1 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) 53620 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 185.5-127 chr5 40407561 40407918 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -272176 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 241.5-40 chr2 52305109 52305361 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -65413 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 148.5-175 chr4 109810795 109811024 + 1 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie -4601 NM_032993 54433 Hs.69851 NM_018983 ENSG00000109534 GAR1 NOLA1 GAR1 ribonucleoprotein protein-coding 113.5-230 chr8 66480242 66480460 + 1 NA Intergenic Intergenic -13215 NM_152765 254778 Hs.268869 NM_152765 ENSG00000169085 VXN C8orf46 vexin protein-coding 139.25-85 chr2 72838933 72839122 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12994 NM_001321729 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 140.5-145 chr3 16602994 16603141 + 1 NA intron (NM_001351, intron 1 of 10) L1ME4a|LINE|L1 1723 NM_001190811 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 137.5-137 chr20 2620153 2620336 + 1 NA intron (NM_080751, intron 16 of 19) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -32388 NR_145428 10528 Hs.376064 NM_006392 ENSG00000101361 NOP56 NOL5A|SCA36 NOP56 ribonucleoprotein protein-coding 213.5-46 chr16 62176960 62177387 + 1 NA Intergenic Intergenic -140735 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 315.75-15 chr20 56752432 56752840 + 1 NA Intergenic Intergenic 123330 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 195.25-94 chr8 85571991 85572208 + 1 NA Intergenic Intergenic 83577 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 222.75-93 chr8 35807173 35807488 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -97010 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 202.75-100 chr6 50805071 50805421 + 1 NA Intergenic Intergenic -13625 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 238.25-55 chr4 41536282 41536552 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 3 of 25) intron (NM_001289122, intron 3 of 25) -1740 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 207.5-126 chr8 144314604 144315023 + 1 NA TTS (NM_005526) TTS (NM_005526) 2502 NR_106907 102465511 NR_106907 ENSG00000284229 MIR6848 hsa-mir-6848 microRNA 6848 ncRNA 247.25-25 chr18 3302833 3303129 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 40262 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 156.25-80 chr2 217882043 217882319 + 1 NA intron (NM_001308023, intron 14 of 29) intron (NM_001308023, intron 14 of 29) 18447 NR_106867 102465485 NR_106867 ENSG00000275458 MIR6809 hsa-mir-6809 microRNA 6809 ncRNA 197.5-166 chr8 136220647 136220905 + 1 NA Intergenic Intergenic -310022 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 135.75-157 chr4 40401412 40401720 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 66233 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 155.5-70 chr17 58113802 58114050 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 30507 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 127.25-78 chr18 74073120 74073268 + 1 NA TTS (NM_152676) TTS (NM_152676) 74640 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 133.75-83 chr18 4626246 4626534 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -171083 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 122.5-136 chr21 27716563 27716864 + 1 NA Intergenic Intergenic -5666 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 180.75-154 chr8 130413456 130413752 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) intron (NM_001362925, intron 1 of 29) 30056 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 122.75-116 chr21 23038744 23038956 + 1 NA Intergenic Intergenic -40434 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 133.25-180 chr5 111647559 111647972 + 1 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) 108486 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 122.25-195 chr8 109952088 109952304 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 23575 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 179.75-41 chr14 61463158 61463381 + 1 NA intron (NM_006255, intron 9 of 13) intron (NM_006255, intron 9 of 13) 106925 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 116.75-85 chr19 56369080 56369224 + 1 NA promoter-TSS (NM_001322072) promoter-TSS (NM_001322072) -769 NM_001322072 79149 Hs.177688 NM_024303 ENSG00000131848 ZSCAN5A ZNF495|ZSCAN5 zinc finger and SCAN domain containing 5A protein-coding 129.5-29 chr10 102284513 102284753 + 1 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) L1MB5|LINE|L1 39101 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 149.5-142 chr4 141273470 141273680 + 1 NA Intergenic Intergenic 52680 NM_014487 27309 Hs.120766 NM_014487 ENSG00000109445 ZNF330 HSA6591|NOA36 zinc finger protein 330 protein-coding 321.5-2 chr10 58349258 58349810 + 1 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) intron (NM_003338, intron 1 of 6) 14528 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 206.5-121 chr7 49337409 49337693 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 413004 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 129.75-188 chr8 131405949 131406087 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -365109 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 161.5-155 chr5 61177973 61178284 + 1 NA intron (NR_109908, intron 1 of 3) intron (NR_109908, intron 1 of 3) -15660 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 163.5-114 chr20 55004175 55004494 + 1 NA Intergenic Intergenic -418709 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 168.5-199 chr9 76300335 76300557 + 1 NA intron (NM_001190482, intron 27 of 36) intron (NM_001190482, intron 27 of 36) 93980 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 148.5-110 chr2 146923424 146923615 + 1 NA Intergenic Intergenic 336462 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 141.5-148 chr3 131730799 131731071 + 1 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -227964 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 125.75-42 chr12 59912134 59912358 + 1 NA Intergenic Intergenic 222876 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 353.25-12 chr2 213804971 213805578 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) L3|LINE|CR1 47207 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 133.5-243 chr7 6180686 6180923 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 4 of 13) intron (NM_001367581, intron 4 of 13) -8667 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 207.5-56 chr2 190072701 190073112 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10177 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 215.75-8 chr1 204269927 204270176 + 1 NA intron (NM_014935, intron 3 of 22) L2b|LINE|L2 -56063 NM_198447 127845 Hs.532401 NM_198447 ENSG00000174567 GOLT1A CGI-141|GOT1|HMFN1187|YMR292W|hGOT1b golgi transport 1A protein-coding 221.75-36 chr2 41908851 41909323 + 1 NA Intergenic Intergenic 24636 NR_110262 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 140.5-89 chr18 21378622 21378872 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 2 of 32) intron (NM_001142966, intron 2 of 32) 136505 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 217.5-18 chr10 99122509 99122827 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1ME3G|LINE|L1 113207 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 144.5-92 chr19 32203699 32203955 + 1 NA Intergenic Intergenic -97911 NR_110694 101927411 Hs.515337 NR_110694 ENSG00000267204 LINC01782 - long intergenic non-protein coding RNA 1782 ncRNA 221.75-78 chr8 78042807 78043135 + 1 NA Intergenic Intergenic -473369 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 362.5-8 chr15 27373636 27374046 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) intron (NM_001270873, intron 5 of 5) -212522 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 290.75-3 chr1 172402900 172403397 + 1 NA intron (NM_001350206, intron 20 of 20) intron (NM_001350206, intron 20 of 20) -17537 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 217.5-128 chr8 125209367 125209766 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 117706 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 204.5-55 chr18 74483919 74484285 + 1 NA Intergenic Intergenic -12261 NM_001370248 55748 Hs.149185 NM_018235 ENSG00000133313 CNDP2 CN2|CPGL|HEL-S-13|HsT2298|PEPA carnosine dipeptidase 2 protein-coding 247.5-23 chr14 68521422 68521880 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 107136 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 155.5-215 chr9 35220209 35220484 + 1 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) L1MA3|LINE|L1 58337 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 152.5-196 chr9 32080701 32080906 + 1 NA Intergenic Intergenic -303800 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 190.5-6 chr1 88767553 88767793 + 1 NA intron (NM_006256, intron 3 of 21) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -82469 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 192.25-32 chr16 77914400 77914645 + 1 NA intron (NM_020927, intron 7 of 8) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -108026 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 244.5-50 chr2 81599246 81599560 + 1 NA Intergenic Intergenic -132457 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 128.5-130 chr21 30674011 30674272 + 1 NA Intergenic Intergenic 31277 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 210.75-49 chr20 11419477 11419880 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -146295 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 203.5-37 chr13 37490137 37490526 + 1 NA Intergenic Intergenic -5547 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 193.5-152 chr7 63953460 63953771 + 1 NA Intergenic Intergenic -45191 NR_145488 100419780 Hs.742917 NR_145488 ZNF722P ZNF722 zinc finger protein 722, pseudogene pseudo 264.75-48 chr6 133335018 133335379 + 1 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 93699 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 189.25-87 chr4 30360116 30360350 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -360136 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 249.5-17 chr11 11984862 11985246 + 1 NA intron (NM_015881, intron 4 of 7) intron (NM_015881, intron 4 of 7) 23585 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 152.5-173 chr7 2265560 2265777 + 1 NA intron (NM_013321, intron 5 of 10) intron (NM_013321, intron 5 of 10) -8091 NR_106895 102465503 NR_106895 ENSG00000284047 MIR6836 hsa-mir-6836 microRNA 6836 ncRNA 217.5-102 chr5 113152241 113152619 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 142508 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 185.5-103 chr3 65900354 65900549 + 1 NA intron (NR_046575, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 6635 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 272.75-11 chr14 33134890 33135196 + 1 NA intron (NM_001164749, intron 2 of 11) intron (NM_001164749, intron 2 of 11) 196164 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 206.5-39 chr18 62682762 62683063 + 1 NA Intergenic Intergenic -32629 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 211.5-141 chr7 28341649 28341881 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L3b|LINE|CR1 42444 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 151.75-48 chr16 56542757 56542963 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -22213 NM_032935 84560 Hs.567624 NM_032935 ENSG00000102891 MT4 MT-4|MT-IV|MTIV metallothionein 4 protein-coding 302.5 chr1 160503746 160504261 + 1 NA intron (NM_001184714, intron 1 of 7) AluSx3|SINE|Alu 19252 NM_001184715 114836 Hs.492348 NM_052931 ENSG00000162739 SLAMF6 CD352|KALI|KALIb|Ly108|NTB-A|NTBA|SF2000 SLAM family member 6 protein-coding 180.75-153 chr8 122999927 123000165 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 25726 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 118.25-111 chr2 234041387 234041537 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -9240 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 289.5-25 chr2 121902004 121902701 + 1 NA Intergenic Intergenic 146701 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 207.5-34 chr17 13177972 13178211 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 128669 NR_146885 105371541 NR_146885 ENSG00000234634 LINC02093 - long intergenic non-protein coding RNA 2093 ncRNA 142.5-178 chr5 125121312 125121552 + 1 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) L1PA14|LINE|L1 84601 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 130.25-159 chr5 60009094 60009404 + 1 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L3|LINE|CR1 -115523 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 327.75-23 chr6 35947052 35947491 + 1 NA intron (NM_001193476, intron 19 of 19) AluSz6|SINE|Alu -26091 NR_034069 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 195.5-132 chr6 46685574 46685818 + 1 NA intron (NR_144468, intron 1 of 3) L1PA7|LINE|L1 2137 NR_134644 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 240.5-98 chr7 4293763 4294182 + 1 NA Intergenic Intergenic -159135 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 171.75-44 chr14 73917168 73917707 + 1 NA intron (NR_040251, intron 8 of 11) L1MC5a|LINE|L1 30578 NM_001242926 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 132.5-226 chr7 39849143 39849400 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 100148 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 349.75-6 chr16 5737388 5738123 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 105288 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 237.5-20 chr10 96012979 96013479 + 1 NA intron (NM_001349008, intron 28 of 34) intron (NM_001349008, intron 28 of 34) 13138 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 370.5-18 chr5 166334971 166335444 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 591163 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 190.75-38 chr17 30054078 30054300 + 1 NA intron (NR_026738, intron 10 of 15) intron (NR_026738, intron 10 of 15) -62618 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 149.75-142 chr6 39981398 39981622 + 1 NA Intergenic Intergenic -47048 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 198.5-155 chr9 21710307 21710566 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -92200 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 171.25-150 chr8 89619708 89619896 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 137909 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 175.25-90 chr3 5066298 5066492 + 1 NA Intergenic Intergenic -55897 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 262.25-35 chr4 138635975 138636351 + 1 NA Intergenic Intergenic 326452 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 233.75-24 chr14 50056297 50056800 + 1 NA intron (NR_131171, intron 2 of 8) intron (NR_131171, intron 2 of 8) 48495 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 160.5-32 chr12 16843008 16843229 + 1 NA Intergenic Intergenic -145629 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 161.25-160 chr7 17732311 17732557 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -173525 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 232.5-82 chr5 28314366 28314770 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -26903 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 174.75-43 chr17 42879900 42880133 + 1 NA intron (NR_027254, intron 3 of 5) intron (NR_027254, intron 3 of 5) 12871 NR_002773 90586 Hs.367781 NR_002773 ENSG00000260105 AOC4P AOC4|UPAT amine oxidase copper containing 4, pseudogene pseudo 172.5-183 chr7 37111562 37111924 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) MIR|SINE|MIR 113947 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 162.75-36 chr14 85382688 85382906 + 1 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -4478 NR_135155 105370605 NR_135155 ENSG00000258814 LINC02329 - long intergenic non-protein coding RNA 2329 ncRNA 117.25-99 chr18 59330614 59330954 + 1 NA 3' UTR (NM_005570, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_005570, exon 13 of 13) -12135 NM_181654 339302 Hs.449884 NM_181654 ENSG00000166569 CPLX4 CPX-IV|CPXIV complexin 4 protein-coding 182.5-39 chr12 40648341 40648588 + 1 NA Intergenic Intergenic -43975 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 131.5-135 chr20 11660982 11661321 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 209564 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 218.25-97 chr8 88127798 88128132 + 1 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 199518 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 132.75-138 chr4 79182416 79182580 + 1 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) intron (NR_038342, intron 3 of 5) 143563 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 249.75-45 chr3 117786242 117786671 + 1 NA Intergenic Intergenic -95531 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 253.75-38 chr3 118928354 118928938 + 1 NA exon (NM_001353318, exon 4 of 8) exon (NM_001353318, exon 4 of 8) -14430 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 135.25-77 chr17 40193069 40193411 + 1 NA promoter-TSS (NR_106927) promoter-TSS (NR_106927) -357 NR_106927 102465523 NR_106927 ENSG00000274621 MIR6867 hsa-mir-6867 microRNA 6867 ncRNA 241.75-23 chr14 29627392 29627764 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 12 of 18) intron (NM_001330069, intron 12 of 18) 299518 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 298.5-37 chr7 85223867 85224290 + 1 NA Intergenic Intergenic -102147 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 213.75-79 chr4 116767653 116767924 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 317788 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 326.5-5 chr11 103250929 103251506 + 1 NA intron (NM_001377, intron 65 of 88) L1M5|LINE|L1 141791 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 133.75-96 chr2 67625814 67626023 + 1 NA Intergenic Intergenic 199644 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 178.75-81 chr5 13700276 13700547 + 1 NA intron (NM_001369, intron 78 of 78) intron (NM_001369, intron 78 of 78) 244069 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 120.25-188 chr6 114906431 114906666 + 1 NA Intergenic Intergenic 737287 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 277.25-15 chr16 62734316 62734630 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -698035 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 157.75-51 chr15 42852353 42852554 + 1 NA intron (NM_173500, intron 3 of 14) intron (NM_173500, intron 3 of 14) 68325 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 165.75-19 chr10 70092670 70092882 + 1 NA intron (NM_018649, intron 4 of 8) intron (NM_018649, intron 4 of 8) 39930 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 151.5-47 chr14 53035617 53035862 + 1 NA Intergenic Intergenic -84642 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 189.25-58 chr2 55370805 55371077 + 1 NA intron (NM_001254943, intron 5 of 33) AluJb|SINE|Alu 48915 NM_001254943 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 134.75-182 chr5 171025374 171025536 + 1 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) L2b|LINE|L2 163437 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 334.25-17 chr4 66893925 66894579 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 527748 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 275.5-5 chr1 226718179 226718854 + 1 NA intron (NM_002221, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 20659 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 231.5-20 chr12 23717853 23718126 + 1 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) intron (NM_152989, intron 9 of 17) -133403 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 247.75-48 chr5 59630954 59631312 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR -43508 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 175.5-84 chr2 33513748 33513985 + 1 NA promoter-TSS (NM_015376) promoter-TSS (NM_015376) -9 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 396.25-8 chr2 212714390 212715073 + 1 NA Intergenic Intergenic -80600 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 217.5-44 chr14 62478565 62478962 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -338790 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 203.25-94 chr7 2390605 2390932 + 1 NA Intergenic Intergenic -12843 NM_018641 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 177.5-18 chr10 99293388 99293734 + 1 NA Intergenic Intergenic -35538 NM_001345889 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 216.5-33 chr14 74016629 74016960 + 1 NA intron (NM_001249, intron 1 of 15) intron (NM_001249, intron 1 of 15) 2494 NM_001321985 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 131.75-204 chr7 84495318 84495481 + 1 NA Intergenic UCON26|Unknown|Unknown -37077 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 181.5-61 chr17 68906074 68906344 + 1 NA intron (NM_001288985, intron 18 of 39) intron (NM_001288985, intron 18 of 39) 49183 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 153.5-70 chr15 77541578 77541865 + 1 NA Intergenic Intergenic 16126 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 248.5-57 chr20 56405392 56405724 + 1 NA 3' UTR (NM_001033522, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001033522, exon 6 of 6) -6478 NM_001164116 57091 Hs.473144 NM_020356 ENSG00000087589 CASS4 C20orf32|CAS4|HEFL|HEPL Cas scaffold protein family member 4 protein-coding 135.5-76 chr17 47271424 47271633 + 1 NA intron (NM_000212, intron 1 of 14) LTR37B|LTR|ERV1 17686 NM_000212 3690 Hs.218040 NM_000212 ENSG00000259207 ITGB3 BDPLT16|BDPLT2|CD61|GP3A|GPIIIa|GT integrin subunit beta 3 protein-coding 213.75-39 chr15 54647479 54647733 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -409141 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 211.5-18 chr10 81574164 81574406 + 1 NA Intergenic Intergenic -300909 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 239.5-59 chr5 97907968 97908416 + 1 NA intron (NR_146299, intron 2 of 2) MER50|LTR|ERV1 67434 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 176.75-72 chr2 239365216 239365498 + 1 NA intron (NM_006037, intron 1 of 26) intron (NM_006037, intron 1 of 26) -13553 NR_039948 100616360 NR_039948 ENSG00000264292 MIR2467 mir-2467 microRNA 2467 ncRNA 285.5-63 chr8 125791607 125792082 + 1 NA Intergenic Intergenic 159353 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 168.25-25 chr11 72017862 72018030 + 1 NA non-coding (NR_104178, exon 2 of 4) non-coding (NR_104178, exon 2 of 4) 3655 NR_104178 100128494 Hs.713607 NR_104178 ENSG00000251143 LOC100128494 - uncharacterized LOC100128494 ncRNA 124.5-245 chr9 95927916 95928100 + 1 NA intron (NM_020207, intron 9 of 18) intron (NM_020207, intron 9 of 18) 52000 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 281.75-31 chr3 7572036 7572508 + 1 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie -36988 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 203.5-80 chr2 233096683 233096987 + 1 NA intron (NM_001017915, intron 2 of 26).2 intron (NM_001017915, intron 2 of 26).2 36493 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 229.5-127 chr7 107658195 107658546 + 1 NA non-coding (NR_028137, exon 2 of 2) non-coding (NR_028137, exon 2 of 2) -2458 NM_000441 5172 Hs.571246 NM_000441 ENSG00000091137 SLC26A4 DFNB4|EVA|PDS|TDH2B solute carrier family 26 member 4 protein-coding 151.25-22 chr10 84786765 84787022 + 1 NA Intergenic Intergenic 361724 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 191.5-45 chr15 58273679 58274041 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 135479 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 230.25-13 chr10 92033650 92034060 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 110085 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 274.5-52 chr5 43579727 43580151 + 1 NA intron (NR_073113, intron 2 of 2) LTR49-int|LTR|ERV1 -22520 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 185.25-31 chr14 81988213 81988549 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -245243 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 123.5-183 chr6 17045037 17045205 + 1 NA Intergenic Intergenic -57137 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 144.5-169 chr5 36739756 36740084 + 1 NA Intergenic Intergenic 133314 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 252.5-51 chr22 25511834 25512262 + 1 NA Intergenic Intergenic -52627 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 177.5-51 chr15 65062131 65062369 + 1 NA intron (NM_001307930, intron 1 of 3) intron (NM_001307930, intron 1 of 3) 5741 NM_001307930 51285 Hs.27018 NM_016563 ENSG00000103710 RASL12 RIS RAS like family 12 protein-coding 177.5-84 chr2 127356917 127357155 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -13807 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 127.5-116 chr2 70904039 70904317 + 1 NA intron (NM_012476, intron 1 of 2) CpG 3602 NM_012476 25806 Hs.249170 NM_012476 ENSG00000116035 VAX2 DRES93 ventral anterior homeobox 2 protein-coding 205.25-56 chr2 137499124 137499545 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 15 of 27) intron (NM_001316349, intron 15 of 27) 428598 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 118.25-197 chr8 89334187 89334314 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 423461 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 162.5-67 chr17 70038352 70038741 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -12725 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 193.75-82 chr3 30652765 30652988 + 1 NA intron (NM_001024847, intron 4 of 7) (TATATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46275 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 148.25-5 chr1 65943027 65943324 + 1 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) L1MA8|LINE|L1 29930 NM_001297441 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 176.25-146 chr9 38394246 38394519 + 1 NA intron (NM_000692, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 1680 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 129.75-92 chr2 88580066 88580278 + 1 NA intron (NM_004836, intron 10 of 16) L3|LINE|CR1 41452 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 201.75-109 chr9 74671323 74671633 + 1 NA intron (NM_006914, intron 8 of 9) intron (NM_006914, intron 8 of 9) 55944 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 192.5-57 chr18 10259008 10259287 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 155223 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 197.5-76 chr2 156759871 156760162 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 323637 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 146.5-121 chr2 209576822 209577022 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -2414 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 159.25-123 chr5 170125184 170125403 + 1 NA Intergenic Intergenic 19396 NM_144769 2299 Hs.87236 NM_012188 ENSG00000168269 FOXI1 FKH10|FKHL10|FREAC-6|FREAC6|HFH-3|HFH3 forkhead box I1 protein-coding 130.25-101 chr2 108222851 108223248 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -5208 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 173.25-74 chr3 59197561 59197896 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -147696 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 151.75-82 chr20 51903151 51903365 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -40345 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 123.75-177 chr7 80065155 80065354 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -69577 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 296.25-2 chr1 247548502 247548889 + 1 NA promoter-TSS (NM_145278) promoter-TSS (NM_145278) -439 NM_145278 148823 Hs.732113 NM_145278 ENSG00000169224 GCSAML C1orf150 germinal center associated signaling and motility like protein-coding 141.75-151 chr6 37512913 37513132 + 1 NA intron (NR_126057, intron 1 of 3) intron (NR_126057, intron 1 of 3) 5674 NR_126057 100505530 Hs.582978 NM_001039791 LINC02520 - long intergenic non-protein coding RNA 2520 ncRNA 126.5-167 chr4 36139795 36140023 + 1 NA intron (NR_146894, intron 19 of 32) intron (NR_146894, intron 19 of 32) 104030 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 207.5-12 chr11 70728369 70728728 + 1 NA intron (NM_012309, intron 13 of 24) intron (NM_012309, intron 13 of 24) -66707 NM_133266 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 281.5-36 chr3 123820875 123821182 + 1 NA intron (NM_001321309, intron 3 of 32) intron (NM_001321309, intron 3 of 32) 63304 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 128.5-17 chr1 183499826 183500062 + 1 NA intron (NM_001174061, intron 1 of 21) MER20B|DNA|hAT-Charlie 27445 NM_001350222 9887 Hs.591463 NM_014837 ENSG00000116698 SMG7 C1orf16|EST1C|SGA56M SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 133.75-176 chr7 27284708 27284926 + 1 NA Intergenic Intergenic -37588 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 144.25-111 chr2 234918882 234919218 + 1 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32967 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 200.5-81 chr21 30745712 30746025 + 1 NA TTS (NM_181617) TTS (NM_181617) 1391 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 204.75-75 chr3 56177250 56177647 + 1 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 291019 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 131.25-26 chr10 63976947 63977176 + 1 NA Intergenic Intergenic -455171 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 416.75 chr1 183344033 183344759 + 1 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 -39522 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 192.5-138 chr8 140205419 140205683 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -105016 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 161.25-127 chr3 116932504 116932818 + 1 NA TTS (NR_121607) TTS (NR_121607) 11230 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 251.5-54 chr3 116237825 116238421 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -121901 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 231.25-8 chr11 81909436 81909819 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR -18791 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 339.5-6 chr11 6220767 6221440 + 1 NA intron (NM_032127, intron 6 of 11) intron (NM_032127, intron 6 of 11) 13533 NM_032127 84067 Hs.501793 NM_032127 ENSG00000051009 FAM160A2 C11orf56|FHIP family with sequence similarity 160 member A2 protein-coding 206.25-2 chr1 38365333 38365659 + 1 NA Intergenic Intergenic -109700 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 140.5-28 chr11 32457084 32457234 + 1 NA intron (NR_120548, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 21120 NR_120546 51352 Hs.567499 NM_015855 ENSG00000183242 WT1-AS WIT-1|WIT1|WT1-AS1|WT1AS WT1 antisense RNA ncRNA 248.75-44 chr3 196040815 196041188 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 41089 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 244.5-10 chr1 202342865 202343162 + 1 NA Intergenic Intergenic -1047 NM_001310326 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 122.75-111 chr20 58820222 58820441 + 1 NA intron (NR_002785, intron 4 of 4) intron (NR_002785, intron 4 of 4) -2018 NR_030580 100126296 NR_030580 ENSG00000216031 MIR298 MIRN298|hsa-mir-298 microRNA 298 ncRNA 165.5-95 chr20 504517 504768 + 1 NA intron (NM_001362771, intron 3 of 13) MER102a|DNA|hAT-Charlie 39148 NM_001895 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 187.5-176 chr8 134881518 134881755 + 1 NA non-coding (NR_125427, exon 3 of 3) non-coding (NR_125427, exon 3 of 3) 31701 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 143.75-144 chr5 74329651 74329945 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 7312 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 173.25-45 chr16 50785472 50785677 + 1 NA intron (NM_015247, intron 13 of 19) L3|LINE|CR1 -21098 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 122.5-161 chr3 190838598 190838772 + 1 NA Intergenic Intergenic 24009 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 159.25-48 chr16 52167491 52167754 + 1 NA Intergenic Intergenic 82341 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 189.5-43 chr14 62216534 62216869 + 1 NA Intergenic Intergenic -76728 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 144.25-141 chr4 55628881 55629045 + 1 NA intron (NR_120489, intron 2 of 8) L1M5|LINE|L1 7335 NM_001292046 10874 Hs.418367 NM_006681 ENSG00000109255 NMU - neuromedin U protein-coding 213.25-48 chr4 66261587 66261892 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -15085 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 172.25-54 chr18 7145780 7146165 + 1 NA Intergenic Intergenic -28175 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 190.25-121 chr8 84940310 84940703 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -166732 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 190.75-115 chr8 131565899 131566135 + 1 NA Intergenic Intergenic -338076 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 150.5-147 chr4 55899367 55899616 + 1 NA intron (NM_001024924, intron 16 of 18) L1ME4a|LINE|L1 45841 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 202.5-58 chr17 56907988 56908268 + 1 NA intron (NM_005082, intron 2 of 8) intron (NM_005082, intron 2 of 8) 5921 NM_005082 7706 Hs.528952 NM_005082 ENSG00000121060 TRIM25 EFP|RNF147|Z147|ZNF147 tripartite motif containing 25 protein-coding 263.5-22 chr17 50231905 50232380 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 17448 NR_110806 101927230 Hs.514326 NR_110806 LINC01969 - long intergenic non-protein coding RNA 1969 ncRNA 179.75-88 chr4 74357195 74357498 + 1 NA Intergenic Intergenic -7799 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 115.75-169 chr5 87943242 87943478 + 1 NA Intergenic Intergenic 281318 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 160.5-76 chr18 62132961 62133254 + 1 NA intron (NM_176787, intron 14 of 30) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 53949 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 227.5-93 chr7 16107023 16107371 + 1 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) L1MA7|LINE|L1 -103289 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 156.5-34 chr12 7756751 7756969 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7319 NM_203503 170482 Hs.351812 NM_130441 ENSG00000198178 CLEC4C BDCA2|CD303|CLECSF11|CLECSF7|DLEC|HECL|PRO34150 C-type lectin domain family 4 member C protein-coding 205.5-21 chr11 60363731 60364038 + 1 NA Intergenic Intergenic -14601 NM_206938 58475 Hs.530735 NM_021201 ENSG00000166927 MS4A7 4SPAN2|CD20L4|CFFM4|MS4A8 membrane spanning 4-domains A7 protein-coding 371.75-8 chr2 20804813 20805574 + 1 NA intron (NM_021925, intron 1 of 6) intron (NM_021925, intron 1 of 6) 17908 NM_001282724 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 208.25-11 chr1 234077604 234078028 + 1 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -136395 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 258.25-59 chr7 119761529 119762010 + 1 NA intron (NR_131961, intron 3 of 3) LTR40A1|LTR|ERVL 145606 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 179.5-3 chr1 37515765 37516119 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -1176 NM_001270875 64769 Hs.17118 NM_022756 ENSG00000163875 MEAF6 C1orf149|CENP-28|EAF6|NY-SAR-91 MYST/Esa1 associated factor 6 protein-coding 201.5-56 chr14 78805890 78806412 + 1 NA intron (NR_073547, intron 9 of 20) intron (NR_073547, intron 9 of 20) -393831 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 171.25-25 chr11 17666129 17666462 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 30644 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 195.5 chr1 47039550 47039934 + 1 NA intron (NM_178033, intron 8 of 11) intron (NM_178033, intron 8 of 11) 16073 NM_178033 260293 Hs.439760 NM_178033 ENSG00000186377 CYP4X1 CYPIVX1 cytochrome P450 family 4 subfamily X member 1 protein-coding 160.75-113 chr4 124717199 124717404 + 1 NA Intergenic Intergenic -4569 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 155.5-157 chr5 9133313 9133492 + 1 NA intron (NM_003966, intron 13 of 22) intron (NM_003966, intron 13 of 22) -79507 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 246.5-63 chr6 44398416 44398809 + 1 NA intron (NM_001253, intron 5 of 15) intron (NM_001253, intron 5 of 15) 10906 NM_001253 988 Hs.485471 NM_001253 ENSG00000096401 CDC5L CDC5|CDC5-LIKE|CEF1|PCDC5RP|dJ319D22.1 cell division cycle 5 like protein-coding 251.25-12 chr11 102993422 102993734 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -37846 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 120.5-116 chr2 77253997 77254197 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MD2|LINE|L1 268132 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 207.75-81 chr3 145838349 145838607 + 1 NA Intergenic Intergenic 230707 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 134.75-140 chr3 50114382 50114602 + 1 NA intron (NM_005778, intron 20 of 24) intron (NM_005778, intron 20 of 24) -13504 NR_045388 100775107 Hs.439480 NR_045388 ENSG00000281691 RBM5-AS1 LUST RBM5 antisense RNA 1 ncRNA 249.75-50 chr4 97877391 97877823 + 1 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 265869 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 138.5-41 chr12 13224576 13224753 + 1 NA Intergenic Intergenic 27938 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 195.75-60 chr2 60697577 60697891 + 1 NA Intergenic Intergenic -58534 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 194.5-108 chr4 88448155 88448444 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -8820 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 308.5-5 chr11 17749894 17750400 + 1 NA intron (NM_001112741, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 14199 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 293.5-15 chr14 61294812 61295178 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -13657 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 164.5-211 chr8 111125478 111125711 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) -98161 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 168.75-53 chr15 66726902 66727210 + 1 NA intron (NR_027654, intron 4 of 4) intron (NR_027654, intron 4 of 4) 24820 NM_005585 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 224.25-71 chr4 119742670 119742952 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 61704 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 163.5-219 chr9 116359797 116360117 + 1 NA intron (NM_002581, intron 17 of 21) intron (NM_002581, intron 17 of 21) 40649 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 170.5-36 chr11 47580357 47580648 + 1 NA intron (NM_004551, intron 2 of 6) intron (NM_004551, intron 2 of 6) 1428 NM_004551 4722 Hs.502528 NM_004551 ENSG00000213619 NDUFS3 CI-30|MC1DN8 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 protein-coding 230.25-49 chr2 213098939 213099324 + 1 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) intron (NM_001371277, intron 3 of 6) 51306 NM_001371275 308.25-37 chr8 135992305 135992750 + 1 NA Intergenic Intergenic 535071 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 171.5-59 chr17 58554124 58554366 + 1 NA intron (NR_110810, intron 4 of 4) intron (NR_110810, intron 4 of 4) -9917 NM_001368771 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 289.25-36 chr9 109348421 109348763 + 1 NA Intergenic Intergenic -27628 NM_018424 54566 Hs.591901 NM_018424 ENSG00000095203 EPB41L4B CG1|EHM2 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B protein-coding 191.5-130 chr6 115143949 115144338 + 1 NA Intergenic Intergenic 499692 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 230.75-24 chr15 63174300 63174659 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15127 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 209.5-31 chr12 85737971 85738221 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 98313 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 143.5-139 chr3 19991678 19991854 + 1 NA intron (NM_001252657, intron 2 of 2) intron (NM_001252657, intron 2 of 2) 20498 NM_001252657 151649 Hs.733161 NM_144714 ENSG00000183977 PP2D1 C3orf48 protein phosphatase 2C like domain containing 1 protein-coding 145.25-49 chr16 78084797 78085015 + 1 NA Intergenic Intergenic -14748 NM_001291997 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 177.5-111 chr3 44323213 44323668 + 1 NA intron (NM_001145030, intron 18 of 19) intron (NM_001145030, intron 18 of 19) -14679 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 198.25-69 chr3 107508737 107508997 + 1 NA Intergenic Intergenic -14095 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 167.25-56 chr16 55977356 55977552 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -21423 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 210.25-4 chr1 75817954 75818344 + 1 NA intron (NM_002440, intron 6 of 19) L2b|LINE|L2 21267 NM_002440 4438 Hs.216639 NM_002440 ENSG00000057468 MSH4 - mutS homolog 4 protein-coding 260.25-54 chr8 81004351 81004766 + 1 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) intron (NM_018440, intron 3 of 8) 107510 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 234.5-55 chr2 207775182 207775458 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5414 NM_003468 7855 Hs.17631 NM_003468 ENSG00000163251 FZD5 C2orf31|HFZ5 frizzled class receptor 5 protein-coding 143.75-141 chr5 25103167 25103381 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 87382 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 277.5-18 chr12 41225019 41225622 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 37000 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 130.25-93 chr2 29795717 29795863 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) L1ME4c|LINE|L1 125796 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 167.75-77 chr2 164680943 164681123 + 1 NA 3' UTR (NM_001278461, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001278461, exon 13 of 13) 6744 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 171.5-58 chr17 32949327 32949615 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21318 NM_015544 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 115.25-74 chr16 73982238 73982395 + 1 NA Intergenic Intergenic 233205 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 133.5-277 chr9 33920210 33920407 + 1 NA TTS (NM_017811) TTS (NM_017811) 14056 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 124.25-99 chr2 128510283 128510461 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -191504 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 304.25-25 chr8 71967137 71967568 + 1 NA intron (NR_033652, intron 4 of 4) intron (NR_033652, intron 4 of 4) 108232 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 189.25-114 chr8 13476422 13476720 + 1 NA intron (NM_024767, intron 2 of 4) intron (NM_024767, intron 2 of 4) 38280 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 117.75-193 chr7 26815516 26815662 + 1 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) UCON31|Unknown|Unknown 42134 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 227.5-83 chr5 37856260 37856602 + 1 NA intron (NR_103441, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 15993 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 164.5-42 chr12 90718763 90719001 + 1 NA Intergenic Intergenic -199141 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 290.5-12 chr14 64609598 64610011 + 1 NA Intergenic Intergenic 59843 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 152.5-199 chrX 55236145 55236400 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 15926 NM_001013435 90737 Hs.668491 NM_130467 ENSG00000158639 PAGE5 CT16|CT16.1|CT16.2|GAGEE1|PAGE-5 PAGE family member 5 protein-coding 249.5-32 chr15 59894735 59895098 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -109395 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 262.5-37 chr2 110953030 110953360 + 1 NA intron (NM_001142807, intron 12 of 17) MIR|SINE|MIR 162393 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 125.5-11 chr1 152976096 152976317 + 1 NA Intergenic Intergenic 5558 NM_173080 163778 Hs.433629 NM_173080 ENSG00000184148 SPRR4 - small proline rich protein 4 protein-coding 211.75-97 chr8 103585890 103586132 + 1 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MA1|LINE|L1 -84101 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 188.5-98 chr3 26074859 26075169 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -201319 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 242.75-8 chr1 239963526 239963964 + 1 NA Intergenic Intergenic -43779 NR_036695 645884 Hs.613280 NR_036695 RPS7P5 RPS7_2_183 ribosomal protein S7 pseudogene 5 pseudo 279.75-48 chr6 72651591 72652073 + 1 NA intron (NR_120503, intron 2 of 3) intron (NR_120503, intron 2 of 3) 21337 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 358.25-5 chr12 15504384 15505204 + 1 NA intron (NM_030667, intron 6 of 26) intron (NM_030667, intron 6 of 26) -41817 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 184.75-83 chr5 159699956 159700184 + 1 NA Intergenic Intergenic 171314 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 177.75-138 chr8 89870971 89871255 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -30755 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 232.5-101 chr8 86444911 86445205 + 1 NA intron (NM_007013, intron 18 of 24) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 63628 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 144.25-216 chr8 136132448 136132614 + 1 NA Intergenic Intergenic -398267 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 131.75-158 chr4 124788108 124788334 + 1 NA Intergenic Intergenic -75489 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 225.5-94 chr6 42619713 42619988 + 1 NA 3' UTR (NM_001184801, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001184801, exon 12 of 12) 55821 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 231.5-5 chr1 220775209 220775587 + 1 NA intron (NM_001331042, intron 4 of 4) intron (NM_001331042, intron 4 of 4) -11515 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 170.5-24 chr10 51456787 51457113 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) L1PB2|LINE|L1 157377 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 226.5-81 chr5 147448681 147449087 + 1 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 4808 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 154.25-85 chr2 142238862 142239180 + 1 NA Intergenic Intergenic -107320 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 214.75-12 chr10 81857624 81857952 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17406 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 190.25-29 chr12 104082789 104083059 + 1 NA intron (NM_013320, intron 7 of 14) intron (NM_013320, intron 7 of 14) 18393 NM_013320 29915 Hs.506558 NM_013320 ENSG00000111727 HCFC2 HCF-2|HCF2 host cell factor C2 protein-coding 120.5-119 chr2 110981532 110981670 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 13 of 18) intron (NM_001371254, intron 13 of 18) 133987 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 173.5-56 chr17 62575417 62575614 + 1 NA intron (NM_001284333, intron 13 of 22) intron (NM_001284333, intron 13 of 22) -52155 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 156.5-6 chr1 163006965 163007222 + 1 NA Intergenic Intergenic -61513 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 161.25-96 chr2 127703327 127703554 + 1 NA 3' UTR (NM_018383, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_018383, exon 22 of 22) 1943 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 317.5-32 chr7 84949739 84950154 + 1 NA Intergenic Intergenic 171985 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 145.75-137 chr6 114759816 114760080 + 1 NA Intergenic Intergenic -697071 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 285.5-27 chr18 8043933 8044594 + 1 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) LTR79|LTR|ERVL 322771 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 286.75-43 chr9 34228868 34229199 + 1 NA intron (NM_001171202, intron 2 of 5) intron (NM_001171202, intron 2 of 5) 49990 NR_033243 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 215.5-88 chr5 53133643 53134070 + 1 NA Intergenic Intergenic 24014 NR_104654 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 186.75-116 chr8 131601158 131601400 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -302814 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 195.25-10 chr1 170918863 170919067 + 1 NA Intergenic Intergenic -16506 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 196.5-82 chr2 59240170 59240626 + 1 NA intron (NR_110219, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 22690 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 297.5-36 chr3 18468594 18469008 + 1 NA intron (NR_125803, intron 4 of 6) Charlie10|DNA|hAT-Charlie -23209 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 121.25-190 chr7 148209800 148209990 + 1 NA intron (NM_014141, intron 17 of 22) L2b|LINE|L2 -380871 NM_145304 202865 Hs.352212 NM_145304 ENSG00000170279 C7orf33 - chromosome 7 open reading frame 33 protein-coding 161.75-32 chr12 89757532 89757719 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -48259 NM_001366528 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 138.75-130 chr4 114352945 114353083 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -245388 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 200.5-67 chr2 78580411 78580740 + 1 NA Intergenic Intergenic 35044 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 120.75-125 chr4 76558069 76558363 + 1 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) -15352 NR_039654 100616299 NR_039654 ENSG00000263445 MIR4450 mir-4450 microRNA 4450 ncRNA 204.5-5 chr1 190095322 190095549 + 1 NA Intergenic Intergenic 380575 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 164.5-58 chr14 63378765 63378983 + 1 NA intron (NM_001282180, intron 13 of 13) intron (NM_001282180, intron 13 of 13) -59939 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 173.5-4 chr1 108111594 108111835 + 1 NA Intergenic Intergenic 81121 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 168.5-16 chr1 177138769 177139100 + 1 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR 25778 NM_001364856 460 Hs.495897 NM_004319 ENSG00000152092 ASTN1 ASTN astrotactin 1 protein-coding 159.5-149 chr3 97662301 97662566 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -102088 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 189.25-48 chr17 60947579 60947989 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) intron (NM_001330413, intron 14 of 25) 269933 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 316.25-11 chr22 28203971 28204637 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -255565 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 116.25-236 chr8 135749592 135749806 + 1 NA Intergenic Intergenic 292243 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 179.25-61 chr17 9398575 9398984 + 1 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) AluSz|SINE|Alu 177041 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 221.75-15 chr11 34699905 34700239 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 67506 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 198.25-44 chr17 63360088 63360457 + 1 NA intron (NM_025185, intron 13 of 25) intron (NM_025185, intron 13 of 25) 79995 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 150.25-25 chr10 106049256 106049522 + 1 NA Intergenic Intergenic -90776 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 289.5-3 chr1 184079372 184079889 + 1 NA intron (NM_001363643, intron 3 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 27900 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 208.5-55 chr17 52203172 52203436 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -43287 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 260.5-17 chr15 91509844 91510164 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 46665 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 172.5-171 chr6 120042406 120042580 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 27314 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 126.5-133 chr20 35824777 35824983 + 1 NA intron (NM_016436, intron 2 of 17) L1MB7|LINE|L1 52865 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 228.5-106 chr9 17839994 17840493 + 1 NA Intergenic Intergenic 261177 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 138.75-54 chr14 78886251 78886463 + 1 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -313625 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 117.75-131 chr3 23731991 23732225 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -73847 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 173.75-25 chr10 77102710 77103039 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 9 of 28) intron (NM_001271519, intron 9 of 28) -37957 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 209.5-80 chr20 43672100 43672487 + 1 NA intron (NM_001278610, intron 1 of 12) intron (NM_001278610, intron 1 of 12) 5179 NM_002466 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 183.5-20 chr10 62582316 62582631 + 1 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) intron (NM_199452, intron 1 of 6) 62025 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 290.5-6 chr10 115133158 115133499 + 1 NA intron (NM_001276282, intron 5 of 7) L1PA5|LINE|L1 39963 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 139.75-121 chr3 60281576 60281855 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) L1MC3|LINE|L1 -200806 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 154.5-111 chr2 183117969 183118273 + 1 NA intron (NM_001287584, intron 1 of 9) intron (NM_001287584, intron 1 of 9) 631 NM_001287584 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 157.25-34 chr12 13460923 13461092 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -84262 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 295.5-46 chr5 8615953 8616464 + 1 NA Intergenic Intergenic 155283 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 171.5-71 chr2 14436642 14436868 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -35797 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 119.25-132 chr3 102885912 102886164 + 1 NA Intergenic Intergenic 451023 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 154.5-140 chr4 105795121 105795384 + 1 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) L1M5|LINE|L1 31920 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 222.75-38 chr14 60987875 60988293 + 1 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 -6394 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 118.25-201 chr8 109392435 109392637 + 1 NA intron (NM_177531, intron 9 of 77) intron (NM_177531, intron 9 of 77) 30075 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 116.5-172 chr4 32686726 32686921 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 335785 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 158.5-153 chr5 34037731 34038005 + 1 NA intron (NR_146599, intron 7 of 11) intron (NR_146599, intron 7 of 11) 5345 NM_030945 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 247.75-41 chr4 40409326 40409694 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 74177 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 158.25-154 chr9 24548873 24549067 + 1 NA Intergenic Intergenic -3073 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 306.5-28 chr3 75208681 75209116 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -5578 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 131.5-79 chr15 92963829 92964047 + 1 NA intron (NM_001271, intron 16 of 38) intron (NM_001271, intron 16 of 38) 59539 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 315.5-23 chr6 122680299 122680927 + 1 NA intron (NM_181795, intron 3 of 4) MER39B|LTR|ERV1 27884 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 260.5-55 chr6 114002555 114002883 + 1 NA intron (NR_125845, intron 4 of 9) intron (NR_125845, intron 4 of 9) -31571 NM_001527 3066 Hs.3352 NM_001527 ENSG00000196591 HDAC2 HD2|KDAC2|RPD3|YAF1 histone deacetylase 2 protein-coding 114.5-232 chr6 163893353 163893633 + 1 NA Intergenic Intergenic -222009 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 173.5-125 chr5 29481285 29481651 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -85492 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 207.25-70 chr5 26089749 26090132 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 898987 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 261.5-64 chr7 86233873 86234148 + 1 NA Intergenic Intergenic -409899 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 148.75-106 chr22 32971325 32971534 + 1 NA intron (NM_003490, intron 3 of 13) intron (NM_003490, intron 3 of 13) 35392 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 158.5-122 chr21 36853281 36853494 + 1 NA intron (NM_001352515, intron 6 of 10) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 108971 NM_001352518 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 316.25 chr1 47710768 47711301 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -273717 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 234.5-87 chr7 46275428 46275803 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -354343 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 132.5-101 chr18 67843630 67843830 + 1 NA intron (NR_033921, intron 3 of 4) intron (NR_033921, intron 3 of 4) -28908 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 261.75-35 chr5 39172220 39172801 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) L1PA16|LINE|L1 47053 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 208.25-19 chr11 85124042 85124419 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 5 of 27) L2a|LINE|L2 -200809 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 371.5-3 chr11 96177203 96177811 + 1 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -163931 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 268.75-46 chr9 14252238 14252612 + 1 NA intron (NR_161383, intron 1 of 7) intron (NR_161383, intron 1 of 7) 47839 NM_001369480 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 150.25-142 chr7 30058649 30058831 + 1 NA intron (NM_001363473, intron 9 of 12) L1ME2|LINE|L1 13655 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 167.5-141 chr5 44826810 44827008 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 17962 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 228.5-46 chr18 60051445 60051715 + 1 NA Intergenic Intergenic 151584 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 284.5-35 chr2 193228969 193229324 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 479301 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 165.5-158 chr6 48677976 48678166 + 1 NA Intergenic Intergenic -609382 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 174.75-68 chr2 184846412 184846624 + 1 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 247989 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 144.5-121 chr21 22777964 22778197 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -301204 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 203.5-121 chr6 79042324 79042606 + 1 NA intron (NM_017934, intron 7 of 39) intron (NM_017934, intron 7 of 39) 35789 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 153.5-148 chr4 178850338 178850616 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -942541 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 206.75-27 chr17 83192238 83192532 + 1 NA Intergenic Intergenic -34512 NR_029406 388574 Hs.546918 NR_029406 ENSG00000232938 RPL23AP87 - ribosomal protein L23a pseudogene 87 pseudo 159.5-94 chr2 25912417 25912675 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34059 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 240.25-10 chr10 63206140 63206579 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 9 of 24) intron (NM_001322258, intron 9 of 24) 62864 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 144.25-95 chr2 46501820 46501974 + 1 NA Intergenic Intergenic 22332 NM_001145051 388946 Hs.733348 NM_001145051 ENSG00000284701 TMEM247 - transmembrane protein 247 protein-coding 220.5-69 chr22 26905194 26905568 + 1 NA intron (NR_110540, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 2089 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 160.25-61 chr18 9538647 9538858 + 1 NA TTS (NM_006788) TTS (NM_006788) 63239 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 195.5-33 chr12 42172952 42173257 + 1 NA intron (NR_135139, intron 4 of 6) intron (NR_135139, intron 4 of 6) -28230 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 202.25-44 chr20 35681807 35682145 + 1 NA exon (NM_001198989, exon 5 of 12) exon (NM_001198989, exon 5 of 12) -17076 NM_006047 10137 Hs.700188 NM_006047 ENSG00000244462 RBM12 HRIHFB2091|SCZD19|SWAN RNA binding motif protein 12 protein-coding 250.25-12 chr15 101047322 101047785 + 1 NA intron (NM_024652, intron 21 of 33) intron (NM_024652, intron 21 of 33) 128196 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 115.25-127 chr22 43214797 43214959 + 1 NA intron (NM_173050, intron 15 of 21) L1MC4|LINE|L1 2204 NR_134632 105373051 Hs.629290 NR_134632 ENSG00000236272 LOC105373051 - uncharacterized LOC105373051 ncRNA 139.5-87 chr18 8253994 8254143 + 1 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 112966 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 232.25-15 chr11 105162425 105162833 + 1 NA Intergenic Intergenic -22860 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 112.5-182 chr4 69837766 69837897 + 1 NA Intergenic Intergenic 22314 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 156.25-69 chr2 57664515 57664754 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -243017 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 265.5-31 chr17 58693777 58694167 + 1 NA intron (NM_002876, intron 1 of 1) intron (NM_002876, intron 1 of 1) 1370 NR_103872 5889 Hs.412587 NM_002876 ENSG00000108384 RAD51C BROVCA3|FANCO|R51H3|RAD51L2 RAD51 paralog C protein-coding 186.25-32 chr14 82759910 82760271 + 1 NA Intergenic Intergenic 117458 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 198.75-97 chr8 124950990 124951381 + 1 NA TTS (NR_027321) TTS (NR_027321) 9177 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 311.75-6 chr11 96377394 96377977 + 1 NA intron (NM_024725, intron 5 of 9) L1M2|LINE|L1 12131 NM_001363594 79780 Hs.525088 NM_014148 ENSG00000149231 CCDC82 HSPC048 coiled-coil domain containing 82 protein-coding 260.75-20 chr18 50870309 50870639 + 1 NA Intergenic Intergenic -8644 NM_002396 4200 Hs.233119 NM_002396 ENSG00000082212 ME2 ODS1 malic enzyme 2 protein-coding 204.25-12 chr10 85559445 85559659 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18179 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 152.5-65 chr16 74267264 74267531 + 1 NA Intergenic Intergenic -29417 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 214.25-85 chr8 138884861 138885320 + 1 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) intron (NM_152888, intron 1 of 64) 28951 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 387.5-14 chr8 116732682 116733511 + 1 NA intron (NM_003756, intron 1 of 7) MER21C|LTR|ERVL 22727 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 214.5-122 chr7 146639921 146640204 + 1 NA Intergenic Intergenic -134209 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 224.25-35 chr16 67771605 67772139 + 1 NA intron (NM_001320240, intron 3 of 16) intron (NM_001320240, intron 3 of 16) 34688 NM_001320238 57610 Hs.368569 NM_020850 ENSG00000141084 RANBP10 - RAN binding protein 10 protein-coding 272.5-31 chr16 75025303 75025717 + 1 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 26486 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 116.25-70 chr14 71493590 71493794 + 1 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) intron (NM_001284247, intron 1 of 23) 5831 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 136.5-4 chr1 53266162 53266385 + 1 NA intron (NM_004631, intron 9 of 18) intron (NM_004631, intron 9 of 18) 27663 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 133.5-110 chr2 35069690 35069848 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 392212 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 113.5-59 chr12 106632314 106632531 + 1 NA intron (NM_001206691, intron 2 of 17) intron (NM_001206691, intron 2 of 17) 31274 NM_001206691 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 176.75-31 chr13 106024578 106024928 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 317923 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 162.75-8 chr1 157367730 157367909 + 1 NA Intergenic Intergenic 184696 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 273.75-40 chr7 138406945 138407355 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -53109 NM_015905 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 124.5-137 chr22 41365270 41365426 + 1 NA Intergenic Intergenic -1985 NM_001145398 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 137.5-57 chr13 30411202 30411464 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 10911 NR_125771 103724387 NR_125771 ENSG00000225039 LINC01058 - long intergenic non-protein coding RNA 1058 ncRNA 210.75-68 chr4 109355496 109355777 + 1 NA Intergenic Intergenic 52601 NR_160939 645078 Hs.518784 NM_001039778 ZCCHC23 - zinc finger CCHC-type containing 23 ncRNA 215.5-15 chr10 84764750 84765144 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 339778 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 293.75-17 chr17 49925631 49926171 + 1 NA Intergenic Intergenic -43289 NM_138281 1748 Hs.591167 NM_001934 ENSG00000108813 DLX4 BP1|DLX7|DLX8|DLX9|OFC15 distal-less homeobox 4 protein-coding 208.75-54 chr3 108768527 108768738 + 1 NA Intergenic Intergenic -11349 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 149.75-115 chr3 120754377 120754603 + 1 NA intron (NM_005513, intron 2 of 4) L1MC|LINE|L1 11746 NM_005513 2960 Hs.445272 NM_005513 ENSG00000153767 GTF2E1 FE|TF2E1|TFIIE-A general transcription factor IIE subunit 1 protein-coding 117.75-8 chr1 100770522 100770746 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 50892 NM_001078 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 154.75-143 chr8 79955732 79956026 + 1 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 74380 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 275.75-20 chr18 71401085 71401613 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 177607 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 243.5-56 chr4 61919198 61919547 + 1 NA intron (NM_001322246, intron 12 of 25) intron (NM_001322246, intron 12 of 25) 242393 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 117.75-84 chr18 9303021 9303347 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -31589 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 180.5-135 chr6 168291710 168291995 + 1 NA TTS (NM_001286351) TTS (NM_001286351) 27925 NM_001286351 168002 Hs.673059 NM_214462 ENSG00000164488 DACT2 C6orf116|DAPPER2|DPR2|bA503C24.7 dishevelled binding antagonist of beta catenin 2 protein-coding 135.75-194 chr8 79959881 79960052 + 1 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 70293 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 157.25-133 chr6 153024940 153025174 + 1 NA intron (NM_012419, intron 3 of 4) AluJr4|SINE|Alu -22242 NM_001301872 54516 Hs.225836 NM_019041 ENSG00000112031 MTRF1L HMRF1L|MRF1L|mtRF1a mitochondrial translational release factor 1 like protein-coding 197.5-100 chr3 120259098 120259428 + 1 NA Intergenic Intergenic -14968 NM_153002 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 117.75-112 chr2 149755784 149755993 + 1 NA intron (NR_110240, intron 2 of 2) L1MEg|LINE|L1 103303 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 116.5-63 chr14 32690865 32691081 + 1 NA intron (NM_004274, intron 8 of 13) intron (NM_004274, intron 8 of 13) -247906 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 205.25-52 chr2 99347585 99348032 + 1 NA intron (NM_015904, intron 1 of 23) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 10419 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 227.5-17 chr11 13993594 13993934 + 1 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) L2a|LINE|L2 31041 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 298.75-6 chr1 162571381 162571890 + 1 NA intron (NM_003115, intron 2 of 9) intron (NM_003115, intron 2 of 9) 9736 NM_001324113 6675 Hs.492859 NM_003115 ENSG00000117143 UAP1 AGX|AGX1|AGX2|SPAG2 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 protein-coding 224.75-48 chr3 128995829 128996081 + 1 NA intron (NM_001348521, intron 1 of 15) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -1879 NM_020741 57501 Hs.518247 NM_020741 ENSG00000114656 KIAA1257 - KIAA1257 protein-coding 274.25-36 chr5 27180243 27180603 + 1 NA Intergenic Intergenic -141837 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 200.75-43 chr18 37987597 37987892 + 1 NA Intergenic Intergenic 330609 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 122.5-109 chr2 57150339 57150477 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -757243 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 255.5-15 chr11 83457091 83457750 + 1 NA 3' UTR (NM_001142700, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001142700, exon 20 of 20) -171013 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 149.25-55 chr15 78179413 78179718 + 1 NA exon (NM_001199377, exon 10 of 14) exon (NM_001199377, exon 10 of 14) 30203 NM_005530 3419 Hs.591110 NM_005530 ENSG00000166411 IDH3A - isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 alpha protein-coding 211.25-18 chr13 22708522 22708885 + 1 NA Intergenic Intergenic 189478 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 194.75-24 chr13 104897680 104897913 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -568071 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 237.25-33 chr15 59392677 59393149 + 1 NA Intergenic Intergenic -20042 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 183.5-3 chr1 72291072 72291335 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -8664 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 186.25-54 chr2 153039791 153040018 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 321267 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 198.75-73 chr5 4260386 4260709 + 1 NA Intergenic Intergenic -512934 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 304.5-6 chr10 86203531 86204153 + 1 NA intron (NM_017551, intron 3 of 15) MER117|DNA|hAT-Charlie 60946 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 219.5-137 chr9 70629781 70630150 + 1 NA intron (NM_001366142, intron 12 of 26) intron (NM_001366142, intron 12 of 26) 180119 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 337.75-5 chr10 50812585 50813225 + 1 NA intron (NM_001370131, intron 9 of 11) intron (NM_001370131, intron 9 of 11) 72722 NM_001370131 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 181.25-32 chr14 72597337 72597681 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 80689 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 146.75-122 chr5 43855315 43855467 + 1 NA Intergenic Intergenic -252161 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 218.75-53 chr3 61918128 61918665 + 1 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 356825 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 270.5-66 chr8 139084360 139084824 + 1 NA Intergenic Intergenic -170551 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 212.5-15 chr10 120461134 120461422 + 1 NA intron (NR_134516, intron 2 of 4) intron (NR_134516, intron 2 of 4) 4324 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 121.5-204 chr5 9460172 9460396 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -51049 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 156.5-154 chr5 109084859 109085119 + 1 NA intron (NR_146155, intron 16 of 19) L1ME3A|LINE|L1 160383 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 136.75-152 chr5 14022218 14022373 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -77815 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 339.5-16 chr22 50136113 50136685 + 1 NA intron (NM_018995, intron 15 of 26) intron (NM_018995, intron 15 of 26) -10656 NM_001164106 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 187.25-11 chr10 44478033 44478480 + 1 NA Intergenic Intergenic -93159 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 159.25-135 chr7 10084995 10085318 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 450886 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 244.75-55 chr7 23733440 23733927 + 1 NA intron (NM_031414, intron 6 of 23) AluYi6_4d|SINE|Alu 23464 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 157.25-84 chr2 194959929 194960159 + 1 NA Intergenic Intergenic 229449 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 126.25-113 chr3 49341325 49341484 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -1351 NM_199443 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 120.75-39 chr14 43037470 43037709 + 1 NA Intergenic Intergenic 1430733 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 252.5-28 chr14 84187280 84187758 + 1 NA Intergenic Intergenic -1084413 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 148.5-195 chr6 61680660 61680884 + 1 NA non-coding (NR_146872, exon 10 of 10) non-coding (NR_146872, exon 10 of 10) 106642 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 258.5-79 chr9 30640255 30640731 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -232039 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 201.25-71 chr4 132769625 132769907 + 1 NA Intergenic Intergenic 178677 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 125.75-41 chr12 24218967 24219215 + 1 NA intron (NM_001261414, intron 4 of 16) intron (NM_001261414, intron 4 of 16) -4180 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 202.5-46 chr14 81418953 81419189 + 1 NA intron (NM_001366850, intron 2 of 7) intron (NM_001366850, intron 2 of 7) 8704 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 268.5-55 chr6 137857842 137858292 + 1 NA intron (NR_049793, intron 3 of 3) intron (NR_049793, intron 3 of 3) -9192 NM_006290 7128 Hs.211600 NM_006290 ENSG00000118503 TNFAIP3 A20|AISBL|OTUD7C|TNFA1P2 TNF alpha induced protein 3 protein-coding 196.75-3 chr1 40844666 40845027 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 17517 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 262.75-40 chr4 57859696 57860024 + 1 NA Intergenic Intergenic 433988 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 204.5-102 chr4 167031677 167032082 + 1 NA intron (NM_001204354, intron 2 of 9) intron (NM_001204354, intron 2 of 9) 202547 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 127.5-66 chr13 92010826 92011026 + 1 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) intron (NM_004466, intron 6 of 7) 341281 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 174.25-51 chr14 69342626 69342923 + 1 NA intron (NM_020692, intron 12 of 15) intron (NM_020692, intron 12 of 15) 55525 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 199.25-107 chr9 112360828 112361169 + 1 NA Intergenic Intergenic -18911 NM_001195822 84263 Hs.59486 NM_032303 ENSG00000119471 HSDL2 C9orf99|SDR13C1 hydroxysteroid dehydrogenase like 2 protein-coding 356.5-5 chr10 122578850 122579390 + 1 NA intron (NM_004406, intron 9 of 39) intron (NM_004406, intron 9 of 39) 18366 NM_001320644 1755 Hs.279611 NM_004406 ENSG00000187908 DMBT1 GP340|SAG|SALSA|muclin deleted in malignant brain tumors 1 protein-coding 355.5 chr1 81549355 81549852 + 1 NA intron (NR_125943, intron 1 of 3) intron (NR_125943, intron 1 of 3) 8099 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 144.5-212 chr8 38771708 38771997 + 1 NA intron (NM_001352804, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu 14577 NM_001352804 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 165.5-170 chr6 138189206 138189412 + 1 NA intron (NM_020340, intron 2 of 33) intron (NM_020340, intron 2 of 33) 27370 NM_020340 57221 Hs.194408 NM_020340 ENSG00000112379 ARFGEF3 A7322|BIG3|C6orf92|KIAA1244|PPP1R33|dJ171N11.1 ARFGEF family member 3 protein-coding 250.75-25 chr2 133070887 133071234 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 155503 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 120.25-95 chr2 77268492 77268741 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 253760 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 172.5 chr1 9841241 9841430 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16809 NM_001302883 22883 Hs.29665 NM_014944 ENSG00000171603 CLSTN1 ALC-ALPHA|CDHR12|CST-1|CSTN1|PIK3CD|XB31alpha|alcalpha1|alcalpha2 calsyntenin 1 protein-coding 163.5-83 chr18 72284121 72284292 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 260136 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 286.5-15 chr11 94027274 94027773 + 1 NA intron (NM_001098672, intron 1 of 19) MIRb|SINE|MIR 6169 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 181.5-91 chr2 188092513 188092789 + 1 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 195040 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 297.5-37 chr3 49508614 49509136 + 1 NA intron (NM_001177641, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 38743 NM_001177644 1605 Hs.76111 NM_004393 ENSG00000173402 DAG1 156DAG|A3a|AGRNR|DAG|LGMDR16|MDDGA9|MDDGC7|MDDGC9 dystroglycan 1 protein-coding 242.75-20 chr17 54541347 54541811 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -359112 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 135.25-144 chr4 81756072 81756274 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -284266 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 229.25-86 chr8 133936673 133936939 + 1 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 50310 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 166.5-74 chr16 30824605 30824855 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -37525 NM_001080417 23361 Hs.301094 NM_001080417 ENSG00000102870 ZNF629 ZNF|ZNF65 zinc finger protein 629 protein-coding 169.5-160 chr7 44168765 44168998 + 1 NA intron (NM_001354800, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 -9599 NM_033507 2645 Hs.1270 NM_000162 ENSG00000106633 GCK FGQTL3|GK|GLK|HHF3|HK4|HKIV|HXKP|LGLK|MODY2 glucokinase protein-coding 230.5-84 chr4 43285622 43285935 + 1 NA Intergenic Intergenic 206765 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 295.25-25 chr5 62363193 62363540 + 1 NA intron (NM_001098511, intron 13 of 20) intron (NM_001098511, intron 13 of 20) 40539 NM_001348077 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 295.5-4 chr1 152538248 152538580 + 1 NA Intergenic Intergenic 23932 NM_019060 54544 Hs.110196 NM_019060 ENSG00000169509 CRCT1 C1orf42|NICE-1|NICE1 cysteine rich C-terminal 1 protein-coding 310.5-31 chr5 121429196 121429814 + 1 NA Intergenic Intergenic 106955 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 173.5-40 chr14 57248313 57248619 + 1 NA intron (NM_006544, intron 1 of 17) L1ME4a|LINE|L1 20439 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 208.5-100 chr4 89812281 89812754 + 1 NA intron (NM_001146054, intron 4 of 5) intron (NM_001146054, intron 4 of 5) -23884 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 288.25-31 chr8 120872395 120872696 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -60499 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 239.25-62 chr4 47894559 47894879 + 1 NA intron (NR_103795, intron 10 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -19508 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 318.25 chr1 24594668 24595234 + 1 NA intron (NM_001010980, intron 1 of 3) intron (NM_001010980, intron 1 of 3) 38864 NM_001010980 400746 Hs.200253 NM_001010980 ENSG00000184454 NCMAP C1orf130|MP11 non-compact myelin associated protein protein-coding 182.75-128 chr7 90205879 90206316 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 5538 NR_110029 100874100 Hs.573339 NR_110029 ENSG00000227646 STEAP2-AS1 - STEAP2 antisense RNA 1 ncRNA 281.75-20 chr15 95472587 95472976 + 1 NA intron (NR_027133, intron 3 of 5) intron (NR_027133, intron 3 of 5) 39688 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 189.5-3 chr1 49368513 49368768 + 1 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) intron (NR_136623, intron 2 of 12) 103445 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 205.5-92 chr3 58220435 58220799 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -9614 NM_001256560 1776 Hs.476453 NM_004944 ENSG00000163687 DNASE1L3 DHP2|DNAS1L3|LSD|SLEB16 deoxyribonuclease 1 like 3 protein-coding 193.5-91 chr2 149598536 149598844 + 1 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) intron (NR_110240, intron 1 of 2) -10915 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 398.5-20 chr8 136618117 136618697 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 87609 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 222.5-11 chr1 213831884 213832224 + 1 NA intron (NR_037850, intron 5 of 5) intron (NR_037850, intron 5 of 5) -92695 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 188.5-35 chr14 47001296 47001553 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) HAL1b|LINE|L1 341822 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 235.25-17 chr13 25867931 25868243 + 1 NA intron (NM_016529, intron 33 of 36) intron (NM_016529, intron 33 of 36) 182973 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 163.5-183 chr7 2802737 2803048 + 1 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 12338 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 235.75-23 chr14 60069883 60070344 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -21798 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 220.75-56 chr5 75872917 75873237 + 1 NA Intergenic Intergenic -155640 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 211.5-146 chr7 52957580 52957941 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -77873 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 121.75-202 chrX 46523589 46523726 + 1 NA intron (NM_001190417, intron 5 of 5) L1MEf|LINE|L1 21764 NM_001146291 641339 Hs.636105 NM_001039891 ENSG00000251192 ZNF674 MRX92|ZNF673B zinc finger protein 674 protein-coding 301.5-40 chr8 68771687 68772105 + 1 NA intron (NM_001349479, intron 9 of 11) L2c|LINE|L2 332294 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 146.75-34 chr12 123379337 123379729 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -4599 NM_001367389 387893 Hs.443735 NM_020382 ENSG00000183955 KMT5A PR-Set7|PR/SET07|SET07|SET8|SETD8 lysine methyltransferase 5A protein-coding 169.75-102 chr3 70702662 70703048 + 1 NA Intergenic Intergenic 362069 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 205.5-80 chr2 193603681 193604023 + 1 NA Intergenic Intergenic -740417 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 148.5-50 chr13 34254683 34254915 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -93244 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 265.75-44 chr22 28140858 28141282 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) MIRb|SINE|MIR -220458 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 193.5-58 chr16 47674350 47674695 + 1 NA intron (NM_001031835, intron 27 of 31) intron (NM_001031835, intron 27 of 31) -184059 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 137.5-114 chr2 45150901 45151115 + 1 NA Intergenic Intergenic 103933 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 170.25-34 chr14 52668819 52669034 + 1 NA intron (NM_014584, intron 6 of 15) intron (NM_014584, intron 6 of 15) 26632 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 299.25-45 chr7 82007286 82007596 + 1 NA intron (NM_000722, intron 16 of 38) intron (NM_000722, intron 16 of 38) -1736 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 128.5-116 chr2 169285357 169285537 + 1 NA intron (NM_004525, intron 9 of 78) intron (NM_004525, intron 9 of 78) 77087 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 206.5-22 chr13 101245600 101245845 + 1 NA intron (NM_001350749, intron 11 of 43) MER51A|LTR|ERV1 170786 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 123.5-140 chr3 112976112 112976277 + 1 NA Intergenic Intergenic -1091 NM_138939 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 253.5-67 chr6 39032289 39032658 + 1 NA Intergenic Intergenic -16308 NR_136562 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 147.25-72 chr20 51417507 51417674 + 1 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) L2b|LINE|L2 35387 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 150.5-100 chr2 144165898 144166167 + 1 NA intron (NM_001284234, intron 2 of 9) L2c|LINE|L2 45547 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 256.25-16 chr17 57503140 57503789 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 20133 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 200.25-37 chr14 55794286 55794658 + 1 NA intron (NR_026796, intron 1 of 3) MER68|LTR|ERVL 2202 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 154.5-87 chr19 33969495 33969710 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 172732 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 182.5-75 chr2 50435151 50435512 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MIRc|SINE|MIR -87575 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 175.5-7 chr1 160850333 160850526 + 1 NA intron (NM_001166664, intron 1 of 7) L1ME3|LINE|L1 12458 NM_001166663 51744 Hs.157872 NM_016382 ENSG00000122223 CD244 2B4|NAIL|NKR2B4|Nmrk|SLAMF4 CD244 molecule protein-coding 148.5-119 chr2 239301075 239301297 + 1 NA intron (NM_006037, intron 2 of 26) intron (NM_006037, intron 2 of 26) -4276 NR_036229 100423043 NR_036229 ENSG00000265215 MIR4269 - microRNA 4269 ncRNA 193.25-79 chr4 18413853 18414311 + 1 NA Intergenic (TTATCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -392207 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 290.75-52 chr9 35718690 35719090 + 1 NA exon (NM_006289, exon 17 of 57) exon (NM_006289, exon 17 of 57) -8149 NR_106911 102465513 NR_106911 ENSG00000284195 MIR6852 hsa-mir-6852 microRNA 6852 ncRNA 333.25-16 chrX 57130467 57130894 + 1 NA Intergenic Intergenic 6945 NM_019003 54466 Hs.460725 NM_019003 ENSG00000147059 SPIN2A DXF34|SPIN2|TDRD25|dJ323P24.1 spindlin family member 2A protein-coding 218.25-70 chr5 81491627 81491964 + 1 NA intron (NM_001256734, intron 4 of 15) intron (NM_001256734, intron 4 of 15) -97661 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 174.5-195 chr8 129544468 129544680 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 30444 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 202.25-82 chr6 162626887 162627127 + 1 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 -100125 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 117.25-173 chr5 84176845 84176973 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 3 of 9) intron (NM_001278642, intron 3 of 9) 207958 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 245.5-22 chr14 55326479 55326791 + 1 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 54481 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 168.5-37 chr11 77397603 77397781 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 76371 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 237.25-74 chr8 80265244 80265677 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 24071 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 507.25-2 chr10 54096983 54098021 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 16 of 34) L2a|LINE|L2 -388728 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 158.5-31 chr10 88737791 88737959 + 1 NA intron (NM_001080518, intron 6 of 8) intron (NM_001080518, intron 6 of 8) 13331 NM_001080518 643414 Hs.632092 NM_001080518 ENSG00000204021 LIPK LIPL2|bA186O14.2 lipase family member K protein-coding 184.75-100 chr7 108791429 108791677 + 1 NA Intergenic Intergenic 93034 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 215.75-89 chr6 144487093 144487328 + 1 NA intron (NM_007124, intron 27 of 73) AluJo|SINE|Alu 81555 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 131.5-194 chr5 160665884 160666095 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 6 of 24) MIRb|SINE|MIR 19402 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 146.5-131 chr22 22873226 22873417 + 1 NA Intergenic Intergenic -12946 NR_049835 100847006 NR_049835 ENSG00000264824 MIR5571 - microRNA 5571 ncRNA 228.75-20 chr14 68650436 68650799 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) -21830 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 137.75-109 chr2 177353185 177353385 + 1 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) intron (NR_026966, intron 1 of 8) -39403 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 180.5-128 chr6 61826713 61827002 + 1 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 252727 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 113.75-18 chr1 236558134 236558335 + 1 NA intron (NM_018072, intron 36 of 44) intron (NM_018072, intron 36 of 44) -33726 NR_034040 100287902 Hs.677376 NR_034040 ENSG00000223776 LGALS8-AS1 - LGALS8 antisense RNA 1 ncRNA 331.75 chr1 28616836 28617498 + 1 NA intron (NM_005644, intron 3 of 5) HAL1|LINE|L1 24672 NM_001193532 115273 Hs.652321 NM_152304 ENSG00000188060 RAB42 - RAB42, member RAS oncogene family protein-coding 191.75-110 chr6 44990240 44990667 + 1 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) L1MA9|LINE|L1 207317 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 144.25-167 chr6 54949571 54949739 + 1 NA Intergenic Intergenic 102884 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 326.5-25 chr6 75921550 75922029 + 1 NA 3' UTR (NM_001282368, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001282368, exon 16 of 16) 150873 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 116.75-203 chr8 131673326 131673594 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -230633 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 356.25-3 chr11 97174540 97174975 + 1 NA Intergenic Intergenic 666332 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 131.75-3 chr1 53162247 53162500 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -19735 NM_001287596 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 166.5-191 chr7 66839073 66839282 + 1 NA intron (NR_003934, intron 3 of 10) L1MC3|LINE|L1 5649 NR_003934 729156 Hs.709878 NR_003934 ENSG00000230583 GTF2IRD1P1 - GTF2I repeat domain containing 1 pseudogene 1 pseudo 142.5-181 chr5 149676798 149677080 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -53371 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 264.75-9 chr11 112586781 112587105 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -31141 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 212.5-64 chr20 63228986 63229274 + 1 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -6775 NM_022161 79444 Hs.256126 NM_022161 ENSG00000101197 BIRC7 KIAP|LIVIN|ML-IAP|MLIAP|RNF50 baculoviral IAP repeat containing 7 protein-coding 236.5-45 chr2 38868160 38868612 + 1 NA exon (NM_198963, exon 2 of 24) exon (NM_198963, exon 2 of 24) 7548 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 249.5-85 chr6 88458277 88458576 + 1 NA Intergenic Intergenic 80943 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 132.5-182 chr4 104989555 104989787 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -156204 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 127.25-188 chr7 6547757 6547940 + 1 NA intron (NM_001145118, intron 1 of 21) intron (NM_001145118, intron 1 of 21) 3588 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 202.5-137 chr7 80275621 80275918 + 1 NA Intergenic Intergenic 98670 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 119.5-146 chr22 49453796 49454034 + 1 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) intron (NR_110523, intron 1 of 4) 89551 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 166.5-63 chr14 65603766 65603954 + 1 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) L1PB1|LINE|L1 132758 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 163.75-14 chr1 215959532 215959759 + 1 NA intron (NM_206933, intron 37 of 71) intron (NM_206933, intron 37 of 71) -112820 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 168.75-66 chr18 3819340 3819545 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) MER104|DNA|TcMar-Tc2 25916 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 278.5-17 chr14 97786170 97786792 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -23650 NR_146447 100132612 Hs.587781 NR_146447 ENSG00000258869 LINC02312 - long intergenic non-protein coding RNA 2312 ncRNA 156.25-47 chr15 100189661 100189871 + 1 NA intron (NM_139057, intron 8 of 21) intron (NM_139057, intron 8 of 21) 152209 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 162.5-28 chr11 71916577 71916751 + 1 NA intron (NR_029192, intron 5 of 6) intron (NR_029192, intron 5 of 6) 11783 NR_029192 100133315 Hs.150324 NR_029192 LOC100133315 - transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2-like pseudo 217.25-13 chr10 59918140 59918503 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -11765 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 123.75-140 chr4 141462185 141462317 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -129634 NR_121625 100507639 Hs.535010 NR_121625 LINC02432 - long intergenic non-protein coding RNA 2432 ncRNA 132.5-30 chr10 63518428 63518669 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) MER20B|DNA|hAT-Charlie -2853 NM_001001330 221035 Hs.499833 NM_001001330 ENSG00000165476 REEP3 C10orf74|Yip2b receptor accessory protein 3 protein-coding 248.25-20 chr14 62383384 62383787 + 1 NA Intergenic Intergenic -243612 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 183.25-68 chr22 35406716 35406931 + 1 NA intron (NM_006739, intron 5 of 16) intron (NM_006739, intron 5 of 16) 6683 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 195.5-70 chr2 71712802 71713294 + 1 NA Intergenic Intergenic 246349 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 156.75-36 chr11 78212304 78212632 + 1 NA intron (NM_020798, intron 10 of 10) L1PA11|LINE|L1 23549 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 137.25-51 chr16 11361745 11361939 + 1 NA Intergenic Intergenic 16383 NM_152308 116028 Hs.347524 NM_152308 ENSG00000175643 RMI2 BLAP18|C16orf75 RecQ mediated genome instability 2 protein-coding 221.75-33 chr18 60527510 60527893 + 1 NA Intergenic Intergenic -154926 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 232.25-17 chr12 4052927 4053319 + 1 NA Intergenic Intergenic -179675 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 284.5-59 chr7 15718816 15719155 + 1 NA Intergenic Intergenic 30607 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 158.25-37 chr13 40395787 40396062 + 1 NA intron (NR_024506, intron 5 of 5) MER1A|DNA|hAT-Charlie 85082 NR_024505 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 122.75-96 chr2 101864959 101865238 + 1 NA intron (NM_004834, intron 16 of 29) intron (NM_004834, intron 16 of 29) -118367 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 147.25-110 chr5 148488114 148488435 + 1 NA intron (NM_001040173, intron 5 of 6) intron (NM_001040173, intron 5 of 6) 104316 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 319.25-14 chr4 187260742 187261383 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 59076 NR_147159 105377600 Hs.641158 NR_147159 LINC02374 - long intergenic non-protein coding RNA 2374 ncRNA 305.5-44 chr6 142737244 142737624 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -99545 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 156.75 chr1 6584802 6585011 + 1 NA intron (NM_001278648, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 4912 NM_005341 3104 Hs.502330 NM_005341 ENSG00000204859 ZBTB48 HKR3|TZAP|ZNF855|pp9964 zinc finger and BTB domain containing 48 protein-coding 205.25-58 chr2 190675728 190676130 + 1 NA intron (NM_001321315, intron 3 of 5) intron (NM_001321315, intron 3 of 5) 16771 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 202.25-61 chr4 115588093 115588318 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -474585 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 174.5-84 chr17 67009287 67009542 + 1 NA intron (NM_014405, intron 1 of 3) intron (NM_014405, intron 1 of 3) -35140 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 164.5-17 chr10 35456444 35456751 + 1 NA intron (NM_001282853, intron 2 of 10) intron (NM_001282853, intron 2 of 10) 119723 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 193.5-120 chr4 64587647 64587930 + 1 NA Intergenic Intergenic -178328 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 210.5-71 chr20 11870440 11870818 + 1 NA promoter-TSS (NR_110635) promoter-TSS (NR_110635) 86 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 221.75-44 chr3 100751724 100752099 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 34 of 35) L2a|LINE|L2 42369 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 166.5-32 chr10 75721469 75721733 + 1 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 9146 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 211.75-82 chr5 152193313 152193877 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 211684 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 117.5-46 chr11 92222926 92223100 + 1 NA Intergenic Intergenic -2021 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 252.25-5 chr10 70081450 70081921 + 1 NA intron (NM_018649, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 28839 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 158.5-90 chr19 56554240 56554513 + 1 NA exon (NM_020828, exon 8 of 8) exon (NM_020828, exon 8 of 8) -13092 NM_001001668 388566 Hs.204449 NM_001001668 ENSG00000197016 ZNF470 CZF-1 zinc finger protein 470 protein-coding 154.5-192 chr8 123279915 123280166 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -4499 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 205.5-154 chr8 127462917 127463220 + 1 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 19071 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 281.5-38 chr4 108529064 108529559 + 1 NA Intergenic Intergenic -27922 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 271.5-24 chr15 60777806 60778194 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 96431 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 127.5-83 chr14 103485800 103485987 + 1 NA intron (NM_001128920, intron 14 of 15) intron (NM_001128920, intron 14 of 15) 36937 NM_001362531 1152 Hs.173724 NM_001823 ENSG00000166165 CKB B-CK|BCK|CKBB|CPK-B|HEL-211|HEL-S-29 creatine kinase B protein-coding 239.5-31 chr14 100532228 100532612 + 1 NA Intergenic Intergenic 35650 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 144.5-157 chr4 105558471 105558703 + 1 NA intron (NM_001242729, intron 1 of 13) intron (NM_001242729, intron 1 of 13) -3004 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 184.25-104 chr5 129140396 129140735 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 42877 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 228.25-42 chr2 57380690 57381057 + 1 NA Intergenic Intergenic -526778 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 191.75-3 chr1 104196798 104197183 + 1 NA Intergenic Intergenic 123967 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 241.5-67 chr3 100290342 100290758 + 1 NA intron (NM_001199198, intron 4 of 18) intron (NM_001199198, intron 4 of 18) 29558 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 235.75-55 chr4 157393057 157393600 + 1 NA Intergenic Intergenic 172600 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 288.75-11 chr10 124977966 124978374 + 1 NA intron (NM_017580, intron 5 of 8) intron (NM_017580, intron 5 of 8) 27848 NM_001363508 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 156.5-58 chr15 66843480 66843742 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 112904 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 272.25-7 chr11 13494869 13495423 + 1 NA intron (NM_001316352, intron 1 of 2) intron (NM_001316352, intron 1 of 2) 851 NM_000315 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 187.5-127 chr4 73772744 73773016 + 1 NA Intergenic Intergenic 32311 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 171.25-74 chr2 66266684 66266915 + 1 NA Intergenic Intergenic 91529 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 221.25-94 chr8 129158678 129158938 + 1 NA Intergenic Intergenic 82432 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 151.25-49 chr13 106289424 106289728 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -86988 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 153.5-89 chr18 64210310 64210533 + 1 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) 49634 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 154.5-110 chr2 179865588 179865796 + 1 NA Intergenic Intergenic -4080 NR_148054 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 230.75-43 chr21 19036742 19037138 + 1 NA Intergenic Intergenic -277128 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 361.5-6 chr12 111461786 111462182 + 1 NA intron (NM_001310123, intron 18 of 21) intron (NM_001310123, intron 18 of 21) 27122 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 181.5-13 chr10 62518325 62518644 + 1 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) intron (NM_199451, intron 4 of 7) -1964 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 148.25-131 chr6 51736045 51736206 + 1 NA intron (NM_170724, intron 60 of 60) MIRb|SINE|MIR 114255 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 208.5-16 chr10 118607234 118607494 + 1 NA Intergenic Intergenic -11716 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 122.5-4 chr1 63006600 63006831 + 1 NA intron (NR_146606, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 4210 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 131.75-194 chr6 151086528 151086754 + 1 NA intron (NR_146719, intron 27 of 28) AluJb|SINE|Alu -16034 NR_162145 113219461 NR_162145 MIR12131 - microRNA 12131 ncRNA 153.5-52 chr14 21339981 21340276 + 1 NA intron (NM_020366, intron 20 of 23) L2a|LINE|L2 43891 NM_007192 11198 Hs.213724 NM_007192 ENSG00000092201 SUPT16H CDC68|FACTP140|SPT16|SPT16/CDC68 SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit protein-coding 142.5-83 chr16 75880313 75880503 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -153918 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 181.25-82 chr3 49342553 49342752 + 1 NA Intergenic Intergenic -2599 NM_199443 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 128.75-204 chr8 112619739 112619901 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 20 of 66) L2|LINE|L2 -23673 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 225.75-5 chr1 106934860 106935138 + 1 NA Intergenic Intergenic 116760 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 213.75-33 chr14 50933853 50934232 + 1 NA intron (NM_002863, intron 3 of 19) L1ME3G|LINE|L1 10441 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 135.5-146 chr4 39030557 39030771 + 1 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) intron (NM_001303228, intron 1 of 6) 1745 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 178.25-21 chr12 6401227 6401424 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 17163 NM_002342 4055 Hs.1116 NM_002342 ENSG00000111321 LTBR D12S370|LT-BETA-R|TNF-R-III|TNFCR|TNFR-RP|TNFR2-RP|TNFR3|TNFRSF3 lymphotoxin beta receptor protein-coding 170.75-49 chr16 84781065 84781255 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -38825 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 172.75-90 chr3 192279100 192279441 + 1 NA intron (NR_046596, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR 40640 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 202.75-84 chr4 59493326 59493621 + 1 NA Intergenic Intergenic 479900 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 312.5-35 chr8 99822820 99823556 + 1 NA intron (NM_017890, intron 50 of 61) MIR|SINE|MIR 70519 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 202.5-94 chr3 82542860 82543187 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 556881 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 282.5 chr1 8599324 8599667 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 4 of 22) intron (NM_001042681, intron 4 of 22) -104582 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 121.25-60 chr14 81173768 81174036 + 1 NA Intergenic Intergenic 28932 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 203.25-56 chr2 142175940 142176291 + 1 NA Intergenic Intergenic -44414 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 132.75-151 chr5 53368046 53368319 + 1 NA Intergenic Intergenic -112447 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 145.75-73 chr2 39302127 39302334 + 1 NA intron (NM_001270425, intron 14 of 32) intron (NM_001270425, intron 14 of 32) -58247 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 139.5-154 chr4 71911811 71912070 + 1 NA Intergenic Intergenic -106420 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 199.5-106 chr3 136417275 136417609 + 1 NA intron (NM_005862, intron 21 of 33) intron (NM_005862, intron 21 of 33) 167102 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 189.25-122 chr8 92702039 92702248 + 1 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu -46649 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 202.5-73 chr2 76491202 76491681 + 1 NA Intergenic Intergenic -494524 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 243.5-88 chr8 135757402 135757973 + 1 NA Intergenic Intergenic 300231 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 150.5-129 chr3 54844740 54845065 + 1 NA intron (NM_018398, intron 16 of 37) intron (NM_018398, intron 16 of 37) 56353 NR_046666 100874237 Hs.570583 NR_046666 ENSG00000243715 CACNA2D3-AS1 - CACNA2D3 antisense RNA 1 ncRNA 296.75-20 chr2 128806192 128806634 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -58187 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 176.75-101 chr5 109526553 109526832 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -116718 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 141.5-164 chr4 186060887 186061161 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -8131 NM_003265 7098 Hs.657724 NM_003265 ENSG00000164342 TLR3 CD283|IIAE2 toll like receptor 3 protein-coding 274.25-51 chr9 36829241 36829573 + 1 NA Intergenic L1M|LINE|L1 -5808 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 181.75-78 chr3 65354043 65354303 + 1 NA 3' UTR (NM_001365903, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001365903, exon 25 of 25) -539643 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-43 chr12 12822135 12822494 + 1 NA intron (NM_201224, intron 5 of 10) intron (NM_201224, intron 5 of 10) 8968 NM_201224 51202 Hs.719938 NM_016355 ENSG00000213782 DDX47 E4-DBP|HQ0256|MSTP162|RRP3 DEAD-box helicase 47 protein-coding 208.25-46 chr2 157184836 157185208 + 1 NA Intergenic Intergenic -72683 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 373.5 chr10 6386426 6386803 + 1 NA Intergenic Intergenic 36298 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 183.25-50 chr18 74284189 74284621 + 1 NA intron (NM_001190807, intron 1 of 3) intron (NM_001190807, intron 1 of 3) 7558 NM_001914 1528 Hs.465413 NM_001914 ENSG00000166347 CYB5A CYB5|MCB5|METAG cytochrome b5 type A protein-coding 395.5-19 chr7 50454754 50455324 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4633 NM_001287495 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 133.25-31 chr11 72785597 72785811 + 1 NA intron (NM_006645, intron 1 of 6) intron (NM_006645, intron 1 of 6) 2174 NR_039841 100616410 NR_039841 ENSG00000265064 MIR4692 - microRNA 4692 ncRNA 200.25-56 chr2 23873744 23874124 + 1 NA intron (NR_125717, intron 8 of 28) AluSz|SINE|Alu 53189 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 190.75-113 chr8 124427934 124428381 + 1 NA Intergenic Intergenic -22663 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 172.75-111 chr6 146169347 146169546 + 1 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 140248 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 260.5-59 chr7 26507269 26507697 + 1 NA intron (NR_148500, intron 5 of 5) intron (NR_148500, intron 5 of 5) 31342 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 304.25-12 chr18 2667462 2667817 + 1 NA intron (NM_015295, intron 3 of 47) intron (NM_015295, intron 3 of 47) 11752 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 141.5-79 chr18 11535611 11535845 + 1 NA Intergenic Intergenic 45680 NR_110778 101927433 Hs.331210 NR_110778 ENSG00000267252 LINC01255 - long intergenic non-protein coding RNA 1255 ncRNA 197.5-19 chr11 25107520 25107751 + 1 NA Intergenic Intergenic 610582 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 135.5-156 chr5 14494835 14495005 + 1 NA intron (NM_007118, intron 49 of 56) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 30937 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 160.5-7 chr1 211409479 211409700 + 1 NA intron (NR_026761, intron 4 of 5) L1MB7|LINE|L1 26834 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 251.5-32 chr18 76710149 76710486 + 1 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 20288 NR_122073 400661 Hs.514963 NR_122073 ENSG00000276397 LINC01879 - long intergenic non-protein coding RNA 1879 ncRNA 240.5-93 chr6 153540298 153540827 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -409280 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 175.5-35 chr12 3370427 3370618 + 1 NA intron (NR_146865, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 2414 NR_146865 101930162 Hs.351489 NR_146865 LINC02417 - long intergenic non-protein coding RNA 2417 ncRNA 215.75-69 chr4 78904165 78904599 + 1 NA intron (NM_198892, intron 15 of 15) intron (NM_198892, intron 15 of 15) 35056 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 196.75-22 chr11 4473853 4474251 + 1 NA Intergenic Intergenic -14827 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 118.5-104 chr2 122632021 122632233 + 1 NA Intergenic Intergenic 441354 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 196.5-20 chr10 55881555 55881767 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -253719 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 312.5-20 chr22 27141329 27141898 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -45903 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 156.25-29 chr11 85070654 85070858 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -147335 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 176.5-132 chr4 41414222 41414544 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 53576 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 144.25-26 chr10 57047121 57047338 + 1 NA Intergenic Intergenic 257330 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 254.25-9 chr10 60803331 60803807 + 1 NA Intergenic Intergenic 25091 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 175.5-168 chr8 124496935 124497221 + 1 NA intron (NM_001146160, intron 7 of 9) L1MC5|LINE|L1 11498 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 119.75-127 chr21 20034960 20035097 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -135273 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 318.75-14 chr4 10707554 10708061 + 1 NA Intergenic (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23039 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 164.5-154 chr5 13557945 13558389 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 386313 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 158.25-74 chr20 9024182 9024414 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44756 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 184.5-110 chr4 73651310 73651545 + 1 NA Intergenic Intergenic -30796 NM_201431 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 146.25-51 chr17 29734344 29734494 + 1 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) intron (NM_033389, intron 2 of 14) 27013 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 127.5-241 chr8 103037114 103037322 + 1 NA intron (NM_001695, intron 1 of 12) intron (NM_001695, intron 1 of 12) 16135 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 294.5-9 chr11 96235534 96235912 + 1 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -105715 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 163.5-40 chr12 38882914 38883124 + 1 NA intron (NM_153634, intron 1 of 19) intron (NM_153634, intron 1 of 19) 22572 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 235.75-47 chr3 150052575 150052869 + 1 NA Intergenic Intergenic -43721 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 205.75-12 chr11 79762870 79763214 + 1 NA Intergenic Intergenic -322012 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 155.5-222 chr9 116530875 116531196 + 1 NA intron (NR_033973, intron 1 of 11) intron (NR_033973, intron 1 of 11) 26752 NR_033973 100128505 Hs.675821 NR_033973 ENSG00000229105 ASTN2-AS1 - ASTN2 antisense RNA 1 ncRNA 252.25-29 chr2 25667041 25667341 + 1 NA intron (NM_033147, intron 1 of 19) L1MEi|LINE|L1 6386 NM_001351389 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 176.25-30 chr12 44393441 44393705 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 482088 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 263.5-30 chr2 49751606 49752347 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 222227 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 175.5-30 chr11 30480816 30481061 + 1 NA intron (NM_001584, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 99555 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 224.5-72 chr3 30160587 30160905 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -226590 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-95 chr2 123096181 123096494 + 1 NA Intergenic Intergenic -22856 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 136.5-154 chr3 153783933 153784101 + 1 NA Intergenic Intergenic -21491 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 184.25-39 chr14 83391416 83391813 + 1 NA Intergenic Intergenic 748982 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 127.25-122 chr3 65338103 65338448 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -555541 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-33 chr11 24775334 24775693 + 1 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 278460 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 141.25-17 chr10 21417936 21418150 + 1 NA Intergenic Intergenic -45093 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 181.75-81 chr3 98894375 98894583 + 1 NA intron (NM_080927, intron 1 of 15) intron (NM_080927, intron 1 of 15) 7216 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 166.25-35 chr11 107968362 107968665 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 40065 NM_017516 54734 Hs.354906 NM_017516 ENSG00000179331 RAB39A RAB39 RAB39A, member RAS oncogene family protein-coding 143.5-121 chr2 149874731 149875139 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15744 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 156.25-43 chr14 73944432 73944687 + 1 NA exon (NM_152445, exon 3 of 9) exon (NM_152445, exon 3 of 9) -5375 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 222.5-117 chr9 4618079 4618386 + 1 NA intron (NM_001353491, intron 11 of 14) intron (NM_001353491, intron 11 of 14) 43991 NM_001353490 55064 Hs.179615 NM_017985 ENSG00000106686 SPATA6L C9orf68|bA6J24.2 spermatogenesis associated 6 like protein-coding 196.5-33 chr11 82311825 82312102 + 1 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 91950 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 203.5-100 chr4 18149427 18149716 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -127696 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 115.5 chr1 8040929 8041153 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -14732 NM_018948 54206 Hs.605445 NM_018948 ENSG00000116285 ERRFI1 GENE-33|MIG-6|MIG6|RALT ERBB receptor feedback inhibitor 1 protein-coding 284.5-21 chr16 48087967 48088402 + 1 NA intron (NM_033226, intron 24 of 28) intron (NM_033226, intron 24 of 28) 58586 NM_033226 94160 Hs.410111 NM_033226 ENSG00000140798 ABCC12 MRP9 ATP binding cassette subfamily C member 12 protein-coding 282.5-15 chr13 59091795 59092152 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -858856 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 147.5-185 chr6 48949648 48949897 + 1 NA Intergenic Intergenic 513481 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 129.75-33 chr11 10438889 10439058 + 1 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? -11348 NM_001172431 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 117.75-27 chr10 61535599 61535939 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 55728 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 122.5-45 chr12 22310190 22310379 + 1 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) intron (NM_003034, intron 1 of 4) 24430 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 320.75-5 chr11 40379710 40380108 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie -86779 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 281.25-25 chr2 121462344 121462865 + 1 NA exon (NM_001142274, exon 10 of 38) exon (NM_001142274, exon 10 of 38) -68276 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 168.5-96 chr2 196515680 196515933 + 1 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 77177 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 188.5-164 chr9 1345766 1346048 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 294420 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 207.5-65 chr3 33431001 33431263 + 1 NA intron (NM_001128160, intron 1 of 14) L1MEg|LINE|L1 9246 NM_001128160 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 195.5-81 chr2 174327249 174327569 + 1 NA non-coding (NR_038897, exon 1 of 3) non-coding (NR_038897, exon 1 of 3) 1382 NR_038897 285084 Hs.275398 NR_038897 ENSG00000231453 LINC01305 - long intergenic non-protein coding RNA 1305 ncRNA 159.5-55 chr14 61333773 61334081 + 1 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 12484 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 172.5-109 chr20 5760378 5760764 + 1 NA intron (NM_152504, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 10170 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 278.75-39 chr8 130167817 130168202 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 10 of 29) intron (NM_001362925, intron 10 of 29) -83241 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 273.5-34 chr2 175666794 175667114 + 1 NA Intergenic Intergenic 335313 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 255.5-8 chr1 171040105 171040370 + 1 NA intron (NM_001163629, intron 20 of 21) L1MA9|LINE|L1 -50668 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 170.5-77 chr18 64611572 64611868 + 1 NA Intergenic Intergenic -351665 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 144.25-181 chr7 19469593 19469758 + 1 NA Intergenic Intergenic 235761 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 213.75-19 chr11 15764684 15765012 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 120963 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 240.75-13 chr10 114015823 114016215 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -27847 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 222.75-16 chr10 34436747 34437315 + 1 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) L1ME4b|LINE|L1 378265 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 190.25-115 chr7 11758575 11758777 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L1MEd|LINE|L1 73522 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 144.25-42 chr11 63840696 63840902 + 1 NA intron (NM_001163296, intron 1 of 16) intron (NM_001163296, intron 1 of 16) 1689 NM_004954 2011 Hs.567261 NM_004954 ENSG00000072518 MARK2 EMK-1|EMK1|PAR-1|Par-1b|Par1b microtubule affinity regulating kinase 2 protein-coding 173.5-135 chr5 168317944 168318178 + 1 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) intron (NM_001161661, intron 1 of 22) 26416 NM_015238 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 126.75-150 chr3 61307786 61307968 + 1 NA Intergenic Intergenic -56416 NR_148921 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 263.5-37 chr22 24209184 24209472 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 27841 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 162.25-49 chr14 51204947 51205144 + 1 NA Intergenic Intergenic -35202 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 281.75-38 chr6 102590365 102590783 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 1191589 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 240.5-14 chr10 115333135 115333573 + 1 NA intron (NM_207303, intron 18 of 28) intron (NM_207303, intron 18 of 28) 239989 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 133.5-22 chr1 233312786 233312974 + 1 NA Intergenic Intergenic -14844 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 269.75-12 chr10 83958386 83958744 + 1 NA Intergenic Intergenic -180944 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 118.25-123 chr22 36374893 36375143 + 1 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) intron (NM_002473, intron 1 of 40) 13049 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 234.5-64 chr3 122031989 122032349 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -9922 NM_001199799 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 126.5-41 chr11 92738500 92738761 + 1 NA intron (NM_001008781, intron 3 of 24) intron (NM_001008781, intron 3 of 24) 176998 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 174.25-138 chr8 17272519 17272921 + 1 NA intron (NM_001363167, intron 4 of 11) intron (NM_001363167, intron 4 of 11) 25762 NM_001363173 137492 Hs.343873 NM_152415 ENSG00000155975 VPS37A HCRP1|PQBP2|SPG53 VPS37A subunit of ESCRT-I protein-coding 182.5-3 chr1 100549623 100549914 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 11629 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 118.5-68 chr16 79159130 79159386 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 441479 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 159.5-133 chr22 44827484 44827767 + 1 NA intron (NM_181335, intron 7 of 11) AluSx1|SINE|Alu 75067 NM_181335 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 156.25-37 chr13 52680398 52680791 + 1 NA intron (NM_001130912, intron 13 of 13) intron (NM_001130912, intron 13 of 13) 27758 NM_006704 10910 Hs.281902 NM_006704 ENSG00000165416 SUGT1 SGT1 SGT1 homolog, MIS12 kinetochore complex assembly cochaperone protein-coding 124.75-132 chr20 63582185 63582343 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -8025 NM_001037335 85441 Hs.517180 NM_033405 ENSG00000130589 HELZ2 PDIP-1|PRIC285 helicase with zinc finger 2 protein-coding 147.5-202 chr7 94918604 94918786 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) L1MB7|LINE|L1 8797 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 116.5-117 chr2 61356772 61356933 + 1 NA intron (NM_014709, intron 10 of 79) intron (NM_014709, intron 10 of 79) 60525 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 155.75-6 chr1 52015956 52016206 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 17729 NM_138417 112970 Hs.476033 NM_138417 ENSG00000198841 KTI12 SBBI81|TOT4 KTI12 chromatin associated homolog protein-coding 179.25-126 chr6 40507891 40508177 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 79330 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 288.5-17 chr16 83064254 83064777 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) MER33|DNA|hAT-Charlie -74217 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 230.5-115 chr8 118987891 118988176 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L1MCa|LINE|L1 35770 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 163.75-121 chr7 76350030 76350310 + 1 NA intron (NM_012479, intron 1 of 1) intron (NM_012479, intron 1 of 1) 8821 NM_012479 7532 Hs.744840 NM_012479 ENSG00000170027 YWHAG 14-3-3GAMMA|EIEE56|PPP1R170 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein gamma protein-coding 118.75-54 chr13 78651298 78651416 + 1 NA intron (NM_024546, intron 1 of 5) intron (NM_024546, intron 1 of 5) 7798 NM_024546 79596 Hs.567576 NM_024546 ENSG00000152193 OBI1 C13orf7|RNF219 ORC ubiquitin ligase 1 protein-coding 183.5-24 chr10 89192358 89192548 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 14864 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 138.75-131 chr4 126509929 126510118 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 1002764 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 241.25-53 chr4 149502654 149503112 + 1 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) intron (NM_001363507, intron 12 of 13) 312960 NM_001363507 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 117.75-33 chr11 69229955 69230164 + 1 NA Intergenic Intergenic -58497 NR_104161 338694 Hs.564235 NR_104161 ENSG00000261070 LOC338694 - uncharacterized LOC338694 ncRNA 164.75-33 chr11 110262576 110263016 + 1 NA intron (NM_001260494, intron 3 of 11) MIRc|SINE|MIR 33916 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 162.75-105 chr4 73618783 73619058 + 1 NA intron (NM_001270392, intron 1 of 9) intron (NM_001270392, intron 1 of 9) 1516 NM_177532 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 113.5-162 chr3 124360651 124360805 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 10 of 59) intron (NM_001024660, intron 10 of 59) -13604 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 203.75-65 chr2 209871464 209871886 + 1 NA intron (NM_032504, intron 22 of 63) intron (NM_032504, intron 22 of 63) 99682 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 127.75-196 chr8 29223543 29223718 + 1 NA intron (NM_015254, intron 2 of 39) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 39440 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 197.5-123 chr5 67882451 67882746 + 1 NA Intergenic Intergenic 89385 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 231.5-8 chr10 23075128 23075546 + 1 NA Intergenic Intergenic -20242 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 167.25-55 chr16 4162624 4162939 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -46339 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 164.75-97 chr3 46322119 46322447 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -31461 NM_001123041 729230 Hs.511794 NM_001123041 ENSG00000121807 CCR2 CC-CKR-2|CCR-2|CCR2A|CCR2B|CD192|CKR2|CKR2A|CKR2B|CMKBR2|MCP-1-R C-C motif chemokine receptor 2 protein-coding 139.5-125 chr22 28181662 28181927 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -261182 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 193.25-10 chr10 39216997 39217309 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 520557 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 157.75-3 chr1 169097985 169098207 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -6028 NR_135799 101928596 Hs.308463 NR_135799 ENSG00000237707 LOC101928596 - uncharacterized LOC101928596 ncRNA 160.25-62 chr18 37378787 37379005 + 1 NA intron (NM_001353724, intron 2 of 12) intron (NM_001353724, intron 2 of 12) 87608 NR_132967 106635546 NR_132967 SNORA111 - small nucleolar RNA, H/ACA box 111 snoRNA 205.75-72 chr6 48521266 48521570 + 1 NA Intergenic LTR108a_Mam|LTR|ERVL -452729 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 272.5-34 chr2 63698520 63698911 + 1 NA Intergenic Intergenic 109564 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 155.5-198 chr7 79747186 79747403 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 293334 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 268.5-4 chr1 87348762 87349083 + 1 NA TTS (NM_001369491) TTS (NM_001369491) 17178 NM_001369491 8543 Hs.436792 NM_006769 ENSG00000143013 LMO4 - LIM domain only 4 protein-coding 187.5-89 chr2 69450243 69450549 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -12768 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 183.75-76 chr3 72123635 72124060 + 1 NA Intergenic Intergenic -23392 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 118.25-182 chr7 47844676 47844826 + 1 NA intron (NM_138295, intron 33 of 56) intron (NM_138295, intron 33 of 56) 49460 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 206.5-20 chr13 23871597 23872001 + 1 NA intron (NM_005932, intron 5 of 18) intron (NM_005932, intron 5 of 18) -17069 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 141.75-171 chr8 120968441 120968617 + 1 NA Intergenic Intergenic -156483 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 126.25-105 chr22 25840771 25840993 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 17 of 43) intron (NM_001318245, intron 17 of 43) 98694 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 168.75-136 chr7 81059715 81060164 + 1 NA Intergenic Intergenic -137550 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 264.25-21 chr18 34654094 34654427 + 1 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) intron (NM_001198939, intron 1 of 21) -56038 NM_032978 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 186.25-21 chr12 12278226 12278551 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11344 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 157.75-42 chr14 26488644 26488884 + 1 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 64666 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 146.5-133 chr22 35097475 35097634 + 1 NA Intergenic Intergenic 31396 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 138.5-24 chr10 32806788 32806985 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 31 of 43) L1M4b|LINE|L1 94586 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 133.25-96 chr2 78470189 78470332 + 1 NA Intergenic Intergenic -75271 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 221.75-39 chr2 135985713 135986033 + 1 NA promoter-TSS (NM_001349) promoter-TSS (NM_001349) -189 NM_001293312 1615 Hs.503787 NM_001349 ENSG00000115866 DARS HBSL|aspRS aspartyl-tRNA synthetase protein-coding 156.75-46 chr12 119740348 119740713 + 1 NA intron (NM_007174, intron 23 of 46) intron (NM_007174, intron 23 of 46) -26806 NR_031589 100302274 NR_031589 ENSG00000283768 MIR1178 MIRN1178|hsa-mir-1178 microRNA 1178 ncRNA 142.5-154 chr4 89385896 89386055 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -78175 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 203.25-19 chr11 20427040 20427357 + 1 NA intron (NM_005788, intron 10 of 15) intron (NM_005788, intron 10 of 15) 39482 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 238.5-16 chr11 36931676 36931990 + 1 NA Intergenic Intergenic -333554 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 172.5-95 chr2 59371272 59371607 + 1 NA Intergenic Intergenic 153731 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 134.5-104 chr2 132782003 132782203 + 1 NA exon (NM_207363, exon 14 of 20) exon (NM_207363, exon 14 of 20) -110577 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 157.5-137 chr3 113663152 113663514 + 1 NA intron (NM_001009899, intron 6 of 6) intron (NM_001009899, intron 6 of 6) 33309 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 143.75-192 chr8 120873643 120873824 + 1 NA Intergenic Intergenic -61687 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 340.75-28 chr9 68472808 68473227 + 1 NA intron (NM_021965, intron 7 of 10) intron (NM_021965, intron 7 of 10) 67850 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 125.25-42 chr12 2259821 2260010 + 1 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 AluJr|SINE|Alu -9861 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 206.5-84 chr4 106051595 106051937 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 26 of 26) intron (NM_001290768, intron 26 of 26) -29288 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 129.5-105 chr2 4171960 4172227 + 1 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 197932 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 130.75-44 chr12 117413159 117413441 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -51498 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 180.75-121 chr5 124821918 124822244 + 1 NA Intergenic Intergenic -76969 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 153.25-118 chr6 146714843 146715070 + 1 NA intron (NM_024694, intron 13 of 35) intron (NM_024694, intron 13 of 35) 88868 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 139.5-142 chr3 184796371 184796688 + 1 NA Intergenic Intergenic -15614 NM_001349292 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 203.25-11 chr1 242580176 242580630 + 1 NA Intergenic Intergenic -55706 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 143.5-143 chr3 75072985 75073217 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -141375 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 227.5-13 chr10 48722589 48722826 + 1 NA intron (NM_020945, intron 4 of 61) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 37244 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 239.5-30 chr14 72931285 72931597 + 1 NA intron (NM_181340, intron 1 of 12) L1M4|LINE|L1 4977 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 309.5-33 chr4 58018896 58019303 + 1 NA Intergenic Intergenic 517229 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 124.25-120 chr21 18952160 18952336 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -192436 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 132.75-137 chr4 77013171 77013540 + 1 NA intron (NM_001306147, intron 6 of 11) intron (NM_001306147, intron 6 of 11) 61555 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 152.75-107 chr3 95689926 95690391 + 1 NA Intergenic Intergenic -6965 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 220.5-104 chr5 128581267 128581517 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -43147 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 136.75-70 chr16 77862992 77863201 + 1 NA intron (NM_020927, intron 4 of 8) intron (NM_020927, intron 4 of 8) 74532 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 197.75-57 chr3 193351482 193351704 + 1 NA intron (NM_198505, intron 6 of 29) intron (NM_198505, intron 6 of 29) 27160 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 205.5-138 chr7 67534872 67535127 + 1 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 199023 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 201.5-90 chr3 129189064 129189342 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5307 NM_001127192 7555 Hs.518249 NM_003418 ENSG00000169714 CNBP CNBP1|DM2|PROMM|RNF163|ZCCHC22|ZNF9 CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein protein-coding 195.5-41 chr14 72069723 72069942 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) AluJb|SINE|Alu 136305 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 208.5-146 chr8 135046559 135046955 + 1 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -187374 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 147.5-10 chr1 85151184 85151436 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 17516 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 137.75-213 chr8 130692307 130692631 + 1 NA Intergenic L1P4d|LINE|L1 -248795 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 144.75-185 chr8 120947244 120947461 + 1 NA Intergenic Intergenic -135306 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 244.25-10 chr12 9264425 9264851 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19019 NR_024374 642846 Hs.447869 NR_024374 LOC642846 - DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11-like ncRNA 119.5-48 chr11 86923685 86923939 + 1 NA intron (NR_120592, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 31583 NM_012193 8322 Hs.591968 NM_012193 ENSG00000174804 FZD4 CD344|EVR1|FEVR|FZD4S|Fz-4|Fz4|FzE4|GPCR|hFz4 frizzled class receptor 4 protein-coding 215.5-53 chr2 104867520 104867896 + 1 NA non-coding (NR_110373, exon 2 of 2) non-coding (NR_110373, exon 2 of 2) 4887 NR_110373 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 216.25-50 chr19 29981975 29982212 + 1 NA intron (NM_001252641, intron 2 of 10) intron (NM_001252641, intron 2 of 10) 39854 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 144.25-37 chr11 10253231 10253395 + 1 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) intron (NM_030962, intron 1 of 39) 40894 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 113.5-100 chr17 48630000 48630193 + 1 NA Intergenic Intergenic 2463 NR_029582 406972 NR_029582 ENSG00000210741 MIR196A1 MIRN196-1|MIRN196A1|mir-196a-1 microRNA 196a-1 ncRNA 164.5-43 chr12 95000566 95000827 + 1 NA intron (NM_018838, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 3001 NM_018838 55967 Hs.506374 NM_018838 ENSG00000184752 NDUFA12 B17.2|DAP13|MC1DN23 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 protein-coding 167.5-101 chr20 31290865 31291109 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 17598 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 115.25-141 chr4 33063553 33063745 + 1 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 712611 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 155.5-169 chr5 93922702 93923000 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -181251 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 278.5-25 chr18 80019540 80020043 + 1 NA intron (NM_001305564, intron 1 of 2) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 14145 NM_001305563 10907 Hs.465498 NM_006701 ENSG00000141759 TXNL4A BMKS|DIB1|DIM1|SNRNP15|TXNL4|U5-15kD thioredoxin like 4A protein-coding 195.75-75 chr3 76005514 76005747 + 1 NA Intergenic Intergenic -220081 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 159.75-137 chr5 90737360 90737593 + 1 NA intron (NR_003149, intron 50 of 89) L1MA7|LINE|L1 178679 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 223.25-47 chr21 22096244 22096603 + 1 NA intron (NR_109959, intron 2 of 5) intron (NR_109959, intron 2 of 5) 2036 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 268.25-36 chr4 88839475 88839805 + 1 NA intron (NM_014883, intron 7 of 23) FLAM_C|SINE|Alu -16279 NM_001015045 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 314.75-4 chr11 111518667 111519137 + 1 NA intron (NM_001100388, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 4117 NM_001100388 399949 Hs.411600 NM_207430 ENSG00000183644 C11orf88 - chromosome 11 open reading frame 88 protein-coding 145.5-107 chr2 176803388 176803744 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 165812 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 216.25-91 chr6 37784120 37784524 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35405 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 212.75-41 chr17 57855460 57855709 + 1 NA Intergenic Intergenic -5540 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 191.5-127 chr6 49808253 49808579 + 1 NA Intergenic THE1-int|LTR|ERVL-MaLR -3124 NR_125839 101927020 Hs.571168 NR_125839 LOC101927020 - uncharacterized LOC101927020 ncRNA 281.5-29 chr2 161775275 161775851 + 1 NA intron (NM_001354453, intron 2 of 24) intron (NM_001354453, intron 2 of 24) 151147 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 116.5-170 chr3 196497093 196497297 + 1 NA intron (NM_152617, intron 1 of 5) L1ME2z|LINE|L1 6573 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 249.75-2 chr1 31392330 31392625 + 1 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -17300 NM_001199038 347735 Hs.270655 NM_018565 ENSG00000168528 SERINC2 FKSG84|PRO0899|TDE2|TDE2L serine incorporator 2 protein-coding 123.25-60 chr14 75952815 75953104 + 1 NA intron (NM_015072, intron 31 of 31) L1MB8|LINE|L1 29036 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 223.75 chr1 42744359 42744694 + 1 NA Intergenic Intergenic -4272 NM_001185117 149461 Hs.496270 NM_148960 ENSG00000164007 CLDN19 HOMG5 claudin 19 protein-coding 134.75-77 chr15 68264134 68264273 + 1 NA Intergenic Intergenic -13542 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 141.75-152 chr6 40958477 40958695 + 1 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 64694 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 248.5-25 chr14 57308557 57309013 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 39814 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 253.75-26 chr2 183800987 183801553 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -577705 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 198.5-143 chr8 86218112 86218406 + 1 NA intron (NM_138817, intron 2 of 3) intron (NM_138817, intron 2 of 3) 12122 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 136.75-108 chr2 198065229 198065480 + 1 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 260761 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 133.5-238 chr6 146259557 146259856 + 1 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) L1MB1|LINE|L1 230508 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 188.75-66 chr2 212374692 212375050 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 51489 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 158.5-15 chr10 9339752 9339951 + 1 NA Intergenic Intergenic -44258 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 145.5-115 chr20 25358365 25358626 + 1 NA intron (NM_001042472, intron 1 of 12) intron (NM_001042472, intron 1 of 12) 32340 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 183.25-101 chr7 27606638 27607037 + 1 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -9137 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 149.75-69 chr18 13284215 13284390 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 6197 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 132.25-125 chr3 26706394 26706530 + 1 NA intron (NM_001317811, intron 2 of 2) intron (NM_001317811, intron 2 of 2) 11905 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 113.5-188 chr4 150037127 150037254 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -41255 NR_036614 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 163.25-134 chr8 22539371 22539573 + 1 NA exon (NM_001243974, exon 14 of 15) exon (NM_001243974, exon 14 of 15) -12455 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 183.25-62 chr2 208438280 208438666 + 1 NA intron (NM_005048, intron 4 of 12) MIR3|SINE|MIR 31643 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 199.25-60 chr2 132436411 132436777 + 1 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 2883 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 195.75-81 chr3 159544611 159544864 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1ME3|LINE|L1 223875 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 250.75-34 chr3 40637628 40638360 + 1 NA Intergenic Intergenic 113034 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 303.5-7 chr12 4906020 4906526 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3632 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 117.5-67 chr15 50817963 50818131 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -52341 NM_032802 84888 Hs.401537 NM_032802 ENSG00000138600 SPPL2A IMP3|PSL2 signal peptide peptidase like 2A protein-coding 151.5-57 chr15 60006142 60006370 + 1 NA 3' UTR (NM_012182, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_012182, exon 2 of 2) 1945 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 154.5-199 chr8 142758919 142759341 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -6598 NM_205545 137797 Hs.441280 NM_205545 ENSG00000197353 LYPD2 LYPDC2|UNQ430 LY6/PLAUR domain containing 2 protein-coding 114.25-183 chr7 90551433 90551736 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -44737 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 305.25-45 chr8 66336513 66337058 + 1 NA Intergenic Intergenic 92192 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 185.5-91 chr20 45787512 45787831 + 1 NA intron (NM_080614, intron 4 of 6) intron (NM_080614, intron 4 of 6) 4212 NM_080614 140686 Hs.419126 NM_080614 ENSG00000124116 WFDC3 WAP14|dJ447F3.3 WAP four-disulfide core domain 3 protein-coding 534.75-3 chr2 113679252 113680117 + 1 NA Intergenic Intergenic 41684 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 230.75-18 chr13 78585488 78585762 + 1 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -10497 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 233.25-51 chr4 21404911 21405270 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) MER31A|LTR|ERV1 59668 NR_107018 102465859 NR_107018 ENSG00000283281 MIR7978 hsa-mir-7978 microRNA 7978 ncRNA 282.25-25 chr3 100629542 100630054 + 1 NA intron (NM_032787, intron 2 of 15) intron (NM_032787, intron 2 of 15) -5740 NM_001308362 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 177.75-128 chr7 29867769 29868035 + 1 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) intron (NM_001080529, intron 2 of 8) 61348 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 213.5-67 chr2 226994279 226994586 + 1 NA intron (NM_001349069, intron 8 of 8) intron (NM_001349069, intron 8 of 8) 158378 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 167.5-100 chr2 213548805 213549031 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -209149 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 192.25-66 chr20 36752664 36752942 + 1 NA exon (NM_001145318, exon 10 of 10) exon (NM_001145318, exon 10 of 10) -6713 NM_032013 57446 Hs.437338 NM_022477 ENSG00000101079 NDRG3 - NDRG family member 3 protein-coding 173.25-70 chr3 18290949 18291224 + 1 NA Intergenic Intergenic 134253 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 126.5-265 chr9 74465821 74465951 + 1 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -31449 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 114.5-74 chr12 123489986 123490130 + 1 NA intron (NM_178314, intron 4 of 6) intron (NM_178314, intron 4 of 6) 30168 NM_001319244 353116 Hs.530315 NM_178314 ENSG00000188026 RILPL1 GOSPEL|RLP1 Rab interacting lysosomal protein like 1 protein-coding 122.5-198 chr6 74229484 74229700 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 160141 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 189.75-45 chr16 13586645 13587004 + 1 NA Intergenic Intergenic -333333 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 162.5-25 chr11 17902189 17902462 + 1 NA intron (NR_104041, intron 8 of 9) intron (NR_104041, intron 8 of 9) 110722 NM_012139 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 434.25-4 chr15 47632718 47633252 + 1 NA intron (NM_001198999, intron 4 of 19) L1MD2|LINE|L1 -84520 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 151.5-75 chr2 30320773 30321005 + 1 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 -25757 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 125.75-63 chr16 9244891 9245187 + 1 NA Intergenic Intergenic -110549 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 203.5-48 chr16 19159133 19159479 + 1 NA Intergenic Intergenic -8528 NM_001330509 51760 Hs.258326 NM_016524 ENSG00000103528 SYT17 sytXVII synaptotagmin 17 protein-coding 132.5-52 chr12 40108783 40109110 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -2865 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 150.5-237 chrX 118552196 118552417 + 1 NA intron (NM_144658, intron 6 of 52) intron (NM_144658, intron 6 of 52) 56397 NM_144658 139818 Hs.368203 NM_144658 ENSG00000147251 DOCK11 ACG|ZIZ2|bB128O4.1 dedicator of cytokinesis 11 protein-coding 171.5-45 chr14 65532513 65532720 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1PREC2|LINE|L1 61514 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 149.5-88 chr2 4717494 4717759 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -61404 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 116.5-208 chr5 174330344 174330521 + 1 NA Intergenic Intergenic -5922 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 169.5-30 chr12 1771623 1772002 + 1 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -48455 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 125.75-24 chr10 62435801 62436041 + 1 NA intron (NM_199451, intron 3 of 7) intron (NM_199451, intron 3 of 7) -60794 NR_104162 283045 NR_104162 LOC283045 - uncharacterized LOC283045 ncRNA 297.5-26 chr2 82303064 82303549 + 1 NA Intergenic Intergenic -553497 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 177.5-154 chr6 63220306 63220623 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 99513 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 153.25-85 chr3 2959952 2960262 + 1 NA intron (NM_175607, intron 13 of 24) intron (NM_175607, intron 13 of 24) 67892 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 180.25-131 chrX 153040839 153041038 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -15532 NM_013364 29944 Hs.449627 NM_013364 ENSG00000183837 PNMA3 MA3|MA5 PNMA family member 3 protein-coding 226.25-18 chr11 82366771 82367054 + 1 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) intron (NR_120571, intron 1 of 7) 37001 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 341.25-9 chr12 17972797 17973186 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 117202 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 179.5-106 chr20 43806783 43807038 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -79908 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 247.25-16 chr14 58255079 58255597 + 1 NA intron (NR_038123, intron 2 of 9) MER119|DNA|hAT-Charlie 10495 NM_002788 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 209.25-10 chr1 182165143 182165476 + 1 NA Intergenic Intergenic -103597 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 183.5-101 chr4 74139769 74140073 + 1 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 16648 NM_001351311 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 169.75-26 chr11 27921033 27921244 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -135677 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 239.25-11 chr11 24670057 24670324 + 1 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 173137 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 284.5-2 chr1 170598934 170599424 + 1 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -64952 NM_006902 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 117.5-11 chr1 118769816 118770026 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 218422 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 401.5-15 chr5 60802255 60802770 + 1 NA intron (NM_024930, intron 1 of 8) intron (NM_024930, intron 1 of 8) 41757 NM_024930 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 131.25-185 chr7 33339776 33340051 + 1 NA intron (NM_198428, intron 10 of 22) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 210349 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 120.5-141 chr3 61470505 61470707 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -90965 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 143.75-186 chr8 82296071 82296222 + 1 NA Intergenic Intergenic -453860 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 125.5-186 chr4 29624178 29624411 + 1 NA Intergenic Intergenic 410002 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 239.75-49 chr4 18628641 18629092 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -606991 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 207.75-17 chr11 33782679 33783052 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 8166 NR_120550 101928440 Hs.202343 NR_120550 ENSG00000254508 FBXO3-DT FBXO3-AS1 FBXO3 divergent transcript ncRNA 293.25-37 chr8 92059663 92060097 + 1 NA intron (NM_001198633, intron 1 of 10) intron (NM_001198633, intron 1 of 10) 2754 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 212.5-66 chr22 19721188 19721518 + 1 NA intron (NM_001009939, intron 7 of 10) CpG-18755 -2190 NM_000407 2812 Hs.283743 NM_000407 ENSG00000203618 GP1BB BDPLT1|BS|CD42C|GPIBB|GPIbbeta glycoprotein Ib platelet subunit beta protein-coding 147.25-107 chr5 78329353 78329589 + 1 NA Intergenic Intergenic 31070 NR_105014 728769 Hs.586193 NR_105014 ENSG00000245556 SCAMP1-AS1 - SCAMP1 antisense RNA 1 ncRNA 246.5-52 chr3 2365263 2365719 + 1 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) 126662 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 152.75-24 chr10 84516783 84517059 + 1 NA 3' UTR (NM_001284243, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001284243, exon 8 of 8) 91752 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 126.25-157 chr5 67128023 67128209 + 1 NA intron (NM_001297651, intron 11 of 25) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 68683 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 157.5-58 chr14 61370324 61370657 + 1 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 49047 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 254.5-85 chrX 74840734 74841037 + 1 NA intron (NM_001008537, intron 1 of 3) L1PA14|LINE|L1 84567 NM_001008537 340533 Hs.124128 NM_001008537 ENSG00000050030 NEXMIF KIAA2022|KIDLIA|MRX98|XPN neurite extension and migration factor protein-coding 185.25-15 chr11 55912877 55913169 + 1 NA TTS (NM_001001960) TTS (NM_001001960) 1559 NM_001001960 390148 Hs.554526 NM_001001960 ENSG00000187612 OR5W2 OR5W2P|OR5W3P olfactory receptor family 5 subfamily W member 2 protein-coding 141.25-143 chr5 125779226 125779402 + 1 NA Intergenic Intergenic 286053 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 178.5-89 chr2 191928210 191928557 + 1 NA Intergenic Intergenic -81295 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 251.75-45 chr21 22766454 22766967 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -312574 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 178.5-116 chr4 31786699 31787070 + 1 NA Intergenic Intergenic -210495 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 127.5-94 chr16 8721789 8721959 + 1 NA intron (NM_001127448, intron 1 of 15) intron (NM_001127448, intron 1 of 15) 1161 NM_001127448 18 Hs.336768 NM_000663 ENSG00000183044 ABAT GABA-AT|GABAT|NPD009 4-aminobutyrate aminotransferase protein-coding 151.5-109 chr3 3081885 3082041 + 1 NA intron (NM_001243099, intron 9 of 10) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -20818 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 172.75-36 chr14 101139484 101139752 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 18762 NR_146490 101929422 NR_146490 ENSG00000259004 LINC02285 - long intergenic non-protein coding RNA 2285 ncRNA 220.75-58 chr5 123281943 123282397 + 1 NA Intergenic Intergenic 141422 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 202.75-6 chr1 172660330 172660819 + 1 NA intron (NM_000639, intron 2 of 3) intron (NM_000639, intron 2 of 3) 1471 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 206.75-52 chr3 45150798 45151075 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -4514 NM_178181 64866 Hs.476093 NM_022842 ENSG00000163814 CDCP1 CD318|SIMA135|TRASK CUB domain containing protein 1 protein-coding 225.5-68 chr21 42646195 42646572 + 1 NA Intergenic Intergenic -7238 NM_002606 5152 Hs.473927 NM_002606 ENSG00000160191 PDE9A HSPDE9A2 phosphodiesterase 9A protein-coding 309.5-37 chr5 123363176 123363853 + 1 NA intron (NM_153223, intron 19 of 20) intron (NM_153223, intron 19 of 20) 60078 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 118.5-74 chr17 73749675 73749886 + 1 NA non-coding (NR_027146, exon 4 of 4) non-coding (NR_027146, exon 4 of 4) 11926 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 149.5-156 chr5 107501375 107501598 + 1 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 169451 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 238.5-19 chr11 122740414 122740690 + 1 NA intron (NM_001363365, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 84830 NM_001363365 84959 Hs.444075 NM_032873 ENSG00000154127 UBASH3B STS-1|STS1|TULA-2|TULA2|p70 ubiquitin associated and SH3 domain containing B protein-coding 152.75-78 chr19 52121726 52122078 + 1 NA intron (NM_178523, intron 3 of 3) intron (NM_178523, intron 3 of 3) 18036 NR_135823 90317 Hs.645225 NM_178523 ENSG00000204611 ZNF616 - zinc finger protein 616 protein-coding 198.5-111 chr5 4203695 4204050 + 1 NA Intergenic Intergenic -569609 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 315.25-20 chr21 23321060 23321445 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 63583 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 122.5-156 chr3 119432896 119433122 + 1 NA intron (NM_018266, intron 8 of 8) intron (NM_018266, intron 8 of 8) 30606 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 191.5-44 chr15 47936054 47936323 + 1 NA Intergenic Intergenic -89952 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 228.5-102 chr8 83560850 83561132 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 157233 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 150.5-219 chr8 104080083 104080372 + 1 NA intron (NR_145711, intron 17 of 21) intron (NR_145711, intron 17 of 21) -143108 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 223.25-54 chr3 140251801 140252103 + 1 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) intron (NM_022131, intron 2 of 16) 256837 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 211.75-35 chr18 7513344 7513691 + 1 NA Intergenic Intergenic -52511 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 246.5-10 chr10 72683919 72684211 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -8066 NM_001270679 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 151.25-125 chr3 78198952 78199169 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -150097 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 116.5-274 chrX 63692451 63692709 + 1 NA intron (NM_001353922, intron 4 of 8) L1MA4|LINE|L1 -21078 NR_138419 100874355 Hs.671524 NR_138419 ENSG00000231729 ARHGEF9-IT1 - ARHGEF9 intronic transcript 1 ncRNA 220.5-7 chr1 116268868 116269287 + 1 NA Intergenic Intergenic -104167 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 116.75-171 chr6 61652560 61652733 + 1 NA intron (NR_146873, intron 10 of 11) intron (NR_146873, intron 10 of 11) 78516 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 146.25-43 chr15 71039644 71039957 + 1 NA intron (NM_017691, intron 15 of 15) intron (NM_017691, intron 15 of 15) -101649 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 219.25-64 chr6 51315949 51316357 + 1 NA Intergenic Intergenic -305717 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 190.5-18 chr10 127731226 127731471 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5837 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 224.5-118 chrX 53729830 53730097 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -43244 NM_031407 10075 Hs.136905 NM_031407 ENSG00000086758 HUWE1 ARF-BP1|HECTH9|HSPC272|Ib772|LASU1|MRXST|MULE|URE-B1|UREB1 HECT, UBA and WWE domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 200.5-74 chr2 177222287 177222816 + 1 NA non-coding (NR_138470, exon 12 of 12) non-coding (NR_138470, exon 12 of 12) 9757 NR_138470 220988 Hs.516539 NM_194247 ENSG00000170144 HNRNPA3 2610510D13Rik|D10S102|FBRNP|HNRPA3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 protein-coding 269.25-18 chr17 48697532 48697969 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 24768 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 342.5-18 chr21 25933733 25934411 + 1 NA intron (NM_001136131, intron 11 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -198418 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 231.5-7 chr1 235678119 235678470 + 1 NA intron (NM_000081, intron 48 of 52) AluSg|SINE|Alu -27540 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 210.5-103 chr5 99781799 99782325 + 1 NA Intergenic Intergenic 248072 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 341.75-6 chr12 20024174 20024621 + 1 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 9712 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 201.75-111 chr9 127202222 127202555 + 1 NA intron (NM_014636, intron 14 of 18) intron (NM_014636, intron 14 of 18) -61274 NM_001286779 84253 Hs.29304 NM_032293 ENSG00000136895 GARNL3 bA356B19.1 GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3 protein-coding 333.25-4 chr15 35809110 35809600 + 1 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) -117501 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 379.5-5 chr10 111330824 111331259 + 1 NA Intergenic Intergenic 216750 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 161.5-150 chr4 177123597 177123780 + 1 NA Intergenic Intergenic -186186 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 164.25-122 chr4 158142218 158142459 + 1 NA intron (NM_016613, intron 3 of 4) intron (NM_016613, intron 3 of 4) -28414 NR_147410 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 177.75-53 chr16 71296048 71296236 + 1 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -6420 NM_001324377 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 268.75-47 chr9 81726969 81727438 + 1 NA intron (NR_109772, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 37490 NR_109772 101927502 Hs.528628 NR_109772 ENSG00000233926 LOC101927502 - uncharacterized LOC101927502 ncRNA 185.5-82 chr2 134144284 134144615 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 17324 NR_037450 100500878 NR_037450 ENSG00000263813 MIR3679 mir-3679 microRNA 3679 ncRNA 150.25-96 chr3 36757125 36757397 + 1 NA Intergenic Intergenic -17400 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 200.5-10 chr1 154960804 154961022 + 1 NA promoter-TSS (NM_001321726) promoter-TSS (NM_001321726) -558 NM_001321726 101928120 Hs.533597 NM_001321726 LOC101928120 - uncharacterized LOC101928120 protein-coding 127.5-142 chr21 29558078 29558311 + 1 NA intron (NM_000830, intron 15 of 16) intron (NM_000830, intron 15 of 16) -37846 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 195.25-28 chr14 46228098 46228336 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 164058 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 157.25-126 chr5 176469944 176470238 + 1 NA intron (NM_014613, intron 1 of 10) intron (NM_014613, intron 1 of 10) 21706 NM_014613 23197 Hs.484242 NM_014613 ENSG00000113194 FAF2 ETEA|UBXD8|UBXN3B Fas associated factor family member 2 protein-coding 206.75-29 chr18 37680036 37680317 + 1 NA Intergenic Intergenic 23041 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 120.5-166 chr4 73296105 73296346 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -37427 NM_032217 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 172.5-42 chr11 115258889 115259102 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu -74582 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 197.75-93 chr8 127076406 127076857 + 1 NA intron (NR_119373, intron 3 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -3243 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 145.25-121 chr4 119093182 119093372 + 1 NA Intergenic Intergenic -42507 NM_016599 51778 Hs.732122 NM_016599 ENSG00000172399 MYOZ2 C4orf5|CMH16|CS-1|FATZ-2 myozenin 2 protein-coding 236.5-5 chr10 8801183 8801588 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -96604 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 187.75-28 chr13 81735209 81735499 + 1 NA Intergenic Intergenic -508371 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 305.5-47 chr7 68183343 68183790 + 1 NA Intergenic Intergenic 163313 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 193.25-91 chr5 40617376 40617666 + 1 NA Intergenic Intergenic -62394 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 140.5-5 chr1 68065023 68065212 + 1 NA intron (NR_040077, intron 2 of 9) MER65C|LTR|ERV1 -13486 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 127.75-173 chr6 76271723 76271954 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -199160 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 160.75-157 chr9 33478495 33478669 + 1 NA Intergenic Intergenic -4639 NM_139235 65083 Hs.493709 NM_022917 ENSG00000165271 NOL6 NRAP|UTP22|bA311H10.1 nucleolar protein 6 protein-coding 130.5-34 chr10 48933412 48933624 + 1 NA intron (NM_020945, intron 47 of 61) intron (NM_020945, intron 47 of 61) -19283 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 115.5-93 chr17 54343637 54343837 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 520810 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 201.25-90 chr8 79109536 79109923 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -222459 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 132.25-7 chr1 81279464 81279733 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -26594 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 232.5-71 chr3 108885418 108885747 + 1 NA Intergenic Intergenic 62796 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 123.25-79 chr17 58758921 58759080 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluSz6|SINE|Alu 3131 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 149.75-40 chr14 54343739 54344160 + 1 NA Intergenic Intergenic -52919 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 174.25-43 chr13 73280449 73280744 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 221591 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 202.25-50 chr22 37526429 37526754 + 1 NA Intergenic Intergenic -7176 NM_014550 29775 Hs.57973 NM_014550 ENSG00000100065 CARD10 BIMP1|CARMA3 caspase recruitment domain family member 10 protein-coding 151.25-190 chr8 114436960 114437131 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1000106 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 158.5-46 chr12 55071344 55071627 + 1 NA Intergenic Intergenic 51511 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 157.75-38 chr13 61096689 61096962 + 1 NA Intergenic Intergenic 103055 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 148.75-124 chr4 135257525 135257864 + 1 NA Intergenic Intergenic -134135 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 191.5-99 chr3 105510802 105511072 + 1 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 144028 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 289.25-4 chr10 93288877 93289434 + 1 NA Intergenic Intergenic 193179 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 227.75-39 chr2 105277138 105277503 + 1 NA intron (NM_001142621, intron 7 of 11) intron (NM_001142621, intron 7 of 11) 35577 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 139.5-182 chr5 147711887 147712081 + 1 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 70744 NM_001270941 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 112.5-94 chr17 70911926 70912066 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 290183 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 279.75-36 chr4 40367842 40368149 + 1 NA Intergenic Intergenic 32662 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 200.5-20 chr10 106497693 106498149 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 357756 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 285.5-25 chr18 2546281 2546712 + 1 NA intron (NM_022840, intron 6 of 8) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 25009 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 226.25-10 chr10 57070037 57070316 + 1 NA Intergenic Intergenic 234383 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 122.25-129 chr3 124587836 124588123 + 1 NA intron (NM_007064, intron 1 of 26) AluJo|SINE|Alu 3320 NM_001323000 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 134.75-175 chr5 99461393 99461608 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -72490 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 310.5-18 chr2 108492099 108492848 + 1 NA intron (NR_028063, intron 17 of 21) MER105|DNA|hAT-Charlie 41746 NR_135290 644903 NM_032658 ENSG00000214184 GCC2-AS1 - GCC2 antisense RNA 1 ncRNA 241.5-75 chr4 121507395 121507784 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -126571 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 223.5-43 chr15 25498880 25499132 + 1 NA Intergenic Intergenic -59950 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 126.25-138 chr4 127627006 127627202 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -5853 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 330.75-18 chr4 71608156 71608893 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 175555 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 246.5-62 chr5 101796635 101796972 + 1 NA Intergenic Intergenic 499481 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 170.75-123 chr7 18675683 18675971 + 1 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 166557 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 167.25-52 chr15 58768826 58769245 + 1 NA intron (NR_135474, intron 1 of 1) LTR13A|LTR|ERVK 1939 NR_135474 101928725 Hs.572321 NR_135474 ENSG00000245975 LOC101928725 - uncharacterized LOC101928725 ncRNA 185.25-121 chr8 22976577 22976826 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10550 NM_001160036 23221 Hs.372688 NM_015178 ENSG00000008853 RHOBTB2 DBC2|EIEE64 Rho related BTB domain containing 2 protein-coding 164.5 chr1 11769900 11770163 + 1 NA intron (NM_001010881, intron 6 of 20) intron (NM_001010881, intron 6 of 20) 7838 NM_001010881 284498 Hs.585415 NM_001010881 C1orf167 - chromosome 1 open reading frame 167 protein-coding 171.5-115 chr4 53551516 53551998 + 1 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) MER50|LTR|ERV1 6512 NM_032622 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 222.25-51 chr3 182189772 182190196 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 237620 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 206.5-119 chr7 32169225 32169552 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -97952 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 280.75-15 chr15 94322349 94322688 + 1 NA intron (NM_018349, intron 3 of 21) MER58A|DNA|hAT-Charlie 24317 NM_001159643 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 141.5-243 chrX 79675234 79675498 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -307814 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 115.75-35 chr11 117707971 117708107 + 1 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) intron (NM_020693, intron 3 of 32) 89177 NM_020693 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 153.25-76 chr2 217636541 217636707 + 1 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) LTR16E1|LTR|ERVL 119969 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 120.75-114 chr3 177333782 177334043 + 1 NA Intergenic Intergenic 39470 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 216.25-75 chr4 30899687 30899931 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 179440 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 151.75-75 chr2 241271107 241271377 + 1 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) intron (NM_005336, intron 1 of 27) 723 NM_001320966 3069 Hs.471851 NM_005336 ENSG00000115677 HDLBP HBP|PRO2900|VGL high density lipoprotein binding protein protein-coding 243.5-72 chr7 37659417 37659702 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -24207 NM_181791 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 171.75-153 chrX 80976371 80976569 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -166593 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 366.75-7 chr14 55523153 55523673 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 56679 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 168.25-132 chr7 20342365 20342740 + 1 NA intron (NM_002214, intron 1 of 13) intron (NM_002214, intron 1 of 13) -10790 NR_110119 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 153.5-163 chr5 128975900 128976053 + 1 NA intron (NM_001017372, intron 1 of 9) intron (NM_001017372, intron 1 of 9) 10488 NM_001017372 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 243.25-29 chr22 28542483 28542903 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME1|LINE|L1 82824 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 157.75-185 chr9 99761622 99761830 + 1 NA intron (NR_109802, intron 2 of 6) intron (NR_109802, intron 2 of 6) 58163 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 206.5-138 chr8 122829321 122829669 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 47840 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 135.5-196 chr8 69053671 69053894 + 1 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) L1MA6|LINE|L1 50408 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 167.25-101 chr22 25159387 25159630 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -40350 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 187.5-26 chr11 16944632 16945004 + 1 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) MIR|SINE|MIR -18796 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 112.25-222 chr8 126272739 126272981 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -52635 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 155.75-164 chr8 116985758 116986015 + 1 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 34911 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 197.5-148 chr7 54430544 54430944 + 1 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 100047 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 243.75-58 chr3 148309806 148310275 + 1 NA intron (NR_146712, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 29149 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 305.5-26 chr2 223357120 223357619 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 244992 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 207.75-131 chr9 32982017 32982346 + 1 NA intron (NR_160920, intron 5 of 6) L1MC4a|LINE|L1 19395 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 181.75-80 chr3 94386706 94386928 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 323756 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 206.25-44 chr18 3322084 3322344 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 28345 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 430.75-5 chr14 58449281 58450049 + 1 NA intron (NM_001329944, intron 7 of 31) MIR1_Amn|SINE|MIR 9984 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 280.75-43 chr8 124614432 124614867 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 75526 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 157.5-4 chr1 38293196 38293477 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -78569 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 195.25-56 chr2 206442184 206442445 + 1 NA Intergenic Intergenic -1218 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 167.5-143 chr5 56362613 56362834 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 119046 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 117.75-98 chr2 19064715 19064928 + 1 NA Intergenic Intergenic -37850 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 151.75-7 chr1 110384432 110384713 + 1 NA intron (NM_004696, intron 2 of 8) intron (NM_004696, intron 2 of 8) 6454 NM_001201549 9122 Hs.351306 NM_004696 ENSG00000168679 SLC16A4 MCT4|MCT5 solute carrier family 16 member 4 protein-coding 126.75-70 chr15 50073546 50073715 + 1 NA intron (NR_073597, intron 3 of 26) L1PA7|LINE|L1 39749 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 263.75-20 chr16 58151299 58151566 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -22007 NR_136632 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 121.75-60 chr17 59792116 59792337 + 1 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) AluJb|SINE|Alu -49040 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 139.25-114 chr3 11039454 11039649 + 1 NA TTS (NM_001348250) TTS (NM_001348250) -20327 NR_046647 100874090 Hs.628542 NR_046647 ENSG00000232287 SLC6A1-AS1 - SLC6A1 antisense RNA 1 ncRNA 119.75-28 chr11 6478354 6478562 + 1 NA intron (NR_163423, intron 5 of 7) intron (NR_163423, intron 5 of 7) 2873 NR_163424 23647 Hs.75139 NM_012402 ENSG00000132254 ARFIP2 POR1 ADP ribosylation factor interacting protein 2 protein-coding 175.25-138 chr8 16602494 16602694 + 1 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 399751 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 151.5-53 chr14 83158883 83159107 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 516363 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 283.75-4 chr10 63720007 63720408 + 1 NA Intergenic Intergenic -198317 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 197.25-104 chr9 81985405 81985648 + 1 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 -3246 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 161.25-51 chr14 58252188 58252394 + 1 NA intron (NR_038123, intron 2 of 9) intron (NR_038123, intron 2 of 9) 7448 NM_002788 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 167.5-79 chr18 20968634 20968922 + 1 NA exon (NM_005406, exon 25 of 33) exon (NM_005406, exon 25 of 33) 143035 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 233.5-29 chr12 32707529 32707933 + 1 NA intron (NM_001278466, intron 4 of 16) AluJb|SINE|Alu 28430 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 326.5-8 chr13 61448081 61448675 + 1 NA Intergenic Intergenic -20432 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 313.5-2 chr1 237299704 237300224 + 1 NA intron (NM_001035, intron 2 of 104) intron (NM_001035, intron 2 of 104) -171155 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 261.5-12 chr12 120171386 120171812 + 1 NA intron (NM_006836, intron 14 of 57) intron (NM_006836, intron 14 of 57) -16100 NR_039719 100616179 NR_039719 ENSG00000266704 MIR4498 mir-4498 microRNA 4498 ncRNA 397.5-13 chr8 144984529 144985207 + 1 NA intron (NR_023392, intron 4 of 4) L1M4b|LINE|L1 -9997 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 164.5-189 chr7 35019686 35019900 + 1 NA intron (NM_015283, intron 1 of 21) intron (NM_015283, intron 1 of 21) 17692 NM_001366673 23333 Hs.408623 NM_015283 ENSG00000173852 DPY19L1 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 protein-coding 138.5-157 chr5 100195971 100196205 + 1 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie 192166 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 232.5-29 chr14 86141113 86141431 + 1 NA Intergenic Intergenic 206594 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 124.75-64 chr12 96195484 96195701 + 1 NA intron (NM_005230, intron 1 of 4) intron (NM_005230, intron 1 of 4) 1217 NM_005230 2004 Hs.46523 NM_005230 ENSG00000111145 ELK3 ERP|NET|SAP-2|SAP2 ETS transcription factor ELK3 protein-coding 215.5-14 chr10 68390102 68390387 + 1 NA intron (NR_103476, intron 7 of 18) intron (NR_103476, intron 7 of 18) 16945 NM_017987 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 134.25-175 chr7 47372297 47372547 + 1 NA intron (NM_022748, intron 16 of 30) intron (NM_022748, intron 16 of 30) 92381 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 241.75-59 chr5 14122812 14123070 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -20401 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 190.5-28 chr11 110988922 110989194 + 1 NA Intergenic Intergenic 108260 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 147.25-57 chr2 64589717 64589890 + 1 NA intron (NM_001002243, intron 8 of 8) L1ME4a|LINE|L1 -17509 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 289.75-16 chr20 46541911 46542307 + 1 NA intron (NM_080721, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 8545 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 406.75-3 chr10 48579936 48580609 + 1 NA intron (NM_001347736, intron 3 of 3) intron (NM_001347736, intron 3 of 3) 24801 NM_001347735 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 200.5-95 chr3 183455773 183456047 + 1 NA non-coding (NR_038302, exon 4 of 4) non-coding (NR_038302, exon 4 of 4) 2096 NR_145763 109617007 NR_145763 ENSG00000199363 SNORA63E - small nucleolar RNA, H/ACA box 63E snoRNA 221.25-70 chr5 55514413 55514761 + 1 NA intron (NR_103485, intron 1 of 6) intron (NR_103485, intron 1 of 6) -5661 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 250.5-33 chr15 53703443 53703804 + 1 NA intron (NM_182758, intron 11 of 19) intron (NM_182758, intron 11 of 19) 56040 NM_182758 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 231.75-74 chr8 125269248 125269741 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -160864 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 178.75-4 chr1 155529546 155529773 + 1 NA intron (NM_018489, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 -32383 NR_147963 645676 Hs.568693 NR_027023 ENSG00000235919 ASH1L-AS1 - ASH1L antisense RNA 1 ncRNA 236.75-65 chr9 28719177 28719515 + 1 NA promoter-TSS (NM_152570) promoter-TSS (NM_152570) -41 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 180.75-119 chr5 121807903 121808183 + 1 NA Intergenic Intergenic -43839 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 295.5-34 chr20 34835500 34835910 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1243 NR_002165 128872 Hs.558624 NR_002165 HMGB3P1 HMG4L|HMGB3L1|dJ18C9.3 high mobility group box 3 pseudogene 1 pseudo 140.25-12 chr1 162049282 162049449 + 1 NA Intergenic Intergenic -20326 NM_001164757 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 169.5-25 chr11 34593944 34594288 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26977 NM_001206615 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 231.25-18 chr14 88452727 88453036 + 1 NA Intergenic Intergenic 67224 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 273.75-22 chr2 174910365 174910810 + 1 NA intron (NM_001025201, intron 6 of 12) intron (NM_001025201, intron 6 of 12) -62969 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 152.5-171 chr6 142614410 142614634 + 1 NA intron (NR_027311, intron 1 of 2) intron (NR_027311, intron 1 of 2) 23314 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 137.5-179 chr4 147077983 147078288 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -132249 NM_031956 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 229.5-113 chr6 28314875 28315315 + 1 NA Intergenic Intergenic 21039 NM_001243243 64288 Hs.656413 NM_030899 ENSG00000235109 ZSCAN31 ZNF20-Lp|ZNF310P|ZNF323 zinc finger and SCAN domain containing 31 protein-coding 229.5-8 chr1 167372264 167372629 + 1 NA intron (NM_001198786, intron 5 of 14) intron (NM_001198786, intron 5 of 14) 43376 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 182.75-102 chr5 44941218 44941421 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 132372 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 190.75-2 chr1 118558448 118558865 + 1 NA Intergenic Intergenic -373428 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 152.5-25 chr11 61924773 61925010 + 1 NA Intergenic Intergenic -4607 NM_001271686 5866 Hs.13759 NM_013401 ENSG00000167994 RAB3IL1 GRAB RAB3A interacting protein like 1 protein-coding 374.5-8 chr2 64354093 64354666 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -13531 NR_106995 102465833 NR_106995 ENSG00000264297 MIR4433B hsa-mir-4433b microRNA 4433b ncRNA 171.25-39 chr12 91731430 91731786 + 1 NA Intergenic Intergenic 410105 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 145.75-4 chr1 89536784 89537064 + 1 NA intron (NM_001369819, intron 2 of 6) intron (NM_001369819, intron 2 of 6) 12086 NM_001369819 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 261.25-17 chr2 188458575 188458959 + 1 NA intron (NM_016315, intron 2 of 11) L1MA2|LINE|L1 161275 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 214.5-108 chr6 47415358 47415576 + 1 NA Intergenic Intergenic -62322 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 199.5-31 chr12 17657578 17657824 + 1 NA Intergenic Intergenic -15598 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 235.75-62 chr6 89907773 89908122 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 13478 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 141.75-68 chr16 57824670 57824818 + 1 NA Intergenic Intergenic 14107 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 137.5-31 chr10 69145453 69145693 + 1 NA intron (NM_001318944, intron 3 of 9) L1M5|LINE|L1 21395 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 136.75-66 chr15 76806057 76806405 + 1 NA intron (NR_148227, intron 5 of 32) L1MB7|LINE|L1 55713 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 115.75-141 chr3 70659417 70659675 + 1 NA Intergenic Intergenic -346908 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 219.5-10 chr1 210378031 210378419 + 1 NA intron (NM_001122834, intron 3 of 11) intron (NM_001122834, intron 3 of 11) 48859 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 146.5-193 chr6 150177838 150178072 + 1 NA intron (NM_030949, intron 1 of 3) intron (NM_030949, intron 1 of 3) 34911 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 151.5-2 chr1 38401243 38401478 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -73836 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 175.5-139 chr5 148827581 148827777 + 1 NA exon (NM_000024, exon 1 of 1) exon (NM_000024, exon 1 of 1) 1086 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 120.5-245 chrX 73936569 73936777 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -7651 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 215.5-4 chr1 77468757 77469169 + 1 NA intron (NM_012093, intron 8 of 13) intron (NM_012093, intron 8 of 13) 185876 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 116.75-194 chr8 60118183 60118403 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 163107 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 252.5-77 chr8 25044883 25045278 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -88211 NM_006158 4747 Hs.521461 NM_006158 ENSG00000277586 NEFL CMT1F|CMT2E|CMTDIG|NF-L|NF68|NFL|PPP1R110 neurofilament light protein-coding 133.75-50 chr14 24863852 24864040 + 1 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) intron (NM_001351943, intron 3 of 6) 185054 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 234.75-2 chr1 45723203 45723590 + 1 NA intron (NM_001145349, intron 5 of 9) intron (NM_001145349, intron 5 of 9) 27257 NM_005897 3652 Hs.744252 NM_005897 ENSG00000197429 IPP KLHL27 intracisternal A particle-promoted polypeptide protein-coding 314.5-7 chr17 52281044 52281741 + 1 NA Intergenic Intergenic -109130 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 321.75-19 chr2 165820130 165820657 + 1 NA Intergenic Intergenic -26146 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 139.25-75 chr19 27961854 27962131 + 1 NA intron (NR_146734, intron 3 of 7) intron (NR_146734, intron 3 of 7) -168052 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 163.5-155 chr5 22777163 22777366 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 76080 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 217.25-8 chr1 223482396 223482722 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 89144 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 266.5-36 chr2 141101513 141101822 + 1 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -514982 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 321.5-17 chr2 63747857 63748419 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -92826 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 181.75-7 chr1 119674946 119675171 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -26792 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 179.75-80 chr4 45117592 45117780 + 1 NA Intergenic Intergenic -391052 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 150.25-17 chr10 23168471 23168795 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23679 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 154.75-92 chr3 100300351 100300666 + 1 NA intron (NM_001199198, intron 10 of 18) AluSz6|SINE|Alu -34249 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 273.25-21 chr21 30962413 30962855 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 75842 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 278.25-36 chr22 28250435 28250768 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger -209268 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 224.5-8 chr1 215644778 215645157 + 1 NA intron (NM_206933, intron 67 of 71) L2|LINE|L2 77663 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 206.5-65 chr2 213811408 213811768 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) 53521 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 193.75-118 chr8 80132819 80133088 + 1 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) 38168 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 186.25-2 chr1 34162452 34162646 + 1 NA intron (NM_052896, intron 1 of 69) intron (NM_052896, intron 1 of 69) 2725 NM_001281956 114784 Hs.656915 NM_052896 ENSG00000121904 CSMD2 dJ1007G16.1|dJ1007G16.2|dJ947L8.1 CUB and Sushi multiple domains 2 protein-coding 139.5-180 chr5 133038491 133038789 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -12091 NR_125337 54819 Hs.29700 NM_017665 ENSG00000155329 ZCCHC10 - zinc finger CCHC-type containing 10 protein-coding 265.75-4 chr10 55453487 55453914 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -145342 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 151.25-110 chr21 22767687 22767951 + 1 NA Intergenic Intergenic -311465 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 257.5-44 chr3 6093483 6094001 + 1 NA Intergenic Intergenic 711707 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 303.5-26 chr2 202634343 202634822 + 1 NA promoter-TSS (NM_173511) promoter-TSS (NM_173511) -387 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 173.25-66 chr21 28724087 28724347 + 1 NA Intergenic Intergenic 161150 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 192.5-53 chr16 89542495 89542715 + 1 NA intron (NM_001363850, intron 9 of 17) intron (NM_001363850, intron 9 of 17) -18052 NM_001243131 6137 Hs.410817 NM_000977 ENSG00000167526 RPL13 BBC1|D16S444E|D16S44E|L13 ribosomal protein L13 protein-coding 243.25-51 chr7 40620094 40620468 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 359658 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 156.5-41 chr12 59156897 59157096 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -236458 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 143.25-147 chr5 142992131 142992341 + 1 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) intron (NR_146198, intron 11 of 22) -123326 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-46 chr14 80252559 80252882 + 1 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) L1ME3D|LINE|L1 -21663 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 115.5-248 chr9 26887583 26887720 + 1 NA intron (NM_024828, intron 1 of 5) intron (NM_024828, intron 1 of 5) 5151 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 370.5-19 chr8 79653398 79654141 + 1 NA intron (NM_007029, intron 3 of 4) intron (NM_007029, intron 3 of 4) 42652 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 116.25-196 chr6 55964082 55964207 + 1 NA Intergenic Intergenic -88554 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 125.5-208 chr5 129109046 129109202 + 1 NA intron (NM_016048, intron 4 of 4) intron (NM_016048, intron 4 of 4) 11436 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 279.25-28 chr4 35185547 35185887 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -915970 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 164.5-33 chr11 110391673 110391893 + 1 NA intron (NR_135100, intron 3 of 3) intron (NR_135100, intron 3 of 3) 36669 NR_135100 105369486 Hs.611557 NR_135100 LINC02732 - long intergenic non-protein coding RNA 2732 ncRNA 279.25-11 chr12 411763 412186 + 1 NA exon (NM_001130147, exon 3 of 12) exon (NM_001130147, exon 3 of 12) 10330 NM_001130146 84318 Hs.631656 NM_032358 ENSG00000120647 CCDC77 - coiled-coil domain containing 77 protein-coding 291.5-35 chr5 27298605 27299008 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -173486 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 191.5-123 chr6 24222572 24222906 + 1 NA intron (NM_016356, intron 7 of 9) intron (NM_016356, intron 7 of 9) 96524 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 232.5-60 chr20 38172033 38172471 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -5744 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 242.75-49 chr4 75740224 75740634 + 1 NA intron (NM_003715, intron 1 of 23) AluJr4|SINE|Alu 15907 NM_003715 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 179.5-14 chr1 206475874 206476095 + 1 NA intron (NM_001193321, intron 4 of 20) intron (NM_001193321, intron 4 of 20) 1181 NR_106919 102466202 NR_106919 ENSG00000278465 MIR6769B hsa-mir-6769b microRNA 6769b ncRNA 186.25-59 chr20 36539467 36539663 + 1 NA intron (NR_109939, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 -1954 NM_006097 10398 Hs.504687 NM_006097 ENSG00000101335 MYL9 LC20|MLC-2C|MLC2|MRLC1|MYRL2 myosin light chain 9 protein-coding 224.25-18 chr11 16194823 16195159 + 1 NA intron (NM_033326, intron 4 of 15) intron (NM_033326, intron 4 of 15) 161555 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 293.75-24 chr2 190994465 190995102 + 1 NA intron (NM_007315, intron 10 of 24) AluSx|SINE|Alu 19467 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 172.5-202 chr8 126921810 126921996 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -91251 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 147.5-198 chr7 54912035 54912221 + 1 NA Intergenic Intergenic -106889 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 172.25-46 chr16 47445753 47445998 + 1 NA intron (NM_030790, intron 5 of 17) intron (NM_030790, intron 5 of 17) 15188 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 325.5-24 chr3 57685335 57685998 + 1 NA intron (NM_152678, intron 1 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 7411 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 246.5-79 chr9 99898635 99899098 + 1 NA intron (NR_038853, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 7735 NR_038853 441461 Hs.163155 NR_038853 ENSG00000255145 STX17-AS1 - STX17 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-212 chr8 123137355 123137513 + 1 NA intron (NM_001363149, intron 17 of 21) MER77|LTR|ERVL -41613 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 113.25-92 chr2 85119810 85119995 + 1 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -13490 NM_031283 83439 Hs.516297 NM_031283 ENSG00000152284 TCF7L1 TCF-3|TCF3 transcription factor 7 like 1 protein-coding 123.5-16 chr1 220723153 220723287 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -25102 NM_017898 54996 Hs.369042 NM_017898 ENSG00000117791 MARC2 MOSC2 mitochondrial amidoxime reducing component 2 protein-coding 160.5-37 chr12 38917034 38917381 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -11616 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 176.5-124 chr3 107398771 107399057 + 1 NA Intergenic Intergenic -16755 NR_126332 101929579 Hs.552750 NR_126332 LOC101929579 - uncharacterized LOC101929579 ncRNA 333.25-12 chr20 46812937 46813395 + 1 NA Intergenic Intergenic -81458 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 237.5-14 chr10 29471506 29471804 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 31 of 38) intron (NM_001323599, intron 31 of 38) 61412 NR_110928 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 159.75-81 chr2 100367478 100367732 + 1 NA Intergenic Intergenic -44872 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 146.75-6 chr1 113378352 113378506 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -12086 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 305.25-47 chr8 117601422 117601833 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 80914 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 127.5-203 chr5 146738577 146738752 + 1 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 140121 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 189.25-131 chr8 126066016 126066330 + 1 NA Intergenic Intergenic -114976 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 313.5-19 chr18 6647128 6647738 + 1 NA Intergenic Intergenic -82283 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 184.25-127 chr8 133709735 133710135 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -25869 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 239.5-33 chr15 79530474 79530847 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 98144 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 238.25-68 chr5 88857800 88858175 + 1 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) 25197 NM_002397 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 272.75-50 chr8 110817324 110817907 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 209818 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 150.5-6 chr1 90703705 90704048 + 1 NA Intergenic Intergenic 13426 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 142.75-77 chr16 80417296 80417502 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -123335 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 145.75-169 chr9 88638287 88638461 + 1 NA Intergenic Intergenic 103196 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 139.75-137 chr4 102798851 102799118 + 1 NA intron (NM_181892, intron 6 of 7) intron (NM_181892, intron 6 of 7) 21947 NR_125932 102723704 Hs.638374 NR_125932 LOC102723704 - uncharacterized LOC102723704 ncRNA 239.75-71 chr7 48265184 48265568 + 1 NA intron (NM_152701, intron 15 of 61) L1ME1|LINE|L1 93918 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 198.5-104 chr4 74237055 74237342 + 1 NA intron (NM_001144978, intron 6 of 7) intron (NM_001144978, intron 6 of 7) -71272 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 197.75-9 chr10 123648368 123648609 + 1 NA Intergenic Intergenic -17867 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 207.5-108 chr8 21967826 21968236 + 1 NA intron (NM_015024, intron 2 of 27) intron (NM_015024, intron 2 of 27) 48369 NR_156173 23039 Hs.172685 NM_015024 ENSG00000130227 XPO7 EXP7|RANBP16 exportin 7 protein-coding 159.5-97 chr2 51014804 51015115 + 1 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 17173 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 121.5-227 chr6 87738861 87739139 + 1 NA Intergenic Intergenic -36767 NM_018064 55122 Hs.485915 NM_018064 ENSG00000135334 AKIRIN2 C6orf166|FBI1|dJ486L4.2 akirin 2 protein-coding 183.75-37 chr13 107565692 107565911 + 1 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -34553 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 181.5-79 chr2 83062665 83063075 + 1 NA Intergenic Intergenic 206067 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 169.25-85 chr4 66644313 66644576 + 1 NA Intergenic Intergenic 367620 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 221.75-21 chr14 65597750 65598198 + 1 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) AluJo|SINE|Alu 126872 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 213.75-94 chr6 39144704 39145198 + 1 NA Intergenic Intergenic -29765 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 205.5-83 chr2 222015878 222016115 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -282151 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 214.25-80 chr8 31955855 31956095 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu -69761 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 123.25-166 chr5 102555979 102556150 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -25304 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 168.25-46 chr15 37373687 37373995 + 1 NA Intergenic Intergenic -272530 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 184.25-93 chr4 154140731 154141139 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 350864 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 112.75-115 chr2 219671659 219671824 + 1 NA Intergenic Intergenic 44111 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 143.5-63 chr14 52963247 52963577 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12315 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 504.75-4 chr5 26106956 26108037 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 916543 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 177.25-4 chr1 89043160 89043434 + 1 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -20431 NM_018284 2635 Hs.720167 NM_018284 ENSG00000117226 GBP3 - guanylate binding protein 3 protein-coding 167.25-12 chr10 15628874 15629163 + 1 NA intron (NM_001291494, intron 12 of 28) MIRb|SINE|MIR 90904 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 273.5-37 chr20 4099296 4099926 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -49168 NM_001270691 54498 Hs.433337 NM_175839 ENSG00000088826 SMOX C20orf16|PAO|PAO-1|PAO1|PAOH|PAOH1|SMO spermine oxidase protein-coding 224.5-26 chr11 72914404 72914651 + 1 NA intron (NM_014824, intron 9 of 19) L1PA12|LINE|L1 100116 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 257.5-7 chr10 52666756 52667257 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 88398 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 117.5-125 chr20 39788100 39788246 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -216288 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 149.5-38 chr10 127647245 127647433 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -89846 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 174.5-5 chr1 86145249 86145525 + 1 NA intron (NM_152890, intron 2 of 59) intron (NM_152890, intron 2 of 59) 11084 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 146.25-35 chr14 68066107 68066359 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1ME4a|LINE|L1 242641 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 315.25-29 chr6 54638381 54638754 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -208204 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 163.5-211 chr8 129931122 129931454 + 1 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) intron (NM_001353256, intron 2 of 13) 8523 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 215.75-21 chr11 125855407 125855799 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 22287 NM_001144874 399968 Hs.436215 NM_001144874 ENSG00000237353 PATE4 PATE-B prostate and testis expressed 4 protein-coding 292.5-44 chr5 147597643 147598107 + 1 NA intron (NR_038902, intron 3 of 3) MLT2B3|LTR|ERVL 37881 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 153.25-57 chr18 13146580 13146955 + 1 NA Intergenic Intergenic -71993 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 175.75-86 chr3 94257367 94257766 + 1 NA Intergenic Intergenic 194505 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 335.75-7 chr17 45068618 45069099 + 1 NA intron (NM_021079, intron 1 of 11) AluSz6|SINE|Alu 7541 NM_021079 4836 Hs.532790 NM_021079 ENSG00000136448 NMT1 NMT N-myristoyltransferase 1 protein-coding 146.75-102 chr3 96278903 96279108 + 1 NA Intergenic Intergenic -80959 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 174.5-120 chr3 64236528 64236964 + 1 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR -11280 NM_198859 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 207.5-106 chr7 129006367 129006650 + 1 NA intron (NM_001191028, intron 4 of 21) intron (NM_001191028, intron 4 of 21) 48665 NM_001191028 23534 Hs.193613 NM_012470 ENSG00000064419 TNPO3 IPO12|LGMD1F|LGMDD2|MTR10A|TRN-SR|TRN-SR2|TRNSR transportin 3 protein-coding 209.25-22 chr11 128179418 128179692 + 1 NA Intergenic Intergenic -29211 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 117.25-114 chr2 98720810 98721032 + 1 NA intron (NM_012214, intron 2 of 15) L1M4b|LINE|L1 10211 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 175.5-70 chr17 7870426 7870699 + 1 NA intron (NM_001330111, intron 2 of 4) intron (NM_001330111, intron 2 of 4) 12559 NM_144607 124637 Hs.27475 NM_144607 ENSG00000182224 CYB5D1 - cytochrome b5 domain containing 1 protein-coding 260.75-48 chr4 86648527 86648989 + 1 NA intron (NM_080685, intron 2 of 47) L1MA4|LINE|L1 54443 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 244.75-27 chr2 28574965 28575352 + 1 NA intron (NR_138141, intron 2 of 35) L1PB2|LINE|L1 8801 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 130.25-21 chr1 226723321 226723620 + 1 NA intron (NM_002221, intron 2 of 7) intron (NM_002221, intron 2 of 7) 15705 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 212.75-83 chr5 152185097 152185502 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 219980 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 131.5-29 chr10 105672134 105672323 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 148105 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 157.75-49 chr14 98673265 98673500 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -38231 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 152.75-86 chr2 115468765 115469117 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 125126 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 215.5-27 chr13 25262036 25262532 + 1 NA intron (NM_004685, intron 5 of 13) intron (NM_004685, intron 5 of 13) 25204 NM_004685 9107 Hs.643702 NM_004685 ENSG00000139505 MTMR6 - myotubularin related protein 6 protein-coding 179.75-7 chr1 115349658 115350122 + 1 NA intron (NR_157569, intron 1 of 1) intron (NR_157569, intron 1 of 1) -11654 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 137.5-32 chr10 75102384 75102625 + 1 NA intron (NM_001320843, intron 1 of 4) intron (NM_001320843, intron 1 of 4) -3014 NM_016364 51207 Hs.178170 NM_016364 ENSG00000079393 DUSP13 BEDP|DUSP13A|DUSP13B|MDSP|SKRP4|TMDP dual specificity phosphatase 13 protein-coding 183.5-115 chr5 75065982 75066304 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -13585 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 191.75-12 chr1 218561664 218562015 + 1 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 51744 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 200.75-109 chr8 143913468 143913830 + 1 NA Intergenic Intergenic 25948 NM_201384 5339 Hs.434248 NM_000445 ENSG00000178209 PLEC EBS1|EBSMD|EBSND|EBSO|EBSOG|EBSPA|HD1|LGMD2Q|LGMDR17|PCN|PLEC1|PLEC1b|PLTN plectin protein-coding 213.5-121 chr8 62592896 62593154 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) L1MEc|LINE|L1 344171 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 141.5-15 chr10 17217032 17217300 + 1 NA intron (NR_108061, intron 1 of 2) intron (NR_108061, intron 1 of 2) 9732 NR_108060 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 194.25-32 chr14 70832503 70832738 + 1 NA Intergenic Intergenic -23107 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 142.25-149 chr6 161149969 161150155 + 1 NA intron (NM_020133, intron 5 of 8) intron (NM_020133, intron 5 of 8) 11920 NR_024277 79992 Hs.664873 NM_024929 ENSG00000279355 AGPAT4-IT1 C6orf59|NCRNA00241 AGPAT4 intronic transcript 1 ncRNA 183.25-15 chr10 93888017 93888322 + 1 NA Intergenic Intergenic -5809 NM_153226 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 245.75-50 chr5 149611495 149611959 + 1 NA intron (NM_001001669, intron 4 of 12) intron (NM_001001669, intron 4 of 12) 30229 NM_001001669 389337 Hs.256206 NM_001001669 ENSG00000183111 ARHGEF37 - Rho guanine nucleotide exchange factor 37 protein-coding 156.5-61 chr15 95333263 95333524 + 1 NA Intergenic Intergenic -6293 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 125.5-83 chr14 66683101 66683248 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 175767 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 266.25-2 chr1 160794864 160795384 + 1 NA Intergenic Intergenic -1050 NM_002348 4063 Hs.403857 NM_002348 ENSG00000122224 LY9 CD229|SLAMF3|hly9|mLY9 lymphocyte antigen 9 protein-coding 246.5-3 chr1 110351092 110351643 + 1 NA Intergenic Intergenic 12044 NM_022768 64783 Hs.435947 NM_022768 ENSG00000162775 RBM15 OTT|OTT1|SPEN RNA binding motif protein 15 protein-coding 158.5-126 chr3 11369166 11369445 + 1 NA intron (NM_001136031, intron 16 of 17) intron (NM_001136031, intron 16 of 17) 96908 NM_006395 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 152.25-6 chr1 187174507 187174672 + 1 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) L1MA8|LINE|L1 81747 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 185.75-26 chr11 111386900 111387132 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7741 NM_006235 5450 Hs.654525 NM_006235 ENSG00000110777 POU2AF1 BOB1|OBF-1|OBF1|OCAB POU class 2 homeobox associating factor 1 protein-coding 152.5-87 chr2 79423786 79423960 + 1 NA Intergenic Intergenic 76971 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 171.5-20 chr10 79065200 79065640 + 1 NA intron (NR_024431, intron 3 of 9) intron (NR_024431, intron 3 of 9) 2028 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 288.5-19 chr18 68778746 68779212 + 1 NA intron (NM_001093729, intron 3 of 9) intron (NM_001093729, intron 3 of 9) -19101 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 115.25-39 chr11 112251082 112251265 + 1 NA intron (NM_001145024, intron 3 of 3) intron (NM_001145024, intron 3 of 3) -9092 NR_133566 100132686 Hs.650455 NR_133566 ENSG00000268472 LOC100132686 - uncharacterized LOC100132686 ncRNA 208.5-50 chr16 63555740 63556061 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1519462 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 192.75-40 chr16 68819364 68819578 + 1 NA intron (NM_001317185, intron 11 of 15) intron (NM_001317185, intron 11 of 15) -24060 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 193.25-52 chr2 62028139 62028449 + 1 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) intron (NM_001321781, intron 2 of 2) 122652 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 134.5-11 chr1 94722817 94723117 + 1 NA intron (NR_160784, intron 1 of 3) L1ME3B|LINE|L1 22933 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 248.75-65 chrX 127693109 127693557 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 359070 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 195.5-118 chr5 77845611 77845903 + 1 NA Intergenic Intergenic -38899 NR_105012 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 320.25-7 chr12 3084240 3084651 + 1 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) intron (NM_006675, intron 2 of 8) 7066 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 146.5-166 chr5 11525027 11525283 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 63762 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 116.5-89 chr17 35576613 35576778 + 1 NA intron (NM_000286, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 1876 NM_000286 5193 Hs.591190 NM_000286 ENSG00000108733 PEX12 PAF-3|PBD3A peroxisomal biogenesis factor 12 protein-coding 132.25-150 chr5 29336426 29336662 + 1 NA Intergenic Intergenic 59432 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 183.25-80 chr5 25681307 25681524 + 1 NA Intergenic Intergenic 490462 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 210.5-137 chr8 129846560 129846943 + 1 NA intron (NM_001353307, intron 13 of 13) intron (NM_001353307, intron 13 of 13) -60127 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 174.5-53 chr12 86598848 86599143 + 1 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) intron (NM_001351285, intron 2 of 8) 146154 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 143.5-158 chr4 64197109 64197481 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 212155 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 157.25-109 chr4 106806231 106806473 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 229961 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 142.75-156 chr5 102663998 102664284 + 1 NA intron (NR_103753, intron 1 of 2) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 7323 NR_103753 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 119.5-202 chr6 142453367 142453547 + 1 NA Intergenic Intergenic 151450 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 234.5-19 chr12 64949673 64949953 + 1 NA intron (NR_146276, intron 3 of 3) intron (NR_146276, intron 3 of 3) 42478 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 286.5-61 chr7 48766665 48767065 + 1 NA Intergenic Intergenic -157682 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 239.5-63 chr6 37744018 37744434 + 1 NA Intergenic Intergenic -46343 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 180.5-130 chr6 73413148 73413366 + 1 NA intron (NM_018665, intron 11 of 16) L1MC5a|LINE|L1 18429 NM_018665 55510 Hs.125507 NM_018665 ENSG00000080007 DDX43 CT13|HAGE DEAD-box helicase 43 protein-coding 141.5-93 chr2 11017075 11017216 + 1 NA Intergenic Intergenic 105211 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 239.25-81 chr6 156273034 156273364 + 1 NA Intergenic Intergenic -105551 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 133.5-101 chr18 48802501 48802786 + 1 NA intron (NM_014772, intron 9 of 11) intron (NM_014772, intron 9 of 11) 132043 NR_039897 100616366 NR_039897 ENSG00000266276 MIR4743 - microRNA 4743 ncRNA 116.5-166 chr3 159698871 159699048 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 69653 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 199.75-15 chr11 99681137 99681656 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 125251 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 173.75-66 chr16 75258179 75258479 + 1 NA intron (NM_001170720, intron 1 of 7) intron (NM_001170720, intron 1 of 7) -6705 NM_001170717 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 170.5-52 chr13 89462469 89462807 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 37871 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 316.5-20 chr2 181178031 181178585 + 1 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 54471 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 124.5-76 chr16 72291742 72291946 + 1 NA intron (NR_126330, intron 9 of 13) intron (NR_126330, intron 9 of 13) -119394 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 164.5-11 chr1 154177244 154177505 + 1 NA intron (NM_152263, intron 2 of 9) intron (NM_152263, intron 2 of 9) 830 NM_001278191 7170 Hs.535581 NM_152263 ENSG00000143549 TPM3 CAPM1|CFTD|HEL-189|HEL-S-82p|NEM1|OK/SW-cl.5|TM-5|TM3|TM30|TM30nm|TM5|TPM3nu|TPMsk3|TRK|hscp30 tropomyosin 3 protein-coding 159.75-43 chr14 62010487 62010782 + 1 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) 82939 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 165.5-94 chr2 197428419 197428667 + 1 NA intron (NM_001005526, intron 1 of 4) intron (NM_001005526, intron 1 of 4) 6550 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 170.5-65 chr14 97828786 97829050 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -66087 NR_146447 100132612 Hs.587781 NR_146447 ENSG00000258869 LINC02312 - long intergenic non-protein coding RNA 2312 ncRNA 134.5-244 chr9 101755721 101755876 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -17218 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 157.75-109 chr3 99542155 99542393 + 1 NA Intergenic Intergenic -96320 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 133.75-110 chr2 218920384 218920545 + 1 NA intron (NR_110238, intron 3 of 4) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 10173 NR_110238 101928537 Hs.611129 NR_110238 ENSG00000228135 LINC01494 - long intergenic non-protein coding RNA 1494 ncRNA 366.25-14 chr7 38011694 38012139 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 90597 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 265.25-4 chr1 235166545 235166842 + 1 NA TTS (NM_016374) TTS (NM_016374) -5443 NR_144492 23029 Hs.535224 NM_015014 ENSG00000188739 RBM34 - RNA binding motif protein 34 protein-coding 204.75-104 chr6 143883628 143884059 + 1 NA intron (NM_001013623, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 19369 NM_001013623 153918 Hs.121188 NM_001013623 ENSG00000118491 ZC2HC1B C6orf94|FAM164B|dJ468K18.5 zinc finger C2HC-type containing 1B protein-coding 157.75-114 chr3 161035731 161036030 + 1 NA non-coding (NR_134243, exon 4 of 6) non-coding (NR_134243, exon 4 of 6) 68852 NM_001349161 8706 Hs.418062 NM_003781 ENSG00000169255 B3GALNT1 B3GALT3|GLCT3|GLOB|Gb4Cer|P|P1|beta3Gal-T3|galT3 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (globoside blood group) protein-coding 176.75-66 chr2 132422831 132423162 + 1 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 6191 NM_001508 2863 Hs.432395 NM_001508 ENSG00000183840 GPR39 - G protein-coupled receptor 39 protein-coding 138.25-138 chr5 43110718 43110961 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -10075 NM_001330709 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 116.25-71 chr14 78843810 78843973 + 1 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -356091 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 194.5-117 chr5 51028301 51028692 + 1 NA Intergenic Intergenic -58309 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 131.25-125 chr22 33612532 33612786 + 1 NA intron (NM_133642, intron 4 of 14) intron (NM_133642, intron 4 of 14) 92261 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 213.75-93 chr5 85419247 85419657 + 1 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -862992 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 144.25-75 chr17 54213143 54213308 + 1 NA Intergenic Intergenic 390298 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 231.5-35 chr17 39758638 39759077 + 1 NA 3' UTR (NM_183230, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_183230, exon 7 of 7) 18890 NM_001242443 2886 Hs.86859 NM_005310 ENSG00000141738 GRB7 - growth factor receptor bound protein 7 protein-coding 159.5-129 chr21 42332256 42332446 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16755 NM_003226 7033 Hs.82961 NM_003226 ENSG00000160180 TFF3 ITF|P1B|TFI trefoil factor 3 protein-coding 234.75-84 chr8 73480464 73480832 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 60574 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 121.5-230 chr6 138155276 138155449 + 1 NA Intergenic Intergenic -6577 NM_020340 57221 Hs.194408 NM_020340 ENSG00000112379 ARFGEF3 A7322|BIG3|C6orf92|KIAA1244|PPP1R33|dJ171N11.1 ARFGEF family member 3 protein-coding 119.5-262 chrX 94748412 94748690 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 314675 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 184.5-38 chr13 64716606 64716967 + 1 NA Intergenic Intergenic -640775 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 170.25-107 chr4 41732074 41732290 + 1 NA Intergenic Intergenic 16788 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 131.25-211 chr9 10636458 10636615 + 1 NA Intergenic Intergenic 23330 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 141.5-143 chr3 83989145 83989415 + 1 NA Intergenic Intergenic 880295 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 201.25-61 chr3 30277996 30278302 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -240719 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 180.25-10 chr11 45742611 45742971 + 1 NA Intergenic Intergenic 20483 NR_047569 100507384 Hs.259426 NR_047569 ENSG00000254519 LOC100507384 - uncharacterized LOC100507384 ncRNA 161.75-61 chr2 58883928 58884131 + 1 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) intron (NR_033873, intron 3 of 13) -333679 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 184.25-21 chr11 8927746 8928067 + 1 NA intron (NM_020643, intron 3 of 6) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 5041 NM_020643 56673 Hs.277349 NM_020643 ENSG00000176029 C11orf16 - chromosome 11 open reading frame 16 protein-coding 268.5-12 chr11 97450201 97450505 + 1 NA Intergenic Intergenic 941928 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 133.5-181 chr4 61099167 61099347 + 1 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -44399 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 165.25-90 chr3 110333532 110333722 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 730799 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 185.5-137 chr5 162098987 162099206 + 1 NA intron (NM_198904, intron 4 of 9) intron (NM_198904, intron 4 of 9) 31454 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 252.5-86 chr9 37670820 37671375 + 1 NA intron (NM_001371223, intron 1 of 15) intron (NM_001371223, intron 1 of 15) 3088 NM_001371223 127.5-55 chr12 28802590 28802791 + 1 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -346588 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 141.25-97 chr20 24427487 24427765 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -41573 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 188.25-108 chr7 81230734 81230938 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -308447 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 188.25-126 chrX 98538232 98538420 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -973791 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-109 chr2 123636022 123636268 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 389029 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 149.5-217 chr9 26843079 26843315 + 1 NA intron (NM_001167575, intron 5 of 5) intron (NM_001167575, intron 5 of 5) 49605 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 229.25-74 chr7 11825243 11825511 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR 6821 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 326.75-18 chr6 142070023 142070543 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 18516 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 184.75-92 chr7 12318281 12318583 + 1 NA Intergenic Intergenic 85433 NM_001135924 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 157.5-172 chr6 3845423 3845639 + 1 NA Intergenic Intergenic -3842 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 213.75-68 chr3 104582703 104583046 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -783839 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 189.5-93 chr3 167452215 167452556 + 1 NA intron (NM_001012303, intron 7 of 9) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 21747 NM_006217 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 194.5-26 chr11 108804724 108804979 + 1 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 139782 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 127.25-140 chr4 40691551 40691727 + 1 NA Intergenic Intergenic -58316 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 160.25-164 chr8 140926467 140926668 + 1 NA intron (NM_001352699, intron 1 of 35) intron (NM_001352699, intron 1 of 35) 74437 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 114.5-34 chr10 51767937 51768091 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -68419 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 277.75-19 chr22 41356117 41356436 + 1 NA intron (NM_017590, intron 20 of 22) intron (NM_017590, intron 20 of 22) -11057 NM_001145398 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 245.75-47 chr5 79328086 79328424 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 92124 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 194.5-40 chr14 75574050 75574365 + 1 NA TTS (NR_110552) TTS (NR_110552) -4413 NM_017791 55640 Hs.509966 NM_017791 ENSG00000119686 FLVCR2 C14orf58|CCT|EPV|FLVCRL14q|MFSD7C|PVHH|SLC49A2 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family member 2 protein-coding 241.25-33 chr2 42232042 42232361 + 1 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -61970 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 158.25-116 chr5 143371846 143372045 + 1 NA intron (NR_157096, intron 1 of 7) intron (NR_157096, intron 1 of 7) 31338 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 149.75-153 chr7 14925359 14925733 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 1 of 24) L1MD1|LINE|L1 -21890 NM_001350712 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 145.75-171 chrX 41112200 41112423 + 1 NA intron (NM_001039591, intron 1 of 44) intron (NM_001039591, intron 1 of 44) 26866 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 174.5-193 chr8 123026172 123026483 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363963) promoter-TSS (NM_001363963) -555 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 127.5-141 chr21 23658390 23658563 + 1 NA Intergenic Intergenic -273641 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 149.5-82 chr18 67011954 67012207 + 1 NA Intergenic Intergenic -69504 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 142.5-179 chr5 143346482 143346624 + 1 NA intron (NR_157096, intron 1 of 7) intron (NR_157096, intron 1 of 7) 56730 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 126.25-62 chr16 72014328 72014639 + 1 NA exon (NM_001361, exon 3 of 9) exon (NM_001361, exon 3 of 9) 5739 NM_001361 1723 Hs.654427 NM_001361 ENSG00000102967 DHODH DHOdehase|POADS|URA1 dihydroorotate dehydrogenase (quinone) protein-coding 151.25-24 chr10 91838277 91838597 + 1 NA intron (NM_025235, intron 13 of 26) intron (NM_025235, intron 13 of 26) 40011 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 217.25-52 chr22 29906792 29907203 + 1 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) AluSz|SINE|Alu 23823 NM_153051 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 184.75 chr1 43305253 43305502 + 1 NA intron (NM_001253357, intron 3 of 22) intron (NM_001253357, intron 3 of 22) 4395 NM_001253357 7075 Hs.78824 NM_005424 ENSG00000066056 TIE1 JTK14|TIE tyrosine kinase with immunoglobulin like and EGF like domains 1 protein-coding 165.5-164 chr6 71643444 71643714 + 1 NA Intergenic Intergenic 222552 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 201.5-122 chr7 82215824 82216096 + 1 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 206783 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 135.25-162 chr5 88494632 88494940 + 1 NA Intergenic Intergenic -55696 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 147.5-148 chr3 143945730 143945984 + 1 NA Intergenic Intergenic -25941 NM_173552 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 197.5-3 chr1 58323288 58323657 + 1 NA Intergenic Intergenic -72925 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 172.5-4 chr1 64041117 64041362 + 1 NA intron (NM_005012, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 70966 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-215 chr8 127649345 127649481 + 1 NA Intergenic Intergenic 84554 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 228.5-58 chr2 111026021 111026476 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 15 of 18) L1ME1|LINE|L1 89340 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 158.5-21 chr10 53279321 53279570 + 1 NA Intergenic Intergenic -507745 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 167.5 chr1 17204029 17204244 + 1 NA promoter-TSS (NM_013358).2 promoter-TSS (NM_013358).2 -992 NM_013358 29943 Hs.412941 NM_013358 ENSG00000142623 PADI1 HPAD10|PAD1|PDI|PDI1 peptidyl arginine deiminase 1 protein-coding 162.5-68 chr17 79569109 79569346 + 1 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) L1MB4|LINE|L1 41824 NM_001350451 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 235.25-27 chr17 62845476 62845729 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 37100 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 316.5-10 chr11 10598247 10598724 + 1 NA intron (NR_034094, intron 2 of 2) L1M|LINE|L1 -29820 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 162.5-13 chr10 35088921 35089202 + 1 NA intron (NM_001198777, intron 1 of 20) AluSq2|SINE|Alu 1280 NM_003591 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 325.25-33 chr8 101018683 101019163 + 1 NA Intergenic Intergenic -33131 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 150.25-59 chr15 91187299 91187535 + 1 NA intron (NM_001323040, intron 2 of 12) intron (NM_001323040, intron 2 of 12) 85621 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 194.5-94 chr3 109244324 109244826 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 66410 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 117.75-213 chr8 109493209 109493342 + 1 NA intron (NM_177531, intron 62 of 77) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46425 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 181.75-98 chr4 141671391 141671861 + 1 NA intron (NR_037840, intron 2 of 7) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 35043 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 270.5-33 chr20 10139455 10139842 + 1 NA intron (NR_040710, intron 2 of 4) intron (NR_040710, intron 2 of 4) -79150 NM_130811 6616 Hs.167317 NM_003081 ENSG00000132639 SNAP25 CMS18|RIC-4|RIC4|SEC9|SNAP|SNAP-25|SUP|bA416N4.2|dJ1068F16.2 synaptosome associated protein 25 protein-coding 134.75-59 chr14 28669624 28669850 + 1 NA Intergenic Intergenic 95582 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 200.5-40 chr14 72450439 72450692 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -66255 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 272.25-25 chr2 39601636 39602144 + 1 NA TTS (NR_037875) TTS (NR_037875) -63608 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 224.75-49 chr3 162699727 162700208 + 1 NA Intergenic Intergenic 603334 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 137.5-45 chr11 107887238 107887499 + 1 NA Intergenic Intergenic -28581 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 120.5-178 chr5 39364194 39364417 + 1 NA intron (NM_001737, intron 1 of 10) intron (NM_001737, intron 1 of 10) 190 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 175.5-52 chr14 69945364 69945634 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -32634 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 228.5-75 chr4 41073256 41073693 + 1 NA intron (NM_173075, intron 3 of 16) intron (NM_173075, intron 3 of 16) 141068 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 143.75-122 chr3 114778341 114778621 + 1 NA intron (NM_001164343, intron 4 of 11) intron (NM_001164343, intron 4 of 11) -19374 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 282.5-37 chr20 9282659 9283220 + 1 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -24861 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 243.75-70 chr5 132615377 132615996 + 1 NA intron (NM_005732, intron 19 of 24) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 26104 NR_132124 101927761 Hs.598812 NR_132124 ENSG00000223442 TH2LCRR TH2-LCR T helper type 2 locus control region associated RNA ncRNA 114.5-245 chr7 90106675 90106814 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -12656 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 129.25-66 chr17 32181159 32181388 + 1 NA intron (NM_001033566, intron 6 of 19) L2a|LINE|L2 -29702 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 179.5-89 chr2 37317714 37317961 + 1 NA promoter-TSS (NM_005813) promoter-TSS (NM_005813) -753 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 195.75-124 chr9 73205446 73205682 + 1 NA Intergenic Intergenic 53699 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 239.25-16 chr12 1215688 1216053 + 1 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) intron (NR_027948, intron 12 of 19) 188122 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 119.5-176 chr5 35538929 35539143 + 1 NA Intergenic Intergenic -78827 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 167.25-121 chr5 2953527 2953720 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 35769 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 268.25-45 chr8 78382439 78383082 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -133580 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 355.5-7 chr11 28742356 28742792 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -265026 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 339.25-23 chr6 140988658 140989107 + 1 NA Intergenic Intergenic 305068 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 196.5-12 chr1 179918140 179918504 + 1 NA 3' UTR (NM_015602, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_015602, exon 10 of 10) 36280 NM_001267578 26092 Hs.496459 NM_015602 ENSG00000143337 TOR1AIP1 LAP1|LAP1B|LGMD2Y torsin 1A interacting protein 1 protein-coding 264.5-57 chr7 87608481 87608894 + 1 NA intron (NM_001348945, intron 2 of 31) intron (NM_001348945, intron 2 of 31) -7803 NM_001348946 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 349.25-9 chr22 44159836 44160387 + 1 NA intron (NM_001243386, intron 10 of 11) intron (NM_001243386, intron 10 of 11) -12845 NM_001137605 64098 Hs.658995 NM_022141 ENSG00000138964 PARVG - parvin gamma protein-coding 149.25-60 chr17 44872662 44872962 + 1 NA intron (NM_001142605, intron 9 of 26) intron (NM_001142605, intron 9 of 26) 24929 NM_016438 51751 Hs.151787 NM_016438 ENSG00000131097 HIGD1B CLST11240|CLST11240-15 HIG1 hypoxia inducible domain family member 1B protein-coding 168.5-124 chr3 193113656 193114086 + 1 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -127351 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 185.25-102 chr5 90459011 90459214 + 1 NA 3' UTR (NM_203406, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_203406, exon 2 of 2) -14817 NM_001370354 10622 Hs.282387 NM_006467 ENSG00000113356 POLR3G RPC32|RPC7 RNA polymerase III subunit G protein-coding 196.5-57 chr16 6091674 6092105 + 1 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 72186 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 158.25-3 chr1 95902718 95903073 + 1 NA Intergenic Intergenic -89173 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 211.75-90 chr7 95334383 95334851 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -10085 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 254.25-33 chr2 119514627 119514967 + 1 NA intron (NM_002980, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu 9655 NM_002980 6344 Hs.42091 NM_002980 ENSG00000080293 SCTR SR secretin receptor protein-coding 145.25-97 chr22 50525810 50526076 + 1 NA promoter-TSS (NM_001169111) promoter-TSS (NM_001169111) 202 NM_001169110 9997 Hs.180903 NM_005138 ENSG00000130489 SCO2 CEMCOX1|ECGF1|Gliostatin|MYP6|PD-ECGF|SCO1L|TP|TYMP|TdRPase SCO cytochrome c oxidase assembly protein 2 protein-coding 133.5-69 chr12 115955426 115955607 + 1 NA Intergenic Intergenic 193138 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 374.5 chr1 84589472 84590081 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -15336 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 142.75-6 chr1 107682958 107683113 + 1 NA intron (NM_006113, intron 19 of 26) intron (NM_006113, intron 19 of 26) 5464 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 136.25-108 chr20 16026599 16026872 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) intron (NM_001351663, intron 15 of 17) -40853 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 211.5-155 chr8 77347957 77348213 + 1 NA Intergenic Intergenic -102612 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 155.75-109 chr3 129976297 129976464 + 1 NA intron (NM_007117, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 1660 NM_007117 7200 Hs.182231 NM_007117 ENSG00000170893 TRH Pro-TRH|TRF thyrotropin releasing hormone protein-coding 153.25-51 chr16 54251181 54251470 + 1 NA intron (NR_126340, intron 1 of 2) L1MB5|LINE|L1 19554 NR_126340 100996338 Hs.232014 NR_126340 LINC02169 - long intergenic non-protein coding RNA 2169 ncRNA 251.75-58 chr4 40666522 40666869 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -36101 NM_001371114 255.25-34 chr3 172297109 172297381 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 8 of 25) MER102b|DNA|hAT-Charlie 151211 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 135.5-152 chr4 130993928 130994097 + 1 NA Intergenic Intergenic 617651 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 133.25-153 chr4 77847328 77847525 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -15404 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 211.5-131 chr6 79557534 79557843 + 1 NA Intergenic Intergenic -20258 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 187.5-90 chr2 74078224 74078495 + 1 NA intron (NM_001287491, intron 5 of 11) L1ME4b|LINE|L1 69553 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 222.5-88 chr5 145504118 145504392 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 331087 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 279.25-14 chr14 70980920 70981359 + 1 NA intron (NM_001308160, intron 6 of 33) MIR|SINE|MIR 73680 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 196.75-55 chr2 53238291 53238522 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -529377 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 214.5-59 chr2 129820033 129820310 + 1 NA Intergenic Intergenic 57320 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 248.25-77 chr9 300606 301040 + 1 NA intron (NM_001193536, intron 3 of 46) L1PA16|LINE|L1 27775 NM_001193536 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 169.5-138 chr5 90655862 90656119 + 1 NA intron (NR_003149, intron 20 of 89) L1ME4a|LINE|L1 97193 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 263.25-23 chr16 14132954 14133485 + 1 NA intron (NM_001365418, intron 3 of 5) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -53467 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 183.75-122 chr8 60285539 60286006 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4372 NM_004056 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 302.5-32 chr5 14312681 14313154 + 1 NA intron (NM_007118, intron 8 of 56) intron (NM_007118, intron 8 of 56) -151066 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 233.5-74 chr3 173858128 173858421 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) 62522 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 211.5-106 chr3 150461211 150461519 + 1 NA non-coding (NR_130136, exon 5 of 5) non-coding (NR_130136, exon 5 of 5) 53067 NR_130136 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 247.25-24 chr17 72196555 72197046 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 75780 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 230.5-43 chr15 78989827 78990146 + 1 NA intron (NM_001145648, intron 22 of 26) MIR|SINE|MIR 11097 NR_148998 100129540 Hs.459035 NR_148998 ENSG00000177699 LOC100129540 - uncharacterized LOC100129540 ncRNA 188.5-127 chr5 162796868 162797193 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -640541 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 224.25-69 chr4 92292199 92292642 + 1 NA Intergenic Intergenic -11546 NM_001510 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 174.75-133 chr8 135507596 135507810 + 1 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) intron (NM_006558, intron 1 of 8) 50247 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 148.75-183 chrX 98739687 98739851 + 1 NA Intergenic Intergenic -1175234 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 145.25-83 chr2 217359903 217360187 + 1 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) intron (NR_026597, intron 8 of 12) 77312 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 183.5-129 chr7 6244431 6244722 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 28048 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 147.5-206 chr8 36754860 36755081 + 1 NA Intergenic Intergenic -29404 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 282.75-21 chr2 190419982 190420327 + 1 NA intron (NM_017694, intron 2 of 7) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 11799 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 272.5-54 chr5 72062196 72062495 + 1 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -45130 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 173.5-17 chr10 34157712 34157944 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -385148 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 134.5-182 chr5 133352950 133353111 + 1 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) HAL1|LINE|L1 74676 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 188.75-53 chr2 48060245 48060672 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -154665 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 194.5-142 chr7 46619199 46619470 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 77788 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 129.5-149 chr3 16619277 16619427 + 1 NA Intergenic Intergenic -13929 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 120.25-9 chr1 77206287 77206460 + 1 NA intron (NM_005482, intron 3 of 10) intron (NM_005482, intron 3 of 10) 13057 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 139.5-147 chr4 35268757 35268978 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 975072 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 192.25-30 chr16 46809375 46809660 + 1 NA intron (NR_145835, intron 3 of 4) intron (NR_145835, intron 3 of 4) 21531 NR_145837 388272 Hs.406551 NM_001001436 ENSG00000155330 C16orf87 - chromosome 16 open reading frame 87 protein-coding 120.75-42 chr14 66418845 66419044 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -67427 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 234.75-40 chr2 150266351 150266851 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -9594 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 141.25-28 chr11 14772553 14772760 + 1 NA intron (NM_000922, intron 2 of 15) L1ME3A|LINE|L1 119549 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 161.5-153 chr5 35024196 35024428 + 1 NA intron (NM_031900, intron 9 of 13) intron (NM_031900, intron 9 of 13) 23637 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 130.75-85 chr2 16740116 16740296 + 1 NA Intergenic Intergenic -74372 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 216.25-18 chr11 74080587 74081043 + 1 NA intron (NM_001286577, intron 22 of 32) MIRb|SINE|MIR -71578 NM_022803 7352 Hs.101337 NM_003356 ENSG00000175564 UCP3 SLC25A9 uncoupling protein 3 protein-coding 258.5-4 chr1 115914516 115915006 + 1 NA Intergenic Intergenic -4615 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 173.5-176 chr9 115363855 115364163 + 1 NA intron (NR_163556, intron 4 of 7) intron (NR_163556, intron 4 of 7) 222191 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 159.75-58 chr16 83074600 83074883 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) MIRb|SINE|MIR -84443 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 137.5-195 chr5 113560103 113560260 + 1 NA intron (NM_001345975, intron 16 of 28) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 46487 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 187.25-44 chr18 5072381 5072699 + 1 NA Intergenic Intergenic -8642 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 161.25-141 chr5 88575383 88575641 + 1 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) intron (NR_152235, intron 2 of 3) 91427 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 145.75-10 chr10 4334813 4335092 + 1 NA Intergenic Intergenic -49294 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 204.25-34 chr13 61340171 61340625 + 1 NA Intergenic Intergenic 75124 NM_022843 64881 Hs.391781 NM_022843 ENSG00000280165 PCDH20 PCDH13 protocadherin 20 protein-coding 186.75-23 chr12 96224950 96225357 + 1 NA intron (NM_005230, intron 2 of 4) intron (NM_005230, intron 2 of 4) -30345 NM_001303511 2004 Hs.46523 NM_005230 ENSG00000111145 ELK3 ERP|NET|SAP-2|SAP2 ETS transcription factor ELK3 protein-coding 143.25-153 chr6 8605692 8605860 + 1 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46433 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 201.75-102 chr8 113313030 113313334 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 63970 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 165.5-40 chr13 98839816 98840040 + 1 NA intron (NM_001366682, intron 38 of 53) intron (NM_001366682, intron 38 of 53) 7844 NR_046663 100874096 Hs.578066 NR_046663 ENSG00000229918 DOCK9-AS1 - DOCK9 antisense RNA 1 ncRNA 307.75-11 chr2 108103108 108103527 + 1 NA Intergenic Intergenic -50562 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 134.75-64 chr14 52669669 52669963 + 1 NA intron (NM_014584, intron 6 of 15) intron (NM_014584, intron 6 of 15) 25742 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 207.75-41 chr17 28105244 28105689 + 1 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) intron (NM_016231, intron 1 of 10) 62789 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 155.5-39 chr11 98616890 98617198 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -403905 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 234.25-4 chr1 111855944 111856281 + 1 NA intron (NR_046783, intron 1 of 1) intron (NR_046783, intron 1 of 1) 793 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 188.25-9 chr10 54060899 54061238 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) intron (NM_001354411, intron 19 of 34) -425162 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 133.75-95 chr2 44871012 44871213 + 1 NA Intergenic Intergenic 67776 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 161.25-115 chr3 5156063 5156281 + 1 NA intron (NM_018184, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -31535 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 205.75-73 chr6 64430701 64430941 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 28 of 43) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 623985 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 112.25-93 chr2 40278762 40278893 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 151477 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 214.25-18 chr12 23117003 23117395 + 1 NA Intergenic Intergenic -58437 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 232.5-33 chr16 4865332 4865603 + 1 NA intron (NM_001079514, intron 7 of 17) AluJb|SINE|Alu 17087 NM_001288656 29855 Hs.440219 NM_016936 ENSG00000118900 UBN1 VT|VT4 ubinuclein 1 protein-coding 182.5-171 chr8 136091958 136092456 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -438591 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 115.25-90 chr19 31892019 31892194 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -133756 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 197.25 chr1 10561474 10561758 + 1 NA intron (NM_004565, intron 3 of 8) L1MC4|LINE|L1 86666 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 164.5-21 chr10 70069697 70069901 + 1 NA intron (NM_018649, intron 1 of 8) intron (NM_018649, intron 1 of 8) 16953 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 226.25-9 chr10 44076279 44076644 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 164059 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 175.5-103 chr20 58747073 58747328 + 1 NA Intergenic Intergenic -26225 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 314.5-10 chr2 73917481 73918084 + 1 NA intron (NM_001615, intron 8 of 8) intron (NM_001615, intron 8 of 8) -9044 NR_134895 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 239.5-17 chr11 96221572 96222116 + 1 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -119594 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 142.5-232 chr8 137092324 137092517 + 1 NA Intergenic Intergenic 321168 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 124.5-40 chr11 93746907 93747094 + 1 NA intron (NM_001369406, intron 1 of 8) intron (NM_001369406, intron 1 of 8) 557 NM_001369406 28970 Hs.8360 NM_014039 ENSG00000182919 C11orf54 PTD012|PTOD012 chromosome 11 open reading frame 54 protein-coding 113.5-229 chr8 64053797 64053961 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 284449 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 145.75-104 chr3 128156861 128157122 + 1 NA intron (NM_021937, intron 1 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -3077 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 170.75-72 chr2 156910303 156910747 + 1 NA Intergenic Intergenic -347180 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 242.25-3 chr1 54987568 54988121 + 1 NA intron (NM_182532, intron 2 of 2) intron (NM_182532, intron 2 of 2) 7216 NM_182532 199964 Hs.663950 NM_182532 ENSG00000143001 TMEM61 - transmembrane protein 61 protein-coding 222.25-49 chr3 164458734 164459177 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -287399 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 193.5-53 chr15 62792252 62792530 + 1 NA intron (NM_015059, intron 42 of 55) intron (NM_015059, intron 42 of 55) -31566 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 258.5-45 chr22 48341198 48341571 + 1 NA Intergenic Intergenic 67020 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 249.75-22 chr15 60386820 60387119 + 1 NA intron (NM_004039, intron 1 of 12) intron (NM_004039, intron 1 of 12) 11017 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 187.75-25 chr12 124176125 124176418 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -112893 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 220.5-43 chr2 51162932 51163351 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 130540 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 127.5-139 chr20 58780157 58780372 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 6839 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 177.75-65 chr2 40403079 40403451 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 27039 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 157.75-108 chr3 96491691 96491930 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 131846 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 220.75-62 chr6 67991109 67991471 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -64061 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 308.5-14 chr18 3230962 3231365 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -11055 NM_003803 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 249.5-71 chr4 70094746 70095096 + 1 NA Intergenic Intergenic 27535 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 200.5-107 chr5 7271794 7272066 + 1 NA Intergenic Intergenic -2576 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 155.5-156 chr4 177793644 177793835 + 1 NA intron (NR_028342, intron 2 of 5) intron (NR_028342, intron 2 of 5) 64982 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 113.5-155 chr3 25611127 25611460 + 1 NA intron (NM_001330700, intron 28 of 35) intron (NM_001330700, intron 28 of 35) 53079 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 213.5-5 chr1 104045826 104046083 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -27069 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 185.75-138 chrX 152653687 152653977 + 1 NA 3' UTR (NM_018558, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018558, exon 9 of 9) 15937 NM_018558 55879 Hs.283081 NM_018558 ENSG00000268089 GABRQ THETA gamma-aminobutyric acid type A receptor theta subunit protein-coding 197.75-96 chr9 30489826 30490267 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -81592 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 116.25-119 chr2 172534968 172535130 + 1 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 -20324 NR_103731 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 266.5-33 chr2 83268554 83268892 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -254091 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 249.5-75 chr4 171329913 171330379 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 143962 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 169.75-52 chr15 62337015 62337316 + 1 NA Intergenic Intergenic -5864 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 253.75-27 chr20 22986457 22986852 + 1 NA Intergenic Intergenic -48766 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 168.5-184 chr8 115939064 115939269 + 1 NA Intergenic Intergenic -270191 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 147.75-47 chr16 89801988 89802147 + 1 NA intron (NM_001018112, intron 8 of 10) L1MA5A|LINE|L1 14580 NM_001351830 2175 Hs.744083 NM_000135 ENSG00000187741 FANCA FA|FA-H|FA1|FAA|FACA|FAH|FANCH FA complementation group A protein-coding 191.5-73 chr2 54791749 54792114 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) intron (NM_001039753, intron 1 of 40) 66919 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 196.25-89 chr4 29530183 29530433 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 316016 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 211.5-130 chr6 53111039 53111610 + 1 NA Intergenic Intergenic 37517 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 278.25-40 chr4 57417524 57418063 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -8079 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 133.75-62 chr14 66401110 66401439 + 1 NA Intergenic Intergenic -85097 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 126.75-130 chr20 13036881 13037077 + 1 NA intron (NM_001349945, intron 2 of 12) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 28007 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 305.25-41 chr6 40560595 40561013 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) MER112|DNA|hAT-Charlie 26560 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 300.5-23 chr2 24869589 24870173 + 1 NA intron (NM_001320613, intron 3 of 21) L1MEg|LINE|L1 50356 NM_001320613 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 118.5-134 chr3 136813343 136813510 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -5593 NM_001097599 80723 Hs.477692 NM_025246 ENSG00000168917 SLC35G2 TMEM22 solute carrier family 35 member G2 protein-coding 117.75-114 chr2 167298055 167298294 + 1 NA Intergenic Intergenic 110802 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 319.25-16 chr9 27602735 27603396 + 1 NA Intergenic LTR38A1|LTR|ERV1 -29199 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 340.75-24 chr8 109590684 109591286 + 1 NA intron (NM_001099754, intron 3 of 6) intron (NM_001099754, intron 3 of 6) 12474 NM_001363032 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 217.5-106 chr6 46691442 46691807 + 1 NA exon (NM_001168359, exon 1 of 3) exon (NM_001168359, exon 1 of 3) -3459 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 200.5-105 chr4 187079220 187079543 + 1 NA Intergenic Intergenic -122605 NR_147159 105377600 Hs.641158 NR_147159 LINC02374 - long intergenic non-protein coding RNA 2374 ncRNA 193.5-56 chr16 22904883 22905252 + 1 NA intron (NM_006043, intron 1 of 1) intron (NM_006043, intron 1 of 1) 90905 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 153.5-91 chr19 58307874 58308125 + 1 NA intron (NR_144445, intron 2 of 3) HERVK3-int|LTR|ERVK 2625 NR_144445 105372481 Hs.435404 NR_144445 ENSG00000142396 ERVK3-1 - endogenous retrovirus group K3 member 1 ncRNA 229.75-12 chr11 105733105 105733364 + 1 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 122528 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 223.5-77 chr3 10428401 10428740 + 1 NA intron (NM_001001331, intron 2 of 22) intron (NM_001001331, intron 2 of 22) -34008 NR_030614 100126334 NR_030614 ENSG00000216135 MIR885 MIRN885|hsa-mir-885|mir-885 microRNA 885 ncRNA 340.5-33 chr7 42961818 42962367 + 1 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 29716 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 192.75-14 chr10 56285908 56286384 + 1 NA Intergenic Intergenic 75113 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 167.5-162 chr6 62576582 62576899 + 1 NA Intergenic Intergenic -290513 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 176.75-49 chr17 17491595 17491908 + 1 NA 3' UTR (NM_018019, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_018019, exon 2 of 2) 4644 NM_001199989 51655 Hs.25829 NM_016084 ENSG00000108551 RASD1 AGS1|DEXRAS1|MGC:26290 ras related dexamethasone induced 1 protein-coding 227.5-115 chr9 95485048 95485463 + 1 NA intron (NM_000264, intron 3 of 23) intron (NM_000264, intron 3 of 23) 21646 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 158.25-128 chr7 6092786 6093007 + 1 NA Intergenic Intergenic -12053 NM_001365764 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 171.5-89 chr2 161029426 161029744 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -107370 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 194.25-120 chr8 128019307 128019586 + 1 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 10548 NR_031611 100302170 NR_031611 ENSG00000283200 MIR1206 MIRN1206|hsa-mir-1206 microRNA 1206 ncRNA 190.25-25 chr12 13284932 13285131 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 88305 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 184.25-107 chr6 52499650 52500078 + 1 NA 3' UTR (NM_012288, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_012288, exon 11 of 11) 77196 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 148.5-227 chr8 103136294 103136557 + 1 NA non-coding (NR_145429, exon 4 of 6) non-coding (NR_145429, exon 4 of 6) -4300 NM_001364874 79870 Hs.533446 NM_024812 ENSG00000164929 BAALC - BAALC binder of MAP3K1 and KLF4 protein-coding 230.5 chr1 6907099 6907456 + 1 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) intron (NM_001349608, intron 2 of 21) 121823 NM_015215 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 214.25-79 chr8 19996636 19996954 + 1 NA Intergenic Intergenic 57542 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 361.5-26 chr8 84252555 84253129 + 1 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) L1M6|LINE|L1 68176 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 117.5-127 chr20 41796230 41796358 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -177917 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 160.5-87 chr2 69532535 69532810 + 1 NA intron (NM_014911, intron 5 of 21) L2c|LINE|L2 -12501 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 150.5-173 chr5 83371618 83371910 + 1 NA Intergenic Intergenic -99910 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 319.25-4 chr14 45200297 45201103 + 1 NA 3' UTR (NM_020937, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_020937, exon 23 of 23) 52502 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 306.75-9 chr16 19851661 19852178 + 1 NA intron (NR_130968, intron 8 of 8) intron (NR_130968, intron 8 of 8) 32929 NM_016235 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 161.5-77 chr16 73949806 73950114 + 1 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 265561 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 218.5-51 chr18 64063779 64064076 + 1 NA Intergenic Intergenic -40164 NR_033881 284294 Hs.385642 NR_033881 ENSG00000267134 LINC01924 - long intergenic non-protein coding RNA 1924 ncRNA 302.5-41 chr7 9023790 9024279 + 1 NA Intergenic Intergenic 590425 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 140.25-31 chr11 17919295 17919505 + 1 NA intron (NR_104040, intron 9 of 11) intron (NR_104040, intron 9 of 11) 93647 NM_012139 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 211.25-35 chr17 58066281 58066617 + 1 NA Intergenic Intergenic 16755 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 195.25-23 chr12 53982216 53982597 + 1 NA Intergenic Intergenic -2740 NM_017409 3226 Hs.44276 NM_017409 ENSG00000180818 HOXC10 HOX3I homeobox C10 protein-coding 137.5-204 chr6 40530350 40530575 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 56902 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 232.75-35 chr2 190730546 190730902 + 1 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie 71566 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 247.75-40 chr3 171794806 171795149 + 1 NA intron (NM_002662, intron 1 of 26) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 15506 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 153.75-63 chr2 52302777 52302947 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1ME3|LINE|L1 -67786 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 200.75-60 chr2 211208890 211209198 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 591473 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 226.25-27 chr14 78324186 78324482 + 1 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) L2b|LINE|L2 -79385 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 133.5-83 chr14 76058749 76058964 + 1 NA 3' UTR (NM_001255995, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001255995, exon 4 of 4) 73093 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 179.75-18 chr10 84931426 84931727 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 267329 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 205.5-152 chr8 124580553 124581130 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 6 of 14) intron (NM_001282971, intron 6 of 14) 41718 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 355.5-15 chr2 75184019 75184624 + 1 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 15199 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 228.5-37 chr15 34948953 34949305 + 1 NA intron (NM_014691, intron 4 of 34) AluSp|SINE|Alu 20613 NM_014691 9716 Hs.510958 NM_014691 ENSG00000021776 AQR IBP160|fSAP164 aquarius intron-binding spliceosomal factor protein-coding 332.75-13 chr2 192977100 192977629 + 1 NA Intergenic Intergenic 227519 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 336.5-22 chr5 7124731 7125256 + 1 NA Intergenic Intergenic 144361 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 174.75-85 chr3 157538859 157539137 + 1 NA Intergenic Intergenic -4314 NR_024016 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 231.75-62 chr5 66072697 66073132 + 1 NA intron (NM_001253697, intron 22 of 25) intron (NM_001253697, intron 22 of 25) -71386 NM_001323529 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 167.75-90 chr22 40831181 40831568 + 1 NA intron (NM_003932, intron 8 of 11) intron (NM_003932, intron 8 of 11) -11975 NM_001282726 10478 Hs.474938 NM_006358 ENSG00000100372 SLC25A17 PMP34 solute carrier family 25 member 17 protein-coding 170.5-191 chr8 118065853 118066069 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 45858 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 180.5-144 chr7 90527326 90527762 + 1 NA Intergenic Intergenic 57905 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 277.5-79 chr9 118416787 118417112 + 1 NA Intergenic Intergenic -262722 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 153.75-113 chr5 52287589 52287904 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 279715 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 164.5-66 chr14 94654861 94655071 + 1 NA Intergenic Intergenic 14241 NR_015340 388007 Hs.527795 NR_015340 ENSG00000187483 SERPINA13P SERPINA13|UNQ6121 serpin family A member 13, pseudogene pseudo 123.75-89 chr2 51762468 51762707 + 1 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -608061 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 206.75-49 chr21 45371781 45372081 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -29941 NR_103811 388830 Hs.592162 NR_103811 ENSG00000237664 LINC00316 C21orf111|NCRNA00316|PRED59 long intergenic non-protein coding RNA 316 ncRNA 277.25-26 chr22 42408970 42409480 + 1 NA intron (NM_001318323, intron 2 of 4) intron (NM_001318323, intron 2 of 4) 23134 NM_001318323 150372 Hs.436677 NM_145912 ENSG00000235568 NFAM1 CNAIP NFAT activating protein with ITAM motif 1 protein-coding 144.25-170 chr6 74880999 74881183 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 247691 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 364.75-7 chr21 22606207 22606721 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -472820 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 137.75-194 chr7 40252067 40252320 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) AluJo|SINE|Alu 117217 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 175.5-46 chr13 87499135 87499418 + 1 NA intron (NR_033829, intron 2 of 5) intron (NR_033829, intron 2 of 5) 119464 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 190.5-57 chr16 10676822 10677165 + 1 NA intron (NM_144674, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu 17937 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 176.75-55 chr19 49459625 49459873 + 1 NA exon (NM_153329, exon 4 of 17) exon (NM_153329, exon 4 of 17) 6524 NM_153329 126133 Hs.719998 NM_153329 ENSG00000161618 ALDH16A1 - aldehyde dehydrogenase 16 family member A1 protein-coding 161.25-126 chr3 105595772 105595975 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 228964 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 151.25-102 chr20 21874841 21875006 + 1 NA Intergenic Intergenic 169259 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 164.5-204 chr8 79099660 79099915 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -232401 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 153.5-214 chr9 75289600 75289865 + 1 NA Intergenic Intergenic 201218 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 124.25-167 chr5 92155741 92155896 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -772501 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 239.75-60 chr5 112320195 112320458 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) intron (NM_001347887, intron 1 of 23) 92043 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 262.5-19 chr14 68187087 68187500 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1PA16|LINE|L1 363701 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 245.25-5 chr1 189154515 189154866 + 1 NA Intergenic Intergenic 1321320 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 172.25-17 chr10 53437392 53437587 + 1 NA Intergenic Intergenic -665789 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 198.25-23 chr11 84836276 84836641 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIRb|SINE|MIR 86963 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 268.75-11 chr13 59167975 59168454 + 1 NA Intergenic Intergenic -844504 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 181.25-80 chr3 33891417 33891763 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 92960 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 267.5-39 chr2 173098028 173098398 + 1 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 22367 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 187.25-21 chr11 96075860 96076064 + 1 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) intron (NM_032427, intron 2 of 4) -151755 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 273.25-34 chr6 62487816 62488208 + 1 NA Intergenic Intergenic -201785 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 115.75-50 chr12 122186159 122186327 + 1 NA exon (NM_001098519, exon 3 of 12) exon (NM_001098519, exon 3 of 12) 3120 NM_001098519 254050 Hs.374856 NM_152759 ENSG00000158113 LRRC43 - leucine rich repeat containing 43 protein-coding 156.5-21 chr10 116327543 116327841 + 1 NA intron (NM_198515, intron 3 of 8) intron (NM_198515, intron 3 of 8) 3244 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 192.25-26 chr14 32478330 32478546 + 1 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) intron (NM_004274, intron 2 of 13) 149140 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 264.5-6 chr10 22742198 22742695 + 1 NA Intergenic Intergenic -27868 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 140.5-76 chr15 87452817 87453081 + 1 NA Intergenic Intergenic -123980 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 229.5-103 chr5 7151471 7151761 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 117738 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 285.5-50 chr6 17841428 17842044 + 1 NA intron (NM_001105567, intron 9 of 36) intron (NM_001105567, intron 9 of 36) 134693 NR_134618 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 183.5-148 chr8 85260814 85261165 + 1 NA intron (NM_198584, intron 3 of 6) intron (NM_198584, intron 3 of 6) 15531 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 182.5-61 chr16 69840635 69841087 + 1 NA intron (NM_001270453, intron 2 of 20) intron (NM_001270453, intron 2 of 20) 2124 NM_001270453 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 166.5-210 chr9 29485315 29485666 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -271889 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 132.75-15 chr1 217343480 217343725 + 1 NA Intergenic Intergenic -205900 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 116.5-256 chr8 126089960 126090173 + 1 NA Intergenic Intergenic -138869 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 154.25-27 chr11 86375802 86376078 + 1 NA intron (NM_001156474, intron 1 of 14) intron (NM_001156474, intron 1 of 14) 1053 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 257.25-41 chr5 56954889 56955319 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -2974 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 151.25-165 chr6 154839924 154840206 + 1 NA Intergenic Intergenic -13295 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 231.25-57 chr3 197818644 197818939 + 1 NA intron (NM_001365717, intron 3 of 19) intron (NM_001365717, intron 3 of 19) 27537 NM_001365715 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 184.25-44 chr17 44567598 44567845 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 10237 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 212.5-89 chr5 153851446 153851719 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 47405 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 185.25-42 chr15 94273014 94273374 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -25007 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 131.75-155 chr4 94503286 94503435 + 1 NA intron (NM_001256428, intron 2 of 11) intron (NM_001256428, intron 2 of 11) 51418 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 134.5-226 chr8 99685007 99685171 + 1 NA intron (NM_017890, intron 35 of 61) AluSg7|SINE|Alu -148228 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 207.75-19 chr11 80967544 80967793 + 1 NA Intergenic Intergenic -204865 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 199.5-67 chr19 27968492 27968736 + 1 NA intron (NR_146734, intron 5 of 7) intron (NR_146734, intron 5 of 7) -174674 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 299.75-21 chr5 19122009 19122441 + 1 NA Intergenic Intergenic 764047 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 158.75-60 chr15 80908267 80908602 + 1 NA intron (NM_001293304, intron 13 of 29) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -66361 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 167.75-3 chr1 30675463 30675739 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -43171 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 245.75-19 chr15 95929280 95929601 + 1 NA Intergenic Intergenic 198401 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 237.5-18 chr10 71632722 71633068 + 1 NA intron (NM_052836, intron 11 of 12) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 86883 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 153.25-116 chr6 138558892 138559061 + 1 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 13593 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 410.25-8 chr2 217020728 217021476 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 150330 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 123.5-63 chr14 78661614 78661831 + 1 NA intron (NR_073547, intron 6 of 20) L3|LINE|CR1 258003 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 148.5-139 chr22 48253917 48254181 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -20315 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 285.75-32 chr3 172224054 172224507 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 183749 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 276.25-31 chr4 27312249 27312691 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 94991 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 180.25-17 chr12 39007998 39008289 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -102552 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 174.5-128 chr3 151944027 151944280 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -15978 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-86 chr18 7874533 7874722 + 1 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 307311 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 382.75-6 chr3 130345351 130345886 + 1 NA non-coding (NR_022012, exon 1 of 42) non-coding (NR_022012, exon 1 of 42) 102 NM_001278298 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 243.5-52 chr3 118033647 118034074 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -342935 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 255.75-8 chr10 57402860 57403192 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -98467 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 137.75-53 chr13 102301162 102301349 + 1 NA intron (NM_001321941, intron 1 of 5) intron (NM_001321941, intron 1 of 5) 9431 NM_001321932 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 187.5-155 chr7 40101194 40101463 + 1 NA Intergenic Intergenic 33294 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 280.75-20 chr18 8239765 8240255 + 1 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 127024 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 173.5-137 chr6 17448901 17449112 + 1 NA intron (NM_001363534, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu 55411 NM_006366 10486 Hs.132902 NM_006366 ENSG00000112186 CAP2 - cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 2 protein-coding 132.5-80 chr15 85807309 85807569 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -12514 NM_022480 64410 Hs.498371 NM_022480 ENSG00000183655 KLHL25 ENC-2|ENC2 kelch like family member 25 protein-coding 135.25-166 chr5 113318235 113318442 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) -23400 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 245.25-74 chr9 77973675 77974131 + 1 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) intron (NM_002072, intron 1 of 6) 57908 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 146.5-86 chr17 79555145 79555331 + 1 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR -39090 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 164.25-154 chr8 117333940 117334162 + 1 NA Intergenic Intergenic -186662 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 229.5-59 chr2 46079991 46080277 + 1 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) intron (NM_005400, intron 10 of 14) -217273 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 319.75-7 chr14 48979453 48979818 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 606745 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 248.5-29 chr14 79351514 79351828 + 1 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 72291 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 155.5-58 chr15 59319134 59319355 + 1 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu 53627 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 163.75-34 chr12 76636133 76636529 + 1 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -76560 NM_001319652 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 341.25-16 chr2 146763792 146764188 + 1 NA Intergenic MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR 176933 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 140.25-44 chr13 108323208 108323436 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 53693 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 168.75-86 chr21 20491477 20491717 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -232912 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 165.5-127 chr4 54828091 54828319 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 170277 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 131.75-168 chr5 59281192 59281411 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -5186 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 212.25-56 chr3 30136113 30136376 + 1 NA Intergenic Intergenic -202088 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 168.5-8 chr1 91351522 91351702 + 1 NA exon (NM_001017975, exon 17 of 39) exon (NM_001017975, exon 17 of 39) 53225 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 254.75-49 chr7 1040713 1041079 + 1 NA intron (NM_001134395, intron 2 of 4) intron (NM_001134395, intron 2 of 4) -3650 NM_001303473 115330 Hs.585007 NM_138445 ENSG00000164849 GPR146 PGR8 G protein-coupled receptor 146 protein-coding 324.25-15 chrX 53626349 53626967 + 1 NA intron (NM_031407, intron 17 of 83) intron (NM_031407, intron 17 of 83) 60061 NM_031407 10075 Hs.136905 NM_031407 ENSG00000086758 HUWE1 ARF-BP1|HECTH9|HSPC272|Ib772|LASU1|MRXST|MULE|URE-B1|UREB1 HECT, UBA and WWE domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 441.25-8 chr6 128659627 128660279 + 1 NA Intergenic Intergenic -139354 NM_001291984 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 116.75-51 chr13 42649267 42649499 + 1 NA Intergenic Intergenic 75231 NM_003701 8600 Hs.333791 NM_003701 ENSG00000120659 TNFSF11 CD254|ODF|OPGL|OPTB2|RANKL|TNLG6B|TRANCE|hRANKL2|sOdf TNF superfamily member 11 protein-coding 153.5-22 chr10 62409129 62409308 + 1 NA intron (NM_199451, intron 3 of 7) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -34091 NR_104162 283045 NR_104162 LOC283045 - uncharacterized LOC283045 ncRNA 168.75-117 chr5 170952989 170953231 + 1 NA intron (NM_022897, intron 12 of 27) intron (NM_022897, intron 12 of 27) 91092 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 131.75-143 chr3 190116845 190117140 + 1 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 3905 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 199.5-44 chr14 69650721 69651054 + 1 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 39291 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 191.75-92 chr4 67341441 67341709 + 1 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 80425 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 157.25-124 chr5 103768549 103768886 + 1 NA Intergenic Intergenic -205928 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 177.25-115 chr5 41583137 41583481 + 1 NA Intergenic Intergenic -72708 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 126.25-172 chr6 25772498 25772717 + 1 NA intron (NM_005495, intron 6 of 11) intron (NM_005495, intron 6 of 11) 17865 NM_005495 10050 Hs.282931 NM_005495 ENSG00000146039 SLC17A4 KAIA2138 solute carrier family 17 member 4 protein-coding 202.5-135 chr7 32579754 32580027 + 1 NA intron (NM_015060, intron 13 of 15) MER5B|DNA|hAT-Charlie 84401 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 158.25-94 chr3 148264438 148264675 + 1 NA Intergenic Intergenic -16335 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 187.5-44 chr12 109085511 109085831 + 1 NA exon (NM_032663, exon 13 of 13) exon (NM_032663, exon 13 of 13) 7801 NM_001145374 121642 Hs.374458 NM_001001655 ENSG00000189046 ALKBH2 ABH2 alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 185.5-33 chr12 32433614 32433849 + 1 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) 34173 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 225.5-53 chr2 21537135 21537430 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 173370 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 218.75-55 chr3 82457929 82458272 + 1 NA non-coding (NR_147146, exon 8 of 9) non-coding (NR_147146, exon 8 of 9) 471958 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 133.5-180 chr4 45789650 45789868 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 334295 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 205.5-37 chr13 101684033 101684270 + 1 NA intron (NM_001271754, intron 6 of 10) L1ME3B|LINE|L1 194199 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 162.5-191 chr9 73767504 73767694 + 1 NA Intergenic Intergenic -603932 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 174.5-87 chr18 22917442 22917669 + 1 NA Intergenic Intergenic -15773 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 300.25-19 chr3 72679175 72679517 + 1 NA Intergenic Intergenic -15097 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 257.5-29 chr17 68874825 68875158 + 1 NA intron (NM_001288985, intron 37 of 39) intron (NM_001288985, intron 37 of 39) 80401 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 267.75-56 chr8 52618309 52618647 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -53048 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 357.5-22 chr9 85355767 85356190 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 386051 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 123.25-171 chr5 144565013 144565143 + 1 NA Intergenic L1HS|LINE|L1 359687 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 162.25-86 chr2 155310685 155310878 + 1 NA Intergenic Intergenic 612086 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 322.25-6 chr17 22128232 22128693 + 1 NA Intergenic Intergenic -74533 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 174.75-34 chr14 71122115 71122291 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -198273 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 216.75-86 chr9 135460920 135461343 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 11118 NR_038969 100506599 Hs.561897 NR_038969 ENSG00000225361 PPP1R26-AS1 - PPP1R26 antisense RNA 1 ncRNA 209.25-64 chr2 236675882 236676225 + 1 NA Intergenic Intergenic 106228 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 216.5-63 chr2 182506584 182506964 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 15752 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 131.5-71 chr15 60810222 60810447 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) HAL1|LINE|L1 128765 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 304.5-32 chr6 121493861 121494384 + 1 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 58476 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 188.75-35 chr16 54613614 54613841 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 234506 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 157.5-55 chr14 44906047 44906237 + 1 NA 3' UTR (NM_001017923, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001017923, exon 5 of 5) 5775 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 305.5-20 chr2 63725957 63726328 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -114822 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 297.75-52 chr8 122925213 122925719 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 100306 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 174.75-69 chr2 211756340 211756621 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 4 of 26) intron (NM_001042599, intron 4 of 26) 669880 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 247.75-12 chr14 46072150 46072725 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 8278 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 136.75-182 chr7 18635974 18636117 + 1 NA intron (NM_058176, intron 7 of 22) intron (NM_058176, intron 7 of 22) 126775 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 335.5-17 chr8 123780454 123780866 + 1 NA intron (NM_144963, intron 8 of 23) intron (NM_144963, intron 8 of 23) 12221 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 155.75-119 chr4 87308746 87309020 + 1 NA intron (NM_178135, intron 6 of 6) L1M5|LINE|L1 -8300 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 238.75-33 chr21 28744481 28744868 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 140693 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 276.75-29 chr21 29611239 29611577 + 1 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) LTR37B|LTR|ERV1 15368 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 168.5-171 chr7 53187913 53188091 + 1 NA Intergenic Intergenic 152369 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 213.75-75 chr4 38229944 38230384 + 1 NA Intergenic Intergenic 110210 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 126.75-161 chr3 185791131 185791289 + 1 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) L2b|LINE|L2 -23306 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 134.5-23 chr10 32543032 32543283 + 1 NA intron (NR_109826, intron 11 of 16) intron (NR_109826, intron 11 of 16) 97017 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 323.25-28 chr8 120987194 120987775 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -175438 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 167.5-77 chr18 4124302 4124607 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -140148 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 238.75-69 chr9 90542917 90543347 + 1 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 39614 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 234.5-76 chr5 57553457 57553865 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -16681 NR_120607 100996645 Hs.582496 NR_120607 LINCR-0003 - uncharacterized LincR-0003 ncRNA 182.5-177 chr9 79013687 79013952 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 131847 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 163.5-188 chr7 8423489 8423783 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9973 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 132.25-47 chr12 37809832 37810036 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -506840 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 143.25-73 chr17 81224827 81225042 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -1969 NM_001009811 22994 Hs.514578 NM_014984 ENSG00000141577 CEP131 AZ1|AZI1|ZA1 centrosomal protein 131 protein-coding 115.5-142 chr2 201279394 201279590 + 1 NA intron (NR_111983, intron 7 of 8) HAL1|LINE|L1 18956 NM_033356 841 Hs.599762 NM_001228 ENSG00000064012 CASP8 ALPS2B|CAP4|Casp-8|FLICE|MACH|MCH5 caspase 8 protein-coding 187.5-55 chr14 44934306 44934629 + 1 NA exon (NM_001308112, exon 3 of 5) exon (NM_001308112, exon 3 of 5) -22550 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 127.75-172 chr6 63974579 63974747 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 167827 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 172.5-172 chr6 133179584 133179819 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -61656 NM_001370458 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 296.75-35 chr8 133943445 133943934 + 1 NA Intergenic Intergenic 57193 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 254.25-14 chr11 41639741 41640033 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -74681 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 290.75-23 chr2 15689209 15689569 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1393 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 221.75-47 chr4 33028718 33029054 + 1 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 677848 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 137.75-61 chr14 63098999 63099223 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -53653 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 118.5-111 chr2 204371290 204371465 + 1 NA Intergenic Intergenic -174098 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 117.75-81 chr17 58755050 58755211 + 1 NA promoter-TSS (NR_048561) promoter-TSS (NR_048561) -724 NM_014906 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 130.75-196 chr8 120726894 120727037 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -34288 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 224.75-42 chr2 210031996 210032224 + 1 NA intron (NM_152519, intron 8 of 14) intron (NM_152519, intron 8 of 14) 2188 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 209.75-22 chr12 102653001 102653347 + 1 NA Intergenic Intergenic 171225 NR_033855 283432 Hs.382110 NR_033855 ENSG00000258169 LINC00485 - long intergenic non-protein coding RNA 485 ncRNA 136.5-124 chr2 198177581 198177764 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 197425 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 118.5-115 chr20 44719253 44719466 + 1 NA intron (NR_132377, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 4515 NM_003881 8839 Hs.592145 NM_003881 ENSG00000064205 CCN5 CT58|CTGF-L|WISP2 cellular communication network factor 5 protein-coding 239.25-85 chr7 105591809 105592181 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10453 NM_001355531 100130771 Hs.719432 NM_001355526 ENSG00000185055 EFCAB10 - EF-hand calcium binding domain 10 protein-coding 186.75-64 chr20 52851678 52851981 + 1 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu -120529 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 143.25-94 chr2 169612595 169612873 + 1 NA intron (NM_004792, intron 7 of 13) L1MB4|LINE|L1 28383 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 162.75-7 chr1 119721266 119721532 + 1 NA intron (NM_006623, intron 2 of 11) intron (NM_006623, intron 2 of 11) 9465 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 179.75-76 chr3 106732340 106732623 + 1 NA Intergenic Intergenic 508157 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 166.5-148 chr4 95801843 95802075 + 1 NA Intergenic Intergenic -38134 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 238.5-48 chr20 2578574 2578866 + 1 NA intron (NM_080751, intron 5 of 19) L1M6|LINE|L1 42113 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 126.75-158 chr3 156728364 156728508 + 1 NA Intergenic Intergenic 51772 NM_001184718 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 226.75-31 chr2 39926842 39927184 + 1 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 9379 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 215.75-77 chr5 57861838 57862106 + 1 NA Intergenic Intergenic 37190 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 147.5-50 chr12 65725019 65725218 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -82746 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 307.25-32 chr5 131039811 131040192 + 1 NA Intergenic Intergenic 125255 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 176.5-102 chr2 176464345 176464636 + 1 NA Intergenic Intergenic 136562 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 296.5-23 chr3 28218279 28218705 + 1 NA Intergenic Intergenic -23127 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 126.5-11 chr1 89109200 89109424 + 1 NA intron (NM_004120, intron 10 of 10) intron (NM_004120, intron 10 of 10) 16802 NM_004120 2634 Hs.386567 NM_004120 ENSG00000162645 GBP2 - guanylate binding protein 2 protein-coding 176.5-177 chr8 129283513 129283727 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -42380 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 202.5-70 chr2 60314202 60314469 + 1 NA Intergenic Intergenic 68701 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 180.5-20 chr11 106140935 106141115 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -8909 NR_135099 105369473 Hs.524010 NR_135099 ENSG00000254580 LINC02719 - long intergenic non-protein coding RNA 2719 ncRNA 188.75-70 chr21 17121117 17121389 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -317637 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 129.25-205 chr8 119621139 119621281 + 1 NA intron (NM_001330600, intron 4 of 25) intron (NM_001330600, intron 4 of 25) 17629 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 134.25-140 chr5 46304905 46305213 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -608679 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 155.25-19 chr1 225513517 225513826 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 7 of 14) L1MC4|LINE|L1 -84816 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 163.5-115 chr20 62408481 62408705 + 1 NA Intergenic Intergenic -1310 NM_031215 81928 Hs.301040 NM_031215 ENSG00000149679 CABLES2 C20orf150|dJ908M14.2|ik3-2 Cdk5 and Abl enzyme substrate 2 protein-coding 150.25-8 chr1 115022272 115022486 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -7445 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 144.25-72 chr16 58818239 58818415 + 1 NA Intergenic (GTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -84011 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 232.25-81 chr8 106262202 106262559 + 1 NA Intergenic Intergenic -7798 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 211.5-37 chr12 34208186 34208441 + 1 NA Intergenic Intergenic 185817 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 196.5-59 chr16 23881809 23882021 + 1 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) L1MB2|LINE|L1 45932 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 136.5-86 chr16 79180118 79180366 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 420495 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 211.5-134 chr6 102882853 102883386 + 1 NA Intergenic Intergenic 1484134 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 215.5-45 chr18 31183234 31183610 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20566 NM_024421 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 121.5-13 chr1 92956359 92956540 + 1 NA intron (NM_001006605, intron 1 of 4) intron (NM_001006605, intron 1 of 4) 5013 NM_001006605 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 192.25-106 chr8 138424779 138425090 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 72327 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 178.75-74 chr4 112128519 112128854 + 1 NA Intergenic Intergenic -16768 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 152.25-27 chr10 100192859 100193066 + 1 NA intron (NM_001320928, intron 19 of 20) intron (NM_001320928, intron 19 of 20) -6933 NM_001347859 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 139.75-181 chr8 138104411 138104796 + 1 NA Intergenic Intergenic -21058 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 151.5-180 chr7 45675145 45675361 + 1 NA intron (NM_021116, intron 8 of 19) L1MD1|LINE|L1 93765 NR_024271 641977 Hs.723477 NR_024271 ENSG00000214765 SEPTIN7P2 SEPT13|SEPT7B|SEPT7P2 septin 7 pseudogene 2 pseudo 136.25-9 chr1 210783320 210783583 + 1 NA intron (NM_002238, intron 9 of 10) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 349923 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 197.5-102 chr3 130676412 130676666 + 1 NA 3' UTR (NM_001102608, exon 36 of 36) 3' UTR (NM_001102608, exon 36 of 36) 70290 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 277.75-35 chr8 124077618 124078018 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 32 of 40) intron (NM_001039112, intron 32 of 40) -37036 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 166.25-47 chr14 69059726 69059957 + 1 NA intron (NM_003861, intron 8 of 8) intron (NM_003861, intron 8 of 8) 80159 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 179.5-181 chr8 82678024 82678251 + 1 NA Intergenic Intergenic -233967 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 264.5-63 chr8 118925064 118925497 + 1 NA intron (NM_002546, intron 4 of 4) intron (NM_002546, intron 4 of 4) 26605 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 166.25-114 chr4 54571560 54571848 + 1 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 35427 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 334.75-22 chr3 130667526 130668066 + 1 NA intron (NM_001102608, intron 35 of 35) L1MEd|LINE|L1 79033 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 185.25-62 chr2 150373273 150373531 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 114293 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 198.25-27 chr13 69601926 69602287 + 1 NA Intergenic Intergenic 379760 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 175.25-30 chr11 112052680 112052915 + 1 NA intron (NM_001931, intron 11 of 13) MER21B|LTR|ERVL 21374 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 219.5-69 chr2 75225326 75225678 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -25982 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 179.25-58 chr16 59605001 59605245 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 150068 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 368.5-20 chr9 16725386 16725939 + 1 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -1152 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 273.5-18 chr12 8649218 8649629 + 1 NA intron (NR_123734, intron 8 of 9) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 13403 NR_123734 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 137.5-68 chr14 67955387 67955628 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 131915 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 196.5-169 chr8 122809389 122809706 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 27892 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 226.25-17 chr11 61793882 61794147 + 1 NA intron (NM_004111, intron 1 of 1) FRAM|SINE|Alu 1103 NM_004111 2237 Hs.409065 NM_004111 ENSG00000168496 FEN1 FEN-1|MF1|RAD2 flap structure-specific endonuclease 1 protein-coding 126.75-119 chr2 160369624 160369838 + 1 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 38151 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 158.25-93 chr3 126768212 126768448 + 1 NA intron (NM_032343, intron 4 of 7) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 64090 NM_032343 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 180.5-75 chr2 141565211 141565495 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 566348 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 186.5-16 chr10 37957963 37958201 + 1 NA intron (NR_138064, intron 2 of 6) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 17898 NR_138069 219749 Hs.499429 NM_145011 ENSG00000175395 ZNF25 KOX19|Zfp9 zinc finger protein 25 protein-coding 127.5-89 chr15 62510080 62510261 + 1 NA Intergenic Intergenic 135011 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 142.25-114 chr3 177016771 177017078 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 179554 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 256.25-25 chr21 21196963 21197286 + 1 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 49962 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 119.5-159 chr3 173380819 173381011 + 1 NA Intergenic Intergenic -15037 NM_001365924 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 230.5-111 chr8 82161260 82161580 + 1 NA Intergenic Intergenic -319134 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 117.75-149 chr4 31935022 31935254 + 1 NA Intergenic Intergenic -62241 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 228.75-16 chr14 34990519 34990895 + 1 NA intron (NM_003136, intron 1 of 15) intron (NM_003136, intron 1 of 15) 7715 NM_003136 6729 Hs.167535 NM_003136 ENSG00000100883 SRP54 - signal recognition particle 54 protein-coding 140.5-140 chr21 46416129 46416279 + 1 NA exon (NM_006031, exon 30 of 47) exon (NM_006031, exon 30 of 47) -42687 NM_001146115 23181 Hs.189585 NM_015151 ENSG00000160305 DIP2A C21orf106|DIP2 disco interacting protein 2 homolog A protein-coding 234.5-39 chr2 17511249 17511569 + 1 NA intron (NM_001099218, intron 2 of 2) intron (NM_001099218, intron 2 of 2) 7031 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 129.5-15 chr1 210287794 210288007 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -40352 NM_001122834 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 160.5-122 chr3 88072270 88072512 + 1 NA intron (NM_001366093, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 13136 NM_001350135 55279 Hs.591650 NM_018293 ENSG00000175105 ZNF654 - zinc finger protein 654 protein-coding 148.5-97 chr2 45249449 45249678 + 1 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) intron (NR_033831, intron 1 of 5) 5378 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 357.5 chr1 152439480 152439889 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -25421 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 176.5-140 chr5 59016681 59016956 + 1 NA intron (NM_006203, intron 6 of 14) L2a|LINE|L2 -16920 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 179.5-119 chr3 24374934 24375119 + 1 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -119061 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 243.5-53 chr3 119721527 119721941 + 1 NA intron (NM_033364, intron 6 of 17) L1MD|LINE|L1 18712 NM_033364 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 175.75-13 chr1 247616820 247617021 + 1 NA Intergenic Intergenic 11334 NM_001001914 81469 Hs.653227 NM_001001914 ENSG00000177476 OR2G3 OR1-33 olfactory receptor family 2 subfamily G member 3 protein-coding 156.5-159 chr5 157530575 157530758 + 1 NA intron (NM_033274, intron 5 of 22) intron (NM_033274, intron 5 of 22) 45109 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 262.5-21 chr14 79047681 79048084 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L1ME2|LINE|L1 -152100 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 315.25-23 chr4 40226545 40227148 + 1 NA intron (NM_001278360, intron 2 of 3) intron (NM_001278360, intron 2 of 3) 29815 NM_004310 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 163.75-120 chr7 75846451 75846638 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -23172 NM_001371193 154.5-159 chr6 64736077 64736241 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -565259 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 114.75-64 chr16 13935032 13935261 + 1 NA exon (NM_005236, exon 8 of 11) exon (NM_005236, exon 8 of 11) 14989 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 192.5-40 chr14 53306586 53306820 + 1 NA Intergenic Intergenic 153349 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 129.5-148 chr3 4680933 4681097 + 1 NA intron (NM_001168272, intron 24 of 60) intron (NM_001168272, intron 24 of 60) 70575 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 190.25-66 chr2 113006869 113007106 + 1 NA intron (NM_014440, intron 3 of 3) intron (NM_014440, intron 3 of 3) 1528 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 199.75-8 chr10 73099917 73100303 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3136 NM_001017962 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 207.75-69 chr22 27953922 27954209 + 1 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1ME4b|LINE|L1 -33453 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 327.5-6 chr12 29779081 29779441 + 1 NA intron (NM_175861, intron 1 of 17) MLT2F|LTR|ERVL 4681 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 194.5-169 chrX 70690710 70691033 + 1 NA intron (NM_001003811, intron 14 of 30) L1MDa|LINE|L1 155424 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 212.75-12 chr10 98798049 98798302 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MA3|LINE|L1 126393 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 343.75-5 chr2 52315388 52315889 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 -55010 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 299.75-11 chr19 30680029 30680362 + 1 NA intron (NM_001352260, intron 5 of 5) intron (NM_001352260, intron 5 of 5) 307811 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 262.5-14 chr13 113581126 113581612 + 1 NA Intergenic Intergenic -3319 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 188.5-114 chr4 84661925 84662297 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 78984 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 165.75-79 chr2 15178255 15178583 + 1 NA intron (NR_052013, intron 50 of 50) intron (NR_052013, intron 50 of 50) 382915 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 112.5-184 chr4 81698624 81698791 + 1 NA Intergenic Intergenic -226800 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 204.75-37 chr14 64509347 64509735 + 1 NA intron (NM_001123329, intron 1 of 1) intron (NM_001123329, intron 1 of 1) -4328 NM_001304508 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 208.25-10 chr1 207666779 207667044 + 1 NA intron (NM_175710, intron 1 of 11) intron (NM_175710, intron 1 of 11) 21778 NM_175710 1379 Hs.628568 NM_175710 ENSG00000197721 CR1L - complement C3b/C4b receptor 1 like protein-coding 199.5-12 chr1 210477975 210478246 + 1 NA intron (NM_001122834, intron 8 of 11) intron (NM_001122834, intron 8 of 11) 148744 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 122.25-161 chr6 106979554 106979699 + 1 NA Intergenic Intergenic -2771 NM_001291738 100133941 Hs.644105 NM_013230 ENSG00000272398 CD24 CD24A CD24 molecule protein-coding 142.5-143 chr3 123893008 123893237 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -8790 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 207.5-119 chr8 119108130 119108433 + 1 NA 3' UTR (NM_006438, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_006438, exon 6 of 6) -39499 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 212.5-112 chr8 42016708 42017033 + 1 NA intron (NM_001305878, intron 2 of 13) intron (NM_001305878, intron 2 of 13) -34880 NR_136589 105379393 Hs.742878 NR_136589 LOC105379393 - uncharacterized LOC105379393 ncRNA 134.5-161 chr4 114541620 114541824 + 1 NA Intergenic Intergenic -56680 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 196.5-144 chr6 75142353 75142641 + 1 NA intron (NM_080645, intron 11 of 50) MIRc|SINE|MIR -13715 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 265.75-6 chr10 97495317 97495640 + 1 NA intron (NM_001289403, intron 1 of 29) intron (NM_001289403, intron 1 of 29) 2944 NM_022362 64210 Hs.500721 NM_022362 ENSG00000155229 MMS19 CIAO4|MET18|MMS19L|hMMS19 MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component protein-coding 213.5-125 chr8 125577859 125578183 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 145812 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 176.75-94 chr4 104309521 104309774 + 1 NA Intergenic Intergenic -181318 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 317.75-16 chr17 30987397 30987781 + 1 NA intron (NM_197939, intron 2 of 3) intron (NM_197939, intron 2 of 3) 12254 NR_002221 503645 Hs.683578 NR_002221 ENSG00000264743 DPRXP4 - divergent-paired related homeobox pseudogene 4 pseudo 123.5-126 chr3 18208709 18208946 + 1 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) LTR33A|LTR|ERVL 216512 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 307.25-12 chr16 86398490 86399084 + 1 NA Intergenic Intergenic -53108 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 262.75-4 chr10 51515137 51515475 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 184289 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 191.5-12 chr1 157642369 157642733 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -44466 NM_031282 83417 Hs.120260 NM_031282 ENSG00000163518 FCRL4 CD307d|FCRH4|IGFP2|IRTA1 Fc receptor like 4 protein-coding 139.25-211 chr9 91560409 91560679 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -75707 NR_037472 100500821 NR_037472 ENSG00000266855 MIR3910-1 mir-3910-1 microRNA 3910-1 ncRNA 150.5-27 chr11 47211476 47211652 + 1 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3378 NM_000107 1643 Hs.700338 NM_000107 ENSG00000134574 DDB2 DDBB|UV-DDB2|XPE damage specific DNA binding protein 2 protein-coding 193.5-73 chr18 55780847 55781181 + 1 NA promoter-TSS (NR_145453) promoter-TSS (NR_145453) -264 NR_145454 100132501 Hs.634003 NR_145452 LINC01415 TCONS_00026208 long intergenic non-protein coding RNA 1415 ncRNA 272.75-9 chr12 45277290 45277861 + 1 NA intron (NM_001204803, intron 2 of 20) HAL1|LINE|L1 -15115 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 188.5-158 chr8 128356199 128356466 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 206216 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 310.5-36 chr7 133000797 133001451 + 1 NA intron (NM_001317177, intron 3 of 8) intron (NM_001317177, intron 3 of 8) 33791 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 251.5-76 chr7 30324373 30324739 + 1 NA intron (NM_147128, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu -34666 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 116.25-106 chr2 65246460 65246732 + 1 NA exon (NM_005722, exon 3 of 9) exon (NM_005722, exon 3 of 9) 18901 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 122.75-176 chr6 74360768 74361067 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 291466 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 177.5-64 chr18 5589980 5590227 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) intron (NM_001281535, intron 3 of 21) 38888 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 225.75-52 chr3 62496131 62496392 + 1 NA intron (NM_003716, intron 18 of 29) MER5B|DNA|hAT-Charlie -122711 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 126.75-33 chr11 105174173 105174412 + 1 NA Intergenic Intergenic -34523 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 179.75-132 chr8 117273147 117273407 + 1 NA Intergenic Intergenic 138282 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 240.75-81 chrX 82024803 82025264 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 822931 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 143.75-90 chr2 73492961 73493228 + 1 NA intron (NM_015120, intron 10 of 22) intron (NM_015120, intron 10 of 22) 35991 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 220.75-25 chr14 48655877 48656285 + 1 NA Intergenic Intergenic -861067 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 196.5-56 chr15 67727858 67728100 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 17 of 21) intron (NM_001206804, intron 17 of 21) -97530 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 126.5-10 chr1 80073444 80073578 + 1 NA Intergenic Intergenic -462244 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 328.5-19 chr2 102110708 102111493 + 1 NA intron (NM_001320980, intron 1 of 11) intron (NM_001320980, intron 1 of 11) 6496 NM_001320986 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 159.5-148 chr3 88160452 88160677 + 1 NA Intergenic Intergenic 10605 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 160.5-81 chr19 55880522 55880729 + 1 NA intron (NM_134444, intron 9 of 9) intron (NM_134444, intron 9 of 9) -43863 NM_145007 204801 Hs.375039 NM_145007 ENSG00000179873 NLRP11 CLR19.6|NALP11|NOD17|PAN10|PYPAF6|PYPAF7 NLR family pyrin domain containing 11 protein-coding 142.5-131 chr21 30245575 30245851 + 1 NA Intergenic Intergenic -29616 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 152.75-147 chr8 81801691 81801908 + 1 NA intron (NM_001348189, intron 9 of 9) intron (NM_001348189, intron 9 of 9) 40386 NR_145474 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 159.75-17 chr10 45150651 45150897 + 1 NA intron (NR_024472, intron 2 of 8) intron (NR_024472, intron 2 of 8) 3822 NR_024472 100133308 Hs.434365 NR_024472 RSU1P2 - Ras suppressor protein 1 pseudogene 2 pseudo 147.5-116 chr2 192076634 192076844 + 1 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 118194 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 232.75-53 chr4 144623492 144623764 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 22391 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 326.75-16 chr4 87330630 87331255 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -8060 NM_178135 345275 Hs.284414 NM_178135 ENSG00000170509 HSD17B13 HMFN0376|NIIL497|SCDR9|SDR16C3 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 13 protein-coding 117.75-128 chr22 34215388 34215591 + 1 NA Intergenic Intergenic -292601 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 177.25-107 chr4 61936026 61936320 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 14 of 23) (CCTCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 225592 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 116.5-74 chr14 73886116 73886349 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242927) promoter-TSS (NM_001242927) -627 NM_001242924 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 235.5-61 chr4 166343242 166343528 + 1 NA Intergenic Intergenic 470148 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 137.5-11 chr1 155074175 155074410 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -4545 NM_004952 1944 Hs.516656 NM_004952 ENSG00000143590 EFNA3 EFL2|EPLG3|Ehk1-L|LERK3 ephrin A3 protein-coding 144.25-3 chr1 28089918 28090233 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -1438 NM_001282562 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 409.5-13 chr5 15412278 15412813 + 1 NA Intergenic Intergenic -87635 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 195.5-13 chr10 27861432 27861741 + 1 NA intron (NM_001290021, intron 11 of 13) intron (NM_001290021, intron 11 of 13) -115767 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 113.75-103 chr2 124435299 124435482 + 1 NA intron (NM_130773, intron 5 of 23) intron (NM_130773, intron 5 of 23) 410103 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 137.5-153 chr22 48107000 48107265 + 1 NA Intergenic Intergenic -167232 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 338.25-10 chr14 43124044 43124515 + 1 NA Intergenic Intergenic 1383004 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 181.5-128 chr4 174035601 174035950 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 138502 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 161.25-163 chr7 77286553 77286800 + 1 NA intron (NM_020879, intron 15 of 18) intron (NM_020879, intron 15 of 18) -86857 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 257.5-47 chr3 51911000 51911386 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7840 NM_152397 132141 Hs.671210 NM_152397 ENSG00000173389 IQCF1 - IQ motif containing F1 protein-coding 212.75-96 chr8 41961205 41961535 + 1 NA intron (NM_001305878, intron 8 of 13) L2a|LINE|L2 -64629 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 144.5-9 chr1 95464836 95465052 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -9793 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 277.5-54 chr4 66324525 66324987 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 47932 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 134.75-181 chr5 169369768 169370045 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -68767 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 225.5-62 chr2 201587433 201587694 + 1 NA intron (NM_001168221, intron 4 of 15) L1M4a1|LINE|L1 31615 NM_152525 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 149.5-133 chr4 70344885 70345076 + 1 NA Intergenic Intergenic 9999 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 263.75-36 chr3 12395685 12396081 + 1 NA intron (NM_001354669, intron 5 of 6) intron (NM_001354669, intron 5 of 6) 44381 NM_015869 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 183.5-50 chr16 13923112 13923549 + 1 NA intron (NM_005236, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 3173 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 287.5-30 chr19 18057618 18058265 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 28993 NM_005535 3594 Hs.567294 NM_005535 ENSG00000096996 IL12RB1 CD212|IL-12R-BETA1|IL12RB|IMD30 interleukin 12 receptor subunit beta 1 protein-coding 254.5-15 chr10 93228788 93229175 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 155088 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 193.25-33 chr14 71612818 71613288 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) intron (NM_001354286, intron 6 of 24) 26755 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 212.25-94 chr8 42417124 42417512 + 1 NA 3' UTR (NM_001257181, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001257181, exon 11 of 11) 25438 NM_005662 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 157.5-41 chr11 131901936 131902181 + 1 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -7866 NR_147850 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 194.75-85 chr6 147778413 147778775 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 269904 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 201.75-29 chr13 70047690 70048068 + 1 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) intron (NM_020866, intron 1 of 10) -59334 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 337.5-23 chr5 64546872 64547470 + 1 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) L1ME3|LINE|L1 -28479 NM_001271890 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 210.5-135 chr8 119128272 119128660 + 1 NA Intergenic Intergenic -59684 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 207.5-8 chr10 114420720 114420968 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -16066 NM_001351070 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 319.5-36 chr6 85168413 85168868 + 1 NA Intergenic Intergenic 221546 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 205.5-108 chr4 73466102 73466515 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -15437 NM_001133 173 Hs.168718 NM_001133 ENSG00000079557 AFM ALB2|ALBA|ALF afamin protein-coding 178.25-63 chr2 68552639 68552843 + 1 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) intron (NM_173545, intron 8 of 9) 85156 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 114.25-122 chr3 7929568 7929748 + 1 NA Intergenic Intergenic 86649 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 125.75-15 chr1 226113213 226113430 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 29746 NR_146920 105373113 Hs.149726 NR_146920 LINC01703 lncPARP1 long intergenic non-protein coding RNA 1703 ncRNA 229.25-26 chr14 63661216 63661607 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -19540 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 142.75-70 chr16 47039347 47039572 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -65785 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 223.5-94 chr4 165344168 165344469 + 1 NA Intergenic Intergenic 16649 NM_006745 6307 Hs.105269 NM_006745 ENSG00000052802 MSMO1 DESP4|ERG25|MCCPD|SC4MOL methylsterol monooxygenase 1 protein-coding 131.5-55 chr14 51927709 51927849 + 1 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -9208 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 198.75-57 chr20 57354587 57354811 + 1 NA intron (NM_003610, intron 2 of 11) intron (NM_003610, intron 2 of 11) 3137 NM_001015885 8480 Hs.371698 NM_003610 ENSG00000101146 RAE1 Gle2|MIG14|MRNP41|Mnrp41|dJ481F12.3|dJ800J21.1 ribonucleic acid export 1 protein-coding 188.75-28 chr14 81823933 81824308 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -80982 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 138.5-144 chr4 33433331 33433551 + 1 NA Intergenic Intergenic 606452 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 216.25-35 chr14 95609767 95610092 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 36367 NR_146450 100506999 Hs.112858 NR_146449 ENSG00000258390 LINC02318 - long intergenic non-protein coding RNA 2318 ncRNA 195.5-3 chr1 56121881 56122123 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 176915 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 222.75-3 chr1 67309021 67309317 + 1 NA intron (NM_001258215, intron 1 of 13) intron (NM_001258215, intron 1 of 13) 1805 NM_001319233 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 330.5-6 chr11 42258487 42259011 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -5059 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 196.25-126 chrX 82895980 82896201 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -612200 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 298.75-8 chr1 195130320 195130781 + 1 NA Intergenic Intergenic 958165 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 199.75-91 chr9 127076970 127077334 + 1 NA intron (NM_001190729, intron 8 of 17) L2b|LINE|L2 45483 NM_012098 23452 Hs.653262 NM_012098 ENSG00000136859 ANGPTL2 ARP2|HARP angiopoietin like 2 protein-coding 188.5-112 chr4 71098288 71098568 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -88831 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 116.25-43 chr12 2327285 2327475 + 1 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 57604 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 222.75 chr1 52567148 52567551 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -14257 NM_001009881 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 170.25-28 chr12 124273231 124273436 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) AluY|SINE|Alu -15831 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 315.5-6 chr14 64559353 64559971 + 1 NA intron (NM_172365, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 9701 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 234.5-99 chr8 119267724 119268085 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21047 NR_149112 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 112.5-58 chr12 94222907 94223102 + 1 NA intron (NM_005761, intron 6 of 30) intron (NM_005761, intron 6 of 30) -39517 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 296.5-41 chr8 52577013 52577372 + 1 NA Intergenic Intergenic -11762 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 287.5-43 chr4 63719044 63719372 + 1 NA Intergenic Intergenic 690242 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 188.5-108 chr4 4247353 4247630 + 1 NA intron (NM_001297551, intron 1 of 4) L1ME4b|LINE|L1 732 NM_001297551 85013 Hs.12845 NM_032927 ENSG00000132406 TMEM128 - transmembrane protein 128 protein-coding 169.5-88 chr20 35502429 35502780 + 1 NA exon (NM_001318219, exon 28 of 33) exon (NM_001318219, exon 28 of 33) 27048 NM_001145350 140873 Hs.158680 NM_080828 ENSG00000125975 C20orf173 dJ477O4.4 chromosome 20 open reading frame 173 protein-coding 148.5-153 chr3 97360263 97360459 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L1M4c|LINE|L1 -79246 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 144.75-132 chr5 28218396 28218740 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 69097 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 159.5-166 chr4 113154610 113154837 + 1 NA intron (NM_001354241, intron 2 of 45) intron (NM_001354241, intron 2 of 45) 2441 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 166.25-86 chr2 205883766 205883960 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 201362 NM_201267 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 162.5-21 chr10 92138887 92139229 + 1 NA intron (NM_001178137, intron 6 of 9) AluSp|SINE|Alu 104221 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 160.5-121 chr3 85366094 85366328 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -19499 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 160.5-181 chr8 41028707 41028868 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -130961 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 270.5-45 chr3 163399262 163399654 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -96157 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 238.25-56 chr4 44035403 44035779 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 18529 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 187.5-39 chr12 40184518 40184890 + 1 NA Intergenic Intergenic 28465 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 171.5-61 chr17 65387080 65387272 + 1 NA Intergenic Intergenic -70365 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 119.25-138 chr4 2104795 2105015 + 1 NA intron (NM_181808, intron 19 of 25) intron (NM_181808, intron 19 of 25) 45578 NM_178557 339983 Hs.318529 NM_178557 ENSG00000185818 NAT8L CML3|NACED|NAT8-LIKE N-acetyltransferase 8 like protein-coding 180.5-122 chr5 77327895 77328186 + 1 NA intron (NM_001029851, intron 3 of 18) intron (NM_001029851, intron 3 of 18) 117360 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 218.5-76 chr3 95260276 95260662 + 1 NA Intergenic Intergenic 322206 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 163.75-124 chr8 79865769 79866030 + 1 NA intron (NR_110954, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 5838 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 244.25-45 chr7 44670891 44671161 + 1 NA intron (NM_002541, intron 5 of 22) AluYm1|SINE|Alu 64399 NM_001003941 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 129.75-98 chr2 153822486 153822702 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -49328 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 207.5-6 chr10 92495417 92495700 + 1 NA intron (NR_136399, intron 11 of 25) AluSx|SINE|Alu 2203 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 143.5-190 chr6 123265808 123266042 + 1 NA intron (NM_006073, intron 32 of 40) intron (NM_006073, intron 32 of 40) -173679 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 144.5-117 chr2 203627530 203627681 + 1 NA Intergenic Intergenic -78870 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 139.5-23 chr11 46279744 46279983 + 1 NA intron (NM_052854, intron 1 of 11) intron (NM_052854, intron 1 of 11) 2201 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 137.75-20 chr10 18729316 18729468 + 1 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 69961 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 192.75-113 chr6 109870760 109871150 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -107301 NM_001286099 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 153.5-175 chr7 4811083 4811385 + 1 NA intron (NM_018059, intron 9 of 14) HY3|scRNA|scRNA -22595 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 180.5-112 chr4 44621707 44621916 + 1 NA TTS (NM_182592) TTS (NM_182592) 29830 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 245.5-13 chr12 49161727 49162030 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 27202 NM_006009 7846 Hs.654422 NM_006009 ENSG00000167552 TUBA1A B-ALPHA-1|LIS3|TUBA3 tubulin alpha 1a protein-coding 227.75-79 chr7 104068574 104068976 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -79117 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 201.5-25 chr10 64833840 64834174 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 8479 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 245.5-55 chr5 2120345 2120744 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 191657 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 201.75-74 chr5 87328596 87328920 + 1 NA intron (NM_001364075, intron 8 of 8) intron (NM_001364075, intron 8 of 8) -5130 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 234.25-40 chr2 225592546 225592837 + 1 NA intron (NM_001371273, intron 5 of 7) intron (NM_001371273, intron 5 of 7) 191805 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 148.25-23 chr10 97605189 97605394 + 1 NA intron (NM_138413, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu 15570 NM_001009997 414157 Hs.662302 NM_001009997 ENSG00000203942 C10orf62 bA548K23.1 chromosome 10 open reading frame 62 protein-coding 121.5-137 chr2 103562537 103562721 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -578200 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 158.5-8 chr1 170297181 170297426 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -13095 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 204.5-107 chr5 79644586 79644848 + 1 NA intron (NM_001349550, intron 9 of 16) intron (NM_001349550, intron 9 of 16) 32276 NM_001114393 167153 Hs.418198 NM_173797 ENSG00000164329 TENT2 APD4|GLD2|PAPD4|TUT2 terminal nucleotidyltransferase 2 protein-coding 155.75-17 chr10 62282838 62283012 + 1 NA Intergenic Intergenic -14081 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 174.5-19 chr10 30895561 30895818 + 1 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) L1MB2|LINE|L1 103828 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 160.5-145 chr5 10393851 10394161 + 1 NA intron (NM_001270660, intron 6 of 24) intron (NM_001270660, intron 6 of 24) -8358 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 280.5-13 chr14 69202255 69202702 + 1 NA intron (NM_001193363, intron 1 of 8) intron (NM_001193363, intron 1 of 8) 10712 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 235.25-35 chr2 116135384 116135722 + 1 NA Intergenic Intergenic 791738 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 161.75-119 chr7 45048091 45048476 + 1 NA intron (NM_001029835, intron 2 of 9) HAL1|LINE|L1 20649 NM_001029835 83605 Hs.148272 NM_031443 ENSG00000136280 CCM2 C7orf22|OSM|PP10187 CCM2 scaffold protein protein-coding 134.5-132 chr3 102120472 102120683 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -43128 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 166.75-31 chr12 18162680 18162947 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -72620 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 131.5-230 chr8 43528428 43528641 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 236092 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 126.75-100 chr2 17050301 17050466 + 1 NA Intergenic Intergenic -384549 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 196.5-87 chr2 187909607 187909864 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -355230 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 198.5-5 chr1 91166677 91167028 + 1 NA Intergenic Intergenic -144597 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 187.75-11 chr10 17177165 17177602 + 1 NA intron (NM_004412, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 24289 NM_001351219 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 135.5-68 chr15 95931855 95932041 + 1 NA Intergenic Intergenic 195893 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 320.5-32 chr4 70874850 70875288 + 1 NA Intergenic Intergenic -27300 NM_173468 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 279.75-2 chr1 233712579 233712980 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 88627 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 281.25-29 chr21 28904521 28904874 + 1 NA Intergenic Intergenic -19324 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 115.75-96 chr2 16333680 16333824 + 1 NA Intergenic Intergenic 283325 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 291.5-41 chr5 123245622 123246128 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -155559 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 149.5-173 chr6 62436505 62436747 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -150399 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 248.5-84 chr5 100122399 100122728 + 1 NA Intergenic Intergenic 265691 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 231.5-62 chr3 60300357 60300700 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) MIRc|SINE|MIR -219619 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 181.5-31 chr12 32610724 32611003 + 1 NA intron (NM_001370297, intron 7 of 14) intron (NM_001370297, intron 7 of 14) -68337 NM_001278463 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 169.75-8 chr1 227056032 227056591 + 1 NA intron (NM_003607, intron 21 of 35) intron (NM_003607, intron 21 of 35) 116017 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 213.5-54 chr18 44137838 44138168 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 393694 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 191.5-60 chr17 74594918 74595296 + 1 NA TTS (NM_152460) TTS (NM_152460) -2824 NM_001115152 100131439 Hs.531099 NM_001115152 ENSG00000204345 CD300LD CD300D|CLM-4|CMRF35-A4|CMRF35A4 CD300 molecule like family member d protein-coding 202.5-81 chr2 162120029 162120281 + 1 NA intron (NR_110255, intron 1 of 3) intron (NR_110255, intron 1 of 3) 5714 NR_110255 101929532 Hs.639883 NR_110255 ENSG00000236841 LOC101929532 - uncharacterized LOC101929532 ncRNA 134.75-134 chr22 28306646 28306907 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -153093 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 157.75-167 chr8 62161057 62161387 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -87632 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 149.5-9 chr1 178690296 178690578 + 1 NA Intergenic Intergenic 12688 NR_039622 100616328 NR_039622 ENSG00000266417 MIR4424 - microRNA 4424 ncRNA 165.5-185 chr7 108946970 108947459 + 1 NA Intergenic Intergenic -62627 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 159.25-67 chr2 32304118 32304373 + 1 NA intron (NM_032312, intron 5 of 5) intron (NM_032312, intron 5 of 5) 26341 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 303.5-11 chr14 51253884 51254269 + 1 NA intron (NM_030755, intron 7 of 7) intron (NM_030755, intron 7 of 7) 13829 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 155.25-170 chr7 113002920 113003082 + 1 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -7358 NR_110162 101928036 Hs.120006 NR_110162 ENSG00000234520 HRAT17 - heart tissue-associated transcript 17 ncRNA 221.5-74 chr5 4999156 4999696 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -34933 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 156.5-183 chr8 9456218 9456434 + 1 NA Intergenic Intergenic -99586 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 221.5-12 chr11 103547364 103547683 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -302383 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 132.75-79 chr17 62697416 62697757 + 1 NA Intergenic Intergenic -8620 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 196.75-92 chr6 53758732 53758935 + 1 NA Intergenic Intergenic -36172 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 208.5-76 chr2 183513187 183513519 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 388910 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 131.5-24 chr10 43770435 43770723 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 8246 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 144.75-106 chr22 27878644 27878872 + 1 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 40456 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 210.5-93 chr5 29256508 29256813 + 1 NA Intergenic Intergenic 113157 NR_130777 101929660 Hs.171348 NR_130777 LINC02109 - long intergenic non-protein coding RNA 2109 ncRNA 254.25-67 chr8 81483147 81483602 + 1 NA promoter-TSS (NM_001442) promoter-TSS (NM_001442) -141 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 157.25-16 chr10 72861370 72861555 + 1 NA intron (NM_138357, intron 4 of 7) AluSz6|SINE|Alu -32277 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 200.25-115 chr8 113487960 113488386 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -51234 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 191.5-104 chr4 30368872 30369169 + 1 NA Intergenic Intergenic -351349 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 306.25-6 chr1 208117840 208118279 + 1 NA intron (NM_025179, intron 4 of 31) LTR78|LTR|ERV1 126325 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 136.5-64 chr13 103288617 103288888 + 1 NA Intergenic Intergenic -136448 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 395.5-16 chr6 47616985 47617563 + 1 NA intron (NM_012120, intron 17 of 17) (TCTTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -39198 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 169.5-76 chr2 81283202 81283443 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 183624 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 159.5-208 chr8 108270084 108270372 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -21511 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 115.75-94 chr2 12356439 12356610 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 157394 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 253.25-56 chr6 108885670 108886034 + 1 NA intron (NM_001286609, intron 4 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie 37430 NM_032131 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 113.25-184 chr9 73366179 73366445 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 214447 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 161.75-71 chr2 186872241 186872639 + 1 NA Intergenic Intergenic -23270 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 235.5-44 chr2 24325086 24325503 + 1 NA intron (NM_001348181, intron 2 of 40) AluJo|SINE|Alu 35242 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 193.25-94 chr5 59850757 59851097 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 42799 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 220.75-74 chr8 72956904 72957124 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -51850 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 278.25-62 chr9 129534768 129535231 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 46339 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 209.25-4 chr1 40704913 40705350 + 1 NA intron (NM_001142590, intron 2 of 14) MIRb|SINE|MIR -4235 NM_001308115 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 177.75-131 chr7 101066894 101067197 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -18436 NM_030961 81844 Hs.521092 NM_030961 ENSG00000169871 TRIM56 RNF109 tripartite motif containing 56 protein-coding 147.75-124 chr5 43069630 43069913 + 1 NA intron (NR_102752, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu -2332 NR_104651 648987 Hs.649468 NR_034085 ENSG00000177738 LOC648987 - uncharacterized LOC648987 ncRNA 173.75-45 chr12 86501846 86502137 + 1 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) intron (NM_001351285, intron 2 of 8) 243158 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 113.25-159 chr7 101518957 101519082 + 1 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) intron (NM_133457, intron 3 of 12) 49987 NR_103749 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 129.5-33 chr10 125191305 125191517 + 1 NA Intergenic Intergenic -30381 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 167.5-51 chr12 86262084 86262335 + 1 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) -4910 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 164.75-111 chr4 109716582 109716919 + 1 NA intron (NM_030821, intron 3 of 3) MER68|LTR|ERVL -13305 NM_001226 839 Hs.654616 NM_001226 ENSG00000138794 CASP6 MCH2 caspase 6 protein-coding 163.5-80 chr18 59647379 59647581 + 1 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) L1ME4a|LINE|L1 49943 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 151.5-170 chr6 76416958 76417193 + 1 NA Intergenic Intergenic 176548 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 145.25-76 chr2 142625436 142625763 + 1 NA Intergenic Intergenic -252065 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 239.5-35 chr16 50513823 50514113 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -34428 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 210.5-11 chr1 234457306 234457585 + 1 NA intron (NM_005646, intron 9 of 29) intron (NM_005646, intron 9 of 29) 21734 NM_005646 6894 Hs.498115 NM_005646 ENSG00000059588 TARBP1 TRM3|TRMT3|TRP-185|TRP185 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 protein-coding 225.75-55 chr3 105968846 105969120 + 1 NA Intergenic Intergenic -99582 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 331.5-2 chr10 15765328 15765846 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -45252 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 345.5-18 chr2 198139596 198140098 + 1 NA intron (NM_006226, intron 5 of 5) intron (NM_006226, intron 5 of 5) 235250 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 150.5-76 chr18 72697114 72697410 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -152920 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 246.5-49 chr20 53146282 53146547 + 1 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -38869 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 182.25-11 chr10 49061514 49061736 + 1 NA intron (NM_001031746, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 53897 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 127.75-31 chr10 62520365 62520557 + 1 NA promoter-TSS (NM_199452) promoter-TSS (NM_199452) 13 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 261.5-71 chr9 99451925 99452440 + 1 NA Intergenic Intergenic -76925 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 157.75-8 chr10 11143886 11144069 + 1 NA intron (NM_001326334, intron 2 of 13) intron (NM_001326334, intron 2 of 13) -20904 NM_001326347 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 205.5-77 chr2 167358593 167358940 + 1 NA Intergenic Intergenic 171394 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 150.5-62 chr16 53479429 53479689 + 1 NA intron (NM_001323608, intron 18 of 22) intron (NM_001323608, intron 18 of 22) 23650 NM_022476 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 143.25-145 chr5 104439872 104440116 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -659480 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 135.25-7 chr1 81926350 81926686 + 1 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 124065 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 185.5-170 chr9 35257674 35258008 + 1 NA intron (NM_006377, intron 6 of 38) intron (NM_006377, intron 6 of 38) -84055 NM_001371188 114.25-211 chrX 65949001 65949202 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -69769 NR_029637 407008 NR_029637 ENSG00000284567 MIR223 MIRN223|miRNA223|mir-223 microRNA 223 ncRNA 151.25-4 chr1 66113417 66113655 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -62818 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 283.25-23 chr21 29093084 29093449 + 1 NA intron (NM_001286634, intron 5 of 7) intron (NM_001286634, intron 5 of 7) 1012 NM_001286619 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 189.5-97 chr4 34976858 34977144 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -707254 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 126.5-219 chr7 11486080 11486300 + 1 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) intron (NM_015204, intron 6 of 26) 346008 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 151.5-100 chr21 15801274 15801535 + 1 NA intron (NM_001283042, intron 6 of 24) intron (NM_001283042, intron 6 of 24) 71422 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 233.5-21 chr10 78319835 78320123 + 1 NA Intergenic Intergenic 52637 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 146.5-26 chr10 21325761 21325968 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 47086 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 219.75-37 chr2 81797256 81797482 + 1 NA Intergenic Intergenic -330423 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 315.25-15 chr2 88089796 88090491 + 1 NA intron (NM_001330364, intron 3 of 8) intron (NM_001330364, intron 3 of 8) -7544 NR_039940 100616447 NR_039940 ENSG00000265003 MIR4780 - microRNA 4780 ncRNA 151.25-60 chr15 80687841 80688038 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -7371 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 150.75-161 chr6 86133073 86133384 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -454495 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 215.5-65 chr3 7757250 7757576 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -222129 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 230.75-71 chr8 88231887 88232171 + 1 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 95454 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 132.5-159 chr3 50789074 50789259 + 1 NA intron (NM_004947, intron 2 of 52) L1PB1|LINE|L1 114086 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 193.5-74 chr18 58938836 58939172 + 1 NA intron (NM_001353534, intron 4 of 8) AluSz6|SINE|Alu 74127 NM_001353527 55205 Hs.529023 NM_018181 ENSG00000074657 ZNF532 - zinc finger protein 532 protein-coding 130.75-53 chr14 49627225 49627460 + 1 NA intron (NM_001083908, intron 1 of 1) intron (NM_001083908, intron 1 of 1) 6543 NM_002408 4247 Hs.93338 NM_002408 ENSG00000168282 MGAT2 CDG2A|CDGS2|GLCNACTII|GNT-II|GNT2 mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 156.75-10 chr1 152171562 152171791 + 1 NA Intergenic Intergenic -12448 NM_001122965 126638 Hs.376144 NM_152364 ENSG00000215853 RPTN - repetin protein-coding 228.75-77 chr8 78300087 78300466 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -216064 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 179.75-2 chr1 65495230 65495498 + 1 NA intron (NM_001003679, intron 2 of 19) L1MA5|LINE|L1 -30287 NM_001198687 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 152.5-10 chr1 223714198 223714358 + 1 NA intron (NM_001748, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 1739 NM_001748 824 Hs.350899 NM_001748 ENSG00000162909 CAPN2 CANP2|CANPL2|CANPml|mCANP calpain 2 protein-coding 124.5-165 chr5 68331002 68331187 + 1 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 38517 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 134.25-122 chr3 192380741 192381053 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 28152 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 153.5-10 chr1 180313259 180313679 + 1 NA intron (NM_032360, intron 7 of 7) L1ME3A|LINE|L1 -38788 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 258.75-48 chr3 53041465 53042014 + 1 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) intron (NM_016329, intron 1 of 20) 4334 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 203.25-6 chr1 84710316 84710553 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -19966 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 144.25-166 chr6 2104755 2105050 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) intron (NM_001253846, intron 4 of 10) 71089 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 185.75-61 chr2 88572037 88572307 + 1 NA intron (NM_004836, intron 13 of 16) intron (NM_004836, intron 13 of 16) 33452 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 215.75-95 chr7 103982716 103983016 + 1 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) FLAM_A|SINE|Alu 6650 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 144.75-95 chr2 171578052 171578287 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 55695 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 225.5-86 chr5 10952082 10952424 + 1 NA Intergenic Intergenic -191019 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 178.5-40 chr13 59166905 59167207 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -845662 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-107 chr4 45801363 45801692 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 322527 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 286.25-32 chr8 121283217 121283707 + 1 NA Intergenic Intergenic -355884 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 194.75-38 chr17 73287415 73287807 + 1 NA intron (NM_012121, intron 1 of 1) intron (NM_012121, intron 1 of 1) 24390 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 175.75-104 chr5 33225337 33225605 + 1 NA Intergenic Intergenic -4264 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 244.5-55 chr2 126480082 126480610 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -175589 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 193.5-44 chr13 64787401 64787700 + 1 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -711539 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 200.25-12 chr10 28704868 28705179 + 1 NA Intergenic Intergenic 27502 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 151.75-43 chr15 44379707 44379940 + 1 NA intron (NR_157849, intron 8 of 9) intron (NR_157849, intron 8 of 9) -47806 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 181.25-53 chr18 9294592 9295018 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -39968 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 167.5-199 chr9 83195077 83195372 + 1 NA Intergenic Intergenic 72044 NM_001244962 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 179.25-54 chr15 63607731 63608033 + 1 NA TTS (NM_003922) TTS (NM_003922) -7055 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 130.5-128 chr2 40722460 40722648 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -210119 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 132.25-58 chr14 51190333 51190477 + 1 NA Intergenic Intergenic -49842 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 138.25-145 chr6 13832325 13832611 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -17908 NM_001031713 63933 Hs.214043 NM_022102 ENSG00000050393 MCUR1 C6orf79|CCDC90A|FMP32 mitochondrial calcium uniporter regulator 1 protein-coding 136.5-213 chr7 68402462 68402815 + 1 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 382385 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 158.5-168 chr6 61937194 61937512 + 1 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) L1MEd|LINE|L1 348872 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 287.5-23 chr17 2469505 2469954 + 1 NA intron (NM_024086, intron 4 of 9) AluSx1|SINE|Alu 42159 NM_024086 79066 Hs.632237 NM_024086 ENSG00000127804 METTL16 METT10D methyltransferase like 16 protein-coding 123.5-148 chr4 4570793 4571060 + 1 NA intron (NR_037888, intron 2 of 5) intron (NR_037888, intron 2 of 5) -28583 NM_001346282 53407 Hs.584913 NM_016930 ENSG00000168818 STX18 Ufe1 syntaxin 18 protein-coding 262.5-5 chr1 101185484 101185925 + 1 NA Intergenic Intergenic 50824 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 195.5-22 chr11 57829199 57829485 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 67540 NM_001206884 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 154.25-152 chr7 5993061 5993284 + 1 NA intron (NM_001322007, intron 7 of 13) AluSx|SINE|Alu 15877 NM_000535 5395 Hs.632637 NM_000535 ENSG00000122512 PMS2 HNPCC4|MLH4|PMS2CL|PMSL2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component protein-coding 176.75-54 chr19 40348028 40348280 + 1 NA promoter-TSS (NM_012268) promoter-TSS (NM_012268) 243 NM_001256441 126526 Hs.631557 NM_178830 ENSG00000160392 C19orf47 - chromosome 19 open reading frame 47 protein-coding 142.5-122 chr20 9406934 9407133 + 1 NA intron (NM_001172646, intron 20 of 37) intron (NM_001172646, intron 20 of 37) 99233 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 153.5-100 chr2 81340277 81340591 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 126512 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 158.5-66 chr14 69526079 69526251 + 1 NA intron (NM_001161498, intron 9 of 12) intron (NM_001161498, intron 9 of 12) 41437 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 157.25-122 chr5 100929206 100929444 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -26043 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 123.25-13 chr1 191628886 191629052 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -400471 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 263.5-18 chr15 61866388 61866785 + 1 NA 3' UTR (NM_018080, exon 80 of 80) 3' UTR (NM_018080, exon 80 of 80) 136668 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 251.5-82 chr7 90825476 90825892 + 1 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) intron (NM_012395, intron 4 of 13) 115868 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 177.5-53 chr15 72112529 72112752 + 1 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) intron (NM_006901, intron 1 of 41) -1618 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 133.5-81 chr14 70125854 70126022 + 1 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) MIR3|SINE|MIR -45721 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 314.75-15 chr4 184883047 184883571 + 1 NA Intergenic Intergenic 16152 NR_039976 100506229 Hs.378150 NR_039975 LINC01093 - long intergenic non-protein coding RNA 1093 ncRNA 126.25-111 chr3 11563459 11563638 + 1 NA intron (NM_001128219, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 5250 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 292.5-56 chr9 69583420 69583937 + 1 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 88693 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 272.25-2 chr10 68682833 68683174 + 1 NA intron (NM_030625, intron 10 of 11) intron (NM_030625, intron 10 of 11) -38236 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 156.5-214 chrX 64510534 64510771 + 1 NA Intergenic Intergenic -115200 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 191.5-95 chr3 30317160 30317445 + 1 NA Intergenic Intergenic -201566 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 168.75-85 chr20 57900599 57900904 + 1 NA Intergenic Intergenic -103153 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 156.5-145 chr5 36979479 36979729 + 1 NA intron (NM_015384, intron 9 of 45) L1PA17|LINE|L1 102835 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 129.75-191 chr8 138161267 138161565 + 1 NA intron (NM_015912, intron 12 of 19) intron (NM_015912, intron 12 of 19) -77871 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 114.25-164 chr6 45701680 45701917 + 1 NA Intergenic Intergenic 235799 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 238.25-31 chr2 13623281 13623584 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -616419 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 280.75-13 chr14 51250862 51251376 + 1 NA intron (NM_030755, intron 7 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 10872 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 122.5-194 chr6 14617833 14618025 + 1 NA Intergenic Intergenic -332475 NR_108097 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 232.5-53 chr2 133856304 133856584 + 1 NA Intergenic Intergenic -263491 NM_001371457 206.75-54 chr3 66370268 66370616 + 1 NA intron (NM_001350992, intron 7 of 8) intron (NM_001350992, intron 7 of 8) 129979 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 282.5-58 chr6 157151502 157151962 + 1 NA intron (NM_020732, intron 9 of 19) intron (NM_020732, intron 9 of 19) 115305 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 239.75-69 chr7 3790919 3791426 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -338513 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 279.75-19 chr2 9313026 9313490 + 1 NA intron (NM_003887, intron 3 of 27) intron (NM_003887, intron 3 of 27) 106446 NM_003887 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 186.5-123 chr7 7444121 7444491 + 1 NA intron (NM_001037763, intron 19 of 34) intron (NM_001037763, intron 19 of 34) 91567 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 208.25-40 chr18 42430978 42431258 + 1 NA intron (NR_046174, intron 4 of 9) intron (NR_046174, intron 4 of 9) 244450 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 198.25-52 chr2 20441758 20442014 + 1 NA Intergenic Intergenic -5188 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 126.5-2 chr1 19680947 19681251 + 1 NA TTS (NM_000871) TTS (NM_000871) 16224 NM_000871 3362 Hs.22180 NM_000871 ENSG00000158748 HTR6 5-HT6|5-HT6R 5-hydroxytryptamine receptor 6 protein-coding 203.75-61 chr2 105198137 105198432 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -43459 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 192.25-100 chr7 31358921 31359193 + 1 NA Intergenic Intergenic -18331 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 203.5-78 chr2 191839941 191840329 + 1 NA intron (NM_004657, intron 1 of 1) intron (NM_004657, intron 1 of 1) 6953 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 197.5-165 chr8 132718537 132718860 + 1 NA intron (NM_144649, intron 7 of 9) L1ME4b|LINE|L1 41884 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 141.5-52 chr14 41032412 41032665 + 1 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) L1PA17|LINE|L1 77827 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 166.5-147 chr4 76847814 76848196 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 50139 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 277.25-50 chr9 111615562 111615890 + 1 NA Intergenic Intergenic -2173 NR_034087 652972 Hs.551134 NM_001037807 ENSG00000204173 LRRC37A5P C9orf29 leucine rich repeat containing 37 member A5, pseudogene pseudo 179.25-11 chr1 207995179 207995554 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -84241 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 191.5-108 chr4 57686660 57686949 + 1 NA Intergenic Intergenic 260932 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 178.5-127 chr4 123454145 123454449 + 1 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 54757 NM_005841 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 287.75-15 chr13 74470226 74470716 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 51298 NR_047005 100874151 Hs.564552 NR_047005 ENSG00000226240 LINC00381 - long intergenic non-protein coding RNA 381 ncRNA 273.5-9 chr10 28726569 28726918 + 1 NA Intergenic Intergenic -16907 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 222.25-34 chr2 60522873 60523341 + 1 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) 30391 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 206.5-146 chr9 72531394 72531733 + 1 NA intron (NM_138691, intron 1 of 23) intron (NM_138691, intron 1 of 23) 9762 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 196.75-26 chr11 122670391 122670751 + 1 NA intron (NM_001363365, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 14849 NM_001363365 84959 Hs.444075 NM_032873 ENSG00000154127 UBASH3B STS-1|STS1|TULA-2|TULA2|p70 ubiquitin associated and SH3 domain containing B protein-coding 171.5-101 chr3 49544951 49545230 + 1 NA Intergenic Intergenic 9276 NR_038866 100132677 Hs.435651 NR_038866 ENSG00000226913 BSN-DT BSN-AS2 BSN divergent transcript ncRNA 179.5-60 chr14 64981570 64981919 + 1 NA intron (NM_001202559, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 -5151 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 206.5-141 chr8 131441631 131441897 + 1 NA Intergenic Intergenic -400855 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 171.5-39 chr12 50817202 50817496 + 1 NA intron (NM_005171, intron 6 of 6) L1ME3F|LINE|L1 -25577 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 213.5-89 chr4 54136660 54137027 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 36680 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 257.25-26 chr20 50788093 50788460 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -6618 NM_017843 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 181.75-11 chr1 226448308 226448608 + 1 NA Intergenic Intergenic -40365 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 133.5-14 chr1 176543059 176543227 + 1 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) intron (NM_021936, intron 1 of 4) 79968 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 187.5-143 chr5 153320971 153321162 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -169458 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 142.5-153 chr4 86937147 86937390 + 1 NA intron (NM_001166693, intron 1 of 20) intron (NM_001166693, intron 1 of 20) 2266 NM_001166693 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 117.75-129 chr3 3032622 3032785 + 1 NA intron (NM_175607, intron 16 of 24) intron (NM_175607, intron 16 of 24) 28442 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 208.25-26 chr13 52388393 52388649 + 1 NA intron (NM_018676, intron 3 of 4) AluSp|SINE|Alu 17651 NM_199263 55901 Hs.325667 NM_018676 ENSG00000136114 THSD1 TMTSP|UNQ3010 thrombospondin type 1 domain containing 1 protein-coding 238.5-81 chr6 54943837 54944176 + 1 NA 3' UTR (NM_001010872, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001010872, exon 5 of 5) 97235 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 209.75-74 chr5 63015057 63015390 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 436404 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 225.5-54 chr2 24357835 24358306 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 1 of 38) AluSx3|SINE|Alu 2466 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 183.75-96 chr5 52328187 52328551 + 1 NA Intergenic Intergenic 320338 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 242.25-46 chr2 64554065 64554356 + 1 NA intron (NM_001002243, intron 2 of 8) intron (NM_001002243, intron 2 of 8) 28697 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 242.5-51 chr2 182751649 182752055 + 1 NA intron (NR_073367, intron 13 of 22) intron (NR_073367, intron 13 of 22) 35595 NM_018981 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 130.25-25 chr10 52551596 52551751 + 1 NA Intergenic Intergenic -81140 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 251.5-92 chr9 28622209 28622669 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1MA2|LINE|L1 96866 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 296.75-17 chr2 54054057 54054430 + 1 NA intron (NM_001320586, intron 3 of 6) intron (NM_001320586, intron 3 of 6) -61372 NM_001320589 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 210.5-27 chr12 81468748 81469065 + 1 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) intron (NM_001220474, intron 2 of 30) 43485 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 287.5-46 chr4 142935589 142935970 + 1 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -89244 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 214.25-59 chr3 190542398 190542682 + 1 NA intron (NM_001364879, intron 1 of 10) intron (NM_001364879, intron 1 of 10) 28455 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 181.25-102 chr5 96813826 96814361 + 1 NA promoter-TSS (NM_001198541) promoter-TSS (NM_001198541) 52 NM_001198541 51752 Hs.666524 NM_016442 ENSG00000164307 ERAP1 A-LAP|ALAP|APPILS|ARTS-1|ARTS1|ERAAP|ERAAP1|PILS-AP|PILSAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 protein-coding 172.75-34 chr14 80983764 80984000 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) intron (NM_001142626, intron 1 of 8) 28261 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 195.5-169 chrX 51174038 51174314 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2755 NR_110382 101926971 Hs.657995 NR_110382 ENSG00000230317 LINC01284 - long intergenic non-protein coding RNA 1284 ncRNA 217.5-101 chr5 112290122 112290629 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 2 of 23) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 62092 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 167.5-90 chr2 98841431 98841711 + 1 NA intron (NM_207362, intron 2 of 9) L1MEg|LINE|L1 -69673 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 119.25-30 chr10 117958050 117958268 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -88662 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 254.25-22 chr14 51914177 51914685 + 1 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) 4140 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 171.5-94 chr21 19486612 19486859 + 1 NA Intergenic Intergenic 413020 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 165.5-124 chr4 44239608 44239889 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 209061 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 121.25-168 chr5 147806560 147806769 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -23936 NM_014790 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 230.75-23 chr14 74571948 74572263 + 1 NA intron (NM_000428, intron 3 of 35) intron (NM_000428, intron 3 of 35) 40132 NM_000428 4053 Hs.512776 NM_000428 ENSG00000119681 LTBP2 C14orf141|GLC3D|LTBP3|MSPKA|MSTP031|WMS3 latent transforming growth factor beta binding protein 2 protein-coding 175.75-121 chr7 55784478 55784661 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 78183 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 168.75-10 chr1 94232254 94232577 + 1 NA intron (NM_001328664, intron 1 of 22) intron (NM_001328664, intron 1 of 22) 5169 NM_004815 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 262.5-23 chr15 76790838 76791286 + 1 NA intron (NM_001353011, intron 9 of 32) L1M5|LINE|L1 70882 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 125.5-147 chr20 34775091 34775315 + 1 NA intron (NM_001242539, intron 2 of 11) L2c|LINE|L2 7201 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 168.5-139 chr5 3064320 3064720 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -113315 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 167.25-11 chr1 242007709 242007953 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -8733 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 210.25-65 chr5 108919662 108919915 + 1 NA intron (NR_146155, intron 10 of 19) MIRb|SINE|MIR -4818 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 241.75-79 chr9 81327824 81328220 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 361513 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 130.25-111 chr2 189843905 189844146 + 1 NA exon (NM_001321048, exon 7 of 14) exon (NM_001321048, exon 7 of 14) 59575 NM_001321049 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 160.75-71 chr2 55912598 55912788 + 1 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) intron (NM_001039349, intron 4 of 10) 11089 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 112.25-86 chr18 52489995 52490114 + 1 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 149857 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 233.5-45 chr18 12529596 12530009 + 1 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) intron (NM_020148, intron 4 of 15) 97028 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 159.5-102 chr2 62011491 62011741 + 1 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 105974 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 126.5-130 chr20 31475574 31475725 + 1 NA intron (NM_014012, intron 1 of 4) intron (NM_014012, intron 1 of 4) 361 NM_014012 28954 Hs.247729 NM_014012 ENSG00000088320 REM1 GD:REM|GES RRAD and GEM like GTPase 1 protein-coding 181.5-41 chr14 49008636 49008954 + 1 NA Intergenic Intergenic 577585 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 140.5-67 chr14 66870371 66870647 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger -318931 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 166.75-16 chr10 56395988 56396410 + 1 NA Intergenic Intergenic -34926 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 184.75-35 chr17 67439510 67439847 + 1 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) L1MA7|LINE|L1 -31811 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 198.5-158 chr9 27267520 27267850 + 1 NA intron (NR_026679, intron 10 of 16) intron (NR_026679, intron 10 of 16) 15108 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 226.5-53 chr20 44013118 44013543 + 1 NA intron (NM_001098797, intron 3 of 8) intron (NM_001098797, intron 3 of 8) 67434 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 209.75-33 chr15 91273921 91274263 + 1 NA intron (NM_001323036, intron 8 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 172296 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 187.5-66 chr16 6305914 6306250 + 1 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 286379 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 118.5-52 chr14 47482207 47482524 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -139119 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 203.5-59 chr18 36070585 36070860 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3128 NM_001303413 55197 Hs.464912 NM_018170 ENSG00000141425 RPRD1A HsT3101|P15RS regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A protein-coding 276.25-22 chr18 386803 387336 + 1 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 113632 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 238.5-53 chr22 21990078 21990424 + 1 NA TTS (NR_135291) TTS (NR_135291) -7464 NM_001349851 8940 Hs.436401 NM_003935 ENSG00000100038 TOP3B TOP3B1 DNA topoisomerase III beta protein-coding 167.5-42 chr11 101622430 101622691 + 1 NA Intergenic Intergenic -38553 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 226.75-75 chr8 106551359 106551664 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 103587 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 203.5-96 chr3 148724614 148724985 + 1 NA intron (NM_000685, intron 2 of 2) intron (NM_000685, intron 2 of 2) -5381 NM_032049 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 163.25-100 chr3 130530631 130530866 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -29586 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 259.5-67 chr3 94206833 94207325 + 1 NA Intergenic Intergenic 144018 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 235.5-31 chr14 44031165 44031499 + 1 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL 475951 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 117.5-168 chr4 171603350 171603536 + 1 NA intron (NR_147157, intron 4 of 4) intron (NR_147157, intron 4 of 4) 35320 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 164.25-126 chr5 24156812 24157172 + 1 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) L1MA2|LINE|L1 205644 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 259.5-68 chr3 99048281 99048615 + 1 NA Intergenic Intergenic -146753 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 169.5-128 chr4 114220892 114221247 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -241422 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 160.75-66 chr2 31357293 31357628 + 1 NA intron (NM_000379, intron 24 of 35) L1MDa|LINE|L1 57282 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 390.25-9 chr8 131070115 131070766 + 1 NA Intergenic Intergenic -29531 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 190.75-53 chr2 139850924 139851219 + 1 NA Intergenic Intergenic 735614 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 165.5-74 chr2 43061897 43062108 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -22459 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 282.5-3 chr1 54883126 54883429 + 1 NA intron (NM_014762, intron 2 of 8) intron (NM_014762, intron 2 of 8) 3918 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 216.5-95 chr5 93955715 93956082 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) 155765 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 164.5-55 chr14 48959921 48960129 + 1 NA Intergenic Intergenic 626355 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 295.5-41 chr4 101834208 101834720 + 1 NA intron (NM_017935, intron 2 of 16) intron (NM_017935, intron 2 of 16) 20622 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 195.25-58 chr20 31054991 31055279 + 1 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -202529 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 218.25-2 chr1 56547565 56547936 + 1 NA intron (NM_003713, intron 1 of 5) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 31813 NM_003713 8613 Hs.405156 NM_003713 ENSG00000162407 PLPP3 Dri42|LPP3|PAP2B|PPAP2B|VCIP phospholipid phosphatase 3 protein-coding 184.75-29 chr14 70922865 70923256 + 1 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) L1ME4b|LINE|L1 15601 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 247.5-16 chr13 30208940 30209389 + 1 NA intron (NM_032116, intron 10 of 10) intron (NM_032116, intron 10 of 10) -56090 NR_138041 102157400 Hs.639879 NR_138041 LINC00384 - long intergenic non-protein coding RNA 384 ncRNA 140.5-186 chr5 134605784 134606010 + 1 NA 3' UTR (NM_016103, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_016103, exon 7 of 7) 26931 NM_016103 51128 Hs.432984 NM_016103 ENSG00000152700 SAR1B ANDD|CMRD|GTBPB|SARA2 secretion associated Ras related GTPase 1B protein-coding 144.5-167 chr5 26542762 26542976 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 495717 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 177.25-97 chr3 129985028 129985271 + 1 NA Intergenic Intergenic 10429 NM_007117 7200 Hs.182231 NM_007117 ENSG00000170893 TRH Pro-TRH|TRF thyrotropin releasing hormone protein-coding 119.25-72 chr16 56458977 56459124 + 1 NA intron (NM_001324363, intron 3 of 11) L1ME4a|LINE|L1 6966 NM_001324358 55239 Hs.231883 NM_018233 ENSG00000087263 OGFOD1 TPA1 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1 protein-coding 207.5-2 chr1 92948237 92948639 + 1 NA intron (NM_001006605, intron 1 of 4) intron (NM_001006605, intron 1 of 4) 13024 NM_001006605 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 201.5-141 chrX 152555714 152556139 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -81969 NM_018558 55879 Hs.283081 NM_018558 ENSG00000268089 GABRQ THETA gamma-aminobutyric acid type A receptor theta subunit protein-coding 231.25-9 chr11 115634143 115634746 + 1 NA Intergenic Intergenic 100318 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 197.75-97 chr9 34036552 34036795 + 1 NA intron (NM_001370059, intron 1 of 28) L2c|LINE|L2 12214 NM_001370064 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 124.5-79 chr17 43840910 43841119 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -6162 NM_001168323 146894 Hs.147313 NM_145273 ENSG00000161649 CD300LG CLM-9|CLM9|NEPMUCIN|TREM-4|TREM4 CD300 molecule like family member g protein-coding 112.25-226 chr8 142444413 142444660 + 1 NA Intergenic Intergenic -5113 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 204.5-65 chr2 70799864 70800200 + 1 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -9389 NM_001004311 344018 Hs.407636 NM_001004311 ENSG00000183733 FIGLA BHLHC8|FIGALPHA|POF6 folliculogenesis specific bHLH transcription factor protein-coding 220.75-63 chr6 123312323 123312561 + 1 NA intron (NM_006073, intron 24 of 40) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -127162 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 115.75-204 chr7 88183004 88183163 + 1 NA TTS (NM_004194) TTS (NM_004194) -33577 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 177.5-75 chr2 32703031 32703331 + 1 NA intron (NM_017735, intron 10 of 19) MIR|SINE|MIR 67926 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 209.25-30 chr14 65216731 65217086 + 1 NA intron (NR_103769, intron 3 of 3) intron (NR_103769, intron 3 of 3) 5439 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 197.5-40 chr14 71692019 71692395 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 14 of 24) intron (NM_001354286, intron 14 of 24) 105909 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 248.5-59 chr21 35148350 35148729 + 1 NA Intergenic MER121|DNA|hAT? -99241 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 159.75-87 chr2 138262934 138263194 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 161180 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 168.75-68 chr19 38888373 38888687 + 1 NA intron (NR_034146, intron 6 of 13).2 intron (NR_034146, intron 6 of 13).2 5625 NR_034146 22933 Hs.466693 NM_012237 ENSG00000068903 SIRT2 SIR2|SIR2L|SIR2L2 sirtuin 2 protein-coding 139.25-33 chr11 91515438 91515682 + 1 NA Intergenic Intergenic -646358 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 165.25-136 chr7 95747498 95747884 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -24815 NM_004411 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 176.75-29 chr13 60336127 60336356 + 1 NA Intergenic Intergenic -60216 NM_001146071 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 347.5-8 chr14 92212726 92213271 + 1 NA Intergenic Intergenic 91029 NM_017437 53981 Hs.657632 NM_017437 ENSG00000165934 CPSF2 CPSF100 cleavage and polyadenylation specific factor 2 protein-coding 203.5-27 chr11 8886975 8887293 + 1 NA intron (NM_005418, intron 1 of 22) intron (NM_005418, intron 1 of 22) 23817 NM_005418 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 220.75-6 chr1 108567377 108567636 + 1 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 7406 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 151.75-91 chr3 100442609 100442883 + 1 NA intron (NM_001085451, intron 2 of 3) MER4A1|LTR|ERV1 41207 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 161.25-56 chr14 73350484 73350762 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu -104622 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 208.5-72 chr2 87218537 87218847 + 1 NA Intergenic Intergenic 23906 NR_039929 100616165 NR_039929 ENSG00000266063 MIR4771-2 - microRNA 4771-2 ncRNA 146.75-10 chr1 198741431 198741596 + 1 NA intron (NM_002838, intron 23 of 32) intron (NM_002838, intron 23 of 32) 102473 NR_052021 5788 Hs.654514 NM_002838 ENSG00000081237 PTPRC B220|CD45|CD45R|GP180|L-CA|LCA|LY5|T200 protein tyrosine phosphatase receptor type C protein-coding 216.5-55 chr2 5956758 5957136 + 1 NA intron (NR_026832, intron 1 of 1) L1PBb|LINE|L1 -17715 NR_106980 102465693 NR_106980 ENSG00000276733 MIR7158 hsa-mir-7158 microRNA 7158 ncRNA 215.25-64 chr3 151580515 151580793 + 1 NA Intergenic Intergenic -14659 NR_049818 100847036 NR_049818 ENSG00000264330 MIR5186 - microRNA 5186 ncRNA 123.5-101 chr2 84284996 84285156 + 1 NA Intergenic Intergenic -5606 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 146.5-12 chr1 90363879 90364068 + 1 NA Intergenic Intergenic -293777 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 168.25-86 chr2 200522903 200523188 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3097 NM_001160046 151246 Hs.655182 NM_152524 ENSG00000163535 SGO2 SGOL2|TRIPIN shugoshin 2 protein-coding 199.5-2 chr1 43632161 43632415 + 1 NA Intergenic Intergenic -17861 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 162.75-92 chr3 39081242 39081504 + 1 NA intron (NR_144401, intron 11 of 19) MamRep605|LTR?|LTR? 26254 NM_001278790 64689 Hs.721946 NM_031899 ENSG00000114745 GORASP1 GOLPH5|GRASP65|P65 golgi reassembly stacking protein 1 protein-coding 275.5-66 chr8 112312800 112313185 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 45 of 66) intron (NM_001363185, intron 45 of 66) -330501 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 206.5-109 chr6 61216106 61216367 + 1 NA Intergenic Intergenic -357894 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 142.5-15 chr1 178185591 178185807 + 1 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1MC3|LINE|L1 91595 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 263.5-71 chrX 107817074 107817590 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8534 NM_012216 11043 Hs.12256 NM_012216 ENSG00000080561 MID2 FXY2|MRX101|RNF60|TRIM1 midline 2 protein-coding 142.5-76 chr15 91316752 91317002 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -146462 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 174.75-59 chr2 74165972 74166272 + 1 NA intron (NM_001317112, intron 3 of 4) intron (NM_001317112, intron 3 of 4) 12192 NM_001317111 55233 Hs.602092 NM_018221 ENSG00000114978 MOB1A C2orf6|MATS1|MOB1|MOBK1B|MOBKL1B|Mob4B MOB kinase activator 1A protein-coding 269.75-14 chr10 119107587 119108119 + 1 NA intron (NM_001303111, intron 2 of 9) intron (NM_001303111, intron 2 of 9) 3740 NM_001303111 404636 Hs.434241 NM_207009 ENSG00000119979 DENND10 FAM45A DENN domain containing 10 protein-coding 377.5-2 chr11 112556244 112556732 + 1 NA promoter-TSS (NR_104155) promoter-TSS (NR_104155) -686 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 236.25-61 chr4 46937765 46938252 + 1 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) intron (NM_001204267, intron 7 of 7) -28763 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 181.5-123 chr4 77455275 77455462 + 1 NA Intergenic Intergenic -56385 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 236.25-50 chr20 16492690 16493097 + 1 NA intron (NM_001199866, intron 12 of 22) intron (NM_001199866, intron 12 of 22) 80555 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 199.75-35 chr17 60904980 60905226 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 11 of 25) L1M5|LINE|L1 227252 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 146.25-88 chr20 42868345 42868520 + 1 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -100311 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 125.5-155 chr21 28450183 28450387 + 1 NA Intergenic Intergenic -89033 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 272.5-59 chr6 124451268 124451683 + 1 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L3|LINE|CR1 168470 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 214.5-89 chr4 64584746 64585014 + 1 NA Intergenic Intergenic -175420 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 146.5-5 chr1 34744889 34745168 + 1 NA Intergenic Intergenic -10019 NM_005268 2709 Hs.198249 NM_005268 ENSG00000189280 GJB5 CX31.1 gap junction protein beta 5 protein-coding 348.5-19 chr5 38980885 38981640 + 1 NA intron (NM_001285439, intron 8 of 38) intron (NM_001285439, intron 8 of 38) 93137 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 300.5-22 chr17 80451791 80452362 + 1 NA Intergenic Intergenic 24531 NM_002522 4884 Hs.514556 NM_002522 ENSG00000171246 NPTX1 NP1 neuronal pentraxin 1 protein-coding 269.75-10 chr10 67830722 67831253 + 1 NA intron (NM_021800, intron 1 of 4) AluSx3|SINE|Alu 7192 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 196.5-139 chr6 47295498 47295777 + 1 NA intron (NM_014452, intron 1 of 5) intron (NM_014452, intron 1 of 5) 14268 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 227.75-20 chr13 41699806 41700039 + 1 NA intron (NM_015058, intron 28 of 44) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -131527 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 203.75-102 chr7 54299305 54299640 + 1 NA Intergenic Intergenic -31225 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 190.5-127 chr5 115005856 115006145 + 1 NA Intergenic Intergenic 163908 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 178.5-154 chr6 53794132 53794434 + 1 NA promoter-TSS (NM_018214) promoter-TSS (NM_018214) -722 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 248.5-17 chr12 44568626 44569018 + 1 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) intron (NM_006159, intron 16 of 20) 306839 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 182.25-14 chr10 62303704 62303936 + 1 NA Intergenic Intergenic -34976 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 207.5-52 chr2 63219714 63220030 + 1 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) AluSx4|SINE|Alu -100330 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 119.25-140 chr4 30383880 30384093 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -336383 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 131.5-174 chr4 54135659 54135896 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 35614 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 219.5-141 chrX 39423766 39423995 + 1 NA Intergenic Intergenic -32106 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 240.75-46 chr2 164271460 164271742 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 296894 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 113.5-113 chr19 55625969 55626259 + 1 NA Intergenic Intergenic -1539 NM_203374 147808 Hs.53996 NM_203374 ENSG00000179922 ZNF784 - zinc finger protein 784 protein-coding 175.75-124 chr8 50495511 50495769 + 1 NA intron (NR_135797, intron 8 of 20) intron (NR_135797, intron 8 of 20) 331509 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 174.75-81 chr3 70919397 70919683 + 1 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 145384 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 183.25-25 chr12 9047872 9048064 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 17102 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 175.5 chr1 27184118 27184358 + 1 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -29113 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 207.75-31 chr14 27191226 27191564 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 282753 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 218.5-121 chr8 102329142 102329408 + 1 NA intron (NM_001282873, intron 10 of 58) intron (NM_001282873, intron 10 of 58) 83414 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 240.25-5 chr1 199322749 199323093 + 1 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) LTR41B|LTR|ERVL 174323 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 209.75-9 chr10 35007845 35008295 + 1 NA TTS (NM_001198777) TTS (NM_001198777) 66213 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 115.75-117 chr2 220708170 220708314 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -801677 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 260.75-24 chr2 14605975 14606267 + 1 NA Intergenic Intergenic -26596 NM_145175 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 280.5-49 chr8 30090026 30090486 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5152 NM_001128208 23484 Hs.146585 NM_015344 ENSG00000104660 LEPROTL1 HSPC112|Vps55|my047 leptin receptor overlapping transcript like 1 protein-coding 227.5-97 chr7 119485023 119485371 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 422178 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 196.75-104 chr7 103368342 103368577 + 1 NA 3' UTR (NM_002803, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002803, exon 12 of 12) 20816 NM_002803 5701 Hs.437366 NM_002803 ENSG00000161057 PSMC2 MSS1|Nbla10058|S7 proteasome 26S subunit, ATPase 2 protein-coding 249.25-43 chr5 89400315 89400685 + 1 NA intron (NR_136221, intron 5 of 6) intron (NR_136221, intron 5 of 6) -496395 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 174.5-55 chr13 39349681 39349892 + 1 NA intron (NM_005780, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 253407 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 136.25-135 chr4 171123066 171123274 + 1 NA Intergenic Intergenic -63014 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 259.5-73 chr3 183411362 183411805 + 1 NA intron (NM_015078, intron 1 of 29) intron (NM_015078, intron 1 of 29) 16686 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 151.5-112 chr3 4558113 4558381 + 1 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) HAL1|LINE|L1 64899 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 150.5-213 chr8 43643061 43643285 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 350731 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 147.5-181 chr5 158028786 158029069 + 1 NA Intergenic Intergenic -169782 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 156.75-150 chr6 121238223 121238397 + 1 NA intron (NR_104452, intron 20 of 35) L1MEf|LINE|L1 96170 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 164.75-114 chr5 19330768 19331092 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 555342 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 176.25-141 chr8 137939783 137940008 + 1 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 143650 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 389.5 chr1 94257805 94258415 + 1 NA Intergenic Intergenic -10364 NM_001328665 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 157.5-122 chr20 44627366 44627660 + 1 NA intron (NR_136160, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 24186 NM_000022 100 Hs.654536 NM_000022 ENSG00000196839 ADA - adenosine deaminase protein-coding 163.75-80 chr20 46508246 46508431 + 1 NA intron (NM_199441, intron 2 of 5) intron (NM_199441, intron 2 of 5) 5234 NM_001353813 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 240.5-35 chr15 91647359 91647744 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 184212 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 387.5-13 chr7 24267490 24268130 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16380 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 116.25-121 chr2 215708720 215708920 + 1 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) intron (NR_037195, intron 5 of 9) -9223 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 128.25-158 chr5 50576154 50576296 + 1 NA Intergenic Intergenic -89706 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 125.25-143 chr4 44591623 44591865 + 1 NA Intergenic Intergenic 59897 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 124.5-250 chrX 24260105 24260347 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 53167 NM_001136233 170067 Hs.716893 NM_001136233 SUPT20HL2 FAM48B1|FAM48B2 SUPT20H like 2 protein-coding 114.75-184 chr8 16125740 16125939 + 1 NA intron (NM_138715, intron 8 of 9) AluJo|SINE|Alu 60433 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 249.5-98 chr9 36547594 36547952 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -25089 NM_001256693 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 134.25-27 chr11 78648874 78649137 + 1 NA Intergenic Intergenic -74141 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 231.5-24 chr12 118892753 118893079 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -59380 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 179.5-88 chr2 26106380 26106724 + 1 NA intron (NM_016131, intron 2 of 5) L1MD2|LINE|L1 -66536 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 135.5-166 chr5 124001773 124001931 + 1 NA Intergenic Intergenic 436668 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 165.25-54 chr17 61189612 61189825 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L2|LINE|L2 177986 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 372.75-4 chr10 61396264 61396693 + 1 NA Intergenic Intergenic -56161 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 288.75-13 chr11 111293536 111294100 + 1 NA 3' UTR (NM_001302646, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001302646, exon 2 of 2) -4728 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 184.25-122 chr8 109793502 109793695 + 1 NA Intergenic Intergenic -101807 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 141.5-242 chr9 134637068 134637287 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -4628 NM_000093 1289 Hs.210283 NM_000093 ENSG00000130635 COL5A1 EDSC|EDSCL1 collagen type V alpha 1 chain protein-coding 168.5-161 chr6 145716717 145716937 + 1 NA intron (NM_001360064, intron 1 of 3) intron (NM_001360064, intron 1 of 3) -18042 NR_038246 100507557 Hs.124537 NR_038244 ENSG00000235652 LOC100507557 - uncharacterized LOC100507557 ncRNA 163.75-90 chr3 10327611 10327818 + 1 NA 3' UTR (NM_001353564, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001353564, exon 21 of 21) -2515 NR_036084 100422933 NR_036084 ENSG00000264534 MIR378B - microRNA 378b ncRNA 252.25-17 chr14 54053123 54053473 + 1 NA Intergenic Intergenic -96407 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 164.75-24 chr10 101841687 101841878 + 1 NA intron (NM_173192, intron 1 of 8) intron (NM_173192, intron 1 of 8) -1911 NM_173194 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 203.5-62 chr19 30285267 30285486 + 1 NA Intergenic Intergenic -87008 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 164.5-197 chr8 15175736 15176003 + 1 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 62562 NM_001322881 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 271.75-47 chr8 117200508 117200943 + 1 NA Intergenic Intergenic 65730 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 232.75-25 chr15 85587097 85587380 + 1 NA intron (NM_007200, intron 8 of 36) L1MB7|LINE|L1 -32712 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 184.25-65 chr2 194928857 194929112 + 1 NA Intergenic Intergenic 198389 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 157.75-177 chr8 131614848 131615262 + 1 NA Intergenic Intergenic -289038 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 264.75-2 chr1 63121799 63122379 + 1 NA Intergenic Intergenic -109618 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 249.5-28 chr14 60786216 60786597 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 51645 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 119.25-104 chr2 209121946 209122093 + 1 NA Intergenic Intergenic -302028 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 314.75-12 chr21 23311670 23312121 + 1 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 72940 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 140.75-175 chr7 139940995 139941199 + 1 NA intron (NM_001366537, intron 4 of 11) intron (NM_001366537, intron 4 of 11) 111833 NM_001166253 6916 Hs.520757 NM_001061 ENSG00000059377 TBXAS1 BDPLT14|CYP5|CYP5A1|GHOSAL|THAS|TS|TXAS|TXS thromboxane A synthase 1 protein-coding 186.5-103 chr4 161776639 161777151 + 1 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) L1MA4|LINE|L1 -245838 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 158.75-66 chr16 72862785 72862967 + 1 NA intron (NM_001164766, intron 3 of 8) L1MC5|LINE|L1 185252 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 180.25-63 chr20 50038121 50038339 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 3399 NR_051976 100887755 Hs.195705 NR_051976 TRERNA1 LINC00651|treRNA translation regulatory long non-coding RNA 1 ncRNA 135.25-199 chr8 107420271 107420613 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 77476 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 152.25-60 chr16 22717008 22717388 + 1 NA Intergenic Intergenic -96964 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 200.25-50 chr19 8485520 8485829 + 1 NA exon (NM_031203, exon 15 of 17) exon (NM_031203, exon 15 of 17) 16966 NM_032152 84106 Hs.465812 NM_032152 ENSG00000133246 PRAM1 PML-RAR|PRAM-1 PML-RARA regulated adaptor molecule 1 protein-coding 279.25-43 chrX 116401274 116401568 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35185 NM_007231 11254 Hs.522109 NM_007231 ENSG00000268104 SLC6A14 BMIQ11 solute carrier family 6 member 14 protein-coding 216.25-34 chr14 83493374 83493610 + 1 NA Intergenic Intergenic 850860 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 158.75-98 chr2 240938679 240938957 + 1 NA intron (NM_001351305, intron 14 of 31) L1ME2|LINE|L1 28633 NR_033841 200772 Hs.647893 NR_033841 ENSG00000233392 LOC200772 - uncharacterized LOC200772 ncRNA 174.5-149 chr5 87641916 87642146 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -20011 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 201.75-64 chr4 2840380 2840664 + 1 NA 3' UTR (NM_001145855, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001145855, exon 13 of 13) -3322 NM_001354762 118 Hs.183706 NM_001119 ENSG00000087274 ADD1 ADDA adducin 1 protein-coding 141.5-13 chr1 190639578 190639845 + 1 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 14821 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 159.75-101 chr22 36055206 36055520 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -26539 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 120.75-132 chr5 4535032 4535364 + 1 NA Intergenic Intergenic -238283 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 175.5-23 chr10 85697631 85697925 + 1 NA intron (NM_017551, intron 12 of 15) L3b|LINE|CR1 120047 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 196.25-2 chr1 80140552 80140813 + 1 NA Intergenic Intergenic -395073 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 129.5-245 chrX 48929017 48929224 + 1 NA intron (NM_001136159, intron 5 of 8) AluSx|SINE|Alu -10096 NM_006875 11040 Hs.727148 NM_006875 ENSG00000102096 PIM2 - Pim-2 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 121.5-86 chr15 60908254 60908422 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 226769 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 134.25-121 chr3 183679070 183679228 + 1 NA non-coding (NR_146169, exon 6 of 6) non-coding (NR_146169, exon 6 of 6) -18648 NM_001351371 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 208.25-55 chr20 61190690 61190932 + 1 NA Intergenic HERVIP10FH-int|LTR|ERV1 -61450 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 210.5-106 chr5 146703944 146704186 + 1 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 174720 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 115.5-213 chr6 49710411 49710578 + 1 NA intron (NM_001261822, intron 2 of 8) intron (NM_001261822, intron 2 of 8) 3049 NM_001142408 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 165.5-182 chr7 93922590 93922902 + 1 NA intron (NM_004126, intron 1 of 1) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 1011 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 198.5-88 chr20 14267303 14267619 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 70151 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 116.75-134 chr3 137691178 137691376 + 1 NA Intergenic Intergenic -73038 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 260.75-4 chr10 59110644 59111059 + 1 NA Intergenic Intergenic 65613 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 114.5-126 chr2 21472482 21472698 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 238062 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 196.5-111 chr4 47065451 47065677 + 1 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 33997 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 144.25-41 chr11 47065540 47065763 + 1 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) L1MB3|LINE|L1 111228 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 117.5-123 chr20 6684328 6684496 + 1 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 51724 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 230.75-69 chr8 51338521 51338871 + 1 NA intron (NM_144651, intron 21 of 22) intron (NM_144651, intron 21 of 22) 470749 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 165.5-7 chr1 163538462 163538758 + 1 NA Intergenic Intergenic -115419 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 123.5-90 chr2 4139006 4139141 + 1 NA Intergenic Intergenic 164912 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 165.75-108 chr22 45135303 45135584 + 1 NA intron (NR_038956, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 17141 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 191.75-76 chr22 37227792 37228073 + 1 NA intron (NM_002872, intron 5 of 6) intron (NM_002872, intron 5 of 6) -15455 NM_001051 6753 Hs.225995 NM_001051 ENSG00000278195 SSTR3 SS-3-R|SS3-R|SS3R|SSR-28 somatostatin receptor 3 protein-coding 209.5-101 chr4 34129562 34129819 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 -89797 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 197.5-10 chr1 216543364 216543608 + 1 NA intron (NM_001243518, intron 6 of 7) intron (NM_001243518, intron 6 of 7) -120038 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 200.5-110 chr5 53634047 53634364 + 1 NA intron (NR_134474, intron 3 of 5) intron (NR_134474, intron 3 of 5) 73566 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 186.5-98 chr4 40046490 40046743 + 1 NA intron (NR_027277, intron 1 of 2) intron (NR_027277, intron 1 of 2) -10234 NM_018177 55728 Hs.391463 NM_018177 ENSG00000078177 N4BP2 B3BP NEDD4 binding protein 2 protein-coding 187.25-29 chr14 41358028 41358253 + 1 NA Intergenic Intergenic -248716 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 130.5-178 chr3 156300678 156300808 + 1 NA intron (NM_172159, intron 1 of 13) intron (NM_172159, intron 1 of 13) 9706 NM_001308222 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 178.25 chr1 58479853 58480169 + 1 NA TTS (NM_145243) TTS (NM_145243) 66715 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 121.25-30 chr10 119480445 119480686 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 55968 NM_002925 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 212.5-72 chr3 106075968 106076361 + 1 NA Intergenic Intergenic -206763 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 158.75-64 chr16 6681666 6681987 + 1 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) MIRc|SINE|MIR -91983 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 183.5-142 chr7 111858612 111858828 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 23 of 52) MLT2B1|LTR|ERVL 50215 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 148.75-19 chr10 29818909 29819224 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -82130 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 272.75-35 chr4 76333376 76333687 + 1 NA intron (NM_001042784, intron 18 of 23) intron (NM_001042784, intron 18 of 23) 27505 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 139.25-39 chr12 57593304 57593575 + 1 NA intron (NM_024779, intron 1 of 9) intron (NM_024779, intron 1 of 9) 2247 NM_001146258 79837 Hs.745011 NM_024779 ENSG00000166908 PIP4K2C PIP5K2C phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 gamma protein-coding 259.75-49 chr8 3191703 3192032 + 1 NA intron (NM_033225, intron 33 of 69) intron (NM_033225, intron 33 of 69) -463416 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 175.75-93 chr4 105324519 105324959 + 1 NA intron (NR_126420, intron 2 of 5) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 28142 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-48 chr12 45545253 45545469 + 1 NA Intergenic Intergenic 182560 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 257.25-49 chr6 120023230 120023654 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 8263 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 216.75-71 chr6 52694670 52695078 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 23761 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 112.5-107 chr2 36844973 36845158 + 1 NA 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 121471 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 199.5-60 chr18 2154341 2154858 + 1 NA Intergenic Intergenic 416906 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 141.25-180 chr8 81506805 81506984 + 1 NA Intergenic Intergenic -23661 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 153.25-90 chr3 71145040 71145428 + 1 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) L1ME1|LINE|L1 -13037 NM_001349342 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 330.25-28 chr9 129576480 129577089 + 1 NA Intergenic Intergenic -32100 NM_001286796 28989 Hs.744027 NM_014064 ENSG00000148335 NTMT1 AD-003|C9orf32|HOMT1A|METTL11A|NRMT|NRMT1|NTM1A N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 protein-coding 172.25-119 chr5 156949959 156950259 + 1 NA intron (NM_138379, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 13117 NM_001146726 91937 Hs.334907 NM_138379 ENSG00000145850 TIMD4 SMUCKLER|TIM4 T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 protein-coding 154.5-70 chr15 78816226 78816420 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4859 NM_014272 11173 Hs.16441 NM_014272 ENSG00000136378 ADAMTS7 ADAM-TS 7|ADAM-TS7|ADAMTS-7 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 7 protein-coding 155.5-171 chr5 109388992 109389245 + 1 NA intron (NM_014819, intron 1 of 9) L1MEg|LINE|L1 20856 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 205.5-101 chr4 12136036 12136336 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -87265 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 126.5-218 chr7 6130782 6130938 + 1 NA intron (NM_032172, intron 3 of 17) MER74B|LTR|ERVL 25911 NM_032172 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 124.5-215 chr8 14054152 14054384 + 1 NA Intergenic Intergenic 424578 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 347.25-16 chr4 182758922 182759326 + 1 NA intron (NM_001080477, intron 22 of 27) intron (NM_001080477, intron 22 of 27) 158129 NM_001351743 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 194.5-72 chr2 144953496 144953721 + 1 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 285641 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 168.5-13 chr1 160891414 160891685 + 1 NA Intergenic Intergenic -6369 NM_017625 55600 Hs.50813 NM_017625 ENSG00000179914 ITLN1 HL-1|HL1|INTL|ITLN|LFR|hIntL|omentin intelectin 1 protein-coding 220.5-26 chr14 59436042 59436370 + 1 NA Intergenic Intergenic 29174 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 153.75-39 chr14 47657010 47657312 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 17793 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 137.5-200 chr6 33619918 33620076 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -1325 NM_002224 3710 Hs.65758 NM_002224 ENSG00000096433 ITPR3 IP3R|IP3R3 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 3 protein-coding 208.5-58 chr17 61995801 61996148 + 1 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) intron (NM_005121, intron 9 of 29) -67992 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 275.5-3 chr1 97031741 97032219 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -63943 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 124.25-40 chr12 19860708 19860926 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -153868 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 208.5-54 chr17 51556701 51556983 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 121415 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 182.5-59 chr16 2377801 2378018 + 1 NA intron (NR_003574, intron 6 of 16) AluJb|SINE|Alu 36987 NR_003574 650655 Hs.376281 NR_003574 ENSG00000238098 ABCA17P ABCA17 ATP binding cassette subfamily A member 17, pseudogene pseudo 327.25-7 chr17 61634356 61635097 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -43507 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 293.25-43 chrX 96527862 96528379 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -156543 NM_007309 1730 Hs.226483 NM_006729 ENSG00000147202 DIAPH2 DIA|DIA2|DRF2|POF|POF2|POF2A diaphanous related formin 2 protein-coding 196.75-59 chr2 79013298 79013611 + 1 NA Intergenic Intergenic -12248 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 169.5-134 chr5 33217974 33218249 + 1 NA Intergenic Intergenic -11624 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 161.5-38 chr11 125163611 125163864 + 1 NA intron (NR_125759, intron 1 of 2) intron (NR_125759, intron 1 of 2) 872 NR_125759 103695364 Hs.576940 NR_125759 ENSG00000254880 PKNOX2-AS1 - PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 141.75-4 chr1 52495653 52495863 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 5 of 29) intron (NM_001009881, intron 5 of 29) 57332 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 152.5-28 chr11 98170145 98170372 + 1 NA Intergenic Intergenic -850691 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 222.25-81 chr7 77189969 77190277 + 1 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) 9696 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 138.25-158 chr7 19775579 19775903 + 1 NA Intergenic Intergenic -2124 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 187.5-2 chr1 32345620 32345910 + 1 NA Intergenic Intergenic -9532 NR_052852 65108 Hs.75061 NM_023009 ENSG00000175130 MARCKSL1 F52|MACMARCKS|MLP|MLP1|MRP MARCKS like 1 protein-coding 336.5-5 chr11 14770135 14770738 + 1 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) L3|LINE|CR1 121769 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 125.5-19 chr1 225490553 225490734 + 1 NA 3' UTR (NM_018212, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_018212, exon 14 of 14) -61788 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 203.75-67 chr3 30910059 30910388 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -15562 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 206.5-99 chr5 110416640 110416918 + 1 NA Intergenic Intergenic 97136 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 166.5-82 chr17 43963938 43964210 + 1 NA intron (NM_004160, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu -21598 NM_002722 5539 Hs.558368 NM_002722 ENSG00000108849 PPY PNP|PP pancreatic polypeptide protein-coding 189.5-75 chr2 179243830 179244204 + 1 NA intron (NM_178123, intron 1 of 17) AluJo|SINE|Alu 20815 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 163.25-13 chr10 25070936 25071297 + 1 NA Intergenic Intergenic -8837 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 288.25-23 chr6 56986465 56986945 + 1 NA intron (NM_001318539, intron 2 of 3) intron (NM_001318539, intron 2 of 3) 31598 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 202.75-77 chr3 145825168 145825472 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 243865 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 138.5-137 chr3 115548400 115548589 + 1 NA Intergenic Intergenic -75016 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 207.75-44 chr18 21961676 21961960 + 1 NA Intergenic Intergenic -130412 NR_110369 102723167 Hs.658808 NR_110369 ENSG00000265142 MIR133A1HG MIR1-2HG MIR133A1 host gene ncRNA 160.5-194 chr8 119862826 119863241 + 1 NA Intergenic Intergenic -7139 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 149.5-46 chr12 21449604 21449865 + 1 NA intron (NM_001350913, intron 4 of 10) intron (NM_001350913, intron 4 of 10) 11819 NM_001350912 79912 Hs.709545 NM_024854 ENSG00000121350 PYROXD1 MFM8 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 protein-coding 287.75-50 chr8 122839681 122840161 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 58266 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 115.75-210 chr8 59707309 59707489 + 1 NA Intergenic Intergenic 574001 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 129.75-68 chr15 80239721 80239875 + 1 NA intron (NM_001352888, intron 1 of 2) intron (NM_001352888, intron 1 of 2) 12415 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 169.5-140 chr5 102823572 102823862 + 1 NA intron (NM_001364582, intron 1 of 24) intron (NM_001364582, intron 1 of 24) 15519 NM_001364582 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 268.75-32 chr4 111850182 111850627 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -295050 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 136.25-164 chr6 45378758 45379064 + 1 NA promoter-TSS (NM_001350324) promoter-TSS (NM_001350324) -977 NM_001350325 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 257.5-15 chr11 126953523 126953817 + 1 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) 12924 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 151.25-134 chr4 8175691 8176027 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -17046 NM_001130087 84448 Hs.233404 NM_032432 ENSG00000163995 ABLIM2 - actin binding LIM protein family member 2 protein-coding 130.5-177 chr3 152808970 152809191 + 1 NA Intergenic Intergenic -26051 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 209.5-66 chr2 102283269 102283654 + 1 NA Intergenic Intergenic -28041 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 166.5-94 chr2 243121 243335 + 1 NA intron (NM_001282682, intron 5 of 10) L1M4b|LINE|L1 13112 NM_001282687 26751 Hs.515951 NM_015677 ENSG00000035115 SH3YL1 RAY SH3 and SYLF domain containing 1 protein-coding 231.5-10 chr10 64537061 64537355 + 1 NA Intergenic Intergenic -288320 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 214.5-111 chr6 117987479 117987829 + 1 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) 80390 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 163.75-36 chr12 85442117 85442534 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 162105 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 144.75-182 chr8 118628566 118628786 + 1 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -6713 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 253.75-53 chr6 69206558 69207076 + 1 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) HERVL-int|LTR|ERVL 571535 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 137.5-81 chr16 22752656 22752877 + 1 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -61396 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 165.5-150 chr5 116423319 116423570 + 1 NA Intergenic Intergenic -24054 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 167.25-6 chr1 80469284 80469614 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -66306 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 186.25-73 chr3 121310124 121310369 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 20 of 27) L1M4b|LINE|L1 235742 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 359.5-2 chr11 7070245 7070836 + 1 NA intron (NM_176822, intron 11 of 11) intron (NM_176822, intron 11 of 11) -18458 NM_014469 27288 Hs.121605 NM_014469 ENSG00000170748 RBMXL2 HNRNPG-T|HNRNPGT|HNRPGT RBMX like 2 protein-coding 226.75-34 chr2 67560830 67561313 + 1 NA Intergenic Intergenic 163738 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 325.25-13 chr2 168711977 168712439 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 6 of 10) intron (NM_001256126, intron 6 of 10) 74221 NR_045787 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 157.5-85 chr18 4048225 4048407 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 85963 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 151.5-168 chr6 36888051 36888345 + 1 NA intron (NM_152734, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 2246 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 153.75-35 chr12 132258120 132258397 + 1 NA intron (NM_001122636, intron 4 of 10) intron (NM_001122636, intron 4 of 10) -17133 NR_024563 100130238 Hs.536338 NR_024563 LOC100130238 - uncharacterized LOC100130238 ncRNA 240.25-18 chr12 65567305 65567861 + 1 NA intron (NR_120434, intron 4 of 4) intron (NR_120434, intron 4 of 4) -10272 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 208.25-29 chr15 58851194 58851660 + 1 NA intron (NM_001040450, intron 7 of 8) AluJr4|SINE|Alu 80125 NM_001040450 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 388.5-16 chr7 48596119 48596709 + 1 NA intron (NM_152701, intron 58 of 61) L1MB8|LINE|L1 -328133 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 132.5-108 chr2 18441867 18442092 + 1 NA Intergenic Intergenic 118674 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 238.5-90 chr8 57600538 57600972 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -145394 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 185.5-166 chr8 127554778 127555079 + 1 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -72789 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 152.5-168 chr6 116170155 116170443 + 1 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) -44167 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 124.5-108 chr2 107714226 107714449 + 1 NA Intergenic Intergenic -39775 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 180.75-150 chr8 113075081 113075373 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 301925 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 141.5-223 chr8 69459442 69459671 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7068 NM_015170 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 279.5-34 chr20 57672175 57672728 + 1 NA intron (NM_199171, intron 1 of 3) CpG 18235 NM_001255976 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 125.5-64 chr13 37038318 37038567 + 1 NA intron (NM_001014286, intron 9 of 25) L1MC5a|LINE|L1 21045 NM_001278482 55578 Hs.435815 NM_017569 ENSG00000102710 SUPT20H C13|C13orf19|FAM48A|FP757|P38IP|SPT20 SPT20 homolog, SAGA complex component protein-coding 158.25-110 chr5 36967370 36967705 + 1 NA intron (NM_015384, intron 6 of 45) L1M5|LINE|L1 90768 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 208.5-121 chr6 76131337 76131746 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -58863 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 180.25-101 chr5 116010234 116010634 + 1 NA intron (NM_173800, intron 13 of 19) intron (NM_173800, intron 13 of 19) -41032 NM_001195581 644100 Hs.98288 NM_001195581 ENSG00000268223 ARL14EPL - ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein like protein-coding 252.75-5 chr10 60838801 60839075 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 60460 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 161.25-70 chr17 32324834 32325009 + 1 NA TTS (NM_001330181) TTS (NM_001330181) 17252 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 123.75-207 chrX 62717380 62717703 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 633791 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 116.25-48 chr12 33350403 33350559 + 1 NA Intergenic Intergenic 89338 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 189.25-104 chr6 56747602 56747932 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 95898 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 138.25-96 chr2 234503448 234503616 + 1 NA Intergenic Intergenic -6451 NM_001282431 10123 Hs.111554 NM_005737 ENSG00000188042 ARL4C ARL7|LAK ADP ribosylation factor like GTPase 4C protein-coding 156.25-18 chr10 53067254 53067538 + 1 NA Intergenic Intergenic -295696 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 218.25-47 chr2 197736360 197736833 + 1 NA intron (NM_033030, intron 10 of 10) L1MC4a|LINE|L1 31227 NM_138395 92935 Hs.744330 NM_138395 ENSG00000247626 MARS2 COXPD25|MetRS|mtMetRS methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 183.75-68 chr22 45869142 45869369 + 1 NA Intergenic Intergenic 107907 NM_058238 7477 Hs.512714 NM_058238 ENSG00000188064 WNT7B - Wnt family member 7B protein-coding 189.75-95 chr5 165228017 165228206 + 1 NA Intergenic Intergenic 757832 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 181.25-27 chr13 28160270 28160511 + 1 NA intron (NM_175854, intron 1 of 18) intron (NM_175854, intron 1 of 18) -21216 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 113.5-91 chr15 93613541 93613745 + 1 NA Intergenic Intergenic -242917 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 121.75-183 chr7 130535760 130535949 + 1 NA intron (NM_012133, intron 20 of 23) intron (NM_012133, intron 20 of 23) -7599 NR_024086 53844 Hs.6421 NR_024086 COPG2IT1 CIT1|COPG2AS|DKFZP761N09121|NCRNA00170 COPG2 imprinted transcript 1 ncRNA 211.5-45 chr13 70284872 70285186 + 1 NA Intergenic Intergenic -176536 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 182.5-108 chr3 135915997 135916211 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -49624 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 123.25-199 chr8 81972163 81972379 + 1 NA Intergenic Intergenic -129985 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 128.5-91 chr18 8488005 8488196 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -121066 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 212.5-27 chr14 59154150 59154501 + 1 NA Intergenic Intergenic -34342 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 162.25-111 chr4 41788554 41788741 + 1 NA Intergenic Intergenic -39677 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 251.5-38 chr2 168275218 168275500 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -27764 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 213.5-34 chr14 50167991 50168534 + 1 NA intron (NM_006939, intron 8 of 22) AluJr|SINE|Alu -51690 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 219.5-28 chr12 50106743 50107048 + 1 NA exon (NM_005276, exon 5 of 8) exon (NM_005276, exon 5 of 8) 2887 NM_005276 2819 Hs.524418 NM_005276 ENSG00000167588 GPD1 GPD-C|GPDH-C|HTGTI glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 protein-coding 257.75-41 chr5 53391730 53392154 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -88687 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 136.5-96 chr19 13892932 13893114 + 1 NA intron (NM_001345843, intron 4 of 8) intron (NM_001345843, intron 4 of 8) 13094 NM_024323 79173 Hs.143288 NM_024323 ENSG00000132016 C19orf57 - chromosome 19 open reading frame 57 protein-coding 258.25-28 chr2 144557769 144558237 + 1 NA intron (NR_110570, intron 1 of 2) intron (NR_110570, intron 1 of 2) -33559 NR_136320 105373656 Hs.734683 NR_136320 LOC105373656 - uncharacterized LOC105373656 ncRNA 180.25-89 chr5 8434679 8434989 + 1 NA intron (NR_039984, intron 2 of 5) intron (NR_039984, intron 2 of 5) 22730 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 204.5-128 chr8 13408084 13408580 + 1 NA intron (NM_024767, intron 2 of 4) intron (NM_024767, intron 2 of 4) 106519 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 193.25-9 chr10 20576500 20576828 + 1 NA Intergenic Intergenic 24694 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 158.75-51 chr14 50366411 50366645 + 1 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 30353 NM_004196 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 132.25-20 chr1 203676822 203677117 + 1 NA intron (NM_001365784, intron 1 of 20) intron (NM_001365784, intron 1 of 20) 49032 NM_001365784 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 273.5-66 chr5 134448092 134448493 + 1 NA Intergenic Intergenic -13245 NR_105044 102546229 NR_105044 LOC102546229 - uncharacterized LOC102546229 ncRNA 274.5-62 chr7 55093396 55093906 + 1 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) -16188 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 247.75-14 chr14 49699360 49699827 + 1 NA intron (NM_172193, intron 1 of 12) intron (NM_172193, intron 1 of 12) 6473 NM_172193 122773 Hs.509258 NM_172193 ENSG00000197776 KLHDC1 MST025 kelch domain containing 1 protein-coding 215.25-108 chr8 85260196 85260571 + 1 NA intron (NM_198584, intron 3 of 6) intron (NM_198584, intron 3 of 6) 14925 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 278.25-51 chr6 130755669 130756008 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -71567 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 129.75-116 chr22 27430276 27430461 + 1 NA Intergenic Intergenic 119717 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 276.75-52 chr9 26954631 26955006 + 1 NA TTS (NR_121605) TTS (NR_121605) 1489 NR_121605 101929602 Hs.127665 NR_121605 ENSG00000234676 IFT74-AS1 - IFT74 antisense RNA 1 ncRNA 246.25-3 chr1 170290590 170291061 + 1 NA Intergenic Intergenic -6617 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 230.25-75 chr7 97170598 97171025 + 1 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) intron (NM_020186, intron 1 of 1) 54218 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 157.5-60 chr14 67547197 67547600 + 1 NA intron (NM_020715, intron 2 of 28) L3|LINE|CR1 -13548 NM_001348546 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 149.75-67 chr17 78749254 78749594 + 1 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu -12522 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 287.75-36 chr3 17089617 17089968 + 1 NA exon (NM_001144382, exon 6 of 6).2 exon (NM_001144382, exon 6 of 6).2 156596 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 151.5-143 chr4 111979284 111979495 + 1 NA Intergenic Intergenic -166065 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 280.75-6 chr10 6274810 6275251 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -51514 NR_040079 399715 NR_040079 ENSG00000215244 LINC02649 - long intergenic non-protein coding RNA 2649 ncRNA 317.5-20 chr22 26453263 26453760 + 1 NA intron (NM_001349902, intron 11 of 11) intron (NM_001349902, intron 11 of 11) 24251 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 145.5-35 chr11 78022095 78022340 + 1 NA intron (NM_001203261, intron 2 of 2) FLAM_C|SINE|Alu 1059 NM_023930 65987 Hs.709780 NM_023930 ENSG00000151364 KCTD14 - potassium channel tetramerization domain containing 14 protein-coding 174.5-32 chr11 47028434 47028744 + 1 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) intron (NR_103472, intron 2 of 7) 91828 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 244.25-48 chr7 56298247 56298945 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 149779 NR_029420 650226 Hs.448401 NR_029420 LOC650226 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene pseudo 234.75-88 chr9 76224484 76224732 + 1 NA intron (NM_001190482, intron 20 of 36) intron (NM_001190482, intron 20 of 36) 169818 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 301.75-35 chr7 80369115 80369621 + 1 NA Intergenic Intergenic 5071 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 255.75-55 chr9 32921402 32921975 + 1 NA Intergenic LTR1B0|LTR|ERV1 79888 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 230.5-79 chr3 70036019 70036466 + 1 NA Intergenic Intergenic 36498 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 135.75-36 chr11 36619045 36619189 + 1 NA intron (NM_001276725, intron 2 of 3) intron (NM_001276725, intron 2 of 3) -20838 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 170.25-151 chr8 73132727 73132990 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -39686 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 299.5-48 chr9 8475536 8475857 + 1 NA intron (NM_130392, intron 14 of 30) L2a|LINE|L2 258250 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 373.25-7 chr18 13373845 13374428 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 53398 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 227.25-9 chr1 211818739 211818994 + 1 NA intron (NM_014873, intron 2 of 7) intron (NM_014873, intron 2 of 7) -10771 NR_135818 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 232.25-11 chr11 26362046 26362509 + 1 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) intron (NM_031418, intron 1 of 26) 30147 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 184.5-106 chr3 189265377 189265699 + 1 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -24944 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 113.5-61 chr13 23312196 23312490 + 1 NA intron (NM_000231, intron 6 of 7) intron (NM_000231, intron 6 of 7) 63165 NM_001278055 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 214.75-6 chr1 118319748 118320153 + 1 NA Intergenic Intergenic -134722 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 156.5-36 chr12 37954794 37954982 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -361886 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 116.5-209 chr5 180919543 180919719 + 1 NA intron (NM_001159710, intron 2 of 6) L1MA10|LINE|L1 10067 NM_001159710 79908 Hs.189109 NM_024850 ENSG00000113303 BTNL8 BTN9.2 butyrophilin like 8 protein-coding 153.5-43 chr12 58361871 58362160 + 1 NA Intergenic Intergenic -229687 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 168.5-121 chr3 132450233 132450440 + 1 NA intron (NM_001329126, intron 5 of 56) intron (NM_001329126, intron 5 of 56) 32834 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 208.75-65 chr5 80615616 80615872 + 1 NA intron (NR_125754, intron 1 of 1) intron (NR_125754, intron 1 of 1) 6780 NR_125754 103689917 Hs.740035 NR_125754 ENSG00000251221 LINC01337 TCONS_00009713 long intergenic non-protein coding RNA 1337 ncRNA 200.5-100 chr4 54059532 54059811 + 1 NA intron (NM_012110, intron 1 of 5) intron (NM_012110, intron 1 of 5) 4934 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 115.5-259 chrX 102797431 102797760 + 1 NA intron (NR_038988, intron 2 of 7) intron (NR_038988, intron 2 of 7) 28442 NR_146590 100287765 Hs.556850 NR_038988 LINC00630 - long intergenic non-protein coding RNA 630 ncRNA 148.75-102 chr22 22840137 22840294 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 17439 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 189.5-158 chr9 32490399 32490731 + 1 NA intron (NM_014314, intron 5 of 17) intron (NM_014314, intron 5 of 17) 35631 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 172.5-186 chr7 39994888 39995078 + 1 NA intron (NM_003718, intron 2 of 13) L1MC4|LINE|L1 44623 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 163.5-48 chr13 71621217 71621475 + 1 NA intron (NM_001366712, intron 3 of 11) intron (NM_001366712, intron 3 of 11) 245846 NM_080760 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 250.5-50 chr2 105297349 105297711 + 1 NA intron (NM_001142621, intron 3 of 11) intron (NM_001142621, intron 3 of 11) 32126 NR_137328 9392 Hs.446350 NM_004257 ENSG00000135966 TGFBRAP1 TRAP-1|TRAP1|VPS3 transforming growth factor beta receptor associated protein 1 protein-coding 271.75-51 chrX 50125214 50125727 + 1 NA Intergenic Intergenic 55969 NM_001282163 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 184.5-34 chr12 15542704 15543007 + 1 NA intron (NM_030667, intron 12 of 26) MER33|DNA|hAT-Charlie -3756 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 231.5-46 chr2 70206119 70206529 + 1 NA Intergenic Intergenic -15305 NM_001348762 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 166.5-45 chr12 10036929 10037119 + 1 NA intron (NM_207345, intron 1 of 8) MER6|DNA|TcMar-Tigger 6342 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 274.75-26 chr2 79571204 79571515 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) L3|LINE|CR1 48176 NM_001282598 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 215.75-47 chr19 2873336 2873636 + 1 NA intron (NR_145838, intron 1 of 3) intron (NR_145838, intron 1 of 3) 6151 NM_024967 80032 Hs.287433 NM_024967 ENSG00000172000 ZNF556 - zinc finger protein 556 protein-coding 194.75-70 chr3 167515058 167515459 + 1 NA intron (NM_001348951, intron 16 of 18) L1PA10|LINE|L1 -41126 NM_001012303 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 222.5-118 chrX 56509959 56510265 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -53481 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 164.75-119 chr5 176908435 176908670 + 1 NA non-coding (NR_146149, exon 13 of 16) non-coding (NR_146149, exon 13 of 16) -9206 NM_002115 3101 Hs.411695 NM_002115 ENSG00000160883 HK3 HKIII|HXK3 hexokinase 3 protein-coding 239.5-88 chrX 58496820 58497237 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -586395 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 134.5-3 chr1 38211296 38211477 + 1 NA intron (NR_038928, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 3381 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 204.5-118 chr7 34852238 34852615 + 1 NA intron (NM_207173, intron 8 of 8) MIR3|SINE|MIR -18095 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 275.5-18 chr14 44178141 44178542 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 328942 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 151.75-69 chr2 166515304 166515560 + 1 NA Intergenic Intergenic -28461 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 228.5-28 chr12 24011062 24011466 + 1 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -60232 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 299.5-33 chr5 128890062 128890578 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -74807 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 260.5-11 chr12 38773184 38773678 + 1 NA intron (NM_153634, intron 7 of 19) L1MB1|LINE|L1 132160 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 297.75-34 chr5 40852664 40853011 + 1 NA exon (NM_032587, exon 3 of 3) exon (NM_032587, exon 3 of 3) 11470 NM_032587 84674 Hs.200242 NM_032587 ENSG00000132357 CARD6 CINCIN1 caspase recruitment domain family member 6 protein-coding 266.25-43 chr7 91940010 91940538 + 1 NA promoter-TSS (NM_005751) promoter-TSS (NM_005751) -588 NM_147185 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 293.5-45 chrX 14519671 14520166 + 1 NA Intergenic Intergenic -9380 NM_001171942 2742 Hs.2700 NM_002063 ENSG00000101958 GLRA2 GLR glycine receptor alpha 2 protein-coding 190.5-140 chr7 7865347 7865632 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) 103263 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 344.5-7 chr12 40890639 40891080 + 1 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) L1MC1|LINE|L1 -17498 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 119.5-249 chr9 20349010 20349180 + 1 NA intron (NM_001286691, intron 10 of 10) intron (NM_001286691, intron 10 of 10) 62143 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 246.5-41 chr2 75563417 75563718 + 1 NA intron (NM_032181, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR -2238 NM_001369524 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 264.5-10 chr10 87676281 87676554 + 1 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) intron (NM_001015880, intron 1 of 12) 16539 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 186.5-82 chr21 30725684 30726040 + 1 NA Intergenic Intergenic -7085 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 227.25-75 chr7 88292307 88292591 + 1 NA intron (NM_001205315, intron 1 of 5) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 14445 NM_024636 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 185.5-5 chr1 87603298 87603542 + 1 NA Intergenic Intergenic -231765 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 252.75-34 chr2 210330008 210330319 + 1 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) L1PA17|LINE|L1 5451 NR_110604 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 220.25-10 chr10 69197553 69197851 + 1 NA intron (NM_001323586, intron 9 of 15) AluJo|SINE|Alu 17468 NM_001323584 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 183.75 chr1 8770600 8771032 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) L1ME3G|LINE|L1 46824 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 273.75-30 chr4 60189129 60189532 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -733289 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 140.5-218 chr7 87740277 87740670 + 1 NA intron (NM_138290, intron 6 of 11) intron (NM_138290, intron 6 of 11) -27150 NM_001348945 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 201.5-5 chr1 45188902 45189149 + 1 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 17580 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 172.5-188 chr7 55144750 55145049 + 1 NA intron (NM_001346899, intron 3 of 26) MIR|SINE|MIR 35060 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 182.25-38 chr14 56608412 56608716 + 1 NA intron (NM_017799, intron 5 of 15) intron (NM_017799, intron 5 of 15) 28766 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 325.75-14 chr2 113023435 113023930 + 1 NA intron (NM_014438, intron 5 of 5) intron (NM_014438, intron 5 of 5) 18223 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 198.25-21 chr11 67206801 67207029 + 1 NA intron (NR_027473, intron 5 of 20) intron (NR_027473, intron 5 of 20) -33099 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 375.5-10 chr2 9915752 9916344 + 1 NA intron (NM_001318977, intron 11 of 13) L1ME1|LINE|L1 -35645 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 315.75-4 chr13 34492451 34492832 + 1 NA intron (NR_047036, intron 2 of 2) L1ME3G|LINE|L1 144598 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 156.5-18 chr10 98447394 98447581 + 1 NA promoter-TSS (NM_001322477) promoter-TSS (NM_001322477) -524 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 261.25-27 chr3 24145704 24146399 + 1 NA intron (NM_001354708, intron 6 of 9) intron (NM_001354708, intron 6 of 9) -5273 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 182.25-70 chr22 26467286 26467529 + 1 NA intron (NR_146315, intron 8 of 14) L1M5|LINE|L1 12081 NR_073136 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 153.25-54 chr17 70572993 70573212 + 1 NA Intergenic Intergenic 403567 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 203.75-114 chr8 121686744 121687051 + 1 NA Intergenic Intergenic -45457 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 143.75-27 chr10 118942217 118942537 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -87337 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 121.25-120 chr21 32564235 32564625 + 1 NA non-coding (NR_146638, exon 11 of 11) non-coding (NR_146638, exon 11 of 11) 21093 NM_144659 140290 Hs.728804 NM_018277 ENSG00000242220 TCP10L C21orf77|PRED77|TCP10A-1|TCP10A-2 t-complex 10 like protein-coding 144.25-55 chr14 48826978 48827203 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 759290 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 184.75-33 chr17 31732102 31732312 + 1 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 126755 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 142.25-88 chr2 58107849 58108131 + 1 NA intron (NM_001130483, intron 7 of 13) intron (NM_001130483, intron 7 of 13) 61278 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 130.25-10 chr1 115053409 115053698 + 1 NA intron (NM_005725, intron 6 of 7) intron (NM_005725, intron 6 of 7) 19607 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 277.5-17 chr12 29102805 29103141 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -46305 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 123.25-183 chr7 6110227 6110437 + 1 NA intron (NM_032172, intron 1 of 17) intron (NM_032172, intron 1 of 17) 5383 NM_032172 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 202.5-72 chr2 72924448 72924802 + 1 NA intron (NM_004097, intron 2 of 2) CpG-16148 7106 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 200.75-98 chr7 31142342 31142693 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 90056 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 195.5-122 chr5 124206665 124206906 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) MER102c|DNA|hAT-Charlie 231735 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 204.5-76 chr21 26455451 26455774 + 1 NA intron (NR_135515, intron 1 of 3) intron (NR_135515, intron 1 of 3) 49669 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 195.5-20 chr11 21915660 21915863 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -277324 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 346.75-5 chr14 52225222 52226052 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -42061 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 245.25 chr1 24525752 24526158 + 1 NA intron (NM_001251985, intron 1 of 1) intron (NM_001251985, intron 1 of 1) 11641 NM_001251982 11123 Hs.656799 NM_013441 ENSG00000117602 RCAN3 DSCR1L2|MCIP3|RCN3|hRCN3 RCAN family member 3 protein-coding 133.5-84 chr14 78462150 78462368 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 58540 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 197.75-54 chr22 42020229 42020716 + 1 NA intron (NM_152613, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 21684 NM_152613 164684 Hs.655541 NM_152613 ENSG00000183066 WBP2NL GRAMD7|PAWP WBP2 N-terminal like protein-coding 238.75-64 chr8 93583695 93584062 + 1 NA intron (NR_033858, intron 5 of 10) intron (NR_033858, intron 5 of 10) 116555 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 331.75-16 chr3 188046079 188046677 + 1 NA Intergenic Intergenic -69971 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 253.5-2 chr1 66600700 66601048 + 1 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) L2c|LINE|L2 -27566 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 219.5-7 chr1 164838681 164838929 + 1 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) intron (NM_001353131, intron 7 of 7) -64164 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 154.5-46 chr12 32397999 32398246 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -1436 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 257.5 chr1 56282677 56283064 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -132093 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 166.75-32 chr12 20549450 20549645 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -22317 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 152.5-8 chr1 180086999 180087266 + 1 NA intron (NM_014810, intron 31 of 37) intron (NM_014810, intron 31 of 37) -67701 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 134.5-181 chr5 123026859 123027029 + 1 NA intron (NM_000943, intron 3 of 4) AluSc8|SINE|Alu 9781 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 216.5-43 chr16 67900196 67900493 + 1 NA intron (NM_006742, intron 1 of 2) intron (NM_006742, intron 1 of 2) 7090 NM_006742 5681 Hs.513683 NM_006742 ENSG00000159792 PSKH1 - protein serine kinase H1 protein-coding 176.5-187 chr9 28326187 28326465 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 392979 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 136.75-119 chr20 50658105 50658368 + 1 NA intron (NR_111906, intron 2 of 2) L1MB3|LINE|L1 12765 NR_111906 100506175 Hs.658270 NR_111906 ENSG00000234693 LOC100506175 - uncharacterized LOC100506175 ncRNA 185.25-61 chr2 142144155 142144542 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12647 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 157.5-120 chr20 18578572 18578817 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9360 NM_001318043 92675 Hs.659442 NM_080820 ENSG00000125821 DTD1 C20orf88|DTD|DUE-B|DUEB|HARS2|pqn-68 D-aminoacyl-tRNA deacylase 1 protein-coding 168.5-101 chr20 8285528 8285739 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 36929 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 160.75-97 chr22 44585652 44585858 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 16415 NR_028409 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 168.25-48 chr15 70830581 70830959 + 1 NA 3' UTR (NM_001286679, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001286679, exon 3 of 3) -22469 NM_001284357 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 243.25-57 chrX 107417255 107417727 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -104959 NM_032428 84443 Hs.496546 NM_032428 ENSG00000147234 FRMPD3 - FERM and PDZ domain containing 3 protein-coding 171.25-117 chr5 39461967 39462263 + 1 NA Intergenic Intergenic -36882 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 161.5-200 chr9 71550988 71551225 + 1 NA Intergenic Intergenic -104135 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 115.25-16 chr1 174071635 174071759 + 1 NA Intergenic Intergenic -78625 NM_001300850 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 179.75-43 chr14 62125092 62125349 + 1 NA intron (NR_015358, intron 2 of 3) intron (NR_015358, intron 2 of 3) 7863 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 155.75-88 chr2 210957713 210957971 + 1 NA Intergenic Intergenic 340271 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 212.5-49 chr2 85505510 85505811 + 1 NA Intergenic Intergenic 33226 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 295.75-5 chr14 69981659 69981988 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 5 of 11) intron (NM_001034852, intron 5 of 11) 3690 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 236.75-30 chr2 116083955 116084334 + 1 NA Intergenic Intergenic 740329 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 256.5-75 chr7 111072079 111072342 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) L1MC4|LINE|L1 -18796 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 191.75-29 chr12 31822606 31822872 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -30441 NM_001013699 440093 Hs.448697 NM_001013699 ENSG00000188375 H3F3C H3.5 H3 histone family member 3C protein-coding 167.5-167 chr6 103862041 103862251 + 1 NA Intergenic Intergenic 997400 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 159.5-125 chr20 43763582 43763864 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -36721 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 219.5-113 chr6 68683179 68683558 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 48086 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 210.5-7 chr1 116003889 116004198 + 1 NA intron (NM_018420, intron 2 of 11) LOR1b|LTR|ERV1 -26767 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 192.25-95 chr6 94492137 94492388 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 773959 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 173.5-159 chr8 35582947 35583164 + 1 NA intron (NM_001322818, intron 3 of 16) intron (NM_001322818, intron 3 of 16) 38663 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 120.25-90 chr2 31643618 31643795 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -62768 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 182.5-114 chr4 32158105 32158326 + 1 NA Intergenic Intergenic -135793 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 180.5-4 chr1 151764000 151764442 + 1 NA promoter-TSS (NM_001300733) promoter-TSS (NM_001300733) -725 NM_031420 65005 Hs.288936 NM_031420 ENSG00000143436 MRPL9 L9mt mitochondrial ribosomal protein L9 protein-coding 201.5-138 chr9 126178177 126178559 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 97547 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 195.75-29 chr11 18325985 18326413 + 1 NA intron (NM_001142307, intron 2 of 15) intron (NM_001142307, intron 2 of 15) 3632 NM_005316 2965 Hs.577202 NM_005316 ENSG00000110768 GTF2H1 BTF2|P62|TFB1|TFIIH general transcription factor IIH subunit 1 protein-coding 116.5-216 chr6 83638288 83638443 + 1 NA intron (NM_001242792, intron 8 of 28) intron (NM_001242792, intron 8 of 28) 70194 NM_001363677 9892 Hs.368046 NM_014841 ENSG00000065609 SNAP91 AP180|CALM synaptosome associated protein 91 protein-coding 204.25-20 chr11 81630117 81630331 + 1 NA Intergenic Intergenic 260612 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 151.25-28 chr11 25883923 25884278 + 1 NA Intergenic Intergenic -305023 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 260.25-40 chr5 29504197 29504526 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -108385 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 162.5-63 chr17 57994117 57994322 + 1 NA Intergenic Intergenic -5965 NM_007146 7716 Hs.463569 NM_007146 ENSG00000136451 VEZF1 DB1|ZNF161 vascular endothelial zinc finger 1 protein-coding 147.5-96 chr2 52913709 52913931 + 1 NA Intergenic Intergenic -211205 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 268.25-5 chr11 7271323 7271798 + 1 NA intron (NM_175733, intron 1 of 6) intron (NM_175733, intron 1 of 6) 19656 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 148.25-35 chr13 92821053 92821253 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -99539 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 213.75-101 chr7 20235762 20236017 + 1 NA Intergenic Intergenic 18312 NR_134568 100506098 Hs.59203 NR_134567 ENSG00000233834 LOC100506098 - uncharacterized LOC100506098 ncRNA 287.25-30 chr20 37811049 37811400 + 1 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -91903 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 134.5-139 chr3 142834760 142834930 + 1 NA intron (NM_013363, intron 5 of 8) L1ME3E|LINE|L1 54238 NM_013363 26577 Hs.8944 NM_013363 ENSG00000163710 PCOLCE2 PCPE2 procollagen C-endopeptidase enhancer 2 protein-coding 153.5-167 chr5 173911965 173912205 + 1 NA intron (NM_001308193, intron 2 of 7) intron (NM_001308193, intron 2 of 7) 19034 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 215.75-99 chr8 128040348 128040726 + 1 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) intron (NR_003367, intron 5 of 8) -8615 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 122.5-32 chr11 31204993 31205155 + 1 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) intron (NM_001367979, intron 9 of 38) 164665 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 171.75-77 chr2 77922752 77923033 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MC3|LINE|L1 6958 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 179.5-38 chr12 26398559 26398778 + 1 NA intron (NM_002223, intron 54 of 56) intron (NM_002223, intron 54 of 56) 203095 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 199.25-73 chr4 71287834 71288054 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) intron (NM_001098484, intron 3 of 25) -51109 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 196.75-63 chr2 125454698 125454937 + 1 NA Intergenic Intergenic 663168 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 175.75-46 chr16 21963130 21963345 + 1 NA intron (NM_003366, intron 6 of 13) AluSz6|SINE|Alu 9876 NM_003366 7385 Hs.528803 NM_003366 ENSG00000140740 UQCRC2 MC3DN5|QCR2|UQCR2 ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 2 protein-coding 181.75-58 chr2 29075314 29075612 + 1 NA promoter-TSS (NM_001029883) promoter-TSS (NM_001029883) -940 NM_001029883 388939 Hs.354243 NM_001029883 ENSG00000179270 PCARE C2orf71|RP54 photoreceptor cilium actin regulator protein-coding 179.5-102 chr20 11490202 11490420 + 1 NA Intergenic Intergenic -216928 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 112.75-19 chr10 20637557 20637765 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 85691 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 217.5-124 chr7 130887747 130888100 + 1 NA intron (NR_110472, intron 2 of 3) intron (NR_110472, intron 2 of 3) -10384 NR_029517 407024 NR_029517 ENSG00000283797 MIR29B1 MIRN29B1|miR-29b|miRNA29B1|mir-29b-1 microRNA 29b-1 ncRNA 158.75-47 chr13 45253405 45253740 + 1 NA intron (NM_004128, intron 6 of 7) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -52527 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 142.25-8 chr1 205695235 205695494 + 1 NA Intergenic Intergenic -14855 NM_033102 85414 Hs.278695 NM_033102 ENSG00000158715 SLC45A3 IPCA-2|IPCA-6|IPCA-8|IPCA6|PCANAP2|PCANAP6|PCANAP8|PRST solute carrier family 45 member 3 protein-coding 160.5-104 chr21 30174240 30174528 + 1 NA Intergenic Intergenic -7579 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 252.75-21 chr16 75540580 75541027 + 1 NA intron (NM_001077416, intron 5 of 5) intron (NM_001077416, intron 5 of 5) -5633 NM_024533 23563 Hs.745424 NM_012126 ENSG00000135702 CHST5 I-GlcNAc-6-ST|I-GlcNAc6ST|glcNAc6ST-3|gn6st-3|hIGn6ST carbohydrate sulfotransferase 5 protein-coding 119.5-220 chr7 105735065 105735213 + 1 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) intron (NM_020725, intron 3 of 11) -55977 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 150.75-123 chr3 5742339 5742557 + 1 NA Intergenic Intergenic -492193 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 180.75-156 chr9 69529065 69529348 + 1 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 143165 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 134.5-184 chr5 168424729 168425065 + 1 NA intron (NM_001161661, intron 11 of 22) intron (NM_001161661, intron 11 of 22) -61574 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 210.5-62 chr2 33027648 33028248 + 1 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) 80995 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 338.5-29 chr6 110005149 110005641 + 1 NA Intergenic Intergenic 27084 NM_005284 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 119.5-104 chr17 66405733 66405914 + 1 NA intron (NR_110822, intron 3 of 3) intron (NR_110822, intron 3 of 3) 11031 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 142.25-96 chr2 224056099 224056442 + 1 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -16951 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 229.5-25 chr11 35018720 35019168 + 1 NA Intergenic Intergenic 77107 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 204.25-103 chr7 4209984 4210269 + 1 NA exon (NM_152744, exon 38 of 45) exon (NM_152744, exon 38 of 45) -75289 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 164.5-35 chr12 7117971 7118241 + 1 NA non-coding (NR_026947, exon 8 of 12) non-coding (NR_026947, exon 8 of 12) -8892 NM_016546 51279 Hs.631730 NM_016546 ENSG00000139178 C1RL C1RL1|C1RLP|C1r-LP|CLSPa complement C1r subcomponent like protein-coding 172.75-109 chr6 64326971 64327311 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) HERV1_I-int|LTR|ERV1 520305 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 236.75-22 chr15 51272932 51273221 + 1 NA intron (NM_000103, intron 1 of 9) AluSx3|SINE|Alu 5066 NM_001347252 1588 Hs.260074 NM_000103 ENSG00000137869 CYP19A1 ARO|ARO1|CPV1|CYAR|CYP19|CYPXIX|P-450AROM cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1 protein-coding 185.25-58 chr2 74384259 74384540 + 1 NA intron (NR_033935, intron 1 of 26) intron (NR_033935, intron 1 of 26) -1104 NR_158172 100189589 Hs.585961 NR_024463 ENSG00000237737 DCTN1-AS1 - DCTN1 antisense RNA 1 ncRNA 215.75-24 chr12 9011540 9012012 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 22151 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 385.75-6 chr16 53591504 53591963 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -88429 NM_001308325 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 304.75-19 chr21 15174345 15174673 + 1 NA Intergenic Intergenic -109509 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 121.25-154 chr4 147155225 147155568 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 189321 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 209.5-19 chr11 31104359 31104641 + 1 NA intron (NM_001367979, intron 13 of 38) L1MC4|LINE|L1 -111814 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 215.75-67 chr4 69810816 69811169 + 1 NA Intergenic Intergenic 49153 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 281.5-57 chr9 93018332 93018738 + 1 NA intron (NM_001369952, intron 10 of 16) LOR1b|LTR|ERV1 -3591 NR_121565 101927954 Hs.673794 NR_121565 LOC101927954 - uncharacterized LOC101927954 ncRNA 278.5-2 chr1 40761350 40761778 + 1 NA intron (NM_001142590, intron 11 of 14) intron (NM_001142590, intron 11 of 14) 4280 NR_029833 407031 NR_029833 ENSG00000207962 MIR30C1 MIRN30C1|mir-30c-1 microRNA 30c-1 ncRNA 202.75-93 chr5 117133944 117134385 + 1 NA Intergenic Intergenic -281348 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 148.5-120 chr20 1530621 1530795 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 26997 NM_178460 128646 Hs.729560 NM_178460 ENSG00000125900 SIRPD PTPNS1L2|dJ576H24.4 signal regulatory protein delta protein-coding 217.5-12 chr10 26058364 26058732 + 1 NA intron (NM_017433, intron 10 of 34) L1MC1|LINE|L1 124319 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 204.25-46 chr18 68063885 68064301 + 1 NA Intergenic Intergenic -249271 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 144.5-91 chr19 11155685 11155876 + 1 NA promoter-TSS (NM_001317032) promoter-TSS (NM_001317032) 2 NM_001317033 147841 Hs.381225 NM_182513 ENSG00000161888 SPC24 SPBC24 SPC24 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 197.75-65 chr5 5040247 5040701 + 1 NA intron (NR_026994, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 6115 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 196.25-25 chr12 81642275 81642622 + 1 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) intron (NM_001220474, intron 2 of 30) -44077 NM_001220478 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 342.5-32 chr9 87521686 87522195 + 1 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 23405 NM_001288729 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 191.75-65 chr2 64371632 64371978 + 1 NA Intergenic Intergenic -30957 NR_106995 102465833 NR_106995 ENSG00000264297 MIR4433B hsa-mir-4433b microRNA 4433b ncRNA 135.5-47 chr12 42278308 42278479 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -40025 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 189.25-111 chr7 50012516 50012855 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 6 of 7) L1M4|LINE|L1 80561 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 153.25-113 chr6 96934718 96934907 + 1 NA intron (NM_001323252, intron 2 of 11) intron (NM_001323252, intron 2 of 11) 10084 NM_001323255 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 174.5-61 chr14 53106671 53106910 + 1 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) L1MC4|LINE|L1 46533 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 180.75-72 chr2 206162972 206163231 + 1 NA TTS (NM_001959) TTS (NM_001959) 873 NR_002590 619569 Hs.742407 NR_002590 ENSG00000207406 SNORA41 ACA41|SNORA41A small nucleolar RNA, H/ACA box 41 snoRNA 123.5-219 chr9 78490685 78490838 + 1 NA Intergenic Intergenic 193636 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 131.75-23 chr10 14966956 14967103 + 1 NA intron (NM_001080836, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu 7641 NM_001080836 644890 Hs.257249 NM_001080836 ENSG00000197889 MEIG1 SPATA39|bA2K17.3 meiosis/spermiogenesis associated 1 protein-coding 174.5-116 chr22 42781591 42781913 + 1 NA Intergenic Intergenic -60451 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 244.75-50 chr5 145810469 145810768 + 1 NA intron (NM_205846, intron 4 of 6) intron (NM_205846, intron 4 of 6) 24724 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 282.75-37 chr6 37025441 37025854 + 1 NA intron (NM_173558, intron 13 of 15) intron (NM_173558, intron 13 of 15) 19992 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 130.25-221 chr9 105297100 105297418 + 1 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) intron (NM_001330731, intron 1 of 15) 52608 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 239.5-25 chr14 30187842 30188308 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -260228 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 326.75-4 chr10 115463579 115463977 + 1 NA intron (NM_207303, intron 22 of 28) L1MB4|LINE|L1 370413 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 258.5-7 chr1 224591446 224591729 + 1 NA intron (NR_136294, intron 4 of 8) intron (NR_136294, intron 4 of 8) -24730 NM_001322305 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 172.5-58 chr12 129019884 129020095 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -89701 NR_104173 283352 Hs.665667 NR_104172 ENSG00000249196 TMEM132D-AS1 - TMEM132D antisense RNA 1 ncRNA 173.5-68 chr2 71494590 71494888 + 1 NA intron (NM_001130985, intron 3 of 54) intron (NM_001130985, intron 3 of 54) 28040 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 176.5-125 chr3 108425999 108426272 + 1 NA intron (NM_014981, intron 28 of 41) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 103187 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 222.25-60 chr4 108096073 108096295 + 1 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 70613 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 239.25-30 chr14 71317390 71317826 + 1 NA Intergenic Intergenic -2868 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 261.5 chr1 80037074 80037557 + 1 NA Intergenic Intergenic -498440 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 131.25-69 chr15 74373924 74374250 + 1 NA Intergenic CpG -4995 NR_146881 105370894 NR_146881 LINC02255 - long intergenic non-protein coding RNA 2255 ncRNA 353.75-17 chr8 34015759 34016418 + 1 NA Intergenic Intergenic -415982 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 302.25-11 chr16 63366852 63367422 + 1 NA Intergenic Intergenic -1330699 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 123.25-172 chr5 159414573 159414865 + 1 NA Intergenic Intergenic 51557 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 177.75-37 chr13 113522997 113523298 + 1 NA intron (NR_146222, intron 8 of 11) L1MDa|LINE|L1 32126 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 166.5-152 chr4 178187739 178188035 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -279951 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 220.25-75 chr8 99628118 99628472 + 1 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -91434 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 215.75-12 chr10 43121156 43121589 + 1 NA intron (NM_020630, intron 15 of 18) intron (NM_020630, intron 15 of 18) 16640 NM_001355216 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 160.25-155 chr8 11538363 11538747 + 1 NA intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 -37980 NR_040035 83655 Hs.742430 NR_040035 ENSG00000170983 LINC00208 C8orf14|NCRNA00208|VIR35 long intergenic non-protein coding RNA 208 ncRNA 124.75-194 chr7 67923537 67923674 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -96648 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 137.5-23 chr1 246629282 246629543 + 1 NA intron (NM_152609, intron 3 of 10) intron (NM_152609, intron 3 of 10) 62956 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 206.5-123 chr7 89030796 89031191 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -235256 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 129.5-17 chr10 28787117 28787315 + 1 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) intron (NR_120652, intron 2 of 3) 8834 NR_038375 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 223.25-37 chr2 88687190 88687539 + 1 NA Intergenic Intergenic -4309 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 285.5-40 chr3 86082361 86082821 + 1 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -254541 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 148.75-50 chr14 24443273 24443621 + 1 NA promoter-TSS (NM_001290293) promoter-TSS (NM_001290293) 494 NR_110032 101927045 Hs.637772 NR_110032 LOC101927045 - uncharacterized LOC101927045 ncRNA 245.75-57 chr7 53715523 53715931 + 1 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) intron (NR_038371, intron 4 of 5) 96204 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 284.25-29 chr6 142147937 142148416 + 1 NA intron (NM_001286372, intron 1 of 5) intron (NM_001286372, intron 1 of 5) 913 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 201.75-21 chr12 49012088 49012305 + 1 NA intron (NR_147178, intron 2 of 2) intron (NR_147178, intron 2 of 2) 6580 NM_001206710 5571 Hs.530862 NM_002733 ENSG00000181929 PRKAG1 AMPKG protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 1 protein-coding 153.5-105 chr2 142957836 142958260 + 1 NA intron (NM_001199241, intron 8 of 14) intron (NM_001199241, intron 8 of 14) 80384 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 210.5-31 chr12 112205287 112205532 + 1 NA intron (NM_001109662, intron 52 of 75) AluSx1|SINE|Alu -42088 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 212.75-18 chr11 123154899 123155311 + 1 NA intron (NM_024769, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 40143 NM_024769 79827 Hs.591949 NM_024769 ENSG00000166250 CLMP ACAM|ASAM|CSBM|CSBS CXADR like membrane protein protein-coding 133.5-268 chr8 121766293 121766482 + 1 NA Intergenic Intergenic -124947 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 167.5-31 chr11 5432725 5433011 + 1 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) 8685 NM_001005288 390063 Hs.553732 NM_001005288 ENSG00000167359 OR51I1 - olfactory receptor family 51 subfamily I member 1 protein-coding 275.25-16 chr14 35397564 35397994 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 6975 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 358.5-20 chr8 101286257 101286859 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -80494 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 199.25-68 chr3 115863585 115864069 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) 41299 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 131.25-32 chr11 81575776 81575990 + 1 NA Intergenic Intergenic 314953 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 156.5-193 chr8 104200001 104200206 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -23232 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 190.25-9 chr1 171034245 171034670 + 1 NA intron (NM_001163629, intron 20 of 21) LTR33A_|LTR|ERVL -56448 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 172.75-129 chr8 110147115 110147592 + 1 NA Intergenic Intergenic -171582 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 233.75-75 chr7 46526581 46527074 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 170295 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 342.75-15 chr22 50090111 50090860 + 1 NA exon (NM_001164105, exon 1 of 26) exon (NM_001164105, exon 1 of 26) 229 NM_001164105 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 208.5-12 chr10 81534119 81534426 + 1 NA Intergenic Intergenic -340922 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 151.75-110 chr5 59839559 59839896 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 53999 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 142.5-199 chr6 169279040 169279290 + 1 NA Intergenic Intergenic -25051 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 188.25-30 chr12 78844974 78845200 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -18895 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 247.75-61 chr7 82996299 82996682 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 166394 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 172.25-107 chr5 18791708 18791921 + 1 NA Intergenic Intergenic 984540 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 164.5-222 chr9 73836319 73836571 + 1 NA Intergenic Intergenic -535086 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 176.5-144 chr5 69059587 69059850 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -29791 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 137.5-158 chr3 89206513 89206676 + 1 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 98973 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 272.75-22 chr2 27043529 27043951 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 6524 NR_046730 100874031 Hs.132725 NR_046730 ENSG00000231636 AGBL5-AS1 - AGBL5 antisense RNA 1 ncRNA 188.5-40 chr14 65943563 65943801 + 1 NA Intergenic Intergenic 472580 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 163.25-90 chr3 29185096 29185366 + 1 NA Intergenic Intergenic 95708 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 172.5-210 chr8 141613488 141613823 + 1 NA Intergenic Intergenic -106425 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 127.75-162 chr5 129764939 129765161 + 1 NA exon (NM_001257308, exon 3 of 3) exon (NM_001257308, exon 3 of 3) 16956 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 139.25-170 chr7 26787569 26787811 + 1 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 70033 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 202.5-118 chr5 92479134 92479401 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 1092076 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 342.25-15 chr5 14241352 14242079 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 98373 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 257.5-31 chr2 35573993 35574381 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 102782 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 137.5-181 chr5 12976029 12976263 + 1 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 56740 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 116.75-163 chr5 35501432 35501720 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -116287 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 241.5-43 chr2 108451295 108451576 + 1 NA intron (NM_181453, intron 3 of 22) intron (NM_181453, intron 3 of 22) 2229 NM_181453 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 332.5-23 chr6 1537391 1537918 + 1 NA Intergenic Intergenic -67877 NR_125804 101927703 Hs.607964 NR_125804 FOXCUT LINC01379|TCONS_00011636 FOXC1 upstream transcript ncRNA 167.5-66 chr15 59668383 59668684 + 1 NA intron (NM_001368058, intron 8 of 9) intron (NM_001368058, intron 8 of 9) -11018 NM_001320930 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 337.25-2 chr1 99263036 99263568 + 1 NA promoter-TSS (NM_001166252) promoter-TSS (NM_001166252) -990 NM_001166252 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 215.25-18 chr12 32901925 32902198 + 1 NA Intergenic Intergenic -5215 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 258.25-31 chr20 57994069 57994475 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9632 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 144.75-98 chr20 24038963 24039186 + 1 NA Intergenic Intergenic -50295 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 317.25 chr1 19705504 19705863 + 1 NA intron (NM_001349112, intron 12 of 14) intron (NM_001349112, intron 12 of 14) 40808 NM_000871 3362 Hs.22180 NM_000871 ENSG00000158748 HTR6 5-HT6|5-HT6R 5-hydroxytryptamine receptor 6 protein-coding 119.5-242 chr8 120749179 120749307 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -12010 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 234.25-50 chr4 42928444 42928818 + 1 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) MER74B|LTR|ERVL 35365 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 303.5-30 chr3 175012222 175012622 + 1 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 102820 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 177.5-13 chr10 47407173 47407580 + 1 NA non-coding (NR_134500, exon 1 of 4) non-coding (NR_134500, exon 1 of 4) 211 NR_134500 107001062 Hs.576719 NR_134500 LOC107001062 - uncharacterized LOC107001062 ncRNA 150.25-3 chr1 42364064 42364219 + 1 NA Intergenic Intergenic -16651 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 130.5-104 chr16 47450554 47450703 + 1 NA intron (NM_030790, intron 5 of 17) intron (NM_030790, intron 5 of 17) 10435 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 322.75-16 chr4 130840493 130840964 + 1 NA Intergenic Intergenic 464367 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 168.5-78 chr2 37946524 37946775 + 1 NA intron (NM_001170792, intron 2 of 10) L2|LINE|L2 -3795 NM_001170793 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 222.5-2 chr1 45860712 45861234 + 1 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) L2c|LINE|L2 -3375 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 165.5-91 chr2 185175694 185175874 + 1 NA Intergenic Intergenic -8712 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 128.5-131 chr21 42038518 42038902 + 1 NA Intergenic Intergenic 16441 NR_027273 150142 Hs.143833 NM_198078 ENSG00000237232 ZNF295-AS1 C21orf121|NCRNA00318|PRED87 ZNF295 antisense RNA 1 ncRNA 144.75-166 chr7 104760323 104760602 + 1 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) 43630 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 308.75-37 chr8 86852776 86853121 + 1 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -13467 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 144.5-210 chr7 131198518 131198755 + 1 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 88542 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 187.5-8 chr1 101488954 101489264 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 165272 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 184.5-17 chr10 43336642 43337037 + 1 NA Intergenic Intergenic -34797 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 115.5-216 chr6 68584860 68584991 + 1 NA Intergenic Intergenic 49399 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 285.5-51 chr6 42226569 42226961 + 1 NA 3' UTR (NM_033502, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_033502, exon 18 of 18) -8904 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 154.5-5 chr1 64750999 64751207 + 1 NA intron (NM_001366165, intron 1 of 11) intron (NM_001366165, intron 1 of 11) 6028 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 269.25-43 chr5 148492397 148492968 + 1 NA intron (NR_104445, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR 108724 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 154.5-55 chr13 56532485 56532722 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -608315 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 226.5-80 chr5 127083350 127083630 + 1 NA Intergenic Intergenic -9998 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 126.5-270 chrX 35389702 35389852 + 1 NA Intergenic Intergenic -408565 NM_001099921 139604 NM_001099921 ENSG00000189023 MAGEB16 - MAGE family member B16 protein-coding 261.25-3 chr11 27458506 27458829 + 1 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) AluSq2|SINE|Alu -13064 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 141.5-84 chr18 69557502 69557683 + 1 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 87661 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 179.5-27 chr10 77429678 77429897 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 78915 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 198.75-43 chr2 71746488 71746839 + 1 NA Intergenic Intergenic 279964 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 201.25-37 chr15 77736571 77736788 + 1 NA intron (NM_001301186, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu -15928 NM_001301197 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 279.75-6 chr11 12047242 12047760 + 1 NA intron (NR_135109, intron 1 of 1) intron (NR_135109, intron 1 of 1) 16626 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 263.75-57 chr9 93322117 93322489 + 1 NA intron (NM_001098808, intron 3 of 4) intron (NM_001098808, intron 3 of 4) 24000 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 299.5-36 chr6 149336550 149336947 + 1 NA intron (NM_015093, intron 2 of 8) intron (NM_015093, intron 2 of 8) 18448 NM_015093 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 265.5-51 chr5 165842168 165842534 + 1 NA Intergenic Intergenic 1084019 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 222.25-14 chr12 72300908 72301288 + 1 NA intron (NM_013381, intron 2 of 18) intron (NM_013381, intron 2 of 18) -27589 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 212.25-41 chr19 53932430 53932744 + 1 NA intron (NM_031896, intron 3 of 4) L1MC5|LINE|L1 19850 NM_031896 59284 Hs.631597 NM_031896 ENSG00000105605 CACNG7 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 7 protein-coding 168.75-160 chrX 55534063 55534241 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -44954 NM_201286 158880 Hs.40061 NM_201286 ENSG00000247746 USP51 - ubiquitin specific peptidase 51 protein-coding 181.5-77 chr2 75234703 75234984 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -35323 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 169.5-122 chr4 54506161 54506424 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 100839 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 173.75-62 chr15 70488860 70489125 + 1 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 16936 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 225.5-41 chr15 82946512 82946901 + 1 NA intron (NM_004839, intron 1 of 8) intron (NM_004839, intron 1 of 8) 6014 NM_199330 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 145.25-29 chr12 59069766 59069942 + 1 NA Intergenic Intergenic -149316 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 185.75-98 chr5 37830336 37830617 + 1 NA intron (NM_001278098, intron 1 of 2) intron (NM_001278098, intron 1 of 2) 4346 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 212.5-105 chr7 38905954 38906215 + 1 NA intron (NM_014396, intron 1 of 28) AluSq2|SINE|Alu 3107 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 193.25-109 chr7 86781249 86781572 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 2 of 4) intron (NM_001363522, intron 2 of 4) 137496 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 188.5-124 chr5 44933174 44933508 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 124394 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 173.5-58 chr18 764563 764739 + 1 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 47591 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 169.25-124 chr8 125781108 125781326 + 1 NA Intergenic Intergenic 169980 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 116.75-11 chr1 159304001 159304134 + 1 NA exon (NM_002001, exon 4 of 6) exon (NM_002001, exon 4 of 6) 10592 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 217.5-30 chr12 12549822 12550094 + 1 NA intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 12905 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 269.25-20 chr17 63221789 63222123 + 1 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) L1ME1|LINE|L1 218311 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 211.5-33 chr12 6151856 6152266 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -27386 NM_000552 7450 Hs.440848 NM_000552 ENSG00000110799 VWF F8VWF|VWD von Willebrand factor protein-coding 212.25-42 chr2 20023290 20023741 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -10847 NM_002381 4148 Hs.656199 NM_002381 ENSG00000132031 MATN3 DIPOA|EDM5|HOA|OADIP|OS2 matrilin 3 protein-coding 230.25-60 chr4 34165572 34165931 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 103996 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 170.75-25 chr12 58503625 58503913 + 1 NA Intergenic Intergenic -87933 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 224.5-18 chr10 74950818 74951046 + 1 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) AluJb|SINE|Alu 38146 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 188.5-51 chr16 56213392 56213605 + 1 NA intron (NM_138736, intron 2 of 7) intron (NM_138736, intron 2 of 7) -18973 NR_026889 26077 Hs.721567 NR_026889 ENSG00000261439 DKFZP434H168 - uncharacterized LOC26077 ncRNA 156.5-4 chr1 69708384 69708651 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) L2a|LINE|L2 139176 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 156.5-5 chr1 159095894 159096233 + 1 NA Intergenic Intergenic -19162 NM_001348247 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 184.5-65 chr18 73084509 73084827 + 1 NA Intergenic Intergenic 179830 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 215.25-107 chr8 80001060 80001288 + 1 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 29085 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 141.75-175 chr9 37797361 37797558 + 1 NA Intergenic Intergenic -3095 NM_001286810 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 308.75-28 chr22 24794883 24795356 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11092 NM_001098498 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 200.5-127 chr7 73465075 73465515 + 1 NA intron (NM_001370402, intron 11 of 18) intron (NM_001370402, intron 11 of 18) 31517 NM_003508 8326 Hs.647029 NM_003508 ENSG00000188763 FZD9 CD349|FZD3 frizzled class receptor 9 protein-coding 139.5-126 chr22 49486473 49486690 + 1 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) intron (NR_110523, intron 1 of 4) 56885 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 160.5-110 chr3 9382442 9382810 + 1 NA intron (NM_001114092, intron 7 of 9) intron (NM_001114092, intron 7 of 9) 13997 NR_132781 440944 Hs.598958 NM_001013713 ENSG00000206573 THUMPD3-AS1 SETD5-AS1 THUMPD3 antisense RNA 1 ncRNA 229.5-60 chr2 52702417 52702757 + 1 NA promoter-TSS (NR_039630) promoter-TSS (NR_039630) 28 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 165.25-70 chr2 123734859 123735119 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 290185 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 214.75-38 chr2 49688448 49688763 + 1 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 285598 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 216.75-28 chr15 93659940 93660350 + 1 NA Intergenic Intergenic -196415 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 185.5-126 chr5 38164233 38164510 + 1 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) 15891 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 295.75-31 chr7 129248346 129248982 + 1 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) L1MB7|LINE|L1 23634 NM_015328 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 253.5-4 chr1 108878007 108878351 + 1 NA intron (NM_001321038, intron 1 of 14) intron (NM_001321038, intron 1 of 14) 1194 NM_001321039 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 154.75-149 chr8 134989609 134989860 + 1 NA Intergenic Intergenic 139799 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 175.5-183 chrX 24684429 24684689 + 1 NA Intergenic Intergenic -9359 NM_001330360 5422 Hs.567319 NM_016937 ENSG00000101868 POLA1 NSX|POLA|p180 DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit protein-coding 225.75-18 chr11 96858272 96858533 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 349977 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 139.25-207 chr9 31605373 31605531 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -223962 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 128.5-159 chr4 61392091 61392362 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 190054 NM_001371342 388.5-3 chr13 52153456 52154093 + 1 NA intron (NM_002498, intron 4 of 15) intron (NM_002498, intron 4 of 15) 5761 NM_152720 4752 Hs.409989 NM_002498 ENSG00000136098 NEK3 HSPK36 NIMA related kinase 3 protein-coding 145.75-129 chr5 104563520 104563716 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -535856 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 235.5-65 chr5 24413397 24413839 + 1 NA Intergenic Intergenic 231360 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 160.25-39 chr14 57305592 57305822 + 1 NA Intergenic Intergenic 36736 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 225.5-103 chr8 77456450 77456742 + 1 NA intron (NR_125830, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 5899 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 238.5-13 chr10 85797636 85797982 + 1 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1PA12|LINE|L1 220078 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 163.5-210 chr8 124488636 124488802 + 1 NA TTS (NM_007218) TTS (NM_007218) 13952 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 193.5-103 chr3 1039737 1039976 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -53168 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 120.25-127 chr3 22313843 22314072 + 1 NA Intergenic Intergenic 356818 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 121.75-166 chr6 138011528 138011763 + 1 NA Intergenic Intergenic -65845 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 145.25-114 chr4 56041904 56042292 + 1 NA Intergenic Intergenic 93153 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 148.25-21 chr10 55462937 55463265 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -135941 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 144.75-193 chr9 75331863 75332235 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 243535 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 228.25-7 chr1 205782327 205782627 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -6995 NM_001135664 8934 Hs.115325 NM_003929 ENSG00000117280 RAB29 RAB7L|RAB7L1 RAB29, member RAS oncogene family protein-coding 156.75-134 chr5 52412950 52413154 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -374864 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 163.25-54 chr17 67662245 67662639 + 1 NA intron (NM_181671, intron 6 of 9) AluSx|SINE|Alu -55391 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 126.75-193 chr5 78570648 78570904 + 1 NA intron (NM_005779, intron 2 of 4) intron (NM_005779, intron 2 of 4) 77996 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 184.25-19 chr10 70547841 70548117 + 1 NA intron (NM_014431, intron 18 of 19) intron (NM_014431, intron 18 of 19) 54762 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 162.5-139 chr5 57030022 57030434 + 1 NA Intergenic Intergenic -78098 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 167.25-7 chr1 81143271 81143542 + 1 NA Intergenic Intergenic -162786 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 275.5-64 chr7 81578446 81578940 + 1 NA non-coding (NR_126026, exon 9 of 9) non-coding (NR_126026, exon 9 of 9) -16874 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 198.5-29 chr12 41751374 41751755 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -12625 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 174.25-33 chr12 15380203 15380601 + 1 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 57894 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 174.5-186 chr8 101584347 101584616 + 1 NA intron (NM_024915, intron 7 of 15) intron (NM_024915, intron 7 of 15) 92042 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 192.5-29 chr11 101581748 101582023 + 1 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 2122 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 141.25-11 chr1 111504563 111504923 + 1 NA promoter-TSS (NM_000677) promoter-TSS (NM_000677) -622 NM_000677 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 310.25-5 chr12 78496047 78496569 + 1 NA Intergenic Intergenic -136562 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 195.5-76 chr2 133645265 133645615 + 1 NA Intergenic Intergenic -76977 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 273.25-2 chr1 85902137 85902455 + 1 NA intron (NR_146344, intron 28 of 58) MER34D|LTR|ERV1 -193863 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 158.5-167 chr6 54179589 54179829 + 1 NA intron (NM_001281746, intron 9 of 11) L1MA2|LINE|L1 68266 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 190.5-93 chr22 26205582 26206002 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 36318 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 224.25-96 chr7 47026179 47026484 + 1 NA Intergenic Intergenic -329209 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 276.5-7 chr1 225764456 225764852 + 1 NA Intergenic Intergenic -13159 NM_003133 6726 Hs.511425 NM_003133 ENSG00000143742 SRP9 ALURBP signal recognition particle 9 protein-coding 284.5-18 chr15 59337051 59337674 + 1 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) intron (NM_004998, intron 1 of 27) 35509 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 212.25-9 chr10 90962427 90962783 + 1 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) intron (NR_131214, intron 3 of 5) 15305 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 127.25-130 chr3 163866112 163866394 + 1 NA Intergenic Intergenic 305303 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 129.5-37 chr11 39385781 39385959 + 1 NA Intergenic Intergenic 737012 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 284.75-20 chr2 214608072 214608610 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 98159 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 147.75-10 chr1 165976334 165976612 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 68552 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 130.5-180 chr4 14409895 14410082 + 1 NA Intergenic Intergenic 298020 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 186.75-68 chr22 26379424 26379879 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 14 of 14) intron (NM_001184776, intron 14 of 14) -49609 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 230.25-35 chr2 26266105 26266459 + 1 NA intron (NM_001281512, intron 4 of 14) AluJr|SINE|Alu 21343 NM_000183 3032 Hs.515848 NM_000183 ENSG00000138029 HADHB ECHB|MSTP029|MTPB|TP-BETA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit beta protein-coding 271.25-31 chr20 58230898 58231321 + 1 NA Intergenic Intergenic -2456 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 228.5-61 chr2 169966478 169966891 + 1 NA intron (NM_172070, intron 24 of 38) MIR|SINE|MIR 139176 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 159.5-31 chr11 30023009 30023311 + 1 NA Intergenic Intergenic -6130 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 134.75-8 chr1 84059459 84059616 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18438 NM_002731 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 184.25-109 chr6 99096914 99097188 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -27558 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 139.25-80 chr2 31747523 31747829 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 56304 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 131.25-95 chr2 6758914 6759145 + 1 NA intron (NR_038369, intron 1 of 5) intron (NR_038369, intron 1 of 5) 11282 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 114.25-126 chr3 87555030 87555267 + 1 NA Intergenic Intergenic -237558 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 305.5-16 chr17 60345618 60346087 + 1 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) AluSz6|SINE|Alu 46281 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 171.75-18 chr10 91707093 91707497 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -74224 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 215.75-40 chr15 68167675 68168089 + 1 NA intron (NM_016166, intron 8 of 13) AluSx3|SINE|Alu 38228 NM_001286694 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 156.25-70 chr2 69634605 69634899 + 1 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 8987 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 258.75-31 chr17 77995266 77995633 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -8788 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 253.75-21 chr2 58571872 58572203 + 1 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 51284 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 149.25-35 chr12 91371458 91371636 + 1 NA Intergenic Intergenic -188730 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 139.75-72 chr17 32725576 32725839 + 1 NA intron (NM_015194, intron 14 of 21) L1MEg|LINE|L1 151417 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 242.5-3 chr1 164190685 164190963 + 1 NA Intergenic Intergenic -368536 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 229.75-51 chr3 126725877 126726290 + 1 NA intron (NM_032343, intron 1 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21843 NM_032343 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 150.25-160 chr9 79564374 79564635 + 1 NA Intergenic Intergenic -7269 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 285.5-5 chr10 56208214 56208814 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 152745 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 140.5-177 chr5 13906598 13906838 + 1 NA intron (NM_001369, intron 12 of 78) L1MEd|LINE|L1 37762 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 325.25-12 chr2 157755286 157755695 + 1 NA intron (NM_001111067, intron 9 of 10) L1PB1|LINE|L1 83140 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 120.5-78 chr15 57280603 57280795 + 1 NA intron (NM_207038, intron 18 of 19) FLAM_A|SINE|Alu -2042 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 115.5-179 chr3 154852973 154853167 + 1 NA Intergenic Intergenic -171054 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 212.5-65 chr21 30613110 30613437 + 1 NA TTS (NM_181602) TTS (NM_181602) 631 NM_181602 337966 Hs.194301 NM_181602 ENSG00000184724 KRTAP6-1 C21orf103|KAP6.1 keratin associated protein 6-1 protein-coding 162.25-59 chr15 83403249 83403546 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -43831 NM_001324185 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 190.75-89 chr5 97007269 97007701 + 1 NA intron (NM_005575, intron 11 of 17) MIR|SINE|MIR 49052 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 208.75-49 chr20 58623770 58624078 + 1 NA Intergenic Intergenic -10848 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 173.5-8 chr1 155203520 155203735 + 1 NA intron (NM_001252608, intron 2 of 20) intron (NM_001252608, intron 2 of 20) 4270 NM_001252608 7059 Hs.169875 NM_007112 ENSG00000169231 THBS3 TSP3 thrombospondin 3 protein-coding 118.5-145 chr4 54625656 54625833 + 1 NA Intergenic Intergenic -18613 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 211.75-26 chr15 67839689 67840113 + 1 NA TTS (NR_104080).5 TTS (NR_104080).5 144 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 232.5-111 chr9 118986539 118986895 + 1 NA Intergenic Intergenic 307046 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 204.5-33 chr14 47322316 47322722 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 20727 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 218.25-91 chr7 106825644 106825871 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -39525 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 179.75-69 chr22 45728117 45728313 + 1 NA intron (NM_013236, intron 6 of 11) L1PB3|LINE|L1 -32309 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 306.75-15 chr3 192719147 192719487 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 8224 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 132.5-220 chr7 4434886 4435098 + 1 NA Intergenic Intergenic -247303 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 242.5-52 chr21 26544728 26545014 + 1 NA intron (NR_135515, intron 2 of 3) AluJo|SINE|Alu 28415 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 141.25-61 chr16 50629807 50629996 + 1 NA intron (NM_033119, intron 6 of 9) LTR16E1|LTR|ERVL -38954 NR_110908 101927272 Hs.460777 NR_110908 ENSG00000260249 LOC101927272 - uncharacterized LOC101927272 ncRNA 435.75 chr10 56034284 56035044 + 1 NA Intergenic Intergenic 326595 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 226.75-60 chr4 166064540 166064939 + 1 NA intron (NM_012464, intron 15 of 20) intron (NM_012464, intron 15 of 20) 191502 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 130.5-124 chr2 1645736 1645953 + 1 NA intron (NM_012293, intron 17 of 22) intron (NM_012293, intron 17 of 22) 98671 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 176.25-39 chr14 43563735 43563970 + 1 NA Intergenic Intergenic 943431 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 170.5-86 chr2 21469955 21470254 + 1 NA Intergenic Intergenic 240548 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 300.75-15 chr15 28907104 28907495 + 1 NA intron (NM_001353792, intron 1 of 13).2 L1ME3G|LINE|L1 -14338 NM_005503 321 Hs.618112 NM_005503 ENSG00000034053 APBA2 D15S1518E|HsT16821|LIN-10|MGC:14091|MINT2|X11-BETA|X11L amyloid beta precursor protein binding family A member 2 protein-coding 304.25-29 chr9 28927294 28927903 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -38643 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 122.5-56 chr14 32935648 32935888 + 1 NA Intergenic Intergenic -3111 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 301.25-8 chr12 30375556 30375937 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 301498 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 256.25-30 chr3 113657709 113658084 + 1 NA exon (NM_001009899, exon 7 of 7) exon (NM_001009899, exon 7 of 7) 38746 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 243.75-47 chr20 44833262 44833736 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -22953 NM_182970 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 133.5-38 chr10 88309147 88309359 + 1 NA intron (NM_001031709, intron 6 of 6) L1PA13|LINE|L1 274065 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 287.5-21 chr14 61867821 61868312 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 55363 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 124.5-12 chr1 113910073 113910277 + 1 NA intron (NM_001319946, intron 2 of 2) intron (NM_001319946, intron 2 of 2) 4849 NM_001363690 64858 Hs.591412 NM_022836 ENSG00000118655 DCLRE1B APOLLO|SNM1B|SNMIB DNA cross-link repair 1B protein-coding 145.25-159 chr7 38443234 38443560 + 1 NA intron (NM_001635, intron 11 of 20) L1ME1|LINE|L1 101820 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 205.5-47 chr15 76883099 76883443 + 1 NA intron (NM_001353012, intron 2 of 32) intron (NM_001353012, intron 2 of 32) -21327 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 183.5-47 chr15 63642646 63642898 + 1 NA intron (NM_003922, intron 59 of 77) MIR3|SINE|MIR -41945 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-16 chr10 10687341 10687551 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 2 of 14) intron (NM_001326317, intron 2 of 14) 107468 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 164.25-57 chr18 75709338 75709599 + 1 NA intron (NR_134646, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 2935 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 228.5-109 chrX 74413673 74414129 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7592 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 124.25-205 chr8 115181170 115181401 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 486728 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 147.5-71 chr15 58011284 58011525 + 1 NA intron (NM_170696, intron 3 of 11) intron (NM_170696, intron 3 of 11) 2619 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 194.5-167 chr9 112808270 112808616 + 1 NA intron (NM_001012994, intron 2 of 8) intron (NM_001012994, intron 2 of 8) 57683 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 198.5-165 chr9 105050483 105050733 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -122453 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 114.5-21 chr1 185344230 185344501 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9326 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 183.5-97 chr4 30767763 30768045 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 47535 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 134.5-135 chr3 118296192 118296393 + 1 NA Intergenic Intergenic -345476 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 357.5-19 chr8 89505004 89505628 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 252395 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 198.5-145 chr8 89882614 89882906 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -19108 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 156.75-83 chr2 51054764 51055037 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1MC5|LINE|L1 22299 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 197.5-121 chr5 45840568 45840886 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -144347 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 224.5-28 chr11 129297301 129297700 + 1 NA Intergenic Intergenic -14336 NR_145484 399975 NM_207431 LOC399975 - uncharacterized LOC399975 ncRNA 330.5-8 chr13 41323157 41323536 + 1 NA intron (NM_001110798, intron 5 of 10) AluY|SINE|Alu -11308 NM_001354076 9617 Hs.382176 NM_004294 ENSG00000120662 MTRF1 MRF1|MTTRF1|RF1 mitochondrial translation release factor 1 protein-coding 150.5-141 chr4 30567066 30567277 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -153198 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 247.25-19 chr14 86521003 86521434 + 1 NA Intergenic Intergenic -384560 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 139.25-61 chr15 97476164 97476547 + 1 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) L1ME2|LINE|L1 45456 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 144.5-204 chr7 85580686 85580954 + 1 NA Intergenic Intergenic 159698 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 292.25-28 chr3 33166782 33167206 + 1 NA intron (NM_015551, intron 4 of 4) AluSq|SINE|Alu 51816 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 196.25-70 chr2 180437200 180437433 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -254788 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 164.5-5 chr1 39881071 39881380 + 1 NA intron (NM_017646, intron 1 of 10) AluSq|SINE|Alu 2279 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 160.5-50 chr14 47313032 47313320 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 30070 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 231.75-39 chr2 98185484 98185890 + 1 NA intron (NR_144297, intron 10 of 18) L2a|LINE|L2 36154 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 341.5-29 chr5 36221466 36222038 + 1 NA intron (NM_001085411, intron 4 of 11) intron (NM_001085411, intron 4 of 11) 19639 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 139.5-22 chr11 31897824 31898096 + 1 NA Intergenic Intergenic 71393 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 126.5-198 chr5 145204489 145204662 + 1 NA Intergenic Intergenic 630767 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 169.75-116 chr4 95686688 95687122 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -137932 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 251.5-75 chr7 4330368 4330733 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy -195713 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 242.5-55 chr3 22286322 22286796 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 329420 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 149.5-31 chr10 78794845 78795092 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 272480 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 234.5-32 chr17 66101795 66102125 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 6 of 26) intron (NM_001353129, intron 6 of 26) 89932 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 331.5-13 chr2 46703056 46703417 + 1 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 3941 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 222.25-58 chr4 38581428 38581767 + 1 NA Intergenic Intergenic 17594 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 373.5-10 chr2 176375124 176375578 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 105909 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 150.5-148 chr4 56718855 56719025 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -37234 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 139.25-198 chr8 96901981 96902342 + 1 NA intron (NM_016134, intron 4 of 7) intron (NM_016134, intron 4 of 7) 256919 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 135.25-34 chr10 109867304 109867580 + 1 NA intron (NM_020383, intron 20 of 20) LTR87|LTR|ERVL? 55804 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 170.25-113 chr4 85382051 85382335 + 1 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -92957 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 274.5-64 chr7 136899554 136899903 + 1 NA non-coding (NR_046103, exon 4 of 4) non-coding (NR_046103, exon 4 of 4) -3439 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 290.5-3 chr1 206871727 206872262 + 1 NA Intergenic Intergenic 6185 NM_018724 50604 Hs.272373 NM_018724 ENSG00000162891 IL20 IL-20|IL10D|ZCYTO10 interleukin 20 protein-coding 151.5-104 chr21 43978511 43978728 + 1 NA intron (NM_001369881, intron 8 of 9) intron (NM_001369881, intron 8 of 9) -33690 NM_003274 7109 Hs.126221 NM_003274 ENSG00000160218 TRAPPC10 EHOC-1|EHOC1|GT334|TMEM1|TRS130|TRS30 trafficking protein particle complex 10 protein-coding 276.5-17 chr12 37879124 37879491 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -437467 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 249.5-97 chr8 124964326 124964834 + 1 NA Intergenic Intergenic -8715 NM_152412 137209 Hs.175350 NM_152412 ENSG00000180938 ZNF572 - zinc finger protein 572 protein-coding 158.25-34 chr12 45073140 45073382 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -7850 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 239.25-86 chr7 131128996 131129373 + 1 NA intron (NM_001145354, intron 1 of 18) L1ME4a|LINE|L1 19090 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 257.75-19 chr17 76307487 76307959 + 1 NA promoter-TSS (NR_130649) promoter-TSS (NR_130649) -43 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 211.5-85 chr2 206600638 206600859 + 1 NA intron (NM_003812, intron 24 of 25) intron (NM_003812, intron 24 of 25) -43479 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 239.75-46 chr3 115034097 115034492 + 1 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 37120 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 258.25-50 chr6 37806155 37806515 + 1 NA Intergenic Intergenic -13392 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 208.5-117 chr6 12745857 12746174 + 1 NA intron (NM_001322308, intron 2 of 13) intron (NM_001322308, intron 2 of 13) 27316 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 190.5-98 chr3 28765334 28765585 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 190181 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 192.5-5 chr1 79807975 79808331 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -727602 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 268.25-23 chr2 66073626 66073990 + 1 NA Intergenic Intergenic 284520 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 113.75-67 chr14 100865052 100865205 + 1 NA Intergenic Intergenic -3932 NR_030172 574450 NR_030172 ENSG00000207989 MIR493 MIRN493|hsa-mir-493|mir-493 microRNA 493 ncRNA 225.25-7 chr10 55522025 55522331 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MA9|LINE|L1 -76864 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 147.25-79 chr3 44313763 44314042 + 1 NA intron (NM_001145030, intron 16 of 19) L1M5|LINE|L1 -24217 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 278.75-23 chr2 116743048 116743598 + 1 NA Intergenic Intergenic -1071368 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 161.25-48 chr14 48055883 48056152 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -261003 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 157.25-68 chr2 25601049 25601343 + 1 NA intron (NM_001351393, intron 4 of 17) intron (NM_001351393, intron 4 of 17) 49026 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 251.25-59 chr8 118554917 118555370 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -65858 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 191.75-87 chr3 173796268 173796501 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 124412 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-146 chr4 33277340 33277559 + 1 NA Intergenic Intergenic 762444 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 193.75-123 chr8 101786476 101786709 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) 4377 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 121.5-243 chr8 69419177 69419315 + 1 NA Intergenic Intergenic 28998 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 127.75-7 chr1 40854967 40855113 + 1 NA Intergenic Intergenic 7323 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 203.75-103 chr7 82553169 82553453 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -109355 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 185.25-72 chr20 33329406 33329652 + 1 NA Intergenic Intergenic 46315 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 197.75-27 chr15 97511011 97511312 + 1 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) intron (NR_120324, intron 2 of 4) 10650 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 258.75-22 chr14 43355732 43356062 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 1151386 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 132.5-248 chr8 130914401 130914580 + 1 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) intron (NM_001115, intron 5 of 17) 126419 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 187.5-175 chr8 129021550 129021779 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -55663 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 188.5-55 chr17 63467365 63467640 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9559 NM_000789 1636 Hs.298469 NM_000789 ENSG00000159640 ACE ACE1|CD143|DCP|DCP1 angiotensin I converting enzyme protein-coding 165.5-166 chr6 99255294 99255646 + 1 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 94204 NM_032511 84553 Hs.573245 NM_032511 ENSG00000146267 FAXC C6orf168|dJ273F20 failed axon connections homolog, metaxin like GST domain containing protein-coding 373.5-8 chr2 144713983 144714375 + 1 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 46212 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 208.75-74 chr6 64088234 64088553 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 281557 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 118.75-66 chr14 90619573 90619691 + 1 NA intron (NM_001320421, intron 15 of 20) MIRb|SINE|MIR -22997 NR_110134 101928909 Hs.662545 NR_110134 ENSG00000259163 LOC101928909 - uncharacterized LOC101928909 ncRNA 122.75-68 chr17 59264656 59264829 + 1 NA intron (NM_182569, intron 6 of 9) intron (NM_182569, intron 6 of 9) 44231 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 135.75-129 chr22 33477238 33477474 + 1 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) LTR84b|LTR|ERVL -40687 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 305.5-45 chr7 5442009 5442460 + 1 NA Intergenic Intergenic -13307 NM_001354886 100129484 Hs.147507 NM_001354886 LOC100129484 - uncharacterized LOC100129484 protein-coding 179.25-113 chr4 66292716 66292940 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 16004 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 158.75-31 chr11 81266444 81266642 + 1 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -503740 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 199.25-27 chr12 132022235 132022475 + 1 NA intron (NM_015409, intron 23 of 52) intron (NM_015409, intron 23 of 52) -8869 NR_002979 677829 Hs.742405 NR_002979 ENSG00000208892 SNORA49 ACA49 small nucleolar RNA, H/ACA box 49 snoRNA 199.5-38 chr14 45638928 45639165 + 1 NA Intergenic Intergenic 76556 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 228.75 chr1 18173166 18173446 + 1 NA intron (NM_032880, intron 1 of 9) AluY|SINE|Alu 65508 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 212.75-23 chr12 56583537 56583844 + 1 NA intron (NM_002898, intron 9 of 13) L1ME4b|LINE|L1 46636 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 233.75-56 chr4 116991487 116991898 + 1 NA Intergenic Intergenic 93884 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 163.25-43 chr14 50713570 50713802 + 1 NA Intergenic Intergenic -45380 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 149.5-86 chr19 48809256 48809539 + 1 NA intron (NM_001284325, intron 1 of 11) intron (NM_001284325, intron 1 of 11) 1632 NM_001164773 587 Hs.512670 NM_001190 ENSG00000105552 BCAT2 BCAM|BCATM|BCT2|PP18 branched chain amino acid transaminase 2 protein-coding 204.5-95 chr3 161594808 161595165 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 98178 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 266.5-76 chr8 99077860 99078331 + 1 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) L1M2|LINE|L1 64829 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 190.25-103 chr5 145175422 145175645 + 1 NA Intergenic Intergenic 659809 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 160.5-28 chr11 85120753 85121053 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 5 of 27) intron (NM_001142699, intron 5 of 27) -197482 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 168.5-88 chr2 132389891 132390121 + 1 NA Intergenic Intergenic -26799 NM_001508 2863 Hs.432395 NM_001508 ENSG00000183840 GPR39 - G protein-coupled receptor 39 protein-coding 146.5-155 chr4 72922481 72922672 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 147140 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 239.5-51 chr3 191249836 191250092 + 1 NA intron (NM_198184, intron 3 of 4) intron (NM_198184, intron 3 of 4) -15359 NR_133663 106480738 NR_133663 ENSG00000233308 OSTN-AS1 - OSTN antisense RNA 1 ncRNA 143.5-125 chr2 206397603 206397864 + 1 NA Intergenic Intergenic -45799 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 225.5-91 chr5 73047549 73047990 + 1 NA intron (NM_001146032, intron 10 of 24) MER2|DNA|TcMar-Tigger -72806 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 359.25-7 chr3 18986552 18987177 + 1 NA Intergenic Intergenic -161646 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 197.5-122 chr5 63485815 63486170 + 1 NA Intergenic Intergenic 476300 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 164.25-54 chr17 33743895 33744175 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L1M4b|LINE|L1 -210275 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 362.5-21 chr6 125547937 125548469 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -126150 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 141.25-45 chr14 43724334 43724571 + 1 NA Intergenic Intergenic 782831 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 236.75-34 chr20 38531091 38531413 + 1 NA intron (NM_001282917, intron 14 of 29) intron (NM_001282917, intron 14 of 29) 14689 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 112.75-49 chr13 33499161 33499422 + 1 NA intron (NM_001243476, intron 4 of 17) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -164025 NR_146541 105370154 NR_146541 LINC02344 - long intergenic non-protein coding RNA 2344 ncRNA 219.25-35 chr2 84340279 84340747 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 49831 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 130.5-111 chr16 85435169 85435387 + 1 NA Intergenic Intergenic -128953 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 204.5-49 chr18 960288 960590 + 1 NA Intergenic Intergenic -32446 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 283.5-13 chr12 43594972 43595374 + 1 NA Intergenic Intergenic -42970 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 250.5-73 chr5 52620947 52621363 + 1 NA Intergenic Intergenic -166761 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 157.75-175 chr8 126569965 126570152 + 1 NA Intergenic Intergenic -11580 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 132.5-49 chr12 19023883 19024225 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -105679 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 123.5-14 chr1 212372372 212372569 + 1 NA intron (NM_001198862, intron 8 of 8) L1MA4|LINE|L1 19652 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 151.75-12 chr1 183628323 183628515 + 1 NA intron (NM_005717, intron 3 of 3) intron (NM_005717, intron 3 of 3) 7364 NM_001270439 10092 Hs.518609 NM_005717 ENSG00000162704 ARPC5 ARC16|dJ127C7.3|p16-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 5 protein-coding 321.75-15 chr2 22422765 22423340 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -113427 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 231.5-41 chr2 22625626 22625938 + 1 NA Intergenic Intergenic 89303 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 210.5-46 chr16 30707104 30707450 + 1 NA exon (NM_006662, exon 5 of 34) exon (NM_006662, exon 5 of 34) -3260 NR_002966 677813 Hs.689718 NR_002966 ENSG00000206755 SNORA30 ACA30|SNORA30A small nucleolar RNA, H/ACA box 30 snoRNA 174.5-52 chr12 63808776 63808965 + 1 NA TTS (NR_126167) TTS (NR_126167) 13286 NR_126167 104169670 Hs.735874 NR_126167 ENSG00000255850 RXYLT1-AS1 TMEM5-AS1 RXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-145 chr4 58569088 58569223 + 1 NA Intergenic Intergenic -32827 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 143.25-81 chr2 17390162 17390470 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 128124 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 127.75-58 chr14 29180839 29181059 + 1 NA Intergenic Intergenic -395162 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 180.25-119 chr8 126306337 126306676 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -18989 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 204.75-15 chr10 14877371 14877761 + 1 NA Intergenic Intergenic -1217 NR_034181 79723 Hs.554883 NM_024670 ENSG00000152455 SUV39H2 KMT1B suppressor of variegation 3-9 homolog 2 protein-coding 131.25-137 chr3 85280902 85281146 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -104686 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 276.25-8 chr12 2919811 2920203 + 1 NA intron (NM_003324, intron 2 of 10) intron (NM_003324, intron 2 of 10) 29116 NM_001160408 7289 Hs.655333 NM_003324 ENSG00000078246 TULP3 TUBL3 TUB like protein 3 protein-coding 269.75-44 chr5 34876310 34876781 + 1 NA intron (NM_001317949, intron 8 of 10) L1MCa|LINE|L1 37164 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 194.5-54 chr18 12647415 12647691 + 1 NA intron (NM_020148, intron 1 of 15) AluJr|SINE|Alu 9179 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 161.5-6 chr1 76695826 76696009 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 83350 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 141.5-132 chr22 19561926 19562176 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 4788 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 144.5-51 chr12 123135432 123135596 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -25025 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 260.75-52 chr5 172854406 172854975 + 1 NA intron (NM_001031711, intron 1 of 9) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 20439 NM_001031711 57222 Hs.509163 NM_020462 ENSG00000113719 ERGIC1 AMCN|ERGIC-32|ERGIC32|NET24 endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment 1 protein-coding 202.75-85 chr4 89306757 89306989 + 1 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) intron (NM_198281, intron 1 of 1) 927 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 232.5-91 chr6 65072160 65072447 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) HAL1M8|LINE|L1 -229115 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 137.5-77 chr15 72171367 72171594 + 1 NA intron (NM_001012642, intron 1 of 11) intron (NM_001012642, intron 1 of 11) 26307 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 136.5-202 chr6 150974347 150974565 + 1 NA intron (NM_001350486, intron 20 of 27) L1MB2|LINE|L1 -32552 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 224.25-31 chr15 61003871 61004138 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 225298 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 311.5-17 chr2 160478904 160479397 + 1 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 14657 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 134.25-185 chr8 56827222 56827487 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 166513 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 120.5-65 chr13 97188970 97189208 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -9467 NR_125725 103625683 Hs.679591 NR_125725 ENSG00000233124 LINC00456 - long intergenic non-protein coding RNA 456 ncRNA 144.75-52 chr13 87414369 87414590 + 1 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu 204261 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 145.5-51 chr13 28464964 28465154 + 1 NA intron (NM_002019, intron 3 of 29) intron (NM_002019, intron 3 of 29) 30069 NM_001160030 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 158.5-152 chr5 27096127 27096362 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -57658 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 243.5-67 chr5 152978976 152979265 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -6771 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 225.5-97 chr7 4785965 4786490 + 1 NA intron (NR_157345, intron 9 of 16) intron (NR_157345, intron 9 of 16) 2412 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 193.75-105 chr6 24231163 24231404 + 1 NA intron (NM_016356, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 105068 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 160.75-58 chr18 12863232 12863454 + 1 NA intron (NM_080423, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 20894 NM_002828 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 208.75-36 chr19 28175814 28176147 + 1 NA Intergenic Intergenic -382040 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 183.25-24 chr11 94578659 94578985 + 1 NA intron (NM_152431, intron 4 of 19) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 11454 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 186.5-33 chr12 79021546 79021882 + 1 NA intron (NM_001291901, intron 2 of 9) intron (NM_001291901, intron 2 of 9) -23978 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 308.75-17 chr16 6075728 6076115 + 1 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 56218 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 247.25-29 chr2 97848348 97848623 + 1 NA intron (NM_015348, intron 5 of 40) MER2|DNA|TcMar-Tigger 114079 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 262.75-19 chr16 34592490 34592914 + 1 NA Intergenic (TTCCATTCGAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -211222 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 151.5-201 chr8 135421300 135421477 + 1 NA Intergenic Intergenic -36068 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 194.5-73 chr2 145423409 145423758 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 755616 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 192.5-27 chr11 74246259 74246548 + 1 NA intron (NM_001271593, intron 10 of 13) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -64959 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 234.25-73 chr7 77895732 77896135 + 1 NA intron (NM_001127357, intron 3 of 17) HY1|scRNA|scRNA 55803 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 227.5-86 chr5 173315545 173315825 + 1 NA 3' UTR (NM_003714, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_003714, exon 4 of 4) 11955 NR_162132 113219469 NR_162132 MIR12118 - microRNA 12118 ncRNA 229.75-69 chr7 42014217 42014621 + 1 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) intron (NM_000168, intron 10 of 14) 222790 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 196.75-107 chr8 126283166 126283390 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -42217 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 149.5-15 chr1 233617245 233617434 + 1 NA intron (NM_002245, intron 1 of 2) intron (NM_002245, intron 1 of 2) 3233 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 121.25-197 chr8 125696289 125696494 + 1 NA Intergenic Intergenic 254806 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 157.75-110 chr3 111086693 111086930 + 1 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) L1ME3A|LINE|L1 14995 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 165.5-115 chr3 110300127 110300418 + 1 NA Intergenic Intergenic 697444 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 213.25-47 chr4 19423121 19423406 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -828642 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 133.5-206 chr5 55852565 55852787 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242639) promoter-TSS (NM_001242639) -646 NM_001242636 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 170.5-105 chr2 222733914 222734163 + 1 NA Intergenic Intergenic 62380 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 148.75-20 chr10 33083580 33083814 + 1 NA intron (NR_160030, intron 1 of 2) intron (NR_160030, intron 1 of 2) 33110 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 205.75-86 chr8 134575597 134575859 + 1 NA intron (NM_020863, intron 10 of 15) intron (NM_020863, intron 10 of 15) -22343 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 191.75-81 chr3 63954172 63954543 + 1 NA intron (NM_001177387, intron 4 of 12) intron (NM_001177387, intron 4 of 12) -13437 NM_001128149 6314 Hs.476595 NM_000333 ENSG00000163635 ATXN7 ADCAII|OPCA3|SCA7|SGF73 ataxin 7 protein-coding 165.5-139 chr4 173879146 173879333 + 1 NA Intergenic Intergenic -18034 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 397.5-9 chr7 46351801 46352490 + 1 NA Intergenic (GAGAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 344977 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 183.75-54 chr2 24273640 24273957 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 17 of 38) intron (NM_001348182, intron 17 of 38) 86738 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 128.75-98 chr2 76708289 76708515 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -277563 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 170.5-71 chr16 78467702 78467983 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 368188 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 242.75-56 chr5 53461044 53461524 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -19345 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 154.25-143 chr6 106722945 106723109 + 1 NA intron (NR_033557, intron 6 of 6) intron (NR_033557, intron 6 of 6) 27542 NR_149100 105377926 Hs.635821 NR_149100 ENSG00000229654 LINC02526 - long intergenic non-protein coding RNA 2526 ncRNA 189.5-25 chr10 112187116 112187538 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3562 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 120.5-89 chr16 75383841 75384025 + 1 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) intron (NM_006324, intron 5 of 6) 49570 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 139.5-214 chr8 100514222 100514424 + 1 NA intron (NM_001270379, intron 5 of 5) intron (NM_001270379, intron 5 of 5) 45436 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 214.5-117 chr7 21890055 21890463 + 1 NA intron (NM_001277115, intron 76 of 81) intron (NM_001277115, intron 76 of 81) 55640 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 254.75 chr1 175573407 175573876 + 1 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 169954 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 195.75-126 chr9 84969928 84970205 + 1 NA intron (NM_001018064, intron 16 of 17) MIR|SINE|MIR 264165 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 157.25-163 chrUn_KI270751v1 149610 149950 + 1 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 345.5-23 chr4 70747334 70747862 + 1 NA intron (NM_001291994, intron 2 of 13) L2|LINE|L2 13188 NM_001291993 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 124.5-197 chr6 138869418 138869593 + 1 NA intron (NM_001077706, intron 13 of 21) intron (NM_001077706, intron 13 of 21) 73394 NM_001195037 345930 Hs.660603 NM_001077706 ENSG00000203734 ECT2L ARHGEF32|C6orf91|FBXO49|LFDH|dJ509I19.2|dJ509I19.3|dJ509I19.5 epithelial cell transforming 2 like protein-coding 181.5-152 chr7 101435800 101436054 + 1 NA intron (NM_133457, intron 2 of 12) intron (NM_133457, intron 2 of 12) 73052 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 207.75-20 chr11 83594592 83594873 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) L3|LINE|CR1 87693 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 186.5-129 chr7 107582838 107583084 + 1 NA intron (NR_163927, intron 2 of 6) intron (NR_163927, intron 2 of 6) 2715 NM_001371354 343.25-12 chr4 53958333 53959016 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 28608 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 175.5-184 chrX 44030328 44030666 + 1 NA Intergenic Intergenic -57107 NM_000266 4693 Hs.522615 NM_000266 ENSG00000124479 NDP EVR2|FEVR|ND norrin cystine knot growth factor NDP protein-coding 172.75-19 chr10 122674511 122674729 + 1 NA intron (NM_001364461, intron 1 of 3) intron (NM_001364461, intron 1 of 3) 1738 NM_001364461 112577516 NM_001364461 LOC112577516 - carbohydrate-binding protein AQN-1-like protein-coding 235.25-51 chr5 31449207 31449562 + 1 NA exon (NM_001100412, exon 21 of 35) exon (NM_001100412, exon 21 of 35) 82709 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 230.5-108 chr8 48016886 48017341 + 1 NA intron (NM_003350, intron 1 of 3) L1MA8|LINE|L1 8682 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 163.5-47 chr12 121132412 121132577 + 1 NA promoter-TSS (NM_002562) promoter-TSS (NM_002562) -382 NR_033953 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 189.5-122 chr6 124443907 124444143 + 1 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 161020 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 241.5-56 chr20 7414994 7415330 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 43554 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 154.25-165 chr8 25374296 25374518 + 1 NA intron (NM_024940, intron 36 of 51) AluJb|SINE|Alu -12895 NR_159962 105379331 NR_159962 LOC105379331 - uncharacterized LOC105379331 ncRNA 147.5-72 chr15 80792002 80792282 + 1 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) intron (NM_018689, intron 1 of 28) 12772 NM_001293298 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 170.5-57 chr14 37605016 37605441 + 1 NA intron (NM_001310135, intron 1 of 32) intron (NM_001310135, intron 1 of 32) 9599 NM_001310135 319089 Hs.659936 NM_001007795 ENSG00000139865 TTC6 C14orf25|NCRNA00291 tetratricopeptide repeat domain 6 protein-coding 172.25-89 chr3 86329144 86329481 + 1 NA Intergenic Intergenic -152631 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 123.5-189 chr6 121783909 121784154 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 348385 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 231.5-43 chr2 42569455 42569895 + 1 NA intron (NM_001330443, intron 1 of 16) intron (NM_001330443, intron 1 of 16) 1043 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 174.5-21 chr10 71154234 71154503 + 1 NA Intergenic Intergenic -58202 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 114.25-74 chr17 45302147 45302313 + 1 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) intron (NM_003954, intron 1 of 15) 14790 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 116.75-140 chr3 182090224 182090526 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 138011 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 127.75-74 chr16 74264988 74265303 + 1 NA Intergenic Intergenic -31669 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 205.75-90 chr9 2940092 2940453 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -96177 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 129.75-95 chr2 105759059 105759195 + 1 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) 14064 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 130.25-44 chr12 5205727 5205961 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 37307 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 316.5-19 chr2 176351720 176352112 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 82474 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 118.5-144 chr4 43683233 43683369 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -190758 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 143.75-84 chr2 45185061 45185215 + 1 NA intron (NR_033831, intron 4 of 5) intron (NR_033831, intron 4 of 5) 69803 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 174.25-68 chr17 67104465 67104701 + 1 NA intron (NM_001330447, intron 31 of 32) L1MB7|LINE|L1 60029 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 135.5-203 chr8 116691040 116691310 + 1 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 39075 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 272.75-29 chr20 18189107 18189450 + 1 NA TTS (NR_028402) TTS (NR_028402) 44179 NR_028402 57325 Hs.488051 NM_020536 ENSG00000149474 KAT14 ATAC2|CRP2BP|CSRP2BP|PRO1194|dJ717M23.1 lysine acetyltransferase 14 protein-coding 258.25-40 chr4 84737635 84737977 + 1 NA intron (NM_014991, intron 40 of 67) intron (NM_014991, intron 40 of 67) 154679 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 209.25-92 chr5 92965712 92965972 + 1 NA Intergenic Intergenic 605501 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 205.25-94 chr6 110752195 110752708 + 1 NA intron (NM_001300964, intron 1 of 12) intron (NM_001300964, intron 1 of 12) -62170 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 186.5-133 chr8 65916360 65916592 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -74412 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 288.5-37 chr6 40663941 40664494 + 1 NA Intergenic Intergenic -76853 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 121.5-250 chr8 118782037 118782305 + 1 NA Intergenic Intergenic -160208 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 190.5-157 chr8 86682935 86683263 + 1 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) intron (NM_019098, intron 3 of 17) 60576 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 223.5-69 chr20 17998223 17998480 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 29333 NM_001310339 92667 Hs.320823 NM_052865 ENSG00000125871 MGME1 C20orf72|DDK1|MTDPS11|bA504H3.4 mitochondrial genome maintenance exonuclease 1 protein-coding 190.5-133 chr6 36760665 36760903 + 1 NA intron (NM_020939, intron 12 of 20) L2a|LINE|L2 -3375 NM_001314018 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 123.5-155 chr4 159073524 159073725 + 1 NA Intergenic Intergenic -30427 NM_001351724 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 204.75-44 chr16 22674455 22674886 + 1 NA Intergenic Intergenic 128972 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 288.25-20 chr4 61938035 61938467 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 14 of 23) intron (NM_001371343, intron 14 of 23) 223514 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 185.5-93 chr20 48364736 48364982 + 1 NA intron (NR_026958, intron 1 of 4) intron (NR_026958, intron 1 of 4) 4948 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 213.5-12 chr1 232104006 232104305 + 1 NA Intergenic Intergenic 178321 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 189.5-9 chr1 115414840 115415086 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -76727 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 148.5-11 chr1 151951764 151952035 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 41960 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 204.5-70 chr2 171530003 171530404 + 1 NA intron (NM_001127383, intron 1 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 7729 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 263.5-56 chr5 140625214 140625620 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 7758 NM_000591 929 Hs.163867 NM_000591 ENSG00000170458 CD14 - CD14 molecule protein-coding 197.5-174 chrX 71178741 71178978 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 34018 NM_181303 54413 Hs.438877 NM_018977 ENSG00000196338 NLGN3 HNL3 neuroligin 3 protein-coding 113.25-17 chr10 66218132 66218309 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 646795 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 115.5-226 chr7 1431413 1431619 + 1 NA Intergenic Intergenic 27954 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 227.75-70 chr6 54339362 54339629 + 1 NA intron (NM_014464, intron 4 of 10) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 31054 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 288.25-11 chr15 71134224 71134813 + 1 NA Intergenic Intergenic -6931 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 253.5-8 chr1 245161088 245161463 + 1 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) intron (NM_018012, intron 2 of 14) 6290 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 150.5-169 chr5 36289162 36289395 + 1 NA intron (NM_001323279, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 12624 NM_001323273 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 158.5-182 chr7 52038687 52038864 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -645519 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 231.25-35 chr2 52598946 52599243 + 1 NA Intergenic Intergenic 103521 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 257.25-8 chr11 7567325 7567921 + 1 NA intron (NM_003621, intron 3 of 23) intron (NM_003621, intron 3 of 23) -9144 NM_001351861 8495 Hs.655714 NM_003621 ENSG00000166387 PPFIBP2 Cclp1 PPFIA binding protein 2 protein-coding 151.25-180 chr7 111113165 111113353 + 1 NA intron (NM_001099658, intron 2 of 2) intron (NM_001099658, intron 2 of 2) 22132 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 370.75-10 chr5 170633934 170634547 + 1 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 47230 NR_136214 105377716 Hs.570880 NR_136214 ENSG00000253591 LOC105377716 - uncharacterized LOC105377716 ncRNA 226.5-98 chr8 47684183 47684563 + 1 NA intron (NR_148204, intron 11 of 19) intron (NR_148204, intron 11 of 19) 24709 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 172.5-169 chr6 69511721 69511969 + 1 NA Intergenic L1P4e|LINE|L1 284621 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 251.25-9 chr10 77339802 77340164 + 1 NA intron (NM_001322838, intron 1 of 29) intron (NM_001322838, intron 1 of 29) 10778 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 187.25-92 chr6 48627382 48627726 + 1 NA Intergenic Intergenic -558865 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 159.25-132 chr6 161534940 161535269 + 1 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) intron (NM_004562, intron 9 of 11) 64127 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 256.75-15 chr15 75989380 75989674 + 1 NA intron (NM_138573, intron 3 of 5) L1MEc|LINE|L1 22897 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 195.75-87 chr4 104630893 104631128 + 1 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -136116 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 225.25-25 chr16 30518693 30519140 + 1 NA intron (NM_002209, intron 29 of 30) intron (NM_002209, intron 29 of 30) 7650 NM_024671 79724 Hs.85658 NM_024671 ENSG00000169957 ZNF768 - zinc finger protein 768 protein-coding 185.5-68 chr18 31451819 31452016 + 1 NA intron (NM_001944, intron 1 of 15) intron (NM_001944, intron 1 of 15) 4176 NM_001944 1830 Hs.1925 NM_001944 ENSG00000134757 DSG3 CDHF6|PVA desmoglein 3 protein-coding 177.25-122 chr5 145448894 145449222 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 386284 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 220.25-76 chr8 104271212 104271634 + 1 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 48088 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 161.5-52 chr13 92712100 92712346 + 1 NA intron (NR_046520, intron 1 of 3) L1MD|LINE|L1 7732 NR_049776 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 266.5-7 chr10 20056763 20057186 + 1 NA intron (NM_032812, intron 3 of 13) intron (NM_032812, intron 3 of 13) 240542 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 133.75-149 chr4 45901362 45901575 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 222586 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 198.5-38 chr13 110600536 110600885 + 1 NA Intergenic Intergenic -14750 NM_001242883 55739 Hs.408324 NM_018210 ENSG00000213995 NAXD CARKD|LP3298|PEBEL2 NAD(P)HX dehydratase protein-coding 224.5-49 chr17 15911335 15911667 + 1 NA Intergenic Intergenic -33416 NM_000676 136 Hs.167046 NM_000676 ENSG00000170425 ADORA2B ADORA2 adenosine A2b receptor protein-coding 214.25-47 chr2 207704358 207704807 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -6958 NM_001330218 151195 Hs.471234 NM_152523 ENSG00000163249 CCNYL1 - cyclin Y like 1 protein-coding 141.5-3 chr1 35637571 35637775 + 1 NA intron (NM_001199779, intron 1 of 5) intron (NM_001199779, intron 1 of 5) 3853 NM_002794 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 118.25-61 chr14 25460161 25460294 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -409930 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 215.75-18 chr11 81414648 81414922 + 1 NA Intergenic Intergenic 476051 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 117.5-161 chr4 88741155 88741358 + 1 NA intron (NM_001015045, intron 13 of 17) L1ME3A|LINE|L1 31467 NR_002806 285512 Hs.744957 NR_002806 ENSG00000248019 FAM13A-AS1 FAM13A1OS|FAM13AOS|NCRNA00039 FAM13A antisense RNA 1 ncRNA 149.5-202 chr8 78292438 78292672 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -223785 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 198.5-17 chr10 54620621 54620940 + 1 NA intron (NR_134503, intron 4 of 5) intron (NR_134503, intron 4 of 5) -12823 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 138.5-192 chr8 103872812 103873033 + 1 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 53702 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 184.5-69 chr2 15234200 15234532 + 1 NA intron (NR_052013, intron 46 of 50) intron (NR_052013, intron 46 of 50) 326968 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 266.5-69 chr6 125012255 125012740 + 1 NA intron (NM_152553, intron 3 of 8) intron (NM_152553, intron 3 of 8) 29129 NM_152553 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 144.75-138 chr5 124693098 124693432 + 1 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) intron (NM_020747, intron 2 of 8) 51847 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 191.5-38 chr14 53911672 53911969 + 1 NA Intergenic Intergenic 36664 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 174.25-139 chr8 55799257 55799575 + 1 NA intron (NM_001317902, intron 7 of 10) intron (NM_001317902, intron 7 of 10) 25970 NM_001317902 96764 Hs.335068 NM_024831 ENSG00000137574 TGS1 NCOA6IP|PIMT|PIPMT trimethylguanosine synthase 1 protein-coding 254.5-44 chr2 188393444 188393926 + 1 NA intron (NM_016315, intron 2 of 11) L1PB3|LINE|L1 96193 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 213.5-4 chr1 57459822 57460122 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR -35051 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 270.25-4 chr1 179501450 179501829 + 1 NA intron (NM_144696, intron 20 of 25) AluSc8|SINE|Alu 74309 NM_001297575 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 129.5-112 chr2 38264600 38264840 + 1 NA Intergenic Intergenic 111810 NM_001330460 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 267.25-39 chr7 2038800 2039121 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) L1MD1|LINE|L1 50092 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 141.25-164 chr6 158971809 158972015 + 1 NA TTS (NM_031924) TTS (NM_031924) 28275 NM_001346418 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 212.75-24 chr12 66400451 66400689 + 1 NA intron (NM_001366722, intron 16 of 24) intron (NM_001366722, intron 16 of 24) 98025 NR_135080 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 221.5-47 chr2 104773077 104773414 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -15526 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 219.5-138 chr9 80933178 80933442 + 1 NA Intergenic Intergenic 756225 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 507.75 chr2 145087433 145088323 + 1 NA Intergenic Intergenic 419911 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 286.25-4 chr10 125627891 125628263 + 1 NA intron (NM_001318133, intron 3 of 3) intron (NM_001318133, intron 3 of 3) 53706 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 197.5-59 chr19 30332627 30332973 + 1 NA Intergenic Intergenic -39584 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 140.25-52 chr15 65783267 65783431 + 1 NA intron (NM_005848, intron 1 of 31) L1MC3|LINE|L1 8944 NM_001320835 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 165.75-103 chr21 28462712 28462880 + 1 NA Intergenic Intergenic -76522 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 188.75-90 chr5 104037891 104038096 + 1 NA Intergenic Intergenic -475204 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 166.25-77 chr2 82276888 82277089 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -579815 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 119.25-40 chr11 91042433 91042648 + 1 NA Intergenic Intergenic -173338 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 230.75-70 chr8 54274416 54274802 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -56077 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 248.5-62 chr22 31399702 31400155 + 1 NA intron (NM_004147, intron 1 of 8) CpG 324 NM_004147 4733 Hs.115242 NM_004147 ENSG00000185721 DRG1 NEDD3 developmentally regulated GTP binding protein 1 protein-coding 214.5-85 chr3 195572476 195572753 + 1 NA intron (NM_001647, intron 3 of 4) intron (NM_001647, intron 3 of 4) 11326 NM_001647 347 Hs.522555 NM_001647 ENSG00000189058 APOD - apolipoprotein D protein-coding 164.75-45 chr14 23670922 23671112 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 34653 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 193.5-71 chr18 4922237 4922552 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -158788 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 165.75-20 chr10 88048751 88048972 + 1 NA Intergenic MER99|DNA|hAT? 185236 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 235.5 chr1 7181149 7181471 + 1 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) L1MC4a|LINE|L1 208444 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 162.5-84 chr2 126951264 126951462 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 52473 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 198.75-78 chr5 135396038 135396391 + 1 NA intron (NM_004893, intron 1 of 8) intron (NM_004893, intron 1 of 8) 3024 NM_138609 9555 Hs.420272 NM_004893 ENSG00000113648 H2AFY H2A.y|H2A/y|H2AF12M|MACROH2A1.1|mH2A1|macroH2A1.2 H2A histone family member Y protein-coding 202.5-53 chr15 101801119 101801481 + 1 NA Intergenic Intergenic -4420 NM_001005326 390648 Hs.553399 NM_001005326 ENSG00000184140 OR4F6 OR15-15|OR4F12 olfactory receptor family 4 subfamily F member 6 protein-coding 161.5-86 chr19 50356060 50356327 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 9446 NM_004851 9476 Hs.512843 NM_004851 ENSG00000131400 NAPSA KAP|Kdap|NAP1|NAPA|SNAPA napsin A aspartic peptidase protein-coding 254.5-25 chr14 59725132 59725525 + 1 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) -78308 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 153.25-89 chr3 50679896 50680206 + 1 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) MIRc|SINE|MIR 4971 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 215.75-59 chr22 29104706 29105242 + 1 NA intron (NM_001039570, intron 3 of 8) L2c|LINE|L2 31939 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 164.5-186 chr7 24489089 24489326 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -84245 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 161.5-64 chr15 64889888 64890247 + 1 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie -21835 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 128.75-39 chr12 28293965 28294281 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) intron (NM_001352082, intron 4 of 13) -103385 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 181.75-8 chr1 168096217 168096547 + 1 NA intron (NM_001267609, intron 4 of 6) intron (NM_001267609, intron 4 of 6) 40054 NM_001267612 23432 Hs.271809 NM_007369 ENSG00000143147 GPR161 RE2 G protein-coupled receptor 161 protein-coding 151.5-178 chr7 22648844 22649042 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 16590 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 154.5-188 chr8 110551669 110551946 + 1 NA Intergenic Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 475626 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 173.75-103 chr22 28438162 28438418 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -21579 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 224.5-47 chr15 87733075 87733321 + 1 NA Intergenic Intergenic 156269 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 206.25-42 chr17 8534906 8535243 + 1 NA intron (NM_001256012, intron 16 of 42) intron (NM_001256012, intron 16 of 42) 95651 NM_001256012 4628 Hs.16355 NM_005964 ENSG00000133026 MYH10 NMMHC-IIB|NMMHCB myosin heavy chain 10 protein-coding 121.5-56 chr12 19692356 19692566 + 1 NA Intergenic Intergenic 251862 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 150.5-192 chr6 130284740 130284979 + 1 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) L1MEd|LINE|L1 -61908 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 124.5-184 chr5 175282684 175282925 + 1 NA Intergenic Intergenic 161378 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 203.5-145 chrX 51797489 51797858 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -5403 NM_001005332 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 191.5-20 chr11 10730188 10730431 + 1 NA Intergenic Intergenic -20937 NM_001346279 9646 Hs.725151 NM_014633 ENSG00000198730 CTR9 SH2BP1|TSBP|p150|p150TSP CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 193.25-117 chr8 108451455 108451738 + 1 NA intron (NR_138033, intron 3 of 9) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 7972 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 125.5-27 chr10 63921661 63921873 + 1 NA Intergenic Intergenic -399877 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 146.25-108 chr4 30466311 30466556 + 1 NA Intergenic Intergenic -253936 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 136.5-144 chr3 20909849 20910119 + 1 NA Intergenic Intergenic -495742 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 187.5-96 chr2 183215922 183216149 + 1 NA Intergenic Intergenic 91592 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 113.5-203 chr5 122090488 122090727 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -12348 NM_002317 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 219.75-89 chr8 134064263 134064643 + 1 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 177957 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 280.25-42 chr4 67376354 67376745 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 45451 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 194.5-10 chr1 229823157 229823393 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 62543 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 150.75-95 chr2 63009493 63009884 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 38023 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 180.75-96 chr3 130999018 130999353 + 1 NA intron (NM_001001485, intron 26 of 27) intron (NM_001001485, intron 26 of 27) 27669 NR_110229 28990 Hs.100878 NM_014065 ENSG00000034533 ASTE1 HT001 asteroid homolog 1 protein-coding 184.5-16 chr10 18292535 18292866 + 1 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) 31978 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 115.25-180 chr7 11472134 11472411 + 1 NA intron (NM_015204, intron 8 of 26) intron (NM_015204, intron 8 of 26) 359926 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 112.5-74 chr14 53508538 53508726 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 355278 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 146.25-78 chr2 169748492 169748724 + 1 NA intron (NM_001199290, intron 5 of 5) intron (NM_001199290, intron 5 of 5) 14776 NM_144711 151230 Hs.655150 NM_144711 ENSG00000213160 KLHL23 DITHP kelch like family member 23 protein-coding 138.25-165 chr7 81893133 81893308 + 1 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -115957 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 197.5-146 chr7 32607816 32608185 + 1 NA intron (NR_036680, intron 12 of 16) AluSg|SINE|Alu 111168 NR_036680 100129460 Hs.633705 NR_036680 DPY19L1P1 - DPY19L1 pseudogene 1 pseudo 229.5-136 chr8 133709069 133709507 + 1 NA Intergenic Intergenic -25222 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 222.25-3 chr1 187743107 187743465 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 299658 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 293.5-25 chr2 18064395 18064864 + 1 NA Intergenic Intergenic 185962 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 212.5-70 chr3 49896558 49896826 + 1 NA intron (NR_134919, intron 8 of 19) intron (NR_134919, intron 8 of 19) 6945 NM_001318913 4486 Hs.517973 NM_002447 ENSG00000164078 MST1R CD136|CDw136|NPCA3|PTK8|RON macrophage stimulating 1 receptor protein-coding 292.25-20 chr2 156046326 156046882 + 1 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) L1P4|LINE|L1 208327 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 175.25-91 chr3 8960441 8960890 + 1 NA intron (NM_020165, intron 1 of 12) intron (NM_020165, intron 1 of 12) 2807 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 130.5-232 chr7 110232091 110232300 + 1 NA Intergenic Intergenic -271982 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 303.5-53 chr9 123252475 123252854 + 1 NA intron (NM_018387, intron 1 of 18) intron (NM_018387, intron 1 of 18) 15922 NR_033234 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 125.25-88 chr18 36679105 36679299 + 1 NA intron (NM_001281740, intron 14 of 28) L1M5|LINE|L1 -15784 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 161.25-66 chr16 22239521 22239755 + 1 NA intron (NM_013302, intron 2 of 17).2 AluJo|SINE|Alu 33360 NM_013302 29904 Hs.498892 NM_013302 ENSG00000103319 EEF2K CaMKIII|HSU93850|eEF-2K eukaryotic elongation factor 2 kinase protein-coding 193.5-43 chr13 53515457 53515699 + 1 NA Intergenic Intergenic -299841 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 178.5-46 chr14 32936463 32936712 + 1 NA Intergenic Intergenic -2292 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 213.5-94 chr4 124835874 124836140 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -123275 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 128.5-28 chr10 74968397 74968549 + 1 NA intron (NM_001370135, intron 4 of 9) intron (NM_001370135, intron 4 of 9) -53260 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 166.5-109 chr2 152995258 152995489 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 276736 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 356.5-20 chr8 88522709 88523145 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -195444 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 222.25-32 chr2 40593052 40593385 + 1 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL -80783 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 173.75-41 chr12 1988879 1989128 + 1 NA intron (NM_152640, intron 3 of 8) intron (NM_152640, intron 3 of 8) 15454 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 120.5-111 chr2 27799310 27799497 + 1 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) intron (NM_022128, intron 7 of 7) 27684 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 128.5-200 chr7 8750103 8750326 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 316605 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 141.75-163 chr7 100448493 100448783 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -12141 NM_001346938 221908 Hs.413359 NM_145030 ENSG00000160813 PPP1R35 C7orf47 protein phosphatase 1 regulatory subunit 35 protein-coding 156.5-102 chr21 33520828 33521014 + 1 NA exon (NM_000819, exon 13 of 22) exon (NM_000819, exon 13 of 22) 21196 NM_175085 2618 Hs.473648 NM_000819 ENSG00000159131 GART AIRS|GARS|GARTF|PAIS|PGFT|PRGS phosphoribosylglycinamide formyltransferase, phosphoribosylglycinamide synthetase, phosphoribosylaminoimidazole synthetase protein-coding 168.5-196 chr9 31239294 31239570 + 1 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 142058 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 151.5-118 chr3 61740583 61741008 + 1 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) intron (NM_002841, intron 1 of 29) 179224 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 165.75-3 chr1 45703541 45703810 + 1 NA intron (NM_001145349, intron 8 of 9) MER103C|DNA|hAT-Charlie 15494 NM_016486 51249 Hs.699548 NM_016486 ENSG00000159596 TMEM69 C1orf154 transmembrane protein 69 protein-coding 131.5-73 chr15 66399116 66399356 + 1 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) L1MC5a|LINE|L1 12363 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 266.75-21 chr2 38916256 38916752 + 1 NA Intergenic Intergenic -2859 NM_001367623 100271715 Hs.99841 NM_001145451 ENSG00000214694 ARHGEF33 - Rho guanine nucleotide exchange factor 33 protein-coding 244.5-111 chrX 58028232 58028647 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -117806 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 263.25-43 chr5 31056053 31056524 + 1 NA Intergenic Intergenic -137398 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 306.5-31 chr6 107562402 107562848 + 1 NA intron (NM_018013, intron 4 of 6) intron (NM_018013, intron 4 of 6) 72508 NM_018013 55084 Hs.445244 NM_018013 ENSG00000112320 SOBP JXC1|MRAMS sine oculis binding protein homolog protein-coding 278.5-42 chr5 38058341 38058803 + 1 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 32875 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 249.5-89 chr7 70195858 70196207 + 1 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 597557 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 162.5-126 chr4 48653937 48654166 + 1 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 126248 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 197.5-137 chr6 143676131 143676409 + 1 NA intron (NM_014721, intron 1 of 12) X7A_LINE|LINE|CR1 -1695 NM_001100165 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 145.5-86 chr18 62759448 62759708 + 1 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) intron (NM_194449, intron 1 of 16) 44037 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 135.25-182 chr6 121305320 121305486 + 1 NA intron (NR_104452, intron 5 of 35) MIRb|SINE|MIR 29077 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 193.5-115 chr4 41448702 41449046 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 88067 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 237.25-11 chr10 52049789 52050198 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) 264135 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 279.5-57 chr6 48799548 48800080 + 1 NA Intergenic Intergenic 663439 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 213.5-10 chr1 224302956 224303311 + 1 NA intron (NM_001243146, intron 6 of 20) intron (NM_001243146, intron 6 of 20) 27039 NM_002533 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 193.5-170 chrX 94102217 94102548 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 428176 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 320.75-3 chr1 227831891 227832457 + 1 NA intron (NM_183062, intron 3 of 4) L1M4a1|LINE|L1 16457 NM_183062 339501 Hs.97604 NM_183062 ENSG00000185888 PRSS38 MPN2 serine protease 38 protein-coding 203.75-71 chr3 138650643 138650945 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 41745 NM_018147 55179 Hs.173438 NM_018147 ENSG00000158234 FAIM FAIM1 Fas apoptotic inhibitory molecule protein-coding 247.5-31 chr16 58563181 58563732 + 1 NA intron (NM_206999, intron 16 of 30) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -3525 NR_002980 677830 Hs.677515 NR_002980 ENSG00000281910 SNORA50A ACA50|SNORA50|SNORA76A small nucleolar RNA, H/ACA box 50A snoRNA 223.25-61 chr5 51759393 51759943 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -248363 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 241.75-10 chr10 107951971 107952374 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 117121 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 126.5-236 chr8 60693541 60693710 + 1 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) 14885 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 218.5-18 chr10 28535764 28536115 + 1 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) intron (NM_100486, intron 3 of 12) 2821 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 248.75-61 chr9 23302452 23302826 + 1 NA Intergenic Intergenic 369760 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 194.5-76 chr2 172228633 172228990 + 1 NA Intergenic Intergenic 125805 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 129.5-52 chr12 31911154 31911370 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -24059 NR_135029 105369723 Hs.736954 NR_135029 ENSG00000255760 LINC02422 - long intergenic non-protein coding RNA 2422 ncRNA 155.5-60 chr15 86271348 86271530 + 1 NA intron (NM_152336, intron 14 of 24) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 45529 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 156.5-128 chr4 33058518 33058745 + 1 NA Intergenic Intergenic 707593 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 245.5-90 chrX 57101269 57101687 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 20068 NM_001006683 474343 Hs.460717 NM_001006681 ENSG00000186787 SPIN2B SPIN-2|SPIN-2B|SPIN2_duplicate|TDRD26|dJ323P24.2 spindlin family member 2B protein-coding 208.25-65 chr4 44402364 44402781 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 46237 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 149.5-107 chr20 33012371 33012601 + 1 NA intron (NM_025227, intron 3 of 15) intron (NM_025227, intron 3 of 15) 4782 NM_025227 80341 Hs.257045 NM_025227 ENSG00000078898 BPIFB2 BPIL1|C20orf184|LPLUNC2|RYSR|dJ726C3.2 BPI fold containing family B member 2 protein-coding 141.5-227 chr8 78840781 78841073 + 1 NA TTS (NR_157588) TTS (NR_157588) 3398 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 249.5-15 chr10 67540355 67540717 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) intron (NM_001127384, intron 3 of 17) 125124 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 278.5-14 chr14 73347803 73348224 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) intron (NM_001005743, intron 4 of 12) -102012 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 248.5-6 chr10 20841946 20842330 + 1 NA intron (NM_006393, intron 12 of 27) intron (NM_006393, intron 12 of 27) 55464 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 170.5-90 chr2 36167122 36167350 + 1 NA Intergenic Intergenic 188334 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 153.5-104 chr2 116183214 116183511 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 839547 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155.5-17 chr1 209897399 209897651 + 1 NA Intergenic Intergenic -40649 NR_027459 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 153.75-51 chr16 5863583 5863836 + 1 NA Intergenic Intergenic -155315 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 289.25-34 chr9 86712684 86713161 + 1 NA Intergenic Intergenic 234584 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 178.5-174 chr7 116958793 116959020 + 1 NA intron (NR_002329, intron 4 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4572 NR_002330 93653 Hs.597516 NR_002330 ENSG00000227199 ST7-AS1 ST7AS1|ST7OT1 ST7 antisense RNA 1 ncRNA 256.75-13 chr14 65687276 65687645 + 1 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 216358 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 224.75-76 chr8 133365311 133365788 + 1 NA Intergenic Intergenic -68245 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 153.5-158 chr5 60649873 60650094 + 1 NA intron (NM_001145208, intron 2 of 9) intron (NM_001145208, intron 2 of 9) 50183 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 146.25-155 chr8 117460391 117460567 + 1 NA Intergenic Intergenic -60234 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 266.5-4 chr1 203716137 203716662 + 1 NA intron (NM_001001396, intron 15 of 21) MER68B|LTR|ERVL -13182 NR_003019 677843 Hs.676135 NR_003019 ENSG00000221643 SNORA77 ACA63|SNORA77A small nucleolar RNA, H/ACA box 77 snoRNA 194.75-35 chr17 31842852 31843146 + 1 NA Intergenic Intergenic 15963 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 162.5-196 chrX 85236020 85236387 + 1 NA intron (NM_001367858, intron 1 of 11) L1MA3|LINE|L1 7576 NM_001367858 340562 Hs.640783 NM_001012980 ENSG00000184788 SATL1 - spermidine/spermine N1-acetyl transferase like 1 protein-coding 236.5-69 chr4 95831916 95832384 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7943 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 351.5-9 chr12 26214034 26214478 + 1 NA intron (NM_005086, intron 1 of 2) intron (NM_005086, intron 1 of 2) 18683 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 151.25-57 chr14 65323241 65323458 + 1 NA Intergenic Intergenic 11834 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 169.25-115 chr7 93862829 93863068 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 27805 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 206.75-89 chr8 15366272 15366652 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -128031 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 219.75-84 chr8 71637657 71637908 + 1 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -89688 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 204.25-9 chr10 59592054 59592409 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 117660 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 273.25-37 chr7 8078471 8078876 + 1 NA intron (NM_138426, intron 6 of 7) intron (NM_138426, intron 6 of 7) 109877 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 127.5-146 chr22 47166205 47166523 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 12 of 12) MER33|DNA|hAT-Charlie -179207 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 127.25-36 chr11 95294884 95295092 + 1 NA Intergenic Intergenic -62513 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 157.75-146 chr5 167863834 167864117 + 1 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 109046 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 168.25-44 chr14 66970242 66970420 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -219109 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 133.75-130 chr3 72955768 72956071 + 1 NA intron (NR_138564, intron 4 of 6) AluSz|SINE|Alu -40824 NM_001318026 151987 Hs.431092 NM_174907 ENSG00000163605 PPP4R2 PP4R2 protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 protein-coding 121.75-50 chr15 65590884 65591178 + 1 NA intron (NR_045106, intron 9 of 11) intron (NR_045106, intron 9 of 11) 20100 NR_045901 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 117.5-147 chr3 141860908 141861071 + 1 NA Intergenic Intergenic -15654 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 212.75-74 chr4 87448975 87449462 + 1 NA exon (NM_198038, exon 5 of 8) exon (NM_198038, exon 5 of 8) 26621 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 225.5-35 chr14 56309011 56309397 + 1 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 190793 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 247.5-24 chr14 73787315 73787806 + 1 NA promoter-TSS (NM_001043318) promoter-TSS (NM_001043318) 200 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 254.25-42 chr3 102022544 102022913 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 81869 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 191.5-89 chr21 25009642 25009990 + 1 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 169266 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 128.25-69 chr16 85865435 85865704 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -33593 NM_002163 3394 Hs.137427 NM_002163 ENSG00000140968 IRF8 H-ICSBP|ICSBP|ICSBP1|IMD32A|IMD32B|IRF-8 interferon regulatory factor 8 protein-coding 248.5-5 chr1 162129682 162130035 + 1 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) intron (NM_014697, intron 1 of 9) -27249 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 132.25 chr1 34950610 34950819 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -21064 NM_001080418 58512 Hs.436393 NM_001080418 ENSG00000116544 DLGAP3 DAP3|SAPAP3 DLG associated protein 3 protein-coding 289.75-15 chr20 12907509 12907874 + 1 NA intron (NR_109868, intron 6 of 11) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 29272 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 158.75-59 chr15 77431924 77432282 + 1 NA intron (NM_001304505, intron 1 of 9) L1MA8|LINE|L1 11215 NM_001304504 10363 Hs.69594 NM_018200 ENSG00000140382 HMG20A HMGX1|HMGXB1 high mobility group 20A protein-coding 148.25-110 chr4 99799599 99799799 + 1 NA Intergenic Intergenic -17128 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 142.5-172 chr5 84907799 84908020 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -523029 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 179.5-39 chr12 40502941 40503214 + 1 NA intron (NM_173600, intron 67 of 173) intron (NM_173600, intron 67 of 173) 109683 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 193.5-109 chr3 111075281 111075532 + 1 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 3590 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 177.25-133 chr7 35898020 35898486 + 1 NA exon (NM_001242956, exon 10 of 12) exon (NM_001242956, exon 10 of 12) 97034 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 157.25-26 chr11 84093349 84093517 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 10 of 27) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 179847 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 218.5-106 chr6 26247838 26248148 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1016 NM_003547 8369 Hs.553507 NM_003547 ENSG00000275663 HIST1H4G H4/l|H4FL histone cluster 1 H4 family member g protein-coding 186.5-81 chr21 28432820 28433053 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -106382 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 180.75-98 chr3 166607722 166608110 + 1 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -290767 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 297.25-18 chr22 19944823 19945257 + 1 NA intron (NM_001362828, intron 1 of 5) MER31-int|LTR|ERV1 -3222 NM_001352300 10587 Hs.443430 NM_006440 ENSG00000184470 TXNRD2 GCCD5|SELZ|TR|TR-BETA|TR3|TRXR2 thioredoxin reductase 2 protein-coding 140.5-110 chr2 72739321 72739529 + 1 NA intron (NM_001321734, intron 1 of 21) L1ME4a|LINE|L1 86608 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 190.5-121 chr5 29787556 29787851 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -92857 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 153.25-92 chr3 105751172 105751580 + 1 NA intron (NM_001321808, intron 5 of 18) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 116215 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 213.75-82 chr4 157354205 157354443 + 1 NA intron (NM_001083620, intron 12 of 15) intron (NM_001083620, intron 12 of 15) 133596 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 132.75-9 chr1 101121097 101121400 + 1 NA Intergenic Intergenic 95402 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 116.25 chr1 9838065 9838325 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -13669 NM_001302883 22883 Hs.29665 NM_014944 ENSG00000171603 CLSTN1 ALC-ALPHA|CDHR12|CST-1|CSTN1|PIK3CD|XB31alpha|alcalpha1|alcalpha2 calsyntenin 1 protein-coding 201.75-32 chr14 40877794 40878084 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -76772 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 223.25-68 chr7 26895124 26895388 + 1 NA Intergenic Intergenic -30666 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 251.5-8 chr10 8825476 8825783 + 1 NA Intergenic Intergenic -72360 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 292.75-17 chr2 54919929 54920467 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 25 of 40) L1MA9|LINE|L1 90074 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 121.5-88 chr15 70625172 70625354 + 1 NA Intergenic Intergenic 9716 NR_126481 104548972 NR_126481 ENSG00000281264 SALRNA3 SAL-RNA3|XLOC_025918 senescence associated long non-coding RNA 3 ncRNA 153.25-69 chr2 116175600 116175778 + 1 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 831874 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 144.5-55 chr13 83569603 83569786 + 1 NA Intergenic MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR 312699 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 123.5-202 chr7 135550858 135551075 + 1 NA Intergenic Intergenic -6951 NM_015135 23165 Hs.743250 NM_015135 ENSG00000155561 NUP205 C7orf14|NPHS13 nucleoporin 205 protein-coding 232.75-49 chr4 61881201 61881468 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 280431 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 167.75-5 chr1 57614408 57614718 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -189642 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 176.5-171 chr8 116344912 116345243 + 1 NA Intergenic Intergenic -20018 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 155.25-161 chr7 29980435 29980734 + 1 NA intron (NM_001145514, intron 1 of 7) intron (NM_001145514, intron 1 of 7) 9217 NM_014766 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 308.5-27 chr4 73153860 73154223 + 1 NA exon (NM_015574, exon 6 of 34) exon (NM_015574, exon 6 of 34) 69016 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 174.75-47 chr18 7914514 7914861 + 1 NA intron (NM_002845, intron 4 of 30) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 347371 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 276.25-20 chr17 17176455 17176913 + 1 NA intron (NM_201274, intron 20 of 23) intron (NM_201274, intron 20 of 23) 29649 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 137.5-49 chr12 13259468 13259705 + 1 NA Intergenic Intergenic 62860 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 220.75-5 chr1 105374461 105374820 + 1 NA Intergenic Intergenic 244295 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 307.25-28 chr4 13643536 13643901 + 1 NA Intergenic Intergenic -11461 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 178.25-12 chr10 96990245 96990461 + 1 NA 3' UTR (NM_001346516, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001346516, exon 8 of 8) -112403 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 189.75-43 chr15 78432832 78433148 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4441 NM_001354994 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 220.5-24 chr14 46448480 46448916 + 1 NA intron (NR_102701, intron 4 of 5) LTR28C|LTR|ERV1 -22661 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 265.5-15 chr12 15364393 15364803 + 1 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 42090 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 162.25-95 chr20 11741281 11741459 + 1 NA Intergenic Intergenic 129345 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 165.5-196 chr8 72817710 72817921 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 85770 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 119.75-192 chr7 5745280 5745437 + 1 NA intron (NM_207111, intron 3 of 16) L1MEg|LINE|L1 -33448 NR_106934 102466203 NR_106934 ENSG00000283419 MIR6874 hsa-mir-6874 microRNA 6874 ncRNA 127.5-195 chr5 93964530 93964711 + 1 NA intron (NR_028080, intron 3 of 8) intron (NR_028080, intron 3 of 8) 147043 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 216.25-93 chr7 75750627 75750974 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11859 NM_005338 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 232.5-2 chr1 67432505 67432886 + 1 NA Intergenic Intergenic -2293 NM_001018067 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 117.25-183 chr6 55016941 55017134 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -89423 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 129.75-9 chr1 66374711 66374857 + 1 NA TTS (NM_001297441) TTS (NM_001297441) 20249 NM_001297442 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 162.25-155 chr8 75675857 75676265 + 1 NA Intergenic Intergenic 136093 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 280.5-24 chr2 96336232 96336790 + 1 NA intron (NM_001281712, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 745 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 239.75-21 chr14 69303335 69303634 + 1 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) intron (NM_020692, intron 1 of 15) 43326 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 179.5-167 chr7 41912712 41912900 + 1 NA Intergenic Intergenic -209716 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 120.5-20 chr10 7911619 7911796 + 1 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) MER102b|DNA|hAT-Charlie 93202 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 265.5-12 chr10 130705337 130705818 + 1 NA Intergenic MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR 257091 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 197.5-74 chr2 133047797 133048054 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 132368 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 294.75-18 chr2 173142989 173143493 + 1 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) L1ME2|LINE|L1 67395 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 183.75-108 chr6 124108417 124108675 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L1MB1|LINE|L1 -174459 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 150.5-175 chr5 99175524 99175791 + 1 NA Intergenic Intergenic -245943 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 120.75-106 chr3 35315967 35316133 + 1 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 77973 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 165.75-56 chr15 62713926 62714093 + 1 NA intron (NM_015059, intron 19 of 55) intron (NM_015059, intron 19 of 55) 66698 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 147.5-119 chr20 7738524 7738808 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 201792 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 197.5-51 chr16 78396546 78396849 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 5 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 297043 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 134.25-42 chr13 19255497 19255822 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 73626 NR_126054 101928697 Hs.742697 NR_126054 LOC101928697 - uncharacterized LOC101928697 ncRNA 235.5-29 chr13 57074938 57075208 + 1 NA Intergenic Intergenic -65845 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 276.5-28 chr19 28333904 28334341 + 1 NA Intergenic Intergenic -272566 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 116.5-136 chr2 220824319 220824469 + 1 NA Intergenic Intergenic 747910 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 214.5-32 chr14 64989576 64989844 + 1 NA intron (NM_002028, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 2815 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 183.25-76 chr4 43766342 43766672 + 1 NA Intergenic Intergenic -250354 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 224.25-50 chr20 54983893 54984285 + 1 NA Intergenic LTR2B|LTR|ERV1 -438954 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 168.5-166 chr7 16607637 16607921 + 1 NA intron (NM_020319, intron 7 of 9) intron (NM_020319, intron 7 of 9) 37975 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 215.5-42 chr17 68775340 68775759 + 1 NA Intergenic Intergenic 147395 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 171.75-143 chr8 137444190 137444374 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -30694 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 203.5-140 chr8 108066400 108066711 + 1 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) intron (NM_178565, intron 2 of 5) 15384 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 176.5-82 chr2 17038711 17038982 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -373012 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 138.5-197 chr8 113250314 113250708 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 126641 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 190.5-160 chr8 112177021 112177395 + 1 NA Intergenic Intergenic -466285 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 172.25-76 chr20 1618198 1618606 + 1 NA intron (NM_001329157, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 1607 NM_001135844 10326 Hs.664861 NM_006065 ENSG00000101307 SIRPB1 CD172b|SIRP-BETA-1 signal regulatory protein beta 1 protein-coding 157.5-188 chr7 39731995 39732158 + 1 NA Intergenic LTR55|LTR|ERVL? -1492 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 229.5-68 chr2 136030606 136030982 + 1 NA Intergenic Intergenic -45110 NM_001293312 1615 Hs.503787 NM_001349 ENSG00000115866 DARS HBSL|aspRS aspartyl-tRNA synthetase protein-coding 166.25-133 chr6 37888406 37888641 + 1 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 68796 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 191.75-26 chr11 85111376 85111627 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -188080 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 178.25-120 chr8 89051280 89051594 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 706274 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 120.25-55 chr13 54897796 54898028 + 1 NA Intergenic Intergenic -276542 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 246.5-56 chr3 185165626 185166007 + 1 NA intron (NR_038990, intron 1 of 6) intron (NR_038990, intron 1 of 6) 2915 NR_038990 339926 Hs.567848 NR_038990 ENSG00000223358 EHHADH-AS1 - EHHADH antisense RNA 1 ncRNA 205.5-91 chr3 56272880 56273249 + 1 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 195403 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 153.75-75 chr20 13539819 13540148 + 1 NA intron (NM_001323602, intron 4 of 9) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 98949 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 156.5-133 chr4 63668510 63668666 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 740862 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 327.25-12 chr3 51022163 51022635 + 1 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L1MEg|LINE|L1 347319 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 223.25-30 chr2 18429856 18430261 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 130595 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 135.75-198 chr8 89134801 89135014 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 622804 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 281.75-26 chr2 120291189 120291602 + 1 NA intron (NM_001369400, intron 4 of 4) intron (NM_001369400, intron 4 of 4) 38543 NM_002881 5899 Hs.469820 NM_002881 ENSG00000144118 RALB - RAS like proto-oncogene B protein-coding 129.25-206 chr8 121720977 121721166 + 1 NA Intergenic Intergenic -79631 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 139.5-209 chr8 24329013 24329243 + 1 NA intron (NM_014265, intron 10 of 22) intron (NM_014265, intron 10 of 22) 35059 NR_130710 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 248.25-49 chr3 124093783 124094191 + 1 NA promoter-TSS (NM_001322990) promoter-TSS (NM_001322990) -694 NM_001024660 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 282.5-60 chr7 45577896 45578392 + 1 NA intron (NM_001281768, intron 2 of 9) intron (NM_001281768, intron 2 of 9) 3776 NM_021116 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 121.25 chr1 8969221 8969507 + 1 NA intron (NM_001270501, intron 5 of 6) L1MEd|LINE|L1 23496 NM_001215 765 Hs.100322 NM_001215 ENSG00000131686 CA6 CA-VI|GUSTIN carbonic anhydrase 6 protein-coding 261.5-24 chr18 57774781 57775219 + 1 NA intron (NM_005603, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 28315 NM_005603 5205 Hs.216623 NM_005603 ENSG00000081923 ATP8B1 ATPIC|BRIC|FIC1|ICP1|PFIC|PFIC1 ATPase phospholipid transporting 8B1 protein-coding 126.25-39 chr12 20547910 20548080 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -23869 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 137.75-25 chr10 63255222 63255453 + 1 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 13886 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 147.5-200 chr7 88167938 88168116 + 1 NA intron (NM_001324421, intron 24 of 28) intron (NM_001324421, intron 24 of 28) -48633 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 232.5-105 chr8 124231604 124232045 + 1 NA intron (NR_125420, intron 1 of 2) L1PB3|LINE|L1 15574 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 119.5-24 chr10 49676005 49676215 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -3541 NM_001042427 282966 Hs.131287 NM_182554 ENSG00000178645 C10orf53 - chromosome 10 open reading frame 53 protein-coding 141.5-71 chr16 83463249 83463431 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -45006 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 215.75-43 chr16 77762078 77762441 + 1 NA Intergenic Intergenic -26305 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 233.5-76 chr4 55238071 55238370 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -108022 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 211.75-101 chr8 124986145 124986438 + 1 NA Intergenic Intergenic 11907 NR_134457 105375744 Hs.575534 NR_134457 ENSG00000253513 LOC105375744 - uncharacterized LOC105375744 ncRNA 192.25-79 chr4 48141169 48141545 + 1 NA exon (NM_003215, exon 15 of 18) exon (NM_003215, exon 15 of 18) -7107 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 135.75-179 chr6 50405218 50405401 + 1 NA Intergenic Intergenic -308235 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 346.5-23 chr3 171360549 171361127 + 1 NA intron (NR_027767, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 99567 NM_001161562 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 263.5-63 chr8 5470065 5470559 + 1 NA Intergenic Intergenic -475398 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 238.25-21 chr15 44273744 44274160 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -14767 NR_157849 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 119.5-127 chr2 81283997 81284306 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 182795 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 276.75-33 chr3 116885653 116886007 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -35463 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 255.5-12 chr10 81398846 81399169 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -476187 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 203.5-66 chr2 38891117 38891411 + 1 NA Intergenic Intergenic 15302 NM_001145450 729967 Hs.729207 NM_194270 ENSG00000188010 MORN2 BLOCK27|MOPT MORN repeat containing 2 protein-coding 126.5-231 chr7 107061323 107061524 + 1 NA intron (NM_002736, intron 1 of 10) L1ME3C|LINE|L1 16718 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 121.5-206 chr5 30835405 30835623 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -358172 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 159.25-17 chr10 58436366 58436659 + 1 NA Intergenic Intergenic 51102 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 164.5-102 chr2 133872160 133872454 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -247628 NM_001371457 113.25-3 chr1 43793272 43793467 + 1 NA intron (NM_001270459, intron 3 of 11) L1MA3|LINE|L1 -45253 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 380.5-11 chr8 93693762 93694264 + 1 NA intron (NR_033858, intron 1 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 6420 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 135.5-18 chr1 218257551 218257777 + 1 NA Intergenic Intergenic -27629 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 242.25-53 chr2 197701243 197701697 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -3899 NM_138395 92935 Hs.744330 NM_138395 ENSG00000247626 MARS2 COXPD25|MetRS|mtMetRS methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 170.5-87 chr2 21733583 21733788 + 1 NA Intergenic Intergenic -23033 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 168.75-73 chr2 118184824 118185114 + 1 NA intron (NR_144530, intron 2 of 2) intron (NR_144530, intron 2 of 2) 1417 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 184.5-160 chr8 121698522 121698898 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -57270 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 203.5-107 chr4 62722655 62722913 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -561019 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-55 chr14 46675553 46675817 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -23904 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 138.75-39 chr12 57777130 57777327 + 1 NA intron (NM_206914, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 4614 NM_015433 25895 Hs.632720 NM_015433 ENSG00000123427 EEF1AKMT3 FAM119B|METTL21B EEF1A lysine methyltransferase 3 protein-coding 117.25-112 chr2 98376242 98376406 + 1 NA intron (NM_001079878, intron 2 of 6) L3|LINE|CR1 29868 NM_001079878 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 167.25-104 chr3 20838650 20838849 + 1 NA Intergenic Intergenic 496281 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 150.75-37 chr11 63524552 63524723 + 1 NA Intergenic Intergenic -12171 NM_004585 5920 Hs.17466 NM_004585 ENSG00000133321 PLAAT4 HRASLS4|HRSL4|PLA1/2-3|PLAAT-4|RARRES3|RIG1|TIG3 phospholipase A and acyltransferase 4 protein-coding 150.5-35 chr12 8755684 8756032 + 1 NA intron (NR_147950, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu 57867 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 120.5-25 chr10 74040066 74040249 + 1 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) L2c|LINE|L2 42041 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 230.75-19 chr14 26589036 26589357 + 1 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) 6901 NM_001366397 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 205.5-145 chr8 81183037 81183370 + 1 NA Intergenic Intergenic -71135 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 278.25-23 chr19 28664788 28665157 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MA5|LINE|L1 58284 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 184.25-134 chr9 104105174 104105418 + 1 NA intron (NM_001042550, intron 9 of 24) MER70-int|LTR|ERVL 10669 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 150.5-221 chr8 109292696 109292865 + 1 NA intron (NM_032869, intron 4 of 9) intron (NM_032869, intron 4 of 9) 37153 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 171.5-125 chr5 127824565 127824860 + 1 NA intron (NM_001317938, intron 5 of 6) intron (NM_001317938, intron 5 of 6) 121323 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 163.75-61 chr2 17016122 17016477 + 1 NA Intergenic Intergenic -350465 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 339.75-25 chr5 60550607 60551283 + 1 NA Intergenic Intergenic -54659 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 151.25-118 chr3 6896303 6896477 + 1 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -2373 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 132.5-157 chr3 23445112 23445365 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) ERVL-E-int|LTR|ERVL 241911 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 207.25-69 chr5 10433256 10433559 + 1 NA intron (NM_001270660, intron 24 of 24) intron (NM_001270660, intron 24 of 24) 8444 NR_102746 100505845 Hs.599395 NR_102746 ROPN1L-AS1 - ROPN1L antisense RNA 1 ncRNA 141.5-229 chr8 83027567 83027745 + 1 NA Intergenic Intergenic 115552 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 185.5-32 chr12 25745387 25745583 + 1 NA Intergenic Intergenic -96907 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 233.75-22 chr13 112751193 112751468 + 1 NA intron (NR_046661, intron 1 of 1) L1ME4b|LINE|L1 3401 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 240.25-46 chr4 15569091 15569418 + 1 NA intron (NM_001080522, intron 27 of 37) intron (NM_001080522, intron 27 of 37) 86103 NM_012161 26234 Hs.643433 NM_012161 ENSG00000118564 FBXL5 FBL4|FBL5|FLR1 F-box and leucine rich repeat protein 5 protein-coding 175.5-162 chr8 86118279 86118624 + 1 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) intron (NM_152565, intron 2 of 7) 19541 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 200.75-69 chr3 113713116 113713487 + 1 NA Intergenic Intergenic -16655 NR_111981 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 189.25 chr1 11904772 11905180 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -3178 NR_002754 26829 NR_002754 ENSG00000199347 RNU5E-1 RNU5E|U5E RNA, U5E small nuclear 1 snRNA 141.5-216 chr7 109063241 109063387 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -178727 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 155.5-85 chr19 55749850 55750092 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -9170 NM_001145014 342931 Hs.631553 NM_001145014 ENSG00000223638 RFPL4A RFPL4|RNF210 ret finger protein like 4A protein-coding 130.75-69 chr17 17411687 17411864 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -65225 NM_018019 55090 Hs.244595 NM_018019 ENSG00000141026 MED9 MED25 mediator complex subunit 9 protein-coding 120.75-77 chr2 66219929 66220107 + 1 NA Intergenic Intergenic 138310 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 268.25-18 chr15 75921802 75922092 + 1 NA intron (NM_012170, intron 5 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 18069 NR_037623 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 275.25-34 chr5 111823498 111823915 + 1 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -65488 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 304.75-5 chr11 15706464 15707122 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 62908 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 220.5-64 chr20 45387002 45387335 + 1 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) L1MC|LINE|L1 -8843 NM_014477 27296 Hs.710271 NM_014477 ENSG00000124251 TP53TG5 C20orf10|CLG01 TP53 target 5 protein-coding 215.25-93 chr6 74826853 74827183 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 301764 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 150.5-187 chr6 65437348 65437618 + 1 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) intron (NM_198283, intron 4 of 9) 136065 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 210.5-66 chr2 111140768 111141086 + 1 NA intron (NM_138625, intron 3 of 4) intron (NM_138625, intron 3 of 4) 20013 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 178.5-176 chr8 32539701 32539988 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -8366 NM_001160005 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 135.25-75 chr17 28460998 28461391 + 1 NA Intergenic Intergenic -12450 NM_001145975 9058 Hs.102307 NM_003984 ENSG00000007216 SLC13A2 NADC1|NaCT|NaDC-1|SDCT1 solute carrier family 13 member 2 protein-coding 213.75-91 chr5 60307884 60308167 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) AluSq2|SINE|Alu 64638 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 208.5-122 chr6 137974090 137974335 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -28412 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 134.75-95 chr18 12493607 12493818 + 1 NA intron (NM_020148, intron 7 of 15) FAM|SINE|Alu 60938 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 209.5-79 chr20 32950971 32951194 + 1 NA intron (NM_001143967, intron 23 of 26) L1ME1|LINE|L1 53351 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 203.75-46 chr17 68651873 68652147 + 1 NA intron (NR_110825, intron 2 of 4) intron (NR_110825, intron 2 of 4) 23856 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 324.5-7 chr13 74066835 74067287 + 1 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) CR1_Mam|LINE|CR1 66868 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 191.25-70 chr3 103295867 103296125 + 1 NA Intergenic Intergenic 228120 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 140.5-242 chr8 139349232 139349427 + 1 NA Intergenic Intergenic 353794 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 125.5-139 chr2 215433406 215433670 + 1 NA intron (NM_212482, intron 2 of 45) intron (NM_212482, intron 2 of 45) 2530 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 228.75-97 chrX 117519830 117520137 + 1 NA Intergenic Intergenic 453755 NM_033495 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 178.5-97 chr20 59022749 59023011 + 1 NA exon (NM_030773, exon 2 of 4) exon (NM_030773, exon 2 of 4) 3626 NM_030773 81027 Hs.303023 NM_030773 ENSG00000101162 TUBB1 - tubulin beta 1 class VI protein-coding 192.5-128 chr8 78592417 78592761 + 1 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) intron (NM_006823, intron 2 of 3) -34086 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 184.5-122 chr5 99145954 99146272 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -216399 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 137.75-6 chr1 83917826 83918010 + 1 NA intron (NM_001350215, intron 12 of 19) intron (NM_001350215, intron 12 of 19) -56922 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 148.5-2 chr1 29293891 29294173 + 1 NA intron (NM_133177, intron 15 of 30) L1ME3E|LINE|L1 56082 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 171.5-162 chr9 23417640 23417848 + 1 NA Intergenic Intergenic 254655 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 215.75 chr1 2243159 2243614 + 1 NA intron (NM_003036, intron 1 of 6) intron (NM_003036, intron 1 of 6) 15067 NM_003036 6497 Hs.656507 NM_003036 ENSG00000157933 SKI SGS|SKV SKI proto-oncogene protein-coding 247.25-34 chr2 233985404 233985797 + 1 NA intron (NM_024080, intron 20 of 25) intron (NM_024080, intron 20 of 25) -65102 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 122.25-210 chr9 102788126 102788263 + 1 NA Intergenic Intergenic -207139 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 292.25-7 chr1 183877760 183878088 + 1 NA intron (NM_001297669, intron 5 of 18) intron (NM_001297669, intron 5 of 18) 72804 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 117.5-49 chr12 7143495 7143691 + 1 NA intron (NM_014718, intron 12 of 17) intron (NM_014718, intron 12 of 17) 13222 NM_014718 9746 Hs.535378 NM_014718 ENSG00000139182 CLSTN3 CDHR14|CSTN3|alcbeta calsyntenin 3 protein-coding 160.5-207 chr9 77018051 77018366 + 1 NA Intergenic Intergenic -1447 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 238.75-57 chr7 18758967 18759325 + 1 NA intron (NM_058176, intron 13 of 22) intron (NM_058176, intron 13 of 22) 249876 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 197.25-79 chr4 126474270 126474626 + 1 NA Intergenic Intergenic 967189 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 157.5-62 chr14 82367674 82367914 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -274838 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 182.75-54 chr17 59387393 59387649 + 1 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) intron (NM_001005404, intron 2 of 4) 21438 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 138.5-78 chr17 57592567 57592835 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) intron (NM_001322250, intron 7 of 13) 15711 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 151.75-11 chr1 174642114 174642375 + 1 NA intron (NM_001366446, intron 14 of 25) intron (NM_001366446, intron 14 of 25) -58295 NM_001366451 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 258.5-47 chr3 57026403 57026763 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 2 of 12) intron (NM_001128615, intron 2 of 12) -34081 NM_181727 353324 Hs.129794 NM_181727 ENSG00000186451 SPATA12 SRG5 spermatogenesis associated 12 protein-coding 177.75-103 chr3 173834518 173834898 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 86088 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 227.25-50 chr2 210452298 210452606 + 1 NA intron (NR_110605, intron 3 of 5) intron (NR_110605, intron 3 of 5) 24253 NM_001136574 10314 Hs.13351 NM_006055 ENSG00000115365 LANCL1 GPR69A|p40 LanC like 1 protein-coding 128.5-39 chr11 32281673 32281827 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 118650 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 144.5-109 chr2 113690590 113690854 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 30646 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 145.5-56 chr13 93149380 93149614 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -77310 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 228.5-23 chr11 26943564 26944160 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -50250 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 120.25-177 chr5 170305989 170306237 + 1 NA Intergenic Intergenic 6603 NR_147701 100128059 Hs.587351 NR_147701 ENSG00000250274 LOC100128059 - uncharacterized LOC100128059 ncRNA 148.75-178 chr9 29183240 29183401 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 28979 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 176.5-63 chr15 61062143 61062401 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 167030 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 208.5-134 chr7 114553608 114553927 + 1 NA intron (NR_033767, intron 4 of 17) intron (NR_033767, intron 4 of 17) -99578 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 332.25 chr1 92166554 92167151 + 1 NA Intergenic Intergenic -2072 NM_015237 23285 Hs.21554 NM_015237 ENSG00000189195 KIAA1107 - KIAA1107 protein-coding 235.75-79 chr8 119438561 119438964 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 22316 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 161.5-74 chr16 21124271 21124510 + 1 NA intron (NM_001347886, intron 10 of 61) intron (NM_001347886, intron 10 of 61) 26456 NM_001347886 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 143.5-138 chr3 3960607 3960892 + 1 NA Intergenic Intergenic -159874 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 148.5-30 chr10 85421739 85422034 + 1 NA Intergenic Intergenic 10886 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 148.5-242 chr9 30925063 30925230 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 456344 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 158.5-79 chr17 33229733 33229979 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 63132 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 208.5-20 chr11 45228926 45229169 + 1 NA 3' UTR (NM_001256695, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001256695, exon 8 of 8) 57294 NM_001247987 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 165.5-193 chr8 60640957 60641160 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -37682 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 284.25-31 chr9 26978642 26979006 + 1 NA intron (NM_001099224, intron 3 of 13) intron (NM_001099224, intron 3 of 13) 22412 NM_025103 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 195.5-119 chr5 94189150 94189398 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) L1ME1|LINE|L1 -77575 NM_001163417 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 128.5-237 chr9 38119613 38119813 + 1 NA Intergenic Intergenic -50486 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 201.25-24 chr11 110119150 110119447 + 1 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 25906 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 193.75-51 chr15 40225434 40225903 + 1 NA intron (NM_001128629, intron 1 of 9) L1M5|LINE|L1 8240 NM_001128628 106821730 Hs.732375 NM_001128628 ENSG00000259288 BUB1B-PAK6 PAK-5|PAK-6|PAK5|PAK6 BUB1B-PAK6 readthrough protein-coding 318.5-35 chr6 89861636 89862120 + 1 NA intron (NM_012115, intron 6 of 9) AluSx1|SINE|Alu 31978 NM_001137667 9994 Hs.558218 NM_012115 ENSG00000118412 CASP8AP2 CED-4|FLASH|RIP25 caspase 8 associated protein 2 protein-coding 224.5-48 chr16 66950378 66950702 + 1 NA Intergenic Intergenic -10726 NM_001185177 23491 Hs.268700 NM_012122 ENSG00000172828 CES3 ES31 carboxylesterase 3 protein-coding 161.5-32 chr11 36523799 36524094 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -13674 NM_004620 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 173.5-26 chr10 118742167 118742429 + 1 NA intron (NM_153810, intron 1 of 8) intron (NM_153810, intron 1 of 8) 12672 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 188.25-41 chr14 66719677 66720139 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 212501 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 126.25-132 chr4 94627984 94628227 + 1 NA intron (NM_006457, intron 8 of 12) MIR|SINE|MIR 129428 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 291.5-52 chr8 144969063 144969478 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -18390 NM_006958 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 117.25-98 chr18 56762123 56762418 + 1 NA intron (NM_052834, intron 16 of 26) L1ME3B|LINE|L1 110885 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 268.5 chr1 37086272 37086623 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51932 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 191.25-24 chr12 12756320 12756614 + 1 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) intron (NM_001130415, intron 1 of 1) -8182 NR_030344 693198 NR_030344 ENSG00000207983 MIR613 MIRN613|hsa-mir-613 microRNA 613 ncRNA 191.5-28 chr12 20485468 20485778 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -86241 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 132.75-128 chr3 124906804 124907035 + 1 NA intron (NM_033049, intron 11 of 11) intron (NM_033049, intron 11 of 11) -5508 NM_001354766 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 133.5-113 chr2 58921791 58921980 + 1 NA intron (NR_033873, intron 4 of 13) intron (NR_033873, intron 4 of 13) -295823 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 322.5-42 chr8 135660928 135661664 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 203840 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 140.75-126 chr3 179203852 179204133 + 1 NA intron (NM_006218, intron 5 of 20) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 47623 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 156.5-177 chr7 110857938 110858163 + 1 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -232956 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 197.75-61 chr4 106235124 106235408 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 16 of 26) intron (NM_001290768, intron 16 of 26) -80344 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 309.5-13 chr13 89339393 89339765 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -102689 NR_131229 105616982 Hs.564527 NR_131229 ENSG00000232225 LINC01047 - long intergenic non-protein coding RNA 1047 ncRNA 227.5-30 chr14 53207000 53207448 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 53870 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 179.5-54 chr13 87195524 87195919 + 1 NA Intergenic Intergenic 283801 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 185.5-62 chr16 1200482 1200772 + 1 NA intron (NM_001005407, intron 7 of 33) CpG 24641 NM_012467 25823 Hs.592076 NM_012467 ENSG00000116176 TPSG1 PRSS31|TMT|trpA tryptase gamma 1 protein-coding 118.5-112 chr2 210390614 210390792 + 1 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) intron (NR_110606, intron 1 of 4) 65991 NR_110604 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 223.25-34 chr2 49992433 49992754 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) L1MC1|LINE|L1 -18390 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 148.5-58 chr14 42632087 42632357 + 1 NA Intergenic Intergenic 1025366 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 181.5-56 chr17 14058724 14059010 + 1 NA intron (NR_049718, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu 10591 NR_049718 100874058 Hs.720411 NR_049718 ENSG00000236088 COX10-AS1 COX10-AS|COX10AS COX10 antisense RNA 1 ncRNA 187.5-74 chr17 77519874 77520205 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -6962 NR_148967 400622 Hs.514516 NR_148967 LOC400622 - uncharacterized LOC400622 ncRNA 118.5-190 chr7 36144887 36145121 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -8250 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 157.5-227 chr9 87028007 87028285 + 1 NA intron (NR_027471, intron 1 of 1) L1PA16|LINE|L1 13980 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 150.5-75 chr18 70034332 70034582 + 1 NA intron (NM_001318520, intron 39 of 47) L1PREC2|LINE|L1 -77658 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 124.5-5 chr1 39219461 39219680 + 1 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) intron (NM_012090, intron 1 of 92) 135403 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 145.5-8 chr1 69720553 69720791 + 1 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) L1MEg|LINE|L1 151331 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 284.5-37 chr22 32947606 32948072 + 1 NA intron (NM_003490, intron 3 of 13) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 58982 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 254.5-26 chr15 79079856 79080266 + 1 NA intron (NM_001145648, intron 1 of 26) intron (NM_001145648, intron 1 of 26) 10719 NM_001145648 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 172.5-144 chr4 85629702 85629932 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) L1MA9|LINE|L1 -92651 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 149.5-134 chr4 77104263 77104527 + 1 NA Intergenic Intergenic -28406 NM_006835 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 249.5-31 chr14 76016485 76016927 + 1 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) L1M2|LINE|L1 30943 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 251.5-50 chr21 30162443 30162861 + 1 NA Intergenic Intergenic 4153 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 136.75-96 chr2 66099129 66099426 + 1 NA Intergenic Intergenic 259051 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 148.5-33 chr10 103943920 103944168 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -23096 NM_001304743 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 251.25-28 chr2 105651821 105652173 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -41438 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 232.25-45 chr3 58023565 58023933 + 1 NA intron (NM_001164318, intron 1 of 45) intron (NM_001164318, intron 1 of 45) 15327 NM_001164319 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 236.5-87 chr8 36311595 36311954 + 1 NA Intergenic Intergenic -472600 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 296.75-9 chr14 69549817 69550193 + 1 NA Intergenic Intergenic 24866 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 193.25-45 chr17 64202489 64202699 + 1 NA intron (NM_018469, intron 2 of 11) intron (NM_018469, intron 2 of 11) 28140 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 228.75-57 chr4 66001226 66001516 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -275453 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 263.5-47 chr4 124306220 124306556 + 1 NA Intergenic Intergenic 252046 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 287.25-3 chr1 160956663 160957205 + 1 NA Intergenic Intergenic -2125 NM_080878 142683 Hs.385631 NM_080878 ENSG00000158764 ITLN2 HL-2|HL2 intelectin 2 protein-coding 250.25-3 chr10 125507000 125507468 + 1 NA Intergenic Intergenic -67137 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-96 chr3 34785067 34785273 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 608853 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 230.25-69 chr5 133817512 133817848 + 1 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -95997 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 191.75-39 chr14 79248823 79249172 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) LTR36|LTR|ERV1 -30383 NM_138970 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 129.75-2 chr1 28868199 28868468 + 1 NA 3' UTR (NM_000911, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_000911, exon 3 of 3) -18758 NM_001166005 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 320.25-16 chr2 149184258 149184647 + 1 NA intron (NM_001317002, intron 4 of 7) intron (NM_001317002, intron 4 of 7) 66278 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 256.5-74 chr7 89321897 89322388 + 1 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) L1MEg|LINE|L1 -526405 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 174.75-22 chr11 112092472 112092747 + 1 NA intron (NR_077060, intron 4 of 4) L1MB7|LINE|L1 5736 NM_001276506 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 278.5-44 chr6 19260584 19261094 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -80359 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 194.75-22 chr12 81264285 81264618 + 1 NA intron (NM_001282536, intron 27 of 29) intron (NM_001282536, intron 27 of 29) -14738 NR_120491 102724663 Hs.667264 NR_120491 ENSG00000257467 PPFIA2-AS1 - PPFIA2 antisense RNA 1 ncRNA 131.5-108 chr2 43362208 43362405 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 135095 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 235.5-37 chr15 42631204 42631535 + 1 NA intron (NM_020759, intron 3 of 32) AluSx|SINE|Alu 55763 NM_020759 57519 Hs.122061 NM_020759 ENSG00000159433 STARD9 KIF16A StAR related lipid transfer domain containing 9 protein-coding 138.5-71 chr16 9848154 9848371 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 5 of 13) AluSz6|SINE|Alu 333805 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 128.5-216 chr7 140123211 140123380 + 1 NA intron (NM_030647, intron 7 of 19) L1MB7|LINE|L1 53688 NM_030647 80853 Hs.308710 NM_030647 ENSG00000006459 KDM7A JHDM1D lysine demethylase 7A protein-coding 123.5-92 chr2 27279143 27279293 + 1 NA intron (NM_173650, intron 5 of 6) intron (NM_173650, intron 5 of 6) -3211 NM_032546 57159 Hs.516036 NM_032546 ENSG00000138100 TRIM54 MURF|MURF-3|RNF30|muRF3 tripartite motif containing 54 protein-coding 123.25-50 chr13 54138557 54138784 + 1 NA Intergenic Intergenic -5799 NR_108062 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 163.5-99 chr2 164187339 164187565 + 1 NA Intergenic Intergenic 381043 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 178.5-63 chr16 69575908 69576261 + 1 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) AluY|SINE|Alu 10118 NM_006599 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 114.5-39 chr10 69140869 69141058 + 1 NA intron (NM_001318944, intron 3 of 9) L1MC5|LINE|L1 16785 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 162.5-64 chr17 61976433 61976649 + 1 NA intron (NM_005121, intron 16 of 29) L1MB8|LINE|L1 -48559 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 234.5-22 chr13 48354087 48354473 + 1 NA intron (NM_000321, intron 6 of 26) L1MA1|LINE|L1 50533 NM_000321 5925 Hs.408528 NM_000321 ENSG00000139687 RB1 OSRC|PPP1R130|RB|p105-Rb|pRb|pp110 RB transcriptional corepressor 1 protein-coding 223.25-9 chr12 17035388 17035725 + 1 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 46809 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 140.75-111 chr20 32091229 32091452 + 1 NA intron (NM_001172131, intron 10 of 12) MIR|SINE|MIR -18374 NM_014742 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 134.75-85 chr17 6513663 6513970 + 1 NA intron (NM_001165966, intron 2 of 18) L1MB7|LINE|L1 42739 NM_001165966 83394 Hs.183983 NM_031220 ENSG00000091622 PITPNM3 ACKR6|CORD5|NIR1|RDGBA3 PITPNM family member 3 protein-coding 148.25-32 chr12 78236235 78236403 + 1 NA Intergenic LTR107_Mam|LTR|LTR 123427 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 135.75-191 chr8 41273528 41273663 + 1 NA intron (NM_003012, intron 2 of 2) L1MA7|LINE|L1 -2452 NR_049801 100847068 NR_049801 ENSG00000263372 MIR548AO - microRNA 548ao ncRNA 125.75-76 chr18 6912624 6912896 + 1 NA 3' UTR (NM_001366230, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001366230, exon 18 of 18) 17109 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 138.5-165 chr5 146198312 146198521 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5189 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 221.5-77 chr5 68359662 68359920 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 67214 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 199.25-18 chr12 19426132 19426498 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -13177 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 159.25-162 chr9 100785616 100785912 + 1 NA Intergenic Intergenic 207685 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 239.5-76 chr8 47383625 47383918 + 1 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) intron (NR_104581, intron 5 of 16) 122833 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 332.25-24 chr4 30821106 30821626 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 100997 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 218.75-43 chr2 216308328 216308646 + 1 NA intron (NM_020814, intron 1 of 3) intron (NM_020814, intron 1 of 3) 63996 NM_020814 57574 Hs.170388 NM_020814 ENSG00000144583 MARCH4 MARCH-IV|RNF174 membrane associated ring-CH-type finger 4 protein-coding 130.5-78 chr12 48557453 48557644 + 1 NA Intergenic Intergenic 12498 NM_002289 3906 Hs.72938 NM_002289 ENSG00000167531 LALBA LYZG lactalbumin alpha protein-coding 176.5-61 chr14 84838166 84838443 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -433628 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 157.25-111 chr4 163652795 163653062 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 -39394 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 164.5-75 chr15 97057464 97057814 + 1 NA Intergenic Intergenic 274204 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 174.75-60 chr2 75294986 75295200 + 1 NA Intergenic Intergenic -95573 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 147.25-16 chr10 42585698 42586091 + 1 NA intron (NR_130950, intron 4 of 4) intron (NR_130950, intron 4 of 4) -33024 NR_026777 100129482 Hs.278064 NR_026777 ENSG00000234420 ZNF37BP KOX21|ZNF37B zinc finger protein 37B, pseudogene pseudo 139.75-178 chr8 127140893 127141055 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 56653 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 171.5-16 chr10 68587626 68587914 + 1 NA intron (NM_030625, intron 2 of 11) intron (NM_030625, intron 2 of 11) 27433 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 133.75-57 chr14 54270932 54271176 + 1 NA Intergenic Intergenic -125814 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 179.5-15 chr1 226302635 226302839 + 1 NA intron (NM_001270410, intron 1 of 14) intron (NM_001270410, intron 1 of 14) 6427 NM_001366245 286826 Hs.120817 NM_173083 ENSG00000183814 LIN9 BARA|BARPsv|Lin-9|TGS|TGS1|TGS2 lin-9 DREAM MuvB core complex component protein-coding 131.25-160 chr5 28593686 28593884 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -306120 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 251.5-66 chr5 72044078 72044788 + 1 NA Intergenic Intergenic -63042 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 183.5-34 chr11 112576735 112576930 + 1 NA Intergenic Intergenic -21030 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 222.25-46 chr3 116274094 116274464 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -85745 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 250.25-54 chrUn_KI270519v1 62907 63216 + 1 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 327.25-24 chr5 141785517 141786177 + 1 NA Intergenic Intergenic 80355 NM_001278615 5097 Hs.79769 NM_002587 ENSG00000156453 PCDH1 PC42|PCDH42 protocadherin 1 protein-coding 294.75-42 chr9 91770347 91770770 + 1 NA intron (NM_001318204, intron 2 of 7) intron (NM_001318204, intron 2 of 7) -134213 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 136.5-111 chr2 65376224 65376451 + 1 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) -9559 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 279.5-3 chr1 65763324 65763735 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -28981 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 187.5-21 chr10 82193334 82193670 + 1 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 39418 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 228.25-23 chr14 43481637 43482093 + 1 NA Intergenic Intergenic 1025418 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 157.5-91 chr19 40033235 40033458 + 1 NA 3' UTR (NM_001005851, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001005851, exon 5 of 5) 22885 NM_001005851 163131 Hs.101139 NM_001005851 ENSG00000128000 ZNF780B ZNF779 zinc finger protein 780B protein-coding 200.25-47 chr18 518483 518712 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -3303 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 194.5-19 chr10 114121119 114121371 + 1 NA non-coding (NR_135815, exon 16 of 16) non-coding (NR_135815, exon 16 of 16) 52934 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 252.5-30 chr16 66476957 66477409 + 1 NA promoter-TSS (NR_109960) promoter-TSS (NR_109960) -781 NR_109960 101927726 Hs.739193 NR_109960 ENSG00000261656 BEAN1-AS1 CTD-2258A20.5 BEAN1 antisense RNA 1 ncRNA 136.5-101 chr2 31216222 31216388 + 1 NA intron (NM_001321270, intron 2 of 21) intron (NM_001321270, intron 2 of 21) 1210 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 116.5-115 chr2 60518097 60518263 + 1 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) 35318 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 195.75-7 chr1 74142608 74142837 + 1 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) intron (NM_001105659, intron 4 of 7) 55454 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 196.75-13 chr10 55704458 55704838 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -76706 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 145.25-66 chr19 24348749 24348947 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -185401 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 220.25-58 chr4 107361731 107361997 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -325551 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 174.75-61 chr2 110898938 110899219 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) L1MDa|LINE|L1 166505 NM_001371254 216.5-111 chr7 133122728 133123114 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -14410 NR_133931 105375512 Hs.521205 NR_133931 LOC105375512 - uncharacterized LOC105375512 ncRNA 146.5-32 chr10 72213065 72213277 + 1 NA intron (NM_001369105, intron 2 of 10) intron (NM_001369105, intron 2 of 10) 2785 NM_001369111 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 165.5-78 chr2 72096213 72096498 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 51507 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 230.5-95 chr4 188308198 188308489 + 1 NA Intergenic Intergenic -147235 NR_033869 401164 Hs.435756 NR_033869 ENSG00000249378 LINC01060 - long intergenic non-protein coding RNA 1060 ncRNA 129.5-38 chr11 41740246 41740469 + 1 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 25789 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 186.5-126 chr7 52560945 52561208 + 1 NA Intergenic Intergenic -474557 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 176.25-92 chr3 65883673 65883903 + 1 NA intron (NR_145422, intron 2 of 2) intron (NR_145422, intron 2 of 2) -10028 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 170.5-142 chr5 28593994 28594233 + 1 NA Intergenic Intergenic -306448 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 128.75-109 chr20 40610903 40611152 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 78209 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 174.5-104 chr2 222758369 222758578 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 86815 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 239.25-23 chr13 29188227 29188580 + 1 NA intron (NM_001033602, intron 3 of 13) LTR55|LTR|ERVL? 163946 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 224.75-67 chr7 36836987 36837348 + 1 NA Intergenic Intergenic 82265 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 151.75-134 chr6 161449030 161449288 + 1 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) intron (NM_004562, intron 9 of 11) -21818 NR_134594 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 151.25-119 chr3 14132679 14132881 + 1 NA intron (NM_024334, intron 5 of 11) intron (NM_024334, intron 5 of 11) 7840 NM_024334 79188 Hs.517817 NM_024334 ENSG00000170876 TMEM43 ARVC5|ARVD5|EDMD7|LUMA transmembrane protein 43 protein-coding 133.75-140 chr3 142128283 142128517 + 1 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 21144 NM_001178139 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 130.25-189 chr7 55651025 55651227 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 36906 NR_027340 360132 Hs.446691 NM_182827 ENSG00000176826 FKBP9P1 FKBP9L FKBP prolyl isomerase 9 pseudogene 1 pseudo 186.25-34 chr15 49457011 49457379 + 1 NA intron (NM_002009, intron 2 of 3) intron (NM_002009, intron 2 of 3) 33953 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 169.5-84 chr2 197810622 197810847 + 1 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 6141 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 150.5-70 chr18 13355522 13355797 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 71875 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 185.75-58 chr2 11756203 11756421 + 1 NA intron (NM_001349204, intron 2 of 21) intron (NM_001349204, intron 2 of 21) 7779 NM_001349205 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 152.5-45 chr14 50829986 50830358 + 1 NA intron (NM_016350, intron 2 of 28) CpG 949 NM_016350 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 182.25-81 chr3 106918712 106918981 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 321792 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 126.5-140 chr21 36175746 36175978 + 1 NA intron (NM_005128, intron 2 of 36) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 11321 NM_005128 9980 Hs.204575 NM_005128 ENSG00000142197 DOP1B 21orf5|C21orf5|DOPEY2 DOP1 leucine zipper like protein B protein-coding 252.5-38 chr2 22782359 22782788 + 1 NA Intergenic Intergenic 246094 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 200.5-3 chr1 54677849 54678221 + 1 NA intron (NM_001039464, intron 10 of 23) L1ME3A|LINE|L1 36249 NM_001039464 374977 Hs.412482 NM_198547 ENSG00000184313 MROH7 C1orf175|HEATR8 maestro heat like repeat family member 7 protein-coding 185.25-119 chr7 106680592 106680817 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -19546 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 126.5-129 chr20 21834822 21835019 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 129256 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 119.25-161 chr5 75388908 75389123 + 1 NA intron (NM_031361, intron 11 of 16) intron (NM_031361, intron 11 of 16) 51795 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 219.25-45 chr22 35260815 35261053 + 1 NA intron (NM_001362972, intron 1 of 9) intron (NM_001362972, intron 1 of 9) 3441 NM_001362972 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 138.25-79 chr2 11606319 11606577 + 1 NA intron (NM_014668, intron 17 of 32) L1ME1|LINE|L1 63747 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 199.5-113 chr4 146419951 146420302 + 1 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) intron (NM_001317816, intron 4 of 10) 11543 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 212.25-106 chr9 128529160 128529405 + 1 NA intron (NM_001499, intron 9 of 13) L2|LINE|L2 -23305 NM_001363765 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 209.75-34 chr16 64655111 64655544 + 1 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 466736 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 166.5-124 chr22 22933664 22933846 + 1 NA Intergenic Intergenic 45939 NM_001178126 100423062 Hs.449574 NM_001178126 ENSG00000254709 IGLL5 IGL|IGLV|VL-MAR immunoglobulin lambda like polypeptide 5 protein-coding 125.25-14 chr1 181085061 181085267 + 1 NA Intergenic Intergenic -3536 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 148.5-53 chr13 88701012 88701275 + 1 NA Intergenic Intergenic 74290 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 364.5-11 chr2 164468431 164469105 + 1 NA Intergenic Intergenic 99727 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 166.5-57 chr13 92194289 92194528 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MIRb|SINE|MIR 157799 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 144.5-60 chr14 49622467 49622897 + 1 NA 3' UTR (NM_002408, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_002408, exon 1 of 1) 1883 NM_002408 4247 Hs.93338 NM_002408 ENSG00000168282 MGAT2 CDG2A|CDGS2|GLCNACTII|GNT-II|GNT2 mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 172.25 chr1 10086465 10086789 + 1 NA intron (NM_006048, intron 2 of 26) intron (NM_006048, intron 2 of 26) 53669 NM_006048 10277 Hs.593974 NM_006048 ENSG00000130939 UBE4B E4|HDNB1|UBOX3|UFD2|UFD2A ubiquitination factor E4B protein-coding 126.5-118 chr2 120708046 120708245 + 1 NA Intergenic Intergenic -27723 NM_001371271 320.25-21 chr5 161008846 161009380 + 1 NA Intergenic Intergenic -70487 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 137.75-4 chr1 69147901 69148096 + 1 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) intron (NR_146608, intron 3 of 4) 92100 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 303.75-14 chr17 30213873 30214363 + 1 NA intron (NM_001045, intron 8 of 14) intron (NM_001045, intron 8 of 14) 21579 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 186.75-7 chr1 169800978 169801424 + 1 NA intron (NM_001366772, intron 3 of 22) AluSq2|SINE|Alu 6161 NM_001366772 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 194.5-131 chr6 127155189 127155400 + 1 NA exon (NM_032784, exon 4 of 5) exon (NM_032784, exon 4 of 5) 36623 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 132.5-217 chr6 142224875 142225050 + 1 NA TTS (NM_016485) TTS (NM_016485) -76957 NM_001032395 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 163.5-94 chr2 127986322 127986630 + 1 NA intron (NM_001330299, intron 14 of 20) intron (NM_001330299, intron 14 of 20) 40819 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 228.25-65 chr5 14215695 14215959 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 72485 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 141.5-26 chr11 80810373 80810577 + 1 NA Intergenic Intergenic -47672 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 259.25-7 chr12 18305906 18306417 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 5 of 32) intron (NM_001288774, intron 5 of 32) 44621 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 121.5-27 chr10 31357475 31357663 + 1 NA intron (NM_001323658, intron 2 of 8) intron (NM_001323658, intron 2 of 8) 35909 NM_001323676 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 204.75-41 chr15 75846592 75846922 + 1 NA intron (NM_001145335, intron 1 of 12) intron (NM_001145335, intron 1 of 12) 2713 NM_001145335 92912 Hs.23033 NM_173469 ENSG00000140367 UBE2Q2 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 protein-coding 264.25-16 chr15 59027600 59028002 + 1 NA intron (NM_001270530, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 39655 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 229.25-85 chr8 133044074 133044348 + 1 NA intron (NM_001282964, intron 5 of 6) intron (NM_001282964, intron 5 of 6) 2370 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 185.25-111 chr6 53143228 53143592 + 1 NA intron (NM_003643, intron 2 of 5) intron (NM_003643, intron 2 of 5) 5431 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 263.25-52 chr7 93947119 93947542 + 1 NA Intergenic Intergenic 25595 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 153.5-55 chr14 54232557 54232807 + 1 NA Intergenic Intergenic -164186 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 172.5-133 chr3 181948180 181948500 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -4024 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 206.75 chr1 2831334 2831653 + 1 NA Intergenic Intergenic -30625 NM_001242672 100287898 Hs.632363 NM_001242672 ENSG00000215912 TTC34 - tetratricopeptide repeat domain 34 protein-coding 143.5-228 chr9 74252772 74252964 + 1 NA Intergenic Intergenic -118663 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 169.5-104 chr3 35979444 35979745 + 1 NA Intergenic Intergenic 235118 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 158.25-71 chr2 200634696 200635121 + 1 NA exon (NM_001159, exon 21 of 35) exon (NM_001159, exon 21 of 35) 48894 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 113.25-37 chr12 56250577 56250696 + 1 NA intron (NM_173595, intron 15 of 27) FLAM_C|SINE|Alu 7748 NM_173595 283373 Hs.524506 NM_173595 ENSG00000139645 ANKRD52 ANKRD33 ankyrin repeat domain 52 protein-coding 130.75-61 chr15 66671811 66672101 + 1 NA intron (NR_110372, intron 3 of 4) intron (NR_110372, intron 3 of 4) -30280 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 275.5-71 chr9 37600531 37601108 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2410 NM_001371225 179.5-30 chr10 120622580 120622867 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 24774 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 117.25-97 chr18 53287123 53287330 + 1 NA intron (NM_005215, intron 12 of 28) L1MB7|LINE|L1 50125 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 243.5-92 chr9 99174057 99174399 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 47714 NM_033087 85365 Hs.40919 NM_033087 ENSG00000119523 ALG2 CDG1I|CDGIi|CMS14|CMSTA3|NET38|hALPG2 ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferase protein-coding 157.5-146 chr4 64452574 64452743 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -43198 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 168.25-129 chr7 3200987 3201236 + 1 NA Intergenic Intergenic -42538 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 163.5-130 chr3 116438796 116439027 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) 6576 NM_002338 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 292.5-50 chr8 52113049 52113624 + 1 NA exon (NM_001352827, exon 27 of 27) exon (NM_001352827, exon 27 of 27) -81026 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 241.75-65 chr5 156449833 156450192 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) intron (NM_001128209, intron 2 of 7) 122848 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 311.75-5 chr11 79072305 79072743 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) intron (NM_001098816, intron 4 of 33) 329585 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 127.75-129 chr3 96765591 96765961 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -48818 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 180.75-85 chr3 6449388 6449891 + 1 NA Intergenic Intergenic 355810 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 203.5-99 chr3 197253962 197254254 + 1 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) L1MEg2|LINE|L1 39840 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 176.75-24 chr12 24303609 24303974 + 1 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 80520 NR_120473 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 291.25-24 chr5 26111396 26111912 + 1 NA Intergenic Intergenic 920701 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 173.75-58 chr14 102927288 102927494 + 1 NA intron (NM_030943, intron 3 of 11) intron (NM_030943, intron 3 of 11) 4735 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 355.75 chr1 46802284 46802731 + 1 NA intron (NM_001319163, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 3461 NM_001319161 1580 Hs.436317 NM_000779 ENSG00000142973 CYP4B1 CYPIVB1|P-450HP cytochrome P450 family 4 subfamily B member 1 protein-coding 143.5-127 chr2 228841570 228841763 + 1 NA Intergenic Intergenic -230271 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 140.5-237 chr8 121005787 121005971 + 1 NA Intergenic Intergenic -193833 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 264.75-14 chr16 1525545 1526113 + 1 NA intron (NM_014714, intron 21 of 30) intron (NM_014714, intron 21 of 30) -2849 NM_001256541 79652 Hs.459652 NM_024600 ENSG00000131634 TMEM204 C16orf30|CLP24 transmembrane protein 204 protein-coding 194.5-89 chr3 82495812 82496143 + 1 NA Intergenic Intergenic 509835 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 198.25-29 chr14 46842606 46842922 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 16 of 16) intron (NM_001113498, intron 16 of 16) -190983 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 269.5-55 chr7 46968651 46969038 + 1 NA Intergenic Intergenic -271722 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 174.5-27 chr10 113495627 113495877 + 1 NA Intergenic Intergenic -55079 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 137.5-113 chr2 44784158 44784316 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 154651 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 313.5-27 chr4 153328805 153329196 + 1 NA intron (NM_001351057, intron 12 of 12) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -15649 NM_001253861 84057 Hs.294088 NM_032117 ENSG00000121211 MND1 GAJ meiotic nuclear divisions 1 protein-coding 147.25-131 chr7 49201028 49201301 + 1 NA Intergenic Intergenic 276617 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 297.5-19 chr15 44023734 44024482 + 1 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -145937 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 128.25-171 chr6 40180627 40180874 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 175256 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 221.25-66 chr4 154701141 154701432 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -39555 NM_001301645 9227 Hs.658427 NM_004744 ENSG00000121207 LRAT LCA14 lecithin retinol acyltransferase protein-coding 327.25-19 chr5 37666251 37666944 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 168225 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 139.75-66 chr16 53307476 53307749 + 1 NA intron (NM_001352157, intron 31 of 37) intron (NM_001352157, intron 31 of 37) 63600 NM_001347693 643802 Hs.451336 NM_001207030 LOC643802 - u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein MPP10-like protein-coding 213.5-7 chr1 113971365 113971695 + 1 NA intron (NM_198268, intron 14 of 15) L2c|LINE|L2 -7861 NM_001286353 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 344.25-10 chr2 8821950 8822475 + 1 NA intron (NM_001348732, intron 2 of 28) intron (NM_001348732, intron 2 of 28) 15401 NM_001348734 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 340.75-16 chr22 45475896 45476354 + 1 NA Intergenic Intergenic -26758 NM_006486 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 217.75-57 chr5 18095211 18095537 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 288100 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 126.25-131 chr4 94588945 94589182 + 1 NA TTS (NM_001011515) TTS (NM_001011515) 137121 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 117.5-206 chr6 54598822 54598982 + 1 NA Intergenic Intergenic -247869 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 137.25-17 chr10 72469482 72469653 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) 54419 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 301.75-17 chr2 11118377 11118788 + 1 NA intron (NR_040080, intron 6 of 8) THE1A|LTR|ERVL-MaLR 13594 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 211.5-58 chr16 82064685 82065097 + 1 NA intron (NM_002153, intron 1 of 4) intron (NM_002153, intron 1 of 4) 29638 NM_002153 3294 Hs.162795 NM_002153 ENSG00000086696 HSD17B2 EDH17B2|HSD17|SDR9C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 2 protein-coding 213.5-102 chr5 105585244 105585590 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 485943 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 221.25-81 chr7 19265657 19266145 + 1 NA Intergenic Intergenic -120480 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 153.5-34 chr11 48291210 48291462 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -14887 NM_001004725 256148 Hs.553657 NM_001004725 ENSG00000176555 OR4S1 OR11-100 olfactory receptor family 4 subfamily S member 1 protein-coding 163.25-68 chr2 133886412 133886742 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -233358 NM_001371457 185.75-105 chr6 63957155 63957513 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 150498 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 233.75-43 chr2 175146694 175146989 + 1 NA intron (NR_045773, intron 2 of 13) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 20868 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 172.75-102 chr5 119269787 119270004 + 1 NA intron (NM_001077654, intron 1 of 1) intron (NM_001077654, intron 1 of 1) 1136 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 291.5-29 chr3 57084496 57084821 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5390 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 162.75-139 chr8 59758115 59758282 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 523202 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 196.5-178 chrX 21460166 21460541 + 1 NA intron (NM_001168648, intron 4 of 20) L2|LINE|L2 85935 NM_001330773 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 321.25-15 chr20 50266238 50266603 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1066 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 125.5-268 chr9 8038167 8038308 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -238459 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 253.25-54 chr5 64974868 64975184 + 1 NA intron (NM_001297644, intron 12 of 12) intron (NM_001297644, intron 12 of 12) 206096 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 184.25-12 chr1 208009833 208010099 + 1 NA Intergenic Intergenic -98841 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 323.5-25 chr6 120056909 120057440 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 41995 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 253.75-7 chr12 91783126 91783648 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 358326 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 205.5-96 chr3 98609248 98609575 + 1 NA Intergenic Intergenic -15800 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 113.5-53 chr12 15271415 15271569 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50075 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 179.5-122 chr3 69885581 69885878 + 1 NA intron (NM_198159, intron 2 of 9) MER106A|DNA|hAT-Charlie 19505 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 120.5-44 chr11 90441567 90441820 + 1 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 114164 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 312.75-22 chr3 40598413 40598949 + 1 NA Intergenic Intergenic 73721 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 165.5-163 chr6 54868105 54868390 + 1 NA intron (NM_001010872, intron 1 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie 21476 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 351.5-28 chr8 30256265 30257075 + 1 NA Intergenic Intergenic 100301 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 168.25-42 chr14 57987398 57987605 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -121409 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 194.25-35 chr15 45253447 45253660 + 1 NA intron (NM_004212, intron 3 of 17) intron (NM_004212, intron 3 of 17) 1319 NM_004212 9153 Hs.367833 NM_004212 ENSG00000137860 SLC28A2 CNT2|HCNT2|HsT17153|SPNT1 solute carrier family 28 member 2 protein-coding 227.25-53 chr3 63519485 63519772 + 1 NA intron (NM_001130003, intron 3 of 5) intron (NM_001130003, intron 3 of 5) 30423 NR_046677 100874016 Hs.441275 NR_046677 ENSG00000241359 SYNPR-AS1 - SYNPR antisense RNA 1 ncRNA 116.75-39 chr11 79947039 79947169 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -506074 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 114.75-189 chr8 66632875 66633089 + 1 NA 3' UTR (NM_025054, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_025054, exon 3 of 3) -19764 NM_001080416 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 238.5-86 chr7 12549030 12549499 + 1 NA Intergenic Intergenic -21456 NR_156701 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 304.25-17 chr3 89537824 89538164 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 430373 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 172.25-128 chr6 156266104 156266296 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -112550 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 244.75-10 chr10 121445465 121445745 + 1 NA Intergenic Intergenic 85709 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 193.5-64 chr17 52785973 52786276 + 1 NA Intergenic Intergenic -75997 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 397.25-5 chr2 96149043 96149586 + 1 NA Intergenic Intergenic -3874 NM_004418 1844 Hs.1183 NM_004418 ENSG00000158050 DUSP2 PAC-1|PAC1 dual specificity phosphatase 2 protein-coding 144.5-194 chr7 4435360 4435515 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -246858 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 170.75-13 chr10 69631119 69631397 + 1 NA intron (NM_145306, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 1011 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 258.75-74 chr8 47313822 47314202 + 1 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) L1ME2z|LINE|L1 53074 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 112.25-18 chr10 48668764 48668957 + 1 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -12595 NR_045675 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 196.5-120 chr5 8557428 8557839 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 96708 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 159.75-179 chr8 139865297 139865549 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) L2a|LINE|L2 -162300 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 204.75-102 chr6 118016580 118017025 + 1 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) -69101 NR_134601 105377967 Hs.692865 NR_134601 LOC105377967 - uncharacterized LOC105377967 ncRNA 148.75-51 chr14 33623133 33623433 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -85654 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 180.75-134 chr6 144781867 144782170 + 1 NA exon (NM_007124, exon 60 of 74) exon (NM_007124, exon 60 of 74) 376363 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 238.5-75 chr5 149818385 149818806 + 1 NA intron (NM_001172699, intron 1 of 10) intron (NM_001172699, intron 1 of 10) 46655 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 193.5-52 chr14 100543077 100543376 + 1 NA intron (NM_001159531, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 24844 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 176.75-10 chr1 203439678 203440028 + 1 NA Intergenic Intergenic -35953 NM_201348 5549 Hs.632481 NM_002725 ENSG00000188783 PRELP MST161|MSTP161|SLRR2A proline and arginine rich end leucine rich repeat protein protein-coding 160.5-201 chr9 25536393 25536657 + 1 NA Intergenic Intergenic 142333 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 236.75-63 chr8 137311091 137311436 + 1 NA Intergenic Intergenic 102325 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 163.5-172 chr6 68219767 68220183 + 1 NA Intergenic Intergenic 109924 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 246.25-49 chr4 61193835 61194307 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -7159 NM_001371343 199.5-26 chr11 131008103 131008404 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -91766 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 162.5-108 chr3 21729466 21729796 + 1 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) intron (NM_024697, intron 1 of 7) 21579 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 140.25-24 chr10 70137609 70137802 + 1 NA TTS (NR_073595) TTS (NR_073595) -4771 NM_001198696 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 340.25-4 chr11 19985683 19986240 + 1 NA intron (NM_182964, intron 11 of 37) intron (NM_182964, intron 11 of 37) -36595 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 189.25-4 chr1 93573071 93573380 + 1 NA intron (NM_001308251, intron 4 of 7) AluSz6|SINE|Alu 11937 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 205.25-88 chr5 114609601 114610029 + 1 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) L1MA5A|LINE|L1 33774 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 193.5-151 chr7 56680955 56681289 + 1 NA Intergenic Intergenic 131614 NR_130727 401357 Hs.457696 NR_130727 LOC401357 - uncharacterized LOC401357 ncRNA 138.25-88 chr2 119832695 119833036 + 1 NA intron (NM_002830, intron 2 of 26) L1M5|LINE|L1 72943 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 237.5-29 chr14 45036015 45036413 + 1 NA intron (NR_131765, intron 11 of 19) intron (NR_131765, intron 11 of 19) -47902 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 143.75-18 chr10 66534897 66535082 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -391047 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 222.25-56 chr4 30651769 30652216 + 1 NA Intergenic Intergenic -68377 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 288.25-12 chr17 26884114 26884438 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 204965 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 232.5-95 chr7 51142740 51143062 + 1 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) intron (NM_015198, intron 5 of 12) 173908 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 275.25-53 chr9 120996578 120996962 + 1 NA intron (NM_001735, intron 21 of 40) intron (NM_001735, intron 21 of 40) -43939 NR_148450 110599590 NR_148450 C5-OT1 C5T1LNCRNA C5 3' UTR overlapping transcript 1 ncRNA 227.75-15 chr11 112054749 112055009 + 1 NA intron (NM_001931, intron 11 of 13) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 19292 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 142.75-157 chr5 116569143 116569389 + 1 NA intron (NM_001300780, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 -5152 NR_147170 105379132 NR_147170 SEMA6A-AS2 - SEMA6A antisense RNA 2 ncRNA 252.5-82 chr8 100844003 100844326 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 106407 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 140.75-26 chr11 75402969 75403181 + 1 NA intron (NM_001260507, intron 3 of 5) intron (NM_001260507, intron 3 of 5) -1346 NR_000025 114599 Hs.689080 NR_000025 ENSG00000207445 SNORD15B RNU15B|U15B small nucleolar RNA, C/D box 15B snoRNA 135.5-111 chr2 142279491 142279723 + 1 NA Intergenic Intergenic -147906 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 169.75-105 chr3 103427196 103427430 + 1 NA Intergenic Intergenic 96803 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 160.5-90 chr2 142530056 142530216 + 1 NA Intergenic Intergenic -347528 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 142.25-54 chr14 25892833 25893144 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 660442 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 124.5-78 chr17 12957983 12958234 + 1 NA intron (NM_001321164, intron 15 of 20) intron (NM_001321164, intron 15 of 20) -40766 NR_039747 100616494 NR_039747 ENSG00000265503 MIR1269B - microRNA 1269b ncRNA 115.75-64 chr14 60068949 60069193 + 1 NA Intergenic Intergenic -22840 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 188.75-98 chr6 114569231 114569648 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -506562 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 283.5-19 chr15 60663173 60663497 + 1 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -18234 NR_120319 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 160.5-49 chr14 40909869 40910114 + 1 NA Intergenic LTR38A1|LTR|ERV1 -44720 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 204.5-12 chr10 64977293 64977576 + 1 NA Intergenic Intergenic -52916 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 278.5-21 chr17 64552329 64552705 + 1 NA intron (NM_022739, intron 15 of 18) intron (NM_022739, intron 15 of 18) 45540 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 167.5-153 chr5 155588440 155588739 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 574834 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 123.25-159 chr5 50573578 50573762 + 1 NA Intergenic Intergenic -92261 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 240.25-49 chr4 104550241 104550701 + 1 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 -55577 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 150.5-28 chr11 72933596 72933766 + 1 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 119270 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 287.75-46 chr7 12559569 12560023 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -10924 NR_156701 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 185.5-10 chr1 175161382 175161874 + 1 NA intron (NM_001162895, intron 2 of 2) intron (NM_001162895, intron 2 of 2) 31148 NM_001162895 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 140.5-201 chr6 135357457 135357729 + 1 NA intron (NM_017651, intron 23 of 27) intron (NM_017651, intron 23 of 27) 118433 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 265.5-2 chr1 77922384 77922908 + 1 NA intron (NM_001172309, intron 4 of 11) AluY|SINE|Alu -33107 NR_103535 374987 Hs.632414 NM_199343 ENSG00000235927 NEXN-AS1 C1orf118 NEXN antisense RNA 1 ncRNA 277.25-29 chr3 100165438 100165828 + 1 NA intron (NM_001167924, intron 4 of 9) L1ME5|LINE|L1 -20191 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 238.5-78 chr6 36470304 36470601 + 1 NA intron (NM_001286579, intron 2 of 4) intron (NM_001286579, intron 2 of 4) 27452 NM_001286579 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 125.5-98 chr16 65374261 65374426 + 1 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) MER58B|DNA|hAT-Charlie -197770 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 163.5-64 chr16 17387218 17387625 + 1 NA intron (NM_022166, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 83539 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 125.5-128 chr2 75926424 75926597 + 1 NA Intergenic Intergenic -215595 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 200.5-142 chr8 143446142 143446470 + 1 NA intron (NM_015117, intron 9 of 11) L1M5|LINE|L1 -15574 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 118.75-39 chr12 7012651 7012897 + 1 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 5702 NM_005768 10162 Hs.655248 NM_005768 ENSG00000111684 LPCAT3 C3F|LPCAT|LPLAT 5|LPSAT|MBOAT5|OACT5|nessy lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 protein-coding 113.75-139 chr4 99358356 99358519 + 1 NA Intergenic Intergenic -5691 NR_133005 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 210.5-73 chr20 39056399 39056680 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 94195 NM_001190809 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 227.5-10 chr10 24498262 24498650 + 1 NA intron (NM_001321681, intron 4 of 13) intron (NM_001321681, intron 4 of 13) 31925 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 174.5-146 chr5 42279730 42279951 + 1 NA Intergenic Intergenic -104495 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 236.75-29 chr2 115052091 115052420 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1MB5|LINE|L1 -12318 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 159.5-71 chr16 82831191 82831379 + 1 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 57966 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 265.25-60 chrX 152215052 152215368 + 1 NA intron (NM_000808, intron 6 of 9) L1PB|LINE|L1 -76632 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 216.5-104 chr7 1575210 1575613 + 1 NA intron (NR_027329, intron 2 of 4) intron (NR_027329, intron 2 of 4) 5338 NR_021487 114796 Hs.436146 NR_021487 ENSG00000230487 PSMG3-AS1 - PSMG3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 120.5-121 chr2 118329760 118329940 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -143464 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 268.5-26 chr18 54702733 54703051 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 111733 NM_173629 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 198.5-6 chr1 211846787 211847275 + 1 NA TTS (NR_135818) TTS (NR_135818) 16070 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 180.75-29 chr12 55316722 55317084 + 1 NA Intergenic Intergenic -3697 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 167.5-44 chr12 17729747 17730040 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 56594 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 168.5-54 chr14 40194661 40194944 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -759909 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 234.25-81 chr9 78384831 78385173 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 87877 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 218.5-26 chr11 46364682 46364987 + 1 NA intron (NM_001105540, intron 1 of 31) intron (NM_001105540, intron 1 of 31) 3228 NM_001105540 8525 Hs.502461 NM_003646 ENSG00000149091 DGKZ DAGK5|DAGK6|DGK-ZETA|hDGKzeta diacylglycerol kinase zeta protein-coding 119.5-189 chr5 163686635 163686794 + 1 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy 181095 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 334.75-11 chr18 47215238 47215721 + 1 NA intron (NM_001278063, intron 7 of 8) intron (NM_001278063, intron 7 of 8) 36181 NM_001037802 652991 Hs.585834 NM_001037802 ENSG00000215474 SKOR2 CH18515|CORL2|FUSSEL18 SKI family transcriptional corepressor 2 protein-coding 178.75-71 chr4 56799284 56799664 + 1 NA Intergenic Intergenic 21999 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 182.25-126 chr8 131684442 131684698 + 1 NA Intergenic Intergenic -219523 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 168.75-3 chr1 43249079 43249297 + 1 NA intron (NM_001195831, intron 23 of 23) AluY|SINE|Alu -20795 NM_144626 128218 Hs.104476 NM_144626 ENSG00000179178 TMEM125 - transmembrane protein 125 protein-coding 317.25-29 chr6 123721817 123722291 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -81792 NM_001300738 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 174.75-100 chr5 64217416 64217778 + 1 NA 3' UTR (NM_178532, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_178532, exon 5 of 5) 51754 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 175.5-117 chr3 52563748 52563951 + 1 NA intron (NM_001366074, intron 26 of 30) intron (NM_001366074, intron 26 of 30) 27244 NM_001124767 440957 Hs.660577 NM_001124767 ENSG00000168273 SMIM4 C3orf78 small integral membrane protein 4 protein-coding 160.25-35 chr14 46205817 46206062 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1MB1|LINE|L1 141780 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 180.5-83 chr21 19213493 19213716 + 1 NA Intergenic Intergenic -453792 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 256.5-48 chr3 193043922 193044374 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -126292 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 169.5-31 chr12 7617275 7617613 + 1 NA Intergenic Intergenic 48464 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 334.5-9 chr19 37498393 37498804 + 1 NA intron (NR_110723, intron 2 of 2) AluSg4|SINE|Alu -8341 NM_001013659 390927 Hs.568010 NM_001013659 ENSG00000188227 ZNF793 - zinc finger protein 793 protein-coding 218.5-6 chr1 67253913 67254269 + 1 NA intron (NM_144701, intron 9 of 10) AluSz6|SINE|Alu -53273 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 181.5-131 chr5 31633538 31633795 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5465 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 207.5-77 chr4 70486795 70487148 + 1 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 14774 NM_152291 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 207.75-115 chr6 163264131 163264496 + 1 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) 60160 NR_028390 285796 Hs.668693 NR_028390 ENSG00000281692 PACRG-AS1 - PACRG antisense RNA 1 ncRNA 211.5-53 chr14 66233933 66234346 + 1 NA Intergenic Intergenic -252232 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 297.75-23 chr20 36802658 36803135 + 1 NA exon (NM_080627, exon 11 of 15) exon (NM_080627, exon 11 of 15) -29133 NM_001145317 79980 Hs.632268 NM_024918 ENSG00000149636 DSN1 C20orf172|KNL3|MIS13|dJ469A13.2|hKNL-3 DSN1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 157.75-4 chr1 186632205 186632547 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 48047 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 234.5-86 chr7 38294945 38295275 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -21463 NM_001003806 445347 Hs.534032 NM_001003799 TARP CD3G|TCRG|TCRGC1|TCRGC2|TCRGV TCR gamma alternate reading frame protein protein-coding 119.5-76 chr14 49558111 49558291 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 28179 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 248.75-34 chr2 164477482 164477837 + 1 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 90836 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 130.25-191 chr7 95350054 95350229 + 1 NA Intergenic Intergenic -25609 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 208.75-57 chr3 167795847 167796111 + 1 NA intron (NM_001122752, intron 5 of 8) intron (NM_001122752, intron 5 of 8) 60256 NM_005025 5274 Hs.478153 NM_005025 ENSG00000163536 SERPINI1 PI12|neuroserpin serpin family I member 1 protein-coding 159.5-20 chr10 34655404 34655630 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 159779 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 199.5-114 chr4 159797746 159798033 + 1 NA Intergenic Intergenic -20105 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 215.75-36 chr15 58492554 58492909 + 1 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 6004 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 167.5-11 chr1 111665604 111665813 + 1 NA intron (NM_001370217, intron 1 of 7) intron (NM_001370217, intron 1 of 7) 914 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 117.25-30 chr10 84738714 84738956 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 313666 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 132.75-132 chr4 3070777 3070952 + 1 NA intron (NR_045414, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 3650 NR_045414 100750326 Hs.575112 NR_045414 HTT-AS HTT-AS1|HTTAS HTT antisense RNA ncRNA 267.75-14 chr14 51890274 51890925 + 1 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) 27972 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 141.5-231 chr8 86548830 86549043 + 1 NA intron (NM_003909, intron 12 of 16) intron (NM_003909, intron 12 of 16) 34501 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 161.75-67 chr2 139768144 139768365 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 818431 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 208.75-91 chrX 87390340 87390698 + 1 NA Intergenic Intergenic -127283 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 139.25-128 chr3 164468637 164468802 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -297163 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 140.5-188 chr5 159490684 159490961 + 1 NA Intergenic Intergenic -24546 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 121.25-155 chr5 4572646 4572816 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -200750 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 253.25-36 chr2 240264294 240264760 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -123869 NM_148961 150677 Hs.148586 NM_148961 ENSG00000178602 OTOS OTOSP otospiralin protein-coding 170.75-35 chr14 58336552 58336751 + 1 NA intron (NM_002892, intron 11 of 23) intron (NM_002892, intron 11 of 23) 38096 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 174.25-116 chr4 106543663 106543869 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 110142 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 237.25-7 chr1 214952187 214952689 + 1 NA Intergenic Intergenic -53104 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 114.75-58 chr14 86257761 86257924 + 1 NA Intergenic Intergenic 323164 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 228.5-94 chr7 2359658 2359944 + 1 NA intron (NM_001037283, intron 1 of 18) MER21C|LTR|ERVL 4974 NM_001037283 8662 Hs.371001 NM_003751 ENSG00000106263 EIF3B EIF3-ETA|EIF3-P110|EIF3-P116|EIF3S9|PRT1 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B protein-coding 278.5-63 chr9 70570188 70570658 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) AluSz|SINE|Alu -155766 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 158.5-117 chr20 48780817 48781070 + 1 NA intron (NM_020820, intron 1 of 39) L1MC4a|LINE|L1 47056 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 191.5-106 chr4 48471883 48472226 + 1 NA Intergenic Intergenic -11289 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 158.5-3 chr1 18028427 18028725 + 1 NA Intergenic Intergenic -37081 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 287.5-15 chr12 16539541 16540020 + 1 NA Intergenic Intergenic 65599 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 179.5-79 chr18 11305835 11306231 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -148445 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 115.75-140 chr3 58991830 58991998 + 1 NA intron (NR_110820, intron 2 of 2) intron (NR_110820, intron 2 of 2) 58111 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 232.5-31 chr15 86265948 86266347 + 1 NA intron (NM_152336, intron 11 of 24) intron (NM_152336, intron 11 of 24) 50821 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 151.5-136 chr4 25800462 25800699 + 1 NA intron (NM_001297592, intron 11 of 23) intron (NM_001297592, intron 11 of 23) 62408 NM_015187 23231 Hs.479384 NM_015187 ENSG00000091490 SEL1L3 Sel-1L3 SEL1L family member 3 protein-coding 207.5-11 chr11 35181450 35181703 + 1 NA intron (NM_001001389, intron 3 of 16) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 18626 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 218.5-70 chr22 28650501 28650793 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 1 of 22) intron (NM_001145418, intron 1 of 22) 29218 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 229.75-70 chr7 97473589 97473818 + 1 NA Intergenic Intergenic -258383 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 126.5-169 chr4 42066853 42067082 + 1 NA intron (NM_006345, intron 13 of 17) intron (NM_006345, intron 13 of 17) 76437 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 150.25-134 chr6 132943295 132943509 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 126183 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 116.5-113 chr2 52400307 52400526 + 1 NA intron (NR_135237, intron 10 of 10) L1MEc|LINE|L1 29768 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 188.5-38 chr14 57528440 57528673 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -34699 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 219.75-18 chr12 45861678 45861941 + 1 NA intron (NM_152641, intron 16 of 20) AluSz|SINE|Alu 128765 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 207.25-65 chr4 91587022 91587256 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 690163 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 130.5-36 chr10 52395178 52395423 + 1 NA Intergenic Intergenic 59972 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 117.5-70 chr15 77548008 77548217 + 1 NA Intergenic Intergenic 22517 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 178.25-49 chr17 35190433 35190698 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 3828 NM_152462 146861 Hs.514814 NM_152462 ENSG00000164729 SLC35G3 AMAC1|TMEM21A solute carrier family 35 member G3 protein-coding 309.5-44 chr8 85940584 85940997 + 1 NA Intergenic Intergenic -112848 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 179.5-121 chr3 62232262 62232654 + 1 NA intron (NM_002841, intron 14 of 29) intron (NM_002841, intron 14 of 29) 86489 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 298.75-13 chr12 594669 595094 + 1 NA intron (NM_016533, intron 1 of 3) L1MC1|LINE|L1 -8395 NR_134624 105369595 Hs.504422 NR_134624 LOC105369595 - uncharacterized LOC105369595 ncRNA 125.5-224 chr6 162081456 162081606 + 1 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 610554 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 285.75-36 chr5 100044234 100044586 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 343844 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 167.75-112 chr5 36818205 36818390 + 1 NA Intergenic Intergenic 58397 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 300.25-15 chr2 117470076 117470493 + 1 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -344407 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 178.5-65 chr17 48476180 48476513 + 1 NA Intergenic Intergenic 31513 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 206.5-55 chr2 107956675 107956929 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -29722 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 245.5-14 chr12 65726673 65726984 + 1 NA Intergenic Intergenic -84456 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 305.75-29 chrUn_KI270519v1 79639 80027 + 1 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 249.25-40 chr5 34881035 34881355 + 1 NA intron (NM_001317949, intron 9 of 10) intron (NM_001317949, intron 9 of 10) 34309 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 321.5-14 chr2 7291451 7291977 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -129547 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 160.75-114 chr5 4748593 4748975 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -24697 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 121.75-28 chr12 14777648 14777861 + 1 NA non-coding (NR_027716, exon 2 of 2) non-coding (NR_027716, exon 2 of 2) 3418 NR_027716 55766 Hs.524280 NM_018267 ENSG00000246705 H2AFJ H2AJ H2A histone family member J protein-coding 173.5-142 chr6 63388352 63388694 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -68540 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 177.75-63 chr2 32112011 32112294 + 1 NA intron (NM_001363823, intron 4 of 16) AluSx|SINE|Alu 48541 NM_001363823 6683 Hs.468091 NM_014946 ENSG00000021574 SPAST ADPSP|FSP2|SPG4 spastin protein-coding 337.5-17 chr19 48963409 48963868 + 1 NA Intergenic Intergenic -1671 NM_000146 2512 Hs.433670 NM_000146 ENSG00000087086 FTL LFTD|NBIA3 ferritin light chain protein-coding 184.5-103 chr3 115483221 115483482 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -140159 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 166.5-204 chr8 117075533 117075810 + 1 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) L2b|LINE|L2 -59324 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 144.75-82 chr2 34757705 34757975 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 80283 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 206.75-9 chr11 22955110 22955346 + 1 NA Intergenic Intergenic -94754 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 145.25-147 chr6 132020663 132020862 + 1 NA Intergenic Intergenic -69390 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 187.75-90 chr5 93773354 93773567 + 1 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) ERVL-E-int|LTR|ERVL -31860 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 368.5-18 chr8 8392119 8392957 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6099 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 112.5-137 chr2 202013180 202013359 + 1 NA Intergenic Intergenic -21318 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 221.25-93 chr8 119428824 119429160 + 1 NA Intergenic Intergenic 12546 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 130.25-9 chr1 114914294 114914598 + 1 NA intron (NM_001282542, intron 20 of 30) intron (NM_001282542, intron 20 of 30) 59583 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 305.75-28 chr8 137523782 137524271 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -110438 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 221.5-68 chr4 28644771 28645145 + 1 NA Intergenic Intergenic -174624 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 169.75-75 chr2 37421396 37421630 + 1 NA Intergenic Intergenic 76883 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 157.5-105 chr2 85022642 85022871 + 1 NA intron (NM_020122, intron 1 of 6) intron (NM_020122, intron 1 of 6) 44591 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 256.25-10 chr12 132795958 132796281 + 1 NA exon (NM_005895, exon 11 of 24) exon (NM_005895, exon 11 of 24) 32270 NM_005895 2802 Hs.507333 NM_005895 ENSG00000090615 GOLGA3 GCP170|MEA-2 golgin A3 protein-coding 132.5-153 chr22 27520686 27520946 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 210165 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 294.5-34 chr4 28879677 28880172 + 1 NA Intergenic Intergenic 60342 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 293.25-34 chr8 46158541 46158937 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 458904 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 146.5-24 chr10 4868924 4869147 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 42828 NM_001040177 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 273.25-30 chr5 45010087 45010362 + 1 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 201277 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 223.5-66 chr2 215730001 215730532 + 1 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) AluJr4|SINE|Alu 12223 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 194.25-76 chr3 156647440 156647784 + 1 NA Intergenic Intergenic -26978 NM_015508 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 185.5-165 chr8 125135522 125135797 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) L1MEc|LINE|L1 43799 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 240.75-36 chr18 2261843 2262192 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 309488 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 187.5-115 chr3 76278716 76279052 + 1 NA Intergenic Intergenic -493335 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 113.5-114 chr2 12408479 12408686 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 209452 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 234.75-87 chr9 29614270 29614732 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -400900 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 194.5-92 chr3 102500050 102500383 + 1 NA Intergenic Intergenic 65201 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 201.25-45 chr2 63575931 63576256 + 1 NA intron (NR_148704, intron 1 of 18) MER21B|LTR|ERVL 12384 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 117.5-187 chr5 110494093 110494260 + 1 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1PA7|LINE|L1 19739 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 127.5-222 chr7 20685434 20685604 + 1 NA intron (NM_178559, intron 6 of 18) intron (NM_178559, intron 6 of 18) 38189 NM_178559 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 114.5-229 chr6 62748278 62748446 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -462135 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 147.5-83 chr17 60706429 60706619 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 28673 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 210.25-20 chr13 93301217 93301595 + 1 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 74599 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 177.5-177 chr8 137773976 137774173 + 1 NA Intergenic Intergenic 309471 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 153.25-98 chr4 19801828 19802094 + 1 NA Intergenic Intergenic -449944 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 322.5-19 chr3 174914344 174914896 + 1 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) intron (NM_207015, intron 1 of 13) 55286 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 150.25-149 chr8 106440659 106441049 + 1 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) intron (NM_018002, intron 2 of 15) -7070 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 165.25-27 chr11 96203162 96203449 + 1 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -138133 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 243.75-38 chr19 17513287 17513575 + 1 NA intron (NM_012088, intron 1 of 4) AluSg|SINE|Alu -1542 NR_147835 100507551 Hs.363138 NR_147835 ENSG00000269439 LOC100507551 - uncharacterized LOC100507551 ncRNA 190.5-20 chr11 14876612 14876876 + 1 NA Intergenic Intergenic 15461 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 157.5-231 chrX 42994155 42994339 + 1 NA Intergenic Intergenic -182747 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 208.75-58 chr4 30535452 30535837 + 1 NA Intergenic Intergenic -184725 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 115.25-166 chr5 95677713 95677888 + 1 NA intron (NR_125328, intron 2 of 7) intron (NR_125328, intron 2 of 7) 5191 NR_125330 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 176.5-67 chr16 21117510 21117834 + 1 NA intron (NM_001347886, intron 11 of 61) L2a|LINE|L2 33174 NM_001347886 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 203.75-62 chr2 107009289 107009778 + 1 NA Intergenic Intergenic -122424 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 190.75-45 chr17 65876458 65876782 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) HAL1|LINE|L1 -50077 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 211.25-49 chr21 18235451 18235858 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -9179 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 157.25-116 chr5 39387626 39387848 + 1 NA intron (NM_001244871, intron 8 of 13) intron (NM_001244871, intron 8 of 13) -23242 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 215.5-58 chr20 11862258 11862633 + 1 NA intron (NR_110635, intron 1 of 1) L2|LINE|L2 8270 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 244.5-31 chr14 53917003 53917485 + 1 NA Intergenic Intergenic 31240 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 247.5-38 chr2 22666760 22667072 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 130437 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 240.5-17 chr11 113534136 113534444 + 1 NA Intergenic Intergenic -58892 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 219.25-9 chr1 241764698 241765001 + 1 NA intron (NM_001367482, intron 15 of 27) L2c|LINE|L2 -83342 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 212.75-3 chr1 46451399 46451825 + 1 NA Intergenic Intergenic -1908 NR_121680 101929651 Hs.638707 NR_121680 ENSG00000224863 LINC01398 - long intergenic non-protein coding RNA 1398 ncRNA 210.75-79 chr5 92744732 92744975 + 1 NA Intergenic Intergenic 826490 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 321.5-32 chr7 89085271 89085815 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -289806 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 169.25-43 chr18 4793736 4793990 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -287319 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 163.5-106 chr2 233413103 233413363 + 1 NA intron (NM_152879, intron 3 of 29) AluSz|SINE|Alu 25079 NM_003648 8527 Hs.471675 NM_003648 ENSG00000077044 DGKD DGKdelta|dgkd-2 diacylglycerol kinase delta protein-coding 145.75-89 chr2 228192433 228192610 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10834 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 115.75-66 chr14 66689549 66689787 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) L1M2|LINE|L1 182261 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 249.25-4 chr10 91931636 91931956 + 1 NA intron (NM_003972, intron 1 of 37) intron (NM_003972, intron 1 of 37) 8026 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 151.5 chr1 10483698 10484001 + 1 NA intron (NM_004565, intron 1 of 8) L1ME2|LINE|L1 8899 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 136.25-34 chr11 79308157 79308322 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 93870 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 137.5-159 chr3 98606319 98606535 + 1 NA Intergenic Intergenic -12816 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 326.25-3 chr1 114431101 114431721 + 1 NA intron (NM_015906, intron 5 of 19) intron (NM_015906, intron 5 of 19) 79792 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 172.25-66 chr2 113948994 113949211 + 1 NA intron (NM_005721, intron 8 of 11) AluSx1|SINE|Alu -20220 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 200.25-65 chr2 153038972 153039263 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 320480 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 129.5-27 chr10 88089813 88090074 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 226318 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 264.5-35 chr2 165154447 165154909 + 1 NA intron (NM_006922, intron 10 of 27) intron (NM_006922, intron 10 of 27) 49372 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 129.25-158 chr5 123791015 123791151 + 1 NA Intergenic Intergenic 245666 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 180.25-3 chr1 218123714 218123997 + 1 NA Intergenic Intergenic 80350 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 176.25-12 chr1 229706114 229706514 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 80067 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 147.75-110 chr3 126512708 126512865 + 1 NA intron (NM_001165974, intron 1 of 20) intron (NM_001165974, intron 1 of 20) 4987 NM_144639 131669 Hs.331148 NM_144639 ENSG00000159650 UROC1 HMFN0320|UROCD urocanate hydratase 1 protein-coding 153.5-93 chr2 30752755 30752943 + 1 NA intron (NM_144575, intron 10 of 22) intron (NM_144575, intron 10 of 22) 54597 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 160.5-126 chr3 103698169 103698403 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -174170 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 136.25-175 chr7 33266330 33266535 + 1 NA intron (NM_198428, intron 7 of 22) L1MEc|LINE|L1 136868 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 236.25-70 chr5 79427956 79428223 + 1 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) intron (NM_004272, intron 5 of 8) 85747 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 186.75-16 chr11 91007851 91008192 + 1 NA Intergenic Intergenic -138819 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 212.75-26 chr12 112342894 112343188 + 1 NA intron (NM_001109662, intron 1 of 75) intron (NM_001109662, intron 1 of 75) 39390 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 179.75-67 chr21 29964284 29964567 + 1 NA Intergenic Intergenic -24373 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 120.5-102 chr18 62099472 62099670 + 1 NA intron (NM_176787, intron 22 of 30) L1M2|LINE|L1 87485 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 166.25-68 chr18 7613722 7613947 + 1 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 46518 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 175.5-12 chr10 20025042 20025235 + 1 NA intron (NM_001282736, intron 2 of 12) L1PA16|LINE|L1 208706 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 135.75-50 chr13 21702048 21702221 + 1 NA 3' UTR (NM_002010, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_002010, exon 3 of 3) 31061 NM_002010 2254 Hs.111 NM_002010 ENSG00000102678 FGF9 FGF-9|GAF|HBFG-9|HBGF-9|SYNS3 fibroblast growth factor 9 protein-coding 164.5-130 chr3 37524285 37524654 + 1 NA intron (NM_002207, intron 12 of 27) intron (NM_002207, intron 12 of 27) 72328 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 205.5-69 chr2 43589511 43589895 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 4 of 37) L1PB1|LINE|L1 6271 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 182.5-170 chr8 133632890 133633252 + 1 NA Intergenic Intergenic 50995 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 302.75-19 chr4 30764137 30764510 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 43954 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 186.25-103 chr6 74068299 74068713 + 1 NA promoter-TSS (NR_110856) promoter-TSS (NR_110856) -945 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 168.75-33 chr12 4969970 4970166 + 1 NA Intergenic Intergenic 60163 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 138.5-171 chr6 50316316 50316491 + 1 NA Intergenic Intergenic -266474 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 302.75-22 chr5 43252181 43252768 + 1 NA intron (NR_072980, intron 2 of 3) intron (NR_072980, intron 2 of 3) 59622 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 161.5-143 chr4 42581898 42582209 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 9 of 35) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 75052 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 151.75-20 chr10 55504642 55504879 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -94282 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 198.5-79 chr2 125016199 125016459 + 1 NA Intergenic Intergenic 991042 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 119.5-46 chr11 67234627 67234770 + 1 NA intron (NR_027473, intron 12 of 20) AluJb|SINE|Alu -5316 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 221.75-10 chr1 167409846 167410081 + 1 NA intron (NM_001198783, intron 13 of 15) intron (NM_001198783, intron 13 of 15) 80893 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 168.5-47 chr12 58456991 58457174 + 1 NA Intergenic Intergenic -134620 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 144.5-175 chr5 112560515 112560788 + 1 NA Intergenic Intergenic -67785 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 218.25-4 chr1 84253140 84253408 + 1 NA Intergenic Intergenic -45264 NM_001010971 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 152.5-104 chr21 29396232 29396530 + 1 NA Intergenic Intergenic 23880 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 169.5-15 chr10 50313298 50313614 + 1 NA intron (NM_147156, intron 8 of 10) HAL1|LINE|L1 -64846 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 272.5-27 chr14 73973668 73974147 + 1 NA exon (NM_001321985, exon 13 of 17) exon (NM_001321985, exon 13 of 17) 23605 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 250.5-11 chr11 7254787 7255196 + 1 NA intron (NM_175733, intron 1 of 6) intron (NM_175733, intron 1 of 6) 3087 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 208.5-85 chr3 5554062 5554395 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -303973 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 226.5-24 chr14 83359066 83359390 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 716596 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 250.5-5 chr1 169764553 169764837 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 29994 NM_001320201 92342 Hs.33922 NM_033418 ENSG00000171806 METTL18 AsTP2|C1orf156|HPM1 methyltransferase like 18 protein-coding 129.5-191 chr5 156847399 156847631 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -2780 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 188.75-113 chr8 63577897 63578180 + 1 NA Intergenic Intergenic 112189 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 137.5-4 chr1 41866948 41867187 + 1 NA intron (NR_038261, intron 2 of 3) intron (NR_038261, intron 2 of 3) 51855 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 244.25-35 chr3 177785440 177785842 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -31224 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 241.5-35 chr2 24659714 24660073 + 1 NA intron (NM_001362950, intron 5 of 23) MER20|DNA|hAT-Charlie 75416 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 156.75-74 chr18 4061823 4062052 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) MER50-int|LTR|ERV1 99584 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 244.5-61 chr20 45292307 45292830 + 1 NA TTS (NM_030590) TTS (NM_030590) -14272 NM_014276 11317 Hs.248217 NM_014276 ENSG00000124232 RBPJL RBPL|RBPSUHL|SUHL recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region like protein-coding 295.25-32 chr7 134986631 134987169 + 1 NA 5' UTR (NM_001367817, exon 1 of 5) 5' UTR (NM_001367817, exon 1 of 5) 392 NR_160300 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 253.5-72 chr7 31379930 31380384 + 1 NA Intergenic Intergenic -39431 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 206.5-103 chr5 159174414 159174930 + 1 NA intron (NM_001199383, intron 5 of 10) intron (NM_001199383, intron 5 of 10) 32976 NM_001199382 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 223.75-73 chr6 40521922 40522379 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 65214 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 229.5-73 chr2 181693800 181694110 + 1 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger -13290 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 211.5-65 chr18 50889722 50889959 + 1 NA intron (NM_002396, intron 1 of 15) LTR49-int|LTR|ERV1 10722 NM_001168335 4200 Hs.233119 NM_002396 ENSG00000082212 ME2 ODS1 malic enzyme 2 protein-coding 142.75-102 chr2 114704821 114705156 + 1 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 128560 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 264.5-45 chr4 177059305 177059814 + 1 NA Intergenic Intergenic 183857 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 219.25-76 chr8 33470353 33470653 + 1 NA intron (NM_032664, intron 1 of 4) intron (NM_032664, intron 1 of 4) 2643 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 183.75-121 chr8 26029669 26029882 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 15638 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 163.5-171 chr6 54082206 54082474 + 1 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 -29103 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 127.25-178 chr6 71642362 71642603 + 1 NA Intergenic Intergenic 221455 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 140.5-90 chr18 53547732 53548065 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -20549 NR_110798 102724651 Hs.123442 NR_110798 ENSG00000263438 LINC01919 - long intergenic non-protein coding RNA 1919 ncRNA 304.25-3 chr10 15855874 15856390 + 1 NA intron (NM_024948, intron 1 of 14) intron (NM_024948, intron 1 of 14) 4375 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 165.5-37 chr13 73603376 73603591 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 39239 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 218.5-53 chr2 30688045 30688458 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 119195 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 117.25-70 chr14 54933081 54933294 + 1 NA Intergenic Intergenic -30361 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 196.75-6 chr1 99487647 99487928 + 1 NA promoter-TSS (NR_125951) promoter-TSS (NR_125951) 17 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 180.25-67 chr22 25497420 25497735 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 41931 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 119.25-55 chr14 55577485 55577631 + 1 NA intron (NR_027123, intron 2 of 2) intron (NR_027123, intron 2 of 2) 2534 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-73 chr14 56962641 56962764 + 1 NA Intergenic Intergenic 149544 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 173.25-51 chr18 5854624 5854975 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 14104 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 144.5-99 chr2 33210055 33210316 + 1 NA intron (NM_206943, intron 7 of 33) intron (NM_206943, intron 7 of 33) 75588 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 152.5-137 chr4 76077566 76077863 + 1 NA intron (NM_001130017, intron 2 of 9) L1MB7|LINE|L1 3019 NM_001179 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 169.5-97 chr22 25800071 25800368 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) L1PB2|LINE|L1 58031 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 174.5-177 chr7 79117303 79117590 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 108458 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 324.5-31 chr7 23649974 23650356 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -30034 NM_199136 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 170.75-64 chr2 39296040 39296245 + 1 NA intron (NM_003618, intron 16 of 33) intron (NM_003618, intron 16 of 33) -52159 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 144.75-178 chr8 104590708 104590938 + 1 NA Intergenic Intergenic -1799 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 322.25-12 chr3 22649003 22649525 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 553314 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 131.25-167 chr5 105413058 105413243 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 313676 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 140.5-147 chr3 34629191 34629379 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 764738 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 154.5-21 chr10 11217101 11217368 + 1 NA intron (NM_001326339, intron 2 of 11) intron (NM_001326339, intron 2 of 11) 52204 NM_001025076 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 133.5-236 chr6 95926119 95926309 + 1 NA Intergenic Intergenic -89760 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 121.75-180 chr7 82271960 82272265 + 1 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 171665 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 251.25-15 chr14 50208344 50208641 + 1 NA intron (NM_006939, intron 1 of 22) AluSx4|SINE|Alu 23086 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 290.25-2 chr1 152437735 152438119 + 1 NA Intergenic Intergenic -23664 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 183.5-87 chr3 31560678 31560992 + 1 NA intron (NM_178862, intron 1 of 15) L1MA4A|LINE|L1 27910 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 150.25-109 chr3 196732650 196732830 + 1 NA intron (NM_017861, intron 5 of 5) intron (NM_017861, intron 5 of 5) -7117 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 168.75-39 chr14 22572262 22572480 + 1 NA intron (NM_001344, intron 2 of 2) intron (NM_001344, intron 2 of 2) -15309 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 134.5-178 chr5 95967810 95968014 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 5911 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 161.5-116 chr20 37844618 37844870 + 1 NA intron (NM_001281495, intron 14 of 16) AluSz6|SINE|Alu -58383 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 208.5-36 chr14 56273261 56273575 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 155007 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 282.5-69 chr9 96281185 96281682 + 1 NA intron (NM_000197, intron 2 of 10) MER41-int|LTR|ERV1 20743 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 295.5-14 chr14 56103754 56104191 + 1 NA Intergenic Intergenic -14439 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 191.5-119 chr5 66340458 66340694 + 1 NA Intergenic Intergenic -131130 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 140.5-164 chr4 45951674 45951850 + 1 NA Intergenic Intergenic 172292 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 227.75-46 chr20 13694761 13695043 + 1 NA Intergenic Intergenic -55966 NR_136630 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 133.5-260 chr8 50665589 50665922 + 1 NA intron (NR_135797, intron 17 of 20) L1MC4|LINE|L1 501624 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 115.25-82 chr17 75241448 75241659 + 1 NA intron (NM_001291642, intron 6 of 13) intron (NM_001291642, intron 6 of 13) 20053 NM_014001 23163 Hs.87726 NM_014001 ENSG00000125447 GGA3 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3 protein-coding 201.5-55 chr14 74402478 74402718 + 1 NA Intergenic Intergenic 23612 NM_001105579 646658 Hs.12400 NM_001105579 ENSG00000183379 SYNDIG1L CAPUCIN|DSPC1|IFITMD4|TMEM90A synapse differentiation inducing 1 like protein-coding 163.5-118 chr21 31894168 31894367 + 1 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 21247 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 256.5-46 chr3 184561355 184561683 + 1 NA promoter-TSS (NM_004443) promoter-TSS (NM_004443) -266 NM_004443 2049 Hs.2913 NM_004443 ENSG00000182580 EPHB3 EK2|ETK2|HEK2|TYRO6 EPH receptor B3 protein-coding 179.5-151 chr5 153235017 153235362 + 1 NA Intergenic Intergenic -255335 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 141.75-19 chr10 29125649 29125927 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -163282 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 205.75-31 chr17 59670673 59671068 + 1 NA intron (NM_001288653, intron 14 of 31) intron (NM_001288653, intron 14 of 31) 36728 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 175.5-13 chr10 22015560 22015806 + 1 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -11953 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 248.5-74 chr4 71068399 71068721 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 74911 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 236.25-54 chr21 43807068 43807480 + 1 NA intron (NR_026961, intron 1 of 1) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 5293 NR_026961 284837 Hs.592159 NM_194310 ENSG00000215458 AATBC - apoptosis associated transcript in bladder cancer ncRNA 157.5-99 chr2 60149330 60149658 + 1 NA Intergenic Intergenic 233542 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 191.5-156 chrX 17791784 17792174 + 1 NA Intergenic Intergenic 54486 NM_006746 6322 Hs.109655 NM_006746 ENSG00000047634 SCML1 - Scm polycomb group protein like 1 protein-coding 159.75-21 chr10 92502521 92502850 + 1 NA intron (NR_136399, intron 11 of 25) intron (NR_136399, intron 11 of 25) -4924 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 289.25-24 chr5 32843159 32843457 + 1 NA Intergenic Intergenic -104135 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 265.25-3 chr1 179980032 179980347 + 1 NA intron (NM_014810, intron 1 of 37) L1MA5A|LINE|L1 25379 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 147.5-152 chr4 4428818 4429092 + 1 NA intron (NM_016930, intron 7 of 10) intron (NM_016930, intron 7 of 10) 33017 NM_001346300 53407 Hs.584913 NM_016930 ENSG00000168818 STX18 Ufe1 syntaxin 18 protein-coding 129.5-73 chr15 38238009 38238196 + 1 NA Intergenic Intergenic -14734 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 142.5 chr1 3951567 3951860 + 1 NA intron (NR_040065, intron 2 of 2) intron (NR_040065, intron 2 of 2) -2733 NR_147024 105376672 Hs.435087 NR_147024 ENSG00000226374 LINC01345 - long intergenic non-protein coding RNA 1345 ncRNA 221.75-49 chr4 89217659 89218050 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 89946 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 151.5-198 chr8 130189528 130189881 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) L1MA4|LINE|L1 -104936 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 191.75-101 chr5 27791208 27791506 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 319065 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 112.5-108 chr2 37887954 37888149 + 1 NA Intergenic Intergenic -12188 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 306.5-14 chr15 57795392 57795831 + 1 NA Intergenic Intergenic 88897 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 251.75-12 chr11 29109601 29110096 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -484565 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 229.5-7 chr1 115389775 115390090 + 1 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -51696 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 183.25-61 chr2 198891215 198891557 + 1 NA Intergenic Intergenic -516289 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 156.5-181 chr7 156577347 156577552 + 1 NA intron (NR_026865, intron 2 of 3) L1ME2|LINE|L1 25746 NR_103858 100506380 Hs.647014 NM_032625 ENSG00000182648 LINC01006 C7orf13|MY040 long intergenic non-protein coding RNA 1006 ncRNA 168.5-59 chr16 12716700 12716949 + 1 NA intron (NM_018340, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 -3497 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 268.5-48 chr5 130331400 130332004 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 427237 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 143.5-34 chr11 82547637 82547933 + 1 NA Intergenic Intergenic -143872 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 119.25-156 chr4 154757228 154757385 + 1 NA Intergenic Intergenic 13306 NM_004744 9227 Hs.658427 NM_004744 ENSG00000121207 LRAT LCA14 lecithin retinol acyltransferase protein-coding 179.75-54 chr2 31835779 31836064 + 1 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -31941 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 291.75-31 chr3 121139324 121139888 + 1 NA intron (NR_145517, intron 7 of 8) intron (NR_145517, intron 7 of 8) 89966 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 160.25-108 chr4 34322350 34322654 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -52755 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 204.75-80 chr4 35419438 35419741 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 824350 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 241.5-95 chr8 60375636 60376000 + 1 NA Intergenic Intergenic 38000 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 191.5-40 chr14 68732444 68732636 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 61374 NM_004926 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 191.75-6 chr1 151946754 151947013 + 1 NA Intergenic Intergenic -37372 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 133.25-166 chr5 22532358 22532590 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) -318624 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 254.25-47 chr4 40639070 40639375 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8628 NM_001371114 198.5-138 chr8 17359670 17359912 + 1 NA intron (NM_004686, intron 4 of 13) L1ME4a|LINE|L1 53560 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 171.75-130 chr7 42515714 42515951 + 1 NA Intergenic Intergenic 190615 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 112.5-11 chr1 166756115 166756294 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -83271 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 287.25-6 chr10 19938592 19938942 + 1 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 122335 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 198.75-84 chr6 49832029 49832320 + 1 NA Intergenic Intergenic -7408 NR_110843 101927048 Hs.742154 NR_110843 LOC101927048 - uncharacterized LOC101927048 ncRNA 171.5-152 chr8 86841455 86841674 + 1 NA Intergenic Intergenic -24851 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 118.25-75 chr16 9100119 9100342 + 1 NA intron (NM_014117, intron 2 of 3) intron (NM_014117, intron 2 of 3) 8586 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 346.75-3 chr10 50169987 50170499 + 1 NA Intergenic Intergenic 78367 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 193.5-65 chr17 61091608 61092051 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 275875 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 293.5-39 chr7 80622488 80622951 + 1 NA intron (NM_001371080, intron 1 of 10) intron (NM_001371080, intron 1 of 10) -1373 NM_001371077 150.5-191 chr6 122024703 122024918 + 1 NA Intergenic Charlie17|DNA|hAT-Charlie -374741 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 128.75-140 chr4 57957311 57957615 + 1 NA Intergenic Intergenic 531591 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 150.25-32 chr11 45242903 45243092 + 1 NA 3' UTR (NM_001247987, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001247987, exon 8 of 8) 43344 NM_001247987 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 238.75-3 chr10 42320638 42320877 + 1 NA Intergenic Intergenic 47288 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 199.25-57 chr2 52685336 52685689 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 17103 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 134.25-31 chr12 794004 794180 + 1 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) L1MB8|LINE|L1 41169 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 120.5-210 chr7 16668269 16668449 + 1 NA intron (NM_001362717, intron 2 of 11) intron (NM_001362717, intron 2 of 11) 7145 NM_001362717 28969 Hs.487635 NM_014038 ENSG00000136261 BZW2 HSPC028|MST017|MSTP017 basic leucine zipper and W2 domains 2 protein-coding 193.5-124 chr4 116496239 116496511 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 196650 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 165.25-28 chr11 103621135 103621357 + 1 NA Intergenic Intergenic -228660 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 236.5-68 chr4 74151020 74151294 + 1 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) intron (NM_001351311, intron 2 of 7) -6951 NM_001144978 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 241.25-32 chr2 32682198 32682725 + 1 NA intron (NM_017735, intron 9 of 19) intron (NM_017735, intron 9 of 19) 47206 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 142.5-13 chr1 99485537 99485742 + 1 NA intron (NR_125951, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 2165 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 181.25-25 chr12 121062448 121062755 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23359 NM_198213 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 165.75-120 chr4 81815930 81816214 + 1 NA Intergenic Intergenic -344165 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 211.5-142 chr7 30565618 30566079 + 1 NA intron (NR_038889, intron 3 of 6) intron (NR_038889, intron 3 of 6) 11931 NR_038889 401320 Hs.561708 NR_038889 GARS-DT - GARS divergent transcript ncRNA 515.75-3 chr12 25866624 25867338 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 7098 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 231.75-59 chr5 41875931 41876241 + 1 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -5661 NR_157114 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 178.5-128 chr4 123956935 123957156 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 182781 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 296.75-26 chr4 106089286 106089680 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 26 of 26) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -67005 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 142.75-21 chr10 62272829 62273183 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -4162 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 283.5-60 chr9 35930674 35931058 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 21376 NM_001348107 158376 Hs.302677 NM_001348107 ENSG00000235387 SPAAR LINC00961|SPAR small regulatory polypeptide of amino acid response protein-coding 135.5-119 chr2 201783649 201783898 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -2840 NM_020919 57679 Hs.471096 NM_020919 ENSG00000003393 ALS2 ALS2CR6|ALSJ|IAHSP|PLSJ alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2 protein-coding 190.25-57 chr18 50609619 50609977 + 1 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 49711 NM_001292040 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 197.25-24 chr12 84120863 84121116 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 791810 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 217.25-53 chr22 50367491 50367770 + 1 NA intron (NM_001242899, intron 1 of 22) intron (NM_001242899, intron 1 of 22) 24303 NM_001242898 9701 Hs.449098 NM_014678 ENSG00000100239 PPP6R2 KIAA0685|PP6R2|SAP190|SAPS2 protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 protein-coding 243.5-37 chr2 82041298 82041578 + 1 NA Intergenic Intergenic -574492 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 130.25-137 chr3 102602989 102603264 + 1 NA Intergenic Intergenic 168111 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 249.75-53 chr4 141023176 141023453 + 1 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 110155 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 176.75-136 chr9 96651957 96652183 + 1 NA intron (NM_153698, intron 2 of 5) L1MA7|LINE|L1 3247 NM_153698 195827 Hs.44640 NM_153698 ENSG00000158122 PRXL2C AAED1|C9orf21 peroxiredoxin like 2C protein-coding 412.75-4 chr4 70075144 70075721 + 1 NA intron (NR_003720, intron 8 of 12) intron (NR_003720, intron 8 of 12) 8046 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 230.25 chr1 35274917 35275194 + 1 NA intron (NM_005095, intron 1 of 29) intron (NM_005095, intron 1 of 29) 6346 NM_005095 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 347.25-10 chr2 64215084 64215574 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -9844 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 114.25-119 chr22 35075409 35075670 + 1 NA intron (NM_001303508, intron 2 of 4) intron (NM_001303508, intron 2 of 4) 9381 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 461.25 chr4 91591414 91592092 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 685549 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 202.5-40 chr14 51150618 51150952 + 1 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -55081 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 112.5-2 chr1 19972963 19973094 + 1 NA Intergenic Intergenic 6631 NM_001161729 5320 Hs.466804 NM_000300 ENSG00000188257 PLA2G2A MOM1|PLA2|PLA2B|PLA2L|PLA2S|PLAS1|sPLA2 phospholipase A2 group IIA protein-coding 145.25-43 chr14 85816397 85816603 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -118178 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 271.25-19 chr12 122085578 122086132 + 1 NA intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7099 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 327.25-22 chr5 117307296 117307836 + 1 NA Intergenic Intergenic -107946 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 163.5-37 chr12 4335372 4335780 + 1 NA intron (NM_020375, intron 2 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 14363 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 248.5-91 chr6 95662689 95662960 + 1 NA Intergenic Intergenic 85289 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 172.5-211 chr9 4622209 4622417 + 1 NA intron (NM_001353491, intron 10 of 14) intron (NM_001353491, intron 10 of 14) 39910 NM_001353490 55064 Hs.179615 NM_017985 ENSG00000106686 SPATA6L C9orf68|bA6J24.2 spermatogenesis associated 6 like protein-coding 239.5-72 chr7 73896601 73896999 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 35641 NM_182504 135886 Hs.647026 NM_182504 ENSG00000175877 TMEM270 WBSCR28 transmembrane protein 270 protein-coding 146.5-101 chr2 65261156 65261346 + 1 NA exon (NM_005722, exon 7 of 9) exon (NM_005722, exon 7 of 9) 33556 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 181.25-56 chr19 11637229 11637554 + 1 NA Intergenic Intergenic 29698 NR_002944 664709 Hs.534822 NR_002944 HNRNPA1P10 HNRPA1L-2 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 10 pseudo 285.75-17 chr19 51954328 51954652 + 1 NA intron (NR_103847, intron 1 of 2) intron (NR_103847, intron 1 of 2) 5356 NR_103847 101669766 Hs.637744 NR_103847 ENSG00000269235 ZNF350-AS1 HCCAT3|uc002pyc ZNF350 antisense RNA 1 ncRNA 143.25-92 chr2 156175874 156176176 + 1 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 78906 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 155.75-87 chr2 156692507 156692726 + 1 NA Intergenic Intergenic 256237 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 277.5-2 chr1 102700063 102700415 + 1 NA Intergenic Intergenic 408257 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 222.5-14 chr10 11437305 11437694 + 1 NA Intergenic Intergenic -92825 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-122 chr8 111028890 111029092 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -1558 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 150.75-69 chr15 83549466 83549760 + 1 NA intron (NM_001324186, intron 2 of 9) L1ME3A|LINE|L1 58999 NM_001324187 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 181.75-24 chr11 26903307 26903548 + 1 NA Intergenic Intergenic -90685 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 356.25-4 chr14 64290024 64290676 + 1 NA intron (NR_073496, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 4060 NM_001040275 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 151.75 chr1 28843013 28843274 + 1 NA intron (NM_000911, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 30973 NM_000911 4985 Hs.372 NM_000911 ENSG00000116329 OPRD1 DOP|DOR|DOR1|OPRD opioid receptor delta 1 protein-coding 185.25-47 chr17 71558625 71558957 + 1 NA Intergenic Intergenic -356612 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 131.25-52 chr13 108070956 108071119 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 143745 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 202.5-44 chr14 73690873 73691126 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 8 of 8) intron (NM_001201366, intron 8 of 8) 23385 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 225.5-70 chr3 29899910 29900284 + 1 NA intron (NM_001003793, intron 10 of 14) intron (NM_001003793, intron 10 of 14) 34059 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 178.75-46 chr2 58137236 58137419 + 1 NA intron (NM_001130483, intron 10 of 13) intron (NM_001130483, intron 10 of 13) 90615 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 176.5-111 chr20 62544585 62544871 + 1 NA non-coding (NR_033263, exon 7 of 7) non-coding (NR_033263, exon 7 of 7) -5725 NM_178463 128826 Hs.86507 NM_178463 MIR1-1HG C20orf166|MIR133A2HG MIR1-1 host gene protein-coding 242.5-9 chr1 239450373 239450851 + 1 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) L1ME3G|LINE|L1 64044 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 140.5-8 chr1 116272090 116272293 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -101053 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 125.5-149 chr20 39083067 39083245 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 120812 NM_001190809 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 171.5-103 chr3 57183428 57183665 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -13229 NM_001318864 54756 Hs.150725 NM_017563 ENSG00000144730 IL17RD HH18|IL-17RD|IL17RLM|SEF interleukin 17 receptor D protein-coding 331.75-11 chr16 75834717 75835146 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -108441 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 175.5-22 chr10 78014042 78014336 + 1 NA intron (NM_007055, intron 10 of 30) intron (NM_007055, intron 10 of 30) 15326 NM_007055 11128 Hs.436896 NM_007055 ENSG00000148606 POLR3A ADDH|HLD7|RPC1|RPC155|WDRTS|hRPC155 RNA polymerase III subunit A protein-coding 123.75-7 chr1 97367623 97367838 + 1 NA intron (NM_000110, intron 16 of 22) intron (NM_000110, intron 16 of 22) 271807 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 242.75-27 chr2 41787537 41787819 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -89877 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 192.75-127 chr8 116512423 116512701 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -139538 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 164.75-135 chr7 72322774 72322974 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) L1MA2|LINE|L1 14517 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 147.5-21 chr10 43952908 43953089 + 1 NA intron (NR_033846, intron 5 of 7) L1MB8|LINE|L1 40596 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 166.5-133 chr3 73517965 73518287 + 1 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) L1MB3|LINE|L1 -3196 NR_121660 101927296 Hs.662049 NR_121660 LOC101927296 - uncharacterized LOC101927296 ncRNA 246.5-39 chr2 49715434 49715870 + 1 NA Intergenic Intergenic 258551 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 120.25-123 chr22 26594233 26594457 + 1 NA Intergenic Intergenic -4213 NM_001362922 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 222.5-40 chr17 44807763 44808034 + 1 NA intron (NM_001080383, intron 1 of 2) intron (NM_001080383, intron 1 of 2) 22389 NM_005497 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 360.25-9 chr2 134368084 134368530 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 11 of 16) intron (NM_001371457, intron 11 of 16) 114235 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 190.75-50 chr2 58747878 58748229 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 227300 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 154.5-208 chrX 130307486 130307799 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -32246 NM_001282197 9016 Hs.194686 NM_003951 ENSG00000102078 SLC25A14 BMCP1|UCP5 solute carrier family 25 member 14 protein-coding 261.5-62 chr7 31116474 31116993 + 1 NA Intergenic Intergenic 64272 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 117.5-16 chr1 192255360 192255571 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -61527 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 178.5-30 chr11 94489425 94489766 + 1 NA intron (NM_001330347, intron 3 of 19) L2a|LINE|L2 4249 NM_001330347 4361 Hs.192649 NM_005590 ENSG00000020922 MRE11 ATLD|HNGS1|MRE11A|MRE11B MRE11 homolog, double strand break repair nuclease protein-coding 174.5-45 chr12 24920166 24920474 + 1 NA intron (NM_001178091, intron 1 of 9) intron (NM_001178091, intron 1 of 9) -17253 NM_001178093 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 229.5-36 chr13 24455441 24455795 + 1 NA intron (NM_006437, intron 21 of 33) AluJo|SINE|Alu 57160 NM_006437 143 Hs.744855 NM_006437 ENSG00000102699 PARP4 ADPRTL1|ARTD4|PARP-4|PARPL|PH5P|VAULT3|VPARP|VWA5C|p193 poly(ADP-ribose) polymerase family member 4 protein-coding 257.25-9 chr11 109811106 109811685 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -281997 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 132.5-25 chr1 208089441 208089597 + 1 NA intron (NM_025179, intron 9 of 31) intron (NM_025179, intron 9 of 31) 154865 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 175.5-8 chr1 162054705 162055001 + 1 NA Intergenic Intergenic -14838 NM_001164757 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 179.75-21 chr10 133073378 133073630 + 1 NA Intergenic Intergenic 13193 NR_111905 100128127 Hs.694139 NR_111905 ADGRA1-AS1 GPR123-AS1 adhesion G protein-coupled receptor A1 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-79 chr17 73947087 73947300 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -118656 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 151.5-139 chr4 66174158 66174478 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -102506 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 147.5-155 chr4 29512751 29512926 + 1 NA Intergenic Intergenic 298546 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 220.5-119 chr7 87354068 87354370 + 1 NA intron (NM_001243745, intron 3 of 3) MER4-int|LTR|ERV1 8555 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 196.5-72 chr18 71532427 71532783 + 1 NA intron (NR_038325, intron 3 of 6) intron (NR_038325, intron 3 of 6) 46351 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 223.5-71 chr20 58076438 58076807 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 72718 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 123.75-113 chr3 275898 276086 + 1 NA intron (NM_001253387, intron 2 of 26) intron (NM_001253387, intron 2 of 26) -43691 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 181.75-45 chr17 49199954 49200146 + 1 NA Intergenic Intergenic 9331 NM_031498 2793 Hs.181781 NM_031498 ENSG00000167083 GNGT2 G-GAMMA-8|G-GAMMA-C|GNG8|GNG9|GNGT8 G protein subunit gamma transducin 2 protein-coding 259.25 chr1 48845390 48845820 + 1 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) intron (NR_136623, intron 5 of 12) -68636 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 177.75-96 chr21 29828505 29828786 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) AluJr|SINE|Alu 80470 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 218.25-36 chr19 51253395 51253931 + 1 NA intron (NR_102324, intron 1 of 4) intron (NR_102324, intron 1 of 4) 2583 NR_102324 284369 Hs.381087 NM_173635 ENSG00000179213 SIGLECL1 C19orf75|SIGLEC23P|SIGLECP7 SIGLEC family like 1 protein-coding 173.25-22 chr11 131369609 131369955 + 1 NA promoter-TSS (NM_001048209) promoter-TSS (NM_001048209) -833 NM_001352005 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 180.5-151 chr8 76652359 76652589 + 1 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) intron (NR_024360, intron 2 of 3) -28773 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 327.5-25 chr5 141342392 141342978 + 1 NA 3' UTR (NM_032009, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_032009, exon 1 of 1) -1144 NM_018916 56112 Hs.368160 NM_018916 ENSG00000254245 PCDHGA3 PCDH-GAMMA-A3 protocadherin gamma subfamily A, 3 protein-coding 231.75-32 chr2 10668479 10668784 + 1 NA intron (NR_048552, intron 6 of 19) intron (NR_048552, intron 6 of 19) 21344 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 193.5-79 chr2 14000574 14000923 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 400210 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 119.5-177 chr5 55371151 55371382 + 1 NA intron (NM_015360, intron 16 of 26) intron (NM_015360, intron 16 of 26) 63277 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 118.75-26 chr10 108683218 108683392 + 1 NA Intergenic Intergenic -614012 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 145.5-95 chr2 53393618 53393827 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -374061 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 172.25-147 chr9 136083209 136083466 + 1 NA intron (NM_144653, intron 1 of 5) intron (NM_144653, intron 1 of 5) 11952 NM_144653 138151 Hs.112895 NM_144653 ENSG00000148411 NACC2 BEND9|BTBD14|BTBD14A|BTBD31|NAC-2|RBB NACC family member 2 protein-coding 305.5-32 chr4 112961387 112961905 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) -87768 NM_001354246 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 234.25-74 chr7 90268426 90268726 + 1 NA intron (NM_001039706, intron 6 of 22) intron (NM_001039706, intron 6 of 22) 23402 NM_001363438 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 203.25-39 chr14 77459202 77459453 + 1 NA intron (NM_012111, intron 1 of 8) intron (NM_012111, intron 1 of 8) 1234 NM_012111 10598 Hs.204041 NM_012111 ENSG00000100591 AHSA1 AHA1|C14orf3|hAha1|p38 activator of HSP90 ATPase activity 1 protein-coding 161.5-80 chr18 6962870 6963138 + 1 NA intron (NM_005559, intron 51 of 62) intron (NM_005559, intron 51 of 62) 8327 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 182.5-10 chr1 181945453 181945809 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 116081 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 147.25-155 chr9 21032637 21032848 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1102 NM_001321903 401494 Hs.716678 NM_001010915 ENSG00000188921 HACD4 PTPLAD2 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 protein-coding 286.5-45 chr3 118040139 118040620 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -349454 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 337.75-4 chr1 225452300 225452878 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -23734 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 129.75-130 chr4 70792554 70792691 + 1 NA 3' UTR (NM_001345840, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001345840, exon 14 of 14) 46881 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 122.5-118 chr2 152681787 152682006 + 1 NA intron (NM_001365601, intron 5 of 24) intron (NM_001365601, intron 5 of 24) 35565 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 256.5-30 chr2 58514202 58514517 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6394 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 113.5-69 chr14 20466208 20466344 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3103 NM_000270 4860 Hs.75514 NM_000270 ENSG00000198805 PNP NP|PRO1837|PUNP purine nucleoside phosphorylase protein-coding 147.75-44 chr15 68408282 68408495 + 1 NA intron (NM_001004439, intron 1 of 29) L2b|LINE|L2 23775 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 161.5-199 chr9 70590333 70590654 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) intron (NM_001366143, intron 21 of 25) -175836 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 117.25-71 chr14 54945499 54945736 + 1 NA intron (NM_007086, intron 24 of 25) AluSx4|SINE|Alu -42791 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 298.25-19 chr22 27707184 27707490 + 1 NA Intergenic Intergenic 94419 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 316.5-14 chr14 79857948 79858481 + 1 NA intron (NR_073547, intron 20 of 20) intron (NR_073547, intron 20 of 20) -353205 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 129.25-146 chr5 5163932 5164208 + 1 NA intron (NM_139056, intron 3 of 22) intron (NM_139056, intron 3 of 22) 23740 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 204.25-2 chr1 16926256 16926623 + 1 NA intron (NM_014675, intron 3 of 36) intron (NM_014675, intron 3 of 36) 4508 NM_014675 9696 Hs.309403 NM_014675 ENSG00000058453 CROCC ROLT|TAX1BP2 ciliary rootlet coiled-coil, rootletin protein-coding 147.25-149 chr8 121455064 121455223 + 1 NA Intergenic Intergenic -184203 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-83 chr18 78244346 78244561 + 1 NA Intergenic Intergenic -250726 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 169.25-63 chr2 178915881 178916202 + 1 NA intron (NM_001316745, intron 7 of 11) LTR40c|LTR|ERVL -108618 NM_003319 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 275.5-36 chr22 28295266 28295581 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MIRb|SINE|MIR -164446 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 191.5-86 chr20 46483894 46484282 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -18796 NR_026640 7686 Hs.717103 NR_026640 ENSG00000225849 MKRN7P MKRNP3|ZNF127L5|dJ981L23.2 makorin ring finger protein 7, pseudogene pseudo 164.75 chr1 38873619 38873819 + 1 NA promoter-TSS (NM_012333) promoter-TSS (NM_012333) 318 NR_135048 105378663 Hs.585419 NR_135048 ENSG00000228436 LOC105378663 - uncharacterized LOC105378663 ncRNA 211.5-92 chr21 29500847 29501083 + 1 NA TTS (NR_146594) TTS (NR_146594) 4918 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 137.5-108 chr19 39023169 39023411 + 1 NA TTS (NM_178820) TTS (NM_178820) 9259 NM_178820 126433 Hs.187461 NM_178820 ENSG00000161243 FBXO27 FBG5|Fbx27 F-box protein 27 protein-coding 179.5-5 chr1 60714940 60715123 + 1 NA intron (NR_110628, intron 4 of 5) intron (NR_110628, intron 4 of 5) -92346 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 114.5-66 chr12 30699933 30700132 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -4163 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 210.75-29 chr16 10102287 10102538 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 79655 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 230.25-20 chr12 29760861 29761217 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 2 of 19) intron (NM_001367875, intron 2 of 19) 22903 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 128.5-211 chr7 82888684 82888927 + 1 NA intron (NM_033026, intron 9 of 24) intron (NM_033026, intron 9 of 24) 274079 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 178.5-54 chr15 76925829 76926128 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -5771 NM_002902 5955 Hs.79088 NM_002902 ENSG00000117906 RCN2 E6BP|ERC-55|ERC55|TCBP49 reticulocalbin 2 protein-coding 216.25-23 chr12 13732266 13732574 + 1 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 247936 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 171.25 chr1 62644887 62645396 + 1 NA intron (NM_001367561, intron 7 of 49) L1MB8|LINE|L1 43227 NM_001271999 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 319.75-12 chr2 67719629 67720160 + 1 NA Intergenic Intergenic 105668 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 121.25-71 chr15 95792616 95792875 + 1 NA Intergenic Intergenic 335096 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 137.25-171 chr8 105587497 105587859 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 268135 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 206.25-85 chr5 111658912 111659193 + 1 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) L1ME3G|LINE|L1 97199 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 165.5-77 chr2 65532515 65532828 + 1 NA Intergenic Intergenic -100072 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 117.25-100 chr18 75457605 75457786 + 1 NA Intergenic Intergenic -29992 NM_001037331 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 229.5-92 chr3 125431655 125431974 + 1 NA Intergenic Intergenic -56460 NM_001348427 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 185.5-70 chr18 67818316 67818586 + 1 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) -3629 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 241.25-28 chr19 51503289 51503565 + 1 NA Intergenic Intergenic -1627 NM_053003 89858 Hs.249741 NM_033329 ENSG00000254521 SIGLEC12 S2V|SIGLECL1|SLG|Siglec-XII sialic acid binding Ig like lectin 12 (gene/pseudogene) protein-coding 255.25-11 chr11 38964354 38964886 + 1 NA Intergenic Intergenic 315762 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 163.25-4 chr1 51332461 51332732 + 1 NA intron (NM_001144832, intron 1 of 17) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -2032 NM_001297663 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 333.75-18 chr3 21194733 21195347 + 1 NA Intergenic Intergenic -210686 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 199.5-123 chr5 128440051 128440310 + 1 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) L1M5|LINE|L1 98065 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 242.5-13 chr10 23155187 23155589 + 1 NA Intergenic Intergenic -36924 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 252.5-4 chr1 201515631 201516098 + 1 NA non-coding (NR_160746, exon 2 of 2) non-coding (NR_160746, exon 2 of 2) -4040 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 159.75-126 chr5 25582947 25583130 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 392085 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 192.5-89 chr3 21395286 21395535 + 1 NA Intergenic Intergenic -10316 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 131.75-210 chr8 41118764 41119026 + 1 NA Intergenic Intergenic 152248 NR_049801 100847068 NR_049801 ENSG00000263372 MIR548AO - microRNA 548ao ncRNA 158.5-89 chr19 45674240 45674526 + 1 NA promoter-TSS (NR_030372) promoter-TSS (NR_030372) -545 NR_030372 693227 NR_030372 ENSG00000207773 MIR642A MIR642|MIRN642|hsa-mir-642|hsa-mir-642a|mir-642a microRNA 642a ncRNA 181.25-83 chr3 61738409 61738731 + 1 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) AluYc|SINE|Alu 176999 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 265.5-34 chr19 38016091 38016487 + 1 NA intron (NM_015073, intron 1 of 21) intron (NM_015073, intron 1 of 21) 109081 NM_015073 23094 Hs.655502 NM_015073 ENSG00000105738 SIPA1L3 CTRCT45|SPAL3|SPAR3 signal induced proliferation associated 1 like 3 protein-coding 214.25-19 chr12 38397649 38397980 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 81040 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 120.75-183 chrX 140660261 140660413 + 1 NA Intergenic Intergenic -49422 NR_028345 286411 Hs.317627 NR_028344 ENSG00000203930 LINC00632 ASINC long intergenic non-protein coding RNA 632 ncRNA 138.5-213 chr9 122230104 122230263 + 1 NA Intergenic Intergenic -1226 NM_014368 26468 Hs.103137 NM_014368 ENSG00000106852 LHX6 LHX6.1 LIM homeobox 6 protein-coding 229.5-6 chr1 107431465 107431732 + 1 NA intron (NM_001113226, intron 5 of 6) intron (NM_001113226, intron 5 of 6) 256901 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 248.5-45 chr2 10583987 10584290 + 1 NA intron (NR_048552, intron 18 of 19) intron (NR_048552, intron 18 of 19) 105837 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 151.5-11 chr1 210767696 210767914 + 1 NA intron (NM_002238, intron 10 of 10) intron (NM_002238, intron 10 of 10) 365569 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 146.5-224 chr8 104170514 104170782 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) L1PB2|LINE|L1 -52687 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 285.25-40 chr8 118887791 118888121 + 1 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 63929 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 258.5-40 chr2 126071447 126071798 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 46363 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 115.5-244 chr8 137730026 137730218 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -316534 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 130.25-121 chr21 42707588 42707817 + 1 NA intron (NM_001001578, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR 53950 NM_001001583 5152 Hs.473927 NM_002606 ENSG00000160191 PDE9A HSPDE9A2 phosphodiesterase 9A protein-coding 163.75-83 chr20 55280118 55280386 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -142791 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 287.75-49 chr8 122107016 122107816 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 461228 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 213.5-27 chr11 88315851 88316255 + 1 NA intron (NM_001814, intron 2 of 6) intron (NM_001814, intron 2 of 6) 21683 NM_148170 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 165.5-101 chr20 38033013 38033248 + 1 NA promoter-TSS (NM_021215) promoter-TSS (NM_021215) 326 NM_014657 9675 Hs.655481 NM_014657 ENSG00000101407 TTI1 KIAA0406|smg-10 TELO2 interacting protein 1 protein-coding 143.75-21 chr10 83621947 83622210 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 55011 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 176.5-156 chr7 63132027 63132218 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 171934 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 277.5-21 chr14 47223775 47224358 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 119180 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 197.75-6 chr10 82657697 82658039 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1ME1|LINE|L1 -424948 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 114.25-150 chr5 93724305 93724509 + 1 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 17193 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 179.5-169 chr7 45571167 45571437 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2838 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 209.5-73 chr2 199918335 199918794 + 1 NA intron (NM_153689, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 7271 NM_153689 205327 Hs.154494 NM_153689 ENSG00000178074 C2orf69 - chromosome 2 open reading frame 69 protein-coding 144.25-221 chr9 120218719 120218893 + 1 NA Intergenic Intergenic 26244 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 153.5-149 chr4 180036328 180036537 + 1 NA Intergenic Intergenic 1122717 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 129.5-150 chr3 16743742 16743938 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -138417 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 192.75-93 chr3 183256743 183257123 + 1 NA intron (NM_032047, intron 1 of 1) intron (NM_032047, intron 1 of 1) 3680 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 396.25-15 chr6 57265183 57265795 + 1 NA Intergenic Intergenic -2143 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 267.5-3 chr1 64181235 64181633 + 1 NA TTS (NM_005012) TTS (NM_005012) -22189 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 218.5-38 chr14 36176143 36176391 + 1 NA intron (NR_049735, intron 1 of 3) intron (NR_049735, intron 1 of 3) 384 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 192.75-75 chr21 23387823 23388110 + 1 NA Intergenic Intergenic -3131 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 182.5-26 chr11 20148362 20148587 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 12001 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 139.75-160 chr6 138444965 138445150 + 1 NA intron (NM_001144060, intron 4 of 7) intron (NM_001144060, intron 4 of 7) -9763 NR_036099 100423001 NR_036099 ENSG00000266555 MIR3145 mir-3145 microRNA 3145 ncRNA 284.75-9 chr12 17181615 17182005 + 1 NA Intergenic Intergenic 193063 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 233.5-9 chr1 169949831 169950135 + 1 NA intron (NM_014970, intron 19 of 19) intron (NM_014970, intron 19 of 19) -56024 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 184.5-15 chr1 188546711 188547070 + 1 NA Intergenic Intergenic 1103262 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 256.25-47 chr8 86999235 86999655 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 133030 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 167.5-8 chr1 94072473 94072893 + 1 NA intron (NM_000350, intron 11 of 49) intron (NM_000350, intron 11 of 49) 48465 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 143.5-112 chr2 58287933 58288117 + 1 NA intron (NR_147010, intron 1 of 2) intron (NR_147010, intron 1 of 2) 12148 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 211.75-94 chr8 98014182 98014579 + 1 NA intron (NM_002380, intron 10 of 18) intron (NM_002380, intron 10 of 18) 27837 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 153.75-69 chr2 180380788 180381013 + 1 NA Intergenic Intergenic -311204 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 149.5-179 chr6 149766262 149766457 + 1 NA intron (NM_001252051, intron 1 of 6) L1MC4|LINE|L1 16618 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 264.5-34 chr2 104597954 104598386 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -87661 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 136.5-137 chr21 30465023 30465236 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 15238 NM_181607 337882 Hs.61552 NM_181607 ENSG00000184351 KRTAP19-1 KAP19.1 keratin associated protein 19-1 protein-coding 166.75-132 chr7 40591166 40591516 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 388598 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 269.5-5 chr1 202762183 202762503 + 1 NA intron (NM_001314042, intron 8 of 27) intron (NM_001314042, intron 8 of 27) 47127 NM_001347591 10765 Hs.18891 NM_006618 ENSG00000117139 KDM5B CT31|JARID1B|MRT65|PLU-1|PLU1|PPP1R98|PUT1|RBBP2H1A|RBP2-H1 lysine demethylase 5B protein-coding 174.5-58 chr14 30641443 30641649 + 1 NA intron (NM_016106, intron 6 of 24) intron (NM_016106, intron 6 of 24) 19227 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 230.5-16 chr10 74823360 74823611 + 1 NA Intergenic Intergenic -1770 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 146.75-144 chr6 159020513 159020713 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20411 NM_031924 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 168.75-78 chr2 213122005 213122194 + 1 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 28338 NM_001371275 154.25-23 chr11 34635826 34636109 + 1 NA intron (NM_001206616, intron 1 of 8) intron (NM_001206616, intron 1 of 8) 3401 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 242.5-58 chr3 180794822 180795282 + 1 NA intron (NR_109986, intron 3 of 13) L1M1|LINE|L1 75126 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 184.75-99 chr7 97018803 97019177 + 1 NA Intergenic Intergenic -4925 NR_015448 285987 Hs.34969 NR_015448 DLX6-AS1 DLX6-AS|DLX6AS|Evf-2|NCRNA00212 DLX6 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-67 chr14 65753122 65753386 + 1 NA Intergenic Intergenic 282152 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 156.5-37 chr12 38498455 38498666 + 1 NA Intergenic Intergenic 181786 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 171.5-14 chr10 51441255 51441459 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 141784 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 161.5-70 chr15 100181476 100181701 + 1 NA intron (NM_139057, intron 8 of 21) L1M1|LINE|L1 160387 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 252.5-64 chr5 7587741 7588169 + 1 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) L1M5|LINE|L1 191817 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 122.5-225 chr8 102687390 102687561 + 1 NA TTS (NR_160672) TTS (NR_160672) 31227 NR_160673 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 222.25-23 chr15 56164690 56165129 + 1 NA intron (NM_001368073, intron 2 of 8) intron (NM_001368073, intron 2 of 8) 25023 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 189.5-49 chr15 98738767 98739030 + 1 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -45528 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 214.25-43 chr2 118098370 118098984 + 1 NA intron (NM_001321329, intron 2 of 5) intron (NM_001321329, intron 2 of 5) 10127 NM_001321329 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 155.75-128 chr5 13176552 13176802 + 1 NA Intergenic Intergenic -143791 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 138.75-180 chr7 81101032 81101191 + 1 NA Intergenic Intergenic -178722 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 173.5-42 chr14 78044659 78044905 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -125591 NR_158973 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 247.25-59 chr8 117440850 117441240 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -79668 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 352.25-12 chr4 34425094 34425803 + 1 NA Intergenic Intergenic -155701 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 197.5-119 chr5 10983265 10983491 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 19 of 20) intron (NM_001288715, intron 19 of 20) -222144 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 127.5-127 chr2 148656203 148656454 + 1 NA intron (NM_015630, intron 1 of 13) intron (NM_015630, intron 1 of 13) 11577 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 166.75-76 chr2 56741750 56742002 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -556106 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 130.5-216 chr6 144384970 144385133 + 1 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) -20604 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 298.75-3 chr1 34611826 34612468 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 57547 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 210.5-43 chr15 76083576 76083922 + 1 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 23764 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 153.5-7 chr1 164845444 164845744 + 1 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) intron (NM_001353131, intron 7 of 7) -70953 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 245.25-33 chr2 18132433 18132807 + 1 NA Intergenic Intergenic 253953 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 174.5-148 chr5 77335566 77335838 + 1 NA intron (NM_001029851, intron 5 of 18) intron (NM_001029851, intron 5 of 18) 125022 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 214.5-80 chr3 62500894 62501251 + 1 NA intron (NM_183393, intron 16 of 26) intron (NM_183393, intron 16 of 26) -127522 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 149.5-3 chr1 54635960 54636209 + 1 NA 3' UTR (NM_015547, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_015547, exon 17 of 17) -5656 NM_001291332 374977 Hs.412482 NM_198547 ENSG00000184313 MROH7 C1orf175|HEATR8 maestro heat like repeat family member 7 protein-coding 264.75-22 chr2 108771805 108772270 + 1 NA intron (NM_006267, intron 21 of 28) intron (NM_006267, intron 21 of 28) -14713 NR_130121 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 281.25-48 chr8 133426735 133427234 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -129680 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 285.25-17 chr20 33262769 33263270 + 1 NA Intergenic Intergenic -20195 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 201.25-82 chr6 121758009 121758339 + 1 NA Intergenic (ATACAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 322528 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 283.75-18 chr2 115881562 115882133 + 1 NA Intergenic Intergenic 538032 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 228.5-100 chr8 20263926 20264326 + 1 NA intron (NM_021020, intron 1 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 9409 NM_001362884 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 337.5-25 chr6 21043562 21044176 + 1 NA intron (NM_017774, intron 11 of 15) intron (NM_017774, intron 11 of 15) 468023 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 174.25-35 chr12 43713897 43714161 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 44761 NM_031292 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 181.25-81 chr3 37373572 37373969 + 1 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 -12499 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 174.5-127 chr3 127412564 127412751 + 1 NA Intergenic Intergenic -21987 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 202.5-119 chr5 110326824 110327159 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 186924 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 277.5-64 chr5 95046292 95046806 + 1 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) intron (NM_024717, intron 1 of 22) 35317 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 173.5-86 chr21 15133857 15134225 + 1 NA Intergenic Intergenic -69041 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 146.25-148 chr8 83688362 83688721 + 1 NA Intergenic Intergenic 284783 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 222.5-28 chr13 32912543 32912959 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1099 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 148.25-116 chr4 154996156 154996398 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -212359 NM_001370180 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 228.5-63 chr2 205473375 205473786 + 1 NA intron (NM_057177, intron 19 of 21) intron (NM_057177, intron 19 of 21) -208920 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 185.5-110 chr3 107838510 107838766 + 1 NA Intergenic Intergenic 39430 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 141.5-33 chr12 12273921 12274121 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -6977 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 136.25-56 chr14 49461963 49462168 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 124315 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 199.5-132 chr7 2686358 2686647 + 1 NA intron (NM_133463, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu -1700 NM_001284355 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 117.5-107 chr2 99369885 99370114 + 1 NA intron (NM_015904, intron 8 of 23) AluSc8|SINE|Alu 32610 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 261.75-53 chr8 107792759 107793203 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 288958 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 126.25-154 chr5 52694690 52694854 + 1 NA Intergenic Intergenic -93144 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 170.5-40 chr11 82540217 82540464 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -136427 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 260.5-62 chr8 34722619 34722941 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -61141 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 200.5-16 chr10 65196340 65196581 + 1 NA Intergenic Intergenic -271942 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 215.25-53 chr21 33924477 33924736 + 1 NA Intergenic Intergenic -6516 NR_038883 100506334 Hs.532855 NM_207472 ENSG00000237945 LINC00649 - long intergenic non-protein coding RNA 649 ncRNA 207.25-45 chr2 138335895 138336225 + 1 NA Intergenic Intergenic -165710 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 237.5-11 chr1 217148206 217148482 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -10642 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 219.5-45 chr15 65486532 65486926 + 1 NA intron (NR_135485, intron 7 of 20) L1PB2|LINE|L1 30545 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 225.5-12 chr10 30402582 30403118 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -30943 NR_120609 729668 Hs.652158 NR_003524 GOLGA2P6 - GOLGA2 pseudogene 6 pseudo 194.25-109 chr7 139257230 139257587 + 1 NA intron (NM_173569, intron 3 of 17) AluSx3|SINE|Alu 26171 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 116.5-214 chr6 55536271 55536396 + 1 NA intron (NM_001287746, intron 4 of 9) intron (NM_001287746, intron 4 of 9) 42881 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 258.25-20 chr14 47008569 47008827 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) MIR3|SINE|MIR 334548 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 224.25-80 chr5 138369128 138369454 + 1 NA intron (NM_016604, intron 1 of 23) intron (NM_016604, intron 1 of 23) 16606 NM_016604 51780 Hs.483486 NM_016604 ENSG00000120733 KDM3B 5qNCA|C5orf7|JMJD1B|NET22 lysine demethylase 3B protein-coding 144.5-185 chr6 13321359 13321512 + 1 NA intron (NM_001318806, intron 2 of 2) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 7102 NM_001318806 51256 Hs.484678 NM_016495 ENSG00000145979 TBC1D7 MGCPH|PIG51|TBC7 TBC1 domain family member 7 protein-coding 224.5-61 chr2 74240968 74241250 + 1 NA intron (NM_133478, intron 20 of 30) intron (NM_133478, intron 20 of 30) 42494 NM_006636 10797 Hs.469030 NM_006636 ENSG00000065911 MTHFD2 NMDMC methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase protein-coding 190.5-99 chr3 41883456 41883809 + 1 NA intron (NR_136342, intron 16 of 34) intron (NR_136342, intron 16 of 34) 78471 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 220.25-23 chr17 55858258 55858665 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 107356 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 226.25-73 chr8 125225878 125226225 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 134191 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 206.25-59 chr20 63779726 63779976 + 1 NA intron (NM_001369741, intron 2 of 4) AluSp|SINE|Alu 25652 NM_025224 140685 Hs.585028 NM_025224 ENSG00000130584 ZBTB46 BTBD4|BZEL|RINZF|ZNF340|dJ583P15.7|dJ583P15.8 zinc finger and BTB domain containing 46 protein-coding 256.5-51 chr4 79153670 79153930 + 1 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) intron (NR_038342, intron 3 of 5) 172261 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 299.25-11 chr11 120459734 120460188 + 1 NA intron (NM_015313, intron 26 of 40) AluSz|SINE|Alu -51785 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 272.75-28 chr20 2444333 2444940 + 1 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 18411 NR_003684 100113378 NR_003684 SNORD119 - small nucleolar RNA, C/D box 119 snoRNA 113.75 chr1 19155556 19155815 + 1 NA intron (NM_020765, intron 42 of 105) intron (NM_020765, intron 42 of 105) 54581 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 245.25-7 chr10 29611179 29611652 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) intron (NM_001323599, intron 3 of 38) -9069 NR_030634 100126327 NR_030634 ENSG00000216035 MIR938 MIRN938|hsa-mir-938 microRNA 938 ncRNA 234.75-57 chr4 36973293 36973760 + 1 NA Intergenic Intergenic -28253 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 175.25-92 chr3 28447954 28448150 + 1 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) intron (NM_001324170, intron 3 of 6) 98903 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 124.5-135 chr22 28734539 28734717 + 1 NA exon (NM_001005735, exon 2 of 16) exon (NM_001005735, exon 2 of 16) 7192 NM_001257387 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 230.5-73 chr20 50627762 50628080 + 1 NA intron (NM_001290268, intron 2 of 21) intron (NM_001290268, intron 2 of 21) 8997 NM_080829 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 167.75-34 chr11 113416808 113417060 + 1 NA exon (NM_000795, exon 4 of 8) exon (NM_000795, exon 4 of 8) 29155 NM_178510 255239 Hs.448473 NM_178510 ENSG00000170209 ANKK1 PKK2|sgK288 ankyrin repeat and kinase domain containing 1 protein-coding 163.25-72 chr2 197417702 197418070 + 1 NA TTS (NM_001308824) TTS (NM_001308824) 17207 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 206.5-80 chr4 61101675 61102039 + 1 NA Intergenic Intergenic -41799 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 210.5-94 chr5 39137152 39137403 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 7 of 18) intron (NM_001243093, intron 7 of 18) -62878 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 197.75-29 chr17 42984585 42984891 + 1 NA intron (NM_001321381, intron 2 of 5) intron (NM_001321381, intron 2 of 5) 4173 NM_001321381 146923 Hs.632255 NM_173079 ENSG00000198863 RUNDC1 - RUN domain containing 1 protein-coding 195.75-92 chr5 41238892 41239101 + 1 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) L1MA4A|LINE|L1 22473 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 194.5-106 chr4 69579474 69579928 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -53687 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 117.25-90 chr17 35624881 35625048 + 1 NA intron (NM_001030006, intron 6 of 21) intron (NM_001030006, intron 6 of 21) 37642 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 280.25-10 chr10 97043536 97044157 + 1 NA intron (NM_003061, intron 18 of 36) L2|LINE|L2 -58910 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 204.75-99 chr6 37911272 37911672 + 1 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) L1MA8|LINE|L1 91745 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 243.5-27 chr14 41240735 41241011 + 1 NA Intergenic Intergenic 286162 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 279.75-52 chr7 39362383 39362696 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) intron (NM_001370959, intron 5 of 9) -33405 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 136.25-99 chr2 195993599 195993882 + 1 NA intron (NM_018897, intron 12 of 64) intron (NM_018897, intron 12 of 64) 75097 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 272.5-75 chr9 27559842 27560229 + 1 NA TTS (NM_145005) TTS (NM_145005) 13446 NM_018325 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 140.5-198 chr6 81900486 81900759 + 1 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) intron (NR_149135, intron 3 of 3) 32858 NR_149136 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 212.75-48 chr19 48285810 48286095 + 1 NA exon (NM_153608, exon 6 of 6) exon (NM_153608, exon 6 of 6) 14665 NM_001369812 163071 Hs.511883 NM_153608 ENSG00000178150 ZNF114 - zinc finger protein 114 protein-coding 121.25-135 chr3 119661212 119661413 + 1 NA promoter-TSS (NM_001308333) promoter-TSS (NM_001308333) -722 NM_001308333 64091 Hs.534383 NM_022135 ENSG00000121577 POPDC2 POP2 popeye domain containing 2 protein-coding 278.25 chr1 71138668 71139052 + 1 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 57536 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 180.75-148 chr8 100470251 100470593 + 1 NA Intergenic Intergenic 87659 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 213.75-104 chr8 123774816 123775101 + 1 NA intron (NM_144963, intron 2 of 23) intron (NM_144963, intron 2 of 23) 6519 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 117.25-62 chr13 97539603 97539756 + 1 NA Intergenic Intergenic 105510 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 112.25-141 chr3 153607698 153607823 + 1 NA intron (NR_146713, intron 3 of 6) L1MEd|LINE|L1 123265 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 149.25-182 chr8 83568578 83568755 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 164908 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 216.5-41 chr16 54753443 54753772 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 94626 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 146.25-58 chr18 8296023 8296237 + 1 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 70904 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 182.25-74 chr3 26456135 26456492 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -166493 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 166.5-208 chr9 7352044 7352257 + 1 NA Intergenic Intergenic 447628 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 242.5-74 chr7 16251866 16252279 + 1 NA intron (NR_038946, intron 2 of 4) L1PA6|LINE|L1 41586 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 200.75-32 chr15 38675950 38676367 + 1 NA Intergenic Intergenic -20440 NR_160786 203.75-68 chr3 37586319 37586695 + 1 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) intron (NM_002207, intron 15 of 27) 134366 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 255.25-39 chr5 41646798 41647187 + 1 NA Intergenic Intergenic -136391 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 136.5-89 chr17 32490194 32490455 + 1 NA 3' UTR (NM_003885, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_003885, exon 2 of 2) 3331 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 173.5-109 chr4 39321088 39321316 + 1 NA intron (NM_001204747, intron 8 of 24) intron (NM_001204747, intron 8 of 24) 45160 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 259.5-66 chr3 51509295 51509627 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -9446 NM_001349171 9730 Hs.716623 NM_014703 ENSG00000145041 DCAF1 RIP|VPRBP DDB1 and CUL4 associated factor 1 protein-coding 260.25-55 chr8 102244118 102244513 + 1 NA intron (NR_125415, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 4864 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 147.5-84 chr17 65208334 65208577 + 1 NA intron (NM_003835, intron 16 of 18) intron (NM_003835, intron 16 of 18) 71085 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 175.5-32 chr11 65277209 65277430 + 1 NA intron (NM_002689, intron 5 of 17) AluJb|SINE|Alu 15357 NM_002689 23649 Hs.201897 NM_002689 ENSG00000014138 POLA2 - DNA polymerase alpha 2, accessory subunit protein-coding 112.25-142 chr3 181652598 181652856 + 1 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) intron (NR_075090, intron 2 of 2) 42393 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 152.5-188 chr8 68721765 68721974 + 1 NA intron (NM_001349479, intron 9 of 11) intron (NM_001349479, intron 9 of 11) 382321 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 289.75-32 chr8 93279052 93279494 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -112423 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 132.75-112 chr20 10608924 10609081 + 1 NA intron (NM_001009608, intron 6 of 7) MIR1_Amn|SINE|MIR 40693 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 113.5-41 chr10 121852789 121852956 + 1 NA intron (NM_001001976, intron 8 of 11) intron (NM_001001976, intron 8 of 11) 75159 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 333.75-17 chr20 63299543 63300081 + 1 NA intron (NM_020882, intron 3 of 35) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6626 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 319.75-5 chr12 71325646 71326093 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -113929 NM_003667 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 182.5-76 chr2 51917483 51917729 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -453042 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 134.25-79 chr2 55234490 55234780 + 1 NA intron (NM_002954, intron 4 of 5) L1MC5a|LINE|L1 471 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 193.25-71 chr3 59344474 59344872 + 1 NA Intergenic Intergenic -294641 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 146.5-7 chr1 62691775 62692017 + 1 NA Intergenic Intergenic -3510 NM_001367561 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 154.25-157 chr7 71400959 71401114 + 1 NA intron (NM_022479, intron 3 of 10) intron (NM_022479, intron 3 of 10) -93266 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 257.75-44 chr6 126009975 126010566 + 1 NA intron (NR_146795, intron 10 of 14) intron (NR_146795, intron 10 of 14) 23730 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 114.75-154 chr5 63394184 63394376 + 1 NA Intergenic Intergenic 568012 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 269.25-35 chr4 21755415 21755754 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -57889 NM_001035003 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 163.5-209 chr8 124089271 124089473 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 33 of 40) L1MA3|LINE|L1 -48590 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 160.25-129 chr5 104362688 104363029 + 1 NA Intergenic Intergenic -736616 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 161.5-181 chr8 24584591 24584794 + 1 NA Intergenic Intergenic -36074 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 367.5-21 chrX 81440416 81440932 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 238572 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 206.5-73 chr3 77778083 77778426 + 1 NA Intergenic Intergenic 270709 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 177.75-127 chr7 20301615 20301930 + 1 NA intron (NR_110117, intron 3 of 4) intron (NR_110117, intron 3 of 4) 5064 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 124.75-210 chr9 18432076 18432285 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -41973 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 114.75-21 chr1 238261940 238262081 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 224007 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 148.5-77 chr16 63418205 63418428 + 1 NA Intergenic LTR18A|LTR|ERVL -1381878 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 213.5-108 chr6 84285336 84285626 + 1 NA Intergenic Intergenic -57838 NM_014895 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 153.25-14 chr10 44762733 44762921 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -148489 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 197.5-65 chr2 36037101 36037440 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 318300 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 214.5-29 chr13 114031676 114032147 + 1 NA intron (NM_001320821, intron 6 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 6 of 25).2 46044 NM_001320822 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 175.5-135 chr5 31425392 31425654 + 1 NA intron (NM_013235, intron 26 of 34) intron (NM_013235, intron 26 of 34) 106570 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 263.5-36 chr20 50554881 50555251 + 1 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) L1MEc|LINE|L1 -30720 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 248.5-39 chr18 51179888 51180296 + 1 NA intron (NM_016626, intron 1 of 1) intron (NM_016626, intron 1 of 1) 17589 NM_016626 51320 Hs.465144 NM_016626 ENSG00000176624 MEX3C BM-013|MEX-3C|RKHD2|RNF194 mex-3 RNA binding family member C protein-coding 166.75-72 chr19 41310636 41310885 + 1 NA 5' UTR (NM_001346100, exon 1 of 5) 5' UTR (NM_001346100, exon 1 of 5) 283 NM_001346100 90324 Hs.437497 NM_052848 ENSG00000142039 CCDC97 - coiled-coil domain containing 97 protein-coding 124.75-104 chr18 73355422 73355764 + 1 NA Intergenic Intergenic 30652 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 177.25-58 chr17 67444362 67444661 + 1 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) -26978 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 332.25-10 chr14 63989833 63990218 + 1 NA intron (NM_015180, intron 19 of 114) intron (NM_015180, intron 19 of 114) 105100 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 217.75-76 chr8 117746514 117747017 + 1 NA Intergenic Intergenic 174148 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 125.5-222 chr6 128886012 128886184 + 1 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) L3|LINE|CR1 2957 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 142.5-170 chr5 69171705 69172001 + 1 NA intron (NM_001354845, intron 4 of 7) intron (NM_001354845, intron 4 of 7) 4703 NM_031966 891 Hs.23960 NM_031966 ENSG00000134057 CCNB1 CCNB cyclin B1 protein-coding 203.5-9 chr1 115259637 115260044 + 1 NA Intergenic Intergenic -23194 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 347.75-4 chr2 79826722 79827177 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 39634 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 215.75-102 chr9 26117469 26117910 + 1 NA 3' UTR (NM_001004352, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001004352, exon 7 of 7) 51014 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 220.5-51 chr2 102959105 102959440 + 1 NA Intergenic Intergenic 25157 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 173.5-18 chr10 60635487 60635838 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) -62706 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 178.5-18 chr10 120222874 120223147 + 1 NA Intergenic Intergenic 132213 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 162.25-61 chr16 3965676 3965859 + 1 NA 3' UTR (NM_001116, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001116, exon 11 of 11) -15323 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 261.25-34 chr4 74202808 74203374 + 1 NA intron (NM_001144978, intron 5 of 7) intron (NM_001144978, intron 5 of 7) 44973 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 154.75-24 chr11 111323473 111323698 + 1 NA Intergenic Intergenic -18537 NM_001302644 399948 Hs.729225 NM_207429 COLCA1 C11orf92|CASC12|LOH11CR1F colorectal cancer associated 1 protein-coding 127.25-111 chr21 8995656 8995997 + 1 NA Intergenic Intergenic 8209 NR_162105 113218501 NR_162105 MIR10396A - microRNA 10396a ncRNA 193.5-29 chr12 32058026 32058272 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -48658 NM_001363603 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 186.75-93 chr5 143364472 143364699 + 1 NA intron (NR_157096, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 38698 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 115.5-183 chr4 30489597 30489845 + 1 NA Intergenic Intergenic -230648 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 246.5-27 chr15 48510307 48510698 + 1 NA intron (NM_000138, intron 13 of 65) intron (NM_000138, intron 13 of 65) 135286 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 144.75-180 chr8 106925101 106925294 + 1 NA Intergenic Intergenic -154953 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 229.5-99 chr4 53930064 53930416 + 1 NA Intergenic Intergenic 57042 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 155.75-29 chr11 38167766 38168017 + 1 NA Intergenic Intergenic 229290 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 141.5-169 chr5 28407720 28407870 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -120130 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 147.25-145 chr8 106675227 106675494 + 1 NA intron (NM_181354, intron 1 of 13) L1MEg|LINE|L1 17552 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 155.5-110 chr20 37966402 37966611 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 63379 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 145.5-47 chr12 60693394 60693571 + 1 NA Intergenic Intergenic 1004112 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 146.5-158 chr4 117819634 117819890 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -14639 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 126.25-175 chr6 52020093 52020292 + 1 NA intron (NM_138694, intron 33 of 66) intron (NM_138694, intron 33 of 66) 67421 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 134.75-48 chr12 8062159 8062339 + 1 NA intron (NM_004054, intron 1 of 1) intron (NM_004054, intron 1 of 1) 4110 NM_001326477 719 Hs.504656 NM_004054 ENSG00000171860 C3AR1 AZ3B|C3AR|HNFAG09 complement C3a receptor 1 protein-coding 240.25-33 chr2 119756282 119756640 + 1 NA Intergenic Intergenic -3461 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 184.5-93 chr22 25880632 25881065 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 25 of 43) L2a|LINE|L2 138660 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 310.5-20 chr2 190733450 190733917 + 1 NA Intergenic Intergenic 74525 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 222.75-103 chr8 137642518 137642833 + 1 NA Intergenic Intergenic -229087 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 142.25-108 chr3 65922695 65922921 + 1 NA intron (NR_046575, intron 2 of 2) intron (NR_046575, intron 2 of 2) 28992 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 123.25-130 chr3 59510727 59511086 + 1 NA Intergenic Intergenic 147591 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 146.5-23 chr1 238887205 238887487 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -401329 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 153.25-115 chr6 130785260 130785540 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -42005 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 300.75-10 chr12 22455357 22455822 + 1 NA intron (NM_001286176, intron 25 of 26) intron (NM_001286176, intron 25 of 26) 88608 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 204.5-91 chr3 65376466 65376807 + 1 NA intron (NM_004742, intron 18 of 22) intron (NM_004742, intron 18 of 22) -517180 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 182.25-119 chr8 62091134 62091392 + 1 NA Intergenic Intergenic -157591 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 188.5-131 chr6 53025732 53026009 + 1 NA intron (NM_014920, intron 5 of 13) intron (NM_014920, intron 5 of 13) 30250 NR_001445 125050 NR_001445 ENSG00000202198 RN7SK 7SK RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein snRNA 134.75-79 chr15 96328373 96328632 + 1 NA intron (NM_001145155, intron 1 of 2) intron (NM_001145155, intron 1 of 2) -1141 NR_102744 644192 Hs.58690 NR_102743 ENSG00000247809 NR2F2-AS1 - NR2F2 antisense RNA 1 ncRNA 156.25-94 chr3 27346358 27346724 + 1 NA intron (NM_152534, intron 4 of 38) MER5B|DNA|hAT-Charlie 22842 NM_199347 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 171.5-141 chr7 123295012 123295286 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -95178 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 128.5-119 chr2 194323610 194323831 + 1 NA Intergenic Intergenic -20549 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 121.75-18 chr11 22032479 22032679 + 1 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -160506 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 208.5-150 chr9 31129655 31129952 + 1 NA Intergenic Intergenic 251687 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 124.25-116 chr20 46983305 46983562 + 1 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) L1MEg|LINE|L1 88590 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 227.25-57 chr4 21372846 21373091 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -69062 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 137.5-54 chr12 57833665 57833913 + 1 NA intron (NM_005730, intron 1 of 7) intron (NM_005730, intron 1 of 7) -9097 NR_029847 407016 NR_029847 ENSG00000207789 MIR26A2 MIRN26A2|mir-26a-2 microRNA 26a-2 ncRNA 241.75-64 chr5 152693841 152694138 + 1 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) intron (NR_109877, intron 3 of 4) 278360 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 179.75-4 chr1 76074051 76074361 + 1 NA promoter-TSS (NM_001160011) promoter-TSS (NM_001160011) -540 NM_001349107 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 197.5-84 chr20 5581509 5581749 + 1 NA intron (NM_019593, intron 6 of 19) intron (NM_019593, intron 6 of 19) 29377 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 148.25-113 chr4 120861800 120862103 + 1 NA intron (NM_001300824, intron 2 of 13) intron (NM_001300824, intron 2 of 13) 60915 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 157.75-44 chr14 32556050 32556365 + 1 NA intron (NM_004274, intron 4 of 13) L1MB2|LINE|L1 226909 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 192.5-98 chr4 59985169 59985518 + 1 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -937276 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 174.75-62 chr2 114635630 114635818 + 1 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 174147 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 177.5 chr1 10052426 10052728 + 1 NA intron (NM_006048, intron 1 of 26) MER45A|DNA|hAT-Tip100 19619 NM_006048 10277 Hs.593974 NM_006048 ENSG00000130939 UBE4B E4|HDNB1|UBOX3|UFD2|UFD2A ubiquitination factor E4B protein-coding 133.75-180 chr7 95673554 95673730 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -77126 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 153.5-40 chr12 5294830 5295035 + 1 NA Intergenic Intergenic -51781 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 283.5-9 chr11 38760999 38761454 + 1 NA Intergenic Intergenic 112368 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 326.25-9 chr12 78711819 78712219 + 1 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -151963 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 266.5-53 chr4 32353270 32353808 + 1 NA TTS (NR_134672) TTS (NR_134672) 2501 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 197.75-64 chr4 137841254 137841766 + 1 NA Intergenic Intergenic -247504 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-190 chr8 127789895 127790267 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4452 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 255.5-23 chr13 90052404 90052824 + 1 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 67103 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 249.5-50 chr2 107704318 107704668 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -49619 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 288.5-23 chr2 188674541 188675074 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 115316 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 130.5-150 chr20 55976595 55976786 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 28829 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 219.75-20 chr14 67281588 67281851 + 1 NA intron (NM_001256550, intron 3 of 14) intron (NM_001256550, intron 3 of 14) 40284 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 282.5-30 chr2 108782141 108782455 + 1 NA exon (NM_006267, exon 27 of 29) exon (NM_006267, exon 27 of 29) -4452 NR_130121 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 210.75-41 chr2 122872722 122873118 + 1 NA Intergenic Intergenic 200561 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 155.5-148 chr4 92866698 92866962 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) AluY|SINE|Alu 562431 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 234.25-67 chr6 127001688 127002018 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -116818 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 211.5-115 chr4 65819790 65820144 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -149472 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 183.75-134 chrX 151377016 151377274 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19450 NM_001363810 203547 Hs.58633 NM_001017980 ENSG00000160131 VMA21 MEAX|XMEA vacuolar ATPase assembly factor VMA21 protein-coding 133.75-161 chr5 36501265 36501430 + 1 NA Intergenic Intergenic -105008 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 189.25-91 chr4 67479866 67480335 + 1 NA intron (NR_155754, intron 17 of 18) AluSq2|SINE|Alu -58100 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 149.5-84 chr19 41170415 41170770 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22627 NM_030622 29785 Hs.98370 NM_030622 ENSG00000167600 CYP2S1 CYPIIS1 cytochrome P450 family 2 subfamily S member 1 protein-coding 115.25-65 chr14 74049962 74050119 + 1 NA exon (NM_025057, exon 8 of 12) exon (NM_025057, exon 8 of 12) 30691 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 203.75-31 chr14 56920899 56921197 + 1 NA TTS (NR_146411) TTS (NR_146411) 107890 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 155.75-69 chr18 10206365 10206718 + 1 NA Intergenic Intergenic 207829 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 198.5-163 chr9 80566418 80566807 + 1 NA Intergenic Intergenic 591589 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 248.25-41 chr20 22960398 22960712 + 1 NA Intergenic Intergenic -74865 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 206.75-14 chr12 9768183 9768596 + 1 NA Intergenic Intergenic -7488 NM_001781 969 Hs.208854 NM_001781 ENSG00000110848 CD69 AIM|BL-AC/P26|CLEC2C|EA1|GP32/28|MLR-3 CD69 molecule protein-coding 179.25-139 chr7 80054170 80054352 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -80570 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 339.75-34 chr9 79018200 79018706 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 127213 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 197.25-14 chr10 123058085 123058572 + 1 NA TTS (NM_001330174) TTS (NM_001330174) 49322 NM_001330174 36 Hs.81934 NM_001609 ENSG00000196177 ACADSB 2-MEBCAD|ACAD7|SBCAD acyl-CoA dehydrogenase short/branched chain protein-coding 132.25-35 chr10 100158901 100159064 + 1 NA intron (NR_144760, intron 8 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 27047 NM_001347860 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 187.25-64 chr21 16063308 16063642 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -7013 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 147.5-59 chr14 49669592 49669844 + 1 NA intron (NM_001348385, intron 5 of 18) intron (NM_001348385, intron 5 of 18) 18496 NM_001197331 5427 Hs.162777 NM_002692 ENSG00000100479 POLE2 DPE2 DNA polymerase epsilon 2, accessory subunit protein-coding 140.5-222 chr7 144139862 144140118 + 1 NA Intergenic Intergenic 10877 NM_001001659 135941 Hs.534547 NM_001001659 ENSG00000221938 OR2A14 OR2A14P|OR2A6|OST182 olfactory receptor family 2 subfamily A member 14 protein-coding 194.25-62 chr2 159736045 159736500 + 1 NA intron (NM_001282807, intron 1 of 8) L1MB8|LINE|L1 2308 NM_001282807 64844 Hs.529272 NM_022826 ENSG00000136536 MARCH7 AXO|AXOT|MARCH-VII|RNF177 membrane associated ring-CH-type finger 7 protein-coding 139.75-35 chr12 43156591 43156869 + 1 NA intron (NR_146866, intron 1 of 3) intron (NR_146866, intron 1 of 3) 1415 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 147.75-33 chr13 75337637 75337951 + 1 NA intron (NM_001286658, intron 7 of 19) intron (NM_001286658, intron 7 of 19) 97206 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 170.75-108 chr5 110429134 110429378 + 1 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) intron (NM_001039763, intron 12 of 13) 84659 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 121.5-47 chr11 95274553 95274764 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -42183 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 190.25-60 chr19 37007264 37007621 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -70780 NM_001329520 147923 Hs.444992 NM_144689 ENSG00000197050 ZNF420 APAK zinc finger protein 420 protein-coding 155.25-166 chr7 88986432 88986800 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -190879 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 386.25-11 chr5 12310506 12311237 + 1 NA Intergenic Intergenic -263986 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 140.5-165 chr4 73192257 73192639 + 1 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 30609 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 302.25-5 chr12 4992374 4993194 + 1 NA Intergenic Intergenic -51095 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 274.5-28 chr18 77939272 77939703 + 1 NA Intergenic Intergenic 54240 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 242.25-57 chr3 97678286 97678718 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) L2|LINE|L2 -86019 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 192.5-52 chr16 85226301 85226644 + 1 NA Intergenic Intergenic 18676 NR_162142 113219463 NR_162142 MIR12128 - microRNA 12128 ncRNA 183.5-123 chr6 48295869 48296083 + 1 NA Intergenic Intergenic -227287 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 145.5-135 chr3 108916666 108916903 + 1 NA intron (NM_001363884, intron 2 of 3) intron (NM_001363884, intron 2 of 3) 37062 NM_001363884 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 291.5-31 chr3 117563264 117563762 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 127412 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 162.25-54 chr15 55093936 55094133 + 1 NA Intergenic Intergenic 37287 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 365.5-3 chr1 158046049 158046551 + 1 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 20750 NR_145471 100505785 Hs.664656 NR_145471 KIRREL1-IT1 KIRREL-IT1 KIRREL1 intronic transcript 1 ncRNA 189.75-128 chr9 28645455 28645684 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 73736 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 169.5-182 chrX 53546384 53546725 + 1 NA exon (NM_031407, exon 70 of 84) exon (NM_031407, exon 70 of 84) 9787 NR_029513 407054 NR_029513 ENSG00000271886 MIR98 MIRLET7L|MIRN98|hsa-mir-98|miR-98 microRNA 98 ncRNA 120.5-136 chr21 20629404 20629594 + 1 NA Intergenic Intergenic 173609 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 223.5 chr1 31935924 31936194 + 1 NA intron (NM_001369859, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 1759 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 140.75-72 chr17 79661724 79661949 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 45413 NR_039893 100616170 NR_039893 ENSG00000266665 MIR4739 mir-4739 microRNA 4739 ncRNA 425.5 chr1 45884534 45885282 + 1 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) intron (NM_001324320, intron 4 of 29) 20560 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 217.75-71 chr8 30486114 30486525 + 1 NA intron (NM_001008710, intron 4 of 8) AluSx|SINE|Alu -100918 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 146.5-60 chr14 29470243 29470422 + 1 NA Intergenic Intergenic 456764 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 213.5-123 chr8 88129539 88129874 + 1 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 197777 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 289.5 chr1 77441218 77441709 + 1 NA intron (NM_012093, intron 8 of 13) L1M2a|LINE|L1 158376 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 191.75-102 chr5 59165569 59165877 + 1 NA intron (NM_001364602, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR 110392 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 245.75-18 chr14 70968674 70969049 + 1 NA intron (NM_014982, intron 4 of 35) intron (NM_014982, intron 4 of 35) 61402 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 185.75-14 chr10 35376877 35377187 + 1 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 40158 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 182.5-113 chr4 3216276 3216583 + 1 NA intron (NM_002111, intron 51 of 66) MIR|SINE|MIR -27940 NM_001330620 345222 Hs.442291 NM_001012982 ENSG00000188981 MSANTD1 C4orf44 Myb/SANT DNA binding domain containing 1 protein-coding 129.25-70 chr17 78511511 78511683 + 1 NA intron (NM_173628, intron 26 of 80) intron (NM_173628, intron 26 of 80) 26687 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 450.5-2 chr11 108076593 108077174 + 1 NA intron (NM_003478, intron 10 of 18) L2|LINE|L2 -44684 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 302.5-38 chr6 65607984 65608508 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -28442 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 482.25-3 chr16 51386384 51386988 + 1 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -235414 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 144.5-40 chr11 27855357 27855515 + 1 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -133406 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 176.5-126 chr3 116425646 116425840 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) (TAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19744 NM_002338 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 212.25-63 chr4 31649266 31649565 + 1 NA Intergenic Intergenic 142871 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 224.25-57 chr3 117268457 117269002 + 1 NA Intergenic Intergenic 347298 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 227.75-27 chr17 14554582 14554922 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 251012 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 180.75-38 chr14 57876693 57876925 + 1 NA Intergenic Intergenic -10717 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 191.75-36 chr14 32816188 32816468 + 1 NA intron (NM_004274, intron 12 of 13) AluJr|SINE|Alu -122551 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 166.5-186 chr7 5578490 5578688 + 1 NA Intergenic Intergenic -14227 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 257.25-42 chr5 85252450 85252804 + 1 NA Intergenic Intergenic -867747 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 255.25-46 chr6 138113734 138114128 + 1 NA Intergenic Intergenic -6512 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 174.25-105 chr3 179835387 179835561 + 1 NA intron (NM_001349408, intron 8 of 14) intron (NM_001349408, intron 8 of 14) -62720 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 182.25-106 chr6 155049103 155049369 + 1 NA Intergenic Intergenic -41053 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 229.75-48 chr3 89301641 89302120 + 1 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 194259 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 203.5-3 chr1 30221695 30222052 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -184261 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 159.25-94 chr3 174046687 174047064 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -126079 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 216.5-36 chr15 59954051 59954309 + 1 NA Intergenic Intergenic -50131 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 205.5-110 chr4 169780359 169780710 + 1 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -22590 NM_017867 54969 Hs.406756 NM_017867 ENSG00000056050 HPF1 C4orf27 histone PARylation factor 1 protein-coding 293.75-14 chr15 69460529 69461066 + 1 NA Intergenic Intergenic 7979 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 127.5-186 chr5 30065264 30065567 + 1 NA Intergenic Intergenic 184855 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 166.75-14 chr10 44401136 44401393 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -16167 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 173.5-118 chr4 121697837 121698045 + 1 NA promoter-TSS (NM_001154) promoter-TSS (NM_001154) -961 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 149.5-210 chr8 123386950 123387169 + 1 NA intron (NM_014109, intron 1 of 27) L1ME4a|LINE|L1 9388 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 313.5-36 chr7 95495479 95495896 + 1 NA intron (NM_145872, intron 1 of 2) intron (NM_145872, intron 1 of 2) 9744 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 190.75 chr1 79625813 79626054 + 1 NA Intergenic Intergenic -619203 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 228.5-74 chr4 6735520 6736126 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 19649 NM_018366 55330 Hs.7570 NM_018366 ENSG00000186222 BLOC1S4 BCAS4L|BLOS4|CNO biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 4 protein-coding 231.25-25 chr16 71272460 71272722 + 1 NA Intergenic Intergenic 16811 NM_001099642 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 271.25-20 chr12 126944991 126945505 + 1 NA intron (NR_104646, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 -70558 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 285.5-52 chr6 113690610 113691009 + 1 NA Intergenic Intergenic -40734 NR_125844 101927686 Hs.402044 NR_125844 ENSG00000230943 LINC02541 - long intergenic non-protein coding RNA 2541 ncRNA 362.25-5 chr2 12936669 12937103 + 1 NA Intergenic Intergenic 70127 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 128.75-6 chr1 83580452 83580618 + 1 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 134481 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 245.75-11 chr11 124347769 124348151 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -27763 NM_001002918 283160 Hs.504212 NM_001002918 ENSG00000279116 OR8D2 JCG2 olfactory receptor family 8 subfamily D member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 121.25-185 chr7 31260265 31260425 + 1 NA Intergenic Intergenic 80381 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 329.75-14 chr4 172716469 172716837 + 1 NA intron (NR_125894, intron 1 of 2) intron (NR_125894, intron 1 of 2) 10225 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 124.75-81 chr14 96446333 96446654 + 1 NA intron (NM_001350890, intron 7 of 16) intron (NM_001350890, intron 7 of 16) 54365 NM_001350890 122481 Hs.667462 NM_152327 ENSG00000140057 AK7 AK 7|SPGF27 adenylate kinase 7 protein-coding 269.25-49 chr7 21227301 21227631 + 1 NA Intergenic Intergenic -200617 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 112.5-60 chr12 112258122 112258448 + 1 NA intron (NM_001109662, intron 20 of 75) intron (NM_001109662, intron 20 of 75) -94964 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 215.5-20 chr11 75118506 75118908 + 1 NA Intergenic Intergenic -21817 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 179.5-168 chr7 44983614 44983913 + 1 NA intron (NR_003697, intron 4 of 4) intron (NR_003697, intron 4 of 4) 1747 NR_002952 677798 Hs.744745 NR_002952 ENSG00000277184 SNORA9 ACA9|SNORA9A small nucleolar RNA, H/ACA box 9 snoRNA 182.5-65 chr17 60364320 60364650 + 1 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) AluSz6|SINE|Alu 27648 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 192.75-104 chr5 13163113 13163432 + 1 NA Intergenic Intergenic -130386 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 118.75-40 chr12 16891233 16891419 + 1 NA Intergenic Intergenic -97421 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 238.25-10 chr10 99231403 99231771 + 1 NA intron (NM_021828, intron 2 of 11) intron (NM_021828, intron 2 of 11) 4288 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 259.5-99 chr9 85217348 85217763 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 511654 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 172.5-101 chr2 148512312 148512587 + 1 NA intron (NM_018328, intron 14 of 14) intron (NM_018328, intron 14 of 14) -132302 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 128.75-143 chr4 73747109 73747283 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 6627 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 353.25-14 chr20 56863194 56863810 + 1 NA Intergenic Intergenic 234196 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 165.25-39 chr14 31721574 31721810 + 1 NA intron (NM_001201574, intron 1 of 5) L1PREC2|LINE|L1 7123 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 154.75-141 chr8 46298526 46298680 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 319040 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 305.5-41 chr6 103106139 103106491 + 1 NA Intergenic Intergenic 1707330 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 201.5-68 chr19 52258696 52258944 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -10767 NM_001010851 90321 Hs.439662 NM_001010851 ENSG00000196214 ZNF766 - zinc finger protein 766 protein-coding 225.75-10 chr1 237592725 237592983 + 1 NA intron (NM_001035, intron 32 of 104) AluSx|SINE|Alu 121735 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 130.5-13 chr1 79444920 79445162 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -438311 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 226.5-87 chr6 161964962 161965255 + 1 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 494131 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 152.5-56 chr15 67951795 67952057 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -102253 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 279.25-39 chr8 66560302 66560833 + 1 NA Intergenic Intergenic 52651 NM_001144755 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 137.75-183 chr6 126649125 126649311 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 164587 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 198.5-122 chr6 25303170 25303547 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 2 of 36) intron (NM_001173977, intron 2 of 36) 23984 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 224.75-53 chr5 24331577 24332088 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 313146 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 316.5-43 chr9 23843159 23843560 + 1 NA intron (NM_001351456, intron 2 of 8) intron (NM_001351456, intron 2 of 8) 7242 NM_001351462 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 143.5-40 chr12 13411098 13411314 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -34461 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 197.75-99 chr9 95815562 95815855 + 1 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) intron (NR_023390, intron 2 of 2) -59983 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 223.75-67 chr5 38694295 38694643 + 1 NA intron (NR_109951, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 25804 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 131.5-247 chr9 86786593 86786887 + 1 NA Intergenic Intergenic 160766 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 154.5-35 chr11 46519033 46519339 + 1 NA intron (NM_001267782, intron 8 of 19) AluSx|SINE|Alu -67297 NR_036117 100422827 NR_036117 ENSG00000265014 MIR3160-1 mir-3160-1 microRNA 3160-1 ncRNA 143.5-114 chr2 79448473 79448776 + 1 NA Intergenic Intergenic 52220 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 308.25-15 chr18 6730237 6731039 + 1 NA promoter-TSS (NR_134645) promoter-TSS (NR_134645) -776 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 158.75-61 chr15 95902601 95902791 + 1 NA Intergenic Intergenic 225145 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 143.5-128 chr20 8209241 8209473 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -39347 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 207.75-28 chr12 57315954 57316275 + 1 NA intron (NM_001351217, intron 1 of 21) intron (NM_001351217, intron 1 of 21) 25660 NM_001351215 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 145.75-95 chr3 3286526 3286734 + 1 NA Intergenic Intergenic -106913 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 143.25-101 chr20 34867772 34867976 + 1 NA intron (NM_178026, intron 1 of 14) intron (NM_178026, intron 1 of 14) 4982 NM_178026 2686 Hs.433738 NM_178026 ENSG00000131067 GGT7 D20S101|GGT4|GGTL3|GGTL5 gamma-glutamyltransferase 7 protein-coding 186.5-134 chr8 75134665 75134941 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 134648 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 239.25-10 chr11 4131848 4132390 + 1 NA intron (NM_001318064, intron 14 of 17) intron (NM_001318064, intron 14 of 17) 16041 NM_001330193 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 269.5-40 chr4 113842019 113842421 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -80293 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 180.5-52 chr15 95144525 95144879 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 182398 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 228.25-11 chr10 43108048 43108344 + 1 NA intron (NM_020630, intron 5 of 18) AluJb|SINE|Alu 3464 NM_001355216 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 185.25-113 chr6 111838911 111839216 + 1 NA intron (NM_153047, intron 2 of 13) intron (NM_153047, intron 2 of 13) 34008 NM_153047 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 249.75-18 chr14 25629233 25629700 + 1 NA Intergenic Intergenic -579169 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 169.5-11 chr1 210622800 210623020 + 1 NA intron (NM_001122834, intron 10 of 11) intron (NM_001122834, intron 10 of 11) 293544 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 171.75-61 chr17 65818692 65818896 + 1 NA intron (NR_126542, intron 1 of 5) intron (NR_126542, intron 1 of 5) 7657 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 157.5-43 chr12 11776140 11776438 + 1 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 126435 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 165.25-140 chr8 119384053 119384381 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -32229 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 307.5-12 chr11 123144337 123144700 + 1 NA intron (NM_024769, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu 50730 NM_024769 79827 Hs.591949 NM_024769 ENSG00000166250 CLMP ACAM|ASAM|CSBM|CSBS CXADR like membrane protein protein-coding 171.25-50 chr15 74144442 74144721 + 1 NA Intergenic Intergenic 13995 NM_020851 57611 Hs.254775 NM_020851 ENSG00000167178 ISLR2 LINX immunoglobulin superfamily containing leucine rich repeat 2 protein-coding 305.5-34 chr5 94446635 94446974 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 13 of 20) L2c|LINE|L2 171800 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 185.5-134 chr5 135644566 135644905 + 1 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) intron (NM_001349335, intron 3 of 10) 9200 NR_027127 340074 Hs.434633 NR_027127 ENSG00000251045 SLC25A48-AS1 LINC01959 SLC25A48 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-93 chr2 203857282 203857530 + 1 NA Intergenic Intergenic -10365 NM_005214 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 128.5-96 chr18 76050476 76050630 + 1 NA Intergenic Intergenic -72445 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 205.25-78 chr4 70802063 70802304 + 1 NA intron (NM_001037442, intron 15 of 17) intron (NM_001037442, intron 15 of 17) 37320 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 240.5-10 chr10 66282267 66282684 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) L2|LINE|L2 -643561 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 181.25-46 chr17 55635446 55635706 + 1 NA Intergenic Intergenic 87288 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 135.5-16 chr1 209843501 209843838 + 1 NA exon (NM_014388, exon 11 of 12) exon (NM_014388, exon 11 of 12) 15697 NM_014388 27042 Hs.194754 NM_014388 ENSG00000117597 UTP25 C1orf107|DEF|DIEXF|DJ434O14.5 UTP25 small subunit processor component protein-coding 233.5-117 chr9 103829954 103830282 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -169591 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 169.5-32 chr12 14095344 14095606 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -115119 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 177.5-116 chr3 98120052 98120351 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -12497 NM_001005338 26341 Hs.537383 NM_001005338 ENSG00000231192 OR5H1 HSHTPCRX14|HTPCRX14 olfactory receptor family 5 subfamily H member 1 protein-coding 210.25-16 chr12 12185788 12186291 + 1 NA intron (NM_002336, intron 4 of 22).2 AluSq2|SINE|Alu 74087 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 158.5-19 chr10 47036305 47036535 + 1 NA Intergenic Intergenic 124698 NM_001320683 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 168.25-150 chr9 86499567 86499758 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -145252 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 139.75-139 chr4 125259749 125260163 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -56456 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 152.75-54 chr14 43616060 43616413 + 1 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 891047 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 199.25-75 chr5 19623737 19624204 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 262302 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 125.75-148 chr5 27840051 27840319 + 1 NA Intergenic Intergenic 367893 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 300.5-20 chr17 59018969 59019365 + 1 NA intron (NR_148346, intron 19 of 23) L1MB7|LINE|L1 87713 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 195.5-103 chr4 31538306 31538608 + 1 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1M2|LINE|L1 31913 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 348.75-3 chr10 114747434 114747886 + 1 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) -17128 NR_120628 101927692 Hs.576909 NR_120628 ENSG00000228484 LOC101927692 - uncharacterized LOC101927692 ncRNA 195.25-99 chr8 138478968 138479308 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) MER21C|LTR|ERVL 18123 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 176.25-41 chr14 71420595 71420776 + 1 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) L1MC5a|LINE|L1 -18254 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 190.75-21 chr12 59267435 59267812 + 1 NA Intergenic Intergenic -328406 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 163.5-169 chr5 145009854 145010167 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 804619 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 183.25-3 chr1 103504626 103505064 + 1 NA intron (NM_001347929, intron 1 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 20666 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 253.25-53 chr5 36227751 36228158 + 1 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) AluYc|SINE|Alu 13437 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 131.5-168 chr4 15109274 15109504 + 1 NA intron (NR_125911, intron 2 of 5) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 106908 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 137.5-97 chr17 61332437 61332646 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) MIRc|SINE|MIR 35163 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 241.5-105 chr9 665292 665673 + 1 NA intron (NM_001256877, intron 2 of 12) L1MA4|LINE|L1 -21285 NM_001354335 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 125.25-78 chr16 81078049 81078298 + 1 NA promoter-TSS (NM_152337) promoter-TSS (NM_152337) -906 NM_001100873 123775 Hs.658684 NM_152337 ENSG00000166455 C16orf46 - chromosome 16 open reading frame 46 protein-coding 172.5-43 chr11 123963482 123963724 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 14088 NM_001004474 219873 Hs.553637 NM_001004474 ENSG00000196248 OR10S1 OR11-279 olfactory receptor family 10 subfamily S member 1 protein-coding 260.25-51 chr8 47693039 47693393 + 1 NA intron (NR_148204, intron 11 of 19) intron (NR_148204, intron 11 of 19) 33552 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 261.5-27 chr2 33508230 33508822 + 1 NA intron (NM_001349975, intron 3 of 19) L2|LINE|L2 -5349 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 140.5-161 chr3 177322419 177322674 + 1 NA non-coding (NR_047465, exon 2 of 2) non-coding (NR_047465, exon 2 of 2) 28104 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 127.25-64 chr15 67538627 67538814 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3983 NM_002757 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 118.5-225 chr8 123533060 123533291 + 1 NA intron (NM_058229, intron 3 of 8) intron (NM_058229, intron 3 of 8) -1032 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 120.25-4 chr1 54674033 54674240 + 1 NA exon (NM_001291332, exon 8 of 22) exon (NM_001291332, exon 8 of 22) 32350 NM_001039464 374977 Hs.412482 NM_198547 ENSG00000184313 MROH7 C1orf175|HEATR8 maestro heat like repeat family member 7 protein-coding 153.5-213 chr9 69807104 69807332 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 13521 NR_038833 494558 Hs.130722 NR_038833 ENSG00000225626 C9orf135-DT C9orf135-AS1 C9orf135 divergent transcript ncRNA 188.5-63 chr2 29466847 29467207 + 1 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) 8350 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 363.25-7 chr20 46511006 46511462 + 1 NA intron (NM_001353826, intron 1 of 4) FLAM_C|SINE|Alu 2338 NM_001353813 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 243.5-18 chr10 54471420 54471879 + 1 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14581 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 169.5-59 chr16 5781207 5781510 + 1 NA Intergenic Intergenic 148891 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 133.75-173 chr6 140287919 140288229 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 82822 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 318.75-5 chr14 45967513 45968076 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -96365 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 281.5-35 chr3 71970086 71970458 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 130183 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 145.5-150 chr4 129255651 129255896 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 159621 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 163.25-14 chr10 67184023 67184232 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 6 of 17) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 171861 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 184.75-72 chr3 124957635 124957908 + 1 NA Intergenic Intergenic -23020 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 214.75-78 chr7 87620874 87621297 + 1 NA intron (NM_001348945, intron 2 of 31) L1M5|LINE|L1 -7313 NM_001134405 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 175.5-133 chr4 152523139 152523445 + 1 NA intron (NM_001349798, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR 11741 NM_033632 55294 Hs.561245 NM_018315 ENSG00000109670 FBXW7 AGO|CDC4|FBW6|FBW7|FBX30|FBXO30|FBXW6|SEL-10|SEL10|hAgo|hCdc4 F-box and WD repeat domain containing 7 protein-coding 211.5-62 chr18 11401098 11401342 + 1 NA Intergenic Intergenic -53258 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 122.5-138 chr22 25626473 25626684 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) intron (NM_001362778, intron 2 of 19) 61903 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 221.5-43 chr2 51051969 51052207 + 1 NA intron (NR_135237, intron 1 of 10) intron (NR_135237, intron 1 of 10) 19487 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 193.75-81 chr3 21311592 21311931 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -93965 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 153.5-107 chr2 161810174 161810343 + 1 NA intron (NM_001354443, intron 4 of 25) L1PA16|LINE|L1 185842 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 222.75-11 chr1 234886091 234886501 + 1 NA Intergenic Intergenic 77703 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 128.5-234 chr9 32709443 32709661 + 1 NA Intergenic Intergenic -73883 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 164.5-190 chr7 41836227 41836514 + 1 NA Intergenic Intergenic -133280 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 129.25-98 chr2 171521768 171521963 + 1 NA promoter-TSS (NM_001127383) promoter-TSS (NM_001127383) -368 NM_001256909 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 213.75-78 chr4 74666877 74667295 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 127437 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 134.5-47 chr12 26570544 26570693 + 1 NA intron (NM_002223, intron 34 of 56) intron (NM_002223, intron 34 of 56) 262576 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 120.75-32 chr12 58346371 58346538 + 1 NA Intergenic Intergenic -245248 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 123.5-80 chr17 56886807 56886992 + 1 NA Intergenic Intergenic -1986 NR_027025 246754 Hs.720736 NR_027025 MTVR2 - mouse mammary tumor virus receptor homolog 2 pseudo 192.5-66 chr2 56994202 56994499 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -808580 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 203.5-92 chr3 111955327 111955857 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 12 of 17) AluJb|SINE|Alu -23434 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 264.75-17 chr17 54757270 54757695 + 1 NA Intergenic Intergenic -143209 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 221.5-112 chrX 155554469 155554775 + 1 NA intron (NM_018196, intron 1 of 7) L1MEg|LINE|L1 -57943 NM_001304990 10251 Hs.381912 NM_005840 ENSG00000168939 SPRY3 spry-3 sprouty RTK signaling antagonist 3 protein-coding 205.75-21 chr14 67999188 67999414 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 175709 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 199.25-6 chr10 33688461 33688738 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 84081 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 161.25-19 chr10 104962663 104962962 + 1 NA intron (NM_014978, intron 3 of 26) L1ME4a|LINE|L1 -296596 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 143.75-145 chr5 76472756 76472968 + 1 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) intron (NM_006633, intron 2 of 35) 69577 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 283.5-38 chr22 40534059 40534601 + 1 NA promoter-TSS (NM_001318139) promoter-TSS (NM_001318139) -503 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 147.75-26 chr11 116423015 116423366 + 1 NA Intergenic Intergenic -216232 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 178.5-114 chr3 193933071 193933405 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 61000 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 189.25-28 chr12 132719707 132720020 + 1 NA TTS (NM_138575) TTS (NM_138575) 9021 NM_138575 192111 Hs.102558 NM_138575 ENSG00000247077 PGAM5 BXLBV68 PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase protein-coding 143.5-56 chr13 103432159 103432365 + 1 NA Intergenic Intergenic 7062 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 323.25 chr1 31314567 31315004 + 1 NA intron (NM_001282574, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 17803 NM_016505 51538 Hs.524094 NM_016505 ENSG00000121766 ZCCHC17 HSPC251|PS1D|pNO40 zinc finger CCHC-type containing 17 protein-coding 169.5-34 chr12 20153336 20153572 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -25553 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 119.5-29 chr10 67413312 67413595 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1PA16|LINE|L1 -10043 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 215.25 chr1 38423047 38423365 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -51990 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 204.25-115 chr8 55837486 55837799 + 1 NA Intergenic Intergenic -42193 NM_002350 4067 Hs.491767 NM_002350 ENSG00000254087 LYN JTK8|p53Lyn|p56Lyn LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 193.5-119 chr4 59251317 59251609 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 237890 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 228.75-68 chr6 85473374 85473638 + 1 NA intron (NM_002526, intron 3 of 8) intron (NM_002526, intron 3 of 8) 23423 NM_002526 4907 Hs.153952 NM_002526 ENSG00000135318 NT5E CALJA|CD73|E5NT|NT|NT5|NTE|eN|eNT 5'-nucleotidase ecto protein-coding 128.25-213 chr8 135192434 135192593 + 1 NA Intergenic Intergenic -41618 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 189.75-72 chr3 77171094 77171531 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 73300 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 177.25-131 chr6 151910091 151910511 + 1 NA intron (NM_001122741, intron 4 of 8) MER3|DNA|hAT-Charlie 101194 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 179.25-31 chr11 41379807 41380223 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 79621 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 145.75-96 chr3 21897626 21897956 + 1 NA Intergenic Intergenic -59348 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 226.75-50 chr3 72067681 72068047 + 1 NA intron (NR_104116, intron 2 of 6) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 32591 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 338.5-38 chr9 73112866 73113274 + 1 NA Intergenic Intergenic -38795 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 234.75-37 chr2 63263706 63264228 + 1 NA intron (NR_148704, intron 14 of 18) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -144425 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 181.25-95 chr4 181091590 181091951 + 1 NA intron (NR_033918, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 67379 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 137.5-44 chr11 86143250 86143412 + 1 NA Intergenic Intergenic -73471 NM_001206947 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 165.5-97 chr20 11196997 11197330 + 1 NA Intergenic Intergenic 76220 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 328.25 chr1 98912291 98912883 + 1 NA intron (NM_001010861, intron 5 of 5) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -91689 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 122.75-19 chr10 11022192 11022407 + 1 NA intron (NM_001326345, intron 1 of 13) intron (NM_001326345, intron 1 of 13) 3543 NM_001326345 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 215.5-115 chr9 69741351 69741681 + 1 NA intron (NM_001366935, intron 1 of 4) intron (NM_001366935, intron 1 of 4) 18495 NM_001099666 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 166.75-68 chr18 66290504 66290698 + 1 NA Intergenic Intergenic 313489 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 343.25-9 chr2 48754950 48755418 + 1 NA intron (NM_000233, intron 1 of 10) intron (NM_000233, intron 1 of 10) 540 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 225.5-6 chr1 110783025 110783401 + 1 NA Intergenic Intergenic -87986 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 239.75-39 chr20 52951718 52952279 + 1 NA Intergenic Intergenic -20360 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 202.75-50 chr18 13784255 13784669 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -39687 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 185.5-51 chr14 72880583 72880939 + 1 NA intron (NM_001280543, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 11888 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 142.75-148 chr4 107469809 107470002 + 1 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 250329 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 168.5-94 chr2 191353830 191354083 + 1 NA intron (NM_012223, intron 7 of 28) L2a|LINE|L2 108552 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 185.25-9 chr10 67174695 67174925 + 1 NA TTS (NM_001291133) TTS (NM_001291133) 162544 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 176.5-44 chr12 110952001 110952193 + 1 NA intron (NR_135002, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 5721 NR_135002 105369980 Hs.564357 NR_135001 ENSG00000258240 LOC105369980 - uncharacterized LOC105369980 ncRNA 201.5-115 chr6 64151113 64151314 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) L1ME3G|LINE|L1 344377 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 166.5-30 chr10 54239098 54239304 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -247029 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 174.5-71 chr15 62739053 62739368 + 1 NA intron (NM_015059, intron 27 of 55) intron (NM_015059, intron 27 of 55) -84747 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 186.5-46 chr16 10014236 10014537 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) L3b|LINE|CR1 167681 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 258.5-60 chr5 104367136 104367734 + 1 NA Intergenic Intergenic -732039 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 187.75-106 chr7 1563431 1563708 + 1 NA Intergenic Intergenic 6463 NM_032302 84262 Hs.446311 NM_032302 ENSG00000157778 PSMG3 C7orf48|PAC3 proteasome assembly chaperone 3 protein-coding 257.5-53 chr4 88547039 88547385 + 1 NA Intergenic Intergenic 23402 NR_134662 101929134 Hs.734064 NR_134662 ENSG00000285122 PIGY-DT - PIGY divergent transcript ncRNA 149.5-99 chr2 121491653 121491916 + 1 NA intron (NM_015282, intron 8 of 38) intron (NM_015282, intron 8 of 38) -39096 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 225.25-67 chr5 144315632 144316018 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 110434 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 157.75-187 chrX 40906269 40906524 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -73200 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 166.5-165 chr5 90144188 90144438 + 1 NA Intergenic Intergenic -127593 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 225.25-53 chr3 36912431 36912842 + 1 NA intron (NM_001329998, intron 1 of 23) intron (NM_001329998, intron 1 of 23) 32418 NM_014831 9881 Hs.170999 NM_014831 ENSG00000168016 TRANK1 LBA1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 protein-coding 330.25-6 chr12 77217164 77217671 + 1 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -151848 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 216.75-79 chr8 129319955 129320294 + 1 NA Intergenic Intergenic -78884 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 182.5-121 chr4 94423701 94423929 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -28042 NM_001011515 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 175.5-146 chr7 36437738 36438241 + 1 NA intron (NM_001284302, intron 19 of 22) AluSq2|SINE|Alu -47632 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 130.5-229 chr7 79825041 79825232 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -309695 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 210.5-90 chr4 126210263 126210690 + 1 NA Intergenic Intergenic 703217 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 214.5-9 chr10 10313271 10313573 + 1 NA Intergenic Intergenic 148927 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 155.5-42 chr12 2713530 2713733 + 1 NA Intergenic Intergenic -22474 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 269.25-26 chr2 178182518 178183124 + 1 NA Intergenic Intergenic -11660 NM_001201482 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 112.25-75 chr17 55551237 55551477 + 1 NA Intergenic Intergenic -129522 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 168.5-191 chr8 140750184 140750448 + 1 NA 3' UTR (NM_001352748, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001352748, exon 19 of 19) -17663 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 300.75-26 chr2 137607325 137607658 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 17 of 27) L1MC4|LINE|L1 320441 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 178.5-60 chr16 57350324 57350643 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -8300 NM_002990 6367 Hs.534347 NM_002990 ENSG00000102962 CCL22 A-152E5.1|ABCD-1|DC/B-CK|MDC|SCYA22|STCP-1 C-C motif chemokine ligand 22 protein-coding 151.5-71 chr19 1903165 1903471 + 1 NA Intergenic Intergenic -2081 NM_079834 113178 Hs.144980 NM_079834 ENSG00000227500 SCAMP4 SCAMP-4 secretory carrier membrane protein 4 protein-coding 112.5-19 chr10 30310972 30311154 + 1 NA 3' UTR (NM_018109, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018109, exon 9 of 9) 38275 NM_018109 55149 Hs.173946 NM_018109 ENSG00000107951 MTPAP PAPD1|SPAX4|TENT6 mitochondrial poly(A) polymerase protein-coding 262.25-21 chr2 140205087 140205633 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 381325 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 315.25-19 chr20 49251930 49252698 + 1 NA intron (NM_021035, intron 12 of 13) AluSx1|SINE|Alu 25743 NM_021035 57169 Hs.371794 NM_021035 ENSG00000124201 ZNFX1 - zinc finger NFX1-type containing 1 protein-coding 167.5-132 chr4 167581439 167581618 + 1 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -346938 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 195.75-107 chr7 4665750 4665990 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16425 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 125.5-52 chr12 15598098 15598308 + 1 NA 3' UTR (NM_030670, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_030670, exon 13 of 13) 51592 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 215.75-10 chr1 246941556 246941870 + 1 NA Intergenic Intergenic -9765 NR_136586 25909 Hs.300887 NM_015446 ENSG00000153207 AHCTF1 ELYS|MST108|MSTP108|TMBS62 AT-hook containing transcription factor 1 protein-coding 339.5-30 chr7 16928269 16928714 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -46508 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 220.75-53 chr4 135863857 135864104 + 1 NA Intergenic MER11D|LTR|ERVK 24113 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 201.5-67 chr19 18551876 18552378 + 1 NA Intergenic Intergenic -5635 NM_001171949 79036 Hs.714548 NM_024069 ENSG00000105700 KXD1 BORCS4|C10orf50|C19orf50|KXDL|MST096|MSTP096 KxDL motif containing 1 protein-coding 224.75-18 chr11 98596899 98597187 + 1 NA Intergenic Intergenic -423906 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 213.75-86 chr5 28602568 28602832 + 1 NA Intergenic Intergenic -315035 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 162.5-2 chr1 63804334 63804640 + 1 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 30470 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 140.25-34 chr12 4531801 4532065 + 1 NA intron (NR_144382, intron 2 of 9) MER83|LTR|ERV1 6536 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 201.5-4 chr1 41983834 41984169 + 1 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 51933 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 167.75-52 chr16 21283170 21283399 + 1 NA intron (NM_001888, intron 1 of 9).2 MER96B|DNA|hAT-Tip100 -17565 NR_026675 400508 Hs.578949 NM_001101368 CRYM-AS1 NCRNA00169 CRYM antisense RNA 1 ncRNA 240.5-55 chr2 216446230 216446642 + 1 NA intron (NM_001127207, intron 10 of 17) intron (NM_001127207, intron 10 of 17) 33671 NM_001127207 50485 Hs.516674 NM_014140 ENSG00000138375 SMARCAL1 HARP|HHARP SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1 protein-coding 270.25-20 chr14 45567030 45567370 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 148402 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 152.5-96 chr2 179868943 179869265 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -7492 NR_148054 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 112.5-160 chr22 37233848 37234007 + 1 NA intron (NM_002872, intron 2 of 6) intron (NM_002872, intron 2 of 6) 10342 NM_002872 5880 Hs.517601 NM_002872 ENSG00000128340 RAC2 EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 Rac family small GTPase 2 protein-coding 127.5-107 chr2 31094693 31094841 + 1 NA intron (NM_001329095, intron 1 of 15) intron (NM_001329095, intron 1 of 15) 34873 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 178.25-68 chr2 224167495 224167829 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -128343 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 322.25-7 chr2 6988517 6989102 + 1 NA intron (NM_001349186, intron 2 of 7) L1MC3|LINE|L1 55725 NM_001349183 9781 Hs.22146 NM_014746 ENSG00000151692 RNF144A RNF144|UBCE7IP4|hUIP4 ring finger protein 144A protein-coding 150.5-65 chr17 57789044 57789315 + 1 NA Intergenic Intergenic -43880 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 344.5-33 chr8 137509066 137509637 + 1 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -95763 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 156.75-175 chrX 88653126 88653452 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -93936 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 163.5-201 chr8 53564734 53565038 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -40921 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 235.75-68 chr7 31893255 31893625 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 176967 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 237.5-72 chr4 94248243 94248643 + 1 NA intron (NM_001128429, intron 6 of 23) intron (NM_001128429, intron 6 of 23) -4866 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 241.5-26 chr15 70366619 70367024 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 139107 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 308.5-18 chr2 157935203 157935714 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -59128 NM_001111067 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 161.25-86 chr2 27180400 27180793 + 1 NA Intergenic Intergenic -31435 NM_080592 51374 Hs.9527 NM_016085 ENSG00000138085 ATRAID APR--3|APR-3|APR3|C2orf28|HSPC013|PRO240|p18 all-trans retinoic acid induced differentiation factor protein-coding 142.5-144 chr3 126403427 126403737 + 1 NA intron (NM_182628, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 8673 NM_182628 348807 Hs.591305 NM_182628 ENSG00000163885 CFAP100 CCDC37|MIA1 cilia and flagella associated protein 100 protein-coding 352.5-31 chr8 67986355 67986934 + 1 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) L2b|LINE|L2 34598 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 149.75-145 chr6 62261198 62261425 + 1 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 24914 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 250.25-7 chr12 123219894 123220287 + 1 NA intron (NR_103517, intron 6 of 23) AluSx|SINE|Alu 13051 NM_022782 10198 Hs.577404 NM_022782 ENSG00000051825 MPHOSPH9 MPP-9|MPP9 M-phase phosphoprotein 9 protein-coding 133.5-89 chr15 54276964 54277211 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 9 of 31) intron (NM_001329919, intron 9 of 31) 264439 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 264.75-65 chrX 52320926 52321412 + 1 NA Intergenic Intergenic 15473 NR_107055 102466880 NR_107055 ENSG00000275335 MIR8088 hsa-mir-8088 microRNA 8088 ncRNA 128.25-193 chr7 80104421 80104608 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -30317 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 200.5-27 chr12 64527046 64527432 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 75119 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 183.75-130 chr8 132667451 132667690 + 1 NA intron (NR_135907, intron 1 of 10) intron (NR_135907, intron 1 of 10) 7975 NM_001321963 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 289.5-45 chr7 35274918 35275258 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -20988 NM_001166220 57057 Hs.404167 NM_020417 ENSG00000164532 TBX20 ASD4 T-box transcription factor 20 protein-coding 270.25-49 chrX 93220214 93220590 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -395499 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 221.25-60 chr4 40342975 40343281 + 1 NA intron (NM_017581, intron 3 of 4) intron (NM_017581, intron 3 of 4) 7795 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 202.5-102 chr4 75281364 75281611 + 1 NA Intergenic Intergenic -72589 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 154.5-122 chr22 48289617 48289810 + 1 NA Intergenic Intergenic 15349 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 161.25-164 chr7 77852044 77852225 + 1 NA intron (NM_001366085, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu 12004 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 124.75-31 chr10 74945365 74945661 + 1 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) AluSz|SINE|Alu 32727 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 186.25-106 chr6 132121595 132121865 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -6467 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 132.5-228 chr7 81718688 81718889 + 1 NA intron (NM_001010932, intron 10 of 17) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -27382 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 198.75-28 chr15 35453347 35453647 + 1 NA intron (NM_080650, intron 4 of 8) intron (NM_080650, intron 4 of 8) -81133 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 217.5-84 chr3 168680160 168680665 + 1 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) intron (NR_021485, intron 5 of 15) 128558 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 184.25-4 chr1 87690577 87690925 + 1 NA Intergenic Intergenic -319096 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 127.5-115 chr2 66291212 66291464 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 66990 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 131.75-50 chr12 53911764 53912062 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26918 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 166.5-47 chr12 15174673 15174916 + 1 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) L1MB8|LINE|L1 22871 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 259.25-5 chr10 14049163 14049476 + 1 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) -24965 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 181.75-15 chr10 55550526 55550802 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -48378 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 243.75-8 chr10 58638310 58638779 + 1 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -76471 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 253.5-75 chr7 55300049 55300347 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -44563 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 174.5-160 chr6 84999238 84999548 + 1 NA Intergenic Intergenic -234795 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 241.75-78 chr8 139902184 139902698 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 20 of 22) intron (NM_001160372, intron 20 of 22) 198094 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 344.5-32 chr8 132346039 132346521 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 100982 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 297.75-3 chr11 115737266 115737640 + 1 NA Intergenic Intergenic -2691 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 202.25-5 chr1 61910720 61911098 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 25 of 43) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 64834 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 161.5-7 chr1 90050330 90050514 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 55312 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 325.25-29 chr7 93245979 93246400 + 1 NA intron (NM_001257998, intron 3 of 28) intron (NM_001257998, intron 3 of 28) 13823 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 144.5-200 chr7 37177058 37177218 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 176530 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 142.25-105 chr22 48887380 48887795 + 1 NA intron (NR_038944, intron 3 of 6) (CATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20817 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 206.5-79 chr4 53938139 53938538 + 1 NA Intergenic Intergenic 48944 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 185.5-130 chr5 97439087 97439319 + 1 NA Intergenic Intergenic -65493 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 189.5-26 chr10 116574914 116575230 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15887 NM_006229 5407 Hs.73923 NM_006229 ENSG00000187021 PNLIPRP1 PLRP1 pancreatic lipase related protein 1 protein-coding 214.5-50 chr2 24259339 24259673 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 21 of 38) L2c|LINE|L2 84453 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 161.5-130 chr3 47607726 47607986 + 1 NA intron (NM_003074, intron 26 of 27) FLAM_A|SINE|Alu -27616 NM_001206945 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 236.5-93 chr8 85535245 85535521 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -70468 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 315.5-10 chr19 57291508 57292109 + 1 NA exon (NM_001330622, exon 3 of 3) exon (NM_001330622, exon 3 of 3) 11323 NM_006635 10794 Hs.99971 NM_006635 ENSG00000197714 ZNF460 HZF8|ZNF272 zinc finger protein 460 protein-coding 197.5-109 chr4 108794284 108794660 + 1 NA Intergenic Intergenic -31419 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 219.75-24 chr16 54864299 54864820 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16326 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 125.25-72 chr15 70518348 70518502 + 1 NA Intergenic Intergenic -12497 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 274.25-13 chr12 40689702 40690097 + 1 NA Intergenic Intergenic -2540 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 192.75-16 chr10 113843959 113844280 + 1 NA exon (NM_014881, exon 5 of 9) exon (NM_014881, exon 5 of 9) 9963 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 195.25-34 chr15 56090218 56090453 + 1 NA 3' UTR (NM_022841, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_022841, exon 10 of 10) -96723 NM_001329212 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 137.25-121 chr5 27016293 27016694 + 1 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) intron (NM_016279, intron 1 of 11) 22093 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 303.75-8 chr10 29750249 29750636 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13506 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 161.25-2 chr1 48523698 48524014 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -51648 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 150.5-138 chr3 143542152 143542422 + 1 NA intron (NM_173653, intron 9 of 15) intron (NM_173653, intron 9 of 15) 200041 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 190.75-42 chr17 57306311 57306560 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 49416 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 181.5-17 chr10 115440792 115441064 + 1 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) L2a|LINE|L2 347563 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 209.5-94 chr3 70268537 70269013 + 1 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) intron (NM_001364676, intron 2 of 4) 43863 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 114.5-4 chr1 53706251 53706444 + 1 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 27857 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 244.25-16 chr14 59785749 59786185 + 1 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 84809 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 174.5-143 chr5 11568047 11568399 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L1MEc|LINE|L1 20694 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 362.25-13 chr6 136039250 136039982 + 1 NA intron (NM_018945, intron 2 of 12) intron (NM_018945, intron 2 of 12) 33211 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 158.5-88 chr19 42350336 42350635 + 1 NA promoter-TSS (NR_107044) promoter-TSS (NR_107044) -646 NR_107044 102465875 NR_107044 ENSG00000277533 MIR8077 hsa-mir-8077 microRNA 8077 ncRNA 181.25-63 chr2 71709087 71709305 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 242497 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 288.25-26 chr7 110020387 110020785 + 1 NA Intergenic Intergenic -60373 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 134.5-107 chr2 177126019 177126236 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 86284 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 307.75-2 chr10 116460988 116461495 + 1 NA exon (NM_001011709, exon 7 of 12) exon (NM_001011709, exon 7 of 12) 33394 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 131.25-126 chr22 37254537 37254706 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10352 NM_002872 5880 Hs.517601 NM_002872 ENSG00000128340 RAC2 EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 Rac family small GTPase 2 protein-coding 187.5-182 chrX 83929739 83930090 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 68768 NM_021118 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 175.25-77 chr2 191997401 191997719 + 1 NA intron (NM_001305134, intron 7 of 9) intron (NM_001305134, intron 7 of 9) -150472 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 167.5-68 chr15 92611306 92611546 + 1 NA Intergenic Intergenic -39163 NR_021493 100144604 Hs.245476 NR_021493 ENSG00000258647 LINC00930 - long intergenic non-protein coding RNA 930 ncRNA 136.5-172 chr5 18956054 18956319 + 1 NA Intergenic Intergenic 930086 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 123.5-88 chr18 40203141 40203333 + 1 NA Intergenic Intergenic 136951 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 250.5-55 chr21 31282709 31283030 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 61485 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 196.75-29 chr12 38790277 38790488 + 1 NA intron (NM_153634, intron 6 of 19) L1MA2|LINE|L1 115209 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 131.5-160 chr3 121341400 121341678 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) L1MA3|LINE|L1 204449 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 170.5-148 chr5 94651101 94651329 + 1 NA intron (NM_032290, intron 6 of 20) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 32546 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 225.25-10 chr10 104118550 104118925 + 1 NA Intergenic Intergenic -3321 NM_145247 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 131.5-17 chr1 216657674 216657885 + 1 NA intron (NM_001243506, intron 2 of 6) intron (NM_001243506, intron 2 of 6) 65650 NM_001438 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 166.5-15 chr1 190007415 190007713 + 1 NA Intergenic Intergenic 468446 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 266.75-32 chr3 109149897 109150263 + 1 NA non-coding (NR_161294, exon 3 of 3) non-coding (NR_161294, exon 3 of 3) 13361 NR_161294 401081 Hs.280892 NM_001351622 ENSG00000241224 C3orf85 - chromosome 3 open reading frame 85 protein-coding 195.75 chr1 12359843 12360229 + 1 NA intron (NM_015378, intron 50 of 69) intron (NM_015378, intron 50 of 69) 130006 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 197.25-103 chr9 70449172 70449546 + 1 NA Intergenic Intergenic -34702 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 224.5-50 chr17 63150202 63150618 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 184175 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 144.5-191 chr6 129098556 129098734 + 1 NA intron (NM_000426, intron 4 of 64) L3b|LINE|CR1 215504 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 181.75-27 chr12 7086219 7086435 + 1 NA intron (NM_001354346, intron 8 of 10) intron (NM_001354346, intron 8 of 10) 5566 NM_001354346 715 Hs.524224 NM_001733 ENSG00000159403 C1R EDSPD1 complement C1r protein-coding 233.25-74 chr9 11174811 11175074 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 561736 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 180.5-119 chr5 16621323 16621533 + 1 NA intron (NR_109946, intron 1 of 3) intron (NR_109946, intron 1 of 3) -4370 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 113.5-156 chr3 44642416 44642573 + 1 NA non-coding (NR_147692, exon 8 of 8) non-coding (NR_147692, exon 8 of 8) -6238 NM_003420 7584 Hs.288658 NM_003420 ENSG00000169981 ZNF35 HF.10|HF10|Zfp105 zinc finger protein 35 protein-coding 260.5-53 chr6 64152530 64152984 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 345921 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 177.5-147 chr5 136173456 136173801 + 1 NA intron (NM_001001420, intron 5 of 6) intron (NM_001001420, intron 5 of 6) 19534 NM_001350994 389332 Hs.127680 NM_001350994 ENSG00000271824 SMIM32 - small integral membrane protein 32 protein-coding 230.5-44 chr15 99248852 99249138 + 1 NA intron (NM_001353869, intron 2 of 12) intron (NM_001353869, intron 2 of 12) 586 NR_109947 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 232.25-35 chr2 195390399 195390692 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -266413 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 185.75-122 chr8 31257835 31258040 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -224581 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 238.5-61 chr4 82005395 82005778 + 1 NA Intergenic Intergenic 368405 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 190.5-103 chr3 119664124 119664413 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -3678 NM_001308333 64091 Hs.534383 NM_022135 ENSG00000121577 POPDC2 POP2 popeye domain containing 2 protein-coding 144.25-136 chr4 31925998 31926262 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -71249 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 168.5-133 chr4 94489012 94489316 + 1 NA intron (NM_001256428, intron 2 of 11) intron (NM_001256428, intron 2 of 11) 37222 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 191.5-59 chr17 70042742 70042980 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8410 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 213.5-104 chr6 50093472 50094138 + 1 NA Intergenic Intergenic -43876 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 220.5-18 chr11 111432712 111433022 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -14681 NR_046085 100132078 Hs.672662 NR_046085 ENSG00000255428 LOC100132078 - uncharacterized LOC100132078 ncRNA 163.5-67 chr16 53949504 53949766 + 1 NA intron (NM_001363894, intron 9 of 9) intron (NM_001363894, intron 9 of 9) -89758 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 329.25-7 chr12 75298645 75299022 + 1 NA intron (NM_001355026, intron 6 of 12) intron (NM_001355026, intron 6 of 12) 31491 NM_001355024 84698 Hs.733835 NM_032606 ENSG00000180881 CAPS2 UG0636c06 calcyphosine 2 protein-coding 154.5-117 chr20 60059142 60059331 + 1 NA intron (NR_161293, intron 2 of 3) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3311 NR_161292 284756 Hs.335319 NR_126504 ENSG00000176659 C20orf197 - chromosome 20 open reading frame 197 ncRNA 159.75-66 chr18 69846144 69846336 + 1 NA 3' UTR (NM_152721, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_152721, exon 8 of 8) 101633 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 135.25-19 chr1 219814174 219814321 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 114404 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 161.5-81 chr18 8183599 8183790 + 1 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 183340 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 160.5-178 chr7 114081478 114081712 + 1 NA Intergenic Intergenic -4732 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 171.25-157 chr9 98324198 98324431 + 1 NA intron (NM_005458, intron 13 of 18) intron (NM_005458, intron 13 of 18) -68665 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 130.75-157 chr5 114185642 114185876 + 1 NA Intergenic Intergenic -176311 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 198.5-148 chr8 106527799 106528135 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 80043 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 166.5-129 chr3 24247270 24247510 + 1 NA intron (NM_001354708, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 96066 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 225.5-29 chr12 118423377 118423655 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 46961 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 162.25-87 chr2 157447894 157448152 + 1 NA Intergenic Intergenic -3934 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 182.75-104 chr5 62078980 62079258 + 1 NA Intergenic Intergenic -227043 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 147.5-184 chr6 45887821 45888037 + 1 NA Intergenic Intergenic 49668 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 205.5-88 chr20 58363496 58363739 + 1 NA 3' UTR (NM_020673, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_020673, exon 7 of 7) -25502 NM_004738 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 196.25-93 chr4 53280690 53281011 + 1 NA intron (NM_152540, intron 3 of 8) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 85211 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 184.5-147 chr7 139701920 139702198 + 1 NA intron (NM_001113239, intron 2 of 14) intron (NM_001113239, intron 2 of 14) 75939 NM_022740 28996 Hs.731417 NM_022740 ENSG00000064393 HIPK2 PRO0593 homeodomain interacting protein kinase 2 protein-coding 219.75-31 chr19 11291695 11292156 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4235 NM_001282509 26526 Hs.579784 NM_012466 ENSG00000130167 TSPAN16 TM-8|TM4-B|TM4SF16 tetraspanin 16 protein-coding 129.75-79 chr18 955936 956190 + 1 NA Intergenic Intergenic -28070 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 291.5-38 chr5 73490080 73490587 + 1 NA Intergenic Intergenic -8092 NM_001207 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 222.25-33 chr2 57427557 57427962 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -479892 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 185.75-18 chr10 83983278 83983537 + 1 NA Intergenic Intergenic -156102 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 192.25-104 chr8 119614339 119614634 + 1 NA intron (NM_001330600, intron 8 of 25) intron (NM_001330600, intron 8 of 25) -21478 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 357.25-6 chr15 75145751 75146248 + 1 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -55883 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 182.5-63 chr17 3400344 3400612 + 1 NA Intergenic Intergenic -2068 NM_003553 8387 NM_003553 ENSG00000180016 OR1E1 HGM071|OR13-66|OR17-2|OR17-32|OR1E5|OR1E6|OR1E8P|OR1E9P|OST547 olfactory receptor family 1 subfamily E member 1 protein-coding 212.5-124 chr9 28375637 28376014 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 343480 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 225.5-50 chr18 64848818 64849141 + 1 NA Intergenic Intergenic -588924 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 245.5-72 chr7 26403066 26403374 + 1 NA intron (NR_148502, intron 1 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -3802 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 195.75-63 chr2 162119124 162119456 + 1 NA intron (NR_110255, intron 1 of 3) intron (NR_110255, intron 1 of 3) 4849 NR_110255 101929532 Hs.639883 NR_110255 ENSG00000236841 LOC101929532 - uncharacterized LOC101929532 ncRNA 172.5-52 chr12 59170687 59170876 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -250243 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 179.5-135 chr4 59318307 59318533 + 1 NA Intergenic Intergenic 304847 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 119.5-93 chr16 55398434 55398660 + 1 NA Intergenic Intergenic 63750 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 276.5-8 chr10 27118487 27119040 + 1 NA intron (NM_139312, intron 15 of 19) intron (NM_139312, intron 15 of 19) -18265 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 164.5-148 chr4 56396353 56396607 + 1 NA intron (NR_156493, intron 10 of 10) intron (NR_156493, intron 10 of 10) -8972 NM_001286669 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 287.5-34 chr2 144748576 144749043 + 1 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 80842 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 142.25-90 chr2 105956387 105956555 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 104624 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 156.5-123 chr3 178486586 178487031 + 1 NA Intergenic Intergenic -49628 NM_181361 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 208.5-96 chr4 39395538 39395929 + 1 NA Intergenic Intergenic -11197 NM_175737 152831 Hs.90756 NM_175737 ENSG00000134962 KLB BKL klotho beta protein-coding 129.5-160 chr3 98794360 98794549 + 1 NA 3' UTR (NM_001323365, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001323365, exon 11 of 11) 31147 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 171.75-4 chr1 56469908 56470101 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 55041 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 223.5-73 chr22 31754612 31754999 + 1 NA intron (NM_001007188, intron 1 of 21) intron (NM_001007188, intron 1 of 21) 782 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 134.5-208 chr7 49272053 49272280 + 1 NA Intergenic Intergenic 347619 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 158.75-80 chr2 7153721 7153954 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -75957 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 116.75-116 chr21 37929656 37929854 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13298 NM_002240 3763 Hs.626242 NM_002240 ENSG00000157542 KCNJ6 BIR1|GIRK-2|GIRK2|KATP-2|KATP2|KCNJ7|KIR3.2|KPLBS|hiGIRK2 potassium voltage-gated channel subfamily J member 6 protein-coding 228.5-103 chr8 86080428 86080775 + 1 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL -10933 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 315.25-36 chrUn_KI270442v1 99756 100238 + 1 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 174.5-129 chr3 165910961 165911261 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -73688 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 239.5-54 chr4 40506098 40506406 + 1 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) intron (NM_001098634, intron 2 of 6) -4133 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 143.75-148 chr5 116984909 116985192 + 1 NA Intergenic Intergenic -222841 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 129.5-23 chr10 80451319 80451541 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -2835 NM_030927 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 219.5-31 chr12 74981183 74981429 + 1 NA Intergenic Intergenic 228442 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 193.5-126 chr4 174590558 174590797 + 1 NA Intergenic Intergenic -67779 NM_001256307 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 212.75-45 chr17 73183615 73184003 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9246 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 194.25-36 chr15 57894942 57895163 + 1 NA Intergenic Intergenic 118971 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 123.5-98 chr2 72558015 72558300 + 1 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 267876 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 223.5-89 chr4 93136940 93137330 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) intron (NM_001286838, intron 3 of 14) -691618 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 172.25-41 chr15 50895670 50895948 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -12874 NM_001252127 23431 Hs.413366 NM_007347 ENSG00000081014 AP4E1 CPSQ4|SPG51|STUT1 adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1 protein-coding 155.75-142 chr6 150297763 150297982 + 1 NA Intergenic Intergenic -71140 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 217.5-63 chr2 55646011 55646589 + 1 NA exon (NM_033109, exon 21 of 28) exon (NM_033109, exon 21 of 28) -28678 NM_001122964 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 361.5-21 chr6 53430566 53431184 + 1 NA Intergenic Intergenic -81696 NM_001242830 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 191.5-78 chr2 139732441 139732649 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 835221 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 262.25-46 chr8 67695967 67696268 + 1 NA intron (NM_020361, intron 1 of 10) L1M4|LINE|L1 50243 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 130.5-209 chr5 129850477 129850639 + 1 NA Intergenic Intergenic -53907 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 114.75-116 chr22 40453668 40453851 + 1 NA intron (NM_020831, intron 4 of 14) intron (NM_020831, intron 4 of 14) 9681 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 182.25-57 chr19 31224913 31225252 + 1 NA intron (NR_138036, intron 2 of 4) intron (NR_138036, intron 2 of 4) 57572 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 114.75-191 chr8 74056493 74056633 + 1 NA Intergenic Intergenic 65171 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 222.5-84 chr5 26601574 26602007 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 436796 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 138.75-154 chr5 108991607 108991855 + 1 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) intron (NR_146155, intron 13 of 19) 67125 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 146.75-39 chr13 79428192 79428526 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 22050 NR_038991 100505538 Hs.600720 NR_038991 ENSG00000227354 RBM26-AS1 - RBM26 antisense RNA 1 ncRNA 176.25-32 chr12 62690977 62691222 + 1 NA intron (NM_020700, intron 7 of 9) L2c|LINE|L2 87413 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 199.75-41 chr2 9647119 9647596 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16360 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 229.5-107 chr5 36974491 36974847 + 1 NA intron (NM_015384, intron 8 of 45) intron (NM_015384, intron 8 of 45) 97900 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 267.5-46 chr21 24452963 24453290 + 1 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) L1ME2|LINE|L1 24386 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 175.5-165 chr8 102945179 102945366 + 1 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) MER53|DNA|hAT -75811 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 120.5-157 chr4 34034651 34034836 + 1 NA intron (NR_125902, intron 1 of 4) intron (NR_125902, intron 1 of 4) 5150 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 134.25-53 chr14 75634401 75634644 + 1 NA intron (NM_017791, intron 4 of 9) intron (NM_017791, intron 4 of 9) 26354 NM_007176 11161 Hs.15106 NM_007176 ENSG00000133935 ERG28 C14orf1|NET51 ergosterol biosynthesis 28 homolog protein-coding 122.75-38 chr12 69246756 69247006 + 1 NA intron (NM_007007, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu 7312 NM_007007 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 233.75-57 chr4 131333635 131333998 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -431022 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 156.75-37 chr11 112957574 112957805 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3731 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 141.5-103 chr2 103410325 103410660 + 1 NA Intergenic Intergenic -426063 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 301.75-38 chr8 122604718 122605238 + 1 NA Intergenic Intergenic -36334 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 249.75-40 chr20 55170860 55171214 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -252006 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 270.25-43 chr5 120542955 120543297 + 1 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) intron (NM_001308088, intron 1 of 3) 11662 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 143.5-102 chr19 31183448 31183772 + 1 NA intron (NR_147209, intron 2 of 4) intron (NR_147209, intron 2 of 4) 16100 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 228.5-104 chr8 103167544 103168020 + 1 NA intron (NR_109954, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 4358 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 186.75-39 chr17 35216237 35216563 + 1 NA Intergenic Intergenic -22007 NM_152462 146861 Hs.514814 NM_152462 ENSG00000164729 SLC35G3 AMAC1|TMEM21A solute carrier family 35 member G3 protein-coding 185.75-25 chr11 89177756 89178028 + 1 NA promoter-TSS (NM_000372) promoter-TSS (NM_000372) 17 NM_000372 7299 Hs.503555 NM_000372 ENSG00000077498 TYR ATN|CMM8|OCA1|OCA1A|OCAIA|SHEP3 tyrosinase protein-coding 157.5-83 chr17 72295348 72295620 + 1 NA Intergenic Intergenic -47327 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 120.5-9 chr1 96705216 96705382 + 1 NA Intergenic Intergenic -16306 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 140.5-190 chr5 174251101 174251298 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -85155 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 119.75-96 chr2 33577759 33578123 + 1 NA Intergenic Intergenic -8511 NR_146505 105374454 NR_146505 LOC105374454 - uncharacterized LOC105374454 ncRNA 127.5-57 chr12 33356064 33356238 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 83668 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 314.25-15 chr2 122423104 122423656 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 650101 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 170.25-123 chr4 186643111 186643587 + 1 NA intron (NM_005245, intron 3 of 26) intron (NM_005245, intron 3 of 26) 80507 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 173.5-90 chr22 31063780 31064039 + 1 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -17409 NM_006932 6525 Hs.149098 NM_006932 ENSG00000183963 SMTN - smoothelin protein-coding 151.5-58 chr15 60792512 60792696 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L1MEf|LINE|L1 111035 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 207.5-89 chr5 98074670 98074928 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 86440 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 277.75-5 chr13 46111992 46112358 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -7099 NM_001278541 1361 Hs.512937 NM_001872 ENSG00000080618 CPB2 CPU|PCPB|TAFI carboxypeptidase B2 protein-coding 184.75-69 chr3 84967835 84968038 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) 8947 NM_001167674 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 284.5-70 chr9 93428873 93429280 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 22532 NM_001322224 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 256.75-41 chr8 86011155 86011632 + 1 NA Intergenic Intergenic 58275 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 156.5-38 chr12 44376053 44376225 + 1 NA intron (NM_001286211, intron 6 of 6) intron (NM_001286211, intron 6 of 6) 499522 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 432.5-9 chr5 61053011 61053506 + 1 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 108053 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 249.25-25 chr2 107518110 107518380 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11174 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 266.5-41 chr2 210660529 210661037 + 1 NA intron (NR_163592, intron 22 of 27) intron (NR_163592, intron 22 of 27) 43212 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 123.5-86 chr18 22844112 22844269 + 1 NA Intergenic Intergenic -57353 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 151.25-198 chr8 141079568 141079769 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -48921 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 245.75-8 chr11 80422306 80422712 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 340294 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 164.5-180 chr6 121975812 121976118 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -423586 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 461.5-6 chr4 59508097 59508951 + 1 NA Intergenic Intergenic 494951 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 161.5-138 chr3 119523720 119523937 + 1 NA TTS (NM_005191) TTS (NM_005191) 25281 NM_016589 51300 Hs.477287 NM_016589 ENSG00000113845 TIMMDC1 C3orf1|MC1DN31 translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 protein-coding 162.25-115 chr4 104303207 104303408 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -187658 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 207.5-16 chr12 7237927 7238309 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 47756 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 253.25-7 chr10 60647315 60647788 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) -74595 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 158.75-20 chr10 100830327 100830558 + 1 NA TTS (NM_003987) TTS (NM_003987) -82521 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 151.25-153 chr5 65430641 65430854 + 1 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) L2c|LINE|L2 51173 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 244.25-53 chr8 126751373 126751669 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -193043 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 240.75-30 chr16 72514142 72514510 + 1 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) L1MB7|LINE|L1 150644 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 239.5-75 chr8 26523890 26524234 + 1 NA intron (NM_001197293, intron 1 of 13) L1MB2|LINE|L1 10031 NM_001197293 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 205.5-68 chr2 36655960 36656331 + 1 NA Intergenic Intergenic -40545 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 221.25-9 chr1 218305651 218306262 + 1 NA intron (NM_016052, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 20663 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 141.5-161 chr4 75912083 75912302 + 1 NA intron (NM_001042402, intron 8 of 8) intron (NM_001042402, intron 8 of 8) -9740 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 156.5-48 chr13 94417878 94418142 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 61672 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 292.25-33 chr4 160726494 160726794 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -948860 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 205.5-59 chr17 80191126 80191384 + 1 NA intron (NM_024110, intron 7 of 20) intron (NM_024110, intron 7 of 20) 3455 NM_052819 79092 Hs.675480 NM_024110 ENSG00000141527 CARD14 BIMP2|CARMA2|PRP|PSORS2|PSS1 caspase recruitment domain family member 14 protein-coding 206.5-149 chrX 52002540 52002954 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 60726 NR_102368 101340250 NR_102368 ENSG00000221705 SNORA11E - small nucleolar RNA, H/ACA box 11E snoRNA 222.5-73 chr4 43433056 43433438 + 1 NA Intergenic Intergenic 59296 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 154.75-123 chr5 180712962 180713133 + 1 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 27011 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 186.25-51 chr2 67880028 67880278 + 1 NA Intergenic Intergenic -54591 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 152.5-13 chr10 32446977 32447200 + 1 NA intron (NR_109827, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 948 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 278.25-45 chr4 176133783 176134301 + 1 NA intron (NM_170710, intron 8 of 30) intron (NM_170710, intron 8 of 30) 61543 NM_144644 132851 Hs.481235 NM_144644 ENSG00000150628 SPATA4 SPEF1B|TSARG2 spermatogenesis associated 4 protein-coding 302.25-20 chr5 39208539 39209088 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 1 of 18) intron (NM_001243093, intron 1 of 18) 10750 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 225.25-61 chr4 187872069 187872547 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -123463 NM_174900 132625 Hs.335787 NM_174900 ENSG00000179059 ZFP42 REX-1|REX1|ZNF754|zfp-42 ZFP42 zinc finger protein protein-coding 227.25-16 chr11 55546037 55546385 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8058 NM_001001920 81309 NM_001001920 ENSG00000181939 OR4C15 OR11-127|OR11-134 olfactory receptor family 4 subfamily C member 15 protein-coding 135.25-135 chr4 38575622 38576017 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 11816 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 304.75-33 chr7 77913226 77913699 + 1 NA intron (NM_001366085, intron 7 of 10) (TTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 73332 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 187.5-95 chr2 181378911 181379304 + 1 NA intron (NR_130784, intron 4 of 4) intron (NR_130784, intron 4 of 4) -73455 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 277.5-30 chr2 51284593 51284934 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 252162 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 119.25-93 chr2 83896091 83896253 + 1 NA Intergenic Intergenic 373358 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 293.5-42 chr8 131483948 131484501 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -419869 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 128.25-161 chr5 74116427 74116645 + 1 NA Intergenic Intergenic 191789 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 118.5-179 chr6 105955330 105955535 + 1 NA Intergenic Intergenic -130904 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 156.75-96 chr2 169032062 169032338 + 1 NA promoter-TSS (NM_003742) promoter-TSS (NM_003742) -876 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 268.25-8 chr12 23781789 23782218 + 1 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 167667 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 153.5-174 chr7 4036883 4037117 + 1 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) Charlie17|DNA|hAT-Charlie -92685 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 216.5-21 chr12 26445802 26446075 + 1 NA intron (NM_002223, intron 45 of 56) L2c|LINE|L2 250365 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 183.5-108 chr5 42039058 42039404 + 1 NA Intergenic Intergenic 113950 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 417.5-7 chr22 28412131 28412679 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -47464 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 142.25-9 chr1 215899509 215899678 + 1 NA intron (NM_206933, intron 40 of 71) intron (NM_206933, intron 40 of 71) -172872 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 112.75-142 chr3 191921399 191921636 + 1 NA Intergenic Intergenic -317113 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 392.75 chr1 42604924 42605451 + 1 NA intron (NM_001080850, intron 10 of 16) ERVL-E-int|LTR|ERVL -53236 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 205.75-43 chr3 52701890 52702215 + 1 NA intron (NM_018446, intron 1 of 9) FLAM_A|SINE|Alu 1646 NM_152932 55830 Hs.297304 NM_018446 ENSG00000016864 GLT8D1 AD-017|MSTP139 glycosyltransferase 8 domain containing 1 protein-coding 229.75-13 chr12 14316833 14317229 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -48601 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 223.25-6 chr10 72798796 72799065 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 77901 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 169.5-152 chr6 56446323 56446662 + 1 NA Intergenic Intergenic -52364 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 119.5-27 chr10 63156768 63157000 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 23556 NM_030759 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 136.75-82 chr18 3924715 3924911 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) (TTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -37540 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 213.5-111 chr6 144412706 144413248 + 1 NA intron (NM_007124, intron 2 of 73) intron (NM_007124, intron 2 of 73) 7322 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 205.5-55 chr17 68022654 68023005 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -12906 NM_002266 3838 Hs.594238 NM_002266 ENSG00000182481 KPNA2 IPOA1|QIP2|RCH1|SRP1-alpha|SRP1alpha karyopherin subunit alpha 2 protein-coding 159.75-52 chr15 75791612 75791830 + 1 NA Intergenic Intergenic -29406 NR_036198 100423035 NR_036198 ENSG00000284385 MIR4313 - microRNA 4313 ncRNA 250.75-40 chr3 149903000 149903456 + 1 NA intron (NM_183383, intron 5 of 8) intron (NM_183383, intron 5 of 8) 67667 NM_053024 5217 Hs.91747 NM_002628 ENSG00000070087 PFN2 D3S1319E|PFL profilin 2 protein-coding 168.25-6 chr1 102513366 102513554 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -516226 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 244.5-113 chrX 106180799 106181046 + 1 NA intron (NM_152423, intron 3 of 4) intron (NM_152423, intron 3 of 4) 12617 NM_152423 139221 Hs.592221 NM_152423 ENSG00000157502 PWWP3B MUM1L1 PWWP domain containing 3B protein-coding 293.75-30 chr21 22749904 22750356 + 1 NA Intergenic Intergenic -329154 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 188.5-9 chr1 170521474 170521672 + 1 NA intron (NR_125958, intron 1 of 2) intron (NR_125958, intron 1 of 2) -10549 NM_001146039 92344 Hs.183702 NM_152281 ENSG00000120370 GORAB GO|NTKLBP1|SCYL1BP1 golgin, RAB6 interacting protein-coding 137.5-41 chr11 61835921 61836118 + 1 NA intron (NM_004265, intron 1 of 11) L1MC5a|LINE|L1 7719 NM_004265 9415 Hs.502745 NM_004265 ENSG00000134824 FADS2 D6D|DES6|FADSD6|LLCDL2|SLL0262|TU13 fatty acid desaturase 2 protein-coding 164.5-65 chr14 88453308 88453610 + 1 NA Intergenic Intergenic 67802 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 199.5-34 chr13 43530571 43530856 + 1 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 81861 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 185.25-109 chr5 168275460 168275815 + 1 NA Intergenic Intergenic -16008 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 188.25-112 chr8 25940081 25940397 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) MIRc|SINE|MIR 105174 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 138.75-201 chr8 129878561 129878890 + 1 NA intron (NM_001353278, intron 4 of 13) intron (NM_001353278, intron 4 of 13) 61086 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 282.25-37 chr9 7729689 7730199 + 1 NA Intergenic Intergenic 69834 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 259.25-34 chr5 17304721 17305126 + 1 NA Intergenic Intergenic 82387 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 210.5-4 chr1 84719993 84720360 + 1 NA Intergenic Intergenic -29708 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 220.75-47 chr21 21637755 21638197 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 99343 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 181.25-116 chr6 124743603 124743948 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -218770 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 243.5-59 chr4 82434720 82435022 + 1 NA intron (NM_021204, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 4281 NM_001292017 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 138.5-13 chr1 104314414 104314626 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 241497 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 256.25-27 chr3 87262591 87263160 + 1 NA intron (NM_001122757, intron 3 of 5) intron (NM_001122757, intron 3 of 5) 13709 NM_001122757 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 185.25-38 chr15 76716552 76716803 + 1 NA intron (NR_148227, intron 17 of 32) L1MA9|LINE|L1 130030 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 168.75-5 chr1 51871685 51871971 + 1 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) intron (NM_001101662, intron 1 of 30) 6212 NM_001242361 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 250.5-10 chr10 120604164 120604594 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 6430 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 206.25-11 chr1 237085341 237085594 + 1 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) intron (NM_001035, intron 1 of 104) 43283 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 183.75-78 chr3 179161155 179161405 + 1 NA intron (NM_006218, intron 1 of 20) intron (NM_006218, intron 1 of 20) 12923 NM_006218 5290 Hs.553498 NM_006218 ENSG00000121879 PIK3CA CLAPO|CLOVE|CWS5|MCAP|MCM|MCMTC|PI3K|PI3K-alpha|p110-alpha phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha protein-coding 166.25-121 chr5 22406232 22406465 + 1 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR -192498 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 229.25-65 chr5 139304412 139304744 + 1 NA intron (NM_001194956, intron 1 of 13) intron (NM_001194956, intron 1 of 13) 10828 NM_001194956 9782 Hs.268939 NM_018834 ENSG00000015479 MATR3 ALS21|MPD2|VCPDM matrin 3 protein-coding 244.5-109 chr9 129072419 129072874 + 1 NA TTS (NR_138425) TTS (NR_138425) -8465 NM_020438 57171 Hs.21701 NM_020438 ENSG00000167130 DOLPP1 LSFR2 dolichyldiphosphatase 1 protein-coding 195.5-80 chr2 172611213 172611436 + 1 NA intron (NR_103731, intron 11 of 13) L1MD|LINE|L1 55234 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 165.25-115 chr5 32013279 32013623 + 1 NA intron (NM_178140, intron 6 of 24) intron (NM_178140, intron 6 of 24) -77292 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 118.25-153 chr5 43613328 43613544 + 1 NA intron (NM_012343, intron 3 of 21) intron (NM_012343, intron 3 of 21) -10206 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 195.5-63 chr2 10482489 10482792 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 32912 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 114.5-178 chr3 95754150 95754478 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -71121 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 135.25-51 chr12 29750587 29750803 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 33247 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 224.75-75 chr8 115231601 115231971 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 436227 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 147.5-86 chr18 4340567 4340842 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 76102 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 133.5-285 chrX 58416785 58417007 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -506263 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 176.5-167 chr8 61611958 61612178 + 1 NA intron (NM_004318, intron 14 of 24) L1M4a1|LINE|L1 77743 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 217.25-93 chrX 78420689 78421134 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -93220 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 132.25-69 chr16 58691297 58691567 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6662 NR_161424 55238 Hs.10499 NM_018231 ENSG00000103042 SLC38A7 SNAT7 solute carrier family 38 member 7 protein-coding 215.25-45 chr2 45020536 45020783 + 1 NA Intergenic Intergenic -11207 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 187.5-54 chr14 41547020 41547252 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -59720 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 201.5-70 chr2 80906822 80907205 + 1 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 559933 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 193.5-16 chr10 47362106 47362479 + 1 NA Intergenic Intergenic 13929 NM_002900 5949 Hs.591928 NM_002900 ENSG00000265203 RBP3 D10S64|D10S65|D10S66|IRBP|RBPI|RP66 retinol binding protein 3 protein-coding 121.25-64 chr15 61263173 61263377 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -33973 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 252.75-2 chr1 213570219 213570701 + 1 NA Intergenic Intergenic -354289 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 135.75-164 chr4 102016964 102017247 + 1 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 203263 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 344.5-23 chr5 110993892 110994255 + 1 NA Intergenic Intergenic -76007 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 179.25-118 chr5 66201186 66201509 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 8099 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 117.25-64 chr14 30415089 30415288 + 1 NA Intergenic Intergenic -143935 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 225.5-107 chr9 12571608 12571869 + 1 NA Intergenic Intergenic -121647 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 136.5-231 chr8 104983716 104983907 + 1 NA Intergenic Intergenic -334627 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 198.75-24 chr13 50135198 50135532 + 1 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) -9824 NR_152566 8847 Hs.547964 NR_002612 ENSG00000231607 DLEU2 ALT1|BCMSUN|DLB2|LEU2|LINC00022|MIR15AHG|NCRNA00022|RFP2|RFP2OS|TRIM13OS deleted in lymphocytic leukemia 2 ncRNA 122.5-168 chr4 96808764 96808966 + 1 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) MER34A1|LTR|ERV1 498162 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 199.25-37 chr15 90544018 90544263 + 1 NA intron (NM_001042574, intron 2 of 14) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 14217 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 138.5-57 chr14 54163468 54163721 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -206703 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 258.25-54 chr7 47402864 47403455 + 1 NA intron (NM_022748, intron 13 of 30) intron (NM_022748, intron 13 of 30) 61644 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 297.5-25 chr2 62453086 62453431 + 1 NA Intergenic Intergenic 52937 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 172.5-193 chr7 94904257 94904561 + 1 NA Intergenic Intergenic -3185 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 302.25-14 chr2 13019794 13020345 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -13056 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 153.5-102 chr2 100867592 100867791 + 1 NA intron (NM_002518, intron 1 of 20) intron (NM_002518, intron 1 of 20) 47552 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 260.5-26 chr2 20568647 20569067 + 1 NA Intergenic Intergenic 23691 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 304.75 chr1 167334136 167334685 + 1 NA intron (NM_001198783, intron 2 of 15) intron (NM_001198783, intron 2 of 15) 5340 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 192.75-122 chr7 93703659 93703898 + 1 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -13150 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 147.75-102 chr3 51920650 51920868 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -17406 NM_152397 132141 Hs.671210 NM_152397 ENSG00000173389 IQCF1 - IQ motif containing F1 protein-coding 128.25-165 chr5 121075645 121075896 + 1 NA Intergenic Intergenic -246780 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 209.5-37 chr13 96732265 96732625 + 1 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1MA8|LINE|L1 251727 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 182.5-98 chr3 25811344 25811657 + 1 NA Intergenic Intergenic 21410 NM_017897 54995 Hs.55781 NM_017897 ENSG00000151093 OXSM CEM1|FASN2D|KASI|KS 3-oxoacyl-ACP synthase, mitochondrial protein-coding 166.5-149 chr4 98308331 98308693 + 1 NA intron (NM_021159, intron 2 of 14) intron (NM_021159, intron 2 of 14) 47128 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 136.25-58 chr14 59964710 59964897 + 1 NA intron (NR_075071, intron 10 of 32) L2c|LINE|L2 45090 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 178.5-129 chr4 150386302 150386618 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 47 of 56) L1PA11|LINE|L1 -192629 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 271.75-44 chr7 37035027 37035628 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 37531 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 189.75-90 chr5 44593685 44594009 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -83565 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 130.5-176 chr3 151952356 151952631 + 1 NA Intergenic Intergenic -24318 NR_110202 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-13 chr1 226199519 226199920 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12978 NM_022735 64746 Hs.520207 NM_022735 ENSG00000182827 ACBD3 GCP60|GOCAP1|GOLPH1|PAP7 acyl-CoA binding domain containing 3 protein-coding 189.5-154 chr8 129322721 129323075 + 1 NA Intergenic Intergenic -81658 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 147.75-82 chr2 202314453 202314703 + 1 NA Intergenic Intergenic 21527 NR_003031 692058 NR_003031 ENSG00000238317 SNORD11 HBII-95 small nucleolar RNA, C/D box 11 snoRNA 135.75-101 chr2 115760685 115760863 + 1 NA intron (NM_001321907, intron 10 of 23) intron (NM_001321907, intron 10 of 23) 416959 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 190.75-76 chr4 72265656 72265870 + 1 NA Intergenic Intergenic 226631 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 117.5-227 chr8 32852474 32852629 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 130716 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 165.25-44 chr14 77857703 77857988 + 1 NA intron (NM_001366490, intron 4 of 11) intron (NM_001366490, intron 4 of 11) 57736 NM_001142545 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 243.5-79 chr8 48180468 48180937 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 172271 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 168.25-142 chr8 112520383 112520572 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 25 of 66) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -123016 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 214.75 chr1 66001189 66001470 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L1MC4|LINE|L1 8713 NM_001037340 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 319.5-5 chr10 64160891 64161459 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -639285 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 371.5-16 chr8 113182129 113182687 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 194744 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 215.5-57 chr20 10307869 10308161 + 1 NA TTS (NM_130811) TTS (NM_130811) -88509 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 373.5-12 chr20 12349174 12349723 + 1 NA Intergenic Intergenic 431555 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 117.5-194 chr5 133051548 133051753 + 1 NA promoter-TSS (NM_002154) promoter-TSS (NM_002154) -363 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 215.5-111 chr9 18879060 18879376 + 1 NA intron (NM_001040272, intron 23 of 28) intron (NM_001040272, intron 23 of 28) 153991 NM_001287050 158297 Hs.731593 NM_153707 ENSG00000155875 SAXO1 C9orf138|FAM154A stabilizer of axonemal microtubules 1 protein-coding 275.75-3 chr10 12097216 12097608 + 1 NA intron (NM_018706, intron 7 of 16) AluSq|SINE|Alu 28458 NM_018706 55526 Hs.104980 NM_018706 ENSG00000181192 DHTKD1 AMOXAD|CMT2Q dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1 protein-coding 203.5-26 chr11 6520386 6520747 + 1 NA 3' UTR (NM_173589, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_173589, exon 8 of 8) 23270 NM_144666 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 163.5-152 chr4 178747233 178747406 + 1 NA Intergenic Intergenic -839383 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 209.5-78 chr20 17099880 17100251 + 1 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -126042 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 147.75-73 chr2 111231423 111231718 + 1 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 89516 NR_039636 100616341 NR_039636 ENSG00000266139 MIR4435-2 mir-4435-2 microRNA 4435-2 ncRNA 276.25-34 chr4 105179021 105179620 + 1 NA intron (NR_126420, intron 2 of 5) intron (NR_126420, intron 2 of 5) 32635 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 137.5-25 chr10 16152906 16153068 + 1 NA Intergenic Intergenic -283956 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 163.5-225 chrX 74813978 74814201 + 1 NA intron (NM_001008537, intron 1 of 3) intron (NM_001008537, intron 1 of 3) 111363 NM_001008537 340533 Hs.124128 NM_001008537 ENSG00000050030 NEXMIF KIAA2022|KIDLIA|MRX98|XPN neurite extension and migration factor protein-coding 160.5-3 chr1 158749777 158750051 + 1 NA Intergenic Intergenic -4902 NM_001005184 128371 Hs.553591 NM_001005184 ENSG00000180433 OR6K6 OR1-21 olfactory receptor family 6 subfamily K member 6 protein-coding 150.5-133 chr3 115368812 115369197 + 1 NA Intergenic Intergenic -221716 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 188.75-23 chr14 43143660 43143858 + 1 NA Intergenic Intergenic 1363524 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 392.5 chr1 45037918 45038399 + 1 NA intron (NM_020883, intron 8 of 13) intron (NM_020883, intron 8 of 13) 25904 NR_036510 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 152.75-135 chr6 37593953 37594132 + 1 NA Intergenic Intergenic -38620 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 173.5-52 chr17 43384271 43384590 + 1 NA intron (NR_027413, intron 1 of 3) intron (NR_027413, intron 1 of 3) 4468 NR_027412 100130581 Hs.546897 NR_027412 ENSG00000188825 LINC00910 - long intergenic non-protein coding RNA 910 ncRNA 259.75-12 chr12 25896054 25896591 + 1 NA Intergenic Intergenic -22243 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 120.5-51 chr12 13957631 13957832 + 1 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 22625 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 230.75-42 chr21 14859111 14859396 + 1 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 59415 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 130.25-50 chr13 50998268 50998566 + 1 NA intron (NR_003923, intron 16 of 16) intron (NR_003923, intron 16 of 16) 67740 NR_003923 2974 Hs.411573 NM_004129 ENSG00000123201 GUCY1B2 GC-SB2 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 2 (pseudogene) pseudo 216.5-12 chr11 107071273 107071636 + 1 NA Intergenic Intergenic -52978 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 242.75-10 chr10 79616818 79617190 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 6065 NM_005411 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 127.75-45 chr11 74269457 74269619 + 1 NA intron (NR_110031, intron 10 of 11) intron (NR_110031, intron 10 of 11) -41824 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 334.5-18 chr3 71137788 71138381 + 1 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) intron (NR_146142, intron 6 of 19) -5887 NM_001349342 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 167.5-152 chr5 129322010 129322283 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 75001 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 122.5-215 chr7 112773915 112774104 + 1 NA intron (NM_022484, intron 3 of 4) intron (NM_022484, intron 3 of 4) 16384 NM_022484 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 261.5-54 chr5 68895453 68895949 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 134226 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 204.25-84 chr4 125452918 125453311 + 1 NA intron (NM_001291303, intron 9 of 16) MIR|SINE|MIR -54145 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 145.5-133 chr3 105076412 105076791 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -290112 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 174.5-184 chr8 87308933 87309133 + 1 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) L1MA4|LINE|L1 442618 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 206.5-19 chr12 118923564 118923841 + 1 NA Intergenic Intergenic -57839 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 208.75-82 chr8 86597960 86598211 + 1 NA intron (NM_019098, intron 15 of 17) L2a|LINE|L2 83650 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 153.75-40 chr14 53061256 53061504 + 1 NA intron (NM_030637, intron 7 of 11) intron (NM_030637, intron 7 of 11) 91943 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 215.75-30 chr13 79154381 79154792 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 251635 NM_001286631 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 287.5-11 chr11 79085494 79085925 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) intron (NM_001098816, intron 4 of 33) 316400 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 134.5-150 chr4 31771829 31772012 + 1 NA Intergenic Intergenic -225459 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 227.75-82 chr8 100293956 100294346 + 1 NA intron (NM_001280539, intron 2 of 10) L1M4a1|LINE|L1 8042 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 282.75-13 chr13 112744484 112744823 + 1 NA TTS (NR_046661) TTS (NR_046661) 10078 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 202.25-86 chr7 15483074 15483642 + 1 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) AluY|SINE|Alu 78657 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 175.25-60 chr17 62312823 62313166 + 1 NA Intergenic Intergenic -37339 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 115.25-133 chr3 53375599 53375767 + 1 NA Intergenic Intergenic -28140 NM_001290206 55802 Hs.476353 NM_018403 ENSG00000272886 DCP1A HSA275986|Nbla00360|SMAD4IP1|SMIF decapping mRNA 1A protein-coding 213.75-30 chr12 125614949 125615208 + 1 NA intron (NM_052907, intron 5 of 8) L1MB7|LINE|L1 -7374 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 226.25-36 chr2 72380353 72380721 + 1 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) AluYj4|SINE|Alu -232675 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 421.5 chr1 45403944 45404738 + 1 NA intron (NM_007170, intron 3 of 10) intron (NM_007170, intron 3 of 10) -63871 NM_001293190 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 150.5-232 chr9 3378161 3378376 + 1 NA intron (NM_134428, intron 3 of 17) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 17328 NM_002919 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 184.5-113 chr4 133921374 133921648 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 280278 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 177.5-24 chr11 58313195 58313579 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -45127 NM_207374 81341 Hs.531507 NM_207374 ENSG00000172772 OR10W1 OR10W1P|OR10W1Q|OR11-236|UNQ6469 olfactory receptor family 10 subfamily W member 1 protein-coding 117.5-25 chr10 6815583 6815737 + 1 NA intron (NR_038291, intron 2 of 4) intron (NR_038291, intron 2 of 4) 36062 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 178.5-143 chr5 87350750 87351205 + 1 NA intron (NM_022650, intron 8 of 24) intron (NM_022650, intron 8 of 24) -27349 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 136.5-166 chr4 138415073 138415300 + 1 NA intron (NR_051987, intron 2 of 2) intron (NR_051987, intron 2 of 2) 105475 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 140.75-83 chr2 59215004 59215167 + 1 NA Intergenic Intergenic -2623 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 155.5-192 chr7 15070348 15070628 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -95630 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 172.25-29 chr12 5908549 5908780 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) intron (NM_001278596, intron 3 of 25) 36595 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 170.5-192 chr8 118783933 118784374 + 1 NA Intergenic Intergenic -162190 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 184.75-113 chr9 125542179 125542396 + 1 NA intron (NM_001006618, intron 7 of 7) intron (NM_001006618, intron 7 of 7) 164921 NM_001006618 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 260.5-13 chr13 107808821 107809327 + 1 NA intron (NR_046848, intron 1 of 1) LTR65|LTR|ERV1 26384 NR_046848 100874375 Hs.653972 NR_046848 FAM155A-IT1 - FAM155A intronic transcript 1 ncRNA 235.25-48 chr4 34415666 34416030 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -146101 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 144.25-38 chr11 24366326 24366485 + 1 NA Intergenic Intergenic -130648 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 183.5-117 chr5 111588440 111588669 + 1 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 -75957 NM_001308057 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 196.75-95 chr6 137249595 137249805 + 1 NA Intergenic Intergenic -30270 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 174.75-64 chr2 116316559 116316810 + 1 NA Intergenic Intergenic 972869 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 163.5-26 chr10 85802522 85802755 + 1 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1ME2|LINE|L1 224907 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-54 chr13 39505057 39505231 + 1 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) intron (NM_005780, intron 2 of 3) 98049 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 160.75-44 chr14 70922328 70922621 + 1 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) intron (NM_014982, intron 1 of 35) 15015 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 194.5-43 chr15 59836112 59836437 + 1 NA Intergenic Intergenic -146954 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 237.25-15 chr12 46465053 46465487 + 1 NA intron (NR_125378, intron 3 of 3) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 81163 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 211.25-48 chr20 59399328 59399743 + 1 NA Intergenic Intergenic 98924 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 174.5-11 chr1 165409865 165410059 + 1 NA intron (NM_001256570, intron 7 of 10) intron (NM_001256570, intron 7 of 10) 15022 NM_001256571 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 223.75-69 chr5 109797826 109798249 + 1 NA intron (NM_002372, intron 12 of 21) L1M6|LINE|L1 -85145 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 121.25-121 chr21 37349892 37350043 + 1 NA Intergenic Intergenic -15606 NM_001396 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 228.25-63 chr4 177816615 177816920 + 1 NA intron (NR_108092, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 88010 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 152.5-91 chr2 126357528 126357847 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -239702 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 121.75-127 chr4 41362631 41362904 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 1960 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 217.5-88 chr4 32572094 32572508 + 1 NA Intergenic Intergenic 221263 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 149.5-194 chr7 132051054 132051219 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 140916 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 213.75-22 chr11 82695287 82695626 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 38408 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 188.5-74 chr2 74962836 74963070 + 1 NA intron (NM_019896, intron 3 of 3) L1ME3B|LINE|L1 4310 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 132.75-207 chrX 50572836 50573135 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -102160 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 221.5-39 chr19 27339867 27340110 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -453443 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 192.75-35 chr15 52382859 52383161 + 1 NA intron (NM_001142495, intron 16 of 39) intron (NM_001142495, intron 16 of 39) -87206 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 158.5-52 chr13 23499856 23500157 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 30494 NR_038995 100506697 Hs.50118 NR_038995 ENSG00000232977 LINC00327 NCRNA00327 long intergenic non-protein coding RNA 327 ncRNA 242.25-76 chr6 75985381 75985797 + 1 NA intron (NM_001563, intron 12 of 16) intron (NM_001563, intron 12 of 16) 87073 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 196.5-95 chr22 30390444 30390784 + 1 NA Intergenic Intergenic -3203 NM_001017981 200312 Hs.592194 NM_001017981 ENSG00000099999 RNF215 - ring finger protein 215 protein-coding 330.5-20 chr2 200615527 200616043 + 1 NA intron (NM_001159, intron 15 of 34) intron (NM_001159, intron 15 of 34) 29771 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 171.5-116 chr4 69554537 69554868 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -28688 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 240.5-67 chr3 106671316 106671797 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 569082 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 195.5-36 chr14 42180853 42181186 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 574163 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 188.75-109 chr7 54563519 54563966 + 1 NA intron (NR_038994, intron 2 of 3) intron (NR_038994, intron 2 of 3) 6772 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 177.25-61 chr18 1985542 1985765 + 1 NA Intergenic Intergenic 585852 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 126.25-44 chr13 26650318 26650531 + 1 NA intron (NM_006646, intron 3 of 9) L1MCa|LINE|L1 92721 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 204.5-88 chr3 48394248 48394537 + 1 NA intron (NM_207102, intron 10 of 10) intron (NM_207102, intron 10 of 10) 22173 NM_001159929 285231 Hs.288793 NM_207102 ENSG00000164049 FBXW12 FBW12|FBXO12|FBXO35 F-box and WD repeat domain containing 12 protein-coding 167.5-28 chr10 112474795 112475171 + 1 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) intron (NM_001365712, intron 3 of 8) -27380 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 150.75-106 chr2 171554978 171555201 + 1 NA 3' UTR (NM_001127383, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001127383, exon 3 of 3) 32615 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 139.75-21 chr10 102387906 102388129 + 1 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6093 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 305.25-30 chr21 31879104 31879479 + 1 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) intron (NM_014586, intron 1 of 10) 6271 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 349.5-12 chr22 31675066 31675751 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12844 NM_001326421 23761 Hs.420559 NM_014338 ENSG00000241878 PISD DJ858B16|PSD|PSDC|PSSC|dJ858B16.2 phosphatidylserine decarboxylase protein-coding 353.5-5 chr12 98022714 98023162 + 1 NA Intergenic Intergenic -27490 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 119.75-69 chr16 35805916 35806076 + 1 NA Intergenic Intergenic 59444 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 214.75-24 chr14 55464756 55465154 + 1 NA Intergenic Intergenic -24410 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 159.5-91 chr2 8229122 8229371 + 1 NA intron (NR_152741, intron 9 of 9) intron (NR_152741, intron 9 of 9) 99173 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 131.5-228 chr8 13217021 13217175 + 1 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) intron (NM_001348082, intron 5 of 16) 59423 NM_001316668 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 138.5-109 chr2 141755372 141755532 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L1ME3G|LINE|L1 376249 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 289.25-25 chr5 66601536 66601893 + 1 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 5321 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 119.5-17 chr1 210818011 210818160 + 1 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) intron (NM_002238, intron 7 of 10) 315289 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 177.75-29 chr12 73181505 73181894 + 1 NA intron (NR_110130, intron 2 of 3) L1M1|LINE|L1 22509 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 135.5-198 chr8 79177795 79178061 + 1 NA Intergenic Intergenic -154260 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 183.5-39 chr13 102882161 102882449 + 1 NA intron (NR_026965, intron 2 of 3) intron (NR_026965, intron 2 of 3) 2206 NR_026965 121952 Hs.660773 NR_026965 ENSG00000250878 METTL21EP METTL21CP1 methyltransferase like 21E, pseudogene pseudo 132.5-235 chr8 37865461 37865691 + 1 NA intron (NM_001002814, intron 5 of 5) AluSx1|SINE|Alu -15715 NM_018310 55290 Hs.709301 NM_018310 ENSG00000104221 BRF2 BRFU|TFIIIB50 BRF2 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit protein-coding 117.75-103 chr2 56533893 56534069 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -348211 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 167.25-152 chr8 110362916 110363153 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -387263 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 202.75-66 chr21 21539960 21540197 + 1 NA 3' UTR (NM_001352591, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001352591, exon 18 of 18) 197241 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 129.75-176 chr7 111201027 111201282 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 110027 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 118.25-178 chr7 13745932 13746191 + 1 NA Intergenic Intergenic 240453 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 145.75-18 chr10 121785136 121785398 + 1 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) intron (NM_001001976, intron 11 of 11) 142764 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 195.75-15 chr10 6379018 6379384 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 28885 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 277.5-78 chr9 117036273 117036765 + 1 NA intron (NM_014010, intron 5 of 21) MER74A|LTR|ERVL 144682 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 158.75-158 chr8 72191273 72191467 + 1 NA Intergenic Intergenic 60264 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 140.5-70 chr14 83945375 83945603 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 1302857 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 167.5-4 chr1 53827636 53827920 + 1 NA intron (NR_033142, intron 3 of 16) intron (NR_033142, intron 3 of 16) 10518 NM_001168551 55706 Hs.476525 NM_018087 ENSG00000058804 NDC1 NET3|TMEM48 NDC1 transmembrane nucleoporin protein-coding 316.25-3 chr1 193986058 193986534 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 681551 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 166.5-72 chr15 101422061 101422341 + 1 NA intron (NM_138325, intron 6 of 13) L1MEf|LINE|L1 67506 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 133.5-271 chr8 131153702 131153906 + 1 NA Intergenic Intergenic -112895 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 154.5-36 chr11 46553827 46554059 + 1 NA intron (NM_001267782, intron 1 of 19) intron (NM_001267782, intron 1 of 19) 33501 NR_160027 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 130.25-133 chr3 38513542 38513688 + 1 NA intron (NM_005107, intron 5 of 5) intron (NM_005107, intron 5 of 5) 17275 NR_134938 9941 Hs.517897 NM_005107 ENSG00000157036 EXOG ENDOGL1|ENDOGL2|ENGL|ENGL-a|ENGL-b|ENGLA|ENGLB exo/endonuclease G protein-coding 212.25-88 chr7 70982489 70982819 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -149490 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 152.75-118 chr4 14004702 14005024 + 1 NA Intergenic Intergenic -107105 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 213.5-84 chr3 193810956 193811361 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 32851 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 230.75-12 chr10 89678785 89679111 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 18980 NR_026835 283011 Hs.679445 NR_026835 FLJ37201 - tigger transposable element derived 2 pseudogene pseudo 158.5-27 chr10 82507789 82508015 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -274982 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 153.25-15 chr10 57535435 57535619 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -230968 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 188.25-36 chr14 20155021 20155436 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 11492 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 197.25-88 chr6 80005061 80005420 + 1 NA intron (NM_003318, intron 1 of 21) intron (NM_003318, intron 1 of 21) 591 NM_003318 7272 Hs.169840 NM_003318 ENSG00000112742 TTK CT96|ESK|MPH1|MPS1|MPS1L1|PYT TTK protein kinase protein-coding 230.25-25 chr14 38806910 38807216 + 1 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -75533 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 150.75-79 chr17 35543122 35543439 + 1 NA Intergenic Intergenic -5419 NM_001363830 100506736 Hs.447559 NM_001145027 ENSG00000205045 SLFN12L - schlafen family member 12 like protein-coding 159.25-11 chr1 231599801 231600230 + 1 NA intron (NR_034037, intron 1 of 1) intron (NR_034037, intron 1 of 1) 12075 NR_034037 100287814 Hs.25555 NR_034037 ENSG00000229228 LINC00582 - long intergenic non-protein coding RNA 582 ncRNA 162.75-34 chr14 59932954 59933236 + 1 NA intron (NR_075071, intron 6 of 32) L2a|LINE|L2 13382 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 274.75-25 chr2 68717521 68717929 + 1 NA Intergenic Intergenic -17086 NM_001007231 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 167.5-144 chr5 57240589 57240826 + 1 NA intron (NM_001331037, intron 7 of 12) AluSp|SINE|Alu 26633 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 121.5-96 chr16 54756040 54756295 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 92066 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 235.5-15 chr10 89202480 89202850 + 1 NA Intergenic Intergenic 4652 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 190.5-13 chr10 62847513 62847909 + 1 NA Intergenic Intergenic -28544 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 189.25-133 chr9 7648035 7648339 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 151591 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 180.25-92 chr5 39118346 39118658 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 16 of 18) intron (NM_001243093, intron 16 of 18) -44103 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 213.75-47 chr18 70979488 70979974 + 1 NA Intergenic Intergenic -328777 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 211.25-34 chr17 57514806 57515237 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 8576 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 177.75-5 chr1 80637464 80637708 + 1 NA intron (NR_125940, intron 2 of 3) MER61-int|LTR|ERV1 -3701 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 135.25-189 chr7 37814016 37814228 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -34475 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 132.75-170 chr6 136403127 136403438 + 1 NA intron (NM_001198611, intron 3 of 16) intron (NM_001198611, intron 3 of 16) 63593 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 231.75-20 chr14 33226571 33226943 + 1 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 287878 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 179.25-89 chr20 4938681 4939021 + 1 NA intron (NM_005116, intron 2 of 16) intron (NM_005116, intron 2 of 16) 62659 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 186.75-104 chr7 46622121 46622347 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 74888 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 203.75-45 chr17 63806697 63806902 + 1 NA intron (NM_203499, intron 8 of 17) intron (NM_203499, intron 8 of 17) -20632 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 113.5-28 chr1 240537974 240538170 + 1 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) intron (NM_022469, intron 1 of 1) 74083 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 151.5-92 chr2 210233143 210233389 + 1 NA Intergenic Intergenic -7819 NM_001608 33 Hs.471277 NM_001608 ENSG00000115361 ACADL ACAD4|LCAD acyl-CoA dehydrogenase long chain protein-coding 217.5-98 chr5 55814165 55814456 + 1 NA intron (NM_024415, intron 19 of 21) intron (NM_024415, intron 19 of 21) -37047 NM_139017 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 363.5-7 chr14 51531300 51531920 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 42482 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 202.75-27 chr12 89333840 89334154 + 1 NA Intergenic Intergenic 18504 NM_022652 1848 Hs.298654 NM_001946 ENSG00000139318 DUSP6 HH19|MKP3|PYST1 dual specificity phosphatase 6 protein-coding 200.25-69 chr2 223673280 223673525 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -71041 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 232.5-86 chr5 119194291 119194778 + 1 NA intron (NM_001290321, intron 30 of 43) intron (NM_001290321, intron 30 of 43) 39897 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 199.25-82 chr5 65954291 65954520 + 1 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) intron (NM_001253697, intron 1 of 25) -8832 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 161.75-133 chr9 28975658 28975900 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -86824 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 257.5-61 chr5 122771962 122772401 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -2815 NM_001278199 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 305.5-19 chr2 53720009 53720511 + 1 NA intron (NM_001201965, intron 4 of 8) MER4A1_|LTR|ERV1 -47523 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 166.25-54 chr16 13004073 13004335 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 102606 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 232.5-11 chr10 75335266 75335519 + 1 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) intron (NR_038226, intron 2 of 3) 39009 NR_038223 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 163.75-48 chr15 60434746 60435133 + 1 NA intron (NR_147171, intron 14 of 16) L1MA4|LINE|L1 -36953 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 115.25-150 chr4 77189376 77189703 + 1 NA Intergenic Intergenic 32332 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 137.5-47 chr12 1277659 1277813 + 1 NA intron (NR_027948, intron 14 of 19) intron (NR_027948, intron 14 of 19) -222755 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 184.5-102 chr3 106750373 106750693 + 1 NA Intergenic Intergenic 490105 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 120.5-131 chr2 199702184 199702335 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 94191 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 122.5-141 chr22 26825360 26825626 + 1 NA Intergenic Intergenic -34718 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 246.25-38 chr2 165176081 165176543 + 1 NA exon (NM_001081676, exon 3 of 28) exon (NM_001081676, exon 3 of 28) 27738 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 186.5-67 chr2 106795892 106796248 + 1 NA Intergenic Intergenic 89958 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 143.5-214 chr8 112227730 112227904 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 66 of 66) AluY|SINE|Alu -415676 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 154.75-54 chr16 67133163 67133362 + 1 NA intron (NM_001320542, intron 7 of 16) intron (NM_001320542, intron 7 of 16) 17736 NM_033309 84752 Hs.744158 NM_033309 ENSG00000237172 B3GNT9 - UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 protein-coding 167.5-149 chr5 101859862 101860083 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 436312 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 172.5-166 chr6 47551011 47551376 + 1 NA intron (NM_012120, intron 4 of 17) intron (NM_012120, intron 4 of 17) 73404 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 185.5-86 chr2 191906600 191906834 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -59629 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 154.75-52 chr16 52427357 52427658 + 1 NA Intergenic Intergenic 119636 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 179.5-4 chr1 44828016 44828226 + 1 NA exon (NM_001166292, exon 14 of 23) exon (NM_001166292, exon 14 of 23) 14823 NM_001166292 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 114.25-19 chr10 63766031 63766204 + 1 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -244227 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 195.5-133 chr6 50682310 50682573 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -31103 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 227.5-53 chr2 66402665 66403071 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 19562 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 167.5-62 chr14 71323924 71324182 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) MIRc|SINE|MIR 3577 NM_001354285 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 132.5-117 chr2 63542220 63542375 + 1 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 46180 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 202.5-143 chr8 130690038 130690298 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -246494 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 160.75-148 chr7 111657492 111657684 + 1 NA Intergenic Intergenic -95071 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 226.75-63 chr5 159767935 159768422 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 103206 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 196.5-69 chr18 3778593 3778893 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) intron (NM_001242762, intron 2 of 9) 66615 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 174.75-146 chr9 136811130 136811375 + 1 NA intron (NM_001173989, intron 1 of 7) MER4E|LTR|ERV1 -2404 NR_024580 100131193 Hs.734812 NR_024580 ENSG00000228544 CCDC183-AS1 KIAA1984-AS1 CCDC183 antisense RNA 1 ncRNA 194.5-97 chr3 191676918 191677279 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 215935 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 159.75-35 chr13 97682064 97682346 + 1 NA Intergenic Intergenic 248036 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 316.5-39 chr8 105149375 105149977 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -168762 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 246.25-47 chr4 22451272 22451545 + 1 NA intron (NM_145290, intron 4 of 18) intron (NM_145290, intron 4 of 18) -63904 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 246.5-75 chr8 103863583 103863902 + 1 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) L1PB4|LINE|L1 44522 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 191.5-16 chr10 69703636 69703869 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 73505 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 157.25-105 chr4 60283946 60284304 + 1 NA Intergenic Intergenic -638494 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 195.5-97 chr3 32890584 32890937 + 1 NA exon (NM_001039111, exon 4 of 4) exon (NM_001039111, exon 4 of 4) -60884 NM_005508 1233 Hs.184926 NM_005508 ENSG00000183813 CCR4 CC-CKR-4|CD194|CKR4|CMKBR4|ChemR13|HGCN:14099|K5-5 C-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 182.5-181 chrX 106149024 106149245 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -19171 NM_001171020 139221 Hs.592221 NM_152423 ENSG00000157502 PWWP3B MUM1L1 PWWP domain containing 3B protein-coding 148.5-117 chr2 200819627 200819995 + 1 NA intron (NM_001207067, intron 9 of 11) AluSz|SINE|Alu 7425 NM_001207068 9689 Hs.355983 NM_014670 ENSG00000082153 BZW1 BZAP45|Nbla10236 basic leucine zipper and W2 domains 1 protein-coding 157.5-76 chr16 72149494 72149838 + 1 NA intron (NM_031293, intron 5 of 20) AluSx|SINE|Alu 22489 NM_031293 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 275.25-33 chr5 98207678 98207976 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -46588 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 171.75-70 chr2 26386381 26386610 + 1 NA exon (NM_033505, exon 9 of 10) exon (NM_033505, exon 9 of 10) -15425 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 133.25-115 chr2 226863295 226863476 + 1 NA intron (NM_001167608, intron 3 of 8) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 27331 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 261.75-3 chr10 87741118 87741485 + 1 NA exon (NM_004670, exon 9 of 12) exon (NM_004670, exon 9 of 12) 76930 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 150.75-5 chr1 33217811 33218024 + 1 NA Intergenic Intergenic -35874 NM_018207 55223 Hs.656006 NM_018207 ENSG00000116525 TRIM62 DEAR1 tripartite motif containing 62 protein-coding 123.5-196 chr7 22167162 22167342 + 1 NA intron (NM_001367603, intron 1 of 5) intron (NM_001367603, intron 1 of 5) 26493 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 148.25-48 chr16 55562031 55562339 + 1 NA intron (NM_017839, intron 11 of 13) intron (NM_017839, intron 11 of 13) -4499 NM_032330 84290 Hs.660027 NM_032330 ENSG00000256812 CAPNS2 CSS2 calpain small subunit 2 protein-coding 271.5-13 chr11 81933266 81933606 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L2|LINE|L2 -42600 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 171.75-134 chr7 112104752 112105054 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 101496 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 124.75-89 chr15 81815765 81816011 + 1 NA Intergenic Intergenic 230130 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 131.75-185 chr6 57758924 57759199 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 177868 NR_133000 375513 Hs.561539 NM_206908 GUSBP4 C6orf216|GUSBL2|SMA3-L|SMAC3L GUSB pseudogene 4 pseudo 149.25-25 chr11 11044619 11044818 + 1 NA Intergenic Intergenic 186501 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 188.75-97 chr6 95243279 95243496 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 334064 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 193.5-51 chr14 97156561 97156787 + 1 NA intron (NR_146554, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 1817 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 168.25-68 chr2 27049151 27049540 + 1 NA TTS (NR_046730) TTS (NR_046730) 919 NR_046730 100874031 Hs.132725 NR_046730 ENSG00000231636 AGBL5-AS1 - AGBL5 antisense RNA 1 ncRNA 217.5-53 chr18 2402105 2402420 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 169243 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 193.5-130 chr5 31353540 31353845 + 1 NA Intergenic Intergenic 160006 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 126.5-158 chr3 116041871 116042089 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -136854 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 147.5-98 chr2 57169541 57169806 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -737978 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 272.5-62 chr6 166827514 166827996 + 1 NA intron (NM_001318936, intron 2 of 22) L1MA9|LINE|L1 34770 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 127.5-128 chr2 157618431 157618654 + 1 NA intron (NM_145259, intron 1 of 8) L1MEf|LINE|L1 10322 NM_145259 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 150.75-176 chr8 29183635 29183814 + 1 NA intron (NM_015254, intron 6 of 39) intron (NM_015254, intron 6 of 39) 79346 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 275.25-26 chr22 26930022 26930522 + 1 NA Intergenic Intergenic 26980 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 184.5-59 chr17 67346307 67346651 + 1 NA intron (NM_174871, intron 6 of 9) AluSc8|SINE|Alu 20098 NM_174871 5718 Hs.4295 NM_002816 ENSG00000197170 PSMD12 Rpn5|STISS|p55 proteasome 26S subunit, non-ATPase 12 protein-coding 237.5-46 chr19 44505487 44505876 + 1 NA TTS (NM_001102598) TTS (NM_001102598) -5159 NM_001288762 7733 Hs.22305 NM_013256 ENSG00000167384 ZNF180 HHZ168 zinc finger protein 180 protein-coding 229.5-54 chr18 63916041 63916286 + 1 NA intron (NM_005024, intron 2 of 7) intron (NM_005024, intron 2 of 7) 8205 NM_005024 5273 Hs.158339 NM_005024 ENSG00000242550 SERPINB10 PI-10|PI10 serpin family B member 10 protein-coding 194.5-140 chr7 36110746 36111012 + 1 NA Intergenic Intergenic 15569 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 192.5-86 chr21 39116801 39117032 + 1 NA Intergenic Intergenic 66535 NM_003720 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 291.5-17 chr2 40746409 40746806 + 1 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -234172 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 127.5-156 chr3 165756983 165757172 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 80346 NR_137636 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 121.75-198 chr9 32437003 32437288 + 1 NA intron (NM_001278352, intron 19 of 21) MIR|SINE|MIR 52502 NM_002197 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 225.5-108 chr9 38660632 38661077 + 1 NA Intergenic Intergenic 39766 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 178.75-56 chr22 20175457 20175646 + 1 NA Intergenic Intergenic -24496 NM_001365892 388849 Hs.454905 NM_001243537 ENSG00000234409 CCDC188 - coiled-coil domain containing 188 protein-coding 134.25-100 chr20 47118181 47118384 + 1 NA intron (NM_172110, intron 9 of 13) intron (NM_172110, intron 9 of 13) -48685 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 152.75-44 chr12 38718736 38719001 + 1 NA intron (NM_153634, intron 13 of 19) L1ME4b|LINE|L1 186723 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 178.25-61 chr2 20540352 20540641 + 1 NA Intergenic Intergenic -38972 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 224.5-20 chr10 84794778 84795093 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 369766 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 120.5-125 chr2 178254463 178254694 + 1 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) MER53|DNA|hAT 60066 NM_032523 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 391.5 chr10 35234258 35235043 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -12375 NM_181698 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 128.25-163 chr5 109177235 109177504 + 1 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 149000 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 137.25-116 chr4 132145564 132145788 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 380838 NR_125884 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 230.75-38 chr2 180290146 180290463 + 1 NA Intergenic Intergenic -283007 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 260.75-29 chr2 108188291 108188562 + 1 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) intron (NR_131251, intron 1 of 4) 29415 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 199.5-92 chr2 201791331 201791560 + 1 NA Intergenic Intergenic -10512 NM_020919 57679 Hs.471096 NM_020919 ENSG00000003393 ALS2 ALS2CR6|ALSJ|IAHSP|PLSJ alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2 protein-coding 173.75-43 chr12 69676533 69676837 + 1 NA intron (NM_152439, intron 3 of 5) intron (NM_152439, intron 3 of 5) 12592 NR_104220 144453 Hs.280782 NM_032735 ENSG00000127325 BEST3 VMD2L3 bestrophin 3 protein-coding 127.5-251 chr8 134857386 134857626 + 1 NA intron (NR_125427, intron 1 of 2) intron (NR_125427, intron 1 of 2) 7571 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 227.75-58 chr4 72396506 72396769 + 1 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) intron (NM_014243, intron 4 of 21) 172584 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 262.25 chr1 90111044 90111513 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 116168 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 151.75-50 chr16 78010837 78011047 + 1 NA Intergenic Intergenic -11606 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 210.5-122 chr7 68323011 68323274 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 302889 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 162.75-19 chr10 98690091 98690341 + 1 NA intron (NM_021828, intron 6 of 11) L1MEb|LINE|L1 234352 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 154.75-64 chr18 32941059 32941213 + 1 NA intron (NM_001308126, intron 23 of 23) intron (NM_001308126, intron 23 of 23) -168113 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 194.25-103 chr6 55178190 55178445 + 1 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) intron (NM_001526, intron 2 of 7) 71857 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 170.75-62 chr2 31287719 31287916 + 1 NA Intergenic Intergenic 53665 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 176.75-83 chr3 130818890 130819142 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -31579 NM_001199180 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 249.5-8 chr1 189315679 189315965 + 1 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 1160188 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 261.75-34 chr4 168150406 168150859 + 1 NA intron (NM_007193, intron 3 of 11) MER72|LTR|ERV1 58095 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 292.75-19 chr21 30865041 30865487 + 1 NA Intergenic (ATATATATAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16316 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 226.25-75 chr8 135178018 135178264 + 1 NA Intergenic Intergenic -55990 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 165.5-10 chr1 185560641 185560838 + 1 NA intron (NR_110793, intron 3 of 3) intron (NR_110793, intron 3 of 3) 67749 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 164.25-86 chr20 57339773 57340005 + 1 NA intron (NM_198265, intron 9 of 11) FRAM|SINE|Alu 10086 NM_198265 23626 Hs.159737 NM_012444 ENSG00000054796 SPO11 CT35|SPATA43|TOPVIA SPO11 initiator of meiotic double stranded breaks protein-coding 205.75-74 chr6 144571381 144571772 + 1 NA intron (NM_007124, intron 49 of 73) HAL1|LINE|L1 165921 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 176.5-11 chr1 208835523 208835742 + 1 NA Intergenic Intergenic 106944 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 206.5-125 chr7 90386423 90386754 + 1 NA 3' UTR (NM_033107, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_033107, exon 10 of 10) -9704 NR_102424 101409256 NR_102424 LOC101409256 - cell division cycle 42 pseudogene pseudo 216.5-59 chr2 165461693 165462059 + 1 NA Intergenic Intergenic -7822 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 165.75-167 chr8 117484578 117484821 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -36014 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 156.25-60 chr19 44692854 44693141 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -6154 NM_001039213 388551 Hs.456381 NM_001039213 ENSG00000213892 CEACAM16 CEAL2|DFNA4B|DFNB113 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 16 protein-coding 135.75-170 chr5 30895843 30896003 + 1 NA Intergenic Intergenic -297763 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 173.5-165 chr8 106042995 106043209 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) LTR40a|LTR|ERVL 17401 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 176.75-97 chr5 14531075 14531378 + 1 NA Intergenic Intergenic -50566 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 198.5-41 chr14 46987671 46988172 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) -336140 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 211.5-87 chr2 234167295 234167545 + 1 NA Intergenic Intergenic 116718 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 321.5-20 chr2 172531095 172531608 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -24022 NR_103731 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 140.5-139 chr21 36739218 36739477 + 1 NA intron (NM_009586, intron 7 of 9) intron (NM_009586, intron 7 of 9) 40232 NM_005069 6493 Hs.146186 NM_005069 ENSG00000159263 SIM2 HMC13F06|HMC29C01|SIM|bHLHe15 SIM bHLH transcription factor 2 protein-coding 172.5-5 chr1 73089143 73089384 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -216907 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 262.75-30 chr2 137381775 137382085 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 12 of 27) HERVL18-int|LTR|ERVL 546002 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 192.5-92 chr3 109602233 109602531 + 1 NA promoter-TSS (NR_039647) promoter-TSS (NR_039647) -446 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 120.25-182 chr6 51718195 51718411 + 1 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) intron (NM_138694, intron 60 of 66) 96433 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 187.5-101 chr20 22888273 22888633 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -146967 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 116.5-211 chr6 12504596 12504776 + 1 NA Intergenic Intergenic 80718 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 234.25-37 chr2 186846116 186846426 + 1 NA intron (NM_182521, intron 2 of 8) L1PB4|LINE|L1 2899 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 186.75-85 chr5 24689120 24689470 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -44317 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 197.5-89 chr22 46759296 46759597 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -3171 NM_001284304 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 266.5-8 chr10 48616674 48617013 + 1 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) L1M4|LINE|L1 -11712 NM_001347737 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 186.25-97 chr5 165503979 165504497 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 1033959 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 163.5-105 chr2 193403906 193404179 + 1 NA Intergenic Intergenic 654197 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 174.5-56 chr13 64546922 64547154 + 1 NA Intergenic Intergenic -471027 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 150.5-135 chr3 122101156 122101394 + 1 NA intron (NM_001206924, intron 2 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 23426 NM_176892 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 186.75-52 chr2 58619722 58620193 + 1 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 99204 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 137.5-33 chr10 77369152 77369329 + 1 NA intron (NR_126365, intron 3 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 18368 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 208.75-28 chr15 59917466 59917906 + 1 NA Intergenic Intergenic -86625 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 204.25-30 chr12 62836287 62836618 + 1 NA intron (NM_020700, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 98698 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 146.75-62 chr17 42095193 42095513 + 1 NA Intergenic Intergenic 17361 NM_024119 79132 Hs.55918 NM_024119 ENSG00000108771 DHX58 D11LGP2|D11lgp2e|LGP2|RLR-3 DExH-box helicase 58 protein-coding 224.5-4 chr1 55694720 55695161 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 250023 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 147.5-81 chr17 17225634 17225914 + 1 NA intron (NM_001353229, intron 6 of 15) AluJr|SINE|Alu 11394 NM_001353230 201163 Hs.31652 NM_144606 ENSG00000154803 FLCN BHD|DENND8B|FLCL folliculin protein-coding 328.5-22 chr22 41341120 41341909 + 1 NA intron (NM_017590, intron 11 of 22) AluY|SINE|Alu -25819 NM_001145398 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 134.5-171 chr5 61153289 61153530 + 1 NA TTS (NM_174889) TTS (NM_174889) -8907 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 224.75-72 chr8 84214319 84214681 + 1 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 29834 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 143.75-172 chr7 68335852 68336070 + 1 NA Intergenic Intergenic 315708 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 209.5-47 chr15 60616718 60617074 + 1 NA intron (NM_002943, intron 1 of 10) intron (NM_002943, intron 1 of 10) 10634 NM_002943 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 352.5-24 chr5 95611268 95612084 + 1 NA Intergenic Intergenic -8411 NM_199243 285601 Hs.143315 NM_199243 ENSG00000178015 GPR150 PGR11 G protein-coupled receptor 150 protein-coding 327.25-20 chr5 72482920 72483597 + 1 NA intron (NM_152625, intron 1 of 4) intron (NM_152625, intron 1 of 4) 24152 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 183.75-9 chr1 199514613 199514999 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 366208 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 143.5-141 chr3 51370235 51370478 + 1 NA intron (NM_004947, intron 49 of 52) intron (NM_004947, intron 49 of 52) -14935 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 194.5-132 chr6 136693152 136693380 + 1 NA intron (NM_005923, intron 7 of 29) L1ME3Cz|LINE|L1 64152 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 137.5-235 chr8 123572662 123572905 + 1 NA Intergenic Intergenic -31577 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 236.25-20 chr12 1679204 1679628 + 1 NA Intergenic Intergenic -11654 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 255.75-19 chr17 78347438 78347917 + 1 NA Intergenic Intergenic 12402 NM_003955 9021 Hs.527973 NM_003955 ENSG00000184557 SOCS3 ATOD4|CIS3|Cish3|SOCS-3|SSI-3|SSI3 suppressor of cytokine signaling 3 protein-coding 211.5-108 chr3 185722142 185722517 + 1 NA non-coding (NR_126326, exon 3 of 8) non-coding (NR_126326, exon 3 of 8) 9077 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 224.5-63 chr2 135712588 135713026 + 1 NA intron (NM_001282798, intron 22 of 25) AluY|SINE|Alu -29048 NM_014607 23190 Hs.591242 NM_014607 ENSG00000144224 UBXN4 UBXD2|UBXDC1|erasin UBX domain protein 4 protein-coding 177.75-12 chr1 166816143 166816376 + 1 NA Intergenic MER52C|LTR|ERV1 -23216 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 125.5-185 chr3 189648165 189648367 + 1 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 16877 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 316.25-10 chr2 227113032 227113506 + 1 NA intron (NM_000092, intron 8 of 47) intron (NM_000092, intron 8 of 47) 51290 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 133.25-91 chr2 17615771 17615919 + 1 NA intron (NM_001366805, intron 2 of 2) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 75149 NM_001366805 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 150.25-127 chr5 161487479 161487774 + 1 NA intron (NM_000813, intron 4 of 9) MIRb|SINE|MIR 60498 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 269.25-21 chr17 67193815 67194213 + 1 NA exon (NM_014877, exon 9 of 33) exon (NM_014877, exon 9 of 33) -50762 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 197.5-170 chr9 35677995 35678225 + 1 NA intron (NM_001216, intron 6 of 10) AluY|SINE|Alu 4182 NM_001216 768 Hs.63287 NM_001216 ENSG00000107159 CA9 CAIX|MN carbonic anhydrase 9 protein-coding 254.5-84 chr9 100758254 100758760 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 180428 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 186.5-14 chr10 29724294 29724561 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 1 of 38) intron (NM_001323599, intron 1 of 38) 11374 NM_003174 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 115.5-58 chr14 21164108 21164331 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -8156 NM_001004731 390445 Hs.553768 NM_001004731 ENSG00000169327 OR5AU1 OR14-38 olfactory receptor family 5 subfamily AU member 1 protein-coding 159.5-88 chr19 7944046 7944337 + 1 NA promoter-TSS (NM_006351) promoter-TSS (NM_006351) -525 NM_006351 10469 Hs.465784 NM_006351 ENSG00000104980 TIMM44 TIM44 translocase of inner mitochondrial membrane 44 protein-coding 118.75-133 chr3 185394139 185394289 + 1 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) intron (NM_004721, intron 1 of 13) 31078 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 146.5-218 chr8 59633840 59634008 + 1 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 514714 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 124.75-151 chr4 33625083 33625262 + 1 NA Intergenic Intergenic 414721 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 137.25-11 chr1 238505139 238505376 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -19240 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 122.25-41 chr12 8620286 8620408 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -7488 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 159.5-63 chr15 94390242 94390530 + 1 NA intron (NM_018349, intron 13 of 21) intron (NM_018349, intron 13 of 21) 34456 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 197.5-156 chr8 49669916 49670218 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -157887 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 183.75-33 chr12 96999922 97000158 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 92574 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 217.5-20 chr11 31862096 31862459 + 1 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) intron (NR_033971, intron 1 of 2) 35710 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 259.25-11 chr14 80691533 80691986 + 1 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 249979 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 160.5-205 chr9 34247606 34247786 + 1 NA intron (NR_033243, intron 5 of 7) AluSx|SINE|Alu 68653 NR_033243 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 143.25-114 chr3 34161348 34161591 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 362839 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 152.25-169 chr9 119668595 119668832 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -266347 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 175.5-99 chr2 198147821 198148085 + 1 NA 3' UTR (NM_006226, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_006226, exon 6 of 6) 227144 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 156.75-153 chr6 158979923 158980190 + 1 NA intron (NM_001346418, intron 4 of 5) intron (NM_001346418, intron 4 of 5) 20131 NM_001346418 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 257.25-56 chr8 88004894 88005209 + 1 NA Intergenic Intergenic -131036 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 289.75-4 chr10 48269440 48269997 + 1 NA intron (NM_001018071, intron 1 of 28) intron (NM_001018071, intron 1 of 28) 4978 NM_001018071 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 127.25-160 chr5 25533809 25533967 + 1 NA Intergenic Intergenic 342935 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 225.5-73 chr3 73176887 73177233 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 115401 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 233.25-47 chr3 34294104 34294487 + 1 NA Intergenic Intergenic 495665 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 158.75-57 chr14 71312063 71312292 + 1 NA Intergenic Intergenic -8299 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 119.75-75 chr17 47297937 47298115 + 1 NA intron (NM_000212, intron 10 of 14) intron (NM_000212, intron 10 of 14) 25587 NR_110881 102724508 Hs.661005 NR_110880 ENSG00000263293 THCAT158 - thyroid cancer-associated transcript 158 ncRNA 191.75-78 chr3 33614763 33615142 + 1 NA intron (NM_001365634, intron 12 of 35) AluSx1|SINE|Alu 44727 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 175.75-71 chr2 168021268 168021522 + 1 NA intron (NM_013233, intron 14 of 17) intron (NM_013233, intron 14 of 17) -80251 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 252.5-89 chr9 95671424 95671866 + 1 NA Intergenic Intergenic -154588 NM_001083602 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 201.5-3 chr1 40821110 40821386 + 1 NA intron (NM_004700, intron 7 of 13) intron (NM_004700, intron 7 of 13) 37461 NM_172163 9132 Hs.473058 NM_004700 ENSG00000117013 KCNQ4 DFNA2|DFNA2A|KV7.4 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 4 protein-coding 217.75-51 chr4 30685427 30685704 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -34804 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 234.75-6 chr1 108941971 108942324 + 1 NA intron (NM_001278202, intron 3 of 8) AluSc8|SINE|Alu 8301 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 162.75-128 chr6 168558084 168558323 + 1 NA intron (NM_001166412, intron 7 of 12) intron (NM_001166412, intron 7 of 12) 117019 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 196.25-71 chr2 223478076 223478530 + 1 NA Intergenic Intergenic 124058 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 349.75-8 chr2 53701019 53701631 + 1 NA intron (NM_001201965, intron 6 of 8) MIR|SINE|MIR -66458 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 211.5-91 chr21 28541240 28541551 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 2077 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 215.25-82 chr5 77224995 77225229 + 1 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) L1MC5|LINE|L1 14432 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 192.25-36 chr18 30941315 30941668 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 101251 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 172.5-115 chr21 37375154 37375434 + 1 NA intron (NM_001347723, intron 1 of 10) intron (NM_001347723, intron 1 of 10) 7737 NM_101395 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 207.75-22 chr11 115191251 115191512 + 1 NA intron (NM_001301045, intron 8 of 10) intron (NM_001301045, intron 8 of 10) -142196 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 147.5-158 chr4 31878751 31879135 + 1 NA Intergenic Intergenic -118436 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 338.75-15 chr21 15323456 15324332 + 1 NA Intergenic Intergenic -258894 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 136.5-191 chr6 13078259 13078501 + 1 NA intron (NM_001322308, intron 4 of 13) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 64826 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 241.75-26 chr14 77218729 77219011 + 1 NA exon (NM_020431, exon 3 of 24) exon (NM_020431, exon 3 of 24) 37072 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 179.75-12 chr10 7404976 7405387 + 1 NA intron (NM_001029880, intron 1 of 20) intron (NM_001029880, intron 1 of 20) 4160 NM_001018039 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 119.5-196 chr6 38381251 38381398 + 1 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) L1MEd|LINE|L1 -100272 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-84 chr18 33742121 33742245 + 1 NA intron (NM_030632, intron 11 of 11) MIRc|SINE|MIR 163964 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 153.5-197 chr8 79217949 79218250 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -114089 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 277.25-11 chr13 61330462 61330954 + 1 NA Intergenic SVA_A|Retroposon|SVA 84814 NM_022843 64881 Hs.391781 NM_022843 ENSG00000280165 PCDH20 PCDH13 protocadherin 20 protein-coding 124.5-199 chr7 5083102 5083287 + 1 NA Intergenic Intergenic 11134 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 313.25-6 chr11 105031896 105032224 + 1 NA intron (NM_033294, intron 2 of 7) L3|LINE|CR1 3084 NM_001257119 834 Hs.2490 NM_001223 ENSG00000137752 CASP1 ICE|IL1BC|P45 caspase 1 protein-coding 227.5-45 chr18 3159405 3159822 + 1 NA intron (NM_019856, intron 10 of 36) L1MB7|LINE|L1 60355 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 132.5-126 chr2 107027354 107027537 + 1 NA Intergenic Intergenic -140336 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 286.5-41 chr3 60870472 60870909 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) MamRep605|LTR?|LTR? -252820 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 223.25-5 chr1 216834522 216834994 + 1 NA intron (NM_001243513, intron 1 of 7) intron (NM_001243513, intron 1 of 7) -29373 NM_001243514 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 250.75-70 chr8 131557521 131557868 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -346399 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 207.5-98 chr6 113805749 113805998 + 1 NA Intergenic Intergenic -51472 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 125.5-60 chr12 116297771 116297976 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -20687 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 209.25-117 chr9 7045551 7045875 + 1 NA intron (NR_148680, intron 16 of 21) intron (NR_148680, intron 16 of 21) 288363 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 194.25-3 chr1 61338180 61338401 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 4 of 10) intron (NM_001134673, intron 4 of 10) -84772 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 357.5-14 chr3 150205296 150205720 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -33011 NR_110168 101927992 Hs.534682 NR_110167 ENSG00000244541 LINC01213 - long intergenic non-protein coding RNA 1213 ncRNA 143.25-100 chr20 32914991 32915176 + 1 NA intron (NM_001143967, intron 17 of 26) AluJr|SINE|Alu 56160 NM_001143967 388795 NM_001143967 ENSG00000215529 EFCAB8 - EF-hand calcium binding domain 8 protein-coding 196.25-42 chr15 85839923 85840351 + 1 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 14502 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 282.25-36 chr8 133668839 133669195 + 1 NA intron (NR_134462, intron 1 of 2) intron (NR_134462, intron 1 of 2) 15049 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 240.75-25 chr14 64631313 64631603 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -72966 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 138.5-130 chr3 21256788 21256983 + 1 NA Intergenic Intergenic -148841 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 134.5-7 chr1 64823112 64823394 + 1 NA intron (NM_001366165, intron 11 of 11) intron (NM_001366165, intron 11 of 11) 78178 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 181.25-91 chr4 32611526 32611866 + 1 NA Intergenic Intergenic 260658 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 173.75-87 chr2 104710054 104710328 + 1 NA Intergenic Intergenic 47528 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 208.25-5 chr1 96823632 96824132 + 1 NA TTS (NM_001300990) TTS (NM_001300990) 101244 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 185.25-83 chr3 97521527 97521740 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 10 of 17) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 82026 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 224.5-60 chr2 74060300 74060685 + 1 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) intron (NM_001287491, intron 4 of 11) 57800 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 196.75-47 chr16 84349565 84349808 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -18837 NM_014861 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 114.75-205 chr9 100556889 100557083 + 1 NA intron (NM_001198812, intron 7 of 9) AluSz6|SINE|Alu -21093 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 150.75-16 chr1 119415582 119416033 + 1 NA intron (NM_000198, intron 2 of 3) intron (NM_000198, intron 2 of 3) 657 NM_000198 3284 Hs.654399 NM_000198 ENSG00000203859 HSD3B2 HSD3B|HSDB|SDR11E2 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 protein-coding 186.75-99 chr6 134193155 134193353 + 1 NA intron (NM_001143676, intron 3 of 13) MER6A|DNA|TcMar-Tigger -15393 NM_001143677 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 170.25-52 chr16 24975817 24976038 + 1 NA intron (NM_001006634, intron 3 of 19) intron (NM_001006634, intron 3 of 19) 39442 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 133.5-137 chr20 44993058 44993313 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 5 of 11) intron (NM_001352385, intron 5 of 11) 26673 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 162.5-165 chr7 136927528 136927758 + 1 NA intron (NR_046103, intron 2 of 3) intron (NR_046103, intron 2 of 3) 24476 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 143.25-137 chr4 106547820 106548104 + 1 NA Intergenic Intergenic 114338 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 168.5-35 chr11 23930016 23930231 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -510933 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 355.5-26 chr8 67573123 67573543 + 1 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) L1MA7|LINE|L1 173027 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 220.5-39 chr19 55940039 55940350 + 1 NA Intergenic Intergenic -7638 NM_176811 126205 Hs.446925 NM_176811 ENSG00000179709 NLRP8 CLR19.2|NALP8|NOD16|PAN4 NLR family pyrin domain containing 8 protein-coding 140.25-95 chr2 109654436 109654717 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 40212 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 237.5-53 chr2 152023832 152024184 + 1 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) -50030 NM_001005747 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 211.5-122 chr5 10474916 10475268 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -2945 NR_106747 102465138 NR_106747 ENSG00000277073 MIR6131 hsa-mir-6131 microRNA 6131 ncRNA 158.75-120 chr3 188972093 188972417 + 1 NA Intergenic Intergenic -24616 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 203.5-103 chr4 36769328 36769575 + 1 NA Intergenic Intergenic -127551 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 162.5-124 chr4 42943397 42943678 + 1 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) MER5A|DNA|hAT-Charlie 50271 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 136.5-8 chr1 98321744 98322004 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 111163 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 212.5-18 chr11 33008366 33008773 + 1 NA Intergenic Intergenic -7309 NM_001077242 91614 Hs.280990 NM_139160 ENSG00000121690 DEPDC7 TR2|dJ85M6.4 DEP domain containing 7 protein-coding 156.5-26 chr11 76539479 76539660 + 1 NA intron (NM_001300944, intron 17 of 20) intron (NM_001300944, intron 17 of 20) 94544 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 224.5-68 chr2 238584208 238584655 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -28932 NR_037809 151171 Hs.652076 NR_037809 ENSG00000225493 LINC01107 - long intergenic non-protein coding RNA 1107 ncRNA 125.5-178 chr3 99759535 99759665 + 1 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -58262 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 156.5-138 chr4 108297718 108297994 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 125736 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-94 chr22 22740832 22741147 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -81787 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 248.5-110 chrX 81901521 81901824 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 699570 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 179.5-50 chr12 128937004 128937578 + 1 NA intron (NM_001366886, intron 8 of 11) intron (NM_001366886, intron 8 of 11) 83813 NM_001366889 144423 Hs.655668 NM_144669 ENSG00000151948 GLT1D1 - glycosyltransferase 1 domain containing 1 protein-coding 176.25-152 chrX 74619164 74619410 + 1 NA Intergenic Intergenic -4663 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 275.75-19 chr17 61957043 61957568 + 1 NA intron (NM_005121, intron 23 of 29) AluSx|SINE|Alu -29323 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 286.5-62 chr7 51983266 51983620 + 1 NA Intergenic Intergenic -590187 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 250.75-51 chr4 73911756 73912152 + 1 NA Intergenic Intergenic 42561 NM_001511 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 130.25-112 chr2 204655756 204655935 + 1 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 110370 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 265.75-45 chr3 9441747 9442125 + 1 NA intron (NM_001080517, intron 9 of 22) intron (NM_001080517, intron 9 of 22) 44236 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 216.75-44 chr2 173793135 173793568 + 1 NA Intergenic Intergenic 170529 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 231.25-67 chr6 53830354 53830646 + 1 NA intron (NM_018214, intron 1 of 13) intron (NM_018214, intron 1 of 13) 35495 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 130.5-119 chr18 3930245 3930409 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -32026 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 233.75-20 chr12 67445836 67446207 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -3462 NR_146500 102724433 NR_146500 ENSG00000256172 LINC02420 - long intergenic non-protein coding RNA 2420 ncRNA 129.5-228 chr8 113828998 113829217 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -392168 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 145.5-61 chr14 46030071 46030348 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -33950 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 255.25-33 chr3 158839758 158840135 + 1 NA Intergenic Intergenic 37892 NM_001289407 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 180.75-106 chr4 94105321 94105780 + 1 NA Intergenic Intergenic 102006 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 137.5-223 chr7 95272897 95273158 + 1 NA intron (NM_001166160, intron 14 of 19) intron (NM_001166160, intron 14 of 19) 51505 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 242.25-41 chr18 22327761 22328072 + 1 NA Intergenic Intergenic 89999 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 242.5-6 chr1 173346949 173347316 + 1 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) MER67C|LTR|ERV1 114230 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 156.25-123 chr5 149048903 149049150 + 1 NA intron (NM_024577, intron 2 of 16) intron (NM_024577, intron 2 of 16) 13383 NR_030310 693169 NR_030310 ENSG00000207714 MIR584 MIRN584|hsa-mir-584 microRNA 584 ncRNA 203.5-71 chr2 108042435 108042710 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 10183 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 127.25-119 chr3 44540397 44540556 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -14717 NM_001288592 55888 Hs.529512 NM_018651 ENSG00000196345 ZKSCAN7 ZFP|ZNF167|ZNF448|ZNF64|ZSCAN39 zinc finger with KRAB and SCAN domains 7 protein-coding 126.5-252 chr8 127263280 127263566 + 1 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) L1MA7|LINE|L1 18786 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 152.5-115 chr3 66133666 66133915 + 1 NA 5' UTR (NM_173471, exon 1 of 11) 5' UTR (NM_173471, exon 1 of 11) 180 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 284.75-5 chr10 68152982 68153382 + 1 NA intron (NR_045663, intron 6 of 17) AluSx|SINE|Alu 43694 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 239.5-24 chr14 21267430 21267800 + 1 NA intron (NM_031314, intron 1 of 8) intron (NM_031314, intron 1 of 8) 1864 NM_031314 3183 Hs.508848 NM_004500 ENSG00000092199 HNRNPC C1|C2|HNRNP|HNRPC|SNRPC heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) protein-coding 209.5-63 chr2 47866795 47867212 + 1 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 21716 NM_025133 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 137.25-14 chr10 29866245 29866416 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -129394 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 258.5-22 chr14 47863419 47863866 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -68628 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 133.5-96 chr16 22350725 22351009 + 1 NA intron (NM_001802, intron 2 of 4).2 intron (NM_001802, intron 2 of 4).2 23752 NM_001802 1039 Hs.513430 NM_001802 ENSG00000140743 CDR2 CDR62|Yo cerebellar degeneration related protein 2 protein-coding 186.5-17 chr10 58152470 58152833 + 1 NA Intergenic Intergenic 115243 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 161.5-175 chr7 80946482 80946953 + 1 NA Intergenic Intergenic -24328 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 140.75-12 chr1 220532074 220532369 + 1 NA intron (NM_018650, intron 1 of 17) intron (NM_018650, intron 1 of 17) 4038 NM_001286124 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 200.75-91 chr6 995941 996175 + 1 NA intron (NR_027116, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 105274 NR_027116 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 227.5-87 chr6 27993557 27993974 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 36524 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 167.5-135 chr5 14099845 14100226 + 1 NA Intergenic Intergenic -43307 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 157.75-137 chr5 82045117 82045309 + 1 NA intron (NM_031482, intron 2 of 7) L1MEc|LINE|L1 73190 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 188.5-101 chr3 54524723 54525054 + 1 NA intron (NM_018398, intron 5 of 37) L1MB8|LINE|L1 114969 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 176.5-19 chr10 59702709 59703054 + 1 NA intron (NM_194298, intron 1 of 5) intron (NM_194298, intron 1 of 5) 7010 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 221.5-78 chr5 172303962 172304329 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 18548 NR_130933 100288254 Hs.531911 NM_001007542 LOC100288254 - uncharacterized LOC100288254 ncRNA 133.5-124 chr2 118437497 118437725 + 1 NA Intergenic Intergenic 165355 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 266.75-44 chr5 165618373 165618719 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 1148267 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 262.5 chr1 19832886 19833341 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17830 NM_019062 54546 Hs.124835 NM_019062 ENSG00000178828 RNF186 - ring finger protein 186 protein-coding 326.5-32 chr9 109249782 109250166 + 1 NA intron (NM_019114, intron 13 of 25) intron (NM_019114, intron 13 of 25) 70990 NM_019114 54566 Hs.591901 NM_018424 ENSG00000095203 EPB41L4B CG1|EHM2 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B protein-coding 196.5-149 chr6 167011106 167011354 + 1 NA intron (NM_194429, intron 6 of 11) intron (NM_194429, intron 6 of 11) 11833 NM_194429 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 173.5-84 chr20 38512221 38512441 + 1 NA intron (NM_001282917, intron 6 of 29) MIR|SINE|MIR -4232 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 156.5-174 chr7 72283397 72283663 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 53861 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 203.75-106 chr7 153058382 153058614 + 1 NA Intergenic Intergenic 298746 NM_020445 57180 Hs.647117 NM_020445 ENSG00000133627 ACTR3B ARP11|ARP3BETA actin related protein 3B protein-coding 234.25-45 chr3 58383172 58383520 + 1 NA intron (NM_017771, intron 4 of 17) intron (NM_017771, intron 4 of 17) 50040 NM_001349498 54899 Hs.190544 NM_017771 ENSG00000168297 PXK MONAKA|SLOB PX domain containing serine/threonine kinase like protein-coding 173.75-31 chr10 116791367 116791659 + 1 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) intron (NM_001330164, intron 2 of 12) 36055 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 133.25-137 chr3 111794847 111795076 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) 62465 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 135.25-24 chr10 28537119 28537297 + 1 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) intron (NM_100486, intron 3 of 12) 4090 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 279.25-9 chr11 32167902 32168290 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -24184 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 264.75-21 chr2 88699716 88700305 + 1 NA exon (NM_144563, exon 3 of 9) exon (NM_144563, exon 3 of 9) 8337 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 124.75-67 chr13 28661480 28661730 + 1 NA intron (NM_015932, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 2475 NM_015932 51371 Hs.268742 NM_015932 ENSG00000132963 POMP C13orf12|HSPC014|PNAS-110|PRAAS2|UMP1 proteasome maturation protein protein-coding 181.25-111 chr6 56216213 56216577 + 1 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) 31185 NM_001318751 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 335.5-10 chr4 86986967 86987505 + 1 NA intron (NM_001166693, intron 2 of 20) intron (NM_001166693, intron 2 of 20) -19752 NM_001313960 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 126.5-256 chr8 138785748 138786011 + 1 NA intron (NM_152888, intron 12 of 64) intron (NM_152888, intron 12 of 64) 128162 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 169.5-137 chr5 90004287 90004565 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 12294 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 255.5-32 chr17 17879437 17880056 + 1 NA intron (NM_001288789, intron 3 of 12) intron (NM_001288789, intron 3 of 12) -42735 NM_004176 6720 Hs.592123 NM_004176 ENSG00000072310 SREBF1 SREBP1|bHLHd1 sterol regulatory element binding transcription factor 1 protein-coding 232.75-10 chr11 47823961 47824297 + 1 NA intron (NM_015231, intron 7 of 35) L1MB2|LINE|L1 24221 NR_134636 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 167.5-197 chr9 30964903 30965203 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 416437 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 252.75-20 chr16 52234054 52234341 + 1 NA Intergenic MamRep1894|DNA|hAT -24367 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 143.75-39 chr12 41123960 41124167 + 1 NA Intergenic Intergenic -64257 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 209.5-83 chr21 16052283 16052596 + 1 NA Intergenic Intergenic -18049 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 223.5-57 chr19 52077765 52078007 + 1 NA intron (NM_001369827, intron 4 of 6) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 16385 NM_001369825 284371 Hs.665751 NM_001136499 ENSG00000197608 ZNF841 - zinc finger protein 841 protein-coding 175.75-31 chr12 118074846 118075133 + 1 NA intron (NM_019086, intron 4 of 8) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -12815 NM_001278557 55884 Hs.506985 NM_018639 ENSG00000176871 WSB2 SBA2 WD repeat and SOCS box containing 2 protein-coding 275.25-42 chr8 18545696 18546210 + 1 NA intron (NM_015310, intron 15 of 15) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 154671 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 187.75-40 chr17 62795019 62795250 + 1 NA intron (NM_001288780, intron 3 of 10) intron (NM_001288780, intron 3 of 10) 11506 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 240.75-16 chr12 1722618 1722904 + 1 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 MIRb|SINE|MIR 31691 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 226.5-105 chr9 36119519 36119835 + 1 NA intron (NM_021111, intron 18 of 20) L2a|LINE|L2 -16859 NR_104640 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 347.5-16 chr5 43283922 43284458 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 28991 NM_001364188 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 117.5-12 chr1 151710994 151711158 + 1 NA intron (NM_007185, intron 2 of 12) MIR3|SINE|MIR 5727 NM_001172649 11189 Hs.26047 NM_007185 ENSG00000159409 CELF3 BRUNOL1|CAGH4|ERDA4|ETR-1|TNRC4 CUGBP Elav-like family member 3 protein-coding 265.75-17 chr14 65493570 65494100 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 22733 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 156.5-185 chr8 21636480 21636759 + 1 NA Intergenic Intergenic 152256 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 133.25-29 chr11 21871384 21871550 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -321618 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 191.25-16 chr11 38661403 38661693 + 1 NA Intergenic Intergenic 12690 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 223.5-48 chr16 60380023 60380379 + 1 NA Intergenic Intergenic -20408 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 256.25-43 chr7 3591600 3592362 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 290729 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 272.5-4 chr1 160157755 160158039 + 1 NA intron (NM_144699, intron 4 of 21) intron (NM_144699, intron 4 of 21) 6335 NM_144699 480 Hs.662219 NM_144699 ENSG00000132681 ATP1A4 ATP1A1|ATP1AL2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 4 protein-coding 170.25-109 chr4 58044500 58044871 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 491643 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 249.75-32 chr2 49777592 49777975 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 196420 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 117.25-102 chr19 4176068 4176284 + 1 NA intron (NM_001321060, intron 4 of 7) intron (NM_001321060, intron 4 of 7) 6130 NM_001321064 51548 Hs.423756 NM_016539 ENSG00000077463 SIRT6 SIR2L6 sirtuin 6 protein-coding 148.25-108 chr4 77276837 77277124 + 1 NA Intergenic MERX|DNA|TcMar-Tigger 119773 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 184.75-111 chr8 141150096 141150434 + 1 NA intron (NM_001362798, intron 5 of 21) intron (NM_001362798, intron 5 of 21) 21676 NM_001352890 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 131.75-115 chr20 2548197 2548529 + 1 NA intron (NM_080751, intron 2 of 19) AluSp|SINE|Alu 11756 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 156.5-127 chr4 32633810 32634067 + 1 NA Intergenic Intergenic 282900 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 164.25-11 chr1 163929673 163930046 + 1 NA Intergenic Intergenic -506668 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 189.5-119 chr6 38233490 38233777 + 1 NA intron (NM_052893, intron 10 of 11) intron (NM_052893, intron 10 of 11) -247963 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 129.25-65 chr16 84956546 84956727 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 54899 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 345.5-4 chr1 169332987 169333494 + 1 NA intron (NR_104229, intron 1 of 12) L1MA1|LINE|L1 34557 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 228.5-66 chr21 19398366 19398777 + 1 NA Intergenic Intergenic 501184 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 208.75-7 chr10 32824417 32824783 + 1 NA exon (NM_001321115, exon 33 of 44) exon (NM_001321115, exon 33 of 44) 76872 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 119.75-111 chr2 126550107 126550263 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -105750 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 157.75-121 chr4 66411038 66411233 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 134311 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 393.5-17 chr8 124723044 124723972 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) intron (NM_001282971, intron 1 of 14) 4965 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 193.25-24 chr11 112770812 112771036 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -190496 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 145.25-133 chr5 58529425 58529758 + 1 NA TTS (NR_039639) TTS (NR_039639) 518 NR_039639 100616339 NR_039639 ENSG00000265699 MIR548AE2 - microRNA 548ae-2 ncRNA 212.5-114 chr8 51841329 51841633 + 1 NA intron (NM_001286783, intron 2 of 5) intron (NM_001286783, intron 2 of 5) -32036 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 156.5-108 chr22 46764394 46764647 + 1 NA intron (NR_104292, intron 1 of 13) intron (NR_104292, intron 1 of 13) 778 NR_104292 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 190.5-123 chr5 75114410 75114615 + 1 NA intron (NM_001164443, intron 18 of 24) L1PA3|LINE|L1 -61954 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 183.25-112 chr8 82102184 82102417 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -260014 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 159.5-60 chr15 54394271 54394540 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 17 of 31) intron (NM_001329919, intron 17 of 31) 381757 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 278.5-7 chr10 8597158 8597474 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -2925 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 341.25-28 chr9 30030840 30031191 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 377439 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 165.5-70 chr19 46734225 46734483 + 1 NA intron (NM_001039877, intron 4 of 17) intron (NM_001039877, intron 4 of 17) -11703 NM_001039885 79147 Hs.515493 NM_024301 ENSG00000181027 FKRP LGMD2I|LGMDR9|MDC1C|MDDGA5|MDDGB5|MDDGC5 fukutin related protein protein-coding 265.75-58 chr5 91373989 91374316 + 1 NA exon (NM_001329670, exon 6 of 8) exon (NM_001329670, exon 6 of 8) 5945 NR_138071 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 130.5-57 chr11 34322467 34322663 + 1 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) AluSz|SINE|Alu 35445 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 222.25-36 chr2 71409312 71409669 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 20 of 27) HAL1ME|LINE|L1 -44071 NM_003494 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 209.75-46 chr2 16645045 16645389 + 1 NA intron (NM_030797, intron 1 of 11) intron (NM_030797, intron 1 of 11) 20617 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 227.25-27 chr14 56946911 56947312 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 133953 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 166.5-65 chr14 65778000 65778307 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 307051 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 203.25-115 chrX 67342387 67342781 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -201437 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 196.5-114 chr4 78448636 78449001 + 1 NA intron (NM_025074, intron 44 of 73) intron (NM_025074, intron 44 of 73) -102952 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 118.5-124 chr3 24951221 24951406 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 121990 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 159.5-175 chr5 78267763 78267973 + 1 NA intron (NM_003664, intron 1 of 26) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 26830 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 214.5-127 chr8 112078608 112078924 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -564727 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 222.5-87 chr5 133528691 133528974 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 83709 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 178.75-109 chr8 93275719 93276109 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -109064 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 194.5-41 chr14 81682845 81683074 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -59898 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 211.25-23 chr14 30611509 30612058 + 1 NA intron (NM_017769, intron 12 of 14) AluJr4|SINE|Alu -10471 NM_001283033 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 244.5-80 chr5 149749069 149749396 + 1 NA intron (NM_001172698, intron 1 of 10) intron (NM_001172698, intron 1 of 10) 16407 NR_029870 494327 NR_029870 ENSG00000199047 MIR378A MIR378|MIRN378|hsa-mir-378|hsa-mir-378a|miRNA378 microRNA 378a ncRNA 373.5-7 chr2 74902468 74902968 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -6413 NR_125792 102724515 Hs.708649 NR_125792 ENSG00000204792 LINC01291 - long intergenic non-protein coding RNA 1291 ncRNA 540.75-2 chr2 123352402 123353289 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -279364 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 260.25-36 chr4 145843016 145843496 + 1 NA intron (NM_178835, intron 7 of 14) intron (NM_178835, intron 7 of 14) 95567 NM_001306215 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 153.5-13 chr1 218201415 218201627 + 1 NA Intergenic Intergenic -83772 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 217.75-60 chr5 109288039 109288385 + 1 NA intron (NR_149040, intron 3 of 3) L1PBa|LINE|L1 38157 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 167.5-102 chr20 46322603 46322855 + 1 NA Intergenic Intergenic -14231 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 142.75-48 chr12 54571462 54571716 + 1 NA intron (NM_001165975, intron 5 of 14) intron (NM_001165975, intron 5 of 14) 10124 NM_001315535 5153 Hs.530871 NM_000924 ENSG00000123360 PDE1B HEL-S-79p|PDE1B1|PDES1B phosphodiesterase 1B protein-coding 146.5-154 chr4 52577232 52577388 + 1 NA Intergenic Intergenic 79229 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 227.75-37 chr2 82906147 82906674 + 1 NA Intergenic Intergenic 49607 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 132.75-213 chrX 150817914 150818207 + 1 NA intron (NM_001242614, intron 2 of 11) L1MB5|LINE|L1 80608 NM_031462 83692 Hs.522805 NM_031462 ENSG00000102181 CD99L2 CD99B|MIC2L1 CD99 molecule like 2 protein-coding 201.5-113 chr6 38020934 38021202 + 1 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 201341 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 147.25-119 chr6 38667820 38668162 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -28062 NM_001099272 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 195.5-93 chr22 45238062 45238443 + 1 NA intron (NM_001009880, intron 1 of 9) intron (NM_001009880, intron 1 of 9) 2517 NM_001009880 23313 Hs.592207 NM_015264 ENSG00000100364 KIAA0930 C22orf9|LSC3 KIAA0930 protein-coding 141.5-81 chr18 13294313 13294483 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 16293 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 112.5-158 chr22 32609663 32609897 + 1 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) AluJr4|SINE|Alu 134543 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 266.5-64 chr5 107389052 107389692 + 1 NA intron (NM_001962, intron 2 of 4) intron (NM_001962, intron 2 of 4) 281565 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 223.25-52 chr3 108246434 108246883 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -24234 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 147.75-41 chr14 75899714 75900109 + 1 NA intron (NM_015072, intron 30 of 31) intron (NM_015072, intron 30 of 31) 82084 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 164.5-3 chr1 24805934 24806186 + 1 NA intron (NM_013943, intron 2 of 5) intron (NM_013943, intron 2 of 5) 60613 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 165.25-109 chr4 122599588 122599820 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -19279 NR_104126 100996941 Hs.439487 NR_104126 ENSG00000227145 IL21-AS1 - IL21 antisense RNA 1 ncRNA 196.25-6 chr1 187730995 187731327 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 287533 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 153.25-79 chr21 24914371 24914624 + 1 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 73947 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 126.75-135 chr20 46079651 46079986 + 1 NA intron (NM_001348150, intron 1 of 8) intron (NM_001348150, intron 1 of 8) 10144 NM_020967 57727 Hs.654991 NM_020967 ENSG00000124160 NCOA5 CIA|bA465L10.6 nuclear receptor coactivator 5 protein-coding 208.5-143 chr8 121012455 121012745 + 1 NA Intergenic Intergenic -200554 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 192.5-136 chr8 137216343 137216578 + 1 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 197128 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 180.75-87 chr3 24787889 24788122 + 1 NA Intergenic Intergenic -41318 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 187.25-16 chr10 95241172 95241512 + 1 NA intron (NM_020992, intron 5 of 6) intron (NM_020992, intron 5 of 6) 47142 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 234.5-31 chr15 87950517 87950887 + 1 NA intron (NM_001320135, intron 12 of 15) MIRb|SINE|MIR -4434 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 219.5-64 chr2 37231006 37231416 + 1 NA promoter-TSS (NM_144736) promoter-TSS (NM_144736) 385 NM_005760 10153 Hs.135406 NM_005760 ENSG00000115816 CEBPZ CBF|CBF2|HSP-CBF|NOC1 CCAAT enhancer binding protein zeta protein-coding 381.25-6 chr17 44358936 44359652 + 1 NA intron (NM_198475, intron 3 of 7) intron (NM_198475, intron 3 of 7) 4559 NM_198475 284069 Hs.154001 NM_198475 ENSG00000161682 FAM171A2 - family with sequence similarity 171 member A2 protein-coding 161.25-6 chr1 157249755 157250112 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -111342 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 188.25-34 chr13 83236199 83236499 + 1 NA Intergenic Intergenic 646044 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 268.5-29 chr2 6436703 6437064 + 1 NA Intergenic Intergenic -61461 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 211.25-74 chr5 79404951 79405479 + 1 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 108621 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 218.75-76 chr6 37543155 37543570 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 12060 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 175.5-63 chr15 75946686 75947023 + 1 NA intron (NM_138573, intron 5 of 5) L1MB3|LINE|L1 42976 NR_037623 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 144.5-80 chr16 62175375 62175568 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -139033 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 258.5-61 chr5 149168353 149168732 + 1 NA intron (NM_001370418, intron 1 of 18) intron (NM_001370418, intron 1 of 18) 26811 NM_001301028 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 177.75-54 chr17 49858443 49858710 + 1 NA Intergenic Intergenic -10559 NM_001077506 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 228.75-43 chr2 111222115 111222480 + 1 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) intron (NR_015395, intron 5 of 6) 98789 NR_039636 100616341 NR_039636 ENSG00000266139 MIR4435-2 mir-4435-2 microRNA 4435-2 ncRNA 264.25-29 chr2 112100609 112101189 + 1 NA intron (NM_001329914, intron 15 of 18) intron (NM_001329914, intron 15 of 18) -37486 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 138.25-130 chr4 109524750 109525071 + 1 NA exon (NM_001318085, exon 15 of 24) exon (NM_001318085, exon 15 of 24) -35336 NM_017918 55013 Hs.234149 NM_017918 ENSG00000005059 MCUB CCDC109B mitochondrial calcium uniporter dominant negative beta subunit protein-coding 220.25-78 chr8 130254058 130254494 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 42257 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 125.5-141 chr2 230790302 230790481 + 1 NA intron (NM_001130850, intron 2 of 8) intron (NM_001130850, intron 2 of 8) -73794 NM_001287241 81618 Hs.111577 NM_030926 ENSG00000135916 ITM2C BRI3|BRICD2C|E25|E25C|ITM3 integral membrane protein 2C protein-coding 184.25-73 chr21 23252740 23252989 + 1 NA Intergenic Intergenic 131971 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 159.75-78 chr2 62969129 62969315 + 1 NA intron (NM_001354215, intron 15 of 24) intron (NM_001354215, intron 15 of 24) 78489 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 156.5-180 chr7 144689188 144689439 + 1 NA intron (NM_001042482, intron 3 of 7) intron (NM_001042482, intron 3 of 7) 49585 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 135.5-150 chr4 61519604 61519853 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 317556 NM_001371342 193.5-45 chr13 86200809 86201051 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -401511 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 129.5-145 chr22 19571683 19571921 + 1 NA Intergenic Intergenic -4963 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 222.75-41 chr14 69973650 69973953 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) intron (NM_001034852, intron 3 of 11) -4332 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 117.5-7 chr1 89738559 89738694 + 1 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 -82406 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 216.25-2 chr1 12383994 12384270 + 1 NA intron (NM_015378, intron 58 of 69) L2a|LINE|L2 -123114 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 167.25-21 chr11 5954209 5954514 + 1 NA Intergenic Intergenic 7014 NM_001003443 390083 Hs.553741 NM_001003443 ENSG00000184478 OR56A3 OR56A2P|OR56A3P|OR56A6 olfactory receptor family 56 subfamily A member 3 protein-coding 184.25-95 chr5 5910738 5911215 + 1 NA Intergenic Intergenic 426316 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 239.75-41 chr21 31288331 31288686 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 55846 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 209.5-111 chr4 126262878 126263229 + 1 NA Intergenic Intergenic 755794 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 203.75-47 chr17 79254797 79255213 + 1 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) intron (NM_001082575, intron 3 of 14) 180068 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 175.25-116 chr5 59201039 59201288 + 1 NA intron (NM_006203, intron 2 of 14) (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 74952 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 237.5-89 chr6 89376801 89377108 + 1 NA intron (NM_021244, intron 5 of 6) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -24232 NM_016021 51465 Hs.163776 NM_016021 ENSG00000198833 UBE2J1 CGI-76|HSPC153|HSPC205|HSU93243|NCUBE-1|NCUBE1|UBC6|UBC6E|Ubc6p ubiquitin conjugating enzyme E2 J1 protein-coding 211.75-33 chr18 6199115 6199345 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 12 of 16) intron (NM_001365769, intron 12 of 16) -57514 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 232.25-53 chr4 89689320 89689779 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -146852 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 140.75-184 chr8 114474580 114474833 + 1 NA Intergenic Intergenic -1037767 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 114.25-185 chr7 105345946 105346114 + 1 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) intron (NM_001350746, intron 2 of 14) 42891 NM_182692 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 323.25-22 chr5 162083433 162083906 + 1 NA intron (NM_198904, intron 1 of 9) intron (NM_198904, intron 1 of 9) 16027 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 182.75-118 chr6 131289840 131290058 + 1 NA Intergenic Intergenic 39545 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 248.75-11 chr12 12766629 12767120 + 1 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 2225 NR_030344 693198 NR_030344 ENSG00000207983 MIR613 MIRN613|hsa-mir-613 microRNA 613 ncRNA 215.25-6 chr10 44337073 44337346 + 1 NA Intergenic Intergenic 44459 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 210.5-52 chr17 17372484 17372785 + 1 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 69261 NM_020201 56953 Hs.513977 NM_020201 ENSG00000205309 NT5M dNT-2|dNT2|mdN 5',3'-nucleotidase, mitochondrial protein-coding 152.75-49 chr13 65194777 65195058 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -671130 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 315.25-31 chr7 30974753 30975350 + 1 NA intron (NM_000823, intron 9 of 12) intron (NM_000823, intron 9 of 12) 11098 NM_000823 2692 Hs.767 NM_000823 ENSG00000106128 GHRHR GHRFR|GRFR|IGHD1B|IGHD4 growth hormone releasing hormone receptor protein-coding 134.25-23 chr11 65765278 65765544 + 1 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger 15565 NM_138368 91056 Hs.591957 NM_138368 ENSG00000254470 AP5B1 AP-5|PP1030 adaptor related protein complex 5 subunit beta 1 protein-coding 174.75-126 chr8 47887025 47887374 + 1 NA intron (NM_001081640, intron 35 of 84) intron (NM_001081640, intron 35 of 84) 72937 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 225.5-100 chr8 24817007 24817390 + 1 NA Intergenic Intergenic -96563 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 214.25-61 chr4 82661576 82661877 + 1 NA intron (NM_024906, intron 3 of 3) intron (NM_024906, intron 3 of 3) -40289 NR_024087 439934 Hs.457189 NM_001033661 ENSG00000231782 LINC00575 C4orf11 long intergenic non-protein coding RNA 575 ncRNA 145.25-78 chr2 173455793 173456003 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 101026 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 202.75-109 chr8 106015370 106015773 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 44932 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 157.75-135 chr5 67474286 67474451 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 172421 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 219.25-18 chr10 86793150 86793498 + 1 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) intron (NM_004329, intron 1 of 12) 36685 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 149.5-39 chr10 129197312 129197543 + 1 NA Intergenic Intergenic -269814 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 117.5-61 chr14 58213589 58213734 + 1 NA exon (NM_018477, exon 6 of 13) exon (NM_018477, exon 6 of 13) 13512 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 248.25-35 chr2 88040603 88040933 + 1 NA intron (NM_001304526, intron 1 of 3) intron (NM_001304526, intron 1 of 3) 15015 NM_016618 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 267.25-4 chr10 37797999 37798365 + 1 NA intron (NR_147992, intron 6 of 8) L1MB7|LINE|L1 -3007 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 241.25-45 chr3 77381889 77382170 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 284017 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 189.5-126 chr7 10214465 10214706 + 1 NA Intergenic Intergenic -488091 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 216.5-19 chr12 11507383 11507810 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -20918 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 214.25-9 chr10 73218139 73218378 + 1 NA intron (NM_173348, intron 7 of 13) MLT1F2-int|LTR|ERVL-MaLR 28997 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 296.25-4 chr11 28026970 28027474 + 1 NA intron (NM_031217, intron 15 of 16) intron (NM_031217, intron 15 of 16) -29593 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 140.5-88 chr18 4343341 4343612 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 78874 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 127.5-206 chr5 161127900 161128125 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -189386 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 134.5-140 chr3 151079656 151079808 + 1 NA non-coding (NR_024066, exon 6 of 6) non-coding (NR_024066, exon 6 of 6) -7066 NM_053002 116931 Hs.744234 NM_053002 ENSG00000144893 MED12L NOPAR|TNRC11L|TRALP|TRALPUSH mediator complex subunit 12L protein-coding 185.25-94 chr5 4454364 4454793 + 1 NA Intergenic Intergenic -318903 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 196.5-9 chr1 159315919 159316266 + 1 NA Intergenic Intergenic -1433 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 167.75-50 chr14 86350101 86350391 + 1 NA Intergenic Intergenic 415568 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 307.5-8 chr10 77115937 77116336 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 6 of 28) intron (NM_001271519, intron 6 of 28) -24695 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 297.75-40 chr6 54729118 54729458 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -117483 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 162.5-95 chr2 221193340 221193569 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 378850 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 493.25-2 chr17 29487043 29488029 + 1 NA intron (NM_025142, intron 8 of 17) L1MC4|LINE|L1 79501 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 174.25-119 chr5 13879422 13879675 + 1 NA intron (NM_001369, intron 21 of 78) L1M3de|LINE|L1 64932 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 203.25-16 chr10 107822952 107823375 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 246130 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 176.5-48 chr13 34493531 34493762 + 1 NA intron (NR_047036, intron 2 of 2) intron (NR_047036, intron 2 of 2) 145603 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 149.5-143 chr4 157391234 157391406 + 1 NA Intergenic Intergenic 170592 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 272.5-44 chr20 56960792 56961086 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -252757 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 205.5-61 chr18 25111268 25111551 + 1 NA intron (NM_001308225, intron 4 of 6) intron (NM_001308225, intron 4 of 6) -123430 NR_146903 105372030 NR_146903 LINC01894 - long intergenic non-protein coding RNA 1894 ncRNA 147.75-174 chrX 154834679 154834891 + 1 NA promoter-TSS (NM_001162936) promoter-TSS (NM_001162936) -123 NM_001162936 100132963 Hs.220762 NM_001162936 ENSG00000203870 SMIM9 CXorf68 small integral membrane protein 9 protein-coding 144.75-11 chr1 197417905 197418076 + 1 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) LTR78|LTR|ERV1 149738 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 224.25-2 chr1 51381748 51382003 + 1 NA intron (NM_001159969, intron 9 of 12) L1MB3|LINE|L1 -36759 NM_001144832 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 221.25-92 chr8 113350354 113350732 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 26609 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 172.5-45 chr12 10758928 10759276 + 1 NA intron (NR_120463, intron 1 of 6) intron (NR_120463, intron 1 of 6) 8868 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 136.5-121 chr2 176771434 176771613 + 1 NA Intergenic Intergenic 133769 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 142.5-47 chr11 106897768 106898016 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) L1MC1|LINE|L1 120584 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 133.25-23 chr10 82541732 82541912 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1MC4|LINE|L1 -308902 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 196.5-124 chr5 51765864 51766179 + 1 NA Intergenic Intergenic -242010 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 321.5-38 chr9 29094284 29094762 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 117776 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 135.5-69 chr16 3235096 3235328 + 1 NA promoter-TSS (NM_001145446) promoter-TSS (NM_001145446) -54 NM_001145446 7752 Hs.632222 NM_003454 ENSG00000010539 ZNF200 - zinc finger protein 200 protein-coding 182.25-53 chr18 6554509 6554757 + 1 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 43217 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 169.75-51 chr15 25997550 25998022 + 1 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) AluSp|SINE|Alu 95426 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 143.75-92 chr2 99924895 99925105 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) AluJb|SINE|Alu 180583 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 161.75-18 chr10 49147568 49147909 + 1 NA intron (NR_038973, intron 5 of 5) L1MEb|LINE|L1 -13718 NM_001164484 170370 Hs.646291 NM_001164484 ENSG00000172538 FAM170B C10orf73 family with sequence similarity 170 member B protein-coding 288.5-51 chr8 134774188 134774588 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 26219 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 223.75-64 chr4 33905217 33905474 + 1 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) L1MC1|LINE|L1 134548 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 170.25-14 chr10 100800227 100800480 + 1 NA intron (NM_003990, intron 6 of 10) AluJr|SINE|Alu 54642 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 171.5-123 chr5 29623851 29624126 + 1 NA Intergenic Intergenic -228012 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 166.5-110 chr2 165296238 165296542 + 1 NA intron (NM_001040143, intron 3 of 27) intron (NM_001040143, intron 3 of 27) 2335 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 151.25-145 chr4 124325016 124325198 + 1 NA Intergenic Intergenic 233327 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 119.5-115 chr2 35002294 35002485 + 1 NA Intergenic Intergenic 324832 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 141.5-16 chr10 24945751 24946067 + 1 NA intron (NM_020200, intron 1 of 8) intron (NM_020200, intron 1 of 8) 6697 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 287.5-54 chr8 126770513 126770971 + 1 NA Intergenic Intergenic -212264 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 158.75-163 chr8 123787401 123787604 + 1 NA intron (NM_144963, intron 13 of 23) intron (NM_144963, intron 13 of 23) 19063 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 159.5-76 chr17 47094998 47095194 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 94199 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 217.25-26 chr14 73955844 73956125 + 1 NA intron (NM_182476, intron 4 of 11) intron (NM_182476, intron 4 of 11) 5682 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 170.5-99 chr2 164357194 164357572 + 1 NA Intergenic Intergenic 211112 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 201.5-64 chr17 79001038 79001554 + 1 NA intron (NM_001159772, intron 1 of 5) intron (NM_001159772, intron 1 of 5) 8468 NM_138793 124583 Hs.8859 NM_138793 ENSG00000171302 CANT1 DBQD|DBQD1|EDM7|SCAN-1|SCAN1|SHAPY calcium activated nucleotidase 1 protein-coding 229.75-67 chr7 22871564 22871942 + 1 NA Intergenic Intergenic 15140 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 380.25-6 chr5 74731666 74732292 + 1 NA intron (NM_032380, intron 16 of 20) AluJb|SINE|Alu 35138 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 250.25-44 chr8 25385309 25385610 + 1 NA intron (NM_024940, intron 40 of 51) L2a|LINE|L2 -23947 NR_159962 105379331 NR_159962 LOC105379331 - uncharacterized LOC105379331 ncRNA 150.5-74 chr18 64011958 64012190 + 1 NA intron (NM_001348367, intron 7 of 7) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 41993 NM_001366198 5271 Hs.368077 NM_002640 ENSG00000166401 SERPINB8 C18orf53|CAP2|PI-8|PI8|PSS5 serpin family B member 8 protein-coding 171.5-26 chr11 96463871 96464187 + 1 NA intron (NR_047481, intron 1 of 4) intron (NR_047481, intron 1 of 4) 42848 NR_047481 100874053 Hs.742044 NR_047481 JRKL-AS1 - JRKL antisense RNA 1 ncRNA 282.25-8 chr11 35414618 35415020 + 1 NA intron (NM_001252652, intron 1 of 11) intron (NM_001252652, intron 1 of 11) 4739 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 196.25-82 chr3 85281844 85282157 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -103710 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 293.25-25 chr5 58298110 58298530 + 1 NA Intergenic Intergenic 161766 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 201.5-80 chr20 45846454 45846845 + 1 NA intron (NM_005469, intron 3 of 5) MIRc|SINE|MIR 10743 NM_005469 10005 Hs.444776 NM_005469 ENSG00000101473 ACOT8 HNAACTE|NAP1|PTE-1|PTE-2|PTE1|PTE2|hACTE-III|hTE acyl-CoA thioesterase 8 protein-coding 230.5-24 chr11 91916123 91916451 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -308747 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 117.25-211 chr8 104928480 104928729 + 1 NA Intergenic Intergenic -339580 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 132.25-144 chr4 150292845 150292995 + 1 NA intron (NM_001199282, intron 53 of 56) intron (NM_001199282, intron 53 of 56) 214475 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 244.5-51 chr2 99169871 99170123 + 1 NA intron (NM_001320419, intron 4 of 5) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 11061 NM_001320419 129531 Hs.14222 NM_138798 ENSG00000158411 MITD1 - microtubule interacting and trafficking domain containing 1 protein-coding 115.25-44 chr12 2542158 2542356 + 1 NA intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 129963 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 226.25-70 chr8 67910030 67910471 + 1 NA Intergenic Intergenic -41796 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 330.5-28 chr7 4724353 4724943 + 1 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) intron (NM_001037165, intron 1 of 8) 42353 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 149.25-48 chr14 68748016 68748356 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 45728 NM_004926 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 168.25-152 chr9 99694268 99694475 + 1 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 125518 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 155.25-153 chr6 69542603 69542777 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 253776 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 152.75-74 chr18 10502094 10502339 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -23811 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 156.5-121 chr3 145733163 145733526 + 1 NA Intergenic Intergenic 335841 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 206.5-77 chr3 159133932 159134257 + 1 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 64775 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 132.5-27 chr1 240962764 240963030 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 4 of 16) L2c|LINE|L2 -169375 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 116.25-99 chr2 10840969 10841136 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -3340 NM_001282705 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 187.5-83 chr2 30952774 30953056 + 1 NA intron (NM_024572, intron 6 of 14) intron (NM_024572, intron 6 of 14) -145469 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 131.5-14 chr1 179636774 179637029 + 1 NA intron (NM_001199091, intron 9 of 16) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 30674 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 147.75-151 chr8 66262038 66262286 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 70048 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 215.5-87 chr5 36808742 36809086 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 67780 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 265.5-52 chr6 44048157 44048438 + 1 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) intron (NR_125864, intron 1 of 4) 26355 NR_125864 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 202.75-51 chr19 30252317 30252629 + 1 NA Intergenic Intergenic -119911 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 206.5-87 chr4 150306057 150306269 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 52 of 56) intron (NM_001367550, intron 52 of 56) 227718 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 285.5-61 chr8 87728697 87729083 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 145125 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 196.75-88 chr5 59920539 59920759 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MIR|SINE|MIR -26923 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 113.25-72 chr17 67241049 67241180 + 1 NA intron (NM_001330447, intron 2 of 32) intron (NM_001330447, intron 2 of 32) -3662 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 177.25-102 chr3 190131390 190131594 + 1 NA intron (NR_126419, intron 2 of 3) intron (NR_126419, intron 2 of 3) -9055 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 149.75-32 chr12 61703972 61704181 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 488763 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 115.25-153 chr4 132551268 132551464 + 1 NA Intergenic Intergenic -39723 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 273.5-47 chr3 71903656 71903994 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -118677 NM_021935 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 167.25-117 chr4 79720014 79720371 + 1 NA Intergenic Intergenic -107279 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 252.75-75 chr8 124544444 124544902 + 1 NA intron (NM_001311168, intron 2 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 5550 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 336.5-21 chr4 72357675 72358081 + 1 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) intron (NM_014243, intron 4 of 21) 211343 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 255.5-49 chr20 49128592 49128934 + 1 NA intron (NM_001319134, intron 5 of 12) L1ME1|LINE|L1 59607 NM_017452 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 189.5-129 chr7 35717502 35717863 + 1 NA intron (NR_108082, intron 2 of 2) intron (NR_108082, intron 2 of 2) 1245 NR_108083 100506725 Hs.304253 NR_108082 ENSG00000227544 LOC100506725 - uncharacterized LOC100506725 ncRNA 202.5-64 chr18 64946923 64947246 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -687029 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 209.75-73 chr5 44688067 44688334 + 1 NA Intergenic Intergenic 120593 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 150.5 chr1 6826270 6826523 + 1 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) intron (NM_001349608, intron 2 of 21) 40942 NM_015215 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 198.5-52 chr15 80081516 80081748 + 1 NA intron (NM_001242912, intron 2 of 6) MER57B2|LTR|ERV1 9071 NM_001242915 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 218.5-111 chr6 140473085 140473451 + 1 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -210546 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 437.25-8 chr8 118619008 118620070 + 1 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) intron (NR_109794, intron 1 of 4) -1462 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 151.5-38 chr12 119755292 119755511 + 1 NA intron (NM_007174, intron 21 of 46) intron (NM_007174, intron 21 of 46) -41677 NR_031589 100302274 NR_031589 ENSG00000283768 MIR1178 MIRN1178|hsa-mir-1178 microRNA 1178 ncRNA 143.75-9 chr1 192631527 192631796 + 1 NA Intergenic Intergenic -4486 NM_144766 6003 Hs.497220 NM_002927 ENSG00000127074 RGS13 - regulator of G protein signaling 13 protein-coding 186.5-113 chr5 156426453 156426739 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) L1PB2|LINE|L1 99432 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 120.25-11 chr1 102900275 102900405 + 1 NA intron (NM_001854, intron 54 of 66) intron (NM_001854, intron 54 of 66) 208156 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 222.5-104 chr7 113756437 113756784 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 162399 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 350.75-13 chr8 133846712 133847197 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -39542 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 115.25-27 chr10 76267684 76267873 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 485017 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 149.75-151 chr6 157234406 157234818 + 1 NA Intergenic Intergenic 89647 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 189.75-70 chr3 39771279 39771589 + 1 NA Intergenic Intergenic -37480 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 224.75-58 chr5 37712265 37712562 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 13 of 17) intron (NM_001345998, intron 13 of 17) 122409 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 154.5-139 chr4 95302314 95302538 + 1 NA intron (NM_003728, intron 2 of 15) intron (NM_003728, intron 2 of 15) 210935 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 243.25-16 chr16 22665459 22665913 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 119988 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 249.5-100 chrX 47241539 47241833 + 1 NA exon (NM_001371072, exon 9 of 21) exon (NM_001371072, exon 9 of 21) 8677 NM_001371072 305.75-26 chr7 3433592 3434348 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 132718 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 193.75-69 chr2 179433569 179433881 + 1 NA Intergenic Intergenic 128863 NR_148055 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 163.5-96 chr2 140756028 140756443 + 1 NA intron (NM_018557, intron 35 of 90) L1MB7|LINE|L1 -169550 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 182.25-91 chr5 46216163 46216494 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -519948 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 181.5-63 chr18 9828981 9829323 + 1 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) L1ME3B|LINE|L1 -56821 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 303.75-11 chr13 111624851 111625540 + 1 NA intron (NR_135814, intron 1 of 1) intron (NR_135814, intron 1 of 1) 29186 NR_135814 105370369 NR_135814 ENSG00000215881 LINC02337 - long intergenic non-protein coding RNA 2337 ncRNA 180.5-58 chr17 58961675 58962013 + 1 NA intron (NR_048561, intron 2 of 5) FAM|SINE|Alu 145036 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 233.5-10 chr1 171531096 171531562 + 1 NA intron (NM_015172, intron 11 of 33) L1ME1|LINE|L1 45799 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 186.75-4 chr1 97679359 97679658 + 1 NA intron (NM_000110, intron 7 of 22) L2c|LINE|L2 -117413 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 183.5-42 chr14 48529368 48529588 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -734464 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 150.5-61 chr16 20078332 20078588 + 1 NA Intergenic Intergenic -4682 NM_001002911 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 291.5-37 chr5 51326005 51326399 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 57130 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 145.25-17 chr10 115686481 115686848 + 1 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 508125 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 155.75-160 chr8 5924393 5924568 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 482068 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 323.25-18 chr4 42606932 42607440 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 5 of 35) intron (NM_001105529, intron 5 of 35) 49919 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 139.5-109 chr2 168077366 168077532 + 1 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) intron (NM_013233, intron 10 of 17) -136305 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 155.5-36 chr11 35620849 35621014 + 1 NA TTS (NM_014344) TTS (NM_014344) 2471 NM_014344 24147 Hs.39384 NM_014344 ENSG00000179431 FJX1 - four-jointed box kinase 1 protein-coding 128.75-123 chr3 88202265 88202425 + 1 NA Intergenic Intergenic 52386 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 250.75-21 chr18 73409881 73410286 + 1 NA Intergenic Intergenic 85142 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 233.75-31 chr17 29218173 29218478 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -28532 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 161.5-192 chr8 142480204 142480424 + 1 NA intron (NM_001702, intron 9 of 30) MIRb|SINE|MIR 30665 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 115.5-211 chr6 35710324 35710552 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) AluJb|SINE|Alu 18145 NM_001145775 2289 Hs.407190 NM_004117 ENSG00000096060 FKBP5 AIG6|FKBP51|FKBP54|P54|PPIase|Ptg-10 FKBP prolyl isomerase 5 protein-coding 266.5-47 chr21 25487290 25487717 + 1 NA Intergenic Intergenic -55802 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 192.5-133 chr8 115968930 115969167 + 1 NA intron (NR_046215, intron 10 of 13) intron (NR_046215, intron 10 of 13) -300073 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 144.75-169 chr8 49905365 49905574 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -4327 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 123.5-46 chr11 127128305 127128537 + 1 NA Intergenic Intergenic 61419 NR_120578 101929473 Hs.737523 NR_120578 ENSG00000255087 LOC101929473 - uncharacterized LOC101929473 ncRNA 285.5-37 chr3 36832174 36832507 + 1 NA exon (NM_014831, exon 21 of 23) exon (NM_014831, exon 21 of 23) -9840 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 314.75-24 chr9 123805416 123805867 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 2 of 18) AluSx1|SINE|Alu 124485 NM_001352966 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 123.5-135 chr3 72266004 72266326 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 114908 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 194.75-81 chr5 112839021 112839353 + 1 NA exon (NM_001354898, exon 16 of 16) exon (NM_001354898, exon 16 of 16) -22001 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 129.25-25 chr10 97394403 97394555 + 1 NA intron (NM_015179, intron 3 of 33) AluJr4|SINE|Alu 6861 NM_001284337 23223 Hs.434251 NM_015179 ENSG00000052749 RRP12 KIAA0690 ribosomal RNA processing 12 homolog protein-coding 126.75-164 chr4 30809793 30809960 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 89507 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 157.5-116 chr2 224344238 224344483 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 57634 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 307.25-6 chr12 13554613 13555016 + 1 NA 3' UTR (NM_000834, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_000834, exon 13 of 13) -178069 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 215.5-76 chr4 74707073 74707427 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 87273 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 145.5-144 chr4 81957427 81957612 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 416472 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 120.5-230 chr8 111121209 111121380 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) -93861 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 189.75-2 chr1 78509051 78509353 + 1 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) intron (NM_001039585, intron 3 of 3) 18228 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 136.5-39 chr11 19963144 19963389 + 1 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) MIRb|SINE|MIR -59290 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 224.5 chr1 7474344 7474699 + 1 NA intron (NM_001349608, intron 5 of 21) intron (NM_001349608, intron 5 of 21) -84767 NR_146201 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 332.75-4 chr10 32599689 32600168 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1M4c|LINE|L1 153788 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 303.75-26 chr5 32051542 32052251 + 1 NA intron (NM_178140, intron 8 of 24) intron (NM_178140, intron 8 of 24) -115737 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 143.5-2 chr1 15273287 15273486 + 1 NA intron (NM_052929, intron 3 of 30) L1MA10|LINE|L1 26161 NM_052929 114827 Hs.659997 NM_052929 ENSG00000142621 FHAD1 - forkhead associated phosphopeptide binding domain 1 protein-coding 146.5-50 chr12 6725526 6725772 + 1 NA intron (NM_016319, intron 2 of 7) intron (NM_016319, intron 2 of 7) 1362 NM_001164093 50813 Hs.530823 NM_016319 ENSG00000111652 COPS7A CSN7|CSN7A|SGN7a COP9 signalosome subunit 7A protein-coding 127.5-179 chr4 145519938 145520162 + 1 NA intron (NM_005900, intron 2 of 6) L1M2|LINE|L1 -2856 NR_126371 104326058 Hs.714527 NR_126371 ENSG00000250902 SMAD1-AS1 - SMAD1 antisense RNA 1 ncRNA 267.5-14 chr11 99014998 99015397 + 1 NA Intergenic UCON29|DNA|PiggyBac? -5752 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 239.5-73 chr7 137903501 137903801 + 1 NA intron (NM_001318246, intron 7 of 11) intron (NM_001318246, intron 7 of 11) 29337 NM_001318246 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 331.5-7 chr12 53195682 53196441 + 1 NA TTS (NM_001004304) TTS (NM_001004304) 11190 NM_000889 3695 Hs.654470 NM_000889 ENSG00000139626 ITGB7 - integrin subunit beta 7 protein-coding 259.25-16 chr16 48052429 48052716 + 1 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 86883 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 185.5-43 chr14 20245080 20245468 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2482 NM_001004479 390442 Hs.553767 NM_001004479 ENSG00000176198 OR11H4 OR14-36 olfactory receptor family 11 subfamily H member 4 protein-coding 150.75-13 chr1 102664018 102664326 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 444324 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 217.75-41 chr20 6003780 6004071 + 1 NA intron (NR_110101, intron 1 of 4) intron (NR_110101, intron 1 of 4) 1896 NR_110101 101929225 Hs.635771 NR_110101 ENSG00000278719 MCM8-AS1 - MCM8 antisense RNA 1 ncRNA 137.75-209 chr8 118784440 118784765 + 1 NA Intergenic Intergenic -162639 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 192.5-2 chr1 47633852 47634110 + 1 NA Intergenic Intergenic -196664 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 192.5-119 chr7 14521697 14521978 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) L1M4a2|LINE|L1 319613 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 208.75-11 chr10 86547834 86548207 + 1 NA Intergenic Intergenic -26228 NM_015045 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 189.75-3 chr1 89934157 89934485 + 1 NA exon (NM_018103, exon 3 of 3) exon (NM_018103, exon 3 of 3) 60645 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 205.75-9 chr11 70539144 70539392 + 1 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) intron (NM_133266, intron 2 of 10) -91826 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 192.75-8 chr1 184213183 184213452 + 1 NA Intergenic Intergenic 161587 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 128.25-145 chr4 63694540 63694757 + 1 NA Intergenic Intergenic 714802 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 405.5-12 chr6 143487115 143487811 + 1 NA intron (NM_003630, intron 11 of 11) intron (NM_003630, intron 11 of 11) 24257 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 170.75-57 chr18 67741530 67741774 + 1 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 73170 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 157.5-87 chr18 13985126 13985346 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -69529 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 261.25-38 chr4 98675802 98676169 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 17083 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 151.25-46 chr13 21557724 21558181 + 1 NA intron (NM_152726, intron 2 of 11) L1M4b|LINE|L1 46218 NM_152726 221154 Hs.412103 NM_152726 ENSG00000165487 MICU2 1110008L20Rik|EFHA1 mitochondrial calcium uptake 2 protein-coding 125.5-82 chr14 66512735 66512939 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 5430 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 115.5-91 chr16 87546518 87546786 + 1 NA Intergenic Intergenic 52465 NR_110943 101928737 Hs.579009 NR_110943 ENSG00000260750 LOC101928737 - uncharacterized LOC101928737 ncRNA 131.5-201 chr6 46059993 46060269 + 1 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) 20217 NM_001114086 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 181.75-41 chr15 84665125 84665485 + 1 NA Intergenic Intergenic -7106 NM_021077 4828 Hs.386470 NM_021077 ENSG00000197696 NMB - neuromedin B protein-coding 485.5-2 chr11 94608888 94609414 + 1 NA intron (NM_152431, intron 15 of 19) MIR|SINE|MIR 41783 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 196.5-81 chr2 32595327 32595604 + 1 NA intron (NM_016252, intron 68 of 73) intron (NM_016252, intron 68 of 73) -20647 NR_125793 103752586 Hs.666092 NR_125793 ENSG00000279897 BIRC6-AS2 linc-birc6|megamind BIRC6 antisense RNA 2 ncRNA 230.25-2 chr1 66350897 66351214 + 1 NA intron (NM_001037339, intron 1 of 9) intron (NM_001037339, intron 1 of 9) -3480 NM_001297442 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 135.5-215 chr9 87720600 87720808 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5415 NM_001257973 1514 Hs.731507 NM_001912 ENSG00000135047 CTSL CATL|CTSL1|MEP cathepsin L protein-coding 271.75-25 chr21 14716774 14717094 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -73827 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 153.5-3 chr1 42044977 42045130 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -9119 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 124.25-55 chr14 69496847 69497241 + 1 NA intron (NM_001161498, intron 1 of 12) intron (NM_001161498, intron 1 of 12) 12316 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 251.75-21 chr13 85529473 85529756 + 1 NA intron (NR_046989, intron 1 of 3) intron (NR_046989, intron 1 of 3) 166011 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 397.5-2 chr10 95697672 95698255 + 1 NA Intergenic MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR -3820 NM_001143973 26123 Hs.438991 NM_015631 ENSG00000119977 TCTN3 C10orf61|JBTS18|OFD4|TECT3 tectonic family member 3 protein-coding 184.75-14 chr11 46199764 46200154 + 1 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 28004 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 117.75-210 chr8 94471839 94472023 + 1 NA intron (NM_012415, intron 1 of 14) MER104|DNA|TcMar-Tc2 3184 NM_012415 25788 Hs.30561 NM_006550 ENSG00000197275 RAD54B RDH54 RAD54 homolog B protein-coding 266.5-30 chr2 28876276 28876758 + 1 NA Intergenic Intergenic -6208 NM_017910 55006 Hs.468026 NM_017910 ENSG00000171103 TRMT61B - tRNA methyltransferase 61B protein-coding 343.25-2 chr1 113653607 113654029 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 14 of 20) intron (NM_001142782, intron 14 of 20) 105337 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 314.75-11 chr20 33163232 33163605 + 1 NA intron (NM_001319164, intron 1 of 8) intron (NM_001319164, intron 1 of 8) 1648 NM_001319164 140683 Hs.125960 NM_080574 ENSG00000131050 BPIFA2 C20orf70|PSP|SPLUNC2|bA49G10.1 BPI fold containing family A member 2 protein-coding 277.5-9 chr10 66395511 66395970 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -530296 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 166.25-100 chr3 25593738 25593918 + 1 NA intron (NR_110892, intron 5 of 6) intron (NR_110892, intron 5 of 6) 70544 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 167.75-20 chr10 49188319 49188559 + 1 NA promoter-TSS (NM_001010863) promoter-TSS (NM_001010863) -48 NM_001288741 170371 Hs.385493 NM_001010863 ENSG00000204161 TMEM273 C10orf128 transmembrane protein 273 protein-coding 225.75-4 chr1 91376884 91377161 + 1 NA intron (NM_001017975, intron 11 of 38) L1ME4a|LINE|L1 27815 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 275.75-24 chr2 206846449 206846795 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -63314 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 153.5-173 chr6 132323742 132323998 + 1 NA intron (NM_015529, intron 7 of 11) intron (NM_015529, intron 7 of 11) 77605 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 199.25-44 chr17 29966738 29967038 + 1 NA intron (NR_026738, intron 3 of 15) L1MC3|LINE|L1 25254 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 214.5-65 chr2 182705254 182705620 + 1 NA Intergenic Intergenic -10820 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 156.75-143 chr6 43780087 43780288 + 1 NA intron (NM_001171628, intron 5 of 5) intron (NM_001171628, intron 5 of 5) 8219 NM_001287044 7422 Hs.73793 NM_003376 ENSG00000112715 VEGFA MVCD1|VEGF|VPF vascular endothelial growth factor A protein-coding 300.75-25 chr2 108803401 108803904 + 1 NA intron (NM_001351555, intron 6 of 13) L1MEf|LINE|L1 16881 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 276.5-60 chr6 149576408 149576754 + 1 NA intron (NM_138785, intron 3 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 10206 NM_138785 116254 Hs.438872 NM_138785 ENSG00000055211 GINM1 C6orf72 glycoprotein integral membrane 1 protein-coding 123.75-97 chr2 172893751 172894040 + 1 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) intron (NM_001282899, intron 1 of 27) 33857 NM_001282899 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 165.5-126 chr4 53660317 53660511 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -35487 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 169.75-100 chr3 28131860 28132089 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -109645 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 135.5-200 chr8 105126712 105127051 + 1 NA Intergenic Intergenic -191557 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 131.5-96 chr18 66798900 66799103 + 1 NA Intergenic Intergenic -194911 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 278.5-46 chr6 45350372 45350712 + 1 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) Charlie10a|DNA|hAT-Charlie 22212 NR_103533 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 131.5-175 chr4 61212832 61213019 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 10753 NM_001371342 142.75-55 chr13 27086714 27086979 + 1 NA intron (NM_182488, intron 6 of 8) intron (NM_182488, intron 6 of 8) -38687 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 147.5-130 chr22 24398330 24398658 + 1 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) intron (NM_001254732, intron 13 of 14) -25103 NM_001278500 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 235.75-60 chr5 125800157 125800399 + 1 NA Intergenic Intergenic 307017 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 279.25-25 chr3 9289865 9290240 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 40296 NR_146969 101927440 NR_146969 ENSG00000235830 SRGAP3-AS4 - SRGAP3 antisense RNA 4 ncRNA 296.5-47 chrUn_KI270538v1 2645 3071 + 1 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 184.25-120 chr8 51273352 51273614 + 1 NA Intergenic LTR16D1|LTR|ERVL 535962 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 208.5-89 chr3 113974758 113975113 + 1 NA intron (NR_148531, intron 14 of 14) intron (NR_148531, intron 14 of 14) 26922 NM_001320468 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 181.25-47 chr17 61512582 61512896 + 1 NA Intergenic Intergenic 56251 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 160.5-68 chr17 50519108 50519388 + 1 NA intron (NM_001366294, intron 6 of 18) intron (NM_001366294, intron 6 of 18) 10809 NR_158785 84073 Hs.398196 NM_032133 ENSG00000136449 MYCBPAP AMAP-1|AMAP1 MYCBP associated protein protein-coding 158.5-22 chr10 60923145 60923622 + 1 NA intron (NM_001350908, intron 2 of 11) L1M6|LINE|L1 20802 NM_001242359 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 203.75-39 chr15 99536594 99537080 + 1 NA Intergenic Intergenic -28580 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 235.5-60 chr4 96276350 96276727 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34165 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 214.5 chr1 68602751 68603019 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -105803 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 303.5-9 chr12 97740135 97740569 + 1 NA non-coding (NR_077241, exon 4 of 7) non-coding (NR_077241, exon 4 of 7) 13246 NR_077241 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 308.5-17 chr2 114067766 114068192 + 1 NA Intergenic Intergenic -87995 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 172.25-53 chr18 2624474 2624846 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 30735 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 154.75-32 chr13 46116073 46116403 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11162 NM_001278541 1361 Hs.512937 NM_001872 ENSG00000080618 CPB2 CPU|PCPB|TAFI carboxypeptidase B2 protein-coding 201.5-118 chr6 91005684 91005923 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -418731 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 268.25-49 chr8 141829694 141830241 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -43654 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 176.5-105 chr2 226757638 226757931 + 1 NA intron (NM_005544, intron 1 of 1) intron (NM_005544, intron 1 of 1) 41006 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 343.5-30 chrX 77514284 77514646 + 1 NA intron (NM_000489, intron 34 of 34) L1PA13|LINE|L1 67076 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 245.75-37 chr3 83868202 83868533 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 1001208 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 160.5-151 chr5 135608127 135608420 + 1 NA intron (NM_001349335, intron 1 of 10) intron (NM_001349335, intron 1 of 10) -28994 NM_004887 9547 Hs.483444 NM_004887 ENSG00000145824 CXCL14 BMAC|BRAK|KEC|KS1|MIP-2g|MIP2G|NJAC|SCYB14 C-X-C motif chemokine ligand 14 protein-coding 224.25-12 chr10 43976284 43976636 + 1 NA intron (NR_136147, intron 4 of 4) L1MB3|LINE|L1 64058 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 227.25-15 chr11 25560135 25560428 + 1 NA Intergenic Intergenic -628842 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 134.75-131 chr21 23635564 23635733 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -250813 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 210.25-84 chr8 137086642 137087025 + 1 NA Intergenic Intergenic 326755 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 141.5-38 chr12 46295343 46295619 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -26438 NM_001278387 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 175.25-142 chr8 81385186 81385499 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 62097 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 134.5-101 chr2 122640127 122640373 + 1 NA Intergenic Intergenic 433231 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 251.5-20 chr12 59918046 59918388 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 228847 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 188.5-145 chr8 47690605 47690895 + 1 NA intron (NR_148204, intron 11 of 19) AluSz|SINE|Alu 31086 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 350.25-23 chr4 35356960 35357485 + 1 NA Intergenic Intergenic 886717 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 212.25-28 chr14 87138607 87138937 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 232994 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 153.5-58 chr14 66481908 66482175 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -4330 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 140.25-162 chr6 37769961 37770147 + 1 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger -49673 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 140.5-154 chr3 98240998 98241281 + 1 NA Intergenic Intergenic -23105 NM_001005479 79295 Hs.554712 NM_001005479 ENSG00000230301 OR5H6 OR3-11 olfactory receptor family 5 subfamily H member 6 (gene/pseudogene) protein-coding 317.5-38 chr9 81173680 81174160 + 1 NA Intergenic Intergenic 515615 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 144.75-170 chr8 52486124 52486373 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -76369 NM_001352837 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 196.25-115 chr7 95198730 95199109 + 1 NA intron (NM_017650, intron 6 of 15) intron (NM_017650, intron 6 of 15) 125613 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 155.5-149 chr4 100739958 100740232 + 1 NA Intergenic Intergenic -64982 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 190.25-26 chr12 16074288 16074748 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 163186 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 127.5-71 chr14 44563051 44563231 + 1 NA Intergenic Intergenic 55732 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 115.5-31 chr11 21707088 21707263 + 1 NA Intergenic Intergenic -485910 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 217.75-20 chr11 100109737 100110010 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) intron (NM_001243270, intron 12 of 23) 553728 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 134.5-210 chr8 3205008 3205189 + 1 NA intron (NM_033225, intron 31 of 69) intron (NM_033225, intron 31 of 69) -476647 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 185.25-24 chr12 118959494 118959836 + 1 NA Intergenic Intergenic -21876 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 196.5-61 chr16 53793000 53793241 + 1 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 88964 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 137.5-135 chr2 205481757 205481913 + 1 NA intron (NM_057177, intron 19 of 21) intron (NM_057177, intron 19 of 21) -200665 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 235.5-14 chr10 82925269 82925665 + 1 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) MIR|SINE|MIR -692547 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-173 chr6 93345862 93346024 + 1 NA intron (NM_004440, intron 5 of 16) intron (NM_004440, intron 5 of 16) 73616 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 130.5-23 chr1 211378127 211378322 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4531 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 209.5-125 chr5 87036188 87036475 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 78623 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 333.75-27 chr8 52773049 52773677 + 1 NA Intergenic Intergenic -58897 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 327.5-26 chr5 144904728 144905289 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 699617 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 167.75-138 chr8 65952638 65952943 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -62188 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 205.5-52 chr16 72854175 72854421 + 1 NA intron (NM_001164766, intron 3 of 8) intron (NM_001164766, intron 3 of 8) -189328 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 160.5-210 chrX 84027395 84027709 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 160383 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 155.5-40 chr12 1230748 1231061 + 1 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) L1MA9|LINE|L1 203156 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 223.5-119 chr7 91029791 91030134 + 1 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) intron (NM_012395, intron 9 of 13) -234471 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 178.75-113 chr8 122478870 122479280 + 1 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L3|LINE|CR1 89569 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 183.5-10 chr1 180492210 180492551 + 1 NA intron (NM_032360, intron 2 of 7) intron (NM_032360, intron 2 of 7) 10197 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 212.5-104 chr7 33999652 33999924 + 1 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 94249 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 278.75-9 chr16 49709869 49710320 + 1 NA intron (NM_001271620, intron 3 of 7) intron (NM_001271620, intron 3 of 7) -45770 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 163.5-116 chr21 21050871 21051231 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) LTR16A|LTR|ERVL 52642 NM_004540 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 241.5-36 chr2 35577625 35578144 + 1 NA Intergenic Intergenic 106479 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 192.5-110 chr5 148037936 148038220 + 1 NA Intergenic Intergenic -25894 NM_006846 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 187.25-14 chr10 86398498 86398702 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -31805 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 166.75-108 chr4 169098718 169099000 + 1 NA intron (NM_020870, intron 11 of 11) MIR1_Amn|SINE|MIR -88604 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 326.25 chr1 20968253 20968749 + 1 NA intron (NM_003760, intron 7 of 31) intron (NM_003760, intron 7 of 31) 19931 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 217.5-108 chr6 55631363 55631678 + 1 NA Intergenic Intergenic -52306 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 119.25-113 chr20 48289775 48289903 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -70072 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 164.5-57 chr14 58898336 58898596 + 1 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 70178 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 138.75-119 chr3 145193937 145194167 + 1 NA Intergenic Intergenic 875133 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 343.25-11 chr22 19365703 19366244 + 1 NA intron (NM_003325, intron 15 of 24) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 65760 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 134.25-91 chr2 180489005 180489309 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -202947 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 228.75-85 chr8 107186716 107187151 + 1 NA Intergenic Intergenic 149582 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 157.5-197 chr7 120176231 120176513 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -96803 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 190.75-49 chr2 20755627 20755875 + 1 NA intron (NM_021925, intron 4 of 6) HAL1|LINE|L1 67350 NM_001282724 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 180.5-78 chr2 201320088 201320406 + 1 NA intron (NM_139163, intron 9 of 14) L1PB3|LINE|L1 37098 NM_001289993 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 283.75-6 chr11 74529716 74530172 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -36220 NM_001144869 387787 Hs.591971 NM_001144869 ENSG00000175536 LIPT2 - lipoyl(octanoyl) transferase 2 protein-coding 184.75-12 chr10 123526113 123526367 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -140115 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 239.25-5 chr1 92995973 92996440 + 1 NA Intergenic Intergenic -34684 NM_001252269 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 166.5-127 chr3 12537890 12538146 + 1 NA intron (NR_135607, intron 12 of 12) intron (NR_135607, intron 12 of 12) 7446 NM_001195279 100129480 Hs.572974 NM_001195279 ENSG00000225526 MKRN2OS C3orf83|MKRN2-AS1 MKRN2 opposite strand protein-coding 230.5-7 chr1 91509387 91509820 + 1 NA intron (NM_001134420, intron 4 of 11) L2a|LINE|L2 8495 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 195.75-115 chr8 28723610 28724005 + 1 NA intron (NM_001440, intron 3 of 6) AluSz6|SINE|Alu 22306 NM_001440 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 190.25-96 chr5 43732882 43733170 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -129796 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 290.25-23 chr4 38979464 38979845 + 1 NA intron (NM_024943, intron 5 of 6) intron (NM_024943, intron 5 of 6) 52755 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 161.5-3 chr1 23889507 23889847 + 1 NA intron (NM_001841, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR -21308 NM_000147 2517 Hs.370858 NM_000147 ENSG00000179163 FUCA1 FUCA alpha-L-fucosidase 1 protein-coding 224.75-25 chr12 79436899 79437323 + 1 NA intron (NM_001291901, intron 8 of 9) intron (NM_001291901, intron 8 of 9) 17854 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 177.75-99 chr22 39519726 39520026 + 1 NA promoter-TSS (NM_001675) promoter-TSS (NM_001675) -683 NM_001675 468 Hs.496487 NM_001675 ENSG00000128272 ATF4 CREB-2|CREB2|TAXREB67|TXREB activating transcription factor 4 protein-coding 182.5-127 chr5 14176627 14176929 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 33436 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 132.75-134 chr4 41582863 41583074 + 1 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) L1MB3|LINE|L1 -29741 NM_001330982 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 185.25-77 chr22 25040457 25040849 + 1 NA exon (NM_001145206, exon 3 of 11) exon (NM_001145206, exon 3 of 11) 12679 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 287.25-43 chr7 41922147 41922647 + 1 NA Intergenic Intergenic -219307 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 200.5-122 chr6 35510220 35510464 + 1 NA intron (NM_001289395, intron 4 of 13) intron (NM_001289395, intron 4 of 13) 2554 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 163.5-175 chr6 121840345 121840610 + 1 NA Intergenic Intergenic 404831 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 274.5-22 chr14 69877709 69878119 + 1 NA Intergenic Intergenic -1502 NM_001034852 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 231.5-23 chr12 81444508 81444897 + 1 NA intron (NM_001282536, intron 3 of 29) (ATATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 67689 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 167.75-113 chr5 58257028 58257225 + 1 NA Intergenic Intergenic -134785 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 145.5-12 chr1 162392482 162392771 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 10898 NM_001085375 400793 Hs.447011 NM_001085375 ENSG00000239887 C1orf226 - chromosome 1 open reading frame 226 protein-coding 165.75-29 chr11 73540884 73541246 + 1 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 57047 NM_001286050 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 172.25-68 chr2 125544148 125544362 + 1 NA Intergenic Intergenic 573730 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 152.25-150 chr8 16493799 16494011 + 1 NA Intergenic Intergenic -301114 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 152.25-74 chr18 75732548 75732751 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20246 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 176.75-111 chr6 165412907 165413350 + 1 NA intron (NM_006661, intron 14 of 22) intron (NM_006661, intron 14 of 22) -103523 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 230.25-7 chr1 192448911 192449245 + 1 NA Intergenic Intergenic -126695 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 170.5-23 chr10 44015280 44015613 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 103044 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 205.5-128 chr6 95785209 95785561 + 1 NA Intergenic Intergenic 207850 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 189.5-103 chr4 152918837 152919114 + 1 NA Intergenic Intergenic -17348 NM_001371116 144.25-217 chr8 138606781 138607156 + 1 NA intron (NM_152888, intron 57 of 64) intron (NM_152888, intron 57 of 64) -109238 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 229.5-41 chr14 70618187 70618440 + 1 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) intron (NR_110071, intron 2 of 2) -17623 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 244.5-106 chr9 75898715 75899097 + 1 NA intron (NR_120409, intron 1 of 19) intron (NR_120409, intron 1 of 19) 8233 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 133.75-75 chr17 12518853 12519096 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -30994 NR_034144 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 231.25-32 chr2 49255175 49255597 + 1 NA Intergenic Intergenic -100859 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 209.75-91 chr7 41598486 41598741 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -95306 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 179.25-144 chr8 84877554 84877894 + 1 NA intron (NM_001354323, intron 7 of 7) L3|LINE|CR1 171797 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 187.25-65 chr21 28374164 28374386 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -145608 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 182.5-51 chr14 68989884 68990120 + 1 NA Intergenic Intergenic 10320 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-56 chr14 83012643 83012859 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 370119 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 190.5-85 chr20 7135274 7135538 + 1 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118796 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 179.5-86 chr2 15815432 15815779 + 1 NA Intergenic Intergenic -104794 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 130.25-201 chr8 99834991 99835195 + 1 NA intron (NM_017890, intron 52 of 61) intron (NM_017890, intron 52 of 61) 58614 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 122.5-102 chr2 4558266 4558449 + 1 NA Intergenic Intergenic 97865 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 189.5-42 chr14 60546515 60546844 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 37533 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 184.75-71 chr3 113881796 113882082 + 1 NA intron (NM_017577, intron 5 of 17) intron (NM_017577, intron 5 of 17) -15561 NM_001172105 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 156.5-95 chr2 222407164 222407405 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie -16704 NM_001320834 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 123.25-107 chr2 124348465 124348729 + 1 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 323310 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 147.75-7 chr1 80957021 80957212 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 315829 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 118.5-167 chr5 88294786 88295037 + 1 NA intron (NR_105019, intron 6 of 7) L1M2|LINE|L1 25895 NR_039994 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 204.75-98 chr5 181080689 181080924 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -37322 NR_107056 102465882 NR_107056 ENSG00000277912 MIR8089 hsa-mir-8089 microRNA 8089 ncRNA 152.5-46 chr14 55581313 55581466 + 1 NA intron (NM_004986, intron 1 of 41) intron (NM_004986, intron 1 of 41) 1182 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 223.5-74 chr22 32215071 32215417 + 1 NA intron (NR_149072, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 10129 NR_149072 110806273 Hs.382171 NR_149072 ENSG00000242082 SLC5A4-AS1 - SLC5A4 antisense RNA 1 ncRNA 136.25-24 chr10 91071214 91071545 + 1 NA Intergenic Intergenic 25571 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 174.75-91 chr4 64941871 64942338 + 1 NA intron (NR_033976, intron 2 of 6) intron (NR_033976, intron 2 of 6) 62396 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 237.75-45 chr2 194779506 194779940 + 1 NA Intergenic Intergenic 49128 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 189.5-86 chr21 42707121 42707424 + 1 NA intron (NM_001001578, intron 3 of 16) intron (NM_001001578, intron 3 of 16) 53520 NM_001001583 5152 Hs.473927 NM_002606 ENSG00000160191 PDE9A HSPDE9A2 phosphodiesterase 9A protein-coding 252.75-51 chr4 63093058 63093443 + 1 NA Intergenic Intergenic -931485 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 123.75-31 chr11 108956154 108956391 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 291203 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 130.5-123 chr19 35729710 35729864 + 1 NA intron (NM_014727, intron 22 of 36) intron (NM_014727, intron 22 of 36) 11768 NM_014727 9757 Hs.92236 NM_014727 ENSG00000272333 KMT2B CXXC10|DYT28|HRX2|MLL1B|MLL2|MLL4|TRX2|WBP-7|WBP7 lysine methyltransferase 2B protein-coding 148.5-9 chr1 116383544 116383745 + 1 NA intron (NM_001160234, intron 1 of 22) intron (NM_001160234, intron 1 of 22) 274 NM_001160234 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 194.5-164 chr9 28720225 28720574 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -1094 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 206.5-90 chr5 7846291 7846588 + 1 NA intron (NM_001089584, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 4694 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 115.75-132 chr21 29090052 29090305 + 1 NA intron (NM_001286622, intron 2 of 8) intron (NM_001286622, intron 2 of 8) -2076 NM_001286619 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 138.75-72 chr17 57385950 57386120 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 129016 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 163.25-136 chr8 27273595 27273910 + 1 NA Intergenic Intergenic -15348 NM_001283054 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 223.5-26 chr11 72923419 72923856 + 1 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) L1MB5|LINE|L1 109226 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 264.25-5 chr10 19141098 19141572 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 10 of 39) L1MB3|LINE|L1 92534 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 153.25-5 chr1 114876214 114876504 + 1 NA intron (NM_001282542, intron 10 of 30) intron (NM_001282542, intron 10 of 30) 21496 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 143.5-213 chr8 101960745 101961060 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 -23530 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 203.5-35 chr12 101811076 101811404 + 1 NA intron (NM_024312, intron 1 of 20) MER58B|DNA|hAT-Charlie 19719 NM_024312 79158 Hs.46850 NM_024312 ENSG00000111670 GNPTAB GNPTA|ICD N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta protein-coding 202.25-70 chr5 126488386 126488665 + 1 NA intron (NR_146196, intron 12 of 14) intron (NR_146196, intron 12 of 14) 23375 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 297.75-25 chr3 22183283 22183780 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 226392 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 310.25-4 chr11 35735152 35735618 + 1 NA intron (NM_017583, intron 3 of 4) intron (NM_017583, intron 3 of 4) 72610 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 192.5-132 chr8 114012471 114012739 + 1 NA Intergenic Intergenic -575666 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 278.75-44 chr9 108297569 108298116 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 558144 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 361.5-27 chr8 89052518 89053154 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 704875 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 126.5-217 chr6 161287858 161288021 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13878 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 164.5-166 chr5 124435107 124435415 + 1 NA intron (NR_125774, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 3259 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 124.25-192 chr7 110224235 110224434 + 1 NA Intergenic Intergenic -264121 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 203.75-69 chr3 87479401 87479729 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -202981 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 195.25-81 chr5 148781183 148781421 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -45291 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 216.75-48 chr3 3437355 3437749 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -257835 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 207.75-83 chr3 187253519 187253802 + 1 NA intron (NR_033519, intron 4 of 9) L1PA8|LINE|L1 -37612 NR_135551 101929130 NR_135551 ENSG00000283175 LOC101929130 - uncharacterized LOC101929130 ncRNA 206.75-21 chr15 45470742 45471110 + 1 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 37876 NR_030599 100126311 NR_030599 ENSG00000284386 MIR147B MIRN147B|mir-147b microRNA 147b ncRNA 140.5-226 chr8 42392572 42392792 + 1 NA intron (NM_001135694, intron 1 of 9) intron (NM_001135694, intron 1 of 9) 802 NM_005662 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 347.5-17 chr6 44643472 44643852 + 1 NA Intergenic Intergenic -91781 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 199.25-36 chr15 68843987 68844425 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -23311 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 187.25-12 chr10 51781162 51781382 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -81677 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 159.5-179 chr6 34337701 34337927 + 1 NA intron (NM_001202470, intron 6 of 8) intron (NM_001202470, intron 6 of 8) 54855 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 277.5-48 chr3 85144139 85144464 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -82037 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 212.25-46 chr2 133415922 133416385 + 1 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) L2b|LINE|L2 149958 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 208.25-12 chr10 4244306 4244804 + 1 NA promoter-TSS (NR_108040) promoter-TSS (NR_108040) -643 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 351.75-9 chr15 58049167 58049854 + 1 NA intron (NM_170696, intron 1 of 11) intron (NM_170696, intron 1 of 11) -15715 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 150.25-117 chr4 165359882 165360059 + 1 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -19038 NM_001873 1363 Hs.75360 NM_001873 ENSG00000109472 CPE CPH carboxypeptidase E protein-coding 192.5-70 chr2 121468010 121468345 + 1 NA intron (NM_015282, intron 9 of 38) L1PA11|LINE|L1 -62703 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 256.5-44 chr3 99486184 99486664 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -152170 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 144.25-77 chr17 66972768 66972987 + 1 NA intron (NM_014405, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 8170 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 119.25-64 chr15 68539688 68539847 + 1 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 21394 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 155.25-65 chr14 82083888 82084139 + 1 NA Intergenic Intergenic -340875 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 177.5-133 chr4 116372095 116372528 + 1 NA Intergenic (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72586 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 196.25-41 chr15 61107543 61107845 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 121608 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 239.75-23 chr14 88916368 88916703 + 1 NA Intergenic Intergenic 91884 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 165.75-166 chr8 88209446 88209635 + 1 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 117943 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 179.75-134 chr8 122170751 122170986 + 1 NA Intergenic Intergenic 397776 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 226.5-5 chr1 191506109 191506502 + 1 NA Intergenic Intergenic -277807 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 215.5-67 chr3 36482505 36482848 + 1 NA intron (NM_001292049, intron 2 of 8) intron (NM_001292049, intron 2 of 8) 102189 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 212.5-28 chr14 66658735 66659045 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1MD1|LINE|L1 151483 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 138.25-15 chr1 160862766 160862934 + 1 NA promoter-TSS (NM_016382) promoter-TSS (NM_016382) 37 NM_001166663 51744 Hs.157872 NM_016382 ENSG00000122223 CD244 2B4|NAIL|NKR2B4|Nmrk|SLAMF4 CD244 molecule protein-coding 207.75-74 chr3 66149626 66149976 + 1 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) MER94|DNA|hAT-Blackjack 16191 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 173.25-118 chr7 77511574 77512017 + 1 NA Intergenic Intergenic -25500 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 189.5-61 chr18 9998769 9998984 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 84860 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 162.5-81 chr2 52771579 52771817 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -69083 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 171.5-36 chr12 38525968 38526163 + 1 NA Intergenic Intergenic 209291 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 161.25-140 chr5 81602325 81602635 + 1 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR 148773 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 122.75-201 chr8 87846116 87846377 + 1 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 27769 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 149.5-19 chr10 15471065 15471299 + 1 NA Intergenic Intergenic -99893 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 209.75-111 chr9 119841571 119841886 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -93332 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 288.5-13 chr15 91149948 91150428 + 1 NA intron (NM_001323040, intron 2 of 12) AluSx1|SINE|Alu 48392 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 133.5-184 chr4 68047026 68047373 + 1 NA Intergenic Intergenic -6309 NR_046116 550113 Hs.130270 NR_046116 LOC550113 - uncharacterized LOC550113 ncRNA 205.5-115 chr5 55825361 55825647 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -25853 NM_139017 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 129.5-179 chr5 33653934 33654144 + 1 NA intron (NM_001324512, intron 7 of 21) L1MDa|LINE|L1 213263 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 169.5-135 chr5 51601152 51601350 + 1 NA Intergenic Intergenic 217803 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 208.5-137 chr8 47547456 47547830 + 1 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) AluSc|SINE|Alu -106445 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 136.5-128 chr2 240182834 240182985 + 1 NA Intergenic Intergenic -42251 NM_148961 150677 Hs.148586 NM_148961 ENSG00000178602 OTOS OTOSP otospiralin protein-coding 113.5-47 chr11 68459193 68459337 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1487 NM_001352361 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 215.25-100 chr7 27755183 27755687 + 1 NA intron (NM_001362794, intron 2 of 16) intron (NM_001362794, intron 2 of 16) 15340 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 271.5-77 chr6 125216590 125216971 + 1 NA intron (NM_001318907, intron 1 of 4) intron (NM_001318907, intron 1 of 4) 13069 NM_001318907 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 247.5-86 chr8 136449651 136449993 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -80976 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 139.5-57 chr13 56829354 56829585 + 1 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger -311449 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 226.5-16 chr12 40263013 40263320 + 1 NA intron (NM_198578, intron 13 of 50) intron (NM_198578, intron 13 of 50) 38169 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 118.5-206 chr8 14421786 14421968 + 1 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) intron (NM_001322881, intron 2 of 6) 431633 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 142.5-101 chr2 28773539 28773875 + 1 NA intron (NM_206876, intron 2 of 8) intron (NM_206876, intron 2 of 8) 21877 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 220.25-69 chr6 127123598 127123875 + 1 NA intron (NM_032784, intron 1 of 4) intron (NM_032784, intron 1 of 4) 5065 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 253.5-19 chr12 119058250 119058576 + 1 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 76872 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 286.5 chr1 30810919 30811287 + 1 NA Intergenic Intergenic -13549 NR_146732 105378622 Hs.209284 NR_146732 ENSG00000223382 LINC01778 - long intergenic non-protein coding RNA 1778 ncRNA 264.5-13 chr11 21786561 21786956 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -406327 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 224.5-95 chr6 142373458 142373866 + 1 NA intron (NM_198569, intron 4 of 24) AluJr4|SINE|Alu 71655 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 177.25-63 chr18 60232348 60232569 + 1 NA Intergenic Intergenic 140317 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 148.5-244 chr9 31701341 31701518 + 1 NA Intergenic LTR53B|LTR|ERVL -319939 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 167.5-14 chr1 175414940 175415191 + 1 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) -222078 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 258.25-53 chr7 12700687 12701278 + 1 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL 13349 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 227.5-26 chr12 96924453 96924795 + 1 NA intron (NM_001135177, intron 4 of 13) L1ME2|LINE|L1 17158 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 337.25-10 chr21 26811459 26811994 + 1 NA Intergenic Intergenic 33683 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 218.75-50 chr22 26588322 26588803 + 1 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 1570 NM_001362923 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 212.5-96 chr6 134046509 134046893 + 1 NA intron (NM_145176, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 5923 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 354.75-19 chr6 64918521 64919032 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 15 of 43) L2|LINE|L2 -382642 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 153.5-131 chr3 87371622 87371913 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -95183 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 173.5-105 chr3 150070024 150070259 + 1 NA Intergenic Intergenic -26302 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 324.5-14 chr17 66087713 66088090 + 1 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) L1MA8|LINE|L1 103991 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 164.5-54 chr14 43610420 43610714 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 896716 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 154.5-61 chr14 71672456 71672683 + 1 NA exon (NM_001354287, exon 12 of 24) exon (NM_001354287, exon 12 of 24) 86271 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 132.5-37 chr11 30587784 30588037 + 1 NA Intergenic Intergenic -1557 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 217.5-19 chr10 125724675 125725020 + 1 NA intron (NR_110859, intron 4 of 25) intron (NR_110859, intron 4 of 25) 5138 NR_110859 26098 Hs.468688 NM_015608 ENSG00000107938 EDRF1 C10orf137 erythroid differentiation regulatory factor 1 protein-coding 220.75-17 chr11 85712225 85712519 + 1 NA intron (NM_206930, intron 1 of 8) intron (NM_206930, intron 1 of 8) 6722 NM_001365829 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 154.5-27 chr10 78858115 78858387 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 209197 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 272.5-29 chr15 62565026 62565706 + 1 NA Intergenic Intergenic 79815 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 239.5-65 chr6 56422820 56423154 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -28859 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 269.25-54 chr8 67123802 67124332 + 1 NA intron (NM_001363133, intron 13 of 27) AluY|SINE|Alu 40219 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 113.75-213 chrX 98930588 98930746 + 1 NA Intergenic Intergenic -1366132 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 236.25-30 chr15 99169661 99170016 + 1 NA intron (NR_109947, intron 9 of 12) intron (NR_109947, intron 9 of 12) 64758 NM_145728 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 206.5-58 chr2 148925915 148926226 + 1 NA intron (NM_004522, intron 2 of 25) intron (NM_004522, intron 2 of 25) -21805 NR_111932 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 199.5-28 chr12 11833359 11833653 + 1 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 183652 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 187.5-107 chr21 19639754 19639996 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 259880 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 246.25-71 chr8 141071286 141071634 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -57129 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 257.5-30 chr2 32799824 32800186 + 1 NA intron (NM_017735, intron 16 of 19) MIR|SINE|MIR -25428 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 301.75-4 chr11 66617740 66618126 + 1 NA intron (NM_001198846, intron 1 of 1) intron (NM_001198846, intron 1 of 1) 1303 NM_006328 10432 Hs.533712 NM_006328 ENSG00000239306 RBM14 COAA|PSP2|SIP|SYTIP1|TMEM137 RNA binding motif protein 14 protein-coding 190.5-105 chr3 196065419 196065660 + 1 NA exon (NM_003234, exon 10 of 19) exon (NM_003234, exon 10 of 19) 16551 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 127.5-54 chr12 28510420 28510692 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 13 of 13) MLT2B4|LTR|ERVL -319818 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 245.5-34 chr2 79828500 79828925 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 37871 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 160.25-3 chr1 55200528 55200700 + 1 NA intron (NM_015306, intron 1 of 67) intron (NM_015306, intron 1 of 67) 14750 NM_015306 23358 Hs.477009 NM_015306 ENSG00000162402 USP24 - ubiquitin specific peptidase 24 protein-coding 203.5-11 chr1 161725028 161725357 + 1 NA intron (NM_001002901, intron 5 of 7) intron (NM_001002901, intron 5 of 7) 2539 NM_001288832 127943 Hs.517422 NM_001002901 ENSG00000162746 FCRLB FCRL2|FCRLM2|FCRLY|FREB-2|FREB2|FcRY Fc receptor like B protein-coding 186.75-110 chr8 72124324 72124714 + 1 NA Intergenic Intergenic -48935 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 204.25-50 chr2 22860221 22860461 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 323862 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 201.25-62 chr3 36748475 36748761 + 1 NA Intergenic Intergenic -8757 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 135.5-17 chr1 214748522 214748732 + 1 NA Intergenic Intergenic 145432 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 230.5-85 chr4 58857997 58858346 + 1 NA Intergenic Intergenic -126111 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 160.5-204 chr9 30365061 30365412 + 1 NA Intergenic Intergenic 43218 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 164.5-169 chr5 145304112 145304442 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 531065 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 184.5-128 chr5 149293832 149294101 + 1 NA intron (NM_152406, intron 1 of 18) MIRb|SINE|MIR 22107 NM_001323062 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 167.75-147 chr9 26983176 26983343 + 1 NA intron (NM_001099224, intron 4 of 13) intron (NM_001099224, intron 4 of 13) 22413 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 212.25-69 chr4 166388884 166389360 + 1 NA Intergenic Intergenic 515885 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 268.25-28 chr20 19842817 19843293 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -43466 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 141.25-168 chr7 29367965 29368287 + 1 NA intron (NM_001293072, intron 3 of 12) intron (NM_001293072, intron 3 of 12) -111586 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 192.5-17 chr10 77159874 77160169 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) intron (NM_001271519, intron 5 of 28) 19190 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 307.5-4 chr10 29349807 29350322 + 1 NA Intergenic Intergenic -59470 NR_110922 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 285.5-13 chr12 67863003 67863528 + 1 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 -65970 NR_120456 101927922 Hs.450769 NR_120456 ENSG00000255772 LINC01479 HRAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1479 ncRNA 152.25-11 chr1 241130364 241130588 + 1 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) -1796 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 247.25-56 chr7 4439975 4440263 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -242176 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 135.25-38 chr10 126531230 126531406 + 1 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) MER20|DNA|hAT-Charlie -9825 NM_001004298 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 158.75-96 chr2 227833912 227834350 + 1 NA Intergenic (TTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20289 NM_001130046 6364 Hs.75498 NM_004591 ENSG00000115009 CCL20 CKb4|Exodus|LARC|MIP-3-alpha|MIP-3a|MIP3A|SCYA20|ST38 C-C motif chemokine ligand 20 protein-coding 242.5-54 chr22 40466818 40467251 + 1 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) intron (NM_020831, intron 3 of 14) -3594 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 133.25-95 chr2 42226700 42226929 + 1 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) L1MA8|LINE|L1 -56583 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 298.75-37 chr8 141282023 141282540 + 1 NA Intergenic Intergenic -27652 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 126.5-107 chr2 28511028 28511206 + 1 NA intron (NM_001170585, intron 1 of 56) L1MEg|LINE|L1 15046 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 280.25-5 chr10 22436861 22437277 + 1 NA non-coding (NR_036533, exon 1 of 1) non-coding (NR_036533, exon 1 of 1) 860 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 165.75-122 chr4 111640209 111640461 + 1 NA Intergenic Intergenic -505119 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 207.25-4 chr1 111811882 111812419 + 1 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 44755 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 146.25-153 chr8 106858712 106858966 + 1 NA Intergenic Intergenic -88595 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 139.25-71 chr18 10814410 10814729 + 1 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) intron (NM_022068, intron 7 of 51) -54920 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 175.5-3 chr1 75189775 75189986 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 55492 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 145.75-152 chr7 43723717 43723997 + 1 NA intron (NM_001371314, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 5666 NR_135581 55744 Hs.268887 NM_018224 ENSG00000106603 COA1 C7orf44|MITRAC15 cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog protein-coding 170.5-193 chr8 121360944 121361238 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -278255 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 241.5-17 chr13 29159957 29160439 + 1 NA intron (NM_001033602, intron 3 of 13) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 135741 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 164.5-52 chr14 23652950 23653187 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 16704 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 187.25-71 chr3 2164828 2165277 + 1 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) AluSq2|SINE|Alu -20811 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 230.5-30 chr13 74722473 74722863 + 1 NA Intergenic Intergenic 169825 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 225.75-72 chr6 162120125 162120354 + 1 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu -606893 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 298.25-32 chr7 40829148 40829549 + 1 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) MER66D|LTR|ERV1 150591 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 223.5-125 chr8 21090061 21090330 + 1 NA Intergenic Intergenic 116209 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 174.75-106 chr6 96706536 96706795 + 1 NA Intergenic Intergenic 130812 NM_030784 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 138.5-90 chr18 56517716 56517952 + 1 NA Intergenic Intergenic 120758 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 272.5-58 chr6 47383171 47383663 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -73512 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 166.5-171 chr5 136957002 136957283 + 1 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -171055 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 246.5-22 chr14 28964419 28964756 + 1 NA Intergenic Intergenic -178800 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 152.75-155 chr8 126398439 126398613 + 1 NA Intergenic Intergenic 73031 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 185.25-18 chr12 22125071 22125379 + 1 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 79007 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 194.5-32 chr12 132089780 132090002 + 1 NA intron (NR_003290, intron 2 of 9) L1MA7|LINE|L1 5608 NR_003290 347918 Hs.122115 NM_182613 ENSG00000185684 EP400P1 EP400NL EP400 pseudogene 1 pseudo 195.75-55 chr18 72896290 72896733 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 27471 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 175.5-36 chr12 3737198 3737479 + 1 NA intron (NM_001144958, intron 1 of 19) L2c|LINE|L2 15771 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 240.5-103 chr8 73545552 73545815 + 1 NA intron (NM_001164382, intron 11 of 13) AluY|SINE|Alu 125609 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 238.25-13 chr11 96716758 96717164 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 208536 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 116.5-235 chr7 111618415 111618648 + 1 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -56014 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 200.5-82 chr21 30781659 30781979 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -26391 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 252.75-22 chr17 50657361 50657748 + 1 NA intron (NM_003786, intron 4 of 30) (CCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22673 NM_003786 8714 Hs.463421 NM_003786 ENSG00000108846 ABCC3 ABC31|EST90757|MLP2|MOAT-D|MRP3|cMOAT2 ATP binding cassette subfamily C member 3 protein-coding 195.75-46 chr15 69053653 69053943 + 1 NA intron (NM_024505, intron 14 of 15) intron (NM_024505, intron 14 of 15) -27052 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 129.75-192 chr8 142514742 142514968 + 1 NA intron (NM_001702, intron 18 of 30) intron (NM_001702, intron 18 of 30) 65206 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 120.25-215 chr8 104856088 104856233 + 1 NA Intergenic (TTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -267136 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 130.75-24 chr11 22377419 22377601 + 1 NA exon (NM_020346, exon 12 of 12) exon (NM_020346, exon 12 of 12) 39129 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 134.25-125 chr4 11138391 11138656 + 1 NA Intergenic Intergenic -230304 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 170.25-31 chr13 106404493 106404683 + 1 NA Intergenic Intergenic 28024 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 197.25-2 chr1 48649348 48649645 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 8 of 12) intron (NM_001323575, intron 8 of 12) 127395 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 145.75-49 chr15 101164370 101164563 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 87582 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 229.5-2 chr1 47596361 47596682 + 1 NA Intergenic Intergenic -159204 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 222.5-39 chr16 89081110 89081418 + 1 NA Intergenic Intergenic -12545 NM_001243279 197322 Hs.461727 NM_174917 ENSG00000176715 ACSF3 - acyl-CoA synthetase family member 3 protein-coding 151.5-85 chr2 114861728 114862144 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -28388 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 282.5-24 chr18 12943666 12944104 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4099 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 282.5-32 chr2 126342594 126342934 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -224779 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 271.25-33 chr3 14738740 14739215 + 1 NA intron (NM_001184957, intron 12 of 16) AluSx1|SINE|Alu 63836 NM_001184958 84077 Hs.661452 NM_032137 ENSG00000131379 C3orf20 - chromosome 3 open reading frame 20 protein-coding 218.25-106 chr9 30918897 30919437 + 1 NA Intergenic Intergenic 462323 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 268.25-7 chr11 130311320 130311638 + 1 NA intron (NR_163265, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 3233 NM_014155 29068 Hs.721470 NM_014155 ENSG00000196323 ZBTB44 BTBD15|HSPC063|ZNF851 zinc finger and BTB domain containing 44 protein-coding 150.25-33 chr11 76190002 76190279 + 1 NA intron (NM_004626, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 16362 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 196.25-123 chr9 92849851 92850079 + 1 NA intron (NM_001354537, intron 4 of 4) AluSz|SINE|Alu 28003 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 259.75-14 chr12 116280075 116280420 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3061 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 197.25-85 chr5 129391278 129391572 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 5722 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 185.75-102 chr6 20585998 20586213 + 1 NA intron (NM_017774, intron 4 of 15) L2|LINE|L2 51648 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 115.5-8 chr1 81428300 81428479 + 1 NA intron (NM_001366004, intron 2 of 27) intron (NM_001366004, intron 2 of 27) 121994 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 123.5-205 chr8 27819408 27819668 + 1 NA intron (NM_001278945, intron 6 of 7) L1M5|LINE|L1 18279 NM_001363040 55872 Hs.104741 NM_018492 ENSG00000168078 PBK CT84|HEL164|Nori-3|SPK|TOPK PDZ binding kinase protein-coding 235.75-56 chr5 28487121 28487568 + 1 NA Intergenic Intergenic -199679 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 221.5-37 chr18 54259918 54260206 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9417 NM_007195 11201 Hs.438533 NM_007195 ENSG00000101751 POLI RAD30B|RAD3OB|eta2 DNA polymerase iota protein-coding 160.25-146 chr7 17842591 17842818 + 1 NA intron (NM_001350862, intron 12 of 25) L1M4c|LINE|L1 97790 NM_001350867 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 207.75-56 chr2 76205881 76206299 + 1 NA Intergenic Intergenic -495175 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 231.75-28 chr17 62758990 62759396 + 1 NA intron (NM_001288779, intron 4 of 11) intron (NM_001288779, intron 4 of 11) 47447 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 202.25-52 chr3 61321655 61321888 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -70310 NR_148921 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 165.75-95 chr2 233289745 233289934 + 1 NA TTS (NR_003006) TTS (NR_003006) 1163 NR_003006 677772 Hs.689637 NR_003006 ENSG00000251791 SCARNA6 U88 small Cajal body-specific RNA 6 ncRNA 196.25-83 chr3 103409381 103409610 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 114621 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 193.5-11 chr1 112093214 112093584 + 1 NA Intergenic Intergenic 102863 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 200.5-24 chr11 122042217 122042511 + 1 NA intron (NR_137178, intron 3 of 4) intron (NR_137178, intron 3 of 4) 57480 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 177.5-150 chr6 49197445 49197756 + 1 NA Intergenic Intergenic 265653 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 160.75-150 chr8 56308616 56308836 + 1 NA intron (NM_001318050, intron 3 of 5) intron (NM_001318050, intron 3 of 5) 12050 NM_138969 195814 Hs.170673 NM_138969 ENSG00000170786 SDR16C5 EPHD-2|RDH#2|RDH-E2|RDHE2|retSDR2 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5 protein-coding 138.5-30 chr11 3741479 3741717 + 1 NA intron (NM_001365129, intron 11 of 31) AluSx1|SINE|Alu 55948 NR_157591 4928 Hs.524750 NM_005387 ENSG00000110713 NUP98 ADIR2|NUP196|NUP96 nucleoporin 98 protein-coding 166.25-3 chr1 34091743 34091940 + 1 NA intron (NM_052896, intron 1 of 69) L1M5|LINE|L1 73433 NM_001281956 114784 Hs.656915 NM_052896 ENSG00000121904 CSMD2 dJ1007G16.1|dJ1007G16.2|dJ947L8.1 CUB and Sushi multiple domains 2 protein-coding 118.25-207 chr8 127678095 127678252 + 1 NA Intergenic Intergenic 55794 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 144.75-69 chr17 62003616 62003792 + 1 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) intron (NM_005121, intron 9 of 29) 61574 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 243.75-4 chr1 186575492 186575793 + 1 NA Intergenic Intergenic 104781 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 184.5-142 chr7 88804704 88805036 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -9133 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 232.5-45 chr2 29893812 29894155 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) MIRb|SINE|MIR 27603 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 191.25-51 chr2 32709188 32709533 + 1 NA intron (NM_017735, intron 10 of 19) L1MD3|LINE|L1 74105 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 236.25-87 chr8 111178539 111178996 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 57436 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 199.75-29 chr14 69886285 69886532 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 6992 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 202.25-94 chr8 139526384 139526673 + 1 NA Intergenic Intergenic 176595 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 316.25-22 chr8 104647259 104647766 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -58488 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 231.75-65 chr6 96727305 96727621 + 1 NA Intergenic Intergenic 110014 NM_030784 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 203.25-32 chr12 123722586 123722893 + 1 NA intron (NM_012463, intron 3 of 19) intron (NM_012463, intron 3 of 19) 10386 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 151.5-149 chr5 28635463 28635694 + 1 NA Intergenic Intergenic -291292 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 128.5-34 chr10 100558571 100558749 + 1 NA 3' UTR (NM_017902, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_017902, exon 8 of 8) 22717 NM_017902 55662 Hs.500788 NM_017902 ENSG00000166135 HIF1AN FIH1 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha inhibitor protein-coding 155.5-32 chr10 103735964 103736249 + 1 NA intron (NM_014631, intron 3 of 13) intron (NM_014631, intron 3 of 13) -10673 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 120.25-184 chr6 69568591 69568787 + 1 NA Intergenic Intergenic 227777 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 175.25-122 chr5 119897632 119897999 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 268256 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 253.5-48 chr22 43789332 43789745 + 1 NA intron (NM_022785, intron 2 of 31) intron (NM_022785, intron 2 of 31) 22767 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 223.5-42 chr14 71349086 71349415 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) MER39|LTR|ERV1 28774 NM_001354285 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 166.5-91 chr19 31218426 31218694 + 1 NA intron (NR_138036, intron 2 of 4) L1MC1|LINE|L1 51050 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 283.25-39 chr8 86611328 86612026 + 1 NA intron (NM_019098, intron 13 of 17) intron (NM_019098, intron 13 of 17) 97242 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 191.75-66 chr2 83038495 83038788 + 1 NA Intergenic Intergenic 181838 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 212.25-35 chr16 79609778 79610101 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9202 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 185.25-93 chr4 179124970 179125333 + 1 NA Intergenic Intergenic -1217215 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 263.75-55 chr9 83437437 83437794 + 1 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) intron (NM_174938, intron 1 of 13) 30127 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 301.5-15 chr11 92297837 92298437 + 1 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) intron (NM_001367949, intron 1 of 27) -53959 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 203.75-32 chr14 70976689 70977087 + 1 NA intron (NM_014982, intron 5 of 35) intron (NM_014982, intron 5 of 35) 69429 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 143.25-14 chr10 27125181 27125350 + 1 NA intron (NM_139312, intron 10 of 19) L1ME4a|LINE|L1 -24767 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 119.5-219 chr7 95422507 95422741 + 1 NA intron (NM_000305, intron 2 of 8) intron (NM_000305, intron 2 of 8) 12404 NM_000305 5445 Hs.514420 NM_000305 ENSG00000105854 PON2 - paraoxonase 2 protein-coding 188.25-105 chr7 34847947 34848360 + 1 NA intron (NM_207172, intron 7 of 8) intron (NM_207172, intron 7 of 8) -13822 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 204.5-31 chr14 25120817 25121095 + 1 NA Intergenic Intergenic -70659 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 250.5-95 chr8 83235042 83235367 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -168554 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 181.75-126 chr8 100256938 100257302 + 1 NA TTS (NM_001353838) TTS (NM_001353838) 45073 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 166.75-79 chr2 146743213 146743479 + 1 NA Intergenic Intergenic 156289 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 293.75-12 chr14 73308311 73308863 + 1 NA intron (NM_001005745, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 -62586 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 329.5-20 chr5 31561084 31561554 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 29018 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 165.25-108 chr4 98909794 98910017 + 1 NA 5' UTR (NM_001331017, exon 2 of 8) 5' UTR (NM_001331017, exon 2 of 8) 19228 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 186.5-23 chr11 36837866 36838279 + 1 NA Intergenic Intergenic -239793 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 157.75-82 chr2 42353074 42353260 + 1 NA intron (NM_001319036, intron 3 of 3) intron (NM_001319036, intron 3 of 3) 6871 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 168.75-58 chr15 76756971 76757299 + 1 NA intron (NR_148227, intron 14 of 32) intron (NR_148227, intron 14 of 32) 104809 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 116.5-50 chr12 77650228 77650393 + 1 NA Intergenic Intergenic -180584 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 122.25-38 chr11 116221727 116221863 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -417627 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 186.5-115 chr5 170909263 170909550 + 1 NA intron (NM_022897, intron 5 of 27) intron (NM_022897, intron 5 of 27) 47388 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 254.75-42 chr5 86925719 86926217 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 179150 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 184.5-76 chr2 83941283 83941576 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -349253 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 252.5-55 chr3 100420973 100421268 + 1 NA intron (NM_001085451, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 19581 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 118.5-220 chr8 102607793 102607947 + 1 NA Intergenic Intergenic 46094 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 219.5-48 chr16 74448186 74448584 + 1 NA non-coding (NR_027265, exon 21 of 21) non-coding (NR_027265, exon 21 of 21) -26915 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 185.5-52 chr14 73935147 73935345 + 1 NA intron (NM_152445, intron 8 of 8) AluY|SINE|Alu -14688 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 208.25-101 chr9 90035213 90035703 + 1 NA intron (NR_038882, intron 2 of 3) intron (NR_038882, intron 2 of 3) 6041 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 232.5-112 chr9 121819814 121820395 + 1 NA Intergenic Intergenic 77319 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 121.75-70 chr19 36420400 36420662 + 1 NA promoter-TSS (NR_033748) promoter-TSS (NR_033748) -643 NR_033748 644189 Hs.608412 NR_033748 LOC644189 - acyl-CoA thioesterase 4 pseudogene pseudo 177.5-123 chr3 191083391 191083851 + 1 NA Intergenic Intergenic -115620 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 139.25-58 chr15 59751239 59751392 + 1 NA Intergenic Intergenic -61995 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 200.75-9 chr1 221521525 221521836 + 1 NA Intergenic Intergenic -185384 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 223.5-33 chr12 43101333 43101693 + 1 NA Intergenic Intergenic -53802 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 113.75-28 chr10 126667318 126667451 + 1 NA intron (NM_001350922, intron 1 of 8) intron (NM_001350922, intron 1 of 8) 3126 NM_001350921 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 348.75-19 chr7 68356349 68357133 + 1 NA Intergenic Intergenic 336488 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 167.25-106 chr3 76868328 76868556 + 1 NA Intergenic Intergenic -171657 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 308.5-29 chr5 61254953 61255502 + 1 NA intron (NR_146624, intron 1 of 2) intron (NR_146624, intron 1 of 2) 9702 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 131.75-120 chr21 26957385 26957581 + 1 NA intron (NM_007038, intron 1 of 7) intron (NM_007038, intron 1 of 7) 3522 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 146.5-125 chr20 49560685 49560953 + 1 NA intron (NM_000961, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 7318 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 143.25-64 chr16 65394404 65394624 + 1 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 181786 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 307.25-25 chr3 99472663 99473367 + 1 NA Intergenic Intergenic -165579 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 216.75-58 chr4 96087675 96088087 + 1 NA Intergenic Intergenic -222822 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 154.5-74 chr16 51941781 51941991 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 132049 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 273.75-14 chr15 89290735 89291373 + 1 NA intron (NM_001113378, intron 19 of 37) intron (NM_001113378, intron 19 of 37) 35756 NR_106824 102466983 NR_106824 ENSG00000275101 MIR6766 hsa-mir-6766 microRNA 6766 ncRNA 201.5-45 chr13 31699962 31700355 + 1 NA Intergenic Intergenic -39368 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 182.75-103 chr5 45303717 45304050 + 1 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) intron (NM_021072, intron 5 of 7) 392497 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 140.5-236 chr8 117566621 117566861 + 1 NA Intergenic Intergenic 46028 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 185.5-121 chr4 99012836 99013142 + 1 NA intron (NM_015143, intron 1 of 10) MER4D1|LTR|ERV1 15602 NR_037455 100500867 NR_037455 ENSG00000265213 MIR3684 - microRNA 3684 ncRNA 297.75-30 chr4 40851965 40852645 + 1 NA intron (NM_001166051, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 4850 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 128.25-220 chr9 78009144 78009490 + 1 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) (CCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22494 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 160.5-44 chr13 47030239 47030486 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -133286 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 127.25-150 chr4 114080200 114080542 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -100724 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 153.5-188 chr7 139230089 139230354 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1016 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 123.5-23 chr10 25670284 25670466 + 1 NA intron (NR_108069, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 18663 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 335.5-11 chr5 101149059 101149585 + 1 NA Intergenic Intergenic -246040 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 273.5-80 chr9 82677325 82677883 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 385538 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 134.5-251 chrX 132717501 132717706 + 1 NA intron (NM_001077188, intron 3 of 5) intron (NM_001077188, intron 3 of 5) 49961 NR_046691 100874102 Hs.619341 NR_046691 ENSG00000235849 HS6ST2-AS1 - HS6ST2 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-91 chr2 29800864 29801081 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 120614 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 132.5-121 chr2 76817968 76818185 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -167889 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 148.5-22 chr10 24071752 24071974 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -136928 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 172.5-208 chr8 140084394 140084599 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L2|LINE|L2 16039 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 370.25-3 chr14 46281070 46281576 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -190036 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 288.25-8 chr14 42228098 42228542 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 621464 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 186.5-31 chr12 75896478 75896848 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 135113 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 194.75-91 chr7 131006339 131006772 + 1 NA intron (NR_109850, intron 3 of 5) intron (NR_109850, intron 3 of 5) 93091 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 248.75-29 chr2 96128276 96128666 + 1 NA intron (NM_001002036, intron 8 of 8) L1M5|LINE|L1 9965 NM_001002036 431705 Hs.447993 NM_001002036 ENSG00000188886 ASTL SAS1B astacin like metalloendopeptidase protein-coding 342.25-17 chr7 122987087 122987780 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 8267 NM_016945 50833 Hs.272395 NM_016945 ENSG00000128519 TAS2R16 BGLPT|T2R16 taste 2 receptor member 16 protein-coding 236.5-28 chr14 64228716 64229175 + 1 NA intron (NM_001271876, intron 7 of 7) intron (NM_001271876, intron 7 of 7) 12991 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 225.75-29 chr16 17836648 17837010 + 1 NA Intergenic Intergenic -365869 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 182.75-23 chr10 26781856 26782043 + 1 NA intron (NM_001012752, intron 2 of 9) HERVL40-int|LTR|ERVL 79138 NM_001348032 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 180.5-102 chr3 158786929 158787268 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14956 NR_110328 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 146.25-100 chr3 94312115 94312285 + 1 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 249139 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 122.25-202 chr8 139913361 139913528 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 187091 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 148.5-163 chr4 36629836 36630038 + 1 NA intron (NR_149124, intron 1 of 4) intron (NR_149124, intron 1 of 4) 11963 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 130.5-130 chr2 56151052 56151265 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -32832 NM_001080433 114800 Hs.117136 NM_001080433 ENSG00000055813 CCDC85A - coiled-coil domain containing 85A protein-coding 124.25-213 chrX 17964911 17965076 + 1 NA Intergenic Intergenic -103656 NM_001172739 10742 Hs.446680 NM_021785 ENSG00000131831 RAI2 - retinoic acid induced 2 protein-coding 136.5-115 chr2 106663707 106663848 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 176413 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 158.5-109 chr2 192287473 192287676 + 1 NA Intergenic Intergenic -92641 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 159.75-30 chr11 95884393 95884726 + 1 NA intron (NM_201278, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR 39548 NM_001243571 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 243.75-39 chr2 9129523 9129839 + 1 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -77084 NM_001135191 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 160.25-85 chr22 25190307 25190697 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 9 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -9356 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 135.75-49 chr12 107645626 107645960 + 1 NA intron (NM_001018072, intron 14 of 16) intron (NM_001018072, intron 14 of 16) -39939 NM_001317963 11137 Hs.506652 NM_007062 ENSG00000136045 PWP1 IEF-SSP-9502 PWP1 homolog, endonuclein protein-coding 166.5-99 chr2 46591408 46591754 + 1 NA intron (NM_173074, intron 5 of 6) L1M5|LINE|L1 -11343 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 371.75-12 chr3 107755416 107756068 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 10 of 16) intron (NM_001276286, intron 10 of 16) 122326 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 181.5-52 chr16 5466569 5466834 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 149549 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 197.75-12 chr11 93034980 93035330 + 1 NA Intergenic Intergenic 65532 NM_005959 4544 Hs.569039 NM_005959 ENSG00000134640 MTNR1B FGQTL2|MEL-1B-R|MT2 melatonin receptor 1B protein-coding 156.25-92 chr3 15658750 15659095 + 1 NA intron (NM_001370752, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 38449 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 207.5-17 chr12 26153262 26153528 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -28358 NM_030762 79365 Hs.177841 NM_030762 ENSG00000123095 BHLHE41 BHLHB3|DEC2|SHARP1|hDEC2 basic helix-loop-helix family member e41 protein-coding 193.75-72 chr2 212850924 212851359 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 55810 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 116.5-13 chr1 186671118 186671279 + 1 NA TTS (NM_000963) TTS (NM_000963) 9225 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 305.5-46 chr7 33982575 33983174 + 1 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) MER110A|LTR|ERV1 77335 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 337.5-22 chr4 59413521 59414132 + 1 NA Intergenic Intergenic 400253 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 142.25-134 chr5 23974628 23974880 + 1 NA intron (NR_131245, intron 1 of 4) L1M4b|LINE|L1 23406 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 147.5-216 chr8 137496675 137496841 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -83170 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 483.25 chr11 29852421 29853186 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 129590 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 193.25-16 chr10 96395740 96395987 + 1 NA intron (NM_012465, intron 12 of 20) intron (NM_012465, intron 12 of 20) -36498 NM_001040102 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 127.5-50 chr12 2014559 2014725 + 1 NA Intergenic Intergenic -10107 NR_135060 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 228.25-12 chr10 67249591 67250041 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 153594 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 180.75-4 chr1 78893308 78893516 + 1 NA intron (NM_022159, intron 12 of 14) intron (NM_022159, intron 12 of 14) 113318 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 262.5-25 chr16 5222774 5223234 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -125184 NM_201598 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 125.5-168 chr3 23502733 23502953 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 4 of 5) intron (NM_001370225, intron 4 of 5) 299516 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 354.5-17 chr6 144702690 144703387 + 1 NA intron (NM_007124, intron 52 of 73) L2a|LINE|L2 297383 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 308.5-21 chr22 35105999 35106707 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 40195 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 134.75-30 chr10 86720002 86720197 + 1 NA intron (NM_001368066, intron 13 of 14) intron (NM_001368066, intron 13 of 14) -36540 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 133.25-80 chr17 80789839 80790026 + 1 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 15700 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 157.5-230 chr9 135085332 135085686 + 1 NA intron (NM_014279, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR -1751 NM_001282612 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 226.5-36 chr19 36392612 36393003 + 1 NA exon (NM_133466, exon 5 of 5) exon (NM_133466, exon 5 of 5) -13606 NM_001297619 57677 Hs.35524 NM_020917 ENSG00000142065 ZFP14 ZNF531 ZFP14 zinc finger protein protein-coding 160.5-164 chr6 155575338 155575556 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 60603 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 178.5-67 chr17 66304769 66304972 + 1 NA intron (NM_002737, intron 1 of 16) intron (NM_002737, intron 1 of 16) 2257 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 180.75-49 chr17 30950184 30950501 + 1 NA intron (NR_144488, intron 6 of 9) MIR3|SINE|MIR -20697 NM_197939 84282 Hs.29874 NM_032322 ENSG00000181481 RNF135 L13|MMFD|REUL|Riplet ring finger protein 135 protein-coding 238.75-39 chr4 33479403 33479795 + 1 NA Intergenic Intergenic 560294 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 166.75-43 chr14 21893575 21893896 + 1 NA Intergenic Intergenic -222718 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 173.25-107 chr6 43491541 43491737 + 1 NA intron (NM_001350567, intron 2 of 10) intron (NM_001350567, intron 2 of 10) 1881 NM_001350565 93643 Hs.520145 NM_080604 ENSG00000137221 TJAP1 PILT|TJP4 tight junction associated protein 1 protein-coding 158.5-185 chr8 22120839 22121028 + 1 NA exon (NM_005144, exon 11 of 19) exon (NM_005144, exon 11 of 19) 10119 NM_018411 55806 Hs.272367 NM_005144 ENSG00000168453 HR ALUNC|AU|HSA277165|HYPT4|MUHH|MUHH1 HR lysine demethylase and nuclear receptor corepressor protein-coding 129.5-182 chr5 53044372 53044581 + 1 NA intron (NR_073106, intron 3 of 29) intron (NR_073106, intron 3 of 29) 55124 NR_073106 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 149.25-97 chr20 10319482 10319781 + 1 NA Intergenic Intergenic -100125 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 232.25-22 chr14 43294643 43295002 + 1 NA Intergenic Intergenic 1212461 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 145.75-54 chr16 67036588 67036849 + 1 NA exon (NM_001368710, exon 3 of 5) exon (NM_001368710, exon 3 of 5) 7569 NM_001368707 865 Hs.460988 NM_001755 ENSG00000067955 CBFB PEBP2B core-binding factor subunit beta protein-coding 204.25-67 chr22 19866861 19867079 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12096 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 234.75-19 chr14 47204002 47204577 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 138957 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 181.75-71 chr21 24582331 24582725 + 1 NA Intergenic Intergenic 153788 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 152.5-78 chr2 16514932 16515170 + 1 NA Intergenic Intergenic 150783 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 169.5-41 chr13 38030555 38030946 + 1 NA Intergenic Intergenic 112482 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 224.25-70 chr4 100193778 100194125 + 1 NA non-coding (NR_125924, exon 4 of 5) non-coding (NR_125924, exon 4 of 5) -3483 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 141.5-106 chr2 124174796 124174982 + 1 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 149602 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 123.75 chr1 15635801 15636092 + 1 NA intron (NM_032341, intron 4 of 9) intron (NM_032341, intron 4 of 9) 18488 NM_032341 84301 Hs.718857 NM_032341 ENSG00000197312 DDI2 - DNA damage inducible 1 homolog 2 protein-coding 185.5-159 chr8 50165608 50165968 + 1 NA intron (NM_001321778, intron 1 of 16) intron (NM_001321778, intron 1 of 16) 1657 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 156.25-59 chr19 43778469 43778681 + 1 NA intron (NM_002250, intron 1 of 8) intron (NM_002250, intron 1 of 8) 2398 NM_002250 3783 Hs.10082 NM_002250 ENSG00000104783 KCNN4 DHS2|IK|IK1|IKCA1|KCA4|KCa3.1|SK4|hIKCa1|hKCa4|hSK4 potassium calcium-activated channel subfamily N member 4 protein-coding 179.25-111 chr4 52879309 52879658 + 1 NA intron (NM_152540, intron 8 of 8) intron (NM_152540, intron 8 of 8) 17166 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 143.25-125 chr3 113396918 113397103 + 1 NA intron (NM_001164496, intron 13 of 34) L2c|LINE|L2 -6988 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 187.25-56 chr2 73341025 73341392 + 1 NA Intergenic Intergenic -44550 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 185.5-66 chr17 9007933 9008148 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13470 NM_004822 9423 Hs.660885 NM_004822 ENSG00000065320 NTN1 MRMV4|NTN1L netrin 1 protein-coding 212.5-120 chr8 86828237 86828639 + 1 NA Intergenic Intergenic -37977 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 124.5-205 chr7 33135422 33135658 + 1 NA intron (NM_001348044, intron 1 of 18) L1MB7|LINE|L1 5976 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 198.5-109 chr4 119544999 119545226 + 1 NA intron (NM_033437, intron 9 of 20) intron (NM_033437, intron 9 of 20) 82625 NM_033430 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 168.75-51 chr15 63659347 63659639 + 1 NA intron (NM_003922, intron 47 of 77) AluJr4|SINE|Alu -58666 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 288.25-18 chr3 50363319 50363752 + 1 NA 3' UTR (NM_001174051, exon 39 of 39) 3' UTR (NM_001174051, exon 39 of 39) -1828 NR_111913 11068 Hs.149443 NM_007022 ENSG00000114395 CYB561D2 101F6|TSP10|XXcos-LUCA11.4 cytochrome b561 family member D2 protein-coding 207.5-88 chr5 89412071 89412439 + 1 NA intron (NR_136221, intron 5 of 6) intron (NR_136221, intron 5 of 6) -508150 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 205.25-38 chr17 69871410 69871738 + 1 NA intron (NR_109972, intron 4 of 4) intron (NR_109972, intron 4 of 4) -90133 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 148.5-98 chr2 51118601 51118887 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 86143 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 166.5-84 chr17 58176692 58177024 + 1 NA Intergenic Intergenic 7202 NM_001004707 124538 Hs.446879 NM_001004707 ENSG00000255713 OR4D2 BC2009|OR17-24 olfactory receptor family 4 subfamily D member 2 protein-coding 231.25-5 chr10 10867373 10867700 + 1 NA intron (NM_001326328, intron 2 of 15) intron (NM_001326328, intron 2 of 15) 68811 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 121.25-42 chr12 39080861 39081018 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -175348 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 199.25-19 chr12 31581039 31581333 + 1 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -8737 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 208.5-113 chr5 133601026 133601252 + 1 NA intron (NM_015082, intron 2 of 15) intron (NM_015082, intron 2 of 15) 11402 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 175.75-67 chr2 71070529 71070876 + 1 NA intron (NM_001365466, intron 2 of 9) intron (NM_001365466, intron 2 of 9) 2054 NM_001330425 55577 Hs.7036 NM_017567 ENSG00000124357 NAGK GNK|HSA242910 N-acetylglucosamine kinase protein-coding 190.25-122 chr8 87155164 87155577 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L2c|LINE|L2 288955 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 132.75-150 chr5 39959323 39959492 + 1 NA Intergenic Intergenic -92884 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 170.5-101 chr2 181797981 181798270 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -93605 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 179.5-31 chr10 125466852 125467165 + 1 NA Intergenic Intergenic -107363 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 134.5-205 chr7 33889034 33889396 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15700 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 267.5-78 chr9 107090319 107090623 + 1 NA intron (NR_126029, intron 3 of 4) L1MD1|LINE|L1 12517 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 251.5-14 chr11 42790124 42790425 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 479095 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 176.5-133 chr4 47791732 47792050 + 1 NA intron (NM_006587, intron 2 of 21) L2c|LINE|L2 -39454 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 236.75-6 chr1 185923491 185923809 + 1 NA exon (NM_031935, exon 8 of 107) exon (NM_031935, exon 8 of 107) 189259 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 200.25-35 chr14 52602161 52602408 + 1 NA intron (NM_001099652, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 49448 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 168.5-147 chr5 41962731 41962994 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 37581 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 121.5-48 chr11 95477591 95477740 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -245190 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 143.5-142 chr3 62041629 62041863 + 1 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) (GAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 277201 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 117.25-154 chr4 49642599 49642782 + 1 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 656048 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 238.5-74 chr5 132927468 132927722 + 1 NA intron (NM_014423, intron 4 of 20) MIR|SINE|MIR 36039 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 114.5-57 chr11 100998943 100999168 + 1 NA Intergenic Intergenic 64781 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 154.25-98 chr20 46282064 46282238 + 1 NA intron (NM_021248, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 26347 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 235.75-52 chr4 48403932 48404327 + 1 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) L1PA10|LINE|L1 62600 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 153.75-22 chr10 101472842 101473041 + 1 NA intron (NM_003939, intron 2 of 13) L1ME2|LINE|L1 115316 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 160.25-64 chr19 5938876 5939169 + 1 NA intron (NM_003624, intron 5 of 16) AluSq|SINE|Alu 24768 NM_004058 828 Hs.584744 NM_004058 ENSG00000105519 CAPS CAPS1 calcyphosine protein-coding 250.5-59 chr3 7044998 7045301 + 1 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -151132 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 144.5-107 chr2 102588910 102589127 + 1 NA Intergenic Intergenic -30535 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 194.75-83 chr6 69389126 69389634 + 1 NA 3' UTR (NM_001704, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_001704, exon 32 of 32) 407086 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 156.25-132 chr6 70076970 70077230 + 1 NA intron (NM_001858, intron 15 of 50) intron (NM_001858, intron 15 of 50) 206097 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 227.5-55 chr2 83047384 83047781 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 190779 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 239.25-65 chr4 104417763 104418083 + 1 NA Intergenic Intergenic -73042 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-168 chr5 125818944 125819187 + 1 NA Intergenic Intergenic 325804 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 221.25-12 chr10 81451858 81452447 + 1 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -423042 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 344.75-10 chr4 57835169 57835839 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 409632 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 112.75-194 chr7 102390186 102390377 + 1 NA intron (NR_038967, intron 4 of 8) MER81|DNA|hAT-Blackjack -6082 NM_024653 79706 Hs.722104 NM_024653 ENSG00000128563 PRKRIP1 C114|KRBOX3 PRKR interacting protein 1 protein-coding 274.25-38 chr5 148436088 148436379 + 1 NA intron (NM_001271723, intron 16 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 52275 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 239.75-58 chr5 58275857 58276150 + 1 NA Intergenic Intergenic -153662 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 179.75-49 chr18 78194768 78195054 + 1 NA Intergenic Intergenic -201184 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 112.5-38 chr11 93680103 93680335 + 1 NA intron (NM_033395, intron 7 of 29) AluJb|SINE|Alu 18537 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 253.5-27 chr14 71769198 71769584 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -162780 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 192.5-134 chr8 129117420 129117705 + 1 NA Intergenic Intergenic 123678 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 212.25-39 chr18 63342871 63343296 + 1 NA intron (NM_002035, intron 7 of 9) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -23703 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 137.5-193 chr5 85854429 85854676 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -427892 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 196.25-81 chr3 33150589 33150837 + 1 NA 3' UTR (NM_015551, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_015551, exon 5 of 5) 36755 NM_006371 10491 Hs.517888 NM_006371 ENSG00000170275 CRTAP CASP|LEPREL3|OI7|P3H5 cartilage associated protein protein-coding 206.75-20 chr15 25342360 25342655 + 1 NA intron (NM_001354542, intron 10 of 11) intron (NM_001354542, intron 10 of 11) 64164 NR_001289 338429 NR_001289 ENSG00000239169 SNORD109B HBII-438B small nucleolar RNA, C/D box 109B snoRNA 150.5-177 chr5 121337987 121338201 + 1 NA Intergenic Intergenic 15544 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 188.5-72 chr2 70276599 70276921 + 1 NA exon (NM_016297, exon 6 of 6) exon (NM_016297, exon 6 of 6) 16464 NM_001317167 6637 Hs.465167 NM_003096 ENSG00000143977 SNRPG SMG|Sm-G small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G protein-coding 175.5-109 chr22 28070393 28070587 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -149878 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 119.5-185 chr5 115249842 115250114 + 1 NA intron (NM_005023, intron 2 of 8) intron (NM_005023, intron 2 of 8) 12899 NM_005023 5229 Hs.254006 NM_005023 ENSG00000164219 PGGT1B BGGI|GGTI protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta protein-coding 363.75-6 chr16 84972786 84973193 + 1 NA Intergenic Intergenic 38546 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 180.5-61 chr17 68357633 68357914 + 1 NA intron (NM_001352904, intron 6 of 12) MER102c|DNA|hAT-Charlie -55850 NM_001278433 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 334.5-24 chr4 101966830 101967221 + 1 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 153183 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 140.75-56 chr15 47875435 47875602 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -29282 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 193.5-88 chr2 109162581 109162894 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) L1PA4|LINE|L1 -21149 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 260.5-20 chr17 66038595 66038922 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 12 of 26) intron (NM_001353129, intron 12 of 26) 153134 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 395.75-3 chr12 39008873 39009536 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -103613 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 435.25-4 chr3 132867823 132868825 + 1 NA intron (NR_002811, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR -145865 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 241.25-52 chr4 92057308 92057577 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 219860 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 199.5-118 chr5 42404698 42405050 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -18565 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 275.25-46 chr8 107210902 107211618 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 125255 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 180.75-144 chr8 52691582 52691860 + 1 NA intron (NM_001083617, intron 1 of 23) intron (NM_001083617, intron 1 of 23) 22714 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 117.75-202 chr7 111787327 111787527 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 32 of 52) intron (NM_001363540, intron 32 of 52) -21078 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 337.5-3 chr1 188712823 188713459 + 1 NA Intergenic Intergenic 1269513 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 168.25-65 chr2 3513383 3513731 + 1 NA intron (NM_001306077, intron 2 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 4190 NM_001306077 55256 Hs.502773 NM_018269 ENSG00000182551 ADI1 APL1|ARD|Fe-ARD|HMFT1638|MTCBP1|Ni-ARD|SIPL|mtnD acireductone dioxygenase 1 protein-coding 150.5-82 chr2 4744914 4745108 + 1 NA Intergenic Intergenic -88789 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 223.5-53 chr18 59585449 59585974 + 1 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) intron (NM_133459, intron 2 of 10) 111712 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 124.75-75 chr14 45677624 45677814 + 1 NA Intergenic Intergenic 37883 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 165.25-8 chr1 200311871 200312113 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 61800 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 129.5-46 chr11 110864563 110864882 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -151533 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 188.75-112 chr8 54863757 54864145 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -238077 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 167.5-113 chr22 25079820 25080155 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 32705 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 186.5-36 chr14 50195133 50195393 + 1 NA intron (NM_006939, intron 4 of 22) L3|LINE|CR1 36315 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 156.25-144 chr8 26182253 26182532 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -109116 NM_002717 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 134.25-55 chr15 38932380 38932622 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 235903 NR_160786 181.75-134 chr8 131001754 131002119 + 1 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 38973 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 490.75 chr2 54728391 54729342 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) intron (NM_001039753, intron 1 of 40) 3854 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 179.5-26 chr10 71453957 71454216 + 1 NA intron (NM_052836, intron 3 of 12) intron (NM_052836, intron 3 of 12) 57152 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 215.5-91 chr5 96562344 96562699 + 1 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) L1ME4b|LINE|L1 -99516 NM_001190442 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 165.75-118 chr4 63911161 63911409 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 498165 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 178.5-47 chr14 45210310 45210583 + 1 NA exon (NM_018353, exon 14 of 17) exon (NM_018353, exon 14 of 17) 42756 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 248.5-104 chr8 132068672 132069240 + 1 NA intron (NM_001145095, intron 14 of 15) intron (NM_001145095, intron 14 of 15) -9574 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 138.75-145 chr5 45358535 45358886 + 1 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) LTR49|LTR|ERV1 337670 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 219.5-43 chr14 68476225 68476627 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 152361 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 216.5-130 chr9 76914526 76914781 + 1 NA Intergenic Intergenic -8539 NM_015225 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 168.75-89 chr22 44786343 44786764 + 1 NA exon (NM_001198726, exon 2 of 11) exon (NM_001198726, exon 2 of 11) 33995 NM_181335 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 241.25-68 chr8 57812439 57812852 + 1 NA Intergenic Intergenic 66496 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 393.25 chr16 4216595 4217188 + 1 NA intron (NM_001323667, intron 1 of 6) intron (NM_001323667, intron 1 of 6) 25189 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 252.75-77 chr9 24844249 24844637 + 1 NA Intergenic Intergenic -298546 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 156.5-100 chr21 29404925 29405124 + 1 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 32523 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 181.5-71 chr2 37001592 37001801 + 1 NA intron (NM_019024, intron 32 of 35) AluSx|SINE|Alu -35160 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 172.5-105 chr2 200434577 200434818 + 1 NA intron (NM_001100424, intron 6 of 11) L1M4a1|LINE|L1 75371 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 188.75-41 chr17 39389778 39390070 + 1 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) intron (NM_001370209, intron 1 of 13) 11702 NM_032875 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 153.5-116 chr20 44399526 44399747 + 1 NA intron (NM_001287183, intron 2 of 10) (CTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1603 NM_001258355 3172 Hs.116462 NM_000457 ENSG00000101076 HNF4A FRTS4|HNF4|HNF4a7|HNF4a8|HNF4a9|HNF4alpha|MODY|MODY1|NR2A1|NR2A21|TCF|TCF14 hepatocyte nuclear factor 4 alpha protein-coding 140.5-77 chr16 27495461 27495704 + 1 NA intron (NM_001520, intron 14 of 36) L2a|LINE|L2 -42189 NR_037158 283888 Hs.660935 NR_037158 ENSG00000259954 IL21R-AS1 - IL21R antisense RNA 1 ncRNA 118.5-150 chr4 91957378 91957558 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 319834 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 180.5-90 chr22 34636251 34636580 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 361501 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 224.25 chr1 23669813 23670083 + 1 NA Intergenic Intergenic -21831 NM_001199802 6135 Hs.719951 NM_000975 ENSG00000142676 RPL11 DBA7|GIG34|L11|uL5 ribosomal protein L11 protein-coding 173.5-103 chr3 141395298 141395606 + 1 NA intron (NM_001350099, intron 2 of 5) LTR54B|LTR|ERV1 -6897 NM_001350100 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 311.5-18 chr2 199968329 199968703 + 1 NA Intergenic Intergenic -13025 NM_001039693 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 176.75-4 chr1 69359055 69359348 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -74054 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 119.5-106 chr18 3242846 3243056 + 1 NA Intergenic Intergenic -4531 NM_001303048 10627 Hs.190086 NM_006471 ENSG00000101608 MYL12A HEL-S-24|MLC-2B|MLCB|MRCL3|MRLC3|MYL2B myosin light chain 12A protein-coding 233.25-73 chr8 138349694 138349948 + 1 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) intron (NM_015912, intron 2 of 19) 147440 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 276.75-12 chr16 27171724 27172449 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -31440 NM_024773 79831 Hs.145717 NM_024773 ENSG00000155666 KDM8 JMJD5 lysine demethylase 8 protein-coding 180.25-125 chr8 141264713 141264942 + 1 NA Intergenic Intergenic -10198 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 241.75-19 chr12 41437063 41437408 + 1 NA promoter-TSS (NM_013377) promoter-TSS (NM_013377) -504 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 222.5-92 chr6 21527659 21527921 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15898 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 171.25-23 chr10 125756504 125756693 + 1 NA intron (NR_110859, intron 24 of 25) L1MCc|LINE|L1 -4538 NR_120633 101927983 Hs.634269 NR_120633 ENSG00000236991 EDRF1-AS1 - EDRF1 antisense RNA 1 ncRNA 356.25 chr1 67718832 67719294 + 1 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 33862 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 251.75-55 chr3 141738986 141739284 + 1 NA intron (NM_001201370, intron 1 of 1) intron (NM_001201370, intron 1 of 1) 837 NM_014245 9616 Hs.134623 NM_014245 ENSG00000114125 RNF7 CKBBP1|ROC2|SAG|rbx2 ring finger protein 7 protein-coding 290.5-40 chr7 32575494 32575953 + 1 NA intron (NM_015060, intron 12 of 15) MIR3|SINE|MIR 80234 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 285.5-18 chr14 34915575 34915917 + 1 NA TTS (NR_151701) TTS (NR_151701) -24176 NR_002937 280655 Hs.639271 NR_002937 IGBP1P1 C14orf19 immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 pseudogene 1 pseudo 236.5-102 chr8 139946998 139947477 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 153298 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 131.5-139 chr20 41621603 41621742 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -3295 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 167.5-136 chr5 14846214 14846495 + 1 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) -20342 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 288.5-14 chr15 93615231 93615804 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -241043 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 118.75-22 chr10 63211423 63211654 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 7 of 24) intron (NM_001322258, intron 7 of 24) 57685 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 132.5-221 chr7 17171250 17171507 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -127274 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 139.75-185 chr9 26848227 26848366 + 1 NA intron (NM_001167575, intron 5 of 5) AluY|SINE|Alu 44506 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 293.5-40 chr8 80517394 80517796 + 1 NA intron (NM_001105539, intron 3 of 5) intron (NM_001105539, intron 3 of 5) 31369 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 147.5-89 chr2 5831650 5831855 + 1 NA Intergenic Intergenic -19156 NR_146954 105373400 Hs.97467 NR_146954 ENSG00000237266 LINC01810 - long intergenic non-protein coding RNA 1810 ncRNA 219.5-97 chr5 21438651 21438962 + 1 NA Intergenic Intergenic -20674 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 137.5-133 chr2 170086394 170086556 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -91672 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 131.5-146 chr22 30935137 30935441 + 1 NA exon (NM_014941, exon 19 of 27) exon (NM_014941, exon 19 of 27) 12981 NR_026920 150291 Hs.592202 NM_153044 ENSG00000235989 MORC2-AS1 C22orf27|NCRNA00325 MORC2 antisense RNA 1 ncRNA 193.25-118 chr8 110544603 110545216 + 1 NA Intergenic Intergenic 482524 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 198.5-102 chr4 24630335 24630653 + 1 NA Intergenic Intergenic -45940 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 182.25-88 chr4 185551325 185551643 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -15926 NM_001257962 27295 Hs.701364 NM_014476 ENSG00000154553 PDLIM3 ALP PDZ and LIM domain 3 protein-coding 121.75-66 chr18 60213481 60213772 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 159149 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 173.5-78 chr2 190341591 190341912 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1838 NM_001128928 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 410.25-10 chr6 99577278 99578006 + 1 NA Intergenic Intergenic -8828 NM_001363537 892 Hs.430646 NM_005190 ENSG00000112237 CCNC CycC|SRB11|hSRB11 cyclin C protein-coding 122.75-174 chr6 15334200 15334376 + 1 NA intron (NM_001267040, intron 1 of 17) intron (NM_001267040, intron 1 of 17) 85433 NM_001267040 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 127.5-111 chr2 47685496 47685671 + 1 NA Intergenic Intergenic -97499 NM_001281493 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 190.25-10 chr1 182864335 182864779 + 1 NA intron (NM_001357, intron 12 of 27) intron (NM_001357, intron 12 of 27) -24966 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 132.5-250 chr8 138963271 138963443 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -49316 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 122.5-28 chr10 92177772 92177928 + 1 NA intron (NM_001178137, intron 4 of 9) intron (NM_001178137, intron 4 of 9) 65429 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 143.75-46 chr13 56572139 56572323 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -568687 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 204.75-128 chr9 70995605 70995858 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 125890 NM_001366150 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 192.5-21 chr10 116475607 116475954 + 1 NA intron (NM_001011709, intron 10 of 11) L2a|LINE|L2 47933 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 126.5-101 chr19 44528498 44528731 + 1 NA intron (NM_001102597, intron 1 of 11) intron (NM_001102597, intron 1 of 11) 1061 NM_001102599 125931 Hs.689632 NM_198444 ENSG00000273777 CEACAM20 UNQ9366 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 20 protein-coding 217.5-47 chr15 62993942 62994394 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -48579 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 189.5-99 chr4 52914778 52915030 + 1 NA intron (NM_152540, intron 6 of 8) intron (NM_152540, intron 6 of 8) 52587 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 205.75-51 chr4 58203965 58204280 + 1 NA Intergenic Intergenic 332206 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 162.25-96 chr20 13909725 13909969 + 1 NA intron (NR_073206, intron 6 of 20) AluSx|SINE|Alu 80767 NM_001271539 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 246.75-17 chr14 20116187 20116579 + 1 NA Intergenic Intergenic -1085 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 134.25-127 chr4 31297047 31297427 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 126093 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 292.25-4 chr1 94896722 94897228 + 1 NA TTS (NM_001286056) TTS (NM_001286056) 28833 NM_001286056 1266 Hs.483454 NM_001839 ENSG00000117519 CNN3 - calponin 3 protein-coding 152.25-28 chr10 114967552 114967790 + 1 NA intron (NM_139169, intron 4 of 7) intron (NM_139169, intron 4 of 7) -26986 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 182.25-105 chr6 151551703 151551953 + 1 NA intron (NM_025059, intron 5 of 10) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 57811 NM_025059 80129 Hs.660044 NM_025059 ENSG00000120262 CCDC170 C6orf97|bA282P11.1 coiled-coil domain containing 170 protein-coding 181.5-29 chr12 10280364 10280664 + 1 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) intron (NM_001351060, intron 2 of 8) -23932 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 221.5-27 chr14 67136089 67136539 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 16 of 21) intron (NM_001024218, intron 16 of 21) -53126 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 146.5-97 chr19 53191334 53191512 + 1 NA intron (NM_001353458, intron 1 of 4) intron (NM_001353458, intron 1 of 4) 1935 NM_001353458 79788 Hs.745230 NM_024733 ENSG00000197497 ZNF665 ZFP160L zinc finger protein 665 protein-coding 137.5-150 chr21 46012198 46012387 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 30543 NM_001848 1291 Hs.474053 NM_001848 ENSG00000142156 COL6A1 BTHLM1|OPLL|UCHMD1 collagen type VI alpha 1 chain protein-coding 200.75-90 chr5 160009482 160009825 + 1 NA intron (NM_003314, intron 1 of 7) MER5B|DNA|hAT-Charlie 514 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 128.75-111 chr20 51384172 51384358 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68712 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 196.5-17 chr10 32627836 32628172 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1MA7|LINE|L1 181864 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 180.5-110 chr4 33087343 33087625 + 1 NA Intergenic Intergenic 736446 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 155.5-98 chr2 123901586 123901919 + 1 NA Intergenic Intergenic 123422 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 206.25-106 chr7 107717906 107718237 + 1 NA TTS (NM_000441) TTS (NM_000441) 25561 NR_144536 101927974 Hs.432792 NR_144536 ENSG00000241764 LOC101927974 - uncharacterized LOC101927974 ncRNA 132.5-223 chr7 26231020 26231212 + 1 NA Intergenic Intergenic 29371 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 227.5-62 chr20 55363933 55364281 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -58936 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 338.75-8 chr15 67205469 67206080 + 1 NA intron (NM_001271885, intron 7 of 9) L2-3_Crp|LINE|L2 39619 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 137.25-37 chr12 82388876 82389097 + 1 NA intron (NR_144942, intron 2 of 10) intron (NR_144942, intron 2 of 10) -30181 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 127.25-181 chr6 124791737 124791961 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 5 of 6) intron (NM_001040214, intron 5 of 6) -170696 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 189.25-42 chr16 10391712 10392039 + 1 NA intron (NM_024997, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 5814 NM_024997 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 176.25-95 chr3 110544126 110544375 + 1 NA Intergenic Intergenic 525709 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 232.5-58 chr20 7988465 7988831 + 1 NA intron (NM_021156, intron 5 of 7) intron (NM_021156, intron 5 of 7) 31113 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 128.5-207 chr7 50971754 50971989 + 1 NA Intergenic (ATGTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -178418 NM_001371008 112.5-18 chr10 25544175 25544441 + 1 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) intron (NM_020752, intron 5 of 10) -107404 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 167.75-130 chr7 13506307 13506640 + 1 NA Intergenic Intergenic 480041 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 211.5-39 chr12 84430571 84430995 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 482016 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 151.75-103 chr4 84920597 84920814 + 1 NA intron (NM_014991, intron 2 of 67) intron (NM_014991, intron 2 of 67) -44911 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 245.5-61 chr5 104408980 104409286 + 1 NA Intergenic Intergenic -690341 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 245.5-37 chr2 119923124 119923663 + 1 NA intron (NM_002830, intron 12 of 26) intron (NM_002830, intron 12 of 26) -89684 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 161.25-135 chr5 11042069 11042392 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) intron (NM_001288715, intron 15 of 20) -280996 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 122.5-195 chr6 35789882 35790156 + 1 NA intron (NM_001348773, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 7304 NM_001832 1208 Hs.1340 NM_001832 ENSG00000137392 CLPS - colipase protein-coding 331.75-17 chr4 55933859 55934671 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -14680 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 139.25-84 chr2 72186850 72187076 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) MER52D|LTR|ERV1 -39101 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 194.75-100 chr9 87023289 87023670 + 1 NA intron (NR_027471, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 18647 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 295.75-4 chr10 98591879 98592354 + 1 NA intron (NM_021828, intron 9 of 11) intron (NM_021828, intron 9 of 11) -145153 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 126.25-134 chr4 96297277 96297554 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13288 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 244.75-28 chr2 57374647 57375036 + 1 NA Intergenic Intergenic -532810 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 147.25-25 chr12 1633197 1633498 + 1 NA intron (NM_032642, intron 3 of 4) intron (NM_032642, intron 3 of 4) 4116 NM_032642 81029 Hs.306051 NM_030775 ENSG00000111186 WNT5B - Wnt family member 5B protein-coding 184.5-145 chr7 137607824 137608243 + 1 NA intron (NM_001321710, intron 10 of 32) intron (NM_001321710, intron 10 of 32) 238299 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 204.5-105 chr5 29484730 29485051 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -88914 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 188.5-44 chr15 65382572 65382781 + 1 NA 3' UTR (NM_020962, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_020962, exon 20 of 20) -4674 NM_004884 9543 Hs.128292 NM_004884 ENSG00000174498 IGDCC3 HsT18880|PUNC immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3 protein-coding 166.75-38 chr13 22144640 22144891 + 1 NA Intergenic Intergenic -65520 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 195.25-79 chr5 120449538 120449983 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -14518 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 148.5-166 chr4 52724311 52724525 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 11169 NR_003016 677810 Hs.635034 NR_003016 ENSG00000212588 SNORA26 HBI-6 small nucleolar RNA, H/ACA box 26 snoRNA 162.25-112 chr4 43011143 43011506 + 1 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) intron (NM_001080476, intron 2 of 3) 118058 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 112.25-177 chr6 36255090 36255307 + 1 NA intron (NM_173676, intron 1 of 7) AluSq|SINE|Alu 12030 NM_173676 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 226.5-74 chr4 113861368 113861721 + 1 NA Intergenic Intergenic -99617 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 132.25-97 chr2 112783147 112783316 + 1 NA intron (NM_000575, intron 2 of 6) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 2167 NM_000575 3552 Hs.1722 NM_000575 ENSG00000115008 IL1A IL-1A|IL1|IL1-ALPHA|IL1F1 interleukin 1 alpha protein-coding 127.5-81 chr14 72456201 72456352 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 4 of 16) intron (NM_001370288, intron 4 of 16) -60544 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 152.5-180 chr7 95049686 95049958 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) L1MC1|LINE|L1 139924 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 152.5-131 chr4 43841784 43842016 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -174961 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 197.5-118 chr5 4249256 4249664 + 1 NA Intergenic Intergenic -524021 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 115.75-222 chr8 126938977 126939226 + 1 NA Intergenic Intergenic -74053 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 371.25-7 chr18 2558307 2559027 + 1 NA intron (NM_022840, intron 3 of 8) L1MEc|LINE|L1 12838 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 159.5-100 chr2 57980595 57980763 + 1 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1PA15|LINE|L1 -65963 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 159.5-53 chr14 47644873 47645155 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 29940 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 128.75-35 chr11 81255250 81255473 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -492558 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 149.75-74 chr2 28911845 28912131 + 1 NA intron (NM_015131, intron 3 of 17) intron (NM_015131, intron 3 of 17) -1674 NR_003074 692209 NR_003074 ENSG00000264994 SNORD92 HBII-316 small nucleolar RNA, C/D box 92 snoRNA 297.5-38 chr3 94780117 94780529 + 1 NA Intergenic Intergenic -157940 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 350.75-2 chr18 10978863 10979462 + 1 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) 169600 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 167.5-50 chr12 74989674 74990048 + 1 NA Intergenic Intergenic 219887 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 157.5-112 chr2 168108933 168109218 + 1 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) MIR|SINE|MIR 138520 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 334.75-8 chr12 132970254 132970689 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -14165 NM_183238 100289635 Hs.29698 NM_183238 ENSG00000196458 ZNF605 - zinc finger protein 605 protein-coding 153.5-28 chr11 20076872 20077047 + 1 NA intron (NM_182964, intron 22 of 37) intron (NM_182964, intron 22 of 37) -27656 NR_046672 100874014 Hs.557916 NR_046672 ENSG00000254453 NAV2-AS2 - NAV2 antisense RNA 2 ncRNA 295.5-35 chr3 36838956 36839369 + 1 NA intron (NM_001329998, intron 18 of 23) intron (NM_001329998, intron 18 of 23) -16662 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 212.5-74 chr3 166633835 166634202 + 1 NA Intergenic Intergenic -264665 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 197.5-15 chr10 110191263 110191760 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -16094 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 116.5-250 chr8 107753664 107753862 + 1 NA Intergenic Intergenic -255845 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 148.25-25 chr11 13533799 13534034 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -37741 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 188.5-117 chr4 130130514 130130816 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -245696 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 128.5-163 chr4 115337978 115338276 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -224507 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 164.5-88 chr2 11029072 11029350 + 1 NA Intergenic (CAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 102965 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 208.25-57 chr22 28188871 28189306 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) AluJr|SINE|Alu -268476 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 184.5-88 chr20 59394812 59395042 + 1 NA Intergenic Intergenic 94316 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 226.5-51 chr2 216133783 216134252 + 1 NA intron (NM_021141, intron 10 of 20) L3|LINE|CR1 24669 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 230.75-45 chr3 33830475 33830762 + 1 NA intron (NM_001162429, intron 7 of 17) FLAM_A|SINE|Alu 31988 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 151.5-105 chr22 34079689 34080097 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie -157005 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 152.5-83 chr2 48339076 48339324 + 1 NA intron (NM_002158, intron 2 of 6) L1ME3E|LINE|L1 24518 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 118.25-186 chr7 80499771 80500008 + 1 NA intron (NM_001102386, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 12175 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 123.5-122 chr21 18979089 18979357 + 1 NA Intergenic Intergenic -219411 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 157.75-118 chr4 13563422 13563623 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -15698 NR_015450 285548 Hs.529284 NR_015450 LINC01096 - long intergenic non-protein coding RNA 1096 ncRNA 179.5-95 chr2 161183645 161183930 + 1 NA intron (NM_001199135, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 23359 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 151.5-73 chr2 13107485 13107823 + 1 NA Intergenic Intergenic -100641 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 180.75-26 chr12 2504549 2504908 + 1 NA intron (NM_001167623, intron 8 of 46).2 intron (NM_001167623, intron 8 of 46).2 167492 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 213.5-127 chr9 4030400 4030685 + 1 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) L1MA1|LINE|L1 121641 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 226.25-40 chr20 7500227 7500550 + 1 NA Intergenic Intergenic 128780 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 203.5-56 chr18 9811783 9812236 + 1 NA intron (NM_006868, intron 3 of 6) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -73964 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 345.75-10 chr5 148024906 148025405 + 1 NA Intergenic Intergenic -38817 NM_006846 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 256.25-29 chr3 102065764 102066181 + 1 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -97733 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 191.5-69 chr2 9681749 9682059 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -50907 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 146.5-184 chr6 19455802 19456083 + 1 NA intron (NR_134615, intron 1 of 1) intron (NR_134615, intron 1 of 1) 6121 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 219.5-99 chr5 38496398 38496767 + 1 NA exon (NM_002310, exon 13 of 20) exon (NM_002310, exon 13 of 20) 51036 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 244.5-110 chrX 52590443 52590938 + 1 NA Intergenic LTR75B|LTR|ERVL -32245 NR_027250 280659 Hs.694472 NM_174961 SSX8P SSX8 SSX family member 8, pseudogene pseudo 113.5-48 chr11 77880553 77880699 + 1 NA intron (NM_033547, intron 22 of 22) intron (NM_033547, intron 22 of 22) 39488 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 157.25-45 chr14 81340834 81341116 + 1 NA intron (NM_001366849, intron 5 of 8) intron (NM_001366849, intron 5 of 8) 86800 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 126.75-32 chr11 101988011 101988172 + 1 NA intron (NM_001363543, intron 10 of 11) L1MEd|LINE|L1 -59346 NM_032930 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 237.75-64 chr5 52408716 52408983 + 1 NA Intergenic Intergenic -379067 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 240.5-94 chr6 156690110 156690490 + 1 NA Intergenic Intergenic -87555 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 275.5-9 chr10 60196610 60197143 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 15 of 43) intron (NM_001204403, intron 15 of 43) -55860 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 178.25-72 chr20 14716196 14716403 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 161915 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 195.5-43 chr14 85925024 85925297 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9518 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 204.5-73 chr2 232470244 232470640 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 14289 NM_001631 248 Hs.37009 NM_001631 ENSG00000163295 ALPI IAP alkaline phosphatase, intestinal protein-coding 160.25-50 chr16 77390863 77391159 + 1 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 44023 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 196.75-31 chr12 114110964 114111306 + 1 NA Intergenic Intergenic 130635 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 174.5-197 chr9 98116750 98116966 + 1 NA intron (NM_033219, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 2364 NM_033219 9830 Hs.575631 NM_014788 ENSG00000106785 TRIM14 - tripartite motif containing 14 protein-coding 133.5-59 chr12 27924248 27924475 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 45615 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 192.5-111 chr5 150950143 150950366 + 1 NA Intergenic Intergenic -3670 NR_026867 134466 Hs.661876 NR_026867 ZNF300P1 - zinc finger protein 300 pseudogene 1 pseudo 120.75-71 chr18 65851716 65851910 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 7 of 11) MIR3|SINE|MIR 100801 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 126.75-40 chr12 96730040 96730175 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 50 of 67) intron (NM_001306084, intron 50 of 67) -177150 NM_001135176 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 171.5-17 chr10 70409360 70409607 + 1 NA intron (NM_004096, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 5338 NM_004096 1979 Hs.621200 NM_004096 ENSG00000148730 EIF4EBP2 4EBP2|PHASII eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 protein-coding 274.5-4 chr10 9149901 9150332 + 1 NA Intergenic Intergenic -125497 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 236.5-80 chr6 74357338 74357625 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 288030 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 137.75-92 chr19 31764697 31764974 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 172554 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 185.5-60 chr15 69385545 69385852 + 1 NA intron (NM_001104554, intron 5 of 8) intron (NM_001104554, intron 5 of 8) -28651 NR_160296 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 261.75-31 chr3 194432589 194432882 + 1 NA intron (NM_001367549, intron 21 of 33) intron (NM_001367549, intron 21 of 33) -33469 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 158.75-124 chr4 46947680 46948053 + 1 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -38621 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 240.25-15 chr12 13764198 13764687 + 1 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 215914 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 229.5-33 chr12 46745348 46745720 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 80463 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 117.25-180 chr6 9566789 9566960 + 1 NA Intergenic Intergenic -837628 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 174.5-106 chr20 21218479 21218765 + 1 NA promoter-TSS (NR_109956) promoter-TSS (NR_109956) -333 NR_109956 101929591 Hs.656066 NR_109956 ENSG00000232712 KIZ-AS1 - KIZ antisense RNA 1 ncRNA 118.25-42 chr11 84096639 84096817 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 10 of 27) intron (NM_001142699, intron 10 of 27) 176552 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 257.5-56 chr4 117354707 117355060 + 1 NA intron (NR_147151, intron 2 of 6) intron (NR_147151, intron 2 of 6) 5756 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 183.5-156 chr8 139108612 139108908 + 1 NA Intergenic Intergenic -194719 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 121.25-171 chr5 168281662 168281807 + 1 NA Intergenic Intergenic -9911 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 181.5-111 chr3 88613275 88613630 + 1 NA Intergenic Intergenic 274996 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 120.5-205 chr6 134854956 134855148 + 1 NA Intergenic Intergenic 95049 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 173.75-26 chr10 89119651 89119881 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -56355 NR_039827 100616192 NR_039827 ENSG00000265375 MIR4679-2 - microRNA 4679-2 ncRNA 143.5-72 chr14 80123772 80123986 + 1 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -87540 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 251.75-44 chr20 51095583 51095889 + 1 NA Intergenic Intergenic -72629 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 154.5-6 chr1 74908387 74908564 + 1 NA Intergenic Intergenic -175067 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 215.5-52 chr2 100123501 100123821 + 1 NA intron (NM_002285, intron 1 of 23) intron (NM_002285, intron 1 of 23) -18078 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 277.25-6 chr10 24361072 24361495 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) AluJb|SINE|Alu 85598 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 134.5-177 chr5 93256463 93256703 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 314760 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 240.5-22 chr14 23221512 23221761 + 1 NA intron (NM_001370218, intron 2 of 15) L1MA2|LINE|L1 -16300 NM_001282322 100507650 NM_001282322 ENSG00000215277 RNF212B C14orf164 ring finger protein 212B protein-coding 223.75-66 chr4 142119906 142120327 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 21 of 25) L1MB7|LINE|L1 483533 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 159.75-92 chr20 1448055 1448246 + 1 NA intron (NM_018839, intron 6 of 7) MIR|SINE|MIR 19542 NM_018839 55968 Hs.12865 NM_016143 ENSG00000088833 NSFL1C P47|UBX1|UBXD10|UBXN2C|dJ776F14.1 NSFL1 cofactor protein-coding 207.5-124 chr8 130933507 130933863 + 1 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) intron (NM_001115, intron 5 of 17) 107224 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 151.75-46 chr16 12893733 12894058 + 1 NA Intergenic Intergenic -7703 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 197.75-22 chr14 29494644 29494993 + 1 NA Intergenic Intergenic 432278 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 172.5-14 chr1 169444322 169444557 + 1 NA intron (NM_001300968, intron 2 of 6) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 16230 NM_001300968 57821 Hs.567557 NM_021179 ENSG00000117477 CCDC181 C1orf114 coiled-coil domain containing 181 protein-coding 181.5-107 chr3 50701436 50701740 + 1 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) L1MA4|LINE|L1 26508 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 157.5-97 chr2 54206432 54206596 + 1 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 49715 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 156.25-36 chr12 58598141 58598444 + 1 NA intron (NR_126341, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 6590 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 235.25-46 chr3 143052614 143052933 + 1 NA intron (NM_001080415, intron 25 of 27) intron (NM_001080415, intron 25 of 27) 51203 NM_001320219 23350 Hs.596572 NM_001080415 ENSG00000163714 U2SURP SR140|fSAPa U2 snRNP associated SURP domain containing protein-coding 222.25-30 chr2 10295512 10295835 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -7231 NM_002149 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 265.5-50 chr5 111314942 111315337 + 1 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 90755 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 194.5-120 chr5 109436848 109437096 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -26998 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 217.25-59 chr4 91880567 91880888 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 396575 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 166.75-65 chr18 21168960 21169218 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -57276 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 189.25-39 chr15 39990381 39990801 + 1 NA intron (NM_001013703, intron 16 of 38) intron (NM_001013703, intron 16 of 38) 48590 NM_003134 6727 Hs.533732 NM_003134 ENSG00000140319 SRP14 ALURBP signal recognition particle 14 protein-coding 226.5-44 chr2 100065034 100065469 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) intron (NM_001025108, intron 2 of 23) 40332 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 180.5-15 chr10 108366574 108366902 + 1 NA Intergenic Intergenic -297445 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 261.5-20 chr15 75470198 75470647 + 1 NA intron (NM_002833, intron 11 of 12) AluJb|SINE|Alu -14607 NM_001145357 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 304.5-40 chr8 120607678 120608278 + 1 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) L1MEd|LINE|L1 -153275 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 190.5-19 chr11 3975768 3976091 + 1 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) L1ME1|LINE|L1 -118756 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 128.25-26 chr11 104658861 104659044 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -49650 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 172.5-134 chr3 190464904 190465168 + 1 NA Intergenic Intergenic -15160 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 160.5-137 chr4 80316286 80316584 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -19285 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 148.5-92 chr2 18222111 18222417 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 338389 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 294.75-3 chr11 59525332 59525672 + 1 NA Intergenic Intergenic 10589 NM_001004711 390199 Hs.553757 NM_001004711 ENSG00000172742 OR4D9 OR11-253 olfactory receptor family 4 subfamily D member 9 protein-coding 260.75-2 chr1 165577423 165577720 + 1 NA intron (NR_026744, intron 1 of 6) L1MB8|LINE|L1 4584 NR_026744 400794 Hs.374847 NR_026744 ENSG00000237463 LRRC52-AS1 - LRRC52 antisense RNA 1 ncRNA 197.25-19 chr11 108409137 108409374 + 1 NA intron (NM_001351110, intron 2 of 8) L1ME3|LINE|L1 58274 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 123.5-7 chr1 155865883 155866070 + 1 NA intron (NM_152280, intron 1 of 3) intron (NM_152280, intron 1 of 3) 6409 NM_152280 23208 Hs.32984 NM_152280 ENSG00000132718 SYT11 SYT12|sytXI synaptotagmin 11 protein-coding 117.5-154 chr4 30846429 30846613 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 126152 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 217.5-2 chr1 53512057 53512301 + 1 NA intron (NM_147193, intron 7 of 9) intron (NM_147193, intron 7 of 9) 52780 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 120.25-28 chr10 57130664 57130873 + 1 NA Intergenic Intergenic 173791 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 131.25-14 chr1 182773492 182773699 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15854 NM_001200050 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 374.25-7 chr4 30403312 30403995 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -316716 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 291.75-43 chr9 15218722 15219176 + 1 NA intron (NM_001168342, intron 1 of 17) intron (NM_001168342, intron 1 of 17) 31269 NM_001168342 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 230.75-56 chr5 33479428 33479706 + 1 NA Intergenic Intergenic 38791 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 165.5-153 chr5 144078284 144078576 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 92229 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 124.5-136 chr22 33460666 33460818 + 1 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -24073 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 201.5-12 chr1 119208676 119209015 + 1 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) intron (NR_125975, intron 4 of 6) -68173 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 168.25-115 chr5 59562585 59562756 + 1 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 23828 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 198.5-123 chr6 53980966 53981177 + 1 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) L1PB4|LINE|L1 -17819 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 199.25-69 chr3 127328847 127329124 + 1 NA intron (NR_110147, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR -40939 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 166.75-88 chr3 4233785 4233990 + 1 NA Intergenic Intergenic -69417 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 133.5-229 chr6 46708230 46708377 + 1 NA intron (NM_005084, intron 9 of 11) intron (NM_005084, intron 9 of 11) -20138 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 149.25-173 chr7 139627760 139627942 + 1 NA intron (NM_001113239, intron 5 of 14) intron (NM_001113239, intron 5 of 14) 104166 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 238.5-37 chr19 13697158 13697574 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -34386 NM_001320565 81576 Hs.24998 NM_030818 ENSG00000104957 CCDC130 - coiled-coil domain containing 130 protein-coding 223.25-33 chr2 42560545 42560800 + 1 NA intron (NM_001282755, intron 2 of 17) AluSx|SINE|Alu -7373 NM_001282756 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 146.25-37 chr14 79192279 79192431 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -7627 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 149.75-15 chr10 69038276 69038554 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -49188 NM_001321053 5552 Hs.1908 NM_002727 ENSG00000122862 SRGN PPG|PRG|PRG1 serglycin protein-coding 208.5-130 chr7 80863841 80864224 + 1 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) L1PB1|LINE|L1 55019 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 236.5-85 chr7 88861273 88861616 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -65707 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 164.75-56 chr15 89695262 89695551 + 1 NA intron (NM_001284395, intron 1 of 16) FRAM|SINE|Alu 4595 NM_001284395 56964 Hs.177557 NM_020212 ENSG00000140527 WDR93 - WD repeat domain 93 protein-coding 200.25-29 chr12 125291982 125292252 + 1 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) intron (NM_001366854, intron 1 of 8) -34499 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 184.5-107 chr4 45747919 45748299 + 1 NA Intergenic Intergenic 375945 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 187.75-118 chr8 130757272 130757607 + 1 NA Intergenic Intergenic 283470 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 156.75-138 chr5 148748592 148748963 + 1 NA Intergenic Intergenic -77816 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 141.25-9 chr1 76032116 76032429 + 1 NA Intergenic Intergenic 20948 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 155.5-134 chr3 134178480 134178748 + 1 NA intron (NM_001005861, intron 10 of 14) MIRb|SINE|MIR 72130 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 209.5-84 chr21 27321197 27321581 + 1 NA Intergenic Intergenic -354301 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 174.5-107 chr20 33903500 33903836 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -90243 NM_007367 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 290.25-34 chr7 93702886 93703375 + 1 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -13798 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 211.25-99 chr9 77301190 77301535 + 1 NA intron (NM_001018038, intron 33 of 68) intron (NM_001018038, intron 33 of 68) -123445 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 162.75-100 chr3 110346735 110346926 + 1 NA Intergenic Intergenic 723129 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-35 chr12 40528936 40529227 + 1 NA intron (NM_173600, intron 114 of 173) intron (NM_173600, intron 114 of 173) 135687 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 240.5-90 chr6 57248851 57249172 + 1 NA Intergenic Intergenic 14335 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 122.25-179 chr7 86462210 86462386 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -181611 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 175.75-70 chr2 155756308 155756483 + 1 NA Intergenic Intergenic 498536 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 170.5-145 chr5 77087922 77088206 + 1 NA promoter-TSS (NM_032367) promoter-TSS (NM_032367) -779 NM_032367 84327 Hs.584988 NM_032367 ENSG00000132846 ZBED3 - zinc finger BED-type containing 3 protein-coding 276.25-33 chr4 64654750 64655207 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -245518 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 192.25-101 chr7 117005031 117005477 + 1 NA intron (NR_161423, intron 1 of 13) intron (NR_161423, intron 1 of 13) -9658 NM_001369602 7982 Hs.368131 NM_018412 ENSG00000004866 ST7 ETS7q|FAM4A|FAM4A1|HELG|RAY1|SEN4|TSG7 suppression of tumorigenicity 7 protein-coding 321.5 chr1 79595840 79596228 + 1 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -589304 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 249.25-46 chr6 53966568 53966948 + 1 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) intron (NR_125842, intron 1 of 3) -32132 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 142.75-114 chr20 44153015 44153435 + 1 NA intron (NM_020433, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 33963 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 196.25-20 chr11 43894181 43894446 + 1 NA intron (NM_139178, intron 7 of 9) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -2990 NR_026952 729799 Hs.368920 NR_026952 ENSG00000213693 SEC14L1P1 - SEC14 like 1 pseudogene 1 pseudo 506.25-5 chr8 80044054 80044765 + 1 NA intron (NM_001287142, intron 4 of 6) intron (NM_001287142, intron 4 of 6) -14150 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 183.25-21 chr11 60819877 60820149 + 1 NA Intergenic Intergenic -22100 NM_024098 79080 Hs.4253 NM_024098 ENSG00000110104 CCDC86 - coiled-coil domain containing 86 protein-coding 158.75-52 chr14 50786501 50786896 + 1 NA intron (NM_016350, intron 5 of 28) intron (NM_016350, intron 5 of 28) -35099 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 190.5-166 chr9 16749634 16749966 + 1 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) intron (NM_017637, intron 1 of 6) 22986 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 275.5-67 chr8 131330302 131330792 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -289638 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 135.25-43 chr11 78666681 78666895 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 32 of 33) MIRb|SINE|MIR -91924 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 158.25-65 chr2 123626377 123626628 + 1 NA Intergenic Intergenic 398672 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 118.75-94 chr2 44107189 44107489 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -61464 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 185.5-148 chr7 7432095 7432407 + 1 NA intron (NM_001037763, intron 25 of 34) L2a|LINE|L2 103622 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 263.5-29 chr2 23596856 23597273 + 1 NA intron (NM_052920, intron 3 of 13) intron (NM_052920, intron 3 of 13) 211885 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 267.5-66 chr7 4519093 4519456 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -163021 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 294.5-30 chr3 111883381 111883847 + 1 NA intron (NM_001134439, intron 1 of 17) intron (NM_001134439, intron 1 of 17) 23787 NM_001134439 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 137.25-172 chr8 112166438 112166610 + 1 NA Intergenic Intergenic -476969 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 182.25-6 chr1 166371414 166371621 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 118522 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 204.75-111 chr7 49725954 49726190 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -47566 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 148.5-209 chr7 33387765 33388044 + 1 NA intron (NM_198428, intron 18 of 22) intron (NM_198428, intron 18 of 22) 258340 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 195.25-82 chr6 54477898 54478169 + 1 NA Intergenic Intergenic 169592 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 199.5-58 chr17 27377689 27377935 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -40193 NR_033892 440419 Hs.385755 NR_033892 ENSG00000266433 TBC1D3P5 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 5 pseudo 134.5-124 chr22 34470628 34470808 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 527198 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 195.75-106 chr7 3615067 3615377 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 313970 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 155.5-103 chr2 176664759 176665001 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 27126 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 181.25-133 chr8 135025026 135025241 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 175198 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 252.25-49 chr5 83685311 83685868 + 1 NA intron (NM_001884, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 35266 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 234.5-66 chr3 174584030 174584575 + 1 NA Intergenic Intergenic -275032 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 182.75-10 chr1 119290808 119291059 + 1 NA Intergenic Intergenic -37319 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 187.5-47 chr13 58339279 58339551 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -106298 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 184.5-79 chr2 136042062 136042322 + 1 NA Intergenic Intergenic -56508 NM_001293312 1615 Hs.503787 NM_001349 ENSG00000115866 DARS HBSL|aspRS aspartyl-tRNA synthetase protein-coding 239.75-13 chr11 103359220 103359548 + 1 NA intron (NM_001377, intron 83 of 88) intron (NM_001377, intron 83 of 88) 249958 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 136.5-235 chr8 120119460 120119714 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -5515 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 184.5-26 chr11 82347785 82348120 + 1 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MC5a|LINE|L1 55961 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 164.5-153 chr5 10154885 10155127 + 1 NA Intergenic Intergenic 94882 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 160.5-203 chr9 30177902 30178085 + 1 NA Intergenic Intergenic 230461 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 182.25-48 chr16 76900796 76901025 + 1 NA Intergenic Intergenic 31974 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 136.75-101 chr2 100478761 100479082 + 1 NA intron (NM_001011717, intron 5 of 9) intron (NM_001011717, intron 5 of 9) 8439 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 143.5-110 chr2 39310506 39310761 + 1 NA intron (NM_003618, intron 13 of 33) L1MA4|LINE|L1 -66650 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 135.75-177 chr6 12470069 12470279 + 1 NA Intergenic Intergenic 115230 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 248.5 chr1 24170496 24170821 + 1 NA intron (NM_173065, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 16631 NM_170743 163702 Hs.221375 NM_170743 ENSG00000185436 IFNLR1 CRF2/12|IFNLR|IL-28R1|IL28RA|LICR2 interferon lambda receptor 1 protein-coding 290.5-10 chr12 98920474 98920800 + 1 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -25346 NM_001352211 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 163.5-208 chr8 117318263 117318613 + 1 NA Intergenic Intergenic 183443 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 128.25-95 chr2 74483529 74483699 + 1 NA promoter-TSS (NM_032779) promoter-TSS (NM_032779) 533 NR_027749 64427 Hs.557709 NM_022492 ENSG00000115282 TTC31 - tetratricopeptide repeat domain 31 protein-coding 125.5-175 chr3 89487788 89488007 + 1 NA Intergenic Intergenic 380276 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 127.75-14 chr1 81141855 81142075 + 1 NA Intergenic Intergenic -164227 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 227.5-52 chr2 59792945 59793283 + 1 NA Intergenic Intergenic 575406 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 140.5-168 chr4 88485331 88485578 + 1 NA intron (NM_016323, intron 13 of 22) intron (NM_016323, intron 13 of 22) 28335 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 123.5-6 chr1 151571765 151571962 + 1 NA intron (NM_020127, intron 7 of 12) intron (NM_020127, intron 7 of 12) 26067 NR_030280 693139 NR_030280 ENSG00000207606 MIR554 MIRN554|hsa-mir-554 microRNA 554 ncRNA 145.75-72 chr2 33394844 33395074 + 1 NA intron (NM_206943, intron 32 of 33) L1PA14|LINE|L1 -23557 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 167.5-49 chr12 47489837 47490166 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 74993 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 253.5-56 chr4 63331776 63332142 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1077491 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 297.5-35 chr22 37547369 37547790 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12901 NM_152243 11135 Hs.225356 NM_152243 ENSG00000128283 CDC42EP1 BORG5|CEP1|MSE55 CDC42 effector protein 1 protein-coding 224.5-52 chr17 70631273 70631580 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 461891 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 161.5-19 chr10 52971959 52972431 + 1 NA Intergenic Intergenic -200495 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 211.25-13 chr11 104150356 104150783 + 1 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 13578 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 128.75-103 chr2 211286072 211286250 + 1 NA Intergenic Intergenic 668590 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 165.5-14 chr10 14027692 14027978 + 1 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) -19285 NM_001318336 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 208.25-6 chr1 169799103 169799524 + 1 NA intron (NM_001366773, intron 2 of 21) intron (NM_001366773, intron 2 of 21) 4273 NM_001366772 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 163.75-125 chr8 83108658 83108878 + 1 NA Intergenic Intergenic 196664 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 226.75-56 chr3 178079413 178079666 + 1 NA Intergenic Intergenic 262674 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 288.25-19 chr4 1973779 1974388 + 1 NA promoter-TSS (NR_003004) promoter-TSS (NR_003004) -553 NR_003004 677770 Hs.676951 NR_003004 ENSG00000249784 SCARNA22 ACA11 small Cajal body-specific RNA 22 ncRNA 241.75-56 chr4 56474601 56475062 + 1 NA intron (NR_151856, intron 5 of 19) AluSz|SINE|Alu 7214 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 163.5-113 chr20 45275810 45276229 + 1 NA Intergenic Intergenic -21455 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 135.75-90 chr2 15209491 15209804 + 1 NA intron (NR_052013, intron 47 of 50) L1MA2|LINE|L1 351687 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 168.25-72 chr2 70674536 70674800 + 1 NA TTS (NM_001185055) TTS (NM_001185055) 93047 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 129.75-58 chr14 29745750 29745922 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 181260 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 358.75-8 chr22 25489032 25489698 + 1 NA Intergenic Intergenic 33719 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 125.5-245 chr8 33816578 33816881 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -216623 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 176.25-87 chr3 234673 235039 + 1 NA intron (NR_045572, intron 1 of 2) intron (NR_045572, intron 1 of 2) 36967 NR_045572 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 235.5-71 chr5 105570497 105570795 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 471172 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 177.5-68 chr18 51522882 51523258 + 1 NA intron (NR_040074, intron 1 of 2) (ATGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 131028 NR_040074 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 164.5-119 chr21 14908763 14909019 + 1 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 9777 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 300.75-35 chr22 36136762 36137283 + 1 NA Intergenic Intergenic 23733 NM_014349 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 187.25-46 chr18 74158417 74158788 + 1 NA 3' UTR (NM_014177, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014177, exon 6 of 6) 10079 NM_014177 29090 Hs.532835 NM_014177 ENSG00000075336 TIMM21 C18orf55|HSPC154|TIM21 translocase of inner mitochondrial membrane 21 protein-coding 163.75-10 chr1 116060412 116060622 + 1 NA intron (NM_018420, intron 8 of 11) intron (NM_018420, intron 8 of 11) -51238 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 139.75-164 chr7 50606097 50606271 + 1 NA intron (NM_001350816, intron 13 of 17) intron (NM_001350816, intron 13 of 17) -40779 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 182.5-85 chr2 186774920 186775158 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 74131 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 195.5-12 chr10 25270800 25271124 + 1 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 -94686 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-118 chr8 32046509 32046858 + 1 NA intron (NR_104156, intron 3 of 3) L1ME1|LINE|L1 20465 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 250.5-9 chr10 71797576 71798154 + 1 NA intron (NM_001171934, intron 2 of 21) intron (NM_001171934, intron 2 of 21) 2094 NM_001171934 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 156.5-126 chr4 29214557 29214840 + 1 NA intron (NR_146996, intron 1 of 2) L1M4|LINE|L1 406 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 239.25-39 chr18 1573306 1573618 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -213833 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 236.75-47 chr5 149662517 149662844 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -67630 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 152.25-40 chr12 67938198 67938544 + 1 NA intron (NR_120456, intron 2 of 2) intron (NR_120456, intron 2 of 2) 9136 NR_120456 101927922 Hs.450769 NR_120456 ENSG00000255772 LINC01479 HRAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1479 ncRNA 158.5-145 chr4 122925516 122925761 + 1 NA intron (NM_001317799, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 2560 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 157.25-44 chr14 71536873 71537182 + 1 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) 49166 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 182.5-150 chr7 5362436 5362670 + 1 NA intron (NM_001080495, intron 12 of 29) MIR3|SINE|MIR 60993 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 369.75-7 chr16 63350674 63351282 + 1 NA Intergenic Intergenic -1314540 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 183.25-103 chr7 39158419 39158764 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) MLT2B3|LTR|ERVL -145024 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 175.5-115 chr3 37424513 37424752 + 1 NA intron (NR_126512, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu 13494 NM_001302831 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 260.5-34 chr2 142683453 142683734 + 1 NA Intergenic Intergenic -194071 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 194.5-115 chr5 33089699 33090019 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -139876 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 171.75-147 chr9 32358036 32358335 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -26418 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 154.75-43 chr15 26620458 26620701 + 1 NA intron (NR_103801, intron 5 of 6) intron (NR_103801, intron 5 of 6) 8511 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 174.5-76 chr16 75998047 75998350 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -271708 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 168.5-42 chr12 19939357 19939672 + 1 NA Intergenic Intergenic -75171 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 216.5-78 chr3 106082783 106083052 + 1 NA Intergenic Intergenic -213516 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 206.25-4 chr1 55106292 55106799 + 1 NA intron (NM_015306, intron 40 of 67) intron (NM_015306, intron 40 of 67) 66323 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 392.5-6 chr2 21117830 21118474 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -5834 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 152.25-22 chr10 69542514 69542666 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 30832 NM_020999 50674 Hs.532682 NM_020999 ENSG00000122859 NEUROG3 Atoh5|Math4B|NGN-3|bHLHa7|ngn3 neurogenin 3 protein-coding 165.25-55 chr17 64142106 64142472 + 1 NA Intergenic Intergenic -3681 NR_132278 105376843 Hs.405444 NR_132278 ENSG00000266402 SNHG25 - small nucleolar RNA host gene 25 ncRNA 229.5-83 chr3 20577326 20577652 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 235021 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 218.5-9 chr1 90985023 90985265 + 1 NA intron (NM_201269, intron 1 of 5) intron (NM_201269, intron 1 of 5) 36364 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 167.25-72 chr18 65836359 65836561 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 6 of 11) intron (NM_001362438, intron 6 of 11) 85448 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 140.25-184 chr8 86288277 86288435 + 1 NA Intergenic Intergenic -54191 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 150.5-167 chr5 25543133 25543371 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 352299 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 158.75-25 chr10 124831147 124831389 + 1 NA intron (NM_032182, intron 7 of 8) intron (NM_032182, intron 7 of 8) 29449 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 172.75-108 chr6 41081595 41081945 + 1 NA intron (NM_002505, intron 3 of 9) intron (NM_002505, intron 3 of 9) 8796 NM_021705 4800 Hs.10441 NM_002505 ENSG00000001167 NFYA CBF-A|CBF-B|HAP2|NF-YA nuclear transcription factor Y subunit alpha protein-coding 165.5-180 chr7 47044993 47045282 + 1 NA Intergenic Intergenic -348015 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 203.5-2 chr1 27723425 27723721 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2388 NM_001143913 199870 Hs.469359 NM_152660 ENSG00000009780 FAM76A - family with sequence similarity 76 member A protein-coding 145.5-193 chr8 118529713 118529907 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) L1PB4|LINE|L1 -91191 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 201.75-62 chr3 188385755 188386113 + 1 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 160529 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 158.75-58 chr15 72740304 72740514 + 1 NA Intergenic Intergenic -42426 NR_040107 100287559 Hs.562587 NR_040107 ENSG00000260898 ADPGK-AS1 - ADPGK antisense RNA 1 ncRNA 130.5-118 chr17 68972202 68972450 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -16934 NM_001288985 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 229.75-78 chr8 136263297 136263852 + 1 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -267224 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 142.5-108 chr2 78336904 78337236 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -46339 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 160.25-31 chr13 37075765 37076007 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16173 NM_001278481 55578 Hs.435815 NM_017569 ENSG00000102710 SUPT20H C13|C13orf19|FAM48A|FP757|P38IP|SPT20 SPT20 homolog, SAGA complex component protein-coding 208.75-26 chr14 59520676 59521153 + 1 NA intron (NM_001164399, intron 17 of 19) L1ME1|LINE|L1 36397 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 190.5-77 chr2 104813144 104813372 + 1 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) intron (NR_037883, intron 1 of 3) 38218 NR_131235 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 199.75-87 chr8 55355170 55355525 + 1 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) L1M8|LINE|L1 99974 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 142.75-139 chr4 35169560 35169819 + 1 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac -899942 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 165.5-86 chr2 156213160 156213362 + 1 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 41670 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 232.25-27 chr15 69284732 69285088 + 1 NA Intergenic Intergenic -14002 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 123.25-219 chrX 95725112 95725406 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 612643 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 370.5 chr1 42728594 42729113 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 11383 NM_148960 149461 Hs.496270 NM_148960 ENSG00000164007 CLDN19 HOMG5 claudin 19 protein-coding 130.5-8 chr1 50291051 50291383 + 1 NA Intergenic Intergenic 132226 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 253.75-64 chr8 102013715 102014042 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) 29446 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 138.5 chr1 15885147 15885386 + 1 NA intron (NM_015001, intron 3 of 14) intron (NM_015001, intron 3 of 14) -37119 NR_024279 729614 Hs.119298 NR_024279 ENSG00000179743 FLJ37453 - uncharacterized LOC729614 ncRNA 139.75-10 chr1 211751825 211752062 + 1 NA intron (NM_014873, intron 6 of 7) HAL1|LINE|L1 76181 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 293.25-38 chr8 128094371 128095000 + 1 NA intron (NR_003367, intron 6 of 8) intron (NR_003367, intron 6 of 8) 45533 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 171.75-101 chr4 68115947 68116162 + 1 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) L1M4|LINE|L1 13815 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 148.5-238 chr8 136374565 136374871 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -156080 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 208.5-4 chr1 90961387 90961663 + 1 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 59983 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 232.5-87 chr5 122871757 122872105 + 1 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 26318 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 174.25-107 chr3 185333434 185333702 + 1 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) L1M5|LINE|L1 -29568 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 121.5-121 chr19 6805525 6805723 + 1 NA intron (NM_001258206, intron 1 of 25) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32916 NM_001258206 7409 Hs.116237 NM_005428 ENSG00000141968 VAV1 VAV vav guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 471.5-6 chr22 30734521 30735175 + 1 NA intron (NM_030758, intron 1 of 13) intron (NM_030758, intron 1 of 13) 3291 NR_036171 100422912 NR_036171 ENSG00000264661 MIR3200 mir-3200 microRNA 3200 ncRNA 155.5-92 chr2 60334616 60334973 + 1 NA Intergenic Intergenic 48242 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 205.25-97 chr7 4116764 4117146 + 1 NA intron (NM_152744, intron 25 of 44) intron (NM_152744, intron 25 of 44) -12730 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 208.75-40 chr2 188531504 188531762 + 1 NA intron (NM_016315, intron 6 of 11) intron (NM_016315, intron 6 of 11) 234141 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 327.25 chr1 97140605 97141047 + 1 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) intron (NM_000110, intron 20 of 22) 44903 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 208.25-39 chr18 6751915 6752164 + 1 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -22177 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 121.5-210 chr5 103200058 103200263 + 1 NA intron (NM_001345878, intron 28 of 28) L1MEf|LINE|L1 -58603 NM_033211 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 162.5-160 chr7 21014735 21014963 + 1 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) intron (NR_126381, intron 2 of 5) 179418 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 157.75-112 chr3 129467428 129467623 + 1 NA intron (NM_052985, intron 9 of 30) L1ME4a|LINE|L1 27301 NM_052985 55764 Hs.655284 NM_018262 ENSG00000163913 IFT122 CED|CED1|SPG|WDR10|WDR10p|WDR140 intraflagellar transport 122 protein-coding 272.25-27 chr2 77958319 77958711 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 -3489 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 175.5-172 chr8 126389085 126389320 + 1 NA Intergenic Intergenic 63707 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 301.25-15 chr17 31681114 31681562 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 105927 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 178.75-73 chr4 101624221 101624492 + 1 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -166251 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 187.75-80 chr4 103667125 103667434 + 1 NA intron (NM_001059, intron 1 of 4) (AAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 52706 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 254.75-44 chr5 173396645 173397004 + 1 NA Intergenic Intergenic 49369 NR_107023 102465862 NR_107023 ENSG00000274994 MIR8056 hsa-mir-8056 microRNA 8056 ncRNA 215.75-34 chr14 70471951 70472282 + 1 NA intron (NR_037933, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 11640 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 194.25-117 chr8 109502087 109502365 + 1 NA intron (NM_177531, intron 67 of 77) HERV16-int|LTR|ERVL -37474 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 170.5-183 chr8 58845282 58845515 + 1 NA intron (NM_014729, intron 4 of 8) intron (NM_014729, intron 4 of 8) -185545 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 163.5-204 chr8 73411923 73412249 + 1 NA Intergenic Intergenic -7988 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 143.25-3 chr1 37433130 37433321 + 1 NA Intergenic Intergenic 41218 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 199.5-109 chr4 95568835 95569068 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -19978 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 284.5-17 chr14 90030307 90030720 + 1 NA intron (NM_001330205, intron 14 of 14) intron (NM_001330205, intron 14 of 14) -31481 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 207.25-62 chr3 193603452 193603954 + 1 NA intron (NM_001354663, intron 2 of 29) MER57A-int|LTR|ERV1 10495 NM_001354663 4976 Hs.594504 NM_015560 ENSG00000198836 OPA1 BERHS|MGM1|MTDPS14|NPG|NTG|largeG OPA1 mitochondrial dynamin like GTPase protein-coding 112.5-177 chr4 61050226 61050397 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -93345 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 125.25-85 chr18 6089646 6089861 + 1 NA intron (NM_001365766, intron 15 of 16) MIRb|SINE|MIR -166991 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-176 chr4 91892094 91892255 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 385128 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 158.25-123 chr6 67493490 67493683 + 1 NA Intergenic Intergenic -561765 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 228.5-21 chr11 24806627 24806940 + 1 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 309730 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 141.5-128 chr21 30124471 30124750 + 1 NA Intergenic Intergenic 42195 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 309.5-40 chr6 167282219 167282716 + 1 NA Intergenic MER92C|LTR|ERV1 -8848 NM_001143947 54346 Hs.567508 NM_018974 ENSG00000112494 UNC93A Unc-93A|dJ366N23.1|dJ366N23.2 unc-93 homolog A protein-coding 193.5-81 chr2 33193602 33193973 + 1 NA intron (NM_206943, intron 7 of 33) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 59190 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 180.75-35 chr14 33629734 33630005 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -79068 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 203.5-116 chr5 133968421 133968712 + 1 NA promoter-TSS (NM_020199) promoter-TSS (NM_020199) 59 NM_020199 56951 Hs.744034 NM_020199 ENSG00000113583 C5orf15 HTGN29|KCT2 chromosome 5 open reading frame 15 protein-coding 188.75-118 chr8 129419838 129420060 + 1 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 64193 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 212.75-91 chr7 2324359 2324659 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10068 NM_013321 29886 Hs.584900 NM_013321 ENSG00000106266 SNX8 Mvp1 sorting nexin 8 protein-coding 187.25-114 chrX 101463709 101463949 + 1 NA intron (NR_028407, intron 4 of 15) AluSz|SINE|Alu -21627 NR_045863 100131755 Hs.729062 NM_152583 ENSG00000196440 ARMCX4 CXorf35|GASP4 armadillo repeat containing X-linked 4 protein-coding 159.5-75 chr17 30340187 30340442 + 1 NA Intergenic Intergenic -6257 NM_001319942 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 171.5-13 chr10 44549065 44549402 + 1 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -164136 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 266.5-75 chr8 86488914 86489298 + 1 NA intron (NM_001286719, intron 2 of 8) intron (NM_001286719, intron 2 of 8) 19580 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 216.25-48 chr18 10298968 10299246 + 1 NA Intergenic Intergenic 115263 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 156.5-158 chr5 151816251 151816463 + 1 NA Intergenic Intergenic -44181 NR_132345 100652758 Hs.587054 NM_001278082 LOC100652758 - uncharacterized LOC100652758 ncRNA 167.25-112 chr3 189393022 189393258 + 1 NA Intergenic Intergenic -152546 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 300.5-24 chr2 28075954 28076387 + 1 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) AluJb|SINE|Alu 79803 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 298.5-12 chr2 39635177 39635696 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30062 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 308.25-4 chr10 68142657 68143077 + 1 NA intron (NM_001256268, intron 6 of 23) intron (NM_001256268, intron 6 of 23) 33379 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 147.5-127 chr21 34133892 34134057 + 1 NA intron (NM_032476, intron 2 of 2) intron (NM_032476, intron 2 of 2) -46703 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 177.5-45 chr14 46279558 46279810 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -191675 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 206.75-43 chr2 205780905 205781177 + 1 NA intron (NM_201266, intron 15 of 16) intron (NM_201266, intron 15 of 16) 98540 NM_201267 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 123.5-60 chr14 62912190 62912368 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 133179 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 128.75-157 chr5 123940772 123940922 + 1 NA Intergenic Intergenic 395430 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 115.75-13 chr10 10640650 10640875 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 154152 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 146.75-140 chr6 119904189 119904466 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -110852 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 160.5-71 chr17 56361526 56361820 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 6 of 20) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 208198 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 301.25-29 chr8 78575869 78576439 + 1 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -17651 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 113.25-101 chr21 29449526 29449659 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -46455 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 182.75-56 chr17 70095104 70095447 + 1 NA intron (NM_001270422, intron 1 of 5) MER89|LTR|ERV1 -9570 NM_001291624 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 250.25-22 chr19 58057340 58057652 + 1 NA Intergenic Intergenic -1743 NM_007134 7694 Hs.85863 NM_003436 ENSG00000176293 ZNF135 ZNF61|ZNF78L1|pHZ-17|pT3 zinc finger protein 135 protein-coding 254.75-52 chr8 26554661 26555069 + 1 NA intron (NM_001197293, intron 1 of 13) L1MCa|LINE|L1 -23080 NM_001386 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 165.5-165 chr6 79847070 79847363 + 1 NA Intergenic Intergenic -34970 NR_131786 89758 Hs.288213 NM_001243308 LINC01621 C6orf7 long intergenic non-protein coding RNA 1621 ncRNA 169.5-44 chr13 98974346 98974515 + 1 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) intron (NM_015296, intron 1 of 55) 3634 NM_001366679 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 198.75-87 chr6 137185107 137185366 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -11592 NM_181309 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 177.25-3 chr1 88063688 88063880 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -620360 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 149.75-30 chr12 38602743 38602955 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 286075 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 255.5-87 chr8 113474968 113475368 + 1 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 -38229 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 152.5-117 chr3 99814270 99814496 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -3479 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 227.75-84 chr8 121348803 121349096 + 1 NA Intergenic Intergenic -290397 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 243.25-37 chr4 68274248 68274657 + 1 NA Intergenic LTR59|LTR|ERV1 -28758 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 271.25-11 chr11 81041887 81042187 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -279234 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 223.5-133 chr8 124050179 124050601 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 22 of 40) intron (NM_001039112, intron 22 of 40) -9608 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 144.75-42 chr12 32866614 32866904 + 1 NA intron (NM_001005242, intron 4 of 12) L1ME1|LINE|L1 30087 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 285.5-2 chr1 214797723 214798066 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 194699 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 122.5-114 chr2 138744280 138744483 + 1 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 36009 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 142.5-162 chr4 185908720 185908883 + 1 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 47571 NM_021069 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 150.5-170 chr5 42578520 42578778 + 1 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 12785 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 116.75-56 chr14 46559029 46559217 + 1 NA Intergenic Intergenic 87764 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 148.5-25 chr10 44960907 44961108 + 1 NA intron (NM_032023, intron 1 of 10) intron (NM_032023, intron 1 of 10) 1205 NM_032023 83937 Hs.522895 NM_032023 ENSG00000107551 RASSF4 AD037 Ras association domain family member 4 protein-coding 196.25-48 chr17 58475009 58475258 + 1 NA intron (NM_001080439, intron 2 of 5) intron (NM_001080439, intron 2 of 5) 13275 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 183.75-34 chr12 110970502 110970815 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -12840 NR_135001 105369980 Hs.564357 NR_135001 ENSG00000258240 LOC105369980 - uncharacterized LOC105369980 ncRNA 178.5-126 chr4 111821150 111821357 + 1 NA Intergenic Intergenic -324201 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 249.25-44 chr5 92705548 92705955 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 865592 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 160.5-8 chr1 217296317 217296560 + 1 NA Intergenic Intergenic -158736 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 184.5-41 chr14 45725888 45726187 + 1 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 -10435 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 132.5-10 chr1 61128301 61128614 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) AluJb|SINE|Alu 45896 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 162.75-119 chr5 106267115 106267329 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 743792 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 204.25-22 chr12 5203519 5203867 + 1 NA Intergenic Intergenic 39458 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 213.5-2 chr1 45221306 45221564 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -14830 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 138.75-13 chr1 210396681 210396852 + 1 NA intron (NM_001170564, intron 4 of 9).2 L1MD2|LINE|L1 67400 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 170.75-6 chr1 176226894 176227104 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19713 NM_022457 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 196.25-35 chr14 55781253 55781484 + 1 NA non-coding (NR_026797, exon 3 of 3) non-coding (NR_026797, exon 3 of 3) 15123 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 138.5-74 chr16 76015957 76016216 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -261315 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 132.75-202 chr9 81724169 81724397 + 1 NA intron (NR_109772, intron 1 of 3) intron (NR_109772, intron 1 of 3) 34570 NR_109772 101927502 Hs.528628 NR_109772 ENSG00000233926 LOC101927502 - uncharacterized LOC101927502 ncRNA 167.25-143 chr7 46230162 46230407 + 1 NA Intergenic Intergenic -309012 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 194.5-150 chr8 4529609 4529917 + 1 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 465151 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 112.5-64 chr13 62025526 62025695 + 1 NA intron (NR_046995, intron 1 of 1) intron (NR_046995, intron 1 of 1) 3938 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 176.75-133 chr9 37181517 37181706 + 1 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1MB7|LINE|L1 61013 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 183.75-39 chr14 46609431 46609715 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 42208 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 212.5-35 chr15 93878794 93879062 + 1 NA TTS (NR_120321) TTS (NR_120321) 21671 NR_138083 283682 Hs.134687 NR_138083 LINC01579 - long intergenic non-protein coding RNA 1579 ncRNA 188.5-144 chr8 11660035 11660393 + 1 NA Intergenic Intergenic -16721 NM_001308094 2626 Hs.243987 NM_002052 ENSG00000136574 GATA4 ASD2|TACHD|TOF|VSD1 GATA binding protein 4 protein-coding 208.75-75 chr6 73925173 73925661 + 1 NA Intergenic SVA_B|Retroposon|SVA -144034 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 159.5-68 chr16 47761335 47761580 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -97124 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 165.5-71 chr2 9614134 9614422 + 1 NA intron (NM_006826, intron 2 of 5) intron (NM_006826, intron 2 of 5) 16719 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 190.25-19 chr11 35614115 35614363 + 1 NA Intergenic Intergenic -4221 NM_014344 24147 Hs.39384 NM_014344 ENSG00000179431 FJX1 - four-jointed box kinase 1 protein-coding 133.5-157 chr3 38939297 38939530 + 1 NA intron (NM_014139, intron 3 of 25) intron (NM_014139, intron 3 of 25) 11148 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 210.5-91 chr4 126835770 126836095 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -797025 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 181.5-149 chr7 75672720 75673064 + 1 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) L1MB3|LINE|L1 66049 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 172.5-63 chr14 38423042 38423342 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -167099 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 198.5-37 chr13 106973065 106973326 + 1 NA Intergenic Intergenic 319315 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 127.25-68 chr16 56180712 56180998 + 1 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 10239 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 224.5-36 chr14 56061037 56061403 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -57191 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 165.25-65 chr2 56074475 56074662 + 1 NA TTS (NR_135590) TTS (NR_135590) 15814 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 131.5-18 chr1 218657954 218658131 + 1 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) L3|LINE|CR1 147947 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 180.5-39 chr14 68311165 68311392 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 317509 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 216.5-4 chr1 172185310 172185629 + 1 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) intron (NR_146559, intron 15 of 20) -40634 NR_103486 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 132.75-67 chr14 74101062 74101217 + 1 NA intron (NM_001024674, intron 4 of 5) intron (NM_001024674, intron 4 of 5) 16186 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 136.75-184 chr7 36464895 36465181 + 1 NA Intergenic MER87|LTR|ERV1 -74681 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 283.75-5 chr10 123838540 123839005 + 1 NA intron (NM_198148, intron 4 of 13) intron (NM_198148, intron 4 of 13) 53035 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 240.75-73 chr7 123277905 123278157 + 1 NA Intergenic Intergenic -78060 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 176.5-104 chr2 216367195 216367476 + 1 NA intron (NM_020814, intron 1 of 3) (TCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 5148 NM_020814 57574 Hs.170388 NM_020814 ENSG00000144583 MARCH4 MARCH-IV|RNF174 membrane associated ring-CH-type finger 4 protein-coding 240.5-109 chrX 52503601 52504001 + 1 NA Intergenic Intergenic 7924 NR_033254 653220 Hs.112208 NM_001097591 ENSG00000204379 XAGE1A CT12.1|CT12.1A|CT12.1B|CTP9|GAGED2|XAGE-1|XAGE1|XAGE1B X antigen family member 1A protein-coding 145.75-140 chr6 137355082 137355445 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -135833 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 338.25-23 chr4 101707648 101708372 + 1 NA Intergenic Intergenic -82597 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 186.25-5 chr1 112403019 112403357 + 1 NA intron (NM_018704, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 6974 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 177.25-46 chr14 73263115 73263391 + 1 NA intron (NM_001365907, intron 18 of 25) intron (NM_001365907, intron 18 of 25) -17252 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 248.75-6 chr10 76444319 76444664 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -443553 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 189.25-123 chr8 99821840 99822083 + 1 NA intron (NM_017890, intron 50 of 61) intron (NM_017890, intron 50 of 61) 71746 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 131.25-50 chr13 69188510 69188675 + 1 NA Intergenic Intergenic -33754 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 202.75-7 chr1 188820020 188820280 + 1 NA Intergenic Intergenic 1376522 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 176.5-58 chr14 67951669 67951956 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) UCON74|DNA?|DNA? 128220 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 198.25-19 chr10 120484916 120485121 + 1 NA intron (NR_134516, intron 2 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 28064 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 294.25-20 chr2 23507068 23507443 + 1 NA intron (NM_052920, intron 2 of 13) intron (NM_052920, intron 2 of 13) 122076 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 174.5-113 chr21 30018991 30019322 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -79104 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 150.25-40 chr12 22466253 22466505 + 1 NA intron (NM_001286176, intron 22 of 26) intron (NM_001286176, intron 22 of 26) 77818 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 148.5-38 chr11 125157582 125157854 + 1 NA TTS (NR_125759) TTS (NR_125759) 6891 NR_125759 103695364 Hs.576940 NR_125759 ENSG00000254880 PKNOX2-AS1 - PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 160.75-62 chr19 28096844 28097060 + 1 NA Intergenic Intergenic -303012 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 186.5-122 chr6 89655179 89655592 + 1 NA intron (NM_014611, intron 92 of 101) intron (NM_014611, intron 92 of 101) -16638 NM_020466 57226 Hs.177275 NM_020466 ENSG00000083099 LYRM2 DJ122O8.2 LYR motif containing 2 protein-coding 135.5-151 chr4 108057185 108057355 + 1 NA intron (NM_001130714, intron 9 of 9) intron (NM_001130714, intron 9 of 9) 52606 NM_001331027 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 198.5-22 chr11 85041617 85041863 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2|LINE|L2 -118319 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 143.75-72 chr18 987957 988327 + 1 NA Intergenic Intergenic -60149 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 245.5-89 chr9 120974470 120974809 + 1 NA intron (NM_001735, intron 30 of 40) L2b|LINE|L2 -21808 NR_148450 110599590 NR_148450 C5-OT1 C5T1LNCRNA C5 3' UTR overlapping transcript 1 ncRNA 137.75-63 chr14 66243340 66243508 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -242947 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 210.5-146 chrY 11295542 11295888 + 1 NA Intergenic AluYh9|SINE|Alu 1125875 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 192.75-94 chr3 194864888 194865339 + 1 NA Intergenic Intergenic -96404 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 148.75-87 chr2 105751961 105752232 + 1 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) MER33|DNA|hAT-Charlie 7033 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 113.75-201 chr8 137144430 137144814 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 268966 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 192.75-126 chr8 113468162 113468409 + 1 NA Intergenic Intergenic -31346 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 272.25-54 chr6 154262203 154262666 + 1 NA intron (NM_001130699, intron 4 of 12) intron (NM_001130699, intron 4 of 12) 67647 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 135.75-51 chr13 72763422 72763655 + 1 NA exon (NM_001322348, exon 15 of 20) exon (NM_001322348, exon 15 of 20) 18362 NM_014953 22894 Hs.744104 NM_014953 ENSG00000083520 DIS3 2810028N01Rik|EXOSC11|KIAA1008|RRP44|dis3p DIS3 homolog, exosome endoribonuclease and 3'-5' exoribonuclease protein-coding 143.75-101 chr2 187942353 187942736 + 1 NA Intergenic (GA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 345147 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 172.5-17 chr1 183422925 183423113 + 1 NA Intergenic Intergenic -4639 NM_015039 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 227.5-51 chr2 51682679 51683118 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 650297 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 208.25-83 chr7 39650766 39651058 + 1 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 27340 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 174.75-75 chr3 5797914 5798238 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -547821 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 192.5-120 chr7 41171189 41171502 + 1 NA Intergenic Intergenic 69741 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 137.5-90 chr17 29291276 29291467 + 1 NA intron (NM_020772, intron 1 of 3) intron (NM_020772, intron 1 of 3) 2777 NM_020772 57532 Hs.462598 NM_020772 ENSG00000108256 NUFIP2 182-FIP|82-FIP|FIP-82|PIG1 nuclear FMR1 interacting protein 2 protein-coding 296.75-24 chr3 186179513 186179958 + 1 NA intron (NM_001346, intron 22 of 24) intron (NM_001346, intron 22 of 24) -70646 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 121.5-60 chr12 59955428 59955646 + 1 NA Intergenic Intergenic 266167 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 342.75-29 chr8 120169449 120170073 + 1 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 44659 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 177.25-29 chr11 92923142 92923328 + 1 NA Intergenic Intergenic -7607 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 147.75-153 chr8 98733918 98734112 + 1 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 91656 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 126.75-112 chr2 105957354 105957557 + 1 NA Intergenic Intergenic 105608 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 126.5-190 chr5 68827691 68827881 + 1 NA Intergenic Intergenic 202141 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 134.25-109 chr3 51484837 51485101 + 1 NA intron (NR_146065, intron 1 of 25) AluSq2|SINE|Alu 15033 NM_001171904 9730 Hs.716623 NM_014703 ENSG00000145041 DCAF1 RIP|VPRBP DDB1 and CUL4 associated factor 1 protein-coding 152.5-162 chr6 28330887 28331216 + 1 NA intron (NM_030899, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 5083 NM_001243243 64288 Hs.656413 NM_030899 ENSG00000235109 ZSCAN31 ZNF20-Lp|ZNF310P|ZNF323 zinc finger and SCAN domain containing 31 protein-coding 160.75-5 chr1 46065324 46065565 + 1 NA intron (NR_137329, intron 4 of 8) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 65229 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 120.25-97 chr2 103497746 103497953 + 1 NA Intergenic Intergenic -513420 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 137.5-191 chr5 63607599 63607843 + 1 NA Intergenic Intergenic 354571 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 227.5-29 chr14 47686596 47687038 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -11863 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 161.25-65 chr16 19961155 19961520 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -75703 NM_001304771 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 112.5-202 chr5 159607108 159607266 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -140911 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 223.5-17 chr10 103160290 103160552 + 1 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) L1MB7|LINE|L1 -6600 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 275.25-10 chr11 34048014 34048492 + 1 NA Intergenic Intergenic -3478 NM_005898 4076 Hs.471818 NM_005898 ENSG00000135387 CAPRIN1 GPIAP1|GPIP137|GRIP137|M11S1|RNG105|p137GPI cell cycle associated protein 1 protein-coding 172.5-140 chr4 47895230 47895582 + 1 NA intron (NR_103795, intron 10 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -18821 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 277.25-20 chr2 13101775 13102107 + 1 NA Intergenic Intergenic -94928 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 225.25-76 chr7 28264842 28265288 + 1 NA Intergenic Intergenic -34256 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 149.75-163 chr8 84760462 84760865 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 54736 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 174.75-63 chr2 114708436 114708649 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 125006 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 348.75-4 chr11 17214338 17214972 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -6669 NM_001321378 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 163.5-22 chr10 57062987 57063206 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 241463 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 144.25-196 chr8 32103308 32103596 + 1 NA intron (NR_104156, intron 3 of 3) L1MA2|LINE|L1 77234 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 266.75-14 chr18 11934716 11935195 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -26638 NM_001319154 65258 Hs.712666 NM_023075 ENSG00000154889 MPPE1 PGAP5 metallophosphoesterase 1 protein-coding 183.5-46 chr14 92098028 92098469 + 1 NA intron (NR_028468, intron 1 of 8) FLAM_A|SINE|Alu 8334 NM_001164776 4287 Hs.532632 NM_004993 ENSG00000066427 ATXN3 AT3|ATX3|JOS|MJD|MJD1|SCA3 ataxin 3 protein-coding 199.5-146 chr8 90348733 90349082 + 1 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) L1MC3|LINE|L1 127419 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 169.5-93 chr21 31072833 31073090 + 1 NA Intergenic Intergenic -34485 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 208.5-77 chr2 187851049 187851408 + 1 NA Intergenic Intergenic -296723 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 148.75-148 chr6 131483408 131483665 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -89690 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 291.5-44 chr6 107903485 107904007 + 1 NA intron (NM_007214, intron 11 of 20) intron (NM_007214, intron 11 of 20) 54462 NM_007214 11231 Hs.26904 NM_007214 ENSG00000025796 SEC63 DNAJC23|ERdj2|PCLD2|PRO2507|SEC63L SEC63 homolog, protein translocation regulator protein-coding 131.5-33 chr11 60235583 60235790 + 1 NA intron (NM_001351235, intron 1 of 5) intron (NM_001351235, intron 1 of 5) 7451 NM_001351235 643680 Hs.559934 NM_001351235 MS4A4E - membrane spanning 4-domains A4E protein-coding 176.5-69 chr17 12799100 12799300 + 1 NA intron (NM_001321164, intron 1 of 20) intron (NM_001321164, intron 1 of 20) -8916 NR_104607 100128006 Hs.567641 NR_104607 ENSG00000265489 LOC100128006 - uncharacterized LOC100128006 ncRNA 169.25-39 chr16 58201794 58201993 + 1 NA Intergenic Intergenic -3787 NM_001896 1459 Hs.82201 NM_001896 ENSG00000070770 CSNK2A2 CK2A2|CK2alpha'|CSNK2A1 casein kinase 2 alpha 2 protein-coding 125.25-132 chr3 42278999 42279217 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -12923 NM_000729 885 Hs.458426 NM_000729 ENSG00000187094 CCK - cholecystokinin protein-coding 118.75-175 chr6 160527475 160527766 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -16496 NR_028092 80350 Hs.654503 NM_024492 ENSG00000213071 LPAL2 APOA2|APOAL|APOARGC|apo(a)rg-C lipoprotein(a) like 2, pseudogene pseudo 194.25-80 chr4 42000409 42000774 + 1 NA intron (NM_006345, intron 1 of 17) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 10061 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 144.5-73 chr15 72177100 72177264 + 1 NA intron (NM_001012642, intron 1 of 11) MER5B|DNA|hAT-Charlie 20605 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 146.25-102 chr3 121028245 121028568 + 1 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) intron (NR_145517, intron 3 of 8) -21234 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 140.75-122 chr3 128450497 128450813 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12939 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 279.75-25 chr2 127337872 127338346 + 1 NA intron (NM_006609, intron 2 of 15) intron (NM_006609, intron 2 of 15) 5120 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 211.5-52 chr14 66017821 66018136 + 1 NA Intergenic Intergenic -468393 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 219.5-68 chr2 70439146 70439583 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42276 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 144.5-158 chr4 106621611 106621847 + 1 NA Intergenic Intergenic 188105 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 135.25-82 chr18 47364634 47364889 + 1 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) L1MA5|LINE|L1 -15735 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 135.5-77 chr17 60044327 60044506 + 1 NA intron (NM_022070, intron 19 of 19) MER91A|DNA|hAT-Tip100 -1311 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 278.5-11 chr12 10800629 10801121 + 1 NA TTS (NM_023919) TTS (NM_023919) 1752 NM_023919 50837 Hs.533754 NM_023919 ENSG00000121377 TAS2R7 T2R7|TRB4 taste 2 receptor member 7 protein-coding 264.25-6 chr10 19811952 19812316 + 1 NA Intergenic Intergenic -4298 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 283.5-57 chr8 123230529 123231209 + 1 NA intron (NM_001204180, intron 5 of 5) AluSx3|SINE|Alu 10508 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 168.5-157 chr6 41010915 41011275 + 1 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 12185 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 150.75-21 chr1 209412770 209413039 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -15916 NR_145436 642587 Hs.510543 NR_145433 ENSG00000230937 MIR205HG LINC00510|NPC-A-5 MIR205 host gene ncRNA 227.5-70 chr3 64026922 64027209 + 1 NA Intergenic Intergenic -3055 NM_001271780 9861 Hs.152536 NM_014814 ENSG00000163636 PSMD6 Rpn7|S10|SGA-113M|p42A|p44S10 proteasome 26S subunit, non-ATPase 6 protein-coding 188.25-21 chr11 66717123 66717568 + 1 NA intron (NM_006946, intron 2 of 36) intron (NM_006946, intron 2 of 36) 4054 NM_006946 6712 Hs.26915 NM_006946 ENSG00000173898 SPTBN2 GTRAP41|SCA5|SCAR14 spectrin beta, non-erythrocytic 2 protein-coding 164.25-36 chr13 40583506 40583789 + 1 NA intron (NM_002015, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 82994 NM_002015 2308 Hs.370666 NM_002015 ENSG00000150907 FOXO1 FKH1|FKHR|FOXO1A forkhead box O1 protein-coding 321.25-24 chr8 110849207 110849978 + 1 NA Intergenic Intergenic 177841 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 273.5-74 chr7 90373542 90374046 + 1 NA intron (NM_001042717, intron 3 of 7) intron (NM_001042717, intron 3 of 7) -22498 NR_102424 101409256 NR_102424 LOC101409256 - cell division cycle 42 pseudogene pseudo 130.5-45 chr10 71831630 71831977 + 1 NA intron (NM_001042465, intron 3 of 14) intron (NM_001042465, intron 3 of 14) 19448 NM_001042465 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 287.25-38 chr5 31588527 31589194 + 1 NA Intergenic LTR10B1|LTR|ERV1 -50271 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 185.5-150 chr7 36372139 36372474 + 1 NA intron (NM_001100425, intron 2 of 6) intron (NM_001100425, intron 2 of 6) -5066 NM_015314 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 155.5-19 chr10 5321045 5321329 + 1 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -43779 NM_053049 114131 Hs.511775 NM_053049 ENSG00000178473 UCN3 SCP|SPC|UCNIII urocortin 3 protein-coding 134.5-216 chr8 60047893 60048086 + 1 NA Intergenic Intergenic 233411 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 159.75-139 chr5 123141191 123141447 + 1 NA intron (NM_001136239, intron 3 of 7) intron (NM_001136239, intron 3 of 7) -51003 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 222.5-90 chr5 157506815 157507351 + 1 NA exon (NM_033274, exon 10 of 23) exon (NM_033274, exon 10 of 23) -46983 NR_136205 102724404 Hs.570889 NR_136204 LOC102724404 - uncharacterized LOC102724404 ncRNA 197.75-30 chr17 51469063 51469344 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 33776 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 221.5-19 chr13 43842962 43843396 + 1 NA intron (NM_144974, intron 6 of 6) L1MEc|LINE|L1 -35999 NM_001128303 144811 Hs.210586 NM_153218 ENSG00000179630 LACC1 C13orf31|FAMIN laccase domain containing 1 protein-coding 195.5-44 chr14 86677576 86677811 + 1 NA Intergenic Intergenic -228085 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 150.25-121 chr5 42698960 42699152 + 1 NA intron (NM_001242403, intron 5 of 9) intron (NM_001242403, intron 5 of 9) -57762 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 253.5-55 chr4 16761910 16762216 + 1 NA intron (NM_001304435, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 136582 NM_001304434 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 157.75-53 chr15 52793347 52793718 + 1 NA Intergenic Intergenic -3196 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 180.25-2 chr1 199799794 199799988 + 1 NA Intergenic Intergenic -227819 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 253.25-20 chr13 53983305 53983602 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 149418 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 187.5-166 chr8 75498634 75498864 + 1 NA intron (NM_001330561, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 -41219 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 159.5-203 chr8 56220803 56221019 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 9122 NM_001011671 79145 Hs.436913 NM_024300 ENSG00000170791 CHCHD7 COX23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 7 protein-coding 147.25-141 chr8 62478321 62478573 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 229593 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 116.25-84 chr17 50355842 50356038 + 1 NA exon (NM_022167, exon 6 of 11) exon (NM_022167, exon 6 of 11) 9814 NM_022167 64132 Hs.463416 NM_022167 ENSG00000015532 XYLT2 PXYLT2|SOS|XT-II|XT2|xylT-II xylosyltransferase 2 protein-coding 170.5-174 chr7 35021067 35021404 + 1 NA intron (NM_015283, intron 1 of 21) intron (NM_015283, intron 1 of 21) 16250 NM_001366673 23333 Hs.408623 NM_015283 ENSG00000173852 DPY19L1 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 protein-coding 113.25-56 chr15 56703495 56703657 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 3 of 20) AluJb|SINE|Alu 30510 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 282.5-59 chr7 7574946 7575260 + 1 NA intron (NM_001370078, intron 3 of 8) intron (NM_001370078, intron 3 of 8) 7077 NM_001370078 54468 Hs.520215 NM_019005 ENSG00000164654 MIOS MIO|Sea4|Yulink meiosis regulator for oocyte development protein-coding 121.5-232 chr7 3862475 3862666 + 1 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -267115 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 154.25-193 chrX 141728546 141728780 + 1 NA Intergenic Intergenic -29924 NM_032417 64648 Hs.375036 NM_032417 ENSG00000196406 SPANXD CT11.3|CT11.4|SPANX-C|SPANX-D|SPANX-E|SPANXC|SPANXE|dJ171K16.1 SPANX family member D protein-coding 139.75-79 chr17 72180594 72180902 + 1 NA Intergenic Intergenic 59728 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 679.25 chr4 94190054 94191282 + 1 NA intron (NR_125922, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 16888 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 192.5-42 chr15 40509941 40510148 + 1 NA Intergenic (ATATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22506 NR_002208 359821 Hs.678598 NR_002208 MRPL42P5 - mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 5 pseudo 168.25-19 chr10 94319692 94319992 + 1 NA intron (NM_001165979, intron 28 of 31) intron (NM_001165979, intron 28 of 31) -32772 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 243.25-39 chr4 87013729 87014176 + 1 NA intron (NM_001313960, intron 1 of 17) intron (NM_001313960, intron 1 of 17) 6951 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 305.25-4 chr1 186034851 186035262 + 1 NA intron (NM_031935, intron 36 of 106) intron (NM_031935, intron 36 of 106) -261217 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 183.75-75 chr3 68739593 68739801 + 1 NA intron (NM_001005527, intron 4 of 5) L1PB4|LINE|L1 192850 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 145.5-5 chr1 30733038 30733424 + 1 NA 3' UTR (NM_006762, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_006762, exon 8 of 8) 6001 NR_039616 100616164 NR_039616 ENSG00000264773 MIR4420 mir-4420 microRNA 4420 ncRNA 162.5-5 chr1 115261859 115262133 + 1 NA Intergenic Intergenic -21038 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 180.5-123 chr5 79752921 79753254 + 1 NA intron (NM_153610, intron 6 of 12) intron (NM_153610, intron 6 of 12) 63251 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 176.5-39 chr12 41408253 41408468 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -29379 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 204.25-11 chr10 68083633 68083980 + 1 NA Intergenic Intergenic -8523 NM_015601 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 203.25-23 chr11 46421350 46421625 + 1 NA intron (NM_001267782, intron 16 of 19) intron (NM_001267782, intron 16 of 19) -29819 NM_001366692 1132 Hs.248100 NM_000741 ENSG00000180720 CHRM4 HM4|M4R cholinergic receptor muscarinic 4 protein-coding 188.25-102 chr6 115049709 115049940 + 1 NA Intergenic Intergenic 594011 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 186.5-12 chr1 198862619 198862846 + 1 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) -3579 NR_029626 406995 NR_029626 ENSG00000207759 MIR181A1 MIR213|MIRN181A1|MIRN213|hsa-mir-181a-1|mir-181a-1|mir-213 microRNA 181a-1 ncRNA 192.75-5 chr1 90206068 90206300 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 211074 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 198.5-139 chr8 26854758 26855045 + 1 NA intron (NM_001322504, intron 1 of 1) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 10754 NM_033303 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 114.25-5 chr1 155380343 155380559 + 1 NA intron (NM_001366177, intron 7 of 27) intron (NM_001366177, intron 7 of 27) -34006 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 187.5-142 chr5 127917957 127918210 + 1 NA intron (NM_001317938, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu 165092 NR_152813 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 199.5-51 chr16 9886175 9886504 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 4 of 13) intron (NM_001134408, intron 4 of 13) 295728 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 223.5-8 chr1 159577189 159577594 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -10435 NM_001639 325 Hs.507080 NM_001639 ENSG00000132703 APCS HEL-S-92n|PTX2|SAP amyloid P component, serum protein-coding 132.25-168 chr6 127075669 127075849 + 1 NA Intergenic Intergenic -42912 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 346.25-18 chr8 111437237 111437909 + 1 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) L1MD|LINE|L1 60934 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 233.5-92 chr5 174533183 174533480 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -191251 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 179.5-20 chr10 56512056 56512352 + 1 NA Intergenic Intergenic -150931 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 242.75-13 chr12 73558369 73558653 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 399321 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 230.5-104 chr7 31846824 31847227 + 1 NA intron (NM_001191059, intron 10 of 18) intron (NM_001191059, intron 10 of 18) 159810 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 211.75-46 chr2 62985897 62986207 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 15 of 22) intron (NM_001142615, intron 15 of 22) 61659 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 121.5-256 chr8 139184640 139184821 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -270689 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 162.25-36 chr12 65819556 65819729 + 1 NA intron (NR_026825, intron 1 of 1) L3|LINE|CR1 -4818 NM_001330190 8091 Hs.505924 NM_003483 ENSG00000149948 HMGA2 BABL|HMGI-C|HMGIC|LIPO|STQTL9 high mobility group AT-hook 2 protein-coding 163.5-154 chr5 14482817 14483128 + 1 NA intron (NM_007118, intron 46 of 56) intron (NM_007118, intron 46 of 56) 18989 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 149.5-219 chr9 29185213 29185464 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 26961 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 189.25-65 chr20 3144270 3144506 + 1 NA intron (NR_038395, intron 6 of 6) L1M4|LINE|L1 15477 NM_199415 22888 Hs.654646 NM_014948 ENSG00000185019 UBOX5 RNF37|UBCE7IP5|UIP5|hUIP5 U-box domain containing 5 protein-coding 183.5-53 chr16 81581009 81581297 + 1 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) L1MB5|LINE|L1 -30195 NR_106759 102465251 NR_106759 ENSG00000275109 MIR6504 hsa-mir-6504 microRNA 6504 ncRNA 293.5-34 chr5 19127642 19128001 + 1 NA Intergenic Intergenic 758451 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 139.5-42 chr12 32727961 32728121 + 1 NA intron (NM_001330380, intron 10 of 18) L1MD2|LINE|L1 27856 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 163.25-80 chr20 49014171 49014386 + 1 NA intron (NM_006420, intron 30 of 38) intron (NM_006420, intron 30 of 38) 31778 NR_110624 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 147.25-135 chr7 129586591 129586753 + 1 NA Intergenic LTR2|LTR|ERV1 -25048 NM_001293164 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 169.5-52 chr14 68168218 68168412 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 344723 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 188.5-56 chr17 67803436 67803743 + 1 NA Intergenic Intergenic -21914 NM_182641 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 163.75-17 chr10 23198630 23198818 + 1 NA Intergenic Intergenic 6412 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 132.5-254 chr9 31126442 31126637 + 1 NA Intergenic Intergenic 254951 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 149.5-118 chr22 35053870 35054130 + 1 NA Intergenic Intergenic -12158 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 142.25-59 chr14 73671779 73672044 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) intron (NM_001201366, intron 6 of 8) 26925 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 142.25-123 chr4 91525501 91525709 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 751697 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 151.25-163 chr6 108097786 108097969 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -23136 NM_014028 28962 Hs.226780 NM_014028 ENSG00000081087 OSTM1 GIPN|GL|HSPC019|OPTB5 osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1 protein-coding 141.75-75 chr18 1479711 1479861 + 1 NA Intergenic Intergenic -120157 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 253.5-62 chr5 72287475 72287876 + 1 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) intron (NM_001286748, intron 4 of 11) 32565 NM_015084 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 151.25-82 chr2 32899578 32899750 + 1 NA intron (NR_027099, intron 9 of 10) AluJb|SINE|Alu -27463 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 233.25-54 chr4 81293291 81293778 + 1 NA Intergenic Intergenic -78312 NM_001363401 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 190.25-20 chr11 74909544 74909867 + 1 NA intron (NM_001270380, intron 8 of 14) intron (NM_001270380, intron 8 of 14) 39386 NM_182969 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 182.5-60 chr16 66000207 66000455 + 1 NA Intergenic Intergenic -366360 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 317.75-8 chr11 34622664 34623359 + 1 NA intron (NM_012153, intron 1 of 8) intron (NM_012153, intron 1 of 8) 1918 NM_012153 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 180.25-30 chr15 80155367 80155578 + 1 NA intron (NM_000137, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 2473 NM_000137 2184 Hs.73875 NM_000137 ENSG00000103876 FAH - fumarylacetoacetate hydrolase protein-coding 193.5-19 chr10 111730281 111730600 + 1 NA Intergenic Intergenic 453325 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 317.5-26 chr5 171959949 171960389 + 1 NA intron (NM_012300, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 46704 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 323.5-11 chr15 67038415 67038910 + 1 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) intron (NR_135686, intron 2 of 5) 25520 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 241.75-62 chr5 98038051 98038335 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 123046 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 137.5-198 chr5 150893894 150894134 + 1 NA TTS (NM_001172832) TTS (NM_001172832) 10969 NM_001172832 91975 Hs.134885 NM_052860 ENSG00000145908 ZNF300 - zinc finger protein 300 protein-coding 294.25-21 chr2 31261114 31261558 + 1 NA intron (NM_014600, intron 4 of 5) intron (NM_014600, intron 4 of 5) 27184 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 248.5-85 chr5 104621373 104621695 + 1 NA Intergenic Intergenic -477940 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 146.5-223 chr8 89585701 89585971 + 1 NA Intergenic Intergenic 171875 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 368.5-7 chr18 1900475 1901058 + 1 NA Intergenic Intergenic -541137 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 123.25-154 chr4 163879476 163879696 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) L1ME3G|LINE|L1 -266052 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 255.75-5 chr10 15164831 15165144 + 1 NA intron (NM_001308295, intron 1 of 12) AluSq2|SINE|Alu 3706 NM_004808 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 227.5-72 chr3 97996705 97997077 + 1 NA intron (NM_001105580, intron 8 of 9) intron (NM_001105580, intron 8 of 9) -24440 NM_001261829 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 213.5-33 chr14 34187227 34187451 + 1 NA Intergenic Intergenic -236265 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 117.75-46 chr12 107842371 107842615 + 1 NA Intergenic Intergenic 61278 NR_037629 728739 Hs.741995 NR_037629 LOC728739 - programmed cell death 2 pseudogene pseudo 191.25-88 chr5 115176671 115177042 + 1 NA TTS (NM_001017398) TTS (NM_001017398) 3438 NM_001300752 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 170.25-95 chr3 38262264 38262463 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -3449 NM_004256 9390 Hs.225941 NM_004256 ENSG00000172940 SLC22A13 OAT10|OCTL1|OCTL3|ORCTL-3|ORCTL3 solute carrier family 22 member 13 protein-coding 421.5-3 chr10 78969559 78970369 + 1 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) intron (NR_015429, intron 3 of 7) 97484 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 166.25-81 chr2 145599691 145600145 + 1 NA Intergenic Intergenic 931951 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 309.75-21 chr2 134645651 134646043 + 1 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) L1ME1|LINE|L1 73153 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 148.5-185 chr5 73494266 73494500 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -4042 NM_001207 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 128.75-95 chr2 53551475 53551693 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -216199 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 183.25-30 chr13 66436665 66437067 + 1 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 218616 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 165.5-151 chr5 127632028 127632322 + 1 NA Intergenic Intergenic -16846 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 154.5-95 chr2 52869527 52869799 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -167048 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 120.25-100 chr2 126796011 126796230 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -102770 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 199.5-30 chr12 14615204 14615567 + 1 NA intron (NM_004963, intron 25 of 26) intron (NM_004963, intron 25 of 26) -47502 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 120.5-34 chr11 25321437 25321621 + 1 NA Intergenic Intergenic 824476 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 172.5-123 chr3 54940744 54940984 + 1 NA intron (NM_001304389, intron 1 of 2) intron (NM_001304389, intron 1 of 2) -12805 NM_020678 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 142.75-84 chr17 80555140 80555375 + 1 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) intron (NM_020761, intron 1 of 33) 10419 NM_001163034 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 159.5-84 chr18 35547077 35547336 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -44531 NR_039771 100616257 NR_039771 ENSG00000283514 MIR3975 - microRNA 3975 ncRNA 231.5-104 chr9 17333254 17333607 + 1 NA intron (NM_001365029, intron 10 of 25) intron (NM_001365029, intron 10 of 25) 198390 NM_001114395 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 165.25-18 chr10 68208380 68208703 + 1 NA intron (NR_045663, intron 17 of 17) intron (NR_045663, intron 17 of 17) 23572 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 140.75-92 chr2 121416238 121416518 + 1 NA intron (NM_001207051, intron 22 of 37) intron (NM_001207051, intron 22 of 37) -114502 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 215.5-104 chr8 40766510 40766749 + 1 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) intron (NM_024645, intron 3 of 6) 131197 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 117.75-219 chr8 139998056 139998257 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) L1MEf|LINE|L1 102379 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 308.5-9 chr15 64166749 64167137 + 1 NA 3' UTR (NM_001329606, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001329606, exon 12 of 12) -3788 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 244.5-88 chr7 42631213 42631550 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 75066 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 290.5-22 chr2 71610754 71611269 + 1 NA intron (NM_001130985, intron 36 of 54) intron (NM_001130985, intron 36 of 54) 144312 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 126.5-42 chr11 94949137 94949375 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 24300 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 167.5-82 chr18 71743888 71744221 + 1 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) intron (NR_126324, intron 1 of 4) 38172 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 282.75-8 chr11 81066994 81067595 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -304491 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 177.5-2 chr1 29881045 29881354 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 156413 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 223.5-22 chr11 28648260 28648589 + 1 NA Intergenic Intergenic -170876 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 113.5-244 chr9 12956786 12957095 + 1 NA Intergenic Intergenic 15693 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 115.5-50 chr13 73497444 73497662 + 1 NA Intergenic Intergenic -66691 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 127.5-215 chr6 134147828 134148130 + 1 NA Intergenic Intergenic 26887 NM_001291995 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 236.5-79 chr6 64535756 64536186 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 729135 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 168.75-150 chr8 104613491 104613841 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -24642 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 219.5-87 chr3 110086047 110086306 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 483348 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 202.75-25 chr12 60468599 60469077 + 1 NA Intergenic Intergenic 779468 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 194.5-7 chr1 204076794 204077098 + 1 NA intron (NM_005686, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 3831 NM_005686 9580 Hs.201671 NM_005686 ENSG00000143842 SOX13 ICA12|Sox-13 SRY-box transcription factor 13 protein-coding 215.5-55 chr2 138025757 138026159 + 1 NA Intergenic Intergenic 61485 NM_001024075 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 237.5-51 chr2 113051098 113051637 + 1 NA intron (NM_173178, intron 1 of 4) intron (NM_173178, intron 1 of 4) 1500 NM_173178 27177 Hs.278909 NM_014438 ENSG00000136696 IL36B FIL1|FIL1-(ETA)|FIL1H|FILI-(ETA)|IL-1F8|IL-1H2|IL1-ETA|IL1F8|IL1H2 interleukin 36 beta protein-coding 213.5-107 chr6 57201712 57201994 + 1 NA intron (NM_001278667, intron 3 of 6) intron (NM_001278667, intron 3 of 6) 19608 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 191.75-2 chr1 77194144 77194371 + 1 NA intron (NM_005482, intron 3 of 10) L1PREC2|LINE|L1 25173 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 131.5-70 chr15 27860622 27860775 + 1 NA intron (NM_001300984, intron 20 of 22) L1PA17|LINE|L1 238617 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 232.5-22 chr13 109738516 109738835 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 10401 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 127.25-167 chr5 45579328 45579631 + 1 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 116901 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 236.75-20 chr14 36129425 36129757 + 1 NA intron (NR_073454, intron 1 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 47060 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 240.25-19 chr12 118441496 118441853 + 1 NA Intergenic Intergenic 65119 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 150.75-23 chr10 29913252 29913578 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 146171 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 229.5-9 chr1 169914293 169914670 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -20522 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 167.5-203 chrX 70511132 70511398 + 1 NA Intergenic Intergenic -55271 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 208.75-33 chr17 59767329 59767587 + 1 NA intron (NM_001329400, intron 4 of 9) intron (NM_001329400, intron 4 of 9) 59804 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 287.25-32 chr3 18245820 18246320 + 1 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) L1MB3|LINE|L1 179269 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 206.75-35 chr2 59694793 59695071 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 477224 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 141.25-5 chr1 48912852 48913065 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) L2c|LINE|L2 -135989 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 115.5-174 chr3 122285924 122286141 + 1 NA 3' UTR (NM_000388, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_000388, exon 7 of 7) -39216 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 331.5-24 chr6 87788878 87789530 + 1 NA intron (NR_110869, intron 2 of 4) intron (NR_110869, intron 2 of 4) 4344 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 215.75-98 chr8 118362515 118362879 + 1 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) intron (NM_001363274, intron 4 of 4) -250878 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 152.75-134 chr6 10068892 10069213 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -335450 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 220.5-83 chr3 196741538 196742052 + 1 NA intron (NM_002577, intron 1 of 14) intron (NM_002577, intron 1 of 14) 1938 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 272.25-12 chr12 100678715 100679169 + 1 NA Intergenic Intergenic 85324 NM_001303131 283431 Hs.20575 NM_174942 ENSG00000139354 GAS2L3 G2L3 growth arrest specific 2 like 3 protein-coding 168.25-5 chr1 80426734 80426919 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -108929 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 234.75-30 chr18 34468327 34468573 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -24840 NM_032975 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 160.5-85 chr2 39956720 39956968 + 1 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 39210 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-154 chr3 79093324 79093478 + 1 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) MER97a|DNA|hAT-Tip100 -73942 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 143.5-113 chr2 66714374 66714590 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -11255 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 229.5 chr1 7631781 7632184 + 1 NA intron (NM_001349608, intron 5 of 21) intron (NM_001349608, intron 5 of 21) -37748 NM_001349621 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 257.75-9 chr11 57801883 57802242 + 1 NA exon (NM_001206885, exon 7 of 20) exon (NM_001206885, exon 7 of 20) 40260 NM_001206884 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 122.5 chr1 6756404 6756609 + 1 NA Intergenic Intergenic 28474 NR_149049 110841581 NR_149049 CAMTA1-DT lncCAMTA1 CAMTA1 divergent transcript ncRNA 248.5-65 chr3 70618030 70618377 + 1 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -305565 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 150.5-144 chr4 45427983 45428199 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 695963 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 217.5-137 chr9 129731087 129731416 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12545 NR_132102 101929437 Hs.112596 NR_132102 ENSG00000236024 PRRX2-AS1 - PRRX2 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-103 chr2 206548639 206548887 + 1 NA intron (NM_003812, intron 8 of 25) intron (NM_003812, intron 8 of 25) -95464 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 129.5-35 chr11 28074051 28074229 + 1 NA intron (NM_031217, intron 10 of 16) intron (NM_031217, intron 10 of 16) 17325 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 206.75-53 chr3 49187615 49187828 + 1 NA intron (NM_001080528, intron 2 of 3) intron (NM_001080528, intron 2 of 3) 4137 NM_001080528 646498 NM_001080528 ENSG00000236980 C3orf84 - chromosome 3 open reading frame 84 protein-coding 122.75-97 chr2 110987877 110988077 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 14 of 18) MER112|DNA|hAT-Charlie 127611 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 114.5-258 chr8 78146799 78146996 + 1 NA Intergenic Intergenic -369443 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 229.75-40 chr20 28785681 28786041 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -183196 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 212.75-11 chr10 80666979 80667233 + 1 NA Intergenic Intergenic 17309 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 176.5-107 chr2 236478496 236478747 + 1 NA intron (NR_073043, intron 5 of 19) L1MA4|LINE|L1 25076 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 272.25-16 chr14 70880407 70880747 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -26882 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 155.75-148 chr7 54534559 54534847 + 1 NA Intergenic Intergenic -7622 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 125.5-84 chr14 68149751 68149888 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 326227 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 303.75-16 chr17 53883339 53883913 + 1 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 60699 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 238.5-43 chr2 132881181 132881546 + 1 NA intron (NM_207481, intron 8 of 17) AluSq2|SINE|Alu -34194 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-122 chr3 67185229 67185443 + 1 NA Intergenic Intergenic -40128 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 252.75-32 chr2 100746323 100746687 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -73634 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 112.5-194 chr5 105539034 105539246 + 1 NA Intergenic Intergenic 439666 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 329.75-20 chr8 111247475 111248258 + 1 NA Intergenic (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -11663 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 179.75-111 chr5 146332859 146333092 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -5864 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 309.5-6 chr10 11483865 11484365 + 1 NA intron (NM_014688, intron 13 of 14) intron (NM_014688, intron 13 of 14) 48165 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 198.75-20 chr12 43546316 43546555 + 1 NA intron (NM_025003, intron 2 of 38) intron (NM_025003, intron 2 of 38) 5768 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 270.25-41 chr5 84218123 84218401 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) intron (NM_001278642, intron 2 of 9) 166605 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 138.75-7 chr1 111173430 111173618 + 1 NA intron (NR_138485, intron 5 of 9) intron (NR_138485, intron 5 of 9) 27122 NM_024901 79961 Hs.557850 NM_024901 ENSG00000162777 DENND2D - DENN domain containing 2D protein-coding 153.5-186 chr7 91669342 91669552 + 1 NA Intergenic Intergenic 211255 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 179.25-78 chr2 135565676 135565993 + 1 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) LTR14A|LTR|ERVK -20518 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 147.75-138 chr7 4478245 4478433 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -203956 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 122.75-163 chr5 72947194 72947516 + 1 NA Intergenic Intergenic -8686 NM_138782 115548 Hs.165762 NM_138782 ENSG00000157107 FCHO2 - FCH domain only 2 protein-coding 119.5-81 chr14 69284398 69284552 + 1 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) intron (NM_020692, intron 1 of 15) 24317 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 188.5-147 chr8 63108380 63108748 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -22511 NM_000370 7274 Hs.69049 NM_000370 ENSG00000137561 TTPA ATTP|AVED|TTP1|alphaTTP alpha tocopherol transfer protein protein-coding 131.75-90 chr17 28377466 28377670 + 1 NA intron (NM_015077, intron 1 of 8) intron (NM_015077, intron 1 of 8) 5874 NM_015077 23098 Hs.743510 NM_015077 ENSG00000004139 SARM1 MyD88-5|SAMD2|SARM sterile alpha and TIR motif containing 1 protein-coding 237.75-53 chr3 169653728 169654232 + 1 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) 9732 NM_001366473 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 148.75-91 chr2 162444057 162444309 + 1 NA intron (NM_033272, intron 7 of 15) L2a|LINE|L2 99815 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 229.25-48 chr2 181982726 181983105 + 1 NA intron (NR_048567, intron 2 of 4) intron (NR_048567, intron 2 of 4) -2909 NM_001080545 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 194.25-23 chr12 46763117 46763415 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 62731 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 134.5-231 chr8 122768730 122768941 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -12820 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 202.5-20 chr10 94881941 94882203 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -56586 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 177.25-85 chr21 28172811 28173083 + 1 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) intron (NR_126012, intron 3 of 5) 55720 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 271.25-6 chr1 204231707 204232267 + 1 NA intron (NM_014935, intron 17 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger -17999 NM_198447 127845 Hs.532401 NM_198447 ENSG00000174567 GOLT1A CGI-141|GOT1|HMFN1187|YMR292W|hGOT1b golgi transport 1A protein-coding 151.25-182 chr7 118073437 118073639 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -110626 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 132.75-201 chr9 74641119 74641340 + 1 NA intron (NM_006914, intron 3 of 9) intron (NM_006914, intron 3 of 9) 25695 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 130.5-228 chr7 55446457 55446678 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 80313 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 120.25-148 chr4 58809174 58809355 + 1 NA Intergenic Intergenic -175018 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 139.25-148 chr5 44737207 44737363 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 71508 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 162.25-150 chr7 21247722 21248111 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -180167 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 268.75-30 chr4 73859541 73859912 + 1 NA Intergenic Intergenic 6430 NM_002620 5197 Hs.72933 NM_002620 ENSG00000109272 PF4V1 CXCL4L1|CXCL4V1|PF4-ALT|PF4A|SCYB4V1 platelet factor 4 variant 1 protein-coding 131.75-106 chr2 55575183 55575347 + 1 NA intron (NM_001122964, intron 11 of 16) intron (NM_001122964, intron 11 of 16) 42357 NM_020463 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 200.25-100 chr7 39843530 39843881 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 105714 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 161.25-46 chr14 33605086 33605481 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) L1ME1|LINE|L1 -103654 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 177.25-129 chr6 80275924 80276176 + 1 NA intron (NR_134945, intron 10 of 10) intron (NR_134945, intron 10 of 10) 169379 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 330.5-7 chr12 14771933 14772484 + 1 NA Intergenic Intergenic -1077 NM_175054 121504 Hs.745457 NM_175054 ENSG00000197837 HIST4H4 H4/p histone cluster 4 H4 protein-coding 230.5-86 chr4 61549749 61550216 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 347810 NM_001371342 114.25-65 chr15 98876789 98876996 + 1 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 92466 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 121.75-188 chr8 80356430 80356607 + 1 NA Intergenic Intergenic 115129 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 141.25-60 chr16 5880185 5880355 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -138754 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 123.75-11 chr1 186839047 186839344 + 1 NA intron (NM_024420, intron 1 of 17) intron (NM_024420, intron 1 of 17) 10246 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 207.5-22 chr14 68056905 68057172 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluSq2|SINE|Alu 233446 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 118.25-166 chr6 35826974 35827149 + 1 NA Intergenic Intergenic 21709 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 170.25-43 chr15 68258393 68258605 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19246 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 220.5-67 chr21 16266969 16267254 + 1 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) 17657 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 117.25-32 chr10 89243276 89243571 + 1 NA intron (NM_001288979, intron 1 of 7) intron (NM_001288979, intron 1 of 7) 8352 NM_000235 3988 Hs.643030 NM_000235 ENSG00000107798 LIPA CESD|LAL lipase A, lysosomal acid type protein-coding 220.5-68 chr21 29682693 29682957 + 1 NA intron (NM_001320621, intron 1 of 13) L1PA16|LINE|L1 -65350 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 257.5-63 chr6 36110160 36110475 + 1 NA 3' UTR (NM_001315, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001315, exon 12 of 12) -20196 NM_002754 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 202.75-16 chr10 116546073 116546356 + 1 NA intron (NM_000936, intron 2 of 12) intron (NM_000936, intron 2 of 12) 283 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 229.5-37 chr13 28173460 28173847 + 1 NA intron (NM_175854, intron 1 of 18) intron (NM_175854, intron 1 of 18) -34479 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 234.25-36 chr2 183514399 183514748 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 390130 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 151.25-115 chr22 20766715 20766975 + 1 NA intron (NM_058004, intron 19 of 54) intron (NM_058004, intron 19 of 54) -7268 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 175.75-47 chr16 25630323 25630587 + 1 NA Intergenic Intergenic -61504 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 119.5-261 chrX 65384491 65384662 + 1 NA Intergenic Intergenic -104159 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 135.25-30 chr10 99091191 99091387 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 144586 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 202.25-46 chr21 26247595 26247823 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -76581 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 207.75-121 chr7 84525877 84526357 + 1 NA Intergenic Intergenic -6359 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 142.5-57 chr13 26000105 26000316 + 1 NA intron (NM_016529, intron 35 of 36) intron (NM_016529, intron 35 of 36) 50850 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 395.5-14 chr3 50325992 50326792 + 1 NA exon (NM_007275, exon 2 of 3) exon (NM_007275, exon 2 of 3) 1846 NM_007275 11334 Hs.517981 NM_007275 ENSG00000114383 TUSC2 C3orf11|FUS1|PAP|PDAP2 tumor suppressor 2, mitochondrial calcium regulator protein-coding 257.5-69 chr7 16467968 16468514 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2503 NM_015464 25928 Hs.648106 NM_015464 ENSG00000171243 SOSTDC1 CDA019|DAND7|ECTODIN|USAG1 sclerostin domain containing 1 protein-coding 198.5-42 chr14 48147251 48147614 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -352418 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 336.25-2 chr10 17337268 17337763 + 1 NA intron (NM_001004470, intron 4 of 7) intron (NM_001004470, intron 4 of 7) -49421 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 178.75-65 chr3 110184353 110184632 + 1 NA Intergenic Intergenic 581664 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 178.5-189 chr9 16854004 16854393 + 1 NA intron (NM_001317940, intron 1 of 5) intron (NM_001317940, intron 1 of 5) 16472 NM_001317939 54796 Hs.656581 NM_017637 ENSG00000173068 BNC2 BSN2 basonuclin 2 protein-coding 371.75-10 chr22 26244315 26244995 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 75181 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 215.75-54 chr2 149236298 149236611 + 1 NA Intergenic Intergenic -93531 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 196.5-36 chr11 100517211 100517490 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -169938 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 127.5-244 chr8 119114135 119114293 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -45432 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 117.25-140 chr3 67242190 67242406 + 1 NA Intergenic Intergenic 16834 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 136.5-31 chr10 101641161 101641412 + 1 NA intron (NR_136613, intron 4 of 7) L1MC5|LINE|L1 -39789 NR_036115 100423033 NR_036115 ENSG00000283558 MIR3158-2 mir-3158-2 microRNA 3158-2 ncRNA 206.5-68 chr21 23838693 23839162 + 1 NA Intergenic Intergenic -454092 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 197.25-61 chr21 14398307 14398514 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -15264 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 246.5-64 chr6 79232068 79232338 + 1 NA intron (NM_138730, intron 1 of 5) intron (NM_138730, intron 1 of 5) -1471 NR_040671 100288198 Hs.586270 NR_040671 ENSG00000270362 HMGN3-AS1 - HMGN3 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-90 chr2 152992728 152992962 + 1 NA Intergenic Intergenic 274208 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 268.25-13 chr14 56382169 56382611 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -131941 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 136.25-6 chr1 67360699 67360964 + 1 NA intron (NM_001319233, intron 10 of 15) L1MCa|LINE|L1 53467 NM_001319233 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 250.25-14 chr17 42853812 42854398 + 1 NA intron (NM_001277732, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 862 NM_001277732 8639 Hs.198241 NM_003734 ENSG00000131471 AOC3 HPAO|SSAO|VAP-1|VAP1 amine oxidase copper containing 3 protein-coding 284.75-36 chr7 7245949 7246422 + 1 NA 3' UTR (NM_020156, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_020156, exon 4 of 4) -8969 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 213.5-37 chr14 60698563 60698938 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 25601 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 191.5-159 chrX 51927081 51927374 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 33604 NM_006986 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 126.5-108 chr2 34049008 34049210 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L1MB7|LINE|L1 -18117 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 151.5-68 chr17 73235649 73235849 + 1 NA exon (NM_001288770, exon 3 of 5) exon (NM_001288770, exon 3 of 5) 3088 NM_001351265 55028 Hs.12929 NM_017941 ENSG00000141219 C17orf80 HLC-8|MIG3|SPEP1 chromosome 17 open reading frame 80 protein-coding 190.75-33 chr15 60156617 60156973 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 152484 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 120.75-60 chr16 83483809 83484078 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -24403 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 166.5-180 chr6 130412962 130413259 + 1 NA intron (NM_001258277, intron 2 of 2) intron (NM_001258277, intron 2 of 2) -7986 NM_001258278 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 177.75-13 chr1 196567556 196567856 + 1 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) L2a|LINE|L2 14775 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 127.75-36 chr10 123377953 123378105 + 1 NA Intergenic Intergenic 223627 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 137.25-10 chr1 237904409 237904640 + 1 NA intron (NR_027247, intron 5 of 11) intron (NR_027247, intron 5 of 11) -13602 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 184.5-62 chr18 8411766 8412038 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -44868 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 325.75-24 chr5 3581625 3582099 + 1 NA Intergenic Intergenic -13970 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 126.25-173 chr6 35762073 35762230 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -14443 NR_104469 389383 Hs.259563 NM_207409 ENSG00000196748 CLPSL2 AAAL3045|C6orf126|UNQ3045|dJ510O8.5 colipase like 2 protein-coding 123.5-33 chr11 24679297 24679579 + 1 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 182385 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 155.25-167 chr7 99676097 99676529 + 1 NA non-coding (NR_033807, exon 2 of 13) non-coding (NR_033807, exon 2 of 13) 3683 NM_001291829 1577 Hs.571258 NM_000777 ENSG00000106258 CYP3A5 CP35|CYPIIIA5|P450PCN3|PCN3 cytochrome P450 family 3 subfamily A member 5 protein-coding 119.5-79 chr14 66973929 66974121 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -215415 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 267.5-65 chr7 360819 361162 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18435 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 187.25-45 chr18 47512881 47513244 + 1 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) intron (NR_147192, intron 1 of 2) 132566 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 260.25-34 chr3 128387665 128387963 + 1 NA intron (NM_021937, intron 6 of 6) intron (NM_021937, intron 6 of 6) -75780 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 157.5-184 chr6 165558974 165559222 + 1 NA intron (NM_001130690, intron 1 of 21) L2|LINE|L2 103002 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 216.75-22 chr14 32166773 32167042 + 1 NA Intergenic Intergenic -35138 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 157.5-223 chr9 71240687 71240951 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -119198 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 123.25-8 chr1 155683241 155683530 + 1 NA intron (NM_001198901, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu -3556 NM_001198899 55249 Hs.584927 NM_018253 ENSG00000163374 YY1AP1 GRNG|HCCA1|HCCA2|YY1AP YY1 associated protein 1 protein-coding 377.75-11 chr6 157707352 157708000 + 1 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -115570 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 157.25-86 chr20 8174214 8174404 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) L1MD2|LINE|L1 42043 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 262.5-8 chr10 70180477 70180950 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10199 NM_001142648 56681 Hs.499960 NM_020150 ENSG00000079332 SAR1A SAR1|SARA1|Sara|masra2 secretion associated Ras related GTPase 1A protein-coding 301.75-10 chr14 25070687 25071139 + 1 NA Intergenic Intergenic -20616 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 273.5-65 chr5 123586319 123586798 + 1 NA intron (NM_001044723, intron 5 of 12) intron (NM_001044723, intron 5 of 12) 41141 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 161.75-19 chr10 50242781 50242993 + 1 NA intron (NM_001143974, intron 3 of 18) MIR|SINE|MIR 5723 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 196.5-152 chr7 9666269 9666589 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 32159 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 177.75-88 chr20 11110477 11110911 + 1 NA Intergenic Intergenic 84150 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 173.5-117 chr4 116414687 116414910 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 115073 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 158.5-75 chr15 69637095 69637321 + 1 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) intron (NR_126437, intron 3 of 5) 45008 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 112.5-126 chr2 117064220 117064443 + 1 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -750360 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 252.75 chr1 160211645 160212067 + 1 NA intron (NM_003768, intron 2 of 3) intron (NM_003768, intron 2 of 3) -2987 NR_123725 729867 Hs.674191 NR_123725 ENSG00000227741 LOC729867 - uncharacterized LOC729867 ncRNA 191.25-97 chr7 77682669 77683084 + 1 NA TTS (NR_038361) TTS (NR_038361) 13389 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 181.25-99 chr5 44262835 44263096 + 1 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -125767 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 292.75-22 chr22 49730373 49731000 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -73167 NR_110523 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 224.25-76 chr5 19201836 19202180 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 684264 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 210.5-101 chr5 85073190 85073439 + 1 NA Intergenic Intergenic -688434 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 234.5-26 chr14 49391686 49392115 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 194480 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 212.5-110 chr7 144829413 144829783 + 1 NA intron (NM_001350887, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 6342 NM_001350880 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 170.75-56 chr18 46555765 46555961 + 1 NA intron (NM_001145472, intron 3 of 23) MIRc|SINE|MIR 906 NM_001308013 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 211.5-165 chr9 12750469 12750970 + 1 NA intron (NR_125775, intron 3 of 3) L1MD2|LINE|L1 -24301 NM_203403 286343 Hs.445356 NM_203403 ENSG00000153714 LURAP1L C9orf150|HYST0841|LRAP35b|bA3L8.2 leucine rich adaptor protein 1 like protein-coding 236.25-46 chr2 160835676 160836001 + 1 NA Intergenic Intergenic -301117 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 199.5-8 chr1 113748133 113748520 + 1 NA intron (NM_001323043, intron 3 of 18) HAL1|LINE|L1 10829 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 114.5-181 chr3 123218930 123219131 + 1 NA intron (NM_012430, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 17087 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 170.5-26 chr10 57880016 57880277 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 387748 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 271.5-92 chr8 130279678 130280100 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 16644 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 139.25-189 chr8 29597316 29597498 + 1 NA Intergenic Intergenic 150702 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 370.5-8 chr14 82834653 82835434 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 192411 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 178.25-103 chr6 108777342 108777561 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 25797 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 166.5-142 chr4 41573949 41574199 + 1 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) 35917 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 229.5-133 chr8 126572197 126572491 + 1 NA Intergenic Intergenic -13866 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 157.75-30 chr11 64413000 64413236 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -35939 NR_073177 100996455 Hs.634142 NR_073177 ENSG00000181908 LINC02724 - long intergenic non-protein coding RNA 2724 ncRNA 225.25-55 chr3 118035529 118035951 + 1 NA Intergenic Intergenic -344815 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 225.25-59 chr4 43142954 43143249 + 1 NA Intergenic Intergenic 249835 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 137.5-101 chr18 1315032 1315265 + 1 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) L1M7|LINE|L1 44481 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 263.25-24 chr16 63492496 63492893 + 1 NA Intergenic Intergenic -1456256 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 150.25-51 chr14 50086503 50086866 + 1 NA intron (NR_131171, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR 18359 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 283.75-16 chr2 63150655 63151147 + 1 NA intron (NR_148704, intron 18 of 18) intron (NR_148704, intron 18 of 18) -31359 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 212.25-54 chr22 37802494 37802753 + 1 NA Intergenic (GAGGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2484 NM_005318 3005 Hs.745024 NM_005318 ENSG00000189060 H1F0 H10|H1FV H1 histone family member 0 protein-coding 141.5-215 chr7 100688434 100688678 + 1 NA 5' UTR (NM_022574, exon 1 of 24) 5' UTR (NM_022574, exon 1 of 24) 892 NM_022574 64599 Hs.414396 NM_022574 ENSG00000146830 GIGYF1 GYF1|PERQ1 GRB10 interacting GYF protein 1 protein-coding 181.75-132 chr8 124572930 124573281 + 1 NA intron (NM_001363294, intron 6 of 13) intron (NM_001363294, intron 6 of 13) 33982 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 165.5-122 chr3 196483805 196483990 + 1 NA intron (NM_152617, intron 3 of 5) intron (NM_152617, intron 3 of 5) 19871 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 150.25-35 chr11 115027952 115028127 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -305538 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 134.25-16 chr10 78060699 78060970 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 26971 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 209.75-82 chr6 42884395 42884737 + 1 NA intron (NM_198486, intron 3 of 6) intron (NM_198486, intron 3 of 6) 4950 NM_001366481 285855 Hs.520133 NM_198486 ENSG00000146223 RPL7L1 dJ475N16.4 ribosomal protein L7 like 1 protein-coding 118.5-5 chr1 78198627 78198913 + 1 NA Intergenic Intergenic -30829 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 312.25-6 chr12 60195824 60196241 + 1 NA Intergenic Intergenic 506662 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 310.25-6 chr14 46479507 46479862 + 1 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) intron (NR_102700, intron 1 of 1) 8325 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 171.5-23 chr11 86094933 86095238 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -25225 NM_001206947 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 165.5-15 chr10 32685855 32686212 + 1 NA exon (NM_001321115, exon 23 of 44) exon (NM_001321115, exon 23 of 44) 215439 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 178.5-117 chr4 36037032 36037337 + 1 NA intron (NR_146893, intron 35 of 36) intron (NR_146893, intron 35 of 36) 206755 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 119.75-122 chr20 15589423 15589545 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) L1MC1|LINE|L1 333830 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 146.75-162 chr8 112215074 112215381 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -428266 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 121.5-165 chr22 35346534 35346666 + 1 NA intron (NR_156428, intron 12 of 13) MIRb|SINE|MIR -9801 NR_106717 102464824 NR_106717 ENSG00000274280 MIR6069 hsa-mir-6069 microRNA 6069 ncRNA 282.25-26 chr3 113628673 113629025 + 1 NA non-coding (NR_136283, exon 24 of 24) non-coding (NR_136283, exon 24 of 24) 33973 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 246.5-42 chr2 78349717 78350207 + 1 NA Intergenic Intergenic -59231 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 273.5-24 chr15 27689765 27690066 + 1 NA Intergenic Intergenic 409400 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 115.5-64 chr14 62715856 62715980 + 1 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) intron (NM_172375, intron 9 of 9) 329540 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 116.25-151 chr3 142322073 142322211 + 1 NA intron (NM_019001, intron 37 of 41) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -96557 NM_001039547 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 173.25-133 chr8 138849523 138849700 + 1 NA intron (NM_152888, intron 3 of 64) L3b|LINE|CR1 64430 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 146.5-143 chr3 153891330 153891610 + 1 NA Intergenic Intergenic -128944 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 143.5-222 chr8 137669804 137670086 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -256357 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 148.5-76 chr16 60101305 60101547 + 1 NA Intergenic Intergenic 246073 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 113.25-75 chr18 25730295 25730520 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 360206 NM_001007559 6760 Hs.129261 NM_005637 ENSG00000141380 SS18 SSXT|SYT SS18 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 185.5-145 chr6 126019305 126019593 + 1 NA intron (NM_001031712, intron 11 of 12) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 32909 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 235.5-81 chr7 100047716 100048178 + 1 NA Intergenic Intergenic -1827 NM_145914 7589 Hs.632294 NM_145914 ENSG00000166529 ZSCAN21 NY-REN-21|ZNF38|Zipro1 zinc finger and SCAN domain containing 21 protein-coding 313.5-42 chrX 86866877 86867440 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 604190 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 114.75-62 chr15 93649454 93649617 + 1 NA Intergenic Intergenic -207025 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 158.25-144 chr8 75087448 75087682 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 87410 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 161.25-111 chr22 33892861 33893097 + 1 NA intron (NM_001362949, intron 1 of 15) intron (NM_001362949, intron 1 of 15) 27449 NM_004737 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 180.25-81 chr3 189009676 189010000 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -62199 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 172.25-149 chrX 58164231 58164573 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -253769 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 153.75-124 chr5 162799349 162799612 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -638091 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 207.75-26 chr12 39082243 39082645 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -176853 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 155.5-146 chr4 83387153 83387455 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -52151 NM_001166498 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 232.25-78 chr8 86990554 86990997 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA3|LINE|L1 124360 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 290.25-16 chr2 45628861 45629407 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -17867 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 136.25-125 chr3 132291946 132292085 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25392 NM_001134194 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 128.25-183 chr7 18418279 18418444 + 1 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) -77349 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 187.5-53 chr13 110659519 110659929 + 1 NA intron (NM_024537, intron 9 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 44140 NM_001242881 55739 Hs.408324 NM_018210 ENSG00000213995 NAXD CARKD|LP3298|PEBEL2 NAD(P)HX dehydratase protein-coding 227.25-72 chr7 26537784 26538289 + 1 NA intron (NR_022006, intron 1 of 1) intron (NR_022006, intron 1 of 1) 789 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 180.5-10 chr10 25803553 25803811 + 1 NA Intergenic Intergenic 130028 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 372.75-9 chr2 173637001 173637438 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 282347 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 188.25-19 chr11 32635463 32635743 + 1 NA intron (NM_001008391, intron 14 of 17) intron (NM_001008391, intron 14 of 17) 51772 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 218.75-81 chr7 8334956 8335328 + 1 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 -72530 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 237.25-24 chr14 58425029 58425293 + 1 NA intron (NM_001304485, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 2081 NR_130751 26520 Hs.440525 NM_012460 ENSG00000100575 TIMM9 TIM9|TIM9A translocase of inner mitochondrial membrane 9 protein-coding 140.75-130 chr4 26215956 26216136 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -103664 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 272.75-15 chr16 87223395 87223733 + 1 NA intron (NR_110939, intron 2 of 2) intron (NR_110939, intron 2 of 2) 11449 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 281.5-11 chr10 115732093 115732554 + 1 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) L1MB8|LINE|L1 462466 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 246.25-23 chr15 56667998 56668477 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 13 of 20) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 65849 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 256.75-47 chr9 98936075 98936431 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -7654 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 415.5-10 chr8 78636640 78637573 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28983 NM_001362969 51101 Hs.271876 NM_016010 ENSG00000104427 ZC2HC1A C8orf70|CGI-62|FAM164A zinc finger C2HC-type containing 1A protein-coding 286.5-70 chr8 120371458 120371829 + 1 NA 3' UTR (NM_021110, exon 48 of 48) 3' UTR (NM_021110, exon 48 of 48) 73507 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 227.5-39 chr15 79795022 79795474 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 101749 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 201.5-10 chr1 97275028 97275363 + 1 NA intron (NR_046590, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 179272 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 127.5-147 chr3 69270763 69271000 + 1 NA intron (NM_015123, intron 5 of 22) intron (NM_015123, intron 5 of 22) 115207 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 161.25-148 chr6 28090019 28090237 + 1 NA promoter-TSS (NR_024063) promoter-TSS (NR_024063) -679 NR_024063 221584 Hs.634723 NR_024063 ZSCAN12P1 ZNF187p1|ZNF305P1|ZNF96L1|ZNF96P1|ZSCAN12L1|dJ313I6.7 zinc finger and SCAN domain containing 12 pseudogene 1 pseudo 129.5-111 chr2 37903021 37903265 + 1 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -22144 NM_001170791 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 135.5-78 chr17 61739655 61739919 + 1 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) L1MEg|LINE|L1 123772 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 214.75-65 chr5 18323799 18324182 + 1 NA Intergenic Intergenic 516716 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 115.5-145 chr2 211884610 211884830 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 541640 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 227.25-66 chr6 48821697 48821962 + 1 NA Intergenic Intergenic 641424 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 149.25-116 chr3 82600170 82600355 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 614120 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 226.5-32 chr18 7933527 7933927 + 1 NA intron (NM_002845, intron 5 of 30) intron (NM_002845, intron 5 of 30) 366411 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 158.25-114 chr5 122807896 122808099 + 1 NA intron (NM_003100, intron 6 of 14) intron (NM_003100, intron 6 of 14) 32917 NM_003100 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 320.5-21 chr2 115227029 115227556 + 1 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 65137 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 281.75-18 chr14 65038649 65039071 + 1 NA intron (NM_002028, intron 7 of 11) HAL1|LINE|L1 -5828 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 177.5-43 chr14 23494247 23494659 + 1 NA Intergenic Intergenic -17307 NR_046051 79178 Hs.655179 NM_024328 ENSG00000259431 THTPA THTP|THTPASE thiamine triphosphatase protein-coding 160.5-69 chr17 51586411 51586679 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 151118 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 277.5-38 chr20 48048231 48048639 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -58318 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 150.25-4 chr1 57274311 57274616 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR 148649 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 252.25-51 chr5 168602086 168602472 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22911 NM_024594 79646 Hs.388400 NM_024594 ENSG00000120137 PANK3 - pantothenate kinase 3 protein-coding 256.75-32 chr5 131455187 131455688 + 1 NA intron (NM_016340, intron 20 of 27) AluY|SINE|Alu 179792 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 223.5-113 chr6 140662853 140663191 + 1 NA Intergenic Intergenic -20792 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 116.5-262 chr9 25440818 25441085 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 237907 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 165.25-9 chr1 210824566 210824737 + 1 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 308723 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 169.5-151 chr6 54447739 54448026 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 139441 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 197.5-32 chr12 48779311 48779595 + 1 NA intron (NM_015270, intron 2 of 21) intron (NM_015270, intron 2 of 21) -7416 NR_039850 100616262 NR_039850 ENSG00000264201 MIR4701 - microRNA 4701 ncRNA 305.75-12 chr2 98016822 98017332 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21129 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 166.75-148 chr9 133094406 133094671 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 11999 NR_001275 1057 Hs.654361 NR_001275 ENSG00000170827 CELP CELL|cell1|cell2|cell3 carboxyl ester lipase pseudogene pseudo 244.75-4 chr1 154464682 154464969 + 1 NA intron (NM_000565, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu -37394 NM_182499 126668 Hs.387671 NM_182499 ENSG00000163239 TDRD10 - tudor domain containing 10 protein-coding 218.5-55 chr2 69908000 69908300 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6891 NM_001202514 4084 Hs.468908 NM_002357 ENSG00000059728 MXD1 BHLHC58|MAD|MAD1 MAX dimerization protein 1 protein-coding 179.5-105 chr20 38356638 38356883 + 1 NA intron (NM_004139, intron 5 of 14) intron (NM_004139, intron 5 of 14) 10278 NM_004139 3929 Hs.154078 NM_004139 ENSG00000129988 LBP BPIFD2 lipopolysaccharide binding protein protein-coding 230.75-26 chr16 55120803 55121232 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 189818 NM_001252197 10265 Hs.435730 NM_005853 ENSG00000176842 IRX5 HMMS|IRX-2a|IRXB2 iroquois homeobox 5 protein-coding 154.5-148 chr5 68780644 68780905 + 1 NA Intergenic Intergenic 249153 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 128.75-113 chr21 28308359 28308558 + 1 NA Intergenic Intergenic -79791 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 296.75-39 chr9 85981332 85981897 + 1 NA intron (NM_024635, intron 11 of 22) intron (NM_024635, intron 11 of 22) 40085 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 304.5-26 chr4 94609368 94609733 + 1 NA intron (NM_001256426, intron 9 of 16) intron (NM_001256426, intron 9 of 16) 147983 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 128.75-13 chr1 215305561 215305788 + 1 NA Intergenic Intergenic 222937 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 138.5-20 chr1 225139835 225140018 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 27 of 85) intron (NM_001367479, intron 27 of 85) 210251 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 226.25-77 chrX 121652896 121653209 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 282080 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 196.5-98 chr22 50096399 50096674 + 1 NA intron (NM_018995, intron 2 of 26) L1MB5|LINE|L1 6280 NM_001164105 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 186.5-99 chr4 90064844 90065074 + 1 NA Intergenic Intergenic -62574 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 255.5-39 chr2 28120958 28121288 + 1 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 85838 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 158.5-10 chr1 187265294 187265584 + 1 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 172597 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 162.25-4 chr1 52647954 52648435 + 1 NA intron (NR_135156, intron 3 of 5) L1ME3G|LINE|L1 15026 NR_135157 348378 Hs.424589 NM_001042693 ENSG00000182183 SHISAL2A FAM159A|PRO7171|WWLS2783 shisa like 2A protein-coding 252.5-48 chr20 58874002 58874489 + 1 NA intron (NR_126334, intron 3 of 4) intron (NR_126334, intron 3 of 4) -14168 NR_132273 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 123.25-140 chr3 149425260 149425405 + 1 NA Intergenic Intergenic 47554 NR_046650 100874091 Hs.549633 NR_046650 ENSG00000240541 TM4SF1-AS1 - TM4SF1 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-49 chr15 68260003 68260397 + 1 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -17545 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 121.5-37 chr11 11365731 11365877 + 1 NA intron (NM_198516, intron 6 of 10) intron (NM_198516, intron 6 of 10) -12554 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 198.25-73 chr3 186305053 186305434 + 1 NA intron (NM_001346, intron 3 of 24) L2a|LINE|L2 56991 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 208.5-118 chr6 40925215 40925538 + 1 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 97904 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 122.75-129 chr3 106039751 106039891 + 1 NA Intergenic MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR -170420 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 300.75-12 chr14 48863239 48863838 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 722842 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 199.75-84 chr6 161872159 161872487 + 1 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 401346 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 238.25-88 chr8 138656193 138656593 + 1 NA intron (NM_152888, intron 44 of 64) intron (NM_152888, intron 44 of 64) -158663 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 213.25-12 chr13 30983208 30983560 + 1 NA Intergenic Intergenic 50728 NM_001353389 122046 Hs.124463 NM_152325 ENSG00000175664 TEX26 C13orf26 testis expressed 26 protein-coding 151.5-31 chr12 10094472 10094708 + 1 NA intron (NM_001297750, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 4395 NM_001297751 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 116.5-67 chr14 48002368 48002539 + 1 NA Intergenic Intergenic -207439 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 178.75-87 chr5 127195452 127195741 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -95168 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 179.5-141 chr4 183609907 183610138 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 49163 NM_001307922 201965 Hs.133337 NM_152682 ENSG00000182552 RWDD4 FAM28A|RWDD4A RWD domain containing 4 protein-coding 148.5-118 chr2 218738011 218738262 + 1 NA exon (NM_014640, exon 3 of 20) exon (NM_014640, exon 3 of 20) 27301 NM_014640 9654 Hs.471405 NM_014640 ENSG00000135912 TTLL4 - tubulin tyrosine ligase like 4 protein-coding 149.25-52 chr15 32998043 32998224 + 1 NA intron (NM_001277313, intron 7 of 20) intron (NM_001277313, intron 7 of 20) 70041 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 130.75-160 chr5 146252751 146253016 + 1 NA intron (NM_018989, intron 9 of 20) intron (NM_018989, intron 9 of 20) 49278 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 163.25-42 chr14 46022144 46022413 + 1 NA Intergenic Intergenic -41881 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 275.5-75 chrX 79033937 79034372 + 1 NA Intergenic Intergenic 88763 NM_001324221 27334 Hs.296433 NM_014499 ENSG00000078589 P2RY10 LYPSR2|P2Y10 P2Y receptor family member 10 protein-coding 170.5-54 chr14 24847490 24847735 + 1 NA intron (NM_001351943, intron 5 of 6) intron (NM_001351943, intron 5 of 6) 201388 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 133.5-263 chr8 84012096 84012326 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -170576 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 152.5-11 chr1 236394163 236394334 + 1 NA promoter-TSS (NM_145861) promoter-TSS (NM_145861) -38 NM_145861 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 126.75-177 chr4 95738458 95738694 + 1 NA Intergenic Intergenic -101517 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 149.75-114 chr3 107830598 107830869 + 1 NA Intergenic Intergenic 47335 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 192.5-38 chr14 52191314 52191654 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -76214 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 322.5-38 chr6 169093930 169094416 + 1 NA Intergenic Intergenic 26387 NR_134619 102724357 Hs.129310 NR_134619 ENSG00000234519 LOC102724357 - uncharacterized LOC102724357 ncRNA 138.25-168 chr8 30738865 30739030 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5217 NM_005671 7993 Hs.153678 NM_005671 ENSG00000104691 UBXN8 D8S2298E|REP8|UBXD6 UBX domain protein 8 protein-coding 134.75-137 chr22 38234413 38234564 + 1 NA intron (NM_001195071, intron 3 of 8) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -9768 NR_132774 106635525 NR_132774 SNORA92 - small nucleolar RNA, H/ACA box 92 snoRNA 194.5-143 chr7 85388159 85388423 + 1 NA Intergenic Intergenic -32831 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 149.5-94 chr2 74400898 74401137 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -8930 NM_001190836 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 230.5-97 chr5 89096280 89096568 + 1 NA intron (NR_136221, intron 4 of 6) intron (NR_136221, intron 4 of 6) -192319 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 180.5-109 chr4 23091833 23092031 + 1 NA Intergenic Intergenic 377843 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 269.5-27 chr2 101756336 101756687 + 1 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 58804 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 226.5-21 chr14 57300252 57300622 + 1 NA Intergenic Intergenic 31466 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 160.5-175 chr7 76139681 76139880 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -31018 NR_135079 101927126 Hs.632320 NR_135079 GTF2IP7 - general transcription factor IIi pseudogene 7 pseudo 341.75-5 chr12 14162978 14163669 + 1 NA Intergenic Intergenic -182967 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 126.5-141 chr21 36906180 36906423 + 1 NA intron (NM_001352515, intron 5 of 10) AluJo|SINE|Alu 56057 NM_001352518 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 228.5-44 chr18 2555351 2555654 + 1 NA intron (NM_022840, intron 3 of 8) intron (NM_022840, intron 3 of 8) 16003 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 118.75-87 chr19 11718961 11719147 + 1 NA Intergenic Intergenic 19892 NM_001080493 55552 Hs.142167 NM_017507 ENSG00000197933 ZNF823 HSZFP36 zinc finger protein 823 protein-coding 311.75-25 chr8 119012992 119013529 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L1MC1|LINE|L1 -53987 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 125.5-162 chr22 29078708 29078920 + 1 NA intron (NM_001039570, intron 1 of 8) intron (NM_001039570, intron 1 of 8) 5779 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 153.75-128 chr6 54004352 54004585 + 1 NA intron (NR_046832, intron 3 of 3) intron (NR_046832, intron 3 of 3) 5578 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 177.25-103 chr4 12992561 12992846 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 491637 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 134.5-69 chr14 80802618 80802857 + 1 NA intron (NM_152446, intron 13 of 24) intron (NM_152446, intron 13 of 24) 139001 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 189.5-52 chr16 53891451 53891755 + 1 NA intron (NM_001363903, intron 7 of 7) AluJo|SINE|Alu -147790 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 217.5-51 chr17 33673277 33673668 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR -139712 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 199.75-58 chr20 50492550 50492764 + 1 NA Intergenic Intergenic -17664 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 170.75-136 chr8 106583018 106583286 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) MamRep1151|LTR?|LTR? -74656 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 165.25-120 chr5 83638305 83638664 + 1 NA 3' UTR (NM_001884, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001884, exon 5 of 5) -76170 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 127.75-140 chr4 29771384 29771617 + 1 NA Intergenic Intergenic 557208 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 242.25-56 chr22 50737494 50737852 + 1 NA promoter-TSS (NM_001097).2 promoter-TSS (NM_001097).2 496 NR_134637 105373100 Hs.475243 NR_134637 ENSG00000225929 LOC105373100 - uncharacterized LOC105373100 ncRNA 171.5-133 chr6 168426013 168426297 + 1 NA Intergenic Intergenic -15029 NM_022138 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 194.5-96 chr3 165899212 165899599 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -61982 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 164.5-133 chr3 71702636 71702901 + 1 NA intron (NM_173359, intron 3 of 7) intron (NM_173359, intron 3 of 7) 22634 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 239.25-48 chr2 61387983 61388333 + 1 NA intron (NM_014709, intron 5 of 79) AluJo|SINE|Alu 29219 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 123.25-142 chr3 161767769 161767958 + 1 NA Intergenic Intergenic 271055 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 185.5-107 chr3 77243404 77243697 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 145538 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 157.25-18 chr10 118702932 118703283 + 1 NA intron (NM_153810, intron 4 of 8) intron (NM_153810, intron 4 of 8) 51863 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 185.25-55 chr2 35179176 35179492 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -292071 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 118.75-147 chr5 35732246 35732396 + 1 NA intron (NM_024867, intron 21 of 36) L3|LINE|CR1 114458 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 189.75-84 chr4 60822549 60822846 + 1 NA Intergenic Intergenic -99922 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 174.75-87 chr3 173672633 173672894 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 88329 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 210.5-105 chr5 127858863 127859172 + 1 NA intron (NM_001317938, intron 5 of 6) intron (NM_001317938, intron 5 of 6) 155628 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 144.5-203 chr7 84129168 84129467 + 1 NA intron (NM_006080, intron 2 of 16) intron (NM_006080, intron 2 of 16) 65472 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 139.75-65 chr16 34586774 34587054 + 1 NA Intergenic Intergenic -205434 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 269.5-15 chr14 74025282 74025831 + 1 NA intron (NM_025057, intron 2 of 11) intron (NM_025057, intron 2 of 11) 6207 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 204.5-125 chr7 113226586 113226910 + 1 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -108166 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 237.75-43 chr2 160018839 160019143 + 1 NA intron (NM_001007267, intron 8 of 26) intron (NM_001007267, intron 8 of 26) 43624 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 176.75-99 chr5 64099095 64099381 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -66605 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 150.25-66 chr17 28499092 28499464 + 1 NA Intergenic Intergenic -7070 NM_001369369 8456 Hs.58611 NM_003593 ENSG00000109101 FOXN1 FKHL20|RONU|WHN forkhead box N1 protein-coding 186.5-136 chr8 102143480 102143895 + 1 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18255 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 207.25-33 chr18 471054 471449 + 1 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 29450 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 133.25-183 chr5 138390340 138390497 + 1 NA intron (NM_016604, intron 7 of 23) intron (NM_016604, intron 7 of 23) 37733 NM_016604 51780 Hs.483486 NM_016604 ENSG00000120733 KDM3B 5qNCA|C5orf7|JMJD1B|NET22 lysine demethylase 3B protein-coding 176.5-16 chr10 44750701 44751085 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -160423 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 158.25-126 chr6 134745817 134746183 + 1 NA Intergenic LTR16D2|LTR|ERVL 204101 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 281.75-15 chr13 77136095 77136636 + 1 NA intron (NM_015057, intron 52 of 82) L2|LINE|L2 60851 NR_046716 100874212 Hs.569288 NR_046716 ENSG00000236051 MYCBP2-AS1 - MYCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-43 chr12 13892710 13892925 + 1 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 87539 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 208.5-132 chr7 108511908 108512204 + 1 NA intron (NM_001256010, intron 3 of 9) intron (NM_001256010, intron 3 of 9) 14079 NM_001256008 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 188.25-71 chr3 22288236 22288594 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 331276 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 124.5-168 chr5 93664853 93665086 + 1 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) AluJb|SINE|Alu -44181 NR_031754 100313887 NR_031754 ENSG00000284336 MIR2277 mir-2277 microRNA 2277 ncRNA 137.75-191 chr7 28657272 28657494 + 1 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -28750 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 267.75-16 chr14 79049146 79049638 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -150590 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 274.75-43 chr5 90951875 90952426 + 1 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) intron (NR_003149, intron 83 of 89) 362252 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 130.5-99 chr15 56757729 56758041 + 1 NA Intergenic Intergenic -23799 NM_001288589 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 218.75-14 chr11 83651812 83652139 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) 30450 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 196.5-77 chr2 17272443 17272791 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 245823 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 161.5-87 chr19 56456845 56457068 + 1 NA intron (NM_001321355, intron 4 of 5) intron (NM_001321355, intron 4 of 5) 20389 NM_001321356 63934 Hs.676605 NM_022103 ENSG00000198046 ZNF667 MIPU1 zinc finger protein 667 protein-coding 221.5-21 chr13 72719331 72719563 + 1 NA intron (NM_001071775, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 8182 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 254.5-68 chr7 17184502 17184831 + 1 NA Intergenic Intergenic -113986 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 121.5-75 chr14 47100610 47100799 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 242542 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 183.5-61 chr2 47903590 47904065 + 1 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) intron (NM_001190274, intron 1 of 22) 1966 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 122.5-158 chr3 141623535 141623744 + 1 NA Intergenic Intergenic -39560 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 125.5-179 chr3 100809650 100809896 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 18 of 35) intron (NM_001349332, intron 18 of 35) 100231 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 145.5-2 chr1 26562655 26562818 + 1 NA intron (NM_002953, intron 17 of 21) intron (NM_002953, intron 17 of 21) 8194 NR_031740 100302190 NR_031740 ENSG00000238705 MIR1976 hsa-mir-1976 microRNA 1976 ncRNA 268.75-29 chr4 31924385 31924728 + 1 NA Intergenic MER72B|LTR|ERV1 -72823 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 161.5-169 chr7 28093987 28094257 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -86335 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 293.5-27 chr20 49405744 49406260 + 1 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) MER20B|DNA|hAT-Charlie 76666 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 223.25-24 chr16 66284104 66284496 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -82391 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 266.25-24 chr2 62344578 62345192 + 1 NA Intergenic MER92D|LTR|ERV1 129364 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 163.5-224 chrX 56977474 56977737 + 1 NA intron (NR_027139, intron 4 of 4) intron (NR_027139, intron 4 of 4) 17936 NM_001010862 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 190.25-76 chr20 35690047 35690385 + 1 NA intron (NM_001198989, intron 4 of 11) AluSx|SINE|Alu 9136 NR_037570 9054 Hs.194692 NM_021100 ENSG00000244005 NFS1 HUSSY-08|IscS|NIFS NFS1 cysteine desulfurase protein-coding 181.5-125 chr4 101545115 101545361 + 1 NA Intergenic Intergenic 197461 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 195.5-150 chr7 52016415 52016883 + 1 NA Intergenic Intergenic -623393 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 153.5-30 chr11 30620620 30620889 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -34401 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 126.75-50 chr14 39178217 39178430 + 1 NA intron (NM_002687, intron 6 of 8) AluSq2|SINE|Alu 3069 NM_002687 5411 Hs.409965 NM_002687 ENSG00000100941 PNN DRS|DRSP|SDK3|memA pinin, desmosome associated protein protein-coding 237.75-34 chr2 4403622 4404239 + 1 NA Intergenic Intergenic 252292 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 163.5-84 chr19 2530334 2530538 + 1 NA intron (NM_052847, intron 3 of 4) intron (NM_052847, intron 3 of 4) 54309 NM_015675 4616 Hs.110571 NM_015675 ENSG00000099860 GADD45B GADD45BETA|MYD118 growth arrest and DNA damage inducible beta protein-coding 113.5-186 chr4 111780144 111780384 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -365190 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 113.5-57 chr12 78647156 78647332 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -216738 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 152.25-154 chr8 77392307 77392555 + 1 NA Intergenic Intergenic -58266 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 182.5-34 chr11 113249726 113249936 + 1 NA intron (NM_001076682, intron 16 of 18) intron (NM_001076682, intron 16 of 18) 24070 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 172.5-165 chr6 33550042 33550324 + 1 NA Intergenic Intergenic 30093 NM_001188 578 Hs.485139 NM_001188 ENSG00000030110 BAK1 BAK|BAK-LIKE|BCL2L7|CDN1 BCL2 antagonist/killer 1 protein-coding 266.25-36 chr5 25936587 25937011 + 1 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 745846 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 144.5-6 chr1 39572037 39572243 + 1 NA intron (NM_001135654, intron 2 of 14) intron (NM_001135654, intron 2 of 14) -4630 NR_002983 677834 Hs.676660 NR_002983 ENSG00000201457 SNORA55 ACA55 small nucleolar RNA, H/ACA box 55 snoRNA 207.75-39 chr16 28252616 28253053 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -39691 NM_001024401 388228 Hs.97837 NM_001024401 ENSG00000188322 SBK1 SBK SH3 domain binding kinase 1 protein-coding 217.25-67 chr5 92059351 92059880 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -676298 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 149.25-90 chr2 165725529 165725693 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 68636 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 248.25 chr1 50937315 50937852 + 1 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) L3|LINE|CR1 22684 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 140.75-10 chr1 203553134 203553289 + 1 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 59058 NM_014359 26254 Hs.632468 NM_014359 ENSG00000188770 OPTC OPT opticin protein-coding 154.5-4 chr1 63487946 63488220 + 1 NA intron (NM_001347145, intron 3 of 7) intron (NM_001347145, intron 3 of 7) 35190 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 223.25-40 chr2 139570187 139570432 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 672985 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 181.5-12 chr10 25083470 25083801 + 1 NA Intergenic Intergenic -21356 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 113.25-68 chr17 42286482 42286604 + 1 NA Intergenic Intergenic -1004 NM_003152 6776 Hs.437058 NM_003152 ENSG00000126561 STAT5A MGF|STAT5 signal transducer and activator of transcription 5A protein-coding 222.5-7 chr1 163598609 163598891 + 1 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger -175559 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 226.75-36 chr2 149244497 149244823 + 1 NA Intergenic Intergenic -85325 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 183.75-124 chr8 79577096 79577289 + 1 NA Intergenic Intergenic -33925 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 202.5-61 chr18 2744247 2744530 + 1 NA intron (NM_015295, intron 29 of 47) intron (NM_015295, intron 29 of 47) 88501 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 175.5-185 chrX 57734336 57734537 + 1 NA Intergenic Intergenic -54176 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 168.5-69 chr18 1392088 1392399 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -32614 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 156.75-101 chr2 227560896 227561126 + 1 NA 3' UTR (NM_001135189, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001135189, exon 12 of 12) 57644 NR_149019 729968 Hs.689550 NR_149019 LOC729968 - spore coat protein SP96 ncRNA 143.25-138 chr4 107456364 107456557 + 1 NA Intergenic Intergenic 263774 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 188.5-60 chr18 8841985 8842272 + 1 NA Intergenic Intergenic 124747 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 157.5-29 chr10 99477705 99477897 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -47177 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 337.25-6 chr16 62019403 62019855 + 1 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 16809 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 253.75-30 chr21 31243299 31243852 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 6 of 27) L1M4a1|LINE|L1 -82635 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 133.5-31 chr10 57569399 57569601 + 1 NA Intergenic Intergenic -264941 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 144.5-159 chr4 111687861 111688079 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -457484 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 228.5-92 chr6 167031449 167031785 + 1 NA intron (NM_001278690, intron 8 of 10) intron (NM_001278690, intron 8 of 10) 32220 NM_194429 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 199.5-86 chr2 124396873 124397355 + 1 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 371827 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 131.75-30 chr10 73798650 73798857 + 1 NA intron (NM_015037, intron 20 of 25) intron (NM_015037, intron 20 of 25) 2646 NR_038357 100507331 Hs.631828 NR_038357 ENSG00000272589 ZSWIM8-AS1 - ZSWIM8 antisense RNA 1 ncRNA 143.75-96 chr2 122249593 122249995 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 494143 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 153.5-49 chr13 95209151 95209477 + 1 NA intron (NM_001105515, intron 6 of 20) intron (NM_001105515, intron 6 of 20) -1030 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 159.5-36 chr11 83002126 83002298 + 1 NA intron (NM_001286060, intron 1 of 4) intron (NM_001286060, intron 1 of 4) 32062 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 135.5-212 chr9 26895735 26895926 + 1 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -3002 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 194.5-95 chr3 153614952 153615288 + 1 NA intron (NR_146713, intron 3 of 6) intron (NR_146713, intron 3 of 6) 130625 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 206.5-51 chr2 102376269 102376531 + 1 NA intron (NM_003855, intron 5 of 10) intron (NM_003855, intron 5 of 10) 20117 NM_001282399 8809 Hs.469521 NM_003855 ENSG00000115604 IL18R1 CD218a|CDw218a|IL-1Rrp|IL18RA|IL1RRP interleukin 18 receptor 1 protein-coding 160.5-124 chr3 97258998 97259283 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -180467 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 207.5-87 chr5 87027135 87027375 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 87699 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 239.25-44 chr2 30689539 30689844 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 117755 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 145.75-163 chr8 140525184 140525440 + 1 NA 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 13316 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 255.5-79 chr7 84583742 84584233 + 1 NA intron (NR_110080, intron 3 of 3) intron (NR_110080, intron 3 of 3) 51511 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 195.75-39 chr12 125683358 125683744 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61099 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 199.25-88 chr7 4742006 4742433 + 1 NA intron (NM_001037165, intron 2 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -33404 NM_014855 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 211.5-158 chr8 98794045 98794410 + 1 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) L1P4|LINE|L1 31444 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 267.75-41 chr4 38110530 38110994 + 1 NA intron (NM_001253913, intron 1 of 5) intron (NM_001253913, intron 1 of 5) 581 NM_001253913 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 211.5-159 chr8 99320272 99320678 + 1 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 216255 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 199.25-77 chr5 30910875 30911179 + 1 NA Intergenic Intergenic -282659 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 184.75-3 chr1 108538063 108538340 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -21899 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 169.5-33 chr12 16362745 16363074 + 1 NA intron (NM_001260512, intron 4 of 4) AluJo|SINE|Alu 9492 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 166.5-90 chr19 31042634 31042846 + 1 NA Intergenic Intergenic -124770 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 194.5-154 chr8 70222323 70222565 + 1 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) intron (NM_001321711, intron 2 of 21) -151192 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 175.5-114 chr3 8826919 8827236 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -57463 NM_001354654 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 187.75-117 chr8 121328269 121328654 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -310885 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-9 chr10 51049212 51049450 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 19221 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 172.5-180 chr7 26051823 26052023 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -100275 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 175.75-19 chr10 60537783 60538126 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 35002 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 353.75-14 chr5 17839158 17839677 + 1 NA intron (NR_134286, intron 2 of 7) L1MEc|LINE|L1 32143 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 135.25-181 chr6 95292738 95293045 + 1 NA Intergenic Intergenic 284560 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 267.75-60 chr8 135296983 135297448 + 1 NA intron (NR_120396, intron 4 of 4) L1ME2|LINE|L1 63084 NR_120396 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 121.5-115 chr18 14054185 14054343 + 1 NA Intergenic Intergenic 78171 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 252.5-63 chr4 57554130 57554582 + 1 NA Intergenic Intergenic 128484 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 116.5-11 chr1 183894607 183894813 + 1 NA intron (NM_001297669, intron 10 of 18) AluJo|SINE|Alu 89590 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 269.75-37 chr3 14279869 14280247 + 1 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 72510 NR_110135 101927565 Hs.306905 NR_110135 ENSG00000251576 LINC01267 - long intergenic non-protein coding RNA 1267 ncRNA 115.75-165 chr5 25947814 25948180 + 1 NA Intergenic Intergenic 757044 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 131.5-72 chr15 64553353 64553548 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 54030 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 133.5-237 chr6 140084984 140085195 + 1 NA intron (NR_121622, intron 2 of 3) intron (NR_121622, intron 2 of 3) -93828 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 294.75-26 chr3 122105827 122106220 + 1 NA intron (NM_001206925, intron 2 of 5) intron (NM_001206925, intron 2 of 5) 28174 NM_176892 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 136.5-217 chr8 23851032 23851227 + 1 NA intron (NM_003155, intron 3 of 3) intron (NM_003155, intron 3 of 3) 3677 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 232.75-29 chr17 40301172 40301578 + 1 NA intron (NM_001254, intron 10 of 11) intron (NM_001254, intron 10 of 11) -7805 NM_000964 5914 Hs.654583 NM_000964 ENSG00000131759 RARA NR1B1|RAR retinoic acid receptor alpha protein-coding 245.5-19 chr14 45563705 45564011 + 1 NA Intergenic Intergenic 151744 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 116.5-228 chr7 46419316 46419544 + 1 NA Intergenic Intergenic 277692 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 289.75-27 chr6 38328022 38328354 + 1 NA intron (NM_052893, intron 8 of 11) L1ME4a|LINE|L1 -153408 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 203.25-113 chr9 129975584 129975814 + 1 NA intron (NM_001363755, intron 4 of 15) AluSz|SINE|Alu 67490 NM_015033 23048 Hs.189409 NM_015033 ENSG00000187239 FNBP1 FBP17 formin binding protein 1 protein-coding 197.5-83 chr2 201444712 201445048 + 1 NA intron (NM_015049, intron 1 of 15) intron (NM_015049, intron 1 of 15) 6578 NM_015049 66008 Hs.152774 NM_015049 ENSG00000115993 TRAK2 ALS2CR3|CALS-C|GRIF-1|GRIF1|MILT2|OIP98 trafficking kinesin protein 2 protein-coding 145.5-130 chr3 94438438 94438612 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 375464 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 152.5-105 chr21 32021788 32022081 + 1 NA Intergenic Intergenic 64361 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 256.75-18 chr17 18773359 18773918 + 1 NA intron (NR_051988, intron 12 of 13) intron (NR_051988, intron 12 of 13) -7357 NM_001316923 51030 Hs.87295 NM_016078 ENSG00000171928 TVP23B CGI-148|FAM18B|FAM18B1|NPD008|YDR084C trans-golgi network vesicle protein 23 homolog B protein-coding 323.5-14 chr18 3347697 3348130 + 1 NA non-coding (NR_146506, exon 3 of 3) non-coding (NR_146506, exon 3 of 3) 2646 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 168.25-77 chr2 136860190 136860531 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 94815 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 206.75-19 chr14 83547437 83547839 + 1 NA Intergenic Intergenic 905006 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 170.5-81 chr19 35591569 35591861 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6180 NR_110750 102723617 Hs.579904 NR_110750 ENSG00000224910 LINC01766 - long intergenic non-protein coding RNA 1766 ncRNA 234.5-45 chr2 110822854 110823141 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 9 of 18) AluSx|SINE|Alu 90424 NM_001371254 216.5 chr1 24963022 24963411 + 1 NA intron (NM_001320672, intron 2 of 6) intron (NM_001320672, intron 2 of 6) 1794 NM_001031680 864 Hs.170019 NM_004350 ENSG00000020633 RUNX3 AML2|CBFA3|PEBP2aC RUNX family transcription factor 3 protein-coding 215.25-4 chr1 112808525 112808767 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 41997 NR_103746 100996702 Hs.632431 NR_103746 ENSG00000215866 LINC01356 - long intergenic non-protein coding RNA 1356 ncRNA 209.75-51 chr2 106655853 106656368 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 168746 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 125.5-195 chr4 131595421 131595546 + 1 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -169355 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 256.5-66 chr6 92419675 92420116 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -729467 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 132.5-67 chr14 50380704 50380868 + 1 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 16095 NM_004196 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 202.5-100 chr4 52938517 52938786 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 76334 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 196.5-66 chr17 60567965 60568312 + 1 NA intron (NR_126009, intron 2 of 3) intron (NR_126009, intron 2 of 3) 3592 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 199.75-2 chr1 79751655 79752040 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -745117 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 225.25-90 chr9 37622188 37622608 + 1 NA intron (NM_001371225, intron 1 of 15) intron (NM_001371225, intron 1 of 15) 19169 NM_001371224 125.5-92 chr15 86317285 86317527 + 1 NA promoter-TSS (NR_046012) promoter-TSS (NR_046012) -438 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-41 chr11 5136372 5136549 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -3818 NM_001005160 390054 Hs.546593 NM_001005160 ENSG00000171944 OR52A5 OR11-33 olfactory receptor family 52 subfamily A member 5 protein-coding 151.5-13 chr1 226768934 226769251 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -29917 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 173.25-97 chr5 51355298 51355494 + 1 NA Intergenic Intergenic 27936 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 183.5-86 chr22 46938255 46938469 + 1 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -22320 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 207.5-30 chr16 59772224 59772635 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -17238 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 237.25-31 chr15 35437532 35437936 + 1 NA intron (NM_080650, intron 5 of 8) HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -65370 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 120.5-71 chr14 45653382 45653672 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 62075 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 209.75-88 chr7 6238313 6238608 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 34164 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 146.25-147 chr8 82902623 82902991 + 1 NA Intergenic Intergenic -9297 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 304.75-20 chr22 40583398 40583873 + 1 NA intron (NM_020831, intron 2 of 14) MER1B|DNA|hAT-Charlie -49808 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 121.5-145 chr2 165064001 165064132 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -108541 NM_173512 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 150.25-138 chr7 20508797 20509091 + 1 NA Intergenic Intergenic -106723 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 131.5-212 chr7 11019798 11020089 + 1 NA intron (NR_033436, intron 4 of 16) intron (NR_033436, intron 4 of 16) 46071 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 112.5-65 chr13 62218852 62219030 + 1 NA intron (NR_125787, intron 1 of 3) intron (NR_125787, intron 1 of 3) 6659 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 167.25-41 chr14 56478569 56478768 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -35663 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 119.75-186 chr6 130885120 130885352 + 1 NA exon (NM_001350310, exon 12 of 18) exon (NM_001350310, exon 12 of 18) 57831 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 180.5-36 chr14 34497737 34498051 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -35654 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 185.75-39 chr13 94609380 94609634 + 1 NA intron (NM_180989, intron 2 of 8) intron (NM_180989, intron 2 of 8) 7650 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 249.5-57 chr20 52163795 52164279 + 1 NA intron (NM_199427, intron 4 of 8) AluJb|SINE|Alu 27742 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 156.75-166 chr8 131656865 131657202 + 1 NA Intergenic Intergenic -247060 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 181.5-89 chr2 177115000 177115378 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 97222 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 234.5-93 chr8 86515897 86516284 + 1 NA intron (NM_003909, intron 2 of 16) intron (NM_003909, intron 2 of 16) 1655 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 284.5-19 chr15 97538532 97538981 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16945 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 212.5-32 chr15 57466802 57467064 + 1 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) intron (NM_032866, intron 8 of 18) 90428 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 226.5-73 chr4 112569163 112569488 + 1 NA intron (NM_018392, intron 16 of 27) Charlie10a|DNA|hAT-Charlie -53145 NM_024019 63973 Hs.744415 NM_024019 ENSG00000178403 NEUROG2 Atoh4|Math4A|NGN2|bHLHa8|ngn-2 neurogenin 2 protein-coding 182.5-119 chr4 73357111 73357306 + 1 NA Intergenic MER9a3|LTR|ERVK -47079 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 195.5-149 chr7 46333318 46333628 + 1 NA Intergenic Intergenic 363649 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 283.5-23 chr19 52344449 52344934 + 1 NA promoter-TSS (NM_173530) promoter-TSS (NM_173530) -738 NM_173530 162963 Hs.147025 NM_173530 ENSG00000167554 ZNF610 - zinc finger protein 610 protein-coding 282.75-7 chr10 115184734 115185284 + 1 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MC4|LINE|L1 91644 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 302.75-29 chr8 105474947 105475492 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 155676 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 170.5-118 chr3 60288733 60288971 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -207943 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 135.5-172 chr6 68670879 68671039 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L1MA1|LINE|L1 35677 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 120.5-53 chr12 25234933 25235108 + 1 NA intron (NM_001369786, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 15909 NM_004985 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 177.25-49 chr15 62169511 62169816 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -4378 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 199.5-157 chr9 34602823 34603069 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 9151 NM_148178 138716 Hs.15961 NM_148178 ENSG00000164967 RPP25L C9orf23|bA296L22.5 ribonuclease P/MRP subunit p25 like protein-coding 176.5-38 chr12 28187797 28188181 + 1 NA non-coding (NR_148936, exon 1 of 1) non-coding (NR_148936, exon 1 of 1) -2467 NM_001352081 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 208.5-57 chr17 61604971 61605229 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -13881 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 265.75-7 chr10 105853903 105854377 + 1 NA Intergenic Intergenic -33807 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 150.5-217 chr8 78748062 78748435 + 1 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 -23874 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 112.5-188 chr4 142374364 142374588 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 7 of 25) intron (NM_001331040, intron 7 of 25) 472059 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 304.5-15 chr17 64231253 64231757 + 1 NA promoter-TSS (NM_001288733) promoter-TSS (NM_001288733) -771 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 185.25-106 chr5 128176597 128176929 + 1 NA intron (NM_001256461, intron 20 of 25) intron (NM_001256461, intron 20 of 25) 92997 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 256.5-19 chr13 85471239 85471688 + 1 NA intron (NR_046989, intron 1 of 3) intron (NR_046989, intron 1 of 3) 107860 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 137.5-9 chr1 115301758 115302012 + 1 NA intron (NM_002506, intron 1 of 2) intron (NM_002506, intron 1 of 2) 18851 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 272.75-51 chr8 137260596 137261068 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 152756 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 186.5-53 chr17 61687089 61687328 + 1 NA intron (NM_032043, intron 18 of 19) AluJr|SINE|Alu -95989 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 129.5-138 chr2 186292673 186292851 + 1 NA Intergenic Intergenic -193498 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 149.25-113 chr3 29014902 29015077 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 265950 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 174.5-140 chr5 3045381 3045671 + 1 NA Intergenic Intergenic 127672 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 363.5-6 chr14 28841415 28841948 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -55894 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 143.5-38 chr12 7715849 7716052 + 1 NA intron (NM_199286, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 4517 NM_199286 359787 Hs.131358 NM_199286 ENSG00000187569 DPPA3 Pgc7|STELLA developmental pluripotency associated 3 protein-coding 180.25-94 chr5 57256826 57257086 + 1 NA intron (NM_001203246, intron 9 of 10) intron (NM_001203246, intron 9 of 10) 42882 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 240.75-34 chr17 66197916 66198289 + 1 NA Intergenic Intergenic -5969 NM_001353128 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 132.75-7 chr1 42692083 42692293 + 1 NA intron (NM_004559, intron 2 of 7) intron (NM_004559, intron 2 of 7) 9052 NR_132737 4904 Hs.473583 NM_004559 ENSG00000065978 YBX1 BP-8|CBF-A|CSDA2|CSDB|DBPB|EFI-A|MDR-NF1|NSEP-1|NSEP1|YB-1|YB1 Y-box binding protein 1 protein-coding 144.5-113 chr2 153862394 153862545 + 1 NA Intergenic Intergenic -9453 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 173.5-95 chr3 16253562 16253854 + 1 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 11235 NM_001047434 285381 Hs.388087 NM_206831 ENSG00000154813 DPH3 DELGIP|DELGIP1|DESR1|DPH3A|KTI11|ZCSL2 diphthamide biosynthesis 3 protein-coding 137.75-26 chr10 76471691 76471966 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 -416216 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-188 chr5 36546134 36546304 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -60136 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 185.25-40 chr15 91289169 91289591 + 1 NA intron (NM_001323036, intron 10 of 11) intron (NM_001323036, intron 10 of 11) -173959 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 186.75-25 chr13 37409951 37410171 + 1 NA Intergenic Intergenic 74723 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 162.5-66 chr17 68483432 68483613 + 1 NA intron (NM_001278433, intron 1 of 10) L1M4|LINE|L1 -25998 NM_001320772 55062 Hs.463964 NM_017983 ENSG00000070540 WIPI1 ATG18|ATG18A|WIPI49 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 protein-coding 138.5-189 chr8 78095579 78095823 + 1 NA Intergenic Intergenic -420639 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 149.25-178 chr8 67278244 67278418 + 1 NA intron (NM_006421, intron 7 of 38) MIRb|SINE|MIR 65450 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 123.5-142 chr3 147692281 147692474 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 271050 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 156.75-159 chr7 88423978 88424141 + 1 NA Intergenic Intergenic -117165 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 272.25-52 chr6 68740214 68740652 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 105151 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 248.5-54 chr2 108975716 108976238 + 1 NA intron (NM_022336, intron 1 of 11) L1MC3|LINE|L1 13243 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 338.75-4 chr11 26048681 26049222 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -140172 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 164.75-87 chr20 50682233 50682576 + 1 NA intron (NM_001290268, intron 1 of 21) AluJr|SINE|Alu 9138 NM_001290268 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 214.75-4 chr1 102549382 102549747 + 1 NA Intergenic Intergenic -552330 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 150.75-20 chr1 189378419 189378671 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1097465 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 124.25-198 chr8 86448640 86448947 + 1 NA intron (NM_007013, intron 20 of 24) intron (NM_007013, intron 20 of 24) 59893 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 153.5-66 chr15 59737769 59737982 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -48555 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 234.5-48 chr2 142724860 142725142 + 1 NA Intergenic Intergenic -152663 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 153.25-128 chr8 56010728 56010984 + 1 NA 3' UTR (NM_001111097, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001111097, exon 13 of 13) 63045 NR_002437 26795 NR_002437 ENSG00000238650 SNORD54 RNU54|U54 small nucleolar RNA, C/D box 54 snoRNA 209.5-60 chr2 33777888 33778245 + 1 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) intron (NR_126403, intron 1 of 5) -49849 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 173.5-114 chr4 63164221 63164490 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -1002590 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 240.75-50 chr22 46773606 46773979 + 1 NA promoter-TSS (NM_001284305) promoter-TSS (NM_001284305) -135 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 340.25-12 chr3 11208775 11209382 + 1 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) intron (NM_001098212, intron 1 of 1) -16903 NM_001098211 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 273.5-41 chr22 27885504 27885943 + 1 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) intron (NM_001284278, intron 7 of 11) 33491 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 138.5-167 chr5 157205165 157205436 + 1 NA intron (NM_005546, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 24404 NM_005546 3702 Hs.558348 NM_005546 ENSG00000113263 ITK EMT|LPFS1|LYK|PSCTK2 IL2 inducible T cell kinase protein-coding 151.5-191 chr8 72796756 72796977 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 64821 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 245.25-50 chr3 186300907 186301195 + 1 NA intron (NM_001346, intron 3 of 24) intron (NM_001346, intron 3 of 24) 61183 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 112.75-27 chr10 91094707 91094980 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 49035 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 191.5-118 chr5 39297623 39297951 + 1 NA intron (NM_001737, intron 9 of 10) L1MEc|LINE|L1 -27138 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 154.25-45 chr14 58364187 58364450 + 1 NA exon (NM_023000, exon 20 of 24) exon (NM_023000, exon 20 of 24) -31612 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 134.25-62 chr16 78935862 78936078 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 664767 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 152.25-61 chr16 53454549 53454825 + 1 NA exon (NM_001323611, exon 8 of 22) exon (NM_001323611, exon 8 of 22) 19068 NM_001323611 5934 Hs.513609 NM_005611 ENSG00000103479 RBL2 P130|Rb2 RB transcriptional corepressor like 2 protein-coding 219.75-44 chr2 155840105 155840435 + 1 NA Intergenic Intergenic 414661 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 214.5-51 chr2 32838312 32838551 + 1 NA intron (NR_027099, intron 3 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 12998 NR_027099 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 154.25-2 chr1 41285480 41285711 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -43289 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 139.75-124 chr3 117334649 117334952 + 1 NA Intergenic Intergenic 356125 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 129.5-58 chr12 128427866 128428042 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 2 of 8) intron (NM_001136103, intron 2 of 8) 133862 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 220.5-90 chr4 82894500 82894852 + 1 NA non-coding (NR_034075, exon 6 of 6) non-coding (NR_034075, exon 6 of 6) 1252 NR_132759 106633808 NR_132759 SNORD143 SNORA96|SNORD171|ZL5 small nucleolar RNA, C/D box 143 snoRNA 143.75-162 chr6 120918712 120918957 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 415646 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 231.25-72 chr6 135504445 135504931 + 1 NA intron (NR_152842, intron 2 of 5) intron (NR_152842, intron 2 of 5) 6887 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 116.5-137 chr2 225023484 225023673 + 1 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) L1M5|LINE|L1 -13038 NR_039641 100616207 NR_039641 ENSG00000263828 MIR4439 - microRNA 4439 ncRNA 156.5-149 chr5 50735442 50735670 + 1 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 68142 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 257.5-68 chr7 8965044 8965566 + 1 NA Intergenic Intergenic 531696 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 241.25-70 chr8 78793586 78793892 + 1 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11724 NM_000880 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 149.5-186 chr7 77484697 77484952 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -52471 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 235.25-56 chr7 4866730 4867014 + 1 NA intron (NM_018059, intron 2 of 14) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -4842 NM_020144 56903 Hs.487409 NM_020144 ENSG00000218823 PAPOLB PAPT|TPAP poly(A) polymerase beta protein-coding 154.25-188 chr9 104458900 104459222 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -45202 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 114.25-147 chr5 38605925 38606124 + 1 NA intron (NR_103554, intron 2 of 8) MER4A1_|LTR|ERV1 -10619 NM_002310 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 185.75-89 chr3 177826605 177826884 + 1 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 9879 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 154.75-80 chr2 217997493 217997742 + 1 NA Intergenic Intergenic 18910 NR_135524 105373878 Hs.630709 NR_135524 ENSG00000223923 LOC105373878 - uncharacterized LOC105373878 ncRNA 134.25-56 chr15 41604868 41605144 + 1 NA Intergenic Intergenic 45034 NM_001330264 7301 Hs.381282 NM_006293 ENSG00000092445 TYRO3 BYK|Dtk|Etk-2|RSE|Rek|Sky|Tif TYRO3 protein tyrosine kinase protein-coding 155.5-120 chr22 49217333 49217587 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 326006 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 181.5-174 chrX 103150645 103150878 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -57618 NM_022052 56000 Hs.60386 NM_022052 ENSG00000147206 NXF3 - nuclear RNA export factor 3 protein-coding 198.5-92 chr22 30897308 30897551 + 1 NA intron (NM_001282741, intron 11 of 12) L1ME3F|LINE|L1 15748 NM_001282742 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 121.25-201 chr8 133637423 133637599 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 46555 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 265.75-8 chr11 19775634 19776020 + 1 NA intron (NM_182964, intron 1 of 37) L2a|LINE|L2 -15744 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 194.25-84 chr4 114500420 114500648 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -97868 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 236.75-67 chr9 107708286 107708728 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -218738 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 228.25-73 chr6 138048724 138049152 + 1 NA Intergenic Intergenic 58481 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 182.5-136 chr5 150322245 150322522 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -19478 NM_001012301 340075 Hs.591252 NM_001012301 ENSG00000183876 ARSI ASI|SPG66 arylsulfatase family member I protein-coding 160.5-92 chr2 186853645 186853886 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -4595 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 128.5-124 chr20 59595565 59595818 + 1 NA intron (NM_001199505, intron 1 of 12) L1MC1|LINE|L1 -8849 NM_080672 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 162.5-44 chr13 32999829 33000107 + 1 NA Intergenic Intergenic -16455 NM_004795 9365 Hs.524953 NM_004795 ENSG00000133116 KL HFTC3 klotho protein-coding 162.5-121 chr4 32207015 32207306 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -143878 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 150.25-124 chr5 121433224 121433416 + 1 NA Intergenic Intergenic 110770 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 114.25-2 chr1 22362290 22362523 + 1 NA Intergenic Intergenic -89445 NM_001330398 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 136.75-63 chr14 85029395 85029637 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -242416 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 181.5-121 chr4 64417554 64417765 + 1 NA Intergenic Intergenic -8199 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 297.5-51 chr7 29544823 29545197 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -18825 NM_175887 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 257.5-39 chr2 232188309 232188843 + 1 NA intron (NR_046477, intron 8 of 18) L1MD2|LINE|L1 15923 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 176.5-141 chr5 60284878 60285087 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 87681 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 188.25-110 chr8 13722442 13722669 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 92865 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 247.5-79 chr7 83680837 83681136 + 1 NA Intergenic Intergenic -31847 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 123.5-224 chrX 155653543 155653699 + 1 NA intron (NM_001304990, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 -40669 NM_001184797 55217 Hs.133321 NM_018196 ENSG00000185973 TMLHE AUTSX6|BBOX2|TMLD|TMLH|TMLHED|XAP130 trimethyllysine hydroxylase, epsilon protein-coding 271.25-35 chr5 34663592 34664076 + 1 NA intron (NM_001145520, intron 1 of 17) intron (NM_001145520, intron 1 of 17) 7343 NM_001145520 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 121.75-52 chr15 68291831 68292158 + 1 NA 3' UTR (NM_015322, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_015322, exon 2 of 2) 14249 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 192.5-7 chr1 174242311 174242596 + 1 NA intron (NM_001366445, intron 5 of 13) intron (NM_001366445, intron 5 of 13) -32647 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 167.5-6 chr1 79395559 79395887 + 1 NA Intergenic Intergenic -388993 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 134.75-88 chr17 58441679 58441869 + 1 NA intron (NM_001080439, intron 5 of 5) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -24192 NM_017763 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 368.5-6 chr14 54376635 54377454 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -19824 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 212.25-84 chr7 35373409 35373816 + 1 NA non-coding (NR_038864, exon 3 of 3) non-coding (NR_038864, exon 3 of 3) 59757 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 157.75-152 chr6 132699564 132699755 + 1 NA intron (NM_004666, intron 2 of 6) intron (NM_004666, intron 2 of 6) 14396 NM_004666 8876 Hs.12114 NM_004666 ENSG00000112299 VNN1 HDLCQ8|Tiff66 vanin 1 protein-coding 151.75-119 chr5 150566090 150566321 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -34871 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 306.25-22 chr2 226227191 226227941 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 84772 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 250.5-65 chr4 35935146 35935447 + 1 NA Intergenic Intergenic 308643 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 187.75-92 chr5 107526038 107526292 + 1 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 144772 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 172.25-124 chr6 84126414 84126621 + 1 NA intron (NM_001286206, intron 25 of 26) intron (NM_001286206, intron 25 of 26) 92398 NM_001346544 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 174.5-94 chr2 19555845 19556251 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -197425 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 125.5-263 chr8 136035759 136035955 + 1 NA Intergenic Intergenic -494941 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 176.25-3 chr1 81482909 81483220 + 1 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) 74638 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 142.25-36 chr12 11685588 11685852 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 35866 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 154.75-94 chr3 105634841 105635119 + 1 NA Intergenic Intergenic 232611 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 278.5-38 chr22 47598625 47599188 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 32663 NR_033377 400932 Hs.561058 NM_001001693 ENSG00000205634 LINC00898 - long intergenic non-protein coding RNA 898 ncRNA 269.75-51 chr7 39028986 39029315 + 1 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 -15583 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 125.5-203 chr5 73356454 73356705 + 1 NA Intergenic Intergenic 18673 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 414.25-3 chr10 60425125 60425866 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -35620 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 247.75-69 chr8 86907774 86908196 + 1 NA intron (NM_173538, intron 3 of 10) intron (NM_173538, intron 3 of 10) 41570 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 185.25-27 chr13 80053139 80053420 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 42202 NR_104138 101515984 Hs.569290 NR_104138 LINC01080 TCONS_00021856 long intergenic non-protein coding RNA 1080 ncRNA 221.25-63 chr4 70584267 70584540 + 1 NA Intergenic Intergenic -7853 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 196.25-52 chr19 6626240 6626610 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35275 NM_001330332 970 Hs.501497 NM_001252 ENSG00000125726 CD70 CD27-L|CD27L|CD27LG|LPFS3|TNFSF7|TNLG8A CD70 molecule protein-coding 209.5-24 chr12 10678734 10679180 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4905 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 167.25-74 chr19 29474090 29474268 + 1 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 51573 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 229.75-6 chr1 192036408 192036741 + 1 NA Intergenic Intergenic -121888 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 238.5-70 chr5 93779602 93779999 + 1 NA intron (NM_032042, intron 9 of 10) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -38200 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 123.25-49 chr13 43522672 43522820 + 1 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 73894 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 163.25-30 chr12 26374589 26374994 + 1 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) intron (NM_002223, intron 55 of 56) 179218 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 361.75-9 chr15 54194615 54195055 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 4 of 31) intron (NM_001329919, intron 4 of 31) 182187 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 164.5-176 chr6 81000395 81000618 + 1 NA Intergenic Intergenic 752175 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 268.75-36 chr5 19990701 19991101 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 3 of 14) intron (NM_001291956, intron 3 of 14) -2701 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 119.5-197 chr6 41112738 41112882 + 1 NA intron (NR_026938, intron 6 of 22) intron (NR_026938, intron 6 of 22) 11776 NR_026938 221442 Hs.374076 NM_001010871 ENSG00000161912 ADCY10P1 - ADCY10 pseudogene 1 pseudo 169.5-70 chr2 30051361 30051549 + 1 NA Intergenic Intergenic -95552 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 147.5-36 chr11 103870024 103870265 + 1 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL 20238 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 195.75-93 chr5 54906957 54907260 + 1 NA Intergenic Intergenic 78485 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 182.5-110 chr3 182445068 182445279 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 41189 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 209.75-56 chr2 155077963 155078185 + 1 NA Intergenic Intergenic 379379 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 226.25-29 chr15 79548100 79548487 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 115777 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 238.75-34 chr22 22710065 22710362 + 1 NA Intergenic Intergenic 63901 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 139.75-64 chr16 20848637 20848881 + 1 NA intron (NM_030941, intron 19 of 19) intron (NM_030941, intron 19 of 19) 42232 NM_001199053 81691 Hs.177926 NM_030941 ENSG00000005189 REXO5 NEF-sp RNA exonuclease 5 protein-coding 338.25-30 chr8 105780107 105780477 + 1 NA TTS (NR_125797) TTS (NR_125797) 280211 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-199 chr8 84428911 84429167 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 13555 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 219.75-92 chrX 155508577 155508811 + 1 NA intron (NM_018196, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 42154 NR_109985 101927830 Hs.638368 NR_109985 LOC101927830 - uncharacterized LOC101927830 ncRNA 181.75-137 chr8 141598094 141598344 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -90989 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 139.5-41 chr12 30136940 30137113 + 1 NA Intergenic Intergenic -352267 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 208.25-34 chr17 2850789 2851119 + 1 NA intron (NM_001330058, intron 2 of 24) AluSq2|SINE|Alu 54516 NM_001100398 23108 Hs.499659 NM_015085 ENSG00000132359 RAP1GAP2 GARNL4|RAP1GA3 RAP1 GTPase activating protein 2 protein-coding 126.5-162 chr3 186439639 186439859 + 1 NA promoter-TSS (NR_151708) promoter-TSS (NR_151708) -596 NR_151709 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 205.25-5 chr1 202902585 202902875 + 1 NA intron (NM_021633, intron 6 of 11) AluJb|SINE|Alu -13581 NM_002871 5877 Hs.90875 NM_002871 ENSG00000183155 RABIF MSS4|RASGFR3|RASGRF3 RAB interacting factor protein-coding 212.25-74 chr5 77393971 77394388 + 1 NA intron (NM_001029854, intron 9 of 20) MER4B-int|LTR|ERV1 98137 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 243.5-51 chr3 74844990 74845490 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -324100 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 117.25-219 chr8 135574998 135575310 + 1 NA intron (NM_006558, intron 5 of 8) intron (NM_006558, intron 5 of 8) 117698 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 242.75-17 chr14 66838242 66838597 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 331012 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 154.25-74 chr19 49383724 49384135 + 1 NA intron (NR_110729, intron 1 of 2) L1MEg|LINE|L1 4152 NR_110729 101928295 Hs.640180 NR_110729 ENSG00000268686 LOC101928295 - uncharacterized LOC101928295 ncRNA 226.75-33 chr2 50883095 50883652 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 148759 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 257.75-38 chr5 26018204 26018472 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 827385 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 122.5-192 chr5 178827069 178827237 + 1 NA Intergenic Intergenic -8718 NR_024035 729522 Hs.382790 NR_024035 ENSG00000250420 AACSP1 AACSL acetoacetyl-CoA synthetase pseudogene 1 pseudo 168.75-23 chr10 103468569 103468762 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -9774 NM_001001412 255022 Hs.680365 NM_001001412 ENSG00000185933 CALHM1 FAM26C calcium homeostasis modulator 1 protein-coding 269.5-61 chr9 27154232 27154669 + 1 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) L1ME4b|LINE|L1 45309 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 181.5-45 chr14 89516010 89516267 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 1 of 6) intron (NM_001085471, intron 1 of 6) -60078 NR_024620 29018 Hs.673124 NM_014099 ENSG00000259073 FOXN3-AS2 PRO1768 FOXN3 antisense RNA 2 ncRNA 182.5-72 chr18 30819414 30819616 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 223227 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 142.25-126 chr4 126432448 126432780 + 1 NA Intergenic Intergenic 925355 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 275.75-12 chr13 59256678 59257029 + 1 NA Intergenic Intergenic -755865 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 201.5-127 chr8 84852047 84852297 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 4 of 7) intron (NM_001287244, intron 4 of 7) 146245 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 221.5-8 chr10 52661781 52662201 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 93413 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 148.25-9 chr1 167678175 167678344 + 1 NA intron (NM_001322923, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 -43723 NM_001146191 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 193.5-89 chr2 125913144 125913511 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 204658 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 171.5-88 chr2 151691637 151691942 + 1 NA intron (NM_001271208, intron 23 of 182) intron (NM_001271208, intron 23 of 182) 42687 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 152.5-44 chr14 50241894 50242117 + 1 NA TTS (NM_024884) TTS (NM_024884) -10427 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 273.75-38 chr6 168512894 168513231 + 1 NA intron (NM_001166412, intron 2 of 12) intron (NM_001166412, intron 2 of 12) 71878 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 202.5-147 chr9 130886855 130887208 + 1 NA 3' UTR (NM_005157, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005157, exon 11 of 11) 9781 NM_198180 347148 Hs.660704 NM_198180 ENSG00000188710 QRFP 26RFa|P518 pyroglutamylated RFamide peptide protein-coding 122.25-105 chr2 215417318 215417575 + 1 NA intron (NM_212482, intron 12 of 45) intron (NM_212482, intron 12 of 45) 18622 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 321.5-22 chr21 17351247 17351716 + 1 NA Intergenic Intergenic -87409 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 272.25-18 chr15 100333670 100334248 + 1 NA intron (NM_139057, intron 2 of 21) intron (NM_139057, intron 2 of 21) 8016 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 150.25-90 chr20 62373917 62374113 + 1 NA Intergenic Intergenic -6703 NM_005560 3911 Hs.473256 NM_005560 ENSG00000130702 LAMA5 - laminin subunit alpha 5 protein-coding 217.75-33 chr17 70551250 70551562 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 381871 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 284.25-26 chr4 144673679 144674295 + 1 NA intron (NM_022475, intron 4 of 12) intron (NM_022475, intron 4 of 12) 27831 NM_022475 64399 Hs.507991 NM_022475 ENSG00000164161 HHIP HIP hedgehog interacting protein protein-coding 146.5-151 chr4 42694481 42694724 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -37497 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 127.25-89 chr2 77929017 77929172 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1M3|LINE|L1 13160 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 339.5-7 chr11 64614704 64615381 + 1 NA intron (NM_015080, intron 22 of 22) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 23822 NM_153378 116085 Hs.174424 NM_144585 ENSG00000197891 SLC22A12 OAT4L|RST|URAT1 solute carrier family 22 member 12 protein-coding 199.75-32 chr15 87048840 87049151 + 1 NA Intergenic Intergenic -60569 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 252.75-13 chr11 116163930 116164246 + 1 NA Intergenic Intergenic -403888 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 115.5-160 chr3 30550665 30550808 + 1 NA Intergenic LTR35A|LTR|ERV1 31868 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 152.5-94 chr2 153713052 153713318 + 1 NA Intergenic Intergenic -158737 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 228.25-38 chr18 66587598 66587850 + 1 NA intron (NM_001271028, intron 1 of 9) intron (NM_001271028, intron 1 of 9) 16366 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 185.5-75 chr2 46572286 46572539 + 1 NA intron (NR_104182, intron 1 of 1) intron (NR_104182, intron 1 of 1) 7826 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 150.5-152 chr4 84589691 84589865 + 1 NA intron (NM_001263, intron 1 of 12) MER110A|LTR|ERV1 6651 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 233.25-63 chr6 24188743 24189153 + 1 NA intron (NM_016356, intron 8 of 9) intron (NM_016356, intron 8 of 9) 62733 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 213.5-80 chr3 111955988 111956218 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 12 of 17) AluJo|SINE|Alu -22923 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 260.5-3 chr10 25037641 25038079 + 1 NA intron (NM_001270383, intron 2 of 5) intron (NM_001270383, intron 2 of 5) 21248 NM_024838 79896 Hs.645274 NM_024838 ENSG00000185875 THNSL1 TSH1 threonine synthase like 1 protein-coding 206.75-57 chr3 119008667 119009039 + 1 NA intron (NM_001353319, intron 1 of 7) MLT2D|LTR|ERVL 25993 NM_001353318 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 246.75-13 chr12 39891543 39891930 + 1 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) MIRb|SINE|MIR 214345 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 132.25-15 chr1 162537416 162537656 + 1 NA Intergenic Intergenic -23904 NM_001324115 6675 Hs.492859 NM_003115 ENSG00000117143 UAP1 AGX|AGX1|AGX2|SPAG2 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 protein-coding 151.25-121 chr3 30560648 30560840 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 41876 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 187.75-100 chr6 48428286 48428516 + 1 NA Intergenic Intergenic -359712 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 232.25-2 chr1 69791907 69792346 + 1 NA exon (NM_001366836, exon 4 of 8) exon (NM_001366836, exon 4 of 8) -127196 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 219.5-96 chr5 14891381 14891746 + 1 NA Intergenic Intergenic -19785 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 170.5-6 chr1 46246590 46246987 + 1 NA promoter-TSS (NM_001370766) promoter-TSS (NM_001370766) -900 NM_001370766 8438 Hs.642042 NM_003579 ENSG00000085999 RAD54L HR54|RAD54A|hHR54|hRAD54 RAD54 like protein-coding 146.5-172 chr5 66615882 66616098 + 1 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 19597 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 147.5-109 chr2 159983502 159983655 + 1 NA intron (NM_001007267, intron 13 of 26) intron (NM_001007267, intron 13 of 26) -78822 NM_001198759 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 170.75-46 chr16 64444384 64444607 + 1 NA Intergenic Intergenic 677568 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 198.75-21 chr12 62982283 62982517 + 1 NA Intergenic Intergenic -47250 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 125.5-48 chr11 130946719 130946882 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -30313 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 113.5-14 chr1 168518080 168518272 + 1 NA Intergenic Intergenic -22532 NR_125956 101928565 Hs.563806 NR_125956 ENSG00000228697 LOC101928565 - uncharacterized LOC101928565 ncRNA 164.75-70 chr19 50700388 50700656 + 1 NA intron (NM_016148, intron 12 of 23) L2c|LINE|L2 19280 NM_016148 50944 Hs.274255 NM_016148 ENSG00000161681 SHANK1 SPANK-1|SSTRIP|synamon SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 protein-coding 227.25-86 chrX 64675711 64676021 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -280414 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 130.5-107 chr16 72532650 72532848 + 1 NA intron (NR_159372, intron 3 of 7) L1MB8|LINE|L1 132221 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 154.25-189 chr9 113144834 113145162 + 1 NA Intergenic Intergenic -6009 NM_001860 1318 Hs.24030 NM_001860 ENSG00000136867 SLC31A2 COPT2|CTR2|hCTR2 solute carrier family 31 member 2 protein-coding 155.5-5 chr1 42080487 42080682 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -44650 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 206.25-108 chr8 9778875 9779244 + 1 NA 3' UTR (NM_003747, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_003747, exon 27 of 27) 37387 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 147.5-29 chr11 3669423 3669646 + 1 NA intron (NM_020402, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 1850 NM_020402 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 215.75-22 chr12 5300649 5300902 + 1 NA Intergenic Intergenic -57624 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 212.5-84 chr5 50886690 50887004 + 1 NA Intergenic Intergenic 83340 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 146.5-100 chr2 50113097 50113280 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) L2b|LINE|L2 -138985 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 113.5-124 chr2 107446712 107446882 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -82622 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 182.5-133 chr5 86135186 86135480 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -147111 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 247.5-21 chr14 51300704 51300997 + 1 NA Intergenic Intergenic 27535 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 146.5-69 chr15 45413199 45413448 + 1 NA intron (NM_001323640, intron 3 of 4) L2|LINE|L2 10987 NR_136648 79029 Hs.369657 NM_024063 ENSG00000171763 SPATA5L1 - spermatogenesis associated 5 like 1 protein-coding 220.75-45 chr2 227468242 227468761 + 1 NA Intergenic Intergenic -3631 NR_049888 100847081 NR_049888 ENSG00000284092 MIR5703 mir-5703 microRNA 5703 ncRNA 213.5-76 chr3 85522626 85522894 + 1 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 17701 NM_001256502 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 277.25-14 chr16 48878046 48878587 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -268136 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 460.75-5 chr5 116368571 116369491 + 1 NA non-coding (NR_104675, exon 3 of 3) non-coding (NR_104675, exon 3 of 3) 5539 NR_104675 101927190 Hs.639849 NR_104675 LOC101927190 - uncharacterized LOC101927190 ncRNA 177.5-56 chr16 46569532 46569862 + 1 NA promoter-TSS (NR_026556) promoter-TSS (NR_026556) -600 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 120.5-30 chr11 5076193 5076410 + 1 NA Intergenic Intergenic 6929 NR_145505 79296 NM_001348221 ENSG00000273085 OR52E1 OR52E1P olfactory receptor family 52 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 152.75-160 chr9 37248928 37249156 + 1 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 128444 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 180.5-167 chrX 40705514 40705835 + 1 NA intron (NM_004229, intron 10 of 30) intron (NM_004229, intron 10 of 30) -29722 NM_001289773 100873985 Hs.460579 NM_001289773 MED14OS MED14-AS1 MED14 opposite strand protein-coding 405.75-4 chr12 114013930 114014522 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -47901 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 164.25-110 chr4 38254226 38254496 + 1 NA Intergenic Intergenic -112553 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 178.25-33 chr14 54880825 54881195 + 1 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) AluSp|SINE|Alu -2817 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 188.75-8 chr1 212773837 212774172 + 1 NA intron (NM_001042549, intron 4 of 6) L1MA3|LINE|L1 17773 NM_001297737 25936 Hs.497692 NM_015471 ENSG00000117697 NSL1 C1orf48|DC8|MIS14 NSL1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 395.75-6 chr14_GL000225v1_random 80980 81612 + 1 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 163.5-153 chr5 3585076 3585339 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -10625 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 125.5-90 chr15 70114804 70114958 + 1 NA Intergenic Intergenic -16964 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 165.5-64 chr17 62400009 62400248 + 1 NA intron (NM_001144933, intron 8 of 11) L2|LINE|L2 19575 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 142.5-59 chr13 64890554 64890921 + 1 NA Intergenic Intergenic -814726 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 170.25-85 chr20 43983531 43983829 + 1 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) MIR3|SINE|MIR 37784 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 226.5-106 chr9 71193408 71193918 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -72042 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 216.5-49 chr17 60503103 60503356 + 1 NA intron (NM_006380, intron 1 of 12) AluSc|SINE|Alu 23011 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 241.5-84 chr6 131577030 131577476 + 1 NA intron (NM_001369020, intron 2 of 5) intron (NM_001369020, intron 2 of 5) 4027 NM_001369020 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 301.25-7 chr11 44267529 44267877 + 1 NA intron (NM_021926, intron 2 of 3) intron (NM_021926, intron 2 of 3) 42436 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 177.25-88 chr22 35602606 35602999 + 1 NA Intergenic Intergenic 14527 NM_005368 4151 Hs.517586 NM_005368 ENSG00000198125 MB PVALB|myoglobgin myoglobin protein-coding 260.25-8 chr10 67355174 67355557 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 48045 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 214.5-112 chr6 154335131 154335442 + 1 NA intron (NM_015553, intron 1 of 11) LTR29|LTR|ERV1 -5205 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 199.25-34 chr15 62929775 62930070 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 105965 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 187.75-39 chr17 61148728 61148953 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 218864 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 146.5-75 chr15 94171178 94171423 + 1 NA Intergenic Intergenic -63362 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 252.5-11 chr10 77019184 77019449 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 16 of 28) intron (NM_001271519, intron 16 of 28) -121515 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 157.75-74 chr18 6129815 6130148 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) L1M5|LINE|L1 -126763 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 200.75-2 chr1 42302053 42302290 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 2 of 12) L1PA15-16|LINE|L1 32784 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 142.5-56 chr12 127345912 127346200 + 1 NA Intergenic Intergenic -5984 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 237.25-2 chr1 36006843 36007174 + 1 NA intron (NM_177422, intron 4 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie 75903 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 178.25-32 chr14 48228844 48229022 + 1 NA Intergenic Intergenic -433919 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 152.5-160 chr6 8685347 8685553 + 1 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) intron (NR_038980, intron 3 of 4) 33241 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 181.5-162 chr8 127426543 127426796 + 1 NA intron (NR_117100, intron 4 of 5) intron (NR_117100, intron 4 of 5) 10844 NM_001159542 5462 Hs.450254 NM_001159542 ENSG00000212993 POU5F1B OCT4-PG1|OCT4PG1|OTF3C|OTF3P1|POU5F1P1|POU5F1P4|POU5FLC20|POU5FLC8 POU class 5 homeobox 1B protein-coding 128.5-203 chr7 22348044 22348253 + 1 NA intron (NM_012294, intron 1 of 25) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 9006 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 198.5-39 chr14 19903584 19903892 + 1 NA Intergenic Intergenic -16869 NM_001005483 79317 Hs.554585 NM_001005483 ENSG00000176281 OR4K5 OR14-16 olfactory receptor family 4 subfamily K member 5 protein-coding 118.25-51 chr12 89574584 89574755 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -48407 NM_001199782 100528030 Hs.25130 NM_001199781 ENSG00000259075 POC1B-GALNT4 GALNT4|GalNAc-T4 POC1B-GALNT4 readthrough protein-coding 155.25-91 chr2 65273489 65273660 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 45879 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 222.75-100 chr8 121440782 121441110 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -198400 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 217.5-103 chr5 146573047 146573307 + 1 NA Intergenic Intergenic -57064 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 261.5-11 chr12 60858569 60858892 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 1169360 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 129.5-206 chr6 165580960 165581119 + 1 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) intron (NM_006661, intron 1 of 22) 81061 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 253.25-30 chr2 51411134 51411574 + 1 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) intron (NR_135237, intron 4 of 10) 378753 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 134.25-90 chr2 165327003 165327226 + 1 NA intron (NM_001040143, intron 14 of 27) intron (NM_001040143, intron 14 of 27) 33059 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 146.25-14 chr10 71482926 71483237 + 1 NA intron (NM_052836, intron 3 of 12) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 28839 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-29 chr10 43598410 43598614 + 1 NA Intergenic Intergenic -7895 NM_001318140 220992 Hs.147440 NM_145312 ENSG00000198298 ZNF485 - zinc finger protein 485 protein-coding 149.5-54 chr14 35543090 35543411 + 1 NA intron (NM_194301, intron 39 of 39) MIRb|SINE|MIR 9086 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 125.5-249 chr8 76929122 76929304 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 37637 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 238.5-36 chr19 7958073 7958516 + 1 NA TTS (NM_001419) TTS (NM_001419) -14628 NM_006351 10469 Hs.465784 NM_006351 ENSG00000104980 TIMM44 TIM44 translocase of inner mitochondrial membrane 44 protein-coding 142.75-151 chr5 4526057 4526251 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -247327 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 342.75-31 chr8 140142232 140142787 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -41974 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 199.25-12 chr10 83237709 83237962 + 1 NA Intergenic Intergenic 439254 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 321.75-20 chr2 201643456 201644120 + 1 NA promoter-TSS (NM_001044385) promoter-TSS (NM_001044385) -285 NM_001044385 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 176.5-79 chr19 27832123 27832408 + 1 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) intron (NR_146734, intron 1 of 7) -38325 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 186.25-35 chr15 63215023 63215464 + 1 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) intron (NM_016530, intron 1 of 7) 25637 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 183.5-128 chr7 2233128 2233510 + 1 NA promoter-TSS (NM_001013836) promoter-TSS (NM_001013836) -374 NM_001304523 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 127.5-68 chr14 21759948 21760155 + 1 NA Intergenic Intergenic -89034 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 243.75-21 chr14 20123092 20123369 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 5762 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 165.5-134 chr4 108663626 108663864 + 1 NA intron (NM_001267818, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR 13146 NM_021227 58505 Hs.445803 NM_021227 ENSG00000198856 OSTC DC2 oligosaccharyltransferase complex non-catalytic subunit protein-coding 131.75-9 chr1 67804040 67804200 + 1 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) intron (NM_018841, intron 1 of 3) -28168 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 193.75-13 chr1 186879112 186879626 + 1 NA intron (NM_024420, intron 3 of 17) intron (NM_024420, intron 3 of 17) 50420 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 186.5-64 chr2 60431138 60431340 + 1 NA Intergenic Intergenic -39864 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 133.5-40 chr10 99597445 99597687 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 22873 NM_031212 81894 Hs.403790 NM_031212 ENSG00000155287 SLC25A28 MFRN2|MRS3/4|MRS4L|NPD016 solute carrier family 25 member 28 protein-coding 117.5-208 chr6 140393347 140393528 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 188185 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 223.5-106 chr6 46865357 46865655 + 1 NA intron (NM_001098518, intron 13 of 20) L2c|LINE|L2 -37965 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 119.75-36 chr11 114482493 114482826 + 1 NA Intergenic Intergenic 43192 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 244.5-21 chr12 30735534 30735874 + 1 NA intron (NM_001002259, intron 3 of 17) intron (NM_001002259, intron 3 of 17) 18810 NM_023925 65981 Hs.234355 NM_023925 ENSG00000110888 CAPRIN2 C1QDC1|EEG-1|EEG1|RNG140 caprin family member 2 protein-coding 161.5-103 chr2 137126061 137126304 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 360637 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 269.25-14 chr16 8382608 8382916 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 207076 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 264.75-44 chr5 110320045 110320510 + 1 NA Intergenic Intergenic 193638 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 170.5-48 chr12 121570640 121570887 + 1 NA intron (NM_001005366, intron 4 of 22) L1MB7|LINE|L1 9483 NM_001005366 84678 Hs.524800 NM_032590 ENSG00000089094 KDM2B CXXC2|FBXL10|Fbl10|JHDM1B|PCCX2 lysine demethylase 2B protein-coding 214.25-76 chr7 94737571 94737785 + 1 NA Intergenic Intergenic 81308 NM_001172438 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 236.25-79 chr7 25565178 25565675 + 1 NA Intergenic Intergenic 97714 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 126.5-211 chr6 133952017 133952206 + 1 NA promoter-TSS (NM_001253676) promoter-TSS (NM_001253676) -59 NM_001253676 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 253.25-29 chr2 42696300 42696869 + 1 NA intron (NM_001330443, intron 10 of 16) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 67677 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 263.25-60 chr9 29027848 29028278 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -139108 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 268.5-7 chr1 238923222 238923600 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -437394 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 170.75-32 chr14 49772127 49772468 + 1 NA intron (NM_014315, intron 2 of 12) intron (NM_014315, intron 2 of 12) 4144 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 191.5-82 chr2 212513949 212514323 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 24492 NM_001042599 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 180.5-81 chr20 58425597 58425820 + 1 NA intron (NM_001195677, intron 2 of 2) MER5A|DNA|hAT-Charlie 36479 NM_001195677 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 167.75-39 chr12 117306727 117306986 + 1 NA intron (NM_001204214, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu -1804 NM_001204213 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 185.5-71 chr2 12401761 12402017 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 202759 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 188.5-125 chr5 69181502 69181794 + 1 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 -7935 NM_022909 64946 Hs.631967 NM_022909 ENSG00000153044 CENPH - centromere protein H protein-coding 210.5 chr1 18436343 18436697 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -44410 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 178.5-104 chr3 26960651 26960925 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 255735 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 124.75-135 chr21 43995814 43996081 + 1 NA Intergenic Intergenic -16362 NM_003274 7109 Hs.126221 NM_003274 ENSG00000160218 TRAPPC10 EHOC-1|EHOC1|GT334|TMEM1|TRS130|TRS30 trafficking protein particle complex 10 protein-coding 122.25-108 chr20 21577149 21577298 + 1 NA intron (NR_109880, intron 1 of 3) intron (NR_109880, intron 1 of 3) 7199 NR_109880 101929625 Hs.542413 NR_109880 LINC01727 - long intergenic non-protein coding RNA 1727 ncRNA 195.5-146 chr7 33461747 33462144 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 332381 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 203.75-94 chr6 127329987 127330362 + 1 NA intron (NM_001105545, intron 1 of 3) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 12233 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 134.5-218 chr8 63975015 63975184 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 205669 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 276.5-67 chrX 148586398 148586750 + 1 NA intron (NM_001169124, intron 1 of 19) intron (NM_001169124, intron 1 of 19) 85957 NM_001169122 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 286.5-63 chr7 79708190 79708643 + 1 NA Intergenic Intergenic 254456 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 122.25-26 chr10 100070444 100070612 + 1 NA intron (NM_001308, intron 2 of 8) intron (NM_001308, intron 2 of 8) 11341 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 176.75-140 chrX 67593678 67593908 + 1 NA intron (NM_001011645, intron 2 of 8) intron (NM_001011645, intron 2 of 8) 49170 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 142.75-122 chr22 26791142 26791338 + 1 NA Intergenic Intergenic -68971 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 115.5-52 chr13 87093796 87093975 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 181965 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 204.5-116 chr6 123990703 123991053 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 187013 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 292.5-6 chr1 214768842 214769169 + 1 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy 165810 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 257.25-22 chr2 61600943 61601356 + 1 NA Intergenic Intergenic -62793 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 150.5-174 chr5 92902719 92902995 + 1 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 668486 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 268.5-10 chr11 93857332 93857696 + 1 NA Intergenic Intergenic -6896 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 118.25-147 chr5 11593968 11594176 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L1ME3A|LINE|L1 -5006 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 145.5-162 chr5 115705662 115706010 + 1 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -33184 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 172.5-148 chr4 111212416 111212781 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -351951 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 139.5-29 chr11 77229566 77229763 + 1 NA intron (NM_182833, intron 14 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 72002 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 319.5-3 chr10 35629670 35630100 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 11367 NR_039831 100616500 NR_039831 ENSG00000284265 MIR4683 - microRNA 4683 ncRNA 268.5-54 chr6 40912112 40912503 + 1 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 110973 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 148.5-148 chr3 67945558 67945817 + 1 NA intron (NR_109992, intron 6 of 6) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -45905 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 236.75-9 chr1 241266441 241266799 + 1 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) 89206 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 169.5-91 chr20 56204480 56204760 + 1 NA Intergenic Intergenic -44112 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 193.5-106 chr3 56296059 56296301 + 1 NA exon (NM_015576, exon 3 of 17) exon (NM_015576, exon 3 of 17) 172287 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 212.75-73 chr4 62621309 62621632 + 1 NA Intergenic Intergenic -459705 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 306.5-23 chr2 117629220 117629591 + 1 NA Intergenic Intergenic -185286 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 298.75-22 chr18 13333695 13334216 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MC1|LINE|L1 55850 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 205.75-88 chr8 138763187 138763501 + 1 NA intron (NM_152888, intron 16 of 64) AluSx|SINE|Alu 150697 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 221.25-59 chr4 37759181 37759626 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -67283 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 133.75-142 chr3 168862828 168863148 + 1 NA Intergenic Intergenic -38957 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 320.5-11 chr14 59047747 59048295 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -140646 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 211.25-43 chr2 136883855 136884159 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 118462 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 214.75-18 chr12 119633609 119634010 + 1 NA intron (NM_001136534, intron 2 of 2) intron (NM_001136534, intron 2 of 2) -34324 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 220.5-22 chr13 100582854 100583290 + 1 NA intron (NM_001195087, intron 2 of 2) L1MC5|LINE|L1 5720 NM_001195087 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 236.25-57 chr3 48768803 48769193 + 1 NA intron (NM_001321982, intron 6 of 11) AluSz|SINE|Alu -51720 NM_001190317 51447 Hs.595983 NM_016291 ENSG00000068745 IP6K2 IHPK2|InsP6K2|PIUS inositol hexakisphosphate kinase 2 protein-coding 236.5-35 chr16 71222513 71222976 + 1 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) L1PB2|LINE|L1 7978 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 169.25-30 chr14 83670568 83670887 + 1 NA Intergenic Intergenic 1028095 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 167.75-80 chr2 214648516 214648779 + 1 NA Intergenic Intergenic 138465 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 277.75-20 chr3 6084371 6084972 + 1 NA Intergenic Intergenic 720778 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 193.75-73 chr2 220667666 220667932 + 1 NA Intergenic Intergenic -761234 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 175.75-49 chr16 79611412 79611587 + 1 NA Intergenic Intergenic -10762 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 126.5-102 chr19 58016277 58016558 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -13071 NM_025027 80095 Hs.654967 NM_025027 ENSG00000166704 ZNF606 ZNF328 zinc finger protein 606 protein-coding 139.5-219 chr8 119758184 119758441 + 1 NA intron (NM_003184, intron 20 of 25) intron (NM_003184, intron 20 of 25) 74529 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 210.75-4 chr1 62588250 62588669 + 1 NA intron (NM_001367561, intron 14 of 49) L1MC5|LINE|L1 -9061 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 146.5-52 chr12 68317114 68317350 + 1 NA intron (NM_001368282, intron 6 of 13) intron (NM_001368282, intron 6 of 13) 15130 NM_001368282 56890 Hs.655702 NM_017440 ENSG00000111554 MDM1 - Mdm1 nuclear protein protein-coding 228.5-41 chr15 99960992 99961350 + 1 NA Intergenic Intergenic 154148 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 220.75-33 chr18 28398998 28399395 + 1 NA Intergenic Intergenic -222066 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 304.5-34 chr7 21768344 21768888 + 1 NA intron (NM_001277115, intron 55 of 81) intron (NM_001277115, intron 55 of 81) 177283 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 113.5-33 chr10 44308718 44308866 + 1 NA Intergenic Intergenic 16042 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 199.75-3 chr1 96669714 96670028 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -51734 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 135.25-138 chr4 48545314 48545660 + 1 NA intron (NM_015030, intron 42 of 63) intron (NM_015030, intron 42 of 63) 55235 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 194.5-4 chr1 169875220 169875526 + 1 NA intron (NM_181093, intron 4 of 13) intron (NM_181093, intron 4 of 13) 18523 NM_020423 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 244.25-49 chr8 57400905 57401206 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 57268 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 211.5-118 chr4 97190692 97190932 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -176114 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 367.75-5 chr15 63298153 63298664 + 1 NA intron (NM_031301, intron 4 of 5) AluJb|SINE|Alu 20803 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 133.5-118 chr2 78722326 78722513 + 1 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 176888 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 156.5-173 chr7 54673260 54673498 + 1 NA Intergenic Intergenic 85832 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 254.5-71 chr7 74140188 74140558 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -33983 NM_022170 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 257.25-46 chr6 42245104 42245564 + 1 NA intron (NM_001297573, intron 14 of 17) intron (NM_001297573, intron 14 of 17) -27473 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 165.5-173 chr6 157073287 157073692 + 1 NA intron (NM_001363725, intron 2 of 17) intron (NM_001363725, intron 2 of 17) 37062 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 237.25-13 chr11 124599813 124600140 + 1 NA Intergenic Intergenic -11452 NM_052959 116337 Hs.99235 NM_052959 ENSG00000154143 PANX3 PX3 pannexin 3 protein-coding 194.5-57 chr18 41973108 41973445 + 1 NA intron (NM_001308020, intron 3 of 23) intron (NM_001308020, intron 3 of 23) 18042 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 166.5-55 chr12 124768880 124769211 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 70626 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 186.5-47 chr16 74272164 74272468 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -24498 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 215.75-51 chr2 126616099 126616507 + 1 NA Intergenic Intergenic -39632 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 173.75-44 chr12 83574063 83574452 + 1 NA Intergenic Intergenic 887102 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 152.5-55 chr15 61669664 61669863 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -60155 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 144.5-68 chr14 74237818 74238017 + 1 NA Intergenic Intergenic -1532 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 172.75-82 chr3 98887221 98887605 + 1 NA intron (NM_080927, intron 1 of 15) intron (NM_080927, intron 1 of 15) 14282 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 174.5-73 chr15 76209387 76209640 + 1 NA Intergenic Intergenic -28027 NR_120360 101929439 Hs.631721 NR_120360 ENSG00000259422 LOC101929439 - uncharacterized LOC101929439 ncRNA 148.5-176 chr4 120525679 120525872 + 1 NA Intergenic Intergenic 397091 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 147.75-103 chr3 65223722 65223899 + 1 NA Intergenic Intergenic -535810 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 170.25-160 chr9 38302162 38302572 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -90335 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 263.5-64 chr8 14332499 14332884 + 1 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) intron (NM_001322881, intron 2 of 6) 520819 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 159.75-111 chr3 125536212 125536446 + 1 NA intron (NM_022776, intron 11 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -16127 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 244.5-82 chr6 49311285 49311678 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 151772 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 144.5-45 chr11 114773455 114773670 + 1 NA Intergenic Intergenic 95035 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 200.25-62 chr2 119293239 119293462 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44279 NR_046721 100874111 Hs.704682 NR_046721 ENSG00000229867 STEAP3-AS1 - STEAP3 antisense RNA 1 ncRNA 196.25-91 chr4 42619159 42619475 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 4 of 35) intron (NM_001105529, intron 4 of 35) 37788 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 175.25-87 chr22 24751204 24751579 + 1 NA non-coding (NR_045648, exon 10 of 22) non-coding (NR_045648, exon 10 of 22) -13110 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 244.25-14 chr14 22754521 22754964 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -11946 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 130.5-112 chr16 86097459 86097651 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -98626 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 194.5-148 chr7 113531874 113532214 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 386965 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 183.5-153 chr8 132902960 132903334 + 1 NA intron (NM_003235, intron 16 of 47) intron (NM_003235, intron 16 of 47) 36189 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 115.25-32 chr10 101239260 101239499 + 1 NA TTS (NR_029380) TTS (NR_029380) 9785 NR_029380 399806 Hs.386143 NR_029380 LBX1-AS1 MUSE LBX1 antisense RNA 1 ncRNA 203.75-20 chr11 83752716 83753097 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) L2a|LINE|L2 -70481 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 358.25-12 chr2 45279979 45280424 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -25260 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 123.75-63 chr14 71139556 71139682 + 1 NA Intergenic Intergenic -180857 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 119.75-136 chr22 40232609 40232850 + 1 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) intron (NM_015088, intron 1 of 20) 54804 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 155.5-161 chr5 15249564 15249870 + 1 NA intron (NR_109944, intron 1 of 2) L3b|LINE|CR1 16843 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 201.25-18 chr10 115500516 115500717 + 1 NA intron (NM_207303, intron 24 of 28) AluSp|SINE|Alu 407251 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 245.5-9 chr10 90196617 90197042 + 1 NA Intergenic Intergenic -239456 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 255.5-61 chr4 32437995 32438385 + 1 NA Intergenic Intergenic 87152 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 134.25-182 chr7 113683558 113683716 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 235372 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 298.5-24 chr20 50902149 50902691 + 1 NA intron (NM_001282532, intron 2 of 3) intron (NM_001282532, intron 2 of 3) 7371 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 142.5-43 chr11 55051658 55051905 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -210374 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 135.5-214 chr9 71563749 71563948 + 1 NA Intergenic Intergenic -116877 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 362.25-17 chr8 118788112 118788633 + 1 NA Intergenic PRIMA4_LTR|LTR|ERV1 163513 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 190.75-102 chr7 45002205 45002558 + 1 NA intron (NM_001363459, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 2180 NM_001363459 83605 Hs.148272 NM_031443 ENSG00000136280 CCM2 C7orf22|OSM|PP10187 CCM2 scaffold protein protein-coding 385.75-3 chr14 72005116 72005809 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 71935 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 220.75-69 chr7 89976073 89976353 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) -143187 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 189.25-15 chr11 45619448 45619894 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 45951 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 113.25-59 chr15 80473581 80473868 + 1 NA intron (NM_014862, intron 4 of 18) intron (NM_014862, intron 4 of 18) 69342 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 213.25-68 chr9 27818852 27819278 + 1 NA Intergenic Intergenic -245199 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 244.75-44 chr5 3549200 3549526 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -13269 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 171.75-123 chr6 143898113 143898381 + 1 NA intron (NM_001013623, intron 4 of 7) AluJb|SINE|Alu 33773 NM_001013623 153918 Hs.121188 NM_001013623 ENSG00000118491 ZC2HC1B C6orf94|FAM164B|dJ468K18.5 zinc finger C2HC-type containing 1B protein-coding 178.5-182 chr8 88181924 88182194 + 1 NA intron (NM_005941, intron 3 of 9) L1MC2|LINE|L1 145424 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 164.5-210 chr8 102891367 102891666 + 1 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) intron (NR_126339, intron 2 of 2) 27245 NR_126339 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 253.25-12 chr11 29659613 29660169 + 1 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 41089 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 236.5-66 chr4 32549118 32549549 + 1 NA Intergenic Intergenic 198295 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 129.5-89 chr16 53928553 53928841 + 1 NA intron (NM_001363894, intron 8 of 9) intron (NM_001363894, intron 8 of 9) -110696 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 267.75-12 chr14 20316693 20317167 + 1 NA intron (NM_182849, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu 6396 NR_145735 109616976 Hs.742613 NR_145735 ENSG00000222489 SNORA79B - small nucleolar RNA, H/ACA box 79B snoRNA 212.5-101 chr7 10929131 10929564 + 1 NA Intergenic Intergenic 10806 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 189.25-56 chr2 45585105 45585408 + 1 NA intron (NM_018079, intron 5 of 20) intron (NM_018079, intron 5 of 20) 26011 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 247.75-46 chr5 26796555 26796989 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 241814 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 135.5-187 chr7 55508711 55509035 + 1 NA intron (NM_001321242, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 18007 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 180.25-95 chr5 79419743 79420113 + 1 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) intron (NM_004272, intron 5 of 8) 93908 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 203.5-47 chr16 8848161 8848432 + 1 NA 3' UTR (NM_000303, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_000303, exon 8 of 8) -1173 NR_147908 100130283 Hs.735515 NR_147908 LOC100130283 - uncharacterized LOC100130283 ncRNA 144.5-148 chr4 59949813 59949986 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 936326 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 189.5-134 chr7 64733992 64734305 + 1 NA Intergenic Intergenic 55084 NR_106898 102465505 NR_106898 ENSG00000275667 MIR6839 hsa-mir-6839 microRNA 6839 ncRNA 200.75-3 chr1 44890606 44890880 + 1 NA intron (NM_001166588, intron 6 of 9) LTR47B4|LTR|ERVL -47490 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 204.25-85 chr4 179753905 179754198 + 1 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 1405098 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 197.5-68 chr2 70708412 70708653 + 1 NA intron (NM_001185055, intron 1 of 11) intron (NM_001185055, intron 1 of 11) 59183 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 122.5-61 chr14 54266220 54266392 + 1 NA Intergenic Intergenic -130562 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 191.25-103 chr8 87262755 87263176 + 1 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) intron (NM_173538, intron 6 of 10) 396550 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 308.75-21 chr18 13084808 13085319 + 1 NA intron (NM_032142, intron 30 of 44) AluSc8|SINE|Alu 93701 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 144.75-96 chr2 200270399 200270543 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -35408 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 210.5-130 chr8 82006183 82006471 + 1 NA Intergenic Intergenic -164041 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 271.25-7 chr10 43075523 43075913 + 1 NA Intergenic Intergenic -1309 NM_020630 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 212.75-79 chr5 66624909 66625165 + 1 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) 28644 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 139.25-69 chr17 66920714 66920982 + 1 NA Intergenic Intergenic -43859 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 189.5-14 chr1 189428240 189428617 + 1 NA Intergenic Intergenic 1047582 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 173.5-156 chr8 27866653 27866952 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 19314 NR_036249 100422828 NR_036249 ENSG00000265847 MIR4287 - microRNA 4287 ncRNA 192.25-65 chr2 236413588 236414131 + 1 NA intron (NM_001270584, intron 7 of 17) intron (NM_001270584, intron 7 of 17) 89838 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 253.25-61 chr8 52744777 52745147 + 1 NA Intergenic Intergenic -30496 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 141.5-97 chr2 57403740 57403994 + 1 NA Intergenic Intergenic -503784 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 266.25-27 chr2 95141998 95142335 + 1 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 17419 NM_001318005 84874 Hs.355664 NM_032788 ENSG00000144026 ZNF514 - zinc finger protein 514 protein-coding 153.5-142 chr4 58848304 58848531 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -135865 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 130.25-57 chr14 52834760 52835037 + 1 NA Intergenic Intergenic -43291 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 320.25-22 chr6 46175105 46175980 + 1 NA Intergenic Intergenic -4532 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 123.75-82 chr18 59424741 59425028 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -65619 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 170.5-109 chr20 38857031 38857312 + 1 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) intron (NM_015568, intron 2 of 10) 51474 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 119.75-64 chr15 27158630 27158789 + 1 NA intron (NR_120343, intron 1 of 2) intron (NR_120343, intron 1 of 2) 2610 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 245.75-40 chr3 147582292 147582669 + 1 NA Intergenic Intergenic 161153 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 192.25-82 chr4 77034016 77034262 + 1 NA intron (NM_001306147, intron 11 of 11) intron (NM_001306147, intron 11 of 11) 40771 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 151.75-31 chr11 79622707 79622917 + 1 NA Intergenic Mam_R4|LINE|Dong-R4 -181782 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 218.5-39 chr14 46574954 46575293 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 76658 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 142.75-88 chr18 74703845 74703995 + 1 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) intron (NM_001146190, intron 2 of 3) 72957 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 294.5-47 chr6 64793095 64793467 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -508137 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 229.5-90 chr3 118710451 118710859 + 1 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 68887 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 194.5-21 chr10 115252687 115253079 + 1 NA intron (NM_207303, intron 10 of 28) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 159518 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 160.5-84 chr2 39672420 39672670 + 1 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 6628 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 165.25-93 chr3 141037703 141037880 + 1 NA Intergenic Intergenic -13556 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 166.5-21 chr10 14141294 14141664 + 1 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 67195 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 194.75-77 chr4 150269096 150269557 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 56 of 56) L1MB4|LINE|L1 190881 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 114.5-90 chr14 48050886 48051054 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -255956 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 190.5-51 chr15 77599434 77599642 + 1 NA Intergenic Intergenic 33374 NM_032808 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 378.5-10 chr21 31986878 31987563 + 1 NA intron (NM_014586, intron 8 of 10) intron (NM_014586, intron 8 of 10) 99075 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 225.5-11 chr10 21944223 21944603 + 1 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 59317 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 231.5-15 chr11 54806052 54806430 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 99409 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 193.25-42 chr17 29768590 29768898 + 1 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) intron (NM_033389, intron 2 of 14) -7312 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 200.75-84 chr5 21433534 21434066 + 1 NA Intergenic Intergenic -25680 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 233.5-98 chr6 153591298 153591665 + 1 NA Intergenic Intergenic -419015 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 117.5-10 chr1 111198159 111198304 + 1 NA intron (NM_001271833, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 2415 NM_024901 79961 Hs.557850 NM_024901 ENSG00000162777 DENND2D - DENN domain containing 2D protein-coding 275.5-6 chr1 240281086 240281515 + 1 NA intron (NM_020066, intron 7 of 17) intron (NM_020066, intron 7 of 17) 189417 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 122.5-94 chr18 67328787 67328930 + 1 NA Intergenic Intergenic -187688 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 142.75-192 chr8 128136353 128136569 + 1 NA Intergenic Intergenic -13655 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 286.25-12 chr17 58860083 58860401 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 104373 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 143.25-89 chr2 98415370 98415554 + 1 NA Intergenic Intergenic -29125 NM_001351424 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 144.75-131 chr5 9453701 9453908 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -57529 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 485.25-5 chr8 80513098 80513903 + 1 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) intron (NM_001105539, intron 2 of 5) 27274 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 124.75-200 chr8 99062160 99062305 + 1 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) intron (NR_047582, intron 4 of 8) 48966 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 191.5-15 chr10 64097765 64098145 + 1 NA Intergenic Intergenic -576065 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 193.75-36 chr12 25207357 25207555 + 1 NA 3' UTR (NM_033360, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_033360, exon 6 of 6) 12219 NM_001001660 144363 Hs.209151 NM_001001660 ENSG00000205707 ETFRF1 LYRM5 electron transfer flavoprotein regulatory factor 1 protein-coding 345.5-20 chr22 27964295 27964921 + 1 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu -43996 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 282.75-41 chr8 58019735 58020234 + 1 NA intron (NM_147189, intron 1 of 4) L1MEf|LINE|L1 25461 NM_147189 90362 Hs.154652 NM_147189 ENSG00000169122 FAM110B C8orf72 family with sequence similarity 110 member B protein-coding 219.25-38 chr2 149759798 149760312 + 1 NA intron (NR_110240, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 99136 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 181.75-31 chr12 55670906 55671297 + 1 NA Intergenic Intergenic -10635 NM_152637 196410 Hs.51483 NM_152637 ENSG00000170439 METTL7B ALDI methyltransferase like 7B protein-coding 137.5-56 chr12 100436170 100436400 + 1 NA Intergenic Intergenic -37581 NM_005123 9971 Hs.282735 NM_005123 ENSG00000012504 NR1H4 BAR|FXR|HRR-1|HRR1|PFIC5|RIP14 nuclear receptor subfamily 1 group H member 4 protein-coding 141.25-187 chr8 136462449 136462653 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -68247 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 159.5-43 chr12 29580950 29581144 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 10 of 19) MIR|SINE|MIR -81354 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 214.25-37 chr19 24359896 24360166 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -196584 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 273.5-44 chr22 35321060 35321442 + 1 NA intron (NR_156428, intron 2 of 13) MER5A|DNA|hAT-Charlie -14389 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 197.25-54 chr2 125808810 125809109 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 309026 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 218.25-40 chr2 58575933 58576348 + 1 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 55387 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 261.5-36 chr20 40137997 40138596 + 1 NA Intergenic Intergenic 133835 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 161.5-39 chr12 4364581 4364900 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 14972 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 236.75-43 chr5 57393384 57393736 + 1 NA Intergenic Intergenic 89251 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 158.75-48 chr13 79463931 79464116 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -17101 NM_019080 54602 Hs.525093 NM_019080 ENSG00000102471 NDFIP2 N4WBP5A Nedd4 family interacting protein 2 protein-coding 259.5-14 chr1 240979656 240979961 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 4 of 16) L2|LINE|L2 -152464 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 188.5-33 chr14 25556001 25556368 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -505887 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 145.75-52 chr16 49844544 49844849 + 1 NA intron (NM_001271620, intron 1 of 7) (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13223 NM_001271620 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 203.75-113 chr8 118202356 118202831 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -90774 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 286.5-29 chr17 70246303 70246770 + 1 NA Intergenic Intergenic 77001 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 160.5-213 chrX 125912834 125913036 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -196827 NR_110409 101928495 Hs.545998 NR_110409 ENSG00000237208 LOC101928495 - uncharacterized LOC101928495 ncRNA 165.5-73 chr2 9776997 9777306 + 1 NA Intergenic Intergenic -66291 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 125.5-213 chr5 147289671 147289866 + 1 NA intron (NM_001112724, intron 4 of 12) L1ME4a|LINE|L1 54742 NM_001287740 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 293.75-31 chr3 97131782 97132341 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -307546 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 181.75 chr1 13884484 13884753 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 135203 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 141.75-48 chr12 128275302 128275604 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) MER1A|DNA|hAT-Charlie 8050 NM_001136103 92293 Hs.49599 NM_001136103 ENSG00000181234 TMEM132C PPP1R152 transmembrane protein 132C protein-coding 164.5-184 chr7 1051669 1052035 + 1 NA intron (NM_001303473, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu -3518 NM_138445 115330 Hs.585007 NM_138445 ENSG00000164849 GPR146 PGR8 G protein-coupled receptor 146 protein-coding 125.5-74 chr14 32600514 32600735 + 1 NA intron (NM_004274, intron 6 of 13) intron (NM_004274, intron 6 of 13) 271326 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 158.75-45 chr12 114338409 114338700 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 67590 NM_181486 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 201.75-67 chr4 71349649 71349909 + 1 NA intron (NM_003759, intron 1 of 22) intron (NM_003759, intron 1 of 22) 10726 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 132.5-244 chr8 113400150 113400372 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) -23109 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 290.75-33 chr21 31213201 31213833 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 9 of 27) intron (NM_001353686, intron 9 of 27) -52577 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 119.75-49 chr12 87541499 87541817 + 1 NA Intergenic Intergenic 210919 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 289.75-29 chr7 122996188 122996685 + 1 NA promoter-TSS (NM_016945) promoter-TSS (NM_016945) -736 NM_016945 50833 Hs.272395 NM_016945 ENSG00000128519 TAS2R16 BGLPT|T2R16 taste 2 receptor member 16 protein-coding 169.75-121 chr5 25035350 25035630 + 1 NA Intergenic Intergenic 155166 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 275.25-22 chr2 159069964 159070381 + 1 NA intron (NM_001350065, intron 4 of 27) L1M5|LINE|L1 101532 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 119.5-207 chr7 25276794 25277025 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -48423 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 167.75-19 chr10 49093212 49093419 + 1 NA intron (NM_001031746, intron 2 of 7) LTR1A2|LTR|ERV1 22207 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 116.25-76 chr15 79709761 79709964 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 187135 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 188.5-76 chr2 85170715 85171068 + 1 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) -15518 NR_046797 100874334 Hs.693125 NR_046797 ENSG00000231134 TCF7L1-IT1 - TCF7L1 intronic transcript 1 ncRNA 187.25-22 chr11 106551311 106551537 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 300017 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 142.75-158 chr5 118448997 118449194 + 1 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) intron (NR_104610, intron 9 of 9) 113022 NR_104610 101927280 Hs.543951 NR_104610 LINC02208 HRAT56 long intergenic non-protein coding RNA 2208 ncRNA 180.75-131 chr6 133368884 133369217 + 1 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 127551 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 171.75-151 chrUn_KI270442v1 1326 1601 + 1 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 184.5-8 chr1 111123999 111124248 + 1 NA intron (NR_146307, intron 5 of 9) MER31B|LTR|ERV1 -15260 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 246.5-40 chr2 68949607 68950009 + 1 NA intron (NM_182536, intron 3 of 5) intron (NM_182536, intron 3 of 5) 3085 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 244.75-51 chr6 36261499 36261989 + 1 NA intron (NM_173676, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR -8716 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 235.25-33 chr2 53742118 53742474 + 1 NA intron (NM_001201965, intron 2 of 8) L1M7|LINE|L1 -25487 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 130.75-145 chr4 81979272 81979414 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 394648 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 222.75-50 chr17 59880556 59880912 + 1 NA intron (NM_001193613, intron 1 of 5) AluY|SINE|Alu 12209 NM_016261 51174 Hs.463638 NM_016261 ENSG00000108423 TUBD1 TUBD tubulin delta 1 protein-coding 124.75-116 chr2 61663147 61663312 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -124873 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 125.25-118 chr2 238708580 238708840 + 1 NA Intergenic Intergenic 139197 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 154.25-128 chr5 52061272 52061532 + 1 NA Intergenic Intergenic 53371 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 148.75-122 chr4 108526356 108526568 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -30771 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 183.75-112 chr6 159987538 159987987 + 1 NA intron (NM_000876, intron 1 of 47) intron (NM_000876, intron 1 of 47) 18663 NM_000876 3482 Hs.487062 NM_000876 ENSG00000197081 IGF2R CD222|CI-M6PR|CIMPR|M6P-R|M6P/IGF2R|MPR 300|MPR1|MPR300|MPRI insulin like growth factor 2 receptor protein-coding 193.75-63 chr2 58389235 58389461 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 113471 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 158.5-144 chr4 107014853 107015141 + 1 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) L1ME3F|LINE|L1 21316 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 177.25-96 chr3 114659258 114659541 + 1 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) -34454 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 131.25-165 chr5 88729755 88729985 + 1 NA intron (NM_001131005, intron 8 of 10) intron (NM_001131005, intron 8 of 10) -38829 NR_152232 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 181.5-73 chr2 43644852 43645139 + 1 NA intron (NM_172069, intron 2 of 29) intron (NM_172069, intron 2 of 29) 7735 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 180.75-103 chr4 56013361 56013581 + 1 NA intron (NM_025009, intron 21 of 25) L1MB3|LINE|L1 64526 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 196.25-102 chr6 36231508 36231977 + 1 NA 3' UTR (NM_015695, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_015695, exon 13 of 13) -11426 NM_001145716 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 174.5-63 chr14 60435496 60435716 + 1 NA TTS (NM_174978) TTS (NM_174978) 50457 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 287.75-6 chr10 55428924 55429505 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MEc|LINE|L1 -169828 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 162.5-31 chr12 14089099 14089306 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -108846 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 189.25-99 chr5 150018447 150018762 + 1 NA exon (NM_001366501, exon 5 of 19) exon (NM_001366501, exon 5 of 19) 17865 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 327.25-11 chr21 28257960 28258602 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -29614 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 156.5-182 chr8 8730912 8731145 + 1 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 29091 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 150.5-110 chr2 214604995 214605183 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 94907 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 216.25-26 chr12 44185268 44185604 + 1 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 349355 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 125.5-58 chr12 97533458 97533699 + 1 NA non-coding (NR_024037, exon 9 of 9) non-coding (NR_024037, exon 9 of 9) -30234 NR_029678 406926 NR_029678 ENSG00000207586 MIR135A2 MIRN135-2|MIRN135A2|mir-135a-2 microRNA 135a-2 ncRNA 230.75-14 chr11 87431450 87431789 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 287792 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 154.5-22 chr10 49314565 49314876 + 1 NA intron (NM_001135196, intron 1 of 2) intron (NM_001135196, intron 1 of 2) 15550 NM_001135196 118461 Hs.585480 NM_199459 ENSG00000177354 C10orf71 CEFIP chromosome 10 open reading frame 71 protein-coding 171.5-48 chr14 74662760 74663043 + 1 NA 3' UTR (NM_001039479, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001039479, exon 20 of 20) 50179 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 212.5-48 chr2 82860304 82860572 + 1 NA Intergenic Intergenic 3635 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 149.5-117 chr22 25957510 25957816 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 39 of 43) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -211799 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 176.5-73 chr17 77187107 77187367 + 1 NA intron (NM_001144001, intron 1 of 14) intron (NM_001144001, intron 1 of 14) 2024 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 235.5-13 chr10 74959753 74960094 + 1 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) 47137 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 265.75-57 chr5 36059511 36059834 + 1 NA intron (NM_001168316, intron 1 of 5) HERVK14-int|LTR|ERVK 7210 NM_001168316 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 224.5-13 chr10 26745258 26745510 + 1 NA intron (NM_001321978, intron 9 of 9) intron (NM_001321978, intron 9 of 9) 47683 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 122.5-151 chr3 88634161 88634314 + 1 NA Intergenic Intergenic 295781 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 116.25-223 chr8 37018082 37018348 + 1 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 233841 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 191.5-120 chr5 68929491 68929772 + 1 NA Intergenic Intergenic 100296 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 191.5-133 chr6 153280681 153281119 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -149618 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 221.5-88 chr7 23120627 23121011 + 1 NA intron (NR_033329, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 14158 NM_018846 55975 Hs.654817 NM_018846 ENSG00000122550 KLHL7 CISS3|KLHL6|SBBI26 kelch like family member 7 protein-coding 167.5-32 chr11 19214531 19214776 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -12670 NM_003476 8048 Hs.83577 NM_003476 ENSG00000129170 CSRP3 CLP|CMD1M|CMH12|CRP3|LMO4|MLP cysteine and glycine rich protein 3 protein-coding 261.5-50 chr5 17948538 17948922 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 141456 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 255.75-30 chr21 27698340 27698858 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -23780 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 210.25-47 chr2 241492372 241492732 + 1 NA TTS (NM_001271977) TTS (NM_001271977) 14647 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 170.5-110 chr20 40640571 40640891 + 1 NA Intergenic Intergenic 48505 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 181.5-118 chr4 51841661 51841879 + 1 NA Intergenic Intergenic -1230 NM_015115 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 155.5-49 chr13 91391808 91392025 + 1 NA Intergenic Intergenic -6705 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 112.5-150 chr21 26360831 26361006 + 1 NA Intergenic Intergenic -32717 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 255.75-12 chr13 65887752 65888096 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 21877 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 163.25-147 chr9 12585618 12585860 + 1 NA Intergenic Intergenic -107646 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 165.5-117 chr3 115398247 115398617 + 1 NA Intergenic Intergenic -225078 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 336.75-21 chr8 139224825 139225280 + 1 NA Intergenic Intergenic -311011 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 222.5-67 chr3 34804844 34805259 + 1 NA Intergenic Intergenic 588972 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 141.5-94 chr2 34773481 34773707 + 1 NA Intergenic Intergenic 96037 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 212.5-23 chr12 22604722 22605224 + 1 NA intron (NR_135030, intron 2 of 3) L1P4|LINE|L1 20073 NR_135030 105369691 Hs.556287 NR_135030 LOC105369691 - uncharacterized LOC105369691 ncRNA 225.5-52 chr2 14116083 14116425 + 1 NA Intergenic Intergenic 284704 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 220.75-59 chr6 11946241 11946630 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 54809 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 176.5-123 chr3 103584453 103584749 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -60485 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 181.5-110 chr3 78591432 78591680 + 1 NA Intergenic Intergenic 427903 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 121.5-193 chr4 61585661 61585860 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 383588 NM_001371342 170.75-42 chr15 65375353 65375674 + 1 NA intron (NM_004884, intron 1 of 13) intron (NM_004884, intron 1 of 13) 2489 NM_004884 9543 Hs.128292 NM_004884 ENSG00000174498 IGDCC3 HsT18880|PUNC immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3 protein-coding 194.5 chr1 31920723 31920971 + 1 NA intron (NM_001195101, intron 1 of 4) intron (NM_001195101, intron 1 of 4) 16971 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 172.25-32 chr13 25024424 25024708 + 1 NA Intergenic Intergenic -56097 NR_026730 646405 Hs.620592 NM_001126062 TPTE2P1 - transmembrane phosphoinositide 3-phosphatase and tensin homolog 2 pseudogene 1 pseudo 136.25-84 chr17 72301290 72301599 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -41367 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 130.25-114 chr2 217595575 217595711 + 1 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) intron (NR_026597, intron 2 of 12) 160950 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 151.25-68 chr17 76896303 76896786 + 1 NA intron (NM_144677, intron 3 of 16) L2c|LINE|L2 23897 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 155.25-82 chr17 59907242 59907461 + 1 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) L1MB7|LINE|L1 14230 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 151.5-7 chr1 85073080 85073297 + 1 NA intron (NM_001288563, intron 3 of 21) intron (NM_001288563, intron 3 of 21) 10861 NM_145172 126820 Hs.97933 NM_145172 ENSG00000162643 WDR63 DIC3|NYD-SP29 WD repeat domain 63 protein-coding 196.25-58 chr2 24249773 24250005 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 24 of 38) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 74836 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 291.25-15 chr2 69368795 69369240 + 1 NA intron (NM_002056, intron 3 of 18) intron (NM_002056, intron 3 of 18) 18210 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 165.5-159 chr6 49527796 49528062 + 1 NA 3' UTR (NM_001010904, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001010904, exon 6 of 6) -22739 NR_146860 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 152.5-73 chr18 6606046 6606323 + 1 NA Intergenic Intergenic 94768 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 195.75-73 chr3 72340301 72340649 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 106148 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 294.5-21 chr2 80465056 80465713 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 152005 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 196.5-18 chr10 36757456 36757793 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -368233 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 160.5-127 chr3 121336332 121336564 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) AluJb|SINE|Alu 209540 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 190.25-91 chr4 58594711 58595063 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -58559 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 135.5-159 chr5 31998767 31998964 + 1 NA intron (NM_178140, intron 4 of 24) MamGypLTR1a|LTR|Gypsy -62706 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 251.75-80 chr9 73932391 73932763 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -438954 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 237.75-62 chr5 11444256 11444753 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 144413 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 162.5-9 chr1 212931110 212931321 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -19326 NM_001301056 79805 Hs.96885 NM_024749 ENSG00000143494 VASH2 - vasohibin 2 protein-coding 203.5-82 chr20 44604946 44605238 + 1 NA intron (NM_001281444, intron 4 of 5) L1ME4b|LINE|L1 22513 NM_001281445 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 141.5-17 chr10 52500913 52501152 + 1 NA Intergenic Intergenic -30499 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 198.5-117 chr5 93195645 93195966 + 1 NA Intergenic Intergenic 375538 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 193.5-111 chr3 130465522 130465997 + 1 NA intron (NM_001278298, intron 37 of 40) L1MEc|LINE|L1 -94575 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 378.5 chr1 217988305 217988961 + 1 NA Intergenic Intergenic -54872 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 129.25-192 chr8 19489717 19490050 + 1 NA intron (NM_001130518, intron 4 of 9) intron (NM_001130518, intron 4 of 9) 112662 NM_001354491 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 229.25-31 chr16 48487581 48487985 + 1 NA Intergenic Intergenic -102370 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 192.25-64 chr2 212916472 212916775 + 1 NA Intergenic Intergenic -9634 NR_039935 100616267 NR_039935 ENSG00000266354 MIR4776-1 mir-4776-1 microRNA 4776-1 ncRNA 135.25-195 chr8 74383333 74383549 + 1 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 33038 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 304.25-24 chr7 93253466 93254041 + 1 NA intron (NM_001257998, intron 4 of 28) intron (NM_001257998, intron 4 of 28) 21387 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 131.25-9 chr1 79771209 79771463 + 1 NA Intergenic Intergenic -764419 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 114.5-180 chr3 107889793 107889970 + 1 NA intron (NR_015394, intron 1 of 2) intron (NR_015394, intron 1 of 2) 6676 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 211.75-32 chr17 80460761 80461095 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 15679 NM_002522 4884 Hs.514556 NM_002522 ENSG00000171246 NPTX1 NP1 neuronal pentraxin 1 protein-coding 153.75-133 chr6 92795521 92795730 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 623934 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 154.5-134 chr3 178719193 178719394 + 1 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 141112 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 224.75-69 chr8 67868131 67868657 + 1 NA Intergenic Intergenic -83652 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 297.25 chr1 164145610 164146135 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -413488 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 303.75-5 chr1 182758007 182758472 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -31210 NM_001200050 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 114.25-201 chr9 14501106 14501236 + 1 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) 30906 NM_001369458 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 116.5-179 chr4 71131406 71131582 + 1 NA Intergenic Intergenic -55765 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 346.5-17 chr21 16452205 16452833 + 1 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) intron (NR_136550, intron 1 of 3) 32224 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 260.5-43 chr4 66322461 66322819 + 1 NA Intergenic Intergenic 45816 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 244.75-8 chr10 73132111 73132460 + 1 NA TTS (NM_001283019) TTS (NM_001283019) -6078 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 128.25-217 chr9 29529363 29529497 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -315829 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 246.5-17 chr12 55874931 55875245 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -32152 NM_002429 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 142.5-38 chr10 129787467 129787742 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 55770 NR_036179 100422873 NR_036179 ENSG00000266676 MIR4297 - microRNA 4297 ncRNA 167.5-36 chr11 46806809 46806992 + 1 NA intron (NM_001008938, intron 8 of 43) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 39380 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 167.25-136 chr6 48810776 48811019 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 652356 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 192.5-36 chr13 113567799 113568165 + 1 NA Intergenic Intergenic -16706 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 132.5-39 chr11 58933462 58933752 + 1 NA TTS (NR_033853) TTS (NR_033853) 5978 NM_001220494 92292 Hs.38085 NM_080661 ENSG00000166840 GLYATL1 GATF-C|GNAT glycine-N-acyltransferase like 1 protein-coding 156.5-2 chr1 40223615 40223952 + 1 NA intron (NM_012421, intron 6 of 7) MIRc|SINE|MIR -24154 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 166.25-92 chr20 38794811 38795122 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -10731 NM_015568 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 218.5-99 chr5 44500451 44500755 + 1 NA non-coding (NR_131946, exon 2 of 3) non-coding (NR_131946, exon 2 of 3) 9679 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 140.25-97 chr2 117736204 117736431 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -78374 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 144.25-67 chr15 87487456 87487738 + 1 NA Intergenic Intergenic -89332 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 116.25-135 chr3 26620296 26620592 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2362 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 119.5-103 chr17 63085885 63086058 + 1 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) L1MCa|LINE|L1 119736 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 191.5-131 chr6 120658773 120659030 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 643722 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 186.5-90 chr3 53590711 53590999 + 1 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) intron (NM_001128840, intron 3 of 47) 96244 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 301.25-2 chr1 88480108 88480745 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -203718 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 160.25-77 chr2 166284627 166284862 + 1 NA exon (NM_002977, exon 12 of 27) exon (NM_002977, exon 12 of 27) 91200 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 313.5-5 chr11 97883292 97883664 + 1 NA Intergenic MER57E1|LTR|ERV1 -1137471 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 174.5-115 chr22 42043377 42043625 + 1 NA Intergenic Intergenic 27311 NM_000262 4668 Hs.75372 NM_000262 ENSG00000198951 NAGA D22S674|GALB alpha-N-acetylgalactosaminidase protein-coding 153.75-81 chr21 28312768 28312937 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -84185 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 140.5-95 chr19 28084187 28084376 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -290341 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 173.75-117 chr4 38607914 38608142 + 1 NA Intergenic Intergenic 44025 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 188.75-38 chr16 73806996 73807225 + 1 NA Intergenic Intergenic 408411 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 203.5-115 chr5 83308535 83308889 + 1 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) intron (NM_022550, intron 7 of 7) -162962 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 181.75-12 chr1 236232375 236232601 + 1 NA intron (NM_019891, intron 9 of 15) intron (NM_019891, intron 9 of 15) 49470 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 176.5-145 chr5 144742128 144742451 + 1 NA Intergenic Intergenic 536898 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 208.25-73 chr5 132129693 132130008 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -55026 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 198.5-2 chr1 85324462 85324720 + 1 NA intron (NM_001134445, intron 6 of 6) intron (NM_001134445, intron 6 of 6) -47959 NM_003921 8915 Hs.193516 NM_003921 ENSG00000142867 BCL10 CARMEN|CIPER|CLAP|IMD37|c-E10|mE10 BCL10 immune signaling adaptor protein-coding 177.25-116 chr5 41695133 41695376 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 148403 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 187.5-43 chr12 92729088 92729391 + 1 NA Intergenic Intergenic -7250 NM_001004330 440107 Hs.591013 NM_001004330 ENSG00000187510 PLEKHG7 - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G7 protein-coding 222.75-32 chr12 119977682 119978040 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11375 NM_001367886 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 175.75-77 chr20 20690126 20690365 + 1 NA intron (NM_020343, intron 1 of 39) intron (NM_020343, intron 1 of 39) 22399 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 116.5-155 chr3 20071785 20071954 + 1 NA intron (NM_003884, intron 1 of 17) intron (NM_003884, intron 1 of 17) 31423 NM_003884 8850 Hs.533055 NM_003884 ENSG00000114166 KAT2B CAF|P/CAF|PCAF lysine acetyltransferase 2B protein-coding 230.5-58 chr18 22912342 22912762 + 1 NA Intergenic Intergenic -20776 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 193.75-87 chr3 95651372 95651581 + 1 NA Intergenic Intergenic 31717 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 159.5-111 chr2 139459591 139459880 + 1 NA Intergenic Intergenic 562411 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 194.5-81 chr20 37154665 37155020 + 1 NA intron (NM_213632, intron 8 of 12) L2b|LINE|L2 -24204 NM_001135771 6185 Hs.370895 NM_002951 ENSG00000118705 RPN2 RIBIIR|RPN-II|RPNII|SWP1 ribophorin II protein-coding 137.25-65 chr2 42343724 42343975 + 1 NA intron (NM_001319038, intron 2 of 2) intron (NM_001319038, intron 2 of 2) 16189 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 127.5-36 chr10 111492474 111492658 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 378275 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 173.5-29 chr11 41739909 41740196 + 1 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 25484 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 174.5-171 chr7 25058279 25058488 + 1 NA Intergenic Intergenic 66978 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 113.5-126 chr2 115877681 115877868 + 1 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 533959 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 260.5-46 chr5 3811890 3812287 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 216256 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 225.75-23 chr14 32003793 32004121 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 59104 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 155.5-44 chr12 28282295 28282492 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) L1PB3|LINE|L1 -91655 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 178.25-70 chr2 229285888 229286144 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -14729 NM_001100818 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 196.75-23 chr11 90960586 90960979 + 1 NA Intergenic Intergenic -91580 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 114.5-196 chr4 121523233 121523396 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -142296 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 225.75-76 chr8 124784331 124784578 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -37531 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 229.25-61 chr5 29726565 29726981 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -153787 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 127.5-87 chr15 57139361 57139535 + 1 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -79982 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 302.5-2 chr1 197927638 197928105 + 1 NA intron (NM_001370213, intron 4 of 4) intron (NM_001370213, intron 4 of 4) 10499 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 302.75-9 chr15 63007421 63007928 + 1 NA Intergenic Intergenic -35073 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 139.5-222 chr8 127960460 127960609 + 1 NA promoter-TSS (NR_031610) promoter-TSS (NR_031610) -99 NR_031610 100302161 NR_031610 ENSG00000221771 MIR1205 MIRN1205|hsa-mir-1205 microRNA 1205 ncRNA 112.5-16 chr1 229605457 229605600 + 1 NA intron (NM_001025247, intron 3 of 3) MLT2D|LTR|ERVL 20519 NM_014409 27097 Hs.270621 NM_014409 ENSG00000135801 TAF5L PAF65B TATA-box binding protein associated factor 5 like protein-coding 199.5-35 chr13 81838297 81838630 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -611480 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 200.5-8 chr1 111591175 111591451 + 1 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 17005 NR_034126 100129269 Hs.689728 NR_034126 LINC01160 - long intergenic non-protein coding RNA 1160 ncRNA 150.5-109 chr2 206424733 206425027 + 1 NA Intergenic Intergenic -18652 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 126.75-126 chr2 241067978 241068151 + 1 NA intron (NM_001080437, intron 22 of 31) intron (NM_001080437, intron 22 of 31) 34223 NM_182501 130916 Hs.159556 NM_182501 ENSG00000122085 MTERF4 MTERFD2 mitochondrial transcription termination factor 4 protein-coding 137.75-180 chr6 73256397 73256694 + 1 NA intron (NM_001251874, intron 2 of 4) intron (NM_001251874, intron 2 of 4) 6651 NM_030568 80759 Hs.433062 NM_030568 ENSG00000135314 KHDC1 C6orf147|C6orf148|Em:AC019205.8|KHDC1L|NDG1|bA257K9.4 KH domain containing 1 protein-coding 124.25-49 chr14 27712626 27712888 + 1 NA Intergenic Intergenic -39536 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 171.75-2 chr1 14555673 14555910 + 1 NA Intergenic Intergenic -42894 NM_201628 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 164.5-198 chr8 19606218 19606481 + 1 NA intron (NR_148898, intron 1 of 9) intron (NR_148898, intron 1 of 9) -3804 NM_001354496 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 174.75-56 chr2 53877808 53878077 + 1 NA intron (NM_014614, intron 41 of 46) L1ME4b|LINE|L1 -17909 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 184.5-42 chr14 51234212 51234493 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -5895 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 166.5-118 chr20 18440884 18441312 + 1 NA intron (NM_001367611, intron 8 of 20) ERVL-E-int|LTR|ERVL 25932 NM_001367612 55184 Hs.472225 NM_018152 ENSG00000089091 DZANK1 ANKRD64|C20orf12|C20orf84 double zinc ribbon and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 224.5-90 chr5 150931710 150931960 + 1 NA non-coding (NR_026867, exon 5 of 5) non-coding (NR_026867, exon 5 of 5) 14749 NR_026867 134466 Hs.661876 NR_026867 ZNF300P1 - zinc finger protein 300 pseudogene 1 pseudo 160.5-167 chr7 3743010 3743320 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -386520 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 224.5-64 chr2 147463692 147463940 + 1 NA Intergenic Intergenic -380701 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 148.25-15 chr1 219541724 219542025 + 1 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 15450 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 181.5-148 chr7 39348980 39349203 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) intron (NM_001370959, intron 5 of 9) -19957 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 161.5-148 chr4 107697446 107697681 + 1 NA intron (NM_005443, intron 2 of 11) intron (NM_005443, intron 2 of 11) 22671 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 168.5-67 chr17 78402119 78402404 + 1 NA intron (NR_110602, intron 5 of 8) intron (NR_110602, intron 5 of 8) 23612 NR_110602 9489 Hs.654671 NM_024419 ENSG00000087157 PGS1 - phosphatidylglycerophosphate synthase 1 protein-coding 190.25-17 chr10 124979662 124979972 + 1 NA intron (NM_017580, intron 5 of 8) L1M4|LINE|L1 26201 NM_001363508 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 218.75-13 chr11 27583201 27583590 + 1 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) intron (NR_033315, intron 2 of 6) 51232 NR_102708 101410541 Hs.471439 NR_102708 ENSG00000254934 LINC00678 - long intergenic non-protein coding RNA 678 ncRNA 140.75-90 chr2 115586392 115586645 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) L1MC5a|LINE|L1 242703 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 135.75-209 chr9 19100473 19100726 + 1 NA intron (NM_001270890, intron 1 of 16) L1MA4|LINE|L1 2305 NM_001270890 54801 Hs.533468 NM_017645 ENSG00000147874 HAUS6 Dgt6|FAM29A HAUS augmin like complex subunit 6 protein-coding 152.25-93 chr2 205374342 205374560 + 1 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) AluSg|SINE|Alu -308049 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 205.5-48 chr16 6785285 6785608 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 11637 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 143.25-157 chr6 64135223 64135559 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 328555 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 217.5-94 chr5 13424476 13424752 + 1 NA Intergenic Intergenic -391728 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 193.5-132 chr5 41441139 41441480 + 1 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) intron (NM_001005473, intron 1 of 2) 69292 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 220.75-71 chr7 108284154 108284538 + 1 NA intron (NM_001371171, intron 3 of 28) intron (NM_001371171, intron 3 of 28) -40961 NM_001371181 178.5-20 chr11 17660035 17660284 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 36780 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 213.5-35 chr14 55822555 55822911 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -26059 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 258.75-2 chr1 119789689 119790137 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -20981 NM_005518 3158 Hs.59889 NM_005518 ENSG00000134240 HMGCS2 - 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 protein-coding 127.5-73 chr14 50715226 50715390 + 1 NA Intergenic Intergenic -47002 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 226.25 chr1 21078093 21078383 + 1 NA intron (NM_003760, intron 1 of 31) L1MA4A|LINE|L1 33145 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 123.25-14 chr1 192927375 192927642 + 1 NA Intergenic Intergenic 20749 NR_126003 102724954 Hs.243488 NR_126003 LINC01032 - long intergenic non-protein coding RNA 1032 ncRNA 123.5-114 chr2 215747242 215747457 + 1 NA non-coding (NR_037195, exon 3 of 10) non-coding (NR_037195, exon 3 of 10) 29306 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 297.75-50 chr8 102917838 102918430 + 1 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 53863 NR_126339 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 201.75-104 chr8 121913744 121914107 + 1 NA Intergenic Intergenic -272485 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 171.75-62 chr17 70262872 70263125 + 1 NA Intergenic Intergenic 93463 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 233.5-19 chr10 15900195 15900519 + 1 NA Intergenic Intergenic -39824 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 126.75-83 chr16 71650643 71650843 + 1 NA intron (NM_015020, intron 18 of 18) intron (NM_015020, intron 18 of 18) 24559 NM_001017967 91862 Hs.513706 NM_052858 ENSG00000140832 MARVELD3 MARVD3|MRVLDC3 MARVEL domain containing 3 protein-coding 258.5-3 chr1 108550577 108550994 + 1 NA Intergenic Intergenic -9315 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 267.25-12 chr14 53929205 53929685 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 19039 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 138.5-153 chr5 32820246 32820410 + 1 NA Intergenic Intergenic 109007 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 244.75-41 chr4 56574728 56575233 + 1 NA intron (NM_001256475, intron 4 of 8) AluY|SINE|Alu 44374 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 201.25-38 chr17 48480845 48481144 + 1 NA Intergenic Intergenic 36161 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 134.75-35 chr10 121112640 121112848 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 261382 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 153.5-160 chr5 124431926 124432211 + 1 NA intron (NR_125774, intron 3 of 5) L1MA6|LINE|L1 6452 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 285.5-21 chr15 61731060 61731524 + 1 NA TTS (NR_146448) TTS (NR_146448) 1374 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 155.75 chr1 14483818 14484052 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -63962 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 187.75-21 chr12 25115201 25115465 + 1 NA intron (NM_001352063, intron 10 of 13) L1MB8|LINE|L1 62627 NM_001204126 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 145.75-41 chr14 72875249 72875433 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 17308 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 213.25-60 chr7 13200058 13200353 + 1 NA Intergenic Intergenic 512572 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 171.75-6 chr1 113040043 113040230 + 1 NA intron (NR_103777, intron 2 of 2) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 32966 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 269.75-28 chr18 9179921 9180404 + 1 NA intron (NM_001204056, intron 1 of 11) L1MDa|LINE|L1 42599 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 266.75-20 chr2 27825663 27826076 + 1 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) intron (NM_022128, intron 7 of 7) 54150 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 164.25-53 chr17 33173562 33173737 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 119339 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 161.25-184 chr9 81084871 81085188 + 1 NA Intergenic Intergenic 604506 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 151.25-107 chr20 45395378 45395610 + 1 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -10499 NM_001197139 55861 Hs.730643 NM_018478 ENSG00000244274 DBNDD2 C20orf35|CK1BP|HSMNP1 dysbindin domain containing 2 protein-coding 167.5-116 chr3 15054247 15054472 + 1 NA intron (NR_135246, intron 2 of 4) L1M4|LINE|L1 10956 NM_022497 64432 Hs.657764 NM_022497 ENSG00000131368 MRPS25 MRP-S25|RPMS25 mitochondrial ribosomal protein S25 protein-coding 174.25-134 chr7 48819985 48820381 + 1 NA Intergenic Intergenic -104364 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 122.5-227 chr8 106477977 106478119 + 1 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 30124 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 195.75-50 chr17 59210492 59210926 + 1 NA exon (NM_018149, exon 1 of 4) exon (NM_018149, exon 1 of 4) 699 NM_018149 55181 Hs.7296 NM_018149 ENSG00000167447 SMG8 C17orf71 SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 305.75-15 chr22 33587477 33588111 + 1 NA intron (NM_133642, intron 5 of 14) intron (NM_133642, intron 5 of 14) 117126 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 177.25-71 chr2 156830502 156830780 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 394262 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 180.5-19 chr11 86892848 86893180 + 1 NA intron (NR_120592, intron 2 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -35060 NR_045004 8587 Hs.741959 NR_045004 ENSG00000255203 OR7E2P OR11-6|OR7E143P|OR7E51P|OR7E52P|OR7F2P|OST245|hg94 olfactory receptor family 7 subfamily E member 2 pseudogene pseudo 234.5-62 chr3 96078672 96079053 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -281102 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 224.75-64 chr7 22407770 22408230 + 1 NA Intergenic Intergenic -50846 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 221.5-16 chr12 53439762 53440172 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -1682 NM_001005354 54458 Hs.744894 NM_018457 ENSG00000205352 PRR13 TXR1 proline rich 13 protein-coding 229.5-42 chr14 78041828 78042155 + 1 NA Intergenic Intergenic -128382 NR_158973 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 204.75-61 chr2 56272941 56273346 + 1 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 -87373 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 182.5-78 chr2 55891666 55891925 + 1 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) intron (NM_001039349, intron 4 of 10) 31987 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 155.75-4 chr1 42758979 42759287 + 1 NA intron (NM_001243246, intron 3 of 13) intron (NM_001243246, intron 3 of 13) 7951 NM_001146289 64175 Hs.720014 NM_022356 ENSG00000117385 P3H1 GROS1|LEPRE1|OI8 prolyl 3-hydroxylase 1 protein-coding 230.5-42 chr15 67610766 67611119 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) intron (NM_001206804, intron 8 of 21) 61848 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 211.5-139 chr7 26848757 26849020 + 1 NA intron (NM_003930, intron 3 of 12) intron (NM_003930, intron 3 of 12) 8835 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 121.75-71 chr19 44604520 44604653 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -8977 NM_001205280 147710 Hs.512509 NM_001205280 ENSG00000216588 IGSF23 - immunoglobulin superfamily member 23 protein-coding 133.25-146 chr4 41306699 41306920 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 49881 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 228.75-46 chr2 159232361 159232636 + 1 NA 3' UTR (NM_033394, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_033394, exon 27 of 27) 45663 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 115.5-32 chr11 121952241 121952384 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 147532 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 119.5-53 chr11 109727312 109727501 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 305216 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 200.5-41 chr14 73093436 73093681 + 1 NA intron (NM_021239, intron 6 of 18) AluSq2|SINE|Alu 35024 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 180.25-13 chr11 109214944 109215154 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -207141 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 244.25-26 chr20 50748571 50748867 + 1 NA intron (NM_032521, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 17139 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 132.75-82 chr18 6993122 6993283 + 1 NA intron (NM_005559, intron 35 of 62) intron (NM_005559, intron 35 of 62) 38525 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 157.5-39 chr11 69978517 69978735 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 85298 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 249.5-55 chr2 233898538 233898893 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18658 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 180.5-64 chr18 6443571 6443807 + 1 NA Intergenic Intergenic -28430 NM_001365765 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 201.5-11 chr1 100440001 100440293 + 1 NA intron (NM_001319212, intron 6 of 13) intron (NM_001319212, intron 6 of 13) 87641 NM_001319210 8556 Hs.127411 NM_003672 ENSG00000079335 CDC14A DFNB105|DFNB32|DFNB35|cdc14|hCDC14 cell division cycle 14A protein-coding 227.5-33 chr14 77358288 77358602 + 1 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) AluSg|SINE|Alu 15464 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 292.75-11 chr17 41849976 41850321 + 1 NA 3' UTR (NM_018143, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_018143, exon 2 of 2) 12323 NM_152467 317719 Hs.127510 NM_152467 ENSG00000161594 KLHL10 SPGF11 kelch like family member 10 protein-coding 180.5-16 chr11 11980271 11980597 + 1 NA intron (NM_015881, intron 4 of 7) intron (NM_015881, intron 4 of 7) 28205 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 136.5-133 chr20 50897581 50897793 + 1 NA intron (NM_001282532, intron 3 of 3) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 12104 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 209.5-26 chr12 44916693 44917000 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -2918 NM_001145110 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 176.25-69 chr2 105216683 105216996 + 1 NA Intergenic Intergenic -24904 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 277.5-53 chr4 52617804 52618216 + 1 NA intron (NM_001286768, intron 5 of 9) intron (NM_001286768, intron 5 of 9) 38529 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 233.5-44 chr18 4081646 4082084 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) LTR48B|LTR|ERV1 119512 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 200.5-99 chr4 47432006 47432289 + 1 NA Intergenic Intergenic 31555 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 284.5-61 chr7 106646117 106646441 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 14879 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 204.5-80 chr22 21844213 21844578 + 1 NA intron (NM_002745, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 23285 NM_002745 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 168.5-151 chr5 88436640 88436936 + 1 NA TTS (NR_039993) TTS (NR_039993) 2302 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 237.25-51 chr4 48026149 48026539 + 1 NA intron (NM_207330, intron 2 of 5) intron (NM_207330, intron 2 of 5) 9572 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 132.75-8 chr1 71826741 71827056 + 1 NA intron (NR_046218, intron 1 of 2) intron (NR_046218, intron 1 of 2) 10114 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 174.5-194 chr8 127977675 127977906 + 1 NA intron (NR_003367, intron 3 of 8) intron (NR_003367, intron 3 of 8) 17157 NR_031610 100302161 NR_031610 ENSG00000221771 MIR1205 MIRN1205|hsa-mir-1205 microRNA 1205 ncRNA 214.75-82 chr8 26032431 26032906 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 12745 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 200.5-46 chr16 66528909 66529443 + 1 NA intron (NR_073520, intron 4 of 8) intron (NR_073520, intron 4 of 8) 20946 NR_073520 7084 Hs.512619 NM_004614 ENSG00000166548 TK2 MTDPS2|MTTK|PEOB3|SCA31 thymidine kinase 2 protein-coding 186.5-71 chr2 193310583 193310967 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 560930 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 287.75-7 chr10 64133732 64134217 + 1 NA Intergenic Intergenic -612084 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 182.5-43 chr13 26955064 26955257 + 1 NA Intergenic Intergenic -170373 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 258.25-62 chr8 86119290 86119626 + 1 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) AluSz|SINE|Alu 20548 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 134.75-71 chr14 77439889 77440156 + 1 NA intron (NM_001193315, intron 11 of 19) AluJb|SINE|Alu -16966 NM_001113475 122945 Hs.97556 NM_138791 ENSG00000165555 NOXRED1 C14orf148 NADP dependent oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 123.5-134 chr3 66263156 66263300 + 1 NA intron (NM_001350992, intron 3 of 8) intron (NM_001350992, intron 3 of 8) 42225 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 146.5-141 chr3 99648204 99648464 + 1 NA intron (NM_020351, intron 1 of 3) intron (NM_020351, intron 1 of 3) 9740 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 212.5-56 chr2 147217876 147218244 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -626457 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 227.5-64 chr21 31391478 31391803 + 1 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu -47286 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 204.25-98 chr6 120197157 120197479 + 1 NA Intergenic Intergenic 182139 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 209.5-44 chr14 61129064 61129376 + 1 NA Intergenic Intergenic -147530 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 275.25-52 chr9 104750181 104750740 + 1 NA intron (NM_015469, intron 1 of 5) MER51B|LTR|ERV1 2777 NM_015469 25934 Hs.530275 NM_015469 ENSG00000136783 NIPSNAP3A HSPC299|NIPSNAP4|TASSC nipsnap homolog 3A protein-coding 187.5-167 chr8 78052251 78052554 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -463938 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 115.5-87 chr16 58149605 58149915 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -20335 NR_136632 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 175.75-38 chr14 46283511 46283748 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -187730 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 131.25-159 chr4 178260637 178260930 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -352847 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 223.25-18 chr14 55967361 55967618 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -150922 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 147.5-66 chr14 72012077 72012412 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME4a|LINE|L1 78717 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 121.5-261 chr9 37078568 37078823 + 1 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -1201 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 192.5-97 chr4 36589114 36589596 + 1 NA intron (NR_149124, intron 2 of 4) L1PA11|LINE|L1 52545 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 209.5-27 chr12 55175324 55175614 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -45556 NM_001005280 121364 Hs.554557 NM_001005280 ENSG00000179919 OR10A7 OR12-6 olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 protein-coding 154.5-204 chr9 89570023 89570204 + 1 NA Intergenic Intergenic -34899 NM_006705 10912 Hs.9701 NM_006705 ENSG00000130222 GADD45G CR6|DDIT2|GADD45gamma|GRP17 growth arrest and DNA damage inducible gamma protein-coding 147.5-35 chr11 94621329 94621587 + 1 NA TTS (NM_152431) TTS (NM_152431) 54090 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 230.5-32 chr14 22373059 22373342 + 1 NA Intergenic Intergenic 59553 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 245.5-74 chr7 28339685 28340173 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L1MA3|LINE|L1 40608 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 171.25-100 chr3 108149701 108149936 + 1 NA Intergenic Intergenic 23997 NR_110028 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 187.5-77 chr18 75103267 75103590 + 1 NA Intergenic Intergenic 102085 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 142.5-9 chr1 63146347 63146676 + 1 NA Intergenic Intergenic -134040 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 315.5-20 chr5 19908583 19909151 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) -22595 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 136.5-33 chr10 112228281 112228484 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -44617 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 210.5-123 chr7 73708480 73708733 + 1 NA exon (NM_004603, exon 3 of 10) exon (NM_004603, exon 3 of 10) -2711 NR_036247 100422948 NR_036247 ENSG00000265724 MIR4284 mir-4284 microRNA 4284 ncRNA 213.5-6 chr1 112464280 112464621 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2091 NM_004185 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 152.5-15 chr10 44819932 44820115 + 1 NA intron (NR_033842, intron 7 of 7) intron (NR_033842, intron 7 of 7) -91293 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 125.25-159 chr5 86623922 86624059 + 1 NA Intergenic Intergenic 3484 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 213.75-98 chr6 137749013 137749383 + 1 NA Intergenic Intergenic -10161 NR_121618 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 243.75-51 chr3 24558867 24559220 + 1 NA Intergenic Intergenic -63335 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 198.75-23 chr13 19016054 19016339 + 1 NA Intergenic Intergenic 7937 NR_026852 348021 Hs.314114 NR_026852 ENSG00000232685 LINC00442 - long intergenic non-protein coding RNA 442 ncRNA 145.5-26 chr10 78609035 78609249 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 341800 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 206.75-47 chr20 45003275 45003646 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 9 of 11) intron (NM_001352385, intron 9 of 11) 36948 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 149.25-44 chr14 45054304 45054675 + 1 NA exon (NM_015091, exon 15 of 19) exon (NM_015091, exon 15 of 19) -29627 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 250.5-96 chr8 85875800 85876270 + 1 NA Intergenic Intergenic -48093 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 209.25-28 chr13 106790408 106790879 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 136763 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 163.5-149 chr4 113832301 113832539 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -70493 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 150.5-48 chr14 45632948 45633186 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 82535 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 163.5-57 chr15 47786061 47786234 + 1 NA Intergenic Intergenic 60089 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 159.75-76 chr2 44510062 44510283 + 1 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L1MC4a|LINE|L1 148225 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 176.25-85 chr21 27223207 27223424 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -256227 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 142.5-36 chr10 118356420 118356664 + 1 NA promoter-TSS (NR_108045) promoter-TSS (NR_108045) -566 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 213.5-79 chr3 107935640 107935996 + 1 NA Intergenic Intergenic 52613 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 190.5-14 chr10 67618410 67618626 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 2 of 17) intron (NM_001127384, intron 2 of 17) 47142 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 150.75-83 chr17 61268386 61268690 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1MB2|LINE|L1 99166 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 159.75-59 chr17 39770726 39770938 + 1 NA intron (NM_001257413, intron 3 of 3) AluSz6|SINE|Alu 7393 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 153.5-39 chr11 134556422 134556764 + 1 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 120111 NR_033852 283177 Hs.504390 NR_033852 LOC283177 - uncharacterized LOC283177 ncRNA 297.5-21 chr17 33333883 33334242 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -41074 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 400.75-9 chr7 27700330 27700914 + 1 NA Intergenic Intergenic -37739 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 196.25-53 chr19 48775848 48776210 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 20505 NM_019113 26291 Hs.283015 NM_019113 ENSG00000105550 FGF21 - fibroblast growth factor 21 protein-coding 115.5-124 chr2 72169385 72169578 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -21619 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 238.5-42 chr2 40585484 40585777 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -73195 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 214.25-5 chr1 95683125 95683367 + 1 NA Intergenic Intergenic 173130 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 134.75-110 chr2 107378994 107379305 + 1 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -29624 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 184.5-130 chr6 52990970 52991227 + 1 NA intron (NM_001512, intron 2 of 6) L1MC5a|LINE|L1 4186 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 192.75-110 chr5 180932114 180932458 + 1 NA intron (NM_001159710, intron 2 of 6) L1PA7|LINE|L1 22722 NM_001159710 79908 Hs.189109 NM_024850 ENSG00000113303 BTNL8 BTN9.2 butyrophilin like 8 protein-coding 117.5-216 chr7 36277063 36277262 + 1 NA intron (NM_030636, intron 3 of 7) intron (NM_030636, intron 3 of 7) 90078 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 127.25-175 chr5 166594624 166594838 + 1 NA Intergenic Intergenic 331639 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 114.75-161 chr6 19032467 19032686 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 147904 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 114.5-96 chr14 71674384 71674531 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 13 of 24) MIR|SINE|MIR 88159 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 177.25-114 chr5 30670863 30671222 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -522644 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 142.5-136 chr22 24846267 24846496 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 3 of 23) (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40160 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 165.75-34 chr11 113005093 113005285 + 1 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) HAL1|LINE|L1 -41729 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 217.5-110 chr6 108500303 108500729 + 1 NA intron (NM_001323005, intron 10 of 11) (ATAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -59309 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 175.5-129 chr4 52705754 52706087 + 1 NA Intergenic Intergenic -6474 NR_024031 57291 Hs.744077 NR_024031 ENSG00000226950 DANCR AGU2|ANCR|KIAA0114|SNHG13|lncRNA-ANCR differentiation antagonizing non-protein coding RNA ncRNA 147.75-60 chr2 8233829 8234022 + 1 NA intron (NR_152741, intron 9 of 9) intron (NR_152741, intron 9 of 9) 94494 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 135.75-8 chr1 89986717 89987025 + 1 NA Intergenic (CTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8095 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 261.75-32 chr4 60302900 60303410 + 1 NA Intergenic Intergenic -619464 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 213.75-92 chr5 60336602 60337020 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 35852 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 254.5-34 chr18 12461617 12462214 + 1 NA intron (NM_020148, intron 11 of 15) AluJr|SINE|Alu 29141 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 201.5-15 chr1 198085676 198085950 + 1 NA Intergenic Intergenic -71185 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 114.5-163 chr21 21528613 21528788 + 1 NA intron (NM_001352592, intron 17 of 18) intron (NM_001352592, intron 17 of 18) 208619 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 278.75-14 chr17 72635744 72636178 + 1 NA intron (NR_033876, intron 2 of 4) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4511 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 124.75-143 chr3 65328425 65328601 + 1 NA Intergenic Intergenic -565303 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 369.5-4 chr12 62970423 62970852 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -35487 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 148.5-80 chr17 27991986 27992144 + 1 NA promoter-TSS (NR_146896) promoter-TSS (NR_146896) -358 NR_146896 105371708 Hs.385535 NR_146896 LINC01992 - long intergenic non-protein coding RNA 1992 ncRNA 186.5-30 chr12 69568708 69568941 + 1 NA intron (NM_001278354, intron 5 of 9) intron (NM_001278354, intron 5 of 9) -15899 NR_037476 100500868 NR_037476 ENSG00000283677 MIR3913-2 mir-3913-2 microRNA 3913-2 ncRNA 136.5-116 chr2 119680344 119680593 + 1 NA intron (NM_001105198, intron 1 of 1) intron (NM_001105198, intron 1 of 1) 1267 NM_030577 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 171.5-11 chr10 32786605 32786918 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 30 of 43) AluSz|SINE|Alu 114711 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 253.25-3 chr1 102920670 102921121 + 1 NA intron (NM_001854, intron 48 of 66) intron (NM_001854, intron 48 of 66) 187601 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 115.5-63 chr14 58504419 58504553 + 1 NA intron (NM_001329944, intron 27 of 31) L2c|LINE|L2 64805 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 197.5-144 chr7 30388763 30389068 + 1 NA Intergenic Intergenic -1970 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 181.5-2 chr1 41568533 41568848 + 1 NA intron (NM_024503, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 -84007 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 211.5-14 chr10 37224124 37224459 + 1 NA intron (NM_052997, intron 34 of 35) intron (NM_052997, intron 34 of 35) -84895 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 224.5-79 chr3 185225901 185226254 + 1 NA intron (NM_001966, intron 4 of 6) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 27195 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 168.5-39 chr11 86484292 86484582 + 1 NA intron (NM_001014811, intron 6 of 13) intron (NM_001014811, intron 6 of 13) 109550 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 181.25-13 chr10 53492185 53492398 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -720591 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 147.75-97 chr22 33157944 33158185 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 49535 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 243.25-28 chr22 24882026 24882453 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 14 of 23) AluJb|SINE|Alu 64456 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 193.75-55 chr17 17037461 17037858 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4798 NM_001364716 23164 Hs.462341 NM_015134 ENSG00000133030 MPRIP M-RIP|MRIP|RHOIP3|RIP3|p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein protein-coding 152.75-140 chr7 6268860 6269080 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) LTR33A_|LTR|ERVL 3654 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 198.5-107 chr4 113755652 113755997 + 1 NA intron (NM_001321592, intron 2 of 2) intron (NM_001321592, intron 2 of 2) 5914 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 214.75-75 chr7 14343863 14344121 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 21 of 24) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -352567 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 229.5-117 chr6 125505893 125506331 + 1 NA Intergenic Intergenic -168241 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 255.5-86 chr8 84676150 84676419 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -29643 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 290.75-45 chr5 63439568 63440106 + 1 NA Intergenic Intergenic 522455 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 145.75-11 chr10 11287071 11287334 + 1 NA intron (NM_001025076, intron 8 of 13) intron (NM_001025076, intron 8 of 13) 57472 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-159 chr6 130879643 130879856 + 1 NA intron (NM_001350301, intron 13 of 20) intron (NM_001350301, intron 13 of 20) 52344 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 254.5-40 chr2 144137032 144137372 + 1 NA intron (NM_001354355, intron 6 of 13) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 74377 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 167.5-63 chr14 76879889 76880191 + 1 NA Intergenic Intergenic 53632 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 258.5-13 chr12 7934703 7935195 + 1 NA intron (NM_006931, intron 1 of 9) intron (NM_006931, intron 1 of 9) 1238 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 235.5-66 chr5 30136635 30137056 + 1 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 256285 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 170.5-21 chr10 20178791 20179043 + 1 NA intron (NM_032812, intron 9 of 13) intron (NM_032812, intron 9 of 13) 362485 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 180.5-41 chr14 86827334 86827635 + 1 NA Intergenic Intergenic -78294 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 131.5-235 chr8 118492273 118492606 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -128562 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-192 chr7 4022387 4022548 + 1 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) Plat_L3|LINE|CR1 -107218 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 232.5-59 chr20 15554042 15554455 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 357408 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 235.5-28 chr12 119283509 119283843 + 1 NA TTS (NR_024246) TTS (NR_024246) 19704 NR_024246 144742 Hs.524782 NR_024246 ENSG00000281196 LINC00934 - long intergenic non-protein coding RNA 934 ncRNA 147.5-221 chr9 117771906 117772099 + 1 NA Intergenic Intergenic 67599 NM_138554 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 177.5-91 chr2 183093265 183093490 + 1 NA intron (NR_135688, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 14630 NR_135688 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 260.5-5 chr10 76799060 76799553 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -88738 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 312.75-20 chr20 11072160 11072507 + 1 NA Intergenic Intergenic 45789 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 273.5-35 chr2 202870016 202870459 + 1 NA intron (NM_001288622, intron 1 of 12) intron (NM_001288622, intron 1 of 12) 1235 NM_001288623 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 154.5-24 chr10 64622831 64623038 + 1 NA Intergenic Intergenic -202594 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 118.5-197 chr7 74276444 74276645 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -12863 NM_032421 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 305.25-9 chr11 11373640 11374254 + 1 NA intron (NM_001363464, intron 5 of 9) intron (NM_001363464, intron 5 of 9) -20697 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 191.25-80 chr4 126113787 126114147 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 606708 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 207.5-18 chr12 121155012 121155377 + 1 NA intron (NR_033951, intron 2 of 11) intron (NR_033951, intron 2 of 11) 22318 NR_033948 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 145.75-91 chr20 17432637 17432808 + 1 NA intron (NM_002594, intron 7 of 11) intron (NM_002594, intron 7 of 11) 98657 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 139.25-188 chr8 3560597 3560880 + 1 NA intron (NM_033225, intron 10 of 69) intron (NM_033225, intron 10 of 69) -832287 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 232.5-47 chr2 31927075 31927341 + 1 NA intron (NM_001137602, intron 2 of 7) AluSc|SINE|Alu 83456 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 291.25-31 chr8 121859103 121859593 + 1 NA Intergenic Intergenic -217908 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 276.5-29 chr2 18277037 18277542 + 1 NA Intergenic Intergenic 283364 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 189.5-82 chr20 49925870 49926184 + 1 NA intron (NR_134564, intron 2 of 2) L1MB4|LINE|L1 10205 NR_134564 105372653 Hs.589895 NR_134564 LOC105372653 - uncharacterized LOC105372653 ncRNA 288.5-44 chr7 37528469 37528918 + 1 NA Intergenic Intergenic -79367 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 119.5-61 chr12 31802052 31802224 + 1 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 -9840 NM_001013699 440093 Hs.448697 NM_001013699 ENSG00000188375 H3F3C H3.5 H3 histone family member 3C protein-coding 176.75-81 chr3 87748157 87748396 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44430 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 136.75-4 chr1 60754973 60755141 + 1 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) L1ME4b|LINE|L1 70527 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 173.75-3 chr1 44540046 44540340 + 1 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -5300 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 168.5-148 chr5 44555682 44555894 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45506 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 212.5-108 chr7 92094668 92095011 + 1 NA intron (NM_147185, intron 39 of 49) AluSc|SINE|Alu 39638 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 269.75-30 chr2 49128553 49128862 + 1 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 25808 NM_181446 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 189.5-106 chr5 54091768 54092008 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -140289 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 362.75-12 chr7 96507970 96508480 + 1 NA intron (NR_163953, intron 2 of 5) intron (NR_163953, intron 2 of 5) -4702 NM_001201450 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 192.5-75 chr2 163202280 163202619 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -363682 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 126.5-147 chr3 4106809 4107028 + 1 NA Intergenic Intergenic -196386 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 146.25-119 chr5 115603933 115604107 + 1 NA intron (NR_109875, intron 2 of 2) intron (NR_109875, intron 2 of 2) -1541 NM_021649 353376 Hs.718838 NM_021649 ENSG00000243414 TICAM2 MyD88-4|TICAM-2|TIRAP3|TIRP|TRAM toll like receptor adaptor molecule 2 protein-coding 282.25-5 chr10 50212431 50212982 + 1 NA intron (NM_019893, intron 9 of 19) intron (NM_019893, intron 9 of 19) 35904 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 181.5-20 chr11 50370022 50370292 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -38990 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 134.25-188 chr8 81705993 81706236 + 1 NA intron (NR_033194, intron 5 of 6) L1MEi|LINE|L1 -11056 NM_001010893 347051 Hs.683849 NM_001010893 ENSG00000253598 SLC10A5 P5 solute carrier family 10 member 5 protein-coding 226.25-21 chr12 21677929 21678358 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20288 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 166.75-111 chr5 40761373 40761643 + 1 NA 3' UTR (NM_001355037, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001355037, exon 9 of 9) -5547 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 284.25-13 chr19 47776731 47777159 + 1 NA Intergenic Intergenic -1758 NM_003009 6415 Hs.631549 NM_003009 ENSG00000178980 SELENOW SEPW1|selW selenoprotein W protein-coding 161.75-99 chr4 93918189 93918352 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 89517 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 116.25-72 chr14 83878695 83878895 + 1 NA Intergenic Intergenic 1236163 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 137.5-205 chr6 41050124 41050308 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2985 NM_006789 10930 Hs.555915 NM_006789 ENSG00000124701 APOBEC2 ARCD1|ARP1 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2 protein-coding 139.25-23 chr10 109114106 109114298 + 1 NA Intergenic Intergenic 809044 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 221.25-95 chr8 129480501 129480797 + 1 NA non-coding (NR_130917, exon 2 of 4) non-coding (NR_130917, exon 2 of 4) 3493 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 263.5-38 chr22 27717792 27718171 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 83775 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 118.5-198 chr7 77679696 77679843 + 1 NA intron (NR_134251, intron 2 of 3) intron (NR_134251, intron 2 of 3) 16496 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 271.75-16 chr19 32349034 32349441 + 1 NA intron (NM_001136156, intron 2 of 6) LTR33A|LTR|ERVL 3627 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 232.5-98 chr7 68227965 68228314 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 207886 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 123.75-100 chr2 211308935 211309083 + 1 NA Intergenic Intergenic 691438 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 177.75-8 chr1 95755874 95756079 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -236092 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 125.5-50 chr12 3939849 3939979 + 1 NA Intergenic Intergenic -66466 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 267.25-14 chr15 58879630 58880061 + 1 NA non-coding (NR_135043, exon 19 of 19) non-coding (NR_135043, exon 19 of 19) 53834 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 186.5-77 chr20 31695660 31695948 + 1 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -25703 NR_131907 103021294 NR_131907 ENSG00000281376 ABALON INXS apoptotic BCL2L1-antisense long non-coding RNA ncRNA 146.5-234 chr9 81500417 81500620 + 1 NA Intergenic Intergenic 189017 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 206.75-41 chr2 174608295 174608534 + 1 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) 26191 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 221.5-81 chr6 39609298 39609687 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 6 of 21) intron (NM_001289020, intron 6 of 21) 115916 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 157.25-75 chr2 51651496 51651733 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 619013 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 181.5-86 chr2 139506768 139507110 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 609615 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 221.5-90 chr7 46735848 46736180 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -38892 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 200.75-8 chr1 219448201 219448583 + 1 NA intron (NR_135822, intron 2 of 3) L1ME3F|LINE|L1 108932 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 187.5-147 chr6 151748742 151749101 + 1 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) intron (NM_001122742, intron 2 of 9) -56752 NM_001122741 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 195.5-82 chr2 178138039 178138322 + 1 NA Intergenic Intergenic 25743 NM_152945 129831 Hs.377257 NM_152945 ENSG00000155636 RBM45 DRB1|RB-1 RNA binding motif protein 45 protein-coding 239.25-15 chr11 97890081 97890525 + 1 NA Intergenic Intergenic -1130646 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 137.5-62 chr14 22784113 22784323 + 1 NA intron (NM_001126105, intron 3 of 10) intron (NM_001126105, intron 3 of 10) 17530 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 169.75-150 chr8 23237156 23237380 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -6369 NM_152272 91782 Hs.5019 NM_152272 ENSG00000147457 CHMP7 - charged multivesicular body protein 7 protein-coding 365.25-8 chr3 34542590 34543305 + 1 NA Intergenic Intergenic 744317 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 213.75-56 chr2 186088532 186088801 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -2349 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 169.75-107 chr3 109411192 109411516 + 1 NA intron (NR_109841, intron 1 of 4) intron (NR_109841, intron 1 of 4) 1364 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 163.5 chr1 19051166 19051470 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -94642 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 208.5-133 chr7 111495902 111496220 + 1 NA intron (NM_032549, intron 2 of 5) intron (NM_032549, intron 2 of 5) 66230 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 313.5-17 chr17 63036895 63037414 + 1 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) MER44D|DNA|TcMar-Tigger 70919 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 203.5-8 chr1 86746875 86747099 + 1 NA 3' UTR (NM_001206651, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001206651, exon 10 of 10) 42411 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 234.5-89 chr7 47981924 47982217 + 1 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -2455 NM_001363683 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 112.25-204 chr7 51115350 51115562 + 1 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) L1MEf|LINE|L1 201353 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 147.25-109 chr5 147051084 147051258 + 1 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 4966 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 431.75-8 chr7 42622848 42623646 + 1 NA Intergenic Intergenic 83200 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 165.5-174 chr6 164675120 164675411 + 1 NA Intergenic Intergenic 146798 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 211.75-50 chr2 200317570 200317797 + 1 NA intron (NM_001282744, intron 1 of 12) intron (NM_001282744, intron 1 of 12) 8733 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 142.75-59 chr14 30315797 30316061 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -243194 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 266.5-60 chr4 187766359 187766767 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -93922 NR_110436 100506272 Hs.508163 NR_110436 ENSG00000250590 LINC02492 - long intergenic non-protein coding RNA 2492 ncRNA 125.5-248 chr8 71137384 71137578 + 1 NA Intergenic Intergenic 219225 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 253.5-42 chr2 110838022 110838347 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 9 of 18) intron (NM_001371254, intron 9 of 18) 105611 NM_001371254 344.25-5 chr10 73555594 73556337 + 1 NA intron (NR_146997, intron 4 of 21) intron (NR_146997, intron 4 of 21) -2625 NR_135250 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 212.5-99 chr6 159563440 159563856 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 129593 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 402.5-7 chr3 175687496 175687971 + 1 NA intron (NM_207015, intron 11 of 13) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 88600 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 265.75-11 chr11 93631707 93632146 + 1 NA Intergenic Intergenic -29756 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 206.5-16 chr12 15769511 15769898 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 19684 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 241.5-72 chr3 183516681 183516974 + 1 NA intron (NM_130446, intron 2 of 6) intron (NM_130446, intron 2 of 6) -31908 NR_046687 100874019 NR_046687 ENSG00000242522 KLHL6-AS1 - KLHL6 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-39 chr12 102865856 102866102 + 1 NA intron (NM_000277, intron 5 of 12) intron (NM_000277, intron 5 of 12) -41580 NR_033855 283432 Hs.382110 NR_033855 ENSG00000258169 LINC00485 - long intergenic non-protein coding RNA 485 ncRNA 153.25-84 chr22 31536854 31537180 + 1 NA intron (NM_001007467, intron 4 of 32) FLAM_C|SINE|Alu 40481 NM_001258326 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 192.5-54 chr17 44999720 45000070 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -31592 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 206.5-43 chr2 35847318 35847656 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 376082 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 185.75-69 chr2 202938110 202938320 + 1 NA intron (NM_001352677, intron 3 of 13) intron (NM_001352677, intron 3 of 13) 25940 NM_001352678 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 317.5-19 chr22 19678992 19679499 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -35258 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 163.5-58 chr15 57120087 57120298 + 1 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -99238 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 115.25-115 chr2 227883803 227884080 + 1 NA intron (NM_001330004, intron 2 of 13) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 12310 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 192.25-11 chr10 61439250 61439527 + 1 NA intron (NR_134508, intron 1 of 6) intron (NR_134508, intron 1 of 6) -13251 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 164.75-64 chr17 67253144 67253566 + 1 NA intron (NR_136398, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 -8159 NM_014877 9931 Hs.370140 NM_014877 ENSG00000198265 HELZ DHRC|DRHC|HUMORF5 helicase with zinc finger protein-coding 199.25-53 chr2 23341087 23341394 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -43939 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 190.5-87 chr20 20641389 20641641 + 1 NA intron (NM_020343, intron 5 of 39) intron (NM_020343, intron 5 of 39) 71129 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 177.75-95 chr20 63602040 63602308 + 1 NA intron (NM_012384, intron 4 of 9) L1MEd|LINE|L1 24927 NM_012384 26205 Hs.473286 NM_012384 ENSG00000101216 GMEB2 GMEB-2|P79PIF|PIF79 glucocorticoid modulatory element binding protein 2 protein-coding 177.25-37 chr12 7613049 7613309 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 52729 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 265.75-22 chr16 7436200 7436644 + 1 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 103577 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 331.25-7 chr2 41259083 41259474 + 1 NA Intergenic Intergenic -618277 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 161.5-66 chr15 69003564 69003891 + 1 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) MER57A-int|LTR|ERV1 -10968 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 149.5-89 chr2 47898043 47898259 + 1 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) intron (NM_001190274, intron 1 of 22) 7642 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 253.5-14 chr11 57105461 57105783 + 1 NA Intergenic Intergenic 68088 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 222.5-23 chr11 75927229 75927469 + 1 NA intron (NM_003369, intron 6 of 14) AluSx|SINE|Alu 112139 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 166.5-59 chr14 51379423 51379673 + 1 NA Intergenic Intergenic 17587 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 121.25-181 chr6 129357067 129357350 + 1 NA intron (NM_000426, intron 32 of 64) intron (NM_000426, intron 32 of 64) 352969 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 120.25-134 chr3 107780420 107780562 + 1 NA intron (NM_020235, intron 13 of 16) intron (NM_020235, intron 13 of 16) 97577 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 260.75-47 chr4 38391260 38391723 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 24577 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 170.75-31 chr14 42727139 42727467 + 1 NA Intergenic Intergenic 1120447 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 193.5-7 chr1 84484004 84484268 + 1 NA intron (NM_025065, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 4870 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 264.25-52 chr8 29000025 29000397 + 1 NA intron (NM_001324384, intron 4 of 10) L1M4|LINE|L1 108897 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 293.75-9 chr14 56010251 56010681 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -107945 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 292.5-31 chr2 81340937 81341522 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 125717 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 140.5-29 chr11 33762800 33763055 + 1 NA intron (NM_012175, intron 3 of 10) L1ME3A|LINE|L1 11593 NM_033406 26273 Hs.406787 NM_012175 ENSG00000110429 FBXO3 FBA|FBX3 F-box protein 3 protein-coding 174.5-144 chr5 23134100 23134368 + 1 NA Intergenic Intergenic -280890 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 188.5-104 chr3 108343827 108344133 + 1 NA intron (NM_001370244, intron 2 of 9) intron (NM_001370244, intron 2 of 9) 32195 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 222.5-109 chr8 93422650 93422920 + 1 NA intron (NR_033858, intron 7 of 10) intron (NR_033858, intron 7 of 10) -255935 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 151.75-93 chr3 109930601 109930910 + 1 NA Intergenic Intergenic 327927 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 137.75-215 chr9 2412122 2412283 + 1 NA Intergenic Intergenic -209585 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 149.75-53 chr15 71655617 71655879 + 1 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 35791 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 183.75-57 chr2 114391362 114391743 + 1 NA Intergenic Intergenic -51089 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 196.25-22 chr12 10701675 10701946 + 1 NA intron (NM_001145426, intron 7 of 8) intron (NM_001145426, intron 7 of 8) 21513 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 226.75-46 chr22 27349798 27350098 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 39297 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 127.5-30 chr10 53940057 53940278 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 25 of 34) intron (NM_001354411, intron 25 of 34) -546063 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 119.25-79 chr17 80284438 80284625 + 1 NA intron (NM_020954, intron 3 of 16) AluSx|SINE|Alu 23679 NM_001256071 57674 Hs.195642 NM_020914 ENSG00000173821 RNF213 ALO17|C17orf27|KIAA1618|MYMY2|MYSTR|NET57 ring finger protein 213 protein-coding 387.75-9 chr2 42423710 42424346 + 1 NA Intergenic Intergenic -55071 NM_001319037 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 136.75-94 chr2 48325326 48325524 + 1 NA intron (NM_002158, intron 1 of 6) (TGTGTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10743 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 229.25-51 chr20 54054997 54055399 + 1 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) L1MA9|LINE|L1 3822 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 128.5-138 chr22 49421691 49421874 + 1 NA intron (NR_110522, intron 1 of 2) L1MEd|LINE|L1 121684 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 181.75-136 chr8 140047108 140047352 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) CpG 53305 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 233.25-61 chr5 121023947 121024188 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -298483 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 209.5-34 chr13 23963122 23963549 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -14020 NR_073430 400110 Hs.744780 NM_207439 ANKRD20A19P - ankyrin repeat domain 20 family member A19, pseudogene pseudo 209.5-93 chr3 65953706 65954188 + 1 NA intron (NR_145422, intron 1 of 2) intron (NR_145422, intron 1 of 2) 611 NR_145422 151877 Hs.476636 NR_145422 ENSG00000272610 MAGI1-IT1 - MAGI1 intronic transcript 1 ncRNA 147.75-67 chr2 69077698 69077859 + 1 NA intron (NM_032208, intron 8 of 17) intron (NM_032208, intron 8 of 17) -25904 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 368.25-14 chr4 86604278 86604894 + 1 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) intron (NM_080685, intron 1 of 47) 10271 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 318.5-29 chr3 147902865 147903463 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -174995 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 229.5-79 chr20 38122796 38123311 + 1 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 42217 NM_004613 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 241.5-37 chr2 39507179 39507680 + 1 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 70013 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 231.25-36 chr2 54690288 54690732 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -34502 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 275.5-7 chr10 53348477 53348974 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -577025 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 152.75-121 chr4 91598996 91599189 + 1 NA 3' UTR (NM_001145065, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001145065, exon 11 of 11) 678210 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 168.75-4 chr1 50817511 50817702 + 1 NA intron (NM_007051, intron 2 of 18) L1MB3|LINE|L1 142661 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 147.5-39 chr12 1575151 1575412 + 1 NA intron (NM_152441, intron 1 of 1) intron (NM_152441, intron 1 of 1) 19300 NM_152441 144699 Hs.367956 NM_152441 ENSG00000171823 FBXL14 Fbl14 F-box and leucine rich repeat protein 14 protein-coding 263.5-43 chr3 183176069 183176421 + 1 NA Intergenic Intergenic -13511 NM_014398 27074 Hs.518448 NM_014398 ENSG00000078081 LAMP3 CD208|DC LAMP|DC-LAMP|DCLAMP|LAMP|LAMP-3|TSC403 lysosomal associated membrane protein 3 protein-coding 175.75-113 chr6 104293421 104293607 + 1 NA Intergenic Intergenic 566032 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 133.5-212 chr5 86715669 86715888 + 1 NA Intergenic Intergenic -31040 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 182.75-74 chr20 8970810 8971093 + 1 NA Intergenic Intergenic -98103 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 121.75-158 chr6 53013331 53013489 + 1 NA intron (NM_014920, intron 9 of 13) MIR|SINE|MIR 17790 NR_001445 125050 NR_001445 ENSG00000202198 RN7SK 7SK RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein snRNA 223.25-11 chr12 26770772 26771028 + 1 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 62294 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 150.25-126 chr5 137911966 137912183 + 1 NA intron (NM_001300921, intron 8 of 14) L1MA9|LINE|L1 22617 NM_001258449 27039 Hs.716884 NM_014386 ENSG00000078795 PKD2L2 TRPP5 polycystin 2 like 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 192.25-83 chr4 143462510 143462840 + 1 NA intron (NM_207123, intron 9 of 10) AluSz|SINE|Alu -51027 NM_003601 8467 Hs.558422 NM_003601 ENSG00000153147 SMARCA5 ISWI|SNF2H|WCRF135|hISWI|hSNF2H SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 protein-coding 213.25-27 chr2 11917224 11917519 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -80385 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 131.75-144 chr4 25885806 25886037 + 1 NA Intergenic Intergenic -22355 NM_001297594 23231 Hs.479384 NM_015187 ENSG00000091490 SEL1L3 Sel-1L3 SEL1L family member 3 protein-coding 170.25-122 chr4 184265071 184265363 + 1 NA Intergenic Intergenic -47344 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 163.5-206 chr8 80305031 80305295 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 63774 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 264.75-38 chr4 60537707 60538079 + 1 NA Intergenic Intergenic -384726 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 219.75-29 chr17 70628128 70628413 + 1 NA Intergenic Intergenic 458735 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 168.25-75 chr2 118789180 118789473 + 1 NA Intergenic Intergenic 58857 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 129.5-147 chr22 40842724 40842891 + 1 NA intron (NM_003932, intron 4 of 11) intron (NM_003932, intron 4 of 11) 13832 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 143.5-148 chr3 136891725 136892010 + 1 NA intron (NM_001291999, intron 1 of 3) L1MB3|LINE|L1 29659 NM_006153 4690 Hs.126889 NM_006153 ENSG00000158092 NCK1 NCK|NCKalpha|nck-1 NCK adaptor protein 1 protein-coding 160.75-59 chr18 67205648 67205894 + 1 NA Intergenic Intergenic 124187 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 235.5-25 chr11 73701733 73702019 + 1 NA intron (NM_001243718, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 52963 NM_001130036 58473 Hs.445489 NM_021200 ENSG00000021300 PLEKHB1 KPL1|PHR1|PHRET1 pleckstrin homology domain containing B1 protein-coding 116.25-232 chr8 122232716 122232966 + 1 NA Intergenic Intergenic 335803 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 129.25-60 chr15 74918803 74919145 + 1 NA TTS (NM_004255) TTS (NM_004255) -12080 NR_135849 57184 Hs.367690 NM_020447 ENSG00000178761 FAM219B C15orf17 family with sequence similarity 219 member B protein-coding 145.75-39 chr14 67059398 67059662 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 10 of 21) MIR3|SINE|MIR -129910 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 178.5-43 chr13 86891647 86891996 + 1 NA Intergenic Intergenic -20099 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 294.5-14 chr14 105115390 105115973 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 21534 NR_110546 102723354 Hs.569410 NR_110546 LINC02298 - long intergenic non-protein coding RNA 2298 ncRNA 185.5-36 chr12 79297889 79298144 + 1 NA intron (NM_001291901, intron 6 of 9) MIRb|SINE|MIR -121241 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 115.75-131 chr21 19992479 19992721 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -92845 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 284.25-19 chr2 206760669 206760991 + 1 NA intron (NR_138468, intron 1 of 11) intron (NR_138468, intron 1 of 11) 4498 NM_001039845 130752 Hs.147816 NM_206892 ENSG00000138400 MDH1B RP11-95H11 malate dehydrogenase 1B protein-coding 184.5-135 chr6 139777196 139777449 + 1 NA intron (NR_038399, intron 1 of 2) intron (NR_038399, intron 1 of 2) 6249 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 164.5-62 chr14 69496323 69496646 + 1 NA intron (NM_001161498, intron 1 of 12) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 11756 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 130.75-9 chr1 119756279 119756554 + 1 NA intron (NM_005518, intron 5 of 9) intron (NM_005518, intron 5 of 9) 12516 NM_001166107 3158 Hs.59889 NM_005518 ENSG00000134240 HMGCS2 - 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 protein-coding 173.5-83 chr20 32443349 32443681 + 1 NA 3' UTR (NM_080616, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_080616, exon 8 of 8) 39975 NM_080616 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 114.75-192 chr8 79608005 79608168 + 1 NA Intergenic Intergenic -3031 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 164.5-142 chr3 155146437 155146625 + 1 NA intron (NM_000902, intron 14 of 22) AluJb|SINE|Alu 66520 NM_007289 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 190.5-101 chr3 98933731 98933941 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -32141 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 174.5-137 chr4 97815291 97815516 + 1 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 328073 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 139.5-201 chr7 67686504 67686771 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -333616 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 280.75-26 chr22 34545143 34545644 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 452523 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 201.5-98 chr4 63326683 63326906 + 1 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 1082656 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 169.5-107 chr3 40382094 40382287 + 1 NA Intergenic Intergenic -4994 NM_001291961 956 Hs.441145 NM_001248 ENSG00000168032 ENTPD3 CD39L3|HB6|NTPDase-3 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 protein-coding 112.5-95 chr17_KI270730v1_random 108910 109074 + 1 NA NA (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 137.25-46 chr14 66453392 66453572 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -32889 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 165.5-12 chr1 208280224 208280459 + 1 NA Intergenic Intergenic -35957 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 180.5-47 chr15 59742608 59742925 + 1 NA Intergenic Intergenic -53446 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 124.25-21 chr10 23520138 23520409 + 1 NA Intergenic Intergenic 81004 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 239.75-70 chr7 3927652 3928036 + 1 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) MER124|DNA?|DNA? -201841 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 212.75-99 chr8 119595624 119596004 + 1 NA intron (NM_001330600, intron 11 of 25) intron (NM_001330600, intron 11 of 25) -2806 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 214.25-49 chr20 57775568 57775853 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -64174 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 240.5-64 chr3 55384682 55385004 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 96555 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 147.75-137 chr6 169266595 169266795 + 1 NA Intergenic Intergenic -12581 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 203.5-51 chr17 56431412 56431784 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 8 of 20) L2c|LINE|L2 -162101 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 276.5-9 chr10 58203747 58204043 + 1 NA intron (NM_152230, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 63999 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 164.25-62 chr2 22455715 22456170 + 1 NA Intergenic Intergenic -80537 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 207.75-8 chr1 159954128 159954548 + 1 NA promoter-TSS (NM_033438) promoter-TSS (NM_033438) -101 NM_001146173 89886 Hs.661712 NM_033438 ENSG00000162723 SLAMF9 CD2F-10|CD2F10|CD84-H1|CD84H1|SF2001 SLAM family member 9 protein-coding 177.25-62 chr18 23802505 23802802 + 1 NA intron (NM_001127717, intron 12 of 73) ERVL-E-int|LTR|ERVL -70367 NM_001127718 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 299.5-47 chr8 137054092 137054672 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 359206 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 199.25-94 chr8 72779751 72780172 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 47916 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 119.75-91 chr2 17369521 17369740 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 148810 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 162.5-110 chr3 41581107 41581318 + 1 NA intron (NR_136342, intron 29 of 34) intron (NR_136342, intron 29 of 34) 380891 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 414.75-7 chr3 64622718 64623378 + 1 NA intron (NM_001318781, intron 15 of 38) intron (NM_001318781, intron 15 of 38) 61702 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-4 chr1 114398504 114398824 + 1 NA intron (NM_015906, intron 18 of 19) intron (NM_015906, intron 18 of 19) 112539 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 191.25-78 chr4 82198576 82198806 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 175300 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 135.25-175 chr6 34009201 34009470 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -9284 NR_031681 100302123 NR_031681 ENSG00000221697 MIR1275 MIRN1275|hsa-mir-1275|mir-1275 microRNA 1275 ncRNA 253.5-17 chr12 7220565 7220922 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 30381 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 117.5-41 chr11 48029309 48029616 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 48903 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 191.5-110 chr4 73407173 73407390 + 1 NA intron (NM_000477, intron 3 of 14) L1MB1|LINE|L1 2994 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 163.5-24 chr10 73098260 73098566 + 1 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -1439 NM_001017962 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 147.5-220 chr9 115375658 115375870 + 1 NA intron (NR_163556, intron 4 of 7) intron (NR_163556, intron 4 of 7) 233946 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 196.5-42 chr12 118585611 118586030 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 175859 NR_134999 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 294.5-40 chr4 184322283 184322621 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 31525 NR_040108 728175 Hs.590107 NR_040108 ENSG00000180712 LINC02363 - long intergenic non-protein coding RNA 2363 ncRNA 152.5-186 chr8 64522563 64522939 + 1 NA Intergenic Intergenic 54512 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 165.5-52 chr15 26503570 26503827 + 1 NA Intergenic Intergenic 125392 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 173.5-70 chr2 77627074 77627336 + 1 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -104772 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 156.75-126 chr4 116464671 116464992 + 1 NA Intergenic Intergenic 165106 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 187.75-33 chr15 63728882 63729112 + 1 NA intron (NM_003922, intron 16 of 77) intron (NM_003922, intron 16 of 77) 104951 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 144.75-56 chr14 42436624 42436801 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 829856 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 178.25-40 chr16 11894427 11894623 + 1 NA intron (NM_002094, intron 5 of 14) intron (NM_002094, intron 5 of 14) 21431 NM_001130006 2935 Hs.528780 NM_002094 ENSG00000103342 GSPT1 551G9.2|ETF3A|GST1|eRF3a G1 to S phase transition 1 protein-coding 138.5-146 chr4 58391619 58391800 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 144619 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 169.75-60 chr16 84405234 84405518 + 1 NA intron (NM_014861, intron 3 of 26) intron (NM_014861, intron 3 of 26) -1212 NM_001291454 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 227.25-39 chr2 9912457 9912965 + 1 NA intron (NM_001318977, intron 10 of 13) MIRb|SINE|MIR -38982 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 185.75-75 chr20 51197762 51198101 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -174824 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 289.25-2 chr1 164261771 164262138 + 1 NA Intergenic Intergenic -297406 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 176.5-78 chr19 10174028 10174251 + 1 NA intron (NM_001379, intron 6 of 39) intron (NM_001379, intron 6 of 39) 20814 NM_001318731 1786 Hs.202672 NM_001379 ENSG00000130816 DNMT1 ADCADN|AIM|CXXC9|DNMT|HSN1E|MCMT|m.HsaI DNA methyltransferase 1 protein-coding 187.5-27 chr11 30445765 30446039 + 1 NA intron (NM_001584, intron 3 of 5) L1MB3|LINE|L1 122798 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 189.5-36 chr12 27759237 27759451 + 1 NA Intergenic Intergenic 12238 NM_001146221 100287284 NM_001146221 ENSG00000205693 MANSC4 - MANSC domain containing 4 protein-coding 115.5-104 chr18 75868201 75868368 + 1 NA Intergenic Intergenic -155881 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 132.5-55 chr12 111647338 111647575 + 1 NA intron (NM_006768, intron 11 of 11) intron (NM_006768, intron 11 of 11) 38500 NM_006768 8315 Hs.530940 NM_006768 ENSG00000089234 BRAP BRAP2|IMP|RNF52 BRCA1 associated protein protein-coding 139.5-28 chr11 72937556 72937788 + 1 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) L2c|LINE|L2 123261 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 161.5-91 chr2 30349080 30349386 + 1 NA intron (NR_122048, intron 1 of 1) intron (NR_122048, intron 1 of 1) 2587 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 188.5-116 chr4 112296301 112296500 + 1 NA promoter-TSS (NM_001253884) promoter-TSS (NM_001253884) -943 NM_001253884 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 144.5-135 chr3 134056359 134056561 + 1 NA intron (NR_135574, intron 1 of 1) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 1188 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 258.5-46 chr3 36584519 36584802 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 155201 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 249.25-33 chr4 75346710 75347212 + 1 NA Intergenic Intergenic -7115 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 194.5-160 chr8 130667945 130668208 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -224402 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 178.5-163 chr7 6647726 6648059 + 1 NA intron (NM_001278559, intron 8 of 8) intron (NM_001278559, intron 8 of 8) 10574 NM_001278559 100131017 Hs.112668 NM_001278559 ENSG00000205903 ZNF316 MZF-3 zinc finger protein 316 protein-coding 220.25-8 chr10 34582092 34582488 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 233006 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 152.5-40 chr12 116890416 116890619 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -9076 NR_073189 8739 Hs.26605 NM_003806 ENSG00000135116 HRK DP5|HARAKIRI harakiri, BCL2 interacting protein protein-coding 221.25-2 chr1 44901951 44902295 + 1 NA intron (NM_001166588, intron 5 of 9) L1ME1|LINE|L1 -58870 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 223.75-52 chr2 230146615 230146896 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 73229 NM_004509 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 252.25-36 chr21 26997132 26997612 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -30284 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 136.25-192 chr9 27352899 27353093 + 1 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) MER103C|DNA|hAT-Charlie -55846 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 244.75-42 chr4 114578786 114579266 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -19376 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 217.5-28 chr11 128009734 128009980 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -198909 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 169.75-172 chrX 103071430 103071847 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -7467 NM_018476 55859 Hs.334370 NM_018476 ENSG00000133169 BEX1 BEX2|HBEX2|HGR74-h brain expressed X-linked 1 protein-coding 194.25-8 chr10 66319160 66319671 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -606621 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 194.5-86 chr22 17946794 17947120 + 1 NA intron (NM_015241, intron 1 of 31) intron (NM_015241, intron 1 of 31) 34004 NR_030378 693233 NR_030378 ENSG00000207780 MIR648 MIRN648|hsa-mir-648 microRNA 648 ncRNA 164.75-122 chr6 34641624 34641905 + 1 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) intron (NM_022758, intron 2 of 3) -54390 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 205.75-14 chr12 11698937 11699253 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 49241 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 116.5-221 chr6 157496691 157496817 + 1 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -32378 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 197.5-111 chr4 123890325 123890657 + 1 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) intron (NR_027105, intron 4 of 5) 116227 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 160.5-153 chr5 153023709 153023885 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -51448 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 147.5-161 chr4 32387405 32387585 + 1 NA Intergenic Intergenic 36457 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 219.5-110 chr6 51041292 51041639 + 1 NA Intergenic Intergenic 222594 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 264.25-4 chr1 235683966 235684296 + 1 NA intron (NM_000081, intron 48 of 52) intron (NM_000081, intron 48 of 52) -33377 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 274.5-61 chr7 25020914 25021227 + 1 NA Intergenic Intergenic -40892 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 131.5-193 chr5 111233563 111233711 + 1 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 9253 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 246.5-29 chr16 4805751 4806260 + 1 NA intron (NM_001324098, intron 14 of 14) intron (NM_001324098, intron 14 of 14) -3055 NM_024589 79641 Hs.459795 NM_024589 ENSG00000067836 ROGDI KTZS rogdi atypical leucine zipper protein-coding 295.5-23 chr19 34081156 34081732 + 1 NA Intergenic Intergenic -91060 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 219.25-33 chr2 78584182 78584618 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 38869 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 136.75-6 chr1 84239401 84239611 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 57874 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 170.75-67 chr2 52218756 52219089 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1M5|LINE|L1 -151726 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 190.25-101 chr5 127769763 127770100 + 1 NA intron (NM_001317938, intron 3 of 6) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 66542 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 180.5-76 chr2 152496873 152497084 + 1 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) L1MC4a|LINE|L1 161804 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 151.5-49 chr14 57533467 57533692 + 1 NA Intergenic Intergenic -39722 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 155.25-150 chr6 40946685 40946972 + 1 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 76452 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 203.25-34 chr14 27914816 27915248 + 1 NA Intergenic Intergenic -241811 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 251.5-24 chr13 96015324 96015707 + 1 NA intron (NM_020121, intron 4 of 38) intron (NM_020121, intron 4 of 38) 37886 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 216.5-124 chr8 125404856 125405268 + 1 NA Intergenic Intergenic -25296 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 219.25-39 chr2 152457050 152457456 + 1 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) L2c|LINE|L2 122079 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 172.5-205 chr8 131310017 131310229 + 1 NA Intergenic Intergenic -269214 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 223.5-65 chr2 177158043 177158505 + 1 NA Intergenic Intergenic 54137 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 261.5-49 chr4 162978402 162978772 + 1 NA Intergenic Intergenic 115041 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 301.5-16 chr12 32149086 32149525 + 1 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 42458 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 197.5-145 chr7 32199665 32200038 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 2 of 17) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 99477 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 117.75-22 chr10 21284639 21284857 + 1 NA Intergenic Intergenic 88202 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 206.25-69 chr3 163051512 163051761 + 1 NA Intergenic Intergenic 251665 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 200.5-44 chr15 40499588 40499975 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 28820 NM_130468 113189 Hs.442449 NM_130468 ENSG00000169105 CHST14 ATCS|D4ST1|EDSMC1|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 14 protein-coding 113.25-23 chr11 20760222 20760351 + 1 NA intron (NM_201551, intron 2 of 18) intron (NM_201551, intron 2 of 18) 90700 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 202.5-38 chr13 94587143 94587512 + 1 NA intron (NR_130732, intron 3 of 10) L1MEd|LINE|L1 8825 NM_014305 23483 Hs.12393 NM_014305 ENSG00000088451 TGDS CATMANS|SDR2E1|TDPGD TDP-glucose 4,6-dehydratase protein-coding 236.5-26 chr14 57547427 57547811 + 1 NA Intergenic Intergenic -53762 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 211.25-2 chr1 67785737 67786126 + 1 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46357 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 203.75-60 chr2 83490572 83491280 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -31888 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 205.25-31 chr15 68088443 68088740 + 1 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 34015 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 129.75-28 chr10 81014361 81014570 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 364668 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 182.25-120 chr8 66392325 66392697 + 1 NA Intergenic Intergenic 36466 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 157.5-10 chr1 97646187 97646450 + 1 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) L1M7|LINE|L1 -150603 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 142.5-156 chr4 118946837 118946984 + 1 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 58056 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 259.25-22 chr21 19095218 19095728 + 1 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -335661 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 243.25-30 chr3 365315 365726 + 1 NA intron (NR_110739, intron 2 of 2) intron (NR_110739, intron 2 of 2) 20275 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 241.75-73 chr7 33480123 33480552 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) L2c|LINE|L2 350773 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 282.25-18 chr2 230176118 230176558 + 1 NA TTS (NM_001185015) TTS (NM_001185015) 43646 NM_004509 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 157.5-6 chr1 59243947 59244384 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -52648 NM_001350796 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 209.25-91 chr5 72680620 72680925 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -20103 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 251.5-9 chr10 19828610 19828948 + 1 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 12347 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 127.75-112 chr2 178852720 178852877 + 1 NA intron (NM_173648, intron 20 of 23) intron (NM_173648, intron 20 of 23) -45375 NM_003319 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 117.75-93 chr19 31383608 31383806 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -34271 NR_138034 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 113.5-209 chr6 57333868 57334006 + 1 NA intron (NM_000947, intron 5 of 13) L1MA8|LINE|L1 16307 NM_000947 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 275.5-72 chr9 85967654 85967991 + 1 NA intron (NM_024635, intron 6 of 22) intron (NM_024635, intron 6 of 22) 26293 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 401.5-12 chr3 36456864 36457524 + 1 NA intron (NM_001292049, intron 2 of 8) intron (NM_001292049, intron 2 of 8) 76707 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 168.5-32 chr10 101688357 101688528 + 1 NA intron (NM_001323541, intron 1 of 8) intron (NM_001323541, intron 1 of 8) 6728 NR_136613 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 131.25-64 chr14 80546318 80546467 + 1 NA intron (NM_152446, intron 21 of 24) intron (NM_152446, intron 21 of 24) -315335 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 175.25-51 chr15 71520539 71520759 + 1 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) MIR|SINE|MIR -26587 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 256.5-17 chr12 46892038 46892487 + 1 NA Intergenic LTR18B|LTR|ERVL -66265 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 197.25-83 chr5 117026434 117026806 + 1 NA Intergenic Intergenic -264411 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 132.5-72 chr14 64315988 64316156 + 1 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) AluJo|SINE|Alu -21662 NM_001437 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 197.5-168 chr9 31891973 31892339 + 1 NA Intergenic Intergenic -492447 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 137.25-110 chr4 74418703 74418876 + 1 NA Intergenic Intergenic -26347 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 138.5-199 chr8 117789187 117789363 + 1 NA Intergenic Intergenic 131638 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 290.5-13 chr14 99148166 99148648 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 123790 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 204.75-9 chr1 169547772 169548212 + 1 NA intron (NM_000130, intron 10 of 24) L1PA12|LINE|L1 38539 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 188.75-74 chr22 25540188 25540493 + 1 NA Intergenic Intergenic -24335 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 229.25-20 chr12 96694637 96694914 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 45 of 67) AluSx1|SINE|Alu 205198 NM_001306084 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 159.75-175 chr8 129637248 129637497 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 42867 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 189.75-59 chr2 68604832 68605053 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -38646 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 202.25-80 chr6 151688787 151689120 + 1 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -1543 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 170.5-176 chr7 51715170 51715477 + 1 NA Intergenic Intergenic -322067 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 187.5-156 chr7 40296202 40296453 + 1 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) intron (NM_024728, intron 8 of 14) 161351 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 118.5-75 chr17 80365820 80365997 + 1 NA intron (NM_001256071, intron 42 of 67) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -49259 NM_001352761 284131 Hs.389678 NM_173627 ENSG00000173818 ENDOV - endonuclease V protein-coding 146.5-214 chr7 130930469 130930754 + 1 NA Intergenic Intergenic 17147 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 151.75-27 chr11 5847029 5847314 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -5274 NM_001005167 390078 NM_001005167 ENSG00000205409 OR52E6 OR11-58 olfactory receptor family 52 subfamily E member 6 protein-coding 150.75-140 chr4 46297532 46297762 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) L1MB5|LINE|L1 91732 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 203.75-73 chr3 165555838 165556056 + 1 NA Intergenic Intergenic 281476 NR_137636 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 115.5-22 chr10 28913358 28913522 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 67032 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 149.5-168 chr6 42043058 42043321 + 1 NA intron (NM_001287434, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 5705 NM_001287434 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 150.5-89 chr2 56058428 56058698 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -11237 NR_126406 104355290 Hs.580331 NR_126406 MIR217HG MIR216AHG|MIR216BHG MIR217 host gene ncRNA 186.5-92 chr3 67047687 67047884 + 1 NA Intergenic Intergenic 49478 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 157.5-48 chr13 36503119 36503318 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 70723 NM_003914 8900 Hs.417050 NM_003914 ENSG00000133101 CCNA1 CT146 cyclin A1 protein-coding 217.75-13 chr10 49605795 49606062 + 1 NA Intergenic Intergenic -3167 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 188.25-4 chr1 181413639 181414093 + 1 NA Intergenic Intergenic -69651 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 125.5-273 chr9 134105115 134105341 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -30854 NM_017588 11091 Hs.397638 NM_017588 ENSG00000196363 WDR5 BIG-3|CFAP89|SWD3 WD repeat domain 5 protein-coding 268.5-36 chr3 30768826 30769154 + 1 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 125671 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 190.75-103 chr7 55306776 55307175 + 1 NA Intergenic Intergenic -51340 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 170.25-141 chr6 129939979 129940175 + 1 NA Intergenic Intergenic -78292 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 196.75-72 chr3 67450208 67450475 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) MER113|DNA|hAT-Charlie 204273 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 196.25-36 chr14 69128771 69129027 + 1 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 23700 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 216.25-85 chr5 77058299 77058544 + 1 NA intron (NM_018046, intron 11 of 13) intron (NM_018046, intron 11 of 13) 22150 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 170.5-29 chr10 75816457 75816755 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 33845 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 117.75-37 chr11 105561483 105561692 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -48486 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 209.5-132 chr6 66503920 66504308 + 1 NA Intergenic Intergenic 716235 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 187.75-69 chr3 104649946 104650178 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -716651 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 165.5-48 chr14 67390818 67391147 + 1 NA intron (NM_016445, intron 6 of 8) intron (NM_016445, intron 6 of 8) 21183 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 157.75-163 chr7 90680075 90680362 + 1 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -29180 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 205.5-157 chr8 135913042 135913388 + 1 NA Intergenic Intergenic 455759 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 201.75-112 chrX 77573258 77573614 + 1 NA intron (NM_000489, intron 28 of 34) intron (NM_000489, intron 28 of 34) 126047 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 131.75-153 chr4 65958234 65958379 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -287811 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 186.75-32 chr14 58883137 58883652 + 1 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 55106 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 244.5-56 chr2 150502709 150503078 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -15198 NM_005168 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 289.75-6 chr11 114372469 114373080 + 1 NA intron (NR_120567, intron 2 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 7265 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 204.5-134 chr8 104982307 104982516 + 1 NA Intergenic Intergenic -336027 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 196.5-7 chr1 116770750 116771054 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 16472 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 117.75-187 chr6 155527853 155528000 + 1 NA Intergenic Intergenic 13082 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 145.5-137 chr3 174582023 174582199 + 1 NA Intergenic Intergenic -277223 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 309.25 chr1 57830206 57830711 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR -30123 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 161.75-88 chr3 112858010 112858218 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -12164 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 362.5-6 chr14 65572481 65572969 + 1 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) L1MC|LINE|L1 101623 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 210.5-143 chr9 78214635 78214898 + 1 NA Intergenic Intergenic -21309 NM_001349840 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 162.5-18 chr10 68359123 68359313 + 1 NA intron (NR_103476, intron 15 of 18) AluSz|SINE|Alu -26290 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 225.5-46 chr17 61012592 61012964 + 1 NA intron (NM_001353144, intron 16 of 25) intron (NM_001353144, intron 16 of 25) 334927 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 140.5-179 chr5 57561729 57561947 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8504 NR_120607 100996645 Hs.582496 NR_120607 LINCR-0003 - uncharacterized LincR-0003 ncRNA 113.75-65 chr14 85926848 85927045 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -7732 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 213.5-71 chr21 31271766 31272194 + 1 NA intron (NM_001353688, intron 4 of 29) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 72374 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 162.75-102 chr3 178062109 178062432 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 245405 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 173.5-141 chr6 54676440 54676648 + 1 NA Intergenic Intergenic -170227 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 206.5-115 chr7 11468103 11468451 + 1 NA intron (NM_015204, intron 9 of 26) (ATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 363921 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 216.25-83 chr4 188246227 188246560 + 1 NA Intergenic Intergenic 106952 NM_178556 339976 Hs.348618 NM_178556 ENSG00000184108 TRIML1 RNF209 tripartite motif family like 1 protein-coding 143.5-25 chr10 59338419 59338639 + 1 NA intron (NM_001347848, intron 4 of 15) intron (NM_001347848, intron 4 of 15) 24020 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 320.25-6 chr10 104655010 104655354 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) AluSx|SINE|Alu 11034 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-101 chr2 65791465 65791614 + 1 NA Intergenic Intergenic -358940 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 345.75-2 chr12 74869382 74870021 + 1 NA Intergenic Intergenic 331866 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 185.5-55 chr14 88062700 88062972 + 1 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) L1MDa|LINE|L1 -36524 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 201.5-139 chrX 48998517 48998749 + 1 NA intron (NM_020137, intron 3 of 25) intron (NM_020137, intron 3 of 25) 3631 NM_020137 56850 Hs.109929 NM_020137 ENSG00000068400 GRIPAP1 GRASP-1 GRIP1 associated protein 1 protein-coding 182.5-120 chr4 86774827 86775073 + 1 NA intron (NM_080685, intron 33 of 47) intron (NM_080685, intron 33 of 47) 74434 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 127.75-115 chr2 230291749 230291934 + 1 NA intron (NM_001278453, intron 16 of 23) L1MB7|LINE|L1 -35330 NR_148198 93349 Hs.589661 NM_138402 ENSG00000185404 SP140L - SP140 nuclear body protein like protein-coding 130.5-80 chr12 90992849 90993118 + 1 NA intron (NM_004950, intron 2 of 6) intron (NM_004950, intron 2 of 6) 11989 NM_004950 1833 Hs.435680 NM_004950 ENSG00000083782 EPYC DSPG3|PGLB|Pg-Lb|SLRR3B epiphycan protein-coding 215.5-73 chr4 22170355 22170616 + 1 NA Intergenic Intergenic 169181 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 280.25-37 chr3 57907828 57908270 + 1 NA intron (NM_001304420, intron 16 of 21) MIRc|SINE|MIR 18047 NM_001304422 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 141.5-109 chr2 158081341 158081690 + 1 NA intron (NM_001135098, intron 2 of 8) L1MA3|LINE|L1 -20355 NM_173355 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 150.5-79 chr19 28444797 28444993 + 1 NA intron (NR_110759, intron 7 of 9) MER51A|LTR|ERV1 -161793 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 287.5-19 chr14 29719286 29719767 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 2 of 18) intron (NM_001330069, intron 2 of 18) 207570 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 234.75-29 chr18 8957404 8957816 + 1 NA Intergenic Intergenic -145089 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 181.25-5 chr1 96182676 96182929 + 1 NA Intergenic Intergenic 190734 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 177.5-49 chr14 73617030 73617294 + 1 NA exon (NM_001365788, exon 2 of 3) exon (NM_001365788, exon 2 of 3) 318 NM_001037162 641372 Hs.122038 NM_001037162 ENSG00000205669 ACOT6 C14orf42|c14_5530 acyl-CoA thioesterase 6 protein-coding 126.75-121 chr2 176647685 176647831 + 1 NA intron (NR_110599, intron 2 of 3) intron (NR_110599, intron 2 of 3) 10004 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 153.25-47 chr15 62703083 62703417 + 1 NA intron (NM_015059, intron 16 of 55) AluSg|SINE|Alu 55939 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 205.25-84 chr5 61210644 61210945 + 1 NA intron (NR_109908, intron 3 of 3) HAL1M8|LINE|L1 -48326 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 180.25-106 chr6 105701854 105702222 + 1 NA Intergenic Intergenic -298956 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 208.5-33 chr13 87551785 87552009 + 1 NA intron (NR_033829, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 66843 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 117.25-125 chr2 196809973 196810211 + 1 NA 5' UTR (NM_213608, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_213608, exon 1 of 3) 184 NM_213608 401027 Hs.245666 NM_213608 ENSG00000187944 C2orf66 IIDS6411|UNQ6411 chromosome 2 open reading frame 66 protein-coding 252.5-44 chr2 148855984 148856389 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19041 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 128.5-144 chr3 70028763 70028933 + 1 NA Intergenic Intergenic 29104 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 270.25-47 chr7 64761355 64761985 + 1 NA Intergenic Intergenic -32758 NM_001271637 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 120.25-185 chr6 93260493 93260701 + 1 NA intron (NM_004440, intron 9 of 16) intron (NM_004440, intron 9 of 16) 158962 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 190.25-30 chr12 120654742 120655070 + 1 NA intron (NM_004276, intron 1 of 5) intron (NM_004276, intron 1 of 5) 4629 NM_004276 9478 Hs.458482 NM_004276 ENSG00000157782 CABP1 CALBRAIN|HCALB_BR calcium binding protein 1 protein-coding 150.5-39 chr12 47850252 47850600 + 1 NA intron (NM_001017535, intron 8 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -30523 NM_001368046 51564 Hs.200063 NM_015401 ENSG00000061273 HDAC7 HD7|HD7A|HDAC7A histone deacetylase 7 protein-coding 179.5-164 chr7 3229622 3229962 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -71219 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 238.75-32 chr2 226517869 226518181 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 140768 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 232.25-72 chr7 5436474 5436833 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7726 NM_001354886 100129484 Hs.147507 NM_001354886 LOC100129484 - uncharacterized LOC100129484 protein-coding 217.75-56 chr4 129757427 129757808 + 1 NA intron (NR_110753, intron 1 of 4) intron (NR_110753, intron 1 of 4) 13861 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 167.25-38 chr14 50719713 50720040 + 1 NA 3' UTR (NM_020921, exon 31 of 31) 3' UTR (NM_020921, exon 31 of 31) -51570 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 197.75-25 chr14 97295535 97295907 + 1 NA Intergenic Intergenic 140864 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 154.25-137 chr6 39516486 39516734 + 1 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) L1ME3G|LINE|L1 -85220 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 179.75-86 chr4 63546215 63546435 + 1 NA Intergenic Intergenic 863125 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 249.5-44 chr18 67176120 67176441 + 1 NA Intergenic Intergenic 94696 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 218.5-49 chr18 23365099 23365613 + 1 NA intron (NR_134876, intron 7 of 10) X7A_LINE|LINE|CR1 72605 NM_032933 85019 Hs.137562 NM_032933 ENSG00000134490 TMEM241 C18orf45|hVVT transmembrane protein 241 protein-coding 157.25-136 chr7 1462619 1462876 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3277 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 214.5-20 chr11 50375527 50375847 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -33460 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 133.5-116 chr2 70355873 70356041 + 1 NA Intergenic Intergenic -53890 NM_001329753 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 256.25 chr1 61706971 61707387 + 1 NA intron (NM_032027, intron 3 of 6) AluJb|SINE|Alu 17962 NM_032027 83941 Hs.656790 NM_032027 ENSG00000162604 TM2D1 BBP TM2 domain containing 1 protein-coding 275.25-24 chr21 38127079 38127542 + 1 NA intron (NR_026839, intron 2 of 2) intron (NR_026839, intron 2 of 2) 5859 NR_026842 84677 Hs.733345 NM_032589 ENSG00000198054 DSCR8 C21orf65|CT25.1a|CT25.1b|MMA-1|MMA-1a|MMA-1b|MMA1|MTAG2 Down syndrome critical region 8 ncRNA 185.25-96 chr5 15201804 15202044 + 1 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) MER41-int|LTR|ERV1 64636 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 265.5-41 chr22 34646861 34647418 + 1 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 350777 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 185.5-153 chr7 50431865 50432074 + 1 NA Intergenic Intergenic 18381 NM_001287492 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 132.75-157 chr5 143294656 143294861 + 1 NA 3' UTR (NM_001204265, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001204265, exon 7 of 7) 102258 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 204.5-101 chr4 70491767 70492089 + 1 NA Intergenic Intergenic 19731 NM_152291 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 160.5-91 chr2 164701059 164701375 + 1 NA intron (NM_001365670, intron 9 of 13) MER5B|DNA|hAT-Charlie -13440 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 212.75-78 chr5 50793135 50793607 + 1 NA intron (NM_024615, intron 10 of 25) intron (NM_024615, intron 10 of 25) 125957 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 157.5-98 chr2 58290835 58291018 + 1 NA intron (NR_147010, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 15049 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 191.25-106 chr8 97095573 97095957 + 1 NA intron (NM_016134, intron 7 of 7) intron (NM_016134, intron 7 of 7) 182163 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 182.75-25 chr10 34338824 34339043 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 15 of 22) intron (NM_001184789, intron 15 of 22) 476363 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 253.25-6 chr10 48953381 48953739 + 1 NA intron (NM_020945, intron 51 of 61) intron (NM_020945, intron 51 of 61) 32027 NR_036182 100422895 NR_036182 ENSG00000264800 MIR4294 - microRNA 4294 ncRNA 143.25-21 chr10 105063614 105063769 + 1 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) intron (NM_014978, intron 5 of 26) -397475 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 250.25-32 chr3 30367190 30367633 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -151457 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 189.25-24 chr12 22809859 22810170 + 1 NA Intergenic Intergenic 184843 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 207.25-78 chr5 148260639 148261012 + 1 NA Intergenic Intergenic -7969 NR_138538 153218 Hs.483771 NM_001040129 ENSG00000214510 SPINK13 HBVDNAPTP1|HESPINTOR|LiESP6|SPINK5L3 serine peptidase inhibitor, Kazal type 13 (putative) protein-coding 168.5-168 chr7 26171030 26171329 + 1 NA intron (NM_004289, intron 1 of 3) L1MC|LINE|L1 18981 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 128.75-197 chr8 92736116 92736259 + 1 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 49873 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 144.75-133 chr5 57705878 57706064 + 1 NA Intergenic Intergenic 55311 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 139.75-188 chr9 84231348 84231516 + 1 NA Intergenic Intergenic 109326 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 113.25-24 chr11 47617074 47617271 + 1 NA TTS (NM_001317231) TTS (NM_001317231) -22761 NM_031909 114900 Hs.662633 NM_031909 ENSG00000172247 C1QTNF4 CTRP4|ZACRP4 C1q and TNF related 4 protein-coding 174.5-133 chr4 53360184 53360521 + 1 NA intron (NM_152540, intron 1 of 8) intron (NM_152540, intron 1 of 8) 5709 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 137.5-13 chr1 177355886 177356042 + 1 NA intron (NR_126001, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 4378 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 343.25-19 chr8 89889438 89890209 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -12045 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 233.5-116 chr9 83056098 83056454 + 1 NA intron (NM_152573, intron 1 of 16) intron (NM_152573, intron 1 of 16) 6866 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 148.75-44 chr12 119417244 119417450 + 1 NA intron (NM_178499, intron 1 of 13) MER20|DNA|hAT-Charlie 82618 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 172.25-110 chr5 43552640 43552883 + 1 NA intron (NM_006451, intron 2 of 10) intron (NM_006451, intron 2 of 10) 4316 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 221.5-45 chr2 72425866 72426170 + 1 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -278156 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 177.75-141 chr8 124184991 124185257 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13602 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 202.25-55 chr4 34174101 34174352 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) L1PA15|LINE|L1 95521 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 134.5-22 chr10 16145472 16145701 + 1 NA Intergenic Intergenic -285053 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 201.5-72 chr2 119321195 119321561 + 1 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 45364 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 197.25-53 chr2 124633359 124633721 + 1 NA intron (NM_130773, intron 12 of 23) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 608253 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 167.75-33 chr11 112306856 112307079 + 1 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 36218 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 228.75-47 chr20 42723690 42724005 + 1 NA intron (NM_133170, intron 6 of 31) intron (NM_133170, intron 6 of 31) 38364 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 235.25-40 chr20 46570208 46570802 + 1 NA intron (NM_001193340, intron 10 of 12) MER47B|DNA|TcMar-Tigger -19851 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 204.5-14 chr10 78824757 78825013 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 242563 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 226.25-16 chr11 25797851 25798136 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -391130 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 176.5-3 chr1 51195641 51195979 + 1 NA non-coding (NR_147076, exon 2 of 2) non-coding (NR_147076, exon 2 of 2) 39286 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 189.5-7 chr1 90912091 90912389 + 1 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 60481 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 250.25-41 chr5 54023572 54024047 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) LTR48B|LTR|ERV1 -72210 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 149.5-166 chr6 35401208 35401501 + 1 NA intron (NM_001171818, intron 3 of 8) L2|LINE|L2 -51007 NM_021922 2178 Hs.302003 NM_021922 ENSG00000112039 FANCE FACE|FAE FA complementation group E protein-coding 200.25-106 chr8 12973370 12973909 + 1 NA intron (NM_020844, intron 1 of 4) LTR78|LTR|ERV1 27966 NM_020844 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 407.75-3 chr17 14868151 14868777 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -146341 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 210.75-91 chr7 41095719 41096100 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5695 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 158.75-81 chr2 13573105 13573321 + 1 NA Intergenic Intergenic -566200 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 171.25-107 chr4 842665 842962 + 1 NA Intergenic Intergenic -16684 NM_006651 10815 Hs.478930 NM_006651 ENSG00000168993 CPLX1 CPX-I|CPX1|EIEE63 complexin 1 protein-coding 222.5-94 chr6 45206507 45206833 + 1 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 -8900 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 254.5-27 chr16 47829162 47829597 + 1 NA Intergenic Intergenic -29202 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 182.5-82 chr2 150478430 150478746 + 1 NA intron (NM_005168, intron 3 of 5) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9107 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 158.5-203 chrX 25558916 25559187 + 1 NA Intergenic Intergenic -543086 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 188.25-56 chr2 16682489 16682937 + 1 NA Intergenic Intergenic -16879 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 291.5-51 chr8 93125790 93126146 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 40882 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 256.75-7 chr12 23115879 23116255 + 1 NA Intergenic Intergenic -59569 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 186.75-63 chr20 32273061 32273363 + 1 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -4439 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 167.5-105 chr20 52641016 52641337 + 1 NA intron (NR_110038, intron 2 of 2) intron (NR_110038, intron 2 of 2) 20338 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 121.75-173 chr7 24330788 24330991 + 1 NA Intergenic Intergenic 46699 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 134.5-151 chr4 38499910 38500131 + 1 NA intron (NR_110951, intron 1 of 7) intron (NR_110951, intron 1 of 7) -9747 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 317.75-20 chr2 167793556 167794038 + 1 NA Intergenic Intergenic -24875 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 139.5-13 chr10 39138607 39138796 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 442105 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 156.5-60 chr15 91696823 91697088 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -156753 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 205.75-13 chr11 105922395 105922641 + 1 NA intron (NR_046356, intron 10 of 16) L1ME4a|LINE|L1 99722 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 330.75-3 chr1 224424684 224425193 + 1 NA intron (NM_001115113, intron 3 of 13) intron (NM_001115113, intron 3 of 13) 9361 NM_025160 80232 Hs.497873 NM_025160 ENSG00000162923 WDR26 CDW2|GID7|MIP2|SKDEAS WD repeat domain 26 protein-coding 138.25-112 chr3 22150347 22150577 + 1 NA Intergenic Intergenic 193323 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 192.5-71 chr2 123744520 123744826 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 280501 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 260.25-39 chr5 10667300 10667773 + 1 NA Intergenic Intergenic 93698 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 147.5-177 chr5 120946275 120946551 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -376137 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 251.5-21 chr12 63892741 63893189 + 1 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 48265 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 162.25-44 chr13 97296542 97296902 + 1 NA intron (NM_144778, intron 2 of 8) intron (NM_144778, intron 2 of 8) 74389 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 259.5-62 chr20 31730085 31730498 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -6328 NM_001322240 598 Hs.516966 NM_001191 ENSG00000171552 BCL2L1 BCL-XL/S|BCL2L|BCLX|Bcl-X|PPP1R52 BCL2 like 1 protein-coding 373.75-14 chr9 32661202 32661818 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -25841 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 262.5-17 chr14 50916980 50917304 + 1 NA intron (NM_002863, intron 7 of 19) intron (NM_002863, intron 7 of 19) 27341 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 134.25-130 chr4 88586945 88587139 + 1 NA Intergenic Intergenic -5381 NM_001271602 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 268.25-22 chr19 3976768 3977361 + 1 NA intron (NM_001961, intron 14 of 14) intron (NM_001961, intron 14 of 14) 5508 NR_002602 26812 NR_002602 ENSG00000206775 SNORD37 RNU37|U37 small nucleolar RNA, C/D box 37 snoRNA 235.25-10 chr11 9645110 9645548 + 1 NA Intergenic Intergenic -18748 NM_001297714 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 159.5-28 chr10 126147849 126148061 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 4 of 18) intron (NM_001288974, intron 4 of 18) -174682 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-170 chr7 23104265 23104503 + 1 NA intron (NR_046220, intron 1 of 2) intron (NR_046220, intron 1 of 2) 1319 NR_046220 100775104 NR_046220 ENSG00000230658 KLHL7-DT KLHL7-AS1|PLATAK KLHL7 divergent transcript ncRNA 212.5-57 chr2 164387289 164387631 + 1 NA Intergenic Intergenic 181035 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 135.75-25 chr10 63129152 63129358 + 1 NA Intergenic Intergenic -3992 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 148.5-155 chr3 118159908 118160171 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -469114 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 164.25-79 chr2 227665540 227665764 + 1 NA Intergenic Intergenic -32332 NM_001162483 56918 Hs.283092 NM_020161 ENSG00000042304 C2orf83 - chromosome 2 open reading frame 83 protein-coding 140.5-48 chr12 43741391 43741573 + 1 NA intron (NM_001098615, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 17308 NM_031292 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 200.5-77 chr2 220938042 220938282 + 1 NA Intergenic Intergenic 634142 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 112.5-82 chr15 53990136 53990355 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 1 of 31) intron (NM_001329919, intron 1 of 31) 11804 NM_001329919 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 165.75-24 chr11 10736540 10736807 + 1 NA Intergenic Intergenic -14573 NM_001346279 9646 Hs.725151 NM_014633 ENSG00000198730 CTR9 SH2BP1|TSBP|p150|p150TSP CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 266.5-70 chr7 83521915 83522232 + 1 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 119358 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 323.75-10 chr15 60587764 60588161 + 1 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) 4564 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 116.5-164 chr3 121217741 121217922 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 10 of 27) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 168191 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 245.25-59 chr6 49095802 49096276 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 367214 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 163.5-89 chr2 50925068 50925328 + 1 NA intron (NM_001330088, intron 2 of 17) intron (NM_001330088, intron 2 of 17) 106934 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 220.5-41 chr2 21686094 21686372 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 24419 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 155.5-108 chr2 225806391 225806572 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -336313 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 138.5-198 chr8 115140844 115141105 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 527039 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 202.5-98 chr4 31697087 31697369 + 1 NA Intergenic Intergenic 190684 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 126.5-83 chr16 13047927 13048132 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 146431 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 174.5-49 chr12 56376755 56377030 + 1 NA Intergenic Intergenic -14035 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 137.25-6 chr1 119680987 119681157 + 1 NA Intergenic Intergenic -30862 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 114.75-173 chr7 38937174 38937397 + 1 NA Intergenic Intergenic -28085 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 315.75-28 chr8 122398210 122398726 + 1 NA Intergenic Intergenic 170176 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 214.5-126 chr8 96005580 96005864 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -57374 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 184.5-70 chr2 20265998 20266284 + 1 NA intron (NM_001282790, intron 11 of 18) intron (NM_001282790, intron 11 of 18) -40708 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 147.5-70 chr15 56143706 56143966 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 6 of 11) intron (NM_001370561, intron 6 of 11) 46096 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 149.5-83 chr19 37823601 37823874 + 1 NA TTS (NR_040015) TTS (NR_040015) 6326 NR_040013 644554 Hs.683930 NR_040013 LOC644554 - uncharacterized LOC644554 ncRNA 264.5-17 chr13 112897250 112897697 + 1 NA Intergenic Intergenic 71165 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 129.75-121 chr3 61526366 61526522 + 1 NA Intergenic Intergenic -35127 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 203.5-61 chr18 73551823 73552145 + 1 NA Intergenic Intergenic 227043 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 210.75-106 chrX 42440090 42440436 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 337900 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 210.75-65 chr4 55520583 55520862 + 1 NA intron (NM_004898, intron 1 of 22) intron (NM_004898, intron 1 of 22) 25210 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 213.75-80 chr4 117822802 117823122 + 1 NA Intergenic Intergenic -11439 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 242.25-89 chr9 80290700 80291167 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 315910 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 138.75-144 chr5 41528249 41528461 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -17754 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 193.5-158 chr7 136079661 136080122 + 1 NA Intergenic Intergenic -102532 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 273.5-2 chr1 44810892 44811478 + 1 NA intron (NM_001136537, intron 3 of 7) AluSz6|SINE|Alu 2703 NM_001136537 149478 Hs.632400 NM_001136537 ENSG00000222009 BTBD19 - BTB domain containing 19 protein-coding 115.75-219 chr8 122975307 122975451 + 1 NA TTS (NM_014943) TTS (NM_014943) 50393 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 131.25-190 chr7 69431837 69432097 + 1 NA Intergenic Intergenic 165657 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 201.5-24 chr10 60781669 60781991 + 1 NA intron (NM_033379, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 3352 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 286.75-26 chr20 58440602 58441095 + 1 NA intron (NM_004738, intron 4 of 5) intron (NM_004738, intron 4 of 5) 51619 NM_001195677 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 180.5-71 chr2 61761830 61762088 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 92101 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 138.5-83 chr17 74226848 74227113 + 1 NA intron (NM_001330453, intron 2 of 13) (CTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11350 NM_001330453 94015 Hs.27935 NM_032646 ENSG00000141540 TTYH2 C17orf29 tweety family member 2 protein-coding 159.5-200 chr8 26340391 26340671 + 1 NA intron (NM_001177591, intron 3 of 9) intron (NM_001177591, intron 3 of 9) 42422 NR_144550 157489 Hs.586388 NR_144550 ENSG00000228451 SDAD1P1 - SDA1 domain containing 1 pseudogene 1 pseudo 129.5-171 chr4 114308807 114309059 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -289469 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 239.25-75 chr5 165734464 165734936 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 1191670 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 142.75-105 chr2 139326401 139326583 + 1 NA Intergenic Intergenic 429168 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 237.5-44 chr18 47488312 47488642 + 1 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) intron (NR_147192, intron 1 of 2) 107981 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 168.75-148 chr8 86256532 86256783 + 1 NA Intergenic Intergenic -26276 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 254.75-50 chr7 118326270 118326571 + 1 NA Intergenic Intergenic 101716 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 311.5-32 chr8 51117872 51118357 + 1 NA Intergenic Intergenic 691331 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 399.75-13 chr8 120464877 120465480 + 1 NA intron (NM_022045, intron 10 of 21) intron (NM_022045, intron 10 of 21) 19759 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 120.25-158 chr4 188803399 188803584 + 1 NA Intergenic Intergenic 26834 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 124.5-203 chr7 27921748 27921979 + 1 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 181768 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 321.5-30 chr5 113811785 113812242 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 298319 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 180.5-87 chr22 22869298 22869683 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -16777 NR_049835 100847006 NR_049835 ENSG00000264824 MIR5571 - microRNA 5571 ncRNA 224.25-46 chr2 156566194 156566516 + 1 NA intron (NM_000408, intron 9 of 16) L1MB3|LINE|L1 129976 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 259.75-2 chr1 102782753 102783184 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 325528 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 160.5-155 chr5 175731698 175732123 + 1 NA Intergenic Intergenic -64623 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 226.25-13 chr10 112692243 112692625 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 58264 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 134.25-18 chr10 117265197 117265434 + 1 NA intron (NM_003054, intron 10 of 15) intron (NM_003054, intron 10 of 15) 24201 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 198.75-95 chr7 109981230 109981464 + 1 NA Intergenic Intergenic -21134 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 114.25-162 chr6 15878922 15879183 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -215994 NM_001271667 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 350.5-11 chr12 58555510 58556098 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -35898 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 186.5-72 chr2 199198847 199199173 + 1 NA Intergenic Intergenic 258929 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 202.5-47 chr14 87865114 87865339 + 1 NA Intergenic Intergenic 127956 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 153.5-211 chr9 26523024 26523203 + 1 NA Intergenic Intergenic 369689 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 142.75-47 chr12 47473821 47474040 + 1 NA Intergenic Intergenic 58922 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 170.75-129 chr7 154991734 154991958 + 1 NA intron (NM_007349, intron 3 of 20) intron (NM_007349, intron 3 of 20) 11278 NM_007349 22976 Hs.443881 NM_007349 ENSG00000157212 PAXIP1 CAGF28|CAGF29|PACIP1|PAXIP1L|PTIP|TNRC2 PAX interacting protein 1 protein-coding 118.75-25 chr10 86257168 86257364 + 1 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) L3|LINE|CR1 7522 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 132.5-107 chr2 8100789 8101014 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) L1M5|LINE|L1 -124087 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 255.75-18 chr17 73428917 73429337 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 12 of 44) intron (NM_001144952, intron 12 of 44) -84556 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 153.5-90 chr19 40320080 40320323 + 1 NA TTS (NM_001256440) TTS (NM_001256440) 28196 NM_001256441 126526 Hs.631557 NM_178830 ENSG00000160392 C19orf47 - chromosome 19 open reading frame 47 protein-coding 200.5-83 chr22 41806832 41807105 + 1 NA intron (NM_024821, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 6289 NM_024821 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 177.5-40 chr13 85492590 85492921 + 1 NA intron (NR_046989, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 129152 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 122.5-7 chr1 97437003 97437226 + 1 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) L1ME1|LINE|L1 341191 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 116.5-5 chr1 71708209 71708392 + 1 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) L1M1|LINE|L1 128712 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 162.5-29 chr11 79449538 79449840 + 1 NA Intergenic Intergenic -8659 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 139.25-195 chr8 59856652 59856848 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 424650 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 148.75-70 chr17 34655843 34656138 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 75241 NM_001304438 124842 Hs.310482 NM_207313 ENSG00000181291 TMEM132E DFNB99 transmembrane protein 132E protein-coding 197.5-42 chr15 53602003 53602370 + 1 NA intron (NM_182758, intron 17 of 19) L1PA13|LINE|L1 -61083 NM_001277176 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 185.75-106 chr6 84006623 84006867 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27027 NM_001346543 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 227.5-22 chr11 75209186 75209498 + 1 NA Intergenic Intergenic -31432 NM_001195528 100507050 Hs.577323 NM_001195528 ENSG00000261594 TPBGL - trophoblast glycoprotein like protein-coding 181.5-170 chr9 129716757 129716996 + 1 NA intron (NR_132102, intron 1 of 1) L1MC5a|LINE|L1 1830 NR_132102 101929437 Hs.112596 NR_132102 ENSG00000236024 PRRX2-AS1 - PRRX2 antisense RNA 1 ncRNA 189.25-67 chr20 53463550 53463818 + 1 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) MER5B|DNA|hAT-Charlie -89086 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 203.75-98 chr7 32050568 32050894 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 19676 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 154.25-140 chr6 56852739 56852929 + 1 NA promoter-TSS (NM_001144770) promoter-TSS (NM_001144770) -918 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 135.75-114 chr2 204791093 204791318 + 1 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 245730 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 253.5-43 chr2 112312823 112313314 + 1 NA intron (NM_198581, intron 5 of 11) MER103C|DNA|hAT-Charlie 37471 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 144.5-164 chr4 181486440 181486720 + 1 NA Intergenic Intergenic -221551 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 120.75-118 chr4 30605685 30605938 + 1 NA Intergenic Intergenic -114558 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 328.5-21 chr21 33715443 33715885 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 1 of 29) intron (NM_001001132, intron 1 of 29) 73163 NM_001001132 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 208.5-136 chr8 39039056 39039282 + 1 NA intron (NR_027638, intron 11 of 20) intron (NR_027638, intron 11 of 20) -20484 NR_145988 109616979 NR_145736 ENSG00000207199 SNORD38D - small nucleolar RNA, C/D box 38D snoRNA 142.75-83 chr17 69772373 69772700 + 1 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 178549 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 256.75-23 chr2 81166363 81167019 + 1 NA Intergenic Intergenic 300255 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 233.5-6 chr1 84338464 84338762 + 1 NA intron (NM_001134663, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 35962 NM_001134664 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 173.25-75 chr3 74123676 74123958 + 1 NA Intergenic Intergenic 314573 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 216.5-18 chr12 10615885 10616228 + 1 NA Intergenic Intergenic -2447 NR_135120 55110 Hs.104650 NM_018048 ENSG00000111196 MAGOHB MGN2|mago|magoh mago homolog B, exon junction complex subunit protein-coding 198.5-112 chr5 28963053 28963347 + 1 NA Intergenic Intergenic 36330 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 254.25-69 chr8 114069642 114069929 + 1 NA Intergenic Intergenic -632846 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 180.5-93 chr3 17424963 17425264 + 1 NA intron (NM_001349091, intron 2 of 19) intron (NM_001349091, intron 2 of 19) 274907 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 242.25-87 chr8 136353004 136353307 + 1 NA Intergenic Intergenic -177643 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 206.25-45 chr18 3566332 3566731 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) intron (NM_001242762, intron 6 of 9) -27583 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 223.25-38 chr2 135139120 135139584 + 1 NA intron (NM_001172435, intron 17 of 24) AluJb|SINE|Alu 2724 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 176.5-137 chr4 176961620 176961860 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 86038 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 220.5-28 chr14 60554219 60554571 + 1 NA Intergenic Intergenic 45249 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 294.5-5 chr10 56030026 56030431 + 1 NA Intergenic Intergenic 331031 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 167.25-111 chr3 187398423 187398651 + 1 NA Intergenic Intergenic 30152 NM_022147 64108 Hs.43388 NM_022147 ENSG00000136514 RTP4 IFRG28|Z3CXXC4 receptor transporter protein 4 protein-coding 210.5-35 chr14 34993389 34993669 + 1 NA intron (NM_003136, intron 1 of 15) intron (NM_003136, intron 1 of 15) 10537 NM_003136 6729 Hs.167535 NM_003136 ENSG00000100883 SRP54 - signal recognition particle 54 protein-coding 122.25-17 chr1 217042885 217043099 + 1 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 34000 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 140.25-75 chr17 72826565 72826793 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -186207 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 179.75-141 chr9 128039870 128040110 + 1 NA Intergenic Intergenic 27330 NM_197956 203245 Hs.373606 NM_197956 ENSG00000171169 NAIF1 C9orf90|bA379C10.2 nuclear apoptosis inducing factor 1 protein-coding 212.5-42 chr18 36982454 36982686 + 1 NA intron (NR_136303, intron 6 of 13) L1MEc|LINE|L1 -58756 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 226.25-69 chr8 38598075 38598487 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 2976 NR_003129 286140 Hs.512071 NR_003129 RNF5P1 - ring finger protein 5 pseudogene 1 pseudo 230.25-57 chr3 52210198 52210479 + 1 NA intron (NM_199166, intron 8 of 10) intron (NM_199166, intron 8 of 10) 12178 NM_000688 211 Hs.476308 NM_000688 ENSG00000023330 ALAS1 ALAS|ALAS-H|ALAS3|ALASH|MIG4 5'-aminolevulinate synthase 1 protein-coding 256.5-35 chr2 146047623 146048054 + 1 NA Intergenic Intergenic -539219 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 364.5 chr10 18706551 18707064 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 47376 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 296.75-31 chr7 36743183 36743512 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -18798 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 197.5-39 chr14 65707711 65707966 + 1 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) L1M2|LINE|L1 236736 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 300.5-39 chr5 135976577 135977108 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21859 NM_002302 3950 Hs.512580 NM_002302 ENSG00000145826 LECT2 chm-II|chm2 leukocyte cell derived chemotaxin 2 protein-coding 281.25-28 chr21 24197648 24198230 + 1 NA Intergenic Intergenic 123438 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 164.75-92 chr22 27363617 27363874 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 53094 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 325.5-37 chr7 70354180 70354555 + 1 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 755892 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 228.75-36 chr19 43629133 43629588 + 1 NA intron (NM_145296, intron 1 of 8) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -9731 NM_182498 126299 Hs.99093 NM_182498 ENSG00000131116 ZNF428 C19orf37|Zfp428 zinc finger protein 428 protein-coding 116.25-168 chr4 171896062 171896251 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) L1ME1|LINE|L1 -82549 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 274.5-16 chr12 92106963 92107434 + 1 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) intron (NR_132341, intron 1 of 4) 34515 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 169.5-80 chr2 163984336 163984588 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -248454 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 213.25-40 chr3 7403880 7404358 + 1 NA intron (NM_000844, intron 4 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie 131165 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 149.25-11 chr1 111626671 111626879 + 1 NA intron (NM_001291896, intron 1 of 7) intron (NM_001291896, intron 1 of 7) -6377 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 181.25-23 chr12 29735980 29736209 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 47848 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 143.75-2 chr1 53540494 53540798 + 1 NA intron (NM_147193, intron 3 of 9) MIRc|SINE|MIR 81247 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 116.5-182 chr4 139130365 139130586 + 1 NA intron (NM_001371339, intron 3 of 9) intron (NM_001371339, intron 3 of 9) -46061 NM_001276457 1998 Hs.634040 NM_006874 ENSG00000109381 ELF2 EU32|NERF|NERF-1A|NERF-1B|NERF-1a,b|NERF-2 E74 like ETS transcription factor 2 protein-coding 169.75-39 chr12 81631028 81631319 + 1 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) AluJb|SINE|Alu -32802 NM_001220478 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 215.5-79 chr4 111754365 111754682 + 1 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -390931 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 215.75-9 chr1 220758620 220758924 + 1 NA intron (NM_001317338, intron 2 of 7) intron (NM_001317338, intron 2 of 7) 10450 NM_001331042 54996 Hs.369042 NM_017898 ENSG00000117791 MARC2 MOSC2 mitochondrial amidoxime reducing component 2 protein-coding 159.5-24 chr10 83553070 83553363 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 123873 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 114.5-26 chr1 203137556 203137699 + 1 NA intron (NM_001365066, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 9901 NM_001365066 134 Hs.77867 NM_000674 ENSG00000163485 ADORA1 RDC7 adenosine A1 receptor protein-coding 314.25-25 chr9 22419863 22420234 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -26776 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 212.5-12 chr10 81829063 81829306 + 1 NA Intergenic Intergenic -46010 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 273.5-23 chr14 64419821 64420202 + 1 NA intron (NM_005956, intron 8 of 27) MIRb|SINE|MIR 31658 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 164.5-207 chr8 91183670 91183851 + 1 NA intron (NR_148895, intron 7 of 10) intron (NR_148895, intron 7 of 10) -21725 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 166.75-147 chr9 89583381 89583636 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -21504 NM_006705 10912 Hs.9701 NM_006705 ENSG00000130222 GADD45G CR6|DDIT2|GADD45gamma|GRP17 growth arrest and DNA damage inducible gamma protein-coding 189.5-143 chr8 69624397 69624607 + 1 NA intron (NR_156414, intron 14 of 20) intron (NR_156414, intron 14 of 20) 31602 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 177.75-139 chr8 114790830 114791138 + 1 NA Intergenic Intergenic 877029 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 249.5-43 chr18 54068905 54069328 + 1 NA Intergenic Intergenic 153296 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 276.25-21 chr17 69103324 69103648 + 1 NA intron (NM_080284, intron 20 of 38) HAL1ME|LINE|L1 -3854 NR_039750 100616316 NR_039750 ENSG00000283385 MIR4524A MIR4524|hsa-mir-4524a|mir-4524a microRNA 4524a ncRNA 194.75-42 chr18 39086218 39086504 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 535814 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 195.75-96 chr5 118206471 118206756 + 1 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 -75961 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 121.25-7 chr1 98017522 98017774 + 1 NA intron (NR_046105, intron 3 of 4) intron (NR_046105, intron 3 of 4) 27703 NR_039604 100616452 NR_039604 ENSG00000284247 MIR2682 mir-2682 microRNA 2682 ncRNA 180.75-54 chr18 7082229 7082593 + 1 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) intron (NM_005559, intron 1 of 62) 35386 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 156.75-164 chr8 91438532 91438726 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 189310 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 256.75-6 chr11 104383185 104383468 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -219179 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 137.75-8 chr1 101614201 101614354 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 232803 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 168.5-117 chr3 100655538 100655775 + 1 NA intron (NM_001308362, intron 6 of 9) intron (NM_001308362, intron 6 of 9) 20118 NM_001308362 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 165.5-161 chr6 53571511 53571877 + 1 NA intron (NR_110840, intron 1 of 3) intron (NR_110840, intron 1 of 3) 1581 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 185.5-133 chr5 131131552 131131834 + 1 NA Intergenic Intergenic 33563 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 183.25-46 chr18 5158439 5158916 + 1 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) intron (NM_001330553, intron 1 of 1) 38580 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 147.75-37 chr14 61877102 61877342 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) -50473 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 116.25-177 chr5 40793197 40793395 + 1 NA intron (NM_001355028, intron 1 of 9) intron (NM_001355028, intron 1 of 9) 4881 NM_001355036 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 140.75-85 chr2 67462442 67462710 + 1 NA Intergenic Intergenic 65243 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 121.5-158 chr20 51228187 51228422 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -205197 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 221.25-38 chr2 78517128 78517408 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -28263 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 274.5-65 chr8 87730062 87730482 + 1 NA Intergenic Intergenic 143743 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 174.25-87 chr20 59845266 59845553 + 1 NA intron (NM_080672, intron 12 of 12) intron (NM_080672, intron 12 of 12) 88228 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 131.75-207 chr7 104008266 104008453 + 1 NA Intergenic Intergenic -18701 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 254.5 chr1 38292321 38292732 + 1 NA Intergenic Intergenic -77759 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 251.75-28 chr16 53701952 53702334 + 1 NA intron (NM_001328422, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 1716 NM_001330538 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 135.5-157 chr5 19637268 19637445 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 248916 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 132.5-230 chr7 107541100 107541394 + 1 NA intron (NM_181733, intron 5 of 20) AluJb|SINE|Alu -22710 NR_073005 11062 Hs.97627 NM_181581 ENSG00000105865 DUS4L DUS4|PP35 dihydrouridine synthase 4 like protein-coding 157.75-57 chr16 46958174 46958421 + 1 NA intron (NM_005880, intron 8 of 8) AluY|SINE|Alu 15377 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 226.5-10 chr10 93571040 93571465 + 1 NA intron (NM_181745, intron 1 of 3) intron (NM_181745, intron 1 of 3) 4587 NM_181745 338557 Hs.661022 NM_181745 ENSG00000186188 FFAR4 BMIQ10|GPR120|GPR129|GT01|O3FAR1|PGR4 free fatty acid receptor 4 protein-coding 114.5-83 chr14 21995505 21995776 + 1 NA Intergenic Intergenic -324623 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 195.75-61 chr2 69165219 69165489 + 1 NA intron (NM_032208, intron 13 of 17) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 61672 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 196.5-89 chr20 20032736 20033023 + 1 NA intron (NM_016100, intron 5 of 5) intron (NM_016100, intron 5 of 5) 15084 NM_181527 51126 Hs.368783 NM_016100 ENSG00000173418 NAA20 NAT3|NAT3P|NAT5|NAT5P|dJ1002M8.1 N(alpha)-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit protein-coding 137.5-132 chr2 163540489 163540698 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 195415 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 223.25-69 chr7 50805705 50805976 + 1 NA Intergenic Intergenic -12387 NM_001371008 200.75-66 chr3 60141899 60142350 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -61215 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 154.5-73 chr16 24999602 24999781 + 1 NA intron (NM_001006634, intron 1 of 19) AluJr|SINE|Alu 15678 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 181.25-45 chr17 48686028 48686356 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 36326 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 133.75-164 chr5 117259176 117259337 + 1 NA Intergenic Intergenic -156256 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 130.25-208 chr8 127901664 127901908 + 1 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu 46937 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 196.75-99 chr7 48546579 48546912 + 1 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) intron (NM_152701, intron 55 of 61) 375287 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 178.5-90 chr2 212947371 212947613 + 1 NA Intergenic Intergenic -21156 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 167.75-12 chr1 162296866 162297159 + 1 NA intron (NM_001164757, intron 3 of 9) intron (NM_001164757, intron 3 of 9) -45534 NR_030283 693141 NR_030283 ENSG00000207729 MIR556 MIRN556|hsa-mir-556|mir-556 microRNA 556 ncRNA 113.5-163 chr3 133026439 133026573 + 1 NA Intergenic Intergenic -11782 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 191.25-111 chr8 129406220 129406528 + 1 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) LTR16A1|LTR|ERVL 77768 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 172.5-66 chr14 61061676 61061985 + 1 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) AluSx1|SINE|Alu -80140 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 122.5-181 chr5 41592951 41593143 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -82446 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 118.5-207 chr8 15665896 15666077 + 1 NA intron (NM_001356429, intron 5 of 10) intron (NM_001356429, intron 5 of 10) 125723 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 194.75-74 chr4 64645002 64645355 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -235718 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 189.25-137 chr9 110707602 110707878 + 1 NA intron (NM_001166281, intron 5 of 11) intron (NM_001166281, intron 5 of 11) -20522 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 153.75-117 chr5 123408431 123408605 + 1 NA intron (NM_153223, intron 5 of 20) L1MC1|LINE|L1 15074 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 199.75-17 chr11 123341673 123342071 + 1 NA Intergenic Intergenic -16550 NM_001367419 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 267.5-25 chr15 37894361 37894854 + 1 NA Intergenic Intergenic -40000 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 200.5-70 chr2 106789904 106790120 + 1 NA Intergenic Intergenic 96016 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 207.75-114 chr6 145657911 145658254 + 1 NA intron (NM_001368131, intron 2 of 3) intron (NM_001368131, intron 2 of 3) 28795 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 126.75-181 chr4 118270921 118271267 + 1 NA Intergenic Intergenic -7668 NR_003584 100093630 Hs.535762 NR_003584 ENSG00000269893 SNHG8 LINC00060|NCRNA00060 small nucleolar RNA host gene 8 ncRNA 233.5-64 chr21 17347489 17347915 + 1 NA Intergenic Intergenic -91188 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 224.75-33 chr15 99432902 99433375 + 1 NA Intergenic Intergenic -132279 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 178.5-39 chr13 57042029 57042305 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -98751 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 190.75-99 chr6 155531080 155531372 + 1 NA Intergenic Intergenic 16382 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 115.5-177 chr3 140555385 140555600 + 1 NA intron (NM_022131, intron 10 of 16) L1ME4b|LINE|L1 -46703 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 237.5-58 chr20 15155325 15155781 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) L2c|LINE|L2 -41287 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 282.25-20 chr20 11510658 11511048 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -237470 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 168.75 chr1 12251917 12252087 + 1 NA intron (NM_015378, intron 6 of 69) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 21972 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 191.25-52 chr2 52780901 52781245 + 1 NA Intergenic Intergenic -78458 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 195.75-41 chr13 79423475 79423922 + 1 NA non-coding (NR_038991, exon 7 of 7) non-coding (NR_038991, exon 7 of 7) 17389 NR_038991 100505538 Hs.600720 NR_038991 ENSG00000227354 RBM26-AS1 - RBM26 antisense RNA 1 ncRNA 125.25-182 chr7 3610682 3610944 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 309561 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 172.75 chr1 17832972 17833239 + 1 NA Intergenic Intergenic 77772 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 142.5-130 chr21 28141925 28142138 + 1 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) AluSg4|SINE|Alu 51628 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 187.75-27 chr13 46636721 46637158 + 1 NA intron (NM_001164213, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 83769 NM_001164213 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 179.75-31 chr12 88258657 88259104 + 1 NA Intergenic Intergenic 116573 NM_001366574 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 297.5-53 chr7 113990725 113991091 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -71899 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 124.25-154 chr4 153528437 153528655 + 1 NA intron (NM_001131007, intron 3 of 34) intron (NM_001131007, intron 3 of 34) 62186 NM_001131007 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 143.5-54 chr13 82093785 82094060 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -866939 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 148.75-62 chr15 79288471 79288719 + 1 NA intron (NM_001146341, intron 1 of 1) intron (NM_001146341, intron 1 of 1) -4650 NR_038997 729911 Hs.513931 NR_038997 ENSG00000259234 ANKRD34C-AS1 - ANKRD34C antisense RNA 1 ncRNA 254.5-50 chr3 20088327 20088723 + 1 NA intron (NM_003884, intron 2 of 17) L1MA5|LINE|L1 48079 NM_003884 8850 Hs.533055 NM_003884 ENSG00000114166 KAT2B CAF|P/CAF|PCAF lysine acetyltransferase 2B protein-coding 166.5-162 chr5 74027510 74027789 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 214103 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 112.75-166 chr5 104515927 104516144 + 1 NA Intergenic Intergenic -583439 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 225.5-99 chr7 84797661 84797927 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 265318 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 149.5-51 chr13 58240087 58240360 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -7106 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 239.5 chr1 67689039 67689308 + 1 NA TTS (NM_001199742) TTS (NM_001199742) 3972 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 133.75-29 chr11 38928276 38928535 + 1 NA Intergenic Intergenic 279547 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 141.5-111 chr2 161130107 161130345 + 1 NA Intergenic Intergenic -6729 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 276.5-37 chr2 241191977 241192414 + 1 NA intron (NM_001001666, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu 3518 NM_001001666 50636 Hs.163909 NM_001001666 ENSG00000146205 ANO7 D-TMPP|DTMPP|IPCA-5|IPCA5|NGEP|PCANAP5|PCANAP5L|TMEM16G anoctamin 7 protein-coding 214.5-17 chr10 113274007 113274382 + 1 NA Intergenic Intergenic 144923 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 128.5-11 chr1 80773771 80773952 + 1 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 132574 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 194.5-156 chr8 87491248 87491525 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 382629 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 136.75-58 chr14 61529799 61530014 + 1 NA intron (NM_006255, intron 11 of 13) L1PA2|LINE|L1 40288 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 202.25-21 chr13 69484110 69484399 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 261908 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 220.5-3 chr1 58327217 58327633 + 1 NA Intergenic Intergenic -76878 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 249.5-39 chr17 61730151 61730614 + 1 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) intron (NM_032043, intron 16 of 19) 133177 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 279.75-59 chr9 79979118 79979497 + 1 NA intron (NR_121212, intron 2 of 4) intron (NR_121212, intron 2 of 4) 4284 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 190.75-95 chr6 73382878 73383181 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -11799 NM_018665 55510 Hs.125507 NM_018665 ENSG00000080007 DDX43 CT13|HAGE DEAD-box helicase 43 protein-coding 127.75-141 chr4 30335751 30335985 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -384501 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 176.75-5 chr1 69421698 69422083 + 1 NA Intergenic MLT1E1A-int|LTR|ERVL-MaLR -11365 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 132.5-160 chr3 53286628 53286886 + 1 NA 3' UTR (NM_001290205, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001290205, exon 11 of 11) -30643 NM_001135055 7086 Hs.89643 NM_001064 ENSG00000163931 TKT HEL-S-48|HEL107|SDDHD|TK|TKT1 transketolase protein-coding 162.5-7 chr1 177730836 177731123 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 30455 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 142.25-98 chr20 44319752 44319996 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -8672 NM_001080472 128486 Hs.632269 NM_001080472 ENSG00000197296 FITM2 C20orf142|Fit2|dJ881L22.2 fat storage inducing transmembrane protein 2 protein-coding 136.25-42 chr12 22966432 22966721 + 1 NA Intergenic Intergenic -209060 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 141.25-115 chr3 152663032 152663239 + 1 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -171996 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 123.5-206 chr8 28703675 28703911 + 1 NA intron (NR_073468, intron 1 of 4) intron (NR_073468, intron 1 of 4) 2292 NM_001440 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 144.25-6 chr1 61405695 61405910 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 8 of 10) intron (NM_001134673, intron 8 of 10) -152284 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 174.25-104 chr3 166136978 166137284 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -299708 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 229.25-6 chr1 240531423 240531696 + 1 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) intron (NM_022469, intron 1 of 1) 80596 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 214.5-78 chr3 43763651 43763877 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -72170 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 152.5-123 chr3 147909419 147909664 + 1 NA Intergenic Intergenic -168618 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 263.75-45 chr5 155857597 155857894 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -469012 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 223.5-131 chr8 118372123 118372540 + 1 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) intron (NM_001363274, intron 4 of 4) -248670 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 243.25-43 chr5 144067041 144067352 + 1 NA Intergenic Intergenic 103463 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 152.5-154 chr5 116602922 116603177 + 1 NA intron (NR_147170, intron 2 of 2) intron (NR_147170, intron 2 of 2) -28226 NM_020796 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 209.5-11 chr10 13997319 13997613 + 1 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) 11084 NM_001318336 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 333.5-16 chr6 126556009 126556558 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 71652 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 171.5-121 chr4 167915268 167915564 + 1 NA Intergenic Intergenic -177121 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 129.25-194 chr8 37248389 37248544 + 1 NA Intergenic Intergenic 245447 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 127.25-109 chr20 50703710 50703943 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -12284 NR_110890 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 360.5-13 chr4 48936991 48937443 + 1 NA Intergenic Intergenic -30389 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 167.25-84 chr2 122410755 122411066 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 655259 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 149.5-147 chr5 10763330 10763618 + 1 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -2240 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 229.75-21 chr15 58879113 58879419 + 1 NA non-coding (NR_135043, exon 19 of 19) non-coding (NR_135043, exon 19 of 19) 54413 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 130.5-74 chr12 40119203 40119435 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13238 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 360.25-3 chr12 9758935 9759342 + 1 NA intron (NM_001781, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 1763 NM_001781 969 Hs.208854 NM_001781 ENSG00000110848 CD69 AIM|BL-AC/P26|CLEC2C|EA1|GP32/28|MLR-3 CD69 molecule protein-coding 160.5-96 chr2 206676740 206676931 + 1 NA intron (NM_001093730, intron 9 of 11) L1MA10|LINE|L1 32608 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 216.25-31 chr14 59917827 59918060 + 1 NA Intergenic Intergenic -1770 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 165.5-102 chr20 47867630 47867924 + 1 NA Intergenic Intergenic -81161 NM_198596 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 164.75-143 chr8 88780305 88780494 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -452916 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 265.25-14 chr15 33393535 33393998 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 82799 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 249.75-62 chr8 135818482 135818944 + 1 NA Intergenic Intergenic 361257 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 116.5-151 chr22 39955985 39956192 + 1 NA intron (NM_001291825, intron 2 of 6) L1ME4b|LINE|L1 9271 NM_001291825 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 159.5-198 chr7 102095467 102095734 + 1 NA intron (NM_001202545, intron 4 of 21) intron (NM_001202545, intron 4 of 21) -189541 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 253.25-62 chr8 68370447 68370734 + 1 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) ERVL-E-int|LTR|ERVL -39099 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-138 chr8 41848241 41848677 + 1 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) intron (NM_001142446, intron 1 of 42) 48282 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 229.5-121 chr7 7758534 7758864 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) L1ME3C|LINE|L1 -40092 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 248.75-37 chr22 31456502 31457036 + 1 NA intron (NM_001164502, intron 5 of 16) AluSz|SINE|Alu 32787 NM_001164501 56478 Hs.517559 NM_019843 ENSG00000184708 EIF4ENIF1 4E-T|Clast4 eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1 protein-coding 152.75-57 chr14 75173127 75173332 + 1 NA intron (NM_006827, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 3383 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 138.25-41 chr12 68233015 68233312 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7353 NM_018402 55801 Hs.272350 NM_018402 ENSG00000111536 IL26 AK155|IL-26 interleukin 26 protein-coding 151.5-164 chr5 168799201 168799423 + 1 NA intron (NM_003062, intron 9 of 35) intron (NM_003062, intron 9 of 35) -31057 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 289.25-23 chr5 5857821 5858215 + 1 NA Intergenic Intergenic 435341 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 227.5-109 chr8 119543292 119543688 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 49518 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 348.75-16 chr4 85932568 85933103 + 1 NA intron (NM_031305, intron 1 of 6) intron (NM_031305, intron 1 of 6) 2819 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 133.75-89 chr19 34880314 34880652 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 18460 NR_046222 100652909 Hs.374015 NR_046222 ENSG00000271649 LINC00904 - long intergenic non-protein coding RNA 904 ncRNA 169.25-19 chr12 60229114 60229449 + 1 NA Intergenic Intergenic 539911 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 183.5-130 chr7 7446887 7447189 + 1 NA intron (NM_001037763, intron 18 of 34) L1MEc|LINE|L1 88835 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 174.75-95 chr5 1263944 1264209 + 1 NA intron (NR_149162, intron 8 of 12) intron (NR_149162, intron 8 of 12) 30971 NM_198253 7015 Hs.492203 NM_198253 ENSG00000164362 TERT CMM9|DKCA2|DKCB4|EST2|PFBMFT1|TCS1|TP2|TRT|hEST2|hTRT telomerase reverse transcriptase protein-coding 147.5-156 chr4 30817930 30818092 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 97642 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 132.25-134 chr3 153752995 153753204 + 1 NA intron (NR_146713, intron 1 of 6) intron (NR_146713, intron 1 of 6) 9427 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 398.5-9 chr2 217034138 217034644 + 1 NA Intergenic Intergenic 163619 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 203.5-139 chr8 104479276 104479511 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 5072 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 221.5-107 chr9 7961158 7961410 + 1 NA Intergenic Intergenic -161506 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 177.5-131 chr4 110941027 110941463 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -80598 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 200.5-54 chr17 52670042 52670380 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -191910 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 125.5-193 chr4 124932358 124932514 + 1 NA Intergenic Intergenic -219704 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 223.5-97 chr5 84152657 84152953 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 3 of 9) intron (NM_001278642, intron 3 of 9) 232062 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 153.75-102 chr4 58416860 58417069 + 1 NA Intergenic Intergenic 119364 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 252.25-14 chr13 21562572 21562911 + 1 NA intron (NM_152726, intron 2 of 11) L1MCb|LINE|L1 41429 NM_152726 221154 Hs.412103 NM_152726 ENSG00000165487 MICU2 1110008L20Rik|EFHA1 mitochondrial calcium uptake 2 protein-coding 220.25-66 chr6 54375795 54376195 + 1 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) L2c|LINE|L2 67554 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 177.75-51 chr16 30715809 30716106 + 1 NA intron (NM_006662, intron 16 of 33) L2c|LINE|L2 5420 NR_002966 677813 Hs.689718 NR_002966 ENSG00000206755 SNORA30 ACA30|SNORA30A small nucleolar RNA, H/ACA box 30 snoRNA 377.25-8 chr2 58701650 58702176 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 181160 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 166.75-93 chr3 128137945 128138274 + 1 NA intron (NM_001319086, intron 1 of 9) L1MA3|LINE|L1 -14297 NM_003707 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 217.5-130 chr9 27796893 27797349 + 1 NA Intergenic Intergenic -223255 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 174.25-151 chr9 34121068 34121394 + 1 NA intron (NM_015397, intron 2 of 8) MER90|LTR|ERV1 5467 NM_015397 25853 Hs.493750 NM_015397 ENSG00000198876 DCAF12 CT102|KIAA1892|TCC52|WDR40A DDB1 and CUL4 associated factor 12 protein-coding 151.5-133 chr3 173053021 173053247 + 1 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 88101 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 143.5-173 chr5 104925336 104925532 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -174040 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 143.25-166 chr7 6285761 6286067 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13290 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 303.5-6 chr11 13264917 13265456 + 1 NA Intergenic Intergenic -11466 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 321.25-2 chr1 66225086 66225683 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 -106724 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 137.75-84 chr17 28839407 28839574 + 1 NA intron (NM_001288636, intron 1 of 5) intron (NM_001288636, intron 1 of 5) 3300 NM_001288637 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 190.25-23 chr12 3726483 3726699 + 1 NA intron (NM_001144958, intron 2 of 19) intron (NM_001144958, intron 2 of 19) 26518 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 248.5-13 chr11 36466848 36467226 + 1 NA Intergenic Intergenic 43235 NM_145803 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 279.25-6 chr1 188651209 188651617 + 1 NA Intergenic Intergenic 1207785 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 204.5-4 chr1 117609485 117609910 + 1 NA intron (NM_017709, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 3649 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 209.25-101 chr6 66713741 66714066 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 926024 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 336.5-19 chr3 156848390 156848801 + 1 NA intron (NM_001004316, intron 2 of 12) L3|LINE|CR1 22242 NM_001193283 389170 Hs.478048 NM_001004316 ENSG00000197980 LEKR1 - leucine, glutamate and lysine rich 1 protein-coding 188.75-5 chr1 101407770 101408020 + 1 NA Intergenic Intergenic 84058 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 222.5-8 chr1 164893573 164893935 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -119113 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 151.75-105 chr4 138059383 138059563 + 1 NA intron (NR_037866, intron 7 of 10) L1PA15|LINE|L1 -29541 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 181.5-103 chr3 17380440 17380766 + 1 NA intron (NM_014744, intron 9 of 21) intron (NM_014744, intron 9 of 21) 319417 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 127.75-100 chr2 79060472 79060829 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 27343 NM_006507 5968 Hs.4158 NM_006507 ENSG00000172023 REG1B PSPS2|REGH|REGI-BETA|REGL regenerating family member 1 beta protein-coding 297.75-53 chr9 30408567 30409013 + 1 NA promoter-TSS (NR_046204) promoter-TSS (NR_046204) -336 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 299.75-5 chr11 34191739 34192071 + 1 NA intron (NM_145804, intron 3 of 16) intron (NM_145804, intron 3 of 16) 86276 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 216.25-12 chr10 35489657 35490041 + 1 NA intron (NM_181698, intron 4 of 11) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -115492 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 196.5-126 chr5 71816249 71816535 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 97117 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 255.5-4 chr1 87531507 87531908 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -160052 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 147.5-164 chr4 78676311 78676724 + 1 NA intron (NR_038303, intron 4 of 4) intron (NR_038303, intron 4 of 4) 30523 NR_038305 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 114.25-28 chr11 73052760 73052894 + 1 NA intron (NM_014824, intron 3 of 19) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 89491 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 177.25-25 chr11 3982368 3982599 + 1 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) intron (NM_001277962, intron 2 of 12) -112202 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 119.75-212 chr9 132450639 132450968 + 1 NA intron (NM_001282957, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 40592 NM_207417 389799 Hs.201709 NM_207417 ENSG00000188523 CFAP77 C9orf171 cilia and flagella associated protein 77 protein-coding 245.25-6 chr10 14211220 14211817 + 1 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 119366 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 187.25-32 chr15 60867672 60867904 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 186219 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 284.25-4 chr1 201304715 201305271 + 1 NA intron (NM_001005337, intron 2 of 13) MIRc|SINE|MIR 21487 NM_001005337 5317 Hs.497350 NM_000299 ENSG00000081277 PKP1 B6P plakophilin 1 protein-coding 194.75-87 chr7 44891299 44891501 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5870 NM_033224 5814 Hs.349150 NM_033224 ENSG00000146676 PURB PURBETA purine rich element binding protein B protein-coding 260.25-16 chr14 48756234 48756674 + 1 NA Intergenic Intergenic 829926 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 169.75-32 chr11 112787016 112787237 + 1 NA Intergenic Intergenic -174294 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 147.5-174 chr5 55509821 55510124 + 1 NA intron (NR_103485, intron 1 of 6) intron (NR_103485, intron 1 of 6) -1046 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 126.5-15 chr1 183167377 183167584 + 1 NA Intergenic Intergenic -18784 NM_018891 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 166.5-112 chr2 209151892 209152197 + 1 NA Intergenic Intergenic -272003 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 306.5-25 chr2 192374310 192374793 + 1 NA Intergenic Intergenic -179618 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 263.5-44 chr4 72341412 72341863 + 1 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) intron (NM_014243, intron 4 of 21) 227584 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 113.5-83 chr15 60525613 60525773 + 1 NA intron (NR_120339, intron 4 of 5) intron (NR_120339, intron 4 of 5) 46515 NR_120339 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 241.25-34 chr2 50830931 50831210 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) L1MA1|LINE|L1 -134808 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 178.75-114 chr8 132259854 132260039 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L1M4|LINE|L1 -154681 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 186.5-26 chr11 111281922 111282161 + 1 NA intron (NM_198498, intron 3 of 4) intron (NM_198498, intron 3 of 4) -16505 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 162.5-3 chr1 75074276 75074606 + 1 NA Intergenic Intergenic -53993 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 206.5-95 chr5 35632782 35633100 + 1 NA intron (NM_144722, intron 2 of 9) L1M4|LINE|L1 15078 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 264.25-15 chr14 52879890 52880470 + 1 NA intron (NM_006832, intron 6 of 14) AluJo|SINE|Alu 70870 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 217.5-42 chr14 47010267 47010544 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) 332841 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 128.25-211 chr8 117235924 117236262 + 1 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 101098 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 114.75-196 chr8 111417451 111417691 + 1 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) L1M2|LINE|L1 40932 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 162.5-129 chr4 55325573 55325786 + 1 NA Intergenic Intergenic -20563 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 170.5-92 chr2 65609324 65609661 + 1 NA Intergenic Intergenic -176893 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 215.25-106 chr8 58735279 58735769 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -75671 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 135.25-100 chr2 120623382 120623566 + 1 NA Intergenic Intergenic -112394 NM_001371271 119.5-157 chr3 143215647 143215837 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 95971 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 162.5-97 chr20 10709866 10710104 + 1 NA Intergenic Intergenic -35986 NM_000214 182 Hs.224012 NM_000214 ENSG00000101384 JAG1 AGS|AGS1|AHD|AWS|CD339|DCHE|HJ1|JAGL1 jagged canonical Notch ligand 1 protein-coding 178.5-133 chr5 13553601 13553891 + 1 NA Intergenic Intergenic 390734 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 131.25-212 chr9 21514708 21514849 + 1 NA intron (NR_152877, intron 1 of 3) intron (NR_152877, intron 1 of 3) -2593 NR_029505 407035 NR_029505 ENSG00000199177 MIR31 MIRN31|hsa-mir-31|miR-31 microRNA 31 ncRNA 162.25-161 chr8 129375123 129375498 + 1 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 108832 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 169.5-71 chr2 52393887 52394160 + 1 NA intron (NR_135237, intron 10 of 10) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 23375 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 204.75-117 chr8 58914316 58914543 + 1 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) 204718 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 153.5-191 chr8 39933758 39934055 + 1 NA Intergenic Intergenic -1049 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 171.5-144 chr8 59978662 59978986 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 302576 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 181.75-104 chr5 18897087 18897319 + 1 NA Intergenic Intergenic 989069 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 212.5-115 chr8 52993262 52993589 + 1 NA Intergenic Intergenic 53517 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 207.5-60 chr20 10585338 10585729 + 1 NA intron (NM_001009608, intron 4 of 7) (CTTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 64162 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 268.25-10 chr13 75347503 75347926 + 1 NA intron (NM_001286658, intron 5 of 19) intron (NM_001286658, intron 5 of 19) 107126 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 159.75-112 chr3 126420615 126420801 + 1 NA intron (NM_182628, intron 11 of 16) MER74A|LTR|ERVL 25799 NM_182628 348807 Hs.591305 NM_182628 ENSG00000163885 CFAP100 CCDC37|MIA1 cilia and flagella associated protein 100 protein-coding 195.75-54 chr18 39050514 39050888 + 1 NA Intergenic Intergenic 571474 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 320.75-24 chr6 130875307 130875803 + 1 NA intron (NM_001350307, intron 12 of 18) L2b|LINE|L2 48150 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 173.75-155 chr8 131269660 131269915 + 1 NA Intergenic Intergenic -228878 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 132.5-43 chr11 87002905 87003064 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -34950 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 120.5-204 chr6 133429817 133430050 + 1 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) L1PA16|LINE|L1 188434 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 157.5-33 chr10 127664928 127665268 + 1 NA Intergenic Intergenic -72087 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 180.25-39 chr17 68894130 68894523 + 1 NA intron (NM_001288985, intron 22 of 39) intron (NM_001288985, intron 22 of 39) 61066 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 149.5-184 chr7 46656060 46656255 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 40965 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 235.5-32 chr14 59830492 59830786 + 1 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 40137 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 326.5-31 chr8 138585008 138585745 + 1 NA Intergenic Intergenic -87646 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 128.5-153 chr3 115008758 115008956 + 1 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) L1ME3G|LINE|L1 62557 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 240.5-25 chr14 54063482 54063759 + 1 NA Intergenic Intergenic -106729 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 184.25-76 chr22 31326190 31326497 + 1 NA 3' UTR (NM_032052, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_032052, exon 5 of 5) -9006 NR_110542 101929760 Hs.661718 NR_110542 ENSG00000228839 PIK3IP1-AS1 - PIK3IP1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 139.75-95 chr2 45281438 45281653 + 1 NA Intergenic Intergenic -26604 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 209.25-111 chr8 86072719 86072971 + 1 NA Intergenic Intergenic -3177 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 295.75-15 chr2 191557266 191557653 + 1 NA Intergenic Intergenic -120613 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 357.25-14 chr7 39700518 39701209 + 1 NA intron (NM_005402, intron 4 of 4) intron (NM_005402, intron 4 of 4) -32705 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 216.5-128 chr9 31813082 31813385 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -431743 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 238.5-93 chr8 132786504 132786950 + 1 NA intron (NM_198513, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 11339 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 115.5-35 chr12 16329925 16330145 + 1 NA Intergenic Intergenic -17107 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 308.5-3 chr10 63322488 63323026 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluSg|SINE|Alu 50291 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 278.75-19 chr2 37333659 37334021 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10790 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 241.5-20 chr13 77999468 77999949 + 1 NA Intergenic Intergenic -4935 NR_108076 101927176 Hs.116150 NR_108076 LINC01069 - long intergenic non-protein coding RNA 1069 ncRNA 143.25-11 chr1 147754240 147754518 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 6223 NM_181703 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 165.25-36 chr12 51431232 51431422 + 1 NA intron (NM_001258403, intron 1 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 6210 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 184.5-165 chr9 28093865 28094131 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -520132 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 175.75-11 chr1 192432196 192432405 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 115308 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 205.5-111 chr5 10227561 10227800 + 1 NA intron (NR_047668, intron 3 of 3) intron (NR_047668, intron 3 of 3) 22208 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 131.5-161 chr3 135220606 135220972 + 1 NA intron (NM_004441, intron 12 of 15) intron (NM_004441, intron 12 of 15) 425529 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 199.25-86 chr6 100863748 100863988 + 1 NA intron (NM_022091, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 17461 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 135.75-214 chrX 40693727 40693912 + 1 NA intron (NM_004229, intron 13 of 30) MIR|SINE|MIR -41577 NM_001289773 100873985 Hs.460579 NM_001289773 MED14OS MED14-AS1 MED14 opposite strand protein-coding 222.75-53 chr18 71714266 71714502 + 1 NA Intergenic Intergenic 67842 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 171.5-15 chr10 64210010 64210317 + 1 NA Intergenic Intergenic -615365 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 297.5-45 chr5 25397597 25398018 + 1 NA Intergenic Intergenic 206854 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 192.5-64 chr2 51669054 51669412 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1MC3|LINE|L1 636632 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 241.5-81 chr6 112937369 112937719 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 495903 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 245.75-6 chr11 10793959 10794379 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 7439 NR_004403 692223 Hs.723086 NR_004403 ENSG00000238622 SNORD97 U97 small nucleolar RNA, C/D box 97 snoRNA 138.75-138 chr5 25029612 25029887 + 1 NA Intergenic Intergenic 160907 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 198.5-154 chr8 141707599 141708071 + 1 NA Intergenic Intergenic 78478 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 188.5-70 chr2 66074578 66074989 + 1 NA Intergenic Intergenic 283545 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 187.25-82 chr4 106654913 106655143 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 221404 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 179.25-74 chr2 54800177 54800467 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) intron (NM_001039753, intron 1 of 40) 75310 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 140.25-8 chr1 78864798 78865007 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 141828 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 190.5-97 chr3 8898892 8899351 + 1 NA intron (NM_020165, intron 10 of 12) intron (NM_020165, intron 10 of 12) 64351 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 145.5-21 chr10 51823358 51823650 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -123909 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 175.5-143 chr7 928954 929343 + 1 NA intron (NM_006869, intron 2 of 10) AluSg|SINE|Alu -1932 NM_001284310 11033 Hs.602573 NM_006869 ENSG00000105963 ADAP1 CENTA1|GCS1L|p42IP4 ArfGAP with dual PH domains 1 protein-coding 219.5-44 chr15 54802036 54802347 + 1 NA Intergenic Intergenic -254556 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 145.75-80 chr2 76923184 76923481 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -62633 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 169.75-5 chr1 113446814 113447127 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L1MB3|LINE|L1 56455 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 143.75-114 chr3 29105226 29105461 + 1 NA Intergenic Intergenic 175596 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 186.5-6 chr1 161394551 161394843 + 1 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -26814 NM_001013625 257177 Hs.534593 NM_001013625 ENSG00000188931 CFAP126 C1orf192|Flattop|Fltp cilia and flagella associated protein 126 protein-coding 115.25-7 chr1 59118277 59118543 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 28397 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 355.5-23 chr6 72659983 72660431 + 1 NA intron (NR_120503, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 29712 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 139.5-43 chr12 33667132 33667401 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -227447 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 144.5-10 chr1 99703142 99703350 + 1 NA TTS (NM_001361041) TTS (NM_001361041) 9707 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 130.5-155 chr21 30979606 30979775 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 58786 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 126.25-187 chr7 48740374 48740614 + 1 NA Intergenic Intergenic -184053 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 217.75-40 chr2 168330303 168330672 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -82892 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 164.75-43 chr13 49183003 49183294 + 1 NA intron (NM_001079673, intron 14 of 25) intron (NM_001079673, intron 14 of 25) -37190 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 210.25-12 chr10 119739331 119739768 + 1 NA intron (NM_014937, intron 1 of 19) intron (NM_014937, intron 1 of 19) 13499 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 132.25-86 chr19 15279861 15280101 + 1 NA intron (NM_001330384, intron 1 of 11) intron (NM_001330384, intron 1 of 11) 470 NM_014299 23476 Hs.187763 NM_014299 ENSG00000141867 BRD4 CAP|HUNK1|HUNKI|MCAP bromodomain containing 4 protein-coding 185.5-81 chr2 133985634 133985841 + 1 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -134198 NM_001371457 211.5-24 chr11 76439722 76440050 + 1 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR -5132 NM_001300942 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 146.75-149 chr7 18106578 18106834 + 1 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 19881 NM_001321869 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 208.75-22 chr12 62053397 62053658 + 1 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 139312 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 181.75-69 chr20 754568 754803 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 13815 NM_033409 113278 Hs.283865 NM_033409 ENSG00000101276 SLC52A3 BVVLS|BVVLS1|C20orf54|RFT2|RFVT3|bA371L19.1|hRFT2 solute carrier family 52 member 3 protein-coding 114.5-59 chr11 108483480 108483656 + 1 NA intron (NM_001363503, intron 3 of 6) intron (NM_001363503, intron 3 of 6) 14816 NM_001363503 143888 Hs.83286 NM_153705 ENSG00000178202 POGLUT3 KDELC2 protein O-glucosyltransferase 3 protein-coding 115.5-209 chr5 174505720 174505884 + 1 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) intron (NR_125806, intron 2 of 5) 169448 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 113.5-3 chr1 24707074 24707238 + 1 NA Intergenic Intergenic -38291 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 195.5-123 chr5 144463889 144464214 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 258660 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 184.75-38 chr18 7276773 7277042 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 45803 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 127.75-122 chr22 42900596 42900875 + 1 NA intron (NM_001349974, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu -43462 NM_001142293 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 132.75-114 chr20 57352480 57352705 + 1 NA intron (NM_001015885, intron 1 of 11) intron (NM_001015885, intron 1 of 11) 1030 NM_001015885 8480 Hs.371698 NM_003610 ENSG00000101146 RAE1 Gle2|MIG14|MRNP41|Mnrp41|dJ481F12.3|dJ800J21.1 ribonucleic acid export 1 protein-coding 217.5-114 chr6 133768763 133769046 + 1 NA non-coding (NR_109982, exon 3 of 9) non-coding (NR_109982, exon 3 of 9) -52243 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 165.5-207 chr9 90813885 90814125 + 1 NA intron (NM_001174168, intron 1 of 12) intron (NM_001174168, intron 1 of 12) 12186 NM_001135052 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 259.75-33 chr21 34562195 34562604 + 1 NA intron (NM_004414, intron 1 of 3) intron (NM_004414, intron 1 of 3) -35389 NM_001331016 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 189.25-125 chr8 106976872 106977101 + 1 NA Intergenic Intergenic -206742 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 160.75-89 chr20 13913904 13914117 + 1 NA intron (NM_001363752, intron 4 of 16) intron (NM_001363752, intron 4 of 16) 76604 NM_001271539 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 246.5-5 chr1 207150649 207150975 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 46579 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 210.5-5 chr1 90342273 90342528 + 1 NA Intergenic Intergenic -315350 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 189.5-56 chr17 28141370 28141632 + 1 NA intron (NM_016231, intron 3 of 10) intron (NM_016231, intron 3 of 10) -85062 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 117.5-213 chr7 22938921 22939090 + 1 NA 3' UTR (NM_001363466, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001363466, exon 12 of 12) 75125 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 155.25-183 chr8 119900765 119900953 + 1 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 27137 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 167.5-109 chr21 28939824 28940114 + 1 NA intron (NM_015565, intron 25 of 29) intron (NM_015565, intron 25 of 29) 52908 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 149.5-79 chr18 7071784 7071995 + 1 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) MIRb|SINE|MIR 45908 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 121.25-107 chr20 2174933 2175158 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -31883 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 249.5-51 chr2 139837728 139838090 + 1 NA Intergenic Intergenic 748776 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 126.5-175 chr4 63142597 63142841 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -980954 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 262.5-77 chr9 76245404 76245865 + 1 NA intron (NM_001190482, intron 24 of 36) intron (NM_001190482, intron 24 of 36) 148792 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 214.5-34 chr14 70663703 70664017 + 1 NA intron (NM_015351, intron 1 of 2) intron (NM_015351, intron 1 of 2) 21944 NM_015351 23508 Hs.79170 NM_015351 ENSG00000133985 TTC9 TTC9A tetratricopeptide repeat domain 9 protein-coding 136.25-39 chr12 1209804 1210042 + 1 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) intron (NR_027948, intron 12 of 19) 182175 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 146.75-100 chr3 50994915 50995135 + 1 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) intron (NM_004947, intron 5 of 52) 319945 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 175.25-103 chr4 35248430 35248643 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -978789 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 202.25-19 chr12 87787593 87787918 + 1 NA intron (NR_149056, intron 2 of 3) L1MA9|LINE|L1 -3044 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 139.5-59 chr13 69601519 69601746 + 1 NA Intergenic Intergenic 379286 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 185.5-105 chr3 74189420 74189633 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 331614 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 156.5-53 chr14 48673300 48673556 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -878414 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 172.5-174 chr6 149099038 149099348 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -66532 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 151.25-41 chr12 79801617 79801910 + 1 NA intron (NM_001244990, intron 15 of 24) L3|LINE|CR1 -110666 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 177.5-32 chr12 11706267 11706585 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 56572 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 168.5-156 chr6 40484950 40485341 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 102219 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 312.25-3 chr10 86323468 86323889 + 1 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) L1MB5|LINE|L1 43117 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 153.5-150 chr4 181872846 181873085 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -42992 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 197.75-70 chr5 81495461 81495808 + 1 NA intron (NM_001256734, intron 4 of 15) intron (NM_001256734, intron 4 of 15) -101500 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 174.5-105 chr20 19516670 19517003 + 1 NA intron (NM_020689, intron 3 of 16) intron (NM_020689, intron 3 of 16) -232240 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 248.25-30 chr19 52382151 52382419 + 1 NA intron (NM_001145434, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 12362 NM_001145434 400713 Hs.502314 NM_001145434 ENSG00000221923 ZNF880 - zinc finger protein 880 protein-coding 149.75-91 chr2 164789382 164789592 + 1 NA intron (NM_001365670, intron 2 of 13) intron (NM_001365670, intron 2 of 13) -51262 NR_110574 101929633 Hs.570267 NR_110574 LOC101929633 - uncharacterized LOC101929633 ncRNA 130.25-196 chr8 56715215 56715465 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -155517 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 259.25-19 chr2 12746899 12747182 + 1 NA Intergenic Intergenic 9673 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 153.25-104 chr5 84082817 84083005 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 5 of 9) intron (NM_001278642, intron 5 of 9) 301956 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 170.25-15 chr11 4865210 4865398 + 1 NA Intergenic Intergenic -4641 NM_001348291 401663 NM_001348291 OR51H1 OR51H1P olfactory receptor family 51 subfamily H member 1 protein-coding 357.25-5 chr15 64365707 64366354 + 1 NA exon (NM_014736, exon 4 of 4) exon (NM_014736, exon 4 of 4) -9857 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 223.5-15 chr10 85751301 85751662 + 1 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) intron (NM_017551, intron 8 of 15) 173750 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 193.5-92 chr2 207482778 207483120 + 1 NA Intergenic Intergenic -47013 NM_001371427 129.25-79 chr19 28562018 28562270 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -44544 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 340.5-16 chr18 12762703 12763197 + 1 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -13528 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 203.5-63 chr2 27052763 27053112 + 1 NA non-coding (NR_138023, exon 2 of 16) non-coding (NR_138023, exon 2 of 16) 1269 NR_104246 60509 Hs.138207 NM_021831 ENSG00000084693 AGBL5 CCP5|RP75 ATP/GTP binding protein like 5 protein-coding 307.25-3 chr10 38128145 38128657 + 1 NA intron (NM_001324258, intron 6 of 6) intron (NM_001324258, intron 6 of 6) 34064 NM_001324249 7587 Hs.292575 NM_003421 ENSG00000075407 ZNF37A KOX21|ZNF37 zinc finger protein 37A protein-coding 150.25-83 chr2 193309020 193309361 + 1 NA Intergenic MER70C|LTR|ERVL 559345 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 263.75-25 chr2 14715171 14715501 + 1 NA Intergenic Intergenic 82619 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 284.5-36 chr20 11001779 11002264 + 1 NA Intergenic Intergenic -24523 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 256.75 chr1 23109911 23110345 + 1 NA intron (NM_033631, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 58728 NM_033631 7798 Hs.257900 NM_033631 ENSG00000169641 LUZP1 LUZP leucine zipper protein 1 protein-coding 173.5-51 chr16 85950067 85950510 + 1 NA Intergenic Intergenic 31941 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 119.75-132 chr22 25573113 25573282 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) intron (NM_001362778, intron 1 of 19) 8522 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 149.5-190 chr7 86651453 86651758 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 7691 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 198.5-12 chr10 18439381 18439754 + 1 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) intron (NM_201593, intron 3 of 13) 38992 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 192.5-121 chr7 45601645 45601875 + 1 NA intron (NM_001281768, intron 3 of 9) intron (NM_001281768, intron 3 of 9) 27392 NM_021116 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 208.5-107 chr5 51248237 51248623 + 1 NA Intergenic Intergenic 134902 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 151.75-151 chr8 82437328 82437659 + 1 NA Intergenic Intergenic -474611 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 114.5-262 chr8 88382063 88382263 + 1 NA Intergenic Intergenic -54680 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 168.5-97 chr2 196896050 196896290 + 1 NA intron (NM_001321099, intron 8 of 27) intron (NM_001321099, intron 8 of 27) 30537 NM_001321100 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 135.25-76 chr17 32407725 32407914 + 1 NA Intergenic Intergenic -36691 NM_002815 5717 Hs.443379 NM_002815 ENSG00000108671 PSMD11 Rpn6|S9|p44.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 11 protein-coding 215.75-61 chr3 17356572 17356886 + 1 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 343291 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 148.5-7 chr1 105678950 105679217 + 1 NA Intergenic Intergenic -60148 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 156.5-107 chr22 46519731 46519997 + 1 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) intron (NM_014246, intron 1 of 34) 17756 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 142.75-41 chr11 87707148 87707442 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 12116 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 246.5-68 chr7 52650834 52651279 + 1 NA Intergenic Intergenic -384577 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 244.25-40 chr5 114265645 114266124 + 1 NA Intergenic Intergenic -96186 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 250.25-21 chr18 45411048 45411505 + 1 NA intron (NM_001371319, intron 4 of 23) intron (NM_001371319, intron 4 of 23) 95760 NR_110899 101927980 Hs.591058 NR_110899 SLC14A2-AS1 - SLC14A2 antisense RNA 1 ncRNA 128.25-107 chr2 187315538 187315833 + 1 NA Intergenic Intergenic 132567 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 164.5-199 chr8 21528780 21529078 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 230690 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 248.5-87 chr6 20978785 20979154 + 1 NA intron (NM_017774, intron 10 of 15) intron (NM_017774, intron 10 of 15) 444512 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 269.75-46 chr5 116966885 116967578 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -205022 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 171.5-126 chr6 36446223 36446434 + 1 NA intron (NR_104481, intron 1 of 3) intron (NR_104481, intron 1 of 3) 3328 NM_001286579 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 174.25-11 chr1 231789621 231789888 + 1 NA intron (NM_001164547, intron 6 of 7) intron (NM_001164547, intron 6 of 7) 28763 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 150.5-68 chr17 79545062 79545351 + 1 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) intron (NM_001350451, intron 1 of 14) -29058 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 201.5-66 chr18 4005140 4005447 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 42940 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 230.5-112 chr8 89003459 89003885 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -676189 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 191.25-85 chr5 32617185 32617439 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 31755 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 138.75-61 chr15 101638526 101638684 + 1 NA intron (NM_001307960, intron 4 of 4) intron (NM_001307960, intron 4 of 4) 13776 NM_078474 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 200.25-68 chr2 202666077 202666376 + 1 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) intron (NM_173511, intron 1 of 7) 31257 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 281.5-33 chr3 18619054 18619438 + 1 NA Intergenic Intergenic -173654 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 267.5-29 chr16 5694215 5694535 + 1 NA Intergenic Intergenic 61908 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 120.25-173 chr5 126882116 126882304 + 1 NA intron (NM_178450, intron 3 of 4) intron (NM_178450, intron 3 of 4) 105074 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 187.75-48 chr2 77009564 77009790 + 1 NA non-coding (NR_110284, exon 4 of 4) non-coding (NR_110284, exon 4 of 4) 23712 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 132.75-73 chr15 88353817 88354074 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -97206 NM_002530 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 227.5-98 chr8 25851727 25852082 + 1 NA intron (NM_022659, intron 14 of 15) intron (NM_022659, intron 14 of 15) 193509 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 162.5-88 chr2 151288635 151288850 + 1 NA intron (NM_004688, intron 1 of 7) intron (NM_004688, intron 1 of 7) 926 NM_004688 9111 Hs.54483 NM_004688 ENSG00000123609 NMI - N-myc and STAT interactor protein-coding 172.5-191 chr7 87232762 87233030 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -12309 NR_138030 79161 Hs.619593 NM_024315 ENSG00000135185 TMEM243 C7orf23|MM-TRAG|MMTRAG transmembrane protein 243 protein-coding 130.75-136 chr4 35617934 35618083 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 625931 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 117.5-169 chr5 2399689 2399859 + 1 NA Intergenic Intergenic -87573 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 132.5-53 chr12 66704593 66704812 + 1 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) -25626 NM_001178074 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 149.5-63 chr15 57226655 57226840 + 1 NA intron (NM_207040, intron 1 of 12) intron (NM_207040, intron 1 of 12) 7317 NM_207040 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 219.5-75 chr2 233129172 233129507 + 1 NA intron (NM_001017915, intron 4 of 26).2 MIRb|SINE|MIR 68997 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 122.5-64 chr14 63672289 63672485 + 1 NA Intergenic Intergenic -30516 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 358.5-4 chr13 33298853 33299305 + 1 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -13324 NM_178006 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 188.5-36 chr14 52271845 52272195 + 1 NA intron (NM_001281469, intron 2 of 2) intron (NM_001281469, intron 2 of 2) 4322 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 170.75-61 chr2 27983176 27983489 + 1 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) L1MB7|LINE|L1 -13035 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 131.25-110 chr2 177112917 177113108 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 99399 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 190.75-59 chr20 42607883 42608192 + 1 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) MIR3|SINE|MIR -77446 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 150.5-225 chr8 127346012 127346255 + 1 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -54266 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 236.75-33 chr20 33268844 33269115 + 1 NA Intergenic Intergenic -14235 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 324.75-33 chr8 110458229 110458618 + 1 NA Intergenic Intergenic -482652 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 226.25-7 chr10 19077867 19078287 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 2 of 39) MIRb|SINE|MIR 29276 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 176.5-10 chr1 181215504 181215722 + 1 NA Intergenic Intergenic -20775 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 165.75-110 chr3 3470960 3471148 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -291337 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 163.5-202 chr8 55358181 55358428 + 1 NA intron (NM_052898, intron 2 of 2) intron (NM_052898, intron 2 of 2) 97017 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 220.5-37 chr17 71190627 71190918 + 1 NA intron (NR_104152, intron 1 of 3) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 11407 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 203.5-33 chr12 28402949 28403232 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) L1MCa|LINE|L1 -212352 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 262.75-57 chr9 29882008 29882361 + 1 NA Intergenic Intergenic 526270 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 267.25-11 chr14 46601841 46602302 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49710 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 334.5-2 chr1 42259509 42260106 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 4 of 12) intron (NM_001198850, intron 4 of 12) 75148 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 135.5-14 chr1 197749285 197749529 + 1 NA intron (NM_001195216, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 26073 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 161.75-68 chr2 140557837 140558065 + 1 NA intron (NM_018557, intron 43 of 90) L2a|LINE|L2 28734 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 164.5-114 chr20 35707095 35707324 + 1 NA intron (NR_040722, intron 14 of 17) intron (NR_040722, intron 14 of 17) 7804 NM_080748 140823 Hs.472564 NM_080748 ENSG00000125995 ROMO1 C20orf52|MTGM|MTGMP|bA353C18.2 reactive oxygen species modulator 1 protein-coding 304.5-38 chr8 106132370 106132725 + 1 NA Intergenic Intergenic -72044 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-15 chr10 67826269 67826650 + 1 NA intron (NM_021800, intron 1 of 4) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11720 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 147.5-140 chr3 38926985 38927271 + 1 NA intron (NM_014139, intron 3 of 25) intron (NM_014139, intron 3 of 25) 23433 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 205.5-72 chr2 84906241 84906841 + 1 NA 3' UTR (NM_021103, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_021103, exon 3 of 3) 885 NM_021103 9168 Hs.446574 NM_021103 ENSG00000034510 TMSB10 MIG12|TB10 thymosin beta 10 protein-coding 177.25-30 chr11 93558260 93558594 + 1 NA Intergenic Intergenic -15036 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 231.5-79 chr5 26596587 26596890 + 1 NA Intergenic Intergenic 441848 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 230.25-15 chr10 110434708 110434994 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -63056 NM_004419 1847 Hs.2128 NM_004419 ENSG00000138166 DUSP5 DUSP|HVH3 dual specificity phosphatase 5 protein-coding 191.75-56 chr19 30184172 30184553 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -188022 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 251.75-38 chr2 88662556 88663031 + 1 NA Intergenic Intergenic -28880 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 146.75-12 chr1 234262556 234262858 + 1 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) -43760 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 161.5-119 chr21 22412263 22412491 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 313760 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 265.5-33 chr18 69772752 69773070 + 1 NA intron (NM_152721, intron 7 of 7) L1MB1|LINE|L1 174962 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 373.25-5 chr13 92933434 92934027 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -111611 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 113.25-186 chr9 93216842 93216956 + 1 NA intron (NM_006648, intron 1 of 28) MER33|DNA|hAT-Charlie 31969 NM_001282394 65268 Hs.654856 NM_006648 ENSG00000165238 WNK2 NY-CO-43|P/OKcl.13|PRKWNK2|SDCCAG43 WNK lysine deficient protein kinase 2 protein-coding 118.25-94 chr2 7192817 7193006 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -115031 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 183.25-8 chr1 191977551 191977774 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -180800 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 166.25-97 chr21 44605374 44605561 + 1 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) L1M3|LINE|L1 4870 NM_198689 386675 Hs.473999 NM_198689 ENSG00000272804 KRTAP10-7 KAP10.7|KAP18.7|KRTAP18-7 keratin associated protein 10-7 protein-coding 153.75-106 chr4 88226709 88226933 + 1 NA intron (NM_001348985, intron 1 of 16) U6|snRNA|snRNA 4805 NM_001257386 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 116.25-15 chr10 8701699 8702053 + 1 NA Intergenic Intergenic -107485 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 360.5-18 chr8 90105040 90105684 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -22483 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 250.5-31 chr15 35992436 35992738 + 1 NA Intergenic Intergenic 65731 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 301.5-37 chr5 160005251 160005618 + 1 NA Intergenic (TATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3666 NM_001282500 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 263.75-56 chr9 86698131 86698590 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 249146 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 198.25-51 chr2 12579027 12579261 + 1 NA TTS (NR_110196) TTS (NR_110196) -137728 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 184.25-98 chr5 37576991 37577406 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 197880 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 211.25-95 chr8 97713600 97713929 + 1 NA exon (NM_001363138, exon 8 of 11) exon (NM_001363138, exon 8 of 11) -62024 NM_018407 55353 Hs.492314 NM_018407 ENSG00000104341 LAPTM4B LAPTM4beta|LC27 lysosomal protein transmembrane 4 beta protein-coding 203.5-122 chr6 98925357 98925749 + 1 NA intron (NM_001278716, intron 4 of 9) L1MC4a|LINE|L1 22393 NR_103837 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 161.5-106 chr2 176777980 176778205 + 1 NA Intergenic Intergenic 140338 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 185.5-79 chr2 70452133 70452437 + 1 NA intron (NM_003236, intron 5 of 5) intron (NM_003236, intron 5 of 5) 29355 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 188.5-73 chr2 73107099 73107400 + 1 NA intron (NM_001371272, intron 1 of 5) intron (NM_001371272, intron 1 of 5) 5699 NM_015470 26056 Hs.24557 NM_015470 ENSG00000135631 RAB11FIP5 GAF1|RIP11|pp75 RAB11 family interacting protein 5 protein-coding 132.5-7 chr1 44057048 44057203 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -25663 NM_001328630 6536 Hs.442590 NM_006934 ENSG00000196517 SLC6A9 GCENSG|GLYT1 solute carrier family 6 member 9 protein-coding 160.75-127 chr5 144466041 144466263 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 260761 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 264.75-52 chr7 33385480 33386173 + 1 NA intron (NM_198428, intron 18 of 22) intron (NM_198428, intron 18 of 22) 256262 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 142.5-230 chr8 128953313 128953572 + 1 NA intron (NR_145483, intron 3 of 3) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 12559 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 350.25-17 chr2 74588880 74589578 + 1 NA intron (NM_001321739, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 35069 NM_001318867 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 129.25-203 chr8 114932040 114932205 + 1 NA Intergenic Intergenic 735891 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 121.5-116 chr18 43934649 43934916 + 1 NA Intergenic Intergenic 596915 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 201.5-100 chr4 149240733 149241034 + 1 NA intron (NR_125887, intron 9 of 12) intron (NR_125887, intron 9 of 12) 86588 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 115.25-45 chr12 29005927 29006102 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -143264 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 154.5-45 chr12 26080638 26080798 + 1 NA TTS (NM_007211) TTS (NM_007211) 28154 NM_001164746 11228 Hs.696433 NM_007211 ENSG00000123094 RASSF8 C12orf2|HOJ1 Ras association domain family member 8 protein-coding 339.75-7 chr11 41735322 41735887 + 1 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) intron (NR_120584, intron 2 of 5) 21036 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 180.75-142 chr7 54558949 54559264 + 1 NA non-coding (NR_038994, exon 2 of 4) non-coding (NR_038994, exon 2 of 4) 2136 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 220.5-79 chr3 173669448 173669761 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 85170 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 162.75-95 chr3 70133622 70133873 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 134003 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 152.5-136 chr4 71471568 71471776 + 1 NA intron (NM_003759, intron 10 of 22) intron (NM_003759, intron 10 of 22) 132619 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 334.75-6 chr12 266443 267135 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3916 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 186.25-95 chr5 144248682 144248892 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 43396 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 307.25-21 chr21 42576008 42576355 + 1 NA intron (NM_001320537, intron 18 of 19) L1MEd|LINE|L1 38914 NR_131192 101928233 Hs.534827 NR_131192 ENSG00000225431 LINC01671 - long intergenic non-protein coding RNA 1671 ncRNA 288.5-24 chr20 1864200 1864587 + 1 NA Intergenic Intergenic -29774 NM_001330728 140885 Hs.581021 NM_080792 ENSG00000198053 SIRPA BIT|CD172A|MFR|MYD-1|P84|PTPNS1|SHPS1|SIRP signal regulatory protein alpha protein-coding 136.5-3 chr1 43040750 43040926 + 1 NA Intergenic Intergenic 81789 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-64 chr14 81039970 81040351 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) L1MA6|LINE|L1 84539 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 135.5-107 chr2 111984149 111984349 + 1 NA intron (NM_006343, intron 8 of 18) MLT2B1|LTR|ERVL -71020 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 137.75-58 chr14 51660430 51660617 + 1 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) intron (NM_001267046, intron 1 of 13) 8613 NM_001267046 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 190.5-10 chr10 7856964 7857219 + 1 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 38586 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 300.5-16 chr14 60080476 60080847 + 1 NA Intergenic Intergenic -11250 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 263.5-10 chr12 2590967 2591311 + 1 NA intron (NM_199460, intron 18 of 49).2 intron (NM_199460, intron 18 of 49).2 81081 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 176.25-137 chr8 93968206 93968385 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 51348 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 162.75-59 chr18 50689428 50689626 + 1 NA intron (NM_002747, intron 2 of 5) intron (NM_002747, intron 2 of 5) 129440 NM_001292040 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 162.75-129 chr7 18661307 18661580 + 1 NA intron (NM_001321878, intron 13 of 13) L2c|LINE|L2 152173 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 170.75-70 chr2 112579343 112579575 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -4988 NR_163920 140.5-78 chr16 48874653 48874824 + 1 NA Intergenic Intergenic -264558 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 158.5-26 chr10 76560904 76561140 + 1 NA TTS (NM_001305581) TTS (NM_001305581) -327022 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 162.75-3 chr1 88315880 88316136 + 1 NA Intergenic Intergenic -368136 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 270.5-43 chr3 106769122 106769533 + 1 NA Intergenic Intergenic 471311 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 187.25 chr1 10278613 10278863 + 1 NA intron (NM_001365953, intron 12 of 20) intron (NM_001365953, intron 12 of 20) -20228 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 140.5-7 chr1 114771089 114771302 + 1 NA non-coding (NR_049742, exon 4 of 4) non-coding (NR_049742, exon 4 of 4) 9490 NM_001102396 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 229.5-70 chr2 156169099 156169374 + 1 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 85695 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 160.5-113 chr3 36305522 36305769 + 1 NA Intergenic Intergenic -74842 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 116.75-97 chr2 80030308 80030516 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -163829 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 158.25-141 chr8 26495348 26495566 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 18415 NM_007257 10687 Hs.591838 NM_007257 ENSG00000240694 PNMA2 MA2|MM2|RGAG2 PNMA family member 2 protein-coding 284.75-32 chr6 130825066 130825515 + 1 NA Intergenic Intergenic -2115 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 117.25-95 chr18 1120940 1121182 + 1 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 -193068 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 227.25-31 chr16 19466863 19467200 + 1 NA intron (NM_024780, intron 5 of 17) AluJb|SINE|Alu 10570 NM_024780 79838 Hs.115838 NM_024780 ENSG00000103534 TMC5 - transmembrane channel like 5 protein-coding 380.25-10 chr9 82279193 82280032 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 290840 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 146.5-126 chr20 51663920 51664204 + 1 NA intron (NM_006045, intron 13 of 27) AluSx|SINE|Alu -101223 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 396.5-5 chr2 107561006 107561629 + 1 NA Intergenic Intergenic 31898 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 120.5-135 chr20 56037014 56037187 + 1 NA Intergenic Intergenic -31581 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 290.5-14 chr15 67384298 67384874 + 1 NA intron (NM_001031715, intron 10 of 20) intron (NM_001031715, intron 10 of 20) -129388 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 297.75-20 chr2 191060695 191061279 + 1 NA intron (NM_003151, intron 10 of 23) intron (NM_003151, intron 10 of 23) 39461 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 267.5-61 chr5 96899680 96900197 + 1 NA intron (NM_001329229, intron 8 of 17) intron (NM_001329229, intron 8 of 17) 23999 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 158.5-149 chr5 11790677 11790897 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 113659 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 171.5-171 chrX 62673057 62673349 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 678129 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 174.5-117 chr3 11637860 11638176 + 1 NA intron (NM_014667, intron 2 of 5) intron (NM_014667, intron 2 of 5) 5897 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 162.75-90 chr3 35492199 35492418 + 1 NA Intergenic Intergenic -98285 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 269.25-15 chr16 54744020 54744489 + 1 NA Intergenic Intergenic 103979 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 210.25-19 chr12 65606072 65606328 + 1 NA non-coding (NR_146529, exon 2 of 3) non-coding (NR_146529, exon 2 of 3) 3331 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 228.25-10 chr10 8811165 8811523 + 1 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -86645 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 130.5-179 chr3 159118019 159118223 + 1 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 48802 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 199.5-90 chr2 180732115 180732462 + 1 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 40184 NR_104319 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 175.75-78 chr20 57427713 57427986 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34793 NR_149006 100291105 Hs.638423 NR_149006 ENSG00000218018 LOC100291105 - uncharacterized LOC100291105 ncRNA 202.75-15 chr10 108092919 108093309 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -23821 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 169.5-73 chr2 68925369 68925612 + 1 NA Intergenic Intergenic 27403 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 165.5-20 chr10 55505946 55506240 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L2c|LINE|L2 -92949 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 230.5-60 chr2 13793888 13794259 + 1 NA Intergenic Intergenic 606885 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 173.5-104 chr3 143836411 143836756 + 1 NA intron (NM_173653, intron 1 of 15) intron (NM_173653, intron 1 of 15) 11885 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 181.75-88 chr3 170866371 170866571 + 1 NA exon (NM_001320451, exon 4 of 4) exon (NM_001320451, exon 4 of 4) 3724 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 285.25-7 chr14 45056343 45056777 + 1 NA intron (NR_131765, intron 16 of 19) L1M2|LINE|L1 -27556 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 303.5-24 chr2 164561542 164562367 + 1 NA intron (NM_004490, intron 2 of 13) intron (NM_004490, intron 2 of 13) 6541 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 223.5-28 chr11 92978382 92978735 + 1 NA intron (NM_005959, intron 1 of 1) intron (NM_005959, intron 1 of 1) 8935 NM_005959 4544 Hs.569039 NM_005959 ENSG00000134640 MTNR1B FGQTL2|MEL-1B-R|MT2 melatonin receptor 1B protein-coding 210.25-44 chr2 172131030 172131248 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 28133 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 233.75-15 chr11 109511484 109511863 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 89483 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 202.5-25 chr11 15642783 15643190 + 1 NA promoter-TSS (NM_001293172) promoter-TSS (NM_001293172) -899 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 192.25-24 chr13 84819988 84820195 + 1 NA Intergenic Intergenic 36437 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 287.75-8 chr10 73936170 73936914 + 1 NA Intergenic Intergenic -13765 NR_160937 414236 Hs.585453 NM_001001791 ENSG00000222047 C10orf55 - chromosome 10 open reading frame 55 ncRNA 144.5-63 chr14 61581301 61581520 + 1 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -10757 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 129.25-182 chr7 28187389 28187548 + 1 NA intron (NR_034097, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR -6673 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 334.75-5 chr10 61938876 61939591 + 1 NA intron (NM_032199, intron 2 of 9) intron (NM_032199, intron 2 of 9) 37534 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 173.5 chr1 7967044 7967302 + 1 NA intron (NM_001123377, intron 3 of 6) L1MA5A|LINE|L1 5462 NM_007262 11315 Hs.419640 NM_007262 ENSG00000116288 PARK7 DJ-1|DJ1|GATD2|HEL-S-67p Parkinsonism associated deglycase protein-coding 130.75-168 chr6 57188122 57188265 + 1 NA non-coding (NR_103822, exon 4 of 4) non-coding (NR_103822, exon 4 of 4) 15867 NM_004282 9532 Hs.745046 NM_004282 ENSG00000112208 BAG2 BAG-2|dJ417I1.2 BCL2 associated athanogene 2 protein-coding 193.75-78 chr20 59620696 59621044 + 1 NA intron (NM_080672, intron 1 of 12) L1MC4a|LINE|L1 7419 NR_040513 100506384 Hs.663924 NR_040513 ENSG00000238194 LOC100506384 - uncharacterized LOC100506384 ncRNA 253.25-48 chr3 170791679 170792115 + 1 NA Intergenic Intergenic 78298 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 182.5 chr1 25997065 25997350 + 1 NA intron (NM_000437, intron 1 of 10) intron (NM_000437, intron 1 of 10) 856 NM_000437 5051 Hs.477083 NM_000437 ENSG00000158006 PAFAH2 HSD-PLA2 platelet activating factor acetylhydrolase 2 protein-coding 156.5-120 chr3 142107562 142107913 + 1 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 41807 NM_001178139 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 250.5-27 chr14 54311128 54311500 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -85554 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 178.5-4 chr1 80851757 80852189 + 1 NA Intergenic Intergenic 210686 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 199.5-98 chr22 43694483 43694757 + 1 NA intron (NM_198856, intron 8 of 29) L1ME1|LINE|L1 117685 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 147.5-165 chr4 87113963 87114205 + 1 NA intron (NM_005935, intron 10 of 19) intron (NM_005935, intron 10 of 19) 106184 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 147.25-34 chr14 49650664 49650995 + 1 NA intron (NM_001348385, intron 16 of 18) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -15599 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 179.25-29 chr11 29200371 29200592 + 1 NA Intergenic Intergenic -393932 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 190.75-75 chr4 58105545 58105779 + 1 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL 430666 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 194.5-13 chr10 15699863 15700242 + 1 NA intron (NM_001291494, intron 2 of 28) intron (NM_001291494, intron 2 of 28) 19870 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 215.5-43 chr17 73228272 73228601 + 1 NA promoter-TSS (NM_001289412) promoter-TSS (NM_001289412) -719 NM_001289412 84923 Hs.741276 NM_032837 ENSG00000133193 FAM104A - family with sequence similarity 104 member A protein-coding 272.75-45 chr6 148283841 148284135 + 1 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) intron (NM_001346505, intron 1 of 19) 11660 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 131.25-222 chrX 35978337 35978489 + 1 NA intron (NM_001304548, intron 15 of 63) intron (NM_001304548, intron 15 of 63) 58679 NM_001304548 286464 Hs.376425 NM_152632 ENSG00000165164 CFAP47 CHDC2|CXorf22|CXorf30|CXorf59 cilia and flagella associated protein 47 protein-coding 224.75-45 chr22 27005046 27005391 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 55300 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 147.25-10 chr1 195346495 195346704 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 742116 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 153.5-201 chr8 118698148 118698437 + 1 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -76329 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 179.5-61 chr14 74964858 74965074 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -9202 NM_001207012 5228 Hs.252820 NM_002632 ENSG00000119630 PGF D12S1900|PGFL|PIGF|PLGF|PlGF-2|SHGC-10760 placental growth factor protein-coding 211.5-48 chr14 42987132 42987432 + 1 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 1380426 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 202.5-54 chr16 46480540 46480787 + 1 NA intron (NR_026556, intron 12 of 16) L1M2|LINE|L1 88434 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 153.5-56 chr14 57323360 57323683 + 1 NA Intergenic Intergenic 54550 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 268.5-64 chr8 126030566 126031119 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -79645 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 197.5-34 chr12 133157309 133157819 + 1 NA 3' UTR (NM_015394, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_015394, exon 5 of 5) -23931 NM_152943 10795 Hs.124047 NM_003415 ENSG00000090612 ZNF268 HZF3 zinc finger protein 268 protein-coding 236.5-77 chr5 174560634 174560938 + 1 NA Intergenic Intergenic -163796 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 150.75-190 chr8 126637014 126637225 + 1 NA Intergenic Intergenic -78641 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 200.5-45 chr15 87872453 87872846 + 1 NA 3' UTR (NM_002530, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_002530, exon 19 of 19) 73619 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 112.75-106 chr2 165529821 165529970 + 1 NA intron (NM_001172173, intron 3 of 6) intron (NM_001172173, intron 3 of 6) -42441 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 277.5-3 chr1 170828358 170828867 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -106859 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 326.5-16 chr17 39730830 39731302 + 1 NA promoter-TSS (NM_032339) promoter-TSS (NM_032339) -503 NM_001330206 84299 Hs.333526 NM_032339 ENSG00000141741 MIEN1 C17orf37|C35|ORB3|RDX12|XTP4 migration and invasion enhancer 1 protein-coding 206.5-114 chr6 152506430 152506747 + 1 NA intron (NM_182961, intron 8 of 145) AluSz6|SINE|Alu 126058 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 144.25-146 chr4 82015413 82015633 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 358468 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 163.25-154 chrX 96473604 96473893 + 1 NA Intergenic Intergenic -135846 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 141.75-45 chr12 31664263 31664502 + 1 NA intron (NM_173802, intron 2 of 3) intron (NM_173802, intron 2 of 3) 4694 NM_001135863 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 265.5-40 chr21 36543154 36543664 + 1 NA promoter-TSS (NM_001146078) promoter-TSS (NM_001146078) -625 NM_001146078 23562 Hs.660278 NM_012130 ENSG00000159261 CLDN14 DFNB29 claudin 14 protein-coding 112.25-150 chr4 43771715 43771982 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -245013 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 190.5-84 chr20 6287910 6288152 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -138701 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 207.5-128 chr9 95910320 95910683 + 1 NA intron (NM_020207, intron 4 of 18) L1MB7|LINE|L1 34493 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 159.5-92 chr2 16017519 16017781 + 1 NA Intergenic Intergenic -32777 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 261.75-26 chr20 50773814 50774410 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -20782 NM_017843 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 167.75-65 chr18 77291522 77291897 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 41861 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 207.25-30 chr17 46991580 46991956 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -12515 NM_203400 388394 Hs.367999 NM_203400 ENSG00000179673 RPRML - reprimo like protein-coding 219.75-23 chr16 7662026 7662436 + 1 NA intron (NM_145893, intron 9 of 13) intron (NM_145893, intron 9 of 13) 329386 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 198.5-151 chr8 118394224 118394595 + 1 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 -226592 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-155 chr5 160166605 160166950 + 1 NA Intergenic Intergenic -20604 NM_001130958 2172 Hs.519719 NM_001445 ENSG00000170231 FABP6 I-15P|I-BABP|I-BALB|I-BAP|ILBP|ILBP3|ILLBP fatty acid binding protein 6 protein-coding 115.5-215 chr6 50884907 50885111 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 66138 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 175.5-15 chr10 50549712 50549929 + 1 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) intron (NM_147156, intron 2 of 10) 74136 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 343.5-23 chr8 24924739 24925167 + 1 NA Intergenic Intergenic 9966 NM_001105541 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 282.5-51 chr5 7255900 7256403 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 13203 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 242.75-43 chr3 102703721 102704020 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 268855 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 167.5-179 chr7 103379723 103379901 + 1 NA intron (NR_135802, intron 13 of 17) intron (NR_135802, intron 13 of 17) 32169 NM_002803 5701 Hs.437366 NM_002803 ENSG00000161057 PSMC2 MSS1|Nbla10058|S7 proteasome 26S subunit, ATPase 2 protein-coding 231.25-16 chr14 58276655 58277049 + 1 NA intron (NR_029435, intron 2 of 3) intron (NR_029435, intron 2 of 3) -11181 NR_146595 55451 NR_146595 ENSG00000279636 LINC00216 C14orf107|NCRNA00216|PRO1617 long intergenic non-protein coding RNA 216 ncRNA 140.5-87 chr17 82494538 82494757 + 1 NA Intergenic Intergenic -25085 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 188.75-116 chr8 100165804 100166163 + 1 NA intron (NM_003114, intron 3 of 18) intron (NM_003114, intron 3 of 18) 7648 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 260.5-39 chr20 57641051 57641468 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -20833 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 163.5-134 chr3 168513049 168513356 + 1 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) -38652 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 157.75-130 chr5 15320172 15320457 + 1 NA Intergenic Intergenic -53754 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 168.5-159 chr6 64350388 64350789 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 543752 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 162.5-143 chr5 101332965 101333177 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -429789 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 194.25-50 chr17 73334274 73334672 + 1 NA TTS (NM_001144952) TTS (NM_001144952) -22472 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 172.25-133 chr7 65423893 65424223 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 50203 NM_152626 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 230.5-78 chr3 43255139 43255496 + 1 NA Intergenic Intergenic -31195 NM_001100594 54861 Hs.476052 NM_017719 ENSG00000163788 SNRK HSNFRK SNF related kinase protein-coding 152.75-164 chrX 84900874 84901072 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -33178 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 164.25-104 chr3 131893454 131893705 + 1 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) L1MA6|LINE|L1 92352 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 231.5-83 chr5 122615804 122616120 + 1 NA Intergenic Intergenic -31362 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 305.25-20 chr18 40090257 40090635 + 1 NA intron (NR_110791, intron 3 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 24160 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 216.5-8 chr10 48739112 48739343 + 1 NA intron (NM_020945, intron 11 of 61) intron (NM_020945, intron 11 of 61) 53764 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 125.75-169 chr7 8534126 8534325 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 100616 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 163.25-58 chr18 30122107 30122334 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -176690 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 178.5-94 chr20 9986298 9986576 + 1 NA non-coding (NR_109861, exon 1 of 2) non-coding (NR_109861, exon 1 of 2) 104 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 171.75-89 chr20 49905884 49906071 + 1 NA exon (NM_001135773, exon 3 of 3) exon (NM_001135773, exon 3 of 3) 7762 NM_001135773 9825 Hs.48513 NM_006038 ENSG00000158480 SPATA2 PD1|PPP1R145|tamo spermatogenesis associated 2 protein-coding 149.5-144 chr4 159765540 159765718 + 1 NA intron (NR_146278, intron 1 of 2) intron (NR_146278, intron 1 of 2) 12155 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 199.5-3 chr1 52501851 52502113 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 4 of 29) L1MB3|LINE|L1 51108 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 267.5-63 chr5 148137061 148137362 + 1 NA 3' UTR (NM_001127698, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_001127698, exon 34 of 34) -31335 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 212.25-36 chr17 6405339 6405774 + 1 NA Intergenic Intergenic 29565 NM_001033054 23746 Hs.279887 NM_014336 ENSG00000129221 AIPL1 AIPL2|LCA4 aryl hydrocarbon receptor interacting protein like 1 protein-coding 195.5-60 chr19 29892211 29892558 + 1 NA Intergenic Intergenic -31273 NM_001252641 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 250.25 chr10 17363365 17363726 + 1 NA intron (NM_001004470, intron 3 of 7) intron (NM_001004470, intron 3 of 7) -23391 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 237.75-22 chr16 20512964 20513333 + 1 NA Intergenic Intergenic 61627 NM_001308954 123876 Hs.298252 NM_001010845 ENSG00000183747 ACSM2A A-923A4.1|ACSM2 acyl-CoA synthetase medium chain family member 2A protein-coding 143.5-18 chr10 15925524 15925783 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -65120 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 125.75-55 chr14 88977325 88977527 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 152775 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 204.5-37 chr14 72454025 72454373 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -62621 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 120.25-198 chr7 41900684 41900853 + 1 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -197678 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 138.75-109 chr22 25145545 25145808 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) AluJr|SINE|Alu -32984 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 285.5-33 chr2 66354663 66355147 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 3423 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 221.25-32 chr16 35452868 35453359 + 1 NA Intergenic Intergenic 27483 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 205.25-29 chr15 47412926 47413266 + 1 NA intron (NM_001198999, intron 2 of 19) intron (NM_001198999, intron 2 of 19) 229007 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 147.5-28 chr10 104627745 104627990 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -13423 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 153.5-123 chr22 28503317 28503606 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 43592 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 189.5-130 chr7 38815739 38816158 + 1 NA intron (NM_014396, intron 7 of 28) MLT2A2|LTR|ERVL 93243 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 180.5-100 chr3 125592153 125592498 + 1 NA intron (NM_022776, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 3172 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 309.5-14 chr13 100057289 100057686 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 31456 NR_132422 105370333 Hs.186291 NR_132422 ENSG00000274605 LOC105370333 - uncharacterized LOC105370333 ncRNA 144.75-37 chr12 7918917 7919194 + 1 NA TTS (NM_006931) TTS (NM_006931) 17132 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 141.25-139 chr5 98500762 98500918 + 1 NA Intergenic Intergenic -267792 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 112.75-80 chr18 47204430 47204631 + 1 NA Intergenic Intergenic -28166 NM_016097 51124 Hs.130917 NM_016097 ENSG00000134049 IER3IP1 HSPC039|MEDS|PRO2309 immediate early response 3 interacting protein 1 protein-coding 167.25-133 chr5 161259603 161259886 + 1 NA Intergenic Intergenic 288380 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 203.5-123 chr6 112703402 112703739 + 1 NA Intergenic Intergenic 356240 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 211.75-104 chr9 103504445 103504765 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -179572 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 179.5-83 chr19 55791040 55791328 + 1 NA intron (NM_001297743, intron 6 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie 22066 NM_001277397 729974 NM_001277397 ENSG00000229292 RFPL4AL1 RNF210B ret finger protein like 4A like 1 protein-coding 185.25-13 chr11 30820258 30820516 + 1 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 172299 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 246.25-44 chr3 42451879 42452278 + 1 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -37221 NM_001251882 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 185.5-31 chr12 14659930 14660180 + 1 NA intron (NM_004963, intron 11 of 26) intron (NM_004963, intron 11 of 26) 36544 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 155.5-219 chr9 87988204 87988409 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13526 NM_001039803 23552 Hs.522274 NM_012119 ENSG00000156345 CDK20 CCRK|CDCH|P42|PNQALRE cyclin dependent kinase 20 protein-coding 189.75-69 chr22 34727334 34727561 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 270469 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 220.25-56 chr4 92773012 92773293 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 468753 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 120.25-25 chr10 45476513 45476769 + 1 NA intron (NM_001282866, intron 3 of 7) L1MA4A|LINE|L1 -23520 NR_120674 102724323 Hs.559151 NR_120674 ENSG00000231964 LOC102724323 - uncharacterized LOC102724323 ncRNA 212.5-60 chr2 220975084 220975447 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 597039 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 311.5-9 chr14 62790094 62790668 + 1 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) L1MA9|LINE|L1 255077 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 162.25-139 chr6 38405273 38405531 + 1 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) -76194 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 148.75-167 chr8 75199107 75199388 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 79234 NR_103848 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 131.5-13 chr1 174954984 174955212 + 1 NA promoter-TSS (NR_121196) promoter-TSS (NR_121196) -837 NR_121196 101928696 Hs.666680 NR_121196 ENSG00000229531 LOC101928696 - uncharacterized LOC101928696 ncRNA 210.5-99 chr5 65986723 65987002 + 1 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -41289 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 190.75-14 chr11 6418206 6418448 + 1 NA intron (NM_145689, intron 1 of 13) L2b|LINE|L2 767 NM_001164 322 Hs.372840 NM_001164 ENSG00000166313 APBB1 FE65|MGC:9072|RIR amyloid beta precursor protein binding family B member 1 protein-coding 305.25-7 chr10 23529374 23529804 + 1 NA Intergenic Intergenic 90320 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 134.5-45 chr12 8991015 8991205 + 1 NA intron (NM_001329102, intron 2 of 5) intron (NM_001329102, intron 2 of 5) 1485 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 214.5-21 chr11 118526100 118526355 + 1 NA 3' UTR (NM_001197104, exon 36 of 36) 3' UTR (NM_001197104, exon 36 of 36) -1206 NM_001346096 143941 Hs.653449 NM_001080441 ENSG00000172425 TTC36 HBP21 tetratricopeptide repeat domain 36 protein-coding 134.5-8 chr1 67579294 67579445 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -105832 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 256.75-30 chr4 83723432 83723720 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 187468 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 220.5-31 chr15 87854726 87855071 + 1 NA Intergenic Intergenic 91370 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 252.5-47 chr20 45158208 45158796 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -16400 NM_002638 5266 Hs.112341 NM_002638 ENSG00000124102 PI3 ESI|SKALP|WAP3|WFDC14|cementoin peptidase inhibitor 3 protein-coding 173.25-6 chr1 114604217 114604474 + 1 NA intron (NM_001256404, intron 11 of 20) intron (NM_001256404, intron 11 of 20) -22730 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 148.5-18 chr1 215078964 215079209 + 1 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) intron (NM_001017424, intron 1 of 6) -3651 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 155.5-101 chr2 150360888 150361060 + 1 NA Intergenic Intergenic -103967 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 192.75-92 chr3 148292777 148293007 + 1 NA intron (NR_146712, intron 2 of 4) intron (NR_146712, intron 2 of 4) 12001 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 128.75-181 chr7 46062272 46062495 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -141111 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 112.5-192 chr5 61131569 61131781 + 1 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) L1ME3G|LINE|L1 -30641 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 168.75-35 chr12 61719419 61719795 + 1 NA intron (NM_178539, intron 4 of 4) LTR8A|LTR|ERV1 473232 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 210.75-23 chr14 21029270 21029548 + 1 NA promoter-TSS (NM_173846) promoter-TSS (NM_173846) -808 NM_173846 122664 Hs.406966 NM_173846 ENSG00000179636 TPPP2 C14orf8|CT152|P18|p25beta tubulin polymerization promoting protein family member 2 protein-coding 128.25-63 chr16 55662038 55662231 + 1 NA intron (NM_001172504, intron 1 of 13) intron (NM_001172504, intron 1 of 13) 5490 NM_001172504 6530 Hs.78036 NM_001043 ENSG00000103546 SLC6A2 NAT1|NET|NET1|SLC6A5 solute carrier family 6 member 2 protein-coding 207.25-77 chr5 144142107 144142526 + 1 NA Intergenic Intergenic 28343 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 331.5-26 chr8 86892329 86892836 + 1 NA intron (NM_173538, intron 2 of 10) intron (NM_173538, intron 2 of 10) 26167 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 132.25-78 chr17 65607138 65607454 + 1 NA Intergenic Intergenic -45648 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 162.75-5 chr1 118782232 118782630 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 205912 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 152.5-89 chr2 107113768 107114066 + 1 NA Intergenic Intergenic -226808 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 122.5-197 chr6 46397759 46397939 + 1 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) -71957 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 225.25-16 chr12 31406106 31406732 + 1 NA intron (NM_144973, intron 14 of 20) intron (NM_144973, intron 14 of 20) -37118 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 168.75-96 chr3 139556894 139557178 + 1 NA intron (NR_121609, intron 3 of 4) MER68B|LTR|ERVL -17294 NM_001130992 5947 Hs.529571 NM_002899 ENSG00000114115 RBP1 CRABP-I|CRBP|CRBP1|CRBPI|RBPC retinol binding protein 1 protein-coding 177.5-128 chr4 70305214 70305590 + 1 NA Intergenic Intergenic -29579 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 185.25-49 chr18 947860 948080 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -19977 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 124.75-99 chr17 78000883 78001111 + 1 NA Intergenic Intergenic -3240 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 144.25-202 chr8 102936452 102936630 + 1 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) intron (NR_126339, intron 2 of 2) 72270 NR_126339 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 131.25-39 chr12 29985457 29985672 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -200805 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 124.75-46 chr11 77519030 77519225 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -45064 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 254.5-38 chr2 122530574 122530996 + 1 NA Intergenic Intergenic 542696 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 162.75-75 chr2 164205605 164205782 + 1 NA Intergenic Intergenic 362802 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 188.75-42 chr17 52397426 52397746 + 1 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) L1MB2|LINE|L1 7064 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 251.75-23 chr14 48785462 48785913 + 1 NA Intergenic Intergenic 800693 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 230.25-17 chr11 82796513 82796828 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -62806 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 125.5-157 chr22 17696783 17697021 + 1 NA intron (NM_001270727, intron 4 of 4) intron (NM_001270727, intron 4 of 4) -9756 NM_001270733 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 370.75-8 chr4 111463263 111463758 + 1 NA Intergenic Intergenic -602863 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 149.25-167 chr7 49061739 49062161 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 137403 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 162.5-152 chr6 52990250 52990588 + 1 NA intron (NM_001512, intron 2 of 6) intron (NM_001512, intron 2 of 6) 4865 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 145.5-19 chr10 16765940 16766198 + 1 NA intron (NM_152724, intron 2 of 7) intron (NM_152724, intron 2 of 7) 51355 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 384.25-14 chr5 100982227 100983071 + 1 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -79367 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 178.5-7 chr1 201867370 201867594 + 1 NA intron (NM_018085, intron 15 of 23) L1ME4a|LINE|L1 4109 NR_106797 102466724 NR_106797 ENSG00000277681 MIR6739 hsa-mir-6739 microRNA 6739 ncRNA 112.75-93 chr2 82146377 82146511 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -679498 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 170.25-55 chr16 82472478 82472757 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -154352 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 125.5-125 chr2 67118972 67119151 + 1 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 32615 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 193.75-29 chr11 97697704 97697989 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 1189421 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 166.25-87 chr2 205979441 205979882 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 106513 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 249.5-59 chr21 20109701 20110064 + 1 NA Intergenic Intergenic 148803 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 219.75-25 chr16 73861674 73862078 + 1 NA Intergenic Intergenic 353645 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 256.5-11 chr10 105302284 105302691 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 517846 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 195.5-37 chr14 54250041 54250248 + 1 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -146724 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 113.5-116 chr2 29813269 29813473 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 108215 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 143.75-83 chr2 39388328 39388536 + 1 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) L1MEd|LINE|L1 48853 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 180.25-62 chr20 34989367 34989571 + 1 NA promoter-TSS (NR_030223) promoter-TSS (NR_030223) -907 NR_030223 574501 NR_030223 ENSG00000207635 MIR499A MIR499|MIRN499|hsa-mir-499a|mir-499a microRNA 499a ncRNA 129.5-197 chr6 35834213 35834373 + 1 NA non-coding (NR_034069, exon 16 of 16) non-coding (NR_034069, exon 16 of 16) 28941 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 270.5-7 chr10 20174985 20175390 + 1 NA intron (NM_032812, intron 7 of 13) MIR|SINE|MIR 358755 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 201.25-6 chr1 85266582 85267092 + 1 NA 3' UTR (NM_003921, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_003921, exon 3 of 3) -7175 NM_198077 148423 Hs.26226 NM_198077 ENSG00000162642 C1orf52 gm117 chromosome 1 open reading frame 52 protein-coding 196.5-141 chr6 61925152 61925361 + 1 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) intron (NR_146874, intron 4 of 13) 351126 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 186.75-122 chr9 125285191 125285405 + 1 NA intron (NR_148733, intron 2 of 26) intron (NR_148733, intron 2 of 26) 23472 NM_001354294 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 216.5-7 chr10 26106469 26106734 + 1 NA intron (NM_017433, intron 17 of 34) L1ME3G|LINE|L1 -109706 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 234.75-60 chr4 188638032 188638556 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -138363 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 135.5-163 chr5 84323582 84323910 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 61121 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 113.5-55 chr12 26402761 26403069 + 1 NA intron (NM_002223, intron 52 of 56) L2c|LINE|L2 207342 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 238.75-22 chr15 81285597 81285944 + 1 NA exon (NM_001172128, exon 10 of 19) exon (NM_001172128, exon 10 of 19) -11200 NM_004513 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 138.5-118 chr20 62176625 62176832 + 1 NA intron (NR_125980, intron 11 of 12) AluSx|SINE|Alu -6297 NM_015666 26164 Hs.340636 NM_015666 ENSG00000101181 MTG2 GTPBP5|ObgH1|dJ1005F21.2 mitochondrial ribosome associated GTPase 2 protein-coding 145.5-203 chrX 100460778 100460967 + 1 NA Intergenic Intergenic -50599 NM_001105243 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 286.5-74 chrX 87591328 87591765 + 1 NA intron (NM_057162, intron 1 of 10) L1MA5|LINE|L1 73744 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 140.25-68 chr17 29728191 29728467 + 1 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) L1MA3|LINE|L1 33103 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 115.5-172 chr3 119457571 119457723 + 1 NA intron (NM_018266, intron 3 of 8) intron (NM_018266, intron 3 of 8) 5968 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 246.75-59 chr6 42673247 42673531 + 1 NA intron (NM_015255, intron 36 of 46) AluSx|SINE|Alu 49208 NM_000322 5961 Hs.654489 NM_000322 ENSG00000112619 PRPH2 AOFMD|AVMD|CACD2|DS|MDBS1|PRPH|RDS|RP7|TSPAN22|rd2 peripherin 2 protein-coding 159.75-80 chr2 86033007 86033328 + 1 NA intron (NM_015425, intron 28 of 33) intron (NM_015425, intron 28 of 33) 72719 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 142.25-132 chr5 18451463 18451773 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 644344 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 180.5-18 chr11 86845345 86845694 + 1 NA intron (NR_120592, intron 2 of 2) intron (NR_120592, intron 2 of 2) 12435 NR_045004 8587 Hs.741959 NR_045004 ENSG00000255203 OR7E2P OR11-6|OR7E143P|OR7E51P|OR7E52P|OR7F2P|OST245|hg94 olfactory receptor family 7 subfamily E member 2 pseudogene pseudo 236.75-14 chr11 77992984 77993479 + 1 NA intron (NM_033547, intron 1 of 22) L2c|LINE|L2 1437 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 115.75-154 chr4 74191468 74191687 + 1 NA intron (NM_001351314, intron 5 of 9) AluSx3|SINE|Alu 33459 NM_001351331 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 145.5-84 chr18 58464818 58465054 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13784 NR_039899 100616357 NR_039899 ENSG00000207778 MIR3591 - microRNA 3591 ncRNA 151.75-28 chr11 12041825 12042052 + 1 NA intron (NR_135109, intron 1 of 1) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 11063 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 230.5-87 chr4 67951153 67951559 + 1 NA intron (NM_001114387, intron 1 of 9) intron (NM_001114387, intron 1 of 9) 12137 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 443.75-2 chr20 56362262 56362930 + 1 NA intron (NM_080821, intron 1 of 2) intron (NM_080821, intron 1 of 2) 3622 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 136.75-163 chr5 144804028 144804258 + 1 NA Intergenic Intergenic 598752 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 205.25-53 chr2 99584037 99584459 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 15 of 23) AluSz|SINE|Alu -94231 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 133.75-168 chr6 47935060 47935211 + 1 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 133554 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 112.25-151 chr4 60065782 60066035 + 1 NA Intergenic Intergenic -856711 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 354.75-11 chr3 15336942 15337347 + 1 NA intron (NM_001018009, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 4236 NM_001018009 9467 Hs.257761 NM_004844 ENSG00000131370 SH3BP5 SAB|SH3BP-5 SH3 domain binding protein 5 protein-coding 147.75-22 chr11 41439048 41439400 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L1PB4|LINE|L1 20412 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 201.5-77 chr2 223747786 223748003 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 89688 NR_110905 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 166.25-28 chr10 116526288 116526487 + 1 NA Intergenic Intergenic -19544 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 272.5-50 chr3 142595481 142595990 + 1 NA promoter-TSS (NM_001145319) promoter-TSS (NM_001145319) -658 NM_001145319 5357 Hs.203637 NM_002670 ENSG00000120756 PLS1 - plastin 1 protein-coding 177.5-129 chr4 92577060 92577297 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 272779 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 151.25-26 chr11 3889923 3890143 + 1 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) intron (NM_001277962, intron 1 of 12) 33971 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 139.75-168 chr7 86382288 86382589 + 1 NA Intergenic Intergenic -261471 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 211.5-28 chr11 81947968 81948325 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MC4|LINE|L1 -57310 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 160.5-179 chr7 148152204 148152554 + 1 NA intron (NM_014141, intron 16 of 22) LTR8B|LTR|ERV1 -438387 NM_145304 202865 Hs.352212 NM_145304 ENSG00000170279 C7orf33 - chromosome 7 open reading frame 33 protein-coding 207.75-14 chr10 44350159 44350584 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 34726 NM_000609 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 199.5-40 chr14 55071895 55072135 + 1 NA Intergenic Intergenic 20368 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 166.5-192 chr7 70220315 70220598 + 1 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) L2a|LINE|L2 621981 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 183.75-70 chr3 41082171 41082576 + 1 NA Intergenic Intergenic -117132 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 188.25-33 chr13 66856785 66857014 + 1 NA intron (NR_046527, intron 1 of 5) intron (NR_046527, intron 1 of 5) 31730 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 206.5-18 chr12 103300790 103301165 + 1 NA TTS (NM_001278420) TTS (NM_001278420) 149135 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 135.5-28 chr10 114131743 114131926 + 1 NA intron (NM_001321829, intron 12 of 16) intron (NM_001321829, intron 12 of 16) 42345 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 243.25-2 chr1 240908354 240908634 + 1 NA intron (NM_001282773, intron 4 of 15) (ATGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -223778 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 167.75-57 chr17 62865395 62865796 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 57093 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 190.25-73 chr20 16990402 16990724 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -235544 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 166.5-160 chr5 43654440 43654613 + 1 NA intron (NM_012343, intron 14 of 21) MER63C|DNA|hAT-Blackjack -51296 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 179.5-116 chr22 48604527 48604727 + 1 NA intron (NM_015381, intron 1 of 3) intron (NM_015381, intron 1 of 3) 28287 NM_015381 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 169.5-176 chr8 121604671 121604934 + 1 NA Intergenic Intergenic -34544 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 154.75-158 chr9 121012354 121012680 + 1 NA intron (NM_001735, intron 17 of 40) AluSq2|SINE|Alu 37758 NM_001317164 727 Hs.494997 NM_001735 ENSG00000106804 C5 C5D|C5a|C5b|CPAMD4|ECLZB complement C5 protein-coding 270.5-68 chr9 27547250 27547743 + 1 NA 3' UTR (NM_018325, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_018325, exon 11 of 11) -17682 NM_024761 79817 Hs.369022 NM_024761 ENSG00000120162 MOB3B C9orf35|MOB1D|MOBKL2B MOB kinase activator 3B protein-coding 182.75-76 chr20 41017087 41017293 + 1 NA intron (NR_145525, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -11632 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 258.25-56 chr7 82930424 82930795 + 1 NA intron (NM_033026, intron 6 of 24) intron (NM_033026, intron 6 of 24) 232275 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 146.75-69 chr18 76904803 76905008 + 1 NA intron (NM_001306089, intron 12 of 30) MIRc|SINE|MIR 80745 NM_007345 7776 Hs.719137 NM_007345 ENSG00000130856 ZNF236 ZNF236A|ZNF236B zinc finger protein 236 protein-coding 165.5-27 chr11 86077077 86077505 + 1 NA Intergenic Intergenic -7431 NM_001206947 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 315.5-29 chrX 127641340 127641856 + 1 NA Intergenic Intergenic 410805 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 218.5-11 chr1 106918855 106919102 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie 100739 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 221.75-66 chr6 57303006 57303254 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -11675 NM_001282488 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 228.5-79 chr4 83427582 83427836 + 1 NA exon (NM_133636, exon 13 of 18) exon (NM_133636, exon 13 of 18) 28114 NM_133636 113510 Hs.480101 NM_133636 ENSG00000163312 HELQ HEL308 helicase, POLQ like protein-coding 190.25-27 chr12 71239603 71239826 + 1 NA Intergenic Intergenic -81715 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 223.5-96 chr5 45609678 45610016 + 1 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 86533 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 246.75-4 chr1 75791899 75792370 + 1 NA intron (NM_004582, intron 6 of 8) intron (NM_004582, intron 6 of 8) 2657 NR_002748 26804 NR_002748 ENSG00000201487 SNORD45B RNU45B|U45b small nucleolar RNA, C/D box 45B snoRNA 119.5-120 chr2 57115174 57115403 + 1 NA Intergenic Intergenic -792363 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 212.25-22 chr12 102930002 102930325 + 1 NA intron (NM_001354304, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR -12919 NM_000277 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 156.5-143 chr5 16028687 16028866 + 1 NA Intergenic Intergenic 93594 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 170.75-16 chr10 82257084 82257514 + 1 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -24379 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 202.75-18 chr11 62148887 62149182 + 1 NA intron (NM_001040694, intron 17 of 18) intron (NM_001040694, intron 17 of 18) 25023 NM_001040694 3619 Hs.142179 NM_020238 ENSG00000149503 INCENP - inner centromere protein protein-coding 171.25-17 chr10 81674319 81674620 + 1 NA Intergenic Intergenic -200725 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 160.5-147 chr5 16061980 16062181 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 117711 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 174.75-140 chr9 91921090 91921356 + 1 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) intron (NM_001318204, intron 1 of 7) 29005 NM_001318204 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 189.75-103 chr6 121960603 121961036 + 1 NA Intergenic Intergenic -438732 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 138.5-151 chr5 9145063 9145252 + 1 NA intron (NM_003966, intron 12 of 22) intron (NM_003966, intron 12 of 22) -91262 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 138.5-142 chr4 3800152 3800375 + 1 NA Intergenic Intergenic 33878 NM_000683 152 Hs.123022 NM_000683 ENSG00000184160 ADRA2C ADRA2L2|ADRA2RL2|ADRARL2|ALPHA2CAR adrenoceptor alpha 2C protein-coding 159.75-12 chr10 6803976 6804149 + 1 NA intron (NR_038291, intron 2 of 4) intron (NR_038291, intron 2 of 4) 24464 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 233.5-4 chr1 59087726 59088166 + 1 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) intron (NR_110626, intron 2 of 2) 58861 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 155.25-184 chr9 14626296 14626580 + 1 NA intron (NR_148717, intron 9 of 11) intron (NR_148717, intron 9 of 11) 66994 NM_178566 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 240.5-6 chr10 25665741 25666188 + 1 NA intron (NR_108067, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 14252 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 129.75-23 chr10 34150975 34151262 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -378438 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 269.25-23 chr2 49944038 49944496 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) 29936 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 175.5-112 chr3 4317949 4318211 + 1 NA TTS (NM_006515) TTS (NM_006515) 14776 NM_001276325 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 248.5-83 chr5 96055576 96056273 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) -23214 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 136.5-122 chr2 181176427 181176629 + 1 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 52691 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 281.5-39 chr4 110300992 110301464 + 1 NA Intergenic Intergenic -102613 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 142.25-135 chr5 40406422 40406613 + 1 NA Intergenic Intergenic -273398 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 143.75-85 chr2 45238661 45238927 + 1 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) intron (NR_033831, intron 1 of 5) 16147 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 212.25-27 chr14 72781229 72781700 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 111185 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 202.5-78 chr2 126844198 126844486 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -54548 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 186.25-96 chr5 159287418 159287784 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 24311 NM_145049 134510 Hs.591733 NM_145049 ENSG00000164332 UBLCP1 CPUB1 ubiquitin like domain containing CTD phosphatase 1 protein-coding 128.75-110 chr20 41948308 41948491 + 1 NA Intergenic Intergenic -330022 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 271.75-15 chr17 44030348 44030885 + 1 NA Intergenic Intergenic -7465 NM_001304813 84336 Hs.514211 NM_032376 ENSG00000091947 TMEM101 - transmembrane protein 101 protein-coding 173.5-94 chr3 12894958 12895157 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9846 NR_136189 105376955 Hs.561179 NR_136189 ENSG00000232746 LINC02022 - long intergenic non-protein coding RNA 2022 ncRNA 190.5-169 chrX 42198425 42198704 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -275010 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 118.25-12 chr1 101104519 101104694 + 1 NA Intergenic Intergenic 78760 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 165.5-123 chr4 36740876 36741174 + 1 NA Intergenic Intergenic -99125 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 152.75-120 chr4 90635014 90635206 + 1 NA intron (NM_207491, intron 6 of 7) L1M5|LINE|L1 400079 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 279.5-35 chr21 40963529 40964097 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -116655 NR_073202 1826 Hs.160418 NM_001389 ENSG00000171587 DSCAM CHD2|CHD2-42|CHD2-52 DS cell adhesion molecule protein-coding 140.25-39 chr12 100511039 100511290 + 1 NA intron (NM_001206978, intron 4 of 9) intron (NM_001206978, intron 4 of 9) 7804 NM_001206993 9971 Hs.282735 NM_005123 ENSG00000012504 NR1H4 BAR|FXR|HRR-1|HRR1|PFIC5|RIP14 nuclear receptor subfamily 1 group H member 4 protein-coding 123.5-130 chr3 40200212 40200387 + 1 NA intron (NM_001284424, intron 10 of 15) MER30|DNA|hAT-Charlie 100288 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 159.75-33 chr12 103147307 103147594 + 1 NA Intergenic Intergenic -4392 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 276.5-44 chr3 107537699 107538140 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) intron (NM_001276286, intron 2 of 16) 14957 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 136.5-9 chr1 98575368 98575572 + 1 NA Intergenic Intergenic -86251 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 155.75-56 chr15 65078035 65078340 + 1 NA exon (NM_001101362, exon 1 of 1) exon (NM_001101362, exon 1 of 1) 1371 NM_001101362 390594 Hs.586890 NM_001101362 ENSG00000234438 KBTBD13 HCG1645727|NEM6 kelch repeat and BTB domain containing 13 protein-coding 125.5-140 chr2 220949189 220949362 + 1 NA Intergenic Intergenic 623029 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 206.75-32 chr19 20154176 20154435 + 1 NA Intergenic LTR3B|LTR|ERVK -12909 NM_052852 90649 Hs.590991 NM_052852 ENSG00000256229 ZNF486 KRBO2 zinc finger protein 486 protein-coding 123.75-186 chr8 84085788 84086099 + 1 NA Intergenic Intergenic -96844 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 112.5-135 chr2 188771896 188772026 + 1 NA intron (NR_161166, intron 1 of 1) ERVL-E-int|LTR|ERVL 18162 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 317.75-14 chr15 68933436 68933895 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 3140 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 137.5-109 chr2 13064028 13064276 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -57139 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 116.5-3 chr1 18290428 18290609 + 1 NA intron (NM_032880, intron 2 of 9) intron (NM_032880, intron 2 of 9) 182720 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 155.25-64 chr14 74358405 74358781 + 1 NA exon (NM_018228, exon 2 of 2) exon (NM_018228, exon 2 of 2) 10122 NM_018228 55237 Hs.578167 NM_018228 ENSG00000133980 VRTN C14orf115|vertnin vertebrae development associated protein-coding 267.25-16 chr17 39892061 39892464 + 1 NA Intergenic Intergenic 24060 NM_198844 124626 Hs.367245 NM_198844 ENSG00000186075 ZPBP2 ZPBPL zona pellucida binding protein 2 protein-coding 266.25-29 chr20 54495541 54496043 + 1 NA TTS (NM_001294161) TTS (NM_001294161) 20199 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 118.5-67 chr16 65970172 65970420 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -393996 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 192.75-77 chr22 26820632 26820866 + 1 NA Intergenic Intergenic -39462 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 112.5-227 chr7 140127619 140127792 + 1 NA intron (NM_030647, intron 4 of 19) intron (NM_030647, intron 4 of 19) 49278 NM_030647 80853 Hs.308710 NM_030647 ENSG00000006459 KDM7A JHDM1D lysine demethylase 7A protein-coding 145.25-109 chr4 17093406 17093686 + 1 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 92511 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 134.5-215 chr8 43142825 43143021 + 1 NA intron (NM_152419, intron 1 of 17) intron (NM_152419, intron 1 of 17) 2459 NM_001363229 138050 Hs.600384 NM_152419 ENSG00000165102 HGSNAT HGNAT|MPS3C|RP73|TMEM76 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase protein-coding 240.5-100 chr7 55232274 55232750 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 23123 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 214.5-105 chr5 112804333 112804743 + 1 NA intron (NM_001354895, intron 8 of 15) AluSc|SINE|Alu -56650 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 126.75-8 chr1 118445781 118446049 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -260687 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 142.5-5 chr1 34912543 34912822 + 1 NA intron (NM_001080418, intron 1 of 11) intron (NM_001080418, intron 1 of 11) 16968 NM_001080418 58512 Hs.436393 NM_001080418 ENSG00000116544 DLGAP3 DAP3|SAPAP3 DLG associated protein 3 protein-coding 231.75-35 chr2 44671161 44671594 + 1 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 267511 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 143.25-143 chr5 63014194 63014433 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 435494 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 164.25-101 chr3 96516111 96516364 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 156273 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 301.5-6 chr1 219624988 219625485 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -12091 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 172.75-113 chr7 333271 333551 + 1 NA Intergenic Intergenic -46014 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 123.25-23 chr10 64383913 64384052 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -441546 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 217.25-68 chr5 109710016 109710365 + 1 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 20824 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 127.25-157 chr5 22425498 22425650 + 1 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -211724 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 350.25-16 chr2 46629146 46629646 + 1 NA 3' UTR (NM_014171, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014171, exon 5 of 5) 12181 NM_014171 9419 Hs.133998 NM_014171 ENSG00000119878 CRIPT HSPC139|SSMDF CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain protein-coding 253.25-32 chr2 138115892 138116316 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 14220 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 163.75-43 chr14 23470468 23470757 + 1 NA intron (NM_001042635, intron 2 of 10) intron (NM_001042635, intron 2 of 10) 909 NM_001042635 25983 Hs.9043 NM_015514 ENSG00000129460 NGDN C14orf120|CANu1|LCP5|NGD|lpd-2 neuroguidin protein-coding 168.75-84 chr20 50594197 50594592 + 1 NA intron (NM_001290268, intron 17 of 21) intron (NM_001290268, intron 17 of 21) 8608 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 118.75-20 chr10 32193797 32193976 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -137461 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 196.25-80 chr3 14298376 14298693 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 54034 NR_110135 101927565 Hs.306905 NR_110135 ENSG00000251576 LINC01267 - long intergenic non-protein coding RNA 1267 ncRNA 203.75-89 chr5 116668249 116668597 + 1 NA Intergenic Intergenic -93600 NM_020796 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 163.25-16 chr10 78964350 78964613 + 1 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR 102967 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 177.5-138 chr5 44542088 44542393 + 1 NA Intergenic Intergenic -31958 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 157.75-131 chr5 15341176 15341431 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -74743 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 261.25-49 chr8 53277193 53277565 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -25682 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 118.25-140 chr4 70405003 70405154 + 1 NA intron (NM_001302807, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 7138 NM_001302807 58503 Hs.661425 NM_021225 ENSG00000171199 OPRPN BPLP|PRL1|PROL1|opiorphin opiorphin prepropeptide protein-coding 140.25-196 chr9 90116584 90116862 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -75224 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 154.75-8 chr1 239076245 239076522 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -310185 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 159.5-38 chr11 111453374 111453643 + 1 NA Intergenic Intergenic -35322 NR_046085 100132078 Hs.672662 NR_046085 ENSG00000255428 LOC100132078 - uncharacterized LOC100132078 ncRNA 285.75-23 chr2 134985130 134985747 + 1 NA intron (NM_001018047, intron 6 of 8) intron (NM_001018047, intron 6 of 8) 38211 NM_001321177 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 215.5-82 chr4 161052041 161052256 + 1 NA Intergenic Intergenic -970585 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 210.5-131 chr8 86252708 86253078 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22512 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 174.25-92 chr22 25216054 25216270 + 1 NA Intergenic Intergenic -3477 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 205.5-103 chr4 23866688 23866985 + 1 NA intron (NM_001330752, intron 3 of 13) intron (NM_001330752, intron 3 of 13) 14456 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 233.25-31 chr17 27438951 27439259 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17343 NM_001367810 8844 Hs.133534 NM_014238 ENSG00000141068 KSR1 KSR|RSU2 kinase suppressor of ras 1 protein-coding 165.5-177 chr7 33454424 33454716 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 325006 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 119.25-33 chr11 24476118 24476366 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -20811 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 112.5-206 chr6 38601046 38601239 + 1 NA intron (NM_001099272, intron 1 of 10) MER5B|DNA|hAT-Charlie -5075 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 195.25-87 chr7 127558634 127558897 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 26831 NM_024523 79571 Hs.521168 NM_024523 ENSG00000179562 GCC1 GCC1P|GCC88 GRIP and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 214.75-56 chr3 162500003 162500320 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 803140 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 112.5-167 chr3 47665571 47665754 + 1 NA intron (NM_003074, intron 19 of 27) intron (NM_003074, intron 19 of 27) -3968 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 248.75-46 chr4 42806538 42806994 + 1 NA Intergenic Intergenic -86500 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 230.5-59 chr18 56766309 56766682 + 1 NA intron (NM_052834, intron 16 of 26) L1MEc|LINE|L1 115110 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 352.5-8 chr2 58760129 58760724 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 239673 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 206.5-97 chr5 64200175 64200483 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 34486 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 209.5-36 chr13 74485417 74485692 + 1 NA Intergenic Intergenic 66381 NR_047005 100874151 Hs.564552 NR_047005 ENSG00000226240 LINC00381 - long intergenic non-protein coding RNA 381 ncRNA 346.75-13 chr7 6431548 6432160 + 1 NA intron (NM_139179, intron 5 of 14) intron (NM_139179, intron 5 of 14) 16100 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 171.5-156 chr8 122133420 122133696 + 1 NA Intergenic Intergenic 435086 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 181.75-84 chr3 124567992 124568275 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 34 of 59) L1MB3|LINE|L1 -16525 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 132.5-185 chr4 128493447 128493586 + 1 NA intron (NR_125882, intron 6 of 8) intron (NR_125882, intron 6 of 8) 65500 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 240.25-73 chr9 96854321 96854652 + 1 NA promoter-TSS (NM_001346991) promoter-TSS (NM_001346991) 28 NM_001346995 158431 Hs.30567 NM_001001662 ENSG00000196597 ZNF782 - zinc finger protein 782 protein-coding 181.25-59 chr2 27834034 27834345 + 1 NA intron (NM_022128, intron 5 of 7) intron (NM_022128, intron 5 of 7) -54520 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 124.5-105 chr2 74308655 74308849 + 1 NA intron (NM_133478, intron 6 of 30) L1MC2|LINE|L1 6273 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 147.25-70 chr20 15110933 15111398 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) AluSx1|SINE|Alu -85675 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 264.25-55 chr9 12936932 12937268 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 35533 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 226.5-6 chr1 212567460 212567810 + 1 NA intron (NM_001030287, intron 1 of 3) intron (NM_001030287, intron 1 of 3) 2301 NM_001030287 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 271.5-89 chr8 121464130 121464600 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -174981 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 293.75-8 chr12 73307257 73307775 + 1 NA Intergenic Intergenic 148326 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 249.75-55 chr5 44964525 44965041 + 1 NA Intergenic Intergenic 155836 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 214.5-71 chr21 23051097 23051516 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -27978 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 172.5-65 chr14 52528602 52528886 + 1 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) intron (NM_020784, intron 6 of 20) 23761 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 215.25-37 chr17 58960746 58961090 + 1 NA intron (NR_048561, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 145962 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 125.75-170 chr7 8913780 8914071 + 1 NA Intergenic Intergenic 480316 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 185.5-172 chrX 73017717 73018013 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 14352 NM_001042506 645974 Hs.567854 NM_001042506 ENSG00000184388 PABPC1L2B RBM32B poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like 2B protein-coding 316.75-20 chr8 78919243 78919669 + 1 NA Intergenic Intergenic 81927 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 145.5-96 chr2 53476942 53477132 + 1 NA Intergenic Intergenic -290746 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 195.5-73 chr2 104385436 104385800 + 1 NA intron (NR_037885, intron 2 of 2) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 22714 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 256.25-41 chr6 47749618 47750128 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -32166 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 199.75-31 chr14_GL000225v1_random 130304 130612 + 1 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 146.25-93 chr22 26467708 26467882 + 1 NA intron (NR_146315, intron 8 of 14) L1ME4a|LINE|L1 11693 NR_073136 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 119.75-50 chr13 34619774 34619940 + 1 NA intron (NR_047036, intron 1 of 2) intron (NR_047036, intron 1 of 2) 20828 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 247.25-45 chr4 37574499 37574997 + 1 NA intron (NM_001104629, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 -9485 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 193.5-78 chr2 9464733 9465024 + 1 NA intron (NM_016207, intron 15 of 17) AluJb|SINE|Alu -9673 NM_001320860 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 217.25-42 chr2 108321840 108322141 + 1 NA promoter-TSS (NR_037191) promoter-TSS (NR_037191) -248 NR_037191 151234 Hs.447681 NR_037191 ENSG00000237223 SULT1C2P1 SULT1C1P sulfotransferase family 1C member 2 pseudogene 1 pseudo 233.5-75 chr4 53693433 53693698 + 1 NA Intergenic Intergenic -2336 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 168.5-72 chr18 63888966 63889144 + 1 NA intron (NM_002575, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 1350 NM_002575 5055 Hs.594481 NM_002575 ENSG00000197632 SERPINB2 HsT1201|PAI|PAI-2|PAI2|PLANH2 serpin family B member 2 protein-coding 166.25-118 chr5 12321738 12322009 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -252984 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 209.75-32 chr15 57121624 57122034 + 1 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -97601 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 202.5-121 chr5 121417950 121418344 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 95597 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 116.25-74 chr15 25835160 25835302 + 1 NA intron (NM_024490, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu 13594 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 191.25-34 chr14 70711002 70711229 + 1 NA intron (NR_125769, intron 3 of 3) MIR3|SINE|MIR 12417 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 131.5-224 chr7 113886729 113886926 + 1 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 32182 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 210.5-68 chr2 153191230 153191627 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 287334 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 182.5-162 chr8 84483194 84483395 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 67810 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 187.75-74 chr3 173929326 173929592 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -8663 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 219.25-68 chr6 110401767 110402057 + 1 NA intron (NR_160546, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 13663 NR_160546 8528 Hs.591348 NM_003649 ENSG00000203797 DDO DASOX|DDO-1|DDO-2 D-aspartate oxidase protein-coding 154.5-168 chr7 8344359 8344567 + 1 NA Intergenic Intergenic -81851 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 122.5-170 chr4 115090668 115090868 + 1 NA intron (NM_022569, intron 1 of 13) intron (NM_022569, intron 1 of 13) 22852 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 269.25-38 chr5 56865129 56865462 + 1 NA intron (NM_005921, intron 4 of 19) intron (NM_005921, intron 4 of 19) -43965 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 218.75-22 chr13 80869500 80869764 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -148759 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 168.5-89 chr2 135211776 135211971 + 1 NA intron (NM_001286569, intron 18 of 21) L1ME4b|LINE|L1 75245 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 248.25-65 chr7 39236905 39237343 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 92010 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 159.5-26 chr10 117300694 117300935 + 1 NA intron (NM_173791, intron 3 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 59700 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 136.5-12 chr1 176424175 176424350 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -38913 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 117.75-223 chr9 83032345 83032590 + 1 NA intron (NM_152573, intron 1 of 16) intron (NM_152573, intron 1 of 16) 30675 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 177.25-95 chr3 102982305 102982551 + 1 NA Intergenic Intergenic 541688 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 158.5-130 chr3 54748057 54748425 + 1 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) intron (NM_018398, intron 11 of 37) -108384 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 175.5-75 chr17 47908285 47908563 + 1 NA intron (NR_103856, intron 2 of 2) intron (NR_103856, intron 2 of 2) 12188 NM_003110 6668 Hs.514276 NM_003110 ENSG00000167182 SP2 - Sp2 transcription factor protein-coding 189.75-53 chr18 63212492 63212709 + 1 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) AluSx3|SINE|Alu 106780 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 221.5-40 chr2 21158548 21158788 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 34682 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 144.5-178 chr5 120340565 120340758 + 1 NA Intergenic Intergenic -123617 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 239.5-90 chrX 134718626 134718920 + 1 NA intron (NM_001316887, intron 2 of 3) intron (NM_001316887, intron 2 of 3) 14863 NM_001316888 10761 Hs.496811 NM_021796 ENSG00000170965 PLAC1 CT92|OOSP2B|OOSP2L placenta enriched 1 protein-coding 115.5-79 chr15 67121803 67121982 + 1 NA intron (NM_005902, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR -3824 NM_001145102 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 173.5-69 chr2 75862309 75862573 + 1 NA Intergenic Intergenic -151526 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 129.5-166 chr4 20531964 20532203 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 16 of 35) intron (NM_001289135, intron 16 of 35) 3808 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 196.25-30 chr13 80668361 80668602 + 1 NA Intergenic Intergenic -327355 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 245.5-59 chr5 93909677 93909941 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -168209 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 160.75-105 chr3 167722836 167723001 + 1 NA intron (NM_145860, intron 1 of 7) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 11924 NM_145860 11235 Hs.478150 NM_007217 ENSG00000114209 PDCD10 CCM3|TFAR15 programmed cell death 10 protein-coding 250.75-5 chr11 5750723 5751006 + 1 NA Intergenic Intergenic -3829 NM_001005175 390072 Hs.553735 NM_001005175 ENSG00000181074 OR52N4 OR11-64 olfactory receptor family 52 subfamily N member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 339.75 chr1 87772170 87772709 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -400784 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 140.75-35 chr12 22940979 22941187 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -234553 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 187.75-121 chr9 32846965 32847347 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 63616 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 200.75-50 chr2 42752553 42752834 + 1 NA intron (NM_001330443, intron 16 of 16) intron (NM_001330443, intron 16 of 16) 11568 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 215.5-50 chr2 78989018 78989384 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -36501 NM_001270040 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 201.5-130 chr8 123985688 123986019 + 1 NA intron (NR_040044, intron 5 of 5) intron (NR_040044, intron 5 of 5) 54929 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 242.5-47 chr2 115412248 115412689 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 68653 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155.5-125 chr3 45963677 45963884 + 1 NA intron (NM_024513, intron 10 of 17) intron (NM_024513, intron 10 of 17) 20316 NM_006564 10663 Hs.34526 NM_006564 ENSG00000172215 CXCR6 BONZO|CD186|STRL33|TYMSTR C-X-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 133.25-50 chr13 102279607 102279914 + 1 NA intron (NM_001321940, intron 1 of 5) intron (NM_001321940, intron 1 of 5) 30926 NM_001321932 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 206.75-55 chr3 106230790 106231189 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -361588 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 237.75-39 chr2 105724375 105724817 + 1 NA Intergenic Intergenic -20316 NM_003581 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 160.5-183 chr8 59178230 59178523 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 59166 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 205.5-73 chr2 97801175 97801408 + 1 NA intron (NM_015348, intron 25 of 40) intron (NM_015348, intron 25 of 40) 66885 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 119.5-130 chr2 170666494 170666626 + 1 NA Intergenic Intergenic 48007 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 223.25-80 chr8 125301100 125301435 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -129091 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 227.5-116 chr9 124809717 124810087 + 1 NA exon (NM_001282715, exon 5 of 5) exon (NM_001282715, exon 5 of 5) 9028 NM_001282715 169611 Hs.357004 NM_182487 ENSG00000185585 OLFML2A PRO34319 olfactomedin like 2A protein-coding 239.5-12 chr11 13926892 13927296 + 1 NA Intergenic Intergenic -2231 NR_135052 101928132 Hs.568970 NR_135052 ENSG00000254438 LINC02683 - long intergenic non-protein coding RNA 2683 ncRNA 259.25-27 chr3 88435339 88435768 + 1 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) intron (NM_001368168, intron 2 of 2) 97097 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 314.75-5 chr12 38688298 38688756 + 1 NA intron (NM_153634, intron 15 of 19) L1PB1|LINE|L1 217064 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 166.25-141 chr7 146818318 146818599 + 1 NA intron (NM_014141, intron 1 of 22) intron (NM_014141, intron 1 of 22) 44187 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 198.75-39 chr18 44961430 44961774 + 1 NA intron (NM_015559, intron 4 of 5) intron (NM_015559, intron 4 of 5) 8564 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 218.5-68 chr21 38654741 38654998 + 1 NA intron (NM_001243432, intron 1 of 11) intron (NM_001243432, intron 1 of 11) 5798 NM_001243428 2078 Hs.473819 NM_004449 ENSG00000157554 ERG erg-3|p55 ETS transcription factor ERG protein-coding 255.75-52 chr8 86356604 86357071 + 1 NA intron (NM_007013, intron 1 of 24) intron (NM_007013, intron 1 of 24) 14290 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 140.75-71 chr17 79220750 79221007 + 1 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) intron (NM_001350453, intron 3 of 13) 145941 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 160.5-64 chr16 6805251 6805498 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) L1PREC2|LINE|L1 31565 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 145.25-174 chr8 126605924 126606217 + 1 NA Intergenic Intergenic -47592 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 186.75-123 chr9 137628108 137628461 + 1 NA intron (NM_001354612, intron 1 of 8) intron (NM_001354612, intron 1 of 8) 9279 NM_001354259 79813 Hs.495511 NM_024757 ENSG00000181090 EHMT1 EHMT1-IT1|EUHMTASE1|Eu-HMTase1|FP13812|GLP|GLP1|KLEFS1|KMT1D euchromatic histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 275.5-52 chr5 10122613 10123228 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 126968 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 202.75-96 chr5 156650965 156651212 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) L1PA16|LINE|L1 -199207 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 218.5-60 chr2 139171724 139172025 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 274550 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 144.25-46 chr12 9102731 9102889 + 1 NA intron (NM_000014, intron 11 of 35) L2a|LINE|L2 13419 NM_001347424 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 124.75-223 chrX 111121789 111122040 + 1 NA intron (NR_136748, intron 1 of 15) intron (NR_136748, intron 1 of 15) -1163 NM_001128172 5063 Hs.593599 NM_002578 ENSG00000077264 PAK3 ARA|MRX30|MRX47|OPHN3|PAK-3|PAK3beta|bPAK|beta-PAK p21 (RAC1) activated kinase 3 protein-coding 158.75-100 chr20 14527601 14528037 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) intron (NM_001351663, intron 4 of 17) -26565 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 234.5-73 chr5 21128111 21128495 + 1 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -331177 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 183.5-66 chr2 67562752 67563069 + 1 NA Intergenic Intergenic 165577 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 242.25-22 chr12 42364774 42365136 + 1 NA intron (NM_001364830, intron 3 of 6) intron (NM_001364830, intron 3 of 6) 33157 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 263.75-18 chr15 62157085 62157579 + 1 NA Intergenic Intergenic 7953 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 193.5-31 chr12 39158974 39159251 + 1 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -253521 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 263.5-34 chr2 103489458 103489863 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -505231 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 255.75-53 chr8 133435767 133436220 + 1 NA Intergenic Intergenic 135894 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 241.75-58 chr4 133486012 133486293 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 336858 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 192.75-118 chr7 40292242 40292737 + 1 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 157513 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 128.5-99 chr19 51498358 51498517 + 1 NA intron (NM_053003, intron 4 of 7) L1ME4b|LINE|L1 1956 NM_033329 89858 Hs.249741 NM_033329 ENSG00000254521 SIGLEC12 S2V|SIGLECL1|SLG|Siglec-XII sialic acid binding Ig like lectin 12 (gene/pseudogene) protein-coding 209.5-67 chr2 114259017 114259273 + 1 NA Intergenic Intergenic -183496 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 257.5-52 chr4 37100573 37101030 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 99022 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 141.75-46 chr12 66104448 66104698 + 1 NA Intergenic Intergenic 26177 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 126.75-194 chr5 78597849 78598072 + 1 NA intron (NM_005779, intron 2 of 4) intron (NM_005779, intron 2 of 4) 50812 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 216.25-71 chr3 171347880 171348195 + 1 NA intron (NR_027767, intron 2 of 2) intron (NR_027767, intron 2 of 2) 112368 NM_001161562 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 230.75-60 chr5 111698883 111699189 + 1 NA intron (NR_040093, intron 2 of 6) intron (NR_040093, intron 2 of 6) 57215 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 248.5-79 chr5 7364342 7364643 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -16515 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 230.5-114 chr8 114672338 114672749 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 995470 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 122.25-107 chr20 8343357 8343549 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) MER5A|DNA|hAT-Charlie 94749 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 122.75-58 chr16 77884806 77884949 + 1 NA intron (NM_020927, intron 7 of 8) intron (NM_020927, intron 7 of 8) 96313 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 161.5-24 chr10 92640114 92640381 + 1 NA intron (NM_004523, intron 17 of 21) MER58A|DNA|hAT-Charlie 47117 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 288.5-12 chr15 35381376 35381758 + 1 NA intron (NM_080650, intron 7 of 8) intron (NM_080650, intron 7 of 8) -9203 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 324.5 chr1 91504443 91504975 + 1 NA intron (NM_001134420, intron 2 of 11) MER94|DNA|hAT-Blackjack 3601 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 177.5-60 chr17 64046304 64046582 + 1 NA intron (NM_001433, intron 19 of 21) intron (NM_001433, intron 19 of 21) -25809 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 277.5-57 chr4 113131717 113132154 + 1 NA intron (NM_001354237, intron 1 of 46) intron (NM_001354237, intron 1 of 46) 15238 NM_001354240 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 187.25-85 chr5 42186632 42186969 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11455 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 232.75-11 chr11 72841948 72842407 + 1 NA intron (NM_014824, intron 17 of 19) intron (NM_014824, intron 17 of 19) 27766 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 276.5-26 chr17 13802843 13803176 + 1 NA Intergenic Intergenic -201080 NM_006042 9955 Hs.462270 NM_006042 ENSG00000153976 HS3ST3A1 3-OST-3A|3OST3A1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3A1 protein-coding 162.25-128 chr5 45707736 45707921 + 1 NA Intergenic Intergenic -11448 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 163.5-32 chr11 39696208 39696430 + 1 NA Intergenic Intergenic 596811 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 219.5-25 chr12 26871117 26871423 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38076 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 121.25-14 chr10 10917165 10917382 + 1 NA intron (NM_001326328, intron 2 of 15) intron (NM_001326328, intron 2 of 15) 34890 NR_024411 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 141.5-239 chr8 130398202 130398385 + 1 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) L1ME3A|LINE|L1 45367 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 123.25-202 chr8 90500377 90500529 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 105610 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 229.5-35 chr12 66253557 66253957 + 1 NA 3' UTR (NM_001142523, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001142523, exon 11 of 11) 2675 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 201.25-56 chr21 28314970 28315417 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -86526 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 125.75-73 chr18 2273464 2273672 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 297937 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 128.25-201 chr8 50853098 50853327 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 689081 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 248.75-17 chr12 81019127 81019415 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -58808 NM_024560 79611 Hs.259559 NM_024560 ENSG00000111058 ACSS3 - acyl-CoA synthetase short chain family member 3 protein-coding 205.75-37 chr19 30365955 30366466 + 1 NA Intergenic Intergenic -6174 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 161.5-62 chr15 50662867 50663075 + 1 NA exon (NM_001301212, exon 2 of 39) exon (NM_001301212, exon 2 of 39) 23826 NR_149154 54822 Hs.512894 NM_017672 ENSG00000092439 TRPM7 ALSPDC|CHAK|CHAK1|LTRPC7|LTrpC-7|TRP-PLIK transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 protein-coding 330.75-23 chr7 4461285 4461914 + 1 NA Intergenic Intergenic -220696 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 188.25-100 chr6 27841685 27841905 + 1 NA Intergenic Intergenic 3133 NM_003520 8341 Hs.534368 NM_003520 ENSG00000233822 HIST1H2BN H2B/d|H2BFD histone cluster 1 H2B family member n protein-coding 278.5-47 chr6 46138235 46138812 + 1 NA intron (NM_014936, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 8534 NM_014936 22875 Hs.643497 NM_014936 ENSG00000001561 ENPP4 NPP4 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 protein-coding 167.5-34 chr11 29498224 29498495 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -96054 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 172.5-213 chr9 30449206 30449467 + 1 NA Intergenic Intergenic -40882 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 128.5-90 chr18 5046983 5047292 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -34045 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 225.75-11 chr10 19262731 19263111 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 19 of 39) L1MA9|LINE|L1 214120 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 210.5-33 chr13 101196000 101196305 + 1 NA intron (NM_001350749, intron 13 of 43) intron (NM_001350749, intron 13 of 43) 220356 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 188.5-167 chr9 32872850 32873141 + 1 NA Intergenic Intergenic 89455 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 149.25-88 chr2 153917642 153917997 + 1 NA intron (NM_052917, intron 2 of 12) intron (NM_052917, intron 2 of 12) -26575 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 117.75-200 chr7 54824618 54824870 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 65431 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 214.25-38 chr2 19622695 19623057 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -245978 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 127.25-169 chr5 79892496 79892655 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -44004 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 218.25-71 chr5 83070667 83071062 + 1 NA intron (NM_174909, intron 1 of 3) intron (NM_174909, intron 1 of 3) -6527 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 148.5-13 chr1 188188142 188188376 + 1 NA Intergenic Intergenic 744631 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 139.5-26 chr11 56151901 56152161 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 8286 NM_001004058 219453 Hs.553626 NM_001004058 ENSG00000181752 OR8K5 OR11-174 olfactory receptor family 8 subfamily K member 5 protein-coding 171.5-60 chr17 58664511 58664737 + 1 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) L2b|LINE|L2 27431 NM_198393 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 295.25-23 chr5 28336846 28337167 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -49341 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 208.5-109 chr5 71725890 71726297 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 6818 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 261.5-52 chr5 23445944 23446265 + 1 NA Intergenic Intergenic -61505 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 227.5-68 chr3 26693687 26694048 + 1 NA promoter-TSS (NM_001317811) promoter-TSS (NM_001317811) -690 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 171.5-128 chr6 69033116 69033403 + 1 NA intron (NM_001704, intron 13 of 31) intron (NM_001704, intron 13 of 31) 397977 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 152.75-76 chr18 52932076 52932257 + 1 NA intron (NM_005215, intron 5 of 28) intron (NM_005215, intron 5 of 28) -304935 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 176.25-121 chr6 157434615 157434995 + 1 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) 53615 NM_153746 79683 Hs.596214 NM_024630 ENSG00000175048 ZDHHC14 NEW1CP zinc finger DHHC-type containing 14 protein-coding 156.25-76 chr2 157215924 157216173 + 1 NA Intergenic Intergenic -41657 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 182.25-114 chr7 86388295 86388521 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -255501 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 167.5-58 chr14 65076852 65077154 + 1 NA intron (NM_002382, intron 4 of 4) intron (NM_002382, intron 4 of 4) -12915 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 213.5-25 chr11 74552519 74553076 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -39785 NM_001363597 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 145.25-28 chr12 42010532 42010826 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 134195 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 123.5-83 chr17 63102895 63103091 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) MER2|DNA|TcMar-Tigger 136758 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 157.5-225 chr9 81251892 81252076 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 437551 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 220.25-52 chr3 131386813 131387085 + 1 NA non-coding (NR_033268, exon 2 of 2) non-coding (NR_033268, exon 2 of 2) 5175 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 242.75-7 chr1 220945314 220945713 + 1 NA Intergenic Intergenic -65373 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 218.5-65 chr20 43900469 43900902 + 1 NA Intergenic Intergenic 5967 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 152.25-38 chr12 16321551 16321850 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -25442 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 287.75 chr1 71001101 71001422 + 1 NA intron (NM_198719, intron 2 of 3) intron (NM_198719, intron 2 of 3) -45245 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 221.75-12 chr1 180900557 180900865 + 1 NA Intergenic Intergenic -12186 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 183.5-13 chr1 217987716 217987971 + 1 NA Intergenic Intergenic -55662 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 195.5-154 chr7 104715336 104715569 + 1 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1MB1|LINE|L1 88640 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-109 chr2 200525441 200525659 + 1 NA promoter-TSS (NM_001160033) promoter-TSS (NM_001160033) -592 NM_001160046 151246 Hs.655182 NM_152524 ENSG00000163535 SGO2 SGOL2|TRIPIN shugoshin 2 protein-coding 297.75-14 chr18 22603032 22603602 + 1 NA Intergenic Intergenic 183520 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 133.25-139 chr3 114039859 114040079 + 1 NA intron (NR_148531, intron 2 of 14) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 16557 NR_148531 57577 Hs.477159 NM_020817 ENSG00000163617 CCDC191 KIAA1407 coiled-coil domain containing 191 protein-coding 115.5-21 chr10 21939966 21940124 + 1 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) HAL1ME|LINE|L1 63685 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 112.25-147 chr4 40746600 40746751 + 1 NA Intergenic Intergenic -3280 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 201.25-64 chr3 73432779 73432990 + 1 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) 1111 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 137.5-82 chr16 49263042 49263309 + 1 NA Intergenic Intergenic 18663 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 168.75-47 chr14 75144447 75144697 + 1 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) intron (NM_006827, intron 3 of 4) -17524 NM_001329238 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 234.25-43 chr22 33266912 33267322 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 158588 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 154.75-122 chr5 176707128 176707355 + 1 NA Intergenic Intergenic -35964 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 224.75-41 chr2 101200679 101201142 + 1 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 49250 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 143.5-22 chr10 43383540 43383720 + 1 NA Intergenic Intergenic 11986 NM_001184963 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 126.5-113 chr2 81338845 81339136 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 127956 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 132.5-133 chr2 190134290 190134570 + 1 NA Intergenic Intergenic -3347 NM_001042521 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 123.5-19 chr1 233863425 233863624 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -41152 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 265.5-24 chr14 70579908 70580385 + 1 NA Intergenic Intergenic 20544 NM_001284209 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 131.75-66 chr14 59279437 59279818 + 1 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) L1ME2|LINE|L1 16186 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 243.5-28 chr14 68971943 68972459 + 1 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) intron (NM_001102, intron 1 of 20) 7101 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 172.5-122 chr3 53310196 53310497 + 1 NA intron (NM_018403, intron 5 of 9) intron (NM_018403, intron 5 of 9) 22781 NR_145715 109617024 NR_145715 ENSG00000207109 SNORD38C - small nucleolar RNA, C/D box 38C snoRNA 159.75-103 chr3 47595406 47595675 + 1 NA intron (NM_003074, intron 26 of 27) (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15300 NM_001206945 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 148.25-41 chr14 65520086 65520271 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 49076 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 135.5-92 chr19 14691338 14691499 + 1 NA intron (NM_001352240, intron 1 of 12) intron (NM_001352240, intron 1 of 12) 1370 NM_001352243 84449 Hs.515215 NM_032433 ENSG00000160961 ZNF333 - zinc finger protein 333 protein-coding 124.5-241 chr9 71779044 71779212 + 1 NA Intergenic Intergenic -10615 NM_001349784 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 136.5-102 chr2 35294385 35294643 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -176891 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 239.5-70 chr7 8296418 8296778 + 1 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -33986 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 138.5-66 chr15 57076204 57076439 + 1 NA intron (NM_001322158, intron 5 of 20) intron (NM_001322158, intron 5 of 20) -143109 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 165.5-51 chr14 95134644 95134891 + 1 NA intron (NM_177438, intron 1 of 26) intron (NM_177438, intron 1 of 26) -1264 NM_001195573 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 184.5-121 chr5 81745049 81745261 + 1 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) intron (NM_012446, intron 1 of 16) 6098 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 139.5-50 chr12 79853104 79853533 + 1 NA intron (NM_001244990, intron 3 of 24) L1MDa|LINE|L1 60593 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 211.5-31 chr11 115839941 115840252 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -79896 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 131.5-238 chr8 121067099 121067351 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -255179 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 127.5-105 chr18 77675651 77675900 + 1 NA Intergenic Intergenic 317952 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 237.5-93 chr7 15370273 15370713 + 1 NA intron (NM_001004320, intron 10 of 12) L1PA16|LINE|L1 191522 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 212.75-66 chr3 162978480 162978834 + 1 NA Intergenic Intergenic 324644 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 186.75-103 chr7 4674961 4675219 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7205 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 264.25-31 chr2 162815311 162815645 + 1 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) 23289 NM_173162 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 142.5-48 chr11 108924656 108924932 + 1 NA intron (NM_004398, intron 17 of 17) intron (NM_004398, intron 17 of 17) 259725 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 193.5-67 chr17 77507515 77507864 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19312 NR_148967 400622 Hs.514516 NR_148967 LOC400622 - uncharacterized LOC400622 ncRNA 197.25-95 chr7 43149984 43150271 + 1 NA promoter-TSS (NR_037508) promoter-TSS (NR_037508) -768 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 190.25-133 chrUn_GL000216v2 35942 36233 + 1 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 153.5-200 chr8 113121659 113122135 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 255255 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 147.75-66 chr2 54530568 54530805 + 1 NA TTS (NR_002229) TTS (NR_002229) 1464 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 151.75-90 chr3 99325986 99326340 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -312431 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 295.25-34 chr8 104112995 104113546 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -110065 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 176.5-59 chr14 68341093 68341354 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 287564 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 120.25-228 chrX 68478510 68478759 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -20148 NM_001195214 286451 Hs.82719 NM_173834 ENSG00000181704 YIPF6 FinGER6 Yip1 domain family member 6 protein-coding 209.75-44 chr2 14335413 14335745 + 1 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) intron (NR_103814, intron 1 of 3) 65379 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 271.25-32 chr21 35334831 35335257 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 245720 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 155.5-195 chr7 40703956 40704196 + 1 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 275863 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 126.75-225 chr7 44352979 44353155 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -27436 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 129.5-128 chr2 104332729 104332959 + 1 NA Intergenic Intergenic 75488 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 290.5-27 chr22 25590408 25590841 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) AluSc|SINE|Alu 25949 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 160.75-32 chr12 44153674 44153859 + 1 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) intron (NM_001286213, intron 3 of 6) 317685 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 234.75-8 chr10 27215148 27215425 + 1 NA intron (NM_001271512, intron 7 of 11) intron (NM_001271512, intron 7 of 11) 25200 NM_001301252 91452 Hs.530597 NM_145698 ENSG00000107897 ACBD5 - acyl-CoA binding domain containing 5 protein-coding 136.25-68 chr15 62558764 62558994 + 1 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 86302 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 138.5-214 chrX 38976190 38976420 + 1 NA Intergenic Intergenic -172422 NR_046706 100874211 Hs.662789 NR_046706 MID1IP1-AS1 - MID1IP1 antisense RNA 1 ncRNA 130.25-12 chr1 156550152 156550368 + 1 NA intron (NM_178229, intron 16 of 37) intron (NM_178229, intron 16 of 37) 22305 NM_178229 128239 Hs.591495 NM_178229 ENSG00000183856 IQGAP3 - IQ motif containing GTPase activating protein 3 protein-coding 117.5-80 chr17 19837658 19837865 + 1 NA intron (NM_014683, intron 10 of 26) L2a|LINE|L2 30175 NM_014683 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 173.5-97 chr3 41569224 41569629 + 1 NA intron (NR_136342, intron 29 of 34) MER21B|LTR|ERVL 369921 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 280.25-33 chr20 44231180 44231615 + 1 NA Intergenic Intergenic -15702 NM_001256738 78997 Hs.517059 NM_024034 ENSG00000124194 GDAP1L1 dJ881L22.1|dJ995J12.1.1 ganglioside induced differentiation associated protein 1 like 1 protein-coding 287.5-50 chr7 112752643 112753101 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 37521 NM_022484 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 194.5-152 chr8 57032260 57032660 + 1 NA Intergenic Intergenic -38593 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 245.25-12 chr11 68277571 68277854 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -5739 NM_001300913 53838 Hs.303025 NM_022338 ENSG00000171067 C11orf24 DM4E3 chromosome 11 open reading frame 24 protein-coding 243.5-68 chr6 42490180 42490653 + 1 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -38192 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 145.5-195 chr8 126322427 126322685 + 1 NA Intergenic Intergenic -2939 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 114.75-42 chr12 3485315 3485467 + 1 NA non-coding (NR_126055, exon 2 of 2) non-coding (NR_126055, exon 2 of 2) -5812 NM_019854 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 196.5-157 chr7 52162766 52163101 + 1 NA Intergenic Intergenic -769677 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 183.75-49 chr18 69829945 69830171 + 1 NA intron (NM_152721, intron 7 of 7) intron (NM_152721, intron 7 of 7) 117815 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 166.5-113 chr2 215010019 215010330 + 1 NA intron (NR_103740, intron 19 of 54) intron (NR_103740, intron 19 of 54) 21912 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 114.25-14 chr1 236677236 236677401 + 1 NA Intergenic Intergenic -9136 NM_001278344 88 Hs.498178 NM_001103 ENSG00000077522 ACTN2 CMD1AA|CMH23 actinin alpha 2 protein-coding 219.5-84 chr3 26824362 26824635 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 129941 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 303.25-29 chr6 158926267 158926626 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 37969 NR_160979 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 213.5-40 chr15 60259296 60259614 + 1 NA Intergenic Intergenic 138531 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 202.5-4 chr1 77818570 77818949 + 1 NA intron (NM_198549, intron 7 of 15) AluSz|SINE|Alu 38954 NM_001363583 374986 Hs.437755 NM_198549 ENSG00000180488 MIGA1 FAM73A mitoguardin 1 protein-coding 259.25-52 chr9 98824783 98825296 + 1 NA intron (NM_024642, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 17369 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 252.75-38 chr20 63525696 63526151 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 5158 NM_001353423 79144 Hs.79625 NM_024299 ENSG00000125534 PPDPF C20orf149|dJ697K14.9|exdpf pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor protein-coding 211.25-67 chr4 61838144 61838627 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 323380 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 240.5-92 chr6 130671898 130672310 + 1 NA Intergenic Intergenic -155301 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 166.25-44 chr14 51858338 51858705 + 1 NA Intergenic Intergenic -2091 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 152.5-64 chr16 71761029 71761330 + 1 NA intron (NM_001128, intron 10 of 22) MER58B|DNA|hAT-Charlie -2692 NR_003059 692111 NR_003059 ENSG00000223224 SNORD71 HBII-239|MIRN768|hsa-mir-768 small nucleolar RNA, C/D box 71 snoRNA 238.5-62 chr4 125782252 125782631 + 1 NA Intergenic Intergenic 275182 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 277.5-10 chr10 71469365 71469660 + 1 NA intron (NM_052836, intron 3 of 12) L1ME1|LINE|L1 42408 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-150 chr7 28104310 28104632 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -75986 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 197.75-11 chr11 56927453 56927757 + 1 NA Intergenic Intergenic -61309 NM_001005323 390181 Hs.554520 NM_001005323 ENSG00000181273 OR5AK2 - olfactory receptor family 5 subfamily AK member 2 protein-coding 166.5-157 chr5 18214094 18214266 + 1 NA Intergenic Intergenic 406906 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 199.5-62 chr18 21365709 21365991 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 123608 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 122.5-103 chr2 7815826 7816021 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83732 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 197.5-128 chr5 108948674 108948973 + 1 NA intron (NR_146155, intron 11 of 19) intron (NR_146155, intron 11 of 19) 24217 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 116.5-52 chr12 104873181 104873323 + 1 NA intron (NM_032148, intron 7 of 11) L1MA9|LINE|L1 85038 NM_001352170 84102 Hs.577463 NM_032148 ENSG00000136052 SLC41A2 SLC41A1-L1 solute carrier family 41 member 2 protein-coding 231.5-57 chr21 29225691 29225986 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) L1MD|LINE|L1 32344 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 117.25-163 chr5 4164954 4165201 + 1 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 569245 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 149.75-154 chr7 32247277 32247562 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 51909 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 169.75-53 chr15 92574769 92575118 + 1 NA Intergenic Intergenic -2680 NR_021493 100144604 Hs.245476 NR_021493 ENSG00000258647 LINC00930 - long intergenic non-protein coding RNA 930 ncRNA 242.25-37 chr17 65065530 65065905 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -8977 NM_006572 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 112.5-70 chr14 22720344 22720474 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46279 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 445.75-7 chr4 34918079 34918710 + 1 NA Intergenic Intergenic -648647 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 163.75-81 chr20 52874480 52874674 + 1 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -97781 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 177.5-78 chr2 60459801 60460100 + 1 NA 3' UTR (NM_022893, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_022893, exon 4 of 4) -68575 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 122.5-40 chr11 115304628 115304794 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -28866 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 258.5-35 chr19 31153043 31153533 + 1 NA intron (NR_138036, intron 4 of 4) intron (NR_138036, intron 4 of 4) -14222 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 254.75-29 chr20 2925401 2925883 + 1 NA intron (NM_080841, intron 1 of 22) AluSz|SINE|Alu 2435 NM_080841 5786 Hs.269577 NM_002836 ENSG00000132670 PTPRA HEPTP|HLPR|HPTPA|HPTPalpha|LRP|PTPA|PTPRL2|R-PTP-alpha|RPTPA protein tyrosine phosphatase receptor type A protein-coding 180.75-110 chr4 188864579 188864787 + 1 NA Intergenic Intergenic 88026 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 374.75-5 chr2 162955049 162955503 + 1 NA Intergenic Intergenic -116509 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 207.25-3 chr1 110671833 110672074 + 1 NA promoter-TSS (NR_109846) promoter-TSS (NR_109846) -178 NR_109846 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 297.75-12 chr15 94140610 94140955 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32844 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 223.5-19 chr11 7372187 7372582 + 1 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) AluJr4|SINE|Alu 93451 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 203.5-142 chr8 144785234 144785514 + 1 NA intron (NM_001286769, intron 1 of 5) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 1971 NM_001286769 80778 Hs.631854 NM_030580 ENSG00000196378 ZNF34 KOX32 zinc finger protein 34 protein-coding 177.5-134 chr5 20207084 20207292 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MA4|LINE|L1 -98363 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-105 chr4 53211900 53212135 + 1 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 154044 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 131.5-223 chr7 100195023 100195368 + 1 NA intron (NM_012447, intron 8 of 33) intron (NM_012447, intron 8 of 33) 17277 NM_012447 10734 Hs.592283 NM_012447 ENSG00000066923 STAG3 - stromal antigen 3 protein-coding 172.75-99 chr5 81490304 81490794 + 1 NA intron (NM_001256734, intron 4 of 15) intron (NM_001256734, intron 4 of 15) -96415 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 202.5-138 chr7 82366568 82366862 + 1 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) L1PA16|LINE|L1 77062 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 272.75-39 chr5 3438612 3438962 + 1 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) intron (NR_033898, intron 2 of 4) -14029 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 183.25-83 chr5 68615365 68615626 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 322918 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 161.25-77 chr17 65266347 65266559 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 129083 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 144.5-209 chr7 124674572 124674832 + 1 NA Intergenic Intergenic 91090 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 179.5-194 chr9 68893688 68893968 + 1 NA intron (NM_003558, intron 7 of 15) L1ME3G|LINE|L1 82013 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 166.5-154 chr5 7026354 7026525 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -198518 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 208.25-4 chr1 92308292 92308635 + 1 NA intron (NM_024813, intron 6 of 12) intron (NM_024813, intron 6 of 12) 9404 NM_024813 79871 Hs.444421 NM_024813 ENSG00000122484 RPAP2 C1orf82|Rtr1 RNA polymerase II associated protein 2 protein-coding 252.75-36 chr20 35220637 35221113 + 1 NA intron (NM_001355008, intron 3 of 14) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -5815 NM_006690 10893 Hs.715494 NM_006690 ENSG00000125966 MMP24 MMP-24|MMP25|MT-MMP 5|MT-MMP5|MT5-MMP|MT5MMP|MTMMP5 matrix metallopeptidase 24 protein-coding 233.5-22 chr10 84406145 84406536 + 1 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) L1ME1|LINE|L1 -18599 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 121.25-5 chr1 82784867 82785040 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -118230 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 146.5-191 chr6 125973355 125973612 + 1 NA intron (NM_138571, intron 3 of 4) intron (NM_138571, intron 3 of 4) -12947 NR_146797 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 143.5-162 chr4 90877374 90877575 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 8 of 10) intron (NM_001145065, intron 8 of 10) 642443 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 218.5-61 chr2 176575881 176576256 + 1 NA Intergenic Intergenic 24984 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 121.75-5 chr1 55968160 55968345 + 1 NA Intergenic Intergenic 23165 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 132.25-114 chr20 47069477 47069785 + 1 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) L1M4|LINE|L1 -97336 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 127.5-148 chr3 75157326 75157618 + 1 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -57004 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 299.75-2 chr1 73613331 73613971 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -61028 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 136.5-189 chr5 121838544 121838855 + 1 NA Intergenic Intergenic -13183 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 176.5-149 chr6 71879383 71879669 + 1 NA Intergenic Intergenic -7177 NM_001350412 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 307.5-16 chr15 70348617 70349015 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 157112 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 117.25-15 chr1 162202446 162202613 + 1 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) L1ME4a|LINE|L1 45422 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 175.25-124 chr6 27246134 27246346 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1461 NM_005865 10279 Hs.274407 NM_005865 ENSG00000112812 PRSS16 TSSP serine protease 16 protein-coding 327.5-19 chr2 235636203 235636612 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -118486 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 146.5-182 chr5 173496102 173496453 + 1 NA Intergenic Intergenic -83357 NR_027108 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 286.5-5 chr1 90667505 90667906 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9955 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 204.5-139 chr9 78907538 78907798 + 1 NA Intergenic Intergenic 237998 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 171.25-38 chr12 82152647 82153198 + 1 NA Intergenic Intergenic 199203 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 126.25-59 chr15 90276529 90276736 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10873 NR_102428 10519 Hs.715556 NM_006384 ENSG00000185043 CIB1 CIB|CIBP|KIP1|PRKDCIP|SIP2-28 calcium and integrin binding 1 protein-coding 124.5-68 chr15 34871029 34871199 + 1 NA intron (NM_014691, intron 30 of 34) intron (NM_014691, intron 30 of 34) -75565 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 220.5-129 chr9 75546601 75546896 + 1 NA Intergenic Intergenic -343896 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 216.25-25 chr12 41904036 41904349 + 1 NA Intergenic Intergenic 140003 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 276.75-14 chr16 51467568 51468149 + 1 NA Intergenic Intergenic -294661 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 185.25-66 chr2 186874806 186875102 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -25784 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 161.5-85 chr19 33990426 33990831 + 1 NA Intergenic Intergenic -181876 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 181.5-39 chr13 106083623 106083921 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -292792 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 114.25-102 chr2 152228489 152228635 + 1 NA Intergenic Intergenic -52799 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 176.25-13 chr1 234750020 234750338 + 1 NA Intergenic Intergenic 9877 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 230.5-45 chr16 5968173 5968538 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -50669 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 290.5-25 chr20 41022487 41022884 + 1 NA intron (NR_145524, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu -6137 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 310.5-8 chr13 47268020 47268457 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -371162 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 449.75-8 chr8 137631380 137632446 + 1 NA Intergenic Intergenic -218325 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 179.5-44 chr12 63813406 63813670 + 1 NA intron (NR_126167, intron 2 of 3) intron (NR_126167, intron 2 of 3) 8618 NR_126167 104169670 Hs.735874 NR_126167 ENSG00000255850 RXYLT1-AS1 TMEM5-AS1 RXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-89 chr18 80163599 80163849 + 1 NA intron (NR_028339, intron 2 of 2) intron (NR_028339, intron 2 of 2) 15800 NR_028339 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 214.25-2 chr1 31031580 31032019 + 1 NA intron (NM_001020658, intron 2 of 21) intron (NM_001020658, intron 2 of 21) 33918 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 208.5-93 chr3 193178882 193179205 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -62179 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 265.75-59 chr5 110243761 110244193 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 269938 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 153.5-195 chr8 53535224 53535415 + 1 NA Intergenic Intergenic -11354 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 196.5-44 chr12 130467621 130467970 + 1 NA intron (NM_015347, intron 4 of 19) MER4A|LTR|ERV1 129908 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 182.5-37 chr12 1363952 1364203 + 1 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) intron (NR_027948, intron 15 of 19) -136414 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 187.25-38 chr17 10537087 10537563 + 1 NA exon (NM_017534, exon 16 of 40) exon (NM_017534, exon 16 of 40) 12298 NM_001100112 4620 Hs.667534 NM_017534 ENSG00000125414 MYH2 IBM3|MYH2A|MYHSA2|MYHas8|MYPOP|MyHC-2A|MyHC-IIa myosin heavy chain 2 protein-coding 160.5-117 chr3 65863401 65863591 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -30320 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 120.25-81 chr2 9670051 9670429 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -39243 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 145.25-145 chr6 85082466 85082700 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 307603 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 124.25-60 chr15 47928668 47928945 + 1 NA Intergenic Intergenic -82570 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 152.75-99 chr21 25065413 25065596 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 224954 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 141.75 chr1 22582864 22583124 + 1 NA intron (NM_020526, intron 3 of 16) intron (NM_020526, intron 3 of 16) 19505 NM_001006943 2046 Hs.283613 NM_020526 ENSG00000070886 EPHA8 EEK|EK3|HEK3 EPH receptor A8 protein-coding 218.25-56 chr3 113648654 113649089 + 1 NA non-coding (NR_111981, exon 7 of 7) non-coding (NR_111981, exon 7 of 7) 47771 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 154.75-72 chr2 64306399 64306593 + 1 NA Intergenic Intergenic -34263 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 179.5-53 chr13 55438246 55438551 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 263944 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 237.5-79 chr5 96891677 96892060 + 1 NA intron (NM_001329229, intron 4 of 17) intron (NM_001329229, intron 4 of 17) 15929 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 237.5-57 chr20 14553926 14554249 + 1 NA promoter-TSS (NR_104193) promoter-TSS (NR_104193) -297 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 220.5-89 chr4 76645406 76645790 + 1 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 70047 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 266.5-21 chr15 41366495 41366969 + 1 NA intron (NM_001243144, intron 6 of 8) L1M2c|LINE|L1 33851 NM_001243142 51203 Hs.615092 NM_016359 ENSG00000137804 NUSAP1 ANKT|BM037|LNP|NUSAP|PRO0310p1|Q0310|SAPL nucleolar and spindle associated protein 1 protein-coding 157.75-13 chr10 64598242 64598596 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -227109 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 121.75-78 chr2 45210590 45210767 + 1 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger 44263 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 116.5-9 chr1 100935480 100935709 + 1 NA intron (NM_133496, intron 8 of 10) intron (NM_133496, intron 8 of 10) 39504 NM_001144884 148867 Hs.533903 NM_133496 ENSG00000162695 SLC30A7 ZNT7|ZnT-7|ZnTL2 solute carrier family 30 member 7 protein-coding 161.5-54 chr14 32204638 32204915 + 1 NA Intergenic Intergenic -1507 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 180.75-126 chr6 47452856 47453171 + 1 NA Intergenic Intergenic -24776 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 265.25-6 chr10 108265788 108266340 + 1 NA Intergenic Intergenic -196771 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 128.25-62 chr16 55532683 55532924 + 1 NA intron (NM_017839, intron 5 of 13) intron (NM_017839, intron 5 of 13) 23731 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 284.25-14 chr2 38487319 38487685 + 1 NA intron (NR_110259, intron 2 of 4) AluSx3|SINE|Alu 28238 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 132.25-84 chr18 22319254 22319484 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 98546 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 227.75-45 chr20 7710746 7711176 + 1 NA Intergenic Intergenic 229497 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 187.5-153 chr7 27603572 27603888 + 1 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -12244 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 196.75-21 chr10 130266840 130267237 + 1 NA Intergenic Intergenic 130629 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 232.5-56 chr20 2661743 2662095 + 1 NA intron (NM_006899, intron 4 of 11) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 2297 NM_174855 3420 Hs.436405 NM_006899 ENSG00000101365 IDH3B RP46 isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 beta protein-coding 119.75-61 chr14 59727755 59728050 + 1 NA intron (NM_021136, intron 2 of 8) intron (NM_021136, intron 2 of 8) -80882 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 333.25-11 chr20 12166840 12167302 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 249178 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 200.5-125 chr6 139051623 139051966 + 1 NA Intergenic Intergenic 23049 NM_021243 58527 Hs.600861 NM_021243 ENSG00000146386 ABRACL C6orf115|Costars|HSPC280|PRO2013 ABRA C-terminal like protein-coding 169.25-99 chr5 137314956 137315162 + 1 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 184267 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 183.75-99 chr5 95383684 95384038 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7505 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 278.5-57 chr8 99552132 99552548 + 1 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) intron (NM_017890, intron 30 of 61) -15479 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 116.5-157 chr3 27252983 27253153 + 1 NA intron (NM_199347, intron 24 of 24) intron (NM_199347, intron 24 of 24) -36545 NM_001031741 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 162.5-173 chr8 83987633 83987909 + 1 NA Intergenic Intergenic -195016 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 229.25-22 chr13 27021886 27022196 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -103492 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 203.5-68 chr2 61373400 61373696 + 1 NA intron (NM_014709, intron 8 of 79) L1MB7|LINE|L1 43829 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 195.5-156 chr7 140844325 140844692 + 1 NA intron (NR_148928, intron 2 of 17) HAL1ME|LINE|L1 80421 NR_148928 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 225.25-44 chr2 95063035 95063413 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 37516 NM_002371 4118 Hs.80395 NM_002371 ENSG00000172005 MAL MVP17|VIP17 mal, T cell differentiation protein protein-coding 129.5-216 chr7 79488662 79488912 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 34827 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 169.25-32 chr15 37934881 37935084 + 1 NA intron (NM_001330255, intron 1 of 11) intron (NM_001330255, intron 1 of 11) 340 NM_001370736 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 236.25-85 chr8 83461222 83461580 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 57643 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 204.5-41 chr15 62544313 62544645 + 1 NA Intergenic Intergenic 100702 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 205.5-109 chr4 80061698 80061928 + 1 NA intron (NM_001286781, intron 3 of 16) intron (NM_001286781, intron 3 of 16) 11416 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 148.75-41 chr12 60609972 60610142 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 920687 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 247.5-56 chr3 118272971 118273246 + 1 NA Intergenic Intergenic -368660 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 172.5-185 chr7 39119791 39120036 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -106346 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 203.75-66 chr20 57036001 57036412 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -177490 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 159.5-119 chr2 209630231 209630435 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 4 of 14) intron (NM_001039538, intron 4 of 14) 50654 NM_002374 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 358.25-14 chr22 34982334 34983172 + 1 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 15163 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 128.75-81 chr18 9120233 9120465 + 1 NA TTS (NR_110771) TTS (NR_110771) 16371 NR_110771 101927275 Hs.656442 NR_110771 ENSG00000266053 NDUFV2-AS1 - NDUFV2 antisense RNA 1 ncRNA 122.75-213 chr9 34690475 34690669 + 1 NA intron (NM_006274, intron 1 of 3) MamRep38|DNA|hAT 704 NM_006274 6363 Hs.50002 NM_006274 ENSG00000172724 CCL19 CKb11|ELC|MIP-3b|MIP3B|SCYA19 C-C motif chemokine ligand 19 protein-coding 203.5-89 chr3 39345974 39346336 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 16446 NM_005201 1237 Hs.113222 NM_005201 ENSG00000179934 CCR8 CC-CKR-8|CCR-8|CDw198|CKRL1|CMKBR8|CMKBRL2|CY6|GPRCY6|TER1 C-C motif chemokine receptor 8 protein-coding 206.25-3 chr1 52627767 52628050 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -5260 NM_001042693 348378 Hs.424589 NM_001042693 ENSG00000182183 SHISAL2A FAM159A|PRO7171|WWLS2783 shisa like 2A protein-coding 131.25-127 chr22 41053159 41053325 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 20479 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 182.5-79 chr2 78142548 78142980 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 54034 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 250.5-93 chr7 112203965 112204378 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 2228 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 282.5-34 chr2 145473749 145474116 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 805965 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 223.5-50 chr17 67672900 67673134 + 1 NA intron (NM_181671, intron 7 of 9) intron (NM_181671, intron 7 of 9) -44816 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 117.75-65 chr15 61968788 61968989 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 28 of 81) MIRb|SINE|MIR 91559 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 238.5-21 chr12 33226997 33227389 + 1 NA Intergenic Intergenic 212626 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 221.5-28 chr14 67284055 67284422 + 1 NA intron (NM_001256550, intron 3 of 14) L1MB7|LINE|L1 42803 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 234.75-81 chr8 17052104 17052562 + 1 NA intron (NR_146233, intron 1 of 15) L1MA4|LINE|L1 25095 NM_001349810 286097 Hs.403594 NM_181723 ENSG00000155970 MICU3 EFHA2 mitochondrial calcium uptake family member 3 protein-coding 147.5-146 chr3 131624285 131624525 + 1 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -121434 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 171.25-131 chr5 161095603 161095893 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -157122 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 209.75-53 chr2 128028440 128028790 + 1 NA promoter-TSS (NM_001330302) promoter-TSS (NM_001330302) -556 NM_001330299 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 206.5-137 chr8 122114320 122114626 + 1 NA Intergenic Intergenic 454171 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 140.5-101 chr2 17085512 17085723 + 1 NA Intergenic Intergenic -419783 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 145.5-39 chr11 121423551 121423764 + 1 NA Intergenic Intergenic -28657 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 252.25-28 chr2 15620298 15620920 + 1 NA intron (NM_004939, intron 17 of 25) intron (NM_004939, intron 17 of 25) 28741 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 197.25-99 chr8 86013665 86013952 + 1 NA Intergenic Intergenic 55860 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 130.5-11 chr1 67721831 67721967 + 1 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) intron (NM_018841, intron 2 of 3) 36698 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 121.5-18 chr1 207065306 207065452 + 1 NA intron (NM_006212, intron 8 of 14) AluJb|SINE|Alu 12104 NM_006212 5208 Hs.282702 NM_006212 ENSG00000123836 PFKFB2 PFK-2/FBPase-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2 protein-coding 200.5-63 chr2 37526144 37526473 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 145891 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 176.25-21 chr11 19743104 19743483 + 1 NA intron (NM_182964, intron 1 of 37) intron (NM_182964, intron 1 of 37) 16790 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 222.5-53 chr2 120283300 120283691 + 1 NA intron (NM_001369400, intron 2 of 4) intron (NM_001369400, intron 2 of 4) 30643 NM_002881 5899 Hs.469820 NM_002881 ENSG00000144118 RALB - RAS like proto-oncogene B protein-coding 182.25-23 chr11 59322264 59322502 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -42076 NM_001004729 390195 Hs.553755 NM_001004729 ENSG00000176495 OR5AN1 OR11-244 olfactory receptor family 5 subfamily AN member 1 protein-coding 209.5-95 chr3 87547249 87547549 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -245307 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 153.25-68 chr2 102060262 102060441 + 1 NA Intergenic Intergenic -10039 NM_001288706 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 146.75-158 chr8 90051191 90051373 + 1 NA intron (NM_001330575, intron 10 of 11) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 31597 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 246.5-26 chr15 38942429 38942831 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 246032 NR_160786 214.75-31 chr17 35362395 35362779 + 1 NA intron (NM_001104588, intron 4 of 6) intron (NM_001104588, intron 4 of 6) 11034 NM_001104588 91607 Hs.745059 NM_152270 ENSG00000172716 SLFN11 SLFN8/9 schlafen family member 11 protein-coding 314.5-12 chr2 135820348 135820709 + 1 NA non-coding (NR_045486, exon 1 of 2) non-coding (NR_045486, exon 1 of 2) 337 NR_045486 100507600 Hs.662020 NR_045486 ENSG00000226806 LOC100507600 - uncharacterized LOC100507600 ncRNA 233.25-13 chr11 37675390 37675776 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -263018 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 147.5-135 chr22 27807942 27808197 + 1 NA Intergenic Intergenic -6313 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 185.5-108 chr3 79082224 79082529 + 1 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) -62917 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 173.5-13 chr1 192939766 192940100 + 1 NA intron (NR_126003, intron 1 of 2) intron (NR_126003, intron 1 of 2) 8324 NR_126003 102724954 Hs.243488 NR_126003 LINC01032 - long intergenic non-protein coding RNA 1032 ncRNA 298.25-33 chr8 18148284 18148996 + 1 NA Intergenic Intergenic -21827 NM_001291962 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 209.75-45 chr2 16428784 16429130 + 1 NA Intergenic MER5C1|DNA|hAT-Charlie 236877 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 125.5-8 chr1 87549836 87549992 + 1 NA Intergenic Intergenic -178259 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 200.5-58 chr18 7928547 7928757 + 1 NA intron (NM_002845, intron 5 of 30) intron (NM_002845, intron 5 of 30) 361336 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 228.75-69 chr6 114201904 114202339 + 1 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) L2a|LINE|L2 -139244 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 179.5-196 chr9 112648789 112649086 + 1 NA intron (NM_001287038, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 69180 NR_138056 58493 Hs.658575 NM_021218 ENSG00000148153 INIP C9orf80|HSPC043|MISE|SOSSC|SSBIP1|hSSBIP1 INTS3 and NABP interacting protein protein-coding 175.5-6 chr1 160798414 160798760 + 1 NA intron (NM_002348, intron 1 of 9) intron (NM_002348, intron 1 of 9) 2413 NM_001033667 4063 Hs.403857 NM_002348 ENSG00000122224 LY9 CD229|SLAMF3|hly9|mLY9 lymphocyte antigen 9 protein-coding 174.25-111 chr4 51896854 51897070 + 1 NA intron (NM_001040402, intron 7 of 10) L2b|LINE|L2 53383 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 359.5-7 chr4 66664975 66665705 + 1 NA Intergenic Intergenic 388516 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 206.5-116 chr7 21513601 21513894 + 1 NA 3' UTR (NM_001326542, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001326542, exon 6 of 6) -29292 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 354.5-10 chr18 4195838 4196397 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 -68485 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 166.75-51 chr14 74054725 74055031 + 1 NA intron (NM_025057, intron 8 of 11) AluSg|SINE|Alu 29575 NM_005589 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 180.5-103 chr3 185619368 185619681 + 1 NA intron (NM_021627, intron 13 of 16) intron (NM_021627, intron 13 of 16) 33229 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 138.5-140 chr3 192031145 192031334 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -207391 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 187.25-57 chr2 112911329 112911739 + 1 NA Intergenic Intergenic -1437 NM_173204 27178 Hs.166371 NM_014439 ENSG00000125571 IL37 FIL1|FIL1(ZETA)|FIL1Z|IL-1F7|IL-1H|IL-1H4|IL-1RP1|IL-37|IL1F7|IL1H4|IL1RP1 interleukin 37 protein-coding 237.25-59 chr5 67657615 67658049 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -11043 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 202.5-84 chr20 14693426 14693797 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 139227 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 225.25-88 chr8 129332410 129332827 + 1 NA Intergenic Intergenic -91378 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 127.75-214 chrX 54058284 54058437 + 1 NA Intergenic Intergenic -13224 NM_001184896 23133 Hs.133352 NM_015107 ENSG00000172943 PHF8 JHDM1F|KDM7B|MRXSSD|ZNF422 PHD finger protein 8 protein-coding 195.25-35 chr15 63551867 63552087 + 1 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) intron (NM_006537, intron 3 of 14) -45410 NM_001367809 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 211.5-161 chr8 116844755 116845099 + 1 NA Intergenic Intergenic -29497 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 238.75 chr1 86099383 86099726 + 1 NA intron (NM_152890, intron 5 of 59) intron (NM_152890, intron 5 of 59) 56917 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 219.5-77 chr21 29486499 29486799 + 1 NA Intergenic Intergenic -9398 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 206.25-36 chr14 59003713 59004110 + 1 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) MER21C|LTR|ERVL 175623 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 197.75-3 chr10 24199035 24199281 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) AluJr|SINE|Alu -9633 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 157.5-169 chr5 173788472 173788646 + 1 NA intron (NR_108028, intron 2 of 3) intron (NR_108028, intron 2 of 3) 2383 NR_108028 101928154 Hs.366725 NR_108028 LINC01485 - long intergenic non-protein coding RNA 1485 ncRNA 214.5-22 chr12 2851928 2852178 + 1 NA intron (NR_157835, intron 1 of 1) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 4986 NM_001365174 101929469 Hs.634625 NM_001365174 ENSG00000283297 TEX52 - testis expressed 52 protein-coding 225.5-9 chr1 215356512 215356856 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -210620 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 244.75-34 chr22 28156211 28156582 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -235784 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 182.25-85 chr4 151269618 151269978 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -7375 NM_001353611 345062 Hs.651266 NM_183375 ENSG00000189099 PRSS48 ESSPL serine protease 48 protein-coding 156.5-12 chr10 4441813 4442129 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 35502 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 168.75-48 chr15 26051189 26051428 + 1 NA intron (NR_040082, intron 3 of 4) intron (NR_040082, intron 3 of 4) -64505 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 211.25-85 chr7 87810033 87810385 + 1 NA intron (NM_138290, intron 10 of 11) MER57D|LTR|ERV1 66151 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 184.75-45 chr2 11475980 11476164 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -9895 NM_001278275 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 166.5-36 chr11 25138012 25138428 + 1 NA Intergenic Intergenic 641167 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 167.75-143 chr8 121114571 121114753 + 1 NA Intergenic Intergenic -302616 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 138.5-148 chr4 162443184 162443387 + 1 NA Intergenic Intergenic -279251 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 197.5-80 chr2 178559240 178559487 + 1 NA exon (NM_133432, exon 155 of 192) exon (NM_133432, exon 155 of 192) 36172 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 245.5-56 chr5 34031286 34031629 + 1 NA intron (NR_037951, intron 3 of 8) intron (NR_037951, intron 3 of 8) 11756 NM_030945 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 114.5-106 chr16 151154 151333 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -1401 NM_005332 3050 Hs.585357 NM_005332 ENSG00000130656 HBZ HBAZ|HBZ-T1|HBZ1 hemoglobin subunit zeta protein-coding 186.5-97 chr4 33035843 33036060 + 1 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 684913 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 273.75-32 chr5 35752974 35753491 + 1 NA intron (NM_024867, intron 23 of 36) (ATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -103659 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 270.75-24 chr17 76457027 76457593 + 1 NA intron (NM_001166579, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 3959 NM_001166579 15 Hs.431417 NM_001088 ENSG00000129673 AANAT DSPS|SNAT aralkylamine N-acetyltransferase protein-coding 133.5-106 chr2 4130461 4130644 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 156391 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 213.5-58 chr2 63696793 63697208 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 107849 NM_001199111 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 132.5-136 chr2 223589719 223589931 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 12536 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 157.25-81 chr2 108861200 108861465 + 1 NA intron (NM_001351557, intron 11 of 12) L1PA17|LINE|L1 74561 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 130.5-50 chr10 102951170 102951353 + 1 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -32926 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 175.5-141 chr6 71435712 71435993 + 1 NA intron (NR_121615, intron 4 of 7) L1M6|LINE|L1 14825 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 122.5-74 chr15 63437772 63437979 + 1 NA TTS (NR_120375) TTS (NR_120375) 47645 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 225.5-25 chr12 28622646 28622913 + 1 NA Intergenic Intergenic -432041 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 204.25-10 chr10 63254276 63254532 + 1 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 14819 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 174.25-137 chr7 122019135 122019333 + 1 NA exon (NM_001206838, exon 13 of 30) exon (NM_001206838, exon 13 of 30) 125015 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 136.5-30 chr10 91717051 91717209 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 81066 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 135.5-63 chr15 35835525 35835769 + 1 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) -91209 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 248.5-86 chr5 114987959 114988450 + 1 NA Intergenic Intergenic 181704 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 361.5-14 chr5 36141791 36142450 + 1 NA intron (NM_001007527, intron 3 of 17) intron (NM_001007527, intron 3 of 17) 5868 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 221.5-91 chr7 51662773 51663139 + 1 NA Intergenic Intergenic -269700 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 124.25-170 chr5 146132361 146132636 + 1 NA intron (NM_016460, intron 22 of 30) intron (NM_016460, intron 22 of 30) -26921 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 235.5-68 chr5 44049866 44050329 + 1 NA Intergenic Intergenic -338635 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 252.5-33 chr18 13904478 13904876 + 1 NA intron (NM_001291911, intron 1 of 1) L1PA8A|LINE|L1 10859 NM_000529 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 149.25-77 chr2 17827292 17827461 + 1 NA Intergenic Intergenic 10916 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 151.5-23 chr11 25652164 25652440 + 1 NA Intergenic Intergenic -536821 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 261.5-58 chr6 126745423 126745956 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 261058 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 251.25 chr1 49797696 49798165 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) AluSx|SINE|Alu 226024 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 159.5-2 chr1 50610439 50610650 + 1 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) intron (NM_007051, intron 8 of 18) -187101 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 176.5-128 chr3 180704985 180705198 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -25602 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 170.5 chr1 3731212 3731522 + 1 NA intron (NM_001204190, intron 9 of 9) intron (NM_001204190, intron 9 of 9) 15404 NR_033712 57212 Hs.49658 NM_207306 ENSG00000227372 TP73-AS1 KIAA0495|PDAM TP73 antisense RNA 1 ncRNA 152.5-3 chr1 37494436 37494668 + 1 NA intron (NR_073090, intron 8 of 8) AluJb|SINE|Alu 6442 NR_049844 100847010 NR_049844 ENSG00000263675 MIR5581 - microRNA 5581 ncRNA 270.5-47 chr4 39325747 39326122 + 1 NA intron (NM_001204747, intron 6 of 24) L2|LINE|L2 40428 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 220.5-2 chr1 39988843 39989115 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 33834 NM_001136493 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 129.25-126 chr3 57924788 57924973 + 1 NA intron (NM_001304420, intron 21 of 21) intron (NM_001304420, intron 21 of 21) 34878 NM_001304422 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 178.5-73 chr2 7487293 7487693 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 66232 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 170.5-160 chr6 104171979 104172174 + 1 NA Intergenic Intergenic 687470 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 193.5-20 chr10 118442435 118442726 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 85472 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 192.5-78 chr2 191783686 191784066 + 1 NA Intergenic Intergenic -8964 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 288.5-27 chr3 47339762 47340105 + 1 NA intron (NM_025010, intron 7 of 9) AluJo|SINE|Alu -41088 NM_015466 25930 Hs.25524 NM_015466 ENSG00000076201 PTPN23 HD-PTP|HDPTP|PTP-TD14 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 23 protein-coding 310.5-41 chr8 127895099 127895520 + 1 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 53414 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 153.5-113 chr2 236456350 236456549 + 1 NA intron (NR_073043, intron 6 of 19) intron (NR_073043, intron 6 of 19) 47248 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 233.75-30 chr15 67219751 67220131 + 1 NA intron (NM_001271885, intron 5 of 9) intron (NM_001271885, intron 5 of 9) 34720 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 132.5-172 chr3 155700474 155700680 + 1 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) intron (NM_001349252, intron 2 of 24) 3687 NM_014996 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 183.25-20 chr11 26891193 26891574 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -102729 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 246.75-5 chr1 115108361 115108699 + 1 NA Intergenic Intergenic -19027 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 164.25-64 chr2 30773137 30773599 + 1 NA intron (NM_144575, intron 4 of 22) L1MEj|LINE|L1 34078 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 163.5-72 chr17 65839088 65839268 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) L1MA4|LINE|L1 -12635 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 226.5-94 chr7 56049557 56049881 + 1 NA intron (NM_001370522, intron 1 of 8) AluSq|SINE|Alu 1725 NM_001370511 5723 Hs.512656 NM_004577 ENSG00000146733 PSPH PSP|PSPHD phosphoserine phosphatase protein-coding 184.5-132 chr6 66988387 66988601 + 1 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -1066857 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 217.5-95 chr5 26199581 26200116 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 838738 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 138.25-91 chr2 178714400 178714688 + 1 NA exon (NM_001267550, exon 91 of 363) exon (NM_001267550, exon 91 of 363) -62382 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 161.5-195 chr9 22595643 22595886 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50436 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 124.75-56 chr12 39752819 39753025 + 1 NA intron (NR_135051, intron 14 of 18) MER5A|DNA|hAT-Charlie 126739 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 314.5-14 chr20 50998191 50998898 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 24563 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 138.25-26 chr11 23313065 23313239 + 1 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 106038 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 137.75-96 chr2 59075762 59075930 + 1 NA Intergenic Intergenic -141862 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 197.75-44 chr2 114308886 114309244 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -133576 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 158.75-73 chr17 63047912 63048195 + 1 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) MER39|LTR|ERV1 81818 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 132.5-251 chr8 139313707 139313849 + 1 NA Intergenic Intergenic 389345 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 155.75-122 chr4 109350810 109350986 + 1 NA Intergenic Intergenic 47863 NR_160939 645078 Hs.518784 NM_001039778 ZCCHC23 - zinc finger CCHC-type containing 23 ncRNA 253.5-83 chr9 70869638 70869924 + 1 NA promoter-TSS (NM_024971) promoter-TSS (NM_024971) -729 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 216.5-109 chr7 71586753 71587166 + 1 NA intron (NM_022479, intron 6 of 10) L1MA4|LINE|L1 -279189 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 174.5-164 chr6 138098679 138098944 + 1 NA intron (NM_022121, intron 1 of 2) intron (NM_022121, intron 1 of 2) 8608 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 258.75-75 chr8 64041036 64041534 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 271855 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 137.5-3 chr1 19651963 19652150 + 1 NA intron (NM_001278166, intron 1 of 3) intron (NM_001278166, intron 1 of 3) 4446 NM_001278166 4681 Hs.654502 NM_005380 ENSG00000158747 NBL1 D1S1733E|DAN|DAND1|NB|NO3 NBL1, DAN family BMP antagonist protein-coding 191.5-33 chr14 20874181 20874526 + 1 NA Intergenic Intergenic -17050 NM_002935 6037 Hs.73839 NM_002935 ENSG00000169397 RNASE3 ECP|RAF1|RNS3 ribonuclease A family member 3 protein-coding 197.75-4 chr10 49502675 49502970 + 1 NA intron (NM_001346440, intron 6 of 20) MER20|DNA|hAT-Charlie 21459 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 203.5-73 chr2 119292093 119292447 + 1 NA Intergenic Intergenic -43199 NR_046721 100874111 Hs.704682 NR_046721 ENSG00000229867 STEAP3-AS1 - STEAP3 antisense RNA 1 ncRNA 132.5-191 chr5 15819409 15819761 + 1 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -115597 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 244.5-39 chr17 61672522 61672865 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -81474 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 196.75-38 chr14 38740529 38740928 + 1 NA Intergenic Intergenic -141868 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 144.75-116 chr3 196461189 196461359 + 1 NA Intergenic Intergenic -28847 NM_015562 26043 Hs.518524 NM_015562 ENSG00000163960 UBXN7 UBXD7 UBX domain protein 7 protein-coding 134.5-200 chr6 169948657 169948880 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13855 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 135.25-111 chr2 188599524 188599896 + 1 NA Intergenic Intergenic 190413 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 155.75-70 chr18 21448924 21449113 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 11 of 32) intron (NM_001142966, intron 11 of 32) 151686 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 162.5-14 chr10 49365170 49365355 + 1 NA 3' UTR (NM_001276451, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001276451, exon 7 of 7) 30827 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 216.5-14 chr11 110080933 110081195 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12328 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 263.75-32 chr21 20905382 20905645 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -92896 NM_001352596 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 274.5-36 chr2 69827106 69827552 + 1 NA TTS (NM_001320702) TTS (NM_001320702) -2331 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 116.25-104 chr2 57382927 57383092 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -524642 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 252.75-54 chr4 174935138 174935503 + 1 NA intron (NM_001130703, intron 3 of 3) intron (NM_001130703, intron 3 of 3) 16962 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 178.75-66 chr3 132426022 132426511 + 1 NA intron (NM_001329126, intron 1 of 56) intron (NM_001329126, intron 1 of 56) 8764 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 156.5-194 chr8 104875253 104875472 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -286338 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 259.5-18 chr11 20794842 20795351 + 1 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) intron (NM_001288714, intron 3 of 18) 125510 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 194.5-145 chr7 109305682 109306064 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -421286 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 220.75-27 chr15 63260135 63260397 + 1 NA intron (NM_016530, intron 6 of 7) intron (NM_016530, intron 6 of 7) -17284 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 305.5-17 chr17 68788173 68788895 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 160380 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 115.5-7 chr1 81101462 81101653 + 1 NA Intergenic Intergenic -204635 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 180.75-82 chr22 46538996 46539249 + 1 NA Intergenic Intergenic -1502 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 153.25-107 chr6 13957897 13958201 + 1 NA intron (NM_001165033, intron 1 of 1) intron (NM_001165033, intron 1 of 1) 32856 NM_001165033 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 273.25-3 chr1 152476542 152477006 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -34029 NM_178438 254910 Hs.516410 NM_178438 ENSG00000186207 LCE5A LEP18|SPRL5A late cornified envelope 5A protein-coding 275.25-38 chr6 50587447 50587954 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -125844 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 154.5-206 chr9 124880405 124880676 + 1 NA exon (NM_002077, exon 23 of 23) exon (NM_002077, exon 23 of 23) 18410 NM_030978 81873 Hs.132499 NM_030978 ENSG00000136950 ARPC5L ARC16-2 actin related protein 2/3 complex subunit 5 like protein-coding 269.75-36 chr3 2143263 2143728 + 1 NA intron (NR_046555, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 746 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 129.75-53 chr12 94244813 94244983 + 1 NA intron (NM_005761, intron 12 of 30) intron (NM_005761, intron 12 of 30) -17623 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 230.5-76 chr21 28074294 28074652 + 1 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) intron (NR_126010, intron 1 of 4) -15930 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 121.5-159 chr20 59170884 59171047 + 1 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -20055 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 140.75-4 chr1 84459189 84459532 + 1 NA Intergenic Intergenic -19906 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 194.25-17 chr11 73509779 73510023 + 1 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 88211 NM_001286050 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 222.25-66 chr5 46042008 46042428 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -345838 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 301.5-39 chr6 150476743 150477263 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 107991 NM_001318495 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 205.75-54 chr4 72861358 72861652 + 1 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 208211 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 189.5-90 chr3 12781951 12782184 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -12610 NM_001284406 55287 Hs.475502 NM_018306 ENSG00000088726 TMEM40 - transmembrane protein 40 protein-coding 254.25-43 chr3 121272293 121272646 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 18 of 27) L1M4c|LINE|L1 222829 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 159.75-164 chr7 110359011 110359490 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -399037 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 255.75-25 chr2 11629823 11630180 + 1 NA exon (NM_014668, exon 26 of 33) exon (NM_014668, exon 26 of 33) 40194 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 202.75-11 chr10 25467585 25467912 + 1 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) LTR60B|LTR|ERV1 -183964 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 271.25-17 chr12 41784399 41784787 + 1 NA Intergenic Intergenic 20404 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 149.5-222 chr9 96079022 96079283 + 1 NA intron (NR_033838, intron 1 of 8) intron (NR_033838, intron 1 of 8) 13313 NR_033838 158435 Hs.652615 NR_033838 LOC158435 - uncharacterized LOC158435 ncRNA 255.25-56 chr8 142977816 142978116 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -17862 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 117.5-198 chr5 143941454 143941678 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 129405 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 225.25-54 chr3 105393164 105393495 + 1 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 26420 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 141.25-55 chr15 55673159 55673489 + 1 NA intron (NM_173814, intron 10 of 19) intron (NM_173814, intron 10 of 19) 69828 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 213.5-122 chr8 77955345 77955590 + 1 NA Intergenic Intergenic 504770 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 215.75-44 chr17 30254204 30254420 + 1 NA intron (NM_000386, intron 11 of 11) intron (NM_000386, intron 11 of 11) -18615 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 144.5-182 chr5 133738296 133738564 + 1 NA Intergenic Intergenic -125889 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 137.5-36 chr10 117422303 117422497 + 1 NA Intergenic Intergenic -46960 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 243.5-17 chr10 53068877 53069282 + 1 NA Intergenic Intergenic -297379 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 226.5-100 chr8 85091814 85092327 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -15168 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 200.5-92 chr3 108160571 108160951 + 1 NA TTS (NM_018010) TTS (NM_018010) 34940 NR_110028 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 258.25-48 chr5 160100696 160100984 + 1 NA intron (NR_146216, intron 1 of 4) L1MB2|LINE|L1 18610 NM_001130864 114825 Hs.744960 NM_052927 ENSG00000170234 PWWP2A MST101 PWWP domain containing 2A protein-coding 307.75-14 chr3 37929003 37929340 + 1 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) L1MB1|LINE|L1 -40233 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 196.5-71 chr18 56259935 56260217 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -68814 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 133.25-130 chr3 38182586 38182838 + 1 NA intron (NM_005109, intron 1 of 17) L1MDb|LINE|L1 17175 NM_005109 9943 Hs.475970 NM_005109 ENSG00000172939 OXSR1 OSR1 oxidative stress responsive kinase 1 protein-coding 121.5-198 chr4 104866637 104866829 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -279142 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 127.5-188 chr5 40149412 40149575 + 1 NA Intergenic Intergenic 97202 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 141.5-209 chr7 39175725 39175946 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) 153299 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 172.5-72 chr15 27022583 27022800 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) intron (NM_001270873, intron 2 of 5) 51510 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 121.25-128 chr3 31120385 31120561 + 1 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger 41314 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 296.5-18 chr2 215114755 215115054 + 1 NA intron (NR_103740, intron 1 of 54) intron (NR_103740, intron 1 of 54) 23722 NM_173076 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 149.5-108 chr20 55695967 55696262 + 1 NA Intergenic Intergenic -268917 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 283.5-59 chr9 29492247 29492640 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -278842 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 215.5-81 chr4 138776863 138777124 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 235653 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 178.5-15 chr10 101916109 101916334 + 1 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) intron (NM_024541, intron 23 of 25) -72301 NM_173192 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 292.5-2 chr1 114793930 114794436 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -13498 NR_049741 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 175.25-84 chr21 26771522 26771771 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 73763 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 176.5-5 chr1 67320190 67320383 + 1 NA intron (NM_001319233, intron 2 of 15) intron (NM_001319233, intron 2 of 15) 12922 NM_001319233 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 160.5-107 chr22 25189629 25189934 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 9 of 10) AluJo|SINE|Alu -10077 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 271.5-68 chr5 37277598 37278044 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -28393 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 138.5-190 chr8 86236674 86236870 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -6391 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 251.75-64 chr5 123439751 123440112 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -16339 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 175.5-88 chr2 102780982 102781261 + 1 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) L1MDa|LINE|L1 19090 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 147.75-88 chr20 48003899 48004243 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -13954 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 198.75-15 chr11 34410182 34410519 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28584 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 224.5-7 chr1 207311807 207312228 + 1 NA Intergenic Intergenic -9661 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 173.25-60 chr2 165620788 165621223 + 1 NA intron (NM_024969, intron 2 of 4) intron (NM_024969, intron 2 of 4) 48669 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 179.75-101 chr5 62467238 62467578 + 1 NA intron (NM_016338, intron 6 of 29) intron (NM_016338, intron 6 of 29) 48524 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 187.5-17 chr10 30171732 30171981 + 1 NA Intergenic Intergenic -39996 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 200.75-4 chr1 68298944 68299435 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -66643 NM_001193334 79971 Hs.647659 NM_024911 ENSG00000116729 WLS C1orf139|EVI|GPR177|MRP|mig-14 Wnt ligand secretion mediator protein-coding 185.75-107 chr6 118790090 118790322 + 1 NA Intergenic Intergenic 7498 NR_037662 100287632 Hs.334026 NR_037662 SELENOKP3 - selenoprotein K pseudogene 3 pseudo 180.25-58 chr2 231366168 231366580 + 1 NA intron (NM_001352754, intron 23 of 24) MLT2D|LTR|ERVL 3666 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 113.5-52 chr11 115099678 115099798 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -233839 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 134.75-113 chr2 121791695 121791978 + 1 NA Intergenic Intergenic 36185 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 309.5-7 chr10 31310584 31311027 + 1 NA intron (NR_148979, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu -7612 NM_001323643 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 272.25-50 chr5 170975645 170976159 + 1 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) L1MB8|LINE|L1 113884 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 207.5-9 chr10 116389235 116389442 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -38509 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 380.75-5 chr5 40951699 40952425 + 1 NA intron (NM_000587, intron 9 of 17) intron (NM_000587, intron 9 of 17) 42565 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 198.5-126 chr6 122877088 122877575 + 1 NA Intergenic Intergenic 88073 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 131.5-77 chr15 86882460 86882646 + 1 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) MIRb|SINE|MIR -50327 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 262.75-50 chr8 16904158 16904716 + 1 NA Intergenic Intergenic 97908 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 279.5 chr1 30991807 30992142 + 1 NA intron (NM_001020658, intron 7 of 21) intron (NM_001020658, intron 7 of 21) -23737 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 238.5-52 chr21 28178570 28178969 + 1 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) intron (NR_126012, intron 3 of 5) 49898 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 154.5-165 chr6 150231972 150232172 + 1 NA intron (NM_030949, intron 3 of 3) L1ME3F|LINE|L1 89028 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 249.75-7 chr1 91276086 91276477 + 1 NA intron (NM_001017975, intron 32 of 38) L2c|LINE|L2 128556 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 272.5-26 chr14 68978251 68978771 + 1 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) CpG 791 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 136.25-26 chr10 104938913 104939206 + 1 NA intron (NM_014978, intron 3 of 26) intron (NM_014978, intron 3 of 26) -272843 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 253.5-73 chr7 38914762 38915193 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5777 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 190.5-117 chr4 95010377 95010634 + 1 NA intron (NM_001256792, intron 1 of 10) intron (NM_001256792, intron 1 of 10) 14273 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 117.75-94 chr19 32135056 32135173 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -29198 NR_110694 101927411 Hs.515337 NR_110694 ENSG00000267204 LINC01782 - long intergenic non-protein coding RNA 1782 ncRNA 211.25-40 chr2 77402727 77403041 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 119492 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 355.5-3 chr10 26035032 26035436 + 1 NA intron (NM_017433, intron 10 of 34) intron (NM_017433, intron 10 of 34) 101005 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 154.25-86 chr2 143603604 143603822 + 1 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) intron (NM_018460, intron 11 of 13) -333354 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 156.5-206 chr9 83508224 83508418 + 1 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) L1ME3A|LINE|L1 30080 NM_001244959 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 218.25-94 chr8 79624777 79625144 + 1 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 13843 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 178.25-125 chrX 155029418 155029804 + 1 NA intron (NM_023934, intron 1 of 4) AluSp|SINE|Alu 2767 NM_023934 65991 Hs.356050 NM_023934 ENSG00000165775 FUNDC2 DC44|HCBP6|HCC3|PD03104 FUN14 domain containing 2 protein-coding 336.25-4 chr12 54174048 54174570 + 1 NA Intergenic Intergenic 14648 NM_001351250 23583 Hs.632721 NM_014311 ENSG00000123415 SMUG1 FDG|HMUDG|UNG3 single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1 protein-coding 141.5-50 chr13 87830353 87830520 + 1 NA Intergenic Intergenic -19916 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 132.75-29 chr10 97213232 97213473 + 1 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) intron (NR_037909, intron 11 of 14) -27393 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 140.75-183 chr8 112528185 112528339 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 25 of 66) intron (NM_001363185, intron 25 of 66) -115231 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 154.5 chr1 12039158 12039338 + 1 NA Intergenic Intergenic 10090 NR_106787 102466982 NR_106787 ENSG00000276869 MIR6729 hsa-mir-6729 microRNA 6729 ncRNA 179.5-29 chr10 118107138 118107358 + 1 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -60307 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 149.75-117 chr3 185022477 185022721 + 1 NA intron (NM_001009921, intron 44 of 46) L1M5|LINE|L1 130461 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 318.5-37 chr7 4944495 4945010 + 1 NA intron (NR_072989, intron 1 of 8) AluY|SINE|Alu 14435 NR_072989 221938 Hs.558694 NM_198403 ENSG00000136297 MMD2 PAQR10 monocyte to macrophage differentiation associated 2 protein-coding 233.5-14 chr1 205240537 205240813 + 1 NA intron (NM_001242925, intron 1 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -5821 NM_001297611 9911 Hs.6360 NM_014858 ENSG00000133069 TMCC2 HUCEP11 transmembrane and coiled-coil domain family 2 protein-coding 340.75-18 chr4 65218897 65219311 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -214604 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 266.5-3 chr1 65047028 65047355 + 1 NA intron (NM_001321853, intron 2 of 26) (TT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10651 NR_037443 100500854 NR_037443 ENSG00000265996 MIR3671 - microRNA 3671 ncRNA 229.5-27 chr11 62915641 62916004 + 1 NA intron (NM_000738, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 5541 NM_000738 1128 Hs.632119 NM_000738 ENSG00000168539 CHRM1 HM1|M1|M1R cholinergic receptor muscarinic 1 protein-coding 190.25-108 chr6 128625578 128625785 + 1 NA Intergenic Intergenic -105082 NM_001291984 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 150.5-97 chr2 126065672 126065868 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 52215 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 156.5-27 chr11 81265292 81265602 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -502644 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 179.75-3 chr1 67983294 67983756 + 1 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) intron (NR_040077, intron 1 of 9) 68106 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 187.5-68 chr16 23562260 23562476 + 1 NA intron (NM_019116, intron 4 of 6) AluSz6|SINE|Alu 4641 NM_019116 56061 Hs.3459 NM_019116 ENSG00000103353 UBFD1 UBPH ubiquitin family domain containing 1 protein-coding 195.5-56 chr18 7840976 7841218 + 1 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 273781 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 155.5-72 chr17 60915054 60915378 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) intron (NM_001330413, intron 12 of 25) 237365 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 242.25-34 chr16 58573901 58574188 + 1 NA intron (NM_206999, intron 16 of 30) AluJo|SINE|Alu -14113 NR_002980 677830 Hs.677515 NR_002980 ENSG00000281910 SNORA50A ACA50|SNORA50|SNORA76A small nucleolar RNA, H/ACA box 50A snoRNA 202.25-36 chr2 36020227 36020553 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 335180 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 199.5-159 chr9 97120695 97120978 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -38891 NR_002942 340508 Hs.680438 NR_002942 ENSG00000228376 GAS2L1P2 - growth arrest specific 2 like 1 pseudogene 2 pseudo 203.75-100 chr7 49042888 49043186 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 118490 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 143.25-130 chr3 195921851 195922067 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -12950 NM_005781 10188 Hs.518513 NM_005781 ENSG00000061938 TNK2 ACK|ACK-1|ACK1|p21cdc42Hs tyrosine kinase non receptor 2 protein-coding 115.5-188 chr4 67795574 67795724 + 1 NA Intergenic (TAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -39563 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 251.75-65 chr5 126633262 126633664 + 1 NA intron (NM_207408, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 1758 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 351.25-7 chr17 79346532 79347026 + 1 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) L1M5|LINE|L1 169369 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 270.5-61 chr8 54333726 54334060 + 1 NA Intergenic Intergenic 3207 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 235.5-27 chr12 31976042 31976322 + 1 NA intron (NM_018169, intron 3 of 5) L1ME3B|LINE|L1 16767 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 191.25-47 chr19 42093861 42094133 + 1 NA intron (NM_001207026, intron 11 of 12) intron (NM_001207026, intron 11 of 12) 17831 NM_022752 64763 Hs.13323 NM_022752 ENSG00000105732 ZNF574 FP972 zinc finger protein 574 protein-coding 283.25-9 chr10 102780300 102780919 + 1 NA intron (NM_017787, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 4388 NM_017787 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 194.75-46 chr2 1879303 1879629 + 1 NA intron (NM_015025, intron 18 of 24) intron (NM_015025, intron 18 of 24) -134951 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 271.5-79 chr7 43404234 43404595 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 6 of 27) L1M6|LINE|L1 118128 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 326.75-11 chr16 87665866 87666326 + 1 NA intron (NM_020655, intron 2 of 4) AluSq|SINE|Alu 63588 NM_020655 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 125.75-56 chr15 34235137 34235414 + 1 NA exon (NM_001042495, exon 25 of 26) exon (NM_001042495, exon 25 of 26) 10259 NM_016454 51234 Hs.250905 NM_016454 ENSG00000128463 EMC4 PIG17|TMEM85 ER membrane protein complex subunit 4 protein-coding 119.25-92 chr2 67516993 67517307 + 1 NA Intergenic Intergenic 119817 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 241.75-36 chr18 66497696 66498072 + 1 NA Intergenic Intergenic 106206 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 147.25-76 chr3 25076578 25076782 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) intron (NM_001290216, intron 3 of 10) 247357 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 137.5-40 chr11 37625517 37625836 + 1 NA Intergenic Intergenic -312925 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 194.5-82 chr20 38101849 38102157 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 63267 NM_004613 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 141.5-225 chr8 77842247 77842450 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 391651 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 144.25-134 chr4 12007004 12007208 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -216345 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 172.5-22 chr1 221585694 221585915 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 151096 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 229.5-18 chr10 65604902 65605349 + 1 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) L1MC4|LINE|L1 33700 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 259.5-84 chr6 145607536 145607844 + 1 NA Intergenic Intergenic 79187 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 226.5-23 chr14 80062090 80062320 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -149214 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-48 chr15 77452535 77452796 + 1 NA intron (NM_018200, intron 2 of 10) L1MB7|LINE|L1 31777 NM_001304504 10363 Hs.69594 NM_018200 ENSG00000140382 HMG20A HMGX1|HMGXB1 high mobility group 20A protein-coding 190.75-39 chr17 30421015 30421380 + 1 NA intron (NM_001304, intron 3 of 20) intron (NM_001304, intron 3 of 20) 40719 NM_001199775 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 157.5-158 chr5 24906323 24906527 + 1 NA Intergenic Intergenic -65842 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 178.5-135 chr5 32588799 32589111 + 1 NA intron (NM_006713, intron 2 of 4) intron (NM_006713, intron 2 of 4) 3398 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 173.75-21 chr10 25649793 25649974 + 1 NA Intergenic Intergenic -1829 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 143.5-99 chr18 67390093 67390300 + 1 NA Intergenic Intergenic -126350 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 189.5-168 chrX 54178030 54178272 + 1 NA intron (NM_198456, intron 1 of 1) intron (NM_198456, intron 1 of 1) 5103 NM_001300788 54954 Hs.86045 NM_017848 ENSG00000184083 FAM120C CXorf17|ORF34 family with sequence similarity 120C protein-coding 254.25-58 chr7 4687946 4688257 + 1 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) L1MC5|LINE|L1 5806 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 141.25-138 chr5 95689710 95689940 + 1 NA intron (NM_001349303, intron 5 of 8) L1PREC2|LINE|L1 -6815 NR_125328 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 256.5-12 chr11 3873793 3874126 + 1 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) intron (NM_001277962, intron 1 of 12) 17897 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 112.5-176 chr3 177896068 177896290 + 1 NA intron (NR_110826, intron 2 of 2) MER103C|DNA|hAT-Charlie 79314 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 230.5-62 chr2 61144983 61145278 + 1 NA promoter-TSS (NM_001367069) promoter-TSS (NM_001367069) 14 NM_001367069 339804 Hs.140617 NM_001143959 ENSG00000237651 C2orf74 - chromosome 2 open reading frame 74 protein-coding 182.5-23 chr10 101450950 101451209 + 1 NA intron (NM_001256856, intron 2 of 13) intron (NM_001256856, intron 2 of 13) 96914 NM_003939 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 163.5-176 chr6 134206211 134206375 + 1 NA intron (NM_001143676, intron 3 of 13) intron (NM_001143676, intron 3 of 13) -28432 NM_001143677 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 134.5-136 chr3 121823394 121823598 + 1 NA intron (NM_001023571, intron 5 of 11) L1MEf|LINE|L1 11564 NM_001023570 9657 Hs.604110 NM_001023570 ENSG00000173226 IQCB1 NPHP5|PIQ|SLSN5 IQ motif containing B1 protein-coding 251.5-11 chr10 73118314 73118810 + 1 NA intron (NM_001283015, intron 2 of 7) intron (NM_001283015, intron 2 of 7) 7645 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 193.5-112 chr3 197089797 197090105 + 1 NA intron (NM_001366216, intron 14 of 23) intron (NM_001366216, intron 14 of 23) -60134 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 142.5-208 chr7 44061543 44061791 + 1 NA TTS (NM_001284315) TTS (NM_001284315) 3900 NM_000290 5224 Hs.632642 NM_000290 ENSG00000164708 PGAM2 GSD10|PGAM-M|PGAMM phosphoglycerate mutase 2 protein-coding 212.25-64 chr4 37437557 37437789 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 5 of 6) intron (NM_001144990, intron 5 of 6) -16252 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 176.75-115 chr7 103044337 103044611 + 1 NA intron (NM_001111038, intron 2 of 18) L1MC5a|LINE|L1 30094 NM_145032 222235 Hs.660029 NM_145032 ENSG00000161040 FBXL13 DRC6|Fbl13 F-box and leucine rich repeat protein 13 protein-coding 195.5-99 chr3 81440261 81440533 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 321248 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 225.25-41 chr2 37987180 37987474 + 1 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) L1MC1|LINE|L1 36863 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 200.5-136 chr8 71476977 71477298 + 1 NA intron (NM_001370334, intron 2 of 19) L1MB5|LINE|L1 70567 NM_172059 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 131.5-134 chr20 2187564 2187914 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -19189 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 252.25-27 chr19 28296306 28296629 + 1 NA Intergenic Intergenic -310221 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 157.5-32 chr10 116307269 116307552 + 1 NA Intergenic Intergenic -17038 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 159.5-144 chr3 63799195 63799476 + 1 NA Intergenic Intergenic -19964 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 254.75-41 chr5 78162826 78163152 + 1 NA intron (NM_003664, intron 12 of 26) intron (NM_003664, intron 12 of 26) 131709 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 127.25-117 chr3 25612216 25612378 + 1 NA intron (NM_001330700, intron 28 of 35) intron (NM_001330700, intron 28 of 35) 52075 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 215.25-31 chr14 61803000 61803371 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -8977 NM_001367650 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 118.75-104 chr2 119360705 119360922 + 1 NA intron (NM_001322329, intron 1 of 6) L1MD1|LINE|L1 5929 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 170.25-8 chr1 191542354 191542576 + 1 NA Intergenic Intergenic -313967 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 237.75-8 chr10 57567363 57567645 + 1 NA Intergenic Intergenic -262945 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 161.5-17 chr1 239018879 239019192 + 1 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -367533 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 180.5-59 chr17 61591938 61592273 + 1 NA promoter-TSS (NM_199290) promoter-TSS (NM_199290) -886 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 258.5-15 chr12 41965545 41966022 + 1 NA Intergenic Intergenic 179091 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 195.5-87 chr20 33108521 33108843 + 1 NA intron (NM_182519, intron 15 of 15) MIR|SINE|MIR 27170 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 256.5-42 chr22 44526482 44526975 + 1 NA Intergenic Intergenic -28495 NM_032287 84247 Hs.744991 NM_032287 ENSG00000188636 RTL6 LDOC1L|Mar6|Mart6|SIRH3|dJ1033E15.2 retrotransposon Gag like 6 protein-coding 208.5-69 chr2 48527595 48527952 + 1 NA Intergenic Intergenic -2152 NM_001198593 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 216.5-56 chr2 47458143 47458456 + 1 NA intron (NM_000251, intron 8 of 15) intron (NM_000251, intron 8 of 15) 55232 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 328.5-27 chr4 84267219 84267609 + 1 NA intron (NR_125909, intron 4 of 8) intron (NR_125909, intron 4 of 8) 31755 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 195.5-158 chr8 70701964 70702318 + 1 NA intron (NM_001287258, intron 4 of 5) intron (NM_001287258, intron 4 of 5) 32802 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 285.25-22 chr3 158659342 158659814 + 1 NA intron (NM_001308164, intron 10 of 18) intron (NM_001308164, intron 10 of 18) 13070 NM_020169 56925 Hs.478067 NM_020169 ENSG00000079257 LXN ECI|TCI latexin protein-coding 208.75-76 chr6 126428387 126428684 + 1 NA intron (NR_104462, intron 2 of 3) intron (NR_104462, intron 2 of 3) -56096 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 290.25-13 chr17 66084716 66085255 + 1 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) intron (NM_001302891, intron 6 of 24) 106907 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 136.5-196 chr6 66075459 66075688 + 1 NA Intergenic Intergenic 287694 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 189.75-8 chr1 229194968 229195309 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -20337 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 150.5-2 chr1 8783406 8783592 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 34141 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 260.75-63 chr8 81463087 81463464 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -1752 NM_001080526 646480 Hs.653176 NM_001080526 ENSG00000205186 FABP9 PERF|PERF15|T-FABP|TLBP fatty acid binding protein 9 protein-coding 246.5-14 chr11 78321132 78321473 + 1 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 20578 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 153.25-11 chr10 19228048 19228237 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) L1ME1|LINE|L1 179341 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 125.5-104 chr16 84057106 84057357 + 1 NA intron (NM_003791, intron 21 of 22) intron (NM_003791, intron 21 of 22) -15074 NM_001080442 146167 NM_001080442 ENSG00000166558 SLC38A8 FVH2 solute carrier family 38 member 8 protein-coding 113.5-34 chr10 66579263 66579430 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -346690 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 174.75-33 chr14 63210838 63211046 + 1 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 6499 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 171.5-160 chr9 8095575 8095809 + 1 NA Intergenic Intergenic -295914 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 114.25-32 chr11 110914399 110914555 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 182841 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 126.75-230 chr7 112187202 112187497 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 19050 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 147.5-153 chr4 6522316 6522496 + 1 NA intron (NM_001206994, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 33209 NM_001206995 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 231.25-15 chr14 48348772 48349225 + 1 NA Intergenic Intergenic -553984 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 136.75-24 chr10 45525439 45525596 + 1 NA intron (NM_001282866, intron 2 of 7) L1MC3|LINE|L1 9854 NM_001282866 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 149.5-58 chr14 45930423 45930601 + 1 NA Intergenic Intergenic -133647 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 153.5-140 chr4 31490065 31490339 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -16342 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 210.5-140 chr9 31278159 31278473 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 103174 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 213.5-51 chr17 49319767 49320072 + 1 NA intron (NM_014897, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 -31465 NR_106745 102465137 NR_106745 ENSG00000273500 MIR6129 hsa-mir-6129 microRNA 6129 ncRNA 120.75-79 chr2 101052827 101053069 + 1 NA intron (NM_001102426, intron 4 of 19) intron (NM_001102426, intron 4 of 19) 50659 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 218.75-61 chr4 29587611 29588041 + 1 NA Intergenic Intergenic 373534 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 200.25-22 chr12 9110098 9110492 + 1 NA intron (NM_000014, intron 5 of 35) intron (NM_000014, intron 5 of 35) 5934 NM_001347424 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 132.5-243 chr8 110930374 110930643 + 1 NA Intergenic Intergenic 96925 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 197.25-39 chr18 8299377 8299705 + 1 NA intron (NM_002845, intron 18 of 30) AluSx|SINE|Alu 67493 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 212.25-90 chr7 111379903 111380321 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 182179 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 281.75-8 chr1 211762672 211763103 + 1 NA intron (NM_014873, intron 6 of 7) intron (NM_014873, intron 6 of 7) -66750 NR_135818 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 171.5-134 chr7 5565439 5565838 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -27178 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 117.5-207 chr6 138216927 138217067 + 1 NA 3' UTR (NM_021635, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_021635, exon 1 of 1) 1493 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 130.5-207 chr5 82053691 82053935 + 1 NA intron (NM_031482, intron 2 of 7) intron (NM_031482, intron 2 of 7) 81790 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 337.25-5 chr14 71944006 71944430 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) intron (NM_001370288, intron 1 of 16) 10691 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 131.5-219 chr7 89586300 89586461 + 1 NA Intergenic Intergenic -533020 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 116.5-26 chr10 80602146 80602274 + 1 NA intron (NM_207372, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu -47587 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 133.25-104 chr2 127223232 127223449 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3041 NM_001367501 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 123.5-173 chr5 132652032 132652257 + 1 NA intron (NR_132125, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 3748 NR_132126 101927761 Hs.598812 NR_132124 ENSG00000223442 TH2LCRR TH2-LCR T helper type 2 locus control region associated RNA ncRNA 356.5-4 chr10 113758258 113758892 + 1 NA intron (NM_001193435, intron 2 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -6244 NM_182601 79949 Hs.228320 NM_024889 ENSG00000148735 PLEKHS1 C10orf81|HEL185 pleckstrin homology domain containing S1 protein-coding 194.5-149 chr7 143908342 143908576 + 1 NA Intergenic Intergenic -6283 NM_014719 9747 Hs.735149 NM_014719 ENSG00000198420 TCAF1 FAM115A TRPM8 channel associated factor 1 protein-coding 112.5-26 chr10 99894342 99894498 + 1 NA intron (NM_015221, intron 11 of 16) intron (NM_015221, intron 11 of 16) 19672 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 204.5-48 chr17 70870202 70870534 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 331811 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 135.25-55 chr12 81026297 81026474 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -51694 NM_024560 79611 Hs.259559 NM_024560 ENSG00000111058 ACSS3 - acyl-CoA synthetase short chain family member 3 protein-coding 168.25-69 chr2 63582341 63582698 + 1 NA intron (NR_148704, intron 1 of 18) L1MEc|LINE|L1 5958 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 159.5-134 chr22 47028673 47028905 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 10 of 12) intron (NM_001284305, intron 10 of 12) -112747 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 260.5-36 chr2 208239512 208239885 + 1 NA intron (NM_001282386, intron 8 of 9) intron (NM_001282386, intron 8 of 9) 14605 NM_001282387 3417 Hs.593422 NM_005896 ENSG00000138413 IDH1 HEL-216|HEL-S-26|IDCD|IDH|IDP|IDPC|PICD isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1, cytosolic protein-coding 284.5-23 chr17 48383558 48383986 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 2 of 12) AluSx1|SINE|Alu 46442 NM_001075099 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 206.5-32 chr16 4988013 4988395 + 1 NA exon (NM_014692, exon 4 of 16) exon (NM_014692, exon 4 of 16) 29874 NM_014692 9717 Hs.512856 NM_014692 ENSG00000103184 SEC14L5 PRELID4B SEC14 like lipid binding 5 protein-coding 146.5-19 chr1 175795473 175795839 + 1 NA Intergenic Intergenic -52061 NM_001328635 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 156.5-179 chr7 135846593 135846790 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -97878 NM_001369697 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 174.5-154 chr5 130250091 130250383 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 345772 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 189.75-113 chr7 77941540 77941923 + 1 NA intron (NM_020432, intron 12 of 16) L2c|LINE|L2 101601 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 118.75-167 chr6 94846329 94846611 + 1 NA Intergenic Intergenic 730981 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 188.25-13 chr10 86518143 86518594 + 1 NA intron (NM_001318328, intron 1 of 18) intron (NM_001318328, intron 1 of 18) 3416 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 236.5-6 chr10 14821893 14822522 + 1 NA intron (NM_001029954, intron 3 of 3) intron (NM_001029954, intron 3 of 3) 15830 NM_001029954 441549 Hs.559067 NM_001029954 ENSG00000185267 CDNF ARMETL1 cerebral dopamine neurotrophic factor protein-coding 124.25-52 chr14 46413873 46414067 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -57389 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 185.5-128 chr5 44079517 44079811 + 1 NA Intergenic Intergenic -309068 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 258.75-18 chr11 124194535 124195082 + 1 NA Intergenic Intergenic 9592 NM_001355213 26497 Hs.538726 NM_001355213 ENSG00000197309 OR10D3 HTPCRX09|OR10D3P olfactory receptor family 10 subfamily D member 3 (putative) protein-coding 139.5-99 chr2 107094818 107095047 + 1 NA Intergenic Intergenic -207823 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 199.25-16 chr11 92004225 92004579 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -220632 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 130.5-98 chr15 53389832 53390073 + 1 NA Intergenic G-rich|Low_complexity|Low_complexity 150900 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 286.75-37 chr5 73559761 73560075 + 1 NA intron (NM_023039, intron 3 of 8) AluJo|SINE|Alu 5721 NM_023039 57763 Hs.239154 NM_023039 ENSG00000164331 ANKRA2 ANKRA ankyrin repeat family A member 2 protein-coding 130.75-174 chr7 19716532 19716763 + 1 NA Intergenic Intergenic -7610 NM_001002926 221830 Hs.353035 NM_001002926 ENSG00000105849 TWISTNB - TWIST neighbor protein-coding 245.75-42 chr4 60661157 60661521 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -261280 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 124.5-72 chr15 62359354 62359536 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 16416 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 193.5-144 chr6 102038619 102038829 + 1 NA intron (NM_001166247, intron 14 of 16) intron (NM_001166247, intron 14 of 16) 639739 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 205.5-45 chr15 63557661 63557980 + 1 NA intron (NM_001256702, intron 4 of 13) intron (NM_001256702, intron 4 of 13) -39567 NM_001367809 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 239.25-74 chr5 151962181 151962511 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 3448 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 139.25-103 chr20 52723449 52723823 + 1 NA Intergenic Intergenic 102798 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 219.5-106 chr5 162327198 162327570 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 259742 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 117.5-135 chr21 27666661 27666841 + 1 NA Intergenic Intergenic -55628 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 162.75-11 chr10 22385372 22385625 + 1 NA intron (NM_172242, intron 4 of 9) intron (NM_172242, intron 4 of 9) 40002 NM_012443 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 227.25-73 chr7 49956859 49957139 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 136247 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 152.5-7 chr1 163585642 163585861 + 1 NA Intergenic Intergenic -162560 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 146.25-74 chr2 135897816 135898085 + 1 NA Intergenic Intergenic -21507 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 159.5-81 chr18 6183355 6183646 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 12 of 16) intron (NM_001365769, intron 12 of 16) -73244 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 190.25-31 chr12 121414339 121414627 + 1 NA intron (NM_194271, intron 2 of 6) intron (NM_194271, intron 2 of 6) 14365 NM_194271 80196 Hs.292804 NM_025126 ENSG00000170633 RNF34 CARP-1|CARP1|RFI|RIF|RIFF|hRFI ring finger protein 34 protein-coding 265.75-32 chr2 55202631 55203045 + 1 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu -29065 NM_001135592 6233 Hs.311640 NM_002954 ENSG00000143947 RPS27A CEP80|HEL112|S27A|UBA80|UBC|UBCEP1|UBCEP80 ribosomal protein S27a protein-coding 258.5-29 chr17 48427966 48428277 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 1 of 12) intron (NM_001075099, intron 1 of 12) 2093 NM_001075099 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 170.75-135 chr8 105002728 105002983 + 1 NA Intergenic Intergenic -315583 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 152.25-16 chr10 28363289 28363594 + 1 NA Intergenic Intergenic -60377 NR_134517 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 160.75-61 chr19 5617004 5617327 + 1 NA intron (NM_014649, intron 2 of 20) L1M5|LINE|L1 5611 NM_014649 9667 Hs.655392 NM_014649 ENSG00000130254 SAFB2 - scaffold attachment factor B2 protein-coding 171.75-86 chr20 17657410 17657711 + 1 NA intron (NM_001042576, intron 4 of 25) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 24682 NM_001365613 6238 Hs.472213 NM_004587 ENSG00000125844 RRBP1 ES/130|ES130|RRp|hES ribosome binding protein 1 protein-coding 203.5-21 chr10 71781579 71781798 + 1 NA intron (NM_022124, intron 39 of 67) intron (NM_022124, intron 39 of 67) -8168 NM_022153 64115 Hs.47382 NM_022153 ENSG00000107738 VSIR B7-H5|B7H5|C10orf54|DD1alpha|Dies1|GI24|PD-1H|PP2135|SISP1|VISTA V-set immunoregulatory receptor protein-coding 226.25-11 chr10 68339098 68339527 + 1 NA intron (NM_001322437, intron 5 of 9) intron (NM_001322437, intron 5 of 9) -6384 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 210.5-92 chr4 159802143 159802436 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -24505 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 151.5-12 chr1 212500007 212500235 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -45573 NR_125985 101929565 NR_125985 ENSG00000228067 LINC01740 - long intergenic non-protein coding RNA 1740 ncRNA 176.75-48 chr16 14015081 14015373 + 1 NA intron (NR_110909, intron 1 of 2) MER113|DNA|hAT-Charlie 791 NR_110909 101927311 NR_110909 ENSG00000262097 LINC02185 - long intergenic non-protein coding RNA 2185 ncRNA 186.5-11 chr1 190820925 190821259 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 196202 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 221.5-33 chr16 84944892 84945142 + 1 NA Intergenic Intergenic 66518 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 144.25-2 chr1 20590704 20590868 + 1 NA intron (NM_001785, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 1689 NM_001785 978 Hs.466910 NM_001785 ENSG00000158825 CDA CDD cytidine deaminase protein-coding 134.75-18 chr1 217050127 217050325 + 1 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 26766 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 295.75-13 chr2 163232269 163232848 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -393791 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 239.75-45 chr3 52699539 52699877 + 1 NA intron (NM_001278281, intron 4 of 10) intron (NM_001278281, intron 4 of 10) 3990 NM_152932 55830 Hs.297304 NM_018446 ENSG00000016864 GLT8D1 AD-017|MSTP139 glycosyltransferase 8 domain containing 1 protein-coding 234.5-104 chr9 25454064 25454407 + 1 NA Intergenic Intergenic 224623 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 163.5-173 chr6 77010656 77010952 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -417181 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 162.5-138 chr5 51407843 51408087 + 1 NA Intergenic Intergenic 24517 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 269.5-9 chr11 110013513 110013908 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -79682 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 152.5-59 chr16 3336090 3336283 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -19703 NM_012368 4993 Hs.258574 NM_012368 ENSG00000168158 OR2C1 OLFmf3|OR2C2P olfactory receptor family 2 subfamily C member 1 protein-coding 304.75-24 chr4 57678620 57679096 + 1 NA Intergenic Intergenic 252986 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 115.5-84 chr16 34581411 34581685 + 1 NA Intergenic Intergenic -200068 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 363.5-5 chr12 14756608 14757250 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 14202 NM_175054 121504 Hs.745457 NM_175054 ENSG00000197837 HIST4H4 H4/p histone cluster 4 H4 protein-coding 155.25-77 chr16 78938797 78939088 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 661795 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 254.75-3 chr1 190705784 190706302 + 1 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 81153 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 128.25-150 chr4 121873142 121873367 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -2757 NM_018190 55212 Hs.591694 NM_018190 ENSG00000138686 BBS7 BBS2L1 Bardet-Biedl syndrome 7 protein-coding 216.75-14 chr10 97114585 97114852 + 1 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) intron (NM_003061, intron 4 of 36) 11962 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-12 chr1 180133294 180133574 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21399 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 254.75-56 chr9 73995449 73995804 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -375905 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 137.75-129 chr3 10363068 10363220 + 1 NA intron (NM_001001331, intron 12 of 22) intron (NM_001001331, intron 12 of 22) 31418 NR_030614 100126334 NR_030614 ENSG00000216135 MIR885 MIRN885|hsa-mir-885|mir-885 microRNA 885 ncRNA 202.5-43 chr14 69835110 69835492 + 1 NA Intergenic Intergenic 23541 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 189.5-53 chr16 57452031 57452476 + 1 NA intron (NM_020312, intron 2 of 8) intron (NM_020312, intron 2 of 8) -4725 NM_001308358 57019 Hs.4900 NM_020313 ENSG00000005194 CIAPIN1 Anamorsin|CIAE2|DRE2|PRO0915 cytokine induced apoptosis inhibitor 1 protein-coding 118.5-138 chr3 185959912 185960066 + 1 NA promoter-TSS (NR_151491) promoter-TSS (NR_151491) 46 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 278.75-24 chr3 168998375 168998710 + 1 NA Intergenic Intergenic 96597 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 176.75-39 chr14 66132468 66132781 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -353747 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 149.5-155 chr5 97005432 97005682 + 1 NA intron (NM_005575, intron 9 of 17) intron (NM_005575, intron 9 of 17) 47124 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 207.5-54 chr2 103883348 103883764 + 1 NA Intergenic Intergenic 524776 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 207.5-55 chr2 121253097 121253365 + 1 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) intron (NM_014553, intron 2 of 14) 31971 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 192.5-146 chrX 42499509 42499882 + 1 NA Intergenic Intergenic 278468 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 126.75-137 chr20 57523615 57523788 + 1 NA exon (NM_001269048, exon 1 of 6) exon (NM_001269048, exon 1 of 6) 1166 NR_072975 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 218.5-67 chr20 46651635 46651968 + 1 NA promoter-TSS (NM_022829) promoter-TSS (NM_022829) -342 NM_001193342 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 186.25-114 chr7 128962944 128963177 + 1 NA intron (NM_001191028, intron 20 of 21) intron (NM_001191028, intron 20 of 21) 21792 NM_001364314 3663 Hs.521181 NM_032643 ENSG00000128604 IRF5 SLEB10 interferon regulatory factor 5 protein-coding 156.5-175 chr7 83002530 83002701 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 160269 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 136.75-193 chr8 80620473 80620619 + 1 NA Intergenic Intergenic 134320 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 143.25-42 chr13 60554602 60554943 + 1 NA intron (NM_030794, intron 12 of 13) intron (NM_030794, intron 12 of 13) -118183 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 180.75-120 chr5 124527820 124528006 + 1 NA Intergenic Intergenic -89393 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 168.25-52 chr15 84793832 84794072 + 1 NA intron (NM_014630, intron 5 of 10) L1MB7|LINE|L1 -22728 NM_020778 57538 Hs.459183 NM_020778 ENSG00000136383 ALPK3 CMH27|MAK|MIDORI alpha kinase 3 protein-coding 182.5-160 chr8 56062237 56062548 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 11509 NR_002437 26795 NR_002437 ENSG00000238650 SNORD54 RNU54|U54 small nucleolar RNA, C/D box 54 snoRNA 113.75-60 chr14 66294493 66294609 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -191820 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 187.5-69 chr16 46949925 46950263 + 1 NA Intergenic Intergenic 23580 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 233.5-18 chr10 14226280 14226672 + 1 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 104408 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 188.5-148 chr8 71699526 71699720 + 1 NA Intergenic Intergenic -143500 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 230.75-25 chr15 64098005 64098296 + 1 NA intron (NM_003099, intron 1 of 14) FLAM_A|SINE|Alu 2168 NM_001242933 6642 Hs.188634 NM_003099 ENSG00000028528 SNX1 HsT17379|VPS5 sorting nexin 1 protein-coding 137.75-23 chr10 33152091 33152263 + 1 NA Intergenic Intergenic -35370 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 123.5-157 chr5 22782573 22782767 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 70674 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 130.75-161 chr5 154111735 154111950 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 72875 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 113.75-193 chr8 109284663 109284860 + 1 NA intron (NM_032869, intron 5 of 9) L1PA16|LINE|L1 45172 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 129.5-115 chr2 52701976 52702191 + 1 NA TTS (NR_039630) TTS (NR_039630) 532 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 203.5-5 chr1 56176432 56176684 + 1 NA Intergenic Intergenic 231471 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 291.5-24 chr2 215850217 215850646 + 1 NA Intergenic Intergenic -6895 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 156.5-98 chr21 21524850 21525018 + 1 NA intron (NM_001352592, intron 17 of 18) L1MC1|LINE|L1 212385 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 222.5-12 chr1 224442321 224442905 + 1 NA intron (NM_001322303, intron 1 of 5) intron (NM_001322303, intron 1 of 5) 7764 NM_001322304 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 159.5-218 chr9 35332071 35332336 + 1 NA intron (NM_006377, intron 10 of 38) AluSx3|SINE|Alu -9693 NM_001371188 294.25-36 chr9 6219662 6220028 + 1 NA intron (NM_001199640, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 4038 NM_001199640 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 118.75-210 chr9 33209526 33209767 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -30521 NM_014471 27290 Hs.555934 NM_014471 ENSG00000122711 SPINK4 HEL136|PEC-60|PEC60 serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 protein-coding 227.25-38 chr19 40261713 40262167 + 1 NA intron (NM_001243028, intron 1 of 12) intron (NM_001243028, intron 1 of 12) 3411 NM_001330511 208 Hs.631535 NM_001626 ENSG00000105221 AKT2 HIHGHH|PKBB|PKBBETA|PRKBB|RAC-BETA AKT serine/threonine kinase 2 protein-coding 138.5-51 chr14 20983102 20983370 + 1 NA Intergenic Intergenic -6744 NM_022734 64745 Hs.512693 NM_022734 ENSG00000165792 METTL17 METT11D1 methyltransferase like 17 protein-coding 206.5-45 chr2 39433157 39433455 + 1 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) intron (NM_003618, intron 1 of 33) 3979 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 137.25-140 chr6 74233397 74233744 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 164119 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 251.5-43 chr2 198348047 198348349 + 1 NA intron (NR_110267, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 26899 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 123.25-110 chr2 177273544 177273840 + 1 NA Intergenic Intergenic -8561 NM_001313902 4780 Hs.744006 NM_006164 ENSG00000116044 NFE2L2 HEBP1|IMDDHH|NRF2 nuclear factor, erythroid 2 like 2 protein-coding 135.5-57 chr14 56776127 56776336 + 1 NA Intergenic Intergenic 29436 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 188.5-90 chr21 34279077 34279362 + 1 NA Intergenic Intergenic -84805 NM_172201 9992 Hs.551521 NM_172201 ENSG00000159197 KCNE2 ATFB4|LQT5|LQT6|MIRP1 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 2 protein-coding 141.5-137 chr22 43286062 43286264 + 1 NA intron (NM_173050, intron 4 of 21) MIR|SINE|MIR 10221 NR_134582 101927447 Hs.621227 NR_134582 ENSG00000203527 LOC101927447 - uncharacterized LOC101927447 ncRNA 182.75 chr1 25849257 25849482 + 1 NA intron (NM_024037, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 10088 NM_024037 79000 Hs.149305 NM_024037 ENSG00000127423 AUNIP AIBP|C1orf135 aurora kinase A and ninein interacting protein protein-coding 210.25-86 chr9 22108937 22109289 + 1 NA intron (NR_003529, intron 14 of 18) intron (NR_003529, intron 14 of 18) -99800 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 166.25-71 chr19 30179051 30179228 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -193245 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 187.75-116 chr8 107536440 107536815 + 1 NA Intergenic Intergenic -38709 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 197.75-79 chr6 99465505 99465744 + 1 NA intron (NM_001346024, intron 9 of 15) intron (NM_001346024, intron 9 of 15) -40279 NM_001322413 25957 Hs.520287 NM_015491 ENSG00000132424 PNISR C6orf111|HSPC306|SFRS18|SRrp130|bA98I9.2 PNN interacting serine and arginine rich protein protein-coding 199.25-13 chr10 102965697 102966160 + 1 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) -47593 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 258.5-69 chr8 74242260 74242740 + 1 NA intron (NM_020647, intron 4 of 5) intron (NM_020647, intron 4 of 5) 78861 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 276.25-18 chr16 57767209 57767811 + 1 NA intron (NM_001318712, intron 7 of 17) intron (NM_001318712, intron 7 of 17) 4842 NR_106830 102465463 NR_106830 ENSG00000274816 MIR6772 hsa-mir-6772 microRNA 6772 ncRNA 170.25-104 chr4 29619778 29619988 + 1 NA Intergenic Intergenic 405591 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 227.5-82 chr5 35486758 35487172 + 1 NA Intergenic Intergenic -130898 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 184.5-31 chr11 105859979 105860218 + 1 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 162142 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 184.75-80 chr5 78325900 78326179 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -31284 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 153.25-127 chr8 35373208 35373551 + 1 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) 137904 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 142.5-160 chr4 166558911 166559146 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 675398 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 168.5-188 chr8 127286435 127286627 + 1 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 41894 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 141.5-199 chr6 64328777 64328994 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) HERV1_I-int|LTR|ERV1 522049 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 162.5-156 chr6 158519623 158520009 + 1 NA Intergenic Intergenic -16620 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 195.75-40 chr13 66719613 66719992 + 1 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -105367 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 258.5-26 chr16 66864049 66864362 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -16310 NM_001329928 57546 Hs.632214 NM_020786 ENSG00000172840 PDP2 PDPC 2|PPM2B|PPM2C2 pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 protein-coding 191.75-127 chr8 111766086 111766528 + 1 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 389668 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 133.5-249 chr7 96129400 96129649 + 1 NA intron (NM_001160210, intron 15 of 17) intron (NM_001160210, intron 15 of 17) 90232 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 284.5-11 chr13 69700020 69700536 + 1 NA TTS (NM_020866) TTS (NM_020866) -406935 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 118.25-52 chr12 118213988 118214233 + 1 NA exon (NM_016281, exon 10 of 21) exon (NM_016281, exon 10 of 21) -23575 NM_001346494 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 192.5-37 chr14 30256607 30257008 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -302316 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 164.75-46 chr14 34594672 34594926 + 1 NA intron (NM_001366519, intron 6 of 12) intron (NM_001366519, intron 6 of 12) 35349 NM_001366519 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 171.75-9 chr1 159053776 159054125 + 1 NA intron (NM_001206567, intron 10 of 10) intron (NM_001206567, intron 10 of 10) 22816 NM_004833 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 133.5-117 chr2 70827655 70827907 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -7182 NM_173535 165530 Hs.681239 NM_173535 ENSG00000152672 CLEC4F CLECSF13|KCLR C-type lectin domain family 4 member F protein-coding 412.5-2 chr10 7607117 7607769 + 1 NA intron (NM_001001851, intron 7 of 11) AluJo|SINE|Alu 12230 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 136.5-171 chr5 11945324 11945538 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -40985 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 137.5-16 chr1 196533164 196533368 + 1 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 49215 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 239.25-31 chr15 23748689 23748989 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -61534 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 200.5-29 chr12 126899941 126900360 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -25460 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 230.5-41 chr15 65182171 65182607 + 1 NA intron (NM_006660, intron 1 of 13) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 2953 NM_006660 10845 Hs.113823 NM_006660 ENSG00000166855 CLPX EPP2 caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit protein-coding 185.25-69 chr2 237080243 237080498 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -5071 NM_198189 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 228.5-108 chr9 108575432 108575737 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 280402 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 144.75-49 chr12 130318455 130318636 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19342 NM_004764 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 264.25-49 chr7 64599986 64600434 + 1 NA intron (NR_077227, intron 2 of 2) BSR/Beta|Satellite|Satellite 17600 NR_033245 641746 Hs.488363 NR_033245 LOC641746 - glycine cleavage system protein H (aminomethyl carrier) pseudogene pseudo 194.5-101 chr4 30660993 30661254 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -59246 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 125.75-128 chr3 105582469 105582607 + 1 NA Intergenic Intergenic 215629 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 212.25 chr1 71667014 71667498 + 1 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) intron (NM_173808, intron 4 of 6) 169756 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 187.5-20 chr10 77335875 77336210 + 1 NA intron (NM_001322838, intron 1 of 29) intron (NM_001322838, intron 1 of 29) 14719 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 236.5-83 chr7 38587548 38587834 + 1 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) intron (NM_001635, intron 1 of 20) 43682 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 165.75-48 chr13 114265189 114265652 + 1 NA intron (NM_001330104, intron 16 of 16) intron (NM_001330104, intron 16 of 16) -8408 NR_039724 100616227 NR_039724 ENSG00000265450 MIR4502 - microRNA 4502 ncRNA 177.75-49 chr15 76238152 76238457 + 1 NA intron (NM_000126, intron 9 of 11) intron (NM_000126, intron 9 of 11) 21848 NR_028510 7302 Hs.684881 NR_002721 TYRO3P - TYRO3P protein tyrosine kinase pseudogene pseudo 249.5-4 chr1 54919566 54920095 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32635 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 219.25-60 chr5 22630340 22630614 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) L1PA15|LINE|L1 222867 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 171.25-156 chr9 36567288 36567546 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5445 NM_001256693 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 122.75-193 chr8 21237210 21237388 + 1 NA Intergenic Intergenic -60940 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 196.5-76 chr2 9906746 9907054 + 1 NA intron (NM_001318977, intron 8 of 13) AluJo|SINE|Alu -44793 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 165.25-86 chr21 43019024 43019309 + 1 NA intron (NM_004571, intron 7 of 10) AluSq|SINE|Alu 44604 NM_004571 5316 Hs.431043 NM_004571 ENSG00000160199 PKNOX1 PREP1|pkonx1c PBX/knotted 1 homeobox 1 protein-coding 160.5-55 chr14 69415561 69415811 + 1 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) intron (NM_001330185, intron 1 of 5) 16994 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 227.75-2 chr1 71496930 71497267 + 1 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 339914 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 241.25-38 chr2 180792580 180792963 + 1 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) intron (NR_104324, intron 3 of 4) 100667 NR_104319 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 312.5-38 chr8 129744821 129745284 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 41572 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 360.75-2 chr10 51665810 51666305 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 33538 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 188.25-55 chr2 274383 274627 + 1 NA intron (NM_007099, intron 3 of 5) intron (NM_007099, intron 3 of 5) 9558 NM_004300 52 Hs.558296 NM_004300 ENSG00000143727 ACP1 HAAP|LMW-PTP|LMWPTP acid phosphatase 1 protein-coding 203.75-22 chr12 17638093 17638445 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -35030 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 127.25-24 chr10 64502084 64502313 + 1 NA Intergenic Intergenic -323330 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 194.5-22 chr11 66402105 66402409 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -18747 NM_001318804 266743 Hs.256036 NM_178864 ENSG00000174576 NPAS4 Le-PAS|NXF|PASD10|bHLHe79 neuronal PAS domain protein 4 protein-coding 273.5-50 chr3 108040931 108041398 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 49924 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 171.5-92 chr20 11170265 11170662 + 1 NA Intergenic Intergenic 102920 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 184.5-27 chr11 88086845 88087146 + 1 NA Intergenic Intergenic 88448 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 242.25-6 chr1 169899187 169899488 + 1 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -5378 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 213.25-36 chr21 18491886 18492125 + 1 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -88220 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 136.5-50 chr11 99039431 99039568 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 18550 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 273.75-2 chr1 31381872 31382338 + 1 NA Intergenic Intergenic -8817 NM_001320996 2170 Hs.576372 NM_004102 ENSG00000121769 FABP3 FABP11|H-FABP|M-FABP|MDGI|O-FABP fatty acid binding protein 3 protein-coding 170.5-70 chr15 63605206 63605516 + 1 NA Intergenic Intergenic -4534 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 166.75-127 chr6 69548333 69548545 + 1 NA Intergenic Intergenic 248027 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 219.25-20 chr12 7726859 7727275 + 1 NA Intergenic Intergenic 15634 NM_199286 359787 Hs.131358 NM_199286 ENSG00000187569 DPPA3 Pgc7|STELLA developmental pluripotency associated 3 protein-coding 189.5-159 chr9 37463546 37463760 + 1 NA intron (NM_014872, intron 1 of 1) intron (NM_014872, intron 1 of 1) 1797 NM_014872 9925 Hs.161276 NM_014872 ENSG00000168795 ZBTB5 - zinc finger and BTB domain containing 5 protein-coding 155.75-173 chrX 106954410 106954590 + 1 NA intron (NM_001085354, intron 14 of 16) intron (NM_001085354, intron 14 of 16) 34098 NM_020384 9075 Hs.522746 NM_020384 ENSG00000165376 CLDN2 - claudin 2 protein-coding 191.75-113 chr6 141572813 141573031 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 515877 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 277.5-44 chr3 53066485 53066986 + 1 NA Intergenic Intergenic -20662 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 130.5-121 chr18 7298500 7298651 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 67471 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 247.75-22 chr15 71026410 71026743 + 1 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) AluJo|SINE|Alu -114873 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 290.25-37 chr8 136652940 136653657 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 122500 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 241.5-78 chr5 8878447 8878732 + 1 NA intron (NR_109932, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 38857 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 211.75-28 chr15 82663833 82664196 + 1 NA intron (NM_001278512, intron 19 of 26) intron (NM_001278512, intron 19 of 26) -1339 NM_001348441 8120 Hs.199593 NM_004644 ENSG00000103723 AP3B2 EIEE48|NAPTB adaptor related protein complex 3 subunit beta 2 protein-coding 210.5-86 chr4 44213440 44213929 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 196622 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 135.5-154 chr4 167884933 167885120 + 1 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -207511 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 179.5-43 chr12 60055667 60055913 + 1 NA Intergenic Intergenic 366420 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 182.5-12 chr1 211882197 211882409 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 51342 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 215.25-74 chr4 179951161 179951686 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 1207726 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 345.5-15 chr15 60735895 60736365 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 54561 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 174.5-62 chr14 60218879 60219216 + 1 NA Intergenic Intergenic -26703 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 112.75-199 chr8 101212022 101212232 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -6063 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 114.75-168 chr7 1187628 1187787 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 26922 NR_110070 101927021 Hs.529566 NR_110065 LOC101927021 - uncharacterized LOC101927021 ncRNA 219.5-109 chr6 21959187 21959606 + 1 NA intron (NR_015410, intron 5 of 11) MIRb|SINE|MIR 187797 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 128.5-170 chr5 18028403 18028758 + 1 NA Intergenic Intergenic 221306 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 249.5-45 chr19 56350271 56350596 + 1 NA intron (NM_001322072, intron 2 of 6) MER83B-int|LTR|ERV1 -17666 NR_003127 147947 Hs.467326 NM_194319 ENSG00000240225 ZNF542P ZNF542 zinc finger protein 542, pseudogene pseudo 113.5-71 chr14 38632773 38632942 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -249739 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 141.5-183 chr5 116804234 116804538 + 1 NA Intergenic Intergenic -42177 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 293.5-18 chr16 72196860 72197252 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -24606 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 116.5-226 chr7 12671498 12671696 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -15230 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 258.5-74 chr8 130193086 130193526 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) AluSz|SINE|Alu 103227 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 206.75-91 chr8 84963885 84964188 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -143202 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 146.75-125 chr5 65308756 65308939 + 1 NA intron (NR_135689, intron 9 of 25) L1M5|LINE|L1 173073 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 144.75-172 chr8 65492823 65493119 + 1 NA Intergenic Intergenic 69695 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 134.25-10 chr1 149878505 149878658 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 8101 NM_003528 8349 Hs.2178 NM_003528 ENSG00000184678 HIST2H2BE GL105|H2B|H2B.1|H2BFQ|H2BGL105|H2BQ histone cluster 2 H2B family member e protein-coding 146.5-210 chr7 51739585 51739951 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -346512 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 195.5-83 chr2 196732470 196732719 + 1 NA 3' UTR (NM_001353340, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001353340, exon 11 of 11) 19056 NM_001353340 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 162.5-111 chr3 54553718 54553995 + 1 NA intron (NM_018398, intron 5 of 37) L3|LINE|CR1 86001 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 197.75-19 chr12 115413428 115413894 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -729486 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 245.75-54 chr6 149615906 149616325 + 1 NA intron (NM_007044, intron 4 of 10) L1MB3|LINE|L1 22499 NR_077247 645958 Hs.632614 NR_077247 RPS18P9 RPS18_6_767 ribosomal protein S18 pseudogene 9 pseudo 127.75-47 chr11 89528793 89529072 + 1 NA intron (NM_001143837, intron 2 of 20) intron (NM_001143837, intron 2 of 20) -36713 NM_001300995 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 172.25-35 chr14 52798790 52799019 + 1 NA Intergenic Intergenic -7297 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 218.75-44 chr20 4395692 4396140 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -146629 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 258.5-9 chr10 71410590 71410927 + 1 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) L1ME3|LINE|L1 13824 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 149.75-177 chrX 56108614 56108909 + 1 NA intron (NM_001324104, intron 2 of 6) L1M4|LINE|L1 -123595 NM_007250 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 156.25-67 chr2 43946126 43946404 + 1 NA intron (NM_133259, intron 20 of 37) intron (NM_133259, intron 20 of 37) 49724 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 135.25-185 chr6 161231106 161231464 + 1 NA intron (NM_020133, intron 2 of 8) intron (NM_020133, intron 2 of 8) 42776 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 225.25-24 chr15 99035889 99036175 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 21328 NR_126487 104564224 Hs.32769 NR_126487 LUNAR1 - leukemia-associated non-coding IGF1R activator RNA 1 ncRNA 160.5-60 chr14 103027424 103027736 + 1 NA intron (NM_006035, intron 1 of 36) L1MB7|LINE|L1 29969 NM_006035 9578 Hs.654634 NM_006035 ENSG00000198752 CDC42BPB MRCKB CDC42 binding protein kinase beta protein-coding 263.5-67 chr9 30101604 30101898 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 306703 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 125.25-63 chr14 49542435 49542770 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 43778 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 213.5-53 chr17 79957911 79958223 + 1 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) L1M5|LINE|L1 -7214 NM_001271845 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 417.5-4 chr17 60683725 60684550 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 3 of 25) intron (NM_001330413, intron 3 of 25) 6286 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 253.25 chr1 62153842 62154120 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 43 of 43) AluSq2|SINE|Alu -40868 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 126.5-168 chr4 36708818 36709005 + 1 NA Intergenic Intergenic -67011 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 260.75-30 chr2 116838671 116839174 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -975769 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 293.5-41 chr8 108651883 108652343 + 1 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 135481 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 230.5-94 chr4 186346639 186346947 + 1 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) intron (NR_033900, intron 1 of 3) 80604 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 355.75-12 chr3 111222847 111223468 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 151341 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 189.5-37 chr12 53094239 53094523 + 1 NA Intergenic Intergenic -3286 NM_002178 3489 Hs.274313 NM_002178 ENSG00000167779 IGFBP6 IBP6 insulin like growth factor binding protein 6 protein-coding 120.5-221 chr7 130138481 130138633 + 1 NA Intergenic Intergenic -3174 NR_149033 100128325 Hs.105944 NR_149033 ENSG00000229196 LOC100128325 - uncharacterized LOC100128325 ncRNA 263.75-34 chr22 33150345 33150760 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 42023 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 164.5-2 chr1 22257092 22257301 + 1 NA Intergenic Intergenic -9043 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 150.75-55 chr14 29270099 29270317 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -484421 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 212.5-123 chr9 13815290 13815548 + 1 NA Intergenic Intergenic -112552 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 181.25-11 chr1 191544891 191545217 + 1 NA Intergenic Intergenic -316556 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 127.5-20 chr1 217444503 217444701 + 1 NA intron (NM_018040, intron 9 of 9) intron (NM_018040, intron 9 of 9) 186488 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 279.5-48 chr4 70870422 70870718 + 1 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -30680 NM_002092 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 114.5-264 chr8 120343902 120344037 + 1 NA intron (NM_021110, intron 44 of 47) intron (NM_021110, intron 44 of 47) 101181 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 327.5-7 chr13 83837615 83837966 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 44603 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 130.25-46 chr12 42418935 42419160 + 1 NA intron (NM_016488, intron 9 of 12) L1MA7|LINE|L1 64568 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 312.5-39 chr8 138468750 138469218 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) AluSx|SINE|Alu 28277 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 137.25-153 chr7 83031934 83032266 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 130784 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 288.75-31 chr2 121676408 121676906 + 1 NA intron (NR_037857, intron 2 of 3) L1PBa|LINE|L1 26668 NR_037856 254128 Hs.712685 NR_037856 ENSG00000236859 NIFK-AS1 - NIFK antisense RNA 1 ncRNA 250.25-2 chr10 76904966 76905273 + 1 NA intron (NR_120655, intron 2 of 3) intron (NR_120655, intron 2 of 3) 17075 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 179.5-185 chr8 120708433 120708829 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 -52622 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 217.75-74 chr8 96907568 96907821 + 1 NA intron (NM_016134, intron 4 of 7) intron (NM_016134, intron 4 of 7) 262452 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 252.5-65 chr5 20127914 20128302 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -139908 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 212.25-19 chr11 112675944 112676339 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -120339 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 146.5-115 chr2 177229619 177229976 + 1 NA TTS (NM_001145413) TTS (NM_001145413) 17003 NR_138470 220988 Hs.516539 NM_194247 ENSG00000170144 HNRNPA3 2610510D13Rik|D10S102|FBRNP|HNRPA3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 protein-coding 236.25-7 chr1 227943190 227943504 + 1 NA intron (NM_003395, intron 1 of 3) intron (NM_003395, intron 1 of 3) -1664 NR_049806 100847072 NR_049806 ENSG00000264483 MIR5008 - microRNA 5008 ncRNA 147.25-35 chr14 66270972 66271149 + 1 NA Intergenic Intergenic -215311 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 229.75-18 chr14 73150832 73151330 + 1 NA intron (NM_000021, intron 3 of 11) AluY|SINE|Alu 14574 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 346.25-15 chr6 152964847 152965290 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 17973 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 267.5-55 chr4 123759438 123759796 + 1 NA intron (NR_027105, intron 3 of 5) L1ME2|LINE|L1 -14647 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 219.25-34 chr2 78618178 78618569 + 1 NA Intergenic Intergenic 72842 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 230.75-20 chr14 47746376 47746665 + 1 NA Intergenic Intergenic 14584 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 203.25-82 chr5 49656337 49656562 + 1 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 784839 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 153.5-101 chr2 100326673 100326945 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4076 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 169.5-68 chr19 51114215 51114401 + 1 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -5899 NM_145232 90353 Hs.148425 NM_145232 ENSG00000142544 CTU1 ATPBD3|NCS6 cytosolic thiouridylase subunit 1 protein-coding 143.75-23 chr10 89949471 89949703 + 1 NA intron (NR_110655, intron 3 of 3) intron (NR_110655, intron 3 of 3) 7786 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 139.25-18 chr10 65573863 65574029 + 1 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) intron (NR_120647, intron 2 of 5) 2521 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 234.75-36 chr2 59158404 59158767 + 1 NA Intergenic Intergenic -59123 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 198.75-62 chr3 97402497 97402711 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -37003 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 197.5-129 chr5 122430248 122430610 + 1 NA intron (NR_131761, intron 5 of 12) MIRb|SINE|MIR 39340 NM_001308105 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 161.75-23 chr10 53628397 53628732 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -856864 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 200.75-58 chr2 176332728 176332962 + 1 NA intron (NM_001319097, intron 9 of 9) intron (NM_001319097, intron 9 of 9) 63403 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 238.75-47 chr5 74906493 74906808 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -39684 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 214.75-67 chr5 151862435 151862800 + 1 NA intron (NM_000171, intron 3 of 8) MER103C|DNA|hAT-Charlie 62234 NM_001146040 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 249.5-93 chr8 83465087 83465703 + 1 NA Intergenic (TCTATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 61637 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 196.5-55 chr15 65427660 65427912 + 1 NA Intergenic Intergenic -4839 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 267.5-8 chr1 229543033 229543411 + 1 NA intron (NM_012089, intron 3 of 12) intron (NM_012089, intron 3 of 12) 15485 NM_012089 23456 Hs.17614 NM_012089 ENSG00000135776 ABCB10 EST20237|M-ABC2|MTABC2 ATP binding cassette subfamily B member 10 protein-coding 218.5-7 chr1 71303821 71304243 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 222708 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 228.75-91 chr8 137490453 137490929 + 1 NA Intergenic Intergenic -77103 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 262.75-21 chr17 71146613 71146952 + 1 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 55397 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 204.5-74 chr20 54954332 54954787 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -468484 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 196.5-6 chr1 106384293 106384677 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -356232 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 143.5-169 chr5 13014901 13015074 + 1 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 17899 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 205.25-60 chr2 210457213 210457505 + 1 NA intron (NM_001136574, intron 3 of 9) intron (NM_001136574, intron 3 of 9) 19346 NM_001136574 10314 Hs.13351 NM_006055 ENSG00000115365 LANCL1 GPR69A|p40 LanC like 1 protein-coding 158.75-4 chr1 64056981 64057265 + 1 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) L1MB7|LINE|L1 55082 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 183.5-127 chr6 141042055 141042387 + 1 NA Intergenic MER61C|LTR|ERV1 358407 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 198.5-125 chr6 104968042 104968363 + 1 NA intron (NM_001004317, intron 2 of 3) intron (NM_001004317, intron 2 of 3) 11095 NM_001004317 389421 Hs.23616 NM_001004317 ENSG00000187772 LIN28B CSDD2 lin-28 homolog B protein-coding 157.5-211 chr8 92168643 92168889 + 1 NA Intergenic Intergenic -65381 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 158.5-161 chr5 166363819 166364052 + 1 NA Intergenic Intergenic 562435 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 202.25-9 chr1 194895973 194896285 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 1192586 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 114.5-88 chr14 45124497 45124768 + 1 NA intron (NM_002013, intron 3 of 6) FAM|SINE|Alu 9849 NM_002013 2287 Hs.509226 NM_002013 ENSG00000100442 FKBP3 FKBP-25|FKBP-3|FKBP25|PPIase FKBP prolyl isomerase 3 protein-coding 328.5-33 chr8 55200149 55200829 + 1 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 98461 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 293.75-36 chr4 71293870 71294226 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) intron (NM_001098484, intron 3 of 25) -45005 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 183.5-90 chr3 106199632 106199973 + 1 NA Intergenic Intergenic -330401 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 200.25-109 chr8 47283364 47283679 + 1 NA intron (NM_001352956, intron 2 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22583 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 293.5-33 chr4 172435196 172435588 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) L2|LINE|L2 253525 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-53 chr14 79987190 79987506 + 1 NA Intergenic Intergenic -224071 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 335.25-7 chr10 76616028 76616475 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -271793 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 164.5-141 chr3 144667098 144667492 + 1 NA Intergenic Intergenic 694214 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 187.5-25 chr11 8702658 8702947 + 1 NA intron (NM_005418, intron 16 of 22) intron (NM_005418, intron 16 of 22) 17363 NR_002977 677826 Hs.745552 NR_002977 ENSG00000212607 SNORA3B ACA3-2|SNORA45|SNORA45B small nucleolar RNA, H/ACA box 3B snoRNA 131.5-232 chr8 72372589 72372744 + 1 NA Intergenic Intergenic -121032 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 198.5-116 chr5 79665040 79665253 + 1 NA intron (NM_001349553, intron 13 of 16) intron (NM_001349553, intron 13 of 16) -24690 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 182.5-55 chr15 56304488 56304681 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -59502 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 172.5-55 chr12 105007378 105007627 + 1 NA 3' UTR (NM_152318, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_152318, exon 4 of 4) 21186 NM_152318 121053 Hs.295563 NM_152318 ENSG00000151131 C12orf45 - chromosome 12 open reading frame 45 protein-coding 192.25-97 chr6 138983384 138983738 + 1 NA intron (NM_031922, intron 1 of 19) MIRb|SINE|MIR 4700 NM_001128617 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 264.25-13 chr14 26540886 26541322 + 1 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 12326 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 138.5-123 chr22 25731607 25731931 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10419 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 303.5-51 chr8 126478852 126479392 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 79356 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 177.5-69 chr18 71014887 71015105 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -364042 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 134.75-91 chr17 69938562 69938783 + 1 NA Intergenic Intergenic -23035 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 180.5-104 chr3 185931276 185931577 + 1 NA intron (NM_004593, intron 1 of 8) intron (NM_004593, intron 1 of 8) 6588 NM_001243879 6434 Hs.533122 NM_004593 ENSG00000136527 TRA2B Htra2-beta|PPP1R156|SFRS10|SRFS10|TRA2-BETA|TRAN2B transformer 2 beta homolog protein-coding 253.25-5 chr1 222946309 222946778 + 1 NA intron (NM_001369594, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 18119 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 125.5-211 chr5 145558887 145559090 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 276354 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 169.5 chr1 2234041 2234304 + 1 NA intron (NM_003036, intron 1 of 6) intron (NM_003036, intron 1 of 6) 5853 NM_003036 6497 Hs.656507 NM_003036 ENSG00000157933 SKI SGS|SKV SKI proto-oncogene protein-coding 309.5 chr1 81150125 81150775 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -155742 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 270.5-4 chr1 97449593 97450132 + 1 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) intron (NM_000110, intron 14 of 22) -347059 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 151.5-39 chr13 45179142 45179328 + 1 NA intron (NM_004128, intron 4 of 7) intron (NM_004128, intron 4 of 7) 21810 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 264.25-3 chr1 220008252 220008739 + 1 NA intron (NM_004446, intron 13 of 31) intron (NM_004446, intron 13 of 31) 38010 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 158.25-64 chr2 113871152 113871352 + 1 NA intron (NR_110174, intron 1 of 4) intron (NR_110174, intron 1 of 4) -18682 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 224.25-55 chr3 85011981 85012335 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) 50106 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 159.75-133 chr5 57039768 57040048 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -87778 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 263.25-18 chr12 112920230 112920516 + 1 NA TTS (NM_016816) TTS (NM_016816) 13411 NM_001320151 4938 Hs.524760 NM_002534 ENSG00000089127 OAS1 E18/E16|IFI-4|OIAS|OIASI 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1 protein-coding 153.5-183 chr7 54371116 54371294 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 40508 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 222.25-6 chr10 59075521 59075916 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 76200 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 269.5-31 chr2 184564758 184565248 + 1 NA Intergenic Intergenic -33526 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 187.5-14 chr1 244005137 244005643 + 1 NA intron (NR_033883, intron 4 of 11) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -43549 NM_001278196 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 172.5-137 chr4 36787740 36788013 + 1 NA Intergenic Intergenic -145976 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 172.75-136 chr8 129272181 129272413 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -31057 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 141.5-179 chr5 77096292 77096477 + 1 NA intron (NR_024398, intron 2 of 3) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -9099 NM_032367 84327 Hs.584988 NM_032367 ENSG00000132846 ZBED3 - zinc finger BED-type containing 3 protein-coding 153.5-151 chr4 185715701 185715976 + 1 NA intron (NM_001145672, intron 1 of 20) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -58869 NM_001145674 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 142.75-175 chr7 92021096 92021385 + 1 NA intron (NM_147185, intron 12 of 49) intron (NM_147185, intron 12 of 49) 80365 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 301.75-26 chr4 55877451 55877822 + 1 NA intron (NM_001024924, intron 8 of 18) intron (NM_001024924, intron 8 of 18) 23986 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 138.25-64 chr17 29212166 29212406 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -31888 NM_203318 399687 Hs.462590 NM_078471 ENSG00000196535 MYO18A MAJN|MYSPDZ|SP-R210|SPR210 myosin XVIIIA protein-coding 267.25-22 chr2 202443808 202444233 + 1 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) MER20|DNA|hAT-Charlie 67693 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 194.5-122 chr5 157535971 157536183 + 1 NA intron (NM_033274, intron 4 of 22) intron (NM_033274, intron 4 of 22) 39698 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 201.75-2 chr1 35922935 35923217 + 1 NA 3' UTR (NM_012199, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012199, exon 19 of 19) -8029 NM_024852 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 198.25 chr1 18458055 18458439 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -22683 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 160.75-149 chr8 10759970 10760395 + 1 NA intron (NR_146188, intron 1 of 2) intron (NR_146188, intron 1 of 2) -29671 NM_031439 83595 Hs.709543 NM_031439 ENSG00000171056 SOX7 - SRY-box transcription factor 7 protein-coding 235.5-21 chr11 28052866 28053182 + 1 NA intron (NM_031217, intron 13 of 16) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -3791 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 268.5-61 chr8 88596967 88597415 + 1 NA Intergenic Intergenic -269708 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 135.5-155 chr4 187863420 187863629 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -132247 NM_174900 132625 Hs.335787 NM_174900 ENSG00000179059 ZFP42 REX-1|REX1|ZNF754|zfp-42 ZFP42 zinc finger protein protein-coding 296.5-26 chr4 58838760 58839138 + 1 NA Intergenic Intergenic -145333 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 277.5-71 chr7 158113234 158113755 + 1 NA intron (NM_130842, intron 8 of 21) intron (NM_130842, intron 8 of 21) 258909 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 141.25-23 chr10 91444248 91444471 + 1 NA intron (NM_182765, intron 2 of 20) intron (NM_182765, intron 2 of 20) 34074 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 150.5-196 chr7 5523449 5523616 + 1 NA intron (NR_126168, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu 7069 NM_001101 60 Hs.520640 NM_001101 ENSG00000075624 ACTB BRWS1|PS1TP5BP1 actin beta protein-coding 267.25-19 chr2 124613410 124613806 + 1 NA intron (NM_130773, intron 12 of 23) intron (NM_130773, intron 12 of 23) 588321 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 183.75-51 chr19 16250556 16250871 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 52802 NM_001130524 8907 Hs.71040 NM_032493 ENSG00000072958 AP1M1 AP47|CLAPM2|CLTNM|MU-1A adaptor related protein complex 1 subunit mu 1 protein-coding 365.5-17 chr9 112364891 112365391 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -14768 NM_001195822 84263 Hs.59486 NM_032303 ENSG00000119471 HSDL2 C9orf99|SDR13C1 hydroxysteroid dehydrogenase like 2 protein-coding 195.25-72 chr5 37508700 37508996 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 8 of 17) L1MD|LINE|L1 129530 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 244.5-75 chr5 5355128 5355385 + 1 NA Intergenic Intergenic -67421 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 215.75-48 chr2 10468320 10468588 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 18726 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 185.25-105 chr5 104749819 104750085 + 1 NA Intergenic Intergenic -349522 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 382.75-3 chr2 54223429 54224057 + 1 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 32486 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 181.5-80 chr2 86238664 86238985 + 1 NA intron (NM_001164732, intron 3 of 4) intron (NM_001164732, intron 3 of 4) 39367 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 188.75-17 chr11 95261264 95261582 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -28948 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 200.5-124 chr6 72410913 72411122 + 1 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 44271 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 206.75-77 chr6 40152019 40152328 + 1 NA Intergenic Intergenic 203833 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 207.5-41 chr18 55905546 55905906 + 1 NA intron (NR_110755, intron 1 of 3) intron (NR_110755, intron 1 of 3) 14473 NR_110755 101927273 Hs.434335 NR_110755 ENSG00000260930 LINC01416 - long intergenic non-protein coding RNA 1416 ncRNA 199.5-83 chr2 107539067 107539353 + 1 NA intron (NR_146968, intron 2 of 2) intron (NR_146968, intron 2 of 2) 9791 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 203.75-21 chr12 12450889 12451139 + 1 NA intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 93936 NM_058169 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 195.25-36 chr15 96052181 96052634 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 75434 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 112.75-207 chr9 69888064 69888328 + 1 NA intron (NM_001010940, intron 5 of 5) intron (NM_001010940, intron 5 of 5) 67379 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 330.5-32 chr8 128079665 128080333 + 1 NA intron (NR_003367, intron 6 of 8) L1MC2|LINE|L1 30847 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 171.75-16 chr10 63530105 63530338 + 1 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) intron (NM_001001330, intron 1 of 7) -8331 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 126.5-195 chr5 118720348 118720578 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 124275 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 214.25-71 chr6 63142216 63142436 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 177651 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 288.5-49 chr8 82730670 82730983 + 1 NA Intergenic Intergenic -181278 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 255.25-17 chr16 75075710 75076079 + 1 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 40878 NM_194436 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 212.5-30 chr14 86661213 86661676 + 1 NA Intergenic Intergenic -244334 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 155.5-188 chr6 150756688 150756964 + 1 NA intron (NM_001329803, intron 2 of 13) intron (NM_001329803, intron 2 of 13) 35727 NM_001329806 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 147.5-33 chr11 60145181 60145421 + 1 NA Intergenic Intergenic 38030 NM_001330275 64231 Hs.523702 NM_022349 ENSG00000110077 MS4A6A 4SPAN3|4SPAN3.2|CD20L3|CDA01|MS4A6|MST090|MSTP090 membrane spanning 4-domains A6A protein-coding 225.5-8 chr1 214499172 214499415 + 1 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) L1ME4b|LINE|L1 52309 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 244.5-103 chr8 137130795 137131160 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 282611 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 158.5-53 chr13 43954851 43955012 + 1 NA Intergenic Intergenic -67404 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 135.25-154 chr5 16687962 16688227 + 1 NA intron (NM_012334, intron 28 of 40) intron (NM_012334, intron 28 of 40) -71036 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 267.5-7 chr1 180762035 180762434 + 1 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) L1PA4|LINE|L1 130212 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 277.5-13 chr11 131359421 131360032 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -10889 NM_001352005 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 179.5-78 chr18 11288519 11288886 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -139940 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 161.5-194 chr9 17233004 17233266 + 1 NA intron (NM_001365029, intron 3 of 25) L1ME4b|LINE|L1 98095 NM_001114395 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 139.25-50 chr14 57883647 57883811 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -17637 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 179.5-131 chr3 174821108 174821342 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -38109 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 179.5-107 chr20 60752019 60752254 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 187574 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 161.75-30 chr12 4039987 4040255 + 1 NA Intergenic Intergenic -166673 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 145.5-155 chr5 40271023 40271183 + 1 NA Intergenic Intergenic 218812 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 174.5-95 chr2 51704969 51705287 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) -665520 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 244.5-17 chr11 74439867 74440209 + 1 NA Intergenic Intergenic 27517 NM_005472 10008 Hs.523899 NM_005472 ENSG00000175538 KCNE3 BRGDA6|HOKPP|HYPP|MiRP2 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 3 protein-coding 438.5-9 chr5 8708836 8709466 + 1 NA Intergenic Intergenic -130581 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 140.25-87 chr2 35192774 35192923 + 1 NA Intergenic Intergenic -278557 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 189.25-121 chr8 92180421 92180644 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -77147 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 279.25-38 chr6 131547286 131547761 + 1 NA Intergenic Intergenic -25703 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 146.5-99 chr2 29751950 29752188 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 169517 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 262.75-10 chr11 129123655 129124130 + 1 NA intron (NM_001142685, intron 3 of 21) intron (NM_001142685, intron 3 of 21) 68306 NM_001142685 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 139.5-174 chr5 42270300 42270492 + 1 NA Intergenic Intergenic -95051 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 142.5-66 chr15 43191120 43191292 + 1 NA intron (NR_027513, intron 5 of 8) intron (NR_027513, intron 5 of 8) 5803 NR_027514 23582 Hs.36794 NM_012142 ENSG00000166946 CCNDBP1 DIP1|GCIP|HHM cyclin D1 binding protein 1 protein-coding 194.5-99 chr3 196309602 196309901 + 1 NA intron (NM_152773, intron 2 of 4) AluSp|SINE|Alu 8489 NM_152773 255758 Hs.733180 NM_152773 ENSG00000213123 TCTEX1D2 SRTD17 Tctex1 domain containing 2 protein-coding 146.25-131 chr6 159260094 159260305 + 1 NA intron (NM_032532, intron 18 of 22) intron (NM_032532, intron 18 of 22) -90192 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 234.5-84 chr7 3673359 3673695 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 372275 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 190.5-30 chr12 7910448 7910669 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19362 NM_001286237 144195 Hs.655169 NM_153449 ENSG00000173262 SLC2A14 GLUT14|SLC2A3P3 solute carrier family 2 member 14 protein-coding 118.75-164 chr6 52208666 52208913 + 1 NA Intergenic Intergenic 22414 NM_002190 3605 Hs.41724 NM_002190 ENSG00000112115 IL17A CTLA-8|CTLA8|IL-17|IL-17A|IL17 interleukin 17A protein-coding 127.5-219 chr7 7828490 7828670 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -109973 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 122.5-191 chr5 175459078 175459371 + 1 NA Intergenic Intergenic -15042 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 214.5-133 chr9 95383660 95384134 + 1 NA Intergenic Intergenic -66188 NM_001243744 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 211.5-127 chr5 102034405 102034727 + 1 NA Intergenic Intergenic 261718 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 249.75-9 chr1 167730123 167730417 + 1 NA intron (NM_024569, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 8288 NM_003953 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 136.5-57 chr12 74358915 74359152 + 1 NA Intergenic Intergenic -66402 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 233.5-20 chr10 30549092 30549444 + 1 NA Intergenic (TCTCTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 80485 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 169.5-5 chr1 150283999 150284193 + 1 NA intron (NM_001300838, intron 3 of 5) AluSq2|SINE|Alu 1542 NM_144697 148523 Hs.54680 NM_144697 ENSG00000159208 CIART C1orf51|CHRONO|GM129 circadian associated repressor of transcription protein-coding 176.25-58 chr19 15320042 15320266 + 1 NA intron (NM_001330384, intron 1 of 11) intron (NM_001330384, intron 1 of 11) 12385 NM_001330384 23476 Hs.187763 NM_014299 ENSG00000141867 BRD4 CAP|HUNK1|HUNKI|MCAP bromodomain containing 4 protein-coding 161.25-28 chr11 105379365 105379763 + 1 NA Intergenic Intergenic -230509 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 167.25-24 chr11 115349379 115349771 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 15998 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 183.5-41 chr14 47301825 47302178 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 41245 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 266.75 chr1 23370819 23371298 + 1 NA non-coding (NR_033690, exon 1 of 1) non-coding (NR_033690, exon 1 of 1) -1222 NM_001370652 80818 Hs.293798 NM_030634 ENSG00000125945 ZNF436 ZNF|Zfp46 zinc finger protein 436 protein-coding 190.25-123 chr8 89359845 89360073 + 1 NA Intergenic Intergenic 397752 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 182.75-48 chr14 72476253 72476496 + 1 NA intron (NM_001370286, intron 10 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie -40446 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 115.75-163 chr4 173327582 173327744 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 6106 NM_001130689 3148 Hs.434953 NM_002129 ENSG00000164104 HMGB2 HMG2 high mobility group box 2 protein-coding 128.5-49 chr12 12537634 12537823 + 1 NA intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 25135 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 313.5-32 chr6 144968465 144969224 + 1 NA Intergenic Intergenic 563189 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 334.5-20 chr4 48460026 48460468 + 1 NA Intergenic Intergenic -23096 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 186.75-27 chr13 74594285 74594651 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 41625 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 168.5-85 chr2 102376986 102377207 + 1 NA intron (NM_003855, intron 5 of 10) intron (NM_003855, intron 5 of 10) 20813 NM_001282399 8809 Hs.469521 NM_003855 ENSG00000115604 IL18R1 CD218a|CDw218a|IL-1Rrp|IL18RA|IL1RRP interleukin 18 receptor 1 protein-coding 239.75-20 chr14 60169241 60169650 + 1 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 419 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 272.5-43 chr20 56920520 56921007 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 291457 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 142.5-40 chr11 7189434 7189691 + 1 NA Intergenic Intergenic -45204 NR_031683 100313774 NR_031683 ENSG00000221703 MIR302E MIRN302E microRNA 302e ncRNA 231.5-30 chr14 88257929 88258279 + 1 NA intron (NM_138317, intron 2 of 6) intron (NM_138317, intron 2 of 6) 12807 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 129.75-82 chr18 12591400 12591715 + 1 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) L2a|LINE|L2 65175 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 143.5-193 chr6 166603126 166603334 + 1 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) LTR86A1|LTR|ERVL 24021 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 180.75-46 chr16 11055013 11055425 + 1 NA intron (NM_015226, intron 17 of 22) L2a|LINE|L2 110655 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 155.5-81 chr18 53960965 53961182 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 261339 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 302.5-12 chr14 51154040 51154556 + 1 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -58594 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 129.75-177 chr8 17449486 17449685 + 1 NA Intergenic Intergenic -36234 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 164.5-219 chr8 144603765 144604076 + 1 NA intron (NM_025251, intron 1 of 10) intron (NM_025251, intron 1 of 10) 1775 NM_025251 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 133.75-101 chr2 115884104 115884313 + 1 NA Intergenic Intergenic 540393 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 167.25-3 chr1 42290481 42290754 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 2 of 12) intron (NM_001198850, intron 2 of 12) 44338 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 193.5-143 chr6 96522047 96522325 + 1 NA intron (NM_015323, intron 1 of 18) CpG 380 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 171.75-21 chr10 115931217 115931419 + 1 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) intron (NM_207303, intron 28 of 28) 263471 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 193.25-105 chr7 17942261 17942726 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1985 NM_001350868 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 147.5-214 chr8 128299804 128300123 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 149847 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 121.5-144 chr2 162849657 162849821 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -10972 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 122.25-180 chr7 127876053 127876373 + 1 NA intron (NM_014390, intron 12 of 23) intron (NM_014390, intron 12 of 23) -121296 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 216.75-36 chr2 16870947 16871221 + 1 NA Intergenic Intergenic -205250 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 223.25-70 chr7 90958997 90959379 + 1 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) intron (NM_012395, intron 8 of 13) 249372 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 153.5-141 chr4 45374189 45374479 + 1 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR -647700 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 290.75-20 chr17 31896243 31896761 + 1 NA intron (NM_018428, intron 2 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 5206 NM_018428 55813 Hs.589862 NM_018428 ENSG00000108651 UTP6 C17orf40|HCA66 UTP6 small subunit processome component protein-coding 115.5-231 chr7 55369612 55369762 + 1 NA intron (NM_018697, intron 1 of 8) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 4239 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 196.5-32 chr11 75164122 75164701 + 1 NA intron (NM_007256, intron 3 of 13) intron (NM_007256, intron 3 of 13) 4579 NM_001145211 11309 Hs.7884 NM_007256 ENSG00000137491 SLCO2B1 OATP-B|OATP2B1|OATPB|SLC21A9 solute carrier organic anion transporter family member 2B1 protein-coding 439.5-10 chr2 73023371 73024063 + 1 NA intron (NR_138476, intron 3 of 14) MIR|SINE|MIR 35455 NM_001330411 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 138.25-28 chr11 30600592 30600887 + 1 NA Intergenic Intergenic -14386 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 180.5-37 chr14 62244191 62244453 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -104349 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 174.25-34 chr12 24741823 24742012 + 1 NA Intergenic Intergenic -157749 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 139.25-161 chr6 36776723 36776884 + 1 NA intron (NM_020939, intron 9 of 20) intron (NM_020939, intron 9 of 20) -19394 NM_001314018 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 144.25-28 chr10 71990568 71990812 + 1 NA intron (NM_004273, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 26295 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 117.75-97 chr2 17812331 17812557 + 1 NA Intergenic Intergenic -4016 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 296.25-8 chr14 86301413 86301958 + 1 NA Intergenic Intergenic 367007 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 167.5-151 chr5 109181716 109182016 + 1 NA intron (NR_146155, intron 18 of 19) L1MB5|LINE|L1 144503 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 177.75-15 chr1 246652509 246652790 + 1 NA intron (NM_152609, intron 9 of 10) intron (NM_152609, intron 9 of 10) -71760 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 136.75-147 chr4 100950229 100950532 + 1 NA Intergenic Intergenic -275267 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 172.25-21 chr10 88883236 88883524 + 1 NA intron (NM_020799, intron 1 of 10) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 3135 NM_020799 57559 Hs.16229 NM_020799 ENSG00000138134 STAMBPL1 ALMalpha|AMSH-FP|AMSH-LP|bA399O19.2 STAM binding protein like 1 protein-coding 199.25-109 chrX 72470575 72470865 + 1 NA intron (NR_051952, intron 6 of 9) L2c|LINE|L2 102123 NR_051952 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 120.25-17 chr1 178305952 178306170 + 1 NA intron (NM_170692, intron 3 of 17) intron (NM_170692, intron 3 of 17) -35390 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 314.5-25 chr7 8023779 8024238 + 1 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L3|LINE|CR1 55212 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 196.5-3 chr1 17286492 17286750 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 8732 NR_039768 100616188 NR_039768 ENSG00000266634 MIR3972 - microRNA 3972 ncRNA 217.25-36 chr18 61373465 61373814 + 1 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 40209 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 115.75-65 chr14 62714462 62714653 + 1 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) intron (NM_172375, intron 9 of 9) 330901 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 227.25-46 chr2 59122167 59122536 + 1 NA Intergenic Intergenic -95357 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 136.75-144 chr4 64869203 64869455 + 1 NA Intergenic Intergenic 135171 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 184.5-97 chr22 42646180 42646543 + 1 NA intron (NM_000398, intron 1 of 8) intron (NM_000398, intron 1 of 8) 628 NM_001171661 1727 Hs.561064 NM_000398 ENSG00000100243 CYB5R3 B5R|DIA1 cytochrome b5 reductase 3 protein-coding 251.25-35 chr3 142775598 142775933 + 1 NA intron (NM_001251845, intron 4 of 12) L1ME3G|LINE|L1 51341 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 201.75-81 chr6 1343452 1343719 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 31487 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 127.25-128 chr3 135944423 135944600 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -21217 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 290.75-18 chr16 68805374 68805873 + 1 NA intron (NM_001317185, intron 3 of 15) AluSq2|SINE|Alu -37908 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 166.5-170 chr5 127235559 127235882 + 1 NA Intergenic Intergenic -55044 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 237.5-6 chr1 175551755 175552098 + 1 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) HAL1|LINE|L1 191669 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 191.5-105 chr4 42184015 42184245 + 1 NA Intergenic Intergenic -31475 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 175.5-74 chr17 31644951 31645202 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 69665 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 198.5-147 chr8 95226914 95227168 + 1 NA Intergenic Intergenic -10667 NR_046232 619344 Hs.741630 NR_046232 ENSG00000253351 LINC01298 C8orf69 long intergenic non-protein coding RNA 1298 ncRNA 169.5-129 chr4 163967974 163968228 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 229610 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 197.5-104 chr3 188888039 188888459 + 1 NA 3' UTR (NM_001167671, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001167671, exon 11 of 11) 59390 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 179.25-25 chr10 91482816 91483238 + 1 NA exon (NM_001348365, exon 8 of 21) exon (NM_001348365, exon 8 of 21) 72742 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 318.5-9 chr14 48089736 48090240 + 1 NA Intergenic Intergenic -294974 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 191.75-77 chr3 109681 110054 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -86729 NM_001253387 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 163.75-44 chr14 52069539 52069845 + 1 NA promoter-TSS (NM_007361) promoter-TSS (NM_007361) -633 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 280.5-46 chr6 52080858 52081278 + 1 NA intron (NM_138694, intron 4 of 66) intron (NM_138694, intron 4 of 66) 6545 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 152.75-65 chr16 60003863 60004094 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 148625 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 229.5-126 chr7 51619052 51619323 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -225931 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 118.5-62 chr15 77418655 77418804 + 1 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 1375 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 168.5-51 chr13 90048914 90049345 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 70588 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 119.25-63 chr15 67334306 67334605 + 1 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 -79257 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 228.5-32 chr12 96451756 96452113 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -37643 NM_001367885 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 179.5-188 chr8 134757503 134757804 + 1 NA Intergenic Intergenic 42954 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 119.25-37 chr11 56487397 56487518 + 1 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 3913 NM_001005282 219484 Hs.554522 NM_001005282 ENSG00000181371 OR5M8 OR11-194 olfactory receptor family 5 subfamily M member 8 protein-coding 122.5-186 chr5 109059530 109059838 + 1 NA intron (NR_146155, intron 16 of 19) L1MB8|LINE|L1 135078 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 177.25-7 chr1 206497636 206497945 + 1 NA TTS (NM_014002) TTS (NM_014002) -9741 NM_182663 83593 Hs.497579 NM_031437 ENSG00000266094 RASSF5 Maxp1|NORE1|NORE1A|NORE1B|RAPL|RASSF3 Ras association domain family member 5 protein-coding 236.25-24 chr14 20987898 20988237 + 1 NA Intergenic Intergenic -1913 NM_022734 64745 Hs.512693 NM_022734 ENSG00000165792 METTL17 METT11D1 methyltransferase like 17 protein-coding 200.5-37 chr14 62520306 62520649 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -380504 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 153.5-145 chr4 89541805 89542080 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -234142 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 273.5-67 chr5 153389549 153389973 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -100763 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 286.75-10 chr11 105822062 105822616 + 1 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 199901 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 268.5-16 chr13 95968859 95969236 + 1 NA intron (NM_020121, intron 12 of 38) MER77|LTR|ERVL 84354 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 191.75-88 chr4 30701521 30701961 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -18628 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 254.75-55 chr8 122266710 122267191 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 301694 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 121.5-211 chr5 107505436 107505588 + 1 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 165425 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 183.25-11 chr10 65618277 65618630 + 1 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) intron (NR_120647, intron 3 of 5) 47028 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 222.25-16 chr13 31261606 31261851 + 1 NA intron (NM_194318, intron 7 of 14) intron (NM_194318, intron 7 of 14) 61753 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 185.5-74 chr2 43783768 43784079 + 1 NA intron (NM_016008, intron 3 of 12) intron (NM_016008, intron 3 of 12) 9884 NM_016008 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 230.5-53 chr17 60275680 60275968 + 1 NA intron (NM_032582, intron 5 of 33) AluSc8|SINE|Alu -44179 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 130.25-13 chr1 158603525 158603674 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -2840 NM_001004478 128368 Hs.553590 NM_001004478 ENSG00000198967 OR10Z1 OR1-15 olfactory receptor family 10 subfamily Z member 1 protein-coding 148.5-65 chr14 71557354 71557599 + 1 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -28822 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 203.5-74 chr2 171343289 171343650 + 1 NA intron (NM_001321158, intron 2 of 8) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 90521 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 168.25-28 chr11 90154441 90154711 + 1 NA intron (NM_001300930, intron 6 of 17) L1ME1|LINE|L1 19913 NM_001300930 10003 Hs.112482 NM_005467 ENSG00000077616 NAALAD2 GCPIII|GPCIII|NAADALASE2|NAALADASE2 N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 protein-coding 239.5-77 chr8 50009176 50009469 + 1 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 97915 NR_135794 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 205.5-56 chr17 71076961 71077436 + 1 NA Intergenic Intergenic 124981 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 114.25-27 chr11 60516545 60516732 + 1 NA intron (NM_001278320, intron 2 of 4) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 1246 NM_001100909 503497 Hs.523704 NM_001012417 ENSG00000204979 MS4A13 - membrane spanning 4-domains A13 protein-coding 195.5-129 chr6 1271008 1271379 + 1 NA Intergenic Intergenic -40905 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 251.75-10 chr10 127627910 127628307 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 78759 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 125.5-106 chr17 40191645 40191832 + 1 NA intron (NM_016339, intron 10 of 14) intron (NM_016339, intron 10 of 14) -1859 NR_106927 102465523 NR_106927 ENSG00000274621 MIR6867 hsa-mir-6867 microRNA 6867 ncRNA 139.75-22 chr10 115793547 115793799 + 1 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) L2a|LINE|L2 401116 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 130.75-82 chr18 77479759 77480113 + 1 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 230088 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 165.75-87 chr2 143626025 143626224 + 1 NA intron (NM_018460, intron 12 of 13) intron (NM_018460, intron 12 of 13) -310943 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 198.75-12 chr10 52462989 52463246 + 1 NA intron (NR_120641, intron 2 of 3) intron (NR_120641, intron 2 of 3) 7416 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 122.5-18 chr1 247669504 247669725 + 1 NA Intergenic Intergenic 3427 NM_001005487 441933 Hs.553834 NM_001005487 ENSG00000197437 OR13G1 OR1-37 olfactory receptor family 13 subfamily G member 1 protein-coding 156.5-166 chr6 139886010 139886230 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 31270 NR_138542 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 242.5-56 chr3 101344322 101344613 + 1 NA intron (NM_020654, intron 13 of 23) intron (NM_020654, intron 13 of 23) -23892 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 113.5-218 chr7 34099123 34099288 + 1 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) MIRb|SINE|MIR 193666 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 144.75-21 chr10 93252327 93252519 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 178530 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 140.5-127 chr2 221063671 221063853 + 1 NA Intergenic Intergenic 508542 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 273.5-76 chr7 126546243 126546688 + 1 NA intron (NM_001371085, intron 8 of 10) intron (NM_001371085, intron 8 of 10) 511719 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 174.75-111 chr7 16668519 16668874 + 1 NA intron (NM_001362717, intron 2 of 11) intron (NM_001362717, intron 2 of 11) 7482 NM_001362717 28969 Hs.487635 NM_014038 ENSG00000136261 BZW2 HSPC028|MST017|MSTP017 basic leucine zipper and W2 domains 2 protein-coding 125.25-36 chr11 32300652 32300780 + 1 NA Intergenic Intergenic 99684 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 211.75-40 chr19 46955902 46956345 + 1 NA intron (NM_004491, intron 3 of 6) AluJb|SINE|Alu -63714 NM_002517 4861 Hs.79564 NM_002517 ENSG00000130751 NPAS1 MOP5|PASD5|bHLHe11 neuronal PAS domain protein 1 protein-coding 134.75-76 chr15 64707650 64707810 + 1 NA Intergenic Intergenic -4449 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 136.75-72 chr16 87557074 87557323 + 1 NA Intergenic Intergenic -44637 NR_073379 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 257.75-23 chr2 161168249 161168548 + 1 NA intron (NM_001199135, intron 1 of 7) HAL1|LINE|L1 7970 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 183.5-147 chr8 81553257 81553558 + 1 NA Intergenic Intergenic -22017 NM_001105281 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 149.5-148 chr5 19417339 19417621 + 1 NA Intergenic Intergenic 468792 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 140.5-10 chr1 174206098 174206365 + 1 NA intron (NM_001366445, intron 1 of 13) intron (NM_001366445, intron 1 of 13) 46711 NM_001366445 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 255.5-70 chr6 6909882 6910174 + 1 NA Intergenic Intergenic -197715 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 162.5-56 chr14 82497592 82497869 + 1 NA Intergenic Intergenic -144902 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 269.75-53 chr7 63156421 63156882 + 1 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL 147405 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 215.25-29 chr14 56413993 56414382 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -100144 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 211.25-6 chr1 94808039 94808403 + 1 NA intron (NR_160783, intron 1 of 3) intron (NR_160783, intron 1 of 3) 12011 NR_160779 101928079 Hs.596857 NR_104131 ENSG00000224081 SLC44A3-AS1 LINC01057|XLOC_000303 SLC44A3 antisense RNA 1 ncRNA 315.75-12 chr18 13155987 13156467 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -62533 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 278.25-12 chr12 64177059 64177346 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 45094 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 198.25-11 chr10 10971963 10972312 + 1 NA intron (NM_001326319, intron 4 of 16) intron (NM_001326319, intron 4 of 16) -19974 NR_015413 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 170.5-185 chr8 84274642 84274874 + 1 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 90092 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 162.25-58 chr15 70019251 70019508 + 1 NA Intergenic Intergenic 60089 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 229.5-50 chr17 53901591 53901923 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 78830 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 116.5-257 chr8 134778743 134778957 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 21757 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 189.25-119 chr8 40380443 40380763 + 1 NA Intergenic Intergenic -37240 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 262.25-2 chr1 172384965 172385284 + 1 NA intron (NR_146559, intron 18 of 20) L2|LINE|L2 -35561 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 135.5-208 chr8 139736753 139737055 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -33781 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 135.75-97 chr2 70686626 70686824 + 1 NA intron (NM_017482, intron 9 of 12) intron (NM_017482, intron 9 of 12) 80990 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 206.5-25 chr14 52622599 52623113 + 1 NA intron (NR_148417, intron 4 of 7) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 70020 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 167.5-154 chr5 158710272 158710599 + 1 NA intron (NM_001364155, intron 13 of 14) intron (NM_001364155, intron 13 of 14) -300662 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 228.75-38 chr2 34191147 34191431 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 124063 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 163.5-93 chr2 81871811 81872121 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -405020 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 137.5-117 chr2 59138980 59139256 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -78590 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 213.5 chr1 39803665 39803972 + 1 NA Intergenic Intergenic 14842 NR_135805 101929536 Hs.552820 NR_135805 ENSG00000261798 LOC101929536 - uncharacterized LOC101929536 ncRNA 140.75-159 chr5 156196270 156196676 + 1 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -130284 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 143.5-115 chr2 106996943 106997147 + 1 NA Intergenic Intergenic -109936 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 270.75-50 chr8 139026819 139027370 + 1 NA Intergenic LTR1B1|LTR|ERV1 -113053 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 168.5-9 chr1 96466509 96466763 + 1 NA Intergenic Intergenic -92511 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 126.5-183 chr5 6343414 6343754 + 1 NA Intergenic Intergenic -6292 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 219.5-17 chr10 64547634 64548123 + 1 NA Intergenic Intergenic -277650 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 432.25-3 chr17_GL000205v2_random 3358 4269 + 1 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 54153 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 151.5-89 chr2 161097502 161097849 + 1 NA Intergenic Intergenic -39280 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 148.5-62 chr14 60247765 60248103 + 1 NA intron (NM_177952, intron 1 of 5) intron (NM_177952, intron 1 of 5) -1287 NM_177951 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 236.5-57 chr22 25903632 25904323 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 31 of 43) intron (NM_001318245, intron 31 of 43) 161789 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 225.5-48 chr18 13766462 13766767 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 39941 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 161.25-16 chr10 66053308 66053497 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) L1MA1|LINE|L1 481977 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 164.5-38 chr12 52501915 52502212 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -8806 NM_005554 3853 Hs.700779 NM_005554 ENSG00000205420 KRT6A CK-6C|CK-6E|CK6A|CK6C|CK6D|K6A|K6C|K6D|KRT6C|KRT6D|PC3 keratin 6A protein-coding 126.5-251 chr8 120154994 120155161 + 1 NA intron (NM_021110, intron 2 of 47) intron (NM_021110, intron 2 of 47) 29975 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 127.5-101 chr17 62048701 62048927 + 1 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) HAL1|LINE|L1 16464 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 228.25-67 chr5 37326546 37327019 + 1 NA intron (NM_001278312, intron 18 of 33) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 44324 NM_153485 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 140.5-158 chr3 166256076 166256339 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -418784 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 143.5-122 chr2 163762825 163763116 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -26962 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 163.25-17 chr10 82633088 82633271 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -400259 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-25 chr10 17613520 17613669 + 1 NA intron (NM_014241, intron 1 of 6) intron (NM_014241, intron 1 of 6) 3780 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 177.25-120 chr5 100583414 100583592 + 1 NA intron (NM_198507, intron 2 of 2) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 48129 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 161.75-70 chr2 179576237 179576567 + 1 NA intron (NR_104234, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 5269 NM_001352814 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 279.5-17 chr12 77042386 77042828 + 1 NA intron (NM_203394, intron 7 of 12) intron (NM_203394, intron 7 of 12) 22962 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 174.5-51 chr12 62772051 62772373 + 1 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) MIR|SINE|MIR 162938 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 170.5-127 chr3 186759959 186760197 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -23499 NM_001967 1974 Hs.518475 NM_001967 ENSG00000156976 EIF4A2 BM-010|DDX2B|EIF4A|EIF4F|eIF-4A-II|eIF4A-II eukaryotic translation initiation factor 4A2 protein-coding 274.75-46 chr5 173924992 173925460 + 1 NA intron (NM_001308193, intron 2 of 7) intron (NM_001308193, intron 2 of 7) 32175 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 385.75-12 chr22 25715481 25716030 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 17 of 19) intron (NM_001362778, intron 17 of 19) -26433 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 217.5-79 chr3 86078223 86078536 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -250329 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 174.75-30 chr13 49963133 49963469 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -26800 NM_001127482 57213 Hs.44235 NM_020456 ENSG00000123178 SPRYD7 C13orf1|CLLD6 SPRY domain containing 7 protein-coding 190.75-28 chr14 48855093 48855395 + 1 NA Intergenic Intergenic 731136 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 233.5-86 chr5 59596272 59596649 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -8835 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 201.75-72 chr5 25157691 25157962 + 1 NA intron (NR_147006, intron 3 of 4) L1PA7|LINE|L1 32830 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 168.5-144 chr5 10247249 10247505 + 1 NA intron (NR_047670, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 2511 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 172.75-130 chr8 110455973 110456295 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -480363 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 113.5-108 chr18 41271215 41271348 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 249396 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 344.5-6 chr11 115464150 115464691 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 39995 NM_001098517 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 202.75-97 chr5 167624764 167625034 + 1 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 51240 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 130.75-191 chr8 104525105 104525340 + 1 NA intron (NM_001135703, intron 1 of 5) intron (NM_001135703, intron 1 of 5) -40757 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 241.5-3 chr1 167517694 167518008 + 1 NA intron (NM_000734, intron 1 of 7) intron (NM_000734, intron 1 of 7) 678 NM_000734 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 179.75-15 chr10 37744070 37744370 + 1 NA Intergenic Intergenic 50955 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 285.25-14 chr2 59325930 59326383 + 1 NA Intergenic Intergenic 108448 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 164.25-146 chr7 12489799 12490014 + 1 NA Intergenic Intergenic -6523 NR_136261 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 213.5-15 chr1 245027750 245027988 + 1 NA intron (NM_032328, intron 3 of 7) HAL1b|LINE|L1 -57000 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 252.25-59 chr7 46267394 46267848 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -346349 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 132.5-179 chr4 48964281 48964531 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -21869 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 121.75-177 chr7 40497490 40497630 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 362584 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 176.5-23 chr10 89374526 89374891 + 1 NA Intergenic Intergenic -3348 NM_001010987 439996 Hs.500491 NM_001010987 ENSG00000204010 IFIT1B IFIT1L|bA149I23.6 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1B protein-coding 275.5-43 chr3 80295562 80295889 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -469172 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 220.25-61 chr4 179430824 179431095 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -1523023 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 153.5-14 chr1 230037170 230037438 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -20485 NM_001291866 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 221.5-3 chr1 246777481 246777978 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -11888 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 131.25-121 chr20 60383897 60384124 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 75536 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 207.75-51 chr2 31981627 31981900 + 1 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 28901 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 145.5-120 chr21 35561467 35561706 + 1 NA intron (NR_073512, intron 1 of 2) intron (NR_073512, intron 1 of 2) 19178 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 160.75-4 chr1 44718615 44718833 + 1 NA intron (NM_001145636, intron 6 of 11) intron (NM_001145636, intron 6 of 11) 3177 NR_002753 26828 NR_002753 ENSG00000199377 RNU5F-1 RNU5F|U5F RNA, U5F small nuclear 1 snRNA 206.5-105 chr5 175763300 175763566 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -33100 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 264.5-19 chr14 66848090 66848564 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 340920 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 139.25-97 chr2 194465254 194465486 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 121101 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 154.5-184 chr8 69570352 69570597 + 1 NA intron (NR_156414, intron 4 of 20) intron (NR_156414, intron 4 of 20) -22426 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 118.5-59 chr15 57099705 57099846 + 1 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -119655 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 117.5-83 chr17 61227964 61228098 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 139673 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 222.25-41 chr20 41033674 41034128 + 1 NA intron (NM_003286, intron 2 of 20) intron (NM_003286, intron 2 of 20) 5079 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 159.25-79 chr22 31752068 31752261 + 1 NA Intergenic Intergenic -1804 NR_157126 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 285.5-34 chr2 78041838 78042342 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -46640 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 416.25-13 chr5 151295207 151295837 + 1 NA intron (NM_181774, intron 3 of 9) intron (NM_181774, intron 3 of 9) 8244 NM_181774 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 303.25 chr1 35941945 35942317 + 1 NA intron (NM_177422, intron 1 of 16) intron (NM_177422, intron 1 of 16) 11026 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 138.5-178 chr6 147469691 147469844 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -38923 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 197.5-114 chr4 133192118 133192430 + 1 NA 3' UTR (NM_032961, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_032961, exon 5 of 5) 42980 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 187.5-128 chr4 106771607 106771825 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 264597 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 217.25-22 chr13 92527872 92528259 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 37902 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 200.25-75 chr22 27879274 27879568 + 1 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) intron (NM_001284278, intron 7 of 11) 39793 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 137.5-107 chr19 29149402 29149641 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 63630 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 168.25-3 chr1 66235762 66235931 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) MER57C1|LTR|ERV1 -96262 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 213.25-8 chr10 12290280 12290607 + 1 NA Intergenic Intergenic -59104 NM_153498 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 211.5 chr1 75051198 75051669 + 1 NA Intergenic Intergenic -77001 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 134.5-75 chr15 63542658 63542921 + 1 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) L1M5|LINE|L1 38196 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 257.75-37 chr5 19512811 19513110 + 1 NA intron (NM_001349559, intron 10 of 12) L1MEg|LINE|L1 373312 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 172.5-195 chr8 46855168 46855429 + 1 NA non-coding (NR_027012, exon 12 of 12) non-coding (NR_027012, exon 12 of 12) 14412 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 121.25-150 chr4 111998521 111998691 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -146848 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 371.75-18 chr8 119320645 119321515 + 1 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -4091 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 125.75-181 chr8 43234324 43234608 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -57976 NM_001005365 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 192.75-59 chr2 103174986 103175198 + 1 NA Intergenic Intergenic -190663 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 151.25-149 chr5 17286507 17286719 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68982 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 213.5-57 chr19 56933330 56933719 + 1 NA Intergenic Intergenic 92622 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 314.5-31 chr9 36943737 36944132 + 1 NA intron (NR_104000, intron 6 of 9) AluJr4|SINE|Alu -50403 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 227.5-47 chr19 31026429 31026693 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -140949 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 141.5-57 chr14 71243989 71244194 + 1 NA Intergenic Intergenic -76385 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 210.25-28 chr16 13574175 13574655 + 1 NA Intergenic Intergenic -345742 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 168.5-108 chr3 29832134 29832543 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) L1M3c|LINE|L1 101818 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 201.5-32 chr11 34534466 34534721 + 1 NA Intergenic Intergenic -20799 NM_001422 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 175.25-147 chr8 136410130 136410352 + 1 NA Intergenic Intergenic -120557 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 279.5-21 chr15 59766333 59766981 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -77337 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 127.75-87 chr18 65810289 65810496 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 3 of 11) intron (NM_001362438, intron 3 of 11) 59380 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 116.5-131 chr2 173907161 173907319 + 1 NA 3' UTR (NM_001017371, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001017371, exon 5 of 5) 56640 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 187.75-77 chr4 54326814 54327138 + 1 NA Intergenic Intergenic -5916 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 155.75-60 chr16 50700827 50701045 + 1 NA intron (NR_163434, intron 2 of 12) intron (NR_163434, intron 2 of 12) 1556 NM_001293557 64127 Hs.592072 NM_022162 ENSG00000167207 NOD2 ACUG|BLAU|BLAUS|CARD15|CD|CLR16.3|IBD1|NLRC2|NOD2B|PSORAS1|YAOS nucleotide binding oligomerization domain containing 2 protein-coding 164.5-28 chr11 34454302 34454655 + 1 NA intron (NM_001752, intron 6 of 12) intron (NM_001752, intron 6 of 12) 15544 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 125.5-42 chr11 72277343 72277552 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -33271 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 128.5-122 chr20 20619989 20620230 + 1 NA intron (NM_020343, intron 11 of 39) intron (NM_020343, intron 11 of 39) 92535 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 305.75-5 chr12 54198945 54199308 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -10132 NM_001351262 23583 Hs.632721 NM_014311 ENSG00000123415 SMUG1 FDG|HMUDG|UNG3 single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1 protein-coding 201.5-101 chr4 161080097 161080529 + 1 NA Intergenic Intergenic -942420 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 251.5-65 chr5 63505466 63505931 + 1 NA Intergenic Intergenic 456594 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 229.5-101 chr4 167793705 167794151 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -298609 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 251.5-7 chr1 201420237 201420610 + 1 NA intron (NM_003281, intron 1 of 7) intron (NM_003281, intron 1 of 7) 1307 NM_003281 7135 Hs.320890 NM_003281 ENSG00000159173 TNNI1 SSTNI|TNN1 troponin I1, slow skeletal type protein-coding 195.75-67 chr2 219389867 219390168 + 1 NA intron (NM_001319116, intron 1 of 14) intron (NM_001319116, intron 1 of 14) -1141 NM_001319121 23549 Hs.258551 NM_012100 ENSG00000123992 DNPEP ASPEP|DAP aspartyl aminopeptidase protein-coding 165.5-50 chr14 79834463 79834680 + 1 NA intron (NM_138970, intron 5 of 5) intron (NM_138970, intron 5 of 5) -376848 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 161.25-137 chr5 66983139 66983376 + 1 NA intron (NM_001290226, intron 1 of 26) intron (NM_001290226, intron 1 of 26) 20897 NR_111908 101928794 Hs.672435 NR_111908 MAST4-AS1 - MAST4 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-79 chr2 109120718 109121053 + 1 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -8320 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 160.5-57 chr14 70674521 70674745 + 1 NA 3' UTR (NM_015351, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_015351, exon 3 of 3) -24065 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 162.25-124 chr5 9515547 9515721 + 1 NA intron (NR_109935, intron 2 of 2) intron (NR_109935, intron 2 of 2) 4301 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 148.5-189 chr5 146267069 146267320 + 1 NA intron (NM_018989, intron 14 of 20) MER90a|LTR|ERV1 63589 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 269.5-7 chr10 115867066 115867584 + 1 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) intron (NM_207303, intron 28 of 28) 327464 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 342.5-17 chr20 21901554 21901987 + 1 NA Intergenic Intergenic -152320 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 160.5-78 chr19 2535680 2535894 + 1 NA intron (NM_052847, intron 3 of 4) intron (NM_052847, intron 3 of 4) 59660 NM_015675 4616 Hs.110571 NM_015675 ENSG00000099860 GADD45B GADD45BETA|MYD118 growth arrest and DNA damage inducible beta protein-coding 142.5-86 chr17 21972980 21973180 + 1 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -229915 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 149.75-42 chr14 59546229 59546459 + 1 NA intron (NM_001164399, intron 8 of 19) L1PA17|LINE|L1 30468 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 130.25-31 chr10 95350287 95350499 + 1 NA intron (NM_006434, intron 14 of 20) intron (NM_006434, intron 14 of 20) -59390 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 238.5-65 chr5 18962805 18963157 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 923291 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 151.25-127 chr3 83388237 83388691 + 1 NA Intergenic Intergenic 1402322 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 211.5-129 chr5 171945024 171945429 + 1 NA intron (NM_033644, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 61647 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 224.5-97 chr7 9345324 9345706 + 1 NA Intergenic Intergenic -288755 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 196.25-122 chr9 88009558 88009966 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -34982 NM_001039803 23552 Hs.522274 NM_012119 ENSG00000156345 CDK20 CCRK|CDCH|P42|PNQALRE cyclin dependent kinase 20 protein-coding 167.25-46 chr14 69064639 69064965 + 1 NA intron (NM_003861, intron 7 of 8) L2b|LINE|L2 85120 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 225.75-17 chr11 5350316 5350619 + 1 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) -1041 NM_001004750 390058 Hs.553730 NM_001004750 ENSG00000176239 OR51B6 HOR5'Beta6 olfactory receptor family 51 subfamily B member 6 protein-coding 152.75-59 chr14 96141832 96142051 + 1 NA Intergenic Intergenic -62857 NM_000623 624 Hs.654542 NM_000623 ENSG00000168398 BDKRB2 B2R|BK-2|BK2|BKR2|BRB2 bradykinin receptor B2 protein-coding 156.25-157 chr9 86306751 86307010 + 1 NA intron (NM_001185059, intron 22 of 26) intron (NM_001185059, intron 22 of 26) -24342 NM_030940 81689 Hs.449291 NM_030940 ENSG00000135070 ISCA1 HBLD2|ISA1|MMDS5|hIscA iron-sulfur cluster assembly 1 protein-coding 131.25-192 chr7 86543346 86543488 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -100492 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 241.5-102 chr8 134947490 134947818 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 97719 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 248.5-67 chr3 89694272 89694649 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 586839 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 132.75-5 chr1 36132957 36133187 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -7850 NM_001294347 1296 Hs.353001 NM_005202 ENSG00000171812 COL8A2 FECD|FECD1|PPCD|PPCD2 collagen type VIII alpha 2 chain protein-coding 172.25-141 chr8 114935993 114936236 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 731899 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 132.5-155 chr3 8762877 8763139 + 1 NA intron (NM_001354656, intron 3 of 3) intron (NM_001354656, intron 3 of 3) 5723 NM_001354656 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 183.25-88 chr6 35340970 35341224 + 1 NA Intergenic Intergenic -1461 NM_001171819 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 213.5-119 chr7 144637291 144637665 + 1 NA intron (NM_001350889, intron 2 of 5) intron (NM_001350889, intron 2 of 5) 101420 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 123.5-201 chr7 133283815 133284014 + 1 NA intron (NM_021807, intron 2 of 17) intron (NM_021807, intron 2 of 17) -6967 NR_106749 102465139 NR_106749 ENSG00000276137 MIR6133 hsa-mir-6133 microRNA 6133 ncRNA 126.25-68 chr17 58757444 58757625 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 1665 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 120.5-115 chr2 65210215 65210408 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -17384 NM_001005386 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 168.25-58 chr16 73773824 73774048 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 387131 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 275.5-19 chr14 65585518 65586017 + 1 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) intron (NM_178156, intron 2 of 9) 114665 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 153.75-12 chr1 221340618 221340826 + 1 NA Intergenic Intergenic -4426 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 140.5-33 chr11 56478524 56478828 + 1 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -8138 NM_001004742 219482 Hs.553631 NM_001004742 ENSG00000174937 OR5M3 OR11-191 olfactory receptor family 5 subfamily M member 3 protein-coding 165.25-146 chr9 27204056 27204422 + 1 NA intron (NM_001290077, intron 12 of 21) HAL1b|LINE|L1 78554 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 232.75-59 chr6 65451062 65451441 + 1 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) intron (NM_198283, intron 4 of 9) 128553 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 168.25-143 chr8 124476341 124476540 + 1 NA intron (NM_007218, intron 1 of 1) MIRc|SINE|MIR 1673 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 163.75-92 chr3 37776443 37776810 + 1 NA intron (NR_110531, intron 3 of 3) intron (NR_110531, intron 3 of 3) 85154 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 185.5-119 chr4 87160308 87160519 + 1 NA non-coding (NR_120447, exon 8 of 8) non-coding (NR_120447, exon 8 of 8) 59855 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 216.75-11 chr10 83236183 83236570 + 1 NA Intergenic Intergenic 440713 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 164.25-65 chr2 49272300 49272498 + 1 NA Intergenic Intergenic -117872 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 154.25-183 chr9 70255255 70255454 + 1 NA intron (NR_039990, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 3520 NR_039990 100507299 Hs.556816 NR_039990 SMC5-AS1 MAMDC2-AS2 SMC5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 144.5-201 chr7 38870515 38870715 + 1 NA intron (NM_014396, intron 2 of 28) L1MEg|LINE|L1 38576 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 153.5-103 chr2 101987130 101987401 + 1 NA Intergenic Intergenic 3800 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 172.75-38 chr15 41451714 41452006 + 1 NA intron (NM_015138, intron 2 of 17) intron (NM_015138, intron 2 of 17) 34756 NM_015138 23168 Hs.511096 NM_015138 ENSG00000137815 RTF1 GTL7|KIAA0252 RTF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 199.75-20 chr12 39803232 39803497 + 1 NA intron (NR_135051, intron 18 of 18) L1MEd|LINE|L1 177181 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 221.5-38 chr19 15328568 15328821 + 1 NA intron (NM_001330384, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 3845 NM_001330384 23476 Hs.187763 NM_014299 ENSG00000141867 BRD4 CAP|HUNK1|HUNKI|MCAP bromodomain containing 4 protein-coding 190.5-52 chr15 80622361 80622738 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 41446 NR_049837 100847042 NR_049837 ENSG00000284059 MIR5572 - microRNA 5572 ncRNA 128.5-117 chr2 174913334 174913561 + 1 NA intron (NM_001025201, intron 6 of 12) intron (NM_001025201, intron 6 of 12) -65829 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 260.25-14 chr12 104886984 104887353 + 1 NA intron (NM_032148, intron 6 of 11) intron (NM_032148, intron 6 of 11) 71122 NM_001352170 84102 Hs.577463 NM_032148 ENSG00000136052 SLC41A2 SLC41A1-L1 solute carrier family 41 member 2 protein-coding 267.25-34 chr5 106581446 106581805 + 1 NA Intergenic Intergenic 429389 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 249.5-27 chr14 53100767 53101093 + 1 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) L2c|LINE|L2 52393 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 167.5-61 chr14 69947757 69948045 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) -30232 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 207.5-110 chr8 51507318 51507638 + 1 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) intron (NM_144651, intron 4 of 22) 301967 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 265.5-13 chr11 78969038 78969463 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) intron (NM_001098816, intron 6 of 33) -394386 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 165.25-87 chr3 27296692 27296873 + 1 NA intron (NM_152534, intron 15 of 38) intron (NM_152534, intron 15 of 38) 72601 NM_199347 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 186.5-50 chr17 30055044 30055303 + 1 NA intron (NR_026738, intron 10 of 15) AluJb|SINE|Alu -61634 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 184.5-73 chr2 68908580 68908889 + 1 NA Intergenic Intergenic -37337 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 132.5-227 chr7 66243402 66243583 + 1 NA intron (NM_003596, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 38158 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 189.5-59 chr17 73473248 73473568 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 2 of 44) intron (NM_001144952, intron 2 of 44) -40275 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 163.75-134 chr9 8302190 8302471 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 431616 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 167.5-134 chr5 13869572 13869742 + 1 NA intron (NM_001369, intron 24 of 78) L1ME4a|LINE|L1 74823 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 246.25-41 chr20 54321524 54321999 + 1 NA Intergenic Intergenic 113674 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 255.5-60 chr4 3355286 3355662 + 1 NA intron (NM_002926, intron 3 of 16) L1ME3B|LINE|L1 -14724 NM_198227 6002 Hs.527061 NM_002926 ENSG00000159788 RGS12 - regulator of G protein signaling 12 protein-coding 128.75-150 chr5 35982949 35983257 + 1 NA intron (NM_001171873, intron 3 of 5) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 8287 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 257.25-28 chr22 28090958 28091604 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -170669 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 137.25-31 chr12 29501843 29502011 + 1 NA 3' UTR (NM_001193451, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001193451, exon 18 of 18) -2234 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 164.75-11 chr1 158752113 158752454 + 1 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -2533 NM_001005184 128371 Hs.553591 NM_001005184 ENSG00000180433 OR6K6 OR1-21 olfactory receptor family 6 subfamily K member 6 protein-coding 145.5-164 chr5 152432012 152432238 + 1 NA Intergenic Intergenic -26846 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 380.25-5 chr5 34996281 34996948 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 51335 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 133.75-9 chr1 172418728 172418946 + 1 NA TTS (NM_001350206) TTS (NM_001350206) -1848 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 140.5-25 chr11 6527718 6527933 + 1 NA intron (NM_144666, intron 10 of 42) intron (NM_144666, intron 10 of 42) 30529 NM_144666 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 137.75-88 chr18 2993523 2993860 + 1 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 18256 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 118.5-182 chr7 2336723 2336845 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17302 NM_001362793 8662 Hs.371001 NM_003751 ENSG00000106263 EIF3B EIF3-ETA|EIF3-P110|EIF3-P116|EIF3S9|PRT1 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B protein-coding 252.25-56 chr6 102365228 102365605 + 1 NA Intergenic Intergenic 966431 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 196.5-128 chr5 104313539 104313864 + 1 NA Intergenic Intergenic -750912 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 227.75-18 chr12 11459484 11459796 + 1 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) FLAM_C|SINE|Alu 27038 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 261.5-68 chr8 77468139 77468456 + 1 NA intron (NR_125830, intron 2 of 2) intron (NR_125830, intron 2 of 2) 17600 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 150.25-128 chr5 161618360 161618576 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -67253 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 193.25-107 chr7 46843834 46844193 + 1 NA Intergenic Intergenic -146891 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 154.25-11 chr1 185698101 185698283 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -36199 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 192.5-59 chr18 63167825 63168099 + 1 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 151418 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 123.5-62 chr14 76931839 76932089 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27674 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 196.5-131 chr5 122537138 122537454 + 1 NA Intergenic Intergenic 47304 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 166.5-29 chr10 35178576 35178837 + 1 NA intron (NM_001267567, intron 1 of 3) intron (NM_001267567, intron 1 of 3) 3113 NM_001267567 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 146.5-140 chr3 94098534 94098750 + 1 NA intron (NM_022072, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 35581 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 135.25-161 chr5 88292169 88292339 + 1 NA intron (NR_105019, intron 5 of 7) L1MD2|LINE|L1 23238 NR_039994 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 362.25-7 chr2 177869445 177869908 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 6 of 20) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 19080 NM_001077196 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 192.75-74 chr20 49489605 49489899 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7084 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 136.5-170 chr5 9503216 9503439 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -8006 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 134.75-56 chr13 42630057 42630367 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 56060 NM_003701 8600 Hs.333791 NM_003701 ENSG00000120659 TNFSF11 CD254|ODF|OPGL|OPTB2|RANKL|TNLG6B|TRANCE|hRANKL2|sOdf TNF superfamily member 11 protein-coding 170.5-172 chr7 28177072 28177491 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -3176 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 448.75 chr2 99165194 99165826 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 10436 NM_001204830 51601 Hs.719172 NM_015929 ENSG00000144182 LIPT1 LIPT1D lipoyltransferase 1 protein-coding 339.5-31 chr7 17712125 17712678 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -153492 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 284.5-56 chr6 148030354 148030759 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -241772 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 144.5-127 chr22 34458701 34458960 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -535942 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 207.5-82 chr5 35891078 35891482 + 1 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 34389 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 160.5-26 chr11 61566623 61566855 + 1 NA intron (NM_001370211, intron 1 of 7) intron (NM_001370211, intron 1 of 7) 14133 NM_004200 9066 Hs.131188 NM_004200 ENSG00000011347 SYT7 IPCA-7|IPCA7|PCANAP7|SYT-VII|SYTVII synaptotagmin 7 protein-coding 275.5-15 chr11 110196657 110197199 + 1 NA intron (NM_001260496, intron 7 of 7) AluJb|SINE|Alu 99784 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 176.5-106 chr2 230509194 230509522 + 1 NA intron (NM_001080391, intron 23 of 28) intron (NM_001080391, intron 23 of 28) 92602 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 112.25-113 chr20 49371546 49371668 + 1 NA 3' UTR (NM_004975, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004975, exon 2 of 2) 90924 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 217.25-79 chr7 61924540 61924790 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1379391 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 181.5-9 chr1 218423814 218424064 + 1 NA intron (NR_138148, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR -13694 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 275.75-39 chr6 48818843 48819184 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 644240 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 122.5-153 chr3 94925979 94926165 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12191 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 230.25-3 chr1 100640889 100641249 + 1 NA intron (NR_038914, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 5935 NR_038914 100128787 Hs.536050 NR_038914 LINC01349 - long intergenic non-protein coding RNA 1349 ncRNA 146.25-91 chr21 27582544 27582830 + 1 NA Intergenic Intergenic -139692 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 127.5-175 chr4 84799977 84800104 + 1 NA intron (NM_014991, intron 17 of 67) intron (NM_014991, intron 17 of 67) -165576 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 175.5-125 chr3 155394272 155394525 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -91405 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 199.5-115 chr5 7965927 7966178 + 1 NA Intergenic Intergenic 96904 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 222.5-69 chr3 161026045 161026380 + 1 NA intron (NM_001317912, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 78520 NM_001349161 8706 Hs.418062 NM_003781 ENSG00000169255 B3GALNT1 B3GALT3|GLCT3|GLOB|Gb4Cer|P|P1|beta3Gal-T3|galT3 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (globoside blood group) protein-coding 139.25-76 chr19 32283638 32283800 + 1 NA Intergenic Intergenic -61891 NM_001136156 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 155.25-33 chr10 120279975 120280310 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 75081 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 179.5-163 chr6 158393205 158393520 + 1 NA intron (NM_020245, intron 1 of 13) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 70380 NR_145798 109623462 NR_145798 SNORA116 - small nucleolar RNA, H/ACA box 116 snoRNA 295.25-4 chr10 95821091 95821841 + 1 NA intron (NM_001312654, intron 2 of 9) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 65303 NM_001164183 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 194.5-110 chr4 105480651 105480889 + 1 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -6700 NM_176867 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 150.75-179 chr8 78166226 78166407 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -350024 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 218.25-93 chr8 59109911 59110266 + 1 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 9059 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 264.25-58 chr9 86585289 86585715 + 1 NA Intergenic Intergenic -231092 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 338.5-5 chr11 43761485 43762013 + 1 NA intron (NM_016142, intron 3 of 10) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 81011 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 161.25-171 chr8 76131597 76131913 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -274899 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 216.5-93 chr5 51132472 51132771 + 1 NA Intergenic Intergenic -162434 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 137.5-236 chr8 126966119 126966405 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -46892 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 125.25-202 chr8 59555440 59555649 + 1 NA Intergenic Intergenic 436334 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 222.25-4 chr1 240766485 240766782 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -154478 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 253.75-56 chr7 14569493 14569786 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) L1MC|LINE|L1 271811 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 217.25-76 chr7 27144775 27145225 + 1 NA TTS (NM_024014) TTS (NM_024014) -1319 NM_019102 3202 Hs.655218 NM_019102 ENSG00000106004 HOXA5 HOX1|HOX1.3|HOX1C homeobox A5 protein-coding 169.25-84 chr4 61694580 61694962 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 466994 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-202 chr8 130404112 130404363 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) intron (NM_001362925, intron 1 of 29) 39423 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 138.5-203 chr8 127081420 127081703 + 1 NA non-coding (NR_109833, exon 1 of 1) non-coding (NR_109833, exon 1 of 1) 660 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 162.5-75 chr19 35938552 35938844 + 1 NA intron (NM_024509, intron 1 of 2) intron (NM_024509, intron 1 of 2) 2324 NM_024509 79414 Hs.143792 NM_024509 ENSG00000126243 LRFN3 FIGLER1|SALM4 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 3 protein-coding 194.5-49 chr16 88697144 88697494 + 1 NA 3' UTR (NM_001171816, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001171816, exon 6 of 6) 6262 NM_001171816 115992 Hs.513804 NM_178841 ENSG00000158717 RNF166 - ring finger protein 166 protein-coding 198.5-87 chr2 215250400 215250674 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -61522 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 131.75-150 chr4 46210319 46210626 + 1 NA Intergenic Intergenic -86418 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 164.25-124 chr5 14597686 14597886 + 1 NA intron (NM_019018, intron 1 of 7) intron (NM_019018, intron 1 of 7) 15994 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 238.25-9 chr10 87968942 87969321 + 1 NA 3' UTR (NM_001304718, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001304718, exon 9 of 9) 105506 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 164.25-138 chr6 68946931 68947160 + 1 NA intron (NM_001704, intron 6 of 31) intron (NM_001704, intron 6 of 31) 311763 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 213.25-44 chr3 89122319 89122586 + 1 NA intron (NM_182644, intron 1 of 6) intron (NM_182644, intron 1 of 6) 14831 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 128.25-124 chr3 4446072 4446261 + 1 NA intron (NM_001164674, intron 2 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 21103 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 120.5-33 chr11 25106623 25106775 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 609646 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 171.25-85 chr20 43899019 43899290 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 4436 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 116.75-76 chr17 55984923 55985122 + 1 NA Intergenic Intergenic -168453 NM_153228 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 237.5-54 chr2 178594539 178594979 + 1 NA intron (NM_001256850, intron 245 of 312) intron (NM_001256850, intron 245 of 312) 71568 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 159.75-147 chr6 43945686 43946054 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -54715 NR_160954 221416 Hs.531926 NM_153246 ENSG00000181577 C6orf223 - chromosome 6 open reading frame 223 ncRNA 217.5-75 chr21 30569743 30570023 + 1 NA Intergenic Intergenic -8570 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 217.5-41 chr14 38775965 38776247 + 1 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -106490 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 213.5-29 chr11 115638522 115639034 + 1 NA Intergenic Intergenic 95984 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 146.75-136 chr5 164713829 164713989 + 1 NA Intergenic Intergenic 243630 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 144.5-83 chr17 56732308 56732657 + 1 NA Intergenic Intergenic 101438 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 155.75-158 chr7 131060239 131060453 + 1 NA intron (NR_109850, intron 2 of 5) intron (NR_109850, intron 2 of 5) 46684 NR_024153 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 142.25-179 chr9 117981026 117981230 + 1 NA Intergenic Intergenic 276725 NM_138554 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 199.5-39 chr14 45763570 45763813 + 1 NA Intergenic Intergenic -48089 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 116.25-175 chr5 27624586 27624726 + 1 NA Intergenic Intergenic 152364 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 358.5-6 chr14 53813516 53814101 + 1 NA Intergenic Intergenic 134676 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 225.75-69 chr6 28167746 28168386 + 1 NA intron (NR_103448, intron 4 of 4) intron (NR_103448, intron 4 of 4) 6305 NR_103448 651302 Hs.172143 NM_001145129 ENSG00000226314 ZNF192P1 ZNF389|ZNF389P|dJ265C24.4 zinc finger protein 192 pseudogene 1 pseudo 138.5-152 chr5 32127504 32127840 + 1 NA intron (NM_022130, intron 3 of 3) intron (NM_022130, intron 3 of 3) 46647 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 190.5-26 chr11 67144450 67144743 + 1 NA intron (NR_027473, intron 2 of 20) AluJb|SINE|Alu 25333 NR_027473 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 310.5-10 chr14 21595618 21596186 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -25158 NM_001005465 26533 Hs.554581 NM_001005465 ENSG00000169208 OR10G3 OR14-40 olfactory receptor family 10 subfamily G member 3 protein-coding 312.5-18 chr20 59170010 59170447 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -20792 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 196.75-27 chr11 122963223 122963529 + 1 NA 3' UTR (NM_024806, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_024806, exon 9 of 9) 18458 NM_001098169 390259 Hs.449687 NM_001098169 ENSG00000188909 BSX BSX1 brain specific homeobox protein-coding 118.75-124 chr3 35755021 35755171 + 1 NA intron (NM_016300, intron 18 of 19) intron (NM_016300, intron 18 of 19) 10620 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 122.5-128 chr2 236398008 236398217 + 1 NA intron (NR_073043, intron 9 of 19) MIRb|SINE|MIR 105585 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 234.75-66 chr6 35680220 35680758 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) 8426 NM_001145776 2289 Hs.407190 NM_004117 ENSG00000096060 FKBP5 AIG6|FKBP51|FKBP54|P54|PPIase|Ptg-10 FKBP prolyl isomerase 5 protein-coding 129.25-129 chr3 96150147 96150305 + 1 NA Intergenic Intergenic -209738 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 141.5-44 chr12 97496782 97497021 + 1 NA intron (NR_024037, intron 7 of 8) intron (NR_024037, intron 7 of 8) 4992 NR_031653 100302289 NR_031653 ENSG00000221479 MIR1251 MIRN1251|hsa-mir-1251 microRNA 1251 ncRNA 245.5-45 chr3 36971016 36971382 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 21932 NM_014805 9852 Hs.28020 NM_014805 ENSG00000178567 EPM2AIP1 - EPM2A interacting protein 1 protein-coding 231.25-79 chr9 85441623 85442028 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 300204 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 404.5-3 chr2 196387694 196388323 + 1 NA intron (NM_020760, intron 2 of 28) intron (NM_020760, intron 2 of 28) -25831 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 131.25-99 chr2 52719619 52719819 + 1 NA Intergenic Intergenic -17104 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 147.5-199 chr7 77751414 77751672 + 1 NA intron (NM_198467, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 46891 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 232.5-94 chr6 165866400 165866845 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -120929 NR_027284 441177 Hs.708964 NM_001013720 ENSG00000281832 LINC00602 - long intergenic non-protein coding RNA 602 ncRNA 199.5-95 chr20 57094314 57094676 + 1 NA Intergenic Intergenic -119201 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 192.25-103 chr8 100030915 100031154 + 1 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) L1MEd|LINE|L1 26452 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 178.75-44 chr2 19912923 19913286 + 1 NA 3' UTR (NM_020779, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_020779, exon 27 of 27) -11121 NM_001008237 130502 Hs.591547 NM_001008237 ENSG00000183891 TTC32 - tetratricopeptide repeat domain 32 protein-coding 319.5-13 chr12 71244092 71244461 + 1 NA Intergenic Intergenic -86277 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 207.25-102 chr8 137203342 137203725 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 210055 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 149.75-61 chr17 49871345 49871536 + 1 NA Intergenic Intergenic -23423 NM_001077506 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 301.25-20 chr22 28476319 28476708 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME3F|LINE|L1 16644 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 213.5-100 chr5 63693550 63693927 + 1 NA Intergenic Intergenic 268554 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 114.25-96 chr2 84457514 84457754 + 1 NA intron (NM_003849, intron 1 of 8) intron (NM_003849, intron 1 of 8) 1646 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 165.25-56 chr17 73669309 73669607 + 1 NA Intergenic (TAATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -25013 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 230.5-47 chr16 71795884 71796344 + 1 NA intron (NM_001128, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 12720 NM_001030007 164 Hs.461253 NM_001128 ENSG00000166747 AP1G1 ADTG|CLAPG1 adaptor related protein complex 1 subunit gamma 1 protein-coding 152.75-4 chr1 77122034 77122345 + 1 NA intron (NM_005482, intron 10 of 10) intron (NM_005482, intron 10 of 10) 62046 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 159.5-101 chr2 59685149 59685373 + 1 NA Intergenic Intergenic 467553 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 190.5-43 chr14 20492893 20493186 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -17433 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 156.25-17 chr10 50964768 50965098 + 1 NA Intergenic Intergenic -25955 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 130.5-93 chr14 69966450 69966659 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) L3|LINE|CR1 -11579 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 189.25-81 chr3 95802006 95802211 + 1 NA Intergenic Intergenic -118915 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 114.75-97 chr2 152469427 152469561 + 1 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 134320 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 329.75-12 chr3 48531946 48532376 + 1 NA intron (NM_001317135, intron 9 of 13) AluSx|SINE|Alu 17860 NR_106881 102465494 NR_106881 ENSG00000278799 MIR6823 hsa-mir-6823 microRNA 6823 ncRNA 233.75-79 chr8 131889972 131890346 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13934 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 121.75-31 chr12 33505999 33506146 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -66253 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 219.5-76 chr21 27206587 27206856 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -239633 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 160.25-11 chr10 68177327 68177650 + 1 NA intron (NR_045662, intron 12 of 19) intron (NR_045662, intron 12 of 19) 54625 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 190.5-139 chr7 7788863 7789168 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -70408 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 311.25-7 chr13 52688742 52689128 + 1 NA 3' UTR (NM_006704, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_006704, exon 13 of 13) 36099 NM_006704 10910 Hs.281902 NM_006704 ENSG00000165416 SUGT1 SGT1 SGT1 homolog, MIS12 kinetochore complex assembly cochaperone protein-coding 256.5-41 chr20 54995029 54995354 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -427852 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 159.25-54 chr18 7054900 7055085 + 1 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 62805 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 161.25-78 chr18 10231955 10232187 + 1 NA Intergenic Intergenic 182299 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 203.25-58 chr2 209088332 209088704 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -335529 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 171.25-75 chr2 71365715 71366044 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 6 of 27) AluJo|SINE|Alu 34097 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 204.5-28 chr13 49422923 49423258 + 1 NA intron (NM_001287337, intron 3 of 11) L3|LINE|CR1 -9339 NM_001287338 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 164.5-63 chr14 69842946 69843189 + 1 NA Intergenic Intergenic 31307 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 227.5-89 chr6 49860708 49861037 + 1 NA intron (NM_001205220, intron 1 of 7) L1M2|LINE|L1 5663 NM_170609 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 152.5-4 chr1 60263470 60263693 + 1 NA Intergenic Intergenic -189811 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 112.5-183 chr4 69935648 69935805 + 1 NA intron (NM_001890, intron 4 of 15) intron (NM_001890, intron 4 of 15) 4658 NM_001890 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 254.25-48 chr4 65093222 65093586 + 1 NA Intergenic Intergenic -88904 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 124.5-213 chr7 108126026 108126222 + 1 NA intron (NM_007356, intron 1 of 33) intron (NM_007356, intron 1 of 33) 4237 NM_001318046 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 215.25-76 chr5 19256743 19257129 + 1 NA Intergenic Intergenic 629336 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 321.5-41 chrX 81514464 81515031 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 312645 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 155.75-136 chr6 34925168 34925515 + 1 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 36086 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 223.5-126 chr8 39012944 39013498 + 1 NA intron (NR_027638, intron 3 of 20) intron (NR_027638, intron 3 of 20) 5464 NR_145988 109616979 NR_145736 ENSG00000207199 SNORD38D - small nucleolar RNA, C/D box 38D snoRNA 123.75-108 chr22 26591043 26591352 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -1065 NM_001362922 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 131.5-109 chr2 47420410 47420633 + 1 NA intron (NM_000251, intron 6 of 15) intron (NM_000251, intron 6 of 15) 17454 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 137.25-178 chr9 98862757 98862998 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 55207 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 211.75-5 chr1 80964449 80964703 + 1 NA Intergenic Intergenic 323289 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 264.75-6 chr11 32107408 32107834 + 1 NA Intergenic Intergenic 16547 NM_002901 5954 Hs.97887 NM_002901 ENSG00000049449 RCN1 HEL-S-84|PIG20|RCAL|RCN reticulocalbin 1 protein-coding 118.25-205 chr8 126140844 126141028 + 1 NA Intergenic Intergenic -184559 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 116.5-243 chr8 69998393 69998598 + 1 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack 72757 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 159.5-207 chr8 107141890 107142133 + 1 NA Intergenic Intergenic 194504 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 261.25-50 chr8 56404190 56404658 + 1 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -13714 NR_103832 442388 Hs.632065 NM_001145251 ENSG00000253542 SDR16C6P SDR16C6 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, pseudogene pseudo 288.5-35 chr5 144197066 144197401 + 1 NA intron (NM_020768, intron 2 of 3) intron (NM_020768, intron 2 of 3) -8158 NM_001370486 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 140.5-13 chr10 15431198 15431372 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -59996 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 208.25-80 chr7 8636012 8636482 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 202638 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 351.5-27 chr7 94237278 94237920 + 1 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 154593 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 129.5-139 chr2 205917695 205917865 + 1 NA Intergenic Intergenic 168394 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 211.5-55 chr15 64831360 64831747 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5906 NM_001286499 80119 Hs.112160 NM_025049 ENSG00000140451 PIF1 C15orf20|PIF PIF1 5'-to-3' DNA helicase protein-coding 193.5-63 chr17 28940187 28940502 + 1 NA intron (NM_001033561, intron 2 of 14) intron (NM_001033561, intron 2 of 14) 11174 NM_001290131 57649 Hs.444173 NM_020889 ENSG00000109118 PHF12 PF1 PHD finger protein 12 protein-coding 155.5-8 chr1 55168431 55168718 + 1 NA intron (NM_015306, intron 5 of 67) L1MEd|LINE|L1 46790 NM_015306 23358 Hs.477009 NM_015306 ENSG00000162402 USP24 - ubiquitin specific peptidase 24 protein-coding 139.5-5 chr1 173086047 173086254 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -35187 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 169.5-157 chr7 8470037 8470348 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 36583 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 175.5-150 chr7 100442443 100442664 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6056 NM_001346938 221908 Hs.413359 NM_145030 ENSG00000160813 PPP1R35 C7orf47 protein phosphatase 1 regulatory subunit 35 protein-coding 173.5-145 chr6 104264615 104264846 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 594816 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 156.5-148 chr5 45435724 45435949 + 1 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 260544 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 310.75-20 chr2 28795625 28796206 + 1 NA intron (NM_206876, intron 8 of 8) L1PA16|LINE|L1 -14919 NM_182756 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 320.5-16 chr17 82096905 82097366 + 1 NA intron (NM_004104, intron 1 of 42) intron (NM_004104, intron 1 of 42) 1101 NM_004104 2194 Hs.83190 NM_004104 ENSG00000169710 FASN FAS|OA-519|SDR27X1 fatty acid synthase protein-coding 193.25-22 chr11 91299251 91299653 + 1 NA Intergenic Intergenic -430250 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 240.75-80 chr9 35404711 35405021 + 1 NA 3' UTR (NM_001371186, exon 39 of 39) 3' UTR (NM_001371186, exon 39 of 39) -1889 NR_110320 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 140.25-55 chr15 88518480 88518725 + 1 NA intron (NR_026645, intron 3 of 4) intron (NR_026645, intron 3 of 4) 27773 NR_135743 55070 Hs.655064 NM_017996 ENSG00000140543 DET1 - DET1 partner of COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 130.5-85 chr13 60186273 60186456 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22379 NM_001258369 81624 Hs.283127 NM_030932 ENSG00000139734 DIAPH3 AN|AUNA1|DIA2|DRF3|NSDAN|diap3|mDia2 diaphanous related formin 3 protein-coding 177.5-71 chr19 28039227 28039544 + 1 NA Intergenic Intergenic -245445 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 168.5-65 chr17 61626914 61627151 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -35813 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 127.5-240 chr8 100325278 100325468 + 1 NA intron (NM_001280539, intron 1 of 10) intron (NM_001280539, intron 1 of 10) 10831 NM_001280539 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 282.75-30 chr3 197278546 197279199 + 1 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 15076 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 145.5-112 chr20 118540 118723 + 1 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -23959 NM_030931 81623 Hs.124211 NM_030931 ENSG00000125788 DEFB126 C20orf8|DEFB-26|DEFB26|HBD26|bA530N10.1|hBD-26 defensin beta 126 protein-coding 158.5-127 chr3 41551444 41551613 + 1 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) L1MA4A|LINE|L1 352023 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 248.25-14 chr12 749329 749718 + 1 NA Intergenic Intergenic -3056 NM_018979 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 174.5-90 chr19 38204991 38205217 + 1 NA intron (NM_015073, intron 21 of 21) intron (NM_015073, intron 21 of 21) 19146 NM_001289978 8193 Hs.631576 NM_004647 ENSG00000011332 DPF1 BAF45b|NEUD4|neuro-d4 double PHD fingers 1 protein-coding 154.25-174 chr8 131455297 131455538 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -414508 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 173.5-44 chr15 57179918 57180219 + 1 NA intron (NM_001322154, intron 6 of 20) intron (NM_001322154, intron 6 of 20) -39362 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 165.5-17 chr10 43175055 43175299 + 1 NA intron (NM_018590, intron 6 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 20280 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 116.75-26 chr10 78918011 78918312 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 149287 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-55 chr16 50635746 50636040 + 1 NA 3' UTR (NM_033119, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_033119, exon 10 of 10) -32962 NR_110908 101927272 Hs.460777 NR_110908 ENSG00000260249 LOC101927272 - uncharacterized LOC101927272 ncRNA 167.5-118 chr3 165058101 165058373 + 1 NA intron (NM_001041, intron 12 of 47) L1M1|LINE|L1 20259 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 157.25-10 chr10 25156065 25156401 + 1 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) AluSc5|SINE|Alu -18768 NM_020752 57512 Hs.499108 NM_020752 ENSG00000151025 GPR158 - G protein-coupled receptor 158 protein-coding 187.25-72 chr3 18904270 18904482 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -244134 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 284.5-52 chr5 164049025 164049652 + 1 NA Intergenic Intergenic 418064 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 148.5-5 chr1 88202521 88202819 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -481474 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 119.5-38 chr10 110779699 110779887 + 1 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) MER21B|LTR|ERVL 91111 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-103 chr3 116080330 116080653 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -175365 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 197.25-105 chr9 95990566 95990824 + 1 NA intron (NM_020207, intron 17 of 18) LTR1C|LTR|ERV1 31116 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 127.75-103 chr2 143763836 143764106 + 1 NA intron (NM_018460, intron 13 of 13) intron (NM_018460, intron 13 of 13) -173096 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 169.75-16 chr10 57412954 57413195 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -108515 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 147.25-139 chr8 48657489 48657846 + 1 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) intron (NR_105002, intron 2 of 3) 37264 NR_105004 101929217 Hs.547790 NR_105004 ENSG00000253455 LOC101929217 - uncharacterized LOC101929217 ncRNA 162.25-71 chr2 3784115 3784356 + 1 NA intron (NM_001287444, intron 9 of 10) intron (NM_001287444, intron 9 of 10) 77393 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 219.25-73 chr7 77265790 77266333 + 1 NA intron (NM_020879, intron 9 of 18) intron (NM_020879, intron 9 of 18) -66242 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 136.25-154 chr5 128211718 128211941 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 128063 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 242.25-9 chr10 14758180 14758461 + 1 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) 16577 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 155.25-86 chr18 52909987 52910380 + 1 NA intron (NM_005215, intron 3 of 28) intron (NM_005215, intron 3 of 28) -326918 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 246.75-70 chr8 75667072 75667620 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 127378 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 230.5-90 chr4 111071927 111072358 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -211495 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 202.5-83 chr20 506144 506465 + 1 NA intron (NM_177560, intron 1 of 11) intron (NM_177560, intron 1 of 11) 37486 NM_001895 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 183.5-134 chr7 43883130 43883338 + 1 NA intron (NM_001077663, intron 3 of 5) intron (NM_001077663, intron 3 of 5) -13717 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 188.5-126 chr5 107363449 107363717 + 1 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 307354 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 112.5-54 chr12 58714695 58714851 + 1 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 66943 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 185.25-32 chr14 100927449 100927775 + 1 NA TTS (NR_003230) TTS (NR_003230) 270 NR_003230 767562 NR_003230 ENSG00000212384 SNORD113-2 14q(I-2) small nucleolar RNA, C/D box 113-2 snoRNA 155.5-126 chr3 60933351 60933655 + 1 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) MER33|DNA|hAT-Charlie -315633 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 269.25-30 chr3 27092154 27092650 + 1 NA Intergenic Intergenic 124121 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 170.5-20 chr1 247378864 247379136 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -37156 NM_001079821 114548 Hs.159483 NM_004895 ENSG00000162711 NLRP3 AGTAVPRL|AII|AVP|C1orf7|CIAS1|CLR1.1|DFNA34|FCAS|FCAS1|FCU|KEFH|MWS|NALP3|PYPAF1 NLR family pyrin domain containing 3 protein-coding 189.75-41 chr15 66557478 66557805 + 1 NA intron (NM_001278562, intron 7 of 11) intron (NM_001278562, intron 7 of 11) 7856 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 158.5-48 chr12 66452887 66453370 + 1 NA intron (NM_001366722, intron 11 of 24) intron (NM_001366722, intron 11 of 24) 150583 NR_135080 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 127.25-120 chr3 49450381 49450561 + 1 NA Intergenic Intergenic -18232 NM_001177643 1605 Hs.76111 NM_004393 ENSG00000173402 DAG1 156DAG|A3a|AGRNR|DAG|LGMDR16|MDDGA9|MDDGC7|MDDGC9 dystroglycan 1 protein-coding 123.25-134 chr3 102952120 102952339 + 1 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 517214 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 176.25-63 chr2 59069313 59069571 + 1 NA Intergenic Intergenic -148266 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 284.5-50 chr5 109631722 109632146 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -57432 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 200.25-104 chr7 127787054 127787402 + 1 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) AluJo|SINE|Alu 135034 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 297.25-2 chr10 56862865 56863192 + 1 NA Intergenic Intergenic 441531 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 150.75-195 chr9 135263127 135263340 + 1 NA Intergenic Intergenic -80016 NM_173520 157927 Hs.559511 NM_173520 C9orf62 - chromosome 9 open reading frame 62 protein-coding 203.5-77 chr2 188177479 188177766 + 1 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) HAL1b|LINE|L1 110069 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 170.5-100 chr2 173651723 173651987 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 296983 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 303.75-30 chr6 62329756 62330228 + 1 NA Intergenic Intergenic -43765 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 180.5-57 chr17 53217306 53217609 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 231952 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 146.75-52 chr15 68912658 68912867 + 1 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -17738 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 283.75-15 chr2 27335143 27335607 + 1 NA promoter-TSS (NR_038427) promoter-TSS (NR_038427) -167 NR_038427 100505624 Hs.666503 NR_038427 ENSG00000234945 GTF3C2-AS1 - GTF3C2 antisense RNA 1 ncRNA 190.25-3 chr1 82766209 82766501 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -136828 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 182.75-29 chr10 125807209 125807427 + 1 NA intron (NM_001324039, intron 6 of 6) intron (NM_001324039, intron 6 of 6) -12422 NR_039704 100616327 NR_039704 ENSG00000265092 MIR4484 mir-4484 microRNA 4484 ncRNA 189.75-6 chr1 154963786 154964209 + 1 NA intron (NM_003029, intron 12 of 12) intron (NM_003029, intron 12 of 12) -2215 NM_138300 90780 Hs.533597 NM_138300 ENSG00000163348 PYGO2 1190004M21Rik pygopus family PHD finger 2 protein-coding 128.75-79 chr18 2258027 2258224 + 1 NA Intergenic Intergenic 313380 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 166.75-74 chr2 20253913 20254099 + 1 NA exon (NM_001352918, exon 20 of 21) exon (NM_001352918, exon 20 of 21) -28573 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 122.5-57 chr14 35682231 35682578 + 1 NA intron (NM_014990, intron 20 of 40) AluY|SINE|Alu 80527 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 185.75-15 chr10 52069961 52070327 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 7 of 17) L1MEd|LINE|L1 243984 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 228.5-85 chr5 139058290 139058725 + 1 NA intron (NM_022464, intron 3 of 9) L1MC4a|LINE|L1 139861 NM_001037633 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 330.75-4 chr10 89006463 89006859 + 1 NA intron (NR_028034, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 -13686 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 232.5-90 chr6 39727420 39727820 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2197 NM_001351503 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 252.75-63 chr6 52386409 52386769 + 1 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) L1PA16|LINE|L1 24438 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 196.25-113 chr7 89942522 89942829 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) -176725 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 180.75-34 chr13 85331262 85331469 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -32238 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 190.25-43 chr15 59156567 59156958 + 1 NA intron (NM_004998, intron 25 of 27) intron (NM_004998, intron 25 of 27) 14500 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 125.25-156 chr5 42435660 42435888 + 1 NA intron (NM_001242401, intron 1 of 10) intron (NM_001242401, intron 1 of 10) 10793 NM_001242401 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 152.5-140 chr4 117569586 117569804 + 1 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 141297 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 131.5-76 chr15 84744923 84745151 + 1 NA Intergenic Intergenic -3555 NM_014630 9640 Hs.79347 NM_014630 ENSG00000166716 ZNF592 CAMOS|SCAR5 zinc finger protein 592 protein-coding 157.5-80 chr17 61978115 61978348 + 1 NA intron (NM_005121, intron 16 of 29) AluSq2|SINE|Alu -50249 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 214.25-36 chr19 9908755 9909075 + 1 NA intron (NM_058164, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 4886 NM_001304347 93145 Hs.169743 NM_058164 ENSG00000105088 OLFM2 NOE2|NOELIN2|NOELIN2_V1|OlfC olfactomedin 2 protein-coding 159.75-184 chr9 89740471 89740779 + 1 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 100842 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 289.75-28 chr6 120022779 120023131 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 7776 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 121.75-37 chr13 59703560 59703749 + 1 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) L1MEg1|LINE|L1 -309064 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 234.75-9 chr10 32509776 32510218 + 1 NA intron (NM_145023, intron 10 of 17) L1MA9|LINE|L1 63857 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 250.25-25 chr2 71489200 71489493 + 1 NA intron (NM_001130985, intron 3 of 54) intron (NM_001130985, intron 3 of 54) 22647 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 208.25-47 chr2 165170406 165170761 + 1 NA intron (NM_006922, intron 3 of 27) intron (NM_006922, intron 3 of 27) 33467 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 250.5-44 chr2 40575530 40575802 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -63231 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 143.5-175 chr5 125069491 125069734 + 1 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 32781 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 194.5-125 chr6 40267499 40267785 + 1 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 88364 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 196.5-159 chr7 109198142 109198530 + 1 NA Intergenic Intergenic -313749 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 180.5-140 chr7 54192671 54192896 + 1 NA Intergenic Intergenic -137914 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 179.5-161 chr6 145123831 145124131 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 562896 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 125.25-77 chr16 53777375 53777698 + 1 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 73380 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 156.25-50 chr16 77988879 77989103 + 1 NA Intergenic Intergenic -33557 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 136.5 chr1 24034320 24034559 + 1 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -53976 NR_034035 10772 Hs.3530 NM_006625 ENSG00000188529 SRSF10 FUSIP1|FUSIP2|NSSR|PPP1R149|SFRS13|SFRS13A|SRp38|SRrp40|TASR|TASR1|TASR2 serine and arginine rich splicing factor 10 protein-coding 164.5-212 chr8 114023825 114024059 + 1 NA Intergenic Intergenic -587003 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 259.5-10 chr1 150640882 150641225 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11431 NM_207168 2029 Hs.632456 NM_004436 ENSG00000143420 ENSA ARPP-19e endosulfine alpha protein-coding 131.5-192 chr5 96027091 96027261 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu -51962 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 184.5-167 chr9 76244119 76244364 + 1 NA intron (NM_001190482, intron 24 of 36) intron (NM_001190482, intron 24 of 36) 150185 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 236.5-98 chr8 129003874 129004379 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -38125 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 229.5-124 chr7 18238061 18238422 + 1 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) MIRc|SINE|MIR -51851 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 150.25-116 chr4 144169523 144169743 + 1 NA Intergenic Intergenic -28915 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 252.75-25 chr18 6818959 6819289 + 1 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -15361 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 179.75-77 chr3 107793654 107793974 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 14 of 16) intron (NM_001276286, intron 14 of 16) 84254 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 119.5-173 chr5 8985443 8985667 + 1 NA Intergenic Intergenic 68340 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 270.25-48 chr9 73947758 73948341 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -423482 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 218.5-22 chr10 102824834 102825109 + 1 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 12442 NM_000102 1586 Hs.438016 NM_000102 ENSG00000148795 CYP17A1 CPT7|CYP17|P450C17|S17AH cytochrome P450 family 17 subfamily A member 1 protein-coding 242.25-5 chr1 96680990 96681260 + 1 NA Intergenic Intergenic -40480 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 156.5-93 chr2 202683719 202684076 + 1 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 48928 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 229.5-46 chr15 75468959 75469274 + 1 NA intron (NM_002833, intron 12 of 12) intron (NM_002833, intron 12 of 12) -13301 NM_001145357 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 250.25-18 chr17 71377003 71377329 + 1 NA Intergenic Intergenic -174987 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 251.25-20 chr17 28733354 28733720 + 1 NA intron (NM_178170, intron 1 of 14) intron (NM_178170, intron 1 of 14) 4749 NM_178170 284086 Hs.448468 NM_178170 ENSG00000160602 NEK8 JCK|NEK12A|NPHP9|RHPD2 NIMA related kinase 8 protein-coding 234.5-38 chr19 34624884 34625234 + 1 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) MER61F|LTR|ERV1 -20814 NR_045208 100130342 Hs.679909 NR_045208 SCGB2B3P C2B|SCGB4A3P secretoglobin family 2B member 3, pseudogene pseudo 232.25-51 chr4 62755418 62755770 + 1 NA Intergenic Intergenic -593829 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 159.75-68 chr19 38658223 38658510 + 1 NA intron (NM_001322033, intron 1 of 20).2 intron (NM_001322033, intron 1 of 20).2 10717 NM_001322033 81 Hs.270291 NM_004924 ENSG00000130402 ACTN4 ACTININ-4|FSGS|FSGS1 actinin alpha 4 protein-coding 205.75-47 chr3 118893671 118893938 + 1 NA Intergenic Intergenic -49272 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-55 chr13 29543438 29543586 + 1 NA intron (NM_003045, intron 2 of 12) intron (NM_003045, intron 2 of 12) 52176 NM_003045 6541 Hs.14846 NM_003045 ENSG00000139514 SLC7A1 ATRC1|CAT-1|ERR|HCAT1|REC1L solute carrier family 7 member 1 protein-coding 177.5-172 chr8 114579107 114579330 + 1 NA Intergenic Intergenic 1088795 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 278.5-4 chr1 82749603 82750031 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -153366 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 174.75-36 chr15 49385893 49386105 + 1 NA intron (NM_152647, intron 11 of 15) L1PB3|LINE|L1 -37243 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 150.5-198 chr7 13308677 13308978 + 1 NA Intergenic Intergenic 621194 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 250.75-26 chr2 147172272 147172637 + 1 NA Intergenic Intergenic 585397 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 190.25-5 chr1 110787535 110787903 + 1 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -83480 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 353.5-15 chr5 34991635 34992179 + 1 NA Intergenic LTR19A|LTR|ERV1 56042 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 270.25-45 chr7 22855900 22856407 + 1 NA promoter-TSS (NR_003075) promoter-TSS (NR_003075) -460 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 206.25-82 chr5 41257310 41257540 + 1 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) L1PA15|LINE|L1 4044 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 169.5-65 chr18 1967060 1967386 + 1 NA Intergenic Intergenic 604282 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 138.25-131 chr4 114419369 114419578 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -178929 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 224.25-103 chr8 19381367 19381722 + 1 NA intron (NM_001363110, intron 7 of 8) L1MB3|LINE|L1 67568 NM_001174159 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 182.25-77 chr3 53644706 53645001 + 1 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) L1MA8|LINE|L1 150242 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 216.25-97 chr7 114332867 114333102 + 1 NA intron (NR_033766, intron 2 of 19) intron (NR_033766, intron 2 of 19) -81831 NR_033767 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 119.5-222 chr7 140072442 140072605 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -8802 NR_130117 64761 Hs.12646 NM_022750 ENSG00000059378 PARP12 ARTD12|MST109|MSTP109|ZC3H1|ZC3HDC1 poly(ADP-ribose) polymerase family member 12 protein-coding 211.25-42 chr2 132429674 132430030 + 1 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) -3859 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 245.25-49 chr3 165628004 165628572 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 209135 NR_137636 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 174.5-37 chr11 85264237 85264412 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) -340903 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 112.5-232 chr8 74797037 74797227 + 1 NA Intergenic Intergenic -27402 NM_015886 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 241.5-86 chr7 3221958 3222422 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -63617 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 189.25-5 chr1 184363040 184363320 + 1 NA Intergenic Intergenic -23849 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 156.75-61 chr15 57473585 57473805 + 1 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 97190 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 171.5-147 chr8 75002236 75002444 + 1 NA intron (NM_001286778, intron 1 of 13) intron (NM_001286778, intron 1 of 13) 2185 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 132.75-179 chr7 87573458 87573678 + 1 NA intron (NM_001348944, intron 6 of 29) L2c|LINE|L2 27316 NM_001348946 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 193.5-138 chr5 158095626 158095928 + 1 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -236632 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 229.25-8 chr10 77518741 77519007 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 118934 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 118.5-189 chr7 35837457 35837612 + 1 NA intron (NM_001363715, intron 3 of 13) L1ME3G|LINE|L1 36315 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 146.5-76 chr16 53875225 53875426 + 1 NA intron (NM_001363900, intron 5 of 7) intron (NM_001363900, intron 5 of 7) -164068 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 177.5-4 chr1 44269704 44269886 + 1 NA intron (NM_001301698, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR -17236 NR_132966 106635545 NR_132966 SNORA110 - small nucleolar RNA, H/ACA box 110 snoRNA 155.25-17 chr1 199786861 199787280 + 1 NA Intergenic Intergenic -240640 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 190.5-76 chr2 78155969 78156316 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu 67412 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 217.75-47 chr22 50714186 50714429 + 1 NA intron (NM_033517, intron 18 of 21).2 intron (NM_033517, intron 18 of 21).2 23862 NR_134637 105373100 Hs.475243 NR_134637 ENSG00000225929 LOC105373100 - uncharacterized LOC105373100 ncRNA 365.75-12 chr3 167159736 167160167 + 1 NA Intergenic Intergenic 220332 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 210.5-24 chr11 119024317 119024784 + 1 NA TTS (NM_016146).2 TTS (NM_016146).2 4930 NM_001164280 2542 Hs.719203 NM_001467 ENSG00000137700 SLC37A4 G6PT1|G6PT2|G6PT3|GSD1b|GSD1c|GSD1d|PRO0685|TRG-19|TRG19 solute carrier family 37 member 4 protein-coding 258.5-49 chr3 77589195 77589492 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 18 of 26) intron (NM_001290039, intron 18 of 26) 459620 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 192.75-19 chr11 34727426 34727762 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 95028 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 115.25-189 chr7 79668860 79668993 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 214966 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 192.5-74 chr2 158391021 158391338 + 1 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) intron (NM_138803, intron 1 of 13) 65574 NM_138803 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 200.75-81 chr5 3703254 3703564 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 107577 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 234.5-12 chr10 76954407 76954650 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 20 of 28) intron (NM_001271519, intron 20 of 28) 66484 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 148.5-12 chr1 172402656 172402853 + 1 NA intron (NM_001350206, intron 20 of 20) intron (NM_001350206, intron 20 of 20) -17931 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 112.5-236 chr8 120065169 120065435 + 1 NA Intergenic Intergenic -59800 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 123.75-88 chr2 16204552 16204731 + 1 NA Intergenic Intergenic 154214 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 125.5-274 chrX 70998214 70998447 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -67234 NM_032803 84889 Hs.175220 NM_032803 ENSG00000165349 SLC7A3 ATRC3|CAT-3|CAT3 solute carrier family 7 member 3 protein-coding 211.75-37 chr18 11044446 11044820 + 1 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 104129 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 141.5-98 chr2 64133835 64134061 + 1 NA intron (NM_020651, intron 1 of 6) intron (NM_020651, intron 1 of 6) 10472 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 170.75-54 chr17 81702099 81702493 + 1 NA TTS (NM_004712) TTS (NM_004712) -1071 NM_002949 6182 Hs.109059 NM_002949 ENSG00000262814 MRPL12 5c5-2|L12mt|MRP-L31/34|MRPL7|MRPL7/L12|RPML12 mitochondrial ribosomal protein L12 protein-coding 155.5-172 chr5 120070617 120070901 + 1 NA Intergenic Intergenic -393519 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 172.5-18 chr1 188957126 188957387 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1513628 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 143.75-20 chr10 76433754 76433973 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -454181 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 373.5-3 chr12 9818751 9819266 + 1 NA intron (NR_159359, intron 1 of 5) L1PA13|LINE|L1 -8473 NM_001291823 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 136.25-60 chr14 66351799 66352044 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -134450 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 138.5-64 chr14 80380057 80380285 + 1 NA intron (NR_038355, intron 4 of 8) AluSz6|SINE|Alu -149114 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 152.5-17 chr10 63952283 63952569 + 1 NA Intergenic Intergenic -430536 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 223.25-21 chr14 71670711 71671084 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 11 of 24) intron (NM_001354286, intron 11 of 24) 84599 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 230.5-96 chr5 5453276 5453621 + 1 NA intron (NM_015325, intron 10 of 18) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 30771 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 113.75-54 chr13 109247079 109247337 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -79905 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 207.5-105 chr7 103348771 103348993 + 1 NA intron (NM_001204453, intron 1 of 4) L1ME4b|LINE|L1 1239 NM_002803 5701 Hs.437366 NM_002803 ENSG00000161057 PSMC2 MSS1|Nbla10058|S7 proteasome 26S subunit, ATPase 2 protein-coding 188.5-27 chr12 41388937 41389157 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -48692 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 290.5-35 chr5 71674203 71674719 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -44814 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 318.5-42 chr9 82395694 82396033 + 1 NA Intergenic Intergenic 407091 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 267.5-4 chr1 88453371 88453747 + 1 NA Intergenic Intergenic -230585 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 116.5-102 chr18 54495450 54495592 + 1 NA Intergenic Intergenic -92238 NM_001307955 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 164.75-104 chr4 30522112 30522519 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -198054 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 194.5-64 chr2 28008825 28009047 + 1 NA intron (NM_199193, intron 5 of 13) intron (NM_199193, intron 5 of 13) 12569 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 150.75-159 chr6 55707250 55707497 + 1 NA Intergenic Intergenic -128159 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 147.5-41 chr12 4814650 4814966 + 1 NA intron (NM_002235, intron 1 of 1) intron (NM_002235, intron 1 of 1) 5632 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 176.75-52 chr19 28514842 28515060 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MEd|LINE|L1 -91737 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 199.5-9 chr1 166362792 166363070 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 127108 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 183.5-38 chr13 40039976 40040277 + 1 NA Intergenic Intergenic -141683 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 140.75-68 chr17 30107609 30107806 + 1 NA intron (NM_198529, intron 22 of 22) intron (NM_198529, intron 22 of 22) -9100 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 117.5-236 chr8 109481955 109482149 + 1 NA intron (NM_177531, intron 56 of 77) intron (NM_177531, intron 56 of 77) -57648 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 213.25-42 chr3 12524291 12524580 + 1 NA intron (NM_025265, intron 8 of 11) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 21029 NM_001195279 100129480 Hs.572974 NM_001195279 ENSG00000225526 MKRN2OS C3orf83|MKRN2-AS1 MKRN2 opposite strand protein-coding 176.75-128 chr8 134709692 134709939 + 1 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) intron (NM_001289394, intron 1 of 16) 3216 NM_001174157 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 127.75-197 chr8 79284519 79284678 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -47590 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 294.5-25 chr2 206952023 206952463 + 1 NA intron (NM_173077, intron 2 of 8) AluSg7|SINE|Alu 12725 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 296.5-33 chr6 51005195 51005646 + 1 NA Intergenic Intergenic 186549 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 188.75-99 chr6 124380042 124380302 + 1 NA intron (NM_153355, intron 3 of 5) intron (NM_153355, intron 3 of 5) 97167 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 189.5-32 chr11 102071564 102071848 + 1 NA intron (NM_032930, intron 4 of 6) L1M2|LINE|L1 24268 NM_001363505 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 206.75-88 chr7 129347863 129348190 + 1 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) intron (NM_001130720, intron 1 of 16) -20354 NM_001130723 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 125.75-164 chr6 104617896 104618080 + 1 NA Intergenic Intergenic 241558 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 187.75-122 chr9 79158548 79159020 + 1 NA Intergenic Intergenic -13118 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 180.25-130 chrX 87074633 87074897 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -443037 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 123.75-13 chr10 32074123 32074289 + 1 NA Intergenic Intergenic -17781 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 129.25-141 chr4 56155369 56155675 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14673 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 112.75-83 chr18 74620975 74621143 + 1 NA Intergenic Intergenic -9904 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 146.25-79 chr2 170515226 170515392 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 28 of 33) intron (NM_001083615, intron 28 of 33) -164366 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 263.25-21 chr15 36642971 36643449 + 1 NA intron (NM_032499, intron 2 of 11) intron (NM_032499, intron 2 of 11) 48333 NM_001290232 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 189.75-79 chr4 32796586 32796930 + 1 NA Intergenic Intergenic 445720 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 231.75-10 chr10 122999112 122999528 + 1 NA intron (NR_073478, intron 1 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie 9367 NM_001271840 64376 Hs.501289 NM_001271840 ENSG00000095574 IKZF5 PEGASUS|ZNFN1A5 IKAROS family zinc finger 5 protein-coding 126.25-127 chr4 55970428 55970734 + 1 NA intron (NM_025009, intron 9 of 25) intron (NM_025009, intron 9 of 25) 21636 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 164.5-67 chr14 97430650 97430867 + 1 NA Intergenic Intergenic -28058 NR_110166 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 112.5-7 chr1 150219512 150219775 + 1 NA 3' UTR (NM_001280559, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001280559, exon 7 of 7) 15035 NM_001136479 81611 Hs.656466 NM_030920 ENSG00000143401 ANP32E LANP-L|LANPL acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E protein-coding 235.5-16 chr10 90146758 90147025 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -189518 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 302.75-11 chr18 9649246 9649658 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 34188 NR_110774 101927323 Hs.151204 NR_110773 ENSG00000263627 PPP4R1-AS1 - PPP4R1 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-116 chr20 37253132 37253421 + 1 NA intron (NM_021081, intron 3 of 3) intron (NM_021081, intron 3 of 3) 3632 NM_001184731 2691 Hs.37023 NM_021081 ENSG00000118702 GHRH GHRF|GRF|INN growth hormone releasing hormone protein-coding 190.25-35 chr14 32446691 32446927 + 1 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) intron (NM_004274, intron 2 of 13) 117511 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 187.5 chr1 15390889 15391173 + 1 NA intron (NM_052929, intron 30 of 30) intron (NM_052929, intron 30 of 30) -18857 NM_024329 79180 Hs.465374 NM_024329 ENSG00000142634 EFHD2 SWS1 EF-hand domain family member D2 protein-coding 153.5-97 chr2 52340926 52341181 + 1 NA intron (NR_135237, intron 8 of 10) intron (NR_135237, intron 8 of 10) -29595 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 270.75-20 chr15 87781684 87782086 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 164383 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 251.5-88 chr8 109624843 109625207 + 1 NA intron (NM_001099746, intron 1 of 5) L1MC5a|LINE|L1 -16963 NM_001330596 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 226.25-31 chr16 82816273 82816729 + 1 NA intron (NR_110938, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 43182 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 208.5-70 chr2 51434024 51434372 + 1 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) L1MC2|LINE|L1 401597 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 248.5-41 chr18 74379776 74380053 + 1 NA Intergenic Intergenic -29534 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 381.25-4 chr15 101048565 101049075 + 1 NA intron (NM_024652, intron 22 of 33) intron (NM_024652, intron 22 of 33) 129463 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 116.25-11 chr1 189296695 189296934 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 1179196 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 236.5-36 chr16 78409080 78409456 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 309614 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 139.75-97 chr2 79589006 79589354 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 60179 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 223.5-56 chr19 46857557 46857912 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3263 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 239.5-39 chr17 75635471 75635754 + 1 NA promoter-TSS (NR_028439) promoter-TSS (NR_028439) -983 NR_028439 643008 Hs.528605 NM_001162995 ENSG00000204323 SMIM5 C17orf109|PP12104 small integral membrane protein 5 protein-coding 145.5-181 chr7 86159668 86159835 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -484158 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 157.5-101 chr2 62892170 62892399 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 155427 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 242.5-53 chr22 21662385 21662709 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3437 NM_148176 23759 Hs.438587 NM_014337 ENSG00000100023 PPIL2 CYC4|CYP60|Cyp-60|UBOX7|hCyP-60 peptidylprolyl isomerase like 2 protein-coding 290.75-7 chr10 91850791 91851399 + 1 NA intron (NM_025235, intron 20 of 26) intron (NM_025235, intron 20 of 26) 52669 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 151.5-182 chr7 84864905 84865089 + 1 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 256934 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 133.75-79 chr17 64249600 64249795 + 1 NA intron (NM_018469, intron 1 of 11) intron (NM_018469, intron 1 of 11) 13563 NM_001288732 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 166.5-68 chr14 77227034 77227360 + 1 NA intron (NM_020431, intron 6 of 23) L2|LINE|L2 -39021 NR_031661 100302236 NR_031661 ENSG00000221754 MIR1260A MIR1260|MIRN1260|hsa-mir-1260|hsa-mir-1260a|mir-1260a microRNA 1260a ncRNA 209.25-51 chr2 14003378 14003819 + 1 NA Intergenic Intergenic 397360 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 230.75-13 chr11 23408681 23408923 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 10388 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 117.25-122 chr2 133677596 133677803 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -109236 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 136.5-197 chr6 90040413 90040737 + 1 NA intron (NM_021813, intron 5 of 8) L1ME4b|LINE|L1 146106 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 176.75-119 chr8 50597250 50597706 + 1 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) L1MA6|LINE|L1 433347 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 123.5-104 chr2 96829659 96829847 + 1 NA intron (NM_199078, intron 6 of 6) intron (NM_199078, intron 6 of 6) 13485 NM_017623 26505 Hs.711617 NM_017623 ENSG00000168763 CNNM3 ACDP3 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3 protein-coding 282.5-6 chr10 24312979 24313433 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 37521 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 208.25-62 chr3 104961055 104961298 + 1 NA Intergenic Intergenic -405537 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 167.5-174 chr7 12631160 12631355 + 1 NA intron (NR_156701, intron 9 of 14) L2a|LINE|L2 41734 NM_033128 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 179.5-136 chr4 72507141 72507504 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 61899 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 123.5-211 chr8 123843139 123843434 + 1 NA Intergenic Intergenic -8701 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 163.75-119 chr7 62618686 62618966 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 685230 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 343.5-28 chr8 137540381 137541004 + 1 NA Intergenic Intergenic -127104 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 165.5-198 chr8 82736132 82736370 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -175853 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 177.5-72 chr19 50261492 50261900 + 1 NA intron (NM_024729, intron 19 of 40) intron (NM_024729, intron 19 of 40) 58068 NM_024729 79784 Hs.467142 NM_024729 ENSG00000105357 MYH14 DFNA4|DFNA4A|FP17425|MHC16|MYH17|NMHC II-C|NMHC-II-C|PNMHH|myosin myosin heavy chain 14 protein-coding 130.75-164 chr6 49891853 49892090 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -14875 NM_001205220 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 182.5-99 chr3 27173340 27173548 + 1 NA intron (NM_001304384, intron 7 of 16) intron (NM_001304384, intron 7 of 16) 43079 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 217.25-29 chr15 71224288 71224544 + 1 NA intron (NM_024817, intron 3 of 16) intron (NM_024817, intron 3 of 16) -35357 NR_120348 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-98 chr2 108420092 108420367 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -28977 NR_028063 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 228.5-69 chr22 50242350 50242694 + 1 NA intron (NM_020461, intron 1 of 24) intron (NM_020461, intron 1 of 24) 2501 NM_020461 85378 Hs.336431 NM_020461 ENSG00000128159 TUBGCP6 GCP-6|GCP6|MCCRP|MCCRP1|MCPHCR tubulin gamma complex associated protein 6 protein-coding 227.25-49 chr2 180329136 180329373 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -321957 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 248.25-36 chr2 139121172 139121513 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 224018 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 157.5-218 chr8 123795753 123796025 + 1 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 27450 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 136.25-90 chr2 15938152 15938361 + 1 NA intron (NR_110230, intron 3 of 3) MIR3|SINE|MIR -2294 NM_005378 4613 Hs.25960 NM_005378 ENSG00000134323 MYCN MODED|N-myc|NMYC|ODED|bHLHe37 MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 205.5-150 chr8 112387851 112388124 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 32 of 66) intron (NM_001363185, intron 32 of 66) -255506 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 126.75-195 chr5 89495543 89495693 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 521102 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 192.75-4 chr1 49051075 49051299 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -206224 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 206.5-60 chr2 170253912 170254218 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) L1PA16|LINE|L1 75918 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 186.75-17 chr11 99415111 99415377 + 1 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) MER39|LTR|ERV1 -140901 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 138.25-167 chr8 27375033 27375303 + 1 NA intron (NM_173175, intron 1 of 29) intron (NM_173175, intron 1 of 29) 49604 NM_173175 2185 Hs.491322 NM_004103 ENSG00000120899 PTK2B CADTK|CAKB|FADK2|FAK2|PKB|PTK|PYK2|RAFTK protein tyrosine kinase 2 beta protein-coding 128.5-205 chr7 38909384 38909687 + 1 NA promoter-TSS (NM_080631) promoter-TSS (NM_080631) -335 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 163.75-99 chr3 196121882 196122137 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -20627 NR_034088 401109 Hs.280133 NM_001001699 ENSG00000224652 LINC00885 - long intergenic non-protein coding RNA 885 ncRNA 144.75-33 chr11 98452885 98453046 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -567984 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 240.5-97 chr7 1983620 1984017 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 14 of 18) L1M5|LINE|L1 -43247 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 127.5-259 chr9 86352990 86353197 + 1 NA exon (NM_024617, exon 2 of 27) exon (NM_024617, exon 2 of 27) 1317 NM_001330718 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 185.5-162 chr8 108912364 108912638 + 1 NA Intergenic Intergenic -124907 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 193.5-101 chr22 32075342 32075603 + 1 NA intron (NM_000343, intron 5 of 14) MIR3|SINE|MIR 16302 NM_001256314 6523 Hs.1964 NM_000343 ENSG00000100170 SLC5A1 D22S675|NAGT|SGLT1 solute carrier family 5 member 1 protein-coding 164.5-39 chr12 61124951 61125219 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 1067754 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 126.75-250 chr8 124660761 124661103 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 67541 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 189.75-127 chr8 136686446 136686757 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 155803 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 173.75-149 chr8 107555669 107555875 + 1 NA Intergenic Intergenic -57854 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 176.5-32 chr12 1113475 1113729 + 1 NA intron (NM_001301248, intron 5 of 18) intron (NM_001301248, intron 5 of 18) 85854 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 202.5-95 chr3 112452231 112452475 + 1 NA Intergenic Intergenic 47119 NM_181780 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 263.5-24 chr17 72501394 72501944 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 91135 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 266.75-5 chr10 14827327 14827849 + 1 NA intron (NM_001029954, intron 2 of 3) intron (NM_001029954, intron 2 of 3) 10449 NM_001029954 441549 Hs.559067 NM_001029954 ENSG00000185267 CDNF ARMETL1 cerebral dopamine neurotrophic factor protein-coding 260.5-65 chr8 91293426 91293727 + 1 NA intron (NM_134266, intron 3 of 18) intron (NM_134266, intron 3 of 18) 44257 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 251.5-84 chr8 68929936 68930426 + 1 NA intron (NR_039986, intron 3 of 4) AluSx3|SINE|Alu 174009 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 295.5-12 chr14 27012101 27012536 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 103676 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 119.5-80 chr14 67144356 67144529 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 17 of 21) intron (NM_001024218, intron 17 of 21) -44998 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 175.5-160 chr8 82861654 82861933 + 1 NA Intergenic Intergenic -50311 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 267.5-26 chr15 51239507 51239866 + 1 NA intron (NM_001347252, intron 2 of 9) L1ME3B|LINE|L1 -2504 NR_039863 100616369 NR_039863 ENSG00000266593 MIR4713 - microRNA 4713 ncRNA 185.5-45 chr14 47684943 47685162 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -10098 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 266.5-16 chr12 37794053 37794457 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -522519 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 200.75-65 chr22 48568427 48568827 + 1 NA intron (NM_001082967, intron 1 of 3) intron (NM_001082967, intron 1 of 3) -7713 NM_015381 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 155.75-75 chr2 22112798 22113162 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -402328 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 132.5-161 chr3 54304824 54305041 + 1 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 182380 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 169.75-54 chr16 8945164 8945363 + 1 NA intron (NM_003470, intron 1 of 30) AluSz6|SINE|Alu 4391 NR_135826 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 198.25-65 chr20 55703735 55704019 + 1 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -276680 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 128.75-40 chr12 32260983 32261218 + 1 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) -138458 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 281.5-53 chr8 105673272 105673781 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 353983 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 196.5-38 chr11 122502812 122503130 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -80100 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 163.75-56 chr18 2179296 2179472 + 1 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 392121 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 182.75-55 chr17 59802825 59803057 + 1 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) AluSp|SINE|Alu -38325 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 178.5-64 chr16 72164386 72164650 + 1 NA intron (NM_001160213, intron 3 of 21) intron (NM_001160213, intron 3 of 21) 7637 NM_031293 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 132.5-260 chrX 45684704 45684952 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -46260 NR_102268 392452 Hs.745266 NR_102268 LOC392452 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 134.5-125 chr22 40134235 40134443 + 1 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) L1MC3|LINE|L1 -43586 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 140.5-182 chr5 93919864 93920079 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -178371 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 141.25-47 chr14 44263138 44263309 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 244060 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 175.75-127 chr8 142616547 142616774 + 1 NA Intergenic Intergenic -2181 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 178.5-120 chr4 47462565 47462866 + 1 NA intron (NM_001329668, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 987 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 133.25-101 chr2 113918311 113918455 + 1 NA intron (NM_005721, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu -27391 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 264.25-24 chr19 56970356 56970682 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 129617 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 157.75-102 chr21 35082150 35082335 + 1 NA Intergenic Intergenic -32944 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 183.5-125 chr6 50991463 50991778 + 1 NA Intergenic Intergenic 172749 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 157.5-64 chr15 26412422 26412781 + 1 NA Intergenic Intergenic 216489 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 317.75-13 chr15 60864295 60864816 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 182986 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 274.5-32 chr2 23339141 23339545 + 1 NA Intergenic Intergenic -45836 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 216.5-51 chr17 82534640 82534909 + 1 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) intron (NM_004514, intron 1 of 8) 15042 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 178.75-82 chr5 32395520 32395779 + 1 NA intron (NM_016107, intron 10 of 19) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -1174 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 155.5-218 chr9 83763938 83764132 + 1 NA intron (NM_001135953, intron 7 of 11) intron (NM_001135953, intron 7 of 11) 53734 NM_025211 80318 Hs.522255 NM_025211 ENSG00000165113 GKAP1 FKSG21|GKAP42 G kinase anchoring protein 1 protein-coding 136.25-111 chr21 23678897 23679252 + 1 NA Intergenic Intergenic -294239 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 191.25-44 chr18 7583969 7584339 + 1 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 16838 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 139.5-160 chr4 153336198 153336409 + 1 NA 3' UTR (NM_001130067, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001130067, exon 12 of 12) -8346 NM_001253861 84057 Hs.294088 NM_032117 ENSG00000121211 MND1 GAJ meiotic nuclear divisions 1 protein-coding 204.5-32 chr14 28346478 28346862 + 1 NA Intergenic Intergenic 418649 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-61 chr2 210615246 210615565 + 1 NA intron (NR_163592, intron 10 of 27) intron (NR_163592, intron 10 of 27) -2166 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 220.25-19 chr15 95405015 95405408 + 1 NA Intergenic Intergenic -27882 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 173.25-28 chr12 115204789 115204993 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -520716 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 194.75-67 chr3 70559507 70559976 + 1 NA Intergenic Intergenic -247103 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 192.5-25 chr11 9686136 9686476 + 1 NA intron (NM_015055, intron 1 of 11) L1ME3G|LINE|L1 22229 NM_015055 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 172.75-120 chr7 138003948 138004133 + 1 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -1954 NM_001253775 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 151.75-45 chr15 64613339 64613552 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 89836 NM_001301302 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 255.5-62 chr4 71961181 71961520 + 1 NA Intergenic Intergenic -70454 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 296.25-16 chr18 7590393 7590773 + 1 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) L1ME4a|LINE|L1 23267 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 249.25-27 chr2 192506030 192506340 + 1 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -243660 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 295.5-58 chr6 136637612 136638055 + 1 NA intron (NM_005923, intron 13 of 29) intron (NM_005923, intron 13 of 29) 8719 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 132.25-24 chr10 5152340 5152537 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 32749 NR_027916 340811 Hs.282513 NM_001007536 ENSG00000264006 AKR1C8P AKR1CL1 aldo-keto reductase family 1 member C8, pseudogene pseudo 219.5-66 chr2 69340257 69340566 + 1 NA intron (NM_002056, intron 12 of 18) intron (NM_002056, intron 12 of 18) 46816 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 144.5-221 chr8 105403704 105403892 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 84255 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 129.25-96 chr2 151740773 151741069 + 1 NA Intergenic Intergenic -6434 NM_001164507 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 143.5-199 chr7 83761044 83761262 + 1 NA Intergenic Intergenic -112014 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 170.25-46 chr15 98225819 98226088 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 105605 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 134.5-61 chr14 58221760 58222012 + 1 NA intron (NM_018477, intron 8 of 12) AluSx3|SINE|Alu 21737 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 181.25-40 chr16 60854679 60854991 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 200931 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 407.25-6 chr2 67092041 67092626 + 1 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 5887 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 181.25 chr1 41190007 41190255 + 1 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) L3|LINE|CR1 -27114 NM_001172221 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 170.5-171 chr7 27600634 27600833 + 1 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -15241 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 186.25-111 chr7 23013302 23013639 + 1 NA intron (NM_032581, intron 1 of 10) CpG 660 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 240.5-75 chr4 62907526 62907863 + 1 NA Intergenic Intergenic -745929 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 152.75-66 chr17 11277380 11277565 + 1 NA intron (NM_001173461, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 36049 NM_001173461 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 179.5-172 chr7 104459825 104460114 + 1 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1PREC2|LINE|L1 131313 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 184.75-82 chr5 151904838 151905191 + 1 NA intron (NM_000171, intron 1 of 8) intron (NM_000171, intron 1 of 8) 19837 NM_001146040 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 152.5-119 chr3 105174391 105174739 + 1 NA Intergenic Intergenic -192148 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 323.75-5 chr1 231189844 231190394 + 1 NA intron (NM_001300889, intron 3 of 11) intron (NM_001300889, intron 3 of 11) -2492 NM_001256615 149373 Hs.632505 NM_001256615 ENSG00000235710 LOC149373 - uncharacterized LOC149373 protein-coding 146.5-183 chr6 10050287 10050659 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -354029 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 173.5-101 chr3 106890970 106891446 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 349430 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 294.25-11 chr13 44053449 44053994 + 1 NA Intergenic Intergenic 31386 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 276.5-18 chr12 60798874 60799239 + 1 NA Intergenic Intergenic 1109686 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 288.5-15 chr16 5592535 5593092 + 1 NA Intergenic Intergenic 23437 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 137.75-29 chr10 96724136 96724352 + 1 NA Intergenic Intergenic -3730 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 179.5-108 chr20 61175554 61175851 + 1 NA Intergenic Intergenic -76559 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 137.5-136 chr2 209468977 209469172 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) L3|LINE|CR1 45027 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 196.5-80 chr2 31099571 31099863 + 1 NA intron (NM_001329095, intron 1 of 15) L1ME4b|LINE|L1 29923 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 278.5-64 chrX 55979717 55980136 + 1 NA intron (NM_001324105, intron 1 of 5) intron (NM_001324105, intron 1 of 5) 71641 NM_001324104 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 163.75-6 chr1 94263976 94264223 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -16353 NM_001328665 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 135.25-141 chr4 55277737 55277936 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -68406 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 119.5-109 chr19 27356566 27356706 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -436795 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 335.25-23 chr22 22155834 22156425 + 1 NA Intergenic Intergenic -88657 NM_001303509 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 229.5-93 chr3 156059008 156059422 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -61333 NM_172160 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 160.5-53 chr14 53937841 53938142 + 1 NA Intergenic (ATTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10493 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 204.25-21 chr11 107175076 107175457 + 1 NA Intergenic Intergenic -156790 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 183.5-55 chr17 62800106 62800458 + 1 NA intron (NM_001288780, intron 3 of 10) intron (NM_001288780, intron 3 of 10) 6358 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 194.5-28 chr12 940463 941007 + 1 NA intron (NR_123713, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 -7659 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 140.5-230 chr8 90198252 90198496 + 1 NA Intergenic Intergenic -23114 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 150.75-46 chr12 21259323 21259671 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 75420 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 229.75-84 chrX 108889852 108890262 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 153517 NR_110652 101928358 Hs.722300 NR_110652 ENSG00000237863 LOC101928358 - uncharacterized LOC101928358 ncRNA 126.5-75 chr15 52752234 52752392 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 28571 NR_073510 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 196.5-2 chr1 11018533 11018830 + 1 NA intron (NM_007375, intron 3 of 5) intron (NM_007375, intron 3 of 5) 6059 NM_007375 23435 Hs.300624 NM_007375 ENSG00000120948 TARDBP ALS10|TDP-43 TAR DNA binding protein protein-coding 179.75-130 chr8 84713133 84713369 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) L1M2|LINE|L1 7324 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 251.75-81 chr9 81187665 81187953 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 501726 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 122.5-205 chr7 7047605 7047864 + 1 NA Intergenic Intergenic 19311 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 287.25-40 chr5 43172523 43172918 + 1 NA intron (NM_003432, intron 6 of 7) intron (NM_003432, intron 6 of 7) -19505 NM_153361 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 148.5-188 chr5 125259789 125260076 + 1 NA intron (NR_109882, intron 4 of 5) intron (NR_109882, intron 4 of 5) 223101 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 198.75-33 chr16 84983132 84983427 + 1 NA intron (NM_017740, intron 3 of 7) intron (NM_017740, intron 3 of 7) 28256 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 190.5-3 chr1 54846201 54846481 + 1 NA Intergenic Intergenic 40278 NM_152607 163747 Hs.376018 NM_152607 ENSG00000162398 LEXM C1orf177|LEM lymphocyte expansion molecule protein-coding 249.5-41 chr18 607137 607601 + 1 NA intron (NM_001289036, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu -9303 NM_001318522 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 144.75-110 chr3 80785862 80786097 + 1 NA intron (NR_147143, intron 3 of 4) intron (NR_147143, intron 3 of 4) 15275 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 141.75-62 chr15 75168495 75168777 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -33246 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 131.5-150 chr3 29610953 29611173 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 323093 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 173.75-60 chr15 61629678 61629901 + 1 NA Intergenic Intergenic -100129 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 232.5-26 chr14 65544679 65544965 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) (TATGAAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 73720 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 221.5-10 chr10 110252901 110253308 + 1 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) intron (NM_005962, intron 3 of 5) 27108 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 238.5-73 chr5 125650966 125651402 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 157923 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 159.75-74 chr2 28094577 28094933 + 1 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) L1ME4b|LINE|L1 98388 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 193.25-93 chr5 52883853 52884162 + 1 NA intron (NM_181501, intron 7 of 28) intron (NM_181501, intron 7 of 28) 96091 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 192.5-43 chr15 48853804 48854137 + 1 NA intron (NM_203349, intron 8 of 11) L1PA16|LINE|L1 -24164 NM_014335 23741 Hs.255973 NM_014335 ENSG00000255302 EID1 C15orf3|CRI1|EID-1|IRO45620|PNAS-22|PTD014|RBP21 EP300 interacting inhibitor of differentiation 1 protein-coding 242.25-8 chr1 190256107 190256457 + 1 NA intron (NM_199051, intron 4 of 7) L1PA6|LINE|L1 219728 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 239.75-10 chr11 20586913 20587206 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12341 NM_004211 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 285.5-11 chr11 122728563 122728913 + 1 NA intron (NM_001363365, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 73016 NM_001363365 84959 Hs.444075 NM_032873 ENSG00000154127 UBASH3B STS-1|STS1|TULA-2|TULA2|p70 ubiquitin associated and SH3 domain containing B protein-coding 122.5-137 chr21 29230675 29230826 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) intron (NR_027072, intron 1 of 1) 37256 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 158.5-157 chr5 59627285 59627598 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -39816 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 163.25-61 chr2 83695423 83695799 + 1 NA Intergenic LTR1C|LTR|ERV1 172797 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 240.25-50 chr4 145501110 145501441 + 1 NA intron (NR_108077, intron 1 of 1) intron (NR_108077, intron 1 of 1) 1705 NR_108077 101927659 Hs.519005 NR_108077 ENSG00000250582 SMAD1-AS2 - SMAD1 antisense RNA 2 ncRNA 380.5-4 chr15 69417433 69418255 + 1 NA intron (NM_138555, intron 3 of 22) intron (NM_138555, intron 3 of 22) -2815 NR_132969 145694 Hs.147229 NR_132969 ENSG00000259426 LOC145694 - uncharacterized LOC145694 ncRNA 158.5-69 chr14 86297549 86297747 + 1 NA Intergenic Intergenic 362970 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 160.25-161 chr8 114202871 114203099 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -766046 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 134.25-162 chr6 143994756 143994966 + 1 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) intron (NM_001289040, intron 1 of 5) 13398 NM_001289046 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 138.5-100 chr2 43117477 43117746 + 1 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR -15166 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 158.5-41 chr11 62883230 62883453 + 1 NA intron (NM_001012664, intron 4 of 9) intron (NM_001012664, intron 4 of 9) 1642 NR_037193 6520 Hs.502769 NM_002394 ENSG00000168003 SLC3A2 4F2|4F2HC|4T2HC|CD98|CD98HC|MDU1|NACAE solute carrier family 3 member 2 protein-coding 152.25-7 chr1 197369590 197369985 + 1 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 101535 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 149.5-141 chr4 123110923 123111214 + 1 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) intron (NM_001345856, intron 14 of 15) 187990 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 140.25-170 chr6 131477135 131477345 + 1 NA Intergenic Intergenic -95986 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 162.5-57 chr15 61338510 61338810 + 1 NA Intergenic Intergenic -109358 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 196.25-43 chr15 98358809 98359146 + 1 NA intron (NR_146567, intron 1 of 2) MER50|LTR|ERV1 -27419 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 211.5-136 chr6 116554976 116555247 + 1 NA intron (NM_001366078, intron 1 of 1) intron (NM_001366078, intron 1 of 1) 1980 NM_001366078 221301 Hs.350750 NM_153036 ENSG00000164451 CALHM4 C6orf78|FAM26D calcium homeostasis modulator family member 4 protein-coding 211.5-16 chr10 63287750 63288183 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluSg|SINE|Alu -18723 NM_001322254 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 157.25-56 chr17 59026864 59027074 + 1 NA intron (NR_148346, intron 19 of 23) L2a|LINE|L2 79911 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 136.25-147 chr5 61088257 61088484 + 1 NA intron (NM_174889, intron 2 of 3) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -73946 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 175.25-112 chr5 38756896 38757093 + 1 NA intron (NR_109951, intron 2 of 3) intron (NR_109951, intron 2 of 3) -36721 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 140.25-62 chr16 53071765 53072072 + 1 NA intron (NM_025134, intron 1 of 38) intron (NM_025134, intron 1 of 38) 16927 NM_025134 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 140.5-111 chr2 74148222 74148421 + 1 NA promoter-TSS (NM_001035505) promoter-TSS (NM_001035505) 340 NR_045637 100507171 Hs.503348 NR_045634 ENSG00000225439 BOLA3-AS1 - BOLA3 divergent transcript ncRNA 263.5-9 chr11 111415538 111415869 + 1 NA intron (NR_046085, intron 2 of 3) intron (NR_046085, intron 2 of 3) 2483 NR_046085 100132078 Hs.672662 NR_046085 ENSG00000255428 LOC100132078 - uncharacterized LOC100132078 ncRNA 141.75-149 chr6 34652243 34652420 + 1 NA intron (NM_024294, intron 2 of 4) intron (NM_024294, intron 2 of 4) -43823 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 189.25-79 chr3 81721375 81721743 + 1 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) intron (NM_000158, intron 1 of 15) 40086 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 316.75-9 chr2 175436814 175437220 + 1 NA Intergenic Intergenic -255307 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 219.25-58 chr5 4586920 4587360 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -186341 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 205.25-6 chr10 36837975 36838199 + 1 NA Intergenic Intergenic -287770 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 197.5-107 chr4 44504947 44505186 + 1 NA Intergenic Intergenic -56257 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 238.75-52 chr5 128286767 128287129 + 1 NA intron (NM_001999, intron 54 of 64) intron (NM_001999, intron 54 of 64) 203182 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 217.5-68 chr2 228254749 228255170 + 1 NA Intergenic Intergenic -73272 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 193.5-86 chr2 75136403 75136678 + 1 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) intron (NM_015727, intron 1 of 3) 45728 NR_049796 100846995 NR_049796 ENSG00000263909 MIR5000 - microRNA 5000 ncRNA 296.75-6 chr11 74098065 74098372 + 1 NA exon (NM_015531, exon 16 of 31) exon (NM_015531, exon 16 of 31) 72784 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 192.25-86 chr5 39106162 39106562 + 1 NA 3' UTR (NM_001349333, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001349333, exon 20 of 20) -31963 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 207.75-52 chr2 33313251 33313641 + 1 NA intron (NM_206943, intron 23 of 33) intron (NM_206943, intron 23 of 33) -105070 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 232.5-46 chr2 31279990 31280321 + 1 NA Intergenic Intergenic 46003 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 173.5-110 chr4 40315985 40316316 + 1 NA promoter-TSS (NR_121640) promoter-TSS (NR_121640) -334 NR_121640 101060498 Hs.351492 NR_121640 ENSG00000249241 LINC02265 - long intergenic non-protein coding RNA 2265 ncRNA 195.5-4 chr1 56827665 56827924 + 1 NA Intergenic Intergenic -8390 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 262.5-68 chr7 53230734 53231050 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 195259 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 262.5-76 chr8 131650896 131651318 + 1 NA Intergenic Intergenic -252986 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 261.5-43 chr3 144330477 144330837 + 1 NA Intergenic Intergenic 357576 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 261.75-25 chr20 44307073 44307385 + 1 NA exon (NM_001080472, exon 2 of 2) exon (NM_001080472, exon 2 of 2) 3973 NM_001080472 128486 Hs.632269 NM_001080472 ENSG00000197296 FITM2 C20orf142|Fit2|dJ881L22.2 fat storage inducing transmembrane protein 2 protein-coding 137.75-31 chr10 116897615 116897787 + 1 NA intron (NM_018330, intron 14 of 14) MIRb|SINE|MIR -47979 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 169.75-157 chr8 119961728 119962006 + 1 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) intron (NM_022783, intron 3 of 8) 88145 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 246.5-58 chr4 37255589 37256050 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) intron (NM_001144990, intron 1 of 6) 11076 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 135.25-101 chr2 121714963 121715272 + 1 NA intron (NR_037857, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 21758 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 231.5-80 chr5 36262126 36262534 + 1 NA intron (NM_001323279, intron 5 of 12) intron (NM_001323279, intron 5 of 12) -20051 NM_001287341 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 132.25-61 chr14 65768529 65768850 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 297587 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 156.5-135 chr4 86148354 86148595 + 1 NA intron (NR_110879, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 28668 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 189.5-140 chr7 125067529 125067878 + 1 NA intron (NR_125718, intron 4 of 10) intron (NR_125718, intron 4 of 10) -116866 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 166.5-215 chrX 65723172 65723393 + 1 NA intron (NM_002444, intron 2 of 12) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 55628 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 186.75-55 chr2 121843945 121844178 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 88410 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 232.5-43 chr2 12978152 12978640 + 1 NA intron (NR_038434, intron 5 of 5) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 28617 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 284.75-43 chr9 26323640 26323993 + 1 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? 257141 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 201.25-77 chr6 11791558 11791879 + 1 NA Intergenic LTR21C|LTR|ERVL -12671 NM_032744 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 175.5-106 chr21 32628680 32628884 + 1 NA TTS (NM_001160306) TTS (NM_001160306) -15911 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 182.25-94 chr5 89023862 89024267 + 1 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) intron (NR_136221, intron 3 of 6) -119959 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 233.75-26 chr15 53377158 53377494 + 1 NA Intergenic Intergenic 163526 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 134.25-135 chr4 172353782 172353972 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 335040 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-5 chr1 63760637 63760881 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13258 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 224.5-84 chr4 85111795 85112164 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 144495 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 313.5-28 chr5 58205327 58205790 + 1 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL -83217 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 252.5-9 chr10 60796909 60797425 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 18689 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 263.75-42 chr5 67399676 67400168 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -203123 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 157.5-35 chr11 34860873 34861059 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -55164 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 192.5-112 chr6 33752262 33752600 + 1 NA Intergenic Intergenic -5446 NM_001142883 117283 Hs.17253 NM_054111 ENSG00000161896 IP6K3 IHPK3|INSP6K3 inositol hexakisphosphate kinase 3 protein-coding 176.5-84 chr2 27919332 27919648 + 1 NA intron (NM_199193, intron 3 of 13) L1M5|LINE|L1 -28376 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 222.25-35 chr2 60565964 60566254 + 1 NA Intergenic Intergenic -12455 NM_022893 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 265.75-64 chr6 125618427 125618883 + 1 NA Intergenic Intergenic -55698 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 279.25-32 chr5 40648455 40648892 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -31242 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 245.5-32 chr2 35144215 35144480 + 1 NA Intergenic Intergenic -327058 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 220.5-44 chr2 58161284 58161640 + 1 NA intron (NR_156742, intron 8 of 9) intron (NR_156742, intron 8 of 9) 79918 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 155.5-18 chr1 238223065 238223275 + 1 NA Intergenic Intergenic 262847 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 158.5-6 chr1 100184152 100184377 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -5991 NM_001256386 127495 Hs.44277 NM_144620 ENSG00000122477 LRRC39 - leucine rich repeat containing 39 protein-coding 267.5-62 chr5 98035990 98036323 + 1 NA Intergenic Intergenic 125083 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 188.5-62 chr18 67376188 67376450 + 1 NA Intergenic Intergenic -140227 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 140.75-91 chr2 118302458 118302712 + 1 NA Intergenic Intergenic -116199 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 158.5-4 chr1 45425837 45426277 + 1 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) AluSx|SINE|Alu 65106 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 150.5-29 chr11 76862639 76862853 + 1 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 1828 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 119.75-66 chr15 46913689 46913945 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -270272 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 142.75-109 chr2 217102658 217102908 + 1 NA Intergenic Intergenic -179950 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-128 chr3 30184112 30184310 + 1 NA Intergenic Intergenic -250055 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 198.25-95 chr7 80682401 80682688 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 35891 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 303.5-14 chr14 97708173 97708625 + 1 NA Intergenic Intergenic -21741 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 147.5-54 chr12 125161675 125161907 + 1 NA Intergenic Intergenic -24595 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 244.5-44 chr2 13129146 13129631 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -122375 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 117.5-9 chr1 107408028 107408178 + 1 NA intron (NM_014917, intron 5 of 5) intron (NM_014917, intron 5 of 5) 260034 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 157.5-68 chr15 79645696 79646006 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 213335 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 198.5-91 chr21 19844833 19845175 + 1 NA Intergenic Intergenic 54751 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 151.25-69 chr18 824692 824863 + 1 NA Intergenic Intergenic -12535 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 191.5-81 chr2 187905198 187905529 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -350858 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 266.75-46 chr6 119089201 119089578 + 1 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu -10725 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 125.5-3 chr1 44658594 44658909 + 1 NA intron (NM_001300746, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 12305 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 218.5-112 chr7 35377721 35378090 + 1 NA Intergenic Intergenic 64050 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 167.25-115 chr4 53017224 53017451 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 155020 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 208.5-48 chr16 13246530 13246804 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 345069 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 152.25-136 chr5 146812264 146812513 + 1 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 66397 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 129.75-106 chr20 4437384 4437633 + 1 NA Intergenic Intergenic -188221 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 137.75-95 chr2 38644742 38644995 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -21246 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 212.25-60 chr3 186002571 186002858 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 42771 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 126.25-225 chr9 109769885 109770049 + 1 NA intron (NM_001037293, intron 1 of 6) intron (NM_001037293, intron 1 of 6) -10231 NM_007203 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 237.75-42 chr2 159063048 159063338 + 1 NA intron (NM_001350065, intron 3 of 27) MamRep605|LTR?|LTR? 94553 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 166.5-175 chr6 69383481 69383777 + 1 NA intron (NM_001704, intron 31 of 31) MIRc|SINE|MIR 412837 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 167.5-29 chr10 124335890 124336249 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 82854 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 198.5-133 chr7 55399730 55400033 + 1 NA intron (NM_018697, intron 3 of 8) intron (NM_018697, intron 3 of 8) 34433 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 130.25-105 chr2 168400035 168400322 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -56094 NM_001256126 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 240.25-54 chr5 86541772 86542035 + 1 NA Intergenic Intergenic -76038 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 119.5-198 chr6 53912458 53912651 + 1 NA intron (NM_018214, intron 10 of 13) (TATATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17428 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 268.25-24 chr2 103619076 103619405 + 1 NA Intergenic Intergenic -634811 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 213.5-59 chr2 68532560 68533008 + 1 NA intron (NM_173545, intron 6 of 9) intron (NM_173545, intron 6 of 9) 65199 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 174.75-104 chr5 166129884 166130160 + 1 NA Intergenic HERV9-int|LTR|ERV1 796348 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 148.25-54 chr17 72560895 72561061 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 31826 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 140.75-22 chr10 121556460 121556713 + 1 NA intron (NR_073009, intron 2 of 16) MIR3|SINE|MIR -25272 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 118.25-122 chr21 29139538 29139719 + 1 NA intron (NM_001286620, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu -5949 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 156.5 chr1 2327595 2327818 + 1 NA intron (NM_024848, intron 12 of 13) CpG 24955 NR_024489 100129534 Hs.655313 NM_001127577 ENSG00000269896 LOC100129534 - small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N pseudogene pseudo 194.5-109 chr4 101051257 101051678 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 10 of 12) intron (NM_001130691, intron 10 of 12) 189405 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 235.5-63 chr5 19318015 19318324 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 568103 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 199.5-4 chr1 66455249 66455682 + 1 NA Intergenic Intergenic -78128 NM_001308203 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 228.25-36 chr17 62089420 62089731 + 1 NA Intergenic Intergenic -24297 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 162.25-62 chr16 11433967 11434202 + 1 NA intron (NM_001370704, intron 37 of 66) intron (NM_001370704, intron 37 of 66) -31176 NR_110907 101927131 Hs.569654 NR_110907 ENSG00000262999 LOC101927131 - uncharacterized LOC101927131 ncRNA 142.75-82 chr17 67122908 67123068 + 1 NA exon (NM_014877, exon 26 of 33) exon (NM_014877, exon 26 of 33) 78434 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 203.25-47 chr18 69710022 69710331 + 1 NA intron (NM_152721, intron 5 of 7) AluJo|SINE|Alu 237697 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 162.5-162 chr7 102404066 102404298 + 1 NA intron (NR_038967, intron 6 of 8) intron (NR_038967, intron 6 of 8) 1673 NR_031669 100313829 NR_031669 ENSG00000221510 MIR548O MIRN548O microRNA 548o ncRNA 221.5-105 chr8 135443333 135443729 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -13925 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 112.5-193 chr5 93250568 93250791 + 1 NA Intergenic Intergenic 320664 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 151.5-171 chr6 112452254 112452443 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 105018 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 214.5-11 chr10 18781579 18781983 + 1 NA Intergenic Intergenic 122350 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 157.25-50 chr16 17716017 17716232 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -245164 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 239.5-5 chr1 213348769 213349168 + 1 NA Intergenic Intergenic 297727 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 206.5-131 chr8 53480087 53480447 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 43698 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 199.5-134 chr7 20423233 20423611 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -91660 NR_110119 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 129.25-85 chr2 15623480 15623752 + 1 NA intron (NM_004939, intron 19 of 25) intron (NM_004939, intron 19 of 25) 31748 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 148.25-87 chr22 34944747 34945087 + 1 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 52999 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 117.75-5 chr1 63834966 63835169 + 1 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 61050 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 254.75-53 chr8 48562136 48562501 + 1 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) L1MD2|LINE|L1 10751 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 161.5-104 chr2 143433973 143434290 + 1 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 304712 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 140.5-166 chr4 82238114 82238324 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 135772 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 195.5-147 chr7 41372931 41373157 + 1 NA Intergenic Intergenic 271440 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 158.25-157 chr9 120774489 120774671 + 1 NA intron (NM_012164, intron 5 of 7) L2a|LINE|L2 18836 NM_012164 26190 Hs.494985 NM_012164 ENSG00000119402 FBXW2 FBW2|Fwd2|Md6 F-box and WD repeat domain containing 2 protein-coding 131.75-186 chr6 65252297 65252583 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L1MD2|LINE|L1 -48978 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 197.5-175 chrX 75529599 75529934 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -6264 NM_001146256 158866 Hs.253211 NM_144969 ENSG00000102383 ZDHHC15 DHHC15|MRX91 zinc finger DHHC-type containing 15 protein-coding 151.5-16 chr10 66052671 66052969 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 481395 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 200.5-148 chrX 43142661 43142989 + 1 NA Intergenic LTR88a|LTR|Gypsy? -34169 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 131.5-49 chr13 24107698 24107920 + 1 NA intron (NM_001286792, intron 3 of 14) intron (NM_001286792, intron 3 of 14) -52911 NM_153023 221178 Hs.434298 NM_153023 ENSG00000182957 SPATA13 ARHGEF29|ASEF2 spermatogenesis associated 13 protein-coding 221.5-30 chr14 87925558 87926057 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 67375 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 270.25-13 chr11 108320665 108321039 + 1 NA intron (NM_001351834, intron 45 of 63) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 97323 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 229.5-11 chr1 210449435 210449860 + 1 NA intron (NM_001122834, intron 7 of 11) intron (NM_001122834, intron 7 of 11) 120281 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 234.25-57 chr5 27853453 27853798 + 1 NA Intergenic Intergenic 381333 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 127.5-113 chr2 58754818 58755004 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu 234158 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 173.5-132 chr5 143267016 143267470 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 74743 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 210.25-49 chr20 16839252 16839484 + 1 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 91015 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 177.5-83 chr2 124243142 124243409 + 1 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 217988 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 185.25-88 chr4 72082240 72082500 + 1 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 43238 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 218.5-95 chr5 18682848 18683148 + 1 NA Intergenic Intergenic 875724 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 255.25-52 chr8 79016222 79016544 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 178854 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 221.5-60 chr20 57204932 57205241 + 1 NA intron (NM_001719, intron 2 of 6) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -8610 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 313.75-9 chr19 52446449 52446907 + 1 NA intron (NM_001291368, intron 4 of 4) AluJo|SINE|Alu -6875 NM_001366182 147660 Hs.157287 NM_152472 ENSG00000258405 ZNF578 - zinc finger protein 578 protein-coding 136.75-209 chrX 56902063 56902399 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 93310 NM_001010862 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 127.75-212 chr9 127140442 127140718 + 1 NA intron (NM_001190729, intron 8 of 17) intron (NM_001190729, intron 8 of 17) -17945 NM_012098 23452 Hs.653262 NM_012098 ENSG00000136859 ANGPTL2 ARP2|HARP angiopoietin like 2 protein-coding 230.5-66 chr2 179034153 179034494 + 1 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) L1PA13|LINE|L1 15814 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 159.5-87 chr18 72632401 72632634 + 1 NA Intergenic Intergenic -88175 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 331.5-8 chr14 52394428 52394985 + 1 NA Intergenic Intergenic 80394 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 203.5-41 chr14 59544846 59545153 + 1 NA intron (NM_001164399, intron 9 of 19) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 31813 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 223.5-111 chr6 122018109 122018369 + 1 NA Intergenic Intergenic -381312 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 211.25-101 chrX 116419674 116419917 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -16811 NM_007231 11254 Hs.522109 NM_007231 ENSG00000268104 SLC6A14 BMIQ11 solute carrier family 6 member 14 protein-coding 228.5-38 chr15 61616948 61617372 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -112758 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 293.25-29 chr6 144389899 144390333 + 1 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) L1MA8|LINE|L1 -15539 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 185.75-40 chr14 22495880 22496102 + 1 NA Intergenic Intergenic -13032 NR_148361 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 231.75-67 chr7 30039993 30040349 + 1 NA intron (NM_001363473, intron 1 of 12) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -4914 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 219.25-54 chr4 44162301 44162634 + 1 NA Intergenic Intergenic 145405 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 156.25-118 chr5 51896743 51897150 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -111085 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 182.5-87 chr2 194055454 194055760 + 1 NA Intergenic Intergenic -288662 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 114.75-23 chr10 22469759 22469934 + 1 NA Intergenic Intergenic -31917 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 339.75-30 chr6 69955883 69956281 + 1 NA intron (NM_001858, intron 9 of 50) L3|LINE|CR1 89526 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 266.5-35 chr2 122799640 122800011 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 273656 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 133.5-267 chr8 115692309 115692625 + 1 NA Intergenic Intergenic -23492 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 118.75-88 chr19 20123677 20123812 + 1 NA Intergenic Intergenic -43470 NM_052852 90649 Hs.590991 NM_052852 ENSG00000256229 ZNF486 KRBO2 zinc finger protein 486 protein-coding 301.5-7 chr1 238553263 238553806 + 1 NA Intergenic Intergenic -67517 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 199.5-84 chr2 110858872 110859381 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 126553 NM_001371254 217.25-80 chr7 86655081 86655468 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 11360 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 225.5-64 chr20 18274661 18275068 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -13364 NM_001282997 7692 Hs.472221 NM_003434 ENSG00000125846 ZNF133 ZNF150|pHZ-13|pHZ-66 zinc finger protein 133 protein-coding 254.25-12 chr10 115269949 115270370 + 1 NA intron (NM_207303, intron 13 of 28) intron (NM_207303, intron 13 of 28) 176794 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 299.75-20 chr3 49315541 49315907 + 1 NA intron (NM_001251877, intron 6 of 6) intron (NM_001251877, intron 6 of 6) 24329 NM_001251877 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 228.75-93 chr9 71274739 71275034 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -153265 NM_001366145 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 256.5-45 chr3 172405611 172405978 + 1 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 42662 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 316.75-14 chr5 24113423 24113878 + 1 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 162302 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 114.5-238 chr7 39149142 39149262 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -135635 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 254.75-59 chrX 71649334 71649870 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 17266 NR_136576 100129291 Hs.558667 NR_136576 ENSG00000237265 LOC100129291 - chromosome X open reading frame 49 pseudogene pseudo 248.75-39 chr3 89468112 89468551 + 1 NA intron (NM_005233, intron 15 of 16) intron (NM_005233, intron 15 of 16) 360710 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 147.75-132 chr5 150183515 150183781 + 1 NA exon (NM_001804, exon 3 of 3) exon (NM_001804, exon 3 of 3) -6414 NM_014228 6534 Hs.241597 NM_014228 ENSG00000011083 SLC6A7 PROT solute carrier family 6 member 7 protein-coding 325.25-28 chr7 54965253 54965602 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -53590 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 191.25-36 chr16 5642832 5643206 + 1 NA Intergenic Intergenic 10552 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 175.25-65 chr2 42361233 42361496 + 1 NA promoter-TSS (NM_004718) promoter-TSS (NM_004718) -121 NM_001319040 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 208.5-68 chr2 31734865 31735156 + 1 NA Intergenic Intergenic 68970 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 146.75-155 chr8 82562903 82563184 + 1 NA Intergenic Intergenic -349061 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 187.75-83 chr5 34885135 34885528 + 1 NA intron (NM_001317949, intron 9 of 10) L1MC4|LINE|L1 30173 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 124.25-178 chr6 56630547 56630683 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 27 of 94) intron (NM_001144770, intron 27 of 94) 12274 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 244.25-55 chr9 29031705 29032001 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -142898 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 245.5-63 chr5 116091912 116092432 + 1 NA intron (NM_001308080, intron 3 of 6) intron (NM_001308080, intron 3 of 6) 6710 NM_001308080 51397 Hs.483136 NM_016144 ENSG00000145781 COMMD10 PTD002 COMM domain containing 10 protein-coding 242.25-58 chr3 99899150 99899412 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) intron (NM_001042459, intron 4 of 4) -23078 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 141.5-74 chr17 44410681 44410960 + 1 NA intron (NM_001002909, intron 6 of 7) intron (NM_001002909, intron 6 of 7) -21171 NM_000419 3674 Hs.411312 NM_000419 ENSG00000005961 ITGA2B BDPLT16|BDPLT2|CD41|CD41B|GP2B|GPIIb|GT|GTA|HPA3|PPP1R93 integrin subunit alpha 2b protein-coding 146.75-60 chr17 20141590 20141759 + 1 NA intron (NM_001033553, intron 3 of 14) L1MB7|LINE|L1 -14398 NM_001033554 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 172.5-214 chr9 33964135 33964359 + 1 NA intron (NR_163243, intron 5 of 24) MamRep605|LTR?|LTR? -11393 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 240.5-61 chr22 42610942 42611221 + 1 NA intron (NR_103820, intron 1 of 8) intron (NR_103820, intron 1 of 8) 3802 NM_032311 84271 Hs.505802 NM_032311 ENSG00000100227 POLDIP3 PDIP3|PDIP46|SKAR DNA polymerase delta interacting protein 3 protein-coding 301.25-27 chr6 78623678 78624158 + 1 NA Intergenic Intergenic -84609 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 114.5-169 chr3 12510328 12510550 + 1 NA intron (NM_025265, intron 6 of 11) intron (NM_025265, intron 6 of 11) 25910 NM_001321279 80746 Hs.335550 NM_025265 ENSG00000154743 TSEN2 PCH2B|SEN2|SEN2L tRNA splicing endonuclease subunit 2 protein-coding 130.75-193 chr8 106716786 106717006 + 1 NA intron (NM_181354, intron 9 of 13) intron (NM_181354, intron 9 of 13) -9211 NM_001198534 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 165.75-163 chr7 118951152 118951403 + 1 NA Intergenic Intergenic 726573 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 275.75-10 chr12 114652551 114652929 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 31435 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 214.75-33 chr18 1414795 1415157 + 1 NA Intergenic Intergenic -55347 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 408.5-3 chr12 96870967 96871665 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 67 of 67) L1MEf|LINE|L1 -35941 NM_001135176 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 208.75-42 chr2 238427504 238427878 + 1 NA intron (NM_001040445, intron 1 of 4) intron (NM_001040445, intron 1 of 4) 764 NM_001040445 51665 Hs.516788 NM_016114 ENSG00000065802 ASB1 ASB-1 ankyrin repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 208.5-127 chr7 28162499 28162826 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -17795 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 170.5-182 chr8 49980923 49981133 + 1 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 69621 NR_135794 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 193.25-54 chr2 71402104 71402383 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 16 of 27) intron (NM_001252613, intron 16 of 27) -51318 NM_003494 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 281.25-40 chr6 131155994 131156370 + 1 NA intron (NM_016377, intron 2 of 7) intron (NM_016377, intron 2 of 7) 20715 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 114.5-62 chr12 9693292 9693446 + 1 NA intron (NM_001004419, intron 5 of 5) intron (NM_001004419, intron 5 of 5) 23656 NM_001197318 29121 Hs.268326 NM_013269 ENSG00000069493 CLEC2D CLAX|LLT1|OCIL C-type lectin domain family 2 member D protein-coding 157.5-103 chr2 73745268 73745446 + 1 NA Intergenic Intergenic -7951 NM_001330392 51002 Hs.157401 NM_016058 ENSG00000144034 TPRKB CGI-121|CGI121|GAMOS5 TP53RK binding protein protein-coding 166.25-103 chr3 98482395 98482651 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 13043 NM_001004736 26339 Hs.621533 NM_001004736 ENSG00000232382 OR5K1 HSHTPCRX10|HTPCRX10|OR3-8 olfactory receptor family 5 subfamily K member 1 protein-coding 134.25-51 chr14 52189456 52189694 + 1 NA Intergenic Intergenic -78123 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 216.25-74 chr4 14901440 14901889 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -13495 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 272.75-31 chr22 26449378 26449919 + 1 NA intron (NM_001349905, intron 13 of 13) intron (NM_001349905, intron 13 of 13) 20388 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 135.75-87 chr2 9962494 9962652 + 1 NA intron (NM_198182, intron 5 of 15) intron (NM_198182, intron 5 of 15) 10880 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 349.75-3 chr12 102823229 102823809 + 1 NA intron (NR_033855, intron 1 of 4) intron (NR_033855, intron 1 of 4) 880 NR_033855 283432 Hs.382110 NR_033855 ENSG00000258169 LINC00485 - long intergenic non-protein coding RNA 485 ncRNA 138.25-4 chr1 34840282 34840448 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 18680 NM_001164824 113444 Hs.27160 NM_138428 ENSG00000163866 SMIM12 C1orf212 small integral membrane protein 12 protein-coding 222.5-47 chr2 64383836 64384184 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -43162 NR_106995 102465833 NR_106995 ENSG00000264297 MIR4433B hsa-mir-4433b microRNA 4433b ncRNA 136.25-202 chrX 74500781 74500946 + 1 NA intron (NM_006517, intron 1 of 5) intron (NM_006517, intron 1 of 5) 79370 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 116.5-186 chr5 11610770 11610992 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -21815 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 113.25-57 chr15 59515547 59515744 + 1 NA intron (NM_152450, intron 7 of 8) intron (NM_152450, intron 7 of 8) 77459 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 224.25-19 chr11 45874341 45874621 + 1 NA intron (NM_001127457, intron 11 of 11) intron (NM_001127457, intron 11 of 11) -11170 NM_005456 9479 Hs.234249 NM_005456 ENSG00000121653 MAPK8IP1 IB1|JIP-1|JIP1|PRKM8IP mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 protein-coding 148.5-66 chr14 88819065 88819445 + 1 NA Intergenic Intergenic -4898 NM_001288781 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 198.75-100 chrX 154530901 154531168 + 1 NA TTS (NM_001360016) TTS (NM_001360016) -11178 NM_001321396 8517 Hs.43505 NM_003639 ENSG00000269335 IKBKG AMCBX1|EDAID1|FIP-3|FIP3|Fip3p|IKK-gamma|IKKAP1|IKKG|IMD33|IP|IP1|IP2|IPD2|NEMO|ZC2HC9 inhibitor of nuclear factor kappa B kinase regulatory subunit gamma protein-coding 165.75-73 chr18 76438821 76439108 + 1 NA intron (NM_014643, intron 3 of 6) intron (NM_014643, intron 3 of 6) -52688 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 233.75-12 chr11 88517263 88517606 + 1 NA intron (NR_049724, intron 4 of 5) intron (NR_049724, intron 4 of 5) 12858 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 164.25-142 chr6 121278755 121279076 + 1 NA intron (NR_104452, intron 15 of 35) intron (NR_104452, intron 15 of 35) 55565 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 194.25-61 chr2 141841915 141842370 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 289559 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 124.25-91 chr2 17512538 17512879 + 1 NA intron (NM_001099218, intron 2 of 2) intron (NM_001099218, intron 2 of 2) 5732 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 291.75-38 chr7 43087733 43088185 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24688 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 152.25-69 chr18 7328245 7328521 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 97279 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 138.5-17 chr1 164285861 164286019 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -273420 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 181.5-124 chr4 92343888 92344156 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 39623 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 112.5-147 chr20 38771134 38771277 + 1 NA intron (NM_024855, intron 8 of 8) intron (NM_024855, intron 8 of 8) 22745 NM_024855 79913 Hs.371585 NM_024855 ENSG00000101442 ACTR5 Arp5|INO80M actin related protein 5 protein-coding 195.5-114 chr5 19894261 19894583 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) -8150 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 236.75-5 chr1 109997028 109997493 + 1 NA intron (NM_001242673, intron 1 of 16) intron (NM_001242673, intron 1 of 16) -3667 NM_001242674 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 119.5-31 chr10 72790755 72790979 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 69838 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 187.5-109 chr3 30539615 30539959 + 1 NA Intergenic Intergenic 20919 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 127.75-95 chr2 56585765 56585955 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -400090 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 135.25-157 chr5 57022898 57023063 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -70850 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 154.5-131 chr3 159108543 159108743 + 1 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 39324 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 154.5-196 chr8 134653994 134654318 + 1 NA intron (NM_020863, intron 2 of 15) AluSq2|SINE|Alu 42399 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 191.25-49 chr2 20298177 20298512 + 1 NA intron (NM_001282790, intron 6 of 18) intron (NM_001282790, intron 6 of 18) 29042 NM_001282791 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 300.5-41 chr6 46761408 46761920 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 14747 NM_001162435 100287718 Hs.736491 NM_001162435 ENSG00000230062 ANKRD66 - ankyrin repeat domain 66 protein-coding 242.5-77 chr7 36325215 36325667 + 1 NA 3' UTR (NM_001100425, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001100425, exon 7 of 7) 41799 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 252.5-6 chr10 22275667 22276118 + 1 NA Intergenic Intergenic 23820 NR_038921 100130992 Hs.48501 NR_038921 LOC100130992 - uncharacterized LOC100130992 ncRNA 222.25-37 chr2 186184173 186184491 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -98015 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 325.25-15 chr20 282024 282568 + 1 NA intron (NM_153269, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 8454 NM_153269 140680 Hs.348112 NM_080571 ENSG00000196476 C20orf96 dJ1103G7.2 chromosome 20 open reading frame 96 protein-coding 154.5-202 chr9 35078428 35078612 + 1 NA intron (NM_004629, intron 3 of 13) intron (NM_004629, intron 3 of 13) 1496 NM_004629 2189 Hs.591084 NM_004629 ENSG00000221829 FANCG FAG|XRCC9 FA complementation group G protein-coding 237.75-11 chr11 76548822 76549383 + 1 NA intron (NM_001300942, intron 21 of 21) L2a|LINE|L2 104077 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 255.5-36 chr19 24345319 24345582 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -182003 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 179.75-109 chr5 129615622 129615836 + 1 NA intron (NM_133638, intron 8 of 22) intron (NM_133638, intron 8 of 22) -132365 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 267.25-48 chr9 86501607 86501977 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -147382 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 146.75-68 chr18 14064395 14064617 + 1 NA Intergenic Intergenic 67929 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 132.25-62 chr14 73653884 73654093 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 2 of 8) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 9002 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 164.5-96 chr2 72230471 72230753 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -82750 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 144.5-205 chr7 88278316 88278538 + 1 NA 3' UTR (NM_001205315, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001205315, exon 6 of 6) 28467 NM_024636 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 164.5-115 chr20 37475308 37475625 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 44837 NM_001317075 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 213.25-39 chr22 36662781 36663078 + 1 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 39929 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 167.5-119 chr3 177806787 177807029 + 1 NA Intergenic Intergenic -9957 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 203.25-68 chr3 26085293 26085631 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -211767 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 120.5-59 chr12 86935252 86935452 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -96352 NM_001351286 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 253.25-63 chr8 107025680 107026123 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -255657 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 173.75-126 chr5 125137396 125137586 + 1 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) MamGypLTR2c|LTR|Gypsy 100660 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 115.5-105 chr19 3259902 3260086 + 1 NA intron (NR_033342, intron 2 of 12) MER33|DNA|hAT-Charlie 34716 NR_033342 60680 Hs.655747 NM_021938 ENSG00000161082 CELF5 BRUNOL-5|BRUNOL5|CELF-5 CUGBP Elav-like family member 5 protein-coding 178.5-164 chr7 13421348 13421699 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 564991 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 238.25-14 chr11 105204361 105204769 + 1 NA Intergenic Intergenic -64796 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 122.5-179 chr5 15967075 15967237 + 1 NA Intergenic Intergenic 31974 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 143.75-88 chr2 57123841 57124199 + 1 NA Intergenic Intergenic -783631 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 130.5-136 chr2 122126010 122126261 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 370484 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 181.25-87 chr3 142974021 142974294 + 1 NA intron (NR_125393, intron 2 of 4) intron (NR_125393, intron 2 of 4) 10099 NR_125393 101927832 Hs.710007 NR_125393 ENSG00000241570 PAQR9-AS1 - PAQR9 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-72 chr18 53326785 53327069 + 1 NA intron (NM_005215, intron 14 of 28) intron (NM_005215, intron 14 of 28) 89826 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 260.5-27 chr2 31870895 31871190 + 1 NA intron (NR_126032, intron 5 of 6) intron (NR_126032, intron 5 of 6) -67062 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 173.25-40 chr15 49244142 49244474 + 1 NA intron (NM_001289030, intron 6 of 10) HAL1|LINE|L1 74061 NR_147895 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 124.25-18 chr1 205122007 205122263 + 1 NA promoter-TSS (NM_005057) promoter-TSS (NM_005057) -157 NM_005057 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 340.25-2 chr10 97924993 97925623 + 1 NA intron (NM_001206528, intron 3 of 14) (AGTGAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -49411 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 135.75-29 chr10 77088727 77088881 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 10 of 28) intron (NM_001271519, intron 10 of 28) -52027 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 319.5-6 chr10 109171897 109172583 + 1 NA Intergenic Intergenic 751006 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 133.25-178 chr5 91989602 91989765 + 1 NA Intergenic Intergenic -606366 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 169.75-69 chr18 62131423 62131620 + 1 NA intron (NM_176787, intron 14 of 30) Looper|DNA|PiggyBac 55535 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 150.25-64 chr16 81637409 81637609 + 1 NA intron (NM_030629, intron 3 of 20) MIRb|SINE|MIR 26161 NR_106759 102465251 NR_106759 ENSG00000275109 MIR6504 hsa-mir-6504 microRNA 6504 ncRNA 246.75-80 chr9 28449283 28449774 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 269777 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 117.5-201 chr6 11830308 11830529 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -51371 NM_032744 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 158.5-84 chr18 44898819 44899114 + 1 NA intron (NM_015559, intron 3 of 5) intron (NM_015559, intron 3 of 5) 71200 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 191.5-46 chr15 62087904 62088253 + 1 NA Intergenic Intergenic 21101 NM_207322 145741 Hs.202656 NM_207322 ENSG00000198535 C2CD4A FAM148A|NLF1 C2 calcium dependent domain containing 4A protein-coding 232.5-99 chr8 9344033 9344422 + 1 NA Intergenic Intergenic 19176 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 185.25-65 chr2 170930840 170931073 + 1 NA intron (NM_015530, intron 1 of 9) intron (NM_015530, intron 1 of 9) 1703 NM_015530 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 254.25-55 chr6 50701630 50702002 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -11728 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 202.5-62 chr18 10840819 10841086 + 1 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) intron (NM_022068, intron 7 of 51) -81303 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 293.5-43 chr9 4614664 4615195 + 1 NA intron (NR_148446, intron 6 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 47294 NM_001353490 55064 Hs.179615 NM_017985 ENSG00000106686 SPATA6L C9orf68|bA6J24.2 spermatogenesis associated 6 like protein-coding 200.25-9 chr1 192757584 192757983 + 1 NA Intergenic Intergenic 41455 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 128.5-181 chr6 19416300 19416528 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -33407 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 195.5-101 chr3 127856891 127857203 + 1 NA Intergenic Intergenic -33797 NM_001003794 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 209.25-96 chr5 148140836 148141125 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -27566 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 195.25-16 chr10 34737193 34737489 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 77955 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 157.75-106 chr3 45602634 45602929 + 1 NA intron (NM_014240, intron 1 of 7) intron (NM_014240, intron 1 of 7) 8030 NM_014240 8994 Hs.193370 NM_014240 ENSG00000144791 LIMD1 - LIM domains containing 1 protein-coding 180.75-66 chr2 119338195 119338512 + 1 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) MER34B|LTR|ERV1 28389 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 142.5-91 chr17 60537454 60537652 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11311 NM_006380 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 174.5-175 chr7 57199500 57199711 + 1 NA Intergenic Intergenic -19449 NR_030766 642006 Hs.562648 NR_030766 GUSBP10 - GUSB pseudogene 10 pseudo 231.5-59 chr22_KI270736v1_random 166860 167190 + 1 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 161.75-92 chr3 171445153 171445381 + 1 NA intron (NM_001161563, intron 1 of 31) AluJb|SINE|Alu 15138 NM_001161562 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 212.75-57 chr20 48318877 48319147 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -40899 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 163.5-108 chr2 237666224 237666504 + 1 NA intron (NM_001137550, intron 1 of 23) intron (NM_001137550, intron 1 of 23) -25800 NM_001137551 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 172.5-207 chr8 136323463 136323729 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -207202 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 207.75-55 chr2 63260154 63260379 + 1 NA intron (NR_148704, intron 14 of 18) intron (NR_148704, intron 14 of 18) -140724 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 178.25-122 chr8 130585602 130585909 + 1 NA Intergenic Intergenic -142081 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 179.5-153 chr6 16113363 16113577 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -15616 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 192.5-67 chr2 68126284 68126577 + 1 NA Intergenic Intergenic 31097 NM_001256476 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 188.5-129 chr5 179226861 179227095 + 1 NA intron (NM_014244, intron 3 of 21) L1ME4b|LINE|L1 118483 NM_014244 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 171.25-19 chr10 109441096 109441438 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 481979 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 149.25-18 chr10 32453589 32453990 + 1 NA intron (NR_109827, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 7649 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 264.5-22 chr16 9330999 9331327 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24425 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 360.25-5 chr14 51581631 51582335 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 17969 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 154.5-25 chr10 67312256 67312461 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) AluSg|SINE|Alu 91052 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 127.5-17 chr1 198940163 198940308 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2806 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 321.5-7 chr16 52319304 52319995 + 1 NA Intergenic Intergenic 61085 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 223.5-5 chr1 50685426 50685946 + 1 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) intron (NM_007051, intron 7 of 18) -262243 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 160.5-30 chr11 125464752 125465019 + 1 NA intron (NM_005103, intron 3 of 9) intron (NM_005103, intron 3 of 9) -30329 NM_001301851 403312 Hs.450611 NM_203452 LOC403312 - putative uncharacterized protein MGC39545 protein-coding 151.5-96 chr20 7035984 7036272 + 1 NA Intergenic (TTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 218074 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 223.25-63 chr5 87928782 87929113 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 266905 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 244.75-17 chr13 46950611 46951063 + 1 NA Intergenic Intergenic -53761 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 134.25-89 chr2 142026901 142027142 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 104680 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 277.5-4 chr1 184173040 184173386 + 1 NA Intergenic Intergenic 121483 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 168.75-154 chr8 116238901 116239281 + 1 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 85968 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 146.25-132 chr7 1193159 1193333 + 1 NA Intergenic Intergenic 32461 NR_110070 101927021 Hs.529566 NR_110065 LOC101927021 - uncharacterized LOC101927021 ncRNA 206.25-96 chr6 125819588 125819860 + 1 NA promoter-TSS (NR_126386) promoter-TSS (NR_126386) -866 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 210.5-125 chr7 154655102 154655440 + 1 NA intron (NR_157196, intron 6 of 25) intron (NR_157196, intron 6 of 25) -273246 NR_024477 100132707 Hs.586358 NR_024476 ENSG00000214106 PAXIP1-AS2 PAXIP1OS PAXIP1 antisense RNA 2 ncRNA 177.5-125 chr4 45958777 45959037 + 1 NA Intergenic Intergenic 165147 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 246.25-24 chr15 68113221 68113613 + 1 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 58841 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 208.5-19 chr11 39260729 39261127 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 612070 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 169.5-148 chr6 16365024 16365301 + 1 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) intron (NM_000332, intron 7 of 8) 126575 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 120.5-36 chr11 32921976 32922108 + 1 NA intron (NM_001076786, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 29231 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 190.75-101 chr7 33696509 33696909 + 1 NA Intergenic Intergenic -208206 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 293.75-23 chr2 139076808 139077354 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 179757 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 136.5-135 chr20 57084049 57084260 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -129542 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 236.5-3 chr1 223132764 223133187 + 1 NA intron (NM_003268, intron 4 of 5) intron (NM_003268, intron 4 of 5) 10273 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 231.5-99 chr8 101635078 101635443 + 1 NA intron (NM_024915, intron 11 of 15) MER5A|DNA|hAT-Charlie 142821 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 165.75-16 chr10 62100258 62100569 + 1 NA Intergenic Intergenic 51056 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 144.5-206 chr7 99707569 99707780 + 1 NA intron (NM_000765, intron 12 of 12) intron (NM_000765, intron 12 of 12) 27522 NM_001256497 100861540 NM_001256497 ENSG00000282301 CYP3A7-CYP3A51P CYP3A7|CYP3A7-3AP1|CYP3A7-CYP3AP1|CYP3A7.1L|CYPIIIA7 CYP3A7-CYP3A51P readthrough protein-coding 224.25-68 chr4 90609438 90609882 + 1 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) intron (NM_207491, intron 5 of 7) 374629 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 236.25-9 chr10 10058282 10058750 + 1 NA promoter-TSS (NR_120636) promoter-TSS (NR_120636) -206 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 269.5-65 chrX 119206178 119206845 + 1 NA Intergenic Intergenic -29734 NM_001282621 10857 Hs.90061 NM_006667 ENSG00000101856 PGRMC1 Dap1|HPR6.6|IZA|MPR progesterone receptor membrane component 1 protein-coding 170.5-61 chr14 55164871 55165211 + 1 NA intron (NM_001146015, intron 12 of 19) L1MB7|LINE|L1 26544 NM_014750 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 202.5-16 chr10 60288390 60288848 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 101256 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 213.75-106 chr9 29046060 29046467 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1PREC2|LINE|L1 -157308 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 147.25-80 chr3 47633917 47634160 + 1 NA intron (NM_003074, intron 24 of 27) intron (NM_003074, intron 24 of 27) 27656 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 306.5-39 chr9 88176609 88176969 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -38308 NM_001350978 645961 Hs.632070 NM_001166137 SPATA31C2 FAM75C2 SPATA31 subfamily C member 2 protein-coding 125.25-148 chr4 101528905 101529125 + 1 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie 181238 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 313.25-26 chr6 154537674 154538311 + 1 NA Intergenic Intergenic -27307 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 176.75-92 chr4 83099285 83099620 + 1 NA intron (NM_001130716, intron 3 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10437 NM_001130716 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 239.25-22 chr12 122724353 122724712 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 6312 NM_032554 27198 Hs.610873 NM_032554 ENSG00000196917 HCAR1 FKSG80|GPR104|GPR81|HCA1|LACR1|TA-GPCR|TAGPCR hydroxycarboxylic acid receptor 1 protein-coding 117.75-228 chr9 117139143 117139319 + 1 NA intron (NM_014010, intron 3 of 21) MIRb|SINE|MIR 41970 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 125.25-48 chr12 105808686 105808933 + 1 NA Intergenic Intergenic 102035 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 294.75-21 chr21 15844853 15845182 + 1 NA intron (NM_013396, intron 18 of 23) intron (NM_013396, intron 18 of 23) 115035 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 295.5-54 chr6 74572711 74573084 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 503446 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 137.5-148 chr21 26868176 26868605 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22981 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 117.5-32 chr10 69110077 69110194 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14018 NM_001035260 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 182.25-56 chr18 76425758 76425993 + 1 NA intron (NM_014643, intron 3 of 6) intron (NM_014643, intron 3 of 6) -65777 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 346.75-9 chr3 9345495 9345906 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17354 NM_001114092 25917 Hs.443081 NM_015453 ENSG00000134077 THUMPD3 - THUMP domain containing 3 protein-coding 218.5-14 chr1 169678549 169679006 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 30080 NR_029467 6402 Hs.728756 NM_000655 ENSG00000188404 SELL CD62L|LAM1|LECAM1|LEU8|LNHR|LSEL|LYAM1|PLNHR|TQ1 selectin L protein-coding 198.5-45 chr14 54244840 54245146 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -151875 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 238.25-79 chr7 16822799 16823184 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -17992 NM_006408 10551 Hs.530009 NM_006408 ENSG00000106541 AGR2 AG-2|AG2|GOB-4|HAG-2|HEL-S-116|HPC8|PDIA17|XAG-2 anterior gradient 2, protein disulphide isomerase family member protein-coding 236.5-4 chr1 237750353 237750808 + 1 NA intron (NM_001035, intron 80 of 104) intron (NM_001035, intron 80 of 104) -111595 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 186.25 chr1 26997824 26998157 + 1 NA intron (NM_001013642, intron 1 of 1) intron (NM_001013642, intron 1 of 1) 4298 NM_001013642 388610 Hs.355747 NM_001013642 ENSG00000253368 TRNP1 C1orf225|TNRP|TRNP TMF1 regulated nuclear protein 1 protein-coding 255.5-29 chr16 50696173 50696445 + 1 NA promoter-TSS (NM_022162) promoter-TSS (NM_022162) -639 NM_022162 64127 Hs.592072 NM_022162 ENSG00000167207 NOD2 ACUG|BLAU|BLAUS|CARD15|CD|CLR16.3|IBD1|NLRC2|NOD2B|PSORAS1|YAOS nucleotide binding oligomerization domain containing 2 protein-coding 171.75-142 chr8 125211797 125212155 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MER94B|DNA|hAT-Blackjack 120116 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 215.25-97 chr6 169463480 169463911 + 1 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) L1MB3|LINE|L1 -209581 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 303.5-32 chr4 53452832 53453162 + 1 NA exon (NM_030917, exon 16 of 18) exon (NM_030917, exon 16 of 18) -47080 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 196.75-18 chr10 104755682 104755983 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) L2c|LINE|L2 -89616 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 242.25-86 chr8 113327205 113327639 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) L1MB7|LINE|L1 49730 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 127.5-9 chr1 58793012 58793181 + 1 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 7945 NR_034014 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 215.75-37 chr15 60051453 60051691 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 47261 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 239.75-62 chr6 27438367 27438721 + 1 NA intron (NR_144688, intron 5 of 8) intron (NR_144688, intron 5 of 8) 34354 NM_001318892 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 142.75-15 chr1 231602407 231602635 + 1 NA intron (NR_034037, intron 1 of 1) intron (NR_034037, intron 1 of 1) 9569 NR_034037 100287814 Hs.25555 NR_034037 ENSG00000229228 LINC00582 - long intergenic non-protein coding RNA 582 ncRNA 157.25-125 chr5 150799831 150800120 + 1 NA Intergenic Intergenic 22029 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 177.5-20 chr11 11238192 11238472 + 1 NA Intergenic Intergenic 114918 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 269.25-2 chr1 71580592 71581027 + 1 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 256203 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 129.75-56 chr13 31757486 31757821 + 1 NA intron (NM_130806, intron 1 of 17) intron (NM_130806, intron 1 of 17) 18111 NM_001166058 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 140.5-75 chr15 70639490 70639733 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 4362 NR_126482 104548973 NR_126482 ENSG00000280515 SALRNA2 SAL-RNA2|XLOC_025931 senescence associated long non-coding RNA 2 ncRNA 142.75-29 chr10 121377797 121378115 + 1 NA Intergenic Intergenic 153358 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 152.5-192 chr8 119556677 119556866 + 1 NA TTS (NR_045555) TTS (NR_045555) 36237 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 212.75-75 chr4 101097649 101097896 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 5 of 12) intron (NM_001130691, intron 5 of 12) 143100 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 173.25-109 chr6 49089817 49090005 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 373342 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 201.25-86 chr7 3803395 3803717 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) AluSz|SINE|Alu -326129 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 302.25-21 chr5 52662066 52662596 + 1 NA Intergenic Intergenic -125585 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 131.5-42 chr12 28265743 28266029 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) intron (NM_001352082, intron 4 of 13) -75148 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 157.25-69 chr2 28594170 28594474 + 1 NA intron (NR_138141, intron 13 of 35) intron (NR_138141, intron 13 of 35) 27965 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 207.75-98 chr5 35413510 35413956 + 1 NA Intergenic Intergenic -183246 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 237.75-9 chr10 76383074 76383380 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -504817 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 140.5-233 chr8 110686914 110687201 + 1 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 340376 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 211.5-94 chr21 35095671 35095927 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -46501 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 151.25-209 chrX 150705697 150705884 + 1 NA intron (NR_148676, intron 2 of 16) L1MD1|LINE|L1 -5965 NM_001353996 8776 Hs.347187 NM_003828 ENSG00000063601 MTMR1 - myotubularin related protein 1 protein-coding 233.5-68 chr22 19574825 19575110 + 1 NA Intergenic Intergenic -8128 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 174.25-95 chr3 29488142 29488496 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 2 of 13) intron (NM_001003792, intron 2 of 13) 207007 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 119.25-206 chr8 89935034 89935266 + 1 NA 3' UTR (NM_002485, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_002485, exon 16 of 16) 32580 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 303.5-55 chrX 87760396 87760995 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 242893 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 177.5-132 chr4 113526799 113527027 + 1 NA intron (NM_001221, intron 8 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 234074 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 170.5-199 chr9 27626787 27627070 + 1 NA Intergenic Intergenic -53062 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 188.25-121 chr8 124719054 124719373 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 9260 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 225.25-13 chr11 75067353 75067701 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 29363 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 234.75-17 chr12 115163474 115163978 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -479551 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 178.5-158 chr6 104601900 104602270 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 257461 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 142.5-45 chr11 100500769 100500927 + 1 NA Intergenic Intergenic -186440 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 165.25-31 chr11 130390992 130391196 + 1 NA intron (NR_148980, intron 2 of 6) intron (NR_148980, intron 2 of 6) 37515 NM_007037 11095 Hs.271605 NM_007037 ENSG00000134917 ADAMTS8 ADAM-TS8|METH2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 8 protein-coding 218.5-84 chr4 53384551 53384990 + 1 NA intron (NM_001134938, intron 4 of 14) intron (NM_001134938, intron 4 of 14) 7117 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 209.5-28 chr12 55317843 55318180 + 1 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2589 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 195.5-48 chr16 5448370 5448622 + 1 NA Intergenic Intergenic 167754 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 194.5-114 chr5 11999169 11999556 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -94916 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 228.25-64 chr5 5343566 5343965 + 1 NA Intergenic Intergenic -78912 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 124.5-186 chr6 34297819 34298046 + 1 NA intron (NM_001202470, intron 6 of 8) intron (NM_001202470, intron 6 of 8) -48824 NM_001287396 221491 Hs.381300 NM_178508 ENSG00000186577 SMIM29 C6orf1|LBH small integral membrane protein 29 protein-coding 261.25-7 chr12 116133543 116134089 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 14838 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 161.25-146 chr5 166083124 166083337 + 1 NA Intergenic Intergenic 843140 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 201.5-89 chr3 108475121 108475448 + 1 NA intron (NM_014981, intron 13 of 41) MIRc|SINE|MIR 54038 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 203.75-29 chr13 114261977 114262341 + 1 NA intron (NM_001330104, intron 14 of 16) intron (NM_001330104, intron 14 of 16) -11669 NR_039724 100616227 NR_039724 ENSG00000265450 MIR4502 - microRNA 4502 ncRNA 307.25-11 chr15 100493575 100494022 + 1 NA intron (NM_001290341, intron 5 of 13) L1M4|LINE|L1 50488 NM_001290342 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 389.25-8 chr5 100873738 100874293 + 1 NA intron (NM_005668, intron 3 of 4) intron (NM_005668, intron 3 of 4) 29267 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 142.25-61 chr14 99410159 99410365 + 1 NA intron (NM_199123, intron 8 of 8) intron (NM_199123, intron 8 of 8) 70597 NM_199123 84193 Hs.510407 NM_032233 ENSG00000183576 SETD3 C14orf154|hSETD3 SET domain containing 3, actin histidine methyltransferase protein-coding 184.75-68 chr3 79178812 79179057 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -159475 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 231.5-90 chr7 34559386 34559644 + 1 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -98703 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 135.5-32 chr11 17787544 17787728 + 1 NA TTS (NR_104041) TTS (NR_104041) 51688 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 238.75-9 chr11 87945883 87946363 + 1 NA Intergenic Intergenic -226712 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 185.75-46 chr14 76697282 76697543 + 1 NA Intergenic Intergenic -64056 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 123.5-182 chr6 14768620 14768826 + 1 NA Intergenic Intergenic -477346 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 204.5-30 chr13 104561151 104561414 + 1 NA Intergenic Intergenic -904585 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 242.25 chr1 34347110 34347570 + 1 NA Intergenic Intergenic 170433 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 122.5-235 chr9 99285026 99285209 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 62835 NM_006808 10952 Hs.191887 NM_006808 ENSG00000106803 SEC61B - SEC61 translocon beta subunit protein-coding 144.5-220 chr8 105157142 105157472 + 1 NA Intergenic Intergenic -161131 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 115.5-60 chr14 50657937 50658074 + 1 NA intron (NM_021818, intron 2 of 4) intron (NM_021818, intron 2 of 4) 10301 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 144.25-118 chr21 45557979 45558237 + 1 NA intron (NM_001352511, intron 1 of 5) intron (NM_001352511, intron 1 of 5) 4917 NM_001352511 6573 Hs.84190 NM_003056 ENSG00000173638 SLC19A1 CHMD|FOLT|IFC-1|IFC1|REFC|RFC|RFC1 solute carrier family 19 member 1 protein-coding 246.5-57 chr4 31709947 31710320 + 1 NA Intergenic Intergenic 203589 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 132.5-31 chr10 65549806 65550029 + 1 NA Intergenic Intergenic -21508 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 236.25-48 chr2 169895548 169895849 + 1 NA intron (NM_172070, intron 7 of 38) intron (NM_172070, intron 7 of 38) 68190 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 209.75-54 chr2 137207487 137207872 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 442134 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 127.25-129 chr3 155131639 155131777 + 1 NA intron (NM_000902, intron 8 of 22) intron (NM_000902, intron 8 of 22) 51697 NM_007289 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 222.5-30 chr13 91363578 91363910 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 12430 NR_029508 407048 Hs.24115 NR_029508 ENSG00000283705 MIR92A1 C13orf25|MIR17HG|MIR92-1|MIRH1|MIRHG1|MIRN92-1|MIRN92A-1|MIRN92A1|miRNA92-1|mir-92a-1 microRNA 92a-1 ncRNA 282.5-50 chr4 105801856 105802160 + 1 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) MIRb|SINE|MIR 25164 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 199.75-40 chr19 32421838 32422154 + 1 NA intron (NM_207325, intron 3 of 18) L1M7|LINE|L1 15871 NM_207325 147991 Hs.194392 NM_207325 ENSG00000178904 DPY19L3 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 3 protein-coding 112.5-119 chr2 99181922 99182204 + 1 NA intron (NR_028356, intron 1 of 6) intron (NR_028356, intron 1 of 6) 879 NM_145212 51263 Hs.346736 NM_016503 ENSG00000185414 MRPL30 L28MT|L30MT|MRP-L28|MRP-L30|MRPL28|MRPL28M|RPML28 mitochondrial ribosomal protein L30 protein-coding 127.5-48 chr11 82645339 82645522 + 1 NA Intergenic Intergenic 88434 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 237.5-86 chr6 46679000 46679265 + 1 NA TTS (NM_004277) TTS (NM_004277) -1136 NR_144468 221400 Hs.656983 NM_001010870 ENSG00000180113 TDRD6 CT41.2|NY-CO-45|SPATA36|TDR2|bA446F17.4 tudor domain containing 6 protein-coding 255.25-26 chr2 177286813 177287099 + 1 NA non-coding (NR_026966, exon 9 of 9) non-coding (NR_026966, exon 9 of 9) -21825 NM_001313902 4780 Hs.744006 NM_006164 ENSG00000116044 NFE2L2 HEBP1|IMDDHH|NRF2 nuclear factor, erythroid 2 like 2 protein-coding 123.75-102 chr2 228325450 228325664 + 1 NA Intergenic Intergenic -143870 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 181.75-25 chr11 54600539 54600800 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 3329 NM_001004703 119749 Hs.553564 NM_001004703 ENSG00000185926 OR4C46 - olfactory receptor family 4 subfamily C member 46 protein-coding 163.5-147 chr4 103035857 103036108 + 1 NA intron (NM_001370207, intron 9 of 10) L1PREC2|LINE|L1 -16277 NR_047515 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 142.5-12 chr1 81579185 81579437 + 1 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) -21609 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 166.75-91 chr3 73133145 73133338 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 71582 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 257.5-71 chr7 29596218 29596734 + 1 NA Intergenic Intergenic 30943 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 177.75-115 chr5 119516593 119516926 + 1 NA intron (NM_001199291, intron 18 of 24) intron (NM_001199291, intron 18 of 24) 64262 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 196.5-54 chr15 52284865 52285137 + 1 NA intron (NM_018728, intron 1 of 40) AluJo|SINE|Alu -7801 NR_031670 100302202 NR_031670 ENSG00000221052 MIR1266 MIRN1266|hsa-mir-1266|mir-1266 microRNA 1266 ncRNA 183.25-31 chr13 96549846 96550271 + 1 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 122829 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 170.5-3 chr1 21152826 21153015 + 1 NA intron (NM_001198803, intron 1 of 12) AluJr4|SINE|Alu 15119 NM_001198803 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 188.5-143 chr7 126173348 126173613 + 1 NA Intergenic Intergenic 884704 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 152.75-51 chr13 76026137 76026307 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -91090 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 196.75-81 chr4 67689305 67689808 + 1 NA intron (NM_018227, intron 2 of 32) intron (NM_018227, intron 2 of 32) 11599 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 146.5-2 chr1 8415426 8415661 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 12 of 22) intron (NM_001042681, intron 12 of 22) 8289 NM_001042682 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 162.5-166 chr7 145835836 145836115 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -938296 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 136.5-22 chr10 48233470 48233675 + 1 NA intron (NM_001018071, intron 9 of 28) MER45C|DNA|hAT-Tip100 18185 NM_001318191 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 290.5-7 chr11 97442655 97443068 + 1 NA Intergenic Intergenic 934436 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 129.5-32 chr10 114354650 114354894 + 1 NA intron (NM_001001936, intron 1 of 18) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 49730 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 248.5-82 chr5 83164616 83165000 + 1 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) intron (NM_001318012, intron 3 of 7) 87261 NM_003401 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 196.5-109 chr3 171656275 171656636 + 1 NA intron (NM_002662, intron 21 of 26) AluSx|SINE|Alu 154028 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 216.5-25 chr13 50645076 50645505 + 1 NA Intergenic Intergenic -117841 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 142.75-179 chr7 96563577 96563859 + 1 NA intron (NR_163950, intron 3 of 6) L1MEd|LINE|L1 -60195 NM_001201450 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 126.25-55 chr14 88293410 88293680 + 1 NA intron (NM_021161, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 -22634 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 209.5-33 chr12 113794474 113794970 + 1 NA Intergenic Intergenic -21039 NR_110026 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 123.25-215 chr9 110129927 110130075 + 1 NA intron (NM_001136562, intron 1 of 3) intron (NM_001136562, intron 1 of 3) 4500 NM_001136562 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 218.5-57 chr2 115061066 115061312 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -3384 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 265.5-44 chr4 64997649 64998065 + 1 NA intron (NR_033976, intron 1 of 6) intron (NR_033976, intron 1 of 6) 6643 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 186.25-48 chr19 43467558 43467757 + 1 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 -2049 NM_014400 27076 Hs.631594 NM_014400 ENSG00000124466 LYPD3 C4.4A LY6/PLAUR domain containing 3 protein-coding 189.25-19 chr11 114733275 114733647 + 1 NA Intergenic Intergenic 54934 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 222.75-34 chr13 96598879 96599139 + 1 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1PB3|LINE|L1 171780 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 155.75-49 chr14 47951481 47951687 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -156570 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 273.25-24 chr3 190065873 190066485 + 1 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 54718 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 140.75-131 chr4 30734917 30735344 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 14761 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 119.75-104 chr2 77984677 77984849 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA4|LINE|L1 -29737 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 275.5-74 chrX 44315082 44315472 + 1 NA intron (NM_025184, intron 1 of 14) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 28395 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 144.5-64 chr14 69511984 69512261 + 1 NA intron (NM_001161498, intron 6 of 12) L1MC1|LINE|L1 27394 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 187.5-178 chr8 141240364 141240692 + 1 NA intron (NM_001286646, intron 1 of 7) intron (NM_001286646, intron 1 of 7) -11954 NM_001080431 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 173.75-85 chr2 56987543 56987853 + 1 NA Intergenic Intergenic -801928 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 119.5-182 chr5 88802790 88802983 + 1 NA intron (NM_001364333, intron 3 of 9) intron (NM_001364333, intron 3 of 9) -17375 NM_001364353 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 375.75-9 chr2 34986393 34987274 + 1 NA Intergenic Intergenic 309276 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 200.25-86 chr5 9057735 9058173 + 1 NA intron (NM_003966, intron 18 of 22) intron (NM_003966, intron 18 of 22) -4059 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 228.75-76 chr8 29552139 29552436 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 195822 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 217.25-50 chr21 24869452 24869870 + 1 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 29111 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 165.75-134 chr5 58992452 58992655 + 1 NA intron (NM_006203, intron 7 of 14) intron (NM_006203, intron 7 of 14) 7345 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 112.5-43 chr12 707176 707340 + 1 NA Intergenic Intergenic -43813 NM_016533 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 180.5-99 chr3 114407944 114408247 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -24453 NM_001164342 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 272.75-12 chr15 80246313 80246723 + 1 NA intron (NM_001352888, intron 1 of 2) intron (NM_001352888, intron 1 of 2) 5695 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 148.75-93 chr2 182935515 182935746 + 1 NA intron (NM_013436, intron 24 of 30) intron (NM_013436, intron 24 of 30) -68993 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 112.5-83 chr15 67205231 67205405 + 1 NA intron (NM_001271885, intron 7 of 9) intron (NM_001271885, intron 7 of 9) 39163 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 280.5-21 chr19 28077947 28078352 + 1 NA Intergenic Intergenic -284209 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 237.5-76 chr5 37793080 37793416 + 1 NA Intergenic Intergenic 41574 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 182.25-125 chr8 119530774 119531125 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 62059 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 131.75-126 chr22 34984138 34984311 + 1 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 13692 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 123.5-81 chr17 59689554 59689706 + 1 NA intron (NM_001288653, intron 30 of 31) intron (NM_001288653, intron 30 of 31) 17968 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 119.75-14 chr1 212786939 212787073 + 1 NA intron (NM_015471, intron 2 of 5) AluSg|SINE|Alu 4771 NM_001297737 25936 Hs.497692 NM_015471 ENSG00000117697 NSL1 C1orf48|DC8|MIS14 NSL1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 190.5-141 chr7 21394396 21394669 + 1 NA Intergenic Intergenic -33551 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 167.75-148 chr9 27791765 27792050 + 1 NA Intergenic Intergenic -218041 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 173.75-79 chr18 73780985 73781195 + 1 NA Intergenic Intergenic 366744 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 173.5-79 chr2 202996410 202996723 + 1 NA Intergenic Intergenic -18313 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 194.25-104 chr6 146946662 146946976 + 1 NA intron (NR_034115, intron 7 of 10) intron (NR_034115, intron 7 of 10) -142995 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 294.25-27 chr22 35306495 35307127 + 1 NA intron (NR_156428, intron 1 of 13) intron (NR_156428, intron 1 of 13) 6917 NM_005488 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 162.5-107 chr3 20564198 20564469 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 221865 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 202.5-36 chr13 76569103 76569383 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 317162 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 207.25-19 chr13 94297613 94298009 + 1 NA intron (NM_005708, intron 5 of 8) intron (NM_005708, intron 5 of 8) -109820 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 132.25-19 chr1 200046244 200046383 + 1 NA intron (NM_205860, intron 4 of 7) intron (NM_205860, intron 4 of 7) 3488 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 247.25-5 chr10 28969928 28970285 + 1 NA Intergenic Intergenic 123698 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 186.5-8 chr1 167999244 167999548 + 1 NA TTS (NR_031702) TTS (NR_031702) 736 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 190.75-98 chr6 141413213 141413605 + 1 NA Intergenic Intergenic 675390 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 322.5-10 chr13 67690435 67691011 + 1 NA Intergenic Intergenic 318336 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 416.5-9 chr4 35919076 35919719 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 324542 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 199.5-65 chr18 56403523 56403741 + 1 NA Intergenic Intergenic -212370 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 127.25-81 chr2 9746563 9746793 + 1 NA Intergenic Intergenic -96764 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 213.5-14 chr1 241518236 241518657 + 1 NA intron (NM_000143, intron 1 of 9) intron (NM_000143, intron 1 of 9) 1339 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 162.5-41 chr12 84425435 84425642 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 487261 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 192.5-100 chr4 94611511 94611725 + 1 NA intron (NM_001256426, intron 11 of 16) intron (NM_001256426, intron 11 of 16) 145915 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 121.25-17 chr10 33445612 33445809 + 1 NA Intergenic Intergenic -110805 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 138.5-5 chr1 42004398 42004655 + 1 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) intron (NR_038261, intron 1 of 3) 31408 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 139.5-35 chr11 112942302 112942480 + 1 NA Intergenic Intergenic -19029 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 222.5-82 chr4 183124073 183124337 + 1 NA intron (NM_024949, intron 1 of 22) L1M5|LINE|L1 24948 NM_024949 80014 Hs.333179 NM_024949 ENSG00000151718 WWC2 BOMB WW and C2 domain containing 2 protein-coding 132.5-91 chr17 49189631 49189887 + 1 NA Intergenic Intergenic 19622 NM_031498 2793 Hs.181781 NM_031498 ENSG00000167083 GNGT2 G-GAMMA-8|G-GAMMA-C|GNG8|GNG9|GNGT8 G protein subunit gamma transducin 2 protein-coding 200.25-60 chr2 79259077 79259418 + 1 NA Intergenic Intergenic -99494 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 189.25-23 chr12 13900767 13901094 + 1 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) L1ME3E|LINE|L1 79426 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 176.5-122 chr3 95573892 95574086 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 109204 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 226.25-51 chr4 48379574 48380145 + 1 NA intron (NM_020846, intron 4 of 7) intron (NM_020846, intron 4 of 7) 38330 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 193.75 chr1 12467202 12467653 + 1 NA intron (NM_015378, intron 67 of 69) AluSg|SINE|Alu -39819 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 156.75-114 chr3 101643186 101643488 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -33093 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-192 chr8 140878902 140879138 + 1 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) intron (NM_001352737, intron 3 of 32) 121984 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 166.5-19 chr1 229710193 229710549 + 1 NA Intergenic Intergenic 84124 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 131.5-147 chr22 38824557 38824746 + 1 NA intron (NM_014293, intron 3 of 4) intron (NM_014293, intron 3 of 4) 19377 NM_014293 23467 Hs.91622 NM_014293 ENSG00000221890 NPTXR NPR neuronal pentraxin receptor protein-coding 174.25-127 chr6 108374219 108374582 + 1 NA intron (NR_136553, intron 3 of 8) L1PA16|LINE|L1 79346 NM_001323005 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 196.25 chr1 77051550 77051868 + 1 NA intron (NM_030965, intron 4 of 4) intron (NM_030965, intron 4 of 4) -8434 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 140.75-186 chr8 119357751 119358000 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 32704 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 163.5-3 chr1 42538187 42538415 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 8 of 18) AluJr|SINE|Alu 5281 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 175.5-148 chr7 79493007 79493266 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 39176 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 216.5-72 chr3 41104975 41105275 + 1 NA Intergenic Intergenic -94380 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 127.75-164 chr5 151782557 151782744 + 1 NA intron (NM_198395, intron 1 of 11) intron (NM_198395, intron 1 of 11) -10474 NR_132345 100652758 Hs.587054 NM_001278082 LOC100652758 - uncharacterized LOC100652758 ncRNA 121.5-28 chr10 34903402 34903572 + 1 NA Intergenic L1MEa|LINE|L1 87719 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 209.25-50 chr2 9453932 9454245 + 1 NA intron (NM_016207, intron 12 of 17) intron (NM_016207, intron 12 of 17) -20463 NM_001320860 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 209.5-152 chr9 37820597 37820925 + 1 NA intron (NM_001286810, intron 2 of 6) L1MEi|LINE|L1 19964 NM_024345 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 176.25-8 chr1 181567842 181568047 + 1 NA intron (NM_001205293, intron 3 of 47) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 84427 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 169.75-19 chr10 76547348 76547653 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -340544 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-78 chr4 71592509 71592823 + 1 NA Intergenic Intergenic 191413 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 233.75-50 chr3 98777356 98777722 + 1 NA intron (NM_001271147, intron 6 of 9) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 14232 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 175.75-125 chr8 65803535 65803842 + 1 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -14631 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 156.75-63 chr15 89057230 89057443 + 1 NA Intergenic Intergenic -31120 NM_007011 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 126.25-186 chr7 46891999 46892330 + 1 NA Intergenic Intergenic -195042 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 132.5-41 chr11 72157059 72157204 + 1 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 21406 NM_001318045 2352 Hs.352 NM_000804 ENSG00000110203 FOLR3 FR-G|FR-gamma|FRgamma|gamma-hFR folate receptor gamma protein-coding 298.75-21 chr17 77513059 77513453 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13745 NR_148967 400622 Hs.514516 NR_148967 LOC400622 - uncharacterized LOC400622 ncRNA 133.5-209 chr5 76860573 76860740 + 1 NA intron (NM_130772, intron 1 of 4) intron (NM_130772, intron 1 of 4) 10642 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 182.5-89 chr2 226115705 226115967 + 1 NA Intergenic Intergenic -26958 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 231.5-86 chr5 171940671 171940987 + 1 NA intron (NM_033644, intron 1 of 12) AluSg|SINE|Alu 66044 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 206.75-74 chr5 163226245 163226531 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -211183 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 146.5-209 chr7 49624144 49624332 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -149400 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 225.75-71 chr6 65519414 65519887 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) 60154 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 202.75-20 chr11 104058946 104059316 + 1 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 22491 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 146.25-54 chr17 57848855 57849082 + 1 NA intron (NM_016070, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 1076 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 170.5-111 chr20 52962473 52962705 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -9769 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 147.25-42 chr16 8955870 8956055 + 1 NA intron (NM_003470, intron 1 of 30) intron (NM_003470, intron 1 of 30) 418 NM_001321858 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 156.5-77 chr2 47681630 47681970 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -101282 NM_001281493 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 175.75-24 chr11 102145069 102145364 + 1 NA intron (NM_001130145, intron 2 of 8) intron (NM_001130145, intron 2 of 8) 32768 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 208.75-83 chr8 89576002 89576224 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 181598 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 144.5-79 chr16 60489392 60489590 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -129698 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 186.5-144 chrX 50933713 50934076 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 23159 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 125.75-157 chr5 124020646 124020861 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 417767 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 128.5-60 chr14 20180137 20180296 + 1 NA Intergenic Intergenic -17120 NM_001005503 390439 Hs.554582 NM_001005503 ENSG00000196832 OR11G2 OR14-34 olfactory receptor family 11 subfamily G member 2 protein-coding 176.25-83 chr20 51998100 51998396 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 107236 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 136.5-100 chr2 520937 521152 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24761 NR_146470 101927362 Hs.385749 NR_146470 ENSG00000225942 LINC01875 - long intergenic non-protein coding RNA 1875 ncRNA 191.5-61 chr17 82720911 82721176 + 1 NA intron (NR_046408, intron 4 of 6) intron (NR_046408, intron 4 of 6) 4337 NR_046408 79672 Hs.31431 NM_024619 ENSG00000141560 FN3KRP FN3KL fructosamine 3 kinase related protein protein-coding 134.25-194 chr8 138895119 138895359 + 1 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) L1MDa|LINE|L1 18802 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 157.5-228 chr9 92870505 92870708 + 1 NA intron (NM_001261460, intron 2 of 5) L1MDa|LINE|L1 7362 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 211.5-163 chr8 118677769 118678285 + 1 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -56064 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 195.5-112 chr4 187410860 187411129 + 1 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) 40346 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 139.25-44 chr12 122866286 122866497 + 1 NA 3' UTR (NM_024667, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_024667, exon 4 of 4) 29733 NM_024667 79720 Hs.507162 NM_024667 ENSG00000139722 VPS37B - VPS37B subunit of ESCRT-I protein-coding 180.5-148 chr8 35585579 35585901 + 1 NA intron (NM_001322818, intron 3 of 16) intron (NM_001322818, intron 3 of 16) 41348 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 159.5-67 chr16 47043879 47044093 + 1 NA Intergenic Intergenic -70312 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 154.25-10 chr1 185554947 185555269 + 1 NA Intergenic Intergenic 73380 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 218.5-20 chr10 75865669 75866044 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 83095 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 155.5-45 chr12 54712147 54712326 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -63871 NM_053283 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 147.25-142 chr8 86407583 86407887 + 1 NA intron (NM_007013, intron 8 of 24) L1MC2|LINE|L1 65188 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 139.5-2 chr1 118762399 118762716 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 225786 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 231.75-53 chr4 82040245 82040680 + 1 NA Intergenic Intergenic 333529 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 247.5-57 chr3 134977461 134977948 + 1 NA intron (NM_004441, intron 3 of 15) intron (NM_004441, intron 3 of 15) 182444 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 204.5-24 chr12 43262206 43262450 + 1 NA Intergenic Intergenic 107013 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 155.75-57 chr15 73120564 73120763 + 1 NA intron (NM_002499, intron 2 of 28) MIRb|SINE|MIR 68179 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 144.75-154 chr7 17222404 17222612 + 1 NA Intergenic Intergenic -76144 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 229.25-38 chr18 71097300 71097569 + 1 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -446480 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 164.5-41 chr12 76797217 76797419 + 1 NA intron (NM_015336, intron 1 of 16) intron (NM_015336, intron 1 of 16) 33060 NM_001359626 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 142.5-152 chr4 84694987 84695225 + 1 NA intron (NM_014991, intron 58 of 67) intron (NM_014991, intron 58 of 67) 111979 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 128.25-92 chr2 48227916 48228198 + 1 NA Intergenic Intergenic -86625 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 299.75-22 chr5 160401298 160401831 + 1 NA TTS (NM_001364521) TTS (NM_001364521) -1467 NM_001303251 63920 Hs.529464 NM_022090 ENSG00000221886 ZBED8 Buster3|C5orf54 zinc finger BED-type containing 8 protein-coding 310.25-25 chr8 126099550 126100096 + 1 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -148626 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 166.75-40 chr13 93060812 93061033 + 1 NA Intergenic Intergenic 15581 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 266.75-10 chr14 71837046 71837504 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94896 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 217.5-121 chr7 91543755 91544012 + 1 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 279450 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 154.25-54 chr15 23532259 23532481 + 1 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 29761 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 120.25-20 chr1 220852523 220852806 + 1 NA intron (NR_046901, intron 1 of 2) L1MA4|LINE|L1 23409 NR_110797 101929730 Hs.398159 NR_110797 ENSG00000238078 LINC01352 - long intergenic non-protein coding RNA 1352 ncRNA 191.75-33 chr13 70311637 70312151 + 1 NA Intergenic Intergenic -203401 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 280.5-58 chr9 95841007 95841522 + 1 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 -34427 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 151.5-160 chr5 129592587 129592814 + 1 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) intron (NM_133638, intron 7 of 22) -132011 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 168.5-20 chr1 239498769 239499017 + 1 NA intron (NM_001347716, intron 2 of 7) intron (NM_001347716, intron 2 of 7) 112325 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 175.5-137 chr5 92120274 92120608 + 1 NA Intergenic Intergenic -737124 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 298.5-39 chr8 60386803 60387157 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 26838 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 117.5-96 chr2 7366415 7366533 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -54787 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 203.75-2 chr1 73800820 73801256 + 1 NA Intergenic Intergenic 126359 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 231.5-31 chr15 77821874 77822190 + 1 NA Intergenic Intergenic -1132 NM_001301186 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 230.5-15 chr10 65164313 65164668 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -239972 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 172.5-154 chr5 45779076 45779397 + 1 NA Intergenic Intergenic -82856 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 161.75-93 chr3 184847945 184848240 + 1 NA intron (NM_001009921, intron 7 of 46) AluSx1|SINE|Alu 35585 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 115.75-171 chr5 116273523 116273681 + 1 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) 17859 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 162.75-97 chr3 98879058 98879296 + 1 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) L1MC5a|LINE|L1 22518 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 239.5-40 chr18 21052258 21052683 + 1 NA intron (NM_005406, intron 2 of 32) intron (NM_005406, intron 2 of 32) 59343 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 115.5-243 chr8 129615660 129615841 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -40732 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 322.5-35 chr6 74631427 74631973 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 497082 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 175.25-42 chr12 124025186 124025370 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) intron (NM_001347902, intron 2 of 4) 52063 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 141.5-210 chr7 77566533 77566679 + 1 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 28563 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 170.25-63 chr2 20454795 20455064 + 1 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 7855 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 121.25-46 chr12 120526257 120526450 + 1 NA intron (NM_032314, intron 1 of 6) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 2805 NM_032314 84274 Hs.17250 NM_032314 ENSG00000110871 COQ5 - coenzyme Q5, methyltransferase protein-coding 124.5-233 chr8 129118030 129118278 + 1 NA Intergenic Intergenic 123086 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 158.25-83 chr3 15643598 15643798 + 1 NA intron (NM_001370753, intron 3 of 3) L1ME3G|LINE|L1 41729 NM_001281725 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 304.25-7 chr13 24750286 24750780 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -13636 NM_001184993 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 177.5-158 chr6 169224289 169224782 + 1 NA intron (NM_003247, intron 18 of 22) intron (NM_003247, intron 18 of 22) 11323 NR_134621 101929523 Hs.442696 NR_134621 ENSG00000226445 LOC101929523 - uncharacterized LOC101929523 ncRNA 187.25-67 chr22 35007776 35008143 + 1 NA Intergenic Intergenic -10043 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 189.5-64 chr19 46554704 46554990 + 1 NA intron (NM_001370550, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 46069 NM_001370550 100506012 Hs.671661 NM_001205281 ENSG00000230510 PPP5D1 - PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 protein-coding 194.5-171 chrX 139010533 139010767 + 1 NA intron (NM_001139501, intron 2 of 7) L1PB1|LINE|L1 -143095 NM_001139502 2258 Hs.6540 NM_004114 ENSG00000129682 FGF13 FGF-13|FGF2|FHF-2|FHF2|LINC00889 fibroblast growth factor 13 protein-coding 184.5-29 chr11 97344953 97345272 + 1 NA Intergenic Intergenic 836687 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 112.25-44 chr12 39640262 39640473 + 1 NA intron (NM_001031748, intron 1 of 12) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 14184 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 227.5-108 chr8 118845929 118846439 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 105701 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 167.5-198 chr9 70523085 70523362 + 1 NA Intergenic Intergenic -108566 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 222.75-39 chr14 65955897 65956201 + 1 NA Intergenic Intergenic 484947 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 169.5-100 chr3 12448969 12449180 + 1 NA Intergenic Intergenic -35358 NM_001145394 80746 Hs.335550 NM_025265 ENSG00000154743 TSEN2 PCH2B|SEN2|SEN2L tRNA splicing endonuclease subunit 2 protein-coding 131.75-151 chr4 52989042 52989194 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 126801 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 181.5-82 chr2 99075194 99075512 + 1 NA intron (NR_146001, intron 11 of 18) intron (NR_146001, intron 11 of 18) 65827 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 193.5-125 chr4 116498955 116499185 + 1 NA Intergenic Intergenic 199345 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 219.5-39 chr14 45513506 45513903 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 201898 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 153.5-50 chr13 100631426 100631710 + 1 NA intron (NM_001079669, intron 11 of 17) L2a|LINE|L2 -42776 NM_001195087 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 209.25-53 chr2 35890505 35890778 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 419236 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 169.5-75 chr2 75000991 75001233 + 1 NA Intergenic Intergenic 42469 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 193.25-23 chr11 112621703 112621909 + 1 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -66004 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 197.25-59 chr20 50151063 50151497 + 1 NA non-coding (NR_027889, exon 2 of 7) non-coding (NR_027889, exon 2 of 7) 2443 NM_199129 387521 Hs.744839 NM_199129 ENSG00000240849 TMEM189 KUA transmembrane protein 189 protein-coding 159.5-172 chr5 32633502 32633770 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 48079 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 169.5-89 chr20 41304830 41305135 + 1 NA Intergenic Intergenic -4862 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 152.5-159 chr5 167828108 167828365 + 1 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) L2a|LINE|L2 73307 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 211.5-99 chr3 61172624 61172962 + 1 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 78659 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 127.25-159 chr5 24619607 24619755 + 1 NA intron (NM_001362460, intron 1 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 25297 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 182.75-15 chr1 209941796 209942175 + 1 NA intron (NM_153262, intron 1 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 3768 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 213.25-26 chr18 44149213 44149716 + 1 NA Intergenic Intergenic 382233 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 228.75-83 chr8 98792534 98792968 + 1 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) L1PB1|LINE|L1 32920 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 125.25-19 chr1 247436938 247437098 + 1 NA intron (NM_001127462, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 14964 NM_001004492 127623 Hs.446999 NM_001004492 ENSG00000177535 OR2B11 - olfactory receptor family 2 subfamily B member 11 protein-coding 292.75-8 chr12 29757025 29757647 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 3 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie 26606 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 189.25-93 chr4 129330766 129331090 + 1 NA Intergenic Intergenic 234776 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 310.5-19 chr2 116175992 116176436 + 1 NA Intergenic Intergenic 832399 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 194.25-58 chr2 102533936 102534294 + 1 NA TTS (NM_001011552) TTS (NM_001011552) 60889 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 167.75-151 chr9 108763120 108763418 + 1 NA Intergenic Intergenic 92717 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 240.5-54 chr2 200476463 200476773 + 1 NA intron (NM_001100423, intron 12 of 12) LTR1D1|LTR|ERV1 33450 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 115.25-55 chr14 41379295 41379513 + 1 NA Intergenic Intergenic -227452 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 125.5-144 chr2 235892274 235892511 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 10 of 17) intron (NM_001037131, intron 10 of 17) 275994 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 129.75-138 chr4 125203805 125203996 + 1 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -112512 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 113.5-89 chr15 83351423 83351601 + 1 NA Intergenic Intergenic -66848 NM_001717 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 167.5-192 chr8 132376080 132376377 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 71034 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 259.5-59 chr2 145766719 145767134 + 1 NA Intergenic Intergenic -820131 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 123.25-167 chr5 104308308 104308461 + 1 NA Intergenic Intergenic -745595 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 136.5-195 chr6 64702312 64702495 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -599015 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 130.25-59 chr14 69678965 69679240 + 1 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 67506 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 278.25-63 chrX 86458164 86458504 + 1 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 195366 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 211.5-26 chr11 78089991 78090244 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -10255 NM_001203260 100532726 Hs.407860 NM_001203260 ENSG00000259112 NDUFC2-KCTD14 - NDUFC2-KCTD14 readthrough protein-coding 185.25-11 chr11 5713494 5713772 + 1 NA Intergenic MER76-int|LTR|ERVL -22815 NM_001005180 387748 Hs.689609 NM_001005180 ENSG00000181023 OR56B1 OR11-65|OR56B1P olfactory receptor family 56 subfamily B member 1 protein-coding 231.75-33 chr2 20669003 20669411 + 1 NA intron (NM_182828, intron 1 of 1) intron (NM_182828, intron 1 of 1) 2063 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 194.25-101 chr6 15112811 15113204 + 1 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -133062 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 223.25-81 chr9 25097152 25097531 + 1 NA Intergenic Intergenic -551444 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 171.5-82 chr2 102432327 102432667 + 1 NA TTS (NR_039930) TTS (NR_039930) 208 NR_039930 100616157 NR_039930 ENSG00000264764 MIR4772 mir-4772 microRNA 4772 ncRNA 144.5-94 chr19 49581113 49581382 + 1 NA promoter-TSS (NM_001316335) promoter-TSS (NM_001316335) -69 NM_000951 5639 Hs.35101 NM_000951 ENSG00000126460 PRRG2 PRGP2 proline rich and Gla domain 2 protein-coding 146.5-38 chr11 26013544 26013796 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -175453 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 170.5-114 chr22 37214378 37214695 + 1 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -2059 NM_001051 6753 Hs.225995 NM_001051 ENSG00000278195 SSTR3 SS-3-R|SS3-R|SS3R|SSR-28 somatostatin receptor 3 protein-coding 235.75-33 chr18 4846356 4846734 + 1 NA Intergenic Intergenic -234637 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 392.25-15 chr8 99765312 99765797 + 1 NA intron (NM_017890, intron 39 of 61) LTR40c|LTR|ERVL 128153 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 184.25-100 chr5 43487114 43487624 + 1 NA intron (NM_198566, intron 12 of 12) intron (NM_198566, intron 12 of 12) -3504 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 220.5-78 chr3 160473819 160474123 + 1 NA intron (NR_148403, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 11776 NR_148403 100174949 NR_148401 ENSG00000248710 TRIM59-IFT80 IFT80-L TRIM59-IFT80 protein ncRNA 138.5-160 chr5 124974573 124974741 + 1 NA Intergenic Intergenic -62174 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 164.5-95 chr2 60156609 60156837 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 226313 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 135.75-62 chr14 100525524 100525787 + 1 NA intron (NM_001350950, intron 3 of 5) intron (NM_001350950, intron 3 of 5) 42415 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 215.75-58 chr20 60415846 60416112 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 56997 NR_109903 101928048 Hs.572803 NR_109903 LOC101928048 - uncharacterized LOC101928048 ncRNA 214.5-84 chr3 187512130 187512352 + 1 NA Intergenic Intergenic 65195 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 224.75-71 chr8 80831190 80831489 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 43129 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 229.5-119 chr6 137392011 137392472 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 102153 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 143.75-33 chr11 45835670 45835947 + 1 NA Intergenic Intergenic -11310 NM_001127457 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 220.75-68 chr7 89704603 89704966 + 1 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -414616 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 285.75-3 chr1 113858782 113859269 + 1 NA exon (NM_001193431, exon 3 of 21) exon (NM_001193431, exon 3 of 21) 2390 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 170.5-140 chr5 14305885 14306071 + 1 NA intron (NM_007118, intron 8 of 56) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -158005 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 145.5-113 chr20 5812464 5812642 + 1 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) 62152 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 218.25-34 chr17 71204039 71204434 + 1 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT -2057 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 140.5-189 chr5 161434953 161435131 + 1 NA intron (NM_000813, intron 5 of 9) intron (NM_000813, intron 5 of 9) 113082 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 301.25-13 chr15 38142899 38143402 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -70160 NR_147199 107984773 Hs.285193 NR_147199 ENSG00000236914 LINC01852 - long intergenic non-protein coding RNA 1852 ncRNA 120.5-175 chr5 13125880 13126026 + 1 NA Intergenic Intergenic -93067 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 227.75-12 chr10 105109262 105109546 + 1 NA intron (NM_014978, intron 7 of 26) L1M7|LINE|L1 -443188 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-61 chr2 101868477 101868748 + 1 NA intron (NM_004834, intron 19 of 29) intron (NM_004834, intron 19 of 29) -114853 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 186.5-5 chr1 147070676 147070978 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 13929 NR_121645 101447996 NR_121645 ENSG00000286172 RNVU1-8 RNU1-145|vU1.8 RNA, variant U1 small nuclear 8 snRNA 206.25-101 chr7 24592532 24592779 + 1 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 19203 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 119.5-6 chr1 43378768 43378918 + 1 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -10769 NM_001256401 64834 Hs.25597 NM_022821 ENSG00000066322 ELOVL1 CGI-88|Ssc1 ELOVL fatty acid elongase 1 protein-coding 161.5-145 chr4 59996035 59996358 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -926423 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 163.5-120 chr22 44470879 44471169 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 27209 NM_032287 84247 Hs.744991 NM_032287 ENSG00000188636 RTL6 LDOC1L|Mar6|Mart6|SIRH3|dJ1033E15.2 retrotransposon Gag like 6 protein-coding 144.25-49 chr13 33758335 33758629 + 1 NA Intergenic Intergenic -59587 NM_181558 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 186.75-65 chr21 21890226 21890623 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 143439 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 257.5-17 chr13 88206775 88207065 + 1 NA intron (NR_131919, intron 1 of 4) intron (NR_131919, intron 1 of 4) 64053 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 233.5-94 chr6 26306573 26306846 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -21210 NM_003543 8365 Hs.591790 NM_003543 ENSG00000158406 HIST1H4H H4/h|H4FH histone cluster 1 H4 family member h protein-coding 201.25-93 chr8 133884737 133885088 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -1584 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 184.75-48 chr2 46304491 46304877 + 1 NA intron (NM_001430, intron 1 of 15) intron (NM_001430, intron 1 of 15) 7277 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 298.75-31 chr7 25183762 25184338 + 1 NA Intergenic Intergenic -3696 NM_001371351 175.5-167 chr8 105320338 105320600 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 926 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 172.75-29 chr12 84453380 84453791 + 1 NA Intergenic Intergenic 459214 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 224.25-4 chr1 97622683 97623071 + 1 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -174044 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 150.5-168 chr5 28524567 28524863 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -237050 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 182.25-96 chr5 157763721 157763968 + 1 NA Intergenic Intergenic 20132 NM_173491 134353 Hs.23648 NM_173491 ENSG00000155858 LSM11 - LSM11, U7 small nuclear RNA associated protein-coding 271.75-33 chr4 43925954 43926404 + 1 NA Intergenic Intergenic -90682 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 160.5-156 chr5 181078247 181078517 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -34898 NR_107056 102465882 NR_107056 ENSG00000277912 MIR8089 hsa-mir-8089 microRNA 8089 ncRNA 147.5-169 chr4 168633660 168633829 + 1 NA intron (NM_001166109, intron 1 of 18) intron (NM_001166109, intron 1 of 18) 2166 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 182.5-44 chr13 80667345 80667602 + 1 NA Intergenic UCON28c|Unknown|Unknown -326347 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 160.25-165 chr9 27263020 27263288 + 1 NA intron (NR_026679, intron 11 of 16) MIR|SINE|MIR 19639 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 164.5-113 chr20 31058329 31058559 + 1 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -199220 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 153.5-96 chr2 44349566 44349793 + 1 NA intron (NM_001171617, intron 1 of 13) intron (NM_001171617, intron 1 of 13) 10070 NM_001042385 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 193.75-70 chr2 195089900 195090250 + 1 NA Intergenic Intergenic 359480 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 141.25-183 chr8 121404107 121404342 + 1 NA Intergenic Intergenic -235122 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 217.5-112 chr6 123337268 123337699 + 1 NA intron (NM_006073, intron 22 of 40) intron (NM_006073, intron 22 of 40) -102121 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 186.5-105 chr5 32260788 32261076 + 1 NA intron (NM_001294344, intron 7 of 13) intron (NM_001294344, intron 7 of 13) 52007 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 207.25-59 chr3 98912698 98913149 + 1 NA Intergenic Intergenic -11228 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 169.25-100 chr5 153222093 153222395 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -249895 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 161.25-139 chr5 79171906 79172097 + 1 NA Intergenic Intergenic 60192 NM_001713 635 Hs.80756 NM_001713 ENSG00000145692 BHMT BHMT1|HEL-S-61p betaine--homocysteine S-methyltransferase protein-coding 258.5-43 chr21 33676362 33676704 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 1 of 29) intron (NM_001001132, intron 1 of 29) 34032 NM_001001132 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 171.75-10 chr1 172492598 172492781 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -39660 NM_016227 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 338.75-21 chr8 141684512 141685234 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 101440 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 168.5-66 chr17 68957003 68957228 + 1 NA Intergenic Intergenic -1723 NM_001288985 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 165.75-107 chr22 36377101 36377339 + 1 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) intron (NM_002473, intron 1 of 40) 10847 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 114.25-15 chr10 13129803 13129959 + 1 NA intron (NM_001008213, intron 13 of 15) intron (NM_001008213, intron 13 of 15) 29718 NM_001008212 10133 Hs.332706 NM_021980 ENSG00000123240 OPTN ALS12|FIP2|GLC1E|HIP7|HYPL|NRP|TFIIIA-INTP optineurin protein-coding 164.5-36 chr12 38682709 38683099 + 1 NA intron (NM_153634, intron 16 of 19) intron (NM_153634, intron 16 of 19) 222687 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 156.25-27 chr11 45468055 45468394 + 1 NA Intergenic Intergenic 96827 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 379.75-14 chr9 90385149 90385719 + 1 NA intron (NR_109795, intron 1 of 2) intron (NR_109795, intron 1 of 2) 48055 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 223.5-2 chr1 35415066 35415541 + 1 NA intron (NM_005095, intron 27 of 29) intron (NM_005095, intron 27 of 29) -49226 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 235.75-19 chr12 40838763 40839059 + 1 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) L1M2|LINE|L1 10973 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 206.5-44 chr2 37462557 37462972 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 118134 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 126.25-97 chr2 236986917 236987072 + 1 NA Intergenic Intergenic 69173 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 183.75-5 chr1 112635261 112635555 + 1 NA intron (NM_006135, intron 1 of 9) intron (NM_006135, intron 1 of 9) 15576 NM_006135 829 Hs.744974 NM_006135 ENSG00000116489 CAPZA1 CAPPA1|CAPZ|CAZ1 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1 protein-coding 211.25-51 chr22 24895230 24895609 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 17 of 23) intron (NM_001098498, intron 17 of 23) 51276 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 150.5-145 chr4 46014015 46014317 + 1 NA Intergenic Intergenic 109888 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 307.25-15 chr2 26019969 26020427 + 1 NA Intergenic Intergenic -13886 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 230.5-55 chr18 2576793 2577150 + 1 NA intron (NM_006101, intron 3 of 16) intron (NM_006101, intron 3 of 16) 5414 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 158.25-52 chr17 80788882 80789136 + 1 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 16623 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 145.25-176 chr8 139783736 139784103 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) L1ME1|LINE|L1 -80796 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 224.5-100 chr7 27929432 27929714 + 1 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 189478 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 213.5-118 chr7 106393285 106393638 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -108478 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 135.5-193 chr7 94274806 94274948 + 1 NA Intergenic Intergenic 117315 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 245.5-39 chr2 192053498 192053899 + 1 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) intron (NM_001305134, intron 5 of 9) 141235 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 175.5-130 chr4 74585906 74586251 + 1 NA Intergenic Intergenic 140942 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 215.5-117 chrX 123339148 123339625 + 1 NA intron (NM_007325, intron 4 of 15) intron (NM_007325, intron 4 of 15) 155108 NM_001256743 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 134.5-187 chr6 47264019 47264199 + 1 NA intron (NM_014452, intron 3 of 5) intron (NM_014452, intron 3 of 5) 45796 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 206.5-46 chr2 43391284 43391603 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 164232 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 204.75-119 chr8 89642091 89642379 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 115476 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 150.5-160 chr4 168032356 168032672 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -60023 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 231.25-10 chr12 2815012 2815373 + 1 NA intron (NR_130744, intron 1 of 13) intron (NR_130744, intron 1 of 13) -2268 NR_146318 283440 Hs.448720 NR_033958 ENSG00000256150 ITFG2-AS1 - ITFG2 antisense RNA 1 ncRNA 163.25-107 chr4 34305751 34306085 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36171 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 126.5-70 chr14 71447606 71447843 + 1 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) AluSx3|SINE|Alu 8785 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 295.5-22 chr19 30492585 30493033 + 1 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 120425 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 376.5-4 chr15 61786832 61787426 + 1 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie 57211 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 316.5-12 chr12 65978003 65978343 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 45553 NR_106722 102464827 NR_106722 ENSG00000276878 MIR6074 hsa-mir-6074 microRNA 6074 ncRNA 215.25-24 chr12 74043726 74044096 + 1 NA Intergenic Intergenic 248720 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 122.5-125 chr2 213117090 213117244 + 1 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) intron (NM_001371277, intron 3 of 6) 33270 NM_001371275 209.5-6 chr1 158854981 158855207 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 23743 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 146.75-22 chr11 11130698 11130951 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 222426 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 149.25-147 chr5 115989814 115989995 + 1 NA intron (NM_173800, intron 4 of 19) intron (NM_173800, intron 4 of 19) 27429 NM_173800 206338 Hs.98288 NM_173800 ENSG00000172901 LVRN APQ|AQPEP|TAQPEP laeverin protein-coding 186.75-24 chr12 122213978 122214360 + 1 NA intron (NM_001371333, intron 5 of 5) intron (NM_001371333, intron 5 of 5) 10460 NM_030765 79369 Hs.363315 NM_030765 ENSG00000176383 B3GNT4 B3GN-T4|beta3Gn-T4 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 protein-coding 191.5-72 chr2 53935616 53935831 + 1 NA intron (NM_014614, intron 7 of 46) intron (NM_014614, intron 7 of 46) 35270 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 196.5-148 chr6 162544175 162544522 + 1 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -182784 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 171.75-73 chr2 38212477 38212780 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 81523 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 174.25-84 chr2 238468924 238469251 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 42160 NM_001040445 51665 Hs.516788 NM_016114 ENSG00000065802 ASB1 ASB-1 ankyrin repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 174.5-118 chr3 12602070 12602381 + 1 NA intron (NR_148942, intron 7 of 16) intron (NR_148942, intron 7 of 16) 45138 NM_014160 23609 Hs.591666 NM_014160 ENSG00000075975 MKRN2 HSPC070|RNF62 makorin ring finger protein 2 protein-coding 190.75-117 chr9 68505505 68505775 + 1 NA intron (NM_021965, intron 10 of 10) MER21C|LTR|ERVL 35227 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 150.25-150 chr8 109350269 109350587 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12033 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 216.75-32 chr18 1071567 1072025 + 1 NA Intergenic Intergenic -143803 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 116.25-4 chr1 42116374 42116649 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36899 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 213.75-69 chr3 119708294 119708512 + 1 NA intron (NM_033364, intron 3 of 17) intron (NM_033364, intron 3 of 17) 5381 NM_033364 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 344.5-15 chr3 179628840 179629293 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -23974 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 168.5-36 chr11 56171259 56171522 + 1 NA Intergenic Intergenic -5228 NM_001005492 282775 Hs.537145 NM_001005492 ENSG00000174957 OR5J2 OR11-266 olfactory receptor family 5 subfamily J member 2 protein-coding 225.5-105 chr8 85081431 85081768 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -25639 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 186.75 chr1 66540960 66541250 + 1 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) intron (NM_001350218, intron 1 of 22) 6952 NM_001350217 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 161.5-27 chr10 115687481 115687678 + 1 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) L1MB1|LINE|L1 507210 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 209.5-113 chr5 11998537 11998800 + 1 NA Intergenic Intergenic -94222 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 156.25-31 chr11 127742207 127742519 + 1 NA Intergenic Intergenic -466403 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 188.5-166 chr9 19146031 19146299 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -18559 NR_038064 123 Hs.3416 NM_001122 ENSG00000147872 PLIN2 ADFP|ADRP perilipin 2 protein-coding 167.75-31 chr11 98537749 98537916 + 1 NA Intergenic Intergenic -483117 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 352.5-22 chr5 9067158 9067782 + 1 NA intron (NM_003966, intron 16 of 22) intron (NM_003966, intron 16 of 22) -13575 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 131.75-211 chr8 72988245 72988428 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -20528 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 206.25-78 chr4 71195662 71195973 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) intron (NM_001098484, intron 1 of 25) 8531 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 128.25-82 chr18 56232141 56232332 + 1 NA Intergenic Intergenic -40974 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 402.75-5 chr4 44005609 44006179 + 1 NA Intergenic Intergenic -10967 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 248.25-46 chr3 47736969 47737261 + 1 NA intron (NM_003074, intron 4 of 27) AluJr|SINE|Alu 44778 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 177.25-40 chr13 30786821 30787046 + 1 NA Intergenic Intergenic -16273 NR_047012 100874158 Hs.577982 NR_047012 ENSG00000237879 LINC00398 - long intergenic non-protein coding RNA 398 ncRNA 167.75-29 chr11 38255799 38256265 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 317431 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 165.75-62 chr17 27458479 27458832 + 1 NA intron (NM_001367810, intron 1 of 18) intron (NM_001367810, intron 1 of 18) 2207 NM_001367810 8844 Hs.133534 NM_014238 ENSG00000141068 KSR1 KSR|RSU2 kinase suppressor of ras 1 protein-coding 129.5-6 chr1 73050231 73050410 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -255850 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 237.75-6 chr10 34502614 34503017 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) intron (NM_001184789, intron 3 of 22) 312481 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 172.25-127 chr6 120189874 120190124 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 174820 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 117.5-86 chr17 68598475 68598670 + 1 NA intron (NM_001243746, intron 1 of 11) intron (NM_001243746, intron 1 of 11) 2795 NM_001243746 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 308.75-25 chr2 182265427 182265889 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -23595 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 172.75-143 chr9 128838603 128838878 + 1 NA intron (NM_001352989, intron 3 of 12) L2b|LINE|L2 7010 NM_001352993 883 Hs.495250 NM_004059 ENSG00000171097 KYAT1 CCBL1|GTK|KAT1|KATI kynurenine aminotransferase 1 protein-coding 131.75-73 chr14 89307258 89307441 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 3 of 6) intron (NM_001085471, intron 3 of 6) 109884 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 241.5-83 chr6 124816613 124816878 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 5 of 6) intron (NM_001040214, intron 5 of 6) -145800 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 136.5-19 chr10 36164419 36164654 + 1 NA Intergenic Intergenic 386234 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 176.25-9 chr1 194041520 194041792 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 736911 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 162.75-146 chr8 111734842 111735093 + 1 NA Intergenic Intergenic 358328 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 145.5 chr1 5679820 5680175 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 182744 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 248.5-9 chr10 67750040 67750444 + 1 NA Intergenic Intergenic -54047 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 159.5-174 chr5 60403634 60403951 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) -31129 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 221.5-63 chr22 26745136 26745462 + 1 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 72456 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 238.25-52 chr3 189140222 189140607 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -31557 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 182.5-123 chr4 102225659 102225855 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 98555 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 159.5-143 chr3 52092135 52092369 + 1 NA intron (NM_001161580, intron 9 of 9) intron (NM_001161580, intron 9 of 9) -27140 NR_027331 100128378 Hs.640106 NM_001123039 LINC00696 C3orf74 long intergenic non-protein coding RNA 696 ncRNA 167.5-159 chr6 55935929 55936169 + 1 NA Intergenic Intergenic -60459 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 284.5-53 chr6 61561326 61561648 + 1 NA intron (NR_146870, intron 14 of 15) L1M1|LINE|L1 -12643 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 206.5-21 chr13 82156672 82156954 + 1 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -929830 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 238.25-35 chr2 35592973 35593427 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 121795 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 219.75-4 chr1 94202554 94202911 + 1 NA exon (NM_001328667, exon 10 of 22) exon (NM_001328667, exon 10 of 22) 34852 NM_004815 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 207.25-39 chr2 70520355 70520718 + 1 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) intron (NM_003236, intron 1 of 5) 32910 NM_001308158 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 273.75-47 chr9 35077388 35077931 + 1 NA intron (NM_004629, intron 4 of 13) intron (NM_004629, intron 4 of 13) 2357 NM_004629 2189 Hs.591084 NM_004629 ENSG00000221829 FANCG FAG|XRCC9 FA complementation group G protein-coding 147.75-5 chr1 61250857 61251125 + 1 NA intron (NR_104180, intron 2 of 3) intron (NR_104180, intron 2 of 3) 2527 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 304.25-9 chr14 53926932 53927709 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21164 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 260.5-38 chr20 55382588 55383003 + 1 NA Intergenic Intergenic -40248 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 187.5-136 chr5 67778289 67778508 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -14815 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 149.5-22 chr10 21139246 21139418 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -34658 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 139.5-52 chr12 124201901 124202224 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu -87102 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 213.5-124 chr8 123174125 123174399 + 1 NA Intergenic Intergenic -4785 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 234.5-81 chr5 156708109 156708503 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -141989 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 243.25-13 chr15 77183097 77183418 + 1 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 42147 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 266.75-11 chr15 57942627 57943116 + 1 NA Intergenic Intergenic 71152 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 162.75-140 chr8 71524064 71524362 + 1 NA intron (NM_001370334, intron 2 of 19) intron (NM_001370334, intron 2 of 19) 23491 NM_172059 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 266.25-44 chr7 143519708 143520020 + 1 NA non-coding (NR_033897, exon 5 of 5) non-coding (NR_033897, exon 5 of 5) -7853 NR_145518 392133 NM_001348289 ENSG00000176510 OR10AC1 OR10AC1P olfactory receptor family 10 subfamily AC member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 123.75-159 chr6 83920193 83920360 + 1 NA intron (NM_016230, intron 7 of 15) intron (NM_016230, intron 7 of 15) 60587 NM_016230 51167 Hs.5741 NM_016230 ENSG00000065615 CYB5R4 NCB5OR|cb5/cb5R|dJ676J13.1 cytochrome b5 reductase 4 protein-coding 159.5-159 chr4 30583522 30583737 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -136740 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 231.5-29 chr14 82285175 82285597 + 1 NA Intergenic Intergenic -357246 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 163.25-109 chr4 64907658 64907847 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 96748 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 219.75-51 chr3 150462352 150462592 + 1 NA non-coding (NR_130136, exon 5 of 5) non-coding (NR_130136, exon 5 of 5) 54174 NR_130136 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 120.5-31 chr11 15848127 15848361 + 1 NA Intergenic Intergenic 121377 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 214.75-40 chr2 100800266 100800623 + 1 NA Intergenic Intergenic -19695 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 150.5-212 chr8 32194226 32194418 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 168104 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 130.25-6 chr1 82452225 82452547 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -450797 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 289.25-32 chr9 7059470 7059826 + 1 NA intron (NM_001353997, intron 17 of 22) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 302298 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 237.5-77 chr5 75275529 75275878 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -38825 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 247.5-29 chr16 6951530 6951910 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 177911 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 154.75-68 chr2 8145919 8146169 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) -169230 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 238.75-12 chr12 14753934 14754192 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 17068 NM_175054 121504 Hs.745457 NM_175054 ENSG00000197837 HIST4H4 H4/p histone cluster 4 H4 protein-coding 300.75-30 chr2 174664986 174665460 + 1 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) 17676 NM_001077269 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 171.5-150 chr8 86489877 86490096 + 1 NA intron (NM_001286719, intron 2 of 8) intron (NM_001286719, intron 2 of 8) 18700 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 242.25-74 chr6 44985311 44985838 + 1 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 212196 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 200.75-95 chr7 18017533 18017898 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 10131 NM_175886 221823 Hs.169284 NM_175886 ENSG00000229937 PRPS1L1 PRPS1|PRPS3|PRPSL|PRS-III phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 like 1 protein-coding 127.5-129 chr2 166469036 166469176 + 1 NA intron (NR_045628, intron 6 of 25) L1M6|LINE|L1 17865 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 255.25-29 chr20 54158947 54159237 + 1 NA exon (NM_001128915, exon 8 of 11) exon (NM_001128915, exon 8 of 11) 14894 NM_001128915 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 134.5-224 chr8 91000194 91000368 + 1 NA intron (NM_018710, intron 5 of 6) L1MEd|LINE|L1 -15043 NM_001190972 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 228.5-31 chr12 83331136 83331455 + 1 NA Intergenic Intergenic 644140 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 239.5-21 chr12 48388995 48389399 + 1 NA Intergenic Intergenic -37951 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 215.5-89 chr5 77563658 77564037 + 1 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -71531 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 133.5-121 chr2 103436084 103436324 + 1 NA Intergenic Intergenic -451775 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 197.75-47 chr2 157661695 157662067 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -33017 NM_001111033 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 116.75-152 chr4 99722648 99722788 + 1 NA Intergenic Intergenic -68039 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 127.75-203 chr9 19152496 19152714 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -24999 NR_038064 123 Hs.3416 NM_001122 ENSG00000147872 PLIN2 ADFP|ADRP perilipin 2 protein-coding 117.75-102 chr2 46636609 46636800 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 19489 NM_014171 9419 Hs.133998 NM_014171 ENSG00000119878 CRIPT HSPC139|SSMDF CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain protein-coding 272.5-47 chr21 26221935 26222395 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -51037 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 177.5-9 chr1 147746577 147746831 + 1 NA Intergenic Intergenic 13898 NM_181703 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 149.75-166 chr8 91459572 91459792 + 1 NA Intergenic Intergenic 210363 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 222.5-62 chr20 14180828 14181210 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 156593 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 301.25-26 chr5 127421206 127421762 + 1 NA intron (NM_001308121, intron 12 of 13) intron (NM_001308121, intron 12 of 13) -96156 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 116.5-218 chr6 122958113 122958292 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -38033 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 122.25-58 chr14 47933608 47933741 + 1 NA Intergenic Intergenic -138660 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 227.25-61 chr5 1737913 1738193 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -29185 NR_036240 100422966 NR_036240 ENSG00000263746 MIR4277 - microRNA 4277 ncRNA 172.25-143 chr9 24424643 24425004 + 1 NA Intergenic Intergenic 120853 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 232.75-9 chr11 44462355 44462831 + 1 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -103070 NM_001024844 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 210.5-60 chr2 21500412 21500765 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 210064 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 295.5-43 chr4 117734744 117735329 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -99365 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 123.5-54 chr13 24842514 24842737 + 1 NA intron (NM_031277, intron 19 of 35) LTR78B|LTR|ERV1 78456 NM_031277 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 148.75-142 chr5 155929266 155929545 + 1 NA Intergenic Intergenic -397352 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 144.5-214 chr8 75317760 75318150 + 1 NA Intergenic Intergenic -39066 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 153.75-13 chr1 226065380 226065640 + 1 NA intron (NM_002107, intron 2 of 3) intron (NM_002107, intron 2 of 3) 2783 NR_002315 440926 Hs.533624 NR_002315 H3F3AP4 p13 H3 histone, family 3A, pseudogene 4 pseudo 275.75-36 chr4 58860092 58860670 + 1 NA Intergenic Intergenic -123901 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 164.5-168 chr5 141692976 141693192 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10854 NM_022481 64411 Hs.726187 NM_022481 ENSG00000120318 ARAP3 CENTD3|DRAG1 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 protein-coding 112.25-87 chr19 38900302 38900540 + 1 NA promoter-TSS (NM_001193286).2 promoter-TSS (NM_001193286).2 452 NM_002503 4793 Hs.9731 NM_002503 ENSG00000104825 NFKBIB IKBB|TRIP9 NFKB inhibitor beta protein-coding 192.5-116 chr6 131746762 131747073 + 1 NA exon (NM_005021, exon 25 of 25) exon (NM_005021, exon 25 of 25) -35900 NM_001145659 643854 Hs.632613 NM_001145659 ENSG00000236761 CTAGE9 - CTAGE family member 9 protein-coding 143.5-181 chr5 163885731 163885965 + 1 NA Intergenic Intergenic 380229 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 239.25-64 chr4 86803326 86803617 + 1 NA intron (NM_080685, intron 42 of 47) AluJr|SINE|Alu 45913 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 243.75-71 chr5 180616835 180617173 + 1 NA intron (NM_002020, intron 21 of 29) intron (NM_002020, intron 21 of 29) -25505 NM_052863 92304 Hs.62492 NM_052863 ENSG00000161055 SCGB3A1 HIN-1|HIN1|LU105|PnSP-2|UGRP2 secretoglobin family 3A member 1 protein-coding 121.5-199 chr4 110090204 110090453 + 1 NA intron (NM_001130721, intron 3 of 4) intron (NM_001130721, intron 3 of 4) 108287 NM_024090 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 131.25-184 chr7 27404755 27404911 + 1 NA Intergenic Intergenic -157604 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 203.75-92 chr6 65616096 65616504 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -36496 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 301.75-15 chr16 8265278 8265648 + 1 NA Intergenic Intergenic 324375 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 121.5-106 chr17 44616113 44616294 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 34146 NR_110661 101927017 Hs.560554 NR_110661 ENSG00000266979 LINC01180 - long intergenic non-protein coding RNA 1180 ncRNA 142.5-84 chr16 78070342 78070571 + 1 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -29198 NM_001291997 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 246.5-18 chr12 71748023 71748427 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6638 NM_014999 23011 Hs.524590 NM_014999 ENSG00000080371 RAB21 - RAB21, member RAS oncogene family protein-coding 162.25-57 chr15 67646001 67646218 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 9 of 21) intron (NM_001206804, intron 9 of 21) 97015 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 168.5-154 chr5 148645765 148646045 + 1 NA intron (NR_104445, intron 1 of 7) intron (NR_104445, intron 1 of 7) 8622 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 272.5-67 chr7 124200443 124200749 + 1 NA Intergenic Intergenic 151500 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 298.75-15 chr14 40283269 40283780 + 1 NA Intergenic Intergenic -671187 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 221.75-22 chr14 66501907 66502316 + 1 NA Intergenic Intergenic -5296 NM_020806 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 215.5-80 chr4 127042359 127042686 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -590435 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 235.75-24 chr14 60114907 60115247 + 1 NA exon (NM_022495, exon 3 of 10) exon (NM_022495, exon 3 of 10) 23154 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 125.75-160 chr6 63489423 63489576 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -82513 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 302.25-17 chr2 190435785 190436179 + 1 NA 5' UTR (NM_017694, exon 3 of 8) 5' UTR (NM_017694, exon 3 of 8) 27627 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 174.25-3 chr1 25504234 25504483 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -39227 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 208.25-90 chr8 65299174 65299542 + 1 NA Intergenic Intergenic -119018 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 264.5-64 chr8 124340177 124340602 + 1 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER34B-int|LTR|ERV1 32310 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 446.5-2 chr14 69630061 69630776 + 1 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 18822 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 148.5-116 chr2 179355007 179355292 + 1 NA Intergenic Intergenic -90317 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 124.5-212 chr7 75738784 75738938 + 1 NA promoter-TSS (NM_001243198) promoter-TSS (NM_001243198) 80 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 181.75-118 chr7 47908819 47909103 + 1 NA intron (NM_138295, intron 8 of 56) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 39530 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 256.5-22 chr15 65565680 65566098 + 1 NA intron (NM_016395, intron 7 of 10) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 35426 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 174.25-66 chr16 63628316 63628620 + 1 NA Intergenic Intergenic 1493595 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 149.25-191 chr9 35981663 35982023 + 1 NA Intergenic Intergenic -23689 NM_019897 56656 Hs.553540 NM_019897 ENSG00000278889 OR2S2 OR37A|OST715 olfactory receptor family 2 subfamily S member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 295.75-27 chr6 125526333 125526779 + 1 NA Intergenic Intergenic -147797 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 190.5-46 chr14 63287636 63287847 + 1 NA intron (NM_020663, intron 4 of 4) intron (NM_020663, intron 4 of 4) 31194 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 198.5-127 chr6 125802333 125802613 + 1 NA intron (NR_126386, intron 1 of 2) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 11513 NM_181782 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 120.25-56 chr13 70052755 70052905 + 1 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) intron (NM_020866, intron 1 of 10) -54383 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 227.5-73 chr3 110239297 110239575 + 1 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 636608 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 130.25-170 chr6 22553445 22553677 + 1 NA Intergenic Intergenic -16005 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 153.5-16 chr1 241068949 241069184 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 3 of 16) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -63206 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 131.5-38 chr12 10489611 10489778 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -16199 NM_001357731 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 287.25-47 chr8 76401085 76401544 + 1 NA Intergenic Intergenic -5340 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 170.5-203 chr9 81410854 81411054 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 278581 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 118.5-17 chr10 20246677 20246836 + 1 NA intron (NM_032812, intron 13 of 13) intron (NM_032812, intron 13 of 13) -305214 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 171.75-11 chr1 219061095 219061433 + 1 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1ME1|LINE|L1 112524 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 150.75-86 chr19 38061504 38061879 + 1 NA intron (NM_015073, intron 2 of 21) (AGAGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -101405 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 113.75-21 chr10 24968213 24968391 + 1 NA Intergenic Intergenic -15696 NM_020200 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 127.5-77 chr14 58139453 58139646 + 1 NA intron (NM_001320173, intron 1 of 4) intron (NM_001320173, intron 1 of 4) 12664 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 151.25-175 chr7 44303449 44303818 + 1 NA intron (NM_172081, intron 1 of 18) L1MC2|LINE|L1 21961 NM_172080 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 214.25-77 chr7 147606175 147606546 + 1 NA intron (NM_014141, intron 11 of 22) intron (NM_014141, intron 11 of 22) -65319 NR_133930 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 288.5-28 chr3 84284692 84285036 + 1 NA Intergenic Intergenic 584711 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 171.5-169 chr9 86856962 86857326 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 90362 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 186.75-56 chr2 132623373 132623672 + 1 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 46683 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 265.75-76 chr9 29307075 29307629 + 1 NA Intergenic Intergenic -93751 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 225.5-83 chr4 118168426 118168778 + 1 NA intron (NM_004784, intron 6 of 13) L1MB1|LINE|L1 -110160 NR_003584 100093630 Hs.535762 NR_003584 ENSG00000269893 SNHG8 LINC00060|NCRNA00060 small nucleolar RNA host gene 8 ncRNA 175.5-16 chr10 57428078 57428511 + 1 NA Intergenic Intergenic -123735 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 239.5-49 chr3 103089338 103089663 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 434616 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 180.5-95 chr3 38489218 38489409 + 1 NA 3' UTR (NM_001106, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001106, exon 11 of 11) -6959 NM_001145464 9941 Hs.517897 NM_005107 ENSG00000157036 EXOG ENDOGL1|ENDOGL2|ENGL|ENGL-a|ENGL-b|ENGLA|ENGLB exo/endonuclease G protein-coding 239.75 chr1 20226116 20226482 + 1 NA Intergenic Intergenic -16796 NR_147205 105376827 Hs.559701 NR_147205 ENSG00000228105 LINC01757 - long intergenic non-protein coding RNA 1757 ncRNA 284.5-73 chrX 77951654 77952181 + 1 NA intron (NM_001282224, intron 1 of 21) L1MC1|LINE|L1 17721 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 157.5-191 chr7 43845575 43845822 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 23819 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 272.5-64 chr7 69865632 69865990 + 1 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 267336 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 165.75-125 chr4 117572914 117573161 + 1 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 144639 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 137.75-131 chr3 51005288 51005504 + 1 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L2a|LINE|L2 330316 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 221.75-23 chr14 67461035 67461428 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19301 NR_049879 100847064 NR_049879 ENSG00000265993 MIR5694 - microRNA 5694 ncRNA 184.75-101 chr7 117935858 117936210 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -62593 NM_001363351 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 131.25-11 chr1 151363036 151363313 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 9531 NM_001258288 8991 Hs.632460 NM_003944 ENSG00000143416 SELENBP1 EHMTO|HEL-S-134P|LPSB|MTO|SBP56|SP56|hSBP selenium binding protein 1 protein-coding 131.75-112 chr2 191204987 191205252 + 1 NA Intergenic Intergenic -40285 NM_001330237 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 143.5-109 chr2 36848342 36848623 + 1 NA 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 118054 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 208.5-44 chr15 66917276 66917642 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 39056 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 190.25-100 chr5 120550759 120551015 + 1 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) intron (NM_001308088, intron 1 of 3) 19423 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 174.25-47 chr14 40371568 40371856 + 1 NA Intergenic Intergenic -582999 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 220.25 chr1 67775751 67776082 + 1 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) intron (NM_018841, intron 2 of 3) -56372 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 184.75-94 chr7 41507433 41507904 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -186251 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 125.25-178 chr6 154264731 154264959 + 1 NA intron (NM_001130699, intron 4 of 12) L3|LINE|CR1 65236 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 125.5-16 chr1 185821311 185821547 + 1 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 87038 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 117.25-213 chr8 121248856 121248994 + 1 NA Intergenic Intergenic -390421 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-70 chr2 54636199 54636530 + 1 NA intron (NM_178313, intron 16 of 30) intron (NM_178313, intron 16 of 30) 77970 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 200.75-78 chr4 125848410 125848794 + 1 NA Intergenic Intergenic 341343 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 121.5-62 chr12 76953881 76954067 + 1 NA Intergenic Intergenic -74955 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 320.5-39 chr7 79460738 79461184 + 1 NA non-coding (NR_038343, exon 4 of 4) non-coding (NR_038343, exon 4 of 4) 7001 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 120.5-165 chr4 63459002 63459151 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 950374 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 124.5-92 chr18 72281613 72281753 + 1 NA Intergenic Intergenic 262659 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 250.5-58 chr22 27059120 27059501 + 1 NA intron (NM_001318329, intron 1 of 1) intron (NM_001318329, intron 1 of 1) 1208 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 196.75-79 chr4 32705486 32705717 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 354563 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 271.75-13 chr16 11737506 11737780 + 1 NA intron (NR_136673, intron 1 of 9) AluSc8|SINE|Alu 5214 NM_001303447 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 136.5-11 chr1 150206299 150206578 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 28240 NM_001136479 81611 Hs.656466 NM_030920 ENSG00000143401 ANP32E LANP-L|LANPL acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E protein-coding 136.75-95 chr2 64560023 64560237 + 1 NA intron (NM_001002243, intron 2 of 8) intron (NM_001002243, intron 2 of 8) 34617 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 124.75-222 chrX 73326567 73326781 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -111823 NM_021963 4674 Hs.66180 NM_021963 ENSG00000186462 NAP1L2 BPX nucleosome assembly protein 1 like 2 protein-coding 139.75-77 chr17 61219206 61219444 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 148379 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 182.5-92 chr20 52668385 52668694 + 1 NA Intergenic Intergenic 47701 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 139.25-73 chr18 79491275 79491424 + 1 NA intron (NM_001278673, intron 8 of 8) intron (NM_001278673, intron 8 of 8) -87933 NR_148949 284240 Hs.448912 NR_148949 LOC284240 - uncharacterized LOC284240 ncRNA 117.5-158 chr4 69696981 69697144 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -43815 NM_001252275 10941 Hs.225950 NM_006798 ENSG00000173610 UGT2A1 UDPGT2A1 UDP glucuronosyltransferase family 2 member A1 complex locus protein-coding 240.75-6 chr10 13635791 13636122 + 1 NA Intergenic Intergenic 48991 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 218.25-35 chr18 66909479 66909845 + 1 NA Intergenic Intergenic -171922 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 130.5-211 chr6 14986567 14986804 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -259384 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 255.75-34 chr3 164792596 164792928 + 1 NA intron (NR_126405, intron 1 of 3) intron (NR_126405, intron 1 of 3) 38718 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 113.5-181 chr4 71635171 71635351 + 1 NA Intergenic Intergenic 148818 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 153.75-149 chr8 53504641 53504852 + 1 NA Intergenic Intergenic 19219 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 118.5-6 chr1 78909695 78909977 + 1 NA intron (NM_022159, intron 12 of 14) L1M5|LINE|L1 96894 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 154.5-75 chr17 28596999 28597241 + 1 NA intron (NM_006461, intron 2 of 23) MER3|DNA|hAT-Charlie 1905 NM_006461 10615 Hs.514033 NM_006461 ENSG00000076382 SPAG5 DEEPEST|MAP126|hMAP126 sperm associated antigen 5 protein-coding 242.75-68 chr8 107987625 107987902 + 1 NA intron (NM_001282863, intron 2 of 4) intron (NM_001282863, intron 2 of 4) 94176 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 379.25-17 chr9 103946094 103946563 + 1 NA Intergenic Intergenic -53381 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 147.25-156 chr9 28383298 28383561 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 335876 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 175.25-82 chr20 50411790 50412017 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -90561 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 125.5-259 chr8 125802003 125802204 + 1 NA Intergenic Intergenic 149094 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 121.5-12 chr1 86038025 86038202 + 1 NA intron (NM_152890, intron 12 of 59) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 118358 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 198.5-101 chr3 158182016 158182311 + 1 NA intron (NM_001271834, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 72074 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 238.75-19 chr14 55609985 55610475 + 1 NA intron (NR_073129, intron 2 of 45) MER8|DNA|TcMar-Tigger 30023 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 172.5-131 chr3 142239119 142239340 + 1 NA Intergenic Intergenic -13644 NM_001039547 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 263.25-64 chrX 40127081 40127375 + 1 NA intron (NM_001123384, intron 1 of 13) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -29270 NM_017745 54880 Hs.659681 NM_017745 ENSG00000183337 BCOR ANOP2|MAA2|MCOPS2 BCL6 corepressor protein-coding 211.75-86 chr6 65136455 65136932 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) AluJb|SINE|Alu -164725 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 201.25-51 chr20 35721571 35721845 + 1 NA intron (NR_040722, intron 10 of 17) intron (NR_040722, intron 10 of 17) 20552 NM_004902 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 177.25-13 chr10 8795314 8795501 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -102582 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 224.25-16 chr10 81074025 81074260 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 424345 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 142.5-79 chr16 57143568 57143730 + 1 NA intron (NM_152727, intron 14 of 15) intron (NM_152727, intron 14 of 15) 38901 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 286.75-13 chr14 50915479 50915951 + 1 NA intron (NM_002863, intron 10 of 19) intron (NM_002863, intron 10 of 19) 28768 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 116.75-198 chr8 88662603 88662730 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -335183 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 147.25-100 chr4 138993595 138993832 + 1 NA intron (NR_133945, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 18933 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 273.5-54 chr4 91484532 91485009 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 792532 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 219.5-60 chr2 8649232 8649668 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32411 NR_110153 100506299 Hs.439031 NR_110153 ENSG00000235092 ID2-AS1 - ID2 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-155 chr7 41166991 41167185 + 1 NA Intergenic Intergenic 65484 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 175.5-76 chr17 76426129 76426462 + 1 NA intron (NM_022066, intron 1 of 17) AluJb|SINE|Alu 26857 NM_022066 63893 Hs.16130 NM_022066 ENSG00000175931 UBE2O E2-230K ubiquitin conjugating enzyme E2 O protein-coding 179.25-101 chr3 76615383 76615616 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -424600 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 170.75-124 chr7 28635636 28635883 + 1 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50374 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 167.5-87 chr2 52871165 52871475 + 1 NA Intergenic Intergenic -168705 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 179.25-153 chr9 88892912 88893238 + 1 NA Intergenic Intergenic -97788 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 293.75-41 chr7 23068463 23068790 + 1 NA Intergenic Intergenic 37077 NR_046220 100775104 NR_046220 ENSG00000230658 KLHL7-DT KLHL7-AS1|PLATAK KLHL7 divergent transcript ncRNA 225.5-44 chr16 59994409 59994819 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 139261 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 181.5-64 chr18 14048375 14048635 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 83930 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 188.25-120 chr8 123518590 123518825 + 1 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 13436 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 139.5-77 chr16 69511879 69512076 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 53891 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 168.5-178 chr8 40570929 40571169 + 1 NA intron (NM_024645, intron 6 of 6) intron (NM_024645, intron 6 of 6) -227686 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 205.5-142 chr7 113121035 113121321 + 1 NA Intergenic Intergenic -2596 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 125.5-199 chr5 36379831 36380019 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -78023 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 165.75-35 chr12 1062418 1062624 + 1 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) L1P4|LINE|L1 34773 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 255.75-11 chr12 114849017 114849549 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -165108 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 230.25-77 chr8 5117611 5117926 + 1 NA Intergenic Intergenic -122854 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 269.75-24 chr15 75651259 75651667 + 1 NA intron (NM_153271, intron 1 of 1) intron (NM_153271, intron 1 of 1) 2456 NM_153271 257364 Hs.8705 NM_153271 ENSG00000173548 SNX33 SH3PX3|SH3PXD3C|SNX30 sorting nexin 33 protein-coding 121.5-72 chr13 88791952 88792224 + 1 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 165235 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 125.25-41 chr11 120311878 120312028 + 1 NA intron (NM_001244682, intron 10 of 12) intron (NM_001244682, intron 10 of 12) -13346 NM_001198674 219902 Hs.643516 NM_174926 ENSG00000181264 TLCD5 TMEM136 TLC domain containing 5 protein-coding 211.75-44 chr2 50669681 50670011 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) (AAATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26416 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 187.25-48 chr18 77170485 77170731 + 1 NA Intergenic Intergenic -37825 NM_001025100 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 241.25-30 chr2 26720877 26721227 + 1 NA intron (NM_002246, intron 1 of 1) intron (NM_002246, intron 1 of 1) 28330 NM_002246 3777 Hs.24040 NM_002246 ENSG00000171303 KCNK3 K2p3.1|OAT1|PPH4|TASK|TASK-1|TBAK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 3 protein-coding 223.25-27 chr18 50029470 50029805 + 1 NA intron (NM_001080467, intron 4 of 39) intron (NM_001080467, intron 4 of 39) 96926 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 250.5-92 chr7 109487676 109488061 + 1 NA Intergenic Intergenic 472345 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 128.5-113 chr2 133624818 133625023 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -56457 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 205.25-93 chr6 93163647 93163937 + 1 NA Intergenic Intergenic 255767 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 206.25-23 chr10 104220206 104220629 + 1 NA intron (NM_025145, intron 3 of 37) L2b|LINE|L2 -1534 NR_030340 693194 NR_030340 ENSG00000208033 MIR609 MIRN609|hsa-mir-609 microRNA 609 ncRNA 117.75-142 chr3 148983826 148984079 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -7456 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 154.5-187 chr8 101996675 101996953 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) 12382 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 163.5-148 chr4 108383792 108384061 + 1 NA Intergenic Intergenic -173307 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 232.75-36 chr20 9300179 9300467 + 1 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) intron (NM_182797, intron 1 of 35) -7477 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 158.5-58 chr14 27722250 27722472 + 1 NA Intergenic Intergenic -49140 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 151.5-140 chr4 70424086 70424348 + 1 NA Intergenic Intergenic -6275 NM_001145006 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 177.5-136 chr5 28140760 28140973 + 1 NA Intergenic Intergenic 146799 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 187.75-94 chr5 138304888 138305449 + 1 NA intron (NM_001790, intron 7 of 13) MER81|DNA|hAT-Blackjack 26636 NM_001790 995 Hs.656 NM_001790 ENSG00000158402 CDC25C CDC25|PPP1R60 cell division cycle 25C protein-coding 206.25-105 chr7 51621507 51621809 + 1 NA Intergenic Intergenic -228402 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 226.5-104 chr8 117513801 117514442 + 1 NA Intergenic Intergenic -6592 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 231.25-71 chr6 130937859 130938270 + 1 NA intron (NR_146620, intron 1 of 12) intron (NR_146620, intron 1 of 12) 32419 NM_001350310 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 236.75-28 chr2 76986082 76986374 + 1 NA intron (NR_110284, intron 1 of 3) LTR90A|LTR|LTR 263 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 166.5-40 chr11 78106385 78106631 + 1 NA intron (NM_001007027, intron 10 of 13) intron (NM_001007027, intron 10 of 13) -26646 NM_001203260 100532726 Hs.407860 NM_001203260 ENSG00000259112 NDUFC2-KCTD14 - NDUFC2-KCTD14 readthrough protein-coding 232.75-61 chr6 150869453 150869882 + 1 NA intron (NM_001350487, intron 1 of 27) intron (NM_001350487, intron 1 of 27) 3181 NM_001350491 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 231.5-89 chr7 27720867 27721174 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -18353 NM_001206901 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 224.5-33 chr14 46169998 46170287 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 105983 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 158.5-112 chr2 222924943 222925169 + 1 NA intron (NM_004457, intron 11 of 16) AluSx|SINE|Alu 64020 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 144.25-133 chr3 190908689 190908938 + 1 NA Intergenic Intergenic 30883 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 191.25-109 chr8 117762406 117762778 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 158321 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 117.75-176 chr5 102557663 102557845 + 1 NA Intergenic Intergenic -23614 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 147.5-47 chr12 33181843 33182141 + 1 NA Intergenic Intergenic 257827 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 375.75-20 chr9 21984924 21985609 + 1 NA intron (NM_001363763, intron 1 of 2) intron (NM_001363763, intron 1 of 2) 9225 NM_058195 1029 Hs.512599 NM_000077 ENSG00000147889 CDKN2A ARF|CDK4I|CDKN2|CMM2|INK4|INK4A|MLM|MTS-1|MTS1|P14|P14ARF|P16|P16-INK4A|P16INK4|P16INK4A|P19|P19ARF|TP16 cyclin dependent kinase inhibitor 2A protein-coding 206.5-11 chr11 44757289 44757584 + 1 NA intron (NM_130783, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 30474 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 159.75-91 chr2 227042917 227043270 + 1 NA exon (NM_000092, exon 36 of 48) exon (NM_000092, exon 36 of 48) 121466 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 133.5-279 chr9 69009639 69009844 + 1 NA TTS (NM_001278253) TTS (NM_001278253) 4382 NM_002732 5568 Hs.158029 NM_002732 ENSG00000165059 PRKACG BDPLT19|KAPG|PKACg protein kinase cAMP-activated catalytic subunit gamma protein-coding 179.5-101 chr2 207683935 207684173 + 1 NA Intergenic Intergenic 21624 NR_135567 102724714 Hs.443475 NR_135566 ENSG00000224137 LINC01857 - long intergenic non-protein coding RNA 1857 ncRNA 236.25-25 chr14 40498696 40498998 + 1 NA Intergenic Intergenic -455864 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 265.5-56 chr7 1698646 1699145 + 1 NA intron (NM_001128636, intron 1 of 2) L1ME3A|LINE|L1 10776 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 191.75-85 chr3 155444095 155444382 + 1 NA Intergenic Intergenic -41565 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 210.25-2 chr1 48651390 48651737 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 8 of 12) intron (NM_001323575, intron 8 of 12) 125328 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 229.25-2 chr1 63571863 63572228 + 1 NA intron (NM_032437, intron 13 of 13) intron (NM_032437, intron 13 of 13) -21366 NM_002633 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 176.75-122 chr8 79330728 79331041 + 1 NA Intergenic Intergenic -1304 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 194.75-47 chr2 6792564 6793033 + 1 NA Intergenic Intergenic -22487 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 232.25-31 chr2 59742519 59742972 + 1 NA Intergenic Intergenic 525037 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 171.5-41 chr12 114979906 114980193 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -295874 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 309.25-20 chr4 66192096 66192667 + 1 NA Intergenic Intergenic -84443 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 226.5-34 chr18 35634287 35634625 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -20113 NM_020474 2589 Hs.514806 NM_020474 ENSG00000141429 GALNT1 GALNAC-T1 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 157.5-26 chr10 75125864 75126052 + 1 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) intron (NM_144660, intron 1 of 4) 14302 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 203.5-79 chr2 226864170 226864553 + 1 NA intron (NM_001167608, intron 3 of 8) intron (NM_001167608, intron 3 of 8) 28307 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 450.25 chr11 46180494 46181359 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 8971 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 271.75-5 chr10 26917467 26917890 + 1 NA Intergenic Intergenic 24323 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 145.5-22 chr10 58112577 58112785 + 1 NA Intergenic Intergenic 155213 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 118.5-33 chr11 55542836 55542982 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11360 NM_001001920 81309 NM_001001920 ENSG00000181939 OR4C15 OR11-127|OR11-134 olfactory receptor family 4 subfamily C member 15 protein-coding 256.5-37 chr2 193678788 193679149 + 1 NA Intergenic Intergenic -665301 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 222.75-92 chr7 125908074 125908337 + 1 NA Intergenic Intergenic -643914 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 139.25-54 chr14 70267934 70268184 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -20258 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 176.5-116 chr3 7746992 7747298 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -211861 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-115 chr21 29032597 29032980 + 1 NA intron (NM_001032410, intron 4 of 18) L1MD2|LINE|L1 8120 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 299.5-23 chr20 53669270 53669666 + 1 NA Intergenic LTR9B|LTR|ERV1 61114 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 251.75-17 chr12 7638996 7639270 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 26775 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 156.25-95 chr3 62986037 62986215 + 1 NA Intergenic Intergenic -110710 NM_183393 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 123.75-162 chr6 129935047 129935286 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -73851 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 154.75-90 chr3 83899686 83900026 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 969719 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 215.5-18 chr11 3801115 3801369 + 1 NA intron (NR_027017, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 3344 NM_001346401 27315 Hs.133968 NM_014489 ENSG00000148985 PGAP2 CWH43-N|FRAG1|HPMRS3|MRT17|MRT21 post-GPI attachment to proteins 2 protein-coding 182.25-100 chr6 81605703 81605922 + 1 NA Intergenic Intergenic 146869 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 139.75-78 chr17 71856391 71856714 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 169427 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 183.25-118 chr9 33175665 33176043 + 1 NA intron (NR_108108, intron 1 of 3) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 7995 NR_108108 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 321.5-39 chr9 35535899 35536283 + 1 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) -2541 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 119.75-16 chr1 225081300 225081533 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 19 of 85) intron (NM_001367479, intron 19 of 85) 151741 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 147.25-93 chr3 196180022 196180361 + 1 NA Intergenic Intergenic 31209 NM_001039617 131540 Hs.111591 NM_001039617 ENSG00000163958 ZDHHC19 DHHC19 zinc finger DHHC-type containing 19 protein-coding 195.5-110 chr4 164044582 164044777 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 153032 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 129.25-5 chr1 77674169 77674440 + 1 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) L1ME3A|LINE|L1 8354 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 134.5-236 chr8 141312010 141312209 + 1 NA Intergenic Intergenic -28440 NR_024441 731779 Hs.586414 NR_024441 ENSG00000253595 LINC01300 - long intergenic non-protein coding RNA 1300 ncRNA 252.5-69 chr5 170273162 170273604 + 1 NA intron (NM_005565, intron 6 of 20) intron (NM_005565, intron 6 of 20) 24394 NM_005565 3937 Hs.304475 NM_005565 ENSG00000043462 LCP2 SLP-76|SLP76 lymphocyte cytosolic protein 2 protein-coding 140.25-133 chr4 100595430 100595657 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -77521 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 239.5-52 chr4 32699550 32699967 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 348720 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 137.5-30 chr10 66029626 66029890 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) L2a|LINE|L2 458333 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 279.75-23 chr2 109290177 109290862 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 23106 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 137.75-75 chr15 68556908 68557129 + 1 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -21975 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 251.75-40 chr2 145282719 145283196 + 1 NA Intergenic Intergenic 614990 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 190.25-95 chr4 137388076 137388347 + 1 NA Intergenic Intergenic 144283 NM_001300828 54510 Hs.591691 NM_019035 ENSG00000189184 PCDH18 PCDH68L protocadherin 18 protein-coding 124.75-115 chr2 42653548 42653797 + 1 NA intron (NM_001330443, intron 6 of 16) intron (NM_001330443, intron 6 of 16) 85040 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 160.5-206 chr9 35502258 35502518 + 1 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) 12277 NR_052015 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 196.5-129 chr5 105750001 105750332 + 1 NA Intergenic Intergenic 650692 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 172.5-162 chr5 170074651 170074873 + 1 NA intron (NR_156756, intron 47 of 52) HAL1|LINE|L1 -31135 NM_012188 2299 Hs.87236 NM_012188 ENSG00000168269 FOXI1 FKH10|FKHL10|FREAC-6|FREAC6|HFH-3|HFH3 forkhead box I1 protein-coding 176.75-14 chr10 13796312 13796621 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 4 of 23) intron (NM_001318336, intron 4 of 23) -88899 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 134.5-56 chr14 25505293 25505558 + 1 NA Intergenic Intergenic -455128 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 220.5-96 chr5 17714196 17714589 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -58754 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 186.75-102 chr7 4277822 4278061 + 1 NA Intergenic Intergenic -143104 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 169.5-63 chr17 64564262 64564479 + 1 NA intron (NM_022739, intron 10 of 18) L1ME1|LINE|L1 57393 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 282.5-12 chr11 112716117 112716557 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -160535 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 214.75-76 chr7 25302185 25302550 + 1 NA Intergenic Intergenic -73881 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 195.5-145 chr7 26610429 26610776 + 1 NA Intergenic Intergenic -27269 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 121.5-34 chr10 97659193 97659372 + 1 NA intron (NM_018425, intron 4 of 8) AluJo|SINE|Alu 18596 NM_018425 55361 Hs.25300 NM_018425 ENSG00000155252 PI4K2A PI4KII|PIK42A phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha protein-coding 133.25-155 chr4 103966156 103966541 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -246363 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 180.25-57 chr2 212972662 212972995 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -46492 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 114.5-123 chr19 29306891 29307123 + 1 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L1ME3C|LINE|L1 -93856 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 213.25-18 chr15 61755787 61756265 + 1 NA Intergenic Intergenic 26108 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 186.75-60 chr20 845601 845884 + 1 NA 3' UTR (NM_001289146, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001289146, exon 2 of 2) 1099 NM_031424 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 135.5-160 chr5 52579721 52580019 + 1 NA Intergenic Intergenic -208046 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 141.5-232 chr8 102119154 102119338 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 5088 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 183.5-140 chr7 84256786 84257119 + 1 NA Intergenic Intergenic -62163 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 259.5-15 chr10 62180067 62180459 + 1 NA Intergenic Intergenic 88581 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 120.5-23 chr10 51366757 51366989 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 67300 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 315.25 chr1 77756581 77757060 + 1 NA intron (NM_015017, intron 1 of 24) intron (NM_015017, intron 1 of 24) 3032 NM_201626 23032 Hs.480597 NM_015017 ENSG00000077254 USP33 VDU1 ubiquitin specific peptidase 33 protein-coding 205.25-75 chr4 34512133 34512486 + 1 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 -242562 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 191.75-83 chr3 104202359 104202729 + 1 NA Intergenic Intergenic -678428 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 338.25-17 chr22 33563926 33564393 + 1 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -127490 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 134.5-157 chr4 74419374 74419579 + 1 NA Intergenic Intergenic -25660 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 166.75-78 chr2 135787125 135787410 + 1 NA TTS (NM_002299) TTS (NM_002299) -32924 NR_045486 100507600 Hs.662020 NR_045486 ENSG00000226806 LOC100507600 - uncharacterized LOC100507600 ncRNA 185.5-156 chr8 26678598 26678950 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 100369 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 119.75-194 chr7 135836892 135837121 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -88193 NM_001369697 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 164.75-4 chr1 90898784 90899170 + 1 NA Intergenic Intergenic 47218 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 116.75-61 chr14 82191891 82192210 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -448912 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 228.25-62 chr4 169686338 169686730 + 1 NA intron (NM_173872, intron 3 of 13) AluSg|SINE|Alu 26472 NM_001243374 1182 Hs.481186 NM_001829 ENSG00000109572 CLCN3 CLC3|ClC-3 chloride voltage-gated channel 3 protein-coding 130.5-97 chr15 34177893 34178122 + 1 NA intron (NM_024713, intron 1 of 9) intron (NM_024713, intron 1 of 9) 32089 NM_024713 79768 Hs.633566 NM_024713 ENSG00000134152 KATNBL1 C15orf29 katanin regulatory subunit B1 like 1 protein-coding 204.25-66 chr21 31349301 31349574 + 1 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -5083 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 167.5-80 chr18 22490546 22490917 + 1 NA Intergenic Intergenic -72816 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 119.75-140 chr3 81877812 81878072 + 1 NA Intergenic Intergenic -108200 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 125.5-34 chr10 100244318 100244471 + 1 NA intron (NM_001303404, intron 9 of 12) AluY|SINE|Alu -7092 NR_002954 677800 Hs.662165 NR_002954 ENSG00000212464 SNORA12 U108 small nucleolar RNA, H/ACA box 12 snoRNA 127.5-120 chr2 101393605 101393794 + 1 NA Intergenic Intergenic -6196 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 166.5-26 chr10 21420849 21421122 + 1 NA Intergenic Intergenic -48035 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 271.5-63 chr4 113933854 113934392 + 1 NA intron (NM_001354211, intron 4 of 6) L1MA4|LINE|L1 45524 NM_001354210 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 253.5-7 chr1 226440717 226441207 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -32869 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 169.5-161 chr7 48099360 48099635 + 1 NA intron (NM_001287430, intron 3 of 5) intron (NM_001287430, intron 3 of 5) 10232 NM_003364 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 154.5-158 chr6 51286669 51286965 + 1 NA Intergenic Intergenic -335053 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 166.5-187 chr7 28942511 28942737 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 15706 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 126.5-196 chr5 120288271 120288412 + 1 NA Intergenic Intergenic -175937 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 175.25-9 chr1 185805683 185805961 + 1 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 71431 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 183.5-118 chr5 123624112 123624410 + 1 NA Intergenic Intergenic 78844 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 211.5-98 chr3 60015522 60015802 + 1 NA intron (NM_001320901, intron 2 of 6) intron (NM_001320901, intron 2 of 6) 65247 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 224.25-49 chr2 219065455 219065854 + 1 NA Intergenic Intergenic -4733 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 255.5-40 chr2 43957106 43957526 + 1 NA intron (NM_133259, intron 14 of 37) intron (NM_133259, intron 14 of 37) 38673 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 131.5-119 chr2 113026741 113026981 + 1 NA TTS (NM_173178) TTS (NM_173178) 21402 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 174.5-64 chr14 61874388 61874636 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) -53183 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 140.5-22 chr10 118373560 118373751 + 1 NA Intergenic Intergenic 16547 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 160.25-18 chr11 130318818 130319119 + 1 NA intron (NR_148980, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 3975 NR_148980 646383 Hs.155288 NM_001039787 ENSG00000175773 ZBTB44-DT - ZBTB44 divergent transcript ncRNA 130.5-77 chr12 47027582 47027824 + 1 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -51900 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 158.25-77 chr20 45804632 45804816 + 1 NA intron (NM_052951, intron 8 of 12) L2b|LINE|L2 -7852 NM_001281742 11065 Hs.93002 NM_007019 ENSG00000175063 UBE2C UBCH10|dJ447F3.2 ubiquitin conjugating enzyme E2 C protein-coding 122.25-74 chr17 60908245 60908407 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 11 of 25) intron (NM_001330413, intron 11 of 25) 230475 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 160.5-168 chr7 5378754 5378931 + 1 NA intron (NM_001080495, intron 5 of 29) intron (NM_001080495, intron 5 of 29) 44704 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 261.75-50 chr8 10118742 10119239 + 1 NA intron (NM_001199729, intron 2 of 6) intron (NM_001199729, intron 2 of 6) 23339 NM_001199729 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 312.5-16 chr2 84704517 84705167 + 1 NA intron (NM_001370, intron 51 of 76) intron (NM_001370, intron 51 of 76) 176242 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 121.5-149 chr2 196479729 196479936 + 1 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) 113151 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 170.25-13 chr10 80969621 80969870 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 319948 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 224.5-62 chr2 89848914 89849347 + 1 NA Intergenic Intergenic -211223 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 198.5-110 chr4 167282209 167282477 + 1 NA Intergenic Intergenic -47753 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 150.75-9 chr1 62003148 62003330 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 28 of 43) intron (NM_001350145, intron 28 of 43) -75547 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 163.5-126 chr3 65337594 65337831 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -556104 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 276.5-5 chr1 165279867 165280321 + 1 NA intron (NM_177398, intron 3 of 8) intron (NM_177398, intron 3 of 8) 76147 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 212.5 chr1 7727608 7728026 + 1 NA intron (NM_001349624, intron 1 of 11) intron (NM_001349624, intron 1 of 11) 23081 NM_001349626 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 173.5-41 chr14 73323458 73323654 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) intron (NM_001005743, intron 4 of 12) -77555 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 249.5-22 chr12 44832023 44832440 + 1 NA intron (NM_006159, intron 3 of 20) intron (NM_006159, intron 3 of 20) 43430 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 211.75-67 chr4 86398466 86398799 + 1 NA intron (NM_002753, intron 1 of 13) L1PA16|LINE|L1 -27765 NM_001318068 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 216.75-60 chr5 19002657 19002968 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 883460 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 211.5-132 chr6 90035814 90036226 + 1 NA intron (NM_021813, intron 5 of 8) intron (NM_021813, intron 5 of 8) 141551 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 131.5-52 chr13 75468122 75468326 + 1 NA intron (NM_001286658, intron 1 of 19) intron (NM_001286658, intron 1 of 19) 13944 NM_001286658 9882 Hs.210891 NM_014832 ENSG00000136111 TBC1D4 AS160|NIDDM5 TBC1 domain family member 4 protein-coding 223.25-32 chr2 23244349 23244647 + 1 NA Intergenic Intergenic -140681 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 189.5-114 chr5 157188955 157189315 + 1 NA intron (NM_005546, intron 1 of 16) intron (NM_005546, intron 1 of 16) 8239 NM_005546 3702 Hs.558348 NM_005546 ENSG00000113263 ITK EMT|LPFS1|LYK|PSCTK2 IL2 inducible T cell kinase protein-coding 115.5-123 chr2 68153469 68153613 + 1 NA intron (NR_046234, intron 1 of 6) MER5B|DNA|hAT-Charlie 3986 NM_001256476 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 192.5-31 chr12 6178950 6179152 + 1 NA Intergenic Intergenic -20895 NM_001330312 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 153.5-181 chr7 42901815 42902070 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 9901 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 150.5-5 chr1 75914947 75915319 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 17271 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 202.75-24 chr12 32206252 32206523 + 1 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) AluSx|SINE|Alu 99540 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 141.75-96 chr2 103815238 103815541 + 1 NA Intergenic Intergenic 592943 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 198.75-8 chr1 210099966 210100291 + 1 NA non-coding (NR_027459, exon 7 of 9) non-coding (NR_027459, exon 7 of 9) -132668 NM_001354173 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 156.5-197 chr8 127711890 127712150 + 1 NA intron (NR_117102, intron 2 of 3) L1MD3|LINE|L1 21947 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 155.5-75 chr17 62878263 62878511 + 1 NA Intergenic Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -65828 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 270.75-12 chr12 5884115 5884606 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) intron (NM_001278596, intron 3 of 25) 60899 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 155.25-164 chr7 53802305 53802570 + 1 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) intron (NR_038371, intron 1 of 5) 9494 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 166.5-182 chr6 135131273 135131551 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49896 NM_001161659 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 198.75-4 chr1 84139010 84139280 + 1 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) L1MD|LINE|L1 -5126 NM_182948 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 130.5-12 chr1 67812240 67812469 + 1 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR -19934 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 205.75-32 chr18 3218639 3218900 + 1 NA intron (NM_019856, intron 1 of 36) intron (NM_019856, intron 1 of 36) 1199 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 118.5-169 chr5 121656780 121656968 + 1 NA Intergenic Intergenic -195008 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 173.5-31 chr11 104459317 104459624 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 149832 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 189.5-110 chr5 82491698 82491997 + 1 NA Intergenic Intergenic 212385 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 150.75-189 chr8 125749172 125749426 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 201898 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 201.5-99 chr4 80849053 80849454 + 1 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -181455 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 159.5-217 chr9 31758802 31759005 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -377413 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 221.5-50 chr2 146639458 146639752 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 52548 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 118.75-180 chr7 53809194 53809467 + 1 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) intron (NR_038371, intron 1 of 5) 2601 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 160.25-59 chr18 4777301 4777540 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -303762 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 271.5-43 chr2 187959151 187959682 + 1 NA Intergenic Intergenic 328275 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 180.5-38 chr14 63979274 63979728 + 1 NA intron (NM_015180, intron 14 of 114) intron (NM_015180, intron 14 of 114) 115624 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 183.75-38 chr14 40555911 40556130 + 1 NA Intergenic Intergenic -398691 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 139.5-113 chr2 230223781 230224023 + 1 NA intron (NM_001185015, intron 1 of 15) intron (NM_001185015, intron 1 of 15) 1734 NM_001185015 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 139.5-190 chr6 66160332 66160545 + 1 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 372559 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 266.5-25 chr16 13256059 13256780 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 354821 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 151.5-5 chr1 76716877 76717243 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 62207 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 124.5-204 chr7 32550989 32551117 + 1 NA intron (NM_015060, intron 4 of 15) MIR|SINE|MIR 55564 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 212.5-77 chr4 5340932 5341182 + 1 NA intron (NM_001306082, intron 5 of 12) intron (NM_001306082, intron 5 of 12) -183512 NR_126519 10141 Hs.177972 NM_005750 ENSG00000082929 LINC01587 C4orf6|aC1 long intergenic non-protein coding RNA 1587 ncRNA 142.5-186 chr6 52352563 52352752 + 1 NA Intergenic Intergenic -9494 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 254.5-83 chr9 81552948 81553342 + 1 NA Intergenic Intergenic 136390 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 120.25-128 chr3 25627551 25627767 + 1 NA intron (NM_001330700, intron 15 of 35) L1MC5a|LINE|L1 36713 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 246.25-8 chr10 119593715 119594253 + 1 NA intron (NM_001323970, intron 1 of 12) intron (NM_001323970, intron 1 of 12) 3045 NM_001323969 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 149.75-54 chr15 86837904 86838084 + 1 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -94886 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 136.75-177 chr6 157984098 157984461 + 1 NA intron (NM_003898, intron 1 of 26) intron (NM_003898, intron 1 of 26) 2416 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 113.5-115 chr2 17782495 17782645 + 1 NA 3' UTR (NM_001130009, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001130009, exon 14 of 14) 28432 NM_001130009 348654 Hs.467793 NM_182625 ENSG00000178295 GEN1 Gen GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease protein-coding 221.5-59 chr20 56994471 56994744 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -219089 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 161.25-114 chr22 44767039 44767308 + 1 NA intron (NM_181335, intron 1 of 11) intron (NM_181335, intron 1 of 11) 14615 NM_181335 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 170.5-31 chr11 8164431 8164636 + 1 NA intron (NM_001346692, intron 1 of 6) AluJr4|SINE|Alu 4492 NM_001135109 79608 Hs.231850 NM_024557 ENSG00000166405 RIC3 AYST720|PRO1385 RIC3 acetylcholine receptor chaperone protein-coding 119.25-190 chr7 39639775 39640077 + 1 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) MER6B|DNA|TcMar-Tigger 16354 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 164.5-163 chr5 68753701 68753956 + 1 NA Intergenic Intergenic 276099 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 211.5-112 chr4 33933239 33933674 + 1 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) intron (NR_125902, intron 4 of 4) 106437 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 169.25-88 chr4 96368344 96368540 + 1 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) L1P4|LINE|L1 57739 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 128.5-238 chr9 74995159 74995402 + 1 NA intron (NR_121183, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 31871 NM_001320497 138199 Hs.567688 NM_152420 ENSG00000156017 CARNMT1 C9orf41|UPF0586 carnosine N-methyltransferase 1 protein-coding 169.5-82 chr2 181815353 181815614 + 1 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -76247 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 128.75-201 chr8 104030220 104030366 + 1 NA intron (NR_145710, intron 24 of 29) FLAM_A|SINE|Alu -193042 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 222.75-86 chr7 27696231 27696702 + 1 NA Intergenic Intergenic -33583 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 199.25-85 chr6 73734762 73735146 + 1 NA intron (NM_001159587, intron 4 of 32) intron (NM_001159587, intron 4 of 32) 38751 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 188.25-32 chr12 90894419 90894826 + 1 NA Intergenic Intergenic -23401 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 321.75-9 chr14 68178648 68179279 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 355371 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 341.5-3 chr12 130895508 130895961 + 1 NA Intergenic Intergenic 23668 NM_006325 5901 Hs.10842 NM_006325 ENSG00000132341 RAN ARA24|Gsp1|TC4 RAN, member RAS oncogene family protein-coding 147.5-11 chr1 203731079 203731402 + 1 NA non-coding (NR_046213, exon 1 of 1) non-coding (NR_046213, exon 1 of 1) 663 NR_046213 84719 Hs.661178 NM_032633 LINC00260 C1orf217|NCRNA00260 long intergenic non-protein coding RNA 260 ncRNA 195.5-163 chr8 141807144 141807475 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -20996 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 224.5-37 chr14 57747400 57747870 + 1 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1MC5|LINE|L1 117364 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 250.75-50 chr4 67941033 67941409 + 1 NA intron (NM_001114387, intron 3 of 9) intron (NM_001114387, intron 3 of 9) 22272 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 140.25-42 chr12 127500064 127500255 + 1 NA Intergenic Intergenic 136308 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 134.5-6 chr1 60299912 60300095 + 1 NA Intergenic Intergenic -226233 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 161.25-14 chr10 32004847 32005048 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 51478 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 117.5-88 chr18 9938920 9939108 + 1 NA intron (NM_194434, intron 4 of 5) L1MC5|LINE|L1 24998 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 159.5-32 chr11 41004823 41005138 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 454656 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 233.5-41 chr17 64578349 64578636 + 1 NA exon (NM_022739, exon 9 of 19) exon (NM_022739, exon 9 of 19) 71515 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 150.75-63 chr15 35101345 35101574 + 1 NA Intergenic Intergenic -16051 NM_001355281 388112 Hs.635882 NM_001355281 ENSG00000255192 NANOGP8 NANOGP1|PN8 Nanog homeobox retrogene P8 protein-coding 131.25-181 chr6 148495733 148496049 + 1 NA intron (NM_001346506, intron 9 of 20) AluSx|SINE|Alu -12608 NM_001346508 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 251.5-68 chr5 106648303 106648746 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 362490 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 211.25-80 chr7 24662887 24663491 + 1 NA intron (NM_016447, intron 6 of 12) intron (NM_016447, intron 6 of 12) 89737 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 147.5-120 chr20 22337162 22337335 + 1 NA Intergenic Intergenic -54447 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 212.5-81 chr4 125359647 125359988 + 1 NA intron (NM_001291303, intron 1 of 16) intron (NM_001291303, intron 1 of 16) 43405 NM_001291285 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 389.75-4 chr4 91131625 91132200 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR 896881 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 204.5-111 chr5 170603209 170603543 + 1 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) intron (NM_001278339, intron 1 of 7) 78094 NR_136214 105377716 Hs.570880 NR_136214 ENSG00000253591 LOC105377716 - uncharacterized LOC105377716 ncRNA 181.5-168 chr9 86288785 86289037 + 1 NA intron (NM_001185059, intron 26 of 26) intron (NM_001185059, intron 26 of 26) -6373 NM_030940 81689 Hs.449291 NM_030940 ENSG00000135070 ISCA1 HBLD2|ISA1|MMDS5|hIscA iron-sulfur cluster assembly 1 protein-coding 185.5-102 chr3 61554541 61554917 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -6842 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 134.5-64 chr14 64225682 64225853 + 1 NA TTS (NM_001291712) TTS (NM_001291712) 9813 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 252.25-64 chr8 127287164 127287565 + 1 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 42727 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 285.25-44 chrX 86689693 86690242 + 1 NA intron (NM_001139515, intron 4 of 11) intron (NM_001139515, intron 4 of 11) 426999 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 292.25-40 chr7 26905996 26906403 + 1 NA Intergenic Intergenic -41609 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 300.5-4 chr1 95936051 95936421 + 1 NA Intergenic Intergenic -55832 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 212.5-116 chr8 62183136 62183508 + 1 NA Intergenic Intergenic -65532 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 247.5-73 chr6 97943591 97943857 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -80807 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 160.75-115 chr5 10084738 10085081 + 1 NA Intergenic Intergenic 164979 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 123.5-143 chr3 148838441 148838673 + 1 NA intron (NM_001871, intron 3 of 10) (TTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10746 NM_001871 1360 Hs.477891 NM_001871 ENSG00000153002 CPB1 CPB|PASP|PCPB carboxypeptidase B1 protein-coding 168.25-147 chr8 138993343 138993649 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -79455 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 153.25-66 chr2 41716264 41716523 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -161162 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 183.5-51 chr16 61345276 61345547 + 1 NA Intergenic Intergenic -289645 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 141.5-134 chr22 29484739 29484915 + 1 NA intron (NM_021076, intron 2 of 3) intron (NM_021076, intron 2 of 3) 4609 NM_021076 4744 Hs.198760 NM_021076 ENSG00000100285 NEFH CMT2CC|NFH neurofilament heavy protein-coding 196.5-161 chr8 82591499 82591836 + 1 NA Intergenic Intergenic -320437 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 124.75-57 chr12 46676557 46676869 + 1 NA Intergenic Intergenic 149284 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 210.75-46 chr2 181943605 181943956 + 1 NA Intergenic Intergenic -10461 NR_048567 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 122.75-166 chr5 98968446 98968691 + 1 NA intron (NR_151718, intron 1 of 3) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -38854 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 160.25-109 chr4 35394481 35394669 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 849364 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 230.5-107 chr7 97503497 97503961 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -228357 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 126.25-128 chr4 75703825 75704106 + 1 NA Intergenic Intergenic -20557 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 127.75-41 chr11 11321093 11321346 + 1 NA intron (NM_001363464, intron 8 of 9) L1ME3|LINE|L1 32031 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 274.75-34 chr3 95940226 95940653 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -257246 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 219.5-74 chr2 225636359 225636728 + 1 NA intron (NM_001371273, intron 6 of 7) L1P2|LINE|L1 235657 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 183.5-92 chr3 125122807 125123147 + 1 NA intron (NM_001195483, intron 5 of 12) HAL1ME|LINE|L1 28575 NR_049815 100847039 NR_049815 ENSG00000264986 MIR5092 - microRNA 5092 ncRNA 236.25-69 chr5 35764623 35764991 + 1 NA intron (NM_024867, intron 26 of 36) intron (NM_024867, intron 26 of 36) -92084 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 234.5-44 chr2 108904506 108904982 + 1 NA intron (NM_022336, intron 11 of 11) L1MD1|LINE|L1 84476 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 171.75-87 chr20 31063073 31063362 + 1 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -194447 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 180.5-131 chr6 103254944 103255134 + 1 NA Intergenic Intergenic 1604507 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 241.5-74 chr4 70820032 70820423 + 1 NA 3' UTR (NM_002092, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_002092, exon 10 of 10) 19276 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 367.75-9 chr2 122516817 122517259 + 1 NA Intergenic Intergenic 556443 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 148.25-62 chr18 69166117 69166358 + 1 NA Intergenic Intergenic -234651 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 164.5-13 chr1 155869964 155870158 + 1 NA intron (NM_152280, intron 2 of 3) intron (NM_152280, intron 2 of 3) 10494 NM_152280 23208 Hs.32984 NM_152280 ENSG00000132718 SYT11 SYT12|sytXI synaptotagmin 11 protein-coding 158.25-60 chr2 98731898 98732128 + 1 NA promoter-TSS (NM_012214) promoter-TSS (NM_012214) -881 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 112.5-96 chr18 11552985 11553119 + 1 NA Intergenic Intergenic -56506 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 183.5-26 chr10 117818713 117819021 + 1 NA Intergenic Intergenic -227954 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 272.5-53 chr5 24982874 24983256 + 1 NA Intergenic Intergenic -142482 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 143.5-212 chr8 96989878 96990073 + 1 NA intron (NM_016134, intron 5 of 7) intron (NM_016134, intron 5 of 7) 287953 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 169.75-168 chr9 136573967 136574367 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 26325 NR_121577 101928483 Hs.170035 NR_121577 NALT1 LINC01573|MIR4674HG|NALT|TCONS_l2_00029132 NOTCH1 associated lncRNA in T cell acute lymphoblastic leukemia 1 ncRNA 222.25-55 chr4 30645914 30646279 + 1 NA Intergenic Intergenic -74273 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 154.25-99 chr20 52339863 52340156 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -148024 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 205.5-146 chr8 85949903 85950213 + 1 NA Intergenic Intergenic 119610 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 164.75-80 chr2 145788611 145788909 + 1 NA Intergenic Intergenic -798297 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 161.25-81 chr19 33785650 33785986 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -11052 NM_001129995 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 185.25-71 chr20 32135680 32135894 + 1 NA intron (NM_001363731, intron 2 of 17) L1ME4c|LINE|L1 26059 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 200.75-77 chr4 119963756 119964092 + 1 NA non-coding (NR_121639, exon 2 of 2) non-coding (NR_121639, exon 2 of 2) 24384 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 154.75-121 chr5 154096378 154096667 + 1 NA Intergenic Intergenic 57555 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 120.5-238 chr9 9290841 9291076 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 432940 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 238.5-47 chr2 186643143 186643445 + 1 NA intron (NM_001145000, intron 10 of 27) intron (NM_001145000, intron 10 of 27) 43089 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 220.25-16 chr14 87174011 87174270 + 1 NA Intergenic Intergenic 268362 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 299.5-6 chr11 98645907 98646472 + 1 NA Intergenic Intergenic -374760 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 159.25-96 chr4 13108569 13108753 + 1 NA Intergenic Intergenic 375679 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 119.5-19 chr1 232467036 232467279 + 1 NA intron (NM_020808, intron 6 of 20) intron (NM_020808, intron 6 of 20) 48451 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 227.5-81 chr4 175528997 175529481 + 1 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 258437 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 153.25-126 chr8 27461531 27461762 + 1 NA exon (NM_001282455, exon 7 of 7) exon (NM_001282455, exon 7 of 7) 17615 NM_001282455 1135 Hs.57718 NM_000742 ENSG00000120903 CHRNA2 - cholinergic receptor nicotinic alpha 2 subunit protein-coding 135.25-205 chr8 136538457 136538724 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 7792 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 184.5-154 chr8 82095419 82095740 + 1 NA Intergenic Intergenic -253293 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 171.5-99 chr3 28766657 28766985 + 1 NA Intergenic Intergenic 191543 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 210.25-11 chr10 72831124 72831423 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) -62466 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 182.75-141 chr9 25496234 25496515 + 1 NA Intergenic Intergenic 182484 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 281.75-24 chr18 1964478 1964798 + 1 NA Intergenic Intergenic -605009 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 235.25-64 chr8 111355425 111355985 + 1 NA Intergenic Intergenic -20934 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 176.5-185 chr9 15796167 15796466 + 1 NA intron (NM_001355547, intron 20 of 24) L1MEd|LINE|L1 232338 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 248.25-28 chr16 78677272 78677785 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MER102b|DNA|hAT-Charlie 577874 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 204.25-100 chr6 155840564 155840861 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -106085 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 237.25-45 chr2 114866186 114866510 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -32800 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 155.5-186 chr6 136166214 136166478 + 1 NA intron (NM_018945, intron 8 of 12) L2a|LINE|L2 83965 NM_001318738 113115 Hs.121536 NM_138419 ENSG00000146410 MTFR2 DUFD1|FAM54A mitochondrial fission regulator 2 protein-coding 165.5-104 chr21 32527963 32528217 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 57433 NM_144659 140290 Hs.728804 NM_018277 ENSG00000242220 TCP10L C21orf77|PRED77|TCP10A-1|TCP10A-2 t-complex 10 like protein-coding 235.75-16 chr11 97438218 97438570 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 929969 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 155.75-140 chr6 130589433 130589624 + 1 NA Intergenic Intergenic 152411 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 144.25-211 chr8 126027432 126027620 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -76329 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 280.75-22 chr2 133081152 133081584 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 165811 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-46 chr14 33507104 33507395 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -201688 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 198.25-94 chr7 48332909 48333444 + 1 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) L1MDa|LINE|L1 161718 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 167.75-76 chr2 114802805 114803046 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 30623 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 139.75-175 chr8 121110126 121110290 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -298162 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 216.75-19 chr12 1938066 1938397 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1655 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 204.5-42 chr15 80809288 80809519 + 1 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) intron (NM_018689, intron 1 of 28) 30033 NM_001293298 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 138.75-203 chr8 130859999 130860290 + 1 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1MC3|LINE|L1 180765 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 236.5-19 chr13 24915389 24915795 + 1 NA intron (NR_047594, intron 1 of 17) AluSq2|SINE|Alu 7269 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 189.5-67 chr2 62990430 62990713 + 1 NA intron (NM_001354213, intron 17 of 24) intron (NM_001354213, intron 17 of 24) 57140 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 193.5-163 chr8 83743069 83743353 + 1 NA Intergenic Intergenic 339453 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 260.5-47 chr5 9980608 9980876 + 1 NA Intergenic Intergenic -76918 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 343.75-11 chr3 86207592 86208301 + 1 NA Intergenic Intergenic -273997 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 208.5-80 chr20 8199790 8200055 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) MIR|SINE|MIR -48782 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 184.25-32 chr12 61194214 61194406 + 1 NA Intergenic Intergenic 998529 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 172.75-39 chr15 59744222 59744453 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -55017 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 133.5-139 chr20 54049352 54049716 + 1 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) intron (NM_001366297, intron 3 of 8) 9486 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 160.5-45 chr13 62019449 62019753 + 1 NA intron (NR_046995, intron 1 of 1) (TATAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9947 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 226.5-71 chr4 73307625 73307902 + 1 NA Intergenic Intergenic -48965 NM_032217 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 154.5-175 chr7 100985931 100986104 + 1 NA intron (NM_001164462, intron 1 of 11) intron (NM_001164462, intron 1 of 11) 16394 NM_001164462 10071 Hs.489355 NM_001164462 ENSG00000205277 MUC12 MUC-11|MUC-12|MUC11 mucin 12, cell surface associated protein-coding 254.75-43 chr5 107949289 107949733 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) L3|LINE|CR1 -278574 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 114.5-157 chr20 2764986 2765156 + 1 NA Intergenic Intergenic 35556 NM_019609 56265 Hs.659346 NM_019609 ENSG00000088882 CPXM1 CPX1|CPXM carboxypeptidase X, M14 family member 1 protein-coding 168.5-10 chr1 102734226 102734585 + 1 NA Intergenic Intergenic 374091 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 180.75-10 chr1 172018429 172018771 + 1 NA intron (NM_001278252, intron 4 of 14) L1MC1|LINE|L1 -120208 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 220.25-3 chr1 234288087 234288320 + 1 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) -18264 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 263.5-26 chr17 79851521 79851839 + 1 NA Intergenic Intergenic -12240 NM_003655 8535 Hs.405046 NM_003655 ENSG00000141582 CBX4 NBP16|PC2 chromobox 4 protein-coding 169.25-16 chr12 24991870 24992165 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 5448 NM_001101339 196415 Hs.434453 NM_001101339 C12orf77 - chromosome 12 open reading frame 77 protein-coding 132.5-168 chr3 117284388 117284534 + 1 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 363030 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 145.5-136 chr3 110545672 110546040 + 1 NA Intergenic Intergenic 524103 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 142.5-35 chr10 116312790 116312962 + 1 NA Intergenic Intergenic -11572 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 188.5-170 chr9 131376937 131377214 + 1 NA Intergenic Intergenic -53015 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 338.75-20 chr8 119406130 119406688 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -10037 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 115.5-13 chr1 163403670 163403892 + 1 NA Intergenic Intergenic 19410 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 190.5-86 chr20 9575733 9576007 + 1 NA intron (NM_020341, intron 5 of 10) MIRb|SINE|MIR -60872 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 471.5-8 chr8 134054208 134054921 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 168068 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 246.75-60 chr6 48077676 48078127 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -9212 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 287.5-29 chr19 15593647 15594015 + 1 NA Intergenic Intergenic -21387 NM_007253 11283 Hs.268554 NM_007253 ENSG00000186526 CYP4F8 CPF8|CYPIVF8 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 8 protein-coding 122.5-221 chr8 80456717 80457043 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28713 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 189.75-66 chr21 21822944 21823182 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 76078 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 228.25-92 chrX 122117492 122117956 + 1 NA Intergenic Intergenic 746752 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 357.25-7 chr18 14018494 14018998 + 1 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -103039 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 156.5-164 chr6 82307459 82307654 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -55650 NM_006670 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 184.5-55 chr16 83885382 83885624 + 1 NA Intergenic Intergenic -13612 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 156.25-40 chr14 57468317 57468582 + 1 NA TTS (NM_001283057) TTS (NM_001283057) 25408 NM_001283057 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 161.75-55 chr18 69506247 69506451 + 1 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 36418 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 143.75-155 chr6 48853544 48853831 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 609566 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 249.25-3 chr10 70520209 70520620 + 1 NA intron (NM_014431, intron 1 of 19) intron (NM_014431, intron 1 of 19) 41647 NM_014431 27143 Hs.202351 NM_014431 ENSG00000107719 PALD1 KIAA1274|PALD phosphatase domain containing paladin 1 protein-coding 143.5-235 chrX 142832454 142832721 + 1 NA Intergenic Intergenic -193341 NM_001009613 441525 Hs.535082 NM_001009613 ENSG00000189326 SPANXN4 CT11.9 SPANX family member N4 protein-coding 178.5-52 chr15 64359225 64359563 + 1 NA Intergenic Intergenic -3221 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 328.5-9 chr12 33753670 33754249 + 1 NA Intergenic Intergenic -268537 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 139.75-7 chr1 155919877 155920091 + 1 NA promoter-TSS (NR_002974) promoter-TSS (NR_002974) 58 NR_002974 677823 Hs.676501 NR_002974 ENSG00000207475 SNORA80E ACA42|SNORA42 small nucleolar RNA, H/ACA box 80E snoRNA 350.25 chr1 40547144 40547606 + 1 NA exon (NM_152373, exon 5 of 5) exon (NM_152373, exon 5 of 5) 15738 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 139.25-93 chr2 114275062 114275347 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -167437 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 366.75-20 chr6 93616294 93616796 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -87472 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 200.5-141 chr8 139322702 139323020 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 380262 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 209.5-54 chr17 69888454 69888777 + 1 NA intron (NR_109971, intron 5 of 5) intron (NR_109971, intron 5 of 5) -73092 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 256.5-14 chr11 117656110 117656523 + 1 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) MIRb|SINE|MIR 140900 NM_020693 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 199.75-88 chr8 90351957 90352224 + 1 NA intron (NR_051989, intron 3 of 3) intron (NR_051989, intron 3 of 3) 130602 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 168.5-90 chr2 164434407 164434636 + 1 NA Intergenic Intergenic 133974 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 254.75-35 chr3 157153563 157154053 + 1 NA intron (NM_001308185, intron 3 of 10) intron (NM_001308185, intron 3 of 10) 6952 NM_001308185 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 143.5-14 chr1 198808279 198808511 + 1 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) MER2|DNA|TcMar-Tigger 50587 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 287.75-51 chr8 124288237 124288885 + 1 NA Intergenic Intergenic -41163 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 172.5-97 chr2 79225579 79225841 + 1 NA Intergenic Intergenic -65957 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 143.75-157 chr6 56868957 56869237 + 1 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -17181 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 238.25-47 chr3 50693950 50694341 + 1 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) AluSx1|SINE|Alu 19065 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 122.75-75 chr18 5410788 5411003 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 14 of 21) intron (NM_001281535, intron 14 of 21) -113842 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 126.75-138 chr21 9759394 9759675 + 1 NA Intergenic Intergenic 61527 NR_038377 441058 Hs.130535 NR_038377 LINC01667 - long intergenic non-protein coding RNA 1667 ncRNA 161.25-36 chr12 50318680 50318925 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -35282 NM_016357 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 245.5-36 chr2 99076734 99077282 + 1 NA intron (NR_146001, intron 11 of 18) L2a|LINE|L2 64172 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 365.5-2 chr1 113522788 113523225 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 132491 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 287.25-35 chr4 139952299 139952733 + 1 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) intron (NM_018717, intron 1 of 4) -175499 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 161.5-9 chr1 176316868 176317148 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -109722 NM_022457 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 203.5-29 chr11 32021984 32022304 + 1 NA Intergenic Intergenic 19174 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 268.75 chr1 180967190 180967742 + 1 NA Intergenic Intergenic -12579 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 290.75-37 chr3 37352350 37352775 + 1 NA intron (NM_001172713, intron 21 of 22) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -33707 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 202.5-9 chr1 219513223 219513626 + 1 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) L1MC4a|LINE|L1 43900 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 134.25-88 chr2 132679974 132680140 + 1 NA intron (NM_207481, intron 17 of 17) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -8531 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 256.75-31 chr4 114349083 114349502 + 1 NA Intergenic Intergenic -249110 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 163.5-44 chr12 76995765 76995949 + 1 NA Intergenic Intergenic 69712 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 191.75-122 chr7 114132942 114133494 + 1 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 46891 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 161.5-144 chr4 59630391 59630586 + 1 NA Intergenic Intergenic 616915 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 184.5-111 chr4 103262190 103262444 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -63974 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 391.5-8 chr12 14690874 14691434 + 1 NA intron (NM_004963, intron 1 of 26) intron (NM_004963, intron 1 of 26) 5445 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 188.25-17 chr11 8979951 8980287 + 1 NA TTS (NM_020645) TTS (NM_020645) -15108 NM_001286095 56674 Hs.501853 NM_020644 ENSG00000175348 TMEM9B C11orf15 TMEM9 domain family member B protein-coding 136.75-43 chr11 104071074 104071239 + 1 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) L1MB1|LINE|L1 34516 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 148.5-167 chr4 84106434 84106704 + 1 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) intron (NR_125909, intron 7 of 8) 192600 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 161.5-79 chr17 72512643 72512828 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 80069 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 305.25-6 chr10 13735804 13736264 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 11 of 23) AluSx1|SINE|Alu -28467 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 239.5-89 chrX 93869226 93869642 + 1 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 195228 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 113.5-190 chr4 179972919 179973081 + 1 NA Intergenic Intergenic 1186149 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 154.5-94 chr2 44248483 44248654 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -26912 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 271.25-37 chr6 37764199 37764641 + 1 NA Intergenic MER104|DNA|TcMar-Tc2 -55307 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 140.5-60 chr13 103019081 103019312 + 1 NA Intergenic Intergenic 47221 NM_000452 6555 Hs.194783 NM_000452 ENSG00000125255 SLC10A2 ASBT|IBAT|ISBT|NTCP2|PBAM solute carrier family 10 member 2 protein-coding 153.5-159 chr5 83530164 83530391 + 1 NA intron (NM_001164098, intron 7 of 13) intron (NM_001164098, intron 7 of 13) 32037 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 158.75-170 chr9 35891884 35892188 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14166 NM_001039792 646962 Hs.208081 NM_001039792 ENSG00000196196 HRCT1 LGLL338|PRO537|UNQ338 histidine rich carboxyl terminus 1 protein-coding 270.75-49 chr8 54864299 54864739 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -237509 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 300.5-44 chr6 158288526 158288977 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -23714 NM_001007466 56995 Hs.486993 NM_020245 ENSG00000130338 TULP4 TUSP TUB like protein 4 protein-coding 204.25-40 chr14 76009234 76009616 + 1 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) intron (NM_001102564, intron 2 of 8) 23662 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 204.75-25 chr11 86302957 86303293 + 1 NA intron (NR_024598, intron 1 of 3) intron (NR_024598, intron 1 of 3) 885 NM_001322407 51501 Hs.283322 NM_016401 ENSG00000149196 HIKESHI C11orf73|HLD13|HSPC138|HSPC179|L7RN6|OPI10 heat shock protein nuclear import factor hikeshi protein-coding 276.75-23 chr2 59944488 59944779 + 1 NA Intergenic Intergenic 438403 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 141.5-171 chr5 30742047 30742345 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -451490 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 409.75-7 chr5 92556807 92557460 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 1014210 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-20 chr10 10829444 10829592 + 1 NA intron (NM_001326327, intron 1 of 14) intron (NM_001326327, intron 1 of 14) 30793 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 195.5-117 chr5 67863248 67863494 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 70158 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 172.75-78 chr22 48809460 48809724 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 29297 NR_039761 100616415 NR_039761 ENSG00000266887 MIR4535 - microRNA 4535 ncRNA 245.5-58 chr5 93894969 93895372 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -153570 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 248.5-60 chr22 26415571 26416120 + 1 NA Intergenic Intergenic -13415 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 224.75-29 chr14 52903232 52903482 + 1 NA intron (NM_006832, intron 3 of 14) AluJr4|SINE|Alu 47693 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 279.5-51 chr4 152915324 152915719 + 1 NA Intergenic Intergenic -20802 NM_001371116 231.5-4 chr1 185851256 185851602 + 1 NA intron (NM_031935, intron 2 of 106) intron (NM_031935, intron 2 of 106) 117038 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 120.5-74 chr14 69901392 69901612 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 22086 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 297.5-40 chr3 168887838 168888152 + 1 NA Intergenic Intergenic -13950 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 122.25-122 chr3 57881776 57881922 + 1 NA intron (NM_001304420, intron 12 of 21) intron (NM_001304420, intron 12 of 21) -8065 NM_001311179 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 136.25-148 chr5 67220742 67220944 + 1 NA Intergenic Intergenic -24044 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 339.25-5 chr14 90000511 90001054 + 1 NA intron (NM_001008744, intron 13 of 15) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 44855 NM_001330205 55775 Hs.209945 NM_018319 ENSG00000042088 TDP1 - tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 protein-coding 117.5-115 chr2 152064775 152065075 + 1 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) 33838 NM_001330113 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 211.5-41 chr12 109115491 109115746 + 1 NA promoter-TSS (NM_001093) promoter-TSS (NM_001093) -969 NM_001093 32 Hs.234898 NM_001093 ENSG00000076555 ACACB ACC2|ACCB|HACC275 acetyl-CoA carboxylase beta protein-coding 279.25-18 chr17 66329572 66330058 + 1 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 27202 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 191.5-111 chr4 87423637 87423950 + 1 NA intron (NM_024047, intron 1 of 7) intron (NM_024047, intron 1 of 7) 1196 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 209.75-106 chr9 69176780 69177147 + 1 NA intron (NM_001369872, intron 1 of 21) intron (NM_001369872, intron 1 of 21) 2686 NM_004817 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 139.5-232 chrX 12037703 12038004 + 1 NA intron (NM_001368398, intron 3 of 18) L1PREC2|LINE|L1 -27688 NM_001368402 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 129.5-172 chr4 128521577 128521736 + 1 NA Intergenic Intergenic 93640 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 144.5-193 chr6 161290916 161291076 + 1 NA Intergenic Intergenic -16935 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 209.25-62 chr2 188766413 188766946 + 1 NA intron (NR_161166, intron 1 of 1) intron (NR_161166, intron 1 of 1) 23444 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 271.5-53 chr3 34839869 34840243 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 553967 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 179.5-159 chr6 123156559 123156858 + 1 NA Intergenic Intergenic 160473 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 149.25-16 chr1 184320332 184320583 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -66572 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 375.25-10 chr9 125038301 125038960 + 1 NA intron (NM_173690, intron 4 of 18) intron (NM_173690, intron 4 of 18) -97547 NM_002077 2800 Hs.59504 NM_002077 ENSG00000136935 GOLGA1 golgin-97 golgin A1 protein-coding 233.5-119 chrX 96391657 96392042 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -53947 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 198.5-159 chr9 29217360 29217625 + 1 NA Intergenic Intergenic -3891 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 165.5-168 chr6 117344219 117344536 + 1 NA intron (NM_002944, intron 26 of 42) intron (NM_002944, intron 26 of 42) 78819 NM_182645 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 132.75-127 chr3 124863074 124863222 + 1 NA intron (NM_001354766, intron 2 of 13) intron (NM_001354766, intron 2 of 13) 24217 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 258.75-9 chr10 107499116 107499548 + 1 NA Intergenic Intergenic -334626 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 123.25-68 chr16 1618375 1618732 + 1 NA intron (NM_020825, intron 1 of 19) intron (NM_020825, intron 1 of 19) 3913 NM_020825 57585 Hs.603676 NM_020825 ENSG00000007545 CRAMP1 CRAMP1L|HN1L|TCE4 cramped chromatin regulator homolog 1 protein-coding 145.5-143 chr4 80905156 80905381 + 1 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) intron (NM_152770, intron 4 of 5) -125440 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 137.75-128 chr22 46580467 46580625 + 1 NA intron (NM_001366660, intron 1 of 17) intron (NM_001366660, intron 1 of 17) 3458 NM_001366660 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 169.75-106 chr3 109150483 109150793 + 1 NA non-coding (NR_161294, exon 3 of 3) non-coding (NR_161294, exon 3 of 3) 13919 NR_161294 401081 Hs.280892 NM_001351622 ENSG00000241224 C3orf85 - chromosome 3 open reading frame 85 protein-coding 151.75-3 chr1 40660887 40661275 + 1 NA intron (NM_014747, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 4601 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 149.25-80 chr2 43516385 43516709 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) intron (NM_001083953, intron 22 of 37) 79427 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 124.5-217 chr8 27171048 27171291 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 87235 NM_030795 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 152.25-94 chr20 40007543 40007776 + 1 NA intron (NR_109936, intron 2 of 2) intron (NR_109936, intron 2 of 2) 3198 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 116.25-125 chr21 23357209 23357371 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 27545 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 253.25-41 chr3 33595734 33596275 + 1 NA intron (NM_001365632, intron 19 of 37) intron (NM_001365632, intron 19 of 37) 63675 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 282.5-47 chr4 85010748 85011170 + 1 NA Intergenic Intergenic 43475 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 254.25-17 chr12 15356172 15356530 + 1 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 33843 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 206.5-52 chr2 104706045 104706420 + 1 NA Intergenic Intergenic 51487 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 242.5-63 chr4 157562946 157563428 + 1 NA Intergenic Intergenic -9303 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 228.5-34 chr14 35069566 35069936 + 1 NA intron (NM_001079519, intron 4 of 6) intron (NM_001079519, intron 4 of 6) -11330 NR_110415 101927178 Hs.617139 NR_110415 ENSG00000151327 LOC101927178 - uncharacterized LOC101927178 ncRNA 202.75-44 chr17 58024808 58025151 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -17633 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 183.25-54 chr2 41675799 41676200 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -201556 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 236.5-30 chr14 70921653 70921940 + 1 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) L1ME2z|LINE|L1 14337 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 163.5-186 chr7 5067477 5067698 + 1 NA 3' UTR (NM_021163, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_021163, exon 5 of 5) -4473 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 269.5-62 chr9 76904030 76904393 + 1 NA intron (NM_001308048, intron 1 of 17) intron (NM_001308048, intron 1 of 17) 1876 NR_131751 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 266.5-66 chr6 43568752 43569236 + 1 NA intron (NR_144392, intron 5 of 32) intron (NR_144392, intron 5 of 32) 7044 NM_020750 57510 Hs.203206 NM_020750 ENSG00000124571 XPO5 exp5 exportin 5 protein-coding 145.5-90 chr2 16089762 16090011 + 1 NA Intergenic Intergenic 39459 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 307.25-9 chr13 85661186 85661640 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 138006 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 247.5-84 chr8 114387009 114387278 + 1 NA Intergenic LTR12E|LTR|ERV1 -950204 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 340.25-7 chr15 92927390 92928018 + 1 NA intron (NM_001042572, intron 4 of 12) intron (NM_001042572, intron 4 of 12) 23305 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 272.5-46 chr21 22926395 22926745 + 1 NA Intergenic Intergenic -152714 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 253.75-44 chr4 122277412 122277758 + 1 NA intron (NM_015312, intron 48 of 83) intron (NM_015312, intron 48 of 83) -101426 NM_139243 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 116.75-184 chr7 48408123 48408329 + 1 NA intron (NM_152701, intron 39 of 61) L1MA9|LINE|L1 236768 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 341.75-18 chr5 121392948 121393354 + 1 NA Intergenic Intergenic 70601 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 209.5-151 chr9 37751046 37751317 + 1 NA Intergenic Intergenic -2622 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 126.75-192 chr5 42613719 42613957 + 1 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 47974 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 119.5-191 chr6 8053037 8053188 + 1 NA intron (NR_037618, intron 4 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11277 NM_201280 63915 Hs.719272 NM_201280 ENSG00000188428 BLOC1S5 BLOS5|MU|MUTED biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 5 protein-coding 175.25-44 chr14 34313923 34314224 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 148167 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 151.25-172 chr7 40946765 40947081 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 33016 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 172.5-147 chr4 100832871 100833100 + 1 NA Intergenic Intergenic -157872 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 205.5-84 chr2 232594634 232594876 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11302 NM_001243252 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 170.25-116 chr4 91417176 91417372 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PA11|LINE|L1 860028 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 129.25-110 chr20 47925725 47926101 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -57313 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 170.75-83 chr22 35492622 35492890 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -47738 NM_001366725 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 136.75-3 chr1 34201649 34201802 + 1 NA intron (NM_032884, intron 3 of 6) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 24818 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 290.5-9 chr12 58816528 58816859 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -34977 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 183.5-133 chr7 37541819 37542119 + 1 NA Intergenic Intergenic -92643 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 258.5-57 chr5 9773362 9773761 + 1 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L1MA3|LINE|L1 -80816 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 217.25-46 chr2 173680272 173680625 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 283432 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 379.5 chr1 15212616 15213182 + 1 NA intron (NM_001319665, intron 2 of 3) intron (NM_001319665, intron 2 of 3) -34326 NM_052929 114827 Hs.659997 NM_052929 ENSG00000142621 FHAD1 - forkhead associated phosphopeptide binding domain 1 protein-coding 132.25-55 chr14 21909418 21909612 + 1 NA Intergenic Intergenic -238498 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 178.5-190 chr9 29918542 29918864 + 1 NA Intergenic Intergenic 489751 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 176.25-106 chr4 177792417 177792833 + 1 NA intron (NR_028342, intron 2 of 5) intron (NR_028342, intron 2 of 5) 63868 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 151.25-3 chr1 65622199 65622466 + 1 NA intron (NM_001003679, intron 18 of 19) intron (NM_001003679, intron 18 of 19) 96643 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 168.5-76 chr2 10940061 10940255 + 1 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 28224 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 179.5-64 chr15 76063832 76064099 + 1 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) intron (NM_152335, intron 1 of 10) 3980 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 169.25-89 chr4 166298962 166299208 + 1 NA Intergenic Intergenic 425848 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 143.25-155 chr6 50865827 50866012 + 1 NA Intergenic Intergenic 47048 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 311.5-12 chr17 32940297 32940672 + 1 NA intron (NM_001301746, intron 8 of 8) MER103C|DNA|hAT-Charlie 12331 NM_015544 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 192.5-65 chr2 54127055 54127340 + 1 NA intron (NM_001320588, intron 1 of 3) Ricksha|DNA|MULE-MuDR 3914 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 144.25-15 chr1 165519639 165519898 + 1 NA intron (NR_026744, intron 4 of 6) L1PA16|LINE|L1 -24473 NM_001005214 440699 Hs.664975 NM_001005214 ENSG00000162763 LRRC52 - leucine rich repeat containing 52 protein-coding 199.5-96 chr21 18848642 18849120 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -89069 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 153.5-71 chr16 20308887 20309131 + 1 NA TTS (NM_001502) TTS (NM_001502) 18504 NM_001007240 2813 Hs.53985 NM_001502 ENSG00000169347 GP2 ZAP75 glycoprotein 2 protein-coding 118.5-100 chr2 88167959 88168177 + 1 NA Intergenic Intergenic -2227 NM_001244676 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 174.25-91 chr21 29344453 29344863 + 1 NA 3' UTR (NM_001186, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001186, exon 5 of 5) -27843 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 357.25-15 chr7 93378000 93378621 + 1 NA Intergenic Intergenic 104545 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 162.75-42 chr15 85908805 85909047 + 1 NA Intergenic Intergenic 83291 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 293.75-3 chr10 100056787 100057212 + 1 NA intron (NM_001308, intron 6 of 8) intron (NM_001308, intron 6 of 8) 24870 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 144.25-212 chr8 127414199 127414380 + 1 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) -1536 NM_001159542 5462 Hs.450254 NM_001159542 ENSG00000212993 POU5F1B OCT4-PG1|OCT4PG1|OTF3C|OTF3P1|POU5F1P1|POU5F1P4|POU5FLC20|POU5FLC8 POU class 5 homeobox 1B protein-coding 127.5-67 chr13 114179285 114179500 + 1 NA Intergenic Intergenic -46769 NM_007368 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 127.75-113 chr2 190319027 190319154 + 1 NA intron (NM_198047, intron 1 of 12) intron (NM_198047, intron 1 of 12) 736 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 197.5-26 chr12 1930575 1930796 + 1 NA non-coding (NR_036546, exon 2 of 2) non-coding (NR_036546, exon 2 of 2) 5891 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 169.75-64 chr17 65071083 65071446 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -14524 NM_006572 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 143.5-27 chr10 84582290 84582553 + 1 NA Intergenic Intergenic 157252 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 134.5-243 chr9 84760800 84760968 + 1 NA intron (NM_001018064, intron 12 of 17) intron (NM_001018064, intron 12 of 17) 54983 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 200.75-76 chr4 106271829 106272130 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 3 of 26) MER5A|DNA|hAT-Charlie -43631 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 181.5-48 chr15 62475758 62475947 + 1 NA Intergenic Intergenic 132823 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 141.75-52 chr14 34166937 34167235 + 1 NA Intergenic Intergenic -216012 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 240.25-75 chrX 72043777 72044155 + 1 NA promoter-TSS (NR_002309) promoter-TSS (NR_002309) -443 NR_002309 441502 Hs.449523 NR_002309 RPS26P11 RPS26L1|RPS26_22_1784|bA366E13.1 ribosomal protein S26 pseudogene 11 pseudo 162.25-144 chr6 104651356 104651716 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 208010 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 178.5-27 chr11 77134087 77134408 + 1 NA intron (NM_001127180, intron 2 of 48) L1M4|LINE|L1 6001 NM_000260 4647 Hs.370421 NM_000260 ENSG00000137474 MYO7A DFNA11|DFNB2|MYOVIIA|MYU7A|NSRD2|USH1B myosin VIIA protein-coding 246.75-72 chr8 89992634 89993095 + 1 NA Intergenic Intergenic -8140 NM_001024688 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 241.25-13 chr11 5144050 5144354 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 8167 NM_012375 23538 Hs.553520 NM_012375 ENSG00000182070 OR52A1 HPFH1OR olfactory receptor family 52 subfamily A member 1 protein-coding 244.5-65 chr3 44048944 44049423 + 1 NA Intergenic Intergenic -65029 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 184.5-46 chr14 67995478 67995724 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 172009 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 131.5-117 chr2 96398885 96399106 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 63229 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 202.75-21 chr11 126056132 126056604 + 1 NA intron (NM_016952, intron 1 of 19) intron (NM_016952, intron 1 of 19) 6924 NM_001243597 50937 Hs.38034 NM_016952 ENSG00000064309 CDON CDO|CDON1|HPE11|ORCAM cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 171.75-52 chr15 61942786 61943131 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 45 of 81) L1PA16|LINE|L1 117489 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 226.75-77 chr8 136103631 136103950 + 1 NA Intergenic Intergenic -427008 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 137.5-172 chr4 56806749 56806973 + 1 NA Intergenic Intergenic 14612 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 239.25-28 chr14 50353226 50353649 + 1 NA intron (NM_001282236, intron 3 of 8) intron (NM_001282236, intron 3 of 8) 41113 NM_015684 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 266.5-22 chr15 61533661 61534014 + 1 NA Intergenic Intergenic -196081 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 128.25-147 chr4 64572600 64572791 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -163235 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 322.75-8 chr18 6363711 6364222 + 1 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 3717 NM_001365770 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 268.75-18 chr2 175182131 175182626 + 1 NA promoter-TSS (NM_001689) promoter-TSS (NM_001689) -668 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 240.25-2 chr1 79094869 79095289 + 1 NA Intergenic Intergenic -88349 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 213.75-32 chr14 43169209 43169597 + 1 NA Intergenic Intergenic 1337880 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 134.5-235 chr8 134873353 134873531 + 1 NA intron (NR_125427, intron 1 of 2) intron (NR_125427, intron 1 of 2) 23507 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 126.75-186 chr5 5241221 5241370 + 1 NA intron (NM_139056, intron 16 of 22) intron (NM_139056, intron 16 of 22) 100965 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 123.5-55 chr13 47543444 47543713 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 389044 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 137.75-30 chr10 102630222 102630406 + 1 NA 3' UTR (NM_016169, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_016169, exon 12 of 12) -14181 NM_030912 81603 Hs.336810 NM_030912 ENSG00000171206 TRIM8 GERP|RNF27 tripartite motif containing 8 protein-coding 191.5-9 chr1 105796926 105797166 + 1 NA Intergenic Intergenic -178111 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 190.25-106 chr6 65704297 65704705 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) intron (NM_001292009, intron 1 of 43) 2724 NM_001292009 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 252.5-41 chr2 41317813 41318175 + 1 NA Intergenic Intergenic -559561 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 207.25-94 chr8 81619296 81619632 + 1 NA intron (NR_146081, intron 6 of 7) LTR56|LTR|ERV1 11813 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 218.5-116 chr8 20543306 20543630 + 1 NA Intergenic Intergenic 71458 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 163.25-141 chr8 91355278 91355600 + 1 NA intron (NM_134266, intron 11 of 18) HAL1b|LINE|L1 106120 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 177.25-43 chr14 52835591 52835849 + 1 NA Intergenic Intergenic -44113 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 233.5-106 chr8 64194985 64195404 + 1 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 173364 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 153.5-81 chr17 78525843 78526023 + 1 NA intron (NM_173628, intron 24 of 80) intron (NM_173628, intron 24 of 80) 41023 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 282.25-35 chr7 50442105 50442648 + 1 NA 3' UTR (NM_001346564, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001346564, exon 4 of 4) 7974 NM_001287492 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 148.5-201 chr6 167975046 167975238 + 1 NA TTS (NM_001129895) TTS (NM_001129895) 1797 NM_001129895 100128124 Hs.448059 NM_001129895 HGC6.3 - uncharacterized LOC100128124 protein-coding 141.75-9 chr1 154057475 154057664 + 1 NA intron (NM_001159484, intron 22 of 37) intron (NM_001159484, intron 22 of 37) 47023 NR_049883 100847024 NR_049883 ENSG00000263987 MIR5698 - microRNA 5698 ncRNA 127.25-166 chr5 45272645 45272780 + 1 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) intron (NM_021072, intron 6 of 7) 423668 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 125.25-196 chr7 83615847 83616170 + 1 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 25423 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 347.5-19 chr8 81195031 81195431 + 1 NA Intergenic Intergenic -83163 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 163.25-131 chr7 49274898 49275169 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 350486 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 197.75-92 chr8 123545249 123545581 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4209 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 265.5-20 chr14 45524646 45525197 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 190681 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 159.5-152 chr3 127834592 127834927 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11509 NM_001003794 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 296.5-37 chr7 97115239 97115722 + 1 NA Intergenic Intergenic -1113 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 170.5-170 chr7 25598359 25598606 + 1 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 64658 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 139.75-47 chr14 50776600 50776761 + 1 NA intron (NM_016350, intron 7 of 28) intron (NM_016350, intron 7 of 28) -45117 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 130.5-41 chr10 66747124 66747300 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -178824 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 163.5-199 chr8 21070923 21071163 + 1 NA Intergenic Intergenic 97057 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 219.5-58 chr19 51308516 51308979 + 1 NA Intergenic Intergenic -3101 NM_001101372 402665 NM_001101372 ENSG00000142549 IGLON5 - IgLON family member 5 protein-coding 212.75-84 chr5 153495986 153496249 + 1 NA intron (NM_001258019, intron 2 of 14) intron (NM_001258019, intron 2 of 14) 3945 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 238.5-80 chr6 53103021 53103383 + 1 NA Intergenic Intergenic 32229 NM_012347 26268 Hs.216653 NM_012347 ENSG00000112146 FBXO9 FBX9|NY-REN-57|VCIA1|dJ341E18.2 F-box protein 9 protein-coding 154.25-154 chr7 26599681 26599870 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -38096 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 156.5-215 chrX 87632223 87632449 + 1 NA exon (NM_019117, exon 7 of 11) exon (NM_019117, exon 7 of 11) 114534 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 136.75-75 chr17 52246849 52247052 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -86933 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 187.75-23 chr12 72542514 72542808 + 1 NA intron (NM_013381, intron 7 of 18) intron (NM_013381, intron 7 of 18) -269152 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 249.5-61 chr22 31724235 31724545 + 1 NA intron (NM_173566, intron 3 of 8) intron (NM_173566, intron 3 of 8) 25742 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 269.5-37 chr4 40321456 40321827 + 1 NA intron (NR_121640, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 5157 NR_121640 101060498 Hs.351492 NR_121640 ENSG00000249241 LINC02265 - long intergenic non-protein coding RNA 2265 ncRNA 192.25-93 chr6 21322641 21322837 + 1 NA Intergenic Intergenic 189153 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 182.75-112 chr5 150772891 150773275 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -4863 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 210.75-12 chr10 43185490 43185839 + 1 NA TTS (NR_135077) TTS (NR_135077) 30767 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 269.5-57 chr7 100113281 100113716 + 1 NA intron (NM_001365004, intron 5 of 15) intron (NM_001365004, intron 5 of 15) 5859 NM_001364999 6878 Hs.489309 NM_005641 ENSG00000106290 TAF6 ALYUS|MGC:8964|TAF(II)70|TAF(II)80|TAF2E|TAFII-70|TAFII-80|TAFII70|TAFII80|TAFII85 TATA-box binding protein associated factor 6 protein-coding 197.5-103 chr3 171043243 171043516 + 1 NA Intergenic Intergenic -16659 NM_001278659 6514 Hs.167584 NM_000340 ENSG00000163581 SLC2A2 GLUT2 solute carrier family 2 member 2 protein-coding 234.25-41 chr2 240898854 240899152 + 1 NA Intergenic Intergenic -2847 NM_001085437 79919 Hs.193745 NM_024861 ENSG00000172478 MAB21L4 C2orf54 mab-21 like 4 protein-coding 310.75-15 chr14 55274857 55275531 + 1 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 3040 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 113.75-146 chr5 7316176 7316396 + 1 NA Intergenic Intergenic -9572 NR_033906 442132 Hs.727388 NM_001034846 LOC442132 - golgin A6 family-like 1 pseudogene pseudo 193.5-82 chr2 33498633 33498959 + 1 NA intron (NM_001349975, intron 3 of 19) L2c|LINE|L2 -15079 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 127.75-64 chr14 67697789 67698082 + 1 NA Intergenic LTR47B2|LTR|ERVL -2171 NM_016026 51109 Hs.719925 NM_016026 ENSG00000072042 RDH11 ARSDR1|CGI82|HCBP12|MDT1|PSDR1|RALR1|RDJCSS|SCALD|SDR7C1 retinol dehydrogenase 11 protein-coding 197.75-20 chr13 108013751 108014238 + 1 NA Intergenic (GATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -146498 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 193.75-37 chr12 104668092 104668334 + 1 NA intron (NM_018413, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 76580 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 195.75-69 chr22 26880116 26880470 + 1 NA intron (NR_146604, intron 5 of 5) MER97a|DNA|hAT-Tip100 20082 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 205.25-30 chr15 67575484 67575816 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 3 of 21) intron (NM_001206804, intron 3 of 21) 26556 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 154.5-71 chr15 95590025 95590184 + 1 NA Intergenic Intergenic 157011 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 171.5-66 chr18 68083443 68083769 + 1 NA Intergenic Intergenic -268784 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 158.75-176 chrX 79782788 79783044 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -231837 NM_001109878 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 116.25-226 chr8 88248081 88248280 + 1 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) L1MEh|LINE|L1 79303 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 222.25-68 chr5 74559085 74559362 + 1 NA Intergenic Intergenic -22247 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 114.75-72 chr17 62091305 62091440 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26094 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 124.75-61 chr12 62528569 62528855 + 1 NA intron (NM_001278469, intron 11 of 35) intron (NM_001278469, intron 11 of 35) 61886 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 202.5-116 chr5 73759420 73759775 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -53949 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 195.25-57 chr20 1341821 1342128 + 1 NA intron (NR_040047, intron 1 of 2) intron (NR_040047, intron 1 of 2) -12835 NM_080489 27111 Hs.657015 NM_015685 ENSG00000125775 SDCBP2 SITAC|SITAC18|ST-2|ST2 syndecan binding protein 2 protein-coding 136.75-42 chr11 84835026 84835245 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 88286 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 151.5-206 chr9 102679036 102679329 + 1 NA Intergenic Intergenic 159545 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 257.5-48 chr3 69777837 69778194 + 1 NA intron (NM_006722, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 14204 NM_006722 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 236.25-78 chr6 116087455 116087770 + 1 NA Intergenic Intergenic -13241 NM_152729 221294 Hs.520341 NM_152729 ENSG00000178425 NT5DC1 C6orf200|LP2642|NT5C2L1 5'-nucleotidase domain containing 1 protein-coding 141.25-117 chr3 186083170 186083458 + 1 NA intron (NM_004454, intron 5 of 12) intron (NM_004454, intron 5 of 12) 25775 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 245.5-81 chr8 119506828 119507216 + 1 NA Intergenic Intergenic 85986 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 140.75-99 chr2 142208492 142208760 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -76925 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 278.5-32 chr2 96969184 96969592 + 1 NA intron (NM_001122646, intron 4 of 16) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 17192 NM_001122646 51252 Hs.107922 NM_016490 ENSG00000168754 FAM178B - family with sequence similarity 178 member B protein-coding 192.5-130 chr8 89761537 89762042 + 1 NA intron (NM_003821, intron 1 of 10) intron (NM_003821, intron 1 of 10) 3973 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 144.5-168 chr5 29870611 29870848 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -9831 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 152.5-134 chr4 70172923 70173122 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 18785 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 253.5-66 chr6 37802118 37802536 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17400 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 422.25-4 chr3 190500199 190500863 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -13554 NR_157352 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 161.25-41 chr12 125405479 125405660 + 1 NA intron (NM_052907, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 78953 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 212.5-44 chr2 11839114 11839421 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2281 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 324.75-11 chr14 62161580 62162201 + 1 NA Intergenic Intergenic -21917 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 185.25-129 chr8 142868673 142868903 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 11032 NM_000497 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 142.75-205 chrX 18910707 18910902 + 1 NA intron (NM_000292, intron 20 of 32) intron (NM_000292, intron 20 of 32) 20508 NR_029379 100132163 Hs.607628 NR_029379 PHKA2-AS1 - PHKA2 antisense RNA 1 ncRNA 140.5-252 chrX 77983697 77983862 + 1 NA intron (NR_104109, intron 2 of 9) AluSq|SINE|Alu -14141 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 218.75-84 chr8 6932317 6932826 + 1 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 5735 NM_001925 1669 Hs.591391 NM_001925 ENSG00000164821 DEFA4 DEF4|HNP-4|HP-4|HP4 defensin alpha 4 protein-coding 195.5-65 chr2 14949379 14949659 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 316802 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 143.5-29 chr10 94204773 94204955 + 1 NA intron (NM_001165979, intron 3 of 31) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 82206 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 238.5-2 chr1 41197458 41197820 + 1 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) L1MB4|LINE|L1 -34622 NM_001172221 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 171.25-124 chr5 112327472 112327643 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) AluJr|SINE|Alu 91720 NM_001347888 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 174.75-96 chr5 3615408 3615887 + 1 NA Intergenic Intergenic 19815 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 116.5-249 chr8 106645377 106645520 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -12360 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 175.75-114 chr6 116991924 116992198 + 1 NA Intergenic Intergenic 114819 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 120.25-220 chr9 19018247 19018463 + 1 NA intron (NM_001287049, intron 1 of 3) intron (NM_001287049, intron 1 of 3) 14854 NM_001287050 158297 Hs.731593 NM_153707 ENSG00000155875 SAXO1 C9orf138|FAM154A stabilizer of axonemal microtubules 1 protein-coding 163.5-39 chr12 15492855 15493061 + 1 NA intron (NM_030667, intron 2 of 26) L1MEi|LINE|L1 -53653 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 222.5-89 chr5 151165912 151166296 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8325 NM_001363114 309 Hs.412117 NM_001155 ENSG00000197043 ANXA6 ANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70 annexin A6 protein-coding 129.75-99 chr2 176305294 176305625 + 1 NA intron (NM_001319097, intron 3 of 9) intron (NM_001319097, intron 3 of 9) 36017 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 319.75-17 chr5 136108250 136108691 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -24375 NM_001001420 4090 Hs.167700 NM_005903 ENSG00000113658 SMAD5 DWFC|JV5-1|MADH5 SMAD family member 5 protein-coding 125.75-173 chr7 70409217 70409396 + 1 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) -722838 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 177.5-109 chr3 16723599 16723912 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -118332 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 284.25-8 chr12 3318873 3319218 + 1 NA intron (NR_148995, intron 1 of 11) intron (NR_148995, intron 1 of 11) 47077 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 127.75-147 chr4 93213968 93214263 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 4 of 14) intron (NM_001286838, intron 4 of 14) -614638 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 172.5-80 chr16 61660404 61660631 + 1 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) L1M4b|LINE|L1 375921 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 142.75-40 chr11 78884815 78885016 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 9 of 33) MIR|SINE|MIR -310051 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 157.25-82 chr2 116209351 116209643 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 865682 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 167.5-126 chr4 95246211 95246435 + 1 NA intron (NM_003728, intron 5 of 15) AluJo|SINE|Alu 154832 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 320.5-38 chr7 49440375 49440943 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -332979 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 201.75-84 chr6 112013314 112013705 + 1 NA Intergenic Intergenic -40566 NM_003880 8838 Hs.558428 NM_003880 ENSG00000112761 CCN6 LIBC|PPAC|PPD|WISP-3|WISP3 cellular communication network factor 6 protein-coding 218.5-66 chr20 45488043 45488393 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 18465 NM_006103 10406 Hs.2719 NM_006103 ENSG00000101443 WFDC2 EDDM4|HE4|WAP5|dJ461P17.6 WAP four-disulfide core domain 2 protein-coding 175.5-142 chr6 119938266 119938463 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -76815 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 154.75-82 chr20 47528086 47528383 + 1 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) intron (NM_181659, intron 1 of 22) 26347 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 228.25-69 chr5 83762325 83762700 + 1 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -41657 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 253.75-22 chr2 60562651 60562964 + 1 NA Intergenic Intergenic -9153 NM_022893 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 125.5-137 chr2 189389123 189389304 + 1 NA Intergenic Intergenic -52220 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 285.5-43 chr3 186196215 186196575 + 1 NA intron (NM_001346, intron 21 of 24) AluSx1|SINE|Alu -87306 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 271.5-4 chr1 69292697 69293218 + 1 NA Intergenic Intergenic -140298 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 215.25-28 chr14 55152036 55152420 + 1 NA intron (NM_001146015, intron 16 of 19) MER58A|DNA|hAT-Charlie 15245 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 239.5-9 chr10 26754828 26755388 + 1 NA intron (NM_001178125, intron 5 of 6) intron (NM_001178125, intron 5 of 6) 57407 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 119.25-187 chr7 28303512 28303692 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) 4281 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 267.5-45 chr21 15475998 15476281 + 1 NA Intergenic Intergenic -253795 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 267.75-51 chr6 123994942 123995335 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 191273 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 135.5-30 chr10 124955531 124955862 + 1 NA intron (NM_017580, intron 1 of 8) intron (NM_017580, intron 1 of 8) 13573 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 162.5-79 chr2 21365155 21365444 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 241313 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 171.75-36 chr13 87149396 87149647 + 1 NA Intergenic Intergenic 237601 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 122.75-219 chrX 80239554 80239699 + 1 NA intron (NR_110646, intron 5 of 5) intron (NR_110646, intron 5 of 5) 95692 NR_110646 101060146 Hs.546064 NR_110646 ENSG00000278530 CHMP1B2P - charged multivesicular body protein 1B2, pseudogene pseudo 196.25-109 chr6 77042461 77042853 + 1 NA Intergenic Intergenic 421365 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 272.75-6 chr11 90575906 90576298 + 1 NA intron (NR_104190, intron 2 of 6) intron (NR_104190, intron 2 of 6) -20245 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 208.75-84 chr8 113098575 113098836 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 278447 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 163.25-29 chr12 20473985 20474248 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) L1ME3D|LINE|L1 -97748 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 137.75-64 chr14 72877969 72878209 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 14560 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 282.75-25 chr2 240553998 240554591 + 1 NA intron (NM_017844, intron 3 of 13) intron (NM_017844, intron 3 of 13) 3694 NM_001282771 51281 Hs.656615 NM_016552 ENSG00000144504 ANKMY1 ZMYND13 ankyrin repeat and MYND domain containing 1 protein-coding 132.75-212 chrX 99374438 99374659 + 1 NA Intergenic Intergenic 1035725 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 181.5-154 chr7 131390124 131390430 + 1 NA intron (NM_001321316, intron 4 of 17) intron (NM_001321316, intron 4 of 17) 62401 NM_001321316 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 172.5-156 chr5 82772386 82772883 + 1 NA Intergenic Intergenic -67521 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 216.5-24 chr12 117067950 117068190 + 1 NA intron (NR_031766, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 31346 NR_031766 54997 Hs.525709 NM_017899 ENSG00000088992 TESC CHP3|TSC tescalcin protein-coding 188.25-49 chr15 83690927 83691166 + 1 NA intron (NM_207517, intron 2 of 29) intron (NM_207517, intron 2 of 29) 36923 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 134.5-54 chr13 93577754 93577963 + 1 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) L1M2|LINE|L1 280615 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 356.25-7 chr19 31134453 31134886 + 1 NA Intergenic Intergenic -32841 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 193.25-74 chr3 102401620 102401957 + 1 NA Intergenic Intergenic -33227 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 135.5-108 chr2 115822960 115823333 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 22 of 25) L1MEd|LINE|L1 479331 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 183.75-77 chr3 124474470 124474766 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 25 of 59) intron (NM_001024660, intron 25 of 59) 100286 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 125.25-123 chr20 55027898 55028081 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -395054 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 241.25-42 chr22 26810176 26810645 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -49801 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 214.5-57 chr2 96193153 96193582 + 1 NA intron (NM_020151, intron 3 of 7) intron (NM_020151, intron 3 of 7) -15049 NR_046322 285033 Hs.58648 NM_001037228 STARD7-AS1 - STARD7 antisense RNA 1 ncRNA 166.25-116 chr4 124239383 124239650 + 1 NA Intergenic Intergenic 318918 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 224.5-24 chr11 31421390 31421871 + 1 NA intron (NM_181706, intron 3 of 4) (TTTTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 51770 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 131.5-142 chr21 20519768 20519924 + 1 NA Intergenic Intergenic -261161 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 125.5-146 chr20 17699161 17699301 + 1 NA promoter-TSS (NM_178477) promoter-TSS (NM_178477) -717 NM_178477 140836 Hs.115366 NM_178477 ENSG00000125888 BANF2 BAF-L|BAF2|BAFL|C20orf179 barrier to autointegration factor 2 protein-coding 224.5-76 chr3 123738576 123738858 + 1 NA intron (NM_001321309, intron 6 of 32) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 49073 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 114.5-204 chr5 27212222 27212423 + 1 NA Intergenic Intergenic -173736 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 324.5-22 chr3 124583298 124583718 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 34 of 59) intron (NM_001024660, intron 34 of 59) -1150 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 214.5-63 chr2 151338943 151339230 + 1 NA non-coding (NR_110248, exon 3 of 3) non-coding (NR_110248, exon 3 of 3) -18506 NM_007115 7130 Hs.437322 NM_007115 ENSG00000123610 TNFAIP6 TSG-6|TSG6 TNF alpha induced protein 6 protein-coding 178.75-78 chr4 156033165 156033423 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -79428 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 204.5-133 chr8 104582014 104582373 + 1 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) intron (NM_013437, intron 1 of 6) 6831 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 112.5-229 chr8 29379157 29379430 + 1 NA Intergenic Intergenic -28609 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 186.5-22 chr11 23514882 23515246 + 1 NA Intergenic Intergenic -95874 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 291.5-30 chr3 87591029 87591528 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -201428 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 134.75-123 chr2 213872091 213872256 + 1 NA intron (NR_047660, intron 10 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 114106 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 162.5-106 chr3 2487042 2487272 + 1 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) 248328 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 181.25-122 chr7 93030159 93030385 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 87707 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 247.5-19 chr13 89233740 89234114 + 1 NA intron (NR_131229, intron 1 of 4) intron (NR_131229, intron 1 of 4) -1364 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 182.75-133 chr8 54948401 54948726 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -153465 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 132.25-116 chr22 25011370 25011576 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16501 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 237.5-67 chr4 60456830 60457334 + 1 NA Intergenic Intergenic -465537 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 456.5-3 chr10 98757063 98757622 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1PA15|LINE|L1 167226 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 277.25-16 chr16 84190235 84190653 + 1 NA promoter-TSS (NM_139174) promoter-TSS (NM_139174) -713 NM_001145400 161931 Hs.8977 NM_139174 ENSG00000140955 ADAD2 TENRL adenosine deaminase domain containing 2 protein-coding 218.5-119 chr8 70253740 70254152 + 1 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) L1MB3|LINE|L1 149444 NM_001321707 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 185.75-20 chr10 123382344 123382758 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 228149 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 185.75-76 chr20 52138905 52139356 + 1 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) L1PA16|LINE|L1 -33646 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 205.5-34 chr13 26656700 26656923 + 1 NA intron (NM_006646, intron 3 of 9) intron (NM_006646, intron 3 of 9) 99108 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 183.75-27 chr12 8679402 8679653 + 1 NA Intergenic Intergenic -2073 NR_123740 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 147.5-114 chr2 171661679 171661881 + 1 NA Intergenic Intergenic -25689 NM_001378 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 130.5-120 chr18 6866933 6867138 + 1 NA intron (NM_001010000, intron 4 of 16) intron (NM_001010000, intron 4 of 16) 32550 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 218.5-79 chr3 181827057 181827335 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 115271 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 148.5-106 chr2 124063696 124063938 + 1 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 38530 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 229.75-65 chr6 40718136 40718475 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -130941 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 181.75-135 chr8 137438415 137438765 + 1 NA Intergenic Intergenic -25002 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 188.5-141 chr7 106586956 106587314 + 1 NA Intergenic Intergenic 74023 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 193.5-80 chr2 31353123 31353378 + 1 NA intron (NM_000379, intron 24 of 35) intron (NM_000379, intron 24 of 35) 61492 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 261.75-44 chr7 21800115 21800524 + 1 NA intron (NM_001277115, intron 61 of 81) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 145580 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 184.25-117 chr8 29939716 29939976 + 1 NA intron (NR_024473, intron 2 of 2) intron (NR_024473, intron 2 of 2) 17502 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 137.5-215 chr6 150598663 150598927 + 1 NA Intergenic Intergenic -1090 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 148.75-73 chr17 61917217 61917506 + 1 NA intron (NM_001351695, intron 5 of 24) L1PA16|LINE|L1 10621 NM_001351695 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 246.5-33 chr18 5269768 5270166 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 25759 NM_001243702 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 188.5-162 chr8 134439223 134439474 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -158723 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 209.75-8 chr10 34457155 34457504 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 4 of 22) intron (NM_001184789, intron 4 of 22) 357967 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 187.25-89 chr5 125698152 125698420 + 1 NA Intergenic Intergenic 205025 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 160.75-24 chr10 129695077 129695386 + 1 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) intron (NM_002412, intron 2 of 4) 148143 NR_036179 100422873 NR_036179 ENSG00000266676 MIR4297 - microRNA 4297 ncRNA 210.75-99 chr8 140037048 140037614 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) MIR|SINE|MIR 63204 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 162.5-102 chr22 23163818 23164080 + 1 NA non-coding (NR_146295, exon 10 of 10) non-coding (NR_146295, exon 10 of 10) -16560 NM_021574 613 Hs.517461 NM_004327 ENSG00000186716 BCR ALL|BCR1|CML|D22S11|D22S662|PHL BCR activator of RhoGEF and GTPase protein-coding 192.25-78 chr3 188396435 188396710 + 1 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 171167 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 268.25-4 chr10 99505601 99505980 + 1 NA Intergenic Intergenic 25387 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 138.75-113 chr22 45245397 45245569 + 1 NA Intergenic Intergenic -4714 NM_001009880 23313 Hs.592207 NM_015264 ENSG00000100364 KIAA0930 C22orf9|LSC3 KIAA0930 protein-coding 170.5-206 chrX 148922146 148922366 + 1 NA intron (NM_001170628, intron 6 of 17) intron (NM_001170628, intron 6 of 17) 203165 NM_001170628 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 135.25-115 chr2 227601062 227601376 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 17436 NR_149019 729968 Hs.689550 NR_149019 LOC729968 - spore coat protein SP96 ncRNA 252.25-2 chr1 166842145 166842512 + 1 NA intron (NM_001314014, intron 2 of 3) intron (NM_001314014, intron 2 of 3) 2853 NM_017542 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 316.5-26 chr3 80962517 80962878 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -31171 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 221.75-85 chr8 117672556 117672901 + 1 NA Intergenic Intergenic 152015 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 219.5-133 chr8 141624434 141624871 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -117422 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 128.5-58 chr13 48441909 48442149 + 1 NA intron (NM_005767, intron 1 of 6) intron (NM_005767, intron 1 of 6) 2640 NM_005767 10161 Hs.123464 NM_005767 ENSG00000139679 LPAR6 ARWH1|HYPT8|LAH3|P2RY5|P2Y5 lysophosphatidic acid receptor 6 protein-coding 166.5-117 chr2 238483068 238483357 + 1 NA Intergenic Charlie12|DNA|hAT-Charlie 56285 NM_001040445 51665 Hs.516788 NM_016114 ENSG00000065802 ASB1 ASB-1 ankyrin repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 149.5-24 chr10 32770235 32770540 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1PBa|LINE|L1 131085 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 169.75-110 chr3 175189636 175190040 + 1 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) L1M2a|LINE|L1 -74596 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 211.5-90 chr20 50288861 50289167 + 1 NA Intergenic Intergenic -3706 NR_034124 284751 Hs.282325 NM_001025463 ENSG00000203999 LINC01270 - long intergenic non-protein coding RNA 1270 ncRNA 245.5-67 chr6 40675922 40676360 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -88777 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 167.5-19 chr10 5320794 5320981 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -44079 NM_053049 114131 Hs.511775 NM_053049 ENSG00000178473 UCN3 SCP|SPC|UCNIII urocortin 3 protein-coding 175.75-8 chr1 163129536 163129743 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -32036 NR_110699 101928404 Hs.683933 NR_110699 ENSG00000232892 LOC101928404 - uncharacterized LOC101928404 ncRNA 183.25-36 chr14 75575910 75576099 + 1 NA intron (NR_110552, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu -2616 NM_017791 55640 Hs.509966 NM_017791 ENSG00000119686 FLVCR2 C14orf58|CCT|EPV|FLVCRL14q|MFSD7C|PVHH|SLC49A2 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family member 2 protein-coding 202.25-91 chr8 46460114 46460436 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 157368 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 246.25-43 chr3 12568398 12568709 + 1 NA intron (NM_001271707, intron 1 of 6) intron (NM_001271707, intron 1 of 6) 11466 NM_014160 23609 Hs.591666 NM_014160 ENSG00000075975 MKRN2 HSPC070|RNF62 makorin ring finger protein 2 protein-coding 125.75-37 chr11 40300365 40300621 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) intron (NM_001258419, intron 4 of 6) -7363 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 205.25-59 chr2 204787570 204787828 + 1 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 242224 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 240.5-7 chr10 55477491 55477787 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -121403 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 127.25-106 chr20 33004805 33004949 + 1 NA promoter-TSS (NM_080675) promoter-TSS (NM_080675) -444 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 195.5-134 chr6 92693720 92694036 + 1 NA Intergenic Intergenic 725681 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 401.5-5 chr14 50510704 50511524 + 1 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) L1MA5A|LINE|L1 21455 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 244.25-13 chr13 62322659 62322926 + 1 NA promoter-TSS (NR_047038) promoter-TSS (NR_047038) -865 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 117.5-241 chr9 26163697 26163900 + 1 NA Intergenic Intergenic 97123 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 197.5-112 chr4 124226620 124226942 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 331653 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 269.5-25 chr19 30360418 30360816 + 1 NA Intergenic Intergenic -11767 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 143.25-133 chr4 70139554 70139879 + 1 NA intron (NR_033311, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 6112 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 271.5 chr1 35276438 35277244 + 1 NA intron (NM_005095, intron 1 of 29) AluSq|SINE|Alu 8132 NM_005095 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 187.5-98 chr2 220862827 220863255 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 709263 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 129.5-229 chr8 119871078 119871241 + 1 NA Intergenic Intergenic -2496 NM_001283012 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 131.5-252 chrX 81991635 81991822 + 1 NA Intergenic Intergenic 789626 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 230.75-48 chr4 22952630 22953037 + 1 NA Intergenic Intergenic 238744 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 118.5-35 chr11 77806099 77806287 + 1 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 14641 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 259.5-16 chr10 110646044 110646510 + 1 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 1941 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 238.25-92 chr9 127336310 127336662 + 1 NA intron (NR_104591, intron 11 of 26) intron (NR_104591, intron 11 of 26) -60652 NM_001271712 29988 Hs.179522 NM_014580 ENSG00000136856 SLC2A8 GLUT8|GLUTX1 solute carrier family 2 member 8 protein-coding 140.25-122 chr3 156441319 156441487 + 1 NA non-coding (NR_046618, exon 3 of 3) non-coding (NR_046618, exon 3 of 3) 5533 NR_046618 100874084 Hs.131282 NR_046618 ENSG00000242370 KCNAB1-AS1 - KCNAB1 antisense RNA 1 ncRNA 125.75-155 chr5 58702405 58702530 + 1 NA intron (NM_138453, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 119392 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 118.5-143 chr4 39915640 39915854 + 1 NA intron (NM_001100399, intron 8 of 32) intron (NM_001100399, intron 8 of 32) 62164 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 147.25-94 chr4 32623669 32623921 + 1 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL 272757 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 207.75-27 chr12 44604599 44604907 + 1 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) L2b|LINE|L2 270908 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 179.5-199 chr9 132704767 132705040 + 1 NA Intergenic Intergenic 34439 NM_012204 9329 Hs.22302 NM_012204 ENSG00000125484 GTF3C4 KAT12|TF3C-delta|TFIII90|TFIIIC290|TFIIIC90|TFIIICDELTA general transcription factor IIIC subunit 4 protein-coding 131.25-198 chr8 73511940 73512106 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) L1MB7|LINE|L1 91949 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-13 chr1 204483324 204483654 + 1 NA intron (NM_002646, intron 2 of 33) intron (NM_002646, intron 2 of 33) 6857 NM_002646 5287 Hs.497487 NM_002646 ENSG00000133056 PIK3C2B C2-PI3K phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta protein-coding 137.5-17 chr1 196588026 196588208 + 1 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) -5636 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 173.75-33 chr11 68307989 68308197 + 1 NA Intergenic Intergenic -4498 NM_001291902 4041 Hs.6347 NM_002335 ENSG00000162337 LRP5 BMND1|EVR1|EVR4|HBM|LR3|LRP-5|LRP-7|LRP7|OPPG|OPS|OPTA1|PCLD4|VBCH2 LDL receptor related protein 5 protein-coding 280.5-37 chr3 158797013 158797392 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4852 NR_110328 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 222.5-19 chr10 96017605 96017973 + 1 NA intron (NM_001349008, intron 30 of 34) (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17698 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 187.75-109 chr7 113910217 113910416 + 1 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 8693 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 243.5-45 chr20 57756534 57756922 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -45192 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 116.25-110 chr2 88733320 88733457 + 1 NA intron (NM_144563, intron 4 of 8) intron (NM_144563, intron 4 of 8) -32514 NR_015424 645784 Hs.105323 NR_015424 ENSG00000230006 ANKRD36BP2 - ankyrin repeat domain 36B pseudogene 2 pseudo 216.75-72 chr6 141209170 141209566 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 525554 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 164.75-30 chr11 76479719 76480009 + 1 NA intron (NM_001300942, intron 9 of 21) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 34839 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 178.25-90 chr4 32869608 32869953 + 1 NA Intergenic Intergenic 518742 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 311.25-11 chr2 106234214 106234586 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -40061 NM_025076 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 333.75-10 chr18 1817972 1818533 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -458623 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 235.75-13 chr10 116233003 116233396 + 1 NA intron (NM_005264, intron 4 of 10) AluSz|SINE|Alu 22596 NM_001348099 2674 Hs.388347 NM_005264 ENSG00000151892 GFRA1 GDNFR|GDNFRA|GFR-ALPHA-1|RET1L|RETL1|TRNR1 GDNF family receptor alpha 1 protein-coding 162.5-71 chr18 52567038 52567251 + 1 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 226947 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 132.5-253 chr9 28370442 28370692 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 348738 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 254.75-40 chr4 183668356 183668663 + 1 NA intron (NM_199053, intron 5 of 30) intron (NM_199053, intron 5 of 30) 9216 NM_021942 60684 Hs.443240 NM_021942 ENSG00000168538 TRAPPC11 C4orf41|FOIGR|GRY|LGMD2S|LGMDR18 trafficking protein particle complex 11 protein-coding 208.25-8 chr1 177288438 177288649 + 1 NA Intergenic Intergenic -63043 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 191.5-21 chr11 30169706 30169977 + 1 NA Intergenic Intergenic -61173 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 252.75-73 chr8 58363099 58363393 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -48018 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 142.5-116 chr2 164077114 164077367 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -341232 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 164.25-93 chr22 34519433 34519751 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 478324 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 286.5-11 chr10 131168291 131168680 + 1 NA intron (NM_174937, intron 4 of 11) intron (NM_174937, intron 4 of 11) 73267 NR_120623 101927489 Hs.659317 NR_120623 ENSG00000230098 TCERG1L-AS1 - TCERG1L antisense RNA 1 ncRNA 255.25-21 chr2 104931725 104932017 + 1 NA Intergenic Intergenic -59276 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 123.75-84 chr18 77669052 77669186 + 1 NA Intergenic Intergenic 324608 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 170.25-82 chr20 503213 503593 + 1 NA intron (NM_001362771, intron 3 of 13) intron (NM_001362771, intron 3 of 13) 40387 NM_001895 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 258.5-59 chr5 65671150 65671620 + 1 NA intron (NM_019072, intron 10 of 10) intron (NM_019072, intron 10 of 10) 46358 NM_024941 80006 Hs.591760 NM_024941 ENSG00000113597 TRAPPC13 C5orf44|SHLD3 trafficking protein particle complex 13 protein-coding 186.5-88 chr3 15868655 15868903 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -4992 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 174.25-2 chr1 23862868 23863232 + 1 NA intron (NM_000147, intron 3 of 7) intron (NM_000147, intron 3 of 7) 5319 NM_000147 2517 Hs.370858 NM_000147 ENSG00000179163 FUCA1 FUCA alpha-L-fucosidase 1 protein-coding 221.25-86 chr7 93667302 93667552 + 1 NA Intergenic Intergenic -49501 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 160.5-115 chr3 56191698 56192039 + 1 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 276599 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 336.25-7 chr15 67562587 67563149 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 2 of 21) intron (NM_001206804, intron 2 of 21) 13774 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 217.5-131 chr9 32557843 32558147 + 1 NA intron (NM_182739, intron 2 of 2) intron (NM_182739, intron 2 of 2) -5367 NM_001195622 10210 Hs.589962 NM_005802 ENSG00000197579 TOPORS LUN|P53BP3|RP31|TP53BPL TOP1 binding arginine/serine rich protein protein-coding 135.5-165 chr5 92024700 92024873 + 1 NA Intergenic Intergenic -641469 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 115.25-227 chr9 138030243 138030470 + 1 NA intron (NM_001243812, intron 20 of 45) L1MC2|LINE|L1 14715 NR_121582 101928786 Hs.678847 NR_121582 LOC101928786 - uncharacterized LOC101928786 ncRNA 231.25-53 chr3 94295689 94296018 + 1 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 232792 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 263.25-6 chr1 221830964 221831479 + 1 NA intron (NR_125989, intron 3 of 3) intron (NR_125989, intron 3 of 3) 9445 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 157.5-165 chr5 107772912 107773095 + 1 NA Intergenic Intergenic -102066 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 237.75-73 chr5 158686098 158686421 + 1 NA Intergenic Intergenic -276486 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 276.5-4 chr1 160054810 160055170 + 1 NA intron (NM_002241, intron 1 of 1) intron (NM_002241, intron 1 of 1) 15170 NM_002241 3766 Hs.408960 NM_002241 ENSG00000177807 KCNJ10 BIRK-10|KCNJ13-PEN|KIR1.2|KIR4.1|SESAME potassium voltage-gated channel subfamily J member 10 protein-coding 188.5-10 chr10 21051349 21051651 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) L1M4c|LINE|L1 -122490 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 161.25-11 chr1 231823139 231823335 + 1 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) -4720 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 196.5-64 chr17 8156845 8157225 + 1 NA Intergenic Intergenic -4631 NM_002616 5187 Hs.445534 NM_002616 ENSG00000179094 PER1 PER|RIGUI|hPER period circadian regulator 1 protein-coding 150.25-91 chr21 18169329 18169596 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) L1M4|LINE|L1 -75371 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 143.5-35 chr11 113106686 113106908 + 1 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -143337 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 177.25-146 chr9 85496310 85496652 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 245548 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 149.75-71 chr18 54725419 54725799 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -102868 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 230.5-109 chr8 68981078 68981359 + 1 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 122972 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 199.5-37 chr14 45428006 45428239 + 1 NA Intergenic Intergenic -174920 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 137.75-52 chr13 63411823 63412031 + 1 NA Intergenic Intergenic -83833 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 150.5-24 chr11 16572953 16573217 + 1 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) -96697 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 165.5-188 chr8 37187321 37187643 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 306431 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 211.75-74 chr5 59343452 59344044 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 13222 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 220.5-70 chr3 21674838 21675193 + 1 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) X8_LINE|LINE|CR1 76195 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 239.5-34 chr15 83123236 83123636 + 1 NA intron (NM_001353881, intron 6 of 9) intron (NM_001353881, intron 6 of 9) 15791 NM_001353879 53346 Hs.513094 NM_023003 ENSG00000136404 TM6SF1 - transmembrane 6 superfamily member 1 protein-coding 174.75-29 chr13 44240974 44241325 + 1 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -44949 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 135.5-59 chr14 66349872 66350120 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -136375 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 113.5-238 chr8 118364506 118364683 + 1 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) MER5B|DNA|hAT-Charlie -252775 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 358.5-15 chr21 32635341 32635791 + 1 NA intron (NM_203446, intron 31 of 32) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -22695 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 186.75-10 chr10 31902022 31902273 + 1 NA intron (NM_001270696, intron 3 of 17) L1MD|LINE|L1 6779 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 205.75-25 chr15 23636875 23637238 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 10811 NM_019066 54551 Hs.141496 NM_019066 ENSG00000254585 MAGEL2 NDNL1|PWLS|SHFYNG|nM15 MAGE family member L2 protein-coding 223.5-34 chr12 80008442 80008901 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -73216 NM_001143885 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 206.25-49 chr2 32629830 32630069 + 1 NA intron (NM_017735, intron 1 of 19) intron (NM_017735, intron 1 of 19) 1899 NM_001193509 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 301.25-12 chr14 85555436 85556020 + 1 NA intron (NR_144387, intron 3 of 4) (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22379 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 200.5-132 chr7 107739370 107739747 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 4074 NR_144536 101927974 Hs.432792 NR_144536 ENSG00000241764 LOC101927974 - uncharacterized LOC101927974 ncRNA 194.25-55 chr2 56971745 56972002 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -786103 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 128.25-79 chr17 82620594 82620856 + 1 NA intron (NM_019613, intron 6 of 9) intron (NM_019613, intron 6 of 9) 27719 NM_019613 56270 Hs.132161 NM_019613 ENSG00000141580 WDR45B NEDSBAS|WDR45L|WIPI-3|WIPI3 WD repeat domain 45B protein-coding 215.75-14 chr10 60454852 60455275 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -65188 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 114.75-76 chr18 59399924 59400100 + 1 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL -40747 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 150.75-61 chr14 77871300 77871489 + 1 NA intron (NM_001366489, intron 4 of 9) AluSx|SINE|Alu 71285 NM_001142545 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 204.75-92 chr5 53553754 53554054 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -6735 NM_002495 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 196.75-110 chr8 130344745 130345063 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -48371 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 157.25-70 chr2 34037911 34038087 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -29227 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 220.5-84 chr4 55820416 55820757 + 1 NA intron (NM_001351574, intron 1 of 2) intron (NM_001351574, intron 1 of 2) 583 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 183.75-50 chr19 11331820 11332147 + 1 NA intron (NM_004283, intron 4 of 4) L1MC5a|LINE|L1 7674 NM_004283 9545 Hs.744916 NM_004283 ENSG00000105514 RAB3D D2-2|GOV|RAB16|RAD3D RAB3D, member RAS oncogene family protein-coding 223.75-46 chr2 102519610 102519985 + 1 NA intron (NM_001011552, intron 8 of 11) intron (NM_001011552, intron 8 of 11) 46571 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 198.25-55 chr2 41761151 41761581 + 1 NA Intergenic Intergenic -116189 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 253.75-19 chr19 2805474 2805866 + 1 NA intron (NM_003249, intron 6 of 12) intron (NM_003249, intron 6 of 12) -14198 NM_001102651 115196 Hs.307043 NM_152303 ENSG00000172006 ZNF554 - zinc finger protein 554 protein-coding 156.5-122 chr3 169167690 169167955 + 1 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -20351 NM_001164000 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 238.25-77 chr6 144696665 144697080 + 1 NA intron (NM_007124, intron 51 of 73) intron (NM_007124, intron 51 of 73) 291217 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 131.5-165 chr3 162268539 162268767 + 1 NA Intergenic Intergenic 771845 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 349.5-13 chr22 38495172 38495823 + 1 NA intron (NM_006386, intron 6 of 12) AluY|SINE|Alu 10814 NM_001098504 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 171.75-3 chr1 52824676 52825108 + 1 NA 3' UTR (NM_024646, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_024646, exon 14 of 14) -17868 NM_001004339 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 262.75-16 chr14 64917073 64917666 + 1 NA intron (NM_001204063, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 2914 NM_001202558 100529261 Hs.325531 NM_001202558 ENSG00000125954 CHURC1-FNTB FNTB|FTase-beta CHURC1-FNTB readthrough protein-coding 148.5-187 chr5 120258509 120258687 + 1 NA Intergenic Intergenic -205680 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 115.75-72 chr15 48462707 48462854 + 1 NA intron (NM_000138, intron 42 of 65) intron (NM_000138, intron 42 of 65) 130583 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 131.25-115 chr2 219953059 219953387 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -46658 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 160.5 chr1 45206889 45207206 + 1 NA promoter-TSS (NM_020883) promoter-TSS (NM_020883) -442 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 270.5-13 chr13 70000379 70000704 + 1 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 -106672 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 124.25-177 chr6 40695182 40695331 + 1 NA Intergenic Intergenic -107892 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 124.5-117 chr2 231746883 231747128 + 1 NA intron (NM_002601, intron 1 of 4) intron (NM_002601, intron 1 of 4) 33691 NR_036262 100422885 NR_036262 ENSG00000283498 MIR1244-2 - microRNA 1244-2 ncRNA 210.25-9 chr10 32619424 32619661 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) intron (NM_001321115, intron 19 of 43) 173402 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 220.5-71 chr3 22459118 22459387 + 1 NA Intergenic Intergenic 502113 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 252.5-74 chr7 19719306 19719797 + 1 NA 3' UTR (NM_001363562, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001363562, exon 5 of 5) -10514 NM_001002926 221830 Hs.353035 NM_001002926 ENSG00000105849 TWISTNB - TWIST neighbor protein-coding 215.25-98 chr7 10151503 10151803 + 1 NA Intergenic Intergenic 517383 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 250.5-67 chr4 61001383 61001752 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 78948 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 133.5-215 chr5 109759585 109759807 + 1 NA intron (NM_002372, intron 5 of 21) L1ME1|LINE|L1 70330 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 150.5-188 chr6 70519613 70519857 + 1 NA intron (NM_020819, intron 11 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -47195 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 197.5-17 chr11 21666327 21666541 + 1 NA Intergenic Intergenic -526651 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 148.5-174 chr4 93469294 93469622 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 10 of 14) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -359295 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 241.75-51 chr3 58887230 58887534 + 1 NA intron (NR_147234, intron 5 of 10) intron (NR_147234, intron 5 of 10) 62911 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 123.25-164 chr5 97349712 97350051 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -154815 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 170.75-19 chr11 20397687 20397996 + 1 NA intron (NM_005788, intron 7 of 15) intron (NM_005788, intron 7 of 15) 10125 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 159.5-64 chr15 96910976 96911318 + 1 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 127712 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 139.25-83 chr2 70564678 70564907 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -10966 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 213.75-63 chr21 35894661 35894994 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 8382 NR_144547 54036 Hs.228809 NR_144547 PPP1R2P2 - protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 2 pseudo 120.75-124 chr4 65884297 65884481 + 1 NA Intergenic Intergenic -213894 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 155.75-43 chr12 85139834 85140191 + 1 NA intron (NM_001079910, intron 19 of 26) intron (NM_001079910, intron 19 of 26) 103661 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 185.5-131 chr5 112905618 112905900 + 1 NA intron (NM_005669, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 16468 NM_005669 7905 Hs.429608 NM_005669 ENSG00000129625 REEP5 C5orf18|D5S346|DP1|TB2|YOP1|Yip2e receptor accessory protein 5 protein-coding 172.25-4 chr1 97802287 97802525 + 1 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) 5485 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 121.5-31 chr10 84127342 84127550 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -12063 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 212.5-46 chr2 54203005 54203312 + 1 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) L1MB7|LINE|L1 53071 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 183.5-158 chr8 139863537 139863771 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -160531 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 257.75-30 chr3 167445728 167446435 + 1 NA intron (NM_001012303, intron 9 of 9) MIRc|SINE|MIR 28051 NM_006217 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 243.75-2 chr1 67065970 67066280 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -11977 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 142.75-75 chr16 73294350 73294608 + 1 NA Intergenic Intergenic -92326 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 207.75-43 chr17 70059060 70059354 + 1 NA intron (NR_104130, intron 1 of 1) intron (NR_104130, intron 1 of 1) 7936 NR_104129 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 205.5-156 chr8 134325359 134325614 + 1 NA Intergenic Intergenic -272585 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 174.25-49 chr14 48850367 48850666 + 1 NA Intergenic Intergenic 735864 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 236.75-2 chr1 93494496 93494785 + 1 NA intron (NM_001024948, intron 1 of 13) MER21C|LTR|ERVL 46509 NM_001024948 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 164.5-192 chr7 86589962 86590183 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -53837 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 198.75-14 chr11 30330450 30330715 + 1 NA intron (NM_152316, intron 1 of 3) intron (NM_152316, intron 1 of 3) 7478 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 138.75-71 chr17 35111622 35111867 + 1 NA intron (NR_037711, intron 2 of 8) L1MC4|LINE|L1 8014 NM_133629 5892 Hs.631757 NM_002878 ENSG00000185379 RAD51D BROVCA4|R51H3|RAD51L3|TRAD RAD51 paralog D protein-coding 155.5-27 chr10 75444311 75444675 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 12869 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 130.5-58 chr11 36525842 36526045 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -15671 NM_004620 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 264.75-63 chr9 84612738 84613036 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -55571 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 132.75-125 chr3 106427287 106427574 + 1 NA Intergenic Intergenic -558029 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 163.25-62 chr2 105761003 105761306 + 1 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) 16091 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 161.5-67 chr15 70722374 70722619 + 1 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) AluJo|SINE|Alu -20214 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 218.5-85 chr4 57378769 57379047 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -46964 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 294.5-29 chr3 44099368 44099865 + 1 NA Intergenic Intergenic -14596 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 193.5-54 chr15 63541414 63541671 + 1 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) intron (NM_006537, intron 3 of 14) 36949 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 201.5-134 chr9 26936893 26937173 + 1 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) AluSq10|SINE|Alu -9957 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 231.75-47 chr3 68303402 68303633 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) AluY|SINE|Alu -197120 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 136.5-112 chr2 67085739 67085937 + 1 NA promoter-TSS (NR_110564) promoter-TSS (NR_110564) -608 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 318.5 chr1 51637583 51637997 + 1 NA intron (NM_148906, intron 1 of 22) MamRep605|LTR?|LTR? 20698 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 123.5-217 chr9 207396 207710 + 1 NA Intergenic Intergenic -7312 NM_203447 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 139.5-104 chr2 135633709 135633954 + 1 NA intron (NM_001282798, intron 9 of 25) intron (NM_001282798, intron 9 of 25) -31566 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 141.5-147 chr3 126254673 126254895 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -73598 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 132.25-137 chr4 811408 811595 + 1 NA intron (NM_006651, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 14628 NM_006651 10815 Hs.478930 NM_006651 ENSG00000168993 CPLX1 CPX-I|CPX1|EIEE63 complexin 1 protein-coding 296.25-13 chr15 95249901 95250260 + 1 NA Intergenic Intergenic 77020 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 145.5-145 chr4 88376100 88376267 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -2556 NM_001165136 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 193.25-103 chr6 153314628 153314941 + 1 NA Intergenic Intergenic -183502 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 174.25-131 chr7 13378353 13378738 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 607969 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 201.5-37 chr12 5989726 5990058 + 1 NA intron (NM_000552, intron 38 of 51) intron (NM_000552, intron 38 of 51) -43660 NM_001278597 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 147.5-179 chr5 136349345 136349576 + 1 NA intron (NM_020389, intron 2 of 11) intron (NM_020389, intron 2 of 11) 16016 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 279.25-19 chr19 55615454 55615851 + 1 NA exon (NM_001195605, exon 1 of 1) exon (NM_001195605, exon 1 of 1) 2059 NM_001195605 100507290 Hs.729114 NM_001195605 ENSG00000261221 ZNF865 - zinc finger protein 865 protein-coding 259.5-98 chr8 129605311 129605628 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1PA4|LINE|L1 -30451 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 242.5-60 chr4 84779630 84780114 + 1 NA intron (NM_014991, intron 26 of 67) intron (NM_014991, intron 26 of 67) -185744 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 228.5-97 chr7 47659512 47659908 + 1 NA 3' UTR (NM_001123065, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001123065, exon 3 of 3) 4466 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 296.5-46 chr9 88017345 88018048 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -42916 NM_001039803 23552 Hs.522274 NM_012119 ENSG00000156345 CDK20 CCRK|CDCH|P42|PNQALRE cyclin dependent kinase 20 protein-coding 170.25-133 chr5 145314071 145314277 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 521168 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 152.25-41 chr12 73497076 73497372 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 338034 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 417.25-5 chr22 27657893 27658763 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 143428 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 240.25-41 chr20 37538624 37539088 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -10925 NM_001167820 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 121.5-80 chr14 78220821 78220959 + 1 NA intron (NR_073547, intron 1 of 20) intron (NR_073547, intron 1 of 20) 50517 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 259.5-65 chr22 43394645 43394964 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5527 NR_146918 105373054 NR_146918 ENSG00000236117 LINC01639 - long intergenic non-protein coding RNA 1639 ncRNA 282.25-14 chr2 96210420 96210732 + 1 NA intron (NR_046322, intron 1 of 3) HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -1741 NM_020151 56910 Hs.469331 NM_020151 ENSG00000084090 STARD7 GTT1 StAR related lipid transfer domain containing 7 protein-coding 187.25-43 chr18 4971576 4971858 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -109465 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 151.25 chr1 35450742 35451064 + 1 NA intron (NM_024874, intron 13 of 20) intron (NM_024874, intron 13 of 20) -84826 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 173.25-19 chr10 103397991 103398275 + 1 NA intron (NM_014976, intron 1 of 35) L2c|LINE|L2 1507 NM_014976 22984 Hs.239499 NM_014976 ENSG00000148843 PDCD11 ALG-4|ALG4|NFBP|RRP5 programmed cell death 11 protein-coding 156.5-47 chr13 57107125 57107299 + 1 NA Intergenic Intergenic -33706 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 116.75-114 chr21 28585912 28586048 + 1 NA Intergenic Intergenic 46662 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 152.25-15 chr10 23292418 23292652 + 1 NA intron (NM_001365862, intron 5 of 15) intron (NM_001365862, intron 5 of 15) -51422 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 151.5-88 chr2 141896741 141897093 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 234784 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 191.75-112 chr6 115822689 115823070 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -179044 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 208.5-106 chr5 6338122 6338374 + 1 NA promoter-TSS (NR_028351) promoter-TSS (NR_028351) -956 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 244.25-38 chr5 45148866 45149331 + 1 NA Intergenic Intergenic 340151 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 145.5-52 chr13 36480026 36480264 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 47650 NM_003914 8900 Hs.417050 NM_003914 ENSG00000133101 CCNA1 CT146 cyclin A1 protein-coding 112.5-203 chr5 168262531 168262710 + 1 NA exon (NM_001368146, exon 28 of 28) exon (NM_001368146, exon 28 of 28) -29025 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 266.5-78 chr8 119433603 119434068 + 1 NA Intergenic Intergenic 17389 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 198.25-4 chr1 173078476 173078889 + 1 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 -27719 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 207.25-20 chr14 34600405 34600648 + 1 NA intron (NM_001366519, intron 5 of 12) FLAM_C|SINE|Alu 29622 NM_001366519 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 241.25-9 chr1 227029540 227029838 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 29 of 36) intron (NM_001366019, intron 29 of 36) 89395 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 153.5-130 chr3 70637558 70637819 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -325050 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 251.5-59 chr4 37046024 37046350 + 1 NA Intergenic Intergenic 44408 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 202.5-146 chr9 28002482 28002835 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -428792 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 154.75-119 chr5 133646135 133646420 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33736 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 241.75-71 chr6 138801472 138802014 + 1 NA intron (NM_001195037, intron 1 of 20) AluSx|SINE|Alu 5632 NM_001195037 345930 Hs.660603 NM_001077706 ENSG00000203734 ECT2L ARHGEF32|C6orf91|FBXO49|LFDH|dJ509I19.2|dJ509I19.3|dJ509I19.5 epithelial cell transforming 2 like protein-coding 161.5-201 chrX 80338750 80338971 + 1 NA intron (NM_001170574, intron 2 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 3356 NM_001170574 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 198.5-31 chr12 64861970 64862213 + 1 NA intron (NM_001364838, intron 8 of 11) L3|LINE|CR1 -21683 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 253.25-64 chr8 131340269 131340591 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -299521 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 292.5-36 chr3 4881554 4882153 + 1 NA Intergenic Intergenic 24648 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-96 chr3 85377597 85377772 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -8026 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 335.25-15 chr17 50290950 50291451 + 1 NA Intergenic Intergenic -3345 NR_125805 103752589 Hs.612913 NR_125805 ENSG00000251179 TMEM92-AS1 TCONS_00025237|lncRNA-508851 TMEM92 antisense RNA 1 ncRNA 211.75-68 chr4 106624765 106625180 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 191348 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 127.5-109 chr2 36399634 36399880 + 1 NA intron (NM_016441, intron 2 of 16) L2|LINE|L2 43979 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 211.5-71 chr2 31549591 31550000 + 1 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) L1MD|LINE|L1 31143 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 189.5-50 chr15 100231828 100232420 + 1 NA intron (NM_139057, intron 7 of 21) intron (NM_139057, intron 7 of 21) 109851 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 274.75-23 chr2 21533465 21533808 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 177016 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 244.75-12 chr11 1902612 1902978 + 1 NA intron (NR_120534, intron 2 of 3) MER41A|LTR|ERV1 6036 NR_120534 101927624 Hs.523404 NR_120534 LINC01150 2G7|TCONS_00019134 long intergenic non-protein coding RNA 1150 ncRNA 115.5-181 chr3 193512401 193512608 + 1 NA intron (NM_032279, intron 2 of 29) intron (NM_032279, intron 2 of 29) -40709 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 158.5-178 chr7 40091666 40091882 + 1 NA intron (NM_031267, intron 12 of 13) intron (NM_031267, intron 12 of 13) 42848 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 224.25-107 chr8 109022822 109023077 + 1 NA Intergenic Intergenic -63679 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 243.5-6 chr1 107024739 107025144 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -31733 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 344.25-2 chr1 200774788 200775641 + 1 NA intron (NM_001297707, intron 2 of 17) L2a|LINE|L2 35642 NM_001297708 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 159.5-15 chr10 10297605 10297849 + 1 NA Intergenic Intergenic 164622 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 231.75-68 chr7 30364539 30364842 + 1 NA intron (NM_147128, intron 4 of 4) intron (NM_147128, intron 4 of 4) -5360 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 122.75-183 chr7 48231285 48231520 + 1 NA intron (NM_152701, intron 7 of 61) L2b|LINE|L2 59944 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 292.25-31 chr4 55943064 55943450 + 1 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 -5688 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 387.25-6 chr2 65912814 65913441 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 445201 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 220.25-55 chr4 70136302 70136696 + 1 NA intron (NR_033311, intron 2 of 7) intron (NR_033311, intron 2 of 7) 2895 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 133.5-248 chr7 90598230 90598490 + 1 NA intron (NM_001287135, intron 1 of 14) intron (NM_001287135, intron 1 of 14) 2039 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 140.5-187 chr5 146427285 146427453 + 1 NA Intergenic Intergenic -19964 NM_001040006 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 150.25-143 chr7 79749975 79750186 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 296120 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 204.75-36 chr14 63074656 63075191 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29465 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 274.25-49 chr8 127571184 127571962 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -89434 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 266.75-4 chr1 154727600 154727955 + 1 NA intron (NM_170782, intron 4 of 7) intron (NM_170782, intron 4 of 7) -99780 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 302.5-15 chr16 86676340 86676864 + 1 NA Intergenic Intergenic 45357 NR_135181 101928614 Hs.399823 NR_135181 ENSG00000260026 LINC02189 - long intergenic non-protein coding RNA 2189 ncRNA 210.5-14 chr10 17167375 17167675 + 1 NA intron (NM_001321006, intron 2 of 8) intron (NM_001321006, intron 2 of 8) 34147 NM_001351219 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 227.75-29 chr19 45761950 45762348 + 1 NA exon (NM_001310124, exon 13 of 15) exon (NM_001310124, exon 13 of 15) -5647 NR_147193 109729182 Hs.664071 NR_147193 ENSG00000267395 DM1-AS - DM1 locus antisense RNA ncRNA 360.25-17 chr8 125776060 125776735 + 1 NA Intergenic Intergenic 174800 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 116.25-93 chr18 71376168 71376408 + 1 NA Intergenic Intergenic 202668 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 197.5-14 chr10 61947708 61948058 + 1 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 46184 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 213.5-88 chr4 47833089 47833497 + 1 NA intron (NR_125881, intron 1 of 2) L1MA10|LINE|L1 1948 NR_125881 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 130.25-34 chr10 109941427 109941665 + 1 NA Intergenic Intergenic -17993 NM_001167604 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 313.25-25 chr5 109785501 109786150 + 1 NA intron (NM_002372, intron 10 of 21) intron (NM_002372, intron 10 of 21) 96459 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 297.25-13 chr2 64772997 64773386 + 1 NA Intergenic Intergenic 90440 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 219.75-63 chr5 75348908 75349253 + 1 NA intron (NM_001364187, intron 6 of 19) intron (NM_001364187, intron 6 of 19) 11860 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 179.5-90 chr2 37507067 37507336 + 1 NA Intergenic Intergenic 162571 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 199.75-69 chr4 59481407 59481774 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 468017 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 223.5-135 chr8 131804621 131804986 + 1 NA Intergenic Intergenic -99290 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 161.25-104 chr20 6658506 6658948 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 77409 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 136.5-174 chr5 25981788 25982023 + 1 NA Intergenic Intergenic 790952 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 139.5-131 chr3 56710919 56711227 + 1 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -27808 NM_001365635 23272 Hs.116877 NM_015224 ENSG00000163946 TASOR C3orf63|FAM208A|RAP140|TASOR1|se89-1 transcription activation suppressor protein-coding 157.5-95 chr2 36532798 36533012 + 1 NA intron (NM_016441, intron 13 of 16) MIR|SINE|MIR 65263 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 258.75-62 chr6 48530864 48531254 + 1 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -462370 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 240.75-71 chr7 88520305 88520710 + 1 NA Intergenic Intergenic -213613 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 217.25-45 chr2 141098342 141098692 + 1 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -511832 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 181.25-114 chr6 101492169 101492463 + 1 NA intron (NM_001166247, intron 1 of 16) intron (NM_001166247, intron 1 of 16) 93331 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 196.5-74 chr19 51166175 51166485 + 1 NA promoter-TSS (NR_047529) promoter-TSS (NR_047529) -998 NR_047530 284367 Hs.132045 NR_002804 ENSG00000171101 SIGLEC17P HSPC078|SIGLECP2|SIGLECP3 sialic acid binding Ig like lectin 17, pseudogene pseudo 233.5-101 chr7 43311369 43311751 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) intron (NM_001287059, intron 2 of 27) 160665 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 292.25-10 chr10 33508320 33508759 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -173634 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 323.5-33 chr8 130658237 130658748 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -214818 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 153.75-15 chr10 19523819 19524196 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 31 of 39) intron (NM_001142308, intron 31 of 39) 204543 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 163.25-112 chr5 55143653 55144001 + 1 NA intron (NM_001145734, intron 3 of 10) intron (NM_001145734, intron 3 of 10) -16344 NM_001306197 493869 Hs.289044 NM_001008397 ENSG00000164294 GPX8 EPLA847|GPx-8|GSHPx-8|UNQ847 glutathione peroxidase 8 (putative) protein-coding 125.25-107 chr2 120002285 120002503 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10683 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 153.25-25 chr11 109837569 109837872 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -255672 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 123.75-169 chr7 11585957 11586299 + 1 NA intron (NM_015204, intron 4 of 26) intron (NM_015204, intron 4 of 26) 246070 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 183.75-29 chr12 44142570 44142753 + 1 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 306580 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 120.25-213 chr8 80580247 80580415 + 1 NA Intergenic Intergenic 94105 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 166.25-129 chr5 80853612 80853852 + 1 NA intron (NM_002439, intron 20 of 23) intron (NM_002439, intron 20 of 23) -106631 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 160.5-161 chr6 144223735 144223971 + 1 NA Intergenic Intergenic -67884 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 182.5-4 chr1 105721471 105721796 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -102698 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 118.25-171 chr6 58073594 58073764 + 1 NA Intergenic Intergenic -112233 NR_003660 106660613 Hs.561539 NR_003660 ENSG00000283352 LINC00680-GUSBP4 - LINC00680-GUSBP4 readthrough pseudo 165.5-92 chr2 187259001 187259277 + 1 NA Intergenic Intergenic 189113 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 158.5-164 chr6 418454 418770 + 1 NA Intergenic Intergenic 26860 NR_046000 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 268.75-9 chr13 38507385 38507865 + 1 NA Intergenic Intergenic -60099 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 135.5-141 chr3 141071022 141071243 + 1 NA intron (NM_080862, intron 2 of 2) intron (NM_080862, intron 2 of 2) 19785 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 184.75-49 chr2 51224829 51225092 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 192359 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 308.75-2 chr1 192682090 192682714 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33926 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 205.25-95 chr6 129588166 129588449 + 1 NA intron (NM_033515, intron 12 of 14) AluSz|SINE|Alu 121870 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 307.5-33 chr3 5485061 5485388 + 1 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -234969 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 123.75-20 chr10 121216072 121216282 + 1 NA Intergenic Intergenic 315137 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 172.75-68 chr2 173440945 173441156 + 1 NA Intergenic Intergenic 86178 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 159.25-106 chr4 111389147 111389480 + 1 NA Intergenic Intergenic -528666 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 271.75-34 chr4 45976168 45976667 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 147637 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 250.25-29 chr20 540258 540664 + 1 NA intron (NM_001362770, intron 1 of 14) MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR 3329 NM_001895 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 195.5-11 chr10 8791698 8792073 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -106104 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 168.5-2 chr1 17905704 17905914 + 1 NA Intergenic (TGAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 150476 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 169.5-180 chr9 98194643 98194902 + 1 NA Intergenic Intergenic -2135 NM_052820 7464 Hs.113094 NM_003389 ENSG00000106789 CORO2A CLIPINB|IR10|WDR2 coronin 2A protein-coding 316.5-38 chr8 88326010 88326451 + 1 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 1253 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 192.75-131 chr9 31618613 31618825 + 1 NA Intergenic Intergenic -237229 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 152.75-71 chr17 71442448 71442811 + 1 NA Intergenic Intergenic -240450 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 136.25-106 chr20 2872299 2872637 + 1 NA intron (NM_002836, intron 5 of 27) CpG -1028 NM_080840 5786 Hs.269577 NM_002836 ENSG00000132670 PTPRA HEPTP|HLPR|HPTPA|HPTPalpha|LRP|PTPA|PTPRL2|R-PTP-alpha|RPTPA protein tyrosine phosphatase receptor type A protein-coding 160.25-9 chr10 37526048 37526454 + 1 NA Intergenic Intergenic 76680 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 196.75-115 chr9 94003270 94003540 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -27408 NM_177995 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 250.75-49 chr4 61738356 61738686 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) L1PB1|LINE|L1 423244 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 168.5-43 chr12 23281736 23282010 + 1 NA Intergenic Intergenic 106237 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 134.25-81 chr2 60917104 60917286 + 1 NA intron (NM_002908, intron 5 of 10) L1ME4a|LINE|L1 35621 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 142.5-14 chr1 112797526 112797833 + 1 NA Intergenic Intergenic 52964 NR_103746 100996702 Hs.632431 NR_103746 ENSG00000215866 LINC01356 - long intergenic non-protein coding RNA 1356 ncRNA 216.5-60 chr2 170075529 170075840 + 1 NA intron (NM_172070, intron 36 of 38) intron (NM_172070, intron 36 of 38) -102463 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 146.5-107 chr2 104115358 104115571 + 1 NA Intergenic Intergenic 292868 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 186.5-75 chr2 231225019 231225356 + 1 NA intron (NM_001352757, intron 6 of 19) intron (NM_001352757, intron 6 of 19) 26556 NR_148040 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 125.5-181 chr3 103821027 103821255 + 1 NA Intergenic Intergenic -297025 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 157.25-137 chr7 18081558 18081800 + 1 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -5146 NM_001321868 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 132.25-66 chr15 91635155 91635404 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 171940 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 282.25-33 chr7 3361116 3361669 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 60140 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 172.25-86 chr3 49597044 49597426 + 1 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) L1MD2|LINE|L1 42758 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 239.75-42 chr21 33290822 33291326 + 1 NA intron (NM_000628, intron 6 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 24707 NM_000628 3588 Hs.654593 NM_000628 ENSG00000243646 IL10RB CDW210B|CRF2-4|CRFB4|D21S58|D21S66|IL-10R2 interleukin 10 receptor subunit beta protein-coding 211.75-56 chr22 46258226 46258487 + 1 NA exon (NM_006071, exon 1 of 1) exon (NM_006071, exon 1 of 1) 4987 NM_006071 10343 Hs.241383 NM_006071 ENSG00000130943 PKDREJ - polycystin family receptor for egg jelly protein-coding 126.5-220 chr7 23254228 23254410 + 1 NA intron (NM_001005340, intron 3 of 10) intron (NM_001005340, intron 3 of 10) 7544 NM_001005340 10457 Hs.190495 NM_002510 ENSG00000136235 GPNMB HGFIN|NMB|PLCA3 glycoprotein nmb protein-coding 160.25-30 chr12 119387710 119388059 + 1 NA intron (NM_178499, intron 1 of 13) L1ME3G|LINE|L1 53155 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 249.75-42 chr3 51226897 51227384 + 1 NA intron (NM_004947, intron 15 of 52) intron (NM_004947, intron 15 of 52) -158151 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 235.25-43 chr3 31263438 31263898 + 1 NA Intergenic Intergenic -101881 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 157.25-42 chr14 59857328 59857573 + 1 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 13326 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 208.5-31 chr12 40308602 40309003 + 1 NA intron (NM_198578, intron 29 of 50) intron (NM_198578, intron 29 of 50) 83805 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 170.25-41 chr15 61415678 61415949 + 1 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -186511 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 155.75-95 chr20 62876199 62876378 + 1 NA Intergenic Intergenic 6615 NR_145839 109623463 NR_145839 SNORA117 - small nucleolar RNA, H/ACA box 117 snoRNA 126.75-31 chr11 91841962 91842256 + 1 NA Intergenic Intergenic -382925 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 149.25-146 chr5 112103805 112104026 + 1 NA Intergenic MER106B|DNA|hAT-Charlie -56611 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 168.5-193 chr8 141865771 141865998 + 1 NA Intergenic Intergenic -79571 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 186.25-93 chr5 133407516 133407849 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 20024 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 230.5-38 chr15 26983323 26983802 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu 12381 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 193.5-40 chr13 30067889 30068154 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 40854 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 139.75-126 chr3 160144559 160144815 + 0.75 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) intron (NR_108088, intron 3 of 9) 62405 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 388.75-14 chrX 84548815 84549751 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -46830 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 116.25-166 chr4 102595217 102595489 + 0.75 NA intron (NM_003998, intron 13 of 23) intron (NM_003998, intron 13 of 23) -92867 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 161.5-44 chr12 60582808 60583047 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 893557 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 125.75-200 chrX 57899939 57900199 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10564 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 255-14 chr12 125068578 125069046 + 0.75 NA intron (NM_001319839, intron 1 of 16) intron (NM_001319839, intron 1 of 16) 3377 NM_001319840 65985 Hs.656073 NM_023928 ENSG00000081760 AACS ACSF1|SUR-5 acetoacetyl-CoA synthetase protein-coding 119-135 chr4 101238904 101239176 + 0.75 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 1832 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 166-121 chr7 107308871 107309289 + 0.75 NA intron (NM_181733, intron 11 of 20) L1MC5|LINE|L1 140077 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 201-78 chr8 117781587 117781912 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139164 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 196.5-100 chr3 23122083 23122513 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 80280 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 171-138 chr9 120765354 120765698 + 0.75 NA intron (NM_012164, intron 7 of 7) MIR3|SINE|MIR 27890 NM_012164 26190 Hs.494985 NM_012164 ENSG00000119402 FBXW2 FBW2|Fwd2|Md6 F-box and WD repeat domain containing 2 protein-coding 323-25 chr7 31533616 31534422 + 0.75 NA intron (NM_001257968, intron 1 of 14) MER1B|DNA|hAT-Charlie 4557 NM_001257968 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 213.75-90 chr5 57658513 57659026 + 0.75 NA intron (NR_104668, intron 1 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 8109 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 115-191 chr9 18026863 18027080 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -447182 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 121.5-124 chr2 11528864 11529088 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5069 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 234-34 chr22 30607523 30607844 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001282328) promoter-TSS (NM_001282328) 509 NM_000355 6948 Hs.417948 NM_000355 ENSG00000185339 TCN2 D22S676|D22S750|II|TC|TC II|TC-2|TC2|TCII transcobalamin 2 protein-coding 136.75-51 chr12 102467523 102467722 + 0.75 NA intron (NM_000618, intron 2 of 3) intron (NM_000618, intron 2 of 3) 10928 NM_001111284 3479 Hs.160562 NM_000618 ENSG00000017427 IGF1 IGF|IGF-I|IGFI|MGF insulin like growth factor 1 protein-coding 179.5-48 chr12 103080899 103081181 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70802 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 271.5-59 chr3 175945625 175946183 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -169571 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 233-51 chr5 3123035 3123421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54607 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 225.5-39 chr15 47203164 47203641 + 0.75 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) LTR48|LTR|ERV1 19313 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 143.75-150 chr6 23010402 23010729 + 0.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -292641 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 171.75-12 chr1 222032614 222032994 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54284 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 170.5-37 chr11 63134944 63135292 + 0.75 NA intron (NM_173586, intron 1 of 3) intron (NM_173586, intron 1 of 3) 9103 NM_173586 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 115-36 chr12 7575363 7575600 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -71663 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 146.75-169 chr8 133221831 133222169 + 0.75 NA intron (NM_003882, intron 3 of 4) (GATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30961 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 187.75-113 chr8 72695652 72696168 + 0.75 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -36135 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 164.75-130 chr7 1288015 1288406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55338 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 189-43 chr16 85043211 85043591 + 0.75 NA intron (NM_001286566, intron 1 of 11) intron (NM_001286566, intron 1 of 11) 15650 NM_001286566 9764 Hs.301658 NM_014732 ENSG00000135709 KIAA0513 - KIAA0513 protein-coding 136.5-70 chr14 60902611 60902885 + 0.75 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L1M4|LINE|L1 78331 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 173.25-117 chr7 51135901 51136270 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) intron (NM_015198, intron 6 of 12) 180724 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 125-126 chr5 28548842 28549133 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -261322 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 242.5-41 chr18 12822313 12822774 + 0.75 NA intron (NM_001207013, intron 5 of 10) intron (NM_001207013, intron 5 of 10) 18419 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 123.5-18 chr1 226369599 226369808 + 0.75 NA intron (NM_001618, intron 15 of 22) AluSz6|SINE|Alu 38390 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 161.75-59 chr2 34592100 34592578 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85218 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 115.75-217 chr8 97818342 97818664 + 0.75 NA intron (NM_018407, intron 4 of 6) intron (NM_018407, intron 4 of 6) 42715 NM_018407 55353 Hs.492314 NM_018407 ENSG00000104341 LAPTM4B LAPTM4beta|LC27 lysosomal protein transmembrane 4 beta protein-coding 152.75 chr1 24439353 24439690 + 0.75 NA intron (NM_001322862, intron 3 of 12) intron (NM_001322862, intron 3 of 12) 23496 NM_001322857 57185 Hs.523442 NM_020448 ENSG00000001461 NIPAL3 DJ462O23.2|NPAL3 NIPA like domain containing 3 protein-coding 150.75-129 chr3 70715655 70715897 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 349148 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 145-8 chr1 111147741 111148139 + 0.75 NA non-coding (NR_138483, exon 2 of 10) non-coding (NR_138483, exon 2 of 10) 7717 NM_006090 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 145.25-108 chr3 158677936 158678136 + 0.75 NA intron (NM_001308164, intron 14 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5388 NM_020169 56925 Hs.478067 NM_020169 ENSG00000079257 LXN ECI|TCI latexin protein-coding 201-4 chr1 90181070 90181382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186116 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 158.75-128 chr4 133469262 133469506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 320090 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 188.75-83 chr4 42645292 42645581 + 0.75 NA intron (NM_001105529, intron 1 of 35) intron (NM_001105529, intron 1 of 35) 11669 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 160.25-167 chr9 72659584 72659884 + 0.75 NA intron (NM_138691, intron 5 of 23) intron (NM_138691, intron 5 of 23) 137933 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 210.25-82 chr8 129378333 129378910 + 0.75 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) intron (NR_130918, intron 1 of 2) 105521 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 160-68 chr3 145356944 145357223 + 0.75 NA Intergenic HERVIP10FH-int|LTR|ERV1 712102 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 201.75-61 chr3 66142219 66142532 + 0.75 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) LTR29|LTR|ERV1 8765 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 115.75-213 chr8 81866548 81866731 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -24353 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 134.75-158 chr4 48798828 48799158 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18694 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 206.75-67 chr5 36774429 36774844 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 102058 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 254.75-27 chr2 185086943 185087369 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 79916 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 125-47 chr15 93351427 93351628 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 145461 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 190.25-41 chr15 25601988 25602371 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -163123 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 166.5-145 chr4 53873536 53873850 + 0.75 NA Intergenic ORSL-2a|DNA|hAT-Tip100 113589 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 196.25-86 chr3 142027879 142028365 + 0.75 NA intron (NM_001178139, intron 3 of 12) intron (NM_001178139, intron 3 of 12) 504 NM_001178141 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 157-5 chr1 165738708 165739029 + 0.75 NA intron (NM_001256164, intron 6 of 6) intron (NM_001256164, intron 6 of 6) 30000 NM_001366129 54499 Hs.31498 NM_019026 ENSG00000143183 TMCO1 HP10122|PCIA3|PNAS-136|TMCC4 transmembrane and coiled-coil domains 1 protein-coding 143.75-201 chr9 116168320 116168598 + 0.75 NA intron (NM_002581, intron 1 of 21) L2c|LINE|L2 14668 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 167.75-30 chr11 45184285 45184700 + 0.75 NA intron (NM_001256695, intron 4 of 7) L2b|LINE|L2 37149 NM_001256695 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 124.25-155 chr4 189341004 189341214 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -318497 NR_121679 101928971 Hs.519164 NR_121679 ENSG00000250739 LINC01262 TCONS_l2_00021807 long intergenic non-protein coding RNA 1262 ncRNA 155.5-209 chr8 130589993 130590298 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -146471 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 156.75-105 chr20 57905438 57905780 + 0.75 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -98295 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 114-39 chr12 88821939 88822091 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 197677 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 171.25-106 chr3 184782966 184783448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10052 NR_110043 101928992 Hs.507129 NR_110043 ENSG00000229433 LINC02069 - long intergenic non-protein coding RNA 2069 ncRNA 197.25-18 chr11 107004476 107004947 + 0.75 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 13765 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 170.75-93 chr4 33211937 33212278 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 827786 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 133.75-56 chr14 50629958 50630316 + 0.75 NA intron (NM_015915, intron 13 of 13) intron (NM_015915, intron 13 of 13) 38169 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 140.25-167 chr6 118528748 118529028 + 0.75 NA intron (NM_001042475, intron 3 of 12) intron (NM_001042475, intron 3 of 12) -19408 NM_002667 5350 Hs.170839 NM_002667 ENSG00000198523 PLN CMD1P|CMH18|PLB phospholamban protein-coding 116.5-135 chr2 218813157 218813429 + 0.75 NA intron (NM_000784, intron 5 of 8) intron (NM_000784, intron 5 of 8) -9797 NR_128707 103504730 NR_128707 ENSG00000283639 MIR9500 hsa-mir-9500 microRNA 9500 ncRNA 168-93 chr4 172157724 172158030 + 0.75 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -344270 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 155.75-110 chr3 139779407 139779637 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -101472 NM_001363968 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 166-8 chr10 30889674 30889942 + 0.75 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) intron (NM_001143766, intron 5 of 7) 109709 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 142.75-172 chr7 14502862 14503091 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) intron (NM_001350717, intron 19 of 24) 338474 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 185.75-108 chr6 139194536 139194980 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 59678 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 166.75-85 chr21 15872347 15872605 + 0.75 NA intron (NM_001283042, intron 22 of 24) intron (NM_001283042, intron 22 of 24) 142494 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 141-148 chr7 83585973 83586224 + 0.75 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 55333 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 168.75-45 chr14 66322283 66322756 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -163852 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 183.75-10 chr1 201241557 201241884 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -41732 NM_000299 5317 Hs.497350 NM_000299 ENSG00000081277 PKP1 B6P plakophilin 1 protein-coding 158.5-118 chr20 53195974 53196264 + 0.75 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) intron (NM_001193421, intron 1 of 2) 10836 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 218.5-33 chr12 62550051 62550452 + 0.75 NA intron (NM_001278469, intron 23 of 35) AluJr|SINE|Alu 53183 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 117.75-218 chr8 139625427 139625664 + 0.75 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 77578 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 174.75-37 chr15 61485261 61485657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -244459 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 195.5-131 chr6 42141456 42141897 + 0.75 NA intron (NM_001164446, intron 1 of 4) intron (NM_001164446, intron 1 of 4) 944 NM_001164446 647024 Hs.444277 NM_001164446 ENSG00000188112 C6orf132 bA7K24.2 chromosome 6 open reading frame 132 protein-coding 186.5-138 chr8 121208367 121208772 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -396523 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 177.5-121 chr3 184404267 184404526 + 0.75 NA intron (NR_161198, intron 1 of 2) intron (NR_161198, intron 1 of 2) 2859 NR_161199 105374250 Hs.129464 NR_161198 LINC02054 - long intergenic non-protein coding RNA 2054 ncRNA 242.75-11 chr10 86448933 86449392 + 0.75 NA intron (NM_001318328, intron 15 of 18) intron (NM_001318328, intron 15 of 18) 72622 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 282.5-43 chr3 96690961 96691530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123349 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 130-97 chr22 28439686 28440015 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSq2|SINE|Alu -20019 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 161-37 chr14 53099556 53099903 + 0.75 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) intron (NM_030637, intron 2 of 11) 53594 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 131-59 chr15 24078338 24078614 + 0.75 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) LTR12C|LTR|ERV1 91472 NR_152824 791115 Hs.560378 NR_026647 ENSG00000260551 PWRN2 NCRNA00199 Prader-Willi region non-protein coding RNA 2 ncRNA 126-10 chr1 168649102 168649391 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 72641 NM_002995 6375 Hs.546295 NM_002995 ENSG00000143184 XCL1 ATAC|LPTN|LTN|SCM-1|SCM-1a|SCM1|SCM1A|SCYC1 X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 256-44 chr3 35436770 35437186 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -42955 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 117-43 chr12 96714462 96714800 + 0.75 NA intron (NM_001306084, intron 48 of 67) L2a|LINE|L2 -192626 NM_001135176 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 182-7 chr1 173341434 173341855 + 0.75 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 119718 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 212.75-68 chr3 194600471 194600839 + 0.75 NA intron (NM_138399, intron 9 of 10) AluSc|SINE|Alu 16387 NR_047575 100507297 Hs.586059 NR_047573 TMEM44-AS1 - TMEM44 antisense RNA 1 ncRNA 164.5-97 chr2 72815823 72816353 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) AluSx1|SINE|Alu 9945 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 205.75-78 chr7 25594178 25594570 + 0.75 NA non-coding (NR_157808, exon 5 of 5) non-coding (NR_157808, exon 5 of 5) 68766 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 291.5-11 chr14 30583903 30584415 + 0.75 NA intron (NM_017769, intron 2 of 14) L1MB5|LINE|L1 -6802 NR_151720 105370431 Hs.603980 NR_151720 ENSG00000257636 G2E3-AS1 CAT1647 G2E3 antisense RNA 1 ncRNA 121.5-78 chr14 65061734 65062067 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001202559, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001202559, exon 14 of 14) 17212 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 131.25-134 chr3 66618584 66618924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118333 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 232.25-23 chr14 44954957 44955286 + 0.75 NA intron (NM_017658, intron 1 of 4) L1MC5|LINE|L1 6364 NM_001308112 54813 Hs.550906 NM_017658 ENSG00000179454 KLHL28 BTBD5 kelch like family member 28 protein-coding 128.5-179 chr6 380367 380675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11231 NM_001195286 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 137.5-220 chr7 34478973 34479306 + 0.75 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -179079 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 239.75-28 chr17 39646288 39646728 + 0.75 NA intron (NM_001165938, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 9364 NM_006804 10948 Hs.728838 NM_006804 ENSG00000131748 STARD3 CAB1|MLN64|es64 StAR related lipid transfer domain containing 3 protein-coding 184.5-32 chr11 114512744 114512997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47011 NM_152315 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 205.25-20 chr12 112827371 112827743 + 0.75 NA intron (NM_001347955, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 35809 NR_145126 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 155-35 chr14 47074163 47074404 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 268963 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 126.25-104 chr21 35398268 35398515 + 0.75 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 182373 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 197.75-40 chr2 45333457 45333727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78651 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 116.25-143 chr3 104666630 104666949 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -699924 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 202.5-11 chr10 8136461 8136964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 82024 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 179.75-140 chr9 27909187 27909585 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -335520 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 191.75-59 chr2 24640891 24641296 + 0.75 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) L1M4a1|LINE|L1 56616 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 123.75-42 chr12 110745083 110745294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2297 NM_002710 5501 Hs.79081 NM_002710 ENSG00000186298 PPP1CC PP-1G|PP1C|PPP1G protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma protein-coding 124.25-87 chr19 34962283 34962481 + 0.75 NA intron (NM_175872, intron 1 of 3) MER89|LTR|ERV1 1847 NM_175872 126375 Hs.50405 NM_175872 ENSG00000180884 ZNF792 - zinc finger protein 792 protein-coding 116-94 chr20 32731008 32731202 + 0.75 NA intron (NM_053041, intron 1 of 8) AluJr4|SINE|Alu 12903 NM_053041 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 129.25-165 chr6 35560613 35560808 + 0.75 NA Intergenic LTR13|LTR|ERVK -47814 NM_001289395 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 138.25-34 chr11 116559711 116560057 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -79538 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 142-43 chr13 91184181 91184544 + 0.75 NA intron (NR_047004, intron 2 of 3) intron (NR_047004, intron 2 of 3) 27336 NR_047004 100874150 Hs.711947 NR_047004 LINC00379 - long intergenic non-protein coding RNA 379 ncRNA 144.5-115 chr2 167006075 167006425 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 117763 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 191.75-20 chr10 106518044 106518363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 378038 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 193.25-2 chr1 24478314 24478622 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23876 NM_001251979 11123 Hs.656799 NM_013441 ENSG00000117602 RCAN3 DSCR1L2|MCIP3|RCN3|hRCN3 RCAN family member 3 protein-coding 134.5-133 chr3 105698097 105698470 + 0.75 NA intron (NR_135809, intron 13 of 18) intron (NR_135809, intron 13 of 18) 169308 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 118.25-121 chr21 28802792 28803077 + 0.75 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 82433 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 126.25-211 chr8 127151163 127151449 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46321 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 151-100 chr4 88028811 88029218 + 0.75 NA intron (NR_156488, intron 2 of 13) LTR106_Mam|LTR|LTR 21379 NM_000297 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 141.75-50 chr13 93176135 93176387 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -50546 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 181.5-138 chr5 159208545 159208872 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001199381) promoter-TSS (NM_001199381) -635 NM_001199381 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 148.5-217 chr7 109447138 109447385 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 512952 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 300.5-36 chr5 81041736 81042328 + 0.75 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) L1ME1|LINE|L1 -81125 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 163.5-150 chr4 125632126 125632525 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 125066 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 116.75-87 chr2 12079985 12080235 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) MER57B1|LTR|ERV1 72994 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 116.25-94 chr18 71751587 71751749 + 0.75 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) L1MCb|LINE|L1 30558 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 178-88 chr6 115900766 115901136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137780 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 185.25-114 chr6 121296196 121296539 + 0.75 NA intron (NR_104452, intron 10 of 35) intron (NR_104452, intron 10 of 35) 38113 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 140.5-64 chr14 59877831 59878174 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -7226 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 127.75-102 chr2 101352692 101352950 + 0.75 NA intron (NM_153836, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 34682 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 117-23 chr11 34569999 34570358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50915 NM_001206615 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 178.75-10 chr10 68839138 68839424 + 0.75 NA intron (NM_152709, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 11744 NM_001130160 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 131-126 chr3 179135653 179135951 + 0.75 NA intron (NR_125401, intron 1 of 2) L1MA4A|LINE|L1 12171 NR_125401 101928739 Hs.434553 NR_125401 ENSG00000229102 LOC101928739 - uncharacterized LOC101928739 ncRNA 162.75-152 chr9 34140273 34140580 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -13728 NM_015397 25853 Hs.493750 NM_015397 ENSG00000198876 DCAF12 CT102|KIAA1892|TCC52|WDR40A DDB1 and CUL4 associated factor 12 protein-coding 118-130 chr4 61602763 61602937 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 400678 NM_001371342 181-54 chr2 79522934 79523218 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001282598) promoter-TSS (NM_001282598) -107 NM_001282598 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 194-22 chr10 118341837 118342328 + 0.75 NA intron (NM_022063, intron 1 of 8) CpG 242 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 165-79 chr20 53913281 53913572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37717 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 143.25-2 chr1 35744366 35744606 + 0.75 NA intron (NM_001190481, intron 15 of 23) AluJb|SINE|Alu 25492 NM_022111 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 191-51 chr3 30920463 30920755 + 0.75 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 -25948 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 163.75-86 chr22 20952414 20952657 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005207, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_005207, exon 3 of 3) -4557 NR_110537 101928891 Hs.648264 NR_110537 ENSG00000237476 LINC01637 - long intergenic non-protein coding RNA 1637 ncRNA 174-27 chr15 38009130 38009479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31089 NR_120330 101928227 Hs.602381 NR_120330 ENSG00000259225 LINC02345 - long intergenic non-protein coding RNA 2345 ncRNA 194.25-16 chr11 39027458 39027790 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 378766 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 226.25-63 chr6 50789255 50789735 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -29376 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 253.25-49 chr3 171657896 171658280 + 0.75 NA intron (NM_002662, intron 21 of 26) L1MB8|LINE|L1 152395 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 208-31 chr17 62807604 62808001 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_135634) promoter-TSS (NR_135634) 512 NM_152598 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 143.75-117 chr3 59152392 59152784 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -102556 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 147.5-57 chr13 104621470 104621723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -844271 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 204-8 chr11 98631204 98631533 + 0.75 NA Intergenic LTR22B|LTR|ERVK -389581 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 172.5-113 chr21 18776219 18776490 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -16542 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 146-131 chr8 117559948 117560202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39362 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 140.75-150 chr5 90395716 90396088 + 0.75 NA intron (NM_004365, intron 4 of 4) intron (NM_004365, intron 4 of 4) 13884 NM_001297768 1070 Hs.591767 NM_004365 ENSG00000153140 CETN3 CDC31|CEN3 centrin 3 protein-coding 152.5-61 chr16 53528820 53529293 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25752 NM_001308325 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 132.75-139 chr4 99253791 99253983 + 0.75 NA intron (NR_037884, intron 4 of 9) intron (NR_037884, intron 4 of 9) -34641 NR_132990 130 Hs.586161 NM_000672 ENSG00000172955 ADH6 ADH-5 alcohol dehydrogenase 6 (class V) protein-coding 128-4 chr1 73713316 73713653 + 0.75 NA intron (NR_146300, intron 3 of 3) LTR33A_|LTR|ERVL 38805 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 118.75-201 chr8 121484208 121484526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154979 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 146.75-46 chr14 70617651 70618039 + 0.75 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 -17155 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 140-45 chr15 67106921 67107276 + 0.75 NA intron (NM_005902, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 -18618 NM_001145102 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 165.5-154 chr5 155467924 155468214 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 454314 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 130.5-90 chr14 65025908 65026325 + 0.75 NA intron (NM_002028, intron 4 of 11) intron (NM_002028, intron 4 of 11) -18572 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 148.75-82 chr2 54516074 54516465 + 0.75 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) MIR|SINE|MIR -12953 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 156-94 chr20 57634774 57635104 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -14513 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 129.5-174 chr4 163800168 163800381 + 0.75 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) L1PA16|LINE|L1 -186740 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 138.75-196 chr8 107898983 107899225 + 0.75 NA TTS (NM_001317942) TTS (NM_001317942) 182835 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 158.5-86 chr18 75295314 75295671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83963 NM_001308210 10194 Hs.284217 NM_005786 ENSG00000179981 TSHZ1 CAA|NY-CO-33|SDCCAG33|TSH1 teashirt zinc finger homeobox 1 protein-coding 268.75-38 chr5 66284649 66285214 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75485 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 178.25-43 chr16 52078575 52078988 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4846 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 159.75-18 chr10 68462763 68463044 + 0.75 NA intron (NM_001080449, intron 4 of 20) AluSx|SINE|Alu 9070 NM_001080449 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 194.5-111 chr4 119820071 119820440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15740 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 301.75 chr10 56974677 56975210 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 329616 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 158-112 chr5 146409802 146410127 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37369 NM_001040006 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 167.5-81 chr18 28736026 28736535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -559150 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 157.5-77 chr16 84729930 84730237 + 0.75 NA intron (NM_001272075, intron 2 of 14) intron (NM_001272075, intron 2 of 14) 30083 NR_073578 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 211.25-15 chr12 13296140 13296661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80345 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 148.75-29 chr10 110236812 110237178 + 0.75 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 10999 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 168-41 chr12 76520398 76520910 + 0.75 NA intron (NM_001003712, intron 1 of 22) intron (NM_001003712, intron 1 of 22) 39117 NM_001319653 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 125.25-166 chr5 174537989 174538271 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -186452 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 134.75-211 chr8 76006731 76006932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -399823 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 155.25-148 chr6 37621605 37621929 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66345 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 173-28 chr11 117096028 117096373 + 0.75 NA intron (NM_001366687, intron 1 of 4) intron (NM_001366687, intron 1 of 4) 2228 NM_001281749 23387 Hs.167451 NM_025164 ENSG00000160584 SIK3 L19|QSK|SEMDK|SIK-3 SIK family kinase 3 protein-coding 132.75-37 chr11 60080244 60080469 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8308 NM_001256916 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 153.75-147 chr7 157253745 157254074 + 0.75 NA intron (NM_014671, intron 19 of 22) intron (NM_014671, intron 19 of 22) -83095 NM_001363676 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 146-23 chr11 106253747 106253970 + 0.75 NA intron (NR_120551, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 2451 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 134.5-27 chr10 67569289 67569501 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) intron (NM_001127384, intron 3 of 17) 96265 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 141.25-3 chr1 31309931 31310174 + 0.75 NA 5' UTR (NM_016505, exon 2 of 8) 5' UTR (NM_016505, exon 2 of 8) 13070 NM_016505 51538 Hs.524094 NM_016505 ENSG00000121766 ZCCHC17 HSPC251|PS1D|pNO40 zinc finger CCHC-type containing 17 protein-coding 222-57 chr4 42350473 42351085 + 0.75 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) intron (NR_134668, intron 1 of 1) 40489 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 169.5-18 chr10 97959127 97959540 + 0.75 NA intron (NM_001206528, intron 2 of 14) LTR32|LTR|ERVL 71288 NM_018058 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 117.75-221 chr8 141020704 141020989 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -18767 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 134.75-126 chr20 14310614 14310950 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 26830 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 117.75-179 chr5 149451818 149452107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21316 NR_029686 406937 NR_029686 ENSG00000276365 MIR145 MIRN145|miR-145|miRNA145 microRNA 145 ncRNA 140.5-93 chr19 12980532 12980863 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 11079 NM_152654 199699 Hs.331981 NM_152654 ENSG00000179284 DAND5 CER2|CERL2|CKTSF1B3|COCO|CRL2|DANTE|GREM3|SP1 DAN domain BMP antagonist family member 5 protein-coding 232.75-54 chr4 177580096 177580594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137842 NR_033655 175 Hs.207776 NM_000027 ENSG00000038002 AGA AGU|ASRG|GA aspartylglucosaminidase protein-coding 135.75-215 chrX 73972822 73973073 + 0.75 NA intron (NR_024582, intron 2 of 4) L1MA7|LINE|L1 28623 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 173-146 chr9 10682753 10683104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69722 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 195.25-32 chr14 72351173 72351641 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -165413 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 126.75-42 chr12 118068698 118068959 + 0.75 NA intron (NM_019086, intron 7 of 8) intron (NM_019086, intron 7 of 8) -6654 NM_001278557 55884 Hs.506985 NM_018639 ENSG00000176871 WSB2 SBA2 WD repeat and SOCS box containing 2 protein-coding 194-26 chr11 75899353 75899773 + 0.75 NA intron (NM_003369, intron 5 of 14) MIR|SINE|MIR 84353 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 133.75-54 chr14 39692514 39692914 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -260214 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 177.5-15 chr10 62468262 62468632 + 0.75 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -52001 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 182-20 chr12 24955597 24955969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6682 NM_005504 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 218.5-12 chr1 109009948 109010344 + 0.75 NA intron (NM_014969, intron 5 of 14) L1ME4a|LINE|L1 32082 NM_001142551 22911 Hs.570055 NM_014969 ENSG00000085433 WDR47 - WD repeat domain 47 protein-coding 167.5-10 chr1 111146849 111147287 + 0.75 NA intron (NR_138484, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 6845 NM_006090 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 128.5-74 chr15 85596890 85597115 + 0.75 NA intron (NM_007200, intron 8 of 36) intron (NM_007200, intron 8 of 36) -22948 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 214.25-10 chr10 91197903 91198332 + 0.75 NA intron (NM_001257101, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -22034 NM_001256549 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 144.25-81 chr18 9412012 9412252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63381 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 163-82 chr4 38455419 38455832 + 0.75 NA intron (NR_110951, intron 2 of 7) intron (NR_110951, intron 2 of 7) -54142 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 226.75-27 chr18 1843962 1844358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -484531 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 176.25-100 chr4 64735773 64736162 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 268533 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 138.5-70 chr15 91291050 91291255 + 0.75 NA intron (NM_001323036, intron 11 of 11) intron (NM_001323036, intron 11 of 11) -172187 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 151-102 chr4 92105730 92105957 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 171459 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 155.25-73 chr16 57237456 57237741 + 0.75 NA intron (NM_001305164, intron 14 of 14) intron (NM_001305164, intron 14 of 14) -7661 NM_012106 23568 Hs.632873 NM_012106 ENSG00000102931 ARL2BP BART|BART1|RP66 ADP ribosylation factor like GTPase 2 binding protein protein-coding 156.5-52 chr14 39988675 39989016 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -556345 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 142.5-51 chr12 90501701 90502079 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 208572 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 196.5-96 chr22 35302608 35302889 + 0.75 NA intron (NR_156428, intron 1 of 13) MIR3|SINE|MIR 2854 NM_005488 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 186.25-110 chr7 2016800 2017238 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) intron (NM_001013837, intron 12 of 18) 72033 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 172.25-114 chr5 116219510 116219818 + 0.75 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -36079 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 153.75-104 chr4 81021528 81021742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9073 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 166-28 chr13 113726864 113727293 + 0.75 NA intron (NM_002929, intron 4 of 6) intron (NM_002929, intron 4 of 6) 24011 NR_028064 100130386 Hs.704121 NM_001137672 ENSG00000279770 LINC00552 - long intergenic non-protein coding RNA 552 ncRNA 177.75-119 chr6 20119003 20119328 + 0.75 NA intron (NR_073465, intron 5 of 9) L2|LINE|L2 93304 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 224.5-81 chr3 190649204 190649666 + 0.75 NA non-coding (NR_157353, exon 10 of 10) non-coding (NR_157353, exon 10 of 10) 135350 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 217.5-32 chr12 23395660 23396296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 188608 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 178.75-51 chr2 216470710 216471106 + 0.75 NA intron (NM_001127207, intron 14 of 17) L1ME4a|LINE|L1 -27936 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 141.75-37 chr11 85099209 85099468 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -175917 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 132.75-47 chr12 15350124 15350400 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 27754 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 129.25-2 chr1 53670161 53670531 + 0.75 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) intron (NM_001367484, intron 2 of 10) 63858 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 240.5-49 chr2 25680874 25681526 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -7526 NM_001256304 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 209.25-100 chr6 55756506 55757069 + 0.75 NA intron (NM_001329756, intron 4 of 4) intron (NM_001329756, intron 4 of 4) 118803 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 160.75-84 chr2 177557668 177557931 + 0.75 NA Intergenic MSTB2-int|LTR|ERVL-MaLR -5003 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 205.5-13 chr10 73340844 73341330 + 0.75 NA intron (NM_001367801, intron 7 of 27) L1ME4b|LINE|L1 17667 NM_001350934 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 124.5-227 chr8 107259928 107260161 + 0.75 NA intron (NM_001199859, intron 8 of 8) intron (NM_001199859, intron 8 of 8) 76471 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 147.5-88 chr19 56862967 56863337 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 22250 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 148.25-102 chr4 15592695 15592960 + 0.75 NA intron (NM_001080522, intron 34 of 37) L2|LINE|L2 62530 NM_012161 26234 Hs.643433 NM_012161 ENSG00000118564 FBXL5 FBL4|FBL5|FLR1 F-box and leucine rich repeat protein 5 protein-coding 178-2 chr1 186001745 186002216 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 28 of 106) intron (NM_031935, intron 28 of 106) 267589 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 142.5-117 chr2 172203987 172204465 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101220 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 179.5-120 chr3 62037717 62038134 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 281022 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 172-66 chr21 32743358 32743766 + 0.75 NA TTS (NR_038879) TTS (NR_038879) 15448 NR_038880 100506215 Hs.657123 NR_038879 ENSG00000238197 PAXBP1-AS1 GCFC1-AS1 PAXBP1 antisense RNA 1 ncRNA 133-26 chr11 100635371 100635573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51816 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 120.25-33 chr10 118526510 118526802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68992 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 132.75-185 chr8 53188062 53188434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63389 NM_000912 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 209-61 chr7 23121393 23122020 + 0.75 NA intron (NR_033329, intron 2 of 5) AluY|SINE|Alu 15045 NM_018846 55975 Hs.654817 NM_018846 ENSG00000122550 KLHL7 CISS3|KLHL6|SBBI26 kelch like family member 7 protein-coding 201-58 chr4 54202476 54202847 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -26632 NM_001347827 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 112.75-84 chr18 76813853 76814146 + 0.75 NA intron (NR_040024, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu 8296 NR_040024 100131655 Hs.385806 NR_040024 ENSG00000264278 ZNF236-DT - ZNF236 divergent transcript ncRNA 131.75-195 chr7 6259005 6259401 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 13421 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 237.5-32 chr14 69559131 69559789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15411 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 226.75-26 chr17 77658483 77659050 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 69793 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 195-60 chr22 42710688 42710999 + 0.75 NA intron (NM_001318038, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 10027 NR_146459 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 157.5-173 chr6 4496372 4496743 + 0.75 NA TTS (NR_149117) TTS (NR_149117) 7759 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 126-114 chr3 30326608 30326874 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -192127 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 149.5-196 chr8 16677809 16678054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 324414 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 115.5-19 chr1 240200090 240200405 + 0.75 NA intron (NM_001348094, intron 4 of 14) intron (NM_001348094, intron 4 of 14) 108364 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 139.25-4 chr1 67853787 67854014 + 0.75 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) intron (NR_040077, intron 1 of 9) -20433 NM_018841 55970 Hs.431101 NM_018841 ENSG00000172380 GNG12 - G protein subunit gamma 12 protein-coding 127.5-208 chr6 24615669 24615896 + 0.75 NA intron (NM_001350409, intron 1 of 21) HAL1|LINE|L1 30239 NM_001168376 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 183.5-58 chr2 17148734 17149284 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 369431 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 201.25-41 chr18 6347984 6348276 + 0.75 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1ME3A|LINE|L1 10900 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 134.5-154 chr4 58254810 58255093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 281377 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 366.25-5 chr14 75001585 75002362 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014239) promoter-TSS (NM_014239) -948 NM_014239 8892 Hs.409137 NM_014239 ENSG00000119718 EIF2B2 EIF-2Bbeta|EIF2B eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta protein-coding 242.5-68 chr5 167451784 167452390 + 0.75 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -121572 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 262.75-46 chr5 144921043 144921584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 715922 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 122.5-24 chr10 55580739 55580998 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -18174 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 244.5-25 chr13 32347476 32347917 + 0.75 NA intron (NM_000059, intron 13 of 26) HAL1|LINE|L1 32216 NM_000059 675 Hs.34012 NM_000059 ENSG00000139618 BRCA2 BRCC2|BROVCA2|FACD|FAD|FAD1|FANCD|FANCD1|GLM3|PNCA2|XRCC11 BRCA2 DNA repair associated protein-coding 116-97 chr22 25693792 25694025 + 0.75 NA intron (NM_001362778, intron 11 of 19) AluSp|SINE|Alu -48280 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 149-75 chr22 35189669 35190000 + 0.75 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 41222 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 181-87 chr5 106839781 106840085 + 0.75 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) L1PA7|LINE|L1 171081 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 200-95 chr8 141537362 141537816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30359 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 223.75-27 chr15 39630327 39630757 + 0.75 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 49463 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 139.75-16 chr10 63307697 63307934 + 0.75 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) HAL1|LINE|L1 -38572 NM_001322254 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 172.25-43 chr15 95019306 95019584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164082 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 164.75-8 chr1 110516265 110516542 + 0.75 NA TTS (NM_005549) TTS (NM_005549) 2772 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 161.25-33 chr12 6324584 6324889 + 0.75 NA intron (NM_001144857, intron 12 of 14) intron (NM_001144857, intron 12 of 14) 12085 NM_001144857 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 165-3 chr1 85728639 85729008 + 0.75 NA TTS (NR_146343) TTS (NR_146343) -20390 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 176.25-11 chr1 212562198 212562508 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2981 NM_001030287 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 164.5-110 chr20 12967893 12968212 + 0.75 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -15533 NR_109868 101929486 Hs.548761 NR_109868 ENSG00000233048 LINC01722 - long intergenic non-protein coding RNA 1722 ncRNA 114.5-28 chr1 234326724 234327019 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20404 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 129.5-159 chr3 95166075 95166313 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 227931 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 170.75-37 chr14 61843988 61844352 + 0.75 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1MA2|LINE|L1 31467 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 240-8 chr10 16418618 16419066 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18101 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 124.25-26 chr10 61088401 61088627 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 72239 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 116.75-80 chr18 72492092 72492247 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 52173 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 114-43 chr14 46268734 46268942 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -202521 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 132.25-101 chr2 152118459 152118795 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005843, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005843, exon 14 of 14) -19460 NM_000726 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 139.5-20 chr11 22615354 22615694 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 10317 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 235.5-75 chr6 91099371 91099847 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -422051 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 156-110 chr4 93126814 93127076 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) intron (NM_001286838, intron 3 of 14) -701808 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 187.5-22 chr10 99568051 99568340 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 35253 NM_145285 159296 Hs.243272 NM_145285 ENSG00000119919 NKX2-3 CSX3|NK2.3|NKX2.3|NKX2C|NKX4-3 NK2 homeobox 3 protein-coding 155.25-32 chr10 107040376 107040669 + 0.75 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 124184 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 149-116 chr6 127161422 127161661 + 0.75 NA intron (NM_032784, intron 4 of 4) intron (NM_032784, intron 4 of 4) 42870 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 141.75-174 chr8 139702603 139702937 + 0.75 NA exon (NM_001282534, exon 1 of 2) exon (NM_001282534, exon 1 of 2) 353 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 161.25-91 chr2 79972047 79972306 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -105593 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 128.75-54 chr13 109472887 109473122 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72308 NR_126361 104326054 Hs.569298 NR_126361 ENSG00000229792 LINC00399 TCONS_00021596 long intergenic non-protein coding RNA 399 ncRNA 112.25-34 chr11 85575324 85575509 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) AluJr|SINE|Alu 51854 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 126.5-115 chr2 107010409 107010718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123454 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 116-96 chr21 28502591 28502890 + 0.75 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -36578 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 187.25-39 chr17 47629025 47629425 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -20694 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 135.75-6 chr1 59686887 59687298 + 0.75 NA intron (NM_001350790, intron 15 of 16) LTR33A|LTR|ERVL 46204 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 227.25-55 chr3 106403591 106404016 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -534402 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 229-30 chr2 27844810 27845223 + 0.75 NA intron (NM_022128, intron 4 of 7) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -43693 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 125.25-97 chr2 56891131 56891453 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -705522 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 227.75-24 chr14 81451208 81451635 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -1264 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 287-38 chr8 100936297 100937037 + 0.75 NA intron (NM_001135700, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 13904 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 201.75-59 chr3 31459132 31459438 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -73640 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 153.75-110 chr4 170654996 170655307 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 88584 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 134-132 chr4 73170197 73170389 + 0.75 NA intron (NM_032217, intron 2 of 33) L1MA2|LINE|L1 52764 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 136-58 chr17_KI270729v1_random 34037 34358 + 0.75 NA NA (GAATG)n|Satellite|Satellite NA NA 180.75-143 chr7 135551863 135552139 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5916 NM_015135 23165 Hs.743250 NM_015135 ENSG00000155561 NUP205 C7orf14|NPHS13 nucleoporin 205 protein-coding 151.25-63 chr16 68466538 68466899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18210 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 204.25-28 chr12 50809820 50810400 + 0.75 NA intron (NM_005171, intron 4 of 6) AluSq|SINE|Alu -32816 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 117.5-237 chr8 126535740 126535932 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22642 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 138-136 chr6 40826948 40827262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 196175 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 171.25-126 chr5 118393665 118393905 + 0.75 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) intron (NR_104610, intron 9 of 9) 111211 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 241.5-33 chr19 38181064 38181521 + 0.75 NA intron (NM_015073, intron 15 of 21) intron (NM_015073, intron 15 of 21) 18196 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 153.75-83 chr21 30685407 30685679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33234 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 154.5-28 chr10 99908893 99909172 + 0.75 NA exon (NM_001318326, exon 2 of 14) exon (NM_001318326, exon 2 of 14) 5060 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 193.75-44 chr14 59114702 59115140 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -73746 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 132.5-8 chr1 57600407 57600768 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -175666 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 125-14 chr1 212332307 212332522 + 0.75 NA intron (NM_006243, intron 2 of 12) intron (NM_006243, intron 2 of 12) -20404 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 151.25-86 chr2 65508324 65508678 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -75902 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 126.75-118 chr2 159840252 159840459 + 0.75 NA intron (NM_002349, intron 25 of 34) AluJb|SINE|Alu -42100 NM_001198764 9936 Hs.130014 NM_014880 ENSG00000241399 CD302 BIMLEC|CLEC13A|DCL-1|DCL1 CD302 molecule protein-coding 330.75-14 chr2 210549046 210549805 + 0.75 NA non-coding (NR_161225, exon 1 of 39) non-coding (NR_161225, exon 1 of 39) 300 NR_161225 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 116.25-212 chr7 42663706 42663924 + 0.75 NA intron (NR_110833, intron 2 of 2) HAL1b|LINE|L1 42632 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 192-100 chr8 86545450 86545767 + 0.75 NA intron (NM_003909, intron 9 of 16) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 31173 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 143.75-68 chr17 58677052 58677436 + 0.75 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) AluJr|SINE|Alu 14811 NM_198393 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 175.5-51 chr14 58164333 58164746 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12326 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 203.75-16 chr10 132796709 132797057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10736 NM_177400 84504 Hs.134013 NM_177400 ENSG00000148826 NKX6-2 GTX|NKX6.2|NKX6B|SPAX8 NK6 homeobox 2 protein-coding 145.25-11 chr10 9560349 9560574 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -264868 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 116-133 chr5 150808477 150808721 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 30653 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 136-106 chr3 102150356 102150612 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -13221 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 129.5-41 chr11 72110231 72110433 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001145309, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001145309, exon 9 of 9) 1900 NM_001278494 25906 Hs.38044 NM_014042 ENSG00000110200 ANAPC15 APC15|C11orf51|HSPC020 anaphase promoting complex subunit 15 protein-coding 173.75-156 chr8 131949332 131949728 + 0.75 NA intron (NR_136616, intron 4 of 23) AluJr|SINE|Alu 32757 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 173.75-159 chr9 78823455 78823911 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 321983 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 179.25-15 chr10 29342526 29342900 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 53643 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 161.75-58 chr2 30383878 30384261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37423 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 142.5-158 chr4 143412365 143412740 + 0.75 NA intron (NM_207123, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 69092 NR_036091 100423017 NR_036091 ENSG00000265623 MIR3139 - microRNA 3139 ncRNA 166.25-63 chr17 55141754 55141988 + 0.75 NA intron (NM_178509, intron 17 of 17) L2a|LINE|L2 -123089 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 143.25-19 chr10 76424392 76424626 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) AluY|SINE|Alu -463535 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 127.25-137 chr4 35424267 35424558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 819527 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 126-123 chr4 34421603 34421856 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151982 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 120-132 chr4 41854411 41854743 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28034 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 129.25-157 chr5 123055173 123055445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18584 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 260.75-8 chr12 46726318 46726760 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 99458 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 237.75-47 chr20 34984668 34985222 + 0.75 NA exon (NM_020884, exon 12 of 45) exon (NM_020884, exon 12 of 45) -5431 NR_030223 574501 NR_030223 ENSG00000207635 MIR499A MIR499|MIRN499|hsa-mir-499a|mir-499a microRNA 499a ncRNA 136-128 chr6 51535142 51535370 + 0.75 NA Intergenic (TCTCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -86614 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 126-58 chr14 80849802 80850011 + 0.75 NA intron (NM_152446, intron 9 of 24) intron (NM_152446, intron 9 of 24) 91832 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 122.75-212 chr8 134799876 134800265 + 0.75 NA TTS (NR_029666) TTS (NR_029666) 537 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 234.75-69 chr6 145479331 145479819 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 207302 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 147.5-192 chr7 20753656 20753889 + 0.75 NA intron (NM_178559, intron 18 of 18) intron (NM_178559, intron 18 of 18) 33114 NM_198956 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 120-7 chr1 119511853 119512171 + 0.75 NA intron (NM_001328615, intron 3 of 3) intron (NM_001328615, intron 3 of 3) 4802 NM_000862 3283 Hs.364941 NM_000862 ENSG00000203857 HSD3B1 3BETAHSD|HSD3B|HSDB3|HSDB3A|SDR11E1 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 protein-coding 131.25-56 chr14 52453352 52453645 + 0.75 NA intron (NM_001160047, intron 18 of 20) L1MA3|LINE|L1 99007 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 118.25-90 chr18 72809181 72809386 + 0.75 NA intron (NM_001354018, intron 4 of 11) L1M5|LINE|L1 44099 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 169.5-72 chr2 58880989 58881272 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) intron (NR_033873, intron 3 of 13) -336578 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 201.25-2 chr1 23337843 23338172 + 0.75 NA intron (NM_001297622, intron 2 of 8).2 L2a|LINE|L2 6277 NM_001297620 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 144-133 chr8 101759639 101759895 + 0.75 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) intron (NM_001040625, intron 4 of 6) 31202 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 164.5-227 chrX 81132647 81132971 + 0.75 NA intron (NM_030763, intron 1 of 6) L1PA13|LINE|L1 69104 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 264.75-8 chr11 83239511 83239951 + 0.75 NA intron (NM_001300975, intron 8 of 10) L1MD3|LINE|L1 46019 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 173-137 chr8 39958137 39958642 + 0.75 NA intron (NM_194294, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 23434 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 139-118 chr5 106781241 106781463 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 229662 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 189.5-39 chr12 123063017 123063460 + 0.75 NA intron (NM_020845, intron 1 of 24) MIR3|SINE|MIR -18146 NR_038290 100507091 Hs.683912 NR_038290 ENSG00000251497 PITPNM2-AS1 - PITPNM2 antisense RNA 1 ncRNA 188.25-97 chr5 144259357 144259766 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 54170 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 221.25-76 chr6 55040474 55041031 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -65708 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 175.5-38 chr12 22062383 22062737 + 0.75 NA intron (NR_135117, intron 6 of 6) L1ME4a|LINE|L1 16342 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 241-58 chr8 127288976 127289386 + 0.75 NA TTS (NR_117100) TTS (NR_117100) 44544 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 154.5-180 chr8 25217542 25217983 + 0.75 NA intron (NM_024940, intron 1 of 51) MER113|DNA|hAT-Charlie 33073 NM_001322810 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 170.25-112 chr4 79819012 79819327 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -8302 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 206.75-99 chr9 115163478 115163974 + 0.75 NA intron (NR_163556, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 21908 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 218.75 chr1 18955172 18955675 + 0.75 NA intron (NM_001136265, intron 1 of 8) intron (NM_001136265, intron 1 of 8) 1253 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 113-126 chr3 194350469 194350748 + 0.75 NA intron (NM_001080513, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 720 NM_001080513 1370 Hs.528368 NM_001309 ENSG00000178772 CPN2 ACBP carboxypeptidase N subunit 2 protein-coding 248.5-47 chr2 30756070 30756475 + 0.75 NA intron (NM_144575, intron 8 of 22) intron (NM_144575, intron 8 of 22) 51174 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 140.25-179 chr7 84610505 84610734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78143 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 160.5-65 chr16 17720656 17721003 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -249869 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 194.25-118 chr8 114652912 114653292 + 0.75 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 1014911 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 214-51 chr5 88822618 88823069 + 0.75 NA intron (NM_001131005, intron 3 of 10) intron (NM_001131005, intron 3 of 10) 1084 NM_001193348 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 237.25-9 chr1 233500878 233501238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113048 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 128.75-93 chr2 26332584 26332821 + 0.75 NA intron (NR_135916, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 13109 NM_001321975 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 139-154 chr8 139377880 139378203 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325082 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 219.25-17 chr10 79228519 79229018 + 0.75 NA intron (NM_020338, intron 7 of 24) intron (NM_020338, intron 7 of 24) -118701 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 181.5-84 chr2 118466649 118466953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136165 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 124-120 chr4 34358749 34358978 + 0.75 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -89116 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 320.25-15 chr2 104113369 104114062 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 294617 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 279-22 chr2 156673773 156674363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 237689 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 220.5-20 chr12 52806321 52806715 + 0.75 NA TTS (NM_002272) TTS (NM_002272) 7598 NM_002272 3851 Hs.654610 NM_002272 ENSG00000170477 KRT4 CK-4|CK4|CYK4|K4|WSN1 keratin 4 protein-coding 149-15 chr10 100194522 100194782 + 0.75 NA intron (NM_001278, intron 16 of 20) intron (NM_001278, intron 16 of 20) -8623 NM_001347859 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 200.25-110 chr8 80913596 80914054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39044 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 198.5-103 chr4 43539740 43540409 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47531 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 161.75-53 chr18 63883423 63883737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4125 NM_001143818 5055 Hs.594481 NM_002575 ENSG00000197632 SERPINB2 HsT1201|PAI|PAI-2|PAI2|PLANH2 serpin family B member 2 protein-coding 148-79 chr3 36949954 36950160 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -5003 NM_001329998 9881 Hs.170999 NM_014831 ENSG00000168016 TRANK1 LBA1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 protein-coding 125.5-76 chr14 38552198 38552561 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -296286 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 116.25-158 chr4 5169450 5169698 + 0.75 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) intron (NM_001306082, intron 4 of 12) 118094 NM_001345969 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 278.25-29 chr2 86322952 86323410 + 0.75 NA intron (NM_001164730, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 14445 NM_022912 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 147.5-25 chr10 75873406 75873720 + 0.75 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 90802 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 166.25-8 chr1 76228127 76228525 + 0.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 153580 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 126.5-257 chr8 138895940 138896215 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) L1MDa|LINE|L1 17964 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 197.5-33 chr12 121049042 121049567 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10062 NM_198213 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 133-104 chr3 30982069 30982450 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87598 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 141.25-58 chr15 85500370 85500778 + 0.75 NA intron (NM_007200, intron 2 of 36) intron (NM_007200, intron 2 of 36) -119376 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 189.25-72 chr22 28583372 28583690 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 96334 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 144.25-132 chr3 147282986 147283294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109290 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 159.5-44 chr12 41773522 41773778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9461 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 125-164 chr8 122481793 122482025 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 86735 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 205.75-41 chr2 186759169 186759755 + 0.75 NA intron (NM_177454, intron 6 of 7) L1MA3|LINE|L1 65402 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 240.5-32 chr15 44674623 44675228 + 0.75 NA intron (NM_001330283, intron 2 of 14) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 1963 NM_001330283 197135 Hs.11594 NM_001145112 ENSG00000229474 PATL2 OOMD4|Pat1a|hPat1a PAT1 homolog 2 protein-coding 142.5-18 chr1 196492781 196493105 + 0.75 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 89538 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 149.5-165 chr6 13833576 13833926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19191 NM_001031713 63933 Hs.214043 NM_022102 ENSG00000050393 MCUR1 C6orf79|CCDC90A|FMP32 mitochondrial calcium uniporter regulator 1 protein-coding 169.75-171 chrX 99509400 99509777 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 900685 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 198.25-25 chr12 27738255 27738592 + 0.75 NA intron (NM_021821, intron 7 of 7) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 27591 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 248.75-8 chr11 90534347 90534906 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 21231 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 193.25-38 chr16 4830523 4830906 + 0.75 NA intron (NM_001324097, intron 4 of 14) intron (NM_001324097, intron 4 of 14) 16574 NM_001324098 84656 Hs.387255 NM_032569 ENSG00000140632 GLYR1 BM045|HIBDL|N-PAC|NP60 glyoxylate reductase 1 homolog protein-coding 142-82 chr2 48528191 48528585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1537 NM_001198593 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 245-59 chr5 115977749 115978313 + 0.75 NA intron (NM_173800, intron 1 of 19) intron (NM_173800, intron 1 of 19) 15556 NM_173800 206338 Hs.98288 NM_173800 ENSG00000172901 LVRN APQ|AQPEP|TAQPEP laeverin protein-coding 180.75-74 chr2 222976691 222977079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75045 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 181-104 chr7 81075328 81075719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153134 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 162.75-76 chr2 164552917 164553179 + 0.75 NA intron (NM_004490, intron 2 of 13) intron (NM_004490, intron 2 of 13) 15447 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 146-139 chrX 152671040 152671234 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -27657 NM_005362 4102 Hs.417816 NM_005362 ENSG00000221867 MAGEA3 CT1.3|HIP8|HYPD|MAGE3|MAGEA6 MAGE family member A3 protein-coding 116-57 chr16 11664258 11664450 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4101 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 175.75-123 chr7 156780942 156781216 + 0.75 NA intron (NM_001363413, intron 6 of 18) intron (NM_001363413, intron 6 of 18) 112104 NM_001363409 64327 Hs.209989 NM_022458 ENSG00000105983 LMBR1 ACHP|C7orf2|DIF14|LSS|PPD2|THYP|TPT|ZRS limb development membrane protein 1 protein-coding 168.5-95 chr2 196418942 196419341 + 0.75 NA intron (NM_020760, intron 2 of 28) intron (NM_020760, intron 2 of 28) -56964 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 133.75-182 chr7 134864505 134864770 + 0.75 NA intron (NM_033157, intron 2 of 14) AluSx1|SINE|Alu -26763 NM_033139 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 135-71 chr19 30341370 30341607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30896 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 191.5-24 chr11 78066350 78066829 + 0.75 NA intron (NM_003251, intron 1 of 1) intron (NM_003251, intron 1 of 1) 2728 NM_003251 7069 Hs.591969 NM_003251 ENSG00000151365 THRSP LPGP1|Lpgp|S14|SPOT14|THRP thyroid hormone responsive protein-coding 153-93 chr3 31329408 31329859 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -167846 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 187.75-15 chr11 6492326 6492656 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4789 NM_173589 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 142.75-115 chr20 54396962 54397338 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78443 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 113.75-175 chr7 42908236 42908533 + 0.75 NA TTS (NM_001363436) TTS (NM_001363436) 3459 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 136.5-95 chr18 66787556 66787798 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -183587 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 129.5-152 chr3 37757333 37757660 + 0.75 NA intron (NR_110531, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 104284 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 146.5-162 chr5 4082681 4083057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 487037 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 147-2 chr1 23058887 23059301 + 0.75 NA exon (NM_001009999, exon 9 of 21) exon (NM_001009999, exon 9 of 21) 14789 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 136-23 chr11 33362171 33362528 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13759 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 161.75-72 chr2 228902248 228902730 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -291094 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 240.25-7 chr10 28704330 28704820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27054 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 293-12 chr2 103669566 103670200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -685454 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 194.75-92 chr8 16288543 16288925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95943 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 184.5-173 chrX 43962608 43962899 + 0.75 NA intron (NR_046631, intron 4 of 5) intron (NR_046631, intron 4 of 5) 10637 NM_000266 4693 Hs.522615 NM_000266 ENSG00000124479 NDP EVR2|FEVR|ND norrin cystine knot growth factor NDP protein-coding 163.25-48 chr15 87566076 87566332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10725 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 133.5-78 chr14 52964820 52965087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13856 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 218.75-56 chr3 97169822 97170338 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1PA8|LINE|L1 -269527 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 200.5-116 chr5 123830683 123831014 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 285431 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 146.5-18 chr1 174550425 174550655 + 0.75 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) intron (NM_001366446, intron 13 of 25) 102576 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 203-19 chr10 115682501 115682957 + 0.75 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 512060 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 257-47 chr5 45331738 45332268 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) intron (NM_021072, intron 5 of 7) 364377 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 119.5-35 chr10 98673098 98673439 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 6 of 11) intron (NM_021828, intron 6 of 11) -226305 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 122.5-182 chr5 67238925 67239236 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -42281 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 124-110 chr3 26073772 26074002 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -200192 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 135-44 chr14 59850836 59851095 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 19811 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 194-43 chr19 44588621 44589087 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -24709 NM_001205280 147710 Hs.512509 NM_001205280 ENSG00000216588 IGSF23 - immunoglobulin superfamily member 23 protein-coding 205.75-62 chr5 18722394 18722832 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 915339 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 134.25-191 chr8 98109482 98109820 + 0.75 NA intron (NM_005836, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 7520 NM_005836 10247 Hs.18426 NM_005836 ENSG00000132541 RIDA HRSP12|P14.5|PSP|UK114|hp14.5 reactive intermediate imine deaminase A homolog protein-coding 136.25-127 chr4 18322650 18322971 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -300935 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 114.25-77 chr18 7744707 7744916 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 177495 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 166-122 chr7 141017718 141018020 + 0.75 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -2917 NM_053035 51650 Hs.416207 NM_016071 ENSG00000090263 MRPS33 CGI-139|MRP-S33|PTD003|S33mt mitochondrial ribosomal protein S33 protein-coding 148.75-16 chr10 23867948 23868237 + 0.75 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 5S|rRNA|rRNA 173365 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 150-42 chr14 62982626 62983022 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 5 of 10) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 62634 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 146.5-192 chr6 148767746 148768003 + 0.75 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 20844 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 128-15 chr1 225989760 225989953 + 0.75 NA intron (NM_152608, intron 5 of 6) AluJb|SINE|Alu 9487 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 128.5-77 chr15 97354838 97355086 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 166849 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 198-59 chr4 143666673 143667236 + 0.75 NA intron (NM_001168235, intron 2 of 7) L1MB8|LINE|L1 33721 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 272.5-66 chr7 95104402 95104937 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR 194771 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 123.5-100 chr2 80270606 80270854 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 34022 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 154.75-93 chr3 101076328 101076587 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82967 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 138-93 chr22 24706969 24707290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47982 NR_024593 646074 Hs.531306 NM_001025230 POM121L10P - POM121 transmembrane nucleoporin like 10, pseudogene pseudo 232.75-8 chr10 86432174 86432655 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -65619 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 129-39 chr11 78103792 78103992 + 0.75 NA intron (NM_001007027, intron 12 of 13) intron (NM_001007027, intron 12 of 13) -24030 NM_001203260 100532726 Hs.407860 NM_001203260 ENSG00000259112 NDUFC2-KCTD14 - NDUFC2-KCTD14 readthrough protein-coding 115-141 chr5 121643026 121643249 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -208745 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 170.5-12 chr1 163107645 163108100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35967 NM_001113380 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 138.25-149 chr6 66701421 66701685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 913674 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 199.5-128 chr6 70034534 70035069 + 0.75 NA intron (NM_001858, intron 13 of 50) intron (NM_001858, intron 13 of 50) 168245 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 238.5-40 chr2 21609187 21609748 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101185 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 154.25-26 chr11 83098009 83098253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26065 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 208.25-68 chr4 110729183 110729656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87296 NM_001204397 5308 Hs.643588 NM_000325 ENSG00000164093 PITX2 ARP1|ASGD4|Brx1|IDG2|IGDS|IGDS2|IHG2|IRID2|Otlx2|PTX2|RGS|RIEG|RIEG1|RS paired like homeodomain 2 protein-coding 130.5-164 chr3 62791459 62791780 + 0.75 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) intron (NM_003716, intron 1 of 29) 83797 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 252.25-34 chr2 148022736 148023192 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -1360 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 118.75-134 chr4 23914601 23914809 + 0.75 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -24658 NR_148984 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 248-59 chr5 101537488 101537875 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -634399 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 120.75-84 chr2 202641197 202641498 + 0.75 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) intron (NM_173511, intron 1 of 7) 6378 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 138.25-8 chr1 97348148 97348547 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 16 of 22) intron (NM_000110, intron 16 of 22) 252424 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 177.25-65 chr19 56999106 56999448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120864 NM_020903 57663 Hs.515632 NM_020903 ENSG00000131864 USP29 HOM-TES-84/86 ubiquitin specific peptidase 29 protein-coding 207.25-91 chr7 72760437 72760772 + 0.75 NA intron (NM_001145440, intron 7 of 13) MER65-int|LTR|ERV1 62701 NR_039793 100616310 NR_039793 ENSG00000266525 MIR4650-1 - microRNA 4650-1 ncRNA 235.25-59 chr7 30603592 30604052 + 0.75 NA intron (NM_002047, intron 6 of 16) intron (NM_002047, intron 6 of 16) 8944 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 211.75-79 chr5 119285434 119285827 + 0.75 NA intron (NM_001077654, intron 1 of 1) intron (NM_001077654, intron 1 of 1) 16871 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 135.5-58 chr14 59857707 59857902 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 12972 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 203.5-36 chr12 131183211 131183691 + 0.75 NA intron (NR_026670, intron 1 of 4) L1PB3|LINE|L1 18440 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 221-9 chr10 45641232 45641611 + 0.75 NA intron (NR_104256, intron 5 of 6) intron (NR_104256, intron 5 of 6) 31311 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 159-13 chr10 58552712 58552982 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 39975 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 141.25-86 chr2 126815277 126815622 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -83441 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 176.75-105 chr6 56512416 56512996 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 64 of 94) intron (NM_001144770, intron 64 of 94) -118578 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 140.25-19 chr10 28417642 28417964 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 78010 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 220.25-29 chr2 4632127 4632551 + 0.75 NA intron (NR_034134, intron 4 of 4) L1MEb|LINE|L1 23883 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 148.75-131 chr5 31172986 31173410 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -20488 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 139-91 chr22 31246788 31247135 + 0.75 NA intron (NM_005569, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR -1423 NM_016733 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 118.25-36 chr11 27177339 27177589 + 0.75 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) intron (NR_125767, intron 2 of 4) 41304 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 193.25-96 chr5 80597105 80597655 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25144 NR_125754 103689917 Hs.740035 NR_125754 ENSG00000251221 LINC01337 TCONS_00009713 long intergenic non-protein coding RNA 1337 ncRNA 225.25-63 chr5 26371593 26371918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 666831 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 136.75-170 chr6 113181357 113181602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 251968 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 147-156 chr9 70796239 70796640 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 6 of 25) intron (NM_001366143, intron 6 of 25) 13645 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 164.25-85 chr20 47616597 47616993 + 0.75 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) intron (NM_181659, intron 2 of 22) 114908 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 181 chr1 44306708 44306994 + 0.75 NA intron (NM_001301698, intron 5 of 7) intron (NM_001301698, intron 5 of 7) 48406 NM_001301698 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 182.75-134 chr8 97824978 97825318 + 0.75 NA exon (NM_018407, exon 6 of 7) exon (NM_018407, exon 6 of 7) -43916 NM_030583 4147 Hs.189445 NM_002380 ENSG00000132561 MATN2 - matrilin 2 protein-coding 204.25-39 chr14 59118853 59119399 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -69541 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 115-156 chr6 66224698 66224967 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 436953 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 178.5-105 chr3 30490887 30491429 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27710 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 115-119 chr4 34423393 34423620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153759 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 122.25-136 chr4 37763623 37764005 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -62872 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 135.75-115 chr2 225777602 225777985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -365001 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 172.5-145 chr4 99378640 99379118 + 0.75 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -26133 NR_133005 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 188-38 chr2 68968410 68968831 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5953 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 253.5-33 chr17 75692493 75693010 + 0.75 NA intron (NM_001301855, intron 4 of 11) intron (NM_001301855, intron 4 of 11) 25413 NM_013260 29115 Hs.655088 NM_013260 ENSG00000161526 SAP30BP HCNGP|HTRG|HTRP SAP30 binding protein protein-coding 243.25-5 chr10 71601418 71601788 + 0.75 NA intron (NM_052836, intron 9 of 12) intron (NM_052836, intron 9 of 12) -89683 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 212.25-107 chrX 47501153 47501497 + 0.75 NA Intergenic MER68-int|LTR|ERVL -18056 NM_001324148 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 159.5-59 chr15 40653689 40653962 + 0.75 NA intron (NM_144508, intron 21 of 25) L2c|LINE|L2 41280 NR_040058 100505648 Hs.586876 NR_040058 ENSG00000245849 RAD51-AS1 TODRA RAD51 antisense RNA 1 ncRNA 175.75-65 chr2 29391767 29392104 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) MIR|SINE|MIR 83442 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 179.5-63 chr15 39938978 39939237 + 0.75 NA intron (NM_001013703, intron 1 of 38) L2a|LINE|L2 4992 NM_001013703 440275 Hs.656673 NM_001013703 ENSG00000128829 EIF2AK4 GCN2|PVOD2 eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4 protein-coding 172.5-75 chr15 67378861 67379228 + 0.75 NA intron (NM_001031715, intron 10 of 20) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -123846 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 169.75-163 chr9 34638832 34639185 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1182 NM_001282207 10280 Hs.522087 NM_005866 ENSG00000147955 SIGMAR1 ALS16|DSMA2|OPRS1|SIG-1R|SR-BP|SR-BP1|SRBP|hSigmaR1|sigma1R sigma non-opioid intracellular receptor 1 protein-coding 169.75-37 chr12 28127132 28127464 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63158 NM_001352081 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 120.25-92 chr2 59418685 59419000 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 201134 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 152.5-6 chr1 159382172 159382622 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -15068 NM_001363557 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 146-17 chr10 83105888 83106257 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 571017 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 120-167 chr6 146792477 146792836 + 0.75 NA intron (NM_024694, intron 33 of 35) intron (NM_024694, intron 33 of 35) 11168 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 168.75-149 chr8 93453238 93453720 + 0.75 NA intron (NR_033858, intron 7 of 10) intron (NR_033858, intron 7 of 10) 246954 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 130.5-63 chr11 78961226 78961612 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) intron (NM_001098816, intron 6 of 33) -386555 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 212.75-9 chr1 235755926 235756269 + 0.75 NA intron (NM_000081, intron 24 of 52) intron (NM_000081, intron 24 of 52) 96963 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 136.5-56 chr12 54455160 54455534 + 0.75 NA TTS (NM_144594) TTS (NM_144594) 18255 NM_144594 121355 Hs.524476 NM_144594 ENSG00000170627 GTSF1 Cue110|FAM112B gametocyte specific factor 1 protein-coding 206.5-101 chr5 115001765 115002234 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR2b|LTR|Gypsy 167909 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 200.25-16 chr10 84153323 84153788 + 0.75 NA TTS (NM_014394) TTS (NM_014394) 14046 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 193-84 chr7 24797271 24797786 + 0.75 NA non-coding (NR_104112, exon 21 of 21) non-coding (NR_104112, exon 21 of 21) -39589 NM_004403 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 178.25-17 chr11 94530037 94530460 + 0.75 NA intron (NM_001190462, intron 3 of 3) intron (NM_001190462, intron 3 of 3) -13603 NM_002033 2526 Hs.390420 NM_002033 ENSG00000196371 FUT4 CD15|ELFT|FCT3A|FUC-TIV|FUTIV|LeX|SSEA-1 fucosyltransferase 4 protein-coding 199.5-163 chrX 85694971 85695312 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -140639 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 128-13 chr1 187753169 187753510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 309711 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 146-116 chr7 13614851 13615216 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 371481 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 232-27 chr19 29914401 29914790 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -9062 NM_001252641 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 115.75-218 chr8 110548629 110549008 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 478615 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 181.75-19 chr10 102133806 102134169 + 0.75 NA intron (NM_001288728, intron 1 of 13) (GCTGAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 947 NM_015062 23082 Hs.533551 NM_015062 ENSG00000148840 PPRC1 PRC PPARG related coactivator 1 protein-coding 156-24 chr11 19437615 19437865 + 0.75 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 69489 NR_049725 100874012 Hs.434602 NR_049725 ENSG00000255043 NAV2-AS5 - NAV2 antisense RNA 5 ncRNA 156.5-189 chr8 52632243 52632508 + 0.75 NA intron (NM_001083617, intron 20 of 23) intron (NM_001083617, intron 20 of 23) -66945 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 128.5-47 chr11 128510179 128510475 + 0.75 NA intron (NM_001143820, intron 3 of 9) intron (NM_001143820, intron 3 of 9) 11983 NM_001162422 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 162.25-159 chr8 122071092 122071364 + 0.75 NA Intergenic MER48|LTR|ERV1 -429788 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 137-160 chr7 31808769 31808988 + 0.75 NA intron (NM_001322057, intron 17 of 17) intron (NM_001322057, intron 17 of 17) 121663 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 117.75-182 chr6 9911721 9911896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -492694 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 140.5-123 chr2 195668680 195668963 + 0.75 NA intron (NM_020342, intron 1 of 9) intron (NM_020342, intron 1 of 9) 11595 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 138.25-77 chr19 52034920 52035250 + 0.75 NA exon (NM_014650, exon 5 of 5) exon (NM_014650, exon 5 of 5) -6706 NM_025040 80110 Hs.292336 NM_025040 ENSG00000142556 ZNF614 - zinc finger protein 614 protein-coding 208-82 chr8 123838703 123839005 + 0.75 NA Intergenic (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -13133 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 174.75-93 chr4 106037246 106037617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14953 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 162.75-141 chr8 90765691 90766015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25922 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 133.5-205 chr5 55082661 55082969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19831 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 189.5-169 chrX 64751631 64752032 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 224619 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 123-38 chr12 65189179 65189456 + 0.75 NA intron (NM_001167614, intron 1 of 12) MER57A-int|LTR|ERV1 19734 NM_014319 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 120-166 chr6 139575143 139575475 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -100713 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 190.5-67 chr18 38550382 38550693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 893402 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 161.25-75 chr17 59034116 59034485 + 0.75 NA intron (NR_148346, intron 17 of 23) intron (NR_148346, intron 17 of 23) 72580 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 113.25-95 chr2 134491061 134491281 + 0.75 NA intron (NM_030923, intron 5 of 7) intron (NM_030923, intron 5 of 7) 227829 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 140.25-158 chr6 16376320 16376557 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) intron (NM_000332, intron 7 of 8) 137851 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 146-57 chr17 81299870 81300148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4702 NM_138570 124565 Hs.352240 NM_138570 ENSG00000157637 SLC38A10 PP1744 solute carrier family 38 member 10 protein-coding 130.75-146 chr4 82508239 82508449 + 0.75 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) FLAM_A|SINE|Alu 53644 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 122.75-211 chr8 131116125 131116344 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -75325 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 133.5-158 chr3 40258863 40259091 + 0.75 NA non-coding (NR_104316, exon 17 of 17) non-coding (NR_104316, exon 17 of 17) 50721 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 122.75-167 chr5 103157247 103157525 + 0.75 NA intron (NM_001345878, intron 14 of 28) intron (NM_001345878, intron 14 of 28) 37085 NM_001345871 23262 Hs.212046 NM_015216 ENSG00000145725 PPIP5K2 CFAP160|DFNB100|HISPPD1|IP7K2|VIP2 diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 protein-coding 160.25-36 chr14 51324853 51325090 + 0.75 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 3414 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 146.25-151 chr8 101635717 101635988 + 0.75 NA intron (NM_024915, intron 11 of 15) intron (NM_024915, intron 11 of 15) 143413 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 120.75-87 chr2 226729916 226730153 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 68756 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 177.5-149 chr5 180399442 180399807 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -46288 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 175-45 chr16 4170345 4170633 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54047 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 136.5-66 chr14 31361212 31361537 + 0.75 NA intron (NM_015473, intron 14 of 35) intron (NM_015473, intron 14 of 35) 59176 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 182.5-152 chr7 26545071 26545375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6398 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 124-84 chr2 69094095 69094339 + 0.75 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) MIRc|SINE|MIR -9465 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 133.75-147 chr4 41462346 41462574 + 0.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) -75697 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 164.75-42 chr12 126971574 126971806 + 0.75 NA intron (NR_104646, intron 4 of 6) (CCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 88707 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 283.5-11 chr11 82357193 82357627 + 0.75 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) intron (NR_120571, intron 1 of 7) 46503 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 144.25-124 chr3 8664389 8664634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12427 NM_001256749 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 186.5-119 chr6 66183155 66183440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 395418 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 169-74 chr5 30787166 30787459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -406374 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 123-65 chr15 86401146 86401524 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) L1PB2|LINE|L1 -84367 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 172.25-49 chr17 42796182 42796566 + 0.75 NA intron (NM_032387, intron 17 of 18) intron (NM_032387, intron 17 of 18) 2330 NM_001040431 28958 Hs.16059 NM_001040431 ENSG00000183978 COA3 CCDC56|COX25|HSPC009|MITRAC12 cytochrome c oxidase assembly factor 3 protein-coding 121.5-4 chr1 41149348 41149593 + 0.75 NA intron (NM_001172220, intron 4 of 13) L1MB7|LINE|L1 11962 NR_135092 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 143.5-183 chr5 171872234 171872467 + 0.75 NA intron (NM_012300, intron 9 of 12) intron (NM_012300, intron 9 of 12) 86478 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 117.5-246 chrX 91395960 91396212 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -38753 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 138.75-142 chr5 36231264 36231604 + 0.75 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) intron (NM_001287341, intron 1 of 12) 9957 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 129.25-172 chr6 126879513 126879861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -238984 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 164.75-132 chr7 31886637 31886866 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 183656 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 246-49 chr5 26142274 26142894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 896002 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 219-89 chr7 4409006 4409420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -273082 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 131.5-6 chr1 104902659 104902964 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 716124 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 143.75-119 chr3 77825899 77826207 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 222910 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 203.5-58 chr18 35680093 35680526 + 0.75 NA intron (NM_020474, intron 3 of 10) L2b|LINE|L2 25740 NM_020474 2589 Hs.514806 NM_020474 ENSG00000141429 GALNT1 GALNAC-T1 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 198.5-28 chr12 40167218 40167531 + 0.75 NA non-coding (NR_146526, exon 2 of 2) non-coding (NR_146526, exon 2 of 2) 11135 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 129-138 chr5 26209465 26209764 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 828972 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 156-132 chr6 81266676 81267071 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 485808 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 161.75-100 chr4 112049804 112050145 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -95480 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 161.25 chr1 27870048 27870491 + 0.75 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -2274 NM_001286115 9473 Hs.10649 NM_004848 ENSG00000130775 THEMIS2 C1orf38|ICB-1|ICB1 thymocyte selection associated family member 2 protein-coding 265-45 chr9 7869584 7870089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70058 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 122.5-174 chr5 10304222 10304422 + 0.75 NA intron (NM_138809, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 3580 NM_138809 134147 Hs.192586 NM_138809 ENSG00000164237 CMBL JS-1 carboxymethylenebutenolidase homolog protein-coding 272.25-15 chr14 47535120 47535548 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 139620 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 145.75-135 chr6 51233312 51233674 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -388377 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 131-125 chr3 164232874 164233187 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -61474 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 118 chr1 6056996 6057253 + 0.75 NA intron (NM_001199862, intron 2 of 15) intron (NM_001199862, intron 2 of 15) 11236 NM_001199862 8514 Hs.440497 NM_003636 ENSG00000069424 KCNAB2 AKR6A5|HKvbeta2|HKvbeta2.1|HKvbeta2.2|KCNA2B|KV-BETA-2 potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2 protein-coding 164.25-120 chr4 115599220 115599580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -485780 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 184.25-62 chr2 168734337 168734661 + 0.75 NA intron (NM_001256126, intron 8 of 10) intron (NM_001256126, intron 8 of 10) 51930 NR_045787 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-44 chr11 131471585 131471814 + 0.75 NA intron (NM_001352003, intron 1 of 8) intron (NM_001352003, intron 1 of 8) 69168 NR_110140 101929653 Hs.559159 NR_110140 ENSG00000237654 LOC101929653 - uncharacterized LOC101929653 ncRNA 211.5-119 chr4 124460345 124460791 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97866 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 151-116 chr5 177253003 177253339 + 0.75 NA intron (NM_172349, intron 13 of 23) intron (NM_172349, intron 13 of 23) 50548 NM_001031677 53917 Hs.16258 NM_130781 ENSG00000169228 RAB24 - RAB24, member RAS oncogene family protein-coding 144.75-126 chr4 142989760 142990058 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -143374 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 196 chr1 10535319 10535868 + 0.75 NA intron (NM_004565, intron 2 of 8) intron (NM_004565, intron 2 of 8) 60643 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 203-38 chr15 70883793 70884313 + 0.75 NA intron (NM_020147, intron 1 of 2) intron (NM_020147, intron 1 of 2) 8380 NM_020147 56906 Hs.591123 NM_020147 ENSG00000129028 THAP10 - THAP domain containing 10 protein-coding 112.75-55 chr14 46327488 46327722 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -143754 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 207.75-50 chr2 31219424 31219951 + 0.75 NA intron (NM_001321270, intron 2 of 21) MIR3|SINE|MIR -2172 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 166.5-8 chr1 70525643 70525978 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 114542 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 151-58 chr2 51123259 51123554 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1ME1|LINE|L1 90805 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 155.75-40 chr12 40225729 40225947 + 0.75 NA intron (NM_198578, intron 2 of 50) intron (NM_198578, intron 2 of 50) 841 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 163.5-158 chr5 52480923 52481246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -306832 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 175.75-83 chr3 18306359 18306737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118791 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 172.5-82 chr16 79024782 79025221 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 575736 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 148.75-163 chr8 28203852 28204283 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 110928 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 138.25-162 chr7 43227993 43228240 + 0.75 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) intron (NM_015052, intron 2 of 29) 77221 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 149-102 chr5 67320354 67320601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123678 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 133.75-199 chr9 29535378 29535667 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -321921 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 166.75-35 chr12 85955210 85955460 + 0.75 NA TTS (NM_001351289) TTS (NM_001351289) 81040 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 192.75-109 chr5 119793582 119793896 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 164180 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 143.75-190 chr8 117003221 117003500 + 0.75 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) MIRc|SINE|MIR 52385 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 168.75-157 chr8 124886162 124886478 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -55688 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 127-56 chr14 27075121 27075356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 166596 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 112.25-199 chr7 23179480 23179741 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2438 NM_001370444 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 133-8 chr1 187866118 187866393 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 422627 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 137-27 chr10 91300021 91300396 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79545 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 113.25-171 chr8 91444808 91445009 + 0.75 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 195589 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 333.5-5 chr12 129185576 129186358 + 0.75 NA intron (NM_133448, intron 5 of 8) intron (NM_133448, intron 5 of 8) -22634 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 151-110 chr5 71784060 71784351 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 64930 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 157-32 chr14 87300260 87300520 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 354904 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 113-107 chr21 30993579 30993758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44808 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 171.5-143 chr8 17363104 17363567 + 0.75 NA intron (NM_004686, intron 3 of 13) intron (NM_004686, intron 3 of 13) 50016 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 276.25-28 chr22 34125658 34126210 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -203046 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 243-46 chr3 51071047 51071740 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 6 of 52) intron (NM_004947, intron 6 of 52) -313898 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 115.75-223 chr8 130904210 130904512 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 6 of 17) intron (NM_001115, intron 6 of 17) 136548 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 177.25-143 chr8 117289046 117289398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 154227 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 121.5-140 chr2 125796464 125796697 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 321405 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 120-126 chr3 190991354 190991695 + 0.75 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 113594 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 136.5-59 chr12 111503779 111504070 + 0.75 NA intron (NR_132311, intron 14 of 23) intron (NR_132311, intron 14 of 23) 69062 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 248-64 chr6 110810589 110811016 + 0.75 NA intron (NM_001300963, intron 1 of 13) AluSp|SINE|Alu -3819 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 132-40 chr12 106671312 106671538 + 0.75 NA intron (NM_001206691, intron 4 of 17) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 13275 NR_038912 100505978 Hs.662583 NR_038912 ENSG00000257711 LOC100505978 - uncharacterized LOC100505978 ncRNA 129-36 chr11 61051804 61052187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41968 NM_001346456 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 139.75-53 chr14 73991230 73991423 + 0.75 NA intron (NM_001249, intron 3 of 15) AluSz|SINE|Alu 27962 NM_001321985 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 115-9 chr1 99993855 99994060 + 0.75 NA intron (NM_001271684, intron 2 of 5) intron (NM_001271684, intron 2 of 5) 23440 NM_001271685 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 247-41 chr3 4551317 4551881 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 58251 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 144.25-145 chr4 73491855 73492112 + 0.75 NA exon (NM_001133, exon 8 of 15) exon (NM_001133, exon 8 of 15) 10238 NM_001133 173 Hs.168718 NM_001133 ENSG00000079557 AFM ALB2|ALBA|ALF afamin protein-coding 119.5-89 chr15 84034170 84034386 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 28 of 29) HAL1ME|LINE|L1 -45909 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 129.75-171 chr7 31326409 31326621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14211 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 151.25-100 chr20 4344673 4344925 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -95512 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 232.25-64 chr5 78933904 78934247 + 0.75 NA intron (NM_198709, intron 5 of 7) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 51235 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 138-46 chr14 90854028 90854305 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001322234, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001322234, exon 17 of 17) -37736 NM_001010854 145567 Hs.655697 NM_001010854 ENSG00000165914 TTC7B TTC7L1|c14_5685 tetratricopeptide repeat domain 7B protein-coding 159-83 chr5 16154806 16155066 + 0.75 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 24855 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 147.5-125 chr20 39387974 39388272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -163375 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 204.75-66 chr2 160366596 160367082 + 0.75 NA intron (NM_002897, intron 2 of 13) intron (NM_002897, intron 2 of 13) 41043 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 159-133 chrX 16113084 16113553 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10247 NM_005314 2925 Hs.567282 NM_005314 ENSG00000126010 GRPR BB2|BB2R gastrin releasing peptide receptor protein-coding 174.5-122 chr3 110764214 110764507 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 305599 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 113.5-191 chr5 36168487 36168774 + 0.75 NA intron (NM_032637, intron 5 of 9) L2b|LINE|L2 16519 NM_032637 6502 Hs.23348 NM_005983 ENSG00000145604 SKP2 FBL1|FBXL1|FLB1|p45 S-phase kinase associated protein 2 protein-coding 254.5-39 chr2 134540815 134541401 + 0.75 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) intron (NM_030923, intron 4 of 7) 177892 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 122-26 chr10 47241776 47242087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58266 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 224-7 chr1 169092488 169093055 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5766 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 139.25-19 chr10 67669225 67669497 + 0.75 NA intron (NM_013266, intron 1 of 17) L2|LINE|L2 -3676 NM_001127384 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 152.5-22 chr10 109234648 109235020 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 688412 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 192.25-55 chr2 75811754 75812152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101038 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 136.75-210 chrX 65470248 65470675 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18274 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 230.75-57 chr5 66802985 66803592 + 0.75 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 -25485 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 117.25-72 chr14 56218389 56218695 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 100131 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 247.5-3 chr1 191514832 191515198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -286517 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 194.25-59 chr2 104382578 104383083 + 0.75 NA intron (NR_037885, intron 2 of 2) intron (NR_037885, intron 2 of 2) 25502 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 116.5-146 chr21 35076004 35076211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26809 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 119-172 chr6 140599800 140600062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83883 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 317-3 chr1 83833748 83834569 + 0.75 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) MamRep1151|LTR?|LTR? 26388 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 140.25-137 chr4 112027623 112027838 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117724 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 172.75-100 chr5 84109251 84109560 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 4 of 9) AluSx|SINE|Alu 275462 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 151-73 chr22 24067634 24067885 + 0.75 NA intron (NM_012295, intron 16 of 36) MIRb|SINE|MIR 56389 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 182-85 chr4 134474235 134474619 + 0.75 NA intron (NR_147155, intron 3 of 3) L1M7|LINE|L1 50559 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 220-13 chr11 70427371 70427833 + 0.75 NA intron (NM_005231, intron 13 of 17) intron (NM_005231, intron 13 of 17) 29073 NM_001184740 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 165.5-66 chr17 67142886 67143404 + 0.75 NA intron (NM_001330447, intron 21 of 32) L1M4b|LINE|L1 98591 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 135-74 chr19 45598626 45598849 + 0.75 NA intron (NM_005282, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR 3475 NM_005282 2828 Hs.17170 NM_005282 ENSG00000177464 GPR4 - G protein-coupled receptor 4 protein-coding 144-32 chr12 30497757 30498091 + 0.75 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 179320 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 162.25 chr1 17817703 17818028 + 0.75 NA intron (NM_030812, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 62532 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 232.75-6 chr10 11757892 11758306 + 0.75 NA intron (NM_024693, intron 4 of 4) intron (NM_024693, intron 4 of 4) 15717 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 157-12 chr10 107391313 107391588 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -226744 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 178.5-28 chr11 78348371 78348762 + 0.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 -6686 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 149.5-124 chr3 98184938 98185208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16373 NM_001005515 403274 Hs.554713 NM_001005515 ENSG00000233412 OR5H15 - olfactory receptor family 5 subfamily H member 15 protein-coding 124-112 chr3 38346377 38346768 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_005108) promoter-TSS (NM_005108) -188 NM_001349179 9942 Hs.659985 NM_005108 ENSG00000093217 XYLB - xylulokinase protein-coding 236.25-49 chr2 190069344 190069853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6869 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 237.75-4 chr1 198162119 198162531 + 0.75 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 5327 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 144.5-84 chr17 57258925 57259179 + 0.75 NA intron (NM_001322250, intron 4 of 13) intron (NM_001322250, intron 4 of 13) 2033 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 184.75-24 chr12 93699552 93699968 + 0.75 NA intron (NM_001320100, intron 2 of 2) intron (NM_001320100, intron 2 of 2) 20991 NM_001330126 8738 Hs.38533 NM_003805 ENSG00000169372 CRADD MRT34|RAIDD CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with death domain protein-coding 174.75-16 chr10 117670710 117671020 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -125797 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 177.75-114 chr5 94799613 94800123 + 0.75 NA intron (NM_001002796, intron 17 of 22) intron (NM_001002796, intron 17 of 22) 181199 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 278-3 chr1 154241037 154241663 + 0.75 NA intron (NM_001127320, intron 8 of 24) AluSp|SINE|Alu -18377 NR_145714 109617023 NR_145714 ENSG00000201129 SNORA58B - small nucleolar RNA, H/ACA box 58B snoRNA 119.5-223 chr7 145670226 145670599 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -834359 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 235.25-54 chr5 176738573 176739101 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4368 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 167.75-106 chr4 140584045 140584498 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15310 NM_021833 7350 Hs.249211 NM_021833 ENSG00000109424 UCP1 SLC25A7|UCP uncoupling protein 1 protein-coding 149-117 chr7 6625825 6626136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10370 NM_017560 54753 Hs.592170 NM_017560 ENSG00000236609 ZNF853 - zinc finger protein 853 protein-coding 166-59 chr2 37326369 37326651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9426 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 288.25-3 chr10 17733086 17733908 + 0.75 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -18704 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 114.5-282 chrX 118522396 118522573 + 0.75 NA intron (NM_144658, intron 1 of 52) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 26575 NM_144658 139818 Hs.368203 NM_144658 ENSG00000147251 DOCK11 ACG|ZIZ2|bB128O4.1 dedicator of cytokinesis 11 protein-coding 188.25-109 chr7 125761403 125761715 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -497268 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 231.75-54 chr4 85638824 85639212 + 0.75 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -83450 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 232-26 chr19 6881643 6882041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5737 NM_001256255 2015 Hs.2375 NM_001974 ENSG00000174837 ADGRE1 EMR1|TM7LN3 adhesion G protein-coupled receptor E1 protein-coding 156.25-99 chr3 114331701 114331989 + 0.75 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -15276 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 250.75-12 chr14 59310994 59311398 + 0.75 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) intron (NM_001270520, intron 3 of 24) 47755 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 124.25-121 chr21 29711369 29711678 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -36652 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 207.75-18 chr11 73105780 73106227 + 0.75 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) intron (NM_014824, intron 2 of 19) 36315 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 157.25-80 chr2 88318851 88319140 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 133698 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 205.25-28 chr14 72215144 72215555 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 281822 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 141.25-68 chr17 59304823 59305119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26684 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 163.75-38 chr12 110476422 110476797 + 0.75 NA intron (NM_013300, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 7764 NM_013300 29902 Hs.436618 NM_013300 ENSG00000204856 FAM216A C12orf24|HSU79274 family with sequence similarity 216 member A protein-coding 227.75-42 chr2 148175229 148175720 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -153870 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 141.75-132 chr5 7259681 7259942 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 9543 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 157-20 chr11 84419385 84419740 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -102223 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 217.5-62 chr2 42104369 42104859 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 56593 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 196.75-45 chr16 64198605 64198895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 923313 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 223.25-59 chr5 17887306 17887721 + 0.75 NA intron (NR_134286, intron 5 of 7) L1ME3F|LINE|L1 80239 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 131.5-106 chr2 38577972 38578305 + 0.75 NA intron (NM_138394, intron 6 of 12) intron (NM_138394, intron 6 of 12) 24790 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 195.75-110 chr7 31189979 31190455 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 137756 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 137-120 chr4 58833924 58834224 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -150208 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 170-40 chr18 4924606 4924958 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -156400 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 204.75-58 chr2 23762456 23762856 + 0.75 NA intron (NR_125717, intron 24 of 28) intron (NR_125717, intron 24 of 28) 164467 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 167.25-51 chr15 51354052 51354424 + 0.75 NA intron (NM_181789, intron 1 of 9) intron (NM_181789, intron 1 of 9) 12583 NM_181789 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 121.75-199 chr9 81028586 81028780 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 660852 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 184.5-137 chr6 161808760 161809184 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) AluJo|SINE|Alu 337995 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 160.75-154 chr8 136333765 136333995 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -196918 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 113.5-2 chr1 12300707 12300952 + 0.75 NA intron (NM_015378, intron 25 of 69) intron (NM_015378, intron 25 of 69) 70799 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 199.25-38 chr16 13125182 13125597 + 0.75 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 223791 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 157.5-163 chr5 68983960 68984394 + 0.75 NA intron (NR_130778, intron 1 of 3) AluJr4|SINE|Alu 45750 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 190.5-2 chr1 13462870 13463435 + 0.75 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 50851 NM_001010847 126755 Hs.657356 NM_001010847 ENSG00000162494 LRRC38 - leucine rich repeat containing 38 protein-coding 131.5-171 chr4 40143909 40144156 + 0.75 NA intron (NM_001318359, intron 16 of 18) MLT2B3|LTR|ERVL -47048 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 140-116 chr3 144521054 144521494 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 548193 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 203.5-83 chr20 57692446 57692895 + 0.75 NA intron (NM_199171, intron 1 of 3) intron (NM_199171, intron 1 of 3) -1984 NM_001255976 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 116-141 chr6 105979658 105979890 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -106562 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 138.25-129 chr4 104267614 104267948 + 0.75 NA Intergenic MER70B|LTR|ERVL -223184 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 250.25-10 chr14 63184974 63185339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19287 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 128-155 chr7 96355191 96355433 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -33165 NM_001160210 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 117.5-3 chr1 60273646 60273840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -199973 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 114.5-103 chr15 82007481 82007711 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 38422 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 155.75-154 chr7 109963860 109964147 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -3790 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 150.25-129 chr5 176459177 176459682 + 0.75 NA intron (NM_014613, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 11044 NM_014613 23197 Hs.484242 NM_014613 ENSG00000113194 FAF2 ETEA|UBXD8|UBXN3B Fas associated factor family member 2 protein-coding 163.75-91 chr3 32833985 32834385 + 0.75 NA intron (NM_001039111, intron 1 of 3) intron (NM_001039111, intron 1 of 3) 16188 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 180.75-93 chr3 88134576 88134849 + 0.75 NA intron (NM_001350135, intron 4 of 6) intron (NM_001350135, intron 4 of 6) 15154 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 125.25-223 chrX 154958388 154958620 + 0.75 NA intron (NM_000132, intron 10 of 25) intron (NM_000132, intron 10 of 25) 64219 NM_000132 2157 Hs.632836 NM_000132 ENSG00000185010 F8 AHF|DXS1253E|F8B|F8C|FVIII|HEMA coagulation factor VIII protein-coding 117-89 chr2 70651717 70652057 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -98061 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 193.5-145 chr6 164251232 164251548 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 570673 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 163.25-117 chr5 101468570 101468890 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -565448 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 172-8 chr1 110228083 110228507 + 0.75 NA intron (NM_001039574, intron 3 of 3) intron (NM_001039574, intron 3 of 3) 17981 NR_036437 3749 Hs.153521 NM_004978 ENSG00000116396 KCNC4 C1orf30|HKSHIIIC|KSHIIIC|KV3.4 potassium voltage-gated channel subfamily C member 4 protein-coding 124.75-153 chr4 58260673 58260911 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 275536 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 137.75-175 chr6 47386431 47386819 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -76720 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 190.5-156 chr8 83165895 83166294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -237664 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 168.5-197 chr9 31753715 31754075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -372405 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 149.75-13 chr10 53232498 53232909 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -461003 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 192-98 chr8 50278206 50278507 + 0.75 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) intron (NR_135797, intron 2 of 20) 114225 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 129.5-74 chr15 49284254 49284521 + 0.75 NA intron (NM_001289030, intron 8 of 10) intron (NM_001289030, intron 8 of 10) 114140 NR_147895 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 180.5-50 chr15 69795287 69795701 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39740 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 254-14 chr12 75135652 75136133 + 0.75 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 73856 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 152.25-129 chr5 88220232 88220471 + 0.75 NA intron (NM_001349407, intron 5 of 14) HAL1|LINE|L1 48494 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 151-43 chr17 19401235 19401614 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -9808 NM_007148 7732 Hs.189482 NM_007148 ENSG00000128482 RNF112 BFP|ZNF179 ring finger protein 112 protein-coding 148-3 chr1 43663289 43663605 + 0.75 NA intron (NM_014663, intron 5 of 21) intron (NM_014663, intron 5 of 21) 13298 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 148.25-69 chr2 39069932 39070367 + 0.75 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) intron (NM_005633, intron 1 of 22) 50314 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 134.75-208 chr7 130809451 130809756 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67207 NR_029503 407021 NR_029503 ENSG00000284032 MIR29A MIRN29|MIRN29A|hsa-mir-29|hsa-mir-29a|miRNA29A|mir-29a microRNA 29a ncRNA 117.75-222 chr9 6495787 6496016 + 0.75 NA intron (NM_152896, intron 10 of 15) intron (NM_152896, intron 10 of 15) 82702 NM_152896 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 114.75-113 chr22 20210578 20210804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4359 NR_026919 150197 Hs.635544 NM_152508 ENSG00000236499 LINC00896 - long intergenic non-protein coding RNA 896 ncRNA 124-48 chr14 97965481 97965694 + 0.75 NA intron (NR_152748, intron 2 of 2) intron (NR_152748, intron 2 of 2) 12537 NR_152747 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 157.5-27 chr10 83205974 83206230 + 0.75 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 470987 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 161-14 chr10 59000979 59001250 + 0.75 NA intron (NR_108046, intron 1 of 1) intron (NR_108046, intron 1 of 1) 1596 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 137.75-37 chr11 45344891 45345106 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10373 NR_120558 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 222.25-83 chr7 107895056 107895432 + 0.75 NA intron (NM_001289750, intron 2 of 11) MIR|SINE|MIR 4061 NM_000108 1738 Hs.131711 NM_000108 ENSG00000091140 DLD DLDD|DLDH|E3|GCSL|LAD|PHE3 dihydrolipoamide dehydrogenase protein-coding 133.25-222 chr9 71575447 71575862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128683 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 189.75-17 chr11 42511135 42511477 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -257616 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 194-49 chr2 236096310 236096603 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 16 of 17) AluSx|SINE|Alu 71930 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 150.75-10 chr1 87644724 87644965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -273189 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 122.25-80 chr18 5883820 5884127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11981 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 134.25-43 chr13 32263932 32264231 + 0.75 NA intron (NM_023037, intron 53 of 60) intron (NM_023037, intron 53 of 60) 47873 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 163.25-50 chr16 77018380 77018830 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 149669 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 165.75-4 chr1 76301332 76301809 + 0.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 226824 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 186-3 chr1 160900327 160900787 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -15377 NM_017625 55600 Hs.50813 NM_017625 ENSG00000179914 ITLN1 HL-1|HL1|INTL|ITLN|LFR|hIntL|omentin intelectin 1 protein-coding 119.25-32 chr11 15256971 15257171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 107969 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 159.5-162 chr4 80613641 80613934 + 0.75 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 278067 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 116.25-47 chr12 27260780 27260990 + 0.75 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 16599 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 115.75-215 chr8 89436215 89436405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 321401 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 150.5-197 chr7 7961153 7961590 + 0.75 NA intron (NR_110018, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 7381 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 156.25-107 chr4 14539510 14539844 + 0.75 NA intron (NR_126435, intron 5 of 6) L1PA8A|LINE|L1 348492 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 124-158 chr7 31954070 31954283 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 116231 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 258.25-11 chr11 46050068 46050581 + 0.75 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 70495 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 135.5-139 chr3 123361785 123362168 + 0.75 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 54366 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 133.5-10 chr1 158175987 158176296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3806 NM_001319145 912 Hs.1799 NM_001766 ENSG00000158473 CD1D CD1A|R3|R3G1 CD1d molecule protein-coding 211.5-6 chr1 152902162 152902599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6165 NM_005547 3713 Hs.516439 NM_005547 ENSG00000163207 IVL - involucrin protein-coding 113-87 chr2 62385827 62386109 + 0.75 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 120227 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 200-22 chr12 17838009 17838348 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 164879 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 128.5-242 chrX 31443514 31443879 + 0.75 NA intron (NM_000109, intron 60 of 78) intron (NM_000109, intron 60 of 78) 64602 NM_004014 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 137.5-201 chr6 35894896 35895098 + 0.75 NA intron (NR_034069, intron 2 of 15) HAL1|LINE|L1 26101 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 191.75-27 chr12 14768003 14768318 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 2971 NM_175054 121504 Hs.745457 NM_175054 ENSG00000197837 HIST4H4 H4/p histone cluster 4 H4 protein-coding 175.25-6 chr1 153020695 153021165 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -10273 NM_003125 6699 Hs.1076 NM_003125 ENSG00000169469 SPRR1B CORNIFIN|GADD33|SPR-IB|SPRR1 small proline rich protein 1B protein-coding 114.75-5 chr1 69539702 69540009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27479 NM_001366839 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 128-173 chr9 69372787 69373063 + 0.75 NA intron (NM_001127608, intron 3 of 10) L1MB2|LINE|L1 43600 NM_004816 9413 Hs.118003 NM_004816 ENSG00000135063 FAM189A2 C9orf61|X123 family with sequence similarity 189 member A2 protein-coding 146.75-49 chr14 79330965 79331181 + 0.75 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 51693 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 113.75-87 chr18 26602854 26603033 + 0.75 NA intron (NM_001258222, intron 1 of 4) L1PA14|LINE|L1 -11408 NR_107024 102466874 NR_107024 ENSG00000276221 MIR8057 hsa-mir-8057 microRNA 8057 ncRNA 183-110 chr7 127616451 127616757 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001366111) promoter-TSS (NM_001366111) -577 NM_001366111 5078 Hs.129706 NM_006193 ENSG00000106331 PAX4 KPD|MODY9 paired box 4 protein-coding 157-117 chr8 114611255 114611532 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 1056620 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 193-85 chr7 97715275 97715625 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -16636 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 172.25-101 chr4 79066290 79066646 + 0.75 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 94720 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 315.75-6 chr14 55351901 55352421 + 0.75 NA exon (NM_017943, exon 2 of 2) exon (NM_017943, exon 2 of 2) 59697 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 213-48 chr2 110814584 110814986 + 0.75 NA intron (NM_001371254, intron 9 of 18) HAL1ME|LINE|L1 82212 NM_001371254 133.25-66 chr16 9851086 9851446 + 0.75 NA intron (NM_001134408, intron 4 of 13) intron (NM_001134408, intron 4 of 13) 330801 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 163.75-25 chr11 36234268 36234581 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 55000 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 143.75-63 chr17 21279169 21279515 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5369 NM_145109 5606 Hs.514012 NM_002756 ENSG00000034152 MAP2K3 MAPKK3|MEK3|MKK3|PRKMK3|SAPKK-2|SAPKK2 mitogen-activated protein kinase kinase 3 protein-coding 199.25-64 chr20 41704538 41704847 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86315 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 174.75-67 chr2 151381098 151381379 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1867 NR_110248 101929319 Hs.639241 NR_110248 LOC101929319 - uncharacterized LOC101929319 ncRNA 151.25-177 chr7 88354006 88354381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47299 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 140.5-244 chr9 5738198 5738595 + 0.75 NA intron (NM_001206557, intron 7 of 24) intron (NM_001206557, intron 7 of 24) 94721 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 134.5-77 chr15 65071654 65072040 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3856 NM_016563 51285 Hs.27018 NM_016563 ENSG00000103710 RASL12 RIS RAS like family 12 protein-coding 229-68 chr6 150468611 150468970 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 99778 NM_001318495 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 148-41 chr16 78960627 78960919 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 639964 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 140.25-40 chr12 111937903 111938163 + 0.75 NA intron (NM_001193453, intron 5 of 9) intron (NM_001193453, intron 5 of 9) 38970 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 226-44 chr3 147006010 147006373 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 84268 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 172-83 chr4 63660099 63660598 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 749102 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 159.5-165 chr4 105612932 105613343 + 0.75 NA intron (NM_001242729, intron 2 of 13) intron (NM_001242729, intron 2 of 13) 51546 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 209.25-58 chr2 107209227 107209518 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) LTR49-int|LTR|ERV1 140153 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 173.75-161 chr9 131633110 131633399 + 0.75 NA intron (NM_198679, intron 5 of 23) intron (NM_198679, intron 5 of 23) 76588 NM_198679 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 118-63 chr16 76139544 76139780 + 0.75 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -137739 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 200.25-4 chr1 152211506 152211867 + 0.75 NA TTS (NM_001009931) TTS (NM_001009931) 12510 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 150.5-54 chr14 87709540 87709881 + 0.75 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -54416 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 154.25-84 chr2 105854129 105854457 + 0.75 NA intron (NM_001004720, intron 1 of 3) L1MC1|LINE|L1 2446 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 182.5-45 chr13 107601942 107602449 + 0.75 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR -70947 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 170-102 chr8 141113665 141113921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14796 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 185.25-23 chr12 116129235 116129741 + 0.75 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) 19166 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 158-135 chr8 46286375 46286702 + 0.75 NA Intergenic GSAT|Satellite|centr 331105 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 123-40 chr12 113569487 113569715 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 97598 NR_126425 104355219 Hs.641707 NR_126425 LHX5-AS1 locus 4010|locus4010 LHX5 antisense RNA 1 ncRNA 153-39 chr14 48135926 48136371 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -341134 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 129.25-185 chr7 52597902 52598120 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -437622 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 164.75-54 chr15 64703591 64703943 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_002537) promoter-TSS (NM_002537) -486 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 127-28 chr11 42556092 42556523 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -302617 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 120.25-124 chr22 32957075 32957472 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 3 of 13) intron (NM_003490, intron 3 of 13) 49548 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 135.25-191 chr7 86352373 86352722 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -291362 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 158.25-49 chr17 44345553 44345837 + 0.75 NA intron (NM_002087, intron 1 of 12) intron (NM_002087, intron 1 of 12) 609 NM_002087 2896 Hs.514220 NM_002087 ENSG00000030582 GRN CLN11|GEP|GP88|PCDGF|PEPI|PGRN granulin precursor protein-coding 256-19 chr16 79338544 79339055 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 261938 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 166.5-188 chr7 29993586 29994036 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3522 NM_001145514 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 117-190 chr8 135163898 135164130 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -70117 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 232.5-67 chr3 13769159 13769691 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110646 NM_004625 7476 Hs.72290 NM_004625 ENSG00000154764 WNT7A Wnt-7a Wnt family member 7A protein-coding 202-17 chr11 102651912 102652383 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -26815 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 160-12 chr10 66260318 66260594 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) LTR29|LTR|ERV1 -665580 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 128.25-109 chr2 208941038 208941291 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 398522 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 118.5-86 chr2 16708623 16708920 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42937 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 132-119 chr3 183781392 183781738 + 0.75 NA intron (NM_001351371, intron 19 of 21) MLT2B2|LTR|ERVL 28886 NR_046727 100874113 NR_046727 YEATS2-AS1 - YEATS2 antisense RNA 1 ncRNA 145.75-167 chr9 74987542 74987743 + 0.75 NA intron (NR_135282, intron 5 of 6) L1ME1|LINE|L1 34677 NR_121183 101927380 Hs.257556 NR_121183 CARNMT1-AS1 C9orf41-AS1 CARNMT1 antisense RNA 1 ncRNA 233-9 chr10 128240688 128241112 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45050 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 141.5-101 chr2 84572553 84572798 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 11 of 76) intron (NM_001370, intron 11 of 76) 56220 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 140.5-141 chr22 30591921 30592194 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014303) promoter-TSS (NM_014303) -147 NM_001243225 23481 Hs.517543 NM_014303 ENSG00000100029 PES1 NOP7|PES pescadillo ribosomal biogenesis factor 1 protein-coding 194.25-21 chr12 27047556 27047906 + 0.75 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 25173 NM_004264 9412 Hs.286145 NM_004264 ENSG00000152944 MED21 SRB7|SURB7|hSrb7 mediator complex subunit 21 protein-coding 156.5-137 chr4 95599581 95599978 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50806 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 189.25-62 chr2 201831655 201832052 + 0.75 NA intron (NM_001366386, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR 25274 NM_001366386 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 149.25-153 chr6 39918596 39918901 + 0.75 NA intron (NR_033233, intron 2 of 8) intron (NR_033233, intron 2 of 8) 8968 NM_005943 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 123.25-18 chr1 233791515 233791761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113038 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 117-146 chr5 55706022 55706308 + 0.75 NA intron (NM_001349382, intron 2 of 17) intron (NM_001349382, intron 2 of 17) 6159 NM_173514 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 214.75-85 chr8 89181432 89181822 + 0.75 NA Intergenic (TACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 576084 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 132.25-132 chr3 118351086 118351320 + 0.75 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -290565 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 296-5 chr10 96156697 96157259 + 0.75 NA exon (NM_001330737, exon 7 of 7) exon (NM_001330737, exon 7 of 7) 26356 NM_001330734 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 128.5-195 chr6 121495750 121495981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60219 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 123.5-146 chr3 177704816 177705026 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) intron (NR_047568, intron 3 of 3) -111944 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 112.75-99 chr2 108360879 108361189 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -16920 NM_001321770 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 165.75-59 chr16 54299334 54299820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12790 NM_024336 79191 Hs.499205 NM_024336 ENSG00000177508 IRX3 IRX-1|IRXB1 iroquois homeobox 3 protein-coding 137.25-157 chr8 13001741 13002045 + 0.75 NA intron (NM_020844, intron 2 of 4) intron (NM_020844, intron 2 of 4) -10371 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 198.5-136 chr7 104687342 104687653 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) MER21B|LTR|ERVL 116595 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 218.25-48 chr2 220128586 220128990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222223 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 192.5-93 chr3 110965662 110966069 + 0.75 NA Intergenic HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 104094 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 158.5-163 chr5 177613170 177613467 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 13186 NM_007255 11285 Hs.455109 NM_007255 ENSG00000027847 B4GALT7 EDSP1|EDSSLA|EDSSPD1|XGALT1|XGPT|XGPT1 beta-1,4-galactosyltransferase 7 protein-coding 154.25-72 chr18 77141080 77141367 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -8440 NM_001025100 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 163-132 chrX 43405575 43405792 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 228689 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 171.25-54 chr16 7240044 7240336 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) AluSx1|SINE|Alu -92655 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 128-77 chr2 113150311 113150526 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 22820 NM_173842 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 132-45 chr13 71166454 71166753 + 0.75 NA intron (NR_047699, intron 2 of 3) intron (NR_047699, intron 2 of 3) 151462 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 178-74 chr4 93243006 93243537 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -585482 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 117.75-136 chr3 70443373 70443592 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -130844 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 196.25-125 chr9 105611178 105611613 + 0.75 NA intron (NR_147213, intron 7 of 9) L1PA13|LINE|L1 -51062 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 291.25-21 chr4 83225725 83226412 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58727 NM_001358921 27235 Hs.144304 NM_015697 ENSG00000173085 COQ2 CL640|COQ10D1|MSA1|PHB:PPT coenzyme Q2, polyprenyltransferase protein-coding 134.25-159 chr6 102865641 102865865 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 1466768 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 172.25-19 chr10 80178288 80178744 + 0.75 NA intron (NM_001278409, intron 1 of 16) intron (NM_001278409, intron 1 of 16) 25975 NM_001278408 311 Hs.530291 NM_001157 ENSG00000122359 ANXA11 ALS23|ANX11|CAP-50|CAP50 annexin A11 protein-coding 161.25-74 chr17 57428874 57429220 + 0.75 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 94550 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 153.25-145 chr9 70682243 70682515 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 8 of 25) intron (NM_001366143, intron 8 of 25) 127705 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 149.75-134 chr5 160392400 160392660 + 0.75 NA TTS (NM_022090) TTS (NM_022090) 7524 NM_022090 63920 Hs.529464 NM_022090 ENSG00000221886 ZBED8 Buster3|C5orf54 zinc finger BED-type containing 8 protein-coding 164.25-50 chr17 529490 529860 + 0.75 NA intron (NM_001128159, intron 19 of 21) L1ME3|LINE|L1 -83735 NM_182705 359845 Hs.345588 NM_182705 ENSG00000183688 RFLNB CFM1|FAM101B refilin B protein-coding 124.5-171 chr5 118251391 118251609 + 0.75 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L1MA4A|LINE|L1 -31074 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 156.5-79 chr2 59752947 59753254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 535392 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 261.75-13 chr14 72041856 72042654 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) AluSx|SINE|Alu 108728 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 155.5-105 chr2 206173384 206173759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11343 NR_002590 619569 Hs.742407 NR_002590 ENSG00000207406 SNORA41 ACA41|SNORA41A small nucleolar RNA, H/ACA box 41 snoRNA 125-62 chr18 56258055 56258437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66984 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 211.75-13 chr11 110132406 110132808 + 0.75 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) intron (NM_033390, intron 1 of 5) 39215 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 210-19 chr11 112854443 112854828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106785 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 260.75-49 chr4 137252239 137252671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39656 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 116.25-73 chr14 86631466 86631732 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -274179 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 166-70 chr2 236742523 236742856 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172864 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 131.5-46 chr12 111927679 111928018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28785 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 120-56 chr16 3685389 3685750 + 0.75 NA intron (NM_001272049, intron 3 of 16) intron (NM_001272049, intron 3 of 16) 30865 NM_001351825 1773 Hs.629638 NM_005223 ENSG00000213918 DNASE1 DNL1|DRNI deoxyribonuclease 1 protein-coding 143.25-135 chr4 80224666 80224979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27319 NM_001099403 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 201.75 chr1 31484789 31485296 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -15043 NR_034112 149086 Hs.729905 NR_034112 ENSG00000260386 LDC1P LINC01225 leucine decarboxylase 1, pseudogene pseudo 222.5-46 chr2 4194723 4195225 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 220813 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 130.75-43 chr12 109296977 109297285 + 0.75 NA intron (NM_213596, intron 2 of 9) intron (NM_213596, intron 2 of 9) 12153 NM_213596 121643 Hs.528316 NM_213596 ENSG00000139445 FOXN4 - forkhead box N4 protein-coding 144-73 chr20 34901762 34902054 + 0.75 NA intron (NM_001076552, intron 2 of 18) intron (NM_001076552, intron 2 of 18) 25296 NM_018677 55902 Hs.517034 NM_018677 ENSG00000131069 ACSS2 ACAS2|ACECS|ACS|ACSA|dJ1161H23.1 acyl-CoA synthetase short chain family member 2 protein-coding 168.25-50 chr15 82641687 82641986 + 0.75 NA intron (NM_001365240, intron 1 of 12) intron (NM_001365240, intron 1 of 12) 5527 NM_001365242 64506 Hs.459132 NM_030594 ENSG00000214575 CPEB1 CPE-BP1|CPEB|CPEB-1|h-CPEB|hCPEB-1 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 protein-coding 148.25-77 chr2 206504256 206504541 + 0.75 NA intron (NM_003812, intron 3 of 25) intron (NM_003812, intron 3 of 25) 60866 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 144.75-64 chr16 8095428 8095736 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 494256 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 122.75-17 chr1 212785745 212786051 + 0.75 NA intron (NM_015471, intron 2 of 5) intron (NM_015471, intron 2 of 5) 5879 NM_001297737 25936 Hs.497692 NM_015471 ENSG00000117697 NSL1 C1orf48|DC8|MIS14 NSL1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 158.75-137 chr5 30974209 30974477 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -219343 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 206.5-91 chr5 17822804 17823225 + 0.75 NA intron (NR_134286, intron 2 of 7) intron (NR_134286, intron 2 of 7) 15740 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 138-110 chr4 20279325 20279570 + 0.75 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) 27542 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 196-41 chr17 73627261 73627590 + 0.75 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 17020 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 201-64 chr5 131274611 131274943 + 0.75 NA intron (NM_001038702, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 10768 NM_020240 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 156-86 chr2 125138386 125138618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 979483 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 122.75-67 chr17 56573769 56574187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19721 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 219.75-72 chr6 161713088 161713498 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) MER21B|LTR|ERVL 242316 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 172.5-178 chr7 8546475 8546835 + 0.75 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 113046 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 137.5-129 chr2 140213017 140213321 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 373516 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 157-119 chr8 131420405 131420725 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -379656 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 126.5-149 chr3 8862988 8863188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93474 NM_001354654 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 203.5-128 chr7 53925916 53926301 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114177 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 190.5-120 chr4 160162603 160163082 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -385058 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 159.75-171 chr8 100184509 100184841 + 0.75 NA exon (NM_172218, exon 7 of 19) exon (NM_172218, exon 7 of 19) 26340 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 202.25-69 chr5 117646149 117646537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84018 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 182.75-6 chr1 87627302 87627842 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -255917 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 115.75-17 chr10 58077182 58077469 + 0.75 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL 190569 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 112.5-219 chr7 47413986 47414258 + 0.75 NA intron (NM_022748, intron 11 of 30) intron (NM_022748, intron 11 of 30) 50681 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 119.75-131 chr21 41270738 41271002 + 0.75 NA intron (NM_138991, intron 7 of 7) L1MEc|LINE|L1 -45931 NM_058186 54097 Hs.473877 NM_058186 ENSG00000183844 FAM3B 2-21|C21orf11|C21orf76|ORF9|PANDER|PRED44 family with sequence similarity 3 member B protein-coding 156.25-108 chr4 17493979 17494302 + 0.75 NA intron (NM_001306140, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 17950 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 118-149 chr5 63536407 63536582 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 425798 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 164.25-7 chr1 104505875 104506261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 433045 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 113.25-161 chr7 114538157 114538452 + 0.75 NA intron (NM_148899, intron 2 of 8) intron (NM_148899, intron 2 of 8) 111802 NM_148899 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 164.25-134 chr5 175766536 175766894 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -29818 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 232.75-30 chr18 8409613 8410137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42841 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 183.75-72 chr3 50964731 50965047 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L1MEc|LINE|L1 289809 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 205-73 chr7 125856367 125856852 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -592318 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 125.75-191 chr8 144857372 144857656 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -3958 NM_001081003 28991 Hs.493218 NM_014066 ENSG00000170619 COMMD5 HCARG|HT002 COMM domain containing 5 protein-coding 128.25-126 chr3 27218022 27218348 + 0.75 NA intron (NM_199347, intron 24 of 24) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -1662 NM_001031741 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 133.75-32 chr11 81591455 81591694 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 299262 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 209.75-47 chr2 34104773 34105266 + 0.75 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie 37793 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 131.75-110 chr2 145895094 145895342 + 0.75 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -691839 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 187.75-91 chr5 106245224 106245766 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 765519 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 128.75-33 chr11 78036395 78036725 + 0.75 NA intron (NM_001203261, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 9631 NM_001282406 65987 Hs.709780 NM_023930 ENSG00000151364 KCTD14 - potassium channel tetramerization domain containing 14 protein-coding 136.75-5 chr1 67202586 67202897 + 0.75 NA intron (NM_144701, intron 5 of 10) AluJo|SINE|Alu 36287 NM_144701 149233 Hs.677426 NM_144701 ENSG00000162594 IL23R - interleukin 23 receptor protein-coding 128.5-209 chr7 72420270 72420565 + 0.75 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) intron (NM_001363460, intron 1 of 5) -8079 NM_031468 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 143.25-49 chr14 72344135 72344426 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -172540 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 183.5-159 chr9 14464861 14465173 + 0.75 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) -66034 NM_001190738 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 124.75-144 chr3 73253099 73253296 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 180798 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 184.25-133 chr9 98650774 98651031 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) L1MB3|LINE|L1 58033 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 149.75-113 chr3 100880048 100880299 + 0.75 NA intron (NM_001349332, intron 6 of 35) intron (NM_001349332, intron 6 of 35) 113317 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 155.5-176 chr5 149065439 149065782 + 0.75 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) L2|LINE|L2 2293 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 128.5-137 chr22 36451166 36451553 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 30281 NM_012473 25828 Hs.211929 NM_012473 ENSG00000100348 TXN2 COXPD29|MT-TRX|MTRX|TRX2|TXN thioredoxin 2 protein-coding 125.25-207 chr8 113267455 113267698 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) L1MA4A|LINE|L1 109576 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 124.5-113 chr2 178676425 178676721 + 0.75 NA intron (NM_001256850, intron 144 of 312) MIRb|SINE|MIR -100353 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 171-128 chr8 85961247 85961538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108276 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 190.75-31 chr14 70949570 70949882 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 2 of 35) intron (NM_014982, intron 2 of 35) 42267 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 129.25-68 chr17 51059038 51059330 + 0.75 NA intron (NM_001130527, intron 2 of 29) L1ME3A|LINE|L1 -12306 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 143.75-111 chr3 11005200 11005641 + 0.75 NA TTS (NR_046647) TTS (NR_046647) 12672 NM_003042 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 233.5-38 chr15 61855338 61855845 + 0.75 NA intron (NM_020821, intron 83 of 84) intron (NM_020821, intron 83 of 84) 125673 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 218.25-66 chr5 44226861 44227223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161690 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 259.75-18 chr14 70292085 70292636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44559 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 153-142 chr7 80915919 80916151 + 0.75 NA intron (NM_001350121, intron 2 of 18) intron (NM_001350121, intron 2 of 18) 3016 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 155.5-88 chr2 36422017 36422224 + 0.75 NA intron (NM_016441, intron 2 of 16) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 66342 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 116-172 chr8 116138538 116138773 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 186404 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 221.25-4 chr1 102068934 102069442 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71954 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 139-155 chr9 69190962 69191335 + 0.75 NA intron (NM_001369871, intron 3 of 24) intron (NM_001369871, intron 3 of 24) -13863 NM_001170415 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 213 chr1 21379000 21379475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33733 NM_001113348 1889 Hs.195080 NM_001397 ENSG00000117298 ECE1 ECE endothelin converting enzyme 1 protein-coding 182.25-30 chr12 125608907 125609154 + 0.75 NA intron (NM_052907, intron 5 of 8) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -13422 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 183.5-151 chr8 100068524 100068852 + 0.75 NA intron (NM_001286693, intron 4 of 25) AluJb|SINE|Alu 36938 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 122.25-101 chr2 169561346 169561604 + 0.75 NA intron (NM_024622, intron 4 of 14) intron (NM_024622, intron 4 of 14) 12390 NM_024622 79675 Hs.529276 NM_024622 ENSG00000138399 FASTKD1 - FAST kinase domains 1 protein-coding 185.5-3 chr1 43891767 43892262 + 0.75 NA intron (NR_073018, intron 6 of 10) AluSx|SINE|Alu -41306 NM_057090 9048 Hs.632404 NM_003976 ENSG00000117407 ARTN ART|ENOVIN|EVN|NBN artemin protein-coding 154.25-102 chr22 28890976 28891263 + 0.75 NA intron (NM_001206998, intron 1 of 8) intron (NM_001206998, intron 1 of 8) 7547 NM_001206998 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 158.75-30 chr11 79975515 79975829 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -534642 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 236.5-92 chr8 82364211 82364787 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -522213 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 248.5-109 chrX 62719092 62719632 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 631970 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 113.25-176 chr8 126902345 126902585 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -110689 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 175-17 chr10 66289273 66289576 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -636612 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 195-24 chr14 41164796 41165253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 210313 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 117.75-101 chr2 46272035 46272318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25231 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 130.75-187 chr8 42061514 42061741 + 0.75 NA intron (NR_136589, intron 1 of 1) L1MEc|LINE|L1 -9640 NM_006766 7994 Hs.491577 NM_006766 ENSG00000083168 KAT6A MOZ|MRD32|MYST-3|MYST3|RUNXBP2|ZC2HC6A|ZNF220 lysine acetyltransferase 6A protein-coding 158.25-101 chr4 57008693 57009136 + 0.75 NA intron (NM_001303269, intron 11 of 25) L2c|LINE|L2 30018 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 155 chr1 58034591 58034870 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 174149 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 156-121 chr5 85618524 85618902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -663731 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 185.25-73 chr20 53609150 53609541 + 0.75 NA intron (NR_134576, intron 1 of 2) intron (NR_134576, intron 1 of 2) 991 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 161-27 chr12 59113837 59114233 + 0.75 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -193497 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 154.75-138 chr7 82774503 82774831 + 0.75 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) L1MC1|LINE|L1 -330711 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 169.25-31 chr14 84135363 84135769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1136366 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 143.5-117 chr2 112754807 112755245 + 0.75 NA intron (NR_130712, intron 5 of 9) L2b|LINE|L2 9583 NM_152515 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 142-6 chr1 116280460 116280712 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -92658 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 154.75-126 chr6 50580385 50580684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133010 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 121.25-10 chr1 191379012 191379320 + 0.75 NA Intergenic (TAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -150668 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 184.25-13 chr1 232208366 232208726 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 282712 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 187-116 chrX 145294183 145294486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46831 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 187.5-140 chr5 92493160 92493623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1077952 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 167.25-47 chr14 80051562 80051888 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -159694 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 125-90 chr21 31742967 31743227 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -10979 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 152.75-70 chr17 70210798 70211226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41477 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 124-62 chr17 31932071 31932322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4811 NM_001321207 23512 Hs.462732 NM_015355 ENSG00000178691 SUZ12 CHET9|JJAZ1 SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit protein-coding 117.25-11 chr1 99297391 99297729 + 0.75 NA intron (NM_014839, intron 3 of 6) intron (NM_014839, intron 3 of 6) 33268 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 123.25-6 chr1 90877312 90877528 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 25661 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 239.75-27 chr16 72460860 72461244 + 0.75 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) intron (NR_159371, intron 3 of 5) 203918 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 148.5-52 chr13 79783902 79784219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20326 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 185.5-132 chr5 130417361 130417735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 513083 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 218-25 chr16 84911947 84912315 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 92146 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 145.75-139 chr6 128576267 128576677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55873 NM_001291984 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 131.5-21 chr1 228305328 228305621 + 0.75 NA intron (NM_001271223, intron 54 of 115) intron (NM_001271223, intron 54 of 115) 91635 NR_106800 102465444 NR_106800 ENSG00000284311 MIR6742 hsa-mir-6742 microRNA 6742 ncRNA 188.25-81 chr4 61069506 61069863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73972 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 131-24 chr10 102785871 102786165 + 0.75 NA intron (NM_017787, intron 1 of 3) intron (NM_017787, intron 1 of 3) 9797 NM_017787 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 216.5-15 chr11 114369482 114369925 + 0.75 NA intron (NR_120567, intron 2 of 2) MER58A|DNA|hAT-Charlie 10336 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 112.75-20 chr10 22339097 22339273 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6260 NM_001253855 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 287-5 chr1 241638251 241638819 + 0.75 NA intron (NM_014322, intron 1 of 3) intron (NM_014322, intron 1 of 3) 1834 NM_014322 23596 Hs.409081 NM_014322 ENSG00000054277 OPN3 ECPN|PPP1R116 opsin 3 protein-coding 120.75-49 chr15 42927438 42927755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6818 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 145.75-53 chr16 59114116 59114380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -379932 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 193-16 chr11 123715786 123716144 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 15020 NM_001301819 7753 Hs.112556 NM_003455 ENSG00000166261 ZNF202 ZKSCAN10|ZSCAN42 zinc finger protein 202 protein-coding 229.25-16 chr12 32065143 32065516 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41478 NM_001363603 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 176.75-45 chr15 69914510 69914908 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79475 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 213.5-31 chr12 18813753 18814225 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 75870 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 116.25-154 chr3 157408342 157408542 + 0.75 NA intron (NM_024621, intron 6 of 13) intron (NM_024621, intron 6 of 13) -28408 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 233.25-77 chr9 34352641 34353012 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 23257 NM_147172 318 Hs.493767 NM_001161 ENSG00000164978 NUDT2 APAH1 nudix hydrolase 2 protein-coding 203-84 chr5 80624936 80625207 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2547 NR_125754 103689917 Hs.740035 NR_125754 ENSG00000251221 LINC01337 TCONS_00009713 long intergenic non-protein coding RNA 1337 ncRNA 157-16 chr11 59800182 59800436 + 0.75 NA intron (NM_004177, intron 10 of 10) intron (NM_004177, intron 10 of 10) 10469 NM_017840 54948 Hs.530734 NM_017840 ENSG00000166902 MRPL16 L16mt|MRP-L16|PNAS-111 mitochondrial ribosomal protein L16 protein-coding 167.75-46 chr14 59799771 59800130 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L1MCc|LINE|L1 70826 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 142-171 chr9 21294775 21294997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10427 NM_002169 3442 Hs.37113 NM_002169 ENSG00000147873 IFNA5 IFN-alpha-5|IFN-alphaG|INA5|INFA5|leIF G interferon alpha 5 protein-coding 203.5-111 chr5 36940072 36940469 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 63501 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 113.25-53 chr14 88606342 88606636 + 0.75 NA intron (NR_136936, intron 11 of 15) AluJb|SINE|Alu 12069 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 158-51 chr14 64888500 64888965 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -8825 NM_001355437 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 201.75-80 chr5 181070971 181071302 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -27652 NR_107056 102465882 NR_107056 ENSG00000277912 MIR8089 hsa-mir-8089 microRNA 8089 ncRNA 125.5-77 chr14 39240745 39240999 + 0.75 NA intron (NM_001329214, intron 3 of 28) MIR|SINE|MIR 6957 NM_054024 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 149.25-70 chr19 38831591 38831941 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001398) promoter-TSS (NM_001398) 28 NM_001398 1891 Hs.196176 NM_001398 ENSG00000104823 ECH1 HPXEL enoyl-CoA hydratase 1 protein-coding 153.5-78 chr17 60944210 60944500 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 13 of 25) L1MEf|LINE|L1 266504 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 139-100 chr4 62770193 62770388 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -608525 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 120-192 chr8 124253501 124253709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6207 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 198.25-10 chr1 246226487 246226899 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 190719 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 144.75 chr1 26753407 26753693 + 0.75 NA intron (NM_139135, intron 4 of 19) intron (NM_139135, intron 4 of 19) -34413 NM_017837 55650 Hs.259605 NM_017837 ENSG00000060642 PIGV GPI-MT-II|HPMRS1|PIG-V phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V protein-coding 119-16 chr10 72588463 72588673 + 0.75 NA intron (NM_006077, intron 1 of 11) L1PB|LINE|L1 37511 NM_001195518 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 113-102 chr20 11254170 11254427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19085 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 193-13 chr11 55936051 55936449 + 0.75 NA exon (NM_006637, exon 1 of 1) exon (NM_006637, exon 1 of 1) 150 NM_006637 10798 Hs.533706 NM_006637 ENSG00000167825 OR5I1 HSOlf1|OLF1 olfactory receptor family 5 subfamily I member 1 protein-coding 215.25-21 chr12 54923313 54923658 + 0.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 50247 NR_147069 9840 Hs.33187 NM_014796 ENSG00000135426 TESPA1 HSPC257|ITPRID3|KIAA0748 thymocyte expressed, positive selection associated 1 protein-coding 128-64 chr18 63618485 63618695 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 25666 NM_002974 6318 Hs.123035 NM_002974 ENSG00000206073 SERPINB4 LEUPIN|PI11|SCCA-2|SCCA1|SCCA2 serpin family B member 4 protein-coding 173-100 chr4 122073646 122074107 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -96727 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 115-176 chr8 27475009 27475223 + 0.75 NA intron (NM_001347705, intron 1 of 6) L1ME4a|LINE|L1 4145 NM_001282455 1135 Hs.57718 NM_000742 ENSG00000120903 CHRNA2 - cholinergic receptor nicotinic alpha 2 subunit protein-coding 192.75-38 chr16 23938462 23938791 + 0.75 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 102643 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 211.5-72 chr2 34416846 34417262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260503 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 239.25-83 chr7 27436305 27436749 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -179447 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 156.5-131 chr4 46813906 46814191 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) L1M2|LINE|L1 95197 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 146.25-4 chr1 113430366 113430838 + 0.75 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 40087 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 150.75-97 chr2 96255796 96256030 + 0.75 NA intron (NM_017849, intron 2 of 3) AluJr4|SINE|Alu 10084 NM_001193304 55654 Hs.164303 NM_017849 ENSG00000135956 TMEM127 - transmembrane protein 127 protein-coding 141-17 chr1 241333771 241334129 + 0.75 NA intron (NM_001350116, intron 1 of 16) (ATTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21876 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 168.5-56 chr14 75056951 75057246 + 0.75 NA intron (NR_126394, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 -5566 NM_001040108 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 118-29 chr11 66970604 66970782 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -4611 NM_001136485 254439 Hs.232604 NM_001136485 ENSG00000173237 C11orf86 - chromosome 11 open reading frame 86 protein-coding 220-45 chr4 82196548 82196892 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 177271 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 132-186 chr9 122183088 122183276 + 0.75 NA intron (NM_001286828, intron 3 of 3) intron (NM_001286828, intron 3 of 3) 23274 NM_198469 254956 Hs.71428 NM_198469 ENSG00000185681 MORN5 C9orf113|C9orf18 MORN repeat containing 5 protein-coding 159.75-45 chr14 66744630 66744961 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 237388 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 130.75-147 chr4 85426374 85426556 + 0.75 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -48685 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 175-59 chr19 37935401 37935802 + 0.75 NA intron (NM_015073, intron 1 of 21) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 28393 NM_015073 23094 Hs.655502 NM_015073 ENSG00000105738 SIPA1L3 CTRCT45|SPAL3|SPAR3 signal induced proliferation associated 1 like 3 protein-coding 137.25-133 chr5 166616382 166616668 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 309845 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 140.25-82 chr19 31182510 31182792 + 0.75 NA intron (NR_147209, intron 2 of 4) intron (NR_147209, intron 2 of 4) 15141 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 182.5-41 chr12 53499507 53499928 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001193511) promoter-TSS (NM_001193511) -259 NM_006301 7786 Hs.713539 NM_006301 ENSG00000139625 MAP3K12 DLK|MEKK12|MUK|ZPK|ZPKP1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 12 protein-coding 155.25-126 chr3 196117528 196117905 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -24920 NR_034088 401109 Hs.280133 NM_001001699 ENSG00000224652 LINC00885 - long intergenic non-protein coding RNA 885 ncRNA 139.25-101 chr2 232051158 232051554 + 0.75 NA intron (NR_046477, intron 5 of 18) intron (NR_046477, intron 5 of 18) 89643 NR_046476 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 199-48 chr21 27158515 27158886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191612 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 188.75-2 chr1 93029746 93030175 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49275 NM_001164393 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 179.5-152 chr6 1378787 1379146 + 0.75 NA Intergenic CpG -10610 NM_001452 2295 Hs.484423 NM_001452 ENSG00000137273 FOXF2 FKHL6|FREAC-2|FREAC2 forkhead box F2 protein-coding 123-162 chr5 120144626 120144878 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -319526 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 144-7 chr1 106813721 106813948 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -4405 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 190.25-18 chr11 17743960 17744451 + 0.75 NA intron (NM_001112741, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 8257 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 192.75-88 chr3 116173662 116174086 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -186150 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 166-12 chr10 43475818 43476116 + 0.75 NA intron (NM_001355447, intron 2 of 2) intron (NM_001355447, intron 2 of 2) 38856 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 168-117 chr7 14106707 14107158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115507 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 194.25-12 chr10 83751457 83751895 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -74587 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 197.5-169 chr9 34733020 34733320 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -3682 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 134.5-80 chr15 95791477 95791858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 336174 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 121-59 chr14 55401525 55401813 + 0.75 NA intron (NM_014924, intron 1 of 9) intron (NM_014924, intron 1 of 9) 10189 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 266.25-8 chr11 124884900 124885351 + 0.75 NA exon (NM_001301088, exon 17 of 18) exon (NM_001301088, exon 17 of 18) 8311 NR_163414 64221 Hs.435621 NM_022370 ENSG00000154134 ROBO3 HGPPS|HGPPS1|HGPS|RBIG1|RIG1 roundabout guidance receptor 3 protein-coding 156.75-67 chr17 58253673 58254093 + 0.75 NA intron (NR_027647, intron 7 of 11) AluJr|SINE|Alu 15299 NR_027647 4025 Hs.234742 NM_006151 ENSG00000167419 LPO SPO lactoperoxidase protein-coding 174.75-110 chr7 10027575 10027911 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 393473 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 173.25-137 chr9 31288719 31289229 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 92516 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 213.5-99 chr5 54746956 54747327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2883 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 113-86 chr2 50112120 50112342 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) -138028 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 197.75-95 chr8 142462952 142463526 + 0.75 NA intron (NM_001702, intron 1 of 30) intron (NM_001702, intron 1 of 30) 13590 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 120.75-141 chr5 176314494 176314687 + 0.75 NA intron (NM_001308200, intron 2 of 6) intron (NM_001308200, intron 2 of 6) 1445 NM_001308200 375484 Hs.719847 NM_198567 ENSG00000170085 SIMC1 C5orf25|OOMA1|PLEIAD SUMO interacting motifs containing 1 protein-coding 163.25-22 chr10 119941715 119942011 + 0.75 NA non-coding (NR_037771, exon 18 of 18) non-coding (NR_037771, exon 18 of 18) -16650 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 136.5-210 chr7 45517252 45517509 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -56760 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 142.75-153 chr5 66136329 66136536 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -7868 NM_001323529 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 144.75-88 chr2 112235998 112236299 + 0.75 NA intron (NM_032494, intron 4 of 8) AluSx1|SINE|Alu 18894 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 171.25-34 chr11 117432735 117433199 + 0.75 NA intron (NM_020693, intron 29 of 32) intron (NM_020693, intron 29 of 32) 105113 NM_014956 22897 Hs.504009 NM_014956 ENSG00000110274 CEP164 NPHP15 centrosomal protein 164 protein-coding 237.5-41 chr17 61177393 61177968 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1ME1|LINE|L1 190024 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 140-65 chr18 12884878 12885201 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001207013) promoter-TSS (NM_001207013) -704 NM_001207013 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 145-23 chr10 35625253 35625525 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 15863 NR_039831 100616500 NR_039831 ENSG00000284265 MIR4683 - microRNA 4683 ncRNA 174.25-24 chr11 75627701 75628020 + 0.75 NA intron (NM_207577, intron 1 of 2) LTR78|LTR|ERV1 40574 NM_207577 4135 Hs.585540 NM_033063 ENSG00000171533 MAP6 MAP6-N|MTAP6|N-STOP|STOP microtubule associated protein 6 protein-coding 148.5-129 chr21 24574833 24575230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146291 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 177.25-82 chr20 49398252 49398500 + 0.75 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 84292 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 224.75-9 chr1 81060783 81061165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245218 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 158.5-194 chr8 105144863 105145087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173463 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 156.25-125 chr5 161105243 161105667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166829 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 182-24 chr12 42523859 42524258 + 0.75 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -40048 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 170-91 chr7 54351781 54352065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21226 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 138.25-39 chr12 54652138 54652471 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -3939 NM_053283 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 173.5-112 chr4 48286217 48286479 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -16510 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 137-72 chr2 43940261 43940547 + 0.75 NA intron (NM_133259, intron 23 of 37) intron (NM_133259, intron 23 of 37) 55585 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 146-7 chr1 151524168 151524583 + 0.75 NA intron (NM_020770, intron 7 of 20) intron (NM_020770, intron 7 of 20) 12988 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 244.25-47 chr7 51185300 51185662 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 4 of 12) intron (NM_015198, intron 4 of 12) 131328 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 118.5-224 chr8 121412786 121413033 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -226437 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 165-33 chr12 106568888 106569235 + 0.75 NA intron (NR_040246, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu -13846 NM_213594 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 168.5-202 chr9 85367522 85368067 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 374235 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 155.75-64 chr16 88003614 88003896 + 0.75 NA intron (NM_017869, intron 4 of 11) intron (NM_017869, intron 4 of 11) 33737 NM_001173543 54971 Hs.461705 NM_017869 ENSG00000172530 BANP BEND1|SMAR1|SMARBP1 BTG3 associated nuclear protein protein-coding 200-90 chr8 92044349 92044802 + 0.75 NA intron (NM_001198633, intron 1 of 10) intron (NM_001198633, intron 1 of 10) 18059 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 185.25-117 chr7 91445471 91445842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 181223 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 124.25-207 chr8 139543379 139543683 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 159592 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 223-83 chr8 119228226 119228620 + 0.75 NA intron (NR_149114, intron 3 of 5) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 18434 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 200-9 chr1 234251342 234251697 + 0.75 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) 37308 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 251.5-60 chr4 111788833 111789370 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -356353 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 212.5-31 chr15 45107389 45107838 + 0.75 NA intron (NM_014080, intron 13 of 33) AluSz|SINE|Alu 6548 NM_014080 50506 Hs.71377 NM_014080 ENSG00000140279 DUOX2 LNOX2|NOXEF2|P138-TOX|TDH6|THOX2 dual oxidase 2 protein-coding 159.25-165 chr9 126541787 126542149 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -72475 NM_002316 4010 Hs.129133 NM_002316 ENSG00000136944 LMX1B LMX1.2|NPS1 LIM homeobox transcription factor 1 beta protein-coding 150.75-148 chr5 14462316 14462595 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 35 of 56) intron (NM_007118, intron 35 of 56) -1528 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 153.5-135 chr3 177745312 177745702 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) intron (NR_047568, intron 3 of 3) -71358 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 182-78 chr4 45989178 45989522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134704 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 222.25-5 chr10 8211201 8211609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56900 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 188-57 chr5 89308601 89309052 + 0.75 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -404721 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 193-63 chr4 62915940 62916247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -754328 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 122-87 chr2 40367983 40368279 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) CR1-3_Croc|LINE|CR1 62173 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 143.75-164 chr7 632743 632993 + 0.75 NA intron (NM_001164760, intron 4 of 10) intron (NM_001164760, intron 4 of 10) 29470 NR_110055 101926963 Hs.521338 NR_110054 LOC101926963 - uncharacterized LOC101926963 ncRNA 279.25-10 chr11 46240045 46240498 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37391 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 166.5-73 chr16 13439504 13439850 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -480480 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 114.25-11 chr1 200438753 200438990 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28835 NM_001281293 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 197.5-120 chr5 44682774 44683193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125810 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 142-68 chr17 59610399 59610728 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -9126 NM_001288653 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 170.75-79 chr20 52133402 52133811 + 0.75 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) L1M1|LINE|L1 -28122 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 141.25-192 chr9 94677583 94677817 + 0.75 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -37451 NM_001127628 2203 Hs.494496 NM_000507 ENSG00000165140 FBP1 FBP fructose-bisphosphatase 1 protein-coding 144.75-17 chr10 37836031 37836375 + 0.75 NA intron (NR_147992, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 21407 NM_001267607 57209 Hs.528423 NM_021045 ENSG00000198105 ZNF248 bA162G10.3 zinc finger protein 248 protein-coding 114.5-58 chr11 102201679 102201891 + 0.75 NA intron (NM_001130145, intron 4 of 8) L1MC5a|LINE|L1 89337 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 128-183 chrX 154951211 154951436 + 0.75 NA intron (NM_000132, intron 12 of 25) intron (NM_000132, intron 12 of 25) -63865 NR_036260 100422977 NR_036260 ENSG00000221603 MIR1184-3 - microRNA 1184-3 ncRNA 154.5-59 chr14 31332866 31333265 + 0.75 NA intron (NM_015473, intron 22 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 87485 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 215-5 chr1 61007455 61007821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36862 NR_110618 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 153.25-131 chr8 81152637 81153084 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40792 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 206-10 chr10 89151502 89151922 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55605 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 148.75-146 chr6 119105607 119105825 + 0.75 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) -27052 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 129.25-9 chr1 160081839 160082261 + 0.75 NA intron (NM_004983, intron 1 of 2) intron (NM_004983, intron 1 of 2) 512 NM_004983 3765 Hs.66726 NM_004983 ENSG00000162728 KCNJ9 GIRK3|KIR3.3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 9 protein-coding 121-98 chr2 31575159 31575403 + 0.75 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) intron (NM_000348, intron 1 of 4) 5657 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 172-75 chr3 184830137 184830519 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 3 of 46) L1ME3A|LINE|L1 17821 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 147.75-126 chr5 55091662 55091989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10821 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 160.75-100 chr3 72426976 72427327 + 0.75 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 19472 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 128.75-120 chr3 30009208 30009500 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001177711, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001177711, exon 14 of 14) -75198 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 115-127 chr5 24300085 24300335 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 344768 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 124.25-162 chr5 54325583 54325871 + 0.75 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) intron (NR_126379, intron 1 of 4) 4783 NR_126379 104355136 Hs.559024 NR_126379 ENSG00000249069 LINC01033 - long intergenic non-protein coding RNA 1033 ncRNA 145-54 chr16 61524945 61525232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -469322 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 120-57 chr16 7597899 7598222 + 0.75 NA intron (NM_145893, intron 6 of 13) intron (NM_145893, intron 6 of 13) 265215 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 203-94 chr7 48413981 48414471 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 41 of 61) L2b|LINE|L2 242768 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 140.25-81 chr19 27822853 27823165 + 0.75 NA intron (NR_146736, intron 2 of 2) L1PA12|LINE|L1 -29069 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 242.25-81 chr7 33981832 33982360 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 76557 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 157.25-65 chr2 13860478 13860702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 540368 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 205.25-113 chrX 41601540 41601901 + 0.75 NA intron (NM_003688, intron 12 of 26) L1M4|LINE|L1 -87253 NM_005300 2857 Hs.495989 NM_005300 ENSG00000171659 GPR34 LYPSR1 G protein-coupled receptor 34 protein-coding 219.5-130 chr8 125114515 125114924 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) MER20|DNA|hAT-Charlie 22859 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 185.75-30 chr12 9136049 9136333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19962 NM_001347423 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 193-45 chr2 177241615 177242154 + 0.75 NA intron (NM_001313903, intron 1 of 4) intron (NM_001313903, intron 1 of 4) 14126 NR_036075 100422824 NR_036075 ENSG00000265396 MIR3128 mir-3128 microRNA 3128 ncRNA 143.75-199 chr9 94134061 94134269 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -41792 NR_029476 406881 NR_029476 ENSG00000199165 MIRLET7A1 LET7A1|MIRNLET7A1|let-7a-1 microRNA let-7a-1 ncRNA 199.5-63 chr18 37575699 37576191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10147 NR_148526 56853 Hs.435976 NM_020180 ENSG00000101489 CELF4 BRUNOL4|CELF-4 CUGBP Elav-like family member 4 protein-coding 222.5-55 chr2 168272079 168272752 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -24820 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 171.5-73 chr2 22905168 22905561 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 368885 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 219.75-48 chr22 47648109 47648607 + 0.75 NA intron (NR_122046, intron 2 of 8) intron (NR_122046, intron 2 of 8) 16684 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 126.75-248 chr8 116453992 116454329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129101 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 218.5-91 chr4 128919818 128920151 + 0.75 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) L1PA15|LINE|L1 108140 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 162.25-22 chr10 125816655 125816871 + 0.75 NA intron (NM_001324037, intron 1 of 9) intron (NM_001324037, intron 1 of 9) -2977 NR_039704 100616327 NR_039704 ENSG00000265092 MIR4484 mir-4484 microRNA 4484 ncRNA 239.25-33 chr15 85022839 85023223 + 0.75 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) L2|LINE|L2 41057 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 195.25-4 chr1 77480815 77481296 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 8 of 13) LTR16A1|LTR|ERVL 197968 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 132.75-65 chr14 72378573 72378960 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1MA5A|LINE|L1 -138054 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 121.5-103 chr16 80857759 80858036 + 0.75 NA intron (NR_131948, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 34699 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 149.5-139 chr4 111911164 111911374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -234185 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 191.75-45 chr16 70430233 70430529 + 0.75 NA intron (NM_006927, intron 1 of 6) intron (NM_006927, intron 1 of 6) 8719 NM_006927 6483 Hs.368611 NM_006927 ENSG00000157350 ST3GAL2 Gal-NAc6S|SIAT4B|ST3GALII|ST3GalA.2 ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 protein-coding 229.25-55 chr3 98456790 98457295 + 0.75 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -12438 NM_001004736 26339 Hs.621533 NM_001004736 ENSG00000232382 OR5K1 HSHTPCRX10|HTPCRX10|OR3-8 olfactory receptor family 5 subfamily K member 1 protein-coding 118.5-129 chr3 108938280 108938560 + 0.75 NA intron (NM_001363884, intron 1 of 3) intron (NM_001363884, intron 1 of 3) 15426 NM_001363884 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 250.5-20 chr12 34336853 34337237 + 0.75 NA Intergenic CpG 314549 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 294.75-13 chr2 66340495 66340995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17583 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 144-124 chr7 113801793 113802042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117092 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 183-90 chr5 105218483 105218909 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 119222 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 129.25-100 chr2 182279209 182279619 + 0.75 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -37351 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 252.25-10 chr12 3878055 3878493 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4826 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 117.75-157 chr4 73163527 73163752 + 0.75 NA intron (NM_032217, intron 2 of 33) intron (NM_032217, intron 2 of 33) 59418 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 195-8 chr10 20578175 20578462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26348 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 202.5-18 chr10 75358151 75358646 + 0.75 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) intron (NR_038226, intron 2 of 3) -43130 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 192.75-91 chr3 144062828 144063167 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 89916 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 139.75-133 chr4 53575512 53575743 + 0.75 NA intron (NM_001126328, intron 1 of 10) intron (NM_001126328, intron 1 of 10) 15859 NM_001126328 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 186-26 chr14 58295428 58295724 + 0.75 NA intron (NR_029435, intron 1 of 3) AluSc8|SINE|Alu 2561 NR_029434 379025 Hs.531089 NR_029434 ENSG00000257621 PSMA3-AS1 - PSMA3 antisense RNA 1 ncRNA 269.25-29 chr22 49731284 49731938 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -74092 NR_110523 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 230.75-36 chr2 148342588 148342996 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) L1PA16|LINE|L1 -301959 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 150-31 chr12 48635285 48635665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19043 NR_002968 677815 Hs.689717 NR_002968 ENSG00000221491 SNORA2C ACA34|MIR1291|SNORA34 small nucleolar RNA, H/ACA box 2C snoRNA 209.25-25 chr12 114318836 114319241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77268 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 274.75-39 chr4 182173648 182174303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4682 NR_031640 100302270 NR_031640 ENSG00000221227 MIR1305 MIRN1305|hsa-mir-1305|mir-1305 microRNA 1305 ncRNA 170.75-132 chr8 71662535 71662893 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -114620 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 132-155 chr7 3819102 3819307 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -310481 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 188-94 chrX 73982127 73982404 + 0.75 NA intron (NR_024582, intron 2 of 4) L1MB8|LINE|L1 37941 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 202.25-28 chr16 51022823 51023205 + 0.75 NA intron (NR_110913, intron 2 of 2) intron (NR_110913, intron 2 of 2) 5256 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 125-3 chr1 44327562 44327876 + 0.75 NA intron (NM_001301701, intron 2 of 7) intron (NM_001301701, intron 2 of 7) 27538 NM_001301698 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 144.5-146 chr4 58262263 58262509 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 273942 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 120.5-48 chr11 133733031 133733238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77242 NR_120444 646522 Hs.560000 NR_120444 ENSG00000255258 LINC02743 - long intergenic non-protein coding RNA 2743 ncRNA 130.75-39 chr12 18876932 18877196 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 138945 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 167.25-27 chr12 62295485 62295823 + 0.75 NA intron (NR_147080, intron 2 of 19) L1MEc|LINE|L1 35250 NM_001252078 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 291.25 chr1 23564609 23565280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5443 NM_002167 3399 Hs.76884 NM_002167 ENSG00000117318 ID3 HEIR-1|bHLHb25 inhibitor of DNA binding 3, HLH protein protein-coding 205-9 chr10 4302249 4302801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58613 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 254-10 chr11 63753977 63754370 + 0.75 NA intron (NR_049751, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 14602 NM_001144936 65998 Hs.191073 NM_001144936 ENSG00000188070 C11orf95 - chromosome 11 open reading frame 95 protein-coding 150.75-156 chr5 172288693 172289093 + 0.75 NA intron (NR_130933, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 3296 NR_130933 100288254 Hs.531911 NM_001007542 LOC100288254 - uncharacterized LOC100288254 ncRNA 121-104 chr2 107458830 107459038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70485 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 126.5-21 chr1 222571052 222571376 + 0.75 NA intron (NM_001201536, intron 5 of 11) L1MB8|LINE|L1 -18706 NR_110613 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 219.75-5 chr1 97495087 97495541 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) intron (NM_000110, intron 13 of 22) -301607 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 244.75-16 chr12 37805905 37806521 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -510561 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 163.5-53 chr14 73101725 73102228 + 0.75 NA intron (NM_021239, intron 9 of 18) intron (NM_021239, intron 9 of 18) -34531 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 156-158 chr8 128077072 128077567 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 6 of 8) intron (NR_003367, intron 6 of 8) 28167 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 113.75-57 chr14 46107051 46107231 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) MER52A|LTR|ERV1 42982 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 167-86 chr4 58406821 58407233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129301 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 166.5-169 chr5 124315042 124315299 + 0.75 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) FAM|SINE|Alu 123350 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 193.25-3 chr1 36516327 36516777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33238 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 159.75-39 chr14 45785765 45786090 + 0.75 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -70325 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 229.75-41 chr20 47345097 47345610 + 0.75 NA intron (NM_001281774, intron 3 of 23) intron (NM_001281774, intron 3 of 23) 6544 NM_001363741 23613 Hs.446240 NM_012408 ENSG00000101040 ZMYND8 PRKCBP1|PRO2893|RACK7 zinc finger MYND-type containing 8 protein-coding 197.5-152 chr7 124873480 124873893 + 0.75 NA intron (NM_015450, intron 6 of 18) L1MA8|LINE|L1 56139 NM_015450 25913 Hs.31968 NM_015450 ENSG00000128513 POT1 CMM10|GLM9|HPOT1 protection of telomeres 1 protein-coding 147-45 chr15 98925040 98925458 + 0.75 NA intron (NM_001291858, intron 13 of 20) intron (NM_001291858, intron 13 of 20) 80407 NM_001102612 145814 Hs.592021 NM_001102612 ENSG00000183571 PGPEP1L - pyroglutamyl-peptidase I like protein-coding 142.5-191 chr6 97582879 97583097 + 0.75 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) L1MA3|LINE|L1 277402 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 131.25 chr1 7907296 7907595 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 35720 NM_001561 3604 Hs.86447 NM_001561 ENSG00000049249 TNFRSF9 4-1BB|CD137|CDw137|ILA TNF receptor superfamily member 9 protein-coding 204.25-35 chr14 38775354 38775703 + 0.75 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -107068 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 215.75-104 chr9 33263695 33264340 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001195536) promoter-TSS (NM_001195536) 691 NM_004323 573 Hs.377484 NM_004323 ENSG00000107262 BAG1 BAG-1|HAP|RAP46 BCL2 associated athanogene 1 protein-coding 138.75-52 chr14 67768300 67768542 + 0.75 NA intron (NM_015346, intron 30 of 41) intron (NM_015346, intron 30 of 41) 48169 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 124.75-201 chr8 102175137 102175418 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49845 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 122.5-34 chr11 69681732 69681932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6479 NM_153451 220064 Hs.667996 NM_153451 ENSG00000149716 LTO1 CIAB1|ORAOV1|TAOS1 LTO1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 223.5-79 chr3 42289036 42289415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23040 NM_000729 885 Hs.458426 NM_000729 ENSG00000187094 CCK - cholecystokinin protein-coding 130-11 chr1 230279248 230279513 + 0.75 NA exon (NM_001291866, exon 16 of 16) exon (NM_001291866, exon 16 of 16) 146952 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 179-79 chr5 117546288 117546640 + 0.75 NA intron (NR_046089, intron 4 of 5) intron (NR_046089, intron 4 of 5) 130952 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 141.75-130 chr4 144512063 144512373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133801 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 125-117 chr4 90251771 90252050 + 0.75 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) L1MB8|LINE|L1 16879 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 137-162 chr7 47240446 47240789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 224186 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 136.75-114 chr2 232854370 232854760 + 0.75 NA intron (NM_015575, intron 30 of 30) intron (NM_015575, intron 30 of 30) -14449 NM_001346122 389084 Hs.657509 NM_206895 ENSG00000182600 SNORC ASCL830|C2orf82|UNQ830 secondary ossification center associated regulator of chondrocyte maturation protein-coding 134.25-49 chr14 46863325 46863584 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 14 of 16) intron (NM_001113498, intron 14 of 16) -211673 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 135.5-147 chr4 41222631 41222913 + 0.75 NA intron (NR_102709, intron 1 of 2) intron (NR_102709, intron 1 of 2) -8230 NM_001330658 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 125.25-114 chr2 183680124 183680318 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 555778 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 134.5-89 chr17 75543966 75544323 + 0.75 NA intron (NM_001015002, intron 2 of 9) intron (NM_001015002, intron 2 of 9) 18442 NM_001015002 3993 Hs.514477 NM_004524 ENSG00000073350 LLGL2 HGL|Hugl-2|LGL2 LLGL scribble cell polarity complex component 2 protein-coding 115.75-180 chr5 158263992 158264228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 145663 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 177.25-109 chr4 162937511 162937994 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155876 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 158.25-38 chr13 64517004 64517344 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -441163 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 128.25-22 chr11 71947815 71948071 + 0.75 NA intron (NM_001300926, intron 1 of 6) intron (NM_001300926, intron 1 of 6) 18897 NM_018320 55298 Hs.368554 NM_018320 ENSG00000137522 RNF121 - ring finger protein 121 protein-coding 119.25-31 chr11 9400682 9400957 + 0.75 NA intron (NM_006391, intron 1 of 24) intron (NM_006391, intron 1 of 24) 16167 NM_006391 10527 Hs.744911 NM_006391 ENSG00000205339 IPO7 Imp7|RANBP7 importin 7 protein-coding 215-8 chr1 169242372 169242791 + 0.75 NA intron (NR_104229, intron 7 of 12) L1MD|LINE|L1 125216 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 117.25-41 chr11 92530172 92530421 + 0.75 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 178200 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 216.5-10 chr10 104494837 104495216 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -14751 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 148-13 chr11 50560620 50561019 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 151672 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 177.5-12 chr10 16147687 16148184 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -287402 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 123.25-34 chr11 34628093 34628340 + 0.75 NA intron (NM_012153, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu -4350 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 229.75-61 chr5 55151074 55151471 + 0.75 NA intron (NM_001145734, intron 2 of 10) MER102a|DNA|hAT-Charlie -8899 NM_001306197 493869 Hs.289044 NM_001008397 ENSG00000164294 GPX8 EPLA847|GPx-8|GSHPx-8|UNQ847 glutathione peroxidase 8 (putative) protein-coding 193.5-84 chr2 68122872 68123224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34479 NM_001256476 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 126.75-104 chr2 45462568 45462890 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) AluY|SINE|Alu 148538 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 145.25-36 chr14 37582994 37583239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12133 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 223.75-18 chr12 82604083 82604559 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -82585 NM_152588 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 132.5-34 chr10 125708401 125708742 + 0.75 NA non-coding (NR_033848, exon 5 of 5) non-coding (NR_033848, exon 5 of 5) 10922 NR_033847 399821 Hs.535286 NR_033847 ENSG00000224023 EDRF1-DT - EDRF1 divergent transcript ncRNA 184.5-164 chr8 142537552 142538099 + 0.75 NA intron (NM_001702, intron 26 of 30) intron (NM_001702, intron 26 of 30) 76654 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 152-163 chrX 41538200 41538557 + 0.75 NA intron (NM_001126055, intron 20 of 24) intron (NM_001126055, intron 20 of 24) 90918 NM_022567 60506 Hs.302019 NM_022567 ENSG00000188937 NYX CLRP|CSNB1|CSNB1A|CSNB4|NBM1 nyctalopin protein-coding 128.25-166 chr5 124802070 124802314 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -57080 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 239.5-68 chr6 141701281 141701799 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 387259 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 150-114 chr5 34934355 34934706 + 0.75 NA intron (NM_194283, intron 2 of 12) AluSz|SINE|Alu 4937 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 156.5-69 chr18 76141214 76141450 + 0.75 NA intron (NR_040034, intron 4 of 5) intron (NR_040034, intron 4 of 5) 18334 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 153.25-35 chr13 109796156 109796422 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9706 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 224-44 chr5 75352670 75353214 + 0.75 NA intron (NM_001364187, intron 11 of 19) L2c|LINE|L2 15722 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 203-20 chr11 13387215 13387681 + 0.75 NA TTS (NM_001297742) TTS (NM_001297742) 52831 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 248.25-58 chr5 126342393 126343022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17413 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 171-4 chr1 53034639 53034968 + 0.75 NA intron (NM_001007250, intron 2 of 3) intron (NM_001007250, intron 2 of 3) 19865 NM_001007250 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 174.25-121 chr5 160870943 160871274 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -18897 NM_001366656 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 135.25-112 chr2 205916370 205916572 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 169703 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 128-53 chr15 90680601 90680820 + 0.75 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) intron (NR_120372, intron 2 of 3) 20476 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 122.5-65 chr14 65281477 65281680 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 53605 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 174.25-102 chr3 136443282 136443555 + 0.75 NA intron (NM_005862, intron 14 of 33) intron (NM_005862, intron 14 of 33) 193078 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 178.75-108 chr8 85391040 85391390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13102 NM_001128831 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 181.25-93 chr4 102519830 102520399 + 0.75 NA intron (NM_001319226, intron 1 of 23) MER20|DNA|hAT-Charlie -17628 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 144.75-164 chr7 96972531 96972779 + 0.75 NA intron (NR_015448, intron 2 of 2) intron (NR_015448, intron 2 of 2) -32898 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 133.75-67 chr16 8379700 8379958 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 210009 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 183-9 chr10 96337291 96337689 + 0.75 NA intron (NM_004088, intron 10 of 10) intron (NM_004088, intron 10 of 10) 19669 NM_001284326 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 140-12 chr1 184507686 184508124 + 0.75 NA intron (NM_030806, intron 3 of 5) intron (NM_030806, intron 3 of 5) 120876 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 232.5-74 chr3 185593224 185593661 + 0.75 NA intron (NM_021627, intron 2 of 16) intron (NM_021627, intron 2 of 16) 7147 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 256.75-24 chr2 123927420 123928043 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97443 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 141.5-92 chr2 7439808 7440171 + 0.75 NA intron (NR_038432, intron 4 of 5) intron (NR_038432, intron 4 of 5) 18728 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 229.5-28 chr11 65794567 65795008 + 0.75 NA intron (NM_004561, intron 3 of 3) intron (NM_004561, intron 3 of 3) -3919 NR_108085 101927828 Hs.666246 NR_108085 ENSG00000255120 OVOL1-AS1 - OVOL1 antisense RNA 1 ncRNA 169.75-148 chr7 94203308 94203662 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 188707 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 167.25-131 chr5 124586078 124586320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -147679 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 185.5-80 chr2 118651918 118652296 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -49141 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 150.5-108 chr2 184287777 184288044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91065 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 173.75-164 chrX 84217192 84217598 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8433 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 223.5-24 chr11 42592995 42593442 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -339528 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 149.5-113 chr21 25081434 25081824 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 241079 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 142-53 chr15 62483898 62484161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141000 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 182.75-50 chr16 19446895 19447233 + 0.75 NA intron (NM_001261841, intron 4 of 21) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -9397 NM_024780 79838 Hs.115838 NM_024780 ENSG00000103534 TMC5 - transmembrane channel like 5 protein-coding 173.25-82 chr3 177418361 177418847 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -23317 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 122-143 chr5 119961614 119961816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 332156 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 112.25-11 chr1 171026748 171026983 + 0.75 NA intron (NM_001163629, intron 20 of 21) L1M7|LINE|L1 -64040 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 137-123 chr4 96002607 96002966 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 162693 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 180.5-67 chr19 44194782 44195112 + 0.75 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -17581 NM_001289168 7770 Hs.298089 NM_182490 ENSG00000131115 ZNF227 - zinc finger protein 227 protein-coding 154.75-65 chr18 55513027 55513359 + 0.75 NA intron (NM_001348217, intron 2 of 18) intron (NM_001348217, intron 2 of 18) -2421 NM_001348211 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 195.5-148 chr7 42253667 42254057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16653 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 145.25-34 chr13 76867833 76868142 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 18418 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 166-3 chr1 57750247 57750516 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -110200 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 123-48 chr14 43813090 43813399 + 0.75 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 694039 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 123.75-28 chr11 79994475 79994727 + 0.75 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -553571 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 140-74 chr2 96313203 96313464 + 0.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -7787 NM_014014 23020 Hs.246112 NM_014014 ENSG00000144028 SNRNP200 ASCC3L1|BRR2|HELIC2|RP33|U5-200KD small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 protein-coding 209-58 chr5 132576626 132577069 + 0.75 NA intron (NM_005732, intron 3 of 24) intron (NM_005732, intron 3 of 24) 19870 NM_005732 10111 Hs.633509 NM_005732 ENSG00000113522 RAD50 NBSLD|RAD502|hRad50 RAD50 double strand break repair protein protein-coding 116-166 chr8 67991373 67991614 + 0.75 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 39447 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 194.25-13 chr10 108934278 108934774 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -865233 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 220.5-120 chr8 65235560 65236003 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55441 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 192.25-45 chr2 17161351 17161827 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 356851 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 151.75-62 chr2 43478543 43478779 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) intron (NM_001083953, intron 26 of 37) 117313 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 201.25-58 chr22 20411125 20411512 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 17167 NM_001256525 7625 Hs.517418 NM_003426 ENSG00000185252 ZNF74 COS52|ZFP520|ZNF520|hZNF7 zinc finger protein 74 protein-coding 177.5-110 chr3 25321024 25321386 + 0.75 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) intron (NM_001290216, intron 4 of 10) -19597 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 165.75-117 chr4 13619586 13619866 + 0.75 NA intron (NM_148894, intron 2 of 25) intron (NM_148894, intron 2 of 25) 7999 NM_148894 259282 Hs.744935 NM_148894 ENSG00000038219 BOD1L1 BOD1L|FAM44A biorientation of chromosomes in cell division 1 like 1 protein-coding 135.25-81 chr18 8557704 8558102 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -51542 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 229-78 chr9 105447515 105447895 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001145313) promoter-TSS (NM_001145313) -329 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 125.25-205 chr8 82180680 82180968 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -338538 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 168.75-118 chr6 34729319 34729735 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -27567 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 158.75-91 chr2 138593131 138593398 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 91494 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 140-181 chr9 127981512 127981721 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001035254) promoter-TSS (NM_001035254) -627 NM_001035254 399665 Hs.535972 NM_203305 ENSG00000167106 FAM102A C9orf132|EEIG1|SYM-3A|bA203J24.7 family with sequence similarity 102 member A protein-coding 142-107 chr3 114466939 114467248 + 0.75 NA intron (NR_121661, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 13500 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 188.75-69 chr20 39770298 39770632 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -233996 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 215.75-23 chr12 8774271 8774668 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001352267, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001352267, exon 6 of 6) -48152 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 215.25-115 chr9 69283690 69284048 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 23187 NR_047671 100885775 Hs.49768 NR_047671 ENSG00000278910 BANCR LINC00586 BRAF-activated non-protein coding RNA ncRNA 218.5-56 chr2 78630595 78630926 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 85229 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 151-70 chr20 61601553 61601907 + 0.75 NA intron (NM_001252339, intron 1 of 14) intron (NM_001252339, intron 1 of 14) 1969 NM_001252339 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 144.25-137 chr4 37099460 37099741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97821 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 151.5-95 chr2 236651621 236651871 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 81921 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 152.25-158 chr8 118013227 118013616 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu -92508 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 130-173 chr8 117786444 117786840 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 134271 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 279.5-41 chr3 122948527 122949134 + 0.75 NA intron (NM_001256348, intron 1 of 21) intron (NM_001256348, intron 1 of 21) 27304 NM_001256347 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 148.25-79 chr2 229094141 229094399 + 0.75 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) L1PB|LINE|L1 137822 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 142.25-100 chr21 29657327 29657572 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 4 of 16) intron (NM_000830, intron 4 of 16) 61409 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 272.25-56 chr7 105161755 105162398 + 0.75 NA intron (NM_182692, intron 6 of 15) AluSz|SINE|Alu 107001 NM_001350744 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 179.25-130 chr6 123411374 123411703 + 0.75 NA intron (NM_001251987, intron 12 of 20) intron (NM_001251987, intron 12 of 20) -28066 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 124.5-63 chr14 63232180 63232566 + 0.75 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 27930 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 168.5-99 chr2 228172913 228173221 + 0.75 NA intron (NM_030623, intron 1 of 10) intron (NM_030623, intron 1 of 10) 8578 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 206-50 chr3 28332381 28332863 + 0.75 NA intron (NM_022461, intron 5 of 7) intron (NM_022461, intron 5 of 7) -16099 NM_001040432 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 247.75-47 chr5 59511024 59511654 + 0.75 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 75159 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 158-105 chr4 4671562 4671904 + 0.75 NA intron (NR_037888, intron 4 of 5) intron (NR_037888, intron 4 of 5) 7407 NR_145783 109623454 NR_145783 SNORD162 - small nucleolar RNA, C/D box 162 snoRNA 177.75-23 chr11 55960967 55961321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7319 NM_001005491 282770 Hs.554525 NM_001005491 ENSG00000174970 OR10AG1 OR11-160 olfactory receptor family 10 subfamily AG member 1 protein-coding 236-35 chr2 202305262 202305891 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12525 NR_003031 692058 NR_003031 ENSG00000238317 SNORD11 HBII-95 small nucleolar RNA, C/D box 11 snoRNA 132.75-69 chr15 72357744 72358036 + 0.75 NA intron (NM_001318825, intron 1 of 13) intron (NM_001318825, intron 1 of 13) 18124 NR_134869 3073 Hs.604479 NM_000520 ENSG00000213614 HEXA TSD hexosaminidase subunit alpha protein-coding 203.5-119 chr6 65364812 65365210 + 0.75 NA intron (NM_198283, intron 7 of 9) intron (NM_198283, intron 7 of 9) 63593 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 215.25-92 chr6 46466270 46466802 + 0.75 NA intron (NM_001251973, intron 1 of 4) intron (NM_001251973, intron 1 of 4) 24787 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 200.5-97 chr3 193130494 193131005 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110473 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 144.75-140 chr5 132376370 132376697 + 0.75 NA intron (NM_003060, intron 1 of 9) intron (NM_003060, intron 1 of 9) -6617 NR_110997 553103 Hs.570908 NR_110997 ENSG00000233006 MIR3936HG SLC22A5-AS1 MIR3936 host gene ncRNA 124-134 chr5 63085306 63085647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 506657 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 166.5-10 chr1 81053359 81053799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -252613 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 115.25-149 chr4 74366285 74366562 + 0.75 NA intron (NM_001432, intron 1 of 4) intron (NM_001432, intron 1 of 4) 1278 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 221.25-61 chr4 45276418 45276863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -550006 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 234.5-49 chr2 149538017 149538396 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49152 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 203.75-23 chr12 23228447 23228928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53051 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 246.25-60 chr6 147768666 147769021 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 260153 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 136-61 chr18 59739310 59739568 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -42016 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 209-18 chr14 36913349 36913912 + 0.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) 38761 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 187.75-29 chr13 95908371 95908650 + 0.75 NA intron (NM_020121, intron 20 of 38) L1PA2|LINE|L1 144891 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 136.25-93 chr2 65816445 65816826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -384036 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 190.75-63 chr3 56071661 56072193 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) intron (NR_132749, intron 7 of 17) -219333 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 231.75-18 chr14 20131859 20132281 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -11666 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 172.5-136 chr4 13550080 13550351 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2391 NR_015450 285548 Hs.529284 NR_015450 LINC01096 - long intergenic non-protein coding RNA 1096 ncRNA 162.5-43 chr13 20793022 20793401 + 0.75 NA intron (NM_022459, intron 18 of 22) intron (NM_022459, intron 18 of 22) -19250 NM_001318939 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 133-192 chrX 118286105 118286341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59850 NM_001184966 54521 Hs.98510 NM_019045 ENSG00000131725 WDR44 RAB11BP|RPH11|SYM-4 WD repeat domain 44 protein-coding 167.5-196 chr9 25391312 25391661 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 287372 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 247.75-73 chrX 50820854 50821251 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -7008 NR_027121 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 153.5-69 chr15 65669656 65669897 + 0.75 NA intron (NM_005848, intron 26 of 31) intron (NM_005848, intron 26 of 31) 26897 NM_001254740 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 125.5-166 chr3 17467415 17467640 + 0.75 NA intron (NM_014744, intron 3 of 21) intron (NM_014744, intron 3 of 21) 232493 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 183-2 chr1 75670908 75671213 + 0.75 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -53287 NM_001286044 34 Hs.445040 NM_000016 ENSG00000117054 ACADM ACAD1|MCAD|MCADH acyl-CoA dehydrogenase medium chain protein-coding 122-128 chr4 33230018 33230257 + 0.75 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 809756 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 179-89 chr8 103629947 103630192 + 0.75 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MDa|LINE|L1 -128159 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 221.5-5 chr10 24546357 24546707 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001282767, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001282767, exon 19 of 19) 76311 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 235.25-28 chr18 1286814 1287333 + 0.75 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) L1MB8|LINE|L1 72556 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 186.25-77 chr4 5225421 5225783 + 0.75 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) intron (NM_001306082, intron 4 of 12) 174122 NM_001345969 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 156.75-111 chr3 62558138 62558456 + 0.75 NA intron (NM_003716, intron 9 of 29) intron (NM_003716, intron 9 of 29) -184747 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 126-100 chr2 123226283 123226514 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -152917 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 124.5-93 chr18 72605029 72605302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60823 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 124.25-14 chr1 170216605 170216811 + 0.75 NA intron (NR_146891, intron 1 of 4) intron (NR_146891, intron 1 of 4) 42329 NR_146891 105371609 Hs.508115 NR_146891 LINC01681 - long intergenic non-protein coding RNA 1681 ncRNA 141.5-184 chr5 134705047 134705359 + 0.75 NA intron (NM_021982, intron 16 of 22) FLAM_A|SINE|Alu -33345 NM_001745 819 Hs.529846 NM_001745 ENSG00000164615 CAMLG CAML|GET2 calcium modulating ligand protein-coding 141-30 chr11 47002877 47003194 + 0.75 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) intron (NR_103472, intron 2 of 7) 66274 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 197.5-24 chr11 105286820 105287208 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -147245 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 222.75-2 chr1 60861680 60862110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36311 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 196.75-28 chr12 26268539 26269027 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 73210 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 202.5-150 chrX 98279147 98279613 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -714845 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 227.5-112 chr8 136238226 136238560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -292405 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 253-6 chr10 56287625 56288312 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73291 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 276.5-2 chr1 102119775 102120485 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122896 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 153-154 chr8 85348757 85349127 + 0.75 NA intron (NM_001128830, intron 1 of 8) intron (NM_001128830, intron 1 of 8) -7228 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 131.75-65 chr14 55414559 55414759 + 0.75 NA intron (NM_199047, intron 6 of 6) intron (NM_199047, intron 6 of 6) -2801 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 125.25-160 chr5 130102361 130102742 + 0.75 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 198086 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 152-95 chr20 58016045 58016297 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 12267 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 250.75-48 chr4 57204089 57204564 + 0.75 NA intron (NR_034081, intron 3 of 4) intron (NR_034081, intron 3 of 4) -93941 NM_001553 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 149.25-160 chr6 154089682 154089946 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001285528) promoter-TSS (NM_001285528) 52 NM_001285527 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 149.5-132 chr4 69942470 69942782 + 0.75 NA intron (NM_001890, intron 14 of 15) intron (NM_001890, intron 14 of 15) 11558 NM_001890 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 146.75-156 chr8 85900076 85900364 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72278 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 138-130 chr5 81908936 81909159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62976 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 163-57 chr2 50062908 50063278 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -88890 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 163.25-108 chr4 36204426 36204781 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 6 of 32) HAL1|LINE|L1 39336 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 144.75-99 chr20 37598567 37599046 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 24313 NR_047461 100861522 Hs.580680 NR_047461 ENSG00000225759 LINC00489 - long intergenic non-protein coding RNA 489 ncRNA 225.5-38 chr15 26942926 26943319 + 0.75 NA intron (NM_001165037, intron 9 of 10) intron (NM_001165037, intron 9 of 10) -28059 NM_033223 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 139.5-102 chr2 124029715 124029955 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 4548 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 127.75-178 chr6 166882118 166882343 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -19705 NM_001318936 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 155.25-152 chr6 66101225 66101567 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 313517 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 154.25-37 chr12 85353645 85353914 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73559 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 184.75-22 chr12 67049825 67050230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46257 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 112.25-67 chr15 26327685 26327983 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 212021 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 165-119 chr5 164425234 164425459 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 42056 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 126.5-114 chr2 88839730 88839930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27460 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 120.75-172 chr9 13433834 13434094 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2635 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 195.75-33 chr12 3859744 3860176 + 0.75 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 13439 NM_001286522 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 242.75-6 chr1 207599060 207599465 + 0.75 NA intron (NM_000573, intron 27 of 38) L1ME3G|LINE|L1 -45871 NM_175710 1379 Hs.628568 NM_175710 ENSG00000197721 CR1L - complement C3b/C4b receptor 1 like protein-coding 162-111 chr8 6402294 6402661 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 4071 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 113.75-192 chr8 102880126 102880340 + 0.75 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) intron (NR_126339, intron 2 of 2) 15962 NR_126339 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 143-12 chr10 99464496 99464793 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34020 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 125.5-93 chr15 88412477 88412706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54797 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 162.75-50 chr17 60732800 60733144 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) intron (NM_001330413, intron 5 of 25) 55121 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 154.25-97 chr20 35335783 35336041 + 0.75 NA intron (NM_001184977, intron 5 of 7) AluJb|SINE|Alu -43487 NM_178468 128876 Hs.592149 NM_178468 ENSG00000125998 FAM83C C20orf128|dJ614O4.7 family with sequence similarity 83 member C protein-coding 166.5-77 chr16 66555364 66555772 + 0.75 NA intron (NM_001202509, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 2992 NM_001204099 100529251 Hs.698621 NM_001202509 ENSG00000254788 CKLF-CMTM1 - CKLF-CMTM1 readthrough protein-coding 205.5-24 chr11 129017634 129018037 + 0.75 NA intron (NM_001142685, intron 10 of 21) L1MD|LINE|L1 6353 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 160-44 chr17 75456388 75456688 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001351202) promoter-TSS (NM_001351202) -97 NM_001351202 9772 Hs.514474 NM_014738 ENSG00000177728 TMEM94 IDDCDF|KIAA0195 transmembrane protein 94 protein-coding 208.25-92 chr8 117401804 117402345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118639 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 139.75-111 chr21 14320213 14320451 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46533 NR_003088 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 112.25-8 chr1 96476527 96476714 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102495 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 121.25-180 chr6 103365560 103365905 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 1493814 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 179.5-16 chr10 4630277 4630560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25738 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 150.5-122 chr21 10685512 10685752 + 0.75 NA Intergenic (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 164118 NM_199259 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 123-55 chr14 71244563 71244847 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75771 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 135.5-173 chr6 72501170 72501386 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -120565 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 151.75-36 chr12 105272919 105273222 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -36840 NM_001251904 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 190-90 chr9 106832517 106832905 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -30455 NM_001347997 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 126.75-14 chr10 27119130 27119325 + 0.75 NA intron (NM_139312, intron 15 of 19) intron (NM_139312, intron 15 of 19) -18729 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 172-53 chr2 112581771 112582137 + 0.75 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -2493 NR_163920 159.75-100 chr22 28791145 28791489 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 9255 NM_005080 7494 Hs.437638 NM_005080 ENSG00000100219 XBP1 TREB-5|TREB5|XBP-1|XBP2 X-box binding protein 1 protein-coding 119-166 chr6 86068564 86068939 + 0.75 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -390018 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 133.5-114 chr2 67299198 67299492 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -84026 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 134-169 chr8 87670035 87670311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203842 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 118-84 chr2 73220737 73220998 + 0.75 NA intron (NM_006062, intron 4 of 12) intron (NM_006062, intron 4 of 12) 6622 NM_006062 10322 Hs.631882 NM_006062 ENSG00000135632 SMYD5 NN8-4AG|RAI15|RRG1|ZMYND23 SMYD family member 5 protein-coding 168.5-116 chr3 97064841 97065245 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 250449 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 183-102 chr6 118978307 118978558 + 0.75 NA intron (NM_024581, intron 11 of 17) intron (NM_024581, intron 11 of 17) -43270 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 203.5-60 chr18 68079470 68079778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -264802 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 123.25-91 chr2 18545545 18545885 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 14938 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 185.25-82 chr3 85963783 85964321 + 0.75 NA intron (NM_001256504, intron 9 of 10) intron (NM_001256504, intron 9 of 10) -136002 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 171-81 chr20 43265998 43266352 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -76269 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 241.75-52 chr3 94162917 94163487 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 100141 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 167.5-194 chr8 136846043 136846304 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 315375 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 181.5-58 chr17 35721898 35722327 + 0.75 NA intron (NM_001030006, intron 21 of 21) AluSx|SINE|Alu -9527 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 145-112 chr4 97667642 97667911 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 300850 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 304-36 chr9 112271118 112271608 + 0.75 NA intron (NM_001244896, intron 2 of 12) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 61663 NM_001244898 9991 Hs.269988 NM_005156 ENSG00000119314 PTBP3 ROD1 polypyrimidine tract binding protein 3 protein-coding 200-55 chr3 57862758 57863088 + 0.75 NA intron (NM_001304420, intron 9 of 21) intron (NM_001304420, intron 9 of 21) -26991 NM_001311179 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 219.75-43 chr2 155100639 155101226 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 402237 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 145.75-76 chr2 42325654 42325926 + 0.75 NA intron (NM_001145076, intron 19 of 21) intron (NM_001145076, intron 19 of 21) 34248 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 156.25-111 chr4 44294225 44294567 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) LTR89|LTR|ERVL? 154413 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 166-75 chr20 52561474 52561875 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59164 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 177.75-30 chr12 98161376 98161707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166093 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 116.75-199 chr8 89110089 89110279 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 647527 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 178-79 chr5 66304753 66305129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95495 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 159-96 chr6 55519392 55519792 + 0.75 NA intron (NM_001287746, intron 4 of 9) intron (NM_001287746, intron 4 of 9) 59622 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 152.5-146 chr5 5035555 5035988 + 0.75 NA intron (NR_026994, intron 1 of 6) intron (NR_026994, intron 1 of 6) 1412 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 205-8 chr1 247572977 247573480 + 0.75 NA intron (NM_145278, intron 4 of 4) L1PA8|LINE|L1 -15132 NM_001001915 81470 Hs.690208 NM_001001915 ENSG00000177489 OR2G2 OR1-32 olfactory receptor family 2 subfamily G member 2 protein-coding 157.5-104 chr2 81534373 81534679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67580 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 165-52 chr16 88506783 88507177 + 0.75 NA intron (NM_153813, intron 3 of 9) CpG 24073 NR_148997 100128882 Hs.722546 NR_148997 ENSG00000261744 LOC100128882 - uncharacterized LOC100128882 ncRNA 188.25-25 chr12 4518995 4519249 + 0.75 NA intron (NM_001346157, intron 5 of 11) intron (NM_001346157, intron 5 of 11) 19347 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 195-12 chr10 58761628 58762053 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) intron (NM_001080512, intron 3 of 20) 46825 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 190-9 chr10 12863990 12864366 + 0.75 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 137535 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 141.5-151 chr3 156102684 156102959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17727 NM_172160 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 164.5-181 chr6 124614865 124615177 + 0.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 332016 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 297.5-5 chr1 115835259 115835753 + 0.75 NA TTS (NM_005599) TTS (NM_005599) 5197 NM_001111061 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 115.25-13 chr1 89522543 89522735 + 0.75 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -2190 NM_001134476 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 146.75-108 chr3 193825315 193825560 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 18572 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 155.5-74 chr17 62051938 62052281 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) intron (NM_005121, intron 3 of 29) 13169 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 144.5-228 chr8 133297370 133297686 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001258432) promoter-TSS (NM_001258432) -224 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 261-2 chr1 79020287 79020735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13781 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 168-87 chr3 178166320 178166752 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -252665 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 285.5-23 chr15 84743960 84744591 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4317 NM_014630 9640 Hs.79347 NM_014630 ENSG00000166716 ZNF592 CAMOS|SCAR5 zinc finger protein 592 protein-coding 134.75-65 chr14 53776884 53777180 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 171452 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 155.25-71 chr16 17422093 17422394 + 0.75 NA intron (NM_022166, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu 48717 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 219.75-91 chr9 77447847 77448297 + 0.75 NA intron (NR_121184, intron 1 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 423 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-9 chr10 74336082 74336400 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) L1MC4|LINE|L1 159478 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 134.5-36 chr10 112664379 112664595 + 0.75 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) 30317 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 278.25-46 chr4 190177916 190178460 + 0.75 NA intron (NR_137167, intron 2 of 5) BSR/Beta|Satellite|Satellite 4414 NR_137167 100288687 Hs.728749 NM_001205218 ENSG00000260596 DUX4 DUX4L double homeobox 4 protein-coding 263.5-19 chr15 66909235 66909873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46961 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 148.75-120 chr4 39744399 39744740 + 0.75 NA intron (NM_005339, intron 2 of 6) intron (NM_005339, intron 2 of 6) 46433 NM_001111113 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 114.75-167 chr6 144892588 144892781 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 487029 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 150.75-75 chr16 86403377 86403616 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -57817 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 124.25-134 chr3 86983899 86984163 + 0.75 NA intron (NM_001320493, intron 1 of 3) intron (NM_001320493, intron 1 of 3) 7118 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 115.25-33 chr11 10226207 10226394 + 0.75 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) intron (NM_030962, intron 1 of 39) 67907 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 161-96 chr5 114581978 114582261 + 0.75 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 6078 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 214.75-46 chr20 21153927 21154431 + 0.75 NA intron (NM_018474, intron 4 of 12) intron (NM_018474, intron 4 of 12) 28097 NM_001352435 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 137.25-54 chr16 78888260 78888590 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 712312 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 137.75-76 chr15 76916349 76916595 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -11132 NM_001353012 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 159.25-105 chr4 75520724 75520981 + 0.75 NA intron (NR_133920, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 6379 NM_144721 152815 Hs.479971 NM_144721 ENSG00000174796 THAP6 - THAP domain containing 6 protein-coding 198-64 chr5 83908237 83908579 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -187553 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 179.5-183 chr8 117531766 117532153 + 0.75 NA intron (NM_080651, intron 3 of 3) intron (NM_080651, intron 3 of 3) 11246 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 137.75-193 chr7 39880384 39880567 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68944 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 213-47 chr2 108162366 108162674 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55321 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 399.25-6 chr17 66320561 66321311 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 18323 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 191.25-20 chr11 101597945 101598333 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14132 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 256.75-35 chr6 165432676 165433110 + 0.75 NA intron (NM_006661, intron 8 of 22) intron (NM_006661, intron 8 of 22) -123288 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 205.5-106 chr4 58574133 58574672 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38074 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 163-75 chr3 132447328 132447777 + 0.75 NA intron (NM_001329126, intron 4 of 56) intron (NM_001329126, intron 4 of 56) 30050 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 124.5-53 chr12 124060706 124060990 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 87633 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 147.75-75 chr2 138549960 138550268 + 0.75 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) intron (NM_001001664, intron 1 of 10) 48344 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 295-17 chr2 27243908 27244366 + 0.75 NA TTS (NM_004341) TTS (NM_004341) 18910 NM_003459 7781 Hs.467981 NM_003459 ENSG00000115194 SLC30A3 ZNT3 solute carrier family 30 member 3 protein-coding 195.5-31 chr12 38430055 38430394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113450 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 261.25-44 chr7 24576178 24576866 + 0.75 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) intron (NM_001303037, intron 1 of 11) 3070 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 238.5-97 chr9 38087475 38088068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18544 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 177.25-80 chr20 39449070 39449392 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -224483 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 188.75-117 chr8 114118210 114118593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -681462 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 152.5-93 chr2 153633429 153633801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154853 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 134.5-55 chr13 114244848 114245223 + 0.75 NA TTS (NR_049839) TTS (NR_049839) 530 NR_049839 100847035 NR_049839 ENSG00000264539 MIR548AR - microRNA 548ar ncRNA 165.25-72 chr2 176006897 176007255 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -4256 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 116.75-133 chr3 123008964 123009252 + 0.75 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) intron (NR_046079, intron 1 of 22) -15835 NM_001256346 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 133.75-200 chr9 34720730 34720935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8656 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 117-26 chr11 81376097 81376281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 514647 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 162-120 chr8 121940686 121941010 + 0.75 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -299408 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 203.5-6 chr1 59483162 59483552 + 0.75 NA intron (NM_001350794, intron 6 of 14) L2b|LINE|L2 -32273 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 151-108 chr5 44312114 44312403 + 0.75 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR -76474 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 182.25-104 chr6 137226304 137226573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7008 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 232.25-29 chr17 6874295 6874821 + 0.75 NA intron (NR_002710, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR -19219 NR_120453 245 Hs.378695 NR_002710 ENSG00000262943 ALOX12P2 ALOX12E arachidonate 12-lipoxygenase pseudogene 2 pseudo 207-73 chr6 66613043 66613506 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 825395 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 140.75-182 chr8 111366839 111367099 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -9670 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 154.25-9 chr1 162078030 162078362 + 0.75 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) intron (NM_014697, intron 1 of 9) 8505 NM_014697 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 182.75-109 chr5 126535931 126536286 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 59111 NM_001201377 501 Hs.483239 NM_001182 ENSG00000164904 ALDH7A1 ATQ1|EPD|PDE aldehyde dehydrogenase 7 family member A1 protein-coding 133.5-26 chr10 28717625 28717854 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25911 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 221-83 chr9 16456901 16457195 + 0.75 NA intron (NM_001317939, intron 4 of 6) intron (NM_001317939, intron 4 of 6) -180735 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 238.5-35 chr17 79553250 79553636 + 0.75 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) L1M5|LINE|L1 -37295 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 218.75-82 chr7 93851117 93851457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39466 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 259-36 chr7 50427600 50428300 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2-int|LTR|ERVL-MaLR 22400 NM_001287492 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 175-115 chr7 7283584 7283912 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 28594 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 148.75-141 chr5 143826760 143827109 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14773 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 152-68 chr17 66328480 66328944 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 26099 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 190.75-32 chr14 91098463 91098787 + 0.75 NA intron (NM_001358312, intron 1 of 13) MER63B|DNA|hAT-Blackjack -15388 NM_001102368 80017 Hs.309849 NM_024952 ENSG00000133943 DGLUCY C14orf159 D-glutamate cyclase protein-coding 237-9 chr11 46402801 46403297 + 0.75 NA intron (NM_001267782, intron 19 of 19) intron (NM_001267782, intron 19 of 19) -11381 NM_001366692 1132 Hs.248100 NM_000741 ENSG00000180720 CHRM4 HM4|M4R cholinergic receptor muscarinic 4 protein-coding 166-84 chr3 164221453 164221784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50062 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 124-58 chr16 51557959 51558226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204427 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 115.25-54 chr13 88435823 88436009 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -104913 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 114-155 chr7 41638388 41638557 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55447 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 212.5-54 chr2 134007136 134007616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112559 NM_001371457 228-3 chr1 47519279 47519706 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -82175 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 249-19 chr18 60490297 60490933 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -117840 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 242-4 chr1 94325030 94325587 + 0.75 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -77562 NM_001328665 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 171-79 chr20 8924987 8925372 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 93994 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 121-115 chr20 47075844 47076102 + 0.75 NA intron (NM_172110, intron 7 of 13) L1PA15|LINE|L1 -90994 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 182.25-71 chr22 49222775 49223177 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 320490 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 138-43 chr14 71569274 71569633 + 0.75 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -16845 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 204.75-120 chr8 102763340 102763710 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -43297 NR_149020 401472 NR_149020 GASAL1 GASL1 growth arrest associated lncRNA 1 ncRNA 125.75-22 chr10 57892637 57892960 + 0.75 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 375096 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 188.5-87 chr20 32845704 32846100 + 0.75 NA intron (NM_012325, intron 5 of 6) intron (NM_012325, intron 5 of 6) -13021 NM_001143967 388795 NM_001143967 ENSG00000215529 EFCAB8 - EF-hand calcium binding domain 8 protein-coding 139.25-9 chr1 115403588 115403866 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65491 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 190.75-9 chr10 68779797 68780130 + 0.75 NA intron (NR_104262, intron 18 of 23) intron (NR_104262, intron 18 of 23) 24791 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 130.25-127 chr22 35126193 35126560 + 0.75 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) AluSz|SINE|Alu 60218 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 117-129 chr4 24016762 24016941 + 0.75 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -126804 NR_148984 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 192.75-65 chr2 205403370 205403734 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) intron (NM_205863, intron 19 of 21) -278948 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 176.25-80 chr20 13545116 13545586 + 0.75 NA intron (NM_001323602, intron 4 of 9) intron (NM_001323602, intron 4 of 9) 93581 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 209.25-63 chr2 232156079 232156501 + 0.75 NA intron (NR_046476, intron 8 of 20) L1M7|LINE|L1 -16363 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 179-82 chr7 8202090 8202401 + 0.75 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 59807 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 157.25-20 chr10 125279834 125280156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118965 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 168-16 chr10 78322527 78322918 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 55380 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 180.75-21 chr11 13834398 13834844 + 0.75 NA intron (NR_149108, intron 3 of 3) intron (NR_149108, intron 3 of 3) 35995 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 137.25-23 chr10 129502857 129503059 + 0.75 NA intron (NM_002412, intron 1 of 4) intron (NM_002412, intron 1 of 4) 35717 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 129.75-54 chr12 111938314 111938598 + 0.75 NA intron (NM_001193453, intron 4 of 9) intron (NM_001193453, intron 4 of 9) 39393 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 247.5-69 chr5 99227743 99228302 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -298308 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 127.75-186 chr7 17340617 17340802 + 0.75 NA intron (NM_001621, intron 10 of 10) OldhAT1|DNA|hAT-Ac -34208 NR_110015 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 181-11 chr10 117243454 117243761 + 0.75 NA intron (NM_003054, intron 2 of 15) AluSx|SINE|Alu 2493 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 179.75-6 chr1 112098695 112099100 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 108361 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 169.25-60 chr2 167256961 167257322 + 0.75 NA intron (NM_001199144, intron 8 of 8) HAL1M8|LINE|L1 69769 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 117.75-216 chr8 134610678 134610838 + 0.75 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) intron (NM_020863, intron 3 of 15) 12687 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 179.25-134 chr7 5008805 5009137 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 34986 NR_015449 441191 Hs.520636 NR_015449 ENSG00000196204 RNF216P1 RNF216L|hCG2040556 ring finger protein 216 pseudogene 1 pseudo 131-144 chr6 89196850 89197025 + 0.75 NA intron (NM_001267582, intron 7 of 11) intron (NM_001267582, intron 7 of 11) 20840 NM_001256704 2569 Hs.99927 NM_002042 ENSG00000146276 GABRR1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho1 subunit protein-coding 174.25-113 chr4 76301113 76301364 + 0.75 NA intron (NM_001242939, intron 6 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 -4788 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 117.5-65 chr14 82900900 82901193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258414 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 204.75-14 chr10 11785696 11786124 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37446 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 122.75-30 chr11 68462528 68462782 + 0.75 NA intron (NM_001352362, intron 2 of 24) intron (NM_001352362, intron 2 of 24) 1903 NR_147966 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 140.25-107 chr20 34276145 34276455 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 15935 NM_001672 434 Hs.659995 NM_001672 ENSG00000101440 ASIP AGSW|AGTI|AGTIL|ASP|SHEP9 agouti signaling protein protein-coding 180.75-62 chr2 35885082 35885495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 413883 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 170.25-83 chr20 5205757 5206371 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79056 NM_003818 8760 Hs.126857 NM_003818 ENSG00000101290 CDS2 - CDP-diacylglycerol synthase 2 protein-coding 140.75-54 chr15 23923124 23923431 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -51870 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 193-88 chr8 59213228 59213589 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 94198 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 144-117 chr7 15973486 15973712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236887 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 235.75-66 chr7 28919648 28920159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38427 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 128.5-106 chr2 58203765 58204022 + 0.75 NA intron (NR_156742, intron 2 of 9) intron (NR_156742, intron 2 of 9) 37487 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 205.5-132 chr7 19496605 19496935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 208666 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 193.75-94 chr4 67824758 67825179 + 0.75 NA intron (NM_004262, intron 9 of 9) intron (NM_004262, intron 9 of 9) 59034 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 225-53 chr4 180602296 180602712 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 556645 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 250.5-8 chr10 19719469 19719979 + 0.75 NA intron (NR_120646, intron 3 of 4) intron (NR_120646, intron 3 of 4) 8826 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 172.75-55 chr18 22405575 22405872 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 12192 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 118.25-184 chr7 65827024 65827282 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -45921 NM_173517 154807 Hs.427232 NM_173517 ENSG00000196715 VKORC1L1 - vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 like 1 protein-coding 251.75-78 chr9 28365599 28366227 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 353392 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 151.75-137 chr7 20170079 20170397 + 0.75 NA intron (NM_182762, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 28322 NR_046756 100874041 Hs.145104 NR_046756 ENSG00000228598 MACC1-AS1 - MACC1 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-152 chr4 71214885 71215104 + 0.75 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) intron (NM_001098484, intron 1 of 25) 27708 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 162.25-103 chr22 27449490 27449934 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 139061 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 124.25-126 chr3 7168101 7168371 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -274219 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 211.25-100 chrX 108951710 108952094 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 215362 NR_110652 101928358 Hs.722300 NR_110652 ENSG00000237863 LOC101928358 - uncharacterized LOC101928358 ncRNA 193.75-79 chr21 31777467 31777848 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -45539 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 158-63 chr18 34518049 34518486 + 0.75 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) L1MD2|LINE|L1 24955 NM_001198945 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 158.75-40 chr12 28826600 28826815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -322571 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 155.25-95 chr2 124906897 124907328 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 22 of 23) intron (NM_130773, intron 22 of 23) 881825 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 187.25-107 chr8 84417567 84418046 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 1 of 9) intron (NM_001354308, intron 1 of 9) 2322 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 149-64 chr2 205398645 205398955 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -283700 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 197.75-18 chr12 78863181 78863500 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001135805) promoter-TSS (NM_001135805) -642 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 117.25-126 chr2 218789674 218789922 + 0.75 NA intron (NM_000784, intron 1 of 8) MER57-int|LTR|ERV1 7651 NM_000784 1593 Hs.516700 NM_000784 ENSG00000135929 CYP27A1 CP27|CTX|CYP27 cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1 protein-coding 113.75-97 chr2 51292282 51292496 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 259788 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 190.25-132 chr9 95458180 95458504 + 0.75 NA intron (NM_000264, intron 17 of 23) intron (NM_000264, intron 17 of 23) -5267 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 137.5-185 chr5 26750599 26750897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 287838 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 162.5-53 chr14 69319204 69319505 + 0.75 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) intron (NM_020692, intron 1 of 15) 59196 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 139.5-229 chr9 89306634 89307103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4327 NM_001827 1164 Hs.83758 NM_001827 ENSG00000123975 CKS2 CKSHS2 CDC28 protein kinase regulatory subunit 2 protein-coding 138.75-57 chr15 62320317 62320619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15734 NR_107034 102465869 NR_107034 ENSG00000277919 MIR8067 hsa-mir-8067 microRNA 8067 ncRNA 172.25-139 chr8 106493593 106493976 + 0.75 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 45860 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 224.5-46 chr15 71106288 71106670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34970 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 142.25-34 chr11 112202929 112203175 + 0.75 NA intron (NM_031938, intron 8 of 11) AluSx1|SINE|Alu -23376 NM_000317 5805 Hs.503860 NM_000317 ENSG00000150787 PTS PTPS 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase protein-coding 135.25-65 chr14 62377967 62378309 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -238165 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 203.75-41 chr16 20071919 20072307 + 0.75 NA intron (NM_001318483, intron 1 of 2) intron (NM_001318483, intron 1 of 2) 1665 NM_001318483 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 228-53 chr3 66993134 66993493 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -4994 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 154.75-136 chr7 76387186 76387462 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10198 NM_007155 7784 Hs.656137 NM_007155 ENSG00000188372 ZP3 OOMD3|ZP3A|ZP3B|ZPC|Zp-3 zona pellucida glycoprotein 3 protein-coding 227.5-31 chr14 62886902 62887300 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 158357 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 239-57 chr7 106774813 106775288 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -90232 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 153.5-138 chr4 26566044 26566440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17682 NM_001292054 55296 Hs.479403 NM_018317 ENSG00000109680 TBC1D19 - TBC1 domain family member 19 protein-coding 122.5-131 chr20 31069112 31069376 + 0.75 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -188420 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 203-53 chr2 186645753 186646063 + 0.75 NA intron (NM_001145000, intron 10 of 27) AluY|SINE|Alu 45703 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 254-12 chr11 103152550 103153168 + 0.75 NA intron (NM_001377, intron 21 of 88) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 43433 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 155-71 chr2 203185108 203185486 + 0.75 NA intron (NM_001114132, intron 43 of 54) intron (NM_001114132, intron 43 of 54) -53144 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 112.25-172 chr5 130130350 130130596 + 0.75 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 226008 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 119.25-115 chr21 35057630 35057837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8435 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 219.75-73 chr7 10739436 10739940 + 0.75 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 37012 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 201.5-133 chr9 2533398 2533803 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -88187 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 194.75-79 chr5 38073577 38074019 + 0.75 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) MER74A|LTR|ERVL 48101 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 222.75-85 chr7 19351566 19352016 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -206370 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 142.5-94 chr18 30807469 30807729 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 235143 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 118-156 chr5 125141723 125141909 + 0.75 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) intron (NR_109882, intron 2 of 5) 104985 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 173-42 chr14 24550110 24550510 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 25940 NM_001911 1511 Hs.421724 NM_001911 ENSG00000100448 CTSG CATG|CG cathepsin G protein-coding 119-64 chr17 38965394 38965683 + 0.75 NA intron (NM_001008777, intron 1 of 10) intron (NM_001008777, intron 1 of 10) 1865 NM_001008777 494188 Hs.549536 NM_001008777 ENSG00000204952 FBXO47 - F-box protein 47 protein-coding 132.25-180 chr8 96697091 96697327 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) L1MA2|LINE|L1 51967 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 148.75-79 chr2 15131980 15132297 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 429196 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 204.25-51 chr2 27337803 27338188 + 0.75 NA TTS (NR_038427) TTS (NR_038427) 2453 NR_038427 100505624 Hs.666503 NR_038427 ENSG00000234945 GTF3C2-AS1 - GTF3C2 antisense RNA 1 ncRNA 152.5-33 chr12 32458362 32458621 + 0.75 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) -27481 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 176.25-90 chr3 15343662 15344090 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -2496 NM_001018009 9467 Hs.257761 NM_004844 ENSG00000131370 SH3BP5 SAB|SH3BP-5 SH3 domain binding protein 5 protein-coding 147-146 chr8 90219291 90219502 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -2092 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 169.75-136 chr7 2869175 2869656 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -25107 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 121.5-242 chr8 51603795 51604052 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) intron (NM_144651, intron 2 of 22) 205522 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 136.5-118 chr2 126653947 126654255 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1834 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 155.5-160 chr5 13236312 13236627 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -203583 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 153.25-59 chr18 66569592 66569897 + 0.75 NA intron (NM_001271028, intron 2 of 9) intron (NM_001271028, intron 2 of 9) 34346 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 144-128 chr8 34914764 34915196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131059 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 133.75-7 chr1 151745830 151746035 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -17037 NM_001134939 51686 Hs.713789 NM_016178 ENSG00000143450 OAZ3 AZ3|OAZ-t|TISP15 ornithine decarboxylase antizyme 3 protein-coding 124-54 chr16 8418995 8419250 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 170716 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 212.5-52 chr2 97869495 97869822 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 4 of 40) intron (NM_015348, intron 4 of 40) 126290 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 195.5-5 chr1 87993431 87993758 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -621939 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 173.5-148 chr7 7327040 7327356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72044 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 168-60 chr18 1755593 1755907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -396121 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 272.75-19 chr18 51597265 51597661 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 205421 NR_040074 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 203-85 chr5 99681837 99682177 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 148017 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 261-44 chr5 36638040 36638457 + 0.75 NA intron (NM_004172, intron 3 of 9) L2c|LINE|L2 31642 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 114.75-166 chr6 140210661 140210850 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 5503 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 155.25-141 chr5 86920889 86921229 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 174241 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 146.5-227 chr8 131622054 131622443 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -281845 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 205-47 chr22 32361087 32361407 + 0.75 NA TTS (NM_001098535) TTS (NM_001098535) 3380 NM_001098535 10738 Hs.558455 NM_006604 ENSG00000128276 RFPL3 RNF120 ret finger protein like 3 protein-coding 152.5-29 chr12 1725079 1725380 + 0.75 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 AluSq2|SINE|Alu 34159 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 136.5-186 chr5 101603262 101603477 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 692915 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 118-87 chr2 108622070 108622433 + 0.75 NA intron (NM_001193484, intron 1 of 9) intron (NM_001193484, intron 1 of 9) 1000 NM_001193484 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 169-59 chr21 40857711 40858122 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10758 NR_073202 1826 Hs.160418 NM_001389 ENSG00000171587 DSCAM CHD2|CHD2-42|CHD2-52 DS cell adhesion molecule protein-coding 169.25-12 chr11 4768981 4769255 + 0.75 NA exon (NM_001004752, exon 1 of 1) exon (NM_001004752, exon 1 of 1) 820 NM_001004752 256892 NM_001004752 ENSG00000280021 OR51F1 OR11-21|OR51F1P olfactory receptor family 51 subfamily F member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 173.25-39 chr15 42742045 42742312 + 0.75 NA 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) -5050 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 186.5-18 chr10 65419869 65420143 + 0.75 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -151419 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 181-65 chr22 33525175 33525709 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -88773 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 143.5-97 chr18 50688307 50688680 + 0.75 NA intron (NM_002747, intron 2 of 5) intron (NM_002747, intron 2 of 5) 128406 NM_001292040 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 117.25-113 chr2 98573877 98574074 + 0.75 NA intron (NM_001351428, intron 23 of 24) intron (NM_001351428, intron 23 of 24) 34537 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 170.75-133 chr8 72335625 72335932 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -84144 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 117-11 chr10 12020122 12020348 + 0.75 NA intron (NM_080599, intron 3 of 21) intron (NM_080599, intron 3 of 21) 22574 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 225-46 chr3 86967729 86968148 + 0.75 NA intron (NM_001320493, intron 3 of 3) X6B_LINE|LINE|CR1 23211 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 212.75-35 chr14 97051454 97051805 + 0.75 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -103228 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 150.25-100 chr3 72808175 72808515 + 0.75 NA intron (NM_018130, intron 9 of 10) L1MC5|LINE|L1 40100 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 146.5-87 chr18 3692625 3692896 + 0.75 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 89023 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 197-4 chr10 53476658 53476985 + 0.75 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -705121 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 206.5-128 chr8 11519615 11520127 + 0.75 NA intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 25484 NM_001330465 640 Hs.146591 NM_001715 ENSG00000136573 BLK MODY11 BLK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 175.5-110 chr22 31719709 31720009 + 0.75 NA intron (NM_173566, intron 3 of 8) AluJo|SINE|Alu 30273 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 120.25-170 chr5 119810056 119810397 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 180667 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 121.25-178 chr6 75600734 75601036 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001304792) promoter-TSS (NM_001304792) -624 NM_001304792 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 140.75-88 chr2 73056221 73056429 + 0.75 NA intron (NM_001330406, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 2847 NM_001330411 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 220.25-81 chr9 74212119 74212515 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -159214 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 170.75-126 chr7 99186104 99186418 + 0.75 NA intron (NM_001145715, intron 6 of 9) intron (NM_001145715, intron 6 of 9) 21228 NM_001145715 402569 Hs.253050 NM_001145715 ENSG00000185467 KPNA7 IPOA8 karyopherin subunit alpha 7 protein-coding 197.25-106 chr9 96325137 96325597 + 0.75 NA intron (NM_001286990, intron 6 of 8) intron (NM_001286990, intron 6 of 8) -23191 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 132-25 chr11 8843656 8843987 + 0.75 NA intron (NM_005418, intron 2 of 22) L2c|LINE|L2 -32486 NM_139157 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 193.5-94 chr2 239604025 239604503 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -158596 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 318-15 chr2 65794407 65795132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -362170 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 131.5-153 chr3 53977138 53977371 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -85395 NM_021237 58515 Hs.58471 NM_021237 ENSG00000113811 SELENOK HSPC030|HSPC297|SELK selenoprotein K protein-coding 122-78 chr18 14036126 14036316 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96214 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 199.75-24 chr14 42254043 42254343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 647337 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 155-40 chr14 66811562 66811830 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 304289 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 115-76 chr2 20438478 20438681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8495 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 197.5-135 chr6 77766211 77766493 + 0.75 NA intron (NM_001282136, intron 3 of 4) intron (NM_001282136, intron 3 of 4) 113313 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 222.75-98 chr8 108120090 108120423 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36636 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 366.25-16 chr8 109399730 109400597 + 0.75 NA exon (NM_177531, exon 13 of 78) exon (NM_177531, exon 13 of 78) 37702 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 177.75-75 chr2 139109353 139109681 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 212193 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 126.5-174 chr4 61958959 61959184 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 16 of 23) intron (NM_001371343, intron 16 of 23) 202694 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 185.75-67 chr2 176002742 176003175 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001305009) promoter-TSS (NM_001305009) -138 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 229.25-28 chr14 69958014 69958384 + 0.75 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) AluJo|SINE|Alu -19934 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 156.25-104 chr3 186065819 186066115 + 0.75 NA exon (NM_004454, exon 8 of 13) exon (NM_004454, exon 8 of 13) 43122 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 234.25-9 chr10 19822377 19822812 + 0.75 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) L1MA9|LINE|L1 6162 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 159.5-187 chr6 122772094 122772456 + 0.75 NA intron (NM_001319042, intron 1 of 3) intron (NM_001319042, intron 1 of 3) -7200 NM_001319039 2173 Hs.26770 NM_001446 ENSG00000164434 FABP7 B-FABP|BLBP|FABPB|MRG fatty acid binding protein 7 protein-coding 185.5-122 chr4 105688900 105689229 + 0.75 NA intron (NM_001142471, intron 5 of 6) intron (NM_001142471, intron 5 of 6) 19625 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 228.25-34 chr16 79077082 79077446 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 523473 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 140-122 chr4 39563936 39564255 + 0.75 NA intron (NM_174921, intron 3 of 4) intron (NM_174921, intron 3 of 4) 36256 NR_047679 100885776 Hs.640769 NR_047679 ENSG00000249348 UGDH-AS1 - UGDH antisense RNA 1 ncRNA 159-68 chr3 110304004 110304289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 701318 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 193.75-101 chr5 138762365 138762838 + 0.75 NA intron (NM_001323982, intron 2 of 18) intron (NM_001323982, intron 2 of 18) -8677 NR_134244 105379194 Hs.445981 NR_134244 ENSG00000253404 LOC105379194 - uncharacterized LOC105379194 ncRNA 179-77 chr4 86507337 86507707 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 35030 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 137.75-163 chr5 57843742 57844028 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55277 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 327-13 chr17 62040618 62041212 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) L1MB4|LINE|L1 24363 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 141-8 chr1 152810088 152810432 + 0.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -1711 NM_178349 353132 Hs.375103 NM_178349 ENSG00000196734 LCE1B LEP2|SPRL2A late cornified envelope 1B protein-coding 135.75-34 chr11 26164154 26164388 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24852 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 165.25-135 chr7 41398122 41398584 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -295566 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 154.5-68 chr15 70994362 70994613 + 0.75 NA intron (NM_017691, intron 11 of 15) AluJb|SINE|Alu 102044 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 192.75-17 chr10 128637621 128638180 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -274933 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 157-106 chr6 52148387 52148790 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_029903) promoter-TSS (NR_029903) -335 NR_029903 442890 NR_029903 ENSG00000199080 MIR133B MIRN133B|miRNA133B|mir-133b microRNA 133b ncRNA 218.5-2 chr1 18411047 18411442 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -69686 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 212.75-98 chr8 118223523 118224069 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -111977 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 137.25-89 chr22 27898662 27899045 + 0.75 NA intron (NM_001284278, intron 3 of 11) L1M5|LINE|L1 20361 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 251.75-69 chr6 86819045 86819531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118240 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 170.25-16 chr11 29397794 29398187 + 0.75 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -196423 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 126.25-202 chr8 79941197 79941434 + 0.75 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) -69578 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 122.25-135 chr4 31701065 31701280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 194628 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 288.25-21 chr4 74114793 74115274 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8240 NM_001351310 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 130.25-158 chr5 36620150 36620427 + 0.75 NA intron (NM_001289939, intron 2 of 8) intron (NM_001289939, intron 2 of 8) 13682 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 140.25-110 chr21 29959727 29960103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19863 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 116.75-139 chr3 176185686 176185958 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58729 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 134.5-38 chr11 4424805 4425082 + 0.75 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -24352 NM_001005172 119774 Hs.553568 NM_001005172 ENSG00000181963 OR52K2 OR11-7 olfactory receptor family 52 subfamily K member 2 protein-coding 132-126 chr4 81210691 81210931 + 0.75 NA intron (NM_006259, intron 1 of 18) L1MC2|LINE|L1 4306 NM_006259 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 124.75-159 chr4 96919003 96919245 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -447802 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 213.5-105 chr6 55575424 55576037 + 0.75 NA intron (NM_001287746, intron 1 of 9) intron (NM_001287746, intron 1 of 9) 3484 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 144-127 chr8 31276884 31277177 + 0.75 NA Intergenic Alu|SINE|Alu -243674 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 129.75-91 chr2 66820526 66820789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83779 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 185.25-87 chr4 38857998 38858414 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1389 NM_006068 10333 Hs.575090 NM_006068 ENSG00000174130 TLR6 CD286 toll like receptor 6 protein-coding 114.5-8 chr1 72802889 72803059 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -503196 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 157.75-168 chr8 68243680 68244076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86495 NM_001349476 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 137.5-79 chr16 8164250 8164590 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 425418 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 121-180 chr7 91374220 91374491 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109922 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 205-52 chr3 135145080 135145633 + 0.75 NA intron (NM_004441, intron 5 of 15) intron (NM_004441, intron 5 of 15) 350096 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 148.25-112 chr4 109964957 109965341 + 0.75 NA intron (NM_001357021, intron 9 of 19) intron (NM_001357021, intron 9 of 19) 52266 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 248.75-38 chr3 35188284 35188878 + 0.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MER89|LTR|ERV1 205442 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 113-143 chr5 36602737 36603009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3482 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 114.75-207 chr9 134111575 134111775 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -24407 NM_017588 11091 Hs.397638 NM_017588 ENSG00000196363 WDR5 BIG-3|CFAP89|SWD3 WD repeat domain 5 protein-coding 162-66 chr2 189186297 189186731 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6753 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 125.5-262 chr8 133599633 133600036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27947 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 130.5-247 chr8 124092498 124092827 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 34 of 40) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -51880 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 158.75-173 chrUn_KI270442v1 50471 50682 + 0.75 NA NA (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 117.5-62 chr14 60441275 60441580 + 0.75 NA intron (NM_174978, intron 17 of 17) intron (NM_174978, intron 17 of 17) 44636 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 119.5-187 chr5 132164246 132164572 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -20467 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 171.75-100 chr4 67061476 67061883 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 360321 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 125.5-143 chr2 233996781 233997006 + 0.75 NA intron (NM_024080, intron 22 of 25) LTR78|LTR|ERV1 -53809 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 139.25-126 chr3 140324020 140324294 + 0.75 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) intron (NM_022131, intron 2 of 16) 184632 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 194.5-25 chr11 103738418 103738693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111351 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 291.75-35 chr6 51204027 51204526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 385405 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 113.75-169 chr6 163661713 163662101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9577 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 122.75-106 chr2 234709798 234710040 + 0.75 NA intron (NR_132376, intron 2 of 2) intron (NR_132376, intron 2 of 2) 27251 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 193.25-82 chr4 53677826 53678322 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -17827 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 163.5-213 chr8 137797742 137798015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 285667 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 159.75-54 chr15 98217293 98217649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114087 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 129-185 chr8 131540505 131540766 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -363458 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 135-139 chr5 32024912 32025170 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 6 of 24) intron (NM_178140, intron 6 of 24) -88882 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 115-35 chr12 7432705 7432910 + 0.75 NA intron (NM_174941, intron 3 of 19) intron (NM_174941, intron 3 of 19) 11378 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 141.5-35 chr12 17777660 17777902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104482 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 118.25-221 chrX 84181197 84181550 + 0.75 NA intron (NM_014496, intron 1 of 21) intron (NM_014496, intron 1 of 21) 6562 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 129-175 chr8 73933000 73933365 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 38726 NM_001204862 6921 Hs.533437 NM_005648 ENSG00000154582 ELOC SIII|TCEB1 elongin C protein-coding 223-3 chr1 88391354 88391759 + 0.75 NA Intergenic MSTB2-int|LTR|ERVL-MaLR -292588 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 242.25-15 chr11 40271704 40272185 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) intron (NM_001258419, intron 4 of 6) 21186 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 159-54 chr2 177937955 177938296 + 0.75 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -15288 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 159.25-88 chr3 109492615 109493148 + 0.75 NA intron (NR_109841, intron 4 of 4) intron (NR_109841, intron 4 of 4) 82891 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 152.5-182 chr8 30381072 30381452 + 0.75 NA TTS (NR_046205) TTS (NR_046205) -3239 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 177.75-74 chr2 125759958 125760308 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 357852 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 171.25-153 chr8 125844267 125844709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106709 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 125-127 chr5 42210449 42210715 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -35237 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 121.5-93 chr16 4060495 4060827 + 0.75 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) L1M4a2|LINE|L1 55781 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 134.5-134 chr3 113113350 113113605 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54254 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 246.25-16 chr11 125311947 125312465 + 0.75 NA intron (NM_022062, intron 2 of 12) MIRc|SINE|MIR 147455 NM_022062 63876 Hs.278564 NM_022062 ENSG00000165495 PKNOX2 PREP2 PBX/knotted 1 homeobox 2 protein-coding 208.5-38 chr14 74688110 74688729 + 0.75 NA intron (NM_001039479, intron 2 of 19) intron (NM_001039479, intron 2 of 19) 24661 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 186.75-18 chr11 106996675 106997208 + 0.75 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) intron (NM_001256424, intron 1 of 8) 21535 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 275.25-6 chr10 74794629 74795226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30328 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 164.75-47 chr14 47620693 47621138 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 54039 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 154.75-86 chr21 31470263 31470506 + 0.75 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) AluSq|SINE|Alu 88703 NM_001353688 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 237.25-63 chr5 119914881 119915265 + 0.75 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 285514 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 316.25-24 chr8 145057763 145058396 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5612 NM_023080 65265 Hs.169615 NM_023080 ENSG00000182307 C8orf33 - chromosome 8 open reading frame 33 protein-coding 186.25-107 chr6 144170992 144171324 + 0.75 NA intron (NM_003764, intron 1 of 1) intron (NM_003764, intron 1 of 1) 20641 NM_003764 8676 Hs.118958 NM_003764 ENSG00000135604 STX11 FHL4|HLH4|HPLH4 syntaxin 11 protein-coding 246.25-35 chr2 122567415 122567888 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 505830 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 168.5-164 chr7 2979313 2979608 + 0.75 NA intron (NM_032415, intron 1 of 24) intron (NM_032415, intron 1 of 24) 64407 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 117.25-138 chr3 19436607 19436858 + 0.75 NA intron (NM_144633, intron 7 of 15) intron (NM_144633, intron 7 of 15) -121801 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 138-55 chr16 74957746 74958058 + 0.75 NA intron (NM_001324172, intron 2 of 13) intron (NM_001324172, intron 2 of 13) 27221 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 119.5-241 chr8 120169183 120169377 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 44178 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 217.5-116 chr7 6165824 6166375 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 10 of 13) intron (NM_001367581, intron 10 of 13) 6038 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 126-50 chr14 44777355 44777563 + 0.75 NA intron (NR_146457, intron 2 of 4) intron (NR_146457, intron 2 of 4) 21667 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 123.5-113 chr2 201205105 201205372 + 0.75 NA intron (NM_001206524, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu 22097 NM_001206542 843 Hs.5353 NM_001230 ENSG00000003400 CASP10 ALPS2|FLICE2|MCH4 caspase 10 protein-coding 276.25-3 chr10 4686096 4686651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8303 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 208.5-91 chr3 130956926 130957390 + 0.75 NA intron (NM_001001485, intron 11 of 27) MER85|DNA|PiggyBac 62568 NM_001001486 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 130.25-42 chr11 97182952 97183300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 674701 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 130.25-148 chr4 37446204 37446494 + 0.75 NA exon (NM_001144990, exon 7 of 7) exon (NM_001144990, exon 7 of 7) -7576 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 154.75-29 chr12 94047298 94047705 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -101076 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 245.75-66 chr9 18639700 18640159 + 0.75 NA intron (NM_052866, intron 7 of 12) intron (NM_052866, intron 7 of 12) 66623 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 218-16 chr12 29540757 29541204 + 0.75 NA intron (NM_001367875, intron 12 of 19) AluSg4|SINE|Alu -41287 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 113.75-119 chr21 32110652 32110910 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -24486 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 131.5-74 chr15 68084795 68085019 + 0.75 NA intron (NM_001320687, intron 2 of 14) intron (NM_001320687, intron 2 of 14) 30331 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 143-138 chr8 18245923 18246113 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 24350 NM_001160174 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 200-68 chr4 166109748 166110053 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 236663 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 180.75-67 chr2 139867781 139868113 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 718738 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 122.75-145 chr4 57492402 57492761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66709 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 144.75-181 chr8 117869403 117869676 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 51374 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 206-29 chr15 57158900 57159346 + 0.75 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -60307 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 194.75-31 chr16 28957725 28958261 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_039742) promoter-TSS (NR_039742) -590 NR_039742 100616487 NR_039742 ENSG00000284541 MIR4517 mir-4517 microRNA 4517 ncRNA 191.25-59 chr2 149955126 149955675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96209 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 142.25-150 chr7 1335203 1335414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102436 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 172.5-201 chr8 113605434 113605703 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -168629 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 113.5-17 chr1 172351963 172352161 + 0.75 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) intron (NM_015569, intron 17 of 20) -68623 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 188.5-47 chr15 82841126 82841477 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 31673 NM_001080435 123720 Hs.377360 NM_001080435 ENSG00000156232 WHAMM WHAMM1|WHDC1 WASP homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules protein-coding 131-117 chr3 82868483 82868791 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 882495 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 159.5-108 chr2 101368348 101368596 + 0.75 NA intron (NM_153836, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 19031 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 143.5-19 chr10 23034327 23034667 + 0.75 NA intron (NM_001282745, intron 18 of 18) MIRb|SINE|MIR -61082 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 154.5-193 chr8 127382525 127382849 + 0.75 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -17712 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 160.5-77 chr18 76781206 76781599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40893 NR_040024 100131655 Hs.385806 NR_040024 ENSG00000264278 ZNF236-DT - ZNF236 divergent transcript ncRNA 195-56 chr22 26859555 26860020 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_146604) promoter-TSS (NR_146604) -424 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 154.5-173 chr7 83958193 83958481 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006080, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_006080, exon 17 of 17) 236452 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 144.25-223 chrX 54360417 54360834 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2579 NM_001002838 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 122.75-160 chr5 39456809 39457119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31731 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 134.25-171 chr7 12617583 12617818 + 0.75 NA intron (NR_156701, intron 4 of 14) intron (NR_156701, intron 4 of 14) 28177 NM_033128 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 205-54 chr3 159739404 159739808 + 0.75 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 29006 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 327.25-27 chr8 6082962 6083700 + 0.75 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 323217 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 114.75-45 chr12 114993820 114994073 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309771 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 142.75-85 chr18 817041 817293 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4925 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 117.75-56 chr14 53104324 53104657 + 0.75 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 48833 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 189.25-78 chr3 74134613 74135006 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325565 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 207.25-106 chr9 113422227 113422703 + 0.75 NA intron (NM_152786, intron 5 of 13) intron (NM_152786, intron 5 of 13) -11716 NM_001278255 54107 Hs.108112 NM_017443 ENSG00000148229 POLE3 CHARAC17|CHRAC17|CHRAC2|YBL1|p17 DNA polymerase epsilon 3, accessory subunit protein-coding 152-23 chr10 83739544 83739869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62617 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 164.5-59 chr14 68662574 68662999 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) -33999 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 126.75-16 chr10 32356863 32357195 + 0.75 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) intron (NR_104163, intron 1 of 1) 9665 NR_104163 102031319 Hs.128132 NR_104163 ENSG00000229327 LOC102031319 - uncharacterized LOC102031319 ncRNA 134-184 chr9 32780899 32781236 + 0.75 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -2473 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 123.75-126 chr3 127159221 127159520 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33761 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 210-89 chr7 31509079 31509510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4777 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 168.5-195 chr9 27286743 27286988 + 0.75 NA intron (NM_001161585, intron 5 of 6) intron (NM_001161585, intron 5 of 6) -4072 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 156.5-30 chr11 101848593 101848836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66296 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 131.5-241 chr8 128193795 128194120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43841 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 263.5-62 chr7 88734504 88735042 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -24927 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 170.25-131 chr5 119830417 119830711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 201005 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 113.5-198 chr5 79609790 79609962 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2541 NM_001114394 167153 Hs.418198 NM_173797 ENSG00000164329 TENT2 APD4|GLD2|PAPD4|TUT2 terminal nucleotidyltransferase 2 protein-coding 242-40 chr4 32983615 32984126 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 632832 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 113-116 chr3 44010136 44010348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103970 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 192.5-56 chr18 2159016 2159342 + 0.75 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 412326 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 176.5-70 chr17 29068895 29069367 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 6478 NM_004740 9220 Hs.462590 NM_004740 ENSG00000221995 TIAF1 MAJN|SPR210 TGFB1-induced anti-apoptotic factor 1 protein-coding 127.75-179 chr7 1259100 1259365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26360 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 143.5-187 chr6 64960073 64960486 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -341139 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 128.5-65 chr14 82915959 82916184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 273439 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 188.5-122 chr5 24990755 24991242 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -150415 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 173.25-69 chr22 36026892 36027310 + 0.75 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) MIR3|SINE|MIR 1436 NM_001349999 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 140.5-24 chr10 126055389 126055604 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 14 of 18) MIRb|SINE|MIR -82223 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-216 chr6 11966870 11967090 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34264 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 194-82 chr8 94645426 94645684 + 0.75 NA intron (NM_017697, intron 3 of 15) (TTTGTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4381 NM_001122827 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 117.5-136 chr22 37344266 37344569 + 0.75 NA intron (NR_110512, intron 1 of 2) intron (NR_110512, intron 1 of 2) 10422 NR_110515 100506271 Hs.220558 NR_110515 ENSG00000237862 LOC100506271 - uncharacterized LOC100506271 ncRNA 167-118 chr8 129029140 129029525 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -63331 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 274-22 chr2 211232725 211233119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 615351 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 164.5-226 chrX 53163959 53164260 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31379 NR_106955 102465539 NR_106955 ENSG00000276575 MIR6895 hsa-mir-6895 microRNA 6895 ncRNA 159.5-110 chr2 117083804 117084165 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -730707 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 143.75-118 chr3 67922955 67923325 + 0.75 NA intron (NR_109992, intron 6 of 6) intron (NR_109992, intron 6 of 6) -68452 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 188-10 chr10 124428906 124429239 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -10096 NM_000274 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 122.25-203 chr8 144306971 144307247 + 0.75 NA intron (NM_005526, intron 1 of 12) L1M4|LINE|L1 10206 NR_106907 102465511 NR_106907 ENSG00000284229 MIR6848 hsa-mir-6848 microRNA 6848 ncRNA 117.25-162 chr5 2108846 2109038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203259 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 126.25-141 chr5 1627296 1627496 + 0.75 NA intron (NR_003713, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 6609 NR_003713 728613 Hs.720393 NR_003713 LOC728613 - programmed cell death 6 pseudogene pseudo 187-91 chr7 71237044 71237359 + 0.75 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) intron (NM_022479, intron 1 of 10) -70473 NR_037479 100500920 NR_037479 ENSG00000283278 MIR3914-2 - microRNA 3914-2 ncRNA 197.75-43 chr2 103165473 103165800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -181207 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 118-60 chr15 90385015 90385204 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3133 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 125-100 chr3 30651542 30651775 + 0.75 NA intron (NM_001024847, intron 4 of 7) L1ME3G|LINE|L1 45057 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 119.25-143 chr4 53989204 53989401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2020 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 191.5-152 chr9 30219965 30220291 + 0.75 NA Intergenic AluYg6|SINE|Alu 188326 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 118-134 chr4 106211533 106211809 + 0.75 NA intron (NM_001290768, intron 21 of 26) intron (NM_001290768, intron 21 of 26) -103939 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 163-104 chr5 151243500 151243923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9474 NM_000405 2760 Hs.483873 NM_000405 ENSG00000196743 GM2A GM2-AP|SAP-3 GM2 ganglioside activator protein-coding 167.25-39 chr14 53598778 53599144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 349523 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 204.5-66 chr2 74365278 74365645 + 0.75 NA intron (NM_004082, intron 25 of 31) intron (NM_004082, intron 25 of 31) 9274 NM_023019 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 167-63 chr2 121894570 121894910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139089 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 167.5-17 chr1 215792515 215792805 + 0.75 NA intron (NM_206933, intron 50 of 71) intron (NM_206933, intron 50 of 71) 225356 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 160.75-128 chr5 163965601 163965926 + 0.75 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 460144 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 161.5-152 chr5 29670992 29671406 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -209361 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 204.25-33 chr12 117700462 117700888 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) intron (NM_173598, intron 4 of 19) 268315 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 134.5-160 chr4 105722812 105723071 + 0.75 NA intron (NM_001370181, intron 3 of 11) intron (NM_001370181, intron 3 of 11) 12128 NM_001031720 79807 Hs.161429 NM_024751 ENSG00000138780 GSTCD - glutathione S-transferase C-terminal domain containing protein-coding 169.25-23 chr13 70078327 70078814 + 0.75 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR -28643 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 287.5-20 chr14 61732016 61732723 + 0.75 NA intron (NM_181054, intron 6 of 13) intron (NM_181054, intron 6 of 13) 16720 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 176.75-69 chr2 169161951 169162309 + 0.75 NA intron (NM_004525, intron 63 of 78) MIRb|SINE|MIR 81023 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 210-74 chr5 63289785 63290277 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 672261 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 128-141 chr6 130165096 130165310 + 0.75 NA intron (NM_001277185, intron 7 of 10) intron (NM_001277185, intron 7 of 10) 50682 NM_001277185 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 199-58 chr4 34373318 34373615 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103719 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 252.5-52 chr22 36118898 36119338 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 41637 NM_014349 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 195.25-38 chr16 51699284 51699719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63018 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 245-55 chr4 149436930 149437390 + 0.75 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) intron (NM_001363507, intron 12 of 13) 282865 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 194.25-66 chr20 53769358 53769694 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106183 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 124.25-141 chr3 143443463 143443793 + 0.75 NA intron (NM_173653, intron 12 of 15) intron (NM_173653, intron 12 of 15) 101382 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-156 chr5 77162657 77162900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17526 NM_001349752 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 125.25-39 chr11 97922328 97922611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1098480 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 128.75-43 chr12 51442783 51443037 + 0.75 NA intron (NM_001039960, intron 2 of 24) intron (NM_001039960, intron 2 of 24) 17793 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 168-96 chr5 20308609 20309108 + 0.75 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 3307 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 156.5-188 chr8 51373623 51373961 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 18 of 22) LTR80B|LTR|ERVL 435653 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 159.5-21 chr10 63874738 63875005 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -352981 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 226-45 chr3 174997386 174997865 + 0.75 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) AluSq|SINE|Alu 117617 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 190-54 chr4 116843396 116843757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 242000 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 113.75-131 chr3 123366867 123367177 + 0.75 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) intron (NM_183357, intron 1 of 20) 49320 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 127.5-56 chr12 33279704 33279917 + 0.75 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 160009 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 140.5-227 chr8 72438683 72439015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98376 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 112.5-145 chr20 31357983 31358270 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -10475 NM_054112 117285 Hs.274124 NM_054112 ENSG00000131068 DEFB118 C20orf63|DEFB-18|ESC42|ESP13.6 defensin beta 118 protein-coding 116.75-105 chr2 203639991 203640207 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -66376 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 131.5-32 chr11 58927292 58927595 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001220494) promoter-TSS (NM_001220494) -186 NM_001220494 92292 Hs.38085 NM_080661 ENSG00000166840 GLYATL1 GATF-C|GNAT glycine-N-acyltransferase like 1 protein-coding 112.25-159 chr5 9661613 9661925 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) intron (NR_027112, intron 9 of 12) -31418 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 173.25-20 chr11 38639068 38639501 + 0.75 NA intron (NR_120554, intron 1 of 4) L1MA3|LINE|L1 7072 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 139-104 chr4 111869594 111870010 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -275652 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 115.5-103 chr18 68039212 68039450 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -224509 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 175-61 chr2 28035046 28035499 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 6 of 13) intron (NM_199193, intron 6 of 13) 38905 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 150.75-84 chr18 2552610 2553037 + 0.75 NA intron (NM_022840, intron 4 of 8) intron (NM_022840, intron 4 of 8) 18682 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 161.25-35 chr12 28356144 28356652 + 0.75 NA intron (NM_001352084, intron 6 of 11) intron (NM_001352084, intron 6 of 11) -165660 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 129.25-12 chr1 213093410 213093643 + 0.75 NA intron (NM_001349671, intron 4 of 12) intron (NM_001349671, intron 4 of 12) 42285 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 125.75-3 chr1 57650328 57650647 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -210094 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 133.25-16 chr10 27612471 27612924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108393 NM_001256411 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 246-23 chr17 12319144 12319571 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -230611 NR_034144 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 132-134 chr5 21066593 21066865 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -392751 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 177.75-133 chr8 27145427 27145957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96729 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 161 chr1 72651125 72651458 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -368752 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 154-7 chr1 109187682 109188104 + 0.75 NA intron (NM_001284353, intron 1 of 14) intron (NM_001284353, intron 1 of 14) 1344 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 139.75-5 chr1 112657873 112658315 + 0.75 NA intron (NM_006135, intron 5 of 9) MIRc|SINE|MIR -16218 NM_020963 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 195.5-153 chr7 98416603 98416918 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15670 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 166.5-181 chr6 132664822 132665087 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -18928 NM_138327 134864 Hs.375030 NM_138327 ENSG00000146399 TAAR1 TA1|TAR1|TRAR1 trace amine associated receptor 1 protein-coding 115.5-185 chr4 46836792 46837075 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 72312 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 121.5-9 chr1 68881711 68881941 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -174072 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 135.5-65 chr15 66554571 66554948 + 0.75 NA intron (NM_001278562, intron 7 of 11) L1ME4b|LINE|L1 10738 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 175.75-37 chr14 38678965 38679250 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -203489 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 147-139 chr8 34876355 34876791 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92652 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 222-15 chr10 110855375 110855769 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 15332 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 142.5-80 chr16 61429401 61429906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -373887 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 120-74 chr17 61652013 61652229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60902 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 143.75-4 chr1 58525528 58525984 + 0.75 NA intron (NM_145243, intron 7 of 8) L1MEg|LINE|L1 20970 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 215-14 chr11 76558280 76558651 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 111473 NR_163259 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 162.75-70 chr2 97754903 97755382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20736 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 175.5-37 chr12 13804415 13804704 + 0.75 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 175797 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 114.25-125 chr3 54112215 54112558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10166 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 126.75-12 chr1 232689295 232689523 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28662 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 119-199 chr8 114128484 114128670 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -691638 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 136.25-168 chr6 68724728 68725002 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 89583 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 371-14 chr2 72597856 72598658 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MC2|LINE|L1 227776 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 143.25-85 chr2 58148777 58148992 + 0.75 NA intron (NM_001130482, intron 12 of 12) L1ME2|LINE|L1 92496 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 236.5-106 chr9 132213382 132213833 + 0.75 NA intron (NM_032536, intron 3 of 7) LTR85c|LTR|Gypsy? 51549 NM_032536 84628 Hs.163642 NM_032536 ENSG00000196358 NTNG2 LHLL9381|Lmnt2|NTNG1|bA479K20.1 netrin G2 protein-coding 153.25-130 chr8 80995272 80995642 + 0.75 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) intron (NM_018440, intron 3 of 8) 116611 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 164.5-60 chr14 68939361 68939658 + 0.75 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) intron (NM_001102, intron 1 of 20) 39793 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 126-84 chr19 41053367 41053659 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -34938 NM_000766 1553 Hs.567252 NM_000766 ENSG00000197838 CYP2A13 CPAD|CYP2A|CYPIIA13 cytochrome P450 family 2 subfamily A member 13 protein-coding 205.25-69 chr3 100222682 100223159 + 0.75 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 37096 NR_028357 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 161.5-82 chr18 13096379 13096762 + 0.75 NA intron (NM_032142, intron 36 of 44) intron (NM_032142, intron 36 of 44) 105208 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 210.75-85 chr5 164513508 164514052 + 0.75 NA intron (NR_105065, intron 2 of 3) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43501 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 128-32 chr12 61497616 61497925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 695069 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 163.75-60 chr19 52526842 52527212 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001039886) promoter-TSS (NM_001039886) -629 NM_001321425 388558 Hs.729294 NM_001039886 ENSG00000198482 ZNF808 - zinc finger protein 808 protein-coding 212.25-81 chr6 113434580 113434935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1310 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 198-33 chr17 76601542 76601991 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -15906 NM_006456 10610 Hs.592105 NM_006456 ENSG00000070731 ST6GALNAC2 SAITL1|SIAT7|SIAT7B|SIATL1|ST6GalNAII|STHM ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 260.75-9 chr12 115502937 115503620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 645376 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 129.75-94 chr2 102101899 102102184 + 0.75 NA intron (NM_001320978, intron 1 of 11) intron (NM_001320978, intron 1 of 11) -2563 NM_001320980 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 196.5-135 chr5 150350139 150350533 + 0.75 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie -7303 NM_001135243 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 146.5-147 chr4 16049045 16049381 + 0.75 NA intron (NM_001371408, intron 2 of 24) intron (NM_001371408, intron 2 of 24) 26905 NM_001145851 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 130.5-224 chr7 40375194 40375489 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 240365 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 121-114 chr20 41755686 41755983 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -137457 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 121.75-33 chr12 67082110 67082278 + 0.75 NA intron (NR_120490, intron 3 of 3) intron (NR_120490, intron 3 of 3) 14090 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 149.5-64 chr15 65154194 65154467 + 0.75 NA intron (NM_006660, intron 11 of 13) intron (NM_006660, intron 11 of 13) -20522 NM_005707 10081 Hs.458596 NM_005707 ENSG00000090470 PDCD7 ES18|HES18 programmed cell death 7 protein-coding 116.5-58 chr13 87475815 87475995 + 0.75 NA intron (NR_033829, intron 2 of 5) L1MB4|LINE|L1 142835 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 279.75-3 chr1 238520019 238520531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34258 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 192.75-98 chr4 78370610 78371093 + 0.75 NA intron (NM_001166133, intron 23 of 41) intron (NM_001166133, intron 23 of 41) 81866 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 152-121 chr5 11143561 11143967 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 11 of 20) intron (NM_001288715, intron 11 of 20) -382530 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 158-98 chr3 74709407 74709807 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188467 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 177.5-61 chr17 70660712 70661079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 491360 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 222.5-22 chr11 17809982 17810338 + 0.75 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 74212 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 113-146 chr5 54711566 54711824 + 0.75 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -8371 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 124.5-218 chr8 70383149 70383362 + 0.75 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) intron (NM_001321703, intron 1 of 22) 20135 NM_001321707 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 157.75-120 chr4 62176615 62177002 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -15043 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-183 chr6 25228627 25228804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32692 NR_110863 101928663 Hs.561600 NR_110862 LOC101928663 - uncharacterized LOC101928663 ncRNA 155.75-162 chr8 111433180 111433464 + 0.75 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) L1PA15|LINE|L1 56683 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 227-71 chr9 104671012 104671431 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -23201 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 118.5-80 chr19 12481177 12481488 + 0.75 NA intron (NM_152601, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 3484 NM_152601 163051 Hs.631623 NM_152601 ENSG00000242852 ZNF709 - zinc finger protein 709 protein-coding 203.5-97 chr3 167922302 167922669 + 0.75 NA non-coding (NR_033843, exon 8 of 8) non-coding (NR_033843, exon 8 of 8) 26537 NR_145443 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 118.25-80 chr16 84380115 84380514 + 0.75 NA intron (NM_014861, intron 1 of 26) intron (NM_014861, intron 1 of 26) 11791 NM_001286527 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 131-178 chr8 123748518 123748824 + 0.75 NA Intergenic (TAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -11278 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 168.25-73 chr2 74322374 74322669 + 0.75 NA intron (NM_133478, intron 5 of 30) L1ME3Cz|LINE|L1 -7496 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 130-120 chr4 147740132 147740372 + 0.75 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) AluSx|SINE|Alu 8164 NM_024605 79658 Hs.368631 NM_024605 ENSG00000071205 ARHGAP10 GRAF2|PS-GAP|PSGAP Rho GTPase activating protein 10 protein-coding 351.75-20 chr5 110580256 110581102 + 0.75 NA intron (NM_001039763, intron 10 of 13) L1MB1|LINE|L1 -66764 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 133-156 chr7 53943729 53943934 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -131900 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 117-58 chr14 67011992 67012175 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -177357 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 156.25-154 chr9 27679710 27680212 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -106095 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 132.5-204 chr5 164267424 164267639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199871 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 169-8 chr10 27429263 27429565 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -15046 NM_001034842 374308 Hs.631832 NM_001034842 ENSG00000182077 PTCHD3 PTR patched domain containing 3 protein-coding 117.75-143 chr3 178429972 178430153 + 0.75 NA intron (NR_046786, intron 1 of 2) intron (NR_046786, intron 1 of 2) 10861 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 127-79 chr17 30290222 30290488 + 0.75 NA intron (NM_000386, intron 2 of 11) intron (NM_000386, intron 2 of 11) 1589 NM_000386 642 Hs.371914 NM_000386 ENSG00000108578 BLMH BH|BMH bleomycin hydrolase protein-coding 155-137 chr8 48928427 48928692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7130 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 149.25-98 chr20 34341536 34341785 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -21613 NM_031483 83737 Hs.632272 NM_031483 ENSG00000078747 ITCH ADMFD|AIF4|AIP4|NAPP1 itchy E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 134-117 chr3 98172792 98173135 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 4263 NM_001005515 403274 Hs.554713 NM_001005515 ENSG00000233412 OR5H15 - olfactory receptor family 5 subfamily H member 15 protein-coding 216.75-43 chr2 167380031 167380515 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 192901 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 123.5-84 chr18 10010298 10010601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96433 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 127.25-163 chr5 32485534 32485796 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -40925 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 182.75-13 chr1 185151349 185151643 + 0.75 NA intron (NM_030934, intron 2 of 14) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 5457 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 189.5-54 chr16 72786509 72786852 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006885, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_006885, exon 10 of 10) -121710 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 191.75-133 chr9 88520851 88521281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14035 NM_001161625 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 235-42 chr3 23673291 23673718 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -132451 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 177.75-22 chr11 35741445 35741737 + 0.75 NA intron (NM_017583, intron 4 of 4) intron (NM_017583, intron 4 of 4) 78816 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 281-8 chr12 65931821 65932390 + 0.75 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -49780 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 219.25-4 chr1 74000149 74000661 + 0.75 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 197771 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 168.5-25 chr10 25895133 25895578 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 38355 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 177.25-140 chr8 86647646 86647984 + 0.75 NA exon (NM_019098, exon 8 of 18) exon (NM_019098, exon 8 of 18) 95860 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 186.5-110 chr5 134959457 134959834 + 0.75 NA intron (NM_032151, intron 3 of 3) intron (NM_032151, intron 3 of 3) -8262 NM_178019 347732 Hs.631804 NM_178019 ENSG00000152705 CATSPER3 CACRC cation channel sperm associated 3 protein-coding 271.5-93 chr8 139820271 139821011 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) L1ME3G|LINE|L1 -117518 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 154.5-108 chr2 160653772 160654024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160091 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 150.75-141 chr4 58108981 58109305 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 427185 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 120-116 chr3 42394256 42394555 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 16205 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 125.25-125 chr21 15971718 15971926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98666 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 164.5-48 chr13 86521098 86521398 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -390672 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 196-80 chr5 123348227 123348678 + 0.75 NA intron (NM_153223, intron 20 of 20) L2c|LINE|L2 75140 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 218.25-18 chr11 50213946 50214454 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84262 NR_003034 441601 Hs.144683 NR_003034 ENSG00000255042 LOC441601 - septin 7 pseudogene pseudo 130.5-122 chr19 29550733 29551100 + 0.75 NA intron (NM_001146339, intron 4 of 4) intron (NM_001146339, intron 4 of 4) 24332 NM_001146339 342865 Hs.451618 NM_001146339 ENSG00000187135 VSTM2B - V-set and transmembrane domain containing 2B protein-coding 219.25-14 chr10 47013525 47013896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101988 NM_001320683 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 136.25-19 chr10 77229308 77229561 + 0.75 NA intron (NM_001322838, intron 3 of 29) intron (NM_001322838, intron 3 of 29) 88603 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 129.5-98 chr17 75215711 75216038 + 0.75 NA intron (NM_001303276, intron 5 of 17) intron (NM_001303276, intron 5 of 17) 10195 NM_024844 79902 Hs.362817 NM_024844 ENSG00000125450 NUP85 FROUNT|NPHS17|Nup75 nucleoporin 85 protein-coding 158.5-166 chr6 50617782 50618039 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -95634 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 151.5-131 chr3 139266648 139266949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33276 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 193.25-99 chr6 27897742 27898053 + 0.75 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 4472 NM_003527 8348 Hs.484991 NM_003527 ENSG00000274641 HIST1H2BO H2B.2|H2B/n|H2BFN|dJ193B12.2 histone cluster 1 H2B family member o protein-coding 144.25-171 chr6 79898667 79899073 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 48683 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 158.5-67 chr14 72565925 72566365 + 0.75 NA non-coding (NR_135235, exon 19 of 19) non-coding (NR_135235, exon 19 of 19) 49325 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 160.5-166 chr7 727897 728385 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001164759) promoter-TSS (NM_001164759) -465 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 146.75-43 chr14 62745710 62745926 + 0.75 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) LTR79|LTR|ERVL 299640 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 117-153 chr5 159600191 159600436 + 0.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -134037 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 208.25-85 chr7 99120364 99120684 + 0.75 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) intron (NM_020429, intron 1 of 18) 23584 NM_020429 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 125-111 chr4 45753013 45753304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 370896 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 142.25-14 chr10 13562887 13563194 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -23925 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 178.25-73 chr20 23390169 23390480 + 0.75 NA intron (NM_001283026, intron 4 of 9) intron (NM_001283026, intron 4 of 9) 25961 NM_001317019 64412 Hs.709462 NM_022482 ENSG00000125812 GZF1 JLSM|ZBTB23|ZNF336 GDNF inducible zinc finger protein 1 protein-coding 181-67 chr3 8145297 8145678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129180 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 139.5-44 chr12 40941401 40941682 + 0.75 NA intron (NM_001256064, intron 12 of 15) intron (NM_001256064, intron 12 of 15) 33184 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 177-27 chr13 64889570 64890055 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -813801 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 152.75-125 chr4 141720360 141720747 + 0.75 NA exon (NM_000585, exon 4 of 8) exon (NM_000585, exon 4 of 8) 83970 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 119-83 chr2 59349216 59349461 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 131630 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 157.25-88 chr20 55473270 55473540 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46208 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 123.25-12 chr1 183193124 183193308 + 0.75 NA intron (NM_005562, intron 1 of 22) intron (NM_005562, intron 1 of 22) 6952 NM_005562 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 117.5 chr1 35749521 35749793 + 0.75 NA exon (NM_022111, exon 11 of 25) exon (NM_022111, exon 11 of 25) 20321 NM_022111 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 115.75-54 chr13 86732199 86732417 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -179612 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 132.75-3 chr1 12650300 12650514 + 0.75 NA intron (NM_001013630, intron 1 of 3) MER117|DNA|hAT-Charlie 5860 NM_001013630 343066 Hs.209954 NM_001013630 ENSG00000204518 AADACL4 - arylacetamide deacetylase like 4 protein-coding 181.25-15 chr10 99500441 99500869 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 30522 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 247.75-19 chr15 58725738 58726283 + 0.75 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) L1MEc|LINE|L1 23697 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 163-64 chr21 19041047 19041322 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -281372 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 154-51 chr17 59801435 59801704 + 0.75 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -39697 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 118.75-14 chr1 221588072 221588288 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 148720 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 129.5-25 chr10 85971252 85971468 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) L1ME3|LINE|L1 293428 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 173.5-128 chr5 65785210 65785475 + 0.75 NA intron (NM_020726, intron 6 of 12) L1MB3|LINE|L1 63137 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 130.5-245 chr8 115660993 115661215 + 0.75 NA intron (NM_014112, intron 1 of 6) intron (NM_014112, intron 1 of 6) 6909 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 125-105 chr3 152585463 152585776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -244629 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 163-60 chr2 129622233 129622655 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 255047 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 135.25-190 chr7 51992839 51993270 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -599798 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 136.75-145 chr4 65504742 65504995 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 164620 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 122.5-73 chr15 62968949 62969251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73647 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 224.25-82 chr6 34434236 34434630 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8308 NM_001202470 100529239 Hs.188882 NM_001202470 ENSG00000270800 RPS10-NUDT3 - RPS10-NUDT3 readthrough protein-coding 251.25-34 chr3 120293378 120293876 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -49332 NM_153002 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 157-13 chr10 124298804 124299083 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119980 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 114-56 chr16 89221890 89222048 + 0.75 NA intron (NR_037705, intron 2 of 5) intron (NR_037705, intron 2 of 5) 4266 NM_001201407 197320 Hs.647385 NM_182531 ENSG00000170100 ZNF778 - zinc finger protein 778 protein-coding 205.5-123 chr6 34721922 34722446 + 0.75 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 25239 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 160.5-46 chr13 91617480 91617815 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) (TCCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 219026 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 118-32 chr11 96713482 96713676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 205154 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 196-15 chr11 72757171 72757619 + 0.75 NA intron (NM_006645, intron 5 of 6) intron (NM_006645, intron 5 of 6) -5006 NM_001040118 116985 Hs.503165 NM_015242 ENSG00000186635 ARAP1 CENTD2 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 216.25-59 chr20 51715199 51715538 + 0.75 NA intron (NM_006045, intron 3 of 27) intron (NM_006045, intron 3 of 27) 53022 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 130.75-118 chr3 106770303 106770532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 470221 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 185.5-90 chr2 226260997 226261271 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 118340 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 159.75-165 chr7 111124105 111124504 + 0.75 NA exon (NM_001099660, exon 4 of 4) exon (NM_001099660, exon 4 of 4) 33177 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 208.75-47 chr20 44183897 44184237 + 0.75 NA intron (NM_175913, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 3121 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 171.5-75 chr2 58717756 58718160 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 197205 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 167.75-133 chr7 49951585 49951978 + 0.75 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1MB5|LINE|L1 141465 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 186-78 chr6 102602502 102602888 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1203710 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 195.5-142 chr7 4543354 4543669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138784 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 199.25-5 chr10 25255321 25255617 + 0.75 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -79193 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 229-60 chr4 143609801 143610198 + 0.75 NA intron (NM_001168235, intron 6 of 7) intron (NM_001168235, intron 6 of 7) 50527 NR_003675 441046 Hs.135705 NM_001011539 ENSG00000236296 GUSBP5 GYPELOC441046 GUSB pseudogene 5 pseudo 246.75-53 chr5 87022833 87023326 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 91875 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 159.75-183 chr9 85594762 85595010 + 0.75 NA intron (NM_015239, intron 18 of 25) intron (NM_015239, intron 18 of 25) 147143 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 167-29 chr11 78762623 78763030 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 18 of 33) intron (NM_001098816, intron 18 of 33) -187962 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 122.75-130 chr3 112390745 112391076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57754 NM_005944 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 140.75-125 chr3 172906273 172906504 + 0.75 NA intron (NM_031955, intron 10 of 10) intron (NM_031955, intron 10 of 10) 155386 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 117.25-79 chr15 37705513 37705788 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -228957 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 142.25-177 chr9 88575457 88575803 + 0.75 NA 3' UTR (NM_145283, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_145283, exon 3 of 3) 40452 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 199.5-77 chr2 69258731 69259178 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 128273 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 187.75-57 chr2 209365704 209366154 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -58118 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 149.25-154 chr6 41232982 41233339 + 0.75 NA intron (NM_198153, intron 4 of 5) L1MEh|LINE|L1 4811 NM_198153 285852 Hs.434181 NM_198153 ENSG00000188056 TREML4 TLT-4|TLT4 triggering receptor expressed on myeloid cells like 4 protein-coding 156.75-123 chr4 70855092 70855420 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -15366 NM_002092 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 160.25-123 chr5 30104706 30104991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 224288 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 125.25-86 chr18 7663001 7663257 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 95813 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 189.5-66 chr2 43497587 43497896 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 25 of 37) AluSx4|SINE|Alu 98233 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 151.5-148 chr5 27588266 27588599 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 116140 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 124.75-128 chr20 3385267 3385528 + 0.75 NA intron (NM_001009984, intron 1 of 36) L1MD|LINE|L1 22265 NM_001009984 25943 Hs.516853 NM_001009984 ENSG00000088854 C20orf194 - chromosome 20 open reading frame 194 protein-coding 177-20 chr11 103647700 103647963 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -202075 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 115.75-208 chr8 57412757 57412943 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 69063 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 142.25-58 chr14 71456763 71457128 + 0.75 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) intron (NM_001284247, intron 1 of 23) 18006 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 162.25-75 chr2 43614079 43614436 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18211 NM_001345925 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 167.25-163 chrX 147314561 147314884 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -29994 NR_030240 574518 NR_030240 ENSG00000207867 MIR514A3 MIR514-3|MIRN514-3|hsa-mir-514a-3 microRNA 514a-3 ncRNA 163.75-131 chr8 139621795 139622089 + 0.75 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 81181 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 150.75-40 chr11 87378690 87378907 + 0.75 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 340613 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 139.25-66 chr17 48885898 48886118 + 0.75 NA intron (NR_135674, intron 2 of 3) intron (NR_135674, intron 2 of 3) -6779 NM_001002027 516 Hs.80986 NM_005175 ENSG00000159199 ATP5MC1 ATP5A|ATP5G|ATP5G1 ATP synthase membrane subunit c locus 1 protein-coding 160.5-88 chr2 73376089 73376373 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -9527 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 116.25-21 chr10 78885707 78885968 + 0.75 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 181611 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 120.25-115 chr20 57013379 57013593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -200210 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 256-34 chr2 174436235 174436690 + 0.75 NA intron (NM_001267051, intron 14 of 14) intron (NM_001267051, intron 14 of 14) 40732 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 132-12 chr10 11948688 11949029 + 0.75 NA intron (NM_080599, intron 15 of 21) intron (NM_080599, intron 15 of 21) -54148 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 134.25-70 chr18 71103511 71103757 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -452680 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 193-12 chr10 109249823 109250257 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 673206 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 113-100 chr2 229533994 229534181 + 0.75 NA intron (NM_139072, intron 5 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 180468 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 170.5-146 chr5 81510743 81511129 + 0.75 NA intron (NM_001256734, intron 4 of 15) L2c|LINE|L2 -116802 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 162.25-74 chr2 26102896 26103153 + 0.75 NA intron (NM_016131, intron 2 of 5) intron (NM_016131, intron 2 of 5) 68940 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 152.25-63 chr16 81995956 81996239 + 0.75 NA 3' UTR (NM_145168, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_145168, exon 3 of 3) 15373 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 169.75-125 chr5 67777937 67778251 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -15119 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 145.25-182 chr9 32705045 32705517 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69612 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 219-45 chr17 72979153 72979586 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 113319 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 167.5-170 chr6 140213604 140213889 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 8494 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 141.25-169 chr7 31482263 31482493 + 0.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -31693 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 196.5-79 chr2 30096592 30096882 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -50270 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 129-140 chr5 37076466 37076731 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -172448 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 124.5-114 chr2 196891830 196892002 + 0.75 NA intron (NM_001321100, intron 8 of 25) L1MC5|LINE|L1 34791 NM_001321100 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 166-56 chr19 36061330 36061611 + 0.75 NA intron (NM_001083961, intron 3 of 31) intron (NM_001083961, intron 3 of 31) 6573 NM_173636 284403 Hs.116244 NM_173636 ENSG00000075702 WDR62 C19orf14|MCPH2 WD repeat domain 62 protein-coding 228-15 chr11 86017974 86018508 + 0.75 NA intron (NM_001008660, intron 4 of 19) intron (NM_001008660, intron 4 of 19) 50843 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 275.5-11 chr11 36603229 36603687 + 0.75 NA intron (NM_001276724, intron 1 of 5) intron (NM_001276724, intron 1 of 5) -5179 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 145.75-149 chr7 28639144 28639422 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -46850 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 131-28 chr11 25101782 25101977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 604826 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 162.75-46 chr16 60423899 60424279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64296 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 139.25-7 chr1 107460527 107460918 + 0.75 NA intron (NM_001113226, intron 6 of 6) intron (NM_001113226, intron 6 of 6) 227777 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 152.75-151 chr8 100717610 100717863 + 0.75 NA intron (NM_002568, intron 3 of 14) intron (NM_002568, intron 3 of 14) 4352 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 197.5-162 chr8 119188609 119188984 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -19567 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 165.5-67 chr18 1907358 1907696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -547898 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 117.75-21 chr10 13759891 13760145 + 0.75 NA intron (NM_001318336, intron 7 of 23) MER58B|DNA|hAT-Charlie -52451 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 135.25-72 chr16 56902008 56902319 + 0.75 NA intron (NM_001126108, intron 23 of 25) intron (NM_001126108, intron 23 of 25) -2101 NR_106923 102466752 NR_106923 ENSG00000283471 MIR6863 hsa-mir-6863 microRNA 6863 ncRNA 132.25-76 chr17 59755774 59756212 + 0.75 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) AluJo|SINE|Alu 48339 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 139.25-150 chr5 57036168 57036518 + 0.75 NA Intergenic MER96|DNA|hAT-Tip100 -84213 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 211 chr1 9273364 9273698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19363 NM_025106 80176 Hs.8261 NM_025106 ENSG00000171621 SPSB1 SSB-1|SSB1 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 protein-coding 149-105 chr5 123527833 123528088 + 0.75 NA intron (NM_001364148, intron 1 of 8) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 15783 NM_001364140 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 161.25-50 chr14 57293096 57293536 + 0.75 NA non-coding (NR_026895, exon 7 of 7) non-coding (NR_026895, exon 7 of 7) 24345 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 189.75-74 chr3 101724453 101724793 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001303401) promoter-TSS (NM_001303401) 9 NM_024548 79598 Hs.444135 NM_024548 ENSG00000182504 CEP97 2810403B08Rik|LRRIQ2 centrosomal protein 97 protein-coding 191.25-83 chr5 10076889 10077297 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172795 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 139-62 chr19 36043912 36044289 + 0.75 NA intron (NM_001331104, intron 1 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 10185 NM_152658 199745 Hs.350209 NM_152658 ENSG00000161277 THAP8 - THAP domain containing 8 protein-coding 280.5-8 chr10 70128157 70128804 + 0.75 NA intron (NM_001198696, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 4345 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 177.5-25 chr11 76988418 76988914 + 0.75 NA intron (NM_001300953, intron 4 of 9) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -45732 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 205.5-107 chr4 71210496 71211072 + 0.75 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 23498 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 245-8 chr10 113085287 113085939 + 0.75 NA intron (NM_001198528, intron 4 of 14) intron (NM_001198528, intron 4 of 14) 40258 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 114.25-35 chr11 128974049 128974247 + 0.75 NA exon (NM_014715, exon 11 of 13) exon (NM_014715, exon 11 of 13) -30749 NM_001195195 63970 Hs.160953 NM_022112 ENSG00000120471 TP53AIP1 P53AIP1 tumor protein p53 regulated apoptosis inducing protein 1 protein-coding 187.75-16 chr11 32645611 32645976 + 0.75 NA intron (NM_001008391, intron 12 of 17) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 61962 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 157.5-14 chr1 166580996 166581246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22795 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 170.75-117 chr6 74430693 74431189 + 0.75 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 361490 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 160-97 chr6 76000114 76000459 + 0.75 NA intron (NM_001563, intron 12 of 16) L1MB5|LINE|L1 72376 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 142-102 chr3 23494842 23495166 + 0.75 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 291677 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 123.75-38 chr12 28651558 28651745 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -460913 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 196-2 chr1 35322536 35322854 + 0.75 NA intron (NM_001350140, intron 2 of 27) AluSx3|SINE|Alu 43382 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-41 chr11 92289646 92290001 + 0.75 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 -62273 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 164.25-75 chr2 166052258 166052648 + 0.75 NA intron (NR_148667, intron 7 of 28) intron (NR_148667, intron 7 of 28) -29078 NR_110260 101929680 Hs.662210 NR_110260 ENSG00000236107 SCN1A-AS1 - SCN1A and SCN9A antisense RNA 1 ncRNA 163.25-93 chr3 44261205 44261449 + 0.75 NA intron (NM_001145030, intron 4 of 19) L1PREC2|LINE|L1 19441 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 174 chr1 61889726 61890104 + 0.75 NA intron (NM_001350145, intron 22 of 43) intron (NM_001350145, intron 22 of 43) 43840 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 241.75-38 chr2 34564272 34564698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113072 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 120.5-150 chr3 169026182 169026502 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119181 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 141.5-58 chr14 73929373 73929617 + 0.75 NA intron (NM_001242928, intron 12 of 12) intron (NM_001242928, intron 12 of 12) -20439 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 192.25-67 chr20 50314740 50315215 + 0.75 NA TTS (NR_034124) TTS (NR_034124) 6365 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 249.5-48 chr2 70268747 70269186 + 0.75 NA intron (NM_016297, intron 3 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 10829 NM_016297 51449 Hs.567502 NM_016297 ENSG00000116005 PCYOX1 PCL1 prenylcysteine oxidase 1 protein-coding 213.75-95 chr6 42084775 42085257 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34492 NM_138572 129685 Hs.520122 NM_138572 ENSG00000137413 TAF8 II|TAF|TAF(II)43|TAFII-43|TAFII43|TBN TATA-box binding protein associated factor 8 protein-coding 136.25-205 chrX 87657877 87658254 + 0.75 NA intron (NM_057162, intron 9 of 10) L1PB4|LINE|L1 140263 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 178.5-192 chr9 124774060 124774511 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2848 NM_182487 169611 Hs.357004 NM_182487 ENSG00000185585 OLFML2A PRO34319 olfactomedin like 2A protein-coding 153-71 chr2 62951123 62951471 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 13 of 22) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 96414 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 178.5-85 chr2 157151412 157151703 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106148 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 185.5-101 chr3 57294397 57294778 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 73 of 73) intron (NM_001366028, intron 73 of 73) -1902 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 149.25-198 chrX 96370591 96370978 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32882 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 278.75-34 chr6 17462662 17463254 + 0.75 NA intron (NM_001363534, intron 3 of 11) intron (NM_001363534, intron 3 of 11) 48307 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 184-74 chr5 104587561 104587907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -511740 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 156.25-163 chrX 75042503 75042841 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 113611 NM_001271696 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 121-65 chr14 69193674 69194018 + 0.75 NA intron (NM_001193363, intron 1 of 8) MER20|DNA|hAT-Charlie 2080 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 226-26 chr16 73296711 73297286 + 0.75 NA Intergenic AluYf1|SINE|Alu -89807 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 207 chr1 69409744 69410181 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -23293 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 333.25-2 chr1 166537535 166538193 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -47825 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 162.5-48 chr14 46356430 46356695 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -114797 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 136.75-46 chr12 28973906 28974264 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175193 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 128-179 chr9 115922175 115922562 + 0.75 NA intron (NR_024032, intron 1 of 2) intron (NR_024032, intron 1 of 2) 2839 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 207.5-47 chr19 56261949 56262358 + 0.75 NA intron (NM_001322061, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu -10595 NM_001354658 100506374 Hs.631532 NM_001354658 ENSG00000267710 EDDM13 - epididymal protein 13 protein-coding 128.5-63 chr14 73437898 73438134 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 20564 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 138.75-194 chr8 87800224 87800610 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 73598 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 213.75-40 chr16 68729473 68729825 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7643 NM_001317184 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 145.5-48 chr12 63372054 63372345 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -219389 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 162-11 chr10 23715794 23716075 + 0.75 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 21207 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 117.25-110 chr2 72589054 72589338 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 236837 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 169.25-18 chr12 59126447 59126793 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -206082 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 190-13 chr12 60140193 60140648 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 451050 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 147-109 chr5 62613324 62613642 + 0.75 NA intron (NM_016338, intron 29 of 29) AluJr|SINE|Alu 34664 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 167.75-72 chr2 67078705 67079036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7576 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 116-89 chr2 158263560 158263791 + 0.75 NA intron (NM_138803, intron 9 of 13) intron (NM_138803, intron 9 of 13) 97025 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-205 chr8 136995274 136995656 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 418123 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 199.5-59 chr17 51034589 51034984 + 0.75 NA intron (NM_001130528, intron 5 of 29) L1MC4a|LINE|L1 12092 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 135.75-138 chr3 63003173 63003526 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -99339 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 141.5-112 chr2 164765808 164766222 + 0.75 NA intron (NM_001365670, intron 2 of 13) L1MB8|LINE|L1 -74734 NR_110574 101929633 Hs.570267 NR_110574 LOC101929633 - uncharacterized LOC101929633 ncRNA 172.25-56 chr18 53733784 53734072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152869 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 212.25-99 chr8 116693125 116693567 + 0.75 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 41246 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 189.75-44 chr15 94835259 94835719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19874 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 189.75-60 chr2 106077568 106077888 + 0.75 NA intron (NM_032411, intron 3 of 3) intron (NM_032411, intron 3 of 3) 12040 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 175.75-63 chr2 16207990 16208285 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 157710 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 150.25-44 chr13 20837978 20838308 + 0.75 NA intron (NM_022459, intron 6 of 22) intron (NM_022459, intron 6 of 22) -64182 NM_001318939 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 252.75-7 chr10 110629777 110630211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14342 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 191.5-8 chr1 97098834 97099181 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) intron (NM_000110, intron 20 of 22) 3084 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 165-65 chr2 62673301 62673636 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001142615) promoter-TSS (NM_001142615) -410 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 174.25-114 chr4 88675153 88675460 + 0.75 NA intron (NM_001271602, intron 15 of 24) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 22523 NM_153757 266812 Hs.12554 NM_153757 ENSG00000177432 NAP1L5 DRLM nucleosome assembly protein 1 like 5 protein-coding 229.5-115 chr6 96671409 96671915 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 108537 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 132-111 chr3 50057200 50057424 + 0.75 NA intron (NM_001349194, intron 5 of 17) AluSq2|SINE|Alu -31607 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 302-28 chr7 21733135 21733711 + 0.75 NA intron (NM_001277115, intron 45 of 81) intron (NM_001277115, intron 45 of 81) 190384 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 136.5-178 chr5 65513497 65513734 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -31695 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 115.75-127 chr20 47814840 47815011 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28309 NM_198596 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 199-38 chr2 102931839 102932303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36349 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 118.75-122 chr3 3438434 3438764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -258882 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 144.25-32 chr10 89567797 89568070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24894 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 162.25-16 chr10 25598564 25598916 + 0.75 NA exon (NM_020752, exon 11 of 11) exon (NM_020752, exon 11 of 11) -52972 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 162-38 chr14 61990665 61991046 + 0.75 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) intron (NM_001367657, intron 3 of 6) 63160 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 152.75-102 chr22 32633225 32633665 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) 158208 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 176.75-135 chr9 88895923 88896254 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -94775 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 132.75-45 chr12 1896906 1897248 + 0.75 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 AluJr|SINE|Alu 21575 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 119.75-8 chr1 97777126 97777427 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) -19645 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 159-36 chr15 70351322 70351803 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 154366 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 132.5-92 chr17 61329675 61329979 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 37877 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 150.75-163 chr6 166100935 166101217 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 3356 NR_147704 729681 Hs.520550 NR_147704 LOC729681 - uncharacterized LOC729681 ncRNA 154.25-131 chr5 62020913 62021253 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -285079 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 157.5-152 chr4 120596736 120596949 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 326024 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 153.25-111 chr6 68183803 68184044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128572 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 189.75-22 chr12 77713973 77714245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116785 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 128.5-241 chr9 121121022 121121258 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001369892) promoter-TSS (NM_001369892) -630 NR_163191 11064 Hs.653263 NM_007018 ENSG00000119397 CNTRL CEP1|CEP110|FAN|bA165P4.1 centriolin protein-coding 148-122 chr7 46119216 46119426 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -198049 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 120.25-101 chr2 128526981 128527339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -208292 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 189.25-95 chr5 24068146 24068520 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 116985 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 207.75-113 chr6 123368216 123368742 + 0.75 NA intron (NM_001251987, intron 19 of 20) MER5B|DNA|hAT-Charlie -71125 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 251.25-17 chr14 66824356 66824969 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 317255 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 144.75-145 chr6 39400242 39400440 + 0.75 NA intron (NM_001289024, intron 2 of 9) intron (NM_001289024, intron 2 of 9) 31049 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 132.25-135 chr3 163976729 163976948 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 194718 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 141.5-86 chr19 7159186 7159488 + 0.75 NA intron (NM_001079817, intron 9 of 20) L1MB3|LINE|L1 89634 NM_001044388 79230 Hs.591380 NM_024341 ENSG00000130544 ZNF557 - zinc finger protein 557 protein-coding 134-91 chr2 84004940 84005279 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -285573 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 117.75-113 chr2 155229717 155229950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 531138 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 181.25-43 chr17 29711331 29711831 + 0.75 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) intron (NM_033389, intron 2 of 14) 49851 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 115.5-42 chr12 88472358 88472619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 107983 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 121.75-111 chr22 29848249 29848474 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10087 NM_001369933 84164 Hs.731754 NM_032204 ENSG00000100325 ASCC2 ASC1p100|p100 activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 protein-coding 143.75-69 chr17 61781176 61781385 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 11 of 19) MIR3|SINE|MIR 82279 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 155-154 chr9 113674487 113674786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80507 NM_001276262 5998 Hs.494875 NM_017790 ENSG00000138835 RGS3 C2PA|RGP3 regulator of G protein signaling 3 protein-coding 221.5-58 chr20 56638010 56638407 + 0.75 NA 3' UTR (NM_003222, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_003222, exon 7 of 7) 8902 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 182.5-140 chr6 63749984 63750233 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 41 of 43) L1M3d|LINE|L1 -56728 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 225.25-65 chr5 125472737 125473073 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -20356 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 152.25-174 chrX 53252637 53252941 + 0.75 NA intron (NM_001111125, intron 4 of 14) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -27367 NM_001353984 8242 Hs.631768 NM_004187 ENSG00000126012 KDM5C DXS1272E|JARID1C|MRX13|MRXJ|MRXSCJ|MRXSJ|SMCX|XE169 lysine demethylase 5C protein-coding 137.75-114 chr20 11056762 11056980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30327 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 127.25-100 chr2 210370377 210370734 + 0.75 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) L1M2|LINE|L1 45843 NR_110604 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 138-145 chr6 125461235 125461470 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -159385 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 118.25-26 chr10 14267371 14267657 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 63370 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 263.25-48 chr5 104325334 104325925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -762840 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 192-83 chr5 6229345 6229658 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 107791 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 130.75-5 chr1 56739367 56739687 + 0.75 NA intron (NM_001004303, intron 13 of 19) intron (NM_001004303, intron 13 of 19) 79877 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 130.75-58 chr14 68262625 68262923 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 366013 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 128.25-101 chr2 138177921 138178126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76139 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 114.75-120 chr3 33600419 33600614 + 0.75 NA intron (NM_001365632, intron 18 of 37) L1M4|LINE|L1 59163 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 187.25-111 chr8 129951745 129952040 + 0.75 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 -12081 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 190-82 chr8 129528727 129529146 + 0.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -44794 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 263.75-50 chr8 78167635 78168097 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -348474 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 150.5-16 chr10 36241271 36241515 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 463091 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 196.5-153 chr7 21357224 21357668 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -70637 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 185.5-138 chr5 176852712 176853175 + 0.75 NA intron (NM_133369, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 42384 NM_133369 90249 Hs.33191 NM_133369 ENSG00000113763 UNC5A UNC5H1 unc-5 netrin receptor A protein-coding 199.25-10 chr10 75819327 75819673 + 0.75 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 36739 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 117.25-94 chr17 77946907 77947181 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57193 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 152.25-171 chr9 134238514 134238771 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 56755 NR_146518 105376310 Hs.573484 NR_146518 ENSG00000223729 LINC02247 - long intergenic non-protein coding RNA 2247 ncRNA 167.5-67 chr15 66511326 66511656 + 0.75 NA intron (NM_001287822, intron 2 of 17) AluJb|SINE|Alu 6165 NM_001287821 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 125.5-217 chr6 38388587 38388828 + 0.75 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) intron (NM_052893, intron 7 of 11) -92889 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 134.5-232 chr8 125309558 125309818 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) AluJo|SINE|Alu -120670 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 124.75-209 chr8 136351944 136352270 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -178691 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 159.25-99 chr4 38203719 38204030 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 83920 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 127-16 chr10 59690010 59690280 + 0.75 NA intron (NM_194298, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 19746 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 140.25-187 chr8 102339792 102340028 + 0.75 NA intron (NM_001282873, intron 9 of 58) intron (NM_001282873, intron 9 of 58) 72779 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 133.5-207 chr5 57709068 57709428 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 58588 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 181.5-139 chr6 7919887 7920361 + 0.75 NA intron (NR_037616, intron 4 of 12) L2a|LINE|L2 -9336 NM_030810 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 123.5-57 chr14 34650916 34651109 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -20864 NM_152233 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 141-133 chr5 108505501 108505803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123554 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 283.5-46 chr5 73834996 73835699 + 0.75 NA intron (NM_001177693, intron 10 of 35) AluY|SINE|Alu 21801 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 263-16 chr14 64938295 64938754 + 0.75 NA TTS (NM_002083) TTS (NM_002083) 4221 NR_046321 2877 Hs.2704 NM_002083 ENSG00000176153 GPX2 GI-GPx|GPRP|GPRP-2|GPx-2|GPx-GI|GSHPX-GI|GSHPx-2 glutathione peroxidase 2 protein-coding 139.5-137 chr3 110842446 110842731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 227371 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 145-111 chr4 77200808 77201169 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43781 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 116-136 chr6 16437800 16437979 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) intron (NM_000332, intron 7 of 8) 199302 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 144.25-106 chr2 192026535 192026768 + 0.75 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) intron (NM_001305134, intron 5 of 9) 168282 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 187.75-31 chr14 79352613 79352888 + 0.75 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 73370 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 255-65 chr9 25746489 25746924 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -33350 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 158.5-139 chr4 44197171 44197547 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L1PA16|LINE|L1 180297 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 153.5-178 chr7 18371140 18371417 + 0.75 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) 81186 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 147.25-125 chr6 157102961 157103244 + 0.75 NA intron (NM_020732, intron 6 of 19) MER58A|DNA|hAT-Charlie 66675 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 160.25-156 chr8 31925525 31925866 + 0.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 -100041 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 135-41 chr14 50462304 50462641 + 0.75 NA intron (NM_198794, intron 13 of 31) intron (NM_198794, intron 13 of 31) -65174 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 148.75-147 chr6 127465483 127465816 + 0.75 NA intron (NM_001012279, intron 7 of 11) intron (NM_001012279, intron 7 of 11) -6260 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 159.25-158 chr9 9299557 9300003 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 441762 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 176.5-164 chr8 36711797 36712105 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -72423 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 241.5-108 chrX 103014714 103015258 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49185 NM_018476 55859 Hs.334370 NM_018476 ENSG00000133169 BEX1 BEX2|HBEX2|HGR74-h brain expressed X-linked 1 protein-coding 291-17 chr17 50543100 50543739 + 0.75 NA 3' UTR (NM_017957, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_017957, exon 10 of 10) -3670 NM_001258372 64847 Hs.103147 NM_022827 ENSG00000006282 SPATA20 HEL-S-98|SSP411|Tisp78 spermatogenesis associated 20 protein-coding 163.5-97 chr2 157451674 157452063 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -7779 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 130-98 chr22 46744613 46744833 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6471 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 193.5-68 chr17 82191159 82191453 + 0.75 NA intron (NM_001367828, intron 5 of 16) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 21536 NM_001316321 284001 Hs.631724 NM_152675 ENSG00000176155 CCDC57 - coiled-coil domain containing 57 protein-coding 131-181 chr9 33969107 33969373 + 0.75 NA intron (NR_163243, intron 5 of 24) L1MB7|LINE|L1 -16386 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 123.75-176 chr7 70086784 70087090 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 488462 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 114.75-95 chr2 122161758 122162000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 406228 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 187-115 chrX 125484221 125484662 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 164570 NM_001195272 100129520 NM_001195272 ENSG00000282815 TEX13C - TEX13 family member C protein-coding 146.5-40 chr11 42096740 42097022 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11423 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 235.5-76 chr7 23235696 23236129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10863 NM_002510 10457 Hs.190495 NM_002510 ENSG00000136235 GPNMB HGFIN|NMB|PLCA3 glycoprotein nmb protein-coding 151-35 chr14 43796679 43796924 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 710482 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 175.75-116 chr7 3227857 3228273 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -69492 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 241.5-32 chr19 29065684 29066265 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 63419 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 125.25-214 chr8 136058936 136059226 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -471717 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 159.75-128 chr5 30907513 30907752 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -286054 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 135-154 chr6 46496407 46496682 + 0.75 NA intron (NR_125837, intron 1 of 2) intron (NR_125837, intron 1 of 2) -4477 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 193-37 chr2 38170899 38171392 + 0.75 NA intron (NR_027252, intron 2 of 2) intron (NR_027252, intron 2 of 2) 40040 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 218.5-90 chr4 117817703 117818093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16503 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 136.75-175 chr6 153146478 153146846 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -15380 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 153.75-20 chr10 61858475 61858837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43043 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 115.75-58 chr14 28585512 28585720 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 179703 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 221.75 chr1 25342432 25342986 + 0.75 NA intron (NM_014313, intron 2 of 6) intron (NM_014313, intron 2 of 6) 4375 NM_014313 23585 Hs.705699 NM_014313 ENSG00000183726 TMEM50A IFNRC|SMP1 transmembrane protein 50A protein-coding 118.75-136 chr4 55977613 55977871 + 0.75 NA intron (NM_025009, intron 11 of 25) L1MA7|LINE|L1 28797 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 223.75-23 chr14 66127420 66127799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -358762 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 257-28 chr2 206391797 206392196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51536 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 230.5-69 chr2 220054451 220055078 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -148199 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 221.5-35 chr17 82411856 82412322 + 0.75 NA intron (NR_033265, intron 2 of 9) intron (NR_033265, intron 2 of 9) -6258 NM_173620 284004 Hs.744207 NM_173620 ENSG00000169660 HEXD HEXDC hexosaminidase D protein-coding 126.75-178 chr4 97531322 97531578 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 164524 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 133.25-8 chr1 188424472 188424734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 980975 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 204.5-68 chr2 99062924 99063302 + 0.75 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 78067 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 141.75-137 chr5 38837917 38838209 + 0.75 NA intron (NR_109951, intron 1 of 3) intron (NR_109951, intron 1 of 3) 7766 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 117-52 chr14 45113560 45113790 + 0.75 NA intron (NM_017922, intron 11 of 13) intron (NM_017922, intron 11 of 13) 2800 NR_003691 100113389 Hs.712501 NR_003691 ENSG00000239043 SNORD127 - small nucleolar RNA, C/D box 127 snoRNA 136.5-212 chr7 51530310 51530546 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137172 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 136-32 chr12 47989158 47989365 + 0.75 NA exon (NM_001844, exon 18 of 54) exon (NM_001844, exon 18 of 54) 15215 NM_033150 1280 Hs.408182 NM_001844 ENSG00000139219 COL2A1 ANFH|AOM|COL11A3|SEDC|STL1 collagen type II alpha 1 chain protein-coding 162.25-2 chr1 32672744 32673103 + 0.75 NA intron (NM_005610, intron 11 of 11) intron (NM_005610, intron 11 of 11) 21565 NM_001135256 5928 Hs.16003 NM_005610 ENSG00000162521 RBBP4 NURF55|RBAP48|lin-53 RB binding protein 4, chromatin remodeling factor protein-coding 121.5-184 chr3 138567861 138568170 + 0.75 NA intron (NM_001288967, intron 2 of 13) intron (NM_001288967, intron 2 of 13) 23941 NM_001320600 80321 Hs.531962 NM_024491 ENSG00000114107 CEP70 BITE centrosomal protein 70 protein-coding 260.5-56 chr6 121553264 121553748 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 117860 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 166.25-82 chr2 165541981 165542323 + 0.75 NA intron (NM_001172173, intron 3 of 6) intron (NM_001172173, intron 3 of 6) -30184 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 165.5-107 chr22 20764722 20765165 + 0.75 NA exon (NM_001362863, exon 21 of 54) exon (NM_001362863, exon 21 of 54) -9170 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 150.75-131 chr3 100435109 100435445 + 0.75 NA intron (NM_001085451, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 33738 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 204.5-120 chr7 40972773 40973372 + 0.75 NA intron (NR_110831, intron 1 of 2) X9_LINE|LINE|L1 6867 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 165.5-144 chr5 8747939 8748391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91567 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 122-135 chr5 3607086 3607320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11371 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 182-28 chr13 32560744 32561154 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -22064 NM_033111 10443 Hs.507680 NM_014887 ENSG00000244754 N4BP2L2 92M18.3|CG005|CG016|PFAAP5 NEDD4 binding protein 2 like 2 protein-coding 156.25-5 chr1 110486163 110486648 + 0.75 NA intron (NR_003599, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 3853 NR_108042 440602 Hs.708945 NR_108042 ENSG00000235407 CYMP-AS1 - CYMP antisense RNA 1 ncRNA 153.75-153 chr9 17033707 17034047 + 0.75 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL -101163 NM_017738 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 223.25-74 chr8 72242080 72242451 + 0.75 NA intron (NR_033867, intron 3 of 19) intron (NR_033867, intron 3 of 19) 9369 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 120.5-137 chr3 23141326 23141723 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 61054 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 116.75-96 chr2 79640039 79640244 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) intron (NM_001282598, intron 1 of 17) 9218 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 245.75-53 chr6 49715663 49716227 + 0.75 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -2355 NM_001261822 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 229.25-14 chr11 132896064 132896466 + 0.75 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) ERVL-int|LTR|ERVL 47372 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 158.75-107 chr22 27028843 27029061 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 31566 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 120.25-88 chr2 24091325 24091485 + 0.75 NA intron (NR_111929, intron 2 of 5) AluY|SINE|Alu -6190 NM_147184 9540 Hs.50649 NM_004881 ENSG00000115129 TP53I3 PIG3 tumor protein p53 inducible protein 3 protein-coding 180.75-68 chr2 155026301 155026702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 327806 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 119-48 chr14 61081223 61081387 + 0.75 NA intron (NM_001172702, intron 16 of 16) intron (NM_001172702, intron 16 of 16) -99615 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 144.25-34 chr10 101936521 101936992 + 0.75 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) L1MB3|LINE|L1 -92836 NM_173192 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 121-19 chr10 39066509 39066780 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 370048 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 145.5-159 chr5 92871576 92871857 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 699627 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 128.5-36 chr10 105874815 105875142 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -54645 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 139-95 chr3 53409675 53410029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62309 NM_001290206 55802 Hs.476353 NM_018403 ENSG00000272886 DCP1A HSA275986|Nbla00360|SMAD4IP1|SMIF decapping mRNA 1A protein-coding 124.25-27 chr10 69885469 69885651 + 0.75 NA intron (NM_080801, intron 6 of 38) intron (NM_080801, intron 6 of 38) 83654 NM_001320951 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 149.75-102 chr20 36667537 36667927 + 0.75 NA intron (NM_032013, intron 9 of 15) intron (NM_032013, intron 9 of 15) -21536 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 147.25-29 chr12 112201809 112202144 + 0.75 NA intron (NM_001109662, intron 54 of 75) intron (NM_001109662, intron 54 of 75) -38655 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 136.25-100 chr2 200071443 200071715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116088 NM_001039693 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 141.75-105 chr2 227044199 227044542 + 0.75 NA intron (NM_000092, intron 35 of 47) intron (NM_000092, intron 35 of 47) 120189 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 154-15 chr10 26396199 26396438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42023 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 133.25-131 chr3 45432809 45433107 + 0.75 NA intron (NM_001368263, intron 5 of 20) L1MDa|LINE|L1 44382 NM_001368263 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 115.25-175 chr6 53449210 53449462 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 95765 NM_001197115 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 145.25-46 chr15 67036879 67037194 + 0.75 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu 27146 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 189.5-132 chr7 45029505 45029809 + 0.75 NA intron (NM_001029835, intron 1 of 9) intron (NM_001029835, intron 1 of 9) 2023 NM_001029835 83605 Hs.148272 NM_031443 ENSG00000136280 CCM2 C7orf22|OSM|PP10187 CCM2 scaffold protein protein-coding 125.5-230 chr7 35357528 35357727 + 0.75 NA intron (NR_038864, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 43772 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 166.75-129 chr7 3579567 3579943 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1PREC2|LINE|L1 278503 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 137-69 chr18 9246382 9246651 + 0.75 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) intron (NM_001204056, intron 7 of 11) -88257 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 141.75-168 chr8 73463329 73463668 + 0.75 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 43424 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 154-70 chr2 100073534 100073777 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) intron (NM_001025108, intron 2 of 23) 31928 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 217.5-80 chr3 86520691 86521203 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39004 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 179.75-35 chr14 26357128 26357565 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 196084 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 120-80 chr19 11404941 11405125 + 0.75 NA intron (NM_001035223, intron 9 of 18) intron (NM_001035223, intron 9 of 18) 14281 NM_001161616 57139 Hs.375142 NM_001035223 ENSG00000205517 RGL3 - ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 3 protein-coding 237.5-28 chr14 40497408 40498042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -456986 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 124.5-49 chr12 92034575 92034819 + 0.75 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 107016 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 128.5-24 chr10 33618418 33618809 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 154067 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 207.5-35 chr17 28660885 28661213 + 0.75 NA intron (NR_045585, intron 1 of 2) intron (NR_045585, intron 1 of 2) 857 NM_006923 6388 Hs.514036 NM_006923 ENSG00000132581 SDF2 - stromal cell derived factor 2 protein-coding 257-59 chr9 32609461 32610136 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25871 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 244.5-108 chr9 113929947 113930293 + 0.75 NA intron (NM_001318042, intron 1 of 14) intron (NM_001318042, intron 1 of 14) 53811 NM_001318041 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 130.75-90 chr2 71741029 71741304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 274467 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 174.75-143 chr9 94077542 94077910 + 0.75 NA intron (NM_177995, intron 2 of 9) MER21B|LTR|ERVL -6703 NM_152422 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 146.5-142 chr3 113588303 113588593 + 0.75 NA intron (NR_136285, intron 7 of 20) intron (NR_136285, intron 7 of 20) -6428 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 149.5-33 chr10 91678694 91679044 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -45798 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 119-112 chr22 47740364 47740576 + 0.75 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 108796 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 166.5-134 chr3 108812819 108813221 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -9766 NM_016388 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 141.25-181 chr8 115602979 115603265 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 64891 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 114-159 chr8 10263953 10264304 + 0.75 NA intron (NM_001199729, intron 4 of 6) intron (NM_001199729, intron 4 of 6) 168477 NM_001199729 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 151.5-150 chr5 31661103 31661427 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 22134 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 183-46 chr18 71464745 71465139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114014 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 230.25-86 chr8 137228545 137228910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 184861 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 180.25-117 chr8 113443667 113444132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6960 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 157.25-27 chr11 84249067 84249434 + 0.75 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 24030 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 284-38 chr4 121267910 121268451 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40697 NM_001244764 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 231.25-50 chr22 22146788 22147185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97800 NM_001303509 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 233.75-78 chr8 125572465 125572834 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 140440 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 195.25-64 chr3 178088592 178088901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 271881 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 167.5-103 chr20 46811909 46812294 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -82523 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 131-186 chr9 103683056 103683410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -316476 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 199.5-112 chr4 125854207 125854579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 347134 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 199-80 chr7 144586352 144586819 + 0.75 NA intron (NM_001042482, intron 6 of 7) intron (NM_001042482, intron 6 of 7) 152313 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 177.75-56 chr17 71563606 71563930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -361589 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 183-107 chr7 52018497 52018866 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -625425 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 170.25-78 chr2 193704585 193704902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -639526 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 183.5-98 chr4 58224942 58225398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 311158 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 130.25-192 chr7 97190963 97191200 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 74488 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 124.75-168 chr5 15994283 15994510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59214 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 171-22 chr11 76474078 76474385 + 0.75 NA intron (NM_001300942, intron 9 of 21) intron (NM_001300942, intron 9 of 21) 29206 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 152.75-60 chr15 25032296 25032623 + 0.75 NA non-coding (NR_146168, exon 1 of 1) non-coding (NR_146168, exon 1 of 1) 586 NR_146168 100506965 Hs.592473 NR_146168 PWAR6 HBT8|PAR-6 Prader Willi/Angelman region RNA 6 ncRNA 118.5 chr1 9603291 9603508 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001010866, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001010866, exon 6 of 6) 14488 NM_001010866 199953 Hs.632365 NM_001010866 ENSG00000188807 TMEM201 Ima1|NET5|SAMP1 transmembrane protein 201 protein-coding 112.75-89 chr2 22787473 22787680 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 251097 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 169.75-149 chr7 139595800 139596305 + 0.75 NA intron (NM_001113239, intron 12 of 14) intron (NM_001113239, intron 12 of 14) 72367 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 117.5-92 chr18 60840591 60840801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -467921 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 158-108 chr4 62106085 62106332 + 0.75 NA intron (NR_110595, intron 6 of 7) L1PA13|LINE|L1 55557 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 267-51 chr7 101523215 101523657 + 0.75 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) L1ME3A|LINE|L1 45570 NR_103749 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 155.25-85 chr18 42794069 42794289 + 0.75 NA intron (NM_002930, intron 4 of 4) intron (NM_002930, intron 4 of 4) 321506 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 171.25-121 chr5 86992055 86992446 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 122704 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 131-163 chr7 102134723 102134926 + 0.75 NA intron (NM_001913, intron 8 of 22) AluJb|SINE|Alu -150317 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 149.5-145 chr4 170718254 170718610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25303 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 125.25-93 chr2 19588567 19588778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230049 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 116.25-150 chr3 138791599 138791780 + 0.75 NA intron (NM_006219, intron 2 of 23) L2a|LINE|L2 43239 NM_006219 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 181.75-56 chr2 5325579 5325862 + 0.75 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 365398 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 136.75-140 chr4 10491973 10492262 + 0.75 NA intron (NM_052964, intron 18 of 18) MIRc|SINE|MIR -34691 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 242.5-32 chr15 65533270 65533928 + 0.75 NA intron (NM_016395, intron 1 of 10) MER90|LTR|ERV1 3136 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 236.75-27 chr2 50228730 50229098 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 118840 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 210.5-13 chr1 241666097 241666382 + 0.75 NA intron (NM_001367482, intron 2 of 27) intron (NM_001367482, intron 2 of 27) 13958 NM_001367482 128025 Hs.97527 NM_144625 ENSG00000162843 WDR64 - WD repeat domain 64 protein-coding 311-6 chr10 83518269 83518900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158505 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 140.5-232 chr8 108392938 108393154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50537 NR_138033 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 177-4 chr1 111166511 111166910 + 0.75 NA intron (NM_001007794, intron 4 of 8) intron (NM_001007794, intron 4 of 8) 26487 NM_006090 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 154.75-39 chr14 51069542 51069839 + 0.75 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) MER102b|DNA|hAT-Charlie 26014 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 198.75-31 chr16 74020216 74020679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 195074 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 125.75-82 chr2 26388931 26389130 + 0.75 NA exon (NM_033505, exon 10 of 10) exon (NM_033505, exon 10 of 10) -12890 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 133.25-21 chr10 66659381 66659668 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -266512 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 143-31 chr13 59822083 59822429 + 0.75 NA intron (NM_001258369, intron 24 of 26) intron (NM_001258369, intron 24 of 26) -190462 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-202 chr7 33466829 33467022 + 0.75 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 337361 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 261.75-30 chr3 49963846 49964432 + 0.75 NA intron (NR_146071, intron 2 of 15) AluSz|SINE|Alu 23989 NM_001349191 10180 Hs.696735 NM_005777 ENSG00000004534 RBM6 3G2|DEF-3|DEF3|HLC-11|NY-LU-12|g16 RNA binding motif protein 6 protein-coding 186.25-100 chr6 55582079 55582507 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3079 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 174.25-96 chr3 35549665 35549970 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89708 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 228.25-54 chr4 36883245 36883762 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -118276 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 135.25-18 chr1 218070892 218071097 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 27489 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 170.5-147 chr5 88719667 88719949 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001364347, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001364347, exon 11 of 11) -28767 NR_152232 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 162.75-101 chr3 127637929 127638222 + 0.75 NA intron (NM_015720, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 8890 NM_015720 50512 Hs.591290 NM_015720 ENSG00000114631 PODXL2 EG|PODLX2 podocalyxin like 2 protein-coding 135.25-48 chr11 133234322 133234552 + 0.75 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -290669 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 142.25-81 chr2 18036070 18036280 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 157508 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 222.25-57 chr4 33135435 33135843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 784601 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 231-32 chr16 30393808 30394373 + 0.75 NA intron (NM_001214907, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu -1022 NM_001214909 197407 Hs.513501 NM_152652 ENSG00000180035 ZNF48 ZNF553 zinc finger protein 48 protein-coding 210.5-45 chr16 12654339 12654810 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -65747 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 215.5-54 chr2 117117562 117118070 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -696875 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 141.25-77 chr2 37388246 37388481 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 43733 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 221-10 chr10 70555908 70556408 + 0.75 NA intron (NM_014431, intron 18 of 19) intron (NM_014431, intron 18 of 19) 46583 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 218.25-107 chr9 112541433 112541918 + 0.75 NA intron (NM_133465, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu -54031 NM_001350649 100133204 Hs.662552 NM_001350649 C9orf147 - chromosome 9 open reading frame 147 protein-coding 156.25-158 chr9 96112544 96112848 + 0.75 NA intron (NR_132344, intron 2 of 2) intron (NR_132344, intron 2 of 2) 3715 NR_132344 158434 Hs.381771 NM_001256408 ENSG00000275465 LOC158434 - uncharacterized LOC158434 ncRNA 139.5-173 chr5 42263292 42263529 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -88065 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 132.5-4 chr1 37333967 37334183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140368 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 194.5-77 chr2 174077719 174078091 + 0.75 NA intron (NM_001011708, intron 9 of 9) intron (NM_001011708, intron 9 of 9) 52625 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 202.75-58 chr2 115784554 115785070 + 0.75 NA intron (NM_001321912, intron 18 of 25) AluSp|SINE|Alu 440997 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 220.25-34 chr2 121102920 121103389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182048 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 153.25-102 chr5 52009392 52009645 + 0.75 NA intron (NR_147166, intron 1 of 3) intron (NR_147166, intron 1 of 3) 1487 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 135-84 chr2 174393275 174393622 + 0.75 NA intron (NM_004882, intron 1 of 9) intron (NM_004882, intron 1 of 9) 2264 NM_004882 9541 Hs.632531 NM_004882 ENSG00000138433 CIR1 CIR corepressor interacting with RBPJ, 1 protein-coding 211.25-55 chr3 11673392 11673889 + 0.75 NA intron (NM_001284390, intron 2 of 6) HAL1|LINE|L1 -29725 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 156-82 chr2 59597122 59597406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 379556 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 112.75-215 chrX 100433300 100433516 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -23135 NM_001105243 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 146.5-70 chr15 53583633 53583976 + 0.75 NA intron (NM_182758, intron 18 of 19) intron (NM_182758, intron 18 of 19) -42701 NM_001277176 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 140.5-38 chr11 89435435 89435868 + 0.75 NA intron (NM_001143837, intron 9 of 20) intron (NM_001143837, intron 9 of 20) 55109 NM_001291929 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 215-16 chr12 30573576 30573953 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 103480 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 131.25-70 chr16 11089782 11090178 + 0.75 NA intron (NM_015226, intron 18 of 22) intron (NM_015226, intron 18 of 22) 145416 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 163.75-123 chr8 75807519 75807807 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 267695 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 219.25-49 chr3 87998833 87999335 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16508 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 145.25-5 chr1 71201310 71201637 + 0.75 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 120149 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 219-14 chr11 8973948 8974265 + 0.75 NA intron (NR_073431, intron 4 of 4) intron (NR_073431, intron 4 of 4) -9095 NM_001286095 56674 Hs.501853 NM_020644 ENSG00000175348 TMEM9B C11orf15 TMEM9 domain family member B protein-coding 172.5-78 chr16 55423818 55424263 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 38257 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 163.5-55 chr14 83698966 83699413 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1056557 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 121-165 chr6 46965172 46965519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10406 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 127-151 chr6 100367860 100368080 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 95705 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 136-134 chr7 55992684 55992938 + 0.75 NA intron (NM_001202469, intron 5 of 7) MamRep605|LTR?|LTR? 28226 NM_001483 2631 Hs.591069 NM_001483 ENSG00000146729 NIPSNAP2 GBAS nipsnap homolog 2 protein-coding 124.75-177 chr5 169350873 169351088 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49841 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 222.75-80 chr6 39149272 39149694 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34297 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 166.5-96 chr2 27486231 27486496 + 0.75 NA intron (NM_015662, intron 1 of 47) intron (NM_015662, intron 1 of 47) 3380 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 121.25-66 chr15 76455148 76455343 + 0.75 NA intron (NR_148227, intron 25 of 32) L1MA9|LINE|L1 118472 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 128.75-29 chr11 29262577 29262921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -331664 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 126.25 chr1 12466366 12466714 + 0.75 NA intron (NM_015378, intron 67 of 69) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -40706 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 179.25-143 chr8 73004566 73004889 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4137 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 231-8 chr10 68315668 68316163 + 0.75 NA intron (NM_001033083, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 -15778 NM_001322438 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 147.75-28 chr12 4305768 4306080 + 0.75 NA TTS (NM_001759) TTS (NM_001759) -15289 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 114-117 chr4 136702693 136702872 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -490974 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 177-18 chr11 59326784 59327188 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -37473 NM_001004729 390195 Hs.553755 NM_001004729 ENSG00000176495 OR5AN1 OR11-244 olfactory receptor family 5 subfamily AN member 1 protein-coding 186.5-89 chr3 40122794 40123095 + 0.75 NA intron (NM_001284426, intron 1 of 14) L1PA15|LINE|L1 22933 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 134-4 chr1 62277183 62277518 + 0.75 NA intron (NM_181712, intron 2 of 9) intron (NM_181712, intron 2 of 9) 42084 NM_001320269 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 114-153 chr7 38120505 38120818 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57584 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 133-73 chr18 8956343 8956560 + 0.75 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -146248 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 164.25-161 chr9 122635212 122635490 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -5816 NM_001004450 347169 Hs.553710 NM_001004450 ENSG00000280094 OR1B1 OR9-26|OR9-B olfactory receptor family 1 subfamily B member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 159-70 chr4 7037567 7037814 + 0.75 NA intron (NR_033828, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 5311 NM_153376 257236 Hs.656757 NM_153376 ENSG00000173013 CCDC96 - coiled-coil domain containing 96 protein-coding 127.75-29 chr10 35316203 35316543 + 0.75 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) intron (NM_181698, intron 3 of 11) -20136 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 122.25-155 chr5 130195046 130195354 + 0.75 NA Intergenic (CTTCTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 290735 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 142.75-67 chr15 58233801 58234035 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 95537 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 167.75-25 chr10 92467174 92467450 + 0.75 NA intron (NR_136399, intron 20 of 25) AluJr|SINE|Alu 30449 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 267.5-34 chr17 69377993 69378459 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -36471 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 231-64 chr4 175398734 175399308 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 388655 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 145.5-123 chr22 24514207 24514506 + 0.75 NA intron (NM_016327, intron 5 of 9) intron (NM_016327, intron 5 of 9) 19024 NM_016327 51733 Hs.731656 NM_016327 ENSG00000100024 UPB1 BUP1 beta-ureidopropionase 1 protein-coding 242-58 chr7 80695155 80695618 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 48733 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 115.5-168 chr3 97426660 97427018 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) L1PA13|LINE|L1 -12768 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 179.25-33 chr11 56012168 56012502 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17710 NM_003697 338674 Hs.553702 NM_003697 ENSG00000149133 OR5F1 OR11-10 olfactory receptor family 5 subfamily F member 1 protein-coding 224.5-38 chr14 60826290 60826900 + 0.75 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) AluSx4|SINE|Alu 91834 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 121.25-27 chr10 98881077 98881306 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 43377 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 291.25-25 chr5 157055966 157056608 + 0.75 NA intron (NM_001173393, intron 2 of 8) intron (NM_001173393, intron 2 of 8) 1954 NM_012206 26762 Hs.129711 NM_012206 ENSG00000113249 HAVCR1 CD365|HAVCR|HAVCR-1|KIM-1|KIM1|TIM|TIM-1|TIM1|TIMD-1|TIMD1 hepatitis A virus cellular receptor 1 protein-coding 146.75-131 chr5 111075065 111075516 + 0.75 NA intron (NR_045089, intron 4 of 4) intron (NR_045089, intron 4 of 4) 1916 NM_138551 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 117-39 chr12 69060742 69061075 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -97668 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 126.5-123 chr2 147140062 147140406 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 553177 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 219.25-52 chr3 164236731 164237084 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65351 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 149-20 chr12 894376 894711 + 0.75 NA intron (NM_001184985, intron 22 of 27) intron (NM_001184985, intron 22 of 27) 38533 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 152.5-77 chr19 50796436 50796670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 2572 NR_003068 692203 NR_003068 ENSG00000221381 SNORD88B HBII-180B small nucleolar RNA, C/D box 88B snoRNA 157.75-58 chr16 51628759 51629030 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -133625 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 145.25-124 chr4 180962311 180962561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 196713 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 137.75-192 chr7 30109689 30110023 + 0.75 NA intron (NM_001350973, intron 13 of 13) AluJb|SINE|Alu -25130 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 193.75-68 chr2 172423153 172423679 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3920 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 130.5-92 chr14 67909525 67909937 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluJb|SINE|Alu 86139 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 231.5-6 chr1 233207160 233207644 + 0.75 NA intron (NM_014801, intron 13 of 33) intron (NM_014801, intron 13 of 33) 88323 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 148.25-94 chr3 64365293 64365539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97243 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 164.25-8 chr1 104685949 104686477 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 613190 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 140.25-155 chr5 151700965 151701215 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14175 NM_001309444 6678 Hs.111779 NM_003118 ENSG00000113140 SPARC BM-40|OI17|ON secreted protein acidic and cysteine rich protein-coding 146.5-164 chr5 8043717 8044038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 174729 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 170.5-108 chr20 38155274 38155560 + 0.75 NA intron (NM_001323317, intron 2 of 11) AluJr|SINE|Alu 9853 NM_004613 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 112.25-17 chr10 36675834 36676116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -449882 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 125.5-39 chr11 15893208 15893517 + 0.75 NA Intergenic Charlie10a|DNA|hAT-Charlie 76259 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 132-59 chr15 68572821 68573135 + 0.75 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) (CACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6015 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 123.5-36 chr11 37834821 37835034 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -103674 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 128-62 chr18 21656819 21657057 + 0.75 NA exon (NM_001308256, exon 6 of 7) exon (NM_001308256, exon 6 of 7) 7276 NM_001308257 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 212-53 chr22 35039434 35039859 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26512 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 187-68 chr4 28182383 28182696 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -637043 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 125.5-191 chr4 118907576 118907832 + 0.75 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) HAL1b|LINE|L1 18850 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 198.25-41 chr17 28414047 28414455 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8039 NM_080669 113235 Hs.446689 NM_080669 ENSG00000076351 SLC46A1 G21|HCP1|PCFT solute carrier family 46 member 1 protein-coding 126.75-157 chr3 144128639 144128954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155715 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 143.75-147 chr5 104213777 104214189 + 0.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -651194 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 143.5-92 chr17 63328114 63328374 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 10 of 25) L1PA15|LINE|L1 112023 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 191.5-134 chr7 4805437 4805786 + 0.75 NA exon (NM_018059, exon 10 of 15) exon (NM_018059, exon 10 of 15) -16972 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 117.75-74 chr16 12028360 12028638 + 0.75 NA intron (NM_032167, intron 4 of 20) AluJo|SINE|Alu 51765 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 133.5-217 chr5 120755618 120755921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 224305 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 200.75-79 chr4 170456210 170456758 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 229893 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 182.5-52 chr14 71519868 71520147 + 0.75 NA intron (NM_001354286, intron 4 of 24) AluJb|SINE|Alu 32146 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 210-15 chr10 124941693 124941986 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_017580) promoter-TSS (NM_017580) -284 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 180.25-32 chr16 29947690 29947977 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -14246 NM_001369690 124446 Hs.460574 NM_194280 ENSG00000149932 TMEM219 IGFBP-3R transmembrane protein 219 protein-coding 189-23 chr10 128927501 128927826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14830 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 139.75-102 chr2 190969921 190970323 + 0.75 NA 3' UTR (NM_007315, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_007315, exon 25 of 25) 44128 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 151-6 chr1 108888952 108889243 + 0.75 NA intron (NM_013296, intron 2 of 14) LTR10C|LTR|ERV1 12112 NM_001321039 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 132-181 chr8 141839727 141840050 + 0.75 NA Intergenic (GGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -53575 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 170.25-162 chr9 85405851 85406186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 336011 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 124-149 chr6 63735681 63736055 + 0.75 NA intron (NM_001142800, intron 41 of 42) L1MC4|LINE|L1 -70968 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 235 chr1 3210109 3210519 + 0.75 NA intron (NM_022114, intron 2 of 16) intron (NM_022114, intron 2 of 16) 82339 NR_036215 100422968 NR_036215 ENSG00000283572 MIR4251 - microRNA 4251 ncRNA 153.5-27 chr11 18307977 18308432 + 0.75 NA intron (NM_181507, intron 6 of 22) intron (NM_181507, intron 6 of 22) 13936 NM_007216 11234 Hs.437599 NM_007216 ENSG00000110756 HPS5 AIBP63|BLOC2S2 HPS5 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 2 protein-coding 166.25-56 chr16 63052092 63052541 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1015878 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 195.75-104 chr6 158759601 158760015 + 0.75 NA intron (NM_001242394, intron 14 of 17) AluSx1|SINE|Alu 4945 NR_037482 100500851 NR_037482 ENSG00000265558 MIR3918 mir-3918 microRNA 3918 ncRNA 158.5-142 chr4 73314451 73314697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55776 NM_032217 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 125.75-70 chr17 78019981 78020194 + 0.75 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) intron (NM_018996, intron 2 of 20) 15850 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 236.75-45 chr5 97016634 97017063 + 0.75 NA intron (NM_005575, intron 13 of 17) intron (NM_005575, intron 13 of 17) 58415 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 127.5-25 chr10 20677811 20678168 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 126019 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 243-47 chr3 51756704 51757046 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 22362 NM_001143833 440956 Hs.444316 NM_001143833 ENSG00000214686 IQCF6 - IQ motif containing F6 protein-coding 114-157 chr7 123747542 123747730 + 0.75 NA intron (NM_003941, intron 1 of 10) intron (NM_003941, intron 1 of 10) 1367 NM_003941 8976 Hs.143728 NM_003941 ENSG00000106299 WASL N-WASP|NWASP|WASPB WASP like actin nucleation promoting factor protein-coding 166-36 chr15 39201002 39201459 + 0.75 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -49439 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 137-142 chr5 106254293 106254548 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 756594 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 241.25-71 chr8 127034977 127035393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22031 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 198.75-26 chr14 49027825 49028295 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 558320 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 204.75-84 chr4 84297930 84298226 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 1 of 8) L1MA4A|LINE|L1 1091 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 164.5-87 chr19 49215089 49215417 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 57461 NM_001321281 54795 Hs.467101 NM_017636 ENSG00000130529 TRPM4 LTrpC4|PFHB1B|TRPM4B|hTRPM4 transient receptor potential cation channel subfamily M member 4 protein-coding 118.75-181 chr7 74166900 74167173 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7320 NM_022170 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 177.75-58 chr18 582662 583021 + 0.75 NA TTS (NM_004066) TTS (NM_004066) 2461 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 147.75-55 chr17 78468536 78468906 + 0.75 NA exon (NM_173628, exon 55 of 81) exon (NM_173628, exon 55 of 81) -16189 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-9 chr1 95083765 95084100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8585 NM_001199679 148534 Hs.483512 NM_152487 ENSG00000152078 TLCD4 TMEM56 TLC domain containing 4 protein-coding 131.75-184 chr6 41848035 41848362 + 0.75 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 23439 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 172.75-20 chr11 21067267 21067596 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 397845 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 263-47 chr7 7692423 7692917 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) AluSc|SINE|Alu 25937 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 212.75-103 chr9 109132859 109133472 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014334, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014334, exon 5 of 5) -13218 NM_032012 23731 Hs.308074 NM_032012 ENSG00000106771 TMEM245 C9orf5|CG-2|CG2 transmembrane protein 245 protein-coding 135-30 chr12 47695024 47695258 + 0.75 NA intron (NM_024604, intron 5 of 16) L1ME3F|LINE|L1 10889 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 120.5-160 chr4 55614652 55614925 + 0.75 NA intron (NM_001292045, intron 2 of 8) intron (NM_001292045, intron 2 of 8) 21510 NM_001292046 10874 Hs.418367 NM_006681 ENSG00000109255 NMU - neuromedin U protein-coding 215-26 chr15 69186514 69186865 + 0.75 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) intron (NM_001324093, intron 2 of 5) 26054 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 132.25-27 chr10 14091010 14091282 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 3 of 3) intron (NR_134578, intron 3 of 3) 16862 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 183.5-69 chr2 128101415 128101893 + 0.75 NA intron (NR_027671, intron 2 of 40) MIRb|SINE|MIR 10454 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 169.25-102 chr5 158409035 158409292 + 0.75 NA intron (NR_109888, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 610 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 153-77 chr2 151366459 151366788 + 0.75 NA intron (NM_007115, intron 3 of 5) intron (NM_007115, intron 3 of 5) -1711 NR_039931 100616392 NR_039931 ENSG00000264684 MIR4773-1 - microRNA 4773-1 ncRNA 144.25-105 chr2 180537688 180537908 + 0.75 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -154306 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 129.5-47 chr11 131018900 131019110 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -102518 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 146.25-20 chr11 101879794 101880152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35037 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 134.75-42 chr11 85676368 85676746 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 9638 NM_152723 220388 Hs.376241 NM_152723 ENSG00000179071 CCDC89 - coiled-coil domain containing 89 protein-coding 126.5-232 chr7 108648158 108648402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78406 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 186.25-45 chr17 60493191 60493615 + 0.75 NA intron (NM_006380, intron 3 of 12) intron (NM_006380, intron 3 of 12) 32837 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 184.5-138 chr7 28770188 28770545 + 0.75 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 84233 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 177.25-139 chr8 85885739 85886177 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58016 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 129.25-155 chr5 119189061 119189411 + 0.75 NA intron (NM_001290321, intron 28 of 43) intron (NM_001290321, intron 28 of 43) 34599 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 123.25-129 chr3 39065523 39065868 + 0.75 NA intron (NM_001303402, intron 2 of 17) intron (NM_001303402, intron 2 of 17) 13403 NM_001346228 57599 Hs.109778 NM_020839 ENSG00000114742 WDR48 P80|SPG60|UAF1 WD repeat domain 48 protein-coding 176.25-56 chr18 58630472 58630855 + 0.75 NA Intergenic (CATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1572 NM_052947 115701 Hs.628152 NM_052947 ENSG00000198796 ALPK2 HAK alpha kinase 2 protein-coding 208 chr1 8691685 8692003 + 0.75 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) intron (NM_001042681, intron 1 of 22) 125796 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 228-40 chr2 142614590 142615095 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262822 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 195.75-57 chr2 30753065 30753370 + 0.75 NA intron (NM_144575, intron 9 of 22) intron (NM_144575, intron 9 of 22) 54229 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 162-89 chr4 123587958 123588184 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -61920 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 177.75-120 chr6 37069906 37070311 + 0.75 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 64453 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 291.25-7 chr13 86593281 86593779 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -318390 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 125.5-97 chr16 61269337 61269532 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -213668 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 165.5-31 chr12 51596285 51596576 + 0.75 NA intron (NM_001369788, intron 1 of 25) MIRc|SINE|MIR 5194 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 245.75-49 chr5 127172087 127172670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98886 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 114-42 chr14 28348510 28348734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 416697 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 122-81 chr19 37373719 37373967 + 0.75 NA intron (NM_032453, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 2744 NM_032453 84503 Hs.590940 NM_032453 ENSG00000189164 ZNF527 - zinc finger protein 527 protein-coding 153.25-62 chr19 43694632 43694965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21278 NM_019612 56269 Hs.515444 NM_019612 ENSG00000124449 IRGC CINEMA|IFGGE|IRGC1|Iigp5|R30953_1 immunity related GTPase cinema protein-coding 216-19 chr15 65416528 65416901 + 0.75 NA intron (NM_020962, intron 1 of 19) intron (NM_020962, intron 1 of 19) 6233 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 181.5-34 chr12 59835018 59835464 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 145871 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 172.75-42 chr16 9341300 9341538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14169 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 127.75-69 chr15 71481024 71481316 + 0.75 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -66066 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 156.5-14 chr10 10943863 10944183 + 0.75 NA intron (NM_001326319, intron 4 of 16) intron (NM_001326319, intron 4 of 16) 8140 NR_024411 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 167.5-94 chr2 111232005 111232356 + 0.75 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) L1MD2|LINE|L1 88906 NR_039636 100616341 NR_039636 ENSG00000266139 MIR4435-2 mir-4435-2 microRNA 4435-2 ncRNA 145-3 chr1 40531066 40531431 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_152373) promoter-TSS (NM_152373) -389 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 132.5-167 chr3 114442045 114442364 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -11389 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 141.25-31 chr11 88235024 88235272 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 58646 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 241.25-6 chr1 167501595 167501943 + 0.75 NA intron (NM_000734, intron 1 of 7) intron (NM_000734, intron 1 of 7) 16760 NM_000734 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 149.25-152 chr6 35655261 35655586 + 0.75 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) 9366 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 130.75-184 chr7 86130567 86130898 + 0.75 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 -513177 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 123.25-37 chr11 77998311 77998537 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -3756 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 270.25-12 chr11 17424927 17425568 + 0.75 NA intron (NR_147094, intron 16 of 37) intron (NR_147094, intron 16 of 37) -35901 NM_001166290 3767 Hs.248141 NM_000525 ENSG00000187486 KCNJ11 BIR|HHF2|IKATP|KIR6.2|MODY13|PHHI|TNDM3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 11 protein-coding 113.5-154 chr3 24497370 24497577 + 0.75 NA intron (NR_046244, intron 1 of 1) intron (NR_046244, intron 1 of 1) -1765 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 181-17 chr11 116377079 116377445 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -262160 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 138-26 chr12 74510038 74510385 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27624 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 115.5-143 chr2 201500564 201500899 + 0.75 NA intron (NM_001168216, intron 11 of 12) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 48991 NM_001206864 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 242.75-78 chr9 38110351 38110784 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -41340 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 151.75-21 chr10 62056539 62056951 + 0.75 NA intron (NM_001244638, intron 2 of 6) intron (NM_001244638, intron 2 of 6) 7388 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 140-31 chr12 58243158 58243368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155371 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 138.75-121 chr3 155133824 155134175 + 0.75 NA intron (NM_000902, intron 8 of 22) intron (NM_000902, intron 8 of 22) 53988 NM_007289 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 185.25-5 chr1 119249021 119249330 + 0.75 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) MER102c|DNA|hAT-Charlie -79077 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 211.75-19 chr12 111090612 111091080 + 0.75 NA intron (NM_015267, intron 1 of 21) intron (NM_015267, intron 1 of 21) -9158 NM_001370598 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 286.75-33 chr4 77853983 77854594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8542 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 119-119 chr3 107421232 107421533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9548 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 178.5-124 chr4 70507908 70508201 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10515 NM_001286731 401138 Hs.453069 NM_212557 ENSG00000187689 AMTN AI3B|UNQ689 amelotin protein-coding 169.5-23 chr11 21406847 21407287 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) 737481 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 133.5-25 chr10 20827642 20828036 + 0.75 NA intron (NM_006393, intron 17 of 27) L1PA13|LINE|L1 69763 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 117-117 chr3 43091854 43092081 + 0.75 NA intron (NM_032806, intron 1 of 1) L1MC4a|LINE|L1 14112 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 166.25-153 chrX 38247877 38248109 + 0.75 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -27069 NM_001170750 8406 Hs.15154 NM_006307 ENSG00000101955 SRPX DRS|ETX1|HEL-S-83p|SRPX1 sushi repeat containing protein X-linked protein-coding 252-49 chr3 181918891 181919297 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33270 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 130.75-101 chr2 198514891 198515160 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -139928 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 219.25-55 chr4 59973534 59973869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -948918 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 132.5-147 chr21 27646514 27646797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75724 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 131.25-109 chr2 165412518 165412791 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -57044 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 189.25-34 chr14 63416112 63416458 + 0.75 NA intron (NR_104104, intron 3 of 12) FLAM_A|SINE|Alu 91953 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 169.5-24 chr11 29444020 29444275 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -150266 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 152-118 chr4 131369456 131369749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -395236 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 123.25-44 chr12 37657818 37658056 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -658837 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 173.25-87 chr4 81677430 81677842 + 0.75 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -205729 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 122.25-14 chr1 202952432 202952720 + 0.75 NA intron (NM_015999, intron 1 of 7) MLT2B2|LTR|ERVL 5408 NM_001290553 51094 Hs.5298 NM_015999 ENSG00000159346 ADIPOR1 ACDCR1|CGI-45|CGI45|PAQR1|TESBP1A adiponectin receptor 1 protein-coding 152.75-69 chr17 61311876 61312193 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 55670 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 140-87 chr20 40433421 40433666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 255693 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 163.75-41 chr13 33139212 33139586 + 0.75 NA intron (NM_178007, intron 4 of 13) intron (NM_178007, intron 4 of 13) 46692 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 185-11 chr11 43610435 43610850 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29248 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 168-88 chr3 188756253 188756732 + 0.75 NA intron (NM_001167672, intron 6 of 9) intron (NM_001167672, intron 6 of 9) 67711 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 131.5-128 chr2 189597822 189598061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17130 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 112.25-163 chr5 35599366 35599636 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -18362 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 140-94 chr21 31910806 31911138 + 0.75 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 37952 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 140.25-46 chr14 41656206 41656408 + 0.75 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) intron (NM_001346173, intron 1 of 4) 49451 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 274.75-14 chr14 63783220 63783828 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -55459 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 274.25-42 chr6 53804432 53805017 + 0.75 NA intron (NM_018214, intron 1 of 13) L1ME3G|LINE|L1 9719 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 131-154 chr7 33140538 33140785 + 0.75 NA intron (NM_001348044, intron 1 of 18) intron (NM_001348044, intron 1 of 18) 11097 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 175-108 chr5 164227108 164227519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 240089 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 237-21 chr17 79221692 79222235 + 0.75 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) intron (NM_001350453, intron 3 of 13) 147026 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 138.5-79 chr17 58373528 58373876 + 0.75 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) L1MA2|LINE|L1 -21501 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 128.25-140 chr4 33696387 33696757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 343321 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 185.75-37 chr13 87690698 87690977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18222 NM_015567 26050 Hs.591208 NM_015567 ENSG00000165300 SLITRK5 LRRC11|bA364G4.2 SLIT and NTRK like family member 5 protein-coding 165.75-28 chr11 46739064 46739304 + 0.75 NA intron (NM_000506, intron 13 of 13) intron (NM_000506, intron 13 of 13) 14008 NR_049846 100847020 NR_049846 ENSG00000263540 MIR5582 - microRNA 5582 ncRNA 129-112 chr20 57055905 57056240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157624 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 169.5-158 chr7 14097938 14098331 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -106709 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 202.25-12 chr10 57891882 57892341 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 375783 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 120-146 chr5 67966177 67966495 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 173123 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 188.5-82 chr2 185755595 185755889 + 0.75 NA intron (NM_173651, intron 8 of 22) intron (NM_173651, intron 8 of 22) -15265 NR_110217 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 163-14 chr10 52267019 52267314 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 10 of 17) intron (NM_001098512, intron 10 of 17) 46962 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 144 chr1 35940596 35941032 + 0.75 NA intron (NM_177422, intron 1 of 16) L2|LINE|L2 9709 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 158.5-202 chrX 21456914 21457226 + 0.75 NA intron (NM_001168648, intron 4 of 20) L1MA9|LINE|L1 82652 NM_001330773 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 169-115 chr9 110761260 110761680 + 0.75 NA intron (NM_001166281, intron 7 of 11) intron (NM_001166281, intron 7 of 11) 33208 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 171.25-69 chr19 32054599 32055025 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 28950 NR_110675 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 133.25-57 chr15 65551566 65551806 + 0.75 NA exon (NM_016395, exon 2 of 11) exon (NM_016395, exon 2 of 11) 21223 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 146.25-67 chr2 50244219 50244434 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 103428 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 126.25-223 chr9 104474124 104474421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29991 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 190.5-92 chr22 19569667 19570134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3061 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 173-123 chr6 122500504 122500899 + 0.75 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 28784 NM_001270393 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 120.75-133 chr5 11108209 11108421 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 13 of 20) intron (NM_001288715, intron 13 of 20) -347081 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 131-78 chr2 8138060 8138521 + 0.75 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) -161476 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 140.5-102 chr2 23765145 23765402 + 0.75 NA intron (NR_125717, intron 24 of 28) intron (NR_125717, intron 24 of 28) 161850 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 148.25-104 chr4 36165871 36166132 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 10 of 32) intron (NR_146894, intron 10 of 32) 77938 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 297.5-29 chr2 155480377 155481042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 774222 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 171.5-114 chr4 42210732 42211022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58222 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 151.25-117 chr22 31025361 31025719 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -55778 NM_006932 6525 Hs.149098 NM_006932 ENSG00000183963 SMTN - smoothelin protein-coding 153.75-9 chr1 183299683 183299965 + 0.75 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) L1MD2|LINE|L1 5050 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 157.75-63 chr16 80824568 80824954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20163 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 114-13 chr1 206958092 206958261 + 0.75 NA 3' UTR (NM_032029, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_032029, exon 7 of 7) -11710 NM_002644 5284 Hs.497589 NM_002644 ENSG00000162896 PIGR - polymeric immunoglobulin receptor protein-coding 224.25-62 chr3 185148510 185148915 + 0.75 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) intron (NM_001025266, intron 1 of 1) 4348 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 128-114 chr4 84356602 84356791 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -57527 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 171-123 chr7 8011004 8011392 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) L1MB3|LINE|L1 42402 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 149.75-152 chr6 163263232 163263684 + 0.75 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) 61015 NR_028390 285796 Hs.668693 NR_028390 ENSG00000281692 PACRG-AS1 - PACRG antisense RNA 1 ncRNA 198.5-24 chr12 1134264 1134682 + 0.75 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) AluJr|SINE|Alu 106725 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 134.25-141 chr5 53668639 53668949 + 0.75 NA intron (NR_134474, intron 5 of 5) intron (NR_134474, intron 5 of 5) 108155 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 161.5-65 chr15 66643012 66643254 + 0.75 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -59103 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 214-29 chr19 51226465 51226867 + 0.75 NA intron (NM_001772, intron 4 of 6) L1MA5A|LINE|L1 1586 NM_001772 945 Hs.83731 NM_001772 ENSG00000105383 CD33 SIGLEC-3|SIGLEC3|p67 CD33 molecule protein-coding 127.75-187 chr7 31123236 31123461 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70887 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 176-86 chrX 75092043 75092369 + 0.75 NA intron (NM_001271699, intron 3 of 14) L1MC2|LINE|L1 64077 NM_001271696 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 159-61 chr3 6677342 6677712 + 0.75 NA intron (NR_110123, intron 2 of 3) intron (NR_110123, intron 2 of 3) 127922 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 121.25-94 chr2 98833529 98833743 + 0.75 NA intron (NM_207362, intron 3 of 9) intron (NM_207362, intron 3 of 9) -61738 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 159-86 chr5 25335382 25335872 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 144674 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 212-63 chr4 81077644 81077955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47091 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 117-13 chr10 50977950 50978188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12819 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 263-9 chr11 43381002 43381623 + 0.75 NA intron (NM_001307943, intron 2 of 19) L1MEi|LINE|L1 22392 NM_018259 55761 Hs.191186 NM_018259 ENSG00000052841 TTC17 - tetratricopeptide repeat domain 17 protein-coding 138-99 chr22 45023596 45023879 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13732 NM_138415 112885 Hs.254097 NM_138415 ENSG00000056487 PHF21B BHC80L|PHF4 PHD finger protein 21B protein-coding 210-37 chr17 55431063 55431502 + 0.75 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 -9447 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 181.25-52 chr18 9235311 9235696 + 0.75 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) L1MC5|LINE|L1 97940 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 134-115 chr3 34352177 34352493 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 553705 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 115.75-178 chr5 151414486 151414658 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22474 NM_001308151 206358 Hs.269004 NM_078483 ENSG00000123643 SLC36A1 Dct1|LYAAT1|PAT1|TRAMD3 solute carrier family 36 member 1 protein-coding 131.75-134 chr3 39561793 39562109 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 59885 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 181.5-146 chr7 23197685 23198082 + 0.75 NA intron (NM_001370443, intron 6 of 7) L1ME1|LINE|L1 15835 NM_001370443 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 135.75-212 chr9 128377535 128377777 + 0.75 NA intron (NM_030914, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 6282 NR_049743 81605 Hs.495229 NM_030914 ENSG00000167118 URM1 C9orf74 ubiquitin related modifier 1 protein-coding 143.5-69 chr14 63958643 63958944 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 8 of 114) L1MC3|LINE|L1 105789 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 122-172 chr7 97183480 97183752 + 0.75 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 67023 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 200.5-143 chr9 22308705 22308980 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -137982 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 174.5-23 chr10 84552725 84553034 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 127710 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 134.5-74 chr15 63134957 63135249 + 0.75 NA intron (NM_032857, intron 5 of 5) intron (NM_032857, intron 5 of 5) 13242 NM_001288585 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 196.5-160 chr8 10649814 10650123 + 0.75 NA intron (NM_178857, intron 1 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 5175 NM_178857 94137 Hs.33538 NM_178857 ENSG00000183638 RP1L1 DCDC4B RP1 like 1 protein-coding 229-38 chr2 180312142 180312603 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -305075 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 178-93 chr7 24217504 24218033 + 0.75 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -66422 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 136-28 chr11 112485170 112485363 + 0.75 NA intron (NR_120560, intron 1 of 2) intron (NR_120560, intron 1 of 2) 921 NR_120560 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 165.25-79 chr20 59145277 59145646 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -45559 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 138.25-11 chr1 104653666 104654070 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 580845 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 187.75-22 chr12 25747105 25747429 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98689 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 197-26 chr17 75097683 75098058 + 0.75 NA intron (NM_004695, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 9916 NM_001369668 9121 Hs.592095 NM_004695 ENSG00000170190 SLC16A5 MCT5|MCT6 solute carrier family 16 member 5 protein-coding 146.25-124 chr6 72772849 72773147 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 142503 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 116.25-180 chr5 76223603 76223857 + 0.75 NA intron (NM_014979, intron 4 of 12) intron (NM_014979, intron 4 of 12) 140347 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 115.75-67 chr14 69607467 69607717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4004 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 138-50 chr15 99168868 99169208 + 0.75 NA intron (NR_109947, intron 9 of 12) intron (NR_109947, intron 9 of 12) 63958 NM_145728 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 155-156 chrX 87047450 87047705 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -470225 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 145-34 chr12 12490781 12491095 + 0.75 NA intron (NM_030640, intron 4 of 6).2 Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 71925 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 125.5-228 chr7 23980413 23980627 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 270301 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 156.75-33 chr11 37008367 37008711 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -410260 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 156.75-124 chr4 74137108 74137434 + 0.75 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) L1MA4|LINE|L1 13998 NM_001351311 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 167.75-141 chr8 109677317 109677602 + 0.75 NA intron (NM_001099743, intron 1 of 7) intron (NM_001099743, intron 1 of 7) 3507 NM_001099745 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 130.5-239 chr8 47864278 47864618 + 0.75 NA intron (NM_001081640, intron 41 of 84) intron (NM_001081640, intron 41 of 84) 95688 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 262.5-34 chr2 35548422 35548878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77245 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 129.25-114 chr21 26042254 26042575 + 0.75 NA intron (NM_001136131, intron 5 of 15) intron (NM_001136131, intron 5 of 15) 97976 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 120.75-121 chr4 43387803 43388006 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104639 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 138-33 chr13 20266675 20267023 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34454 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 170.5-33 chr11 29549856 29550360 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -44305 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 144-42 chr15 62722464 62722821 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 23 of 55) intron (NM_015059, intron 23 of 55) 75331 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 230.75-9 chr10 60918974 60919372 + 0.75 NA intron (NM_001350908, intron 2 of 11) intron (NM_001350908, intron 2 of 11) 25012 NM_001242359 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 158-94 chr22 27873442 27873713 + 0.75 NA intron (NM_001284278, intron 8 of 11) intron (NM_001284278, intron 8 of 11) 45637 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 171.25-123 chr5 107771240 107771601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100483 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 119-7 chr1 163263961 163264165 + 0.75 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 57728 NR_045630 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 136.25-140 chr5 15552523 15552725 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 51186 NM_001278317 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 156.75-131 chr5 41426372 41426696 + 0.75 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 84067 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 131.5-136 chr20 19103178 19103501 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109303 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 155.75-10 chr1 77414928 77415353 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 7 of 13) intron (NM_012093, intron 7 of 13) 132053 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 161.25-39 chr12 117820712 117820990 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) intron (NM_173598, intron 3 of 19) 148139 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 125.5-110 chr17 74578150 74578523 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6343 NM_001302809 146723 Hs.350775 NM_152460 C17orf77 - chromosome 17 open reading frame 77 protein-coding 163.75-112 chr5 163107563 163107962 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -329809 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 395.25-9 chr7 7147904 7148698 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34314 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 119.5-107 chr18 68359100 68359304 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 355906 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 192.25-84 chr4 184465811 184466189 + 0.75 NA intron (NM_002199, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 8550 NM_002199 3660 Hs.654566 NM_002199 ENSG00000168310 IRF2 IRF-2 interferon regulatory factor 2 protein-coding 129.75-76 chr17 65329892 65330156 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -127517 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 120.25-83 chr2 14080184 14080440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 320646 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 175.25-131 chr7 40225002 40225340 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) intron (NM_024728, intron 6 of 14) 90195 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 166.25-50 chr15 64717548 64717848 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14417 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 179.25-151 chr9 84377230 84377608 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -8692 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 140.75-168 chr7 33254988 33255221 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) L1MA9|LINE|L1 125540 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 228.5-72 chr3 41451235 41451741 + 0.75 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) intron (NR_136342, intron 32 of 34) 251983 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 158-49 chr14 54069493 54069796 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -112753 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 129-10 chr1 163194374 163194592 + 0.75 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR 8433 NM_003617 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 221.75-83 chr8 111546430 111546993 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170072 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 118.25-215 chr9 37528279 37528614 + 0.75 NA intron (NM_012166, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 42498 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 133.25-83 chr18 36561200 36561404 + 0.75 NA intron (NM_001281740, intron 5 of 28) intron (NM_001281740, intron 5 of 28) 102116 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 159.25-44 chr15 81020340 81020632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19563 NM_022566 59274 Hs.513071 NM_022566 ENSG00000140406 TLNRD1 MESDC1 talin rod domain containing 1 protein-coding 129.25-95 chr2 142468468 142468836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -336951 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 133.5-261 chr8 54301956 54302209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28604 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 146.75-168 chr8 129739536 129739858 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46927 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 144.5-161 chr4 140089805 140090144 + 0.75 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) intron (NM_018717, intron 1 of 4) -38041 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 189.75-105 chr6 130868097 130868574 + 0.75 NA intron (NM_001252660, intron 12 of 16) intron (NM_001252660, intron 12 of 16) 40930 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 173.5-88 chr21 29784864 29785173 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 36843 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 126-185 chr9 105639977 105640213 + 0.75 NA non-coding (NR_147214, exon 11 of 11) non-coding (NR_147214, exon 11 of 11) -22362 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 218-31 chr2 21221750 21222196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97987 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 146-66 chr2 105739386 105739645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5397 NM_003581 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 143.75-77 chr18 68120741 68121134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -306115 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 142.75-13 chr1 214901892 214902360 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103416 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 112.75-190 chr7 69633465 69633765 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) L1MA9|LINE|L1 35140 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 140.75-50 chr14 56194653 56194989 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 76410 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 129.25-38 chr12 113589541 113589745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117640 NR_126425 104355219 Hs.641707 NR_126425 LHX5-AS1 locus 4010|locus4010 LHX5 antisense RNA 1 ncRNA 118-50 chr14 56506610 56506906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7573 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 151.75-61 chr2 42868799 42869058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76345 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 217-62 chr4 81908832 81909410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -437214 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 114.25-91 chr2 45962695 45962862 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) intron (NM_005400, intron 2 of 14) 311103 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 168.75-43 chr14 58333762 58334107 + 0.75 NA intron (NM_002892, intron 11 of 23) intron (NM_002892, intron 11 of 23) 35379 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 200.25-81 chr3 185339944 185340457 + 0.75 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) -22936 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 132-56 chr15 56839379 56839602 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -78600 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 134-58 chr14 74273948 74274311 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 28805 NM_001353607 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 183.25-81 chr5 36030384 36030774 + 0.75 NA Intergenic MER70-int|LTR|ERVL -29557 NM_001171873 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 167.5-57 chr14 46368208 46368733 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -102889 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 242-51 chr6 66523749 66524139 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 736065 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 148-61 chr2 156575028 156575295 + 0.75 NA intron (NM_000408, intron 13 of 16) L3|LINE|CR1 138782 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 240.75-76 chr8 117806057 117806736 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 9 of 10) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 114517 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 208.75-51 chr3 15456101 15456591 + 0.75 NA intron (NM_080539, intron 13 of 15) intron (NM_080539, intron 13 of 15) 28748 NM_033083 85403 Hs.716733 NM_033083 ENSG00000144597 EAF1 - ELL associated factor 1 protein-coding 212.25-93 chr8 38441295 38441839 + 0.75 NA intron (NM_001174064, intron 2 of 18) intron (NM_001174064, intron 2 of 18) 26157 NM_001174065 2260 Hs.264887 NM_015850 ENSG00000077782 FGFR1 BFGFR|CD331|CEK|ECCL|FGFBR|FGFR-1|FLG|FLT-2|FLT2|HBGFR|HH2|HRTFDS|KAL2|N-SAM|OGD|bFGF-R-1 fibroblast growth factor receptor 1 protein-coding 131-80 chr2 24307023 24307248 + 0.75 NA intron (NM_001348182, intron 8 of 38) intron (NM_001348182, intron 8 of 38) 53401 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 256-43 chr22 26731954 26732653 + 0.75 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) intron (NR_110543, intron 2 of 5) 59460 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 118.5-156 chr5 4149572 4149890 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 553899 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 130.5-66 chr11 103255885 103256085 + 0.75 NA intron (NM_001377, intron 67 of 88) intron (NM_001377, intron 67 of 88) 146559 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 179.75-113 chr6 18762504 18762786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190861 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 146.75-105 chr3 113635240 113635546 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40517 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 135.25-110 chr2 187291757 187291939 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 156404 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 122.5-222 chr8 83312595 83312821 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -91050 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 166.5-51 chr12 44370359 44370712 + 0.75 NA intron (NM_001286211, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu 505126 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 134.75-189 chr6 118390443 118390622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110841 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 151.75-29 chr11 23691945 23692343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -272954 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 179.5-124 chr3 99800089 99800517 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17559 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 246.75-57 chr5 123475805 123476402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35996 NM_001031812 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 211-14 chr12 12634295 12634771 + 0.75 NA intron (NM_001310, intron 1 of 3) intron (NM_001310, intron 1 of 3) 22657 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 168-89 chr4 70241827 70242143 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_005212) promoter-TSS (NM_005212) -631 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 191.25-35 chr15 67153883 67154218 + 0.75 NA intron (NM_001145103, intron 1 of 8) intron (NM_001145103, intron 1 of 8) -12105 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 150-85 chr22 45664758 45665191 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -6824 NM_001167621 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 168.5-109 chr3 31983405 31983744 + 0.75 NA intron (NM_001137674, intron 1 of 1) intron (NM_001137674, intron 1 of 1) -1724 NM_001174060 114884 Hs.150122 NM_017784 ENSG00000144645 OSBPL10 ORP10|OSBP9 oxysterol binding protein like 10 protein-coding 157.25-17 chr10 94253789 94254063 + 0.75 NA intron (NM_001165979, intron 8 of 31) intron (NM_001165979, intron 8 of 31) 33144 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 153.75-55 chr16 61704350 61704613 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) intron (NM_001796, intron 10 of 11) 331957 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 179-90 chr8 117469415 117469730 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51141 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 168.25-66 chr2 5875248 5875514 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -57306 NR_026832 150622 Hs.560891 NR_026832 SILC1 LINC01105 sciatic injury induced lincRNA upregulator of SOX11 ncRNA 121.5-46 chr11 80924858 80925049 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -162150 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 121.25-47 chr13 30365105 30365266 + 0.75 NA intron (NR_024464, intron 3 of 4) intron (NR_024464, intron 3 of 4) 8729 NR_024464 100188949 Hs.439791 NR_024464 ENSG00000238121 LINC00426 - long intergenic non-protein coding RNA 426 ncRNA 199.75-94 chrX 84117033 84117389 + 0.75 NA intron (NM_014496, intron 10 of 21) intron (NM_014496, intron 10 of 21) 70724 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 144.25-36 chr10 120157044 120157283 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 198060 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 205-78 chr8 91681993 91682433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 335467 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 182.75-57 chr17 73674384 73674730 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -30112 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 166.5-22 chr10 17145530 17145962 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001321007, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001321007, exon 12 of 12) -15929 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 207.25-7 chr10 15794959 15795536 + 0.75 NA intron (NM_024948, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR 65260 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 163.25-119 chr5 109255154 109255573 + 0.75 NA intron (NR_149040, intron 3 of 3) intron (NR_149040, intron 3 of 3) 71006 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 119.75-208 chr9 13940718 13940897 + 0.75 NA intron (NR_038194, intron 1 of 2) intron (NR_038194, intron 1 of 2) 12836 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 220-25 chr17 76166777 76167227 + 0.75 NA intron (NM_052916, intron 5 of 18) intron (NM_052916, intron 5 of 18) -25757 NM_001454 2302 Hs.651204 NM_001454 ENSG00000129654 FOXJ1 FKHL13|HFH-4|HFH4 forkhead box J1 protein-coding 146.75-181 chrX 98685172 98685676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1120889 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 165-73 chr2 157801393 157801682 + 0.75 NA intron (NM_001111067, intron 2 of 10) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 37093 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 197.25-56 chr2 229535499 229535921 + 0.75 NA intron (NM_139072, intron 5 of 12) AluSx|SINE|Alu 178845 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 129.75-115 chr22 26081446 26081657 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -87911 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 164.25-99 chr3 84932416 84932720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26421 NM_001167675 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 123.5-78 chr17 40315206 40315433 + 0.75 NA intron (NM_000964, intron 1 of 8) FLAM_C|SINE|Alu -2926 NM_001145301 5914 Hs.654583 NM_000964 ENSG00000131759 RARA NR1B1|RAR retinoic acid receptor alpha protein-coding 246-11 chr12 88407407 88407935 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 172800 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 211.5-23 chr11 35901771 35902231 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -41980 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 253-14 chr14 63274441 63275209 + 0.75 NA intron (NM_020663, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 44110 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 171-26 chr12 23739730 23740186 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 8 of 17) L2a|LINE|L2 -155372 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 221-28 chr17 69207647 69208022 + 0.75 NA intron (NM_080282, intron 10 of 39) L1MA8|LINE|L1 27178 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 119.25-2 chr1 31892076 31892346 + 0.75 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 45607 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 264-10 chr11 31753949 31754531 + 0.75 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) L2a|LINE|L2 46421 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 120-180 chr7 97612093 97612333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -119873 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 131.5-111 chr2 52573281 52573664 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 129143 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 148.25-114 chr4 128395778 128396100 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -32077 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 146.75-137 chr6 7671392 7671648 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54579 NM_001718 654 Hs.285671 NM_001718 ENSG00000153162 BMP6 VGR|VGR1 bone morphogenetic protein 6 protein-coding 125.75-92 chr2 76284826 76285019 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -574007 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 164.25-132 chr5 144755118 144755426 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 549881 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 153-151 chr8 80712457 80712674 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) CR1_Mam|LINE|CR1 161903 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 142.75-145 chr4 80316669 80316964 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -18904 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 140-163 chr7 91135380 91135598 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -128944 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 147.75-69 chr2 76763615 76763924 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -222196 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 138.75-190 chr8 84144518 84144924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38066 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 116.25-237 chr8 137235571 137235805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 177900 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 134.5-72 chr15 41045011 41045346 + 0.75 NA intron (NM_017553, intron 23 of 35) intron (NM_017553, intron 23 of 35) 71068 NR_104038 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 188-84 chr8 132076584 132076961 + 0.75 NA intron (NM_001145095, intron 11 of 15) intron (NM_001145095, intron 11 of 15) -17390 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 233.5-113 chr9 13056587 13057036 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -84178 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 138.5-193 chr8 108127657 108127841 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -44129 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 212.75-55 chr20 19917859 19918210 + 0.75 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) intron (NM_001242581, intron 2 of 11) 28468 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 148.75-132 chr5 39073716 39074014 + 0.75 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) CpG 534 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 175.5-40 chr12 44054913 44055331 + 0.75 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 219041 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 158.5-81 chr17 58079257 58079550 + 0.75 NA non-coding (NR_110809, exon 2 of 3) non-coding (NR_110809, exon 2 of 3) 3801 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 116.25-197 chr6 72199505 72199684 + 0.75 NA intron (NM_014989, intron 6 of 33) HAL1ME|LINE|L1 -13299 NM_001350455 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 115.25-14 chr1 106691439 106691646 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -126697 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 141-137 chr6 52407258 52407592 + 0.75 NA 3' UTR (NM_133367, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_133367, exon 2 of 2) -12917 NM_018100 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 222-75 chr7 115132721 115133034 + 0.75 NA intron (NR_126407, intron 2 of 4) HERVL40-int|LTR|ERVL 53919 NR_120521 102724386 Hs.352357 NR_120521 ENSG00000225535 LINC01393 - long intergenic non-protein coding RNA 1393 ncRNA 261-25 chr2 34668784 34669238 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -8546 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 205.75-94 chr9 81823452 81823787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89818 NR_026851 347127 Hs.215235 NM_198509 ENSG00000240632 SPATA31D5P FAM75D5|FAM75D5P SPATA31 subfamily D member 5, pseudogene pseudo 135.5-178 chr7 7185672 7185922 + 0.75 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 3182 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 169.25-110 chr7 49320459 49320809 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 396087 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 207.75-73 chr3 63231614 63232099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46452 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 134.5-48 chr12 30880129 30880357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46505 NM_001370302 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 135.75-211 chr9 77826201 77826404 + 0.75 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) -177980 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 126.5-271 chrX 49290642 49290938 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12856 NM_001098413 102724473 NM_001098413 ENSG00000215274 GAGE10 GAGE-10 G antigen 10 protein-coding 210.5-48 chr16 73000654 73001081 + 0.75 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) intron (NM_006885, intron 1 of 9) 47261 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 113.25-128 chr4 173156976 173157256 + 0.75 NA intron (NR_134241, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 -11695 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 133-17 chr11 17117281 17117581 + 0.75 NA intron (NM_001321380, intron 18 of 31) intron (NM_001321380, intron 18 of 31) -39764 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 220.5-73 chr3 44086046 44086453 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -27963 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 136-11 chr10 16500784 16501048 + 0.75 NA intron (NM_001261837, intron 4 of 4) intron (NM_001261837, intron 4 of 4) 20963 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 136-36 chr13 72237824 72238122 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -370769 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 158.25-130 chr7 13909487 13909988 + 0.75 NA intron (NM_001163147, intron 8 of 11) intron (NM_001163147, intron 8 of 11) 76777 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 124.5-2 chr1 18585095 18585332 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -45633 NM_002584 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 156.5-205 chr9 80928456 80928872 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 760871 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 222.75-95 chr8 77159547 77160048 + 0.75 NA Intergenic Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -158753 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 155.5-65 chr17 29048500 29048789 + 0.75 NA intron (NM_016518, intron 2 of 7) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 5503 NM_016518 51268 Hs.462585 NM_016518 ENSG00000179761 PIPOX LPIPOX pipecolic acid and sarcosine oxidase protein-coding 183.5-73 chr2 177018834 177019176 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 193406 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 120.75-155 chr7 25960562 25960840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10715 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 140.75-86 chr2 67545132 67545537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148001 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 122-174 chr7 99818302 99818647 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9539 NM_022820 64816 Hs.306220 NM_022820 ENSG00000021461 CYP3A43 - cytochrome P450 family 3 subfamily A member 43 protein-coding 120-174 chr7 53800254 53800465 + 0.75 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) intron (NR_038371, intron 1 of 5) 11572 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 137-20 chr10 17439721 17440032 + 0.75 NA intron (NM_001004470, intron 2 of 7) LTR52-int|LTR|ERVL 14719 NM_001345961 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 215.75-28 chr12 89467987 89468515 + 0.75 NA intron (NM_172240, intron 7 of 11) L2|LINE|L2 56545 NM_003774 8693 Hs.25130 NM_003774 ENSG00000257594 GALNT4 GALNAC-T4|GALNACT4 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4 protein-coding 148.5-205 chr7 8074868 8075245 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 6 of 7) intron (NM_138426, intron 6 of 7) 106260 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 125.5-269 chr9 76410711 76411017 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 12265 NR_026890 653162 Hs.655646 NR_026890 RPSAP9 LAMR1P9|RPSA_20_986 ribosomal protein SA pseudogene 9 pseudo 169.5-103 chr3 33661351 33661579 + 0.75 NA intron (NM_001365634, intron 7 of 35) L2|LINE|L2 -1786 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 156.75-28 chr10 113798439 113798876 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20603 NR_039703 100616162 NR_039703 ENSG00000283656 MIR4483 - microRNA 4483 ncRNA 149.25-47 chr14 55745965 55746372 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20077 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 170.25-62 chr2 9899299 9899558 + 0.75 NA intron (NM_001318977, intron 7 of 13) L1MB3|LINE|L1 -52265 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 126-141 chr5 67971581 67971924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178539 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 156.25-146 chr8 80110042 80110418 + 0.75 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) MER57A-int|LTR|ERV1 -29399 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 269.75-41 chr4 53189131 53189608 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 176692 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 114.5-164 chr21 26223637 26223855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52618 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 121-74 chr15 88034774 88035032 + 0.75 NA intron (NM_001007156, intron 13 of 15) intron (NM_001007156, intron 13 of 15) -88635 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 166.75-81 chr20 3205301 3205717 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_023935) promoter-TSS (NM_023935) -827 NM_023935 65992 Hs.471975 NM_023935 ENSG00000198171 DDRGK1 C20orf116|SEMDSH|UFBP1|dJ1187M17.3 DDRGK domain containing 1 protein-coding 267-35 chr4 67946291 67946878 + 0.75 NA intron (NM_001114387, intron 1 of 9) intron (NM_001114387, intron 1 of 9) 16909 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 194.25-49 chr17 66137976 66138314 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 4 of 26) LOR1a|LTR|ERV1 53747 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 189.5-65 chr2 10110021 10110407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12354 NM_001165931 6241 Hs.226390 NM_001034 ENSG00000171848 RRM2 R2|RR2|RR2M ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 protein-coding 129.75-162 chr6 90573738 90573967 + 0.75 NA intron (NM_145331, intron 1 of 16) intron (NM_145331, intron 1 of 16) 13220 NM_003188 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 245.75-23 chr18 4129239 4129889 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -135038 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 163.25-132 chr7 95465435 95465701 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -20333 NM_145872 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 123.5-162 chr5 53003757 53004034 + 0.75 NA intron (NR_073107, intron 1 of 28) FLAM_C|SINE|Alu 14543 NR_073106 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 116.5-8 chr1 82445339 82445583 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -457722 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 192.75-72 chr20 34482993 34483489 + 0.75 NA intron (NM_001257137, intron 21 of 25) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 16916 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 119.75-84 chr18 4761360 4761632 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -306189 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 223.5-49 chr17 17559723 17560147 + 0.75 NA intron (NM_148173, intron 2 of 6) intron (NM_148173, intron 2 of 6) 17561 NM_148173 10400 Hs.714193 NM_007169 ENSG00000133027 PEMT PEAMT|PEMPT|PEMT2|PLMT|PNMT phosphatidylethanolamine N-methyltransferase protein-coding 112.25-78 chr17 70595920 70596093 + 0.75 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 426471 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 124-179 chr9 114295174 114295558 + 0.75 NA intron (NM_032888, intron 49 of 60) L1ME1|LINE|L1 -27657 NM_000607 5004 Hs.522356 NM_000607 ENSG00000229314 ORM1 AGP-A|AGP1|HEL-S-153w|ORM orosomucoid 1 protein-coding 136.25-17 chr10 67591044 67591283 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) intron (NM_001127384, intron 3 of 17) 74497 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 129.25-93 chr2 120129052 120129320 + 0.75 NA intron (NM_001330310, intron 17 of 24) L1PA17|LINE|L1 94214 NM_024121 79134 Hs.376722 NM_024121 ENSG00000226479 TMEM185B FAM11B transmembrane protein 185B protein-coding 182.25-129 chr8 144511503 144511907 + 0.75 NA TTS (NM_138431) TTS (NM_138431) 2635 NM_138431 113655 Hs.7678 NM_138431 ENSG00000167700 MFSD3 - major facilitator superfamily domain containing 3 protein-coding 164.5-167 chr5 138904991 138905417 + 0.75 NA intron (NM_001323995, intron 7 of 14) AluJb|SINE|Alu 29804 NM_001324006 1495 Hs.445981 NM_001903 ENSG00000044115 CTNNA1 CAP102|MDPT2 catenin alpha 1 protein-coding 173.5-53 chr17 51544251 51544540 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 108968 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 155.5-151 chr4 107009607 107009872 + 0.75 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 26574 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 166.75-23 chr11 40344474 40344740 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1PA13|LINE|L1 -51477 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 154.75-26 chr12 10790160 10790390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12352 NM_023919 50837 Hs.533754 NM_023919 ENSG00000121377 TAS2R7 T2R7|TRB4 taste 2 receptor member 7 protein-coding 160.25-145 chr7 11365377 11365652 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 391642 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 124-102 chr20 41405445 41405712 + 0.75 NA intron (NM_032221, intron 36 of 36) intron (NM_032221, intron 36 of 36) -38760 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 131.75-147 chr4 32461977 32462183 + 0.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 111042 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 131.25-215 chr9 74311992 74312199 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -59436 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 202.25-51 chr3 31592856 31593272 + 0.75 NA intron (NM_178862, intron 3 of 15) L1M4c|LINE|L1 60139 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 198.75-10 chr1 237556149 237556614 + 0.75 NA intron (NM_001035, intron 27 of 104) AluSx3|SINE|Alu 85262 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 165-146 chr8 108337076 108337359 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -88500 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 295.5-44 chr4 119595501 119596024 + 0.75 NA intron (NM_033437, intron 3 of 20) MLT2B2|LTR|ERVL 31975 NM_033430 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 186.75-89 chr5 83821276 83821642 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -100604 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 169.75-129 chr5 88480309 88480598 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41363 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 127.25-125 chr3 101355670 101355885 + 0.75 NA intron (NM_020654, intron 11 of 23) L1PREC2|LINE|L1 -35202 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 303.75-6 chr1 198093628 198094384 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -62992 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 118.75-96 chr2 64303348 64303672 + 0.75 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -37249 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 116-140 chr6 104952636 104953003 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4288 NM_001004317 389421 Hs.23616 NM_001004317 ENSG00000187772 LIN28B CSDD2 lin-28 homolog B protein-coding 196.75-46 chr16 71514026 71514428 + 0.75 NA intron (NR_135172, intron 1 of 1) intron (NR_135172, intron 1 of 1) 416 NR_135171 105371335 Hs.564879 NR_135171 ENSG00000260520 LOC105371335 - uncharacterized LOC105371335 ncRNA 128.75-211 chr9 96654544 96654793 + 0.75 NA intron (NM_153698, intron 2 of 5) CpG 649 NM_153698 195827 Hs.44640 NM_153698 ENSG00000158122 PRXL2C AAED1|C9orf21 peroxiredoxin like 2C protein-coding 128-147 chr7 19566055 19566382 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 139218 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 157.75-76 chr18 41761980 41762236 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193126 NM_001308020 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 191-69 chr5 121105660 121106037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -216702 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 167-35 chr14 20094850 20095219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22434 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 276.5-42 chr3 52365906 52366697 + 0.75 NA intron (NM_015512, intron 34 of 77) MIR|SINE|MIR 43707 NM_004656 8314 Hs.106674 NM_004656 ENSG00000163930 BAP1 HUCEP-13|UCHL2|hucep-6 BRCA1 associated protein 1 protein-coding 132.5-82 chr15 93283800 93284144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77906 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 372-10 chr17 8906984 8907607 + 0.75 NA intron (NM_001142633, intron 3 of 18) AluSc5|SINE|Alu 5222 NM_014308 23533 Hs.278901 NM_014308 ENSG00000141506 PIK3R5 F730038I15Rik|FOAP-2|P101-PI3K|p101 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 protein-coding 136.25-31 chr11 37045477 37045730 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -447324 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 171.5-62 chr18 1594176 1594449 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -234683 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 119.5-258 chr9 119656422 119656693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -278503 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 124.75-50 chr12 12479303 12479717 + 0.75 NA intron (NM_030640, intron 6 of 6).2 intron (NM_030640, intron 6 of 6).2 83353 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 153-74 chr2 109479696 109480033 + 0.75 NA intron (NM_001099289, intron 8 of 9) intron (NM_001099289, intron 8 of 9) 133803 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 120.25-54 chr13 53755865 53756079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59447 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 219.75-21 chr15 60378107 60378518 + 0.75 NA intron (NM_001002857, intron 4 of 13) L1MB8|LINE|L1 19674 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 158.5-143 chr4 96852660 96852934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -514129 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-48 chr12 10396886 10397100 + 0.75 NA non-coding (NR_120430, exon 4 of 4) non-coding (NR_120430, exon 4 of 4) -6952 NM_007360 22914 Hs.387787 NM_007360 ENSG00000213809 KLRK1 CD314|D12S2489E|KLR|NKG2-D|NKG2D killer cell lectin like receptor K1 protein-coding 141.5-23 chr11 36895108 36895309 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -296929 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 128.5-197 chr6 132126391 132126708 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -7429 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 158-90 chr21 28517960 28518290 + 0.75 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -21193 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 140.5-116 chr2 125302494 125302773 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 815352 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 132-102 chr22 28541429 28541852 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEc|LINE|L1 81771 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 152.25-82 chr2 61986765 61987055 + 0.75 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 81268 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 122-139 chr5 95599923 95600161 + 0.75 NA intron (NM_198150, intron 6 of 7) intron (NM_198150, intron 6 of 7) -20045 NM_199243 285601 Hs.143315 NM_199243 ENSG00000178015 GPR150 PGR11 G protein-coupled receptor 150 protein-coding 174.25-42 chr13 68529437 68529733 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 355740 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 138.75-30 chr11 66053266 66053567 + 0.75 NA TTS (NR_145738) TTS (NR_145738) 272 NR_145738 109616986 NR_145738 SNORD13F - small nucleolar RNA, C/D box 13F snoRNA 158.75-44 chr12 112778813 112779163 + 0.75 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -12550 NM_001347953 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 119.75-181 chr6 42578617 42578829 + 0.75 NA intron (NM_015255, intron 2 of 46) intron (NM_015255, intron 2 of 46) 14694 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 180.5-155 chr8 108691103 108691434 + 0.75 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 96326 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 140.5-142 chr22 37398911 37399262 + 0.75 NA intron (NM_052906, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 28384 NR_110512 114794 Hs.344170 NM_052906 ENSG00000166897 ELFN2 LRRC62|PPP1R29 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 120.5-5 chr1 73625227 73625462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49335 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 211.5-32 chr12 1039491 1039823 + 0.75 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) intron (NR_027949, intron 2 of 15) 11909 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 119.25-14 chr1 170537449 170537767 + 0.75 NA intron (NM_001320252, intron 3 of 6) MER102b|DNA|hAT-Charlie -4999 NR_125958 101928650 Hs.676662 NR_125958 GORAB-AS1 - GORAB antisense RNA 1 ncRNA 137.5-190 chr5 44859779 44860020 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 50952 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 224.25-29 chr14 21637697 21638100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2958 NM_001005466 26534 Hs.554580 NM_001005466 ENSG00000255582 OR10G2 OR14-41 olfactory receptor family 10 subfamily G member 2 protein-coding 160.5-111 chr3 10894680 10894982 + 0.75 NA intron (NM_014229, intron 6 of 13) L1MA8|LINE|L1 78603 NM_014229 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 178.5-139 chr5 55698429 55698815 + 0.75 NA intron (NM_001349385, intron 2 of 14) intron (NM_001349385, intron 2 of 14) -5569 NR_047649 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 194.75-44 chr19 31847468 31847867 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -178195 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 202.75-99 chr6 47082772 47083090 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -40599 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 161.5-141 chr4 31712743 31713139 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 206397 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 322-15 chr17 35257974 35258486 + 0.75 NA intron (NM_144975, intron 1 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 15158 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 188.25-93 chr5 86907784 86908062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161105 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 193.25-85 chr4 180363328 180363731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 795620 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 135-170 chr7 82364518 82364870 + 0.75 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 79083 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 194.25-70 chr3 28019772 28020079 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -185789 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 112.5-3 chr1 53028454 53028725 + 0.75 NA intron (NM_001007250, intron 2 of 3) intron (NM_001007250, intron 2 of 3) 13651 NM_001007250 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 176.5-163 chr7 131509830 131510164 + 0.75 NA intron (NM_005397, intron 2 of 7) intron (NM_005397, intron 2 of 7) 46631 NM_001018111 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 133.5-54 chr11 88565427 88565692 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 7 of 8) intron (NM_001143831, intron 7 of 8) 60983 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 229.75-73 chr8 49561123 49561558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49160 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 154.5-56 chr13 62838890 62839317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31744 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 128.5-12 chr1 104652422 104652629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 579502 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 169.5-39 chr12 87014997 87015429 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -176213 NM_001351286 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 128.75-50 chr12 127257334 127257583 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 26825 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 269.25-60 chr9 125343515 125343912 + 0.75 NA intron (NM_001282680, intron 19 of 27) L2a|LINE|L2 81887 NM_001354294 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 277.75-8 chr16 3766489 3767060 + 0.75 NA intron (NM_004380, intron 16 of 30) AluJr|SINE|Alu -49250 NM_001272049 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 116.25-134 chr3 20056735 20056958 + 0.75 NA intron (NM_003884, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 16400 NM_003884 8850 Hs.533055 NM_003884 ENSG00000114166 KAT2B CAF|P/CAF|PCAF lysine acetyltransferase 2B protein-coding 211.5-4 chr1 84963076 84963425 + 0.75 NA intron (NM_153259, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 33863 NM_001330647 255231 Hs.591446 NM_153259 ENSG00000153898 MCOLN2 TRP-ML2|TRPML2 mucolipin 2 protein-coding 114.25-166 chr6 50673615 50673844 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -39815 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 166.75-5 chr1 185840455 185840911 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 106292 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 177.75-39 chr14 34889668 34890039 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14493 NM_182648 11177 Hs.509140 NM_013448 ENSG00000198604 BAZ1A ACF1|WALp1|WCRF180|hACF1 bromodomain adjacent to zinc finger domain 1A protein-coding 214.25-70 chr5 120396232 120396633 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67846 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 126.25-64 chr17 1965399 1965633 + 0.75 NA intron (NM_178568, intron 1 of 1) intron (NM_178568, intron 1 of 1) -52200 NR_135642 105371485 Hs.655867 NR_135642 ENSG00000228133 LOC105371485 - uncharacterized LOC105371485 ncRNA 132.75-194 chr8 138258121 138258339 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 4 of 19) intron (NM_015912, intron 4 of 19) -174685 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 123.25-127 chr3 33687448 33687698 + 0.75 NA intron (NM_001365634, intron 4 of 35) intron (NM_001365634, intron 4 of 35) -27894 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 138.5-209 chr9 74539006 74539293 + 0.75 NA intron (NM_006914, intron 1 of 9) intron (NM_006914, intron 1 of 9) -40596 NR_125791 103752585 Hs.635501 NR_125791 RORB-AS1 - RORB antisense RNA 1 ncRNA 137-188 chr9 76460997 76461263 + 0.75 NA intron (NM_001490, intron 2 of 3) intron (NM_001490, intron 2 of 3) 1948 NM_001490 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 121.5-237 chr7 33358105 33358304 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 16 of 22) (TTATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 228640 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 126.5-95 chr18 594947 595148 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1951 NM_014410 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 210.5-121 chr7 42437842 42438242 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -200833 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 241.75-15 chr11 87411193 87411607 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 308011 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 184.25-129 chr9 24753878 24754372 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -208228 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 210.5-83 chr3 131729575 131729982 + 0.75 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) -226807 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 254.5-19 chr12 19410683 19411235 + 0.75 NA Intergenic (AACTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28533 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 156.75-49 chr13 64672047 64672343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -596184 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 112.25-28 chr11 33069247 33069445 + 0.75 NA intron (NM_001145541, intron 9 of 9) intron (NM_001145541, intron 9 of 9) -6804 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 151.25-36 chr11 119048534 119048735 + 0.75 NA intron (NM_006389, intron 18 of 25).2 intron (NM_006389, intron 18 of 25).2 8571 NM_001130991 10525 Hs.277704 NM_006389 ENSG00000149428 HYOU1 GRP-170|Grp170|HSP12A|IMD59|ORP-150|ORP150 hypoxia up-regulated 1 protein-coding 114.25-112 chr20 41747172 41747480 + 0.75 NA Intergenic L1P4b|LINE|L1 -128949 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 121-91 chr18 62466337 62466566 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -56574 NM_017742 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 130.75-71 chr17 64051231 64051639 + 0.75 NA intron (NM_001433, intron 17 of 21) L1MC4|LINE|L1 -30801 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 236-68 chr7 91004173 91004538 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) L1MD|LINE|L1 -260078 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 206.5-112 chr6 116903116 116903631 + 0.75 NA intron (NM_173560, intron 6 of 18) intron (NM_173560, intron 6 of 18) 26131 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 133.75-93 chr2 27885367 27885599 + 0.75 NA intron (NM_001287580, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 -3226 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 166.25-10 chr1 101943737 101944015 + 0.75 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 53358 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 139.75-30 chr12 11659145 11659525 + 0.75 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 9481 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 135.75-22 chr10 51349309 51349596 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 49879 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 202.25-35 chr2 10785211 10785581 + 0.75 NA TTS (NM_144583) TTS (NM_144583) 27389 NM_005742 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 132-161 chr7 40667093 40667356 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) L1P4|LINE|L1 312715 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 255.5-78 chr7 77578515 77579029 + 0.75 NA intron (NM_001131009, intron 2 of 16) intron (NM_001131009, intron 2 of 16) 40729 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 128.75-203 chr8 110504913 110505132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 522411 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 143.5-60 chr14 44253462 44253837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 253634 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 157-30 chr14 72940215 72940578 + 0.75 NA intron (NM_181341, intron 4 of 11) intron (NM_181341, intron 4 of 11) 13932 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 166.5-207 chr8 128258449 128258719 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 108468 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 249.25-19 chr19 8011610 8011961 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -6144 NM_001419 1994 Hs.184492 NM_001419 ENSG00000066044 ELAVL1 ELAV1|HUR|Hua|MelG ELAV like RNA binding protein 1 protein-coding 114-65 chr19 51103975 51104230 + 0.75 NA exon (NM_145232, exon 2 of 3) exon (NM_145232, exon 2 of 3) 4307 NM_145232 90353 Hs.148425 NM_145232 ENSG00000142544 CTU1 ATPBD3|NCS6 cytosolic thiouridylase subunit 1 protein-coding 289.75-30 chr8 87957067 87957637 + 0.75 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -83337 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 112.75-170 chr5 139104416 139104664 + 0.75 NA intron (NM_022464, intron 3 of 9) intron (NM_022464, intron 3 of 9) 93828 NM_001037633 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 212.25-50 chr20 39653801 39654160 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -350481 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 296.5-10 chr14 61926011 61926632 + 0.75 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) L3|LINE|CR1 -1374 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 149.5-35 chr10 100018156 100018419 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -8340 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 128.5-155 chr4 19711437 19711815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -540279 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 136.25-157 chr5 154777401 154777828 + 0.75 NA intron (NM_001367719, intron 1 of 18) intron (NM_001367719, intron 1 of 18) 20460 NM_001367719 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 212-45 chr2 228374997 228375411 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -193517 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 121.75-149 chr5 75707431 75707615 + 0.75 NA intron (NM_152408, intron 2 of 10) intron (NM_152408, intron 2 of 10) 4932 NM_152408 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 140-147 chr6 21104684 21105113 + 0.75 NA intron (NM_017774, intron 12 of 15) intron (NM_017774, intron 12 of 15) 406994 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 182-35 chr14 71959656 71960033 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 26317 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 142.5-214 chr7 154809860 154810205 + 0.75 NA intron (NR_157196, intron 16 of 25) AluSz6|SINE|Alu -118485 NR_024477 100132707 Hs.586358 NR_024476 ENSG00000214106 PAXIP1-AS2 PAXIP1OS PAXIP1 antisense RNA 2 ncRNA 147.5-112 chr2 169581597 169581938 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2584 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 276.25-6 chr11 43888653 43889139 + 0.75 NA intron (NM_139178, intron 5 of 9) intron (NM_139178, intron 5 of 9) 8065 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 147-21 chr10 109143227 109143490 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 779888 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 185.25-48 chr17 83141177 83141498 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 60191 NM_001363853 284207 Hs.378821 NM_001004431 ENSG00000176845 METRNL - meteorin like, glial cell differentiation regulator protein-coding 164.25-111 chr4 42373713 42374239 + 0.75 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) LTR12_|LTR|ERV1 17292 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 225.5-13 chr10 31762697 31763235 + 0.75 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 145960 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 143-2 chr1 48600744 48601110 + 0.75 NA intron (NM_001323575, intron 9 of 12) intron (NM_001323575, intron 9 of 12) -128719 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 159.25-10 chr1 223455745 223456010 + 0.75 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 62462 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 223.75-57 chr22 23655990 23656451 + 0.75 NA intron (NR_024448, intron 11 of 11) intron (NR_024448, intron 11 of 11) -23899 NM_016449 51233 Hs.517466 NM_016449 ENSG00000189269 DRICH1 C22orf43|KB-208E9.1 aspartate rich 1 protein-coding 137.25-114 chr4 122163355 122163586 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -7133 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 157.25-12 chr10 34298882 34299242 + 0.75 NA intron (NM_001184790, intron 18 of 22) intron (NM_001184790, intron 18 of 22) 516234 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 145-170 chr9 109271103 109271300 + 0.75 NA intron (NM_019114, intron 2 of 25) intron (NM_019114, intron 2 of 25) 49763 NM_019114 54566 Hs.591901 NM_018424 ENSG00000095203 EPB41L4B CG1|EHM2 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B protein-coding 127.75-124 chr3 1792347 1792543 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -306358 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 167.5-98 chr2 133599474 133599803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31175 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 213.5-117 chr7 49100235 49100766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175953 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 114.5-185 chr3 197837969 197838214 + 0.75 NA intron (NM_001365717, intron 9 of 19) intron (NM_001365717, intron 9 of 19) 46837 NM_001365715 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 158.75-146 chr6 78848821 78849181 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18550 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 214-27 chr18 67639736 67640087 + 0.75 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) -123191 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 137-155 chr6 131310648 131310955 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 60397 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 117.5-29 chr10 21945083 21945291 + 0.75 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) L2|LINE|L2 58543 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 116.25-41 chr11 88416264 88416543 + 0.75 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -78667 NM_001114173 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 155-104 chr4 170819376 170819635 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75770 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 154.75-15 chr10 120247082 120247430 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 107967 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 142-11 chr1 221072772 221073060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -192776 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 191.25-21 chr11 114865745 114866178 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 187434 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 171-69 chr2 80344329 80344668 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 31119 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 156.25-4 chr1 96192287 96192530 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 181717 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 155-95 chr4 54196051 54196336 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33100 NM_001347827 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 201.75-57 chr3 12977914 12978195 + 0.75 NA intron (NM_001134382, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 9047 NM_001330619 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 181.25-7 chr1 117320746 117321067 + 0.75 NA intron (NR_126408, intron 2 of 2) MER39|LTR|ERV1 25440 NR_126408 104355292 Hs.576446 NR_126408 ENSG00000235202 LINC01525 lnc-MAN1A2-1 long intergenic non-protein coding RNA 1525 ncRNA 236-56 chr5 86207629 86208023 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74618 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 189.75-121 chr8 43743491 43743907 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 451257 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 138.5-126 chr22 38442972 38443323 + 0.75 NA intron (NM_152868, intron 1 of 1) intron (NM_152868, intron 1 of 1) 881 NM_004981 3761 Hs.32505 NM_004981 ENSG00000168135 KCNJ4 HIR|HIRK2|HRK1|IRK-3|IRK3|Kir2.3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 4 protein-coding 221-65 chr5 133120576 133120992 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68771 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 135.25-173 chr6 2743113 2743353 + 0.75 NA intron (NM_001012418, intron 2 of 12) intron (NM_001012418, intron 2 of 12) 7689 NM_001012418 340156 Hs.127830 NM_001012418 ENSG00000145949 MYLK4 SgK085 myosin light chain kinase family member 4 protein-coding 143.5-200 chr7 84811400 84811664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 279056 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 206.25-100 chr6 163273946 163274260 + 0.75 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) L1PA5|LINE|L1 50370 NR_028390 285796 Hs.668693 NR_028390 ENSG00000281692 PACRG-AS1 - PACRG antisense RNA 1 ncRNA 133.75-36 chr11 108420696 108421003 + 0.75 NA intron (NM_001351110, intron 2 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 46680 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 131-2 chr1 45967984 45968217 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 5 of 29) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 103752 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 178-46 chr2 105920434 105920772 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68756 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 120.25-224 chr9 75271855 75272130 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 183478 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 154.75-129 chr6 143917412 143917714 + 0.75 NA intron (NM_001013623, intron 6 of 7) L1M4c|LINE|L1 43847 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 174.25-85 chr20 37227191 37227496 + 0.75 NA intron (NM_001135771, intron 10 of 16) intron (NM_001135771, intron 10 of 16) 29565 NM_001184731 2691 Hs.37023 NM_021081 ENSG00000118702 GHRH GHRF|GRF|INN growth hormone releasing hormone protein-coding 168-108 chr6 5931616 5931885 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72294 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 132-152 chr6 131990077 131990358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38845 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 116.5-142 chr20 40925816 40926080 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -54765 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 184-79 chr6 70291187 70291554 + 0.75 NA intron (NM_001851, intron 5 of 37) L2c|LINE|L2 -8173 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 133.75-195 chr8 123553904 123554237 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12864 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 201.25-46 chr2 78772478 78772886 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 227151 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 113-187 chr9 135473241 135473415 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -1079 NR_038969 100506599 Hs.561897 NR_038969 ENSG00000225361 PPP1R26-AS1 - PPP1R26 antisense RNA 1 ncRNA 113.25-30 chr11 109507764 109508000 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 85692 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 132.75-49 chr12 56437190 56437388 + 0.75 NA intron (NR_138471, intron 1 of 28) intron (NR_138471, intron 1 of 28) 12137 NM_003920 8914 Hs.118631 NM_003920 ENSG00000111602 TIMELESS TIM|TIM1|hTIM timeless circadian regulator protein-coding 130.5-131 chr2 58009289 58009537 + 0.75 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) -37229 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 188.5-50 chr16 22683822 22684230 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -130136 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 155.25-40 chr11 88691790 88692171 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 187404 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 151.75-146 chr8 11172409 11172739 + 0.75 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) 28792 NR_138152 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 132.5-112 chr2 41204959 41205261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -672445 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 251.5-78 chr7 37795787 37796201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52603 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 146.5-55 chr12 100547743 100548078 + 0.75 NA intron (NR_135146, intron 9 of 10) AluSc8|SINE|Alu -25774 NM_001363672 283431 Hs.20575 NM_174942 ENSG00000139354 GAS2L3 G2L3 growth arrest specific 2 like 3 protein-coding 175-124 chr7 97576306 97576612 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -155627 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 200.75-34 chr15 76585984 76586400 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_037464) promoter-TSS (NR_037464) -455 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 199-43 chr20 5137057 5137446 + 0.75 NA intron (NM_003818, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 10243 NM_003818 8760 Hs.126857 NM_003818 ENSG00000101290 CDS2 - CDP-diacylglycerol synthase 2 protein-coding 161.25-99 chr2 166185475 166185726 + 0.75 NA intron (NR_110260, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 -36439 NM_001353950 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 180-74 chr20 63203005 63203349 + 0.75 NA exon (NM_017798, exon 4 of 5) exon (NM_017798, exon 4 of 5) 12954 NM_017798 54915 Hs.744852 NM_017798 ENSG00000149658 YTHDF1 C20orf21 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 protein-coding 114.75-96 chr2 129789135 129789379 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 88234 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 158-38 chr12 13506632 13507018 + 0.75 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -130080 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 237.75-58 chr4 85683204 85683593 + 0.75 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -39070 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 116.75-126 chr3 80754654 80754810 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -10165 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 192.5-94 chr3 173846556 173846955 + 0.75 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) 74041 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 179-69 chr3 184540991 184541502 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15672 NR_046593 100874079 Hs.574899 NR_046593 ENSG00000230215 LINC01840 EIF2B5-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 1840 ncRNA 129-90 chr2 54348192 54348585 + 0.75 NA intron (NM_001369403, intron 2 of 3) (TTCTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17504 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 139-11 chr10 21092374 21092757 + 0.75 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) Plat_L3|LINE|CR1 -81425 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 234.75-42 chr20 54393334 54393840 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -82006 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 155-22 chr11 48223630 48223862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6936 NM_001005470 119765 Hs.553566 NM_001005470 ENSG00000175619 OR4B1 OR11-106|OST208 olfactory receptor family 4 subfamily B member 1 protein-coding 127.5-85 chr15 28862197 28862428 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -13627 NM_001365371 728310 Hs.589351 NM_001365371 ENSG00000261649 GOLGA6L7 GOLGA6L7P golgin A6 family like 7 protein-coding 200.5-147 chr9 125940678 125941095 + 0.75 NA intron (NR_024122, intron 4 of 7) L1ME3A|LINE|L1 192703 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 188-15 chr11 91442759 91443093 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -573724 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 114.75-199 chr8 135759823 135760107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 302509 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 159.25-156 chr8 124145940 124146290 + 0.75 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) intron (NR_103547, intron 1 of 4) 25407 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 251.5-71 chr5 160376460 160377072 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6140 NM_031908 114898 Hs.110062 NM_031908 ENSG00000145861 C1QTNF2 CTRP2|zacrp2 C1q and TNF related 2 protein-coding 180-41 chr15 74048702 74049055 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 33672 NM_001038640 342096 Hs.546408 NM_001038640 ENSG00000159289 GOLGA6A GLP|GOLGA6 golgin A6 family member A protein-coding 127.25-112 chr21 21972829 21973043 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125523 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 131.75-19 chr1 216020563 216020789 + 0.75 NA intron (NM_206933, intron 32 of 71) MER21C|LTR|ERVL -51789 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 115.75-205 chr7 116262176 116262434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24359 NR_130921 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 145.75-47 chr15 97025891 97026157 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 242589 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 178.75-70 chr4 14747673 14747972 + 0.75 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) intron (NR_126435, intron 2 of 6) 140347 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 190-78 chr8 102192533 102192956 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46087 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 134.5-129 chr3 79411295 79411667 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_110133) promoter-TSS (NR_110133) -246 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 188-33 chr2 27418787 27419235 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8779 NM_001321357 29959 Hs.515876 NM_013392 ENSG00000115216 NRBP1 BCON3|MADM|MUDPNP|NRBP nuclear receptor binding protein 1 protein-coding 147-120 chr6 66736382 66736657 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 948640 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 211-40 chr3 44577007 44577385 + 0.75 NA intron (NM_001288592, intron 5 of 5) AluJr4|SINE|Alu -7768 NR_147692 110354863 Hs.157035 NM_001351732 ZNF660-ZNF197 - ZNF660-ZNF197 readthrough protein-coding 180-93 chr4 97769360 97769734 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) intron (NM_174952, intron 9 of 10) 373929 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 173-13 chr10 26154093 26154420 + 0.75 NA intron (NM_017433, intron 24 of 34) AluSx1|SINE|Alu -62051 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 158.25-27 chr11 113313922 113314208 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_147891) promoter-TSS (NR_147891) -518 NR_147891 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 137.75-170 chr5 154009140 154009431 + 0.75 NA intron (NM_001317993, intron 10 of 14) L1MC4|LINE|L1 29625 NM_001317995 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 124.25-80 chr17 53813958 53814256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8820 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 206.5-129 chr8 29031006 29031385 + 0.75 NA intron (NM_001324384, intron 6 of 10) intron (NM_001324384, intron 6 of 10) 139881 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 218.5-103 chr5 157115015 157115487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6207 NM_032782 84868 Hs.710500 NM_032782 ENSG00000135077 HAVCR2 CD366|HAVcr-2|KIM-3|SPTCL|TIM3|TIMD-3|TIMD3|Tim-3 hepatitis A virus cellular receptor 2 protein-coding 165-47 chr15 81864406 81864763 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 181434 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 116.5-200 chr5 65138111 65138379 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 343675 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 120.25-135 chr3 124603779 124604016 + 0.75 NA intron (NM_007064, intron 1 of 26) intron (NM_007064, intron 1 of 26) 19238 NM_001323000 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 179.75-9 chr1 202565088 202565424 + 0.75 NA intron (NM_002481, intron 21 of 23) intron (NM_002481, intron 21 of 23) 25142 NM_001197131 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 116.5-160 chr3 113339417 113339738 + 0.75 NA intron (NM_001164496, intron 24 of 34) HUERS-P2-int|LTR|ERV1 -64421 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-149 chr5 112985514 112985839 + 0.75 NA intron (NR_038352, intron 1 of 8) intron (NR_038352, intron 1 of 8) 8878 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 205-45 chr20 46993714 46994266 + 0.75 NA intron (NM_172110, intron 2 of 13) intron (NM_172110, intron 2 of 13) 99147 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 166-124 chr8 60798842 60799089 + 0.75 NA intron (NM_017780, intron 4 of 37) intron (NM_017780, intron 4 of 37) 57706 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 134.25-61 chr16 69751601 69751819 + 0.75 NA intron (NR_074074, intron 2 of 7) L1MC5|LINE|L1 3216 NM_014062 28987 Hs.271695 NM_014062 ENSG00000141101 NOB1 ART-4|MST158|MSTP158|NOB1P|PSMD8BP1 NIN1 (RPN12) binding protein 1 homolog protein-coding 145.25-68 chr2 28168864 28169163 + 0.75 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) intron (NR_120504, intron 1 of 2) 37948 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 189.25-127 chr8 114745676 114746105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 922123 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 133.5-201 chr5 28233201 28233489 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54320 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 120-81 chr19 34656485 34656721 + 0.75 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 10730 NR_045208 100130342 Hs.679909 NR_045208 SCGB2B3P C2B|SCGB4A3P secretoglobin family 2B member 3, pseudogene pseudo 216-35 chr19 46909389 46909832 + 0.75 NA intron (NM_004491, intron 1 of 6) intron (NM_004491, intron 1 of 6) 48613 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 214-14 chr12 15575515 15576160 + 0.75 NA intron (NM_030671, intron 7 of 13) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 29226 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 297 chr1 153522844 153523339 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 12900 NM_014624 6277 Hs.275243 NM_014624 ENSG00000197956 S100A6 2A9|5B10|CABP|CACY|PRA|S10A6 S100 calcium binding protein A6 protein-coding 198.25-45 chr17 63633534 63633882 + 0.75 NA intron (NM_002401, intron 2 of 15) intron (NM_002401, intron 2 of 15) 11291 NM_203351 4215 Hs.29282 NM_002401 ENSG00000198909 MAP3K3 MAPKKK3|MEKK3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 protein-coding 194.75-94 chr8 76315874 76316315 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -90560 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 207-27 chr14 66009227 66009745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -476885 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 238.5-50 chr20 44796541 44796884 + 0.75 NA intron (NM_001205317, intron 1 of 5) intron (NM_001205317, intron 1 of 5) 13834 NM_001205317 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 116.75-153 chr4 116647975 116648275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 348400 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 167.25-77 chr2 56835339 56835801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -649800 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 155-143 chr8 121120077 121120503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -308244 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 141.25-10 chr1 101207079 101207282 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 29348 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 149.25-176 chr8 55096970 55097371 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -4858 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 116.75-146 chr4 39848797 39849152 + 0.75 NA intron (NM_001100399, intron 27 of 32) intron (NM_001100399, intron 27 of 32) 128937 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 145.5-45 chr12 34659532 34659879 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 637209 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 216.75-82 chr9 70878663 70879078 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -9818 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 135-82 chr2 124550905 124551123 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 10 of 23) intron (NM_130773, intron 10 of 23) 525727 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 144.5-13 chr1 157007716 157008107 + 0.75 NA intron (NM_014784, intron 1 of 39) L2a|LINE|L2 37831 NM_198236 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 204.25-106 chr7 32296361 32296939 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 2678 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 178.75-3 chr1 52482869 52483177 + 0.75 NA intron (NM_001009881, intron 9 of 29) L1ME4a|LINE|L1 70067 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 293.5-5 chr10 30893908 30894526 + 0.75 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) intron (NM_001143766, intron 5 of 7) 105300 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 189.5-108 chr5 64113875 64114160 + 0.75 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -51826 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 154.75-145 chr8 91352423 91352809 + 0.75 NA intron (NM_134266, intron 10 of 18) intron (NM_134266, intron 10 of 18) 103297 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 167.5-150 chr5 105680200 105680569 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 580910 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 127.25-52 chr13 68245411 68245757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 639741 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 112.75-62 chr14 60920682 60920985 + 0.75 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) intron (NM_001177963, intron 6 of 6) 60246 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 140-16 chr1 239245649 239245958 + 0.75 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -140765 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 135-133 chr4 166699647 166699913 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 534646 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 219.25-24 chr14 44590355 44590823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83180 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 175.5-42 chr12 55880158 55880424 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -37355 NM_002429 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 142.5-107 chr2 72451874 72452162 + 0.75 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -304156 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 174-107 chr9 95260769 95261035 + 0.75 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) intron (NM_001243744, intron 1 of 13) 56352 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 135.25-165 chr5 102576464 102576818 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -4727 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 158.5-199 chr9 68634062 68634405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71007 NM_003558 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 120.5-207 chr7 2505138 2505345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7288 NM_001166355 3955 Hs.159142 NM_002304 ENSG00000106003 LFNG SCDO3 LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 213.75-60 chr21 16583799 16584235 + 0.75 NA intron (NR_136547, intron 2 of 2) intron (NR_136547, intron 2 of 2) -4581 NR_136549 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 129.5-57 chr12 71824253 71824585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15340 NM_001146213 64786 Hs.284630 NM_022771 ENSG00000121749 TBC1D15 RAB7-GAP TBC1 domain family member 15 protein-coding 196-42 chr17 73632651 73633002 + 0.75 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 11619 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 122.5-167 chr4 86298528 86298746 + 0.75 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 56007 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 185.75-68 chr2 191648853 191649272 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -29010 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 162-68 chr2 200700537 200700952 + 0.75 NA intron (NR_135011, intron 2 of 31) intron (NR_135011, intron 2 of 31) 5021 NR_135012 107161151 Hs.148269 NR_135011 AOX3P-AOX2P AOX3/AOX3L1 AOX3P-AOX2P readthrough, transcribed pseudogene pseudo 150-153 chrX 63720546 63720832 + 0.75 NA intron (NM_001173479, intron 1 of 8) MIR3|SINE|MIR 34434 NM_001369045 23229 Hs.54697 NM_015185 ENSG00000131089 ARHGEF9 COLLYBISTIN|EIEE8|HPEM-2|PEM-2|PEM2 Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9 protein-coding 221.5-29 chr14 75399273 75399789 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -28193 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 174.25-94 chr3 20811244 20811592 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 468950 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 127.5-39 chr10 128788285 128788510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124436 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 195.25-54 chr2 173752216 173752513 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 211516 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 163-35 chr14 28019013 28019326 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -345948 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 228.5-36 chr14 55488102 55488524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47768 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 135.5-211 chr9 25880470 25880753 + 0.75 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 100555 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 203-102 chr8 105961244 105961630 + 0.75 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 99066 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 166.25-110 chr4 21970380 21970706 + 0.75 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -21792 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 136.5-106 chr2 45410545 45410904 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 19 of 20) MER21B|LTR|ERVL -155783 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 121.25-122 chr21 42664808 42665020 + 0.75 NA intron (NM_001001575, intron 1 of 14) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 11162 NM_001001583 5152 Hs.473927 NM_002606 ENSG00000160191 PDE9A HSPDE9A2 phosphodiesterase 9A protein-coding 130.25-90 chr2 6260368 6260612 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114932 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 289-38 chr5 141589815 141590506 + 0.75 NA intron (NM_005219, intron 1 of 27) intron (NM_005219, intron 1 of 27) 28840 NM_001079812 1729 Hs.529451 NM_005219 ENSG00000131504 DIAPH1 DFNA1|DIA1|DRF1|LFHL1|SCBMS|hDIA1 diaphanous related formin 1 protein-coding 129.5-11 chr1 166623398 166623676 + 0.75 NA intron (NR_002925, intron 5 of 6) intron (NR_002925, intron 5 of 6) 19621 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 197.5-140 chr7 16556907 16557334 + 0.75 NA intron (NM_001195280, intron 3 of 8) intron (NM_001195280, intron 3 of 8) 30295 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 175.25-98 chr3 135573455 135573851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -392075 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 139.25-180 chr7 66150389 66150603 + 0.75 NA intron (NR_024548, intron 6 of 6) intron (NR_024548, intron 6 of 6) 35649 NM_014478 27297 Hs.300684 NM_014478 ENSG00000241258 CRCP CGRP-RCP|CGRPRCP|RCP|RCP9|RPC9 CGRP receptor component protein-coding 127-149 chr6 51378460 51378785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -243248 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 182.25-134 chr9 110159669 110159979 + 0.75 NA intron (NM_147150, intron 9 of 9) intron (NM_147150, intron 9 of 9) 34323 NM_001136562 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 147.75-143 chr7 42450141 42450472 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -213097 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 127.25-29 chr11 7591174 7591591 + 0.75 NA intron (NM_001351860, intron 1 of 21) intron (NM_001351860, intron 1 of 21) -5804 NM_001256568 8495 Hs.655714 NM_003621 ENSG00000166387 PPFIBP2 Cclp1 PPFIA binding protein 2 protein-coding 128.25-125 chr3 4566253 4566471 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 73014 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 156.75-3 chr1 44627431 44627688 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 4 of 13) intron (NM_001319957, intron 4 of 13) 43497 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 113.25-73 chr17 77188431 77188609 + 0.75 NA intron (NM_001144001, intron 1 of 14) L1MD1|LINE|L1 3307 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 161.25-138 chr5 74571879 74572221 + 0.75 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -35074 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 169.75 chr1 19156183 19156639 + 0.75 NA exon (NM_020765, exon 42 of 106) exon (NM_020765, exon 42 of 106) 53855 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 154.75-128 chr6 136452889 136453212 + 0.75 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) 13825 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 169.5-14 chr1 246602944 246603269 + 0.75 NA intron (NM_152609, intron 2 of 10) intron (NM_152609, intron 2 of 10) 36650 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 135-176 chr8 15840885 15841161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 300760 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 121.25-144 chr4 78235749 78236008 + 0.75 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) AluJb|SINE|Alu -53107 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 118-129 chr4 38908618 38908806 + 0.75 NA exon (NM_001350634, exon 5 of 13) exon (NM_001350634, exon 5 of 13) 40680 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 134.25-59 chr15 88569989 88570228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23405 NM_001144074 55070 Hs.655064 NM_017996 ENSG00000140543 DET1 - DET1 partner of COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 118-97 chr2 221801380 221801699 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -227337 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 113-4 chr1 108051324 108051535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86249 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 210.5-97 chr5 64920788 64921315 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) L1PA16|LINE|L1 152121 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 280.25-52 chr7 90820100 90820614 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 110541 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 159.5-85 chr18 46850280 46850691 + 0.75 NA intron (NR_148699, intron 4 of 11) L1MC5a|LINE|L1 67022 NM_001354033 9063 Hs.57769 NM_004671 ENSG00000078043 PIAS2 ARIP3|DIP|MIZ1|PIASX|SIZ2|ZMIZ4 protein inhibitor of activated STAT 2 protein-coding 118.75-89 chr19 28629271 28629455 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MA5A|LINE|L1 22675 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 147.75-100 chr3 33740388 33740697 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -22288 NM_001365629 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 182-71 chr3 19604522 19604810 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -289735 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 175.25-86 chr21 46613208 46613590 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -8317 NM_006272 6285 Hs.422181 NM_006272 ENSG00000160307 S100B NEF|S100|S100-B|S100beta S100 calcium binding protein B protein-coding 207-64 chr5 35138224 35138570 + 0.75 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -20275 NM_001204317 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 168.25-87 chr20 18237202 18237625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50815 NM_001282997 7692 Hs.472221 NM_003434 ENSG00000125846 ZNF133 ZNF150|pHZ-13|pHZ-66 zinc finger protein 133 protein-coding 133.25-98 chr2 80123801 80124203 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 180750 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 115-195 chr9 128552180 128552491 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001130438) promoter-TSS (NM_001130438) -252 NM_001363765 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 152-138 chr6 155024673 155024962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65472 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 207.5-97 chr6 73579191 73579612 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -58369 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 162.75-98 chr3 100713831 100714137 + 0.75 NA intron (NM_001007565, intron 2 of 7) AluJr4|SINE|Alu 4442 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 132-72 chr17 60914648 60914882 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 236914 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 142.5-31 chr10 56374738 56374973 + 0.75 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -13582 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 135.5-80 chr17 78194101 78194365 + 0.75 NA intron (NM_001145526, intron 2 of 10) AluSz6|SINE|Alu 6916 NM_001145526 125061 Hs.558614 NM_001010982 ENSG00000183077 AFMID FKF|KF|KFA arylformamidase protein-coding 130.25-30 chr10 88589313 88589504 + 0.75 NA intron (NM_001010939, intron 2 of 10) intron (NM_001010939, intron 2 of 10) 2646 NM_001010939 142910 Hs.440959 NM_001010939 ENSG00000204022 LIPJ LIPL1|bA425M17.2 lipase family member J protein-coding 175-8 chr1 206884297 206884813 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -12888 NM_006850 11009 Hs.58831 NM_006850 ENSG00000162892 IL24 C49A|FISP|IL10B|MDA7|MOB5|ST16 interleukin 24 protein-coding 188.75-43 chr17 59007697 59008185 + 0.75 NA intron (NR_148346, intron 22 of 23) intron (NR_148346, intron 22 of 23) 98939 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 140.75-70 chr17 60699578 60699929 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) intron (NM_001330413, intron 4 of 25) 21902 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 158-100 chr3 102632530 102633009 + 0.75 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 197754 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 159.75-105 chr3 58768172 58768582 + 0.75 NA intron (NM_001351532, intron 14 of 14) intron (NM_001351532, intron 14 of 14) -56094 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 124-157 chr7 8787084 8787348 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 353607 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 164.25-97 chr3 33671153 33671466 + 0.75 NA intron (NM_001365634, intron 6 of 35) L1MC1|LINE|L1 -11630 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 228-11 chr10 65099625 65100143 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -175366 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 164.5-8 chr1 62081569 62081917 + 0.75 NA intron (NM_001350145, intron 32 of 43) AluSq2|SINE|Alu -2887 NR_036059 100422946 NR_036059 ENSG00000283690 MIR3116-2 - microRNA 3116-2 ncRNA 157-22 chr12 24770796 24771077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131286 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 126.75-256 chr9 109453461 109453681 + 0.75 NA intron (NM_001145368, intron 5 of 24) intron (NM_001145368, intron 5 of 24) -2187 NM_001145370 5774 Hs.436429 NM_002829 ENSG00000070159 PTPN3 PTP-H1|PTPH1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 3 protein-coding 124.75-122 chr2 178737482 178737711 + 0.75 NA intron (NM_001256850, intron 47 of 312) AluSc8|SINE|Alu -39330 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 144.5-20 chr1 189542084 189542289 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 933824 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 321-28 chr7 79436683 79437208 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1PA16|LINE|L1 -16012 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 193-92 chr8 139110210 139110643 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -196385 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 156.75-135 chr5 64970403 64970699 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 201621 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 197.5-20 chr11 69318118 69318676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24242 NM_138768 26579 Hs.523848 NM_138768 ENSG00000172927 MYEOV OCIM myeloma overexpressed protein-coding 126.25-210 chr8 126994817 126995189 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18151 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 151.25-193 chr8 121218226 121218538 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -406336 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 163.25-144 chr8 132352515 132353053 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MamRep564|Unknown|Unknown 94478 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 146.75-154 chr8 72214855 72215133 + 0.75 NA intron (NR_033867, intron 13 of 19) intron (NR_033867, intron 13 of 19) 36640 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 188-82 chr8 125180624 125181128 + 0.75 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 89016 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 126.25-165 chr5 113482453 113482686 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) L1MB7|LINE|L1 5884 NM_001085377 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 266.5-56 chr4 110125899 110126511 + 0.75 NA intron (NM_001130721, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 72410 NM_024090 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 151.75-85 chr22 27759797 27760038 + 0.75 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) intron (NM_002430, intron 1 of 1) 41839 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 163.25-102 chr3 169989530 169989876 + 0.75 NA intron (NM_003262, intron 7 of 7) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 22896 NM_003262 7095 Hs.744859 NM_003262 ENSG00000008952 SEC62 Dtrp1|HTP1|TLOC1|TP-1 SEC62 homolog, preprotein translocation factor protein-coding 127.25 chr1 36674770 36675053 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191597 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 182-82 chr4 71200560 71200836 + 0.75 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) intron (NM_001098484, intron 1 of 25) 13412 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 113.75-154 chr5 63349020 63349202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 613181 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 275.25-17 chr17 60476250 60476793 + 0.75 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) intron (NM_006380, intron 4 of 12) 49719 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 254.75-14 chr14 69951606 69952046 + 0.75 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR -26307 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 141-73 chr2 73295459 73295780 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2071 NM_001965 1961 Hs.3052 NM_001965 ENSG00000135625 EGR4 AT133|NGFI-C|NGFIC|PAT133 early growth response 4 protein-coding 180.25-38 chr17 62049803 62050195 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) HAL1|LINE|L1 15279 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 210.25-43 chr2 170222280 170222610 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 6 of 33) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 44298 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 125.25-181 chr7 2136035 2136239 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) intron (NM_001013837, intron 11 of 18) -47085 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 139-130 chr6 125780712 125781073 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001199619) promoter-TSS (NM_001199619) -223 NM_001199619 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 157.75-10 chr10 22059164 22059469 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -55586 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 230.75-72 chr8 120044055 120044568 + 0.75 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) AluSx|SINE|Alu -80791 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 166.75-64 chr18 9633356 9633656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18242 NR_110774 101927323 Hs.151204 NR_110773 ENSG00000263627 PPP4R1-AS1 - PPP4R1 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-32 chr14 19938575 19939038 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 3198 NM_001004063 79544 Hs.554584 NM_001004063 ENSG00000155249 OR4K1 OR14-19 olfactory receptor family 4 subfamily K member 1 protein-coding 178-70 chr4 36349352 36349745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67932 NM_001170700 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 159.75-107 chr3 65317181 65317641 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -576405 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 121.5-152 chr2 215443582 215443769 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -7605 NM_001306130 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 164-2 chr1 57724600 57724888 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -135837 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-161 chr5 126237145 126237393 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 47906 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 180.75-58 chr19 16019987 16020301 + 0.75 NA intron (NR_026828, intron 2 of 8) intron (NR_026828, intron 2 of 8) 4510 NR_026828 126536 Hs.131824 NR_026828 ENSG00000205396 LINC00661 - long intergenic non-protein coding RNA 661 ncRNA 255-56 chr7 25217916 25218609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10224 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 121.25-131 chr3 56774475 56774734 + 0.75 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) (ACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1113 NM_001128616 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 126.75-148 chr3 24928886 24929090 + 0.75 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 99665 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 156.25-33 chr12 29335789 29336215 + 0.75 NA TTS (NM_001271784) TTS (NM_001271784) -18154 NR_103860 100506606 Hs.298851 NR_103860 ENSG00000257176 LOC100506606 - uncharacterized LOC100506606 ncRNA 114.25-95 chr2 81046003 81046243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 420823 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 169-44 chr2 46696081 46696515 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2662 NM_014011 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 131.5-222 chr7 97199649 97199945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83204 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 143.5-155 chr4 48392194 48392525 + 0.75 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) intron (NM_020846, intron 6 of 7) 50830 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 143.25-127 chr3 173924005 173924243 + 0.75 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -3328 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 236.5-63 chr3 111195596 111195927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 123945 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 158-14 chr1 171588004 171588236 + 0.75 NA intron (NM_015172, intron 32 of 33) AluJo|SINE|Alu -31643 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 123.75-67 chr15 60202578 60202846 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 195274 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 260.5-23 chr17 75601689 75602082 + 0.75 NA intron (NM_001309242, intron 14 of 62) MIRb|SINE|MIR 13827 NM_001309242 80022 Hs.390817 NM_001080847 ENSG00000266714 MYO15B MYO15BP myosin XVB protein-coding 159-49 chr2 12420232 12420580 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 221276 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 130-3 chr1 81102096 81102442 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -203923 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 212.5-95 chr6 130285664 130286224 + 0.75 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) intron (NM_001258275, intron 2 of 13) -62993 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 124.75-138 chr22 49511245 49511445 + 0.75 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 32121 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 134-89 chr2 51634665 51634960 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 602211 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 179-7 chr1 171038513 171038776 + 0.75 NA intron (NM_001163629, intron 20 of 21) intron (NM_001163629, intron 20 of 21) -52261 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 168.75-90 chr22 45714287 45714651 + 0.75 NA intron (NM_013236, intron 5 of 11) AluJr|SINE|Alu 42635 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 152.25-18 chr10 53661891 53662191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -824189 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 177.25-86 chr21 35161255 35161562 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -112110 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 150.5-50 chr14 59614562 59614802 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -4543 NM_001363702 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 153.5-85 chr18 12317463 12317776 + 0.75 NA intron (NM_001303525, intron 3 of 3) intron (NM_001303525, intron 3 of 3) 9378 NM_001303530 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 209.5-146 chr8 120406591 120407071 + 0.75 NA intron (NM_014078, intron 6 of 6) intron (NM_014078, intron 6 of 6) 38319 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 119.25-208 chr8 94181774 94182053 + 0.75 NA intron (NM_001144663, intron 3 of 17) L1MB7|LINE|L1 26642 NM_004063 1015 Hs.591853 NM_004063 ENSG00000079112 CDH17 CDH16|HPT-1|HPT1 cadherin 17 protein-coding 178.25-29 chr13 104152374 104152696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 727335 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 165.25-11 chr10 14221678 14222106 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 108992 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 144.25-61 chr14 83038907 83039341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 396492 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 124-91 chr2 149243659 149243918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86197 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 113.25-33 chr12 13221034 13221238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24410 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 130.5-144 chr2 208609092 208609322 + 0.75 NA intron (NR_136588, intron 2 of 5) intron (NR_136588, intron 2 of 5) 66565 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 119.5-231 chr8 70764147 70764380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94924 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 167.25-132 chr5 150092342 150092709 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001349736) promoter-TSS (NM_001349736) 99 NM_001349736 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 227.75-64 chr5 32287763 32288207 + 0.75 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) HERVL-int|LTR|ERVL 24954 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 220.75-29 chr16 75424552 75425101 + 0.75 NA intron (NM_006324, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 8677 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 123-192 chr8 133834538 133834886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51784 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 166.75-94 chr3 133096800 133097201 + 0.75 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) intron (NM_001136469, intron 2 of 5) -27821 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 175.25-146 chr8 129750503 129750786 + 0.75 NA intron (NM_031415, intron 10 of 13) intron (NM_031415, intron 10 of 13) 35980 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 140.25-48 chr14 76655414 76655627 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -105948 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 157.75-154 chr6 141297510 141297782 + 0.75 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 613832 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 179.5-146 chr5 41370652 41371067 + 0.75 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) intron (NM_001005473, intron 2 of 2) -109390 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 150-6 chr1 79746732 79747008 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -740140 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 166.5-52 chr12 83286725 83287099 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 599757 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 119-157 chr5 159942525 159942704 + 0.75 NA intron (NM_000679, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 26132 NM_000679 147 Hs.368632 NM_000679 ENSG00000170214 ADRA1B ADRA1|ALPHA1BAR adrenoceptor alpha 1B protein-coding 119.75-68 chr15 100820051 100820337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29558 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 178.5-150 chr5 175079021 175079334 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -83446 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 234-33 chr22 29289224 29289931 + 0.75 NA intron (NM_013986, intron 9 of 17) intron (NM_013986, intron 9 of 17) -17446 NM_001278730 10634 Hs.322852 NM_006478 ENSG00000185340 GAS2L1 GAR22 growth arrest specific 2 like 1 protein-coding 221.25 chr1 12197093 12197531 + 0.75 NA intron (NM_001066, intron 8 of 9) intron (NM_001066, intron 8 of 9) 5599 NR_039775 100616438 NR_039775 ENSG00000263676 MIR4632 - microRNA 4632 ncRNA 186.75-83 chr5 13008152 13008532 + 0.75 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 24544 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 161.25-144 chr5 147900860 147901151 + 0.75 NA intron (NM_206966, intron 2 of 3) intron (NM_206966, intron 2 of 3) 5533 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 147-92 chr3 33475342 33475795 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -35163 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 171-134 chr8 141984996 141985306 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191188 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 144.5-41 chr11 56399717 56400184 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -12647 NR_145506 79482 NM_001348230 ENSG00000272987 OR5AL1 OR5AL1P olfactory receptor family 5 subfamily AL member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 174.75-102 chr5 132964137 132964600 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014423) promoter-TSS (NM_014423) -734 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 195.5-140 chr6 141626256 141626584 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 462379 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 186-74 chr6 4545128 4545623 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 56577 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 116.5-161 chr3 113784973 113785243 + 0.75 NA intron (NM_001690, intron 5 of 14) intron (NM_001690, intron 5 of 14) 38073 NM_001690 523 Hs.477155 NM_001690 ENSG00000114573 ATP6V1A ARCL2D|ATP6A1|ATP6V1A1|HO68|IECEE3|VA68|VPP2|Vma1 ATPase H+ transporting V1 subunit A protein-coding 276.5-56 chr5 134931579 134932220 + 0.75 NA intron (NM_032151, intron 2 of 3) intron (NM_032151, intron 2 of 3) 26779 NM_032151 84105 Hs.710014 NM_032151 ENSG00000132570 PCBD2 DCOH2|DCOHM|PHS2 pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2 protein-coding 136.25-80 chr17 66968888 66969150 + 0.75 NA intron (NM_014405, intron 1 of 3) intron (NM_014405, intron 1 of 3) 4312 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 174.5-203 chrX 140907450 140907751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18631 NR_031725 100302169 NR_031725 ENSG00000221081 MIR320D2 MIR320D-2|MIRN320D2|hsa-mir-320d-2|mir-320d-2 microRNA 320d-2 ncRNA 114.5-25 chr1 195419869 195420054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 668754 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 209.25-23 chr12 6877139 6877551 + 0.75 NA intron (NR_135083, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 -4042 NM_001146316 84727 Hs.479856 NM_032641 ENSG00000111671 SPSB2 GRCC9|SSB2 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2 protein-coding 228.5-52 chr2 31972455 31972958 + 0.75 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 37958 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 319.75-20 chr7 110883233 110884028 + 0.75 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -207376 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 200.75-62 chr20 4555435 4555715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130881 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 228.25-5 chr1 191667701 191668064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -439384 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 138.75-147 chr5 58334768 58335113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125146 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 256-37 chr20 19901761 19902154 + 0.75 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) AluSx1|SINE|Alu 12391 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 123.25-84 chr18 11205423 11205635 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -56767 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 178-61 chr3 69306056 69306417 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 3 of 22) intron (NM_015123, intron 3 of 22) 79852 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 133.25-135 chr3 64956521 64956741 + 0.75 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) intron (NR_038264, intron 4 of 5) -268631 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 157.5-155 chr5 2973373 2973730 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55697 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 234.75-46 chr3 21123973 21124454 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -281513 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 122.5-97 chr19 10766877 10767167 + 0.75 NA intron (NM_001005362, intron 2 of 19) intron (NM_001005362, intron 2 of 19) -13232 NR_039903 100616425 NR_039903 ENSG00000265879 MIR4748 mir-4748 microRNA 4748 ncRNA 132.25-6 chr1 69644043 69644267 + 0.75 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 74814 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 199.5-53 chr16 49023482 49023797 + 0.75 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 258199 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 124.75-63 chr12 80764664 80764918 + 0.75 NA intron (NR_120469, intron 3 of 4) L1MA9|LINE|L1 1637 NR_120468 101928420 Hs.739989 NR_120468 ENSG00000257741 LINC01490 - long intergenic non-protein coding RNA 1490 ncRNA 134.25-83 chr2 64790479 64790767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73008 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 228.75-61 chr4 123879967 123880548 + 0.75 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) intron (NR_027105, intron 4 of 5) 105993 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 132-115 chr3 117811308 117811652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120555 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 119.5-12 chr1 105743665 105743857 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -124826 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 235.5-53 chr20 22181849 22182532 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 100611 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 114.5-50 chr11 35381016 35381234 + 0.75 NA intron (NM_001252652, intron 1 of 11) intron (NM_001252652, intron 1 of 11) 38433 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 161-65 chr2 111188391 111188846 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67704 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 141.25-70 chr17 71423525 71423957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221562 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 145.25-119 chr4 115109349 115109615 + 0.75 NA intron (NM_022569, intron 1 of 13) intron (NM_022569, intron 1 of 13) 4138 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 162.25-137 chr5 149272237 149272602 + 0.75 NA intron (NM_152406, intron 1 of 18) intron (NM_152406, intron 1 of 18) 560 NM_001323062 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 148.75-57 chr15 24066206 24066422 + 0.75 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) MER41-int|LTR|ERV1 91167 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 137-93 chr20 56817293 56817719 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 188200 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 155-77 chr20 54138137 54138506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35665 NM_001128915 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 193-27 chr15 84765719 84766191 + 0.75 NA intron (NM_014630, intron 2 of 10) intron (NM_014630, intron 2 of 10) 17363 NM_014630 9640 Hs.79347 NM_014630 ENSG00000166716 ZNF592 CAMOS|SCAR5 zinc finger protein 592 protein-coding 165.75-63 chr17 30482208 30482635 + 0.75 NA intron (NM_004871, intron 2 of 8) L1ME3C|LINE|L1 5013 NM_001007025 9527 Hs.462680 NM_004871 ENSG00000108587 GOSR1 GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 golgi SNAP receptor complex member 1 protein-coding 149-136 chr9 19468611 19468868 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59730 NM_001010887 340485 Hs.41379 NM_001010887 ENSG00000177076 ACER2 ALKCDase2|ASAH3L alkaline ceramidase 2 protein-coding 172.5-121 chr3 45466356 45466717 + 0.75 NA intron (NM_001368263, intron 7 of 20) intron (NM_001368263, intron 7 of 20) 43009 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-124 chr22 27110359 27110717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50020 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 114.25-20 chr10 76380070 76380318 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1P4|LINE|L1 -507850 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 162.25-154 chr8 20976613 20977053 + 0.75 NA intron (NR_033894, intron 1 of 4) intron (NR_033894, intron 1 of 4) 2847 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 143-108 chr4 136578613 136578915 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -614992 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 124-7 chr1 76334544 76334905 + 0.75 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 259978 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 159.5-83 chr18 28051144 28051513 + 0.75 NA intron (NM_001792, intron 2 of 15) intron (NM_001792, intron 2 of 15) -14687 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 193.75-125 chr8 131180146 131180549 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -139438 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 127.75-176 chr6 121450670 121450959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15168 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 155.5-107 chr2 221639595 221640056 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -65623 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 226.5-54 chr20 46451941 46452326 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 5510 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 199.5-89 chr2 164504055 164504409 + 0.75 NA intron (NM_004490, intron 8 of 13) intron (NM_004490, intron 8 of 13) 64263 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 183.5-146 chr8 80773472 80773919 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) L1MD1|LINE|L1 100773 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 132.5-193 chr5 23170500 23170833 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -317322 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 208.25-67 chr4 84522471 84523088 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24545 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 169.5-17 chr10 90976846 90977172 + 0.75 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) intron (NR_131214, intron 3 of 5) 29709 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 139.5-195 chr7 28344696 28345153 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L1M1|LINE|L1 45603 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 123.25-42 chr11 116753961 116754250 + 0.75 NA intron (NM_032725, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu 18882 NM_032725 84811 Hs.437341 NM_032725 ENSG00000137656 BUD13 Cwc26|fSAP71 BUD13 homolog protein-coding 166-110 chr6 102719747 102720158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1320967 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 145-125 chr5 56411715 56412145 + 0.75 NA Intergenic (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 69839 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 228.75-27 chr16 86070940 86071324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125049 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 146.5-34 chr10 88749419 88749741 + 0.75 NA intron (NM_001080518, intron 8 of 8) L1PA15|LINE|L1 -11826 NM_001102469 643418 Hs.632091 NM_001102469 ENSG00000204020 LIPN ARCI8|LI4|LIPL4|bA186O14.3 lipase family member N protein-coding 167.25-66 chr17 78922779 78923167 + 0.75 NA intron (NM_003255, intron 1 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 2414 NM_003255 7077 Hs.633514 NM_003255 ENSG00000035862 TIMP2 CSC-21K|DDC8 TIMP metallopeptidase inhibitor 2 protein-coding 140-49 chr15 96604095 96604402 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 177406 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 134-79 chr18 71737981 71738217 + 0.75 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) L1MC4a|LINE|L1 44127 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 215.5-69 chr3 80750444 80750904 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -14223 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 197.5-9 chr1 214952828 214953518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52369 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 115-93 chr2 210625255 210625508 + 0.75 NA intron (NR_163592, intron 11 of 27) intron (NR_163592, intron 11 of 27) 7810 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 240-35 chr3 33660774 33661126 + 0.75 NA intron (NM_001365634, intron 7 of 35) intron (NM_001365634, intron 7 of 35) -1271 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 198-50 chr3 94190857 94191253 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 127994 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 128-111 chr4 45936348 45936723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 187519 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 155-61 chr2 49179916 49180174 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -25518 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 145.75-97 chr3 31028221 31028493 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 133430 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 165.75-58 chr15 88629142 88629540 + 0.75 NA exon (NM_022767, exon 3 of 4) exon (NM_022767, exon 3 of 4) -6291 NM_001303234 3669 Hs.459265 NM_002201 ENSG00000172183 ISG20 CD25|HEM45 interferon stimulated exonuclease gene 20 protein-coding 157.25-23 chr11 29292383 29292689 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -301877 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 162.75-65 chr2 35340951 35341202 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -130329 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 127-63 chr14 77361633 77361950 + 0.75 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) L1MA9|LINE|L1 12118 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 147.5-65 chr14 71180334 71180610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -140004 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 387.5-12 chr6 123065295 123066443 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001010852, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001010852, exon 6 of 6) 69634 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 119.75-197 chr8 80110787 80110949 + 0.75 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) MER57E1|LTR|ERV1 -30037 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 114.5-222 chr5 135346456 135346733 + 0.75 NA intron (NM_138610, intron 6 of 8) intron (NM_138610, intron 6 of 8) 52644 NM_138609 9555 Hs.420272 NM_004893 ENSG00000113648 H2AFY H2A.y|H2A/y|H2AF12M|MACROH2A1.1|mH2A1|macroH2A1.2 H2A histone family member Y protein-coding 192-74 chr3 94986424 94986828 + 0.75 NA intron (NR_015400, intron 4 of 7) intron (NR_015400, intron 4 of 7) 48363 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 161.75-138 chr9 118452142 118452636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -227282 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 218-10 chr1 231515450 231515817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13020 NR_028397 100303453 Hs.13318 NR_028393 ENSG00000270106 TSNAX-DISC1 - TSNAX-DISC1 readthrough (NMD candidate) ncRNA 174.25-146 chr8 105939661 105940038 + 0.75 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 120654 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 178-3 chr1 217896559 217896827 + 0.75 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) intron (NR_048550, intron 1 of 3) 3793 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 277-8 chr12 58509042 58509769 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -82297 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 125.5-194 chr4 131114794 131115223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -649830 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 131.5-170 chr4 30293617 30293906 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -426608 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 124.5-251 chrX 95793760 95794018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 544013 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 143.75-26 chr10 117445060 117445480 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -69830 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 165.75-54 chr15 60396357 60396613 + 0.75 NA intron (NM_001136015, intron 1 of 13) intron (NM_001136015, intron 1 of 13) 1501 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 131-51 chr14 57653833 57654164 + 0.75 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -160141 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 141.75-120 chr3 160332553 160332810 + 0.75 NA intron (NM_001190242, intron 7 of 18) L1MC5|LINE|L1 51085 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 232-51 chr3 28449119 28449649 + 0.75 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) L1MB3|LINE|L1 100235 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 149.25-105 chr22 25238987 25239365 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 19537 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 167.75-6 chr1 84461815 84462252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17233 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 173.5-35 chr12 85029748 85030019 + 0.75 NA exon (NM_001100917, exon 2 of 9) exon (NM_001100917, exon 2 of 9) 6394 NM_001100917 144448 Hs.156962 NM_001100917 ENSG00000231738 TSPAN19 - tetraspanin 19 protein-coding 164.75-77 chr2 124242283 124242541 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 217125 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 162.75-13 chr10 52715427 52715677 + 0.75 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) AluYh3|SINE|Alu 39852 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 236.25-89 chr8 129927692 129928215 + 0.75 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) L1MB7|LINE|L1 11858 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 173.25-89 chr4 91192737 91193111 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 957893 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 178.25-19 chr11 122494804 122495185 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -72123 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 290.75-12 chr14 52725796 52726272 + 0.75 NA intron (NR_158967, intron 14 of 14) MIR3|SINE|MIR -4132 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 120.5-211 chr7 19353556 19353843 + 0.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -208278 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 171.75-94 chr21 45443933 45444332 + 0.75 NA intron (NM_130445, intron 2 of 42) intron (NM_130445, intron 2 of 42) -11390 NM_130444 80781 Hs.517356 NM_030582 ENSG00000182871 COL18A1 KNO|KNO1|KS collagen type XVIII alpha 1 chain protein-coding 163.75-104 chr4 35425342 35425758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 818389 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 140.5-169 chr4 120739522 120739908 + 0.75 NA intron (NM_001300824, intron 12 of 13) intron (NM_001300824, intron 12 of 13) 183151 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 231-30 chr15 47691998 47692388 + 0.75 NA intron (NM_001198999, intron 4 of 19) intron (NM_001198999, intron 4 of 19) -25312 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 197.5-101 chr3 128383399 128384012 + 0.75 NA intron (NM_021937, intron 6 of 6) intron (NM_021937, intron 6 of 6) -79889 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 220-43 chr3 129532639 129532945 + 0.75 NA intron (NM_000539, intron 4 of 4) intron (NM_000539, intron 4 of 4) 4153 NM_000539 6010 Hs.247565 NM_000539 ENSG00000163914 RHO CSNBAD1|OPN2|RP4 rhodopsin protein-coding 149.25-68 chr18 58983321 58983595 + 0.75 NA intron (NM_001353535, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -52221 NR_024021 390858 Hs.716280 NR_024021 OACYLP ACYL3P O-acyltransferase like, pseudogene pseudo 162.5-174 chr8 100482247 100482525 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77373 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 168.25-127 chr6 150327933 150328262 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -40915 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 230.75-37 chr2 169614021 169614448 + 0.75 NA intron (NM_004792, intron 7 of 13) intron (NM_004792, intron 7 of 13) 29883 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 177.5-77 chr2 59813451 59813870 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 569376 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 218.75-6 chr10 4618207 4618715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37695 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 237.5-69 chr4 71462895 71463514 + 0.75 NA intron (NM_003759, intron 9 of 22) intron (NM_003759, intron 9 of 22) 124151 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 201-7 chr1 182858958 182859324 + 0.75 NA intron (NM_001357, intron 11 of 27) intron (NM_001357, intron 11 of 27) -19550 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 246.25-27 chr2 20767282 20767779 + 0.75 NA intron (NM_021925, intron 4 of 6) MER52D|LTR|ERV1 55571 NM_001282724 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 146.25-121 chr5 154904158 154904407 + 0.75 NA intron (NM_015465, intron 18 of 27) intron (NM_015465, intron 18 of 27) 33929 NM_015465 25929 Hs.483921 NM_015465 ENSG00000082516 GEMIN5 GEMIN-5 gem nuclear organelle associated protein 5 protein-coding 124.75-189 chr7 15023382 15023597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48631 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 198.5-86 chr2 213320788 213321126 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 4 of 14) intron (NR_047660, intron 4 of 14) 36493 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 131-99 chr2 186675485 186675875 + 0.75 NA exon (NM_001144999, exon 27 of 30) exon (NM_001144999, exon 27 of 30) -18380 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 176.75-138 chrX 11805715 11806189 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -16487 NM_001368398 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 116-72 chr18 1396639 1396974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37177 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 248-74 chr8 52264295 52264756 + 0.75 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) -10033 NM_001352841 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 177.5-170 chr8 77279821 77280142 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -170716 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 255.25-59 chrX 146774629 146775175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34869 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 265-42 chr8 134444770 134445332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153020 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 123-85 chr18 1374746 1374991 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -15239 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 119.5-14 chr1 149934507 149934810 + 0.75 NA intron (NM_001145862, intron 5 of 16) intron (NM_001145862, intron 5 of 16) 1715 NM_181873 10903 Hs.425144 NM_006697 ENSG00000014914 MTMR11 CRA myotubularin related protein 11 protein-coding 251-14 chr10 56458084 56458542 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -97040 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 181.75-131 chr8 124356316 124356683 + 0.75 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 16200 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 147-100 chr4 58542365 58542635 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6172 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 198.25-12 chr10 44180986 44181486 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -111514 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 180.25-74 chr3 100116729 100117059 + 0.75 NA intron (NM_001167924, intron 1 of 9) intron (NM_001167924, intron 1 of 9) 1964 NM_001167924 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 179.75-120 chr6 125685803 125686087 + 0.75 NA intron (NR_038906, intron 3 of 3) L1MB7|LINE|L1 11592 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 193.5-142 chr6 70633872 70634191 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -33852 NM_021940 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 138.25-180 chrX 42633533 42633717 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 144538 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 182.75-125 chr7 68762772 68763206 + 0.75 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL 742736 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 176.5-60 chr14 69200126 69200560 + 0.75 NA intron (NM_001193363, intron 1 of 8) L1MB4|LINE|L1 8577 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 155.75-93 chr20 47430686 47431006 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18702 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 187.5-172 chr8 119495856 119496330 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 79647 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 264.75-41 chr5 28644564 28644960 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -282108 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 153.75-95 chr3 119563010 119563402 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -3592 NM_005191 941 Hs.838 NM_005191 ENSG00000121594 CD80 B7|B7-1|B7.1|BB1|CD28LG|CD28LG1|LAB7 CD80 molecule protein-coding 130-107 chr3 125175362 125175658 + 0.75 NA intron (NM_001195483, intron 4 of 12) intron (NM_001195483, intron 4 of 12) -23958 NR_049815 100847039 NR_049815 ENSG00000264986 MIR5092 - microRNA 5092 ncRNA 221.25-26 chr14 56235640 56236016 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 117417 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 199.75-34 chr16 73204564 73204994 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60332 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 139.25-190 chr8 29661303 29661544 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86686 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 146.5-211 chr7 85576235 85576626 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155308 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 184.75-75 chr4 92795492 92795880 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 491287 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 163.25-6 chr1 66214180 66214526 + 0.75 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -117755 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 148.75-111 chr3 110555109 110555499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 514655 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 173.75-140 chr7 21130370 21130723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 295115 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 204-65 chr5 94628413 94628903 + 0.75 NA intron (NM_032290, intron 1 of 20) intron (NM_032290, intron 1 of 20) 9989 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 161-95 chr5 104081712 104081942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -519038 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 144.25-160 chr5 97540846 97541074 + 0.75 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) MER5B|DNA|hAT-Charlie 36264 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 172.75-25 chr11 130260421 130260731 + 0.75 NA intron (NM_001370222, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 54136 NM_014155 29068 Hs.721470 NM_014155 ENSG00000196323 ZBTB44 BTBD15|HSPC063|ZNF851 zinc finger and BTB domain containing 44 protein-coding 219.75-77 chr7 35983325 35984045 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111625 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 172.5-161 chr5 157066103 157066412 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7141 NM_001173393 26762 Hs.129711 NM_012206 ENSG00000113249 HAVCR1 CD365|HAVCR|HAVCR-1|KIM-1|KIM1|TIM|TIM-1|TIM1|TIMD-1|TIMD1 hepatitis A virus cellular receptor 1 protein-coding 136-159 chr8 131191428 131191726 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -150668 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 177.25-132 chr7 28627926 28628327 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -58007 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 215.75-96 chr8 14970245 14970626 + 0.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 -116925 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 136.25-167 chr6 63554185 63554469 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17685 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 161.25-18 chr10 95571810 95572173 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10620 NM_001290295 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 127.5-80 chr14 71269549 71269763 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -50820 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 120.75-169 chr8 105507491 105507774 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 188089 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 162.25-166 chrX 11039608 11039899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71579 NM_001122608 3052 Hs.211571 NM_005333 ENSG00000004961 HCCS CCHL|LSDMCA1|MCOPS7|MLS holocytochrome c synthase protein-coding 267.75-3 chr1 149924605 149924991 + 0.75 NA intron (NM_005850, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 3005 NM_005850 10262 Hs.516160 NM_005850 ENSG00000143368 SF3B4 AFD1|Hsh49|SAP49|SF3b49 splicing factor 3b subunit 4 protein-coding 163.5-180 chr6 162200999 162201239 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) -526013 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 174.25-103 chr3 160444427 160444714 + 0.75 NA intron (NR_148403, intron 1 of 20) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 5216 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 120-107 chr22 27669538 27669833 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132071 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 112.5-56 chr12 65657601 65657860 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -15358 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 165-40 chr14 59439217 59439668 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25938 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 145-21 chr10 32301325 32301597 + 0.75 NA intron (NM_001272004, intron 2 of 13) L1MD2|LINE|L1 45697 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 193-15 chr11 73523045 73523525 + 0.75 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) intron (NM_001286051, intron 1 of 5) 74827 NM_001286050 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 119.5-210 chr7 33347209 33347582 + 0.75 NA intron (NR_145413, intron 13 of 23) intron (NR_145413, intron 13 of 23) 217831 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 127-76 chr16 76514785 76515098 + 0.75 NA intron (NR_136213, intron 15 of 23) intron (NR_136213, intron 15 of 23) -120057 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 218.25-61 chr4 49107225 49107853 + 0.75 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 120897 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 143.25-86 chr2 63541896 63542122 + 0.75 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) intron (NR_148705, intron 1 of 16) 46468 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 137.5-61 chr13 113465893 113466289 + 0.75 NA intron (NM_001014283, intron 4 of 6) AluSz6|SINE|Alu -12603 NM_138430 113622 Hs.98669 NM_138430 ENSG00000153531 ADPRHL1 ARH2 ADP-ribosylhydrolase like 1 protein-coding 118.5-223 chr8 118503160 118503365 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -117739 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 306.25-27 chr22 26319106 26319644 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 9 of 14) L2a|LINE|L2 -109885 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 201.75-5 chr1 187615098 187615424 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 171633 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 208.25-53 chr20 38491617 38492108 + 0.75 NA intron (NM_001282917, intron 2 of 29) L3|LINE|CR1 19019 NM_001282917 57148 Hs.598850 NM_020336 ENSG00000170471 RALGAPB KIAA1219|RalGAPbeta Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit protein-coding 120.5-243 chrX 39928141 39928370 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 90694 NR_039763 100616251 NR_039763 ENSG00000263972 MIR1587 - microRNA 1587 ncRNA 125.25-184 chr7 23507802 23508202 + 0.75 NA intron (NM_001362759, intron 3 of 6) intron (NM_001362759, intron 3 of 6) 17614 NR_026676 256355 Hs.367935 NR_026676 ENSG00000232818 RPS2P32 RPS2_14_794 ribosomal protein S2 pseudogene 32 pseudo 133.5-287 chrX 71560386 71560668 + 0.75 NA intron (NM_181672, intron 14 of 21) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17497 NM_052957 93953 Hs.135167 NM_052957 ENSG00000147174 GCNA ACRC|NAAR1 germ cell nuclear acidic peptidase protein-coding 204-40 chr2 213694127 213694426 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -63791 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 123.25-53 chr13 76840298 76840505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46004 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 206.5-111 chr6 89022854 89023229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57710 NM_006813 10957 Hs.75969 NM_006813 ENSG00000146278 PNRC1 B4-2|PNAS-145|PROL2|PRR2 proline rich nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 129.25-177 chr7 2674865 2675065 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -4557 NM_133463 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 222.5 chr1 25577861 25578372 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34531 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 132.25-22 chr1 217012344 217012583 + 0.75 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 64529 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 139.5-143 chr3 192401039 192401313 + 0.75 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 7873 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 202.5-85 chr21 30095713 30096132 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 70883 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 175.75-98 chr4 179006379 179006667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1098587 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 158.5-177 chr7 28886544 28887038 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 71539 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 201-53 chr3 167733840 167734252 + 0.75 NA intron (NM_145859, intron 1 of 8) intron (NM_145859, intron 1 of 8) 796 NM_145860 11235 Hs.478150 NM_007217 ENSG00000114209 PDCD10 CCM3|TFAR15 programmed cell death 10 protein-coding 178.5-169 chr7 48343733 48344003 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 29 of 61) HAL1ME|LINE|L1 172410 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 152-114 chr4 84807102 84807405 + 0.75 NA intron (NM_014991, intron 15 of 67) intron (NM_014991, intron 15 of 67) -158363 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 115.5-140 chr2 194035350 194035639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -308775 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 135-181 chr8 88561103 88561445 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -233791 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 134-33 chr11 102320595 102320823 + 0.75 NA intron (NM_182962, intron 1 of 9) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 3225 NM_182962 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 209.25 chr1 11327341 11327816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54380 NM_013319 29914 Hs.522933 NM_013319 ENSG00000120942 UBIAD1 SCCD|TERE1 UbiA prenyltransferase domain containing 1 protein-coding 121.25-164 chr5 75375654 75375875 + 0.75 NA intron (NM_031361, intron 16 of 16) intron (NM_031361, intron 16 of 16) 38544 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 155.25-41 chr11 98581942 98582310 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -438823 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 125.25-8 chr1 99601003 99601277 + 0.75 NA intron (NR_031666, intron 1 of 4) intron (NR_031666, intron 1 of 4) -44973 NM_017734 54873 Hs.483993 NM_017734 ENSG00000099260 PALMD C1orf11|PALML palmdelphin protein-coding 149.25-124 chr3 185729597 185729838 + 0.75 NA TTS (NR_126326) TTS (NR_126326) 16465 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 150.25-130 chr6 56832720 56833129 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) AluSq2|SINE|Alu 10741 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 211.5-149 chr7 110595469 110595820 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -495362 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 161.5-203 chrX 130998687 130998945 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 59330 NR_126350 104266960 Hs.573575 NR_126350 ENSG00000228659 LINC01201 TCONS_00017091 long intergenic non-protein coding RNA 1201 ncRNA 143-134 chr7 88988729 88989015 + 0.75 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -193135 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 130.25-218 chr9 76300810 76301094 + 0.75 NA intron (NM_001190482, intron 27 of 36) intron (NM_001190482, intron 27 of 36) 93474 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 199.75-27 chr14 66161761 66162083 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -324449 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 128.5-244 chrX 73311849 73312024 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -97085 NM_021963 4674 Hs.66180 NM_021963 ENSG00000186462 NAP1L2 BPX nucleosome assembly protein 1 like 2 protein-coding 158.75-145 chr6 36903788 36904172 + 0.75 NA intron (NM_152734, intron 3 of 7) intron (NM_152734, intron 3 of 7) 18028 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 176.5-191 chrX 85960398 85960798 + 0.75 NA intron (NM_001320959, intron 5 of 14) AluSx|SINE|Alu -56891 NR_029848 494323 NR_029848 ENSG00000199051 MIR361 MIRN361|hsa-mir-361|mir-361 microRNA 361 ncRNA 118-69 chr17 80107888 80108170 + 0.75 NA intron (NM_001079804, intron 5 of 19) intron (NM_001079804, intron 5 of 19) 6448 NM_001079804 2548 Hs.1437 NM_000152 ENSG00000171298 GAA LYAG glucosidase alpha, acid protein-coding 189.5-167 chrX 37952044 37952365 + 0.75 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -38575 NM_012274 25763 Hs.122959 NM_012274 ENSG00000187516 HYPM CXorf27|HIP17 huntingtin interacting protein M protein-coding 137-22 chr10 28037388 28037629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35870 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 168.75-61 chr17 32696589 32696950 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) LTR106_Mam|LTR|LTR 180355 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 141.5-220 chr8 49503293 49503618 + 0.75 NA intron (NR_134294, intron 1 of 1) intron (NR_134294, intron 1 of 1) 8725 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 138.25-90 chr2 175279264 175279487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97665 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 147-37 chr15 34740735 34741090 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 14086 NM_020660 57369 Hs.283816 NM_020660 ENSG00000159248 GJD2 CX36|GJA9 gap junction protein delta 2 protein-coding 171.5-148 chr8 77150377 77150744 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -149516 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 201-83 chr9 22606658 22607178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39282 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 161.75-83 chr3 549896 550158 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -42078 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 138-143 chr6 100460104 100460417 + 0.75 NA intron (NM_005068, intron 1 of 10) intron (NM_005068, intron 1 of 10) 3415 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 187.75-17 chr11 40947948 40948202 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 511561 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 122.5-207 chr7 12659456 12659771 + 0.75 NA non-coding (NR_156701, exon 15 of 15) non-coding (NR_156701, exon 15 of 15) -27214 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 246.75-52 chr5 67941452 67942024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148525 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 171.25-81 chr2 138433278 138433706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68278 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 129.75-96 chr2 123753471 123753658 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 271610 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 245-15 chr14 54640063 54640559 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 72699 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 208.25-3 chr1 58523161 58523507 + 0.75 NA intron (NM_145243, intron 7 of 8) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 23392 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 145-142 chr6 158429877 158430106 + 0.75 NA intron (NM_020245, intron 3 of 13) intron (NM_020245, intron 3 of 13) -106445 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 160.75-26 chr11 94086880 94087189 + 0.75 NA intron (NM_001098672, intron 11 of 19) intron (NM_001098672, intron 11 of 19) -41807 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 218.5-86 chr4 70266374 70266854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23998 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 120-31 chr12 109231656 109231952 + 0.75 NA intron (NM_001093, intron 28 of 52) MER68|LTR|ERVL 77480 NM_213596 121643 Hs.528316 NM_213596 ENSG00000139445 FOXN4 - forkhead box N4 protein-coding 175.25-62 chr2 22686237 22686513 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 149896 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 168.5-192 chr8 141627483 141627819 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120421 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 272-23 chr22 27729607 27730241 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 71832 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 142.5-195 chr6 146333859 146334203 + 0.75 NA intron (NM_001278065, intron 4 of 9) intron (NM_001278065, intron 4 of 9) -209802 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 148.75-92 chr2 166000045 166000432 + 0.75 NA intron (NR_148667, intron 24 of 28) intron (NR_148667, intron 24 of 28) 42820 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 203.25-69 chr3 110719335 110719733 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 350425 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-39 chr16 13511022 13511472 + 0.75 NA Intergenic MER124|DNA?|DNA? -408910 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 260.25-28 chr20 50868826 50869354 + 0.75 NA intron (NM_198799, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR 40701 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 202.5-41 chr14 55107673 55108058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21387 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 205.25-87 chr5 112986708 112987253 + 0.75 NA intron (NM_152624, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 10182 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 222.25-45 chr3 98587381 98587828 + 0.75 NA intron (NM_000097, intron 4 of 6) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 6007 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 133.75-175 chr7 25356720 25356978 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -128363 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 205.5-100 chr3 196402967 196403473 + 0.75 NA intron (NM_015562, intron 2 of 10) AluSz6|SINE|Alu -28165 NR_046745 100874034 Hs.617990 NR_046745 UBXN7-AS1 - UBXN7 antisense RNA 1 ncRNA 187.5-3 chr1 40444196 40444733 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5600 NM_001369565 65243 Hs.133034 NM_023070 ENSG00000187801 ZFP69B ZKSCAN23B|ZNF643|ZSCAN54B ZFP69 zinc finger protein B protein-coding 226-64 chr7 44212501 44212865 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001363678, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001363678, exon 6 of 6) 11705 NM_001363678 10652 Hs.520794 NM_006555 ENSG00000106636 YKT6 - YKT6 v-SNARE homolog protein-coding 153.75-131 chr6 64755028 64755447 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) L1PB4|LINE|L1 -546181 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 125.5-188 chr4 65371052 65371307 + 0.75 NA intron (NM_182472, intron 8 of 16) intron (NM_182472, intron 8 of 16) 298309 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 134.5-12 chr1 96205109 96205383 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 168879 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 177.75-16 chr10 13056396 13056961 + 0.75 NA intron (NM_001282658, intron 4 of 6) intron (NM_001282658, intron 4 of 6) 43311 NM_001282658 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 173.75-92 chr2 172584135 172584432 + 0.75 NA intron (NM_002610, intron 8 of 10) intron (NM_002610, intron 8 of 10) 28193 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 285-47 chr9 79192245 79192821 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -46867 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 144.75-146 chr6 42483119 42483369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31020 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 154-110 chr5 78632333 78632706 + 0.75 NA intron (NM_005779, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 16253 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 130.75-8 chr1 117490153 117490342 + 0.75 NA intron (NM_006699, intron 8 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 115523 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 145.25-164 chr7 84311716 84312049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117093 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 116.5-230 chr7 53011572 53011805 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -23945 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 244.25-39 chr5 55122491 55122980 + 0.75 NA intron (NM_152623, intron 9 of 11) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 20089 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 205.5-137 chr7 34139058 34139705 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) intron (NM_133468, intron 14 of 15) 233842 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 116.75-75 chr17 52756558 52756825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105430 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 159.5-160 chr4 41386594 41387014 + 0.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 25997 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 148.5-226 chr8 103122683 103123063 + 0.75 NA intron (NR_145429, intron 1 of 5) MER51B|LTR|ERV1 1841 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 136.25-121 chr3 71673023 71673319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52231 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 252.5-27 chr14 53755042 53755480 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 193223 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 154.5-12 chr1 109687651 109688067 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_000561) promoter-TSS (NM_000561) 42 NM_000561 2944 Hs.301961 NM_000561 ENSG00000134184 GSTM1 GST1|GSTM1-1|GSTM1a-1a|GSTM1b-1b|GTH4|GTM1|H-B|MU|MU-1 glutathione S-transferase mu 1 protein-coding 164.25-22 chr10 116179448 116179837 + 0.75 NA intron (NM_145793, intron 3 of 8) intron (NM_145793, intron 3 of 8) 15147 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 125.75-125 chr3 133971 134198 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -62512 NM_001253387 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 221-15 chr12 25574669 25575176 + 0.75 NA intron (NM_001352234, intron 1 of 8) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -21639 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 164.75-81 chr2 150084519 150084825 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 172335 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 134-105 chr2 196470262 196470630 + 0.75 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) -108269 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 138-112 chr4 32851344 32851651 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 500459 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 125.25-154 chr5 27353866 27354121 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -118299 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 170.5-116 chr3 28824087 28824411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 248971 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 196.75-86 chr5 32402829 32403150 + 0.75 NA intron (NM_016107, intron 8 of 19) L2c|LINE|L2 -8514 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 167-91 chr5 16044945 16045262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109921 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 150.75-188 chr8 124073618 124073967 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 31 of 40) L2a|LINE|L2 -33010 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 140-114 chr3 143643677 143643920 + 0.75 NA intron (NM_173653, intron 6 of 15) intron (NM_173653, intron 6 of 15) 204670 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 177.5-34 chr12 29332359 29332765 + 0.75 NA intron (NM_001271783, intron 10 of 11) intron (NM_001271783, intron 10 of 11) -14714 NR_103860 100506606 Hs.298851 NR_103860 ENSG00000257176 LOC100506606 - uncharacterized LOC100506606 ncRNA 213.75-84 chr5 2989999 2990553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72422 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 154.5-169 chr7 30434825 30435111 + 0.75 NA intron (NM_006092, intron 11 of 13) AluJr|SINE|Alu 43816 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 125-44 chr15 46054407 46054619 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 349318 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 200.5-84 chr22 43322164 43322627 + 0.75 NA intron (NM_173050, intron 2 of 21) L2|LINE|L2 20977 NM_173050 80274 Hs.133995 NM_152514 ENSG00000159307 SCUBE1 - signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 1 protein-coding 137.25-85 chr20 53125775 53126079 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -59356 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 125-9 chr1 99093926 99094163 + 0.75 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -89183 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 175.25-106 chr4 62946173 62946585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -784614 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 156.5-203 chr9 38145253 38145530 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -76164 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 157.75-45 chr14 35911983 35912391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 85849 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 150-49 chr15 58014546 58015015 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_170697) promoter-TSS (NM_170697) -757 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 262.75-33 chr3 19127227 19127850 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -20972 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 120.5-188 chr5 127552540 127552812 + 0.75 NA 3' UTR (NM_130809, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_130809, exon 9 of 9) 35036 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 126-75 chr17 34346382 34346551 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -10014 NM_005408 6357 Hs.414629 NM_005408 ENSG00000181374 CCL13 CKb10|MCP-4|NCC-1|NCC1|SCYA13|SCYL1 C-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 147.5-68 chr15 36960304 36960665 + 0.75 NA intron (NM_172316, intron 8 of 12) intron (NM_172316, intron 8 of 12) 12417 NR_107030 102466875 NR_107030 ENSG00000277202 MIR8063 hsa-mir-8063 microRNA 8063 ncRNA 112.25-144 chr4 22119256 22119405 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -170579 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 114.75-71 chr17 60625902 60626138 + 0.75 NA intron (NM_003620, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 25837 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 166.25-53 chr15 101444127 101444404 + 0.75 NA intron (NM_138325, intron 1 of 13) intron (NM_138325, intron 1 of 13) 45442 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 165-88 chr22 49221260 49221537 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 322068 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 113-91 chr2 114381536 114381778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60984 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155.5-158 chr5 10382980 10383451 + 0.75 NA intron (NM_005885, intron 4 of 25) HAL1ME|LINE|L1 -19149 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 112.25-47 chr12 95835059 95835345 + 0.75 NA intron (NR_135014, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 23637 NR_135014 105369921 Hs.125549 NR_135014 ENSG00000258343 LOC105369921 - uncharacterized LOC105369921 ncRNA 186.5-9 chr1 169010012 169010288 + 0.75 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) intron (NR_104091, intron 3 of 4) 76855 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 133.5-71 chr12 122783354 122783681 + 0.75 NA intron (NR_027918, intron 3 of 12) AluY|SINE|Alu 8945 NR_027918 84660 Hs.592008 NM_032573 ENSG00000130783 CCDC62 CT109|ERAP75|TSP-NY coiled-coil domain containing 62 protein-coding 160.75-9 chr1 209924215 209924471 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13831 NR_027459 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 209.5-105 chr4 83666019 83666594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130198 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 148.5-230 chr8 117578592 117578899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58032 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 198.75-40 chr2 38368435 38368962 + 0.75 NA intron (NM_001330462, intron 1 of 13) intron (NM_001330462, intron 1 of 13) 7832 NM_001330460 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 143.75-24 chr10 91067332 91067626 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 21671 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 172.5-176 chr7 3606808 3607320 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 305812 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 127.75-3 chr1 20829383 20829647 + 0.75 NA intron (NM_003760, intron 25 of 31) intron (NM_003760, intron 25 of 31) -42827 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 207.5-79 chr4 170944316 170944650 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96119 NR_038838 100506122 Hs.434205 NR_038838 ENSG00000248872 LINC02431 - long intergenic non-protein coding RNA 2431 ncRNA 212.75-86 chr6 52908637 52909057 + 0.75 NA intron (NM_000847, intron 1 of 6) intron (NM_000847, intron 1 of 6) 851 NM_001363542 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 245.5-16 chr12 71273046 71273520 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -115284 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 137.5-134 chr2 184667210 184667525 + 0.75 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 68838 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 168.75-63 chr17 48160541 48160875 + 0.75 NA intron (NM_001075099, intron 11 of 12) intron (NM_001075099, intron 11 of 12) -4197 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 161.75-96 chr4 44153478 44153823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136588 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 150.25-43 chr12 112023954 112024306 + 0.75 NA TTS (NM_001034025) TTS (NM_001034025) 10704 NM_006817 10961 Hs.75841 NM_006817 ENSG00000089248 ERP29 C12orf8|ERp28|ERp31|HEL-S-107|PDI-DB|PDIA9 endoplasmic reticulum protein 29 protein-coding 182.75-51 chr17 15374288 15374754 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -32924 NM_031898 64518 Hs.414648 NM_031898 ENSG00000125409 TEKT3 - tektin 3 protein-coding 154-29 chr11 57357928 57358193 + 0.75 NA intron (NM_002559, intron 8 of 11) intron (NM_002559, intron 8 of 11) 19708 NM_002559 5024 Hs.146738 NM_002559 ENSG00000109991 P2RX3 P2X3 purinergic receptor P2X 3 protein-coding 176.75-6 chr1 75492583 75492852 + 0.75 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) intron (NM_001320285, intron 2 of 25) 118397 NM_001130058 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 200.5-23 chr11 115403189 115403474 + 0.75 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L1MC4a|LINE|L1 6575 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 144-84 chr3 95683815 95684134 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_077228) promoter-TSS (NR_077228) -781 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 146.75-74 chr2 65590063 65590405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157635 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 117-92 chr2 95259123 95259430 + 0.75 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -15173 NM_001165978 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 131.5-34 chr11 76449596 76449957 + 0.75 NA intron (NM_001300942, intron 2 of 21) intron (NM_001300942, intron 2 of 21) 4751 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 171.25-56 chr16 82234751 82235040 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64671 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 128-58 chr17 45158598 45158869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1441 NM_001303439 124790 Hs.56382 NM_144608 ENSG00000168517 HEXIM2 L3 HEXIM P-TEFb complex subunit 2 protein-coding 182.75-7 chr1 92732747 92733180 + 0.75 NA intron (NM_001350198, intron 2 of 19) FLAM_C|SINE|Alu 52145 NM_001350198 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 163.5-178 chr6 152738554 152738887 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12077 NM_194435 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 149.5-162 chr5 146113000 146113203 + 0.75 NA TTS (NM_001317964) TTS (NM_001317964) -7524 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 133-52 chr14 75873281 75873543 + 0.75 NA intron (NM_015072, intron 29 of 31) L1MB1|LINE|L1 108583 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 276.75-30 chr22 26238443 26238926 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 69210 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 193.5-98 chr20 56026030 56026321 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -20656 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 119.25-56 chr14 55869418 55869675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72872 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 153.5-45 chr13 41555958 41556225 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 12304 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 156.75-168 chr9 27623436 27623832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49768 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 134-181 chr9 26455896 26456219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 389382 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 150.75-181 chr8 80605870 80606205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119811 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 140.75-67 chr17 11809906 11810203 + 0.75 NA intron (NM_001372, intron 44 of 68) intron (NM_001372, intron 44 of 68) -72848 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 182.5-36 chr11 116316834 116317077 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -322467 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 158.5-135 chr3 170854858 170855149 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 15192 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 115.5-106 chr19 3278786 3279083 + 0.75 NA intron (NR_033342, intron 5 of 12) intron (NR_033342, intron 5 of 12) 53656 NR_033342 60680 Hs.655747 NM_021938 ENSG00000161082 CELF5 BRUNOL-5|BRUNOL5|CELF-5 CUGBP Elav-like family member 5 protein-coding 148.5-228 chr8 107665996 107666283 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -168221 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 134-11 chr1 207465626 207465877 + 0.75 NA intron (NM_001006658, intron 1 of 19) intron (NM_001006658, intron 1 of 19) 11423 NM_001877 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 219-9 chr10 20858983 20859345 + 0.75 NA intron (NM_006393, intron 8 of 27) intron (NM_006393, intron 8 of 27) 38438 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 117.25-205 chr7 127863524 127863707 + 0.75 NA intron (NM_014390, intron 12 of 23) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -133894 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 247-48 chr5 10316114 10316514 + 0.75 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -8412 NM_138809 134147 Hs.192586 NM_138809 ENSG00000164237 CMBL JS-1 carboxymethylenebutenolidase homolog protein-coding 176.75-121 chr8 78099322 78099761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -416799 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 128.75-88 chr19 43673301 43673628 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3118 NM_001005376 5329 Hs.466871 NM_002659 ENSG00000011422 PLAUR CD87|U-PAR|UPAR|URKR plasminogen activator, urokinase receptor protein-coding 132-159 chr7 39176214 39176528 + 0.75 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 152763 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 158.5-47 chr12 62240606 62240912 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -19581 NM_001351162 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 139.25-153 chr5 101986861 101987251 + 0.75 NA Intergenic (AATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 309228 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 155.5-140 chr3 197742522 197742975 + 0.75 NA intron (NM_001145642, intron 1 of 20) intron (NM_001145642, intron 1 of 20) -5822 NM_001346873 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 222.75-10 chr1 233743356 233743810 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 119431 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 143.5-186 chr6 11979041 11979394 + 0.75 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 22027 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 186.25-60 chr20 42382234 42382574 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) intron (NM_133170, intron 9 of 31) -303079 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 223.5-75 chr22 40462263 40462585 + 0.75 NA intron (NM_020831, intron 4 of 14) intron (NM_020831, intron 4 of 14) 1016 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 214.75-51 chr3 10369674 10370082 + 0.75 NA intron (NM_001001331, intron 12 of 22) intron (NM_001001331, intron 12 of 22) 24684 NR_030614 100126334 NR_030614 ENSG00000216135 MIR885 MIRN885|hsa-mir-885|mir-885 microRNA 885 ncRNA 142.25-55 chr14 52514163 52514385 + 0.75 NA intron (NM_001160047, intron 8 of 20) intron (NM_001160047, intron 8 of 20) 38231 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 200.25-87 chr5 17302412 17302941 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84634 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 124.25-151 chr4 97873919 97874188 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) intron (NM_174952, intron 8 of 10) 269423 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 183-18 chr12 121318109 121318593 + 0.75 NA exon (NM_001330489, exon 15 of 17) exon (NM_001330489, exon 15 of 17) -20043 NM_153500 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 209.25-119 chr9 32742641 32742988 + 0.75 NA Intergenic LTR91|LTR|ERVL -40726 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 128.75-86 chr18 40461295 40461508 + 0.75 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 395115 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 115.5-198 chr5 25765701 25765956 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 574875 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 246.25-22 chr15 42739596 42739952 + 0.75 NA 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) -2646 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 137.75-122 chr21 27096986 27097248 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -130029 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 221-68 chr5 160052207 160052712 + 0.75 NA intron (NM_003314, intron 7 of 7) AluJo|SINE|Alu 43320 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 129.25-204 chr8 117125511 117125777 + 0.75 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -9351 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 119.25-106 chr20 6716678 6716938 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19328 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 193.25-57 chr2 88182869 88183202 + 0.75 NA exon (NM_018271, exon 6 of 8) exon (NM_018271, exon 6 of 8) 9896 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 120.75-147 chr6 87720371 87720599 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -18252 NM_018064 55122 Hs.485915 NM_018064 ENSG00000135334 AKIRIN2 C6orf166|FBI1|dJ486L4.2 akirin 2 protein-coding 129.5-246 chrX 57004574 57004843 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -9167 NR_027139 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 126.75-125 chr2 234044574 234044810 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -6010 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 193.25-30 chr13 94344366 94344780 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) 135109 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 140-18 chr10 53784605 53784940 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -701458 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 160.75-16 chr10 38486298 38486648 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58327 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 149.5-135 chr4 87953898 87954195 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21604 NM_001040060 6696 Hs.313 NM_000582 ENSG00000118785 SPP1 BNSP|BSPI|ETA-1|OPN secreted phosphoprotein 1 protein-coding 150.25-112 chr4 55549824 55550135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3070 NM_004898 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 395.75-11 chr7 77876420 77877335 + 0.75 NA intron (NM_001366089, intron 2 of 18) intron (NM_001366089, intron 2 of 18) 36747 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 140.75-162 chr6 40252967 40253304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102871 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 199-49 chr22 27586689 27587064 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 214880 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 135.5-113 chr2 171628849 171629115 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -58487 NM_001378 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 144.5-136 chr3 136491953 136492328 + 0.75 NA intron (NM_005862, intron 9 of 33) intron (NM_005862, intron 9 of 33) 241800 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 141.25-156 chr6 62777140 62777373 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -491029 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 229.75-44 chr22 19987901 19988401 + 0.75 NA intron (NM_001670, intron 3 of 19) intron (NM_001670, intron 3 of 19) 24398 NR_039918 100616414 NR_039918 ENSG00000284031 MIR4761 - microRNA 4761 ncRNA 186.75-14 chr10 117915487 117915896 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -131130 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 259.75-36 chr3 79237985 79238498 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -173486 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 181.75-63 chr2 119884839 119885201 + 0.75 NA intron (NM_002830, intron 8 of 26) MER5A|DNA|hAT-Charlie 125098 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 160.25-65 chr2 6371557 6371994 + 0.75 NA non-coding (NR_110251, exon 1 of 3) non-coding (NR_110251, exon 1 of 3) 3647 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 121-140 chr3 182669029 182669299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124340 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 166.75-3 chr1 88270587 88271022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -413340 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 186.75-82 chr5 12183546 12183930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -279292 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 131.25-88 chr18 54841638 54841848 + 0.75 NA intron (NM_004163, intron 1 of 5) intron (NM_004163, intron 1 of 5) 13266 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 179.75-70 chr22_KI270733v1_random 146090 146503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16092 NR_146118 109864272 NR_146118 RNA28SN4 RN28S1|RNA28S5 RNA, 28S ribosomal N4 rRNA 116.5 chr1 12253380 12253635 + 0.75 NA intron (NM_015378, intron 6 of 69) L2b|LINE|L2 23477 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 189-18 chr10 59493683 59494147 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -130734 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 175-70 chr2 119338862 119339168 + 0.75 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) L1MC4|LINE|L1 27727 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 171-72 chr2 162321522 162321973 + 0.75 NA intron (NM_001330265, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 2765 NM_001330267 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 154.5-80 chr17 58807586 58808057 + 0.75 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 51952 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 117.75-70 chr15 96302445 96302713 + 0.75 NA intron (NR_102744, intron 1 of 1) intron (NR_102744, intron 1 of 1) -23467 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 172.25-72 chr2 164625703 164626224 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -4481 NM_004490 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 124.25-47 chr13 21835111 21835395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42907 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 114.5-15 chr1 151580251 151580459 + 0.75 NA intron (NM_020127, intron 11 of 12) intron (NM_020127, intron 11 of 12) -31695 NM_030918 81609 Hs.192326 NM_030918 ENSG00000143376 SNX27 MRT1|MY014 sorting nexin 27 protein-coding 156-29 chr12 1258377 1258660 + 0.75 NA intron (NR_027946, intron 13 of 18) intron (NR_027946, intron 13 of 18) 230770 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 135.75-192 chr8 50128394 50128770 + 0.75 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR -35549 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 201.5-49 chr14 20113771 20114062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3552 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 133-72 chr18 3066799 3067079 + 0.75 NA 3' UTR (NM_003803, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_003803, exon 38 of 38) -54992 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 132.5-87 chr16 68174563 68174912 + 0.75 NA intron (NM_004555, intron 6 of 10) AluJr4|SINE|Alu 58762 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 172-28 chr12 10560928 10561265 + 0.75 NA intron (NR_146456, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 7717 NR_146455 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 139.75-25 chr11 71201361 71201626 + 0.75 NA intron (NM_012309, intron 1 of 24) intron (NM_012309, intron 1 of 24) 23303 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 131.75-63 chr14 45015498 45015862 + 0.75 NA intron (NM_001308120, intron 7 of 19) MIR|SINE|MIR 53490 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 156.5-84 chr2 109583155 109583468 + 0.75 NA intron (NM_001321508, intron 1 of 5) L1PA16|LINE|L1 30356 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 230.25-9 chr1 204006338 204006996 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 34597 NR_027902 284573 Hs.406979 NR_027902 ENSG00000176754 LINC00303 C1orf157|NCRNA00303 long intergenic non-protein coding RNA 303 ncRNA 114.25-115 chr21 19778382 19778726 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121201 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 133.5-67 chr12 70772345 70772692 + 0.75 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) intron (NM_002849, intron 2 of 13) 16402 NM_001207015 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 113-161 chr6 89900134 89900337 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 5766 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 131.75-49 chr12 42486209 42486438 + 0.75 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 -2313 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 148.75-159 chr7 84898926 84899328 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 222804 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 219.5-18 chr10 89730080 89730642 + 0.75 NA intron (NM_016195, intron 18 of 32) L2c|LINE|L2 28771 NM_001284259 9585 Hs.240 NM_016195 ENSG00000138182 KIF20B CT90|KRMP1|MPHOSPH1|MPP-1|MPP1 kinesin family member 20B protein-coding 141.25-18 chr10 22133920 22134120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75963 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 131.5-54 chr14 26333408 26333724 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 219864 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 122.75-190 chr7 104440591 104440864 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 112071 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 149-113 chr6 57117592 57118011 + 0.75 NA intron (NR_110742, intron 2 of 3) intron (NR_110742, intron 2 of 3) 27613 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 189.25-120 chr8 66616808 66617102 + 0.75 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -3737 NM_001080416 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 142.5-16 chr1 188854670 188854926 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 1411170 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 160.5-114 chr3 43748872 43749160 + 0.75 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -57422 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 166.5-174 chr6 51492729 51493120 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -128946 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 138.25-137 chr5 40538166 40538464 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -141600 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 122.5-51 chr13 45225370 45225564 + 0.75 NA intron (NM_004128, intron 5 of 7) AluSq4|SINE|Alu -24422 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 166.75-125 chr6 64517278 64517554 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 710580 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 121-186 chr8 81555219 81555560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23999 NM_001105281 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 205.75-8 chr10 114673268 114673784 + 0.75 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 10917 NM_001322883 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 158.5-99 chr2 83901874 83902117 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 379181 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 140.5-202 chr6 137522989 137523227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28714 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 192.5-126 chr8 61231182 61231613 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -56573 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 147-101 chr4 63561033 63561365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 848251 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 159.25-72 chr2 167658647 167658926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -159886 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 115-124 chr4 76011915 76012194 + 0.75 NA intron (NM_001130017, intron 1 of 9) intron (NM_001130017, intron 1 of 9) 874 NM_001130017 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 121.25-50 chr14 26586087 26586321 + 0.75 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) 9893 NM_001366397 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 175.25-141 chr8 67808941 67809273 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -62747 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 177.5-88 chr2 164418655 164418996 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 149670 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 190-24 chr18 1307254 1307798 + 0.75 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 52103 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 121-72 chr15 69600866 69601078 + 0.75 NA intron (NR_126438, intron 1 of 3) Plat_L3|LINE|CR1 8772 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 146.75-83 chr2 183653060 183653286 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 528730 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 113.5-38 chr10 104284626 104284918 + 0.75 NA intron (NM_001191014, intron 3 of 4) intron (NM_001191014, intron 3 of 4) 9606 NM_001191014 119391 Hs.107384 NM_183239 ENSG00000065621 GSTO2 GSTO 2-2|bA127L20.1 glutathione S-transferase omega 2 protein-coding 181.25-38 chr15 93378588 93378975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172715 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 306.5-17 chr15 80410826 80411459 + 0.75 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) L2b|LINE|L2 6760 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 147.25-2 chr1 60062738 60062972 + 0.75 NA intron (NM_152377, intron 2 of 11) intron (NM_152377, intron 2 of 11) 10915 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 163-23 chr11 94613301 94613607 + 0.75 NA intron (NM_152431, intron 15 of 19) L1MA9|LINE|L1 46086 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 198.25-80 chr5 23673236 23673822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165874 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 215.75-38 chr15 60260498 60260838 + 0.75 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 137318 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 233.25-22 chr14 33948739 33949119 + 0.75 NA intron (NM_001308103, intron 1 of 4) intron (NM_001308103, intron 1 of 4) 2145 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 112.5-112 chr2 63969184 63969367 + 0.75 NA intron (NM_001005739, intron 4 of 22) MER1A|DNA|hAT-Charlie 50153 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 151.75-56 chr18 13956494 13956729 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -40904 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 123-165 chr5 164235089 164235318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232199 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 138.25-17 chr10 34034704 34035042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262193 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 243-52 chr4 65741372 65741779 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -71080 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 145.75-106 chr3 182496968 182497256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10012 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 119.75-31 chr11 27755455 27755691 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33543 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 129.75-17 chr1 191028615 191028830 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 199776 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 173.25-81 chr3 148123995 148124353 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 46015 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 153-130 chr6 46808078 46808362 + 0.75 NA intron (NM_005588, intron 5 of 13) intron (NM_005588, intron 5 of 13) 14831 NM_005588 4224 Hs.179704 NM_005588 ENSG00000112818 MEP1A PPHA meprin A subunit alpha protein-coding 164-126 chr7 30264154 30264474 + 0.75 NA intron (NR_136267, intron 1 of 3) L1MB4|LINE|L1 -20283 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 196.5-117 chr4 124803723 124804102 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91180 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 202.25-66 chr5 10261842 10262304 + 0.75 NA intron (NM_012073, intron 8 of 10) intron (NM_012073, intron 8 of 10) 11536 NM_001306156 22948 Hs.1600 NM_012073 ENSG00000150753 CCT5 CCT-epsilon|CCTE|HEL-S-69|PNAS-102|TCP-1-epsilon chaperonin containing TCP1 subunit 5 protein-coding 257.25-30 chr3 68734176 68734796 + 0.75 NA intron (NM_001005527, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 198061 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 186.25-79 chr4 72209409 72209778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170461 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 156.75-15 chr1 241564809 241565022 + 0.75 NA intron (NM_003679, intron 7 of 14) intron (NM_003679, intron 7 of 14) 32537 NM_003679 8564 Hs.731056 NM_003679 ENSG00000117009 KMO dJ317G22.1 kynurenine 3-monooxygenase protein-coding 185.5-78 chr2 67030892 67031320 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55340 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 173-96 chr4 92225417 92225850 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51669 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 239-36 chr3 112501953 112502399 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -2704 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 152-93 chr20 39578148 39578432 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -353542 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 117.75-207 chr8 55770391 55770637 + 0.75 NA intron (NM_001286660, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu 2864 NM_001363176 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 185-64 chr5 9815839 9816186 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) intron (NR_027112, intron 4 of 12) -38365 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 116.25-101 chr2 25077217 25077444 + 0.75 NA intron (NM_001319099, intron 1 of 22) AluSq2|SINE|Alu 34867 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 135.75-12 chr1 161317735 161318006 + 0.75 NA intron (NM_001035513, intron 1 of 3) L1MA8|LINE|L1 3489 NM_001035511 6391 Hs.444472 NM_003001 ENSG00000143252 SDHC CYB560|CYBL|PGL3|QPS1|SDH3 succinate dehydrogenase complex subunit C protein-coding 125-82 chr2 225513614 225513797 + 0.75 NA intron (NM_001371273, intron 4 of 7) intron (NM_001371273, intron 4 of 7) 112819 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 164.75-90 chr21 37307256 37307522 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -39281 NM_001331022 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 195.75-88 chr4 121358045 121358600 + 0.75 NA intron (NM_198179, intron 1 of 5) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 22696 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 126.5-38 chr11 76129712 76129897 + 0.75 NA intron (NM_003369, intron 14 of 14) L2c|LINE|L2 76698 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 180.25-14 chr11 128995239 128995553 + 0.75 NA intron (NM_001142685, intron 11 of 21) AluJr|SINE|Alu 28792 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 156.25-6 chr1 174916445 174916721 + 0.75 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) intron (NM_001366451, intron 5 of 12) 37678 NR_121196 101928696 Hs.666680 NR_121196 ENSG00000229531 LOC101928696 - uncharacterized LOC101928696 ncRNA 164-63 chr2 237854203 237854480 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -5282 NM_001308353 10267 Hs.471783 NM_005855 ENSG00000132329 RAMP1 - receptor activity modifying protein 1 protein-coding 147.25-68 chr2 220612125 220612593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -705794 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 203.75-53 chr2 2246727 2247162 + 0.75 NA intron (NM_015025, intron 2 of 24) intron (NM_015025, intron 2 of 24) -72288 NR_024468 730811 Hs.629472 NR_024468 ENSG00000225619 MYT1L-AS1 - MYT1L antisense RNA 1 ncRNA 208.25 chr1 43866843 43867260 + 0.75 NA intron (NR_073021, intron 6 of 9) AluSg|SINE|Alu 28429 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 122-50 chr12 60732588 60732826 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 1043337 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 207.25-50 chr2 237042863 237043265 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 13103 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 140.75-103 chr2 174082752 174082992 + 0.75 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) intron (NM_001011708, intron 6 of 9) 57592 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 176.75-67 chr2 136366138 136366465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248146 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 138.75-85 chr2 44173635 44173856 + 0.75 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 4870 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 161.5-69 chr15 95582502 95582861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 149588 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 132-132 chr5 9510799 9511097 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_109935) promoter-TSS (NR_109935) -385 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 240.25-63 chr7 67487710 67488400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 152079 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 197-68 chrX 64430929 64431282 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -35653 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 197.75-50 chr20 20653607 20653932 + 0.75 NA intron (NM_020343, intron 3 of 39) intron (NM_020343, intron 3 of 39) 58875 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 113.25-114 chr3 170555895 170556074 + 0.75 NA intron (NM_020949, intron 1 of 7) intron (NM_020949, intron 1 of 7) 30091 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 120.25-208 chr8 29098543 29098791 + 0.75 NA intron (NM_015254, intron 36 of 39) L1MEf|LINE|L1 164403 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 140.25-192 chr8 130279197 130279423 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 17223 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 132-109 chr3 45305154 45305335 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -78957 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 241.25-58 chr5 177225873 177226207 + 0.75 NA intron (NM_172349, intron 6 of 23) L1ME4b|LINE|L1 77679 NM_001031677 53917 Hs.16258 NM_130781 ENSG00000169228 RAB24 - RAB24, member RAS oncogene family protein-coding 198.25-70 chr3 172390833 172391226 + 0.75 NA intron (NM_001135095, intron 25 of 25) intron (NM_001135095, intron 25 of 25) 57427 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 145.25-103 chr3 109370232 109370554 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -32821 NM_001348929 55211 Hs.317659 NM_018189 ENSG00000121570 DPPA4 2410091M23Rik developmental pluripotency associated 4 protein-coding 142.25-74 chr17 80294688 80294983 + 0.75 NA exon (NM_001256071, exon 9 of 68) exon (NM_001256071, exon 9 of 68) 33983 NM_001256071 57674 Hs.195642 NM_020914 ENSG00000173821 RNF213 ALO17|C17orf27|KIAA1618|MYMY2|MYSTR|NET57 ring finger protein 213 protein-coding 187.5-86 chr2 48789978 48790414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34472 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 154-46 chr16 54793089 54793379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54999 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 171.25-119 chr5 78995814 78996189 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10043 NM_198709 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 168-26 chr11 33136817 33137143 + 0.75 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 24500 NM_001326 1479 Hs.44402 NM_001326 ENSG00000176102 CSTF3 CSTF-77 cleavage stimulation factor subunit 3 protein-coding 178.5-175 chr7 117830316 117830619 + 0.75 NA intron (NM_001363351, intron 2 of 22) intron (NM_001363351, intron 2 of 22) 41753 NM_001363349 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 234-72 chr9 38111745 38112241 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -42766 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 164.75-102 chr3 107866224 107866477 + 0.75 NA intron (NR_024276, intron 3 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 11718 NR_015414 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 162-67 chr2 191871211 191871567 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -24301 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 224.5-57 chr2 25589576 25590173 + 0.75 NA intron (NM_001320935, intron 4 of 17) MER52A|LTR|ERV1 60348 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 187-89 chr7 23588854 23589219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2509 NR_002711 1197 Hs.632635 NR_002711 CLK2P1 CLK2P CDC like kinase 2, pseudogene 1 pseudo 187.75-102 chr6 96965850 96966256 + 0.75 NA intron (NM_001323252, intron 2 of 11) intron (NM_001323252, intron 2 of 11) 41325 NM_001323255 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 169.25-44 chr18 26307219 26307647 + 0.75 NA intron (NR_121653, intron 10 of 15) intron (NR_121653, intron 10 of 15) 80988 NR_121653 6875 Hs.369519 NM_005640 ENSG00000141384 TAF4B SPGF13|TAF2C2|TAFII105 TATA-box binding protein associated factor 4b protein-coding 183.25-79 chr4 173744029 173744413 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153052 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 156.25-81 chr2 223160919 223161375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109217 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 134.5-206 chr7 42405719 42406018 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -168659 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 118.5-83 chr19 50938546 50938808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14361 NM_012427 25818 Hs.50915 NM_012427 ENSG00000167754 KLK5 KLK-L2|KLKL2|SCTE kallikrein related peptidase 5 protein-coding 218-69 chr9 80210246 80210575 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 235387 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 157.25-128 chr6 70060782 70061052 + 0.75 NA intron (NM_001858, intron 14 of 50) L2c|LINE|L2 194361 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 148.25-17 chr10 12629590 12630036 + 0.75 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) intron (NM_001351032, intron 4 of 11) 23384 NR_039701 100616320 NR_039701 ENSG00000283699 MIR4481 - microRNA 4481 ncRNA 123-69 chr16 25173681 25173905 + 0.75 NA intron (NM_001032391, intron 7 of 8) FLAM_C|SINE|Alu -24761 NR_039998 100506655 Hs.657576 NR_039998 ENSG00000260034 LCMT1-AS2 - LCMT1 antisense RNA 2 ncRNA 113.5-73 chr14 49018618 49018865 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 567639 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 174.5-14 chr1 214120921 214121338 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132596 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 116.25-17 chr10 21037523 21037880 + 0.75 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -136289 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 118.25-64 chr14 56696245 56696476 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109307 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 149.75-68 chr18 2384601 2384820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186795 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 137.75-77 chr15 78345609 78345912 + 0.75 NA intron (NM_004378, intron 3 of 3) intron (NM_004378, intron 3 of 3) 5407 NM_004378 1381 Hs.346950 NM_004378 ENSG00000166426 CRABP1 CRABP|CRABP-I|CRABPI|RBP5 cellular retinoic acid binding protein 1 protein-coding 168.5-45 chr12 42149794 42150141 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5093 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 142-138 chr6 27539727 27540022 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -66756 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 272.5-49 chr3 31303233 31303863 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -141761 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 119.5-129 chr2 139375233 139375478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 478031 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 179-61 chr2 189376249 189376660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64979 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 135.25-40 chr11 20992835 20993146 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 323404 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 205.25-42 chr18 8599221 8599643 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -10013 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 144.25-33 chr10 98816418 98816682 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 108018 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 136.25-163 chr6 36590058 36590346 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4111 NR_036610 6428 Hs.405144 NM_003017 ENSG00000112081 SRSF3 SFRS3|SRp20 serine and arginine rich splicing factor 3 protein-coding 151-41 chr16 62716184 62716593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -679950 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 143-50 chr16 85953077 85953417 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 34900 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 129.25-61 chr15 89386955 89387347 + 0.75 NA intron (NR_133001, intron 3 of 6) intron (NR_133001, intron 3 of 6) 9109 NR_015411 254559 Hs.136313 NR_015411 ENSG00000255571 MIR9-3HG LINC00925 MIR9-3 host gene ncRNA 120.5-213 chr7 37073039 37073217 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) L1ME4a|LINE|L1 75332 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 118.5-227 chr8 126672386 126672762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114096 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 196.5-107 chr3 115560146 115560627 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -63124 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 199-16 chr11 29485576 29485896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -108677 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 133.75-179 chr7 77946375 77946605 + 0.75 NA intron (NM_001366081, intron 14 of 16) L1ME3Cz|LINE|L1 106360 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 150.5-203 chr7 30357318 30357528 + 0.75 NA intron (NM_147128, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 -12627 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 175.5-102 chr20 51030845 51031175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7903 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 159.75-151 chr6 70874803 70875135 + 0.75 NA intron (NM_080742, intron 2 of 3) L1M4|LINE|L1 82091 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 226.25-24 chr12 129720094 129720441 + 0.75 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) intron (NM_133448, intron 1 of 8) 183758 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 160.75-116 chr5 13557337 13557669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 386977 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 217.25 chr1 22410826 22411249 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -40814 NM_001330398 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 138-169 chr8 138087742 138088137 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -4394 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 171-6 chr1 94111286 94111642 + 0.75 NA exon (NM_000350, exon 3 of 50) exon (NM_000350, exon 3 of 50) 9684 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 222-74 chr7 46574495 46574960 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 122395 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 113-18 chr1 248698204 248698401 + 0.75 NA intron (NR_125950, intron 1 of 1) intron (NR_125950, intron 1 of 1) 1240 NR_125950 101928226 NR_125950 LYPD9P - LY6/PLAUR domain containing 9, pseudogene pseudo 187.75-68 chr3 12232797 12233317 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -54428 NM_001354666 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 116.5-34 chr11 5710768 5711130 + 0.75 NA TTS (NM_006074) TTS (NM_006074) 21159 NM_001199573 10346 Hs.501778 NM_006074 ENSG00000132274 TRIM22 GPSTAF50|RNF94|STAF50 tripartite motif containing 22 protein-coding 180.75-90 chr3 72220477 72220894 + 0.75 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 69428 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 148.75-151 chr7 1365675 1365994 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 93636 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 237.25-61 chr5 72110811 72111345 + 0.75 NA intron (NM_005909, intron 1 of 6) intron (NM_005909, intron 1 of 6) 3603 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 200.75-39 chr17 58570490 58570983 + 0.75 NA intron (NM_031272, intron 24 of 31) AluSz|SINE|Alu -26408 NM_001368771 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 147.25-158 chr9 38227729 38228065 + 0.75 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -158670 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 128-174 chr9 69880602 69880902 + 0.75 NA intron (NM_001308084, intron 4 of 4) L1MA2|LINE|L1 59935 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 143-95 chr3 143469232 143469477 + 0.75 NA intron (NM_173653, intron 11 of 15) intron (NM_173653, intron 11 of 15) 127108 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-45 chr11 107390662 107390866 + 0.75 NA intron (NM_152434, intron 11 of 17) MLT2A2|LTR|ERVL 67082 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 246-57 chr7 28018105 28018520 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -162145 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 124.75-112 chr2 19835221 19835448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33520 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 126.25-180 chr6 133389175 133389529 + 0.75 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) L2b|LINE|L2 147853 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 160.25-137 chr6 45039873 45040118 + 0.75 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 157775 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 143-149 chr8 121676204 121676419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34871 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 148-24 chr14 35944583 35944790 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118348 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 113-2 chr1 65165135 65165332 + 0.75 NA intron (NM_001330616, intron 1 of 4) intron (NM_001330616, intron 1 of 4) 16239 NM_001330616 205 Hs.10862 NM_013410 ENSG00000162433 AK4 AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2 adenylate kinase 4 protein-coding 149-125 chr7 112044423 112044714 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) L2a|LINE|L2 161831 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 156-46 chr14 56581825 56582111 + 0.75 NA intron (NM_017799, intron 1 of 15) intron (NM_017799, intron 1 of 15) 2170 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 151-129 chr7 72477760 72478235 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -30854 NM_001363460 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 187.25-4 chr1 96423221 96423588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49279 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 112.75-11 chr1 110865598 110865789 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -5506 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 153.5-127 chr3 36390711 36390961 + 0.75 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 10349 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 210.5-95 chr5 44440522 44440977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51329 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 149.75-26 chr11 78322973 78323322 + 0.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L1PA17|LINE|L1 18733 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 349.5-9 chr2 115202270 115202933 + 0.75 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 40446 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 236-57 chr5 145493683 145494417 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 341292 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 154.25-162 chr7 113894967 113895313 + 0.75 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 23869 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 119-93 chr2 144884206 144884464 + 0.75 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 216368 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 152.75-32 chr11 41068005 41068227 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 391520 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 130.75-74 chr17 77484078 77484276 + 0.75 NA intron (NM_006640, intron 3 of 10) intron (NM_006640, intron 3 of 10) 8934 NM_001113495 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 152.25-148 chr7 84645758 84645985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113395 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 206.5-67 chr21 20216800 20217253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41659 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 128.5-148 chr3 87955104 87955307 + 0.75 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 -27371 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 206.5-74 chr3 123416676 123417037 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001199642) promoter-TSS (NM_001199642) -514 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 170-14 chr11 13727442 13727723 + 0.75 NA exon (NM_032228, exon 11 of 12) exon (NM_032228, exon 11 of 12) -56804 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 189.75-115 chr7 87192405 87192887 + 0.75 NA intron (NR_024550, intron 14 of 17) intron (NR_024550, intron 14 of 17) 27086 NM_024315 79161 Hs.619593 NM_024315 ENSG00000135185 TMEM243 C7orf23|MM-TRAG|MMTRAG transmembrane protein 243 protein-coding 166-53 chr18 63838873 63839099 + 0.75 NA Intergenic (TATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -48719 NM_001143818 5055 Hs.594481 NM_002575 ENSG00000197632 SERPINB2 HsT1201|PAI|PAI-2|PAI2|PLANH2 serpin family B member 2 protein-coding 341.5-35 chr8 66735553 66736155 + 0.75 NA intron (NM_001033578, intron 1 of 16) intron (NM_001033578, intron 1 of 16) 23073 NM_001033578 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 160.75-159 chr9 85563250 85563620 + 0.75 NA intron (NM_015239, intron 25 of 25) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 178594 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 167-104 chr7 11774641 11775006 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) AluSz6|SINE|Alu 57375 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 130.75-112 chr3 27787361 27787677 + 0.75 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -10069 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 295.5-27 chr2 76640872 76641607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -344726 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 132-42 chr12 128428256 128428453 + 0.75 NA intron (NM_001136103, intron 2 of 8) intron (NM_001136103, intron 2 of 8) 134262 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 122.75-214 chr9 36692701 36693079 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 119995 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 146.75-55 chr16 20209251 20209548 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 118114 NM_001007240 2813 Hs.53985 NM_001502 ENSG00000169347 GP2 ZAP75 glycoprotein 2 protein-coding 143.5-197 chr7 70369049 70369248 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) -762996 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 178.75-22 chr12 131853111 131853587 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24956 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 117.5-36 chr11 26854109 26854422 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132205 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 171.5-118 chr4 101661612 101662115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128744 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 148-97 chr5 26390564 26390884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 647862 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 130.75-92 chr2 121865217 121865567 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 109741 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 160.5-208 chr9 112147386 112147809 + 0.75 NA intron (NM_022486, intron 3 of 16) AluSc|SINE|Alu 27700 NM_001282643 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 159.75-22 chr10 99281713 99282095 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -46029 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 144.75-160 chr7 79898334 79898626 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -236351 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 167.25-116 chr4 74702945 74703203 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 91449 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 211.5-166 chr9 75179233 75179592 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 90898 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 135.25-210 chr9 119212048 119212368 + 0.75 NA intron (NM_014618, intron 6 of 7) intron (NM_014618, intron 6 of 7) 157227 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 142-98 chr22 28635354 28635647 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 1 of 22) intron (NM_001145418, intron 1 of 22) 44365 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 182.5-180 chrX 72641856 72642232 + 0.75 NA intron (NM_002637, intron 14 of 31) L2c|LINE|L2 -46905 NR_110391 101928259 Hs.666679 NR_110391 ENSG00000231944 PHKA1-AS1 - PHKA1 antisense RNA 1 ncRNA 316.75-5 chr16 8239584 8240089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 350002 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 116-9 chr1 231225958 231226227 + 0.75 NA intron (NM_152379, intron 5 of 6) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 15083 NM_001300830 128061 Hs.743464 NM_152379 ENSG00000143633 C1orf131 - chromosome 1 open reading frame 131 protein-coding 148.25-4 chr1 43983300 43983641 + 0.75 NA intron (NM_001005417, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 2965 NM_001005417 8704 Hs.632403 NM_003780 ENSG00000117411 B4GALT2 B4Gal-T2|B4Gal-T3|beta4Gal-T2 beta-1,4-galactosyltransferase 2 protein-coding 247.25-8 chr11 108056069 108056557 + 0.75 NA intron (NM_003478, intron 7 of 18) intron (NM_003478, intron 7 of 18) 47415 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 197.75-51 chr20 42911803 42912207 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) L1ME4a|LINE|L1 -56738 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 127.5-233 chr7 129142563 129142816 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2018 NM_178562 340348 Hs.27267 NM_178562 ENSG00000158457 TSPAN33 PEN|PEN.|TSPAN-33 tetraspanin 33 protein-coding 134.75-205 chr7 110167810 110168145 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -207764 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 159.25-84 chr3 71306450 71306777 + 0.75 NA TTS (NR_126463) TTS (NR_126463) -1842 NM_001244812 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 122.75-87 chr2 32522924 32523100 + 0.75 NA intron (NM_016252, intron 57 of 73) L1MEc|LINE|L1 -9141 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 140.5-35 chr11 75404556 75404893 + 0.75 NA TTS (NR_000025) TTS (NR_000025) 303 NR_000025 114599 Hs.689080 NR_000025 ENSG00000207445 SNORD15B RNU15B|U15B small nucleolar RNA, C/D box 15B snoRNA 164-142 chr8 134851388 134851680 + 0.75 NA non-coding (NR_125427, exon 1 of 3) non-coding (NR_125427, exon 1 of 3) 1599 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 120.5-105 chr19 48559779 48560031 + 0.75 NA intron (NM_177973, intron 1 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 7733 NM_177973 6820 Hs.369331 NM_004605 ENSG00000088002 SULT2B1 ARCI14|HSST2 sulfotransferase family 2B member 1 protein-coding 124.75-146 chr3 113621233 113621465 + 0.75 NA intron (NR_136285, intron 17 of 20) FLAM_C|SINE|Alu 26473 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 169.75-66 chr18 7817859 7818155 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 250691 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 122-20 chr1 194998610 194998950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1089935 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 168-54 chr16 8448381 8448642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141327 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 181.5-50 chr15 68092777 68093242 + 0.75 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 38433 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 190.5-107 chr4 35775407 35775779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 468346 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 127.25-200 chr7 116823823 116824054 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -38649 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 114.5-16 chr1 164379986 164380297 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -179219 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 158.75-22 chr10 117290092 117290421 + 0.75 NA exon (NM_173791, exon 4 of 5) exon (NM_173791, exon 4 of 5) 49142 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 160-72 chr4 30842820 30843206 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 122644 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 193.25-15 chr10 89983921 89984397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26786 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 128.75-178 chr6 136941050 136941312 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 18880 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 113-109 chr22 25001840 25002098 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26005 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 225.75-79 chrX 49058325 49058863 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001163323) promoter-TSS (NM_001163323) -372 NM_001271835 90060 Hs.522643 NM_033626 ENSG00000147144 CCDC120 JM11 coiled-coil domain containing 120 protein-coding 134.5-152 chr4 39208682 39208969 + 0.75 NA intron (NM_025132, intron 9 of 36) MER2|DNA|TcMar-Tigger 26296 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 159-118 chr8 121503259 121503552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135941 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-181 chr6 37407942 37408183 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -25159 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 169.25-73 chr3 88955787 88956141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151657 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 116.5-236 chr7 115905550 115905771 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62653 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 178.75-17 chr11 106491309 106491697 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 240096 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 183-108 chr7 79386271 79386651 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -66496 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 143.75-34 chr11 66359517 66359906 + 0.75 NA intron (NR_135761, intron 1 of 1) (TGACCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11720 NR_135761 102724064 Hs.614641 NR_135761 ENSG00000255468 LOC102724064 - uncharacterized LOC102724064 ncRNA 214.5-18 chr10 126383462 126383791 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) HAL1|LINE|L1 4851 NM_001288974 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 220.5-107 chr6 53882885 53883271 + 0.75 NA intron (NM_018214, intron 4 of 13) intron (NM_018214, intron 4 of 13) -46904 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 176.25-125 chr7 40572368 40572710 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 407400 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 153.75-38 chr14 33306116 33306482 + 0.75 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 367420 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 142.25-119 chr4 56352928 56353364 + 0.75 NA intron (NM_001286672, intron 9 of 10) AluJo|SINE|Alu 34345 NM_001323892 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 189-99 chr7 70574553 70575020 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -557358 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 126.75-93 chr18 2096336 2096572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 475051 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 196.25-95 chr4 164517192 164517506 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -134094 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 180.5-138 chr7 40299118 40299540 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) MER102c|DNA|hAT-Charlie 164353 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 169.25-119 chr8 91112818 91113072 + 0.75 NA intron (NM_001354470, intron 1 of 3) L1MA9|LINE|L1 10326 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 117.25-106 chr2 48644572 48644888 + 0.75 NA intron (NM_172311, intron 6 of 10) intron (NM_172311, intron 6 of 10) 26874 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 164.25-81 chr20 11922942 11923212 + 0.75 NA exon (NM_001282552, exon 4 of 4) exon (NM_001282552, exon 4 of 4) 5184 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 133-145 chr5 151315007 151315337 + 0.75 NA 3' UTR (NM_181776, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_181776, exon 10 of 10) -11406 NM_001145017 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 119.5-82 chr14 78725609 78725959 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) L3|LINE|CR1 322065 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 117.25-60 chr13 23438209 23438413 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -4609 NM_014363 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 160.25-126 chr5 81622827 81623244 + 0.75 NA intron (NM_012446, intron 3 of 16) intron (NM_012446, intron 3 of 16) 128218 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 207.75-46 chr18 54120066 54120499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102130 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 128-48 chr15 56628933 56629277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104981 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 149.5-128 chr4 11854684 11854947 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 71637 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 117-12 chr10 25137289 25137560 + 0.75 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) intron (NR_120649, intron 6 of 7) 24366 NR_120649 101929025 Hs.553324 NR_120649 ENSG00000231422 LINC01516 - long intergenic non-protein coding RNA 1516 ncRNA 144.25-59 chr14 81566141 81566457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32438 NM_001244984 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 143.25-84 chr2 39146041 39146294 + 0.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -25704 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 292.75-35 chr8 132678109 132678573 + 0.75 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -2796 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 207.25-76 chr5 135940808 135941141 + 0.75 NA non-coding (NR_152420, exon 6 of 6) non-coding (NR_152420, exon 6 of 6) 10677 NR_152420 26223 Hs.591275 NM_012159 FBXL21P FBL3B|FBXL21|FBXL3B|FBXL3P|Fbl21 F-box and leucine rich repeat protein 21, pseudogene pseudo 193.75-75 chr20 3889888 3890334 + 0.75 NA intron (NM_001324193, intron 1 of 6) intron (NM_001324193, intron 1 of 6) 295 NM_001324193 80025 Hs.114180 NM_024960 ENSG00000125779 PANK2 C20orf48|HARP|HSS|NBIA1|PKAN pantothenate kinase 2 protein-coding 200.25-11 chr10 17959239 17959535 + 0.75 NA intron (NM_001145195, intron 2 of 12) intron (NM_001145195, intron 2 of 12) 7469 NM_001145195 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 132.5-81 chr15 92990658 92990942 + 0.75 NA intron (NM_001271, intron 26 of 38) intron (NM_001271, intron 26 of 38) 82356 NM_001166286 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 145.5-57 chr13 94656415 94656728 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 51915 NR_120417 101927248 NR_120417 LOC101927248 - uncharacterized LOC101927248 ncRNA 157-41 chr16 60042258 60042557 + 0.75 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 187054 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 135.75-85 chr2 9426154 9426384 + 0.75 NA intron (NM_001321834, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 2615 NM_016207 51692 Hs.515972 NM_016207 ENSG00000119203 CPSF3 CPSF-73|CPSF73 cleavage and polyadenylation specific factor 3 protein-coding 175-126 chr8 27541131 27541535 + 0.75 NA intron (NM_001979, intron 15 of 18) intron (NM_001979, intron 15 of 18) 50190 NM_001256482 2053 Hs.212088 NM_001979 ENSG00000120915 EPHX2 ABHD20|CEH|SEH epoxide hydrolase 2 protein-coding 172.5-44 chr12 9248126 9248490 + 0.75 NA intron (NR_137434, intron 4 of 6) intron (NR_137434, intron 4 of 6) 8305 NR_137431 100499405 Hs.182314 NR_036466 ENSG00000237248 LINC00987 - long intergenic non-protein coding RNA 987 ncRNA 126.5-77 chr15 92292887 92293218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100829 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 125.25-13 chr1 165876916 165877177 + 0.75 NA intron (NM_012474, intron 1 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -30875 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 289.75-21 chr4 19738887 19739591 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -512666 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 177.25-99 chr3 162285042 162285424 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 788425 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 176.25-97 chr3 123065467 123065895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1344 NM_006810 10954 Hs.477352 NM_006810 ENSG00000065485 PDIA5 PDIR protein disulfide isomerase family A member 5 protein-coding 124-24 chr11 29342625 29342867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -251667 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 226.75-72 chr8 52023189 52023719 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -124268 NM_001286782 115294 Hs.671268 NM_052937 ENSG00000168300 PCMTD1 - protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 217.5-64 chr2 156840563 156841128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 404466 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 128-157 chr7 105614163 105614378 + 0.75 NA exon (NM_020725, exon 10 of 12) exon (NM_020725, exon 10 of 12) -32728 NM_001355531 100130771 Hs.719432 NM_001355526 ENSG00000185055 EFCAB10 - EF-hand calcium binding domain 10 protein-coding 115-108 chr3 102237660 102237897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74073 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 155.25-45 chr12 10598351 10598626 + 0.75 NA intron (NR_028045, intron 1 of 6) intron (NR_028045, intron 1 of 6) 1347 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 154.75-97 chr3 117137251 117137724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 216056 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 202.5-42 chr14 63963780 63964169 + 0.75 NA exon (NM_182914, exon 10 of 116) exon (NM_182914, exon 10 of 116) 110970 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 134.25-12 chr10 11308236 11308462 + 0.75 NA intron (NM_001025076, intron 9 of 13) L1M4b|LINE|L1 36325 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 134-2 chr1 44773421 44773746 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1957 NM_001012 6202 Hs.512675 NM_001012 ENSG00000142937 RPS8 S8 ribosomal protein S8 protein-coding 152.75-113 chr3 180393494 180393799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20527 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 174.25-144 chr8 87102330 87102716 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L2|LINE|L2 236108 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 131.75-31 chr10 81134992 81135266 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 485332 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 195.25-84 chr7 18040568 18041072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12974 NM_175886 221823 Hs.169284 NM_175886 ENSG00000229937 PRPS1L1 PRPS1|PRPS3|PRPSL|PRS-III phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 like 1 protein-coding 129.25-39 chr12 115138026 115138258 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -453967 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 256.5-10 chr10 93437508 93437922 + 0.75 NA intron (NM_013451, intron 3 of 53) intron (NM_013451, intron 3 of 53) 44619 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 123.75-127 chr3 127883478 127883683 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31652 NM_001370224 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 119.75-73 chr17 16607046 16607315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37968 NM_001346170 57336 Hs.99724 NM_020653 ENSG00000141040 ZNF287 ZKSCAN13|ZSCAN45 zinc finger protein 287 protein-coding 150.5-127 chr3 42344197 42344543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66240 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 175.75-59 chr18 40580201 40580538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 514083 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 141.75-119 chr3 121258844 121259131 + 0.75 NA intron (NM_001348343, intron 17 of 27) intron (NM_001348343, intron 17 of 27) 209347 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 145-36 chr12 43781097 43781535 + 0.75 NA intron (NM_001351343, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 22372 NM_001351343 51135 Hs.138499 NM_016123 ENSG00000198001 IRAK4 IPD1|IRAK-4|NY-REN-64|REN64 interleukin 1 receptor associated kinase 4 protein-coding 171-21 chr11 74910737 74910975 + 0.75 NA intron (NM_001270380, intron 8 of 14) intron (NM_001270380, intron 8 of 14) 38235 NM_182969 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 224-17 chr14 53547596 53548156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 394522 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 134.25-147 chr5 131901229 131901493 + 0.75 NA intron (NM_001303622, intron 8 of 12) L1PA15|LINE|L1 44302 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 131.25-149 chr3 145385492 145385709 + 0.75 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 683585 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 216.75-2 chr1 60984688 60985091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14113 NR_110618 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 169.75-84 chr2 133695829 133696232 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -127567 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 139.5-200 chr7 55141711 55141996 + 0.75 NA intron (NM_001346900, intron 1 of 27) intron (NM_001346900, intron 1 of 27) 32014 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 185-74 chr6 16580053 16580378 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 5 of 8) intron (NM_000332, intron 5 of 8) 179969 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 189.75-112 chr7 51923169 51923631 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -530144 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 168.25-79 chr2 145513746 145514090 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 845951 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 116-82 chr2 54521862 54522062 + 0.75 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) AluJb|SINE|Alu -7260 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 239.75-25 chr15 88149006 88149561 + 0.75 NA intron (NM_001007156, intron 5 of 15) intron (NM_001007156, intron 5 of 15) 56691 NM_001320135 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 255-61 chr8 92097592 92098189 + 0.75 NA intron (NM_175634, intron 1 of 11) intron (NM_175634, intron 1 of 11) 1798 NM_001198628 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 177.75-146 chrX 63048288 63048779 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 302799 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 141.25-66 chr17 40006203 40006471 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9103 NM_172219 1440 Hs.2233 NM_000759 ENSG00000108342 CSF3 C17orf33|CSF3OS|GCSF colony stimulating factor 3 protein-coding 198.75-72 chr4 166853316 166853854 + 0.75 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) intron (NM_001040159, intron 6 of 10) 380841 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 218.25-3 chr1 67369505 67369964 + 0.75 NA intron (NM_001258215, intron 10 of 13) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 60668 NM_015640 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 167.5-186 chr8 121860383 121860814 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -219158 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 197.75-49 chr20 1410611 1410929 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -17598 NM_001199786 2280 Hs.471933 NM_000801 ENSG00000088832 FKBP1A FKBP-12|FKBP-1A|FKBP1|FKBP12|PKC12|PKCI2|PPIASE FKBP prolyl isomerase 1A protein-coding 135.75-118 chr20 1717075 1717288 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -59402 NM_018556 55423 Hs.590883 NM_018556 ENSG00000089012 SIRPG CD172g|SIRP-B2|SIRPB2|SIRPgamma|bA77C3.1 signal regulatory protein gamma protein-coding 205.5-42 chr14 53445423 53445856 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292285 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 196.5-138 chr6 41254035 41254379 + 0.75 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 4830 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 145-73 chr2 59542753 59542989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325163 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 161-73 chr22 28430104 28430345 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -29645 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 162.5-82 chr2 83639734 83640135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117120 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 179.25-96 chr22 24708234 24708546 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -49243 NR_024593 646074 Hs.531306 NM_001025230 POM121L10P - POM121 transmembrane nucleoporin like 10, pseudogene pseudo 229.25-76 chr7 24995667 24996041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15676 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 119.75-203 chr8 126207158 126207508 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -118162 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 137-91 chr20 42768430 42768745 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 5 of 31) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 83104 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 143-157 chrX 66967750 66968030 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -328592 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 121-4 chr1 51854588 51854813 + 0.75 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) FLAM_C|SINE|Alu -18298 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 212.75-17 chr11 87534110 87534543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 185085 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 121.25-206 chr9 84068615 84068845 + 0.75 NA intron (NR_110995, intron 2 of 8) intron (NR_110995, intron 2 of 8) 5287 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 139-121 chr5 134358639 134358937 + 0.75 NA intron (NM_001113575, intron 3 of 12) AluJo|SINE|Alu 8286 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 172.25-120 chr5 159017454 159017841 + 0.75 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 80309 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 140.25-121 chr3 145588837 145589181 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 480176 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 127.25-196 chr7 80401124 80401455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26850 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 220.25-5 chr10 24471943 24472312 + 0.75 NA intron (NM_001282770, intron 1 of 11) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 5596 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 139.75-68 chr16 61877088 61877427 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 3 of 11) intron (NM_001796, intron 3 of 11) 159181 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 233.25-46 chr3 32858825 32859457 + 0.75 NA intron (NM_001039111, intron 1 of 3) intron (NM_001039111, intron 1 of 3) 41144 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 197.5-95 chr3 44074480 44074875 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -39535 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 114.75-57 chr14 85592128 85592370 + 0.75 NA intron (NM_001346143, intron 1 of 1) intron (NM_001346143, intron 1 of 1) 58900 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 137.5-184 chr5 22547500 22547806 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 305691 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 144.5-145 chr4 56915496 56915739 + 0.75 NA intron (NM_001193508, intron 2 of 3) intron (NM_001193508, intron 2 of 3) 6704 NM_001193508 5978 Hs.307836 NM_005612 ENSG00000084093 REST DFNA27|GINGF5|HGF5|NRSF|WT6|XBR RE1 silencing transcription factor protein-coding 148-7 chr10 96593783 96594068 + 0.75 NA 3' UTR (NM_152309, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_152309, exon 17 of 17) -6913 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 201.25-20 chr11 46066624 46067014 + 0.75 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) L1ME3G|LINE|L1 54000 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 217-63 chr4 111385957 111386461 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -525562 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 121.5-148 chr2 183387296 183387527 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 262968 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 157.25-29 chr11 106382001 106382425 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 130806 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 179.75-114 chr6 43354815 43355169 + 0.75 NA exon (NM_014345, exon 4 of 10) exon (NM_014345, exon 4 of 10) 14655 NM_014345 24149 Hs.509718 NM_014345 ENSG00000171467 ZNF318 HRIHFB2436|TZF|ZFP318 zinc finger protein 318 protein-coding 126.5-208 chr6 90620934 90621169 + 0.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -33979 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 156.5-160 chr5 168112142 168112497 + 0.75 NA intron (NM_001368145, intron 8 of 26) L1PA13|LINE|L1 -53526 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 234.25-80 chr8 138056490 138057121 + 0.75 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 26740 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 218.25-98 chr8 121113860 121114312 + 0.75 NA Intergenic AluYk4|SINE|Alu -302040 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 145.75-5 chr1 162993958 162994326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74464 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 163.75-42 chr13 67719258 67719601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 347042 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 140.25-117 chr3 38652518 38652857 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -3000 NM_001354701 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 167.75-142 chr8 115099429 115099743 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 568427 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 177.5-93 chr2 193154935 193155304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 405274 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 172.25-121 chr6 13567418 13567724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6958 NM_001193267 23408 Hs.567431 NM_012241 ENSG00000124523 SIRT5 SIR2L5 sirtuin 5 protein-coding 256.75-44 chr8 141161881 141162561 + 0.75 NA intron (NM_001362798, intron 9 of 21) intron (NM_001362798, intron 9 of 21) 33632 NM_001352890 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 127.5-97 chr16 86595581 86595945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17254 NM_005250 2300 Hs.533830 NM_005250 ENSG00000176678 FOXL1 FKH6|FKHL11|FREAC7 forkhead box L1 protein-coding 183.5-103 chr4 119180154 119180445 + 0.75 NA intron (NM_016599, intron 5 of 5) L1M6|LINE|L1 -32328 NM_019050 54532 Hs.431081 NM_019050 ENSG00000145390 USP53 - ubiquitin specific peptidase 53 protein-coding 159.5-22 chr10 67425892 67426401 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -22736 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 130.5-225 chr7 47247477 47247877 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 217126 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 168.75-104 chr4 99062957 99063324 + 0.75 NA TTS (NM_015143) TTS (NM_015143) 25648 NM_000671 128 Hs.78989 NM_000671 ENSG00000197894 ADH5 ADH-3|ADHX|FALDH|FDH|GSH-FDH|GSNOR|HEL-S-60p alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide protein-coding 181.25-49 chr17 72251033 72251461 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91564 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 223.5-45 chr15 60056522 60056904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52402 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 150.25-9 chr1 165883725 165883953 + 0.75 NA intron (NM_012474, intron 1 of 6) intron (NM_012474, intron 1 of 6) -24082 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 124.75-59 chr12 50742142 50742389 + 0.75 NA intron (NM_173602, intron 37 of 37) AluJb|SINE|Alu -21836 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 195.75-120 chr8 127676070 127676408 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 57728 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 143.25-83 chr2 18409655 18409979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150836 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 212-28 chr16 2804717 2805247 + 0.75 NA exon (NM_001354586, exon 7 of 7) exon (NM_001354586, exon 7 of 7) -8450 NR_145775 109616997 NR_145775 ENSG00000221719 SNORA3C - small nucleolar RNA, H/ACA box 3C snoRNA 155.25-147 chr5 132782387 132782632 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -4640 NM_001098813 23176 Hs.522057 NM_015146 ENSG00000164402 SEPTIN8 SEP2|SEPT8 septin 8 protein-coding 120.5-123 chr2 132885572 132885791 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 8 of 17) intron (NM_207481, intron 8 of 17) -29876 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 199.75-5 chr10 53060132 53060443 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -288587 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 135.75-145 chr3 105620848 105621124 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 246605 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 213-92 chr8 3799872 3800446 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) intron (NM_033225, intron 5 of 69) -1071708 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 142-147 chr7 16460849 16461094 + 0.75 NA TTS (NM_015464) TTS (NM_015464) 4767 NM_015464 25928 Hs.648106 NM_015464 ENSG00000171243 SOSTDC1 CDA019|DAND7|ECTODIN|USAG1 sclerostin domain containing 1 protein-coding 219.75-6 chr1 119076678 119077136 + 0.75 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 29502 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 155.25-145 chr5 123561897 123562191 + 0.75 NA intron (NM_001044723, intron 3 of 12) intron (NM_001044723, intron 3 of 12) 16627 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 132.5-231 chr7 111601355 111601551 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -38936 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 119.75-113 chr2 142449796 142450112 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -318253 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 202.5-148 chrX 81511337 81511716 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 309424 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 175.25-13 chr1 221005529 221005835 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -125542 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 176-45 chr3 98019098 98019533 + 0.75 NA intron (NM_001105580, intron 3 of 9) intron (NM_001105580, intron 3 of 9) 15989 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 165-128 chr7 25524333 25524594 + 0.75 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 138677 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 132-7 chr1 190213676 190213899 + 0.75 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) intron (NM_199051, intron 6 of 7) 262223 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 140.75-171 chr7 105541823 105542125 + 0.75 NA intron (NR_144478, intron 3 of 13) intron (NR_144478, intron 3 of 13) 9773 NM_021930 60561 Hs.531388 NM_021930 ENSG00000135249 RINT1 RINT-1 RAD50 interactor 1 protein-coding 122.5-232 chr9 93129801 93130125 + 0.75 NA intron (NM_004148, intron 1 of 3) intron (NM_004148, intron 1 of 3) 4288 NM_004148 4814 Hs.494457 NM_004148 ENSG00000131669 NINJ1 NIN1|NINJURIN ninjurin 1 protein-coding 123.25-194 chr7 146780151 146780449 + 0.75 NA intron (NM_014141, intron 1 of 22) AluY|SINE|Alu 6029 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 120-177 chr7 82793795 82794107 + 0.75 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) HAL1|LINE|L1 -349995 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 142.25-169 chr8 115063289 115063557 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 604590 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 237.5-47 chr2 59301655 59302125 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84182 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 151.5-122 chr3 104423761 104423990 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -899759 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 114.25-22 chr10 108403132 108403329 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -333937 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 237.5-75 chr5 30550657 30551102 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -642807 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 125.25-218 chr9 74388329 74388547 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 16907 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 122.5-189 chr5 167781254 167781430 + 0.75 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) MER113|DNA|hAT-Charlie 26413 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 135.25-120 chr20 61812089 61812506 + 0.75 NA intron (NM_001252339, intron 3 of 14) intron (NM_001252339, intron 3 of 14) -92549 NR_147702 100128310 Hs.683806 NR_147702 ENSG00000179253 LOC100128310 - uncharacterized LOC100128310 ncRNA 152-103 chr3 25787932 25788209 + 0.75 NA intron (NM_001145294, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 1969 NM_001145294 55768 Hs.368960 NM_018297 ENSG00000151092 NGLY1 CDDG|CDG1V|PNG1|PNGase N-glycanase 1 protein-coding 228.25-80 chr8 58833943 58834512 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 5 of 8) intron (NM_014729, intron 5 of 8) -174374 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 163.25-96 chr3 99713414 99713892 + 0.75 NA intron (NM_001850, intron 2 of 4) intron (NM_001850, intron 2 of 4) 75059 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 144.5-85 chr17 62092792 62093106 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -27671 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 237.75-36 chr2 23010081 23010647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -374815 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 142.25-174 chr8 135301274 135301600 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67306 NR_120396 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 145.25-180 chr9 30359929 30360209 + 0.75 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 48385 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 134.5-35 chr10 111722218 111722444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 461434 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 136.75-59 chr14 66802221 66802512 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) L1MA2|LINE|L1 294959 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 133.25-26 chr10 118636415 118636613 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -40866 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 113-155 chr6 8578433 8578635 + 0.75 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) intron (NR_038980, intron 3 of 4) -73675 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 132.5-11 chr1 62848658 62848951 + 0.75 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) L1MC4|LINE|L1 64672 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 204.25-3 chr1 63089989 63090347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77697 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 152.25-66 chr17 63571559 63572045 + 0.75 NA intron (NR_073585, intron 1 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 21325 NR_073585 10238 Hs.410596 NM_005828 ENSG00000136485 DCAF7 AN11|HAN11|SWAN-1|WDR68 DDB1 and CUL4 associated factor 7 protein-coding 155.25-173 chr8 5318669 5318954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -323897 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 166.5-54 chr12 99838806 99839086 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 1 of 25) L1M5|LINE|L1 145708 NM_001352186 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 229.25-39 chr19 34612514 34612991 + 0.75 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) L1MA5|LINE|L1 -18167 NM_001025591 284402 Hs.656990 NM_001025591 ENSG00000205209 SCGB2B2 SCGB4A2|SCGBL secretoglobin family 2B member 2 protein-coding 144.5-35 chr10 96108345 96108674 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -18274 NR_134320 728558 Hs.538374 NR_038444 ENSG00000226688 ENTPD1-AS1 - ENTPD1 antisense RNA 1 ncRNA 203.75-93 chr6 90091005 90091349 + 0.75 NA intron (NM_021813, intron 4 of 8) intron (NM_021813, intron 4 of 8) 196708 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 204.5-124 chr7 91664340 91664878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 216093 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 193.25-84 chr4 176376508 176376876 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56726 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 142.25-127 chr4 127732887 127733247 + 0.75 NA intron (NM_001318467, intron 1 of 6) MER20B|DNA|hAT-Charlie 2667 NM_001318467 83447 Hs.149030 NM_031291 ENSG00000151475 SLC25A31 AAC4|ANT 4|ANT4|SFEC35kDa solute carrier family 25 member 31 protein-coding 189-107 chr8 135048883 135049235 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185072 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 130.25-146 chr4 34959064 34959373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -689471 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 124-5 chr1 61827309 61827596 + 0.75 NA exon (NM_176877, exon 16 of 43) exon (NM_176877, exon 16 of 43) -18623 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 123.5-165 chr5 75170753 75170935 + 0.75 NA intron (NM_001164443, intron 10 of 24) L1MEf|LINE|L1 66034 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 135.75-55 chr14 50977931 50978217 + 0.75 NA intron (NM_015163, intron 9 of 9) intron (NM_015163, intron 9 of 9) -33591 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 132.25-190 chr9 23877496 23877801 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -27047 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 217-81 chr9 31023160 31023490 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 358165 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 209.75-40 chr18 48727624 48728009 + 0.75 NA intron (NM_014772, intron 7 of 11) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 57216 NR_039897 100616366 NR_039897 ENSG00000266276 MIR4743 - microRNA 4743 ncRNA 217.75-73 chr8 88960331 88960774 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -633069 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 144.25-62 chr15 52822617 52822876 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32410 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 141.5-167 chr5 22478934 22479225 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -265229 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 115.75-200 chr7 42357586 42357756 + 0.75 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR -120462 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 124.75-41 chr11 34722042 34722292 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 89601 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 268.75-25 chr22 25451631 25452155 + 0.75 NA intron (NR_033734, intron 1 of 4) L1MA6|LINE|L1 -3753 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 298.25 chr1 85462087 85462692 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 2770 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 180.5-29 chr12 121919186 121919547 + 0.75 NA intron (NM_001178003, intron 1 of 17) intron (NM_001178003, intron 1 of 17) 774 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 115.25-19 chr1 200492597 200492825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82675 NM_001281293 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 296-11 chr12 32271117 32271742 + 0.75 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) LTR24B|LTR|ERV1 -128129 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 141-152 chr7 115490984 115491205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90347 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 183-20 chr13 54576380 54576704 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -264494 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 182.5-25 chr11 6919782 6920171 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -1026 NM_001004684 120775 Hs.446766 NM_001004684 ENSG00000178358 OR2D3 OR11-89 olfactory receptor family 2 subfamily D member 3 protein-coding 205.25-101 chr7 48469258 48469754 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 44 of 61) intron (NM_152701, intron 44 of 61) 298048 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 206.25-41 chr15 94637401 94637712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -217807 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 113.75-101 chr2 112955362 112955660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22495 NM_001278568 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 157-62 chr2 149553575 149553908 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33617 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 210-93 chr7 116249922 116250494 + 0.75 NA exon (NM_152829, exon 4 of 7) exon (NM_152829, exon 4 of 7) 27255 NM_152829 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 112.25-188 chr6 105817430 105817616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -268813 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 225.5-67 chr21 34070767 34071100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2645 NM_006933 6526 Hs.302742 NM_006933 ENSG00000198743 SLC5A3 BCW2|SMIT|SMIT1|SMIT2 solute carrier family 5 member 3 protein-coding 210.25-59 chr4 62924813 62925106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -763194 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 119.5-194 chr6 37269479 37269677 + 0.75 NA intron (NR_130108, intron 1 of 12) intron (NR_130108, intron 1 of 12) -11423 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 205.75-11 chr11 78346737 78347062 + 0.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) intron (NM_080491, intron 1 of 9) -5019 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 129.5-220 chr7 143248220 143248491 + 0.75 NA intron (NM_001130026, intron 8 of 10) (TCCCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15074 NM_001143680 373156 Hs.390667 NM_015917 ENSG00000197448 GSTK1 GST|GST 13-13|GST13|GST13-13|GSTK1-1|hGSTK1 glutathione S-transferase kappa 1 protein-coding 147.75-40 chr14 72435515 72435818 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -81154 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 132.5-148 chr21 28869777 28870106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15426 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 167-77 chr3 62774423 62774960 + 0.75 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 100725 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 133.25-212 chr8 111327487 111327706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49043 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 119.25-181 chr6 154596410 154596752 + 0.75 NA Intergenic Charlie17a|DNA|hAT-Charlie -85896 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 155-97 chr4 77162904 77163234 + 0.75 NA intron (NM_004354, intron 6 of 7) intron (NM_004354, intron 6 of 7) 5862 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 257-46 chr5 5996821 5997418 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 340173 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 146.25-57 chr18 7281675 7282149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50808 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 122-163 chr6 154822486 154822679 + 0.75 NA intron (NM_014892, intron 16 of 19) intron (NM_014892, intron 16 of 19) -30778 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 166.5-88 chr18 23569962 23570197 + 0.75 NA intron (NM_000271, intron 3 of 24) L2c|LINE|L2 16427 NM_000271 4864 Hs.464779 NM_000271 ENSG00000141458 NPC1 NPC|POGZ|SLC65A1 NPC intracellular cholesterol transporter 1 protein-coding 129.75-100 chr2 183145638 183145952 + 0.75 NA intron (NR_109856, intron 4 of 7) intron (NR_109856, intron 4 of 7) 21352 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 312.25-4 chr10 126239374 126239865 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) intron (NM_001288974, intron 3 of 18) 148858 NM_001288974 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 220.75-2 chr1 51504654 51505198 + 0.75 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) AluSz6|SINE|Alu 14340 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 128.75-188 chr7 95599751 95600120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3419 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 143.75-56 chr15 67937860 67938149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97959 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 267.5-6 chr1 118876682 118877186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 111409 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 252.25-40 chr4 30681662 30682301 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38388 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 163.5-73 chr17 71061206 71061521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140816 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 166.5-37 chr11 38508570 38508887 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137628 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 114.5-69 chr12 51121979 51122212 + 0.75 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) intron (NM_005653, intron 1 of 14) -38499 NM_030809 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 143-129 chr7 35685359 35685673 + 0.75 NA intron (NM_022373, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 9619 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 123.5-195 chr7 4088555 4088783 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 22 of 44) L1MEd|LINE|L1 -41016 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 166.5-53 chr12 97716631 97716894 + 0.75 NA intron (NR_077241, intron 6 of 6) intron (NR_077241, intron 6 of 6) 36836 NR_077241 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 127.5-224 chr7 21653638 21653935 + 0.75 NA intron (NM_001277115, intron 28 of 81) intron (NM_001277115, intron 28 of 81) 110747 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 290.25-25 chr5 31125906 31126589 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -67439 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 201.75-96 chr7 92330100 92330484 + 0.75 NA intron (NM_019004, intron 5 of 19) L2c|LINE|L2 -84192 NM_001350679 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 112.25-52 chr13 100199753 100200037 + 0.75 NA intron (NR_148031, intron 6 of 22) L1MC5|LINE|L1 110802 NM_000282 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 193.75-86 chr3 81952914 81953202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33084 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 123.25-32 chr11 21358044 21358212 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) L1PB2|LINE|L1 688542 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 208.25-36 chr17 63076022 63076416 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) L1MEj|LINE|L1 109984 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 134.75-58 chr13 75988843 75989105 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -53842 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 137.25-7 chr1 172039862 172040151 + 0.75 NA intron (NM_001278252, intron 7 of 14) L2c|LINE|L2 -98802 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 143-94 chr3 118738599 118738856 + 0.75 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 72106 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 162.5-187 chr9 13633947 13634234 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -202761 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 137-59 chr17 9261753 9262108 + 0.75 NA intron (NM_004853, intron 7 of 7) L3|LINE|CR1 -82812 NR_110828 101928266 Hs.639880 NR_110828 ENSG00000262966 LOC101928266 - uncharacterized LOC101928266 ncRNA 152-18 chr1 207647084 207647405 + 0.75 NA intron (NM_175710, intron 1 of 11) intron (NM_175710, intron 1 of 11) 2111 NM_175710 1379 Hs.628568 NM_175710 ENSG00000197721 CR1L - complement C3b/C4b receptor 1 like protein-coding 144.5-239 chrX 66363571 66363915 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 195993 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 124.25-66 chr15 83711439 83711612 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 3 of 29) intron (NM_207517, intron 3 of 29) 57402 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 156.25-134 chr6 127177366 127177657 + 0.75 NA intron (NM_032784, intron 4 of 4) intron (NM_032784, intron 4 of 4) 58840 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 158-149 chr8 130868914 130869332 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 8 of 17) intron (NM_001115, intron 8 of 17) 171786 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 234-25 chr2 143284145 143284733 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 155020 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 169-119 chrX 108115264 108115576 + 0.75 NA intron (NM_001321287, intron 1 of 13) L1ME3|LINE|L1 23642 NM_052936 115201 Hs.8763 NM_052936 ENSG00000101844 ATG4A APG4A|AUTL2 autophagy related 4A cysteine peptidase protein-coding 205-22 chr14 86723887 86724208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -181731 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 143.75-45 chr13 46906801 46907077 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -9863 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 122.25-154 chr5 125472361 125472667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20747 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 217.5-43 chr14 52524254 52524557 + 0.75 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) intron (NM_020784, intron 6 of 20) 28100 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 131.25-23 chr10 58947151 58947539 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -52173 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 112.25-189 chr6 124683509 124683683 + 0.75 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -278949 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 219.5-94 chr4 115249969 115250494 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -136611 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 225.5-19 chr11 27642349 27642925 + 0.75 NA intron (NR_033314, intron 4 of 6) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -8010 NR_102708 101410541 Hs.471439 NR_102708 ENSG00000254934 LINC00678 - long intergenic non-protein coding RNA 678 ncRNA 134.75-19 chr1 240126874 240127156 + 0.75 NA intron (NM_020066, intron 2 of 17) intron (NM_020066, intron 2 of 17) 35132 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 133.5-55 chr11 96169292 96169545 + 0.75 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -172020 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 140.25-197 chr9 116368681 116368983 + 0.75 NA intron (NM_002581, intron 19 of 21) intron (NM_002581, intron 19 of 21) 31774 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 135-127 chr4 100211785 100212158 + 0.75 NA intron (NR_125924, intron 4 of 4) intron (NR_125924, intron 4 of 4) -21503 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 162.75-9 chr1 197991992 197992282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74765 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 113-34 chr10 116580345 116580619 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -10477 NM_006229 5407 Hs.73923 NM_006229 ENSG00000187021 PNLIPRP1 PLRP1 pancreatic lipase related protein 1 protein-coding 191.5-36 chr14 46589501 46589855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62103 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 151.75-81 chr20 40311276 40311600 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 306977 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 155-69 chr2 137881548 137881959 + 0.75 NA intron (NR_120402, intron 2 of 2) MER70C|LTR|ERVL 46179 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 159.75-153 chr6 80767842 80768098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 661299 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 153.5-8 chr1 166937082 166937480 + 0.75 NA intron (NM_199351, intron 4 of 9) intron (NM_199351, intron 4 of 9) 38259 NM_199351 387597 Hs.444835 NM_199351 ENSG00000143195 ILDR2 C1orf32|dJ782G3.1 immunoglobulin like domain containing receptor 2 protein-coding 225.25-72 chr7 313478 313995 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -65689 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 145-130 chr5 132536224 132536601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7110 NM_000879 3567 Hs.2247 NM_000879 ENSG00000113525 IL5 EDF|IL-5|TRF interleukin 5 protein-coding 147.75-39 chr14 70702754 70703055 + 0.75 NA intron (NR_125769, intron 2 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 4206 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 192.25-47 chr2 33618372 33618840 + 0.75 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 -19244 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 121.25-109 chr20 6859894 6860146 + 0.75 NA Intergenic Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron 92334 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 114.75-43 chr12 64038798 64039003 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 4 of 21) intron (NM_001346201, intron 4 of 21) 183396 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 137.75-138 chr3 108460978 108461197 + 0.75 NA intron (NM_014981, intron 17 of 41) intron (NM_014981, intron 17 of 41) 68235 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 143.25-150 chr5 152902756 152903034 + 0.75 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 69454 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 116.75-94 chr2 54180710 54180975 + 0.75 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 57559 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 121.5-29 chr10 41731524 41731798 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 636384 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 139-50 chr17 4436235 4436502 + 0.75 NA intron (NM_001320449, intron 1 of 10) intron (NM_001320449, intron 1 of 10) 2428 NM_182538 201305 Hs.657543 NM_182538 ENSG00000182557 SPNS3 SLC62A3 sphingolipid transporter 3 (putative) protein-coding 175.25-3 chr1 82665705 82666000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -237331 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 183.25-38 chr15 58257824 58258204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119633 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 211.75-42 chr2 36082202 36082691 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 273124 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 127-123 chr4 32696365 32696738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 345513 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 147.75-30 chr12 14049553 14049793 + 0.75 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -69317 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 214.5-6 chr1 184944456 184944851 + 0.75 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) L3|LINE|CR1 29855 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 176-79 chr9 11342886 11343169 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 729821 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 193.5-46 chr13 93735777 93736096 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 122537 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 341.5-16 chr20 39855461 39856348 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -148557 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 153.25-28 chr12 25161835 25162212 + 0.75 NA intron (NR_147909, intron 1 of 14) intron (NR_147909, intron 1 of 14) 33137 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 243.25-52 chr7 47184455 47185084 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 280034 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 166.75-86 chr21 28581430 28581712 + 0.75 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL 42253 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 138-32 chr12 126123106 126123332 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 27227 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 150.5-57 chr15 61765979 61766262 + 0.75 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 36202 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 154-128 chr8 105609136 105609385 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 289717 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 191.75-37 chr14 49592610 49592973 + 0.75 NA intron (NM_001351375, intron 1 of 2) AluSp|SINE|Alu -5906 NR_037792 122769 Hs.451090 NM_152329 ENSG00000165501 LRR1 4-1BBLRR|LRR-1|PPIL5 leucine rich repeat protein 1 protein-coding 129.75-86 chr2 7412971 7413301 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -8125 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 127.5-119 chr2 98484760 98484991 + 0.75 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 38865 NM_001351428 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 192.25-70 chr21 29821148 29821538 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 73168 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 114.25-111 chr20 17732670 17732890 + 0.75 NA intron (NM_001014977, intron 2 of 2) intron (NM_001014977, intron 2 of 2) 32832 NM_001014977 140836 Hs.115366 NM_178477 ENSG00000125888 BANF2 BAF-L|BAF2|BAFL|C20orf179 barrier to autointegration factor 2 protein-coding 116.75-9 chr1 153172076 153172276 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2342 NR_110685 101928009 Hs.385720 NR_110685 ENSG00000229699 LOC101928009 - uncharacterized LOC101928009 ncRNA 187-27 chr14 19741083 19741472 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -6151 NM_172194 441669 Hs.553828 NM_172194 ENSG00000182652 OR4Q3 C14orf13|HSA6|OR14-3|OR4Q4|c14_5008 olfactory receptor family 4 subfamily Q member 3 protein-coding 156.75-95 chr2 168012123 168012393 + 0.75 NA intron (NM_013233, intron 16 of 17) AluSq2|SINE|Alu -71114 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 131.25-197 chr8 66403696 66404120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25069 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 130.5-64 chr11 100128600 100128821 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -558578 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 134-7 chr1 99426921 99427178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60755 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 123.5-118 chr20 23488807 23489055 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2186 NM_005492 10047 Hs.121602 NM_005492 ENSG00000125815 CST8 CRES|CTES5 cystatin 8 protein-coding 188.25-58 chr2 57407772 57408176 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -499677 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 167.5-201 chr9 133770821 133771119 + 0.75 NA intron (NM_001134398, intron 26 of 29) intron (NM_001134398, intron 26 of 29) -31015 NM_007101 1757 Hs.198003 NM_007101 ENSG00000123453 SARDH BPR-2|DMGDHL1|SAR|SARD|SDH sarcosine dehydrogenase protein-coding 136-139 chr7 92937477 92937761 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -100992 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 114.5-269 chr8 130264611 130264985 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 31735 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 125.25-94 chr2 21758547 21758792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48017 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 156.25-120 chr5 78322434 78322663 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27793 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 176.5-152 chr6 133375414 133375823 + 0.75 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 134119 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 137.25-27 chr11 83175087 83175454 + 0.75 NA intron (NM_001346413, intron 9 of 15) AluSx|SINE|Alu 12214 NR_133914 106736475 Hs.595343 NR_133914 PCF11-AS1 - PCF11 antisense RNA 1 ncRNA 125.75-150 chr5 33091803 33092042 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -137813 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 187.25-25 chr13 32885061 32885426 + 0.75 NA intron (NR_047020, intron 3 of 4) intron (NR_047020, intron 3 of 4) 26409 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 128.75-195 chr8 60503886 60504222 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -12856 NM_001242644 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 170.5-158 chr6 62172985 62173279 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) L1PA14|LINE|L1 113093 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 222.25-9 chr10 110239973 110240582 + 0.75 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) L1ME3A|LINE|L1 14281 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 119-58 chr15 77225707 77226048 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_026813) promoter-TSS (NR_026813) -473 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 122-104 chr2 192211388 192211571 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -16546 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 143.25-26 chr11 34375492 34375742 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -17607 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 115.25-75 chr16 76132661 76132878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -144632 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 234.25-23 chr14 83337662 83338152 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 695275 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 142.5-8 chr1 61438651 61438910 + 0.75 NA intron (NM_001134673, intron 10 of 10) intron (NM_001134673, intron 10 of 10) -185262 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 191-6 chr10 5169808 5170271 + 0.75 NA intron (NR_027916, intron 1 of 7) LTR19-int|LTR|ERV1 15148 NR_027916 340811 Hs.282513 NM_001007536 ENSG00000264006 AKR1C8P AKR1CL1 aldo-keto reductase family 1 member C8, pseudogene pseudo 234-70 chr8 138236711 138237104 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) L2b|LINE|L2 -153362 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 188.25-68 chr22 34873948 34874318 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 123783 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 174-29 chr15 44535175 44535589 + 0.75 NA non-coding (NR_034171, exon 3 of 3) non-coding (NR_034171, exon 3 of 3) 1518 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 145.25-4 chr1 68984127 68984389 + 0.75 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -71640 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 115-41 chr12 68108005 68108174 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 51651 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 126.75-188 chr5 28464008 28464320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176499 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 154.25-166 chr8 50250171 50250401 + 0.75 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L1MA4A|LINE|L1 86155 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 148.75-161 chr7 132010445 132010718 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 100361 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 132.5-59 chr12 127555461 127555780 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 80847 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 149.5-100 chr2 126508471 126508708 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -147346 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 265.75-36 chr2 99751514 99751999 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 8 of 23) intron (NM_001025108, intron 8 of 23) -261739 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 145.5-177 chr6 164876366 164876722 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -54481 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 166.75-61 chr17 64703526 64703818 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -41365 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 189.5-70 chr2 120338433 120338846 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7497 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 163.5-166 chr5 127685952 127686419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17204 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 181.25-74 chr20 53382442 53382978 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -170060 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 147-115 chr5 130026071 130026380 + 0.75 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 121760 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 181.25-132 chr8 131563558 131563843 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -340393 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 181.75-29 chr12 52071626 52072009 + 0.75 NA intron (NM_001098673, intron 2 of 3) AluSz|SINE|Alu 1839 NM_001098673 60673 Hs.9911 NM_021934 ENSG00000123395 ATG101 C12orf44 autophagy related 101 protein-coding 151.75-160 chr9 16045493 16045779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 207471 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 166.75-59 chr17 49072203 49072663 + 0.75 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -60027 NM_001159388 124872 Hs.374679 NM_153446 ENSG00000167080 B4GALNT2 B4GALT|GALGT2 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 2 protein-coding 198.75-51 chr2 198989627 198989927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 468162 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 122.75-139 chr3 153613305 153613594 + 0.75 NA intron (NR_146713, intron 3 of 6) intron (NR_146713, intron 3 of 6) 128954 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 116.75-8 chr1 96564127 96564451 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157316 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 253.75-14 chr17 12301591 12302152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 219972 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 128.5-4 chr1 18175408 18175629 + 0.75 NA intron (NM_032880, intron 1 of 9) X7A_LINE|LINE|CR1 67720 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 179.75-46 chr14 82813216 82813537 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 170744 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 127.75-43 chr11 47948809 47949094 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31608 NM_002843 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 117.5-130 chr20 49339773 49340048 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 59227 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 129.5-121 chr2 69202918 69203137 + 0.75 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 99345 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 119-128 chr3 190152395 190152608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30064 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 117.25-82 chr15 68900075 68900288 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -30319 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 154.75-57 chr17 59145931 59146336 + 0.75 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) intron (NM_182620, intron 1 of 3) 5088 NR_029842 407027 NR_029842 ENSG00000207996 MIR301A MIR301|MIRN301|MIRN301A|mir-301a microRNA 301a ncRNA 221.75-64 chr6 9125670 9126083 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 473667 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 126.5-51 chr12 86472577 86472866 + 0.75 NA intron (NM_013244, intron 1 of 6) intron (NM_013244, intron 1 of 6) -215422 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 118.75-34 chr11 46867985 46868219 + 0.75 NA exon (NM_002334, exon 34 of 38) exon (NM_002334, exon 34 of 38) 21691 NR_038909 100507401 Hs.675301 NR_038909 ENSG00000247675 LRP4-AS1 - LRP4 antisense RNA 1 ncRNA 234.25-59 chr5 33179780 33180185 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -49753 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 149-127 chr7 122222042 122222418 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77981 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 184.25-66 chr2 205268366 205268764 + 0.75 NA intron (NM_057177, intron 16 of 21) intron (NM_057177, intron 16 of 21) -413935 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 115-89 chr2 103945772 103946059 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 462417 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 163-70 chr3 65071342 65071565 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -383453 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 170.75-89 chr3 106844227 106844684 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 396183 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 242.25-7 chr1 188183977 188184449 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 740585 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 138.75-103 chr2 239745299 239745561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17430 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 196.75-117 chr9 128707258 128707689 + 0.75 NA intron (NM_013355, intron 6 of 21) MIRb|SINE|MIR 4970 NM_001317926 29941 Hs.300485 NM_013355 ENSG00000160447 PKN3 UTDP4-1 protein kinase N3 protein-coding 129.25-94 chr2 124665718 124666046 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) AluY|SINE|Alu 640595 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 162.5-155 chr6 133718288 133718567 + 0.75 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 -102720 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 146.5-129 chr21 34830944 34831170 + 0.75 NA intron (NM_001122607, intron 4 of 4) intron (NM_001122607, intron 4 of 4) 57642 NM_001122607 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 150.75-99 chr2 105205444 105205698 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -36172 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 183.25-94 chr6 116202511 116202915 + 0.75 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) 51362 NM_021648 23270 Hs.284141 NM_021648 ENSG00000187189 TSPYL4 dJ486I3.2 TSPY like 4 protein-coding 120.75-137 chr5 113380042 113380226 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) intron (NM_001085377, intron 2 of 18) 54855 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 147-17 chr10 52527028 52527405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56683 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 251-61 chr9 35468962 35469591 + 0.75 NA non-coding (NR_003581, exon 12 of 18) non-coding (NR_003581, exon 12 of 18) -20835 NM_014806 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 128.25-97 chr2 107162313 107162601 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 187068 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 113.25-120 chr4 61657793 61658121 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 455785 NM_001371342 200.25-83 chr4 32532776 32533102 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 181901 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 154.5-62 chr14 75751849 75752133 + 0.75 NA intron (NM_015072, intron 17 of 31) MER41A|LTR|ERV1 90745 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 115.75-89 chr18 23813707 23814092 + 0.75 NA intron (NM_001127717, intron 14 of 73) intron (NM_001127717, intron 14 of 73) -59121 NM_001127718 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 247-65 chr9 71372596 71373265 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L1PA10|LINE|L1 74041 NM_001366143 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 128.75-5 chr1 82888645 82888848 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -14437 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 132.25-141 chr4 43840299 43840575 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -176424 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 170.25 chr1 14889777 14890089 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) -34196 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 206.75-78 chr6 74872051 74872522 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 256496 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 122.5-13 chr1 164911010 164911248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -136488 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 232.25-34 chr2 168176960 168177297 + 0.75 NA intron (NM_013233, intron 2 of 17) intron (NM_013233, intron 2 of 17) 70467 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 178-62 chr3 112620089 112620543 + 0.75 NA intron (NM_199512, intron 3 of 7) intron (NM_199512, intron 3 of 7) -18347 NR_109779 100506621 Hs.86538 NR_109779 LINC01279 - long intergenic non-protein coding RNA 1279 ncRNA 117-172 chr7 70690240 70690499 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -441775 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 193.5-122 chr4 96950746 96951139 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -415984 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-62 chr14 46280158 46280510 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) LTR78|LTR|ERV1 -191025 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 213.75-17 chr10 92605210 92605669 + 0.75 NA intron (NM_004523, intron 1 of 21) intron (NM_004523, intron 1 of 21) 12309 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 128.25-73 chr17 60415650 60415972 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6678 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 139.5-14 chr10 39180763 39181087 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 484329 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 166.5-176 chr6 70777987 70778302 + 0.75 NA intron (NM_021940, intron 4 of 9) L1MA2|LINE|L1 109614 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 279.25-2 chr1 29748467 29749083 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 288837 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 178.75-96 chr7 11455874 11456183 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 11 of 26) intron (NM_015204, intron 11 of 26) 376170 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 242.25-40 chr18 3137734 3138232 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 14 of 36) intron (NM_019856, intron 14 of 36) 81985 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 125.75-190 chr8 136085928 136086342 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -444663 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 117.75-14 chr1 181651217 181651584 + 0.75 NA exon (NM_001205294, exon 7 of 46) exon (NM_001205294, exon 7 of 46) 167883 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 175.75-3 chr1 80104761 80105171 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -430789 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 149.5-154 chr5 84395929 84396320 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -11244 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 214.25-83 chr8 123172749 123173248 + 0.75 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -6049 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 141.5-39 chr12 47700751 47701012 + 0.75 NA intron (NM_024604, intron 3 of 16) intron (NM_024604, intron 3 of 16) 5149 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 155.25-13 chr1 171595726 171595946 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23927 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 156-3 chr1 41161390 41161750 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001350668) promoter-TSS (NM_001350668) -138 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 260-34 chr5 80923917 80924423 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -36193 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 143.75-133 chr4 64636735 64637042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -227428 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 112.75-90 chr2 30554768 30555028 + 0.75 NA intron (NM_001304446, intron 3 of 5) L1MEi|LINE|L1 107652 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 237-72 chr9 32509300 32509720 + 0.75 NA intron (NM_014314, intron 1 of 17) L1PA7|LINE|L1 16686 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 140.5-192 chr6 41083561 41083840 + 0.75 NA intron (NM_002505, intron 3 of 9) intron (NM_002505, intron 3 of 9) 10726 NM_021705 4800 Hs.10441 NM_002505 ENSG00000001167 NFYA CBF-A|CBF-B|HAP2|NF-YA nuclear transcription factor Y subunit alpha protein-coding 129-119 chr3 51339637 51340004 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 37 of 52) intron (NM_004947, intron 37 of 52) -45471 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 116-125 chr5 80008189 80008351 + 0.75 NA intron (NM_001306213, intron 2 of 22) intron (NM_001306213, intron 2 of 22) 16974 NM_001306213 7060 Hs.211426 NM_003248 ENSG00000113296 THBS4 TSP-4|TSP4 thrombospondin 4 protein-coding 120-97 chr2 214506575 214506800 + 0.75 NA intron (NM_001080500, intron 3 of 3) intron (NM_001080500, intron 3 of 3) -3495 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 174.25-153 chr9 105134665 105135021 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -109762 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 185-72 chr5 121872286 121872694 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20608 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 116.5-154 chr3 18947490 18947719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -200906 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 121-117 chr20 63303185 63303363 + 0.75 NA intron (NM_020882, intron 3 of 35) FLAM_C|SINE|Alu 10088 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 325.25-3 chr12 30192272 30193027 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -407890 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 175.25-43 chr13 28511042 28511453 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -16119 NM_001159920 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 350-19 chr8 90726766 90727365 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -64710 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 295.75-6 chr16 35891487 35892256 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 145319 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 142.25-113 chr3 176910833 176911233 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -94032 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 135.75-3 chr1 37637770 37638085 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3035 NM_001242910 284654 Hs.135015 NM_173640 ENSG00000169218 RSPO1 CRISTIN3|RSPO R-spondin 1 protein-coding 166.75-96 chr3 151270804 151271026 + 0.75 NA intron (NM_014879, intron 1 of 2) intron (NM_014879, intron 1 of 2) 7627 NM_014879 9934 Hs.2465 NM_014879 ENSG00000174944 P2RY14 BPR105|GPR105|P2Y14 purinergic receptor P2Y14 protein-coding 179.25-91 chr20 25149660 25150098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1089 NR_027091 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 164.5-128 chr3 6556519 6556862 + 0.75 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 248759 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 241.25-8 chr1 184310571 184310960 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -76264 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 130-159 chr7 129990381 129990660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37560 NM_182697 7328 Hs.643548 NM_003344 ENSG00000186591 UBE2H E2-20K|GID3|UBC8|UBCH|UBCH2 ubiquitin conjugating enzyme E2 H protein-coding 184.5-100 chr3 80960824 80961128 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -32892 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 126.25-31 chr11 58108470 58108638 + 0.75 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) 10890 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 135.75-59 chr14 64617515 64617923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67758 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 202.25-98 chrX 82989363 82989680 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -518769 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 131.75-136 chr3 59920386 59920718 + 0.75 NA intron (NR_135491, intron 5 of 6) intron (NR_135491, intron 5 of 6) 160357 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 166.25-147 chr9 35796333 35796699 + 0.75 NA intron (NM_003995, intron 2 of 21) intron (NM_003995, intron 2 of 21) 4107 NM_003995 4882 Hs.78518 NM_000907 ENSG00000159899 NPR2 AMDM|ANPRB|ANPb|ECDM|GUC2B|GUCY2B|NPRB|NPRBi|SNSK natriuretic peptide receptor 2 protein-coding 112.25-30 chr11 34941404 34941678 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_039836) promoter-TSS (NR_039836) -296 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 132.75-200 chr9 33153600 33153897 + 0.75 NA intron (NM_001497, intron 1 of 5) L1M4|LINE|L1 -13200 NR_108110 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 212-46 chr20 5917535 5917898 + 0.75 NA intron (NM_001819, intron 3 of 4) intron (NM_001819, intron 3 of 4) 6206 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 144.25-117 chr20 49493789 49494042 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -11247 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 132.5-170 chr3 129377676 129377901 + 0.75 NA Intergenic MER52C|LTR|ERV1 19560 NR_002992 677797 Hs.711399 NR_002992 ENSG00000207088 SNORA7B ACA7B small nucleolar RNA, H/ACA box 7B snoRNA 216-28 chr17 60630744 60631151 + 0.75 NA intron (NM_003620, intron 2 of 5) intron (NM_003620, intron 2 of 5) 30764 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 152.25-45 chr13 33114051 33114397 + 0.75 NA intron (NM_178007, intron 8 of 13) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 71867 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 124-26 chr11 115206489 115206741 + 0.75 NA intron (NM_001301045, intron 7 of 10) intron (NM_001301045, intron 7 of 10) -126962 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 152.75-116 chr3 190603076 190603533 + 0.75 NA intron (NR_157352, intron 3 of 10) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 89219 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 288-34 chr3 84577303 84577994 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 291927 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 143.25-165 chr7 6229767 6230077 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 42702 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 152.75-62 chr15 71059915 71060263 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -81360 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 168.25-89 chr20 39427436 39427680 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -202810 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 128.75-70 chr17 29056951 29057181 + 0.75 NA 3' UTR (NM_016518, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_016518, exon 8 of 8) 13925 NM_016518 51268 Hs.462585 NM_016518 ENSG00000179761 PIPOX LPIPOX pipecolic acid and sarcosine oxidase protein-coding 168-58 chr17 61875720 61876119 + 0.75 NA intron (NM_001351695, intron 18 of 24) AluJo|SINE|Alu -12360 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 293.25-13 chr19 28540002 28540442 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MEf|LINE|L1 -66466 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 157.75-29 chr11 56672795 56673229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9326 NM_001004730 219493 Hs.553633 NM_001004730 ENSG00000172459 OR5AR1 OR11-209 olfactory receptor family 5 subfamily AR member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 268.25-39 chr5 40981068 40981740 + 0.75 NA exon (NM_000587, exon 18 of 18) exon (NM_000587, exon 18 of 18) 71907 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 208.5-73 chr2 133545218 133545625 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 23042 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 186-36 chr18 1582617 1583038 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -223198 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 143.5-233 chrX 95053089 95053382 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 9991 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 136.5-158 chr4 21152332 21152559 + 0.75 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 151461 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 120-156 chr5 161222553 161222763 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -284032 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 176.75-130 chr8 140225178 140225665 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 16 of 22) intron (NM_001160372, intron 16 of 22) -124886 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 143.25-75 chr18 7130290 7130492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12594 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 135-46 chr14 85739933 85740170 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -194627 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 182.75-113 chr5 150787946 150788257 + 0.75 NA intron (NM_032947, intron 1 of 1) intron (NM_032947, intron 1 of 1) 10155 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 177.75-109 chr4 128760091 128760455 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -49427 NM_024900 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 170.5-165 chr6 151716498 151716766 + 0.75 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) L1PA7|LINE|L1 26136 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 140.75-80 chr2 36664425 36664811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32072 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 217.5-86 chr3 191750157 191750653 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 289242 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 169.5-115 chr3 101651982 101652290 + 0.75 NA intron (NM_014415, intron 10 of 10) AluSx1|SINE|Alu -24294 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 117.75-42 chr12 20260069 20260360 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109031 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 159.5-220 chr9 98870446 98870731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62918 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 162.75-4 chr1 112164212 112164564 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 173852 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 134.75-233 chrX 95552145 95552481 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -489087 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 145.5-23 chr10 62365432 62365726 + 0.75 NA intron (NR_104162, intron 1 of 3) MER89|LTR|ERV1 -8578 NM_199450 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 195.5-167 chr9 106384038 106384486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -216666 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 150.5-151 chr4 72749819 72750128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -180752 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 199-18 chr12 33905100 33905586 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117153 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 139.25-92 chr2 108993430 108993733 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4361 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 131-81 chr2 29530338 29530653 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) -55118 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 118.75-212 chr9 108581332 108581510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 274565 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 178.5-109 chr3 116585530 116585916 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 33250 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 234.5-50 chr2 165468920 165469406 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001172173) promoter-TSS (NM_001172173) -535 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 165-4 chr1 112478833 112479157 + 0.75 NA intron (NM_001291880, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 12454 NM_001291880 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 173-69 chr2 183080816 183081148 + 0.75 NA intron (NR_135688, intron 1 of 2) intron (NR_135688, intron 1 of 2) 2235 NR_135688 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 221.5-100 chr8 111069052 111069533 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -41859 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 154.5-201 chr9 28132861 28133161 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -559145 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 169.75-152 chr8 87560797 87561099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313067 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 166.5-67 chr14 72390197 72390641 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -126401 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 168.5-126 chr4 33464083 33464405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 575649 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 123.75-111 chr22 45692056 45692244 + 0.75 NA intron (NM_013236, intron 2 of 11) intron (NM_013236, intron 2 of 11) 20316 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 174.25-41 chr13 26377881 26378230 + 0.75 NA intron (NM_001346501, intron 4 of 11) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 123926 NM_001346501 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 125.75-147 chr5 19193710 19194052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 692391 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 199.5-82 chr2 103999313 103999707 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 408822 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 137.25-78 chr2 123771914 123772272 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 253081 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 177.5-160 chr7 11724938 11725248 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 107105 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 188-11 chr11 43896912 43897371 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_026952) promoter-TSS (NR_026952) -162 NR_026952 729799 Hs.368920 NR_026952 ENSG00000213693 SEC14L1P1 - SEC14 like 1 pseudogene 1 pseudo 138.5-101 chr2 47049588 47049962 + 0.75 NA intron (NM_001288951, intron 17 of 20) intron (NM_001288951, intron 17 of 20) 105533 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 119-196 chr8 88539351 88539561 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -211973 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 115.25-61 chr14 56963969 56964177 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150915 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 195.75-70 chr22 46597704 46598106 + 0.75 NA intron (NM_001366660, intron 1 of 17) intron (NM_001366660, intron 1 of 17) 20817 NM_001366660 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 321.5-29 chr5 89027873 89028708 + 0.75 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) intron (NR_136221, intron 3 of 6) -124185 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 118.75-29 chr10 125366836 125367165 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -205970 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 186.25-17 chr11 82553143 82553584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149450 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 168.75-83 chr20 39884600 39884913 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -119705 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 187.25-109 chr8 100925344 100925727 + 0.75 NA intron (NM_001135700, intron 2 of 5) intron (NM_001135700, intron 2 of 5) 25036 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 121.5-32 chr10 87606389 87606606 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53381 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 123.25-191 chr7 92126539 92126856 + 0.75 NA intron (NM_000786, intron 4 of 9) intron (NM_000786, intron 4 of 9) 7780 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 122-96 chr2 98101129 98101352 + 0.75 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) intron (NR_144297, intron 2 of 18) 14073 NM_144992 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 192.25-39 chr19 30318784 30319337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53324 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 113.5-197 chr5 76144361 76144613 + 0.75 NA intron (NM_014979, intron 2 of 12) MER91A|DNA|hAT-Tip100 61104 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 227-61 chr6 149081596 149082027 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -49150 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 137.25-112 chr4 110985935 110986168 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125404 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 187.25-91 chr6 43105574 43106134 + 0.75 NA intron (NM_001270398, intron 1 of 19) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 29040 NM_001270398 5754 Hs.90572 NM_002821 ENSG00000112655 PTK7 CCK-4|CCK4 protein tyrosine kinase 7 (inactive) protein-coding 156.75-110 chr3 62175437 62175754 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 8 of 29) L2c|LINE|L2 143352 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 239.25-17 chr12 13970150 13970507 + 0.75 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 10028 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 148-28 chr14 61915826 61916146 + 0.75 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) Charlie24|DNA|hAT-Charlie -11709 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 246.75-42 chr3 108231801 108232200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9576 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 112.75-206 chr9 30764367 30764568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -356013 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 178.25-27 chr13 77172098 77172556 + 0.75 NA intron (NM_015057, intron 37 of 82) L2a|LINE|L2 96813 NR_046716 100874212 Hs.569288 NR_046716 ENSG00000236051 MYCBP2-AS1 - MYCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 118.5-187 chr7 33594446 33594732 + 0.75 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -310326 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 165.75-74 chr19 34402830 34403184 + 0.75 NA TTS (NM_001289790) TTS (NM_001289790) -1391 NM_001353433 84306 Hs.515344 NM_032346 ENSG00000126249 PDCD2L - programmed cell death 2 like protein-coding 124.25-164 chr5 62897549 62897843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 318877 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 211.25-84 chr7 87548570 87548934 + 0.75 NA intron (NM_001348944, intron 16 of 29) L2a|LINE|L2 52132 NM_001348946 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 177.75-145 chr8 144490912 144491196 + 0.75 NA intron (NM_001329444, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu 12703 NM_001329445 84988 Hs.521937 NM_032902 ENSG00000160972 PPP1R16A MYPT3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 16A protein-coding 123.75-172 chr7 35383561 35383846 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 69848 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 156.5-213 chrX 50824087 50824382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10190 NR_027121 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 198.25-48 chr18 10706603 10706948 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 36 of 51) intron (NM_022068, intron 36 of 51) 44842 NR_110777 101927410 Hs.436902 NR_110777 ENSG00000260779 LOC101927410 - uncharacterized LOC101927410 ncRNA 253-23 chr18 2074687 2075058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 496633 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 339.75-10 chr13 75038045 75038748 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 201985 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 145-123 chr5 52196277 52196609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 188412 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 179.25-28 chr11 16755836 16756192 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014267, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014267, exon 5 of 5) 17367 NM_014267 10944 Hs.368226 NM_014267 ENSG00000110696 C11orf58 IMAGE145052|SMAP chromosome 11 open reading frame 58 protein-coding 172.25-3 chr1 79069282 79069590 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -62706 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 187.5-94 chr2 160958239 160958871 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -178400 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 144-13 chr1 196052314 196052574 + 0.75 NA intron (NR_146895, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 36271 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 188.25-76 chr3 115404078 115404484 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -219229 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 121.25-65 chr15 62328278 62328543 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14619 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 214.25-58 chr3 179414253 179414722 + 0.75 NA intron (NM_021629, intron 6 of 9) intron (NM_021629, intron 6 of 9) 36983 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 127.5-61 chr12 106875607 106875836 + 0.75 NA intron (NM_001330147, intron 10 of 10) intron (NM_001330147, intron 10 of 10) -80001 NM_001319664 90488 Hs.257664 NM_152261 ENSG00000151135 TMEM263 C12orf23 transmembrane protein 263 protein-coding 160.5-185 chr8 67780776 67781170 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -34613 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 136-136 chr7 86527209 86527674 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -116468 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 130.5-48 chr10 80284940 80285187 + 0.75 NA intron (NM_000429, intron 2 of 8) intron (NM_000429, intron 2 of 8) 4595 NM_000429 4143 Hs.282670 NM_000429 ENSG00000151224 MAT1A MAT|MATA1|SAMS|SAMS1 methionine adenosyltransferase 1A protein-coding 200.75-73 chr4 56119899 56120220 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50136 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 174.5-99 chr2 102519051 102519301 + 0.75 NA intron (NM_001011552, intron 8 of 11) intron (NM_001011552, intron 8 of 11) 45950 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 157.25-120 chr5 66584858 66585254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11337 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 216.5-20 chr12 16701760 16702145 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -93738 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 154.25-17 chr10 66417257 66417592 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) L1MA4A|LINE|L1 -508612 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 114.5-141 chr2 122371332 122371517 + 0.75 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 615773 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 282.25-31 chr5 95842926 95843478 + 0.75 NA intron (NR_157807, intron 2 of 2) intron (NR_157807, intron 2 of 2) 8375 NR_157807 102724720 NR_157807 LOC102724720 - uncharacterized LOC102724720 ncRNA 118.75-31 chr11 27354224 27354548 + 0.75 NA intron (NM_030771, intron 2 of 5) intron (NM_030771, intron 2 of 5) 8829 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 133.75-53 chr14 32162395 32162579 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -39558 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 166.75-28 chr11 107731431 107731775 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -19547 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 116.25-9 chr1 107302607 107302778 + 0.75 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 154623 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 178-40 chr2 21155197 21155614 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 31419 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 155.25-68 chr15 70505593 70505958 + 0.75 NA intron (NR_146562, intron 1 of 1) intron (NR_146562, intron 1 of 1) 153 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 175.25-52 chr15 95311873 95312303 + 0.75 NA intron (NR_034095, intron 1 of 3) intron (NR_034095, intron 1 of 3) 15012 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 149.25-17 chr1 236992564 236992859 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 11730 NM_001276687 645745 Hs.632513 NM_001039954 ENSG00000244020 MT1HL1 MT1P2 metallothionein 1H like 1 protein-coding 119.25-192 chr7 72540138 72540365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93108 NM_001363460 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 296.5-45 chr9 30217008 30217521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 191190 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 187.5-48 chr13 78840738 78841197 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_046869) promoter-TSS (NR_046869) -917 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 159-10 chr10 17514875 17515234 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60459 NM_001004470 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 143.75-196 chr9 30133914 30134167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 274414 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 279.5-31 chr2 177341568 177342208 + 0.75 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -28006 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 118.75-57 chr13 104572475 104572677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -893291 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 173.75-123 chr5 30063750 30064004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 183317 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 126.75-224 chr7 40623442 40623810 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 356313 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 175.75-27 chr12 49062654 49063198 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 7053 NM_144593 121268 Hs.159013 NM_144593 ENSG00000167550 RHEBL1 RHEBL1c RHEB like 1 protein-coding 171.25-47 chr15 59462747 59463053 + 0.75 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) L1MB7|LINE|L1 24714 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 133-71 chr18 2902810 2903185 + 0.75 NA intron (NM_032048, intron 4 of 7) intron (NM_032048, intron 4 of 7) 43626 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 234.25-64 chr5 178623160 178623829 + 0.75 NA intron (NM_020666, intron 1 of 12) intron (NM_020666, intron 1 of 12) 3556 NM_020666 57396 Hs.406557 NM_020666 ENSG00000113240 CLK4 - CDC like kinase 4 protein-coding 156.25-137 chr7 7169943 7170246 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -12521 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 130.5-110 chr16 74602235 74602598 + 0.75 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) L1MC5a|LINE|L1 4698 NM_012201 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 143.25-5 chr1 83571197 83571401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125245 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 221-72 chr6 148388017 148388561 + 0.75 NA intron (NM_001346506, intron 1 of 20) intron (NM_001346506, intron 1 of 20) 45451 NM_001346506 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 163-17 chr10 121299479 121299746 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 231702 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 118.5-51 chr14 21390486 21390736 + 0.75 NA intron (NM_001170629, intron 37 of 37) AluSg4|SINE|Alu 1642 NR_003029 692053 Hs.675950 NR_003029 ENSG00000199436 SNORD9 mgU6-53B small nucleolar RNA, C/D box 9 snoRNA 221.75-2 chr1 34377204 34377690 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 200540 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 135.5-40 chr11 101503571 101503988 + 0.75 NA intron (NM_004621, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 16126 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 363.5-18 chr5 39216334 39217024 + 0.75 NA intron (NM_001349333, intron 1 of 19) intron (NM_001349333, intron 1 of 19) 2884 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 223.75-71 chr5 142121837 142122509 + 0.75 NA intron (NM_030571, intron 1 of 7) L1ME3A|LINE|L1 13394 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 117.5-200 chr5 180695110 180695309 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 11113 NR_146728 105377765 Hs.131536 NR_146728 LINC02222 - long intergenic non-protein coding RNA 2222 ncRNA 146.5-35 chr10 95943800 95944132 + 0.75 NA intron (NM_001349008, intron 9 of 34) intron (NM_001349008, intron 9 of 34) 36001 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 187.75-72 chr3 125526804 125527289 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6844 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 132.5-89 chr17 39233104 39233352 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7283 NM_001351360 342667 Hs.145068 NM_198993 ENSG00000141750 STAC2 24b2|24b2/STAC2 SH3 and cysteine rich domain 2 protein-coding 212-31 chr17 56137204 56137543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16102 NM_153228 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 206-64 chr5 150333959 150334387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23466 NM_001135243 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 149.25-30 chr11 66097460 66097763 + 0.75 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 27339 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 169-118 chrX 46774016 46774306 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15043 NM_032591 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 145.75-166 chr9 70224502 70224822 + 0.75 NA intron (NR_125850, intron 12 of 13) MLT2B3|LTR|ERVL 34212 NR_039990 100507299 Hs.556816 NR_039990 SMC5-AS1 MAMDC2-AS2 SMC5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 119.75-184 chr6 125708932 125709176 + 0.75 NA intron (NR_038906, intron 3 of 3) L1ME4b|LINE|L1 34701 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 210.75-52 chr20 54117170 54117643 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -46641 NM_003657 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 115.25-20 chr1 210108637 210108882 + 0.75 NA intron (NM_153262, intron 6 of 7) L2|LINE|L2 -124037 NM_001354173 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 162-85 chr4 58616478 58616817 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -80319 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 131-61 chr15 80693084 80693409 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2064 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 137-175 chr8 79076499 79076752 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 239096 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 166.5-62 chr14 62693281 62693581 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 352027 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 252-78 chr9 103358402 103358817 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -33576 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 127.75-125 chr3 15722018 15722225 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001370752, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001370752, exon 5 of 5) -24750 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 164.25-70 chr2 79869905 79870204 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 5 of 17) intron (NM_001282598, intron 5 of 17) -3471 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 201.5-93 chr3 190890424 190890908 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12736 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 161-8 chr1 245120807 245121164 + 0.75 NA intron (NM_001143943, intron 6 of 6) intron (NM_001143943, intron 6 of 6) -34000 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 217.75-17 chr10 128384023 128384401 + 0.75 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 98262 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 115.25-99 chr2 50088552 50088727 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -114436 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 152.75-53 chr14 39034404 39034638 + 0.75 NA intron (NM_006364, intron 19 of 19) intron (NM_006364, intron 19 of 19) -68619 NR_146545 105370458 NR_146545 ENSG00000258651 SEC23A-AS1 - SEC23A antisense RNA 1 ncRNA 247.5-43 chr2 138530596 138531172 + 0.75 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) L1MEg1|LINE|L1 29114 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 153.75-45 chr14 101057424 101057854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1420 NR_036133 574410 NR_029969 ENSG00000208004 MIR323B MIR453|MIRN453|hsa-mir-453|mir-323b microRNA 323b ncRNA 147.5-64 chr14 70101790 70102207 + 0.75 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -21781 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 130.75-185 chr7 103659808 103660047 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 12 of 64) intron (NM_005045, intron 12 of 64) -213720 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 202.75-30 chr12 124583026 124583400 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -15601 NM_001077261 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 146-48 chr16 9940378 9940724 + 0.75 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 241516 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 230.5-56 chr18 13781613 13782087 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -42299 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 138-122 chr4 172826352 172826751 + 0.75 NA intron (NM_001034845, intron 7 of 12) intron (NM_001034845, intron 7 of 12) -99673 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-220 chr8 121009293 121009512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -197356 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 129.5-249 chrX 113916224 113916504 + 0.75 NA intron (NR_131204, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 21854 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 149.25-139 chr5 5913846 5914106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 423316 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 222.75-33 chr13 79788876 79789289 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -15304 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 193.75-74 chr2 227558926 227559326 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001135189, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001135189, exon 12 of 12) 59529 NR_149019 729968 Hs.689550 NR_149019 LOC729968 - spore coat protein SP96 ncRNA 129.25-180 chr7 16347754 16348076 + 0.75 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) L1M3de|LINE|L1 73623 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 152.75-119 chr4 40809395 40809692 + 0.75 NA TTS (NM_001166054) TTS (NM_001166054) 47612 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 131.75-176 chr5 133965172 133965422 + 0.75 NA intron (NM_020199, intron 1 of 2) intron (NM_020199, intron 1 of 2) 3328 NM_020199 56951 Hs.744034 NM_020199 ENSG00000113583 C5orf15 HTGN29|KCT2 chromosome 5 open reading frame 15 protein-coding 162-74 chr21 31255911 31256268 + 0.75 NA intron (NM_001353686, intron 4 of 27) intron (NM_001353686, intron 4 of 27) 88265 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 152-14 chr1 177456082 177456352 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 104631 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 208.5-52 chr16 73382391 73382855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4182 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 149.5-214 chr8 133547828 133548082 + 0.75 NA intron (NM_003033, intron 1 of 8) intron (NM_003033, intron 1 of 8) 23932 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 179.25-90 chr20 14453725 14454031 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1ME4a|LINE|L1 -100506 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 127-84 chr17 65705575 65705876 + 0.75 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) L1MC5a|LINE|L1 120726 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 135.25-87 chr19 40066443 40066779 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -10380 NM_001005851 163131 Hs.101139 NM_001005851 ENSG00000128000 ZNF780B ZNF779 zinc finger protein 780B protein-coding 247.25-61 chr9 9338816 9339288 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) -460340 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 149.75-96 chr2 205602323 205602568 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 21 of 21) L1PA10|LINE|L1 -80055 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 148-36 chr15 97895850 97896194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21593 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 121.5-43 chr11 75508783 75509047 + 0.75 NA intron (NM_030792, intron 1 of 16) intron (NM_030792, intron 1 of 16) 16658 NM_001351168 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 143-74 chr2 105832254 105832546 + 0.75 NA intron (NM_003581, intron 2 of 4) L1MA5|LINE|L1 -19447 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 163.25-60 chr2 25839935 25840158 + 0.75 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) intron (NM_018263, intron 2 of 11) -9145 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 123-80 chr17 17212775 17212990 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001353229, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001353229, exon 16 of 16) -6549 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 167.25-94 chr2 202560067 202560307 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001204, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001204, exon 13 of 13) -74782 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 136.75-185 chr7 50196623 50196841 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100646 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 198.5-49 chr14 80682894 80683425 + 0.75 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) L1PA15-16|LINE|L1 258579 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 160.5-136 chr4 74852480 74852823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58128 NM_001316963 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 232.75-69 chr9 93274974 93275390 + 0.75 NA intron (NM_001282394, intron 19 of 29) L1ME1|LINE|L1 71121 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 220.25-44 chr22 27832281 27832638 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30703 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 127.75-60 chr14 47504325 47504553 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -161193 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 184.5-35 chr12 15802023 15802517 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12882 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 118-184 chr8 90155238 90155505 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -66117 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 183-88 chr5 84605296 84605566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -220551 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 140-96 chr22 31720409 31720665 + 0.75 NA intron (NM_173566, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 29595 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 188-88 chr9 31038170 31038510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 343150 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 221.25-30 chr15 92092767 92093169 + 0.75 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 238664 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 128-9 chr1 168808287 168808487 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 21446 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 159-107 chr8 15553343 15553738 + 0.75 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 13277 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 227.5-60 chr20 41713814 41714259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95659 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 221.25-89 chr8 67245652 67246265 + 0.75 NA intron (NM_006421, intron 19 of 38) L1M1|LINE|L1 97823 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 114.5-120 chr18 40244839 40245083 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 178675 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 207.5-13 chr11 82033789 82034345 + 0.75 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) intron (NR_120571, intron 5 of 7) -143231 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 143.75-151 chr6 36735660 36736009 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 21566 NM_001314020 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 143.75-71 chr17 70107160 70107527 + 0.75 NA intron (NM_001291623, intron 1 of 2) intron (NM_001291623, intron 1 of 2) 2498 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 179.5-100 chr2 194005830 194006257 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -338226 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 141.5-2 chr1 15554358 15554627 + 0.75 NA intron (NR_109898, intron 7 of 14) L1ME3A|LINE|L1 12326 NR_135613 107397391 NR_135613 ENSG00000251866 SCARNA21B - small Cajal body-specific RNA 21B ncRNA 136.5-153 chr3 150351593 150351805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27952 NR_110187 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 135-169 chr7 81131148 81131562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -208966 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 218.5-62 chr2 219315090 219315677 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5982 NM_001199763 5798 Hs.89655 NM_002846 ENSG00000054356 PTPRN IA-2|IA-2/PTP|IA2|ICA512|R-PTP-N protein tyrosine phosphatase receptor type N protein-coding 158.25-35 chr12 72393037 72393539 + 0.75 NA intron (NM_013381, intron 3 of 18) intron (NM_013381, intron 3 of 18) -119779 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 147.75-48 chr17 20285249 20285554 + 0.75 NA intron (NM_001033553, intron 12 of 14) intron (NM_001033553, intron 12 of 14) -35773 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 177.5-36 chr12 103237199 103237489 + 0.75 NA TTS (NR_103526) TTS (NR_103526) 85502 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 167.75-94 chr4 2010832 2011186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2035 NM_005663 7469 Hs.21771 NM_005663 ENSG00000185049 NELFA NELF-A|P/OKcl.15|WHSC2 negative elongation factor complex member A protein-coding 270-32 chr21 34601316 34601983 + 0.75 NA intron (NM_004414, intron 1 of 3) AluY|SINE|Alu 12194 NM_001285389 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 152.25-104 chr3 106822603 106823042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 417816 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 146.5-180 chr5 149512798 149513207 + 0.75 NA intron (NM_001271742, intron 5 of 9) intron (NM_001271742, intron 5 of 9) 37363 NM_001271742 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 189-106 chr8 125537045 125537471 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 105049 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 159.25-161 chr9 32156164 32156574 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -228234 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 166.25-109 chr3 185388252 185388568 + 0.75 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 25274 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 183.25-96 chr6 154514216 154514676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3761 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 155-66 chr2 109502861 109503240 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001099289, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001099289, exon 10 of 10) 110617 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 159.25-108 chr4 114468889 114469150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129383 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 130-62 chr18 70362760 70363104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21659 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 235-21 chr14 89119102 89119623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 294711 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 219.25-78 chr8 79487600 79488005 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123315 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 138.25-117 chr3 98886145 98886563 + 0.75 NA intron (NM_080927, intron 1 of 15) intron (NM_080927, intron 1 of 15) 15341 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 180.25-68 chr22 35262179 35262474 + 0.75 NA non-coding (NR_027780, exon 2 of 12) non-coding (NR_027780, exon 2 of 12) 4833 NM_001362972 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 154.75-53 chr16 59641193 59641460 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 113865 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 114.5-53 chr11 81438111 81438295 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 452633 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 198.25-2 chr1 43273322 43273705 + 0.75 NA 3' UTR (NM_144626, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_144626, exon 4 of 4) 3530 NM_001320244 128218 Hs.104476 NM_144626 ENSG00000179178 TMEM125 - transmembrane protein 125 protein-coding 179.25-124 chr5 126575481 126575802 + 0.75 NA intron (NM_001202404, intron 6 of 15) intron (NM_001202404, intron 6 of 15) 19578 NM_001201377 501 Hs.483239 NM_001182 ENSG00000164904 ALDH7A1 ATQ1|EPD|PDE aldehyde dehydrogenase 7 family member A1 protein-coding 133.25-48 chr13 85513318 85513677 + 0.75 NA intron (NR_046989, intron 1 of 3) intron (NR_046989, intron 1 of 3) 149894 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 197-16 chr13 82325977 82326239 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -1099125 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 138.5-188 chr8 28873404 28873702 + 0.75 NA intron (NM_001145159, intron 1 of 15) L1ME3|LINE|L1 16362 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 124.75-185 chr6 164437305 164437538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 384642 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 134.25-206 chrX 87729476 87729836 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 211854 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 129-63 chr14 61423187 61423478 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 101889 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 215-61 chr5 9231877 9232246 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 6 of 22) intron (NM_003966, intron 6 of 22) -178166 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 169-53 chr20 18039524 18039783 + 0.75 NA intron (NM_001303461, intron 3 of 3) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 18263 NM_021220 58495 Hs.661013 NM_021220 ENSG00000125850 OVOL2 CHED|CHED1|CHED2|EUROIMAGE566589|PPCD1|ZNF339 ovo like zinc finger 2 protein-coding 118.5-239 chrX 76643737 76643956 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 216136 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 212.25-100 chr8 125033729 125034105 + 0.75 NA intron (NM_014846, intron 26 of 28) L1M5|LINE|L1 35412 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 113.25-69 chr17 54574485 54574755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -326071 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 128.75-198 chr8 100081550 100081749 + 0.75 NA intron (NM_015668, intron 3 of 27) intron (NM_015668, intron 3 of 27) 23977 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 185.5-4 chr1 81851219 81851570 + 0.75 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 48941 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 131.75-10 chr1 72156783 72157109 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) (TGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 125593 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 129-46 chr12 21187184 21187519 + 0.75 NA intron (NM_006446, intron 7 of 14) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 56157 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 221.75-32 chr18 54794322 54794831 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -33901 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 121-9 chr1 106459960 106460331 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -358094 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 189.25-14 chr10 125941820 125942244 + 0.75 NA intron (NM_001363549, intron 1 of 10) L1ME3F|LINE|L1 31241 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 234.25-58 chr5 28312600 28312939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25104 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 163-120 chr8 113641299 113641642 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -204531 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 128.75-42 chr12 50224183 50224407 + 0.75 NA intron (NM_016357, intron 3 of 10) intron (NM_016357, intron 3 of 10) -1637 NM_001113547 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 220.5-62 chr2 232636822 232637232 + 0.75 NA intron (NM_025202, intron 1 of 3) intron (NM_025202, intron 1 of 3) 3423 NM_025202 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 198.75-37 chr17 45199894 45200195 + 0.75 NA intron (NR_147507, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 21721 NR_147507 339192 Hs.560498 NR_147507 ENSG00000267121 LOC339192 - uncharacterized LOC339192 ncRNA 177.5-157 chr6 164140594 164140880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -469253 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 115-67 chr17 64526384 64526641 + 0.75 NA intron (NM_138363, intron 10 of 19) intron (NM_138363, intron 10 of 19) 19535 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 113.5-207 chr6 42744909 42745243 + 0.75 NA exon (NM_003192, exon 1 of 1) exon (NM_003192, exon 1 of 1) 1027 NM_003192 6903 Hs.75064 NM_003192 ENSG00000124659 TBCC CFC tubulin folding cofactor C protein-coding 261.25-14 chr19 37603309 37603922 + 0.75 NA intron (NM_001172225, intron 4 of 4) intron (NM_001172225, intron 4 of 4) 8739 NM_001172225 163255 Hs.728927 NM_152606 ENSG00000171817 ZNF540 Nbla10512 zinc finger protein 540 protein-coding 177.75-105 chr4 60588733 60589039 + 0.75 NA Intergenic LTR90A|LTR|LTR -333733 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 172.5-93 chr2 47039246 47039643 + 0.75 NA intron (NM_001288951, intron 15 of 20) intron (NM_001288951, intron 15 of 20) -97589 NM_001171508 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 173-66 chr2 100758433 100758853 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -61496 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 307-16 chr2 45390345 45390862 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 20 of 20) intron (NM_018079, intron 20 of 20) -135662 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 166.25-26 chr10 90863504 90863788 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -5607 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 159-120 chr8 129261498 129261813 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -20415 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 165.75-173 chr9 84259277 84259688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 81276 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 366.75 chr10 43894955 43895785 + 0.75 NA TTS (NR_038268) TTS (NR_038268) -13926 NR_033846 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 133.75-48 chr13 92531847 92532066 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 41793 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 186-5 chr1 168881385 168881806 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94654 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 145-78 chr2 129791114 129791422 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 86223 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 152.75-97 chr20 34797633 34797905 + 0.75 NA intron (NM_014071, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu -15365 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 174-109 chr9 104712325 104712652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18066 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 238-52 chr4 78682790 78683300 + 0.75 NA non-coding (NR_038304, exon 4 of 4) non-coding (NR_038304, exon 4 of 4) 37051 NR_038305 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 229.25-89 chr9 112793560 112793944 + 0.75 NA intron (NM_001012994, intron 1 of 8) L1M6B|LINE|L1 42992 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 126.25-117 chr3 80875197 80875519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104654 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 150.25-6 chr1 84872940 84873328 + 0.75 NA intron (NM_012152, intron 1 of 2) L1MC3|LINE|L1 20072 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 122.25-93 chr2 107936775 107937076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49599 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 151.25-156 chr5 116903399 116903844 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -141412 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 141-83 chr2 147647855 147648128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -196526 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 113.5-97 chr16 81231600 81231776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7001 NM_017429 53630 Hs.212172 NM_017429 ENSG00000135697 BCO1 BCDO|BCDO1|BCMO|BCMO1|BCO beta-carotene oxygenase 1 protein-coding 200.25-67 chr2 179183130 179183599 + 0.75 NA intron (NM_178123, intron 2 of 17) intron (NM_178123, intron 2 of 17) 81468 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 218.25-103 chr9 24703427 24703940 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -157786 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 250.25-24 chr2 69410477 69410952 + 0.75 NA intron (NR_045632, intron 4 of 5) L1M5|LINE|L1 -23460 NM_001244710 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 143.5-6 chr1 48337695 48338009 + 0.75 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1M5|LINE|L1 115136 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 203-76 chr4 181740263 181740639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 89522 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 150-37 chr14 51072309 51072604 + 0.75 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 23248 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 279.25-16 chr15 92291764 92292301 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101849 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 176.25-134 chr8 69211256 69211739 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -107307 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 266.75-51 chr9 28319440 28320032 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) L1ME1|LINE|L1 399569 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 123.5-137 chr3 96916737 96916964 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 102256 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 183.5-28 chr11 66775611 66775883 + 0.75 NA intron (NM_024650, intron 4 of 16) L1M3d|LINE|L1 30978 NM_001302084 79703 Hs.292088 NM_024650 ENSG00000173715 C11orf80 HYDM4|TOP6BL|TOPOVIBL chromosome 11 open reading frame 80 protein-coding 124-52 chr15 93893637 93893932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6815 NR_138083 283682 Hs.134687 NR_138083 LINC01579 - long intergenic non-protein coding RNA 1579 ncRNA 215-63 chr5 112672756 112673247 + 0.75 NA intron (NR_104673, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 9887 NR_104673 102467216 Hs.174158 NR_104673 LOC102467216 - uncharacterized LOC102467216 ncRNA 160-69 chr3 146473444 146473679 + 0.75 NA intron (NM_020359, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu -4260 NM_001199978 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 146.5-118 chr2 194105613 194105854 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -238536 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 180-12 chr10 68439230 68439690 + 0.75 NA intron (NM_001080449, intron 9 of 20) AluSc8|SINE|Alu -32166 NM_001278225 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 119.75-128 chr21 30437105 30437299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3077 NM_181623 254950 Hs.553654 NM_181623 ENSG00000186970 KRTAP15-1 KAP15.1 keratin associated protein 15-1 protein-coding 243.5-70 chr6 122359279 122359812 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -40006 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 294.5 chr1 58800826 58801498 + 0.75 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) L1PA8|LINE|L1 16011 NR_034014 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 139-13 chr10 30041323 30041608 + 0.75 NA intron (NM_020848, intron 2 of 3) intron (NM_020848, intron 2 of 3) 18121 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 170.5-164 chr6 143446610 143446962 + 0.75 NA intron (NM_182503, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 3909 NM_182503 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 228.75-41 chr2 62666726 62667214 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6908 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 184.5-152 chr8 74562516 74562793 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14045 NR_049871 100847091 NR_049871 ENSG00000283505 MIR5681B - microRNA 5681b ncRNA 127.25-197 chr7 88406080 88406250 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99271 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 142.25-13 chr10 4447832 4448165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41529 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 183.5-167 chrX 94306324 94306611 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 632261 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 211-4 chr1 186471448 186471986 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -10603 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 156.75-156 chr7 34042415 34042860 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 137098 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 141-126 chr5 55949221 55949633 + 0.75 NA intron (NR_157112, intron 14 of 17) AluJr4|SINE|Alu 45536 NR_157112 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 159.25-138 chr7 69960567 69960907 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 362262 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 205.5-14 chr10 107185947 107186298 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -21416 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 168.5-198 chr9 35098112 35098481 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -1695 NM_152850 84720 Hs.522099 NM_032634 ENSG00000165282 PIGO HPMRS2 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class O protein-coding 117-83 chr2 6693767 6694036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43382 NR_110497 102800314 Hs.258100 NR_110497 ENSG00000236172 MIR7515HG - MIR7515 host gene ncRNA 115-152 chr5 170865252 170865429 + 0.75 NA intron (NM_022897, intron 1 of 27) AluSx|SINE|Alu 3322 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 158.5-192 chr8 91431874 91432121 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182678 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 161.75-116 chr7 32110766 32111282 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -39588 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 122.5-188 chr5 156332608 156332922 + 0.75 NA intron (NM_172244, intron 2 of 7) L1ME2|LINE|L1 5601 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 147.25-11 chr1 197753113 197753463 + 0.75 NA intron (NM_001195216, intron 2 of 2) intron (NM_001195216, intron 2 of 2) 22192 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 223.25-62 chr5 80408368 80408747 + 0.75 NA intron (NM_001284237, intron 1 of 3) CpG 493 NM_001284236 9765 Hs.482660 NM_014733 ENSG00000039319 ZFYVE16 PPP1R69 zinc finger FYVE-type containing 16 protein-coding 213-17 chr10 113900645 113901064 + 0.75 NA intron (NM_198514, intron 6 of 10) intron (NM_198514, intron 6 of 10) 46193 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 162.5-99 chr20 44990416 44990696 + 0.75 NA intron (NM_001352385, intron 5 of 11) HAL1|LINE|L1 24044 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 172.75-51 chr18 4070779 4071124 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 108598 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 160.5-72 chr17 65351524 65351797 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -105881 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 236.75-26 chr2 32285870 32286348 + 0.75 NA intron (NM_032312, intron 1 of 5) Charlie6|DNA|hAT-Charlie 8205 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 167-52 chr17 72644954 72645361 + 0.75 NA TTS (NM_001159770) TTS (NM_001159770) -4685 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 186-25 chr14 54461567 54462037 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -20428 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 128.5-97 chr18 79229865 79230089 + 0.75 NA intron (NR_148360, intron 11 of 31) intron (NR_148360, intron 11 of 31) 160583 NM_198531 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 230.75-59 chr5 102831589 102832133 + 0.75 NA intron (NM_001364582, intron 1 of 24) intron (NM_001364582, intron 1 of 24) 23663 NM_001364582 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 128.25-228 chrX 82404103 82404448 + 0.75 NA Intergenic MLT1-int|LTR|ERVL-MaLR -1104015 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 114.5-226 chr6 47008007 47008181 + 0.75 NA intron (NM_153840, intron 11 of 14) MIR|SINE|MIR 34238 NM_153840 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 154-125 chr8 5644043 5644302 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -649258 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 141.5-19 chr10 124510248 124510667 + 0.75 NA intron (NM_001167880, intron 5 of 5) intron (NM_001167880, intron 5 of 5) 48634 NM_001318331 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 185.5-115 chr4 69844612 69845027 + 0.75 NA intron (NM_005420, intron 6 of 7) intron (NM_005420, intron 6 of 7) 15326 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 161-41 chr14 72113058 72113386 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 179695 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 238.5-58 chr3 183211900 183212315 + 0.75 NA intron (NM_015078, intron 22 of 29) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -41146 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 170.25-156 chr8 121779274 121779573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137983 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 173.5-143 chr6 75923566 75924070 + 0.75 NA intron (NM_001563, intron 15 of 16) intron (NM_001563, intron 15 of 16) 148844 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 127-24 chr11 23586610 23586837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -167533 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 119.75-164 chr4 164219449 164219669 + 0.75 NA intron (NM_001166373, intron 1 of 7) intron (NM_001166373, intron 1 of 7) -21848 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 220.75-36 chr18 70793686 70794095 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142936 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 150.75-137 chr4 27525018 27525401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 307730 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 176.5-112 chr21 25644686 25644978 + 0.75 NA intron (NR_072999, intron 1 of 9) intron (NR_072999, intron 1 of 9) 5550 NM_001270407 58494 Hs.517227 NM_021219 ENSG00000154721 JAM2 C21orf43|CD322|JAM-B|JAMB|PRO245|VE-JAM|VEJAM junctional adhesion molecule 2 protein-coding 165.25-23 chr11 57911412 57911804 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -112273 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 202.5-152 chrX 133729037 133729542 + 0.75 NA intron (NM_001164617, intron 3 of 8) intron (NM_001164617, intron 3 of 8) -168154 NR_148713 110806308 Hs.658628 NR_148713 ENSG00000286096 GPC3-AS1 - GPC3 antisense RNA 1 ncRNA 153.25-7 chr1 209803407 209803701 + 0.75 NA intron (NM_006147, intron 1 of 8) intron (NM_006147, intron 1 of 8) 2588 NM_006147 3664 Hs.591415 NM_006147 ENSG00000117595 IRF6 LPS|OFC6|PIT|PPS|PPS1|VWS|VWS1 interferon regulatory factor 6 protein-coding 186.75-30 chr14 40552121 40552527 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -402387 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 187.5-81 chr2 28364202 28364653 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28431 NM_005253 2355 Hs.220971 NM_005253 ENSG00000075426 FOSL2 FRA2 FOS like 2, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 141.5-165 chr5 14505712 14505919 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 55 of 56) intron (NM_007118, intron 55 of 56) 41832 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 196.25-65 chr2 107260018 107260378 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 89327 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 328.75-5 chr14 100198254 100198735 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -38849 NM_206918 123099 Hs.159643 NM_206918 ENSG00000168350 DEGS2 C14orf66|DES2|FADS8 delta 4-desaturase, sphingolipid 2 protein-coding 130.25-5 chr1 80741410 80741649 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 100242 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 167.25-110 chr3 152232852 152233152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27573 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 170.5-63 chr14 57564797 57565218 + 0.75 NA intron (NM_001306087, intron 7 of 7) L1MB5|LINE|L1 -71150 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 214.5-106 chr5 171026593 171027038 + 0.75 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) intron (NM_022897, intron 14 of 27) 164797 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 197.25-31 chr15 52792129 52792632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2044 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 165.75-128 chr4 163384991 163385318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41052 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 135.5-117 chr2 192201973 192202288 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -7197 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 264.25-48 chr7 47412659 47413093 + 0.75 NA intron (NM_022748, intron 12 of 30) MER2|DNA|TcMar-Tigger 51927 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 152-31 chr11 46178696 46179079 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 6932 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 120.5-19 chr1 245109203 245109462 + 0.75 NA intron (NM_001143943, intron 6 of 6) intron (NM_001143943, intron 6 of 6) -45653 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 132.25-46 chr12 20001977 20002293 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -12550 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 166-51 chr18 10561577 10561840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35681 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 155-139 chr8 78963398 78963758 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 126049 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 155-130 chr7 32492621 32492860 + 0.75 NA intron (NM_001130710, intron 1 of 4) intron (NM_001130710, intron 1 of 4) -2360 NR_024466 23658 Hs.424908 NM_012322 ENSG00000106355 LSM5 YER146W LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 215.75-65 chr3 173592245 173592722 + 0.75 NA intron (NM_001365928, intron 1 of 6) intron (NM_001365928, intron 1 of 6) 8049 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 158.5-45 chr12 53231202 53231466 + 0.75 NA intron (NM_000966, intron 1 of 9) intron (NM_000966, intron 1 of 9) 875 NM_000966 5916 Hs.1497 NM_000966 ENSG00000172819 RARG NR1B3|RARC retinoic acid receptor gamma protein-coding 158-88 chr20 56133877 56134161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114713 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 193-52 chr3 35089597 35089940 + 0.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 304255 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 138.5-10 chr1 74180237 74180696 + 0.75 NA intron (NM_001105659, intron 3 of 7) intron (NM_001105659, intron 3 of 7) 17710 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 128.25-86 chr2 10599637 10599855 + 0.75 NA intron (NR_048552, intron 16 of 19) intron (NR_048552, intron 16 of 19) 90229 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 132.75-57 chr14 45286203 45286555 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -33177 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 185.75-60 chr2 67784486 67785044 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 40797 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 123.5-109 chr2 150422060 150422283 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 65524 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 290.75-4 chr10 44789286 44789709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -121819 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 202-80 chr9 81913414 81913974 + 0.75 NA intron (NR_026851, intron 1 of 3) intron (NR_026851, intron 1 of 3) 257 NR_026851 347127 Hs.215235 NM_198509 ENSG00000240632 SPATA31D5P FAM75D5|FAM75D5P SPATA31 subfamily D member 5, pseudogene pseudo 282.25 chr1 73891686 73892254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 217291 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 112.75-71 chr15 87036369 87036561 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -48039 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 248.5-33 chr16 3364967 3365605 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7382 NM_001190476 100463285 NM_001190476 ENSG00000232196 MTRNR2L4 HN4 MT-RNR2 like 4 protein-coding 201-18 chr11 76940360 76940694 + 0.75 NA intron (NM_001300955, intron 2 of 9) (GTATCTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 79609 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 114.25-97 chr2 103125966 103126268 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -141688 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 179.5-182 chr8 115060515 115061004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 607254 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 124.25-171 chr5 158196250 158196627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 213335 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 149.5-45 chr11 110911284 110911578 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 185887 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 209.5-48 chr15 62139611 62140090 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 25435 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 302.25-12 chr17 62939977 62940705 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3874 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 237.5-40 chr17 15059006 15059574 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 28315 NR_033371 94150 Hs.147654 NR_033371 ENSG00000259944 CDRT7 LINC00025|NCRNA00025 CMT1A duplicated region transcript 7 ncRNA 159-105 chr7 106596774 106597119 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 64212 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 114-64 chr19 46365013 46365313 + 0.75 NA intron (NM_001204284, intron 2 of 11) AluSz|SINE|Alu 18076 NM_006247 5536 Hs.654604 NM_006247 ENSG00000011485 PPP5C PP5|PPP5|PPT protein phosphatase 5 catalytic subunit protein-coding 134-30 chr11 88236392 88236749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60068 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 209.25-52 chr2 29117071 29117513 + 0.75 NA intron (NM_024692, intron 1 of 15) MER3|DNA|hAT-Charlie 1877 NM_024692 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 123-167 chr6 4638737 4638949 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 28278 NR_122107 497048 Hs.591355 NM_001011540 ENSG00000205444 KU-MEL-3 - uncharacterized LOC497048 ncRNA 133-167 chr8 30090831 30091026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4480 NM_001128208 23484 Hs.146585 NM_015344 ENSG00000104660 LEPROTL1 HSPC112|Vps55|my047 leptin receptor overlapping transcript like 1 protein-coding 145-53 chr16 8201251 8201589 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 388418 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 125.75-159 chr6 12831412 12831696 + 0.75 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) 112855 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 131-4 chr1 119867283 119867674 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22598 NM_001047980 343505 NM_001047980 NBPF7 - NBPF member 7 protein-coding 152.25-156 chr8 100128553 100128861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17110 NR_036491 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 163-25 chr11 114293023 114293466 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2569 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 148.5-164 chr4 43189224 43189500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296096 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 179.25-102 chr3 82609974 82610401 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 624045 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 192.5-91 chr3 64893925 64894356 + 0.75 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -206140 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 121.75-182 chr7 116032987 116033149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2305 NM_001018058 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 146.5-89 chr18 11462126 11462483 + 0.75 NA intron (NR_146901, intron 2 of 3) L1MDa|LINE|L1 7826 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 164.75-121 chr6 16528399 16528743 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 5 of 8) intron (NM_000332, intron 5 of 8) 231613 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 120.75-100 chr22 28066044 28066212 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) L1MA9|LINE|L1 -145516 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 141.25-107 chr3 34320526 34320818 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 522042 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 162.5-148 chr5 180847371 180847670 + 0.75 NA TTS (NM_152283) TTS (NM_152283) 13766 NM_001172638 643836 Hs.509227 NM_152283 ENSG00000196670 ZFP62 ZET|ZNF755 ZFP62 zinc finger protein protein-coding 244-53 chr7 7329018 7329655 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74182 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 136.5-91 chr17 52988960 52989421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3685 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 170.75-85 chr22 45376622 45377063 + 0.75 NA intron (NM_148674, intron 12 of 24) intron (NM_148674, intron 12 of 24) 36757 NM_001291501 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 180.75-14 chr1 221327694 221328104 + 0.75 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8397 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 230.5-29 chr13 36089787 36090265 + 0.75 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) 41356 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 218.25-17 chr11 44194314 44194740 + 0.75 NA intron (NM_207122, intron 8 of 13) intron (NM_207122, intron 8 of 13) 98330 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 145.25-9 chr1 160344610 160344906 + 0.75 NA exon (NM_001349729, exon 2 of 16) exon (NM_001349729, exon 2 of 16) 1375 NM_001290184 23385 Hs.517249 NM_015331 ENSG00000162736 NCSTN ATAG1874 nicastrin protein-coding 174.25-148 chr8 125343105 125343531 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -87040 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 119.5-26 chr10 57976168 57976388 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 291616 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 204.5-7 chr1 238814041 238814497 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -328252 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 136.75-78 chr17 74804892 74805118 + 0.75 NA intron (NM_017728, intron 8 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 28506 NM_017728 54868 Hs.370262 NM_017728 ENSG00000109066 TMEM104 - transmembrane protein 104 protein-coding 116.25-160 chr4 35816917 35817198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 426882 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 123.5-77 chr17 35288863 35289158 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 45938 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 183.75-86 chr4 88470476 88470865 + 0.75 NA exon (NM_016323, exon 10 of 23) exon (NM_016323, exon 10 of 23) 13551 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 249.25-48 chr6 73064360 73064771 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 3 of 13) intron (NM_001160132, intron 3 of 13) 78949 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 192-18 chr10 84510895 84511279 + 0.75 NA intron (NM_001351292, intron 11 of 11) intron (NM_001351292, intron 11 of 11) 85918 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 187.5-171 chr8 118613347 118613815 + 0.75 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -7420 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 184.25-14 chr1 238000807 238001281 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -110122 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 117.25-74 chr14 60991847 60992135 + 0.75 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -10301 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 132.5-237 chr8 70660831 70661141 + 0.75 NA non-coding (NR_038881, exon 4 of 4) non-coding (NR_038881, exon 4 of 4) 8199 NM_016027 51110 Hs.118554 NM_016027 ENSG00000147592 LACTB2 CGI-83 lactamase beta 2 protein-coding 173.75-81 chr2 14974302 14974715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 341791 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 152.5-35 chr12 58454731 58455260 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -136707 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 152-125 chr5 110054363 110054579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 171289 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 179.25-145 chr8 100692755 100693130 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 10082 NR_106992 102466854 NR_106992 ENSG00000284570 MIR7705 hsa-mir-7705 microRNA 7705 ncRNA 121.5-179 chr3 104252629 104252936 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -728666 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 238.25-45 chr21 36251845 36252195 + 0.75 NA intron (NM_005128, intron 22 of 36) AluJb|SINE|Alu -68169 NM_001320446 23515 Hs.421150 NM_015358 ENSG00000159256 MORC3 NXP2|ZCW5|ZCWCC3 MORC family CW-type zinc finger 3 protein-coding 120.25-18 chr1 178359632 178359898 + 0.75 NA intron (NM_004841, intron 1 of 15) intron (NM_004841, intron 1 of 15) 18314 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 134-60 chr15 34924845 34925051 + 0.75 NA intron (NM_014691, intron 13 of 34) intron (NM_014691, intron 13 of 34) 44794 NM_014691 9716 Hs.510958 NM_014691 ENSG00000021776 AQR IBP160|fSAP164 aquarius intron-binding spliceosomal factor protein-coding 131-151 chr7 21704299 21704574 + 0.75 NA exon (NM_001277115, exon 38 of 82) exon (NM_001277115, exon 38 of 82) 161397 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 125.5-177 chr3 98890905 98891119 + 0.75 NA intron (NM_080927, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 10683 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 140.5-228 chr8 83195403 83195740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -208187 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 114.5-78 chr13 77358380 77358597 + 0.75 NA Intergenic (TTTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -31394 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 212.25-92 chr8 35054905 35055319 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -180363 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 156.75-80 chr2 34622676 34622936 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54751 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 149.5-66 chr15 81290671 81290954 + 0.75 NA intron (NM_001352686, intron 11 of 18) intron (NM_001352686, intron 11 of 18) -6158 NM_004513 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 128.25-168 chr5 171016472 171016710 + 0.75 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) L1PA5|LINE|L1 154573 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 173-37 chr12 86235593 86235946 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 20622 NM_001351283 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 113.5-226 chr8 28246255 28246429 + 0.75 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -70926 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 166.25-125 chr5 35710837 35711275 + 0.75 NA intron (NM_024867, intron 19 of 36) intron (NM_024867, intron 19 of 36) 93193 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 151.25-58 chr14 76699554 76699908 + 0.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -61737 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 200.25-38 chr15 25499205 25499752 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -60422 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 185.75-35 chr13 39959901 39960228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221745 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 439.5-12 chr3 63301697 63302828 + 0.75 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 23954 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 133.75-206 chr9 116946324 116946662 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 9 of 21) intron (NM_014010, intron 9 of 21) 234708 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 303.75-29 chr6 44041480 44041965 + 0.75 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) intron (NR_125864, intron 1 of 4) 32930 NR_125864 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 115.75-3 chr1 97020200 97020491 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -75578 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 138.25-125 chr3 166181027 166181317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -343749 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 198-86 chr9 35575526 35575864 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -11817 NM_001164310 730112 Hs.98959 NM_001099951 ENSG00000215187 FAM166B - family with sequence similarity 166 member B protein-coding 177-36 chr16 74221736 74221986 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6340 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 185.75-31 chr12 14666798 14667139 + 0.75 NA intron (NM_004963, intron 10 of 26) intron (NM_004963, intron 10 of 26) 29631 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 128.75-14 chr1 235535845 235536017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31479 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 116.5-148 chr22 23129847 23130061 + 0.75 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) intron (NM_014433, intron 4 of 6) 12036 NM_014433 27156 Hs.526920 NM_014433 ENSG00000100218 RSPH14 RTDR1 radial spoke head 14 homolog protein-coding 151.75-133 chr6 149603642 149604064 + 0.75 NA intron (NM_007044, intron 5 of 10) intron (NM_007044, intron 5 of 10) 10237 NR_077247 645958 Hs.632614 NR_077247 RPS18P9 RPS18_6_767 ribosomal protein S18 pseudogene 9 pseudo 127.25-191 chr7 25579913 25580141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83113 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 261.75-38 chr5 112095033 112095436 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -65292 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 122.25-201 chr8 136060334 136060634 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -470314 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 130-66 chr2 26466456 26466819 + 0.75 NA intron (NM_194322, intron 18 of 28) intron (NM_194322, intron 18 of 28) 11487 NM_004802 9381 Hs.91608 NM_004802 ENSG00000115155 OTOF AUNB1|DFNB6|DFNB9|FER1L2|NSRD9 otoferlin protein-coding 229.25-4 chr1 161768928 161769426 + 0.75 NA intron (NM_007348, intron 1 of 15) MER58B|DNA|hAT-Charlie 2857 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 148.5-99 chr2 55886100 55886511 + 0.75 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) intron (NM_001039349, intron 4 of 10) 37477 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 118.75-91 chr2 25851106 25851300 + 0.75 NA intron (NM_018263, intron 1 of 11) L1MC5a|LINE|L1 -20302 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 113.5-219 chr7 34157028 34157231 + 0.75 NA TTS (NM_001365308) TTS (NM_001365308) 251590 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 155.25-192 chrUn_GL000216v2 150071 150375 + 0.75 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 150-71 chr2 62173496 62173755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22490 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 123.25-40 chr11 100904050 100904294 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 6 of 25) intron (NM_001367945, intron 6 of 25) -30102 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 146-21 chr11 75981519 75981781 + 0.75 NA intron (NM_003369, intron 7 of 14) L1MC2|LINE|L1 166440 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 140.75-155 chr5 117195190 117195450 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -220192 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 195-23 chr13 93703112 93703543 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 155146 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 194-38 chr15 65545086 65545433 + 0.75 NA intron (NM_016395, intron 1 of 10) intron (NM_016395, intron 1 of 10) 14796 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 165.75-156 chr7 42667482 42667793 + 0.75 NA intron (NR_110833, intron 2 of 2) LTR33|LTR|ERVL 38810 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 246.75-7 chr10 71591342 71591861 + 0.75 NA intron (NM_052836, intron 9 of 12) MER113|DNA|hAT-Charlie -79681 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 174.75-103 chr5 157475686 157475994 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15740 NR_136205 102724404 Hs.570889 NR_136204 LOC102724404 - uncharacterized LOC102724404 ncRNA 133.75-174 chr6 142597075 142597341 + 0.75 NA intron (NR_027311, intron 1 of 2) LTR85a|LTR|Gypsy? 40628 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 126.75-185 chr5 4487417 4487621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -285962 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 135.5-143 chr4 15797578 15797830 + 0.75 NA intron (NR_132660, intron 1 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 19376 NR_132660 952 Hs.479214 NM_001775 ENSG00000004468 CD38 ADPRC 1|ADPRC1 CD38 molecule protein-coding 147-86 chr20 51864090 51864340 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1302 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 161.25-57 chr14 101857085 101857542 + 0.75 NA intron (NM_001161725, intron 4 of 15) intron (NM_001161725, intron 4 of 15) 47450 NM_001352912 5527 Hs.368264 NM_002719 ENSG00000078304 PPP2R5C B56G|B56gamma|PR61G protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma protein-coding 139.25-172 chr7 27082546 27082780 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 13337 NM_153620 3198 Hs.67397 NM_005522 ENSG00000105991 HOXA1 BSAS|HOX1|HOX1F homeobox A1 protein-coding 338.25-19 chr3 46549752 46550259 + 0.75 NA intron (NM_024512, intron 2 of 8) FLAM_C|SINE|Alu -7393 NR_073385 83598 Hs.570630 NR_073385 ENSG00000268324 LRRC2-AS1 LUZP3|LUZP3P|LUZPP1 LRRC2 antisense RNA 1 ncRNA 220-75 chr9 35504970 35505449 + 0.75 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) 15098 NR_052015 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 118-181 chr8 65576343 65576525 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13768 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 117.25-208 chr8 51727068 51727324 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) intron (NM_144651, intron 1 of 22) 82249 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 185.75-100 chr5 69191743 69192062 + 0.75 NA intron (NM_022909, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 2319 NM_022909 64946 Hs.631967 NM_022909 ENSG00000153044 CENPH - centromere protein H protein-coding 253.25-4 chr1 179416416 179416941 + 0.75 NA intron (NR_073544, intron 12 of 25) LTR47B2|LTR|ERVL 50634 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 150-4 chr1 71787679 71788063 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 2 of 6) intron (NM_173808, intron 2 of 6) 49141 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 264.75-64 chr9 130809856 130810542 + 0.75 NA intron (NM_007313, intron 1 of 10) L1MEc|LINE|L1 -25055 NM_005157 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 188.75-120 chr9 29048331 29048737 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MA1|LINE|L1 -159579 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 165.25-64 chr2 38971058 38971330 + 0.75 NA intron (NM_001145451, intron 15 of 15) intron (NM_001145451, intron 15 of 15) -10850 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 222-41 chr2 88373860 88374224 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 78651 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 119.25-129 chr3 90031490 90031802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 924025 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 180.5-24 chr12 19071756 19072113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57799 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 135-35 chr12 127128712 127128903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68410 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 147.25-134 chr7 111426113 111426492 + 0.75 NA intron (NM_001350961, intron 4 of 7) intron (NM_001350961, intron 4 of 7) 135989 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 237-37 chr3 160240826 160241233 + 0.75 NA intron (NR_148401, intron 18 of 18) LTR10F|LTR|ERV1 15393 NM_001168214 401097 Hs.729755 NM_001168214 ENSG00000180044 C3orf80 - chromosome 3 open reading frame 80 protein-coding 131.75-173 chr5 90355689 90355895 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 53994 NM_001297768 1070 Hs.591767 NM_004365 ENSG00000153140 CETN3 CDC31|CEN3 centrin 3 protein-coding 141.25-186 chr8 134960834 134961150 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 111057 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 131-44 chr12 132097667 132097996 + 0.75 NA intron (NR_003290, intron 3 of 9) L1ME1|LINE|L1 13548 NR_003290 347918 Hs.122115 NM_182613 ENSG00000185684 EP400P1 EP400NL EP400 pseudogene 1 pseudo 175-25 chr11 97145212 97145597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 636979 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 159.5-73 chr16 89404200 89404428 + 0.75 NA intron (NR_045839, intron 2 of 9) intron (NR_045839, intron 2 of 9) -26604 NR_110932 101927817 Hs.667942 NR_110931 LOC101927817 - uncharacterized LOC101927817 ncRNA 135-189 chr8 136130212 136130523 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -400431 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 200-21 chr12 15435075 15435587 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) MamRep564|Unknown|Unknown -111280 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 196.25-104 chr6 40772971 40773472 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -185857 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 113-138 chr4 180064245 180064547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1094753 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 127-181 chr8 140451043 140451310 + 0.75 NA exon (NM_031466, exon 2 of 23) exon (NM_031466, exon 2 of 23) 6568 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 147.5-217 chr9 5675773 5676190 + 0.75 NA intron (NM_001206557, intron 2 of 24) LTR8A|LTR|ERV1 46862 NM_001206557 57589 Hs.211520 NM_020829 ENSG00000107036 RIC1 CIP150|KIAA1432|bA207C16.1 RIC1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1 protein-coding 142-65 chr17 18341309 18341531 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106836) promoter-TSS (NR_106836) -534 NR_106836 102466733 NR_106836 ENSG00000283772 MIR6778 hsa-mir-6778 microRNA 6778 ncRNA 262.25-27 chr21 21316950 21317499 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 6 of 18) LTR55|LTR|ERVL? 170062 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 225.5-4 chr1 63141112 63141573 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -128871 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 248.5-28 chr14 75854382 75854881 + 0.75 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) L1ME2|LINE|L1 127364 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 134-182 chr9 28674092 28674348 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 45085 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 288.75-6 chr10 26073963 26074544 + 0.75 NA intron (NM_017433, intron 14 of 34) intron (NM_017433, intron 14 of 34) 140024 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 187.25-37 chr16 78711151 78711507 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 611675 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 125.25-21 chr10 11222137 11222327 + 0.75 NA intron (NM_001025076, intron 3 of 13) intron (NM_001025076, intron 3 of 13) 57202 NM_001025076 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 412-5 chr2 23184411 23185116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -200416 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 149.75-174 chr9 36684278 36684537 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 111512 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 163-52 chr19 51973327 51973588 + 0.75 NA intron (NM_021632, intron 2 of 4) MER77B|LTR|ERVL 13383 NM_021632 59348 Hs.407694 NM_021632 ENSG00000256683 ZNF350 ZBRK1|ZFQR zinc finger protein 350 protein-coding 151.25-138 chr4 32568925 32569261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 218055 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 262.75-41 chr4 60743297 60743893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179024 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 132.5-192 chr5 20417421 20417757 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 112038 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 173.25-145 chrX 155189173 155189534 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7654 NM_001303544 7411 Hs.436803 NM_003372 ENSG00000155959 VBP1 HIBBJ46|PFD3|PFDN3|VBP-1 VHL binding protein 1 protein-coding 229.5-15 chr10 53613504 53613903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -842003 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 148-40 chr16 65454913 65455180 + 0.75 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 121254 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 130.75-208 chrX 69706713 69707022 + 0.75 NA intron (NM_001005613, intron 2 of 2) MER4B|LTR|ERV1 90754 NM_001005609 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 149.75-155 chr7 48277546 48277796 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 17 of 61) MLT2F|LTR|ERVL 106213 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 125.25-138 chr3 140763945 140764297 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 86057 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 181.75-111 chr6 69128058 69128410 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) intron (NM_001704, intron 17 of 31) 492952 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 197.25-38 chr17 82139318 82139716 + 0.75 NA intron (NM_001367828, intron 13 of 16) AluSx1|SINE|Alu -41281 NM_004104 2194 Hs.83190 NM_004104 ENSG00000169710 FASN FAS|OA-519|SDR27X1 fatty acid synthase protein-coding 173.75-147 chr8 78092526 78092795 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -423680 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 200-2 chr1 95207627 95208175 + 0.75 NA intron (NR_125949, intron 2 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 26081 NR_125949 101928118 Hs.656443 NR_125948 ENSG00000226026 LOC101928118 - uncharacterized LOC101928118 ncRNA 156.5-192 chr8 84340169 84340622 + 0.75 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) L1MB1|LINE|L1 -75089 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 130.25-202 chr8 111348231 111348528 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28260 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 179.5-174 chr7 110255197 110255553 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -295162 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 133.5-222 chr5 169468488 169468866 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115096 NM_001329639 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 164.75-31 chr11 90678231 90678625 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 -122571 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 235-9 chr10 29401381 29402007 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -7840 NR_110922 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 248.75-45 chr4 32781529 32781942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 430697 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 299-17 chr2 146189673 146190383 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -397029 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 165.5-34 chr12 97631446 97631784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67803 NR_029678 406926 NR_029678 ENSG00000207586 MIR135A2 MIRN135-2|MIRN135A2|mir-135a-2 microRNA 135a-2 ncRNA 117.5-75 chr16 55500212 55500462 + 0.75 NA intron (NM_001127891, intron 11 of 12) intron (NM_001127891, intron 11 of 12) -8735 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 186.75-22 chr12 17510454 17510946 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78378 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 115.75-34 chr11 113218548 113218782 + 0.75 NA intron (NM_000615, intron 8 of 17) intron (NM_000615, intron 8 of 17) 55236 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 136.5-176 chr5 37220264 37220508 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 15 of 51) intron (NM_023073, intron 15 of 51) -28660 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 152.5-49 chr14 76832765 76833093 + 0.75 NA intron (NM_194287, intron 3 of 13) LTR26|LTR|ERV1 6521 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 142.75-10 chr1 180272497 180272924 + 0.75 NA intron (NR_037642, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR 1971 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 171-131 chr8 118314496 118314941 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L1MD2|LINE|L1 -202899 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 222.75-40 chr14 69041073 69041563 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 61636 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-77 chr3 108122836 108123246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2023 NR_110030 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 118.5-226 chr8 125313765 125314006 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -116473 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 140-170 chr9 17706332 17706631 + 0.75 NA intron (NM_003026, intron 1 of 8) intron (NM_003026, intron 1 of 8) 127415 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 150.5-165 chr5 15683893 15684297 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -69093 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 119-98 chr2 224689420 224689611 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -104118 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 181.25-85 chr3 112488794 112489110 + 0.75 NA intron (NM_001085357, intron 1 of 3) intron (NM_001085357, intron 1 of 3) 10520 NM_181780 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 180.25-8 chr11 17380952 17381302 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 7532 NM_000525 3767 Hs.248141 NM_000525 ENSG00000187486 KCNJ11 BIR|HHF2|IKATP|KIR6.2|MODY13|PHHI|TNDM3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 11 protein-coding 126.5-48 chr12 27913611 27913946 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 56198 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 162.5-101 chr20 56762093 56762367 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 132924 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 149.5-203 chr8 86016357 86016726 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 53127 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 148-135 chr8 139058348 139058589 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -144427 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 174.75-135 chr8 144423469 144423766 + 0.75 NA TTS (NM_183057) TTS (NM_183057) 4931 NM_016208 51160 Hs.418175 NM_016208 ENSG00000160948 VPS28 - VPS28 subunit of ESCRT-I protein-coding 142.25-109 chr3 95930946 95931306 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247933 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 252.75-24 chr18 5434234 5434783 + 0.75 NA intron (NM_001281535, intron 8 of 21) intron (NM_001281535, intron 8 of 21) 106048 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 120.25-181 chr6 43728099 43728308 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -40391 NM_018135 55168 Hs.520149 NM_018135 ENSG00000096080 MRPS18A HumanS18b|MRP-S18-3|MRP-S18-a|MRPS18-3|S18bmt|S18mt-a mitochondrial ribosomal protein S18A protein-coding 144.25-131 chr3 109684452 109684652 + 0.75 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 81724 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 171.25-103 chr3 145177740 145178062 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 891284 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 126.75-166 chr4 40987424 40987598 + 0.75 NA intron (NM_004307, intron 6 of 17) intron (NM_004307, intron 6 of 17) -130319 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 172-103 chr7 122460351 122460594 + 0.75 NA intron (NM_001167940, intron 14 of 29) L1MEd|LINE|L1 -155722 NM_001024613 389549 Hs.553970 NM_001024613 ENSG00000128610 FEZF1 FEZ|HH22|ZNF312B FEZ family zinc finger 1 protein-coding 137-116 chr4 31953860 31954157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43371 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 115-96 chr20 4524656 4524983 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161637 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 152.25-59 chr15 57932668 57932925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 81227 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 124.5-214 chr7 116161165 116161434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49240 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 159.25-3 chr1 99500838 99501202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13216 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 158-18 chr1 203563096 203563475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63502 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 256.25-2 chr1 187741998 187742476 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 298609 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 123.25-169 chr5 110313442 110313668 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 200360 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 118.75-166 chr6 75754647 75754885 + 0.75 NA intron (NM_001300899, intron 1 of 32) intron (NM_001300899, intron 1 of 32) 5527 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 164.25-133 chr5 160351011 160351299 + 0.75 NA intron (NM_001366504, intron 2 of 3) intron (NM_001366504, intron 2 of 3) -11563 NR_131769 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 146-92 chr3 124792833 124793143 + 0.75 NA intron (NM_001354766, intron 9 of 13) intron (NM_001354766, intron 9 of 13) 60549 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 117.5-57 chr14 50383691 50383898 + 0.75 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) intron (NM_001282236, intron 2 of 8) 13087 NM_004196 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 206.75-70 chr5 67829242 67829683 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36249 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 221.25-33 chr16 69612910 69613274 + 0.75 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) L2c|LINE|L2 47126 NM_006599 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 139.5-31 chr11 84289227 84289477 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -16072 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 189.25-16 chr11 80776656 80777188 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14119 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 200.75-55 chr2 105783042 105783375 + 0.75 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) 38145 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 147-152 chr8 136421811 136422295 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -108745 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 123-181 chr8 47744118 47744311 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -6050 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 120.25-42 chr11 118366346 118366619 + 0.75 NA intron (NM_001204077, intron 2 of 19) intron (NM_001204077, intron 2 of 19) 6882 NM_004788 9354 Hs.75275 NM_004788 ENSG00000110344 UBE4A E4|UBOX2|UFD2 ubiquitination factor E4A protein-coding 158-106 chr4 37521251 37521565 + 0.75 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) L1MA1|LINE|L1 -62825 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 222-83 chr8 116963729 116964143 + 0.75 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) MIRc|SINE|MIR 12961 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 244.5-97 chr8 118778919 118779391 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -157192 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 116-107 chr3 121853697 121853949 + 0.75 NA intron (NM_001320041, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 18614 NM_018456 55840 Hs.477325 NM_018456 ENSG00000145088 EAF2 BM040|TRAITS|U19 ELL associated factor 2 protein-coding 113.75-132 chr3 136808486 136808739 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10407 NM_001097599 80723 Hs.477692 NM_025246 ENSG00000168917 SLC35G2 TMEM22 solute carrier family 35 member G2 protein-coding 146-70 chr2 163845229 163845524 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -109368 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 149.25-155 chr6 61847124 61847492 + 0.75 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) MER67C|LTR|ERV1 273178 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 178-8 chr10 39458234 39458564 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 761803 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 131.25-150 chr3 169321122 169321490 + 0.75 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) AluSc8|SINE|Alu -126561 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 253.25-44 chr3 66849891 66850590 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -111904 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 125.75-153 chr5 44910046 44910271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101211 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 164.5-98 chr2 73006645 73006940 + 0.75 NA intron (NR_138476, intron 6 of 14) intron (NR_138476, intron 6 of 14) 52380 NM_001330411 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 244.5-74 chr4 75814533 75815208 + 0.75 NA TTS (NM_001290049) TTS (NM_001290049) 87582 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 188.5-84 chr2 201163089 201163465 + 0.75 NA non-coding (NR_147249, exon 9 of 10) non-coding (NR_147249, exon 9 of 10) -5485 NR_040030 65072 Hs.664613 NR_040030 ENSG00000226312 CFLAR-AS1 ALS2CR10 CFLAR antisense RNA 1 ncRNA 164.5-82 chr17 76539411 76539680 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001077620) promoter-TSS (NM_001077620) -499 NM_001077620 768206 Hs.634380 NM_001077620 ENSG00000214140 PRCD RP36 photoreceptor disc component protein-coding 178-55 chr21 25278101 25278379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 153461 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 209-46 chr20 50918431 50918863 + 0.75 NA intron (NM_001347511, intron 1 of 4) intron (NM_001347511, intron 1 of 4) -8856 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 210-28 chr14 33422087 33422497 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -286645 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 178.75-2 chr1 40287995 40288330 + 0.75 NA intron (NM_005857, intron 8 of 9) AluJr|SINE|Alu 29124 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 229.5-141 chr9 82696020 82696602 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 366831 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 127-183 chr9 28471455 28471691 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 247732 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 257.75-3 chr10 19542478 19542962 + 0.75 NA intron (NM_001142308, intron 32 of 39) (GATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 185830 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 118.5-107 chr2 171596842 171597060 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 74477 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 143.5-198 chr7 81496082 81496409 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65574 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 163.25-73 chr2 204950012 204950446 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) MIR|SINE|MIR 404754 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 130.75-81 chr18 50135722 50136050 + 0.75 NA intron (NM_001080467, intron 1 of 39) MIRc|SINE|MIR -9323 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 165.25-17 chr10 56052881 56053269 + 0.75 NA Intergenic LTR19A|LTR|ERV1 308184 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 144.75-120 chr4 40817621 40817865 + 0.75 NA intron (NM_173075, intron 16 of 16) intron (NM_173075, intron 16 of 16) 39412 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 136.5-54 chr12 32419330 32419600 + 0.75 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) L1M1|LINE|L1 19907 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 137.5-139 chr20 14837611 14837928 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 91749 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 119.5-166 chr4 76326645 76326954 + 0.75 NA intron (NM_001042784, intron 21 of 23) L1MEg|LINE|L1 20773 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 184.5-155 chr8 82149928 82150192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -307774 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 136.25-21 chr10 81886153 81886446 + 0.75 NA intron (NR_163252, intron 1 of 8) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 8612 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 213.5-38 chr14 67958154 67958779 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 134874 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 160.75-145 chr7 39686571 39686866 + 0.75 NA exon (NM_005402, exon 2 of 5) exon (NM_005402, exon 2 of 5) -46850 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 131-147 chr6 152224412 152224610 + 0.75 NA exon (NM_033071, exon 116 of 146) exon (NM_033071, exon 116 of 146) -39133 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 134.75-200 chr7 55935015 55935219 + 0.75 NA intron (NM_182633, intron 6 of 6) AluSg|SINE|Alu -16760 NM_015969 51373 Hs.44298 NM_015969 ENSG00000239789 MRPS17 HSPC011|MRP-S17|RPMS17|S17mt mitochondrial ribosomal protein S17 protein-coding 133.5-30 chr10 44873741 44874122 + 0.75 NA intron (NR_033842, intron 2 of 7) L3|LINE|CR1 -37385 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 159.75-118 chr4 92735395 92735742 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 431169 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 173.25-112 chr6 159696415 159696714 + 0.75 NA intron (NM_001322817, intron 3 of 7) AluSz|SINE|Alu -3236 NM_001322816 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 161-101 chr5 144409369 144409683 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 204135 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 142.75-17 chr10 12023731 12024091 + 0.75 NA intron (NM_080599, intron 3 of 21) AluJb|SINE|Alu 18898 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 197.5-79 chr2 170238265 170238612 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 60291 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 142.75-113 chr20 42839966 42840314 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -128603 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 141.25-24 chr10 97145794 97146226 + 0.75 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 39949 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 126.5-128 chr20 19216353 19216801 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 1 of 16) AluJr4|SINE|Alu 3935 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 116-179 chr8 135935910 135936168 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 478583 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 163.5-145 chr4 93662715 93663149 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -165821 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 121.75-40 chr13 83688938 83689226 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 193311 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 128.75-108 chr20 21462038 21462275 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 51908 NM_002509 4821 Hs.516922 NM_002509 ENSG00000125820 NKX2-2 NKX2.2|NKX2B NK2 homeobox 2 protein-coding 126.75-218 chr7 3973522 3973745 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 12 of 44) intron (NM_152744, intron 12 of 44) -156052 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 132.75-183 chr8 34845302 34845576 + 0.75 NA intron (NR_125746, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 61518 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 199.5-79 chr2 74133487 74133901 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 14218 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 127.75-57 chr12 127512141 127512361 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 124216 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 247-49 chr5 30079085 30079726 + 0.75 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 198845 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 153.25-94 chr3 174462150 174462580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -396969 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 169.25-17 chr12 53822906 53823211 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -66024 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 204.75-47 chr16 61970320 61970821 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 65868 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 161.5-183 chr8 102229379 102229784 + 0.75 NA intron (NM_001172478, intron 1 of 7) intron (NM_001172478, intron 1 of 7) 9250 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 121.5-130 chr2 55289234 55289537 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018084, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_018084, exon 32 of 32) 7066 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 122.75-23 chr10 43369939 43370265 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1534 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 124.75-199 chr8 86382927 86383171 + 0.75 NA intron (NM_007013, intron 5 of 24) (TAGTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40502 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 184.25-28 chr11 111847883 111848372 + 0.75 NA intron (NR_147984, intron 8 of 15) MIRb|SINE|MIR 23154 NM_001352416 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 169.25-107 chr7 27992276 27992668 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -187985 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-7 chr1 118316415 118316688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -131323 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 185.25-29 chr14 55738366 55738741 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -27692 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 131.75-54 chr12 75322563 75322801 + 0.75 NA intron (NR_149158, intron 1 of 9) intron (NR_149158, intron 1 of 9) 7642 NM_001355024 84698 Hs.733835 NM_032606 ENSG00000180881 CAPS2 UG0636c06 calcyphosine 2 protein-coding 202-54 chr5 100167756 100168129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 220312 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 145.5-25 chr10 68538137 68538405 + 0.75 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL -10748 NM_001324314 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 174.25-29 chr11 129001755 129002097 + 0.75 NA intron (NM_001142685, intron 10 of 21) L1MA2|LINE|L1 22262 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 126.25-115 chr3 70576100 70576311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -263567 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 165.25-94 chr3 144275554 144275933 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 302662 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 196.25-3 chr1 101441070 101441399 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 117397 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 149-12 chr10 56903811 56904062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 400623 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 150-18 chr10 124709000 124709241 + 0.75 NA intron (NR_120630, intron 2 of 2) intron (NR_120630, intron 2 of 2) 5092 NR_120630 101927944 Hs.437448 NR_120630 FAM53B-AS1 - FAM53B antisense RNA 1 ncRNA 158.75-87 chr2 79427402 79427736 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73275 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 215.25-36 chr17 58861803 58862365 + 0.75 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 106215 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 160-114 chr8 115650525 115650908 + 0.75 NA intron (NM_014112, intron 1 of 6) intron (NM_014112, intron 1 of 6) 17297 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 203.25-91 chr6 66972396 66972791 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1082758 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 149.75-7 chr1 113840290 113840544 + 0.75 NA intron (NM_012411, intron 9 of 18) L1MB3|LINE|L1 -16218 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-53 chr14 65638779 65639062 + 0.75 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) intron (NM_004480, intron 5 of 9) 167818 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 323-28 chr9 38297804 38298386 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -94607 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 212.75-33 chr14 64930843 64931187 + 0.75 NA intron (NM_001202559, intron 3 of 13) intron (NM_001202559, intron 3 of 13) 11730 NR_046321 2877 Hs.2704 NM_002083 ENSG00000176153 GPX2 GI-GPx|GPRP|GPRP-2|GPx-2|GPx-GI|GSHPX-GI|GSHPx-2 glutathione peroxidase 2 protein-coding 218.5-24 chr10 123860717 123861203 + 0.75 NA intron (NM_198148, intron 3 of 13) intron (NM_198148, intron 3 of 13) 30847 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 159.75-23 chr11 8187515 8187834 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18649 NM_001346692 79608 Hs.231850 NM_024557 ENSG00000166405 RIC3 AYST720|PRO1385 RIC3 acetylcholine receptor chaperone protein-coding 143.75-52 chr15 25669922 25670222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178753 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 187.5-13 chr1 240640281 240640627 + 0.75 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -28299 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 157.5-175 chr6 36626789 36627008 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4386 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 167.25-153 chr8 111222678 111223157 + 0.75 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) L1ME3B|LINE|L1 13286 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 148-101 chr5 37965098 37965389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16752 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 138.75-59 chr15 75932123 75932461 + 0.75 NA intron (NM_147188, intron 6 of 6) intron (NM_147188, intron 6 of 6) 28414 NR_037623 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 155.5-66 chr17 35691217 35691466 + 0.75 NA intron (NM_001030006, intron 18 of 21) intron (NM_001030006, intron 18 of 21) -40298 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 119.25-210 chr8 108521709 108521977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78219 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 244.25-32 chr3 78120310 78120667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71525 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 131.25-27 chr10 117483902 117484191 + 0.75 NA TTS (NR_002791) TTS (NR_002791) -58399 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 186.75-84 chr5 17478876 17479192 + 0.75 NA intron (NR_134270, intron 2 of 2) intron (NR_134270, intron 2 of 2) 35024 NR_134270 102723526 NR_134270 ENSG00000249662 LINC02218 - long intergenic non-protein coding RNA 2218 ncRNA 220.25-49 chr3 102229619 102230052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66130 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 184-55 chr3 79005774 79006102 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) 13521 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 119-145 chr5 41809465 41809733 + 0.75 NA intron (NM_001364301, intron 7 of 16) L2|LINE|L2 34058 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 176.75-79 chr3 20220882 20221411 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34913 NM_001012413 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 137.25-28 chr11 109112266 109112566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309774 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 115-143 chr5 131170303 131170564 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001293735) promoter-TSS (NM_001293735) -511 NM_181705 90624 Hs.115467 NM_181705 ENSG00000186687 LYRM7 C5orf31|MC3DN8|MZM1L LYR motif containing 7 protein-coding 158.75-149 chr6 161953672 161953996 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 482857 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 126.5-187 chr5 63833493 63833734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128679 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 204.75-88 chr4 174677775 174678072 + 0.75 NA intron (NM_006529, intron 6 of 9) MIRc|SINE|MIR 151324 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 196.5-26 chr11 20849634 20850096 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 4 of 18) MER5B|DNA|hAT-Charlie 180279 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 156.5-73 chr2 22974740 22975054 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -410282 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 124-53 chr15 94576960 94577183 + 0.75 NA Intergenic MER73|LTR|ERVL 221141 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 186.75-62 chr20 14949572 14949947 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -20241 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-39 chr10 91909101 91909498 + 0.75 NA intron (NM_152429, intron 1 of 1) intron (NM_152429, intron 1 of 1) 187 NM_152429 143282 Hs.466120 NM_152429 ENSG00000174721 FGFBP3 C10orf13|FGF-BP3 fibroblast growth factor binding protein 3 protein-coding 137.25-95 chr3 49819756 49820090 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5970 NM_003335 7318 Hs.16695 NM_003335 ENSG00000182179 UBA7 D8|UBA1B|UBE1L|UBE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 7 protein-coding 132.5-252 chr9 23658727 23658966 + 0.75 NA intron (NR_121602, intron 5 of 27) intron (NR_121602, intron 5 of 27) 13553 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 112.75-111 chr2 186941791 186942037 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -92744 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 123.25-160 chr5 55453071 55453335 + 0.75 NA intron (NR_103485, intron 4 of 6) intron (NR_103485, intron 4 of 6) 55723 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 162.5-73 chr18 67953387 67953678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138710 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 120.25-30 chr10 80697228 80697485 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 47559 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 172.25-59 chr2 13895288 13895517 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 505556 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 122-28 chr10 61486331 61486607 + 0.75 NA intron (NR_120643, intron 5 of 5) intron (NR_120643, intron 5 of 5) 6428 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 117-197 chr9 108587887 108588105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 267990 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 209-62 chr7 27318037 27318454 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -71016 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 115.25-95 chr2 14224634 14224979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 176152 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 114.25-18 chr10 57988933 57989089 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 278883 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 124.5-242 chr9 72727457 72727730 + 0.75 NA intron (NM_138691, intron 8 of 23) intron (NM_138691, intron 8 of 23) 146516 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 250-28 chr2 127038883 127039326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42961 NM_001320634 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 114-50 chr15 60708725 60708989 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 27288 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 156.75-100 chr2 189647234 189647486 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14039 NM_001353494 110599588 Hs.101364 NM_001353493 ENSG00000286053 ASDURF ASNSD1|ASNSD1-SEP|NS3TP1 ASNSD1 upstream reading frame protein-coding 175.75-68 chr2 75405117 75405465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118777 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 166.25-139 chr7 94091336 94091679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87152 NR_133908 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 129-178 chr8 96721828 96722034 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 76689 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 160.5-10 chr1 231664433 231664784 + 0.75 NA intron (NM_001164556, intron 1 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 37793 NM_001164544 27185 Hs.13318 NM_018662 ENSG00000162946 DISC1 C1orf136|SCZD9 DISC1 scaffold protein protein-coding 132.75-72 chr15 87161589 87161845 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -173291 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 156-40 chr14 25935609 25935830 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 617711 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 274.25-15 chr12 128595207 128595587 + 0.75 NA intron (NM_001136103, intron 3 of 8) intron (NM_001136103, intron 3 of 8) 228561 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 165.5-96 chr20 7157977 7158391 + 0.75 NA intron (NR_110609, intron 5 of 7) intron (NR_110609, intron 5 of 7) 96018 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 294-20 chr2 170535759 170536429 + 0.75 NA intron (NR_045682, intron 31 of 35) intron (NR_045682, intron 31 of 35) 178473 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 178.5-92 chr20 2173450 2173873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33267 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 156.75-104 chr20 56903772 56904156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 274658 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 160.5-35 chr12 26848867 26849112 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15795 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 160.25-172 chrX 132886411 132886810 + 0.75 NA intron (NM_001077188, intron 3 of 5) L1M4a2|LINE|L1 74760 NM_147175 90161 Hs.385956 NM_147175 ENSG00000171004 HS6ST2 MRXSPM heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 protein-coding 118.75-190 chr7 118030368 118030562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153699 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 232.75-14 chr11 107959045 107959514 + 0.75 NA intron (NM_017516, intron 1 of 1) intron (NM_017516, intron 1 of 1) 30831 NM_017516 54734 Hs.354906 NM_017516 ENSG00000179331 RAB39A RAB39 RAB39A, member RAS oncogene family protein-coding 168.75-2 chr1 41060781 41061050 + 0.75 NA intron (NM_001172218, intron 11 of 15) AluJo|SINE|Alu -39160 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 163-67 chr22 41539617 41539932 + 0.75 NA intron (NM_001018050, intron 2 of 5) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 4696 NM_001018050 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 129.25-220 chr9 125793034 125793368 + 0.75 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) AluY|SINE|Alu 45018 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 214.5-74 chr22 36762130 36762523 + 0.75 NA intron (NM_006860, intron 6 of 6) intron (NM_006860, intron 6 of 6) 13793 NM_001177701 11020 Hs.415172 NM_006860 ENSG00000100360 IFT27 BBS19|RABL4|RAYL intraflagellar transport 27 protein-coding 232.5-10 chr10 48506878 48507413 + 0.75 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) intron (NR_144642, intron 3 of 9) 4444 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 137-35 chr11 77027882 77028132 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6391 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 158.25-86 chr3 49175495 49175833 + 0.75 NA exon (NM_173546, exon 6 of 6) exon (NM_173546, exon 6 of 6) 4066 NM_173546 200942 Hs.13781 NM_173546 ENSG00000185909 KLHDC8B CHL kelch domain containing 8B protein-coding 131.25-30 chr10 125609925 125610164 + 0.75 NA intron (NM_001318133, intron 3 of 3) MER41B|LTR|ERV1 35673 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 154.25-67 chr17 61319507 61319808 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 48047 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 115.5-75 chr15 61719595 61719828 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10207 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 122.25-177 chr7 69853007 69853299 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) L1MD1|LINE|L1 254678 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 123.5-26 chr10 42310692 42310882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57258 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 153.25-44 chr15 38765025 38765363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68596 NR_160786 223.75-17 chr12 72028868 72029349 + 0.75 NA intron (NM_173353, intron 9 of 10) intron (NM_173353, intron 9 of 10) 90263 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 169.75-159 chr8 135656491 135656855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199217 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 246-65 chr8 117477591 117478173 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -42831 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 132.75-43 chr11 128904642 128904897 + 0.75 NA intron (NR_045767, intron 1 of 3) intron (NR_045767, intron 1 of 3) 928 NM_145013 219833 Hs.689860 NM_145013 ENSG00000174370 C11orf45 - chromosome 11 open reading frame 45 protein-coding 178.5-181 chr8 83248740 83249061 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -154858 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 141.25-145 chr5 154037272 154037613 + 0.75 NA intron (NM_018691, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 1468 NM_001317995 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 117.75-73 chr15 98848964 98849270 + 0.75 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) L1ME4b|LINE|L1 64691 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 164-122 chr6 142811135 142811366 + 0.75 NA intron (NM_006734, intron 2 of 9) intron (NM_006734, intron 2 of 9) 133926 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 194.75-43 chr18 40811186 40811723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 709223 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 214.75-26 chr14 73471205 73471711 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7816 NR_135251 101928143 Hs.654609 NR_135251 ENSG00000284930 LOC101928143 - uncharacterized LOC101928143 ncRNA 136-167 chr9 35216433 35216668 + 0.75 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) L1MDa|LINE|L1 54541 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 160-102 chr7 37790097 37790516 + 0.75 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -58291 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 132.75-118 chr22 19349054 19349366 + 0.75 NA intron (NM_003325, intron 24 of 24) AluSx|SINE|Alu -57491 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 120-131 chr4 31124118 31124348 + 0.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -46911 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 154.25-75 chr2 35273256 35273548 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -198003 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 185.25-104 chr5 104464135 104464606 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -635104 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 167.75-127 chr7 412569 412954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33336 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 209.25-68 chr21 18380489 18381033 + 0.75 NA intron (NM_002772, intron 4 of 24) intron (NM_002772, intron 4 of 24) 23024 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 165.75-26 chr11 30142748 30143130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -88075 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 124.25-190 chr7 106994602 106994898 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -49955 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 158.75-72 chr17 53166082 53166552 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 180812 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 216.75-57 chr4 87183815 87184491 + 0.75 NA intron (NM_001292007, intron 2 of 8) intron (NM_001292007, intron 2 of 8) 36115 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 270.5-26 chr17 60997129 60997801 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 15 of 25) intron (NM_001330413, intron 15 of 25) 319614 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 158-107 chr4 44885301 44885770 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -158901 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 178.25-54 chr18 13018343 13018866 + 0.75 NA exon (NM_032142, exon 8 of 45) exon (NM_032142, exon 8 of 45) 27242 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 126-2 chr1 67872900 67873221 + 0.75 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) intron (NR_040077, intron 1 of 9) -39593 NM_018841 55970 Hs.431101 NM_018841 ENSG00000172380 GNG12 - G protein subunit gamma 12 protein-coding 165-11 chr10 9120376 9120947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154952 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 122.25-98 chr2 144284008 144284358 + 0.75 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 10310 NM_001006636 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 117.5-159 chr4 71023130 71023431 + 0.75 NA intron (NM_000788, intron 3 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 29631 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 247.5-76 chr7 3389544 3390048 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 88544 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 125.25-167 chr6 1326169 1326442 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14207 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 216-2 chr1 116154514 116154880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42942 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 285.75-27 chr2 191782857 191783375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9724 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 140.25-25 chr10 75759044 75759340 + 0.75 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -23569 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 196.75-30 chr12 45182445 45182843 + 0.75 NA intron (NR_037144, intron 1 of 2) intron (NR_037144, intron 1 of 2) 33362 NR_037144 51054 Hs.233495 NM_015899 ENSG00000134297 PLEKHA8P1 FAPP-2|FAPP2|PLEKHA8|PLEKHA9|hFAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 pseudogene 1 pseudo 137.5-163 chr3 116367214 116367548 + 0.75 NA intron (NR_109998, intron 1 of 3) intron (NR_109998, intron 1 of 3) 7357 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 128-11 chr1 177520927 177521097 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 169426 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 118.75-187 chr7 96568820 96569046 + 0.75 NA intron (NR_163950, intron 3 of 6) intron (NR_163950, intron 3 of 6) -65410 NM_001201450 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 122.5-183 chr5 78800813 78801029 + 0.75 NA intron (NM_000046, intron 6 of 7) L2c|LINE|L2 -152149 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 155.5-69 chr17 50030217 50030528 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 25367 NR_038230 284080 Hs.274864 NR_038230 ENSG00000246640 PICART1 - p53 inducible cancer associated RNA transcript 1 ncRNA 180-104 chr6 127317011 127317376 + 0.75 NA intron (NM_001002030, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 25214 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 169.75-34 chr12 18293489 18293759 + 0.75 NA intron (NM_001288774, intron 4 of 32) intron (NM_001288774, intron 4 of 32) 32084 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 225.5-69 chr3 29004321 29004704 + 0.75 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie 276427 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 117.5-149 chr3 152089156 152089408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 116147 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 131.5-218 chr7 69419598 69419816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 177917 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 116.75-21 chr10 43651086 43651297 + 0.75 NA intron (NR_038867, intron 1 of 4) intron (NR_038867, intron 1 of 4) -2310 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 114.25-149 chr5 92111385 92111616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -728183 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 221.5-87 chr7 17749010 17749389 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -190290 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 154.75-33 chr13 49072851 49073107 + 0.75 NA intron (NM_001079673, intron 2 of 25) L1MA4|LINE|L1 -37338 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 219.5-142 chrX 84040242 84040605 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 147512 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 124.25-197 chr8 62404023 62404261 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 155288 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 125-154 chr7 147278025 147278287 + 0.75 NA intron (NM_014141, intron 7 of 22) intron (NM_014141, intron 7 of 22) 99965 NR_031645 100313895 NR_031645 ENSG00000221442 MIR548F4 MIR548F-4|MIRN548F4|hsa-mir-548f-4 microRNA 548f-4 ncRNA 130.75-207 chr9 128581716 128582108 + 0.75 NA intron (NM_003127, intron 12 of 55) intron (NM_003127, intron 12 of 55) 29325 NM_001195532 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 196.5-103 chr3 84778505 84778854 + 0.75 NA intron (NR_033860, intron 10 of 20) intron (NR_033860, intron 10 of 20) 90896 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 174.75-11 chr1 240621269 240621562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9260 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 125.75-187 chr8 117004836 117005159 + 0.75 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) L1MB8|LINE|L1 54022 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 144.25-224 chrX 96693375 96693683 + 0.75 NA intron (NM_007309, intron 1 of 26) intron (NM_007309, intron 1 of 26) 8687 NM_006729 1730 Hs.226483 NM_006729 ENSG00000147202 DIAPH2 DIA|DIA2|DRF2|POF|POF2|POF2A diaphanous related formin 2 protein-coding 222.25-86 chr8 31415413 31415911 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -224090 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 125.25-170 chr6 55614465 55614763 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35400 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 159.5-209 chr8 122265183 122265470 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 303318 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 142.25-64 chr15 62841651 62841940 + 0.75 NA 3' UTR (NM_015059, exon 56 of 56) 3' UTR (NM_015059, exon 56 of 56) 17838 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 129.25-223 chrX 52569713 52569995 + 0.75 NA Intergenic HERV1_I-int|LTR|ERV1 -52633 NM_001097604 653067 Hs.112208 NM_020411 ENSG00000204382 XAGE1B CT12.1|CT12.1C|CT12.1D|CT12.1E|CT12.1b|CTP9|GAGED2|XAGE-1|XAGE1|XAGE1C|XAGE1D|XAGE1E X antigen family member 1B protein-coding 115.5-125 chr2 84847771 84848036 + 0.75 NA intron (NM_001307978, intron 2 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 33181 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 182.75-66 chr2 113139975 113140371 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 12575 NM_173842 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 147.75-77 chr2 164007363 164007668 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -271507 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 117.25-37 chr11 36706740 36706919 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -108550 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 143-21 chr11 80964421 80964732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -201773 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 123.75-53 chr13 112755410 112755688 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_046661) promoter-TSS (NR_046661) -818 NR_109811 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 188.75-93 chr5 126241268 126241692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43695 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 170-93 chr7 125726638 125727131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -462593 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 204-86 chr9 30268812 30269220 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 139438 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 196.25-21 chr11 131948338 131948681 + 0.75 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) intron (NR_147849, intron 2 of 6) 37691 NR_147851 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 148.25-47 chr15 85025314 85025704 + 0.75 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) intron (NM_173454, intron 1 of 20) 43535 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 185.75-44 chr14 62625207 62625668 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 420021 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 146-51 chr17 19711264 19711513 + 0.75 NA intron (NR_135625, intron 5 of 15) AluSx1|SINE|Alu 5196 NM_001256663 146802 Hs.126830 NM_152908 ENSG00000180638 SLC47A2 MATE2|MATE2-B|MATE2-K|MATE2K solute carrier family 47 member 2 protein-coding 187.5-24 chr11 7480086 7480395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5266 NM_001370500 283298 Hs.503500 NM_198474 ENSG00000183801 OLFML1 MVAL564|UNQ564 olfactomedin like 1 protein-coding 161.5-174 chr7 78693653 78693955 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -315184 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 125.5-189 chr4 78648006 78648287 + 0.75 NA intron (NR_038307, intron 1 of 2) intron (NR_038307, intron 1 of 2) 2152 NR_038305 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 152.75-127 chr5 15488194 15488503 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -11832 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 118.5-158 chr5 13061650 13061823 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -28850 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 217-3 chr1 186844880 186845306 + 0.75 NA intron (NM_024420, intron 1 of 17) AluSx1|SINE|Alu 16144 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 121.5-214 chr5 146029902 146030163 + 0.75 NA intron (NM_152550, intron 5 of 9) intron (NM_152550, intron 5 of 9) 75545 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 136.75-117 chr20 44447650 44447867 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 2799 NR_109893 101927242 Hs.143307 NR_109893 ENSG00000168746 LINC01430 - long intergenic non-protein coding RNA 1430 ncRNA 147.5-87 chr19 28353293 28353544 + 0.75 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -253270 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 209.5-53 chr17 54467611 54468098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -432837 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 143.5-67 chr14 59624898 59625147 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) 5792 NM_206852 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 172.75-2 chr1 73984624 73985091 + 0.75 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 213319 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 133-175 chr8 122057390 122057699 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -416104 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 189.75-91 chr5 85824006 85824420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -458231 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 146-31 chr13 26579911 26580138 + 0.75 NA intron (NM_006646, intron 1 of 9) MER30|DNA|hAT-Charlie 22321 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 175-83 chr22 41818155 41818548 + 0.75 NA intron (NM_024821, intron 6 of 6) MER68|LTR|ERVL -14754 NR_103834 6721 Hs.443258 NM_004599 ENSG00000198911 SREBF2 SREBP-2|SREBP2|bHLHd2 sterol regulatory element binding transcription factor 2 protein-coding 138-147 chr6 133832336 133832716 + 0.75 NA intron (NR_027030, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 11379 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 126.75-162 chr3 187119026 187119318 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 20324 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 195.5-104 chr4 34405346 34405749 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -135800 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 129.75-63 chr14 61999684 61999947 + 0.75 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 72120 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 208.75-59 chr4 36024755 36025133 + 0.75 NA intron (NR_146893, intron 35 of 36) intron (NR_146893, intron 35 of 36) 218995 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 217.25-75 chr7 8313987 8314277 + 0.75 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 -51520 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 115.5-239 chr8 30105465 30105647 + 0.75 NA intron (NM_001128208, intron 3 of 3) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10148 NM_015344 23484 Hs.146585 NM_015344 ENSG00000104660 LEPROTL1 HSPC112|Vps55|my047 leptin receptor overlapping transcript like 1 protein-coding 142.5-206 chr7 38985399 38985610 + 0.75 NA intron (NR_138047, intron 4 of 6) intron (NR_138047, intron 4 of 6) 7595 NM_001166018 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 234-17 chr18 3113298 3113702 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 20 of 36) AluJb|SINE|Alu -101553 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 197.25-97 chr7 83848032 83848446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -199100 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 142.25-60 chr14 76878216 76878503 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 51951 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 122.25-49 chr12 120700518 120700831 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001303627, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001303627, exon 5 of 5) -9784 NM_001080533 84747 Hs.127610 NM_032661 ENSG00000175970 UNC119B POC7B unc-119 lipid binding chaperone B protein-coding 193.25-70 chr3 57430049 57430356 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 32 of 73) L1ME3Cz|LINE|L1 114142 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 140.25-182 chr7 137100578 137100815 + 0.75 NA intron (NR_046103, intron 1 of 3) intron (NR_046103, intron 1 of 3) 63645 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 173.75-97 chr20 19370010 19370517 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) intron (NM_020689, intron 2 of 16) -85667 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 266-9 chr13 96526913 96527397 + 0.75 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 99926 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 191.5-132 chr6 126856854 126857177 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -261656 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 114.5-68 chr12 44075533 44075751 + 0.75 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 239561 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 151.75-144 chr7 91155619 91155875 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -108686 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 133.5-199 chr5 23934453 23934794 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -16725 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 325.25-22 chr5 5442392 5443009 + 0.75 NA intron (NM_015325, intron 5 of 18) intron (NM_015325, intron 5 of 18) 20023 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 145.5-27 chr10 80476356 80476580 + 0.75 NA intron (NM_001351270, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 8205 NM_001351272 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 161.25-121 chr3 32901530 32901908 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49925 NM_005508 1233 Hs.184926 NM_005508 ENSG00000183813 CCR4 CC-CKR-4|CD194|CKR4|CMKBR4|ChemR13|HGCN:14099|K5-5 C-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 156-36 chr12 88341768 88342144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199649 NM_001366574 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 170.25-39 chr14 74845629 74846079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17980 NM_001080408 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 182.75-38 chr12 43546979 43547504 + 0.75 NA intron (NM_025003, intron 2 of 38) intron (NM_025003, intron 2 of 38) 4962 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 121.25-15 chr10 27234849 27235035 + 0.75 NA intron (NM_001301251, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu 5544 NM_001301252 91452 Hs.530597 NM_145698 ENSG00000107897 ACBD5 - acyl-CoA binding domain containing 5 protein-coding 131.75-81 chr16 35851351 35851582 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104914 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 212.75-29 chr13 112677316 112677705 + 0.75 NA intron (NM_207440, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 -12819 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 120-48 chr14 83485465 83485680 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 842940 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 125.5-255 chr8 101781773 101782068 + 0.75 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 9049 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 202-59 chr5 173215499 173215917 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 19498 NM_001166175 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 187.5-62 chr15 55550786 55551147 + 0.75 NA intron (NM_015617, intron 1 of 2) MER1B|DNA|hAT-Charlie 37379 NM_001330326 26108 Hs.87194 NM_015617 ENSG00000171016 PYGO1 - pygopus family PHD finger 1 protein-coding 210.75-19 chr11 70637158 70637688 + 0.75 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) intron (NM_133266, intron 2 of 10) 6329 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 191.75-55 chr19 14272033 14272400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61527 NR_134916 101928845 Hs.531617 NR_134916 ENSG00000267147 LINC01842 - long intergenic non-protein coding RNA 1842 ncRNA 216.25-36 chr15 50576442 50576941 + 0.75 NA intron (NR_149154, intron 30 of 37) intron (NR_149154, intron 30 of 37) -30025 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 131-96 chr2 148872898 148873278 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -2139 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 208-74 chr7 6460959 6461428 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006854, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_006854, exon 5 of 5) -13181 NM_001142936 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 184.75-91 chr7 3654297 3654666 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 353229 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 115.75-98 chr2 52955472 52955740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -252991 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 179-21 chr10 125638657 125639012 + 0.75 NA intron (NM_001318133, intron 3 of 3) intron (NM_001318133, intron 3 of 3) 44329 NM_001318133 387718 Hs.148259 NM_001128202 ENSG00000175018 TEX36 C10orf122|bA383C5.1 testis expressed 36 protein-coding 146-81 chr20 37078843 37079148 + 0.75 NA intron (NM_002895, intron 2 of 21) AluJb|SINE|Alu 17002 NM_002895 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 136-54 chr17 48069828 48070116 + 0.75 NA TTS (NM_001127228) TTS (NM_001127228) 21613 NM_003204 4779 Hs.514284 NM_003204 ENSG00000082641 NFE2L1 LCR-F1|NRF1|TCF11 nuclear factor, erythroid 2 like 1 protein-coding 123.25-115 chr2 229167405 229167642 + 0.75 NA intron (NM_001100818, intron 1 of 2) L1MC4a|LINE|L1 64569 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 128.75-146 chr4 99169653 99169953 + 0.75 NA intron (NR_037884, intron 3 of 9) L1PB3|LINE|L1 -8156 NR_028270 359806 Hs.537400 NR_028270 PCNAP1 p1PCNA proliferating cell nuclear antigen pseudogene 1 pseudo 117.75-127 chr22 25425892 25426119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22082 NR_033734 1416 Hs.571835 NR_033733 ENSG00000100058 CRYBB2P1 CRYB2B crystallin beta B2 pseudogene 1 pseudo 118-96 chr2 197209057 197209297 + 0.75 NA intron (NM_153697, intron 1 of 9) intron (NM_153697, intron 1 of 9) 11186 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 384.25-10 chr2 153517779 153518741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39498 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 115.75-7 chr1 167355563 167355856 + 0.75 NA intron (NM_001365849, intron 3 of 16) FLAM_C|SINE|Alu 26639 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 119.5-151 chr3 87634329 87634618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158233 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 181-40 chr17 58751371 58751872 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4233 NM_014906 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 123.75-142 chr5 18482028 18482288 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 674884 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 172.25-117 chr5 141982811 141983122 + 0.75 NA intron (NM_001201365, intron 6 of 8) intron (NM_001201365, intron 6 of 8) 13861 NM_183398 9604 Hs.483616 NM_004290 ENSG00000013561 RNF14 ARA54|HFB30|HRIHFB2038|TRIAD2 ring finger protein 14 protein-coding 199.5-137 chr7 33108818 33109140 + 0.75 NA intron (NM_203288, intron 1 of 5) intron (NM_203288, intron 1 of 5) 425 NM_203288 6100 Hs.326805 NM_203288 ENSG00000164610 RP9 PAP-1|PAP1 RP9 pre-mRNA splicing factor protein-coding 199.25-66 chr22 24561717 24562259 + 0.75 NA intron (NR_103819, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 5989 NM_004175 6634 Hs.356549 NM_004175 ENSG00000100028 SNRPD3 SMD3|Sm-D3 small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide protein-coding 154.75-111 chr5 19073914 19074197 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 812217 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 167.5-55 chr13 95000261 95000592 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 40385 NR_047487 100861544 Hs.48706 NR_047487 ENSG00000260962 LINC00557 - long intergenic non-protein coding RNA 557 ncRNA 142.75-39 chr11 72949895 72950161 + 0.75 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) L1MB5|LINE|L1 135617 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 172-93 chr5 112453556 112453948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34169 NR_027706 54508 Hs.591264 NR_027706 ENSG00000278921 EPB41L4A-DT EPB41L4A-AS2 EPB41L4A divergent transcript ncRNA 114.25-141 chr4 87452951 87453250 + 0.75 NA intron (NM_024047, intron 6 of 7) AluSq2|SINE|Alu 30503 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 194.25-22 chr12 38745348 38745772 + 0.75 NA intron (NM_153634, intron 10 of 19) AluJr|SINE|Alu 160031 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 120.25-218 chr8 133021458 133021720 + 0.75 NA intron (NM_003235, intron 39 of 47) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 24992 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 150.25-166 chr9 122028465 122028681 + 0.75 NA intron (NM_194252, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 65033 NM_001139442 158135 Hs.438937 NM_194252 ENSG00000175764 TTLL11 C9orf20|bA244O19.1 tubulin tyrosine ligase like 11 protein-coding 164.25-2 chr1 32311309 32311657 + 0.75 NA intron (NM_004964, intron 2 of 13) intron (NM_004964, intron 2 of 13) 19400 NM_004964 3065 Hs.88556 NM_004964 ENSG00000116478 HDAC1 GON-10|HD1|KDAC1|RPD3|RPD3L1 histone deacetylase 1 protein-coding 139.25-40 chr12 58425699 58425947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -165879 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 158-42 chr12 65951203 65951513 + 0.75 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -69033 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 124.75-181 chr6 50054565 50054771 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4739 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 153-105 chr4 93036935 93037240 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 732688 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 147.25-28 chr12 106008717 106008951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131199 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 171-35 chr14 43562287 43562516 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 944882 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 154-66 chr2 50047271 50047538 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) LTR86A1|LTR|ERVL -73201 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 171.5-158 chr8 140205139 140205376 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -104722 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 150.25-133 chr6 123896967 123897327 + 0.75 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 93282 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 138-24 chr12 55589563 55589960 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 15346 NM_001258285 121129 Hs.742584 NM_001258285 ENSG00000179615 OR2AP1 OR2AP1P olfactory receptor family 2 subfamily AP member 1 protein-coding 242.25-91 chrX 103100721 103101154 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7794 NM_022052 56000 Hs.60386 NM_022052 ENSG00000147206 NXF3 - nuclear RNA export factor 3 protein-coding 203.5-137 chr8 88725317 88725701 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -398026 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 129-131 chr4 100012169 100012389 + 0.75 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 61785 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 233.5-85 chr5 59459546 59459986 + 0.75 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) -102796 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 202.5 chr1 33202064 33202551 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20264 NM_018207 55223 Hs.656006 NM_018207 ENSG00000116525 TRIM62 DEAR1 tripartite motif containing 62 protein-coding 179.25-53 chr15 40095228 40095716 + 0.75 NA intron (NM_001003943, intron 3 of 3) intron (NM_001003943, intron 3 of 3) 10614 NM_001003942 90427 Hs.591104 NM_033503 ENSG00000104081 BMF - Bcl2 modifying factor protein-coding 225-31 chr16 47406465 47406878 + 0.75 NA intron (NM_030790, intron 6 of 17) L2a|LINE|L2 54392 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 178.5-179 chr8 71141824 71142156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 214716 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 133.25-190 chr6 159182951 159183225 + 0.75 NA intron (NM_032532, intron 1 of 22) intron (NM_032532, intron 1 of 22) -13081 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 229-13 chr11 113494059 113494471 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -18867 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 167.25-99 chr22 19265822 19266276 + 0.75 NA intron (NM_007098, intron 2 of 32) AluJr|SINE|Alu 25670 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 184.25-70 chr2 233850190 233850644 + 0.75 NA intron (NM_018410, intron 3 of 8) intron (NM_018410, intron 3 of 8) 4118 NM_018410 55355 Hs.532968 NM_018410 ENSG00000123485 HJURP FAKTS|URLC9|hFLEG1 Holliday junction recognition protein protein-coding 142.25-82 chr2 21511406 21511840 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 199029 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 142.5-3 chr1 18650048 18650239 + 0.75 NA intron (NM_001135254, intron 4 of 8) intron (NM_001135254, intron 4 of 8) 19297 NM_013945 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 144.5-17 chr1 180181264 180181623 + 0.75 NA intron (NM_002826, intron 5 of 11) intron (NM_002826, intron 5 of 11) 26574 NM_002826 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 157-18 chr11 80124098 80124419 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 638545 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 162-94 chr5 128378030 128378326 + 0.75 NA intron (NM_001999, intron 12 of 64) intron (NM_001999, intron 12 of 64) 160067 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 132.25-174 chr7 80250291 80250544 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 114633 NM_001256414 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 192-20 chr10 100180929 100181228 + 0.75 NA intron (NR_144755, intron 2 of 11) intron (NR_144755, intron 2 of 11) 4951 NM_001347860 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 191.25-12 chr10 69647554 69647855 + 0.75 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 17457 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 140-166 chr8 61675920 61676130 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001164756, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001164756, exon 5 of 5) 13786 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 117.75-9 chr1 109441963 109442176 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15621 NM_001199773 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 173.5-3 chr1 77463962 77464392 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 8 of 13) MER61A|LTR|ERV1 181090 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 166-112 chr6 140841900 140842383 + 0.75 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie 158327 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 141-108 chr3 130666795 130667034 + 0.75 NA intron (NM_001102608, intron 35 of 35) L1MEd|LINE|L1 79915 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 190.25-62 chr2 48332717 48333259 + 0.75 NA intron (NM_002158, intron 2 of 6) intron (NM_002158, intron 2 of 6) 18306 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 131.5-65 chr14 74104566 74104809 + 0.75 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L1MC5|LINE|L1 19734 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 203-13 chr10 69628863 69629215 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1208 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 165-105 chr4 55886635 55886978 + 0.75 NA intron (NM_178237, intron 10 of 17) intron (NM_178237, intron 10 of 17) 33156 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 187.75-49 chr2 84730798 84731131 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 61 of 76) L1M4b|LINE|L1 150120 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 130.25-65 chr15 53720358 53720588 + 0.75 NA intron (NM_182758, intron 3 of 19) L1MEd|LINE|L1 39190 NM_182758 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 132-63 chr16 21319490 21319795 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -16580 NM_001888 1428 Hs.924 NM_001888 ENSG00000103316 CRYM DFNA40|THBP crystallin mu protein-coding 112.25-63 chr14 70815877 70816173 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -6512 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 139.5-169 chr5 24967114 24967337 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -126642 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 157.5-89 chr18 40631397 40631675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 565250 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 116.75-162 chr5 20260238 20260567 + 0.75 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) MLT1E1A-int|LTR|ERVL-MaLR -45149 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 194.25-96 chr5 156568738 156569199 + 0.75 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) intron (NM_001128209, intron 3 of 7) 241804 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 180-92 chr4 76616416 76616791 + 0.75 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) L1MB3|LINE|L1 41052 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 139.25-213 chrX 5317704 5317937 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -684248 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 141-69 chr2 9780168 9780403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63157 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 166-52 chr18 42969033 42969348 + 0.75 NA intron (NM_001272077, intron 3 of 5) intron (NM_001272077, intron 3 of 5) 146495 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 135.5-64 chr15 56966964 56967238 + 0.75 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) AluSx1|SINE|Alu 47656 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 116.5-197 chr5 41000926 41001237 + 0.75 NA intron (NM_173489, intron 37 of 41) intron (NM_173489, intron 37 of 41) 70261 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 146.25-113 chr4 166682689 166683071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 551546 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 222.75-66 chr20 6693119 6693577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42788 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 152.25-122 chr4 169482149 169482511 + 0.75 NA intron (NM_001199400, intron 20 of 32) AluJr|SINE|Alu 130253 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 163.25-94 chr3 63284125 63284391 + 0.75 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 5950 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 140.75-40 chr12 128583860 128584075 + 0.75 NA intron (NM_001136103, intron 3 of 8) intron (NM_001136103, intron 3 of 8) 239991 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 155.75-153 chr7 87764470 87764932 + 0.75 NA intron (NM_138290, intron 7 of 11) L1PB4|LINE|L1 -51378 NM_001348945 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 112.5-46 chr12 14897440 14897617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11674 NM_001190839 4256 Hs.365706 NM_000900 ENSG00000111341 MGP GIG36|MGLAP|NTI matrix Gla protein protein-coding 166.75-41 chr13 103424385 103424746 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_126374) promoter-TSS (NR_126374) -635 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 317.25-9 chr12 34520281 34520866 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 498077 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 174.5-167 chr7 6209623 6210203 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) L1MC2|LINE|L1 -37776 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 206.25-102 chr7 36114330 36114906 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 19308 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 241.25-3 chr1 44846553 44846947 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3497 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 162.75-40 chr15 83181697 83182023 + 0.75 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 25963 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 159.25-50 chr16 78429941 78430262 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 6 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 330447 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 112.5-35 chr11 78876454 78876681 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 9 of 33) L2c|LINE|L2 -301703 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 127-180 chr8 137313114 137313496 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 100283 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 257.5-16 chr12 81686965 81687622 + 0.75 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) L2c|LINE|L2 71214 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 185.75-135 chr9 80104265 80104599 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 129409 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 173-84 chr3 65135708 65136196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -447952 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 113.5-64 chr13 49298372 49298593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50557 NM_030911 81602 Hs.388220 NM_030911 ENSG00000102543 CDADC1 NYD-SP15|bA103J18.1 cytidine and dCMP deaminase domain containing 1 protein-coding 214.75-10 chr10 28662530 28663074 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14719 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 121-121 chr22 28565145 28565328 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 105367 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 140.25-18 chr10 16760948 16761326 + 0.75 NA intron (NM_152724, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu 56287 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 141.5-238 chr8 127188689 127188998 + 0.75 NA intron (NR_120364, intron 1 of 2) AluYj4|SINE|Alu 8784 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 158.75-139 chr5 73364286 73364636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26555 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 214-37 chr2 232695681 232696025 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -1478 NM_001103148 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 145.25-154 chr7 5546642 5547009 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -16224 NM_001101 60 Hs.520640 NM_001101 ENSG00000075624 ACTB BRWS1|PS1TP5BP1 actin beta protein-coding 152.75-26 chr10 99286677 99286893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42314 NM_001345889 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 144-90 chr4 38493858 38494179 + 0.75 NA non-coding (NR_110951, exon 2 of 8) non-coding (NR_110951, exon 2 of 8) -15749 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 143-11 chr10 95343148 95343461 + 0.75 NA intron (NM_001034955, intron 24 of 30) AluSp|SINE|Alu -52301 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 190.75-66 chr3 110908106 110908405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161704 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 268.25-34 chr4 31661769 31662408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155544 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 133-18 chr11 21085271 21085626 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) AluJr4|SINE|Alu 415862 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 129.5-143 chr20 22750244 22750457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65006 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 122.75-161 chr5 64619251 64619609 + 0.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 43780 NM_001271891 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 175-95 chr5 13613096 13613501 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 331182 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 167.75-56 chr17 59071460 59071738 + 0.75 NA intron (NR_148346, intron 8 of 23) intron (NR_148346, intron 8 of 23) 35281 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 118-132 chr4 79447568 79447893 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -39502 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 130.5-191 chr4 148544396 148544728 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -99864 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 259.75-45 chr6 77063075 77063605 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 400682 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 138.5-206 chr9 27855163 27855549 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -281490 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 222-72 chr6 74321285 74321688 + 0.75 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 252035 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 126-71 chr16 79681832 79682158 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -81258 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 277.75-21 chr3 20094490 20095118 + 0.75 NA intron (NM_003884, intron 2 of 17) intron (NM_003884, intron 2 of 17) -42761 NR_036086 100422901 NR_036086 ENSG00000266745 MIR3135A MIR3135|hsa-mir-3135a microRNA 3135a ncRNA 123-148 chr4 62990496 62990821 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -828893 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-195 chr7 36884553 36884770 + 0.75 NA intron (NR_038120, intron 2 of 5) intron (NR_038120, intron 2 of 5) 34771 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 139.25-46 chr13 67871456 67871799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 499240 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 153-17 chr11 11847557 11847840 + 0.75 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) L2a|LINE|L2 6275 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 202.75-46 chr17 69524794 69525478 + 0.75 NA intron (NM_001330450, intron 9 of 11) MIR3|SINE|MIR 22874 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 155.75-112 chr3 177856097 177856547 + 0.75 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 39457 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 187-99 chr8 80678591 80678934 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 4 of 8) intron (NM_001033723, intron 4 of 8) 192536 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 112.5-49 chr12 26188708 26188899 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6533 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 130.75-124 chr3 135835266 135835512 + 0.75 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -130339 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 130.75-89 chr2 66695633 66695831 + 0.75 NA TTS (NR_110156) TTS (NR_110156) 7495 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 254.25-64 chr7 137499889 137500418 + 0.75 NA intron (NM_001321710, intron 21 of 32) intron (NM_001321710, intron 21 of 32) -156420 NM_002825 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 117.5-51 chr12 105647693 105648015 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -56349 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 116.5-267 chr9 110602459 110602710 + 0.75 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -22843 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 134.75-55 chr12 112040690 112040880 + 0.75 NA intron (NM_024953, intron 20 of 23) intron (NM_024953, intron 20 of 23) -3070 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 187-114 chrX 123631637 123631996 + 0.75 NA exon (NM_001081550, exon 22 of 39) exon (NM_001081550, exon 22 of 39) 101236 NM_001081550 57187 Hs.149991 NM_020449 ENSG00000125676 THOC2 CXorf3|MRX12|MRX35|THO2|dJ506G2.1|hTREX120 THO complex 2 protein-coding 249.75-29 chr18 13526059 13526634 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 66399 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 125.5-103 chr16 78988246 78988530 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) LTR33|LTR|ERVL 612349 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 177.5-38 chr12 132328699 132329124 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_120467) promoter-TSS (NR_120467) 678 NM_001122636 50614 Hs.301062 NM_021808 ENSG00000182870 GALNT9 GALNAC-T9|GALNACT9 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 protein-coding 125.5-41 chr11 56474822 56475149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4447 NM_001004742 219482 Hs.553631 NM_001004742 ENSG00000174937 OR5M3 OR11-191 olfactory receptor family 5 subfamily M member 3 protein-coding 128-148 chr7 43801995 43802290 + 0.75 NA intron (NM_001253823, intron 7 of 8) AluSx|SINE|Alu 43462 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 172.5-32 chr10 70065905 70066362 + 0.75 NA intron (NM_018649, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 13287 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 191.25-115 chr9 84348245 84348617 + 0.75 NA intron (NM_022127, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR -7673 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 143.5-123 chr2 186469440 186469783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16649 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 268.5-59 chr8 75240251 75240812 + 0.75 NA intron (NR_103849, intron 1 of 1) intron (NR_103849, intron 1 of 1) 37950 NR_103848 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 139.5-162 chr4 175925101 175925306 + 0.75 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 77488 NM_001261447 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 155.75-54 chr15 38854183 38854536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157761 NR_160786 170.25-20 chr11 108108518 108108981 + 0.75 NA TTS (NM_003478) TTS (NM_003478) -12818 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 119.5-100 chr17 48462861 48463121 + 0.75 NA intron (NR_110804, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 18158 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 175-117 chr7 8141394 8141905 + 0.75 NA intron (NM_001350836, intron 11 of 14) intron (NM_001350836, intron 11 of 14) 120403 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 276-33 chr3 194255561 194256021 + 0.75 NA intron (NR_125402, intron 3 of 3) intron (NR_125402, intron 3 of 3) -5638 NR_125403 100505920 Hs.436654 NR_125403 ENSG00000225742 LINC02036 - long intergenic non-protein coding RNA 2036 ncRNA 170.25-22 chr11 110207645 110207969 + 0.75 NA intron (NM_001260493, intron 14 of 15) MER58B|DNA|hAT-Charlie 88905 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 171-114 chr5 115402469 115402740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105950 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 230.25-84 chr8 123265954 123266378 + 0.75 NA intron (NM_001017926, intron 2 of 3) intron (NM_001017926, intron 2 of 3) 8120 NM_001204180 100533106 Hs.707401 NM_001204180 ENSG00000259305 ZHX1-C8orf76 - ZHX1-C8orf76 readthrough protein-coding 132.5-240 chr8 84907324 84907683 + 0.75 NA intron (NM_001287244, intron 7 of 7) MIRb|SINE|MIR -199735 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 131.5-206 chr6 94563528 94563863 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 845392 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 152.25 chr1 41394170 41394526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18679 NR_135817 101929901 NR_135817 ENSG00000229901 LOC101929901 - uncharacterized LOC101929901 ncRNA 182.75-18 chr1 234707377 234707827 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16440 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 117.75-156 chr4 59615007 59615199 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 601530 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 262.75-56 chr8 142622242 142622864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8074 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 210.5-119 chr7 22812327 22812700 + 0.75 NA TTS (NM_019059) TTS (NM_019059) 10336 NM_019059 54543 Hs.112318 NM_019059 ENSG00000196683 TOMM7 TOM7 translocase of outer mitochondrial membrane 7 protein-coding 119.75-35 chr11 112179219 112179617 + 0.75 NA exon (NM_001256398, exon 2 of 10) exon (NM_001256398, exon 2 of 10) 3052 NM_001256400 83875 Hs.728325 NM_031938 ENSG00000197580 BCO2 B-DIOX-II|BCDO2 beta-carotene oxygenase 2 protein-coding 204.5-2 chr1 96707327 96707765 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14059 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 122.5-53 chr13 75854866 75855094 + 0.75 NA intron (NM_001366632, intron 26 of 27) intron (NM_001366632, intron 26 of 27) -16058 NM_001257995 729420 Hs.586820 NM_001257995 LMO7DN C13orf45 LMO7 downstream neighbor protein-coding 150.75-4 chr1 29146517 29146867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22789 NM_001003682 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 166.5-195 chr7 130695145 130695444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7862 NM_001304968 114960 Hs.592266 NM_052933 ENSG00000213265 TSGA13 - testis specific 13 protein-coding 165.25-67 chr2 77937058 77937316 + 0.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 17839 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 204.25-116 chr8 79249683 79250052 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -82321 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 160.5-140 chr4 170877109 170877411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133525 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 140.5-208 chr7 13230444 13230678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 542928 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 155.5-102 chr2 154297526 154297900 + 0.75 NA intron (NM_052917, intron 8 of 12) L2c|LINE|L2 159725 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 154.5-88 chr19 34428101 34428331 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_005499) promoter-TSS (NM_005499) -165 NM_005499 10054 Hs.631580 NM_005499 ENSG00000126261 UBA2 ARX|HRIHFB2115|SAE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 2 protein-coding 120.75-13 chr1 230653657 230653997 + 0.75 NA intron (NM_007357, intron 1 of 17) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 11346 NM_001145036 22796 Hs.211800 NM_007357 ENSG00000135775 COG2 CDG2Q|LDLC component of oligomeric golgi complex 2 protein-coding 133.5-280 chr9 76840484 76840789 + 0.75 NA intron (NM_001308048, intron 4 of 17) intron (NM_001308048, intron 4 of 17) 65451 NR_131751 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 149.25-82 chr2 67416133 67416483 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 18975 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 126.75-52 chr14 45280737 45281086 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27709 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 126.5-253 chr8 129463149 129463360 + 0.75 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 20888 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 164.25-149 chr7 40102714 40103025 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 31753 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 161.75-84 chr3 88998129 88998386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109364 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 113.5-247 chr9 78865881 78866154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 279649 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 177.75-20 chr11 10313538 10313937 + 0.75 NA intron (NR_103765, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 5424 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 264.5-15 chr12 14462758 14463171 + 0.75 NA intron (NM_181352, intron 9 of 14) intron (NM_181352, intron 9 of 14) 77683 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 166.5-43 chr11 85976496 85976827 + 0.75 NA exon (NM_001206947, exon 17 of 19) exon (NM_001206947, exon 17 of 19) 92423 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 128.25-106 chr2 179926101 179926303 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -64590 NR_148054 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 169.25-98 chr5 118310639 118311045 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 28268 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 209-33 chr18 39220311 39220691 + 0.75 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) intron (NR_024391, intron 3 of 3) 401674 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 257.75-2 chr1 153075651 153076138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4283 NM_001017418 6701 Hs.568239 NM_001017418 ENSG00000196805 SPRR2B - small proline rich protein 2B protein-coding 171.75-91 chr20 63143003 63143417 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -35290 NR_029670 406909 NR_029670 ENSG00000207598 MIR124-3 MIRN124-3|MIRN124A3|mir-124-3 microRNA 124-3 ncRNA 115.25-131 chr3 44514479 44514829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4037 NM_001287349 285346 Hs.648974 NM_001287349 ENSG00000178917 ZNF852 - zinc finger protein 852 protein-coding 265.25-38 chr4 40749012 40749681 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001330648) promoter-TSS (NM_001330648) -609 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 116.25-44 chr12 12797191 12797416 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 11644 NM_030817 81575 Hs.23388 NM_030817 ENSG00000178878 APOLD1 VERGE apolipoprotein L domain containing 1 protein-coding 181.5-171 chrX 45448878 45449273 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -56313 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 140.75-137 chr4 76271845 76272134 + 0.75 NA intron (NM_001242939, intron 5 of 6) intron (NM_001242939, intron 5 of 6) 20268 NM_001136570 100129583 Hs.720509 NM_001136570 ENSG00000189157 FAM47E - family with sequence similarity 47 member E protein-coding 151.25-169 chr7 29039730 29040027 + 0.75 NA intron (NM_001371256, intron 15 of 16) intron (NM_001371256, intron 15 of 16) 59911 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 167.25-71 chr18 11551055 11551546 + 0.75 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -58258 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 124.75-124 chr2 191962455 191962656 + 0.75 NA intron (NM_001305134, intron 7 of 9) intron (NM_001305134, intron 7 of 9) -115467 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 148.75-42 chr12 71138541 71138918 + 0.75 NA intron (NM_001369760, intron 3 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 19080 NM_001369760 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 181.75-139 chr9 36597237 36597641 + 0.75 NA intron (NM_001256691, intron 4 of 15) intron (NM_001256691, intron 4 of 15) 24544 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 225.75-36 chr2 53879003 53879460 + 0.75 NA intron (NM_014614, intron 41 of 46) L1MC5a|LINE|L1 -19198 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 119-194 chr8 74921770 74921969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62636 NM_031461 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 190.5-129 chr5 118367408 118367749 + 0.75 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 85004 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 180.75-69 chr2 157044380 157044832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213099 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 157-49 chr2 9933752 9934124 + 0.75 NA exon (NM_005680, exon 15 of 15) exon (NM_005680, exon 15 of 15) -17755 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 128.5-102 chr2 27749561 27749916 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21979 NM_145330 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 203-82 chr5 60391176 60391536 + 0.75 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -18693 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 134-69 chr16 54859074 54859381 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -10994 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 121.5-117 chr18 53078817 53079114 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 7 of 28) intron (NM_005215, intron 7 of 28) -158136 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 136-52 chr17 31613607 31614056 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 38420 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 197.75 chr1 70651559 70651871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54738 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 120.5-212 chr7 22421800 22422016 + 0.75 NA intron (NM_207342, intron 4 of 4) intron (NM_207342, intron 4 of 4) -64754 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 135.75-113 chr2 204426072 204426276 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -119301 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 188.75-60 chr2 142965548 142965966 + 0.75 NA intron (NM_001199241, intron 9 of 14) intron (NM_001199241, intron 9 of 14) 88093 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 149.25-158 chr6 114288417 114288700 + 0.75 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -225681 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 116-52 chr15 61626757 61627018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103031 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 119.25-139 chr4 27295926 27296267 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 78617 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 137.5-147 chr21 23886183 23886593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 434989 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 198.75-48 chr2 140986459 140986976 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 17 of 90) L2c|LINE|L2 -400032 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 198.25-20 chr11 23118451 23118826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -258164 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 164-40 chr15 60664104 60664546 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -17244 NR_120319 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 137.25-8 chr1 178974878 178975242 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -50744 NM_001324310 9917 Hs.5737 NM_014864 ENSG00000116199 FAM20B gxk1 FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase protein-coding 183-44 chr18 9344104 9344401 + 0.75 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) L1MB7|LINE|L1 9479 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 156.5-92 chr2 201893539 201893844 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001261435, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001261435, exon 14 of 14) 87112 NM_001366386 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 117.25-222 chr9 21632191 21632501 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -72548 NR_152878 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 121.5-247 chr8 111439098 111439349 + 0.75 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) intron (NR_146282, intron 2 of 3) 62584 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 189.5-38 chr12 56831904 56832291 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68773 NM_003725 8630 Hs.524513 NM_003725 ENSG00000025423 HSD17B6 HSE|RODH|SDR9C6 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 6 protein-coding 167.5-161 chr6 56635169 56635450 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 21 of 94) L2a|LINE|L2 7580 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 249.75-59 chr8 23627777 23628402 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 54800 NM_001256339 4824 Hs.55999 NM_006167 ENSG00000167034 NKX3-1 BAPX2|NKX3|NKX3.1|NKX3A NK3 homeobox 1 protein-coding 231-4 chr1 186903324 186903665 + 0.75 NA intron (NM_001311193, intron 5 of 15) MER1A|DNA|hAT-Charlie 74545 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 150.5-87 chr2 41187343 41187639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -675056 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 132-4 chr1 111808344 111808553 + 0.75 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 48457 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 177.5-164 chr7 93272098 93272370 + 0.75 NA intron (NM_001257998, intron 11 of 28) intron (NM_001257998, intron 11 of 28) 39868 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 354.5-13 chr4 58222238 58222992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313713 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 121.5-161 chr21 27328295 27328642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -361380 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 245.25-35 chr2 29837341 29837872 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) L1MEc|LINE|L1 83980 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 229-5 chr1 187032687 187033197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59900 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 120-72 chr17 38943632 38943913 + 0.75 NA intron (NM_001008777, intron 7 of 10) intron (NM_001008777, intron 7 of 10) 18604 NR_038847 100505576 Hs.634043 NR_038847 ENSG00000263874 LINC00672 - long intergenic non-protein coding RNA 672 ncRNA 205.25-46 chr19 29123540 29123878 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 89442 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 146-15 chr10 44335999 44336312 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43405 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 225.25-70 chr6 44983634 44984034 + 0.75 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) intron (NM_181356, intron 8 of 12) 213936 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 144.25-175 chr6 147683516 147683921 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 175028 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 148-125 chr8 9193972 9194263 + 0.75 NA intron (NR_125431, intron 2 of 3) intron (NR_125431, intron 2 of 3) 5118 NR_125431 101929128 NR_125431 ENSG00000248538 LOC101929128 - uncharacterized LOC101929128 ncRNA 177.25-60 chr17 82781773 82782237 + 0.75 NA intron (NM_005993, intron 7 of 38) intron (NM_005993, intron 7 of 38) 29940 NM_005993 6904 Hs.464391 NM_005993 ENSG00000141556 TBCD PEBAT|SSD-1|tfcD tubulin folding cofactor D protein-coding 131.5-16 chr1 190941037 190941313 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 287323 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 146.25-45 chr15 86848479 86848714 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -84284 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 197.5-70 chr2 100340324 100340766 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17812 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 200.5-50 chr16 83780511 83780860 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 11 of 12) (TCTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 23291 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 162-82 chr4 43122777 43123126 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 229685 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 126.5-135 chr20 47410058 47410287 + 0.75 NA intron (NR_146494, intron 1 of 3) AluSq|SINE|Alu 1222 NR_146495 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 152.5-147 chr5 34891790 34892257 + 0.75 NA intron (NM_001317949, intron 9 of 10) intron (NM_001317949, intron 9 of 10) 23481 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 212.5-82 chr4 163619433 163619825 + 0.75 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) L1ME4b|LINE|L1 -6095 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 119-94 chr2 197230463 197230635 + 0.75 NA intron (NM_153697, intron 1 of 9) intron (NM_153697, intron 1 of 9) 32558 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 136.5-97 chr19 51881277 51881564 + 0.75 NA intron (NM_001370450, intron 1 of 5) intron (NM_001370450, intron 1 of 5) 6516 NM_001135590 84765 Hs.723015 NM_032679 ENSG00000161551 ZNF577 - zinc finger protein 577 protein-coding 130.75-154 chr5 24130323 24130608 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 179117 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 274.5-11 chr11 76844664 76845446 + 0.75 NA Intergenic Merlin1_HS|DNA|Merlin -15863 NM_001300954 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 264.75-25 chr20 35762148 35762851 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9516 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 153-3 chr1 162447347 162447603 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -35339 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 114.75-78 chr18 70224170 70224324 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -18560 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 118-193 chr8 123376460 123376759 + 0.75 NA intron (NM_014109, intron 2 of 27) L1MB7|LINE|L1 19838 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 126.75-236 chr8 30968946 30969169 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -56049 NM_001350162 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 128-68 chr2 26825996 26826382 + 0.75 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -21943 NM_020134 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 200.75-86 chr5 109138145 109138621 + 0.75 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) L1MA9|LINE|L1 187986 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 154.75-4 chr1 110344904 110345345 + 0.75 NA intron (NM_001201545, intron 1 of 1) intron (NM_001201545, intron 1 of 1) 5801 NM_022768 64783 Hs.435947 NM_022768 ENSG00000162775 RBM15 OTT|OTT1|SPEN RNA binding motif protein 15 protein-coding 143-54 chr17 45208723 45209050 + 0.75 NA intron (NR_147507, intron 2 of 2) FLAM_C|SINE|Alu 12879 NR_147507 339192 Hs.560498 NR_147507 ENSG00000267121 LOC339192 - uncharacterized LOC339192 ncRNA 270.5-52 chr5 62043698 62044294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262166 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 201.25-75 chr5 144616983 144617294 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 411747 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 227.5-105 chr8 86887069 86887734 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 1 of 10) intron (NM_173538, intron 1 of 10) 20986 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 138-167 chr8 131093964 131094311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53228 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 160-111 chr8 90454164 90454599 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 151682 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 116-47 chr14 54087236 54087414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130434 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 117.5-231 chr8 67029495 67029675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1031 NM_001364912 286187 Hs.583933 NM_001013626 ENSG00000178125 PPP1R42 LRRC67|TLLR|TLRR|dtr protein phosphatase 1 regulatory subunit 42 protein-coding 196-84 chr6 51541755 51542354 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79816 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 162-57 chr2 17298512 17298764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 219802 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 211.75-78 chr5 117172492 117172956 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242788 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 157-3 chr1 51210034 51210265 + 0.75 NA intron (NR_147076, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 24947 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 161.75-10 chr1 199391426 199391694 + 0.75 NA non-coding (NR_147896, exon 4 of 4) non-coding (NR_147896, exon 4 of 4) 242962 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 128.75-168 chr6 57239203 57239412 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16993 NR_103822 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 122.75-117 chr21 24785039 24785303 + 0.75 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -55379 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 288-37 chr4 117024092 117024764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61148 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 152.5-185 chr8 54035098 54035442 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -12822 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 265.25-52 chr7 28730544 28731166 + 0.75 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) MIRc|SINE|MIR 44722 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 133.25-200 chr7 45692509 45692786 + 0.75 NA intron (NM_021116, intron 14 of 19) L1MA9|LINE|L1 76371 NR_024271 641977 Hs.723477 NR_024271 ENSG00000214765 SEPTIN7P2 SEPT13|SEPT7B|SEPT7P2 septin 7 pseudogene 2 pseudo 145.5-173 chr6 67372864 67373080 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -682379 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 166.25-58 chr16 64766516 64766800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 355405 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 128.25-114 chr20 52145419 52145681 + 0.75 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu -40066 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 113-156 chr6 39297711 39298022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16553 NM_001135111 89822 Hs.162282 NM_031460 ENSG00000124780 KCNK17 K2p17.1|TALK-2|TALK2|TASK-4|TASK4 potassium two pore domain channel subfamily K member 17 protein-coding 154-114 chr5 174228918 174229156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107317 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 222-58 chr4 54469980 54470452 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 136915 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 115.75-134 chr22 32095783 32096018 + 0.75 NA intron (NM_000343, intron 11 of 14) L1PB1|LINE|L1 -26077 NR_040114 23782 Hs.581098 NR_040114 ENSG00000234479 AP1B1P1 ADTB1L1|dJ127L4.2 AP1B1 pseudogene 1 pseudo 136.5-16 chr1 230295037 230295351 + 0.75 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 131138 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 226.25-61 chr5 153365296 153365655 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -125049 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 172.75-64 chr2 120513019 120513272 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -46796 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 116-156 chr7 92586551 92586787 + 0.75 NA intron (NM_001040057, intron 1 of 11) intron (NM_001040057, intron 1 of 11) 3380 NM_001288584 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 116.75-111 chr20 64059929 64060090 + 0.75 NA intron (NM_198723, intron 1 of 10) intron (NM_198723, intron 1 of 10) 3037 NM_198723 6919 Hs.505004 NM_003195 ENSG00000171703 TCEA2 TFIIS transcription elongation factor A2 protein-coding 201.75-65 chr4 52327633 52328063 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 276544 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 172.5-209 chr8 140876238 140876651 + 0.75 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) L1ME3F|LINE|L1 124560 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 316.75-21 chr8 96009109 96009768 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61090 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 189-65 chr2 194728659 194729095 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1718 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 140.75-62 chr16 28539372 28539592 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_012385) promoter-TSS (NM_012385) -508 NM_001042483 26471 Hs.513463 NM_012385 ENSG00000176046 NUPR1 COM1|P8 nuclear protein 1, transcriptional regulator protein-coding 198.25-50 chr2 12453306 12453726 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 254386 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 139.5-178 chr5 64942541 64942780 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 173730 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 178.5-61 chr16 58373682 58374017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18622 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 158-56 chr16 75296740 75297077 + 0.75 NA intron (NM_006324, intron 6 of 6) intron (NM_006324, intron 6 of 6) -28901 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 139.75-149 chr5 107704085 107704396 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -33303 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 185.75-72 chr20 35935004 35935313 + 0.75 NA intron (NM_016436, intron 15 of 17) intron (NM_016436, intron 15 of 17) 19468 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 174.25-18 chr10 62152946 62153259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 103745 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 195-7 chr10 16576700 16577097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55019 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 166.5-78 chr16 67597629 67597875 + 0.75 NA intron (NM_001191022, intron 2 of 9) intron (NM_001191022, intron 2 of 9) 26979 NM_001363916 10664 Hs.368367 NM_006565 ENSG00000102974 CTCF MRD21 CCCTC-binding factor protein-coding 140.75-75 chr18 76838506 76838825 + 0.75 NA intron (NM_007345, intron 1 of 30) intron (NM_007345, intron 1 of 30) 14505 NM_007345 7776 Hs.719137 NM_007345 ENSG00000130856 ZNF236 ZNF236A|ZNF236B zinc finger protein 236 protein-coding 161-103 chr5 152256085 152256336 + 0.75 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 149069 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 125.5-252 chr8 83253282 83253530 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -150352 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 126.75-88 chr17 39768475 39768803 + 0.75 NA intron (NM_001257413, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 9586 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 156-164 chr9 35595784 35595993 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -9374 NM_001318230 7016 Hs.708096 NM_006285 ENSG00000107140 TESK1 - testis associated actin remodelling kinase 1 protein-coding 299.25-30 chr21 29301197 29302095 + 0.75 NA intron (NM_206866, intron 1 of 4) intron (NM_206866, intron 1 of 4) 2271 NM_206866 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 147.5-215 chr8 131784431 131784736 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -119510 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 173-140 chr8 80443401 80443757 + 0.75 NA Intergenic Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -42014 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 220.75-60 chr6 18481654 18482217 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -40812 NR_149116 105374956 Hs.561599 NR_149116 MIR548A1HG - MIR548A1 host gene ncRNA 157.25-77 chr2 75502106 75502487 + 0.75 NA intron (NM_032181, intron 3 of 3) intron (NM_032181, intron 3 of 3) -21772 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 181.5-126 chr4 152319003 152319315 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -18496 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-186 chr8 72443754 72444106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93295 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 126.25-52 chr14 69171727 69172003 + 0.75 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -18668 NM_001284206 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 196.75-61 chr2 119331287 119331715 + 0.75 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) L1MEc|LINE|L1 35241 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 203.25-111 chr8 128445181 128445626 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) AluSp|SINE|Alu 119276 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 131-10 chr1 182273045 182273299 + 0.75 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) L1MD2|LINE|L1 40889 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 117.25-155 chr4 61761515 61761807 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) AluJr|SINE|Alu 400104 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 179.25-99 chr3 61220742 61221028 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 1 of 9) intron (NM_001320900, intron 1 of 9) 30567 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 160.5-43 chr13 34327276 34327540 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -20635 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 140.75-33 chr11 124265805 124266140 + 0.75 NA TTS (NM_001005198) TTS (NM_001005198) 1145 NM_001005198 219865 Hs.722725 NM_001005198 ENSG00000255298 OR8G5 OR11-298|OR8G5P|OR8G6 olfactory receptor family 8 subfamily G member 5 protein-coding 152-109 chr4 36513839 36514209 + 0.75 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) LTR79|LTR|ERVL -87596 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 126.25-139 chr4 128066949 128067295 + 0.75 NA intron (NR_146772, intron 1 of 19) intron (NR_146772, intron 1 of 19) 5810 NM_001278604 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 127-5 chr1 164139265 164139532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -419962 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 144.5-233 chr9 32517879 32518107 + 0.75 NA intron (NM_014314, intron 1 of 17) LOR1-int|LTR|ERV1 8203 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 145.75-145 chr7 10392236 10392490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -310313 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 152.25-118 chr4 113621464 113621718 + 0.75 NA intron (NM_001221, intron 3 of 18) intron (NM_001221, intron 3 of 18) 140147 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 126.25-150 chr5 37545743 37545949 + 0.75 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 166528 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 173.5-107 chr4 31836723 31837093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160471 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 181.25-68 chr2 176957570 176957933 + 0.75 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 254660 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 309-49 chr8 106672206 106673075 + 0.75 NA intron (NM_181354, intron 1 of 13) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 14832 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 151-45 chr17 32783374 32783765 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) intron (NM_015194, intron 1 of 21) 93555 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 143.75-79 chr19 14310290 14310520 + 0.75 NA intron (NR_134908, intron 3 of 3) MER74B|LTR|ERVL -23338 NR_134916 101928845 Hs.531617 NR_134916 ENSG00000267147 LINC01842 - long intergenic non-protein coding RNA 1842 ncRNA 184-68 chr5 11762472 11762827 + 0.75 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 141797 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 209-2 chr1 81584853 81585319 + 0.75 NA intron (NM_001366008, intron 3 of 26) intron (NM_001366008, intron 3 of 26) -27384 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 176.25-27 chr11 92017569 92017923 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -207288 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 309.25-23 chr5 41282347 41282959 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21184 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 172.75-112 chr6 149771228 149771616 + 0.75 NA intron (NM_001360452, intron 2 of 7) intron (NM_001360452, intron 2 of 7) 21681 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 145-45 chr14 29813356 29813609 + 0.75 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 113614 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 124.5-209 chr7 53427862 53428031 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 383985 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 234.75-89 chr9 88553915 88554380 + 0.75 NA intron (NM_145283, intron 1 of 2) intron (NM_145283, intron 1 of 2) 18969 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 144.75-12 chr1 221645896 221646253 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 90826 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 157.25-67 chr2 21172291 21172556 + 0.75 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 48437 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 187.5-85 chr2 46111835 46112232 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) L1MC3|LINE|L1 -185374 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 186.75-109 chr8 48424655 48424997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126741 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 118-162 chr6 26170712 26171045 + 0.75 NA intron (NM_138720, intron 1 of 1) intron (NM_138720, intron 1 of 1) 12757 NM_021063 3017 Hs.591797 NM_021063 ENSG00000158373 HIST1H2BD H2B.1B|H2B/a|H2B/b|H2B/g|H2B/h|H2B/k|H2B/l|H2BFA|H2BFB|H2BFG|H2BFH|H2BFK|H2BFL|HIRIP2|HIST1H2BC|HIST1H2BE|HIST1H2BF|HIST1H2BG|HIST1H2BI|dJ221C16.6 histone cluster 1 H2B family member d protein-coding 161.5-93 chr2 33588183 33588425 + 0.75 NA intron (NM_001304538, intron 3 of 6) intron (NM_001304538, intron 3 of 6) 10995 NM_015475 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 187-95 chr8 60150681 60150974 + 0.75 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL 130573 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 135.75-148 chr3 134840368 134840725 + 0.75 NA intron (NM_004441, intron 1 of 15) intron (NM_004441, intron 1 of 15) 45286 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 147-30 chr14 60757907 60758279 + 0.75 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 23332 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 148.5-39 chr12 11456799 11457063 + 0.75 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) intron (NR_148969, intron 2 of 4) 29747 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 197.5-150 chr7 80396236 80396609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21983 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 112.75-5 chr1 56812907 56813114 + 0.75 NA intron (NM_001004303, intron 1 of 19) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 6394 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 166.25-30 chr11 33482160 33482565 + 0.75 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) L1M5|LINE|L1 106254 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 143-30 chr13 58173025 58173362 + 0.75 NA intron (NR_120416, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 7366 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 140.75-64 chr16 66732366 66732622 + 0.75 NA intron (NM_006141, intron 6 of 12) intron (NM_006141, intron 6 of 12) 19115 NM_006141 1783 Hs.369068 NM_006141 ENSG00000135720 DYNC1LI2 DNCLI2|LIC2 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 protein-coding 132.75-81 chr17 74102711 74103042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100802 NM_000999 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 178-90 chr6 151447052 151447450 + 0.75 NA intron (NM_017909, intron 1 of 11) intron (NM_017909, intron 1 of 11) 4875 NM_017909 55005 Hs.486835 NM_017909 ENSG00000155906 RMND1 C6orf96|COXPD11|RMD1|bA351K16|bA351K16.3 required for meiotic nuclear division 1 homolog protein-coding 167.5-115 chr22 34659209 34659434 + 0.75 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 338595 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 241.5-89 chr7 32498450 32498879 + 0.75 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) intron (NM_015060, intron 1 of 15) 3175 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 234-2 chr1 83820586 83820919 + 0.75 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 39794 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 129.5-9 chr1 150132221 150132445 + 0.75 NA intron (NR_103998, intron 13 of 13) intron (NR_103998, intron 13 of 13) -17101 NM_001304724 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 211.75-88 chr6 123874308 123874686 + 0.75 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 70632 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 273.75 chr1 7129934 7130506 + 0.75 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) AluSz|SINE|Alu 259534 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 148.5-236 chr8 132565304 132565620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3983 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 143-120 chr5 114481271 114481537 + 0.75 NA intron (NR_130785, intron 6 of 12) L1PA11|LINE|L1 47893 NM_170775 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 119.75-214 chrX 21072614 21072815 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -301704 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 154.25-71 chr18 71366066 71366350 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 212748 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 185-75 chr6 40968610 40968952 + 0.75 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 54499 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 170.5-83 chr19 56656561 56656987 + 0.75 NA non-coding (NR_163262, exon 6 of 6) non-coding (NR_163262, exon 6 of 6) 13615 NM_001193628 147670 Hs.336588 NM_001193628 ENSG00000268182 SMIM17 - small integral membrane protein 17 protein-coding 140.25-186 chr8 102245145 102245343 + 0.75 NA intron (NR_125415, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 5793 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 136.5-49 chr11 88745619 88745904 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 241185 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 221.75-53 chr4 114243647 114244201 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -264277 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 304-18 chr16 69691598 69692281 + 0.75 NA exon (NM_006599, exon 12 of 14) exon (NM_006599, exon 12 of 14) 16736 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 174.5-191 chr8 121782672 121782948 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -141370 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 113.75-176 chr7 54049093 54049255 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -237243 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 115.5-253 chr9 89108834 89109119 + 0.75 NA intron (NM_016848, intron 2 of 11) intron (NM_016848, intron 2 of 11) 69842 NM_016848 53358 Hs.292737 NM_016848 ENSG00000148082 SHC3 N-Shc|NSHC|RAI|SHCC SHC adaptor protein 3 protein-coding 117-105 chr20 50207636 50207792 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15645 NR_125739 101927559 Hs.442486 NR_125739 ENSG00000277449 CEBPB-AS1 - CEBPB antisense RNA 1 ncRNA 145.25-106 chr3 124704622 124704828 + 0.75 NA intron (NM_007064, intron 24 of 26) AluJb|SINE|Alu -25641 NR_033434 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 164.5-53 chr14 41002726 41003079 + 0.75 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 48191 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 193.25-29 chr12 126156354 126156872 + 0.75 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 60621 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 121.5-223 chr6 69162855 69163089 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) intron (NM_001704, intron 17 of 31) 527690 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 114.5-112 chr17 42383292 42383511 + 0.75 NA intron (NM_213662, intron 1 of 23) FLAM_C|SINE|Alu 5041 NM_001369518 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 140-89 chr20 48405972 48406294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46222 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 124.75-78 chr14 53992564 53992804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35793 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 149.75-106 chr22 19491574 19491862 + 0.75 NA intron (NM_001369291, intron 5 of 18) AluSz6|SINE|Alu 11798 NR_161281 8318 Hs.474217 NM_003504 ENSG00000093009 CDC45 CDC45L|CDC45L2|MGORS7|PORC-PI-1 cell division cycle 45 protein-coding 112.75-109 chr2 181663103 181663428 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -6158 NR_027690 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 155-13 chr10 44401625 44401927 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -16679 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 120.25-180 chr6 36265863 36266120 + 0.75 NA intron (NM_173676, intron 1 of 7) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -4469 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 113-17 chr1 240506160 240506335 + 0.75 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) intron (NM_022469, intron 1 of 1) 105908 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 116.5-93 chr17 59774638 59774809 + 0.75 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) AluJb|SINE|Alu -66543 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 121.5-111 chr18 8366388 8366673 + 0.75 NA intron (NR_024419, intron 1 of 3) intron (NR_024419, intron 1 of 3) 504 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 187.25-94 chr6 126000138 126000562 + 0.75 NA intron (NM_001031712, intron 7 of 12) intron (NM_001031712, intron 7 of 12) 13810 NM_001031712 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 139.25-20 chr10 67831343 67831657 + 0.75 NA intron (NM_021800, intron 1 of 4) intron (NM_021800, intron 1 of 4) 6679 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 269.75-57 chr9 34623360 34624020 + 0.75 NA exon (NM_001017363, exon 4 of 7) exon (NM_001017363, exon 4 of 7) -3167 NM_001281425 11258 Hs.511768 NM_007234 ENSG00000137100 DCTN3 DCTN-22|DCTN22 dynactin subunit 3 protein-coding 188.25-52 chr17 61636765 61637163 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -45745 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 189.75-96 chr5 169966940 169967326 + 0.75 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 13362 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 173.25-114 chr7 14337979 14338299 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -346714 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 161.25-106 chr20 45421240 45421506 + 0.75 NA intron (NM_001184729, intron 8 of 10) intron (NM_001184729, intron 8 of 10) -4137 NR_106870 102465487 NR_106870 ENSG00000273555 MIR6812 hsa-mir-6812 microRNA 6812 ncRNA 133-11 chr1 202941452 202941729 + 0.75 NA exon (NM_001290629, exon 9 of 9) exon (NM_001290629, exon 9 of 9) -12991 NM_001303051 59349 Hs.706793 NM_021633 ENSG00000117153 KLHL12 C3IP1|DKIR kelch like family member 12 protein-coding 120.5-109 chr2 21083722 21083981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39778 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 229.75-9 chr11 34384871 34385326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27088 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 294.5-23 chr2 184097386 184097980 + 0.75 NA Intergenic MER61D|LTR|ERV1 -281292 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 116.75-2 chr1 42663211 42663465 + 0.75 NA intron (NM_006347, intron 5 of 9) MIRc|SINE|MIR 4915 NM_006347 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 166-73 chr20 22488665 22489106 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -68242 NR_027089 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 299-19 chr2 167656808 167657251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161643 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 139.75-15 chr10 61942041 61942392 + 0.75 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) intron (NM_032199, intron 3 of 9) 40517 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 147.5-40 chr12 1960493 1960706 + 0.75 NA intron (NR_135060, intron 6 of 10) L1MA8|LINE|L1 -24023 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 186.25-120 chr8 82679553 82680119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -232268 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 136.25-184 chr8 8810932 8811152 + 0.75 NA intron (NM_004225, intron 1 of 2) intron (NM_004225, intron 1 of 2) 82588 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 155.75-130 chr5 31501437 31501747 + 0.75 NA intron (NM_013235, intron 10 of 34) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 30501 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 165.5-54 chr15 58283642 58283945 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 145412 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 155.75-168 chr9 28981396 28981644 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -92565 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 231.75-16 chr13 24921523 24921908 + 0.75 NA intron (NR_047594, intron 1 of 17) intron (NR_047594, intron 1 of 17) 1146 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 138.75-83 chr2 31725139 31725523 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 78649 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 174.5-65 chr14 72700064 72700543 + 0.75 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) MER45A|DNA|hAT-Tip100 183483 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 166.75-24 chr11 77037594 77037919 + 0.75 NA intron (NM_138706, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 3358 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 137.5-151 chr22 24732827 24733036 + 0.75 NA intron (NM_001008496, intron 14 of 20) intron (NM_001008496, intron 14 of 20) -31570 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 122-147 chr5 153953304 153953608 + 0.75 NA Intergenic MER121|DNA|hAT? -54469 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 132.75-147 chr5 9244988 9245264 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -191231 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 180.75-147 chr8 100285461 100285797 + 0.75 NA intron (NM_001353837, intron 2 of 9) intron (NM_001353837, intron 2 of 9) 16564 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 133.25-22 chr10 68199409 68199657 + 0.75 NA exon (NM_032578, exon 17 of 20) exon (NM_032578, exon 17 of 20) 32580 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 167.75-124 chr6 72893039 72893307 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 74580 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 294.25-16 chr19 30173087 30173674 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -199004 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 140.75-152 chr5 94724742 94725005 + 0.75 NA intron (NM_001297777, intron 16 of 19) intron (NM_001297777, intron 16 of 19) 106204 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 121.75-157 chr6 45146549 45146813 + 0.75 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 51089 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 218.25-14 chr10 97209382 97209762 + 0.75 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) L2b|LINE|L2 -23613 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 190-79 chr8 115913856 115914313 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245109 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 188.75-115 chr8 92106686 92107073 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3494 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 187.5-111 chr3 30883524 30884056 + 0.75 NA intron (NM_207359, intron 1 of 14) L1MB2|LINE|L1 10871 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 191.75-21 chr11 66911070 66911490 + 0.75 NA intron (NM_001040716, intron 3 of 22) MIRb|SINE|MIR -3327 NM_022172 5091 Hs.89890 NM_000920 ENSG00000173599 PC PCB pyruvate carboxylase protein-coding 194.75-5 chr1 95555576 95555990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45667 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 148.25-44 chr14 77694645 77694863 + 0.75 NA exon (NM_006020, exon 3 of 6) exon (NM_006020, exon 3 of 6) 13269 NM_006020 8846 Hs.94542 NM_006020 ENSG00000100601 ALKBH1 ABH|ABH1|ALKBH|alkB|hABH alkB homolog 1, histone H2A dioxygenase protein-coding 169.5-27 chr11 82753069 82753354 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -19347 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 199.75-71 chr4 96807077 96807423 + 0.75 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 496547 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 118.75-159 chr5 131914624 131914802 + 0.75 NA intron (NM_001303622, intron 7 of 12) intron (NM_001303622, intron 7 of 12) 30950 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 141-169 chrX 66379312 66379619 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 211715 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 190.25-63 chr2 66878465 66878744 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25832 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 174.75-21 chr11 109387226 109387592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34781 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 160-95 chr5 156169149 156169510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157428 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 308.25-14 chr18 5909997 5910467 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -14278 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 140.5-91 chr18 71244978 71245272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 333831 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 117.75-208 chr8 64503503 64503820 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 73602 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 217.75-61 chr5 127315973 127316341 + 0.75 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) intron (NM_001308119, intron 2 of 14) 25361 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 129.75-93 chr2 100308247 100308581 + 0.75 NA intron (NM_198461, intron 2 of 11) intron (NM_198461, intron 2 of 11) 14319 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 273-5 chr1 218373204 218373709 + 0.75 NA intron (NR_138149, intron 2 of 7) intron (NR_138149, intron 2 of 7) -27778 NR_046268 728463 Hs.568469 NR_046268 ENSG00000232480 TGFB2-AS1 - TGFB2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 254-45 chr8 104946164 104946705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -357410 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 190.75-73 chr4 53607049 53607567 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 14352 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 194.75-58 chr2 137028111 137028485 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 262753 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 257.75-46 chr7 39711982 39712563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21296 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 287.5-41 chr3 94365817 94366380 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 303037 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 211-8 chr10 39273646 39274031 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 577242 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 144.25-103 chr2 152432736 152433113 + 0.75 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 97750 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 220.5-56 chr2 163842036 163842472 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -106246 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 131.75-56 chr12 111484228 111484468 + 0.75 NA intron (NR_132311, intron 17 of 23) FLAM_C|SINE|Alu 49486 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 168.75-88 chr22 27841637 27841984 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -40054 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 146.5-205 chr7 38980835 38981206 + 0.75 NA non-coding (NR_138047, exon 7 of 7) non-coding (NR_138047, exon 7 of 7) 3111 NM_001166018 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 149.25-170 chr7 85090425 85090737 + 0.75 NA intron (NM_152754, intron 2 of 16) intron (NM_152754, intron 2 of 16) 31350 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 127-120 chr3 148567748 148568003 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -129996 NM_004835 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 207.25-90 chr7 53060208 53060615 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24778 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 140.75-93 chr2 125130909 125131163 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 986949 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 135.75-149 chr3 136369049 136369439 + 0.75 NA exon (NM_005862, exon 24 of 34) exon (NM_005862, exon 24 of 34) 118904 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 216.25-77 chr4 49119484 49120045 + 0.75 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 133122 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 125.25-126 chr22 27014326 27014567 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 46072 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 189.75-75 chr3 141874853 141875220 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1607 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 149.75-168 chr8 116816238 116816538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49864 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 118.5-24 chr10 92407648 92407883 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10896 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 133.75-94 chr2 29203731 29204001 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 26 of 28) HAL1|LINE|L1 20034 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 119-68 chr17 71882057 71882355 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 143773 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 117.75-91 chr19 29413365 29413597 + 0.75 NA intron (NR_040029, intron 2 of 9) intron (NR_040029, intron 2 of 9) 112271 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 174.25-58 chr15 83810880 83811445 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 5 of 29) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 157039 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 207.75-116 chr7 5206144 5206624 + 0.75 NA intron (NM_016003, intron 2 of 11) L1MC5a|LINE|L1 -7885 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 119-180 chr7 29604452 29604751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39068 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 138-90 chr20 59301238 59301661 + 0.75 NA exon (NM_001302456, exon 2 of 4) exon (NM_001302456, exon 2 of 4) 838 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 262.75-42 chr4 72013408 72014022 + 0.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -18089 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 177.25-5 chr1 117511573 117511895 + 0.75 NA intron (NM_006699, intron 12 of 12) L2a|LINE|L2 94036 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 131.25-40 chr12 32468721 32468942 + 0.75 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) AluSx1|SINE|Alu -17141 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 150.75-186 chr8 117168943 117169227 + 0.75 NA intron (NM_173851, intron 6 of 7) intron (NM_173851, intron 6 of 7) 34090 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 166.5-217 chrX 97148736 97149061 + 0.75 NA intron (NM_007309, intron 22 of 26) intron (NM_007309, intron 22 of 26) 264990 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 133.5-165 chr3 81318785 81319107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325078 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 212-35 chr19 52237682 52238178 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 15910 NR_106859 102466984 NR_106859 ENSG00000274380 MIR6801 hsa-mir-6801 microRNA 6801 ncRNA 221-82 chr8 140852704 140853238 + 0.75 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) MER77|LTR|ERVL -120318 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 179.75-64 chr2 199259094 199259520 + 0.75 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 198632 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 162-126 chr9 12153111 12153352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -540154 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 221.5-62 chr22 21068599 21068997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22852 NR_027006 400891 Hs.291198 NM_001013675 ENSG00000187905 LRRC74B - leucine rich repeat containing 74B protein-coding 154.75-38 chr14 43334964 43335462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1172070 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 184.25-59 chr2 79294272 79294664 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -134715 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 141.5-193 chr6 48021577 48021773 + 0.75 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 47014 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 126-9 chr1 114475773 114475975 + 0.75 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) AluJr|SINE|Alu 35329 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 139.25-116 chr3 16543038 16543317 + 0.75 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 6859 NR_103843 100996597 Hs.599432 NR_103843 ENSG00000233570 LINC00690 - long intergenic non-protein coding RNA 690 ncRNA 191.75-121 chr7 99972722 99973176 + 0.75 NA intron (NM_001185, intron 1 of 3) AluY|SINE|Alu 3082 NM_001185 563 Hs.546239 NM_001185 ENSG00000160862 AZGP1 ZA2G|ZAG alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding protein-coding 158.5-85 chr18 69747249 69747661 + 0.75 NA intron (NM_152721, intron 6 of 7) intron (NM_152721, intron 6 of 7) 200418 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 147.75-13 chr1 211396018 211396398 + 0.75 NA intron (NR_026761, intron 3 of 5) intron (NR_026761, intron 3 of 5) 13453 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 137-38 chr11 110466714 110467102 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36960 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 155.5-100 chr2 138240505 138240807 + 0.75 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 138772 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 225-58 chr5 50730300 50730627 + 0.75 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 63049 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 127.75-138 chr4 14201738 14201999 + 0.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 89900 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 174.5-159 chr6 44674416 44674712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122683 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 113.25-39 chr12 77971755 77971965 + 0.75 NA intron (NM_001024383, intron 5 of 39) intron (NM_001024383, intron 5 of 39) 140966 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 186.75-9 chr10 25786645 25787023 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 135122 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 120-94 chr2 128458864 128459085 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -140106 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 177.5-41 chr14 20053986 20054458 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5823 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 176.5-90 chr2 69719611 69719979 + 0.75 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu -22339 NM_001153 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 194.25-56 chr2 57395615 57396072 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -511808 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 182.25-78 chr3 76317332 76317710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -531972 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 160.25-83 chr21 29599366 29599637 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 3461 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 159.5-6 chr1 150227656 150228054 + 0.75 NA intron (NM_001280560, intron 3 of 4) intron (NM_001280560, intron 3 of 4) 6823 NM_001136479 81611 Hs.656466 NM_030920 ENSG00000143401 ANP32E LANP-L|LANPL acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E protein-coding 163.75-115 chr6 80854609 80854899 + 0.75 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 748083 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 125.5-80 chr14 60072576 60072861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19193 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 194.75-20 chr12 56539637 56540108 + 0.75 NA intron (NM_002898, intron 1 of 13) intron (NM_002898, intron 1 of 13) 18052 NM_002898 5939 Hs.505729 NM_002898 ENSG00000076067 RBMS2 SCR3 RNA binding motif single stranded interacting protein 2 protein-coding 225-11 chr10 18652240 18652643 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001351117) promoter-TSS (NM_001351117) -854 NM_001351118 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 189.75-88 chr5 21430066 21430408 + 0.75 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -29243 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 152-39 chr12 26801784 26802096 + 0.75 NA intron (NM_002223, intron 1 of 56) L1MEd|LINE|L1 31254 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 137.25-43 chr14 48161858 48162213 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -367021 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 150-43 chr14 68992181 68992533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12675 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 174-77 chr5 57698963 57699379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48511 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 168-10 chr1 213112100 213112408 + 0.75 NA intron (NR_146208, intron 3 of 10) intron (NR_146208, intron 3 of 10) 61013 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 118-146 chr5 41765117 41765454 + 0.75 NA intron (NR_157114, intron 12 of 15) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 78372 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 269.75-40 chr4 7812877 7813317 + 0.75 NA intron (NM_198595, intron 8 of 16) intron (NM_198595, intron 8 of 16) 59007 NR_026892 84740 Hs.663029 NM_032654 ENSG00000272620 AFAP1-AS1 AFAP1-AS|AFAP1AS AFAP1 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-213 chr6 140639984 140640231 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -43707 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 116.25-186 chr5 146307342 146307537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31400 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 160.75-104 chr3 116465455 116465700 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20090 NM_001318915 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 136.75-197 chr8 113070690 113070990 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) L1MA9|LINE|L1 306312 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 172-77 chr4 3114928 3115281 + 0.75 NA intron (NM_002111, intron 6 of 66) intron (NM_002111, intron 6 of 66) 40423 NM_002111 3064 Hs.518450 NM_002111 ENSG00000197386 HTT HD|IT15|LOMARS huntingtin protein-coding 209.25-77 chr3 34630533 34631149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 763182 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 236.25-33 chr16 79442796 79443327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157676 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 113.5-110 chr19 28645500 28645715 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MB7|LINE|L1 38919 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 122-88 chr2 41884753 41884974 + 0.75 NA intron (NR_033996, intron 1 of 2) MER20|DNA|hAT-Charlie 7308 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 117.5-17 chr1 200648263 200648544 + 0.75 NA intron (NM_001349804, intron 4 of 4) intron (NM_001349804, intron 4 of 4) 18348 NM_001320182 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 117.75-116 chr2 231493774 231493948 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 20478 NR_024079 151477 Hs.375211 NM_173513 ENSG00000181798 LINC00471 C2orf52 long intergenic non-protein coding RNA 471 ncRNA 270.5-54 chr6 89512333 89512911 + 0.75 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) intron (NM_001242809, intron 1 of 15) -49696 NM_001242811 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 133.75-183 chr8 30485734 30485975 + 0.75 NA intron (NM_001008710, intron 4 of 8) intron (NM_001008710, intron 4 of 8) -100453 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 177.25-84 chr21 21856447 21856773 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 109625 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 147.25-23 chr11 112528246 112528599 + 0.75 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 27380 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 177-93 chr7 44493906 44494264 + 0.75 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -3427 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 127.25-190 chr7 22010900 22011261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65181 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 112.75-167 chr5 109502045 109502248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92172 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 154.25-8 chr1 151217093 151217378 + 0.75 NA intron (NM_001135637, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 18683 NM_001135636 8394 Hs.655131 NM_003557 ENSG00000143398 PIP5K1A - phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 alpha protein-coding 341.5-14 chr2 163781542 163782041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45783 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 128.5-27 chr10 71901353 71901653 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -50252 NM_001042466 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 145.5-17 chr10 8025341 8025588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27027 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 160-59 chr2 157262075 157262453 + 0.75 NA intron (NM_014568, intron 1 of 9) intron (NM_014568, intron 1 of 9) 4559 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 345.5-16 chr17 16460160 16460838 + 0.75 NA intron (NM_001113567, intron 2 of 3) intron (NM_001113567, intron 2 of 3) 19273 NR_003054 692106 NR_003054 ENSG00000277512 SNORD65 HBII-135|SNORD65A small nucleolar RNA, C/D box 65 snoRNA 171.5-42 chr12 130079497 130079796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8311 NR_146538 105370078 NR_146538 LINC02419 - long intergenic non-protein coding RNA 2419 ncRNA 174.5-50 chr12 60519101 60519559 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 829960 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 249.75-36 chr2 203310838 203311433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17104 NM_001282932 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 258.75-60 chr5 103961059 103961603 + 0.75 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -398542 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 137.75-13 chr1 192492542 192492864 + 0.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -83070 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 139.75-163 chr7 46026383 46026757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105298 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 211.75-77 chr5 116815635 116815995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53606 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 143-58 chr18 6179190 6179444 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 12 of 16) intron (NM_001365769, intron 12 of 16) -77427 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-152 chr4 110294367 110294629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95883 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 121-152 chr5 9762908 9763113 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 5 of 12) intron (NR_027112, intron 5 of 12) -91367 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 173.75-30 chr10 116458843 116459227 + 0.75 NA intron (NM_001011709, intron 5 of 11) L2c|LINE|L2 31188 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 120-45 chr14 59939309 59939515 + 0.75 NA intron (NR_075071, intron 7 of 32) L2|LINE|L2 19699 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 131.75-42 chr11 114515147 114515407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44604 NM_152315 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 157.5-144 chr4 23119161 23119445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 405214 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 114.75 chr1 23734464 23734634 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -8817 NM_003198 6924 Hs.15535 NM_003198 ENSG00000011007 ELOA SIII|SIII p110|TCEB3|TCEB3A elongin A protein-coding 133.5-151 chr22 44452079 44452322 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 8873 NR_109966 101927526 Hs.339290 NR_109966 ENSG00000232655 LINC01656 - long intergenic non-protein coding RNA 1656 ncRNA 195.75-123 chr9 21766953 21767366 + 0.75 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -35477 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 157.25-49 chr16 8374446 8374692 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 215269 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 296.5-36 chr7 35515189 35515596 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 179743 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 128-78 chr2 115770317 115770577 + 0.75 NA intron (NM_001321912, intron 14 of 25) intron (NM_001321912, intron 14 of 25) 426632 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 153-94 chr3 83786449 83786705 + 0.75 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 1082998 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 134-96 chr2 114711435 114711656 + 0.75 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) MIR|SINE|MIR 122003 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 241-39 chr5 50721241 50721871 + 0.75 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 54142 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 121.5-245 chr8 100493578 100493833 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 66054 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 185.25-53 chr2 18776022 18776372 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -186617 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 210.75-54 chr22 40315352 40315761 + 0.75 NA intron (NM_015088, intron 18 of 20) intron (NM_015088, intron 18 of 20) -30944 NM_000026 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 126.25-143 chr5 12291096 12291347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -283636 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 134.25-158 chr6 84294135 84294417 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -66633 NM_014895 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 143.5-145 chr3 105954402 105954593 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -85096 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 131.5-195 chr5 163421665 163421860 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -15809 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 112.25-194 chr7 17785062 17785318 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 155304 NM_001350867 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 141.75-98 chr2 107495170 107495588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34040 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 180.75-89 chr3 30375047 30375530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -143580 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 147.25-138 chr8 47481107 47481356 + 0.75 NA intron (NM_001080394, intron 8 of 19) intron (NM_001080394, intron 8 of 19) -172857 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 189.25-86 chr3 182464466 182464802 + 0.75 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) L1MA5|LINE|L1 21728 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 147.25-50 chr17 72411416 72411770 + 0.75 NA intron (NR_036488, intron 3 of 3) intron (NR_036488, intron 3 of 3) 68782 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 215.25-102 chr7 73382418 73382999 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -51070 NM_003508 8326 Hs.647029 NM_003508 ENSG00000188763 FZD9 CD349|FZD3 frizzled class receptor 9 protein-coding 148-90 chr4 38724067 38724302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58806 NM_001195107 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 118.25-209 chr8 134910310 134910533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60486 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 162.5-195 chrX 49884203 49884492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4863 NM_001145073 389856 Hs.143587 NM_001145073 ENSG00000273820 USP27X MRX105|USP22L|USP27 ubiquitin specific peptidase 27 X-linked protein-coding 112.5-81 chr14 98771640 98771838 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60126 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 157.75-15 chr10 76859566 76859798 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -28362 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-80 chr17 39122751 39123012 + 0.75 NA intron (NM_020405, intron 2 of 13) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 28756 NM_020405 57125 Hs.125036 NM_020405 ENSG00000161381 PLXDC1 TEM3|TEM7 plexin domain containing 1 protein-coding 136-157 chr8 129728359 129728707 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -48294 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 223.25-42 chr20 559965 560371 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -16378 NM_177560 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 155.25-117 chr3 62182050 62182346 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 8 of 29) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 136749 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 217-12 chr11 15409144 15409657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -234485 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 141.25-128 chr5 20305560 20305797 + 0.75 NA non-coding (NR_146519, exon 1 of 2) non-coding (NR_146519, exon 1 of 2) 127 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-24 chr10 102865951 102866322 + 0.75 NA intron (NR_037644, intron 5 of 14) MIR3|SINE|MIR -3334 NM_020682 57412 Hs.720370 NM_020682 ENSG00000214435 AS3MT CYT19 arsenite methyltransferase protein-coding 196.5-22 chr10 63674119 63674661 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -152500 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 161-76 chr3 117795031 117795338 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104259 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 156.5-10 chr1 186438614 186438959 + 0.75 NA intron (NR_126002, intron 2 of 4) intron (NR_126002, intron 2 of 4) 3625 NR_126002 102724919 Hs.576493 NR_126002 ENSG00000229739 LOC102724919 - uncharacterized LOC102724919 ncRNA 133.25-67 chr16 22782438 22782664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31611 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 134.25-14 chr10 45662148 45662475 + 0.75 NA intron (NM_174890, intron 2 of 9) MIR3|SINE|MIR 10421 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 154.75-75 chr2 99782742 99782964 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) -292836 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 228-22 chr12 66233352 66233866 + 0.75 NA intron (NM_007199, intron 8 of 11) intron (NM_007199, intron 8 of 11) -17473 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 157.5-22 chr10 47410226 47410489 + 0.75 NA intron (NR_134500, intron 2 of 3) intron (NR_134500, intron 2 of 3) 3192 NR_134500 107001062 Hs.576719 NR_134500 LOC107001062 - uncharacterized LOC107001062 ncRNA 210-20 chr11 116000934 116001251 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -240892 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 187.75-44 chr19 51698676 51699044 + 0.75 NA intron (NR_024330, intron 1 of 7) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -5404 NR_108100 102238594 Hs.640185 NR_108100 ENSG00000269959 SPACA6P-AS LINC01129 SPACA6P antisense RNA ncRNA 209.5 chr1 9067544 9067895 + 0.75 NA intron (NM_003039, intron 1 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie 1916 NM_001328621 6518 Hs.530003 NM_003039 ENSG00000142583 SLC2A5 GLUT-5|GLUT5 solute carrier family 2 member 5 protein-coding 113.5-231 chr8 68516173 68516482 + 0.75 NA intron (NR_146187, intron 4 of 13) intron (NR_146187, intron 4 of 13) -184836 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 141.25-89 chr2 143144943 143145237 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 1 of 13) intron (NM_018460, intron 1 of 13) 15671 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 120.25-86 chr2 17376417 17376789 + 0.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 141837 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 167-22 chr10 79976733 79977144 + 0.75 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -27833 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 189.5-149 chr8 114053127 114053560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -616404 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 145.75-108 chr4 30769077 30769356 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 48847 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 171.5-96 chr21 29563171 29563638 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 14 of 16) intron (NM_000830, intron 14 of 16) -32636 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 175-130 chr8 93531172 93531473 + 0.75 NA intron (NR_033858, intron 6 of 10) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 169111 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 253.25-57 chr6 135456381 135456756 + 0.75 NA intron (NM_017651, intron 8 of 27) intron (NM_017651, intron 8 of 27) 41172 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 152.75-91 chr2 180433885 180434146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -258089 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 174.25-81 chr2 164419583 164419915 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 148746 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 147.25-159 chr9 79796636 79797130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27647 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 284.5-47 chr5 16607948 16608767 + 0.75 NA intron (NM_001034850, intron 1 of 8) intron (NM_001034850, intron 1 of 8) -7569 NR_109946 101929524 Hs.734029 NR_109946 ENSG00000246214 LOC101929524 - uncharacterized LOC101929524 ncRNA 123-44 chr13 93603706 93603916 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 254662 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 265.25-47 chr6 143893381 143893996 + 0.75 NA intron (NM_001013623, intron 4 of 7) AluY|SINE|Alu 29214 NM_001013623 153918 Hs.121188 NM_001013623 ENSG00000118491 ZC2HC1B C6orf94|FAM164B|dJ468K18.5 zinc finger C2HC-type containing 1B protein-coding 151.5-193 chr8 117931710 117932015 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -10949 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 113.25-83 chr2 29591400 29591619 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -116132 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 169-68 chr4 113998718 113999139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19281 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 128-61 chr18 12930415 12930702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17426 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 134.5-83 chr16 53786201 53786430 + 0.75 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 82159 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 133-169 chr8 73008301 73008619 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_003218) promoter-TSS (NM_003218) -404 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 161-107 chr6 62096626 62097053 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) L1MA6|LINE|L1 189386 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 147.25-49 chr17 68669679 68669939 + 0.75 NA intron (NR_110825, intron 2 of 4) intron (NR_110825, intron 2 of 4) 41655 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 202.5-89 chr22 46740864 46741171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2765 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 194-69 chr5 127390772 127391042 + 0.75 NA intron (NM_001308121, intron 5 of 13) MIR|SINE|MIR 100111 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 151-44 chr17 27069327 27069638 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 19759 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 307.5-37 chr3 94014930 94015446 + 0.75 NA exon (NM_001001850, exon 2 of 2) exon (NM_001001850, exon 2 of 2) 13409 NM_001001850 415117 Hs.679768 NM_001001850 ENSG00000178750 STX19 - syntaxin 19 protein-coding 214.25-14 chr11 129308389 129308811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25436 NR_145484 399975 NM_207431 LOC399975 - uncharacterized LOC399975 ncRNA 164.25-90 chr22 27855606 27855953 + 0.75 NA intron (NM_001284278, intron 10 of 11) intron (NM_001284278, intron 10 of 11) -54023 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 246.75-20 chr15 91086654 91087037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12743 NM_001323031 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 196.5-105 chr3 94586564 94586827 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -351568 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 245.75-10 chr11 121505879 121506354 + 0.75 NA intron (NM_003105, intron 6 of 47) L1MB7|LINE|L1 53802 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 171.25-37 chr12 77576694 77576975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -254060 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 232-10 chr11 16624870 16625488 + 0.75 NA intron (NM_001367872, intron 2 of 16) L1ME2|LINE|L1 113298 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 121-57 chr14 47450120 47450339 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -106983 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 118.5-61 chr15 64530251 64530485 + 0.75 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 30948 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 304-6 chr10 93519175 93519987 + 0.75 NA intron (NM_018131, intron 7 of 8) intron (NM_018131, intron 7 of 8) 22969 NM_001127182 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 172.25-136 chr7 112649407 112649788 + 0.75 NA intron (NR_110158, intron 5 of 7) L1MA9|LINE|L1 27216 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 126.25-153 chr5 51477204 51477572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 93940 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 253.75-50 chr5 143011155 143011534 + 0.75 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) L2a|LINE|L2 -142434 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-67 chr22 32778593 32779120 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -21960 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 234.25-35 chr2 183432543 183432979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 308318 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 204-43 chr20 43692735 43693053 + 0.75 NA intron (NM_001278610, intron 5 of 12) L1ME1|LINE|L1 25780 NM_002466 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 116.5-205 chr5 153127338 153127614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -155127 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 178.25-44 chr16 69270471 69270812 + 0.75 NA intron (NM_006750, intron 4 of 6) intron (NM_006750, intron 4 of 6) -40709 NM_013245 27183 Hs.128420 NM_013245 ENSG00000132612 VPS4A SKD1|SKD1A|SKD2|VPS4|VPS4-1 vacuolar protein sorting 4 homolog A protein-coding 123.25-109 chr2 157726975 157727261 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -98254 NM_001111033 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 150-93 chr3 99149422 99149671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247851 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 201-90 chrX 130865755 130866174 + 0.75 NA intron (NM_006375, intron 2 of 14) L2b|LINE|L2 37353 NM_182314 10495 Hs.171458 NM_006375 ENSG00000165675 ENOX2 APK1|COVA1|tNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 2 protein-coding 114.5-237 chr7 39111635 39111828 + 0.75 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) L3|LINE|CR1 -98164 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 178.5-145 chr5 113677316 113677700 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 163814 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 198.25-33 chr14 87910607 87911029 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 82364 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 163.5-195 chr7 110305143 110305422 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -345069 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 153.75-90 chr3 74297547 74297913 + 0.75 NA intron (NM_020872, intron 17 of 21) MER4C|LTR|ERV1 223410 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 160.25-24 chr12 53720564 53720832 + 0.75 NA intron (NM_001143682, intron 6 of 13) intron (NM_001143682, intron 6 of 13) 6754 NM_001143682 57658 Hs.156667 NM_020898 ENSG00000012822 CALCOCO1 Cocoa|PP13275|calphoglin calcium binding and coiled-coil domain 1 protein-coding 114-126 chr5 25526324 25526607 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 335512 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 218.5-4 chr1 39239237 39239873 + 0.75 NA intron (NM_012090, intron 2 of 92) intron (NM_012090, intron 2 of 92) 155388 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 127.25-76 chr18 64315069 64315279 + 0.75 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) L1MC1|LINE|L1 -55119 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 166-85 chr3 172557323 172557698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34080 NM_001190942 8743 Hs.478275 NM_003810 ENSG00000121858 TNFSF10 APO2L|Apo-2L|CD253|TL2|TNLG6A|TRAIL TNF superfamily member 10 protein-coding 180.5-97 chr3 83948994 83949447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 920355 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 204-79 chr8 64781112 64781543 + 0.75 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 17410 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 118.75-205 chr8 132597095 132597307 + 0.75 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) intron (NR_135913, intron 9 of 10) -35722 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 220.75 chr1 40230003 40230389 + 0.75 NA intron (NM_012421, intron 6 of 7) intron (NM_012421, intron 6 of 7) -17741 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 122.25-213 chrX 44907314 44907477 + 0.75 NA intron (NR_111960, intron 2 of 27) AluSq|SINE|Alu 34220 NM_001291418 7403 Hs.522616 NM_021140 ENSG00000147050 KDM6A KABUK2|UTX|bA386N14.2 lysine demethylase 6A protein-coding 171.25-89 chr22 17533192 17533464 + 0.75 NA intron (NM_001290046, intron 9 of 18) AluSg|SINE|Alu -30111 NM_001303484 83733 Hs.282982 NM_031481 ENSG00000182902 SLC25A18 GC2 solute carrier family 25 member 18 protein-coding 234.5-65 chr3 135863827 135864399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101615 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 193.25-20 chr11 72030406 72030930 + 0.75 NA intron (NR_104476, intron 3 of 24) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 16377 NR_104178 100128494 Hs.713607 NR_104178 ENSG00000251143 LOC100128494 - uncharacterized LOC100128494 ncRNA 165.75-133 chr5 40034481 40034784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17659 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 214-67 chr8 116124717 116125280 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 6 of 13) intron (NR_046215, intron 6 of 13) 200061 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 259.75-51 chr8 56944391 56944908 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49218 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 305.25-14 chr14 49482090 49482878 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 103896 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 115.75-236 chrX 114151842 114152172 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -213789 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 114-47 chr14 84041144 84041338 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -1230691 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 147.5-224 chrX 136193411 136193785 + 0.75 NA intron (NM_001369328, intron 2 of 7) intron (NM_001369328, intron 2 of 7) -3191 NM_001159701 2273 Hs.435369 NM_001449 ENSG00000022267 FHL1 FCMSU|FHL-1|FHL1A|FHL1B|FLH1A|KYOT|RBMX1A|RBMX1B|SLIM|SLIM-1|SLIM1|SLIMMER|XMPMA four and a half LIM domains 1 protein-coding 137.5-211 chr6 127215316 127215595 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51227 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 116.75-82 chr19 29950899 29951177 + 0.75 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) FLAM_C|SINE|Alu 8799 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 154.5-172 chr7 48235431 48235701 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 8 of 61) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 64108 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 209.5-122 chr5 63755091 63755424 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 207035 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 193.5-50 chr14 73462241 73462578 + 0.75 NA intron (NR_135251, intron 2 of 2) intron (NR_135251, intron 2 of 2) 1233 NR_135251 101928143 Hs.654609 NR_135251 ENSG00000284930 LOC101928143 - uncharacterized LOC101928143 ncRNA 177.75-116 chr5 127849793 127850201 + 0.75 NA intron (NM_001317938, intron 5 of 6) intron (NM_001317938, intron 5 of 6) 146608 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 127.75-207 chr9 76710553 76710849 + 0.75 NA non-coding (NR_131751, exon 7 of 16) non-coding (NR_131751, exon 7 of 16) -18286 NM_001308050 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 125.5-218 chr6 63125705 63125974 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 194138 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 125.75-143 chr4 156713666 156713894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258019 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 181.75-53 chr18 73907168 73907504 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 240498 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 145-162 chr8 139857909 139858147 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -154905 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 156.75-122 chr4 67171394 67171636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 250485 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 228.25-30 chr16 51305564 51305885 + 0.75 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -154452 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 215.25-56 chr22 45085562 45086195 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 66706 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 132.75-14 chr1 201401389 201401635 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -2188 NM_005558 3898 Hs.519035 NM_005558 ENSG00000159166 LAD1 LadA ladinin 1 protein-coding 118.25-194 chr8 40154763 40155077 + 0.75 NA 3' UTR (NM_020130, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_020130, exon 1 of 1) 1438 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 117.75-183 chr6 18733579 18733793 + 0.75 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 161902 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 142.5-123 chr20 16219942 16220163 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -234170 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 156-68 chr18 11030319 11030718 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 118244 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 245-54 chr4 126017746 126018254 + 0.75 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 510741 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 159.25-155 chr8 121413887 121414112 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -225347 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-174 chr5 105164553 105165015 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 65310 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 145.75-14 chr10 62278746 62279182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10120 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 173-105 chr5 19607133 19607469 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 6 of 12) L1MEg|LINE|L1 278971 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 187.5-110 chr3 30710338 30710724 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 103930 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 215.25-50 chr2 186638823 186639240 + 0.75 NA intron (NM_001145000, intron 8 of 27) intron (NM_001145000, intron 8 of 27) 38826 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 165.25-127 chr6 101527218 101527562 + 0.75 NA intron (NM_001166247, intron 1 of 16) intron (NM_001166247, intron 1 of 16) 128405 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 240.5-70 chr3 184036306 184036987 + 0.75 NA intron (NM_001145143, intron 4 of 7) intron (NM_001145143, intron 4 of 7) 3815 NM_001163646 200909 Hs.448004 NM_182537 ENSG00000186090 HTR3D 5HT3D 5-hydroxytryptamine receptor 3D protein-coding 162.25-3 chr1 35252634 35253061 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15862 NM_001350139 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 123.5-71 chr16 34582209 34582505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -200877 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 166.5-101 chr2 64526971 64527238 + 0.75 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) L1ME3Cz|LINE|L1 1591 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 125.5-183 chr3 122998301 122998540 + 0.75 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) MIRc|SINE|MIR -5147 NM_001256346 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 234.5-16 chr11 127157207 127157795 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90499 NR_120578 101929473 Hs.737523 NR_120578 ENSG00000255087 LOC101929473 - uncharacterized LOC101929473 ncRNA 120.75-123 chr4 48917051 48917265 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -10330 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 138.75-46 chr13 102589394 102589810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7384 NR_160411 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 142.25-121 chr4 65666664 65666878 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 1 of 16) intron (NM_001281767, intron 1 of 16) 2717 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 261.25-11 chr15 98170483 98170882 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -81929 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 196.25-24 chr12 37889315 37889671 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -427281 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 171.75-31 chr12 6308138 6308544 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2095 NM_018173 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 167.5-148 chr5 74655680 74655987 + 0.75 NA intron (NM_001292004, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR -14409 NM_003633 8507 Hs.104925 NM_003633 ENSG00000171617 ENC1 CCL28|ENC-1|KLHL35|KLHL37|NRPB|PIG10|TP53I10 ectodermal-neural cortex 1 protein-coding 186-59 chr3 83995995 83996400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 873378 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 143.25-172 chr7 122551168 122551537 + 0.75 NA intron (NM_001167940, intron 8 of 29) intron (NM_001167940, intron 8 of 29) 147765 NM_139175 168433 Hs.126730 NM_139175 ENSG00000188050 RNF133 - ring finger protein 133 protein-coding 166.5-34 chr11 19906207 19906527 + 0.75 NA intron (NM_182964, intron 6 of 37) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -116189 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 202.5-59 chr17 58095496 58095846 + 0.75 NA TTS (NM_080677) TTS (NM_080677) 12252 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 145.25-111 chr4 45950905 45951324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172940 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 225.25-87 chr8 120343282 120343797 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 44 of 47) intron (NM_021110, intron 44 of 47) 101611 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 178.5-34 chr12 41057572 41057997 + 0.75 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) -130536 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 244.75-13 chr11 6739754 6740300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18148 NR_003945 387751 Hs.494757 NR_003945 ENSG00000254838 GVINP1 GVIN1|GVIN1P|VLIG-1|VLIG1 GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 pseudo 139.25-49 chr14 55710515 55710834 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55571 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 169.75-44 chr13 104460038 104460358 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1005669 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 129.75-136 chr4 106840512 106840824 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 195645 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 132.25-18 chr1 184921804 184922107 + 0.75 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) intron (NM_052966, intron 1 of 13) 52553 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 136.25-109 chr20 47693398 47693619 + 0.75 NA intron (NM_198596, intron 4 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 92556 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 135.75-66 chr15 70657225 70657577 + 0.75 NA intron (NM_018003, intron 18 of 18) AluSz|SINE|Alu 22152 NR_126482 104548973 NR_126482 ENSG00000280515 SALRNA2 SAL-RNA2|XLOC_025931 senescence associated long non-coding RNA 2 ncRNA 150.25-167 chrX 9044236 9044493 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10237 NM_205849 171483 Hs.733351 NM_173696 ENSG00000177138 FAM9B TEX39B family with sequence similarity 9 member B protein-coding 203.75-35 chr15 56469998 56470365 + 0.75 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -5044 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 146.5-54 chr12 97387910 97388142 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74750 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 160.75-54 chr16 14381149 14381523 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -11070 NR_131191 105447648 Hs.554151 NR_131191 ENSG00000260009 LINC02130 - long intergenic non-protein coding RNA 2130 ncRNA 231.25-78 chr9 31913649 31914145 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -470706 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 170.75-114 chr6 38713242 38713562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1909 NM_001371 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 148.5-249 chr9 137225843 137226166 + 0.75 NA exon (NM_199001, exon 2 of 2) exon (NM_199001, exon 2 of 2) 830 NM_199001 375791 Hs.495540 NM_199001 ENSG00000197191 CYSRT1 C9orf169 cysteine rich tail 1 protein-coding 211-66 chr8 82516958 82517239 + 0.75 NA Intergenic MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR -395006 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 192.5-88 chr22 40843056 40843498 + 0.75 NA intron (NM_003932, intron 4 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 13362 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 131-120 chr3 133247978 133248171 + 0.75 NA non-coding (NR_110812, exon 3 of 3) non-coding (NR_110812, exon 3 of 3) 9047 NR_110812 101927455 Hs.570550 NR_110812 ENSG00000251011 TMEM108-AS1 - TMEM108 antisense RNA 1 ncRNA 234.75-82 chr8 40390990 40391463 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47863 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 150.25-78 chr2 146044136 146044386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -542796 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 271-10 chr13 51467454 51467940 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 14352 NR_103812 100507398 Hs.594897 NR_103812 ENSG00000236778 INTS6-AS1 - INTS6 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-8 chr1 112179732 112180148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 189404 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 183.75-66 chr21 29922922 29923219 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 16926 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 217.25-81 chr8 48301012 48301445 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -250339 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 126-29 chr11 15924513 15924812 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44959 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 114.5-174 chr3 46094547 46094766 + 0.75 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -67173 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 168.5-28 chr10 69245553 69245876 + 0.75 NA intron (NM_025130, intron 7 of 17) intron (NM_025130, intron 7 of 17) -13224 NR_120648 101928994 Hs.562925 NR_120648 ENSG00000229261 LOC101928994 - uncharacterized LOC101928994 ncRNA 136.5-150 chr3 95793246 95793597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110228 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 145.5-190 chr8 86088694 86088987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10070 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 176.25-126 chr7 40795783 40796116 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 183990 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 165.5-212 chrX 100586772 100587075 + 0.75 NA intron (NM_022144, intron 2 of 6) intron (NM_022144, intron 2 of 6) 1987 NM_022144 64102 Hs.132957 NM_022144 ENSG00000000005 TNMD BRICD4|CHM1L|TEM tenomodulin protein-coding 137.5-116 chr2 54922977 54923353 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 25 of 40) AluSp|SINE|Alu 87107 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 116.25-80 chr16 85694856 85695046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5997 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 159.25-81 chr3 31795315 31795647 + 0.75 NA intron (NM_001174060, intron 3 of 10) intron (NM_001174060, intron 3 of 10) 91268 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 113.75-171 chr7 10484582 10484831 + 0.75 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -217970 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 203.75-43 chr16 82552074 82552621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74622 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 181.5-157 chr8 76646942 76647356 + 0.75 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 -34098 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 209.25-40 chr17 31567066 31567410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7242 NR_029710 406968 NR_029710 ENSG00000207614 MIR193A MIRN193|MIRN193A|mir-193a microRNA 193a ncRNA 170.75-143 chr8 125458052 125458406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26020 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 189.25-18 chr11 100061458 100061733 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 9 of 23) intron (NM_001243270, intron 9 of 23) 505450 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 201.5-39 chr12 12640522 12640967 + 0.75 NA intron (NM_001310, intron 3 of 3) MER11A|LTR|ERVK 28868 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 187.25-78 chr4 6982276 6982627 + 0.75 NA intron (NM_020773, intron 3 of 13) L1ME1|LINE|L1 -4758 NM_001113363 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 149.25-184 chr8 100490915 100491194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68705 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 127.5-78 chr14 62438414 62438695 + 0.75 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -298581 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 132-32 chr11 94458678 94458973 + 0.75 NA intron (NM_001330347, intron 13 of 19) L1M3|LINE|L1 7755 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 180.25-4 chr1 230249274 230249770 + 0.75 NA intron (NM_004481, intron 9 of 15) intron (NM_004481, intron 9 of 15) 176810 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 270.5-2 chr1 69058040 69058627 + 0.75 NA intron (NR_146608, intron 1 of 4) MER39|LTR|ERV1 2435 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 159.75-99 chr22 27307280 27307570 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3226 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 142-111 chr3 153922685 153922966 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -160299 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 165.75-37 chr12 31514066 31514298 + 0.75 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -75741 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 121-35 chr11 25945697 25945858 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -243346 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 201.5-131 chr8 124324571 124324898 + 0.75 NA intron (NM_194291, intron 3 of 6) intron (NM_194291, intron 3 of 6) 47965 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 132.25-140 chr4 33507496 33507726 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 532282 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 179.5-80 chr18 13000419 13000785 + 0.75 NA intron (NM_032142, intron 2 of 44) intron (NM_032142, intron 2 of 44) 9240 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 138.25-183 chrX 100578564 100578853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6228 NM_022144 64102 Hs.132957 NM_022144 ENSG00000000005 TNMD BRICD4|CHM1L|TEM tenomodulin protein-coding 133.25-2 chr1 27448176 27448447 + 0.75 NA intron (NM_006990, intron 1 of 8) intron (NM_006990, intron 1 of 8) 41856 NM_001201404 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 170.75-63 chr2 34228428 34228747 + 0.75 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 161361 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 275-25 chr20 55711466 55711907 + 0.75 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -284489 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 142-124 chr4 179879415 179879717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1279583 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 123-115 chr2 219963515 219963812 + 0.75 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -57098 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 181.25-89 chr3 164362386 164362651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190962 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 279.25 chr1 3473684 3474240 + 0.75 NA intron (NM_014448, intron 8 of 14) intron (NM_014448, intron 8 of 14) 19297 NM_014448 27237 Hs.87435 NM_014448 ENSG00000130762 ARHGEF16 GEF16|NBR Rho guanine nucleotide exchange factor 16 protein-coding 123.75-105 chr20 53949214 53949416 + 0.75 NA intron (NM_001366297, intron 8 of 8) intron (NM_001366297, intron 8 of 8) -73606 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 139.75-152 chr5 155823943 155824323 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -502624 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 142-95 chr20 32940185 32940402 + 0.75 NA intron (NM_001143967, intron 22 of 26) L1MB8|LINE|L1 64140 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 159.75-166 chr7 118390065 118390421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165539 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 132.75-119 chr22 26010493 26010934 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 42 of 43) intron (NM_001318245, intron 42 of 43) -158749 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 141-65 chr19 5306328 5306601 + 0.75 NA intron (NM_002850, intron 1 of 37) intron (NM_002850, intron 1 of 37) 34348 NM_130854 5802 Hs.744928 NM_002850 ENSG00000105426 PTPRS PTPSIGMA|R-PTP-S|R-PTP-sigma protein tyrosine phosphatase receptor type S protein-coding 161.75-9 chr1 186488288 186488609 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -27334 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 186.5-42 chr15 72715771 72716102 + 0.75 NA intron (NM_033028, intron 5 of 15) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 29729 NM_033028 585 Hs.208681 NM_033028 ENSG00000140463 BBS4 - Bardet-Biedl syndrome 4 protein-coding 195.75-76 chr3 101068802 101069350 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75586 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 235-48 chr3 193961878 193962430 + 0.75 NA intron (NR_033944, intron 1 of 2) intron (NR_033944, intron 1 of 2) 32084 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 156-157 chr8 124017737 124018142 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 16 of 40) intron (NM_001039112, intron 16 of 40) 22843 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 122.75-115 chr21 21502463 21502681 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 16 of 18) intron (NM_001352592, intron 16 of 18) 234747 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 148.5-183 chr5 44572579 44572827 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -62421 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 276.25-39 chr7 6492220 6492699 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8307 NM_006854 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 154.75-99 chr3 121244620 121244965 + 0.75 NA intron (NM_001348343, intron 14 of 27) L1M4|LINE|L1 195152 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 217-19 chr14 31801668 31802036 + 0.75 NA intron (NM_001201573, intron 5 of 8) intron (NM_001201573, intron 5 of 8) 87283 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 127.75-166 chr6 10036564 10036907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -367767 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 142-81 chr2 43637890 43638087 + 0.75 NA intron (NM_172069, intron 1 of 29) intron (NM_172069, intron 1 of 29) 728 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 145.5-191 chr8 112010543 112010882 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -632781 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 144.75-149 chr6 139560065 139560462 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -85667 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 224.5-16 chr10 43194872 43195368 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001282862, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001282862, exon 13 of 13) 34619 NM_001282862 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 146.5-11 chr1 81154605 81154898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151441 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 216.75-38 chr2 46560145 46560484 + 0.75 NA intron (NM_012249, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 -17737 NM_001371281 114.75-24 chr10 81019037 81019303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 369373 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 184.5-105 chr3 186373571 186374024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11563 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 118-33 chr11 101883236 101883410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31687 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 167.5-85 chr2 20219359 20219729 + 0.75 NA intron (NM_001006946, intron 2 of 5) intron (NM_001006946, intron 2 of 5) 5586 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 135.25-213 chrX 14587561 14587887 + 0.75 NA intron (NM_002063, intron 4 of 8) L1PA16|LINE|L1 58188 NM_002063 2742 Hs.2700 NM_002063 ENSG00000101958 GLRA2 GLR glycine receptor alpha 2 protein-coding 173.25-63 chr2 232922817 232923178 + 0.75 NA intron (NM_001114090, intron 2 of 12) AluSq2|SINE|Alu 5154 NM_001114090 25791 Hs.97316 NM_019850 ENSG00000066248 NGEF ARHGEF27|EPHEXIN neuronal guanine nucleotide exchange factor protein-coding 123.5-158 chr5 24118426 24118669 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) L1MD2|LINE|L1 167199 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 114-131 chr5 56107043 56107246 + 0.75 NA intron (NM_024669, intron 10 of 11) intron (NM_024669, intron 10 of 11) 111977 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 166.25-85 chr2 204250356 204250790 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -294902 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 185.5-15 chr10 59889638 59890065 + 0.75 NA intron (NM_005436, intron 1 of 8) LTR33A_|LTR|ERVL 16705 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 165-39 chr14 57287711 57287961 + 0.75 NA intron (NR_026895, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 18865 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 115.5-189 chr4 73121132 73121356 + 0.75 NA intron (NM_032217, intron 19 of 33) intron (NM_032217, intron 19 of 33) -51485 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 135.75-31 chr10 115786955 115787238 + 0.75 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) intron (NM_207303, intron 27 of 28) 407693 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 112.75-32 chr11 2616532 2616839 + 0.75 NA non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) 83313 NR_002728 10984 Hs.604823 NR_002728 ENSG00000269821 KCNQ1OT1 KCNQ1-AS2|KCNQ10T1|Kncq1|KvDMR1|KvLQT1-AS|LIT1|NCRNA00012 KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1 ncRNA 173-52 chr16 13252586 13253129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 351259 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 175.75-122 chr7 104225504 104225841 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -17625 NM_181747 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 142.5-113 chr2 148237445 148237777 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -216007 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 138.5-145 chr4 46245644 46246003 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001330690, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001330690, exon 11 of 11) -121769 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 165.5-167 chr6 102604155 102604441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1205313 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 195.5-130 chr6 39264843 39265380 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -35636 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 280-43 chr5 41104822 41105352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33745 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 196.25-14 chr10 95677032 95677408 + 0.75 NA intron (NM_015631, intron 13 of 13) intron (NM_015631, intron 13 of 13) 16707 NM_015631 26123 Hs.438991 NM_015631 ENSG00000119977 TCTN3 C10orf61|JBTS18|OFD4|TECT3 tectonic family member 3 protein-coding 115-64 chr17 15025088 15025385 + 0.75 NA intron (NR_135638, intron 1 of 1) intron (NR_135638, intron 1 of 1) -5739 NR_033371 94150 Hs.147654 NR_033371 ENSG00000259944 CDRT7 LINC00025|NCRNA00025 CMT1A duplicated region transcript 7 ncRNA 148.25-45 chr14 82300898 82301225 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -341571 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 236.5-7 chr10 28218151 28218653 + 0.75 NA intron (NR_134517, intron 2 of 16) intron (NR_134517, intron 2 of 16) 63721 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 166.5-193 chr7 79269591 79269948 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) LTR8B|LTR|ERV1 -183188 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 222.5-85 chr5 31541473 31541886 + 0.75 NA intron (NR_134298, intron 6 of 8) AluJr|SINE|Alu 9378 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 131.25-191 chr7 81221637 81221897 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -299378 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 211.25-57 chr3 19772482 19772838 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 161557 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 128.25-180 chr6 129762135 129762463 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52122 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 148.5-248 chr9 133094986 133095491 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 12699 NR_001275 1057 Hs.654361 NR_001275 ENSG00000170827 CELP CELL|cell1|cell2|cell3 carboxyl ester lipase pseudogene pseudo 192.5-46 chr15 91563795 91564346 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100731 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 139-147 chr8 53282837 53283155 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -31299 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 144.25-128 chr3 38435996 38436282 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -17751 NM_001106 93 Hs.174273 NM_001106 ENSG00000114739 ACVR2B ACTRIIB|ActR-IIB|HTX4 activin A receptor type 2B protein-coding 138.5-208 chr9 68948180 68948424 + 0.75 NA intron (NM_001278253, intron 13 of 13) intron (NM_001278253, intron 13 of 13) 27539 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 157.5-128 chr3 6208315 6208568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 597008 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 133-49 chr14 72095166 72095556 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 161834 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 156.25-121 chr5 110919381 110919641 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -150569 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 236.25-3 chr1 74526355 74527027 + 0.75 NA intron (NM_015978, intron 23 of 24) intron (NM_015978, intron 23 of 24) -14077 NM_001364666 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 121.25-76 chr16 86476916 86477099 + 0.75 NA non-coding (NR_033925, exon 4 of 4) non-coding (NR_033925, exon 4 of 4) 31853 NR_033925 400550 Hs.448825 NR_033925 ENSG00000268388 FENDRR FOXF1-AS1|FOXF1AS1|TCONS_00024240|lincFOXF1|onco-lncRNA-21 FOXF1 adjacent non-coding developmental regulatory RNA ncRNA 228.5-6 chr1 69880699 69881127 + 0.75 NA intron (NM_001370785, intron 7 of 26) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -38409 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 229-66 chr5 90534107 90534646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4792 NM_198273 116068 Hs.136235 NM_198273 ENSG00000176018 LYSMD3 - LysM domain containing 3 protein-coding 242-57 chr7 33410294 33410881 + 0.75 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) L2|LINE|L2 281023 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 213-93 chr8 8844879 8845242 + 0.75 NA intron (NM_004225, intron 1 of 2) intron (NM_004225, intron 1 of 2) 48570 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 155.75-11 chr1 118391264 118391657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -206232 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 142-144 chr6 143203824 143204270 + 0.75 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) L2|LINE|L2 39265 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 135-60 chr17 60992939 60993187 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 15 of 25) intron (NM_001330413, intron 15 of 25) 315212 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 186.5-74 chr2 216100519 216100872 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001142312, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001142312, exon 3 of 3) -8653 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 172.75-84 chr3 111434670 111434931 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -107397 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 130-80 chr2 178128368 178128611 + 0.75 NA intron (NM_001365579, intron 9 of 9) intron (NM_001365579, intron 9 of 9) 16052 NM_152945 129831 Hs.377257 NM_152945 ENSG00000155636 RBM45 DRB1|RB-1 RNA binding motif protein 45 protein-coding 201.5-26 chr10 66222381 66222934 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 651232 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 164.25-45 chr15 61950280 61950717 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 40 of 81) intron (NM_001018088, intron 40 of 81) 109949 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 123.25-81 chr17 72000871 72001052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25018 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 173.25-64 chr20 6341340 6341596 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85264 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 250-21 chr2 46596423 46597080 + 0.75 NA intron (NM_173074, intron 4 of 6) HAL1|LINE|L1 -16513 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 122.25-69 chr16 7092345 7092545 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) L1ME4a|LINE|L1 -240400 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 124.25-147 chr4 67515674 67515923 + 0.75 NA intron (NR_155754, intron 7 of 18) intron (NR_155754, intron 7 of 18) 29705 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 133.75-114 chr20 36237076 36237419 + 0.75 NA intron (NM_015511, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 769 NM_001271874 25980 Hs.11314 NM_015511 ENSG00000131043 AAR2 C20orf4|CGI-23 AAR2 splicing factor protein-coding 142.25-110 chr3 102233748 102233997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70167 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 120.5-201 chr6 110784368 110784659 + 0.75 NA intron (NM_001300963, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 -30108 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 148-69 chr2 237546188 237546452 + 0.75 NA intron (NR_104019, intron 13 of 16) MER4A|LTR|ERV1 -20254 NM_015893 51052 Hs.247710 NM_015893 ENSG00000071677 PRLH PRH|PRRP prolactin releasing hormone protein-coding 169.5-108 chr3 40967397 40967687 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -231963 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 189.75-30 chr14 51733025 51733380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15919 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 242.75-39 chr22 19270106 19270508 + 0.75 NA intron (NM_007098, intron 2 of 32) L1MB7|LINE|L1 21412 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 234.25-63 chr5 175598207 175598600 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -59668 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 118.75-103 chr2 108372417 108372788 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5352 NM_001321770 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 229.25-13 chr11 104778194 104778727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 120210 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 181.25-121 chr7 26307994 26308268 + 0.75 NA intron (NM_001318199, intron 1 of 6) MER21A|LTR|ERVL 15100 NM_001318199 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 117-96 chr2 135191509 135191864 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 55058 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 153.25-27 chr12 23138712 23139033 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36764 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 177.25-137 chr8 40103877 40104210 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49439 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 230.25-42 chr2 80398130 80398712 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 2 of 11) intron (NM_001282599, intron 2 of 11) 85042 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 130.75-202 chr9 88482503 88482731 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -52484 NM_001161625 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 179.5-59 chr14 61337866 61338146 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 16563 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 114.5-115 chr17 53512134 53512425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -310648 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 379.5-12 chr3 102376384 102377226 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -58210 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 160.5-21 chr11 26099709 26100017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89260 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 188-30 chr17 30784185 30784583 + 0.75 NA non-coding (NR_073118, exon 7 of 7) non-coding (NR_073118, exon 7 of 7) 40308 NM_015986 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 258.5-37 chr19 47522887 47523523 + 0.75 NA intron (NM_001277075, intron 14 of 16) AluSx3|SINE|Alu -8142 NR_038457 8775 Hs.126938 NM_003827 ENSG00000105402 NAPA SNAPA NSF attachment protein alpha protein-coding 128-121 chr4 172350621 172350838 + 0.75 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 338188 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 182.75-44 chr13 108912368 108912652 + 0.75 NA intron (NM_015011, intron 16 of 34) MIR3|SINE|MIR 254793 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 153.75-44 chr14 99982741 99983040 + 0.75 NA intron (NM_001330221, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 11468 NM_001330221 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 205-58 chr4 180053032 180053478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1105894 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 182.25-45 chr16 8477322 8477804 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 112275 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 132.25-175 chr7 96806349 96806704 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96635 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 158.5-97 chr2 76070830 76071095 + 0.75 NA Intergenic (TTATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -360047 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 185-9 chr10 67658283 67658590 + 0.75 NA intron (NM_001291133, intron 1 of 8) intron (NM_001291133, intron 1 of 8) 7224 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 148.75-175 chr9 13323782 13324015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44185 NM_001330637 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 146.5-27 chr10 34412299 34412629 + 0.75 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) intron (NM_001184791, intron 4 of 20) 402832 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 206.5-13 chr11 104998443 104998974 + 0.75 NA intron (NM_004347, intron 7 of 9) intron (NM_004347, intron 7 of 9) 24460 NM_001136112 838 Hs.213327 NM_004347 ENSG00000137757 CASP5 ICE(rel)III|ICEREL-III|ICH-3 caspase 5 protein-coding 177.75-94 chr20 60670763 60671015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106327 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 139.75-69 chr16 71511166 71511470 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2493 NR_135172 105371335 Hs.564879 NR_135171 ENSG00000260520 LOC105371335 - uncharacterized LOC105371335 ncRNA 130.75-98 chr2 179020225 179020423 + 0.75 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 29813 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 130-46 chr14 83076357 83076578 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 433835 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 148.75-181 chr9 131453172 131453567 + 0.75 NA intron (NM_013318, intron 8 of 30) intron (NM_013318, intron 8 of 30) 23279 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 197.25-77 chr4 91268179 91268509 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 1008958 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 125.5-73 chr14 20964096 20964362 + 0.75 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 8742 NM_002934 6036 Hs.728 NM_002934 ENSG00000169385 RNASE2 EDN|RAF3|RNS2 ribonuclease A family member 2 protein-coding 175.75-55 chr18 2296507 2296831 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 274836 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 185.75-95 chr5 5248224 5248624 + 0.75 NA intron (NM_139056, intron 17 of 22) intron (NM_139056, intron 17 of 22) 108094 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 139-159 chrX 79368500 79368826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1111 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 146.75-166 chr8 126988667 126989075 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -24283 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 157-99 chr5 137603225 137603543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44265 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 117.5-48 chr12 5523957 5524344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30018 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 124-6 chr1 68385817 68386165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63963 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 175-60 chr2 11100140 11100553 + 0.75 NA intron (NR_040080, intron 8 of 8) intron (NR_040080, intron 8 of 8) 31830 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 121.75-142 chr5 28116774 28117002 + 0.75 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 170777 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 117.75-220 chr8 140178951 140179153 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1ME1|LINE|L1 -78517 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 265.5-21 chr14 50901573 50902012 + 0.75 NA intron (NM_001206673, intron 9 of 12) intron (NM_001206673, intron 9 of 12) 29632 NM_181814 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 150.5-149 chr4 60585689 60585963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -336793 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 131.75-117 chr20 44408188 44408390 + 0.75 NA TTS (NR_037419) TTS (NR_037419) 169 NR_037419 100500813 NR_037419 ENSG00000266151 MIR3646 - microRNA 3646 ncRNA 191-84 chr8 125897250 125897779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53683 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 256.5-33 chr2 122274328 122274918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 518972 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 118.75-74 chr17 16500872 16501068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8777 NM_001113567 388341 Hs.25425 NM_207387 ENSG00000181350 LRRC75A C17orf76|FAM211A leucine rich repeat containing 75A protein-coding 227-31 chr2 42421435 42421943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52732 NM_001319037 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 232 chr1 61179922 61180327 + 0.75 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 73394 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 248.25-68 chr8 29315103 29315592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33458 NM_057158 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 180.25-83 chr4 45481537 45481844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 642364 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 232.75-2 chr1 110976604 110977224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12970 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 145.5-7 chr1 49293024 49293451 + 0.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MER52A|LTR|ERV1 35826 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 169-3 chr1 189331691 189332183 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 1144073 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 164.5-6 chr1 47940020 47940398 + 0.75 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) L2c|LINE|L2 57176 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 134.5-21 chr10 11703943 11704324 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -38249 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 175.25-41 chr12 123769663 123769926 + 0.75 NA intron (NM_207437, intron 2 of 77) AluJr4|SINE|Alu 7299 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 115.5-14 chr1 173771869 173772132 + 0.75 NA intron (NM_014458, intron 8 of 11) HAL1M8|LINE|L1 52132 NM_001171182 91687 Hs.531856 NM_033319 ENSG00000120334 CENPL C1orf155|CENP-L|dJ383J4.3 centromere protein L protein-coding 213-58 chr21 26388660 26389194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4708 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 309.25-15 chr2 96575926 96576633 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 38400 NM_001319092 10865 Hs.920 NM_006673 ENSG00000196843 ARID5A MRF-1|MRF1|RP11-363D14 AT-rich interaction domain 5A protein-coding 220.25-4 chr1 241194368 241194813 + 0.75 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) 62318 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 135-119 chr4 15161382 15161756 + 0.75 NA intron (NR_125911, intron 2 of 5) intron (NR_125911, intron 2 of 5) 159088 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 169-47 chr2 79913820 79914094 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) AluYa5|SINE|Alu -47374 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 206-22 chr14 36215644 36216116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39229 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 172.75-41 chr16 5920567 5920848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98317 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 208.25-63 chr3 193726002 193726456 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -98897 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 169.5-141 chr5 107238026 107238386 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -227192 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 119.75-81 chr17 80436867 80437079 + 0.75 NA non-coding (NR_148044, exon 8 of 8) non-coding (NR_148044, exon 8 of 8) 17555 NR_039883 100616359 NR_039883 ENSG00000264961 MIR4730 - microRNA 4730 ncRNA 131-185 chr9 98909243 98909451 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34560 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 147.75-94 chr21 16422631 16422978 + 0.75 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) intron (NR_136550, intron 1 of 3) 2509 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 195-80 chr7 50771696 50772168 + 0.75 NA intron (NM_001001555, intron 1 of 16) intron (NM_001001555, intron 1 of 16) 10964 NM_001350814 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 133-74 chr18 14931299 14931533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14851 NR_104164 400644 Hs.514732 NR_104164 ENSG00000266554 LINC01443 - long intergenic non-protein coding RNA 1443 ncRNA 273.5-38 chr20 50915274 50915734 + 0.75 NA intron (NM_001347511, intron 1 of 4) intron (NM_001347511, intron 1 of 4) -5713 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 327.5-23 chr5 16966646 16967317 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -30693 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 182.25-117 chr8 36098736 36099161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -388628 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 245.75-20 chr16 12648219 12648697 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -71863 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 127.75-215 chrX 78688287 78688511 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29071 NM_152694 203430 Hs.134873 NM_152694 ENSG00000179300 RTL3 Mar3|Mart3|SIRH9|ZCCHC5|ZHC5 retrotransposon Gag like 3 protein-coding 179.5-126 chr3 118817996 118818364 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -7347 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 202.75-60 chr2 123116632 123117033 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -43351 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 166-34 chr15 25520294 25520745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81463 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 188.75-54 chr2 51766632 51767090 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) L1MA8|LINE|L1 -603787 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 143.25-129 chr3 188881807 188882061 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001167671, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001167671, exon 11 of 11) 65705 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 131.5-214 chr7 27744692 27745049 + 0.75 NA intron (NM_001362794, intron 1 of 16) intron (NM_001362794, intron 1 of 16) 4775 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 141.25-162 chr6 149466733 149466921 + 0.75 NA intron (NM_207360, intron 2 of 5) AluSg|SINE|Alu 18187 NM_207360 340152 Hs.632618 NM_207360 ENSG00000178199 ZC3H12D C6orf95|MCPIP4|TFL|dJ281H8.1|p34 zinc finger CCCH-type containing 12D protein-coding 116.5-246 chr8 89967602 89967945 + 0.75 NA intron (NM_001024688, intron 8 of 16) MamRep1527|LTR|LTR 16898 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 160.5-6 chr1 199609223 199609623 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -418287 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 170.75-24 chr12 41753071 41753383 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -10962 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 164.5-112 chr20 19406789 19407274 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) MER117|DNA|hAT-Charlie -122435 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 232.75-16 chr12 16970881 16971264 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -17675 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 183.5-119 chr5 152968488 152968821 + 0.75 NA intron (NR_109877, intron 1 of 4) L1PB3|LINE|L1 3695 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 215.75-73 chr4 113169857 113170396 + 0.75 NA intron (NM_001354241, intron 2 of 45) intron (NM_001354241, intron 2 of 45) 17844 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 300.75-24 chr2 59768875 59769680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 551569 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 189.75-5 chr1 116162889 116163324 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 51351 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 187-42 chr2 74728600 74728998 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 74552 NR_073398 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 143-112 chr5 30670422 30670643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -523154 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 149-112 chr6 55490428 55490807 + 0.75 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) intron (NR_109869, intron 3 of 4) 88597 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 164-61 chr2 213491477 213491707 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 207128 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 115.75-80 chr17 49538612 49538853 + 0.75 NA intron (NR_103773, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 27915 NR_106751 102465141 NR_106751 ENSG00000277478 MIR6165 hsa-mir-6165 microRNA 6165 ncRNA 200.5-96 chr3 187139490 187139956 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_052969) promoter-TSS (NM_052969) -227 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 276.75-18 chr19 19390856 19391465 + 0.75 NA intron (NM_001359631, intron 1 of 10) intron (NM_001359631, intron 1 of 10) 5357 NM_001359631 54815 Hs.118964 NM_017660 ENSG00000167491 GATAD2A p66alpha GATA zinc finger domain containing 2A protein-coding 202.25-42 chr20 18344570 18344940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34294 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 142-137 chr5 171990664 171990985 + 0.75 NA intron (NM_012300, intron 1 of 12) intron (NM_012300, intron 1 of 12) 16049 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 149-39 chr15 71574619 71574905 + 0.75 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 27526 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 112.5-104 chr19 47277567 47277898 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 2847 NM_178511 255783 Hs.128690 NM_178511 ENSG00000257704 INAFM1 PRR24 InaF motif containing 1 protein-coding 175.25 chr1 41919147 41919465 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_038260) promoter-TSS (NR_038260) -384 NR_038260 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 168.5-140 chr5 6471429 6471982 + 0.75 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 22846 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 116.25-153 chr3 154440059 154440259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9969 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 121.75-10 chr1 222804368 222804684 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10513 NM_032890 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 130.5-44 chr10 68210054 68210411 + 0.75 NA intron (NR_045663, intron 17 of 17) intron (NR_045663, intron 17 of 17) 21881 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 150.5-67 chr17 75465343 75465658 + 0.75 NA intron (NM_014738, intron 1 of 31) AluJo|SINE|Alu 8865 NM_014738 9772 Hs.514474 NM_014738 ENSG00000177728 TMEM94 IDDCDF|KIAA0195 transmembrane protein 94 protein-coding 230-71 chr8 130799671 130800158 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 15 of 17) intron (NM_001115, intron 15 of 17) 240995 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 121.5-8 chr1 68117774 68117998 + 0.75 NA intron (NR_040077, intron 7 of 9) intron (NR_040077, intron 7 of 9) 65724 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 157-97 chr5 110379132 110379487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134606 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 238-58 chr5 163474032 163474535 + 0.75 NA intron (NM_012484, intron 10 of 17) intron (NM_012484, intron 10 of 17) 13651 NM_012484 3161 Hs.740467 NM_012484 ENSG00000072571 HMMR CD168|IHABP|RHAMM hyaluronan mediated motility receptor protein-coding 235-58 chr5 30456931 30457421 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 576616 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 115.5-195 chr4 183372590 183372774 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -50256 NM_001185149 100132463 Hs.727475 NM_001185149 ENSG00000185758 CLDN24 CLDN21 claudin 24 protein-coding 154-91 chr3 47748409 47748771 + 0.75 NA intron (NM_003074, intron 2 of 27) intron (NM_003074, intron 2 of 27) 33303 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 127.25-192 chr7 34125853 34126139 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) L2a|LINE|L2 220457 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 156-77 chr2 15640267 15640678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48604 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 208.5-17 chr10 127772828 127773351 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35904 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 306.25-16 chr16 55289 55884 + 0.75 NA intron (NM_024571, intron 2 of 4) intron (NM_024571, intron 2 of 4) 1758 NM_024571 79622 Hs.15277 NM_024571 ENSG00000161981 SNRNP25 C16orf33 small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25 protein-coding 172-95 chr6 2728505 2728870 + 0.75 NA intron (NM_001012418, intron 2 of 12) intron (NM_001012418, intron 2 of 12) 22235 NM_001012418 340156 Hs.127830 NM_001012418 ENSG00000145949 MYLK4 SgK085 myosin light chain kinase family member 4 protein-coding 129.25-218 chr9 86971415 86971684 + 0.75 NA intron (NR_049794, intron 2 of 6) intron (NR_049794, intron 2 of 6) 22851 NR_049794 100506834 Hs.553987 NR_049794 ENSG00000226237 GAS1RR LncRNA-Hh GAS1 adjacent regulatory RNA ncRNA 142.5-207 chr7 43317967 43318167 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 3 of 27) L2b|LINE|L2 167172 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 123.75-170 chr7 16955655 16955896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73792 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 173.25-25 chr12 30903616 30903970 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22955 NM_001370302 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 177.75-118 chr5 167878515 167878899 + 0.75 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 123778 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 205.5-11 chr10 14587634 14587994 + 0.75 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR -15439 NM_001282700 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 267.5-49 chr4 1044095 1044774 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31970 NM_021923 53834 Hs.193326 NM_021923 ENSG00000127418 FGFRL1 FGFR-5|FGFR5|FHFR fibroblast growth factor receptor like 1 protein-coding 120.25-167 chr5 99593444 99593794 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 59629 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 122.5-133 chr20 48670717 48671061 + 0.75 NA intron (NM_020820, intron 14 of 39) MIRb|SINE|MIR 157110 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 144-79 chr3 11144301 11144496 + 0.75 NA intron (NM_001098213, intron 1 of 1) intron (NM_001098213, intron 1 of 1) 7160 NM_001098213 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 122-73 chr17 66380636 66380887 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 36093 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 192.75-6 chr1 109966915 109967191 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -17712 NM_001242673 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 196.75-17 chr10 82868454 82868734 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -635674 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 136.5-13 chr1 179492864 179493144 + 0.75 NA intron (NM_144696, intron 20 of 25) L1ME1|LINE|L1 82944 NM_001297575 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 115.75-56 chr13 109903209 109903503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116773 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 197.5-93 chr3 36770451 36771001 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -30865 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 252.25-66 chr9 34449965 34450530 + 0.75 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 8323 NM_147202 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 125.75-46 chr13 25347632 25347996 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24160 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 121.25-113 chr20 40501587 40501897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 187494 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 145.25-38 chr14 45155298 45155690 + 0.75 NA intron (NM_001308133, intron 7 of 21) intron (NM_001308133, intron 7 of 21) 19555 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 209.75-60 chr20 38494684 38495186 + 0.75 NA intron (NM_001282917, intron 3 of 29) intron (NM_001282917, intron 3 of 29) -21628 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 131-158 chr7 47437349 47437681 + 0.75 NA intron (NM_022748, intron 6 of 30) intron (NM_022748, intron 6 of 30) 27288 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 231.25-77 chr9 27818224 27818664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -244578 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 199.5-50 chr15 95745077 95745482 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 312186 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 121.75-124 chr3 177476612 177476860 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 34815 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 172.75-5 chr1 108946936 108947282 + 0.75 NA intron (NM_001048210, intron 4 of 11) AluSx1|SINE|Alu 3339 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 138.5-60 chr14 64859044 64859319 + 0.75 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) AluSz6|SINE|Alu 20726 NM_001355436 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 342.5-9 chr11 114589553 114590320 + 0.75 NA intron (NM_017678, intron 2 of 5) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 5850 NM_001077639 54827 Hs.179100 NM_017678 ENSG00000137634 NXPE4 C11orf33|FAM55D neurexophilin and PC-esterase domain family member 4 protein-coding 238.25-34 chr2 32360265 32360794 + 0.75 NA intron (NM_016252, intron 1 of 73) intron (NM_016252, intron 1 of 73) 3501 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 228.5-91 chr6 159430792 159431274 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 47502 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 132.25-110 chr2 235321188 235321438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172730 NM_001244888 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 148.5-51 chr13 70862593 70862811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152439 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 157.25-85 chr2 217602008 217602371 + 0.75 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 154404 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 173-125 chr6 135886871 135887268 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) L1PB2|LINE|L1 35368 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 148.75-119 chr4 34213885 34214139 + 0.75 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) intron (NR_147184, intron 2 of 3) 55735 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 206.5-108 chr6 56590705 56591164 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 41 of 94) intron (NM_001144770, intron 41 of 94) 51955 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 154.5-38 chr11 86197769 86198086 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -46457 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 159.75-38 chr14 44790407 44790785 + 0.75 NA intron (NR_146457, intron 2 of 4) intron (NR_146457, intron 2 of 4) 8530 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 166.5-24 chr10 18105060 18105353 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35218 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 151.75-130 chr6 120810744 120811052 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 523582 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 148.5-48 chr12 121207158 121207394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2853 NM_001261397 5025 Hs.321709 NM_002560 ENSG00000135124 P2RX4 P2X4|P2X4R purinergic receptor P2X 4 protein-coding 212.25-70 chr5 30794752 30795258 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -398681 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 131.25-180 chr6 146913953 146914301 + 0.75 NA intron (NR_034115, intron 7 of 10) intron (NR_034115, intron 7 of 10) -110303 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 130.5-161 chr3 2454962 2455216 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) 216260 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 159.5-216 chr9 12611103 12611348 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -82160 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 214.25-17 chr12 19519858 19520177 + 0.75 NA 3' UTR (NM_153207, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_153207, exon 8 of 8) 79418 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 202.25-24 chr14 63385071 63385559 + 0.75 NA intron (NR_104104, intron 10 of 12) AluJb|SINE|Alu -66380 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 120.5-66 chr13 111294858 111295106 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001354059, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001354059, exon 20 of 20) -21203 NM_001303133 121793 Hs.210677 NM_152324 ENSG00000153495 TEX29 C13orf16|bA474D23.1 testis expressed 29 protein-coding 200-34 chr15 96798212 96798554 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14948 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 123.25-156 chr4 174104255 174104637 + 0.75 NA intron (NR_125896, intron 2 of 4) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 115952 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 138.5-19 chr1 199300902 199301212 + 0.75 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) X6A_LINE|LINE|CR1 152459 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 177.25-98 chr3 135789427 135789860 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176085 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 223.75-53 chr20 10798153 10798592 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 45282 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 208.5-78 chr2 190249357 190249715 + 0.75 NA intron (NM_198047, intron 9 of 12) intron (NM_198047, intron 9 of 12) 68673 NM_032321 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 176-49 chr3 157282594 157282960 + 0.75 NA intron (NM_024621, intron 12 of 13) intron (NM_024621, intron 12 of 13) -122017 NM_020307 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 149-67 chr20 36982990 36983283 + 0.75 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -31293 NM_015474 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 118.5-30 chr10 133107775 133107940 + 0.75 NA intron (NM_001083909, intron 5 of 6) intron (NM_001083909, intron 5 of 6) 5611 NM_001291085 84435 Hs.435183 NM_032422 ENSG00000197177 ADGRA1 GPR123 adhesion G protein-coupled receptor A1 protein-coding 170.5-95 chr2 103887191 103887445 + 0.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 521014 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 176.25-84 chr20 57623982 57624251 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -3690 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 122.75-71 chr17 65252095 65252346 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 114850 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 136.25-123 chr3 81983526 81983777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2491 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 167.5-37 chr11 72366191 72366572 + 0.75 NA intron (NM_001258393, intron 3 of 14) AluSx|SINE|Alu 68150 NM_030813 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 194.75-29 chr15 57282945 57283220 + 0.75 NA intron (NM_001322157, intron 19 of 19) intron (NM_001322157, intron 19 of 19) -4425 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 126.25-14 chr1 240567233 240567486 + 0.75 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) L1MEc|LINE|L1 44796 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 204.75-26 chr11 95535452 95535869 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 254122 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 180.25-120 chr8 132376602 132376938 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 70492 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 136.5-161 chr4 39496457 39496698 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 16322 NR_026854 401127 Hs.383197 NR_026854 ENSG00000224097 LOC401127 - WD repeat domain 5 pseudogene pseudo 170-106 chr9 97416550 97416855 + 0.75 NA intron (NM_001302884, intron 1 of 15) intron (NM_001302884, intron 1 of 15) 4606 NM_014290 23424 Hs.193842 NM_014290 ENSG00000196116 TDRD7 CATC4|PCTAIRE2BP|TRAP tudor domain containing 7 protein-coding 283.25-11 chr11 42577544 42578172 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -324168 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 205.75-22 chr14 68901687 68902152 + 0.75 NA intron (NM_001102, intron 8 of 20) intron (NM_001102, intron 8 of 20) 77383 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 115-193 chr9 30566193 30566436 + 0.75 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -157860 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 163-16 chr10 101592687 101592944 + 0.75 NA intron (NM_001329746, intron 1 of 2) AluSc|SINE|Alu 4494 NM_001329742 25911 Hs.658128 NM_015448 ENSG00000166171 DPCD - deleted in primary ciliary dyskinesia homolog (mouse) protein-coding 222.5-102 chr7 36460354 36460785 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -70212 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 153.5-171 chr6 85471309 85471554 + 0.75 NA intron (NM_002526, intron 3 of 8) intron (NM_002526, intron 3 of 8) 21348 NM_002526 4907 Hs.153952 NM_002526 ENSG00000135318 NT5E CALJA|CD73|E5NT|NT|NT5|NTE|eN|eNT 5'-nucleotidase ecto protein-coding 187.25-87 chr5 106162091 106162340 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 848799 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 221.75-57 chr5 18609687 18610096 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 802617 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 184.5-166 chr9 28120040 28120407 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -546357 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 173.75-35 chr11 94538226 94538550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5463 NM_002033 2526 Hs.390420 NM_002033 ENSG00000196371 FUT4 CD15|ELFT|FCT3A|FUC-TIV|FUTIV|LeX|SSEA-1 fucosyltransferase 4 protein-coding 137.25-138 chr6 44201692 44202028 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15066 NM_001315494 101929726 Hs.438979 NM_001315494 ENSG00000262179 MYMX MINION|hMINION myomixer, myoblast fusion factor protein-coding 256-66 chr7 36778706 36779359 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -54483 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 185.5-49 chr14 67094071 67094388 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 11 of 21) intron (NM_001024218, intron 11 of 21) -95211 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 137.25-127 chr5 57239785 57240116 + 0.75 NA intron (NM_001331037, intron 7 of 12) intron (NM_001331037, intron 7 of 12) 25876 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 167.75-64 chr18 14073305 14073715 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 58925 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 125.25-162 chr5 145533560 145533731 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 301697 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 163-126 chr9 31811471 31811798 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -430144 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 130-76 chr2 145810208 145810406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -776750 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 218.75-33 chr2 31230360 31230730 + 0.75 NA intron (NM_001321270, intron 1 of 21) L1ME3D|LINE|L1 3412 NM_001321270 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 135.25-42 chr11 25075835 25076177 + 0.75 NA intron (NM_001009909, intron 10 of 11) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 578953 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 127.5-227 chr7 43534273 43534569 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 22 of 27) intron (NM_001287059, intron 22 of 27) -11879 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 156-143 chr7 80687711 80688058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41231 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 143.5-78 chr15 67391094 67391471 + 0.75 NA intron (NM_001322472, intron 8 of 13) intron (NM_001322472, intron 8 of 13) 129691 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 172-84 chr4 74122404 74122907 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001351310) promoter-TSS (NM_001351310) -618 NM_001351310 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 137-52 chr14 102194260 102194593 + 0.75 NA intron (NM_001353658, intron 2 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 41000 NM_001353832 5891 Hs.36859 NM_014226 ENSG00000080823 MOK RAGE|RAGE-1|RAGE1|STK30 MOK protein kinase protein-coding 198.25-47 chr18 2275192 2275779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296020 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 114-115 chr4 92883739 92883947 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 579444 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 204.25-31 chr12 100950039 100950317 + 0.75 NA intron (NM_001286616, intron 4 of 26) intron (NM_001286616, intron 4 of 26) 48532 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 120.25-7 chr1 75272810 75273056 + 0.75 NA intron (NM_001320283, intron 4 of 21) L1PB2|LINE|L1 138545 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 124.25-57 chr14 79066781 79066962 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L1P3|LINE|L1 -133111 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 163.25-52 chr17 42645402 42645681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13743 NM_001320509 27175 Hs.279669 NM_016437 ENSG00000037042 TUBG2 - tubulin gamma 2 protein-coding 149.25-81 chr2 51300539 51300890 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 268113 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 137.25-41 chr14 42323814 42324215 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 717158 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 128-86 chr2 229437898 229438089 + 0.75 NA intron (NM_139072, intron 8 of 12) intron (NM_139072, intron 8 of 12) -166706 NM_001100818 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 220.5-124 chr8 89549055 89549462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 208453 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 200.5-120 chr5 149295177 149295526 + 0.75 NA intron (NM_152406, intron 1 of 18) intron (NM_152406, intron 1 of 18) 23492 NM_001323062 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 224.5-107 chr8 91781144 91781701 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 236258 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 167.25-58 chr16 67456413 67456812 + 0.75 NA intron (NM_004691, intron 1 of 7) intron (NM_004691, intron 1 of 7) 24545 NM_004691 9114 Hs.106876 NM_004691 ENSG00000159720 ATP6V0D1 ATP6D|ATP6DV|P39|VATX|VMA6|VPATPD ATPase H+ transporting V0 subunit d1 protein-coding 124.75-219 chrUn_KI270438v1 100200 100396 + 0.75 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 143.75-183 chr8 75339488 75339762 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -60736 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 115.75-48 chr12 83392870 83393214 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 705887 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 251.75-82 chr9 110188353 110188966 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19474 NM_001012993 401546 Hs.125608 NM_001012993 ENSG00000188959 C9orf152 bA470J20.2 chromosome 9 open reading frame 152 protein-coding 182.5-40 chr12 44708720 44709061 + 0.75 NA intron (NM_006159, intron 12 of 20) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 166771 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 237.25-36 chr16 61907423 61907980 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 128737 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 194-29 chr12 63853688 63854021 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 9154 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 160-116 chr9 7140901 7141314 + 0.75 NA intron (NR_148680, intron 19 of 21) L2b|LINE|L2 383757 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 154-26 chr11 32328474 32328838 + 0.75 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 71744 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 229.5-63 chr2 80113467 80113936 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) MER58A|DNA|hAT-Charlie 191051 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 131.75-223 chr9 29892402 29892714 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 515896 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 167-59 chr2 102395559 102395820 + 0.75 NA intron (NM_003855, intron 10 of 10) intron (NM_003855, intron 10 of 10) -23101 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 187.25-8 chr10 24933153 24933641 + 0.75 NA intron (NM_020200, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 19209 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 174.25-7 chr1 100411862 100412132 + 0.75 NA intron (NM_001319212, intron 4 of 13) L2b|LINE|L2 59491 NM_001319210 8556 Hs.127411 NM_003672 ENSG00000079335 CDC14A DFNB105|DFNB32|DFNB35|cdc14|hCDC14 cell division cycle 14A protein-coding 227.5-54 chr2 79833006 79833475 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 33343 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 114-161 chr8 35512503 35512749 + 0.75 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) -31766 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 190.25-48 chr16 74198645 74198980 + 0.75 NA intron (NR_104657, intron 3 of 3) intron (NR_104657, intron 3 of 3) 16709 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 144.25-104 chr2 170596314 170596618 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) intron (NM_001083615, intron 31 of 33) 118101 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 126.75-247 chr8 116429988 116430322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105096 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 122 chr1 17149567 17149729 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30197 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 162.75-6 chr1 119281974 119282219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46156 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 114.5-5 chr1 54842785 54843134 + 0.75 NA TTS (NM_152607) TTS (NM_152607) 36896 NM_152607 163747 Hs.376018 NM_152607 ENSG00000162398 LEXM C1orf177|LEM lymphocyte expansion molecule protein-coding 132-139 chr5 91595216 91595567 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -212074 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 240.25-12 chr12 10025980 10026400 + 0.75 NA intron (NR_120484, intron 2 of 2) intron (NR_120484, intron 2 of 2) 4416 NR_120484 102724020 Hs.737731 NR_120484 ENSG00000256803 LOC102724020 - uncharacterized LOC102724020 ncRNA 212.25-49 chr2 201799774 201800323 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6381 NM_139158 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 146.5-236 chr9 135773493 135773832 + 0.75 NA intron (NM_001272003, intron 18 of 30) intron (NM_001272003, intron 18 of 30) 71477 NM_001272003 57582 Hs.104950 NM_020822 ENSG00000107147 KCNT1 EIEE14|ENFL5|KCa4.1|SLACK|Slo2.2|bA100C15.2 potassium sodium-activated channel subfamily T member 1 protein-coding 215.5-97 chr7 41104595 41105041 + 0.75 NA intron (NR_110832, intron 1 of 5) intron (NR_110832, intron 1 of 5) 3214 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 191.5-116 chr4 186258715 186259009 + 0.75 NA TTS (NM_000892) TTS (NM_000892) -7102 NM_000128 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 142.5-112 chr2 127432198 127432411 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -8686 NR_039944 100616187 NR_039944 ENSG00000264075 MIR4783 - microRNA 4783 ncRNA 114.5-230 chr6 84557162 84557408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82356 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 134.5-158 chr4 93460138 93460568 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 10 of 14) L2c|LINE|L2 -368400 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 154.25-185 chr9 86741194 86741450 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 206184 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 153.25-123 chr7 81311743 81312109 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 249893 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 130-136 chr5 154230613 154230834 + 0.75 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) intron (NM_198321, intron 1 of 11) 39990 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 136.5-32 chr10 106220791 106221086 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 80773 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 239.5-20 chr12 2264371 2264863 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 -5159 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 154-50 chr17 42154560 42154958 + 0.75 NA intron (NM_201434, intron 1 of 6) intron (NM_201434, intron 1 of 6) 230 NM_001252039 5878 Hs.650382 NM_004583 ENSG00000108774 RAB5C L1880|RAB5CL|RAB5L|RABL RAB5C, member RAS oncogene family protein-coding 135-111 chr3 95317914 95318236 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 365118 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 166.5-105 chr2 84585879 84586167 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 15 of 76) MER52C|LTR|ERV1 69568 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 118.25-29 chr10 48523060 48523327 + 0.75 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie -11604 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 131.5-210 chr6 136895204 136895431 + 0.75 NA intron (NM_000288, intron 8 of 9) intron (NM_000288, intron 8 of 9) -26984 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 166.5-106 chr2 88689740 88690094 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1756 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 149.75-44 chr14 61443863 61444152 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 3 of 13) intron (NM_006255, intron 3 of 13) 122564 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 225-70 chr7 15714197 15714590 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26015 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 138.75-96 chr2 145342418 145342651 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 674567 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 139.5-157 chr4 101858029 101858397 + 0.75 NA intron (NM_017935, intron 3 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie 44371 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 117.75-188 chr7 733356 733640 + 0.75 NA intron (NR_075098, intron 2 of 12) L1M1|LINE|L1 -5822 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 135.25-71 chr16 22151808 22151992 + 0.75 NA intron (NM_173615, intron 30 of 33) L2c|LINE|L2 -10631 NM_001365288 100288072 NM_001365288 SDR42E2 - short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2 protein-coding 116-86 chr2 99431136 99431329 + 0.75 NA intron (NR_135652, intron 8 of 21) intron (NR_135652, intron 8 of 21) 58785 NR_135650 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 148.5-90 chr18 12673284 12673523 + 0.75 NA non-coding (NR_073537, exon 12 of 13) non-coding (NR_073537, exon 12 of 13) 14664 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 126.5-182 chr4 180057087 180057458 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1101877 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 118-19 chr10 103092942 103093172 + 0.75 NA intron (NM_001351194, intron 14 of 17) intron (NM_001351194, intron 14 of 17) 60764 NM_001351191 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 113.5-125 chr2 114932626 114932792 + 0.75 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1ME3|LINE|L1 -99161 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 147.75-71 chr2 101747702 101748033 + 0.75 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 50160 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 216.75-21 chr13 44245425 44245820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49422 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 153.75-139 chr7 20074340 20074786 + 0.75 NA intron (NR_110114, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 65863 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 177.5-76 chr2 56381934 56382287 + 0.75 NA intron (NM_001348513, intron 5 of 5) intron (NM_001348513, intron 5 of 5) -196340 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 192.5-82 chr20 5998885 5999477 + 0.75 NA TTS (NM_032485) TTS (NM_032485) 6640 NR_110101 101929225 Hs.635771 NR_110101 ENSG00000278719 MCM8-AS1 - MCM8 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-90 chr2 1057535 1057791 + 0.75 NA intron (NM_018968, intron 1 of 16) MLT2A2|LTR|ERVL -106271 NR_136151 101060391 Hs.120377 NR_136151 SNTG2-AS1 - SNTG2 antisense RNA 1 ncRNA 198.75-30 chr16 72732572 72733034 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -67833 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 255-40 chr3 168450952 168451412 + 0.75 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) -100672 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 185-5 chr1 159445736 159446041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6166 NM_012351 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 133-182 chr8 142868285 142868608 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 11374 NM_000497 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 154.75-107 chr4 58285134 58285377 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 251073 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 141.75-76 chr18 2078994 2079340 + 0.75 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 492338 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 138.25-52 chr14 79674108 79674512 + 0.75 NA intron (NM_004796, intron 14 of 16) L1MA10|LINE|L1 394930 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 118.75-157 chr5 113886080 113886318 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 372505 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 142.25-154 chr7 13856393 13856707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129964 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 124.5-238 chr9 33483924 33484096 + 0.75 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -10067 NM_139235 65083 Hs.493709 NM_022917 ENSG00000165271 NOL6 NRAP|UTP22|bA311H10.1 nucleolar protein 6 protein-coding 119.5-252 chr9 36988024 36988249 + 0.75 NA intron (NM_001280554, intron 4 of 8) intron (NM_001280554, intron 4 of 8) 46132 NM_001280554 5079 Hs.654464 NM_016734 ENSG00000196092 PAX5 ALL3|BSAP paired box 5 protein-coding 122.25-124 chr3 64471796 64472032 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89432 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 210.25-22 chr14 62526646 62527152 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -386926 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 135.5-61 chr14 77769487 77769782 + 0.75 NA non-coding (NR_161323, exon 3 of 3) non-coding (NR_161323, exon 3 of 3) -8478 NM_012245 22938 Hs.445498 NM_012245 ENSG00000100603 SNW1 Bx42|FUN20|NCOA-62|PRPF45|Prp45|SKIIP|SKIP|SKIP1 SNW domain containing 1 protein-coding 126.75-220 chr7 4746706 4746930 + 0.75 NA intron (NM_001037165, intron 2 of 8) intron (NM_001037165, intron 2 of 8) -28805 NM_014855 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 172.5-120 chr3 41875178 41875443 + 0.75 NA intron (NR_136342, intron 16 of 34) AluJo|SINE|Alu 86793 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 242.25-69 chr5 12221588 12222088 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -317392 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 334.25-19 chr4 181452063 181452887 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -187446 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 115.25-200 chr8 55600591 55600823 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -79729 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 141.75-122 chr3 193381663 193381901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3029 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 167.5-114 chr22 30700803 30701193 + 0.75 NA intron (NM_030758, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 6124 NM_001282739 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 160-103 chr7 103344844 103345237 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001362667) promoter-TSS (NM_001362667) -167 NM_001362668 27000 Hs.558476 NM_014377 ENSG00000105821 DNAJC2 MPHOSPH11|MPP11|ZRF1|ZUO1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 protein-coding 127-90 chr18 75635739 75636091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76488 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 146-76 chr20 865262 865656 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 20816 NM_031424 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 250.5-23 chr13 114056704 114057123 + 0.75 NA intron (NM_001320821, intron 3 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 3 of 25).2 21042 NM_001320822 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 125-134 chr5 117073685 117073986 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -311626 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 131-12 chr1 187831384 187831601 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 387864 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 173.75-73 chr17 71105583 71105944 + 0.75 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) L1PA16|LINE|L1 96416 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 177-69 chr4 55821770 55822094 + 0.75 NA intron (NM_001351574, intron 1 of 2) intron (NM_001351574, intron 1 of 2) 1929 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 343.75-16 chr8 47524586 47525296 + 0.75 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) intron (NM_001352958, intron 10 of 21) -129147 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 135.75-20 chr10 36540434 36540673 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -585304 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 172-91 chr5 84758913 84759278 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -374215 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 113.5-106 chr18 13070653 13070950 + 0.75 NA intron (NM_032142, intron 27 of 44) intron (NM_032142, intron 27 of 44) 79439 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 149.25-14 chr1 152245135 152245533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21138 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 159.5-70 chr16 79037144 79037407 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 563462 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 126.25-89 chr2 78603182 78603392 + 0.75 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu 57756 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 129.5-165 chr4 12315606 12315945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92324 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 174-70 chr4 111780999 111781311 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -364299 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 282.75-32 chr4 70455408 70456058 + 0.75 NA intron (NM_001145006, intron 1 of 3) intron (NM_001145006, intron 1 of 3) -16225 NM_001145007 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 147.75-96 chr22 27359288 27359746 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 48866 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 140.75-192 chr8 139864024 139864271 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -161024 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 214.25 chr1 20851812 20852303 + 0.75 NA intron (NM_003760, intron 22 of 31) AluSp|SINE|Alu -65369 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 114.75-123 chr3 67264382 67264535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38994 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 195.5-2 chr1 53658763 53659268 + 0.75 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) intron (NM_001367484, intron 2 of 10) 75189 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 140.75-199 chr9 129951602 129951872 + 0.75 NA intron (NM_001363755, intron 6 of 15) AluJb|SINE|Alu 82132 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 142.5-71 chr15 69750934 69751284 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84125 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 140-168 chr8 133168740 133169068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22135 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 210.5-108 chr6 41505819 41506175 + 0.75 NA intron (NR_120347, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 3553 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 197-17 chr14 47635237 47635571 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 39550 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 186-76 chr6 39987590 39988085 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53375 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 193-71 chr5 45420014 45420312 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 276217 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 162-99 chr6 40809905 40810172 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 213242 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 154.25-83 chr2 85264295 85264570 + 0.75 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) 50780 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 166.25-18 chr1 197894041 197894328 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -8446 NM_001024594 388722 Hs.61329 NM_001024594 ENSG00000203724 C1orf53 - chromosome 1 open reading frame 53 protein-coding 271.75-19 chr2 81371936 81372670 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 94643 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 116.5-118 chr2 64633434 64633775 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014755, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_014755, exon 2 of 2) 20309 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 144.5-66 chr14 73673254 73673506 + 0.75 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger 28394 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 195-73 chr6 116013204 116013652 + 0.75 NA intron (NM_002031, intron 1 of 7) intron (NM_002031, intron 1 of 7) -25303 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 300.75-33 chr22 28345588 28346090 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L3b|LINE|CR1 -114030 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 168.25-11 chr1 225507045 225507443 + 0.75 NA intron (NM_001008493, intron 11 of 14) intron (NM_001008493, intron 11 of 14) -78389 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 175.25-67 chr2 66561017 66561283 + 0.75 NA intron (NM_002398, intron 9 of 12) intron (NM_002398, intron 9 of 12) -12880 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 166.5-20 chr1 234988331 234988616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24474 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 199-45 chr20 58907073 58907409 + 0.75 NA intron (NM_080425, intron 6 of 12) intron (NM_080425, intron 6 of 12) 15078 NR_132272 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 196.5-119 chr5 4317081 4317475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -456203 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 209.25-56 chr2 53247221 53247569 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -520388 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 188.5-159 chr8 129115520 129115839 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125561 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 266-7 chr11 76815187 76815562 + 0.75 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 23622 NM_001318477 25987 Hs.8361 NM_015516 ENSG00000182704 TSKU E2IG4|LRRC54|TSK tsukushi, small leucine rich proteoglycan protein-coding 202.25-41 chr2 155703941 155704352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 550785 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 131.5-220 chr7 92450873 92451188 + 0.75 NA intron (NM_021167, intron 3 of 4) intron (NM_021167, intron 3 of 4) 3548 NR_052016 57798 Hs.21145 NM_021167 ENSG00000157259 GATAD1 CMD2B|ODAG|RG083M05.2 GATA zinc finger domain containing 1 protein-coding 219.75-41 chr2 121637582 121637946 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) AluSx|SINE|Alu 11698 NM_001207051 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 203.5-15 chr1 194222416 194222747 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 917836 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 155.75-147 chr7 53873172 53873415 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -61362 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 137.25-150 chr7 32428810 32429132 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001322059) promoter-TSS (NM_001322059) -747 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 124.5-62 chr14 58797235 58797500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30921 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 243-28 chr16 58770279 58770662 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36154 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 158.75-116 chr3 135840080 135840465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125456 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 251.5-51 chr22 49278554 49279166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 264606 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 210.5-3 chr1 82483389 82483942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -419518 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 148.75-38 chr12 14855948 14856314 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -12605 NM_001354646 420 Hs.591158 NM_021071 ENSG00000111339 ART4 ARTC4|CD297|DO|DO/ART4|DOK1 ADP-ribosyltransferase 4 (Dombrock blood group) protein-coding 116.25-200 chr6 133770131 133770387 + 0.75 NA intron (NR_109982, intron 2 of 8) intron (NR_109982, intron 2 of 8) -50888 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 124.5-127 chr20 35424548 35424799 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -8356 NR_161326 554250 Hs.711481 NM_001350519 ENSG00000204183 GDF5OS - growth differentiation factor 5 opposite strand ncRNA 197.5-117 chr4 161261660 161261993 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -760907 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 143.5-86 chr16 65754491 65754760 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -178325 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 113.5-185 chr4 92538086 92538260 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 233774 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 245.5-18 chr12 121451153 121451620 + 0.75 NA intron (NM_001005366, intron 13 of 22) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -7034 NR_106957 102465665 NR_106957 ENSG00000284402 MIR7107 hsa-mir-7107 microRNA 7107 ncRNA 189.5-79 chr2 235396071 235396436 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -97790 NM_001244888 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 179.25-103 chr3 90116611 90116910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1009139 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 277.75-30 chr7 20819779 20820177 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -7320 NR_026673 222901 Hs.722187 NR_026673 ENSG00000219451 RPL23P8 RPL23_4_790 ribosomal protein L23 pseudogene 8 pseudo 138.5-200 chr8 121181811 121182038 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -369878 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 232.5-5 chr1 155892580 155893274 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 17991 NM_001256821 6016 Hs.491234 NM_006912 ENSG00000143622 RIT1 NS8|RIBB|RIT|ROC1 Ras like without CAAX 1 protein-coding 123-146 chr4 45890816 45891167 + 0.75 NA Intergenic LTR34|LTR|ERV1 233063 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 151.25-109 chr20 54361099 54361381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114353 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 197.5-87 chr20 38014689 38015026 + 0.75 NA intron (NM_001303457, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 18599 NM_014657 9675 Hs.655481 NM_014657 ENSG00000101407 TTI1 KIAA0406|smg-10 TELO2 interacting protein 1 protein-coding 173.5-121 chr4 183936260 183936703 + 0.75 NA intron (NM_020225, intron 1 of 3) intron (NM_020225, intron 1 of 3) 31174 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 175-30 chr12 17309969 17310374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 278907 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 167.25-73 chr18 74236235 74236558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55567 NM_001914 1528 Hs.465413 NM_001914 ENSG00000166347 CYB5A CYB5|MCB5|METAG cytochrome b5 type A protein-coding 191.5-6 chr1 50700110 50700533 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) intron (NM_007051, intron 7 of 18) 259946 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 207.5-118 chr8 116181871 116182460 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 142894 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 208-18 chr12 88132767 88133064 + 0.75 NA intron (NM_025114, intron 6 of 53) L1PA11|LINE|L1 9301 NM_025114 80184 Hs.150444 NM_025114 ENSG00000198707 CEP290 3H11Ag|BBS14|CT87|JBTS5|LCA10|MKS4|NPHP6|POC3|SLSN6|rd16 centrosomal protein 290 protein-coding 214-2 chr1 31745585 31746074 + 0.75 NA intron (NM_001294335, intron 4 of 32) intron (NM_001294335, intron 4 of 32) 12906 NR_036216 100423028 NR_036216 ENSG00000266580 MIR4254 - microRNA 4254 ncRNA 123-5 chr1 57020495 57020722 + 0.75 NA intron (NM_001365793, intron 11 of 14) intron (NM_001365793, intron 11 of 14) -54468 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 149.25-104 chr21 34030732 34030964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42730 NM_006933 6526 Hs.302742 NM_006933 ENSG00000198743 SLC5A3 BCW2|SMIT|SMIT1|SMIT2 solute carrier family 5 member 3 protein-coding 157.5-42 chr12 2767117 2767371 + 0.75 NA intron (NR_146317, intron 3 of 3) intron (NR_146317, intron 3 of 3) -27726 NM_002014 2288 Hs.524183 NM_002014 ENSG00000004478 FKBP4 FKBP51|FKBP52|FKBP59|HBI|Hsp56|PPIase|p52 FKBP prolyl isomerase 4 protein-coding 171.5-108 chr3 166643764 166644019 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -254792 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 147-22 chr12 22857983 22858366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 233003 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 141.25-110 chr3 94064567 94064847 + 0.75 NA intron (NM_022072, intron 2 of 5) intron (NM_022072, intron 2 of 5) 1646 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 242.25-88 chr9 19853838 19854310 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -67055 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 126.75-141 chr21 27027559 27027847 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -60615 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 136.25-170 chr6 108341358 108341653 + 0.75 NA intron (NM_145315, intron 2 of 12) intron (NM_145315, intron 2 of 12) 46451 NM_001323005 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 356.5-9 chr14 61322231 61322868 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) CpG 1106 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 170.5-180 chr7 134993483 134993806 + 0.75 NA exon (NM_178563, exon 4 of 17) exon (NM_178563, exon 4 of 17) 7136 NR_160300 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 161.25-68 chr16 84889107 84889481 + 0.75 NA exon (NM_031476, exon 14 of 15) exon (NM_031476, exon 14 of 15) 69309 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 185.75-77 chr20 54368644 54369052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106745 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 132.75-27 chr10 89490014 89490401 + 0.75 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) intron (NM_213606, intron 2 of 7) 34216 NR_120614 101926906 Hs.568874 NR_120614 ENSG00000234452 SLC16A12-AS1 - SLC16A12 antisense RNA 1 ncRNA 135-115 chr3 166077159 166077463 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -239888 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 137-54 chr15 60536618 60536841 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 55797 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 187-37 chr2 12613405 12613788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103276 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 191.25-71 chr3 172343401 172343824 + 0.75 NA intron (NM_001135095, intron 18 of 25) intron (NM_001135095, intron 18 of 25) 104844 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 125-149 chr7 77207976 77208165 + 0.75 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) -8251 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 116.75-109 chr20 37669864 37670070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6943 NR_040021 100287792 Hs.517026 NM_001001690 ENSG00000204117 LOC100287792 - uncharacterized LOC100287792 ncRNA 151.25-147 chr4 174769673 174770014 + 0.75 NA intron (NM_006529, intron 2 of 9) HAL1|LINE|L1 59404 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 165.5-142 chr4 184152675 184152924 + 0.75 NA intron (NM_153343, intron 2 of 7) intron (NM_153343, intron 2 of 7) 65074 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 131.5-102 chr2 18400565 18400832 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 159955 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 127-126 chr4 83392562 83392848 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -57552 NM_001166498 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 164.75-37 chr12 32947600 32947961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50934 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 162.25-151 chr7 93809578 93809857 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 81036 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 118.5-18 chr10 21042213 21042466 + 0.75 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) MER63B|DNA|hAT-Blackjack -131651 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 121.25-132 chr3 77461806 77462136 + 0.75 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) AluSx|SINE|Alu 363959 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 187.25-97 chr7 53351717 53352089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 316270 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 242.5-42 chr18 62923571 62924093 + 0.75 NA intron (NM_194449, intron 10 of 16) intron (NM_194449, intron 10 of 16) 208291 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 133.5-129 chr2 179717177 179717634 + 0.75 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) (GAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28261 NM_001352813 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 186.5-114 chr5 158807007 158807321 + 0.75 NA intron (NM_001324107, intron 8 of 15) intron (NM_001324107, intron 8 of 15) 290792 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 130.25-197 chr8 76737990 76738330 + 0.75 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -54885 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 144-152 chrX 57525264 57525501 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -66454 NM_007157 158586 Hs.156257 NM_007157 ENSG00000198455 ZXDB ZNF905|dJ83L6.1 zinc finger X-linked duplicated B protein-coding 158.25-143 chr8 34436432 34436806 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -347302 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 134-85 chr2 13986157 13986490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 414635 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 175-38 chr14 72535217 72535540 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 15 of 16) intron (NM_001370288, intron 15 of 16) 18558 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 128.75-119 chr3 28679019 28679215 + 0.75 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 103839 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 194-54 chr3 19560517 19560891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245773 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 291.25-8 chr13 98834627 98835518 + 0.75 NA TTS (NR_046663) TTS (NR_046663) 2988 NR_046663 100874096 Hs.578066 NR_046663 ENSG00000229918 DOCK9-AS1 - DOCK9 antisense RNA 1 ncRNA 235-7 chr1 204459038 204459424 + 0.75 NA intron (NM_002646, intron 9 of 33) AluJo|SINE|Alu 31115 NM_002646 5287 Hs.497487 NM_002646 ENSG00000133056 PIK3C2B C2-PI3K phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta protein-coding 150.75-183 chr8 90596971 90597237 + 0.75 NA intron (NR_104062, intron 1 of 2) intron (NR_104062, intron 1 of 2) 8959 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 113.75-178 chr7 80810809 80810979 + 0.75 NA intron (NM_006379, intron 5 of 17) intron (NM_006379, intron 5 of 17) 108157 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 130.5-183 chr4 27464485 27464698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 247112 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 114.5-251 chr8 22265731 22265999 + 0.75 NA intron (NR_134293, intron 1 of 1) HERVL40-int|LTR|ERVL 9297 NR_134293 100507071 Hs.458623 NR_134293 ENSG00000254064 LOC100507071 - uncharacterized LOC100507071 ncRNA 117.25-123 chr2 163403125 163403408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 332742 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 233.75-45 chr21 45360805 45361154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18989 NR_103811 388830 Hs.592162 NR_103811 ENSG00000237664 LINC00316 C21orf111|NCRNA00316|PRED59 long intergenic non-protein coding RNA 316 ncRNA 147.75-125 chr5 46154998 46155252 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -458745 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 177.5-22 chr11 35652363 35652735 + 0.75 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -10226 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 254.5-81 chr8 140953264 140953760 + 0.75 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 47492 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 118-56 chr15 24821210 24821535 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -2236 NM_022808 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 154.25-87 chr2 152436430 152436880 + 0.75 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 101481 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 157-40 chr16 51462984 51463271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -299392 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 147-143 chr8 76675360 76675717 + 0.75 NA intron (NR_024360, intron 1 of 3) intron (NR_024360, intron 1 of 3) -5709 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 151.75-44 chr15 58602059 58602456 + 0.75 NA intron (NM_001320570, intron 13 of 14) L1MC4|LINE|L1 91350 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 212.5-118 chr8 79808142 79808513 + 0.75 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) intron (NR_110954, intron 3 of 5) 40185 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 261-3 chr1 182217644 182218361 + 0.75 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) intron (NR_104175, intron 2 of 2) 96059 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 131-177 chr8 123094893 123095113 + 0.75 NA intron (NM_001363149, intron 5 of 21) L1MC5|LINE|L1 21754 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 136-175 chrX 42854306 42854645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76312 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 180.25-45 chr18 73776630 73776943 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 371048 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 155.25-38 chr11 67342084 67342480 + 0.75 NA intron (NR_024469, intron 2 of 3) L1M2|LINE|L1 11264 NM_021173 57804 Hs.523829 NM_021173 ENSG00000175482 POLD4 POLDS|p12 DNA polymerase delta 4, accessory subunit protein-coding 182.5-53 chr14 76823768 76824048 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2500 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 120.25-102 chr2 171331851 171332192 + 0.75 NA intron (NR_135568, intron 2 of 6) AluJr4|SINE|Alu -100728 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 190.75-116 chr9 37540507 37540921 + 0.75 NA intron (NM_012166, intron 2 of 10) intron (NM_012166, intron 2 of 10) 35666 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 119.5-36 chr10 103858189 103858408 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2892 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 182.75-117 chr6 109885896 109886216 + 0.75 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -92200 NM_001286099 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 127.25-115 chr3 16215362 16215552 + 0.75 NA intron (NM_001319051, intron 6 of 9) MIR3|SINE|MIR -1319 NM_001319052 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 137-100 chr3 51337940 51338249 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 35 of 52) intron (NM_004947, intron 35 of 52) -47197 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 134.25-184 chr8 50718113 50718375 + 0.75 NA intron (NM_001287814, intron 16 of 16) intron (NM_001287814, intron 16 of 16) 554113 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 166.25-99 chr3 11631837 11632134 + 0.75 NA intron (NM_014667, intron 2 of 5) intron (NM_014667, intron 2 of 5) 11930 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 267.75-61 chr8 141086942 141087394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41421 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 187.5-80 chr2 22039578 22039930 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -329102 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 273-39 chr4 53135676 53136248 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 230099 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 197-40 chr22 46031960 46032279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12749 NR_027036 100271722 Hs.528519 NR_027036 LINC00899 - long intergenic non-protein coding RNA 899 ncRNA 118.25-212 chr8 139171038 139171342 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257149 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 175.25-110 chr5 7168150 7168447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101056 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 152.75-30 chr11 3713639 3714011 + 0.75 NA exon (NM_001365127, exon 19 of 33) exon (NM_001365127, exon 19 of 33) -42441 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 131.75-45 chr12 8039881 8040153 + 0.75 NA exon (NM_018416, exon 2 of 11) exon (NM_018416, exon 2 of 11) 7301 NM_018416 55810 Hs.120844 NM_018416 ENSG00000065970 FOXJ2 FHX forkhead box J2 protein-coding 186.75-77 chr4 47776927 47777375 + 0.75 NA intron (NM_001278585, intron 2 of 19) L2c|LINE|L2 -54194 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 152.25-73 chr18 68848286 68848551 + 0.75 NA intron (NM_001093729, intron 6 of 9) intron (NM_001093729, intron 6 of 9) 50338 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 184.25-9 chr1 160557781 160558119 + 0.75 NA intron (NM_001184882, intron 1 of 5) L1PA11|LINE|L1 21546 NM_001184881 8832 Hs.398093 NM_003874 ENSG00000066294 CD84 LY9B|SLAMF5|hCD84|mCD84 CD84 molecule protein-coding 127.25-220 chr9 125471064 125471328 + 0.75 NA intron (NM_001006619, intron 8 of 10) intron (NM_001006619, intron 8 of 10) 209370 NM_001354294 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 161-78 chr3 150423486 150423811 + 0.75 NA intron (NM_014779, intron 2 of 3) intron (NM_014779, intron 2 of 3) 15350 NR_130136 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 174-53 chr2 185855369 185855608 + 0.75 NA Intergenic MSTB2-int|LTR|ERVL-MaLR -55337 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 113.25-106 chr3 20946573 20946743 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -459068 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 141-116 chr4 123194070 123194460 + 0.75 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) MER30|DNA|hAT-Charlie -202530 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 155-140 chr8 80669575 80669926 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 5 of 8) intron (NM_001033723, intron 5 of 8) 183524 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 120.5-235 chr8 135527460 135527840 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 70194 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 141.5-46 chr12 128938061 128938300 + 0.75 NA intron (NM_001366886, intron 8 of 11) MIR|SINE|MIR 84702 NM_001366889 144423 Hs.655668 NM_144669 ENSG00000151948 GLT1D1 - glycosyltransferase 1 domain containing 1 protein-coding 134.5-126 chr3 5293010 5293379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42939 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 179.25-5 chr1 103072213 103072603 + 0.75 NA intron (NM_001854, intron 4 of 66) intron (NM_001854, intron 4 of 66) 36088 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 115.5-6 chr1 79778071 79778377 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -757531 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 160-99 chr7 28905754 28906043 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 52432 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 201.25-22 chr11 76611239 76611585 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 58526 NR_163259 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 167-94 chr5 37767019 37767263 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67681 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 176.5-157 chr7 69008701 69009213 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 588667 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 186-98 chrX 43343190 43343606 + 0.75 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 166404 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 176.75-77 chr22 41554976 41555310 + 0.75 NA intron (NR_134631, intron 1 of 1) intron (NR_134631, intron 1 of 1) 5740 NR_134631 105373044 Hs.551351 NR_134631 LOC105373044 - uncharacterized LOC105373044 ncRNA 157.5-86 chr18 9470490 9470831 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4853 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 135.5-180 chr7 13120366 13120604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 432852 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 156-95 chr21 14823735 14824087 + 0.75 NA non-coding (NR_146322, exon 4 of 4) non-coding (NR_146322, exon 4 of 4) 94757 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 320.75-4 chr10 106786135 106786758 + 0.75 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 378260 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 233.5-7 chr1 108346387 108346801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102513 NM_001143989 148545 Hs.511849 NM_152488 ENSG00000196427 NBPF4 - NBPF member 4 protein-coding 149.75-150 chr6 134308172 134308550 + 0.75 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) intron (NM_001143676, intron 1 of 13) 9697 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 115.75-90 chr18 31802980 31803179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42199 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 215-29 chr15 98324179 98324574 + 0.75 NA non-coding (NR_146566, exon 3 of 3) non-coding (NR_146566, exon 3 of 3) 7182 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 254.25-63 chr7 94351471 94351952 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40481 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 123.75-23 chr11 30397308 30397605 + 0.75 NA intron (NM_001145399, intron 6 of 6) intron (NM_001145399, intron 6 of 6) 74352 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 226-36 chr2 49107200 49107618 + 0.75 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 47106 NM_181446 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 174.75-123 chr8 9911245 9911729 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8015 NR_029668 406907 NR_029668 ENSG00000284321 MIR124-1 MIR124A|MIR124A1|MIRN124-1|MIRN124A1|mir-124-1 microRNA 124-1 ncRNA 157.25-40 chr14 39811870 39812240 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -379555 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 257.5-27 chr16 80102640 80103081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 307611 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 117.75-199 chr7 46567140 46567330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129887 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 127.5-138 chr20 44515619 44515839 + 0.75 NA intron (NM_006811, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 6341 NM_006811 10955 Hs.272168 NM_006811 ENSG00000132824 SERINC3 AIGP1|DIFF33|SBBI99|TDE|TDE1|TMS-1 serine incorporator 3 protein-coding 213.25-23 chr16 63740313 63740720 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1381547 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 137.5-46 chr12 293909 294276 + 0.75 NA intron (NM_001042603, intron 26 of 27) intron (NM_001042603, intron 26 of 27) -31219 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 181.75-46 chr17 54994581 54994993 + 0.75 NA intron (NM_178509, intron 4 of 17) L2b|LINE|L2 -26002 NM_001162861 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 237.5-97 chr7 37428694 37429101 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) 20055 NM_014800 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 197.25-60 chr20 58795400 58795888 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22050 NR_029844 407022 NR_029844 ENSG00000284040 MIR296 MIRN296|miRNA296|mir-296 microRNA 296 ncRNA 199.75-93 chr9 133925214 133925706 + 0.75 NA intron (NM_001134398, intron 2 of 29) AluSx|SINE|Alu 66864 NM_001134398 7410 Hs.369921 NM_003371 ENSG00000160293 VAV2 VAV-2 vav guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 160.25-102 chr3 134845671 134846023 + 0.75 NA intron (NM_004441, intron 1 of 15) intron (NM_004441, intron 1 of 15) 50587 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 126-28 chr10 120881681 120882048 + 0.75 NA intron (NM_018117, intron 13 of 28) L1M5|LINE|L1 30502 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 121-119 chr21 33210277 33210505 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -19504 NM_207585 3455 Hs.708195 NM_000874 ENSG00000159110 IFNAR2 IFN-R|IFN-alpha-REC|IFNABR|IFNARB|IMD45 interferon alpha and beta receptor subunit 2 protein-coding 159.75-29 chr11 64293187 64293512 + 0.75 NA intron (NR_133661, intron 2 of 6) intron (NR_133661, intron 2 of 6) 1351 NM_001317090 50801 Hs.647233 NM_016611 ENSG00000182450 KCNK4 FHEIG|K2p4.1|TRAAK|TRAAK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 4 protein-coding 163.5-190 chr7 50448128 50448578 + 0.75 NA intron (NM_001346562, intron 1 of 3) intron (NM_001346562, intron 1 of 3) 1997 NM_001287492 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 142.25-145 chr6 146724579 146724929 + 0.75 NA intron (NM_024694, intron 18 of 35) intron (NM_024694, intron 18 of 35) 79070 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 137.5-156 chr3 34695132 34695353 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 698781 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 115.75-179 chr5 157446954 157447244 + 0.75 NA intron (NR_136204, intron 1 of 3) intron (NR_136204, intron 1 of 3) -12920 NM_001172292 348938 Hs.4285 NM_001099287 ENSG00000172548 NIPAL4 ARCI6|ICHTHYIN|ICHYN NIPA like domain containing 4 protein-coding 135.25-198 chr8 104018988 104019268 + 0.75 NA intron (NR_145710, intron 24 of 29) AluSz6|SINE|Alu 199908 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 147.25-162 chr9 100904456 100904652 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -124173 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 122.25-168 chr7 2248913 2249189 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_160264) promoter-TSS (NR_160264) -260 NR_160264 4521 Hs.534331 NM_002452 ENSG00000106268 NUDT1 MTH1 nudix hydrolase 1 protein-coding 284 chr1 197106769 197107470 + 0.75 NA intron (NM_018136, intron 17 of 27) L1MD2|LINE|L1 39550 NM_018136 259266 Hs.121028 NM_018136 ENSG00000066279 ASPM ASP|Calmbp1|MCPH5 abnormal spindle microtubule assembly protein-coding 179-71 chr4 37965338 37965737 + 0.75 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) 5139 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 136.25-160 chr6 13420601 13420976 + 0.75 NA intron (NM_018988, intron 1 of 1) intron (NM_018988, intron 1 of 1) -12651 NM_001242630 54438 Hs.484686 NM_018988 ENSG00000145990 GFOD1 ADG-90|C6orf114 glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 251.75-54 chr3 129699279 129699861 + 0.75 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) MER41B|LTR|ERV1 -10838 NM_015008 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 121.75-104 chr20 54510186 54510482 + 0.75 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) intron (NM_018431, intron 1 of 7) 34741 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 112.75-183 chr7 1009118 1009315 + 0.75 NA intron (NM_001134395, intron 3 of 4) intron (NM_001134395, intron 3 of 4) 13810 NR_029898 442907 NR_029898 ENSG00000199023 MIR339 MIRN339|hsa-mir-339|mir-339 microRNA 339 ncRNA 121-136 chr3 158802863 158803095 + 0.75 NA intron (NM_001167903, intron 1 of 14) intron (NM_001167903, intron 1 of 14) 925 NM_001289407 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 164.75-103 chr3 122048819 122049201 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -6352 NM_175862 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 123.75-163 chr6 131652779 131652984 + 0.75 NA exon (NM_005021, exon 5 of 25) exon (NM_005021, exon 5 of 25) 15579 NR_133007 5169 Hs.486489 NM_005021 ENSG00000154269 ENPP3 B10|CD203c|NPP3|PD-IBETA|PDNP3 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3 protein-coding 154-79 chr2 185789900 185790127 + 0.75 NA exon (NM_173651, exon 16 of 23) exon (NM_173651, exon 16 of 23) 10137 NR_144453 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-134 chr3 177904323 177904639 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 87616 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 120.75-104 chr3 13106627 13106963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33366 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 139.75-190 chr9 100445901 100446177 + 0.75 NA intron (NM_001198807, intron 3 of 3) intron (NM_001198807, intron 3 of 3) 4133 NM_001198812 100526694 Hs.598100 NM_001198812 MSANTD3-TMEFF1 C9orf2|C9orf3-TMEFF1|C9orf30-TMEFF1|H7365|TMEFF1|TR-1 MSANTD3-TMEFF1 readthrough protein-coding 115.5-116 chr2 34354713 34354898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 287579 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 138.75-212 chrX 96267574 96267826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70202 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 199-41 chr2 180825024 180825412 + 0.75 NA intron (NR_104323, intron 3 of 5) intron (NR_104323, intron 3 of 5) 133114 NR_104319 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 187.25-74 chr3 143306505 143306773 + 0.75 NA intron (NM_173653, intron 14 of 15) intron (NM_173653, intron 14 of 15) -35607 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-84 chr18 1316662 1317023 + 0.75 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 42787 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 165-50 chr16 21238752 21238989 + 0.75 NA intron (NM_145865, intron 1 of 1) intron (NM_145865, intron 1 of 1) 5171 NM_145865 257629 Hs.115959 NM_145865 ENSG00000175311 ANKS4B HARP ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 4B protein-coding 130.25-48 chr12 131823909 131824204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4337 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 128.75-37 chr11 113718537 113718788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12289 NR_110046 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 156.75-75 chr18 9848011 9848353 + 0.75 NA intron (NM_006868, intron 6 of 6) (TCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -37791 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 191.5-154 chr9 37912870 37913228 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8696 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 139-82 chr2 202909692 202910086 + 0.75 NA intron (NM_018256, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu -2329 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 115.25-52 chr13 21065051 21065246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3562 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 216.25-5 chr1 112315564 112316095 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -80385 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 129.25-188 chr7 79981740 79982094 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152914 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 211.5-156 chr8 78709513 78710017 + 0.75 NA intron (NM_016010, intron 7 of 8) MER30|DNA|hAT-Charlie 14609 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 118.25-204 chr8 124666394 124666633 + 0.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 61960 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 126.25-81 chr2 43127535 43127764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25204 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 140.75-149 chr5 80994665 80994935 + 0.75 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -33893 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 173.5-115 chr4 63439670 63440112 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 969559 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 115-183 chr8 116336002 116336244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11064 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 124.5-195 chr6 126976232 126976441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142335 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 173.5-111 chr4 44999138 44999514 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -272692 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 143.5-20 chr10 27712645 27713065 + 0.75 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) AluJr|SINE|Alu -31760 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 170.25-74 chr2 157089019 157089384 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -168504 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 164.5-91 chr2 35811125 35811457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 339886 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 200.75-64 chr22 25555558 25555990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8901 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 132-39 chr12 92755146 92755369 + 0.75 NA intron (NM_001004330, intron 6 of 11) intron (NM_001004330, intron 6 of 11) 18768 NM_001004330 440107 Hs.591013 NM_001004330 ENSG00000187510 PLEKHG7 - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G7 protein-coding 279-31 chr4 83704204 83704673 + 0.75 NA Intergenic LTR57|LTR|ERVL 168330 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 237-8 chr10 116977804 116978283 + 0.75 NA intron (NM_001258298, intron 1 of 15) intron (NM_001258298, intron 1 of 15) 27144 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 193.75-25 chr11 35491372 35491750 + 0.75 NA intron (NM_015430, intron 3 of 11) intron (NM_015430, intron 3 of 11) 34055 NM_015430 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 198.25-99 chr8 85838449 85838938 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -10751 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 140.75-84 chr2 59664205 59664502 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 446645 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 165-75 chr2 185693152 185693494 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 45396 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 165.25-114 chr5 22661513 22661993 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 191591 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 189.25-10 chr10 59582618 59583013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 127076 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 255.25-13 chr13 66932293 66932823 + 0.75 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) -44831 NR_046636 100874086 Hs.577908 NR_046636 ENSG00000225263 PCDH9-AS3 - PCDH9 antisense RNA 3 ncRNA 118.25-155 chr5 53094318 53094536 + 0.75 NA non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) 15330 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 115.75-118 chr2 223897115 223897357 + 0.75 NA intron (NM_020830, intron 6 of 11) intron (NM_020830, intron 6 of 11) 48099 NM_020830 57590 Hs.368359 NM_020830 ENSG00000085449 WDFY1 FENS-1|FENS1|WDF1|ZFYVE17 WD repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 178.25-31 chr14 47510809 47511345 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 163877 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 179.25-129 chr6 64137049 64137517 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 330447 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 174.5-156 chr5 176851958 176852353 + 0.75 NA intron (NM_133369, intron 1 of 14) intron (NM_133369, intron 1 of 14) 41596 NM_133369 90249 Hs.33191 NM_133369 ENSG00000113763 UNC5A UNC5H1 unc-5 netrin receptor A protein-coding 154.25-4 chr1 65241298 65241577 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -23257 NM_001256865 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 129.5-212 chr7 37722783 37722956 + 0.75 NA intron (NM_001329994, intron 3 of 3) L1ME4a|LINE|L1 39103 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 136.25-152 chr5 109312318 109312698 + 0.75 NA intron (NR_149040, intron 3 of 3) intron (NR_149040, intron 3 of 3) 13861 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 132.5-141 chr20 59893242 59893475 + 0.75 NA intron (NM_014258, intron 21 of 44) intron (NM_014258, intron 21 of 44) 40279 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 139.75-119 chr3 18538010 18538245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92535 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 170.75-15 chr10 74672912 74673230 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) intron (NM_001369124, intron 9 of 9) -143747 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 147.75-119 chr4 91031213 91031603 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 796377 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 320.25-10 chr14 55020606 55021411 + 0.75 NA intron (NM_001008396, intron 1 of 24) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 6091 NM_001008396 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 135.25-73 chr16 58890801 58891059 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -156614 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 233.5-72 chr3 66813166 66813538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75016 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 157.5-162 chr5 62566868 62567266 + 0.75 NA intron (NM_016338, intron 27 of 29) L1M1|LINE|L1 -11668 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 118-155 chr5 120416325 120416512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47860 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 226.75-18 chr13 111962747 111963210 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9332 NR_120392 100505996 Hs.654853 NR_120392 ENSG00000224243 SOX1-OT LINC00403 SOX1 overlapping transcript ncRNA 181-6 chr1 198818766 198819062 + 0.75 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) 40068 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 133.25-47 chr13 29208387 29208644 + 0.75 NA intron (NM_001033602, intron 3 of 13) L1PB1|LINE|L1 184058 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 155.75-102 chr3 34863004 34863430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 530806 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 175.25-74 chr2 147698950 147699340 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -145372 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 127-174 chr8 92133555 92133883 + 0.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -30334 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 113.25-96 chr2 202140802 202141124 + 0.75 NA intron (NM_001277372, intron 13 of 23) intron (NM_001277372, intron 13 of 23) -23905 NR_135243 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 159.25-16 chr10 52386587 52387064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68447 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 155.25-79 chr16 85270538 85271033 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12173 NR_038859 197196 Hs.679002 NM_153238 ENSG00000179219 LINC00311 NCRNA00311|TMEM148 long intergenic non-protein coding RNA 311 ncRNA 122-161 chr6 119287119 119287409 + 0.75 NA intron (NM_005907, intron 5 of 12) intron (NM_005907, intron 5 of 12) 62497 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 159 chr1 53111755 53112068 + 0.75 NA intron (NM_001287596, intron 3 of 3) intron (NM_001287596, intron 3 of 3) 30727 NM_001287595 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 141.25 chr1 23328413 23328849 + 0.75 NA intron (NM_001297622, intron 3 of 8).2 AluSz|SINE|Alu 15653 NM_001297620 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 148.75-165 chr8 53993961 53994180 + 0.75 NA intron (NM_201437, intron 2 of 8) intron (NM_201437, intron 2 of 8) 28378 NR_109901 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 119.75-193 chr7 66157839 66158072 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 43108 NM_014478 27297 Hs.300684 NM_014478 ENSG00000241258 CRCP CGRP-RCP|CGRPRCP|RCP|RCP9|RPC9 CGRP receptor component protein-coding 240.75-32 chr17 59636337 59636810 + 0.75 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) AluJr|SINE|Alu 16678 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 167.75-40 chr12 117922678 117922975 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 1 of 19) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 46164 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 153-114 chr5 18666130 18666446 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 859014 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 189.25-118 chr8 25895503 25895932 + 0.75 NA intron (NM_022659, intron 7 of 15) intron (NM_022659, intron 7 of 15) 149696 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 121.75-57 chr16 55133853 55134135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190565 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 179-35 chr14 69988884 69989309 + 0.75 NA intron (NM_001034852, intron 5 of 11) L1MB7|LINE|L1 10963 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 128.5-240 chr9 98628248 98628549 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) intron (NM_005458, intron 1 of 18) 80537 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 174.25-4 chr1 67263158 67263437 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -44067 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 118.75-202 chr8 124154879 124155080 + 0.75 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 16543 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 186-8 chr10 24367157 24367528 + 0.75 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) -82072 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 160.25-86 chr22 33645059 33645295 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 3 of 14) L1PA8|LINE|L1 59743 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 136.75-138 chr3 188408965 188409351 + 0.75 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) intron (NM_001167672, intron 2 of 9) 159508 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 172.5-47 chr12 25210717 25211199 + 0.75 NA intron (NM_001369787, intron 4 of 4) intron (NM_001369787, intron 4 of 4) 15721 NM_001001660 144363 Hs.209151 NM_001001660 ENSG00000205707 ETFRF1 LYRM5 electron transfer flavoprotein regulatory factor 1 protein-coding 202.25-65 chr5 8205610 8206048 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 251735 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 140.25-38 chr12 55309040 55309292 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -11434 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 127.5-187 chr5 36141066 36141426 + 0.75 NA intron (NM_001007527, intron 3 of 17) intron (NM_001007527, intron 3 of 17) 6742 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 127.75-27 chr10 28834024 28834260 + 0.75 NA Intergenic (ATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12266 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 266-42 chr6 102761133 102761626 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1362394 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 123.25-211 chr8 134839556 134839857 + 0.75 NA intron (NR_126028, intron 1 of 2) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 1637 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 117.75-150 chr4 35127041 35127231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -857389 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 211.75-89 chr7 3933166 3933594 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) AluJb|SINE|Alu -196305 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 210.75-94 chr8 36789191 36789535 + 0.75 NA intron (NM_001031836, intron 2 of 26) AluJo|SINE|Alu 4989 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 141-18 chr10 6627534 6627790 + 0.75 NA non-coding (NR_120634, exon 5 of 6) non-coding (NR_120634, exon 5 of 6) -7408 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 176.75-27 chr12 106102236 106102549 + 0.75 NA intron (NM_014840, intron 2 of 6) MER3|DNA|hAT-Charlie 37641 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 135-197 chr9 38631150 38631473 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 10223 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 128.75-171 chr6 64632590 64632766 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -668740 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 123.5-209 chr8 105807644 105807844 + 0.75 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 252759 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 164.25 chr1 9612252 9612698 + 0.75 NA intron (NM_001130924, intron 10 of 10) intron (NM_001130924, intron 10 of 10) 23564 NM_001010866 199953 Hs.632365 NM_001010866 ENSG00000188807 TMEM201 Ima1|NET5|SAMP1 transmembrane protein 201 protein-coding 242.75-55 chr5 46085912 46086376 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -389764 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 149.25-19 chr10 68951218 68951673 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4725 NM_004728 9188 Hs.223141 NM_004728 ENSG00000165732 DDX21 GUA|GURDB|RH-II/GU|RH-II/GuA DExD-box helicase 21 protein-coding 184-28 chr15 92009733 92010094 + 0.75 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 155609 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 129.75-122 chr3 80301492 80301714 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -463294 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 155.5-170 chr5 99890573 99891071 + 0.75 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 356832 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 269.75-2 chr1 98056229 98056662 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6752 NR_046105 400765 Hs.451802 NM_001001688 ENSG00000225206 MIR137HG - MIR137 host gene ncRNA 198.5-46 chr14 71435840 71436221 + 0.75 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) L1ME4b|LINE|L1 -2909 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 133.75-134 chr3 93978004 93978272 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -2001 NM_001174151 200894 Hs.533086 NM_144996 ENSG00000169379 ARL13B ARL2L1|JBTS8 ADP ribosylation factor like GTPase 13B protein-coding 280.5-7 chr1 248223137 248223680 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -15521 NM_017504 26245 Hs.381309 NM_017504 ENSG00000171180 OR2M4 HSHTPCRX18|HTPCRX18|OR1-55|OST710|TPCR100 olfactory receptor family 2 subfamily M member 4 protein-coding 189.5-77 chr2 185479758 185480247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258717 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 193.75-54 chr16 69739541 69739958 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -13189 NM_000903 1728 Hs.406515 NM_000903 ENSG00000181019 NQO1 DHQU|DIA4|DTD|NMOR1|NMORI|QR1 NAD(P)H quinone dehydrogenase 1 protein-coding 176.25-20 chr11 5728394 5728692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7905 NM_001005180 387748 Hs.689609 NM_001005180 ENSG00000181023 OR56B1 OR11-65|OR56B1P olfactory receptor family 56 subfamily B member 1 protein-coding 119.75-175 chr5 163544382 163544712 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 38928 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 112.75-185 chr7 16053497 16053710 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -156883 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 135.5-95 chr19 50933596 50933902 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 19289 NM_012427 25818 Hs.50915 NM_012427 ENSG00000167754 KLK5 KLK-L2|KLKL2|SCTE kallikrein related peptidase 5 protein-coding 123.75-2 chr1 20881513 20881782 + 0.75 NA intron (NM_003760, intron 14 of 31) AluJb|SINE|Alu -94959 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 162.25-109 chr4 14642345 14642743 + 0.75 NA intron (NR_126435, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 245625 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 146-61 chr2 19614606 19614816 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -254143 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 269.75-20 chr14 97393550 97394060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65011 NR_110166 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 143.5-157 chr4 60056401 60056697 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -866070 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 156.25-112 chr4 60511555 60511942 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -410871 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 175-122 chr7 90225971 90226251 + 0.75 NA intron (NM_001244944, intron 3 of 5) intron (NM_001244944, intron 3 of 5) 12291 NM_001040666 261729 Hs.489051 NM_152999 ENSG00000157214 STEAP2 IPCA1|PCANAP1|PUMPCn|STAMP1|STMP STEAP2 metalloreductase protein-coding 149.25-193 chr9 85083707 85083976 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 377940 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 146.5-102 chr2 69405857 69406114 + 0.75 NA intron (NM_001002756, intron 5 of 6) intron (NM_001002756, intron 5 of 6) -18731 NM_001244710 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 125.5-43 chr11 79600275 79600581 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -159398 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 147.25-13 chr1 212570968 212571251 + 0.75 NA intron (NM_001030287, intron 1 of 3) L1ME2z|LINE|L1 5775 NM_001030287 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 162.75-89 chr20 55677363 55677671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -250320 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 133.75-151 chr4 59966947 59967171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 953486 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 155.25-36 chr11 62646885 62647173 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_198334) promoter-TSS (NM_198334) -303 NM_001278194 23193 Hs.595071 NM_014610 ENSG00000089597 GANAB G2AN|GIIA|GLUII|PKD3 glucosidase II alpha subunit protein-coding 177.5-67 chr18 46454325 46454700 + 0.75 NA intron (NM_152470, intron 6 of 7) intron (NM_152470, intron 6 of 7) 64574 NM_001173129 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 120.75-7 chr1 158959554 158959726 + 0.75 NA intron (NM_198929, intron 7 of 7) LTR22B1|LTR|ERVK 28088 NM_152501 149628 Hs.710248 NM_152501 ENSG00000163564 PYHIN1 IFIX pyrin and HIN domain family member 1 protein-coding 271.75-42 chr7 4745056 4745753 + 0.75 NA intron (NM_001037165, intron 2 of 8) CpG -30219 NM_014855 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 237.25-18 chr12 80977713 80978077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39980 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 122.25-173 chr7 33133481 33133679 + 0.75 NA intron (NM_001348044, intron 1 of 18) L1MB7|LINE|L1 4016 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 233-5 chr1 78112001 78112514 + 0.75 NA intron (NM_001304725, intron 3 of 5) LTR88a|LTR|Gypsy? 66291 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 176.5-94 chr2 101232798 101233229 + 0.75 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 -19873 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 197.5-45 chr16 19171496 19171789 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001308157) promoter-TSS (NM_001308157) -693 NM_001308157 51760 Hs.258326 NM_016524 ENSG00000103528 SYT17 sytXVII synaptotagmin 17 protein-coding 245-74 chr9 100533021 100533391 + 0.75 NA intron (NM_001198812, intron 5 of 9) L1PA2|LINE|L1 -44873 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 157.5-15 chr1 204353313 204353604 + 0.75 NA intron (NM_014935, intron 1 of 22) intron (NM_014935, intron 1 of 22) 6471 NM_014935 22874 Hs.253146 NM_014935 ENSG00000143850 PLEKHA6 PEPP-3|PEPP3 pleckstrin homology domain containing A6 protein-coding 157.75-141 chr5 117064759 117065109 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -302725 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 133.75-181 chr7 106653288 106653474 + 0.75 NA TTS (NM_175884) TTS (NM_175884) 7777 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 237.5-3 chr1 53599118 53599533 + 0.75 NA intron (NM_147193, intron 2 of 9) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 134879 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 159.25-53 chr18 1214725 1215087 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 144723 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 256.75-38 chr7 80255315 80255779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118892 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 177.25-90 chr3 15429418 15429969 + 0.75 NA intron (NM_033083, intron 1 of 5) L1MC5|LINE|L1 2095 NM_033083 85403 Hs.716733 NM_033083 ENSG00000144597 EAF1 - ELL associated factor 1 protein-coding 121.5-164 chr22 33432439 33432830 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) 4035 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 114.5-156 chr2 234652013 234652265 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -30529 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 137.75-107 chr2 139115938 139116402 + 0.75 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 218846 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 141.5-191 chr6 23223043 23223277 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -505236 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 242.25-4 chr1 90034826 90035200 + 0.75 NA 3' UTR (NM_182976, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_182976, exon 12 of 12) 39903 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 238.25-39 chr2 134587999 134588459 + 0.75 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 130771 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 149.75-148 chr6 130727256 130727518 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -100018 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 262-5 chr1 85422168 85422547 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) L1MC3|LINE|L1 -17851 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 194-81 chr7 156164752 156165153 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 202320 NM_001291913 389602 Hs.583071 NM_001291913 LOC389602 - uncharacterized LOC389602 protein-coding 185-23 chr14 82772285 82772783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129902 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 137-36 chr11 88138949 88139183 + 0.75 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) AluYh3|SINE|Alu 36377 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 116.5-224 chr7 6550129 6550389 + 0.75 NA intron (NM_001145118, intron 1 of 21) AluJo|SINE|Alu 1177 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 198-5 chr1 167340527 167340883 + 0.75 NA intron (NM_001365849, intron 3 of 16) AluSz|SINE|Alu 11635 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 129-47 chr12 24196434 24196653 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -15878 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 143.25-41 chr13 47719595 47719963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 212843 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 124.75-162 chr4 143737850 143738090 + 0.75 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -37295 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 152.25-19 chr10 58087285 58087653 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 180425 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 122-102 chr2 184434394 184434614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55529 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 142.25-168 chr8 111168885 111169241 + 0.75 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 67140 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 207.75-86 chr4 27858771 27859112 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 641462 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 131.75-160 chr5 4043097 4043504 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 447468 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 127.25-75 chr18 58927412 58927622 + 0.75 NA intron (NM_001353538, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 62640 NM_001353527 55205 Hs.529023 NM_018181 ENSG00000074657 ZNF532 - zinc finger protein 532 protein-coding 167.75-55 chr16 74993019 74993302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5864 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 130.25-147 chr4 35398369 35398601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 845454 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 215.75-94 chr7 95676677 95677052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80348 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 168.75-71 chr2 70488921 70489317 + 0.75 NA intron (NM_003236, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR -7479 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 219.25-10 chr10 18817770 18818265 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158586 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 157.5-140 chr3 129812084 129812429 + 0.75 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu -17644 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 124.75-25 chr10 15185414 15185642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16835 NM_001308295 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 135.5-11 chr1 151688923 151689262 + 0.75 NA intron (NM_030918, intron 8 of 11) intron (NM_030918, intron 8 of 11) 27711 NM_001172649 11189 Hs.26047 NM_007185 ENSG00000159409 CELF3 BRUNOL1|CAGH4|ERDA4|ETR-1|TNRC4 CUGBP Elav-like family member 3 protein-coding 119.25-137 chr3 176273818 176274195 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29455 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 218.25-80 chr6 62927254 62927760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 392470 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 149.25 chr1 29361673 29362050 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11747 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 193.75-39 chr13 61635738 61636130 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -207988 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 161.75-95 chr4 39053230 39053575 + 0.75 NA intron (NM_001171654, intron 1 of 10) intron (NM_001171654, intron 1 of 10) 8571 NM_001171654 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 152.5-127 chr3 196064238 196064663 + 0.75 NA intron (NM_001313966, intron 8 of 16) intron (NM_001313966, intron 8 of 16) 17640 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 114.25-113 chr20 44205446 44205647 + 0.75 NA intron (NM_016470, intron 2 of 3) intron (NM_016470, intron 2 of 3) 5225 NM_016470 51526 Hs.75798 NM_016470 ENSG00000132823 OSER1 C20orf111|HSPC207|Osr1|Perit1|dJ1183I21.1 oxidative stress responsive serine rich 1 protein-coding 230.5-40 chr15 63623007 63623416 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 73 of 77) intron (NM_003922, intron 73 of 77) -22384 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 128.25-197 chr8 5548060 5548277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -553254 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 115.25-139 chr3 190254512 190254767 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 67807 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 175.25-128 chr7 1395010 1395593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64169 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 148.75-66 chr16 13010343 13010596 + 0.75 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 108871 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 173.25-121 chr7 113590275 113590769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 328487 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 163.5-74 chr17 79920906 79921371 + 0.75 NA intron (NR_110850, intron 4 of 5) intron (NR_110850, intron 4 of 5) 1781 NR_110851 101928738 Hs.399280 NR_110851 ENSG00000262188 LINC01978 - long intergenic non-protein coding RNA 1978 ncRNA 168.75-130 chr7 340421 340951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38739 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 214.75-59 chr4 48723110 48723414 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) AluJr|SINE|Alu 57037 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 178.75-104 chr8 60802246 60802565 + 0.75 NA intron (NM_017780, intron 6 of 37) intron (NM_017780, intron 6 of 37) 61146 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 131.5-88 chr17 55461741 55462080 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40075 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 232-79 chrX 21126905 21127340 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247296 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 195-96 chr8 139467068 139467399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 235890 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 225.5-58 chr2 68864410 68864764 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014482, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_014482, exon 2 of 2) 6810 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 121.75-6 chr1 82017743 82017931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 215384 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 167-20 chr10 72736913 72737346 + 0.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 16100 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 144.25-183 chr7 21639298 21639624 + 0.75 NA intron (NM_001277115, intron 28 of 81) intron (NM_001277115, intron 28 of 81) 96422 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 153.75-135 chr6 140816041 140816322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132367 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 173.25-129 chr8 124038697 124038945 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 19 of 40) L1M5|LINE|L1 1961 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-147 chr7 82467810 82468186 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -24042 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 114.75-194 chr8 90505049 90505327 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 100875 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 116.25-241 chr9 31317794 31317974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63606 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 149.5-17 chr1 240451150 240451466 + 0.75 NA intron (NM_020066, intron 16 of 17) AluSg4|SINE|Alu 160847 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 179.5-66 chr15 87220676 87221228 + 0.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -232526 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 159.5-30 chr11 29002205 29002444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -524776 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 226.25-55 chr4 73609211 73609539 + 0.75 NA intron (NM_001270391, intron 2 of 9) intron (NM_001270391, intron 2 of 9) 11061 NM_177532 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 136.25-14 chr10 57493385 57493653 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -188960 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 135.25-88 chr19 50903096 50903343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6821 NR_002948 606293 Hs.643424 NR_002948 ENSG00000197588 KLKP1 KARMA|KLK31P|KRSP1|PsiKLK1|YKLK1 kallikrein pseudogene 1 pseudo 113.5-93 chr15 97125416 97125605 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 342075 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 165.5-6 chr1 119636378 119636855 + 0.75 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) intron (NM_001080470, intron 1 of 2) 11650 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 138.5-119 chr21 35272991 35273246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -223820 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 288.5-50 chr8 114400477 114401070 + 0.75 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -963834 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 180.25-78 chr3 168379403 168379704 + 0.75 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) L1MA2|LINE|L1 130031 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 171.75-15 chr10 56533813 56534117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172692 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 132.25-75 chr17 58931403 58931670 + 0.75 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1M7|LINE|L1 175344 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 198-35 chr18 13450966 13451332 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR -8798 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 231.75-17 chr13 25922052 25922363 + 0.75 NA intron (NM_016529, intron 33 of 36) intron (NM_016529, intron 33 of 36) 128853 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 176.75-47 chr15 98350240 98350842 + 0.75 NA intron (NR_146567, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 -18983 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 343.25-5 chr14 19952918 19953521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17611 NM_001004063 79544 Hs.554584 NM_001004063 ENSG00000155249 OR4K1 OR14-19 olfactory receptor family 4 subfamily K member 1 protein-coding 124-130 chr5 19258912 19259177 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 627228 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 166.25-154 chrX 94164520 94164928 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 490518 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 134.5-219 chr8 71950221 71950450 + 0.75 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) L1MEh|LINE|L1 -105839 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 160-45 chr18 8925580 8925880 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -176969 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 118.75-73 chr16 85991253 85991425 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 72992 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 190.75-55 chr2 174397107 174397619 + 0.75 NA intron (NM_001193528, intron 1 of 7) intron (NM_001193528, intron 1 of 7) 1633 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 170-53 chr20 20805798 20806087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93298 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 179.25-150 chr9 68766218 68766595 + 0.75 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) L1ME4a|LINE|L1 -13659 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 155.75-45 chr12 113925396 113925742 + 0.75 NA intron (NM_001146698, intron 17 of 24) MIR|SINE|MIR 40756 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 151.75-111 chr5 67467927 67468178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178737 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 214-64 chr8 13594045 13594432 + 0.75 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) intron (NM_001348082, intron 1 of 16) 10382 NM_001348082 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 189.5-72 chr2 127280394 127280750 + 0.75 NA exon (NM_000122, exon 9 of 15) exon (NM_000122, exon 9 of 15) 13572 NM_001303418 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 183.5-110 chr5 45487750 45488166 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 208422 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 149.75-144 chr6 56578508 56578746 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 42 of 94) intron (NM_001144770, intron 42 of 94) 64262 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 206.75-82 chr6 136175297 136175787 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 9 of 12) L1ME4a|LINE|L1 74769 NM_001318738 113115 Hs.121536 NM_138419 ENSG00000146410 MTFR2 DUFD1|FAM54A mitochondrial fission regulator 2 protein-coding 129.75-112 chr22 22172652 22172851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72035 NM_001303509 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 115-62 chr16 73014769 73015101 + 0.75 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) intron (NM_006885, intron 1 of 9) 33193 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 134.25-202 chr9 125893379 125893600 + 0.75 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 145306 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 233.5-115 chr9 28602039 28602869 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 116851 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 125.75-185 chr8 103629160 103629378 + 0.75 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MDa|LINE|L1 -127359 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 118-4 chr1 74831229 74831455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97934 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 145.25-27 chr12 19926362 19926688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -88160 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 131.5-254 chrX 153601861 153602189 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 2685 NR_131982 105373383 Hs.547831 NR_131982 ENSG00000260081 LOC105373383 - uncharacterized LOC105373383 ncRNA 335.25-25 chr3 116342364 116343010 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -17337 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 179.25-19 chr10 56638590 56638964 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -277504 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 169-20 chr12 67938847 67939192 + 0.75 NA intron (NR_120456, intron 2 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 9784 NR_120456 101927922 Hs.450769 NR_120456 ENSG00000255772 LINC01479 HRAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1479 ncRNA 175.75-85 chr3 87127427 87127759 + 0.75 NA intron (NR_104153, intron 1 of 2) intron (NR_104153, intron 1 of 2) 38313 NR_047469 100846978 Hs.570649 NR_047469 ENSG00000281392 LINC00506 - long intergenic non-protein coding RNA 506 ncRNA 144.5-76 chr16 18933643 18933876 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7355 NM_015092 23049 Hs.460179 NM_015092 ENSG00000157106 SMG1 61E3.4|ATX|LIP SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase protein-coding 138.25-45 chr13 92271220 92271478 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 80858 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 170-6 chr1 226001604 226001907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2412 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 244.25-4 chr1 230324856 230325401 + 0.75 NA intron (NM_001258311, intron 6 of 6) intron (NM_001258311, intron 6 of 6) 101204 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 138-165 chr8 126472724 126472937 + 0.75 NA Intergenic MER83|LTR|ERV1 85648 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 249.75-4 chr1 44513282 44513878 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -31913 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 180.5-152 chr8 88970272 88970578 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -642942 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 139-19 chr10 73348461 73348723 + 0.75 NA intron (NM_001367801, intron 3 of 27) intron (NM_001367801, intron 3 of 27) 10162 NM_001350934 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 115.25-165 chr5 83665250 83665560 + 0.75 NA intron (NM_001884, intron 2 of 4) intron (NM_001884, intron 2 of 4) 55450 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 119-143 chr5 31769655 31769858 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 130625 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 258.5-78 chr9 27289773 27290227 + 0.75 NA intron (NM_001161585, intron 4 of 6) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 7139 NM_001161585 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 133-186 chr9 73753178 73753367 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 601407 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 162.25-92 chr2 205085557 205085822 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 4 of 21) intron (NM_205863, intron 4 of 21) 540214 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 165-133 chr7 103629740 103630178 + 0.75 NA exon (NM_173054, exon 20 of 64) exon (NM_173054, exon 20 of 64) -183752 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 149.75-128 chr5 64810198 64810580 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) L1MA7|LINE|L1 41459 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 226.5-96 chr7 93741283 93741729 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 24578 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 122-160 chr6 99099876 99100079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24632 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 144.25-97 chr2 60469657 60470025 + 0.75 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) -78466 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 215-17 chr12 62505160 62505623 + 0.75 NA intron (NM_001278469, intron 7 of 35) L2c|LINE|L2 38565 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 187.25-99 chr7 132268009 132268310 + 0.75 NA intron (NM_020911, intron 4 of 31) intron (NM_020911, intron 4 of 31) 7298 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 144.5-179 chr5 123943053 123943271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 397745 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 149.75-6 chr1 111392130 111392370 + 0.75 NA Intergenic (CTCTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2399 NR_029429 441897 Hs.568387 NR_029429 ENSG00000227179 PGCP1 - progastricsin pseudogene 1 pseudo 134.75-47 chr12 5926671 5926973 + 0.75 NA intron (NM_001278597, intron 1 of 25) intron (NM_001278597, intron 1 of 25) 18437 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 113.75-70 chr15 52258551 52258787 + 0.75 NA intron (NM_018728, intron 10 of 40) intron (NM_018728, intron 10 of 40) 18531 NR_031670 100302202 NR_031670 ENSG00000221052 MIR1266 MIRN1266|hsa-mir-1266|mir-1266 microRNA 1266 ncRNA 151.25-32 chr11 108143500 108143742 + 0.75 NA intron (NM_000019, intron 9 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie 22054 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 211.75-4 chr1 66184367 66184736 + 0.75 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -133833 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 113.75-13 chr1 183655362 183655577 + 0.75 NA intron (NM_001297670, intron 1 of 17) intron (NM_001297670, intron 1 of 17) -2153 NM_203454 403314 Hs.97335 NM_203454 ENSG00000173627 APOBEC4 C1orf169 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4 protein-coding 128.25-9 chr1 118964143 118964424 + 0.75 NA intron (NM_152380, intron 1 of 7) intron (NM_152380, intron 1 of 7) 24060 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 214.75-64 chr4 124423436 124423843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134795 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 174-100 chr8 87642255 87642561 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 231607 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 182-103 chr7 79070676 79071118 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1PA7|LINE|L1 61909 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 116.25-22 chr10 80484745 80485014 + 0.75 NA intron (NM_001351270, intron 2 of 9) intron (NM_001351270, intron 2 of 9) 16616 NM_001351272 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 195.25-24 chr12 62999721 63000124 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64772 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 121.5-143 chr2 157860629 157860900 + 0.75 NA intron (NM_001347666, intron 1 of 11) intron (NM_001347666, intron 1 of 11) 14235 NM_001105 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 161.75-122 chr8 48348868 48349188 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -202539 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 172.75-117 chr7 44726358 44726797 + 0.75 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -21989 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 131-97 chr2 150791984 150792333 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 163261 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 129-2 chr1 28897792 28898000 + 0.75 NA intron (NM_001166007, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 10796 NM_001166007 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 122.75-3 chr1 45811999 45812242 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 1 of 29) L2|LINE|L2 8507 NM_001319245 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 170.25-19 chr11 83647218 83647580 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) HAL1|LINE|L1 35026 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 178.5-12 chr10 21623233 21623564 + 0.75 NA intron (NM_001195626, intron 8 of 22) MER21C|LTR|ERVL 89226 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 141-81 chr2 139527731 139527988 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 630535 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 169.25-15 chr11 103589776 103590204 + 0.75 NA Intergenic LTR1F|LTR|ERV1 -259916 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 131-9 chr1 181049545 181049767 + 0.75 NA intron (NM_001194999, intron 3 of 6) intron (NM_001194999, intron 3 of 6) 16231 NM_001194999 3140 Hs.13500 NM_001531 ENSG00000153029 MR1 HLALS major histocompatibility complex, class I-related protein-coding 121.25-75 chr16 73137092 73137280 + 0.75 NA intron (NM_207385, intron 2 of 3) intron (NM_207385, intron 2 of 3) 7261 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 120-68 chr17 7381504 7381838 + 0.75 NA intron (NM_003985, intron 1 of 12).2 intron (NM_003985, intron 1 of 12).2 582 NM_003985 8711 Hs.203420 NM_003985 ENSG00000174292 TNK1 - tyrosine kinase non receptor 1 protein-coding 136-95 chr22 25452265 25452571 + 0.75 NA intron (NR_033734, intron 1 of 4) L1MA6|LINE|L1 -3228 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 144-77 chr21 7917736 7918135 + 0.75 NA Intergenic (ATTCCATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -88303 NM_001330065 102723475 NM_001330065 ENSG00000276289 KCNE1B - potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1B protein-coding 189-60 chr2 109719850 109720142 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72762 NM_001123363 729540 Hs.535589 NM_001037866 ENSG00000183054 RGPD6 RGP6|RGPD7|RanBP2L1|RanBP2L2 RANBP2 like and GRIP domain containing 6 protein-coding 129.25-224 chrX 145368290 145368605 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 120944 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 125-113 chr4 57086300 57086568 + 0.75 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) HAL1M8|LINE|L1 -23328 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 221.75-14 chr10 132740539 132740913 + 0.75 NA intron (NM_005539, intron 9 of 15) intron (NM_005539, intron 9 of 15) 45421 NM_177400 84504 Hs.134013 NM_177400 ENSG00000148826 NKX6-2 GTX|NKX6.2|NKX6B|SPAX8 NK6 homeobox 2 protein-coding 114.75-33 chr11 31018015 31018311 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -25477 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 144.75-184 chr8 120630270 120630522 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) LTR33|LTR|ERVL -130857 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 199.75-46 chr2 66861457 66861774 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42821 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 140.25-9 chr1 87001093 87001304 + 0.75 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) intron (NM_012262, intron 1 of 6) 86563 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 142.5-227 chr8 120404760 120405121 + 0.75 NA intron (NM_014078, intron 6 of 6) L2b|LINE|L2 40210 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 176-23 chr14 59265866 59266137 + 0.75 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 2560 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 202 chr1 46263068 46263346 + 0.75 NA intron (NM_001142548, intron 9 of 18) intron (NM_001142548, intron 9 of 18) 15444 NM_003579 8438 Hs.642042 NM_003579 ENSG00000085999 RAD54L HR54|RAD54A|hHR54|hRAD54 RAD54 like protein-coding 200.5-64 chr2 50293870 50294429 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 53605 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 170.5-197 chr8 140315296 140315614 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) MER4-int|LTR|ERV1 142289 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 142-119 chr4 44228163 44228402 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 211220 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 190.25-127 chr9 28568739 28569227 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1MA9|LINE|L1 150322 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 257.5-73 chr7 54980617 54981126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38146 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 168.25 chr1 25576082 25576457 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 32684 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 140-176 chr9 78783280 78783589 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 362232 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 206.75-90 chr8 38331244 38331623 + 0.75 NA exon (NM_017778, exon 5 of 10) exon (NM_017778, exon 5 of 10) 50838 NM_023034 54904 Hs.434966 NM_017778 ENSG00000147548 NSD3 KMT3F|KMT3G|WHISTLE|WHSC1L1|pp14328 nuclear receptor binding SET domain protein 3 protein-coding 117-150 chr5 78290853 78291049 + 0.75 NA intron (NM_003664, intron 1 of 26) AluJo|SINE|Alu 3747 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 214.25-41 chr2 51604959 51605327 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1PA10|LINE|L1 572542 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 185.75-7 chr1 157563195 157563594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10879 NM_031281 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 125.5-219 chr6 65081158 65081363 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) MIRb|SINE|MIR -220158 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 116.5-185 chr4 182901002 182901263 + 0.75 NA intron (NM_001012732, intron 3 of 5) intron (NM_001012732, intron 3 of 5) 16121 NM_001351743 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 158.5-74 chr15 66935107 66935379 + 0.75 NA intron (NR_135687, intron 2 of 2) intron (NR_135687, intron 2 of 2) 21272 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 113.75-40 chr12 1467178 1467461 + 0.75 NA intron (NR_027948, intron 19 of 19) intron (NR_027948, intron 19 of 19) -33172 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 122-30 chr10 66576869 66577120 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1PA16|LINE|L1 -349042 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 172-67 chr22 27966539 27966931 + 0.75 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 -46123 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 175.5-171 chr8 126093216 126093511 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142166 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 335.75-2 chr1 82184767 82185588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 382724 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 191.25-58 chr2 133395037 133395568 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 129107 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 144.25-135 chr4 31088418 31088632 + 0.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -82619 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 191-42 chr2 167833890 167834251 + 0.75 NA intron (NM_020981, intron 1 of 1) intron (NM_020981, intron 1 of 1) 15398 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 176.5-87 chr2 39072057 39072346 + 0.75 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) L2c|LINE|L2 48262 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 214.75-15 chr11 71453673 71454247 + 0.75 NA intron (NM_018161, intron 1 of 20) AluSx|SINE|Alu 757 NM_018161 55191 Hs.556986 NM_018161 ENSG00000172890 NADSYN1 - NAD synthetase 1 protein-coding 190-45 chr3 115381904 115382289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -234808 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 140-139 chr5 102588444 102588778 + 0.75 NA intron (NR_047462, intron 1 of 1) intron (NR_047462, intron 1 of 1) 7243 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 193.25-32 chr14 68830275 68830595 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -34192 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 117-29 chr11 109823837 109824032 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -269458 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 207.5-96 chr6 54498336 54498714 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 190084 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 140.75-164 chr6 62767028 62767321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -480947 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 152.75-19 chr10 51421260 51421647 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) AluJr|SINE|Alu 121880 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 114.25-63 chr15 77409533 77409834 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 10421 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 196-91 chr7 84221183 84221498 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -26551 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 153.5-162 chr5 126232127 126232432 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 52702 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 137.5-202 chr6 37627061 37627389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70658 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 162-8 chr1 182819520 182819818 + 0.75 NA intron (NM_001200052, intron 10 of 11) intron (NM_001200052, intron 10 of 11) -19678 NR_033302 1660 Hs.191518 NM_001357 ENSG00000135829 DHX9 DDX9|LKP|NDH2|NDHII|RHA DExH-box helicase 9 protein-coding 151.25-34 chr11 112835572 112835786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125741 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 196.75-58 chr2 75604449 75604729 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34870 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 138-38 chr14 45726224 45726531 + 0.75 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 -10775 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 132.25-151 chr5 30395990 30396226 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 515548 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 212.5-55 chr2 137628377 137628783 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 20 of 27) intron (NM_001316349, intron 20 of 27) 299352 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 271.75-40 chr6 78709895 78710322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157443 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 130.25-220 chr9 98813253 98813625 + 0.75 NA intron (NM_024642, intron 1 of 9) intron (NM_024642, intron 1 of 9) 5769 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 180-95 chr4 179046517 179046858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1138751 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 184.25-18 chr10 30997723 30998158 + 0.75 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 1577 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 124.75-38 chr10 122306978 122307310 + 0.75 NA intron (NM_001318189, intron 9 of 15) intron (NM_001318189, intron 9 of 15) 35848 NM_144587 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 148.5-8 chr1 114319657 114320035 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -165977 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 212.25-83 chr7 24329892 24330258 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 45885 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 192.75-81 chr22 45841671 45842015 + 0.75 NA intron (NM_013236, intron 10 of 11) intron (NM_013236, intron 10 of 11) 81319 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 167-89 chr4 185888585 185888902 + 0.75 NA intron (NM_021069, intron 1 of 20) intron (NM_021069, intron 1 of 20) 67629 NM_021069 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 192.5-141 chr9 79377310 79377600 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -194318 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 127.5-198 chr5 115991845 115992116 + 0.75 NA intron (NM_173800, intron 4 of 19) intron (NM_173800, intron 4 of 19) 29505 NM_173800 206338 Hs.98288 NM_173800 ENSG00000172901 LVRN APQ|AQPEP|TAQPEP laeverin protein-coding 114.75-20 chr1 235515897 235516087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11540 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 134.25-34 chr12 45368408 45368718 + 0.75 NA intron (NM_001025356, intron 9 of 19) intron (NM_001025356, intron 9 of 19) 75873 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 144-146 chr9 23912905 23913261 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -62482 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 147.25-6 chr1 86222903 86223299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66117 NR_146340 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 114.5-82 chr14 20165923 20166118 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 22284 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 164.75-125 chr6 50633785 50634169 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -79567 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 155-6 chr1 149916044 149916425 + 0.75 NA intron (NM_014849, intron 1 of 12) intron (NM_014849, intron 1 of 12) 1610 NM_014849 9900 Hs.516153 NM_014849 ENSG00000159164 SV2A SV2 synaptic vesicle glycoprotein 2A protein-coding 150.25-10 chr1 168324488 168324716 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 43725 NM_005149 9095 Hs.716656 NM_005149 ENSG00000143178 TBX19 TBS19|TPIT|dJ747L4.1 T-box transcription factor 19 protein-coding 140.25-47 chr14 46051910 46052196 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -12106 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 128.75-91 chr2 24118346 24118758 + 0.75 NA intron (NM_199346, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 4782 NM_199346 375189 Hs.442718 NM_199346 ENSG00000176732 PFN4 - profilin family member 4 protein-coding 137.5-175 chr4 67561387 67561617 + 0.75 NA intron (NM_012108, intron 1 of 8) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 2775 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 167.5-138 chr5 27419837 27420143 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -52302 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 193.25-58 chr2 88776121 88776541 + 0.75 NA intron (NR_015424, intron 2 of 16) intron (NR_015424, intron 2 of 16) 10429 NR_015424 645784 Hs.105323 NR_015424 ENSG00000230006 ANKRD36BP2 - ankyrin repeat domain 36B pseudogene 2 pseudo 184.5-99 chr3 52839883 52840356 + 0.75 NA 3' UTR (NM_198563, exon 8 of 9) 3' UTR (NM_198563, exon 8 of 9) -5100 NM_205853 389125 Hs.556077 NM_205853 ENSG00000272573 MUSTN1 MUSTANG musculoskeletal, embryonic nuclear protein 1 protein-coding 237.75-61 chr4 136030786 136031393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117409 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 145-121 chr5 35513745 35513981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104000 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 210.25-74 chr7 116014663 116015141 + 0.75 NA intron (NM_012252, intron 1 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 15861 NM_012252 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 164.5-9 chr1 74834564 74834948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101348 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 193.5-121 chr4 86756822 86757233 + 0.75 NA intron (NM_080685, intron 20 of 47) intron (NM_080685, intron 20 of 47) 92357 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 190-57 chr5 8967449 8967818 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86262 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 133.75-105 chr2 153746438 153746756 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -125325 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 164-71 chr22 45000387 45000732 + 0.75 NA TTS (NR_147506) TTS (NR_147506) 3060 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 155.75-152 chr7 86136685 86136976 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -507079 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 152.75-9 chr1 162373373 162373707 + 0.75 NA 3' UTR (NM_182581, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_182581, exon 3 of 3) 3314 NM_182581 284680 Hs.97784 NM_182581 ENSG00000171722 SPATA46 C1orf111|HSD20 spermatogenesis associated 46 protein-coding 191-35 chr2 62971604 62972033 + 0.75 NA intron (NM_001354215, intron 15 of 24) intron (NM_001354215, intron 15 of 24) 75893 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 171-38 chr14 72695280 72695674 + 0.75 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) intron (NM_001280544, intron 6 of 9) 178657 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 235.75-81 chr8 130405852 130406503 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) L2a|LINE|L2 37483 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 182.75-31 chr11 94733640 94733914 + 0.75 NA intron (NR_135096, intron 1 of 6) intron (NR_135096, intron 1 of 6) 6578 NR_135096 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 136.5-5 chr1 54359421 54359696 + 0.75 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) intron (NM_001009955, intron 4 of 16) 46836 NM_001009955 23648 Hs.476706 NM_018070 ENSG00000157216 SSBP3 CSDP|SSDP|SSDP1 single stranded DNA binding protein 3 protein-coding 124.5-163 chr5 45708562 45708784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12293 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 115.75-168 chr5 77331061 77331286 + 0.75 NA intron (NM_001029851, intron 4 of 18) intron (NM_001029851, intron 4 of 18) 120493 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 152.75-61 chr15 47455633 47455943 + 0.75 NA intron (NM_001198999, intron 2 of 19) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -261717 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 140-75 chr2 98453016 98453483 + 0.75 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 7239 NM_001351428 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 124.5-247 chr9 105622210 105622468 + 0.75 NA intron (NM_001351498, intron 9 of 9) intron (NM_001351498, intron 9 of 9) -40118 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 286.75-24 chr2 210165225 210165976 + 0.75 NA intron (NM_001307976, intron 1 of 13) intron (NM_001307976, intron 1 of 13) 5809 NM_001307976 151050 Hs.282260 NM_152519 ENSG00000144445 KANSL1L C2orf67|MSL1v2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like protein-coding 135.25-183 chr6 156497632 156497927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119029 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 217-87 chrX 75053518 75053898 + 0.75 NA intron (NM_001271699, intron 14 of 14) intron (NM_001271699, intron 14 of 14) 102575 NM_001271696 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 213.25-31 chr2 89845051 89845605 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -207421 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 135.75-121 chr20 25324118 25324400 + 0.75 NA intron (NM_001042472, intron 2 of 12) intron (NM_001042472, intron 2 of 12) 66576 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 135.75-120 chr20 22911366 22911661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123907 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 160.25-118 chr4 166875254 166875498 + 0.75 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) intron (NM_001040159, intron 6 of 10) 359050 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 123.25-77 chr17 31608950 31609143 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 33635 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 115.5-210 chr6 18478177 18478402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44458 NR_149116 105374956 Hs.561599 NR_149116 MIR548A1HG - MIR548A1 host gene ncRNA 148.25-50 chr17 27888716 27889010 + 0.75 NA intron (NM_001076680, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 4502 NM_001076680 201229 Hs.687951 NM_001076680 ENSG00000232859 LYRM9 C17orf108|HSD24 LYR motif containing 9 protein-coding 116-17 chr10 61346121 61346388 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -106385 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 182.25-7 chr1 174734604 174734892 + 0.75 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) 33753 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 128-70 chr2 34723180 34723431 + 0.75 NA TTS (NR_126404) TTS (NR_126404) 45748 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 170.5-173 chr7 33825166 33825411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79627 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 167.75-123 chr6 64487345 64487741 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 680707 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 162-130 chr9 102771144 102771494 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -224014 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 198.5-98 chr3 135968401 135968803 + 0.75 NA intron (NM_001190447, intron 1 of 12) MER5B|DNA|hAT-Charlie 2874 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 243.75-63 chr4 62793523 62793943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -631968 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 124.75-137 chr22 40791443 40791764 + 0.75 NA intron (NR_104235, intron 5 of 10) L1MB2|LINE|L1 22355 NR_039923 100616283 NR_039923 ENSG00000266594 MIR4766 mir-4766 microRNA 4766 ncRNA 228-80 chr8 103350470 103350872 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -20867 NM_138455 115908 Hs.405614 NM_138455 ENSG00000164932 CTHRC1 - collagen triple helix repeat containing 1 protein-coding 190.5-41 chr13 67342061 67342560 + 0.75 NA Intergenic HERVP71A-int|LTR|ERV1 -30077 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 152.75-163 chr9 92520266 92520565 + 0.75 NA intron (NM_001197296, intron 2 of 9) L1MB5|LINE|L1 7643 NR_039817 100616351 NR_039817 ENSG00000264158 MIR4670 - microRNA 4670 ncRNA 112.5-159 chr22 34139772 34139988 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -216992 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 136.5-139 chr22 25097160 25097484 + 0.75 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 15370 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 124.25-89 chr2 9526927 9527217 + 0.75 NA intron (NM_003183, intron 5 of 18) AluSz|SINE|Alu 28758 NM_003183 6868 Hs.404914 NM_003183 ENSG00000151694 ADAM17 ADAM18|CD156B|CSVP|NISBD|NISBD1|TACE ADAM metallopeptidase domain 17 protein-coding 159.5-72 chr16 87363827 87364101 + 0.75 NA intron (NM_001282683, intron 2 of 9) intron (NM_001282683, intron 2 of 9) 19812 NM_024735 79791 Hs.567582 NM_024735 ENSG00000103264 FBXO31 FBX14|FBXO14|Fbx31|MRT45|pp2386 F-box protein 31 protein-coding 137-11 chr1 170304493 170304819 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20448 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 180.5-127 chr6 39636438 39636791 + 0.75 NA intron (NM_001289020, intron 4 of 21) intron (NM_001289020, intron 4 of 21) 88794 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 124-65 chr17 67737414 67737784 + 0.75 NA exon (NM_015462, exon 12 of 18) exon (NM_015462, exon 12 of 18) -3071 NR_003706 100124536 Hs.693446 NR_003706 ENSG00000200394 SNORA38B - small nucleolar RNA, H/ACA box 38B snoRNA 129.5-84 chr15 94881319 94881538 + 0.75 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 26065 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 129.5-239 chr9 80175195 80175497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 200323 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 123-106 chr2 88530814 88531069 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 6292 NM_152670 200523 Hs.132104 NM_152670 ENSG00000172073 TEX37 C2orf51|TSC21 testis expressed 37 protein-coding 184-31 chr16 52869122 52869440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 183592 NR_147075 105371267 Hs.147562 NR_136518 ENSG00000277639 LOC105371267 PR-lncRNA-1 p53-regulated lncRNA 1 ncRNA 153-65 chr2 18823587 18823861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203247 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 129.75-154 chr5 149971797 149972050 + 0.75 NA intron (NM_000112, intron 1 of 2) intron (NM_000112, intron 1 of 2) 11186 NM_000112 1836 Hs.302738 NM_000112 ENSG00000155850 SLC26A2 D5S1708|DTD|DTDST|EDM4|MST153|MSTP157 solute carrier family 26 member 2 protein-coding 123-194 chr8 141475711 141476040 + 0.75 NA intron (NR_102364, intron 12 of 26) MIR1_Amn|SINE|MIR 31354 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 139-37 chr14 48150892 48151246 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -356055 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 132-110 chr3 49756907 49757202 + 0.75 NA intron (NM_153273, intron 1 of 5) intron (NM_153273, intron 1 of 5) 29140 NM_001242829 9807 Hs.386168 NM_153273 ENSG00000176095 IP6K1 IHPK1|PiUS inositol hexakisphosphate kinase 1 protein-coding 146.75-139 chr6 19562191 19562473 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 112511 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 318.25-20 chr8 117625040 117625627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104620 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 127.5-245 chr8 123970544 123970953 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 6 of 40) intron (NM_001039112, intron 6 of 40) 70034 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 263.25-61 chr9 73522772 73523365 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 371203 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 119-43 chr13 69166628 69166957 + 0.75 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -55554 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 190.75-74 chr4 56691527 56691917 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -10016 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 173-145 chr8 128998250 128998603 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -32425 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 149.5-91 chr2 59908855 59909105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 474056 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 145-30 chr11 83737614 83737876 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) AluYk12|SINE|Alu -55320 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 123-103 chr2 79249629 79249850 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89986 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 121-127 chr3 21106714 21106932 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -298903 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 280.25-23 chr15 90385474 90386058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2476 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 161.25-150 chr6 46172325 46172828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1566 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 143.75-143 chr5 59263811 59264197 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 12111 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 180.75-25 chr11 113195035 113195382 + 0.75 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 78693 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 195.75-121 chr8 127734121 127734548 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_117102) promoter-TSS (NR_117102) -367 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 191.5-2 chr1 17918247 17918709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -147179 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 120.25-175 chr5 148397518 148397756 + 0.75 NA intron (NM_001271723, intron 2 of 20) intron (NM_001271723, intron 2 of 20) 13679 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 155.25-158 chr6 135630553 135630797 + 0.75 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) intron (NR_152845, intron 2 of 4) 132874 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 143.75-43 chr12 131148321 131148598 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -16552 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 137.25-120 chr5 23769631 23769925 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -181570 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 129.75-5 chr1 52987372 52987726 + 0.75 NA intron (NM_001193600, intron 9 of 14) intron (NM_001193600, intron 9 of 14) -27388 NM_001007100 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 199.25-43 chr17 29336367 29336701 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -42386 NM_020772 57532 Hs.462598 NM_020772 ENSG00000108256 NUFIP2 182-FIP|82-FIP|FIP-82|PIG1 nuclear FMR1 interacting protein 2 protein-coding 150.25-34 chr11 100202742 100203064 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 14 of 23) intron (NM_001243270, intron 14 of 23) -484385 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 153.5-73 chr16 78639693 78639918 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) AluSq2|SINE|Alu 540151 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 227.5-102 chr8 69899799 69900335 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -65089 NM_030958 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 202-47 chr4 103760653 103761022 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -40852 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 230-18 chr14 42391922 42392408 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 785309 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 142-72 chr18 54967308 54967547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7966 NM_025214 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 128.5-193 chr6 97684258 97684544 + 0.75 NA intron (NR_110757, intron 3 of 4) intron (NR_110757, intron 3 of 4) -340130 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 127-86 chr18 1798495 1798734 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -438985 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 139.25-131 chr4 17914380 17914715 + 0.75 NA intron (NR_158563, intron 4 of 5) intron (NR_158563, intron 4 of 5) 103568 NM_022346 64151 Hs.567567 NM_022346 ENSG00000109805 NCAPG CAPG|CHCG|NY-MEL-3|YCG1 non-SMC condensin I complex subunit G protein-coding 136.75-135 chr3 155883479 155883783 + 0.75 NA intron (NM_003875, intron 1 of 15) intron (NM_003875, intron 1 of 15) 12981 NM_003875 8833 Hs.591314 NM_003875 ENSG00000163655 GMPS GATD7 guanine monophosphate synthase protein-coding 160.5-157 chr6 6813919 6814315 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -191291 NR_026970 285780 Hs.655737 NM_173675 ENSG00000216863 LY86-AS1 LY86-AS|LY86AS LY86 antisense RNA 1 ncRNA 136.25-25 chr10 101292411 101292676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28993 NR_120621 101927419 Hs.638503 NR_120621 ENSG00000229649 LINC02681 - long intergenic non-protein coding RNA 2681 ncRNA 170.75-59 chr19 33790770 33791115 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5928 NM_001129995 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 184-18 chr11 114758375 114758664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79992 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 165.75-146 chr6 67283074 67283552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -772038 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 180-28 chr14 23915274 23915635 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -38316 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 235-31 chr2 39104002 39104495 + 0.75 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) AluSq10|SINE|Alu 16215 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 115.25-9 chr1 63812102 63812325 + 0.75 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) AluSx3|SINE|Alu 38196 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 137-130 chr5 19520572 19520878 + 0.75 NA exon (NM_001349563, exon 11 of 14) exon (NM_001349563, exon 11 of 14) 365547 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 148-93 chr4 91996743 91997067 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 280397 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 237.5-43 chr18 7685497 7686109 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 118487 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 117-34 chr12 995906 996161 + 0.75 NA intron (NR_027948, intron 1 of 19) intron (NR_027948, intron 1 of 19) 4810 NR_027948 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 283.75-32 chr8 112282120 112282669 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 54 of 66) intron (NM_001363185, intron 54 of 66) -361099 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 121.5-212 chr5 130909344 130909536 + 0.75 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 255816 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 228.75-62 chr5 5202810 5203409 + 0.75 NA intron (NM_139056, intron 9 of 22) MER131|DNA?|DNA? 62779 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 224-64 chr8 139124597 139125044 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -210779 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 181.5-159 chr8 111263968 111264399 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -27980 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 216.75-70 chr6 49633390 49633741 + 0.75 NA intron (NM_000324, intron 1 of 9) intron (NM_000324, intron 1 of 9) 3309 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 221.75-18 chr12 93445939 93446550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4297 NM_003348 7334 Hs.524630 NM_003348 ENSG00000177889 UBE2N HEL-S-71|UBC13|UBCHBEN; UBC13|UbcH-ben|UbcH13 ubiquitin conjugating enzyme E2 N protein-coding 134-93 chr2 104313530 104313855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94640 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 181.75-48 chr17 65695719 65695992 + 0.75 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 130596 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 160.25-98 chr3 103202178 103202559 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 321748 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 116.5-210 chr6 10947663 10947961 + 0.75 NA intron (NM_001040274, intron 23 of 29) L1MEd|LINE|L1 6277 NR_125851 101928191 Hs.638939 NR_125851 LOC101928191 - uncharacterized LOC101928191 ncRNA 154.5-89 chr19 37979756 37980000 + 0.75 NA intron (NM_015073, intron 1 of 21) intron (NM_015073, intron 1 of 21) 72670 NM_015073 23094 Hs.655502 NM_015073 ENSG00000105738 SIPA1L3 CTRCT45|SPAL3|SPAR3 signal induced proliferation associated 1 like 3 protein-coding 167-39 chr14 47409625 47409929 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -66531 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 112.75-68 chr15 61372726 61373007 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -143564 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 233.75-47 chr3 4817501 4818002 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 58 of 60) MIRb|SINE|MIR -66161 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 284.5-13 chr14 52786911 52787546 + 0.75 NA intron (NM_198066, intron 1 of 5) intron (NM_198066, intron 1 of 5) 4379 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 167.75-48 chr14 68130040 68130340 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 306598 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 163.75-63 chr2 38459663 38459953 + 0.75 NA intron (NR_110259, intron 4 of 4) AluSx1|SINE|Alu 28514 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 170.5-56 chr14 30058663 30059113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -131041 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 144.5-44 chr11 111895144 111895388 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 15473 NM_001368246 1410 Hs.53454 NM_001885 ENSG00000109846 CRYAB CMD1II|CRYA2|CTPP2|CTRCT16|HEL-S-101|HSPB5|MFM2 crystallin alpha B protein-coding 123.75-156 chr6 52138786 52139064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5424 NR_029713 406989 NR_029713 ENSG00000207604 MIR206 MIRN206|miRNA206|mir-206 microRNA 206 ncRNA 135.25-107 chr2 159278525 159278799 + 0.75 NA intron (NM_001330279, intron 2 of 9) intron (NM_001330279, intron 2 of 9) 8041 NM_001330278 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 141-44 chr14 55298103 55298457 + 0.75 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) MER30|DNA|hAT-Charlie 26126 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 164.75-41 chr12 107016946 107017431 + 0.75 NA intron (NM_004075, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 -30022 NM_025198 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 138-107 chr3 131063753 131064106 + 0.75 NA intron (NM_001353038, intron 4 of 18) L1MB7|LINE|L1 36201 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 135-86 chr2 178388667 178389016 + 0.75 NA intron (NM_001201480, intron 21 of 25) L2c|LINE|L2 -24818 NR_110206 101927027 Hs.715694 NR_110204 ENSG00000223960 CHROMR CHROME|PRKRA-AS1 cholesterol induced regulator of metabolism RNA ncRNA 113.75-43 chr12 20726624 20726913 + 0.75 NA intron (NM_017435, intron 9 of 14) L1PA16|LINE|L1 31303 NM_001145944 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 122-95 chr2 88122749 88122912 + 0.75 NA TTS (NM_001443) TTS (NM_001443) 5232 NM_001443 2168 Hs.380135 NM_001443 ENSG00000163586 FABP1 FABPL|L-FABP fatty acid binding protein 1 protein-coding 264.5-54 chr6 135777384 135777943 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -74038 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 126.75-114 chr2 108195288 108195501 + 0.75 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22447 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 126.25-226 chrX 8621400 8621696 + 0.75 NA intron (NM_000216, intron 3 of 13) intron (NM_000216, intron 3 of 13) 110589 NM_000216 3730 Hs.521869 NM_000216 ENSG00000011201 ANOS1 ADMLX|HH1|HHA|KAL|KAL1|KALIG-1|KMS|WFDC19 anosmin 1 protein-coding 149.25-59 chr17 41786874 41787282 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001352773) promoter-TSS (NM_001352773) -310 NM_001352775 3728 Hs.514174 NM_002230 ENSG00000173801 JUP CTNNG|DP3|DPIII|PDGB|PKGB junction plakoglobin protein-coding 134.75-114 chr2 127250669 127250872 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -30471 NM_001367501 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 174.5-67 chr14 82816459 82816782 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 173988 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 347.75-13 chr7 43845999 43846850 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23093 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 173.75-120 chr4 145206180 145206635 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25818 NM_001366057 54726 Hs.270851 NM_017493 ENSG00000164164 OTUD4 DUBA6|HIN1|HSHIN1 OTU deubiquitinase 4 protein-coding 186.25-87 chr5 7965426 7965767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96448 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 136.25-92 chr2 40164269 40164543 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 6 of 8) intron (NM_001351483, intron 6 of 8) 246772 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 202-19 chr12 41029321 41029781 + 0.75 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) L1MA9|LINE|L1 121194 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 143.25-12 chr1 182612780 182613012 + 0.75 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -2244 NR_036490 284648 Hs.253475 NR_036490 ENSG00000261504 LINC01686 - long intergenic non-protein coding RNA 1686 ncRNA 184-20 chr12 24146874 24147282 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) L1ME2|LINE|L1 -65343 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 193.5-33 chr12 52926664 52926953 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001256282) promoter-TSS (NM_001256282) -339 NM_001256282 3856 Hs.533782 NM_002273 ENSG00000170421 KRT8 CARD2|CK-8|CK8|CYK8|K2C8|K8|KO keratin 8 protein-coding 116-110 chr3 173686077 173686324 + 0.75 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 101766 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 142.5-189 chr6 76924940 76925139 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -331416 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 220.75-81 chrX 29121576 29121974 + 0.75 NA intron (NM_014271, intron 2 of 10) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -452503 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 163-95 chr5 55942461 55942944 + 0.75 NA non-coding (NR_120480, exon 17 of 18) non-coding (NR_120480, exon 17 of 18) 52261 NR_157112 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 135.5-106 chr2 106081107 106081368 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 15549 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 157.75-47 chr14 63491584 63491904 + 0.75 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 16494 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 229-4 chr1 62853481 62853982 + 0.75 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) AluJr|SINE|Alu 69599 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 155.25-128 chr4 36093826 36094264 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 27 of 32) intron (NR_146894, intron 27 of 32) 149894 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 253-28 chr21 15869912 15870495 + 0.75 NA intron (NM_001283042, intron 22 of 24) intron (NM_001283042, intron 22 of 24) 140221 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 166.25-140 chr7 145903744 145904015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -870392 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 134-153 chr6 135903782 135904047 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) intron (NM_018945, intron 1 of 12) 52213 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 191-93 chrX 98785815 98786192 + 0.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -1221468 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 126-104 chr2 159864673 159865040 + 0.75 NA exon (NM_001198759, exon 14 of 39) exon (NM_001198759, exon 14 of 39) 39900 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 126.75-97 chr19 11783078 11783320 + 0.75 NA 3' UTR (NM_152355, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_152355, exon 4 of 4) -15324 NM_152356 126069 Hs.631634 NM_152356 ENSG00000177599 ZNF491 - zinc finger protein 491 protein-coding 210.25-26 chr15 95946315 95946939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 181214 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 207.25-25 chr15 35465474 35465853 + 0.75 NA intron (NM_080650, intron 3 of 8) intron (NM_080650, intron 3 of 8) 80502 NM_001141972 89978 Hs.107196 NM_080650 ENSG00000134146 DPH6 ATPBD4 diphthamine biosynthesis 6 protein-coding 153.5-187 chr7 108044056 108044406 + 0.75 NA intron (NM_001318046, intron 28 of 33) intron (NM_001318046, intron 28 of 33) -41070 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 211.75-6 chr1 87014912 87015434 + 0.75 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) AluSc|SINE|Alu 100538 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 209-53 chr4 60650080 60650580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -272289 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 122.25-120 chr3 4813391 4813627 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 56 of 60) intron (NM_001168272, intron 56 of 60) -61919 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 126.75-55 chr14 57704390 57704604 + 0.75 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 160502 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 133-12 chr1 214133734 214134030 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 145349 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 183-51 chr2 121271799 121272248 + 0.75 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) intron (NM_014553, intron 2 of 14) 13179 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 144.5-124 chr22 24816640 24816939 + 0.75 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 10568 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 132.75-32 chr10 104794678 104795097 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -128671 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 228.75-40 chr2 53747251 53747804 + 0.75 NA intron (NM_001201965, intron 2 of 8) AluSq2|SINE|Alu -20256 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 165.75-71 chr18 71395513 71395951 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 183224 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 119.5-255 chr9 91791532 91791740 + 0.75 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 -155291 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 199.25-7 chr10 51843271 51843735 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -143908 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 191.75-119 chr7 69804578 69805154 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) MER5A|DNA|hAT-Charlie 206391 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 150.5-10 chr1 162188397 162188718 + 0.75 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) intron (NM_014697, intron 2 of 9) 31450 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 182.25-75 chr3 37229736 37230054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13376 NM_001172713 2803 Hs.344151 NM_002078 ENSG00000144674 GOLGA4 CRPF46|GCP2|GOLG|MU-RMS-40.18|p230 golgin A4 protein-coding 188.5-99 chr3 37499009 37499341 + 0.75 NA intron (NM_002207, intron 5 of 27) intron (NM_002207, intron 5 of 27) 47034 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 200.5-111 chr5 97111836 97112241 + 0.75 NA intron (NM_153234, intron 2 of 5) intron (NM_153234, intron 2 of 5) 30573 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 155-153 chr9 107263594 107263864 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -19550 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 116.75-165 chr5 68204310 68204507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11348 NM_181523 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 189.75-86 chr4 115845344 115845634 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -454236 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 142.25-91 chr2 124217468 124217691 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 192292 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 169.25-132 chrX 53196081 53196400 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106955) promoter-TSS (NR_106955) -752 NR_106955 102465539 NR_106955 ENSG00000276575 MIR6895 hsa-mir-6895 microRNA 6895 ncRNA 240-52 chr5 96140384 96140782 + 0.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 61445 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 208.5-15 chr10 118142009 118142586 + 0.75 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -95356 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 203.25-90 chr6 27778897 27779218 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 17313 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 301.5-24 chr17 42809742 42810346 + 0.75 NA TTS (NM_001313998) TTS (NM_001313998) 11183 NM_001330222 124817 Hs.12272 NM_173478 ENSG00000176563 CNTD1 CNTD|COSA1 cyclin N-terminal domain containing 1 protein-coding 234-14 chr15 40575452 40575895 + 0.75 NA TTS (NM_001286407) TTS (NM_001286407) 6374 NM_152260 27079 Hs.173311 NM_152260 ENSG00000166133 RPUSD2 C15orf19|C18B11|PUS9 RNA pseudouridine synthase domain containing 2 protein-coding 162.75-69 chr2 77304389 77304738 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 217813 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 192.5-143 chr9 117293865 117294377 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 1 of 21) MIR3|SINE|MIR -112920 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 281.5-24 chr2 36526144 36526689 + 0.75 NA intron (NM_016441, intron 13 of 16) intron (NM_016441, intron 13 of 16) 71752 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 192-21 chr10 108383030 108383391 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -313917 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 209.75-42 chr19 15873706 15874077 + 0.75 NA Intergenic LTR10F|LTR|ERV1 -8967 NM_001302493 102724279 Hs.164360 NM_001302493 LINC01835 - long intergenic non-protein coding RNA 1835 protein-coding 227.5-20 chr11 35886067 35886498 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -57699 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 163.5-91 chr2 71917815 71918307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 229801 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 133.25-224 chr9 90013099 90013356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10308 NR_036253 100422963 NR_036253 ENSG00000263967 MIR4290 - microRNA 4290 ncRNA 145.75-79 chr2 75617134 75617459 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -29487 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 184.5-101 chr3 105967961 105968303 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -98731 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 126.75-197 chr5 103322722 103323114 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 63494 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 168.5-14 chr1 172049260 172049675 + 0.75 NA intron (NM_001278252, intron 10 of 14) intron (NM_001278252, intron 10 of 14) -89341 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 198.5-93 chr22 45445495 45445766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31937 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 208.75-4 chr1 118584283 118584751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -399289 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 112.25-186 chr6 72580616 72580896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41087 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 178.5-96 chr20 47750804 47751293 + 0.75 NA intron (NM_198596, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 35016 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 181-32 chr15 39235800 39236157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14691 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 133.25-27 chr11 14140066 14140305 + 0.75 NA intron (NM_006108, intron 6 of 15) intron (NM_006108, intron 6 of 15) 177462 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 169-76 chr5 59989897 59990197 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 2 of 16) intron (NM_001165899, intron 2 of 16) -96321 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 114-81 chr2 175132248 175132454 + 0.75 NA intron (NM_001256091, intron 3 of 13) L1M5|LINE|L1 35358 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 159.75-75 chr2 33613988 33614246 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -14755 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 213.75-45 chr17 81838374 81838856 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3565 NM_001007533 116729 Hs.454720 NM_001007533 ENSG00000182676 PPP1R27 DYSFIP1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 27 protein-coding 130.75-10 chr1 162991919 162992137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76578 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 154.25-21 chr11 16785211 16785554 + 0.75 NA intron (NM_001329630, intron 24 of 26) intron (NM_001329630, intron 24 of 26) 46735 NM_014267 10944 Hs.368226 NM_014267 ENSG00000110696 C11orf58 IMAGE145052|SMAP chromosome 11 open reading frame 58 protein-coding 178-104 chr8 106532811 106533191 + 0.75 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) L1MC3|LINE|L1 85077 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 150.75-135 chr3 186073340 186073746 + 0.75 NA intron (NM_004454, intron 7 of 12) intron (NM_004454, intron 7 of 12) 35546 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 191.25-61 chr2 171907590 171907978 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -13478 NR_047549 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 112.75-189 chr7 68991281 68991624 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 606172 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 161.75-129 chr8 133913484 133913884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27188 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 122.75-207 chr8 123951730 123951951 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 88942 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 190.25-124 chr8 110439290 110439632 + 0.75 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -463690 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 182.75-95 chr4 111687175 111687623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -458055 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 156.75-38 chr12 8859162 8859618 + 0.75 NA intron (NM_001282424, intron 15 of 24) intron (NM_001282424, intron 15 of 24) 14386 NM_001282424 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 145.25-59 chr18 8900643 8900909 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 183395 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 160-58 chr2 153910121 153910433 + 0.75 NA intron (NM_052917, intron 2 of 12) L1PREC2|LINE|L1 -34117 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 184.75-107 chr8 89862686 89863161 + 0.75 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -38945 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 305.5-22 chr2 108622700 108623264 + 0.75 NA intron (NM_001193484, intron 1 of 9) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1731 NM_001193484 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 160.25-48 chr15 77412884 77413236 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L1MD3|LINE|L1 7044 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 194.25-88 chr5 19777467 19777965 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 108556 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 138.5-73 chr16 64588088 64588412 + 0.75 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 533813 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 155.25-57 chr14 58880830 58881246 + 0.75 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 52750 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 338-11 chr14 73586071 73586672 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -5335 NM_152331 122970 Hs.49433 NM_152331 ENSG00000177465 ACOT4 PTE-Ib|PTE1B|PTE2B acyl-CoA thioesterase 4 protein-coding 144.75-158 chr7 54413345 54413648 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 82799 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 230.5-118 chr8 131054688 131055155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14012 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 182.75-52 chr17 32330905 32331316 + 0.75 NA 3' UTR (NM_022344, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_022344, exon 10 of 10) 11063 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 130-153 chr7 69639821 69640144 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) MIR3|SINE|MIR 41507 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 199.5-47 chr15 57537926 57538319 + 0.75 NA intron (NM_032866, intron 14 of 18) intron (NM_032866, intron 14 of 18) -53782 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 131.5-121 chr2 126444070 126444264 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -211768 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 190.5-32 chr12 9384974 9385491 + 0.75 NA intron (NR_120479, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu -3810 NR_120481 101928030 Hs.201719 NR_120481 LOC101928030 - uncharacterized LOC101928030 ncRNA 217.75-6 chr1 119033408 119033753 + 0.75 NA intron (NM_201263, intron 5 of 5) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -13825 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 112.5-211 chr6 63196211 63196397 + 0.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 123673 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 132-95 chr2 122889961 122890213 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 183394 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 243-54 chr4 105127210 105127689 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18426 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 117.25-40 chr11 92033306 92033576 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191593 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 182-22 chr12 30688437 30688840 + 0.75 NA intron (NM_006390, intron 2 of 24) intron (NM_006390, intron 2 of 24) 7231 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 124-66 chr17 69578416 69578686 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15436 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 123.25-26 chr10 86719015 86719237 + 0.75 NA intron (NM_001368066, intron 13 of 14) AluJr|SINE|Alu -37513 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 124.5-190 chr6 72235137 72235372 + 0.75 NA intron (NM_001350433, intron 2 of 25) L1MA5A|LINE|L1 18313 NM_001350471 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 269.25-12 chr14 65393052 65393582 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17275 NM_004480 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 127.25-154 chr5 8608217 8608405 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 147386 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 145.25-16 chr10 98079928 98080164 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -49218 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 249-5 chr11 6542569 6543114 + 0.75 NA intron (NM_144666, intron 18 of 42) intron (NM_144666, intron 18 of 42) 45545 NM_144666 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 126-83 chr19 30066158 30066391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 124035 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 162.5-183 chr8 123034333 123034671 + 0.75 NA intron (NM_024295, intron 1 of 7) intron (NM_024295, intron 1 of 7) 7800 NM_024295 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 119-86 chr2 64974759 64974967 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -13616 NM_001348406 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 118.75-125 chr3 59500061 59500289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158322 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 197-49 chr4 111468117 111468469 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -607646 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 160.25-138 chr6 48570665 48571070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -502178 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 206.25-111 chr9 31040584 31040948 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 340724 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 148.75-12 chr1 227742306 227742548 + 0.75 NA intron (NM_001323931, intron 2 of 5) intron (NM_001323931, intron 2 of 5) 6732 NM_001323934 116841 Hs.325081 NM_053052 ENSG00000143740 SNAP47 C1orf142|ESFI5812|HEL-S-290|HEL170|SNAP-47|SVAP1 synaptosome associated protein 47 protein-coding 190.5-151 chr7 105255570 105256060 + 0.75 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) AluSx1|SINE|Alu 13262 NM_001350744 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 140.25-20 chr10 32938149 32938473 + 0.75 NA intron (NM_002211, intron 1 of 15) intron (NM_002211, intron 1 of 15) -2753 NM_033668 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 134.5-57 chr14 29898948 29899142 + 0.75 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 28051 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 150.5-126 chr3 18352414 18352712 + 0.75 NA intron (NM_001131010, intron 9 of 10) intron (NM_001131010, intron 9 of 10) 72776 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 169 chr1 73477892 73478206 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 171879 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 137.75-164 chr5 81483492 81483800 + 0.75 NA intron (NM_001256733, intron 5 of 15) intron (NM_001256733, intron 5 of 15) -89512 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 145.25-89 chr20 59865471 59865829 + 0.75 NA exon (NM_014258, exon 43 of 45) exon (NM_014258, exon 43 of 45) 67987 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 161-74 chr3 61338018 61338248 + 0.75 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -86672 NR_148921 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 167.25-147 chr8 52647396 52647883 + 0.75 NA intron (NM_001083617, intron 15 of 23) intron (NM_001083617, intron 15 of 23) 66796 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 124.75-192 chr7 44983015 44983301 + 0.75 NA non-coding (NR_152597, exon 3 of 3) non-coding (NR_152597, exon 3 of 3) 2352 NR_002952 677798 Hs.744745 NR_002952 ENSG00000277184 SNORA9 ACA9|SNORA9A small nucleolar RNA, H/ACA box 9 snoRNA 204.75-2 chr1 12116827 12117284 + 0.75 NA intron (NM_001243, intron 8 of 14) intron (NM_001243, intron 8 of 14) -49888 NR_107000 102465836 NR_107000 ENSG00000283789 MIR7846 hsa-mir-7846 microRNA 7846 ncRNA 164-144 chr8 144928160 144928454 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 22573 NM_001029976 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 204.5 chr1 83699144 83699643 + 0.75 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) L1MA10|LINE|L1 161153 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 157.5-36 chr11 36793904 36794290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -195818 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 159.75-136 chr5 80665617 80666005 + 0.75 NA intron (NM_002439, intron 3 of 23) intron (NM_002439, intron 3 of 23) -10828 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 142.75-57 chr13 75944713 75944922 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9685 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 183-78 chr3 160169922 160170197 + 0.75 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) MER39|LTR|ERV1 37033 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 137.5-208 chr6 118344729 118345000 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -156509 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 196-25 chr14 50129204 50129509 + 0.75 NA intron (NM_006939, intron 21 of 22) intron (NM_006939, intron 21 of 22) -12784 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 122.25-204 chr9 9478519 9478751 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -320757 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 172.25-9 chr1 183785195 183785600 + 0.75 NA intron (NM_001297669, intron 3 of 18) L2c|LINE|L2 -19723 NM_001297671 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 279.75-13 chr12 58512699 58513332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78687 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 141-39 chr13 19320913 19321132 + 0.75 NA intron (NR_027248, intron 7 of 20) intron (NR_027248, intron 7 of 20) 23951 NR_027248 100101938 Hs.129283 NR_027248 ANKRD26P3 LINC00414 ankyrin repeat domain 26 pseudogene 3 pseudo 136.75-127 chr3 23901364 23901646 + 0.75 NA intron (NM_020345, intron 3 of 4) intron (NM_020345, intron 3 of 4) -15040 NM_002948 6138 Hs.381219 NM_002948 ENSG00000174748 RPL15 DBA12|EC45|L15|RPL10|RPLY10|RPYL10 ribosomal protein L15 protein-coding 192.5-6 chr1 116380740 116381121 + 0.75 NA intron (NM_001160233, intron 1 of 22) intron (NM_001160233, intron 1 of 22) -2440 NM_001160234 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 112.25-89 chr2 13682595 13682899 + 0.75 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -675734 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 196.75-118 chrX 54607409 54607802 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 77386 NM_001184819 54552 Hs.654677 NM_019067 ENSG00000130119 GNL3L GNL3B G protein nucleolar 3 like protein-coding 131.25-179 chr6 135705630 135705952 + 0.75 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) intron (NR_152842, intron 5 of 5) -145910 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 170.25-84 chr20 33366456 33366905 + 0.75 NA intron (NM_001365728, intron 13 of 14) L1MD|LINE|L1 34839 NM_016408 51654 Hs.435952 NM_016082 ENSG00000101391 CDK5RAP1 C20orf34|C42|CGI-05|HSPC167 CDK5 regulatory subunit associated protein 1 protein-coding 280.75-2 chr1 35093068 35093524 + 0.75 NA intron (NM_001319955, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 13911 NM_024772 79830 Hs.471243 NM_024772 ENSG00000197056 ZMYM1 MYM zinc finger MYM-type containing 1 protein-coding 133.25-121 chr21 18907961 18908215 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -148276 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 173.25-8 chr1 161344272 161344634 + 0.75 NA intron (NM_001278172, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 23430 NM_001013625 257177 Hs.534593 NM_001013625 ENSG00000188931 CFAP126 C1orf192|Flattop|Fltp cilia and flagella associated protein 126 protein-coding 205.5-93 chr3 67366643 67366975 + 0.75 NA intron (NM_001177599, intron 10 of 10) intron (NM_001177599, intron 10 of 10) 141345 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 122.25-174 chr7 43205823 43206032 + 0.75 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) intron (NM_015052, intron 2 of 29) 55032 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 125.75-16 chr1 229968054 229968276 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -34552 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 119-77 chr2 14132128 14132303 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 268743 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 119.75-22 chr10 59735012 59735316 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 18291 NM_001304731 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 210.75-67 chr4 64217496 64217863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 191771 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 218.5-15 chr1 186044949 186045434 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 40 of 106) MIR3|SINE|MIR -251082 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 182.25-68 chr20 50796024 50796388 + 0.75 NA intron (NM_017843, intron 1 of 5) AluSq2|SINE|Alu 1312 NM_001010974 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 117.25-174 chr5 91835165 91835404 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -451967 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 171.25-146 chr8 41522193 41522487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6921 NM_032336 84296 Hs.656996 NM_032336 ENSG00000147536 GINS4 SLD5 GINS complex subunit 4 protein-coding 130.5-137 chr2 125463237 125463603 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 654565 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 217.25-88 chr9 27136844 27137256 + 0.75 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) AluSc|SINE|Alu 27909 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 153.5-180 chr7 20920782 20921122 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) intron (NR_126381, intron 2 of 5) 85521 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 131.25-220 chr9 116328631 116328975 + 0.75 NA intron (NM_002581, intron 10 of 21) intron (NM_002581, intron 10 of 21) 71803 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 192.25-53 chr2 65488251 65488563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55808 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 246.5-37 chr19 9682256 9682664 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7360 NM_001300885 54811 Hs.371107 NM_017656 ENSG00000171466 ZNF562 - zinc finger protein 562 protein-coding 275.25-3 chr1 239614496 239615002 + 0.75 NA intron (NM_001347716, intron 3 of 7) intron (NM_001347716, intron 3 of 7) -14324 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 132-46 chr14 22659135 22659356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24401 NM_001348233 79549 NM_001348233 ENSG00000255804 OR6J1 OR6J1P|OR6J2 olfactory receptor family 6 subfamily J member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 213.25-53 chr5 51687052 51687478 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 303817 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 125-49 chr16 13078083 13078333 + 0.75 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MER2|DNA|TcMar-Tigger 176610 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 145.5-198 chr9 113879803 113880040 + 0.75 NA intron (NM_001318042, intron 1 of 14) intron (NM_001318042, intron 1 of 14) 3612 NM_001318041 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 204.25-90 chr5 28190618 28191124 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96794 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 127.25-170 chr5 83951269 83951470 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 9 of 9) intron (NM_001278642, intron 9 of 9) -230514 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 203-97 chr8 21454864 21455165 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 156775 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 190.5-15 chr10 67922383 67922757 + 0.75 NA 3' UTR (NM_015601, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_015601, exon 25 of 25) 31168 NM_001314049 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 153.25-6 chr1 185749981 185750237 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) L2a|LINE|L2 15718 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 235.25-57 chr7 10202018 10202587 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -500374 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 131.75-159 chr4 176037065 176037266 + 0.75 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -28676 NM_001350727 116966 Hs.532056 NM_170710 ENSG00000150627 WDR17 - WD repeat domain 17 protein-coding 144.5-95 chr2 17309667 17309917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 208648 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 278.25-35 chr2 220794215 220794959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 777717 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 136.25-61 chr14 72265555 72265895 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -251095 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 197.75-84 chr7 108122487 108122906 + 0.75 NA intron (NM_001318048, intron 2 of 17) intron (NM_001318048, intron 2 of 17) 7665 NM_001318046 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 222.75-88 chr7 29863513 29864004 + 0.75 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) L1MD|LINE|L1 57204 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 129-34 chr11 33109608 33109830 + 0.75 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) L1MEj|LINE|L1 33569 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 230.5-51 chr17 56684322 56684896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90910 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 137.25-91 chr3 10125288 10125633 + 0.75 NA intron (NM_018462, intron 1 of 2) intron (NM_018462, intron 1 of 2) 9785 NM_018462 55845 Hs.649307 NM_018462 ENSG00000254999 BRK1 C3orf10|HSPC300|MDS027|hHBrk1 BRICK1 subunit of SCAR/WAVE actin nucleating complex protein-coding 271.5-54 chr3 48621472 48622181 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001008269) promoter-TSS (NM_001008269) -57 NM_001008269 440955 Hs.631922 NM_001008269 ENSG00000183396 TMEM89 - transmembrane protein 89 protein-coding 223-53 chr3 48104969 48105538 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -16405 NM_030885 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 168.25-54 chr16 48916645 48916952 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -306618 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 202.75-101 chr6 68944193 68944465 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 6 of 31) intron (NM_001704, intron 6 of 31) 309047 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 152.5-99 chr2 218417646 218417886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1357 NM_007127 7429 Hs.654595 NM_007127 ENSG00000127831 VIL1 D2S1471|VIL villin 1 protein-coding 144.75-107 chr3 16005791 16005997 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 132123 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 188.25-54 chr18 28351303 28351629 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -174336 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 121.25-29 chr10 114845819 114846098 + 0.75 NA intron (NM_001135051, intron 8 of 16) intron (NM_001135051, intron 8 of 16) 24178 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 219.5-70 chr2 80866723 80867126 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 553545 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 136-14 chr10 44717794 44718120 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -193359 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 206.5-142 chr8 140275800 140276137 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 14 of 22) intron (NM_001160372, intron 14 of 22) -175433 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 121-50 chr13 20038760 20038969 + 0.75 NA intron (NM_197968, intron 12 of 24) L1PA13|LINE|L1 -63837 NR_126380 104355137 Hs.578016 NR_126380 ENSG00000236076 LINC01072 - long intergenic non-protein coding RNA 1072 ncRNA 114.75-155 chr5 85611419 85611665 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -670902 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 132-107 chr3 20682223 20682502 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 339894 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 159.5-47 chr12 94108306 94108649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40100 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 134.25-76 chr2 25077691 25077890 + 0.75 NA intron (NM_001319099, intron 1 of 22) L1ME4a|LINE|L1 35327 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 200.5-101 chr4 59297708 59298000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 284281 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 128-162 chr8 28715022 28715281 + 0.75 NA intron (NM_001440, intron 2 of 6) intron (NM_001440, intron 2 of 6) 13650 NM_001440 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 124.25-143 chr4 17474842 17475138 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 37100 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 124.5-248 chr9 111643954 111644158 + 0.75 NA intron (NR_037148, intron 2 of 4) intron (NR_037148, intron 2 of 4) 12704 NR_037148 548645 Hs.534196 NM_001015882 ENSG00000059769 DNAJC25 bA16L21.2.1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C25 protein-coding 118-78 chr2 7278807 7278989 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -142363 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 129.75-49 chr12 46765117 46765422 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001143824, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001143824, exon 16 of 16) 60728 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 135-83 chr2 167181579 167181929 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 3 of 10) intron (NM_152381, intron 3 of 10) -5618 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 252.25-15 chr13 45760980 45761697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58869 NM_001286342 220082 Hs.186363 NM_152719 ENSG00000174015 SPERT CBY2|NURIT spermatid associated protein-coding 141.25-56 chr15 77205322 77205695 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 19896 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 125.25-177 chr6 152878753 152878947 + 0.75 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 104191 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 173-78 chr20 59713616 59713953 + 0.75 NA intron (NM_001199506, intron 1 of 12) L1ME3A|LINE|L1 -7426 NM_183246 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 172.5-73 chr15 46646358 46646664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -537578 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 249.5-30 chr14 72403231 72403612 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1MA5|LINE|L1 -113399 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 219.5-57 chr19 50244815 50245249 + 0.75 NA intron (NM_024729, intron 10 of 40) intron (NM_024729, intron 10 of 40) 41404 NM_024729 79784 Hs.467142 NM_024729 ENSG00000105357 MYH14 DFNA4|DFNA4A|FP17425|MHC16|MYH17|NMHC II-C|NMHC-II-C|PNMHH|myosin myosin heavy chain 14 protein-coding 161.25-17 chr10 74860158 74860397 + 0.75 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) 33677 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 125.25-106 chr2 119748817 119749009 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -11009 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 121.5-71 chr13 81027355 81027590 + 0.75 NA intron (NR_125770, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 9081 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 140.75-74 chr18 60220748 60220991 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 151906 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 228.5-16 chr10 49025441 49025769 + 0.75 NA intron (NM_001031746, intron 7 of 7) intron (NM_001031746, intron 7 of 7) -40018 NR_036182 100422895 NR_036182 ENSG00000264800 MIR4294 - microRNA 4294 ncRNA 168.5-52 chr13 107280623 107280929 + 0.75 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 40187 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 166.75-42 chr13 108421734 108422195 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 152335 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 200-36 chr15 98807538 98807911 + 0.75 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 23298 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 132-49 chr14 68087247 68087453 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 263758 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 116.75-81 chr19 20544053 20544360 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001159293, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001159293, exon 4 of 4) 21575 NM_001159293 100129842 Hs.515696 NM_001159293 ENSG00000237440 ZNF737 ZNF102 zinc finger protein 737 protein-coding 148.75-2 chr1 50434844 50435103 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11530 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 166.75-60 chr17 50301168 50301568 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -13513 NR_125805 103752589 Hs.612913 NR_125805 ENSG00000251179 TMEM92-AS1 TCONS_00025237|lncRNA-508851 TMEM92 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-171 chr5 9593641 9593895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36583 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 196.75-114 chr9 72216802 72217241 + 0.75 NA intron (NM_001351573, intron 5 of 14) L1MB7|LINE|L1 67581 NM_001351573 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 245.75-39 chr3 132091776 132092299 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -52431 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 142.75-91 chr19 44960352 44960590 + 0.75 NA intron (NM_001294, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 5091 NM_001294 1209 Hs.444441 NM_001294 ENSG00000104853 CLPTM1 - CLPTM1 regulator of GABA type A receptor forward trafficking protein-coding 213.25-2 chr1 73938099 73938418 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 259918 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 254.25-5 chr1 205714062 205714549 + 0.75 NA 3' UTR (NM_022731, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_022731, exon 7 of 7) -33796 NM_033102 85414 Hs.278695 NM_033102 ENSG00000158715 SLC45A3 IPCA-2|IPCA-6|IPCA-8|IPCA6|PCANAP2|PCANAP6|PCANAP8|PRST solute carrier family 45 member 3 protein-coding 183.75-30 chr12 50068610 50068921 + 0.75 NA intron (NM_020039, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 -4820 NM_001256830 41 Hs.274361 NM_001095 ENSG00000110881 ASIC1 ACCN2|ASIC|BNaC2 acid sensing ion channel subunit 1 protein-coding 217.25-47 chr2 228302330 228302989 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -120972 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 170.25-50 chr16 14289885 14290153 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -12269 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 157-15 chr11 45171485 45171806 + 0.75 NA intron (NM_001256695, intron 1 of 7) intron (NM_001256695, intron 1 of 7) 24302 NM_001256695 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 193.25-104 chr7 9352189 9352601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -281875 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 136.25-74 chr16 81124697 81125054 + 0.75 NA intron (NM_052892, intron 37 of 43) AluSx|SINE|Alu -28480 NR_033249 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 156.25-91 chr22 30706135 30706405 + 0.75 NA intron (NM_030758, intron 1 of 13) intron (NM_030758, intron 1 of 13) 11396 NM_001282739 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 187.75-32 chr15 59607460 59607889 + 0.75 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 -4109 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 204.25-61 chr20 3959336 3959842 + 0.75 NA intron (NM_001134337, intron 2 of 5) intron (NM_001134337, intron 2 of 5) -42026 NR_031722 100302282 NR_031722 ENSG00000283320 MIR103B2 MIR103-2-AS|MIR103-2AS|MIRN103-2AS|hsa-mir-103-2-as microRNA 103b-2 ncRNA 211.25-78 chr5 132300937 132301352 + 0.75 NA intron (NM_003059, intron 1 of 9) intron (NM_003059, intron 1 of 9) 6750 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 141.25-78 chr2 55245875 55246221 + 0.75 NA intron (NM_001005369, intron 11 of 16) intron (NM_001005369, intron 11 of 16) 11884 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 142.25-148 chr6 159643535 159643804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49572 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 153-43 chr14 68464275 68464495 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) L2a|LINE|L2 164402 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 144.25-197 chr8 61435819 61436149 + 0.75 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) intron (NM_173519, intron 3 of 5) 148014 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 120.5-202 chr6 124106608 124106872 + 0.75 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 -176265 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 168.5-102 chr20 17911672 17911985 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 51118 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 182.5-131 chr5 54677095 54677388 + 0.75 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 26083 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 174-99 chr8 83175467 83175869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -228090 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 163.75-4 chr1 58566941 58567231 + 0.75 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 10166 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 225-73 chr7 84455790 84456254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76454 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 141-142 chr6 124696778 124697230 + 0.75 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -265541 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 254.5-58 chr5 23285581 23286171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221733 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 155.75-18 chr10 63304757 63305015 + 0.75 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu -35643 NM_001322254 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 156.5-152 chr5 100237625 100238014 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 150435 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 168-125 chr8 83199572 83199900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204022 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 148.25-109 chr4 92581255 92581524 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 276990 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 134.5-82 chr16 24757369 24757728 + 0.75 NA intron (NM_014494, intron 3 of 24) intron (NM_014494, intron 3 of 24) 27897 NM_014494 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 130.5-37 chr10 53953802 53954207 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 24 of 34) AluY|SINE|Alu -532226 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 196.25-112 chr7 89824524 89824836 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -294720 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 179.75 chr1 29412376 29412689 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -62418 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 162.25-164 chr9 12408723 12408994 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -284527 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 144.25-9 chr1 77547298 77547751 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 13 of 13) AluSc|SINE|Alu 135134 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 224-3 chr1 67301440 67301844 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5722 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 146-138 chr9 135078040 135078316 + 0.75 NA intron (NM_014279, intron 1 of 5) intron (NM_014279, intron 1 of 5) 2673 NM_014279 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 174.25-67 chr17 43807664 43808072 + 0.75 NA intron (NM_001932, intron 19 of 19) AluJr|SINE|Alu 25326 NR_148342 4356 Hs.396566 NM_001932 ENSG00000161647 MPP3 DLG3 membrane palmitoylated protein 3 protein-coding 115.25-134 chr3 58507736 58507896 + 0.75 NA intron (NM_003500, intron 14 of 14) intron (NM_003500, intron 14 of 14) 9451 NM_153331 200845 Hs.13982 NM_153331 ENSG00000168301 KCTD6 KCASH3 potassium channel tetramerization domain containing 6 protein-coding 148.75-45 chr12 121117896 121118195 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14831 NR_033953 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 180.75-64 chr2 45770166 45770500 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 118658 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 138.5-128 chr3 3616500 3616737 + 0.75 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -182813 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 120.25-147 chr4 53494504 53494867 + 0.75 NA intron (NM_001126328, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 -5392 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 132-128 chr5 2828387 2828742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76433 NM_001294337 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 190.75-69 chr3 196372193 196372511 + 0.75 NA intron (NM_015562, intron 5 of 10) AluSz|SINE|Alu -33932 NR_037950 100534611 Hs.733180 NR_037950 TM4SF19-TCTEX1D2 - TM4SF19-TCTEX1D2 readthrough (NMD candidate) ncRNA 152-65 chr17 59450203 59450526 + 0.75 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 76493 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 135-3 chr1 69823760 69824159 + 0.75 NA intron (NM_001370785, intron 4 of 26) MIR|SINE|MIR -95363 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 177-29 chr13 113859477 113859721 + 0.75 NA intron (NM_000820, intron 2 of 14) intron (NM_000820, intron 2 of 14) 4477 NM_000820 2621 Hs.646346 NM_000820 ENSG00000183087 GAS6 AXLLG|AXSF growth arrest specific 6 protein-coding 117-171 chr7 48028862 48029048 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001284350, exon 1 of 11) 5' UTR (NM_001284350, exon 1 of 11) 152 NM_001030019 256979 Hs.406741 NM_152782 ENSG00000164744 SUN3 SUNC1 Sad1 and UNC84 domain containing 3 protein-coding 116.5-158 chr3 38895384 38895721 + 0.75 NA intron (NM_014139, intron 14 of 25) intron (NM_014139, intron 14 of 25) 55009 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 174.25-150 chr9 16366672 16367127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90586 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 158-73 chr2 58283601 58283915 + 0.75 NA intron (NR_147010, intron 1 of 2) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 7881 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 143.75-126 chr3 182368866 182369163 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117348 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 122-187 chr8 108820067 108820240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32559 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 167.5-12 chr1 119224180 119224445 + 0.75 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -83640 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 113.25-102 chr21 31528105 31528401 + 0.75 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) AluJr4|SINE|Alu 30834 NM_001353688 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 196-58 chr20 60878966 60879455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -199854 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 147.75-17 chr10 93557275 93557507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9274 NM_001195755 338557 Hs.661022 NM_181745 ENSG00000186188 FFAR4 BMIQ10|GPR120|GPR129|GT01|O3FAR1|PGR4 free fatty acid receptor 4 protein-coding 155.75-169 chr9 70890423 70890707 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) HAL1|LINE|L1 -21513 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 199.5-94 chr20 54103287 54103651 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -32704 NM_003657 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 178.75-18 chr11 107355302 107355616 + 0.75 NA intron (NM_152434, intron 12 of 17) (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 102387 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 212-82 chr8 79781745 79782208 + 0.75 NA intron (NR_125410, intron 3 of 3) intron (NR_125410, intron 3 of 3) 13834 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 136-12 chr10 20766872 20767223 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 130555 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 124.75-148 chr3 129557966 129558177 + 0.75 NA intron (NM_015103, intron 33 of 35) intron (NM_015103, intron 33 of 35) 9686 NM_001308262 132243 Hs.97358 NM_153833 ENSG00000178804 H1FOO H1.8|H1oo|osH1 H1 histone family member O oocyte specific protein-coding 180-26 chr13 77847882 77848167 + 0.75 NA intron (NR_103853, intron 6 of 6) AluYh3|SINE|Alu 29087 NR_103853 100505518 Hs.742215 NR_103853 EDNRB-AS1 - EDNRB antisense RNA 1 ncRNA 258-12 chr14 25293570 25294134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -243555 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 141.75-82 chr18 66090898 66091124 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 339999 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 171.5-97 chr22 41547855 41548224 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3433 NM_001282884 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 131.25-43 chr12 90721016 90721394 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -196818 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 121.25-2 chr1 25912311 25912520 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5538 NM_203399 3925 Hs.209983 NM_005563 ENSG00000117632 STMN1 C1orf215|LAP18|Lag|OP18|PP17|PP19|PR22|SMN stathmin 1 protein-coding 142.25-22 chr10 91201545 91201906 + 0.75 NA intron (NM_001257101, intron 1 of 9) intron (NM_001257101, intron 1 of 9) -18426 NM_001256549 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 156-118 chr5 56550303 56550570 + 0.75 NA intron (NR_161255, intron 2 of 5) intron (NR_161255, intron 2 of 5) 55820 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 168.25-153 chr9 100500951 100501257 + 0.75 NA intron (NM_001198812, intron 2 of 9) L1MEf|LINE|L1 27955 NM_003692 8577 Hs.598100 NM_003692 ENSG00000241697 TMEFF1 C9orf2|CT120.1|H7365|TR-1 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1 protein-coding 140-141 chr5 113111505 113111887 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 6 of 18) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 134898 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 172.75-57 chr19 16797483 16797897 + 0.75 NA intron (NM_001007525, intron 15 of 18) intron (NM_001007525, intron 15 of 18) -31708 NM_015260 23309 Hs.13999 NM_015260 ENSG00000127511 SIN3B - SIN3 transcription regulator family member B protein-coding 178.25-6 chr1 114167645 114168071 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13989 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 213-94 chr8 25492722 25493109 + 0.75 NA intron (NM_001317906, intron 12 of 13) MIR|SINE|MIR 33682 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 192-32 chr12 11684194 11684569 + 0.75 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 34527 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 217.75-31 chr17 60162657 60163014 + 0.75 NA intron (NR_137422, intron 8 of 11) intron (NR_137422, intron 8 of 11) 12862 NM_000717 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 260.25-31 chr21 28852753 28853127 + 0.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 32427 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 127.25-176 chr6 22143304 22143539 + 0.75 NA intron (NR_034143, intron 2 of 2) intron (NR_034143, intron 2 of 2) 3772 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 127.75-25 chr10 8249418 8249627 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 18783 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 220.5-12 chr10 112892392 112892752 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57675 NM_001198527 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 127-134 chr5 44921927 44922145 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 113089 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 131.5-248 chr9 99719770 99719999 + 0.75 NA intron (NR_109802, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 100005 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 144.25-204 chr8 108525056 108525338 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 81573 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 180.25-22 chr14 26499705 26500038 + 0.75 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 53559 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 169.25-91 chr5 10263390 10263709 + 0.75 NA intron (NM_012073, intron 10 of 10) intron (NM_012073, intron 10 of 10) 13012 NM_001306156 22948 Hs.1600 NM_012073 ENSG00000150753 CCT5 CCT-epsilon|CCTE|HEL-S-69|PNAS-102|TCP-1-epsilon chaperonin containing TCP1 subunit 5 protein-coding 128.75-141 chr4 61985361 61985621 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 18 of 23) intron (NM_001371343, intron 18 of 23) 176274 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-14 chr10 36668005 36668433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -457638 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 128-163 chr8 61789273 61789565 + 0.75 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 74631 NR_039680 100616484 NR_039680 ENSG00000264408 MIR4470 mir-4470 microRNA 4470 ncRNA 129.5-181 chr5 35951541 35951826 + 0.75 NA 3' UTR (NM_152404, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_152404, exon 7 of 7) 12882 NR_104630 100506406 Hs.116864 NR_104630 ENSG00000249748 LOC100506406 - uncharacterized LOC100506406 ncRNA 150.75-28 chr10 74299014 74299241 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 122364 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 146.5-221 chr8 78816834 78817240 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -11514 NM_001199888 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 233.25-45 chr22 34482136 34482728 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 515484 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 133-77 chr19 52044117 52044333 + 0.75 NA intron (NM_001322284, intron 2 of 4) intron (NM_001322284, intron 2 of 4) 4336 NM_001322285 9668 Hs.655934 NM_014650 ENSG00000256087 ZNF432 - zinc finger protein 432 protein-coding 220-20 chr14 65705666 65705971 + 0.75 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 234716 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 185.5-21 chr11 18685871 18686197 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -12745 NM_153347 144110 Hs.502100 NM_153347 ENSG00000151117 TMEM86A - transmembrane protein 86A protein-coding 177.75-68 chr2 61389712 61389967 + 0.75 NA intron (NM_014709, intron 5 of 79) intron (NM_014709, intron 5 of 79) 27538 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 204.5-131 chr8 81198428 81198790 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -81927 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 144.5-219 chr8 102587179 102587469 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 35735 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 137.5-143 chr20 52521545 52521798 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -99167 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 209.5-64 chr2 50281621 50281983 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 65952 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 132.5-184 chr4 106964679 106964888 + 0.75 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) MLT2C1|LTR|ERVL 71530 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 197.25-91 chr7 1482530 1482996 + 0.75 NA intron (NM_001080453, intron 26 of 47) intron (NM_001080453, intron 26 of 47) 21626 NM_001080453 26173 Hs.532188 NM_001080453 ENSG00000164880 INTS1 INT1|NET28 integrator complex subunit 1 protein-coding 115.25-30 chr10 93764805 93765107 + 0.75 NA intron (NR_131777, intron 2 of 5) intron (NR_131777, intron 2 of 5) 7020 NM_005097 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 138.25-16 chr1 202944481 202944713 + 0.75 NA intron (NM_001290553, intron 5 of 7) intron (NM_001290553, intron 5 of 7) 13387 NM_001290553 51094 Hs.5298 NM_015999 ENSG00000159346 ADIPOR1 ACDCR1|CGI-45|CGI45|PAQR1|TESBP1A adiponectin receptor 1 protein-coding 126-111 chr21 27128342 27128721 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161443 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 229.5-102 chr4 169984169 169984680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8522 NR_037878 100506085 Hs.649173 NR_037878 ENSG00000248319 LINC02275 - long intergenic non-protein coding RNA 2275 ncRNA 216-18 chr14 102288655 102288984 + 0.75 NA intron (NR_148552, intron 1 of 9) L1ME3A|LINE|L1 16345 NR_148552 5891 Hs.36859 NM_014226 ENSG00000080823 MOK RAGE|RAGE-1|RAGE1|STK30 MOK protein kinase protein-coding 259.5-31 chr14 56310639 56311183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 192500 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 137.5-241 chr9 98407805 98408262 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 7 of 18) intron (NM_005458, intron 7 of 18) -152384 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 159.25-65 chr2 21694799 21695219 + 0.75 NA intron (NR_038837, intron 2 of 2) intron (NR_038837, intron 2 of 2) 15643 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 202.75-28 chr12 104173555 104173983 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -35559 NM_006166 4801 Hs.84928 NM_006166 ENSG00000120837 NFYB CBF-A|CBF-B|HAP3|NF-YB nuclear transcription factor Y subunit beta protein-coding 189-38 chr14 68286840 68287176 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 341779 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 136.75-201 chr8 140357150 140357467 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) intron (NM_001160372, intron 9 of 22) 100436 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 267.75-25 chr2 23134328 23134754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -250638 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 146.5-134 chr22 45645115 45645368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26557 NM_001167621 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 165.75-164 chr8 25401183 25401429 + 0.75 NA intron (NM_024940, intron 47 of 51) MER5A|DNA|hAT-Charlie 22955 NM_001083111 2796 Hs.82963 NM_000825 ENSG00000147437 GNRH1 GNRH|GRH|LHRH|LNRH gonadotropin releasing hormone 1 protein-coding 155.25-135 chr4 146253794 146254094 + 0.75 NA TTS (NM_001300842) TTS (NM_001300842) 39406 NM_001354631 345051 Hs.170876 NM_001354631 ENSG00000250673 REELD1 - reeler domain containing 1 protein-coding 121-128 chr3 71838147 71838533 + 0.75 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -53192 NM_021935 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 123.75-158 chr6 66852330 66852636 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 1064604 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 205-44 chr20 33592150 33592740 + 0.75 NA intron (NM_005093, intron 2 of 11) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30080 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 136.75-64 chr15 26259657 26259959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 143995 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 146.25-7 chr1 200224761 200225139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148842 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 147.5-55 chr13 21078770 21079245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17421 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 142.5-221 chr8 98000989 98001202 + 0.75 NA intron (NM_002380, intron 7 of 18) intron (NM_002380, intron 7 of 18) 41122 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 116.75-132 chr3 121763793 121764156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14207 NM_001256488 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 183-86 chr5 7422241 7422574 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 26269 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 151.5-35 chr12 56865681 56866112 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 68512 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 113-153 chr5 140794173 140794453 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_018905) promoter-TSS (NM_018905) -539 NM_018905 56146 Hs.199343 NM_018905 ENSG00000204969 PCDHA2 PCDH-ALPHA2 protocadherin alpha 2 protein-coding 152.5-108 chr22 36511516 36511920 + 0.75 NA exon (NM_003753, exon 14 of 15) exon (NM_003753, exon 14 of 15) -4678 NM_001363042 80020 Hs.387601 NM_024955 ENSG00000100350 FOXRED2 ERFAD FAD dependent oxidoreductase domain containing 2 protein-coding 121-195 chr8 129812889 129813060 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -26350 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 251.5-41 chr2 185756646 185757211 + 0.75 NA intron (NM_173651, intron 9 of 22) intron (NM_173651, intron 9 of 22) -16451 NR_110217 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 151.25-15 chr10 33381075 33381435 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46350 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 155.5-112 chr21 21530431 21530720 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 17 of 18) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 206744 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 122.25-68 chr15 90822886 90823241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45525 NM_002569 5045 Hs.513153 NM_002569 ENSG00000140564 FURIN FUR|PACE|PCSK3|SPC1 furin, paired basic amino acid cleaving enzyme protein-coding 174.5-202 chrX 124363176 124363492 + 0.75 NA intron (NM_001114937, intron 1 of 3) intron (NM_001114937, intron 1 of 3) 17052 NM_001114937 4068 Hs.349094 NM_002351 ENSG00000183918 SH2D1A DSHP|EBVS|IMD5|LYP|MTCP1|SAP|SAP/SH2D1A|XLP|XLPD|XLPD1 SH2 domain containing 1A protein-coding 168.25-82 chr2 159424237 159424625 + 0.75 NA intron (NM_001329858, intron 12 of 36) intron (NM_001329858, intron 12 of 36) -137728 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 192-78 chr4 59445806 59446115 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 432387 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 148.75-55 chr14 60714530 60714742 + 0.75 NA intron (NM_017420, intron 2 of 2) intron (NM_017420, intron 2 of 2) 9715 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 129.5-222 chr8 30469192 30469496 + 0.75 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -83943 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 238.25-51 chr3 182184166 182184734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232086 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 140-144 chr5 143888643 143888914 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76617 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 215.75-110 chrX 134785352 134785708 + 0.75 NA intron (NM_001170757, intron 8 of 9) AluSx1|SINE|Alu 10825 NM_001166599 159090 Hs.404706 NM_145284 ENSG00000156504 FAM122B SPACIA2 family with sequence similarity 122B protein-coding 129.75-61 chr14 54011405 54011763 + 0.75 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -54693 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 116.5-44 chr12 12318562 12318742 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 31590 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 216.75-54 chr4 48567972 48568388 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 27 of 63) AluJb|SINE|Alu 77928 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 228.5-83 chr5 98711921 98712445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56449 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 143.5-101 chr19 3439584 3439781 + 0.75 NA intron (NM_001245002, intron 6 of 10) intron (NM_001245002, intron 6 of 10) 40843 NM_001136503 284422 Hs.130714 NM_001136503 ENSG00000095932 SMIM24 C19orf77|HSPC323|MARDI small integral membrane protein 24 protein-coding 153.75-114 chr5 54432962 54433275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22581 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 152.5-68 chr17 44545702 44545992 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -11637 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 118.5-55 chr14 69569462 69569732 + 0.75 NA TTS (NM_001271507) TTS (NM_001271507) 5274 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 178-111 chr9 121086941 121087343 + 0.75 NA intron (NM_001369895, intron 2 of 31) L2b|LINE|L2 -1154 NM_007018 11064 Hs.653263 NM_007018 ENSG00000119397 CNTRL CEP1|CEP110|FAN|bA165P4.1 centriolin protein-coding 138.25-140 chr5 77005051 77005407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25175 NM_018046 55109 Hs.634849 NM_018046 ENSG00000164252 AGGF1 GPATC7|GPATCH7|HSU84971|HUS84971|VG5Q angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 protein-coding 175.75-101 chr5 15688408 15688709 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -73556 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 125-37 chr13 27186921 27187212 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 14807 NR_046548 100874071 Hs.735400 NR_046548 USP12-AS2 - USP12 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 122.5-240 chrX 77911983 77912281 + 0.75 NA intron (NM_001282224, intron 1 of 21) intron (NM_001282224, intron 1 of 21) 1439 NM_000052 538 Hs.496414 NM_000052 ENSG00000165240 ATP7A DSMAX|MK|MNK|SMAX3 ATPase copper transporting alpha protein-coding 178-86 chr6 55088606 55089080 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -17617 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 159.25-93 chr3 168573495 168573829 + 0.75 NA intron (NR_021485, intron 4 of 15) MER57C2|LTR|ERV1 21808 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 150.25-75 chr2 62001048 62001447 + 0.75 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) intron (NM_001321781, intron 2 of 2) 95605 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 162.75-37 chr15 62587524 62587984 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 57427 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 113.25-85 chr2 46345101 46345415 + 0.75 NA intron (NM_001430, intron 1 of 15) intron (NM_001430, intron 1 of 15) 47851 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 146.5-226 chr8 117801986 117802352 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 10 of 10) intron (NM_000127, intron 10 of 10) 118744 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 179.25-88 chr2 236603488 236603815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33826 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 187-105 chr9 36083835 36084234 + 0.75 NA intron (NM_021111, intron 8 of 20) L1ME3G|LINE|L1 47121 NM_001316346 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 186-75 chr6 25747520 25747934 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -6972 NM_001286121 10050 Hs.282931 NM_005495 ENSG00000146039 SLC17A4 KAIA2138 solute carrier family 17 member 4 protein-coding 140.5-136 chr20 49598153 49598466 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -30172 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 148-87 chr3 142312110 142312596 + 0.75 NA intron (NM_019001, intron 41 of 41) intron (NM_019001, intron 41 of 41) -86768 NM_001039547 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 206.5-53 chr2 105661824 105662360 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -51533 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 119.25-50 chr13 31894780 31895048 + 0.75 NA intron (NR_027062, intron 1 of 3) intron (NR_027062, intron 1 of 3) 48131 NR_027062 196549 Hs.507667 NM_145293 EEF1DP3 - eukaryotic translation elongation factor 1 delta pseudogene 3 pseudo 220.25-17 chr14 103045242 103045739 + 0.75 NA intron (NM_006035, intron 1 of 36) intron (NM_006035, intron 1 of 36) 12059 NM_006035 9578 Hs.654634 NM_006035 ENSG00000198752 CDC42BPB MRCKB CDC42 binding protein kinase beta protein-coding 201.5-86 chr3 50720249 50720775 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) L1PA14|LINE|L1 45432 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 144.5-62 chr14 59107469 59107779 + 0.75 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 -81043 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 150.75-38 chr11 75245116 75245426 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4497 NM_001195528 100507050 Hs.577323 NM_001195528 ENSG00000261594 TPBGL - trophoblast glycoprotein like protein-coding 185-62 chr4 52363731 52364052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292648 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 198-41 chr2 133864669 133865081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -255060 NM_001371457 189.75-47 chr16 52377595 52377947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119207 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 131.5-27 chr10 79457749 79458000 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -12250 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 179.25-41 chr12 23654481 23654813 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 10 of 17) intron (NM_152989, intron 10 of 17) -70061 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 165-92 chr3 97712508 97712834 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -51850 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 148.75-169 chr8 82240781 82241015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -398612 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 160.5-89 chr2 78385941 78386252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95365 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 142-136 chr5 148800064 148800355 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -26384 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 196.5-97 chr22 39379549 39379897 + 0.75 NA intron (NM_004711, intron 3 of 3) intron (NM_004711, intron 3 of 3) 15553 NM_145738 9145 Hs.216226 NM_004711 ENSG00000100321 SYNGR1 - synaptogyrin 1 protein-coding 130.25-207 chr8 127190387 127190693 + 0.75 NA intron (NR_120364, intron 1 of 2) intron (NR_120364, intron 1 of 2) 7087 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 152-21 chr1 227142039 227142324 + 0.75 NA intron (NM_001366019, intron 9 of 36) L2a|LINE|L2 176311 NM_001366011 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 158.25-11 chr10 49113089 49113347 + 0.75 NA intron (NM_001031746, intron 1 of 7) intron (NM_001031746, intron 1 of 7) 2304 NM_144984 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 130.5-86 chr14 26898375 26898549 + 0.75 NA intron (NR_110041, intron 3 of 3) intron (NR_110041, intron 3 of 3) -10180 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 195.75-114 chr7 92172881 92173167 + 0.75 NA intron (NR_122110, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 -7748 NM_001161528 401387 Hs.671729 NM_001045475 ENSG00000240720 LRRD1 - leucine rich repeats and death domain containing 1 protein-coding 117.5-155 chr4 32080808 32081030 + 0.75 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) L1PB3|LINE|L1 -58497 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 353.5-22 chr8 140877647 140878259 + 0.75 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) intron (NM_001352737, intron 3 of 32) 123051 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 205.5-20 chr11 56526500 56526849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16583 NM_001005245 219487 Hs.553632 NM_001005245 ENSG00000255223 OR5M11 OR11-199 olfactory receptor family 5 subfamily M member 11 protein-coding 143.75-65 chr17 29604984 29605203 + 0.75 NA intron (NM_152345, intron 1 of 14) L1MEc|LINE|L1 11961 NM_152345 124930 Hs.662164 NM_152345 ENSG00000198720 ANKRD13B - ankyrin repeat domain 13B protein-coding 148.25-129 chr5 160572702 160573003 + 0.75 NA intron (NM_001366652, intron 23 of 24) L1ME3Cz|LINE|L1 87500 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 238.75-68 chr9 76074958 76075511 + 0.75 NA intron (NR_120409, intron 7 of 19) (AAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 184561 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 257.25-7 chr11 4394558 4395238 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -1196 NM_003141 6737 Hs.532357 NM_003141 ENSG00000132109 TRIM21 RNF81|RO52|Ro/SSA|SSA|SSA1 tripartite motif containing 21 protein-coding 182.25-63 chr2 60211212 60211518 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 171671 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 268-64 chr9 118004796 118005198 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 300594 NM_138554 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 126.5-250 chr8 118297905 118298218 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR -186242 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 156.5-168 chr6 156349125 156349475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29450 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 138.25-69 chr17 82581991 82582371 + 0.75 NA intron (NM_004514, intron 4 of 8) intron (NM_004514, intron 4 of 8) 62449 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 121.5-260 chr9 27786840 27787195 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -213151 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 149.25-91 chr2 174424440 174424830 + 0.75 NA exon (NM_001193528, exon 7 of 8) exon (NM_001193528, exon 7 of 8) 28905 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 113.25-40 chr12 91427933 91428173 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245236 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 156.75-151 chr6 136738707 136739018 + 0.75 NA intron (NM_005923, intron 1 of 29) L2a|LINE|L2 -45185 NR_134635 101928429 Hs.672896 NR_134635 LOC101928429 - uncharacterized LOC101928429 ncRNA 161-52 chr17 9983302 9983669 + 0.75 NA intron (NM_201432, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu -23990 NM_003644 8522 Hs.462214 NM_003644 ENSG00000007237 GAS7 - growth arrest specific 7 protein-coding 214.5-16 chr10 111290022 111290425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175932 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 118-66 chr17 39191481 39191736 + 0.75 NA intron (NM_199248, intron 2 of 12) intron (NM_199248, intron 2 of 12) 6061 NM_199248 782 Hs.635 NM_000723 ENSG00000067191 CACNB1 CAB1|CACNLB1|CCHLB1 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 1 protein-coding 146.5-103 chr2 88001436 88001943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15899 NM_001024457 400966 Hs.728970 NM_001024457 ENSG00000187627 RGPD1 RGP1|RGPD2|RanBP2L2 RANBP2 like and GRIP domain containing 1 protein-coding 203.25-43 chr16 80382226 80382654 + 0.75 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -158294 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 178.25-58 chr18 76219781 76220289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10525 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 164-48 chr17 31735292 31735645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 123494 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 206.5-10 chr11 22695216 22695694 + 0.75 NA intron (NM_005256, intron 2 of 6) intron (NM_005256, intron 2 of 6) 20681 NM_005256 2620 Hs.711297 NM_005256 ENSG00000148935 GAS2 GAS-2 growth arrest specific 2 protein-coding 195.75-51 chr17 62953490 62953782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9421 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 235.75-2 chr1 82780177 82780699 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -122745 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 129.25-181 chr7 18777303 18777561 + 0.75 NA intron (NM_058176, intron 15 of 22) intron (NM_058176, intron 15 of 22) 268162 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 167.75-53 chr16 67492947 67493369 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -9345 NM_001138 181 Hs.104633 NM_001138 ENSG00000159723 AGRP AGRT|ART|ASIP2 agouti related neuropeptide protein-coding 136-138 chr7 92879622 92879866 + 0.75 NA intron (NR_110087, intron 2 of 2) L1M3b|LINE|L1 -43117 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 197.5-66 chr2 52796938 52797315 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -94511 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 116-54 chr15 97731874 97732127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 142429 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 116.5-86 chr16 75412613 75412835 + 0.75 NA exon (NM_006324, exon 3 of 7) exon (NM_006324, exon 3 of 7) 20779 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 156.25-19 chr10 87646935 87647352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12735 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 133.25-143 chr3 184975887 184976227 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 39 of 46) L1PA16|LINE|L1 163550 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 215.25-109 chr8 86328258 86328786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14025 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 153.75-18 chr10 43871971 43872179 + 0.75 NA intron (NR_038268, intron 3 of 4) intron (NR_038268, intron 3 of 4) 12664 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 162-5 chr1 151990082 151990373 + 0.75 NA intron (NM_002966, intron 1 of 2) intron (NM_002966, intron 1 of 2) 3632 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 179.25-8 chr1 152725779 152726232 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 6483 NM_001024679 100129271 Hs.601077 NM_001024679 ENSG00000198854 C1orf68 LEP7|XP32 chromosome 1 open reading frame 68 protein-coding 159-50 chr2 28428961 28429218 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -34417 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 120-43 chr14 59101781 59102018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86768 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 132.25-33 chr10 77251964 77252290 + 0.75 NA intron (NM_001271518, intron 1 of 27) intron (NM_001271518, intron 1 of 27) 98634 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 114.75-180 chr7 106849945 106850154 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -15233 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 176.5-21 chr10 62594679 62595042 + 0.75 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) MER58A|DNA|hAT-Charlie 74412 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 246-9 chr12 13176872 13177283 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19649 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 160.75-110 chr4 65124916 65125240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120578 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 268.75-27 chr3 31195569 31196348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34171 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 113.25-169 chr8 75103030 75103253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102986 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 125.5-81 chr14 61625752 61626057 + 0.75 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -55251 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 145.25-152 chr6 156023596 156023885 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 76943 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 131.5-152 chr3 50447479 50447731 + 0.75 NA intron (NM_001291101, intron 2 of 37) intron (NM_001291101, intron 2 of 37) 56029 NM_001174051 9254 Hs.476273 NM_006030 ENSG00000007402 CACNA2D2 CACNA2D calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 2 protein-coding 158.25-79 chr21 29050448 29050841 + 0.75 NA intron (NM_001032410, intron 17 of 18) L2b|LINE|L2 23004 NM_006585 10694 Hs.125113 NM_006585 ENSG00000156261 CCT8 C21orf112|Cctq|D21S246|PRED71 chaperonin containing TCP1 subunit 8 protein-coding 209.25-59 chr2 123325843 123326214 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -252547 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 158.5-119 chr20 58544017 58544371 + 0.75 NA intron (NR_034147, intron 5 of 6) intron (NR_034147, intron 5 of 6) -28795 NM_153360 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 224.25-100 chr7 107515741 107516370 + 0.75 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) intron (NM_181733, intron 6 of 20) 45998 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 164.5-213 chr8 118658251 118658784 + 0.75 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR -36554 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 134.5-213 chr8 32644195 32644408 + 0.75 NA intron (NM_013960, intron 5 of 12) intron (NM_013960, intron 5 of 12) -2431 NM_013959 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 143.5-150 chr3 141378574 141378968 + 0.75 NA intron (NM_001080412, intron 3 of 7) intron (NM_001080412, intron 3 of 7) -7654 NM_001350099 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 203.75-104 chr7 128156655 128157032 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51029 NR_029596 406917 NR_029596 ENSG00000207705 MIR129-1 MIR-129b|MIRN129-1|mir-129-1 microRNA 129-1 ncRNA 162.5-15 chr10 55345597 55345937 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -253275 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 140.5-131 chr20 15808971 15809204 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) L2a|LINE|L2 114227 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 132.5-16 chr1 159421940 159422225 + 0.75 NA intron (NM_001363558, intron 3 of 3) L1MA4A|LINE|L1 -10110 NR_145510 391121 NM_001348286 ENSG00000249730 OR10J4 OR10J4P|OST717 olfactory receptor family 10 subfamily J member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 120-153 chr5 156592780 156593039 + 0.75 NA intron (NM_001128209, intron 4 of 7) intron (NM_001128209, intron 4 of 7) -257386 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 213.75-58 chr20 9593355 9593806 + 0.75 NA intron (NM_020341, intron 4 of 10) L1PA7|LINE|L1 -78582 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 176-58 chr4 176644727 176645160 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147979 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 154.25-35 chr12 30339343 30339580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 337783 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 212.5-24 chr12 26051951 26052367 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001164746) promoter-TSS (NM_001164746) -405 NM_001164746 11228 Hs.696433 NM_007211 ENSG00000123094 RASSF8 C12orf2|HOJ1 Ras association domain family member 8 protein-coding 126-79 chr18 11355968 11356213 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -98388 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 163-39 chr14 67067854 67068331 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 10 of 21) L1P2|LINE|L1 -121348 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 125.5-119 chr19 29902325 29902680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21155 NM_001252641 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 159-52 chr2 82252917 82253369 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -603660 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 165.75-168 chr8 122873752 122874020 + 0.75 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 92231 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 131.25-182 chr6 169532223 169532469 + 0.75 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 169683 NM_001350623 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 145.5-24 chr10 62692043 62692303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112547 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 143-91 chr3 55004620 55004990 + 0.75 NA exon (NM_018398, exon 32 of 38) exon (NM_018398, exon 32 of 38) -37703 NM_001304389 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 121.25-32 chr11 14270135 14270320 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 88258 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 248.25-7 chr10 8779924 8780401 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -117827 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 143-88 chr3 4104011 4104336 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -199131 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 117.75-164 chr4 117302566 117302747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57983 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 130.25-28 chr10 71747366 71747558 + 0.75 NA TTS (NM_022153) TTS (NM_022153) -9612 NM_001168390 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 196.75-24 chr11 94542462 94542808 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1216 NM_002033 2526 Hs.390420 NM_002033 ENSG00000196371 FUT4 CD15|ELFT|FCT3A|FUC-TIV|FUTIV|LeX|SSEA-1 fucosyltransferase 4 protein-coding 178-95 chr7 40753416 40753836 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 226313 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 117.75-79 chr17 8934490 8934763 + 0.75 NA intron (NM_001142633, intron 1 of 18) L1MEf|LINE|L1 -22109 NM_014308 23533 Hs.278901 NM_014308 ENSG00000141506 PIK3R5 F730038I15Rik|FOAP-2|P101-PI3K|p101 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 protein-coding 139-92 chr3 1187715 1187935 + 0.75 NA intron (NM_001289080, intron 2 of 22) intron (NM_001289080, intron 2 of 22) 94801 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 145-26 chr10 57236522 57236840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67878 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 187.75-4 chr1 78430074 78430440 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -60717 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 117-169 chr7 21960579 21960811 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -14796 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 185-84 chr8 36962290 36962585 + 0.75 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 178063 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 163-131 chrX 4524888 4525319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108469 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 241.5-13 chr12 27796912 27797337 + 0.75 NA intron (NM_020782, intron 2 of 2) intron (NM_020782, intron 2 of 2) 16891 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 172.75-139 chr9 82364332 82364667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 375727 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 127.75-127 chr3 44181924 44182105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59872 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 249.75-3 chr1 31483812 31484346 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16006 NR_034112 149086 Hs.729905 NR_034112 ENSG00000260386 LDC1P LINC01225 leucine decarboxylase 1, pseudogene pseudo 197.5-138 chr6 165023409 165023732 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -201507 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 115-57 chr15 88449398 88449673 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 17853 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 191.5-66 chr18 30240622 30241025 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -58087 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 174.25-124 chr6 43603950 43604374 + 0.75 NA intron (NM_006502, intron 7 of 10) intron (NM_006502, intron 7 of 10) 23191 NM_001286216 54676 Hs.485449 NM_019096 ENSG00000172432 GTPBP2 JABELS GTP binding protein 2 protein-coding 137.75-113 chr20 6064651 6065022 + 0.75 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -10776 NM_152611 164312 Hs.149133 NM_152611 ENSG00000125872 LRRN4 C20orf75|NLRR-4|NLRR4|dJ1056H1.1 leucine rich repeat neuronal 4 protein-coding 115.75-9 chr1 202703867 202704119 + 0.75 NA intron (NM_177402, intron 1 of 8) intron (NM_177402, intron 1 of 8) 6461 NM_177402 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 122.25-76 chr17 74469529 74469875 + 0.75 NA intron (NM_001330457, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 3068 NM_007261 11314 Hs.9688 NM_007261 ENSG00000167851 CD300A CLM-8|CMRF-35-H9|CMRF-35H|CMRF35-H|CMRF35-H9|CMRF35H|CMRF35H9|IGSF12|IRC1|IRC1/IRC2|IRC2|IRp60 CD300a molecule protein-coding 116.25-63 chr14 42692817 42693105 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 1086105 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 144.5-163 chr4 170248742 170249067 + 0.75 NA intron (NR_125889, intron 1 of 2) intron (NR_125889, intron 1 of 2) 22313 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 215.25-90 chr5 170982041 170982495 + 0.75 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) HAL1|LINE|L1 120250 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 139.5-170 chr5 27231940 27232283 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193525 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 176.75-34 chr14 43234208 43234601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1272879 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 121.75-96 chr2 240990823 240991033 + 0.75 NA intron (NM_001351305, intron 30 of 31) intron (NM_001351305, intron 30 of 31) -7690 NM_001080437 25992 Hs.471834 NM_001080437 ENSG00000162804 SNED1 IRE-BP1|SST3|Snep sushi, nidogen and EGF like domains 1 protein-coding 134.25-40 chr12 132200509 132200805 + 0.75 NA intron (NM_001122636, intron 8 of 10) intron (NM_001122636, intron 8 of 10) 5371 NM_021808 50614 Hs.301062 NM_021808 ENSG00000182870 GALNT9 GALNAC-T9|GALNACT9 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 protein-coding 220.75-28 chr16 60129053 60129413 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 230560 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 170.5-106 chr2 232731540 232731865 + 0.75 NA intron (NR_103493, intron 5 of 6) intron (NR_103493, intron 5 of 6) -2715 NR_103492 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 123-157 chr5 89370386 89370651 + 0.75 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) L1MA6|LINE|L1 -466413 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 162.5-46 chr13 112122757 112123078 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 15798 NR_120394 100505996 Hs.654853 NR_120392 ENSG00000224243 SOX1-OT LINC00403 SOX1 overlapping transcript ncRNA 175-47 chr16 14360421 14360858 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 9627 NR_131191 105447648 Hs.554151 NR_131191 ENSG00000260009 LINC02130 - long intergenic non-protein coding RNA 2130 ncRNA 187.5-119 chr3 147329187 147329534 + 0.75 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 63070 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 168-42 chr12 110299193 110299521 + 0.75 NA intron (NM_170665, intron 5 of 19) intron (NM_170665, intron 5 of 19) 18110 NM_001681 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 146.25-48 chr16 74898686 74898990 + 0.75 NA intron (NM_030581, intron 18 of 25) intron (NM_030581, intron 18 of 25) 86285 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 137.75-86 chr17 61029297 61029565 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 17 of 25) intron (NM_001330413, intron 17 of 25) 338273 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 138.25-100 chr20 52593162 52593425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27545 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 124.5-146 chr3 198022151 198022474 + 0.75 NA intron (NR_026786, intron 14 of 16) intron (NR_026786, intron 14 of 16) 17155 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 121.75-93 chr2 203689385 203689741 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -16912 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 281.25-4 chr1 165068826 165069490 + 0.75 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 287083 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 217.25-86 chr8 137677488 137677914 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -264113 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 123.5-185 chr6 37457454 37457803 + 0.75 NA intron (NM_015050, intron 8 of 23) L1MD3|LINE|L1 24407 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 240.5-89 chr6 48039332 48039854 + 0.75 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) L1ME3B|LINE|L1 29096 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 221.75-92 chrX 79750477 79750966 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -264032 NM_001109878 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 119.75-117 chr2 200428615 200428900 + 0.75 NA intron (NM_001100424, intron 6 of 11) L2c|LINE|L2 81311 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 142.25-180 chrX 101104534 101104746 + 0.75 NA intron (NM_001318523, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu 3582 NM_001318523 2491 Hs.348920 NM_006733 ENSG00000102384 CENPI CENP-I|FSHPRH1|LRPR1 centromere protein I protein-coding 133-115 chr4 16356007 16356332 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 129506 NR_027696 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 146.5-15 chr1 154688726 154688964 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -60848 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 132.75-206 chr9 135667420 135667762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4269 NM_001001676 392399 Hs.532679 NM_001001676 ENSG00000148386 LCN9 HEL129 lipocalin 9 protein-coding 144.75-39 chr12 15294087 15294326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28302 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 130.5-5 chr1 40591951 40592280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60478 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 217.25-24 chr14 26306953 26307349 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 246279 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 213.25-38 chr22 33618935 33619414 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 4 of 14) LTR28C|LTR|ERV1 85746 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 157.75-157 chr6 153499253 153499712 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -368200 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 127.5-27 chr10 22638412 22638645 + 0.75 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 75580 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 291-24 chr3 94899782 94900332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38206 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 144-143 chr8 138635831 138636061 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 48 of 64) L2a|LINE|L2 -138216 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 125.5-14 chr1 176097910 176098259 + 0.75 NA intron (NM_022457, intron 9 of 19) MER61-int|LTR|ERV1 109160 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 137.25-29 chr12 405094 405365 + 0.75 NA intron (NM_001130146, intron 1 of 11) L1MB8|LINE|L1 3585 NM_001130146 84318 Hs.631656 NM_032358 ENSG00000120647 CCDC77 - coiled-coil domain containing 77 protein-coding 188-19 chr13 96751381 96751861 + 0.75 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 232551 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 147.25-52 chr19 9222437 9222684 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -7689 NM_001005191 125958 Hs.446910 NM_001005191 ENSG00000174667 OR7D4 OR19-7|OR19-B|OR19B|OR7D4P|hg105 olfactory receptor family 7 subfamily D member 4 protein-coding 229.5-21 chr10 118969552 118970127 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -59875 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 144.75-15 chr10 12528131 12528394 + 0.75 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) -50491 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 137.75-44 chr12 78872129 78872467 + 0.75 NA intron (NM_001291901, intron 1 of 9) intron (NM_001291901, intron 1 of 9) 7524 NM_001291901 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 149.5-123 chr3 81464656 81464917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296859 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 167-120 chr9 88097328 88097779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19653 NR_135137 102724156 Hs.633031 NR_135137 LOC102724156 - uncharacterized LOC102724156 ncRNA 163.5-68 chr16 60590578 60590821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230906 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 123-98 chr2 41800316 41800692 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -77051 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 229-34 chr2 66493566 66493990 + 0.75 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -53448 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 199.75-14 chr11 62186599 62186978 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3428 NM_006552 10648 Hs.202686 NM_006552 ENSG00000168515 SCGB1D1 LIPA|LPHA|LPNA secretoglobin family 1D member 1 protein-coding 123.25-7 chr1 119063328 119063678 + 0.75 NA TTS (NR_126447) TTS (NR_126447) 16098 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 207.5-46 chr19 41683271 41683645 + 0.75 NA intron (NM_006890, intron 3 of 4) intron (NM_006890, intron 3 of 4) 4812 NM_006890 1087 Hs.74466 NM_006890 ENSG00000007306 CEACAM7 CGM2 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 7 protein-coding 200-3 chr1 112577931 112578439 + 0.75 NA intron (NM_017744, intron 10 of 14) MIRb|SINE|MIR 40956 NM_017744 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 249.75-26 chr17 27189931 27190379 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -100914 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 120-198 chr9 20134320 20134530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 276813 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 209-52 chr3 194719916 194720280 + 0.75 NA intron (NR_037891, intron 1 of 3) intron (NR_037891, intron 1 of 3) 11677 NR_037891 100507391 Hs.590099 NR_037891 ENSG00000237222 LINC01968 - long intergenic non-protein coding RNA 1968 ncRNA 140.75-167 chr6 165768632 165768991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106531 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 118-81 chr2 46100380 46100577 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -196929 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 196.75-100 chr7 64520932 64521407 + 0.75 NA exon (NM_178558, exon 4 of 4) exon (NM_178558, exon 4 of 4) 41902 NM_178558 340252 Hs.520886 NM_178558 ENSG00000173041 ZNF680 - zinc finger protein 680 protein-coding 207.75-58 chr2 113826516 113826879 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63237 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 188.75-75 chr22 26374429 26374710 + 0.75 NA intron (NM_001184773, intron 14 of 16) intron (NM_001184773, intron 14 of 16) -54691 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 142-84 chr2 55947396 55947671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23751 NM_001039348 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 157.75-155 chr6 144265175 144265581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26359 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 118.75-55 chr13 94192994 94193246 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) -5129 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 154-131 chr9 19916153 19916492 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -129303 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 141.5-75 chr17 51281781 51282058 + 0.75 NA intron (NM_016001, intron 9 of 13) intron (NM_016001, intron 9 of 13) 21373 NM_016001 51096 Hs.709327 NM_016001 ENSG00000011260 UTP18 CGI-48|WDR50 UTP18 small subunit processome component protein-coding 112.5-20 chr10 31977377 31977582 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -48603 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 138.25-82 chr2 50219999 50220221 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 127644 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 116.25-120 chr2 190499040 190499292 + 0.75 NA intron (NM_017694, intron 7 of 7) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35556 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 151.5-146 chr4 159078138 159078368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25798 NM_001351724 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 160.75-35 chr12 108103627 108103959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25495 NM_014653 9671 Hs.143591 NM_014653 ENSG00000075035 WSCD2 - WSC domain containing 2 protein-coding 179.75-68 chr21 30400903 30401385 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5113 NM_181599 140258 Hs.407653 NM_181599 ENSG00000198390 KRTAP13-1 KAP13.1|KRTAP13.1 keratin associated protein 13-1 protein-coding 219-65 chr3 11437322 11437725 + 0.75 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) intron (NM_001349238, intron 17 of 17) 131275 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 163-56 chr2 46148523 46148883 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 12 of 14) intron (NM_005400, intron 12 of 14) -148704 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 215.5-106 chr8 102127295 102127830 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 2130 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 117-82 chr2 5263739 5263967 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 427265 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 133.25-123 chr21 29875388 29875658 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 64473 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 176.25-130 chr7 68065038 68065310 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44921 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 200.25-76 chr3 95174189 95174492 + 0.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 236077 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 165.5-202 chr8 113313807 113314161 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 63168 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 166.75-50 chr14 73204738 73205192 + 0.75 NA intron (NM_000021, intron 8 of 11) intron (NM_000021, intron 8 of 11) -32541 NR_158678 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 164.25-26 chr11 43643410 43643733 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37167 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 137.5-69 chr14 73227467 73227748 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9899 NR_158678 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 140.25-94 chr2 101645034 101645267 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52553 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 112.25-146 chr4 38861862 38862091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5159 NM_006068 10333 Hs.575090 NM_006068 ENSG00000174130 TLR6 CD286 toll like receptor 6 protein-coding 171.5-12 chr10 37838828 37839389 + 0.75 NA intron (NR_147991, intron 1 of 4) MER68|LTR|ERVL 18502 NM_001267607 57209 Hs.528423 NM_021045 ENSG00000198105 ZNF248 bA162G10.3 zinc finger protein 248 protein-coding 117-84 chr2 25391125 25391324 + 0.75 NA intron (NM_001351385, intron 14 of 17) L1M4|LINE|L1 -48634 NM_175629 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 179.25-108 chr4 31576659 31577040 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 70305 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 171.75-98 chr3 39400777 39401099 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -5782 NM_001304288 3921 Hs.449909 NM_002295 ENSG00000168028 RPSA 37LRP|67LR|ICAS|LAMBR|LAMR1|LBP|LBP/p40|LRP|LRP/LR|NEM/1CHD4|SA|lamR|p40 ribosomal protein SA protein-coding 145.5-63 chr14 58071713 58072056 + 0.75 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) intron (NM_001001872, intron 5 of 7) 80329 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 147.75-131 chr5 137259941 137260236 + 0.75 NA intron (NM_004598, intron 3 of 10) MIR3|SINE|MIR 131891 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 134.75-198 chr7 52845113 52845435 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -190359 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 135.75-60 chr14 68597956 68598292 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 30663 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 120.5-164 chr4 62192245 62192516 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30615 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 173-86 chr3 82620259 82620794 + 0.75 NA Intergenic MER11A|LTR|ERVK 634384 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 200.75-115 chr9 92940169 92940537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7170 NM_001083536 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 113-11 chr1 188087860 188088075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 644339 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 125.25-109 chr2 153988552 153988778 + 0.75 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) intron (NM_052917, intron 3 of 12) 44271 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 129.75-26 chr10 68992369 68992603 + 0.75 NA intron (NM_015634, intron 1 of 6) intron (NM_015634, intron 1 of 6) 3683 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 118.5-199 chr7 78031852 78032248 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 20 of 20) intron (NM_001301128, intron 20 of 20) 191920 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 119.25-120 chr3 3695046 3695326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104245 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 125-78 chr2 179240768 179240991 + 0.75 NA intron (NM_178123, intron 1 of 17) L1MD1|LINE|L1 23953 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 133.75-125 chr22 49954778 49955053 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5857 NM_001001852 415116 Hs.530381 NM_001001852 ENSG00000198355 PIM3 pim-3 Pim-3 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 138.25-84 chr2 58126122 58126349 + 0.75 NA intron (NM_001130483, intron 8 of 13) intron (NM_001130483, intron 8 of 13) 79523 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 159.75-173 chr8 116964652 116965032 + 0.75 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 13867 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 119.25-26 chr10 78875103 78875477 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 192158 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 157-27 chr14 49588219 49588475 + 0.75 NA intron (NM_001351375, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 1767 NR_002715 6029 NR_002715 ENSG00000276168 RN7SL1 7L1a|7SL|RN7SL|RNSRP1 RNA component of signal recognition particle 7SL1 scRNA 177-24 chr12 99983533 99983876 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 1 of 25) intron (NM_152788, intron 1 of 25) 950 NM_001352186 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 241.5-28 chr16 89477914 89478356 + 0.75 NA intron (NM_001256182, intron 1 of 13) intron (NM_001256182, intron 1 of 13) 12426 NR_045839 29123 Hs.335003 NM_013275 ENSG00000167522 ANKRD11 ANCO-1|ANCO1|LZ16|T13 ankyrin repeat domain 11 protein-coding 181-56 chr2 162803271 162803756 + 0.75 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR 34577 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 126-171 chr8 76469181 76469451 + 0.75 NA intron (NR_105006, intron 2 of 5) L1PA15|LINE|L1 62662 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 179-52 chr2 62613339 62613817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60300 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 168.25-120 chr5 138625552 138625952 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -50351 NM_004134 3313 Hs.184233 NM_004134 ENSG00000113013 HSPA9 CRP40|CSA|EVPLS|GRP-75|GRP75|HEL-S-124m|HSPA9B|MOT|MOT2|MTHSP75|PBP74|SAAN|SIDBA4 heat shock protein family A (Hsp70) member 9 protein-coding 144.25-176 chr6 156478813 156479017 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 100165 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 143.5-17 chr1 233152801 233153106 + 0.75 NA intron (NM_014801, intron 19 of 33) MIRb|SINE|MIR 142772 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 114.25-89 chr2 40002734 40002944 + 0.75 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 85205 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 146.5-179 chr5 134343478 134343902 + 0.75 NA intron (NM_001349366, intron 1 of 8) LTR8|LTR|ERV1 23384 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 257-54 chr7 71634369 71634952 + 0.75 NA intron (NM_022479, intron 6 of 10) AluSx1|SINE|Alu -326890 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 259.5-3 chr1 41613187 41613597 + 0.75 NA intron (NM_024503, intron 3 of 8) L2c|LINE|L2 -128709 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 198.75-50 chr2 190256695 190257011 + 0.75 NA intron (NM_198047, intron 7 of 12) L1MEc|LINE|L1 62973 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 163.75-51 chr15 85663657 85664060 + 0.75 NA intron (NM_006738, intron 12 of 36) intron (NM_006738, intron 12 of 36) 43908 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 275.5-35 chr20 56690642 56691121 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61575 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 148.25-146 chr8 89496808 89497021 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 260797 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 179.25-121 chr5 107812088 107812490 + 0.75 NA Intergenic X6A_LINE|LINE|CR1 -141352 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 123.75-145 chr5 64851957 64852251 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) intron (NM_005869, intron 10 of 13) 83174 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 220.5-110 chr6 139295943 139296465 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -4206 NM_153235 167838 Hs.535820 NM_153235 ENSG00000164440 TXLNB C6orf198|LST001|MDP77|dJ522B19.2 taxilin beta protein-coding 220.25-51 chr3 130790457 130790849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43824 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 274-37 chr8 135196913 135197473 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36938 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 151.5-156 chr5 112644197 112644631 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 15978 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 171.75-127 chr7 24771278 24771609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13504 NM_004403 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 147.5-4 chr1 27018452 27018822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5787 NM_052943 115572 Hs.632378 NM_052943 ENSG00000158246 TENT5B FAM46B terminal nucleotidyltransferase 5B protein-coding 157.5-18 chr1 226300802 226301141 + 0.75 NA intron (NM_001366241, intron 2 of 14) intron (NM_001366241, intron 2 of 14) 8193 NM_001366245 286826 Hs.120817 NM_173083 ENSG00000183814 LIN9 BARA|BARPsv|Lin-9|TGS|TGS1|TGS2 lin-9 DREAM MuvB core complex component protein-coding 144.25-96 chr2 57417489 57417735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -490039 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 137.25-124 chr5 32190756 32191047 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16582 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 149-76 chr22 36039440 36039667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10729 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 150-46 chr14 82572718 82572948 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -69799 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 142.25-31 chr11 88658055 88658275 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) MER1B|DNA|hAT-Charlie 153589 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 193-24 chr15 37243868 37244243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142744 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 121.5-45 chr11 77148654 77148933 + 0.75 NA intron (NM_001127180, intron 4 of 48) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 20547 NM_000260 4647 Hs.370421 NM_000260 ENSG00000137474 MYO7A DFNA11|DFNB2|MYOVIIA|MYU7A|NSRD2|USH1B myosin VIIA protein-coding 193.5-15 chr10 21886792 21887132 + 0.75 NA intron (NM_022365, intron 7 of 11) L1PA13|LINE|L1 116768 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 218.75-85 chr8 71767810 71768319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75059 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 190.25-50 chr17 51095451 51095855 + 0.75 NA intron (NM_001130527, intron 1 of 29) AluSx3|SINE|Alu 25215 NM_001130528 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 243-71 chr7 151863037 151863460 + 0.75 NA intron (NM_016203, intron 1 of 15) intron (NM_016203, intron 1 of 15) -13794 NR_038926 100505483 Hs.649054 NR_038926 PRKAG2-AS1 - PRKAG2 antisense RNA 1 ncRNA 179-81 chr6 62773699 62774208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -487726 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 348-3 chr10 62211473 62212152 + 0.75 NA intron (NM_145307, intron 9 of 11) AluSc8|SINE|Alu 57032 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 167-16 chr10 14672394 14672911 + 0.75 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) -68251 NM_001282696 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 319.5-24 chr18 36995582 36996219 + 0.75 NA intron (NR_136303, intron 6 of 13) intron (NR_136303, intron 6 of 13) -72086 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 209.5-142 chr8 80731935 80732443 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) L1MEg|LINE|L1 142279 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 218.25-38 chr2 23722774 23723105 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 204184 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 269.25-46 chr6 57156610 57157368 + 0.75 NA intron (NM_015555, intron 12 of 13) MER1B|DNA|hAT-Charlie 15224 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 126.25-217 chr9 562415 562707 + 0.75 NA intron (NM_001256877, intron 2 of 12) intron (NM_001256877, intron 2 of 12) 58006 NM_001354334 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 140-72 chr2 68701744 68702089 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -32895 NM_001007231 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 166.5-95 chr2 12318291 12318539 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 119285 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 119.5-195 chr6 37549847 37550167 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 5415 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 135.75-155 chr4 33960240 33960640 + 0.75 NA intron (NR_125902, intron 3 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 79453 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 155-89 chr3 164056701 164057186 + 0.75 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 114613 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 149-5 chr1 110401461 110401894 + 0.75 NA intron (NM_006402, intron 3 of 3) intron (NM_006402, intron 3 of 3) -6132 NR_102697 101410535 Hs.559121 NR_102697 LAMTOR5-AS1 - LAMTOR5 antisense RNA 1 ncRNA 195.75-44 chr14 52144747 52145254 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -75941 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 243.75-54 chr3 42680632 42681296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4573 NM_152393 131377 Hs.350288 NM_152393 ENSG00000157119 KLHL40 KBTBD5|NEM8|SRYP|SYRP kelch like family member 40 protein-coding 126.5-56 chr12 119004281 119004708 + 0.75 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) intron (NM_194286, intron 1 of 12) 22953 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 171.25-101 chr3 117111739 117112062 + 0.75 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy 190469 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 130.5-100 chr15 61871838 61872070 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 79 of 81) intron (NM_001018088, intron 79 of 81) 142036 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 137-179 chr8 116832314 116832566 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -41984 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 132.75-66 chr14 73435548 73435792 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 22910 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 157-81 chr4 32050623 32050850 + 0.75 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -28314 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 131.25-146 chr3 133818183 133818413 + 0.75 NA intron (NR_163491, intron 6 of 7) intron (NR_163491, intron 6 of 7) 12483 NR_163491 58477 Hs.12152 NM_021203 ENSG00000144867 SRPRB APMCF1|SR-beta SRP receptor subunit beta protein-coding 176.5-55 chr14 58440689 58440989 + 0.75 NA intron (NM_001244193, intron 1 of 26) L1MA9|LINE|L1 1158 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 206.25-20 chr10 90699827 90700389 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 157931 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 271-55 chrX 69227879 69228380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48572 NR_103715 100996279 NR_103715 ENSG00000215162 LINC00269 CXorf62|NCRNA00269 long intergenic non-protein coding RNA 269 ncRNA 114.5-93 chr14 62115019 62115256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2220 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 156.5-130 chr4 41765246 41765751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16528 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 113.5-99 chr17 32191264 32191494 + 0.75 NA intron (NM_001033566, intron 8 of 19) intron (NM_001033566, intron 8 of 19) -39808 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 147.75-29 chr12 4473970 4474169 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -28455 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 221.75-84 chr8 111743274 111743592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 366794 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 204-32 chr2 43768030 43768404 + 0.75 NA TTS (NM_172069) TTS (NM_172069) -5822 NM_001348912 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 145-143 chr6 163480432 163480691 + 0.75 NA intron (NM_206853, intron 3 of 6) intron (NM_206853, intron 3 of 6) 65843 NM_006775 9444 Hs.510324 NM_006775 ENSG00000112531 QKI Hqk|QK|QK1|QK3|hqkI QKI, KH domain containing RNA binding protein-coding 188.5-41 chr14 70789010 70789291 + 0.75 NA intron (NM_033141, intron 2 of 12) intron (NM_033141, intron 2 of 12) -5698 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 128.5-56 chr13 36217833 36218200 + 0.75 NA intron (NM_001198910, intron 6 of 15) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -3401 NM_001282147 54937 Hs.124519 NM_017826 ENSG00000120669 SOHLH2 SOSF2|SPATA28|TEB1|bHLHe81 spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 protein-coding 116.75-40 chr11 80881302 80881670 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -118683 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 115.25-128 chr3 21349990 21350199 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55632 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 121-137 chr3 160166621 160166875 + 0.75 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) FLAM_C|SINE|Alu 40344 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 151.25-150 chr5 33969317 33969644 + 0.75 NA intron (NM_001012509, intron 2 of 5) intron (NM_001012509, intron 2 of 5) 15213 NM_001297417 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 181-66 chr22 41292606 41292947 + 0.75 NA intron (NM_001317930, intron 1 of 15) intron (NM_001317930, intron 1 of 15) -6589 NM_002883 5905 Hs.183800 NM_002883 ENSG00000100401 RANGAP1 Fug1|RANGAP|SD Ran GTPase activating protein 1 protein-coding 183-14 chr11 67587745 67588072 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4313 NM_000852 2950 Hs.523836 NM_000852 ENSG00000084207 GSTP1 DFN7|FAEES3|GST3|GSTP|HEL-S-22|PI glutathione S-transferase pi 1 protein-coding 154.75-2 chr1 37597289 37597548 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -1433 NM_001323623 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 118-169 chr7 2920009 2920229 + 0.75 NA intron (NM_001324281, intron 18 of 25) L1ME3|LINE|L1 -75811 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 136.75-19 chr10 6224951 6225233 + 0.75 NA intron (NM_001314063, intron 13 of 15) intron (NM_001314063, intron 13 of 15) 22160 NM_001323017 5209 Hs.195471 NM_004566 ENSG00000170525 PFKFB3 IPFK2|PFK2|iPFK-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 protein-coding 124.75-101 chr18 12470411 12470677 + 0.75 NA intron (NM_020148, intron 9 of 15) intron (NM_020148, intron 9 of 15) 37770 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 228.5-64 chr2 238334775 238335251 + 0.75 NA intron (NM_001139490, intron 7 of 14) intron (NM_001139490, intron 7 of 14) 14469 NM_001139490 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 169.25-28 chr14 58408599 58408901 + 0.75 NA TTS (NM_001304487) TTS (NM_001304487) 12820 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 161.25-61 chr15 78212991 78213439 + 0.75 NA intron (NM_015162, intron 1 of 13) intron (NM_015162, intron 1 of 13) 21350 NM_001199377 23205 Hs.655760 NM_015162 ENSG00000103740 ACSBG1 BG|BG1|BGM|GR-LACS|LPD acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 protein-coding 157.25-134 chr6 159110589 159111018 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -58597 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 125.5-148 chr20 35402086 35402326 + 0.75 NA intron (NM_001184977, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 9767 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 143.5-195 chr7 48128957 48129269 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39848 NM_003364 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 164-100 chr5 68739757 68740250 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 289924 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 207.25-29 chr17 42185463 42185962 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001524) promoter-TSS (NM_001524) -260 NM_001524 3060 Hs.158348 NM_001524 ENSG00000161610 HCRT NRCLP1|OX|PPOX hypocretin neuropeptide precursor protein-coding 149.75-19 chr11 23546854 23547277 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -127875 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 145.5-4 chr1 30262768 30262979 + 0.75 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -225261 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 121.25-153 chr4 132210892 132211109 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -380089 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 163.75-74 chr2 128709283 128709535 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -155191 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 120-141 chr5 26271095 26271350 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 767364 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 127.5-194 chr5 82251176 82251417 + 0.75 NA intron (NM_031482, intron 5 of 7) intron (NM_031482, intron 5 of 7) 27058 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 126.5-171 chr4 55537450 55537838 + 0.75 NA intron (NM_004898, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 8288 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 141.5-31 chr11 130850913 130851365 + 0.75 NA intron (NR_125383, intron 3 of 5) L1MC4a|LINE|L1 10971 NR_125383 100507431 Hs.375101 NR_125383 LINC02551 - long intergenic non-protein coding RNA 2551 ncRNA 152.25-3 chr1 80709034 80709297 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 67878 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 141.25-154 chr6 45618124 45618550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 196062 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 154.75-10 chr10 52290050 52290309 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 16 of 17) intron (NM_001098512, intron 16 of 17) 23949 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 144.25-210 chr8 122825533 122825895 + 0.75 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 44059 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 206-28 chr14 89204507 89204997 + 0.75 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 212481 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 186-35 chr17 81851011 81851310 + 0.75 NA intron (NM_000918, intron 4 of 10) AluY|SINE|Alu 9375 NM_000918 5034 Hs.464336 NM_000918 ENSG00000185624 P4HB CLCRP1|DSI|ERBA2L|GIT|P4Hbeta|PDI|PDIA1|PHDB|PO4DB|PO4HB|PROHB prolyl 4-hydroxylase subunit beta protein-coding 133-133 chr5 19236231 19236414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 649950 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 172.75-87 chr3 133254869 133255195 + 0.75 NA intron (NR_110812, intron 1 of 2) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 2089 NR_110812 101927455 Hs.570550 NR_110812 ENSG00000251011 TMEM108-AS1 - TMEM108 antisense RNA 1 ncRNA 233.5-70 chr3 20777328 20777736 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 435064 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 127.5-59 chr12 88878394 88878627 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 141182 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 142.5-30 chr10 54280627 54280871 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -205481 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 129.25-163 chr6 13095183 13095449 + 0.75 NA intron (NM_001322308, intron 4 of 13) intron (NM_001322308, intron 4 of 13) 81762 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 115-78 chr2 44094022 44094217 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74684 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 144.25-51 chr13 87955422 87955660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -145021 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 133.5-11 chr1 162267896 162268147 + 0.75 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) AluSz6|SINE|Alu -74525 NR_030283 693141 NR_030283 ENSG00000207729 MIR556 MIRN556|hsa-mir-556|mir-556 microRNA 556 ncRNA 127.75-209 chr9 104797838 104798107 + 0.75 NA intron (NM_005502, intron 37 of 49) intron (NM_005502, intron 37 of 49) 33843 NM_018376 55335 Hs.429294 NM_018376 ENSG00000165028 NIPSNAP3B FP944|NIPSNAP3|SNAP1 nipsnap homolog 3B protein-coding 145.25-88 chr20 53921795 53922059 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46218 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 116.75-183 chr7 43290124 43290414 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) MER4D|LTR|ERV1 139374 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 177-83 chr5 168004634 168005094 + 0.75 NA intron (NM_001080428, intron 3 of 24) intron (NM_001080428, intron 3 of 24) -160981 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 155.25-14 chr1 175170157 175170511 + 0.75 NA intron (NM_001319230, intron 1 of 2) intron (NM_001319230, intron 1 of 2) 22442 NM_001162895 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 231.25-20 chr15 64941016 64941545 + 0.75 NA intron (NM_182703, intron 9 of 14) intron (NM_182703, intron 9 of 14) 29378 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 149.25-172 chr7 107659157 107659469 + 0.75 NA non-coding (NR_028137, exon 2 of 2) non-coding (NR_028137, exon 2 of 2) -1515 NM_000441 5172 Hs.571246 NM_000441 ENSG00000091137 SLC26A4 DFNB4|EVA|PDS|TDH2B solute carrier family 26 member 4 protein-coding 139.25-167 chr6 153961104 153961332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49278 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 185.75-136 chr9 101834765 101835217 + 0.75 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -96411 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 118-74 chr18 13740991 13741297 + 0.75 NA intron (NM_003799, intron 6 of 11) intron (NM_003799, intron 6 of 11) 14471 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 167.25-36 chr14 48512522 48513043 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -717768 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 152.5-21 chr10 102397527 102397815 + 0.75 NA exon (NM_002502, exon 8 of 23) exon (NM_002502, exon 8 of 23) 1966 NM_002502 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 232.75-24 chr15 63848913 63849331 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -15174 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 132-143 chr5 148484936 148485239 + 0.75 NA intron (NM_001040173, intron 5 of 6) intron (NM_001040173, intron 5 of 6) 101129 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 132.5-46 chr11 116336536 116336768 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -302770 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 155.75-114 chr3 192058670 192059076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179757 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-195 chrX 124900555 124900956 + 0.75 NA intron (NM_014253, intron 1 of 30) intron (NM_014253, intron 1 of 30) 63062 NM_001163279 10178 Hs.23796 NM_014253 ENSG00000009694 TENM1 ODZ1|ODZ3|TEN-M1|TNM|TNM1|ten-1 teneurin transmembrane protein 1 protein-coding 115.5-15 chr1 184078886 184079066 + 0.75 NA intron (NM_001363643, intron 3 of 3) intron (NM_001363643, intron 3 of 3) 27246 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 124.25-142 chr3 169689704 169689923 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -26101 NM_001366466 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 175-33 chr12 118393112 118393403 + 0.75 NA intron (NM_022491, intron 6 of 11) intron (NM_022491, intron 6 of 11) 16702 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 166-10 chr10 33497078 33497408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -162338 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 197-66 chr9 15230856 15231350 + 0.75 NA intron (NM_001168340, intron 2 of 18) L1MB8|LINE|L1 19115 NM_001168342 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 172.5-135 chr3 191521191 191521421 + 0.75 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 60143 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 208.25-31 chr15 62174965 62175582 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -9988 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 200.75-24 chr12 64249374 64249784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27283 NM_001300941 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 157.75-107 chr3 84750105 84750510 + 0.75 NA intron (NR_033860, intron 10 of 20) intron (NR_033860, intron 10 of 20) 119268 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 128.25-209 chr8 114729653 114729878 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 938248 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 172.75-31 chr12 124214833 124215330 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) AluSx|SINE|Alu -74083 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 291.25-23 chr5 6688903 6689467 + 0.75 NA intron (NR_103771, intron 2 of 2) L1MEc|LINE|L1 18526 NR_103771 100505625 Hs.550028 NR_103771 ENSG00000248677 LINC02102 - long intergenic non-protein coding RNA 2102 ncRNA 175.5-86 chr2 48715695 48716164 + 0.75 NA intron (NM_000233, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 39795 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 189-51 chr2 12892003 12892413 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 114805 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 139.75-34 chr12 25066275 25066465 + 0.75 NA non-coding (NR_159368, exon 5 of 21) non-coding (NR_159368, exon 5 of 21) 13664 NM_001204126 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 133.5-53 chr11 86483388 86483801 + 0.75 NA intron (NM_001014811, intron 6 of 13) intron (NM_001014811, intron 6 of 13) 108707 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 113.5-187 chr4 139837992 139838199 + 0.75 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 172276 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 169.5-132 chr5 24613185 24613418 + 0.75 NA intron (NM_001362460, intron 1 of 9) intron (NM_001362460, intron 1 of 9) 31677 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 134-146 chr5 150325557 150325834 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22790 NM_001012301 340075 Hs.591252 NM_001012301 ENSG00000183876 ARSI ASI|SPG66 arylsulfatase family member I protein-coding 118.75-92 chr2 39844862 39845089 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -65699 NM_001321474 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 227.5-41 chr16 70259004 70259349 + 0.75 NA exon (NM_001605, exon 14 of 21) exon (NM_001605, exon 14 of 21) -7236 NM_058219 118460 Hs.660633 NM_058219 ENSG00000223496 EXOSC6 EAP4|MTR3|Mtr3p|hMtr3p|p11 exosome component 6 protein-coding 163.25-135 chr8 26384142 26384616 + 0.75 NA intron (NM_004331, intron 1 of 5) intron (NM_004331, intron 1 of 5) 1325 NM_004331 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 187-79 chr5 94670126 94670497 + 0.75 NA intron (NM_032290, intron 13 of 20) intron (NM_032290, intron 13 of 20) 51642 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 197.5-106 chr4 40312920 40313353 + 0.75 NA intron (NR_121641, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 -3348 NR_121640 101060498 Hs.351492 NR_121640 ENSG00000249241 LINC02265 - long intergenic non-protein coding RNA 2265 ncRNA 122.75-132 chr3 117816810 117817104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126032 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 168-123 chr8 49588284 49588661 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -76292 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 192.75-36 chr15 57082781 57083088 + 0.75 NA intron (NM_001322158, intron 5 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 -136496 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 129.75-127 chr3 191429991 191430227 + 0.75 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) MER31B|LTR|ERV1 4585 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 208-78 chr8 95056967 95057270 + 0.75 NA intron (NR_148915, intron 9 of 9) intron (NR_148915, intron 9 of 9) -15796 NR_036105 100422964 NR_036105 ENSG00000283522 MIR3150A MIR3150|mir-3150a microRNA 3150a ncRNA 128-52 chr15 87908503 87908789 + 0.75 NA intron (NM_001012338, intron 17 of 19) intron (NM_001012338, intron 17 of 19) 37622 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 193-70 chr5 36521924 36522183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84302 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 238.75-56 chr7 4327692 4328276 + 0.75 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -193147 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 206-75 chr8 89936479 89936832 + 0.75 NA intron (NM_001024688, intron 16 of 16) intron (NM_001024688, intron 16 of 16) 34085 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 127.75-48 chr11 118269906 118270133 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5483 NM_144765 10205 Hs.116651 NM_005797 ENSG00000149573 MPZL2 DFNB111|EVA|EVA1 myelin protein zero like 2 protein-coding 148.25-59 chr18 710984 711257 + 0.75 NA intron (NM_001318760, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 1510 NM_017512 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 237-64 chr7 69268764 69269153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 328666 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 164-109 chr5 152633788 152634071 + 0.75 NA intron (NR_109877, intron 4 of 4) intron (NR_109877, intron 4 of 4) -228650 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 129.25-107 chr20 12248492 12248768 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 330737 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 126.25-80 chr2 20678238 20678626 + 0.75 NA 3' UTR (NM_182828, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_182828, exon 2 of 2) 11288 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 113.25-86 chr2 48696377 48696587 + 0.75 NA intron (NM_000233, intron 9 of 10) intron (NM_000233, intron 9 of 10) 59242 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 225.75-70 chr6 51753467 51753910 + 0.75 NA intron (NM_138694, intron 56 of 66) intron (NM_138694, intron 56 of 66) 131818 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 114.5-161 chr21 20710282 20710494 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92720 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 146.25-11 chr10 19105676 19106055 + 0.75 NA intron (NM_001142308, intron 5 of 39) L1MA6|LINE|L1 57064 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 122.5-124 chr2 207364924 207365123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95599 NR_031633 100302130 NR_031633 ENSG00000221628 MIR1302-4 MIRN1302-4|hsa-mir-1302-4 microRNA 1302-4 ncRNA 188.25-5 chr1 189729351 189729640 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 746515 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 204.75-12 chr1 234780231 234780633 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -20376 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 192-51 chr16 50100205 50100544 + 0.75 NA intron (NR_138092, intron 14 of 15) intron (NR_138092, intron 14 of 15) 34404 NR_138092 55027 Hs.733027 NM_017939 ENSG00000155393 HEATR3 SYO1 HEAT repeat containing 3 protein-coding 160.25-131 chr5 110453387 110453715 + 0.75 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) AluSc5|SINE|Alu 60364 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 119.25-53 chr14 42791216 42791487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1184495 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 158.25-73 chr2 211739094 211739391 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 5 of 26) L1M5|LINE|L1 687118 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 170-24 chr13 52399204 52399523 + 0.75 NA intron (NM_018676, intron 2 of 4) intron (NM_018676, intron 2 of 4) 6809 NM_199263 55901 Hs.325667 NM_018676 ENSG00000136114 THSD1 TMTSP|UNQ3010 thrombospondin type 1 domain containing 1 protein-coding 166-11 chr10 43410365 43410758 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1313 NM_001098204 3185 Hs.808 NM_004966 ENSG00000169813 HNRNPF HNRPF|OK/SW-cl.23|mcs94-1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F protein-coding 123.5-4 chr1 41013768 41014065 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_037868) promoter-TSS (NR_037868) -674 NR_037868 100507178 Hs.660056 NR_037868 ENSG00000281207 SLFNL1-AS1 - SLFNL1 antisense RNA 1 ncRNA 243.5-15 chr10 18138305 18138847 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1848 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 135.25-94 chr2 48966294 48966546 + 0.75 NA intron (NM_000145, intron 9 of 9) intron (NM_000145, intron 9 of 9) -93183 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 114.75-137 chr4 47232079 47232389 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 200667 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 167.75-111 chr5 35319241 35319547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -88907 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 128.25-131 chr3 89406870 89407079 + 0.75 NA intron (NM_005233, intron 7 of 16) intron (NM_005233, intron 7 of 16) 299353 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 114-154 chr7 38899280 38899541 + 0.75 NA intron (NM_014396, intron 1 of 28) L3|LINE|CR1 9781 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 200.5-87 chr3 47586497 47586915 + 0.75 NA 3' UTR (NM_003074, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_003074, exon 28 of 28) -6466 NM_001206945 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 133.75-107 chr2 156948480 156948882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309024 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 134.75-10 chr1 100806408 100806640 + 0.75 NA Intergenic (TTCTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 86782 NM_001078 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 152.25-37 chr12 3497406 3497698 + 0.75 NA intron (NM_019854, intron 1 of 9) intron (NM_019854, intron 1 of 9) -4733 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 177.25-56 chr17 27122458 27122909 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33442 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 180.5-124 chr5 179087039 179087371 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 26832 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 182.5-159 chr8 53725168 53725638 + 0.75 NA intron (NM_213620, intron 13 of 13) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 117639 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 172.25-135 chr7 109969438 109969743 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -9377 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 178.25-96 chr4 154536914 154537425 + 0.75 NA intron (NM_002669, intron 14 of 14) intron (NM_002669, intron 14 of 14) 13231 NM_002669 5356 Hs.249996 NM_002669 ENSG00000171566 PLRG1 Cwc1|PRL1|PRP46|PRPF46|TANGO4 pleiotropic regulator 1 protein-coding 175.25-23 chr11 39613213 39613446 + 0.75 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 679801 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 141.75-160 chr7 25179236 25179477 + 0.75 NA intron (NM_001371352, intron 1 of 9) intron (NM_001371352, intron 1 of 9) 998 NM_138811 136895 Hs.122055 NM_138811 ENSG00000153790 C7orf31 - chromosome 7 open reading frame 31 protein-coding 124-40 chr13 69806094 69806305 + 0.75 NA intron (NM_001286725, intron 5 of 9) L1M5|LINE|L1 -301014 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 193.75-95 chr4 77020915 77021452 + 0.75 NA intron (NM_001306147, intron 9 of 11) intron (NM_001306147, intron 9 of 11) 53727 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 123.5-34 chr11 27692392 27692649 + 0.75 NA intron (NR_033312, intron 8 of 8) AluJb|SINE|Alu 7147 NM_170734 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 218-61 chr6 96118357 96119036 + 0.75 NA intron (NM_006581, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 102722 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 131.75-79 chr16 13814161 13814517 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -105818 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 128.75-164 chr6 50141899 50142131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92086 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 216.25-53 chr2 97771265 97771594 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 33 of 40) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 37023 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 165.25-48 chr15 100750634 100750975 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -98948 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 173.25-139 chr9 38077212 38077576 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8167 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 164-145 chr9 3786224 3786495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112287 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 238.25-67 chr5 58146946 58147438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24851 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 157-44 chr17 58340388 58340677 + 0.75 NA intron (NR_038418, intron 2 of 3) FLAM_A|SINE|Alu 3330 NR_038416 100506779 Hs.718477 NR_038410 ENSG00000265148 TSPOAP1-AS1 BZRAP1-AS1 TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1 ncRNA 144.25-63 chr15 59591346 59591636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20292 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 185.25-35 chr15 66871435 66871821 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 84887 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 172-46 chr18 13896856 13897247 + 0.75 NA intron (NM_001291911, intron 1 of 1) L1MA1|LINE|L1 18485 NM_000529 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 142-2 chr1 63484701 63485015 + 0.75 NA intron (NM_001347145, intron 3 of 7) L1MEd|LINE|L1 38415 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 154.5-96 chr2 63769767 63770255 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -70953 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 119-136 chr4 108227596 108227801 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 55578 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 151.5-165 chr5 174268852 174269163 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -67347 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 189.25-33 chr14 48706211 48706557 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 879996 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 141.5-55 chr14 55472139 55472545 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -31797 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 132.5-261 chrX 153973281 153973527 + 0.75 NA intron (NM_003492, intron 1 of 1) intron (NM_003492, intron 1 of 1) 650 NM_003492 8269 Hs.23119 NM_003492 ENSG00000177854 TMEM187 CXorf12|DXS9878E|ITBA1 transmembrane protein 187 protein-coding 132.75-103 chr2 138844300 138844613 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -52868 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 193.25-17 chr10 115743368 115743693 + 0.75 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) intron (NM_207303, intron 27 of 28) 451259 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 116.5-268 chr9 128904554 128904934 + 0.75 NA intron (NM_001127244, intron 2 of 3) AluY|SINE|Alu -16238 NM_174933 254295 Hs.709447 NM_174933 ENSG00000175287 PHYHD1 - phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1 protein-coding 168-82 chr3 74604504 74604932 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -83578 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 138.5-65 chr14 87660449 87660728 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -5294 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 119.25-186 chr7 27275870 27276153 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28782 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 171.75-56 chr16 60200233 60200570 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 159392 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 167.5-121 chr3 183756251 183756776 + 0.75 NA intron (NM_001351371, intron 11 of 21) intron (NM_001351371, intron 11 of 21) 46274 NM_001351369 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 124-63 chr17 56910338 56910619 + 0.75 NA intron (NM_005082, intron 1 of 8) intron (NM_005082, intron 1 of 8) 3571 NM_005082 7706 Hs.528952 NM_005082 ENSG00000121060 TRIM25 EFP|RNF147|Z147|ZNF147 tripartite motif containing 25 protein-coding 183.5-154 chr8 133674898 133675189 + 0.75 NA intron (NR_134462, intron 1 of 2) intron (NR_134462, intron 1 of 2) 9023 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 187.25-33 chr15 63521122 63521541 + 0.75 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) L1MC4|LINE|L1 16738 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 130.75-50 chr13 43753959 43754135 + 0.75 NA intron (NM_001347969, intron 1 of 16) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32925 NR_145132 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 208.5-97 chr4 40160771 40161125 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -30132 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 168.75-82 chr20 36685680 36686004 + 0.75 NA intron (NR_038370, intron 3 of 13) AluJb|SINE|Alu -39646 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 113.25-66 chr16 82796132 82796341 + 0.75 NA intron (NR_110938, intron 1 of 2) intron (NR_110938, intron 1 of 2) 22917 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 147.75-122 chr4 181017813 181018097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141194 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 115.5-256 chrX 23994881 23995077 + 0.75 NA intron (NM_030624, intron 3 of 3) intron (NM_030624, intron 3 of 3) 32207 NM_030624 80311 Hs.495854 NM_030624 ENSG00000174010 KLHL15 HEL-S-305 kelch like family member 15 protein-coding 122.75-210 chr8 131106784 131107132 + 0.75 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 -66049 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 175-75 chr2 239278893 239279409 + 0.75 NA intron (NM_006037, intron 2 of 26) intron (NM_006037, intron 2 of 26) -26311 NR_036229 100423043 NR_036229 ENSG00000265215 MIR4269 - microRNA 4269 ncRNA 265-17 chr18 5906072 5906675 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -10419 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 195.5-157 chr7_KI270803v1_alt 513601 513983 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55667 NR_162121 113839523 NR_162121 MIR11400 - microRNA 11400 ncRNA 137.25-59 chr17 80130548 80130779 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 16465 NM_014740 9775 Hs.389649 NM_014740 ENSG00000141543 EIF4A3 DDX48|Fal1|MUK34|NMP265|NUK34|RCPS|eIF-4A-III|eIF4A-III|eIF4AIII eukaryotic translation initiation factor 4A3 protein-coding 196-95 chr8 8575843 8576319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125856 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 139.75-123 chr3 109212464 109212695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34414 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 200.25-90 chr5 130646447 130646804 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 518631 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 155.5-89 chr2 39456008 39456300 + 0.75 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) intron (NR_037875, intron 3 of 5) 18738 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 197.75-59 chr4 92457106 92457529 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 152918 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 228.5-89 chr6 126889361 126889878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -229052 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 119.25-131 chr3 99663037 99663244 + 0.75 NA intron (NM_020351, intron 1 of 3) intron (NM_020351, intron 1 of 3) 24546 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 118.25-44 chr11 96385971 96386205 + 0.75 NA intron (NM_024725, intron 3 of 9) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 3728 NM_001363594 79780 Hs.525088 NM_014148 ENSG00000149231 CCDC82 HSPC048 coiled-coil domain containing 82 protein-coding 140.5-121 chr2 167253813 167254050 + 0.75 NA intron (NM_001199144, intron 7 of 8) intron (NM_001199144, intron 7 of 8) 66559 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 152.5-20 chr10 81229611 81229938 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 579977 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 140.75-65 chr16 74937284 74937736 + 0.75 NA intron (NM_001324172, intron 8 of 13) intron (NM_001324172, intron 8 of 13) 47613 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 139-51 chr17 33729699 33729995 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR -196087 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 169-85 chr6 42464422 42464651 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -12312 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 148.25-83 chr20 49928609 49928970 + 0.75 NA TTS (NR_134564) TTS (NR_134564) -7608 NM_018683 55905 Hs.144949 NM_018683 ENSG00000124226 RNF114 PSORS12|ZNF313 ring finger protein 114 protein-coding 203-69 chr4 43806830 43807145 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -209874 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 175.75-126 chr8 124203910 124204314 + 0.75 NA intron (NR_125420, intron 2 of 2) intron (NR_125420, intron 2 of 2) -32590 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 146.75-174 chr8 144541595 144541825 + 0.75 NA intron (NM_025251, intron 5 of 10) L1MB3|LINE|L1 -12599 NM_001001795 414919 Hs.105685 NM_001001795 ENSG00000213563 C8orf82 - chromosome 8 open reading frame 82 protein-coding 154.25-89 chr2 178704865 178705070 + 0.75 NA intron (NM_001256850, intron 101 of 312) intron (NM_001256850, intron 101 of 312) -71959 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 136.75-186 chr7 53638421 53638783 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 173329 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 119.75-45 chr12 46775471 46775705 + 0.75 NA intron (NM_018018, intron 13 of 16) intron (NM_018018, intron 13 of 16) 50409 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 202.25-34 chr19 30979765 30980111 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -187572 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 190-27 chr19 37195015 37195320 + 0.75 NA intron (NM_152279, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 15369 NM_152279 92285 Hs.390568 NM_152279 ENSG00000245680 ZNF585B SZFP41 zinc finger protein 585B protein-coding 195-74 chr7 3927070 3927463 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -202419 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 162.5-116 chr3 139244041 139244393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10695 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 148.5-239 chr8 144419077 144419533 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2461 NM_130849 55630 Hs.521934 NM_017767 ENSG00000147804 SLC39A4 AEZ|AWMS2|ZIP4 solute carrier family 39 member 4 protein-coding 129.5-204 chr6 113071364 113071659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 361936 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 142.75-101 chr2 108539451 108539837 + 0.75 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) L1ME4b|LINE|L1 5289 NM_001193483 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 113-128 chr3 195078939 195079095 + 0.75 NA intron (NM_152531, intron 3 of 3) intron (NM_152531, intron 3 of 3) -15571 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 249.5-82 chr5 173969742 173970379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19110 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 276.5-51 chr5 19260331 19260758 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 625728 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 153-111 chr4 183447144 183447462 + 0.75 NA exon (NM_017632, exon 3 of 3) exon (NM_017632, exon 3 of 3) 2667 NM_001317343 55602 Hs.592508 NM_017632 ENSG00000168564 CDKN2AIP CARF CDKN2A interacting protein protein-coding 204-92 chrX 116872198 116872539 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -54508 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 212-5 chr1 186628097 186628533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52108 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 142.75-78 chr17 3771085 3771509 + 0.75 NA intron (NM_002208, intron 2 of 30) L1ME3A|LINE|L1 29891 NM_002208 3682 Hs.513867 NM_002208 ENSG00000083457 ITGAE CD103|HUMINAE integrin subunit alpha E protein-coding 188.75-84 chr4 46886698 46887131 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) intron (NM_130902, intron 1 of 2) 22331 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 157.75-85 chr2 62762484 62762763 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 3 of 22) L2a|LINE|L2 55726 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 192.5-8 chr1 202890886 202891328 + 0.75 NA TTS (NM_001303051) TTS (NM_001303051) -1958 NM_002871 5877 Hs.90875 NM_002871 ENSG00000183155 RABIF MSS4|RASGFR3|RASGRF3 RAB interacting factor protein-coding 151.25-161 chr6 63215403 63215801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104375 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 134-27 chr11 75541403 75541786 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -15653 NM_030792 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 257-43 chr4 76273129 76273587 + 0.75 NA intron (NM_001242939, intron 5 of 6) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 21637 NM_001136570 100129583 Hs.720509 NM_001136570 ENSG00000189157 FAM47E - family with sequence similarity 47 member E protein-coding 222.25-20 chr14 66383931 66384423 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102194 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 175.75-103 chr5 27484927 27485301 + 0.75 NA intron (NR_038848, intron 3 of 4) intron (NR_038848, intron 3 of 4) 12822 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 191-19 chr12 53108918 53109443 + 0.75 NA intron (NM_003578, intron 5 of 14) AluSx4|SINE|Alu 5694 NM_003578 8435 Hs.656544 NM_003578 ENSG00000167780 SOAT2 ACACT2|ACAT2|ARGP2 sterol O-acyltransferase 2 protein-coding 131.75-183 chr6 39200139 39200380 + 0.75 NA intron (NM_003740, intron 1 of 4) intron (NM_003740, intron 1 of 4) 29216 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 131.75-142 chr3 136113135 136113523 + 0.75 NA intron (NM_181897, intron 12 of 12) L1P4|LINE|L1 81139 NM_001145417 55167 Hs.18631 NM_018133 ENSG00000174579 MSL2 MSL-2|MSL2L1|RNF184 MSL complex subunit 2 protein-coding 236.5-9 chr11 456479 456928 + 0.75 NA intron (NM_030783, intron 1 of 11) intron (NM_030783, intron 1 of 11) 6424 NM_001329544 81490 Hs.12851 NM_030783 ENSG00000174915 PTDSS2 PSS2 phosphatidylserine synthase 2 protein-coding 258.5-10 chr11 73899592 73900091 + 0.75 NA intron (NM_001267803, intron 6 of 12) intron (NM_001267803, intron 6 of 12) 11060 NM_001363556 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 182.75-90 chr4 47259381 47259790 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 204117 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 150.75-18 chr1 176849545 176850015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179665 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 134.25-73 chr19 49756156 49756533 + 0.75 NA intron (NM_021733, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu 6962 NM_021733 60385 Hs.515858 NM_021733 ENSG00000126467 TSKS PPP1R161|STK22S1|TSKS1|TSSKS testis specific serine kinase substrate protein-coding 119-5 chr1 118370181 118370388 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -185056 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 157.5-127 chr22 41878596 41878910 + 0.75 NA non-coding (NR_103834, exon 10 of 22) non-coding (NR_103834, exon 10 of 22) -22191 NR_029507 407039 NR_029507 ENSG00000207932 MIR33A MIR33|MIRN33|MIRN33A|hsa-mir-33|hsa-mir-33a|miR-33|miRNA33A|mir-33a microRNA 33a ncRNA 184-33 chr16 58582037 58582504 + 0.75 NA intron (NM_206999, intron 10 of 30) AluSx|SINE|Alu -22339 NR_002980 677830 Hs.677515 NR_002980 ENSG00000281910 SNORA50A ACA50|SNORA50|SNORA76A small nucleolar RNA, H/ACA box 50A snoRNA 187.25-77 chr3 188515998 188516520 + 0.75 NA intron (NM_001167672, intron 3 of 9) intron (NM_001167672, intron 3 of 9) 52407 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 188.5-135 chr6 140349940 140350352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 144894 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 114-31 chr11 104453929 104454095 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155290 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 205-43 chr2 222738694 222739228 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 67303 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 202-66 chr7 43876516 43877002 + 0.75 NA exon (NM_017920, exon 5 of 5) exon (NM_017920, exon 5 of 5) -7242 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 171-125 chr7 14431439 14431783 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 409839 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 215.5-98 chr7 54892772 54893241 + 0.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -126011 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 187.75-20 chr11 133614124 133614494 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81808 NM_001319104 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 196-87 chr6 123723664 123724029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80000 NM_001300738 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 173-98 chr4 111830958 111831247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -314352 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 149-108 chr6 16362622 16363013 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) intron (NM_000332, intron 7 of 8) 124230 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 133.25-14 chr10 17783791 17784074 + 0.75 NA intron (NM_001098844, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 -25416 NM_002438 4360 Hs.75182 NM_002438 ENSG00000260314 MRC1 CD206|CLEC13D|CLEC13DL|MMR|MRC1L1|bA541I19.1|hMR mannose receptor C-type 1 protein-coding 115.75-156 chr4 84100360 84100605 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) L1MC|LINE|L1 198687 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 186.25-65 chr22 27188840 27189274 + 0.75 NA exon (NM_001318392, exon 3 of 3) exon (NM_001318392, exon 3 of 3) 1541 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 116.25-191 chr6 11098223 11098539 + 0.75 NA intron (NM_001135575, intron 1 of 1) L2|LINE|L2 4547 NM_001135575 221710 Hs.656600 NM_001135575 ENSG00000224531 SMIM13 C6orf228 small integral membrane protein 13 protein-coding 178.25-41 chr16 12524008 12524304 + 0.75 NA intron (NM_032167, intron 19 of 20) intron (NM_032167, intron 19 of 20) -196165 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 202.5-144 chr8 143006786 143007149 + 0.75 NA intron (NR_026913, intron 1 of 1) L1PA13|LINE|L1 11139 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 170.25-134 chr5 162889043 162889358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -548371 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 135-126 chr4 94391396 94391647 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -48685 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 161-105 chr6 39670780 39671094 + 0.75 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) intron (NM_001289020, intron 3 of 21) 54471 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 116.75-130 chr3 108092567 108092757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1574 NM_198793 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 131.5-120 chr2 124539096 124539348 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 10 of 23) intron (NM_130773, intron 10 of 23) 513935 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 135.25-194 chr8 51220004 51220342 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 589272 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 227.5-114 chr9 37169087 37169518 + 0.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 48704 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 138.25-65 chr17 78444088 78444365 + 0.75 NA intron (NM_173628, intron 71 of 80) intron (NM_173628, intron 71 of 80) -40684 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 202.75-45 chr17 59211562 59212089 + 0.75 NA intron (NM_018149, intron 1 of 3) intron (NM_018149, intron 1 of 3) 1815 NM_018149 55181 Hs.7296 NM_018149 ENSG00000167447 SMG8 C17orf71 SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 149.75-83 chr2 67074615 67074903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11687 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 134.75-98 chr18 72088871 72089177 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -306798 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 144.25-130 chr3 100020992 100021255 + 0.75 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) -56725 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 122.25-82 chr18 12699427 12699627 + 0.75 NA intron (NM_024899, intron 3 of 11) intron (NM_024899, intron 3 of 11) 3196 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 167.75-101 chr4 96170560 96170885 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -139981 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 183-48 chr2 14245438 14245759 + 0.75 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) intron (NR_103814, intron 2 of 3) 155360 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 213.5-30 chr12 7095400 7095770 + 0.75 NA 3' UTR (NM_016546, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_016546, exon 6 of 6) -3140 NM_001733 715 Hs.524224 NM_001733 ENSG00000159403 C1R EDSPD1 complement C1r protein-coding 114.75-50 chr14 54494010 54494223 + 0.75 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -5136 NM_004124 2764 Hs.151413 NM_004124 ENSG00000197045 GMFB GMF glia maturation factor beta protein-coding 125.75-120 chr21 33845697 33846049 + 0.75 NA intron (NM_001331010, intron 28 of 38) intron (NM_001331010, intron 28 of 38) 69931 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 116.75-84 chr19 53713358 53713558 + 0.75 NA TTS (NR_030202) TTS (NR_030202) 111 NR_030202 574480 NR_030202 ENSG00000207981 MIR519D MIRN519D|mir-519d microRNA 519d ncRNA 132.25-142 chr4 52841107 52841443 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21042 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 156.5-74 chr2 25602950 25603367 + 0.75 NA intron (NM_001351393, intron 4 of 17) intron (NM_001351393, intron 4 of 17) 47064 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 131.75-156 chr4 104170262 104170483 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -320593 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 127.75-130 chr3 109099431 109099663 + 0.75 NA intron (NM_014429, intron 5 of 27) intron (NM_014429, intron 5 of 27) -1909 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 213.5-131 chr9 79791183 79791575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33151 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 233.75-72 chr7 1283903 1284577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51368 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 173-88 chr3 89374450 89374797 + 0.75 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 267002 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 129.25-90 chr2 83686897 83687138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164203 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 149-66 chr2 228748096 228748388 + 0.75 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -136847 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 164.5-139 chr3 121837180 121837491 + 0.75 NA intron (NM_018456, intron 1 of 5) intron (NM_018456, intron 1 of 5) 2126 NM_018456 55840 Hs.477325 NM_018456 ENSG00000145088 EAF2 BM040|TRAITS|U19 ELL associated factor 2 protein-coding 153-158 chr8 110126673 110126937 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151034 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 129.75-126 chr3 163777929 163778161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 393511 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 219.5-95 chr5 5435607 5436015 + 0.75 NA intron (NM_015325, intron 1 of 18) AluSx1|SINE|Alu 13134 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 214.75-88 chr8 106365523 106365950 + 0.75 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) intron (NM_018002, intron 2 of 15) -82188 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 144.5-142 chr4 39026225 39026559 + 0.75 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) intron (NM_001303228, intron 1 of 6) 6017 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 121.75-193 chr8 119723770 119724039 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50514 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 115.5-73 chr15 54236204 54236425 + 0.75 NA intron (NM_001080534, intron 4 of 30) intron (NM_001080534, intron 4 of 30) 223666 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 125.5-86 chr14 102807409 102807748 + 0.75 NA intron (NM_001199427, intron 1 of 7) intron (NM_001199427, intron 1 of 7) 30099 NM_145725 7187 Hs.510528 NM_003300 ENSG00000131323 TRAF3 CAP-1|CAP1|CD40bp|CRAF1|IIAE5|LAP1|RNF118 TNF receptor associated factor 3 protein-coding 172.75-63 chr2 113148640 113149039 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 21241 NM_173842 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 189.25-54 chr2 22082891 22083207 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -372397 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 124.5-41 chr11 113031127 113031352 + 0.75 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -67779 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 201.75-12 chr10 76581728 76582136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -306112 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 131.5-177 chr4 81211959 81212335 + 0.75 NA intron (NM_006259, intron 1 of 18) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 2970 NM_006259 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 128-98 chr3 26610196 26610402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12507 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 116.5-212 chr6 20934243 20934500 + 0.75 NA intron (NM_017774, intron 9 of 15) intron (NM_017774, intron 9 of 15) 399914 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 124.5-134 chr22 22767692 22767858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55001 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 159.75-127 chr5 30504001 30504333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 623607 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 139.25-143 chr5 12009621 12009902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105315 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 177.25-70 chr2 137211379 137211727 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 446008 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 245.75-64 chr8 132676748 132677200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1429 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 136.75-85 chr18 73427470 73427827 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 102707 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 173-120 chr6 62790392 62790679 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -504308 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 183.75-114 chr7 12414927 12415262 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -11153 NM_001346973 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 196.75-66 chr20 35251379 35251745 + 0.75 NA intron (NM_006690, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR 24872 NM_006690 10893 Hs.715494 NM_006690 ENSG00000125966 MMP24 MMP-24|MMP25|MT-MMP 5|MT-MMP5|MT5-MMP|MT5MMP|MTMMP5 matrix metallopeptidase 24 protein-coding 130.5-73 chr12 39764433 39764648 + 0.75 NA exon (NM_052885, exon 9 of 10) exon (NM_052885, exon 9 of 10) 138357 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 155.5-111 chr20 47812341 47812652 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -25880 NM_198596 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 217-70 chr5 104925694 104926211 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -173522 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 162.25-39 chr12 120480915 120481312 + 0.75 NA intron (NM_001037494, intron 1 of 2) (TATTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11271 NM_001037494 8655 Hs.5120 NM_003746 ENSG00000088986 DYNLL1 DLC1|DLC8|DNCL1|DNCLC1|LC8|LC8a|PIN|hdlc1 dynein light chain LC8-type 1 protein-coding 125-114 chr4 67846464 67846739 + 0.75 NA intron (NM_004262, intron 3 of 9) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 37401 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 142-90 chr2 155397487 155397706 + 0.75 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 698901 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 118.25-129 chr3 116743166 116743452 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 33521 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 150-36 chr14 30564535 30564872 + 0.75 NA intron (NR_151720, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 5545 NM_017769 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 149.5-42 chr11 30456722 30457081 + 0.75 NA intron (NM_001584, intron 3 of 5) intron (NM_001584, intron 3 of 5) 123592 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 203.25-98 chr7 93626311 93626858 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -51854 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 113-65 chr15 59320727 59320948 + 0.75 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) L1PA16|LINE|L1 52034 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 115.75-229 chr9 84266260 84266446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74405 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 170.75-20 chr11 79453016 79453291 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -12123 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 172-61 chr20 23376156 23376594 + 0.75 NA non-coding (NR_104266, exon 10 of 11) non-coding (NR_104266, exon 10 of 11) 12012 NM_001317019 64412 Hs.709462 NM_022482 ENSG00000125812 GZF1 JLSM|ZBTB23|ZNF336 GDNF inducible zinc finger protein 1 protein-coding 124.5-100 chr2 28811859 28812110 + 0.75 NA intron (NM_001142634, intron 1 of 6) intron (NM_001142634, intron 1 of 6) 1150 NM_001142634 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 191.25-37 chr16 47586280 47586726 + 0.75 NA intron (NM_001031835, intron 9 of 31) intron (NM_001031835, intron 9 of 31) 125172 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 187.5-130 chr4 113676833 113677452 + 0.75 NA intron (NM_001221, intron 2 of 18) L2b|LINE|L2 84596 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 199-20 chr12 68280507 68280804 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27051 NM_020525 50616 Hs.287369 NM_020525 ENSG00000127318 IL22 IL-21|IL-22|IL-D110|IL-TIF|ILTIF|TIFIL-23|TIFa|zcyto18 interleukin 22 protein-coding 254.25-73 chr9 85052251 85052686 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 346567 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 140.25-190 chr8 127854397 127854609 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 58541 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 283-10 chr10 119909275 119909974 + 0.75 NA intron (NM_007190, intron 5 of 18) AluJr4|SINE|Alu 16894 NM_007190 11196 Hs.435004 NM_007190 ENSG00000107651 SEC23IP MSTP053|P125|P125A SEC23 interacting protein protein-coding 199.75-65 chr3 88212445 88212882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62704 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 166.75-120 chr5 128495772 128496086 + 0.75 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) L1M4b|LINE|L1 42316 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 128-128 chr5 127370006 127370208 + 0.75 NA intron (NM_001308121, intron 5 of 13) intron (NM_001308121, intron 5 of 13) 79311 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 147.25-63 chr2 146179058 146179296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -407880 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 151.75-161 chr9 26147309 26147563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80761 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 206-27 chr14 85095415 85095724 + 0.75 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -176363 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 204.5-59 chr2 15406600 15406945 + 0.75 NA intron (NR_052013, intron 25 of 50) L1MC5|LINE|L1 154562 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 244-18 chr17 57524085 57524591 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_110808) promoter-TSS (NR_110808) -741 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 130.25-58 chr14 55726231 55726573 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -39843 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 222-73 chr7 28562850 28563446 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) -122985 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 116.25-205 chr7 9648827 9649108 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14697 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 178-28 chr14 54560265 54560679 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -7140 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 182-27 chr12 130965009 130965488 + 0.75 NA intron (NM_198827, intron 2 of 24) L1M5|LINE|L1 11341 NM_198827 283383 Hs.719239 NM_198827 ENSG00000111452 ADGRD1 GPR133|PGR25 adhesion G protein-coupled receptor D1 protein-coding 117.75-206 chr8 55172788 55173070 + 0.75 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 70901 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 124.25-58 chr14 95237769 95238054 + 0.75 NA intron (NM_024734, intron 1 of 12) intron (NM_024734, intron 1 of 12) -79901 NM_030621 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 206.25-81 chr5 16533894 16534324 + 0.75 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -25111 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 170.5-30 chr10 92682713 92683007 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7095 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 127.25-199 chr7 107530876 107531100 + 0.75 NA intron (NM_181733, intron 5 of 20) L1ME3B|LINE|L1 -32969 NR_073005 11062 Hs.97627 NM_181581 ENSG00000105865 DUS4L DUS4|PP35 dihydrouridine synthase 4 like protein-coding 189.25-70 chr21 33595920 33596198 + 0.75 NA intron (NM_145858, intron 10 of 12) intron (NM_145858, intron 10 of 12) -7375 NM_017613 29980 Hs.436341 NM_017613 ENSG00000159147 DONSON B17|C21orf60|MIMIS|MISSLA downstream neighbor of SON protein-coding 184.5-36 chr12 26191842 26192125 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3353 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 146.5-197 chr7 8221807 8222055 + 0.75 NA intron (NM_001350838, intron 4 of 11) intron (NM_001350838, intron 4 of 11) 40121 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 188-81 chr8 119672227 119672543 + 0.75 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) intron (NM_001330600, intron 1 of 25) 1005 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 142.5-100 chr2 5737457 5737721 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45205 NM_003108 6664 Hs.432638 NM_003108 ENSG00000176887 SOX11 MRD27 SRY-box transcription factor 11 protein-coding 194.25-26 chr13 87593569 87594060 + 0.75 NA intron (NR_033829, intron 1 of 5) intron (NR_033829, intron 1 of 5) 24926 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 186.5-62 chr2 48353831 48354358 + 0.75 NA intron (NM_002158, intron 3 of 6) intron (NM_002158, intron 3 of 6) 39412 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 116.5-111 chr2 48104461 48104814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -198844 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 211.75-66 chr4 66047225 66047675 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -229374 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 128.5-218 chr8 18097639 18097957 + 0.75 NA TTS (NR_125429) TTS (NR_125429) -12837 NM_004315 427 Hs.527412 NM_004315 ENSG00000104763 ASAH1 AC|ACDase|ASAH|PHP|PHP32|SMAPME N-acylsphingosine amidohydrolase 1 protein-coding 182.75-139 chr8 140517720 140518180 + 0.75 NA TTS (NM_017444) TTS (NM_017444) 5954 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 140.25-128 chr4 48353343 48353596 + 0.75 NA intron (NM_020846, intron 1 of 7) intron (NM_020846, intron 1 of 7) 11940 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 194-46 chr2 126627518 126627895 + 0.75 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 -28229 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 173.75-107 chr3 96421246 96421529 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61423 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 210-88 chr6 158692789 158693117 + 0.75 NA intron (NM_001242394, intron 6 of 17) AluY|SINE|Alu 29550 NM_001318745 94120 Hs.436977 NM_001009991 ENSG00000164674 SYTL3 SLP3 synaptotagmin like 3 protein-coding 146.25-97 chr22 33729653 33729985 + 0.75 NA intron (NR_038950, intron 3 of 6) intron (NR_038950, intron 3 of 6) 4833 NR_038949 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 187.5-121 chr4 2232568 2232926 + 0.75 NA intron (NM_001303143, intron 5 of 5) intron (NM_001303143, intron 5 of 5) 9374 NM_001303143 79441 Hs.665869 NM_024511 ENSG00000214367 HAUS3 C4orf15|IT1|dgt3 HAUS augmin like complex subunit 3 protein-coding 169.75-169 chrX 21293943 21294189 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80352 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 138.5-52 chr14 27414716 27414971 + 0.75 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -197745 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 121-182 chr7 108828000 108828304 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 56435 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 142.75-135 chr3 195277070 195277327 + 0.75 NA 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) -6039 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 263.25-59 chr8 129686141 129686725 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6194 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 247-50 chr5 34476113 34476656 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -179944 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 196-23 chr13 60559016 60559505 + 0.75 NA intron (NM_030794, intron 12 of 13) MIR|SINE|MIR -113695 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 147-129 chr7 42993078 42993427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60876 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 176.75-33 chr14 40943508 40943893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11011 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 129-76 chr16 62681610 62681881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -645307 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 116.5-94 chr17 63080730 63081027 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) MIR|SINE|MIR 114643 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 198.5-15 chr10 33212120 33212639 + 0.75 NA intron (NM_001244973, intron 9 of 16) L1MB2|LINE|L1 -95572 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 120-206 chrX 88655765 88655948 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -91369 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 207-23 chr12 123427909 123428494 + 0.75 NA intron (NR_130703, intron 1 of 2) AluY|SINE|Alu 8532 NR_130703 196383 Hs.488173 NM_145058 ENSG00000150977 RILPL2 RLP2 Rab interacting lysosomal protein like 2 protein-coding 118.25-65 chr14 66825690 66825972 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 318424 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 116-143 chr6 124495332 124495647 + 0.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 212484 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 161.75-3 chr1 62503005 62503259 + 0.75 NA intron (NM_001367561, intron 37 of 49) L1M8|LINE|L1 66083 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 120.5-81 chr15 67976578 67976906 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -77437 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 118.25-83 chr17 71109677 71109863 + 0.75 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 92409 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 148-51 chr19 16019247 16019507 + 0.75 NA intron (NR_026828, intron 2 of 8) intron (NR_026828, intron 2 of 8) 3743 NR_026828 126536 Hs.131824 NR_026828 ENSG00000205396 LINC00661 - long intergenic non-protein coding RNA 661 ncRNA 118-73 chr18 12848816 12849037 + 0.75 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) L1M5|LINE|L1 -7964 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 158.5-30 chr10 88275799 88276149 + 0.75 NA intron (NM_018363, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu 307344 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 207.75-92 chr4 124931093 124931594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -218611 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 138.5-163 chr5 137809745 137810146 + 0.75 NA non-coding (NR_002713, exon 2 of 2) non-coding (NR_002713, exon 2 of 2) 8752 NR_002713 4888 Hs.643466 NR_002713 ENSG00000226306 NPY6R NPY1RL|NPY6RP|PP2|Y2B neuropeptide Y receptor Y6 (pseudogene) pseudo 140.75-169 chr7 55420365 55420780 + 0.75 NA intron (NM_018697, intron 6 of 8) L1MEf|LINE|L1 55124 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 154-120 chr7 1141662 1142100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3624 NM_001350968 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 176-16 chr12 20557391 20557809 + 0.75 NA intron (NM_000921, intron 2 of 15) intron (NM_000921, intron 2 of 15) -14264 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 115.5-165 chr3 76700658 76700945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -339298 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 166-17 chr10 123391813 123392132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 237570 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 225.5-24 chr12 23406464 23406874 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 177917 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 128.25-56 chr15 72165453 72165765 + 0.75 NA intron (NM_001012642, intron 7 of 11) intron (NM_001012642, intron 7 of 11) 32178 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 144.5-74 chr15 81884596 81884938 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 161251 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 170.5-69 chr15 62723871 62724306 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 23 of 55) AluSz6|SINE|Alu 76777 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 166.75-138 chr8 72549199 72549519 + 0.75 NA intron (NM_004770, intron 1 of 2) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 12134 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 145.5-167 chr5 159716518 159716759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 154746 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 137.25-18 chr10 74542485 74542828 + 0.75 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) L1MC4a|LINE|L1 -13332 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 141.25-16 chr10 15203717 15203962 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -35146 NM_001308295 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 159-136 chrX 67799194 67799645 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 254796 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 166.75-150 chrX 79421837 79422147 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -54440 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 135.75-176 chr5 139891011 139891351 + 0.75 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 95373 NM_032289 84249 Hs.21963 NM_032289 ENSG00000146005 PSD2 EFA6C pleckstrin and Sec7 domain containing 2 protein-coding 184.25-64 chr2 187500751 187501163 + 0.75 NA intron (NM_001318941, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 -52705 NM_005795 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 229-62 chr5 34566968 34567463 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -89113 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 128.5-110 chr2 95333937 95334280 + 0.75 NA intron (NM_013434, intron 2 of 8) intron (NM_013434, intron 2 of 8) -12550 NM_001034914 30818 Hs.437376 NM_013434 ENSG00000115041 KCNIP3 CSEN|DREAM|KCHIP3 potassium voltage-gated channel interacting protein 3 protein-coding 131.25-120 chr20 25158140 25158463 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9511 NR_027091 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 182-63 chr2 156464409 156464888 + 0.75 NA intron (NM_000408, intron 1 of 16) intron (NM_000408, intron 1 of 16) 28269 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 226.5-17 chr12 62521372 62521702 + 0.75 NA intron (NM_001278469, intron 8 of 35) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 54711 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 129.5-64 chr14 42579487 42579913 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 972844 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 162.75-123 chr6 36321671 36322066 + 0.75 NA intron (NM_001010903, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 15020 NM_001010903 389384 Hs.162104 NM_001010903 ENSG00000189325 BNIP5 C6orf222 BCL2 interacting protein 5 protein-coding 228.75-65 chr5 39997017 39997378 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -55094 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 203.75-76 chr4 8664083 8664508 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71530 NM_001014447 8532 Hs.61995 NM_003652 ENSG00000109625 CPZ - carboxypeptidase Z protein-coding 135.75-100 chr2 114326439 114326806 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -116019 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 182.5-146 chr6 123589265 123589718 + 0.75 NA intron (NM_001256020, intron 1 of 8) intron (NM_001256020, intron 1 of 8) 47459 NM_001251987 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 170.75-80 chr21 14665324 14665660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22385 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 222.5-43 chr18 24576572 24576980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51406 NR_040033 729950 Hs.585850 NR_040033 ENSG00000265485 LINC01915 - long intergenic non-protein coding RNA 1915 ncRNA 142-151 chr7 89755443 89755782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -363788 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 115.5-95 chr17 77020131 77020415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51074 NR_136416 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 187.75-46 chr2 21483837 21484132 + 0.75 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 226668 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 143.25-160 chr6 113363167 113363395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70166 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 155.5-184 chr6 114315342 114315621 + 0.75 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -252604 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 124.5-252 chrX 98315548 98315765 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -751121 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-117 chr20 13148600 13148790 + 0.75 NA intron (NM_001349945, intron 10 of 12) intron (NM_001349945, intron 10 of 12) -72579 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 177.25-23 chr10 111253997 111254307 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 139861 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 133.75-38 chr12 51372148 51372404 + 0.75 NA intron (NM_007210, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu -19041 NM_001267615 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 138.5-215 chrX 40570679 40570969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10146 NM_005765 10159 Hs.495960 NM_005765 ENSG00000182220 ATP6AP2 APT6M8-9|ATP6IP2|ATP6M8-9|ELDF10|HT028|M8-9|MRXE|MRXSH|MSTP009|PRR|RENR|XMRE|XPDS ATPase H+ transporting accessory protein 2 protein-coding 141.5-21 chr11 20040504 20040889 + 0.75 NA intron (NM_182964, intron 12 of 37) intron (NM_182964, intron 12 of 37) 8607 NR_046672 100874014 Hs.557916 NR_046672 ENSG00000254453 NAV2-AS2 - NAV2 antisense RNA 2 ncRNA 150.25-139 chr7 20660458 20660797 + 0.75 NA TTS (NM_001163942) TTS (NM_001163942) 13297 NM_178559 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 134.25-134 chr4 153367791 153368157 + 0.75 NA intron (NR_045605, intron 6 of 9) L1MB8|LINE|L1 23286 NM_032117 84057 Hs.294088 NM_032117 ENSG00000121211 MND1 GAJ meiotic nuclear divisions 1 protein-coding 157.5-176 chr6 41991001 41991232 + 0.75 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu -49268 NM_001287427 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 112.75-162 chr5 64420232 64420503 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -85648 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 132-88 chr2 77729876 77730199 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185897 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 144.75-183 chr8 119300433 119300791 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24559 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 114.5-42 chr10 95047340 95047581 + 0.75 NA intron (NM_001198855, intron 6 of 9) intron (NM_001198855, intron 6 of 9) 22037 NM_001198854 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 195.75-9 chr1 107660818 107661140 + 0.75 NA intron (NM_006113, intron 19 of 26) intron (NM_006113, intron 19 of 26) 27520 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 228.25-43 chr2 59798816 59799270 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 581335 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 193.75-52 chr15 87818311 87818672 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 127777 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 180-24 chr12 116809524 116810015 + 0.75 NA intron (NM_001109903, intron 7 of 11) AluSq2|SINE|Alu 71454 NM_032814 84900 Hs.437195 NM_032814 ENSG00000135119 RNFT2 TMEM118 ring finger protein, transmembrane 2 protein-coding 135.5-27 chr10 96158268 96158520 + 0.75 NA exon (NM_001330737, exon 7 of 7) exon (NM_001330737, exon 7 of 7) 27772 NM_001330734 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 266-52 chr9 121842855 121843578 + 0.75 NA intron (NM_001139442, intron 8 of 8) L1MC2|LINE|L1 100431 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 221.75-55 chr4 134554663 134555144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131035 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 216-27 chr17 43363318 43363622 + 0.75 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 25428 NR_027412 100130581 Hs.546897 NR_027412 ENSG00000188825 LINC00910 - long intergenic non-protein coding RNA 910 ncRNA 168.75-120 chr6 63242569 63242948 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 77219 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 163-2 chr1 65372696 65372950 + 0.75 NA intron (NM_001256864, intron 4 of 18) intron (NM_001256864, intron 4 of 18) -47829 NM_001003680 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 154.75-14 chr10 90828699 90829070 + 0.75 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) L1M1|LINE|L1 29155 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 123.75-109 chr22 34909775 34910197 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 87930 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 458.5-6 chr5 16459400 16460255 + 0.75 NA intron (NM_033414, intron 3 of 5) L1ME3A|LINE|L1 5973 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 164.25-18 chr10 58932176 58932427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67217 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 190-16 chr14 20427654 20428131 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001365790, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001365790, exon 5 of 5) 7938 NM_001109997 123103 Hs.556014 NM_001109997 ENSG00000185271 KLHL33 - kelch like family member 33 protein-coding 172.5-143 chr4 74053596 74054010 + 0.75 NA TTS (NR_026769) TTS (NR_026769) 1596 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 155.25-182 chr8 118609221 118609622 + 0.75 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) intron (NR_109794, intron 1 of 4) -11580 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-52 chr16 74785593 74786038 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10995 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 169.25-105 chr7 10486833 10487282 + 0.75 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) intron (NR_147499, intron 2 of 2) -215619 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 219.25-11 chr10 34554315 34554852 + 0.75 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 260713 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 164.5-151 chr4 135482223 135482677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -358891 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 122.75-53 chr15 80672226 80672568 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22913 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 160.25-153 chr7 107046297 107046559 + 0.75 NA intron (NM_002736, intron 1 of 10) intron (NM_002736, intron 1 of 10) 1723 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 135.5-24 chr10 42546203 42546460 + 0.75 NA intron (NR_026777, intron 5 of 7) AluSx4|SINE|Alu 6539 NR_026777 100129482 Hs.278064 NR_026777 ENSG00000234420 ZNF37BP KOX21|ZNF37B zinc finger protein 37B, pseudogene pseudo 454.25-2 chr2 72778774 72779763 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) MIR|SINE|MIR 46765 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 124.5-220 chr8 79998730 79998953 + 0.75 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 31418 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 166-44 chr17 40417268 40417499 + 0.75 NA intron (NM_001067, intron 1 of 34) intron (NM_001067, intron 1 of 34) 513 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 220.75-64 chr6 165450033 165450438 + 0.75 NA intron (NM_006661, intron 5 of 22) intron (NM_006661, intron 5 of 22) -140630 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 183.25-17 chr10 116971937 116972294 + 0.75 NA intron (NM_001258298, intron 1 of 15) intron (NM_001258298, intron 1 of 15) 33072 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 127.25-127 chr3 130248831 130249159 + 0.75 NA intron (NR_027898, intron 17 of 22) intron (NR_027898, intron 17 of 22) 36175 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 180.75-61 chr2 30200071 30200575 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 12889 NR_145719 109616960 NR_145719 ENSG00000207187 SNORA10B - small nucleolar RNA, H/ACA box 10B snoRNA 122.25-29 chr11 47611143 47611434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16877 NM_031909 114900 Hs.662633 NM_031909 ENSG00000172247 C1QTNF4 CTRP4|ZACRP4 C1q and TNF related 4 protein-coding 167.5-111 chr21 41276335 41276760 + 0.75 NA 3' UTR (NM_012105, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_012105, exon 9 of 9) -40254 NM_058186 54097 Hs.473877 NM_058186 ENSG00000183844 FAM3B 2-21|C21orf11|C21orf76|ORF9|PANDER|PRED44 family with sequence similarity 3 member B protein-coding 119.5-3 chr1 42177974 42178172 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001198852, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001198852, exon 12 of 12) -13328 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 129.25-49 chr14 47316519 47316741 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 26616 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 204.75-43 chr16 11965977 11966461 + 0.75 NA exon (NM_001192, exon 2 of 3) exon (NM_001192, exon 2 of 3) 1009 NM_001192 608 Hs.2556 NM_001192 ENSG00000048462 TNFRSF17 BCM|BCMA|CD269|TNFRSF13A TNF receptor superfamily member 17 protein-coding 237.25-76 chr8 121017082 121017404 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -205197 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 162.5-120 chr4 15448726 15449060 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 20860 NM_031911 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 148.5-57 chr14 21589969 21590340 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -19410 NM_001005465 26533 Hs.554581 NM_001005465 ENSG00000169208 OR10G3 OR14-40 olfactory receptor family 10 subfamily G member 3 protein-coding 143.75-159 chr6 82059084 82059335 + 0.75 NA intron (NR_149135, intron 2 of 3) intron (NR_149135, intron 2 of 3) 42556 NR_149135 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 123-21 chr10 53052139 53052360 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -280549 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 178.25-52 chr18 2175218 2175552 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 396120 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 196.5-4 chr1 86767836 86768132 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 63408 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 122.5-30 chr10 111811703 111812004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 371912 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 138.5-31 chr11 5476207 5476645 + 0.75 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) -12259 NM_001005163 390066 Hs.553734 NM_001005163 ENSG00000181609 OR52D1 OR11-43 olfactory receptor family 52 subfamily D member 1 protein-coding 140.5-105 chr2 43847296 43847514 + 0.75 NA intron (NM_001357321, intron 3 of 12) intron (NM_001357321, intron 3 of 12) 8434 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 116.25-189 chr5 164619281 164619572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 149147 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 140.25-29 chr11 10981738 10981947 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 123625 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 280.25-27 chr2 67822187 67822719 + 0.75 NA intron (NR_110271, intron 2 of 2) intron (NR_110271, intron 2 of 2) 3109 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 187.5-59 chr14 85538323 85538678 + 0.75 NA intron (NM_001346143, intron 1 of 1) intron (NM_001346143, intron 1 of 1) 5151 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 177-31 chr14 60088698 60089026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3049 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 126.5-240 chr8 81475807 81476095 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 7282 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 206-47 chr21 28969382 28969756 + 0.75 NA exon (NM_001320766, exon 9 of 29) exon (NM_001320766, exon 9 of 29) 23308 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 130-50 chr15 65437209 65437603 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14459 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 183.5-131 chr7 7898152 7898459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70447 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 163.5-21 chr10 55526001 55526231 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -72926 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 121.25-130 chr3 50956533 50956776 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) MIRc|SINE|MIR 281574 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 295.5-39 chr4 67293136 67294017 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 128424 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 185-81 chr7 102283167 102283627 + 0.75 NA 3' UTR (NM_181500, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_181500, exon 23 of 23) -1744 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 162.25-64 chr16 59202366 59202789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -468261 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 237-32 chr2 231318014 231318437 + 0.75 NA intron (NM_001352759, intron 19 of 19) L1M4a1|LINE|L1 -44483 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 186-38 chr18 39679951 39680320 + 0.75 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) -3358 NR_049848 100846997 NR_049848 ENSG00000283645 MIR5583-2 - microRNA 5583-2 ncRNA 149.75-39 chr14 52606767 52606966 + 0.75 NA intron (NM_001099652, intron 3 of 6) L1MA4|LINE|L1 54030 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 202.5-69 chr2 54437045 54437380 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -19115 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 122.75-11 chr1 109794750 109795020 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30962 NM_024526 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 178.5-184 chr8 108854238 108854563 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -66806 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 184.75-27 chr14 62127740 62128067 + 0.75 NA non-coding (NR_015358, exon 3 of 4) non-coding (NR_015358, exon 3 of 4) 10546 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 118-28 chr11 58606386 58606672 + 0.75 NA intron (NM_001197051, intron 2 of 10) L1PA16|LINE|L1 -16136 NM_000614 1270 Hs.524920 NM_000614 ENSG00000242689 CNTF HCNTF ciliary neurotrophic factor protein-coding 150-54 chr15 92377699 92378011 + 0.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -16026 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 126.5-222 chr7 26988657 26988919 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 107212 NM_153620 3198 Hs.67397 NM_005522 ENSG00000105991 HOXA1 BSAS|HOX1|HOX1F homeobox A1 protein-coding 247-28 chr2 20483564 20483993 + 0.75 NA intron (NR_157978, intron 2 of 3) intron (NR_157978, intron 2 of 3) 17746 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 188.75-46 chr17 72740526 72740874 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -100228 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 150.75-39 chr11 77459197 77459461 + 0.75 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 14734 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 130-75 chr2 137566004 137566380 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 16 of 27) L2a|LINE|L2 361740 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 257.5-23 chr15 57271888 57272524 + 0.75 NA intron (NM_001322152, intron 18 of 20) L1ME1|LINE|L1 6451 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 187.25-9 chr10 29635518 29635895 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_021738) promoter-TSS (NM_021738) -735 NM_021738 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 215-68 chr6 132123282 132123726 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8241 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 165.25-34 chr12 28809583 28809901 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -339536 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 114.75-79 chr19 29788242 29788489 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -23626 NM_001322262 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 198.5 chr1 42001315 42001788 + 0.75 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 34383 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 130.75-29 chr11 73766520 73766806 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5589 NM_198896 5870 Hs.503222 NM_002869 ENSG00000175582 RAB6A RAB6 RAB6A, member RAS oncogene family protein-coding 120-191 chr8 111780881 111781198 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 404400 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 118.5-90 chr2 30782255 30782518 + 0.75 NA intron (NM_144575, intron 2 of 22) intron (NM_144575, intron 2 of 22) 25060 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 135.25-79 chr17 62031038 62031242 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 6 of 29) L1MC4|LINE|L1 34138 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 159.25-97 chr4 24299893 24300223 + 0.75 NA intron (NM_001330752, intron 1 of 13) intron (NM_001330752, intron 1 of 13) 172847 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 203.25-31 chr12 68422146 68422521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29151 NR_120458 100507195 Hs.450772 NR_120458 ENSG00000251301 LINC02384 - long intergenic non-protein coding RNA 2384 ncRNA 127.75-73 chr16 26884057 26884253 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -182772 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 131.75-137 chr3 66265328 66265554 + 0.75 NA intron (NM_001350992, intron 4 of 8) intron (NM_001350992, intron 4 of 8) 44438 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 114.5-49 chr11 31042633 31042876 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -50068 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 202.25-64 chr5 4014326 4014692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 418677 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 135.25-160 chr5 82157263 82157622 + 0.75 NA intron (NM_031482, intron 3 of 7) intron (NM_031482, intron 3 of 7) 120912 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 181.25-90 chr3 179180390 179180709 + 0.75 NA intron (NM_006218, intron 1 of 20) intron (NM_006218, intron 1 of 20) 32192 NM_006218 5290 Hs.553498 NM_006218 ENSG00000121879 PIK3CA CLAPO|CLOVE|CWS5|MCAP|MCM|MCMTC|PI3K|PI3K-alpha|p110-alpha phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha protein-coding 196.75-11 chr10 21842460 21842773 + 0.75 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) L2|LINE|L2 161114 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 217-7 chr10 23149658 23150070 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -42448 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 183.25-97 chr7 3096881 3097221 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -53184 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 112.25-153 chr4 63744950 63745185 + 0.75 NA Intergenic (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 664383 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 302.75 chr1 98769635 98770153 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 108173 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 156.5-35 chr12 8488692 8489135 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -24590 NM_080387 338339 Hs.351811 NM_080387 ENSG00000166527 CLEC4D CD368|CLEC-6|CLEC6|CLECSF8|Dectin-3|MCL|MPCL C-type lectin domain family 4 member D protein-coding 179.75-75 chr3 105563250 105563618 + 0.75 NA intron (NM_001243280, intron 13 of 14) L1ME2|LINE|L1 196525 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 170-85 chr5 174571619 174571914 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152816 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 261.75-9 chr12 13996816 13997252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16678 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 119.25-122 chr3 16150078 16150296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24493 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 211.75-9 chr1 240647881 240648228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35899 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 136.5-132 chr20 41160828 41161096 + 0.75 NA intron (NM_182811, intron 4 of 31) L2|LINE|L2 -8061 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 129.5-227 chr8 107275620 107275877 + 0.75 NA intron (NM_001199859, intron 7 of 8) intron (NM_001199859, intron 7 of 8) 60767 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 205-12 chr10 82130583 82130923 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) L1MA3|LINE|L1 102167 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 184-66 chr4 113034939 113035290 + 0.75 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) -14300 NM_001354246 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 164-9 chr1 208518205 208518487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -210342 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 122-191 chr8 125629136 125629371 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 197044 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 129.5-39 chr11 45333507 45333734 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -21751 NR_120558 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 148.5-14 chr1 188975440 188975764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1500408 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 144.75-139 chr5 130051649 130051931 + 0.75 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 147325 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 121.25-45 chr12 103837167 103837456 + 0.75 NA intron (NM_001031701, intron 1 of 13) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 3923 NM_001031701 51559 Hs.48428 NM_016575 ENSG00000111696 NT5DC3 TU12B1-TY|TU12B1TY 5'-nucleotidase domain containing 3 protein-coding 158-12 chr1 167929777 167930126 + 0.75 NA intron (NM_001143674, intron 2 of 5) intron (NM_001143674, intron 2 of 5) 6045 NR_026550 25874 Hs.517768 NM_015415 ENSG00000143158 MPC2 BRP44|SLC54A2 mitochondrial pyruvate carrier 2 protein-coding 158-33 chr11 46785556 46785800 + 0.75 NA intron (NM_001008938, intron 16 of 43) AluJo|SINE|Alu -23179 NR_003056 692108 Hs.693252 NR_003056 ENSG00000212135 SNORD67 HBII-166 small nucleolar RNA, C/D box 67 snoRNA 180.5-165 chr9 83162888 83163266 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -99935 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 121.5-53 chr12 2793954 2794199 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_002014) promoter-TSS (NM_002014) -894 NM_002014 2288 Hs.524183 NM_002014 ENSG00000004478 FKBP4 FKBP51|FKBP52|FKBP59|HBI|Hsp56|PPIase|p52 FKBP prolyl isomerase 4 protein-coding 318.5-41 chr8 138968646 138969350 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -54957 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 131-38 chr12 37799325 37799551 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -517336 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 131-188 chrX 51828923 51829192 + 0.75 NA intron (NM_001005332, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 25981 NM_001005332 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 248.75-4 chr1 210007077 210007804 + 0.75 NA intron (NM_001146261, intron 3 of 9) intron (NM_001146261, intron 3 of 9) 69223 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 154.25-191 chrX 46399402 46399641 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -47668 NM_017776 55634 Hs.632800 NM_017776 ENSG00000147121 KRBOX4 ZNF673 KRAB box domain containing 4 protein-coding 179.5-93 chr2 101917891 101918206 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -65417 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 146.75-173 chr8 140624213 140624448 + 0.75 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 11303 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 186.5-3 chr1 88352062 88352521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -331853 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 142-154 chr7 118922827 118923189 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 698304 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 118.75-8 chr1 103392764 103392942 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 132658 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 144.25-143 chr4 71833194 71833440 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -27797 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 165.75-153 chr7 8784978 8785380 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 351570 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 181.75-35 chr14 55132566 55132950 + 0.75 NA intron (NM_002306, intron 1 of 5) AluSx3|SINE|Alu 3506 NM_002306 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 133.5-278 chr9 34280843 34281116 + 0.75 NA intron (NM_194313, intron 6 of 12) intron (NM_194313, intron 6 of 12) 48289 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 192-106 chr9 105451878 105452280 + 0.75 NA intron (NM_001287191, intron 1 of 13) intron (NM_001287191, intron 1 of 13) 4045 NM_001287192 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 167.25-109 chr3 144948745 144949113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 975848 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 130.25-161 chr5 95372708 95372931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18547 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 145.25-99 chr3 30765930 30766229 + 0.75 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 128582 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 196.75-57 chr2 67448836 67449186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51678 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 217-67 chr4 175912471 175912960 + 0.75 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) intron (NR_048571, intron 1 of 5) 89976 NM_001261447 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 155-28 chr12 62700438 62700687 + 0.75 NA intron (NM_020700, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 96876 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 159-100 chr7 46413538 46413810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 283448 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 174.25-118 chr4 116682854 116683162 + 0.75 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 383283 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 134.75-5 chr1 71825789 71826065 + 0.75 NA intron (NR_046218, intron 1 of 2) intron (NR_046218, intron 1 of 2) 11085 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 255.5-72 chr6 84434537 84435012 + 0.75 NA intron (NR_132100, intron 4 of 4) intron (NR_132100, intron 4 of 4) 40155 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 148.25-18 chr10 15500504 15500718 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -129322 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 178.5-70 chr18 3816913 3817191 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 28306 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 213.5-90 chr4 69532901 69533305 + 0.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -7089 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 137.5-225 chr7 109547251 109547474 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 412851 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 159-5 chr1 191571323 191571734 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -343030 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 120-32 chr12 118812499 118812718 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 20928 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 168.75-57 chr15 75460976 75461464 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5405 NM_001145357 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 150-130 chr7 46451936 46452260 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 245024 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 216.5-120 chr8 111718642 111718940 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 342152 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 130.25-198 chr8 81131805 81132019 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19844 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 190-48 chr3 187677586 187678057 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -7427 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 128.75-189 chr7 99051469 99051765 + 0.75 NA intron (NM_020429, intron 7 of 18) intron (NM_020429, intron 7 of 18) 38452 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 131-174 chr8 88479600 88479787 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -152210 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 267.75-50 chr6 117684919 117685375 + 0.75 NA intron (NM_138459, intron 1 of 4) intron (NM_138459, intron 1 of 4) 9678 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 195.5-21 chr11 47044562 47044981 + 0.75 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 108010 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 134-162 chr7 27439586 27439904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176229 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 142-45 chr14 20610778 20611197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20164 NM_001024822 493901 Hs.729466 NM_001024822 ENSG00000258436 RNASE12 HEL-S-85p|RAI1 ribonuclease A family member 12 (inactive) protein-coding 153.25-70 chr2 132916005 132916290 + 0.75 NA intron (NR_135572, intron 1 of 1) intron (NR_135572, intron 1 of 1) 590 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 156.25-85 chr20 11590494 11590911 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 280013 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 209.5-4 chr1 112614520 112614907 + 0.75 NA intron (NM_017744, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 4428 NM_017744 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 127.5-150 chr3 95753021 95753298 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -69966 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 165.25-97 chr3 181140916 181141185 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 2 of 7) L1ME3G|LINE|L1 -34094 NR_075093 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 165.25-132 chr7 24598974 24599276 + 0.75 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 25673 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 161.25-13 chr10 25525277 25525705 + 0.75 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) L1MB8|LINE|L1 -126221 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 164-96 chr5 27056475 27056797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18050 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 175.75-102 chr5 17603505 17603941 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 51915 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 162.5-22 chr10 96816751 96817294 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 11742 NR_030338 693192 NR_030338 ENSG00000207976 MIR607 MIRN607|hsa-mir-607 microRNA 607 ncRNA 199.5-17 chr10 25862066 25862589 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71383 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 168.75-137 chr7 81306106 81306550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 255491 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 167.5-193 chr8 132606946 132607271 + 0.75 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -45629 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 151.5-166 chr6 7876617 7877045 + 0.75 NA intron (NM_001718, intron 4 of 6) L1MEd|LINE|L1 33246 NM_001145549 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 179-19 chr10 95302161 95302488 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -11321 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 156-99 chr22 34995038 34995310 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) MLT2B1|LTR|ERVL 2742 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 138.75-81 chr2 21001997 21002243 + 0.75 NA exon (NM_000384, exon 29 of 29) exon (NM_000384, exon 29 of 29) 41953 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 134.25-105 chr22 39748863 39749275 + 0.75 NA intron (NM_152512, intron 6 of 6) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 144691 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 162-106 chr7 12991768 12992247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 304374 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 154.25-133 chr5 121268362 121268608 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -54065 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 134-29 chr11 87410394 87410595 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 308917 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 136.75-91 chr2 41494598 41494820 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -382846 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 119.5-97 chr17 30954595 30954788 + 0.75 NA intron (NR_144488, intron 8 of 9) intron (NR_144488, intron 8 of 9) -16348 NM_197939 84282 Hs.29874 NM_032322 ENSG00000181481 RNF135 L13|MMFD|REUL|Riplet ring finger protein 135 protein-coding 172-52 chr2 80413940 80414234 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 2 of 11) intron (NM_001282599, intron 2 of 11) 100708 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 260.25-2 chr1 204465181 204465830 + 0.75 NA intron (NM_002646, intron 3 of 33) intron (NM_002646, intron 3 of 33) 24841 NM_002646 5287 Hs.497487 NM_002646 ENSG00000133056 PIK3C2B C2-PI3K phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta protein-coding 161.5-14 chr1 219291879 219292248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117094 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 131.25-188 chr7 48715136 48715372 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -209293 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 157.75-14 chr10 75697222 75697469 + 0.75 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -15110 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 175-81 chr22 28466262 28466635 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 6579 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 113.5-87 chr15 68927936 68928108 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -2478 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 206-34 chr17 54860445 54860910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40014 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 250-64 chr8 131855729 131856397 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -48030 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 250.5-56 chr22 23706424 23707024 + 0.75 NA intron (NR_024448, intron 5 of 11) L1PA16|LINE|L1 10308 NM_001329425 266747 Hs.658997 NM_153615 ENSG00000159496 RGL4 Rgr ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 4 protein-coding 139-89 chr21 29465026 29465299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30885 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 193.5-21 chr10 121840848 121841162 + 0.75 NA intron (NM_001001976, intron 9 of 11) intron (NM_001001976, intron 9 of 11) 87026 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 119.25-213 chr8 139419338 139419626 + 0.75 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 283641 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 138.25-171 chr8 114234667 114234919 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -797854 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 122.75-153 chr4 132639047 132639233 + 0.75 NA intron (NR_126401, intron 1 of 3) intron (NR_126401, intron 1 of 3) 48051 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 169.25-123 chr8 120812610 120812883 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_021021) promoter-TSS (NM_021021) -700 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 125-112 chr4 52978993 52979298 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 116828 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 193.25-73 chr3 89980581 89980954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 873146 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 175.25-144 chr8 87144154 87144626 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MEd|LINE|L1 277975 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 115.75-76 chr16 2965892 2966094 + 0.75 NA intron (NM_024507, intron 2 of 7) CpG-9143 1718 NM_001253726 79412 Hs.661128 NM_024507 ENSG00000131650 KREMEN2 KRM2 kringle containing transmembrane protein 2 protein-coding 116.25-142 chr3 94589608 94589854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -348532 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 133-9 chr1 189801459 189801704 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 674429 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 137.75-108 chr2 164669637 164669853 + 0.75 NA intron (NM_001365671, intron 14 of 15) MIR|SINE|MIR 18032 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 155.5-62 chr16 13537473 13537743 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -382549 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 276.25-25 chr19 51999165 52000013 + 0.75 NA intron (NM_198480, intron 5 of 5) L1MB8|LINE|L1 8622 NM_001199324 284370 Hs.368355 NM_198480 ENSG00000197619 ZNF615 - zinc finger protein 615 protein-coding 162.75-124 chr6 54027425 54027754 + 0.75 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) 8619 NM_001281746 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 263.75-8 chr11 114712760 114713561 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 34633 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 159.75-176 chr8 131819612 131820006 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84284 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 186.25-23 chr12 17425056 17425370 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 163865 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 241.75-70 chr6 117914060 117914568 + 0.75 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) 7050 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 164.75-149 chr8 137205430 137205738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 208004 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 219-31 chr13 81273348 81273831 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46606 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 134-109 chr21 14867048 14867392 + 0.75 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) intron (NR_146322, intron 1 of 3) 51448 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 192.5-99 chr4 63531458 63531830 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 877806 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 167.5-168 chr6 106835279 106835566 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -47881 NR_033557 100422737 Hs.634681 NR_015365 ENSG00000235142 LINC02532 - long intergenic non-protein coding RNA 2532 ncRNA 132.5-57 chr12 125726363 125726563 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 104011 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 117.5-26 chr10 10505334 10505586 + 0.75 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) L1MD1|LINE|L1 42910 NM_001326317 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 178.75-30 chr14 68896628 68896997 + 0.75 NA intron (NM_001102, intron 8 of 20) intron (NM_001102, intron 8 of 20) 82490 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 144.25-178 chr6 161763725 161763987 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 292879 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 241-25 chr2 61109220 61109619 + 0.75 NA intron (NM_001129993, intron 16 of 21) intron (NM_001129993, intron 16 of 21) 35556 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 142.5-67 chr15 58732008 58732286 + 0.75 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) intron (NM_001320570, intron 1 of 14) 17560 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 179.75-42 chr14 61588128 61588379 + 0.75 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -17600 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 143.75-112 chr3 24029369 24029810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73658 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 181.75-124 chr8 42054945 42055320 + 0.75 NA intron (NR_136589, intron 1 of 1) L1MEg|LINE|L1 -3145 NM_006766 7994 Hs.491577 NM_006766 ENSG00000083168 KAT6A MOZ|MRD32|MYST-3|MYST3|RUNXBP2|ZC2HC6A|ZNF220 lysine acetyltransferase 6A protein-coding 165-144 chr8 88897302 88897535 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -569935 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 184.5-83 chr2 222363997 222364358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43516 NR_136639 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 202-8 chr1 221430225 221430627 + 0.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -94130 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 228.25-85 chr8 124960464 124960852 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12637 NM_152412 137209 Hs.175350 NM_152412 ENSG00000180938 ZNF572 - zinc finger protein 572 protein-coding 150.5-95 chr2 104562046 104562463 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51745 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 158.75-46 chr12 126044136 126044438 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -51705 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 198.25-104 chr9 21532426 21532831 + 0.75 NA intron (NR_152877, intron 1 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -20443 NR_029505 407035 NR_029505 ENSG00000199177 MIR31 MIRN31|hsa-mir-31|miR-31 microRNA 31 ncRNA 138.25-111 chr3 13644306 13644612 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6262 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 179.75-107 chr5 111793633 111793923 + 0.75 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu -35560 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 123.25-190 chr7 86240086 86240454 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -403639 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 130-8 chr1 175407198 175407397 + 0.75 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) -214310 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 129.5-140 chr2 220804676 220805046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 767443 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 187.75-14 chr10 97887601 97888147 + 0.75 NA intron (NM_001206528, intron 11 of 14) intron (NM_001206528, intron 11 of 14) -11977 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 118.5-79 chr19 8679325 8679525 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19370 NM_178525 284382 Hs.209206 NM_178525 ENSG00000181786 ACTL9 HSD21 actin like 9 protein-coding 247.75-20 chr15 62769121 62769537 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 38 of 55) intron (NM_015059, intron 38 of 55) -54628 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 152.75-109 chr3 120010346 120010710 + 0.75 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 74120 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 130.75-122 chr3 124505136 124505379 + 0.75 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) intron (NM_001024660, intron 33 of 59) -79401 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 144.5-42 chr11 64003463 64003685 + 0.75 NA intron (NM_014067, intron 4 of 10) intron (NM_014067, intron 4 of 10) 17721 NR_003089 55611 Hs.473788 NM_017670 ENSG00000167770 OTUB1 HSPC263|OTB1|OTU1 OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1 protein-coding 247.5-90 chr9 88997482 88997910 + 0.75 NA intron (NM_005226, intron 1 of 1) intron (NM_005226, intron 1 of 1) 6228 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 219.75-68 chr6 77903474 77903855 + 0.75 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) L1MA8|LINE|L1 250625 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 152.25-92 chr2 170203637 170203899 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 3 of 33) intron (NM_001083615, intron 3 of 33) 25621 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 193.25-5 chr1 114584875 114585338 + 0.75 NA 3' UTR (NM_198459, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_198459, exon 18 of 18) -3491 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 188.5-85 chr2 210616995 210617455 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_002763) promoter-TSS (NR_002763) -346 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 137-169 chr7 146299812 146300170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -474280 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 126.25-86 chr2 64806444 64806741 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 57039 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 187.25-51 chr19 55194712 55195066 + 0.75 NA intron (NM_002842, intron 10 of 19) L1MB8|LINE|L1 -14600 NM_003180 6861 Hs.631566 NM_003180 ENSG00000129990 SYT5 - synaptotagmin 5 protein-coding 159.5-42 chr12 28717968 28718348 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -431120 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 145-168 chr9 93583167 93583426 + 0.75 NA intron (NM_005392, intron 1 of 21) L1MB5|LINE|L1 6712 NM_005392 5253 Hs.211441 NM_005392 ENSG00000197724 PHF2 CENP-35|GRC5|JHDM1E|KDM7C PHD finger protein 2 protein-coding 119-80 chr2 38462143 38462458 + 0.75 NA intron (NR_110259, intron 4 of 4) intron (NR_110259, intron 4 of 4) 31006 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 169.75-27 chr11 40087320 40087818 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 205561 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 205.25-23 chr14 40017001 40017345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -584673 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 113.25-77 chr18 78739530 78739753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -240634 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 231.75-70 chr8 58885947 58886358 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) -226299 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 197.5-115 chr4 139139657 139140068 + 0.75 NA intron (NM_001371339, intron 1 of 9) intron (NM_001371339, intron 1 of 9) 37356 NM_001371339 207-49 chr2 212314687 212315025 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 111504 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 242.5-26 chr12 125656124 125656569 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001286219, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001286219, exon 5 of 5) 33894 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 113-149 chr5 97246434 97246767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63353 NM_018343 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 141.25-92 chr2 211569828 211570046 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 19 of 26) intron (NM_001042599, intron 19 of 26) 856423 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 195.75-58 chr2 42888809 42889297 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -96470 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 221.75-40 chr2 191342409 191342765 + 0.75 NA intron (NM_012223, intron 5 of 28) AluSz6|SINE|Alu 97183 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 166-102 chr5 87257019 87257445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10651 NM_002890 5921 Hs.664080 NM_002890 ENSG00000145715 RASA1 CM-AVM|CMAVM|CMAVM1|GAP|PKWS|RASA|RASGAP|p120|p120GAP|p120RASGAP RAS p21 protein activator 1 protein-coding 190.25-84 chr3 86262261 86262601 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -219512 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 186.75-21 chr12 13118474 13118794 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14967 NM_001080555 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 146.5-104 chr2 97856911 97857184 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 5 of 40) intron (NM_015348, intron 5 of 40) 122641 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 159.75-62 chr17 62843208 62843662 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 34933 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 127-44 chr12 50199673 50199970 + 0.75 NA intron (NM_001243775, intron 1 of 4) intron (NM_001243775, intron 1 of 4) 1712 NM_001243775 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 205-33 chr2 17262190 17262573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 256059 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 196.75-76 chr3 120101958 120102399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7731 NM_001354596 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 138.5-53 chr14 32305435 32305647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23757 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 146-32 chr13 58601690 58601978 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -368717 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 236.5-17 chr12 104463315 104463873 + 0.75 NA intron (NM_018413, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 6646 NM_001173982 50515 Hs.17569 NM_018413 ENSG00000171310 CHST11 C4ST|C4ST-1|C4ST1|HSA269537|OCBMD carbohydrate sulfotransferase 11 protein-coding 269.5-42 chr5 11106958 11107386 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 13 of 20) intron (NM_001288715, intron 13 of 20) -345938 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 274.75-42 chr5 84360606 84361158 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 23985 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 170.5-179 chr7 104523156 104523641 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 194742 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 252-11 chr10 122205392 122205880 + 0.75 NA intron (NM_206862, intron 8 of 22) intron (NM_206862, intron 8 of 22) 42006 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 139-71 chr2 35024259 35024697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 346921 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 146.75-7 chr1 154651247 154651630 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -23441 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 177.25-38 chr12 10034095 10034429 + 0.75 NA intron (NM_207345, intron 1 of 8) intron (NM_207345, intron 1 of 8) 3580 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 129-6 chr1 110598833 110599250 + 0.75 NA 3' UTR (NM_004974, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_004974, exon 3 of 3) 7317 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 122.75-26 chr10 106723433 106723751 + 0.75 NA intron (NM_001206569, intron 6 of 25) intron (NM_001206569, intron 6 of 25) 441114 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 128.25-85 chr19 11336454 11336714 + 0.75 NA intron (NM_004283, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 3073 NM_004283 9545 Hs.744916 NM_004283 ENSG00000105514 RAB3D D2-2|GOV|RAB16|RAD3D RAB3D, member RAS oncogene family protein-coding 126-113 chr3 15327442 15327674 + 0.75 NA intron (NM_001018009, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 5028 NM_004844 9467 Hs.257761 NM_004844 ENSG00000131370 SH3BP5 SAB|SH3BP-5 SH3 domain binding protein 5 protein-coding 151-64 chr2 112987638 112988019 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 9822 NM_019618 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 122-175 chr7 101482379 101482623 + 0.75 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) MIRc|SINE|MIR 86505 NR_103749 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 114.5-70 chr12 65057387 65057604 + 0.75 NA intron (NM_007191, intron 7 of 9) intron (NM_007191, intron 7 of 9) 63810 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 157.5-13 chr1 117875591 117875923 + 0.75 NA TTS (NM_001135589) TTS (NM_001135589) 53864 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 118.5-110 chr2 187083063 187083398 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -234060 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 122.5-211 chr7 49696525 49696776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76988 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 138-96 chr22 32638552 32638928 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) L1PA16|LINE|L1 -162076 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 228.75-70 chr6 131771116 131771499 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -20865 NR_039610 100616455 NR_039610 ENSG00000266807 MIR548H5 - microRNA 548h-5 ncRNA 128.75-115 chr21 33894725 33894998 + 0.75 NA 3' UTR (NM_003024, exon 40 of 40) 3' UTR (NM_003024, exon 40 of 40) 20943 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 149.75-173 chr9 31631216 31631627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -249931 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 228.25-66 chr5 30936492 30936815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257033 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 122.5-106 chr2 34178305 34178525 + 0.75 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 111189 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 123.75-14 chr10 41885839 41886161 + 0.75 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 482045 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 174.25-88 chr21 16646041 16646359 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 55963 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 166.5-44 chr12 7444304 7444709 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_174941) promoter-TSS (NM_174941) -321 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 190.25-114 chr7 6238720 6239168 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 33680 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 151.75-2 chr1 33120558 33120962 + 0.75 NA TTS (NM_001301825) TTS (NM_001301825) 38582 NM_001301825 113451 Hs.101807 NM_052998 ENSG00000142920 AZIN2 ADC|AZI2|AZIB1|ODC-p|ODC1L|ODCp antizyme inhibitor 2 protein-coding 114.5-105 chr15 97160927 97161226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 360735 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 206.25-33 chr13 114221598 114222025 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13034 NM_003903 8881 Hs.374127 NM_003903 ENSG00000130177 CDC16 ANAPC6|APC6|CDC16Hs|CUT9 cell division cycle 16 protein-coding 134-81 chr18 80112007 80112272 + 0.75 NA intron (NM_014913, intron 1 of 3) intron (NM_014913, intron 1 of 3) 2877 NM_014913 22850 Hs.131915 NM_014913 ENSG00000101544 ADNP2 ZNF508 ADNP homeobox 2 protein-coding 113.75-75 chr16 22174643 22174900 + 0.75 NA intron (NM_001365288, intron 6 of 11) intron (NM_001365288, intron 6 of 11) 12240 NM_001365288 100288072 NM_001365288 SDR42E2 - short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2 protein-coding 158-80 chr2 165168024 165168369 + 0.75 NA intron (NM_006922, intron 5 of 27) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 35854 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 189.5-111 chr5 94249846 94250154 + 0.75 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -138301 NM_001163417 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 262-33 chr2 241117284 241117882 + 0.75 NA intron (NM_015148, intron 12 of 17) HAL1ME|LINE|L1 -15251 NR_028051 130916 Hs.159556 NM_182501 ENSG00000122085 MTERF4 MTERFD2 mitochondrial transcription termination factor 4 protein-coding 127-115 chr3 70252093 70252453 + 0.75 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) intron (NM_001364676, intron 2 of 4) 60365 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 121.5-192 chr4 46711339 46711518 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 197817 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 162.75-32 chr14 44539208 44539520 + 0.75 NA TTS (NR_135257) TTS (NR_135257) 31955 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 126-144 chr5 94514962 94515285 + 0.75 NA intron (NM_001145678, intron 5 of 20) intron (NM_001145678, intron 5 of 20) 103481 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 157.5-214 chr8 104584130 104584443 + 0.75 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) intron (NM_013437, intron 1 of 6) 4738 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 153.75-161 chrX 130021545 130021778 + 0.75 NA intron (NM_021946, intron 4 of 11) intron (NM_021946, intron 4 of 11) 16473 NM_001184772 63035 Hs.496748 NM_021946 ENSG00000085185 BCORL1 BCoR-L1|CXorf10 BCL6 corepressor like 1 protein-coding 186-4 chr1 161500894 161501439 + 0.75 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4291 NM_021642 2212 Hs.352642 NM_021642 ENSG00000143226 FCGR2A CD32|CD32A|CDw32|FCG2|FCGR2|FCGR2A1|FcGR|IGFR2 Fc fragment of IgG receptor IIa protein-coding 127.25-142 chr4 58029450 58029715 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 506746 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 158.5-35 chr11 11461334 11461674 + 0.75 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) intron (NM_001363464, intron 1 of 9) -108254 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 134.75-197 chr7 45050104 45050294 + 0.75 NA intron (NM_001029835, intron 2 of 9) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 22565 NM_001029835 83605 Hs.148272 NM_031443 ENSG00000136280 CCM2 C7orf22|OSM|PP10187 CCM2 scaffold protein protein-coding 125.25-108 chr2 137847211 137847379 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 80637 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 208.5-79 chr2 204433601 204434064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111643 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 193.25-77 chr3 182375441 182375889 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110697 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 136.25-169 chr6 86882817 86883060 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -54590 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 137-106 chr3 119687522 119687725 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -10227 NM_005694 10063 Hs.534383 NM_005694 ENSG00000138495 COX17 - cytochrome c oxidase copper chaperone COX17 protein-coding 142.5-226 chr8 118558420 118558700 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) AluY|SINE|Alu -62441 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 154-20 chr10 75386418 75386737 + 0.75 NA intron (NR_120651, intron 1 of 3) intron (NR_120651, intron 1 of 3) -14951 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 138.25-36 chr12 24776416 24776735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125647 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 122.75-101 chr2 143316915 143317180 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) L2a|LINE|L2 187628 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 165.75-78 chr2 14711716 14712115 + 0.75 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 79198 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 168.75-101 chr4 59468578 59468841 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 455136 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 155.5-83 chr18 69862607 69862883 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001303619, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001303619, exon 5 of 5) 85128 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 136-129 chr6 155116083 155116480 + 0.75 NA intron (NM_012454, intron 1 of 25) intron (NM_012454, intron 1 of 25) 25992 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 144-30 chr12 14458177 14458438 + 0.75 NA intron (NM_181352, intron 8 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 73026 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 207.25-36 chr2 45291101 45291444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36331 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 183.75-40 chr15 22899087 22899416 + 0.75 NA intron (NM_001033028, intron 7 of 15) L1MC4|LINE|L1 18062 NM_001033028 23191 Hs.26704 NM_014608 ENSG00000273749 CYFIP1 P140SRA-1|SHYC|SRA-1|SRA1 cytoplasmic FMR1 interacting protein 1 protein-coding 143.25-96 chr2 219458274 219458706 + 0.75 NA intron (NM_005876, intron 6 of 40) MER5A|DNA|hAT-Charlie -2322 NM_001173476 10290 Hs.21639 NM_005876 ENSG00000072195 SPEG APEG-1|APEG1|BPEG|CNM5|MYLK6|SPEGalpha|SPEGbeta striated muscle enriched protein kinase protein-coding 188.25-59 chr2 102748512 102748838 + 0.75 NA intron (NM_001321346, intron 1 of 3) intron (NM_001321346, intron 1 of 3) 11740 NM_001321343 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 192.5-73 chr2 156852463 156852816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -405066 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 125.25-151 chr5 1818050 1818354 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 16795 NM_004553 4726 Hs.408257 NM_004553 ENSG00000145494 NDUFS6 CI-13kA|CI-13kD-A|CI13KDA|MC1DN9 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S6 protein-coding 193-66 chr4 106239121 106239516 + 0.75 NA intron (NM_001290768, intron 13 of 26) L1MCb|LINE|L1 -76292 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 160.75-72 chr2 62522022 62522483 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16057 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 167.75-23 chr10 70932719 70933087 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -6150 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 121.25-59 chr14 67420724 67421027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8710 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 121.25-187 chr7 112215992 112216332 + 0.75 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) intron (NM_021994, intron 1 of 11) 9467 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 127.5-143 chr21 34633726 34633975 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -18737 NM_004414 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 124-43 chr13 113980873 113981162 + 0.75 NA intron (NM_001320821, intron 25 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 25 of 25).2 -6941 NM_001365455 100507747 Hs.704267 NM_001365455 ENSG00000283199 C13orf46 - chromosome 13 open reading frame 46 protein-coding 144.5-111 chr2 140206083 140206402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 380443 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 113-25 chr10 64931321 64931623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6954 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 114.5-256 chr8 48172756 48172936 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164415 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 182-94 chr5 180424200 180424473 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70043 NM_001370473 57472 Hs.608380 NM_015455 ENSG00000113300 CNOT6 CCR4|Ccr4a CCR4-NOT transcription complex subunit 6 protein-coding 166.5-135 chr3 114345042 114345535 + 0.75 NA intron (NR_121662, intron 6 of 6) intron (NR_121662, intron 6 of 6) -6523 NR_038993 100131117 Hs.122417 NR_038993 ENSG00000241560 ZBTB20-AS1 - ZBTB20 antisense RNA 1 ncRNA 128.25-77 chr17 73774441 73774748 + 0.75 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) intron (NR_027146, intron 2 of 3) -12228 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 233-53 chr5 146707453 146707891 + 0.75 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 171113 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 130.75-40 chr12 39169329 39169550 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -263848 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 140.25-27 chr10 104787404 104787750 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -121361 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-25 chr10 43673257 43673644 + 0.75 NA intron (NR_038867, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 -24569 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 200.25-33 chr14 21357742 21358260 + 0.75 NA exon (NM_007192, exon 21 of 26) exon (NM_007192, exon 21 of 26) 26018 NM_007192 11198 Hs.213724 NM_007192 ENSG00000092201 SUPT16H CDC68|FACTP140|SPT16|SPT16/CDC68 SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit protein-coding 173-68 chr2 171457701 171458105 + 0.75 NA intron (NM_001164821, intron 6 of 11) intron (NM_001164821, intron 6 of 11) -23100 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 236.5-51 chr2 174175113 174175625 + 0.75 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) L1ME1|LINE|L1 73163 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 168.75-115 chr5 140007863 140008277 + 0.75 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 35229 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 189.5-164 chr9 98536974 98537456 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 3 of 18) L1ME1|LINE|L1 171720 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 191-38 chr2 127785604 127786102 + 0.75 NA intron (NM_001006622, intron 1 of 5) L1MC1|LINE|L1 25318 NM_001006623 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 178.75-88 chr5 133805529 133806019 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107903 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 157.5-93 chr2 25795804 25796193 + 0.75 NA intron (NM_001369346, intron 3 of 10) intron (NM_001369346, intron 3 of 10) -1307 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 160.75-18 chr10 66394758 66395022 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -531146 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 196.75-4 chr1 53257763 53258134 + 0.75 NA intron (NM_004631, intron 14 of 18) intron (NM_004631, intron 14 of 18) 19338 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 135.5-66 chr15 72972608 72972871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79724 NM_002499 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 184.25-99 chr5 40762165 40762539 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001355037, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001355037, exon 9 of 9) -6391 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 117.5-124 chr20 32388649 32388878 + 0.75 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) L1MEc|LINE|L1 29698 NM_001363734 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 186.25-67 chr3 12134021 12134552 + 0.75 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 24626 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 115.25-214 chr8 127043433 127043646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30385 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 142.5-219 chr8 91528819 91529072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 279626 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 187.75-67 chr3 4452233 4452593 + 0.75 NA intron (NM_001164675, intron 2 of 7) intron (NM_001164675, intron 2 of 7) 14856 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 125.75-114 chr20 59800551 59800778 + 0.75 NA intron (NM_080672, intron 7 of 12) L1MEc|LINE|L1 79454 NM_183244 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 130.75-131 chr4 10062439 10062687 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 16129 NR_036090 100423011 NR_036090 ENSG00000264931 MIR3138 mir-3138 microRNA 3138 ncRNA 148.25-100 chr3 194628236 194628501 + 0.75 NA intron (NM_001011655, intron 2 of 9) intron (NM_001011655, intron 2 of 9) 5051 NM_001166305 93109 Hs.478729 NM_138399 ENSG00000145014 TMEM44 - transmembrane protein 44 protein-coding 163-72 chr3 99525638 99526058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112746 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 170-10 chr10 58809310 58809563 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 17 of 20) AluJb|SINE|Alu 94421 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 168.25-2 chr1 64186663 64186999 + 0.75 NA Intergenic LTR18A|LTR|ERVL -16792 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 118-26 chr11 44986760 44987069 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 13012 NR_026681 221122 Hs.551656 NR_026681 ENSG00000254654 LINC02685 - long intergenic non-protein coding RNA 2685 ncRNA 158-7 chr1 69831707 69831933 + 0.75 NA intron (NM_001370785, intron 5 of 26) MER6B|DNA|TcMar-Tigger -87502 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 175.25-24 chr11 42959018 42959386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 310167 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 133.25-192 chr7 2794158 2794445 + 0.75 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) intron (NM_007353, intron 2 of 3) 20929 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 145-146 chr7 40271578 40271839 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) L1MA4|LINE|L1 136732 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 148-95 chr4 187455053 187455463 + 0.75 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) 50355 NR_038931 339975 Hs.639361 NR_038931 LOC339975 - uncharacterized LOC339975 ncRNA 217.25-9 chr1 239736568 239736920 + 0.75 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) -17625 NR_103776 100506915 Hs.667175 NR_103776 ENSG00000233355 CHRM3-AS2 - CHRM3 antisense RNA 2 ncRNA 133.5-202 chr5 39430748 39431050 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -5666 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 183.25-105 chr7 88416399 88416869 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -109740 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 194.5-59 chr18 72327767 72328230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 216344 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 172.5-126 chr3 99504750 99505103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133668 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 113.75-14 chr1 213245606 213245801 + 0.75 NA intron (NM_001136138, intron 11 of 13) intron (NM_001136138, intron 11 of 13) 194462 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 145-151 chr7 106113064 106113411 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006754) promoter-TSS (NM_006754) -661 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 134.5-246 chr9 125071585 125071890 + 0.75 NA intron (NM_173690, intron 2 of 18) intron (NM_173690, intron 2 of 18) 71791 NM_001144877 286205 Hs.59504 NM_173690 ENSG00000173611 SCAI C9orf126|NET40 suppressor of cancer cell invasion protein-coding 159-94 chr6 44377196 44377505 + 0.75 NA TTS (NM_145026) TTS (NM_145026) -10356 NM_001253 988 Hs.485471 NM_001253 ENSG00000096401 CDC5L CDC5|CDC5-LIKE|CEF1|PCDC5RP|dJ319D22.1 cell division cycle 5 like protein-coding 138.25-120 chr3 119215557 119215779 + 0.75 NA intron (NM_003778, intron 7 of 7) L1MC5a|LINE|L1 -10818 NR_046574 100874201 Hs.721307 NR_046574 ENSG00000240254 B4GALT4-AS1 - B4GALT4 antisense RNA 1 ncRNA 207-22 chr12 63910090 63910582 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 65636 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 226.5-19 chr13 75574071 75574470 + 0.75 NA intron (NM_006002, intron 6 of 8) L2a|LINE|L2 24520 NM_006002 7347 Hs.162241 NM_006002 ENSG00000118939 UCHL3 UCH-L3 ubiquitin C-terminal hydrolase L3 protein-coding 204.75-24 chr11 75506790 75507212 + 0.75 NA intron (NM_030792, intron 1 of 16) intron (NM_030792, intron 1 of 16) 18572 NM_001351168 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 238-35 chr20 24741225 24741705 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -207804 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 139.25-127 chr3 157490184 157490473 + 0.75 NA intron (NM_024621, intron 2 of 13) intron (NM_024621, intron 2 of 13) 5178 NM_001167917 79674 Hs.658046 NM_024621 ENSG00000197415 VEPH1 MELT|VEPH ventricular zone expressed PH domain containing 1 protein-coding 236-17 chr14 45704325 45704812 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 11034 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 128.75-214 chrX 94220963 94221271 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 546911 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 125.25-142 chr4 33690201 33690436 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 349575 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 128-132 chr5 171864616 171864834 + 0.75 NA intron (NM_012300, intron 12 of 12) intron (NM_012300, intron 12 of 12) 78853 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 195.5-98 chr3 39923041 39923481 + 0.75 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) L1MDa|LINE|L1 113601 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 149-18 chr11 100860201 100860562 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 6 of 25) intron (NM_001367945, intron 6 of 25) -73893 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 114.5-213 chr5 74035675 74035989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 222286 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 118.5-46 chr12 112319112 112319313 + 0.75 NA intron (NM_001109662, intron 2 of 75) intron (NM_001109662, intron 2 of 75) 63219 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 159.25-119 chr5 74950448 74950812 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -83664 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 140.5-253 chrX 118283332 118283567 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62624 NM_001184966 54521 Hs.98510 NM_019045 ENSG00000131725 WDR44 RAB11BP|RPH11|SYM-4 WD repeat domain 44 protein-coding 142.5-187 chr6 70109703 70110079 + 0.75 NA intron (NM_001858, intron 16 of 50) intron (NM_001858, intron 16 of 50) 173306 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 133.25-75 chr17 34397038 34397386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33979 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 158.75-85 chr2 44333447 44333693 + 0.75 NA intron (NM_001042385, intron 6 of 12) intron (NM_001042385, intron 6 of 12) 26179 NM_001042385 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 145-62 chr17 60822687 60822977 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 144981 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 227.25-17 chr11 62128164 62128566 + 0.75 NA intron (NM_001040694, intron 2 of 18) intron (NM_001040694, intron 2 of 18) 4354 NM_001040694 3619 Hs.142179 NM_020238 ENSG00000149503 INCENP - inner centromere protein protein-coding 151.25-72 chr18 13839232 13839678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15306 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 138.25-102 chr21 29972869 29973158 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32961 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 164.75-141 chr8 78040178 78040563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -475970 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 152.75-28 chr10 107451201 107451502 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -286645 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 201-44 chr2 124069801 124070191 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) L1MA2|LINE|L1 44709 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 115.25-108 chr2 160828934 160829124 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -307926 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 172-33 chr13 58047157 58047459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118519 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 232.25-76 chr7 116442706 116443101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56835 NM_001206747 858 Hs.212332 NM_001233 ENSG00000105971 CAV2 CAV caveolin 2 protein-coding 246-55 chr6 127568167 127568526 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -8828 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 153.5-143 chr4 59689305 59689635 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 675897 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 156-4 chr1 85563534 85563868 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 1 of 6) L1MEc|LINE|L1 14499 NM_001134445 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 173.25-80 chr3 138639282 138639626 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 30405 NM_018147 55179 Hs.173438 NM_018147 ENSG00000158234 FAIM FAIM1 Fas apoptotic inhibitory molecule protein-coding 150.5-239 chrX 150607744 150607981 + 0.75 NA intron (NM_000252, intron 4 of 14) L2b|LINE|L2 39265 NM_000252 4534 Hs.655056 NM_000252 ENSG00000171100 MTM1 CNM|MTMX|XLMTM myotubularin 1 protein-coding 189.5-96 chr4 30443609 30443941 + 0.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -276594 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 253.5-28 chr16 56779971 56780502 + 0.75 NA intron (NM_014669, intron 3 of 21) intron (NM_014669, intron 3 of 21) -1593 NM_001242795 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 229-26 chr18 67083282 67083689 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 1901 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 158-103 chr3 145481758 145482188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 587212 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 121.5-167 chr3 250314 250533 + 0.75 NA intron (NM_001253387, intron 2 of 26) MER34A|LTR|ERV1 52534 NR_045572 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 210.5-128 chr8 38764937 38765404 + 0.75 NA intron (NM_001352804, intron 1 of 10) intron (NM_001352804, intron 1 of 10) 7895 NM_001352804 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 202.5-50 chr15 58596598 58597030 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) 96793 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 127-80 chr17 32334813 32335196 + 0.75 NA intron (NM_022344, intron 6 of 9) intron (NM_022344, intron 6 of 9) 7169 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 229.5-139 chr9 29879640 29880037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 528616 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 153-31 chr12 117491650 117492113 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 14 of 19) intron (NM_173598, intron 14 of 19) -130079 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 131-34 chr11 114427285 114427505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12072 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 196-45 chr19 10878423 10878840 + 0.75 NA intron (NM_001370089, intron 1 of 14) intron (NM_001370089, intron 1 of 14) 6202 NM_001370089 10498 Hs.323213 NM_199141 ENSG00000142453 CARM1 PRMT4 coactivator associated arginine methyltransferase 1 protein-coding 147.25-150 chr8 123266979 123267250 + 0.75 NA intron (NM_001017926, intron 2 of 3) intron (NM_001017926, intron 2 of 3) 7172 NM_001204180 100533106 Hs.707401 NM_001204180 ENSG00000259305 ZHX1-C8orf76 - ZHX1-C8orf76 readthrough protein-coding 128.25-105 chr2 175935857 175936201 + 0.75 NA intron (NR_130941, intron 13 of 14) intron (NR_130941, intron 13 of 14) 66238 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 203.75-55 chr2 49974752 49975231 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001320156) promoter-TSS (NM_001320156) -788 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 127-122 chr4 15674263 15674471 + 0.75 NA Intergenic Charlie9|DNA|hAT-Charlie -7460 NM_001145191 285550 Hs.399980 NM_001145191 ENSG00000237765 FAM200B C4orf53 family with sequence similarity 200 member B protein-coding 127-14 chr10 15952581 15952777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92146 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 117-126 chr3 190910083 190910448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32335 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 117-63 chr15 27669613 27669826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 429596 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 124.75-22 chr1 226052560 226052748 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -10062 NM_002107 3020 Hs.533624 NM_002107 ENSG00000163041 H3F3A H3.3A|H3F3 H3 histone family member 3A protein-coding 274-18 chr2 37322431 37322995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5629 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 168.5-82 chr2 76370205 76370604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -615561 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 164.5-116 chr20 43810766 43811209 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -83731 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 220.25-84 chr9 137853968 137854448 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 15789 NR_030333 693187 NR_030333 ENSG00000207693 MIR602 MIRN602|hsa-mir-602 microRNA 602 ncRNA 267-54 chr8 83659235 83659705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 255712 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 199.25-62 chr2 219459902 219460389 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001173476) promoter-TSS (NM_001173476) -667 NM_001173476 10290 Hs.21639 NM_005876 ENSG00000072195 SPEG APEG-1|APEG1|BPEG|CNM5|MYLK6|SPEGalpha|SPEGbeta striated muscle enriched protein kinase protein-coding 187.5-145 chr6 15209142 15209463 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -36767 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 160.75-51 chr15 67967144 67967466 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -86874 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 150.25-92 chr22 21740185 21740569 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4583 NR_130910 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 154-74 chr2 128494272 128494551 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175543 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 160.25-105 chr3 189102313 189102556 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -69537 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 117.5-133 chr21 19100266 19100487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -340564 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 139.75-150 chr5 118900004 118900366 + 0.75 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) L1ME3A|LINE|L1 -74401 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 134.75-147 chr3 113611432 113611715 + 0.75 NA intron (NR_136284, intron 14 of 21) AluSx3|SINE|Alu 16697 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 224.5-40 chr14 66032827 66033222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -453347 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 117-175 chr7 112091132 112091402 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 115132 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 161.75-87 chr3 99676584 99676857 + 0.75 NA intron (NM_001850, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 38126 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 275-19 chr18 5457667 5458215 + 0.75 NA intron (NM_001281535, intron 5 of 21) intron (NM_001281535, intron 5 of 21) 82615 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 158.75-77 chr19 6879760 6880096 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -7651 NM_001256255 2015 Hs.2375 NM_001974 ENSG00000174837 ADGRE1 EMR1|TM7LN3 adhesion G protein-coupled receptor E1 protein-coding 228.5-2 chr1 35812580 35812925 + 0.75 NA intron (NM_017629, intron 1 of 17) AluSx1|SINE|Alu 4736 NM_017629 192670 Hs.744858 NM_017629 ENSG00000134698 AGO4 EIF2C4 argonaute RISC component 4 protein-coding 126.5-254 chr8 135390884 135391082 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -66473 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 115-125 chr5 4634995 4635179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138394 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 180.5-107 chr4 7016692 7017104 + 0.75 NA intron (NM_001286805, intron 10 of 11) intron (NM_001286805, intron 10 of 11) 26103 NM_153376 257236 Hs.656757 NM_153376 ENSG00000173013 CCDC96 - coiled-coil domain containing 96 protein-coding 173-26 chr11 113873253 113873530 + 0.75 NA intron (NM_020886, intron 1 of 24) intron (NM_020886, intron 1 of 24) 2181 NM_001346273 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 149.75-121 chr4 72692174 72692400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123066 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 158.5-128 chr3 44940077 44940394 + 0.75 NA intron (NR_146162, intron 3 of 6) intron (NR_146162, intron 3 of 6) 35939 NM_001349379 51304 Hs.61430 NM_016598 ENSG00000163812 ZDHHC3 DHHC-3|DHHC3|GODZ|ZNF373 zinc finger DHHC-type containing 3 protein-coding 155.25-136 chr5 2900986 2901407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16658 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 155.5-53 chr14 57073850 57074331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 194815 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 233-40 chr21 35036560 35036984 + 0.75 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) intron (NM_001754, intron 2 of 8) 2654 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 165.5-57 chr15 88869607 88869833 + 0.75 NA intron (NM_001369268, intron 14 of 18) intron (NM_001369268, intron 14 of 18) 25824 NM_001307952 145864 Hs.447530 NM_178232 ENSG00000140511 HAPLN3 EXLD1|HsT19883 hyaluronan and proteoglycan link protein 3 protein-coding 153.75-60 chr2 20062266 20062518 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10764 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 173.75-6 chr1 90486989 90487355 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -170578 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 304.25-28 chr8 129507089 129507601 + 0.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -23203 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 167.75-107 chr4 150654939 150655382 + 0.75 NA intron (NM_001367550, intron 37 of 56) L1MC5a|LINE|L1 73009 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 172.75-106 chr5 145589046 145589528 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 246055 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 236.25-16 chr11 24165821 24166474 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -330906 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 174.75-122 chr7 146011298 146011609 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -762818 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 159.75-156 chr7 37851819 37852086 + 0.75 NA intron (NM_016616, intron 5 of 17) intron (NM_016616, intron 5 of 17) 3355 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 275-34 chr4 105460041 105460526 + 0.75 NA intron (NM_176869, intron 1 of 11) MER2|DNA|TcMar-Tigger 13779 NM_176869 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 122.5-196 chr6 41878498 41878764 + 0.75 NA intron (NM_018561, intron 2 of 6) intron (NM_018561, intron 2 of 6) -6994 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 187-53 chr20 58663758 58664192 + 0.75 NA intron (NM_001001433, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 12692 NM_001134772 8675 Hs.307913 NM_003763 ENSG00000124222 STX16 SYN16 syntaxin 16 protein-coding 169.5-142 chr5 110402780 110403153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110949 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 120.5-189 chr5 150541684 150541890 + 0.75 NA intron (NM_001301063, intron 9 of 13) intron (NM_001301063, intron 9 of 13) 33656 NM_001543 3340 Hs.222055 NM_001543 ENSG00000070614 NDST1 HSST|MRT46|NST1 N-deacetylase and N-sulfotransferase 1 protein-coding 125.5-190 chr4 87338720 87338958 + 0.75 NA intron (NM_016245, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR -15957 NM_178135 345275 Hs.284414 NM_178135 ENSG00000170509 HSD17B13 HMFN0376|NIIL497|SCDR9|SDR16C3 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 13 protein-coding 196.75-20 chr10 124316576 124317068 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 102101 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 193.75-113 chr7 102821369 102821808 + 0.75 NA intron (NR_105043, intron 20 of 20) intron (NR_105043, intron 20 of 20) 72589 NR_146986 222234 Hs.202543 NM_147194 ENSG00000222011 FAM185A - family with sequence similarity 185 member A protein-coding 232.25-59 chr5 9169859 9170389 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 11 of 22) intron (NM_003966, intron 11 of 22) -116229 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 190.25-52 chr17 69254494 69254940 + 0.75 NA intron (NM_018672, intron 30 of 37) AluJo|SINE|Alu -9902 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 158.75-17 chr10 66141013 66141301 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) AluSx|SINE|Alu 569732 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 139.5-32 chr11 90808805 90809093 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 4 of 6) intron (NR_104190, intron 4 of 6) 60253 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 161.25-147 chr6 27191980 27192364 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 44546 NR_036096 100422934 NR_036096 ENSG00000265565 MIR3143 mir-3143 microRNA 3143 ncRNA 125.25-62 chr14 48770140 48770528 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 816046 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 234.25-48 chr3 152988103 152988454 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 153147 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 185.75-11 chr1 202152217 202152558 + 0.75 NA intron (NM_001199797, intron 8 of 9) intron (NM_001199797, intron 8 of 9) 7067 NM_001364878 5778 Hs.402773 NM_002832 ENSG00000143851 PTPN7 BPTP-4|HEPTP|LC-PTP|LPTP|PTPNI protein tyrosine phosphatase non-receptor type 7 protein-coding 130.5-168 chr3 104001479 104001706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -477476 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 239.5-11 chr10 110733158 110733659 + 0.75 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 89072 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 186.5-41 chr15 71701179 71701674 + 0.75 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -9887 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 209-29 chr17 59359091 59359519 + 0.75 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) intron (NM_001005404, intron 2 of 4) -6778 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 113-151 chr5 104542682 104542921 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -556673 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 137-94 chr21 26947974 26948184 + 0.75 NA intron (NM_007038, intron 2 of 7) intron (NM_007038, intron 2 of 7) -5882 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 140.75-19 chr10 57185244 57185666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119104 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 152.75-6 chr1 95426031 95426401 + 0.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -48521 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 124.25-118 chr20 57347127 57347328 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -4028 NM_003610 8480 Hs.371698 NM_003610 ENSG00000101146 RAE1 Gle2|MIG14|MRNP41|Mnrp41|dJ481F12.3|dJ800J21.1 ribonucleic acid export 1 protein-coding 131-54 chr14 67901834 67902159 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1PB4|LINE|L1 78404 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 155-100 chr4 112388883 112389270 + 0.75 NA intron (NM_001102406, intron 4 of 15) AluSc|SINE|Alu 91707 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 170.5-112 chr22 28625484 28625956 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEa|LINE|L1 54145 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 163.5-223 chrX 50921162 50921419 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 10555 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 176.25-117 chr5 155433549 155433861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 419950 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 137.5-199 chr5 177475941 177476208 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2381 NM_001363541 1627 Hs.130316 NM_004395 ENSG00000113758 DBN1 D0S117E drebrin 1 protein-coding 116-45 chr14 47614493 47614824 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 60296 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 146.5-177 chr5 94875187 94875435 + 0.75 NA intron (NM_001297777, intron 10 of 19) L2a|LINE|L2 206555 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 194.5-23 chr11 91846052 91846438 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -378789 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 149.5-13 chr1 225095570 225095827 + 0.75 NA intron (NM_001367479, intron 21 of 85) L1ME1|LINE|L1 166023 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 118-117 chr3 129551549 129551767 + 0.75 NA TTS (NM_153833) TTS (NM_153833) 3273 NM_001308262 132243 Hs.97358 NM_153833 ENSG00000178804 H1FOO H1.8|H1oo|osH1 H1 histone family member O oocyte specific protein-coding 137.5-246 chrX 46496904 46497119 + 0.75 NA TTS (NM_001039891) TTS (NM_001039891) 48410 NM_001146291 641339 Hs.636105 NM_001039891 ENSG00000251192 ZNF674 MRX92|ZNF673B zinc finger protein 674 protein-coding 162-101 chr6 63931845 63932084 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) L1MA7|LINE|L1 125128 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 292-9 chr11 44044075 44044848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3520 NM_001363113 390110 Hs.558851 NM_001031854 ENSG00000205126 ACCSL - 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) like protein-coding 234-38 chr3 57309581 57310073 + 0.75 NA exon (NM_001366028, exon 68 of 74) exon (NM_001366028, exon 68 of 74) -17142 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 203.5-40 chr14 32849261 32849586 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -89456 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 113-144 chr5 42676733 42676884 + 0.75 NA intron (NM_001242403, intron 3 of 9) intron (NM_001242403, intron 3 of 9) -80010 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 173.75-137 chr6 131415892 131416267 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -157147 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 121-31 chr11 15237021 15237341 + 0.75 NA intron (NM_001042536, intron 10 of 12) L2b|LINE|L2 88079 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 118.25-146 chr5 11070481 11070859 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) L1MEg|LINE|L1 -309436 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 175-139 chrX 102923562 102923965 + 0.75 NA intron (NR_146589, intron 10 of 11) L1ME3|LINE|L1 -13509 NM_001031834 282808 Hs.449517 NM_001031834 ENSG00000102128 RAB40AL MRXSMP|RAR2|RLGP RAB40A like protein-coding 163.5-36 chr12 4142119 4142419 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -131493 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 171.5-67 chr18 74954831 74955275 + 0.75 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 250460 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 123.25-217 chrX 35680745 35680945 + 0.75 NA Intergenic LTR69|LTR|ERVL -117497 NM_001099921 139604 NM_001099921 ENSG00000189023 MAGEB16 - MAGE family member B16 protein-coding 165.25-130 chr7 18142783 18143175 + 0.75 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) intron (NM_001204144, intron 1 of 12) -15670 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 125-99 chr3 25873722 25874013 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_034055) promoter-TSS (NR_034055) -172 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 113.75-81 chr17 60461806 60462034 + 0.75 NA intron (NM_006380, intron 7 of 12) intron (NM_006380, intron 7 of 12) 39431 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 149-65 chr2 212796746 212796977 + 0.75 NA TTS (NR_131942) TTS (NR_131942) 1530 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 194.5-129 chr6 62143855 62144148 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) L3|LINE|CR1 142224 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 152-97 chr22 28327941 28328326 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -131736 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 154-87 chr22 24985783 24986114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39253 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 165.75-51 chr14 48972763 48973142 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 613428 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 132-176 chr8 100691397 100691685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11483 NR_106992 102466854 NR_106992 ENSG00000284570 MIR7705 hsa-mir-7705 microRNA 7705 ncRNA 245-57 chr5 64311741 64312154 + 0.75 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) intron (NM_001113561, intron 5 of 7) 146104 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 174.5-124 chr3 118166108 118166435 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -475346 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 195.5-6 chr1 175196075 175196499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3300 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 207.75-35 chr14 52588695 52589108 + 0.75 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) L1MC4|LINE|L1 36065 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 311.5-25 chr4 91833374 91834026 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 443602 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 191.75-71 chr2 155749899 155750339 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 504812 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 188.25-64 chr20 38863958 38864334 + 0.75 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) L1MB8|LINE|L1 58449 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 187-107 chr9 80552304 80552587 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 577422 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 181.5-151 chr7 99069696 99070001 + 0.75 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) intron (NM_020429, intron 1 of 18) 56683 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 163-84 chr4 90306815 90307088 + 0.75 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) intron (NM_207491, intron 1 of 7) 71920 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 207.25-57 chr3 17217776 17218240 + 0.75 NA intron (NM_014744, intron 17 of 21) L1MB7|LINE|L1 284812 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 179-64 chr3 112634679 112635167 + 0.75 NA intron (NM_199512, intron 2 of 7) intron (NM_199512, intron 2 of 7) 6220 NM_199512 151887 Hs.477128 NM_199511 ENSG00000091986 CCDC80 CL2|DRO1|SSG1|URB|okuribin coiled-coil domain containing 80 protein-coding 115.75-148 chr3 187146781 187147036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7412 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 113.75-56 chr14 39320140 39320344 + 0.75 NA intron (NM_001247988, intron 18 of 22) (TGTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 52857 NM_001354141 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 233.75-58 chr5 3602887 3603473 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7348 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 171-9 chr10 13880272 13880778 + 0.75 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) L2a|LINE|L2 91371 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 191.75-67 chr2 107639109 107639554 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109912 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 154-44 chr15 69843233 69843491 + 0.75 NA TTS (NR_026764) TTS (NR_026764) 8128 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 223.5-130 chr8 117086328 117086772 + 0.75 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -48445 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 217.5-118 chr7 83578206 83578705 + 0.75 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) AluSx1|SINE|Alu 62976 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 161.75-38 chr14 60255335 60255923 + 0.75 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 6408 NM_021003 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 121.25-198 chr8 126669716 126669937 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111348 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 115.5-120 chr2 60005418 60005632 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 377511 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 277.5-20 chr13 41817216 41817746 + 0.75 NA intron (NM_001009814, intron 15 of 25) intron (NM_001009814, intron 15 of 25) 143604 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 149.75-51 chr15 63509823 63510093 + 0.75 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) intron (NM_001256702, intron 1 of 13) 5365 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 116.5-251 chr8 109399431 109399659 + 0.75 NA intron (NM_177531, intron 12 of 77) intron (NM_177531, intron 12 of 77) 37084 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 228.5-13 chr1 214274850 214275351 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6059 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 148-35 chr15 93065376 93065705 + 0.75 NA intron (NM_001166286, intron 1 of 2) intron (NM_001166286, intron 1 of 2) 7616 NM_001166286 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 121.5-15 chr1 119527866 119528106 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 20776 NM_000862 3283 Hs.364941 NM_000862 ENSG00000203857 HSD3B1 3BETAHSD|HSD3B|HSDB3|HSDB3A|SDR11E1 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 protein-coding 161.5-182 chr8 56171245 56171625 + 0.75 NA intron (NM_001114634, intron 1 of 3) intron (NM_001114634, intron 1 of 3) 39838 NM_001114635 5324 Hs.14968 NM_002655 ENSG00000181690 PLAG1 PSA|SGPA|ZNF912 PLAG1 zinc finger protein-coding 126.75-103 chr2 45432902 45433304 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) -178162 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 175-57 chr18 13717486 13717848 + 0.75 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) intron (NM_001098801, intron 1 of 4) 8891 NM_001098801 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 160.75-2 chr1 8901386 8901709 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 22712 NR_038351 100505975 Hs.429843 NR_038351 ENSG00000230679 ENO1-AS1 - ENO1 antisense RNA 1 ncRNA 124-169 chr8 128535629 128535906 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 28912 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 128.75-101 chr2 139302255 139302426 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 405016 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 180.5-142 chr7 86336671 86337059 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -307044 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 162.25-100 chr21 29660190 29660494 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 4 of 16) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 64302 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 133.5-123 chr2 115791128 115791352 + 0.75 NA intron (NM_001321912, intron 19 of 25) intron (NM_001321912, intron 19 of 25) 447425 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 192-7 chr1 115939666 115939973 + 0.75 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) intron (NR_125970, intron 2 of 4) 20443 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 122.75-79 chr18 22573948 22574234 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -156176 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 120-123 chr3 135344035 135344275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 548895 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 222.75-90 chr7 48238915 48239401 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 8 of 61) intron (NM_152701, intron 8 of 61) 67700 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 112.75-191 chr7 77461761 77462061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45562 NM_001350896 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 195.5-27 chr12 9880966 9881254 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001190765) promoter-TSS (NM_001190765) -379 NM_001190765 100431172 Hs.725113 NM_001190765 ENSG00000256797 KLRF2 NKp65 killer cell lectin like receptor F2 protein-coding 221.75-20 chr14 64737332 64737824 + 0.75 NA intron (NM_001308147, intron 14 of 16) intron (NM_001308147, intron 14 of 16) 33154 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 125.5-53 chr12 19912438 19912635 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -102149 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 268-19 chr14 68505687 68506158 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 122865 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 264.25-2 chr1 36835148 36835705 + 0.75 NA intron (NM_000831, intron 10 of 15) LTR16E2|LTR|ERVL 199089 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 155-80 chr22 24403725 24403993 + 0.75 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) FLAM_A|SINE|Alu -19738 NM_001278500 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 231.75-11 chr11 1750364 1750925 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001170820) promoter-TSS (NM_001170820) -49 NM_001170820 402778 Hs.121575 NM_001170820 ENSG00000244242 IFITM10 DSPA3 interferon induced transmembrane protein 10 protein-coding 120.5-84 chr15 87554533 87554722 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -22302 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 156.5-178 chr7 112145250 112145699 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 60925 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 205.75-30 chr16 78431641 78432061 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 6 of 7) AluJo|SINE|Alu 332197 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 127.75-79 chr17 75524266 75524635 + 0.75 NA 3' UTR (NM_207346, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_207346, exon 11 of 11) -1247 NM_001031803 3993 Hs.514477 NM_004524 ENSG00000073350 LLGL2 HGL|Hugl-2|LGL2 LLGL scribble cell polarity complex component 2 protein-coding 176.5-64 chr15 65880155 65880471 + 0.75 NA intron (NM_004663, intron 4 of 4) intron (NM_004663, intron 4 of 4) 10822 NM_001206836 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 173-108 chr5 35005409 35005808 + 0.75 NA intron (NM_031900, intron 12 of 13) intron (NM_031900, intron 12 of 13) 42341 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 160.5-133 chr4 55869423 55869740 + 0.75 NA intron (NM_001024924, intron 5 of 18) intron (NM_001024924, intron 5 of 18) 15931 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 176.5-57 chr14 67447701 67448110 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -5975 NR_049879 100847064 NR_049879 ENSG00000265993 MIR5694 - microRNA 5694 ncRNA 141.25-82 chr2 86627017 86627284 + 0.75 NA intron (NM_001198954, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR -3273 NM_001198951 7844 Hs.469199 NM_005667 ENSG00000239305 RNF103 HKF-1|KF-1|KF1|ZFP-103|ZFP103 ring finger protein 103 protein-coding 134.25-8 chr1 101678816 101679029 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 168158 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 128-49 chr15 59486288 59486525 + 0.75 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) L1MA3|LINE|L1 48220 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 166.25-126 chr5 63597936 63598226 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 364211 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 114.25-120 chr22 37181112 37181388 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001365878, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001365878, exon 5 of 5) -6132 NM_001346222 3560 Hs.474787 NM_000878 ENSG00000100385 IL2RB CD122|IL15RB|P70-75 interleukin 2 receptor subunit beta protein-coding 152.75-110 chr3 121732665 121733099 + 0.75 NA intron (NM_001256486, intron 1 of 21) L1MC3|LINE|L1 16859 NM_001366282 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 160.25-20 chr12 12392251 12392505 + 0.75 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 35300 NM_058169 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 130.25-29 chr10 81773760 81774064 + 0.75 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -101282 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 127.75-119 chr20 47649415 47649729 + 0.75 NA intron (NM_001174087, intron 19 of 22) intron (NM_001174087, intron 19 of 22) 136492 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 185.25-123 chr8 70679622 70679998 + 0.75 NA intron (NM_001287259, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 10471 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 145.5-108 chr2 177390923 177391127 + 0.75 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) intron (NR_026966, intron 1 of 8) 1666 NR_026966 100130691 Hs.707723 NM_182585 ENSG00000213963 LOC100130691 - uncharacterized LOC100130691 ncRNA 179.25-127 chr6 49923788 49924231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25435 NR_163261 403339 Hs.745543 NM_001166478 ENSG00000214643 DEFB133 - defensin beta 133 pseudo 205-50 chr3 66425051 66425408 + 0.75 NA intron (NM_015541, intron 3 of 18) intron (NM_015541, intron 3 of 18) 75192 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 120.75-11 chr1 216684847 216685135 + 0.75 NA intron (NM_001134285, intron 3 of 8) intron (NM_001134285, intron 3 of 8) 38438 NM_001438 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 176.25 chr1 24859814 24860150 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 59434 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 262.25-36 chr4 155481959 155482828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105428 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 194.25-86 chr4 153125126 153125497 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27023 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 141.5-218 chr7 137603794 137604112 + 0.75 NA intron (NM_001321710, intron 10 of 32) intron (NM_001321710, intron 10 of 32) 242379 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 138-6 chr1 213058382 213058585 + 0.75 NA intron (NM_001136138, intron 1 of 13) L1MC3|LINE|L1 7242 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 159.25-149 chr8 88703425 88703820 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -376139 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 141-54 chr16 76150224 76150531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -127024 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 121.5-267 chr9 125370194 125370461 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 108501 NM_001354294 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 174.75-57 chr2 68171647 68171937 + 0.75 NA intron (NM_001329916, intron 5 of 5) L2|LINE|L2 13904 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 166.25-78 chr2 85074857 85075237 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -7700 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 160.25-55 chr17 71069120 71069390 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 132924 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 125-53 chr16 71874797 71875018 + 0.75 NA intron (NM_001201552, intron 3 of 7) intron (NM_001201552, intron 3 of 7) 5569 NM_001318239 55565 Hs.744055 NM_017530 ENSG00000102984 ZNF821 - zinc finger protein 821 protein-coding 132.75-75 chr16 46391612 46391971 + 0.75 NA Intergenic (AATGGAATCATCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 177306 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 152.75-104 chr3 18603319 18603576 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -157855 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 148.25-106 chr4 62254688 62254904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93031 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 155.25-111 chr21 29061710 29061978 + 0.75 NA intron (NM_001282907, intron 12 of 15) intron (NM_001282907, intron 12 of 15) 11804 NM_006585 10694 Hs.125113 NM_006585 ENSG00000156261 CCT8 C21orf112|Cctq|D21S246|PRED71 chaperonin containing TCP1 subunit 8 protein-coding 191.5-25 chr11 118905326 118905752 + 0.75 NA intron (NM_182557, intron 3 of 7) intron (NM_182557, intron 3 of 7) 5003 NM_182557 283149 Hs.414740 NM_182557 ENSG00000186174 BCL9L B9L|BCL9-2|DLNB11 BCL9 like protein-coding 177.5-130 chr4 101255294 101255668 + 0.75 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) -14609 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 166.5-206 chr8 123655075 123655416 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1444 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 144.5-56 chr13 93289778 93290175 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 63169 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 148-23 chr14 35832400 35832780 + 0.75 NA intron (NM_032352, intron 2 of 9) intron (NM_032352, intron 2 of 9) 6252 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 199.5-61 chr18 11543741 11544096 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53870 NR_110778 101927433 Hs.331210 NR_110778 ENSG00000267252 LINC01255 - long intergenic non-protein coding RNA 1255 ncRNA 149-26 chr13 102181415 102181722 + 0.75 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 129118 NM_001321932 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 141.75-24 chr10 128859218 128859535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53457 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 124-8 chr1 93380816 93381056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35029 NM_001938 1810 Hs.348418 NM_001938 ENSG00000117505 DR1 NC2|NC2-BETA|NC2B|NCB2 down-regulator of transcription 1 protein-coding 121.25-92 chr2 79523701 79523957 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) L1ME3G|LINE|L1 646 NM_001282598 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 115.25-210 chr8 110382063 110382398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -406459 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 200.25-30 chr12 127522325 127522769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113920 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 115.75-52 chr13 52924351 52924697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75884 NM_002590 5100 Hs.19492 NM_002590 ENSG00000136099 PCDH8 ARCADLIN|PAPC protocadherin 8 protein-coding 201.75-79 chr5 168999653 168999991 + 0.75 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) -13405 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 116-5 chr1 68889262 68889469 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166533 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 120.25-14 chr1 116928325 116928553 + 0.75 NA intron (NM_020440, intron 1 of 8) intron (NM_020440, intron 1 of 8) 18523 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 116.25-246 chr9 97887882 97888104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34577 NM_001330725 51531 Hs.9196 NM_016481 ENSG00000136932 TRMO C9orf156|HSPC219|NAP1 tRNA methyltransferase O protein-coding 211-6 chr10 27826039 27826633 + 0.75 NA intron (NM_018076, intron 19 of 19) intron (NM_018076, intron 19 of 19) -80517 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 271.75-23 chr2 198632359 198632799 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -257482 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 124.25-70 chr16 49585431 49585678 + 0.75 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) intron (NM_001271620, intron 5 of 7) -66969 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 125.25-158 chr5 81051767 81052137 + 0.75 NA intron (NM_006909, intron 2 of 26) L1MB7|LINE|L1 -91045 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-11 chr1 189903414 189903820 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 572393 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 154.75-55 chr17 29483030 29483494 + 0.75 NA intron (NM_025142, intron 8 of 17) AluJb|SINE|Alu 83775 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 113-140 chr5 4803188 4803478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29852 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 202.5-26 chr11 47363059 47363482 + 0.75 NA intron (NM_001080547, intron 2 of 4) AluSx1|SINE|Alu -10568 NM_000256 4607 Hs.524906 NM_000256 ENSG00000134571 MYBPC3 CMD1MM|CMH4|FHC|LVNC10|MYBP-C myosin binding protein C, cardiac protein-coding 146-6 chr1 150750660 150750880 + 0.75 NA intron (NM_001199739, intron 4 of 6) AluJo|SINE|Alu 15008 NM_004079 1520 Hs.181301 NM_004079 ENSG00000163131 CTSS - cathepsin S protein-coding 176.75-25 chr12 28216394 28216690 + 0.75 NA intron (NM_001352080, intron 2 of 13) LFSINE_Vert|SINE|tRNA -25804 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 259.5-56 chr2 67959847 67960484 + 0.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 102839 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 158.25-150 chr8 140685855 140686115 + 0.75 NA intron (NM_001352743, intron 27 of 32) L1PA15|LINE|L1 32584 NM_001352751 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 175.75-32 chr13 27594814 27595270 + 0.75 NA intron (NM_153371, intron 1 of 9) intron (NM_153371, intron 1 of 9) 25487 NM_153371 222484 Hs.132359 NM_153371 ENSG00000139517 LNX2 PDZRN1 ligand of numb-protein X 2 protein-coding 167.75-86 chr20 50947097 50947437 + 0.75 NA intron (NM_003859, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 11297 NM_001317034 8813 Hs.654951 NM_003859 ENSG00000000419 DPM1 CDGIE|MPDS dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 1, catalytic protein-coding 153 chr1 45535497 45536004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12860 NM_001202431 5052 Hs.180909 NM_002574 ENSG00000117450 PRDX1 MSP23|NKEF-A|NKEFA|PAG|PAGA|PAGB|PRX1|PRXI|TDPX2 peroxiredoxin 1 protein-coding 244.75-39 chr3 118269448 118269991 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -372049 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 175-55 chr18 2280585 2280890 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 290768 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 205.25-22 chr13 49764912 49765272 + 0.75 NA intron (NM_002267, intron 1 of 16) L2|LINE|L2 27590 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 146.25-52 chr17 40023977 40024442 + 0.75 NA intron (NR_052017, intron 18 of 24) intron (NR_052017, intron 18 of 24) 2200 NR_106944 102466757 NR_106944 ENSG00000283721 MIR6884 hsa-mir-6884 microRNA 6884 ncRNA 125.25-169 chr6 55336060 55336322 + 0.75 NA intron (NM_207410, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 8722 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 119.25-23 chr10 65693616 65693811 + 0.75 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) intron (NR_120647, intron 4 of 5) 122288 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 161.5-161 chr5 164761447 164761693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 291291 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 131-122 chr3 151789999 151790287 + 0.75 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) L1MC4|LINE|L1 19687 NR_026915 201651 Hs.383050 NR_026915 ENSG00000240602 AADACP1 - arylacetamide deacetylase pseudogene 1 pseudo 154.25-136 chr6 34873037 34873517 + 0.75 NA 3' UTR (NM_017754, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_017754, exon 21 of 21) 14765 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 120.25-168 chr5 110922941 110923222 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -146999 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 156.75-76 chr18 51032212 51032643 + 0.75 NA intron (NM_005359, intron 1 of 11) intron (NM_005359, intron 1 of 11) 2214 NM_005359 4089 Hs.75862 NM_005359 ENSG00000141646 SMAD4 DPC4|JIP|MADH4|MYHRS SMAD family member 4 protein-coding 180-40 chr15 63010824 63011123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31774 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 119-121 chr3 108432804 108433097 + 0.75 NA intron (NM_014981, intron 26 of 41) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 96372 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 231.5-69 chr3 194495110 194495658 + 0.75 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 8244 NR_033929 401106 Hs.407087 NR_033929 LINC00884 - long intergenic non-protein coding RNA 884 ncRNA 119.5-58 chr11 120498792 120499079 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12811 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 147-46 chr16 9755139 9755456 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000833, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_000833, exon 14 of 14) -299792 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 268-4 chr1 71083325 71083790 + 0.75 NA intron (NR_046217, intron 1 of 3) intron (NR_046217, intron 1 of 3) 2233 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 129-132 chr4 115636454 115636670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -522942 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 129.5-42 chr11 84165121 84165346 + 0.75 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 108047 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 315-10 chr14 89270838 89271321 + 0.75 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) (CACATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 146154 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 169.5-77 chr2 99821490 99821760 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 283958 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 204.5-110 chr5 169784349 169784768 + 0.75 NA intron (NR_156756, intron 25 of 52) MER113|DNA|hAT-Charlie 147283 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 164-28 chr12 51508975 51509346 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001258401, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001258401, exon 25 of 25) -82073 NM_014191 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 148-67 chr2 229132602 229132877 + 0.75 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) intron (NM_001330157, intron 1 of 1) 99353 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 204-77 chr8 47808526 47808998 + 0.75 NA intron (NM_001081640, intron 68 of 84) intron (NM_001081640, intron 68 of 84) -70598 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 166.5-41 chr11 79494958 79495319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54108 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 180-78 chr22 28249424 28249791 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -210262 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 151.25-87 chr2 76486084 76486319 + 0.75 NA Intergenic (TTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -499764 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 133.75-194 chr8 120906882 120907230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95010 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 181.5-130 chr5 14995622 14996081 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -124073 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 149.5-59 chr14 62000817 62001132 + 0.75 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) FRAM|SINE|Alu 73279 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 170-26 chr14 23752908 23753356 + 0.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 116768 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 189.75-99 chr6 49433472 49433858 + 0.75 NA intron (NM_000255, intron 12 of 12) intron (NM_000255, intron 12 of 12) 29588 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 202.75 chr1 6849645 6850229 + 0.75 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) AluSz6|SINE|Alu 64483 NM_015215 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 157.5-61 chr14 71194645 71194930 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -125689 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 163.75-31 chr11 112579946 112580237 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -24289 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 212.75-89 chr6 94340115 94340495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 622002 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 125.5-70 chr13 99403301 99403707 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 47373 NR_030353 693208 NR_030353 ENSG00000207719 MIR623 MIRN623|hsa-mir-623 microRNA 623 ncRNA 114.75-93 chr2 117297735 117297959 + 0.75 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 -516844 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 162.5-94 chr2 210696614 210697060 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 79266 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 134.25-75 chr2 21722094 21722353 + 0.75 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -11571 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 150.75-193 chr9 115324974 115325386 + 0.75 NA intron (NR_163556, intron 4 of 7) intron (NR_163556, intron 4 of 7) 183362 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 146-50 chr16 87832940 87833222 + 0.75 NA intron (NM_003486, intron 9 of 9) intron (NM_003486, intron 9 of 9) 1579 NR_106833 102465464 NR_106833 ENSG00000278598 MIR6775 hsa-mir-6775 microRNA 6775 ncRNA 129.25-63 chr16 7275940 7276172 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -56789 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 125.75-158 chr5 174818425 174818626 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 66791 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 176.25-6 chr1 170047830 170048090 + 0.75 NA intron (NM_001204516, intron 1 of 18) intron (NM_001204516, intron 1 of 18) 20955 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 150-94 chr3 100900438 100900699 + 0.75 NA intron (NM_001349332, intron 3 of 35) intron (NM_001349332, intron 3 of 35) 92922 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 183.75-80 chr3 179955066 179955408 + 0.75 NA intron (NM_001349396, intron 1 of 13) intron (NM_001349396, intron 1 of 13) 18988 NM_001349406 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 225.25-37 chr19 28392925 28393467 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -213492 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 174.5-147 chr5 77202970 77203277 + 0.75 NA intron (NM_001349752, intron 1 of 21) intron (NM_001349752, intron 1 of 21) -6770 NM_001349753 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 117.75-226 chr9 100480663 100480950 + 0.75 NA intron (NM_003692, intron 1 of 9) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 7657 NM_003692 8577 Hs.598100 NM_003692 ENSG00000241697 TMEFF1 C9orf2|CT120.1|H7365|TR-1 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1 protein-coding 222.75-9 chr1 231530510 231531006 + 0.75 NA intron (NR_028398, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 2089 NM_005999 7257 Hs.13318 NM_005999 ENSG00000116918 TSNAX C3PO|TRAX translin associated factor X protein-coding 189.5-161 chr9 70631671 70632094 + 0.75 NA intron (NM_001366142, intron 12 of 26) intron (NM_001366142, intron 12 of 26) 178202 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 127.25-49 chr12 132777607 132778017 + 0.75 NA intron (NM_005895, intron 18 of 23) intron (NM_005895, intron 18 of 23) -15980 NM_015114 23141 Hs.654628 NM_015114 ENSG00000176915 ANKLE2 KIAA0692|LEMD7|Lem4|MCPH16 ankyrin repeat and LEM domain containing 2 protein-coding 171.75-67 chr19 17913394 17913871 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -19383 NM_001136203 115098 Hs.100043 NM_138442 ENSG00000007080 CCDC124 - coiled-coil domain containing 124 protein-coding 156.5-209 chr9 104555364 104555691 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13641 NM_001004483 138802 Hs.553599 NM_001004483 ENSG00000186943 OR13C8 OR37H|OR9-10 olfactory receptor family 13 subfamily C member 8 protein-coding 204.75-56 chr18 70741596 70742045 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -90866 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 164.75-27 chr11 43873527 43873848 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -7144 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 140.5-98 chr2 5600783 5600990 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 90232 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 112.5-114 chr2 69640490 69640665 + 0.75 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 3162 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 124.25-23 chr10 50995166 50995426 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 4408 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 246-36 chr2 190148920 190149507 + 0.75 NA intron (NM_001042521, intron 1 of 2) AluSp|SINE|Alu -1033 NM_001042520 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 211.5-66 chr18 71449275 71449846 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 129396 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 166-16 chr10 104305665 104305949 + 0.75 NA TTS (NM_183239) TTS (NM_183239) -17557 NR_120622 101927472 Hs.670333 NR_120622 ITPRIP-AS1 - ITPRIP antisense RNA 1 ncRNA 125-21 chr10 57725071 57725450 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -420701 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 120.25-74 chr17 57962668 57962896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7370 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 149-114 chr6 69133806 69134066 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) L1PB1|LINE|L1 498654 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 114.5-224 chr5 173142179 173142489 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2197 NM_001205 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 132-53 chr14 84728617 84729049 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -543099 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 146.75-9 chr1 192272914 192273298 + 0.75 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -43886 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 237.75-21 chr15 69347881 69348233 + 0.75 NA intron (NM_001104554, intron 2 of 8) intron (NM_001104554, intron 2 of 8) 33654 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 148.25-37 chr13 106118882 106119251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257498 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 118-17 chr10 74578264 74578605 + 0.75 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) intron (NM_001369123, intron 7 of 9) -49110 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 248-13 chr11 113478701 113479274 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3589 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 235.75-76 chr8 63305610 63306086 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136845 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 124-160 chr7 64289525 64289838 + 0.75 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -24192 NM_001294255 728927 Hs.386162 NM_001170905 ENSG00000234444 ZNF736 - zinc finger protein 736 protein-coding 125.5-184 chr3 128254270 128254488 + 0.75 NA intron (NM_021937, intron 2 of 6) intron (NM_021937, intron 2 of 6) -100465 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 119.25-146 chr4 59343023 59343402 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 329639 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 174-63 chr3 83709341 83709649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1160080 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 300.5-52 chr8 105202150 105202725 + 0.75 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -116001 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 153-6 chr1 184851588 184851940 + 0.75 NA intron (NM_052966, intron 5 of 13) intron (NM_052966, intron 5 of 13) -96906 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 126.25-2 chr1 13514064 13514253 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001010847) promoter-TSS (NM_001010847) -155 NM_001010847 126755 Hs.657356 NM_001010847 ENSG00000162494 LRRC38 - leucine rich repeat containing 38 protein-coding 142.5-239 chr9 90144178 90144454 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -102817 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 127-150 chr6 56603091 56603372 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 36 of 94) intron (NM_001144770, intron 36 of 94) 39658 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 136.25-115 chr22 17423275 17423641 + 0.75 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) AluSx3|SINE|Alu 53998 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 191.75-16 chr10 61805168 61805602 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -96314 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 126.25-184 chr7 3996961 3997216 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 14 of 44) L1ME2|LINE|L1 -132597 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 159.25-104 chr4 62215175 62215610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53627 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 181.5-40 chr14 42706712 42707098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1100049 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 178.75-41 chr17 62072602 62073169 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7607 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 138.25-72 chr18 57500854 57501173 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65639 NM_004852 9480 Hs.194725 NM_004852 ENSG00000119547 ONECUT2 OC-2|OC2 one cut homeobox 2 protein-coding 143-52 chr17 21233014 21233349 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -18586 NM_003876 8834 Hs.592945 NM_003876 ENSG00000178307 TMEM11 C17orf35|PM1|PMI transmembrane protein 11 protein-coding 117-179 chr8 60091461 60091709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 189815 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 115.5-69 chr14 74080489 74080749 + 0.75 NA intron (NM_001278593, intron 1 of 11) AluJr4|SINE|Alu 3834 NM_005589 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 126.75-163 chr3 193240844 193241104 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001366112) promoter-TSS (NM_001366112) -248 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 185.5-57 chr15 41068603 41068957 + 0.75 NA intron (NM_017553, intron 14 of 35) AluSx1|SINE|Alu 47466 NR_104038 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 152.25-161 chr8 122811595 122811893 + 0.75 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 30089 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 143-43 chr15 61944345 61944553 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 45 of 81) L1PA16|LINE|L1 115998 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 176.75-103 chr5 132704898 132705268 + 0.75 NA intron (NM_007054, intron 9 of 16) intron (NM_007054, intron 9 of 16) -22454 NR_134248 105379176 Hs.73917 NR_134248 LOC105379176 - uncharacterized LOC105379176 ncRNA 144-93 chr4 74369970 74370325 + 0.75 NA intron (NM_001432, intron 1 of 4) intron (NM_001432, intron 1 of 4) 5002 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 143.25-98 chr2 237048197 237048432 + 0.75 NA TTS (NR_135202) TTS (NR_135202) 7853 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 123.75-131 chr4 29550196 29550419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 336015 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 215.25-86 chr5 111316390 111316717 + 0.75 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 92169 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 218-21 chr15 59908635 59909167 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -95410 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 176.25-31 chr12 59528303 59528550 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -67603 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 126-164 chr7 28358799 28359009 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) -53614 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 206.5-8 chr10 117594250 117594571 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49342 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 146.5-189 chr6 66153538 66153829 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 365804 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 129.5-153 chr3 43729013 43729266 + 0.75 NA intron (NM_001355186, intron 7 of 7) intron (NM_001355186, intron 7 of 7) -37545 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 153.5-137 chr4 22055097 22055382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106488 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 138.75-169 chr7 4739388 4739686 + 0.75 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) intron (NM_001037165, intron 1 of 8) -36086 NM_014855 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 149.75-161 chr8 65992093 65992400 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -22732 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 154-77 chr2 157923724 157924029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47546 NM_001111067 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 128.5-187 chr6 50321275 50321536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271476 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 215.75-74 chr5 28521408 28521885 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -233981 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 184.25-17 chr10 24111027 24111415 + 0.75 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -97570 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 195-37 chr17 3362783 3363170 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 35434 NM_003553 8387 NM_003553 ENSG00000180016 OR1E1 HGM071|OR13-66|OR17-2|OR17-32|OR1E5|OR1E6|OR1E8P|OR1E9P|OST547 olfactory receptor family 1 subfamily E member 1 protein-coding 130-93 chr20 43908387 43908599 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6359 NM_001098797 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 252.75-60 chr5 159940814 159941218 + 0.75 NA intron (NM_000679, intron 1 of 1) intron (NM_000679, intron 1 of 1) 24534 NM_000679 147 Hs.368632 NM_000679 ENSG00000170214 ADRA1B ADRA1|ALPHA1BAR adrenoceptor alpha 1B protein-coding 214.75-30 chr16 51762986 51763491 + 0.75 NA intron (NR_110916, intron 1 of 2) intron (NR_110916, intron 1 of 2) 719 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 173.75-70 chr17 58266163 58266559 + 0.75 NA intron (NR_027647, intron 10 of 11) intron (NR_027647, intron 10 of 11) 14574 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 125.5-57 chr12 65876402 65876643 + 0.75 NA intron (NR_120478, intron 2 of 2) intron (NR_120478, intron 2 of 2) 5056 NR_120478 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 217.25-16 chr10 82509918 82510315 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 -277196 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-54 chr14 48975536 48975758 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 610733 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 229.75-50 chr3 115582816 115583241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40482 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 151.25-129 chr3 121988892 121989159 + 0.75 NA intron (NM_001199799, intron 7 of 7) intron (NM_001199799, intron 7 of 7) 33222 NM_001199800 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 124-64 chr17 61240902 61241207 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 126650 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 225.5-87 chr5 17347243 17347814 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 39782 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 159.5-151 chr3 120709572 120709785 + 0.75 NA intron (NM_173825, intron 3 of 7) intron (NM_173825, intron 3 of 7) -27439 NM_000187 3081 Hs.368254 NM_000187 ENSG00000113924 HGD AKU|HGO homogentisate 1,2-dioxygenase protein-coding 135.75-182 chr6 107374968 107375203 + 0.75 NA intron (NM_020381, intron 1 of 7) L1MD|LINE|L1 84479 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 212-29 chr16 84923330 84923647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 88047 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 179.75-131 chr8 101202733 101203057 + 0.75 NA intron (NM_001042510, intron 1 of 4) intron (NM_001042510, intron 1 of 4) 2778 NM_016096 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 131.25-75 chr16 78896770 78897110 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) L1ME2|LINE|L1 703797 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 146.5-4 chr1 30726428 30726852 + 0.75 NA non-coding (NR_034182, exon 4 of 4) non-coding (NR_034182, exon 4 of 4) -3055 NM_002379 4146 Hs.150366 NM_002379 ENSG00000162510 MATN1 CMP|CRTM matrilin 1 protein-coding 148.5-64 chr14 64653484 64653683 + 0.75 NA Intergenic (CACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50841 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 120.75-2 chr1 37041159 37041373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6751 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 152-139 chr7 2408188 2408425 + 0.75 NA intron (NM_018641, intron 1 of 1) AluSq2|SINE|Alu 4695 NM_001243794 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 183-75 chr3 127675555 127676005 + 0.75 NA intron (NR_033429, intron 3 of 11) intron (NR_033429, intron 3 of 11) 2828 NM_172027 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 112.75-150 chr4 52307274 52307518 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 256092 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 229.25-12 chr11 95606524 95606901 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 183070 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 148.25-103 chr4 31024547 31024842 + 0.75 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -146450 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 119-162 chr6 54180285 54180569 + 0.75 NA intron (NM_001281746, intron 9 of 11) L1MA2|LINE|L1 68984 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 193-67 chr4 126455662 126456083 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 948613 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 142.5-27 chr10 6190434 6190696 + 0.75 NA intron (NM_001282630, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu -12367 NM_001363545 5209 Hs.195471 NM_004566 ENSG00000170525 PFKFB3 IPFK2|PFK2|iPFK-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 protein-coding 144.5-69 chr14 77466497 77466918 + 0.75 NA intron (NM_012111, intron 6 of 8) intron (NM_012111, intron 6 of 8) 8614 NM_012111 10598 Hs.204041 NM_012111 ENSG00000100591 AHSA1 AHA1|C14orf3|hAha1|p38 activator of HSP90 ATPase activity 1 protein-coding 167-56 chr2 32896745 32897016 + 0.75 NA intron (NR_027099, intron 7 of 10) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -30247 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 182-21 chr12 25313693 25314148 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -62991 NM_001369787 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 125.5-197 chr5 9667804 9668119 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) L1PA15|LINE|L1 -37610 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 165.75-45 chr13 36060226 36060565 + 0.75 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) 70987 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 113-88 chr2 66483451 66483714 + 0.75 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -43252 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 241.75-7 chr10 57026597 57027201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 277660 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 113.25-13 chr1 190286063 190286355 + 0.75 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 189801 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 157.75-35 chr12 47191403 47191758 + 0.75 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) intron (NM_001281429, intron 2 of 2) 3768 NR_039847 100616486 NR_039847 ENSG00000263838 MIR4698 - microRNA 4698 ncRNA 150-148 chr8 129990607 129990872 + 0.75 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 17714 NR_049826 100847051 NR_049826 ENSG00000264653 MIR5194 mir-5194 microRNA 5194 ncRNA 145-92 chr22 24894597 24894898 + 0.75 NA intron (NM_001098497, intron 17 of 24) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 51948 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 169.25-96 chr5 42895168 42895621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83318 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 266.75-50 chr7 87340936 87341374 + 0.75 NA intron (NR_015381, intron 2 of 2) intron (NR_015381, intron 2 of 2) 4337 NR_015381 11257 Hs.274329 NM_007233 ENSG00000182165 TP53TG1 LINC00096|NCRNA00096|P53TG1|P53TG1-D|TP53AP1 TP53 target 1 ncRNA 271.25-5 chr1 182488003 182488530 + 0.75 NA intron (NM_001366934, intron 7 of 22) intron (NM_001366934, intron 7 of 22) 38120 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 147-150 chr8 129263700 129264136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22678 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 153.25-24 chr11 17640573 17640857 + 0.75 NA intron (NM_001277269, intron 48 of 54) intron (NM_001277269, intron 48 of 54) 56224 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 154-68 chr2 76221251 76221514 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -510467 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 135.75-5 chr1 56442583 56442965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27811 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 123-138 chr3 188933391 188933782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14053 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 123.5 chr1 8678841 8679184 + 0.75 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) MER3|DNA|hAT-Charlie 138628 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 194-41 chr17 48052477 48052847 + 0.75 NA intron (NM_001330261, intron 2 of 5) intron (NM_001330261, intron 2 of 5) 4303 NM_003204 4779 Hs.514284 NM_003204 ENSG00000082641 NFE2L1 LCR-F1|NRF1|TCF11 nuclear factor, erythroid 2 like 1 protein-coding 131-62 chr15 87912441 87912657 + 0.75 NA intron (NM_001012338, intron 17 of 19) MIR3|SINE|MIR 33719 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 195.5-30 chr12 28589563 28589879 + 0.75 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -398983 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 137-86 chr2 195241044 195241241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -415816 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 206.75-37 chr2 112657227 112657717 + 0.75 NA intron (NM_005415, intron 6 of 10) intron (NM_005415, intron 6 of 10) 11533 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 200.5-59 chr18 55253966 55254469 + 0.75 NA intron (NM_001348216, intron 8 of 12) L1MB7|LINE|L1 48443 NM_001348216 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 173.75-55 chr14 68387375 68387912 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 241144 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 134.25-176 chr7 54006092 54006308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -194269 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 136-3 chr1 50267799 50268008 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 155540 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 188.5-53 chr16 76752308 76752642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116461 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 156-98 chr22 24922981 24923337 + 0.75 NA intron (NM_001098498, intron 23 of 23) AluSz6|SINE|Alu 23536 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 211.5-107 chr3 172675128 172675709 + 0.75 NA intron (NM_001146276, intron 1 of 4) L1PA6|LINE|L1 35649 NM_001146276 57552 Hs.444099 NM_020792 ENSG00000144959 NCEH1 AADACL1|NCEH neutral cholesterol ester hydrolase 1 protein-coding 156.75-62 chr15 68594733 68595015 + 0.75 NA intron (NM_006091, intron 1 of 11) MIR3|SINE|MIR 15881 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 121-79 chr16 77305878 77306080 + 0.75 NA intron (NM_199355, intron 16 of 22) intron (NM_199355, intron 16 of 22) 106571 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 135.5-121 chr2 218825699 218825993 + 0.75 NA intron (NM_017431, intron 10 of 13) AluSc|SINE|Alu 2756 NR_128707 103504730 NR_128707 ENSG00000283639 MIR9500 hsa-mir-9500 microRNA 9500 ncRNA 172-100 chr7 93738254 93738531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21464 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 240.5-77 chr4 83657705 83658384 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121936 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 166.25-49 chr15 27119584 27119869 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 41593 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 134-71 chr17 34148362 34148617 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 8317 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 117-125 chr3 129048458 129048683 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -12197 NM_000174 2815 Hs.1144 NM_000174 ENSG00000169704 GP9 CD42a|GPIX glycoprotein IX platelet protein-coding 329-34 chr5 160028801 160029431 + 0.75 NA intron (NM_003314, intron 2 of 7) L1MC5a|LINE|L1 19977 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 157-47 chr19 29239959 29240395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27026 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 146.25-130 chr6 154628282 154628531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104972 NM_001286194 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 133.75-162 chr5 96766409 96766800 + 0.75 NA intron (NM_001042446, intron 22 of 26) intron (NM_001042446, intron 22 of 26) 23002 NR_104285 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 163.5-131 chr3 150781590 150782111 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -18681 NM_005067 6478 Hs.477959 NM_005067 ENSG00000181788 SIAH2 hSiah2 siah E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 265-40 chr8 85098741 85099205 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -8265 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 161.25-161 chr7 44740119 44740529 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8242 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 135.5-82 chr18 5861684 5861915 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 21104 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 200-25 chr14 23164252 23164599 + 0.75 NA intron (NM_012244, intron 3 of 10) MIRc|SINE|MIR -8967 NM_001267036 23428 Hs.596643 NM_012244 ENSG00000092068 SLC7A8 LAT2|LPI-PC1 solute carrier family 7 member 8 protein-coding 145.5-140 chr4 2129515 2129815 + 0.75 NA intron (NM_181808, intron 17 of 25) AluJo|SINE|Alu 70338 NM_178557 339983 Hs.318529 NM_178557 ENSG00000185818 NAT8L CML3|NACED|NAT8-LIKE N-acetyltransferase 8 like protein-coding 144.5-11 chr1 112251036 112251413 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -144990 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 132.5-194 chr5 51841201 51841642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166610 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 230-54 chr6 15048155 15048695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -197644 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 212.25-33 chr16 8867780 8868266 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001278264) promoter-TSS (NM_001278264) 338 NM_001278263 23589 Hs.632184 NM_014316 ENSG00000153048 CARHSP1 CRHSP-24|CRHSP24|CSDC1 calcium regulated heat stable protein 1 protein-coding 175-10 chr10 8194910 8195192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73254 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 116-8 chr1 209305233 209305437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20121 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 193.75-122 chr8 97709800 97710148 + 0.75 NA intron (NM_001363139, intron 6 of 9) intron (NM_001363139, intron 6 of 9) 65790 NM_001363136 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 129-197 chrX 154852967 154853228 + 0.75 NA intron (NM_019863, intron 4 of 4) L1MB5|LINE|L1 -18435 NM_001162936 100132963 Hs.220762 NM_001162936 ENSG00000203870 SMIM9 CXorf68 small integral membrane protein 9 protein-coding 136-154 chr8 118249647 118249883 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -137946 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 248-66 chr6 122003774 122004104 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -395612 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 138-84 chr20 14286129 14286329 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 51383 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 156.5-63 chr16 73404340 73404685 + 0.75 NA intron (NR_038234, intron 1 of 2) intron (NR_038234, intron 1 of 2) 17707 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 181-59 chr2 196060301 196060643 + 0.75 NA intron (NM_018897, intron 1 of 64) intron (NM_018897, intron 1 of 64) 8365 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 143.75-82 chr2 13924436 13924776 + 0.75 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 476352 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 209.75-78 chr5 125874582 125875242 + 0.75 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -304665 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 114.75-142 chr4 89710045 89710252 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -126253 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 161-12 chr10 55089188 55089623 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -288114 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 133.75-133 chr3 83750987 83751407 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 1118378 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 129.75-195 chr9 91713512 91713749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77285 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 146.75-128 chr5 78463834 78464076 + 0.75 NA intron (NR_110885, intron 7 of 7) intron (NR_110885, intron 7 of 7) 103338 NM_004866 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 151.25-8 chr1 182362479 182362763 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 28783 NM_001033056 2752 Hs.132016 NM_002065 ENSG00000135821 GLUL GLNS|GS|PIG43|PIG59 glutamate-ammonia ligase protein-coding 210.5-79 chr22 24016375 24016836 + 0.75 NA intron (NM_001199281, intron 1 of 36) L1MC4a|LINE|L1 5235 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 112.5-122 chr2 111681371 111681601 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 89648 NR_039928 100616370 NR_039928 ENSG00000264793 MIR4771-1 - microRNA 4771-1 ncRNA 154-2 chr1 52544511 52544750 + 0.75 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) L1MB3|LINE|L1 8460 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 121-135 chr3 147402742 147403155 + 0.75 NA intron (NM_001243256, intron 1 of 3) intron (NM_001243256, intron 1 of 3) 1336 NM_001168378 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 122.5-173 chr5 7454336 7454609 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 58334 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 148.5-203 chr7 4190032 4190368 + 0.75 NA intron (NM_001079653, intron 9 of 19) intron (NM_001079653, intron 9 of 19) -55363 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 187-34 chr18 13724615 13725073 + 0.75 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) AluSg|SINE|Alu 1714 NM_001098801 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 130.75-117 chr3 101238929 101239224 + 0.75 NA intron (NM_016247, intron 14 of 18) L1PA7|LINE|L1 81499 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 184.75-4 chr1 159092219 159092627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15522 NM_001348247 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 237.5-5 chr1 154918818 154919236 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 17692 NM_001348696 10654 Hs.30954 NM_006556 ENSG00000163344 PMVK HUMPMKI|PMK|PMKA|PMKASE|POROK1 phosphomevalonate kinase protein-coding 282.5-8 chr10 32072806 32073521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16738 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 227.75-26 chr15 83816706 83817214 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 5 of 29) AluJb|SINE|Alu 162837 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 137-187 chr9 13550140 13550405 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -118943 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 163.75-20 chr10 57253656 57254003 + 0.75 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 50730 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 116.75-20 chr10 30571959 30572141 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 57703 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 171-10 chr10 30850483 30850866 + 0.75 NA intron (NM_001143766, intron 6 of 7) L2c|LINE|L2 127455 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 258.75-68 chr7 7595432 7596053 + 0.75 NA intron (NR_163250, intron 9 of 11) intron (NR_163250, intron 9 of 11) 27716 NM_001370078 54468 Hs.520215 NM_019005 ENSG00000164654 MIOS MIO|Sea4|Yulink meiosis regulator for oocyte development protein-coding 146.5-132 chr22 27274845 27275045 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35706 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 258.5-20 chr13 61311878 61312239 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 103464 NM_022843 64881 Hs.391781 NM_022843 ENSG00000280165 PCDH20 PCDH13 protocadherin 20 protein-coding 200 chr1 83931162 83931551 + 0.75 NA intron (NM_001350215, intron 8 of 19) intron (NM_001350215, intron 8 of 19) 67776 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 121.25-82 chr17 61812066 61812378 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) intron (NM_032043, intron 6 of 19) 51337 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 113.5-172 chr4 49091784 49091951 + 0.75 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 105225 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 175-4 chr1 89022210 89022693 + 0.75 NA intron (NM_018284, intron 1 of 10) intron (NM_018284, intron 1 of 10) 415 NR_135007 2635 Hs.720167 NM_018284 ENSG00000117226 GBP3 - guanylate binding protein 3 protein-coding 241.25-18 chr12 132249128 132249735 + 0.75 NA intron (NM_001122636, intron 5 of 10) intron (NM_001122636, intron 5 of 10) -25960 NR_024563 100130238 Hs.536338 NR_024563 LOC100130238 - uncharacterized LOC100130238 ncRNA 150.25-157 chr9 22193424 22193782 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -184290 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 261.75-36 chr5 60859116 60859742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15155 NM_001104558 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 143.25-173 chr8 34036002 34036331 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -436060 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 146.75-58 chr16 77503892 77504227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69025 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 159.25-100 chr4 42381576 42381998 + 0.75 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) intron (NR_134668, intron 1 of 1) 9481 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 158.25-137 chr7 55835144 55835377 + 0.75 NA intron (NM_207366, intron 5 of 9) AluYm1|SINE|Alu 27492 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 150.25-141 chr7 26285262 26285667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6414 NM_001362754 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 116.75-92 chr2 30306117 30306272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40452 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 121.5-136 chr2 101623471 101623719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74108 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 114-165 chr9 25013261 25013492 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -467479 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 117.25-61 chr13 83975122 83975470 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92822 NM_001281503 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 177.75-55 chr17 71081245 71081665 + 0.75 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 120724 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 173.75-32 chr11 64930827 64931181 + 0.75 NA intron (NM_006244, intron 8 of 13) AluJo|SINE|Alu 4889 NM_130769 170589 Hs.436119 NM_130769 ENSG00000149735 GPHA2 A2|GPA2|ZSIG51 glycoprotein hormone subunit alpha 2 protein-coding 173-47 chr15 46616393 46616741 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -567522 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 176.5-119 chr3 71254841 71255226 + 0.75 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) -9956 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 156.25-149 chr8 111405393 111405770 + 0.75 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) intron (NR_146282, intron 2 of 3) 28942 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 156-55 chr15 75548072 75548355 + 0.75 NA intron (NM_002833, intron 1 of 12) intron (NM_002833, intron 1 of 12) 31102 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 170.5-11 chr1 116483082 116483315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4372 NR_125972 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 153-118 chr5 37177603 37177870 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 29 of 51) intron (NM_023073, intron 29 of 51) -71310 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 211.25-3 chr1 80742793 80743185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101702 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 130.5-114 chr17 34242695 34243029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12423 NM_002982 6347 Hs.303649 NM_002982 ENSG00000108691 CCL2 GDCF-2|HC11|HSMCR30|MCAF|MCP-1|MCP1|SCYA2|SMC-CF C-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 166.75-118 chr5 103249750 103250204 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -8786 NM_033211 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 150.75-118 chr22 39117856 39118252 + 0.75 NA Intergenic PrimLTR79|LTR|ERV1 20810 NM_001166002 164668 Hs.440515 NM_181773 ENSG00000100298 APOBEC3H A3H|ARP-10|ARP10 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H protein-coding 183.25-43 chr17 61822643 61823035 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) intron (NM_032043, intron 6 of 19) 40720 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 178.75 chr1 17494032 17494401 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45482 NR_137288 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 172.5-12 chr1 162140283 162140606 + 0.75 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) L1PA16|LINE|L1 -16663 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 170-105 chr9 82927818 82928165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 135151 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 131-133 chr5 7642408 7642757 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 4 of 24) L1PA16|LINE|L1 208551 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 121.25-93 chr2 88834590 88834947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22398 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 134.25-198 chr9 28831357 28831648 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 32204 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 171.25-111 chr4 102675549 102675982 + 0.75 NA intron (NM_005908, intron 7 of 16) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 85203 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 138.5-55 chr14 40050400 40050638 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -618019 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 139.25-154 chr5 106184693 106185039 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 826148 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 172.5-167 chr6 50544395 50544719 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -168987 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 127.5-236 chr8 32630621 32630882 + 0.75 NA intron (NM_013960, intron 5 of 12) intron (NM_013960, intron 5 of 12) -15981 NM_013959 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 115.5-46 chr12 118494490 118494853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118116 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 272.25-61 chr8 105859473 105859922 + 0.75 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) intron (NR_125796, intron 2 of 7) 200806 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-32 chr12 114093955 114094395 + 0.75 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -127850 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 224.25-23 chr12 44891342 44891787 + 0.75 NA intron (NM_001145110, intron 1 of 20) intron (NM_001145110, intron 1 of 20) -14714 NM_001145107 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 177.75-93 chr20 53233967 53234435 + 0.75 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) intron (NM_001193421, intron 1 of 2) 48918 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 118.5-94 chr2 47121975 47122257 + 0.75 NA intron (NM_001163561, intron 5 of 6) HAL1|LINE|L1 33192 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 141.5-70 chr16 83445293 83445640 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -62880 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 128.25-195 chr7 99442766 99442947 + 0.75 NA intron (NM_001318162, intron 1 of 7) intron (NM_001318162, intron 1 of 7) 3480 NM_001318162 10898 Hs.489287 NM_006693 ENSG00000160917 CPSF4 CPSF30|NAR|NEB-1|NEB1 cleavage and polyadenylation specific factor 4 protein-coding 224.75-79 chr9 74152304 74152804 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -218977 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 115.5-38 chr12 29542720 29542911 + 0.75 NA intron (NM_001367875, intron 12 of 19) intron (NM_001367875, intron 12 of 19) -43122 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 125-92 chr21 35407057 35407298 + 0.75 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 173587 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 224.75-28 chr14 37975421 37975777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73475 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 229-69 chr7 4188648 4189265 + 0.75 NA intron (NM_001079653, intron 9 of 19) intron (NM_001079653, intron 9 of 19) -54119 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 117.75-71 chr15 96755849 96756100 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 25680 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 169.75-13 chr10 32448362 32448682 + 0.75 NA intron (NR_109827, intron 1 of 8) Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 2382 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 210.5-32 chr13 48591714 48592076 + 0.75 NA Intergenic LTR2B|LTR|ERV1 -10994 NR_051983 100129597 Hs.175225 NR_051983 ENSG00000233610 LINC00462 - long intergenic non-protein coding RNA 462 ncRNA 156.75-165 chr8 129964702 129965101 + 0.75 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) intron (NM_001353256, intron 2 of 13) -25090 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 220.75-22 chr12 122067841 122068330 + 0.75 NA non-coding (NR_135044, exon 3 of 4) non-coding (NR_135044, exon 3 of 4) 4795 NR_135044 100506691 Hs.536336 NR_135044 ENSG00000256546 LOC100506691 - uncharacterized LOC100506691 ncRNA 155.75-59 chr16 5363383 5363641 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 252738 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 197.25-8 chr1 233280457 233280755 + 0.75 NA intron (NM_014801, intron 1 of 33) intron (NM_014801, intron 1 of 33) 15119 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 218.75-93 chr9 111053739 111054092 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -14917 NM_001351399 1902 Hs.126667 NM_001401 ENSG00000198121 LPAR1 EDG2|GPR26|Gpcr26|LPA1|Mrec1.3|VZG1|edg-2|rec.1.3|vzg-1 lysophosphatidic acid receptor 1 protein-coding 119-63 chr17 15373714 15373945 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -32232 NM_031898 64518 Hs.414648 NM_031898 ENSG00000125409 TEKT3 - tektin 3 protein-coding 198-46 chr21 31668051 31668423 + 0.75 NA intron (NM_000454, intron 4 of 4) intron (NM_000454, intron 4 of 4) 8615 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 118.75-106 chr2 125789263 125789449 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 328629 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 157.5-220 chr9 32632538 32632985 + 0.75 NA exon (NM_153809, exon 1 of 1) exon (NM_153809, exon 1 of 1) 2908 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 206.75-64 chr4 81815572 81815892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -343825 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 183-5 chr1 239636377 239636637 + 0.75 NA intron (NM_001347716, intron 4 of 7) intron (NM_001347716, intron 4 of 7) 7434 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 152-152 chr8 133954363 133954608 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 67989 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 150-28 chr12 17222805 17223266 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 234288 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 139.25-204 chr8 139718511 139718810 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -15537 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 132.25-191 chr9 25340846 25341195 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 337838 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 245-33 chr2 228148782 228149121 + 0.75 NA intron (NM_030623, intron 1 of 10) intron (NM_030623, intron 1 of 10) 32694 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 145.75-109 chr4 32659682 32659974 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 308790 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 132.25-59 chr14 51957447 51957739 + 0.75 NA intron (NM_001243773, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 -31953 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 203.75-87 chr5 74750222 74750645 + 0.75 NA intron (NR_104006, intron 7 of 19) intron (NR_104006, intron 7 of 19) 16684 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 151.5-20 chr10 99240762 99241304 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5158 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 168.75-74 chr2 139653216 139653564 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 756066 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 134.5-5 chr1 55559972 55560229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 334459 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 195.25-85 chr7 54566415 54566888 + 0.75 NA intron (NR_038994, intron 2 of 3) intron (NR_038994, intron 2 of 3) 9681 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 151-61 chr2 77497350 77497627 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 24888 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 206-48 chr21 30337359 30337829 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001077711) promoter-TSS (NM_001077711) 100 NM_001077711 643812 Hs.580881 NM_001077711 ENSG00000206107 KRTAP27-1 - keratin associated protein 27-1 protein-coding 134.25-60 chr16 242721 242934 + 0.75 NA intron (NM_032039, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu 8006 NM_001284497 83986 Hs.513225 NM_032039 ENSG00000167930 FAM234A C16orf9|ITFG3|gs19 family with sequence similarity 234 member A protein-coding 130.25-53 chr13 106209739 106209980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166705 NR_163477 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 155.75-81 chr2 74863124 74863338 + 0.75 NA intron (NM_000189, intron 2 of 17) intron (NM_000189, intron 2 of 17) 30576 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 118.25-195 chr8 53995534 53995777 + 0.75 NA intron (NM_201437, intron 2 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 26793 NR_109901 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 185.25-74 chr21 15305487 15306022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -240754 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 147-82 chr2 198070096 198070464 + 0.75 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 265687 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 154.25-127 chr5 44801675 44801960 + 0.75 NA intron (NR_109863, intron 1 of 3) intron (NR_109863, intron 1 of 3) 6976 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 202.25-47 chr21 34174058 34174462 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6417 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 191.5-14 chr10 25677469 25677798 + 0.75 NA intron (NR_108069, intron 3 of 3) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 25921 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 230-51 chr5 146616874 146617239 + 0.75 NA intron (NM_181678, intron 8 of 10) L1MA2|LINE|L1 -100943 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 228.5-11 chr1 189554336 189554807 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 921439 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 190.75-104 chr7 137277382 137277790 + 0.75 NA intron (NM_001321387, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu -8731 NM_001321386 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 175-44 chr15 83870694 83871109 + 0.75 NA exon (NM_001301110, exon 9 of 30) exon (NM_001301110, exon 9 of 30) -209286 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 157.75-83 chr2 60695375 60695824 + 0.75 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -60669 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 247.5-10 chr11 104627727 104628265 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18694 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 118.25-55 chr13 36881384 36881738 + 0.75 NA intron (NM_001127217, intron 1 of 6) intron (NM_001127217, intron 1 of 6) 38677 NM_005905 4093 Hs.123119 NM_005905 ENSG00000120693 SMAD9 MADH6|MADH9|PPH2|SMAD8|SMAD8/9|SMAD8A|SMAD8B SMAD family member 9 protein-coding 230.25-16 chr10 117301336 117301799 + 0.75 NA intron (NM_173791, intron 3 of 4) intron (NM_173791, intron 3 of 4) 60453 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 197-43 chr3 62274169 62274579 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 23 of 29) intron (NM_002841, intron 23 of 29) 44573 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 119.75-43 chr12 39786948 39787165 + 0.75 NA intron (NM_052885, intron 7 of 9) intron (NM_052885, intron 7 of 9) 160873 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 186.5-73 chr2 201015880 201016408 + 0.75 NA intron (NM_001321619, intron 5 of 11) intron (NM_001321619, intron 5 of 11) -52484 NM_006190 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 147.5-3 chr1 19501427 19501679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16014 NM_001206541 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 149-61 chr2 153866517 153866861 + 0.75 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -5233 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 154.5-13 chr1 113421978 113422421 + 0.75 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L1MD2|LINE|L1 31684 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 164.25-102 chr3 112816617 112817126 + 0.75 NA intron (NM_001370552, intron 7 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 14393 NR_149027 100129297 Hs.570655 NR_149026 CD200R1L-AS1 - CD200R1L antisense RNA 1 ncRNA 186.25-7 chr1 151976001 151976341 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 17688 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 181.75-26 chr11 83006919 83007391 + 0.75 NA intron (NM_001286060, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 27119 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 167.25-124 chr5 18585960 18586441 + 0.75 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 778926 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 135-95 chr20 50257864 50258239 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9435 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 202.75-76 chr3 134043761 134044078 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 13729 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 128.75-162 chr6 46890159 46890473 + 0.75 NA intron (NM_001098518, intron 3 of 20) AluJb|SINE|Alu -13155 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 153.5-92 chr2 8358213 8358470 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -29922 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 154.25-173 chr8 131221354 131221644 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -180590 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 129.25-18 chr10 51993336 51993525 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) -293835 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 242-20 chr14 54333817 54334315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62802 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 113.25-93 chr2 86171022 86171270 + 0.75 NA intron (NM_006839, intron 5 of 14) intron (NM_006839, intron 5 of 14) 21962 NR_039939 100616159 NR_039939 ENSG00000265420 MIR4779 - microRNA 4779 ncRNA 130.25-8 chr1 108964063 108964393 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_015127) promoter-TSS (NM_015127) -729 NM_015127 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 127.5-90 chr15 65310342 65310643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5815 NR_002757 26832 NR_002757 ENSG00000200156 RNU5B-1 RNU5B|RNU5B-1P|U5B1 RNA, U5B small nuclear 1 snRNA 129.25-171 chr6 78039526 78039730 + 0.75 NA Intergenic (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 386589 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 129.5-7 chr1 99902397 99902603 + 0.75 NA intron (NM_000028, intron 26 of 33) intron (NM_000028, intron 26 of 33) 51525 NM_000646 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 121.75-95 chr2 239939206 239939515 + 0.75 NA intron (NR_136158, intron 7 of 10) intron (NR_136158, intron 7 of 10) 3734 NR_039949 100616417 NR_039949 ENSG00000264279 MIR4786 mir-4786 microRNA 4786 ncRNA 130.25-163 chr5 113846694 113846897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 333101 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 121.25-157 chr5 28673564 28673829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -253174 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 169.25-26 chr14 45937537 45937911 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -126435 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 148.25-58 chr18 447545 447910 + 0.75 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 52974 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 175-74 chr2 208800509 208800889 + 0.75 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) L1PA3|LINE|L1 258057 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 240-60 chr7 107968989 107969393 + 0.75 NA intron (NM_002291, intron 13 of 33) AluY|SINE|Alu 33970 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 262.5-80 chrX 154496765 154497383 + 0.75 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -6445 NM_019848 8273 Hs.522826 NM_019848 ENSG00000126903 SLC10A3 DXS253E|P3 solute carrier family 10 member 3 protein-coding 151.5-189 chr8 54971618 54971991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130224 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 177.25-104 chr4 20574271 20574529 + 0.75 NA intron (NM_001289135, intron 28 of 35) intron (NM_001289135, intron 28 of 35) 46125 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 139-54 chr17 74254812 74255133 + 0.75 NA intron (NM_001330453, intron 13 of 13) intron (NM_001330453, intron 13 of 13) 6606 NM_052869 94015 Hs.27935 NM_032646 ENSG00000141540 TTYH2 C17orf29 tweety family member 2 protein-coding 251.25-22 chr17 58002037 58002486 + 0.75 NA non-coding (NR_034041, exon 4 of 4) non-coding (NR_034041, exon 4 of 4) 4985 NM_006924 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 136.5-240 chrX 75097613 75097920 + 0.75 NA intron (NM_001271699, intron 3 of 14) intron (NM_001271699, intron 3 of 14) 58517 NM_001271696 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 120-122 chr3 121618579 121618884 + 0.75 NA intron (NM_016298, intron 1 of 3) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 25352 NM_016298 51725 Hs.272564 NM_016298 ENSG00000163833 FBXO40 FBX40 F-box protein 40 protein-coding 124-77 chr19 49925478 49925757 + 0.75 NA intron (NM_001193357, intron 1 of 1) L1MC3|LINE|L1 -3085 NM_012068 22809 Hs.9754 NM_012068 ENSG00000169136 ATF5 ATFX|HMFN0395 activating transcription factor 5 protein-coding 152.75-7 chr1 97461274 97461531 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) LTR48|LTR|ERV1 -335519 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 192.5-30 chr11 119151583 119151927 + 0.75 NA intron (NM_001142505, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR 2166 NM_001142505 64137 Hs.126378 NM_022169 ENSG00000172350 ABCG4 WHITE2 ATP binding cassette subfamily G member 4 protein-coding 155-18 chr10 82865390 82865658 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -632604 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 134.5-103 chr2 124549685 124549996 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 10 of 23) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 524553 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 190.25-40 chr14 83508301 83508643 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 865840 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 272.75 chr1 14838869 14839297 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) -85046 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 168.25-13 chr10 17216080 17216421 + 0.75 NA non-coding (NR_108060, exon 3 of 4) non-coding (NR_108060, exon 3 of 4) 10648 NR_108060 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 175.75-4 chr1 90194004 90194323 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199053 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 162.75-52 chr17 70065098 70065486 + 0.75 NA intron (NR_104129, intron 2 of 2) intron (NR_104129, intron 2 of 2) -9933 NM_001270422 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 199.75-80 chr5 166159984 166160448 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 766154 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 222.75-43 chr14 74506194 74506660 + 0.75 NA intron (NM_000428, intron 27 of 35) intron (NM_000428, intron 27 of 35) 12662 NM_194279 122961 Hs.291079 NM_194279 ENSG00000165898 ISCA2 HBLD1|ISA2|MMDS4|c14_5557 iron-sulfur cluster assembly 2 protein-coding 203.5-22 chr10 81482702 81483064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -392311 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 130.5-68 chr11 122958744 122959074 + 0.75 NA intron (NM_001363089, intron 8 of 8) intron (NM_001363089, intron 8 of 8) 22925 NM_001098169 390259 Hs.449687 NM_001098169 ENSG00000188909 BSX BSX1 brain specific homeobox protein-coding 251.75-20 chr12 87382640 87383090 + 0.75 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 52126 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 190.25-65 chr2 75641524 75641939 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -5052 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 172.5-7 chr1 102957813 102958308 + 0.75 NA intron (NM_001854, intron 41 of 66) intron (NM_001854, intron 41 of 66) 150436 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 128.25-221 chr9 94508320 94508597 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -46587 NR_121569 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 234.5-77 chr5 77196257 77196678 + 0.75 NA intron (NM_001349752, intron 1 of 21) L1MB5|LINE|L1 -13426 NM_001349753 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 122-13 chr1 110273573 110273890 + 0.75 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 63417 NR_036437 3749 Hs.153521 NM_004978 ENSG00000116396 KCNC4 C1orf30|HKSHIIIC|KSHIIIC|KV3.4 potassium voltage-gated channel subfamily C member 4 protein-coding 178.25-42 chr16 51181342 51181701 + 0.75 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) intron (NR_039672, intron 2 of 6) -30249 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 156-37 chr13 36366688 36367073 + 0.75 NA intron (NR_045181, intron 3 of 4) intron (NR_045181, intron 3 of 4) 3300 NM_001142294 23111 Hs.440414 NM_015087 ENSG00000133104 SPART SPG20|TAHCCP1 spartin protein-coding 232.75-57 chr5 145458897 145459270 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 376259 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 148.25-36 chr13 101272259 101272517 + 0.75 NA intron (NM_001350750, intron 9 of 42) intron (NM_001350750, intron 9 of 42) 144120 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 139.75-59 chr15 62514916 62515348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130049 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 223-22 chr12 86454913 86455405 + 0.75 NA intron (NM_013244, intron 1 of 6) intron (NM_013244, intron 1 of 6) -197860 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 132.5-32 chr10 74189556 74189911 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 12970 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 121.5-6 chr1 60522288 60522497 + 0.75 NA intron (NR_146508, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR 100293 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 142.5-190 chr6 84696292 84696580 + 0.75 NA intron (NR_125877, intron 2 of 2) intron (NR_125877, intron 2 of 2) 6978 NR_125876 102724201 Hs.667523 NR_125875 ENSG00000228290 TBX18-AS1 - TBX18 antisense RNA 1 ncRNA 387.75-11 chr2 176696546 176697366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59202 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 114.25-139 chr4 58396603 58396815 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 139619 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 138.75-78 chr18 23598696 23598955 + 0.75 NA TTS (NM_001308238) TTS (NM_001308238) -12319 NM_000271 4864 Hs.464779 NM_000271 ENSG00000141458 NPC1 NPC|POGZ|SLC65A1 NPC intracellular cholesterol transporter 1 protein-coding 134.75-24 chr10 36765840 36766117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -359879 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 151.25-19 chr10 68656602 68656903 + 0.75 NA intron (NM_030625, intron 6 of 11) AluSc8|SINE|Alu -64487 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 172.75-9 chr10 16660856 16661254 + 0.75 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) L1MEd|LINE|L1 -139176 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 199-54 chr3 120365803 120366261 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -16678 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 125-144 chr6 158120603 158120812 + 0.75 NA intron (NM_032861, intron 10 of 16) intron (NM_032861, intron 10 of 16) 47555 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 190.75-114 chr8 129731782 129732130 + 0.75 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -51717 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 132.25-94 chr2 84613132 84613372 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 22 of 76) L2a|LINE|L2 96797 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 124.5-39 chr11 80778721 80779029 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16072 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 195.5-9 chr1 220440228 220440767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87639 NM_018650 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 122.5-187 chr5 131278097 131278313 + 0.75 NA intron (NM_001038702, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 14196 NM_020240 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 136.75-71 chr16 80649231 80649538 + 0.75 NA intron (NM_152342, intron 2 of 6) L1MA2|LINE|L1 -76576 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 121.25-3 chr1 64829819 64830067 + 0.75 NA intron (NM_001366165, intron 11 of 11) intron (NM_001366165, intron 11 of 11) 84868 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 138.75-4 chr1 88738961 88739251 + 0.75 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) intron (NM_001320708, intron 1 of 20) -53902 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 334.5-19 chr3 163963855 163964570 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 207344 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 247.5-2 chr1 159257124 159257669 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -32318 NM_002001 2205 Hs.897 NM_002001 ENSG00000179639 FCER1A FCE1A|FcERI Fc fragment of IgE receptor Ia protein-coding 161.5-180 chr8 18115259 18115553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30445 NM_004315 427 Hs.527412 NM_004315 ENSG00000104763 ASAH1 AC|ACDase|ASAH|PHP|PHP32|SMAPME N-acylsphingosine amidohydrolase 1 protein-coding 121.5-30 chr10 76315860 76316128 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) MER52A|LTR|ERV1 533233 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 137.5-75 chr15 62169170 62169402 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -4001 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 241-30 chr3 21992529 21993174 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 35712 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 120.25-153 chr4 79823049 79823438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4228 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 118.25-139 chr4 67128103 67128291 + 0.75 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 293803 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 133.25-4 chr1 96994126 96994437 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -101642 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 229.25-83 chr8 89170368 89170754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 587150 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 116.75-129 chr3 104480499 104480790 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -886069 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 159.5-163 chr4 81431610 81431974 + 0.75 NA intron (NM_152545, intron 13 of 13) intron (NM_152545, intron 13 of 13) 40115 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 142.25-124 chr4 100586331 100586673 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -68480 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 149.5-204 chr8 96232057 96232364 + 0.75 NA intron (NM_001199975, intron 3 of 4) intron (NM_001199975, intron 3 of 4) 3424 NR_045639 7381 Hs.131255 NM_006294 ENSG00000156467 UQCRB MC3DN3|QCR7|QP-C|QPC|UQBC|UQBP|UQCR6|UQPC ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein protein-coding 119.25-49 chr12 132133587 132133957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10547 NM_175066 317781 Hs.445168 NM_175066 ENSG00000185163 DDX51 - DEAD-box helicase 51 protein-coding 145-102 chr3 167199627 167199933 + 0.75 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 180503 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 132.25-31 chr10 62299068 62299291 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30335 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 117-128 chr3 193793855 193794083 + 0.75 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 50040 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 166.25-124 chr5 35613010 35613446 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -4635 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 255.25-48 chr6 166747698 166748409 + 0.75 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) 114472 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 124-81 chr2 37407191 37407419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62675 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 181.5-99 chr21 29806898 29807409 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 58978 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 164.75-137 chr7 132948186 132948514 + 0.75 NA intron (NM_001317177, intron 4 of 8) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 86565 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 223.25-82 chrX 50604494 50604873 + 0.75 NA intron (NR_027121, intron 6 of 9) intron (NR_027121, intron 6 of 9) -133858 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 154-69 chr2 99310479 99310795 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -5862 NM_001371380 141.75-127 chr4 38644738 38645040 + 0.75 NA intron (NR_026804, intron 1 of 7) intron (NR_026804, intron 1 of 7) -19310 NM_016531 51274 Hs.298658 NM_016531 ENSG00000109787 KLF3 BKLF Kruppel like factor 3 protein-coding 159.5-19 chr10 33863138 33863657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90717 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 234-76 chrX 80971302 80971735 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -161641 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 112.25-26 chr11 18904376 18904610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30509 NM_147199 259249 Hs.711459 NM_147199 ENSG00000170255 MRGPRX1 GPCR|MGRG2|MRGX1|SNSR4 MAS related GPR family member X1 protein-coding 167.25-88 chr2 129663994 129664238 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 213375 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 193.25-35 chr15 57320957 57321314 + 0.75 NA intron (NR_120337, intron 2 of 4) intron (NR_120337, intron 2 of 4) 1997 NR_120337 101928611 Hs.569495 NR_120337 LINC01413 - long intergenic non-protein coding RNA 1413 ncRNA 237.25-67 chr7 49686534 49687027 + 0.75 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -86858 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 155.25-154 chr6 75096918 75097397 + 0.75 NA intron (NM_080645, intron 44 of 50) intron (NM_080645, intron 44 of 50) 31625 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 123.75-27 chr11 75296317 75296509 + 0.75 NA intron (NM_004041, intron 1 of 15) intron (NM_004041, intron 1 of 15) 38773 NR_029891 442900 NR_029891 ENSG00000199090 MIR326 MIRN326|hsa-mir-326|mir-326 microRNA 326 ncRNA 153.75-156 chr9 78684412 78684747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 387454 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 145.5-32 chr11 54910805 54911070 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 204105 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 118.25-8 chr1 57625425 57625674 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 -200628 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 115.25-100 chr2 68039310 68039632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23533 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 161.25-156 chr7 2811933 2812209 + 0.75 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 3159 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 127.75-75 chr16 79521808 79522115 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 78776 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 163.75-8 chr1 110539689 110539911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20625 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 128.25-104 chr2 173650862 173651115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296116 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 120-98 chr2 218455021 218455224 + 0.75 NA intron (NM_020935, intron 25 of 25) intron (NM_020935, intron 25 of 25) 35999 NM_007127 7429 Hs.654595 NM_007127 ENSG00000127831 VIL1 D2S1471|VIL villin 1 protein-coding 199.25-89 chr7 14133706 14134110 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -142483 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 170.75-92 chr3 182675965 182676277 + 0.75 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 -117383 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 205.75-20 chr14 62830728 62831071 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 214559 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 148-5 chr1 85453103 85453450 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 11883 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 141-68 chr2 1720690 1720881 + 0.75 NA intron (NM_012293, intron 1 of 22) MLT2C2|LTR|ERVL 23730 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 175-68 chr2 77508818 77509300 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 13317 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 125.5-200 chr5 38400728 38401008 + 0.75 NA non-coding (NR_102749, exon 2 of 2) non-coding (NR_102749, exon 2 of 2) 2603 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 188.25-70 chr3 9246828 9247159 + 0.75 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) intron (NM_014850, intron 1 of 21) 2653 NM_014850 9901 Hs.654743 NM_014850 ENSG00000196220 SRGAP3 ARHGAP14|MEGAP|SRGAP2|WRP SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3 protein-coding 158.5-131 chr3 72847870 72848194 + 0.75 NA intron (NM_018130, intron 1 of 10) CpG 413 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 118-42 chr14 29820415 29820727 + 0.75 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) L2c|LINE|L2 106525 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 149.75-103 chr20 38409838 38410224 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 15299 NR_002910 26776 Hs.400876 NR_002910 ENSG00000235408 SNORA71B RNU71B|U71b small nucleolar RNA, H/ACA box 71B snoRNA 170.25-88 chr20 63084498 63085072 + 0.75 NA non-coding (NR_033370, exon 4 of 5) non-coding (NR_033370, exon 4 of 5) -16507 NR_003244 768096 Hs.549606 NR_003244 HAR1A HAR1F|LINC00064|NCRNA00064 highly accelerated region 1A ncRNA 151.25-130 chr3 124997446 124997699 + 0.75 NA intron (NM_020733, intron 12 of 16) intron (NM_020733, intron 12 of 16) 58425 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 145.75-124 chr5 50932300 50932685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37695 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 147.25-69 chr2 226891780 226892085 + 0.75 NA intron (NM_001349069, intron 5 of 8) intron (NM_001349069, intron 5 of 8) 55878 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 186.25-64 chr21 30561105 30561462 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_181614) promoter-TSS (NM_181614) 30 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 125.5-151 chr20 46546085 46546316 + 0.75 NA exon (NM_080721, exon 2 of 3) exon (NM_080721, exon 2 of 3) 4454 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 255.25-9 chr10 80558055 80558536 + 0.75 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) L1M4|LINE|L1 17476 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 197.75-98 chr9 71540743 71541189 + 0.75 NA Intergenic Charlie22a|DNA|hAT-Charlie -93995 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 162.25-32 chr11 128614319 128614675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26939 NM_001143820 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 171.25-138 chr7 5231153 5231483 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001033518, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001033518, exon 13 of 13) 17049 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 194.25-38 chr15 86112941 86113270 + 0.75 NA intron (NR_120368, intron 1 of 5) intron (NR_120368, intron 1 of 5) 3612 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 152-75 chr19 35998545 35998798 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 3483 NM_001042631 644096 Hs.356460 NM_001042631 ENSG00000205138 SDHAF1 LYRM8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 1 protein-coding 153.25-17 chr10 81279609 81280013 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -595383 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 146.5-79 chr16 73291088 73291302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95610 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 119.75-105 chr2 78598856 78599107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53450 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 156.5-70 chr19 13279732 13280167 + 0.75 NA intron (NM_023035, intron 22 of 46) AluSx|SINE|Alu 129538 NM_004907 9592 Hs.501629 NM_004907 ENSG00000160888 IER2 ETR101 immediate early response 2 protein-coding 243.75-59 chr4 33881320 33881776 + 0.75 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 158345 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 128.75-159 chr5 146778282 146778656 + 0.75 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 100316 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 198-75 chr8 70914670 70915264 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 245628 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 141.75-72 chr17 51184243 51184454 + 0.75 NA intron (NM_017643, intron 16 of 16) intron (NM_017643, intron 16 of 16) 17626 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 157.25-156 chr8 131992137 131992474 + 0.75 NA intron (NM_001323558, intron 19 of 23) intron (NM_001323558, intron 19 of 23) 67077 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 152-22 chr10 36354222 36354557 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 576087 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 120-171 chr7 37397391 37397651 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) -43853 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 144.75-168 chr7 121805361 121805619 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -67671 NM_001206839 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 157.75-104 chr22 34861087 34861349 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 136698 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 197-38 chr21 29437009 29437406 + 0.75 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -58840 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 163-36 chr14 50683639 50683976 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -15501 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 138.25-144 chr5 175099915 175100209 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -104331 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 195.5-100 chr3 123502072 123502637 + 0.75 NA intron (NM_001329786, intron 4 of 5) intron (NM_001329786, intron 4 of 5) -53809 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 125.75-5 chr1 79143989 79144193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137361 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 239.75-52 chr4 47075458 47076029 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 44176 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 196.5-8 chr1 159289951 159290415 + 0.75 NA intron (NM_002001, intron 1 of 5) LTR78B|LTR|ERV1 469 NM_002001 2205 Hs.897 NM_002001 ENSG00000179639 FCER1A FCE1A|FcERI Fc fragment of IgE receptor Ia protein-coding 192-25 chr11 18506051 18506486 + 0.75 NA intron (NM_006292, intron 6 of 9) intron (NM_006292, intron 6 of 9) 20674 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 135-192 chr9 20850735 20851105 + 0.75 NA intron (NM_017794, intron 17 of 45) L2b|LINE|L2 63993 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 211.5-15 chr10 52515203 52515542 + 0.75 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -44839 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 151.75-78 chr20 25355965 25356294 + 0.75 NA intron (NM_001042472, intron 1 of 12) intron (NM_001042472, intron 1 of 12) 34706 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 154-71 chr2 106936525 106936893 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -49600 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 234.75-73 chr7 37857489 37857883 + 0.75 NA intron (NM_016616, intron 6 of 17) intron (NM_016616, intron 6 of 17) 9089 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 122.75-164 chr5 73818956 73819184 + 0.75 NA intron (NM_001244364, intron 1 of 27) intron (NM_001244364, intron 1 of 27) 5524 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 122.5-107 chr2 41937689 41937994 + 0.75 NA non-coding (NR_161189, exon 4 of 4) non-coding (NR_161189, exon 4 of 4) -4118 NR_110263 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 218.75-91 chr8 134129306 134129723 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 243018 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 179.75-110 chr5 146313460 146313892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25163 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 229.75-30 chr2 11876285 11876637 + 0.75 NA Intergenic MER67A|LTR|ERV1 -39475 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 119-155 chr5 155009402 155009643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4233 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 212-26 chr15 56557253 56557662 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -92320 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 176.5-30 chr11 86778784 86779156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12101 NM_001293180 11098 Hs.25338 NM_007173 ENSG00000150687 PRSS23 SIG13|SPUVE|ZSIG13 serine protease 23 protein-coding 190.75-26 chr14 21798033 21798485 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -127242 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 118-187 chr8 102057720 102058059 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 66445 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 127-190 chr9 128549345 128549680 + 0.75 NA intron (NR_031672, intron 2 of 2).4 AluSz|SINE|Alu -3075 NM_001363765 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 278.75-17 chr2 21411115 21411515 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 287329 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 177.25-67 chr2 21127932 21128290 + 0.75 NA intron (NM_001306137, intron 2 of 3) intron (NM_001306137, intron 2 of 3) 4125 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 139-140 chr7 47399127 47399536 + 0.75 NA intron (NM_022748, intron 15 of 30) L1PB|LINE|L1 65472 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 141-110 chr3 193647994 193648251 + 0.75 NA exon (NM_130834, exon 19 of 30) exon (NM_130834, exon 19 of 30) -20790 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 249.5-73 chr4 115261837 115262244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -148420 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 174-73 chr5 23236095 23236526 + 0.75 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -271299 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 127-145 chr5 157892574 157892880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33582 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 125-118 chr4 95090688 95091001 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001256794) promoter-TSS (NM_001256794) -647 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 126.5-54 chr12 96635590 96635778 + 0.75 NA intron (NM_001306084, intron 32 of 67) MER21C|LTR|ERVL 146107 NM_001306084 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 191-77 chr8 58284302 58284642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12371 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 208.75-21 chr12 42460545 42460903 + 0.75 NA intron (NM_001144881, intron 7 of 7) intron (NM_001144881, intron 7 of 7) 22891 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 132.75-161 chr6 20894520 20894844 + 0.75 NA intron (NM_017774, intron 9 of 15) intron (NM_017774, intron 9 of 15) 360225 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 119.25-177 chr6 86317707 86317949 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -619700 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 240-11 chr10 110299273 110299847 + 0.75 NA intron (NM_005871, intron 2 of 5) intron (NM_005871, intron 2 of 5) 5360 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 134-70 chr17 30940597 30940807 + 0.75 NA intron (NR_144488, intron 4 of 9) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 18757 NM_018404 55803 Hs.514063 NM_018404 ENSG00000184060 ADAP2 CENTA2|HSA272195|cent-b ArfGAP with dual PH domains 2 protein-coding 143.5-137 chr22 19052659 19052938 + 0.75 NA intron (NM_001184781, intron 6 of 9) L1MD1|LINE|L1 -4423 NR_024157 25786 Hs.720269 NR_024157 ENSG00000273311 DGCR11 DGS-D DiGeorge syndrome critical region gene 11 ncRNA 137-133 chr5 27154480 27154723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116015 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 226-21 chr15 34706897 34707327 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 47886 NM_020660 57369 Hs.283816 NM_020660 ENSG00000159248 GJD2 CX36|GJA9 gap junction protein delta 2 protein-coding 115-88 chr2 100515684 100515989 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 45354 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 244.25-29 chr22 32401323 32401846 + 0.75 NA intron (NM_014306, intron 5 of 11) intron (NM_014306, intron 5 of 11) 10663 NM_014306 51493 Hs.474643 NM_014306 ENSG00000100220 RTCB C22orf28|DJ149A16.6|FAAP|HSPC117 RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase protein-coding 127.25-35 chr11 84332081 84332272 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -14837 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 176.75-51 chr18 783910 784173 + 0.75 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 28201 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 173.75-14 chr1 166856440 166856752 + 0.75 NA TTS (NM_053053) TTS (NM_053053) 17121 NM_017542 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 205.75-6 chr1 234309652 234310025 + 0.75 NA intron (NM_173508, intron 4 of 7) intron (NM_173508, intron 4 of 7) 3371 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 147-89 chr22 27211575 27211984 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 12900 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 117.75-163 chr4 111266605 111266854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -406082 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 175.25-22 chr11 20139066 20139379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21253 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 221.75-65 chr6 41368855 41369225 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33432 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 160.25-17 chr11 123030040 123030488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12698 NR_027288 341056 Hs.620309 NR_027288 LOC341056 - SUMO1 activating enzyme subunit 1 pseudogene pseudo 139-17 chr10 56002768 56003014 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 358368 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 127.25-108 chr20 44974098 44974486 + 0.75 NA non-coding (NR_147974, exon 4 of 4) non-coding (NR_147974, exon 4 of 4) 7780 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 154-31 chr11 93509687 93510114 + 0.75 NA intron (NM_020179, intron 1 of 2) L1PB1|LINE|L1 33491 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 159.5-16 chr10 12673063 12673418 + 0.75 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) L1MB8|LINE|L1 -20043 NR_039701 100616320 NR_039701 ENSG00000283699 MIR4481 - microRNA 4481 ncRNA 206.75-8 chr11 19364171 19364517 + 0.75 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 13620 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 162.75-114 chr5 29779573 29779880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100834 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 159.75-146 chr6 35456787 35457149 + 0.75 NA intron (NM_021922, intron 2 of 9) intron (NM_021922, intron 2 of 9) 4607 NM_021922 2178 Hs.302003 NM_021922 ENSG00000112039 FANCE FACE|FAE FA complementation group E protein-coding 112.5-51 chr12 28831453 28831673 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -317715 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 145.75-69 chr2 7955253 7955509 + 0.75 NA intron (NR_015405, intron 2 of 2) intron (NR_015405, intron 2 of 2) 21433 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 204.75-29 chr12 636358 636938 + 0.75 NA intron (NR_122124, intron 3 of 4) L1MB4|LINE|L1 5757 NR_122124 100049716 Hs.655804 NR_122124 ENSG00000177406 LOC100049716 - uncharacterized LOC100049716 ncRNA 186.5-7 chr1 163009543 163009866 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -58902 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 202.25-17 chr11 102002625 102003116 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -44567 NM_032930 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 143-13 chr11 2186424 2186641 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13469 NR_039834 100616126 NR_039834 ENSG00000265258 MIR4686 - microRNA 4686 ncRNA 159-98 chr7 31206693 31207001 + 0.75 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 133879 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 143-109 chr5 2471016 2471315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158964 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 137.25-115 chr4 125468204 125468544 + 0.75 NA intron (NM_001291303, intron 10 of 16) intron (NM_001291303, intron 10 of 16) -38885 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 150.75-124 chr3 15438761 15438977 + 0.75 NA intron (NM_033083, intron 5 of 5) intron (NM_033083, intron 5 of 5) 11271 NM_033083 85403 Hs.716733 NM_033083 ENSG00000144597 EAF1 - ELL associated factor 1 protein-coding 226.75-79 chr8 138830057 138830467 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 5 of 64) MIRc|SINE|MIR 83779 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 169.75-111 chr4 2712051 2712293 + 0.75 NA intron (NM_001256666, intron 18 of 19) intron (NM_001256666, intron 18 of 19) 44164 NM_024309 79155 Hs.368551 NM_024309 ENSG00000168884 TNIP2 ABIN2|FLIP1|KLIP TNFAIP3 interacting protein 2 protein-coding 113.25 chr1 14588177 14588510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10342 NM_201628 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 116.25-245 chr9 87245191 87245370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96636 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 188.75-96 chr6 65956801 65957262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 169152 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 196-103 chrX 55215643 55216018 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -4516 NM_130467 90737 Hs.668491 NM_130467 ENSG00000158639 PAGE5 CT16|CT16.1|CT16.2|GAGEE1|PAGE-5 PAGE family member 5 protein-coding 203.25-37 chr14 74405617 74406064 + 0.75 NA TTS (NM_001105579) TTS (NM_001105579) 20370 NM_001105579 646658 Hs.12400 NM_001105579 ENSG00000183379 SYNDIG1L CAPUCIN|DSPC1|IFITMD4|TMEM90A synapse differentiation inducing 1 like protein-coding 158.75-123 chr4 42006897 42007123 + 0.75 NA intron (NM_006345, intron 2 of 17) intron (NM_006345, intron 2 of 17) 16480 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 211.5-81 chr2 118644369 118644831 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41634 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 232.75-17 chr12 38978246 38978846 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -72955 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 180-73 chr20 54009152 54009701 + 0.75 NA intron (NM_001366297, intron 4 of 8) L1MD1|LINE|L1 49594 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 166.25-32 chr11 46210088 46210401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38289 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 132.75-142 chr4 113608853 113609188 + 0.75 NA intron (NM_001221, intron 4 of 18) intron (NM_001221, intron 4 of 18) 152718 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 138.5-14 chr1 112443943 112444188 + 0.75 NA intron (NM_018704, intron 3 of 5) intron (NM_018704, intron 3 of 5) 17768 NR_036210 100422976 NR_036210 ENSG00000283296 MIR4256 - microRNA 4256 ncRNA 140.75-8 chr1 185895672 185895888 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 4 of 106) intron (NM_031935, intron 4 of 106) 161389 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 113.75-41 chr12 12426223 12426499 + 0.75 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 69283 NM_058169 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 146-98 chr4 89159520 89159933 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 46909 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 162.5-149 chr6 26504923 26505387 + 0.75 NA exon (NM_001732, exon 4 of 8) exon (NM_001732, exon 4 of 8) 4852 NM_001732 696 Hs.153058 NM_001732 ENSG00000124557 BTN1A1 BT|BTN|BTN1 butyrophilin subfamily 1 member A1 protein-coding 176.25-140 chr8 129741351 129741661 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 45118 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 139-75 chr2 69638640 69638961 + 0.75 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 4939 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 131.75-12 chr1 93742825 93743047 + 0.75 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) intron (NM_001261408, intron 2 of 13) 32447 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 267.25-17 chr17 53387564 53388109 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 402331 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 172.5-38 chr11 31731644 31731983 + 0.75 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) L1MB1|LINE|L1 68848 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 143.75-3 chr1 56926831 56927111 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39044 NM_000066 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 117.25-36 chr11 32170564 32170932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26836 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 153.5-124 chr22 29136105 29136317 + 0.75 NA intron (NM_001039570, intron 5 of 8) AluSx|SINE|Alu 63176 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 163-65 chr21 27023871 27024228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56961 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 140.75-30 chr11 102634477 102634716 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -9264 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 135.25-44 chr11 95811713 95812014 + 0.75 NA intron (NM_014679, intron 2 of 10) intron (NM_014679, intron 2 of 10) 21365 NM_014679 9702 Hs.101014 NM_014679 ENSG00000166037 CEP57 MVA2|PIG8|TSP57 centrosomal protein 57 protein-coding 228-48 chr3 7913463 7913800 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 102676 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 142.5-69 chr15 67366123 67366412 + 0.75 NA intron (NM_001031715, intron 8 of 20) intron (NM_001031715, intron 8 of 20) -111069 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 170.75-10 chr10 16997729 16997963 + 0.75 NA intron (NM_001081, intron 28 of 66) intron (NM_001081, intron 28 of 66) 131971 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 140.75-82 chr2 48863838 48864097 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -108243 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 121.75-160 chr6 88775652 88775963 + 0.75 NA intron (NM_001286428, intron 10 of 13) L1MA9|LINE|L1 187811 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 120.5-177 chr5 27566862 27567159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94718 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 187.75-5 chr1 80369194 80369495 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -166411 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 149 chr1 33225132 33225391 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -31231 NM_152493 149076 Hs.743358 NM_152493 ENSG00000160094 ZNF362 RN|lin-29 zinc finger protein 362 protein-coding 131-46 chr14 26080784 26081074 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 472501 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 170.75-77 chr20 24852610 24853037 + 0.75 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -96446 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 133.5-73 chr13 40372892 40373173 + 0.75 NA intron (NR_024506, intron 5 of 5) intron (NR_024506, intron 5 of 5) 107974 NR_024505 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 226.75-13 chr11 131614253 131614737 + 0.75 NA intron (NM_001352003, intron 1 of 8) intron (NM_001352003, intron 1 of 8) 49061 NR_126159 101929637 Hs.730330 NM_207432 ENSG00000224795 NTM-AS1 C11orf39 NTM antisense RNA 1 ncRNA 202.5-57 chr17 49954743 49955344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14147 NM_138281 1748 Hs.591167 NM_001934 ENSG00000108813 DLX4 BP1|DLX7|DLX8|DLX9|OFC15 distal-less homeobox 4 protein-coding 150.5-63 chr16 62821413 62821674 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -785105 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 215.25-39 chr18 1726372 1726849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -366981 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 238.25-60 chr4 115466073 115466537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -352685 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 204-55 chr4 30355129 30355660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -364975 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 160.25-124 chr5 45382814 45383241 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 313353 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 167.25-138 chr6 124474031 124474479 + 0.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L1MC4|LINE|L1 191250 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 170.5-177 chr7 74469966 74470295 + 0.75 NA intron (NM_016328, intron 1 of 26) AluJb|SINE|Alu 16224 NM_016328 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 154.25-52 chr14 77432287 77432689 + 0.75 NA intron (NM_001193315, intron 16 of 19) L1MA7|LINE|L1 -9432 NM_001113475 122945 Hs.97556 NM_138791 ENSG00000165555 NOXRED1 C14orf148 NADP dependent oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 247.75-55 chr6 93918147 93918652 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 200096 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 144.75-5 chr1 81349614 81349965 + 0.75 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) intron (NM_001366003, intron 2 of 27) 43394 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 200.25-108 chr8 43675972 43676461 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 383774 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 154.25-167 chr8 62346201 62346661 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 97577 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 118.25-47 chr11 114184414 114184695 + 0.75 NA intron (NM_001354752, intron 2 of 4) intron (NM_001354752, intron 2 of 4) -111259 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 159.75-88 chr2 153380617 153381005 + 0.75 NA Intergenic (TGTATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 97951 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 213-98 chr8 131750741 131751409 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -153018 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 260.25-12 chr11 99970105 99970637 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 7 of 23) intron (NM_001243270, intron 7 of 23) 414226 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 205-29 chr18 22847991 22848431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61374 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 226.75-68 chr7 48899103 48899527 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -25232 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 196.25-29 chr13 65453184 65453614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -412648 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 177.75-142 chr8 125351715 125352137 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) AluSx1|SINE|Alu -78432 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 120.75-53 chr15 63710556 63710790 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 24 of 77) L2a|LINE|L2 -109846 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-76 chr4 28502905 28503296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -316482 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 128.5-67 chr14 103724895 103725068 + 0.75 NA intron (NM_024071, intron 1 of 6) intron (NM_024071, intron 1 of 6) 9237 NM_001198953 79038 Hs.592322 NM_024071 ENSG00000100711 ZFYVE21 HCVP7TP1|ZF21 zinc finger FYVE-type containing 21 protein-coding 158-17 chr1 189822701 189822932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 653194 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 195-6 chr1 231773849 231774274 + 0.75 NA intron (NM_001164547, intron 6 of 7) AluJr4|SINE|Alu 44456 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 119-65 chr17 64173452 64173677 + 0.75 NA intron (NM_018469, intron 6 of 11) intron (NM_018469, intron 6 of 11) 27225 NR_002995 677842 Hs.405444 NR_002995 ENSG00000277887 SNORA50C ACA62|SNORA76|SNORA76C small nucleolar RNA, H/ACA box 50C snoRNA 186.75-46 chr2 30282986 30283356 + 0.75 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 51637 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 148.5-37 chr11 115284840 115285075 + 0.75 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -48620 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 179.25-64 chr17 72182209 72182524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61346 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 133.75-145 chr4 25327100 25327424 + 0.75 NA intron (NM_001318148, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 14488 NM_024936 29063 Hs.278945 NM_024936 ENSG00000168228 ZCCHC4 HSPC052|ZGRF4 zinc finger CCHC-type containing 4 protein-coding 186.75-81 chr4 124621382 124621869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63191 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 140.25-5 chr1 60430323 60430710 + 0.75 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 192169 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 222.75-56 chr2 19404818 19405311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46441 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 144.25-54 chr14 47440085 47440429 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -97011 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 167.5-56 chr13 102167332 102167631 + 0.75 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) -121477 NR_039854 100616239 NR_039854 ENSG00000264482 MIR4705 - microRNA 4705 ncRNA 135.75-21 chr10 44618301 44618533 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -233320 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 135-159 chr6 133261075 133261329 + 0.75 NA intron (NM_172103, intron 1 of 18) intron (NM_172103, intron 1 of 18) 19703 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 112.75-132 chr3 6790586 6790799 + 0.75 NA intron (NR_110125, intron 2 of 3) intron (NR_110125, intron 2 of 3) 14757 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 125-150 chr7 89874413 89874738 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -244825 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 248 chr1 11215905 11216323 + 0.75 NA intron (NM_004958, intron 20 of 57) intron (NM_004958, intron 20 of 57) 26759 NM_021146 10218 Hs.146559 NM_021146 ENSG00000171819 ANGPTL7 AngX|CDT6|dJ647M16.1 angiopoietin like 7 protein-coding 197.75-24 chr14 64475823 64476394 + 0.75 NA intron (NM_001304508, intron 2 of 2) intron (NM_001304508, intron 2 of 2) 10609 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 187.75-97 chr5 172896339 172896605 + 0.75 NA intron (NM_001031711, intron 2 of 9) intron (NM_001031711, intron 2 of 9) -18611 NR_162113 113218510 NR_162113 MIR10523 - microRNA 10523 ncRNA 131.5-97 chr19 1673007 1673257 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20517 NM_003200 6929 Hs.371282 NM_003200 ENSG00000071564 TCF3 AGM8|E2A|E47|ITF1|TCF-3|VDIR|bHLHb21|p75 transcription factor 3 protein-coding 114.5-187 chr4 44512798 44513021 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -64100 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 123.25-151 chr4 132305455 132305657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -285533 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 130.25-199 chr8 87236487 87236716 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 5 of 10) intron (NM_173538, intron 5 of 10) 370186 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 133.75-10 chr1 195782641 195782869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 305960 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 182.5-7 chr1 165002415 165002720 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -227926 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 187-56 chr21 24738135 24738455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102255 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 245.75-22 chr16 69686205 69686619 + 0.75 NA intron (NM_173215, intron 11 of 13) AluJb|SINE|Alu 22263 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 116.25-201 chr6 135258614 135258800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19547 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 180.75-158 chr9 106599660 106600063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1067 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 309.5-35 chr5 9983480 9984074 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79953 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 172.5-29 chr10 55078161 55078532 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MA4A|LINE|L1 -277055 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 125.75-83 chr2 33691018 33691290 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -15732 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 175-11 chr10 31016319 31016690 + 0.75 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 15433 NR_026560 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 127.25-86 chr2 54764429 54764649 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) intron (NM_001039753, intron 1 of 40) 39527 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 222.75-19 chr10 65437401 65437801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133824 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 121-13 chr1 191189058 191189362 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 39288 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 127.5-252 chr8 136013458 136013723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -517208 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 168-22 chr11 10545778 10546095 + 0.75 NA intron (NR_034094, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 4700 NR_034093 100129827 Hs.246769 NR_034093 ENSG00000177112 MRVI1-AS1 - MRVI1 antisense RNA 1 ncRNA 171.5-98 chr22 41758701 41759028 + 0.75 NA intron (NM_152513, intron 18 of 30) AluSz|SINE|Alu -41758 NM_001304797 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 148.75-174 chr8 137446143 137446431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32699 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 135-33 chr12 77756024 77756425 + 0.75 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -74670 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 138-102 chr3 54661360 54661699 + 0.75 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) intron (NM_018398, intron 11 of 37) -21672 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 156-156 chr8 121087007 121087380 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -275147 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 119.5-263 chrX 96993752 96993955 + 0.75 NA intron (NM_007309, intron 17 of 26) L2c|LINE|L2 109945 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 132-149 chr6 73171287 73171556 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 11 of 13) intron (NM_001160132, intron 11 of 13) -27907 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 140-58 chr17 39846859 39847253 + 0.75 NA intron (NM_012481, intron 1 of 7) intron (NM_012481, intron 1 of 7) 17132 NM_001284514 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 116.25-68 chr14 59760005 59760239 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L1ME4b|LINE|L1 110654 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 155-107 chr5 19524604 19524910 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 9 of 12) AluY|SINE|Alu 361515 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 170.25-87 chr20 53241666 53242060 + 0.75 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 56580 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 159.5-121 chr20 7000523 7000788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232969 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 299.75-23 chr6 75044883 75045648 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 83517 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 142.75-161 chr5 127547551 127548001 + 0.75 NA intron (NM_130809, intron 7 of 8) intron (NM_130809, intron 7 of 8) 30136 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 116.25-208 chr7 26162346 26162618 + 0.75 NA intron (NM_004289, intron 1 of 3) L1MC5a|LINE|L1 10284 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 217.75-10 chr10 25746093 25746552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94610 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 189.75-110 chr7 31898844 31899228 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 171371 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 114-84 chr2 223589998 223590216 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 12254 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 129-143 chr5 84810371 84810646 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -425628 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 129-38 chr11 77383883 77384272 + 0.75 NA intron (NM_001128620, intron 2 of 15) L2b|LINE|L2 -82411 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 113-10 chr1 180432379 180432542 + 0.75 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) L1MC2|LINE|L1 5930 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 155.75-74 chr18 73859712 73859919 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 288019 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 125.25-127 chr22 28515808 28516011 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSq2|SINE|Alu 56040 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 155-37 chr14 53018989 53019239 + 0.75 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -68017 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 131-112 chr21 27794163 27794492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71948 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 124-70 chr18 8258560 8258894 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 108307 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 145.75-60 chr17 18236375 18236720 + 0.75 NA intron (NM_004140, intron 11 of 22) L2b|LINE|L2 10912 NM_004140 3996 Hs.513983 NM_004140 ENSG00000131899 LLGL1 DLG4|HUGL|HUGL-1|HUGL1|LLGL|Lgl1|Mgl1 LLGL scribble cell polarity complex component 1 protein-coding 239.5-22 chr13 32481358 32481970 + 0.75 NA intron (NM_001320836, intron 6 of 9) intron (NM_001320836, intron 6 of 9) 16828 NR_051980 100462953 Hs.687692 NR_051980 MICOS10P1 CG012|MINOS1P1|N4BP2L2-IT|N4BP2L2-IT1|N4BP2L2IT1 MICOS10 pseudogene 1 pseudo 119.25-35 chr11 32920657 32920892 + 0.75 NA intron (NM_001076786, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 27963 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 154.5-114 chr20 38366784 38367129 + 0.75 NA intron (NM_004139, intron 9 of 14) intron (NM_004139, intron 9 of 14) 20474 NM_004139 3929 Hs.154078 NM_004139 ENSG00000129988 LBP BPIFD2 lipopolysaccharide binding protein protein-coding 163-94 chr5 40913864 40914255 + 0.75 NA intron (NM_000587, intron 1 of 17) AluJb|SINE|Alu 4562 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 171.25-7 chr1 161370997 161371435 + 0.75 NA non-coding (NR_103459, exon 7 of 7) non-coding (NR_103459, exon 7 of 7) -3333 NM_001013625 257177 Hs.534593 NM_001013625 ENSG00000188931 CFAP126 C1orf192|Flattop|Fltp cilia and flagella associated protein 126 protein-coding 116.25-28 chr11 7354716 7354999 + 0.75 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) intron (NM_175733, intron 3 of 6) 102953 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 144.75-97 chr2 224707182 224707516 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -121952 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 169.25-112 chr7 53226772 53227204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 191355 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 220-74 chr9 33877493 33878020 + 0.75 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) intron (NM_017811, intron 1 of 4) 56608 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 134-168 chr8 81220010 81220296 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -60383 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 149.5-12 chr1 190606690 190606989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18051 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 134.25-170 chr7 7360644 7360893 + 0.75 NA intron (NM_001037763, intron 33 of 34) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 105614 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 127.25-26 chr10 91000058 91000316 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32979 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 158-123 chr6 130918693 130919066 + 0.75 NA intron (NM_001350320, intron 2 of 15) intron (NM_001350320, intron 2 of 15) 51604 NM_001350310 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 141.75-173 chr8 133226341 133226560 + 0.75 NA intron (NM_003882, intron 4 of 4) (TTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35411 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 154.75-153 chr9 12617222 12617676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75936 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 173-113 chr5 112223218 112223528 + 0.75 NA intron (NM_001347887, intron 12 of 23) intron (NM_001347887, intron 12 of 23) -4910 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 157.75-180 chr9 33193131 33193462 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 25437 NR_108108 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 170.5-184 chr8 66477453 66477965 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -15857 NM_152765 254778 Hs.268869 NM_152765 ENSG00000169085 VXN C8orf46 vexin protein-coding 158.75-118 chr3 143100945 143101267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18665 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 120-34 chr13 80921884 80922160 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96369 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 124-116 chr3 142474866 142475090 + 0.75 NA intron (NM_001354579, intron 35 of 45) L1ME3F|LINE|L1 -26916 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 144-35 chr14 52980753 52981024 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -29791 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 187.25-6 chr1 194515009 194515492 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 1210505 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 177.75-67 chr2 54241949 54242433 + 0.75 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 14038 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 125.5-105 chr17 31337054 31337287 + 0.75 NA intron (NM_001042492, intron 42 of 57) intron (NM_001042492, intron 42 of 57) -15548 NM_014210 2123 Hs.591198 NM_014210 ENSG00000126860 EVI2A EVDA|EVI-2A|EVI2 ecotropic viral integration site 2A protein-coding 124.25-7 chr1 73497203 73497474 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -177341 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 206.25-97 chr6 132878116 132878522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61100 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 150.5-209 chr7 154824970 154825303 + 0.75 NA intron (NR_157196, intron 16 of 25) intron (NR_157196, intron 16 of 25) -103381 NR_024477 100132707 Hs.586358 NR_024476 ENSG00000214106 PAXIP1-AS2 PAXIP1OS PAXIP1 antisense RNA 2 ncRNA 312.5-34 chr8 91705411 91705939 + 0.75 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 312005 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 164.5-19 chr10 44757965 44758352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153158 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 174.5-77 chr16 77988012 77988302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34391 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 144.5-156 chr4 105420203 105420446 + 0.75 NA intron (NM_176867, intron 1 of 5) FLAM_C|SINE|Alu 53738 NM_176869 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 137.75-146 chr4 8416046 8416248 + 0.75 NA intron (NM_003501, intron 2 of 17) intron (NM_003501, intron 2 of 17) 24576 NM_003501 8310 Hs.479122 NM_003501 ENSG00000087008 ACOX3 - acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl protein-coding 124.75-14 chr1 154906534 154906882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30011 NM_001348696 10654 Hs.30954 NM_006556 ENSG00000163344 PMVK HUMPMKI|PMK|PMKA|PMKASE|POROK1 phosphomevalonate kinase protein-coding 248-46 chr3 44942247 44942883 + 0.75 NA intron (NR_146162, intron 3 of 6) intron (NR_146162, intron 3 of 6) 33609 NM_001349379 51304 Hs.61430 NM_016598 ENSG00000163812 ZDHHC3 DHHC-3|DHHC3|GODZ|ZNF373 zinc finger DHHC-type containing 3 protein-coding 290-16 chr14 69847368 69847854 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -31805 NM_001034852 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 162.25-35 chr12 50268369 50268638 + 0.75 NA intron (NM_016357, intron 1 of 10) intron (NM_016357, intron 1 of 10) 15017 NM_001113546 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 177.5-142 chr5 66784140 66784440 + 0.75 NA intron (NM_001290228, intron 2 of 4) intron (NM_001290228, intron 2 of 4) -44483 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 161.25-182 chr9 72430405 72430779 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -65384 NM_001102421 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 118.25-150 chr5 26849097 26849343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 189366 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 179.75-146 chrX 118004955 118005338 + 0.75 NA intron (NM_001168303, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger -19733 NM_001168299 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 134-77 chr18 1634157 1634541 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -274720 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 246.75-47 chr4 35919761 35920331 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 323893 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 276.75-56 chrX 45355052 45355603 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -150061 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 126-91 chr2 34811446 34811757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134044 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 131-16 chr1 213751156 213751399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173472 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 115-42 chr12 74162501 74162781 + 0.75 NA intron (NR_038300, intron 4 of 6) intron (NR_038300, intron 4 of 6) 129990 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 155-98 chr4 91750394 91750658 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 526776 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 137.75-204 chr8 101522855 101523237 + 0.75 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu 30607 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 206.5-28 chr15 23655562 23655944 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -7886 NM_019066 54551 Hs.141496 NM_019066 ENSG00000254585 MAGEL2 NDNL1|PWLS|SHFYNG|nM15 MAGE family member L2 protein-coding 120.25-229 chrX 95221395 95221765 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -158354 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 146-30 chr12 117799870 117800138 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) intron (NM_173598, intron 3 of 19) 168986 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 192-12 chr1 230120145 230120445 + 0.75 NA intron (NM_004481, intron 1 of 15) intron (NM_004481, intron 1 of 15) 53057 NM_004481 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 149.25-50 chr14 95964420 95964845 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74692 NM_001282464 56967 Hs.6434 NM_020215 ENSG00000227051 C14orf132 C14orf88 chromosome 14 open reading frame 132 protein-coding 143.25-158 chr6 69043176 69043422 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 13 of 31) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 408017 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 119.25-116 chr22 28617009 28617311 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 62705 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 139.75-57 chr15 27014816 27015092 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) L1MB1|LINE|L1 43773 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 396.25-16 chr8 80638001 80638919 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 152234 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 113.25-80 chr2 4198568 4198787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 224516 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 130.5-165 chr3 83114677 83114975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1128684 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 188-37 chr2 67669370 67669874 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 155940 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 150.75-128 chr3 66411110 66411442 + 0.75 NA intron (NM_015541, intron 6 of 18) intron (NM_015541, intron 6 of 18) 89145 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 160.75-68 chr2 45582561 45582974 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 5 of 20) L1MC4|LINE|L1 28500 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 150.25-11 chr1 174906351 174906616 + 0.75 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) AluSx1|SINE|Alu 30965 NM_001035230 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 142-166 chr8 123257237 123257542 + 0.75 NA intron (NM_001017926, intron 2 of 3) intron (NM_001017926, intron 2 of 3) -16012 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 198.25-74 chr4 58016026 58016344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 520143 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 119.5-179 chr5 66429550 66429738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 81960 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 232-11 chr11 57982946 57983535 + 0.75 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -40641 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 174.25-154 chrX 71432092 71432546 + 0.75 NA intron (NR_104387, intron 32 of 39) intron (NR_104387, intron 32 of 39) 60130 NR_002226 27160 Hs.721806 NR_002226 ENSG00000243468 INGX ING1-like|ING2 inhibitor of growth family, X-linked (pseudogene) pseudo 146.25-107 chr4 27354303 27354535 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 136940 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 222.5-119 chrX 57880712 57881146 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 29704 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 266-53 chrX 4927025 4927630 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -293755 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 183.25-87 chr5 145293932 145294273 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 541240 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 120.25-110 chr20 41691383 41691592 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -73110 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 164.25-156 chr8 125288764 125289162 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) AluJb|SINE|Alu -141395 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 146-111 chr6 5873139 5873503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130723 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 154.5-166 chr6 150967554 150967905 + 0.75 NA intron (NM_001350486, intron 19 of 27) L2a|LINE|L2 -39279 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 179.75-55 chr2 47742218 47742561 + 0.75 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 -40693 NM_001281493 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 117.75-160 chr4 104817234 104817479 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -322462 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 196-30 chr14 90137763 90138196 + 0.75 NA intron (NM_022054, intron 1 of 1) intron (NM_022054, intron 1 of 1) 75985 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 127-74 chr16 57259336 57259627 + 0.75 NA intron (NM_015993, intron 2 of 3) intron (NM_015993, intron 2 of 3) 14222 NM_012106 23568 Hs.632873 NM_012106 ENSG00000102931 ARL2BP BART|BART1|RP66 ADP ribosylation factor like GTPase 2 binding protein protein-coding 177.25-118 chr5 72143225 72143506 + 0.75 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -26102 NR_039967 100616377 NR_039967 ENSG00000264099 MIR4803 - microRNA 4803 ncRNA 166.75-142 chr8 120949047 120949327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137141 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 147-41 chr15 80631231 80631491 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 50258 NR_049837 100847042 NR_049837 ENSG00000284059 MIR5572 - microRNA 5572 ncRNA 152-71 chr18 8460953 8461279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94082 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 164.75-73 chr2 61855605 61855884 + 0.75 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -1684 NR_037710 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 167.5-88 chr2 62691549 62691937 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 1 of 22) MIR3|SINE|MIR -13881 NM_001354212 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 152.25-17 chr10 33811227 33811566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38716 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 135.5-195 chr8 64700178 64700478 + 0.75 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) intron (NM_004820, intron 1 of 5) 98409 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 176.75-98 chr5 23919355 23919741 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -31800 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 149.75-176 chr9 115701454 115701694 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 42665 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 204.75-73 chr22 38763790 38764213 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8003 NM_015374 25777 Hs.517622 NM_015374 ENSG00000100242 SUN2 UNC84B Sad1 and UNC84 domain containing 2 protein-coding 161-111 chr7 5196519 5196864 + 0.75 NA intron (NM_001278299, intron 2 of 12) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 6458 NM_016003 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 207.75-118 chr7 39403991 39404465 + 0.75 NA TTS (NR_046711) TTS (NR_046711) 2118 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 184.5 chr1 9591061 9591600 + 0.75 NA intron (NM_001010866, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 2419 NM_001010866 199953 Hs.632365 NM_001010866 ENSG00000188807 TMEM201 Ima1|NET5|SAMP1 transmembrane protein 201 protein-coding 128.25-222 chr9 106657919 106658106 + 0.75 NA intron (NR_104145, intron 3 of 6) intron (NR_104145, intron 3 of 6) 41954 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 144.75-84 chr2 48546308 48546658 + 0.75 NA intron (NM_001198595, intron 2 of 4) intron (NM_001198595, intron 2 of 4) 16314 NM_006873 11037 Hs.44385 NM_006873 ENSG00000243244 STON1 SALF|SBLF|STN1|STNB1 stonin 1 protein-coding 185.75-52 chr16 12167647 12167941 + 0.75 NA intron (NM_032167, intron 13 of 20) MER58A|DNA|hAT-Charlie 191060 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 122.75-92 chr2 76954427 76954695 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MB1|LINE|L1 -31404 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 193.5-4 chr1 51017398 51017729 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -42274 NR_039617 100616189 NR_039617 ENSG00000265538 MIR4421 - microRNA 4421 ncRNA 113-68 chr15 63857846 63858078 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13057 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 191.75-96 chr4 153607122 153607452 + 0.75 NA intron (NM_001131007, intron 25 of 34) (CTTTGAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32881 NR_134873 100419170 Hs.382102 NR_134873 ENSG00000250771 LOC100419170 - toll like receptor 2 pseudogene pseudo 186.25-125 chr9 85928835 85929114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12168 NM_001321881 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 121.25-193 chr8 63975860 63976099 + 0.75 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 206549 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 131.25-111 chr2 193757636 193758043 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -586430 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 253.5-13 chr11 47894454 47895053 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -46209 NM_001318399 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 157.5-121 chr20 43835175 43835425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59418 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 115.25-116 chr20 9606158 9606486 + 0.75 NA intron (NM_020341, intron 4 of 10) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -91324 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 166-78 chr22 26079266 26079543 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -90058 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 144.75-77 chr19 30138985 30139279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 196893 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 181.25-94 chr4 173448577 173448880 + 0.75 NA intron (NM_001329597, intron 2 of 3) intron (NM_001329597, intron 2 of 3) -49612 NM_007281 11341 Hs.7122 NM_007281 ENSG00000164106 SCRG1 SCRG-1 stimulator of chondrogenesis 1 protein-coding 113-157 chr6 45865625 45865891 + 0.75 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 71839 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 137.5-98 chr17 68534160 68534427 + 0.75 NA TTS (NM_001369389) TTS (NM_001369389) 18899 NM_001276290 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 239 chr1 26922365 26922722 + 0.75 NA intron (NM_006600, intron 1 of 8) intron (NM_006600, intron 1 of 8) 800 NM_006600 10726 Hs.263812 NM_006600 ENSG00000090273 NUDC HNUDC|MNUDC|NPD011 nuclear distribution C, dynein complex regulator protein-coding 201.5-116 chr6 78598216 78598594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59096 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 266.5-29 chr2 12450837 12451260 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 251918 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 297.75-33 chr5 28441264 28441875 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153904 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 120.75-101 chr22 33652428 33652661 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) intron (NM_133642, intron 2 of 14) 52376 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 174.5-108 chr20 36700281 36700706 + 0.75 NA intron (NM_022477, intron 2 of 14) intron (NM_022477, intron 2 of 14) 45597 NR_038370 57446 Hs.437338 NM_022477 ENSG00000101079 NDRG3 - NDRG family member 3 protein-coding 127-135 chr5 55296000 55296317 + 0.75 NA intron (NR_144323, intron 4 of 26) intron (NR_144323, intron 4 of 26) 11536 NR_144325 54505 Hs.593268 NM_019030 ENSG00000067248 DHX29 DDX29 DExH-box helicase 29 protein-coding 114.25-123 chr3 10961492 10961778 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -31099 NM_001348253 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 145-144 chr7 13667853 13668234 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 318471 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 190.5-171 chrX 87040467 87040761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -477188 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 133.25-184 chr6 28128033 28128305 + 0.75 NA TTS (NM_001320558) TTS (NM_001320558) 3560 NM_001320556 80345 Hs.656641 NM_025231 ENSG00000196812 ZSCAN16 ZNF392|ZNF435|dJ265C24.3 zinc finger and SCAN domain containing 16 protein-coding 141.25-182 chr8 117335399 117335811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185108 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 186.5-120 chr6 68848121 68848512 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 213034 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 115-187 chr8 130169722 130169929 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 9 of 29) MIR|SINE|MIR -85057 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 331.25-17 chr6 61475381 61475875 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -98502 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 135.75-189 chr8 26869555 26869867 + 0.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -2433 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 219.5-41 chr14 60245067 60245413 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_177952) promoter-TSS (NM_177952) -510 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 175.5-10 chr1 223843790 223844099 + 0.75 NA intron (NM_005426, intron 1 of 18) MIRb|SINE|MIR 2003 NM_001031685 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 167.5-165 chr6 72784196 72784476 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 153841 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 142.5-150 chr4 56412840 56413159 + 0.75 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) intron (NR_156493, intron 1 of 10) 22616 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 126.5-34 chr11 35688808 35689002 + 0.75 NA intron (NM_017583, intron 2 of 4) intron (NM_017583, intron 2 of 4) 26130 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 207.75-33 chr14 51105971 51106497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10530 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 112.5-124 chr2 114587386 114587561 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 125896 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 215.75-35 chr14 74850454 74850958 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 13128 NM_001080408 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 168.25-55 chr16 59890387 59890782 + 0.75 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) MLT2A2|LTR|ERVL 35231 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 135.5-33 chr11 31778206 31778489 + 0.75 NA intron (NM_001288725, intron 10 of 10) X9_LINE|LINE|L1 22314 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 154-133 chr9 109814992 109815284 + 0.75 NA intron (NM_053016, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 34940 NM_053016 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 179.75-96 chr5 13673811 13674307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 270421 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 159-45 chr18 6289629 6289914 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) MER101-int|LTR|ERV1 33027 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-119 chr20 31901614 31901845 + 0.75 NA intron (NM_001367620, intron 4 of 11) L2b|LINE|L2 21912 NR_160276 164395 Hs.712915 NM_001008409 ENSG00000131044 TTLL9 C20orf125 tubulin tyrosine ligase like 9 protein-coding 132.25-187 chr8 135608877 135609212 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 7 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 151588 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 130.75-119 chr3 117984536 117984891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -293788 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 145-157 chr8 119253212 119253479 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -6488 NR_149112 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 135-99 chr22 21985601 21985795 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2911 NM_001349851 8940 Hs.436401 NM_003935 ENSG00000100038 TOP3B TOP3B1 DNA topoisomerase III beta protein-coding 156.75-5 chr1 84427554 84427993 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19422 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 112.5-179 chr4 65191337 65191636 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -186986 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 129.5-123 chr2 73742024 73742281 + 0.75 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -4746 NM_001330392 51002 Hs.157401 NM_016058 ENSG00000144034 TPRKB CGI-121|CGI121|GAMOS5 TP53RK binding protein protein-coding 147.5-175 chr5 80165033 80165409 + 0.75 NA intron (NR_126061, intron 7 of 13) intron (NR_126061, intron 7 of 13) -81556 NR_109930 101929215 NR_109930 ENSG00000249825 CTD-2201I18.1 - uncharacterized LOC101929215 ncRNA 249.75-43 chr3 58745478 58745897 + 0.75 NA intron (NM_001351530, intron 15 of 15) intron (NM_001351530, intron 15 of 15) -78784 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-18 chr10 58385930 58386172 + 0.75 NA intron (NR_073073, intron 1 of 7) intron (NR_073073, intron 1 of 7) 641 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 156-57 chr15 89709603 89710048 + 0.75 NA intron (NM_001284395, intron 4 of 16) L1ME2|LINE|L1 19014 NM_001284395 56964 Hs.177557 NM_020212 ENSG00000140527 WDR93 - WD repeat domain 93 protein-coding 160.5-56 chr14 69866776 69867068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12494 NM_001034852 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 161-75 chr3 115336883 115337226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -189766 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 125.25-179 chr6 155205275 155205593 + 0.75 NA intron (NM_012454, intron 13 of 25) intron (NM_012454, intron 13 of 25) -11532 NM_001010927 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 148.5-181 chr5 30981665 30981910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -211899 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 125.25-172 chr6 110618323 110618639 + 0.75 NA intron (NM_001300963, intron 13 of 13) MER41E|LTR|ERV1 -141868 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 120-161 chr6 56591278 56591439 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 41 of 94) intron (NM_001144770, intron 41 of 94) 51531 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 123.75-157 chr6 52191816 52192137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5601 NM_002190 3605 Hs.41724 NM_002190 ENSG00000112115 IL17A CTLA-8|CTLA8|IL-17|IL-17A|IL17 interleukin 17A protein-coding 241.5-16 chr12 119591824 119592234 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -1745 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 151.75-53 chr17 73900144 73900425 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -71747 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 112.5-111 chr2 57130104 57130310 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -777444 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 163.25-9 chr1 198901156 198901560 + 0.75 NA intron (NR_040073, intron 1 of 2) intron (NR_040073, intron 1 of 2) 36071 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 124.75-18 chr1 202995556 202995814 + 0.75 NA intron (NR_036557, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 11580 NR_036557 100506747 Hs.642024 NR_036557 LOC100506747 - alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog pseudo 197.25-92 chr7 3534373 3534745 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MB1|LINE|L1 233307 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 175.5-67 chr16 59511284 59511641 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 243729 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 169.75-160 chr9 17628416 17628729 + 0.75 NA intron (NM_003026, intron 1 of 8) intron (NM_003026, intron 1 of 8) 49506 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 114.25-61 chr15 27279447 27279763 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) L1MD2|LINE|L1 -118286 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 166-21 chr11 45211041 45211443 + 0.75 NA intron (NM_001256695, intron 5 of 7) intron (NM_001256695, intron 5 of 7) 63899 NM_001256695 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 174.25-39 chr12 79397921 79398323 + 0.75 NA intron (NM_001291901, intron 8 of 9) intron (NM_001291901, intron 8 of 9) -21135 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 139.75-122 chr3 84555920 84556230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313500 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 131.5-87 chr17 54869728 54870043 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30806 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 198.5-82 chr2 182510135 182510534 + 0.75 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 12192 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 228.75-21 chr15 63643375 63643774 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 57 of 77) intron (NM_003922, intron 57 of 77) -42747 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-32 chr14 42138405 42138978 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 531835 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 186-39 chr18 52880604 52880926 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 2 of 28) L1MA2|LINE|L1 -356336 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 178.25-10 chr10 70646005 70646414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26297 NM_080722 140766 Hs.352156 NM_080722 ENSG00000138316 ADAMTS14 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 14 protein-coding 142.25-131 chr5 6890953 6891205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63158 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 113.75-179 chr7 93506726 93507005 + 0.75 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -22846 NR_030164 574442 NR_030164 ENSG00000207656 MIR489 MIRN489|hsa-mir-489|mir-489 microRNA 489 ncRNA 197-65 chr9 2015139 2015684 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_003070) promoter-TSS (NM_003070) 64 NM_139045 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 140-174 chr9 24416470 24416762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129060 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 124.75-191 chr7 38074575 38074885 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -103515 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 228.75-58 chr4 79356697 79357125 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -30850 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 165.5-205 chr9 37872246 37872541 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31734 NM_033412 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 125.5-55 chr12 28531339 28531674 + 0.75 NA intron (NM_001352082, intron 13 of 13) intron (NM_001352082, intron 13 of 13) -340768 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 189-11 chr1 119823452 119823769 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -12150 NM_001159353 83998 Hs.660883 NM_032044 ENSG00000134193 REG4 GISP|REG-IV|RELP regenerating family member 4 protein-coding 138.75-98 chr2 163591551 163591797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 144334 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 136.25-67 chr15 58513989 58514261 + 0.75 NA intron (NM_000236, intron 1 of 8) intron (NM_000236, intron 1 of 8) -15390 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 117.75-20 chr10 7932946 7933216 + 0.75 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 114576 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 175.5-89 chr2 109012293 109012695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23274 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 181-89 chr5 133330139 133330494 + 0.75 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 97390 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 178.75-5 chr1 168236046 168236377 + 0.75 NA intron (NM_199344, intron 4 of 7) intron (NM_199344, intron 4 of 7) 10207 NM_199344 375035 Hs.645435 NM_199344 ENSG00000213064 SFT2D2 UNQ512|dJ747L4.C1.2 SFT2 domain containing 2 protein-coding 140.75-170 chr7 77950622 77950870 + 0.75 NA intron (NM_020432, intron 14 of 16) intron (NM_020432, intron 14 of 16) 110616 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 144.25-161 chr5 113429130 113429510 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 5669 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 127.5-82 chr14 87633577 87633772 + 0.75 NA TTS (NR_146551) TTS (NR_146551) 21620 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 150.75-104 chr2 143358992 143359279 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 229716 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 168.5-186 chr8 123216469 123216867 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_039808) promoter-TSS (NR_039808) -805 NR_039808 100616260 NR_039808 ENSG00000266324 MIR4663 - microRNA 4663 ncRNA 182.75-9 chr1 116208818 116209151 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 97229 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 121.75-159 chr6 87064203 87064506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30752 NM_000735 1081 Hs.119689 NM_000735 ENSG00000135346 CGA CG-ALPHA|FSHA|GPA1|GPHA1|GPHa|HCG|LHA|TSHA glycoprotein hormones, alpha polypeptide protein-coding 144.75-58 chr14 54349275 54349589 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47436 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 224.75-56 chr5 33594615 33595007 + 0.75 NA intron (NM_001324512, intron 15 of 21) intron (NM_001324512, intron 15 of 21) 154035 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 146.5-178 chr5 127975786 127976047 + 0.75 NA intron (NR_152803, intron 1 of 1) L1MA6|LINE|L1 107259 NR_152813 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 186.75-71 chr3 108619812 108620193 + 0.75 NA intron (NM_014648, intron 5 of 32) MER68B|LTR|ERVL 30280 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 171.25-91 chr22 35076838 35077263 + 0.75 NA intron (NM_001303508, intron 2 of 4) MIRc|SINE|MIR 10892 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 217.5-3 chr1 72006556 72007070 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -169801 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 173.5-75 chr2 147257436 147257751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -586924 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 118.75-128 chr3 105152750 105153022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213827 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 175.25-83 chr20 53453498 53453899 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -99072 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 114.5-266 chr8 123332193 123332428 + 0.75 NA intron (NM_014109, intron 24 of 27) intron (NM_014109, intron 24 of 27) -15724 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 157.75-159 chr7 29904974 29905248 + 0.75 NA intron (NM_001080529, intron 8 of 8) intron (NM_001080529, intron 8 of 8) 84690 NM_014766 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 159.5-156 chr4 3083635 3084029 + 0.75 NA intron (NM_002111, intron 1 of 66) L1MD2|LINE|L1 9151 NM_002111 3064 Hs.518450 NM_002111 ENSG00000197386 HTT HD|IT15|LOMARS huntingtin protein-coding 129-150 chr6 36295795 36296010 + 0.75 NA intron (NM_173676, intron 5 of 7) intron (NM_173676, intron 5 of 7) 25442 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 130.25-143 chr3 176565374 176565639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50403 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 125.25-98 chr2 62159854 62160091 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -36143 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 209.25-17 chr11 31594529 31594877 + 0.75 NA intron (NM_001288725, intron 3 of 10) intron (NM_001288725, intron 3 of 10) 84936 NM_001288726 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 179-48 chr18 76848827 76849328 + 0.75 NA intron (NM_007345, intron 1 of 30) intron (NM_007345, intron 1 of 30) 24917 NM_007345 7776 Hs.719137 NM_007345 ENSG00000130856 ZNF236 ZNF236A|ZNF236B zinc finger protein 236 protein-coding 265.75-43 chr21 17511575 17512304 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001207066) promoter-TSS (NM_001207066) -967 NM_001207066 1525 Hs.627078 NM_001338 ENSG00000154639 CXADR CAR|CAR4/6|HCAR CXADR Ig-like cell adhesion molecule protein-coding 166.5-179 chr6 124600923 124601235 + 0.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 318074 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 196-86 chr6 121971363 121971659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -428040 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 180.75-71 chr2 180927430 180927767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52787 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 142-10 chr1 218444852 218445113 + 0.75 NA TTS (NR_125715) TTS (NR_125715) 2356 NR_125715 103611157 Hs.133379 NR_125715 ENSG00000281453 TGFB2-OT1 - TGFB2 overlapping transcript 1 ncRNA 141.75-111 chr22 22088622 22088962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44858 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 182.5-17 chr10 36624219 36624689 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -501403 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 158.75-117 chr3 139614491 139614909 + 0.75 NA intron (NM_001320510, intron 3 of 6) L1MC4|LINE|L1 63272 NM_001320510 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 146.25-9 chr1 213773552 213773800 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -151073 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 170-4 chr1 175959589 175960051 + 0.75 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) intron (NM_022457, intron 18 of 19) 8659 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 170-90 chr7 50329582 50329989 + 0.75 NA intron (NM_001291840, intron 2 of 2) intron (NM_001291840, intron 2 of 2) 10737 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 135.5-199 chr8 98813454 98813703 + 0.75 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) 12093 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 207.5-3 chr10 27836416 27836778 + 0.75 NA intron (NM_018076, intron 19 of 19) intron (NM_018076, intron 19 of 19) -90778 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 119.25-5 chr1 67433885 67434133 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3607 NM_001018067 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 303.75-22 chr3 1182289 1182734 + 0.75 NA intron (NM_001289080, intron 2 of 22) intron (NM_001289080, intron 2 of 22) 89487 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 140.5-21 chr10 117522535 117522788 + 0.75 NA intron (NR_002791, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 -19784 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 121.25-77 chr17 28093490 28093866 + 0.75 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 51001 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 135.75-188 chr7 115662656 115662888 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81331 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 128.25-170 chr6 24653669 24653891 + 0.75 NA intron (NM_016614, intron 5 of 6) L2c|LINE|L2 -7589 NM_001350409 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 238-68 chrX 13251451 13251997 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 51728 NR_146309 109729169 Hs.348675 NR_146309 LINC02154 - long intergenic non-protein coding RNA 2154 ncRNA 196.5-127 chr5 92691255 92691627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 879902 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 134-6 chr1 70668517 70668789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37800 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 138.5-75 chr16 87542106 87542315 + 0.75 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL 48023 NR_110943 101928737 Hs.579009 NR_110943 ENSG00000260750 LOC101928737 - uncharacterized LOC101928737 ncRNA 214-7 chr1 207359757 207360233 + 0.75 NA non-coding (NR_125349, exon 11 of 11) non-coding (NR_125349, exon 11 of 11) 38317 NM_000574 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 164.75-60 chr16 88613357 88613687 + 0.75 NA intron (NM_001294340, intron 9 of 18) L1MB8|LINE|L1 -25050 NM_013278 27189 Hs.278911 NM_013278 ENSG00000124391 IL17C CX2|IL-17C interleukin 17C protein-coding 152.5-144 chr4 169592718 169593051 + 0.75 NA intron (NM_001199400, intron 4 of 32) intron (NM_001199400, intron 4 of 32) 19699 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 223-74 chr7 6453025 6453427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5214 NM_001142936 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 172.75-118 chr7 81312887 81313157 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 248797 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 206.75-92 chr8 104536948 104537325 + 0.75 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) L1MEc|LINE|L1 51888 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 158-70 chr2 32802059 32802418 + 0.75 NA intron (NM_017735, intron 16 of 19) intron (NM_017735, intron 16 of 19) -23195 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 116.75-4 chr1 65612030 65612235 + 0.75 NA intron (NM_001003679, intron 14 of 19) intron (NM_001003679, intron 14 of 19) 86443 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 128-17 chr1 240064479 240064677 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -27305 NM_001348094 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 119-17 chr10 76761867 76762069 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -126076 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-82 chr2 198301395 198301696 + 0.75 NA non-coding (NR_110267, exon 3 of 3) non-coding (NR_110267, exon 3 of 3) 73552 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 125.25-116 chr2 192287723 192287939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92898 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 128.75-65 chr15 94643266 94643474 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -211993 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 191.25-73 chr4 38742033 38742375 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 40786 NM_001195107 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 181.25-4 chr1 71288850 71289339 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 207770 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 158.5-76 chr15 86688922 86689198 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -243820 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 140.75-139 chr5 10972671 10973028 + 0.75 NA non-coding (NR_109988, exon 22 of 22) non-coding (NR_109988, exon 22 of 22) -211615 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 126.75-38 chr12 62008332 62008638 + 0.75 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 184354 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 229.5-75 chr2 215421581 215422115 + 0.75 NA intron (NM_212482, intron 10 of 45) intron (NM_212482, intron 10 of 45) 14220 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 255.5-92 chr9 129512732 129513103 + 0.75 NA intron (NR_038955, intron 4 of 4) AluSp|SINE|Alu 24257 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 124-161 chr7 100164703 100164997 + 0.75 NA intron (NM_024637, intron 3 of 3) intron (NM_024637, intron 3 of 3) 3767 NM_024637 79690 Hs.44856 NM_024637 ENSG00000197093 GAL3ST4 GAL3ST-4 galactose-3-O-sulfotransferase 4 protein-coding 133.5-5 chr1 51674850 51675083 + 0.75 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) MER30|DNA|hAT-Charlie -54884 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 113.25-132 chr5 31335177 31335361 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 141583 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 138-157 chr7 114664851 114665166 + 0.75 NA intron (NR_033767, intron 17 of 17) intron (NR_033767, intron 17 of 17) 11663 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 130.75-66 chr16 79248117 79248405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 352476 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 211-7 chr10 32424090 32424429 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 21797 NR_120660 101929431 Hs.639819 NR_120660 LOC101929431 - uncharacterized LOC101929431 ncRNA 198.25-75 chr4 60921801 60922157 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_039652) promoter-TSS (NR_039652) -640 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 120-92 chr2 114672097 114672344 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 161328 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 121.75-131 chr4 71766319 71766521 + 0.75 NA intron (NM_000583, intron 3 of 12) MamTip1|DNA|hAT-Tip100 17659 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 221-44 chr20 33209805 33210137 + 0.75 NA intron (NR_026760, intron 8 of 8) intron (NR_026760, intron 8 of 8) -7339 NM_001042439 128861 Hs.360989 NM_178466 ENSG00000131059 BPIFA3 C20orf71|SPLUNC3 BPI fold containing family A member 3 protein-coding 122.5-38 chr11 101744158 101744442 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160293 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 130-151 chr7 48178810 48179111 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 1 of 61) intron (NM_152701, intron 1 of 61) 7502 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 114-83 chr2 204467118 204467355 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78239 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 113.75-159 chr5 105171850 105172005 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 72453 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 266.5-82 chrX 80515845 80516331 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 95641 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 177.25-136 chr8 37260870 37261320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232818 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 145.75-103 chr3 119099991 119100344 + 0.75 NA intron (NM_152538, intron 3 of 8) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 45853 NM_152538 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 118-68 chr17 77991454 77991659 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -12681 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 124.5-201 chr7 12308361 12308728 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 95321 NM_001135924 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 200.25-43 chr16 8180645 8181126 + 0.75 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 408953 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 194.75-10 chr1 211650681 211651134 + 0.75 NA intron (NR_131925, intron 2 of 2) intron (NR_131925, intron 2 of 2) 11099 NR_131925 105748977 Hs.553186 NR_131925 LINC01693 - long intergenic non-protein coding RNA 1693 ncRNA 181.75-49 chr18 5615793 5616164 + 0.75 NA intron (NM_001281535, intron 1 of 21) intron (NM_001281535, intron 1 of 21) 13013 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 127.75-66 chr14 87179350 87179662 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 273728 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 132-19 chr10 64302082 64302395 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -523290 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 187-88 chr7 20964571 20965102 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) intron (NR_126381, intron 2 of 5) 129405 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 199.5-14 chr1 237697482 237697967 + 0.75 NA intron (NM_001035, intron 63 of 104) intron (NM_001035, intron 63 of 104) -164451 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 172.5-24 chr10 21361598 21362025 + 0.75 NA intron (NR_155751, intron 3 of 4) AluJr|SINE|Alu 11139 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 151.5-64 chr17 31255192 31255449 + 0.75 NA intron (NM_001042492, intron 31 of 57) intron (NM_001042492, intron 31 of 57) 41919 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 177.75-25 chr11 126865205 126865628 + 0.75 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -75330 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 139.5-155 chr4 85639387 85639624 + 0.75 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -82963 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 137.75-199 chr7 94987990 94988298 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 78246 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 178 chr1 152579146 152579679 + 0.75 NA TTS (NM_032563) TTS (NM_032563) 1104 NM_032563 84648 Hs.244349 NM_032563 ENSG00000163202 LCE3D LEP16|SPRL6A|SPRL6B late cornified envelope 3D protein-coding 151.25-81 chr2 31731380 31731631 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72475 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 119-73 chr18 31583565 31583762 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -8104 NM_000371 7276 Hs.427202 NM_000371 ENSG00000118271 TTR ATTR|CTS|CTS1|HEL111|HsT2651|PALB|TBPA transthyretin protein-coding 174-19 chr11 104540571 104540909 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68562 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 245.75-5 chr10 56697984 56698484 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -336961 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 179.25-21 chr10 60224066 60224350 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 9 of 43) intron (NM_001204403, intron 9 of 43) -83192 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 117.5-175 chr5 40467415 40467683 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -212366 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 147-4 chr1 68961580 68961957 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -94130 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 139.25-8 chr1 108868284 108868678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8504 NM_001321038 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 120.25-61 chr14 51072014 51072248 + 0.75 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 23573 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 139-137 chr7 32207395 32207598 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 2 of 17) intron (NM_001322059, intron 2 of 17) 91832 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 139-8 chr1 167997873 167998232 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_031702) promoter-TSS (NR_031702) -608 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 136.75-88 chr2 30528863 30529059 + 0.75 NA intron (NM_182551, intron 3 of 6) intron (NM_182551, intron 3 of 6) 81715 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 112.25-80 chr17 76821121 76821324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22178 NR_110837 101928514 Hs.617206 NR_110837 ENSG00000267065 LINC02080 - long intergenic non-protein coding RNA 2080 ncRNA 121.5-109 chr17 68974166 68974427 + 0.75 NA TTS (NM_080283) TTS (NM_080283) -18904 NM_001288985 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 203-48 chr2 30435300 30435643 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11775 NM_001304446 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 219.25-27 chr14 81768053 81768378 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -25077 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 129.75-178 chr8 19972492 19972872 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33429 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 145-86 chr2 223100611 223100998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48874 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 175.5-111 chr22 33357716 33358017 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 9 of 14) intron (NM_133642, intron 9 of 14) 78803 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 149.5-65 chr15 80736137 80736414 + 0.75 NA intron (NM_021214, intron 1 of 2) intron (NM_021214, intron 1 of 2) 40965 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 154.75-60 chr18 2330080 2330527 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 241202 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 142.5-92 chr18 2743781 2744038 + 0.75 NA exon (NM_015295, exon 29 of 48) exon (NM_015295, exon 29 of 48) 88022 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 208.75-87 chr8 134067176 134067576 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 180880 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 238-7 chr1 151865113 151865586 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11637 NM_182578 284486 Hs.132648 NM_182578 ENSG00000196407 THEM5 ACOT15 thioesterase superfamily member 5 protein-coding 131-74 chr19 28431196 28431458 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175361 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 128.25-78 chr17 82215980 82216224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3260 NM_001367828 284001 Hs.631724 NM_152675 ENSG00000176155 CCDC57 - coiled-coil domain containing 57 protein-coding 178.5-58 chr15 90305279 90305672 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -39716 NR_102428 10519 Hs.715556 NM_006384 ENSG00000185043 CIB1 CIB|CIBP|KIP1|PRKDCIP|SIP2-28 calcium and integrin binding 1 protein-coding 113.75-69 chr15 51865688 51865934 + 0.75 NA intron (NM_014547, intron 2 of 9) intron (NM_014547, intron 2 of 9) 36158 NM_014547 29766 Hs.4998 NM_014547 ENSG00000138594 TMOD3 UTMOD tropomodulin 3 protein-coding 182-96 chr6 53530337 53530619 + 0.75 NA intron (NM_001498, intron 1 of 15) intron (NM_001498, intron 1 of 15) 14623 NM_001197115 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 267.75-64 chr9 31071024 31071445 + 0.75 NA Intergenic MER52C|LTR|ERV1 310256 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 185.5-56 chr14 95295566 95295901 + 0.75 NA intron (NM_024734, intron 1 of 12) intron (NM_024734, intron 1 of 12) 24175 NM_024734 79789 Hs.301478 NM_024734 ENSG00000165959 CLMN - calmin protein-coding 213.75-23 chr11 102450346 102450707 + 0.75 NA intron (NM_052932, intron 1 of 4) intron (NM_052932, intron 1 of 4) 2239 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 211-65 chr7 92927488 92927923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91078 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 180.25-40 chr17 78907260 78907672 + 0.75 NA intron (NM_003255, intron 1 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4265 NM_001243540 100653515 Hs.734636 NM_001243540 ENSG00000178404 CEP295NL DDC8|KIAA1731NL CEP295 N-terminal like protein-coding 120.25-35 chr11 18450883 18451198 + 0.75 NA exon (NM_002301, exon 8 of 8) exon (NM_002301, exon 8 of 8) -4816 NM_001144071 160287 Hs.668877 NM_144972 ENSG00000166800 LDHAL6A LDH6A lactate dehydrogenase A like 6A protein-coding 184.5-67 chr19 39315169 39315466 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_020862) promoter-TSS (NM_020862) 19 NM_020862 57622 Hs.97860 NM_020862 ENSG00000128011 LRFN1 SALM2 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 125.25-49 chr12 114179397 114179609 + 0.75 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 62267 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 172-50 chr2 10639350 10639865 + 0.75 NA intron (NR_048552, intron 12 of 19) intron (NR_048552, intron 12 of 19) 50368 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 140.5-180 chr5 59816443 59816712 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -47729 NM_001364603 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 116.25-185 chr5 120051748 120052080 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -412364 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 143.75-176 chr7 106608810 106609113 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 52197 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 178.25-118 chr8 83553934 83554462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150440 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 184.5-150 chr8 58369339 58369622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41784 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 188-91 chr9 96599343 96599660 + 0.75 NA intron (NR_147239, intron 1 of 14) L1ME4b|LINE|L1 20342 NM_001351567 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 158-45 chr13 101667586 101667873 + 0.75 NA intron (NM_001271754, intron 6 of 10) LTR57-int|LTR|ERVL 177777 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 201.5-97 chr4 53716769 53717110 + 0.75 NA non-coding (NR_125918, exon 2 of 3) non-coding (NR_125918, exon 2 of 3) 21038 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 126.5-221 chr7 26078996 26079266 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73067 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 175.5-101 chr20 8801824 8802335 + 0.75 NA exon (NM_182734, exon 32 of 33) exon (NM_182734, exon 32 of 33) -29106 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 187.5-79 chr2 20171016 20171361 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53942 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 133.25-164 chr5 17234720 17235026 + 0.75 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 17242 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 170-15 chr11 35462094 35462584 + 0.75 NA intron (NM_015430, intron 6 of 11) intron (NM_015430, intron 6 of 11) -42281 NM_001195728 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 171-12 chr10 58773469 58773892 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) intron (NM_001080512, intron 3 of 20) 58665 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 145-145 chr7 26461401 26461691 + 0.75 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) -62128 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 117-91 chr2 77584807 77585000 + 0.75 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -62470 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 195.75-25 chr10 88192808 88193324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 329441 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 195.25-106 chrX 136989883 136990255 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41605 NM_054021 83550 Hs.350569 NM_054021 ENSG00000165370 GPR101 GPCR6|PAGH2|PITA2 G protein-coupled receptor 101 protein-coding 139-129 chr6 104038414 104038643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 821018 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 134.5-192 chr6 72790736 72790959 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 160352 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 135.5-124 chr20 52122224 52122675 + 0.75 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) AluY|SINE|Alu -16965 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 153.25-109 chr6 52282582 52282843 + 0.75 NA exon (NM_001366371, exon 3 of 18) exon (NM_001366371, exon 3 of 18) 2030 NR_158963 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 137.5-207 chr6 55974063 55974285 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -98584 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 180-88 chr3 161914921 161915331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 418318 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 139-101 chr4 85575428 85575717 + 0.75 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) 100422 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 112.5-231 chr8 58854226 58854565 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) -194542 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 139.75-148 chr5 93106286 93106515 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 464943 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-162 chr5 61087114 61087555 + 0.75 NA intron (NM_174889, intron 2 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -74982 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-135 chr4 38939086 38939484 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001350631, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001350631, exon 12 of 12) 71253 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 119.25-36 chr11 38795657 38795903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146922 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 175-119 chr7 47716365 47716678 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -44955 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 178.25-46 chr16 82138272 82138585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31796 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 180.25-71 chr3 42596783 42597299 + 0.75 NA TTS (NM_001370300) TTS (NM_001370300) -3645 NM_005385 4820 Hs.529509 NM_005385 ENSG00000114857 NKTR p104 natural killer cell triggering receptor protein-coding 190.25-117 chr7 28160742 28161054 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -19559 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 207-79 chr7 23692648 23693003 + 0.75 NA intron (NM_001127365, intron 3 of 4) (TTAATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12626 NM_001300932 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 149.25-142 chr5 88202111 88202529 + 0.75 NA intron (NM_001349403, intron 8 of 10) intron (NM_001349403, intron 8 of 10) 66525 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 162-72 chr20 53573069 53573466 + 0.75 NA intron (NR_110051, intron 5 of 5) AluSg|SINE|Alu 9830 NM_006526 7764 Hs.155040 NM_006526 ENSG00000171940 ZNF217 ZABC1 zinc finger protein 217 protein-coding 123.5-161 chr5 40796956 40797315 + 0.75 NA intron (NM_001355028, intron 1 of 9) L1PB3|LINE|L1 1042 NM_001355036 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 203.25-70 chr3 126548180 126548667 + 0.75 NA intron (NR_130715, intron 4 of 5) intron (NR_130715, intron 4 of 5) 10509 NR_130715 152065 Hs.178210 NM_152533 ENSG00000180697 C3orf22 - chromosome 3 open reading frame 22 protein-coding 155-2 chr1 95978937 95979264 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -12968 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 126.5-151 chr3 49164807 49165058 + 0.75 NA intron (NM_022903, intron 1 of 1) intron (NM_022903, intron 1 of 1) 1399 NM_022903 64925 Hs.211472 NM_022903 ENSG00000177352 CCDC71 - coiled-coil domain containing 71 protein-coding 152-16 chr1 194594169 194594630 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1289654 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 187.5-73 chr17 72804707 72805256 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) AluSc|SINE|Alu -164509 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 162.25-45 chr13 98368772 98369198 + 0.75 NA intron (NM_005766, intron 5 of 26) AluSx1|SINE|Alu 153140 NM_003576 8428 Hs.508514 NM_003576 ENSG00000102572 STK24 HEL-S-95|MST3|MST3B|STE20|STK3 serine/threonine kinase 24 protein-coding 139.5-227 chr9 18691031 18691421 + 0.75 NA intron (NM_001040272, intron 13 of 28) intron (NM_001040272, intron 13 of 28) 117920 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 170.25-18 chr11 61262109 61262670 + 0.75 NA intron (NM_152718, intron 19 of 19) MIRb|SINE|MIR 21213 NM_014224 5222 Hs.432854 NM_014224 ENSG00000256713 PGA5 Pg5 pepsinogen 5, group I (pepsinogen A) protein-coding 126-34 chr11 111572752 111573007 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29570 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 147.5-124 chr20 37241104 37241546 + 0.75 NA exon (NM_001324303, exon 17 of 17) exon (NM_001324303, exon 17 of 17) 15583 NM_001184731 2691 Hs.37023 NM_021081 ENSG00000118702 GHRH GHRF|GRF|INN growth hormone releasing hormone protein-coding 175.25-57 chr17 41594891 41595208 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8154 NM_000526 3861 Hs.654380 NM_000526 ENSG00000186847 KRT14 CK14|EBS3|EBS4|K14|NFJ keratin 14 protein-coding 185.5-113 chr3 186255210 186255685 + 0.75 NA intron (NM_001346, intron 17 of 24) L2b|LINE|L2 106787 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 129.5-40 chr11 48248986 48249271 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 4024 NM_001004727 119764 Hs.553565 NM_001004727 ENSG00000172208 OR4X2 OR11-105 olfactory receptor family 4 subfamily X member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 168 chr1 24285676 24285939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33550 NM_001195010 57822 Hs.657920 NM_021180 ENSG00000158055 GRHL3 SOM|TFCP2L4|VWS2 grainyhead like transcription factor 3 protein-coding 164.5-23 chr10 76763012 76763467 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124805 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 156.25-162 chrX 16801325 16801597 + 0.75 NA intron (NM_001168683, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu 14995 NM_018360 55787 Hs.555961 NM_018360 ENSG00000086712 TXLNG CXorf15|ELRG|FIAT|LSR5|TXLNGX taxilin gamma protein-coding 176.25-98 chr4 19906485 19906840 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -345243 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 132.75-58 chr14 46731603 46731932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79986 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 148.75-160 chr7 104329440 104329756 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 942 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 207.25-48 chr2 193206396 193206833 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 456769 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 184.25-135 chr9 110342388 110342798 + 0.75 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -4709 NM_001286947 255220 Hs.147064 NM_001003936 ENSG00000204193 TXNDC8 SPTRX-3|SPTRX3|TRX6|bA427L11.2 thioredoxin domain containing 8 protein-coding 147-35 chr15 27663698 27664043 + 0.75 NA Intergenic LTR15|LTR|ERV1 435445 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 169.25-54 chr2 115781009 115781506 + 0.75 NA intron (NM_001321912, intron 17 of 25) intron (NM_001321912, intron 17 of 25) 437442 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 215-49 chr20 9474312 9474649 + 0.75 NA intron (NM_182797, intron 35 of 35) intron (NM_182797, intron 35 of 35) -39878 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 120.25-165 chr5 82673632 82673792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166443 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 144.5-15 chr1 175065383 175065764 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2260 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 156-90 chr2 197391939 197392385 + 0.75 NA 3' UTR (NM_012433, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_012433, exon 25 of 25) 42931 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 119.75-216 chrX 147796719 147796995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114960 NR_024502 100126270 Hs.561999 NR_024499 ENSG00000268066 FMR1-AS1 ASFMR1|FMR1-AS|FMR1AS|FMR4 FMR1 antisense RNA 1 ncRNA 172.5-138 chr4 38345830 38346181 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20909 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 130-110 chr4 16327917 16328130 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 101360 NR_027696 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 251.25-62 chr8 131413293 131413862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -372668 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 135.25-85 chr18 64586702 64586974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -326783 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 145.75-82 chr2 106170880 106171094 + 0.75 NA intron (NM_025076, intron 1 of 14) intron (NM_025076, intron 1 of 14) 23352 NM_001253875 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 154.5-14 chr1 164384673 164384928 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -174560 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 153.25-124 chr8 3257256 3257580 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 26 of 69) L2a|LINE|L2 -528967 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 200.75-36 chr15 95900403 95900759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 227260 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 128.75-83 chr18 12856709 12857006 + 0.75 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu -15895 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 142-32 chr11 84368942 84369282 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -51773 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 182.75-142 chr9 130403090 130403439 + 0.75 NA exon (NM_001291815, exon 79 of 98) exon (NM_001291815, exon 79 of 98) -41443 NM_000050 445 Hs.160786 NM_000050 ENSG00000130707 ASS1 ASS|CTLN1 argininosuccinate synthase 1 protein-coding 118-39 chr13 46067373 46067624 + 0.75 NA intron (NM_001872, intron 6 of 10) intron (NM_001872, intron 6 of 10) 14650 NR_046227 100509894 Hs.626139 NR_046226 ENSG00000235903 CPB2-AS1 - CPB2 antisense RNA 1 ncRNA 203.25-109 chr8 124798222 124798726 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23511 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 187.5-61 chr15 49627987 49628384 + 0.75 NA intron (NM_020234, intron 3 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 7137 NM_001144955 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 201.75-8 chr10 30080957 30081556 + 0.75 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) -21670 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 133.75-82 chr17 78329115 78329344 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 30850 NM_003955 9021 Hs.527973 NM_003955 ENSG00000184557 SOCS3 ATOD4|CIS3|Cish3|SOCS-3|SSI-3|SSI3 suppressor of cytokine signaling 3 protein-coding 193.75-102 chr5 146752898 146753186 + 0.75 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 125743 NM_181675 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 116-155 chr7 77744601 77744755 + 0.75 NA intron (NM_198467, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu -47333 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 155-48 chr15 86075693 86076184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3682 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 201-2 chr1 64076114 64076459 + 0.75 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) intron (NM_005012, intron 4 of 8) 35919 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 157.25-33 chr12 10403234 10403557 + 0.75 NA intron (NM_001199805, intron 4 of 12) L1M5|LINE|L1 6362 NM_013431 8302 Hs.721094 NM_013431 ENSG00000183542 KLRC4 NKG2-F|NKG2F killer cell lectin like receptor C4 protein-coding 158.5-146 chr4 128055582 128055982 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5530 NM_032239 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 114.25-207 chr9 93708282 93708486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110973 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 160.25-171 chr9 124955495 124955917 + 0.75 NA intron (NM_173690, intron 18 of 18) intron (NM_173690, intron 18 of 18) -14623 NM_002077 2800 Hs.59504 NM_002077 ENSG00000136935 GOLGA1 golgin-97 golgin A1 protein-coding 114.25-193 chr8 104692983 104693228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104081 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 182-3 chr1 23333919 23334420 + 0.75 NA intron (NM_001297621, intron 3 of 8).2 AluSx|SINE|Alu 10115 NM_001297620 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 198.5-18 chr10 68663584 68664168 + 0.75 NA intron (NM_030625, intron 6 of 11) intron (NM_030625, intron 6 of 11) -57363 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 127.5-49 chr11 95029626 95029869 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 4489 NM_001161630 390245 Hs.714692 NM_001161630 ENSG00000235268 KDM4E JMJD2E|KDM4DL|KDM5E lysine demethylase 4E protein-coding 152.25-111 chr4 61668214 61668481 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 466175 NM_001371342 136.75-61 chr14 73408490 73408759 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) AluSq2|SINE|Alu 49956 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 120.75-22 chr10 119132513 119132729 + 0.75 NA intron (NM_207009, intron 8 of 8) intron (NM_207009, intron 8 of 8) 28508 NM_001303111 404636 Hs.434241 NM_207009 ENSG00000119979 DENND10 FAM45A DENN domain containing 10 protein-coding 129-44 chr11 121660686 121660994 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 208526 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 116.5-201 chr5 89542686 89542972 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 473891 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 117.25-78 chr14 80411370 80411682 + 0.75 NA intron (NR_038355, intron 8 of 8) intron (NR_038355, intron 8 of 8) -180469 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 184-4 chr1 118174054 118174370 + 0.75 NA intron (NM_206996, intron 1 of 48) L1MA4|LINE|L1 11016 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 226.75-5 chr10 24205937 24206349 + 0.75 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -2648 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 164-146 chr9 29086654 29087109 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 125418 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 134.25-196 chr9 26355359 26355595 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 288802 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 191.25-113 chr8 131289320 131289613 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248557 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 168.5-29 chr10 69688968 69689365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58919 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 124.5-148 chr4 33264178 33264395 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 775607 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 118.75-84 chr18 39249428 39249644 + 0.75 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 372639 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 130.5-171 chr3 114635418 114635627 + 0.75 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) L1M4c|LINE|L1 -10577 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 164.5-76 chr16 59821555 59822014 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -33569 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 115.5-241 chr8 76113467 76113708 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -293067 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 193.5-166 chr9 23087613 23087899 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 441556 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 139.25-68 chr17 66873665 66873884 + 0.75 NA intron (NM_145811, intron 1 of 5) intron (NM_145811, intron 1 of 5) 38657 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 192-89 chr6 143671989 143672308 + 0.75 NA intron (NM_014721, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 -5817 NM_001100165 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 151.75-66 chr2 110894706 110895017 + 0.75 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) L1MDa|LINE|L1 162288 NM_001371254 113.75-197 chr8 121697090 121697376 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55793 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 123-29 chr11 4389072 4389382 + 0.75 NA intron (NM_003141, intron 3 of 6) intron (NM_003141, intron 3 of 6) 4475 NM_003141 6737 Hs.532357 NM_003141 ENSG00000132109 TRIM21 RNF81|RO52|Ro/SSA|SSA|SSA1 tripartite motif containing 21 protein-coding 135-22 chr11 43530180 43530430 + 0.75 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -29351 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 178.5-93 chr20 4565822 4566150 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -120470 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 127.5-43 chr11 34125182 34125443 + 0.75 NA intron (NM_001144030, intron 9 of 26) intron (NM_001144030, intron 9 of 26) 19683 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 132-51 chr14 71709296 71709535 + 0.75 NA exon (NM_001354287, exon 17 of 24) exon (NM_001354287, exon 17 of 24) 123117 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 128-140 chr6 109267072 109267404 + 0.75 NA intron (NR_152435, intron 21 of 45) intron (NR_152435, intron 21 of 45) 101407 NR_152435 221262 Hs.373914 NM_173671 ENSG00000203799 CCDC162P C6orf183|C6orf184|C6orf185|CCDC162 coiled-coil domain containing 162, pseudogene pseudo 176-67 chr7 4420275 4420694 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -261811 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 151.25-164 chr6 144456486 144456722 + 0.75 NA intron (NM_007124, intron 18 of 73) AluSc5|SINE|Alu 50949 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 121.25-39 chr11 113940837 113941026 + 0.75 NA intron (NM_006028, intron 6 of 8) intron (NM_006028, intron 6 of 8) 32090 NM_001363563 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 127.25-93 chr2 104011090 104011375 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 397100 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 184.25-101 chr5 72662752 72663105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2259 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 131.75-32 chr10 92657296 92657532 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -32541 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 206.75-59 chr3 184619141 184619444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57507 NM_004443 2049 Hs.2913 NM_004443 ENSG00000182580 EPHB3 EK2|ETK2|HEK2|TYRO6 EPH receptor B3 protein-coding 120.5-11 chr1 105152229 105152435 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 466603 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 176.25-149 chr9 105245599 105245948 + 0.75 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) intron (NM_001330731, intron 1 of 15) 1122 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 181.75-77 chr3 49598613 49599149 + 0.75 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) L1MD|LINE|L1 44404 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 158-147 chr8 128523477 128523794 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 41044 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 197.25-71 chr3 101831048 101831405 + 0.75 NA intron (NM_001005474, intron 2 of 12) MER106A|DNA|hAT-Charlie 3236 NM_001005474 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 174.5-166 chr6 164618158 164618482 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203743 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 148.5-21 chr10 12947403 12947874 + 0.75 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) intron (NM_001282658, intron 6 of 6) 54075 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 197.25-109 chrX 75342509 75342918 + 0.75 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu 68628 NM_145052 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 132.5-246 chr8 118849319 118849521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102465 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 135.75-86 chr2 9774801 9775070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68507 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 204.75-130 chrX 70994967 70995306 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -64040 NM_032803 84889 Hs.175220 NM_032803 ENSG00000165349 SLC7A3 ATRC3|CAT-3|CAT3 solute carrier family 7 member 3 protein-coding 143-115 chr5 42541015 42541251 + 0.75 NA intron (NM_001242400, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 -6910 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 174.25-60 chr15 86516312 86516618 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -199497 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-85 chr16 48174825 48175064 + 0.75 NA intron (NM_001370497, intron 26 of 29) FAM|SINE|Alu -28174 NM_033226 94160 Hs.410111 NM_033226 ENSG00000140798 ABCC12 MRP9 ATP binding cassette subfamily C member 12 protein-coding 253.5 chr1 19152760 19153249 + 0.75 NA intron (NM_020765, intron 46 of 105) intron (NM_020765, intron 46 of 105) 57262 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 161.5-142 chr4 32784541 32784796 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 433630 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 130-149 chr7 43894301 43894618 + 0.75 NA intron (NM_001077664, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 12137 NM_001204871 100534592 NM_001204871 ENSG00000270617 URGCP-MRPS24 - URGCP-MRPS24 readthrough protein-coding 147.75-27 chr11 131178775 131179054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191701 NM_001352005 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 171-108 chr5 31943821 31944280 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -7891 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 155-20 chr10 98014512 98014885 + 0.75 NA intron (NM_001206528, intron 1 of 14) L1MB3|LINE|L1 15923 NM_018058 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 227.75-78 chr7 99712813 99713248 + 0.75 NA intron (NM_000765, intron 9 of 12) intron (NM_000765, intron 9 of 12) 22166 NM_001256497 100861540 NM_001256497 ENSG00000282301 CYP3A7-CYP3A51P CYP3A7|CYP3A7-3AP1|CYP3A7-CYP3AP1|CYP3A7.1L|CYPIIIA7 CYP3A7-CYP3A51P readthrough protein-coding 117-180 chr8 65268591 65268800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -88355 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 199-46 chr20 59671620 59672057 + 0.75 NA intron (NM_001281507, intron 1 of 12) MER102c|DNA|hAT-Charlie -4823 NM_001199506 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 137.25-117 chr4 184760137 184760440 + 0.75 NA intron (NM_001995, intron 18 of 20) intron (NM_001995, intron 18 of 20) -26192 NM_024629 79682 Hs.575032 NM_024629 ENSG00000151725 CENPU CENP50|CENPU50|KLIP1|MLF1IP|PBIP1 centromere protein U protein-coding 217.75-39 chr2 104623710 104624227 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -113459 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 128.5-43 chr11 84613658 84613943 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 107142 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 160.5-51 chr14 49280044 49280387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 306165 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 139.75-24 chr11 63181816 63182115 + 0.75 NA intron (NM_199352, intron 5 of 8) intron (NM_199352, intron 5 of 8) -37744 NM_001136506 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 134-53 chr14 60720292 60720595 + 0.75 NA exon (NM_017420, exon 2 of 3) exon (NM_017420, exon 2 of 3) 3908 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 144.5-70 chr14 88725202 88725613 + 0.75 NA intron (NM_183387, intron 8 of 42) intron (NM_183387, intron 8 of 42) 67546 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 167-98 chr6 52040005 52040251 + 0.75 NA intron (NM_138694, intron 27 of 66) L1MB7|LINE|L1 47485 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 222-64 chr5 29560369 29560822 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -164619 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 215.75-3 chr1 56825459 56825780 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6215 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 186-89 chr7 81772950 81773287 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3071 NM_001010932 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 149.25-72 chr19 49873545 49873766 + 0.75 NA intron (NM_001278160, intron 1 of 4) intron (NM_001278160, intron 1 of 4) 2594 NM_001278159 84335 Hs.515542 NM_032375 ENSG00000204673 AKT1S1 Lobe|PRAS40 AKT1 substrate 1 protein-coding 170.5-181 chr7 140688201 140688536 + 0.75 NA intron (NM_052853, intron 5 of 7) intron (NM_052853, intron 5 of 7) -8340 NM_004546 4708 Hs.655788 NM_004546 ENSG00000090266 NDUFB2 AGGG|CI-AGGG NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2 protein-coding 145.5-139 chr3 190785500 190785849 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 77020 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 148.75-59 chr15 66473804 66474125 + 0.75 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) AluSz6|SINE|Alu 23070 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 213-80 chr5 164780495 164780909 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 310423 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 180-7 chr1 216875253 216875624 + 0.75 NA intron (NM_001243507, intron 2 of 7) L1ME3A|LINE|L1 64235 NM_001243513 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 178.75-45 chr2 44317715 44318025 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001171603, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001171603, exon 15 of 15) 41879 NM_001042385 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 114-62 chr18 12903440 12903729 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -19249 NM_001207013 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 202.25-77 chr6 114600342 114600709 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -537648 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 167.5-3 chr1 46171266 46171750 + 0.75 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) intron (NM_001303427, intron 1 of 9) 3393 NM_001328648 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 136.75-192 chr8 76412208 76412495 + 0.75 NA intron (NR_105006, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 5697 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 114.5-76 chr13 38105610 38105859 + 0.75 NA intron (NR_047500, intron 1 of 5) L1PA15|LINE|L1 37498 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 173.5-25 chr10 102267947 102268293 + 0.75 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) intron (NM_001199378, intron 3 of 39) 22588 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 198.75-3 chr1 73478876 73479386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172961 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 114-98 chr3 5269845 5270128 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -19731 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 130-111 chr4 16956685 16957008 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58037 NM_001304435 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 135.75-139 chr3 65263767 65263992 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -575879 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 166.25-119 chr5 16060815 16061119 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 118824 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 212.5-83 chr4 174119179 174119560 + 0.75 NA intron (NR_125896, intron 2 of 4) MER5B|DNA|hAT-Charlie 101029 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 143.25-37 chr12 49761810 49762054 + 0.75 NA intron (NM_001098576, intron 9 of 9) intron (NM_001098576, intron 9 of 9) 20123 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 135.5-161 chr5 59829703 59830043 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -61025 NM_001364603 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 171-105 chr4 127083422 127083773 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -549360 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 169.5-96 chr22 22815354 22815697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7251 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 120-160 chr6 44843485 44843790 + 0.75 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) L1ME1|LINE|L1 -291756 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 174.5-162 chr6 118745629 118745911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35695 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 124.75-15 chr1 158645218 158645407 + 0.75 NA exon (NM_003126, exon 29 of 52) exon (NM_003126, exon 29 of 52) 38873 NM_001004478 128368 Hs.553590 NM_001004478 ENSG00000198967 OR10Z1 OR1-15 olfactory receptor family 10 subfamily Z member 1 protein-coding 158.5-43 chr11 78135456 78135849 + 0.75 NA intron (NM_001007027, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 3974 NM_024079 79053 Hs.503368 NM_024079 ENSG00000159063 ALG8 CDG1H|PCLD3 ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 123.5-28 chr10 69426503 69426775 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -9721 NM_001057 6865 Hs.88372 NM_001057 ENSG00000075073 TACR2 NK2R|NKNAR|SKR|TAC2R tachykinin receptor 2 protein-coding 158-57 chr16 87121704 87121976 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 64056 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 161-43 chr15 63340662 63340984 + 0.75 NA intron (NR_135511, intron 5 of 9) intron (NR_135511, intron 5 of 9) 41023 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 158.25-66 chr2 130347093 130347494 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001320304, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001320304, exon 9 of 9) -4612 NM_001321118 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 122.25-77 chr17 76310715 76311037 + 0.75 NA TTS (NM_001366236) TTS (NM_001366236) -3196 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 158.75-42 chr12 52033639 52033983 + 0.75 NA intron (NM_001202233, intron 1 of 7) intron (NM_001202233, intron 1 of 7) -3904 NM_001202234 3164 Hs.524430 NM_002135 ENSG00000123358 NR4A1 GFRP1|HMR|N10|NAK-1|NGFIB|NP10|NUR77|TR3 nuclear receptor subfamily 4 group A member 1 protein-coding 163.25-78 chr20 37751331 37751679 + 0.75 NA intron (NM_001281495, intron 5 of 16) intron (NM_001281495, intron 5 of 16) 57475 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 120-200 chr9 73537970 73538223 + 0.75 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 386231 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 152-2 chr1 15238592 15238968 + 0.75 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -8445 NM_052929 114827 Hs.659997 NM_052929 ENSG00000142621 FHAD1 - forkhead associated phosphopeptide binding domain 1 protein-coding 138-11 chr10 76150029 76150265 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 367386 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 127.75-181 chr7 3879667 3879914 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -249895 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 195.25-60 chr22 36349813 36350247 + 0.75 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) intron (NM_002473, intron 1 of 40) 38037 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 150-47 chr15 23782660 23782880 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -95465 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 183.75-20 chr10 90968790 90969175 + 0.75 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) MamRep605|LTR?|LTR? 21682 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 151-114 chr5 148941258 148941666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114869 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 187.75-111 chr8 55487779 55488175 + 0.75 NA intron (NM_052898, intron 2 of 2) Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -32656 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 120-114 chr3 35197572 35197737 + 0.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 196369 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 142-74 chr19 29149836 29150141 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 63163 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 202.75-111 chr8 142027825 142028178 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -148338 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 160.75-129 chr5 180552076 180552390 + 0.75 NA intron (NM_001370474, intron 2 of 10) intron (NM_001370474, intron 2 of 10) 10579 NM_001370474 57472 Hs.608380 NM_015455 ENSG00000113300 CNOT6 CCR4|Ccr4a CCR4-NOT transcription complex subunit 6 protein-coding 208.75-72 chr5 161958522 161959079 + 0.75 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) intron (NR_126372, intron 1 of 2) 42396 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 121.75-132 chr4 91885441 91885717 + 0.75 NA Intergenic (TTTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 391723 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 170.75-78 chr20 50874358 50874619 + 0.75 NA intron (NM_198799, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 35303 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 125-145 chr6 160354193 160354419 + 0.75 NA intron (NM_021977, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 5928 NM_021977 6581 Hs.567337 NM_021977 ENSG00000146477 SLC22A3 EMT|EMTH|OCT3 solute carrier family 22 member 3 protein-coding 206.25-40 chr15 59764579 59765070 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -75504 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 151.75-22 chr10 84636780 84637087 + 0.75 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 211764 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 126.25-176 chr6 69978965 69979267 + 0.75 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) L1M1|LINE|L1 112560 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 128.5-25 chr10 44415744 44415968 + 0.75 NA Intergenic MER65B|LTR|ERV1 -30759 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 159.25-150 chr8 95773201 95773499 + 0.75 NA intron (NR_038205, intron 2 of 2) intron (NR_038205, intron 2 of 2) 174998 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 114-127 chr5 26756844 26757019 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 281655 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 118-49 chr14 54194636 54194975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -202063 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 200.75-16 chr11 34820141 34820736 + 0.75 NA Intergenic LTR75|LTR|ERVL -95692 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 161.75-135 chr9 99560091 99560370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -184973 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 145.25-77 chr2 145741770 145742182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -845081 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 241-20 chr17 47633678 47634193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15984 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 131.75-96 chr18 5234868 5235070 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 3060 NR_026849 147525 Hs.657197 NM_152471 LINC00526 C18orf18|HsT959 long intergenic non-protein coding RNA 526 ncRNA 225.25-83 chr8 81154956 81155491 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43155 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 156.25-155 chr9 37717044 37717306 + 0.75 NA intron (NM_001371225, intron 5 of 15) CR1-3_Croc|LINE|CR1 -36628 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 235.5-17 chr10 99514763 99515244 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 16174 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 221.25-6 chr1 172711715 172712066 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52787 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 135.25-174 chr6 28459924 28460154 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16548 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 144.25-98 chr2 74773262 74773605 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -59222 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 240.5-66 chr3 95759865 95760597 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -77038 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 168.25-62 chr17 73447239 73447521 + 0.75 NA intron (NM_001144952, intron 5 of 44) intron (NM_001144952, intron 5 of 44) -66303 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 336.75-22 chr8 139823775 139824400 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) MIRc|SINE|MIR -120964 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 135.25-177 chr6 52564683 52564931 + 0.75 NA intron (NM_012288, intron 1 of 10) intron (NM_012288, intron 1 of 10) 12253 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 148.75-60 chr15 68202909 68203344 + 0.75 NA intron (NM_001286694, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 2984 NM_001286694 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 242.5-76 chr7 31559411 31559944 + 0.75 NA intron (NM_194300, intron 3 of 12) AluSz6|SINE|Alu 6675 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 154.5-197 chr8 138999074 138999384 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85188 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 117.5-20 chr1 221817799 221818026 + 0.75 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 22754 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 161-118 chr8 110059494 110059837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83894 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 173.25-92 chr4 126588529 126588853 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -1044266 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 195.75-85 chr4 97876098 97876502 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) intron (NM_174952, intron 8 of 10) 267176 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 221-75 chr7 138063345 138063681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12946 NM_001190907 6718 Hs.201667 NM_005989 ENSG00000122787 AKR1D1 3o5bred|CBAS2|SRD5B1 aldo-keto reductase family 1 member D1 protein-coding 146-87 chr21 21179026 21179523 + 0.75 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) intron (NM_001352597, intron 1 of 10) 32112 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 151.75-88 chr3 96955039 96955419 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) L1ME3G|LINE|L1 140635 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 131.5-215 chr7 29559198 29559433 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4520 NM_175887 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 118.25 chr1 7201979 7202345 + 0.75 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) L1MB7|LINE|L1 187592 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 159.25-75 chr20 33879830 33880263 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 68698 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 121.5-91 chr15 85994109 85994297 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -85417 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 229.75-56 chr4 121213941 121214484 + 0.75 NA intron (NM_001128843, intron 2 of 12) intron (NM_001128843, intron 2 of 12) 2415 NM_001128843 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 127-111 chr22 30599495 30599737 + 0.75 NA intron (NM_001282327, intron 2 of 16) LTR57-int|LTR|ERVL 7397 NM_001282328 23481 Hs.517543 NM_014303 ENSG00000100029 PES1 NOP7|PES pescadillo ribosomal biogenesis factor 1 protein-coding 182.5-13 chr1 214260589 214261184 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -20273 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 224.5-87 chr5 13805771 13806311 + 0.75 NA intron (NM_001369, intron 47 of 78) intron (NM_001369, intron 47 of 78) 138439 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 252.5-8 chr10 45030074 45030476 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 29352 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 164.75-108 chr4 80926361 80926580 + 0.75 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) intron (NM_152770, intron 4 of 5) -104238 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 115.25-123 chr22 19481930 19482147 + 0.75 NA intron (NM_001178011, intron 3 of 17) intron (NM_001178011, intron 3 of 17) 2118 NR_161281 8318 Hs.474217 NM_003504 ENSG00000093009 CDC45 CDC45L|CDC45L2|MGORS7|PORC-PI-1 cell division cycle 45 protein-coding 122-36 chr10 122093910 122094084 + 0.75 NA intron (NM_001291877, intron 5 of 19) MIRc|SINE|MIR -18888 NM_001291879 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 146.25-19 chr11 50390678 50390893 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -18362 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 141.25-149 chr5 169503584 169503901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80031 NM_001329639 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 169-84 chr6 39942018 39942451 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -7772 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 186-101 chrX 75166323 75166801 + 0.75 NA intron (NM_001363821, intron 2 of 9) intron (NM_001363821, intron 2 of 9) 10193 NM_001363821 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 123.5-181 chr6 12426195 12426398 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 135935 NM_001955 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 201-13 chr10 98833209 98833553 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 91187 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 204-2 chr1 100910185 100910570 + 0.75 NA intron (NM_133496, intron 3 of 10) intron (NM_133496, intron 3 of 10) 14287 NM_001144884 148867 Hs.533903 NM_133496 ENSG00000162695 SLC30A7 ZNT7|ZnT-7|ZnTL2 solute carrier family 30 member 7 protein-coding 133.25-18 chr10 35813436 35813724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35278 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 120.75-99 chr22 28008392 28008639 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 14 of 22) intron (NM_001145418, intron 14 of 22) -87903 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 143.25-66 chr16 79157138 79157596 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MIRc|SINE|MIR 443370 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 206.75-25 chr17 60314998 60315494 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) AluSx|SINE|Alu 76887 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 137.5-21 chr1 219518474 219518763 + 0.75 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 38706 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 140.25-199 chrX 64236828 64237058 + 0.75 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -6336 NM_130388 142689 Hs.56281 NM_130388 ENSG00000198881 ASB12 - ankyrin repeat and SOCS box containing 12 protein-coding 140-40 chr14 23748966 23749263 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 112750 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 151.25-123 chr3 64523864 64524147 + 0.75 NA intron (NM_001318781, intron 37 of 38) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -37341 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-157 chr5 68465467 68465695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 173004 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 183-58 chr2 230402754 230403171 + 0.75 NA non-coding (NR_148198, exon 18 of 18) non-coding (NR_148198, exon 18 of 18) -13194 NM_001206703 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 117.5-55 chr13 69876948 69877121 + 0.75 NA intron (NM_001286725, intron 4 of 9) AluSq|SINE|Alu -230179 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 147.25-143 chr8 96097772 96098009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62916 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 121.25-125 chr22 40326784 40327036 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001024843, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001024843, exon 24 of 24) -19590 NM_000026 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 234.75-3 chr1 72033140 72033641 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -196378 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 117.5-233 chr8 79464617 79464927 + 0.75 NA Intergenic MLT2B5|LTR|ERVL 132584 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 129.5-50 chr12 15427835 15428180 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1M6|LINE|L1 105499 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 158.25-78 chr21 23476450 23476738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91759 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 243.5-47 chr3 4682246 4682607 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 25 of 60) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 69164 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 138-7 chr10 51005389 51005663 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 14638 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 156.75-4 chr1 78556172 78556436 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -64144 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 159.5-105 chr2 79665491 79665846 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) intron (NM_001282598, intron 2 of 17) -16309 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 129.25-195 chr8 55246788 55247152 + 0.75 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 144942 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 124.25-156 chr5 13955105 13955347 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -10746 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 157.75-79 chr19 29486154 29486668 + 0.75 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) L1M5|LINE|L1 39341 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 198-17 chr12 15638397 15638662 + 0.75 NA intron (NM_004447, intron 17 of 20) intron (NM_004447, intron 17 of 20) 91918 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 156.75-39 chr12 9330479 9330739 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -36855 NR_120479 101930452 Hs.734183 NR_120479 ENSG00000260423 LINC02367 - long intergenic non-protein coding RNA 2367 ncRNA 174.25-46 chr14 32113377 32113728 + 0.75 NA intron (NM_001173, intron 2 of 6) intron (NM_001173, intron 2 of 6) 36248 NM_001173 394 Hs.592313 NM_001173 ENSG00000100852 ARHGAP5 GFI2|RhoGAP5|p190-B|p190BRhoGAP Rho GTPase activating protein 5 protein-coding 191.75-22 chr11 75604927 75605313 + 0.75 NA 3' UTR (NM_207577, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_207577, exon 3 of 3) 21924 NR_145823 105369391 Hs.689687 NR_145823 ENSG00000255326 LOC105369391 - uncharacterized LOC105369391 ncRNA 196-82 chr5 179599432 179599810 + 0.75 NA non-coding (NR_110560, exon 5 of 9) non-coding (NR_110560, exon 5 of 9) 4120 NR_110560 101928445 Hs.663255 NR_110560 ENSG00000244945 LOC101928445 - uncharacterized LOC101928445 ncRNA 144-112 chr6 111810526 111810841 + 0.75 NA intron (NM_153047, intron 2 of 13) intron (NM_153047, intron 2 of 13) -50766 NM_001370529 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 115-13 chr1 187222383 187222543 + 0.75 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) L1MA1|LINE|L1 129621 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 118.75-9 chr1 109423960 109424245 + 0.75 NA intron (NM_001199774, intron 1 of 8) intron (NM_001199774, intron 1 of 8) 2346 NM_001199774 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 171.25-82 chr2 196289261 196289579 + 0.75 NA intron (NM_020760, intron 14 of 28) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 29396 NR_110225 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 271.5-98 chr9 83233393 83234047 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33548 NM_001244962 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 160.25-142 chr6 77758764 77759120 + 0.75 NA intron (NM_001282136, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 105903 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 167.75-81 chr2 225482064 225482492 + 0.75 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) intron (NM_001371273, intron 3 of 7) 81392 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 142.75-37 chr11 67018205 67018465 + 0.75 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -4458 NM_001177880 91683 Hs.287636 NM_177963 ENSG00000173227 SYT12 SYT11|sytXII synaptotagmin 12 protein-coding 120.75-92 chr20 34512996 34513249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3262 NM_014183 83658 Hs.593920 NM_014183 ENSG00000125971 DYNLRB1 BITH|BLP|DNCL2A|DNLC2A|ROBLD1 dynein light chain roadblock-type 1 protein-coding 135.5-127 chr21 19948868 19949105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49231 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 145.25-30 chr12 63216620 63216826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63913 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 156.5-156 chr5 143562290 143562658 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117386 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 115.75-150 chr4 32855854 32856057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 504917 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 169.25-128 chr9 37607967 37608252 + 0.75 NA intron (NM_001371225, intron 1 of 15) intron (NM_001371225, intron 1 of 15) 4880 NM_001371224 132.25-193 chr9 68842297 68842635 + 0.75 NA intron (NM_003558, intron 4 of 15) intron (NM_003558, intron 4 of 15) 62401 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 225.5-104 chr8 82178258 82178619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -336152 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 137.25-151 chr7 62606341 62606638 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 697567 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 173.25-23 chr12 20592182 20592671 + 0.75 NA intron (NM_001244683, intron 1 of 14) intron (NM_001244683, intron 1 of 14) 20562 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 166.5-48 chr12 17461748 17462172 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 127118 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 178.25-114 chr8 59682488 59682740 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 563404 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 231.5-32 chr15 93406826 93407370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 201032 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 277.25-10 chr12 114523567 114524010 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115346 NM_000192 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 122.25-56 chr14 22295314 22295539 + 0.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 137327 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 117.75-161 chr4 106923374 106923592 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014421, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_014421, exon 4 of 4) 112830 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 124.25-150 chr4 87948575 87948861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26932 NM_001040060 6696 Hs.313 NM_000582 ENSG00000118785 SPP1 BNSP|BSPI|ETA-1|OPN secreted phosphoprotein 1 protein-coding 252.25-18 chr14 54497119 54497829 + 0.75 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -8494 NM_004124 2764 Hs.151413 NM_004124 ENSG00000197045 GMFB GMF glia maturation factor beta protein-coding 166.25-16 chr1 184586677 184587045 + 0.75 NA intron (NM_030806, intron 3 of 5) L1PA13|LINE|L1 167997 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 196.25-72 chr2 235969945 235970347 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 13 of 17) AluSx|SINE|Alu 198240 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 143-53 chr17 29855158 29855381 + 0.75 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu -74634 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 134-167 chr8 24570658 24570979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22200 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 219.75-86 chr8 87029556 87030030 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 163378 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 207.75-57 chr2 84926905 84927390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21491 NM_021103 9168 Hs.446574 NM_021103 ENSG00000034510 TMSB10 MIG12|TB10 thymosin beta 10 protein-coding 115.25-43 chr12 2347554 2347936 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 77969 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 133.25-110 chr2 180607140 180607340 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84864 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 209-63 chr7 55187362 55187941 + 0.75 NA intron (NR_047551, intron 1 of 1) intron (NR_047551, intron 1 of 1) 1298 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 118.75-33 chr11 31442337 31442539 + 0.75 NA intron (NM_001304274, intron 4 of 5) intron (NM_001304274, intron 4 of 5) 67184 NM_144981 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 171.25-158 chr9 104531857 104532099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4769 NM_001001919 138804 Hs.553601 NM_001001919 ENSG00000148136 OR13C4 HSHTPCRX17|HTPCRX17|OR2K1|OR37F|OR9-7 olfactory receptor family 13 subfamily C member 4 protein-coding 125.25-112 chr2 165696464 165696856 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97587 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 135-163 chr7 32448707 32449034 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 9624 NR_038454 100130673 Hs.609282 NR_038454 LOC100130673 - phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 pseudogene pseudo 191-4 chr1 202894211 202894499 + 0.75 NA intron (NM_001303109, intron 7 of 9) intron (NM_001303109, intron 7 of 9) -5206 NM_002871 5877 Hs.90875 NM_002871 ENSG00000183155 RABIF MSS4|RASGFR3|RASGRF3 RAB interacting factor protein-coding 121.25-179 chr6 82189700 82189944 + 0.75 NA intron (NM_015525, intron 25 of 28).2 intron (NM_015525, intron 25 of 28).2 57922 NM_015525 25998 Hs.306425 NM_015525 ENSG00000005700 IBTK BTBD26|BTKI inhibitor of Bruton tyrosine kinase protein-coding 116.25-85 chr17 65829368 65829685 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) -2983 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 180.25-99 chr5 94094619 94095052 + 0.75 NA intron (NM_032042, intron 1 of 10) MER77B|LTR|ERVL 16828 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 125.75-126 chr3 49726826 49727175 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001242829, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001242829, exon 6 of 6) -3026 NM_013334 29925 Hs.567488 NM_013334 ENSG00000173540 GMPPB LGMDR19|MDDGA14|MDDGB14|MDDGC14 GDP-mannose pyrophosphorylase B protein-coding 190.5-159 chr8 102434939 102435232 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -22385 NM_015902 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 125.5-171 chr3 54582065 54582258 + 0.75 NA intron (NM_018398, intron 9 of 37) intron (NM_018398, intron 9 of 37) 57696 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 133.25-170 chr5 44528152 44528480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18034 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 127.25-73 chr17 58144883 58145109 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -10158 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 140-54 chr16 65099477 65099849 + 0.75 NA intron (NM_001330576, intron 1 of 11) intron (NM_001330576, intron 1 of 11) 22400 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 144.75-24 chr10 118040998 118041417 + 0.75 NA intron (NM_014904, intron 1 of 4) intron (NM_014904, intron 1 of 4) -5614 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 127.25-173 chr5 125543679 125543949 + 0.75 NA intron (NR_109887, intron 3 of 3) L1MD1|LINE|L1 50553 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 174.5-155 chr5 148551932 148552190 + 0.75 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) intron (NM_001040172, intron 1 of 5) 85000 NM_001040173 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 308-17 chr2 39194477 39195249 + 0.75 NA intron (NM_001009565, intron 4 of 7) L1MB4|LINE|L1 34725 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 139.75-76 chr17 52601294 52601514 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 210882 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 180.75-13 chr1 208916197 208916580 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -56066 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 162.25-113 chr4 80733009 80733369 + 0.75 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -297519 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 134-5 chr1 64408792 64408979 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -61244 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 193.75-27 chr11 72930286 72930900 + 0.75 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) AluSx|SINE|Alu 116182 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 224.25-32 chr16 49983891 49984214 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -41154 NM_153261 255919 Hs.59134 NM_153261 ENSG00000205423 CNEP1R1 C16orf69|NEP1-R1|NEP1R1|TMEM188|TMP125 CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 protein-coding 147.25-161 chr9 80434287 80434758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 459499 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 163-42 chr15 56380155 56380466 + 0.75 NA intron (NM_198524, intron 3 of 12) L1M1|LINE|L1 14886 NM_198524 374618 Hs.511476 NM_198524 ENSG00000151575 TEX9 - testis expressed 9 protein-coding 160.25-23 chr12 48563186 48563506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6700 NM_002289 3906 Hs.72938 NM_002289 ENSG00000167531 LALBA LYZG lactalbumin alpha protein-coding 194.5-20 chr10 114128429 114128854 + 0.75 NA intron (NM_001321829, intron 14 of 16) MIRb|SINE|MIR 45538 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 199-5 chr1 186377970 186378321 + 0.75 NA intron (NM_001164246, intron 1 of 12) intron (NM_001164246, intron 1 of 12) 2307 NM_017847 54953 Hs.371210 NM_017847 ENSG00000157181 ODR4 C1orf27|TTG1|odr-4 odr-4 GPCR localization factor homolog protein-coding 165.5-18 chr10 54588427 54588804 + 0.75 NA intron (NR_134503, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu 19342 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 127.25-50 chr13 25992264 25992567 + 0.75 NA intron (NM_016529, intron 35 of 36) L1MD1|LINE|L1 58645 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 197.5-60 chr19 34744325 34744744 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001145665, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001145665, exon 4 of 4) 10291 NM_001029997 339318 Hs.720472 NM_001029997 ENSG00000197841 ZNF181 HHZ181 zinc finger protein 181 protein-coding 138.25-31 chr11 57627326 57627590 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13740 NR_029673 406919 NR_029673 ENSG00000208009 MIR130A MIRN130A|miRNA130A|mir-130a microRNA 130a ncRNA 139-33 chr13 77161068 77161343 + 0.75 NA intron (NM_015057, intron 44 of 82) intron (NM_015057, intron 44 of 82) 85691 NR_046716 100874212 Hs.569288 NR_046716 ENSG00000236051 MYCBP2-AS1 - MYCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 192.75-53 chr2 10408780 10409340 + 0.75 NA intron (NM_134421, intron 3 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 37789 NR_028374 100302743 Hs.730525 NR_028374 ENSG00000206633 SNORA80B ACA67B small nucleolar RNA, H/ACA box 80B snoRNA 180-84 chr3 105615920 105616252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 249177 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 173-122 chr6 85941514 85941797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262922 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 126.75-64 chr14 79007211 79007463 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -192645 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 198.75-44 chr2 96880323 96880679 + 0.75 NA intron (NM_001122646, intron 14 of 16) intron (NM_001122646, intron 14 of 16) -10421 NM_017789 54910 Hs.516220 NM_017789 ENSG00000168758 SEMA4C M-SEMA-F|SEMACL1|SEMAF|SEMAI semaphorin 4C protein-coding 211.25-77 chr5 130484359 130484714 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 580071 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 140.5-221 chr7 137163535 137163722 + 0.75 NA intron (NR_046103, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 713 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 168-67 chr2 101215411 101215760 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -37301 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 219-28 chr13 28222973 28223339 + 0.75 NA intron (NM_175854, intron 6 of 18) intron (NM_175854, intron 6 of 18) -83982 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 216.25-49 chr18 11135347 11135861 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 1 of 51) AluSc8|SINE|Alu 13158 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 145.75-64 chr17 59705998 59706297 + 0.75 NA intron (NM_001015509, intron 1 of 2) intron (NM_001015509, intron 1 of 2) 1451 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 175.75-115 chr6 129312966 129313439 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 23 of 64) intron (NM_000426, intron 23 of 64) 396975 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 185-60 chr3 188502846 188503233 + 0.75 NA intron (NM_001167672, intron 3 of 9) L1M4c|LINE|L1 65627 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 145.5-98 chr2 59483901 59484252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 266368 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 122.25-126 chr3 94981861 94982215 + 0.75 NA intron (NR_015400, intron 4 of 7) L1MC3|LINE|L1 43775 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 195-55 chr20 57203745 57204305 + 0.75 NA intron (NM_001719, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR -9671 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 153.75-145 chr7 101795407 101795694 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -20457 NM_001202543 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 136-153 chr8 99832582 99832953 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 52 of 61) intron (NM_017890, intron 52 of 61) 60940 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 155.75-138 chr6 50168029 50168292 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -118231 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 175-129 chr8 89258223 89258603 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 499298 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 190.75-88 chr5 83634617 83635086 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -72537 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 186-97 chr9 130847265 130847571 + 0.75 NA intron (NM_005157, intron 1 of 10) intron (NM_005157, intron 1 of 10) 12164 NM_005157 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 219-19 chr12 14185002 14185326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -180468 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 135.75-153 chr3 195844446 195844768 + 0.75 NA intron (NR_134939, intron 1 of 1) AluSx3|SINE|Alu 9621 NR_134940 101929697 Hs.551750 NR_134939 LINC01983 - long intergenic non-protein coding RNA 1983 ncRNA 195.75-45 chr14 70033661 70034175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46299 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 127.25-70 chr16 88609884 88610284 + 0.75 NA intron (NM_001294340, intron 8 of 18) intron (NM_001294340, intron 8 of 18) -28488 NM_013278 27189 Hs.278911 NM_013278 ENSG00000124391 IL17C CX2|IL-17C interleukin 17C protein-coding 136.75-211 chrX 115434926 115435298 + 0.75 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 -126062 NM_001282337 5358 Hs.496622 NM_005032 ENSG00000102024 PLS3 BMND18|T-plastin plastin 3 protein-coding 144.75-6 chr1 91595453 91595671 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 94454 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 166.25-113 chr4 48502238 48502656 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 61 of 63) AluSx1|SINE|Alu 12195 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 190.75-37 chr17 27284110 27284468 + 0.75 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 9707 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 230.75-74 chr8 123832894 123833236 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18922 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 206.75-11 chr11 107517617 107518066 + 0.75 NA intron (NM_138775, intron 10 of 11) L1MA8|LINE|L1 47894 NM_001301010 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 162.5-175 chr8 109440247 109440540 + 0.75 NA intron (NM_177531, intron 32 of 77) intron (NM_177531, intron 32 of 77) 77932 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 122.5-223 chr8 85835160 85835374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7325 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 120-38 chr14 22004382 22004561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -333454 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 128.75-2 chr1 12743774 12744063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2282 NM_001330361 93190 Hs.98095 NM_152290 ENSG00000157330 C1orf158 - chromosome 1 open reading frame 158 protein-coding 112.25-166 chr5 79439118 79439404 + 0.75 NA intron (NM_001277078, intron 4 of 5) intron (NM_001277078, intron 4 of 5) 74575 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 203.5-30 chr11 37368223 37368668 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -570156 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 319-16 chr2 74623175 74623617 + 0.75 NA intron (NM_001321739, intron 2 of 10) AluJb|SINE|Alu 24641 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 159-26 chr12 26163873 26164291 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31254 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 191.5-51 chr16 17581065 17581381 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -110263 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 139.5-122 chr22 19398669 19398928 + 0.75 NA intron (NM_003325, intron 5 of 24) AluJb|SINE|Alu 32935 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 230.75 chr1 50498728 50499081 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 15 of 18) L1MB4|LINE|L1 -75461 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 178.75-27 chr14 44431299 44431629 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 75819 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 125-68 chr2 72831301 72831512 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5373 NM_001321729 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 252.75-53 chr4 163535083 163535717 + 0.75 NA intron (NM_017923, intron 3 of 3) intron (NM_017923, intron 3 of 3) 40710 NM_018352 55319 Hs.267446 NM_018352 ENSG00000198498 TMA16 C4orf43 translation machinery associated 16 homolog protein-coding 130.5-60 chr11 55358326 55358559 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -9442 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 129.5-169 chr4 97754650 97754904 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) L2|LINE|L2 387851 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 185-73 chr5 169323608 169323938 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -22634 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 173.5-62 chr2 21135063 21135376 + 0.75 NA intron (NM_001306137, intron 3 of 3) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11233 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 282.25-28 chr5 40770815 40771196 + 0.75 NA intron (NM_006251, intron 4 of 8) intron (NM_006251, intron 4 of 8) -15044 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 144.25-219 chr9 1609714 1609928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -405526 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 229-2 chr1 27827857 27828290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2709 NM_002713 5511 Hs.533474 NM_002713 ENSG00000117751 PPP1R8 ARD-1|ARD1|NIPP-1|NIPP1|PRO2047 protein phosphatase 1 regulatory subunit 8 protein-coding 135.5-39 chr11 97527786 97528035 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 1019485 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 113-173 chr8 69168786 69169026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64716 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 132-158 chr7 34158862 34159183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 253483 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 190.5-112 chr4 67349347 67349761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72446 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 131-116 chr3 68403259 68403496 + 0.75 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -97260 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 121.5-58 chr12 55018488 55018858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1301 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 164.25-73 chr2 145495097 145495449 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 827306 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 181-24 chr13 111903848 111904177 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10516 NR_120401 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 191.75-11 chr1 218362346 218362700 + 0.75 NA intron (NR_138148, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR -16845 NR_046268 728463 Hs.568469 NR_046268 ENSG00000232480 TGFB2-AS1 - TGFB2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 131.25-168 chr5 106752052 106752330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258823 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 186.5-125 chr7 33590934 33591216 + 0.75 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -313840 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 219.75-50 chr3 102440213 102440609 + 0.75 NA intron (NM_175056, intron 2 of 10) L2|LINE|L2 5396 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 153-36 chr13 113149076 113149487 + 0.75 NA exon (NM_001312674, exon 7 of 7) exon (NM_001312674, exon 7 of 7) -9367 NM_003891 8858 Hs.1011 NM_003891 ENSG00000126231 PROZ PZ protein Z, vitamin K dependent plasma glycoprotein protein-coding 139-149 chr8 72827360 72827589 + 0.75 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 95429 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 169-24 chr13 105704497 105704782 + 0.75 NA Intergenic (AATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2191 NR_120418 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 247-55 chr7 24799096 24799537 + 0.75 NA non-coding (NR_104112, exon 21 of 21) non-coding (NR_104112, exon 21 of 21) -41377 NM_004403 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 117.75-60 chr14 90506641 90506867 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 10455 NR_135274 105370619 Hs.525530 NR_135274 LOC105370619 - uncharacterized LOC105370619 ncRNA 118.25-107 chr2 172005039 172005316 + 0.75 NA intron (NM_001322279, intron 1 of 9) L1PB2|LINE|L1 5224 NR_136273 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 191.25-32 chr14 55398201 55398716 + 0.75 NA intron (NM_014924, intron 1 of 9) L1M5|LINE|L1 13400 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 112.5-97 chr18 12729554 12729746 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 19772 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 135.25-37 chr10 122898220 122898422 + 0.75 NA non-coding (NR_027282, exon 6 of 6) non-coding (NR_027282, exon 6 of 6) -12289 NM_001029888 118670 Hs.369829 NM_001029888 ENSG00000203795 FAM24A - family with sequence similarity 24 member A protein-coding 171.75 chr1 8998753 8999065 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 27436 NM_207420 155184 Hs.531239 NM_207420 ENSG00000197241 SLC2A7 GLUT-7|GLUT7 solute carrier family 2 member 7 protein-coding 194-2 chr1 45210230 45210652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3836 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 147 chr1 15523065 15523412 + 0.75 NA intron (NM_032996, intron 1 of 8) intron (NM_032996, intron 1 of 8) 977 NM_001229 842 Hs.329502 NM_001229 ENSG00000132906 CASP9 APAF-3|APAF3|ICE-LAP6|MCH6|PPP1R56 caspase 9 protein-coding 285.75-22 chr2 115312366 115313114 + 0.75 NA intron (NM_001321909, intron 2 of 24) intron (NM_001321909, intron 2 of 24) 3503 NM_020868 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 187-47 chr2 201508736 201508985 + 0.75 NA intron (NM_001168216, intron 11 of 12) L1MB2|LINE|L1 57120 NM_001206864 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 115.5-212 chr6 41898046 41898259 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -2777 NM_018561 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 149-118 chr7 40823938 40824282 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 155829 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 169.5-79 chr2 161152540 161152847 + 0.75 NA intron (NM_004180, intron 1 of 7) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -7735 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 178.25-113 chr8 51349400 51349753 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 19 of 22) L2c|LINE|L2 459869 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 181.5-127 chr4 160990848 160991157 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -1031731 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 161-11 chr10 45524258 45524549 + 0.75 NA intron (NM_001282866, intron 2 of 7) intron (NM_001282866, intron 2 of 7) 10968 NM_001282866 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 166.5-197 chr8 65294726 65295096 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114571 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 132.25-146 chr4 184392528 184392774 + 0.75 NA intron (NM_002199, intron 7 of 8) intron (NM_002199, intron 7 of 8) -10345 NR_125933 102723766 Hs.432281 NR_125933 ENSG00000249096 LINC02362 - long intergenic non-protein coding RNA 2362 ncRNA 187.5-82 chr2 28466338 28466705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29539 NM_153021 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 315.75-22 chr5 131193030 131193649 + 0.75 NA intron (NM_181705, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 22395 NR_121658 90624 Hs.115467 NM_181705 ENSG00000186687 LYRM7 C5orf31|MC3DN8|MZM1L LYR motif containing 7 protein-coding 133.5-259 chr8 48762584 48762977 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -27469 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 118.75-7 chr1 102265599 102265845 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -268488 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 192-88 chr6 56429489 56429936 + 0.75 NA Intergenic (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -35584 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 115.25-28 chr10 77492760 77493026 + 0.75 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MIR|SINE|MIR 142021 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 133-76 chr18 45662570 45662773 + 0.75 NA intron (NM_007163, intron 10 of 19) MIRc|SINE|MIR 47195 NM_007163 8170 Hs.710927 NM_007163 ENSG00000132874 SLC14A2 HUT2|UT-A2|UT2|UTA|UTR|hUT-A6 solute carrier family 14 member 2 protein-coding 210.25-41 chr2 55926956 55927338 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3365 NM_001039348 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 150.75-122 chr3 4191884 4192280 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -111222 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 201-48 chr20 56560292 56560800 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -17017 NR_136537 105372682 Hs.517135 NR_136537 ENSG00000225657 LINC01716 - long intergenic non-protein coding RNA 1716 ncRNA 200.25-91 chr5 133075854 133076295 + 0.75 NA intron (NM_002154, intron 6 of 18) intron (NM_002154, intron 6 of 18) 24061 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 129-145 chr5 124331637 124331847 + 0.75 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 106778 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 123.25-98 chr2 45997312 45997579 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 6 of 14) L1MC1|LINE|L1 -299962 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 127-75 chr16 65384128 65384348 + 0.75 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 192062 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 135.5-79 chr17 67067173 67067423 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 22744 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 226-33 chr17 72310606 72311048 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -31984 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 119.75-5 chr1 76086632 76086934 + 0.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 12037 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 142.5-125 chr20 51329419 51329644 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 123446 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 151.5-169 chr6 56196867 56197138 + 0.75 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) L1MA9|LINE|L1 50578 NM_001318751 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 147.5-207 chr8 79527541 79527777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83458 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 126.75-113 chr2 108033380 108033766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19182 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 139.25-12 chr10 11311026 11311429 + 0.75 NA intron (NM_001025076, intron 9 of 13) L1MEd|LINE|L1 33447 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 263-19 chr15 99680302 99681023 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001365211, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001365211, exon 8 of 8) 47684 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 164-112 chr6 46818568 46818845 + 0.75 NA intron (NM_005588, intron 6 of 13) L2c|LINE|L2 25317 NM_005588 4224 Hs.179704 NM_005588 ENSG00000112818 MEP1A PPHA meprin A subunit alpha protein-coding 156-129 chr6 47933258 47933795 + 0.75 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 135163 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 144-88 chr3 157229308 157229677 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -68732 NM_020307 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 160.75-39 chr13 88626790 88627027 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_047490) promoter-TSS (NR_047490) 55 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 206-43 chr2 97997772 97998187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2031 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 205.25-33 chr16 27019836 27020136 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -46941 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 234.5-18 chr12 42611131 42611597 + 0.75 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -21618 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 145.25-40 chr14 60068338 60068710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23387 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 149.25-144 chr5 94131577 94131818 + 0.75 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy -19998 NM_001163417 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 151.75-16 chr1 235357188 235357478 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10027 NM_001287802 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 180.5-65 chr18 80242194 80242495 + 0.75 NA intron (NM_032510, intron 1 of 2) intron (NM_032510, intron 1 of 2) 5170 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 140.5-128 chr20 6542414 6542699 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 115824 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 169.5-98 chr22 28201267 28201534 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L2c|LINE|L2 -258469 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 151.25-65 chr16 72879742 72880226 + 0.75 NA intron (NM_001164766, intron 3 of 8) intron (NM_001164766, intron 3 of 8) 168144 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 208.75-71 chr5 159742977 159743331 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 128230 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 115.25-89 chr19 28537641 28537817 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MEf|LINE|L1 -68959 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 139.5-117 chr20 20871195 20871431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158669 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 182.5-169 chr8 131994646 131995062 + 0.75 NA intron (NM_001323558, intron 19 of 23) L2c|LINE|L2 64528 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 122.25-87 chr2 33633666 33633942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34442 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 185.75-54 chr17 19908355 19908967 + 0.75 NA intron (NM_007202, intron 14 of 14) AluSx1|SINE|Alu -40725 NM_001142610 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 133.5-33 chr10 61953475 61953708 + 0.75 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) intron (NM_032199, intron 3 of 9) 51892 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 116-12 chr10 35540761 35541096 + 0.75 NA intron (NM_181698, intron 9 of 11) L1MB8|LINE|L1 -64413 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 150-16 chr10 85554199 85554551 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -23356 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-65 chr15 70677183 70677481 + 0.75 NA intron (NM_018003, intron 11 of 18) intron (NM_018003, intron 11 of 18) 24950 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 129.5-133 chr2 134360412 134360692 + 0.75 NA intron (NM_001371457, intron 10 of 16) intron (NM_001371457, intron 10 of 16) 106480 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 164.25-48 chr15 71654644 71655121 + 0.75 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) intron (NM_001286429, intron 1 of 11) 36657 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 152.5-51 chr14 88691687 88691964 + 0.75 NA intron (NM_183387, intron 17 of 42) intron (NM_183387, intron 17 of 42) 97405 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 264-48 chr4 84993841 84994529 + 0.75 NA intron (NR_152782, intron 2 of 3) intron (NR_152782, intron 2 of 3) 26701 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 159-131 chr9 80269921 80270200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 295037 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 165.75-57 chr15 63130349 63130799 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001288585, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001288585, exon 5 of 5) 8713 NM_001288585 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 115-20 chr10 66628393 66628652 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -297514 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 157-128 chr9 112791685 112792066 + 0.75 NA intron (NM_001012994, intron 1 of 8) L1MC|LINE|L1 41115 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 190-70 chr7 16371486 16371898 + 0.75 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) L1PBa|LINE|L1 49846 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 255-15 chr14 34540186 34540701 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001318916) promoter-TSS (NM_001318916) -706 NM_001318916 55837 Hs.433269 NM_018453 ENSG00000129518 EAPP BM036|C14orf11 E2F associated phosphoprotein protein-coding 136.25-134 chr4 160724380 160724720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -946766 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 155.5-78 chr18 21645418 21645727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18642 NM_001308257 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 132-64 chr16 64593797 64594118 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 528106 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 248.75-25 chr14 90564509 90565078 + 0.75 NA intron (NM_001320421, intron 20 of 20) AluJr4|SINE|Alu -47584 NR_135274 105370619 Hs.525530 NR_135274 LOC105370619 - uncharacterized LOC105370619 ncRNA 180.75-19 chr10 110803122 110803565 + 0.75 NA intron (NM_001134363, intron 7 of 13) MIR1_Amn|SINE|MIR 67561 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 191.5-22 chr11 75504341 75504690 + 0.75 NA intron (NM_030792, intron 1 of 16) L1MB2|LINE|L1 21058 NM_001351168 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 133.75-126 chr3 14208109 14208304 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 29389 NM_014463 27258 Hs.111632 NM_014463 ENSG00000170860 LSM3 SMX4|USS2|YLR438C LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 196.75-105 chr8 60119519 60119986 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161648 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 152.25-115 chr4 67306401 67306691 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115454 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 235.5-88 chr8 82842754 82843275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69090 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 187.75-24 chr12 114414602 114415151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6434 NM_000192 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 187-7 chr1 219322564 219322873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147749 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 176.75-139 chrX 21566427 21566833 + 0.75 NA intron (NM_001168648, intron 13 of 20) intron (NM_001168648, intron 13 of 20) 91700 NM_153270 257240 Hs.448572 NM_153270 ENSG00000185915 KLHL34 - kelch like family member 34 protein-coding 192-36 chr12 42007203 42007504 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137521 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 163-77 chr3 150228351 150228791 + 0.75 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -9948 NR_110168 101927992 Hs.534682 NR_110167 ENSG00000244541 LINC01213 - long intergenic non-protein coding RNA 1213 ncRNA 130-41 chr14 55742854 55743127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23255 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 188.75-55 chr2 52071893 52072160 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -298622 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 245.25-20 chr14 62033768 62034331 + 0.75 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1MB7|LINE|L1 -83308 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 127.75-132 chr3 120837326 120837698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1155 NR_135570 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 210.25-58 chr4 53775228 53775640 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 79533 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 155.25-120 chr3 115873080 115873371 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) AluSx|SINE|Alu 31901 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 173.75-121 chr4 154426019 154426354 + 0.75 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) intron (NM_001358235, intron 1 of 19) 65613 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 197.25-80 chr4 156427909 156428316 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -474246 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 140.25-84 chr19 52308853 52309130 + 0.75 NA intron (NM_001297625, intron 2 of 3) intron (NM_001297625, intron 2 of 3) 11822 NM_001297625 147657 Hs.729317 NM_144684 ENSG00000198464 ZNF480 - zinc finger protein 480 protein-coding 152.75-48 chr13 62046606 62047085 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -17297 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 148.5-56 chr13 112517650 112517967 + 0.75 NA intron (NM_006322, intron 16 of 21) AluSx|SINE|Alu 70345 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 136.5-83 chr15 94291558 94291936 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -6454 NM_018349 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 164-23 chr11 114459889 114460130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20542 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 159-75 chr4 58578110 58578555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42004 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 139.5-107 chr2 162354938 162355128 + 0.75 NA intron (NM_001330271, intron 3 of 7) intron (NM_001330271, intron 3 of 7) 10665 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 134.75-223 chr8 121341786 121342084 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -297411 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 205.75-75 chr6 165616970 165617395 + 0.75 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) intron (NM_006661, intron 1 of 22) 44918 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 170.75-91 chr3 173250211 173250521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109131 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 153-16 chr11 7429852 7430095 + 0.75 NA intron (NM_175733, intron 6 of 6) intron (NM_175733, intron 6 of 6) 35862 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 128.5-175 chr5 143797713 143797968 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14321 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 249.25-52 chr8 81436155 81436633 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 11045 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 191.25-27 chr13 58401539 58401864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -168584 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 120.5-35 chr11 28794069 28794406 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -316689 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 123-152 chr4 147729661 147729959 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2278 NM_024605 79658 Hs.368631 NM_024605 ENSG00000071205 ARHGAP10 GRAF2|PS-GAP|PSGAP Rho GTPase activating protein 10 protein-coding 191.75-74 chr22 28606898 28607271 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER39|LTR|ERV1 72781 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 142.5-39 chr11 5826401 5826686 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 6207 NM_001005174 390077 Hs.553737 NM_001005174 ENSG00000180988 OR52N2 OR11-57 olfactory receptor family 52 subfamily N member 2 protein-coding 207.5-5 chr10 79628044 79628522 + 0.75 NA TTS (NR_134315) TTS (NR_134315) 17344 NM_005411 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 115-185 chr8 118686596 118686858 + 0.75 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) AluJr|SINE|Alu -64764 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 117.75-29 chr11 3993858 3994033 + 0.75 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 -100740 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 112.25-57 chr14 51966821 51967167 + 0.75 NA 3' UTR (NM_053064, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_053064, exon 4 of 4) -22552 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 225.5-102 chr8 52717366 52717992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3213 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 161.75-123 chr8 66592990 66593308 + 0.75 NA exon (NM_001080416, exon 7 of 16) exon (NM_001080416, exon 7 of 16) 20069 NM_001144755 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 125.75-183 chr8 74235879 74236174 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001317830, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001317830, exon 6 of 6) 85335 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 243.25-34 chr4 6437212 6437858 + 0.75 NA intron (NM_001206994, intron 2 of 9) intron (NM_001206994, intron 2 of 9) -16417 NM_001206996 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 193.25-113 chr8 15954608 15954947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 231495 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 116.75-77 chr17 62315623 62315846 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -40079 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 114.5-9 chr1 80680485 80680763 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39337 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 195.25-97 chr8 127907183 127907491 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 41386 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 156.75-20 chr10 44084557 44084955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172354 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 193-90 chr8 121969359 121969842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -328160 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 136.75-118 chr20 45642962 45643308 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -11851 NM_147198 259240 Hs.249828 NM_147198 ENSG00000180205 WFDC9 WAP9|dJ688G8.2 WAP four-disulfide core domain 9 protein-coding 157-63 chr2 149990924 149991297 + 0.75 NA Intergenic (ATATCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -131919 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 143.25-33 chr12 18436808 18437188 + 0.75 NA intron (NM_001288774, intron 18 of 32) intron (NM_001288774, intron 18 of 32) 175458 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 175.75-54 chr17 78440328 78440663 + 0.75 NA intron (NM_173628, intron 72 of 80) AluJb|SINE|Alu -44415 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-72 chr2 30523181 30523529 + 0.75 NA intron (NM_001304445, intron 3 of 7) intron (NM_001304445, intron 3 of 7) 76109 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 165-113 chr5 99320295 99320571 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213557 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 140.25-126 chr4 39458078 39458390 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006859) promoter-TSS (NM_006859) 714 NM_001024921 6133 Hs.412370 NM_000661 ENSG00000163682 RPL9 L9|NPC-A-16 ribosomal protein L9 protein-coding 186.5-55 chr17 75769105 75769525 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4123 NM_000154 2584 Hs.407966 NM_000154 ENSG00000108479 GALK1 GALK|GK1|HEL-S-19 galactokinase 1 protein-coding 212-38 chr2 77701942 77702512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179794 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 129.25-89 chr2 74055765 74056009 + 0.75 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 53195 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 248.25-48 chr3 105035998 105036381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -330524 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 268-11 chr10 69702786 69703161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72726 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 146.5-228 chr8 133620156 133620410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48396 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 147.25-67 chr2 210864184 210864513 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 246777 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 119.25-167 chr5 143573621 143573830 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106135 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 126-36 chr11 129686268 129686553 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -69141 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 163.25-140 chr8 58983657 58983975 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 135331 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 116.5-242 chr8 66986387 66986656 + 0.75 NA intron (NM_001364910, intron 6 of 7) intron (NM_001364910, intron 6 of 7) -23930 NM_001193502 100129654 Hs.120040 NM_001193502 ENSG00000261787 TCF24 TCF-24|bHLHa25 transcription factor 24 protein-coding 121-3 chr1 36962201 36962482 + 0.75 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) intron (NM_000831, intron 1 of 15) 72174 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 197.75-77 chr6 78487922 78488412 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51142 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 115-120 chr4 66708431 66708666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 431724 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 126.75-73 chr15 57018897 57019174 + 0.75 NA intron (NM_001322164, intron 3 of 19) intron (NM_001322164, intron 3 of 19) 99590 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 190-80 chr8 123771659 123772005 + 0.75 NA intron (NM_144963, intron 1 of 23) intron (NM_144963, intron 1 of 23) 3393 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 159.5-131 chr22 26883962 26884237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19193 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 125.5-240 chr7 130109860 130110125 + 0.75 NA intron (NM_014997, intron 2 of 9) L1MC4|LINE|L1 -31739 NR_149033 100128325 Hs.105944 NR_149033 ENSG00000229196 LOC100128325 - uncharacterized LOC100128325 ncRNA 204.75-93 chr5 89414516 89414955 + 0.75 NA intron (NR_136221, intron 5 of 6) intron (NR_136221, intron 5 of 6) -510630 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 209.75-84 chr6 96571995 96572486 + 0.75 NA intron (NM_020482, intron 2 of 6) L1MA5|LINE|L1 9115 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 196.75-113 chr9 29195566 29196034 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 16499 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 141.5-22 chr11 33261313 33261630 + 0.75 NA intron (NM_001278162, intron 1 of 15) L1PREC2|LINE|L1 3140 NM_001278162 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 163.5-63 chr16 8233051 8233320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 356653 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 141.25-118 chr3 189535300 189535560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61316 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 133.5-210 chr5 77064844 77065098 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018046, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_018046, exon 14 of 14) 15600 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 139.75-182 chr8 138339388 138339751 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) intron (NM_015912, intron 2 of 19) 157692 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 119.25-199 chr7 97483410 97483777 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -248493 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 168.25-148 chr9 73648833 73649219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 497161 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 149-78 chr3 96726570 96727080 + 0.75 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -87769 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 231-72 chr5 155590153 155590484 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 576563 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 139.5-189 chr6 62736306 62736559 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -450205 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 145.5-42 chr12 9369098 9369519 + 0.75 NA non-coding (NR_120479, exon 1 of 4) non-coding (NR_120479, exon 1 of 4) 1844 NR_120479 101930452 Hs.734183 NR_120479 ENSG00000260423 LINC02367 - long intergenic non-protein coding RNA 2367 ncRNA 174-17 chr11 62837003 62837488 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001369449, exon 5 of 13) 5' UTR (NM_001369449, exon 5 of 13) 2345 NM_001369449 54663 Hs.654620 NM_018093 ENSG00000133316 WDR74 Nsa1 WD repeat domain 74 protein-coding 142.25-164 chr8 43390640 43390878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98317 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 135-108 chr3 72451007 72451446 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4603 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 212.5-50 chr2 86777961 86778486 + 0.75 NA TTS (NM_022780) TTS (NM_022780) 13491 NM_001768 925 Hs.85258 NM_001768 ENSG00000153563 CD8A CD8|Leu2|p32 CD8a molecule protein-coding 117.25-221 chr9 13604897 13605207 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173723 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 149-91 chr4 61482630 61483072 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 280679 NM_001371342 133.5-148 chr22 34722445 34722858 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 275265 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 173.5-19 chr10 61817390 61817766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84121 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 125-20 chr10 48554093 48554522 + 0.75 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) intron (NR_144642, intron 3 of 9) -42718 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 134.75-196 chr7 41014530 41014875 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -34763 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 298.5-16 chr2 89777734 89778255 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -140087 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 166.5-199 chr8 80119919 80120155 + 0.75 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 -39206 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 133.5-105 chr19 56513197 56513572 + 0.75 NA intron (NM_001321768, intron 2 of 3) L1MEg|LINE|L1 5529 NM_001321768 57573 Hs.230188 NM_020813 ENSG00000196263 ZNF471 ERP1|Z1971 zinc finger protein 471 protein-coding 134.5-223 chr8 83576642 83577056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 173091 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 131.5-140 chr20 56850886 56851236 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 221755 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 176-61 chr5 38809732 38810208 + 0.75 NA intron (NR_109951, intron 1 of 3) intron (NR_109951, intron 1 of 3) 35859 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 160.25-15 chr11 38289375 38289751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 350962 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 260-31 chr5 40429680 40430319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -249916 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 129-64 chr14 64178648 64178988 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 96 of 114) AluJr4|SINE|Alu -35326 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 151.25-40 chr12 42277177 42277480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38960 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 188.25-27 chr12 12434988 12435369 + 0.75 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 78100 NM_058169 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 269.75-31 chr2 96232306 96232906 + 0.75 NA intron (NR_046322, intron 1 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 17967 NR_145789 109623481 NR_145789 SNORA112 - small nucleolar RNA, H/ACA box 112 snoRNA 169.25-58 chr2 163343416 163343657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 392472 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 212.75-13 chr10 119026604 119026995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2915 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 122.75-114 chr21 14787158 14787439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131370 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 201.25-54 chr21 18935067 18935519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175481 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 242.25-42 chr18 53670351 53670789 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -89511 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 120-207 chrX 112821259 112821567 + 0.75 NA intron (NM_133265, intron 2 of 11) intron (NM_133265, intron 2 of 11) 1713 NM_001113490 154796 Hs.528051 NM_133265 ENSG00000126016 AMOT - angiomotin protein-coding 215.75-105 chr9 101526018 101526337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7676 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 146-55 chr17 59669418 59669725 + 0.75 NA intron (NM_001288653, intron 14 of 31) intron (NM_001288653, intron 14 of 31) 38027 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 159.5-66 chr16 18062432 18062738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 270077 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 181.75-6 chr1 76836534 76836917 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -30755 NM_030965 81849 Hs.149201 NM_030965 ENSG00000117069 ST6GALNAC5 SIAT7-E|SIAT7E|ST6GalNAcV ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5 protein-coding 172-6 chr1 66787155 66787519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13922 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 149.25-188 chr8 125453736 125453981 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 21649 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 117.75-61 chr15 55810691 55811076 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -67731 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 210.5-20 chr10 104225157 104225611 + 0.75 NA intron (NM_025145, intron 3 of 37) intron (NM_025145, intron 3 of 37) -6501 NR_030340 693194 NR_030340 ENSG00000208033 MIR609 MIRN609|hsa-mir-609 microRNA 609 ncRNA 260-11 chr17 41550654 41551257 + 0.75 NA intron (NR_038442, intron 2 of 2) intron (NR_038442, intron 2 of 2) 3540 NR_038442 147093 Hs.680576 NR_038442 ENSG00000226629 LINC00974 - long intergenic non-protein coding RNA 974 ncRNA 135.5-5 chr1 72505761 72505967 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -223325 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 124.75-203 chr8 120513086 120513260 + 0.75 NA intron (NM_022045, intron 17 of 21) intron (NM_022045, intron 17 of 21) 67754 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 142.75-14 chr1 222171728 222171990 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -193339 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 166-67 chr2 190991146 190991570 + 0.75 NA intron (NM_007315, intron 10 of 24) intron (NM_007315, intron 10 of 24) 22892 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 219.25-28 chr15 48733856 48734189 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 77047 NM_001194998 22995 Hs.443005 NM_014985 ENSG00000103995 CEP152 MCPH4|MCPH9|SCKL5 centrosomal protein 152 protein-coding 174-74 chr5 26586902 26587219 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 451526 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 171-121 chr6 121914496 121915021 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 479112 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 182.75-40 chr12 76430308 76430684 + 0.75 NA intron (NM_001003712, intron 3 of 22) L1MA9|LINE|L1 -7211 NM_001319655 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 144-78 chr22 25866218 25866453 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) intron (NM_001318245, intron 21 of 43) 124147 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 122.25-175 chr7 49727917 49728298 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45531 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 117-76 chr18 2424700 2424931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146690 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 117.25-225 chr9 113119881 113120075 + 0.75 NA TTS (NR_024366) TTS (NR_024366) 7082 NR_024366 286333 Hs.99052 NR_024366 ENSG00000231528 FAM225A C9orf109|LINC00256A|NCRNA00256A family with sequence similarity 225 member A ncRNA 117.25-31 chr10 87951931 87952221 + 0.75 NA intron (NM_001304718, intron 5 of 8) intron (NM_001304718, intron 5 of 8) 88451 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 181-49 chr19 28321900 28322197 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -284640 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 117-65 chr15 65641089 65641338 + 0.75 NA intron (NM_004727, intron 4 of 9) AluSc|SINE|Alu -1666 NM_001254740 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 207.25-58 chr3 81089285 81089840 + 0.75 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 95694 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 163.5-119 chr22 37216881 37217109 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4518 NM_001051 6753 Hs.225995 NM_001051 ENSG00000278195 SSTR3 SS-3-R|SS3-R|SS3R|SSR-28 somatostatin receptor 3 protein-coding 136-164 chr9 12490354 12490643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -202887 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 154.25-176 chr8 142655390 142655895 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14325 NM_001077527 8629 Hs.535903 NM_003724 ENSG00000234616 JRK JH8|jerky Jrk helix-turn-helix protein protein-coding 137.25-175 chr9 30208251 30208488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 200085 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 147.25-106 chr5 68550801 68551134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258390 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 283-13 chr14 45378175 45378868 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125319 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 119.25-102 chr2 173156022 173156225 + 0.75 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 80277 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 135-49 chr15 79685744 79686164 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 211043 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 116.5-62 chr14 30276452 30276680 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -282557 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 164.25-80 chr20 6818602 6818887 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51058 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 144.25-159 chr5 56049616 56049827 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 54554 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 142.75-69 chr15 66914171 66914478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42191 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 163.25-124 chr6 68762714 68763072 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 127611 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 123.25-208 chr8 131982024 131982311 + 0.75 NA intron (NR_136616, intron 14 of 23) L1ME3B|LINE|L1 65394 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 121.25-11 chr1 197026282 197026501 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 40876 NM_001994 2165 Hs.435782 NM_001994 ENSG00000143278 F13B FXIIIB coagulation factor XIII B chain protein-coding 178.25-39 chr15 64062613 64062924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16283 NM_014326 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 162-76 chr3 14565309 14565690 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25157 NM_001080423 80852 Hs.517819 NM_001080423 ENSG00000144596 GRIP2 - glutamate receptor interacting protein 2 protein-coding 139-85 chr2 215870115 215870437 + 0.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -26740 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 192-67 chr20 7851412 7851880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 88812 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 189.5-8 chr1 107416277 107416680 + 0.75 NA intron (NM_014917, intron 5 of 5) intron (NM_014917, intron 5 of 5) 268409 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 118-59 chr15 63326632 63326869 + 0.75 NA intron (NR_135511, intron 9 of 9) intron (NR_135511, intron 9 of 9) 49145 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 169-81 chr5 122058618 122058927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18402 NM_001317073 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 174.25-69 chr17 67239178 67239577 + 0.75 NA intron (NM_001330447, intron 3 of 32) intron (NM_001330447, intron 3 of 32) -5399 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 219.5-79 chr22 19263701 19264176 + 0.75 NA intron (NM_007098, intron 2 of 32) L1M3|LINE|L1 27781 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 198-43 chr2 136810276 136810640 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 44913 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 221-78 chr8 100330596 100331284 + 0.75 NA intron (NM_001280539, intron 1 of 10) intron (NM_001280539, intron 1 of 10) 5264 NM_001280539 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 116.5-163 chr3 119937887 119938087 + 0.75 NA intron (NM_002093, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 146661 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 134.5-233 chr8 131529431 131529619 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -374568 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 225-66 chr6 65588907 65589387 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -9343 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 187.75-71 chr3 109044735 109045045 + 0.75 NA intron (NM_014429, intron 14 of 27) AluSx1|SINE|Alu -56566 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 169.5-172 chr8 100848583 100848968 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 101796 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 226.25-39 chr20 2473401 2473807 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -2815 NM_198216 6628 Hs.83753 NM_003091 ENSG00000125835 SNRPB CCMS|COD|SNRPB1|Sm-B/B'|SmB/B'|SmB/SmB'|snRNP-B small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 protein-coding 162.75-115 chr5 32537524 32538013 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -47789 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 116.5-82 chr15 94517546 94517731 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 161708 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 163.5-170 chr5 164668645 164668995 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 198541 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 140.75-116 chr21 7918180 7918533 + 0.75 NA Intergenic (ATTCCATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -88724 NM_001330065 102723475 NM_001330065 ENSG00000276289 KCNE1B - potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1B protein-coding 142-13 chr10 13448248 13448505 + 0.75 NA intron (NM_152751, intron 7 of 8) intron (NM_152751, intron 7 of 8) 54600 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 151.75-113 chr5 97069993 97070377 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 72426 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 192.25-111 chr9 82647951 82648412 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 414961 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 164-35 chr14 65367542 65367927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32551 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 127.5-26 chr10 22210407 22210744 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001199938) promoter-TSS (NM_001199938) -592 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 176.25-67 chr2 79778867 79779178 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) MamRep1527|LTR|LTR 87561 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 157.25-92 chr3 22846288 22846546 + 0.75 NA Intergenic (ATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 356161 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 125.25-38 chr11 92766936 92767119 + 0.75 NA intron (NM_001008781, intron 5 of 24) AluSx1|SINE|Alu 148601 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 153.5-112 chr2 232376509 232376826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2084 NM_001632 250 Hs.284255 NM_001632 ENSG00000163283 ALPP ALP|ALPI|IAP|PALP|PLAP|PLAP-1 alkaline phosphatase, placental protein-coding 166.75-98 chr4 30477633 30477977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242564 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 116.5-245 chr8 87604752 87605017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 269131 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 146.5-39 chr11 38376261 38376501 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 269975 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 229.25-3 chr1 115235590 115236035 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47222 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 152-4 chr1 39638420 39638732 + 0.75 NA intron (NM_014571, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 1067 NM_014571 26508 Hs.472566 NM_014571 ENSG00000163909 HEYL HESR3|HEY3|HRT3|bHLHb33 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif like protein-coding 162-73 chr20 56539017 56539420 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 5972 NM_001013646 388799 Hs.287759 NM_001013646 ENSG00000213714 FAM209B C20orf107|dJ1153D9.4 family with sequence similarity 209 member B protein-coding 134.75-152 chr3 186991468 186991706 + 0.75 NA intron (NM_173216, intron 2 of 7) intron (NM_173216, intron 2 of 7) -30268 NM_003032 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 150.75-103 chr2 134157693 134158038 + 0.75 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) MER52A|LTR|ERV1 30740 NR_037450 100500878 NR_037450 ENSG00000263813 MIR3679 mir-3679 microRNA 3679 ncRNA 112.25-122 chr3 28078328 28078495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -163208 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 165.25-141 chr8 119599854 119600294 + 0.75 NA intron (NM_006209, intron 11 of 25) intron (NM_006209, intron 11 of 25) -7066 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 224-5 chr1 151661495 151662082 + 0.75 NA intron (NM_030918, intron 4 of 11) intron (NM_030918, intron 4 of 11) 49738 NM_001330723 81609 Hs.192326 NM_030918 ENSG00000143376 SNX27 MRT1|MY014 sorting nexin 27 protein-coding 134.5-44 chr11 96833512 96833888 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325275 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 176.25-62 chr2 49463814 49464143 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -309451 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 154.5-41 chr11 111765466 111765791 + 0.75 NA intron (NM_181699, intron 1 of 15) intron (NM_181699, intron 1 of 15) 761 NM_001177562 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 115-165 chr7 6188882 6189085 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 2 of 13) intron (NM_001367581, intron 2 of 13) -16846 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 159.75-177 chr8 135843418 135843841 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 386173 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 193.75-2 chr1 34462992 34463344 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 206526 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 182.5-122 chr4 100344334 100344689 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 50736 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 191-10 chr10 114336923 114337428 + 0.75 NA intron (NM_001001936, intron 2 of 18) MIRb|SINE|MIR 67327 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 139.75-104 chr2 228869032 228869286 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -257764 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 158.75-8 chr1 166765875 166766101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73487 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 140.75-120 chr3 88860819 88861249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -246587 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 130.5-54 chr11 23245084 23245375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 173961 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 124.75-109 chr2 10896707 10897098 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -15032 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 137-48 chr14 56526487 56526740 + 0.75 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 12282 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 172.75-66 chr2 132244959 132245304 + 0.75 NA intron (NR_152415, intron 1 of 5) ALR/Alpha|Satellite|centr 11949 NR_031608 100313824 NR_031608 ENSG00000221288 MIR663B MIRN663B|mir-663b microRNA 663b ncRNA 120.25-138 chr3 184407816 184408081 + 0.75 NA intron (NR_161198, intron 1 of 2) intron (NR_161198, intron 1 of 2) 6411 NR_161199 105374250 Hs.129464 NR_161198 LINC02054 - long intergenic non-protein coding RNA 2054 ncRNA 201.5-132 chr9 2053739 2054279 + 0.75 NA intron (NM_001289397, intron 5 of 32) intron (NM_001289397, intron 5 of 32) 32064 NM_001289396 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 225.75-8 chr1 191568541 191569126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -340335 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 145.75-51 chr16 14256373 14256699 + 0.75 NA intron (NM_001308142, intron 15 of 16) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -45752 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 177-8 chr10 9947869 9948242 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110667 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 165.5-140 chr4 176754871 176755263 + 0.75 NA intron (NM_005429, intron 1 of 6) intron (NM_005429, intron 1 of 6) 37855 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 234.5-52 chr2 192849151 192849663 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 99562 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 130-104 chr3 82852712 82852938 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 866683 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 182.5-103 chr3 88135512 88135926 + 0.75 NA intron (NM_001350135, intron 5 of 6) intron (NM_001350135, intron 5 of 6) 14147 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 189.5-63 chr18 66512091 66512481 + 0.75 NA intron (NR_073130, intron 9 of 11) intron (NR_073130, intron 9 of 11) 91804 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 188.25-118 chr8 116894334 116894750 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -19676 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 232.75-32 chr2 56680644 56681215 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -495159 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 119.75-144 chr3 105319146 105319379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47451 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 175-29 chr12 16720119 16720436 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -112063 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 172.25-64 chr2 69495671 69496088 + 0.75 NA intron (NM_014911, intron 17 of 21) intron (NM_014911, intron 17 of 21) 24292 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 116-113 chr4 40944713 40944915 + 0.75 NA intron (NM_001166050, intron 7 of 17) intron (NM_001166050, intron 7 of 17) -87622 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 164.75-23 chr10 99426599 99427100 + 0.75 NA intron (NM_002079, intron 1 of 8) intron (NM_002079, intron 1 of 8) 3775 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 130.25-104 chr2 158274940 158275172 + 0.75 NA intron (NM_138803, intron 9 of 13) intron (NM_138803, intron 9 of 13) 108406 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 152.75-82 chr2 39378841 39379119 + 0.75 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) intron (NM_003618, intron 1 of 33) 58305 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 170.5-2 chr1 17091395 17091684 + 0.75 NA intron (NM_007365, intron 6 of 15) L2b|LINE|L2 27912 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 265.25-16 chr15 64599341 64599777 + 0.75 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 100139 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 147.5-80 chr16 88608614 88608858 + 0.75 NA intron (NM_001294340, intron 7 of 18) L1M3|LINE|L1 -29836 NM_013278 27189 Hs.278911 NM_013278 ENSG00000124391 IL17C CX2|IL-17C interleukin 17C protein-coding 224.25-98 chr7 78173490 78173955 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 13 of 20) intron (NM_001301128, intron 13 of 20) -173520 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 133.5-134 chr20 7131105 7131317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 122991 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 146.5-80 chr16 81348335 81348590 + 0.75 NA intron (NM_022041, intron 1 of 10) HAL1|LINE|L1 33496 NM_022041 8139 Hs.112569 NM_022041 ENSG00000261609 GAN GAN1|KLHL16 gigaxonin protein-coding 126-156 chr6 55923576 55923881 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -48138 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 229.25-68 chr6 75144358 75144879 + 0.75 NA intron (NM_080645, intron 10 of 50) intron (NM_080645, intron 10 of 50) -15836 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 178.25-48 chr17 33434060 33434470 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) HAL1M8|LINE|L1 99495 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 139.5-10 chr1 223815097 223815409 + 0.75 NA intron (NM_001031685, intron 2 of 17) intron (NM_001031685, intron 2 of 17) 30694 NM_001031685 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 157.5-56 chr14 51974907 51975259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14463 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 124.25-53 chr14 55834415 55834738 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -37902 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 289.5-49 chr8 117774760 117775465 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 145801 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 155.25-67 chr15 64811107 64811367 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 14410 NM_001286497 80119 Hs.112160 NM_025049 ENSG00000140451 PIF1 C15orf20|PIF PIF1 5'-to-3' DNA helicase protein-coding 169.75-20 chr10 88804430 88804701 + 0.75 NA intron (NM_001128215, intron 1 of 8) MER66C|LTR|ERV1 1835 NM_001128215 340654 Hs.55118 NM_001128215 ENSG00000173239 LIPM LIPL3|bA304I5.1 lipase family member M protein-coding 182-13 chr10 86807896 86808183 + 0.75 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) L1MC|LINE|L1 51400 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 243.5-48 chr3 7450769 7451143 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 5 of 9) MER103C|DNA|hAT-Charlie 84328 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 132.25-121 chr22 49414569 49414869 + 0.75 NA non-coding (NR_110523, exon 5 of 5) non-coding (NR_110523, exon 5 of 5) 128747 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 115-179 chr8 88879888 88880121 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -552521 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 126.25-13 chr1 228235580 228235823 + 0.75 NA intron (NM_052843, intron 9 of 80) L1MEf|LINE|L1 -22037 NR_073154 574407 Hs.650039 NM_001025495 ENSG00000162913 OBSCN-AS1 C1orf145 OBSCN antisense RNA 1 ncRNA 121.25-80 chr17 54596881 54597068 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -303717 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 152.5-150 chr5 71906361 71906820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 187315 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 182.5-66 chr17 70637611 70637931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 468236 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 225.75-58 chr4 22294492 22294986 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 44927 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 137.5-95 chr17 59133545 59133900 + 0.75 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) intron (NM_182620, intron 1 of 3) 4150 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 139.75-67 chr16 54596598 54596896 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -226048 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 180.25-111 chr7 34158397 34158817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 253068 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 157-29 chr14 66768019 66768254 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) Plat_L3|LINE|CR1 260729 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 195.5-24 chr11 75085479 75085920 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 11191 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 182.25-16 chr10 73617559 73617883 + 0.75 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) AluJb|SINE|Alu 8260 NM_001350995 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 129.25-225 chrX 152146658 152146875 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -8188 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 189-101 chr8 53945666 53946000 + 0.75 NA intron (NM_001286673, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu 64961 NM_003702 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 158.25-46 chr16 74186922 74187305 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28408 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 168.75-129 chr6 140158236 140158682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46793 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 122-158 chr6 87855017 87855322 + 0.75 NA intron (NR_110869, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 70309 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 213-35 chr16 13388414 13388853 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 487035 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 147.5-42 chr12 7974693 7974979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38649 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 150.25-136 chr6 154366808 154367228 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -10252 NM_001130700 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 183.75-3 chr1 100129629 100129973 + 0.75 NA intron (NM_001304829, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 3129 NM_001304829 163786 Hs.591447 NM_194292 ENSG00000156876 SASS6 MCPH14|SAS-6|SAS6 SAS-6 centriolar assembly protein protein-coding 204-15 chr14 66467732 66468162 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -18424 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 153.25-133 chr8 82762384 82762755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149535 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 251.75-32 chr19 35179320 35179689 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 24769 NM_144779 53827 Hs.333418 NM_014164 ENSG00000089327 FXYD5 DYSAD|HSPC113|IWU1|KCT1|OIT2|PRO6241|RIC FXYD domain containing ion transport regulator 5 protein-coding 113.25-98 chr20 32391892 32392092 + 0.75 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) L1ME1|LINE|L1 32927 NM_001363734 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 151.75-101 chr4 56683745 56684053 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -2193 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 167.25-18 chr10 84482841 84483126 + 0.75 NA intron (NM_001284240, intron 9 of 9) intron (NM_001284240, intron 9 of 9) 57814 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 132.5-132 chr2 189022052 189022342 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26567 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 114-60 chr18 8369952 8370143 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 21 of 30) intron (NM_002845, intron 21 of 30) -3013 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 162.75-93 chr3 58881580 58881853 + 0.75 NA TTS (NM_001351533) TTS (NM_001351533) 57245 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 146.75-18 chr10 82278732 82279077 + 0.75 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) L2b|LINE|L2 -45984 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 221-61 chr4 121722699 121723353 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -26046 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 231-63 chr4 114035010 114035380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55548 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 114.75-89 chr2 68177602 68177832 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 19829 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 163.5-192 chr7 91987450 91987762 + 0.75 NA intron (NM_147185, intron 3 of 49) intron (NM_147185, intron 3 of 49) 46731 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 162-98 chr6 37724656 37724929 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26909 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 205.25-41 chr17 78648302 78648725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16456 NR_110848 101928710 Hs.464224 NR_110848 ENSG00000267123 SCAT1 LINC02081|XLOC_012582 S-phase cancer associated transcript 1 ncRNA 203.5-141 chr8 123867189 123867691 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 15453 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 137.75-121 chr20 62502755 62503075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26920 NM_080473 140628 Hs.352250 NM_080473 ENSG00000130700 GATA5 CHTD5|GATAS|bB379O24.1 GATA binding protein 5 protein-coding 125.75-109 chr2 233696742 233696943 + 0.75 NA intron (NM_205862, intron 2 of 5) L1MA4|LINE|L1 3952 NM_001072 54578 Hs.554822 NM_001072 ENSG00000167165 UGT1A6 GNT1|HLUGP|HLUGP1|UDPGT|UDPGT 1-6|UGT-1A|UGT-1C|UGT-1E|UGT1|UGT1-01|UGT1-03|UGT1-05|UGT1.1|UGT1.3|UGT1.5|UGT1A|UGT1A1|UGT1A3|UGT1A5|UGT1A6S|UGT1C|UGT1E|UGT1F|hUG-BR1 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A6 protein-coding 131.25-174 chr6 50784958 50785175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33805 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 133-119 chr4 39188166 39188427 + 0.75 NA intron (NM_025132, intron 3 of 36) intron (NM_025132, intron 3 of 36) 5767 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 166-99 chr5 72668665 72669052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8189 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 156-2 chr1 40997990 40998295 + 0.75 NA intron (NR_125440, intron 9 of 17) AluSc8|SINE|Alu 9623 NM_001301237 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 196.75-74 chr3 110887081 110887538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182650 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 194.75-40 chr18 8490729 8491037 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -118562 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 148-84 chr3 111190369 111190647 + 0.75 NA intron (NM_001243288, intron 7 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 118692 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 153.25-119 chr6 157024090 157024464 + 0.75 NA intron (NM_020732, intron 5 of 19) intron (NM_020732, intron 5 of 19) -12150 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 183.25-56 chr2 84446705 84447012 + 0.75 NA intron (NM_003849, intron 2 of 8) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 12422 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 182.5-158 chr8 20010602 20010967 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 71531 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 158.75-6 chr1 84420295 84420636 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 12114 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 190-30 chr2 65404922 65405247 + 0.75 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) 27515 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 189.25-84 chr3 165253408 165253872 + 0.75 NA intron (NR_125764, intron 1 of 5) intron (NR_125764, intron 1 of 5) 46680 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 153.5-6 chr1 161989794 161990073 + 0.75 NA intron (NM_001347700, intron 6 of 7) MER45B|DNA|hAT-Tip100 34532 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 117.5-89 chr18 11775150 11775431 + 0.75 NA intron (NM_001369387, intron 4 of 11) intron (NM_001369387, intron 4 of 11) 23205 NM_001369387 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 158-59 chr17 71267849 71268090 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -65790 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 119.25-67 chr15 95734914 95735191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 301959 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 116.75-100 chr2 107608471 107608719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79176 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 156.5-66 chr17 63367282 63367568 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 13 of 25) MER30|DNA|hAT-Charlie 72842 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 213.25-33 chr2 208589048 208589460 + 0.75 NA intron (NR_136588, intron 2 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 46612 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 141-87 chr2 192955434 192955904 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 205824 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 134.25-106 chr22 50002326 50002549 + 0.75 NA intron (NM_001371416, intron 2 of 14) intron (NM_001371416, intron 2 of 14) 10328 NM_001371416 189.25-61 chr2 184624016 184624540 + 0.75 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) L1MB4|LINE|L1 25749 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 160-110 chr8 89979716 89980027 + 0.75 NA intron (NM_001024688, intron 5 of 16) intron (NM_001024688, intron 5 of 16) 4800 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 169.75-96 chr20 57924341 57924637 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -79415 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 155-43 chr14 82379931 82380202 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -262566 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 232.75-56 chr5 61410881 61411229 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 78797 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 205.75-4 chr1 171075925 171076345 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -14770 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 141.25-140 chr5 113908320 113908637 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 394784 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 184.75-93 chr7 40846523 40846917 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 133219 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 211.75 chr1 12084862 12085226 + 0.75 NA intron (NM_001243, intron 2 of 14) MIRb|SINE|MIR 21667 NM_001281430 943 Hs.1314 NM_001243 ENSG00000120949 TNFRSF8 CD30|D1S166E|Ki-1 TNF receptor superfamily member 8 protein-coding 212.75-69 chr4 43279333 43279840 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 212957 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 137-134 chr5 27533186 27533489 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 61045 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 211.75-91 chr7 96142575 96143018 + 0.75 NA intron (NM_001160210, intron 14 of 17) intron (NM_001160210, intron 14 of 17) 76960 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 134.75-26 chr10 56424352 56424552 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -63179 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 306-36 chr8 78849134 78849741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11908 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 140.25-36 chr12 33025592 33025817 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -128858 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 121.75-194 chr8 122580087 122580378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11588 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 233.25-43 chr22 25354903 25355414 + 0.75 NA intron (NM_182492, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 7399 NM_182492 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 133.75-119 chr21 28956396 28956693 + 0.75 NA intron (NM_015565, intron 16 of 29) intron (NM_015565, intron 16 of 29) 36333 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 138.25-27 chr11 25045196 25045489 + 0.75 NA intron (NM_001009909, intron 9 of 11) intron (NM_001009909, intron 9 of 11) 548289 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 196.5-115 chr4 79747358 79747787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79899 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 123.25-73 chr16 76765037 76765280 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -103778 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 197.75-89 chr8 77376063 77376462 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -74435 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 261-22 chr16 58362803 58363277 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -29431 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 305.25-42 chr6 45514564 45515201 + 0.75 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) intron (NM_001015051, intron 7 of 7) 92607 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 147.75-72 chr2 106548552 106548852 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 61338 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 135.25-4 chr1 80586120 80586504 + 0.75 NA intron (NR_125940, intron 2 of 3) L1MEi|LINE|L1 50557 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 141.25-190 chr9 38699443 38699683 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 78475 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 228.75-6 chr1 215812800 215813236 + 0.75 NA intron (NM_206933, intron 49 of 71) MIRb|SINE|MIR 245714 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 208.25-77 chr6 152263323 152263788 + 0.75 NA intron (NM_182961, intron 100 of 145) AluJr|SINE|Alu -78177 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 202.25-26 chr15 38714685 38715123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18306 NR_160786 148.25-133 chr6 95167331 95167681 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 409945 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 131.75-178 chr5 169968492 169968726 + 0.75 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) intron (NM_001346304, intron 1 of 3) 11886 NM_001346304 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 120.25-204 chr7 110829460 110829663 + 0.75 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -261445 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 130.25-99 chr2 85190015 85190262 + 0.75 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 3729 NR_046797 100874334 Hs.693125 NR_046797 ENSG00000231134 TCF7L1-IT1 - TCF7L1 intronic transcript 1 ncRNA 208.5-14 chr10 95481886 95482504 + 0.75 NA intron (NM_001290295, intron 2 of 24) intron (NM_001290295, intron 2 of 24) -41015 NM_006434 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 116-118 chr4 57594586 57594810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 168826 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 121.75-54 chr15 98680941 98681138 + 0.75 NA intron (NM_000875, intron 1 of 20) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -29818 NR_126453 104472848 Hs.349049 NR_126453 IRAIN IGF1R-AS IGF1R antisense imprinted non-protein coding RNA ncRNA 168.25-102 chr3 144261687 144262033 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 288779 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 119.5-213 chr7 45934301 45934481 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -13119 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 135.5-73 chr16 77871394 77871685 + 0.75 NA intron (NM_020927, intron 4 of 8) intron (NM_020927, intron 4 of 8) 82975 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 146-112 chr6 18426900 18427129 + 0.75 NA intron (NM_182757, intron 2 of 7) intron (NM_182757, intron 2 of 7) 39664 NM_182757 255488 Hs.148741 NM_182757 ENSG00000137393 RNF144B IBRDC2|PIR2|bA528A10.3|p53RFP ring finger protein 144B protein-coding 289.75-20 chr3 182466375 182466980 + 0.75 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) AluSp|SINE|Alu 19685 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 185.75-96 chr5 8666762 8667161 + 0.75 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -172771 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 256.5-4 chr1 237172285 237172686 + 0.75 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) intron (NM_001035, intron 1 of 104) 130301 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 180.25-113 chr7 86682883 86683193 + 0.75 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 39124 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 271.5-10 chr10 69017708 69018312 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29207 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 164.25-67 chr2 68478495 68479003 + 0.75 NA intron (NM_173545, intron 1 of 9) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 11164 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 236.5-21 chr13 53787763 53788182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27447 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 170-3 chr1 164934095 164934406 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -159609 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 159.25-34 chr12 128407854 128408252 + 0.75 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 113961 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 166.75-69 chr18 66636685 66636988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32746 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 130.25-184 chr7 27817126 27817392 + 0.75 NA intron (NM_001362794, intron 15 of 16) intron (NM_001362794, intron 15 of 16) 77164 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 125.25-134 chr3 99830873 99831110 + 0.75 NA intron (NM_032359, intron 1 of 9) intron (NM_032359, intron 1 of 9) -7126 NR_110821 101929357 Hs.741615 NR_110821 HP09053 - uncharacterized LOC101929357 ncRNA 148-83 chr3 97216409 97216664 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -223071 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 141.5-89 chr19 43984949 43985234 + 0.75 NA intron (NM_001260486, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 903 NM_198089 7711 Hs.279567 NM_003445 ENSG00000204920 ZNF155 pHZ-96 zinc finger protein 155 protein-coding 240.25-43 chr22 46306619 46307159 + 0.75 NA intron (NM_016426, intron 2 of 11) L2c|LINE|L2 10019 NM_016426 51512 Hs.386189 NM_016426 ENSG00000075218 GTSE1 B99 G2 and S-phase expressed 1 protein-coding 141-146 chr7 55523000 55523213 + 0.75 NA intron (NM_030796, intron 1 of 4) intron (NM_030796, intron 1 of 4) 3774 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 139.25-81 chr2 32158330 32158727 + 0.75 NA TTS (NM_199436) TTS (NM_199436) -7313 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 194.5-62 chr2 18990294 18990723 + 0.75 NA intron (NR_135287, intron 3 of 3) intron (NR_135287, intron 3 of 3) 36463 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 112.25-36 chr11 91862993 91863238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -361919 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 115.25-24 chr10 26480222 26480413 + 0.75 NA intron (NM_019043, intron 2 of 14) intron (NM_019043, intron 2 of 14) 41976 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 156-11 chr1 189714502 189714796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 761361 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 135-183 chr8 91094396 91094612 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8115 NR_148895 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 119.5-64 chr12 56927374 56927627 + 0.75 NA intron (NM_148897, intron 3 of 3) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 6908 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 184.5-53 chr16 80695064 80695542 + 0.75 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) L1MA5|LINE|L1 109295 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 167.25-32 chr13 70539241 70539656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -430955 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 302.5-31 chr4 165013479 165014248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18136 NM_152620 166655 Hs.368004 NM_152620 ENSG00000176979 TRIM60 RNF129|RNF33 tripartite motif containing 60 protein-coding 188.75-9 chr1 234918046 234918531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45711 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 122.5-110 chr2 63025421 63025624 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) AluJo|SINE|Alu 22189 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 141.75-59 chr14 90029122 90029448 + 0.75 NA intron (NM_001330205, intron 14 of 14) AluSx|SINE|Alu -32709 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 144.25-22 chr10 22603021 22603300 + 0.75 NA intron (NM_005028, intron 3 of 9) intron (NM_005028, intron 3 of 9) 110948 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 155-134 chr7 102079484 102079740 + 0.75 NA intron (NM_001202545, intron 4 of 21) intron (NM_001202545, intron 4 of 21) -205529 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 145.25-19 chr11 8260342 8260652 + 0.75 NA intron (NM_001270428, intron 1 of 3) intron (NM_001270428, intron 1 of 3) 3381 NM_002315 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 115.25-85 chr18 220672 220895 + 0.75 NA intron (NM_005131, intron 17 of 20) L1MEd|LINE|L1 47264 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 129.25-67 chr17 48649290 48649473 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -16822 NR_029582 406972 NR_029582 ENSG00000210741 MIR196A1 MIRN196-1|MIRN196A1|mir-196a-1 microRNA 196a-1 ncRNA 118.25-185 chr7 73685153 73685338 + 0.75 NA intron (NR_037776, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu 1648 NM_001202560 114049 Hs.647063 NM_017528 ENSG00000071462 BUD23 HASJ4442|HUSSY-3|MERM1|PP3381|WBMT|WBSCR22 BUD23 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 195.5-46 chr15 70223655 70224022 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -125921 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 142.5-102 chr2 29029157 29029500 + 0.75 NA intron (NM_001321538, intron 13 of 18) L1PB1|LINE|L1 45195 NM_001029883 388939 Hs.354243 NM_001029883 ENSG00000179270 PCARE C2orf71|RP54 photoreceptor cilium actin regulator protein-coding 192-79 chr4 99393302 99393813 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -40811 NR_133005 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 112.5-141 chr2 228516810 228517033 + 0.75 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 94474 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 220-38 chr22 34610449 34610927 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 387228 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 137-168 chr7 145021696 145021944 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185767 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 143-125 chr6 64261376 64261731 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 454717 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 173-103 chr5 14234301 14234635 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 91126 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 208.5-67 chr2 23280272 23280684 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -104701 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 205.5-131 chr7 14799139 14799456 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 42153 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 164.75-58 chr16 26130457 26130845 + 0.75 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) 105414 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 356.25-19 chr8 125745650 125746227 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 205259 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 139-56 chr18 948515 948737 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20633 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 161.25-136 chr5 44588645 44589039 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -78560 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 216.25-13 chr10 48513966 48514525 + 0.75 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) L1MB7|LINE|L1 -2656 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 170.75-144 chr8 139747069 139747408 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -44115 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 298-15 chr2 22530913 22531744 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -5151 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 134.25-78 chr2 55100102 55100335 + 0.75 NA intron (NM_001321904, intron 1 of 9) intron (NM_001321904, intron 1 of 9) 37613 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 125.5-227 chr7 15026782 15027030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52048 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 170.75-39 chr14 78794818 78795255 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) AluJr4|SINE|Alu 391317 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 116.5-125 chr2 121395958 121396239 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 29 of 38) MER5B|DNA|hAT-Charlie -110896 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 154-101 chr4 117960011 117960302 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -73166 NR_146513 9348 Hs.480596 NM_004784 ENSG00000164100 NDST3 HSST3 N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 protein-coding 128.75-77 chr17 65425178 65425511 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -32197 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 293.5-31 chr4 65534995 65535651 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 134165 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 141.5-80 chr18 12793849 12794143 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001308287, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001308287, exon 8 of 8) -44574 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 173.25-126 chr8 113620484 113620899 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -183752 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 140.25-23 chr10 60611936 60612214 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -39119 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 158.25-13 chr10 81156987 81157299 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 507346 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 177-51 chr2 232384187 232384700 + 0.75 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 2601 NR_028501 347694 Hs.452575 NR_028501 ENSG00000244280 ECEL1P2 ECEL2 endothelin converting enzyme like 1 pseudogene 2 pseudo 190.5-149 chr7 96427839 96428130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75539 NR_163949 132.25-173 chr7 42678999 42679252 + 0.75 NA intron (NR_110833, intron 1 of 2) LTR85c|LTR|Gypsy? 27322 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 226.25-56 chr4 88949138 88949480 + 0.75 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) L3|LINE|CR1 107876 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 148.75-78 chr2 12296681 12297115 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 97768 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 148.75-100 chr20 42850814 42851161 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) -117756 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 152-102 chr3 4841183 4841545 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 60 of 60) intron (NM_001168272, intron 60 of 60) 65137 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-218 chr9 17042916 17043136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92014 NM_017738 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 160.25-106 chr3 191129146 191129524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69906 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 165-71 chr2 122494274 122494662 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 579013 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 120.75-163 chr7 129719900 129720077 + 0.75 NA intron (NM_005011, intron 9 of 10) intron (NM_005011, intron 9 of 10) 50504 NR_029614 406958 NR_029614 ENSG00000207990 MIR182 MIRN182|miRNA182|mir-182 microRNA 182 ncRNA 133.5-153 chr3 2325416 2325828 + 0.75 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) intron (NM_001206955, intron 1 of 23) 86793 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 226.5-3 chr1 84405366 84405778 + 0.75 NA intron (NM_021233, intron 2 of 5) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -2779 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 155.5-38 chr11 90626258 90626484 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) -70514 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 262-51 chr7 13846709 13847196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139562 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 124-147 chr6 51322340 51322572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -299414 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 189.5-24 chr10 93362387 93362840 + 0.75 NA intron (NM_013451, intron 27 of 53) intron (NM_013451, intron 27 of 53) 119721 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 121.5-151 chr2 212411440 212411642 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) LTR78|LTR|ERV1 14819 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 131.5-68 chr14 87484338 87484553 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 170849 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 135.5-15 chr1 198832148 198832388 + 0.75 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) 26714 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 235-41 chr3 2092711 2093151 + 0.75 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -5872 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 152.5-52 chr15 44587515 44587904 + 0.75 NA intron (NM_025137, intron 28 of 39) AluSz|SINE|Alu 50562 NM_003758 8669 Hs.404056 NM_003758 ENSG00000104131 EIF3J EIF3S1|eIF3-alpha|eIF3-p35 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J protein-coding 162.75 chr1 54704644 54704929 + 0.75 NA intron (NM_001039464, intron 21 of 23) MER102b|DNA|hAT-Charlie -11036 NM_001291333 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 128.5-178 chr5 167739143 167739350 + 0.75 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -15683 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 125-88 chr21 27691542 27691817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30700 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 190.5-23 chr11 25959755 25960122 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -229185 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 164-77 chr3 47298515 47298780 + 0.75 NA intron (NM_025010, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 15703 NM_025010 23276 Hs.517946 NM_025010 ENSG00000114648 KLHL18 - kelch like family member 18 protein-coding 112.25-39 chr11 120406956 120407254 + 0.75 NA intron (NM_015313, intron 2 of 40) intron (NM_015313, intron 2 of 40) 21778 NM_001301084 23365 Hs.24598 NM_015313 ENSG00000196914 ARHGEF12 LARG|PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 protein-coding 275.75-2 chr1 157654746 157655518 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 45637 NR_135216 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 187.75-107 chr7 43473103 43473663 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 14 of 27) intron (NM_001287059, intron 14 of 27) 49159 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 136.25-198 chr9 97779807 97780046 + 0.75 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 73154 NR_147055 101928337 NR_147055 ENSG00000236130 PTCSC2 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 2 ncRNA 177.5-17 chr10 90407308 90407751 + 0.75 NA intron (NR_110657, intron 3 of 6) MER4B|LTR|ERV1 133276 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 282-33 chr21 29241260 29241793 + 0.75 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) AluSq2|SINE|Alu 48032 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 170.75-65 chr2 43503747 43504033 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 24 of 37) intron (NM_001083953, intron 24 of 37) 92084 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 229.5-66 chr2 109183965 109184320 + 0.75 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -42554 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 177 chr1 67708510 67709000 + 0.75 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) intron (NM_018841, intron 2 of 3) 23554 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 132.25-38 chr10 124366025 124366369 + 0.75 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 52726 NM_001322974 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 220.75-78 chr8 97465696 97466064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19383 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 116-43 chr14 38297917 38298167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41949 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 296-32 chr4 15473653 15474133 + 0.75 NA intron (NM_001080522, intron 2 of 37) L2a|LINE|L2 4011 NM_001164720 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 193.25-108 chr7 47114312 47114731 + 0.75 NA Intergenic (TGTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 350282 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 134.75-169 chr5 2835062 2835330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82658 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 120.5-145 chr3 98796253 98796502 + 0.75 NA TTS (NM_001323365) TTS (NM_001323365) 33070 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 113.25-27 chr11 95330098 95330294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97721 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 136-26 chr11 76443317 76443626 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1547 NM_001300942 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 128.5-88 chr17 11542738 11543019 + 0.75 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -55592 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 198-18 chr12 80999993 81000460 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -62311 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 154.5-92 chr2 30583169 30583558 + 0.75 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 136117 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 190-91 chr9 131224717 131225045 + 0.75 NA intron (NM_001318324, intron 32 of 35) intron (NM_001318324, intron 32 of 35) 34742 NM_001318325 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 130.25-219 chr9 95510690 95510938 + 0.75 NA intron (NM_001083603, intron 1 of 23) CpG-28534 -2265 NM_000264 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 138.5-154 chr5 41761820 41762233 + 0.75 NA intron (NM_001364302, intron 13 of 15) intron (NM_001364302, intron 13 of 15) 81631 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 220.5-106 chr6 45330296 45330679 + 0.75 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) intron (NM_001015051, intron 2 of 7) 2157 NR_103533 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 125.75-10 chr1 158015840 158016110 + 0.75 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR -9575 NR_145471 100505785 Hs.664656 NR_145471 KIRREL1-IT1 KIRREL-IT1 KIRREL1 intronic transcript 1 ncRNA 123.75-153 chr5 167141396 167141657 + 0.75 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) 26875 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 310.5-9 chr13 112681859 112682606 + 0.75 NA intron (NM_207440, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu -8097 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 226-59 chr6 50951905 50952427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133295 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 181.75-110 chr5 162017872 162018364 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -16922 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 182.75-60 chr18 40626795 40627177 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 560700 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 304.75-29 chr6 35973208 35973962 + 0.75 NA intron (NM_001193476, intron 10 of 19) MER30|DNA|hAT-Charlie 50915 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 221.25-84 chr7 68029538 68030158 + 0.75 NA intron (NR_120514, intron 4 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 9595 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 115.25-91 chr19 39339882 39340107 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2465 NM_001303614 55095 Hs.612332 NM_018028 ENSG00000179134 SAMD4B SMGB|Smaug2 sterile alpha motif domain containing 4B protein-coding 132.25-10 chr1 92293230 92293542 + 0.75 NA intron (NR_135089, intron 3 of 17) AluYh3|SINE|Alu 5601 NM_053274 11146 Hs.49105 NM_007070 ENSG00000174842 GLMN FAP|FAP48|FAP68|FKBPAP|GLML|GVM|VMGLOM glomulin, FKBP associated protein protein-coding 115.25-148 chr4 70084150 70084381 + 0.75 NA intron (NR_003720, intron 12 of 12) intron (NR_003720, intron 12 of 12) 16879 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 202-5 chr1 184957141 184957510 + 0.75 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) intron (NM_052966, intron 1 of 13) 17183 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 118.5-73 chr17 62967601 62967876 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) intron (NM_025185, intron 1 of 25) 1503 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 133-92 chr2 221224731 221225098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 347390 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 168.25-49 chr15 81633021 81633299 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -258947 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 154.25-62 chr16 83541920 83542186 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 33707 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 166.5-85 chr17 59898021 59898300 + 0.75 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) intron (NM_001272044, intron 2 of 15) 5039 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 147.25-24 chr11 113934672 113934944 + 0.75 NA intron (NM_006028, intron 6 of 8) UCON19|Unknown|Unknown 25967 NM_001363563 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 264-64 chr8 142720604 142721182 + 0.75 NA intron (NR_038925, intron 1 of 2) intron (NR_038925, intron 1 of 2) 6080 NR_038925 100288181 Hs.716823 NR_038925 ENSG00000253741 LNCOC1 Lnc-OC1 lncRNA associated with ovarian cancer 1 ncRNA 123.5-166 chr5 103670568 103670738 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -107864 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 125.75-13 chr1 179220222 179220449 + 0.75 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) intron (NM_007314, intron 1 of 11) 9342 NM_007314 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 143.5-74 chr14 87627811 87628058 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 27360 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 134.75-94 chr18 5407092 5407389 + 0.75 NA intron (NM_001281535, intron 15 of 21) intron (NM_001281535, intron 15 of 21) -110187 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 155.5-131 chr3 110762446 110762711 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 307381 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 166.75-113 chr5 59183193 59183514 + 0.75 NA intron (NM_001349243, intron 6 of 16) intron (NM_001349243, intron 6 of 16) 92762 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 170.25-118 chr4 107085061 107085380 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -48907 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 186.75-20 chr12 1732327 1732682 + 0.75 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 L1MC2|LINE|L1 41434 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 160.25-87 chr22 45461547 45461957 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -41131 NM_006486 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 234.25-61 chr5 121569325 121569808 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 247016 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 127.75-210 chr9 105569737 105570008 + 0.75 NA intron (NM_001351498, intron 1 of 9) intron (NM_001351498, intron 1 of 9) 11741 NM_001198963 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 222.25-2 chr1 179779744 179780268 + 0.75 NA intron (NM_001329719, intron 1 of 4) intron (NM_001329719, intron 1 of 4) -23918 NR_162130 113219451 NR_162130 MIR12116 - microRNA 12116 ncRNA 133.75-91 chr2 18624257 18624513 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -34805 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 142.75-168 chr6 54540590 54540857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232282 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 113-163 chr6 121513466 121513641 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77907 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 260.5-16 chr15 70940891 70941375 + 0.75 NA intron (NM_017691, intron 8 of 15) intron (NM_017691, intron 8 of 15) 48690 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 137.25-26 chr11 73951350 73951602 + 0.75 NA intron (NM_153614, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 1157 NM_153614 374407 Hs.567888 NM_153614 ENSG00000187726 DNAJB13 CILD34|RSPH16A|TSARG5|TSARG6 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B13 protein-coding 124-67 chr17 71932133 71932339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 93743 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 153.75-70 chr2 180959891 180960261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20309 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 162.75-85 chr20 31489882 31490154 + 0.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 4240 NR_024358 140875 Hs.283478 NR_024358 ENSG00000233354 LINC00028 C20orf93|NCRNA00028|dJ1093G12.6 long intergenic non-protein coding RNA 28 ncRNA 210.5-29 chr12 97182978 97183290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 275668 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 118.25-48 chr11 114826431 114826632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148004 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 203.25-77 chr4 156774779 156775126 + 0.75 NA intron (NM_016205, intron 3 of 5) intron (NM_016205, intron 3 of 5) 196847 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 196-17 chr12 5761706 5762239 + 0.75 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) MER34B-int|LTR|ERV1 183287 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 174.25-53 chr14 78270473 78270901 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 2 of 20) MIR|SINE|MIR 100314 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 142.25-115 chr4 6294808 6295080 + 0.75 NA intron (NM_006005, intron 6 of 7) intron (NM_006005, intron 6 of 7) 25094 NM_001145853 7466 Hs.518602 NM_006005 ENSG00000109501 WFS1 CTRCT41|WFRS|WFS|WFSL wolframin ER transmembrane glycoprotein protein-coding 115.75-24 chr10 124459067 124459264 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -2658 NM_001318332 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 219.5 chr1 22399251 22399668 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -52392 NM_001330398 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 143.25-88 chr2 69210312 69210573 + 0.75 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 106760 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 143.75-5 chr1 83806712 83807100 + 0.75 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) intron (NR_119374, intron 2 of 2) 53640 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 147.25-55 chr2 12758144 12758440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20925 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 317.75-26 chr7 64619918 64620611 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 37654 NR_033245 641746 Hs.488363 NR_033245 LOC641746 - glycine cleavage system protein H (aminomethyl carrier) pseudogene pseudo 265.5-10 chr10 91114624 91115318 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 38109 NR_002779 119369 Hs.441287 NR_002779 NUDT9P1 C10orf98|bA56M3.1 nudix hydrolase 9 pseudogene 1 pseudo 167.25-160 chr8 134000438 134000845 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114145 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 204.25-77 chr4 54012067 54012613 + 0.75 NA intron (NM_012110, intron 5 of 5) intron (NM_012110, intron 5 of 5) -25058 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 169.75-21 chr10 94925258 94925533 + 0.75 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -13263 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 207-74 chr6 148940515 148940834 + 0.75 NA intron (NM_005715, intron 2 of 7) intron (NM_005715, intron 2 of 7) 24010 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 185.5-17 chr10 64900940 64901247 + 0.75 NA TTS (NR_134456) TTS (NR_134456) 23425 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 147.5-121 chr20 34349161 34349422 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -13982 NM_031483 83737 Hs.632272 NM_031483 ENSG00000078747 ITCH ADMFD|AIF4|AIP4|NAPP1 itchy E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 114-166 chr9 30146417 30146604 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 261944 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 131.75-29 chr10 69751618 69751857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50169 NM_080802 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 134.75-154 chr4 4936405 4936687 + 0.75 NA intron (NR_125893, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 15738 NR_125893 101928306 Hs.543743 NR_125893 LOC101928306 - uncharacterized LOC101928306 ncRNA 209-27 chr16 79489235 79489731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 111254 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 125-70 chr2 82020894 82021227 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -554114 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 139.25-186 chr7 117867204 117867436 + 0.75 NA intron (NM_001363351, intron 1 of 22) intron (NM_001363351, intron 1 of 22) 4900 NM_001363349 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 145-16 chr1 212509985 212510241 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -35581 NR_125985 101929565 NR_125985 ENSG00000228067 LINC01740 - long intergenic non-protein coding RNA 1740 ncRNA 134.5-81 chr15 98603943 98604149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44493 NM_001291858 3480 Hs.643120 NM_000875 ENSG00000140443 IGF1R CD221|IGFIR|IGFR|JTK13 insulin like growth factor 1 receptor protein-coding 221.25-3 chr1 85390163 85390700 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 14075 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 170.5-47 chr12 62847871 62848141 + 0.75 NA intron (NM_020700, intron 1 of 9) intron (NM_020700, intron 1 of 9) 87144 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 203.25-24 chr11 68340215 68340551 + 0.75 NA intron (NM_002335, intron 1 of 22) MIRb|SINE|MIR 27792 NM_002335 4041 Hs.6347 NM_002335 ENSG00000162337 LRP5 BMND1|EVR1|EVR4|HBM|LR3|LRP-5|LRP-7|LRP7|OPPG|OPS|OPTA1|PCLD4|VBCH2 LDL receptor related protein 5 protein-coding 123-71 chr16 50797871 50798229 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001042412, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001042412, exon 18 of 18) -8622 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 112.25-169 chr5 110028247 110028487 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 145185 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 155.5-57 chr15 58871916 58872150 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 61646 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 121-40 chr11 68310768 68311006 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1704 NM_001291902 4041 Hs.6347 NM_002335 ENSG00000162337 LRP5 BMND1|EVR1|EVR4|HBM|LR3|LRP-5|LRP-7|LRP7|OPPG|OPS|OPTA1|PCLD4|VBCH2 LDL receptor related protein 5 protein-coding 152-146 chr7 134221222 134221574 + 0.75 NA intron (NM_144648, intron 15 of 19) intron (NM_144648, intron 15 of 19) 94058 NM_001365701 136332 Hs.149774 NM_144648 ENSG00000155530 LRGUK CFAP246 leucine rich repeats and guanylate kinase domain containing protein-coding 118.75-101 chr2 86071566 86071745 + 0.75 NA intron (NM_015425, intron 12 of 33) L1ME4a|LINE|L1 34231 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 199.5-66 chr19 15903624 15903905 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -5690 NM_001082 8529 Hs.558423 NM_001082 ENSG00000186115 CYP4F2 CPF2 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 2 protein-coding 184-25 chr14 71935224 71935725 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) intron (NM_001370288, intron 1 of 16) 1947 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 136.5-225 chr8 78140276 78140717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -375844 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 169.75-127 chr5 83987420 83987838 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) intron (NM_001278642, intron 8 of 9) -266774 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 130.75-170 chr6 120633754 120633949 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 618672 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 233.25-48 chr3 41099783 41100208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99510 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 117.5-173 chr5 28677908 28678211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248811 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 189.5-141 chr8 23936650 23936972 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82005 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 127-148 chr6 48807962 48808369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 655088 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 138.5-43 chr12 27012379 27012659 + 0.75 NA intron (NM_016551, intron 1 of 11) intron (NM_016551, intron 1 of 11) 1865 NM_016551 51768 Hs.438641 NM_016551 ENSG00000064115 TM7SF3 - transmembrane 7 superfamily member 3 protein-coding 133.25-149 chr4 60407242 60407634 + 0.75 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -515181 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 166.25-40 chr12 22326542 22326812 + 0.75 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) intron (NM_003034, intron 1 of 4) 8037 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 287.75-5 chr1 172867876 172868405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182823 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 185.75-129 chr8 126892689 126892937 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120341 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 120-52 chr15 77225417 77225656 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_026813) promoter-TSS (NR_026813) -132 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 201.75-90 chr7 12678688 12679072 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -7947 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 161.25-113 chr22 40661409 40661793 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17577 NM_005297 2847 Hs.248122 NM_005297 ENSG00000128285 MCHR1 GPR24|MCH-1R|MCH1R|SLC-1|SLC1 melanin concentrating hormone receptor 1 protein-coding 141.75-12 chr1 194417236 194417598 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 1112672 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 135.75-210 chr9 27064485 27064742 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001349928, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001349928, exon 20 of 20) -44528 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 380.5-2 chr14 55662890 55663752 + 0.75 NA intron (NM_004986, intron 32 of 41) intron (NM_004986, intron 32 of 41) 83114 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 122-167 chr7 54612899 54613278 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 56118 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 126.5-103 chr2 6433140 6433399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57847 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 126-161 chr7 336086 336373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43196 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 123.25-189 chr7 81859785 81859997 + 0.75 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -89844 NM_001010932 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 174.75-132 chr8 125785933 125786194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165134 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 223-46 chr20 43691996 43692409 + 0.75 NA exon (NM_002466, exon 6 of 14) exon (NM_002466, exon 6 of 14) 25088 NM_002466 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 257.5-9 chr10 95393753 95394229 + 0.75 NA intron (NM_001034955, intron 12 of 30) intron (NM_001034955, intron 12 of 30) 47189 NM_001290297 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 217.5-14 chr10 75416352 75416747 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 7392 NR_110304 101929234 Hs.694695 NR_110304 LOC101929234 - uncharacterized LOC101929234 ncRNA 173.5-33 chr12 3703334 3703594 + 0.75 NA intron (NM_001144958, intron 3 of 19) L1ME1|LINE|L1 49645 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 207.5-125 chr8 138365937 138366266 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) intron (NM_015912, intron 2 of 19) 131160 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 306-5 chr11 97978554 97979158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1042093 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 203.75-75 chr3 197309809 197310290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10728 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 247.75-13 chr14 49542980 49543354 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 43213 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 125.5-31 chr10 82698137 82698421 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -465359 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-104 chr2 185924101 185924424 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -124111 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 149-144 chr9 128473457 128473713 + 0.75 NA intron (NM_153433, intron 7 of 20) intron (NM_153433, intron 7 of 20) 16678 NM_153437 4957 Hs.129055 NM_002540 ENSG00000136811 ODF2 CT134|ODF2/1|ODF2/2|ODF84 outer dense fiber of sperm tails 2 protein-coding 113.25-55 chr15 49826796 49827052 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 205876 NM_001144955 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 172-62 chr20 25143713 25144193 + 0.75 NA intron (NR_027091, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 4040 NR_027093 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 166.25-15 chr1 170414542 170414836 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -117433 NM_001146039 92344 Hs.183702 NM_152281 ENSG00000120370 GORAB GO|NTKLBP1|SCYL1BP1 golgin, RAB6 interacting protein-coding 200.25-46 chr17 18944144 18944716 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6246 NM_001282417 125206 Hs.462418 NM_152351 ENSG00000154025 SLC5A10 SGLT-5|SGLT5 solute carrier family 5 member 10 protein-coding 213.5-20 chr10 110825642 110826173 + 0.75 NA intron (NM_001134363, intron 12 of 13) MIR|SINE|MIR 44997 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 217.75-32 chr17 68642155 68642545 + 0.75 NA intron (NR_110825, intron 1 of 4) intron (NR_110825, intron 1 of 4) 14196 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 179.25-114 chr4 139956407 139956724 + 0.75 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) intron (NM_018717, intron 1 of 4) -171450 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 189.25-116 chr8 23983874 23984382 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -129322 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 122-7 chr1 89597770 89598012 + 0.75 NA TTS (NM_001134476) TTS (NM_001134476) 35003 NR_033981 400761 Hs.741594 NR_033981 ENSG00000231999 LRRC8C-DT - LRRC8C divergent transcript ncRNA 126.5-261 chr9 17204171 17204491 + 0.75 NA intron (NM_001365029, intron 2 of 25) L1PA7|LINE|L1 69291 NM_001114395 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 209.75-63 chr3 152241090 152241552 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -27608 NM_001314057 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 173.25-79 chr3 123152220 123152601 + 0.75 NA intron (NM_006810, intron 14 of 16) intron (NM_006810, intron 14 of 16) -9384 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 272.5-13 chr11 82837854 82838499 + 0.75 NA intron (NM_199418, intron 9 of 9) intron (NM_199418, intron 9 of 9) 62254 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 141-6 chr1 118581251 118581614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -396204 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 240-42 chr4 45474945 45475331 + 0.75 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 648916 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 170.25-146 chr7 136819207 136819536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49281 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 190-29 chr2 35167146 35167607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -304029 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 142.5-197 chr6 153003819 153004098 + 0.75 NA TTS (NM_012419) TTS (NM_012419) -1143 NM_001301872 54516 Hs.225836 NM_019041 ENSG00000112031 MTRF1L HMRF1L|MRF1L|mtRF1a mitochondrial translational release factor 1 like protein-coding 215.25-114 chr9 22077986 22078303 + 0.75 NA TTS (NR_047542) TTS (NR_047542) -68831 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 131.5-22 chr10 16782120 16782359 + 0.75 NA intron (NM_152724, intron 1 of 7) intron (NM_152724, intron 1 of 7) 35185 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 165-108 chr4 105627714 105627963 + 0.75 NA intron (NM_001242729, intron 3 of 13) intron (NM_001242729, intron 3 of 13) 66247 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 141-61 chr18 1187119 1187373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172383 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 225-74 chr7 93933280 93933662 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 11736 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 231.5-87 chr6 93556530 93556855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137110 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 124.75-42 chr11 43858166 43858356 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -22570 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 222.25-84 chr7 118467904 118468366 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 243431 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 274.75-18 chr17 80723433 80723858 + 0.75 NA intron (NM_020761, intron 4 of 33) L1MC4a|LINE|L1 81987 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 189-41 chr16 6373621 6374112 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) 354163 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 160.25-100 chr3 119749790 119750209 + 0.75 NA intron (NM_033364, intron 16 of 17) MIRb|SINE|MIR -30485 NM_003889 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 146-5 chr1 113749935 113750186 + 0.75 NA intron (NM_001323051, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 9095 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 152.25-106 chr3 143466731 143466970 + 0.75 NA intron (NM_173653, intron 12 of 15) intron (NM_173653, intron 12 of 15) 124604 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 125-137 chr5 177203452 177203806 + 0.75 NA intron (NM_172349, intron 4 of 23) intron (NM_172349, intron 4 of 23) 69400 NM_001365684 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 177.25-148 chrX 15373699 15374285 + 0.75 NA intron (NR_037859, intron 9 of 14) intron (NR_037859, intron 9 of 14) 10421 NM_004469 2277 Hs.11392 NM_004469 ENSG00000165197 VEGFD FIGF|VEGF-D vascular endothelial growth factor D protein-coding 127.25-219 chr9 116868484 116868673 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 9 of 21) intron (NM_014010, intron 9 of 21) 181273 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 182.25-43 chr15 60336143 60336521 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 61654 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 139-4 chr1 28042565 28042919 + 0.75 NA intron (NM_001282561, intron 3 of 16) intron (NM_001282561, intron 3 of 16) 45868 NM_001990 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 141-131 chr5 101576967 101577309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -673856 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 129.25-151 chr5 36205115 36205400 + 0.75 NA intron (NM_001085411, intron 8 of 11) intron (NM_001085411, intron 8 of 11) 36134 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 159.25-58 chr18 64018010 64018315 + 0.75 NA intron (NM_001348367, intron 7 of 7) intron (NM_001348367, intron 7 of 7) 48081 NM_001366198 5271 Hs.368077 NM_002640 ENSG00000166401 SERPINB8 C18orf53|CAP2|PI-8|PI8|PSS5 serpin family B member 8 protein-coding 143.25-58 chr15 89254149 89254507 + 0.75 NA intron (NM_001113378, intron 2 of 37) L1MC4|LINE|L1 10349 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 129.25-71 chr17 81964832 81965207 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3832 NM_178493 147111 Hs.106137 NM_178493 ENSG00000185269 NOTUM hNOTUM notum, palmitoleoyl-protein carboxylesterase protein-coding 125.75-161 chr6 66751493 66751689 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 963712 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 218.75-25 chr17 5353798 5354256 + 0.75 NA intron (NM_001083585, intron 7 of 16) intron (NM_001083585, intron 7 of 16) -65614 NR_027679 84268 Hs.462086 NM_032308 ENSG00000129197 RPAIN HRIP|RIP RPA interacting protein protein-coding 124.5-172 chr5 120854371 120854654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 323048 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 131.5-53 chr13 90115305 90115620 + 0.75 NA intron (NR_047489, intron 1 of 5) intron (NR_047489, intron 1 of 5) 4255 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 155.75-23 chr10 99710620 99710885 + 0.75 NA TTS (NM_001320975) TTS (NM_001320975) -21482 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 188-42 chr20 33315529 33315900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32500 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 183-76 chr3 128056667 128057098 + 0.75 NA intron (NM_013336, intron 5 of 11) intron (NM_013336, intron 5 of 11) 4445 NM_013336 29927 Hs.518236 NM_013336 ENSG00000058262 SEC61A1 HNFJ4|HSEC61|SEC61|SEC61A SEC61 translocon alpha 1 subunit protein-coding 213.75 chr1 14877738 14878163 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 -46179 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 176.25-45 chr16 7955807 7956141 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 623129 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 192.25-25 chr14 29154244 29154652 + 0.75 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -368661 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 215.5-60 chr20 32263205 32263634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14232 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 168.25-27 chr11 76044659 76045075 + 0.75 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) HAL1|LINE|L1 161635 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 126.75-43 chr12 122256263 122256604 + 0.75 NA intron (NM_001351021, intron 4 of 4) AluSz|SINE|Alu 10061 NM_001351021 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 191.25-9 chr10 48748130 48748428 + 0.75 NA intron (NM_020945, intron 12 of 61) intron (NM_020945, intron 12 of 61) 62816 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 147.5-8 chr1 44315278 44315593 + 0.75 NA intron (NM_001301698, intron 3 of 7) intron (NM_001301698, intron 3 of 7) 39822 NM_001301698 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 155.5-115 chr22 25502335 25502566 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 46804 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 181.25-134 chr8 137262817 137263190 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 150585 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 138.75-177 chr7 51812913 51813249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -419825 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 205.5-126 chr6 66582303 66582635 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 794590 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 115-46 chr14 44577961 44578206 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70674 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 222.5-13 chr1 228371419 228371900 + 0.75 NA exon (NM_001098623, exon 94 of 105) exon (NM_001098623, exon 94 of 105) 25450 NR_106800 102465444 NR_106800 ENSG00000284311 MIR6742 hsa-mir-6742 microRNA 6742 ncRNA 122.5-66 chr14 68214738 68214913 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 391233 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 182.25-26 chr12 1446079 1446401 + 0.75 NA intron (NR_027948, intron 19 of 19) intron (NR_027948, intron 19 of 19) -54251 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 143.25-186 chr8 109017878 109018124 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68627 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 182-89 chr5 54838628 54839099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94605 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 122.25-6 chr1 112634360 112634759 + 0.75 NA intron (NM_006135, intron 1 of 9) intron (NM_006135, intron 1 of 9) 14727 NM_006135 829 Hs.744974 NM_006135 ENSG00000116489 CAPZA1 CAPPA1|CAPZ|CAZ1 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1 protein-coding 209.5-144 chr8 115537267 115537663 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 130548 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 187.5-133 chr5 25460990 25461419 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 270251 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 185.75-84 chr3 10456849 10457353 + 0.75 NA intron (NM_001353564, intron 2 of 20) intron (NM_001353564, intron 2 of 20) 48483 NM_001363862 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 298.75-24 chr20 14431283 14431827 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -93888 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 145-171 chr9 137757015 137757465 + 0.75 NA intron (NM_001354263, intron 8 of 26) intron (NM_001354263, intron 8 of 26) 31166 NR_147508 651337 Hs.603195 NR_147508 ENSG00000255585 LOC651337 - uncharacterized LOC651337 ncRNA 211.5-138 chr7 19740382 19740828 + 0.75 NA intron (NM_001366627, intron 1 of 4) intron (NM_001366627, intron 1 of 4) -31568 NM_001002926 221830 Hs.353035 NM_001002926 ENSG00000105849 TWISTNB - TWIST neighbor protein-coding 237.5-95 chr7 29215152 29215542 + 0.75 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -6377 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 139-15 chr10 51752762 51753151 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -53361 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 270.5-10 chr11 44644917 44645380 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 79485 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 135.25-20 chr1 223257030 223257378 + 0.75 NA intron (NM_001037175, intron 5 of 5) intron (NM_001037175, intron 5 of 5) 106972 NM_017982 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 222.75-77 chr5 25594467 25595063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 403812 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 180.75-146 chr8 86454641 86455085 + 0.75 NA intron (NM_007013, intron 21 of 24) MIRc|SINE|MIR 53823 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 205.75-91 chr9 25154452 25154917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 524174 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 214-56 chr6 46874954 46875297 + 0.75 NA intron (NM_001098518, intron 10 of 20) intron (NM_001098518, intron 10 of 20) -28346 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 181.25-35 chr15 68252545 68252902 + 0.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -22995 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 201.75-6 chr1 192711408 192711938 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -4655 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 158.25-70 chr2 194520276 194520580 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 176159 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 159-64 chr3 83920156 83920562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 949216 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 229.75-42 chr21 27042609 27043120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75776 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 193.5-48 chr14 67782129 67782607 + 0.75 NA intron (NM_015346, intron 21 of 41) MER58A|DNA|hAT-Charlie 34222 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 163-7 chr1 162860262 162860725 + 0.75 NA intron (NM_178550, intron 1 of 3) intron (NM_178550, intron 1 of 3) 8322 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 138.75-188 chr8 58830488 58830770 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 5 of 8) intron (NM_014729, intron 5 of 8) -170776 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 140-106 chr3 65292247 65292725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -601330 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 204.25-83 chr4 119747694 119748129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56604 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 184.5-23 chr11 17548615 17548994 + 0.75 NA intron (NM_001277269, intron 2 of 54) AluJr|SINE|Alu 1431 NM_001277269 340990 Hs.688380 NM_198497 ENSG00000188162 OTOG DFNB18B|MLEMP|OTGN otogelin protein-coding 132.25-184 chr8 123678872 123679091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25180 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 123-156 chr5 74695746 74696027 + 0.75 NA intron (NM_001292004, intron 3 of 13) intron (NM_001292004, intron 3 of 13) 10653 NM_000521 3074 Hs.69293 NM_000521 ENSG00000049860 HEXB ENC-1AS|HEL-248|HEL-S-111 hexosaminidase subunit beta protein-coding 169.75-142 chr7 44832567 44833021 + 0.75 NA TTS (NM_201517) TTS (NM_201517) 15332 NM_012412 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 259-7 chr1 226435563 226436154 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27765 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 153-19 chr11 36971544 36971889 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -373437 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 166-7 chr10 28811051 28811397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15174 NR_038376 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 166-91 chr4 104604541 104604936 + 0.75 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) L1M3a|LINE|L1 -109844 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 161-26 chr12 55917439 55917728 + 0.75 NA intron (NM_032345, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 9542 NM_001143853 84305 Hs.505687 NM_032345 ENSG00000170473 PYM1 PYM|WIBG PYM homolog 1, exon junction complex associated factor protein-coding 142.75-178 chr7 95523220 95523609 + 0.75 NA intron (NM_145872, intron 2 of 2) L1MD|LINE|L1 37471 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 188.25-69 chr22 39186731 39187170 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -34270 NM_175709 23492 Hs.356416 NM_175709 ENSG00000100307 CBX7 - chromobox 7 protein-coding 180-107 chr7 4071891 4072410 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 20 of 44) intron (NM_152744, intron 20 of 44) -57535 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 156.75-93 chr2 155255755 155256129 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 557247 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 213-68 chr4 42892321 42892620 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001080476) promoter-TSS (NM_001080476) -796 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 215.25-5 chr10 17327742 17328213 + 0.75 NA intron (NM_001004470, intron 5 of 7) intron (NM_001004470, intron 5 of 7) -58959 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 153-27 chr12 27301177 27301397 + 0.75 NA intron (NM_015000, intron 2 of 13) AluSc8|SINE|Alu -31549 NM_001248005 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 132.75-141 chr4 112790182 112790471 + 0.75 NA intron (NM_001354269, intron 1 of 43) intron (NM_001354269, intron 1 of 43) -27671 NM_001127493 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 198.25-77 chr4 96643484 96644067 + 0.75 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 333072 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 118.5-174 chr6 846829 847003 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21582 NR_110853 101927691 Hs.552556 NR_110853 LOC101927691 - uncharacterized LOC101927691 ncRNA 209-55 chr4 95935788 95936254 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 95928 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 146.25-149 chr8 87617800 87618162 + 0.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 256034 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 120.25-129 chr3 32664927 32665236 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20107 NR_046352 25904 Hs.444851 NM_015442 ENSG00000182973 CNOT10 - CCR4-NOT transcription complex subunit 10 protein-coding 147.5-162 chr4 46705344 46705583 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203782 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 168-14 chr10 66913464 66913859 + 0.75 NA intron (NR_111911, intron 3 of 6) intron (NR_111911, intron 3 of 6) -12375 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 286.25-21 chr3 117366697 117367306 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 323924 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 231.25-45 chr20 11920735 11921048 + 0.75 NA intron (NM_014962, intron 3 of 3) intron (NM_014962, intron 3 of 3) 2998 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 163-107 chr6 38277418 38277835 + 0.75 NA intron (NM_052893, intron 9 of 11) AluSx1|SINE|Alu -203970 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 196.25-51 chr18 6726026 6726561 + 0.75 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -3423 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 161.5-184 chr8 119357325 119357668 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 32325 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 143.25-109 chr22 28240736 28240996 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1MC4|LINE|L1 -219003 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 183.75-125 chr8 101085705 101086046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33821 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 138.75-151 chr5 96938397 96938819 + 0.75 NA intron (NM_005575, intron 1 of 17) intron (NM_005575, intron 1 of 17) 2528 NM_005575 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 147.25-104 chr5 53775312 53775643 + 0.75 NA TTS (NR_147167) TTS (NR_147167) 44205 NR_147167 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 230.25-14 chr10 95069592 95070029 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001198853) promoter-TSS (NM_001198853) -313 NM_000770 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 157.75-22 chr10 83115771 83116127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 561140 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 159.75-13 chr10 7232735 7233117 + 0.75 NA intron (NM_001029880, intron 9 of 20) intron (NM_001029880, intron 9 of 20) -46142 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 134.25-150 chr5 144323813 144324073 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 118552 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 175.25-2 chr1 61589699 61590061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64362 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 123.25-187 chr7 37451580 37451784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2356 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 174.5-180 chr7 140925869 140926191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1101 NM_001354609 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 179.25-69 chr18 68840644 68841027 + 0.75 NA intron (NM_001093729, intron 5 of 9) intron (NM_001093729, intron 5 of 9) 42755 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 133.5-178 chr4 40572539 40572799 + 0.75 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu -56684 NM_019027 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 122.75-14 chr1 186571325 186571579 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 108971 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 202.25-58 chr4 92501873 92502243 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 197659 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 147.75-45 chr15 85042898 85043203 + 0.75 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) intron (NM_173454, intron 1 of 20) 61076 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 231.5-71 chr4 57109080 57109512 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_034081) promoter-TSS (NR_034081) -466 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 159.25-63 chr19 31008514 31008920 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -158793 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 147.75-104 chr3 76910362 76910614 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -129611 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 165-59 chr17 76314263 76314572 + 0.75 NA intron (NM_001366236, intron 7 of 9) AluSp|SINE|Alu -6737 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 115.25-226 chr9 108365792 108366060 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 490060 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 153.25-8 chr1 217240379 217240664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102819 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 114-21 chr10 80659943 80660202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10275 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 179.25-24 chr10 88866304 88866688 + 0.75 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL -13749 NM_020799 57559 Hs.16229 NM_020799 ENSG00000138134 STAMBPL1 ALMalpha|AMSH-FP|AMSH-LP|bA399O19.2 STAM binding protein like 1 protein-coding 205.25-13 chr12 10235269 10235689 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -3482 NM_001351060 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 144.25-214 chr8 132562808 132563138 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -1494 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 129.5-129 chr2 112162358 112162687 + 0.75 NA intron (NM_001128165, intron 2 of 6) intron (NM_001128165, intron 2 of 6) 24137 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 197.5-73 chr2 117866071 117866455 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 32532 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 132.5-42 chr11 82737747 82738067 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4043 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 119.25-134 chr3 113969105 113969308 + 0.75 NA intron (NR_148531, intron 14 of 14) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 21193 NM_001320468 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 141-115 chr4 84960852 84961236 + 0.75 NA intron (NM_014991, intron 1 of 67) AluSg|SINE|Alu -4572 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 135.25-156 chr5 54017918 54018143 + 0.75 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -66431 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 193.75-61 chr2 38045553 38046001 + 0.75 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) L1MB7|LINE|L1 -9436 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 146.25-85 chr2 235053389 235053718 + 0.75 NA intron (NM_001371302, intron 5 of 5) intron (NM_001371302, intron 5 of 5) 25818 NM_001371306 153.75-99 chr4 6221214 6221516 + 0.75 NA intron (NR_037863, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 20632 NR_037863 285484 Hs.479068 NR_037863 LINC02495 - long intergenic non-protein coding RNA 2495 ncRNA 147.5-63 chr14 66311202 66311466 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -175037 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 153.25-41 chr14 62425477 62425767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -285649 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 157.25-101 chr3 172084562 172084916 + 0.75 NA intron (NM_001135095, intron 1 of 25) intron (NM_001135095, intron 1 of 25) 44208 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 211-11 chr11 6066200 6066517 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38617 NM_001001917 120796 Hs.553543 NM_001001917 ENSG00000180934 OR56A1 OR11-75 olfactory receptor family 56 subfamily A member 1 protein-coding 168.25-16 chr10 59798131 59798411 + 0.75 NA intron (NM_005436, intron 7 of 8) intron (NM_005436, intron 7 of 8) -44816 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 113-30 chr10 95632961 95633306 + 0.75 NA intron (NM_001323415, intron 6 of 17) intron (NM_001323415, intron 6 of 17) 23578 NM_001323413 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 125.5-24 chr10 22901727 22901977 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26172 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 127.75-202 chr8 120855644 120855932 + 0.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -43742 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 163.25-149 chr9 26990995 26991416 + 0.75 NA intron (NM_001099224, intron 8 of 13) intron (NM_001099224, intron 8 of 13) 14467 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 141.25-4 chr1 44431892 44432246 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 8068 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 210.75-45 chr2 150033173 150033529 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -174160 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 131.75-33 chr10 95968490 95968790 + 0.75 NA intron (NM_001349008, intron 14 of 34) intron (NM_001349008, intron 14 of 34) -31451 NM_001001732 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 190.25-28 chr12 85097694 85098099 + 0.75 NA intron (NM_001079910, intron 11 of 26) intron (NM_001079910, intron 11 of 26) 61545 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 167.25-102 chr22 27125360 27125886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61893 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 157.75-125 chr4 111934001 111934280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -211314 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 127.25-204 chr8 27830956 27831190 + 0.75 NA intron (NM_001278945, intron 2 of 7) L1MEc|LINE|L1 6744 NM_001363040 55872 Hs.104741 NM_018492 ENSG00000168078 PBK CT84|HEL164|Nori-3|SPK|TOPK PDZ binding kinase protein-coding 141-88 chr20 2550544 2550836 + 0.75 NA intron (NM_080751, intron 2 of 19) L1MC2|LINE|L1 14083 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 188.25-74 chr3 77529268 77529723 + 0.75 NA intron (NM_001290039, intron 7 of 26) intron (NM_001290039, intron 7 of 26) 431483 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 118-116 chr3 126427393 126427696 + 0.75 NA intron (NM_182628, intron 13 of 16) L1MC|LINE|L1 32635 NM_182628 348807 Hs.591305 NM_182628 ENSG00000163885 CFAP100 CCDC37|MIA1 cilia and flagella associated protein 100 protein-coding 236.75-13 chr11 38475395 38475782 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 170768 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 125.5-254 chr8 86967203 86967482 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MER52C|LTR|ERV1 100927 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 168-35 chr12 26842536 26842996 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9572 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 261.25-25 chr22 34957955 34958509 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 39684 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 145.25-122 chr4 151559068 151559312 + 0.75 NA intron (NM_001109977, intron 3 of 13) intron (NM_001109977, intron 3 of 13) 150014 NM_001348694 729830 Hs.633810 NM_001109977 ENSG00000164142 FAM160A1 - family with sequence similarity 160 member A1 protein-coding 219-32 chr13 97865894 97866263 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87597 NM_002271 3843 Hs.712598 NM_002271 ENSG00000065150 IPO5 IMB3|KPNB3|Pse1|RANBP5|imp5 importin 5 protein-coding 119-154 chr5 152029425 152029618 + 0.75 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) HAL1b|LINE|L1 70623 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 160.25-44 chr15 67075055 67075422 + 0.75 NA intron (NM_005902, intron 1 of 8) intron (NM_005902, intron 1 of 8) 9636 NM_005902 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 150-40 chr14 57094786 57095054 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 173985 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 117.25-215 chr8 122343891 122344115 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 224641 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 155.5-132 chr3 114452336 114452623 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -1114 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 139.5-68 chr14 63265212 63265510 + 0.75 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 53574 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 120.5-199 chr6 74368521 74368871 + 0.75 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 299245 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 218.75-90 chr8 128189106 128189539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39206 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 227.75-41 chr2 135910667 135911044 + 0.75 NA intron (NM_001293312, intron 14 of 14) intron (NM_001293312, intron 14 of 14) -34412 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 128.25-162 chr5 96906123 96906394 + 0.75 NA intron (NM_001329229, intron 12 of 17) (TCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29822 NM_005575 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 122.5-42 chr12 2958256 2958544 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_003213) promoter-TSS (NM_003213) -997 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 112.75-118 chr20 20577163 20577368 + 0.75 NA intron (NM_020343, intron 20 of 39) intron (NM_020343, intron 20 of 39) 135379 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 174-105 chr8 142474373 142474670 + 0.75 NA intron (NM_001702, intron 2 of 30) intron (NM_001702, intron 2 of 30) 24872 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 117-21 chr10 117629160 117629381 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -84202 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 141.75-167 chr8 28720157 28720449 + 0.75 NA intron (NM_001440, intron 3 of 6) intron (NM_001440, intron 3 of 6) 18802 NM_001440 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 173.5-144 chr6 88808143 88808508 + 0.75 NA intron (NM_003800, intron 11 of 15) L1MCc|LINE|L1 155293 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 150.5-34 chr11 133169520 133169810 + 0.75 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -225897 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 193.5-148 chr7 27518884 27519340 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96862 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 126-35 chr11 123176648 123176982 + 0.75 NA intron (NM_024769, intron 1 of 6) intron (NM_024769, intron 1 of 6) 18433 NM_024769 79827 Hs.591949 NM_024769 ENSG00000166250 CLMP ACAM|ASAM|CSBM|CSBS CXADR like membrane protein protein-coding 158.75-102 chr20 48248816 48249126 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -110940 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 118.25-17 chr1 162999906 163000116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68595 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 121-154 chr5 24062727 24063040 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 111535 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 121.75-184 chr8 40302700 40302972 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40527 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 119.75-154 chr4 42867888 42868260 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25192 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 226-72 chr8 142152845 142153376 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23229 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 169.25-20 chr12 72877348 72877725 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -281654 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 204.25-79 chr4 70293150 70293641 + 0.75 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -41586 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 131-52 chr14 61752351 61752708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1432 NR_144368 105370526 Hs.661638 NR_144368 ENSG00000258667 HIF1A-AS3 - HIF1A antisense RNA 3 ncRNA 145.5-104 chr2 154442671 154443024 + 0.75 NA intron (NM_052917, intron 12 of 12) intron (NM_052917, intron 12 of 12) 14591 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 205.75 chr1 29638302 29638706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -288390 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 136.25-88 chr18 7096839 7097087 + 0.75 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) L1M4a1|LINE|L1 20834 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 127.5-95 chr16 47665314 47665627 + 0.75 NA intron (NM_000293, intron 25 of 30) intron (NM_000293, intron 25 of 30) -193111 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 218.75-52 chr22 47098612 47099031 + 0.75 NA intron (NM_001284305, intron 11 of 12) intron (NM_001284305, intron 11 of 12) -182779 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 206.5-72 chr3 71007175 71007666 + 0.75 NA intron (NM_001244812, intron 7 of 15) intron (NM_001244812, intron 7 of 15) 57504 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 221.25-35 chr17 78292571 78293070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14328 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 140.25-108 chr20 56976781 56976998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236807 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 168-23 chr11 15182015 15182444 + 0.75 NA intron (NM_001042536, intron 5 of 12) intron (NM_001042536, intron 5 of 12) 33127 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 117.5-191 chr5 121228002 121228261 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -94419 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 146.25-49 chr16 89149596 89149865 + 0.75 NA intron (NR_104293, intron 10 of 10) LTR27B|LTR|ERV1 -9490 NR_024347 283860 Hs.739138 NM_173617 ENSG00000180422 LINC00304 C16orf81|NCRNA00304 long intergenic non-protein coding RNA 304 ncRNA 182.5-22 chr10 92776789 92777247 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -49813 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 175-20 chr11 36071276 36071595 + 0.75 NA intron (NR_135064, intron 1 of 1) L1ME4a|LINE|L1 6466 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 136-96 chr22 27926195 27926478 + 0.75 NA intron (NR_026963, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 -5724 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 188.5-24 chr12 21547454 21547797 + 0.75 NA intron (NM_021957, intron 11 of 15) L1MC1|LINE|L1 19700 NR_135188 80763 Hs.130692 NM_030572 ENSG00000134548 SPX C12orf39 spexin hormone protein-coding 181.75-123 chr8 22944749 22945049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3822 NM_001363233 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 184.5-149 chr8 58129553 58130100 + 0.75 NA intron (NM_147189, intron 4 of 4) intron (NM_147189, intron 4 of 4) 135303 NM_147189 90362 Hs.154652 NM_147189 ENSG00000169122 FAM110B C8orf72 family with sequence similarity 110 member B protein-coding 171.25-147 chr8 77568131 77568448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117592 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 171.25-68 chr19 23991944 23992321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34179 NR_149007 100505851 Hs.190888 NR_149007 LOC100505851 - uncharacterized LOC100505851 ncRNA 228-21 chr12 22790008 22790414 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 165040 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 113.75-185 chr8 29992236 29992496 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -35018 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 164-16 chr10 93923337 93923683 + 0.75 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 29532 NR_144337 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 148.25-12 chr1 198920377 198920715 + 0.75 NA intron (NR_040073, intron 1 of 2) intron (NR_040073, intron 1 of 2) 16883 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 166.25-108 chr3 183996879 183997221 + 0.75 NA intron (NR_135125, intron 2 of 6) intron (NR_135125, intron 2 of 6) -9288 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 223.5-10 chr1 212859370 212859768 + 0.75 NA intron (NM_014053, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 1294 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 255.75-14 chr14 68452527 68453110 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) MIRb|SINE|MIR 175969 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 125.75-119 chr21 31769379 31769672 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37407 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 257.75-17 chr16 76511636 76512262 + 0.75 NA intron (NR_136213, intron 15 of 23) L2a|LINE|L2 -123049 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 126.5-199 chr5 151871829 151872127 + 0.75 NA intron (NM_000171, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 52873 NM_001146040 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 127.75-28 chr10 30792605 30792853 + 0.75 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 69510 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 151.75-72 chr2 219789338 219789608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115416 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 181.25-78 chr22 40752093 40752353 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 61735 NR_039923 100616283 NR_039923 ENSG00000266594 MIR4766 mir-4766 microRNA 4766 ncRNA 210.25-17 chr12 21336554 21336936 + 0.75 NA intron (NM_134431, intron 2 of 15) intron (NM_134431, intron 2 of 15) -1828 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 149-52 chr2 42603550 42603906 + 0.75 NA intron (NM_001330443, intron 3 of 16) intron (NM_001330443, intron 3 of 16) 35096 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 163.25-44 chr14 56543924 56544149 + 0.75 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 29705 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 116-4 chr1 63498893 63499287 + 0.75 NA intron (NM_001347148, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 24183 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 159.5-10 chr1 176876996 176877248 + 0.75 NA intron (NM_207108, intron 20 of 21) intron (NM_207108, intron 20 of 21) 152323 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 187.25-80 chr4 56659448 56659960 + 0.75 NA intron (NM_032495, intron 1 of 3) intron (NM_032495, intron 1 of 3) -3182 NM_139211 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 172.5-187 chr7 51043079 51043380 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 8 of 12) intron (NM_015198, intron 8 of 12) -249776 NM_001371008 178.5-151 chr6 2166028 2166345 + 0.75 NA intron (NM_001500, intron 1 of 10) intron (NM_001500, intron 1 of 10) 9805 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 220.25-39 chr2 195817714 195818209 + 0.75 NA intron (NM_018897, intron 49 of 64) intron (NM_018897, intron 49 of 64) 160735 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 220.5-53 chr2 107786296 107786788 + 0.75 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 32430 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 181.75-73 chr21 28145952 28146233 + 0.75 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) intron (NR_126012, intron 5 of 5) 55689 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 164.5-61 chr14 69026687 69027064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47193 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 146-68 chr2 146304239 146304568 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -282654 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 114-90 chr20 62172626 62172803 + 0.75 NA non-coding (NR_125981, exon 9 of 12) non-coding (NR_125981, exon 9 of 12) -10311 NM_015666 26164 Hs.340636 NM_015666 ENSG00000101181 MTG2 GTPBP5|ObgH1|dJ1005F21.2 mitochondrial ribosome associated GTPase 2 protein-coding 185.75-109 chr6 155577207 155577497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62508 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 218.25-11 chr10 67029267 67029893 + 0.75 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) L3b|LINE|CR1 17314 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 122.25-104 chr2 202666848 202667196 + 0.75 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) intron (NM_173511, intron 1 of 7) 32053 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 186.75-61 chr20 3621737 3622253 + 0.75 NA intron (NM_001323332, intron 24 of 25) L2a|LINE|L2 41404 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 124.5-65 chr14 71969954 71970153 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 36526 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 229.5-53 chr18 52352150 52352534 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 12145 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 142-58 chr15 85030146 85030394 + 0.75 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) L3|LINE|CR1 48296 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 149-2 chr1 36092257 36092594 + 0.75 NA exon (NM_017825, exon 5 of 6) exon (NM_017825, exon 5 of 6) 3533 NM_017825 54936 Hs.18021 NM_017825 ENSG00000116863 ADPRHL2 ARH3|CONDSIAS ADP-ribosylhydrolase like 2 protein-coding 135-87 chr2 190322344 190322630 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -2661 NM_198047 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 128.5-139 chr3 12638644 12638855 + 0.75 NA intron (NM_001354691, intron 1 of 16) intron (NM_001354691, intron 1 of 16) 24759 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 139.25-82 chr2 43552214 43552433 + 0.75 NA exon (NM_001271643, exon 18 of 18) exon (NM_001271643, exon 18 of 18) 43651 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 203-32 chr14 47216154 47216521 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 126909 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 148.5-225 chr8 93674776 93674989 + 0.75 NA intron (NR_033858, intron 3 of 10) intron (NR_033858, intron 3 of 10) 25551 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 122.75-40 chr13 83397419 83397698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 484835 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 165-142 chr8 86327152 86327414 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -15264 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 195-83 chr7 103946576 103947026 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) intron (NM_005045, intron 1 of 64) 42715 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 118.75-107 chr2 141833801 141834151 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 297725 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 122.75-118 chr22 22880282 22880584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5834 NR_049835 100847006 NR_049835 ENSG00000264824 MIR5571 - microRNA 5571 ncRNA 223.25-41 chr2 163096499 163097147 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -258056 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 189-115 chrX 76557549 76557894 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 130011 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 151.75-168 chrX 71154740 71155036 + 0.75 NA intron (NM_018977, intron 3 of 6) intron (NM_018977, intron 3 of 6) 10047 NM_181303 54413 Hs.438877 NM_018977 ENSG00000196338 NLGN3 HNL3 neuroligin 3 protein-coding 132.75-193 chr8 138027945 138028303 + 0.75 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 55421 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 174.75-83 chr3 99358446 99358940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -279901 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 123.5-51 chr12 108922273 108922585 + 0.75 NA intron (NM_018711, intron 12 of 15) LTR40a|LTR|ERVL 42337 NM_001917 1610 Hs.113227 NM_001917 ENSG00000110887 DAO DAAO|DAMOX|OXDA D-amino acid oxidase protein-coding 114.5-273 chr9 15186853 15187101 + 0.75 NA exon (NM_152574, exon 15 of 20) exon (NM_152574, exon 15 of 20) 63241 NM_001168342 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 245-60 chr5 160834752 160835235 + 0.75 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) intron (NM_001366652, intron 1 of 24) 17218 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 147.75-9 chr1 118845644 118845988 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 142527 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 114.75-162 chr6 44988646 44988922 + 0.75 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) L1M5|LINE|L1 208986 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 171.5-151 chr8 86777406 86777712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33884 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 209.5-117 chr5 31951512 31952153 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) -15673 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 164-85 chr3 187694073 187694400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8130 NR_034062 100131635 Hs.434448 NR_034062 ENSG00000228804 LOC100131635 - hCG1645011-like ncRNA 137.5-171 chr4 48385543 48385848 + 0.75 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu 44166 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 204.25-16 chr11 10063832 10064235 + 0.75 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) L1MEc|LINE|L1 224891 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 144.5-47 chr12 4940599 4940865 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 30827 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 142.75-197 chr9 6426388 6426645 + 0.75 NA intron (NM_152896, intron 2 of 15) intron (NM_152896, intron 2 of 15) 13317 NM_152896 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 129.5-114 chr2 52163076 52163317 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -207452 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 116.25-67 chr14 54042740 54042898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85928 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 228.75-64 chr5 37095493 37095828 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -153386 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 233.5-53 chr2 34019855 34020272 + 0.75 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -47163 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 164.75-19 chr10 82488505 82488760 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -255712 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 114.25-23 chr11 12803502 12803707 + 0.75 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 129183 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 263.75-51 chr8 126362987 126363415 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 37706 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 142-116 chr3 190388981 190389312 + 0.75 NA intron (NM_006580, intron 1 of 4) intron (NM_006580, intron 1 of 4) 1274 NM_006580 10686 Hs.251391 NM_006580 ENSG00000113946 CLDN16 HOMG3|PCLN1 claudin 16 protein-coding 198.25-42 chr17 31424145 31424606 + 0.75 NA intron (NM_032932, intron 1 of 14) intron (NM_032932, intron 1 of 14) 32700 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 215.75-32 chr14 43028738 43029119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1422072 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 120-37 chr14 21691747 21692035 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20874 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 154.75-103 chr3 184343979 184344325 + 0.75 NA intron (NM_001171093, intron 5 of 5) AluSp|SINE|Alu 5319 NM_001366133 131408 Hs.591307 NM_144635 ENSG00000175182 FAM131A C3orf40|FLAT715|PRO1378 family with sequence similarity 131 member A protein-coding 172.5-48 chr12 32237844 32238098 + 0.75 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 131124 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 166.75-57 chr16 76074185 76074585 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -203016 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 176.5-96 chr2 104151596 104152004 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 256532 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 226.75-42 chr20 52450044 52450512 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -170560 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 151.75-149 chr8 73627673 73627894 + 0.75 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR 119057 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 137-152 chr6 97633452 97633736 + 0.75 NA intron (NR_110757, intron 3 of 4) L1MC5a|LINE|L1 328008 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 168-84 chr3 98958783 98959096 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -57244 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 178.25-16 chr11 82565775 82566148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -162048 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 130.75-26 chr11 35603787 35604034 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -14550 NM_014344 24147 Hs.39384 NM_014344 ENSG00000179431 FJX1 - four-jointed box kinase 1 protein-coding 133.25-60 chr15 71760245 71760466 + 0.75 NA intron (NM_001286429, intron 9 of 11) intron (NM_001286429, intron 9 of 11) -50199 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 129.25-193 chr8 32728188 32728566 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001160002, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001160002, exon 5 of 5) 6542 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 149.75-141 chr6 37480343 37480626 + 0.75 NA 3' UTR (NM_015050, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_015050, exon 24 of 24) 19409 NM_138493 154467 Hs.284207 NM_138493 ENSG00000198937 CCDC167 C6orf129|HSPC265 coiled-coil domain containing 167 protein-coding 230.25-28 chr16 19891081 19891416 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -5614 NM_001304771 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 140.5-16 chr10 52328996 52329429 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14931 NM_012242 22943 Hs.40499 NM_012242 ENSG00000107984 DKK1 DKK-1|SK dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 protein-coding 193-43 chr2 128515801 128516337 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -197201 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 204-27 chr18 21481739 21482168 + 0.75 NA intron (NM_001142966, intron 17 of 32) L1ME3A|LINE|L1 118751 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 122.25-143 chr4 106805655 106805960 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 230506 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 214.75-7 chr1 191162492 191162905 + 0.75 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu 65800 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 387-3 chr1 222269085 222269671 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 278726 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 241-16 chr14 53673477 53674301 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 274595 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 135-194 chr9 29681285 29681547 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -467815 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 158.25-80 chr21 30289407 30289799 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001128598) promoter-TSS (NM_001128598) -89 NM_001128598 100131902 Hs.580882 NM_001128598 ENSG00000232263 KRTAP25-1 KAP25.1 keratin associated protein 25-1 protein-coding 143-114 chr5 39401208 39401479 + 0.75 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) intron (NM_001343, intron 1 of 14) 23637 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 199.5-46 chr15 28902660 28903145 + 0.75 NA intron (NM_001353792, intron 1 of 13).2 intron (NM_001353792, intron 1 of 13).2 16928 NM_001353788 321 Hs.618112 NM_005503 ENSG00000034053 APBA2 D15S1518E|HsT16821|LIN-10|MGC:14091|MINT2|X11-BETA|X11L amyloid beta precursor protein binding family A member 2 protein-coding 289.25-35 chr9 97470819 97471248 + 0.75 NA intron (NM_001302884, intron 8 of 15) intron (NM_001302884, intron 8 of 15) -30147 NM_001166116 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 155-62 chr2 50001985 50002334 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -27956 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 116.5-41 chr11 132222237 132222460 + 0.75 NA intron (NM_016522, intron 3 of 6) intron (NM_016522, intron 3 of 6) -61954 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 187.5-149 chr7 12370793 12371225 + 0.75 NA intron (NM_001346973, intron 8 of 26) intron (NM_001346973, intron 8 of 26) 32856 NM_001135924 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 133.25-108 chr2 162825614 162825903 + 0.75 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) L1ME4a|LINE|L1 13009 NM_173162 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 164.25-129 chr5 91506495 91506870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123365 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 202.25-71 chr5 127234498 127234856 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56087 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 140.25-14 chr1 203360159 203360461 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9188 NR_103757 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 133-136 chr5 63172555 63172868 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 593892 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 209.75-21 chr12 65719566 65719975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77398 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 153.25-99 chr4 170780935 170781241 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -37353 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 142.75-23 chr10 68736090 68736383 + 0.75 NA intron (NR_104262, intron 2 of 23) intron (NR_104262, intron 2 of 23) 14997 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 224.25-42 chr2 42114171 42114772 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54882 NM_019063 27436 Hs.713173 NM_019063 ENSG00000143924 EML4 C2orf2|ELP120|EMAP-4|EMAPL4|ROPP120 EMAP like 4 protein-coding 156.75-174 chrX 78654337 78654677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4821 NM_152694 203430 Hs.134873 NM_152694 ENSG00000179300 RTL3 Mar3|Mart3|SIRH9|ZCCHC5|ZHC5 retrotransposon Gag like 3 protein-coding 134-152 chr6 126830877 126831232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -287617 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 130-16 chr10 89423990 89424228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9541 NM_012420 24138 Hs.252839 NM_012420 ENSG00000152778 IFIT5 ISG58|P58|RI58 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5 protein-coding 154-103 chr5 17854201 17854549 + 0.75 NA intron (NR_134286, intron 4 of 7) intron (NR_134286, intron 4 of 7) 47101 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 162.75-67 chr2 54869905 54870168 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 14 of 40) intron (NM_001039753, intron 14 of 40) 140236 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 264.5-37 chr3 68227264 68227716 + 0.75 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) 223243 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 219.5-112 chr6 62259319 62259698 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 26717 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 119.5-28 chr10 63538037 63538263 + 0.75 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) intron (NM_001001330, intron 1 of 7) -16260 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 213-28 chr14 49799634 49799943 + 0.75 NA intron (NM_001301732, intron 22 of 31) intron (NM_001301732, intron 22 of 31) 31635 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 339.75-16 chr18 1352435 1353247 + 0.75 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 6788 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 158.25-88 chr3 79521419 79521705 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 13675 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 176-14 chr12 16982025 16982489 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -6490 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 191.75-52 chr18 7858559 7858855 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 291391 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 167.5-96 chr2 127016161 127016508 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65731 NM_001320634 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 160.75-99 chr3 60859296 60859615 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -241585 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 178.5-41 chr13 74513517 74513892 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -39139 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 154.25-16 chr10 49434026 49434357 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -38102 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 194.25-112 chr8 80476735 80477156 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -8648 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 134.75-6 chr1 76476137 76476450 + 0.75 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) MER58C|DNA|hAT-Charlie 302974 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 112.75-6 chr1 62868366 62868621 + 0.75 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 84361 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 129.75-164 chr6 120204026 120204312 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 188990 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 254.5-78 chr8 86212901 86213408 + 0.75 NA TTS (NM_138817) TTS (NM_138817) 17227 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 147.75-21 chr11 10599871 10600139 + 0.75 NA TTS (NR_034093) TTS (NR_034093) -31340 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 143.25-38 chr12 100896319 100896610 + 0.75 NA intron (NM_001286615, intron 1 of 27) intron (NM_001286615, intron 1 of 27) -5182 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 130.25-95 chr2 44782367 44782676 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 156367 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 164.75-100 chr3 100526430 100526782 + 0.75 NA intron (NM_001363876, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 33987 NM_001363876 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 149.75-27 chr11 93308785 93309115 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -21767 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 130-166 chr8 84827096 84827269 + 0.75 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) HAL1|LINE|L1 121255 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 203.25-29 chr12 39780166 39780552 + 0.75 NA intron (NM_052885, intron 7 of 9) intron (NM_052885, intron 7 of 9) 154176 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 122.25-5 chr1 110973821 110974093 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -10013 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 194.25-2 chr1 59033519 59033983 + 0.75 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 13275 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 116.75-144 chr4 31690626 31690833 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 184185 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 114.5 chr1 35014986 35015141 + 0.75 NA exon (NM_007167, exon 5 of 16) exon (NM_007167, exon 5 of 16) 16882 NM_007167 9204 Hs.533986 NM_007167 ENSG00000163867 ZMYM6 Buster2|MYM|ZBED7|ZNF198L4|ZNF258 zinc finger MYM-type containing 6 protein-coding 177-67 chr4 32709985 32710281 + 0.75 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 359095 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 157.75-67 chr17 39553391 39553724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54363 NM_006160 4761 Hs.322431 NM_006160 ENSG00000171532 NEUROD2 EIEE72|NDRF|bHLHa1 neuronal differentiation 2 protein-coding 270-30 chr20 49621254 49621930 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -53455 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 186-42 chr19 49091626 49091922 + 0.75 NA intron (NM_001301069, intron 4 of 9) intron (NM_001301069, intron 4 of 9) 6323 NM_001301069 6625 Hs.467097 NM_003089 ENSG00000104852 SNRNP70 RNPU1Z|RPU1|SNRP70|Snp1|U1-70K|U170K|U1AP|U1RNP small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70 protein-coding 153.25-2 chr1 14402782 14403235 + 0.75 NA intron (NR_149058, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 16965 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 124.25-22 chr10 37979763 37980037 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3253 NM_001329658 219749 Hs.499429 NM_145011 ENSG00000175395 ZNF25 KOX19|Zfp9 zinc finger protein 25 protein-coding 122.25-215 chrX 140492113 140492379 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 12814 NM_005634 6658 Hs.157429 NM_005634 ENSG00000134595 SOX3 GHDX|MRGH|PHP|PHPX|SOXB SRY-box transcription factor 3 protein-coding 117-70 chr17 39058995 39059350 + 0.75 NA intron (NR_036551, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 2153 NR_036551 100131347 Hs.676510 NR_036551 ENSG00000263818 RDM1P5 - RDM1 pseudogene 5 pseudo 150-140 chr8 28198083 28198508 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 105156 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 149-44 chr17 66329305 66329537 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) L2b|LINE|L2 26808 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 128.5-26 chr10 61534514 61534741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54586 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 307-7 chr10 109886102 109886870 + 0.75 NA intron (NM_020383, intron 7 of 20) MIRc|SINE|MIR 36760 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 199-36 chr2 34918105 34918480 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 240735 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 126-145 chr5 101400044 101400323 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -496901 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 173.75-124 chr5 109713070 109713391 + 0.75 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) intron (NM_002372, intron 1 of 21) 23864 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 292-20 chr17 62591058 62591785 + 0.75 NA intron (NM_001284363, intron 14 of 19) intron (NM_001284363, intron 14 of 19) -36249 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 134-75 chr17 72642700 72642973 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -2364 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 130-45 chr14 71617108 71617534 + 0.75 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 31023 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 153.25-32 chr12 101745195 101745602 + 0.75 NA TTS (NM_024312) TTS (NM_024312) -5926 NM_153694 50511 Hs.506504 NM_153694 ENSG00000139351 SYCP3 COR1|RPRGL4|SCP3|SPGF4 synaptonemal complex protein 3 protein-coding 127.75-217 chrX 98435857 98436046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -871416 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-25 chr13 108807587 108807861 + 0.75 NA intron (NM_015011, intron 7 of 34) L1M3|LINE|L1 178113 NM_001198950 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 149.75-158 chr7 109504264 109504616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 455773 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 158.25-26 chr11 112401449 112401859 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80578 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 131.75-165 chr5 36356421 36356650 + 0.75 NA Intergenic UCON28a|Unknown|Unknown -54633 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 235-71 chr8 36710031 36710478 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -74120 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 117.25-28 chr10 65974808 65975084 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 16 of 17) intron (NM_001127384, intron 16 of 17) 403521 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 140.5-167 chr4 84451019 84451233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47108 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 113.25-130 chr5 12947482 12947674 + 0.75 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) MER92A|LTR|ERV1 85308 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 232.5-75 chr4 40671221 40671883 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -40958 NM_001371114 114.5-209 chr5 59535933 59536255 + 0.75 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 50404 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 112.75-50 chr13 49002522 49002723 + 0.75 NA intron (NR_103528, intron 1 of 25) L1ME3A|LINE|L1 25960 NR_103528 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 187-14 chr10 51343606 51343917 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) MIRc|SINE|MIR 44188 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 182.25-111 chr7 39648290 39648677 + 0.75 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 24911 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 158.75-23 chr10 120874233 120874613 + 0.75 NA intron (NM_018117, intron 11 of 28) L1PA10|LINE|L1 23061 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 150.75-76 chr16 89086655 89086928 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7018 NM_001243279 197322 Hs.461727 NM_174917 ENSG00000176715 ACSF3 - acyl-CoA synthetase family member 3 protein-coding 194.75-99 chr9 28053903 28054254 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -480212 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 144-86 chr3 118409189 118409472 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -232438 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 152.75-63 chr15 80075181 80075441 + 0.75 NA intron (NM_001242912, intron 2 of 6) intron (NM_001242912, intron 2 of 6) 2750 NM_001242915 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 173.75-7 chr1 102257016 102257472 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -260010 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 203.25-92 chr6 161674263 161674705 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 203507 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 125.75-179 chr7 159256148 159256455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111344 NR_130758 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 141.25-64 chr16 75971318 75971792 + 0.75 NA Intergenic (TAGTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -245065 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 161-127 chr9 7006713 7007174 + 0.75 NA intron (NR_148680, intron 13 of 21) intron (NR_148680, intron 13 of 21) 249593 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 258-55 chr8 15503182 15503576 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -36708 NM_178234 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 127.5-192 chr5 79058982 79059163 + 0.75 NA intron (NM_013391, intron 2 of 15) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 10602 NM_013391 29958 Hs.655653 NM_013391 ENSG00000132837 DMGDH DMGDHD|ME2GLYDH dimethylglycine dehydrogenase protein-coding 140.75-21 chr10 117929947 117930165 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -116765 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 122-48 chr12 52737150 52737391 + 0.75 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -33746 NM_175078 374454 Hs.334989 NM_175078 ENSG00000189182 KRT77 K1B|KRT1B keratin 77 protein-coding 208.75-52 chr3 46156864 46157335 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 51214 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 145-87 chr2 225667515 225667918 + 0.75 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) UCON132b|DNA|hAT-Tip100 266830 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 141-143 chr7 10311132 10311538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -391341 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 158.75-9 chr1 195626749 195627005 + 0.75 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 461838 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149.5-114 chr21 28366310 28366642 + 0.75 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 -137809 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 134.5-172 chr5 63025240 63025577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 446589 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 141.5-180 chr5 87607024 87607271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54895 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 295-34 chr9 76337283 76338077 + 0.75 NA intron (NM_001190482, intron 33 of 36) AluSz|SINE|Alu 56746 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 175.25-121 chr5 117740094 117740468 + 0.75 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 9920 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 158.25-95 chr3 182887279 182887638 + 0.75 NA intron (NM_014616, intron 23 of 29) intron (NM_014616, intron 23 of 29) 93080 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 120.5-103 chr19 2158329 2158533 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5502 NM_032482 84444 Hs.713641 NM_032482 ENSG00000104885 DOT1L DOT1|KMT4 DOT1 like histone lysine methyltransferase protein-coding 144.25-5 chr1 56464809 56465067 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 49975 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 219.75-27 chr17 54854417 54854863 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -46051 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 179.25-57 chr16 50475223 50475566 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -73002 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 150-20 chr11 28432590 28432831 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 44838 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 182.5-19 chr10 49566759 49567128 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -27405 NM_001277059 2074 Hs.49063 NM_000124 ENSG00000225830 ERCC6 ARMD5|CKN2|COFS|COFS1|CSB|CSB-PGBD3|POF11|RAD26|UVSS1 ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factor protein-coding 236-29 chr2 17516313 17516956 + 0.75 NA exon (NM_001321233, exon 5 of 7) exon (NM_001321233, exon 5 of 7) 1806 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 140.5-163 chr4 38486523 38486752 + 0.75 NA intron (NR_110951, intron 2 of 7) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -23130 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 200.25-20 chr11 78829723 78830071 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 12 of 33) intron (NM_001098816, intron 12 of 33) -255033 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 202.5-19 chr10 80494218 80494566 + 0.75 NA intron (NM_001128309, intron 2 of 5) MER94|DNA|hAT-Blackjack 26129 NM_001351272 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 113-89 chr2 76666839 76667131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -318980 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 188-17 chr12 120011660 120011979 + 0.75 NA intron (NR_147894, intron 3 of 8) MIR3|SINE|MIR 21975 NM_207311 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 136.75-121 chr22 27401161 27401467 + 0.75 NA Intergenic (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 90663 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 191-89 chr9 88039877 88040272 + 0.75 NA Intergenic HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 37826 NR_135138 102724156 Hs.633031 NR_135137 LOC102724156 - uncharacterized LOC102724156 ncRNA 137.75-147 chr4 35951436 35951683 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 292380 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 122.5-80 chr17 42559232 42559514 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2775 NM_001042529 80347 Hs.296422 NM_025233 ENSG00000068120 COASY DPCK|NBIA6|NBP|PCH12|PPAT|UKR1|pOV-2 Coenzyme A synthase protein-coding 158.25-111 chr5 40041617 40041958 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10504 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 174.75-73 chr22 28184078 28184359 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MIR|SINE|MIR -263606 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 222.25-62 chr4 173314833 173315303 + 0.75 NA intron (NM_017423, intron 9 of 11) L2a|LINE|L2 18701 NM_001130689 3148 Hs.434953 NM_002129 ENSG00000164104 HMGB2 HMG2 high mobility group box 2 protein-coding 190.25-15 chr10 67551910 67552263 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) intron (NM_001127384, intron 3 of 17) 113574 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 402.25-8 chr7 52562628 52563571 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -472534 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 164-141 chr8 133880938 133881255 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5400 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 136-70 chr2 61265451 61265770 + 0.75 NA intron (NM_014709, intron 42 of 79) intron (NM_014709, intron 42 of 79) 88192 NR_152210 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 148.75-135 chr5 86883082 86883308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136377 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 139.75-88 chr2 15744849 15745187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54236 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 145.5-33 chr11 66015799 66016025 + 0.75 NA TTS (NM_053054) TTS (NM_053054) 3904 NM_001323 1474 Hs.139389 NM_001323 ENSG00000175315 CST6 - cystatin E/M protein-coding 173-114 chr5 152711783 152712118 + 0.75 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) intron (NR_109877, intron 3 of 4) 260399 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 220.25-42 chr21 31382697 31383326 + 0.75 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu -38657 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 182.25-60 chr2 37083032 37083445 + 0.75 NA intron (NM_019024, intron 2 of 35) intron (NM_019024, intron 2 of 35) 1134 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 115.5-111 chr19 53704238 53704463 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1613 NR_030196 574474 NR_030196 ENSG00000207862 MIR518B MIRN518B|mir-518b microRNA 518b ncRNA 209.75-24 chr13 57867876 57868320 + 0.75 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 236354 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 185-21 chr14 48737743 48738104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 848457 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 292.75-31 chr7 29615479 29616090 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 50251 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 188.5-52 chr16 64790182 64790597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 331674 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 129.25-156 chr5 120328889 120329100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135284 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 237.75-59 chr4 100460694 100461102 + 0.75 NA intron (NM_016242, intron 4 of 11) L1MA8|LINE|L1 57124 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 134.5-97 chr2 75980667 75980970 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -269903 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 178.75-99 chr7 46415325 46415642 + 0.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 281639 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 168.5-137 chr4 111443243 111443678 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -582813 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 241.25-17 chr12 126008383 126008968 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -25301 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 124-128 chr4 145720766 145721073 + 0.75 NA intron (NM_001080531, intron 2 of 5) intron (NM_001080531, intron 2 of 5) 40715 NM_001080531 646603 NM_001080531 ENSG00000237136 C4orf51 - chromosome 4 open reading frame 51 protein-coding 212.25-15 chr11 43868201 43868514 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -12474 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 141.5-202 chr6 144264695 144265017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26881 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 136.25-71 chr16 51630765 51630946 + 0.75 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -131664 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 113-26 chr10 74540589 74540784 + 0.75 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) AluSz6|SINE|Alu -11362 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 142-146 chr7 3688442 3688661 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 387299 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 204.25-27 chr12 38624661 38625170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 280676 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 184-87 chr7 84760799 84761236 + 0.75 NA Intergenic LTR10C|LTR|ERV1 228541 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 245.5-49 chr3 105293032 105293471 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -73462 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 207-98 chrX 93575008 93575462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98343 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 256.5-36 chr2 167831505 167831881 + 0.75 NA intron (NM_020981, intron 1 of 1) intron (NM_020981, intron 1 of 1) 13021 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 145.5-94 chr2 41320470 41320686 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -556977 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 134.25-169 chr7 4812631 4812890 + 0.75 NA intron (NM_018059, intron 9 of 14) L1MEg1|LINE|L1 -24121 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 112.5-175 chr3 164836146 164836415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4800 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 119.25-84 chr18 62769694 62769900 + 0.75 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) Looper|DNA|PiggyBac 54256 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 136.25-193 chr9 29832292 29832526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 576045 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 156.5-39 chr12 49781791 49782124 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 40148 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 147.5-15 chr1 235974851 235975273 + 0.75 NA TTS (NM_002508) TTS (NM_002508) 90028 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 297.5-3 chr1 65457348 65457980 + 0.75 NA intron (NM_001003679, intron 2 of 19) L1PB4|LINE|L1 36948 NM_001198681 54741 Hs.23581 NM_017526 ENSG00000213625 LEPROT LEPR|OB-RGRP|OBRGRP|VPS55 leptin receptor overlapping transcript protein-coding 148.25-117 chr4 166175776 166176061 + 0.75 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 302681 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 183.75-53 chr19 46317544 46317966 + 0.75 NA intron (NM_152796, intron 7 of 11) intron (NM_152796, intron 7 of 11) 14136 NM_152794 64344 Hs.420830 NM_022462 ENSG00000124440 HIF3A HIF-3A|HIF3-alpha-1|IPAS|MOP7|PASD7|bHLHe17 hypoxia inducible factor 3 subunit alpha protein-coding 157.5-236 chrX 120137837 120138120 + 0.75 NA intron (NR_131238, intron 2 of 4) MER31-int|LTR|ERV1 -18278 NR_126557 104797536 NR_126557 ENSG00000228139 LINC01402 GS1-421I3.4|TCONS_00017087 long intergenic non-protein coding RNA 1402 ncRNA 224-37 chr4 18778336 18778735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -756660 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 112.5-178 chr4 61872063 61872375 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 289546 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 118-43 chr14 34130416 34130624 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179446 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 115.75-92 chr18 44052560 44052792 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 479021 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 143.75-32 chr11 38554658 38555030 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 91512 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 128.5-78 chr16 9452275 9452571 + 0.75 NA intron (NR_126349, intron 1 of 4) L1PB2|LINE|L1 3082 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 158-48 chr14 44497142 44497497 + 0.75 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 9964 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 120.25-16 chr1 161273644 161273873 + 0.75 NA intron (NM_001102566, intron 1 of 2) intron (NM_001102566, intron 1 of 2) 15013 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 228.25-72 chr6 122063592 122064222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -335644 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 149.25-163 chr7 15187080 15187482 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -212423 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 135.25-146 chr4 84585678 84585908 + 0.75 NA intron (NM_001263, intron 1 of 12) intron (NM_001263, intron 1 of 12) 2666 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 154-8 chr1 158205610 158205932 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 25824 NM_001766 912 Hs.1799 NM_001766 ENSG00000158473 CD1D CD1A|R3|R3G1 CD1d molecule protein-coding 121.25-137 chr3 143132053 143132222 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 12366 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 262.75-17 chr15 59459263 59459725 + 0.75 NA intron (NM_152450, intron 2 of 8) MER102b|DNA|hAT-Charlie 21308 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 229-56 chr4 40957348 40957763 + 0.75 NA intron (NM_004307, intron 6 of 17) intron (NM_004307, intron 6 of 17) -100363 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 203.75-116 chr8 132558580 132558882 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 2748 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 139.25-45 chr13 43238080 43238470 + 0.75 NA intron (NM_001347966, intron 15 of 17) intron (NM_001347966, intron 15 of 17) 125110 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 124.75-180 chr6 45008448 45008683 + 0.75 NA intron (NM_001261823, intron 4 of 9) AluJr|SINE|Alu 189205 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 211.75-72 chr5 27948831 27949274 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 338613 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 127.75-99 chr2 78729982 78730302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 184611 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 152.5-53 chr15 51011401 51011662 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25957 NR_146310 109729174 NR_146310 ENSG00000259240 MIR4713HG - MIR4713 host gene ncRNA 114-61 chr18 10908954 10909239 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) L1MC5a|LINE|L1 -149447 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 138-92 chr21 30809968 30810231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3175 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 216.25-51 chr2 50568443 50568942 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) L1MA3|LINE|L1 127570 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 138-139 chr6 66217554 66217751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 429773 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 199.5-24 chr11 87384608 87385086 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 334564 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 283.25-13 chr15 38512869 38513599 + 0.75 NA intron (NM_001306086, intron 6 of 14) intron (NM_001306086, intron 6 of 14) 51580 NM_001306086 10125 Hs.591127 NM_005739 ENSG00000172575 RASGRP1 CALDAG-GEFI|CALDAG-GEFII|RASGRP RAS guanyl releasing protein 1 protein-coding 163.5-214 chr8 144168675 144169022 + 0.75 NA intron (NM_001099281, intron 3 of 11) intron (NM_001099281, intron 3 of 11) 20203 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 148.75-105 chr22 27275378 27275655 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -35135 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 113.75-48 chr12 117213658 117213973 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001204218, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001204218, exon 30 of 30) -23345 NM_015002 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 126.5-50 chr12 40950858 40951189 + 0.75 NA intron (NM_001256064, intron 14 of 15) intron (NM_001256064, intron 14 of 15) 42666 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 142.25-103 chr22 30206092 30206425 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -32936 NR_149070 110806283 NR_149070 ENSG00000232530 LIF-AS1 Lnc-LIF-AS LIF antisense RNA 1 ncRNA 188.25-22 chr11 79353337 79353892 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) 48495 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 225.75-45 chr2 192678673 192679391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70813 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 156-159 chr8 138421412 138421736 + 0.75 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) L1PA15|LINE|L1 75687 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 125.25-32 chr10 129314411 129314734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152669 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 135.75-77 chr17 42715318 42715566 + 0.75 NA intron (NM_001321079, intron 9 of 19) AluJb|SINE|Alu -7291 NR_106838 102466195 NR_106838 ENSG00000275273 MIR6780A hsa-mir-6780a microRNA 6780a ncRNA 121-18 chr10 20365743 20366039 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -186079 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 189.75-93 chr5 117083758 117084150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -321745 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 163-101 chr5 138429581 138429798 + 0.75 NA intron (NM_016604, intron 20 of 23) intron (NM_016604, intron 20 of 23) -9368 NR_073448 51308 Hs.416090 NM_016606 ENSG00000132563 REEP2 C5orf19|SGC32445|SPG72|Yip2d receptor accessory protein 2 protein-coding 177.25-127 chr6 63281685 63282149 + 0.75 NA intron (NM_001143940, intron 3 of 4) intron (NM_001143940, intron 3 of 4) 38060 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 133.75-41 chr12 86092808 86093076 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) L1PA7|LINE|L1 163449 NM_001351283 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 143.5-124 chr2 204011578 204011792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74937 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 126.75-191 chr5 39174658 39175001 + 0.75 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) intron (NM_001243093, intron 2 of 18) 44734 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 126-47 chr13 84097885 84098240 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42540 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 245.25-46 chr21 36014890 36015515 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9882 NR_110419 100996609 Hs.742062 NR_110419 LINC01436 - long intergenic non-protein coding RNA 1436 ncRNA 129.25-78 chr19 9385082 9385459 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 8954 NM_001172651 7730 Hs.728944 NM_003451 ENSG00000188629 ZNF177 PIGX zinc finger protein 177 protein-coding 119.5-126 chr2 73868301 73868491 + 0.75 NA intron (NR_148670, intron 11 of 12) MIRb|SINE|MIR -24612 NM_001615 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 175-132 chr8 129190669 129191018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50397 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 159-25 chr12 21171711 21171981 + 0.75 NA intron (NM_006446, intron 2 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 40652 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 175.75-2 chr1 76262339 76262874 + 0.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 187860 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 198.25-64 chr20 5655701 5656240 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -44964 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 144.5-16 chr1 178211401 178211764 + 0.75 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 117478 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 204-18 chr15 58089171 58089663 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -23494 NM_001206897 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 141.75-8 chr1 110888912 110889154 + 0.75 NA intron (NM_001040033, intron 2 of 8) intron (NM_001040033, intron 2 of 8) 15885 NM_000560 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 131.25-128 chr22 42472920 42473221 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27509 NR_027786 94009 Hs.360940 NM_170694 ENSG00000172250 SERHL BK126B4.1|BK126B4.2|HS126B42|dJ222E13.1 serine hydrolase like (pseudogene) pseudo 170-28 chr14 48051996 48052415 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -257191 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 219.25-66 chr6 75287424 75287923 + 0.75 NA intron (NR_040081, intron 1 of 2) intron (NR_040081, intron 1 of 2) 2659 NR_040081 100506804 Hs.743708 NR_040081 LOC100506804 - uncharacterized LOC100506804 ncRNA 162-36 chr14 49850951 49851294 + 0.75 NA intron (NM_001301732, intron 3 of 31) AluSx|SINE|Alu 1666 NM_004713 9147 Hs.655964 NM_004713 ENSG00000165525 NEMF NY-CO-1|SDCCAG1 nuclear export mediator factor protein-coding 120.25-78 chr18 63009523 63009748 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 294094 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 191.25-99 chr8 41340490 41340864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31204 NM_003012 6422 Hs.213424 NM_003012 ENSG00000104332 SFRP1 FRP|FRP-1|FRP1|FrzA|SARP2 secreted frizzled related protein 1 protein-coding 279.5-52 chr5 41571245 41571666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60854 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 189-34 chr14 49816442 49816726 + 0.75 NA intron (NM_001301732, intron 16 of 31) MER11A|LTR|ERVK 36204 NM_004713 9147 Hs.655964 NM_004713 ENSG00000165525 NEMF NY-CO-1|SDCCAG1 nuclear export mediator factor protein-coding 141.75-92 chr2 73944978 73945389 + 0.75 NA intron (NM_080918, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 18303 NM_001318863 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 272.75-37 chr4 92516335 92516737 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 212137 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 202.75-104 chr7 6080764 6081239 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -21772 NM_001134335 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 129-144 chr5 95632310 95632631 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 12383 NM_199243 285601 Hs.143315 NM_199243 ENSG00000178015 GPR150 PGR11 G protein-coupled receptor 150 protein-coding 138.75-179 chr7 79889455 79889749 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -245229 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 133.25-168 chr5 24485570 24485809 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 159289 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 138.25-98 chr20 21161286 21161488 + 0.75 NA intron (NM_018474, intron 4 of 12) AluSx1|SINE|Alu 35305 NM_001352435 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 193.75-92 chr4 46030962 46031348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92899 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 130-65 chr2 24344569 24344751 + 0.75 NA intron (NM_001348182, intron 1 of 38) MER33|DNA|hAT-Charlie 15876 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 162.75-148 chr8 121300555 121300836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -338651 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 182.5-93 chr21 30895414 30895789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14021 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 144.5-105 chr2 99364691 99365065 + 0.75 NA intron (NM_015904, intron 6 of 23) L1MC5a|LINE|L1 27489 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 114-142 chr6 27557211 27557454 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -84214 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 229.25-88 chr9 90085685 90086026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44356 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 135.75-116 chr2 229503341 229503677 + 0.75 NA intron (NM_139072, intron 6 of 12) MER21-int|LTR|ERVL 211046 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 130.25-17 chr1 177063665 177064045 + 0.75 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) -34410 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 134.5-201 chr7 8127952 8128234 + 0.75 NA exon (NM_001350821, exon 13 of 14) exon (NM_001350821, exon 13 of 14) 133959 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 148.5-103 chr2 68323138 68323397 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -3216 NM_015463 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 167.75-79 chr2 211931845 211932095 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) MIRb|SINE|MIR 494390 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 198-51 chr3 103158052 103158480 + 0.75 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 365850 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 134.5-67 chr14 79893002 79893370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -318233 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 119.75-3 chr1 46428603 46428826 + 0.75 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -5113 NR_045483 729041 Hs.170205 NR_045483 FAAHP1 FAAH-OUT|FAAHOUT|LINC00505 fatty acid amide hydrolase pseudogene 1 pseudo 161.25-73 chr17 55364232 55364596 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 57421 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 151.25-54 chr14 55602160 55602417 + 0.75 NA intron (NR_073129, intron 2 of 45) intron (NR_073129, intron 2 of 45) 22081 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 117-24 chr11 38590738 38590969 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 55503 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 132.5-62 chr13 110856168 110856499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13975 NR_027701 283487 Hs.245390 NM_178514 ENSG00000255874 LINC00346 C13orf29|NCRNA00346 long intergenic non-protein coding RNA 346 ncRNA 172-104 chr8 14636349 14636595 + 0.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 217038 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 194.5-16 chr10 61428000 61428283 + 0.75 NA intron (NR_134508, intron 4 of 6) intron (NR_134508, intron 4 of 6) -24498 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 148.5-122 chr20 11059749 11060055 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33358 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 138-4 chr1 203961797 203962246 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 79243 NR_027902 284573 Hs.406979 NR_027902 ENSG00000176754 LINC00303 C1orf157|NCRNA00303 long intergenic non-protein coding RNA 303 ncRNA 293.75-39 chr5 67544208 67544615 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102378 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 173.25-52 chr18 8676998 8677468 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 30388 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 124.5-20 chr10 14102277 14102482 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) AluSz|SINE|Alu 28095 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 145.25-181 chr9 32332762 32333116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51664 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 145-72 chr2 49035664 49035886 + 0.75 NA intron (NM_000145, intron 2 of 9) UCON132b|DNA|hAT-Tip100 -23828 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 137.75-201 chr8 56521350 56521535 + 0.75 NA intron (NR_038236, intron 1 of 2) intron (NR_038236, intron 1 of 2) 38381 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 121.5-266 chr9 105254554 105254905 + 0.75 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) intron (NM_001330731, intron 1 of 15) 10078 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 205.75-66 chr5 90887919 90888296 + 0.75 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) intron (NR_003149, intron 83 of 89) 329310 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 283.25-38 chr6 163030073 163030754 + 0.75 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 23748 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 160.5-139 chr4 106165015 106165386 + 0.75 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) intron (NM_001290768, intron 24 of 26) -142722 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 146-105 chr5 39414087 39414393 + 0.75 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 10740 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 263.25-17 chr12 80981029 80981463 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43331 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 196-55 chr2 230749056 230749432 + 0.75 NA intron (NM_001130849, intron 1 of 8) L1MC5a|LINE|L1 35696 NM_001130850 51719 Hs.603930 NM_016289 ENSG00000135932 CAB39 CGI-66|MO25 calcium binding protein 39 protein-coding 148.75-11 chr1 211750872 211751184 + 0.75 NA exon (NM_001320808, exon 7 of 8) exon (NM_001320808, exon 7 of 8) 75266 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 147.25-151 chr8 131552340 131552598 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -351624 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 231.75-72 chr8 86254195 86254801 + 0.75 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -24117 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 154-6 chr1 78223335 78223756 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6054 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 284.25-6 chr11 14947301 14947897 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 24687 NM_001033952 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 178.25-24 chr12 53775407 53775753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18546 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 185.75-101 chr5 115631811 115632211 + 0.75 NA Intergenic MERX|DNA|TcMar-Tigger -5832 NM_001164469 100302736 NM_001164468 ENSG00000251201 TMED7-TICAM2 MyD88-4|TICAM-2|TICAM2|TIRAP3|TIRP|TRAM TMED7-TICAM2 readthrough protein-coding 230.5-110 chr8 75438887 75439387 + 0.75 NA intron (NM_001330561, intron 1 of 11) L1MC4a|LINE|L1 31488 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 146.25-90 chr20 58667703 58668109 + 0.75 NA intron (NM_001001433, intron 3 of 8) intron (NM_001001433, intron 3 of 8) 16623 NM_001134772 8675 Hs.307913 NM_003763 ENSG00000124222 STX16 SYN16 syntaxin 16 protein-coding 206-21 chr13 35354135 35354665 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 38 of 57) intron (NM_015678, intron 38 of 57) 122289 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 126-162 chr7 780300 780537 + 0.75 NA intron (NR_075098, intron 12 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -35139 NM_001171946 23353 Hs.438072 NM_025154 ENSG00000164828 SUN1 UNC84A Sad1 and UNC84 domain containing 1 protein-coding 145.75-45 chr15 67668903 67669203 + 0.75 NA intron (NM_001206804, intron 13 of 21) intron (NM_001206804, intron 13 of 21) 119959 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 135.25-45 chr11 97884249 97884593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1136528 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 199.25-30 chr14 78325015 78325425 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) intron (NR_073547, intron 4 of 20) -78499 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 165.75-53 chr14 70439427 70439830 + 0.75 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -12546 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 164.25-52 chr17 31364620 31364930 + 0.75 NA intron (NM_001042492, intron 57 of 57) intron (NM_001042492, intron 57 of 57) -26900 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 158.75-121 chr4 3782165 3782574 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15984 NM_000683 152 Hs.123022 NM_000683 ENSG00000184160 ADRA2C ADRA2L2|ADRA2RL2|ADRARL2|ALPHA2CAR adrenoceptor alpha 2C protein-coding 145-50 chr15 66305568 66305839 + 0.75 NA intron (NM_001323939, intron 3 of 17) AluJo|SINE|Alu 11888 NM_001323943 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 145-63 chr17 69558451 69558755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35384 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 141.75-131 chr4 151081161 151081418 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -18284 NM_001267699 6189 Hs.356572 NM_001006 ENSG00000145425 RPS3A FTE1|MFTL|S3A ribosomal protein S3A protein-coding 165-77 chr2 206575955 206576225 + 0.75 NA intron (NM_003812, intron 18 of 25) intron (NM_003812, intron 18 of 25) -68137 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 140-42 chr14 63414519 63414758 + 0.75 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) intron (NR_104104, intron 4 of 12) 93600 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 189.75-89 chr5 24530558 24530838 + 0.75 NA intron (NM_001362460, intron 5 of 9) intron (NM_001362460, intron 5 of 9) 114280 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 114.25-109 chr2 239510547 239510717 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 108884 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 130.5-22 chr1 202905587 202905929 + 0.75 NA intron (NM_021633, intron 6 of 11) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -16609 NM_002871 5877 Hs.90875 NM_002871 ENSG00000183155 RABIF MSS4|RASGFR3|RASGRF3 RAB interacting factor protein-coding 133.25-218 chr8 130234901 130235189 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 4 of 29) MIRb|SINE|MIR 61488 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 174.75-46 chr18 4084407 4084840 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) MER34|LTR|ERV1 122270 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 191.75-109 chr6 40463693 40464227 + 0.75 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 85623 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 305.5-21 chr2 102663426 102664169 + 0.75 NA intron (NM_003048, intron 2 of 11) intron (NM_003048, intron 2 of 11) 44244 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 138.25-157 chr7 17281842 17282214 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16624 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 152.25-167 chr9 81289949 81290292 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 399415 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 133-83 chr2 117587282 117587563 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -227269 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 244.75-60 chr9 3568585 3569052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42817 NM_001282116 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 166.5-116 chr2 232639055 232639395 + 0.75 NA intron (NM_001308395, intron 2 of 4) intron (NM_001308395, intron 2 of 4) 5621 NM_025202 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 130.25-144 chr4 23981766 23982072 + 0.75 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -91872 NR_148984 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 195.75-80 chr3 150250841 150251221 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 12331 NR_110167 101927992 Hs.534682 NR_110167 ENSG00000244541 LINC01213 - long intergenic non-protein coding RNA 1213 ncRNA 114.5-268 chr8 127944016 127944187 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 3 of 8) intron (NR_003367, intron 3 of 8) 4622 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 114.25-132 chr4 1887677 1887979 + 0.75 NA intron (NM_001042424, intron 1 of 21) HAL1|LINE|L1 -4954 NM_007331 7468 Hs.113876 NM_007331 ENSG00000109685 NSD2 KMT3F|KMT3G|MMSET|REIIBP|TRX5|WHS|WHSC1 nuclear receptor binding SET domain protein 2 protein-coding 239.75-2 chr1 62905455 62906098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105149 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 151-11 chr1 212006044 212006317 + 0.75 NA intron (NM_015434, intron 7 of 19) intron (NM_015434, intron 7 of 19) -29373 NM_001286229 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 132.25-123 chr3 11397497 11397789 + 0.75 NA intron (NM_001144912, intron 16 of 16) AluSz|SINE|Alu 125246 NM_006395 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 117.5-8 chr1 99709313 99709559 + 0.75 NA intron (NM_001013660, intron 15 of 16) intron (NM_001013660, intron 15 of 16) 3517 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 191.75-108 chr6 38821658 38821984 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 25 of 91) AluJb|SINE|Alu 106510 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 175.25-80 chr20 32772103 32772365 + 0.75 NA intron (NM_175848, intron 1 of 21) intron (NM_175848, intron 1 of 21) -7618 NM_175850 1789 Hs.643024 NM_006892 ENSG00000088305 DNMT3B ICF|ICF1|M.HsaIIIB DNA methyltransferase 3 beta protein-coding 181.25-139 chrX 88761376 88761816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14371 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 144.75-30 chr11 70158866 70159172 + 0.75 NA intron (NM_018043, intron 16 of 25) intron (NM_018043, intron 16 of 25) -44144 NM_003824 8772 Hs.86131 NM_003824 ENSG00000168040 FADD GIG3|MORT1 Fas associated via death domain protein-coding 163-128 chr9 124129182 124129582 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117614 NM_004789 9355 Hs.696425 NM_004789 ENSG00000106689 LHX2 LH2|hLhx2 LIM homeobox 2 protein-coding 153-52 chr16 25411975 25412288 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154286 NM_001012981 342357 Hs.513451 NM_001012981 ENSG00000155592 ZKSCAN2 ZNF694|ZSCAN31|ZSCAN34 zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 protein-coding 204.5-8 chr10 23397463 23398080 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41498 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 147-73 chr2 83798142 83798490 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 275502 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 190.5-60 chr16 79821532 79821873 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 26453 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 124.5-56 chr13 63325338 63325759 + 0.75 NA intron (NR_126409, intron 2 of 6) L2|LINE|L2 2546 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 117-186 chr8 86294075 86294362 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -48329 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 132.5-9 chr1 58727177 58727483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27268 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 179.5-123 chr3 81630425 81630716 + 0.75 NA intron (NM_000158, intron 7 of 15) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 131075 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 160-101 chr7 33341833 33342087 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 11 of 22) intron (NM_198428, intron 11 of 22) 212396 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 227.25-41 chr2 46389194 46389645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4748 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 122.5-117 chr2 152626476 152626714 + 0.75 NA exon (NM_052905, exon 17 of 26) exon (NM_052905, exon 17 of 26) 90866 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 134.25-69 chr18 64141385 64141619 + 0.75 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) 7524 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 184-54 chr3 56088159 56088480 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 6 of 17) intron (NR_132749, intron 6 of 17) -235725 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 219.5-37 chr13 97481246 97481641 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47274 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 141.75-94 chr2 85687529 85687763 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6712 NM_006433 10578 Hs.105806 NM_006433 ENSG00000115523 GNLY D2S69E|LAG-2|LAG2|NKG5|TLA519 granulysin protein-coding 151.25-7 chr1 156317979 156318184 + 0.75 NA intron (NM_001008800, intron 6 of 11) intron (NM_001008800, intron 6 of 11) -18444 NM_001004319 391104 Hs.532378 NM_001004319 ENSG00000189030 VHLL VHLP|VLP VHL like protein-coding 150.75-169 chr7 67510843 67511253 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 175072 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 131.25-17 chr1 201035503 201035784 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11929 NM_001252100 23046 Hs.169182 NM_017596 ENSG00000116852 KIF21B - kinesin family member 21B protein-coding 210-87 chr6 152156784 152157245 + 0.75 NA intron (NM_182961, intron 131 of 145) AluSx1|SINE|Alu 11273 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 135.25-2 chr1 63199291 63199595 + 0.75 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) intron (NR_038252, intron 4 of 11) 117814 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 165.25-85 chr21 34630731 34631041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15773 NM_004414 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 132-68 chr17 28260810 28261154 + 0.75 NA Intergenic LTR46|LTR|ERV1 13538 NR_002181 23614 Hs.744962 NR_002181 ENSG00000265060 PPY2P PPY2 pancreatic polypeptide 2, pseudogene pseudo 114.75-198 chr8 134812007 134812276 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -7196 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 120.25-41 chr11 72484184 72484408 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49612 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 150.5-66 chr17 60879337 60879606 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 9 of 25) intron (NM_001330413, intron 9 of 25) 201620 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 122.5-43 chr12 18506625 18506875 + 0.75 NA intron (NM_001288774, intron 24 of 32) intron (NM_001288774, intron 24 of 32) 230759 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 184.25-40 chr15 33382778 33383110 + 0.75 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 71977 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 159.5-197 chr7 94065128 94065543 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -60980 NR_133908 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 158.5-73 chr15 65243112 65243541 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -31853 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 143-111 chr5 15628092 15628405 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -13246 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 117-118 chr3 55575484 55575716 + 0.75 NA intron (NM_015576, intron 16 of 16) MIR|SINE|MIR 83869 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 114.75-94 chr2 120849440 120849642 + 0.75 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) intron (NM_005270, intron 2 of 13) 57260 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 173-121 chr6 84880476 84880766 + 0.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -116023 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 149-135 chr8 136852003 136852366 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 321386 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 121.75-12 chr10 8897535 8897707 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_131944) promoter-TSS (NR_131944) -368 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 141.5-37 chr12 40443123 40443360 + 0.75 NA intron (NM_173600, intron 33 of 173) intron (NM_173600, intron 33 of 173) 49847 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 224.75-61 chr5 145528999 145529474 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 306106 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 125.5-160 chr22 27409822 27410105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 99312 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 113.75-190 chr8 78914919 78915148 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 77504 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 136.25-82 chr17 70732750 70732993 + 0.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 469308 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 164-5 chr1 83046368 83046754 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) MIR|SINE|MIR -60353 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 270.25-17 chr13 45798142 45798652 + 0.75 NA intron (NM_198849, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 53356 NM_198849 283514 Hs.368483 NM_198849 ENSG00000215475 SIAH3 - siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3 protein-coding 139-86 chr20 32140082 32140339 + 0.75 NA intron (NM_001363731, intron 3 of 17) intron (NM_001363731, intron 3 of 17) 30482 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 128.5-219 chr8 71818475 71818799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24486 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 259.25-13 chr15 43462755 43463374 + 0.75 NA intron (NM_001355001, intron 11 of 28) AluSz|SINE|Alu 30092 NM_001141980 7158 Hs.440968 NM_005657 ENSG00000067369 TP53BP1 53BP1|TDRD30|p202|p53BP1 tumor protein p53 binding protein 1 protein-coding 114.75-157 chr5 116670789 116670962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 91334 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 126.5-120 chr2 122993448 122993728 + 0.75 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 79893 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 246.5-16 chr12 37775086 37775554 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -541454 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 298.5-3 chr10 8231173 8231752 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36843 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 164-117 chr6 99166348 99166675 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 41902 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 152-160 chr9 131858595 131858947 + 0.75 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -118827 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 116.25-179 chr5 55488853 55489191 + 0.75 NA intron (NM_003711, intron 1 of 5) AluSq2|SINE|Alu 19904 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 160-62 chr20 37496767 37497166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23337 NM_001317075 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 151.5-43 chr14 32211477 32211851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8395 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 155.5-167 chr5 55300635 55301052 + 0.75 NA intron (NR_144323, intron 1 of 26) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 6851 NR_144325 54505 Hs.593268 NM_019030 ENSG00000067248 DHX29 DDX29 DExH-box helicase 29 protein-coding 140-3 chr1 88783212 88783461 + 0.75 NA intron (NM_006256, intron 6 of 21) L1MEc|LINE|L1 -98132 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 140.75-7 chr1 176379144 176379381 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -83913 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 138.25-55 chr15 93522931 93523145 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 316972 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 182.5-81 chr2 98579451 98579845 + 0.75 NA intron (NM_001351428, intron 24 of 24) intron (NM_001351428, intron 24 of 24) 28864 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 214.75-35 chr19 50572524 50572988 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4321 NM_001080457 94030 Hs.120873 NM_001080457 ENSG00000131409 LRRC4B HSM|LRIG4|NGL-3 leucine rich repeat containing 4B protein-coding 177.5-151 chr6 51978972 51979287 + 0.75 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) intron (NM_138694, intron 35 of 66) 108484 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 117.5-182 chr5 93529286 93529543 + 0.75 NA intron (NR_109825, intron 5 of 8) intron (NR_109825, intron 5 of 8) 41929 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 159.5-40 chr12 20737105 20737532 + 0.75 NA intron (NM_017435, intron 11 of 14) intron (NM_017435, intron 11 of 14) 41853 NM_001145944 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 129.25-111 chr20 47987544 47987752 + 0.75 NA intron (NR_110027, intron 2 of 2) L1MD1|LINE|L1 2469 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 153.75-141 chr7 46157110 46157399 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -235982 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 172.5-118 chr3 22608402 22608684 + 0.75 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 594035 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 169.25-59 chr2 166558725 166559111 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71947 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 269.75-34 chr2 224694759 224695331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109648 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 115.75-115 chr2 191265547 191265809 + 0.75 NA intron (NM_012223, intron 1 of 28) intron (NM_012223, intron 1 of 28) 20274 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 165.25-118 chr5 56942213 56942501 + 0.75 NA intron (NM_001297598, intron 3 of 12) intron (NM_001297598, intron 3 of 12) 9773 NM_152622 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 142.75-171 chr7 8186782 8187021 + 0.75 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 75151 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 230.75-2 chr1 57618944 57619298 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -194200 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 146.75-35 chr13 39259965 39260221 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 221637 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 184-73 chr5 77005659 77006015 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -24567 NM_018046 55109 Hs.634849 NM_018046 ENSG00000164252 AGGF1 GPATC7|GPATCH7|HSU84971|HUS84971|VG5Q angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 protein-coding 137.75-167 chr5 130233997 130234280 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 329673 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 204.5-56 chr18 74723444 74723881 + 0.75 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) L1MEf|LINE|L1 92699 NM_017757 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 187.5-169 chr8 90804456 90804937 + 0.75 NA intron (NM_022351, intron 2 of 12) intron (NM_022351, intron 2 of 12) 12921 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 207.75-6 chr1 103094216 103094595 + 0.75 NA intron (NM_001854, intron 1 of 66) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 14091 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 250-49 chr5 102965371 102965844 + 0.75 NA intron (NM_001364589, intron 14 of 23) intron (NM_001364589, intron 14 of 23) 99784 NM_138821 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 131.5-101 chr2 15686156 15686475 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR -4467 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 128.5-149 chr3 88674153 88674415 + 0.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 335828 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 131.5-5 chr1 98026854 98027227 + 0.75 NA intron (NR_046105, intron 3 of 4) intron (NR_046105, intron 3 of 4) 18311 NR_039604 100616452 NR_039604 ENSG00000284247 MIR2682 mir-2682 microRNA 2682 ncRNA 152.25-51 chr14 56322595 56322854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191607 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 113.25-108 chr3 56130566 56130942 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 6 of 17) intron (NR_132749, intron 6 of 17) -278160 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 155-59 chr2 39770035 39770276 + 0.75 NA intron (NR_135664, intron 2 of 11) intron (NR_135664, intron 2 of 11) 9103 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 187-55 chr21 21243284 21243785 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 2 of 18) intron (NM_001352592, intron 2 of 18) 96372 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 153.25-53 chr17 52798992 52799269 + 0.75 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 -62991 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 215.75-91 chr6 164258996 164259339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 562896 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 153-122 chr5 95303773 95304150 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -19386 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 218.25-69 chr5 67130667 67130981 + 0.75 NA intron (NM_001297651, intron 12 of 25) intron (NM_001297651, intron 12 of 25) 65975 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 112.25-109 chr2 221449848 221450122 + 0.75 NA intron (NM_001363748, intron 8 of 17) intron (NM_001363748, intron 8 of 17) 122319 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 194.75-15 chr10 81757148 81757727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117757 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 135.75-130 chr22 50259464 50259820 + 0.75 NA intron (NM_002969, intron 2 of 11) AluSq2|SINE|Alu 2041 NM_002969 6300 Hs.432642 NM_002969 ENSG00000188130 MAPK12 ERK-6|ERK3|ERK6|MAPK 12|P38GAMMA|PRKM12|SAPK-3|SAPK3 mitogen-activated protein kinase 12 protein-coding 189.5-170 chrX 69023043 69023607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 142128 NM_145119 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 123.25-168 chr5 107209195 107209491 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -198329 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 311.5-29 chr6 137798042 137798581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59274 NR_121618 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 140-24 chr11 37989325 37989618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50870 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 176.75-62 chr2 69615479 69615935 + 0.75 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 28032 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 173.75-46 chr12 96340164 96340574 + 0.75 NA intron (NM_002595, intron 1 of 16) intron (NM_002595, intron 1 of 16) 60070 NM_001170464 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 166.25-89 chr2 222704444 222704840 + 0.75 NA intron (NM_058165, intron 5 of 5) intron (NM_058165, intron 5 of 5) 32984 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 138.75-82 chr2 30455540 30455904 + 0.75 NA intron (NM_001304446, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 8476 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 289.75-2 chr1 226239114 226239766 + 0.75 NA intron (NM_001366237, intron 10 of 13) intron (NM_001366237, intron 10 of 13) 15776 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 143-133 chr7 73653564 73653812 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14143 NM_001077621 155382 Hs.647037 NM_152560 ENSG00000176428 VPS37D WBSCR24 VPS37D subunit of ESCRT-I protein-coding 113.75-181 chr7 104437141 104437391 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 108610 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 156-108 chr4 36745552 36745913 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -103832 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 133.75-27 chr11 11047431 11047782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 189389 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 130.25-78 chr17 47161560 47161804 + 0.75 NA intron (NR_148340, intron 2 of 16) AluSx1|SINE|Alu 27613 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 128-164 chr8 70891964 70892356 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 222821 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 173-24 chr11 94830440 94830841 + 0.75 NA intron (NM_130847, intron 5 of 12) intron (NM_130847, intron 5 of 12) 62284 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 138.5-124 chr22 34853203 34853587 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L1ME1|LINE|L1 144521 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 134.75-187 chr6 49260449 49260733 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 202662 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 205.5-94 chr3 71767935 71768366 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -13377 NM_173359 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 113-124 chr3 162478035 162478232 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 825168 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 130.5-27 chr1 235020803 235021002 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 48916 NR_027454 731656 Hs.702477 NR_027454 LINC01348 - long intergenic non-protein coding RNA 1348 ncRNA 177-52 chr2 241135129 241135526 + 0.75 NA intron (NM_015148, intron 8 of 17) MER8|DNA|TcMar-Tigger 14145 NM_001252122 23178 Hs.397891 NM_015148 ENSG00000115687 PASK PASKIN|STK37 PAS domain containing serine/threonine kinase protein-coding 157.5-3 chr1 27174554 27174819 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19561 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 191-33 chr2 53868687 53869212 + 0.75 NA intron (NM_014614, intron 44 of 46) intron (NM_014614, intron 44 of 46) -8916 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 227.25-21 chr12 13107253 13107744 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3831 NM_001080555 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 157.75-173 chr8 115651153 115651554 + 0.75 NA intron (NM_014112, intron 1 of 6) intron (NM_014112, intron 1 of 6) 16660 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 113.25-31 chr11 114010074 114010231 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 32652 NM_001161772 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 174.75-2 chr1 24498017 24498326 + 0.75 NA intron (NR_144360, intron 1 of 1) AluSq|SINE|Alu -4173 NM_001251979 11123 Hs.656799 NM_013441 ENSG00000117602 RCAN3 DSCR1L2|MCIP3|RCN3|hRCN3 RCAN family member 3 protein-coding 220.5-15 chr11 57082234 57082667 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 44916 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 125.5-131 chr2 134706689 134707001 + 0.75 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 12155 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 200.75-25 chr12 131694275 131694771 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16567 NM_004592 6433 Hs.308171 NM_004592 ENSG00000061936 SFSWAP SFRS8|SWAP splicing factor SWAP protein-coding 118-80 chr2 28910215 28910483 + 0.75 NA intron (NM_015131, intron 3 of 17) intron (NM_015131, intron 3 of 17) -3313 NR_003074 692209 NR_003074 ENSG00000264994 SNORD92 HBII-316 small nucleolar RNA, C/D box 92 snoRNA 122.75-148 chr4 66554086 66554341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 277389 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 183.5-155 chr8 135547475 135547837 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 3 of 8) intron (NM_006558, intron 3 of 8) 90200 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 166.25-69 chr18 51424826 51425169 + 0.75 NA intron (NR_040074, intron 1 of 2) intron (NR_040074, intron 1 of 2) 32955 NR_040074 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 203.5-135 chr8 76092122 76092485 + 0.75 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -314351 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 188.75-45 chr17 72134253 72134572 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 13392 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 142.5-65 chr14 68894138 68894375 + 0.75 NA intron (NM_001102, intron 8 of 20) intron (NM_001102, intron 8 of 20) 85046 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 122.25-43 chr12 43960044 43960411 + 0.75 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 124146 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 170.5-80 chr19 32153417 32153837 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -47711 NR_110694 101927411 Hs.515337 NR_110694 ENSG00000267204 LINC01782 - long intergenic non-protein coding RNA 1782 ncRNA 144.75-60 chr14 62142353 62142633 + 0.75 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -2520 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 144.75-134 chr5 66241542 66241951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32300 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 124.75-27 chr10 43880980 43881223 + 0.75 NA intron (NR_038268, intron 4 of 4) intron (NR_038268, intron 4 of 4) 21690 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 256-28 chr2 52269295 52269703 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) ERVL-E-int|LTR|ERVL -101149 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 143.5-76 chr15 50159556 50159817 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -22510 NM_003645 11001 Hs.11729 NM_003645 ENSG00000140284 SLC27A2 ACSVL1|FACVL1|FATP2|HsT17226|VLACS|VLCS|hFACVL1 solute carrier family 27 member 2 protein-coding 155-135 chr8 11075616 11075834 + 0.75 NA intron (NM_173683, intron 1 of 2) AluSg4|SINE|Alu -8636 NR_134308 101929269 Hs.680442 NR_134308 ENSG00000254839 LOC101929269 - uncharacterized LOC101929269 ncRNA 270.75-42 chr5 72266206 72266616 + 0.75 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) intron (NM_001286748, intron 4 of 11) 53829 NM_015084 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 167.75-115 chr5 126467040 126467271 + 0.75 NA intron (NM_001146321, intron 3 of 14) AluSz|SINE|Alu 2005 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 208-10 chr11 13994223 13994683 + 0.75 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) intron (NM_006108, intron 2 of 15) 31730 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 227.75-88 chr9 135987817 135988129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26600 NM_016172 10422 Hs.9194 NM_016172 ENSG00000130560 UBAC1 GBDR1|KPC2|UBADC1 UBA domain containing 1 protein-coding 219.5-65 chr2 45570606 45571072 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 9 of 20) L1M4|LINE|L1 40428 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 141.5-130 chr21 38421865 38422182 + 0.75 NA intron (NM_001243432, intron 5 of 11) intron (NM_001243432, intron 5 of 11) -75947 NR_110545 102724678 Hs.635675 NR_110545 LINC01423 - long intergenic non-protein coding RNA 1423 ncRNA 132.75-78 chr17 53110072 53110426 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 124744 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 160-43 chr17 5010066 5010321 + 0.75 NA intron (NM_006612, intron 16 of 22) AluSz6|SINE|Alu 9900 NR_120665 102724009 Hs.666487 NR_120665 ENSG00000227495 LOC102724009 - uncharacterized LOC102724009 ncRNA 184.25-112 chr7 7701747 7702095 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 16686 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 323.5-22 chr4 186571181 186571956 + 0.75 NA Intergenic MER87|LTR|ERV1 -16001 NM_005958 4543 Hs.243467 NM_005958 ENSG00000168412 MTNR1A MEL-1A-R|MT1 melatonin receptor 1A protein-coding 146.25-146 chr8 68505034 68505302 + 0.75 NA intron (NR_146187, intron 4 of 13) L1MB7|LINE|L1 -173677 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 221-21 chr14 72633682 72634103 + 0.75 NA intron (NM_001280542, intron 8 of 10) intron (NM_001280542, intron 8 of 10) 117072 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 193.5-118 chr4 52173023 52173364 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121889 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 294.75-22 chr22 39301214 39301972 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 12318 NR_000028 116938 NR_000028 ENSG00000209480 SNORD83B RNU83B|U83B small nucleolar RNA, C/D box 83B snoRNA 194.75-25 chr14 49371305 49371644 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 214906 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 173.25 chr1 44406876 44407323 + 0.75 NA intron (NM_018150, intron 1 of 14) CpG 1844 NM_018150 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 123.25-138 chr3 130559623 130559811 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001102608) promoter-TSS (NM_001102608) -617 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 133-105 chr3 38229047 38229364 + 0.75 NA intron (NM_005109, intron 8 of 17) intron (NM_005109, intron 8 of 17) -36607 NM_004256 9390 Hs.225941 NM_004256 ENSG00000172940 SLC22A13 OAT10|OCTL1|OCTL3|ORCTL-3|ORCTL3 solute carrier family 22 member 13 protein-coding 127-61 chr14 70232849 70233231 + 0.75 NA TTS (NR_135825) TTS (NR_135825) 14761 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 181-42 chr18 2748876 2749269 + 0.75 NA intron (NM_015295, intron 30 of 47) intron (NM_015295, intron 30 of 47) 93185 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 116.75-37 chr11 59494805 59494980 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -8684 NM_001004706 219986 Hs.553651 NM_001004706 ENSG00000176200 OR4D11 OR4D11P olfactory receptor family 4 subfamily D member 11 protein-coding 150.5-118 chr20 51059330 51059670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36393 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 125-139 chr6 74248504 74248709 + 0.75 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 179155 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 168.25-100 chr3 98880731 98881066 + 0.75 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) intron (NM_080927, intron 2 of 15) 20797 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 190.5-59 chr16 74242185 74242616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26879 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 138-52 chr16 71245399 71245692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14823 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 122.75-103 chr2 204237143 204237401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 300524 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 273-21 chr14 62792594 62793109 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) L1MA10|LINE|L1 252607 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 225-14 chr10 102252922 102253418 + 0.75 NA intron (NM_001199378, intron 1 of 39) AluSx1|SINE|Alu 7638 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 172-24 chr12 2950215 2950556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9012 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 128.25-112 chr20 37843720 37844034 + 0.75 NA intron (NM_001281495, intron 14 of 16) intron (NM_001281495, intron 14 of 16) -59250 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 180.25-15 chr12 10467402 10467725 + 0.75 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -12878 NM_001304448 3821 Hs.512576 NM_002259 ENSG00000134545 KLRC1 CD159A|NKG2|NKG2A killer cell lectin like receptor C1 protein-coding 135.75-93 chr2 42658681 42658923 + 0.75 NA intron (NM_001330443, intron 7 of 16) AluJo|SINE|Alu 90170 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 114.75-77 chr18 67865512 67865708 + 0.75 NA intron (NR_033921, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -50788 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 124.5-42 chr11 114184105 114184345 + 0.75 NA intron (NM_001354752, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -111588 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 162.25-146 chr6 139536312 139536619 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -61869 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 120.5-195 chr6 37655198 37655433 + 0.75 NA intron (NM_153487, intron 4 of 16) intron (NM_153487, intron 4 of 16) 42568 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 114.5-27 chr1 217993794 217994035 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49591 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 229.25-64 chr5 134561632 134562051 + 0.75 NA intron (NM_015288, intron 6 of 10) intron (NM_015288, intron 6 of 10) 35733 NM_015288 23338 Hs.732155 NM_015288 ENSG00000043143 JADE2 JADE-2|PHF15 jade family PHD finger 2 protein-coding 204.75-129 chr9 75151146 75151630 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 62874 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 195.5-66 chr2 23710522 23710929 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 216398 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 163.5-111 chr20 24116840 24117141 + 0.75 NA Intergenic MER51C|LTR|ERV1 -82777 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 118.75-116 chr20 53739283 53739483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131029 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 179.5-96 chr2 162175058 162175595 + 0.75 NA intron (NM_004460, intron 21 of 25) intron (NM_004460, intron 21 of 25) -23079 NM_002054 2641 Hs.516494 NM_002054 ENSG00000115263 GCG GLP-1|GLP1|GLP2|GRPP glucagon protein-coding 187.25-86 chr5 87388997 87389351 + 0.75 NA TTS (NM_001364076) TTS (NM_001364076) 23730 NM_001199189 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 118-188 chr8 106036155 106036429 + 0.75 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 24211 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 239.25-21 chr12 119652602 119653134 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -15265 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 151-8 chr1 162612559 162612918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18125 NM_001354983 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 262.5-18 chr14 57588036 57588525 + 0.75 NA intron (NM_001352016, intron 3 of 3) intron (NM_001352016, intron 3 of 3) -94423 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 113-77 chr18 10465801 10466072 + 0.75 NA intron (NM_153000, intron 1 of 4) intron (NM_153000, intron 1 of 4) 11301 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 228.5-40 chr15 70390784 70391277 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 114898 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 146.75-64 chr17 68744100 68744339 + 0.75 NA Intergenic MER105|DNA|hAT-Charlie 116065 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 214.75-44 chr2 214554882 214555400 + 0.75 NA intron (NR_159945, intron 4 of 4) MER4D|LTR|ERV1 44959 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 134.25-96 chr2 231070877 231071188 + 0.75 NA intron (NM_001191037, intron 6 of 23) intron (NM_001191037, intron 6 of 23) 14165 NM_002807 5707 Hs.3887 NM_002807 ENSG00000173692 PSMD1 P112|Rpn2|S1 proteasome 26S subunit, non-ATPase 1 protein-coding 167.75-61 chr18 5196975 5197472 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001145194) promoter-TSS (NM_001145194) 34 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 142-114 chr3 179737914 179738200 + 0.75 NA intron (NM_003940, intron 10 of 20) intron (NM_003940, intron 10 of 20) 85017 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 117-114 chr3 15701042 15701265 + 0.75 NA intron (NM_001349280, intron 13 of 26) intron (NM_001349280, intron 13 of 26) -3782 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 179.5-55 chr14 30360862 30361172 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -198106 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 123.5-87 chr18 33677486 33677701 + 0.75 NA intron (NM_030632, intron 7 of 11) intron (NM_030632, intron 7 of 11) 99374 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 194.75-89 chr7 63111456 63112032 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 192312 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 237-30 chr2 209274327 209274653 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -149557 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 193.75-103 chr5 166089424 166089844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 836736 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 171-96 chr3 121567004 121567432 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001012659) promoter-TSS (NM_001012659) -731 NM_001012659 503582 Hs.224976 NM_001012659 ENSG00000186103 ARGFX - arginine-fifty homeobox protein-coding 189.75-61 chr2 132937029 132937356 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 8 of 17) LTR16C|LTR|ERVL 21635 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-98 chr2 101044470 101044676 + 0.75 NA intron (NM_001102426, intron 5 of 19) intron (NM_001102426, intron 5 of 19) 42284 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 171.5-140 chr7 92365678 92366155 + 0.75 NA intron (NM_019004, intron 10 of 19) AluY|SINE|Alu 71398 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 237.5-102 chr9 27178519 27179001 + 0.75 NA intron (NM_001290077, intron 6 of 21) intron (NM_001290077, intron 6 of 21) 69619 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 112.5-213 chr6 73065068 73065261 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 78350 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 132.25-182 chr8 111871665 111871871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 495129 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 189-55 chr2 40231806 40232242 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 198280 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 138.5-7 chr1 48321926 48322243 + 0.75 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1M1|LINE|L1 99368 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 169.5-42 chr13 80740350 80740601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -277916 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 127-131 chr5 22322063 22322312 + 0.75 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -108337 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 212-80 chr8 57489572 57490034 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146016 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 178.5-75 chr2 46211952 46212253 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -85305 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 126.5-88 chr16 65750094 65750417 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -173955 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 176.5-75 chr18 37651117 37651484 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -5835 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 127-140 chr5 108046267 108046648 + 0.75 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) L1MD1|LINE|L1 335641 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 301.25-14 chr15 60448269 60448919 + 0.75 NA intron (NR_147171, intron 10 of 16) intron (NR_147171, intron 10 of 16) 30548 NM_001018089 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 129.5-224 chr8 76001719 76001942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -404824 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 182-5 chr1 53108350 53108843 + 0.75 NA exon (NM_001287596, exon 4 of 4) exon (NM_001287596, exon 4 of 4) 34042 NM_001287595 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 151.25-140 chr4 97991592 97991803 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1PB1|LINE|L1 151779 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 172-25 chr12 4494545 4494821 + 0.75 NA intron (NR_144382, intron 7 of 9) L1MEg|LINE|L1 43786 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 160.75-19 chr10 72639216 72639451 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13142 NM_006077 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 114-95 chr22 47966060 47966393 + 0.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -308138 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 215-21 chr14 46093026 46093512 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 29110 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 130.75-60 chr14_GL000225v1_random 24858 25168 + 0.75 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 187-77 chr5 23171226 23171619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -318078 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 155.5-153 chr4 132010273 132010591 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 245594 NR_125884 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 147-67 chr2 29536983 29537424 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -61826 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 124-49 chr15 26541341 26541715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 87562 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 253.75-37 chr3 70020531 70021025 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 21034 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 130.25-86 chr18 58525299 58525657 + 0.75 NA intron (NM_052947, intron 6 of 12) L3b|LINE|CR1 -74326 NR_039899 100616357 NR_039899 ENSG00000207778 MIR3591 - microRNA 3591 ncRNA 158.75-147 chr6 138841415 138841787 + 0.75 NA intron (NM_001077706, intron 5 of 21) L1MEg|LINE|L1 45490 NM_001195037 345930 Hs.660603 NM_001077706 ENSG00000203734 ECT2L ARHGEF32|C6orf91|FBXO49|LFDH|dJ509I19.2|dJ509I19.3|dJ509I19.5 epithelial cell transforming 2 like protein-coding 145.75-168 chr9 76008994 76009284 + 0.75 NA intron (NR_120409, intron 3 of 19) intron (NR_120409, intron 3 of 19) 118466 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 204.25-38 chr14 51636092 51636638 + 0.75 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) LTR47A|LTR|ERVL 15379 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-99 chr22 27959566 27959870 + 0.75 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 -39106 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 191.75-53 chr18 63566264 63566716 + 0.75 NA intron (NM_001307928, intron 6 of 6) intron (NM_001307928, intron 6 of 6) 10330 NM_080474 89777 Hs.348541 NM_080474 ENSG00000166634 SERPINB12 YUKOPIN serpin family B member 12 protein-coding 141.5-12 chr1 182520818 182521269 + 0.75 NA intron (NM_001366934, intron 10 of 22) intron (NM_001366934, intron 10 of 22) 68213 NM_021133 6041 Hs.518545 NM_021133 ENSG00000135828 RNASEL PRCA1|RNS4 ribonuclease L protein-coding 155.75-104 chr3 83663708 83664141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1205651 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 122-85 chr2 35561989 35562290 + 0.75 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 90734 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 122.25-170 chr7 22082352 22082656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 111241 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 139.25-155 chr5 133624231 133624585 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -11867 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 138.75-79 chr18 72346840 72347157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197344 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 134.5-115 chr20 45777225 45777506 + 0.75 NA intron (NM_080614, intron 4 of 6) AluJr|SINE|Alu 14518 NM_080614 140686 Hs.419126 NM_080614 ENSG00000124116 WFDC3 WAP14|dJ447F3.3 WAP four-disulfide core domain 3 protein-coding 113-113 chr3 12344382 12344560 + 0.75 NA intron (NM_001330615, intron 1 of 5) intron (NM_001330615, intron 1 of 5) -6946 NM_001354668 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 222.75-44 chr14 83315757 83316202 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 673347 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 256.5-83 chr9 37074017 37074440 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -5668 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 161.5-162 chr5 165525985 165526311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1055869 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 161.5-139 chr3 142160666 142160896 + 0.75 NA non-coding (NR_033289, exon 17 of 17) non-coding (NR_033289, exon 17 of 17) -11237 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 137.5-63 chr14 34199439 34199806 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248548 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 189.25-74 chr3 22782463 22782908 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 419893 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 130-57 chr17 69477588 69477889 + 0.75 NA intron (NR_145982, intron 1 of 1) MIRc|SINE|MIR 7794 NR_145982 105371880 NR_145982 LOC105371880 - uncharacterized LOC105371880 ncRNA 176-52 chr4 38642096 38642612 + 0.75 NA intron (NR_026804, intron 1 of 7) intron (NR_026804, intron 1 of 7) -21845 NM_016531 51274 Hs.298658 NM_016531 ENSG00000109787 KLF3 BKLF Kruppel like factor 3 protein-coding 149.75-20 chr11 26424186 26424438 + 0.75 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) intron (NM_031418, intron 1 of 26) -49590 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 145.75-115 chr4 136604009 136604328 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -589588 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 121-80 chr17 3041494 3041799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21961 NM_014566 8386 Hs.553508 NM_014566 ENSG00000262628 OR1D5 C17orf2|OR17-2|OR17-30|OR17-31|OR1D4 olfactory receptor family 1 subfamily D member 5 protein-coding 123-206 chrX 57648133 57648431 + 0.75 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 31978 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 162.25-118 chr4 123041348 123041761 + 0.75 NA intron (NM_001345856, intron 11 of 15) AluSp|SINE|Alu 118476 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 165.5-138 chr4 122528711 122529096 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -72408 NM_000586 3558 Hs.89679 NM_000586 ENSG00000109471 IL2 IL-2|TCGF|lymphokine interleukin 2 protein-coding 200.5-47 chr16 70662295 70662763 + 0.75 NA 3' UTR (NM_138383, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_138383, exon 15 of 15) 23524 NM_138383 92154 Hs.432387 NM_138383 ENSG00000132613 MTSS2 ABBA|ABBA-1|ABBA1|MTSS1L MTSS I-BAR domain containing 2 protein-coding 148-34 chr15 62995600 62995931 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46982 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 309-45 chr7 52948197 52948762 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -87154 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 138.5-186 chr7 117809442 117809711 + 0.75 NA intron (NM_001363351, intron 3 of 22) intron (NM_001363351, intron 3 of 22) 62644 NM_001363349 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 132.75-182 chr7 113360569 113360787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242096 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 154.75-109 chr4 73924601 73924876 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 55345 NM_001511 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 195.25-46 chr2 13791594 13791923 + 0.75 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 609200 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 195.25-50 chr2 70152444 70152823 + 0.75 NA intron (NR_145969, intron 8 of 8) L1M6|LINE|L1 -27317 NR_024444 100133985 Hs.135528 NR_024444 ENSG00000231327 LINC01816 - long intergenic non-protein coding RNA 1816 ncRNA 146.75-153 chr8 61624493 61624787 + 0.75 NA 3' UTR (NM_032466, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_032466, exon 14 of 14) 65171 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 145.25-26 chr12 4013822 4014224 + 0.75 NA Intergenic (CAGAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -140575 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 158.5-115 chr20 39857255 39857562 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -147053 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 122.5-41 chr12 559932 560219 + 0.75 NA intron (NM_173593, intron 19 of 19) intron (NM_173593, intron 19 of 19) 26411 NR_134624 105369595 Hs.504422 NR_134624 LOC105369595 - uncharacterized LOC105369595 ncRNA 127-146 chr6 36288020 36288292 + 0.75 NA intron (NM_001145717, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 17696 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 129.75-72 chr16 79316032 79316310 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 284566 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 158.75-126 chr4 84878211 84878593 + 0.75 NA intron (NM_014991, intron 3 of 67) intron (NM_014991, intron 3 of 67) -87214 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 230.75-27 chr17 42204465 42204969 + 0.75 NA intron (NM_012448, intron 16 of 18) AluJo|SINE|Alu -10223 NM_032484 84514 Hs.38039 NM_032484 ENSG00000167925 GHDC D11LGP1|LGP1 GH3 domain containing protein-coding 135.75-146 chr3 112473889 112474165 + 0.75 NA intron (NM_181780, intron 2 of 4) intron (NM_181780, intron 2 of 4) 25445 NM_181780 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 165-48 chr15 91894964 91895435 + 0.75 NA intron (NR_135775, intron 1 of 10) intron (NR_135775, intron 1 of 10) 40895 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 229.75-54 chr4 52570009 52570490 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 86290 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 121-141 chr4 15597509 15597717 + 0.75 NA intron (NM_001080522, intron 36 of 37) intron (NM_001080522, intron 36 of 37) 57744 NM_012161 26234 Hs.643433 NM_012161 ENSG00000118564 FBXL5 FBL4|FBL5|FLR1 F-box and leucine rich repeat protein 5 protein-coding 202-26 chr17 32301564 32301882 + 0.75 NA intron (NM_001363835, intron 6 of 7) AluSq2|SINE|Alu 35547 NM_001363834 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 167.75-129 chr7 9132412 9132790 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -501669 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 214.75-68 chr5 164574899 164575298 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104819 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 149-72 chr21 37025280 37025498 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 18687 NM_018962 53820 Hs.254560 NM_018962 ENSG00000183145 RIPPLY3 DSCR6 ripply transcriptional repressor 3 protein-coding 132.75-174 chr7 39157210 39157455 + 0.75 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -143765 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 136.75-148 chr4 165554752 165555131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129698 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 169.75-7 chr1 192599806 192600060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24160 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 187.25-30 chr14 72993132 72993452 + 0.75 NA exon (NM_001281734, exon 4 of 12) exon (NM_001281734, exon 4 of 12) -6336 NM_001281735 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 222-24 chr14 69346875 69347255 + 0.75 NA exon (NM_001168368, exon 13 of 15) exon (NM_001168368, exon 13 of 15) 51234 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 130.25-77 chr16 84106065 84106323 + 0.75 NA intron (NM_003791, intron 1 of 22) AluSq|SINE|Alu 10748 NM_003791 8720 Hs.75890 NM_003791 ENSG00000140943 MBTPS1 PCSK8|S1P|SEDKF|SKI-1 membrane bound transcription factor peptidase, site 1 protein-coding 185.75-50 chr15 93600610 93601081 + 0.75 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie -255715 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 210-34 chr16 87374456 87374924 + 0.75 NA intron (NM_001282683, intron 2 of 9) intron (NM_001282683, intron 2 of 9) 9086 NM_024735 79791 Hs.567582 NM_024735 ENSG00000103264 FBXO31 FBX14|FBXO14|Fbx31|MRT45|pp2386 F-box protein 31 protein-coding 137.75-17 chr1 233116856 233117246 + 0.75 NA intron (NM_014801, intron 21 of 33) L1MD1|LINE|L1 166209 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 187.75-73 chr3 163633049 163633633 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -330040 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 167-84 chr4 44328487 44328926 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 120103 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 113.75-166 chr6 83836649 83836833 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -16525 NM_001009994 134701 Hs.149454 NM_001009994 ENSG00000203877 RIPPLY2 C6orf159|SCDO6|dJ237I15.1 ripply transcriptional repressor 2 protein-coding 213.5-75 chr3 9623271 9623845 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -25947 NM_001077525 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 240.25-21 chr14 23738141 23738549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101981 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 130-30 chr11 88796128 88796418 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 251799 NM_001143831 2915 Hs.147361 NM_000842 ENSG00000168959 GRM5 GPRC1E|MGLUR5|PPP1R86|mGlu5 glutamate metabotropic receptor 5 protein-coding 114.5-118 chr18 9669162 9669463 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -38989 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 246.25-55 chr5 136149792 136150343 + 0.75 NA intron (NM_005903, intron 2 of 7) intron (NM_005903, intron 2 of 7) -15177 NR_026763 9597 Hs.59666 NM_022001 ENSG00000164621 SMAD5-AS1 DAMS|SMAD5AS|SMAD5OS SMAD5 antisense RNA 1 ncRNA 123.5-167 chr5 109562055 109562238 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -127220 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 120.25-87 chr2 21724041 21724296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13516 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 201-50 chr21 39709157 39709558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36050 NM_001080444 150084 Hs.422120 NM_001080444 ENSG00000183067 IGSF5 GSF5|JAM4 immunoglobulin superfamily member 5 protein-coding 142.25-161 chr7 138957821 138958109 + 0.75 NA intron (NM_020910, intron 1 of 19) intron (NM_020910, intron 1 of 19) 23424 NM_001164665 57670 Hs.605380 NM_020910 ENSG00000122778 KIAA1549 - KIAA1549 protein-coding 234.5 chr1 32053029 32053366 + 0.75 NA intron (NR_073499, intron 10 of 10) intron (NR_073499, intron 10 of 10) -18834 NM_001319677 55116 Hs.25544 NM_018056 ENSG00000121775 TMEM39B - transmembrane protein 39B protein-coding 203.5-24 chr10 85777364 85777834 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L2b|LINE|L2 199868 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 236.5-105 chr9 122933466 122934000 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -2221 NM_020924 57684 Hs.5638 NM_020924 ENSG00000171448 ZBTB26 ZNF481|bioref zinc finger and BTB domain containing 26 protein-coding 128.5-235 chr9 37521885 37522254 + 0.75 NA intron (NM_012166, intron 7 of 10) intron (NM_012166, intron 7 of 10) 36121 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 149.25-8 chr1 45890358 45890637 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 26149 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 237-70 chr8 110115360 110115831 + 0.75 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 -139824 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 147-42 chr15 85368425 85368725 + 0.75 NA Intergenic (GTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12021 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 311-4 chr10 27817280 27817795 + 0.75 NA intron (NM_018076, intron 19 of 19) L1PB4|LINE|L1 -71718 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 132-162 chr7 44586162 44586421 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -3996 NM_001303060 222068 Hs.598832 NM_182547 ENSG00000158604 TMED4 ERS25|GMP25iso|HNLF|p24a3|p24alpha3 transmembrane p24 trafficking protein 4 protein-coding 127.25-124 chr3 96198264 96198490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161587 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 161.5-34 chr11 98950538 98950839 + 0.75 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -70261 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 127-121 chr3 177417779 177418200 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -23932 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 119.25-101 chr2 167946980 167947201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5946 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 140.5-63 chr14 59159907 59160222 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -28603 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 130.75-107 chr21 19254877 19255160 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -495206 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 298.75-17 chr15 68780208 68780860 + 0.75 NA intron (NM_006305, intron 5 of 6) intron (NM_006305, intron 5 of 6) 21391 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 150-138 chr8 14849793 14850129 + 0.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 3549 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 170.75-11 chr10 35135305 35135551 + 0.75 NA intron (NM_183060, intron 1 of 5) intron (NM_183060, intron 1 of 5) -2354 NM_183011 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 113.75-124 chr3 28989078 28989310 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 291745 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 182-10 chr10 15315830 15316157 + 0.75 NA intron (NM_001010924, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 55296 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 121.75-46 chr14 65539482 65539792 + 0.75 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 68535 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 189.5-44 chr14 62882875 62883393 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 162324 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 201-43 chr2 107339709 107340050 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 9646 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 148.75-128 chr4 186825246 186825590 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101562 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 165-14 chr10 50404736 50405197 + 0.75 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) L1MC4a|LINE|L1 -156356 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 113-36 chr11 4636074 4636297 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -3530 NM_001004751 390038 Hs.553728 NM_001004751 ENSG00000197428 OR51D1 OR11-14|OR51D1Q olfactory receptor family 51 subfamily D member 1 protein-coding 131.25-113 chr2 216305880 216306170 + 0.75 NA intron (NM_020814, intron 1 of 3) (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 66458 NM_020814 57574 Hs.170388 NM_020814 ENSG00000144583 MARCH4 MARCH-IV|RNF174 membrane associated ring-CH-type finger 4 protein-coding 158-115 chr5 171738948 171739363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46717 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 190-25 chr18 13384776 13385122 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MA8|LINE|L1 42585 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 154-45 chr15 83459414 83459840 + 0.75 NA intron (NM_003027, intron 1 of 8) LTR49-int|LTR|ERV1 12286 NM_003027 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 207.5-107 chr7 136789948 136790451 + 0.75 NA Intergenic (AGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -78453 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 213-53 chr20 14829575 14829962 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 99750 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 172.25-61 chr2 58147762 58148092 + 0.75 NA intron (NM_001130482, intron 12 of 12) L1ME2|LINE|L1 93453 NR_156742 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 182.75-122 chr7 16402562 16402965 + 0.75 NA intron (NM_001101426, intron 2 of 9) L1MEd|LINE|L1 18775 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 146.25-122 chr5 159551533 159551886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85433 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 196-54 chr2 227882979 227883333 + 0.75 NA intron (NM_001330004, intron 2 of 13) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 11525 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 207-14 chr11 30015452 30015923 + 0.75 NA intron (NM_002233, intron 1 of 1) (AAAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1343 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 116.5-255 chr8 125510631 125510978 + 0.75 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 78595 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 173.75-59 chr15 33313832 33314084 + 0.75 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 2991 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 168.75-24 chr10 123120407 123120847 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15343 NM_001105574 340784 Hs.531194 NM_001105574 ENSG00000188620 HMX3 NKX-5.1|NKX5.1|Nkx5-1 H6 family homeobox 3 protein-coding 126.75-209 chr5 170237605 170237828 + 0.75 NA intron (NR_161263, intron 4 of 4) HAL1|LINE|L1 4710 NM_001305393 133874 Hs.519749 NM_001102609 ENSG00000234511 C5orf58 - chromosome 5 open reading frame 58 protein-coding 133.75-212 chrX 94064845 94065160 + 0.75 NA Intergenic (TGTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 390796 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 167-49 chr17 60634845 60635180 + 0.75 NA intron (NM_003620, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 34829 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 218-2 chr1 83047526 83047877 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) intron (NR_147074, intron 5 of 10) -61493 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 143.75-166 chr7 5134797 5135034 + 0.75 NA intron (NR_034163, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu 9631 NR_034163 645700 Hs.690815 NR_034163 ENSG00000159904 ZNF890P - zinc finger protein 890, pseudogene pseudo 123-137 chr3 186017820 186018067 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 58000 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 246.5-45 chr2 176364788 176365329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 95616 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 127.25-95 chr2 170277186 170277388 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) intron (NM_001083615, intron 7 of 33) 73656 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 126.75-189 chr5 29603459 29603751 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -207629 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 211.5-84 chr2 201321238 201321722 + 0.75 NA intron (NM_139163, intron 9 of 14) L1PB3|LINE|L1 35865 NM_001289993 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 142.75-90 chr19 32595847 32596082 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 12505 NR_145718 109616972 NR_145718 ENSG00000201388 SNORA68B - small nucleolar RNA, H/ACA box 68B snoRNA 168.75-36 chr13 26874863 26875238 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -114264 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 160.25-96 chr3 82305155 82305557 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) L1M3b|LINE|L1 319214 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 185.75-74 chr20 39935511 39935890 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -68761 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 165.75-172 chr9 24777989 24778303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -232249 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 173.75-106 chr3 62174800 62175117 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 8 of 29) intron (NM_002841, intron 8 of 29) 143989 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 115.5-81 chr15 77256027 77256239 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 3 of 7) intron (NM_024776, intron 3 of 7) -30729 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 165.5-21 chr10 64943215 64943565 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -18872 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 132.25-171 chr6 140997247 140997573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313596 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 206.25-52 chr2 76828092 76828530 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -157654 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 153.25-63 chr2 21755965 21756320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45490 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 117.25-7 chr1 58329156 58329545 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -78803 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 294.5-28 chr22 49773461 49774192 + 0.75 NA non-coding (NR_146334, exon 13 of 13) non-coding (NR_146334, exon 13 of 13) 50505 NM_001349940 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 178.5-51 chr15 62992683 62993112 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49850 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 171.75-125 chr7 1511861 1512256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7669 NM_001080453 26173 Hs.532188 NM_001080453 ENSG00000164880 INTS1 INT1|NET28 integrator complex subunit 1 protein-coding 201.75-30 chr13 104259395 104259830 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 834412 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 240.25-9 chr10 61170070 61170563 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 154041 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 160.25-74 chr2 106312862 106313154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56737 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 129.75-3 chr1 43466086 43466329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12218 NM_001190880 81888 Hs.709864 NM_031207 ENSG00000178922 HYI HT036 hydroxypyruvate isomerase (putative) protein-coding 136.25-37 chr11 110884788 110885048 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -171729 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 257.5-58 chr5 13552312 13552869 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 391890 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 152.5-191 chr8 109008799 109009217 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -77620 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 138.75-33 chr11 109943335 109943549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149950 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 199.5-116 chr5 8966276 8966761 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 87377 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 167.25-100 chr22 20676321 20676716 + 0.75 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -13037 NR_024592 266697 Hs.558711 NR_024592 POM121L4P - POM121 transmembrane nucleoporin like 4, pseudogene pseudo 180-9 chr1 234414742 234415047 + 0.75 NA intron (NM_005646, intron 22 of 29) AluSx|SINE|Alu 41193 NM_001301733 388753 Hs.23198 NM_001012985 ENSG00000168275 COA6 C1orf31|CEMCOX4 cytochrome c oxidase assembly factor 6 protein-coding 117.75-173 chr5 32026285 32026526 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 6 of 24) AluJo|SINE|Alu -90246 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 147.75-12 chr1 199618526 199618776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -409059 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 127.5-262 chrX 145383734 145384041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136384 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 173.5-61 chr18 13788843 13789276 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -35090 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 124.75-196 chr7 103696568 103696888 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 10 of 64) L2b|LINE|L2 -250521 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 144-104 chr5 99387695 99388036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -146125 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 206.75-3 chr1 44039191 44039621 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7944 NM_001328630 6536 Hs.442590 NM_006934 ENSG00000196517 SLC6A9 GCENSG|GLYT1 solute carrier family 6 member 9 protein-coding 120.5-46 chr11 107146203 107146411 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -127831 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 168.25-32 chr12 41403251 41403551 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -34338 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 310.5-24 chr3 35046886 35047401 + 0.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 346880 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 127.75-150 chr4 125950740 125950991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 443606 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 129.75-150 chr5 68576751 68577001 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 284299 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 160.75-161 chrX 9800994 9801308 + 0.75 NA intron (NM_001649, intron 1 of 9) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 14722 NM_001649 357 Hs.567236 NM_001649 ENSG00000146950 SHROOM2 APXL|HSAPXL shroom family member 2 protein-coding 114.25-76 chr17 67077318 67077676 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014877, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_014877, exon 33 of 33) 32943 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 232.5-65 chr22 41003968 41004433 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 52822 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 148-105 chr5 91275888 91276117 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 38400 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 259.75-30 chr20 35376187 35376645 + 0.75 NA intron (NM_001184977, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 35557 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 162.5-189 chr9 28041693 28042047 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -468004 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 179.25-131 chr6 129813825 129814282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47262 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 139-88 chr21 28587278 28587651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48146 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 185.75-22 chr11 18711331 18711665 + 0.75 NA intron (NR_160413, intron 14 of 20) AluSx1|SINE|Alu 12719 NM_153347 144110 Hs.502100 NM_153347 ENSG00000151117 TMEM86A - transmembrane protein 86A protein-coding 246.75-36 chr2 160827278 160827706 + 0.75 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -309463 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 197.5-53 chr16 88724754 88725099 + 0.75 NA intron (NM_001142864, intron 30 of 50) intron (NM_001142864, intron 30 of 50) -6254 NR_103774 100289580 Hs.437712 NM_207451 LOC100289580 - uncharacterized LOC100289580 ncRNA 119.5-240 chr8 119718418 119718673 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -45155 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 128.5-151 chr3 102671028 102671329 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 236163 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 112.5-218 chr7 7718794 7718955 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_002947) promoter-TSS (NM_002947) -267 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 134.5-170 chr5 41877750 41878097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7498 NR_157114 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 209-57 chr5 14875586 14876067 + 0.75 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X -4048 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 156.5-172 chr7 40437590 40437944 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 302791 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 114-167 chr9 35014717 35014974 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 24555 NM_001135005 25822 Hs.237506 NM_012266 ENSG00000137094 DNAJB5 Hsc40 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B5 protein-coding 117-88 chr2 58671610 58671836 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) L1MEd|LINE|L1 150970 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 206.25-74 chr4 44636607 44637059 + 0.75 NA intron (NM_182592, intron 2 of 5) L1PB4|LINE|L1 14808 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 169-57 chr21 25022867 25023287 + 0.75 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) MER50|LTR|ERV1 182527 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 118.25-18 chr1 171459894 171460163 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -25502 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 188.75-71 chr21 27712999 27713442 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9159 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 135.75-202 chr8 118454313 118454621 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 -166534 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 123.25-132 chr3 95008018 95008233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69862 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 134.25-187 chr8 80303331 80303537 + 0.75 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 62045 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 226.75-16 chr13 45691000 45691451 + 0.75 NA intron (NR_125786, intron 1 of 3) intron (NR_125786, intron 1 of 3) 9959 NR_125786 103752581 NR_125786 LINC01055 - long intergenic non-protein coding RNA 1055 ncRNA 112.5-220 chr7 53276701 53276939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 241187 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 130.25-116 chr2 228173432 228173797 + 0.75 NA intron (NM_030623, intron 1 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 8031 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 219.5-11 chr1 221215221 221215581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 120895 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 144.75-54 chr14 21743566 21743948 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -72740 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 160.25-5 chr1 75233281 75233514 + 0.75 NA intron (NM_001320283, intron 10 of 21) L1PB4|LINE|L1 99009 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 214.5-15 chr10 96538739 96539174 + 0.75 NA intron (NM_020123, intron 9 of 14) L1ME1|LINE|L1 -25030 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 144.5-24 chr10 6953808 6954074 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 174343 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 131-138 chr5 128357128 128357469 + 0.75 NA exon (NM_001999, exon 20 of 65) exon (NM_001999, exon 20 of 65) 180947 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 142.25-15 chr10 13578905 13579178 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -7924 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 136.5-131 chr20 22676621 22676830 + 0.75 NA intron (NR_146527, intron 2 of 2) intron (NR_146527, intron 2 of 2) 8619 NR_146527 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 157-35 chr15 73698420 73698737 + 0.75 NA intron (NM_001329628, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 13808 NM_001329628 80381 Hs.744915 NM_025240 ENSG00000103855 CD276 4Ig-B7-H3|B7-H3|B7H3|B7RP-2 CD276 molecule protein-coding 117.75-133 chr3 45176406 45176591 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30076 NM_178181 64866 Hs.476093 NM_022842 ENSG00000163814 CDCP1 CD318|SIMA135|TRASK CUB domain containing protein 1 protein-coding 223.5-70 chr20 52808769 52809307 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -163320 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 119.5-181 chr5 77784027 77784290 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -7797 NM_004607 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 119.75-211 chr9 129517071 129517277 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 28514 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 133.5-98 chr17 50655629 50655947 + 0.75 NA intron (NM_003786, intron 1 of 30) intron (NM_003786, intron 1 of 30) 20907 NM_003786 8714 Hs.463421 NM_003786 ENSG00000108846 ABCC3 ABC31|EST90757|MLP2|MOAT-D|MRP3|cMOAT2 ATP binding cassette subfamily C member 3 protein-coding 127.75-189 chr7 51032356 51032620 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 8 of 12) intron (NM_015198, intron 8 of 12) -239035 NM_001371008 171.75-48 chr15 26953512 26953823 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -17514 NM_033223 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 156.75-47 chr13 23828597 23828844 + 0.75 NA intron (NM_005932, intron 14 of 18) L1ME3F|LINE|L1 -60148 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 149.5-180 chr6 170121452 170121764 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -39034 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 133.75-31 chr11 44876451 44876661 + 0.75 NA intron (NM_130783, intron 3 of 9) L2c|LINE|L2 73604 NM_001258320 9537 Hs.554791 NM_006034 ENSG00000175274 TP53I11 PIG11 tumor protein p53 inducible protein 11 protein-coding 203.25-65 chr3 2735620 2736111 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -156350 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 159.5-78 chr17 58040639 58041085 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -33516 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 175.5-39 chr12 33039048 33039509 + 0.75 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -142432 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 125.25-7 chr1 79092652 79092840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86016 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 234-58 chr6 48097854 48098278 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29377 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 182.5-164 chr8 90895440 90895744 + 0.75 NA intron (NM_022351, intron 5 of 12) intron (NM_022351, intron 5 of 12) 89485 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 141.75-170 chr8 118261307 118261672 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -149670 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 132.5-20 chr1 177298045 177298416 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -53356 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 163.75-32 chr12 6692550 6692896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3151 NM_001039920 171017 Hs.103315 NM_133476 ENSG00000126746 ZNF384 CAGH1|CAGH1A|CIZ|ERDA2|NMP4|NP|TNRC1 zinc finger protein 384 protein-coding 175-62 chr2 29463063 29463405 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) 12143 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 149.75-109 chr3 28805193 28805586 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 230111 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 232.75-37 chr21 28361896 28362245 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -133403 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 114.75-174 chr7 45206599 45206787 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 48902 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 184.5-13 chr1 160972461 160972948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17895 NM_080878 142683 Hs.385631 NM_080878 ENSG00000158764 ITLN2 HL-2|HL2 intelectin 2 protein-coding 150.5-117 chr20 47413729 47413991 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1716 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 164.75-93 chr22 27922119 27922660 + 0.75 NA intron (NR_026962, intron 2 of 2) intron (NR_026962, intron 2 of 2) -1777 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 198.5-4 chr1 88464478 88464891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -219460 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 144-43 chr15 78467756 78468124 + 0.75 NA intron (NM_001320941, intron 5 of 20) AluJr|SINE|Alu 29519 NM_001320942 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 138.25-147 chr6 37947533 37947889 + 0.75 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) HAL1|LINE|L1 127984 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 187.25-102 chr8 27745643 27745940 + 0.75 NA intron (NM_001304529, intron 5 of 6) intron (NM_001304529, intron 5 of 6) 26849 NR_156432 55246 Hs.445512 NM_018246 ENSG00000147419 CCDC25 - coiled-coil domain containing 25 protein-coding 197.25-36 chr17 70666734 70667253 + 0.75 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 497458 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 145.25-166 chr7 118564413 118564711 + 0.75 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 339858 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 247.25-50 chr5 90791187 90791581 + 0.75 NA intron (NR_003149, intron 70 of 89) intron (NR_003149, intron 70 of 89) 232587 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 251.75-24 chr14 56558734 56559399 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20732 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 201-49 chr20 63112190 63112551 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10051 NR_003245 768097 Hs.635159 NR_003245 ENSG00000231133 HAR1B HAR1R|LINC00065|NCRNA00065 highly accelerated region 1B ncRNA 126-25 chr10 85195430 85195674 + 0.75 NA intron (NR_120668, intron 3 of 3) intron (NR_120668, intron 3 of 3) 3353 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 151.25-146 chr4 174455039 174455389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31419 NR_036236 100423042 NR_036236 ENSG00000265846 MIR4276 - microRNA 4276 ncRNA 171.5-54 chr16 64142274 64142559 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 979647 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 176.75-2 chr1 45540868 45541241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9729 NM_001202413 10327 Hs.474584 NM_006066 ENSG00000117448 AKR1A1 ALDR1|ALR|ARM|DD3|HEL-S-6 aldo-keto reductase family 1 member A1 protein-coding 181-69 chr3 20843689 20844054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 501403 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 143.25-4 chr1 57487192 57487552 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -62451 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 128.5-10 chr1 63090622 63090815 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -78247 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 144.75-159 chr7 54609346 54609656 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 52531 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 135-153 chr6 39006317 39006661 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 87 of 91) L1MB7|LINE|L1 -42292 NR_136562 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 118-37 chr13 38157828 38158017 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -14690 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 119.5-63 chr12 46887279 46887496 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61390 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 119.25-185 chr7 16090350 16090540 + 0.75 NA non-coding (NR_160656, exon 8 of 8) non-coding (NR_160656, exon 8 of 8) -120041 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 127-172 chr8 53286331 53286630 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -34783 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 198.25-6 chr1 191653208 191653608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -424910 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 143.5-176 chr5 127553667 127554086 + 0.75 NA exon (NM_001286808, exon 10 of 10) exon (NM_001286808, exon 10 of 10) 36236 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 167-9 chr1 117163451 117163772 + 0.75 NA intron (NR_045603, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 40225 NM_001253849 79679 Hs.546434 NM_024626 ENSG00000134258 VTCN1 B7-H4|B7H4|B7S1|B7X|B7h.5|PRO1291|VCTN1 V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 protein-coding 194.25-31 chr14 70605686 70606283 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -5294 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 125-138 chr6 71726551 71726744 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -160056 NM_001350412 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 124.25-195 chr8 15820807 15821040 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 280660 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 149-47 chr19 43828714 43828950 + 0.75 NA intron (NM_001297752, intron 3 of 5) intron (NM_001297752, intron 3 of 5) 1511 NM_181845 284349 Hs.652513 NM_181845 ENSG00000167637 ZNF283 HZF19|HZF41 zinc finger protein 283 protein-coding 140.5-44 chr12 2505367 2505648 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 8 of 49).2 intron (NM_199460, intron 8 of 49).2 166713 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 125-42 chr14 101145760 101145968 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 25008 NR_146490 101929422 NR_146490 ENSG00000259004 LINC02285 - long intergenic non-protein coding RNA 2285 ncRNA 144.25-110 chr2 227006604 227007105 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000092, exon 48 of 48) 3' UTR (NM_000092, exon 48 of 48) 157705 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 266.75-15 chr18 12963011 12963391 + 0.75 NA exon (NM_001013437, exon 4 of 9) exon (NM_001013437, exon 4 of 9) 15190 NM_001013437 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 165.25-111 chr4 136150998 136151277 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -237457 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 249.25-45 chr6 13517895 13518473 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30547 NM_001242629 54438 Hs.484686 NM_018988 ENSG00000145990 GFOD1 ADG-90|C6orf114 glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 181.25-118 chr6 146387777 146388227 + 0.75 NA intron (NM_001278065, intron 7 of 9) intron (NM_001278065, intron 7 of 9) -155831 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 146.75-90 chr20 54058119 54058473 + 0.75 NA intron (NM_001366297, intron 2 of 8) intron (NM_001366297, intron 2 of 8) 724 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 142-134 chr5 138169135 138169393 + 0.75 NA exon (NM_001300962, exon 7 of 20) exon (NM_001300962, exon 7 of 20) 9366 NM_001300961 10902 Hs.519337 NM_006696 ENSG00000112983 BRD8 SMAP|SMAP2|p120 bromodomain containing 8 protein-coding 151.75-129 chr6 120350918 120351190 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 335875 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 131.75-146 chr4 31321624 31321843 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 150589 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 171.5-52 chr15 92334067 92334428 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59634 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 193.75-131 chrX 119602616 119603032 + 0.75 NA intron (NM_017544, intron 1 of 2) intron (NM_017544, intron 1 of 2) 3057 NM_017544 55922 Hs.437084 NM_017544 ENSG00000186416 NKRF ITBA4|NRF NFKB repressing factor protein-coding 129.25-29 chr11 27998071 27998309 + 0.75 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -58625 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 166.75-112 chr5 43497371 43497783 + 0.75 NA intron (NM_198566, intron 6 of 12) MIRb|SINE|MIR -13712 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 209.5-87 chr21 34567012 34567456 + 0.75 NA intron (NM_004414, intron 1 of 3) AluSc8|SINE|Alu -40224 NM_001331016 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 187.75-85 chr5 39655421 39655738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 135148 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 151.5-82 chr2 68777277 68777519 + 0.75 NA intron (NM_001007231, intron 2 of 10) MIRc|SINE|MIR 2488 NM_001166276 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 126.25-102 chr20 59441495 59441693 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -135915 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 117-16 chr10 68314503 68314820 + 0.75 NA intron (NM_001033083, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu -17032 NM_001322438 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 176.5-25 chr10 114637134 114637426 + 0.75 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) -4883 NM_001352441 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 161.25-166 chr7 116211824 116212085 + 0.75 NA intron (NM_015641, intron 1 of 6) intron (NM_015641, intron 1 of 6) 1415 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 179.75-39 chr14 59051903 59052161 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -136635 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 123.5-139 chr3 106748945 106749205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 491563 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 134.5-165 chr5 4389429 4389818 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -383858 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 216.5-114 chr8 51124812 51125141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 684469 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 164.5-159 chr5 25304399 25304792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113642 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 136-16 chr10 64408250 64408620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -417093 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 127.5-24 chr10 2276374 2276598 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 38588 NR_038884 399708 Hs.521270 NR_038884 LINC00701 - long intergenic non-protein coding RNA 701 ncRNA 131.75-71 chr14 77165426 77165752 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -16209 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 122-153 chr6 12102688 12103020 + 0.75 NA intron (NM_002114, intron 3 of 8) intron (NM_002114, intron 3 of 8) 90542 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 141-28 chr10 99721476 99721741 + 0.75 NA intron (NM_004376, intron 5 of 8) intron (NM_004376, intron 5 of 8) -10626 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 232-32 chr2 37171954 37172435 + 0.75 NA intron (NM_001367551, intron 5 of 6) AluJb|SINE|Alu -15147 NM_002759 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 202.25-15 chr10 95057938 95058342 + 0.75 NA intron (NM_001198855, intron 6 of 9) intron (NM_001198855, intron 6 of 9) 11357 NM_001198854 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 120.25-225 chr9 96224978 96225202 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -21373 NR_146524 105376162 Hs.662614 NR_146524 ENSG00000232283 HSD17B3-AS1 - HSD17B3 antisense RNA 1 ncRNA 165-67 chr2 72817506 72817769 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 8396 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 148.25-78 chr2 226134471 226134822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8148 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 130.25-106 chr2 173360123 173360433 + 0.75 NA intron (NM_031942, intron 3 of 9) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie 5406 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 183.25-35 chr14 63209927 63210315 + 0.75 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) AluSc|SINE|Alu 5678 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 125.25-221 chr9 124856172 124856420 + 0.75 NA exon (NM_001276374, exon 5 of 9) exon (NM_001276374, exon 5 of 9) 2836 NM_001276375 401551 Hs.343383 NM_001045476 ENSG00000136918 WDR38 - WD repeat domain 38 protein-coding 189.5-128 chr7 24747168 24747476 + 0.75 NA intron (NM_001127454, intron 1 of 8) intron (NM_001127454, intron 1 of 8) 10142 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 115-102 chr22 43364198 43364483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20968 NM_173050 80274 Hs.133995 NM_152514 ENSG00000159307 SCUBE1 - signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 1 protein-coding 136.5-85 chr16 4068933 4069258 + 0.75 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) L1ME4b|LINE|L1 47347 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 113.25-84 chr2 43622595 43622784 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -14571 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 160.5-130 chr3 193279491 193279739 + 0.75 NA intron (NM_198505, intron 27 of 29) intron (NM_198505, intron 27 of 29) -27629 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 157.75-101 chr21 27165851 27166209 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -198942 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 146.75-120 chr5 24264713 24264933 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313475 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 151.25-187 chr8 63389899 63390191 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -75804 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 187-102 chr8 124867121 124867427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45216 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 120-120 chr3 106297014 106297228 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -427720 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 136-8 chr1 165013456 165013824 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -238999 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 159.25-12 chr1 245126799 245127289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27941 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 136.25-138 chr5 3072046 3072332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105646 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 127.25-87 chr2 56390324 56390545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204664 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 137-51 chr14 88891119 88891384 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66600 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 117.5-27 chr10 12141316 12141560 + 0.75 NA intron (NM_001142627, intron 3 of 11) intron (NM_001142627, intron 3 of 11) -10622 NR_039699 100616488 NR_039699 ENSG00000265653 MIR548AK - microRNA 548ak ncRNA 143.25-128 chr3 175963784 175963988 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -187553 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 168.25-146 chr8 138459090 138459373 + 0.75 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 38030 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 195.75-8 chr1 74287485 74287847 + 0.75 NA intron (NM_015978, intron 5 of 24) L1MA9|LINE|L1 52279 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 123.25-82 chr17 78662411 78662633 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -30465 NR_110848 101928710 Hs.464224 NR_110848 ENSG00000267123 SCAT1 LINC02081|XLOC_012582 S-phase cancer associated transcript 1 ncRNA 178.25-7 chr1 125164068 125164497 + 0.75 NA Intergenic (GATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3645170 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 157-65 chr2 195308226 195308566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -348562 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 237.5-60 chr3 4247017 4247602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55995 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 155.5-181 chr6 50251502 50251733 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -201688 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 171.75-83 chr2 168360722 168361152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95335 NM_001256126 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 128-6 chr1 97610139 97610344 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -186680 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 169.25-78 chr3 169815652 169815919 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -2881 NM_001172780 151827 Hs.591289 NM_153353 ENSG00000171757 LRRC34 - leucine rich repeat containing 34 protein-coding 164-90 chr4 73237950 73238271 + 0.75 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) -15053 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 116.5-59 chr13 97086810 97087083 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -92216 NM_001346195 27199 Hs.352218 NM_080818 ENSG00000165621 OXGR1 GPR80|GPR99|P2RY15|P2Y15|aKGR oxoglutarate receptor 1 protein-coding 146.25-55 chr17 60731487 60731779 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) intron (NM_001330413, intron 5 of 25) 53782 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 122-164 chr7 10098879 10099104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 464721 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 198-57 chr4 87386563 87387188 + 0.75 NA intron (NM_016245, intron 1 of 6) intron (NM_016245, intron 1 of 6) 4313 NM_016245 51170 Hs.594923 NM_016245 ENSG00000198189 HSD17B11 17-BETA-HSD11|17-BETA-HSDXI|17BHSD11|DHRS8|PAN1B|RETSDR2|SDR16C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11 protein-coding 157.25-38 chr14 29584886 29585157 + 0.75 NA intron (NM_001330069, intron 17 of 18) intron (NM_001330069, intron 17 of 18) 342075 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 135.75-204 chr8 132229743 132230008 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) -124610 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 121.75-191 chr8 103280630 103280905 + 0.75 NA intron (NR_148213, intron 2 of 3) intron (NR_148213, intron 2 of 3) -17727 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 124.75-208 chr8 132880804 132881035 + 0.75 NA intron (NM_003235, intron 5 of 47) L1ME4a|LINE|L1 13961 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 230.75-61 chr5 112699782 112700129 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -7543 NM_001354897 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 150.5-204 chr7 31384171 31384513 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43616 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 163.5-157 chr5 43775294 43775646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172240 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 142.75-169 chr6 97814800 97815039 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -209612 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 208.75-79 chr7 105974606 105975082 + 0.75 NA exon (NM_152750, exon 2 of 19) exon (NM_152750, exon 2 of 19) 11580 NM_001301161 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 143-152 chr8 140411654 140411890 + 0.75 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) L1MC4|LINE|L1 45972 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 150-104 chr4 48861948 48862211 + 0.75 NA TTS (NM_017830) TTS (NM_017830) -1876 NR_146806 100861517 Hs.661065 NR_146806 ENSG00000248256 OCIAD1-AS1 - OCIAD1 antisense RNA 1 ncRNA 150-84 chr20 50225553 50225928 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33671 NR_125739 101927559 Hs.442486 NR_125739 ENSG00000277449 CEBPB-AS1 - CEBPB antisense RNA 1 ncRNA 169.75-151 chr8 83475960 83476272 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 72358 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 179.5-7 chr1 94221933 94222177 + 0.75 NA intron (NM_001328665, intron 1 of 21) L1MC3|LINE|L1 15529 NM_004815 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 174.5-189 chr8 116783018 116783336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16653 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 129.25-119 chr22 45685832 45686075 + 0.75 NA intron (NM_001167621, intron 1 of 10) intron (NM_001167621, intron 1 of 10) 14119 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 166.75-71 chr19 20108433 20108689 + 0.75 NA intron (NM_007138, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 30561 NM_007138 7643 Hs.55304 NM_007138 ENSG00000213988 ZNF90 HTF9 zinc finger protein 90 protein-coding 125.5-161 chr22 28622056 28622424 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEa|LINE|L1 57625 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 140-56 chr17 13985046 13985360 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39295 NR_003261 94158 Hs.633073 NR_003261 CDRT15P1 CDRT15P CMT1A duplicated region transcript 15 pseudogene 1 pseudo 131.5-182 chr4 105169773 105170082 + 0.75 NA intron (NM_001127208, intron 1 of 10) L1PB1|LINE|L1 23242 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 123-109 chr2 157048817 157049036 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -208779 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 175.25-68 chr2 76638910 76639247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -346887 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 146.5-71 chr15 57071038 57071379 + 0.75 NA intron (NM_207038, intron 4 of 19) AluJo|SINE|Alu -148222 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 162.5-184 chr8 126234561 126234949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90740 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 133-117 chr4 29655576 29655815 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 441403 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 173.75-150 chr8 115883727 115883988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -214882 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 202-52 chr5 75986496 75987006 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -96632 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 141.5-82 chr18 49329552 49329901 + 0.75 NA intron (NM_001353214, intron 8 of 17) intron (NM_001353214, intron 8 of 17) 130919 NM_001353210 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 130-21 chr10 128084449 128084794 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001323355, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001323355, exon 20 of 20) -22196 NR_136150 105378553 NR_136149 AS-PTPRE - lncRNA antisense to PTPRE protein-coding gene ncRNA 140.25-41 chr12 115666152 115666393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 482382 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 148.75-63 chr15 96713949 96714352 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 67504 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 133.25-162 chr5 7277934 7278300 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8763 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 130-168 chr8 103979450 103979834 + 0.75 NA intron (NR_145711, intron 13 of 21) L1MA2|LINE|L1 160422 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 199.75-22 chr12 130830878 130831340 + 0.75 NA intron (NM_001351051, intron 1 of 10) intron (NM_001351051, intron 1 of 10) 8141 NM_001351052 2054 Hs.437585 NM_001980 ENSG00000111450 STX2 EPIM|EPM|STX2A|STX2B|STX2C syntaxin 2 protein-coding 116.75-142 chr4 30847169 30847366 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 126898 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 200.25-94 chr6 67877145 67877545 + 0.75 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -178006 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 180.25-34 chr16 64579412 64579789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 542463 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 120.5-206 chr6 147648868 147649089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140288 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 113.5-161 chr3 115475701 115475928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -147696 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 127.75-165 chr5 158903388 158903732 + 0.75 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 194396 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 174.5-24 chr10 86022030 86022356 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 242595 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 214.25-63 chr5 26056927 26057249 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 866135 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 170.75-97 chr4 61787458 61787948 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) intron (NM_001371343, intron 8 of 23) 374062 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 166.75-75 chr2 47316091 47316356 + 0.75 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -19092 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 127-119 chr3 115829953 115830151 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 7 of 8) intron (NM_001318915, intron 7 of 8) 75074 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 170.5-82 chr19 45276835 45277382 + 0.75 NA intron (NM_001199867, intron 8 of 16) AluSx1|SINE|Alu 25837 NM_031417 57787 Hs.34314 NM_031417 ENSG00000007047 MARK4 MARK4L|MARK4S|MARKL1|MARKL1L|PAR-1D microtubule affinity regulating kinase 4 protein-coding 151.5-145 chr4 130101764 130102104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -274427 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 191.25-29 chr14 20579745 20580164 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8270 NR_122043 254028 Hs.652569 NR_122043 ENSG00000258573 LOC254028 - uncharacterized LOC254028 ncRNA 267-50 chr7 85997468 85998109 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 576666 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 127.5-261 chrX 38346132 38346393 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6342 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 215-67 chr6 130456425 130456751 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 19471 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 153.25-60 chr19 13081368 13081611 + 0.75 NA intron (NM_001365984, intron 6 of 9) MER96B|DNA|hAT-Tip100 21369 NM_005583 4066 Hs.46446 NM_005583 ENSG00000104903 LYL1 bHLHa18 LYL1 basic helix-loop-helix family member protein-coding 227.5-61 chr20 42852932 42853427 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) -115564 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 118.5-13 chr1 196426722 196427027 + 0.75 NA intron (NM_001287820, intron 10 of 26) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 155607 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 195.5-23 chr11 74661349 74661696 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 49845 NM_001304417 25884 Hs.432379 NM_015424 ENSG00000054938 CHRDL2 BNF1|CHL2 chordin like 2 protein-coding 178.5-50 chr15 26634052 26634372 + 0.75 NA intron (NM_000814, intron 3 of 8) L2|LINE|L2 -5122 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 156.25-148 chr8 83334785 83334997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68867 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 149.75-48 chr14 86954542 86954862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48924 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 215.75-70 chr4 84279437 84279983 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 19459 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 170-59 chr3 57446474 57446727 + 0.75 NA exon (NM_001366028, exon 26 of 74) exon (NM_001366028, exon 26 of 74) 97744 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 264-62 chr8 113373219 113373882 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3602 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 156.25-135 chr6 128818209 128818518 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -64775 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 218.5-40 chr14 67766831 67767291 + 0.75 NA intron (NM_015346, intron 31 of 41) intron (NM_015346, intron 31 of 41) 49529 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 185-53 chr22 46836720 46837063 + 0.75 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) AluJr4|SINE|Alu 62964 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 172.25-10 chr1 195428364 195428675 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 660196 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 178-32 chr15 65596621 65597102 + 0.75 NA intron (NR_045106, intron 6 of 11) AluSp|SINE|Alu 14270 NR_045901 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 126-53 chr14 60272113 60272321 + 0.75 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 22996 NM_021003 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 188.25-79 chr4 19102948 19103223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1081210 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 216-36 chr2 6357215 6357684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17973 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 218.75-32 chr2 31193648 31194240 + 0.75 NA intron (NM_001145122, intron 9 of 21) intron (NM_001145122, intron 9 of 21) 23571 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 144.5-104 chr2 79154906 79155175 + 0.75 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 4713 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 286.25-17 chr2 163319190 163319675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 416576 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 163.75-12 chr1 177682750 177683271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17514 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 268.25-40 chr5 57556030 57556603 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14026 NR_120607 100996645 Hs.582496 NR_120607 LINCR-0003 - uncharacterized LincR-0003 ncRNA 134-159 chr7 7190129 7190447 + 0.75 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) LTR65|LTR|ERV1 7673 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 184-15 chr11 46228029 46228514 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49391 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 141.25-191 chr9 80362510 80362792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 387628 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 130-54 chr17 34998830 34999096 + 0.75 NA intron (NM_013975, intron 14 of 19) intron (NM_013975, intron 14 of 19) 18451 NM_013975 3980 Hs.100299 NM_002311 ENSG00000005156 LIG3 LIG2|LIG3alpha DNA ligase 3 protein-coding 132.25-109 chr2 218194621 218195023 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22367 NM_152862 10109 Hs.529303 NM_005731 ENSG00000163466 ARPC2 ARC34|PNAS-139|PRO2446|p34-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 2 protein-coding 126-70 chr16 76291042 76291267 + 0.75 NA intron (NR_136213, intron 1 of 23) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 13753 NM_033401 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 130.5-106 chr16 51587390 51587647 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -175001 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 221-56 chr4 49103952 49104573 + 0.75 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 117620 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 204.75-28 chr11 110942367 110942781 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 154744 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 246.5 chr1 75773944 75774439 + 0.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -12003 NR_073562 5876 Hs.78948 NM_004582 ENSG00000137955 RABGGTB GGTB Rab geranylgeranyltransferase subunit beta protein-coding 251.25-31 chr2 149076640 149077213 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001317004) promoter-TSS (NM_001317004) -596 NM_001317004 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 141-104 chr3 94263111 94263391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 200190 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 162.5-96 chr2 227312638 227313045 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000091, exon 52 of 52) 3' UTR (NM_000091, exon 52 of 52) 12323 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 148.25-80 chr20 11544145 11544395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -270887 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 146-72 chr2 170225247 170225487 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 6 of 33) MIR|SINE|MIR 47220 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 157.25-161 chr9 99119942 99120322 + 0.75 NA intron (NM_004612, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 15019 NM_004612 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 156.5-42 chr12 63060169 63060397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92527 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 128.5-104 chr2 40646783 40647060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -134486 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 149.25-129 chr4 76135095 76135368 + 0.75 NA intron (NR_103780, intron 3 of 10) intron (NR_103780, intron 3 of 10) 13166 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 147-114 chr5 129667599 129667856 + 0.75 NA intron (NM_133638, intron 16 of 22) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -80367 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 139.5-176 chr5 45936372 45936640 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -240126 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 114.75-100 chr2 169024522 169024878 + 0.75 NA intron (NM_003742, intron 1 of 27) L1MC3|LINE|L1 6624 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 254-30 chr22 22083582 22084067 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39890 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 251.75-83 chrX 140195531 140196077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104137 NM_001271560 389895 Hs.127679 NM_001271560 LOC389895 - chromosome 16 open reading frame 72-like protein-coding 241.5-96 chr8 82071260 82071770 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -229229 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 156.5-67 chr18 50591753 50591994 + 0.75 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) intron (NM_001292039, intron 1 of 4) 31786 NM_001292040 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 363-25 chr8 89001968 89002812 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -674907 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 219-38 chr15 61886658 61887076 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 67 of 81) L1MC2|LINE|L1 156949 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 114.75-80 chr19 32656094 32656460 + 0.75 NA intron (NM_032139, intron 2 of 28) intron (NM_032139, intron 2 of 28) 18903 NM_032139 84079 Hs.59236 NM_032139 ENSG00000105186 ANKRD27 PP12899|VARP ankyrin repeat domain 27 protein-coding 148.75-65 chr16 12540773 12541199 + 0.75 NA intron (NM_032167, intron 20 of 20) L1MD3|LINE|L1 -179335 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 170-63 chr3 110320152 110320569 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 717532 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 125.75-141 chr4 113823572 113823864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61791 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 271.25-25 chr17 29524463 29524994 + 0.75 NA intron (NM_020791, intron 17 of 19) intron (NM_020791, intron 17 of 19) 42309 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 172.25-2 chr1 68187484 68187847 + 0.75 NA intron (NM_001193334, intron 1 of 10) intron (NM_001193334, intron 1 of 10) -4055 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 135.25-129 chr3 72465543 72465825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19061 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 151.75-121 chr5 157395070 157395500 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001291721, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001291721, exon 30 of 30) -49608 NM_001001343 408263 Hs.437066 NM_001001343 ENSG00000172568 FNDC9 C5orf40 fibronectin type III domain containing 9 protein-coding 141.25-29 chr11 20867689 20867957 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 4 of 18) intron (NM_201551, intron 4 of 18) 198237 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 145.75-85 chr2 145353468 145353709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 685621 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 131.25-13 chr1 177558072 177558348 + 0.75 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -142314 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 237.75-46 chr2 210897163 210897650 + 0.75 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 279835 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 243.75-76 chr7 105564586 105565162 + 0.75 NA TTS (NM_001355530) TTS (NM_001355530) 16619 NM_001355530 100130771 Hs.719432 NM_001355526 ENSG00000185055 EFCAB10 - EF-hand calcium binding domain 10 protein-coding 120.75-43 chr14 69899729 69899986 + 0.75 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) L1MCa|LINE|L1 20441 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 222.75-79 chr6 5597369 5597805 + 0.75 NA intron (NM_006567, intron 5 of 6) intron (NM_006567, intron 5 of 6) 97685 NR_110842 101927950 Hs.571136 NR_110842 ENSG00000270174 LOC101927950 - uncharacterized LOC101927950 ncRNA 155.25-113 chr22 31359512 31359796 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 12895 NR_120386 54944 Hs.648259 NM_017834 LINC01521 - long intergenic non-protein coding RNA 1521 ncRNA 218.25-53 chr3 45478471 45479074 + 0.75 NA intron (NM_001368263, intron 9 of 20) intron (NM_001368263, intron 9 of 20) 30773 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-145 chr3 97445472 97445910 + 0.75 NA intron (NM_001278300, intron 2 of 12) L1M5|LINE|L1 6084 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 182.5-168 chr8 131896074 131896558 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7777 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 119.25-27 chr10 90142594 90142927 + 0.75 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 -185387 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 186.75-43 chr18 77395923 77396432 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146329 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 141.5-162 chr4 85919928 85920230 + 0.75 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) -9937 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 121.25-97 chr2 145987207 145987395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -599756 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 129.25-115 chr21 34154566 34154873 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -25958 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 294.75-20 chr20 53344356 53344891 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 159340 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 175.75-36 chr14 37933360 37933663 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31387 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 178-19 chr12 60251056 60251297 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 561806 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 152.75-131 chr5 68528277 68528577 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 235850 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 251.5-52 chr3 20915237 20915741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -490237 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 155.25-54 chr13 95014076 95014533 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 54263 NR_047487 100861544 Hs.48706 NR_047487 ENSG00000260962 LINC00557 - long intergenic non-protein coding RNA 557 ncRNA 123.25-205 chr8 105566951 105567178 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 247521 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 144-68 chr2 235535800 235536027 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -17992 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 178.5-194 chrX 74171368 74171789 + 0.75 NA intron (NR_028379, intron 5 of 6) L1M3de|LINE|L1 46883 NR_030398 693122 NR_030398 ENSG00000202566 MIR421 MIRN421|hsa-mir-421 microRNA 421 ncRNA 195.5-74 chr2 105537402 105537782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72967 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 138.5-45 chr12 81751630 81751875 + 0.75 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) intron (NM_003625, intron 3 of 32) 6755 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 175.75-50 chr16 80212684 80213019 + 0.75 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -327883 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 124.5-221 chr8 80845201 80845427 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 29154 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 224.25-14 chr10 53054217 53054681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -282749 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 131.75-62 chr14 42960630 42960870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1353894 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 205.5-44 chr15 33727689 33728085 + 0.75 NA intron (NM_001243996, intron 46 of 102) intron (NM_001243996, intron 46 of 102) -240610 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 251-9 chr1 224093086 224093528 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -20804 NM_001136115 23219 Hs.64691 NM_015176 ENSG00000143756 FBXO28 CENP-30|Fbx28 F-box protein 28 protein-coding 138.5-113 chr20 19026392 19026735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -186079 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 150.75-72 chr16 9556773 9557157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101460 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 131-165 chr8 26793312 26793606 + 0.75 NA intron (NM_001322504, intron 1 of 1) intron (NM_001322504, intron 1 of 1) 72196 NM_033303 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 129-22 chr10 59648105 59648315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61681 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 180.5-158 chr8 124695172 124695553 + 0.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 33111 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 175.75-43 chr15 65844959 65845374 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -24325 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 156-19 chr10 67048564 67048910 + 0.75 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) intron (NR_111909, intron 2 of 2) 36471 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 176.25-76 chr2 188248277 188248550 + 0.75 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 39278 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 209-35 chr18 43652515 43653027 + 0.75 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -375281 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 251.25-8 chr10 68044279 68044944 + 0.75 NA intron (NM_001278185, intron 3 of 23) intron (NM_001278185, intron 3 of 23) 30672 NM_001278186 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 166.25-96 chr21 42842640 42843045 + 0.75 NA TTS (NM_033661) TTS (NM_033661) 36433 NM_001260477 10785 Hs.248815 NM_018669 ENSG00000160193 WDR4 GAMOS6|MIGSB|TRM82|TRMT82 WD repeat domain 4 protein-coding 112.5-14 chr1 189907412 189907664 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 568472 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 149.25-143 chr5 92916522 92916858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 654653 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 121-95 chr19 56438794 56439062 + 0.75 NA TTS (NM_001321356) TTS (NM_001321356) 34596 NM_152478 147949 Hs.146854 NM_152478 ENSG00000198440 ZNF583 - zinc finger protein 583 protein-coding 142.25-6 chr1 161793461 161793711 + 0.75 NA intron (NM_007348, intron 6 of 15) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 27266 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 172-70 chr3 2779142 2779607 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) AluJb|SINE|Alu -112841 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 285.5-49 chr5 160677480 160677915 + 0.75 NA intron (NM_001366652, intron 5 of 24) MIRb|SINE|MIR 7694 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 129.5-94 chr17 34733101 34733324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 152463 NM_001304438 124842 Hs.310482 NM_207313 ENSG00000181291 TMEM132E DFNB99 transmembrane protein 132E protein-coding 115.25-171 chr6 2695514 2695883 + 0.75 NA intron (NM_001012418, intron 2 of 12) intron (NM_001012418, intron 2 of 12) 55224 NM_001012418 340156 Hs.127830 NM_001012418 ENSG00000145949 MYLK4 SgK085 myosin light chain kinase family member 4 protein-coding 122.25-191 chr8 87119106 87119379 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1M2|LINE|L1 252827 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 135.75-193 chr8 62844475 62844798 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) intron (NM_001304533, intron 4 of 6) -133225 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 153.5-161 chr5 124698413 124698790 + 0.75 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) intron (NM_020747, intron 2 of 8) 46511 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 112.5-68 chr13 102333590 102333807 + 0.75 NA intron (NM_001321941, intron 1 of 5) intron (NM_001321941, intron 1 of 5) -15994 NM_001321935 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 284.5-15 chr14 58029181 58029857 + 0.75 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) AluSp|SINE|Alu 122694 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 136.75-29 chr10 62937175 62937396 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118118 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 190-52 chr4 94243508 94243827 + 0.75 NA intron (NM_001128429, intron 6 of 23) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -9642 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 242.25-51 chr2 149198212 149198768 + 0.75 NA intron (NM_001317002, intron 4 of 7) intron (NM_001317002, intron 4 of 7) 80316 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 147.25 chr1 43688912 43689234 + 0.75 NA exon (NM_014663, exon 13 of 22) exon (NM_014663, exon 13 of 22) 18268 NR_033827 100132774 Hs.655569 NR_033827 KDM4A-AS1 - KDM4A antisense RNA 1 ncRNA 173-134 chr7 51119308 51119655 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) intron (NM_015198, intron 6 of 12) 197328 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 153-136 chr7 3421751 3422010 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 120628 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 155.5-26 chr10 72459354 72459652 + 0.75 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) 64483 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 179.75-95 chr5 10796193 10796560 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -35142 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 259-5 chr1 180112055 180112629 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014810, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_014810, exon 38 of 38) -42491 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 157.75-111 chr3 118366872 118367370 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -274647 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 144.25-179 chr7 5621264 5621636 + 0.75 NA 3' UTR (NM_207116, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_207116, exon 17 of 17) 28634 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 138.5-67 chr15 63750341 63750639 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 8 of 77) intron (NM_003922, intron 8 of 77) 83458 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 135.75-213 chrX 38390123 38390408 + 0.75 NA intron (NM_000531, intron 4 of 9) intron (NM_000531, intron 4 of 9) 37661 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 166.5-209 chr9 13548422 13548754 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -117259 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 145.75-17 chr10 91834866 91835209 + 0.75 NA intron (NM_025235, intron 12 of 26) L1ME4c|LINE|L1 36611 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 134.25-101 chr21 15720525 15720754 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -9295 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 200-93 chr8 140368950 140369291 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 8 of 22) MER58A|DNA|hAT-Charlie 88624 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 291.25-28 chr6 162947646 162948133 + 0.75 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) L1MA4|LINE|L1 106272 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 228.75-11 chr11 38613224 38613593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32948 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 126-159 chr6 90345703 90345970 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 33094 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 156.25-58 chr18 73403707 73403981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78903 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 168-66 chr2 63104136 63104486 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 15231 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 142.25-35 chr12 351426 351774 + 0.75 NA intron (NM_001042603, intron 9 of 27) intron (NM_001042603, intron 9 of 27) 37720 NM_001042603 5927 Hs.76272 NM_005056 ENSG00000073614 KDM5A RBBP-2|RBBP2|RBP2 lysine demethylase 5A protein-coding 114.75-140 chr4 81140719 81140936 + 0.75 NA intron (NM_001282485, intron 11 of 18) intron (NM_001282485, intron 11 of 18) 13330 NM_001282482 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 193.25-114 chr8 18840573 18840901 + 0.75 NA intron (NM_015310, intron 4 of 15) intron (NM_015310, intron 4 of 15) -31870 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 179.5-133 chr4 47947968 47948291 + 0.75 NA intron (NM_000087, intron 6 of 10) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 33404 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 164.25-30 chr12 49851191 49851651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8315 NM_181708 144233 Hs.142736 NM_181708 ENSG00000186666 BCDIN3D - BCDIN3 domain containing RNA methyltransferase protein-coding 237.75-40 chr2 112329763 112330153 + 0.75 NA intron (NM_198581, intron 11 of 11) intron (NM_198581, intron 11 of 11) 54361 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 128-66 chr19 36594417 36594670 + 0.75 NA non-coding (NR_110703, exon 4 of 4) non-coding (NR_110703, exon 4 of 4) 10714 NM_001145650 57711 Hs.654960 NM_020951 ENSG00000186020 ZNF529 - zinc finger protein 529 protein-coding 153.5-62 chr15 37551729 37552059 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -382713 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 151.5-187 chr8 9601239 9601574 + 0.75 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 45494 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 146-63 chr2 53158368 53158691 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -455914 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 144.5-72 chr15 48399473 48399749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67414 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 203.75-117 chr8 143373893 143374344 + 0.75 NA intron (NM_052924, intron 1 of 14) intron (NM_052924, intron 1 of 14) 5242 NM_052924 114822 Hs.521912 NM_052924 ENSG00000158106 RHPN1 ODF5|RHOPHILIN|RHPN rhophilin Rho GTPase binding protein 1 protein-coding 120.25-187 chr6 104381963 104382150 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 477490 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 202.5-151 chrX 125227004 125227415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92662 NM_001195272 100129520 NM_001195272 ENSG00000282815 TEX13C - TEX13 family member C protein-coding 150.75-166 chr7 26830419 26830650 + 0.75 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 27189 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 156.25-15 chr10 32944641 32944875 + 0.75 NA intron (NM_002211, intron 1 of 15) intron (NM_002211, intron 1 of 15) -9200 NM_033668 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 157.75-134 chr5 51070568 51070939 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -100566 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 130.25-103 chr2 140271297 140271540 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 85 of 90) intron (NM_018557, intron 85 of 90) 315267 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 225.5-2 chr1 50879427 50879845 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) intron (NM_007051, intron 1 of 18) 80631 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 172-85 chr4 84449730 84450067 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 48336 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 132.75-18 chr1 235404496 235404768 + 0.75 NA intron (NM_001287801, intron 3 of 17).2 Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 37205 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 157-103 chr6 19146020 19146384 + 0.75 NA intron (NR_110860, intron 4 of 10) intron (NR_110860, intron 4 of 10) 34278 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 181.5-44 chr14 85331299 85331562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55845 NR_135155 105370605 NR_135155 ENSG00000258814 LINC02329 - long intergenic non-protein coding RNA 2329 ncRNA 128-18 chr10 24817868 24818197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94145 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 163.75-76 chr2 220761380 220761678 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 810775 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 119.25-103 chr2 180339161 180339445 + 0.75 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -332006 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 140.75-25 chr11 27122403 27122649 + 0.75 NA intron (NM_003986, intron 7 of 8) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 81711 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 155-3 chr1 104899730 104899954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 719093 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 158.5-176 chr7 28363667 28364119 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) -48625 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 137.25-136 chr6 37623600 37623891 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -68323 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 115.75-121 chr20 10844856 10845193 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 64248 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 129.5-3 chr1 51516043 51516274 + 0.75 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) intron (NM_001981, intron 1 of 24) 3108 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 145.5-174 chr6 117600817 117601056 + 0.75 NA intron (NM_001017408, intron 1 of 7) intron (NM_001017408, intron 1 of 7) 1575 NM_001017408 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 148.75-153 chr7 24423026 24423289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 138967 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 200.5-75 chr2 180200897 180201282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193792 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 153.25-52 chr17 14396202 14396469 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92595 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 120.5-91 chr16 78004701 78005024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17686 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 184.75-63 chr3 16921269 16921667 + 0.75 NA intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 -11622 NM_015184 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 198-11 chr10 60709545 60709850 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) AluJb|SINE|Alu 23831 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 126.5-7 chr1 50480316 50480621 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 17 of 18) intron (NM_007051, intron 17 of 18) -57025 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 167.25-2 chr1 12006216 12006649 + 0.75 NA intron (NM_001127660, intron 14 of 17) intron (NM_001127660, intron 14 of 17) -13066 NM_021933 60672 Hs.8595 NM_021933 ENSG00000116691 MIIP IIP45 migration and invasion inhibitory protein protein-coding 144-22 chr10 99789202 99789633 + 0.75 NA intron (NM_000392, intron 2 of 31) intron (NM_000392, intron 2 of 31) 6777 NM_000392 1244 Hs.368243 NM_000392 ENSG00000023839 ABCC2 ABC30|CMOAT|DJS|MRP2|cMRP ATP binding cassette subfamily C member 2 protein-coding 199.75-4 chr1 158400837 158401276 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1590 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 126.5-29 chr10 83422258 83422495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 254713 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 167.75-32 chr11 110756072 110756370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43032 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 204.75-42 chr16 6619602 6620049 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) L1PA13|LINE|L1 -153984 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 175.25-100 chr3 146731771 146732013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125676 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 183.25-19 chr11 24878644 24878908 + 0.75 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) L1PA8A|LINE|L1 381723 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 158.5-198 chr9 28381791 28382235 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 337292 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 211-51 chr5 36568155 36568515 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38020 NM_001289940 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 265.75-3 chr10 48884107 48884597 + 0.75 NA intron (NM_020945, intron 43 of 61) intron (NM_020945, intron 43 of 61) 29883 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 162.75-47 chr16 73538692 73539198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 152140 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 171.75-126 chr7 7655325 7655676 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) intron (NM_002947, intron 4 of 7) 14748 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 158-39 chr12 24298457 24298738 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 75326 NR_120473 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 127.5-35 chr10 104410105 104410520 + 0.75 NA intron (NM_001008723, intron 15 of 17) L1MEd|LINE|L1 56479 NM_001008723 159686 Hs.253576 NM_001008723 ENSG00000120051 CFAP58 C10orf80|CCDC147|bA127L20.4|bA127L20.5|bA554P13.1 cilia and flagella associated protein 58 protein-coding 171-129 chr8 110762690 110763010 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 264583 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 115-56 chr15 68683780 68684019 + 0.75 NA intron (NM_006091, intron 2 of 11) intron (NM_006091, intron 2 of 11) 42396 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 163.25-36 chr13 30390790 30391067 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17014 NR_024464 100188949 Hs.439791 NR_024464 ENSG00000238121 LINC00426 - long intergenic non-protein coding RNA 426 ncRNA 280-24 chr18 5043441 5044027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37448 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 115.25-160 chr5 19828459 19828748 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1PA15|LINE|L1 57669 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 149-35 chr14 90406670 90406960 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001363669, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001363669, exon 6 of 6) 8565 NM_001363670 801 Hs.282410 NM_006888 ENSG00000198668 CALM1 CALML2|CAM2|CAM3|CAMB|CAMC|CAMI|CAMIII|CPVT4|DD132|LQT14|PHKD|caM calmodulin 1 protein-coding 118.25-102 chr2 83298159 83298422 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -224524 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 130.25-140 chr3 126251109 126251338 + 0.75 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -70037 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 147.25-98 chr4 101804351 101804650 + 0.75 NA intron (NM_001127507, intron 1 of 15) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -9342 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 132.75-178 chr7 52834446 52834636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -201092 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 244-50 chr6 120675533 120676167 + 0.75 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 658630 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 142.25-89 chr2 104417923 104418183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4022 NR_135589 101927331 Hs.352254 NR_135589 ENSG00000225765 LINC01831 - long intergenic non-protein coding RNA 1831 ncRNA 157.75-178 chr8 137132737 137132993 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 280723 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 199.75-30 chr14 69927143 69927479 + 0.75 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 47895 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 149.25-110 chr3 774462 774767 + 0.75 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) intron (NR_110118, intron 2 of 3) 182509 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 184-16 chr11 60166840 60167119 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 16352 NM_001330275 64231 Hs.523702 NM_022349 ENSG00000110077 MS4A6A 4SPAN3|4SPAN3.2|CD20L3|CDA01|MS4A6|MST090|MSTP090 membrane spanning 4-domains A6A protein-coding 126.25-74 chr18 13584687 13584877 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -26332 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 170.25-119 chr4 117528504 117528747 + 0.75 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 100227 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 151.5-42 chr14 24217266 24217771 + 0.75 NA intron (NR_137630, intron 3 of 6) AluSx1|SINE|Alu -1448 NM_001199821 145553 Hs.220963 NM_138476 ENSG00000213920 MDP1 FN6PASE|MDP-1 magnesium dependent phosphatase 1 protein-coding 167.25-148 chr8 62340208 62340585 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) MER39|LTR|ERV1 91542 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 181.75-114 chr6 139149289 139149583 + 0.75 NA intron (NM_016217, intron 1 of 3) intron (NM_016217, intron 1 of 3) 14356 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 146-42 chr14 63917250 63917626 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) intron (NM_015180, intron 2 of 114) 64434 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 161.75-102 chr5 13563617 13563952 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 380696 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 128-16 chr1 233702497 233702718 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 78455 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 142.25-163 chr8 34110216 34110602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -510303 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 230.25-61 chr4 36554345 36554796 + 0.75 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) intron (NR_149124, intron 3 of 4) 87330 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 149.25-10 chr1 97909705 97909981 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 11216 NM_001160301 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 189.75-78 chr4 30746276 30746754 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 26146 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 140.75-180 chr8 91483479 91483797 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 234319 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 136.75-110 chr2 220370646 220370866 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -464191 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 118.5-194 chr7 47118099 47118330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 346589 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 132.5-146 chr21 26227734 26227998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56738 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 128-123 chr5 29737694 29737894 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -142766 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 301.5-35 chr3 50665006 50665622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9613 NM_004947 1795 Hs.476284 NM_004947 ENSG00000088538 DOCK3 MOCA|NEDIDHA|PBP dedicator of cytokinesis 3 protein-coding 216.5-118 chr8 79816500 79816913 + 0.75 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) AluSx|SINE|Alu 48564 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 136.5-23 chr10 51185514 51185763 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 111151 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 176.5-168 chr8 93923876 93924394 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001161780, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001161780, exon 3 of 3) 7188 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 129-121 chr3 122963620 122963928 + 0.75 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) intron (NR_046079, intron 1 of 22) 12360 NM_001256347 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 121.25-117 chr20 53903556 53903888 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -28013 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 122.25-197 chr8 120585971 120586274 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) 140703 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 177.5-176 chr8 130927846 130928429 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) AluJr4|SINE|Alu 112772 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 130.75-116 chr3 64254260 64254490 + 0.75 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) intron (NM_001370528, intron 1 of 7) 13798 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 193.25-14 chr10 74367667 74368004 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 161489 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 213-66 chr3 183129401 183129860 + 0.75 NA intron (NM_014398, intron 5 of 5) HAL1b|LINE|L1 -30043 NM_001363880 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 165.25-19 chr10 95841660 95841985 + 0.75 NA intron (NM_001164182, intron 3 of 8) MIR3|SINE|MIR -66143 NM_001130446 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 205.25-18 chr12 68478075 68478550 + 0.75 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -26828 NR_120458 100507195 Hs.450772 NR_120458 ENSG00000251301 LINC02384 - long intergenic non-protein coding RNA 2384 ncRNA 130-68 chr2 43573020 43573262 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 11 of 37) intron (NM_001083953, intron 11 of 37) 22833 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 112.5-88 chr16 57337185 57337379 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -21501 NM_002990 6367 Hs.534347 NM_002990 ENSG00000102962 CCL22 A-152E5.1|ABCD-1|DC/B-CK|MDC|SCYA22|STCP-1 C-C motif chemokine ligand 22 protein-coding 146.75-5 chr1 97021633 97021879 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -74167 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 123.5-66 chr15 81916230 81916561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129623 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 119-29 chr11 93929982 93930213 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -79479 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 127.5-19 chr1 209776723 209777083 + 0.75 NA intron (NR_109871, intron 11 of 12) intron (NR_109871, intron 11 of 12) 7656 NM_152485 148304 Hs.497642 NM_152485 ENSG00000162757 C1orf74 URLC4 chromosome 1 open reading frame 74 protein-coding 309.5-45 chr9 73437117 73437598 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 285492 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 129.25-200 chr8 104017740 104017981 + 0.75 NA intron (NM_001348497, intron 18 of 22) AluJb|SINE|Alu 198640 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 120.5-171 chr4 153492510 153492738 + 0.75 NA intron (NM_001131007, intron 3 of 34) intron (NM_001131007, intron 3 of 34) 26264 NM_001131007 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 126.75-9 chr1 151485287 151485554 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25926 NM_015100 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 175-14 chr10 58376168 58376424 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -8847 NR_073073 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 267.75-22 chr16 23946568 23947106 + 0.75 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 110854 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 159.25-47 chr16 35650206 35650566 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -96166 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 127.5-201 chr5 140121365 140121614 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005859, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_005859, exon 1 of 1) -4448 NM_001007189 492311 Hs.696360 NM_001007189 ENSG00000182700 IGIP C5orf53 IgA inducing protein protein-coding 138.25-95 chr2 228355900 228356137 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -174331 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 119.25-135 chr3 132965320 132965601 + 0.75 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -72828 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 214.25-33 chr18 59166913 59167311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27228 NM_001307941 90701 Hs.45107 NM_033280 ENSG00000166562 SEC11C SEC11L3|SPC21|SPCS4C SEC11 homolog C, signal peptidase complex subunit protein-coding 113-3 chr1 83931631 83931953 + 0.75 NA intron (NM_001350215, intron 8 of 19) intron (NM_001350215, intron 8 of 19) 67340 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 129.25-113 chr21 24340440 24340691 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19188 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 201.5-103 chr5 11381309 11381783 + 0.75 NA intron (NM_001288716, intron 4 of 18) L2a|LINE|L2 207371 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 137.75-62 chr14 63674771 63675047 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -33038 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 136.5-114 chr2 105018918 105019309 + 0.75 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) L1M4c|LINE|L1 -18956 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 133-20 chr11 38188085 38188329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 249606 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 146.5-84 chr17 61869330 61869567 + 0.75 NA intron (NM_001351695, intron 21 of 24) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -5889 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 226-47 chr4 34105635 34105979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65914 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 131.25-151 chr3 185876413 185876668 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -51498 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 135.25-180 chr6 80017391 80017687 + 0.75 NA intron (NM_003318, intron 10 of 21) AluJo|SINE|Alu 12890 NM_003318 7272 Hs.169840 NM_003318 ENSG00000112742 TTK CT96|ESK|MPH1|MPS1|MPS1L1|PYT TTK protein kinase protein-coding 121.25-208 chrX 40352938 40353180 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 90142 NR_110386 101927476 Hs.522607 NR_110386 ENSG00000236393 LOC101927476 - uncharacterized LOC101927476 ncRNA 138.5-211 chr9 79224822 79225076 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -79283 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 120.75-67 chr18 13187087 13187307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31563 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 172-109 chr9 7658704 7659230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140811 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 208-61 chr4 34925022 34925553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -655540 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 120.75-120 chr4 37435204 37435441 + 0.75 NA intron (NM_001144990, intron 5 of 6) intron (NM_001144990, intron 5 of 6) -18603 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 190-21 chr15 101697702 101698106 + 0.75 NA intron (NM_152334, intron 10 of 18) MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR 26569 NM_152334 123283 Hs.657163 NM_152334 ENSG00000185418 TARSL2 - threonyl-tRNA synthetase like 2 protein-coding 132.5-145 chr21 24781459 24781728 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58957 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 184.5-3 chr1 62690318 62690761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2153 NM_001367561 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 170.25-59 chr18 1650270 1650717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -290864 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 181.25-107 chr6 4676745 4677013 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -29259 NM_001368125 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 231.25-23 chr15 69483766 69484225 + 0.75 NA Intergenic (TCCCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31177 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 153.5-12 chr1 185297208 185297514 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006469, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_006469, exon 15 of 15) 19882 NM_006469 10625 Hs.497183 NM_006469 ENSG00000116679 IVNS1ABP ARA3|FLARA3|HSPC068|KLHL39|ND1|NS-1|NS1-BP|NS1BP influenza virus NS1A binding protein protein-coding 113-147 chr5 61184720 61184949 + 0.75 NA intron (NR_109908, intron 3 of 3) intron (NR_109908, intron 3 of 3) -22366 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 165-85 chr22 26384491 26384900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44565 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 215.25-12 chr10 126336437 126336955 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) intron (NM_001288974, intron 1 of 18) 51781 NM_001288974 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 237 chr1 23305060 23305597 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001102398, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001102398, exon 11 of 11) -19810 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 160.25-32 chr13 42373220 42373510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51527 NR_135319 105370177 NR_135319 ENSG00000283554 LINC02341 - long intergenic non-protein coding RNA 2341 ncRNA 144.75-161 chr7 83817372 83817774 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -168434 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 208.5-53 chr16 77134870 77135315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56098 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 134-157 chr6 156285365 156285651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93242 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 148.5-170 chr4 88144808 88145150 + 0.75 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) intron (NM_001257386, intron 1 of 15) 13660 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 155.25-63 chr14 69038366 69038783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58892 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 215.25-81 chr5 64870316 64870832 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) intron (NM_005869, intron 10 of 13) 101644 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 162-12 chr10 35832213 35832514 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 54061 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 145-22 chr10 33642254 33642564 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130271 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 158.25-96 chr3 186564371 186564687 + 0.75 NA intron (NM_001134415, intron 1 of 7) intron (NM_001134415, intron 1 of 7) 2810 NM_018138 55171 Hs.518469 NM_018138 ENSG00000113838 TBCCD1 - TBCC domain containing 1 protein-coding 113.75-100 chr2 111051108 111051368 + 0.75 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) intron (NM_001371254, intron 17 of 18) 64350 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 171.5-106 chr3 131652110 131652584 + 0.75 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -149376 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 207.75-40 chr16 49980086 49980521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44903 NM_153261 255919 Hs.59134 NM_153261 ENSG00000205423 CNEP1R1 C16orf69|NEP1-R1|NEP1R1|TMEM188|TMP125 CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 protein-coding 146.25-34 chr14 67371921 67372212 + 0.75 NA intron (NM_004094, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu 11738 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 134.5-241 chr9 73355617 73355897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203892 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 188.75-89 chr5 77891898 77892246 + 0.75 NA intron (NR_105012, intron 1 of 1) MER130|DNA|DNA 7416 NR_105012 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 138.75-165 chr6 70904271 70904528 + 0.75 NA intron (NM_080742, intron 1 of 3) intron (NM_080742, intron 1 of 3) 52661 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 156.25-24 chr11 13617337 13617625 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -51187 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 168.5-145 chr5 11098123 11098546 + 0.75 NA intron (NM_001364128, intron 12 of 19) intron (NM_001364128, intron 12 of 19) -337100 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 163-28 chr12 13485164 13485481 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -108577 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 165.25-113 chr5 13554804 13555093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 389532 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 143.75-168 chr7 11682573 11682856 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L1PA17|LINE|L1 149484 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 137.75-210 chr8 125012960 125013146 + 0.75 NA intron (NM_003129, intron 7 of 10) L1MB7|LINE|L1 14548 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 138-115 chr4 67051233 67051538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 370615 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 281.5-4 chr1 233021235 233021853 + 0.75 NA intron (NM_014801, intron 26 of 33) MER5A|DNA|hAT-Charlie 70702 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 132.25-90 chr2 26796082 26796454 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 10212 NM_001809 1058 Hs.1594 NM_001809 ENSG00000115163 CENPA CENP-A|CenH3 centromere protein A protein-coding 179-38 chr15 61230037 61230334 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_134261) promoter-TSS (NM_134261) -883 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 165.75-171 chr8 133726367 133726710 + 0.75 NA Intergenic (ATAATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -42472 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 167.5-177 chr7 68579119 68579488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 559050 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 138.75-100 chr2 177648943 177649176 + 0.75 NA intron (NM_001077197, intron 20 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -24263 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 135.25-117 chr20 36289160 36289342 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -17088 NM_001365621 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 166.25-137 chr7 14136523 14136797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -145235 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 197.75-45 chr2 138682525 138683047 + 0.75 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 97604 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 177.5-144 chr5 81877851 81878217 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -93989 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 136-135 chr7 85148440 85148826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26702 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 113.25-127 chr4 157796274 157796490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 223892 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 288.25-22 chr5 95108541 95109003 + 0.75 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) intron (NM_024717, intron 1 of 22) -26906 NM_001297777 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 275.25-12 chr11 80991101 80991542 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -228518 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 204-91 chrX 103222036 103222376 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 7098 NM_001080425 56271 Hs.184736 NM_001080425 ENSG00000102409 BEX4 BEXL1 brain expressed X-linked 4 protein-coding 148.25-111 chr4 105466012 105466416 + 0.75 NA intron (NM_176869, intron 1 of 11) intron (NM_176869, intron 1 of 11) 7848 NM_176869 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 157.75-182 chr9 78162758 78163107 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -73143 NM_001349840 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 116.25-113 chr2 113247528 113247783 + 0.75 NA intron (NM_013952, intron 2 of 11) intron (NM_013952, intron 2 of 11) 11386 NR_015377 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-174 chr5 121321544 121321710 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_104999) promoter-TSS (NR_104999) -923 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 175.75-89 chr3 190075628 190076030 + 0.75 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 45068 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 151.25-98 chr2 227633623 227634021 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001162483) promoter-TSS (NM_001162483) -502 NM_001162483 56918 Hs.283092 NM_020161 ENSG00000042304 C2orf83 - chromosome 2 open reading frame 83 protein-coding 209.75-98 chr8 56787587 56788157 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 205995 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 182-111 chr9 30703732 30704032 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -295428 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 177.75-92 chr20 50438961 50439361 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71160 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 165.25-150 chr9 91463661 91463897 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -39153 NM_001289999 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 134-92 chr2 101891607 101891834 + 0.75 NA 3' UTR (NM_145687, exon 31 of 31) 3' UTR (NM_145687, exon 31 of 31) -91745 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 140.5-4 chr1 45659015 45659282 + 0.75 NA intron (NM_021639, intron 3 of 12) intron (NM_021639, intron 3 of 12) -12463 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 168.75-114 chr5 97876029 97876285 + 0.75 NA intron (NR_146299, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 35399 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 116-137 chr6 41217917 41218109 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_027256) promoter-TSS (NR_027256) -66 NR_027256 340206 Hs.93698 NR_027256 ENSG00000184106 TREML3P TLT3|TREML3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 3, pseudogene pseudo 186.25-61 chr20 44849188 44849738 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -36242 NM_003404 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 128.75-170 chr6 64322773 64323025 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 516063 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 229.5-49 chr17 15162705 15163202 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -56766 NR_103559 94151 Hs.98684 NR_103559 CDRT8 - CMT1A duplicated region transcript 8 ncRNA 179-33 chr14 58574526 58574954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59328 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 206.75-69 chr5 64967373 64967753 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) L1ME1|LINE|L1 198633 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 127.75-38 chr11 3202234 3202584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15923 NR_027138 283303 Hs.151154 NM_173590 ENSG00000236301 MRGPRG-AS1 C11orf36|HSD-40 MRGPRG antisense RNA 1 ncRNA 176-42 chr3 57361291 57361779 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 58 of 73) intron (NM_001366028, intron 58 of 73) -68850 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 176.25-104 chr4 128929506 128929842 + 0.75 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) L1MEg|LINE|L1 117830 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 150.25-118 chr5 2312074 2312436 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_104616) promoter-TSS (NR_104616) -54 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 156.5-29 chr11 96370718 96371113 + 0.75 NA intron (NM_024725, intron 7 of 9) intron (NM_024725, intron 7 of 9) 18901 NM_001363594 79780 Hs.525088 NM_014148 ENSG00000149231 CCDC82 HSPC048 coiled-coil domain containing 82 protein-coding 145-165 chr9 13694081 13694459 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -233701 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 138.25-21 chr10 100885419 100885787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27360 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 125-8 chr1 97226257 97226564 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 19 of 22) L1M2|LINE|L1 130487 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 223-23 chr13 76847702 76848184 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 38462 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 151-135 chr8 121845882 121846277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204639 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 204-52 chr3 43849346 43849750 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -157954 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 115.5-100 chr18 59150153 59150327 + 0.75 NA intron (NM_001307941, intron 2 of 4) intron (NM_001307941, intron 2 of 4) 10356 NM_001307941 90701 Hs.45107 NM_033280 ENSG00000166562 SEC11C SEC11L3|SPC21|SPCS4C SEC11 homolog C, signal peptidase complex subunit protein-coding 129-18 chr10 27271856 27272177 + 0.75 NA intron (NR_138082, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 13254 NR_138082 101060171 Hs.568842 NR_138082 ARMC4P1 - armadillo repeat containing 4 pseudogene 1 pseudo 214.5-101 chr5 50844663 50845061 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001331028, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001331028, exon 26 of 26) 125325 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 224.5-115 chr9 24265255 24265900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 280099 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 157.5-125 chr22 24322270 24322583 + 0.75 NA exon (NM_001254732, exon 4 of 15) exon (NM_001254732, exon 4 of 15) -19682 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 210.5-23 chr11 114065235 114065802 + 0.75 NA intron (NM_006006, intron 2 of 6) AluSp|SINE|Alu 2307 NM_001354752 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 221.5-2 chr1 190600886 190601268 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -23813 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 191.5-29 chr12 51504389 51504692 + 0.75 NA intron (NM_001039960, intron 23 of 24) MIRb|SINE|MIR 79423 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 125.75-121 chr22 26051906 26052278 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -117370 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 186.75-58 chr2 211677663 211678224 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 13 of 26) intron (NM_001042599, intron 13 of 26) 748417 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 162.25-126 chr5 15738868 15739092 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -123978 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 141.5-168 chr5 25626363 25626580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 435518 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 142-56 chr15 76439003 76439411 + 0.75 NA intron (NR_148227, intron 25 of 32) AluSz6|SINE|Alu 102434 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 132-38 chr12 88660969 88661266 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80644 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 156.75-167 chr8 134337078 134337444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260810 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 128.75-15 chr10 5726196 5726448 + 0.75 NA intron (NM_017782, intron 8 of 20) intron (NM_017782, intron 8 of 20) 41484 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 190.75-86 chr5 56715860 56716392 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56745 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 122.75-84 chr2 1644945 1645127 + 0.75 NA intron (NM_012293, intron 17 of 22) L1ME4a|LINE|L1 99479 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 278.75-32 chr5 165885972 165886489 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1040140 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 137.75-40 chr12 20238680 20239000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110939 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 169-79 chr5 68715064 68715459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 314666 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 177.75-126 chr6 114898268 114898569 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 745417 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 284-44 chr7 27691675 27692231 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29070 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 113.5-239 chr8 124685070 124685279 + 0.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) L1MB4|LINE|L1 43299 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 170.25-26 chr12 44051282 44051600 + 0.75 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 215360 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 124.25-43 chr12 48521803 48522127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3667 NM_001005203 341568 Hs.524373 NM_001005203 ENSG00000284723 OR8S1 - olfactory receptor family 8 subfamily S member 1 protein-coding 148-142 chrX 39521694 39521953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130049 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 261.5-29 chr2 48893938 48894539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138514 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 121.75-59 chr17 18258848 18259122 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001256265) promoter-TSS (NM_001256265) 37 NM_001256264 2314 Hs.513984 NM_002018 ENSG00000177731 FLII FLI|FLIL|Fli1 FLII actin remodeling protein protein-coding 168-5 chr1 79114538 79114936 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -108007 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 118.5-118 chr21 25603590 25603906 + 0.75 NA intron (NM_080794, intron 3 of 10) intron (NM_080794, intron 3 of 10) 3741 NM_080794 54148 Hs.420696 NM_017446 ENSG00000154719 MRPL39 C21orf92|L39mt|MRP-L5|MRPL5|MSTP003|PRED22|PRED66|RPML5 mitochondrial ribosomal protein L39 protein-coding 138.5-191 chr8 103130632 103130894 + 0.75 NA intron (NR_145429, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 9731 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 224-45 chr5 114336178 114336563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25700 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 244-40 chr4 99050449 99051035 + 0.75 NA intron (NM_015143, intron 9 of 10) MER1B|DNA|hAT-Charlie 38046 NM_000671 128 Hs.78989 NM_000671 ENSG00000197894 ADH5 ADH-3|ADHX|FALDH|FDH|GSH-FDH|GSNOR|HEL-S-60p alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide protein-coding 267.5-60 chr5 93721921 93722419 + 0.75 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) intron (NM_032042, intron 10 of 10) 19430 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 126.25-192 chr7 134309282 134309483 + 0.75 NA exon (NM_032826, exon 2 of 10) exon (NM_032826, exon 2 of 10) 7548 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 128.75-51 chr13 33792593 33792801 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -25372 NM_181558 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 140.5-176 chr5 13660132 13660470 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 284179 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 192.75 chr1 26588092 26588464 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 33736 NR_031740 100302190 NR_031740 ENSG00000238705 MIR1976 hsa-mir-1976 microRNA 1976 ncRNA 119.5-4 chr1 42486731 42487012 + 0.75 NA intron (NM_001355227, intron 3 of 18) L1MB7|LINE|L1 23585 NM_001355224 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 179.5-143 chr5 25293198 25293555 + 0.75 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) intron (NR_136209, intron 1 of 3) 102423 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 211.25-75 chr5 99452366 99452783 + 0.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -81416 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 130-127 chr5 42972386 42972559 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20861 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 133.75-69 chr16 17237441 17237771 + 0.75 NA intron (NM_022166, intron 3 of 11) intron (NM_022166, intron 3 of 11) 103102 NR_135179 102723692 Hs.737758 NR_135179 ENSG00000261448 LOC102723692 - uncharacterized LOC102723692 ncRNA 145-117 chr5 12606995 12607404 + 0.75 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) L1MB3|LINE|L1 32342 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 114.25-175 chr7 21076299 21076555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 240996 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 254.75-28 chr2 214972788 214973182 + 0.75 NA intron (NR_103740, intron 38 of 54) AluJb|SINE|Alu 59101 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 131-169 chr8 60349007 60349365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64632 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 164.25-72 chr2 129899749 129900055 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -22411 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 127.25-147 chr4 74440156 74440419 + 0.75 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 -4849 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 166.5-190 chr7 49149872 49150259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 225518 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 130-135 chr5 152856849 152857054 + 0.75 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 115398 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 152.5-72 chr17 75121649 75122112 + 0.75 NA intron (NM_024585, intron 2 of 2) L1ME3A|LINE|L1 9862 NM_014595 30833 Hs.67201 NM_014595 ENSG00000125458 NT5C DNT|DNT1|HEL74|P5N2|PN-I|PN-II|UMPH2|cdN|dNT-1 5', 3'-nucleotidase, cytosolic protein-coding 130.5-70 chr12 12982515 12982851 + 0.75 NA intron (NR_038920, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 2846 NR_038920 100506314 Hs.127718 NR_038920 ENSG00000247498 GPRC5D-AS1 - GPRC5D and HEBP1 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-29 chr12 17278745 17278981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 290116 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 165.5-121 chr3 178188629 178189048 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230363 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 174.25-32 chr12 13527031 13527431 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -150486 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 172.5-198 chr8 78492111 78492408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24081 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 159.5-114 chr2 171858184 171858581 + 0.75 NA intron (NM_003705, intron 3 of 17) intron (NM_003705, intron 3 of 17) 35862 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 137.5-240 chr9 91510962 91511405 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -86557 NM_001289999 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 140-5 chr1 96179069 96179415 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 187174 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 134.5-88 chr17 73226258 73226535 + 0.75 NA intron (NM_001098832, intron 2 of 3) intron (NM_001098832, intron 2 of 3) 1321 NM_001289412 84923 Hs.741276 NM_032837 ENSG00000133193 FAM104A - family with sequence similarity 104 member A protein-coding 117.75-36 chr11 104284479 104284750 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -120467 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 152.25-116 chr4 90598012 90598227 + 0.75 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) L1MA9|LINE|L1 363088 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 221-19 chr14 45948645 45949027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115323 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 128.25-84 chr18 70834015 70834270 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -183188 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 185-14 chr12 8737697 8738103 + 0.75 NA intron (NR_147950, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu 39909 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 262.75-37 chr3 127551159 127551627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13613 NR_125397 101927149 Hs.407798 NR_125397 ENSG00000239921 LINC01471 - long intergenic non-protein coding RNA 1471 ncRNA 137.5-34 chr10 82022511 82022856 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) MER33|DNA|hAT-Charlie 144996 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 153-32 chr12 124737036 124737299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102504 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 184.5-171 chr9 125560933 125561336 + 0.75 NA intron (NM_001006619, intron 5 of 10) intron (NM_001006619, intron 5 of 10) 146074 NM_001006618 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 129.25-108 chr20 25556877 25557112 + 0.75 NA intron (NM_025176, intron 1 of 23) L1MB8|LINE|L1 28537 NM_001318226 22981 Hs.631508 NM_025176 ENSG00000101004 NINL NLP ninein like protein-coding 163-99 chr5 85482217 85482584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -800044 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 131.25-74 chr16 64326451 64326811 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 795432 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 204.25-7 chr10 53604005 53604389 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -832497 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 146.5-163 chr5 7847871 7848174 + 0.75 NA intron (NM_001089584, intron 1 of 2) intron (NM_001089584, intron 1 of 2) 3111 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 265-29 chr4 15552483 15553080 + 0.75 NA intron (NM_001080522, intron 19 of 37) L2a|LINE|L2 82899 NM_001164720 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 128.25-33 chr12 38980894 38981197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75454 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 165.25-16 chr10 53390373 53390708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -618840 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 187.75-3 chr1 55882165 55882744 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 62509 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 157-69 chr21 20193169 20193434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65384 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 234.5-7 chr1 229493672 229494237 + 0.75 NA intron (NM_018230, intron 8 of 25) AluSg|SINE|Alu 14387 NM_018230 55746 Hs.12457 NM_018230 ENSG00000069248 NUP133 GAMOS8|NPHS18|hNUP133 nucleoporin 133 protein-coding 142.25-72 chr17 72682353 72682772 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -42090 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 147-8 chr1 93523875 93524237 + 0.75 NA intron (NM_001024948, intron 4 of 13) intron (NM_001024948, intron 4 of 13) 61106 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 160.5-120 chr3 80116456 80116775 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -348617 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 141.25-53 chr14 82669048 82669542 + 0.75 NA intron (NR_146650, intron 2 of 5) intron (NR_146650, intron 2 of 5) 26663 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 181.5-83 chr2 105510751 105511020 + 0.75 NA Intergenic MER57C1|LTR|ERV1 -72372 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 113.5-160 chr3 110114697 110114923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 511982 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 117.5-199 chr5 160683523 160683699 + 0.75 NA intron (NM_001366652, intron 5 of 24) intron (NM_001366652, intron 5 of 24) 1780 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 200.25-123 chrX 148563776 148564291 + 0.75 NA intron (NM_001169124, intron 1 of 19) intron (NM_001169124, intron 1 of 19) 63416 NM_001169122 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 162.25-135 chr5 140189983 140190209 + 0.75 NA intron (NM_032412, intron 1 of 2) L1ME3|LINE|L1 14908 NM_032412 84418 Hs.529798 NM_032412 ENSG00000120306 CYSTM1 C5orf32|ORF1-FL49 cysteine rich transmembrane module containing 1 protein-coding 233.5-66 chr21 30314230 30314855 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 5773 NM_203405 388818 Hs.28704 NM_203405 ENSG00000197683 KRTAP26-1 - keratin associated protein 26-1 protein-coding 170.25-27 chr12 65901294 65901555 + 0.75 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) MER63C|DNA|hAT-Blackjack -19099 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 121.5-11 chr1 84928441 84928767 + 0.75 NA intron (NM_153259, intron 13 of 13) intron (NM_153259, intron 13 of 13) -35398 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 243.5-49 chr3 38746802 38747175 + 0.75 NA intron (NM_006514, intron 12 of 26) intron (NM_006514, intron 12 of 26) 47022 NM_001293306 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 142-18 chr10 52681984 52682239 + 0.75 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 73293 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 127-136 chr5 57962337 57962582 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -63297 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 135.25-208 chr9 75917521 75917923 + 0.75 NA intron (NR_120409, intron 1 of 19) intron (NR_120409, intron 1 of 19) 27049 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 120-76 chr18 12720705 12721026 + 0.75 NA intron (NM_147163, intron 5 of 6) intron (NM_147163, intron 5 of 6) 17823 NM_020232 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 125.25-137 chr3 131223971 131224190 + 0.75 NA intron (NM_001353043, intron 14 of 17) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -137765 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 132.75-106 chr2 187178412 187178665 + 0.75 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 269714 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 139-57 chr18 6109807 6110039 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) intron (NM_001365769, intron 14 of 16) -146821 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 177-30 chr14 23787683 23788095 + 0.75 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 151525 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 145-134 chr6 13830037 13830290 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15603 NM_001031713 63933 Hs.214043 NM_022102 ENSG00000050393 MCUR1 C6orf79|CCDC90A|FMP32 mitochondrial calcium uniporter regulator 1 protein-coding 117.25-47 chr12 3848691 3848876 + 0.75 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) L1MA4|LINE|L1 24616 NM_001286522 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 165-7 chr1 197750734 197751267 + 0.75 NA intron (NM_001195216, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 24480 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 175-97 chr5 28216951 28217332 + 0.75 NA Intergenic LTR77|LTR|ERV1 70524 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 143-124 chr6 43183111 43183449 + 0.75 NA intron (NM_015089, intron 1 of 40) intron (NM_015089, intron 1 of 40) 1084 NM_015089 23113 Hs.485434 NM_015089 ENSG00000112659 CUL9 H7AP1|PARC cullin 9 protein-coding 117.5-225 chr7 106286073 106286300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1203 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 208-73 chr6 145546593 145546968 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140097 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 118.5-136 chr3 176426599 176426811 + 0.75 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -88398 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 222-20 chr12 47342233 47342550 + 0.75 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 21878 NR_039715 100616478 NR_039715 ENSG00000264906 MIR4494 - microRNA 4494 ncRNA 133.25-114 chr2 219012670 219012946 + 0.75 NA intron (NM_194302, intron 24 of 34) MER112|DNA|hAT-Charlie 10593 NR_046086 100129175 Hs.147762 NR_046086 ENSG00000224090 LOC100129175 - uncharacterized LOC100129175 ncRNA 187.75-108 chr7 53749557 53749984 + 0.75 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) L1PA15|LINE|L1 62161 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 156-85 chr2 114043216 114043538 + 0.75 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -63393 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 190.5-24 chr11 30574835 30575152 + 0.75 NA intron (NM_001584, intron 1 of 5) intron (NM_001584, intron 1 of 5) 5500 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 147.5-128 chr22 20453687 20453906 + 0.75 NA intron (NR_033825, intron 4 of 5) AluSz|SINE|Alu -15971 NM_182895 91179 Hs.474251 NM_153334 ENSG00000244486 SCARF2 NSR1|SREC-II|SREC2|SRECRP-1|VDEGS scavenger receptor class F member 2 protein-coding 123.75-34 chr12 3439736 3440060 + 0.75 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) intron (NM_001256536, intron 1 of 9) -51305 NM_019854 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 155.75-100 chr3 26451161 26451472 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -171490 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 219.5-33 chr12 87343021 87343469 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 12506 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 162-114 chr8 56304224 56304573 + 0.75 NA intron (NM_001318049, intron 6 of 7) intron (NM_001318049, intron 6 of 7) 16378 NM_138969 195814 Hs.170673 NM_138969 ENSG00000170786 SDR16C5 EPHD-2|RDH#2|RDH-E2|RDHE2|retSDR2 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5 protein-coding 189.75-63 chr2 177524197 177524489 + 0.75 NA intron (NM_003659, intron 19 of 19) intron (NM_003659, intron 19 of 19) 28453 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 227.5-24 chr12 60072504 60073078 + 0.75 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL 383421 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 234-18 chr19 36777213 36777642 + 0.75 NA TTS (NM_001294306) TTS (NM_001294306) 4309 NM_001294306 728485 Hs.157101 NM_001294306 LOC728485 - uncharacterized LOC728485 protein-coding 209.25-87 chr4 117410887 117411291 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -17309 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 161.5-188 chr8 129299079 129299544 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -58071 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 135.25-6 chr1 81728242 81728575 + 0.75 NA intron (NM_001297704, intron 1 of 20) intron (NM_001297704, intron 1 of 20) 28638 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 138.75-149 chr5 72645673 72645925 + 0.75 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) intron (NR_105007, intron 1 of 2) 14870 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 169-25 chr13 107168860 107169161 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001080396, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001080396, exon 3 of 3) 151953 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 216.5-11 chr10 129282890 129283277 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -184158 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 220.75-3 chr1 52290269 52290580 + 0.75 NA intron (NM_007324, intron 9 of 17) intron (NM_007324, intron 9 of 17) 75781 NM_001330585 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 124.75-30 chr10 73299660 73299968 + 0.75 NA intron (NM_001367801, intron 13 of 27) intron (NM_001367801, intron 13 of 27) 47073 NR_134459 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 118.25-203 chr8 120507690 120507920 + 0.75 NA intron (NM_022045, intron 16 of 21) intron (NM_022045, intron 16 of 21) 62386 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 155.25-180 chr8 88833211 88833558 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -505901 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 137.25-103 chr3 124786211 124786459 + 0.75 NA intron (NM_001354766, intron 9 of 13) FRAM|SINE|Alu 53896 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 349-10 chr4 54587162 54587957 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 19572 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 134.75-105 chr2 31281070 31281492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47129 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 164.5-51 chr14 21917007 21917382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -246177 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 117.25-80 chr15 40932249 40932472 + 0.75 NA exon (NM_019074, exon 6 of 11) exon (NM_019074, exon 6 of 11) 3020 NM_019074 54567 Hs.511076 NM_019074 ENSG00000128917 DLL4 AOS6|delta4|hdelta2 delta like canonical Notch ligand 4 protein-coding 114.75-86 chr2 46677353 46677649 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -21459 NM_014011 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 211.5-47 chr14 32175850 32176336 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -25952 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 167-5 chr1 106995243 106995540 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -61283 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 200.75-117 chrX 54064371 54064817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19458 NM_001184896 23133 Hs.133352 NM_015107 ENSG00000172943 PHF8 JHDM1F|KDM7B|MRXSSD|ZNF422 PHD finger protein 8 protein-coding 190-5 chr1 175975296 175975703 + 0.75 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) AluSz6|SINE|Alu -6959 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 150.25-115 chr4 122408210 122408443 + 0.75 NA intron (NM_001159285, intron 7 of 11) AluSq|SINE|Alu 28808 NM_001159295 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 120.5-226 chr8 89284554 89284875 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 472997 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 198.5-11 chr10 7421852 7422437 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10658 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 159.75-6 chr1 117004188 117004535 + 0.75 NA intron (NM_001256109, intron 1 of 9) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 2611 NM_001256109 9398 Hs.654598 NM_004258 ENSG00000134256 CD101 EWI-101|IGSF2|V7 CD101 molecule protein-coding 252.75-65 chr6 158434202 158434696 + 0.75 NA intron (NM_020245, intron 3 of 13) intron (NM_020245, intron 3 of 13) -101987 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 207.75-67 chr21 35358519 35358998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 222006 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 198-8 chr1 236364377 236364866 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -29665 NM_145861 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 159.25-71 chr2 152558245 152558620 + 0.75 NA intron (NM_052905, intron 4 of 25) intron (NM_052905, intron 4 of 25) 159029 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 124-176 chr9 11194283 11194564 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 581217 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 149.25-46 chr14 50123149 50123650 + 0.75 NA intron (NM_006939, intron 21 of 22) AluSq2|SINE|Alu -6827 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 163.5-168 chr5 141694157 141694618 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12157 NM_022481 64411 Hs.726187 NM_022481 ENSG00000120318 ARAP3 CENTD3|DRAG1 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 protein-coding 137.25-3 chr1 92326097 92326370 + 0.75 NA intron (NM_024813, intron 8 of 12) L1ME3A|LINE|L1 27174 NM_024813 79871 Hs.444421 NM_024813 ENSG00000122484 RPAP2 C1orf82|Rtr1 RNA polymerase II associated protein 2 protein-coding 199.25-70 chr3 146514574 146514988 + 0.75 NA TTS (NM_021105) TTS (NM_021105) -18790 NM_001199979 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 163-22 chr11 88649500 88649880 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 3 of 8) L1MEg|LINE|L1 145114 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 201.75-106 chr8 129634516 129635028 + 0.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 45467 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 141.25-151 chr6 23572871 23573175 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -553192 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 188.25-86 chr4 175986836 175987318 + 0.75 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 15614 NM_001261447 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 186.25-94 chr5 136058172 136058444 + 0.75 NA intron (NM_000358, intron 12 of 16) intron (NM_000358, intron 12 of 16) 22290 NR_030583 100126299 NR_030583 ENSG00000278815 VTRNA2-1 CBL-3|CBL3|MIR886|MIRN886|VTRNA2|hsa-mir-886|hvg-5|nc886|pre-miR-886|svtRNA2-1a vault RNA 2-1 ncRNA 134.25-71 chr19 5388212 5388424 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -47506 NM_130855 5802 Hs.744928 NM_002850 ENSG00000105426 PTPRS PTPSIGMA|R-PTP-S|R-PTP-sigma protein tyrosine phosphatase receptor type S protein-coding 116.75-73 chr17 50980102 50980298 + 0.75 NA intron (NM_001130527, intron 25 of 29) AluSq2|SINE|Alu 66678 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 119.5-248 chr8 139797520 139797727 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) L1MB7|LINE|L1 -94500 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 179.5-49 chr12 109583608 109583935 + 0.75 NA intron (NM_000431, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 9977 NM_000431 4598 Hs.130607 NM_000431 ENSG00000110921 MVK LRBP|MK|MVLK|POROK3 mevalonate kinase protein-coding 337.5-31 chr9 35923945 35924785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14875 NM_001348107 158376 Hs.302677 NM_001348107 ENSG00000235387 SPAAR LINC00961|SPAR small regulatory polypeptide of amino acid response protein-coding 150.25-47 chr13 94159269 94159706 + 0.75 NA intron (NR_046535, intron 3 of 3) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 28504 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 158.75-150 chr7 30399535 30399805 + 0.75 NA intron (NR_108081, intron 1 of 2) L1MD2|LINE|L1 8785 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 168.75-52 chr15 63938201 63938587 + 0.75 NA intron (NM_014326, intron 5 of 11) intron (NM_014326, intron 5 of 11) 10120 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 170-80 chr5 108963778 108964168 + 0.75 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) intron (NR_146155, intron 13 of 19) 39367 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 118.75-15 chr1 229521506 229521798 + 0.75 NA intron (NM_012089, intron 10 of 12) intron (NM_012089, intron 10 of 12) 13222 NR_110630 101927478 Hs.229275 NR_110630 LOC101927478 - uncharacterized LOC101927478 ncRNA 140-64 chr18 7801269 7801614 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 234125 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 155.25-100 chr2 183116903 183117138 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001287584) promoter-TSS (NM_001287584) -470 NM_001287584 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 128.25-187 chr7 33156619 33156986 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 4 of 22) intron (NM_198428, intron 4 of 22) 27238 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 124.25-211 chr9 86199938 86200166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55981 NM_001276368 389766 Hs.632073 NM_001010907 ENSG00000187753 C9orf153 bA507D14.1 chromosome 9 open reading frame 153 protein-coding 125-101 chr3 58449669 58450020 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -15992 NM_001315536 5162 Hs.161357 NM_000925 ENSG00000168291 PDHB PDHBD|PDHE1-B|PDHE1B|PHE1B pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit protein-coding 140-135 chr5 73006016 73006405 + 0.75 NA intron (NM_001146032, intron 5 of 24) intron (NM_001146032, intron 5 of 24) 50169 NM_001146032 115548 Hs.165762 NM_138782 ENSG00000157107 FCHO2 - FCH domain only 2 protein-coding 143.25-141 chr5 32176114 32176434 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1955 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 124.25-166 chr5 77784341 77784512 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -8065 NM_004607 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 220.5-54 chr2 136637730 136638211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -127575 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 136.5-88 chr17 26843975 26844281 + 0.75 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 245113 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 129.25-133 chr3 156612977 156613241 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -57909 NM_001308197 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 229-10 chr11 69953418 69953830 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110300 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 129-191 chr9 84932569 84932972 + 0.75 NA intron (NM_001018064, intron 13 of 17) intron (NM_001018064, intron 13 of 17) 226869 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 219.75-65 chr5 94003668 94004059 + 0.75 NA intron (NR_028080, intron 3 of 8) L1MD1|LINE|L1 107800 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 200-54 chr20 53514954 53515243 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -37672 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 165.5-59 chr16 63554731 63554988 + 0.75 NA Intergenic (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1518421 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 128.75-49 chr12 124061718 124062070 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 88679 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 195.75-65 chr2 178787666 178788037 + 0.75 NA intron (NM_133379, intron 13 of 45) intron (NM_133379, intron 13 of 45) 10925 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 147.75-64 chr2 50338689 50339000 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 8910 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 128.25-34 chr12 44515735 44516129 + 0.75 NA intron (NM_006159, intron 20 of 20) intron (NM_006159, intron 20 of 20) 359729 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 191.25-74 chr4 39206772 39207219 + 0.75 NA intron (NM_025132, intron 9 of 36) L1MEf|LINE|L1 24466 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 164.5-4 chr1 39318906 39319178 + 0.75 NA intron (NM_012090, intron 29 of 92) MIR|SINE|MIR -90031 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 203-79 chr5 37710231 37710562 + 0.75 NA intron (NM_001345998, intron 13 of 17) L1MD2|LINE|L1 124426 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 214.5-135 chr9 134024152 134024713 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -1044 NR_149319 266655 Hs.654869 NM_001355256 ENSG00000235106 BRD3OS LINC00094|LP2477|NCRNA00094 BRD3 opposite strand protein-coding 189-97 chr7 7506772 7507086 + 0.75 NA intron (NM_001037763, intron 10 of 34) intron (NM_001037763, intron 10 of 34) 28944 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 189.25-40 chr15 57462196 57462607 + 0.75 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) intron (NM_032866, intron 8 of 18) 85896 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 129.5-4 chr1 59213370 59213579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66667 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 131.25-208 chr8 132038217 132038533 + 0.75 NA intron (NM_001080399, intron 8 of 13) intron (NM_001080399, intron 8 of 13) 21007 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 132.25-167 chr6 95968468 95968902 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -47289 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 171.75-26 chr11 93218310 93218661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20494 NM_152313 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 133.5-100 chr18 6139426 6139717 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 13 of 16) intron (NM_001365769, intron 13 of 16) -117173 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 220-24 chr17 9744036 9744487 + 0.75 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL 47331 NM_001220493 201140 Hs.61684 NM_001105571 ENSG00000184544 DHRS7C SDR32C2 dehydrogenase/reductase 7C protein-coding 170.5-149 chr5 105700833 105701176 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 601530 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 226.25-30 chr15 95851412 95851898 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 276186 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 186.25-49 chr2 31837077 31837539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33328 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 138-161 chr8 93076726 93076974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47099 NR_107051 102467005 NR_107051 ENSG00000277063 MIR8084 hsa-mir-8084 microRNA 8084 ncRNA 123.25-192 chr7 103544733 103544973 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 42 of 64) intron (NM_005045, intron 42 of 64) -98646 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 119.5-77 chr14 54613463 54613686 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 45962 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 113.5-144 chr20 53951979 53952195 + 0.75 NA intron (NM_001366297, intron 8 of 8) intron (NM_001366297, intron 8 of 8) -76378 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 171.25-105 chr3 167369807 167370254 + 0.75 NA intron (NM_001199202, intron 3 of 20) L2c|LINE|L2 10253 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 197.75-26 chr15 70232415 70232890 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -134735 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 192.25-72 chr3 6906815 6907226 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -13003 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 139.75-115 chr22 47772241 47772676 + 0.75 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) L1PB4|LINE|L1 140784 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 245.5-7 chr10 68719551 68720018 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1455 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 214.75-62 chr4 70795650 70795993 + 0.75 NA intron (NM_001037442, intron 14 of 17) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 43682 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 195-88 chr7 132838386 132838803 + 0.75 NA intron (NR_133671, intron 6 of 10) intron (NR_133671, intron 6 of 10) 79624 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 141.25-75 chr19 41454511 41454925 + 0.75 NA non-coding (NR_136334, exon 3 of 3) non-coding (NR_136334, exon 3 of 3) 11562 NM_001130514 100170765 Hs.649452 NM_001130514 ENSG00000204978 ERICH4 C19orf69 glutamate rich 4 protein-coding 129-85 chr19 48370362 48370627 + 0.75 NA intron (NM_012451, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 6127 NM_012451 23546 Hs.408333 NM_012451 ENSG00000105467 SYNGR4 - synaptogyrin 4 protein-coding 138-28 chr12 99257993 99258338 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) intron (NM_152788, intron 12 of 25) -103075 NM_001352190 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 258-36 chr3 89065777 89066174 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41646 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 253.5-20 chr13 27043751 27044251 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -81532 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 112.5-113 chr2 65948260 65948497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 409950 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 149.75-3 chr1 53393530 53393770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46370 NR_002314 163742 Hs.99394 NR_002314 ENSG00000236253 SLC25A3P1 - solute carrier family 25 member 3 pseudogene 1 pseudo 187.5-124 chr4 45739331 45739732 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 384523 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 212-52 chr22 29929772 29930083 + 0.75 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) intron (NM_153051, intron 1 of 18) 46753 NM_153051 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 163-88 chr5 12179157 12179487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -274876 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 127.5-75 chr14 52740415 52740662 + 0.75 NA intron (NM_001130701, intron 2 of 11) intron (NM_001130701, intron 2 of 11) 10372 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 132.75-101 chr2 114090118 114090433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110291 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 148.25-99 chr3 184834059 184834541 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 4 of 46) intron (NM_001009921, intron 4 of 46) 21793 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 186.75-107 chr7 114708800 114709315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55712 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 120-129 chr3 195262995 195263289 + 0.75 NA intron (NM_152531, intron 1 of 3) intron (NM_152531, intron 1 of 3) 8017 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 195.5-8 chr1 208464028 208464337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -219798 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 134.75-46 chr11 111942078 111942330 + 0.75 NA intron (NM_001037954, intron 1 of 19) intron (NM_001037954, intron 1 of 19) 4861 NM_001037954 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 112.5-89 chr16 65259195 65259371 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82710 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 128-144 chr6 148402492 148402783 + 0.75 NA intron (NM_001346506, intron 2 of 20) AluY|SINE|Alu 59799 NM_001346506 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 121.25-139 chr3 185705631 185705865 + 0.75 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -7504 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 183-26 chr14 52626009 52626298 + 0.75 NA intron (NR_148417, intron 4 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 69405 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 124.25-123 chr22 24907970 24908317 + 0.75 NA intron (NM_001098498, intron 20 of 23) L1MB7|LINE|L1 38552 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 132.25-107 chr2 200804085 200804447 + 0.75 NA intron (NR_110275, intron 1 of 3) intron (NR_110275, intron 1 of 3) -7280 NM_014670 9689 Hs.355983 NM_014670 ENSG00000082153 BZW1 BZAP45|Nbla10236 basic leucine zipper and W2 domains 1 protein-coding 125.25-124 chr21 14567006 14567232 + 0.75 NA intron (NM_001256370, intron 2 of 8) intron (NM_001256370, intron 2 of 8) -15083 NR_046512 100874190 Hs.563053 NR_046512 ENSG00000223662 SAMSN1-AS1 - SAMSN1 antisense RNA 1 ncRNA 148.75-154 chr7 24624031 24624239 + 0.75 NA intron (NM_016447, intron 3 of 12) intron (NM_016447, intron 3 of 12) 50683 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 185.5-135 chr5 139585151 139585552 + 0.75 NA intron (NM_181838, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu 24012 NM_003339 7322 Hs.108332 NM_003339 ENSG00000131508 UBE2D2 E2(17)KB2|PUBC1|UBC4|UBC4/5|UBCH4|UBCH5B ubiquitin conjugating enzyme E2 D2 protein-coding 166.75-67 chr18 60990509 60990852 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -342750 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 159.5-103 chr2 66343005 66343309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15171 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 147.5-60 chr14 50724146 50724523 + 0.75 NA intron (NM_020921, intron 30 of 30) intron (NM_020921, intron 30 of 30) -56028 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 182-65 chr20 2717135 2717621 + 0.75 NA intron (NM_001110514, intron 7 of 17) L1ME2z|LINE|L1 24500 NM_001110514 57593 Hs.471955 NM_020833 ENSG00000088881 EBF4 COE4|O/E-4 EBF family member 4 protein-coding 149-134 chr8 133040696 133040930 + 0.75 NA intron (NM_001282964, intron 5 of 6) intron (NM_001282964, intron 5 of 6) 5768 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 227.75-60 chr4 147926401 147926738 + 0.75 NA intron (NM_024605, intron 13 of 22) L2|LINE|L2 143974 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 129-102 chr2 210217861 210218201 + 0.75 NA exon (NM_001608, exon 3 of 11) exon (NM_001608, exon 3 of 11) 7416 NM_001608 33 Hs.471277 NM_001608 ENSG00000115361 ACADL ACAD4|LCAD acyl-CoA dehydrogenase long chain protein-coding 182.75-67 chr2 133115078 133115388 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) L1MC5|LINE|L1 -150962 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 132-41 chr12 117764448 117764817 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) intron (NM_173598, intron 3 of 19) 204358 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 240-27 chr19 40873205 40873613 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 9343 NM_000764 1549 Hs.719890 NM_000764 ENSG00000198077 CYP2A7 CPA7|CPAD|CYP2A|CYPIIA7|P450-IIA4 cytochrome P450 family 2 subfamily A member 7 protein-coding 148.5-142 chr3 11026242 11026543 + 0.75 NA intron (NM_001348251, intron 10 of 15) intron (NM_001348251, intron 10 of 15) -7168 NR_046647 100874090 Hs.628542 NR_046647 ENSG00000232287 SLC6A1-AS1 - SLC6A1 antisense RNA 1 ncRNA 160-60 chr20 2681705 2681990 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -10933 NR_138537 57593 Hs.471955 NM_020833 ENSG00000088881 EBF4 COE4|O/E-4 EBF family member 4 protein-coding 127.5 chr1 11204048 11204268 + 0.75 NA intron (NM_004958, intron 26 of 57) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 14803 NM_021146 10218 Hs.146559 NM_021146 ENSG00000171819 ANGPTL7 AngX|CDT6|dJ647M16.1 angiopoietin like 7 protein-coding 148.5-78 chr17 13461275 13461671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 82173 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 209.25-65 chr20 15005040 15005567 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -75785 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-76 chr17 39259515 39259741 + 0.75 NA 3' UTR (NM_032875, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_032875, exon 15 of 15) -33683 NM_001351360 342667 Hs.145068 NM_198993 ENSG00000141750 STAC2 24b2|24b2/STAC2 SH3 and cysteine rich domain 2 protein-coding 249.5 chr1 36737404 36737886 + 0.75 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -254331 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 159.75-150 chr6 67986931 67987312 + 0.75 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -68230 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 153-79 chr2 166864209 166864558 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -24104 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 146.75-152 chr7 95776198 95776493 + 0.75 NA intron (NM_004411, intron 1 of 16) intron (NM_004411, intron 1 of 16) 3839 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 117.25-224 chr9 96868016 96868230 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_038890) promoter-TSS (NR_038890) -777 NR_038890 100132781 Hs.710921 NR_038890 LOC100132781 - cyclin Y like 1 pseudogene pseudo 220.25-28 chr19 28939466 28940058 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -25369 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 185.25-103 chr5 97530968 97531372 + 0.75 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) intron (NR_105028, intron 2 of 3) 26474 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 182.75-75 chr20 14781789 14782151 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) AluSz|SINE|Alu 147548 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 155.75-30 chr11 50620455 50620880 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 211520 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 140.5-195 chr6 61512017 61512390 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -61927 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 172.5-108 chr2 241478035 241478299 + 0.75 NA TTS (NR_036083) TTS (NR_036083) 262 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 151.5-56 chr15 24667618 24667947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7612 NM_018958 23742 Hs.649663 NM_018958 ENSG00000185823 NPAP1 C15orf2 nuclear pore associated protein 1 protein-coding 199.75-28 chr14 66896537 66896845 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1M4c|LINE|L1 -292749 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 128.75-78 chr17 66540546 66540794 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -123816 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 143-45 chr15 87589705 87590055 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12951 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 162-78 chr3 152667977 152668441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166922 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 136.5-146 chr3 41610209 41610566 + 0.75 NA intron (NR_136342, intron 29 of 34) intron (NR_136342, intron 29 of 34) 351716 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 187-54 chr20 63536934 63537190 + 0.75 NA intron (NM_005975, intron 1 of 7) intron (NM_005975, intron 1 of 7) 308 NM_001256358 5753 Hs.51133 NM_005975 ENSG00000101213 PTK6 BRK protein tyrosine kinase 6 protein-coding 173.25-59 chr2 84198174 84198708 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -92241 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 150.25-131 chr6 107731186 107731605 + 0.75 NA intron (NM_001286408, intron 4 of 6) intron (NM_001286408, intron 4 of 6) 755 NM_001286409 256380 Hs.486109 NM_198081 ENSG00000146285 SCML4 dJ47M23.1 Scm polycomb group protein like 4 protein-coding 175.5-65 chr16 13822024 13822327 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -97982 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 121.5-63 chr12 111922465 111922860 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 23599 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 235.75-45 chr3 22911064 22911416 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 291338 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 193-18 chr13 57399233 57399676 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 232257 NM_001130407 729250 Hs.525056 NM_001130407 ENSG00000234278 PRR20E PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20C|PRR20D proline rich 20E protein-coding 113.25-180 chr8 137000005 137000315 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 413428 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 164.75-85 chr2 226778634 226778947 + 0.75 NA intron (NM_005544, intron 1 of 1) intron (NM_005544, intron 1 of 1) 20000 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 213.25-3 chr1 94916408 94916894 + 0.75 NA intron (NM_001839, intron 1 of 6) intron (NM_001839, intron 1 of 6) 9157 NM_001286056 1266 Hs.483454 NM_001839 ENSG00000117519 CNN3 - calponin 3 protein-coding 172.25-126 chr6 105143431 105143681 + 0.75 NA intron (NR_037157, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 5869 NR_037157 154442 Hs.586271 NR_037157 ENSG00000203808 BVES-AS1 C6orf112|bA99L11.2 BVES antisense RNA 1 ncRNA 169.75-133 chr6 82064469 82064775 + 0.75 NA intron (NR_149135, intron 2 of 3) intron (NR_149135, intron 2 of 3) 37143 NR_149135 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 147.5-107 chr2 133199017 133199338 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) L1ME2|LINE|L1 -67018 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 215.25-110 chr8 88867384 88867780 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -540099 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 160-10 chr10 37955396 37955756 + 0.75 NA intron (NM_001329663, intron 5 of 6) intron (NM_001329663, intron 5 of 6) 20404 NR_138069 219749 Hs.499429 NM_145011 ENSG00000175395 ZNF25 KOX19|Zfp9 zinc finger protein 25 protein-coding 174-28 chr15 39690003 39690291 + 0.75 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) L2|LINE|L2 92694 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 157-53 chr2 75337218 75337660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137919 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 127.25-205 chr8 51400094 51400427 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 17 of 22) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 409185 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 130.5-91 chr14 65218690 65218866 + 0.75 NA intron (NR_103769, intron 1 of 3) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 3569 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 135.75-111 chr2 144629147 144629337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38725 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 119.5-135 chr20 5731728 5731999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18524 NM_001303477 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 191.5-37 chr14 53049165 53049458 + 0.75 NA intron (NM_030637, intron 11 of 11) intron (NM_030637, intron 11 of 11) -98214 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 158.75-155 chr7 105000681 105001054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9702 NR_039981 100216546 Hs.369356 NR_039981 LINC01004 - long intergenic non-protein coding RNA 1004 ncRNA 202.25-75 chr6 38791110 38791546 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 19 of 91) MIR|SINE|MIR 76017 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 210-65 chr3 73174917 73175216 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 113407 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 172.75-30 chr12 123587710 123587975 + 0.75 NA intron (NM_001321445, intron 3 of 4) intron (NM_001321445, intron 3 of 4) 3290 NM_001321445 10959 Hs.733403 NM_006815 ENSG00000086598 TMED2 P24A|RNP24|p24|p24b1|p24beta1 transmembrane p24 trafficking protein 2 protein-coding 124.25-139 chr3 114968312 114968614 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -67838 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 160.25-127 chr5 84293107 84293370 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 91629 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 195-38 chr17 4285517 4285793 + 0.75 NA intron (NM_003342, intron 4 of 5) HAL1|LINE|L1 -13761 NR_110982 103021295 Hs.741319 NR_110982 LOC103021295 - uncharacterized LOC103021295 ncRNA 135.25-169 chr5 148069543 148069867 + 0.75 NA intron (NM_006846, intron 2 of 32) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 5725 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 235.75-48 chr4 20352173 20352615 + 0.75 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) -39795 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 204.75-32 chr12 93669951 93670302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7245 NR_135147 8738 Hs.38533 NM_003805 ENSG00000169372 CRADD MRT34|RAIDD CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with death domain protein-coding 130-87 chr20 294397 294748 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2998 NM_033089 85364 Hs.28608 NM_033089 ENSG00000247315 ZCCHC3 C20orf99 zinc finger CCHC-type containing 3 protein-coding 178.5-147 chr5 128695208 128695549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157133 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 122.25-214 chrX 85052241 85052456 + 0.75 NA intron (NM_198450, intron 3 of 8) intron (NM_198450, intron 3 of 8) 48471 NM_198450 139322 Hs.512181 NM_198450 ENSG00000155008 APOOL CXorf33|FAM121A|MICOS27|Mic27|UNQ8193 apolipoprotein O like protein-coding 137.75-137 chr3 98529929 98530202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1913 NM_005290 2838 Hs.162987 NM_005290 ENSG00000154165 GPR15 BOB G protein-coupled receptor 15 protein-coding 122.75-91 chr2 63347787 63348011 + 0.75 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) intron (NR_148704, intron 13 of 18) 90108 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 137-47 chr14 47862379 47862758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67554 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 131.75-132 chr3 15071878 15072134 + 0.75 NA 3' UTR (NM_022340, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_022340, exon 14 of 14) -6691 NR_135246 64432 Hs.657764 NM_022497 ENSG00000131368 MRPS25 MRP-S25|RPMS25 mitochondrial ribosomal protein S25 protein-coding 147.5-168 chr4 167182481 167182814 + 0.75 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) AluSg|SINE|Alu 51779 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 198-77 chr8 83148493 83148930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 236607 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 131-104 chr2 224950653 224950854 + 0.75 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) -3704 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 119.75-165 chr5 13347632 13347843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -314851 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 244.75-40 chr4 52743589 52744165 + 0.75 NA exon (NM_001242690, exon 3 of 3) exon (NM_001242690, exon 3 of 3) 7548 NM_001242690 100288413 Hs.363087 NM_024534 ENSG00000226887 ERVMER34-1 HEMO|envMER34 endogenous retrovirus group MER34 member 1, envelope protein-coding 197-5 chr10 113192952 113193518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63964 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 129.5-22 chr10 72782497 72782735 + 0.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluSq2|SINE|Alu 61587 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 121.75-53 chr15 88471501 88471835 + 0.75 NA intron (NM_001321972, intron 2 of 5) intron (NM_001321972, intron 2 of 5) 3960 NM_022839 64963 Hs.111286 NM_022839 ENSG00000181991 MRPS11 HCC-2|MRP-S11|S11mt mitochondrial ribosomal protein S11 protein-coding 120.5-129 chr2 192183919 192184188 + 0.75 NA intron (NM_001305134, intron 3 of 9) intron (NM_001305134, intron 3 of 9) 10880 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 205.25-80 chr4 86863274 86863696 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14101 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 168.5-86 chr2 103064505 103064797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80222 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 193.75-93 chr4 48947412 48947710 + 0.75 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -38714 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 168.5-5 chr1 77170533 77170794 + 0.75 NA intron (NM_005482, intron 3 of 10) intron (NM_005482, intron 3 of 10) 48767 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 115-2 chr1 63167066 63167327 + 0.75 NA intron (NR_038252, intron 7 of 11) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 150061 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 227.25-51 chr20 14437479 14437972 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -100058 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 125-23 chr10 72491774 72492075 + 0.75 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 32062 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 205.75-80 chr8 79358101 79358654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26189 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 177.75-38 chr14 21667578 21668047 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 2729 NM_001001912 26686 Hs.547982 NM_001001912 ENSG00000221977 OR4E2 OR14-42 olfactory receptor family 4 subfamily E member 2 protein-coding 174-62 chr3 64371794 64372141 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -103794 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 222.25-28 chr18 8407982 8408473 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41193 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 235.75-27 chr14 69828191 69828707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16689 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 167-68 chr20 38517787 38518107 + 0.75 NA exon (NM_001282918, exon 9 of 30) exon (NM_001282918, exon 9 of 30) 1384 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 126-69 chr16 75506792 75507120 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -11515 NR_163481 4166 Hs.655622 NM_021615 ENSG00000183196 CHST6 C-GlcNAc6ST|GST4-beta|MCDC1|glcNAc6ST-5|gn6st-5|hCGn6ST carbohydrate sulfotransferase 6 protein-coding 166.25-6 chr1 55973949 55974243 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 29009 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 191.25-86 chr5 54528594 54528884 + 0.75 NA intron (NM_001145427, intron 1 of 1) intron (NM_001145427, intron 1 of 1) 10980 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 240.25-65 chr7 118504062 118504672 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 279663 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 204.25-87 chr5 16634220 16634562 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -17333 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 128.25-192 chr7 52196314 52196530 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -803166 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 215.75-56 chr2 229055865 229056357 + 0.75 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) intron (NM_001330157, intron 1 of 1) 175981 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 145.75-6 chr1 178130562 178130989 + 0.75 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) intron (NM_170692, intron 1 of 17) 36671 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 131.5-132 chr2 212032980 212033213 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 2 of 26) intron (NM_001042599, intron 2 of 26) 393264 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 229.5-140 chr9 71692692 71693122 + 0.75 NA intron (NM_013390, intron 21 of 23) AluJb|SINE|Alu 75606 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 197-44 chr3 80515854 80516412 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248764 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 112.5-185 chr4 88419738 88420072 + 0.75 NA intron (NM_001165136, intron 13 of 21) intron (NM_001165136, intron 13 of 21) -37214 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 212.75-67 chr3 188910539 188910875 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 36932 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 175.25-46 chr14 66391334 66391602 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -94903 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 223-50 chr21 23764689 23765061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -380040 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 144.75-127 chr4 186869240 186869624 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -145576 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 149.25-133 chr4 92320290 92320634 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 16063 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 224.25-105 chr8 50951068 50951498 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 787152 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 155.75-76 chr2 26326871 26327116 + 0.75 NA intron (NR_135916, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu -7891 NM_001145169 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 235.75-7 chr10 22604034 22604578 + 0.75 NA intron (NM_005028, intron 3 of 9) intron (NM_005028, intron 3 of 9) 109802 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 191.25-114 chr9 29090870 29091246 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 121241 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 125.25-55 chr13 81685393 81685706 + 0.75 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -458566 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 165.75-130 chr5 12874763 12875001 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 158004 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 230.75-21 chr14 52352802 52353194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38686 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 227.25-62 chr5 12453046 12453407 + 0.75 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -121631 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 201.25-25 chr12 15334384 15334821 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 12094 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 142.75-107 chr2 191688573 191688800 + 0.75 NA non-coding (NR_045622, exon 7 of 7) non-coding (NR_045622, exon 7 of 7) -1495 NR_131917 105747689 Hs.104972 NR_131917 LOC105747689 - uncharacterized LOC105747689 ncRNA 125-147 chr7 24054976 24055272 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -229066 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 147.75-57 chr18 12451038 12451323 + 0.75 NA intron (NM_020148, intron 15 of 15) intron (NM_020148, intron 15 of 15) 18406 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 294-11 chr14 46475602 46476162 + 0.75 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) intron (NR_102700, intron 1 of 1) 4523 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 192.25-23 chr13 73538508 73539024 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -25478 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 136-38 chr14 42150928 42151165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 544190 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 203.25-41 chr15 69724988 69725314 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -110083 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 139-2 chr1 23776274 23776567 + 0.75 NA intron (NR_038280, intron 1 of 3) intron (NR_038280, intron 1 of 3) 1877 NR_038280 100506963 Hs.592549 NR_038280 ENSG00000236810 ELOA-AS1 TCEB3-AS1 ELOA antisense RNA 1 ncRNA 114.75-163 chr6 63045976 63046197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 273891 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 158-9 chr1 104536172 104536578 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 463352 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 179.75-102 chr5 77967119 77967502 + 0.75 NA Intergenic AluYi6|SINE|Alu 9063 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 196-53 chr2 126252850 126253431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135155 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 113-33 chr10 108671496 108671745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -602327 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 123-18 chr10 13478536 13478849 + 0.75 NA intron (NM_001370075, intron 5 of 8) intron (NM_001370075, intron 5 of 8) 24284 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 148.25-138 chr7 39033493 39033835 + 0.75 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) intron (NM_007252, intron 2 of 10) -20097 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 193-40 chr2 74172952 74173326 + 0.75 NA intron (NM_001317112, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 5175 NM_001317111 55233 Hs.602092 NM_018221 ENSG00000114978 MOB1A C2orf6|MATS1|MOB1|MOBK1B|MOBKL1B|Mob4B MOB kinase activator 1A protein-coding 174.25-108 chr3 194129946 194130495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5928 NM_005524 3280 Hs.250666 NM_005524 ENSG00000114315 HES1 HES-1|HHL|HRY|bHLHb39 hes family bHLH transcription factor 1 protein-coding 116.75-78 chr18 2827693 2828025 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -19147 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 176-81 chr9 38148596 38148844 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -79493 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 137.25-12 chr10 8578022 8578362 + 0.75 NA intron (NR_134492, intron 1 of 1) intron (NR_134492, intron 1 of 1) 16199 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 224.25-61 chr3 183758001 183758461 + 0.75 NA intron (NM_001351371, intron 12 of 21) AluSx|SINE|Alu 47992 NM_001351369 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 209.75-65 chr3 159456286 159456849 + 0.75 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 173921 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 153.25-61 chr19 28032413 28032759 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -238646 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 171.25-130 chr5 142022602 142022855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9701 NM_005471 10007 Hs.633853 NM_005471 ENSG00000113552 GNPDA1 GNP1|GNPDA|GNPI|GPI|HLN glucosamine-6-phosphate deaminase 1 protein-coding 130.75-114 chr3 45036786 45037031 + 0.75 NA TTS (NM_003278) TTS (NM_003278) 6765 NM_001308394 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 174.75-124 chr8 11019339 11019745 + 0.75 NA intron (NM_173683, intron 1 of 2) (GGACACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15760 NR_030328 693183 NR_030328 ENSG00000207600 MIR598 MIRN598|hsa-mir-598|mir-598 microRNA 598 ncRNA 183-45 chr18 57492536 57492989 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 57388 NM_004852 9480 Hs.194725 NM_004852 ENSG00000119547 ONECUT2 OC-2|OC2 one cut homeobox 2 protein-coding 131.75-46 chr12 14252446 14252718 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -113050 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 136-161 chr8 133270175 133270423 + 0.75 NA intron (NM_001258432, intron 1 of 13) intron (NM_001258432, intron 1 of 13) 26953 NM_001135242 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 165.75-14 chr10 44025623 44025979 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 113399 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 145-88 chr20 1346671 1346916 + 0.75 NA intron (NR_040047, intron 1 of 2) L1MC2|LINE|L1 -17654 NM_080489 27111 Hs.657015 NM_015685 ENSG00000125775 SDCBP2 SITAC|SITAC18|ST-2|ST2 syndecan binding protein 2 protein-coding 141.5-172 chr5 33101865 33102252 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -127677 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 155.25-108 chr20 58117543 58117833 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -33214 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 144.25-148 chr4 91422612 91422859 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 854567 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 152-143 chr7 103325406 103325761 + 0.75 NA intron (NM_001362668, intron 6 of 17) MER5B|DNA|hAT-Charlie 19184 NM_014377 27000 Hs.558476 NM_014377 ENSG00000105821 DNAJC2 MPHOSPH11|MPP11|ZRF1|ZUO1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 protein-coding 119.75-55 chr14 21174693 21174944 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -18755 NM_001004731 390445 Hs.553768 NM_001004731 ENSG00000169327 OR5AU1 OR14-38 olfactory receptor family 5 subfamily AU member 1 protein-coding 153.5-74 chr17 32583744 32583973 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) AluJb|SINE|Alu 96865 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 150.25-49 chr14 37849956 37850221 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52036 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 204.75-108 chr7 9592831 9593212 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -41249 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 198.5-113 chr5 34956668 34957113 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001348420, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001348420, exon 12 of 12) 27297 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 152.75-67 chr17 39899016 39899335 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 18365 NM_018530 55876 Hs.306777 NM_018530 ENSG00000073605 GSDMB GSDML|PP4052|PRO2521 gasdermin B protein-coding 223.25-64 chr5 97696642 97697114 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -143880 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 175.75-48 chr16 54048103 54048529 + 0.75 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) 8923 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 138.25-74 chr18 66727977 66728208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124002 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 117.25-91 chr17 41655763 41655937 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15651 NR_033415 284116 Hs.725790 NR_033415 ENSG00000214514 KRT42P - keratin 42 pseudogene pseudo 136.75-142 chr4 46941732 46942114 + 0.75 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) intron (NM_001204267, intron 7 of 7) -32678 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 113-45 chr11 99222293 99222497 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 201446 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 136.75-189 chr8 47814239 47814531 + 0.75 NA intron (NM_001081640, intron 68 of 84) L1MEf|LINE|L1 -76221 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 123-81 chr17 58455831 58456167 + 0.75 NA intron (NM_001080439, intron 5 of 5) L1MA3|LINE|L1 32409 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 121.5-83 chr15 27389529 27389806 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) intron (NM_001270873, intron 5 of 5) -228348 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 160.5-39 chr12 58789959 58790317 + 0.75 NA intron (NR_126341, intron 1 of 1) L1M3|LINE|L1 -8422 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 178-33 chr15 98013137 98013502 + 0.75 NA intron (NR_146563, intron 2 of 2) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10281 NR_146563 105371008 NR_146563 LINC02251 - long intergenic non-protein coding RNA 2251 ncRNA 127.75-22 chr1 201395524 201395715 + 0.75 NA intron (NM_005558, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 3705 NM_005558 3898 Hs.519035 NM_005558 ENSG00000159166 LAD1 LadA ladinin 1 protein-coding 123-63 chr15 70959891 70960119 + 0.75 NA intron (NM_017691, intron 8 of 15) intron (NM_017691, intron 8 of 15) 67562 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 145.5-53 chr13 48189388 48189695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43665 NM_021999 9445 Hs.643683 NM_021999 ENSG00000136156 ITM2B ABRI|BRI|BRI2|BRICD2B|E25B|E3-16|FBD|RDGCA|imBRI2 integral membrane protein 2B protein-coding 135.5-98 chr2 38171574 38171788 + 0.75 NA intron (NR_027252, intron 2 of 2) intron (NR_027252, intron 2 of 2) 40576 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 222.5-51 chr2 101664870 101665381 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -32578 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 113.5-129 chr2 145096543 145096800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 428704 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 168.5-182 chr8 87934067 87934459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60248 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 158 chr1 14629390 14629789 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) 30872 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 173.75-133 chr6 50679668 50680134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33643 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 146.75-19 chr10 84515283 84515593 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001284243, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001284243, exon 8 of 8) 90269 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 122.5-237 chrX 46597345 46597638 + 0.75 NA intron (NM_019886, intron 1 of 1) intron (NM_019886, intron 1 of 1) 23726 NM_019886 56548 Hs.129955 NM_019886 ENSG00000147119 CHST7 C6ST-2|GST-5 carbohydrate sulfotransferase 7 protein-coding 127.5-229 chr7 47200743 47200932 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 263966 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 192.5-22 chr10 117997517 117998044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49041 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 132.5-61 chr13 54529024 54529283 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -217105 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 179-84 chr7 81165055 81165506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242891 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 141.5-77 chr18 4652745 4652964 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -197547 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 117.25-220 chr8 141738389 141738665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47786 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 197.75-13 chr11 114571213 114571807 + 0.75 NA intron (NM_017678, intron 5 of 5) intron (NM_017678, intron 5 of 5) -11629 NM_001367953 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 148.75-97 chr20 3562505 3562779 + 0.75 NA intron (NM_001207047, intron 9 of 24) intron (NM_001207047, intron 9 of 24) 91624 NM_001323332 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 126.75-48 chr13 100613968 100614324 + 0.75 NA intron (NM_001079669, intron 15 of 17) intron (NM_001079669, intron 15 of 17) -25354 NM_001195087 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 153.75-142 chr7 49467515 49467853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -305954 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 150-75 chr2 119958971 119959241 + 0.75 NA intron (NM_002830, intron 22 of 26) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -53971 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 134-34 chr11 108820452 108820826 + 0.75 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) LTR105_Mam|LTR|ERVL 155570 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 169.75-11 chr1 236624062 236624407 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19718 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 144-61 chr2 147704779 147705008 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -139624 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 121 chr1 9089977 9090351 + 0.75 NA Intergenic HERVFH19-int|LTR|ERV1 -17905 NM_001328619 6518 Hs.530003 NM_003039 ENSG00000142583 SLC2A5 GLUT-5|GLUT5 solute carrier family 2 member 5 protein-coding 114-87 chr20 20202124 20202437 + 0.75 NA intron (NM_015585, intron 17 of 26) intron (NM_015585, intron 17 of 26) 145634 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 250.5-104 chr9 114292249 114292606 + 0.75 NA intron (NM_032888, intron 49 of 60) intron (NM_032888, intron 49 of 60) -30596 NM_000607 5004 Hs.522356 NM_000607 ENSG00000229314 ORM1 AGP-A|AGP1|HEL-S-153w|ORM orosomucoid 1 protein-coding 157-130 chrX 30457648 30457889 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 119998 NM_025159 80231 Hs.665009 NM_025159 ENSG00000120280 CXorf21 - chromosome X open reading frame 21 protein-coding 186.75-15 chr10 121250846 121251214 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 280284 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 238.75-65 chr8 116221706 116222105 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 103154 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 272.75-3 chr10 13926254 13926930 + 0.75 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) 45304 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 193.25-40 chr16 53894580 53895005 + 0.75 NA intron (NM_001363903, intron 7 of 7) intron (NM_001363903, intron 7 of 7) -144601 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 193-11 chr10 59439794 59440105 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -76768 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 157-113 chr7 80548580 80548852 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36652 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 117.75-19 chr10 4262980 4263230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19193 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 155-93 chr4 45265566 45265871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -539084 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 241.75-61 chr5 53936565 53937104 + 0.75 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) 14765 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 119.5-11 chr1 90832101 90832413 + 0.75 NA intron (NR_147930, intron 1 of 1) intron (NR_147930, intron 1 of 1) 3904 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 286-22 chr2 146179552 146179995 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -407284 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 188.25-61 chr2 194516214 194516711 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 172193 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 147-103 chr4 85542369 85542716 + 0.75 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) intron (NM_001025616, intron 1 of 9) 67392 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 198-29 chr16 71741575 71742073 + 0.75 NA intron (NM_001128, intron 19 of 22) intron (NM_001128, intron 19 of 22) 16663 NR_003059 692111 NR_003059 ENSG00000223224 SNORD71 HBII-239|MIRN768|hsa-mir-768 small nucleolar RNA, C/D box 71 snoRNA 259.75-8 chr11 74906960 74907639 + 0.75 NA intron (NM_001270380, intron 8 of 14) intron (NM_001270380, intron 8 of 14) 41792 NM_182969 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 232-23 chr17 32231284 32231819 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -34281 NM_001330181 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 112.25-100 chr2 117501474 117501659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -313125 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 113-21 chr10 55033379 55033649 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -232223 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 118.5-98 chr2 76540606 76540818 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -445253 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 122.75-112 chr20 59863175 59863363 + 0.75 NA TTS (NM_014258) TTS (NM_014258) 70368 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 155.25-187 chr9 96005166 96005502 + 0.75 NA intron (NM_020207, intron 18 of 18) L2a|LINE|L2 16477 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 140.5-43 chr11 125040476 125040669 + 0.75 NA intron (NM_025004, intron 15 of 15) intron (NM_025004, intron 15 of 15) -22733 NM_198277 219855 Hs.352661 NM_198277 ENSG00000134955 SLC37A2 pp11662 solute carrier family 37 member 2 protein-coding 122.75-187 chr7 91958234 91958496 + 0.75 NA intron (NM_147185, intron 1 of 49) intron (NM_147185, intron 1 of 49) 17490 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 130-155 chr7 86303398 86303647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -340387 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 169-29 chr14 60994185 60994443 + 0.75 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) AluSp|SINE|Alu -12624 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 137.25-108 chr4 62821022 62821439 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -659465 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-65 chr15 65541291 65541520 + 0.75 NA intron (NM_016395, intron 1 of 10) MER90a|LTR|ERV1 10942 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 142.25-130 chr4 177586311 177586619 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -142292 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 139.75-6 chr1 118214898 118215344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29893 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 123.75-174 chr7 40656131 40656491 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 323628 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 157.75-184 chr9 89816396 89816666 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -152885 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 246-64 chr8 101158983 101159410 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 46477 NM_016096 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 114-37 chr12 60914402 60914666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1225164 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 127.25-193 chr7 50324950 50325170 + 0.75 NA intron (NM_001220771, intron 1 of 3) intron (NM_001220771, intron 1 of 3) 6012 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 237.25-66 chr7 41153906 41154446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52572 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 188.75-27 chr14 72375881 72376353 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1MA5A|LINE|L1 -140703 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 175.75-14 chr10 8785875 8786293 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111905 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 238.75-42 chr4 75375961 75376389 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 22099 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 181.5-108 chr3 57977826 57978170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30424 NM_001164317 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 133.5-60 chr12 33132355 33132671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -235667 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 112.25-207 chr8 20426709 20426973 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122878 NM_021020 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 183-32 chr14 88541027 88541476 + 0.75 NA intron (NM_007039, intron 2 of 18) intron (NM_007039, intron 2 of 18) 13756 NM_007039 11099 Hs.437040 NM_007039 ENSG00000070778 PTPN21 PTPD1|PTPRL10 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 21 protein-coding 152.25-165 chr9 4137335 4137719 + 0.75 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) intron (NM_001042413, intron 2 of 10) 14656 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 144.75-72 chr18 4816871 4817280 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -264107 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 211.25-16 chr12 76210638 76211028 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -49050 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 160.25-73 chr2 102764855 102765249 + 0.75 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) intron (NM_001321346, intron 3 of 3) 3021 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 119-118 chr3 88699356 88699565 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 361004 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 221-77 chr8 95322646 95323028 + 0.75 NA intron (NR_038208, intron 2 of 3) LTR16D|LTR|ERVL -53636 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 134.5-162 chr4 123087806 123088006 + 0.75 NA intron (NM_001345856, intron 13 of 15) L1MC1|LINE|L1 164828 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 136.5-175 chr5 28754269 28754486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172493 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 128-19 chr10 53387012 53387338 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -615475 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 238.25-41 chr2 173750511 173750873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 213188 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 115.75-99 chr2 53301567 53301764 + 0.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -466118 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 159.75-123 chr5 7348595 7348844 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_134277) promoter-TSS (NR_134277) -742 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 216.5-121 chr8 114843615 114844018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 824197 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 137.25-105 chr3 175523574 175523774 + 0.75 NA intron (NM_207015, intron 9 of 13) LTR10F|LTR|ERV1 154134 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 151.25-96 chr2 191682973 191683334 + 0.75 NA intron (NR_045623, intron 4 of 6) intron (NR_045623, intron 4 of 6) 5017 NR_045623 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 122.75-7 chr1 68198976 68199223 + 0.75 NA intron (NM_024911, intron 1 of 11) intron (NM_024911, intron 1 of 11) -15489 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 118.75-203 chr8 125306583 125306819 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -123657 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 144.5-97 chr2 22768585 22768880 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 232253 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 187.5-78 chr19 27571608 27571911 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -221672 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 194.5-79 chr20 9946030 9946349 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -40144 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 154.75-23 chr11 85904709 85904947 + 0.75 NA intron (NM_001286159, intron 7 of 10) L2|LINE|L2 49727 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 169-38 chr17 63204642 63204973 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) AluSx1|SINE|Alu 235460 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 159.5-57 chr14 95969224 95969504 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -69960 NM_001282464 56967 Hs.6434 NM_020215 ENSG00000227051 C14orf132 C14orf88 chromosome 14 open reading frame 132 protein-coding 195.25-65 chr3 191366586 191366931 + 0.75 NA intron (NM_178335, intron 4 of 11) intron (NM_178335, intron 4 of 11) -36222 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 112.5-127 chr2 133317668 133317852 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 51565 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 146.5-199 chr7 16946941 16947232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65103 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 171.75-25 chr11 76548420 76548727 + 0.75 NA intron (NM_001300942, intron 21 of 21) MIR3|SINE|MIR 103548 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 120.75-170 chr8 128546714 128547020 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L1MEd|LINE|L1 17812 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 211-46 chr4 60404233 60404770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -518118 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 157.75-147 chr6 2033991 2034361 + 0.75 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) MER58C|DNA|hAT-Charlie 141815 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 151-27 chr12 116335454 116335850 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -58466 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 122-156 chr6 53001175 53001400 + 0.75 NA TTS (NM_016513) TTS (NM_016513) 5667 NR_001445 125050 NR_001445 ENSG00000202198 RN7SK 7SK RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein snRNA 184 chr1 47690441 47690785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -253296 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 153.75-146 chr7 107417529 107417957 + 0.75 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) intron (NM_181733, intron 6 of 20) -52314 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 147.25-75 chr22 36724236 36724518 + 0.75 NA intron (NR_134623, intron 2 of 3) AluJo|SINE|Alu 20501 NR_134623 105373021 Hs.401697 NR_134623 LOC105373021 - uncharacterized LOC105373021 ncRNA 159.75-8 chr1 187151069 187151397 + 0.75 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) L1MA1|LINE|L1 58391 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 228.5-26 chr12 17574186 17574706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14632 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 133.25-179 chr5 111382736 111383127 + 0.75 NA intron (NM_001744, intron 4 of 10) intron (NM_001744, intron 4 of 10) -129295 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-52 chr14 52966525 52966934 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -15632 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 186.25-13 chr10 48751217 48751586 + 0.75 NA intron (NM_020945, intron 12 of 61) intron (NM_020945, intron 12 of 61) 65938 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 193-10 chr10 6730649 6730980 + 0.75 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 -6568 NR_138480 108570035 Hs.568834 NR_138480 LINP1 - lncRNA in non-homologous end joining pathway 1 ncRNA 159.75-135 chr5 77029083 77029370 + 0.75 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -1178 NM_018046 55109 Hs.634849 NM_018046 ENSG00000164252 AGGF1 GPATC7|GPATCH7|HSU84971|HUS84971|VG5Q angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 protein-coding 183.5-111 chr5 54720666 54721249 + 0.75 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) intron (NR_104658, intron 1 of 2) -17633 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 192.25-60 chr2 195851928 195852361 + 0.75 NA intron (NM_018897, intron 46 of 64) AluY|SINE|Alu 194918 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 161-131 chr9 102288494 102288848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230966 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 149.5-127 chr3 183143165 183143616 + 0.75 NA intron (NM_014398, intron 3 of 5) AluJr|SINE|Alu 19344 NM_014398 27074 Hs.518448 NM_014398 ENSG00000078081 LAMP3 CD208|DC LAMP|DC-LAMP|DCLAMP|LAMP|LAMP-3|TSC403 lysosomal associated membrane protein 3 protein-coding 274.75-45 chr5 152204006 152204687 + 0.75 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 200933 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 146-130 chr8 116438798 116439073 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113876 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 116.5-223 chr7 5643679 5643999 + 0.75 NA intron (NM_207111, intron 14 of 16) L1MB5|LINE|L1 36622 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 144.5-155 chr4 103469371 103469738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44512 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 175.5-4 chr1 75684006 75684247 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -40221 NM_001286044 34 Hs.445040 NM_000016 ENSG00000117054 ACADM ACAD1|MCAD|MCADH acyl-CoA dehydrogenase medium chain protein-coding 124-154 chr6 119668707 119668925 + 0.75 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 119008 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 197.5-164 chr8 126723795 126724316 + 0.75 NA Intergenic Mam_R4|LINE|Dong-R4 -165577 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 167.25-4 chr1 60924668 60925201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45842 NR_110617 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 140-84 chr20 3090300 3090533 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5692 NM_000490 551 Hs.89648 NM_000490 ENSG00000101200 AVP ADH|ARVP|AVP-NPII|AVRP|VP arginine vasopressin protein-coding 200.25-80 chr3 164845126 164845481 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13823 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 138-88 chr20 44730139 44730495 + 0.75 NA intron (NR_132377, intron 3 of 4) AluSz6|SINE|Alu 15473 NM_003881 8839 Hs.592145 NM_003881 ENSG00000064205 CCN5 CT58|CTGF-L|WISP2 cellular communication network factor 5 protein-coding 114.5-2 chr1 35412102 35412277 + 0.75 NA intron (NM_005095, intron 26 of 29) L1MB5|LINE|L1 -46112 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 162.25-165 chr9 123578059 123578391 + 0.75 NA intron (NM_001352968, intron 11 of 18) L1ME1|LINE|L1 -92603 NR_106972 102465688 NR_106972 ENSG00000274932 MIR7150 hsa-mir-7150 microRNA 7150 ncRNA 140-164 chr7 117408119 117408415 + 0.75 NA intron (NM_001301821, intron 4 of 12) MER21C|LTR|ERVL 19226 NM_001301822 136991 Hs.352412 NM_130768 ENSG00000154438 ASZ1 ALP1|ANKL1|C7orf7|CT1.19|GASZ|Orf3 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 protein-coding 129-122 chr3 130573005 130573421 + 0.75 NA intron (NM_001102608, intron 6 of 35) intron (NM_001102608, intron 6 of 35) 12879 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 121.25-84 chr18 2797136 2797307 + 0.75 NA intron (NM_015295, intron 47 of 47) intron (NM_015295, intron 47 of 47) -49785 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 209.75-3 chr1 199188594 199188960 + 0.75 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 40179 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 195-22 chr12 59558450 59558855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37377 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 172.75-133 chr8 121004679 121004977 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -192782 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 223.5-138 chr9 109558935 109559370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47607 NR_037493 100500898 NR_037493 ENSG00000263861 MIR3927 - microRNA 3927 ncRNA 168.5-26 chr10 29623776 29624112 + 0.75 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 11027 NM_021738 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 131.75-166 chr5 40923010 40923336 + 0.75 NA intron (NM_000587, intron 1 of 17) L1M1|LINE|L1 13676 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 207-43 chr2 57992747 57993115 + 0.75 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR -53711 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 122-80 chr18 49464844 49465211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4382 NM_001353213 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 128-3 chr1 53907335 53907590 + 0.75 NA intron (NR_136692, intron 3 of 3) intron (NR_136692, intron 3 of 3) 13275 NM_001324316 1733 Hs.251415 NM_000792 ENSG00000211452 DIO1 5DI|TXDI1 iodothyronine deiodinase 1 protein-coding 189.75-98 chr6 6355547 6355907 + 0.75 NA intron (NR_026970, intron 6 of 7) intron (NR_026970, intron 6 of 7) -35036 NM_000129 2162 Hs.335513 NM_000129 ENSG00000124491 F13A1 F13A coagulation factor XIII A chain protein-coding 115.25-80 chr17 68716782 68717114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 88794 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 155.25-20 chr1 232585121 232585573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69739 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 155.25-155 chr6 82111439 82111693 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -9801 NR_149135 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 115-140 chr5 120749589 120749901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 218281 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 130-101 chr3 24131104 24131401 + 0.75 NA intron (NM_001354708, intron 8 of 9) intron (NM_001354708, intron 8 of 9) -20072 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 171.5-31 chr11 118329483 118329759 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 13084 NM_001040651 915 Hs.504048 NM_000732 ENSG00000167286 CD3D CD3-DELTA|IMD19|T3D CD3d molecule protein-coding 281.25-13 chr12 12737850 12738326 + 0.75 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) intron (NM_001130415, intron 1 of 1) 12171 NM_001130415 81575 Hs.23388 NM_030817 ENSG00000178878 APOLD1 VERGE apolipoprotein L domain containing 1 protein-coding 206-61 chr5 97038036 97038632 + 0.75 NA TTS (NM_175920) TTS (NM_175920) 79901 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 133.75-156 chr4 114412882 114413110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185406 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 227.75-68 chr5 115538048 115538433 + 0.75 NA intron (NM_020177, intron 2 of 2) intron (NM_020177, intron 2 of 2) 6535 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 143-146 chr8 90167862 90168093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53511 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 149.25-3 chr1 32603791 32604047 + 0.75 NA non-coding (NR_111980, exon 4 of 4) non-coding (NR_111980, exon 4 of 4) 46631 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 173-9 chr1 215553062 215553330 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -14108 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 127.5-125 chr2 132971502 132971698 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 7 of 17) L2c|LINE|L2 56043 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 152-72 chr19 13443253 13443546 + 0.75 NA intron (NM_023035, intron 3 of 46) AluJo|SINE|Alu 63061 NM_001127221 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 118-24 chr11 13198581 13198843 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -77940 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 158-91 chr21 36042500 36042737 + 0.75 NA intron (NR_040087, intron 6 of 10) intron (NR_040087, intron 6 of 10) 17746 NM_001007261 54093 Hs.606200 NM_017438 ENSG00000185917 SETD4 C21orf18|C21orf27 SET domain containing 4 protein-coding 159-97 chr6 121104628 121104900 + 0.75 NA intron (NR_104452, intron 34 of 35) intron (NR_104452, intron 34 of 35) 229716 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 222.75-31 chr12 74905817 74906201 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 303739 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 129.25-81 chr19 32511478 32511703 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -69600 NM_004708 9141 Hs.443831 NM_004708 ENSG00000105185 PDCD5 TFAR19 programmed cell death 5 protein-coding 124.5-38 chr11 79264852 79265076 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 2 of 33) intron (NM_001098816, intron 2 of 33) 137145 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 145.5-29 chr10 119547827 119548082 + 0.75 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 -5235 NM_001005339 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 178.5-101 chr3 2171892 2172367 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -27888 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 194.5-66 chr2 60976937 60977373 + 0.75 NA intron (NM_144709, intron 4 of 17) intron (NM_144709, intron 4 of 17) 40057 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 153.25-134 chr8 92609399 92609811 + 0.75 NA intron (NR_125827, intron 3 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 45889 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 116.5-108 chr2 8218770 8219161 + 0.75 NA intron (NR_152741, intron 9 of 9) intron (NR_152741, intron 9 of 9) 109454 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 165-96 chr3 132710381 132710650 + 0.75 NA intron (NR_037804, intron 6 of 44) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -11235 NR_152743 348808 Hs.586111 NR_002811 ENSG00000248724 NPHP3-AS1 NCRNA00119 NPHP3 antisense RNA 1 ncRNA 117-7 chr1 151508550 151508867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2679 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 164.25-82 chr20 29893360 29893788 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -13111 NR_039688 100616184 NR_039688 ENSG00000276029 MIR4477A - microRNA 4477a ncRNA 221.25-88 chr8 48454318 48454696 + 0.75 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -97060 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 186-96 chr9 127750851 127751302 + 0.75 NA intron (NM_001252334, intron 4 of 11) intron (NM_001252334, intron 4 of 11) 4206 NM_001142534 10044 Hs.306412 NM_005489 ENSG00000095370 SH2D3C CHAT|NSP3|PRO34088|SHEP1 SH2 domain containing 3C protein-coding 159-93 chr6 10980565 10980960 + 0.75 NA TTS (NM_017770) TTS (NM_017770) -26673 NR_125851 101928191 Hs.638939 NR_125851 LOC101928191 - uncharacterized LOC101928191 ncRNA 136.75-25 chr10 50538806 50539171 + 0.75 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) intron (NM_147156, intron 2 of 10) 84968 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 192.25-28 chr16 5913822 5914208 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -105009 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 193-79 chr6 63356395 63356794 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36611 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 126.75-253 chr9 89275116 89275509 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -35883 NM_001827 1164 Hs.83758 NM_001827 ENSG00000123975 CKS2 CKSHS2 CDC28 protein kinase regulatory subunit 2 protein-coding 137.25-93 chr3 33894008 33894273 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 95510 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 137-58 chr16 59638028 59638247 + 0.75 NA Intergenic MER96|DNA|hAT-Tip100 117054 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 113.25-104 chr22 27689096 27689312 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 112552 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 117.75-18 chr1 242128813 242129142 + 0.75 NA intron (NM_001320272, intron 6 of 10) intron (NM_001320272, intron 6 of 10) -129879 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 148-19 chr12 41236718 41237029 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 48553 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 158.25-17 chr10 126826566 126826932 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -78660 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 155-121 chr6 63967732 63967997 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) MIRc|SINE|MIR 161028 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 184.5-94 chr22 28347780 28348089 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -111935 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 182.5-128 chr5 19368628 19369013 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 517452 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 164.5-224 chr9 104899336 104899676 + 0.75 NA intron (NM_005502, intron 2 of 49) AluSz|SINE|Alu 28649 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 143.5-70 chr14 68583797 68584058 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) MER115|DNA|hAT-Tip100 44860 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 155.5-59 chr15 80638915 80639239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56233 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 173.25-132 chr8 138723515 138723879 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 25 of 64) intron (NM_152888, intron 25 of 64) 190344 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 152.25-132 chr5 118752177 118752431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 156116 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 190.5-131 chr5 163909413 163909697 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 403936 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 278-19 chr2 179890180 179890615 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -28785 NR_148054 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 119-190 chr8 28025624 28025893 + 0.75 NA intron (NM_001010906, intron 18 of 18) intron (NM_001010906, intron 18 of 18) -33085 NM_173833 286133 Hs.591833 NM_173833 ENSG00000168079 SCARA5 NET33|Tesr scavenger receptor class A member 5 protein-coding 242.25-52 chr2 182393178 182393670 + 0.75 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 33624 NM_001363871 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 120.25-29 chr10 75638712 75638914 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -8696 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 172.25-16 chr10 36112420 36112715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 334265 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 113.75-126 chr3 40128537 40128779 + 0.75 NA intron (NM_001284426, intron 1 of 14) LTR32|LTR|ERVL 28647 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 120.5-13 chr1 178504443 178504679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8548 NM_001170722 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 127.5-135 chr2 230343218 230343463 + 0.75 NA intron (NM_001352892, intron 2 of 18) L1PA11|LINE|L1 16169 NM_001308162 93349 Hs.589661 NM_138402 ENSG00000185404 SP140L - SP140 nuclear body protein like protein-coding 148-49 chr18 62948839 62949078 + 0.75 NA intron (NM_194449, intron 12 of 16) intron (NM_194449, intron 12 of 16) 233417 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 278-22 chr3 169310513 169311000 + 0.75 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -137111 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 183.25-58 chr2 100332157 100332512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9601 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 120-135 chr4 100367131 100367349 + 0.75 NA Intergenic Kanga1d|DNA|TcMar-Tc2 28007 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 158.25-67 chr2 139107429 139107816 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 210298 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 204.5-108 chr5 106188039 106188418 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 822786 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 152.25-101 chr3 5805536 5806038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -555532 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 142-139 chr6 34769546 34769913 + 0.75 NA intron (NR_029472, intron 3 of 4) intron (NR_029472, intron 3 of 4) 12224 NM_003093 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 112.25-167 chr5 96145018 96145352 + 0.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) LTR90A|LTR|LTR 66047 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 161.75-80 chr22 22779822 22780240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42745 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 163.75-101 chr4 6662110 6662499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11577 NR_134665 105374366 Hs.438950 NR_134664 ENSG00000251580 LINC02482 - long intergenic non-protein coding RNA 2482 ncRNA 257.75-11 chr11 133569650 133570093 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -37370 NM_001319104 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 190.5-172 chrX 154492396 154492723 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -1930 NM_019848 8273 Hs.522826 NM_019848 ENSG00000126903 SLC10A3 DXS253E|P3 solute carrier family 10 member 3 protein-coding 121.25-170 chr5 163080374 163080613 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -357078 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 189-72 chr20 58996126 58996489 + 0.75 NA intron (NM_001336, intron 5 of 5) intron (NM_001336, intron 5 of 5) 10947 NM_001336 1522 Hs.252549 NM_001336 ENSG00000101160 CTSZ CTSX cathepsin Z protein-coding 133.25-167 chr5 23201627 23201835 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -305878 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 194.75 chr1 73802000 73802367 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 127504 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 209.75-99 chr8 83545359 83545862 + 0.75 NA Intergenic LTR10F|LTR|ERV1 141852 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 145.75-170 chr9 99618537 99618815 + 0.75 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 201213 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 143-48 chr16 76988353 76988593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119537 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 115.75-128 chr20 51613481 51613691 + 0.75 NA intron (NM_006045, intron 23 of 27) intron (NM_006045, intron 23 of 27) -50747 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 163.75-136 chr9 36305755 36306012 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -28827 NM_001190388 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 240.75-47 chr2 188315738 188316105 + 0.75 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 18429 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 150.75-178 chr8 60532967 60533383 + 0.75 NA intron (NM_001242644, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 16188 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 121.75-27 chr12 9883286 9883576 + 0.75 NA intron (NM_001190765, intron 1 of 5) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 1942 NM_001190765 100431172 Hs.725113 NM_001190765 ENSG00000256797 KLRF2 NKp65 killer cell lectin like receptor F2 protein-coding 139.5-119 chr21 16676822 16677065 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 86706 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 176.25-110 chr5 43020387 43020775 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_104650) promoter-TSS (NR_104650) -938 NR_104650 648987 Hs.649468 NR_034085 ENSG00000177738 LOC648987 - uncharacterized LOC648987 ncRNA 131.25-58 chr14 56302276 56302516 + 0.75 NA TTS (NM_021255) TTS (NM_021255) 183985 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 127.5-248 chr8 131713835 131714152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190100 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 126.5-82 chr16 8851334 8851593 + 0.75 NA intron (NR_147908, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu 1994 NR_147908 100130283 Hs.735515 NR_147908 LOC100130283 - uncharacterized LOC100130283 ncRNA 161.75-54 chr18 66857917 66858250 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -223501 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 217.5-33 chr12 39494745 39495160 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -51832 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 225.75-64 chr5 93889636 93890130 + 0.75 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -148283 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 158.5-110 chr2 197274712 197275019 + 0.75 NA intron (NR_046837, intron 5 of 5) AluJo|SINE|Alu 27654 NR_046837 101927547 Hs.687027 NR_046837 ENSG00000236977 ANKRD44-IT1 - ANKRD44 intronic transcript 1 ncRNA 249.5-67 chr3 119112755 119113385 + 0.75 NA intron (NM_152538, intron 1 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 32950 NM_152538 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 161-25 chr12 20056503 20056840 + 0.75 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 41986 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 119.75-119 chr2 224613734 224613923 + 0.75 NA Intergenic (ACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28431 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 159.75-90 chr2 186106001 186106238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19802 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 131.25-65 chr14 89229152 89229327 + 0.75 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 187994 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 179.75-82 chr4 59088221 59088608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74841 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 118.5-78 chr18 9030715 9030905 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -71889 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 125.5-265 chr8 138134732 138134953 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 19 of 19) intron (NM_015912, intron 19 of 19) -51297 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 146.25-159 chr8 131998984 131999321 + 0.75 NA intron (NM_015137, intron 19 of 22) intron (NM_015137, intron 19 of 22) 60230 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 192-104 chr9 2034372 2034776 + 0.75 NA intron (NM_001289397, intron 3 of 32) intron (NM_001289397, intron 3 of 32) 12629 NM_001289396 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 172-27 chr12 9716721 9717131 + 0.75 NA intron (NM_001267701, intron 2 of 2) intron (NM_001267701, intron 2 of 2) 16373 NM_001267701 160365 Hs.560087 NM_172004 ENSG00000184293 CLECL1 DCAL-1|DCAL1 C-type lectin like 1 protein-coding 143.5-172 chr5 58238011 58238243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115786 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 267.25-2 chr1 90454244 90454782 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -203237 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 164-4 chr1 68874017 68874454 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -181663 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 160.25-88 chr3 19963380 19963858 + 0.75 NA intron (NM_001292048, intron 2 of 5) intron (NM_001292048, intron 2 of 5) 16522 NM_004162 5868 Hs.475663 NM_004162 ENSG00000144566 RAB5A RAB5 RAB5A, member RAS oncogene family protein-coding 180-98 chr5 12807067 12807439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139394 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 196-90 chr7 78512367 78512775 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 4 of 20) AluSx3|SINE|Alu 165329 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 126.25-109 chr3 4454084 4454470 + 0.75 NA intron (NM_001164674, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 12992 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 113.75-16 chr1 220030348 220030720 + 0.75 NA intron (NM_004446, intron 5 of 31) intron (NM_004446, intron 5 of 31) 15971 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 186.75-11 chr10 62230650 62231161 + 0.75 NA intron (NM_145307, intron 6 of 11) L2c|LINE|L2 37939 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 196.25-32 chr14 22215471 22215773 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 217131 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 175.5-100 chr2 209690753 209691092 + 0.75 NA intron (NM_001039538, intron 7 of 14) intron (NM_001039538, intron 7 of 14) -80910 NM_182587 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 132.75-152 chr5 72008529 72008902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98760 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 114-8 chr1 66312765 66312951 + 0.75 NA intron (NM_001037340, intron 5 of 14) MER58A|DNA|hAT-Charlie -19250 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 194.25-30 chr14 67952399 67952854 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 129034 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 155.5-41 chr12 2432717 2433086 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 163125 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 200.5-78 chr20 54608272 54608662 + 0.75 NA intron (NM_018431, intron 5 of 7) intron (NM_018431, intron 5 of 7) 132874 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 186.5-59 chr2 32824384 32824725 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_027098) promoter-TSS (NR_027098) -879 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 113-66 chr15 59364928 59365145 + 0.75 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluSq2|SINE|Alu 7835 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 165.5-87 chr2 160972687 160973091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -164066 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 158.25-81 chr22 26527553 26527833 + 0.75 NA intron (NM_003595, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 15161 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 145-83 chr2 185136590 185136917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30319 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 203.25-54 chr2 133436490 133436802 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 131817 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 112.25-218 chr8 111930299 111930556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 553788 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 120.5-24 chr10 70226686 70226885 + 0.75 NA intron (NM_021129, intron 2 of 10) intron (NM_021129, intron 2 of 10) 6644 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 188.5-80 chr2 150047822 150048254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188847 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 138.25-166 chr8 13344542 13344779 + 0.75 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -67876 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 145.25-169 chr8 68874230 68874536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 229807 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 204.25-93 chr5 112668810 112669397 + 0.75 NA intron (NR_104673, intron 1 of 2) intron (NR_104673, intron 1 of 2) 13785 NR_104673 102467216 Hs.174158 NR_104673 LOC102467216 - uncharacterized LOC102467216 ncRNA 123.75-39 chr12 30416936 30417209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 260172 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 141.5-129 chr21 35030801 35031138 + 0.75 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) L1MA8|LINE|L1 8457 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 166-89 chr4 47310573 47311010 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 152911 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 285-39 chr5 160470425 160470978 + 0.75 NA intron (NR_132748, intron 1 of 1) intron (NR_132748, intron 1 of 1) 2450 NR_132748 107075116 Hs.735831 NR_132748 ENSG00000253522 MIR3142HG - MIR3142 host gene ncRNA 180.5-53 chr16 3193136 3193609 + 0.75 NA intron (NM_001370640, intron 3 of 3) CpG 4250 NM_012360 4992 Hs.664502 NM_012360 ENSG00000168124 OR1F1 OLFMF|OR16-36|OR16-37|OR16-88|OR16-89|OR16-90|OR1F10|OR1F13P|OR1F4|OR1F5|OR1F6|OR1F7|OR1F8|OR1F9|OR3-145|ORL1023 olfactory receptor family 1 subfamily F member 1 protein-coding 193.25-37 chr15 95703411 95703850 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 270537 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 124.25-84 chr18 37163327 37163664 + 0.75 NA intron (NR_136303, intron 9 of 13) intron (NR_136303, intron 9 of 13) -110965 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 223.25-3 chr1 79435696 79436251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -429243 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 155.25-58 chr14 60608522 60608905 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30503 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 130-82 chr2 203120474 203120727 + 0.75 NA intron (NM_001114132, intron 17 of 54) intron (NM_001114132, intron 17 of 54) 105721 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 133.75-34 chr11 88208002 88208248 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 31623 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 137-181 chr8 125550258 125550666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118253 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 140.25-113 chr3 14238249 14238632 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 59623 NM_014463 27258 Hs.111632 NM_014463 ENSG00000170860 LSM3 SMX4|USS2|YLR438C LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 141.25-40 chr12 114035417 114035677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69222 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 154.25-148 chr6 140668446 140668769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15207 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 119.75-18 chr10 13545304 13545550 + 0.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -16413 NM_001369863 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 148-91 chr4 64828625 64828901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175737 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 150.5-228 chr8 132860046 132860283 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -6794 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 193.5-129 chr5 22867308 22867643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14131 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 209.75-107 chr9 72990430 72990947 + 0.75 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -37635 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 178.5-106 chr3 41208537 41208985 + 0.75 NA intron (NM_001904, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 9256 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 114.25-70 chr16 86304475 86304762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18187 NR_038438 146513 Hs.434338 NR_038438 ENSG00000268532 LINC02135 - long intergenic non-protein coding RNA 2135 ncRNA 118.25-82 chr17 32807430 32807837 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) intron (NM_015194, intron 1 of 21) 69491 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 116-116 chr4 52498676 52498944 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157729 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 152.25-85 chr2 84771079 84771380 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 64 of 76) AluSp|SINE|Alu 109855 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 162-34 chr12 117174059 117174471 + 0.75 NA exon (NM_033624, exon 6 of 12) exon (NM_033624, exon 6 of 12) 16205 NM_033624 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 134.5-25 chr10 58546225 58546481 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) MER102c|DNA|hAT-Charlie 33481 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 128.25-53 chr14 92413447 92413743 + 0.75 NA intron (NM_153647, intron 3 of 17) intron (NM_153647, intron 3 of 17) 89787 NM_153646 123041 Hs.385530 NM_153646 ENSG00000140090 SLC24A4 AI2A5|NCKX4|SHEP6|SLC24A2 solute carrier family 24 member 4 protein-coding 123.5-215 chr8 137522658 137522905 + 0.75 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -109193 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 125.25-173 chr6 123000016 123000270 + 0.75 NA intron (NM_001010852, intron 2 of 5) intron (NM_001010852, intron 2 of 5) 3908 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 191.5-10 chr1 109779248 109779615 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15508 NM_024526 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 180.5-168 chrX 49073719 49074182 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_007213) promoter-TSS (NM_007213) 52 NM_007213 11230 Hs.29595 NM_007213 ENSG00000243279 PRAF2 JM4|Yip6a PRA1 domain family member 2 protein-coding 171.75-138 chr8 85209048 85209355 + 0.75 NA exon (NM_001951, exon 6 of 8) exon (NM_001951, exon 6 of 8) 11173 NM_001099673 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 222.25-80 chr7 68331127 68331609 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 311115 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 127.5-13 chr1 95844762 95845075 + 0.75 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -147150 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 138.25-132 chr4 121269735 121270036 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -42402 NM_001244764 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 131.75-4 chr1 62436792 62437093 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_003368) promoter-TSS (NM_003368) -107 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 181.75-108 chr5 38043808 38044089 + 0.75 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) L1ME3|LINE|L1 18251 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 125.75-163 chr6 96425510 96425752 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -96175 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 162-132 chrX 94218235 94218695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 544259 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 132-67 chr17 19256782 19257022 + 0.75 NA intron (NM_001102664, intron 1 of 7) intron (NM_001102664, intron 1 of 7) -14491 NR_046824 100874309 Hs.733657 NR_046824 EPN2-IT1 - EPN2 intronic transcript 1 ncRNA 153.5-63 chr15 46178720 46179119 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 473724 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 132-147 chr6 55077804 55078066 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -28525 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 194-16 chr10 43037586 43037957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39256 NM_020630 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 155.75-61 chr16 68790843 68791241 + 0.75 NA intron (NM_001317185, intron 2 of 15) intron (NM_001317185, intron 2 of 15) -52489 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 294.5-49 chr7 79341014 79341668 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -111616 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 150.25-62 chr16 56138038 56138296 + 0.75 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 52927 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 169-9 chr10 50204189 50204598 + 0.75 NA intron (NM_001143974, intron 12 of 18) L2|LINE|L2 44217 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 121.5-176 chr3 66984079 66984342 + 0.75 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -14097 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 210.25-37 chr2 24515747 24516108 + 0.75 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) 24050 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 141.75-83 chr19 47999118 47999393 + 0.75 NA intron (NM_022142, intron 1 of 6) L1MB4|LINE|L1 4623 NM_022142 64100 Hs.104894 NM_022142 ENSG00000169393 ELSPBP1 E12|EDDM12|EL149|HE12 epididymal sperm binding protein 1 protein-coding 168.75-144 chr8 72103586 72104006 + 0.75 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -28212 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 146.5-106 chr2 102687717 102688124 + 0.75 NA intron (NM_003048, intron 5 of 11) AluSx1|SINE|Alu 48968 NR_136173 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 152.5-37 chr12 70851004 70851298 + 0.75 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR -62231 NM_001207015 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 117.25-77 chr14 72472011 72472209 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 8 of 16) intron (NM_001370288, intron 8 of 16) -44710 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 267.25-45 chr8 120318595 120319179 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 40 of 47) intron (NM_021110, intron 40 of 47) 126263 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 158.75-53 chr14 58362613 58362912 + 0.75 NA intron (NM_002892, intron 19 of 23) AluSz|SINE|Alu -33168 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 118.25-41 chr11 73262439 73262668 + 0.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -1952 NM_176797 5031 Hs.16362 NM_004154 ENSG00000171631 P2RY6 P2Y6 pyrimidinergic receptor P2Y6 protein-coding 221.25-40 chr2 114493584 114493999 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 32214 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 135.75-159 chr4 53577752 53577975 + 0.75 NA intron (NM_001126328, intron 1 of 10) intron (NM_001126328, intron 1 of 10) 13623 NM_001126328 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 209.5-56 chr18 10720488 10720820 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 33 of 51) AluJo|SINE|Alu 38995 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 112.5-52 chr12 39243690 39243911 + 0.75 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 199320 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 224-50 chr6 105637490 105637911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -234618 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 140-102 chr3 33405429 33405709 + 0.75 NA intron (NM_001128160, intron 7 of 14) AluJr4|SINE|Alu 34809 NM_001128160 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 154.5-48 chr12 58567295 58567596 + 0.75 NA intron (NR_120452, intron 7 of 7) LTR85b|LTR|Gypsy? -24257 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 152.25-103 chr3 98536255 98536476 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4387 NM_005290 2838 Hs.162987 NM_005290 ENSG00000154165 GPR15 BOB G protein-coupled receptor 15 protein-coding 118.5-172 chr5 170386888 170387133 + 0.75 NA intron (NM_004137, intron 1 of 3) intron (NM_004137, intron 1 of 3) 2357 NM_004137 3779 Hs.484099 NM_004137 ENSG00000145936 KCNMB1 BKbeta1|K(VCA)beta|SLO-BETA|hbeta1|hslo-beta|k(VCA)beta-1|slo-beta-1 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 1 protein-coding 163.25-33 chr12 59488023 59488296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107870 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 191.75-35 chr14 31418634 31419050 + 0.75 NA intron (NM_015473, intron 1 of 35) intron (NM_015473, intron 1 of 35) 1708 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 209.25-82 chr3 141647994 141648340 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -15032 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 144.75-3 chr1 62220981 62221278 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 26280 NM_019079 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 196-56 chr20 348608 348937 + 0.75 NA intron (NM_001323685, intron 1 of 3) intron (NM_001323685, intron 1 of 3) 867 NM_001323685 80023 Hs.416024 NM_024958 ENSG00000125841 NRSN2 C20orf98|dJ1103G7.6 neurensin 2 protein-coding 163.5-205 chr8 75362317 75362626 + 0.75 NA Intergenic HERVP71A-int|LTR|ERV1 -45178 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 185-78 chr7 40484822 40485343 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR 350106 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 164-56 chr2 27604265 27604615 + 0.75 NA intron (NM_001271289, intron 8 of 12) L1ME1|LINE|L1 21398 NM_032434 84450 Hs.529178 NM_032434 ENSG00000243943 ZNF512 - zinc finger protein 512 protein-coding 135.5-188 chr7 64122812 64123153 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 77548 NM_001159522 442319 Hs.640774 NM_001159522 ENSG00000214652 ZNF727 ZNF727P zinc finger protein 727 protein-coding 160-3 chr1 47351592 47351839 + 0.75 NA intron (NM_001136140, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 17925 NM_016308 51727 Hs.731647 NM_016308 ENSG00000162368 CMPK1 CK|CMK|CMPK|UMK|UMP-CMPK|UMPK cytidine/uridine monophosphate kinase 1 protein-coding 172.75-6 chr1 154264208 154264559 + 0.75 NA TTS (NM_001287815) TTS (NM_001287815) 4656 NR_145714 109617023 NR_145714 ENSG00000201129 SNORA58B - small nucleolar RNA, H/ACA box 58B snoRNA 123.5-67 chr15 81989109 81989402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56763 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 181.25-42 chr16 66930620 66931059 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 3563 NR_024525 51647 Hs.9825 NM_016062 ENSG00000166595 CIAO2B CGI-128|CIA2B|FAM96B|MIP18 cytosolic iron-sulfur assembly component 2B protein-coding 309.25-27 chr8 81742971 81743654 + 0.75 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 10864 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 190-44 chr3 114843336 114843792 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) AluJb|SINE|Alu -29469 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 199-78 chr6 168581245 168581610 + 0.75 NA intron (NM_001166412, intron 7 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 140243 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 250.5-80 chr6 56388648 56389175 + 0.75 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) L1M1|LINE|L1 5217 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 160.5-34 chr12 24112726 24113048 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -99534 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 156-15 chr10 30246464 30246781 + 0.75 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie 34770 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 153.5-132 chr3 105756597 105756910 + 0.75 NA intron (NR_135806, intron 4 of 20) L1ME3B|LINE|L1 110838 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 156-169 chrX 83462493 83462752 + 0.75 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -45668 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 147.5-62 chr14 64705522 64705876 + 0.75 NA intron (NM_001308147, intron 1 of 16) intron (NM_001308147, intron 1 of 16) 1275 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 189.5-131 chr7 39825853 39826221 + 0.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 92469 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 191.5-80 chr2 171795069 171795426 + 0.75 NA intron (NR_047549, intron 12 of 16) intron (NR_047549, intron 12 of 16) 98997 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 150.25-97 chr3 46402230 46402571 + 0.75 NA intron (NR_125406, intron 1 of 3) intron (NR_125406, intron 1 of 3) 4659 NR_125406 102724297 Hs.622021 NR_125406 LOC102724297 - uncharacterized LOC102724297 ncRNA 197.75-31 chr17 56759811 56760134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73948 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 147.25-96 chr4 60506085 60506384 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -416385 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 178-83 chr6 35878285 35878580 + 0.75 NA intron (NM_003137, intron 6 of 15) L1M4c|LINE|L1 42666 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 134.5-33 chr10 102322293 102322654 + 0.75 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) intron (NM_001199378, intron 3 of 39) -71637 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 173.75-113 chr4 21046037 21046416 + 0.75 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -62217 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 188.25-26 chr12 5984532 5984808 + 0.75 NA intron (NM_000552, intron 40 of 51) L3|LINE|CR1 -38438 NM_001278597 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 139.25-140 chr4 109324578 109324824 + 0.75 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 21666 NR_160939 645078 Hs.518784 NM_001039778 ZCCHC23 - zinc finger CCHC-type containing 23 ncRNA 123-87 chr18 10853380 10853630 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) MER50|LTR|ERV1 -93856 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 162.75-54 chr17 72425208 72425546 + 0.75 NA intron (NR_152516, intron 2 of 3) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 82566 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 222.5-114 chr8 122363863 122364361 + 0.75 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack 204532 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 136-118 chr5 5988049 5988425 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 349055 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 125.5-108 chr17 60954374 60954603 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) L1MB3|LINE|L1 276637 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 147.25-111 chr5 150179176 150179528 + 0.75 NA intron (NM_001804, intron 1 of 2) intron (NM_001804, intron 1 of 2) -10710 NM_014228 6534 Hs.241597 NM_014228 ENSG00000011083 SLC6A7 PROT solute carrier family 6 member 7 protein-coding 155.25-29 chr10 95188812 95189212 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5188 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 117-184 chr8 73843434 73843692 + 0.75 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) AluJr4|SINE|Alu 35299 NR_073121 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 127.75-118 chr20 44738817 44739025 + 0.75 NA non-coding (NR_132377, exon 2 of 5) non-coding (NR_132377, exon 2 of 5) -6944 NM_022358 60598 Hs.528664 NM_022358 ENSG00000124249 KCNK15 K2p15.1|KCNK11|KCNK14|KT3.3|TASK-5|TASK5|dJ781B1.1 potassium two pore domain channel subfamily K member 15 protein-coding 258.75-3 chr1 177037808 177038197 + 0.75 NA intron (NM_207108, intron 2 of 21) intron (NM_207108, intron 2 of 21) -8557 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 116.25-131 chr22 37777255 37777510 + 0.75 NA TTS (NM_007032) TTS (NM_007032) -27725 NM_005318 3005 Hs.745024 NM_005318 ENSG00000189060 H1F0 H10|H1FV H1 histone family member 0 protein-coding 192-49 chr15 62678270 62678681 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 8 of 55) L1M1|LINE|L1 31164 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 222.5-100 chr6 131602542 131602925 + 0.75 NA intron (NM_015979, intron 17 of 30) intron (NM_015979, intron 17 of 30) 25509 NM_001270521 9439 Hs.29679 NM_004830 ENSG00000112282 MED23 ARC130|CRSP130|CRSP133|CRSP3|DRIP130|MRT18|SUR-2|SUR2 mediator complex subunit 23 protein-coding 265.5-28 chr15 96342771 96343311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9276 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 121.5-79 chr14 69539734 69539951 + 0.75 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 35029 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 164-42 chr15 68430317 68430608 + 0.75 NA intron (NM_001004439, intron 1 of 29) MIRb|SINE|MIR 1701 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 143.5-106 chr2 20158785 20159029 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 66223 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 151.25-135 chr4 20164124 20164453 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -87617 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 125.75-194 chr9 100600259 100600509 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22305 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 124.5-189 chr6 65333450 65333631 + 0.75 NA intron (NM_001142801, intron 11 of 11) L1M4b|LINE|L1 32122 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 113-115 chr3 27450149 27450336 + 0.75 NA intron (NM_001258380, intron 2 of 23) L2c|LINE|L2 6536 NM_001258380 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 155-29 chr12 88531109 88531412 + 0.75 NA intron (NM_000899, intron 3 of 9) intron (NM_000899, intron 3 of 9) 49211 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 317.5-2 chr10 50956004 50956769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34502 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 180.5-32 chr13 83691743 83692044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190500 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 242.75-51 chr4 109050786 109051239 + 0.75 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 251646 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 140.5 chr1 8093713 8094032 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67563 NM_018948 54206 Hs.605445 NM_018948 ENSG00000116285 ERRFI1 GENE-33|MIG-6|MIG6|RALT ERBB receptor feedback inhibitor 1 protein-coding 153.5-179 chr7 20546229 20546557 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69274 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 117.25-158 chr4 104061133 104061289 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -341226 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 114.75-83 chr2 34767161 34767402 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 89724 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 134-32 chr11 95413101 95413378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -180764 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 156.5-32 chr12 2805324 2805777 + 0.75 NA TTS (NM_002014) TTS (NM_002014) -7118 NR_130744 55846 Hs.239 NM_018463 ENSG00000111203 ITFG2 FGGAP1|MDS028 integrin alpha FG-GAP repeat containing 2 protein-coding 116.75-6 chr1 79387431 79387676 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -380823 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 121-45 chr11 118096038 118096347 + 0.75 NA intron (NM_001290094, intron 2 of 12) intron (NM_001290094, intron 2 of 12) -9229 NM_001354434 100526771 Hs.627426 NM_001354434 SMIM35 TMPRSS4-AS1 small integral membrane protein 35 protein-coding 168-78 chr22 25721166 25721545 + 0.75 NA exon (NM_005160, exon 20 of 21) exon (NM_005160, exon 20 of 21) -20833 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 226.25-15 chr11 19884337 19884836 + 0.75 NA intron (NM_001244963, intron 6 of 39) intron (NM_001244963, intron 6 of 39) -124503 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 152-88 chr2 104932368 104932619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59898 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 150.25-65 chr17 19461125 19461343 + 0.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 50002 NM_007148 7732 Hs.189482 NM_007148 ENSG00000128482 RNF112 BFP|ZNF179 ring finger protein 112 protein-coding 183.75-31 chr12 82061232 82061756 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 107775 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 133.5-275 chr9 24276072 24276353 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 269464 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 120.25-136 chr3 154816846 154817118 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -207142 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 212.75-7 chr1 104785061 104785571 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 712293 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 177.75-41 chr14 50647767 50648119 + 0.75 NA intron (NM_021818, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 20363 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 119-193 chr8 47665130 47665337 + 0.75 NA intron (NM_001352960, intron 3 of 12) L1M4b|LINE|L1 5569 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 187-100 chr8 81726036 81726435 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -4931 NR_033196 79752 Hs.655453 NM_024699 ENSG00000104231 ZFAND1 - zinc finger AN1-type containing 1 protein-coding 170.5-166 chr7 5170184 5170530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19876 NM_015610 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 127.75-21 chr1 179368856 179369216 + 0.75 NA intron (NR_073544, intron 3 of 25) intron (NR_073544, intron 3 of 25) 2992 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 139.5-8 chr1 220617269 220617586 + 0.75 NA intron (NM_018650, intron 7 of 17) intron (NM_018650, intron 7 of 17) -72936 NM_024709 79762 Hs.519839 NM_024709 ENSG00000162817 C1orf115 - chromosome 1 open reading frame 115 protein-coding 129.5-176 chr5 17454251 17454505 + 0.75 NA intron (NR_134270, intron 1 of 2) intron (NR_134270, intron 1 of 2) 10368 NR_134270 102723526 NR_134270 ENSG00000249662 LINC02218 - long intergenic non-protein coding RNA 2218 ncRNA 115.5-26 chr10 97961593 97961925 + 0.75 NA intron (NM_001206528, intron 2 of 14) FLAM_C|SINE|Alu 68862 NM_018058 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 127.25-215 chr9 36428452 36428622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27339 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 122.75-189 chr7 102059694 102059990 + 0.75 NA intron (NM_001913, intron 3 of 22) intron (NM_001913, intron 3 of 22) -225299 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 171.25-8 chr1 182276049 182276385 + 0.75 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 37844 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 139-77 chr2 98441970 98442367 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -2419 NM_001351424 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 208-42 chr2 135158116 135158565 + 0.75 NA intron (NM_001172435, intron 19 of 24) L1MC4|LINE|L1 21712 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 123.5-107 chr2 118986079 118986284 + 0.75 NA intron (NM_006770, intron 12 of 16) intron (NM_006770, intron 12 of 16) 44012 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 123.75-209 chrX 125048550 125048899 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -84907 NM_014253 10178 Hs.23796 NM_014253 ENSG00000009694 TENM1 ODZ1|ODZ3|TEN-M1|TNM|TNM1|ten-1 teneurin transmembrane protein 1 protein-coding 158.75-43 chr12 69341860 69342142 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6353 NM_000239 4069 Hs.524579 NM_000239 ENSG00000090382 LYZ LYZF1|LZM lysozyme protein-coding 297.5-20 chr15 85097990 85098555 + 0.75 NA intron (NM_001243137, intron 9 of 21) intron (NM_001243137, intron 9 of 21) 116298 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 155-75 chr20 45560720 45561080 + 0.75 NA intron (NM_130896, intron 2 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie -13499 NM_001198986 100526773 Hs.274876 NM_001198986 ENSG00000249139 EPPIN-WFDC6 SPINLW1-WFDC6 EPPIN-WFDC6 readthrough protein-coding 151.75-114 chr5 110175992 110176316 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292972 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 274.5-30 chr2 17017599 17018117 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -352024 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 135.5-26 chr10 56586654 56587048 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -225578 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 260-43 chr7 149466031 149466452 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -5179 NM_015694 27153 Hs.38512 NM_015694 ENSG00000196453 ZNF777 - zinc finger protein 777 protein-coding 157.5-153 chr4 124710005 124710310 + 0.75 NA exon (NM_020337, exon 2 of 5) exon (NM_020337, exon 2 of 5) 2575 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 118.25-30 chr10 57045282 57045515 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 259161 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 141.25-123 chr4 85524959 85525296 + 0.75 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) intron (NM_001025616, intron 1 of 9) 49977 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 169.5-83 chr2 187497129 187497383 + 0.75 NA intron (NM_001318941, intron 3 of 7) intron (NM_001318941, intron 3 of 7) -49004 NM_005795 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 221-35 chr2 56742529 56742930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -556959 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 192.75-112 chr6 47572408 47572924 + 0.75 NA intron (NM_012120, intron 5 of 17) MIRb|SINE|MIR -83806 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 139.75-54 chr14 77943835 77944182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 143899 NM_001142545 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 128-85 chr2 209921735 209921970 + 0.75 NA intron (NM_032504, intron 33 of 63) intron (NM_032504, intron 33 of 63) -80713 NM_001278289 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 161.25-125 chr3 95076389 95076776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 138319 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 177.5-162 chr7 52565645 52565985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -469818 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 124.75-26 chr10 33295107 33295331 + 0.75 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 39448 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 131-155 chr7 40698571 40698777 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 281265 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 199.5-10 chr1 199536860 199537327 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 388495 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 281.75-14 chr12 122823281 122824103 + 0.75 NA intron (NM_201435, intron 12 of 12) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -11056 NM_001303099 9026 Hs.524815 NM_003959 ENSG00000130787 HIP1R HIP12|HIP3|ILWEQ huntingtin interacting protein 1 related protein-coding 163.25-40 chr14 33547376 33547691 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -161404 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 124.25-119 chr20 59156423 59156630 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -34494 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 166.5-151 chr4 141664628 141664934 + 0.75 NA intron (NR_037840, intron 2 of 7) L1MC5|LINE|L1 28198 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 118-196 chr8 135537202 135537449 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 79869 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 172.25-87 chr3 52602878 52603400 + 0.75 NA intron (NM_001366074, intron 20 of 30) intron (NM_001366074, intron 20 of 30) 66534 NM_001124767 440957 Hs.660577 NM_001124767 ENSG00000168273 SMIM4 C3orf78 small integral membrane protein 4 protein-coding 213.5-45 chr16 55440561 55441125 + 0.75 NA intron (NR_147198, intron 4 of 6) MIR|SINE|MIR 21454 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 235.5-34 chr14 70086917 70087319 + 0.75 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -6901 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 138.75-8 chr1 115406095 115406377 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -68000 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 160.75-38 chr13 75346459 75346805 + 0.75 NA intron (NM_001286658, intron 5 of 19) L1PA7|LINE|L1 106044 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 218.25-41 chr2 77094688 77095030 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1M2|LINE|L1 108894 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 244-14 chr13 32789900 32790280 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 121562 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 153-76 chr2 150569188 150569461 + 0.75 NA intron (NR_110241, intron 4 of 5) intron (NR_110241, intron 4 of 5) 2897 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 174.25-149 chr8 141329294 141329560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11122 NR_024441 731779 Hs.586414 NR_024441 ENSG00000253595 LINC01300 - long intergenic non-protein coding RNA 1300 ncRNA 162.5-164 chr7 126274840 126275132 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 783198 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 197.25-27 chr13 86120631 86120952 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -321372 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 171.75-114 chr5 101593759 101594045 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -690620 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 139.5-88 chr18 13942802 13943029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27208 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 113.5-75 chr14 51388477 51388782 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 8506 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 137.5-12 chr1 169244064 169244278 + 0.75 NA intron (NR_104229, intron 7 of 12) intron (NR_104229, intron 7 of 12) 123626 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 219-25 chr12 90181435 90181790 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -111706 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 249.25-11 chr14 50124325 50124817 + 0.75 NA intron (NM_006939, intron 21 of 22) L1ME4c|LINE|L1 -7999 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 129.75-102 chr2 207128363 207128580 + 0.75 NA intron (NM_001270943, intron 1 of 3) L1MC4a|LINE|L1 5666 NM_001270944 8609 Hs.59908 NM_003709 ENSG00000118263 KLF7 UKLF Kruppel like factor 7 protein-coding 161.25-63 chr15 101465890 101466335 + 0.75 NA intron (NM_138325, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 23595 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 126.25-167 chr5 132245440 132245681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12098 NM_001131027 8572 Hs.424312 NM_003687 ENSG00000131435 PDLIM4 RIL PDZ and LIM domain 4 protein-coding 153.75-89 chr3 72554471 72554741 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -107983 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 142.5-192 chr6 122630672 122631019 + 0.75 NA intron (NM_181795, intron 1 of 4) intron (NM_181795, intron 1 of 4) 20440 NM_181795 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 157.25-39 chr14 37414806 37415019 + 0.75 NA intron (NM_138731, intron 11 of 13) intron (NM_138731, intron 11 of 13) 180337 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 150.25-73 chr2 12706784 12707118 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -9921 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 177.75-17 chr10 57071351 57071614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 233077 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 135.5-84 chr18 10803731 10804048 + 0.75 NA exon (NM_022068, exon 9 of 52) exon (NM_022068, exon 9 of 52) -44240 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 157.75-164 chr7 136060544 136060760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83293 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 153-150 chr8 79902574 79902869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30984 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 169.25-13 chr11 25896177 25896560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -292755 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 119-113 chr3 15103897 15104168 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4875 NR_126155 64145 Hs.475565 NM_022340 ENSG00000131381 RBSN Rabenosyn-5|ZFYVE20 rabenosyn, RAB effector protein-coding 179.75-61 chr2 95281648 95282143 + 0.75 NA intron (NM_144707, intron 12 of 23) intron (NM_144707, intron 12 of 23) 7446 NM_001165977 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 149.25-39 chr13 48179485 48179893 + 0.75 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -53517 NM_021999 9445 Hs.643683 NM_021999 ENSG00000136156 ITM2B ABRI|BRI|BRI2|BRICD2B|E25B|E3-16|FBD|RDGCA|imBRI2 integral membrane protein 2B protein-coding 164.25-130 chr5 113397129 113397395 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) 37727 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 115.5-207 chr5 161333293 161333576 + 0.75 NA intron (NM_000813, intron 8 of 9) L2b|LINE|L2 214690 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 179.75-139 chr8 131682767 131683367 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -221026 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 195.25-78 chr5 120014711 120015136 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 385364 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 118-190 chr8 107853983 107854333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 227781 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 138.5-174 chr6 121995404 121995881 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -403909 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 280.25-36 chr3 9811544 9812217 + 0.75 NA intron (NM_001366051, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 1618 NM_001366051 26140 Hs.726435 NM_015644 ENSG00000214021 TTLL3 HOTTL tubulin tyrosine ligase like 3 protein-coding 119-55 chr15 58479756 58480026 + 0.75 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 18844 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 153-54 chr16 50565843 50566228 + 0.75 NA intron (NM_033119, intron 3 of 9) intron (NM_033119, intron 3 of 9) 17639 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 143.5-44 chr12 40563695 40563993 + 0.75 NA intron (NM_173600, intron 167 of 173) intron (NM_173600, intron 167 of 173) -128595 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 192-73 chr3 73933628 73934069 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 124604 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 132.75-91 chr19 29196531 29196708 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16532 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 188.75-32 chr15 59752415 59752807 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63291 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 130.75-194 chr8 107395278 107395482 + 0.75 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) L1MA4A|LINE|L1 -58865 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 122-125 chr4 29635482 29635679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 421288 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 158.25-31 chr12 27782662 27782939 + 0.75 NA intron (NM_020782, intron 1 of 2) intron (NM_020782, intron 1 of 2) 2567 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 187-73 chr4 134306972 134307507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105450 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 230.75-11 chr10 67181571 67182044 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 6 of 17) intron (NM_001127384, intron 6 of 17) 169541 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 158.5-186 chr8 47455414 47455864 + 0.75 NA intron (NM_001080394, intron 8 of 19) L1MB4|LINE|L1 194701 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 143.75-7 chr1 97160239 97160635 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) intron (NM_000110, intron 20 of 22) 64514 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 151-136 chr8 138052069 138052415 + 0.75 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) intron (NR_161374, intron 1 of 7) 31303 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 125.75-140 chr4 91959411 91959717 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 317738 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 168.75-122 chr6 66453087 66453492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 665410 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 183.25-14 chr10 86796470 86796886 + 0.75 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 40039 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 140.5-199 chr6 111396705 111397089 + 0.75 NA intron (NM_001286431, intron 7 of 34) L1MA4A|LINE|L1 -86575 NR_034111 643749 Hs.486228 NR_034108 ENSG00000231889 TRAF3IP2-AS1 C6UAS|C6orf3|NCRNA00248|TRAF3IP2-AS2 TRAF3IP2 antisense RNA 1 ncRNA 237.25-35 chr16 53163616 53164050 + 0.75 NA intron (NM_001352127, intron 2 of 38) intron (NM_001352127, intron 2 of 38) 7907 NM_001308319 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 138-66 chr18 3442970 3443385 + 0.75 NA intron (NM_001278686, intron 2 of 3) MamRep38|DNA|hAT -4365 NM_173207 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 170-92 chr7 113091667 113092016 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4063 NM_001146265 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 164-51 chr17 45116241 45116635 + 0.75 NA intron (NM_133373, intron 8 of 14) intron (NM_133373, intron 8 of 14) -2005 NR_106842 102465470 NR_106842 ENSG00000277249 MIR6784 hsa-mir-6784 microRNA 6784 ncRNA 216.75-55 chr4 52788700 52789048 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1120 NR_040106 152578 Hs.383806 NR_040106 ENSG00000250302 LINC01618 - long intergenic non-protein coding RNA 1618 ncRNA 139-98 chr4 37575406 37575749 + 0.75 NA intron (NM_001104629, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 -8656 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 139.75-62 chr15 99532616 99532864 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -32677 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 162-26 chr11 81932203 81932463 + 0.75 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -41497 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 117.25-49 chr12 8632428 8632682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19696 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 174.25-109 chr3 196067707 196068115 + 0.75 NA intron (NM_001313966, intron 6 of 16) intron (NM_001313966, intron 6 of 16) 14179 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 149.25-86 chr2 145315421 145315885 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 647686 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 160.5-67 chr17 30083274 30083721 + 0.75 NA intron (NM_198529, intron 18 of 22) AluSp|SINE|Alu -33310 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 166.25-48 chr14 78080080 78080468 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -90099 NR_158973 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 133-43 chr14 28201880 28202125 + 0.75 NA Intergenic (AGATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -528781 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 182-88 chr5 53062133 53062428 + 0.75 NA intron (NR_073106, intron 12 of 29) intron (NR_073106, intron 12 of 29) 47477 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 123.75-76 chr17 61164380 61164615 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluJr|SINE|Alu 203207 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 172.25-14 chr10 11512184 11512575 + 0.75 NA intron (NM_014688, intron 5 of 14) intron (NM_014688, intron 5 of 14) 19901 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 133.75-45 chr13 55257988 55258252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83666 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 118.25-86 chr18 6871363 6871612 + 0.75 NA intron (NM_001010000, intron 6 of 16) intron (NM_001010000, intron 6 of 16) 37002 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 220.75-26 chr14 81586680 81587123 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 36160 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 130.5-149 chr20 50820626 50820956 + 0.75 NA intron (NM_017843, intron 2 of 5) intron (NM_017843, intron 2 of 5) 25897 NM_001010974 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 119-183 chr7 33987707 33988012 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 82320 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 208.75-20 chr12 37642441 37642907 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -674100 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 286-28 chr4 30628046 30628772 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91960 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 121.25-48 chr13 53982663 53982994 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 150043 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 213.75-6 chr1 152574242 152574716 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6037 NM_032563 84648 Hs.244349 NM_032563 ENSG00000163202 LCE3D LEP16|SPRL6A|SPRL6B late cornified envelope 3D protein-coding 185.25-99 chr5 41498838 41499334 + 0.75 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) L1M4c|LINE|L1 11515 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 161.25-153 chr6 72416736 72417062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50153 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 140.5-219 chr7 93364134 93364407 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 118585 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 134-136 chr4 154379844 154380263 + 0.75 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie 111746 NM_001358235 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 139.75-50 chr14 57525583 57526001 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -31935 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 173-18 chr10 86512823 86513223 + 0.75 NA intron (NM_001318328, intron 2 of 18) intron (NM_001318328, intron 2 of 18) 8761 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 113.5-243 chr8 144251338 144251539 + 0.75 NA intron (NM_001288814, intron 31 of 41) L1MEd|LINE|L1 11299 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 176-55 chr4 80472614 80472905 + 0.75 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) LTR32|LTR|ERVL 137039 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 138.25-139 chr5 44513852 44514054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3671 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 161.25-128 chr4 104044 104456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20226 NR_110527 255403 Hs.636638 NM_001039127 ENSG00000250312 ZNF718 - zinc finger protein 718 protein-coding 196-20 chr12 42280994 42281345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42690 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 320.75-11 chr2 165902176 165903025 + 0.75 NA intron (NM_024753, intron 19 of 28) intron (NM_024753, intron 19 of 28) -30659 NR_045375 100506124 Hs.709870 NR_045375 LOC100506124 - uncharacterized LOC100506124 ncRNA 154-53 chr18 3722434 3722743 + 0.75 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) LTR83|LTR|ERVL 118851 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 171.5-19 chr10 75480774 75481045 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 49285 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 186 chr1 74370029 74370453 + 0.75 NA intron (NM_015978, intron 16 of 24) intron (NM_015978, intron 16 of 24) 113199 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 143-28 chr12 48735055 48735382 + 0.75 NA intron (NM_001351123, intron 1 of 3) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 7783 NM_001351123 255411 Hs.404103 NM_001351123 ENSG00000257987 TEX49 LINC00935 testis expressed 49 protein-coding 151-107 chr5 25496367 25496640 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 305550 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 118.25-137 chr4 40880281 40880497 + 0.75 NA intron (NM_173075, intron 11 of 16) intron (NM_173075, intron 11 of 16) -23197 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 121.25-166 chr5 115336711 115336928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40165 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 185.75-42 chr14 43805302 43805740 + 0.75 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 701762 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 156.25-74 chr2 118104765 118105013 + 0.75 NA intron (NM_001321330, intron 2 of 4) intron (NM_001321330, intron 2 of 4) 16339 NM_001321329 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 130.75-128 chr3 193273735 193273993 + 0.75 NA TTS (NM_198505) TTS (NM_198505) 32085 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 189.75-129 chr9 71935834 71936250 + 0.75 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) intron (NM_001365055, intron 2 of 4) 24403 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 136-69 chr2 58928952 58929392 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) intron (NR_033873, intron 6 of 13) -288536 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 150.75-130 chr3 99805687 99805993 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -12022 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 169.75-131 chr5 146569640 146569917 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -53665 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 118.25-34 chr11 1212164 1212461 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10754 NM_002458 727897 Hs.523395 NM_002458 ENSG00000117983 MUC5B MG1|MUC-5B|MUC5|MUC9 mucin 5B, oligomeric mucus/gel-forming protein-coding 142.5-140 chr3 79219842 79220112 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -191750 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 195-78 chr7 40182182 40182536 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 3 of 14) AluSz|SINE|Alu 47383 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 115-132 chr5 41736888 41737213 + 0.75 NA intron (NR_157114, intron 15 of 15) intron (NR_157114, intron 15 of 15) 106607 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 113.5-245 chr9 16614583 16614763 + 0.75 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu -112141 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 159.25-118 chr5 73785708 73786033 + 0.75 NA intron (NM_001177693, intron 7 of 35) intron (NM_001177693, intron 7 of 35) -27676 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 202.5-67 chr2 40179692 40180179 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 250369 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 153.75-136 chr6 169604255 169604706 + 0.75 NA intron (NM_182552, intron 22 of 25) L1PB4|LINE|L1 97549 NM_001350623 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 131.75-167 chr5 58551386 58551742 + 0.75 NA intron (NR_109904, intron 1 of 3) intron (NR_109904, intron 1 of 3) 6679 NR_109904 101928600 Hs.694699 NR_109904 ENSG00000250127 LINC02108 - long intergenic non-protein coding RNA 2108 ncRNA 168.25-67 chr2 26367590 26367860 + 0.75 NA intron (NR_137633, intron 4 of 9) intron (NR_137633, intron 4 of 9) -20936 NM_153835 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 135.5-88 chr18 33732290 33732689 + 0.75 NA intron (NM_030632, intron 9 of 11) L2b|LINE|L2 154270 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 128.75-8 chr1 92848248 92848525 + 0.75 NA intron (NM_001006605, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 7667 NR_002444 26782 Hs.180946 NR_002444 ENSG00000207523 SNORA66 RNU66|U66 small nucleolar RNA, H/ACA box 66 snoRNA 150.25-18 chr10 29869477 29869864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132734 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 211.75-69 chr4 156291331 156291768 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -337683 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 231.25-64 chr5 6672640 6673093 + 0.75 NA non-coding (NR_136739, exon 6 of 6) non-coding (NR_136739, exon 6 of 6) 34845 NR_103771 100505625 Hs.550028 NR_103771 ENSG00000248677 LINC02102 - long intergenic non-protein coding RNA 2102 ncRNA 192-63 chr2 176713800 176714309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76300 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 159.25-130 chr6 126626189 126626500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141713 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 164.25-89 chr22 19329742 19330087 + 0.75 NA TTS (NM_003325) TTS (NM_003325) -38195 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 165.25-101 chr4 47377023 47377392 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) AluSq|SINE|Alu 86495 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 208.25-99 chr9 33359256 33359872 + 0.75 NA intron (NM_002504, intron 19 of 23) AluSx1|SINE|Alu 43004 NM_001170 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 119-147 chr5 50790257 50790474 + 0.75 NA intron (NM_024615, intron 10 of 25) intron (NM_024615, intron 10 of 25) 122951 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 247.25-42 chr3 111986051 111986539 + 0.75 NA non-coding (NR_073570, exon 2 of 4) non-coding (NR_073570, exon 2 of 4) 7269 NM_001272069 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 170-97 chr8 69936486 69936841 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -101685 NM_030958 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 181.25-17 chr11 16092847 16093296 + 0.75 NA intron (NM_017508, intron 8 of 14) intron (NM_017508, intron 8 of 14) -123450 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 154-19 chr10 58023755 58024093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 243970 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 174.75-39 chr16 3015922 3016313 + 0.75 NA intron (NM_021195, intron 1 of 1) intron (NM_021195, intron 1 of 1) 2066 NM_021195 9074 Hs.533779 NM_021195 ENSG00000184697 CLDN6 - claudin 6 protein-coding 146.25-77 chr2 160046248 160046630 + 0.75 NA intron (NM_001007267, intron 1 of 26) intron (NM_001007267, intron 1 of 26) 16176 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 139.5-207 chr8 6299597 6299943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106778 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 218.5-64 chr20 41901339 41901779 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -283182 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 133.25-73 chr17 11658650 11658877 + 0.75 NA intron (NM_001372, intron 14 of 68) L1ME2|LINE|L1 60293 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 215.75-57 chr2 229435993 229436399 + 0.75 NA intron (NM_139072, intron 8 of 12) L1PA15|LINE|L1 -164909 NM_001100818 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 138.5-29 chr10 122074497 122074715 + 0.75 NA intron (NM_206861, intron 3 of 19) intron (NM_206861, intron 3 of 19) -38279 NM_001291879 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 124-56 chr16 31858178 31858456 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -15441 NR_049749 10308 Hs.460645 NM_003414 ENSG00000185947 ZNF267 HZF2 zinc finger protein 267 protein-coding 125.75-74 chr18 6301333 6301620 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) intron (NM_001365769, intron 4 of 16) 44732 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 179-2 chr1 25247455 25247778 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_135143) promoter-TSS (NR_135143) -97 NR_135144 57035 Hs.259412 NM_020317 ENSG00000117616 RSRP1 C1orf63|NPD014 arginine and serine rich protein 1 protein-coding 177.5-159 chr7 4323717 4324106 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -189074 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 247-21 chr14 54575414 54575855 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 8022 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 204-68 chr5 157317909 157318378 + 0.75 NA intron (NM_001037333, intron 13 of 30) L1MB8|LINE|L1 27534 NM_001001343 408263 Hs.437066 NM_001001343 ENSG00000172568 FNDC9 C5orf40 fibronectin type III domain containing 9 protein-coding 166.75-128 chr7 1914899 1915280 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) intron (NM_001013837, intron 17 of 18) 25482 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 215.25-57 chr3 3252533 3252996 + 0.75 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -73047 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 134.25-118 chr3 124641760 124641949 + 0.75 NA intron (NM_007064, intron 4 of 26) intron (NM_007064, intron 4 of 26) 57195 NM_001323000 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 208.75-14 chr11 6733412 6733741 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11697 NR_003945 387751 Hs.494757 NR_003945 ENSG00000254838 GVINP1 GVIN1|GVIN1P|VLIG-1|VLIG1 GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 pseudo 133.75-118 chr21 26502597 26502777 + 0.75 NA intron (NM_052954, intron 2 of 3) intron (NM_052954, intron 2 of 3) 70599 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 239.75-35 chr2 183346166 183346817 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 222048 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 183.25-55 chr2 80760567 80760838 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 447323 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 151.75-159 chr9 2269553 2269882 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 111261 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 112.25-68 chr15 51647287 51647502 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24623 NM_001174117 23312 Hs.511386 NM_015263 ENSG00000104093 DMXL2 DFNA71|PEPNS|RC3 Dmx like 2 protein-coding 211.5-68 chr2 19837697 19838019 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -30996 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 117.25-209 chr8 66442736 66443080 + 0.75 NA intron (NM_144650, intron 3 of 13) intron (NM_144650, intron 3 of 13) 10404 NM_144650 137872 Hs.720023 NM_144650 ENSG00000147576 ADHFE1 ADH8|HMFT2263|HOT alcohol dehydrogenase iron containing 1 protein-coding 148.25-2 chr1 35876607 35876839 + 0.75 NA intron (NM_001317123, intron 1 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -6472 NM_001317122 26523 Hs.22867 NM_012199 ENSG00000092847 AGO1 EIF2C|EIF2C1|GERP95|Q99|hAgo1 argonaute RISC component 1 protein-coding 190-20 chr15 97451942 97452201 + 0.75 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 69740 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 145.75-50 chr16 6450495 6450738 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -323193 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 214.5-42 chr16 65904117 65904646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -328081 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 243.75-49 chr21 31660871 31661329 + 0.75 NA intron (NM_000454, intron 1 of 4) intron (NM_000454, intron 1 of 4) 1478 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 126-175 chr8 116201244 116201503 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) L1MB4|LINE|L1 123686 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 229.25 chr1 24852092 24852497 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 67122 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 187.75-87 chr5 81541864 81542309 + 0.75 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) L1PA16|LINE|L1 -147952 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 212-47 chr20 36345202 36345605 + 0.75 NA intron (NM_001365621, intron 1 of 12) intron (NM_001365621, intron 1 of 12) 39064 NM_014902 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 142.5-238 chr9 78769355 78769614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 376182 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 136.75-141 chr4 36241326 36241578 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 1 of 32) intron (NR_146894, intron 1 of 32) 2487 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 164.5-80 chr17 45294515 45294857 + 0.75 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) MER5A|DNA|hAT-Charlie 22334 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 222.75-61 chr2 75300874 75301465 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -101649 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 150.75-157 chr6 16490604 16490953 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 6 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 252191 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 134.5-24 chr10 54969563 54969809 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MEc|LINE|L1 -168395 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 126.75-213 chr6 82576527 82576740 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 212389 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 150.25-30 chr11 1899900 1900204 + 0.75 NA intron (NR_120534, intron 1 of 3) MER57A-int|LTR|ERV1 3293 NR_120534 101927624 Hs.523404 NR_120534 LINC01150 2G7|TCONS_00019134 long intergenic non-protein coding RNA 1150 ncRNA 123.25-144 chr4 16208840 16209069 + 0.75 NA intron (NM_153365, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu 17517 NM_153365 202018 Hs.479223 NM_153365 ENSG00000169762 TAPT1 CMVFR|OCLSBG transmembrane anterior posterior transformation 1 protein-coding 128-67 chr19 42635019 42635394 + 0.75 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) intron (NR_073180, intron 2 of 2) -40282 NM_001816 1088 Hs.41 NM_001816 ENSG00000124469 CEACAM8 CD66b|CD67|CGM6|NCA-95 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 8 protein-coding 180.75-95 chr3 128699144 128699662 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -26733 NM_004637 7879 Hs.684374 NM_004637 ENSG00000075785 RAB7A PRO2706|RAB7 RAB7A, member RAS oncogene family protein-coding 161.5-196 chr9 28827034 28827301 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 36539 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 130.25-47 chr12 79153824 79154052 + 0.75 NA intron (NM_005639, intron 3 of 10) MIRc|SINE|MIR 108246 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 123-198 chr9 95828216 95828594 + 0.75 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) MER20|DNA|hAT-Charlie -47286 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 171.25-115 chr5 21912098 21912326 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 6 of 14) intron (NM_004061, intron 6 of 14) -22365 NM_001364109 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 222.75-5 chr1 171969873 171970466 + 0.75 NA intron (NM_001278252, intron 2 of 14) intron (NM_001278252, intron 2 of 14) 105977 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 121.5-118 chr18 63037103 63037433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 282112 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 178.5-118 chr4 39235140 39235545 + 0.75 NA intron (NM_025132, intron 20 of 36) AluJr|SINE|Alu 52813 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 130-6 chr1 111730664 111730913 + 0.75 NA intron (NM_198926, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 8607 NM_019099 55924 Hs.193406 NM_019099 ENSG00000197852 INKA2 C1orf183|FAM212B inka box actin regulator 2 protein-coding 166.5-50 chr12 20410362 20410827 + 0.75 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 41349 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 136.5-21 chr10 37848240 37848472 + 0.75 NA intron (NR_147991, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 9254 NM_001267607 57209 Hs.528423 NM_021045 ENSG00000198105 ZNF248 bA162G10.3 zinc finger protein 248 protein-coding 137.75-143 chr3 180251992 180252421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161967 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 263.5-5 chr10 55057700 55058162 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -256640 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 139.5-171 chr5 36932143 36932490 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L1ME1|LINE|L1 55547 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 196.5-48 chr14 52495109 52495462 + 0.75 NA intron (NM_001160047, intron 9 of 20) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 57220 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 132.25-178 chr8 11181301 11181490 + 0.75 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) 19971 NR_138152 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 112.5-244 chr9 80854498 80854682 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 834945 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 173-80 chr3 2240743 2241181 + 0.75 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) intron (NM_001206955, intron 1 of 23) 2133 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 121.25-136 chr3 140677329 140677575 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_152616) promoter-TSS (NM_152616) -612 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 167.5-112 chr22 19820928 19821188 + 0.75 NA intron (NM_053004, intron 3 of 7) intron (NM_053004, intron 3 of 7) 33816 NM_053004 54584 Hs.105642 NM_053004 ENSG00000185838 GNB1L DGCRK3|FKSG1|GY2|WDR14|WDVCF G protein subunit beta 1 like protein-coding 195.5-64 chr2 13889930 13890190 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 510898 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 223-55 chr3 180017949 180018366 + 0.75 NA intron (NM_016559, intron 1 of 14) intron (NM_016559, intron 1 of 14) 18780 NM_001349389 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 131.75-47 chr12 21943327 21943573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6756 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 114.75-148 chr5 16460719 16460882 + 0.75 NA intron (NM_033414, intron 3 of 5) intron (NM_033414, intron 3 of 5) 5000 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 225-4 chr1 181899067 181899460 + 0.75 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 162449 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 149.25-171 chr7 106293513 106293925 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -8736 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 200.25-89 chr5 104564484 104565046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -534709 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 224-62 chr8 53648974 53649544 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125294 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 144.5-213 chr8 38936561 38936809 + 0.75 NA intron (NM_021623, intron 3 of 11) intron (NM_021623, intron 3 of 11) 35339 NM_021623 59339 Hs.369123 NM_021623 ENSG00000169499 PLEKHA2 TAPP2 pleckstrin homology domain containing A2 protein-coding 144.5-197 chr7 22297669 22297925 + 0.75 NA intron (NM_012294, intron 5 of 25) L1MEf|LINE|L1 59357 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 172.5-6 chr1 78211189 78211440 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -18285 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 132.25-25 chr10 7949706 7949975 + 0.75 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 102651 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 140.75-41 chr13 33157830 33158117 + 0.75 NA intron (NM_178007, intron 3 of 13) intron (NM_178007, intron 3 of 13) 28118 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 203-3 chr1 44415032 44415325 + 0.75 NA intron (NM_001319956, intron 2 of 14) intron (NM_001319956, intron 2 of 14) -8823 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 119.75-21 chr10 55186899 55187098 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -385707 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 143.5-216 chr8 120621544 120621775 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -139594 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 165.5-169 chr6 119760689 119761146 + 0.75 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 211109 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 175.75-107 chr5 66875762 66876074 + 0.75 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) AluJo|SINE|Alu 47145 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 128.25-35 chr12 54980800 54981217 + 0.75 NA intron (NM_001136030, intron 1 of 10) FLAM_C|SINE|Alu 923 NM_001098815 9840 Hs.33187 NM_014796 ENSG00000135426 TESPA1 HSPC257|ITPRID3|KIAA0748 thymocyte expressed, positive selection associated 1 protein-coding 145-85 chr2 206193134 206193421 + 0.75 NA intron (NM_001098199, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu -10099 NR_104359 101669764 Hs.574781 NR_104359 GPR1-AS GPR1-AS1|GPR1AS GPR1 antisense RNA ncRNA 196.25-77 chr22 32846350 32846762 + 0.75 NA intron (NM_000362, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 45740 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 183.25-113 chr8 109626593 109626994 + 0.75 NA intron (NM_001099746, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 16397 NM_001099756 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 199.25-61 chr2 182524513 182524961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1892 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 220.5-122 chr8 82615982 82616441 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -295893 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 158.25-39 chr14 36986009 36986542 + 0.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) L1MC4|LINE|L1 -33884 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 141.5-145 chr3 117490446 117490765 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 200320 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 116.25-140 chr3 61483423 61483749 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -77985 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 183.5-63 chr2 54215877 54216335 + 0.75 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 40123 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 158.75-86 chr2 64534162 64534454 + 0.75 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) intron (NM_001002243, intron 1 of 8) 8795 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 204-19 chr15 60614903 60615213 + 0.75 NA intron (NM_002943, intron 1 of 10) intron (NM_002943, intron 1 of 10) 12472 NM_002943 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 127-66 chr15 58155101 58155316 + 0.75 NA intron (NM_020980, intron 1 of 5) intron (NM_020980, intron 1 of 5) 16827 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 158-99 chr3 82243139 82243562 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) L3|LINE|CR1 257208 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 248.25-24 chr16 59962307 59962693 + 0.75 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 107147 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 130.25-194 chr8 42401479 42401652 + 0.75 NA intron (NM_001135694, intron 6 of 9) intron (NM_001135694, intron 6 of 9) 9685 NM_005662 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 153.25-12 chr10 36641807 36642275 + 0.75 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -483816 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 154.75-102 chr3 172948128 172948362 + 0.75 NA intron (NM_031955, intron 6 of 10) L1M1|LINE|L1 192990 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 213.5-60 chr2 79064488 79064881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23309 NM_006507 5968 Hs.4158 NM_006507 ENSG00000172023 REG1B PSPS2|REGH|REGI-BETA|REGL regenerating family member 1 beta protein-coding 171.5-105 chr3 128030622 128030858 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -21697 NM_013336 29927 Hs.518236 NM_013336 ENSG00000058262 SEC61A1 HNFJ4|HSEC61|SEC61|SEC61A SEC61 translocon alpha 1 subunit protein-coding 116.75-64 chr15 62885738 62885921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61872 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 211-26 chr17 70593748 70594053 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 424365 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 210-38 chr17 56816936 56817365 + 0.75 NA intron (NM_001085430, intron 4 of 7) AluJo|SINE|Alu 16770 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 139.25-99 chr2 214067931 214068310 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 12 of 14) MIR1_Amn|SINE|MIR 310053 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 195.75-116 chr8 41731720 41732266 + 0.75 NA intron (NM_020475, intron 3 of 41) intron (NM_020475, intron 3 of 41) 65629 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 142.25-46 chr12 88543453 88543769 + 0.75 NA intron (NM_000899, intron 2 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 36860 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 244-6 chr11 31505260 31505658 + 0.75 NA intron (NM_144981, intron 1 of 6) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 4163 NM_144981 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 144.75-151 chr6 169321264 169321499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67267 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 159.5-178 chr5 169753158 169753500 + 0.75 NA intron (NR_156756, intron 23 of 52) L1PA8|LINE|L1 116054 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 170.75-82 chr22 35202492 35202837 + 0.75 NA intron (NR_126356, intron 1 of 5) intron (NR_126356, intron 1 of 5) 28392 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 190.25-80 chr22 28377995 28378320 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSz6|SINE|Alu -81712 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 142-85 chr2 74650255 74650460 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2019 NM_001281296 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 213.75-51 chr2 101463740 101464110 + 0.75 NA intron (NM_001367509, intron 2 of 13) LTR78|LTR|ERV1 11187 NM_001367510 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 134.75-108 chr2 81911972 81912288 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -445184 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 288.5-2 chr1 62477175 62477638 + 0.75 NA intron (NM_001367561, intron 44 of 49) intron (NM_001367561, intron 44 of 49) 40357 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 207-33 chr15 92834677 92835254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39481 NR_033769 728619 Hs.684129 NR_033769 ASB9P1 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 pseudo 148.75-90 chr2 155006606 155006811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 308013 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 200.5-93 chr3 152651897 152652414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -182976 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 128.75-67 chr16 50510779 50511071 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -37471 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 124.75-186 chr6 170581368 170581628 + 0.75 NA TTS (NM_001199464) TTS (NM_001199464) 3139 NM_002598 5134 Hs.367900 NM_002598 ENSG00000071994 PDCD2 RP8|ZMYND7 programmed cell death 2 protein-coding 152.5-161 chr6 24577861 24578150 + 0.75 NA intron (NM_001350410, intron 10 of 21) intron (NM_001350410, intron 10 of 21) 5222 NM_001252328 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 171.25-80 chr2 125409152 125409518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 708650 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 141.5-154 chr3 178669229 178669604 + 0.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 110566 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 196-4 chr1 75910827 75911316 + 0.75 NA intron (NM_002440, intron 19 of 19) intron (NM_002440, intron 19 of 19) 21333 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 147-157 chr9 71359587 71359840 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 87258 NM_001366143 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 210.5-111 chr6 49717267 49717898 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -3992 NM_001261822 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 160.75-121 chr5 43303931 43304301 + 0.75 NA intron (NM_002130, intron 1 of 9) intron (NM_002130, intron 1 of 9) 9065 NM_001364188 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 188.5-15 chr10 105433177 105433601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 386944 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 136-112 chr4 67353950 67354220 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 67915 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 142.5-164 chr5 27792048 27792505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 319984 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 217.25-56 chr3 178692987 178693443 + 0.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) L1PA13|LINE|L1 134365 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 114.5-177 chr3 72773813 72774219 + 0.75 NA intron (NM_018130, intron 10 of 10) intron (NM_018130, intron 10 of 10) 74429 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 155.5-64 chr16 86181337 86181771 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14627 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 164.5-32 chr11 108597584 108597878 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3963 NM_001308019 23086 Hs.28540 NM_015065 ENSG00000110723 EXPH5 SLAC2-B|SLAC2B exophilin 5 protein-coding 117.25-76 chr14 69819315 69819615 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 7705 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 145.5-163 chr5 120163807 120164228 + 0.75 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -300261 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 127.5-117 chr2 73563346 73563529 + 0.75 NA intron (NM_015120, intron 15 of 22) intron (NM_015120, intron 15 of 22) 78985 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 125.5-172 chr3 62025865 62026124 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) intron (NM_002841, intron 4 of 29) 292953 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 129.25-64 chr16 55474283 55474492 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4443 NM_001302508 4313 Hs.513617 NM_004530 ENSG00000087245 MMP2 CLG4|CLG4A|MMP-2|MMP-II|MONA|TBE-1 matrix metallopeptidase 2 protein-coding 146.75-161 chr8 106585044 106585456 + 0.75 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -72558 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 149.75-65 chr17 60868580 60868947 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 8 of 25) intron (NM_001330413, intron 8 of 25) 190912 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 221.75-70 chr6 167118316 167118654 + 0.75 NA intron (NM_004367, intron 1 of 2) intron (NM_004367, intron 1 of 2) -4268 NM_031409 1235 Hs.46468 NM_004367 ENSG00000112486 CCR6 BN-1|C-C CKR-6|CC-CKR-6|CCR-6|CD196|CKR-L3|CKRL3|CMKBR6|DCR2|DRY6|GPR29|GPRCY4|STRL22 C-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 112.5-42 chr11 114386056 114386245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6111 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 146.75-130 chr5 93123995 93124267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 447212 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 171.75-34 chr12 47303404 47303697 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 3849 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 164.25-31 chr12 58899983 58900391 + 0.75 NA intron (NM_153377, intron 3 of 18) HAL1|LINE|L1 19359 NM_001136051 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 187.5-35 chr11 83626894 83627173 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) intron (NM_001142699, intron 19 of 27) 55392 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 129.5-77 chr15 66957102 66957399 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_135687) promoter-TSS (NR_135687) -735 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 171.25-112 chr4 105927196 105927671 + 0.75 NA intron (NM_001184692, intron 3 of 10) intron (NM_001184692, intron 3 of 10) 31962 NM_001184692 255743 Hs.518921 NM_198278 ENSG00000168743 NPNT EGFL6L|POEM nephronectin protein-coding 127.25-126 chr3 102630263 102630458 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 195345 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 152.75-88 chr2 166947964 166948428 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) L1MC1|LINE|L1 59709 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 188.75-49 chr19 57426334 57426759 + 0.75 NA Intergenic MER74C|LTR|ERVL -8779 NM_001321954 388567 Hs.467358 NM_001023561 ENSG00000186230 ZNF749 - zinc finger protein 749 protein-coding 246-16 chr14 52259706 52260281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7705 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 169-116 chrUn_GL000216v2 168632 168898 + 0.75 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 118-110 chr3 8429933 8430222 + 0.75 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 71581 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 286.5-46 chr4 5277286 5277824 + 0.75 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) MIRc|SINE|MIR 226075 NM_001345969 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 113.25-78 chr19 8858449 8858706 + 0.75 NA intron (NM_024690, intron 79 of 83) intron (NM_024690, intron 79 of 83) 15984 NM_145208 85509 Hs.133912 NM_145208 ENSG00000170948 MBD3L1 MBD3L methyl-CpG binding domain protein 3 like 1 protein-coding 143.75-73 chr18 5380831 5381080 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83902 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 162-52 chr18 5100227 5100508 + 0.75 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 19185 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 218-12 chr11 57946604 57947011 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77074 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 134.75-109 chr2 101505474 101505839 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30544 NM_001367509 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 137.75-141 chr3 141062505 141062963 + 0.75 NA intron (NM_080862, intron 1 of 2) L1M7|LINE|L1 11387 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 172.25-63 chr2 63957573 63957889 + 0.75 NA intron (NM_001005739, intron 7 of 22) intron (NM_001005739, intron 7 of 22) 61697 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 287.75-13 chr12 32624490 32625110 + 0.75 NA intron (NM_001370297, intron 10 of 14) intron (NM_001370297, intron 10 of 14) -54400 NM_001278463 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 179.5-111 chr21 33043102 33043420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14568 NR_104056 101930746 Hs.580934 NR_104056 ENSG00000232539 LINC00945 - long intergenic non-protein coding RNA 945 ncRNA 194.25-67 chr21 20541278 20541812 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 261563 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 127.25-183 chr6 143094384 143094792 + 0.75 NA intron (NM_001366355, intron 1 of 4) L1M6|LINE|L1 -31551 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 214.75-17 chr12 45898192 45898782 + 0.75 NA intron (NM_152641, intron 20 of 20) intron (NM_152641, intron 20 of 20) 92087 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 182.25-76 chr3 45836819 45837275 + 0.75 NA intron (NM_001276379, intron 3 of 9) intron (NM_001276379, intron 3 of 9) 5072 NM_020347 54585 Hs.30824 NM_020347 ENSG00000163818 LZTFL1 BBS17 leucine zipper transcription factor like 1 protein-coding 133.75-187 chr8 79502007 79502308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -108960 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 163.25-128 chr6 151705621 151705905 + 0.75 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) intron (NM_001122742, intron 2 of 9) 15267 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 140-123 chr4 45270480 45270715 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -543963 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 217-85 chrX 45768255 45768753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21380 NR_029636 407007 NR_029636 ENSG00000207725 MIR222 MIRN222|miRNA222|mir-222 microRNA 222 ncRNA 146-93 chr3 157609909 157610242 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66731 NM_001243729 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 126.5-150 chr3 30209831 30210065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -275792 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 118-194 chr8 131122962 131123312 + 0.75 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -82228 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 210-91 chr7 36140900 36141445 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -12082 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 141.25-49 chr14 54549697 54549978 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17775 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 134.75-159 chr4 53925937 53926333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61147 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 311.75-17 chr4 121696476 121696976 + 0.75 NA intron (NM_001154, intron 1 of 12) CpG-21449 254 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 129.75-113 chr22 23188808 23189045 + 0.75 NA intron (NM_004327, intron 1 of 22) AluSx|SINE|Alu 8417 NM_004327 613 Hs.517461 NM_004327 ENSG00000186716 BCR ALL|BCR1|CML|D22S11|D22S662|PHL BCR activator of RhoGEF and GTPase protein-coding 123.5-132 chr3 63283300 63283501 + 0.75 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 5092 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 145-51 chr15 95401766 95402109 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31156 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 225.25-60 chr4 156205669 156206132 + 0.75 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -252034 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 189.75-106 chr6 133222765 133223290 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -18330 NM_001370458 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 174.75-55 chr2 51930257 51930674 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 -440183 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 168.25-96 chr3 45193509 45193779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32643 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 120.75-5 chr1 115411667 115412026 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -73610 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 132.5-120 chr2 72786653 72787007 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L2b|LINE|L2 39203 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 133-132 chr5 14211182 14211458 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 67978 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 145.5-170 chr6 27311147 27311392 + 0.75 NA exon (NM_033482, exon 1 of 1) exon (NM_033482, exon 1 of 1) 963 NM_033482 94026 Hs.729955 NM_033482 ENSG00000158553 POM121L2 POM121-L|POM121L POM121 transmembrane nucleoporin like 2 protein-coding 150.25-105 chr3 133668747 133669126 + 0.75 NA intron (NM_001354703, intron 1 of 22) LTR16C|LTR|ERVL 6938 NM_001354703 7018 Hs.518267 NM_001063 ENSG00000091513 TF HEL-S-71p|PRO1557|PRO2086|TFQTL1 transferrin protein-coding 156-33 chr12 46534415 46534779 + 0.75 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) intron (NR_125380, intron 3 of 3) 150490 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 216.5-44 chr16 74029886 74030353 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 185402 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 130.75-54 chr14 50727892 50728280 + 0.75 NA intron (NM_182944, intron 29 of 29) intron (NM_182944, intron 29 of 29) -59780 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 320.75-15 chr22 25837299 25838104 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 17 of 43) intron (NM_001318245, intron 17 of 43) 95513 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 144.25-88 chr2 7829146 7829407 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 70379 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 163.5-112 chr20 25267963 25268438 + 0.75 NA intron (NM_002862, intron 2 of 19) intron (NM_002862, intron 2 of 19) 20115 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 177.75-122 chr6 46288393 46288740 + 0.75 NA intron (NR_125838, intron 1 of 3) intron (NR_125838, intron 1 of 3) 12242 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 180-91 chr4 64038754 64039111 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 370518 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 164.75-36 chr12 13750023 13750381 + 0.75 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 230154 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 191-5 chr1 209009946 209010381 + 0.75 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 37709 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 130.5-184 chr4 31237523 31237927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66581 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 279-52 chr8 76022866 76023330 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -383556 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 115-49 chr14 65758909 65759200 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 287952 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 165.5-53 chr15 50285096 50285412 + 0.75 NA TTS (NM_002041) TTS (NM_002041) -19528 NM_002112 3067 Hs.1481 NM_002112 ENSG00000140287 HDC - histidine decarboxylase protein-coding 138-148 chr7 3448079 3448278 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1ME3G|LINE|L1 146926 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 133.25 chr1 27152642 27152907 + 0.75 NA intron (NM_003047, intron 1 of 11) intron (NM_003047, intron 1 of 11) 2351 NM_003047 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 121-172 chr7 3407220 3407472 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 106094 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 208-21 chr13 80628054 80628579 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -287190 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 178.5-9 chr10 15779472 15779853 + 0.75 NA intron (NM_024948, intron 14 of 14) intron (NM_024948, intron 14 of 14) -59327 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 233.75-80 chr8 139270999 139271404 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -357160 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 222-2 chr1 77071994 77072355 + 0.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 12031 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 249.25-36 chr4 101623221 101623796 + 0.75 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -167099 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 265-2 chr1 81719231 81719717 + 0.75 NA intron (NM_001297704, intron 1 of 20) intron (NM_001297704, intron 1 of 20) 19704 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 210.5-118 chr7 20214784 20215131 + 0.75 NA intron (NM_182762, intron 1 of 6) intron (NM_182762, intron 1 of 6) 2427 NM_182762 346389 Hs.598388 NM_182762 ENSG00000183742 MACC1 7A5|SH3BP4L MET transcriptional regulator MACC1 protein-coding 120.5-56 chr12 69078293 69078522 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -115167 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 132.5-169 chr3 127037667 127037877 + 0.75 NA TTS (NM_032242) TTS (NM_032242) 49178 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 142-25 chr11 3073818 3074099 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16535 NM_001014437 833 Hs.274873 NM_001751 ENSG00000110619 CARS CARS1|CYSRS|MGC:11246 cysteinyl-tRNA synthetase protein-coding 264.5-65 chr9 28057814 28058320 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L2b|LINE|L2 -484201 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 178.25-99 chr5 31960897 31961231 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) -24905 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 189.75-32 chr14 61078379 61078787 + 0.75 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) intron (NR_033344, intron 15 of 16) -96893 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 202.5-86 chr22 30401059 30401604 + 0.75 NA intron (NM_001204204, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 4313 NM_001204204 23541 Hs.335614 NM_012429 ENSG00000100003 SEC14L2 C22orf6|SPF|TAP|TAP1 SEC14 like lipid binding 2 protein-coding 194-23 chr11 9656358 9656713 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7542 NM_001297714 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 119.5-200 chr6 93671309 93671594 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32566 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 143.25-80 chr19 57372265 57372600 + 0.75 NA intron (NM_173631, intron 3 of 3) intron (NM_173631, intron 3 of 3) 8881 NM_001355204 10597 Hs.446620 NM_001355204 ENSG00000256060 TRAPPC2B MIP-2A|SEDLP|SEDLP1|TRAPPC2P1 trafficking protein particle complex 2B protein-coding 117.25-179 chr5 159772026 159772259 + 0.75 NA Intergenic (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 99242 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 116.5-225 chr7 12148007 12148207 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -63187 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 194.75-34 chr16 75320909 75321284 + 0.75 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) AluJo|SINE|Alu -53089 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 196.25-9 chr1 242560438 242560931 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -35987 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 147.75-160 chr8 124130185 124130545 + 0.75 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 41157 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 140.75 chr1 23118951 23119209 + 0.75 NA intron (NM_033631, intron 1 of 4) intron (NM_033631, intron 1 of 4) 49776 NM_033631 7798 Hs.257900 NM_033631 ENSG00000169641 LUZP1 LUZP leucine zipper protein 1 protein-coding 145-59 chr17 51886389 51886763 + 0.75 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) intron (NM_001082533, intron 4 of 9) 272138 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 162.75-74 chr2 160238479 160238743 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33284 NR_103775 100505984 Hs.729532 NR_103775 ENSG00000285373 LINC02478 - long intergenic non-protein coding RNA 2478 ncRNA 212.5-91 chr6 35036296 35036626 + 0.75 NA intron (NM_015245, intron 11 of 23) MIR3|SINE|MIR 104878 NM_001366325 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 165.25-57 chr17 74507109 74507492 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 24175 NM_174892 124599 Hs.313343 NM_174892 ENSG00000178789 CD300LB CD300b|CLM-7|CLM7|CMRF35-A2|IREM-3|IREM3|TREM-5|TREM5 CD300 molecule like family member b protein-coding 190.25-47 chr16 64482177 64482724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 639613 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 183.5-59 chr2 32095588 32095895 + 0.75 NA intron (NM_001363875, intron 3 of 15) AluJo|SINE|Alu 32130 NM_001363823 6683 Hs.468091 NM_014946 ENSG00000021574 SPAST ADPSP|FSP2|SPG4 spastin protein-coding 149.25-145 chr5 96221454 96221720 + 0.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 142449 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 200-56 chr3 62730138 62730484 + 0.75 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) MER20|DNA|hAT-Charlie 145105 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 147-142 chr8 73431776 73432011 + 0.75 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 11819 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 114.75-203 chr9 35406898 35407186 + 0.75 NA intron (NR_003581, intron 1 of 17) intron (NR_003581, intron 1 of 17) 287 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 206.75-39 chr2 137114566 137114894 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 4 of 27) intron (NM_001316349, intron 4 of 27) 349185 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 136.25-172 chr7 4868578 4868906 + 0.75 NA intron (NM_018059, intron 2 of 14) L1M5|LINE|L1 -6712 NM_020144 56903 Hs.487409 NM_020144 ENSG00000218823 PAPOLB PAPT|TPAP poly(A) polymerase beta protein-coding 119.75-178 chr6 39780032 39780359 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12181 NM_001201427 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 333.75-29 chr9 108743502 108744246 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 112112 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 150.75-82 chr17 48470141 48470426 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25450 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 173.25-134 chr8 141751668 141752065 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 34447 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 251-2 chr1 30003316 30003717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34096 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 228.25-91 chr9 136470066 136470443 + 0.75 NA intron (NM_014866, intron 4 of 31) intron (NM_014866, intron 4 of 31) -12756 NM_152571 158055 Hs.212613 NM_152571 C9orf163 - chromosome 9 open reading frame 163 protein-coding 172.75-13 chr10 67539908 67540217 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) intron (NM_001127384, intron 3 of 17) 125598 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 114.25-50 chr14 23114409 23114664 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 5075 NM_001805 1053 Hs.558308 NM_001805 ENSG00000092067 CEBPE C/EBP-epsilon|CRP1 CCAAT enhancer binding protein epsilon protein-coding 171-107 chr5 30766687 30767056 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -426815 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 180.25-64 chr21 17951277 17951759 + 0.75 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) intron (NM_001204177, intron 1 of 4) 34178 NM_001204176 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 181.25-44 chr17 40472646 40473123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28739 NM_032865 84951 Hs.438292 NM_032865 ENSG00000131746 TNS4 CTEN|PP14434 tensin 4 protein-coding 150.5-207 chr7 46629128 46629463 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 67827 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 126.25-72 chr18 3028760 3028964 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16915 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 138.25-154 chr7 2893571 2893800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49377 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 190.5-69 chr18 52428794 52429224 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 88812 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 124.25-102 chr2 167399740 167399905 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 212450 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 143 chr1 41292496 41292861 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -50372 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 219-11 chr10 69611193 69611833 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -18734 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 176.5-190 chr9 75673256 75673571 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -217231 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 145.25-15 chr10 90111435 90111732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154210 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 208.25-38 chr17 69093378 69093844 + 0.75 NA intron (NM_080284, intron 25 of 38) HERV1_LTRe|LTR|ERV1 -5931 NR_049834 100847008 NR_049834 ENSG00000265331 MIR4524B - microRNA 4524b ncRNA 212.75-49 chr2 54855536 54855967 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 10 of 40) intron (NM_001039753, intron 10 of 40) 130739 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 188-68 chr7 44968574 44968988 + 0.75 NA intron (NM_033054, intron 12 of 21) AluSz6|SINE|Alu 10234 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 160.5-41 chr12 86652965 86653381 + 0.75 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) intron (NM_001351285, intron 2 of 8) 91976 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 144-67 chr2 228337841 228338290 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -156378 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 130.5-145 chr2 213607284 213607597 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -150627 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 188.5-140 chr7 48206852 48207233 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 3 of 61) L1MA4|LINE|L1 35584 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 116.25-141 chr3 66996669 66996855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1545 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 243.5-62 chr5 16250058 16250479 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 70027 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 184.25-6 chr1 113227656 113228073 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21611 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 120.5-68 chr14 24650879 24651151 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -16825 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 153.75-116 chr5 73850220 73850602 + 0.75 NA intron (NM_001177693, intron 13 of 35) intron (NM_001177693, intron 13 of 35) 36865 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 120-112 chr3 29320499 29320722 + 0.75 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 39298 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 193.5-27 chr12 2273350 2273823 + 0.75 NA intron (NR_046769, intron 1 of 2) intron (NR_046769, intron 1 of 2) 3810 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 174.25-5 chr1 70520557 70520919 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109470 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 161.5-168 chr7 27167995 27168217 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_046609) promoter-TSS (NR_046609) -793 NR_046609 100874323 Hs.716765 NR_046609 ENSG00000253187 HOXA10-AS HOXA-AS4 HOXA10 antisense RNA ncRNA 144.25-123 chr3 5687557 5688031 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -437539 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 171.5-170 chr9 88424774 88425134 + 0.75 NA intron (NM_006717, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 36510 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 184.25-49 chr18 11696037 11696570 + 0.75 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 7039 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 313.75-2 chr11 6283683 6284175 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 24091 NM_001318029 887 Hs.203 NM_176875 ENSG00000110148 CCKBR CCK-B|CCK2R|GASR cholecystokinin B receptor protein-coding 140.5-27 chr11 31370673 31370983 + 0.75 NA exon (NM_181706, exon 2 of 5) exon (NM_181706, exon 2 of 5) 968 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 269.75-32 chr2 112317682 112318230 + 0.75 NA intron (NM_198581, intron 7 of 11) intron (NM_198581, intron 7 of 11) 42359 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 116.5-187 chr5 15601301 15601658 + 0.75 NA TTS (NR_109945) TTS (NR_109945) 13523 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 194.25-71 chr3 34053470 34053948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 255079 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 124-69 chr18 8247078 8247255 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 15 of 30) intron (NM_002845, intron 15 of 30) 119868 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 124.5-37 chr11 78034789 78034972 + 0.75 NA intron (NM_001203261, intron 2 of 2) intron (NM_001203261, intron 2 of 2) 11311 NM_001282406 65987 Hs.709780 NM_023930 ENSG00000151364 KCTD14 - potassium channel tetramerization domain containing 14 protein-coding 204.75-70 chr22 23102495 23103014 + 0.75 NA intron (NM_002073, intron 2 of 2) intron (NM_002073, intron 2 of 2) 32235 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 198.5-97 chr3 82002489 82002921 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 16563 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 166.75-131 chr7 31409000 31409426 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -68487 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 152.5-130 chr4 41753507 41753754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4660 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 120.75-46 chr14 100484193 100484428 + 0.75 NA intron (NM_001350950, intron 3 of 5) intron (NM_001350950, intron 3 of 5) 83760 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 127.25-65 chr15 69165066 69165340 + 0.75 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L1PA11|LINE|L1 4568 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 145.75-138 chr6 127398485 127398747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55007 NM_018479 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 256-23 chr2 15007943 15008478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 375493 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 151.5-142 chr4 88973047 88973294 + 0.75 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) L1MCa|LINE|L1 84015 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 185.75-55 chr18 3888530 3889049 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 3436 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 180.25-37 chr17 53270674 53270984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 285324 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 172.25-97 chr4 51878007 51878333 + 0.75 NA intron (NM_001040402, intron 5 of 10) intron (NM_001040402, intron 5 of 10) 34591 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 182-97 chr6 70537511 70538002 + 0.75 NA intron (NM_020819, intron 18 of 20) intron (NM_020819, intron 18 of 20) -29174 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 118-200 chr9 37861678 37861943 + 0.75 NA 3' UTR (NM_024345, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_024345, exon 7 of 7) 42317 NM_033412 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 314-24 chr8 91201345 91202001 + 0.75 NA intron (NM_001354470, intron 3 of 3) intron (NM_001354470, intron 3 of 3) -3812 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 157.5-189 chr7 40197435 40197733 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) intron (NM_024728, intron 6 of 14) 62608 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 127-17 chr10 78707634 78707935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 359664 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-63 chr14 73331964 73332192 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) L1MEd|LINE|L1 -86077 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 113-41 chr11 56465085 56465400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1841 NM_001004743 390162 Hs.553749 NM_001004743 ENSG00000150269 OR5M9 OR11-190 olfactory receptor family 5 subfamily M member 9 protein-coding 283.75-11 chr17 77040732 77041444 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -47555 NR_027058 654434 Hs.720923 NR_027058 ENSG00000234912 SNHG20 C17orf86|LINC00338|NCRNA00338|SCARNA16HG small nucleolar RNA host gene 20 ncRNA 112.25-217 chr8 110876324 110876644 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 150949 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 152.75-72 chr17 71543022 71543369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -341016 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 388.75-5 chr3 177718563 177719421 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -97873 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 224.5-35 chr14 55612455 55613023 + 0.75 NA intron (NR_073129, intron 3 of 45) intron (NR_073129, intron 3 of 45) 32532 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 180.75-100 chr3 194459637 194460060 + 0.75 NA exon (NM_024524, exon 4 of 32) exon (NM_024524, exon 4 of 32) 8391 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 115.5-122 chr2 66919802 66920021 + 0.75 NA intron (NR_110169, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 2579 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 236.25-66 chr5 15815701 15816250 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -119207 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 122.25-42 chr12 33517760 33517991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78056 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 180.5-136 chr7 3416168 3416557 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 115110 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 236-66 chr7 45991767 45992192 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -70707 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 155.25-101 chr2 191737849 191738122 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47804 NR_131917 105747689 Hs.104972 NR_131917 LOC105747689 - uncharacterized LOC105747689 ncRNA 284.25-32 chrX 66361646 66362186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 194166 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 115.25-106 chr2 153049717 153049944 + 0.75 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 331193 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 116.25-118 chr2 164118349 164118587 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -382460 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 133.25-5 chr1 98086876 98087097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37293 NR_046105 400765 Hs.451802 NM_001001688 ENSG00000225206 MIR137HG - MIR137 host gene ncRNA 159.5-33 chr11 44333771 44334119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23806 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 145-55 chr16 83649401 83649723 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) intron (NM_001220489, intron 7 of 12) 141216 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 134-14 chr10 8121048 8121391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66531 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 162.5-193 chr9 103360597 103360842 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -35686 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 138.5-176 chr6 135888144 135888519 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 36630 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 164.25-25 chr11 32860822 32861150 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 31059 NM_024081 79056 Hs.471695 NM_024081 ENSG00000135378 PRRG4 PRGP4|TMG4 proline rich and Gla domain 4 protein-coding 164-29 chr13 20944388 20944626 + 0.75 NA intron (NR_104058, intron 2 of 5) intron (NR_104058, intron 2 of 5) 4921 NR_104058 101930748 Hs.637638 NR_104058 ENSG00000233780 LINC00367 - long intergenic non-protein coding RNA 367 ncRNA 151-139 chr9 71635406 71635799 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 132911 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 165.75-50 chr14 41321824 41322169 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -284860 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 184-106 chrX 85538686 85539122 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -159239 NM_001307940 79983 Hs.267038 NM_024921 ENSG00000124429 POF1B POF|POF2B POF1B actin binding protein protein-coding 188.5-119 chr4 163539722 163540037 + 0.75 NA intron (NM_017923, intron 3 of 3) intron (NM_017923, intron 3 of 3) 45189 NM_018352 55319 Hs.267446 NM_018352 ENSG00000198498 TMA16 C4orf43 translation machinery associated 16 homolog protein-coding 138-44 chr14 82452375 82452757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190066 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 223.5-61 chr2 125321588 125322051 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 796166 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 185-3 chr1 62844768 62845152 + 0.75 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 60828 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 200.75-17 chr11 60673335 60673686 + 0.75 NA intron (NR_026946, intron 6 of 6) L1M4b|LINE|L1 -26102 NM_031457 83661 Hs.150878 NM_031457 ENSG00000166959 MS4A8 4SPAN4|CD20L5|MS4A4|MS4A8B membrane spanning 4-domains A8 protein-coding 131.75-91 chr17 33477771 33478063 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 55843 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 147.75-142 chr7 39688884 39689260 + 0.75 NA intron (NM_005402, intron 2 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -44496 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 173.75-69 chr17 55902104 55902360 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 151127 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 198.5-130 chr7 24723103 24723563 + 0.75 NA intron (NM_004403, intron 3 of 9) intron (NM_004403, intron 3 of 9) 34131 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 145.5-99 chr2 85013142 85013483 + 0.75 NA intron (NM_020122, intron 1 of 6) intron (NM_020122, intron 1 of 6) 42151 NM_020122 56888 Hs.654968 NM_020122 ENSG00000176407 KCMF1 DEBT91|FIGC|PCMF|ZZZ1 potassium channel modulatory factor 1 protein-coding 200.25-42 chr15 96474595 96475132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141098 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 119.75-155 chr4 62224098 62224293 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62430 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 122.5-208 chr7 26455918 26456111 + 0.75 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) -56596 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 250.25-30 chr3 878038 878407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -214802 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 197.5-6 chr1 96776187 96776624 + 0.75 NA intron (NM_001300985, intron 5 of 13) intron (NM_001300985, intron 5 of 13) 53767 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 179.75-58 chr2 63125415 63125701 + 0.75 NA intron (NR_148704, intron 18 of 18) FLAM_A|SINE|Alu -6016 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 253-52 chr8 88264145 88264522 + 0.75 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) AluJr4|SINE|Alu 63150 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 148.75-67 chr16 59359794 59360062 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 395263 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 121.25-184 chr7 12204732 12205041 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -6408 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 244-24 chr2 82789058 82789492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67528 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 139-64 chr19 46691923 46692154 + 0.75 NA intron (NM_016457, intron 10 of 17) intron (NM_016457, intron 10 of 17) 17316 NR_036157 100422913 NR_036157 ENSG00000211513 MIR320E mir-320e microRNA 320e ncRNA 320-26 chr3 53488210 53488785 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -6114 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 137.75-115 chr20 34926669 34927017 + 0.75 NA intron (NM_001076552, intron 17 of 18) intron (NM_001076552, intron 17 of 18) 28792 NM_001322495 2937 Hs.82327 NM_000178 ENSG00000100983 GSS GSHS|HEL-S-64p|HEL-S-88n glutathione synthetase protein-coding 173.5-92 chr22 43233910 43234308 + 0.75 NA intron (NM_173050, intron 7 of 21) intron (NM_173050, intron 7 of 21) 21435 NR_134632 105373051 Hs.629290 NR_134632 ENSG00000236272 LOC105373051 - uncharacterized LOC105373051 ncRNA 165.25-50 chr16 53104829 53105180 + 0.75 NA intron (NM_025134, intron 1 of 38) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26008 NM_001352127 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 167-53 chr17 76595691 76595924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9947 NM_006456 10610 Hs.592105 NM_006456 ENSG00000070731 ST6GALNAC2 SAITL1|SIAT7|SIAT7B|SIATL1|ST6GalNAII|STHM ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 129 chr1 3404704 3405113 + 0.75 NA intron (NM_022114, intron 7 of 16) CpG-267 -49757 NM_014448 27237 Hs.87435 NM_014448 ENSG00000130762 ARHGEF16 GEF16|NBR Rho guanine nucleotide exchange factor 16 protein-coding 149.5-25 chr10 37468386 37468638 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134419 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 112.25-69 chr15 67654954 67655163 + 0.75 NA intron (NM_001206804, intron 11 of 21) AluSx|SINE|Alu 105964 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 114-30 chr11 82179726 82179994 + 0.75 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 224053 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 127.25-103 chr20 9337590 9337890 + 0.75 NA intron (NM_000933, intron 2 of 35) intron (NM_000933, intron 2 of 35) 29940 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 120-27 chr11 102912668 102912999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37851 NM_002426 4321 Hs.1695 NM_002426 ENSG00000262406 MMP12 HME|ME|MME|MMP-12 matrix metallopeptidase 12 protein-coding 191.75-31 chr13 45784698 45784970 + 0.75 NA intron (NM_198849, intron 1 of 1) intron (NM_198849, intron 1 of 1) 66919 NM_198849 283514 Hs.368483 NM_198849 ENSG00000215475 SIAH3 - siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3 protein-coding 129.5-8 chr1 104783588 104783840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 710691 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 169-77 chr5 67301421 67301703 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104763 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 194-74 chr6 161810491 161810938 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 339737 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 222.25-59 chr4 47208179 47208533 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) L1MB4|LINE|L1 176789 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 232.5-3 chr1 69506184 69506627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60929 NM_001366839 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 145.5-88 chr19 28233447 28233784 + 0.75 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -373073 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 122-184 chr8 89871706 89871928 + 0.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -30051 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 186.75-87 chr5 38828139 38828639 + 0.75 NA intron (NR_109951, intron 1 of 3) intron (NR_109951, intron 1 of 3) 17440 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 172.5-103 chr2 174400363 174400683 + 0.75 NA intron (NM_024583, intron 3 of 7) AluJr4|SINE|Alu 4793 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 320.5-28 chr3 115211950 115212568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64971 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 132.75-105 chr2 180487606 180487989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204307 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 129-137 chr5 15925662 15925885 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9409 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 272.25-21 chr17 59141272 59141671 + 0.75 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu -3599 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 129.75-85 chr19 58378056 58378332 + 0.75 NA intron (NM_138466, intron 1 of 2) intron (NM_138466, intron 1 of 2) 2836 NM_138466 116412 Hs.222236 NM_138466 ENSG00000152475 ZNF837 - zinc finger protein 837 protein-coding 118.25-136 chr4 22743572 22743897 + 0.75 NA intron (NR_102356, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 29645 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 144.5-211 chr8 11318554 11318836 + 0.75 NA intron (NM_015458, intron 8 of 9).2 intron (NM_015458, intron 8 of 9).2 -12291 NM_054028 83650 Hs.458397 NM_054028 ENSG00000177710 SLC35G5 AMAC|AMAC1L2 solute carrier family 35 member G5 protein-coding 126-135 chr5 26846547 26846812 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 191907 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 190.5-111 chr4 66078221 66078665 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -198381 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 232.25-75 chr7 103807165 103807733 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) HAL1|LINE|L1 182067 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 113.75-183 chr8 22933838 22934165 + 0.75 NA intron (NM_001363233, intron 1 of 6) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -6087 NM_144962 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 131-63 chr15 95941564 95941797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186161 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 228-89 chrX 38771749 38772378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29369 NM_021242 58526 Hs.522605 NM_021242 ENSG00000165175 MID1IP1 G12-like|MIG12|S14R|STRAIT11499|THRSPL MID1 interacting protein 1 protein-coding 214.5-53 chr2 36866026 36866612 + 0.75 NA intron (NM_003162, intron 12 of 17) AluJb|SINE|Alu 100217 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 234-75 chrX 10846198 10846766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12799 NM_033290 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 150.75-165 chr7 21008788 21009209 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 173567 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 316.25-16 chr3 187845408 187846208 + 0.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -100340 NM_001706 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 122.25-119 chr22 47235293 47235486 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -110182 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 140-59 chr17 53257342 53257630 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 271981 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 168.25-40 chr14 52736277 52736611 + 0.75 NA intron (NM_001130701, intron 2 of 11) intron (NM_001130701, intron 2 of 11) 6278 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 122.25-86 chr2 22719631 22719821 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 183247 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 119.25-20 chr10 46048708 46048984 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -2577 NM_002443 4477 Hs.255462 NM_002443 ENSG00000263639 MSMB HPC13|IGBF|MSP|MSPB|PN44|PRPS|PSP|PSP-94|PSP57|PSP94 microseminoprotein beta protein-coding 173.5-164 chr8 101577990 101578425 + 0.75 NA intron (NM_024915, intron 7 of 15) intron (NM_024915, intron 7 of 15) 85768 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 134-43 chr12 113624225 113624450 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 149346 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 118.75-48 chr12 86325079 86325295 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) -67888 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 213.5-55 chr19 31954565 31955153 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -71003 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 153.75-59 chr19 29786029 29786449 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25752 NM_001322262 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 155.5-37 chr11 56391710 56392029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16245 NM_001013356 504189 NM_001013356 OR8U8 - olfactory receptor family 8 subfamily U member 8 protein-coding 134-144 chr5 116313661 116313964 + 0.75 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 58069 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 115.75-33 chr11 112955077 112955352 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -6206 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 137.75-16 chr1 214830530 214830769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -174893 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 158-76 chr2 69780600 69781095 + 0.75 NA intron (NM_001365496, intron 2 of 13) intron (NM_001365496, intron 2 of 13) 38713 NM_001320700 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 160-13 chr10 72270089 72270478 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3641 NM_019058 54541 Hs.744875 NM_019058 ENSG00000168209 DDIT4 Dig2|REDD-1|REDD1 DNA damage inducible transcript 4 protein-coding 182-101 chr7 69622281 69622734 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 24032 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 173-119 chr6 55703174 55703432 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124089 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 114.5-189 chr4 59281983 59282184 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 268510 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 222.25-7 chr10 68378746 68379140 + 0.75 NA intron (NM_001278225, intron 11 of 11) intron (NM_001278225, intron 11 of 11) 28246 NM_017987 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 131.5-208 chr6 126267454 126267710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72207 NM_001012507 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 170.25-153 chr8 80600850 80601256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114827 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 170.5-96 chr2 109050900 109051254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61857 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 148.75-140 chr5 129623043 129623387 + 0.75 NA intron (NM_133638, intron 10 of 22) intron (NM_133638, intron 10 of 22) -124879 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 127.25-149 chr4 105938212 105938526 + 0.75 NA exon (NM_001184691, exon 6 of 13) exon (NM_001184691, exon 6 of 13) 42898 NM_001184692 255743 Hs.518921 NM_198278 ENSG00000168743 NPNT EGFL6L|POEM nephronectin protein-coding 140.75-165 chr6 141201074 141201363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 517404 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 175.5-53 chr14 102383666 102383959 + 0.75 NA intron (NM_014844, intron 2 of 19) intron (NM_014844, intron 2 of 19) 20871 NM_001172631 9895 Hs.195667 NM_014844 ENSG00000196663 TECPR2 KIAA0329|SPG49 tectonin beta-propeller repeat containing 2 protein-coding 202.75-52 chr19 52409679 52410112 + 0.75 NA intron (NM_032423, intron 6 of 6) AluSx|SINE|Alu 12046 NM_032423 84436 Hs.662043 NM_032423 ENSG00000167555 ZNF528 - zinc finger protein 528 protein-coding 159.25-60 chr19 5418799 5419172 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36432 NM_181710 148066 Hs.126496 NM_181710 ENSG00000105428 ZNRF4 RNF204|SPERIZIN|Ssrzf1|spzn zinc and ring finger 4 protein-coding 153-124 chr5 136885501 136885787 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -242553 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 148.25-120 chr5 55350086 55350441 + 0.75 NA intron (NM_015360, intron 12 of 26) intron (NM_015360, intron 12 of 26) 42274 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 219-69 chr3 60559912 60560372 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) intron (NM_001320900, intron 5 of 9) 57728 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 117.5-235 chr8 88637900 88638159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -310546 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 203-61 chr22 48543101 48543519 + 0.75 NA intron (NR_038917, intron 4 of 4) intron (NR_038917, intron 4 of 4) 4077 NR_038917 284933 Hs.159057 NR_038917 ENSG00000281732 LOC284933 - uncharacterized LOC284933 ncRNA 167-121 chr9 91218477 91218912 + 0.75 NA intron (NM_001698, intron 7 of 9) intron (NM_001698, intron 7 of 9) 99632 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 116.25-95 chr19 15398452 15398673 + 0.75 NA intron (NM_001291478, intron 9 of 13) intron (NM_001291478, intron 9 of 13) -18775 NM_005858 10270 Hs.594496 NM_005858 ENSG00000105127 AKAP8 AKAP 95|AKAP-8|AKAP-95|AKAP95 A-kinase anchoring protein 8 protein-coding 240.25-4 chr1 173717043 173717407 + 0.75 NA intron (NM_014458, intron 2 of 11) intron (NM_014458, intron 2 of 11) 2244 NM_014458 27252 Hs.495035 NM_014458 ENSG00000076321 KLHL20 KHLHX|KLEIP|KLHLX kelch like family member 20 protein-coding 117.5-228 chr8 36291796 36291999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -492477 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 123.25-111 chr2 198009990 198010308 + 0.75 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 205556 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 169.25-129 chr9 80190563 80190810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 215663 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 218.75-49 chr21 28115666 28116315 + 0.75 NA TTS (NR_126012) TTS (NR_126012) 25587 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 184.75-110 chr8 137504257 137504592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90836 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 249.5-7 chr1 106942149 106942581 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -114309 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 129-62 chr14 60373053 60373285 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 49973 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 151.25-48 chr13 61981585 61981874 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 47819 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 142.5-147 chr3 197018899 197019178 + 0.75 NA TTS (NM_033316) TTS (NM_033316) 10779 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 116.75-150 chr4 86924127 86924337 + 0.75 NA TTS (NR_038841) TTS (NR_038841) 10618 NR_038841 100506746 Hs.657766 NR_038841 AFF1-AS1 - AFF1 antisense RNA 1 ncRNA 194.25-114 chr8 90831216 90831648 + 0.75 NA intron (NM_022351, intron 3 of 12) intron (NM_022351, intron 3 of 12) 39657 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 125.5-239 chr7 121704185 121704382 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -168878 NM_001206839 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 124.75-98 chr17 65625506 65625777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63993 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 164.5-135 chr3 85220091 85220559 + 0.75 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -158061 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 119.75-151 chr3 180258845 180259028 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -155237 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 131.75-15 chr1 164041328 164041561 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -517916 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 243-44 chr22 41722525 41723095 + 0.75 NA intron (NM_152513, intron 6 of 30) L2c|LINE|L2 23307 NM_152513 150365 Hs.116419 NM_152513 ENSG00000167077 MEI1 HYDM3|SPATA38 meiotic double-stranded break formation protein 1 protein-coding 175.25-33 chr12 4600304 4600666 + 0.75 NA intron (NM_001371301, intron 10 of 14) L2c|LINE|L2 -4378 NM_001282285 8798 Hs.439530 NM_003845 ENSG00000010219 DYRK4 - dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4 protein-coding 170.75-12 chr10 68266862 68267166 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -34901 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 173.75-65 chr16 12301953 12302383 + 0.75 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) 325434 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 277-12 chr14 53165935 53166506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12866 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 142.25-24 chr10 98518571 98518783 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 9 of 11) AluSz|SINE|Alu -71714 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 167-105 chr7 17605859 17606308 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -47174 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 127.5-228 chr7 44941605 44941829 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 37298 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 137-108 chr3 123281886 123282252 + 0.75 NA TTS (NM_001199642) TTS (NM_001199642) 80126 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 233.25 chr1 6805427 6805833 + 0.75 NA intron (NR_146204, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 20176 NM_015215 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 152.75-47 chr13 20898795 20899055 + 0.75 NA intron (NM_022459, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 3849 NM_022459 64328 Hs.507452 NM_022459 ENSG00000132953 XPO4 exp4 exportin 4 protein-coding 185.25-6 chr1 173799228 173799551 + 0.75 NA TTS (NM_001127181) TTS (NM_001127181) 24743 NM_001171182 91687 Hs.531856 NM_033319 ENSG00000120334 CENPL C1orf155|CENP-L|dJ383J4.3 centromere protein L protein-coding 142.5-89 chr17 39174451 39174873 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000723, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_000723, exon 14 of 14) -8501 NM_001143968 390790 Hs.568007 NM_001143968 ENSG00000141748 ARL5C ARL12 ADP ribosylation factor like GTPase 5C protein-coding 153.75-32 chr12 72641948 72642192 + 0.75 NA intron (NM_013381, intron 15 of 18) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -368561 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 166.25-131 chr5 177470686 177470968 + 0.75 NA intron (NM_004395, intron 1 of 13) intron (NM_004395, intron 1 of 13) 2043 NM_080881 1627 Hs.130316 NM_004395 ENSG00000113758 DBN1 D0S117E drebrin 1 protein-coding 120.75-179 chr9 116061768 116062081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91867 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 120-40 chr14 43217544 43217767 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 1289628 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 139.75-151 chr5 119181603 119181977 + 0.75 NA intron (NM_001290321, intron 28 of 43) AluSx|SINE|Alu 27153 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 232.75-12 chr11 77007310 77007827 + 0.75 NA intron (NM_001300953, intron 6 of 9) L1MDa|LINE|L1 -26830 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 155.75-131 chr5 65758634 65759098 + 0.75 NA intron (NM_020726, intron 2 of 12) intron (NM_020726, intron 2 of 12) 36661 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 148.75-134 chr5 55070856 55071054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31691 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 279.75-30 chr22 24984771 24985264 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38322 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 151.5-209 chrX 9295214 9295631 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -167873 NM_001139468 6907 Hs.495656 NM_005647 ENSG00000101849 TBL1X EBI|SMAP55|TBL1 transducin beta like 1 X-linked protein-coding 139.5-91 chr19 30729161 30729480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 356936 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 179-42 chr16 78947960 78948262 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MIRb|SINE|MIR 652626 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 180.25-118 chr8 119905146 119905420 + 0.75 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 31561 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 127.25-212 chr8 131212046 131212315 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -171271 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 119-28 chr11 70293176 70293376 + 0.75 NA intron (NR_045286, intron 2 of 28) intron (NR_045286, intron 2 of 28) 9321 NR_031624 100313770 NR_031624 ENSG00000221333 MIR548K MIRN548K microRNA 548k ncRNA 207.5-63 chr22 37577882 37578356 + 0.75 NA intron (NM_006498, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 1968 NM_006498 3957 Hs.531776 NM_006498 ENSG00000100079 LGALS2 HL14 galectin 2 protein-coding 140.25-177 chr7 32557702 32557994 + 0.75 NA intron (NM_015060, intron 8 of 15) L1MC4|LINE|L1 62359 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 164.5-140 chr3 123895218 123895545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11049 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 173-5 chr1 106534122 106534428 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -283964 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 126.25-206 chr8 109239809 109240147 + 0.75 NA TTS (NM_001128211) TTS (NM_001128211) 89955 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 149.5-93 chr2 63245350 63245573 + 0.75 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -125919 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 181-98 chr6 119672091 119672624 + 0.75 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 122549 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 125-148 chr7 37219842 37220054 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 10 of 21) intron (NM_001206480, intron 10 of 21) 133720 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 196.25-12 chr10 44920497 44920986 + 0.75 NA intron (NM_001345926, intron 1 of 3) intron (NM_001345926, intron 1 of 3) 9404 NM_001123376 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 132.25-60 chr14 57000029 57000324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 187018 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 155-128 chr7 14690544 14690817 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 9 of 24) MER58A|DNA|hAT-Charlie 150770 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 149.25-76 chr2 13862418 13862794 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 538352 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 217.5-93 chr4 178646397 178646885 + 0.75 NA Intergenic LTR14B|LTR|ERVK -738705 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 150.25-156 chr9 6897869 6898258 + 0.75 NA intron (NR_148680, intron 8 of 21) intron (NR_148680, intron 8 of 21) 140713 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 115.5-55 chr13 112581799 112582054 + 0.75 NA intron (NM_006322, intron 1 of 21) intron (NM_006322, intron 1 of 21) 6227 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 163.75-49 chr15 65107436 65107802 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1260 NM_001163692 390595 Hs.659256 NM_001163692 ENSG00000246922 UBAP1L UBAP-1L ubiquitin associated protein 1 like protein-coding 223-45 chr2 161574867 161575265 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -49269 NM_001354450 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 153.5-88 chr18 32498282 32498591 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -13227 NR_003558 441818 Hs.549773 NR_003558 ENSG00000260389 WBP11P1 HsT3017 WW domain binding protein 11 pseudogene 1 pseudo 182.75-81 chr3 84075062 84075460 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 794314 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 120.25-157 chr4 168260750 168261082 + 0.75 NA exon (NM_017631, exon 25 of 38) exon (NM_017631, exon 25 of 38) 57836 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 213.75-76 chr4 48597813 48598199 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 13 of 63) intron (NM_015030, intron 13 of 63) 107754 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 289.5-21 chr2 21726884 21727314 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16447 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 151.5-181 chr7 51107717 51108072 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) intron (NM_015198, intron 6 of 12) 208915 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 177-82 chr5 158588169 158588563 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -178593 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 125-29 chr11 37059467 37059648 + 0.75 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -461278 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 159-138 chrX 144921761 144922034 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -325606 NM_001009614 494118 NM_001009614 ENSG00000203923 SPANXN1 CT11.6 SPANX family member N1 protein-coding 180.75-48 chr16 78433124 78433764 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 333790 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 130-5 chr1 108343021 108343306 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -99082 NM_001143989 148545 Hs.511849 NM_152488 ENSG00000196427 NBPF4 - NBPF member 4 protein-coding 123.25-170 chr5 144168096 144168455 + 0.75 NA intron (NM_001271732, intron 1 of 4) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 2384 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 122.25-48 chr12 115720753 115720950 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 427803 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 278.5-16 chr14 77203306 77203943 + 0.75 NA intron (NM_020431, intron 1 of 23) L2b|LINE|L2 21826 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 233.75-63 chr5 106185405 106185861 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 825381 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 125-75 chr2 137227183 137227490 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 461791 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 166.75-25 chr11 79235945 79236267 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 2 of 33) intron (NM_001098816, intron 2 of 33) 166003 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 150.5-8 chr1 110371262 110371536 + 0.75 NA intron (NM_001201548, intron 6 of 6) intron (NM_001201548, intron 6 of 6) 19627 NM_001201549 9122 Hs.351306 NM_004696 ENSG00000168679 SLC16A4 MCT4|MCT5 solute carrier family 16 member 4 protein-coding 118.5-3 chr1 29979161 29979452 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 58306 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 201.75-24 chr12 69690003 69690375 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_152439) promoter-TSS (NM_152439) -912 NM_152439 144453 Hs.280782 NM_032735 ENSG00000127325 BEST3 VMD2L3 bestrophin 3 protein-coding 156.25-102 chr3 162627406 162627696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 675750 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 124-122 chr4 51830404 51830753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12422 NM_015115 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 139.25-149 chr5 54454168 54454522 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1354 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 186.5-57 chr19 35214349 35214751 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 14175 NM_152481 148109 Hs.128069 NM_152481 ENSG00000177558 FAM187B TMEM162 family with sequence similarity 187 member B protein-coding 160.5-101 chr20 34589276 34589536 + 0.75 NA intron (NM_080476, intron 7 of 11) AluSc|SINE|Alu 30688 NM_032514 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 187-43 chr2 109228605 109229119 + 0.75 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) MER21C|LTR|ERVL 84763 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 114.25-47 chr13 33067905 33068138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51598 NM_004795 9365 Hs.524953 NM_004795 ENSG00000133116 KL HFTC3 klotho protein-coding 211.25-98 chr8 129534868 129535201 + 0.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 39984 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 145.5-138 chr3 184656947 184657218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54982 NM_022149 64110 Hs.306123 NM_022149 ENSG00000177383 MAGEF1 MAGE-F1 MAGE family member F1 protein-coding 120.5-144 chr3 95300069 95300328 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 361935 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 165.75-55 chr15 60792910 60793247 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 111509 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 122.5-95 chr18 70366269 70366483 + 0.75 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 18215 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 142.75-104 chr2 122598042 122598378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 475271 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 147.5-186 chr6 62507183 62507647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221188 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 114.5-108 chr16 67367060 67367236 + 0.75 NA exon (NM_001161575, exon 5 of 11) exon (NM_001161575, exon 5 of 11) 19793 NM_001161575 55282 Hs.125139 NM_018296 ENSG00000159708 LRRC36 RORBP70|XLHSRF2 leucine rich repeat containing 36 protein-coding 162-121 chr8 123478449 123478766 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 53536 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 134.75-87 chr17 32569233 32569520 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) intron (NM_015194, intron 21 of 21) 82383 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 191.75-38 chr14 63844614 63844958 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -8179 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 163-18 chr11 42234825 42235301 + 0.75 NA intron (NR_038309, intron 4 of 5) intron (NR_038309, intron 4 of 5) 18627 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 153.5-217 chr9 133181525 133181825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17761 NM_001282632 26301 Hs.495419 NM_021996 ENSG00000148288 GBGT1 A3GALNT|FS|UNQ2513 globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (FORS blood group) protein-coding 122-21 chr1 199261827 199262159 + 0.75 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 113395 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 120.25-223 chr9 68904318 68904617 + 0.75 NA intron (NM_003558, intron 8 of 15) intron (NM_003558, intron 8 of 15) 71374 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 183.25-84 chr5 76042645 76042961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40580 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 225.5-49 chr18 40289577 40289953 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 223479 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 136.75-31 chr10 81617240 81617473 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -257838 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 128.25-129 chr3 66745022 66745351 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6850 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 148.25-33 chr12 85134867 85135153 + 0.75 NA intron (NM_001079910, intron 18 of 26) L1MC5|LINE|L1 98659 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 293-23 chr3 102339163 102339898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95485 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 177.5-81 chr2 108071007 108071339 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -18418 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 280.25-18 chr13 51532827 51533465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19443 NR_039852 100616423 NR_039852 ENSG00000266611 MIR4703 - microRNA 4703 ncRNA 158.25-122 chr6 52448492 52448768 + 0.75 NA intron (NR_033327, intron 3 of 9) L1PA5|LINE|L1 27622 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 113.75-7 chr1 91033583 91033759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11416 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 186.5-32 chr12 76919977 76920354 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41146 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 118.25-23 chr1 223126551 223126846 + 0.75 NA intron (NM_003268, intron 5 of 5) intron (NM_003268, intron 5 of 5) 16550 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 142.75-187 chr8 112401389 112401614 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 31 of 66) intron (NM_001363185, intron 31 of 66) -241992 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 185.25-79 chr3 6554911 6555221 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 250383 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 125.75-124 chr22 46336754 46336959 + 0.75 NA intron (NR_104241, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 1142 NM_001282782 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 231.25-42 chr2 143600969 143601403 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) intron (NM_018460, intron 11 of 13) -335881 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 153.75-121 chr5 131177058 131177548 + 0.75 NA intron (NR_121658, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 6359 NR_121658 90624 Hs.115467 NM_181705 ENSG00000186687 LYRM7 C5orf31|MC3DN8|MZM1L LYR motif containing 7 protein-coding 115.5-186 chr4 54698608 54698796 + 0.75 NA intron (NM_000222, intron 3 of 20) intron (NM_000222, intron 3 of 20) 40774 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 116-39 chr12 112135927 112136156 + 0.75 NA intron (NM_006700, intron 4 of 11) AluSx1|SINE|Alu 10481 NM_006700 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 113.25-82 chr2 16653996 16654240 + 0.75 NA intron (NM_030797, intron 1 of 11) intron (NM_030797, intron 1 of 11) 11716 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 114-116 chr4 120606748 120606927 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 316029 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 149.5-199 chr8 47934415 47934700 + 0.75 NA intron (NM_001081640, intron 14 of 84) intron (NM_001081640, intron 14 of 84) 25579 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 123.75-85 chr19 27742686 27742972 + 0.75 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -50602 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 169-100 chr7 91025687 91026026 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) intron (NM_012395, intron 9 of 13) -238577 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 143-78 chr2 234048448 234048742 + 0.75 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -2107 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 112.5-234 chr8 115469184 115469377 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 198733 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 161-99 chr5 137699065 137699504 + 0.75 NA intron (NM_017415, intron 3 of 14) L2c|LINE|L2 7143 NM_001257195 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 125-115 chr4 70335302 70335620 + 0.75 NA exon (NM_033122, exon 1 of 2) exon (NM_033122, exon 1 of 2) 480 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 191.25-6 chr1 225936813 225937271 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001172425, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001172425, exon 5 of 5) 4178 NM_003240 7044 Hs.520187 NM_003240 ENSG00000143768 LEFTY2 EBAF|LEFTA|LEFTYA|TGFB4 left-right determination factor 2 protein-coding 118.25-79 chr16 81165878 81166179 + 0.75 NA intron (NM_052892, intron 18 of 43) intron (NM_052892, intron 18 of 43) 15303 NM_001278423 114780 Hs.413525 NM_052892 ENSG00000166473 PKD1L2 PC1L2 polycystin 1 like 2 (gene/pseudogene) protein-coding 153.25-37 chr14 41012679 41013123 + 0.75 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 58190 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 130.25-97 chr2 67040916 67041138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45419 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 137.25-64 chr2 20859499 20859869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36554 NM_001282721 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 124.75-55 chr12 38514629 38514973 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 198027 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 159.25-85 chr3 72421055 72421414 + 0.75 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 25389 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 187.5-33 chr11 74553346 74553640 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -39089 NM_001363597 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 148.5-45 chr12 66181253 66181468 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7854 NM_001142523 11213 Hs.369265 NM_007199 ENSG00000090376 IRAK3 ASRT5|IRAKM interleukin 1 receptor associated kinase 3 protein-coding 219-5 chr1 184576266 184576781 + 0.75 NA intron (NM_030806, intron 3 of 5) intron (NM_030806, intron 3 of 5) 178335 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 131.75-200 chr7 45702874 45703246 + 0.75 NA intron (NM_021116, intron 14 of 19) intron (NM_021116, intron 14 of 19) 65958 NR_024271 641977 Hs.723477 NR_024271 ENSG00000214765 SEPTIN7P2 SEPT13|SEPT7B|SEPT7P2 septin 7 pseudogene 2 pseudo 198.25-8 chr1 228779664 228779996 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 44351 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 226.75-45 chr22 25119933 25120487 + 0.75 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -7518 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 200.75-38 chr17 29254200 29254668 + 0.75 NA TTS (NM_005208) TTS (NM_005208) 7577 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 146-114 chr6 150665450 150665900 + 0.75 NA intron (NM_001029884, intron 2 of 16) intron (NM_001029884, intron 2 of 16) -17972 NM_001329800 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 186.75-54 chr2 101167461 101167846 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 15993 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-139 chr3 122255611 122255865 + 0.75 NA intron (NM_001178065, intron 2 of 6) intron (NM_001178065, intron 2 of 6) -69510 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 157.75-52 chr15 50026364 50026644 + 0.75 NA intron (NR_073596, intron 6 of 27) intron (NR_073596, intron 6 of 27) 86875 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 135.25-122 chr22 29655926 29656300 + 0.75 NA intron (NR_156186, intron 7 of 16) AluJb|SINE|Alu 52480 NM_181830 4771 Hs.187898 NM_000268 ENSG00000186575 NF2 ACN|BANF|SCH neurofibromin 2 protein-coding 128.5-51 chr12 58814950 58815183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33350 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 116.75-16 chr1 218060631 218060822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17221 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 178-39 chr19 57320396 57320950 + 0.75 NA 5' UTR (NM_213598, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_213598, exon 1 of 4) 201 NM_213598 125919 Hs.202544 NM_213598 ENSG00000178229 ZNF543 - zinc finger protein 543 protein-coding 192.25-8 chr1 206814221 206814516 + 0.75 NA intron (NM_153758, intron 2 of 6) intron (NM_153758, intron 2 of 6) -14509 NM_013371 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 165.75-75 chr2 7618911 7619225 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197807 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 141.25-13 chr1 181133166 181133448 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -41177 NR_125966 101928973 Hs.637822 NR_125966 ENSG00000237292 LINC01732 - long intergenic non-protein coding RNA 1732 ncRNA 115-32 chr11 81002621 81002811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -239913 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 229-74 chr8 138545128 138545597 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -47632 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 206.5-83 chr4 93224871 93225223 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 6 of 14) intron (NM_001286838, intron 6 of 14) -603706 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 168-39 chr12 60522145 60522457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 832931 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 124-123 chr4 66932135 66932336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 489765 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 238 chr1 52758713 52759241 + 0.75 NA intron (NM_024646, intron 2 of 13) AluSx1|SINE|Alu 32524 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 192.5-101 chr4 114727629 114728161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71136 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 241.25-14 chr11 90499059 90499401 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 56627 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 150.75-145 chr4 101378514 101378818 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 30889 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 328-26 chr5 13434964 13435688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -402440 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 113-171 chr7 125150236 125150620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34141 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 121.75-107 chr21 22780677 22780956 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -298468 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 180.75-149 chr8 108320869 108321359 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -72397 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 194-36 chr14 82418157 82418484 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -224312 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 201.75-91 chr7 27846425 27846826 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) L1MA9|LINE|L1 106530 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 200.5-34 chr14 48478984 48479320 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -684138 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 229.75-29 chr17 61653690 61654040 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -62646 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 200.5-62 chr2 31080328 31080679 + 0.75 NA intron (NM_001329095, intron 1 of 15) intron (NM_001329095, intron 1 of 15) 49137 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 153.75-140 chr7 30763640 30764032 + 0.75 NA intron (NR_037598, intron 2 of 19) intron (NR_037598, intron 2 of 19) -7581 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 201.25-31 chr13 23304659 23304938 + 0.75 NA intron (NM_000231, intron 6 of 7) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 70710 NM_001278055 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 258.25-12 chr12 23009395 23009986 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -165946 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 156.75-58 chr14 56116605 56116856 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1681 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 113.25-154 chr7 8017733 8017941 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) intron (NM_138426, intron 2 of 7) 49041 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 115.25-64 chr14 66946589 66946893 + 0.75 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) intron (NM_020806, intron 8 of 22) -242699 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 216.5-66 chr20 5260650 5261170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55822 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 251.75-47 chr21 45965435 45965908 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -7299 NR_109931 101928796 Hs.130919 NR_109931 LOC101928796 - uncharacterized LOC101928796 ncRNA 133.25-119 chr21 14898355 14898822 + 0.75 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 20080 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 263.25-44 chr5 39245072 39245532 + 0.75 NA intron (NM_001243093, intron 1 of 18) intron (NM_001243093, intron 1 of 18) 25347 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 226.25-52 chr4 48787187 48787766 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -7177 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 139.25-65 chr17 9652730 9652983 + 0.75 NA intron (NM_001267576, intron 1 of 14) L1ME4a|LINE|L1 7319 NM_001267576 124739 Hs.709621 NM_153210 ENSG00000154914 USP43 - ubiquitin specific peptidase 43 protein-coding 286-30 chr4 72074776 72075349 + 0.75 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) MLT2A1|LTR|ERVL 35930 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 255-51 chr5 106309908 106310518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 700801 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 114.75-30 chr10 123406346 123406549 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 252045 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 132.75-131 chr3 196567253 196567494 + 0.75 NA intron (NM_182627, intron 1 of 3) intron (NM_182627, intron 1 of 3) 1181 NM_001345918 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 150.5-230 chr8 141234650 141234968 + 0.75 NA intron (NM_001286646, intron 1 of 7) intron (NM_001286646, intron 1 of 7) -6235 NM_001080431 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 142-22 chr10 108875797 108876135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -806673 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 167-18 chr10 65410709 65411027 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -160557 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 153.5-204 chr8 130823172 130823462 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 12 of 17) intron (NM_001115, intron 12 of 17) 217592 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 152.75-10 chr1 169775444 169775802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19066 NM_001320201 92342 Hs.33922 NM_033418 ENSG00000171806 METTL18 AsTP2|C1orf156|HPM1 methyltransferase like 18 protein-coding 147.5-31 chr11 20945336 20945557 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 10 of 18) LTR16A2|LTR|ERVL 275860 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 256.5-32 chr2 119084802 119085275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73713 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 215.75-33 chr14 61220637 61221066 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60487 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 148.5-158 chr3 154035904 154036141 + 0.75 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -84981 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 134.25-124 chr3 197344173 197344617 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45074 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 138.25-179 chr9 117017708 117018029 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 5 of 21) intron (NM_014010, intron 5 of 21) 163333 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 174-43 chr17 72666554 72666925 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -26267 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 134.5-249 chrX 77062957 77063249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48571 NR_110401 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 117.25-89 chr17 8423000 8423319 + 0.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -12725 NM_001330129 81565 Hs.372123 NM_030808 ENSG00000166579 NDEL1 EOPA|MITAP1|NDE1L1|NDE2|NUDEL nudE neurodevelopment protein 1 like 1 protein-coding 292-15 chr14 40387784 40388358 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -566640 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 145.75-37 chr14 53697827 53698205 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 250468 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 118.75-93 chr2 40240190 40240447 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 189986 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 131.5-11 chr1 167475515 167475870 + 0.75 NA intron (NM_000734, intron 1 of 7) L1MC5|LINE|L1 42837 NM_000734 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 202-44 chr3 170163989 170164444 + 0.75 NA intron (NM_024947, intron 4 of 14) AluJo|SINE|Alu 17517 NM_001308116 80012 Hs.529592 NM_024947 ENSG00000173889 PHC3 EDR3|HPH3 polyhomeotic homolog 3 protein-coding 114.75-22 chr10 8433920 8434175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 160344 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 168.25-88 chr20 23835339 23835682 + 0.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -8781 NM_001322 1470 Hs.669305 NM_001322 ENSG00000170369 CST2 - cystatin SA protein-coding 171.75-40 chr14 48352414 48352726 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -557556 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 145.25-62 chr18 44532095 44532289 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_110792) promoter-TSS (NR_110792) 413 NR_131768 105667213 Hs.135737 NR_131768 LINC01601 - long intergenic non-protein coding RNA 1601 ncRNA 235.75-41 chr21 45069530 45070071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3411 NR_027292 728039 Hs.309203 NM_032653 ENSG00000235374 SSR4P1 C21orf122|PRED57|PRED90 signal sequence receptor subunit 4 pseudogene 1 pseudo 142.25-125 chr4 125646695 125647065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139621 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 139.75-105 chr2 236052485 236052817 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 16 of 17) intron (NM_001037131, intron 16 of 17) 115735 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 285.75-37 chr6 62804266 62804926 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 515381 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 125.75-14 chr1 185667277 185667558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38929 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 157.25-164 chrX 94655482 94655776 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 407597 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 112.75-52 chr14 20046064 20046282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11415 NM_001004714 390433 Hs.553573 NM_001004714 ENSG00000176253 OR4K13 OR14-27 olfactory receptor family 4 subfamily K member 13 protein-coding 163.75-7 chr1 97296559 97296918 + 0.75 NA intron (NR_046590, intron 2 of 4) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 200815 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 112.75-204 chr8 138145881 138146202 + 0.75 NA exon (NM_001362965, exon 15 of 20) exon (NM_001362965, exon 15 of 20) -62496 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 123.25-102 chr2 78504472 78504736 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -40927 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 158.75-28 chr11 21970819 21971062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222145 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 151.25-103 chr20 25304513 25304835 + 0.75 NA intron (NM_001042472, intron 10 of 12) AluSx3|SINE|Alu 56589 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 142.25-69 chr16 83009453 83009763 + 0.75 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR -19310 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 183.25-114 chr8 123596530 123596827 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55472 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 127.25-185 chr6 146039467 146039763 + 0.75 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) L2|LINE|L2 10417 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 120.25-166 chr5 90348110 90348368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58168 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 189 chr1 12285587 12285915 + 0.75 NA intron (NM_015378, intron 21 of 69) L1MC5a|LINE|L1 55721 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 145.5-76 chr16 81456032 81456396 + 0.75 NA intron (NM_198390, intron 1 of 20) intron (NM_198390, intron 1 of 20) 11044 NM_198390 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 174.25-89 chr21 27174150 27174524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207249 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 222.25-52 chr3 191934066 191934444 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -304375 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 186-44 chr2 31205580 31205983 + 0.75 NA intron (NM_001321270, intron 2 of 21) intron (NM_001321270, intron 2 of 21) 11734 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 202.75-48 chr18 5801921 5802274 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -38598 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 163.5-98 chr2 160379834 160380207 + 0.75 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 27862 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 148-126 chr8 78259018 78259337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257163 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 116-68 chr17 61122124 61122321 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 245482 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 227.25-71 chr7 3884874 3885238 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -244629 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 195.5-151 chr7 68624594 68625038 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 604563 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 179.75-72 chr3 58631146 58631482 + 0.75 NA intron (NR_134853, intron 2 of 3) intron (NR_134853, intron 2 of 3) -3704 NM_001282714 11170 Hs.506357 NM_007177 ENSG00000168309 FAM107A DRR1|TU3A family with sequence similarity 107 member A protein-coding 131.25-34 chr11 90140530 90140748 + 0.75 NA intron (NM_001300930, intron 2 of 17) L1MEf|LINE|L1 5976 NM_001300930 10003 Hs.112482 NM_005467 ENSG00000077616 NAALAD2 GCPIII|GPCIII|NAADALASE2|NAALADASE2 N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 protein-coding 140.5-17 chr10 78560074 78560475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292932 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 138-135 chr6 34907659 34907896 + 0.75 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) MIR|SINE|MIR 18522 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 114.75-73 chr17 66480459 66480751 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -63751 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 159.75-149 chr6 65567742 65568218 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) LTR29|LTR|ERV1 11824 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 127.75-177 chr6 122182232 122182596 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -217137 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 120.5-162 chr4 56385268 56385604 + 0.75 NA intron (NM_001286672, intron 1 of 10) intron (NM_001286672, intron 1 of 10) 2055 NM_001323892 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 238-54 chr5 39758040 39758455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 237816 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 124.25-94 chr2 34993580 34993927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 316196 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 143.75-113 chr3 28342602 28342852 + 0.75 NA intron (NM_001271650, intron 1 of 8) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -5994 NM_001040432 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 261.5-10 chr12 27672589 27673117 + 0.75 NA intron (NM_003622, intron 15 of 29) intron (NM_003622, intron 15 of 29) -23594 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 172.25-140 chr8 110648696 110648976 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 378597 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 129.25-46 chr14 35081511 35081882 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001289022, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001289022, exon 6 of 6) 615 NR_110415 101927178 Hs.617139 NR_110415 ENSG00000151327 LOC101927178 - uncharacterized LOC101927178 ncRNA 248.25-23 chr15 62641704 62642180 + 0.75 NA intron (NR_026897, intron 1 of 2) intron (NR_026897, intron 1 of 2) 3239 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 157.5-7 chr1 68350829 68351254 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98913 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 137-9 chr1 111924614 111924848 + 0.75 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 15074 NR_046619 100873995 Hs.535274 NR_046619 ENSG00000237556 KCND3-AS1 - KCND3 antisense RNA 1 ncRNA 126-6 chr1 106843693 106843918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25566 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 113.5-253 chrX 95521661 95521875 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -458542 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 132.25-36 chr10 110864044 110864286 + 0.75 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL 6739 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 119.5-212 chr7 38818309 38818531 + 0.75 NA intron (NM_014396, intron 6 of 28) intron (NM_014396, intron 6 of 28) 90771 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 140.25-161 chr6 37437552 37437906 + 0.75 NA intron (NM_015050, intron 2 of 23) intron (NM_015050, intron 2 of 23) 4508 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 140.75-109 chr20 2001305 2001555 + 0.75 NA intron (NR_134520, intron 3 of 3) intron (NR_134520, intron 3 of 3) -7145 NM_001190899 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 197-13 chr13 32265875 32266279 + 0.75 NA intron (NM_023037, intron 54 of 60) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 45877 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 176.5-13 chr10 34750153 34750468 + 0.75 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 64986 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 164.25-94 chr22 44155249 44155484 + 0.75 NA intron (NM_001243385, intron 10 of 12) intron (NM_001243385, intron 10 of 12) -17590 NM_001137605 64098 Hs.658995 NM_022141 ENSG00000138964 PARVG - parvin gamma protein-coding 153-139 chr7 26093414 26093857 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -58563 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 167.25-126 chr5 86188912 86189308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93334 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 140.5-207 chr7 7672698 7673025 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) intron (NM_002947, intron 4 of 7) 32109 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 129-193 chrX 88993411 88993696 + 0.75 NA Intergenic MER83A-int|LTR|ERV1 246328 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 174-93 chr7 51775158 51775519 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -382082 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 170.25-126 chr5 43874652 43874953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271572 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 132.25-51 chr13 86047347 86047640 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -248074 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 212.25-105 chr9 117106575 117107072 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 3 of 21) intron (NM_014010, intron 3 of 21) 74378 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 201.5-6 chr1 57430626 57430949 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -5866 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 155-131 chr7 83678656 83678899 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29638 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 152-162 chrUn_KI270438v1 108607 108812 + 0.75 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 123.5-61 chr14 76785706 76786022 + 0.75 NA TTS (NM_015305) TTS (NM_015305) 860 NR_104184 100506603 Hs.673984 NR_104183 ENSG00000258301 VASH1-AS1 - VASH1 antisense RNA 1 ncRNA 204.75-121 chr8 104318595 104318954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21022 NM_001257317 81501 Hs.652230 NM_030788 ENSG00000164935 DCSTAMP FIND|TM7SF4|hDC-STAMP dendrocyte expressed seven transmembrane protein protein-coding 187.5-103 chr20 42935227 42935546 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) AluJr4|SINE|Alu -33357 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 138-142 chr6 93460258 93460592 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -40843 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 120.5-198 chr6 70589019 70589290 + 0.75 NA 3' UTR (NM_145267, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_145267, exon 3 of 3) 22224 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 113.25-88 chr2 68379339 68379613 + 0.75 NA intron (NM_002664, intron 1 of 8) intron (NM_002664, intron 1 of 8) 14194 NM_002664 5341 Hs.468840 NM_002664 ENSG00000115956 PLEK P47 pleckstrin protein-coding 239-10 chr10 103670997 103671388 + 0.75 NA intron (NM_014631, intron 6 of 13) intron (NM_014631, intron 6 of 13) 7023 NM_001365079 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 125.25-60 chr14 29320635 29320829 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -534945 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 131.25-100 chr2 72688882 72689103 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) MIRc|SINE|MIR 137041 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 155.5-51 chr14 50131524 50131832 + 0.75 NA intron (NM_006939, intron 19 of 22) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -15106 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 184-56 chr3 128780854 128781152 + 0.75 NA intron (NM_004637, intron 1 of 5) intron (NM_004637, intron 1 of 5) 54867 NM_004637 7879 Hs.684374 NM_004637 ENSG00000075785 RAB7A PRO2706|RAB7 RAB7A, member RAS oncogene family protein-coding 188.75-26 chr14 61501724 61502205 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 68230 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 187.25-88 chr5 108934755 108935305 + 0.75 NA intron (NM_001308031, intron 1 of 10) intron (NM_001308031, intron 1 of 10) 10424 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 135-116 chr3 178487971 178488294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48304 NM_181361 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 125.5-46 chr11 117171937 117172218 + 0.75 NA intron (NR_110269, intron 6 of 7) intron (NR_110269, intron 6 of 7) -6666 NM_001040455 51092 Hs.712144 NM_015996 ENSG00000149577 SIDT2 CGI-40 SID1 transmembrane family member 2 protein-coding 151.25-205 chrX 43052099 43052301 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -124794 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 139.5-186 chr5 163638142 163638378 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 132641 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 124.25-67 chr16 8499038 8499264 + 0.75 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 90687 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 170.75-111 chr5 133575386 133575678 + 0.75 NA intron (NM_015082, intron 2 of 15) intron (NM_015082, intron 2 of 15) 37009 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 171.5-165 chr9 73682870 73683287 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 531213 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 157.5-5 chr1 45907614 45907865 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) L1MB4|LINE|L1 43391 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 201.25-85 chr6 157992928 157993356 + 0.75 NA intron (NM_003898, intron 1 of 26) L1MA2|LINE|L1 -7965 NR_046796 100874300 Hs.742238 NR_046796 ENSG00000233496 SYNJ2-IT1 - SYNJ2 intronic transcript 1 ncRNA 173.5-23 chr10 92352104 92352405 + 0.75 NA 3' UTR (NM_017824, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_017824, exon 6 of 6) 61087 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 197.75-14 chr12 9784807 9785252 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -15023 NR_159359 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 143-98 chr3 180707745 180708010 + 0.75 NA non-coding (NR_109986, exon 14 of 14) non-coding (NR_109986, exon 14 of 14) -28388 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 150-66 chr18 11700849 11701072 + 0.75 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) 11696 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 126-88 chr2 17824166 17824462 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 7854 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 115-171 chr7 70793739 70794009 + 0.75 NA TTS (NM_001127231) TTS (NM_001127231) -338270 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 125.5-257 chr8 111819127 111819486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 442667 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 209.5-106 chr4 106382805 106383153 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -15544 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 140-169 chr8 144045512 144045804 + 0.75 NA intron (NM_198572, intron 4 of 4) intron (NM_198572, intron 4 of 4) -3740 NR_158554 392275 NR_158554 SMPD5 MA-nSMase sphingomyelin phosphodiesterase 5 pseudo 214.75-32 chr17 68274345 68274770 + 0.75 NA intron (NM_004694, intron 2 of 5) intron (NM_004694, intron 2 of 5) 15375 NM_001352904 22901 Hs.437249 NM_014960 ENSG00000141337 ARSG USH4 arylsulfatase G protein-coding 199.25-98 chr8 100901081 100901465 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 49298 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 208.5-105 chr5 4472779 4473300 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -300442 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 152.75-58 chr14 75177794 75178059 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -1314 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 313.75-22 chr7 157391403 157392003 + 0.75 NA intron (NM_058246, intron 8 of 9) intron (NM_058246, intron 8 of 9) 54699 NM_058246 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 125.75-91 chr2 76117102 76117354 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -406313 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 178.25-77 chr21 37271019 37271384 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3093 NM_001331022 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 141-164 chr9 73636994 73637261 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 485262 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 116.5-233 chr7 105340617 105340809 + 0.75 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu -41934 NM_001278273 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 116.5-183 chr4 149545349 149545720 + 0.75 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) L1MA9|LINE|L1 270309 NM_001363507 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 228.75-66 chr6 35110615 35111203 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 30430 NM_001366325 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 118.75-174 chr6 145273608 145273878 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 413134 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 120.75-72 chr18 69901100 69901323 + 0.75 NA intron (NM_001303619, intron 1 of 4) intron (NM_001303619, intron 1 of 4) 46662 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 219.5-61 chr2 9827208 9827704 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15986 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 112.5-157 chr22 30111556 30111743 + 0.75 NA intron (NM_001329457, intron 6 of 11) intron (NM_001329457, intron 6 of 11) 31185 NM_152510 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 150.75-98 chr2 101322028 101322389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12758 NR_049881 100847007 NR_049881 ENSG00000264857 MIR5696 - microRNA 5696 ncRNA 177.25-112 chr5 26380344 26380769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 658030 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 168.75-110 chr5 83963392 83963797 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) intron (NM_001278642, intron 8 of 9) -242739 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 207-47 chr2 199516925 199517234 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -45813 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 175-103 chr5 102345986 102346270 + 0.75 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 -49844 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 195.75-77 chr3 103837111 103837456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -313167 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 171.25-42 chr13 110630351 110630633 + 0.75 NA intron (NM_001242882, intron 5 of 9) L1MB3|LINE|L1 14908 NM_001242881 55739 Hs.408324 NM_018210 ENSG00000213995 NAXD CARKD|LP3298|PEBEL2 NAD(P)HX dehydratase protein-coding 157.5-25 chr10 71548475 71548725 + 0.75 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -36680 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 169.75-167 chr9 117493847 117494106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78919 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 150.75-199 chrX 93821485 93821934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147503 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 116.5-91 chr17 52719164 52719407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142836 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 124.75-93 chr16 81750378 81750669 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -28768 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 126.75-79 chr16 1752494 1752853 + 0.75 NA intron (NM_001040439, intron 9 of 30) AluJo|SINE|Alu 17688 NR_036138 100423012 NR_036138 ENSG00000265820 MIR3177 mir-3177 microRNA 3177 ncRNA 180.75-160 chrX 29431765 29432215 + 0.75 NA intron (NM_014271, intron 5 of 10) intron (NM_014271, intron 5 of 10) -142288 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 152-159 chr9 99196586 99196896 + 0.75 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 25201 NM_033087 85365 Hs.40919 NM_033087 ENSG00000119523 ALG2 CDG1I|CDGIi|CMS14|CMSTA3|NET38|hALPG2 ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferase protein-coding 254.25-38 chr20 62689431 62689884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19179 NM_002531 4923 Hs.590869 NM_002531 ENSG00000101188 NTSR1 NTR neurotensin receptor 1 protein-coding 203-39 chr16 2902051 2902388 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9760 NM_020912 84256 Hs.655321 NM_020912 ENSG00000059122 FLYWCH1 - FLYWCH-type zinc finger 1 protein-coding 186.5-108 chr5 82216104 82216407 + 0.75 NA intron (NM_031482, intron 5 of 7) intron (NM_031482, intron 5 of 7) 62099 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 122.75-90 chr2 45583539 45583778 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 5 of 20) MER112|DNA|hAT-Charlie 27609 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 156.75-91 chr2 146882888 146883140 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 295957 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 135.25-93 chr2 42385255 42385451 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16396 NM_001319037 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 180.25-124 chr8 140711248 140711504 + 0.75 NA intron (NR_148037, intron 25 of 34) AluSz6|SINE|Alu 7193 NM_001352751 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 212.5-90 chr6 4032535 4032953 + 0.75 NA exon (NM_003913, exon 2 of 15) exon (NM_003913, exon 2 of 15) 11444 NR_146784 8899 Hs.159014 NM_003913 ENSG00000112739 PRPF4B PR4H|PRP4|PRP4H|PRP4K|dJ1013A10.1 pre-mRNA processing factor 4B protein-coding 126.5-22 chr1 230263801 230263993 + 0.75 NA intron (NM_004481, intron 13 of 15) intron (NM_004481, intron 13 of 15) 162435 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 140.5-196 chr6 67683580 67683895 + 0.75 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -371614 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 159.75-27 chr11 34906733 34907017 + 0.75 NA intron (NM_015957, intron 1 of 6) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -9255 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 167.25-145 chr7 120461918 120462226 + 0.75 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 188897 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 130.25-213 chr9 3097994 3098225 + 0.75 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -83480 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 165.25-45 chr15 60801427 60801703 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 119996 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 171.25-3 chr1 90480710 90481178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176806 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 157.25-144 chr8 28505262 28505508 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_036250) promoter-TSS (NR_036250) -203 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 158-137 chr8 72948467 72948754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60254 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 226.5-29 chr17 9875861 9876267 + 0.75 NA intron (NM_004246, intron 10 of 12) AluSp|SINE|Alu 29207 NM_002903 5957 Hs.80539 NM_002903 ENSG00000109047 RCVRN RCV1 recoverin protein-coding 114.5-203 chr5 26960088 26960274 + 0.75 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) HAL1ME|LINE|L1 78405 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 216.25-98 chr8 73830834 73831246 + 0.75 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) MER21B|LTR|ERVL 47822 NR_073121 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 113.5-62 chr13 32228913 32229275 + 0.75 NA intron (NM_023037, intron 40 of 60) intron (NM_023037, intron 40 of 60) 82860 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 159.5-3 chr1 61984539 61984958 + 0.75 NA intron (NM_001350145, intron 27 of 43) intron (NM_001350145, intron 27 of 43) -94038 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 124.25-210 chr9 83005758 83006013 + 0.75 NA intron (NM_152573, intron 7 of 16) intron (NM_152573, intron 7 of 16) 57257 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 163.25-21 chr10 113189201 113189571 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 60115 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 121.75-133 chr4 97853426 97853798 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) intron (NM_174952, intron 8 of 10) 289864 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 264.5-36 chr22 32555862 32556422 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) MER119|DNA|hAT-Charlie 80905 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 151.25-88 chr2 81643194 81643552 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -176427 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 151.5-208 chr9 110142512 110142955 + 0.75 NA intron (NM_147150, intron 8 of 9) intron (NM_147150, intron 8 of 9) 17232 NM_001136562 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 181.25-76 chr21 24156992 24157402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164180 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 138.75-107 chr20 52857707 52858008 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114501 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 202-30 chr19 31805776 31806147 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 213680 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 141.5-222 chr8 59737426 59737827 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 543774 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 149.5-183 chr7 46386177 46386424 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 310822 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 139.5-98 chr2 98597064 98597306 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 11327 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 132.25-100 chr2 149265742 149265984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64122 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 178.5-23 chr11 38896141 38896472 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 247448 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 192.75-108 chr5 117078096 117078559 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -316118 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 156.5-13 chr10 9086858 9087265 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188552 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 132-145 chr5 164412949 164413204 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 54326 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 158.25-33 chr12 42259040 42259401 + 0.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -20852 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 153-92 chr22 45150298 45150643 + 0.75 NA intron (NR_038956, intron 1 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 2114 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 115-126 chr5 8946326 8946579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106720 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 147.5-171 chr5 10697720 10698232 + 0.75 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 63258 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 163-81 chr4 32319154 32319577 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -31673 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 181.75-38 chr14 65158821 65159273 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -56352 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 112.5-186 chr4 91368386 91368611 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 908804 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 179.25-125 chr5 165143217 165143518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 673088 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 141-22 chr10 17619384 17619769 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -2202 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 143-14 chr11 14071238 14071584 + 0.75 NA intron (NM_006108, intron 3 of 15) intron (NM_006108, intron 3 of 15) 108688 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 264-54 chr5 158427034 158427584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17536 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 114-121 chr5 9826772 9827062 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L2c|LINE|L2 -27460 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 117.25-96 chr18 4853736 4854024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -227302 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 187.25-112 chr9 74138316 74138771 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -232988 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 177-49 chr2 155454548 155455013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 756085 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 210.25-77 chr8 9169704 9170120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18373 NM_001201329 79660 Hs.458513 NM_024607 ENSG00000173281 PPP1R3B GL|PPP1R4|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3B protein-coding 218.75-83 chr7 108603135 108603588 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 33487 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 137-90 chr20 32108800 32109153 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014742) promoter-TSS (NM_014742) -738 NM_014742 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 127.5-100 chr17 61714460 61714785 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 17 of 19) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -123403 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 228-2 chr1 35021000 35021457 + 0.75 NA intron (NM_007167, intron 2 of 15) AluSx|SINE|Alu 10717 NM_007167 9204 Hs.533986 NM_007167 ENSG00000163867 ZMYM6 Buster2|MYM|ZBED7|ZNF198L4|ZNF258 zinc finger MYM-type containing 6 protein-coding 114.75-16 chr1 182794274 182794477 + 0.75 NA exon (NM_030769, exon 3 of 13) exon (NM_030769, exon 3 of 13) 4602 NM_001200051 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 120-10 chr1 188571323 188571601 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 1127834 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 124.25-165 chr5 66317008 66317300 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -107708 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 148.5-178 chr5 20571425 20571662 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 4170 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 117.75-63 chr15 60330756 60331028 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 67094 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 158.5-70 chr15 33401763 33402231 + 0.75 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 91030 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 166.75-99 chr4 41379662 41380017 + 0.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) AluSx|SINE|Alu 19032 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 275.75-17 chr16 24709963 24710436 + 0.75 NA intron (NM_001351850, intron 2 of 23) AluSp|SINE|Alu -19452 NM_001330520 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 158.5-17 chr10 33916220 33916526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -143693 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 253.75-17 chr18 51346944 51347404 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44868 NR_040075 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 117.25-19 chr1 207054454 207054673 + 0.75 NA intron (NM_006212, intron 1 of 14) intron (NM_006212, intron 1 of 14) 1288 NM_006212 5208 Hs.282702 NM_006212 ENSG00000123836 PFKFB2 PFK-2/FBPase-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2 protein-coding 155.75-144 chr6 156697467 156697918 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -80163 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 122.75-134 chr3 122876813 122877039 + 0.75 NA intron (NM_032839, intron 8 of 8) intron (NM_032839, intron 8 of 8) -9587 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 132-69 chr17 31455430 31455690 + 0.75 NA intron (NM_032932, intron 3 of 14) intron (NM_032932, intron 3 of 14) -32548 NM_001346749 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 127.5-178 chr4 140035137 140035411 + 0.75 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) intron (NM_018717, intron 1 of 4) -92741 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 146.5-173 chr5 74327370 74327706 + 0.75 NA intron (NR_105010, intron 2 of 2) intron (NR_105010, intron 2 of 2) 5052 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 202.25-95 chr8 140044993 140045412 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) MIR|SINE|MIR 55333 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 219.5-124 chr7 110718451 110718916 + 0.75 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -372323 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 154-93 chr3 89925687 89926061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 818253 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 163.5-160 chr5 63664232 63664530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 297911 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 123.5-147 chr3 188350621 188351000 + 0.75 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 125405 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 145-32 chr11 93309434 93309705 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -21148 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 183.25-10 chr10 54147609 54147955 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 15 of 34) intron (NM_001354411, intron 15 of 34) -338448 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 157.75 chr1 9508219 9508623 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -31044 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 114.5-242 chr7 50839955 50840289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46669 NM_001371008 197.25-96 chr7 47627200 47627610 + 0.75 NA non-coding (NR_108090, exon 3 of 4) non-coding (NR_108090, exon 3 of 4) 5466 NR_108090 101929086 Hs.563487 NR_108090 ENSG00000236078 LINC01447 - long intergenic non-protein coding RNA 1447 ncRNA 176.25-15 chr10 23013550 23014027 + 0.75 NA intron (NM_001282745, intron 16 of 18) intron (NM_001282745, intron 16 of 18) -81791 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 285-44 chr8 79327138 79327769 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -4735 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 116.25-114 chr2 128592172 128592400 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -272314 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 183-115 chr8 138527454 138528006 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30000 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 145.75-116 chr4 149115567 149116044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38490 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 209-67 chr7 101384376 101384873 + 0.75 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) intron (NM_133457, intron 1 of 12) 21749 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 113.25-60 chr16 2031952 2032138 + 0.75 NA intron (NM_004785, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu -1249 NM_001252075 9351 Hs.440896 NM_004785 ENSG00000065054 SLC9A3R2 E3KARP|NHE3RF2|NHERF-2|NHERF2|OCTS2|SIP-1|SIP1|TKA-1 SLC9A3 regulator 2 protein-coding 202-4 chr1 106491951 106492278 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -326125 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 136-147 chr8 72533564 72533935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3476 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 147.25-53 chr19 44941539 44941797 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_037932) promoter-TSS (NR_037932) -569 NM_001646 346 Hs.731599 NM_001646 ENSG00000267467 APOC4 APO-CIV|APOC-IV apolipoprotein C4 protein-coding 210.5-22 chr11 101832757 101833139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82062 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 116-28 chr11 88480888 88481150 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23557 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-143 chr3 131782151 131782386 + 0.75 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) 203663 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 127-138 chr5 68724946 68725271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 304819 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 116.25-187 chr5 148404937 148405311 + 0.75 NA intron (NM_001271723, intron 6 of 20) intron (NM_001271723, intron 6 of 20) 21166 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 212.75-38 chr15 87629523 87630155 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 52910 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 177.75-57 chr17 73823743 73824175 + 0.75 NA intron (NR_027146, intron 1 of 3) intron (NR_027146, intron 1 of 3) 4578 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 269.25-45 chr6 51546264 51546754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75361 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 136.5-44 chr11 64062948 64063242 + 0.75 NA intron (NM_014067, intron 3 of 10) intron (NM_014067, intron 3 of 10) -40795 NM_013280 23769 Hs.584876 NM_013280 ENSG00000126500 FLRT1 SPG68 fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 protein-coding 151.5-17 chr10 76297941 76298300 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 515359 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 124-105 chr21 25382696 25382880 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 48913 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 186.5-40 chr14 62894057 62894499 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 151180 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 176-27 chr16 27766292 27766719 + 0.75 NA intron (NM_015202, intron 20 of 27) intron (NM_015202, intron 20 of 27) -47476 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 166.25-120 chr5 19635350 19635600 + 0.75 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 250797 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 118-76 chr19 35096212 35096577 + 0.75 NA intron (NR_024561, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 9877 NR_024561 100128675 Hs.633989 NR_024561 ENSG00000227392 HPN-AS1 - HPN antisense RNA 1 ncRNA 120.5-140 chr3 58944399 58944627 + 0.75 NA intron (NR_147234, intron 4 of 10) intron (NR_147234, intron 4 of 10) 105512 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 114.75-99 chr2 166243733 166244041 + 0.75 NA intron (NM_001365536, intron 18 of 26) L2c|LINE|L2 -94726 NM_001353950 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 131-105 chr20 23555747 23555957 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 12632 NM_080610 128821 Hs.121554 NM_080610 ENSG00000101435 CST9L CTES7B|bA218C14.1 cystatin 9 like protein-coding 213.25-17 chr14 70951915 70952287 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 2 of 35) MIR|SINE|MIR 44642 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 127.5-52 chr12 23722891 23723177 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) intron (NM_152989, intron 9 of 17) -138448 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 177-80 chr5 109372295 109372803 + 0.75 NA intron (NM_014819, intron 4 of 9) L2|LINE|L2 37425 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 312-7 chr10 82210793 82211518 + 0.75 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 21765 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 153.25-137 chr8 103505274 103505527 + 0.75 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1ME4b|LINE|L1 -3490 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 124-78 chr2 11528507 11528733 + 0.75 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -5425 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 210.75-90 chr7 5240364 5240802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26314 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 134.25-68 chr18 58674021 58674264 + 0.75 NA intron (NM_006785, intron 1 of 16) intron (NM_006785, intron 1 of 16) -2269 NM_001289967 101927322 Hs.644875 NM_001289967 LOC101927322 - uncharacterized LOC101927322 protein-coding 242.5-24 chr11 132522892 132523443 + 0.75 NA intron (NM_002545, intron 3 of 6) AluSq2|SINE|Alu 238865 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 137.5-166 chr3 178589930 178590337 + 0.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 31283 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 214-18 chr14 29950813 29951141 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -23130 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 204.25-64 chr20 48734209 48734707 + 0.75 NA intron (NM_020820, intron 4 of 39) intron (NM_020820, intron 4 of 39) 93541 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 126.5-105 chr2 20349354 20349618 + 0.75 NA intron (NM_001352920, intron 1 of 19) intron (NM_001352920, intron 1 of 19) 1358 NM_015317 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 181-28 chr14 48583369 48583739 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -788540 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 148-127 chr8 87745693 87745963 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 128187 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 140.75-2 chr1 33193446 33193745 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -11552 NM_018207 55223 Hs.656006 NM_018207 ENSG00000116525 TRIM62 DEAR1 tripartite motif containing 62 protein-coding 114.5-45 chr10 114834271 114834472 + 0.75 NA intron (NM_001135051, intron 3 of 16) intron (NM_001135051, intron 3 of 16) 12591 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 196.25-124 chr9 102833784 102834147 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161368 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 127.75-82 chr18 5065271 5065525 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -15784 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 134.5-207 chr7 44647290 44647666 + 0.75 NA exon (NM_001165036, exon 4 of 23) exon (NM_001165036, exon 4 of 23) 40851 NM_001003941 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 124.75-58 chr12 48798254 48798476 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 8789 NR_110020 100506125 Hs.306727 NR_110019 ENSG00000257660 ADCY6-DT - ADCY6 divergent transcript ncRNA 244.25-22 chr2 135109988 135110417 + 0.75 NA intron (NM_001172435, intron 5 of 24) AluJr|SINE|Alu -26426 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 131-94 chr2 100010814 100011212 + 0.75 NA intron (NM_002285, intron 3 of 23) AluY|SINE|Alu 94570 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 192.5-131 chr8 112722309 112722669 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L1MC4|LINE|L1 78996 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 162.25-83 chr2 127891740 127892185 + 0.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -6022 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 170.75-98 chr4 72278802 72279102 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 239820 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 135.25-212 chr9 136725987 136726307 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_002975) promoter-TSS (NR_002975) 90 NR_002975 677824 Hs.495480 NR_002975 ENSG00000280496 SNORA17B ACA43|SNORA43 small nucleolar RNA, H/ACA box 17B snoRNA 284.5-69 chr8 138480580 138481315 + 0.75 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) MIRb|SINE|MIR 16314 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 257.75-31 chr3 185324407 185324750 + 0.75 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) -38558 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 130.75-181 chr7 70079907 70080233 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 481595 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 159-30 chr12 108837912 108838351 + 0.75 NA intron (NM_018984, intron 2 of 14) intron (NM_018984, intron 2 of 14) -1125 NR_030350 693204 NR_030350 ENSG00000207622 MIR619 MIRN619|hsa-mir-619 microRNA 619 ncRNA 121.25-146 chr4 87083443 87083651 + 0.75 NA intron (NM_005935, intron 3 of 19) intron (NM_005935, intron 3 of 19) 76546 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 119.75-32 chr11 40142790 40143165 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 150153 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 178.75-24 chr13 91413964 91414465 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 1 of 7) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 15593 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 163.25-38 chr13 94557898 94558216 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8651 NM_001322186 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 126.25-199 chr8 64520739 64520998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56395 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 142.5-146 chr3 196088035 196088348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6101 NM_001313965 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 206.75-2 chr1 40540424 40540743 + 0.75 NA intron (NM_152373, intron 2 of 4) intron (NM_152373, intron 2 of 4) 8946 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 248.5-53 chr2 103172766 103173136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188522 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 146.25-154 chr8 114409713 114410039 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -972937 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 171.5-104 chr3 67291299 67291779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66075 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 255.5-20 chr12 50938028 50938529 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 13263 NM_014033 25840 Hs.711113 NM_014033 ENSG00000185432 METTL7A AAM-B|AAMB methyltransferase like 7A protein-coding 166.75-145 chr9 22105900 22106256 + 0.75 NA intron (NR_003529, intron 14 of 18) AluSg|SINE|Alu -96765 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 251.25-18 chr14 72696523 72697033 + 0.75 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 179958 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 248.5-32 chr15 94362091 94362637 + 0.75 NA intron (NM_018349, intron 9 of 21) intron (NM_018349, intron 9 of 21) 6434 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 127.5-225 chr7 26138080 26138406 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -13955 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 148-131 chr8 118955569 118955889 + 0.75 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 3466 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 212.5-33 chr15 67942628 67942944 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -102741 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 206.25-57 chr20 43674766 43675247 + 0.75 NA intron (NM_001278610, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 7892 NM_002466 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 174-44 chr17 77843100 77843459 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 40808 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 137.75-136 chr3 93858519 93858759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115442 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 120.25-196 chr7 37464660 37464879 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15443 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 168.5-93 chr2 182920932 182921220 + 0.75 NA 3' UTR (NM_205842, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_205842, exon 32 of 32) -54439 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 157.25-95 chr3 99049125 99049438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -147586 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 185.25-115 chr7 46912512 46912826 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -215547 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 129.5-12 chr1 182381243 182381526 + 0.75 NA 3' UTR (NM_002065, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_002065, exon 8 of 8) 10020 NM_001033056 2752 Hs.132016 NM_002065 ENSG00000135821 GLUL GLNS|GS|PIG43|PIG59 glutamate-ammonia ligase protein-coding 159.5-34 chr11 79603247 79603713 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -162450 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 132.75-13 chr1 200828423 200828720 + 0.75 NA intron (NM_001297708, intron 4 of 16) intron (NM_001297708, intron 4 of 16) -44410 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 159.25-115 chr5 32923004 32923323 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -24280 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 168.75-103 chr4 94578873 94579223 + 0.75 NA intron (NM_006457, intron 5 of 12) intron (NM_006457, intron 5 of 12) 127106 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 122.5-159 chr3 183556276 183556504 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_130446) promoter-TSS (NM_130446) -684 NM_130446 89857 Hs.659147 NM_130446 ENSG00000172578 KLHL6 - kelch like family member 6 protein-coding 153.5-190 chr8 9340555 9340932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15692 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 216.25-55 chr2 170436293 170436652 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 22 of 33) intron (NM_001083615, intron 22 of 33) -85529 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 127.75-62 chr14 62686997 62687241 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 358339 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 165.5-93 chr2 191352622 191352892 + 0.75 NA intron (NM_012223, intron 7 of 28) intron (NM_012223, intron 7 of 28) 107353 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 173.75-86 chr2 63039366 63039696 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 21 of 22) intron (NM_001142615, intron 21 of 22) 8180 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 150.25-5 chr1 68726306 68726611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -229376 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 161.75-50 chr17 79131892 79132188 + 0.75 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) intron (NM_001350453, intron 3 of 13) 57103 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 123-171 chr6 169444632 169444857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190630 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 188.25-24 chr11 114951304 114951713 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 272981 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 135.25-58 chr12 122535053 122535318 + 0.75 NA intron (NM_014708, intron 3 of 63) intron (NM_014708, intron 3 of 63) 7936 NM_014708 9735 Hs.300559 NM_014708 ENSG00000184445 KNTC1 ROD kinetochore associated 1 protein-coding 135.25-80 chr17 79164226 79164534 + 0.75 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) intron (NM_001350453, intron 3 of 13) 89443 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 113-183 chr8 135535344 135535547 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 77989 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 140-119 chr3 166708342 166708651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190187 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 136-169 chr9 73429282 73429569 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 277560 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 212.75-42 chr17 58193704 58194108 + 0.75 NA intron (NM_000502, intron 4 of 12) intron (NM_000502, intron 4 of 12) 1180 NM_000502 8288 Hs.279259 NM_000502 ENSG00000121053 EPX EPO|EPP|EPX-PEN|EPXD eosinophil peroxidase protein-coding 119.75-86 chr18 42843042 42843370 + 0.75 NA intron (NM_002930, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 272479 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 150.75-154 chr5 115361887 115362292 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65435 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 168-119 chr8 32373690 32374026 + 0.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -66888 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 156.5-72 chr19 48883259 48883685 + 0.75 NA intron (NM_003323, intron 11 of 12) MER41B|LTR|ERV1 11080 NM_014330 23645 Hs.631593 NM_014330 ENSG00000087074 PPP1R15A GADD34 protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A protein-coding 169-71 chr5 14407159 14407479 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 33 of 56) MER54A|LTR|ERVL -56664 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 149-46 chr19 42211915 42212129 + 0.75 NA intron (NR_073050, intron 2 of 3) AluSp|SINE|Alu 5655 NR_073046 162989 Hs.515432 NM_133328 ENSG00000160570 DEDD2 FLAME-3|FLAME3 death effector domain containing 2 protein-coding 143.25-187 chr8 112724076 112724406 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L2a|LINE|L2 80748 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 184-13 chr11 29500260 29500650 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93958 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 130.5-189 chr4 98074788 98075111 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1MEg|LINE|L1 68527 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 175.25-58 chr17 44051361 44051737 + 0.75 NA intron (NM_001369486, intron 1 of 3) AluSc|SINE|Alu 15122 NM_001369486 124801 Hs.355570 NM_152344 ENSG00000161654 LSM12 PNAS-135 LSM12 homolog protein-coding 113.5-175 chr4 61009710 61009920 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 87196 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 127.5-124 chr2 131122742 131122979 + 0.75 NA intron (NM_017958, intron 2 of 7) intron (NM_017958, intron 2 of 7) 18013 NM_001267063 55041 Hs.469944 NM_017958 ENSG00000115762 PLEKHB2 EVT2 pleckstrin homology domain containing B2 protein-coding 173.25-27 chr12 104722328 104722725 + 0.75 NA intron (NM_018413, intron 2 of 2) intron (NM_018413, intron 2 of 2) 130893 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 113.5-250 chr9 95055157 95055348 + 0.75 NA intron (NM_032823, intron 11 of 14) intron (NM_032823, intron 11 of 14) -10098 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 134.25-160 chr6 112742913 112743159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 395706 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 149.75-119 chr3 197011338 197011599 + 0.75 NA intron (NM_005929, intron 9 of 15) intron (NM_005929, intron 9 of 15) 8562 NR_038285 100507057 Hs.666451 NR_038285 ENSG00000228109 MELTF-AS1 MFI2-AS1 MELTF antisense RNA 1 ncRNA 116.5-202 chr5 117623330 117623577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106908 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 116.75-211 chr9 84325554 84325740 + 0.75 NA intron (NM_022127, intron 2 of 18) intron (NM_022127, intron 2 of 18) 15111 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 174-54 chr2 189538643 189539044 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 41968 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 247.25-48 chr5 2366641 2367152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54695 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 204.25-5 chr1 201980601 201980956 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1870 NM_001319184 6051 Hs.497391 NM_020216 ENSG00000176393 RNPEP AP-B|APB arginyl aminopeptidase protein-coding 187-12 chr10 36302957 36303211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 524782 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 156-116 chr5 24173987 24174468 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 222879 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 126-101 chr2 131030132 131030359 + 0.75 NA intron (NM_001367493, intron 5 of 13) intron (NM_001367493, intron 5 of 13) 62917 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 184.75-5 chr1 163383677 163384092 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 39307 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 156.25-140 chr7 44344385 44344766 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -18944 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 116-158 chr7 95824148 95824371 + 0.75 NA intron (NM_001135557, intron 4 of 15) AluJb|SINE|Alu 51753 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 134.25-15 chr10 67727772 67728044 + 0.75 NA Intergenic (TATATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -31713 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 170.5-168 chr7 8029823 8030275 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L1MA2|LINE|L1 61253 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 125.5-253 chr8 85369460 85369758 + 0.75 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) intron (NM_001738, intron 1 of 8) 8504 NM_001128829 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 115.25-161 chr5 36758208 36758472 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118354 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 133.75-21 chr10 68804525 68804843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22847 NM_001130161 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 237.5-83 chr5 163669598 163670188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164274 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 165.75-77 chr2 12900211 12900561 + 0.75 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 106627 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 134.75-209 chr7 131234716 131234934 + 0.75 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 92954 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 136.25-141 chr5 21254665 21255042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204627 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 115-44 chr12 114197408 114197626 + 0.75 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 44253 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 155.25-39 chr11 74137814 74138168 + 0.75 NA intron (NM_001286577, intron 5 of 32) intron (NM_001286577, intron 5 of 32) 33011 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 148.25-135 chr7 8036312 8036641 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L1PB4|LINE|L1 67680 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 207.25-2 chr1 73210286 73210654 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -95700 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 230-69 chr8 122510124 122510497 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 58334 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 144.5-152 chr4 97644259 97644601 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 277504 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 142-145 chr6 156535530 156535753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 156891 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 192.25-37 chr18 48235725 48236256 + 0.75 NA intron (NM_001371285, intron 1 of 5) L1MEd|LINE|L1 -16311 NM_001350280 84322 Hs.334493 NM_032362 C18orf12 HEIL1|HsT2508 chromosome 18 open reading frame 12 protein-coding 143-128 chr6 142354748 142355155 + 0.75 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) intron (NM_198569, intron 2 of 24) 52944 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 153.75-96 chr3 160182549 160182827 + 0.75 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) intron (NR_108088, intron 3 of 9) 24404 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 116-181 chr8 141913050 141913351 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -126887 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 136.25-162 chr6 24800623 24800987 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1888 NM_001282492 101928603 Hs.635133 NM_001282492 ENSG00000260286 ARMH2 C6orf229 armadillo like helical domain containing 2 protein-coding 125.5-95 chr15 97524538 97524747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2831 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 155.75-73 chr18 70558649 70558989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92135 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 227-36 chr22 23578024 23578441 + 0.75 NA intron (NM_001369906, intron 1 of 2) intron (NM_001369906, intron 1 of 2) 2058 NM_152855 3543 Hs.348935 NM_020070 ENSG00000128322 IGLL1 14.1|AGM2|CD179b|IGL1|IGL5|IGLJ14.1|IGLL|IGO|IGVPB|VPREB2 immunoglobulin lambda like polypeptide 1 protein-coding 218-59 chr5 120657293 120657649 + 0.75 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 126007 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 243-9 chr10 69221196 69221823 + 0.75 NA intron (NM_025130, intron 1 of 17) intron (NM_025130, intron 1 of 17) 1177 NM_025130 80201 Hs.522988 NM_025130 ENSG00000156510 HKDC1 - hexokinase domain containing 1 protein-coding 130-72 chr2 101577763 101577945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102742 NM_001367509 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 229.25-36 chr18 10092050 10092571 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 178294 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 169.75-3 chr1 59258002 59258304 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -38660 NM_001350796 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 162.25-11 chr1 208465759 208466065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221528 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 129.25-28 chr11 6182114 6182353 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -11907 NM_001004052 255725 Hs.690457 NM_001004052 ENSG00000255307 OR52B2 OR11-70 olfactory receptor family 52 subfamily B member 2 protein-coding 137-98 chr22 34940812 34941045 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 56988 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 137.5-142 chr20 50155191 50155625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1610 NM_001162505 387521 Hs.744839 NM_199129 ENSG00000240849 TMEM189 KUA transmembrane protein 189 protein-coding 120.5-184 chr5 82624841 82625094 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -215188 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 154.75-74 chr2 96565706 96566090 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 28019 NM_001319092 10865 Hs.920 NM_006673 ENSG00000196843 ARID5A MRF-1|MRF1|RP11-363D14 AT-rich interaction domain 5A protein-coding 194.25-90 chr5 23459645 23460144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47715 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 165-30 chr12 8619178 8619462 + 0.75 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 -6461 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 153.75-108 chr4 123681389 123681737 + 0.75 NA intron (NR_027105, intron 3 of 5) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31572 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 113-103 chr20 38975720 38975999 + 0.75 NA intron (NM_021931, intron 3 of 21) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 13515 NM_001190809 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 124.5-3 chr1 21012958 21013202 + 0.75 NA intron (NM_003760, intron 2 of 31) L1PBa|LINE|L1 -24648 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 124-85 chr2 101039345 101039735 + 0.75 NA intron (NM_001102426, intron 6 of 19) intron (NM_001102426, intron 6 of 19) 37251 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 120-142 chr5 29870142 29870393 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -10293 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 200.25-48 chr18 12982467 12982773 + 0.75 NA exon (NM_001013437, exon 7 of 9) exon (NM_001013437, exon 7 of 9) -8742 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 183.75-120 chr7 110726029 110726477 + 0.75 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -364753 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 121.5-142 chr2 144246602 144246872 + 0.75 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) intron (NM_001354354, intron 1 of 12) -1848 NM_001354358 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 114.75-102 chr2 215249970 215250157 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -61996 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 214.25-65 chr5 35709239 35709574 + 0.75 NA intron (NM_024867, intron 19 of 36) intron (NM_024867, intron 19 of 36) 91543 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 142.5-194 chr6 136633050 136633422 + 0.75 NA intron (NR_125858, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 4122 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 118-108 chr3 4524739 4524918 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) MIR|SINE|MIR 31480 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 115.75-228 chr9 81784410 81784572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94778 NR_109772 101927502 Hs.528628 NR_109772 ENSG00000233926 LOC101927502 - uncharacterized LOC101927502 ncRNA 141-85 chr2 187341505 187341935 + 0.75 NA TTS (NM_001271751) TTS (NM_001271751) 106532 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 158.5-23 chr10 68421499 68421888 + 0.75 NA intron (NM_001080449, intron 17 of 20) AluSx1|SINE|Alu -14399 NM_001278225 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 115.75-237 chrX 132401539 132401827 + 0.75 NA intron (NM_001170704, intron 3 of 8) intron (NM_001170704, intron 3 of 8) 11892 NM_001170702 55796 Hs.105134 NM_018388 ENSG00000076770 MBNL3 CHCR|MBLX|MBLX39|MBXL muscleblind like splicing regulator 3 protein-coding 128-56 chr16 87334447 87334718 + 0.75 NA intron (NM_024735, intron 7 of 8) intron (NM_024735, intron 7 of 8) 17073 NR_135180 101928659 Hs.667450 NR_135180 ENSG00000270006 LOC101928659 - uncharacterized LOC101928659 ncRNA 234.5-105 chrX 42019354 42019839 + 0.75 NA Intergenic Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger -96042 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 161.25-94 chr2 102359579 102360003 + 0.75 NA intron (NM_003855, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 3508 NM_001282399 8809 Hs.469521 NM_003855 ENSG00000115604 IL18R1 CD218a|CDw218a|IL-1Rrp|IL18RA|IL1RRP interleukin 18 receptor 1 protein-coding 132.5-28 chr10 22179606 22179888 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 30236 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 149.75-52 chr15 65692354 65692576 + 0.75 NA intron (NM_005848, intron 21 of 31) intron (NM_005848, intron 21 of 31) 4471 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 211.75-15 chr12 27845985 27846427 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 65973 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 118.5-81 chr19 29700088 29700287 + 0.75 NA 3' UTR (NM_031448, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_031448, exon 3 of 3) 14869 NM_001031726 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 141-7 chr1 119969427 119969884 + 0.75 NA exon (NM_024408, exon 6 of 34) exon (NM_024408, exon 6 of 34) -73140 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 167.5-107 chr21 25070783 25071017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 230350 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 151.5-185 chr7 121266039 121266325 + 0.75 NA intron (NM_024913, intron 18 of 22) intron (NM_024913, intron 18 of 22) -59185 NM_016087 51384 Hs.272375 NM_016087 ENSG00000002745 WNT16 - Wnt family member 16 protein-coding 187-96 chr8 66800946 66801429 + 0.75 NA intron (NM_001204173, intron 5 of 18) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 25982 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 133.5-198 chr5 9408766 9408979 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 2 of 22) intron (NM_003966, intron 2 of 22) -102461 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 119.75-78 chr17 57982308 57982515 + 0.75 NA intron (NM_001330393, intron 3 of 6) intron (NM_001330393, intron 3 of 6) 5843 NM_001330393 7716 Hs.463569 NM_007146 ENSG00000136451 VEZF1 DB1|ZNF161 vascular endothelial zinc finger 1 protein-coding 161.5-125 chr3 4286506 4286837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16633 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 131.25-90 chr18 74475950 74476140 + 0.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -18777 NM_001044369 125704 Hs.371690 NM_001044369 ENSG00000187773 DIPK1C C18orf51|FAM69C divergent protein kinase domain 1C protein-coding 209-74 chr9 79358435 79358940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213021 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 254.25-41 chr3 96248883 96249319 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110863 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 151.75-5 chr1 52089637 52090047 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001136497, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001136497, exon 5 of 5) 33547 NM_152265 91408 Hs.429839 NM_152265 ENSG00000134717 BTF3L4 - basic transcription factor 3 like 4 protein-coding 151.25-189 chr8 100750935 100751216 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -28987 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 121-92 chr18 70404945 70405115 + 0.75 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -20439 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 117-115 chr3 27283900 27284095 + 0.75 NA intron (NM_152534, intron 23 of 38) intron (NM_152534, intron 23 of 38) -67474 NM_001031741 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 163-119 chr8 100091052 100091459 + 0.75 NA intron (NM_015668, intron 3 of 27) intron (NM_015668, intron 3 of 27) 14371 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 117-41 chr12 87382133 87382318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51486 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 114-14 chr1 227865891 227866063 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 50260 NM_183062 339501 Hs.97604 NM_183062 ENSG00000185888 PRSS38 MPN2 serine protease 38 protein-coding 127.25-53 chr13 77388561 77388799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61586 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 168.25-104 chr4 36962619 36962894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39023 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 125.75-53 chr14 64020390 64020743 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 35 of 114) intron (NM_015180, intron 35 of 114) 74559 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 163.5-101 chr2 168782024 168782288 + 0.75 NA intron (NR_045787, intron 1 of 2) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 4273 NR_045787 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 146.25-137 chr7 82439197 82439517 + 0.75 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 4420 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 118.75-51 chr13 33143879 33144125 + 0.75 NA intron (NM_178007, intron 3 of 13) intron (NM_178007, intron 3 of 13) 42089 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 117-119 chr3 69843053 69843317 + 0.75 NA intron (NM_001354608, intron 2 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -23039 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 156.25-62 chr2 14645226 14645711 + 0.75 NA intron (NR_144632, intron 3 of 4) intron (NR_144632, intron 3 of 4) 12751 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 189.25-2 chr1 41913761 41914103 + 0.75 NA intron (NR_038261, intron 2 of 3) intron (NR_038261, intron 2 of 3) 4990 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 172.75-145 chrX 76312324 76312696 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -115200 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 115.5-157 chr22 16784981 16785154 + 0.75 NA intron (NM_001318251, intron 3 of 3) AluY|SINE|Alu -36629 NR_134584 101929350 Hs.561087 NR_134584 ENSG00000235343 LINC01665 - long intergenic non-protein coding RNA 1665 ncRNA 154.5-30 chr10 111370767 111371220 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 256702 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 265-37 chr7 37412295 37412813 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) 36398 NM_014800 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 198.75-69 chr4 77274205 77274585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117188 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 158.5-103 chr2 145991044 145991379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -595846 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 233-39 chr21 29549988 29550543 + 0.75 NA TTS (NM_000830) TTS (NM_000830) -45775 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 220.25-2 chr1 83022725 83023069 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) L2b|LINE|L2 -36689 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 226.75-64 chr6 35886291 35886759 + 0.75 NA intron (NM_003137, intron 6 of 15) intron (NM_003137, intron 6 of 15) 34573 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 151-76 chr22 28426811 28427212 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -32858 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 286.75-12 chr14 50244773 50245492 + 0.75 NA 3' UTR (NM_024884, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_024884, exon 10 of 10) -13554 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 133.75-70 chr16 50402101 50402326 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7080 NR_146572 105371248 NR_146572 ENSG00000261092 LINC02178 - long intergenic non-protein coding RNA 2178 ncRNA 195.5-85 chr2 240834364 240834848 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14298 NM_001244008 547 Hs.516802 NM_004321 ENSG00000130294 KIF1A ATSV|C2orf20|HSN2C|MRD9|SPG30|UNC104 kinesin family member 1A protein-coding 191.75-93 chr4 87879607 87880065 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 45133 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 162.25-160 chr8 127342779 127343130 + 0.75 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) MIR3|SINE|MIR -57445 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 127.75-56 chr12 82285069 82285338 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 73184 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 157.5-111 chr2 167483754 167484176 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296593 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 121.75-130 chr4 61163478 61163804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19985 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 189-30 chr12 94682215 94682497 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31799 NM_020698 57458 Hs.370410 NM_020698 ENSG00000057704 TMCC3 - transmembrane and coiled-coil domain family 3 protein-coding 159.5-190 chr7 11649530 11649808 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 182529 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 259.75-21 chr17 62104612 62104984 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -39520 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 112.75-23 chr10 30560183 30560380 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 69472 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 113.25-175 chr8 122708521 122708793 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14551 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 112.5-171 chr3 85505511 85505796 + 0.75 NA intron (NM_001256502, intron 1 of 10) intron (NM_001256502, intron 1 of 10) 594 NM_001256502 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 194.75-32 chr16 62539664 62540251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -503519 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 161.5-159 chr5 125050900 125051193 + 0.75 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) LTR40a|LTR|ERVL 14215 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 312.5-2 chr1 95470668 95471184 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -3811 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 224.25-60 chr3 177459533 177459949 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 17820 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 121.5-190 chr4 43688836 43689142 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -196446 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 177.75-47 chr14 76325126 76325413 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46078 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 146.25-24 chr12 13738724 13739076 + 0.75 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) MER5B|DNA|hAT-Charlie 241456 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 133-13 chr1 238847069 238847327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -361181 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 153.25-114 chr6 123375333 123375607 + 0.75 NA intron (NM_001251987, intron 19 of 20) intron (NM_001251987, intron 19 of 20) -64134 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 186.25-6 chr1 115370418 115370862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32404 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 126.25-222 chr9 98885936 98886164 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -57857 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 123.5-138 chr3 97194759 97194987 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1MA3|LINE|L1 -244734 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 137-121 chr4 67736716 67737078 + 0.75 NA TTS (NM_000406) TTS (NM_000406) 19189 NM_000406 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 129.25-51 chr14 63874992 63875260 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) AluJo|SINE|Alu 22122 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 191-52 chr3 43953692 43954183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160275 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 118.25-28 chr10 30194228 30194450 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -17513 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 130-91 chr20 31495193 31495400 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9518 NR_024358 140875 Hs.283478 NR_024358 ENSG00000233354 LINC00028 C20orf93|NCRNA00028|dJ1093G12.6 long intergenic non-protein coding RNA 28 ncRNA 173-56 chr18 66773500 66773969 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -169644 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 216-67 chr5 161040718 161041126 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -102296 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 301.75-24 chr3 130595247 130595797 + 0.75 NA intron (NM_001102608, intron 17 of 35) L1ME3A|LINE|L1 35188 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 140.25-165 chr6 70214300 70214599 + 0.75 NA TTS (NM_078485) TTS (NM_078485) 68748 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 119.25-209 chr8 107723310 107723537 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -225505 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 121-58 chr14 49381292 49381569 + 0.75 NA Intergenic MER105|DNA|hAT-Charlie 204950 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 219.25-29 chr17 47170042 47170492 + 0.75 NA intron (NM_001293091, intron 2 of 17) AluJo|SINE|Alu 19028 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 129-114 chr22 26584606 26584809 + 0.75 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 5425 NM_001362923 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 187.5-160 chr7 129631151 129631419 + 0.75 NA intron (NM_001040110, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu 1207 NM_001040110 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 145.5-142 chr4 77822269 77822499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2115 NM_001365006 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 130-58 chr17 70283495 70283716 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114070 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 141-38 chr12 75923502 75923729 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108161 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 277.25-2 chr1 58620501 58621059 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -43528 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 125.5-165 chr3 12351202 12351486 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001354668) promoter-TSS (NM_001354668) -73 NM_001354668 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 188-4 chr1 207340502 207340831 + 0.75 NA TTS (NM_001300902) TTS (NM_001300902) 18988 NM_000574 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 265.25-59 chrX 78887071 78887594 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 13917 NR_036258 100422932 NR_036258 ENSG00000283622 MIR4328 - microRNA 4328 ncRNA 169.25-77 chr3 160017437 160017855 + 0.75 NA intron (NR_108088, intron 4 of 9) AluSq2|SINE|Alu -3003 NR_104132 730109 Hs.99333 NR_104132 LINC01100 - long intergenic non-protein coding RNA 1100 ncRNA 134.75-61 chr14 45732467 45732704 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16983 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 156-145 chr7 91051376 91051821 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 10 of 13) Penelope1_Vert|LINE|Penelope -212835 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 113.25-141 chr5 122564017 122564192 + 0.75 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 20496 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 157-118 chr8 127749271 127749630 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 13219 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 121.5-39 chr11 33427555 33427785 + 0.75 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) L1MB5|LINE|L1 51562 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 224.5-109 chr8 108193251 108193862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55161 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 209.75-18 chr11 108703409 108703732 + 0.75 NA intron (NM_004398, intron 9 of 17) AluSc|SINE|Alu 38501 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 115.5-134 chr2 158606718 158606927 + 0.75 NA intron (NM_001005476, intron 4 of 20) intron (NM_001005476, intron 4 of 20) 128180 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 185-16 chr13 46972781 46973202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75915 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 198.5-152 chr8 124894929 124895323 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -46882 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 120.75-23 chr11 25909266 25909503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -279739 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 211.75-96 chr8 100375783 100376214 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6765 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 142.25-147 chr6 152766385 152766724 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 15757 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 118.75-42 chr12 21667462 21667702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9727 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 169.5-13 chr1 228191451 228191918 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16360 NM_052843 84033 Hs.650039 NM_052843 ENSG00000154358 OBSCN ARHGEF30|UNC89 obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF protein-coding 124-30 chr12 39977086 39977295 + 0.75 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) MIRb|SINE|MIR 128891 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 121.5-110 chr17 82513741 82513980 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -5872 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 115-98 chr20 47067644 47067921 + 0.75 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) L1MDa|LINE|L1 -99185 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 129.5-21 chr10 68207451 68207643 + 0.75 NA intron (NR_045663, intron 17 of 17) intron (NR_045663, intron 17 of 17) 24566 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 189.5-120 chr6 75165101 75165474 + 0.75 NA intron (NM_004370, intron 14 of 65) intron (NM_004370, intron 14 of 65) -36505 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 138-119 chr4 124372216 124372481 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 186086 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 234-67 chr8 96663363 96663810 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) intron (NM_016134, intron 1 of 7) 18344 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 199-53 chr3 99117426 99117893 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -215964 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 196.25-74 chr21 15579961 15580318 + 0.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -149795 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 143.75-188 chr8 106703929 106704230 + 0.75 NA intron (NM_181354, intron 6 of 13) intron (NM_181354, intron 6 of 13) -22028 NM_001198534 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 114.75-4 chr1 62597455 62597732 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014495) promoter-TSS (NM_014495) 73 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 199.5-6 chr1 88966544 88966878 + 0.75 NA intron (NM_001008661, intron 4 of 13) L1MC|LINE|L1 25918 NM_001008661 56267 Hs.481898 NM_001008661 ENSG00000137944 KYAT3 CCBL2|KAT3|KATIII kynurenine aminotransferase 3 protein-coding 175.25-132 chr7 45357310 45357682 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 199705 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 205.75-69 chr5 140963932 140964312 + 0.75 NA intron (NM_018898, intron 1 of 3) intron (NM_018898, intron 1 of 3) -2354 NM_018899 56134 Hs.199343 NM_018899 ENSG00000243232 PCDHAC2 PCDH-ALPHA-C2 protocadherin alpha subfamily C, 2 protein-coding 153-131 chr6 56609920 56610299 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 36 of 94) intron (NM_001144770, intron 36 of 94) 32780 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 203.5-113 chr5 59727423 59727879 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR -23948 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 118-40 chr13 54481217 54481434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -169277 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 238.25-53 chr4 33269452 33270041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 770147 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 144.25-85 chr19 1962881 1963251 + 0.75 NA intron (NM_001319, intron 1 of 11) L1MB5|LINE|L1 -8517 NR_033400 255193 Hs.374717 NM_152771 ENSG00000180846 CSNK1G2-AS1 C19orf34 CSNK1G2 antisense RNA 1 ncRNA 114.75-165 chr6 127100733 127100963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17823 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 130-32 chr11 124521023 124521260 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22513 NM_001005195 219858 Hs.553634 NM_001005195 ENSG00000170953 OR8B12 OR11-317 olfactory receptor family 8 subfamily B member 12 protein-coding 218.5-94 chr5 8865590 8865953 + 0.75 NA intron (NR_109932, intron 1 of 2) intron (NR_109932, intron 1 of 2) 26039 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 174.75-112 chr7 26389975 26390347 + 0.75 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -8408 NR_148499 441204 Hs.587432 NR_015364 ENSG00000214870 LOC441204 - uncharacterized LOC441204 ncRNA 254.25-39 chr22 27402692 27403168 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 92279 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 146.5 chr1 1374104 1374401 + 0.75 NA exon (NM_017900, exon 3 of 4) exon (NM_017900, exon 3 of 4) 955 NM_001127229 54998 Hs.632515 NM_017900 ENSG00000175756 AURKAIP1 AIP|AKIP|MRP-S38 aurora kinase A interacting protein 1 protein-coding 174.25-120 chr5 158422467 158422844 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -12882 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 133.5-150 chr22 42371653 42371952 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2594 NR_120597 102723775 Hs.335413 NR_120595 ENSG00000229891 LINC01315 C22orf32-1|lnc-C22orf32-1 long intergenic non-protein coding RNA 1315 ncRNA 119.25-38 chr11 58573309 58573505 + 0.75 NA intron (NM_001143995, intron 1 of 8) intron (NM_001143995, intron 1 of 8) 2510 NM_004811 9404 Hs.125474 NM_004811 ENSG00000110031 LPXN LDPL leupaxin protein-coding 131.5-244 chr9 26926234 26926531 + 0.75 NA intron (NM_001321546, intron 5 of 12) intron (NM_001321546, intron 5 of 12) -20608 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 183.25-74 chr4 35772037 35772472 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 471685 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 147.25-48 chr17 67853931 67854173 + 0.75 NA exon (NM_004459, exon 2 of 30) exon (NM_004459, exon 2 of 30) 28549 NM_004459 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 151.25-10 chr1 199927195 199927424 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100401 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 240.25-32 chr2 27064213 27064877 + 0.75 NA intron (NR_104246, intron 11 of 15) AluJb|SINE|Alu 7109 NM_001134693 100128731 Hs.502948 NM_001134693 ENSG00000228474 OST4 - oligosaccharyltransferase complex subunit 4, non-catalytic protein-coding 130.75-99 chr2 188977784 188977965 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_031647) promoter-TSS (NR_031647) -218 NR_031647 100302219 NR_031647 ENSG00000221502 MIR1245A MIR1245|MIRN1245|hsa-mir-1245|hsa-mir-1245a|mir-1245a microRNA 1245a ncRNA 113.5-8 chr1 97944808 97945117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3222 NR_146275 109729128 NR_146275 LINC01930 - long intergenic non-protein coding RNA 1930 ncRNA 193-5 chr1 95448114 95448465 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -26448 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 212-43 chr2 148711866 148712236 + 0.75 NA intron (NM_015630, intron 2 of 13) L1MCa|LINE|L1 67300 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 162.25-152 chr7 95296780 95297063 + 0.75 NA TTS (NM_001166162) TTS (NM_001166162) 27611 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 150.25-135 chr6 145135991 145136406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 550679 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 174.75-31 chr13 74338468 74338860 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80451 NR_144452 100288208 Hs.532467 NM_001013669 ENSG00000177596 LOC100288208 - uncharacterized LOC100288208 ncRNA 113.75-149 chr5 19630559 19630818 + 0.75 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 255584 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 117.75-55 chr14 50019070 50019448 + 0.75 NA intron (NR_131171, intron 6 of 8) MIR|SINE|MIR -11739 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 119.75-71 chr16 72810459 72810735 + 0.75 NA intron (NM_001164766, intron 6 of 8) intron (NM_001164766, intron 6 of 8) -145627 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 214.5-12 chr10 54989855 54990288 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -188780 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 148.5-137 chr22 37140832 37141069 + 0.75 NA intron (NM_001346222, intron 4 of 9) MIRc|SINE|MIR 8966 NM_000878 3560 Hs.474787 NM_000878 ENSG00000100385 IL2RB CD122|IL15RB|P70-75 interleukin 2 receptor subunit beta protein-coding 126-87 chr2 6583708 6583975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49946 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 192.25-51 chr2 59726565 59727063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 509106 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 163-58 chr2 53490041 53490386 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -277570 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 121-99 chr2 37481103 37481376 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 136609 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 123-22 chr10 57762819 57763058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -458379 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 120.5-52 chr12 15504026 15504296 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 6 of 26) intron (NM_030667, intron 6 of 26) -42450 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 193.25-50 chr2 47512234 47512636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15102 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 149-90 chr4 53322561 53322886 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 2 of 8) intron (NM_152540, intron 2 of 8) 43338 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 151.25-128 chr3 96113304 96113658 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -246483 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 209.25-105 chr7 24097582 24097936 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -186431 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 216.75-34 chr19 5538208 5538617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29622 NR_027064 257000 Hs.515575 NM_153375 ENSG00000223573 TINCR LINC00036|NCRNA00036|PLAC2|onco-lncRNA-16 TINCR ubiquitin domain containing ncRNA 186-53 chr20 48634807 48635285 + 0.75 NA intron (NM_020820, intron 32 of 39) L2a|LINE|L2 192953 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 143.75-131 chr4 40897033 40897294 + 0.75 NA intron (NM_173075, intron 9 of 16) intron (NM_173075, intron 9 of 16) -39971 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 162-53 chr18 48728154 48728491 + 0.75 NA intron (NM_014772, intron 7 of 11) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 57722 NR_039897 100616366 NR_039897 ENSG00000266276 MIR4743 - microRNA 4743 ncRNA 166.75-66 chr18 23560699 23561093 + 0.75 NA intron (NM_000271, intron 5 of 24) intron (NM_000271, intron 5 of 24) 25610 NM_000271 4864 Hs.464779 NM_000271 ENSG00000141458 NPC1 NPC|POGZ|SLC65A1 NPC intracellular cholesterol transporter 1 protein-coding 196-62 chr3 3424143 3424635 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -244672 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 185.25-3 chr1 95835433 95835917 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -156393 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 157.25-66 chr2 13967188 13967520 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 433604 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 128.25-25 chr11 104031092 104031405 + 0.75 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) L1PA10|LINE|L1 -5392 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 144.75-50 chr13 63394631 63394863 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -66653 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 189.25-136 chr9 95462805 95463121 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_038982) promoter-TSS (NR_038982) -646 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 175.25-149 chr9 20747427 20747867 + 0.75 NA intron (NM_017794, intron 7 of 45) L1MB7|LINE|L1 31542 NR_030166 574444 NR_030166 ENSG00000207609 MIR491 MIRN491|hsa-mir-491|mir-491 microRNA 491 ncRNA 135.25-57 chr12 116053510 116053757 + 0.75 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) MIR|SINE|MIR 95021 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 145.25 chr1 13751230 13751458 + 0.75 NA intron (NM_001135610, intron 6 of 7) intron (NM_001135610, intron 6 of 7) 1929 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 137.5-131 chr2 158634604 158634815 + 0.75 NA intron (NM_001005476, intron 9 of 20) intron (NM_001005476, intron 9 of 20) 100293 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 224.25-87 chr7 5511779 5512133 + 0.75 NA intron (NM_024963, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 1853 NM_001363442 80028 Hs.623974 NM_024963 ENSG00000155034 FBXL18 Fbl18 F-box and leucine rich repeat protein 18 protein-coding 116.5-29 chr10 109687677 109688075 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 235370 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 233.5-79 chr5 3834327 3834858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 238760 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 145.25-150 chr6 153965050 153965405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45269 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 135.75-103 chr2 122690479 122690764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 382860 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 163.75-129 chr8 127115971 127116246 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33887 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 203.25-44 chr17 74746902 74747327 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001163989, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001163989, exon 9 of 9) -1499 NR_037409 100500847 NR_037409 ENSG00000284186 MIR3615 mir-3615 microRNA 3615 ncRNA 138.25-110 chr3 4126672 4126930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176503 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 169.75-10 chr1 236576194 236576680 + 0.75 NA intron (NM_018072, intron 21 of 44) intron (NM_018072, intron 21 of 44) 28079 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 149.75-43 chr14 61165921 61166264 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 115246 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 158.25-119 chr6 35820788 35821121 + 0.75 NA intron (NM_182548, intron 3 of 3) intron (NM_182548, intron 3 of 3) 15602 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 138.25-2 chr1 20355274 20355532 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001039500, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001039500, exon 22 of 22) 64528 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 150.25-31 chr11 8652066 8652390 + 0.75 NA intron (NM_014818, intron 1 of 19) intron (NM_014818, intron 1 of 19) 6608 NM_014818 9866 Hs.130836 NM_014818 ENSG00000166436 TRIM66 C11orf29|TIF1D|TIF1DELTA tripartite motif containing 66 protein-coding 208.5-61 chr18 75658622 75658949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53618 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 224.25-9 chr1 225098301 225098770 + 0.75 NA intron (NM_001367479, intron 22 of 85) intron (NM_001367479, intron 22 of 85) 168860 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 160.75-158 chr9 35850424 35850838 + 0.75 NA intron (NM_001042589, intron 11 of 13) intron (NM_001042589, intron 11 of 13) 19770 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 119.5-78 chr14 59882925 59883233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12303 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 165-120 chr6 40174266 40174510 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 181618 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 119.25-157 chr4 160829191 160829415 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -1051519 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 212.75-101 chr9 30277032 30277456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131210 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 135-132 chr4 163154881 163155165 + 0.75 NA intron (NM_138386, intron 2 of 7) intron (NM_138386, intron 2 of 7) 11867 NM_138386 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 135-78 chr2 101178107 101178334 + 0.75 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 26560 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 166.25-73 chr19 40575653 40575902 + 0.75 NA 3' UTR (NM_020971, exon 36 of 36) 3' UTR (NM_020971, exon 36 of 36) -1096 NM_138392 92799 Hs.26506 NM_138392 ENSG00000160410 SHKBP1 PP203|Sb1 SH3KBP1 binding protein 1 protein-coding 118.75-176 chr7 7540606 7540813 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4836 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 119.25-126 chr3 52304440 52304640 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10232 NR_029677 406925 NR_029677 ENSG00000207926 MIR135A1 MIRN135-1|MIRN135A1|mir-135a-1 microRNA 135a-1 ncRNA 183-43 chr18 5756804 5757280 + 0.75 NA intron (NR_038839, intron 1 of 4) intron (NR_038839, intron 1 of 4) 8223 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 225-2 chr1 81949046 81949503 + 0.75 NA intron (NM_001366002, intron 6 of 20) intron (NM_001366002, intron 6 of 20) 146821 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 132.5-114 chr2 51988437 51988734 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -382063 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 267.5-35 chr17 74850825 74851280 + 0.75 NA intron (NM_001278553, intron 4 of 11) L2c|LINE|L2 8832 NR_103735 2905 Hs.436980 NM_000835 ENSG00000161509 GRIN2C GluN2C|NMDAR2C|NR2C glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C protein-coding 236.25-51 chr21 15792696 15793214 + 0.75 NA intron (NM_001283042, intron 5 of 24) intron (NM_001283042, intron 5 of 24) 62973 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 203.5-42 chr14 60268994 60269335 + 0.75 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 19943 NM_021003 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 198-7 chr1 205052943 205053401 + 0.75 NA non-coding (NR_144350, exon 2 of 23) non-coding (NR_144350, exon 2 of 23) 9960 NR_144350 6900 Hs.519220 NM_005076 ENSG00000184144 CNTN2 AXT|FAME5|TAG-1|TAX|TAX1 contactin 2 protein-coding 160-91 chr5 95400748 95401143 + 0.75 NA intron (NM_152548, intron 3 of 9) intron (NM_152548, intron 3 of 9) 9579 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 149.5-10 chr1 181696649 181697076 + 0.75 NA intron (NM_001205293, intron 7 of 47) intron (NM_001205293, intron 7 of 47) 213345 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 133.25-194 chr7 3920709 3921130 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) L2c|LINE|L2 -208766 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 136.5-155 chr3 179831959 179832187 + 0.75 NA intron (NM_001349408, intron 8 of 14) L2c|LINE|L2 -66121 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 213.5-56 chr19 33309690 33310240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7144 NR_026887 80054 Hs.287521 NR_026887 ENSG00000267296 CEBPA-DT CEBPA-AS1 CEBPA divergent transcript ncRNA 226.75-80 chr9 5067631 5068275 + 0.75 NA intron (NM_004972, intron 10 of 24) AluSc|SINE|Alu 26260 NM_001322204 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 172.5-96 chr2 65016438 65016741 + 0.75 NA exon (NM_001348407, exon 5 of 8) exon (NM_001348407, exon 5 of 8) 27190 NM_003038 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 186.25-24 chr12 19892272 19892688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122205 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 193.5-150 chr7 51503105 51503629 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -110111 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 142-93 chr20 11599674 11600039 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 270859 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 133-143 chr5 130466289 130466617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 561988 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 134.25-94 chr2 219083106 219083588 + 0.75 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) -22426 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 191.75-132 chr9 28689150 28689525 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 29968 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 149.75-170 chr8 127754492 127754745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18387 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 229-17 chr14 58350277 58350745 + 0.75 NA intron (NM_002892, intron 15 of 23) intron (NM_002892, intron 15 of 23) -45419 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 118.75-60 chr14 47148394 47148632 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 194733 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 170.25-121 chr4 140442288 140442747 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001277353, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001277353, exon 11 of 11) -14856 NM_001130675 1047 Hs.86368 NM_004362 ENSG00000153132 CLGN - calmegin protein-coding 235-39 chr22 36332757 36333298 + 0.75 NA intron (NM_002473, intron 3 of 40) intron (NM_002473, intron 3 of 40) -46120 NR_106877 102465491 NR_106877 ENSG00000278420 MIR6819 hsa-mir-6819 microRNA 6819 ncRNA 176-60 chr5 21407222 21407623 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -52058 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 133.75-39 chr12 57641341 57641642 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -8252 NM_001276469 2583 Hs.159481 NM_001478 ENSG00000135454 B4GALNT1 GALGT|GALNACT|GalNAc-T|SPG26 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1 protein-coding 131.75-114 chr2 240301942 240302240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133572 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 220.25-62 chr5 36649614 36650065 + 0.75 NA intron (NM_004172, intron 3 of 9) intron (NM_004172, intron 3 of 9) 43233 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 241-35 chr4 84425684 84426238 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 72273 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 156.5-82 chr2 88232563 88232811 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 59548 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 171-44 chr15 60529312 60529607 + 0.75 NA intron (NR_120339, intron 5 of 5) intron (NR_120339, intron 5 of 5) 50281 NR_120339 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 169-7 chr10 25949985 25950414 + 0.75 NA intron (NM_001368265, intron 2 of 7) intron (NM_001368265, intron 2 of 7) 15970 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 195.25-30 chr14 60241750 60242168 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -3791 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 141.5-212 chr7 85517332 85517631 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96359 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 138.75-21 chr10 73805829 73806233 + 0.75 NA intron (NR_160744, intron 6 of 14) intron (NR_160744, intron 6 of 14) -4632 NR_038357 100507331 Hs.631828 NR_038357 ENSG00000272589 ZSWIM8-AS1 - ZSWIM8 antisense RNA 1 ncRNA 191.75-103 chr5 80540560 80540895 + 0.75 NA intron (NM_205548, intron 5 of 5) intron (NM_205548, intron 5 of 5) 29553 NM_001004441 340120 Hs.519404 NM_001004441 ENSG00000189127 ANKRD34B DP58 ankyrin repeat domain 34B protein-coding 230-65 chr8 84599099 84599632 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1MA7|LINE|L1 -106562 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 127.5-163 chr4 33405460 33405679 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 634324 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 126.25-30 chr11 56685773 56686135 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -14434 NM_001013358 504191 NM_001013358 OR9G9 OR9G1 olfactory receptor family 9 subfamily G member 9 protein-coding 183.5-11 chr1 181216794 181217171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19406 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 134.25-9 chr1 111948614 111948946 + 0.75 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 39123 NR_046619 100873995 Hs.535274 NR_046619 ENSG00000237556 KCND3-AS1 - KCND3 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-146 chr22 36097180 36097498 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 63416 NM_014349 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 136.25-107 chr20 4717046 4717288 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4742 NM_012409 23627 Hs.406696 NM_012409 ENSG00000171864 PRND DOPPEL|DPL|PrPLP|dJ1068H6.4 prion like protein doppel protein-coding 192-26 chr11 28359870 28360391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117418 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 171.5-122 chr4 169487739 169488026 + 0.75 NA intron (NM_001199400, intron 20 of 32) L1PA11|LINE|L1 124701 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 119.75-171 chr5 80488880 80489296 + 0.75 NA intron (NM_205548, intron 1 of 5) L1ME4a|LINE|L1 988 NM_205548 167555 Hs.338182 NM_205548 ENSG00000152380 FAM151B UNQ9217 family with sequence similarity 151 member B protein-coding 191.25-91 chr6 92199959 92200287 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -509695 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 187.25-110 chr8 117630818 117631223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110307 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 168.25-30 chr11 113305419 113305865 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8941 NR_147891 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 158-146 chr8 123692818 123693049 + 0.75 NA intron (NM_001003954, intron 9 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie -39132 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 140.5-203 chr6 140068410 140068728 + 0.75 NA intron (NR_121622, intron 2 of 3) intron (NR_121622, intron 2 of 3) -77308 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 141.25-79 chr2 69287337 69287801 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 99658 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 215.25-42 chr18 73253497 73253813 + 0.75 NA intron (NR_034133, intron 2 of 5) L1MCa|LINE|L1 10843 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 128-35 chr13 66308799 66309183 + 0.75 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 90741 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 236-71 chr9 90071519 90072053 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30287 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 123.5-203 chr7 138232004 138232217 + 0.75 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 108352 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 166.25-20 chr1 246198921 246199406 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) L1PA16|LINE|L1 218249 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 165.25-148 chr9 85519491 85519941 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 222313 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 127.25-151 chr4 155708214 155708422 + 0.75 NA intron (NM_001130685, intron 5 of 9) intron (NM_001130685, intron 5 of 9) 40656 NM_001130684 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 196.75-119 chrX 96116629 96117089 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 221043 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 120.25-195 chr7 28223542 28223770 + 0.75 NA intron (NR_034097, intron 3 of 3) LTR102_Mam|LTR|ERVL -42861 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 197.5-23 chr11 100793464 100793879 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 2 of 25) intron (NM_001367945, intron 2 of 25) -105716 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 161.75-73 chr2 237234505 237234815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148771 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 181.75-37 chr14 56365054 56365417 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149096 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 215-30 chr16 52379461 52379832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121082 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 163.25-88 chr3 17961048 17961407 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1325 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 129.25-16 chr10 48644956 48645352 + 0.75 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) L1MB7|LINE|L1 7348 NM_001256025 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 117-79 chr19 29963969 29964239 + 0.75 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) L1MEg|LINE|L1 21865 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 172.75-124 chr8 9219270 9219566 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30419 NR_125431 101929128 NR_125431 ENSG00000248538 LOC101929128 - uncharacterized LOC101929128 ncRNA 149.75-2 chr1 21952201 21952435 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15008 NM_005529 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 123.75-91 chr2 57453602 57453839 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -453931 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 122.25-113 chr21 44616038 44616230 + 0.75 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) intron (NM_144991, intron 1 of 11) 4055 NM_198695 386681 Hs.528021 NM_198695 ENSG00000187766 KRTAP10-8 KAP10.8|KRTAP18-8|KRTAP18.8 keratin associated protein 10-8 protein-coding 187-40 chr2 51553107 51553433 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 520669 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 139.25-35 chr11 105935058 105935344 + 0.75 NA intron (NM_000829, intron 14 of 16) intron (NM_000829, intron 14 of 16) 87039 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 165.25-131 chr7 20850399 20850788 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 1 of 5) AluJr4|SINE|Alu 15162 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 220.25-12 chr11 28547643 28548018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70282 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 210.25-54 chr3 113892349 113892693 + 0.75 NA intron (NM_017577, intron 6 of 17) intron (NM_017577, intron 6 of 17) -4979 NM_001172105 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 134.25-192 chr8 102484166 102484376 + 0.75 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 -67318 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 156-60 chr16 87594174 87594607 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7445 NR_073379 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 137.75-27 chr10 80749872 80750055 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 100166 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 158.5-183 chr7 102805458 102805737 + 0.75 NA intron (NR_146989, intron 7 of 7) L1PB1|LINE|L1 56598 NR_146986 222234 Hs.202543 NM_147194 ENSG00000222011 FAM185A - family with sequence similarity 185 member A protein-coding 122.5-19 chr10 25741850 25742104 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 90265 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 112.75-38 chr12 15549312 15549539 + 0.75 NA intron (NM_030671, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR 2814 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 205.25-10 chr11 64515979 64516470 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -39717 NM_018484 55867 Hs.220844 NM_018484 ENSG00000168065 SLC22A11 OAT4|hOAT4 solute carrier family 22 member 11 protein-coding 156.75-139 chr5 150685047 150685292 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 15893 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 112.25-77 chr17 62197427 62197681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78101 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 176.25-40 chr14 60545920 60546401 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 37014 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 268.25-32 chr3 66712969 66713431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25136 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 145-67 chr19 42268915 42269182 + 0.75 NA intron (NM_001304815, intron 1 of 20) CpG 511 NM_001304815 23152 Hs.388236 NM_015125 ENSG00000079432 CIC MRD45 capicua transcriptional repressor protein-coding 189.25-128 chr8 121578230 121578549 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -60957 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 188-29 chr16 78185750 78186141 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu 86291 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 156.5-212 chrX 50515942 50516239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45265 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 172.5-163 chr6 23247069 23247446 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -529333 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 196.25-118 chr9 22468086 22468398 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 21418 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 139.5-17 chr10 89526182 89526439 + 0.75 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) intron (NM_213606, intron 2 of 7) 9284 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 139.25-2 chr1 65293722 65294080 + 0.75 NA intron (NM_014787, intron 1 of 18) intron (NM_014787, intron 1 of 18) -15642 NM_001256864 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 164-73 chr3 10430068 10430361 + 0.75 NA intron (NM_001001331, intron 2 of 22) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -35652 NR_030614 100126334 NR_030614 ENSG00000216135 MIR885 MIRN885|hsa-mir-885|mir-885 microRNA 885 ncRNA 191.75-32 chr13 47879433 47879792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53010 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 150.5-178 chr5 132710659 132710984 + 0.75 NA intron (NM_001300791, intron 9 of 18) intron (NM_001300791, intron 9 of 18) 26725 NM_007054 11127 Hs.43670 NM_007054 ENSG00000131437 KIF3A FLA10|KLP-20 kinesin family member 3A protein-coding 142-30 chr11 56629134 56629519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13113 NM_001002925 338675 Hs.449692 NM_001002925 ENSG00000172464 OR5AP2 OR9J1 olfactory receptor family 5 subfamily AP member 2 protein-coding 120.25-197 chr7 40855071 40855346 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) HAL1ME|LINE|L1 124731 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 160-82 chr5 13572395 13572684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 371941 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 142.25-2 chr1 25162154 25162418 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 70216 NM_207170 25949 Hs.20013 NM_015484 ENSG00000117614 SYF2 CBPIN|NTC31|P29|fSAP29 SYF2 pre-mRNA splicing factor protein-coding 207-96 chr9 98684644 98685015 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) intron (NM_005458, intron 1 of 18) 24106 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 138.75-137 chr5 24725939 24726251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81117 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 139.5-132 chr3 80501810 80502053 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262966 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 252.5-10 chr10 61359444 61359865 + 0.75 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -92985 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 140-99 chr22 35233930 35234202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3010 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 112.25-183 chr6 61636034 61636347 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 13 of 13) intron (NR_146874, intron 13 of 13) 62060 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 130.5-134 chr2 77365266 77365581 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 156953 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 234.5-11 chr10 74255208 74255683 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) MER101B|LTR|ERV1 78682 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 206-76 chr8 121133188 121133512 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -321304 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 144.75-16 chr10 17390396 17390749 + 0.75 NA non-coding (NR_144322, exon 3 of 7) non-coding (NR_144322, exon 3 of 7) 3636 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 160-26 chr12 69593762 69594181 + 0.75 NA intron (NM_006431, intron 10 of 15) AluSz|SINE|Alu 8082 NM_001198842 10576 Hs.189772 NM_006431 ENSG00000166226 CCT2 99D8.1|CCT-beta|CCTB|HEL-S-100n|PRO1633|TCP-1-beta chaperonin containing TCP1 subunit 2 protein-coding 266.25-47 chr8 80573598 80574150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 87648 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 228-62 chr4 135705663 135706176 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 182174 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 172-82 chr4 52778039 52778410 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -11770 NR_040106 152578 Hs.383806 NR_040106 ENSG00000250302 LINC01618 - long intergenic non-protein coding RNA 1618 ncRNA 119.25-170 chr5 169391885 169392148 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -90877 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 150.75-19 chr1 180702458 180702674 + 0.75 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) L1HS|LINE|L1 70544 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 123.25-2 chr1 27414072 27414388 + 0.75 NA intron (NM_006990, intron 6 of 8) intron (NM_006990, intron 6 of 8) 21608 NM_005281 2827 Hs.66542 NM_005281 ENSG00000181773 GPR3 ACCA G protein-coupled receptor 3 protein-coding 136.25-33 chr11 42568173 42568492 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -314642 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 283.25-22 chr21 26152814 26153339 + 0.75 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) L1PB3|LINE|L1 -12686 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 120.75-152 chr6 161108808 161109037 + 0.75 NA intron (NM_005922, intron 22 of 26) intron (NM_005922, intron 22 of 26) 53060 NR_024277 79992 Hs.664873 NM_024929 ENSG00000279355 AGPAT4-IT1 C6orf59|NCRNA00241 AGPAT4 intronic transcript 1 ncRNA 213-30 chr14 88344154 88344706 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17518 NM_021161 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 144-75 chr20 36194430 36194900 + 0.75 NA intron (NM_177996, intron 12 of 19) intron (NM_177996, intron 12 of 19) -38905 NR_147703 100130373 Hs.570339 NR_147703 LOC100130373 - uncharacterized LOC100130373 ncRNA 209.75-61 chr3 40268829 40269191 + 0.75 NA intron (NR_033965, intron 2 of 2) intron (NR_033965, intron 2 of 2) 40688 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 128.75-94 chr2 47394440 47394629 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -8533 NM_000251 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 222.25-43 chr22 22372115 22372577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74248 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 139.75-41 chr12 127025273 127025515 + 0.75 NA intron (NR_104646, intron 2 of 6) intron (NR_104646, intron 2 of 6) 35003 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 133.25-37 chr12 21539455 21539746 + 0.75 NA intron (NM_021957, intron 14 of 15) intron (NM_021957, intron 14 of 15) 11675 NR_135188 80763 Hs.130692 NM_030572 ENSG00000134548 SPX C12orf39 spexin hormone protein-coding 198.25-46 chr17 73724911 73725242 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12778 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 199-14 chr10 82719709 82720078 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -486973 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 237.25-54 chr4 84152604 84153348 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) HAL1|LINE|L1 146193 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 156.5-144 chr5 17000423 17000776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64311 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 146-40 chr14 52534898 52535235 + 0.75 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) intron (NM_020784, intron 6 of 20) 17439 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 245.75-56 chr7 46599067 46599726 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97726 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 153.5-84 chr18 9025399 9025770 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -77115 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 129-135 chr5 13892538 13892837 + 0.75 NA intron (NM_001369, intron 16 of 78) L3b|LINE|CR1 51793 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 155.25-142 chr5 91871519 91871749 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -488317 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 176.5-22 chr10 84158402 84158945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13403 NR_134505 642934 NR_134505 ENSG00000285972 CERNA2 HOST2|lncRNA-HOST2 competing endogenous lncRNA 2 for microRNA let-7b ncRNA 208.75-30 chr16 56574633 56575105 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 9796 NM_032935 84560 Hs.567624 NM_032935 ENSG00000102891 MT4 MT-4|MT-IV|MTIV metallothionein 4 protein-coding 151.25-113 chr21 30626747 30627026 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 6259 NM_001350977 100151643 Hs.580879 NM_001350977 ENSG00000206105 KRTAP20-4 KAP20.4 keratin associated protein 20-4 protein-coding 129.75-111 chr20 64277269 64277483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13009 NR_040415 140849 Hs.745565 NR_040415 LINC00266-1 C20orf69|NCRNA00266|NCRNA00266-1|bA476I15.3 long intergenic non-protein coding RNA 266-1 ncRNA 196.5-91 chr20 48694254 48694706 + 0.75 NA intron (NM_020820, intron 7 of 39) L2a|LINE|L2 133519 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 151-49 chr17 64579698 64580214 + 0.75 NA intron (NM_022739, intron 8 of 18) intron (NM_022739, intron 8 of 18) 72979 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 153.75-88 chr3 63962996 63963290 + 0.75 NA intron (NM_001177387, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu -4651 NM_001128149 6314 Hs.476595 NM_000333 ENSG00000163635 ATXN7 ADCAII|OPCA3|SCA7|SGF73 ataxin 7 protein-coding 125.75-19 chr10 25670730 25670923 + 0.75 NA intron (NR_108069, intron 3 of 3) intron (NR_108069, intron 3 of 3) 19114 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 134.5-127 chr3 20638214 20638581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 295929 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 142.5-93 chr18 12751045 12751513 + 0.75 NA Intergenic (CACCAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1857 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 112.25-209 chr8 50589944 50590134 + 0.75 NA intron (NR_135797, intron 14 of 20) intron (NR_135797, intron 14 of 20) 425908 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 135.75-64 chr15 58962201 58962443 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25341 NM_001330331 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 155-81 chr22 31806815 31807149 + 0.75 NA intron (NR_146296, intron 18 of 42) AluJr|SINE|Alu 52959 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 113.5-216 chr7 24322361 24322584 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 38282 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 149.25-132 chr4 87828136 87828464 + 0.75 NA intron (NM_001184694, intron 1 of 3) intron (NM_001184694, intron 1 of 3) -4669 NM_001184696 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 188-56 chr5 76102998 76103336 + 0.75 NA intron (NM_014979, intron 1 of 12) intron (NM_014979, intron 1 of 12) 19784 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 158.5-92 chr2 23274086 23274449 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110912 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 113.75-33 chr11 31205934 31206132 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) intron (NM_001367979, intron 9 of 38) 163706 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 221.25-96 chr9 34916315 34916755 + 0.75 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -20771 NM_001309426 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 130.5-196 chr5 23317788 23318072 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -189679 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 181.25-98 chr5 27406507 27407189 + 0.75 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -65444 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 136.25-151 chr5 92522762 92522953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1048486 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 127-51 chr13 32767190 32767525 + 0.75 NA intron (NM_015032, intron 31 of 34) L1M5|LINE|L1 144295 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 136 chr1 40174327 40174587 + 0.75 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 13070 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 205.25-89 chr5 121092625 121093044 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -229716 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 135.5-60 chr14 73778578 73778905 + 0.75 NA intron (NM_001043318, intron 1 of 11) intron (NM_001043318, intron 1 of 11) 8467 NM_001043318 91748 Hs.594157 NM_194278 ENSG00000156030 ELMSAN1 C14orf117|C14orf43|LSR68|MIDEAS|c14_5541 ELM2 and Myb/SANT domain containing 1 protein-coding 136-27 chr11 96481739 96481967 + 0.75 NA intron (NR_047481, intron 1 of 4) intron (NR_047481, intron 1 of 4) 25024 NR_047481 100874053 Hs.742044 NR_047481 JRKL-AS1 - JRKL antisense RNA 1 ncRNA 160.25-112 chr4 92835238 92835592 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 531016 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 147-69 chr2 62551845 62552224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45839 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 126-115 chr3 60240627 60240834 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -159821 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 219.25-42 chr2 224637576 224637992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52387 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 124.25-200 chr8 90234851 90235105 + 0.75 NA intron (NR_051989, intron 1 of 3) intron (NR_051989, intron 1 of 3) 13490 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 227.5-28 chr14 26452329 26452705 + 0.75 NA intron (NM_006489, intron 3 of 3) intron (NM_006489, intron 3 of 3) 100913 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 126.5-23 chr10 9909557 9909872 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149008 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 129-164 chr7 40719437 40719721 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 260360 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 181-108 chr8 73426159 73426490 + 0.75 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) L1MA5A|LINE|L1 6250 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-89 chr3 10949200 10949505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43382 NM_001348253 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 158.75-130 chr4 167217898 167218271 + 0.75 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) intron (NM_001204352, intron 2 of 11) 16342 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 170-43 chr2 21058270 21058667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14395 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 113.5-74 chr14 50644516 50644702 + 0.75 NA intron (NM_021818, intron 3 of 4) intron (NM_021818, intron 3 of 4) 23697 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 203-107 chrX 10217717 10218216 + 0.75 NA intron (NM_001830, intron 11 of 12) AluSz|SINE|Alu 60991 NM_001830 1183 Hs.495674 NM_001830 ENSG00000073464 CLCN4 CLC4|ClC-4|ClC-4A|MRX15|MRX49|MRXSRC chloride voltage-gated channel 4 protein-coding 115.5-158 chr3 2692603 2692848 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -199490 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 150.75-108 chr2 218744127 218744550 + 0.75 NA intron (NM_014640, intron 5 of 19) intron (NM_014640, intron 5 of 19) 33503 NM_014640 9654 Hs.471405 NM_014640 ENSG00000135912 TTLL4 - tubulin tyrosine ligase like 4 protein-coding 209.5-74 chr2 200272075 200272490 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33597 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 198-55 chr4 6863952 6864376 + 0.75 NA exon (NM_014743, exon 7 of 10) exon (NM_014743, exon 7 of 10) -45280 NM_001113361 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 206.5-100 chr5 111385143 111385470 + 0.75 NA intron (NM_001744, intron 4 of 10) L2c|LINE|L2 -126920 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 142-113 chr3 176315574 176315921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71196 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 234.25-75 chr7 98463820 98464250 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62945 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 122.25-194 chr8 101043334 101043590 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8592 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 195.25-103 chr9 79068191 79068704 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 77219 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 197.75-88 chr8 58653460 58653836 + 0.75 NA intron (NM_003580, intron 1 of 30) L1MEd|LINE|L1 5759 NM_001144772 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 207.75-49 chr2 19219953 19220300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128303 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 119.75-174 chr5 161233028 161233332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -294554 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 217.5-40 chr14 24306191 24306509 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001286367, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001286367, exon 10 of 10) -3790 NM_019839 56413 Hs.642693 NM_019839 ENSG00000213906 LTB4R2 BLT2|BLTR2|JULF2|KPG_004|LTB4-R 2|LTB4-R2|NOP9 leukotriene B4 receptor 2 protein-coding 163-59 chr2 128428778 128429057 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -110049 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 121.75-42 chr13 103321361 103321587 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -103726 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 205.25-39 chr17 71325981 71326363 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -123993 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 139-45 chr15 36950366 36950575 + 0.75 NA intron (NM_172316, intron 8 of 12) intron (NM_172316, intron 8 of 12) 22431 NR_107030 102466875 NR_107030 ENSG00000277202 MIR8063 hsa-mir-8063 microRNA 8063 ncRNA 161.75-27 chr11 8130915 8131364 + 0.75 NA intron (NM_001346690, intron 4 of 6) (TCAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 37886 NM_001135109 79608 Hs.231850 NM_024557 ENSG00000166405 RIC3 AYST720|PRO1385 RIC3 acetylcholine receptor chaperone protein-coding 126-40 chr12 23240963 23241214 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 65452 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 215.75-31 chr14 30569479 30569885 + 0.75 NA intron (NR_151720, intron 2 of 3) intron (NR_151720, intron 2 of 3) 7675 NR_151720 105370431 Hs.603980 NR_151720 ENSG00000257636 G2E3-AS1 CAT1647 G2E3 antisense RNA 1 ncRNA 337-7 chr10 107674609 107675404 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 394287 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 153.25-122 chr7 35759444 35759724 + 0.75 NA intron (NR_120511, intron 3 of 5) intron (NR_120511, intron 3 of 5) 41041 NR_120511 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 114.5-137 chr2 75269007 75269204 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -69585 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 132.5-256 chr9 90503592 90503962 + 0.75 NA intron (NR_034157, intron 4 of 5) L1M3c|LINE|L1 -70288 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 123.25-22 chr10 61673992 61674175 + 0.75 NA intron (NM_001366906, intron 2 of 7) intron (NM_001366906, intron 2 of 7) 11122 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 296-30 chr20 8231640 8232131 + 0.75 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -16819 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 131-50 chr14 57277220 57277424 + 0.75 NA intron (NM_018229, intron 2 of 7) intron (NM_018229, intron 2 of 7) 8351 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 135.25-139 chr4 49639086 49639363 + 0.75 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 652582 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 125.5-59 chr12 114247131 114247448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5519 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 185.25-45 chr17 35422951 35423369 + 0.75 NA intron (NM_001289009, intron 1 of 3) intron (NM_001289009, intron 1 of 3) 9340 NM_018042 55106 Hs.663548 NM_018042 ENSG00000172123 SLFN12 SLFN3 schlafen family member 12 protein-coding 128.5-152 chr3 114929786 114930053 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -29294 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 133.75-44 chr13 45176252 45176616 + 0.75 NA intron (NM_004128, intron 4 of 7) L1MC4|LINE|L1 24611 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 233.5-91 chr5 147536851 147537298 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22920 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-6 chr1 75785718 75785945 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_073562) promoter-TSS (NR_073562) -363 NR_073562 5876 Hs.78948 NM_004582 ENSG00000137955 RABGGTB GGTB Rab geranylgeranyltransferase subunit beta protein-coding 147.5-18 chr10 36013805 36014159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 235680 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 122.75-104 chr2 223477202 223477449 + 0.75 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 125036 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 231.25-33 chr2 50073752 50074132 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -99739 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 117.75-180 chr5 161227059 161227324 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -288565 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 213.25-11 chr11 35557656 35558131 + 0.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -27593 NM_001282675 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 209.25-108 chr7 54247852 54248299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82622 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 252.75-4 chr10 26741486 26741872 + 0.75 NA intron (NM_014317, intron 10 of 11) intron (NM_014317, intron 10 of 11) 43978 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 158.5-154 chr5 36118497 36118756 + 0.75 NA intron (NM_001007527, intron 9 of 17) L1MC4|LINE|L1 29362 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 147-44 chr15 97101473 97101742 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 318172 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 171.75-39 chr14 24501234 24501789 + 0.75 NA intron (NR_110032, intron 2 of 2) intron (NR_110032, intron 2 of 2) 6754 NM_001308083 1215 Hs.135626 NM_001836 ENSG00000092009 CMA1 CYH|MCT1|chymase chymase 1 protein-coding 163.75-35 chr12 84779097 84779476 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133513 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 125.75-71 chr18 719337 719679 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6844 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 189.5-20 chr10 16379312 16379749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57413 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 150.75-94 chr2 62297733 62297965 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 82328 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 203-16 chr10 93980098 93980469 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -13648 NM_016341 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 138-128 chr5 52344078 52344357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 336186 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 132.25-143 chr4 91722151 91722380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 555037 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 144.75-41 chr12 28296105 28296405 + 0.75 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) intron (NM_001352082, intron 4 of 13) -105517 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 211.25-58 chr3 69071092 69071493 + 0.75 NA intron (NM_001363861, intron 3 of 15) intron (NM_001363861, intron 3 of 15) 9073 NM_198195 9039 Hs.154320 NM_003968 ENSG00000144744 UBA3 NAE2|UBE1C|hUBA3 ubiquitin like modifier activating enzyme 3 protein-coding 118-35 chr12 66171633 66171863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1676 NM_001282606 51643 Hs.505934 NM_016056 ENSG00000155957 TMBIM4 CGI-119|GAAP|LFG4|S1R|ZPRO transmembrane BAX inhibitor motif containing 4 protein-coding 184.75-104 chr8 51570582 51571036 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 3 of 22) intron (NM_144651, intron 3 of 22) 238636 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 145-28 chr10 82178752 82179163 + 0.75 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) L1MB1|LINE|L1 53963 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 162.75-142 chr8 99499464 99500008 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 25 of 61) intron (NM_017890, intron 25 of 61) 36994 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 242.75-76 chr9 7807098 7807658 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7600 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 223-42 chr2 95219986 95220492 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -54210 NM_001165978 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 120.5-236 chr8 142674773 142675081 + 0.75 NA intron (NR_033343, intron 1 of 2) intron (NR_033343, intron 1 of 2) 4630 NR_033343 8000 Hs.652235 NM_005672 ENSG00000167653 PSCA PRO232 prostate stem cell antigen protein-coding 138-141 chr6 88366608 88366861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172635 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 137.5-169 chr4 30622875 30623170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97347 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 267-10 chr11 16062251 16062967 + 0.75 NA intron (NM_017508, intron 8 of 14) intron (NM_017508, intron 8 of 14) -92988 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 129.5-151 chr3 24865793 24866036 + 0.75 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 36591 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 192.25-69 chr21 15603113 15603627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126564 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 201.75-60 chr3 58508230 58508629 + 0.75 NA intron (NM_003500, intron 14 of 14) intron (NM_003500, intron 14 of 14) 10064 NM_153331 200845 Hs.13982 NM_153331 ENSG00000168301 KCTD6 KCASH3 potassium channel tetramerization domain containing 6 protein-coding 124.25-160 chr5 37179514 37179788 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 28 of 51) intron (NM_023073, intron 28 of 51) -69395 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 288-31 chr3 200133 200968 + 0.75 NA intron (NR_045572, intron 1 of 2) intron (NR_045572, intron 1 of 2) 2661 NR_045572 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 164-41 chr15 68117752 68117995 + 0.75 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) L1MA6|LINE|L1 63297 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 270.5-57 chr7 42317981 42318478 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -81020 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 164.25-107 chr4 727530 727806 + 0.75 NA intron (NM_001317836, intron 1 of 11) L1MC|LINE|L1 21836 NM_006315 10336 Hs.144309 NM_006315 ENSG00000185619 PCGF3 DONG1|RNF3|RNF3A polycomb group ring finger 3 protein-coding 125.5-182 chr3 105022398 105022644 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -344192 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 239.25-3 chr1 45924907 45925426 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) intron (NM_001324320, intron 4 of 29) 60818 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 142.75-127 chr3 52264311 52264614 + 0.75 NA intron (NM_025222, intron 3 of 8) intron (NM_025222, intron 3 of 8) 3899 NR_029660 406890 NR_029660 ENSG00000199150 MIRLET7G LET7G|MIRNLET7G|hsa-let-7g|let-7g microRNA let-7g ncRNA 151-117 chr6 9893718 9893962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -510662 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 318-11 chr16 21980831 21981550 + 0.75 NA intron (NM_003366, intron 13 of 13) intron (NM_003366, intron 13 of 13) 19926 NM_173806 255762 Hs.98244 NM_173806 ENSG00000155714 PDZD9 C16orf65 PDZ domain containing 9 protein-coding 150.5-234 chr9 72734850 72735226 + 0.75 NA intron (NM_138691, intron 8 of 23) intron (NM_138691, intron 8 of 23) 139071 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 127.25-72 chr17 40038901 40039097 + 0.75 NA intron (NR_052017, intron 3 of 24) intron (NR_052017, intron 3 of 24) -11354 NR_102369 101340251 NR_102369 ENSG00000238793 SNORD124 - small nucleolar RNA, C/D box 124 snoRNA 167.5-164 chr6 72537235 72537682 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -84385 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 147.5-14 chr1 221329805 221330064 + 0.75 NA TTS (NR_024236) TTS (NR_024236) 6362 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 171.5-56 chr16 80781220 80781699 + 0.75 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) L1MB5|LINE|L1 23139 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 231-28 chr14 81890827 81891244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -147897 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 157.5-232 chrX 49220398 49220693 + 0.75 NA intron (NM_001256790, intron 18 of 47) intron (NM_001256790, intron 18 of 47) 12795 NM_001256790 778 Hs.632799 NM_005183 ENSG00000102001 CACNA1F AIED|COD3|COD4|CORDX|CORDX3|CSNB2|CSNB2A|CSNBX2|Cav1.4|Cav1.4alpha1|JM8|JMC8|OA2 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 F protein-coding 211.25-14 chr12 8066582 8067052 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001326475) promoter-TSS (NM_001326475) -458 NM_001326475 719 Hs.504656 NM_004054 ENSG00000171860 C3AR1 AZ3B|C3AR|HNFAG09 complement C3a receptor 1 protein-coding 182.5-172 chr8 139221445 139221824 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -307593 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 206-78 chr8 132498340 132498780 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -17465 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 281-7 chr12 31701798 31702418 + 0.75 NA intron (NR_103523, intron 1 of 5) intron (NR_103523, intron 1 of 5) 26913 NM_001113402 196394 Hs.585084 NM_001113402 ENSG00000151743 AMN1 - antagonist of mitotic exit network 1 homolog protein-coding 235.75-5 chr1 196544698 196545247 + 0.75 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 37509 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 114.5-84 chr14 24733724 24733935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99639 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 150.75-73 chr16 80883856 80884109 + 0.75 NA intron (NR_131948, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 8614 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 161.5-173 chr7 71475987 71476231 + 0.75 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) intron (NM_022479, intron 5 of 10) -168339 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 130-40 chr14 51971966 51972185 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -17471 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 160.25-148 chr7 39724222 39724528 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9193 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 192.75-83 chr3 32986922 32987314 + 0.75 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 35474 NM_005508 1233 Hs.184926 NM_005508 ENSG00000183813 CCR4 CC-CKR-4|CD194|CKR4|CMKBR4|ChemR13|HGCN:14099|K5-5 C-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 180.25-102 chr5 121933953 121934256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27871 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 148.25-149 chr8 130864061 130864381 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1MC3|LINE|L1 176688 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 234.75-13 chr11 37372772 37373416 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -565507 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 118.25-103 chr2 84190339 84190580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100223 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 167-106 chr7 42157711 42158006 + 0.75 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 79351 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 160.5-66 chr17 9457427 9457872 + 0.75 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 118171 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 146.75-76 chr2 73150913 73151158 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -38087 NM_001371272 166-127 chr8 84145691 84146012 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36936 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 212.5-111 chr8 33131486 33131975 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 341416 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 135.25-60 chr13 108856828 108857272 + 0.75 NA intron (NM_015011, intron 11 of 34) intron (NM_015011, intron 11 of 34) 227439 NM_001198950 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 242.5-57 chr3 173102648 173103238 + 0.75 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 38292 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 162-86 chr4 71542330 71542741 + 0.75 NA intron (NM_003759, intron 15 of 22) L2c|LINE|L2 203482 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 175-66 chr2 53771585 53772035 + 0.75 NA intron (NM_001008708, intron 1 of 2) intron (NM_001008708, intron 1 of 2) 4006 NM_001008708 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 116.25-190 chr6 8504327 8504547 + 0.75 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) intron (NR_038980, intron 2 of 4) 68814 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 121.75-200 chr9 97761607 97761903 + 0.75 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 -64346 NM_000380 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 132.25-17 chr1 176093672 176093908 + 0.75 NA intron (NM_022457, intron 9 of 19) AluY|SINE|Alu 113454 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 118-52 chr14 61446265 61446484 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 4 of 13) intron (NM_006255, intron 4 of 13) 123820 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 139.5-199 chr7 53419995 53420230 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 384479 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 138-62 chr17 61679264 61679515 + 0.75 NA 3' UTR (NM_032043, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_032043, exon 20 of 20) -88170 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 141-31 chr11 70382037 70382266 + 0.75 NA non-coding (NR_045286, exon 28 of 29) non-coding (NR_045286, exon 28 of 29) -16355 NM_138565 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 135.25-116 chr20 35325215 35325502 + 0.75 NA intron (NM_001184977, intron 5 of 7) L1MB4|LINE|L1 -32933 NM_178468 128876 Hs.592149 NM_178468 ENSG00000125998 FAM83C C20orf128|dJ614O4.7 family with sequence similarity 83 member C protein-coding 207-95 chr9 95025927 95026309 + 0.75 NA intron (NM_032823, intron 11 of 14) intron (NM_032823, intron 11 of 14) -39232 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 189.25-26 chr12 92607949 92608417 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94660 NM_001037671 338809 Hs.326303 NM_001037671 ENSG00000187510 C12orf74 - chromosome 12 open reading frame 74 protein-coding 172.5-216 chr9 129930688 129931004 + 0.75 NA intron (NM_001363755, intron 6 of 15) intron (NM_001363755, intron 6 of 15) 61241 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 171.5-154 chr8 120597608 120598023 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) 152396 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 159-119 chr8 122483928 122484337 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) LTR33|LTR|ERVL 84512 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 157.75-17 chr10 79428387 79428702 + 0.75 NA intron (NM_153367, intron 2 of 3) L1MB3|LINE|L1 17080 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 194.5-5 chr1 170637224 170637632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26703 NM_006902 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 146.25-86 chr20 14495343 14495577 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -58924 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 331.75-9 chr15 24959640 24960194 + 0.75 NA intron (NM_001349465, intron 2 of 10) intron (NM_001349465, intron 2 of 10) 4925 NM_001349465 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 201.5-50 chr14 30035109 30035608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107511 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 186.5-60 chr2 37563430 37563841 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108564 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 172.75-47 chr17 49022930 49023440 + 0.75 NA intron (NM_001160423, intron 2 of 12) intron (NM_001160423, intron 2 of 12) 25800 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 153.75-53 chr16 30113755 30114022 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_024307) promoter-TSS (NM_024307) -351 NM_024307 79153 Hs.289015 NM_024307 ENSG00000102886 GDPD3 GDE7 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 protein-coding 190.5-147 chr7 84336484 84336867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -141886 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 181-121 chrX 135341730 135342127 + 0.75 NA 5' UTR (NM_007131, exon 1 of 7) 5' UTR (NM_007131, exon 1 of 7) 2181 NM_007131 7626 Hs.371717 NM_007131 ENSG00000186376 ZNF75D D8C6|ZKSCAN24|ZNF75|ZNF82|ZSCAN28 zinc finger protein 75D protein-coding 125.5-99 chr16 66509926 66510265 + 0.75 NA non-coding (NR_073520, exon 9 of 9) non-coding (NR_073520, exon 9 of 9) -33693 NR_109960 101927726 Hs.739193 NR_109960 ENSG00000261656 BEAN1-AS1 CTD-2258A20.5 BEAN1 antisense RNA 1 ncRNA 290.5-31 chr4 93805285 93805844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23189 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 152-9 chr1 100080350 100080583 + 0.75 NA intron (NM_033055, intron 10 of 11) intron (NM_033055, intron 10 of 11) 42371 NM_033055 64645 Hs.124156 NM_033055 ENSG00000156875 MFSD14A HIAT1 major facilitator superfamily domain containing 14A protein-coding 182.75-4 chr1 62556273 62556707 + 0.75 NA intron (NM_001367561, intron 20 of 49) intron (NM_001367561, intron 20 of 49) -41030 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 175.75-57 chr18 11183548 11183883 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34953 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 156.75-160 chr7 94807784 94808117 + 0.75 NA Intergenic MER11C|LTR|ERVK -99644 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 200.5-7 chr1 106689169 106689614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128848 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 119.25-188 chr7 33583237 33583492 + 0.75 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -321551 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 182.75-98 chr5 3228616 3229167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51056 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 196.25-56 chr2 19370224 19370721 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -11849 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 220-6 chr1 236564418 236564781 + 0.75 NA exon (NM_018072, exon 32 of 45) exon (NM_018072, exon 32 of 45) 39917 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 170.75-103 chr4 171482697 171482964 + 0.75 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 155933 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 171.25-36 chr12 48466029 48466429 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -6436 NM_012404 23519 Hs.532658 NM_012404 ENSG00000139223 ANP32D PP32R2 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member D protein-coding 126.5-153 chr3 55982959 55983195 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 11 of 17) intron (NR_132749, intron 11 of 17) -130483 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 122.25-137 chr4 45650380 45650629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 473550 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 224.5-78 chr3 182919970 182920347 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014616, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_014616, exon 30 of 30) 60380 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 225.25-19 chr14 58019981 58020392 + 0.75 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 132027 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 128.75-96 chr2 55285086 55285310 + 0.75 NA TTS (NR_027258) TTS (NR_027258) 2879 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 188.75-18 chr11 115797218 115797526 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37172 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 253.5-31 chr17 59042810 59043349 + 0.75 NA intron (NR_148346, intron 16 of 23) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 63801 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 160-56 chr2 98959432 98959708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23345 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 166.25-122 chr5 25979275 25979586 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 788477 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 121.5-139 chr2 107232117 107232366 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) L1MEg|LINE|L1 117284 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 133.75-71 chr16 62826888 62827238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -790625 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 136.25-158 chr5 166820252 166820589 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105950 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 129.25-207 chr8 123436876 123437164 + 0.75 NA intron (NM_018024, intron 4 of 5) intron (NM_018024, intron 4 of 5) 20246 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 126.25-8 chr1 108078296 108078506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113221 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 124.25-62 chr15 61286857 61287228 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -57740 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 279.5-14 chr11 88495475 88496083 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8797 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-129 chr5 168650621 168651114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56060 NR_130737 101927969 Hs.661903 NR_130737 LOC101927969 - uncharacterized LOC101927969 ncRNA 228-27 chr14 64632704 64633052 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -71546 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 207-51 chr20 31682656 31683123 + 0.75 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -38618 NR_131907 103021294 NR_131907 ENSG00000281376 ABALON INXS apoptotic BCL2L1-antisense long non-coding RNA ncRNA 179-88 chr8 58090670 58091067 + 0.75 NA intron (NM_147189, intron 4 of 4) intron (NM_147189, intron 4 of 4) 96345 NM_147189 90362 Hs.154652 NM_147189 ENSG00000169122 FAM110B C8orf72 family with sequence similarity 110 member B protein-coding 121.5-222 chr6 68418806 68419071 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -89039 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 198.5-51 chr15 60536950 60537348 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) 55377 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 115.25-207 chr8 90521050 90521247 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 84915 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 113.75-112 chr20 48166692 48166902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176680 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 132-37 chr12 49678900 49679282 + 0.75 NA intron (NM_001367835, intron 1 of 26) MIR|SINE|MIR 28314 NM_175736 91010 Hs.179838 NM_175736 ENSG00000161791 FMNL3 FHOD3|FRL2|WBP-3|WBP3 formin like 3 protein-coding 122.25-97 chr2 133512272 133512527 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 56064 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 114.25-177 chr7 40833381 40833574 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 146462 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 174.5-198 chr9 131012338 131012755 + 0.75 NA intron (NM_006059, intron 1 of 27) intron (NM_006059, intron 1 of 27) 3372 NM_006059 10319 Hs.201805 NM_006059 ENSG00000050555 LAMC3 OCCM laminin subunit gamma 3 protein-coding 196.5-99 chr3 11670684 11671179 + 0.75 NA intron (NM_014667, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu -27016 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 127.5-104 chr18 8042218 8042412 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 324719 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 327-9 chr14 70905199 70905894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1913 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 155-96 chr4 75719550 75719790 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4852 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 137.25-69 chr2 74502276 74502540 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_024606) promoter-TSS (NR_024606) -185 NR_152616 151534 Hs.745121 NM_138482 ENSG00000257702 LBX2-AS1 - LBX2 antisense RNA 1 ncRNA 178-94 chr7 30788388 30788758 + 0.75 NA intron (NR_037598, intron 6 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 17156 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 194-10 chr1 115557053 115557466 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -84711 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 224-10 chr10 100110741 100111334 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -29168 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 158-127 chr7 41612930 41613237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80836 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 216.25-29 chr13 42970115 42970443 + 0.75 NA intron (NM_001331228, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 21962 NM_001002264 94240 Hs.546467 NM_033255 ENSG00000133106 EPSTI1 BRESI1 epithelial stromal interaction 1 protein-coding 202.5-126 chr6 22239160 22239545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57684 NM_000948 5617 Hs.1905 NM_000948 ENSG00000172179 PRL GHA1 prolactin protein-coding 125.75-95 chr2 96201315 96201555 + 0.75 NA intron (NM_020151, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -6981 NR_046322 285033 Hs.58648 NM_001037228 STARD7-AS1 - STARD7 antisense RNA 1 ncRNA 116-128 chr5 117374404 117374591 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -41015 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 131-17 chr10 18514364 18514644 + 0.75 NA intron (NM_201570, intron 6 of 12) intron (NM_201570, intron 6 of 12) 113929 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 159.75-159 chr7 54434406 54434678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 103845 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 157.75-19 chr10 82195355 82195669 + 0.75 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 37408 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 125.75-135 chr4 31753525 31753949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -243642 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 123-77 chr16 80517026 80517345 + 0.75 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -23549 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 154.25-121 chr4 168851054 168851521 + 0.75 NA intron (NM_001367567, intron 1 of 11) intron (NM_001367567, intron 1 of 11) 19192 NM_001367570 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 173-38 chr12 121285926 121286393 + 0.75 NA intron (NM_172215, intron 1 of 15) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 10550 NM_001270485 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 116.25-162 chr4 54476753 54476987 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 130261 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 164.25-59 chr19 9087591 9087905 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5497 NM_001004456 125963 Hs.553577 NM_001004456 ENSG00000170929 OR1M1 OR19-5|OR19-6 olfactory receptor family 1 subfamily M member 1 protein-coding 209.25-104 chr7 18315574 18315990 + 0.75 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) 25690 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 152.75-50 chr13 75312887 75313202 + 0.75 NA intron (NM_001286659, intron 10 of 18) intron (NM_001286659, intron 10 of 18) 72456 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 120.75-176 chr9 37948079 37948457 + 0.75 NA intron (NM_003028, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR -43915 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 167.75-42 chr13 79626977 79627350 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60436 NR_125772 103724388 Hs.434862 NR_125772 ENSG00000227676 LINC01068 - long intergenic non-protein coding RNA 1068 ncRNA 209-30 chr17 61868806 61869242 + 0.75 NA intron (NM_001351695, intron 23 of 24) intron (NM_001351695, intron 23 of 24) -5465 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 186.5-28 chr11 131822423 131822732 + 0.75 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -87347 NR_147850 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 136.25-64 chr14 103340718 103340915 + 0.75 NA intron (NM_183004, intron 10 of 10) intron (NM_183004, intron 10 of 10) 2967 NR_002964 677811 Hs.658237 NR_002964 ENSG00000272533 SNORA28 ACA28 small nucleolar RNA, H/ACA box 28 snoRNA 173-81 chr3 17199358 17199716 + 0.75 NA intron (NM_014744, intron 18 of 21) intron (NM_014744, intron 18 of 21) 266341 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 209.5-147 chr8 136551484 136552109 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M2|LINE|L1 20998 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 174-49 chr2 50357221 50357805 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) AluSp|SINE|Alu -9757 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 140.75-123 chr3 155140650 155140905 + 0.75 NA intron (NM_000902, intron 10 of 22) intron (NM_000902, intron 10 of 22) 60766 NM_007289 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 125.25-23 chr10 21419669 21419930 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -46849 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 205.75-42 chr22 40093152 40093478 + 0.75 NA intron (NM_001024843, intron 1 of 23) L1MEd|LINE|L1 48498 NM_001024843 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 128.5-123 chr20 57079659 57080062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133836 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 160-54 chr2 74617871 74618095 + 0.75 NA intron (NM_001321739, intron 2 of 10) intron (NM_001321739, intron 2 of 10) 30054 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 112.25-131 chr3 108024633 108024871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66336 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 131.25-114 chr2 217927980 217928290 + 0.75 NA intron (NM_022648, intron 1 of 32) intron (NM_022648, intron 1 of 32) -7899 NM_001308022 7145 Hs.471381 NM_022648 ENSG00000079308 TNS1 MST091|MST122|MST127|MSTP091|MSTP122|MSTP127|MXRA6|PPP1R155|TNS tensin 1 protein-coding 128.25-179 chr6 127641209 127641487 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 64174 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 173-32 chr12 21224662 21224996 + 0.75 NA exon (NM_006446, exon 14 of 15) exon (NM_006446, exon 14 of 15) 93635 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 207.25-16 chr12 75855482 75855891 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 176090 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 148.75-145 chr6 77889594 77889883 + 0.75 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 236699 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 140.25-7 chr1 69425941 69426225 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7172 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 153.75-36 chr13 61901422 61901782 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 127946 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 173-20 chr10 96860750 96861066 + 0.75 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) intron (NM_001170766, intron 2 of 8) 27963 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 144.5-144 chr4 53270665 53270904 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) L1M5|LINE|L1 95277 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 215-56 chr4 35984862 35985231 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 258893 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 114-135 chr5 74276864 74277101 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 31343 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 280.25-47 chr6 137304516 137305216 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85436 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 143.25-136 chr4 98381188 98381462 + 0.75 NA intron (NM_021159, intron 5 of 14) intron (NM_021159, intron 5 of 14) 119941 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 233-8 chr10 21236934 21237333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62831 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 137.75-103 chr2 114656774 114657012 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 176655 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 120-199 chr9 70622241 70622534 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 13 of 25) intron (NM_001366143, intron 13 of 25) 187697 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 162.25-48 chr14 41849939 41850447 + 0.75 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) intron (NM_001330106, intron 2 of 4) 243337 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 157.5-46 chr12 42521347 42521681 + 0.75 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -37504 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 180.5-163 chr8 138609642 138609967 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 56 of 64) intron (NM_152888, intron 56 of 64) -112074 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 113.5-4 chr1 35094434 35094663 + 0.75 NA intron (NM_024772, intron 2 of 9) intron (NM_024772, intron 2 of 9) 15163 NM_024772 79830 Hs.471243 NM_024772 ENSG00000197056 ZMYM1 MYM zinc finger MYM-type containing 1 protein-coding 131.25-101 chr2 73121167 73121470 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -8370 NM_001371272 114-51 chr15 90403543 90403790 + 0.75 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) L1ME4b|LINE|L1 15424 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 113.5-39 chr10 104747035 104747299 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -80951 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 127-169 chr8 30343284 30343593 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -41063 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 113.25-179 chr8 136617318 136617684 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MER113|DNA|hAT-Charlie 86703 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 113.5-150 chr22 44093228 44093497 + 0.75 NA intron (NM_001243385, intron 1 of 12) intron (NM_001243385, intron 1 of 12) 24245 NM_001243385 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 134.25-183 chr8 10920068 10920326 + 0.75 NA intron (NM_173683, intron 2 of 2) intron (NM_173683, intron 2 of 2) 80171 NR_125432 101929229 Hs.129800 NR_125432 LOC101929229 - uncharacterized LOC101929229 ncRNA 145.5-69 chr15 40556994 40557251 + 0.75 NA intron (NM_001080792, intron 3 of 3) intron (NM_001080792, intron 3 of 3) 7920 NM_052849 90416 Hs.654661 NM_052849 ENSG00000128891 CCDC32 C15orf57 coiled-coil domain containing 32 protein-coding 113.5-213 chr6 137901295 137901471 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33150 NR_049793 100130476 Hs.598050 NR_049793 ENSG00000237499 WAKMAR2 lnc-TNFAIP3 wound and keratinocyte migration associated lncRNA 2 ncRNA 140.5-229 chr8 88104913 88105120 + 0.75 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 222467 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 176.25-103 chr4 106905236 106905490 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 130950 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 125.25-215 chr8 140833400 140833610 + 0.75 NA intron (NM_001352746, intron 4 of 30) intron (NM_001352746, intron 4 of 30) -100852 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 171.25-6 chr1 152668098 152668533 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 4935 NM_178430 353141 Hs.490225 NM_178430 ENSG00000187223 LCE2D LEP12|SPRL1A late cornified envelope 2D protein-coding 147.5-38 chr11 127416638 127416983 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 145740 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 146-83 chr20 41428955 41429346 + 0.75 NA intron (NM_032221, intron 27 of 36) intron (NM_032221, intron 27 of 36) -62332 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 138.75-92 chr2 98953271 98953547 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -17184 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 135.5-25 chr10 53458217 53458541 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -686679 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 200.75-106 chr8 99633302 99633647 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -96613 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 115-134 chr5 78706264 78706451 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -57585 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 121.5-215 chr5 166974534 166974845 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48319 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 160.25-60 chr18 8309349 8309709 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 18 of 30) AluJo|SINE|Alu 57505 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 159.25-28 chr12 10294809 10295110 + 0.75 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) L1ME3A|LINE|L1 -9487 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 237-31 chr2 221232111 221232555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 339971 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 208-20 chr12 131893463 131893896 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_003565) promoter-TSS (NM_003565) -943 NM_003565 8408 Hs.47061 NM_003565 ENSG00000177169 ULK1 ATG1|ATG1A|UNC51|Unc51.1|hATG1 unc-51 like autophagy activating kinase 1 protein-coding 140-157 chr7 30790294 30790625 + 0.75 NA intron (NR_037598, intron 6 of 19) AluSz|SINE|Alu 19042 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 118.5-22 chr10 76470708 76470931 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1MB4|LINE|L1 -417225 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-234 chr8 100537754 100538181 + 0.75 NA intron (NM_001270377, intron 1 of 4) intron (NM_001270377, intron 1 of 4) 21792 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 164.5-177 chr6 89367063 89367476 + 0.75 NA 3' UTR (NM_021244, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_021244, exon 7 of 7) -14547 NM_016021 51465 Hs.163776 NM_016021 ENSG00000198833 UBE2J1 CGI-76|HSPC153|HSPC205|HSU93243|NCUBE-1|NCUBE1|UBC6|UBC6E|Ubc6p ubiquitin conjugating enzyme E2 J1 protein-coding 142-174 chr9 102277397 102277655 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242111 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 160.75-6 chr1 56422469 56422690 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 7616 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 183.25-23 chr11 90392538 90392980 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) L1PBa|LINE|L1 141527 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 149-80 chr3 137793748 137794082 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22004 NR_109987 100507274 Hs.360349 NR_109987 ENSG00000239513 LINC01210 - long intergenic non-protein coding RNA 1210 ncRNA 225.5-57 chr2 57372495 57372800 + 0.75 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -535004 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 156 chr1 37875793 37876034 + 0.75 NA intron (NR_158630, intron 17 of 24) intron (NR_158630, intron 17 of 24) -16321 NM_005955 4520 Hs.471991 NM_005955 ENSG00000188786 MTF1 MTF-1|ZRF metal regulatory transcription factor 1 protein-coding 272.75-52 chr9 4426851 4427375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63355 NM_004170 6505 Hs.444915 NM_004170 ENSG00000106688 SLC1A1 DCBXA|EAAC1|EAAT3|SCZD18 solute carrier family 1 member 1 protein-coding 131-69 chr17 64517793 64518127 + 0.75 NA intron (NM_138363, intron 5 of 19) AluSz|SINE|Alu 10983 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 171.25-31 chr11 108868997 108869365 + 0.75 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) intron (NM_004398, intron 16 of 17) 204112 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 139.5-175 chr5 42290816 42291248 + 0.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -115687 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 232-56 chr4 1103610 1104065 + 0.75 NA intron (NR_159500, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 9727 NR_159497 285498 Hs.248290 NM_194439 ENSG00000178222 RNF212 ZHP3 ring finger protein 212 protein-coding 126.5-28 chr10 82603231 82603436 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -370413 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 122.25-96 chr2 129221553 129221788 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 52221 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 131.75-192 chr6 137318024 137318438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98801 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 262.5-9 chr11 26106927 26107490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81915 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 134.25-77 chr2 40033340 40033575 + 0.75 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 115823 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 145.75-62 chr17 51390254 51390474 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -45063 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 136.25-35 chr11 88164703 88165072 + 0.75 NA intron (NM_022337, intron 1 of 2) intron (NM_022337, intron 1 of 2) 10556 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 171.5-138 chr7 26632299 26632676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5384 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 115-48 chr14 63935190 63935377 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) intron (NM_015180, intron 2 of 114) 82279 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 167.75-88 chr20 54426624 54426899 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -48832 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 166.25-105 chr3 113203292 113203809 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8007 NM_001301867 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 119.25-141 chr4 30596159 30596410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124085 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 166.75-6 chr1 192476093 192476441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99506 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 183.75-109 chr6 132895235 132895699 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78248 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 155-144 chr8 122703586 122703999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9686 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 114.75-12 chr1 158489052 158489301 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9298 NM_001004472 343406 Hs.451913 NM_001004472 ENSG00000198965 OR10R2 OR1-8|OR10R2Q olfactory receptor family 10 subfamily R member 2 protein-coding 112.25-219 chr8 119818105 119818273 + 0.75 NA intron (NM_003184, intron 3 of 25) MER5A|DNA|hAT-Charlie 14652 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 208.75-18 chr12 3232096 3232574 + 0.75 NA intron (NM_001168320, intron 2 of 7) intron (NM_001168320, intron 2 of 7) 133787 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 119.5-102 chr17 62625023 62625317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2500 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 143-89 chr3 28956210 28956536 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 324566 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 156.75-119 chr4 13613495 13613823 + 0.75 NA exon (NM_148894, exon 5 of 26) exon (NM_148894, exon 5 of 26) 14066 NM_148894 259282 Hs.744935 NM_148894 ENSG00000038219 BOD1L1 BOD1L|FAM44A biorientation of chromosomes in cell division 1 like 1 protein-coding 157.5-38 chr11 47989554 47989923 + 0.75 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 9179 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 163.25-34 chr12 90727434 90727681 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -190466 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 121.25-203 chr9 13571426 13571626 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -140197 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 112.5-48 chr12 25982162 25982493 + 0.75 NA intron (NM_001164747, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 8572 NM_001164747 11228 Hs.696433 NM_007211 ENSG00000123094 RASSF8 C12orf2|HOJ1 Ras association domain family member 8 protein-coding 118.25-148 chr5 20403784 20403992 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 98337 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 219.25-37 chr2 144385033 144385369 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014795, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_014795, exon 10 of 10) -52132 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 118.25-113 chr20 2049299 2049545 + 0.75 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -52405 NM_080836 140901 Hs.100057 NM_080836 ENSG00000125834 STK35 CLIK1|STK35L1 serine/threonine kinase 35 protein-coding 169.25-61 chr2 176009463 176009788 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -6805 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 176.25-150 chr9 132760583 132760981 + 0.75 NA intron (NM_001317959, intron 13 of 14) L1M5|LINE|L1 90318 NM_012204 9329 Hs.22302 NM_012204 ENSG00000125484 GTF3C4 KAT12|TF3C-delta|TFIII90|TFIIIC290|TFIIIC90|TFIIICDELTA general transcription factor IIIC subunit 4 protein-coding 121-191 chr8 108992621 108992976 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93830 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 168.75-98 chr3 170157132 170157574 + 0.75 NA intron (NM_024947, intron 4 of 14) intron (NM_024947, intron 4 of 14) 24380 NM_001308116 80012 Hs.529592 NM_024947 ENSG00000173889 PHC3 EDR3|HPH3 polyhomeotic homolog 3 protein-coding 211.5-96 chr22 25758180 25758673 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 1 of 43) L1MB7|LINE|L1 16238 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 236.25-93 chrUn_KI270417v1 336 927 + 0.75 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 230.75-47 chr3 166064514 166065055 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -227361 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 166.5-87 chr17 67793088 67793455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32232 NM_182641 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 218-26 chr18 10824505 10824871 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) L1MC3|LINE|L1 -65039 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 138.75-55 chr15 53195813 53196063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79573 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 205.5-32 chr12 93949074 93949613 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5737 NR_135017 105369911 Hs.577495 NR_135017 ENSG00000257283 LOC105369911 - uncharacterized LOC105369911 ncRNA 137.5-110 chr2 31528375 31528620 + 0.75 NA intron (NM_000348, intron 4 of 4) AluSx1|SINE|Alu 52441 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 142.25-170 chr8 121163937 121164261 + 0.75 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -352053 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 119.75-13 chr1 198158356 198158561 + 0.75 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 1460 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 169-26 chr13 111891934 111892243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1290 NR_046992 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 226.75-37 chr2 191416842 191417470 + 0.75 NA intron (NM_012223, intron 28 of 28) intron (NM_012223, intron 28 of 28) 171752 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 281.25-32 chr3 117632756 117633480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57807 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 115-51 chr14 72494005 72494260 + 0.75 NA intron (NM_001370294, intron 12 of 14) HAL1|LINE|L1 -22688 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 150.25-85 chr2 223494005 223494328 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108195 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 256.5-87 chr9 124428669 124429131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13458 NM_002799 5695 Hs.213470 NM_002799 ENSG00000136930 PSMB7 Z proteasome subunit beta 7 protein-coding 119.25-91 chr2 63949930 63950104 + 0.75 NA intron (NM_001005739, intron 7 of 22) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 69411 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 216.5-91 chr5 28187140 28187545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100323 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 199-65 chr4 168264526 168264954 + 0.75 NA intron (NM_017631, intron 22 of 37) intron (NM_017631, intron 22 of 37) 54012 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 176.25-35 chr12 102273279 102273672 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -75642 NM_002674 5367 Hs.707990 NM_002674 ENSG00000183395 PMCH MCH|ppMCH pro-melanin concentrating hormone protein-coding 149.5-4 chr1 57718702 57719032 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -141714 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 182.5-118 chr4 66395903 66396212 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 119233 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 171.25-24 chr10 129635242 129635567 + 0.75 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 168163 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 211.5-38 chr12 63887473 63887897 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 42985 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 165.25-139 chr8 85475769 85476194 + 0.75 NA intron (NM_000067, intron 5 of 6) intron (NM_000067, intron 5 of 6) -11066 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 121-21 chr10 51617958 51618237 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 81498 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 149.5-76 chr17 41132755 41133056 + 0.75 NA intron (NM_001277332, intron 3 of 5) L1MC4|LINE|L1 7582 NM_030976 81871 Hs.307014 NM_030976 ENSG00000198090 KRTAP4-6 KAP4.15|KAP4.6|KRTAP4-15|KRTAP4.15 keratin associated protein 4-6 protein-coding 158.25-42 chr15 57349079 57349355 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27288 NM_001252335 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 158-28 chr11 6432538 6432917 + 0.75 NA intron (NM_000613, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 8260 NM_000613 3263 Hs.426485 NM_000613 ENSG00000110169 HPX HX hemopexin protein-coding 148-25 chr14 54657008 54657326 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 89555 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 149.5-181 chr7 14990144 14990466 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -15447 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 146.5-81 chr16 89250073 89250292 + 0.75 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 32479 NM_001201407 197320 Hs.647385 NM_182531 ENSG00000170100 ZNF778 - zinc finger protein 778 protein-coding 192.75-78 chr22 31891710 31892093 + 0.75 NA intron (NR_146296, intron 38 of 42) intron (NR_146296, intron 38 of 42) 46553 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 172.25-109 chr5 40925638 40925957 + 0.75 NA intron (NM_000587, intron 1 of 17) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 16300 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 168.5-173 chr7 87170241 87170614 + 0.75 NA intron (NR_024550, intron 4 of 17) L2a|LINE|L2 17873 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 138.5-216 chrX 51833989 51834214 + 0.75 NA intron (NM_001005332, intron 1 of 12) L1ME3E|LINE|L1 31025 NM_001005332 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 147-113 chr5 129608138 129608410 + 0.75 NA intron (NM_133638, intron 8 of 22) L1MA9|LINE|L1 -139820 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 127.75-71 chr15 95884595 95884870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 243109 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 142.75-184 chr8 77864286 77864486 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 413689 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 195-11 chr10 56588984 56589308 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -227873 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 155-41 chr14 68482299 68482601 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 146337 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 134.25-190 chr8 95199221 95199487 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17020 NR_046232 619344 Hs.741630 NR_046232 ENSG00000253351 LINC01298 C8orf69 long intergenic non-protein coding RNA 1298 ncRNA 135.5-71 chr16 50359568 50359851 + 0.75 NA intron (NM_013263, intron 2 of 16) HY3|scRNA|scRNA 9279 NM_013263 29117 Hs.437894 NM_013263 ENSG00000166164 BRD7 BP75|CELTIX1|NAG4 bromodomain containing 7 protein-coding 157.75-176 chr8 128386126 128386415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178409 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 185.75-16 chr10 52604283 52604670 + 0.75 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) -133943 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 210-63 chr22 27332758 27333261 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 22358 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 121.25-96 chr2 122325196 122325404 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 569649 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 141.5-51 chr13 113415880 113416196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1645 NM_001304433 101928841 Hs.646609 NM_001003399 LOC101928841 - collagen alpha-1(II) chain-like protein-coding 201.75-48 chr2 124905254 124905645 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 22 of 23) intron (NM_130773, intron 22 of 23) 880162 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 326.5-27 chr7 122903493 122904186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17080 NM_001167940 93664 Hs.649459 NM_017954 ENSG00000081803 CADPS2 CAPS2 calcium dependent secretion activator 2 protein-coding 251.5-85 chr8 89670478 89671110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86917 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 185-61 chr4 45165753 45166052 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -439268 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 177.75-83 chr2 198389849 198390242 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14948 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 140.5-155 chr3 98846119 98846339 + 0.75 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) intron (NM_080927, intron 3 of 15) 55466 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 210.5-47 chr16 61720504 61721111 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 9 of 11) intron (NM_001796, intron 9 of 11) 315631 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 160-20 chr11 84751060 84751321 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -30248 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 169.5-60 chr16 57220573 57221032 + 0.75 NA exon (NM_001305163, exon 9 of 15) exon (NM_001305163, exon 9 of 15) -24457 NM_012106 23568 Hs.632873 NM_012106 ENSG00000102931 ARL2BP BART|BART1|RP66 ADP ribosylation factor like GTPase 2 binding protein protein-coding 135.25-214 chrX 47498076 47498410 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -14974 NM_001324148 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 283-40 chr6 36429883 36430384 + 0.75 NA intron (NM_152990, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu -12634 NM_001286580 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 215.5-22 chr12 1000444 1000910 + 0.75 NA intron (NR_027948, intron 1 of 19) AluSc|SINE|Alu 9454 NR_027948 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 170.25-93 chr3 33032940 33033324 + 0.75 NA intron (NM_001079811, intron 10 of 15) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 63700 NM_001079811 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 115.5-28 chr10 125398370 125398627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175873 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 217.25-10 chr10 20979753 20980235 + 0.75 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) intron (NM_001173484, intron 3 of 6) -82392 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 149.25-185 chr8 109586789 109587143 + 0.75 NA intron (NM_001099754, intron 3 of 6) intron (NM_001099754, intron 3 of 6) 16493 NM_001363032 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 211.25-79 chr6 21271096 21271710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 240489 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 139.5-58 chr13 59641254 59641528 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -371327 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 173-138 chr8 74421377 74421828 + 0.75 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 71199 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 350 chr10 58896148 58896844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103022 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 137-159 chr7 25782712 25783095 + 0.75 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 -6704 NR_157810 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 165.75-143 chr6 17655899 17656260 + 0.75 NA intron (NM_001278209, intron 11 of 22) AluSz|SINE|Alu -50051 NR_134616 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 123-8 chr1 100734615 100734916 + 0.75 NA exon (NM_001078, exon 8 of 9) exon (NM_001078, exon 8 of 9) 15023 NM_001078 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 137-32 chr11 42306131 42306468 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52609 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 130.5-18 chr1 147400181 147400379 + 0.75 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L1MD1|LINE|L1 117595 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 126.75-155 chr3 114560219 114560461 + 0.75 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 63866 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 114.25-170 chr6 115596769 115597023 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46939 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 136.25-15 chr10 57523004 57523323 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -218604 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 135-15 chr10 68666046 68666365 + 0.75 NA intron (NM_030625, intron 6 of 11) intron (NM_030625, intron 6 of 11) -55034 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 177.25-6 chr1 176573332 176573691 + 0.75 NA intron (NM_021936, intron 2 of 4) intron (NM_021936, intron 2 of 4) 110336 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 204.75-89 chr4 184531785 184532122 + 0.75 NA intron (NR_147158, intron 1 of 2) L1MA7|LINE|L1 5630 NR_147158 105377585 Hs.519127 NR_147158 ENSG00000271538 LINC02427 - long intergenic non-protein coding RNA 2427 ncRNA 244-63 chrX 113893765 113894368 + 0.75 NA intron (NR_131204, intron 1 of 2) MER50|LTR|ERV1 44152 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 172-34 chr14 55680398 55680839 + 0.75 NA intron (NM_004986, intron 41 of 41) intron (NM_004986, intron 41 of 41) -85627 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 272.75-30 chr20 37225473 37225998 + 0.75 NA exon (NM_001324303, exon 11 of 17) exon (NM_001324303, exon 11 of 17) 31173 NM_001184731 2691 Hs.37023 NM_021081 ENSG00000118702 GHRH GHRF|GRF|INN growth hormone releasing hormone protein-coding 158.5-132 chr3 95178554 95178822 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 240425 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 119.25-164 chr5 101793677 101793922 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 502485 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 121.5-57 chr12 42473267 42473640 + 0.75 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 10162 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 181.75-22 chr11 15113790 15114063 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001042536) promoter-TSS (NM_001042536) -997 NM_001042536 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 209.5-21 chr11 65843113 65843448 + 0.75 NA intron (NM_152760, intron 1 of 12) L1ME3|LINE|L1 9317 NM_152760 254122 Hs.591950 NM_152760 ENSG00000172803 SNX32 SNX6B sorting nexin 32 protein-coding 128.25-89 chr2 23148913 23149191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236127 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 125.75-52 chr14 59313299 59313589 + 0.75 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) intron (NM_001270520, intron 3 of 24) 50003 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 244-20 chr18 65156978 65157440 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -593043 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 179-28 chr12 11483751 11484139 + 0.75 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 2733 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 220.25-14 chr11 41008162 41008521 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L2|LINE|L2 451295 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 176.75-126 chr8 117836237 117836731 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 2 of 10) intron (NM_000127, intron 2 of 10) 84429 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 112.25-81 chr17 79446890 79447180 + 0.75 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 69113 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 170.25-51 chr16 19135286 19135555 + 0.75 NA Intergenic (TATCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21456 NR_028028 162073 Hs.530899 NM_001034841 ENSG00000205730 ITPRIPL2 - ITPRIP like 2 protein-coding 160.75-96 chr22 26965824 26966262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62751 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 120-20 chr10 109478061 109478341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 445045 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 186.5-65 chr2 65391419 65391847 + 0.75 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) -24855 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 190-50 chr4 54617972 54618341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11025 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 116.5-176 chr4 55050060 55050224 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 75453 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 186.25-104 chr6 112504837 112505195 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157686 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 135.75-9 chr1 99764858 99765164 + 0.75 NA intron (NM_001361041, intron 1 of 16) intron (NM_001361041, intron 1 of 16) 782 NM_001013660 391059 Hs.454779 NM_001013660 ENSG00000156869 FRRS1 SDFR2|SDR2 ferric chelate reductase 1 protein-coding 137.5-7 chr1 92612822 92613064 + 0.75 NA intron (NM_001350198, intron 16 of 19) L1MCa|LINE|L1 -126018 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 120.75-161 chr7 110226332 110226674 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -266290 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 121.5-252 chr8 125636625 125636902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 204554 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 178.25-94 chr4 66670800 66671314 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 394233 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 165.75-154 chr7 40512259 40512599 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 377453 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 178.25-111 chr7 89821913 89822369 + 0.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -297259 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 192.5 chr1 43884924 43885255 + 0.75 NA intron (NR_073018, intron 6 of 10) intron (NR_073018, intron 6 of 10) 46467 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 131-175 chr8 92692174 92692479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36832 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 144.5-189 chr6 62454286 62454604 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -168218 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 151.75-118 chr5 143968188 143968558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 156212 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 145.75-28 chr12 82527602 82528024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -159093 NM_152588 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 149.75-50 chr15 61556879 61557252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172853 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 161.25-49 chr14 51022163 51022640 + 0.75 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 73303 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 144.75-68 chr17 43212701 43213037 + 0.75 NA intron (NM_145041, intron 2 of 8) intron (NM_145041, intron 2 of 8) 994 NM_001291587 113277 Hs.536474 NM_145041 ENSG00000184988 TMEM106A - transmembrane protein 106A protein-coding 115.5-18 chr1 210493557 210493826 + 0.75 NA intron (NM_001122834, intron 8 of 11) L2|LINE|L2 164325 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 202.75-4 chr1 111334461 111334800 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -11930 NR_125338 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 216.25-16 chr11 13199768 13200347 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -76595 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 153-159 chr8 112802816 112803123 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 10 of 66) intron (NM_001363185, intron 10 of 66) 159476 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 189.5-33 chr11 102162948 102163267 + 0.75 NA intron (NM_001282097, intron 3 of 7) intron (NM_001282097, intron 3 of 7) 50659 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 134.5-105 chr2 148524357 148524695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120225 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 218-65 chr7 53036999 53037332 + 0.75 NA TTS (NM_182595) TTS (NM_182595) 1532 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 143.25-196 chrX 78071620 78071866 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -32505 NM_000291 5230 Hs.78771 NM_000291 ENSG00000102144 PGK1 HEL-S-68p|MIG10|PGKA phosphoglycerate kinase 1 protein-coding 200-42 chr19 52010627 52011260 + 0.75 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -2713 NM_001321322 284370 Hs.368355 NM_198480 ENSG00000197619 ZNF615 - zinc finger protein 615 protein-coding 121-148 chr4 126298147 126298401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 791015 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 144.5-216 chr8 81698667 81699070 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3810 NM_001010893 347051 Hs.683849 NM_001010893 ENSG00000253598 SLC10A5 P5 solute carrier family 10 member 5 protein-coding 123-185 chr8 87426892 87427198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 446970 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 275.75-33 chr4 22353678 22354244 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -14295 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 124-144 chr6 38376359 38376655 + 0.75 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) intron (NM_052893, intron 7 of 11) -105089 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-16 chr1 185996995 185997274 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 24 of 106) L2|LINE|L2 262743 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 115.5-41 chr12 83717858 83718053 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 1030800 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 174-6 chr1 220505280 220505693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22650 NM_018650 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 231.5-13 chr10 108363829 108364281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -294762 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 136.5-151 chr3 115078789 115079136 + 0.75 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) -7548 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 118.25-35 chr11 12921393 12921730 + 0.75 NA intron (NM_021961, intron 10 of 12) intron (NM_021961, intron 10 of 12) 67987 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 144-64 chr2 166073402 166073709 + 0.75 NA exon (NM_001202435, exon 3 of 28) exon (NM_001202435, exon 3 of 28) -7976 NR_110260 101929680 Hs.662210 NR_110260 ENSG00000236107 SCN1A-AS1 - SCN1A and SCN9A antisense RNA 1 ncRNA 166.5-125 chr22 24782846 24783210 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8308 NR_045649 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 147.75-3 chr1 29405345 29405694 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -55405 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 113.5-142 chr20 48186604 48186845 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -173187 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 208.75-56 chr3 147962233 147962748 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115669 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 163.5-203 chr8 64728469 64728842 + 0.75 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 70082 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 161.5-156 chr5 90235792 90236031 + 0.75 NA intron (NR_120601, intron 3 of 5) intron (NR_120601, intron 3 of 5) 54160 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 150.75-100 chr2 106727621 106727980 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 158228 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 160.75-88 chr20 2999454 2999726 + 0.75 NA intron (NM_080841, intron 8 of 22) L1M5|LINE|L1 -44032 NM_178331 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 186-50 chr2 219365627 219365903 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 21597 NM_001319118 23549 Hs.258551 NM_012100 ENSG00000123992 DNPEP ASPEP|DAP aspartyl aminopeptidase protein-coding 242-32 chr20 41999721 42000209 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -381588 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 131.5-137 chr20 34284785 34285082 + 0.75 NA intron (NM_001362750, intron 9 of 10) MER102a|DNA|hAT-Charlie 18057 NM_001322084 191 Hs.388004 NM_000687 ENSG00000101444 AHCY SAHH|adoHcyase adenosylhomocysteinase protein-coding 129.25-154 chr5 67547591 67548009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98989 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 199.75-6 chr10 65003436 65003816 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -79108 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 145.5-160 chr5 110445922 110446293 + 0.75 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) HAL1|LINE|L1 67808 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 195-10 chr10 49590892 49591258 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -18020 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 178.25-93 chr4 65111665 65112145 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -107405 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 147.25-47 chr17 34823333 34823608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137990 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 121.75-87 chr2 138604002 138604201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102331 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 157.75-27 chr11 43599823 43600203 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 18619 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 151-46 chr17 39166442 39166875 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001143968) promoter-TSS (NM_001143968) -497 NM_001143968 390790 Hs.568007 NM_001143968 ENSG00000141748 ARL5C ARL12 ADP ribosylation factor like GTPase 5C protein-coding 122.75-31 chr11 92782922 92783106 + 0.75 NA intron (NM_001008781, intron 6 of 24) intron (NM_001008781, intron 6 of 24) 132614 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 182.75-73 chr2 224933760 224934117 + 0.75 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) 13111 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 119-33 chr11 124679760 124680103 + 0.75 NA intron (NM_017425, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 -3628 NM_001199922 54414 Hs.10056 NM_018978 ENSG00000110013 SIAE AIS6|CSE-C|CSEC|LSE|YSG2 sialic acid acetylesterase protein-coding 182.75-59 chr18 11660303 11660820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5620 NR_106975 102465690 NR_106975 ENSG00000283492 MIR7153 hsa-mir-7153|mir-7153 microRNA 7153 ncRNA 130.25-178 chr6 120883042 120883418 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 451250 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 145.75-38 chr14 62594969 62595227 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 450360 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 214.75-73 chr6 170192671 170193050 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 32218 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 116-48 chr14 72122199 72122425 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 188785 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 138.75-101 chr2 223115156 223115482 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63389 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 216.5-16 chr11 114852389 114852747 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 174041 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 206-13 chr10 109145609 109146102 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 777391 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 146.5-152 chr4 49153401 49153766 + 0.75 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 166941 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 122.25-196 chr8 117781090 117781347 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 139695 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 129-19 chr10 29597143 29597423 + 0.75 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) MER50B|LTR|ERV1 5063 NR_030634 100126327 NR_030634 ENSG00000216035 MIR938 MIRN938|hsa-mir-938 microRNA 938 ncRNA 172-16 chr10 95975493 95975889 + 0.75 NA intron (NM_001349008, intron 17 of 34) intron (NM_001349008, intron 17 of 34) -24400 NM_001001732 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 121.25-49 chr13 104883811 104884009 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -581957 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 128.25-36 chr12 55074739 55074969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54880 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 236.25-15 chr11 15255262 15255705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106381 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 116.75-18 chr1 225592357 225592598 + 0.75 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) intron (NM_001008493, intron 1 of 14) 60646 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 156.25-138 chr7 33229031 33229525 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) L1MA9|LINE|L1 99714 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 125-170 chrX 73568541 73568848 + 0.75 NA intron (NM_001300884, intron 1 of 4) intron (NM_001300884, intron 1 of 4) 5546 NM_001300884 53344 Hs.496323 NM_001039840 ENSG00000204116 CHIC1 BRX cysteine rich hydrophobic domain 1 protein-coding 155.75-46 chr13 31718363 31718871 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -20909 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 254.5-70 chr7 52696648 52697073 + 0.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -338773 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 176.75-50 chr17 80178436 80178946 + 0.75 NA intron (NM_024110, intron 1 of 20) intron (NM_024110, intron 1 of 20) 183 NM_001257970 79092 Hs.675480 NM_024110 ENSG00000141527 CARD14 BIMP2|CARMA2|PRP|PSORS2|PSS1 caspase recruitment domain family member 14 protein-coding 120-175 chr7 65940232 65940429 + 0.75 NA intron (NM_001284342, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 41883 NM_000181 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 153.5-26 chr10 113961768 113962042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81961 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 245.5-28 chr16 54648901 54649337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199114 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 139.75-14 chr10 52298169 52298539 + 0.75 NA TTS (NM_006258) TTS (NM_006258) 15774 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 249-30 chr21 25370296 25370691 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61208 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 182.5-74 chr2 48407045 48407475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33506 NR_024188 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 164.75-28 chr11 45683526 45683902 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8062 NR_106976 102465691 NR_106976 ENSG00000276639 MIR7154 hsa-mir-7154 microRNA 7154 ncRNA 168.75-17 chr10 14289657 14289889 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) L1MB1|LINE|L1 41111 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 238.75-36 chr22 38574415 38574790 + 0.75 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 4102 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 134.75-107 chr2 64907349 64907735 + 0.75 NA intron (NR_036586, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 24905 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 166.25-146 chr9 20404903 20405246 + 0.75 NA intron (NM_001286691, intron 5 of 10) intron (NM_001286691, intron 5 of 10) 6164 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 185-17 chr13 67780187 67780609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 408011 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 125-95 chr22 41029999 41030209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43617 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 121.75-4 chr1 47890087 47890343 + 0.75 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) intron (NM_001194986, intron 2 of 6) 107170 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 148.75-53 chr14 54338861 54339280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57798 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 137.75-154 chr4 63458176 63458414 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 951155 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 203.25-72 chr3 147656743 147657151 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 235620 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 134.25-58 chr15 86388081 86388281 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 17 of 24) intron (NM_152336, intron 17 of 24) -71213 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 165-140 chr8 82669374 82669693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242571 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 151.25-116 chr22 27946013 27946362 + 0.75 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MEf|LINE|L1 -25575 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 143.75-181 chr8 60200272 60200714 + 0.75 NA intron (NR_135821, intron 9 of 9) intron (NR_135821, intron 9 of 9) 80907 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 114.25-114 chr20 44869988 44870252 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -15585 NM_003404 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 112.25-135 chr3 134836305 134836517 + 0.75 NA intron (NM_004441, intron 1 of 15) UCON107|DNA|hAT-Tag1 41151 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 176.5-80 chr2 10892213 10892599 + 0.75 NA Intergenic (CCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 14139 NR_110575 101929733 Hs.736697 NR_110575 ENSG00000271952 LINC01954 - long intergenic non-protein coding RNA 1954 ncRNA 124-146 chr6 49333889 49334069 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129274 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 155-25 chr11 118048089 118048389 + 0.75 NA intron (NM_001354434, intron 2 of 5) MER113A|DNA|hAT-Charlie -28773 NM_001173551 56649 Hs.161985 NM_019894 ENSG00000137648 TMPRSS4 CAPH2|MT-SP2|TMPRSS3 transmembrane serine protease 4 protein-coding 164.25-20 chr10 88390833 88391229 + 0.75 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) MER20B|DNA|hAT-Charlie 192287 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 136.25-55 chr14 42681002 42681210 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1074250 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 199.5-99 chr3 18389375 18389839 + 0.75 NA intron (NM_001131010, intron 7 of 10) intron (NM_001131010, intron 7 of 10) 35732 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 118-197 chr8 142314873 142315038 + 0.75 NA intron (NM_001366903, intron 8 of 9) intron (NM_001366903, intron 8 of 9) 88227 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 177-70 chr4 63711068 63711478 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 698177 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 134.75-34 chr10 114347057 114347280 + 0.75 NA intron (NM_001001936, intron 1 of 18) intron (NM_001001936, intron 1 of 18) 57334 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 177.75-36 chr13 111916678 111917036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23361 NR_120401 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 205-75 chr8 48695170 48695730 + 0.75 NA non-coding (NR_105002, exon 3 of 4) non-coding (NR_105002, exon 3 of 4) 39818 NR_157027 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 116.25-243 chr9 72768989 72769317 + 0.75 NA intron (NM_138691, intron 12 of 23) MIRc|SINE|MIR 104956 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 167.5-53 chr13 20653497 20653976 + 0.75 NA intron (NR_148462, intron 22 of 28) intron (NR_148462, intron 22 of 28) -49607 NM_138284 53342 Hs.655142 NM_138284 ENSG00000172458 IL17D IL-17D interleukin 17D protein-coding 195-72 chr6 47848371 47848829 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 61532 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 112.25-107 chr2 220588453 220588802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -682062 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 149.5-189 chr7 84974929 84975179 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 146877 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 203.5-87 chr22 40280557 40280883 + 0.75 NA intron (NM_015088, intron 9 of 20) intron (NM_015088, intron 9 of 20) -65780 NM_000026 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 167.75-35 chr11 115654258 115654608 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 80329 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 244.75-63 chr9 106096541 106097132 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 402295 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 220.75-14 chr10 78661117 78661668 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 394050 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 112.25-12 chr1 196514341 196514504 + 0.75 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 68059 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 128-176 chr9 81338323 81338613 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 351067 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 155.25-121 chr3 131394105 131394348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12452 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 116-79 chr2 15768019 15768194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77324 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 165.5-210 chr9 126250923 126251302 + 0.75 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 24803 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 137.25-86 chr20 59485566 59485800 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91826 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 161.5-90 chr2 29846099 29846441 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) L2a|LINE|L2 75316 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 139.25-218 chrX 155653215 155653451 + 0.75 NA intron (NM_001304990, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 -40381 NM_001184797 55217 Hs.133321 NM_018196 ENSG00000185973 TMLHE AUTSX6|BBOX2|TMLD|TMLH|TMLHED|XAP130 trimethyllysine hydroxylase, epsilon protein-coding 169.5-53 chr14 68217409 68217705 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 393965 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 167.75-2 chr1 15918858 15919136 + 0.75 NA exon (NM_015001, exon 7 of 15) exon (NM_015001, exon 7 of 15) 57135 NM_001324138 7709 Hs.433764 NM_003443 ENSG00000116809 ZBTB17 MIZ-1|ZNF151|ZNF60|pHZ-67 zinc finger and BTB domain containing 17 protein-coding 133.75-138 chr3 123462706 123463115 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14365 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 224.5-30 chr12 64045793 64046471 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 6 of 21) L2a|LINE|L2 176164 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 219-4 chr1 88053949 88054266 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -630037 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 129.25-184 chr7 51215195 51215387 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 2 of 12) intron (NM_015198, intron 2 of 12) 101518 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 243-76 chr8 129409258 129409695 + 0.75 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 74666 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 128.25-61 chr15 99513848 99514044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51471 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 126.5-45 chr12 1640792 1641061 + 0.75 NA intron (NM_032642, intron 4 of 4) intron (NM_032642, intron 4 of 4) 11695 NM_032642 81029 Hs.306051 NM_030775 ENSG00000111186 WNT5B - Wnt family member 5B protein-coding 146.75-124 chr5 63404693 63405091 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 557400 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 164.75-116 chr5 119340246 119340620 + 0.75 NA intron (NM_001286814, intron 1 of 1) intron (NM_001286814, intron 1 of 1) 7258 NM_001286814 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 152.25-99 chr22 35129360 35129692 + 0.75 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) AluY|SINE|Alu 63368 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 174.75-71 chr20 45112293 45112690 + 0.75 NA intron (NM_145652, intron 1 of 3) intron (NM_145652, intron 1 of 3) 2683 NM_145652 149708 Hs.375031 NM_145652 ENSG00000175121 WFDC5 PRG5|WAP1|dJ211D12.5 WAP four-disulfide core domain 5 protein-coding 171.25-96 chr3 29449977 29450328 + 0.75 NA intron (NM_001003792, intron 2 of 13) intron (NM_001003792, intron 2 of 13) 168840 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 152-150 chr8 124115485 124115856 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 39 of 40) MIRb|SINE|MIR 55852 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 119-3 chr1 106281542 106281766 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -253401 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 130.25-193 chr7 131972583 131972901 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 62522 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 126-178 chr8 130069508 130069786 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 27 of 29) U6|snRNA|snRNA 15121 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 132.75 chr1 8536469 8536669 + 0.75 NA intron (NM_001042681, intron 7 of 22) intron (NM_001042681, intron 7 of 22) -41656 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 136.5-214 chr7 69908131 69908540 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 309860 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 121-22 chr10 52419987 52420198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35180 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 165.25-83 chr21 32644548 32644770 + 0.75 NA intron (NM_203446, intron 26 of 32) intron (NM_203446, intron 26 of 32) -31788 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 151-65 chr2 123176087 123176416 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102770 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 165.5-22 chr10 91466938 91467205 + 0.75 NA intron (NM_182765, intron 5 of 20) L1PA13|LINE|L1 56786 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 123.5-115 chr2 229307225 229307424 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -36037 NM_001100818 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 168.75-72 chr2 80318800 80319105 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 5573 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 165-102 chr4 30650742 30651097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69450 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 219.75-78 chr7 57997918 57998333 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 547948 NM_001159279 441234 Hs.533121 NM_001159279 ENSG00000182111 ZNF716 - zinc finger protein 716 protein-coding 179.5-22 chr10 63159820 63160257 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26710 NM_030759 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 124.75-24 chr10 13123993 13124294 + 0.75 NA intron (NM_001008213, intron 10 of 15) intron (NM_001008213, intron 10 of 15) 23980 NM_001008212 10133 Hs.332706 NM_021980 ENSG00000123240 OPTN ALS12|FIP2|GLC1E|HIP7|HYPL|NRP|TFIIIA-INTP optineurin protein-coding 144.25-147 chr4 91107943 91108249 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 873065 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 130.25-183 chr7 19698277 19698593 + 0.75 NA exon (NM_001002926, exon 4 of 4) exon (NM_001002926, exon 4 of 4) 7001 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 172.75-69 chr2 173513817 173514219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 159146 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 162.25-123 chr5 3432647 3432983 + 0.75 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) intron (NR_033898, intron 2 of 4) -20001 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 176.75-96 chr4 169100903 169101199 + 0.75 NA intron (NM_020870, intron 11 of 11) L2c|LINE|L2 -90796 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 142.25-166 chr8 100142117 100142403 + 0.75 NA intron (NM_001029860, intron 1 of 4) intron (NM_001029860, intron 1 of 4) 3557 NR_036491 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 121.5-228 chr6 94282094 94282336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 563912 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 124.25-103 chr2 174445486 174445692 + 0.75 NA intron (NM_001267051, intron 11 of 14) intron (NM_001267051, intron 11 of 14) 41440 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 221.5-57 chr20 35936724 35937097 + 0.75 NA intron (NM_016436, intron 15 of 17) MER4D1|LTR|ERV1 17716 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 217.25-58 chr4 48202392 48202749 + 0.75 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) intron (NM_003215, intron 2 of 17) 67268 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 130.5-156 chr22 18058226 18058483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19566 NM_001199319 55670 Hs.517400 NM_017929 ENSG00000215193 PEX26 PBD7A|PBD7B|PEX26M1T|Pex26pM1T peroxisomal biogenesis factor 26 protein-coding 139.75-87 chr19 6727185 6727495 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6690 NM_000064 718 Hs.529053 NM_000064 ENSG00000125730 C3 AHUS5|ARMD9|ASP|C3a|C3b|CPAMD1|HEL-S-62p complement C3 protein-coding 116-3 chr1 58814957 58815207 + 0.75 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 29931 NR_034014 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 127.5-53 chr12 26297754 26298001 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102304 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 174.75-40 chr16 78408723 78409005 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 5 of 7) intron (NM_001291997, intron 5 of 7) 309210 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 175-128 chr8 60540849 60541158 + 0.75 NA intron (NM_001242644, intron 1 of 6) L1MC3|LINE|L1 24016 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 212.25-38 chr18 7771072 7771639 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 204039 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 189.75-39 chr15 54124641 54125098 + 0.75 NA intron (NM_001329919, intron 2 of 31) L1MD2|LINE|L1 112221 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 139.75-82 chr18 6591237 6591548 + 0.75 NA TTS (NR_120518) TTS (NR_120518) 79976 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 116.25-221 chr8 19233319 19233640 + 0.75 NA intron (NR_038919, intron 2 of 4) G-rich|Low_complexity|Low_complexity 12043 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 126-11 chr1 177799817 177800023 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 99396 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 243.25-54 chr8 49825486 49826146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83980 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 148-58 chr2 84076167 84076579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -214309 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 135.75-18 chr10 29613351 29613771 + 0.75 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) AluJo|SINE|Alu -11215 NR_030634 100126327 NR_030634 ENSG00000216035 MIR938 MIRN938|hsa-mir-938 microRNA 938 ncRNA 181.5-18 chr10 124934341 124934723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7591 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 205-42 chr2 194237472 194237898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106584 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 150.5-136 chr3 127380836 127381136 + 0.75 NA intron (NR_110147, intron 1 of 4) intron (NR_110147, intron 1 of 4) 9684 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 145-6 chr1 74976845 74977155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151434 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 154.25-161 chr7 103947822 103948159 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) intron (NM_005045, intron 1 of 64) 41526 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 136.5-18 chr10 31367776 31368188 + 0.75 NA intron (NM_001368169, intron 1 of 1) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31773 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 135.5-36 chr11 66069294 66069590 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_018026) promoter-TSS (NM_018026) -830 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 128.25-32 chr12 34709211 34709505 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 686862 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 126-61 chr15 57973392 57973697 + 0.75 NA intron (NM_170696, intron 6 of 11) intron (NM_170696, intron 6 of 11) 40479 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 240.25-61 chr7 41362219 41362863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 260937 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 170.25-94 chr3 33300064 33300398 + 0.75 NA intron (NM_001349322, intron 3 of 12) intron (NM_001349322, intron 3 of 12) 22789 NM_001349324 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 171-50 chr17 28926002 28926454 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_110803) promoter-TSS (NR_110803) -47 NR_110803 101927018 Hs.665702 NR_110803 ENSG00000265845 LOC101927018 - uncharacterized LOC101927018 ncRNA 185-49 chr20 51907211 51907699 + 0.75 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie -44542 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 120.75-90 chr20 12282162 12282385 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 364380 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 193-20 chr14 49921312 49921750 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28449 NM_001663 382 Hs.525330 NM_001663 ENSG00000165527 ARF6 - ADP ribosylation factor 6 protein-coding 173.75-15 chr1 176776652 176777082 + 0.75 NA intron (NM_020318, intron 17 of 22) (ATTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 252578 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 136-71 chr2 66093811 66093998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 264424 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 150.5-72 chr18 56093394 56093643 + 0.75 NA intron (NR_040026, intron 5 of 8) intron (NR_040026, intron 5 of 8) 44018 NR_040026 100505474 Hs.662191 NR_040025 ENSG00000267712 LINC01539 - long intergenic non-protein coding RNA 1539 ncRNA 145-96 chr3 24485321 24485616 + 0.75 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 -8619 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 132-83 chr19 36166778 36167018 + 0.75 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -14451 NM_001864 1346 Hs.421621 NM_001864 ENSG00000161281 COX7A1 COX7A|COX7AH|COX7AM cytochrome c oxidase subunit 7A1 protein-coding 143.5-170 chr5 37623095 37623441 + 0.75 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 211554 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 178.25-117 chr8 79947168 79947617 + 0.75 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 -75655 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 206.25-29 chr12 81719399 81719777 + 0.75 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) intron (NM_003625, intron 3 of 32) 38919 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 164.75-150 chr8 138994709 138995156 + 0.75 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -80891 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 171-78 chr20 305704 306002 + 0.75 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 8283 NM_033089 85364 Hs.28608 NM_033089 ENSG00000247315 ZCCHC3 C20orf99 zinc finger CCHC-type containing 3 protein-coding 124.25-51 chr14 44925781 44926073 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001308112, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001308112, exon 5 of 5) -14010 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 113.25-100 chr20 55354639 55354961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68243 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 178.5-187 chr8 130205132 130205571 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 91182 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 194.75-45 chr19 36369767 36370204 + 0.75 NA intron (NM_001297619, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 9216 NM_020917 57677 Hs.35524 NM_020917 ENSG00000142065 ZFP14 ZNF531 ZFP14 zinc finger protein protein-coding 116.5-147 chr22 22069041 22069236 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25204 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 154.25-33 chr12 10710337 10710717 + 0.75 NA intron (NM_003651, intron 5 of 9) intron (NM_003651, intron 5 of 9) 12796 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 113.5-149 chr22 38596198 38596403 + 0.75 NA intron (NM_001013647, intron 15 of 16) AluSx|SINE|Alu 25800 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 121.75-14 chr10 63115031 63115302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18081 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 120.5-180 chr5 46118242 46118468 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -421975 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 122-57 chr14 64514753 64515009 + 0.75 NA intron (NR_110550, intron 3 of 3) intron (NR_110550, intron 3 of 3) -9668 NM_001304508 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 217.75-45 chr20 63248515 63248990 + 0.75 NA intron (NM_001363747, intron 3 of 6) intron (NM_001363747, intron 3 of 6) 4743 NM_001363718 128414 Hs.46627 NM_152864 ENSG00000101198 NKAIN4 C20orf58|FAM77A|bA261N11.2 sodium/potassium transporting ATPase interacting 4 protein-coding 135-168 chr7 65435167 65435497 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 61477 NM_152626 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 199.5-18 chr10 69059029 69059407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28385 NM_001321053 5552 Hs.1908 NM_002727 ENSG00000122862 SRGN PPG|PRG|PRG1 serglycin protein-coding 136.25-131 chr4 88515841 88516186 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 7763 NM_032906 100996939 Hs.26136 NM_032906 ENSG00000145337 PYURF PREY PIGY upstream reading frame protein-coding 158.25-2 chr1 72952844 72953300 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -353098 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 126.75-207 chr5 159048877 159049150 + 0.75 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 48943 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 115.25-110 chr2 165111828 165112198 + 0.75 NA intron (NM_006922, intron 21 of 27) intron (NM_006922, intron 21 of 27) 92037 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 143-25 chr12 29647528 29647983 + 0.75 NA intron (NM_175861, intron 5 of 17) intron (NM_175861, intron 5 of 17) 136187 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 143.75-89 chr2 66223245 66223596 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 134908 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 139.5-205 chr7 130822886 130823135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53800 NR_029503 407021 NR_029503 ENSG00000284032 MIR29A MIRN29|MIRN29A|hsa-mir-29|hsa-mir-29a|miRNA29A|mir-29a microRNA 29a ncRNA 165.5-61 chr17 10720453 10720741 + 0.75 NA intron (NM_001330140, intron 3 of 3) L1MC5|LINE|L1 -4015 NR_049723 100506898 Hs.674373 NR_049723 MAGOH2P MAGOH2 mago homolog 2, pseudogene pseudo 207.5-81 chr5 35381677 35382100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151401 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 186.25-16 chr11 78409261 78409560 + 0.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) AluSp|SINE|Alu 8410 NM_080491 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 160-57 chr2 146380853 146381242 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -206010 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 193-59 chr3 193294738 193295070 + 0.75 NA intron (NM_198505, intron 25 of 29) MER47B|DNA|TcMar-Tigger -12340 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-191 chr8 53016568 53016881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76816 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 114.25-174 chr7 6338065 6338306 + 0.75 NA intron (NM_001037163, intron 1 of 1) intron (NM_001037163, intron 1 of 1) 10782 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 140.75-105 chr2 185732444 185732774 + 0.75 NA intron (NR_110217, intron 1 of 2) intron (NR_110217, intron 1 of 2) 6110 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 139.75-134 chr4 65240595 65240977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236286 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 127.25-45 chr12 46913838 46914090 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -87967 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 135.5-213 chr9 32245493 32245851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138931 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 136.5-163 chr4 41136782 41137035 + 0.75 NA intron (NM_173075, intron 2 of 16) intron (NM_173075, intron 2 of 16) 77634 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 133-19 chr11 24196235 24196434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -300719 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 175-12 chr10 47080560 47080883 + 0.75 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 168999 NM_001320683 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 131.5-4 chr1 92031441 92031676 + 0.75 NA intron (NM_173567, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR 1573 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 161.75-21 chr10 52427753 52428027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27382 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 254.5-47 chr2 216230515 216231136 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 13936 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 214.5-128 chr8 114254320 114254871 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -817656 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 120-14 chr10 52655193 52655395 + 0.75 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 100110 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 115.25-4 chr1 37454969 37455140 + 0.75 NA non-coding (NR_038842, exon 3 of 3) non-coding (NR_038842, exon 3 of 3) 19389 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 118.75-46 chr12 74029278 74029597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 263194 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 115.5-77 chr15 64261822 64262013 + 0.75 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) AluSg|SINE|Alu 94256 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 177-25 chr13 34711598 34712145 + 0.75 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -71186 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 143.75-53 chr15 38170967 38171390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81658 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 120.75-85 chr2 209526761 209526976 + 0.75 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -52468 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 186-15 chr11 9068793 9069315 + 0.75 NA intron (NM_001367977, intron 5 of 22) intron (NM_001367977, intron 5 of 22) 21325 NR_049874 100847015 NR_049874 ENSG00000264984 MIR5691 - microRNA 5691 ncRNA 132-99 chr21 24806021 24806329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34375 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 134.75-168 chr4 162179266 162179548 + 0.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -15373 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 125-122 chr5 10684465 10684634 + 0.75 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 76685 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 134.5-143 chr3 179014782 179015005 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56916 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 145.5-67 chr14 72901379 72901626 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7386 NM_001280543 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 187-57 chr21 25237079 25237549 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 194387 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 177.5-44 chr14 39675661 39676126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -243393 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 134.25-47 chr14 41920534 41920896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313859 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 240.25-39 chr20 32260459 32261086 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16879 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 133.75-139 chr3 141722515 141722812 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15546 NR_037703 9616 Hs.134623 NM_014245 ENSG00000114125 RNF7 CKBBP1|ROC2|SAG|rbx2 ring finger protein 7 protein-coding 117.25-160 chr4 111845129 111845315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -300232 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 129.75-57 chr13 65557184 65557450 + 0.75 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -308730 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 221-32 chr19 38829491 38829896 + 0.75 NA intron (NM_001398, intron 3 of 9) AluY|SINE|Alu 2101 NM_001398 1891 Hs.196176 NM_001398 ENSG00000104823 ECH1 HPXEL enoyl-CoA hydratase 1 protein-coding 126.5-209 chr6 93847842 93848070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129653 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 168.5-92 chr2 174508099 174508543 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -21233 NM_001267051 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 184.75-10 chr10 82166205 82166554 + 0.75 NA intron (NR_163251, intron 2 of 9) L1ME4b|LINE|L1 66541 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 132.75-44 chr11 129229602 129229804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37505 NM_001142685 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 175.75-12 chr1 206770153 206770625 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_153758) promoter-TSS (NM_153758) -384 NM_153758 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 114.5-260 chr8 81273711 81274010 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -6676 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 214-34 chr2 161046302 161046879 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -90365 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 202.5-82 chr2 182826892 182827198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39592 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 159.25-124 chr6 39614131 39614445 + 0.75 NA intron (NM_001289020, intron 5 of 21) intron (NM_001289020, intron 5 of 21) 111120 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 179.25-17 chr10 54067805 54068114 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 18 of 34) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -418271 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 231.5-2 chr1 81049076 81049427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -256941 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 140-9 chr1 162059720 162059971 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9846 NM_001164757 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 170.25-9 chr10 23370056 23370360 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -25411 NM_153714 256815 Hs.132442 NM_153714 ENSG00000179133 C10orf67 C10orf115|LINC01552 chromosome 10 open reading frame 67 protein-coding 116.25-198 chr6 125711734 125711898 + 0.75 NA intron (NR_038906, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 37463 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 159.25-31 chr12 55842802 55843025 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_073606) promoter-TSS (NR_073606) 23 NR_073606 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 201.25-59 chr22 33506183 33506744 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -69794 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 142-123 chr4 169585303 169585673 + 0.75 NA exon (NM_001199398, exon 10 of 35) exon (NM_001199398, exon 10 of 35) 27095 NM_012224 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 127.25-74 chr17 60741685 60742033 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) L1ME3A|LINE|L1 64008 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 115.25-138 chr3 112717755 112717979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19222 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 113-59 chr13 93572388 93572624 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) MER5A|DNA|hAT-Charlie 285967 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 263-6 chr10 98197377 98197898 + 0.75 NA intron (NM_001256620, intron 3 of 8) intron (NM_001256620, intron 3 of 8) 62980 NM_001351016 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 187-65 chr3 151545215 151545658 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20559 NR_049818 100847036 NR_049818 ENSG00000264330 MIR5186 - microRNA 5186 ncRNA 148-78 chr3 6499661 6499927 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 305655 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 239.25-53 chr2 202686051 202686577 + 0.75 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 51345 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 157.5-123 chr20 47176478 47176716 + 0.75 NA intron (NM_172110, intron 12 of 13) intron (NM_172110, intron 12 of 13) 9630 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 209-8 chr10 60566800 60567226 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 5943 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 137.75-14 chr1 195468146 195468596 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 620344 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 160.5-159 chr6 14291518 14291949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6279 NR_108097 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 123-89 chr18 36282812 36283180 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -14717 NM_001281739 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 181-120 chrX 72567318 72567807 + 0.75 NA TTS (NM_001166420) TTS (NM_001166420) 5281 NR_051952 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 133-67 chr17 78125080 78125329 + 0.75 NA exon (NM_001127198, exon 6 of 20) exon (NM_001127198, exon 6 of 20) 3590 NM_001321185 11322 Hs.632227 NM_007267 ENSG00000141524 TMC6 EV1|EVER1|EVIN1|LAK-4P transmembrane channel like 6 protein-coding 157.5-20 chr10 35446359 35446703 + 0.75 NA intron (NM_001282853, intron 2 of 10) intron (NM_001282853, intron 2 of 10) 109657 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 184-92 chr8 105969499 105969773 + 0.75 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1PREC2|LINE|L1 90867 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 231.25-68 chr6 61859528 61859969 + 0.75 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 285618 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 128.25-21 chr11 47920441 47920733 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59972 NM_002843 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 330-6 chr12 30503927 30504940 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 172811 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 221-73 chr7 13887073 13887430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 99263 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 140.25-17 chr1 245852372 245852621 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 10 of 11) intron (NM_022743, intron 10 of 11) 564916 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 127.75-17 chr1 89893458 89893664 + 0.75 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 71622 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 116.5-195 chr5 33792684 33793018 + 0.75 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) MER91A|DNA|hAT-Tip100 99139 NM_030955 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 121.5-233 chr7 4187863 4188190 + 0.75 NA intron (NM_001079653, intron 9 of 19) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -53189 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 121.25-63 chr15 52074139 52074490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38461 NM_001306168 10017 Hs.283672 NM_020396 ENSG00000137875 BCL2L10 BCL-B|Boo|Diva|bcl2-L-10 BCL2 like 10 protein-coding 145.25-42 chr14 79026351 79026639 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) (AAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -173487 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 162.5-119 chr3 182753420 182753729 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -39930 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 196.25-7 chr1 197638959 197639242 + 0.75 NA intron (NR_125340, intron 9 of 19) AluSx|SINE|Alu 136380 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 171-39 chr15 23554530 23554860 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 7436 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 215.25-46 chr2 51695431 51695819 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 663024 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 191.25-23 chr12 12657252 12657612 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 38751 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 167.75-118 chr5 155543371 155543798 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 529829 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 158.5-125 chr3 3683200 3683545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116059 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 250-6 chr10 81907785 81908166 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 30288 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 212.75-85 chr5 173360764 173361148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13501 NR_107023 102465862 NR_107023 ENSG00000274994 MIR8056 hsa-mir-8056 microRNA 8056 ncRNA 163.5-138 chr4 29313147 29313489 + 0.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 99026 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 135.25-203 chr8 129054071 129054290 + 0.75 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -88179 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 228.25-55 chr4 43551299 43551751 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -58982 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 144-147 chr9 69940025 69940244 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -103447 NM_001347990 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 164.25-105 chr3 182062496 182063038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110403 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 172.5-206 chr8 134822990 134823301 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14924 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 151.5-63 chr17 27844831 27845153 + 0.75 NA Intergenic LTR39-int|LTR|ERV1 -44463 NM_000625 4843 Hs.709191 NM_000625 ENSG00000007171 NOS2 HEP-NOS|INOS|NOS|NOS2A nitric oxide synthase 2 protein-coding 160.25-10 chr10 56927521 56927848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 376875 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 213.75-99 chr6 153046778 153047126 + 0.75 NA intron (NM_012419, intron 1 of 4) L1MEi|LINE|L1 -44137 NM_001301872 54516 Hs.225836 NM_019041 ENSG00000112031 MTRF1L HMRF1L|MRF1L|mtRF1a mitochondrial translational release factor 1 like protein-coding 211.5-34 chr12 8558865 8559186 + 0.75 NA Intergenic HERVK22-int|LTR|ERVK -18120 NM_014358 26253 Hs.236516 NM_014358 ENSG00000166523 CLEC4E CLECSF9|MINCLE C-type lectin domain family 4 member E protein-coding 151-75 chr22 26984467 26984731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75919 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 176.75-88 chr4 41206955 41207378 + 0.75 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) AluSx1|SINE|Alu 7376 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 159.25-110 chr4 146659821 146660150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21092 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 213.5-96 chr4 162187953 162188298 + 0.75 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -24091 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 199-19 chr12 61875800 61876201 + 0.75 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 316839 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 118.25-187 chr7 80517534 80517878 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5642 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 177.25-125 chr6 49663191 49663501 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26472 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 176.75-65 chr2 112223798 112224198 + 0.75 NA intron (NM_032494, intron 8 of 8) AluSx1|SINE|Alu 31044 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 147.5-101 chr2 86000515 86000874 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105192 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 144.25-218 chr9 1271747 1272042 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 220407 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 155.75-77 chr2 27931552 27931965 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) intron (NM_199193, intron 4 of 13) -40644 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 167.75-24 chr10 82947438 82947804 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) L1ME1|LINE|L1 -714701 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 192-105 chr9 30736786 30737187 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -328532 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 155.25-47 chr12 27856001 27856253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75894 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 203.25-99 chr7 102182466 102183050 + 0.75 NA intron (NM_001913, intron 11 of 22) intron (NM_001913, intron 11 of 22) -102383 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 165-69 chr2 75015295 75015620 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 56814 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 124.5-77 chr16 79064915 79065125 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 535717 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 131.75-217 chr8 109846649 109847008 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 128943 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 172.25-103 chr4 124993372 124993684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -280796 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 152-155 chr9 22146187 22146497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137029 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 113.25-2 chr1 17447805 17448135 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8293 NM_018715 55920 Hs.380857 NM_018715 ENSG00000179051 RCC2 TD-60 regulator of chromosome condensation 2 protein-coding 158.5-196 chr8 121347489 121347754 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -291725 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 216.5-77 chr3 78526712 78527152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -477969 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 161-83 chr4 108990567 108990922 + 0.75 NA intron (NM_198721, intron 5 of 36) MIRb|SINE|MIR -227691 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 133.75-104 chr2 150998575 150998903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 263124 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 182.5-56 chr15 62051109 62051572 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 1 of 81) MIRc|SINE|MIR 9107 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 134.25-80 chr2 57918618 57918888 + 0.75 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) 11102 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 136.5-113 chr2 88705909 88706219 + 0.75 NA intron (NM_144563, intron 3 of 8) L1PA10|LINE|L1 14391 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 162.75-72 chr2 134919773 134920052 + 0.75 NA intron (NR_135468, intron 2 of 9) intron (NR_135468, intron 2 of 9) 1090 NM_001320748 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 163.25-77 chr20 32040928 32041263 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11147 NM_001172132 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 144.25-70 chr16 50817407 50817629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10846 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 204.25-62 chr20 13303539 13303952 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64058 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 175-120 chr7 54978058 54978409 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40784 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 153.75-86 chr3 52275066 52275451 + 0.75 NA intron (NM_025222, intron 1 of 8) intron (NM_025222, intron 1 of 8) 3391 NM_025222 80335 Hs.194110 NM_025222 ENSG00000164091 WDR82 MST107|MSTP107|PRO2730|PRO34047|SWD2|TMEM113|WDR82A WD repeat domain 82 protein-coding 147.75-87 chr20 40837348 40837625 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -122863 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 156.25-2 chr1 66342535 66342811 + 0.75 NA intron (NM_001037339, intron 1 of 9) AluSq|SINE|Alu 10565 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 146.5-112 chr2 148320363 148320728 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) AluJb|SINE|Alu -298941 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 159.5-14 chr1 231048634 231048959 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8542 NM_198552 375061 Hs.38516 NM_198552 ENSG00000182118 FAM89A C1orf153 family with sequence similarity 89 member A protein-coding 138.75-48 chr14 38654705 38654959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -227764 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 118.5-42 chr12 40010615 40010794 + 0.75 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 95377 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 185.75-9 chr1 187927910 187928297 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 484475 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 129.5-85 chr15 96025466 96025742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102237 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 137.5-94 chr17 34437738 34438176 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74724 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 202.75-47 chr18 5185907 5186317 + 0.75 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) L1PA15|LINE|L1 11145 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 135.25-153 chr5 10376556 10376888 + 0.75 NA intron (NM_001270661, intron 1 of 22) SSU-rRNA_Hsa|rRNA|rRNA 23027 NM_005885 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 155.25-139 chr5 44419366 44419611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30068 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 121.75-99 chr20 36371882 36372087 + 0.75 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) intron (NM_001365621, intron 2 of 12) 65645 NM_014902 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 130.25-204 chr8 118575195 118575401 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -45703 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 160.5-27 chr11 77193739 77194091 + 0.75 NA intron (NM_001127180, intron 31 of 48) intron (NM_001127180, intron 31 of 48) 65669 NM_000260 4647 Hs.370421 NM_000260 ENSG00000137474 MYO7A DFNA11|DFNB2|MYOVIIA|MYU7A|NSRD2|USH1B myosin VIIA protein-coding 287.5-4 chr1 166924196 166924793 + 0.75 NA intron (NM_199351, intron 7 of 9) intron (NM_199351, intron 7 of 9) -48230 NM_053053 117143 Hs.435967 NM_053053 ENSG00000152382 TADA1 ADA1|HFI1|STAF42|TADA1L|hADA1 transcriptional adaptor 1 protein-coding 132.75-16 chr1 226902192 226902533 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 31746 NM_000447 5664 Hs.25363 NM_000447 ENSG00000143801 PSEN2 AD3L|AD4|CMD1V|PS2|STM2 presenilin 2 protein-coding 126-119 chr3 113937166 113937436 + 0.75 NA intron (NM_001172105, intron 9 of 12) intron (NM_001172105, intron 9 of 12) -10600 NM_001363952 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 172.5-203 chr8 130071049 130071409 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 27 of 29) FLAM_C|SINE|Alu 13539 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 232.75-26 chr15 94412978 94413423 + 0.75 NA intron (NM_001159643, intron 16 of 19) intron (NM_001159643, intron 16 of 19) 57270 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 158.75-26 chr10 124926548 124926827 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -15436 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 154-23 chr10 123287147 123287557 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 132950 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 210.5-70 chr2 215374754 215375184 + 0.75 NA intron (NM_212482, intron 38 of 45) intron (NM_212482, intron 38 of 45) 61099 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 212.75-8 chr1 151904292 151904844 + 0.75 NA intron (NM_053055, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 4943 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 193.75-124 chr8 123835528 123835980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16233 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 283.25-34 chr5 33000788 33001483 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 53692 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 222-56 chr3 184135754 184136133 + 0.75 NA intron (NM_003907, intron 1 of 15) intron (NM_003907, intron 1 of 15) 585 NM_003907 8893 Hs.283551 NM_003907 ENSG00000145191 EIF2B5 CACH|CLE|EIF-2B|EIF2Bepsilon|LVWM eukaryotic translation initiation factor 2B subunit epsilon protein-coding 128.5-215 chr7 125142478 125142730 + 0.75 NA intron (NR_125719, intron 7 of 7) intron (NR_125719, intron 7 of 7) -41965 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 175-26 chr11 100915129 100915455 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 7 of 25) intron (NM_001367945, intron 7 of 25) -18982 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 172-3 chr1 37595914 37596240 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001323623) promoter-TSS (NM_001323623) -92 NM_001323623 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 210-27 chr14 24167696 24168122 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4171 NM_005132 9985 Hs.419259 NM_005132 ENSG00000100918 REC8 HR21spB|REC8L1|Rec8p REC8 meiotic recombination protein protein-coding 113.75-109 chr2 203676093 203676349 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30254 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 180.5-89 chr22 28275301 28275767 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -184335 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 121.75-169 chr7 9791509 9791761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157365 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 142-133 chr5 132898519 132898807 + 0.75 NA intron (NM_014423, intron 9 of 20) AluSx1|SINE|Alu 24995 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 154-132 chr9 98448436 98448679 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 7 of 18) AluJb|SINE|Alu -192908 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 119.75-51 chr13 64276848 64277179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -201002 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 213.75-83 chr5 2209242 2209585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102788 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 158.25-4 chr1 113082407 113082663 + 0.75 NA intron (NM_014813, intron 1 of 17) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 9337 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 122.5-79 chr17 12171172 12171426 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 89400 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 155.75-22 chr10 96010990 96011293 + 0.75 NA intron (NM_001159747, intron 4 of 11) intron (NM_001159747, intron 4 of 11) 11050 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 279.5-67 chr8 86141246 86141881 + 0.75 NA intron (NM_152565, intron 4 of 7) intron (NM_152565, intron 4 of 7) 42653 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 119.25-118 chr22 40556560 40556903 + 0.75 NA intron (NM_020831, intron 2 of 14) intron (NM_020831, intron 2 of 14) -22904 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 122-114 chr3 47098962 47099165 + 0.75 NA intron (NR_146158, intron 8 of 21) intron (NR_146158, intron 8 of 21) 64914 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 183-30 chr14 81145483 81145843 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000369, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_000369, exon 10 of 10) 57171 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 135-180 chr8 58832246 58832465 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 5 of 8) intron (NM_014729, intron 5 of 8) -172502 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 185-19 chr14 22953552 22953932 + 0.75 NA intron (NM_017815, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 3287 NR_039856 100616424 NR_039856 ENSG00000284118 MIR4707 mir-4707 microRNA 4707 ncRNA 176-53 chr4 54057729 54058084 + 0.75 NA intron (NM_012110, intron 1 of 5) intron (NM_012110, intron 1 of 5) 6699 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 128.5-189 chr6 52319061 52319271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34424 NR_158964 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 280.5-36 chr3 96565753 96566446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 206135 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 133.75-160 chr5 31782201 31782464 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) MER53|DNA|hAT 143201 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 148.75-83 chr2 55188841 55189237 + 0.75 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 -42864 NM_001135592 6233 Hs.311640 NM_002954 ENSG00000143947 RPS27A CEP80|HEL112|S27A|UBA80|UBC|UBCEP1|UBCEP80 ribosomal protein S27a protein-coding 235.75-72 chr7 92338189 92338633 + 0.75 NA intron (NM_019004, intron 5 of 19) AluJb|SINE|Alu -92311 NM_001350679 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 167-30 chr12 24557999 24558389 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 4297 NM_152989 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 128.5-57 chr13 44500139 44500374 + 0.75 NA intron (NM_183422, intron 1 of 2) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -25955 NM_001243798 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 136-113 chr4 77857250 77857503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5454 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 255.75-32 chr3 124761959 124762643 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001354765, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001354765, exon 15 of 15) 29862 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 147.5-118 chr2 227991493 227991828 + 0.75 NA intron (NM_030623, intron 8 of 10) intron (NM_030623, intron 8 of 10) 120029 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 122-14 chr1 113258489 113258808 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -52395 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 204.25-114 chr8 30054979 30055430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27860 NM_016127 51669 Hs.521487 NM_016127 ENSG00000133872 SARAF FOAP-7|HSPC035|TMEM66|XTP3 store-operated calcium entry associated regulatory factor protein-coding 144.25-220 chr9 37894909 37895224 + 0.75 NA intron (NM_033412, intron 2 of 2) L1PA13|LINE|L1 9061 NM_033412 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 133.5-247 chr7 44113798 44114045 + 0.75 NA TTS (NM_001127218) TTS (NM_001127218) 3072 NR_039792 100616346 NR_039792 ENSG00000284412 MIR4649 mir-4649 microRNA 4649 ncRNA 126.25-166 chr5 125956840 125957106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222604 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 156-31 chr12 32176971 32177402 + 0.75 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu 70339 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 134.5-70 chr14 87578380 87578576 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76816 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 114.25-145 chr5 6613554 6613758 + 0.75 NA intron (NM_017755, intron 9 of 18) intron (NM_017755, intron 9 of 18) 19388 NM_017755 54888 Hs.481526 NM_017755 ENSG00000037474 NSUN2 MISU|MRT5|SAKI|TRM4 NOP2/Sun RNA methyltransferase 2 protein-coding 274-30 chr4 30693558 30694136 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -26522 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 144.75-71 chr17 82286117 82286464 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 6524 NR_135639 101929511 Hs.147682 NR_135639 ENSG00000265692 LINC01970 - long intergenic non-protein coding RNA 1970 ncRNA 134.5-108 chr2 186115314 186115579 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -29129 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 133.25-132 chr3 50703389 50703726 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) L1MA4|LINE|L1 28477 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 171.5-146 chr8 60725781 60726209 + 0.75 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) -15264 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 139.75-74 chr17 42443608 42443933 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -15108 NM_005177 535 Hs.463074 NM_005177 ENSG00000033627 ATP6V0A1 ATP6N1|ATP6N1A|Stv1|VPP1|Vph1|a1 ATPase H+ transporting V0 subunit a1 protein-coding 190.75-46 chr18 21362180 21362775 + 0.75 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 120235 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 135.5-126 chr21 18484394 18484635 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80729 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 123.5-22 chr10 22068813 22069187 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -65270 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 185.75-81 chr21 29987611 29988011 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -47759 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 222.75-48 chr17 47977370 47977798 + 0.75 NA intron (NM_176096, intron 9 of 13) intron (NM_176096, intron 9 of 13) 6471 NM_001278198 80279 Hs.20157 NM_025197 ENSG00000108465 CDK5RAP3 C53|HSF-27|IC53|LZAP|MST016|OK/SW-cl.114|PP1553 CDK5 regulatory subunit associated protein 3 protein-coding 120.75-20 chr10 92161341 92161662 + 0.75 NA intron (NM_001178137, intron 4 of 9) AluSq2|SINE|Alu 81778 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 194.75-17 chr11 31601045 31601304 + 0.75 NA intron (NM_001288726, intron 4 of 11) intron (NM_001288726, intron 4 of 11) 91407 NM_001288726 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 142-31 chr11 73868441 73868704 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8127 NM_001267806 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 151.25-92 chr2 128024246 128024492 + 0.75 NA intron (NM_001330303, intron 2 of 19) intron (NM_001330303, intron 2 of 19) 2926 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 139-47 chr15 77534040 77534269 + 0.75 NA TTS (NR_135692) TTS (NR_135692) 8559 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 131-84 chr2 43580816 43581074 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 8 of 37) intron (NM_001083953, intron 8 of 37) 15029 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 130-7 chr1 114629789 114630072 + 0.75 NA intron (NM_198459, intron 1 of 17) intron (NM_198459, intron 1 of 17) 40119 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 222-8 chr1 190473014 190473378 + 0.75 NA intron (NM_199051, intron 1 of 7) intron (NM_199051, intron 1 of 7) 2814 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 226.25-65 chr6 161055106 161055713 + 0.75 NA intron (NM_005922, intron 3 of 26) L1MC3|LINE|L1 63640 NM_005922 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 176.25-82 chr20 22395295 22395665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25163 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 174.75-79 chr3 31868772 31869152 + 0.75 NA intron (NM_017784, intron 3 of 11) intron (NM_017784, intron 3 of 11) -112788 NM_001137674 344787 Hs.585139 NM_001137674 ENSG00000197385 ZNF860 - zinc finger protein 860 protein-coding 132.5-154 chr22 46298633 46298929 + 0.75 NA intron (NM_016426, intron 2 of 11) L2|LINE|L2 1911 NM_016426 51512 Hs.386189 NM_016426 ENSG00000075218 GTSE1 B99 G2 and S-phase expressed 1 protein-coding 127.25-172 chr5 108411988 108412206 + 0.75 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -29999 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 152.5-169 chr6 119589310 119589626 + 0.75 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 39660 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 115.75-189 chr6 134488265 134488441 + 0.75 NA intron (NR_038219, intron 4 of 4) L1ME2|LINE|L1 -9456 NR_125852 101928231 Hs.634168 NR_125852 CT69 - cancer/testis associated transcript 69 ncRNA 175.25-140 chr8 62911982 62912241 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -65750 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 114.5-198 chr4 158742444 158742757 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -19204 NM_005038 5481 Hs.183958 NM_005038 ENSG00000171497 PPID CYP-40|CYPD peptidylprolyl isomerase D protein-coding 152.75-142 chr7 52193441 52193798 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -800363 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 185.75-29 chr12 4742123 4742507 + 0.75 NA intron (NM_017417, intron 3 of 10) intron (NM_017417, intron 3 of 10) 21915 NM_017417 26290 Hs.511985 NM_017417 ENSG00000130035 GALNT8 GALNAC-T8 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 8 protein-coding 169-35 chr16 63900310 63900602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1221607 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 206.25-6 chr1 81889137 81889740 + 0.75 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 86985 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 131.75-222 chr8 136431672 136432006 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -98959 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 124.75-127 chr2 230562844 230563146 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 137534 NR_040038 151475 Hs.528154 NR_040038 ENSG00000226125 LINC01907 - long intergenic non-protein coding RNA 1907 ncRNA 180.5-105 chr3 192679397 192679650 + 0.75 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 48018 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 247-35 chr2 122960499 122960955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 112754 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 266.75-54 chrUn_KI270438v1 112047 112481 + 0.75 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 133.5-47 chr11 14080531 14080792 + 0.75 NA intron (NM_006108, intron 5 of 15) intron (NM_006108, intron 5 of 15) 117938 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 115-22 chr10 97258860 97259171 + 0.75 NA intron (NM_032900, intron 5 of 11) intron (NM_032900, intron 5 of 11) 11642 NM_001256423 84986 Hs.80305 NM_032900 ENSG00000213390 ARHGAP19 - Rho GTPase activating protein 19 protein-coding 140.5-151 chr3 62626573 62626880 + 0.75 NA intron (NM_003716, intron 6 of 29) MER113|DNA|hAT-Charlie 248690 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 152.75-34 chr11 60419401 60419677 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy -10033 NM_023945 64232 Hs.178066 NM_023945 ENSG00000166930 MS4A5 CD20-L2|CD20L2|TETM4 membrane spanning 4-domains A5 protein-coding 133-88 chr2 138023702 138024133 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59444 NM_001024075 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 175.75-112 chr6 82344489 82344906 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -18509 NM_006670 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 131-60 chr15 63415154 63415412 + 0.75 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 25053 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 123.25-193 chr7 105174424 105174653 + 0.75 NA intron (NM_182692, intron 3 of 15) LTR83|LTR|ERVL 94539 NM_001350744 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 204.75-13 chr10 10366732 10367208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 95379 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 143.25-183 chr8 86857315 86857764 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8876 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 325-19 chr6 63797054 63797601 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 37 of 43) intron (NM_001292009, intron 37 of 43) -9509 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 140.25-106 chr20 17372473 17372775 + 0.75 NA intron (NM_002594, intron 5 of 11) intron (NM_002594, intron 5 of 11) 145584 NM_002594 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 128-30 chr12 2498529 2498806 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 7 of 49).2 intron (NM_199460, intron 7 of 49).2 173553 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 113.5-23 chr1 201055361 201055658 + 0.75 NA intron (NM_000069, intron 28 of 43) MER3|DNA|hAT-Charlie -31795 NM_001252100 23046 Hs.169182 NM_017596 ENSG00000116852 KIF21B - kinesin family member 21B protein-coding 122.25-146 chr5 110900 111237 + 0.75 NA intron (NM_052909, intron 1 of 19) intron (NM_052909, intron 1 of 19) 18900 NM_052909 153478 Hs.535800 NM_052909 ENSG00000153404 PLEKHG4B - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B protein-coding 142.25-178 chr9 108671447 108671844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 184341 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 117.5-19 chr1 220233451 220233728 + 0.75 NA intron (NM_012414, intron 1 of 34) MIRb|SINE|MIR -32913 NR_002994 677818 Hs.730572 NR_002994 ENSG00000222370 SNORA36B ACA36b small nucleolar RNA, H/ACA box 36B snoRNA 131.75-95 chr17 74945120 74945322 + 0.75 NA intron (NM_178233, intron 5 of 6) AluJr|SINE|Alu 9323 NM_001272005 347741 Hs.454407 NM_178233 ENSG00000182938 OTOP3 - otopetrin 3 protein-coding 224.5-44 chr15 65562435 65562869 + 0.75 NA intron (NM_016395, intron 5 of 10) intron (NM_016395, intron 5 of 10) 32189 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 191.75-75 chr22 36690346 36690680 + 0.75 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) intron (NM_006078, intron 1 of 3) 12345 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 127-54 chr13 107964663 107964974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97322 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 151-109 chr5 68719782 68720100 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 309986 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 113.75-141 chr4 109039457 109039645 + 0.75 NA intron (NM_198721, intron 4 of 36) L2c|LINE|L2 263107 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 113-130 chr4 52260500 52260702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 209297 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 132-144 chr5 150606330 150606587 + 0.75 NA intron (NM_001166208, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 5382 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 173.25-17 chr10 97607424 97607888 + 0.75 NA intron (NM_138413, intron 6 of 6) L1MDa|LINE|L1 17935 NM_001009997 414157 Hs.662302 NM_001009997 ENSG00000203942 C10orf62 bA548K23.1 chromosome 10 open reading frame 62 protein-coding 127-72 chr15 90237475 90237775 + 0.75 NA intron (NM_001322811, intron 3 of 4) L1M3|LINE|L1 3416 NM_001322811 390637 Hs.304673 NM_001013657 ENSG00000183208 GDPGP1 C15orf58|VTC2 GDP-D-glucose phosphorylase 1 protein-coding 181.5-173 chrX 97838443 97838773 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -274073 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 161.5-115 chr20 5783499 5783800 + 0.75 NA intron (NM_152504, intron 2 of 2) intron (NM_152504, intron 2 of 2) 33248 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 136-132 chr7 24677867 24678268 + 0.75 NA intron (NM_016447, intron 10 of 12) intron (NM_016447, intron 10 of 12) 79397 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 119.75-148 chr3 124600083 124600324 + 0.75 NA intron (NM_007064, intron 1 of 26) intron (NM_007064, intron 1 of 26) 15544 NM_001323000 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 130.75-4 chr1 55393557 55393908 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 168091 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 137.25-126 chr5 52052348 52052582 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 44434 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 202.25-96 chr9 28176462 28176823 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) MIRc|SINE|MIR 542663 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 189.75-35 chr14 72392998 72393278 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -123682 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 148.25-51 chr17 29579821 29580234 + 0.75 NA intron (NM_001085454, intron 7 of 20) L2b|LINE|L2 9621 NM_001085454 28964 Hs.514051 NM_014030 ENSG00000108262 GIT1 - GIT ArfGAP 1 protein-coding 201-17 chr11 64192574 64192900 + 0.75 NA intron (NM_001282653, intron 1 of 13) intron (NM_001282653, intron 1 of 13) 6566 NM_006819 10963 Hs.337295 NM_006819 ENSG00000168439 STIP1 HEL-S-94n|HOP|IEF-SSP-3521|P60|STI1|STI1L stress induced phosphoprotein 1 protein-coding 205.5-160 chr9 77813375 77813732 + 0.75 NA intron (NM_002072, intron 3 of 6) intron (NM_002072, intron 3 of 6) -165231 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 122.75-100 chr2 142399087 142399383 + 0.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -267534 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 144.25-192 chr7 95577420 95577674 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 18969 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 200-85 chr7 31615291 31615574 + 0.75 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) MIRb|SINE|MIR 62430 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 118.25-104 chr2 117068596 117068864 + 0.75 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -745961 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 162.75-10 chr10 8280655 8281107 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12576 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 125.75-123 chr22 40062974 40063243 + 0.75 NA intron (NM_001024843, intron 1 of 23) L1MEc|LINE|L1 18291 NM_001024843 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 182.25-54 chr18 12379392 12379841 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -2340 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 125.25-161 chr5 143806357 143806589 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5688 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 141.5-140 chr3 29265532 29265785 + 0.75 NA intron (NR_109804, intron 2 of 2) intron (NR_109804, intron 2 of 2) 15281 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 112.75-214 chrX 58221496 58221826 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -311028 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 219.5-136 chr9 36657429 36657768 + 0.75 NA intron (NM_001256691, intron 11 of 15) intron (NM_001256691, intron 11 of 15) 84703 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 124.25-185 chr7 49778042 49778440 + 0.75 NA intron (NR_136188, intron 1 of 3) intron (NR_136188, intron 1 of 3) 2908 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 132.5-151 chr22 24748650 24748992 + 0.75 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) intron (NM_001008496, intron 12 of 20) -15680 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 115.75-4 chr1 101229630 101229992 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 6717 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 127-43 chr12 48894904 48895099 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9132 NM_001286957 85478 Hs.512805 NM_033124 ENSG00000139537 CCDC65 CFAP250|DRC2|FAP250|NYD-SP28 coiled-coil domain containing 65 protein-coding 131.25-59 chr14 57995801 57996157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129887 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 223.75-22 chr14 55908040 55908532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111612 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 112.5-84 chr15 87776121 87776382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170017 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 167.75-140 chr8 105350441 105350867 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 31111 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 126-60 chr14 92675591 92675954 + 0.75 NA intron (NM_024832, intron 7 of 9) intron (NM_024832, intron 7 of 9) 72855 NM_005606 5641 Hs.18069 NM_005606 ENSG00000100600 LGMN AEP|LGMN1|PRSC1 legumain protein-coding 228.5-99 chr7 134833944 134834524 + 0.75 NA intron (NM_033157, intron 1 of 14) intron (NM_033157, intron 1 of 14) 54600 NM_033157 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 131.25-136 chr3 81761146 81761346 + 0.75 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) CpG 399 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 129-11 chr1 173059369 173059661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8552 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 165.25-4 chr1 86147874 86148274 + 0.75 NA intron (NM_152890, intron 1 of 59) MER5A|DNA|hAT-Charlie 8397 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 133-106 chr3 50892553 50892813 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 4 of 52) L1M3c|LINE|L1 217603 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 139.5-135 chr3 96244095 96244356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115739 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 144.75-61 chr14 75801741 75802012 + 0.75 NA intron (NM_015072, intron 27 of 31) intron (NM_015072, intron 27 of 31) 140630 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 117-20 chr10 105192826 105193038 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 14 of 26) intron (NM_014978, intron 14 of 26) -526716 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 141.25-141 chr5 114243193 114243622 + 0.75 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -118663 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 149.5-109 chr20 56453185 56453445 + 0.75 NA intron (NM_001164116, intron 6 of 6) intron (NM_001164116, intron 6 of 6) -15270 NM_001283036 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 127.75 chr1 11687949 11688241 + 0.75 NA intron (NM_001127325, intron 1 of 8) intron (NM_001127325, intron 1 of 8) 3526 NM_001127325 10459 Hs.19400 NM_006341 ENSG00000116670 MAD2L2 FANCV|MAD2B|POLZ2|REV7 mitotic arrest deficient 2 like 2 protein-coding 160.75-7 chr1 94690121 94690520 + 0.75 NA intron (NR_160779, intron 2 of 5) intron (NR_160779, intron 2 of 5) 55580 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 238.75-7 chr10 130594463 130594812 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 368031 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 226.25-45 chr22 24945664 24946018 + 0.75 NA intron (NM_001001663, intron 1 of 3) intron (NM_001001663, intron 1 of 3) 854 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 159-57 chr20 42467922 42468172 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 8 of 31) intron (NM_133170, intron 8 of 31) -217436 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 226.5-67 chr4 42234476 42234890 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -82028 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 196.75-43 chr15 69625428 69625764 + 0.75 NA intron (NR_126437, intron 2 of 5) intron (NR_126437, intron 2 of 5) 33396 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 170.25-6 chr1 177821679 177822208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121419 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 159.5-50 chr13 98630036 98630379 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 52952 NR_046542 100874069 Hs.594160 NR_046542 STK24-AS1 - STK24 antisense RNA 1 ncRNA 166 chr1 29244042 29244336 + 0.75 NA intron (NM_133177, intron 1 of 30) intron (NM_133177, intron 1 of 30) 7667 NM_133177 10076 Hs.19718 NM_005704 ENSG00000060656 PTPRU FMI|PCP-2|PTP|PTP-J|PTP-PI|PTP-RO|PTPPSI|PTPRO|PTPU2|R-PTP-PSI|R-PTP-U|hPTP-J protein tyrosine phosphatase receptor type U protein-coding 173-151 chr9 102354494 102354861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -164960 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 118.75-215 chrX 83017452 83017736 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -490696 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 130.25-71 chr15 81654305 81654611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -280245 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 231-31 chr15 87195764 87196395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207653 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 207-77 chr7 9812639 9813161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178630 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 134-19 chr10 63396268 63396591 + 0.75 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -23381 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 149.5-188 chr7 83234134 83234404 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71385 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 154.75-113 chr5 43845321 43845610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242235 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 130-81 chr2 180162435 180162727 + 0.75 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -155284 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 116.5-19 chr10 14176616 14176898 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) AluSc5|SINE|Alu 102473 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 127.5-246 chr8 125700731 125701020 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 250322 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 136-73 chr2 80221913 80222160 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 82716 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 113.25-144 chr5 166913588 166913903 + 0.75 NA intron (NR_108020, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 12625 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 173.75-57 chr14 86479651 86480144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -425881 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 176.75-60 chr2 56814122 56814715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -628648 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 176.25-123 chr7 13550998 13551260 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 435385 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 143.75-116 chr3 57418605 57418846 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 37 of 73) intron (NM_001366028, intron 37 of 73) 125619 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 180-59 chr2 64258789 64259198 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 30592 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 161.5-134 chr3 68867098 68867359 + 0.75 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) L1MA4|LINE|L1 65319 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 200.5-21 chr11 17155221 17155651 + 0.75 NA intron (NM_001321380, intron 2 of 31) intron (NM_001321380, intron 2 of 31) 52550 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 207-5 chr1 217470011 217470356 + 0.75 NA intron (NM_018040, intron 8 of 9) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 160907 NM_018040 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 138-49 chr15 90898765 90899003 + 0.75 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -3498 NM_001320977 4122 Hs.116459 NM_006122 ENSG00000196547 MAN2A2 MANA2X mannosidase alpha class 2A member 2 protein-coding 255.25-25 chr2 157364557 157365118 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 15672 NR_034169 728066 Hs.470311 NR_034169 FAM133DP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 144.75-191 chr9 20067478 20067745 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -280592 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 126-30 chr11 42066864 42067066 + 0.75 NA intron (NR_135065, intron 4 of 9) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 18493 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 207.5-39 chr17 60614845 60615402 + 0.75 NA intron (NM_003620, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 14940 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 210-71 chr4 46792723 46793113 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 116327 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 198.75-80 chr6 8543608 8543952 + 0.75 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) intron (NR_038980, intron 2 of 4) 108157 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 181-16 chr11 78649974 78650380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75313 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 142.25-79 chr19 44691013 44691364 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7963 NM_001039213 388551 Hs.456381 NM_001039213 ENSG00000213892 CEACAM16 CEAL2|DFNA4B|DFNB113 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 16 protein-coding 127-186 chr9 86819615 86819836 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 127781 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 116.5-78 chr15 63983808 63984051 + 0.75 NA intron (NM_014326, intron 2 of 11) intron (NM_014326, intron 2 of 11) 55655 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 118.5-41 chr12 9905416 9905605 + 0.75 NA intron (NM_207375, intron 4 of 4) HERVI-int|LTR|ERV1 24021 NM_001190765 100431172 Hs.725113 NM_001190765 ENSG00000256797 KLRF2 NKp65 killer cell lectin like receptor F2 protein-coding 160.5-186 chr8 72426574 72426947 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -110465 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 185.5-77 chr2 66544484 66544771 + 0.75 NA intron (NM_002398, intron 8 of 12) intron (NM_002398, intron 8 of 12) -29403 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 245.5-87 chr9 77115587 77116165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61569 NM_015186 23230 Hs.459790 NM_015186 ENSG00000197969 VPS13A CHAC|CHOREIN vacuolar protein sorting 13 homolog A protein-coding 121.5-231 chr7 3535682 3536008 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 234593 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 216.5-68 chr20 49015376 49015684 + 0.75 NA intron (NM_006420, intron 30 of 38) L1ME4a|LINE|L1 30526 NR_110624 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 154.25-171 chr8 109540480 109540972 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001278938) promoter-TSS (NM_001278938) 100 NM_001278938 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 153.75-28 chr12 17094705 17095086 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106148 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 212.75-62 chr3 17134980 17135415 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 202001 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 122-67 chr16 62543462 62543685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -507135 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 124.75-155 chr4 67994288 67994677 + 0.75 NA intron (NR_033737, intron 2 of 3) intron (NR_033737, intron 2 of 3) 2957 NR_033737 644759 Hs.646883 NR_033737 ENSG00000229009 TMPRSS11GP - transmembrane serine protease 11G, pseudogene pseudo 246.25-2 chr1 97779764 97780348 + 0.75 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) -16865 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 188-72 chr7 100090382 100090682 + 0.75 NA intron (NM_006833, intron 4 of 9) intron (NM_006833, intron 4 of 9) 1563 NM_006833 10980 Hs.15591 NM_006833 ENSG00000168090 COPS6 CSN6|MOV34-34KD COP9 signalosome subunit 6 protein-coding 203.25-33 chr12 124050420 124050887 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) intron (NM_001347902, intron 2 of 4) 77438 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 201.25-84 chr6 150632997 150633360 + 0.75 NA non-coding (NR_138140, exon 1 of 3) non-coding (NR_138140, exon 1 of 3) 214 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 124.5-30 chr10 119515604 119515812 + 0.75 NA intron (NM_001005339, intron 3 of 4) intron (NM_001005339, intron 3 of 4) 20825 NM_002925 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 233.5-15 chr1 208730755 208731352 + 0.75 NA intron (NR_146914, intron 3 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 2365 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 218.5-43 chr16 55626422 55626960 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29373 NM_001172501 6530 Hs.78036 NM_001043 ENSG00000103546 SLC6A2 NAT1|NET|NET1|SLC6A5 solute carrier family 6 member 2 protein-coding 147.75-123 chr5 35110835 35111083 + 0.75 NA intron (NR_037910, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 7163 NM_001204314 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 202-23 chr13 94641084 94641560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39465 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 168.25-37 chr14 35966378 35966649 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -103914 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 114.5-116 chr17 69696989 69697177 + 0.75 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) intron (NR_109972, intron 3 of 4) 103096 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 222-38 chr2 62672397 62672796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1282 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 128.25-144 chr4 57342021 57342306 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -83709 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 123.75-203 chr9 102806164 102806403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -189050 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 223.5-87 chr4 35991178 35991627 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 252537 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 238.25-19 chr14 49333579 49333972 + 0.75 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 252605 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 235-52 chr4 123919180 123919809 + 0.75 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 145230 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 209.75-36 chr17 43442208 43442728 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2239 NR_146952 106660605 NR_146952 ENSG00000267151 MIR2117HG - MIR2117 host gene ncRNA 147.5-105 chr2 111213947 111214210 + 0.75 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) L1ME1|LINE|L1 93164 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 156.5-15 chr10 76911260 76911661 + 0.75 NA intron (NM_001322836, intron 24 of 27) MIR|SINE|MIR 23416 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 163.5-218 chr9 106172022 106172406 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -428714 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 116-41 chr13 72297967 72298204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 429544 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 252.75-40 chr22 24341567 24342137 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001254733) promoter-TSS (NM_001254733) -256 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 142-150 chr7 47110778 47111035 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 353897 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 116.5-15 chr1 195954537 195954793 + 0.75 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 134050 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 136.25-117 chr3 11041621 11041819 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -22496 NR_046647 100874090 Hs.628542 NR_046647 ENSG00000232287 SLC6A1-AS1 - SLC6A1 antisense RNA 1 ncRNA 144.5-96 chr2 18376854 18377182 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 183635 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 181-103 chr7 74357638 74357975 + 0.75 NA intron (NM_032421, intron 6 of 15) AluSg|SINE|Alu 68331 NM_003388 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 203.75-107 chr8 24727666 24727998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179214 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 140.75-79 chr2 5326377 5326706 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 364577 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 193.75-76 chr20 34622568 34622875 + 0.75 NA intron (NM_080476, intron 6 of 11) intron (NM_080476, intron 6 of 11) 54564 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 129.25-48 chr14 45919070 45919268 + 0.75 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -144990 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 145.25-160 chr7 42073492 42073735 + 0.75 NA intron (NM_000168, intron 4 of 14) intron (NM_000168, intron 4 of 14) 163596 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 185.5-164 chr8 120773151 120773562 + 0.75 NA intron (NR_125419, intron 3 of 4) intron (NR_125419, intron 3 of 4) 12103 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 184.25-60 chr2 148054897 148055196 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) L1M5|LINE|L1 -33442 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 112.25-124 chr3 44351144 44351361 + 0.75 NA intron (NM_001282914, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 12486 NM_173826 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 132.75-144 chr4 120129375 120129725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62702 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 197-3 chr10 43165624 43166005 + 0.75 NA intron (NM_001319654, intron 4 of 5) AluSx|SINE|Alu 10917 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 174.75-115 chr7 42648566 42648868 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57730 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 160.5-170 chr7 25681790 25682149 + 0.75 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 -11238 NR_157816 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 124.25-74 chr16 86607618 86607801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29200 NM_005250 2300 Hs.533830 NM_005250 ENSG00000176678 FOXL1 FKH6|FKHL11|FREAC7 forkhead box L1 protein-coding 151.5-135 chr3 192295832 192296187 + 0.75 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) AluJb|SINE|Alu 57379 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 205.5-6 chr1 118886007 118886369 + 0.75 NA intron (NM_152380, intron 7 of 7) intron (NM_152380, intron 7 of 7) 102155 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 122.5-78 chr16 65916205 65916414 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -340009 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 127-94 chr2 10591464 10591745 + 0.75 NA intron (NR_048552, intron 16 of 19) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 98371 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 113-82 chr19 3522144 3522473 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001136197) promoter-TSS (NM_001136197) -648 NM_001136198 51343 Hs.413133 NM_016263 ENSG00000105325 FZR1 CDC20C|CDH1|FZR|FZR2|HCDH|HCDH1 fizzy and cell division cycle 20 related 1 protein-coding 146.5-216 chr7 157127503 157127858 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -11246 NM_014671 9690 Hs.118351 NM_014671 ENSG00000009335 UBE3C HECTH2 ubiquitin protein ligase E3C protein-coding 287.5-49 chr7 40863435 40864038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 116203 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 179.5-186 chr8 130751921 130752425 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 288736 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 188.25-122 chr8 126764312 126764639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -205997 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 153.5-64 chr15 51944884 51945138 + 0.75 NA intron (NM_001323903, intron 11 of 12) intron (NM_001323903, intron 11 of 12) -20891 NR_109775 100422556 Hs.664788 NR_109775 LOC100422556 - LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component pseudogene pseudo 160.75-106 chr4 32043674 32043940 + 0.75 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -21385 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 126.75-18 chr10 44544003 44544286 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -159047 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 146.75-32 chr12 58370485 58370731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221094 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 261.5-46 chr4 39739307 39739889 + 0.75 NA intron (NM_005339, intron 2 of 6) AluSx4|SINE|Alu 41462 NM_001111113 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 138-72 chr19 48562685 48563001 + 0.75 NA intron (NM_177973, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 10671 NM_177973 6820 Hs.369331 NM_004605 ENSG00000088002 SULT2B1 ARCI14|HSST2 sulfotransferase family 2B member 1 protein-coding 171.75-150 chr9 130391629 130392017 + 0.75 NA intron (NM_001291815, intron 65 of 97) intron (NM_001291815, intron 65 of 97) -52884 NM_000050 445 Hs.160786 NM_000050 ENSG00000130707 ASS1 ASS|CTLN1 argininosuccinate synthase 1 protein-coding 119.25-198 chr7 94406177 94406375 + 0.75 NA exon (NM_000089, exon 12 of 52) exon (NM_000089, exon 12 of 52) 11715 NM_000089 1278 Hs.489142 NM_000089 ENSG00000164692 COL1A2 EDSARTH2|EDSCV|OI4 collagen type I alpha 2 chain protein-coding 173.75-93 chr2 201383993 201384381 + 0.75 NA exon (NM_015049, exon 15 of 16) exon (NM_015049, exon 15 of 16) -26789 NM_139163 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 188.5-95 chr22 45900881 45901303 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 76070 NM_058238 7477 Hs.512714 NM_058238 ENSG00000188064 WNT7B - Wnt family member 7B protein-coding 191-91 chrX 48661057 48661493 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -22522 NM_000377 7454 Hs.2157 NM_000377 ENSG00000015285 WAS IMD2|SCNX|THC|THC1|WASP|WASPA WASP actin nucleation promoting factor protein-coding 239.25-2 chr1 35444497 35444992 + 0.75 NA intron (NM_024874, intron 16 of 20) intron (NM_024874, intron 16 of 20) -78667 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 152.75-149 chr8 88628921 88629223 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -301589 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 190.5-44 chr14 42922611 42923013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1315956 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 224-60 chr8 25173879 25174216 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10642 NM_024940 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 136.5-162 chr4 40485303 40485563 + 0.75 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) intron (NM_001098634, intron 2 of 6) 16686 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 180.75-127 chr6 53041502 53041772 + 0.75 NA intron (NM_014920, intron 1 of 13) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 20165 NM_016513 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 130.25-115 chr2 218230887 218231220 + 0.75 NA intron (NM_152862, intron 4 of 10) intron (NM_152862, intron 4 of 10) 13656 NM_005731 10109 Hs.529303 NM_005731 ENSG00000163466 ARPC2 ARC34|PNAS-139|PRO2446|p34-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 2 protein-coding 184-48 chr20 41888399 41888718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -270181 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 160-78 chr4 87570890 87571204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37482 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 200.5-73 chr2 153787740 153788240 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -83932 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 143.25-161 chr6 125406700 125406988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104877 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 192.25-31 chr16 64452711 64453017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 669199 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 162.75-111 chr5 12420695 12421069 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -153975 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 140.5-215 chr7 62705085 62705452 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 598788 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 160-112 chr8 91511742 91511987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 262545 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 148.5-145 chr3 58228568 58228832 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -8802 NM_020676 57406 Hs.476454 NM_020676 ENSG00000163686 ABHD6 - abhydrolase domain containing 6 protein-coding 247.5-20 chr13 95851124 95851679 + 0.75 NA intron (NM_020121, intron 36 of 38) L2|LINE|L2 174262 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 163-62 chr20 49411133 49411422 + 0.75 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 71391 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 189.5-88 chr3 252399 252759 + 0.75 NA intron (NM_001253387, intron 2 of 26) MIRc|SINE|MIR 54690 NR_045572 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 126.75-34 chr11 121802396 121802650 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 297321 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 206.5-34 chr17 65351999 65352532 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -105276 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 186-62 chr4 47173618 47173980 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 142232 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 244.25-28 chr22 32131333 32131943 + 0.75 NA intron (NR_040114, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 9661 NR_040114 23782 Hs.581098 NR_040114 ENSG00000234479 AP1B1P1 ADTB1L1|dJ127L4.2 AP1B1 pseudogene 1 pseudo 169.75-40 chr12 125440804 125441161 + 0.75 NA intron (NM_052907, intron 3 of 8) intron (NM_052907, intron 3 of 8) 114366 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 191.25-96 chr7 50716769 50717173 + 0.75 NA intron (NM_001350816, intron 2 of 17) MIRb|SINE|MIR -11670 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 155-99 chr4 99541399 99541699 + 0.75 NA intron (NM_032149, intron 8 of 8) intron (NM_032149, intron 8 of 8) 22174 NM_152292 93587 Hs.380412 NM_152292 ENSG00000145331 TRMT10A HEL-S-88|MSSGM|MSSGM1|RG9MTD2|TRM10 tRNA methyltransferase 10A protein-coding 165.5-211 chrX 87558892 87559123 + 0.75 NA intron (NM_057162, intron 1 of 10) MER58B|DNA|hAT-Charlie 41205 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 125.25-105 chr2 111189662 111190007 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68920 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 113.25-20 chr10 110260589 110260774 + 0.75 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) intron (NM_005962, intron 3 of 5) 34685 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 230.5-125 chrX 98945183 98945602 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1380857 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 201.75-28 chr12 113256890 113257349 + 0.75 NA intron (NM_001351347, intron 1 of 26) L1ME1|LINE|L1 12751 NM_001351347 53373 Hs.524763 NM_017901 ENSG00000186815 TPCN1 TPC1 two pore segment channel 1 protein-coding 211-42 chr3 47892473 47892770 + 0.75 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 43066 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 166-76 chr20 63290028 63290435 + 0.75 NA TTS (NM_018209) TTS (NM_018209) -2955 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 144.5-123 chr21 34848910 34849255 + 0.75 NA intron (NM_001001890, intron 3 of 5) intron (NM_001001890, intron 3 of 5) 39617 NM_001122607 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 113.25-5 chr1 96631053 96631280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90439 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 124.25-86 chr19 27557673 27557889 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -235650 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 131.75-219 chr8 118683252 118683488 + 0.75 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) L1MC|LINE|L1 -61407 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 163.25-56 chr17_KI270729v1_random 12739 13067 + 0.75 NA NA (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 115-166 chr7 9209895 9210202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -424222 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 170.25-148 chr8 53379656 53380101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128181 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 157.5-201 chr8 32034297 32034635 + 0.75 NA intron (NR_104156, intron 3 of 3) L1PA10|LINE|L1 8248 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 217.5-107 chr6 53824804 53825336 + 0.75 NA intron (NM_018214, intron 1 of 13) intron (NM_018214, intron 1 of 13) 30065 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 153.75-49 chr15 99216772 99217040 + 0.75 NA intron (NR_109947, intron 7 of 12) L1ME5|LINE|L1 32675 NR_109947 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 162.75-35 chr14 67307015 67307307 + 0.75 NA intron (NM_001256550, intron 8 of 14) intron (NM_001256550, intron 8 of 14) 52643 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 184-32 chr16 53947199 53947672 + 0.75 NA intron (NM_001363894, intron 9 of 9) intron (NM_001363894, intron 9 of 9) -91958 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 211.5-5 chr1 151648478 151648817 + 0.75 NA intron (NM_030918, intron 2 of 11) AluSp|SINE|Alu 36597 NM_001330723 81609 Hs.192326 NM_030918 ENSG00000143376 SNX27 MRT1|MY014 sorting nexin 27 protein-coding 116-123 chr5 39467364 39467565 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42231 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 264-25 chr18 72719577 72720202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133493 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 151-98 chr4 64057018 64057337 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 352273 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 128.25-176 chr6 87249365 87249565 + 0.75 NA intron (NM_015021, intron 7 of 7) intron (NM_015021, intron 7 of 7) -73123 NM_001287445 57150 Hs.70769 NM_020425 ENSG00000111850 SMIM8 C6orf162|dJ102H19.2 small integral membrane protein 8 protein-coding 276.25-13 chr15 61248674 61249420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19745 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 157.75-119 chr4 28261404 28261760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -558000 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 146.75-23 chr11 37726984 37727300 + 0.75 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -211459 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 119-46 chr14 44757601 44757932 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 41360 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 169.5-2 chr1 31916630 31916900 + 0.75 NA intron (NM_001369860, intron 2 of 5) intron (NM_001369860, intron 2 of 5) 21053 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 123.5-24 chr10 34189284 34189539 + 0.75 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -416731 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 115-71 chr18 820461 820643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8310 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 115.75-136 chr3 5465402 5465622 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -215257 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 186.5-21 chr10 120138945 120139251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 180585 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 131.5-188 chr5 44435591 44435860 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -46305 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 219.75-69 chr6 135110170 135110612 + 0.75 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL -55569 NM_001363686 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 145.75-46 chr15 74645052 74645438 + 0.75 NA intron (NM_001142443, intron 7 of 9) L1MC4|LINE|L1 30251 NM_001130028 1198 Hs.511790 NM_001292 ENSG00000179335 CLK3 PHCLK3|PHCLK3/152 CDC like kinase 3 protein-coding 209.75-29 chr14 73697843 73698328 + 0.75 NA 3' UTR (NM_031427, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_031427, exon 8 of 8) 16299 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 141-4 chr1 91990147 91990360 + 0.75 NA intron (NM_001726, intron 12 of 18) intron (NM_001726, intron 12 of 18) 38101 NM_001726 676 Hs.482520 NM_001726 ENSG00000137948 BRDT BRD6|CT9|SPGF21 bromodomain testis associated protein-coding 128.5-182 chr6 24876576 24876813 + 0.75 NA intron (NM_001286446, intron 1 of 13) intron (NM_001286446, intron 1 of 13) 576 NM_015864 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 122.75-34 chr12 2779931 2780106 + 0.75 NA intron (NR_146317, intron 2 of 3) intron (NR_146317, intron 2 of 3) -14952 NM_002014 2288 Hs.524183 NM_002014 ENSG00000004478 FKBP4 FKBP51|FKBP52|FKBP59|HBI|Hsp56|PPIase|p52 FKBP prolyl isomerase 4 protein-coding 116.25-124 chr20 59912135 59912376 + 0.75 NA intron (NM_014258, intron 13 of 44) intron (NM_014258, intron 13 of 44) 21382 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 176.5-24 chr10 99684636 99685163 + 0.75 NA intron (NM_001349962, intron 6 of 13) intron (NM_001349962, intron 6 of 13) 25270 NM_001349963 57089 Hs.28326 NM_020354 ENSG00000198018 ENTPD7 LALP1 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 protein-coding 130.25-4 chr1 79295073 79295349 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -288481 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 183.5-164 chr9 132067125 132067388 + 0.75 NA intron (NM_001253881, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 12611 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 134.5-197 chr6 139704117 139704391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66819 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 143.75-171 chr7 44702269 44702609 + 0.75 NA intron (NM_002541, intron 20 of 22) intron (NM_002541, intron 20 of 22) -46127 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 242-11 chr10 90624932 90625430 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -84376 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 113-32 chr10 107386604 107386843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222017 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 118.5-157 chr5 7833553 7833843 + 0.75 NA intron (NM_001089584, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 17435 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 155.75-34 chr11 94921148 94921636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52164 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 114.25-57 chr14 62340687 62340867 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -200804 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 240.25-70 chr8 98275876 98276464 + 0.75 NA intron (NR_135747, intron 1 of 11) L1MC1|LINE|L1 18065 NR_135747 79815 Hs.309489 NM_024759 ENSG00000104361 NIPAL2 NPAL2 NIPA like domain containing 2 protein-coding 160.75-8 chr1 111491679 111492103 + 0.75 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) intron (NM_001081976, intron 1 of 5) 11742 NM_001302678 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 224.25-56 chr3 97153219 97153593 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -286201 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 237.75-49 chr3 33605046 33605532 + 0.75 NA intron (NM_001365634, intron 16 of 35) intron (NM_001365634, intron 16 of 35) 54390 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 129.75-13 chr1 121442901 121443105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45098 NR_104189 100873165 Hs.568525 NR_104189 ENSG00000230806 SRGAP2-AS1 - SRGAP2 antisense RNA 1 ncRNA 180 chr1 38659846 38660109 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 184781 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 156.75-136 chr5 66925725 66925978 + 0.75 NA intron (NM_015183, intron 3 of 27) intron (NM_015183, intron 3 of 27) -33222 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 181.5-51 chr15 91763942 91764212 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -89631 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 162-129 chr9 98228595 98229113 + 0.75 NA TTS (NR_106913) TTS (NR_106913) 363 NR_106913 102465514 NR_106913 ENSG00000278412 MIR6854 hsa-mir-6854 microRNA 6854 ncRNA 195.5-105 chr4 38558466 38558808 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -5366 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 156.25-100 chr3 114542697 114542949 + 0.75 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 81383 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 131.25-178 chr6 132629837 132630112 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5699 NM_001033080 9287 Hs.272382 NM_014626 ENSG00000146378 TAAR2 GPR58|taR-2 trace amine associated receptor 2 (gene/pseudogene) protein-coding 159.5-161 chr4 52123503 52123799 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 72347 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 195.25-92 chr8 43169610 43170138 + 0.75 NA intron (NM_152419, intron 6 of 17) AluJb|SINE|Alu 29410 NM_001363229 138050 Hs.600384 NM_152419 ENSG00000165102 HGSNAT HGNAT|MPS3C|RP73|TMEM76 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase protein-coding 122-200 chrX 71918763 71919105 + 0.75 NA intron (NM_001013627, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 7846 NM_001013627 340527 Hs.397836 NM_001013627 ENSG00000204131 NHSL2 - NHS like 2 protein-coding 136.25-69 chr15 67934149 67934493 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -94276 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 148.25-88 chr22 47398028 47398295 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 52590 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 184.75-102 chr8 6055387 6055839 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 350935 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 194.5-78 chr2 207284374 207284704 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -15115 NR_031633 100302130 NR_031633 ENSG00000221628 MIR1302-4 MIRN1302-4|hsa-mir-1302-4 microRNA 1302-4 ncRNA 122.25-16 chr1 211890990 211891194 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 60131 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 123.75-144 chr5 64172849 64173156 + 0.75 NA intron (NM_001113561, intron 1 of 7) ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 7159 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 116.75-196 chr8 64329712 64329939 + 0.75 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 38733 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 228.5-10 chr1 157115965 157116626 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12067 NR_001560 360155 Hs.491808 NR_001560 ENSG00000235700 CYCSP52 HC6|HCP2 CYCS pseudogene 52 pseudo 116.75-53 chr13 97131697 97131915 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 47816 NR_125725 103625683 Hs.679591 NR_125725 ENSG00000233124 LINC00456 - long intergenic non-protein coding RNA 456 ncRNA 204-76 chr7 88677377 88677861 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -82081 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 114-66 chr2 21312950 21313196 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 189087 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 193.75-84 chr3 57047186 57047605 + 0.75 NA intron (NM_001128615, intron 1 of 12) (CAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -13269 NM_181727 353324 Hs.129794 NM_181727 ENSG00000186451 SPATA12 SRG5 spermatogenesis associated 12 protein-coding 211-13 chr12 8771226 8771768 + 0.75 NA intron (NR_147950, intron 5 of 8) MER21A|LTR|ERVL -51124 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 233-6 chr1 188104617 188105102 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 661231 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 129-32 chr11 29776536 29776922 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157927 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 140.25-174 chr7 3858083 3858549 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) FLAM_A|SINE|Alu -271369 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 122.25-59 chr14 55092237 55092527 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36870 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 131.5-39 chr12 10609381 10609734 + 0.75 NA intron (NR_135120, intron 3 of 5) intron (NR_135120, intron 3 of 5) 3421 NM_001300739 55110 Hs.104650 NM_018048 ENSG00000111196 MAGOHB MGN2|mago|magoh mago homolog B, exon junction complex subunit protein-coding 177.25-32 chr11 111427858 111428157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9821 NR_046085 100132078 Hs.672662 NR_046085 ENSG00000255428 LOC100132078 - uncharacterized LOC100132078 ncRNA 175.5-31 chr11 37697672 37697971 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -240780 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 117-131 chr4 52070092 52070388 + 0.75 NA intron (NR_123728, intron 5 of 12) intron (NR_123728, intron 5 of 12) 18936 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 129.5-88 chr16 25366045 25366228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -108291 NM_001012981 342357 Hs.513451 NM_001012981 ENSG00000155592 ZKSCAN2 ZNF694|ZSCAN31|ZSCAN34 zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 protein-coding 194-21 chr10 118115449 118115793 + 0.75 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -68680 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 174.75-8 chr1 198855412 198855650 + 0.75 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) 3451 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 179.25-98 chr3 26795208 26795532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100813 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 118.75-132 chr3 181632749 181632936 + 0.75 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 22508 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 181-22 chr12 108247107 108247437 + 0.75 NA intron (NM_001304447, intron 9 of 9) MIR|SINE|MIR 73390 NM_001142345 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 197.75-53 chr21 24448705 24449213 + 0.75 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) LTR108e_Mam|LTR|ERVL 20219 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 166.5-98 chr2 43186540 43186938 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39867 NM_006887 678 Hs.503093 NM_006887 ENSG00000152518 ZFP36L2 BRF2|ERF-2|ERF2|RNF162C|TIS11D ZFP36 ring finger protein like 2 protein-coding 126-174 chr8 106939741 106939957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -169605 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 186.5-145 chrX 81494098 81494551 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 292222 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 170-18 chr11 72060165 72060672 + 0.75 NA intron (NR_104476, intron 2 of 24) AluJb|SINE|Alu 11884 NR_036123 100422953 NR_036123 ENSG00000263742 MIR3165 mir-3165 microRNA 3165 ncRNA 182-100 chr7 17706636 17707141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -147979 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 208.75-85 chr8 128972814 128973158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6985 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 204.75-3 chr1 16934399 16934777 + 0.75 NA intron (NM_014675, intron 8 of 36) AluJb|SINE|Alu 12657 NM_014675 9696 Hs.309403 NM_014675 ENSG00000058453 CROCC ROLT|TAX1BP2 ciliary rootlet coiled-coil, rootletin protein-coding 130.25-125 chr22 28605772 28606091 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MA7|LINE|L1 73934 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 137.75-178 chr6 62516224 62516453 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230111 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 374.25-8 chr4 61889680 61890323 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 271764 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 149-74 chr22 29483665 29483922 + 0.75 NA intron (NM_021076, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 3575 NM_021076 4744 Hs.198760 NM_021076 ENSG00000100285 NEFH CMT2CC|NFH neurofilament heavy protein-coding 197.75-37 chr19 45734400 45734729 + 0.75 NA intron (NM_001310124, intron 1 of 14) AluJo|SINE|Alu 1313 NM_001310124 388553 Hs.721835 NM_001310124 ENSG00000237452 BHMG1 HMGDC basic helix-loop-helix and HMG-box containing 1 protein-coding 194-5 chr1 88130637 88131093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -553279 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 140-130 chr4 131650283 131650540 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114427 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 195.75-12 chr1 168073088 168073418 + 0.75 NA intron (NM_001017977, intron 18 of 18) intron (NM_001017977, intron 18 of 18) 63183 NM_001267612 23432 Hs.271809 NM_007369 ENSG00000143147 GPR161 RE2 G protein-coupled receptor 161 protein-coding 135.25-14 chr1 203068149 203068495 + 0.75 NA intron (NM_001304331, intron 26 of 29) intron (NM_001304331, intron 26 of 29) -15473 NR_160550 114004358 NR_160550 MYOPARR - myogenin promoter associated myogenic regulatory antisense long non coding RNA ncRNA 138.25-14 chr1 112660461 112660671 + 0.75 NA intron (NM_006135, intron 7 of 9) AluSp|SINE|Alu -13746 NM_020963 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 178.25-87 chr3 178698397 178698764 + 0.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) L1PA13|LINE|L1 139730 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 155.5-168 chr5 84479589 84479930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94879 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 198-47 chr22 35340771 35341127 + 0.75 NA intron (NR_156428, intron 11 of 13) intron (NR_156428, intron 11 of 13) -4150 NR_106717 102464824 NR_106717 ENSG00000274280 MIR6069 hsa-mir-6069 microRNA 6069 ncRNA 126.25-159 chr5 84960740 84961139 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -576059 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 114.75-18 chr1 199196422 199196646 + 0.75 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 47936 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 224.25-79 chr5 111310442 111310984 + 0.75 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 86329 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 128.25-181 chr6 136223591 136223792 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 26620 NM_001318738 113115 Hs.121536 NM_138419 ENSG00000146410 MTFR2 DUFD1|FAM54A mitochondrial fission regulator 2 protein-coding 152.75-129 chr5 66142118 66142354 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -2064 NM_001323529 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 153.25-73 chr2 188627638 188627962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 162323 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 175.75-29 chr12 56200336 56200710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11040 NM_139067 6601 Hs.236030 NM_003075 ENSG00000139613 SMARCC2 BAF170|CRACC2|CSS8|Rsc8 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 2 protein-coding 226-15 chr13 54852623 54853158 + 0.75 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -321564 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 154.25-169 chr8 86136122 86136403 + 0.75 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) intron (NM_152565, intron 2 of 7) 37352 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 170.75-30 chr14 34093284 34093565 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142350 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 122-118 chr3 66153975 66154314 + 0.75 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) intron (NM_173471, intron 1 of 10) 20534 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 193-73 chr5 107451238 107451545 + 0.75 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 219546 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 130-59 chr17 75718403 75718591 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2962 NM_001005731 3691 Hs.632226 NM_000213 ENSG00000132470 ITGB4 CD104|GP150 integrin subunit beta 4 protein-coding 218.25-85 chr6 140867424 140867874 + 0.75 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 183835 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 210-97 chr8 87919248 87919687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45452 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 155-148 chr8 139080765 139081091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166887 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 114-3 chr1 32611536 32611747 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 38909 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 171.5-109 chr3 172690411 172690686 + 0.75 NA intron (NM_001146276, intron 1 of 4) L1ME4c|LINE|L1 20519 NM_001146276 57552 Hs.444099 NM_020792 ENSG00000144959 NCEH1 AADACL1|NCEH neutral cholesterol ester hydrolase 1 protein-coding 177.25-145 chr9 21753107 21753538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49314 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 227.25-24 chr12 100791996 100792505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2526 NM_001286615 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 205.25-32 chr16 3021553 3021956 + 0.75 NA TTS (NM_017885) TTS (NM_017885) 1386 NM_016639 51330 Hs.355899 NM_016639 ENSG00000006327 TNFRSF12A CD266|FN14|TWEAKR TNF receptor superfamily member 12A protein-coding 186.25-124 chr8 129547355 129547618 + 0.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 27532 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 139.25-187 chr7 143129357 143129651 + 0.75 NA intron (NM_001130026, intron 9 of 10) MIR|SINE|MIR -2573 NM_002652 5304 Hs.99949 NM_002652 ENSG00000159763 PIP GCDFP-15|GCDFP15|GPIP4 prolactin induced protein protein-coding 112.25-82 chr18 1909360 1909577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -549839 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 217.75-3 chr1 70299479 70299861 + 0.75 NA intron (NM_030816, intron 7 of 12) L2c|LINE|L2 55052 NM_030816 81573 Hs.744989 NM_030816 ENSG00000118454 ANKRD13C dJ677H15.3 ankyrin repeat domain 13C protein-coding 128.5-15 chr1 171038051 171038261 + 0.75 NA intron (NM_001163629, intron 20 of 21) intron (NM_001163629, intron 20 of 21) -52749 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 137.25-107 chr4 46957195 46957513 + 0.75 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) intron (NM_001204267, intron 7 of 7) 36227 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 178.25-74 chr20 58830760 58831046 + 0.75 NA intron (NR_002785, intron 4 of 4) intron (NR_002785, intron 4 of 4) -8845 NM_016592 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 186.75-13 chr10 95196919 95197267 + 0.75 NA intron (NM_207321, intron 2 of 10) L1ME3G|LINE|L1 2893 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 201-51 chr3 43433264 43433581 + 0.75 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) intron (NM_001346464, intron 12 of 13) -81460 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 197-63 chr8 80849248 80849687 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 25001 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 175.25-49 chr15 59681147 59681408 + 0.75 NA intron (NM_001368060, intron 1 of 8) intron (NM_001368060, intron 1 of 8) 7649 NM_001320675 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 215.5-93 chr5 161013357 161013805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74955 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 123.5-64 chr15 62032325 62032568 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 5 of 81) intron (NM_001018088, intron 5 of 81) 28001 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 186-24 chr13 33719381 33719701 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -42747 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 133.5-77 chr14 51241278 51241657 + 0.75 NA intron (NM_030755, intron 1 of 7) intron (NM_030755, intron 1 of 7) 1220 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 280.25-54 chrX 149851433 149851844 + 0.75 NA intron (NR_109813, intron 1 of 2) L1PB1|LINE|L1 25930 NR_109813 101241891 Hs.744829 NR_109813 ENSG00000280752 LINC00850 KUCG1 long intergenic non-protein coding RNA 850 ncRNA 136.75-154 chr5 23287484 23287783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -219976 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 153-120 chr5 78176032 78176469 + 0.75 NA intron (NM_003664, intron 9 of 26) intron (NM_003664, intron 9 of 26) 118448 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 115.75-214 chr8 89097659 89097863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 659950 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 168-133 chr9 75560967 75561368 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -329477 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 125-163 chr8 117179518 117179930 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 44729 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 150.25-154 chr8 129896364 129896801 + 0.75 NA intron (NM_001353307, intron 4 of 13) intron (NM_001353307, intron 4 of 13) 43229 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 139.5-197 chr7 39200960 39201316 + 0.75 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 127996 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 136.25-204 chrX 86410204 86410482 + 0.75 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 147375 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 163.75-140 chrX 66007290 66007619 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -11416 NR_029637 407008 NR_029637 ENSG00000284567 MIR223 MIRN223|miRNA223|mir-223 microRNA 223 ncRNA 143.5-111 chr2 48690864 48691265 + 0.75 NA intron (NM_000233, intron 10 of 10) intron (NM_000233, intron 10 of 10) 64660 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 115-81 chr2 56629582 56629853 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -443947 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 119.5-257 chr9 107684694 107684941 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -195048 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 152.75-3 chr1 55770842 55771132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 173976 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 157-98 chr5 119589503 119589730 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39942 NM_001367956 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 164.25-27 chr12 12174778 12175132 + 0.75 NA intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 63003 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 133-98 chr20 48162124 48162520 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -172205 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 148.5-186 chr5 82690849 82691117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149172 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 150-126 chr7 4480201 4480473 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -201958 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 131.5-105 chr2 29489067 29489337 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) L2b|LINE|L2 -13825 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 175.75-7 chr1 118826619 118826960 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161554 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 117.25-85 chr16 13836657 13836934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83362 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 146.5-30 chr10 63139895 63140206 + 0.75 NA intron (NM_001282405, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 6722 NM_030759 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 146.25-152 chr8 104688152 104688499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99301 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 147.25-19 chr11 8745411 8745677 + 0.75 NA intron (NM_005418, intron 5 of 22) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -23234 NR_120590 102724784 Hs.613276 NR_120590 LOC102724784 - uncharacterized LOC102724784 ncRNA 188.25-14 chr10 91239854 91240133 + 0.75 NA intron (NM_001256549, intron 2 of 9) intron (NM_001256549, intron 2 of 9) 19330 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 141.5-160 chr4 61067032 61067278 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -76501 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 214.5-77 chr3 36387540 36387964 + 0.75 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 7265 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 194.25-111 chr8 76843146 76843619 + 0.75 NA intron (NM_024721, intron 6 of 10) intron (NM_024721, intron 6 of 10) 123468 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 158.75-164 chr8 130181774 130182037 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 7 of 29) intron (NM_001362925, intron 7 of 29) -97137 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 133.25-64 chr15 88190596 88190885 + 0.75 NA intron (NM_001007156, intron 3 of 15) MIRb|SINE|MIR 15234 NM_001320135 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 139.5-75 chr15 100609014 100609241 + 0.75 NA intron (NM_198243, intron 2 of 5) intron (NM_198243, intron 2 of 5) 6538 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 114-68 chr2 28001530 28001819 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 5 of 13) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 5307 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 167.25-37 chr14 49915783 49916029 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 22824 NM_001663 382 Hs.525330 NM_001663 ENSG00000165527 ARF6 - ADP ribosylation factor 6 protein-coding 125.5-243 chr8 5171701 5171979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176926 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 159.25-152 chr8 103758093 103758357 + 0.75 NA intron (NM_001348496, intron 3 of 23) L1MEi|LINE|L1 -60995 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 153.25-36 chr14 28303653 28303900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 461543 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 211.25-27 chr15 59923182 59923534 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80953 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 122.25-89 chr2 64726686 64726889 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72874 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 253.75-61 chr7 96663987 96664490 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_038948) promoter-TSS (NR_038948) 100 NR_038948 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 165-66 chr2 65458344 65458646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25896 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 178-34 chr17 31384289 31384620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7221 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 161.25-95 chr2 113722656 113723008 + 0.75 NA intron (NM_001330315, intron 14 of 16) intron (NM_001330315, intron 14 of 16) -1464 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 147.5-13 chr1 218939707 218939921 + 0.75 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -21303 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 139.25-22 chr10 105069931 105070179 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) intron (NM_014978, intron 5 of 26) -403839 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 135.25-125 chr3 28741126 28741494 + 0.75 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 166032 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 138.75-62 chr16 7604706 7605008 + 0.75 NA intron (NM_145893, intron 6 of 13) intron (NM_145893, intron 6 of 13) 272012 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 165.75-18 chr10 64859877 64860143 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34482 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 133.5-44 chr10 118606036 118606373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10556 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 203.75 chr1 15617546 15617964 + 0.75 NA exon (NM_032341, exon 1 of 10) exon (NM_032341, exon 1 of 10) 297 NM_032341 84301 Hs.718857 NM_032341 ENSG00000197312 DDI2 - DNA damage inducible 1 homolog 2 protein-coding 215-6 chr1 68789568 68789905 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -266162 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 153.75-127 chr6 37710961 37711429 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13312 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 137.75-155 chr4 81819714 81819928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -347914 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 140-126 chr4 97192425 97192784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -174322 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 216-47 chr20 36595407 36595889 + 0.75 NA intron (NM_001199535, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu -10131 NR_026562 55969 Hs.584985 NM_018840 ENSG00000101084 RAB5IF C20orf24|PNAS-11|RIP5 RAB5 interacting factor protein-coding 200-91 chr8 121855237 121855587 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -213972 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 169.75-141 chr7 37827436 37827896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20931 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 203.25-26 chr11 84244941 84245414 + 0.75 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 28103 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 226.75-62 chr5 38325992 38326323 + 0.75 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) intron (NM_152403, intron 1 of 21) -35171 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 128.75-156 chr5 109497186 109497514 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87376 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 185-55 chr3 58806512 58806866 + 0.75 NA intron (NM_001351530, intron 13 of 15) L1PA3|LINE|L1 -17782 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 133-114 chr4 12293400 12293660 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 70079 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 160.25-170 chr9 122857363 122857598 + 0.75 NA intron (NM_001354479, intron 12 of 19) MIRb|SINE|MIR 22839 NR_003071 692206 Hs.693253 NR_003071 ENSG00000212447 SNORD90 HBII-295 small nucleolar RNA, C/D box 90 snoRNA 124.75-161 chr4 112025684 112025962 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -119631 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 141.25-25 chr10 114748993 114749286 + 0.75 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) -15649 NR_120628 101927692 Hs.576909 NR_120628 ENSG00000228484 LOC101927692 - uncharacterized LOC101927692 ncRNA 244.5-62 chr21 28555093 28555511 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 15984 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 167.25-13 chr10 18005312 18005579 + 0.75 NA intron (NR_038419, intron 3 of 4) intron (NR_038419, intron 3 of 4) 5117 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 155.75-134 chr5 153658445 153658691 + 0.75 NA intron (NM_000827, intron 5 of 15) intron (NM_000827, intron 5 of 15) 166396 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 217-40 chr2 185561181 185561705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 177276 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 133.75-74 chr17 8936165 8936598 + 0.75 NA intron (NM_001142633, intron 1 of 18) L1MC2|LINE|L1 -23864 NM_014308 23533 Hs.278901 NM_014308 ENSG00000141506 PIK3R5 F730038I15Rik|FOAP-2|P101-PI3K|p101 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 protein-coding 245.75-4 chr1 194794489 194794878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1294032 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 190.25-79 chr21 33756144 33756606 + 0.75 NA intron (NM_001001132, intron 8 of 29) intron (NM_001001132, intron 8 of 29) 113874 NM_001001132 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 209-11 chr11 63801720 63802213 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11490 NM_138471 144097 Hs.502793 NM_138471 ENSG00000168005 SPINDOC C11orf84|SPIN-DOC spindlin interactor and repressor of chromatin binding protein-coding 115.5-99 chr18 22585692 22585912 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -167887 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 131-20 chr10 60670705 60670905 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 62723 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 148.25-26 chr11 74342045 74342331 + 0.75 NA intron (NM_173582, intron 12 of 13) intron (NM_173582, intron 12 of 13) -30548 NM_182904 283208 Hs.660541 NM_182904 ENSG00000149380 P4HA3 - prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 3 protein-coding 219-54 chr2 165077520 165077881 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -122175 NM_173512 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 156.5-46 chr12 102540221 102540479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59787 NM_001111285 3479 Hs.160562 NM_000618 ENSG00000017427 IGF1 IGF|IGF-I|IGFI|MGF insulin like growth factor 1 protein-coding 182.75-115 chr6 40713929 40714183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126692 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 150.5-125 chr3 2143993 2144262 + 0.75 NA intron (NR_046555, intron 1 of 2) intron (NR_046555, intron 1 of 2) 114 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 132.25-96 chr2 101452399 101452595 + 0.75 NA intron (NM_001367509, intron 2 of 13) intron (NM_001367509, intron 2 of 13) 22615 NM_001367510 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 133.5-51 chr11 39171750 39171962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 522998 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 205-11 chr10 69476055 69476492 + 0.75 NA intron (NM_001351263, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 24806 NM_001351263 23555 Hs.499941 NM_012339 ENSG00000099282 TSPAN15 2700063A19Rik|NET-7|NET7|TM4SF15 tetraspanin 15 protein-coding 145.25-45 chr15 43379722 43380014 + 0.75 NA intron (NM_014444, intron 5 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie 8767 NM_001286414 27229 Hs.584887 NM_014444 ENSG00000137822 TUBGCP4 76P|GCP-4|GCP4|Grip76|MCCRP3 tubulin gamma complex associated protein 4 protein-coding 262.75-12 chr12 22948868 22949363 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -226521 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 149-96 chr4 140296261 140296666 + 0.75 NA intron (NR_033939, intron 2 of 4) intron (NR_033939, intron 2 of 4) 39155 NM_032547 60592 Hs.480815 NM_032547 ENSG00000153130 SCOC HRIHFB2072|SCOCO|UNC-69 short coiled-coil protein protein-coding 177.75-112 chr5 61838734 61839054 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -103196 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-127 chr22 27859097 27859336 + 0.75 NA intron (NM_001284278, intron 9 of 11) intron (NM_001284278, intron 9 of 11) -57460 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 133-99 chr20 53890839 53891022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15221 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 182-34 chr14 67130784 67131055 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 16 of 21) L1PA16|LINE|L1 -58521 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 149.25-157 chr6 86091811 86092275 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -413310 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 165.5-25 chr11 59777789 59778066 + 0.75 NA intron (NM_001178040, intron 2 of 9) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 22551 NM_001178040 6809 Hs.180711 NM_004177 ENSG00000166900 STX3 STX3A syntaxin 3 protein-coding 149-62 chr2 154521566 154521997 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -64343 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 176-26 chr15 68119491 68119750 + 0.75 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) L1MEc|LINE|L1 65044 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 119.5-133 chr2 203486568 203486775 + 0.75 NA intron (NM_001329728, intron 4 of 15) intron (NM_001329728, intron 4 of 15) 48630 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 128-57 chr17 9794645 9795031 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3246 NM_001105571 201140 Hs.61684 NM_001105571 ENSG00000184544 DHRS7C SDR32C2 dehydrogenase/reductase 7C protein-coding 133.25-58 chr15 67662505 67662727 + 0.75 NA intron (NM_001206804, intron 12 of 21) intron (NM_001206804, intron 12 of 21) 113522 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 113-170 chr7 113623669 113623954 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 295198 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 167.75-18 chr10 16035378 16035634 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -174973 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 169.5-146 chr5 164887595 164887984 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 417510 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 129.75-44 chr11 131338330 131338586 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -32157 NM_001352005 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 194.25-119 chr8 124390180 124390595 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -17688 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 115.25-120 chr21 18374602 18374845 + 0.75 NA intron (NM_002772, intron 5 of 24) intron (NM_002772, intron 5 of 24) 29062 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 170.25-3 chr1 69693118 69693397 + 0.75 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) MER53|DNA|hAT 123916 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 195.5-166 chr9 87336220 87336534 + 0.75 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -160851 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 118.5-57 chr14 72349165 72349471 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -167502 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 144.5-218 chr8 96837997 96838349 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 3 of 7) intron (NM_016134, intron 3 of 7) 192931 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 169.75-47 chr14 46692967 46693331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41368 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 136.5-165 chr4 124903338 124903621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190747 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 161-66 chr2 113004391 113004743 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014440) promoter-TSS (NM_014440) -892 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 191.25-117 chr9 119379369 119379686 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10092 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 194.25-39 chr15 99350631 99351018 + 0.75 NA intron (NR_135755, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu 93299 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 154.5-116 chr20 58222414 58222741 + 0.75 NA intron (NM_001304369, intron 2 of 3) intron (NM_001304369, intron 2 of 3) 6076 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 165-13 chr10 44328185 44328438 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 35561 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 142.25-68 chr16 81166740 81166929 + 0.75 NA intron (NM_052892, intron 18 of 43) intron (NM_052892, intron 18 of 43) 14497 NM_001278423 114780 Hs.413525 NM_052892 ENSG00000166473 PKD1L2 PC1L2 polycystin 1 like 2 (gene/pseudogene) protein-coding 215.5-11 chr10 28838614 28839012 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7595 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 201.5-136 chr9 36690382 36690994 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 117793 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 190.75-68 chr3 153274420 153274858 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 112413 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 260.75-57 chr6 150265536 150266123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103183 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 149.25-137 chr4 130932705 130932959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 556471 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 188-22 chr14 56880873 56881308 + 0.75 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 67932 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 168-32 chr12 4524202 4524505 + 0.75 NA intron (NM_001346157, intron 5 of 11) intron (NM_001346157, intron 5 of 11) 14116 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 184.5-5 chr1 69903118 69903546 + 0.75 NA intron (NM_001370785, intron 7 of 26) L1P3|LINE|L1 -15990 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 114.75-206 chr9 107717384 107717608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -227727 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 213.5-81 chr3 123199036 123199462 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -2694 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 136.25-70 chr16 14076762 14076999 + 0.75 NA intron (NM_001365419, intron 1 of 4) L1MC5a|LINE|L1 5561 NM_001365412 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 238.5-3 chr1 75215438 75215973 + 0.75 NA intron (NM_001320283, intron 17 of 21) intron (NM_001320283, intron 17 of 21) 81317 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 116-32 chr12 16390080 16390395 + 0.75 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 36820 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 144.5-236 chr9 82037924 82038216 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49298 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 228-39 chr2 30155290 30155706 + 0.75 NA intron (NM_001127400, intron 2 of 3) intron (NM_001127400, intron 2 of 3) 8491 NM_016061 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 143.25-156 chr6 54371218 54371416 + 0.75 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) MIRb|SINE|MIR 62876 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 288.75-8 chr10 41899089 41899924 + 0.75 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 468539 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 191.25-67 chr22 39407395 39407921 + 0.75 NA intron (NM_153497, intron 1 of 10) AluSc8|SINE|Alu 7878 NM_006116 10454 Hs.507681 NM_006116 ENSG00000100324 TAB1 3'-Tab1|MAP3K7IP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 protein-coding 121.25-129 chr3 45511030 45511268 + 0.75 NA intron (NM_001368263, intron 14 of 20) intron (NM_001368263, intron 14 of 20) -1604 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 215-42 chr2 71852134 71852638 + 0.75 NA Intergenic CpG 295476 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 141.25-103 chr22 37845235 37845446 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_036556) promoter-TSS (NR_036556) -893 NR_146279 129138 Hs.135259 NM_138797 ENSG00000100124 ANKRD54 LIAR ankyrin repeat domain 54 protein-coding 118.75-188 chr7 104530689 104530877 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 202127 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 126.75-175 chr4 70613551 70613787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15075 NM_031889 10117 Hs.667018 NM_031889 ENSG00000132464 ENAM ADAI|AI1C|AIH2 enamelin protein-coding 131.25-186 chr7 37389957 37390193 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) -36407 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 164-104 chr5 102216100 102216438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80015 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 236-25 chr19 46594848 46595331 + 0.75 NA intron (NM_001370550, intron 1 of 2) L1M2|LINE|L1 5827 NM_001370550 100506012 Hs.671661 NM_001205281 ENSG00000230510 PPP5D1 - PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 protein-coding 212-57 chr3 89288192 89288679 + 0.75 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 180814 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 209.75-4 chr1 203651527 203651892 + 0.75 NA intron (NM_001365784, intron 1 of 20) AluJo|SINE|Alu 23772 NM_001365784 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 127.25-148 chr4 104243225 104243511 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -247597 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 257.5-72 chr7 54904221 54904623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114595 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 169-28 chr14 42880121 42880402 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 1273405 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 163-6 chr1 159894289 159894578 + 0.75 NA intron (NM_012337, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 5646 NR_130464 100422852 NR_130464 ENSG00000266458 MIR4259 - microRNA 4259 ncRNA 202.5-122 chr5 129274933 129275344 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 122009 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 165-149 chr8 131502756 131503040 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -401195 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 289.75 chr1 116176947 116177540 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 65488 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 155-138 chr8 67408528 67408860 + 0.75 NA intron (NR_136224, intron 1 of 4) intron (NR_136224, intron 1 of 4) 64860 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 135-109 chr3 86072573 86072777 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001167675, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001167675, exon 10 of 10) -244625 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 121.75-134 chr4 119188631 119188905 + 0.75 NA TTS (NM_016599) TTS (NM_016599) -23859 NM_019050 54532 Hs.431081 NM_019050 ENSG00000145390 USP53 - ubiquitin specific peptidase 53 protein-coding 196.5-176 chr9 69823020 69823403 + 0.75 NA intron (NR_131757, intron 1 of 2) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 2394 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 197.25-101 chr8 116154757 116155170 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 170096 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 130.75-177 chr7 46417175 46417411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 279829 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 123.5-110 chr2 179019215 179019554 + 0.75 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 30753 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 167.5-176 chr7 37908300 37908542 + 0.75 NA intron (NM_003014, intron 5 of 5) intron (NM_003014, intron 5 of 5) 8396 NM_003014 6424 Hs.658169 NM_003014 ENSG00000106483 SFRP4 FRP-4|FRPHE|FRZB-2|PYL|sFRP-4 secreted frizzled related protein 4 protein-coding 190-94 chrX 154317731 154318048 + 0.75 NA intron (NM_001145934, intron 6 of 11) L2b|LINE|L2 12832 NM_001145934 8277 Hs.102866 NM_012253 ENSG00000007350 TKTL1 TKR|TKT2 transketolase like 1 protein-coding 145.75-132 chr5 126283367 126283786 + 0.75 NA intron (NR_105039, intron 1 of 2) intron (NR_105039, intron 1 of 2) 1599 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 138.5-122 chr22 19989634 19989905 + 0.75 NA intron (NM_001670, intron 3 of 19) intron (NM_001670, intron 3 of 19) 26016 NR_039918 100616414 NR_039918 ENSG00000284031 MIR4761 - microRNA 4761 ncRNA 141.75-145 chr5 138933133 138933335 + 0.75 NA intron (NM_001324005, intron 15 of 15) intron (NM_001324005, intron 15 of 15) 57834 NM_001324006 1495 Hs.445981 NM_001903 ENSG00000044115 CTNNA1 CAP102|MDPT2 catenin alpha 1 protein-coding 144.75-40 chr12 16623181 16623430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15091 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 204-28 chr2 8007215 8007596 + 0.75 NA TTS (NR_034135) TTS (NR_034135) -30591 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 132.5-77 chr14 87923882 87924110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69186 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 117.75-138 chr3 104250472 104250658 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -726449 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 113.5-179 chr4 71523577 71523858 + 0.75 NA intron (NM_003759, intron 13 of 22) intron (NM_003759, intron 13 of 22) 184664 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 259.5-46 chr16 71720506 71720996 + 0.75 NA intron (NM_015020, intron 1 of 18) AluSp|SINE|Alu 3950 NM_015020 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 143.75-120 chr3 81361693 81361979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 367968 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 136.75-164 chr6 27351587 27351901 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 19781 NR_002722 7754 Hs.8198 NR_002722 ZNF204P ZNF184-Lp|ZNF204|ZNF315P|b24o18.1 zinc finger protein 204, pseudogene pseudo 122.25-21 chr10 25084895 25085263 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -22800 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 185.5-29 chr11 114180884 114181358 + 0.75 NA intron (NM_001354752, intron 2 of 4) intron (NM_001354752, intron 2 of 4) -114692 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 121.25-44 chr12 85483359 85483586 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203252 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 265.5-63 chr8 138124068 138124542 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40760 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 188.5-155 chr8 120115976 120116330 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8949 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 227 chr1 14767774 14768124 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) -156180 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 174.75-99 chr5 36767694 36768145 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108775 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 152.25-109 chr4 42743387 42743648 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86412 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 112.75-203 chr8 136415396 136415557 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -115322 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 152.5-179 chr7 66345404 66345824 + 0.75 NA intron (NM_003596, intron 3 of 5) L1MCb|LINE|L1 54794 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 126.5-33 chr11 27468645 27468888 + 0.75 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) MIR3|SINE|MIR -2965 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 122.5-68 chr14 75644315 75644532 + 0.75 NA intron (NM_017791, intron 9 of 9) intron (NM_017791, intron 9 of 9) 16453 NM_007176 11161 Hs.15106 NM_007176 ENSG00000133935 ERG28 C14orf1|NET51 ergosterol biosynthesis 28 homolog protein-coding 165.5-9 chr1 168858097 168858368 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 71291 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 129-182 chr8 125974529 125974734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23434 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 161.25-22 chr10 126351842 126352074 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) intron (NM_001288974, intron 1 of 18) 36519 NM_001288974 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 130.5-102 chr15 76309059 76309253 + 0.75 NA intron (NM_000126, intron 1 of 11) intron (NM_000126, intron 1 of 11) 2313 NM_000126 2108 Hs.39925 NM_000126 ENSG00000140374 ETFA EMA|GA2|MADD electron transfer flavoprotein subunit alpha protein-coding 130.75-23 chr11 9350305 9350548 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -34226 NM_006391 10527 Hs.744911 NM_006391 ENSG00000205339 IPO7 Imp7|RANBP7 importin 7 protein-coding 189.5-30 chr11 77688568 77688935 + 0.75 NA intron (NM_016578, intron 9 of 15) FLAM_A|SINE|Alu -50945 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 168.25-60 chr17 42263014 42263279 + 0.75 NA intron (NM_012448, intron 1 of 18) AluJb|SINE|Alu 13260 NM_012448 6777 Hs.595276 NM_012448 ENSG00000173757 STAT5B STAT5 signal transducer and activator of transcription 5B protein-coding 180.5-80 chr20 32119226 32119534 + 0.75 NA intron (NM_001363731, intron 1 of 17) L1M4|LINE|L1 9652 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 153.75-3 chr1 75958254 75958545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25995 NR_026546 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 137 chr1 32664623 32665025 + 0.75 NA intron (NM_005610, intron 3 of 11) intron (NM_005610, intron 3 of 11) 13466 NM_001135256 5928 Hs.16003 NM_005610 ENSG00000162521 RBBP4 NURF55|RBAP48|lin-53 RB binding protein 4, chromatin remodeling factor protein-coding 161.75-97 chr4 67044845 67045227 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 376964 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 170.5-159 chr6 68492796 68493155 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 141349 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 139.25-212 chr9 96861628 96862068 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -7052 NR_038890 100132781 Hs.710921 NR_038890 LOC100132781 - cyclin Y like 1 pseudogene pseudo 127.25-156 chr5 21081510 21081722 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -377864 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 119.75-112 chr2 128953695 128953961 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 89228 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 140.25-50 chr15 58814742 58815156 + 0.75 NA intron (NM_001040450, intron 4 of 8) L1M4|LINE|L1 43647 NM_001040450 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 262.75-24 chr18 54167119 54167632 + 0.75 NA intron (NM_003927, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 55037 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 161.25-130 chr4 38402005 38402247 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 35212 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 216.25-72 chr3 177920642 177921208 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 104060 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 155.25-61 chr14 65569319 65569581 + 0.75 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 98348 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 132.5-109 chr2 25039138 25039444 + 0.75 NA non-coding (NR_034113, exon 3 of 3) non-coding (NR_034113, exon 3 of 3) -2785 NM_014971 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 157-58 chr2 82941271 82941615 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84640 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 112.75-37 chr12 2150429 2150593 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 72970 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 178.25-107 chr7 11963105 11963486 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -131097 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 147.25-140 chr8 61257024 61257315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30801 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 162.5-86 chr2 142202387 142202767 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -70876 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 128.25-130 chr3 87802840 87803155 + 0.75 NA intron (NM_001322208, intron 1 of 2) intron (NM_001322208, intron 1 of 2) 10291 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 150-128 chr7 9456577 9456893 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -177535 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 136.25-179 chr7 95863357 95863786 + 0.75 NA intron (NM_004411, intron 5 of 16) intron (NM_004411, intron 5 of 16) 91065 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 241.5-87 chr7 8327169 8327532 + 0.75 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -64738 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 120.75-83 chr2 190046297 190046499 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 16331 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 204-3 chr1 213303355 213303733 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 252303 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 142.5-128 chr21 18188471 18188800 + 0.75 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -56198 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 133.5-233 chr6 62014051 62014331 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 272034 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 126.5-230 chr7 97107210 97107471 + 0.75 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -9253 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 316.5-36 chr7 26878699 26879223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14371 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 207.75-71 chr3 49026625 49026998 + 0.75 NA exon (NM_000884, exon 7 of 14) exon (NM_000884, exon 7 of 14) 2587 NM_000884 3615 Hs.654400 NM_000884 ENSG00000178035 IMPDH2 IMPD2|IMPDH-II inosine monophosphate dehydrogenase 2 protein-coding 187.25-60 chr2 155241648 155242063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 543160 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 119-167 chr6 90752047 90752416 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -165159 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 120.25-50 chr12 39687691 39687935 + 0.75 NA intron (NM_001031748, intron 10 of 12) intron (NM_001031748, intron 10 of 12) 61630 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 164.25-163 chr9 134041185 134041625 + 0.75 NA intron (NM_007371, intron 8 of 11) intron (NM_007371, intron 8 of 11) -12885 NR_135126 100130548 Hs.671096 NR_135126 ENSG00000235138 LOC100130548 - uncharacterized LOC100130548 ncRNA 172.5-39 chr11 48159263 48159600 + 0.75 NA intron (NM_002843, intron 21 of 24) MER102b|DNA|hAT-Charlie -57379 NM_001005470 119765 Hs.553566 NM_001005470 ENSG00000175619 OR4B1 OR11-106|OST208 olfactory receptor family 4 subfamily B member 1 protein-coding 195-36 chr16 88723653 88724037 + 0.75 NA intron (NM_001142864, intron 31 of 50) intron (NM_001142864, intron 31 of 50) -7335 NR_103774 100289580 Hs.437712 NM_207451 LOC100289580 - uncharacterized LOC100289580 ncRNA 118.5-128 chr3 106972028 106972204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 268522 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 142.75-60 chr14 34681425 34681776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32217 NM_021914 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 125.75-168 chr6 156321585 156321894 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -57011 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 131.75-163 chr5 26417801 26418088 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 620642 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 198-73 chr7 95321986 95322411 + 0.75 NA intron (NM_000446, intron 1 of 8) intron (NM_000446, intron 1 of 8) 2334 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 186.25-105 chr6 129420188 129420504 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 40 of 64) intron (NM_000426, intron 40 of 64) 289831 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 174.25-10 chr1 230715303 230715726 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -1392 NM_000029 183 Hs.19383 NM_000029 ENSG00000135744 AGT ANHU|SERPINA8|hFLT1 angiotensinogen protein-coding 193-30 chr16 52938177 52938575 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 114497 NR_147075 105371267 Hs.147562 NR_136518 ENSG00000277639 LOC105371267 PR-lncRNA-1 p53-regulated lncRNA 1 ncRNA 149-83 chr3 157734604 157734864 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 191390 NM_001243729 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 176.5-109 chr20 32335468 32335768 + 0.75 NA TTS (NM_004798) TTS (NM_004798) -22726 NM_015338 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 200.5-91 chr3 106685250 106685718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 555154 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 116.25-240 chr9 18325269 18325589 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -148724 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 301.75-37 chr7 111758589 111759343 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 40 of 52) intron (NM_001363540, intron 40 of 52) -49539 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-174 chrX 46861141 46861592 + 0.75 NA intron (NM_006915, intron 3 of 4) L3|LINE|CR1 24323 NM_006915 6102 Hs.44766 NM_006915 ENSG00000102218 RP2 DELXp11.3|NM23-H10|NME10|TBCCD2|XRP2 RP2 activator of ARL3 GTPase protein-coding 148-104 chr5 90756071 90756394 + 0.75 NA intron (NR_003149, intron 55 of 89) intron (NR_003149, intron 55 of 89) 197435 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 266.5-52 chr3 117525580 117526070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165100 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 127.75-30 chr10 58391600 58391921 + 0.75 NA intron (NR_073073, intron 6 of 7) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 6350 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 177.75-6 chr1 86897713 86898049 + 0.75 NA intron (NR_144512, intron 2 of 4) intron (NR_144512, intron 2 of 4) 16245 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 216-82 chr9 21464426 21464836 + 0.75 NA intron (NR_152878, intron 2 of 2) L1PA14|LINE|L1 17682 NM_176891 338376 Hs.682604 NM_176891 ENSG00000184995 IFNE IFN-E|IFNE1|IFNT1|INFE1|PRO655 interferon epsilon protein-coding 183.75-18 chr10 72787668 72788195 + 0.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluSx|SINE|Alu 66902 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 194.25-108 chr7 78619901 78620334 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 272875 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 146.75-157 chr8 86108823 86109135 + 0.75 NA intron (NM_152565, intron 1 of 7) intron (NM_152565, intron 1 of 7) 10069 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 119.5-34 chr10 85631274 85631469 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 13 of 15) intron (NM_017551, intron 13 of 15) 53640 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 114.75-60 chr15 61517190 61517408 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -212619 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 133.25-102 chr2 120688196 120688468 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47536 NM_001371271 144.75-109 chr3 59879214 59879524 + 0.75 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) 201540 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 163.75-79 chr20 38825933 38826271 + 0.75 NA intron (NM_015568, intron 1 of 10) intron (NM_015568, intron 1 of 10) 20405 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 119.25-100 chr2 166958016 166958249 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 69645 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 125.25-101 chr2 100336401 100336627 + 0.75 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -13781 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 180.75-83 chr22 48104773 48105198 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -169379 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 181-43 chr18 11838171 11838555 + 0.75 NA intron (NM_001369387, intron 5 of 11) L1MB8|LINE|L1 -13050 NM_020412 57132 Hs.656244 NM_020412 ENSG00000255112 CHMP1B C10orf2|C18-ORF2|C18orf2|CHMP1.5|Vps46-2|Vps46B|hVps46-2 charged multivesicular body protein 1B protein-coding 171-84 chr21 20013857 20014169 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114258 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 131.5-155 chr3 62229483 62229690 + 0.75 NA intron (NM_002841, intron 13 of 29) intron (NM_002841, intron 13 of 29) 89361 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 151.5-19 chr10 95646514 95646920 + 0.75 NA intron (NM_001323414, intron 2 of 17) intron (NM_001323414, intron 2 of 17) 9994 NM_001323413 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 136-89 chr20 44345235 44345439 + 0.75 NA exon (NM_178491, exon 4 of 5) exon (NM_178491, exon 4 of 5) 8179 NM_178491 140902 Hs.580807 NM_178491 ENSG00000101074 R3HDML dJ881L22.3 R3H domain containing like protein-coding 149.5-26 chr10 54313363 54313639 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -172729 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 125-63 chr2 6895855 6896261 + 0.75 NA 3' UTR (NM_080657, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_080657, exon 6 of 6) 18281 NM_080657 91543 Hs.17518 NM_080657 ENSG00000134321 RSAD2 2510004L01Rik|cig33|cig5|vig1 radical S-adenosyl methionine domain containing 2 protein-coding 129.75-147 chr5 61409801 61410093 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 77689 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 192.75-95 chr4 30888614 30888988 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L1MC5|LINE|L1 168432 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 142.75-99 chr2 81380124 81380425 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 86672 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 114.5-236 chr7 26382825 26383011 + 0.75 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -6217 NR_136270 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 185.25-60 chr2 142123072 142123334 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 8498 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 121.5-44 chr11 75886619 75886794 + 0.75 NA intron (NM_003369, intron 4 of 14) intron (NM_003369, intron 4 of 14) 71496 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 178.25-100 chr5 146091685 146092070 + 0.75 NA intron (NM_001029869, intron 2 of 3) intron (NM_001029869, intron 2 of 3) 13700 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 180.25-19 chr13 95247019 95247334 + 0.75 NA intron (NM_001105515, intron 2 of 20) intron (NM_001105515, intron 2 of 20) 36832 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 128.5-87 chr16 87129560 87129823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71907 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 233.5-82 chr5 24831136 24831682 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 9174 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 130-164 chr8 73782012 73782218 + 0.75 NA intron (NM_001271015, intron 5 of 5) AluSc|SINE|Alu -34407 NM_001164384 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 113.5-212 chr6 94693148 94693334 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 884210 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 156.25-141 chr7 69942653 69943081 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 344392 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 178-105 chr8 137796945 137797248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 286449 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 155.25-105 chr20 9901339 9901707 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -62447 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 145.25-110 chr4 44239040 44239381 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 209599 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 192.25-74 chr3 17358162 17358636 + 0.75 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) AluSp|SINE|Alu 341621 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 199.25-24 chr12 114200882 114201475 + 0.75 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 40592 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 161.75-20 chr10 51025498 51025894 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) LTR78|LTR|ERV1 34808 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 142.25-171 chr8 128177923 128178286 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27988 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 122.5-175 chr5 11068997 11069162 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) intron (NM_001288715, intron 15 of 20) -307845 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 213.5-98 chr4 175939986 175940417 + 0.75 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) intron (NR_048571, intron 1 of 5) 62490 NM_001261447 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 174-91 chr7 46301444 46301806 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -380353 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 154-27 chr11 44200933 44201247 + 0.75 NA intron (NM_207122, intron 9 of 13) intron (NM_207122, intron 9 of 13) 104893 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 196-77 chr5 39898190 39898516 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153938 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 123.75-118 chr3 97045542 97045816 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 231085 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 138.25-152 chr6 153311814 153312108 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -180679 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 124.5-120 chr20 7306453 7306646 + 0.75 NA intron (NR_135005, intron 1 of 1) intron (NR_135005, intron 1 of 1) 883 NR_135005 101929288 Hs.738005 NR_135005 ENSG00000261249 LINC01751 - long intergenic non-protein coding RNA 1751 ncRNA 116.5-83 chr15 96619018 96619188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 162551 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 138.75 chr1 58937714 58937904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82667 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 186-94 chr9 37834958 37835272 + 0.75 NA intron (NM_001286810, intron 2 of 6) intron (NM_001286810, intron 2 of 6) 34318 NM_024345 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 141.75-133 chr5 14370246 14370634 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 18 of 56) intron (NM_007118, intron 18 of 56) -93543 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 139.75-90 chr2 19438564 19438774 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -80046 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 147-116 chr5 149948261 149948522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3598 NM_000440 5145 Hs.567314 NM_000440 ENSG00000132915 PDE6A CGPR-A|PDEA|RP43 phosphodiesterase 6A protein-coding 147.75-53 chr17 59639113 59639353 + 0.75 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) intron (NM_001288653, intron 1 of 31) 19338 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 151.75-79 chr20 38566589 38567029 + 0.75 NA intron (NM_001282917, intron 25 of 29) intron (NM_001282917, intron 25 of 29) -14388 NM_001018082 149685 Hs.368028 NM_174906 ENSG00000182035 ADIG SMAF1 adipogenin protein-coding 183.5-35 chr11 114943231 114943554 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 264865 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 133.5-162 chr3 53475686 53475922 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -18807 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 231-52 chr3 115464574 115465146 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -158650 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 145.5-178 chr7 23182941 23183241 + 0.75 NA intron (NM_001370446, intron 1 of 7) intron (NM_001370446, intron 1 of 7) 1043 NM_001370443 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 138.25-119 chr3 110217112 110217464 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 614460 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 131.5-50 chr13 43610550 43610727 + 0.75 NA intron (NM_001127615, intron 1 of 16) intron (NM_001127615, intron 1 of 16) 18839 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 218.5-104 chr5 162084849 162085294 + 0.75 NA intron (NM_198904, intron 1 of 9) intron (NM_198904, intron 1 of 9) 17429 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 118.5-152 chr4 124089321 124089656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 315224 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 150.25-148 chr8 97302697 97302977 + 0.75 NA intron (NR_125390, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR -24909 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 116-88 chr2 144650359 144650620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17478 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 125.5-134 chr2 162260183 162260452 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16872 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 158.75-127 chr4 85171400 85171724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 204078 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 202.25-30 chr17 58040118 58040490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32958 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 130.75-169 chr6 76862374 76862762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -268945 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 123.75-60 chr14 65359347 65359683 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -24332 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 176-74 chr8 123781542 123781919 + 0.75 NA intron (NM_144963, intron 8 of 23) AluSx1|SINE|Alu 13291 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 155-76 chr20 45810887 45811143 + 0.75 NA intron (NM_052951, intron 12 of 12) intron (NM_052951, intron 12 of 12) -1561 NM_001281742 11065 Hs.93002 NM_007019 ENSG00000175063 UBE2C UBCH10|dJ447F3.2 ubiquitin conjugating enzyme E2 C protein-coding 272.5-41 chr20 849301 849868 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 4941 NM_031424 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 119.5-41 chr11 6927305 6927526 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001354854) promoter-TSS (NM_001354854) -247 NM_001354854 7762 Hs.523457 NM_013250 ENSG00000149054 ZNF215 BAZ-2|BAZ2|ZKSCAN11|ZSCAN43 zinc finger protein 215 protein-coding 333.75-8 chr15 60884648 60885245 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 203377 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 174.5-139 chr4 136398791 136399102 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -485266 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 120-91 chr2 114114195 114114466 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -134346 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 146.75-110 chr4 34195907 34196258 + 0.75 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) intron (NR_147184, intron 2 of 3) 73665 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 172.25-28 chr12 578645 579111 + 0.75 NA intron (NM_016533, intron 1 of 3) intron (NM_016533, intron 1 of 3) 7608 NR_134624 105369595 Hs.504422 NR_134624 LOC105369595 - uncharacterized LOC105369595 ncRNA 151-90 chr3 182807201 182807403 + 0.75 NA intron (NM_014616, intron 1 of 29) intron (NM_014616, intron 1 of 29) 13798 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 280-21 chr16 73178608 73179253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34483 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 138-126 chr5 27387238 27387555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84896 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 256 chr1 70273212 70273826 + 0.75 NA intron (NM_030816, intron 11 of 12) L1ME3G|LINE|L1 52139 NM_001350613 9295 Hs.479693 NM_004768 ENSG00000116754 SRSF11 NET2|SFRS11|dJ677H15.2|p54 serine and arginine rich splicing factor 11 protein-coding 164-38 chr15 23877694 23878095 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97253 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 278.75-8 chr14 78603427 78604114 + 0.75 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 200051 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 142.5-217 chr8 77115732 77116151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114897 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 157.25-79 chr2 82145463 82145732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -678651 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 165.75-22 chr10 125488898 125489238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85303 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 159-85 chr5 20382175 20382605 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 76839 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 126-12 chr1 186732705 186733034 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52215 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 214.5-35 chr14 83570978 83571535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 928624 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 189.25-135 chr9 35634095 35634385 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -12030 NR_135130 101926948 Hs.639412 NR_135130 LOC101926948 - uncharacterized LOC101926948 ncRNA 127.75-50 chr11 130470007 130470177 + 0.75 NA intron (NM_139055, intron 5 of 7) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 21118 NM_139055 170689 Hs.534221 NM_139055 ENSG00000166106 ADAMTS15 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 15 protein-coding 154.5-141 chr4 118955079 118955351 + 0.75 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 66361 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 247-10 chr11 46645810 46646276 + 0.75 NA intron (NM_001346358, intron 4 of 16) intron (NM_001346358, intron 4 of 16) 28767 NR_144422 9776 Hs.127403 NM_014741 ENSG00000175224 ATG13 KIAA0652|PARATARG8 autophagy related 13 protein-coding 129.5-142 chr20 20899615 20899816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -187071 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 139.5-110 chr2 174642597 174642926 + 0.75 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) FRAM|SINE|Alu -8156 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 131.75-6 chr1 64998107 64998371 + 0.75 NA intron (NR_119383, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 4237 NR_119383 101927084 Hs.734218 NR_119383 ENSG00000226891 LINC01359 - long intergenic non-protein coding RNA 1359 ncRNA 323.25-7 chr11 91164245 91164867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -295354 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 165-81 chr21 25688832 25689258 + 0.75 NA intron (NM_001270407, intron 2 of 8) intron (NM_001270407, intron 2 of 8) -45927 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 191.75-104 chr5 87846376 87846891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 184591 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 119.5-184 chr5 112837186 112837466 + 0.75 NA intron (NM_001354895, intron 15 of 15) intron (NM_001354895, intron 15 of 15) -23862 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 121.75-73 chr2 11939242 11939505 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -67743 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 218-3 chr1 96648027 96648599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73292 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 149.75-59 chr16 73923384 73923659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292000 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 149-100 chr5 45490077 45490316 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 206184 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 157.25-158 chr9 12084547 12084795 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -608714 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 200-32 chr15 62158147 62158564 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 6930 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 143.75-74 chr18 36316460 36316720 + 0.75 NA intron (NM_001281740, intron 1 of 28) intron (NM_001281740, intron 1 of 28) 18877 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 133-78 chr2 9493707 9493927 + 0.75 NA exon (NM_003183, exon 16 of 19) exon (NM_003183, exon 16 of 19) 18762 NM_001320858 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 170.75-55 chr18 1578520 1578859 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -219060 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 129-130 chr4 99743512 99743755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73194 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 198.75 chr1 13741084 13741432 + 0.75 NA intron (NM_012231, intron 4 of 9) intron (NM_012231, intron 4 of 9) -8157 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 165.5-49 chr14 75486679 75486958 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35651 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 233.5-32 chr13 91253893 91254275 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -42386 NR_047004 100874150 Hs.711947 NR_047004 LINC00379 - long intergenic non-protein coding RNA 379 ncRNA 119.25-107 chr20 13127821 13128124 + 0.75 NA intron (NM_001349945, intron 10 of 12) intron (NM_001349945, intron 10 of 12) -93302 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 126-21 chr10 57726218 57726501 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -421800 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 131.75-169 chr5 64517633 64517849 + 0.75 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) intron (NM_001029875, intron 2 of 5) 11726 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 139.25-32 chr11 79638778 79639144 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -197931 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 131.75-61 chr14 41455424 41455702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151293 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 140.5-2 chr1 15443459 15443661 + 0.75 NA intron (NM_007272, intron 5 of 7) intron (NM_007272, intron 5 of 7) 5117 NM_007272 11330 Hs.631869 NM_007272 ENSG00000162438 CTRC CLCR|ELA4 chymotrypsin C protein-coding 132-26 chr11 9121534 9121871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27339 NR_027713 283102 Hs.689472 NR_027713 ENSG00000213538 KRT8P41 - keratin 8 pseudogene 41 pseudo 122.75-215 chr9 37736380 37736569 + 0.75 NA intron (NM_001371225, intron 13 of 15) AluSq2|SINE|Alu -17329 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 167.25-54 chr16 1456613 1456979 + 0.75 NA intron (NM_001287, intron 9 of 24) AluSx1|SINE|Alu -12307 NM_001143980 645811 Hs.355232 NM_001143980 ENSG00000197599 CCDC154 C16orf29 coiled-coil domain containing 154 protein-coding 143-19 chr11 43120501 43120711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148763 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 163.75-105 chr4 46290109 46290529 + 0.75 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) L1MB5|LINE|L1 99060 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 117 chr1 5941556 5941766 + 0.75 NA intron (NR_111987, intron 9 of 32) L1MD3|LINE|L1 50764 NM_001291593 261734 Hs.462348 NM_015102 ENSG00000131697 NPHP4 POC10|SLSN4 nephrocystin 4 protein-coding 146.75-178 chr9 102052408 102052652 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -313950 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 150-65 chr18 6210031 6210391 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 12 of 16) intron (NM_001365769, intron 12 of 16) -46533 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 135.25-16 chr1 209368532 209368816 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3381 NR_146491 101929476 Hs.568721 NR_146491 LINC01698 - long intergenic non-protein coding RNA 1698 ncRNA 176.5-89 chr2 64177100 64177408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28231 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 131.5-112 chr2 64472793 64473090 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13412 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 145.75-65 chr18 3190266 3190638 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 3 of 36) intron (NM_019856, intron 3 of 36) 29516 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 178-68 chr3 186106575 186107075 + 0.75 NA intron (NM_004454, intron 1 of 12) intron (NM_004454, intron 1 of 12) 2264 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 135.5-177 chr6 142110494 142110769 + 0.75 NA intron (NM_001324308, intron 1 of 2) L1MB8|LINE|L1 -21832 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 174.5-121 chr3 110130152 110130480 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 527488 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 122.75-218 chrX 78519970 78520273 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139207 NM_152694 203430 Hs.134873 NM_152694 ENSG00000179300 RTL3 Mar3|Mart3|SIRH9|ZCCHC5|ZHC5 retrotransposon Gag like 3 protein-coding 162.5-69 chr18 2921650 2921896 + 0.75 NA intron (NM_014646, intron 17 of 19) intron (NM_014646, intron 17 of 19) 24850 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 147.5-43 chr12 13728766 13729104 + 0.75 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 251421 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 259-9 chr10 66562245 66562757 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -363535 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 119-187 chr7 80610256 80610481 + 0.75 NA intron (NM_001371080, intron 1 of 10) intron (NM_001371080, intron 1 of 10) 8161 NM_001289911 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 214-73 chr9 124206989 124207347 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -50438 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 151.25-23 chr10 88262711 88262932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 320497 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 203.75-17 chr11 56983048 56983586 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -5597 NM_001005323 390181 Hs.554520 NM_001005323 ENSG00000181273 OR5AK2 - olfactory receptor family 5 subfamily AK member 2 protein-coding 136.25-36 chr11 100147005 100147337 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) L2|LINE|L2 -540117 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 149.5-208 chr8 116748940 116749194 + 0.75 NA intron (NM_003756, intron 1 of 7) intron (NM_003756, intron 1 of 7) 6756 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 123.5-133 chr3 63711160 63711348 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 58579 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 175.25-31 chr11 113846577 113846810 + 0.75 NA intron (NM_001346268, intron 1 of 20) intron (NM_001346268, intron 1 of 20) 28879 NM_001346273 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 254-51 chr8 144805796 144806310 + 0.75 NA intron (NR_134285, intron 3 of 3) LTR13|LTR|ERVK 7177 NR_134285 340385 Hs.521942 NM_213605 ENSG00000197363 ZNF517 - zinc finger protein 517 protein-coding 145-139 chr6 133261467 133261697 + 0.75 NA intron (NM_172103, intron 1 of 18) intron (NM_172103, intron 1 of 18) 20083 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 115.75-19 chr10 66357560 66357760 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) L1MB8|LINE|L1 -568376 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 131.5-138 chr20 37380893 37381152 + 0.75 NA intron (NM_198291, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR 34894 NM_198291 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 128.5-61 chr14 52396636 52396912 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 82462 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 160.25-14 chr11 32422227 32422571 + 0.75 NA intron (NR_160306, intron 3 of 9) intron (NR_160306, intron 3 of 9) 8414 NM_001198552 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 128.25-148 chr4 79418680 79419014 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -10619 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 182.25-82 chr3 107136483 107136777 + 0.75 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) MER21-int|LTR|ERVL 104008 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 161-47 chr15 97141460 97141824 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 358207 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 164.5-126 chr22 27599177 27599429 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 202453 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 116.5-248 chr8 99907308 99907607 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -13750 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 122-115 chr3 50733648 50733868 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) L1M4c|LINE|L1 58678 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 119.5-134 chr2 224862370 224862551 + 0.75 NA intron (NM_001290263, intron 14 of 55) intron (NM_001290263, intron 14 of 55) 84589 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 114.75-118 chr3 2086826 2086996 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11892 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 172.25-106 chr5 15038381 15038792 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -166808 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 139.5-127 chr3 4935780 4936031 + 0.75 NA intron (NR_125916, intron 1 of 2) intron (NR_125916, intron 1 of 2) -29404 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 204-66 chr5 99308489 99308893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -225299 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 170.25-57 chr17 64136873 64137323 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6954 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 136.5-234 chr8 118220047 118220313 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -108361 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 166.5-172 chr5 169489882 169490343 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -93661 NM_001329639 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 133.25-92 chr2 33384388 33384642 + 0.75 NA intron (NM_206943, intron 31 of 33) intron (NM_206943, intron 31 of 33) -34001 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 124.75-9 chr1 105806989 105807322 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -188220 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 163.75-23 chr11 29333304 29333770 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -260876 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 232.75-48 chr4 56406242 56406887 + 0.75 NA exon (NM_002703, exon 3 of 11) exon (NM_002703, exon 3 of 11) -19056 NM_001286669 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 196-27 chr14 51321950 51322387 + 0.75 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) intron (NR_145423, intron 1 of 1) 6217 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 155.75-51 chr14 62564115 62564510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -424339 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 166.5-64 chr14 65752333 65752744 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 281436 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 140.25-71 chr17 54931098 54931407 + 0.75 NA intron (NM_001321173, intron 8 of 9) MIRb|SINE|MIR 30400 NM_005486 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 120.75-18 chr10 84627453 84627740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 202427 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 206-40 chr19 29687098 29687469 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 21822 NM_024310 79156 Hs.466383 NM_024310 ENSG00000166289 PLEKHF1 APPD|LAPF|PHAFIN1|ZFYVE15 pleckstrin homology and FYVE domain containing 1 protein-coding 142.75-116 chr21 22628806 22629144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -450309 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 152.5-62 chr16 54124918 54125136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 85634 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 160-39 chr15 94056149 94056500 + 0.75 NA intron (NR_120320, intron 2 of 8) intron (NR_120320, intron 2 of 8) 51614 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 141.75-20 chr10 55022330 55022628 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MA8|LINE|L1 -221188 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 256.75-25 chr2 236769531 236770082 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199981 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 157.75-116 chr3 190193128 190193499 + 0.75 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -70876 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 154-56 chr19 15710256 15710675 + 0.75 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 -17559 NM_013939 26538 Hs.247694 NM_013939 ENSG00000171942 OR10H2 - olfactory receptor family 10 subfamily H member 2 protein-coding 143.25-36 chr12 45225827 45226103 + 0.75 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) 9870 NM_001025356 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 123-95 chr2 29007285 29007574 + 0.75 NA intron (NM_001321538, intron 6 of 18) intron (NM_001321538, intron 6 of 18) 26131 NM_001321538 165186 Hs.525977 NM_199280 ENSG00000189350 TOGARAM2 FAM179A TOG array regulator of axonemal microtubules 2 protein-coding 148-57 chr2 80273919 80274366 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 30610 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 153.5-206 chr8 132231142 132231457 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -126034 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 137-21 chr10 26812281 26812504 + 0.75 NA intron (NM_001012752, intron 2 of 9) intron (NM_001012752, intron 2 of 9) 48695 NM_001348032 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 139.25-169 chr7 16278198 16278574 + 0.75 NA intron (NR_160656, intron 3 of 7) intron (NR_160656, intron 3 of 7) 67900 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 126.5-127 chr20 13399168 13399440 + 0.75 NA intron (NM_017714, intron 13 of 13) L2a|LINE|L2 -159617 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-74 chr17 14261821 14262109 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -25103 NM_001007530 146822 Hs.447556 NM_001007530 ENSG00000223510 CDRT15 - CMT1A duplicated region transcript 15 protein-coding 128.25-173 chr6 53625550 53625782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2714 NR_125841 101927171 Hs.334005 NR_125841 ENSG00000235899 LINC01564 TCONS_00011314|XLOC_005327 long intergenic non-protein coding RNA 1564 ncRNA 153-144 chr7 143183687 143184006 + 0.75 NA exon (NM_176881, exon 1 of 1) exon (NM_176881, exon 1 of 1) 427 NM_176881 259285 Hs.553660 NM_176881 ENSG00000236398 TAS2R39 T2R39|T2R57 taste 2 receptor member 39 protein-coding 125.25-176 chr6 147382344 147382748 + 0.75 NA intron (NM_139244, intron 24 of 25) intron (NM_139244, intron 24 of 25) -126144 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 141.25-12 chr1 164430852 164431283 + 0.75 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu -128293 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 129-84 chr19 44842719 44842920 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3478 NM_001042724 5819 Hs.655455 NM_002856 ENSG00000130202 NECTIN2 CD112|HVEB|PRR2|PVRL2|PVRR2 nectin cell adhesion molecule 2 protein-coding 164.25-139 chr6 109098375 109098739 + 0.75 NA intron (NM_001350663, intron 1 of 9) AluJr|SINE|Alu -3711 NM_014454 27244 Hs.591336 NM_014454 ENSG00000080546 SESN1 PA26|SEST1 sestrin 1 protein-coding 161.25-62 chr15 96712873 96713191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68622 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 126.5-19 chr1 214163736 214163935 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117324 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 192.75-3 chr1 31135701 31136221 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70244 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 206.75-48 chr21 17429114 17429434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9616 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 127.75-216 chrX 97438736 97439120 + 0.75 NA intron (NM_006729, intron 26 of 26) intron (NM_006729, intron 26 of 26) 125607 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 122.75-124 chr3 6606765 6607017 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 198558 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 183.5 chr1 20840678 20841131 + 0.75 NA exon (NM_001198801, exon 28 of 35) exon (NM_001198801, exon 28 of 35) -54216 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 203-73 chr4 100540290 100540641 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -22443 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 123.25-155 chr4 168920853 168921075 + 0.75 NA intron (NM_001367567, intron 7 of 11) intron (NM_001367567, intron 7 of 11) 88869 NM_001367570 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 177.25-92 chr3 20780905 20781265 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 438617 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 255.5-30 chr16 57443947 57444353 + 0.75 NA intron (NM_001308358, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 3235 NM_020313 57019 Hs.4900 NM_020313 ENSG00000005194 CIAPIN1 Anamorsin|CIAE2|DRE2|PRO0915 cytokine induced apoptosis inhibitor 1 protein-coding 144.5-28 chr10 25346502 25346777 + 0.75 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -170363 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 229.75-5 chr1 80179744 80180139 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -355814 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 208-47 chr20 53654576 53654914 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 46391 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 227.25-4 chr1 54519523 54520213 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -28360 NM_147161 26027 Hs.745173 NM_015547 ENSG00000162390 ACOT11 BFIT|STARD14|THEA|THEM1 acyl-CoA thioesterase 11 protein-coding 218-32 chr2 63053139 63053625 + 0.75 NA intron (NM_001199770, intron 3 of 4) intron (NM_001199770, intron 3 of 4) 2552 NR_130153 5013 Hs.734360 NM_014562 ENSG00000115507 OTX1 - orthodenticle homeobox 1 protein-coding 128.5-190 chr6 56248359 56248636 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_134850) promoter-TSS (NR_134850) -917 NM_030820 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 164.75-151 chr9 9036393 9036712 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 10 of 45) L1MC3|LINE|L1 178534 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 166-15 chr10 103296833 103297249 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19903 NM_032727 9118 Hs.500916 NM_032727 ENSG00000148798 INA NEF5|NF-66|TXBP-1 internexin neuronal intermediate filament protein alpha protein-coding 139.25-27 chr10 124638272 124638519 + 0.75 NA intron (NM_014661, intron 4 of 4) (AAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -65633 NR_120631 101927944 Hs.437448 NR_120630 FAM53B-AS1 - FAM53B antisense RNA 1 ncRNA 123.5-198 chr7 35467467 35467754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 153755 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 127.5-230 chr7 48036587 48036812 + 0.75 NA intron (NM_001100159, intron 2 of 8) intron (NM_001100159, intron 2 of 8) 1156 NM_001100159 136288 Hs.258357 NM_001100159 ENSG00000164746 C7orf57 - chromosome 7 open reading frame 57 protein-coding 183.5-145 chr8 29087132 29087428 + 0.75 NA intron (NM_015254, intron 37 of 39) L3|LINE|CR1 175790 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 141-90 chr20 47700465 47700822 + 0.75 NA intron (NM_198596, intron 4 of 20) AluSx1|SINE|Alu 85421 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 159.5-123 chr20 14257642 14257987 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1PB1|LINE|L1 79798 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 129.75-123 chr3 103477152 103477332 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 46874 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 278.5-51 chr7 73885165 73885789 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24318 NM_182504 135886 Hs.647026 NM_182504 ENSG00000175877 TMEM270 WBSCR28 transmembrane protein 270 protein-coding 146-78 chr20 13800072 13800362 + 0.75 NA intron (NR_147981, intron 6 of 11) intron (NR_147981, intron 6 of 11) 15189 NR_029377 79133 Hs.472165 NM_024120 ENSG00000101247 NDUFAF5 C20orf7|MC1DN16|bA526K24.2|dJ842G6.1 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5 protein-coding 246.75-38 chr21 27121270 27121692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154393 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 119.5-128 chr2 82684017 82684222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172684 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 174.25-38 chr12 67168681 67169037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72575 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 127.5-211 chr6 63637281 63637482 + 0.75 NA intron (NM_001290260, intron 1 of 3) intron (NM_001290260, intron 1 of 3) 900 NM_001290260 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 252.25-11 chr12 15818261 15818742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29113 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 225.5-72 chr3 60659329 60659734 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) L1M4c|LINE|L1 -41661 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 202-41 chr3 31676941 31677352 + 0.75 NA intron (NM_001174060, intron 7 of 10) intron (NM_001174060, intron 7 of 10) -27067 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-47 chr13 26108274 26108571 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -48900 NR_146971 107984009 NR_146971 LINC00415 - long intergenic non-protein coding RNA 415 ncRNA 141.25-21 chr10 48807312 48807580 + 0.75 NA intron (NM_020945, intron 27 of 61) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 106789 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 131-106 chr20 34458649 34459018 + 0.75 NA intron (NM_001257137, intron 14 of 25) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -7492 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 133-146 chr5 153266755 153267081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -223606 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 188.25-101 chr6 109298887 109299278 + 0.75 NA intron (NR_152435, intron 28 of 45) intron (NR_152435, intron 28 of 45) 82657 NM_001346500 8763 Hs.520313 NM_006016 ENSG00000135535 CD164 DFNA66|MGC-24|MGC-24v|MUC-24|endolyn CD164 molecule protein-coding 126-170 chr8 55591986 55592299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71164 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 194-12 chr1 203577271 203577740 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -49282 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 121.75-49 chr15 62771931 62772211 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 39 of 55) AluJr|SINE|Alu -51886 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 177.25-22 chr10 99378278 99378702 + 0.75 NA intron (NM_020348, intron 7 of 10) intron (NM_020348, intron 7 of 10) 49134 NM_020348 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 175.75-110 chr6 40008982 40009310 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -74684 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 112.75-45 chr12 128405448 128405618 + 0.75 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) MER113|DNA|hAT-Charlie 111441 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 169.5-163 chr7 55266322 55266632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10842 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 150.5-42 chr13 54515726 54515933 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -203781 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 123-24 chr10 58918614 58918797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80813 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 126.25-15 chr1 246263187 246263424 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) MIRb|SINE|MIR 154107 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 142.5-70 chr15 68123652 68123877 + 0.75 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 69188 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 230.5-48 chr16 74861861 74862271 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -87246 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 130.25-118 chr20 44005048 44005271 + 0.75 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) L1MEd|LINE|L1 59263 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 182.75-100 chr5 24085548 24085918 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 134385 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 177.75-72 chr2 108274252 108274632 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -14453 NM_001056 6819 Hs.436123 NM_001056 ENSG00000198203 SULT1C2 ST1C1|ST1C2|SULT1C1|humSULTC2 sulfotransferase family 1C member 2 protein-coding 161.75-29 chr11 13828811 13829254 + 0.75 NA intron (NR_149108, intron 3 of 3) MER74A|LTR|ERVL 41584 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 227-33 chr2 119018805 119019212 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76839 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 146.25-165 chr9 124985937 124986404 + 0.75 NA intron (NM_173690, intron 15 of 18) AluSc8|SINE|Alu -45087 NM_002077 2800 Hs.59504 NM_002077 ENSG00000136935 GOLGA1 golgin-97 golgin A1 protein-coding 166.25-36 chr11 109675800 109676075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 253747 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 158.5-63 chr14 63186896 63187228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17381 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 199.5-139 chr7 40445630 40445935 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 310806 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 143.25-110 chr22 29464854 29465254 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15164 NM_021076 4744 Hs.198760 NM_021076 ENSG00000100285 NEFH CMT2CC|NFH neurofilament heavy protein-coding 271.25-13 chr11 104081178 104081646 + 0.75 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 44772 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 147.25-95 chr4 45577069 45577391 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 546824 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 146.5-195 chr6 155616352 155616745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101704 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 128-112 chr4 48244201 48244393 + 0.75 NA intron (NM_003215, intron 1 of 17) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 25541 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 292.5-5 chr1 195807781 195808292 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 280679 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 213-88 chr7 43352753 43353196 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 4 of 27) intron (NM_001287059, intron 4 of 27) 169568 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 180.5-118 chr5 11095198 11095662 + 0.75 NA intron (NM_001364128, intron 12 of 19) intron (NM_001364128, intron 12 of 19) -334196 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 166-48 chr17 61238327 61238825 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 129128 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 172 chr1 5646540 5646884 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 216029 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 191.25-42 chr18 2722365 2722719 + 0.75 NA exon (NM_015295, exon 20 of 48) exon (NM_015295, exon 20 of 48) 66655 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 136.5-35 chr11 6364140 6364541 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26134 NM_001007593 6609 Hs.498173 NM_000543 ENSG00000166311 SMPD1 ASM|ASMASE|NPD sphingomyelin phosphodiesterase 1 protein-coding 141.5-214 chr7 93447462 93447765 + 0.75 NA intron (NM_001164738, intron 7 of 12) intron (NM_001164738, intron 7 of 12) 35242 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 175-52 chr17 58138895 58139228 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16093 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 115.75-119 chr2 224137764 224137965 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -98545 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 173.75-119 chr4 127367989 127368449 + 0.75 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -264738 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 161.75-101 chr5 8023235 8023669 + 0.75 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 154304 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 193-69 chr5 31717926 31718243 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 78953 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 113.25-49 chr14 74966634 74966862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10984 NM_001207012 5228 Hs.252820 NM_002632 ENSG00000119630 PGF D12S1900|PGFL|PIGF|PLGF|PlGF-2|SHGC-10760 placental growth factor protein-coding 118.5-119 chr21 31411813 31412064 + 0.75 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) L1PB4|LINE|L1 -67584 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 141.5-119 chr2 199769884 199770105 + 0.75 NA intron (NM_001350855, intron 3 of 3) intron (NM_001350855, intron 3 of 3) 81179 NM_001350854 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 120.25-94 chr2 71291788 71291990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39866 NM_001252612 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 140-19 chr10 65523149 65523395 + 0.75 NA Intergenic (TATATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -48153 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 116.5-272 chrX 45316633 45316874 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -115877 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 207.75-89 chr4 63230880 63231345 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -1069347 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 232-19 chr16 52562416 52562951 + 0.75 NA intron (NR_033920, intron 3 of 3) intron (NR_033920, intron 3 of 3) -14881 NM_001146188 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 124.75-6 chr1 80251465 80251823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -284111 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 259-26 chr3 10261628 10262053 + 0.75 NA intron (NM_014760, intron 3 of 7) HAL1|LINE|L1 13381 NM_014760 9797 Hs.475401 NM_014760 ENSG00000157014 TATDN2 - TatD DNase domain containing 2 protein-coding 124.5-94 chr18 79105401 79105663 + 0.75 NA intron (NR_148360, intron 2 of 31) intron (NR_148360, intron 2 of 31) 36138 NM_198531 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 224.5-39 chr14 61333047 61333458 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 11809 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 126.5-78 chr15 95899990 95900298 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 227697 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 165-111 chr5 30786675 30787036 + 0.75 NA Intergenic (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -406831 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 125.25-190 chr7 42515149 42515492 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 191127 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 218.75-66 chr4 125267355 125267752 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48859 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 143.25-188 chr8 115182106 115182416 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 485752 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 120.5-62 chr13 23330384 23330644 + 0.75 NA exon (NM_001278055, exon 8 of 8) exon (NM_001278055, exon 8 of 8) 44994 NM_001278055 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 140.75-176 chr8 37064597 37064817 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 280333 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 175.25-12 chr1 214522744 214523054 + 0.75 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) intron (NM_005401, intron 1 of 18) 28703 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 139.25-115 chr3 13978859 13979196 + 0.75 NA intron (NR_002223, intron 1 of 2) intron (NR_002223, intron 1 of 2) 41720 NR_002223 348825 Hs.529180 NR_002223 ENSG00000180438 TPRXL TPRX3P tetrapeptide repeat homeobox like pseudo 124.75-62 chr12 71968186 71968421 + 0.75 NA intron (NM_173353, intron 5 of 10) intron (NM_173353, intron 5 of 10) 29458 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 159.75-168 chr8 34761507 34761788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22274 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 198.5-140 chr8 35043620 35044010 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191660 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 125.25-201 chr8 42716401 42716653 + 0.75 NA intron (NM_001347717, intron 4 of 6) MER66B|LTR|ERV1 19151 NM_001347717 1142 Hs.654576 NM_000749 ENSG00000147432 CHRNB3 - cholinergic receptor nicotinic beta 3 subunit protein-coding 125.5-123 chr2 40477889 40478109 + 0.75 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) -25909 NM_001351493 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 116.25-194 chr6 41896411 41896620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1140 NM_018561 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 154.75-63 chr18 22175636 22175926 + 0.75 NA intron (NM_005257, intron 2 of 6) intron (NM_005257, intron 2 of 6) 6344 NM_005257 2627 Hs.514746 NM_005257 ENSG00000141448 GATA6 - GATA binding protein 6 protein-coding 133-50 chr14 72177769 72178138 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 244426 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 211.75-70 chr5 2050740 2051107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 163592 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 157.5-181 chr6 138110350 138110823 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3167 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 143.5-4 chr1 27167416 27167621 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12393 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 124-148 chr6 63716979 63717227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70577 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 184-82 chr6 162240683 162240984 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) intron (NM_004562, intron 3 of 11) -486299 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 175.5-29 chr11 14450778 14451106 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 48916 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 127.5-189 chr5 43778684 43778934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175579 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 170-41 chr18 24140006 24140284 + 0.75 NA intron (NM_138644, intron 1 of 5) AluY|SINE|Alu 661 NM_138644 26256 Hs.511983 NM_012189 ENSG00000154040 CABYR CABYRa|CABYRc|CABYRc/d|CABYRe|CBP86|CT88|FSP-2|FSP2 calcium binding tyrosine phosphorylation regulated protein-coding 187-74 chr4 175002639 175003061 + 0.75 NA Intergenic THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 84492 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 130.5-222 chr7 11114239 11114459 + 0.75 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) intron (NR_033436, intron 16 of 16) 140477 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 268.5-11 chr11 95830041 95830621 + 0.75 NA intron (NM_014679, intron 10 of 10) intron (NM_014679, intron 10 of 10) 39833 NM_014679 9702 Hs.101014 NM_014679 ENSG00000166037 CEP57 MVA2|PIG8|TSP57 centrosomal protein 57 protein-coding 149.75-112 chr3 100229552 100229881 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -31276 NM_018309 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 172.75-54 chr18 13368448 13368754 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 58933 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 210.75-72 chr4 167006019 167006366 + 0.75 NA intron (NM_001204354, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 228234 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 212.25-82 chr6 150883445 150883798 + 0.75 NA intron (NM_001350486, intron 5 of 27) intron (NM_001350486, intron 5 of 27) 17135 NM_001350491 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 126.5-163 chr3 187858059 187858358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112740 NM_001706 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 221-57 chr4 69916436 69916946 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14377 NM_001025104 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 125.5-142 chr2 231502549 231502882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11624 NR_024079 151477 Hs.375211 NM_173513 ENSG00000181798 LINC00471 C2orf52 long intergenic non-protein coding RNA 471 ncRNA 256.5-2 chr1 21904695 21905136 + 0.75 NA intron (NM_005529, intron 1 of 96) intron (NM_005529, intron 1 of 96) 32395 NM_001291860 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 182.25-99 chr6 36463388 36463826 + 0.75 NA intron (NR_104481, intron 1 of 3) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 20607 NM_001286579 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 259.25-21 chr20 23295814 23296203 + 0.75 NA Intergenic MER54B|LTR|ERVL -54783 NM_013248 29107 Hs.516933 NM_013248 ENSG00000132661 NXT1 MTR2|P15 nuclear transport factor 2 like export factor 1 protein-coding 112.5-92 chr17 33738094 33738342 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 -204458 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 140.75-134 chr4 72361683 72361954 + 0.75 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) intron (NM_014243, intron 4 of 21) 207403 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 153.25-21 chr11 3211508 3211713 + 0.75 NA Intergenic LTR7C|LTR|ERV1 -6722 NR_027138 283303 Hs.151154 NM_173590 ENSG00000236301 MRGPRG-AS1 C11orf36|HSD-40 MRGPRG antisense RNA 1 ncRNA 118.75-204 chr8 126494835 126495046 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 63538 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 183-19 chr13 35386503 35386817 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 38 of 57) intron (NM_015678, intron 38 of 57) 90029 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 269-21 chr16 82122748 82123200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47250 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 147.75-171 chr9 102441569 102441776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77965 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 206-26 chr14 66863437 66863805 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) L1MA2|LINE|L1 -325819 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 143.25-18 chr10 75876771 75877105 + 0.75 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 94177 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 172.5-40 chr11 77440993 77441415 + 0.75 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 32859 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 148-10 chr11 32629951 32630219 + 0.75 NA intron (NM_001008391, intron 14 of 17) L1MEc|LINE|L1 46254 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 156-170 chrX 86079737 86080161 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -32391 NM_001145414 1121 Hs.496449 NM_000390 ENSG00000188419 CHM DXS540|GGTA|HSD-32|REP-1|TCD CHM Rab escort protein protein-coding 207-16 chr11 100577328 100577651 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -109799 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 180.75-11 chr1 191562690 191563042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -334368 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 141.75-93 chr2 80037308 80037665 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -170903 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 145.5-37 chr11 109440695 109440974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18644 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 152.75-27 chr10 102713351 102713643 + 0.75 NA intron (NM_004311, intron 1 of 5) intron (NM_004311, intron 1 of 5) 900 NM_004311 403 Hs.182215 NM_004311 ENSG00000138175 ARL3 ARFL3|JBTS35|RP83 ADP ribosylation factor like GTPase 3 protein-coding 257.25-15 chr14 72226317 72226839 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -290242 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 157.5-92 chr19 44602491 44602756 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10940 NM_001205280 147710 Hs.512509 NM_001205280 ENSG00000216588 IGSF23 - immunoglobulin superfamily member 23 protein-coding 146.75-93 chr22 24517446 24517754 + 0.75 NA intron (NM_016327, intron 6 of 9) intron (NM_016327, intron 6 of 9) 22268 NM_016327 51733 Hs.731656 NM_016327 ENSG00000100024 UPB1 BUP1 beta-ureidopropionase 1 protein-coding 172.75-137 chr8 136052074 136052530 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -478496 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 137-115 chr4 31733531 31733718 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 227080 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 143.5-90 chr17 62867137 62867536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58834 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 125.25-46 chr12 27812983 27813193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32855 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 183.75-7 chr1 172715009 172715511 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56157 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 130.25-70 chr15 71959360 71959593 + 0.75 NA intron (NM_006901, intron 14 of 41) intron (NM_006901, intron 14 of 41) 148922 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 142.5-81 chr16 63249921 63250277 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -1213661 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 160.75-108 chr4 60384872 60385193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -537587 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 169-39 chr17 68926542 68926824 + 0.75 NA intron (NM_001288985, intron 10 of 39) intron (NM_001288985, intron 10 of 39) 28709 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 223.25-78 chr8 100015514 100015923 + 0.75 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) intron (NM_015668, intron 14 of 27) 11136 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 185-34 chr18 42929100 42929487 + 0.75 NA intron (NM_001272077, intron 3 of 5) intron (NM_001272077, intron 3 of 5) 186392 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 129.5-49 chr12 8873092 8873308 + 0.75 NA intron (NM_001282424, intron 22 of 24) intron (NM_001282424, intron 22 of 24) 28196 NM_001282424 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 159.75-125 chr5 19660322 19660580 + 0.75 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 225821 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 197.5-11 chr10 11456707 11457068 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014688, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_014688, exon 15 of 15) 75393 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 122.75-179 chr6 136404695 136404930 + 0.75 NA intron (NM_001198611, intron 3 of 16) intron (NM_001198611, intron 3 of 16) 62063 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 175-84 chr22 48857051 48857354 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9568 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 113-62 chr14 66236550 66236776 + 0.75 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? -249708 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 197.75-63 chr4 125020566 125021150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -295554 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 208.5-84 chr22 46581264 46581632 + 0.75 NA intron (NM_001366660, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 4360 NM_001366660 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 234-69 chr8 132103021 132103661 + 0.75 NA intron (NM_001145095, intron 2 of 15) AluSx|SINE|Alu 1924 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 139.25-217 chrX 142490198 142490551 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -285084 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 175.25-133 chr7 61938058 61938418 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1365818 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 191-13 chr11 110985093 110985439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 112052 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 142.5-224 chr8 115546226 115546496 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 121652 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 138.5-210 chr9 75579279 75579515 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -311247 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 175-100 chr5 73889570 73890151 + 0.75 NA intron (NM_001177693, intron 26 of 35) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 76314 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 118.25-135 chr4 18169399 18169608 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -147628 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 129.25-13 chr1 234657885 234658095 + 0.75 NA intron (NR_125944, intron 3 of 3) intron (NR_125944, intron 3 of 3) 11701 NR_125944 101927787 Hs.520658 NR_125944 ENSG00000228044 LOC101927787 - uncharacterized LOC101927787 ncRNA 192.25-10 chr10 19447464 19448026 + 0.75 NA intron (NM_001142308, intron 28 of 39) intron (NM_001142308, intron 28 of 39) 280805 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 368-10 chr4 95499436 95500000 + 0.75 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 49255 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 165.5-201 chr8 111382221 111382578 + 0.75 NA intron (NR_146282, intron 1 of 3) L1PB3|LINE|L1 5760 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 145.75-74 chr2 39677573 39677799 + 0.75 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) intron (NM_152390, intron 1 of 3) 11769 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 114.5-267 chr8 125167247 125167536 + 0.75 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) AluSc|SINE|Alu 75531 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 122.25-34 chr11 107821532 107821731 + 0.75 NA intron (NM_017515, intron 1 of 7) intron (NM_017515, intron 1 of 7) 37156 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 173.5-168 chr8 112869767 112870163 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) L1PA8|LINE|L1 226472 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 119.75-115 chr2 183081686 183081888 + 0.75 NA intron (NR_135688, intron 1 of 2) intron (NR_135688, intron 1 of 2) 3040 NR_135688 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 116.25-83 chr17 42630613 42630904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21075 NM_001070 7283 Hs.279669 NM_001070 ENSG00000131462 TUBG1 CDCBM4|GCP-1|TUBG|TUBGCP1 tubulin gamma 1 protein-coding 233-19 chr14 70399019 70399354 + 0.75 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) MER52D|LTR|ERV1 17904 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 170.75-52 chr17 62916398 62916742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27645 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 181-46 chr18 73569209 73569658 + 0.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 244492 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 145.5-141 chr4 30374924 30375311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -345252 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 259.75-38 chr3 149821149 149821577 + 0.75 NA intron (NM_007282, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 8675 NM_007282 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 162-71 chr20 52618145 52618415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2558 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 182-69 chr21 27018226 27018626 + 0.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -51338 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 253.5-78 chr8 124773628 124774261 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -45437 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 135.75-48 chr12 95715693 95715977 + 0.75 NA intron (NM_001329701, intron 3 of 9) intron (NM_001329701, intron 3 of 9) 66580 NR_077225 100132594 Hs.676211 NR_077225 ENSG00000257150 PGAM1P5 - phosphoglycerate mutase 1 pseudogene 5 pseudo 118.25-152 chr5 43209897 43210156 + 0.75 NA intron (NR_072980, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 17174 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 147.25-46 chr16 81095201 81095547 + 0.75 NA intron (NM_004483, intron 1 of 4) intron (NM_004483, intron 1 of 4) 1001 NM_004483 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 166-118 chr7 89353042 89353299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -557433 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 258.75-63 chr6 85000793 85001378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236487 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 207.25-88 chr7 38781117 38781532 + 0.75 NA intron (NM_014396, intron 10 of 28) MER33|DNA|hAT-Charlie -94235 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 134-50 chr14 48290072 48290309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -495176 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 157.5-44 chr12 41772360 41772722 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 8352 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 127.75-106 chr2 154846920 154847191 + 0.75 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 148360 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 140.75-46 chr13 69761686 69762063 + 0.75 NA intron (NM_001286725, intron 6 of 9) MER57A-int|LTR|ERV1 -345339 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 159-67 chr3 97218633 97218881 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -220850 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 209.5-98 chr3 189861603 189861990 + 0.75 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) MIR|SINE|MIR 31874 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 170.5-188 chr8 107746417 107746773 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -248677 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 163-10 chr1 220737896 220738234 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -10257 NM_017898 54996 Hs.369042 NM_017898 ENSG00000117791 MARC2 MOSC2 mitochondrial amidoxime reducing component 2 protein-coding 261.25-24 chr22 24944765 24945375 + 0.75 NA intron (NM_001001663, intron 1 of 3) AluSc|SINE|Alu 1625 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 214.25-89 chrX 146105569 146105957 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -77891 NR_030581 100126341 NR_030581 ENSG00000216056 MIR891A MIRN891A microRNA 891a ncRNA 228.5-84 chr5 130173232 130173635 + 0.75 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L1MD2|LINE|L1 268968 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 116.75-168 chr6 42307180 42307510 + 0.75 NA intron (NM_001297573, intron 3 of 17) intron (NM_001297573, intron 3 of 17) -89484 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 149.75-175 chr9 80906496 80906853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 782861 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 285-11 chr12 25824604 25825111 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49222 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 167.5-195 chr9 1644280 1644517 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -370949 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 181.5-36 chr12 132465744 132466129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24215 NM_001142641 57666 Hs.411138 NM_001142641 ENSG00000112787 FBRSL1 - fibrosin like 1 protein-coding 122-15 chr1 115535719 115535974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106124 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 139.25-178 chr7 49101395 49101787 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 177044 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 194-77 chr7 39048258 39048680 + 0.75 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) L1PA15|LINE|L1 -34902 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 183.5-6 chr1 109458693 109458974 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7713 NM_001040709 284612 Hs.528366 NM_001006603 ENSG00000143028 SYPL2 MG29 synaptophysin like 2 protein-coding 233.5-71 chr3 38263555 38264001 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2034 NM_004256 9390 Hs.225941 NM_004256 ENSG00000172940 SLC22A13 OAT10|OCTL1|OCTL3|ORCTL-3|ORCTL3 solute carrier family 22 member 13 protein-coding 228.75-32 chr18 59324198 59324913 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -5906 NM_181654 339302 Hs.449884 NM_181654 ENSG00000166569 CPLX4 CPX-IV|CPXIV complexin 4 protein-coding 224.75-19 chr11 129639578 129639998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22519 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 175.75-87 chr3 123744253 123744661 + 0.75 NA intron (NM_001321309, intron 4 of 32) intron (NM_001321309, intron 4 of 32) 54813 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 253.5-35 chr18 6620634 6621209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -108795 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 118.75-69 chr15 93155260 93155458 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -50707 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 177-71 chr4 65469673 65470070 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 5 of 16) intron (NM_001281767, intron 5 of 16) 199617 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 132.5-13 chr1 71009769 71009973 + 0.75 NA 3' UTR (NM_198715, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_198715, exon 2 of 2) -36635 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 150.25-94 chr3 17072813 17073073 + 0.75 NA intron (NM_015184, intron 5 of 5) HAL1b|LINE|L1 139747 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 133-102 chr22 23030598 23030842 + 0.75 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -39799 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 217.75-23 chr12 69664015 69664369 + 0.75 NA intron (NM_001282613, intron 7 of 7) intron (NM_001282613, intron 7 of 7) 25085 NR_104220 144453 Hs.280782 NM_032735 ENSG00000127325 BEST3 VMD2L3 bestrophin 3 protein-coding 115.25-126 chr22 41799153 41799384 + 0.75 NA exon (NM_152513, exon 31 of 31) exon (NM_152513, exon 31 of 31) -1354 NM_001304797 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 140.5-61 chr14 45043714 45043995 + 0.75 NA intron (NR_131765, intron 12 of 19) intron (NR_131765, intron 12 of 19) -40262 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 211-27 chr17 78162423 78162793 + 0.75 NA intron (NM_001163075, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR -5937 NM_004710 9144 Hs.464210 NM_004710 ENSG00000108639 SYNGR2 - synaptogyrin 2 protein-coding 159-23 chr12 2094993 2095491 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 41957 NM_001167624 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 115-74 chr18 70118065 70118384 + 0.75 NA intron (NM_001318520, intron 25 of 47) L1M2|LINE|L1 87463 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 151-14 chr10 4525518 4525799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119189 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 135.75-53 chr14 21445866 21446208 + 0.75 NA intron (NM_001170629, intron 1 of 37) AluSg4|SINE|Alu -8762 NM_020920 57680 Hs.530698 NM_020920 ENSG00000100888 CHD8 AUTS18|HELSNF1 chromodomain helicase DNA binding protein 8 protein-coding 144-63 chr2 161665507 161665720 + 0.75 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 41197 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 119-139 chr4 163197295 163197606 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30560 NM_001128931 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 127.25-56 chr14 32224713 32225011 + 0.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -21593 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 143-44 chr15 77379461 77379776 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 40486 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 123.75-41 chr12 62291911 62292119 + 0.75 NA intron (NR_147080, intron 1 of 19) L1PA15-16|LINE|L1 31611 NM_001252078 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 258.75-10 chr10 116880279 116880681 + 0.75 NA TTS (NM_018330) TTS (NM_018330) -30758 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 160.75-126 chr5 133086983 133087313 + 0.75 NA intron (NM_002154, intron 8 of 18) intron (NM_002154, intron 8 of 18) 35135 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 155.5-24 chr10 62239044 62239427 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001282941, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001282941, exon 5 of 5) 29609 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 154.5-153 chr5 171947631 171947889 + 0.75 NA intron (NM_033644, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 59113 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 131.75-64 chr14 53649420 53649738 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 298905 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 166-6 chr1 222192763 222193152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -214437 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 125.5-167 chr3 21996799 21997076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39798 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 156.75-116 chr3 112895039 112895421 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -49280 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 135.25-23 chr10 16638722 16639110 + 0.75 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) intron (NM_152724, intron 7 of 7) -117037 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 124.5-231 chr8 123176889 123177121 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2042 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 140-35 chr12 126428784 126429083 + 0.75 NA intron (NR_146291, intron 2 of 2) intron (NR_146291, intron 2 of 2) 2787 NR_146291 105370059 NR_146291 LINC02350 - long intergenic non-protein coding RNA 2350 ncRNA 234.75-34 chr19 28512108 28512548 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -94360 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 188.75-48 chr18 4077544 4078073 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 115455 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 188.25-28 chr12 46028439 46028763 + 0.75 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -38027 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 215.25-87 chr5 129524932 129525385 + 0.75 NA intron (NM_133638, intron 3 of 22) L1ME3A|LINE|L1 -64469 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-13 chr10 33675515 33675952 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 96947 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 147.5-195 chr7 48821190 48821430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103237 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 227.5-101 chr8 62272286 62272767 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 23672 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 155.25-27 chr10 74266627 74266966 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 90033 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 217-42 chr2 219549620 219550079 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_036082) promoter-TSS (NR_036082) -702 NR_036082 100423039 NR_036082 ENSG00000265252 MIR3132 - microRNA 3132 ncRNA 385.5-23 chr8 88044094 88044763 + 0.75 NA intron (NM_005941, intron 9 of 9) intron (NM_005941, intron 9 of 9) -170413 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 166-134 chr9 107202099 107202545 + 0.75 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -80957 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 158-37 chr12 4007085 4007391 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -133790 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 124.25-209 chr9 72282325 72282659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22944 NR_110952 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 133.75-115 chr20 47761421 47761647 + 0.75 NA intron (NM_198596, intron 1 of 20) MER113|DNA|hAT-Charlie 24530 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 124.75-202 chr8 119265222 119265445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18476 NR_149112 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 228.25-84 chr8 124048775 124049372 + 0.75 NA intron (NR_103547, intron 3 of 4) AluSc|SINE|Alu -8291 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 161-23 chr11 93636664 93637057 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -24822 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 185.25-126 chr8 135215630 135215934 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -18349 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 202.75-43 chr16 68093204 68093660 + 0.75 NA intron (NM_004555, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 8062 NM_004555 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 143-110 chr5 15147162 15147551 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 119204 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 133.75-33 chr11 83026828 83027048 + 0.75 NA intron (NM_001286060, intron 1 of 4) HAL1|LINE|L1 7336 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 193.25-112 chr8 10638648 10639038 + 0.75 NA intron (NM_178857, intron 1 of 3) LTR102_Mam|LTR|ERVL 16300 NM_178857 94137 Hs.33538 NM_178857 ENSG00000183638 RP1L1 DCDC4B RP1 like 1 protein-coding 182-25 chr12 65177823 65178197 + 0.75 NA intron (NM_001167614, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 8427 NM_014319 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 112.5-224 chr7 98700010 98700194 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 82817 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 152-38 chr12 889405 889736 + 0.75 NA intron (NM_001184985, intron 21 of 27) AluY|SINE|Alu 43506 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 127-166 chr7 136155525 136155751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -178279 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 127.25-134 chr4 21489331 21489648 + 0.75 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -24731 NR_107018 102465859 NR_107018 ENSG00000283281 MIR7978 hsa-mir-7978 microRNA 7978 ncRNA 152.75-130 chr5 66789003 66789297 + 0.75 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) L1MC4|LINE|L1 -39623 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 192 chr1 21915115 21915629 + 0.75 NA intron (NM_005529, intron 1 of 96) intron (NM_005529, intron 1 of 96) 21938 NM_001291860 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 198.25-78 chr4 150922619 150923134 + 0.75 NA intron (NM_001367550, intron 4 of 56) MIR|SINE|MIR 92391 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 138.75-3 chr1 78253445 78253776 + 0.75 NA intron (NR_027310, intron 3 of 5) AluSx|SINE|Alu 24011 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 130.5-167 chr3 99026790 99027060 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -125230 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 172.75-140 chr9 93541650 93541938 + 0.75 NA intron (NM_001286722, intron 10 of 17) intron (NM_001286722, intron 10 of 17) -34790 NM_005392 5253 Hs.211441 NM_005392 ENSG00000197724 PHF2 CENP-35|GRC5|JHDM1E|KDM7C PHD finger protein 2 protein-coding 141.25-136 chr5 71652603 71652961 + 0.75 NA intron (NM_022132, intron 16 of 16) intron (NM_022132, intron 16 of 16) 65442 NM_022132 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 133.25-74 chr17 16648436 16648658 + 0.75 NA intron (NM_020787, intron 2 of 5) intron (NM_020787, intron 2 of 5) 5303 NM_020787 57547 Hs.128078 NM_020787 ENSG00000197566 ZNF624 - zinc finger protein 624 protein-coding 237.5-92 chr6 168656355 168656771 + 0.75 NA intron (NM_001166412, intron 11 of 12) AluSx|SINE|Alu 215379 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 119.25-59 chr14 75725678 75725902 + 0.75 NA intron (NM_015072, intron 12 of 31) intron (NM_015072, intron 12 of 31) 64544 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 222.5-9 chr1 170619089 170619480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44847 NM_006902 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 122.5-58 chr14 41203947 41204171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 249348 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 116.75-190 chr8 8430902 8431104 + 0.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -44564 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 117.25-63 chr13 106973442 106973711 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 319696 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 152.5-141 chr4 125380102 125380477 + 0.75 NA intron (NM_001291303, intron 1 of 16) intron (NM_001291303, intron 1 of 16) 63877 NM_001291285 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 174.75-25 chr12 49873288 49873668 + 0.75 NA intron (NM_012306, intron 11 of 11) MamRep605|LTR?|LTR? -30372 NM_181708 144233 Hs.142736 NM_181708 ENSG00000186666 BCDIN3D - BCDIN3 domain containing RNA methyltransferase protein-coding 154.75-9 chr10 7839876 7840228 + 0.75 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 21547 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 161.25-186 chr9 123328401 123328650 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -27672 NM_173689 286204 Hs.568340 NM_173689 ENSG00000148204 CRB2 FSGS9|VMCKD crumbs cell polarity complex component 2 protein-coding 170-98 chr8 98510060 98510309 + 0.75 NA intron (NM_006281, intron 10 of 10) intron (NM_006281, intron 10 of 10) 83226 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 131.75-77 chr15 80586567 80586815 + 0.75 NA intron (NM_014862, intron 17 of 18) AluSz|SINE|Alu 5588 NR_049837 100847042 NR_049837 ENSG00000284059 MIR5572 - microRNA 5572 ncRNA 210.5-100 chr5 72542919 72543322 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -13957 NR_105008 102503427 Hs.429280 NR_105008 LOC102503427 - uncharacterized LOC102503427 ncRNA 145.75-94 chr22 26507372 26507623 + 0.75 NA intron (NM_001346862, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 4976 NM_012143 24144 Hs.20225 NM_012143 ENSG00000100109 TFIP11 NTR1|STIP|STIP-1|Spp382|TIP39|bK445C9.6 tuftelin interacting protein 11 protein-coding 128.5-16 chr1 179152307 179152536 + 0.75 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -9345 NM_001136000 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 157.75-48 chr14 73047343 73047596 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11065 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 197.5-67 chr2 53517953 53518339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -249637 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 118.75-10 chr1 118022914 118023094 + 0.75 NA intron (NM_206996, intron 28 of 48) intron (NM_206996, intron 28 of 48) 93265 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 233.75-77 chr8 74164602 74165290 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 156415 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 146.5-127 chr20 59416475 59416713 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 115983 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 165.25-117 chr5 52110906 52111279 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 103061 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 142.25-50 chr13 85675960 85676197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 123341 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 143.75-67 chr17 42169006 42169398 + 0.75 NA intron (NM_012285, intron 9 of 16) AluSz|SINE|Alu 11940 NM_012285 23415 Hs.304081 NM_012285 ENSG00000089558 KCNH4 BEC2|ELK1|Kv12.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 4 protein-coding 160.5-73 chr17 65481025 65481443 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 23693 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 239.75-57 chr5 42039701 42040404 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 114771 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 122.5-172 chr4 169381094 169381321 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -110251 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 121.75-51 chr15 67245088 67245437 + 0.75 NA intron (NM_001271885, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 9399 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 151-128 chr7 52743678 52743967 + 0.75 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL -291811 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 114.5-194 chr4 118978203 118978480 + 0.75 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 89487 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 117.75-225 chr9 90540750 90541047 + 0.75 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 41848 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 192.25-87 chr5 61371435 61371735 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 39327 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 139.25-129 chr3 168696782 168696992 + 0.75 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) MamRep564|Unknown|Unknown 145033 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 113.75-4 chr1 43652348 43652515 + 0.75 NA intron (NM_014663, intron 1 of 21) intron (NM_014663, intron 1 of 21) 2282 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 166-77 chr22 22131377 22131764 + 0.75 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -87636 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 113-135 chr4 89218606 89218854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 89070 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 121-171 chr6 149012275 149012532 + 0.75 NA intron (NM_005715, intron 5 of 7) intron (NM_005715, intron 5 of 7) 20258 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 141.5-65 chr15 95565372 95565730 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132458 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 159.25-21 chr10 117645328 117645806 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -100499 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 195-67 chr4 11750710 11751181 + 0.75 NA intron (NR_146995, intron 1 of 3) L1MA7|LINE|L1 18523 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 115.25-25 chr10 44602377 44602609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -217396 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 196.75-77 chr3 180357070 180357440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56918 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 176.25-143 chr8 138938089 138938450 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24228 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 181.75-66 chr2 149646720 149647186 + 0.75 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) intron (NR_110240, intron 1 of 2) -59178 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 132.5-196 chr5 79480252 79480563 + 0.75 NA intron (NM_001277078, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 33429 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 123.25-106 chr2 121414512 121414862 + 0.75 NA intron (NM_001207051, intron 22 of 37) intron (NM_001207051, intron 22 of 37) -116193 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 169.25-40 chr17 2467758 2468078 + 0.75 NA intron (NM_024086, intron 4 of 9) intron (NM_024086, intron 4 of 9) 43970 NM_024086 79066 Hs.632237 NM_024086 ENSG00000127804 METTL16 METT10D methyltransferase like 16 protein-coding 127.75-204 chr9 29289162 29289366 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -75663 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 166.75-89 chr3 51789412 51789769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10353 NM_001368368 440956 Hs.444316 NM_001143833 ENSG00000214686 IQCF6 - IQ motif containing F6 protein-coding 171.75-90 chr20 55141546 55141844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -281348 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 115-169 chr7 43952036 43952345 + 0.75 NA intron (NM_015983, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 25754 NM_015983 51619 Hs.19196 NM_015983 ENSG00000078967 UBE2D4 HBUCE1 ubiquitin conjugating enzyme E2 D4 (putative) protein-coding 237.75-41 chr2 150787463 150787950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158809 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 170.25-60 chr18 6317717 6318026 + 0.75 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1PB3|LINE|L1 41159 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 134-110 chr21 14968790 14969128 + 0.75 NA intron (NM_003489, intron 3 of 3) intron (NM_003489, intron 3 of 3) -50291 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 134-172 chr8 125224404 125224645 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) L1MA7|LINE|L1 132664 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 258-23 chr2 27638141 27638664 + 0.75 NA intron (NM_007266, intron 8 of 13) intron (NM_007266, intron 8 of 13) 9352 NM_007266 11321 Hs.18259 NM_007266 ENSG00000198522 GPN1 ATPBD1A|MBDIN|NTPBP|RPAP4|XAB1 GPN-loop GTPase 1 protein-coding 174.5-132 chr4 17978334 17978671 + 0.75 NA intron (NR_158566, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 43253 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 157.5-12 chr1 102313406 102313751 + 0.75 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 -316344 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 154.5-98 chr2 74788363 74788641 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -44153 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 193.25-46 chr19 31106421 31106802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60899 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 308.25-35 chr8 125677700 125678394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 245838 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 205-14 chr10 120355754 120356332 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_000982) promoter-TSS (NM_000982) -820 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 238.75-15 chr12 84963278 84963727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50673 NM_018057 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 150.5-46 chr13 102750875 102751195 + 0.75 NA intron (NM_001146197, intron 3 of 3) MLT2D|LTR|ERVL 8037 NM_001146197 643677 Hs.368382 NM_001146197 ENSG00000175820 CCDC168 C13orf40 coiled-coil domain containing 168 protein-coding 219.75-16 chr11 34345930 34346349 + 0.75 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 11871 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 157.25-115 chr5 24764387 24764874 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 75953 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 118.25-144 chr4 174170500 174170878 + 0.75 NA intron (NR_125896, intron 1 of 4) intron (NR_125896, intron 1 of 4) 49709 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 118.75-47 chr12 83455073 83455290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 768026 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 161.75-11 chr1 238776514 238776815 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -290647 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 146.75-92 chr22 20904684 20905042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12544 NM_005207 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 193.75-7 chr1 111081773 111082268 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -57363 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 204.5-38 chr14 72470339 72470633 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 8 of 16) LTR79|LTR|ERVL -46334 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 147.25-103 chr5 37245179 37245491 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 4 of 51) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3711 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 222-82 chr8 106123647 106124216 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -63428 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 122.5-46 chr12 32421332 32421564 + 0.75 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) 21890 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 141-165 chr9 81306679 81306924 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 382734 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 290-31 chr20 9554126 9554730 + 0.75 NA intron (NM_020341, intron 8 of 10) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -39430 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 140.75-60 chr15 76934666 76934927 + 0.75 NA intron (NM_001271837, intron 2 of 7) MER113|DNA|hAT-Charlie 3047 NM_001271837 5955 Hs.79088 NM_002902 ENSG00000117906 RCN2 E6BP|ERC-55|ERC55|TCBP49 reticulocalbin 2 protein-coding 238.5-11 chr10 67908212 67908754 + 0.75 NA intron (NM_001142498, intron 5 of 7) intron (NM_001142498, intron 5 of 7) 17081 NM_001314049 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 186-11 chr10 107805841 107806142 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 263302 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 128-29 chr12 1707053 1707437 + 0.75 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 L1ME1|LINE|L1 16175 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 165.5-69 chr18 64688072 64688300 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -428131 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 141.75-65 chr15 99272841 99273039 + 0.75 NA intron (NR_135755, intron 2 of 8) intron (NR_135755, intron 2 of 8) 15415 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 163.5-107 chr2 236018842 236019159 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 13 of 17) intron (NM_001037131, intron 13 of 17) 149386 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 158.25-85 chr3 30019702 30019962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85676 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-189 chr8 92289254 92289443 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185963 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 214.5-70 chr21 21549187 21549546 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 187953 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 117.5-165 chr4 129538848 129539056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232526 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 199.5-15 chr10 6687027 6687388 + 0.75 NA Intergenic MER70B|LTR|ERVL -50175 NR_138480 108570035 Hs.568834 NR_138480 LINP1 - lncRNA in non-homologous end joining pathway 1 ncRNA 159-112 chr8 86912892 86913176 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 3 of 10) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46619 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 149.75-85 chr2 83418286 83418566 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -104388 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 129.75-25 chr10 62077060 62077336 + 0.75 NA intron (NM_001244638, intron 5 of 6) intron (NM_001244638, intron 5 of 6) 27841 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 144.25-35 chr10 118472679 118472995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115729 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 183.75-44 chr16 57152161 57152590 + 0.75 NA TTS (NM_001354101) TTS (NM_001354101) 30175 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 112.75-33 chr11 21780972 21781235 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -411982 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 152-49 chr14 49475471 49475802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110744 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 126.5-125 chr2 205457195 205457455 + 0.75 NA intron (NM_057177, intron 19 of 21) L1MD2|LINE|L1 -225175 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 132.75-145 chr4 144320315 144320576 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -179727 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 126-44 chr12 117797690 117798000 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) AluJo|SINE|Alu 171145 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 132.5-258 chr9 132794309 132794558 + 0.75 NA intron (NM_001317959, intron 12 of 14) L2b|LINE|L2 -83911 NR_133631 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 194 chr1 42824369 42824728 + 0.75 NA intron (NM_001017922, intron 1 of 11) LTR16E1|LTR|ERVL -1030 NM_018538 114625 Hs.439437 NM_018538 ENSG00000164010 ERMAP BTN5|PRO2801|RD|SC erythroblast membrane associated protein (Scianna blood group) protein-coding 180.75-16 chr10 71108736 71109020 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -103692 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 174.5-125 chr3 118305495 118305814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -336114 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 154.75-127 chr6 70852787 70853168 + 0.75 NA intron (NM_001044305, intron 8 of 10) intron (NM_001044305, intron 8 of 10) 104083 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 160-41 chr16 14136023 14136320 + 0.75 NA intron (NM_001365418, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu -50515 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 141.75-85 chr2 22658212 22658526 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 121890 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 130.25-80 chr17 62333391 62333634 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36706 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 136.5-138 chr21 35910854 35911239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24601 NR_144547 54036 Hs.228809 NR_144547 PPP1R2P2 - protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 2 pseudo 202.75-90 chr5 59180729 59181076 + 0.75 NA intron (NM_001349243, intron 6 of 16) intron (NM_001349243, intron 6 of 16) 95213 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 121-43 chr11 78255858 78256215 + 0.75 NA intron (NM_012296, intron 2 of 9) MIRc|SINE|MIR 67117 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 159-113 chr8 91326142 91326471 + 0.75 NA intron (NM_134266, intron 5 of 18) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 76987 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 151.5-174 chr6 145544028 145544522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 142602 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 165-97 chr3 192184782 192185080 + 0.75 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) -53699 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-87 chr16 68101097 68101299 + 0.75 NA intron (NM_004555, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 15828 NM_004555 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 197.25-9 chr1 245934008 245934597 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 483110 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 180.25-97 chr5 81098155 81098504 + 0.75 NA intron (NM_006909, intron 12 of 26) L2a|LINE|L2 -134991 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 122.5-10 chr1 108211852 108212201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11683 NM_013386 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 283.5-2 chr1 101917173 101917749 + 0.75 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 45449 NR_033424 94236 Hs.606193 NR_033424 DNAJA1P5 HEJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 pseudogene 5 pseudo 143.5-116 chr2 107552596 107552946 + 0.75 NA intron (NR_146968, intron 2 of 2) intron (NR_146968, intron 2 of 2) 23352 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 137.25-130 chr5 101895647 101895897 + 0.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 400512 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 136.25-203 chrX 85817312 85817676 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -18286 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 164-46 chr16 54279713 54280042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6910 NM_024336 79191 Hs.499205 NM_024336 ENSG00000177508 IRX3 IRX-1|IRXB1 iroquois homeobox 3 protein-coding 189.25-94 chr5 22381742 22382142 + 0.75 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -168092 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 128-26 chr11 70200669 70200876 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -2391 NM_003824 8772 Hs.86131 NM_003824 ENSG00000168040 FADD GIG3|MORT1 Fas associated via death domain protein-coding 183.25-39 chr15 89014003 89014356 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -74277 NM_007011 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 116-185 chrX 50464610 50464794 + 0.75 NA intron (NM_001013742, intron 1 of 27) intron (NM_001013742, intron 1 of 27) 6123 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 188.5-68 chr2 49906427 49906807 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 67586 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 208.25-88 chr8 38893238 38893703 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -7876 NM_021623 59339 Hs.369123 NM_021623 ENSG00000169499 PLEKHA2 TAPP2 pleckstrin homology domain containing A2 protein-coding 155.75-52 chr14 63680061 63680374 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -38346 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 200.75-104 chr8 43782841 43783365 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 490661 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 120.5-187 chr5 123279833 123280041 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 143655 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 218-54 chr5 2917154 2917496 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_136207) promoter-TSS (NR_136207) -529 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 172.5-67 chr14 61485197 61485652 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 9 of 13) intron (NM_006255, intron 9 of 13) 84770 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 134-123 chr3 185969580 185969780 + 0.75 NA intron (NR_151491, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 9737 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 127-137 chr5 66032098 66032392 + 0.75 NA intron (NM_001253697, intron 14 of 25) MER117|DNA|hAT-Charlie -86672 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 161.5-95 chr2 42154925 42155212 + 0.75 NA intron (NR_110584, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 -14285 NM_019063 27436 Hs.713173 NM_019063 ENSG00000143924 EML4 C2orf2|ELP120|EMAP-4|EMAPL4|ROPP120 EMAP like 4 protein-coding 153.75-79 chr20 52799363 52799728 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -172813 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 127-73 chr16 13450714 13450950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -469325 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 114.5-235 chr7 8321821 8322036 + 0.75 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -59316 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 294.5-32 chr3 190407786 190408550 + 0.75 NA intron (NM_006580, intron 3 of 4) intron (NM_006580, intron 3 of 4) 20296 NM_006580 10686 Hs.251391 NM_006580 ENSG00000113946 CLDN16 HOMG3|PCLN1 claudin 16 protein-coding 235.5-22 chr11 48938186 48938595 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -93210 NM_001206626 283116 Hs.448644 NM_001206626 ENSG00000182053 TRIM49B - tripartite motif containing 49B protein-coding 186-73 chr5 160378654 160378983 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -8192 NM_031908 114898 Hs.110062 NM_031908 ENSG00000145861 C1QTNF2 CTRP2|zacrp2 C1q and TNF related 2 protein-coding 250.5-15 chr11 98310335 98310821 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -710371 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 132.5-200 chr5 107054490 107054824 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -43643 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 232.75-22 chr14 49525626 49526007 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60564 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 185.25-17 chr11 77320541 77320816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19012 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 173.25-71 chr3 21859154 21859485 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97820 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 117.75-170 chr5 17343132 17343325 + 0.75 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 44082 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 149.5-36 chr10 125702261 125702661 + 0.75 NA intron (NR_033848, intron 3 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 17032 NR_033847 399821 Hs.535286 NR_033847 ENSG00000224023 EDRF1-DT - EDRF1 divergent transcript ncRNA 178.75-28 chr14 60052465 60052792 + 0.75 NA intron (NR_075071, intron 29 of 32) MER68B|LTR|ERVL -39283 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 177.25-110 chr4 178956712 178956982 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -1048911 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 125.5-17 chr1 191013357 191013714 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 214963 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 152.75-85 chr2 113015013 113015283 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9689 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 136.25-66 chr15 35499905 35500199 + 0.75 NA intron (NM_080650, intron 3 of 8) intron (NM_080650, intron 3 of 8) 46113 NM_001141972 89978 Hs.107196 NM_080650 ENSG00000134146 DPH6 ATPBD4 diphthamine biosynthesis 6 protein-coding 195-15 chr10 84010288 84010690 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129020 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 134.5-212 chr8 28889274 28889543 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001324393) promoter-TSS (NM_001324393) 507 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 171-66 chr2 68682000 68682374 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 38599 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 152.25-135 chr5 145563325 145563635 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 271862 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 198.75-36 chr17 41167042 41167463 + 0.75 NA TTS (NM_033187) TTS (NM_033187) 491 NM_001277332 100505724 NM_001277332 ENSG00000180386 KRTAP9-7 KAP9.7|KRTAP9L1 keratin associated protein 9-7 protein-coding 192.25-41 chr19 40979394 40979903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11634 NM_000767 1555 Hs.1360 NM_000767 ENSG00000197408 CYP2B6 CPB6|CYP2B|CYP2B7|CYP2B7P|CYPIIB6|EFVM|IIB1|P450 cytochrome P450 family 2 subfamily B member 6 protein-coding 163.5-137 chr3 192725747 192726090 + 0.75 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 1623 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 163-80 chr4 32028464 32028810 + 0.75 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) MER65-int|LTR|ERV1 -6215 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 139-148 chr8 71237806 71238080 + 0.75 NA intron (NM_001370336, intron 12 of 17) intron (NM_001370336, intron 12 of 17) 118763 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 328.25-14 chr8 72532186 72533072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4596 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 118.5-222 chr8 118101563 118101894 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 10091 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 174.75-44 chr17 58403035 58403428 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001305545) promoter-TSS (NM_001305545) -510 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 161.25-15 chr10 56513578 56513962 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -152497 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 197-46 chr3 177342598 177343063 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 48388 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 182.25-5 chr1 119948569 119948931 + 0.75 NA intron (NM_001200001, intron 16 of 21) intron (NM_001200001, intron 16 of 21) -52235 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 148.75-133 chr5 52312228 52312581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 304373 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 204-60 chr4 155091851 155092213 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -116604 NM_001370180 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 187-20 chr10 122398202 122398499 + 0.75 NA intron (NM_001330178, intron 4 of 13) intron (NM_001330178, intron 4 of 13) 6047 NM_021622 59338 Hs.643512 NM_021622 ENSG00000107679 PLEKHA1 TAPP1 pleckstrin homology domain containing A1 protein-coding 130.25-79 chr17 60428023 60428379 + 0.75 NA intron (NM_181707, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 5712 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 184.75-18 chr11 90451112 90451500 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 104551 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 178.5-183 chr8 96939881 96940277 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 4 of 7) intron (NM_016134, intron 4 of 7) 294837 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 233.75-34 chr18 55659844 55660366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24148 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 255.25-15 chr14 55140902 55141573 + 0.75 NA intron (NR_003225, intron 2 of 3) intron (NR_003225, intron 2 of 3) 4254 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 177.5-108 chr22 49196136 49196600 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 329598 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 150-96 chr3 105930005 105930309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60756 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 141.5-234 chr8 121272828 121273120 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -366372 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 223.5-108 chr6 64008443 64009016 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) L1PA15|LINE|L1 201893 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 239.5-58 chr4 157121337 157121734 + 0.75 NA intron (NM_000824, intron 3 of 9) intron (NM_000824, intron 3 of 9) 45132 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 201.75-94 chr7 45405436 45405895 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -168475 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 140.75-108 chr2 237153246 237153502 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 67485 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 204.25-109 chr7 51932600 51932944 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -539516 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 215.25-60 chr3 94496782 94497365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 434012 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 149.75-99 chr2 232828912 232829278 + 0.75 NA intron (NM_015575, intron 23 of 30) L1MEb|LINE|L1 -39919 NM_001346122 389084 Hs.657509 NM_206895 ENSG00000182600 SNORC ASCL830|C2orf82|UNQ830 secondary ossification center associated regulator of chondrocyte maturation protein-coding 160.25-28 chr12 94338938 94339403 + 0.75 NA intron (NR_160431, intron 7 of 12) AluSp|SINE|Alu 76649 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 158-87 chr20 49481380 49481743 + 0.75 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) intron (NM_004975, intron 1 of 1) 1107 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 180.25-104 chr6 54475237 54475583 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 166969 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 127.75-23 chr1 214261872 214262188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19129 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 182-114 chrX 48966364 48966630 + 0.75 NA intron (NM_004979, intron 4 of 5) intron (NM_004979, intron 4 of 5) 5347 NM_004979 3750 Hs.55276 NM_004979 ENSG00000102057 KCND1 KV4.1 potassium voltage-gated channel subfamily D member 1 protein-coding 202.75-81 chr4 41581925 41582358 + 0.75 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) -30568 NM_001330982 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 130.75-163 chr6 20389826 20390171 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -11881 NM_001949 1871 Hs.269408 NM_001949 ENSG00000112242 E2F3 E2F-3 E2F transcription factor 3 protein-coding 115.75-26 chr11 28412206 28412530 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 65180 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 241.75-25 chr14 66305236 66305630 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -180938 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 121-177 chr7 67836811 67837030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -183333 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 163.5-11 chr1 166897115 166897364 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -20975 NM_053053 117143 Hs.435967 NM_053053 ENSG00000152382 TADA1 ADA1|HFI1|STAF42|TADA1L|hADA1 transcriptional adaptor 1 protein-coding 181.25-138 chr9 70374895 70375187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39616 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 155.5-52 chr14 51866032 51866390 + 0.75 NA intron (NM_001243774, intron 1 of 2) intron (NM_001243774, intron 1 of 2) 5599 NM_001243774 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 174.5-18 chr10 16301815 16302141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -134965 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 167-103 chr6 146726665 146727089 + 0.75 NA intron (NM_024694, intron 19 of 35) LTR78B|LTR|ERV1 76947 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 140.75-138 chr5 6784814 6785038 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -10954 NR_146281 109729133 Hs.582455 NR_146281 ENSG00000251365 LINC02236 - long intergenic non-protein coding RNA 2236 ncRNA 124.25-137 chr3 105648010 105648312 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 219430 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 213.5-18 chr10 65479545 65479943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91681 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 121.75-74 chr2 17532558 17532735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2232 NM_001321233 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 121.5-127 chr2 48308313 48308566 + 0.75 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -6243 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 128-10 chr1 169365960 169366253 + 0.75 NA intron (NR_104229, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 1691 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 140-77 chr2 123550515 123550810 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 474512 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 165.75-151 chr7 4937372 4937684 + 0.75 NA intron (NR_072989, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 21659 NR_072989 221938 Hs.558694 NM_198403 ENSG00000136297 MMD2 PAQR10 monocyte to macrophage differentiation associated 2 protein-coding 213-52 chr20 11473379 11473839 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -200226 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 142-100 chr3 8975666 8975911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12316 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 115.25-135 chr3 62673900 62674180 + 0.75 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) intron (NM_003716, intron 3 of 29) 201376 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 206.75-44 chr2 209475143 209475721 + 0.75 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 51385 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 149.25-126 chr4 33633258 33633590 + 0.75 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 406469 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 159-101 chr7 50540561 50540816 + 0.75 NA intron (NR_033845, intron 3 of 4) intron (NR_033845, intron 3 of 4) 8929 NR_033845 100129427 Hs.680434 NR_033845 ENSG00000226122 DDC-AS1 - DDC antisense RNA 1 ncRNA 115.5-247 chr9 26028707 26028952 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37846 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 219.75-11 chr10 84324671 84325084 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -3712 NM_001351290 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 142.5-58 chr13 41359189 41359445 + 0.75 NA TTS (NM_018527) TTS (NM_018527) -47279 NM_001354076 9617 Hs.382176 NM_004294 ENSG00000120662 MTRF1 MRF1|MTTRF1|RF1 mitochondrial translation release factor 1 protein-coding 115-80 chr2 46366210 46366405 + 0.75 NA intron (NM_001430, intron 6 of 15) Charlie30a|DNA|hAT-Charlie 27860 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 179.25-55 chr15 93981492 93981852 + 0.75 NA intron (NR_120320, intron 4 of 8) AluSp|SINE|Alu 80971 NR_120322 101927129 Hs.652658 NR_120322 ENSG00000258785 LINC01580 - long intergenic non-protein coding RNA 1580 ncRNA 229.25-84 chr8 126817015 126817586 + 0.75 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -195854 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 141-111 chr4 32916406 32916734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 565532 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 218-13 chr11 120606375 120606822 + 0.75 NA intron (NM_001282470, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 42162 NM_001282473 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 130.25 chr1 12167849 12168098 + 0.75 NA TTS (NR_107000) TTS (NR_107000) 982 NM_001066 7133 Hs.256278 NM_001066 ENSG00000028137 TNFRSF1B CD120b|TBPII|TNF-R-II|TNF-R75|TNFBR|TNFR1B|TNFR2|TNFR80|p75|p75TNFR TNF receptor superfamily member 1B protein-coding 124-159 chr7 50828278 50828541 + 0.75 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -34956 NM_001371008 138.25-6 chr1 68040100 68040339 + 0.75 NA intron (NR_040077, intron 2 of 9) MER65A|LTR|ERV1 11412 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 217.25-62 chr5 12833308 12833951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165770 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 139.75-145 chr5 35864111 35864469 + 0.75 NA intron (NR_120485, intron 2 of 5) L1ME2|LINE|L1 7399 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 201.5-102 chr4 161551941 161552427 + 0.75 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) intron (NM_001128428, intron 8 of 14) -470549 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 113.75-142 chr4 117894616 117894797 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60305 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 286.75-7 chr10 122258426 122258951 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12608 NM_001318189 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 127.25-218 chr9 104191200 104191392 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78933 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 173.25-142 chr9 87104754 87105148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19726 NR_036691 494127 Hs.626316 NR_036691 LOC494127 - NFYC pseudogene pseudo 297-40 chr5 169045552 169046164 + 0.75 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) L2c|LINE|L2 32631 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 190.25-33 chr13 22484634 22484953 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 274508 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 242-54 chr6 133442504 133442963 + 0.75 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) L1MEf|LINE|L1 201234 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 217.75 chr1 39547359 39547878 + 0.75 NA non-coding (NR_003929, exon 5 of 9) non-coding (NR_003929, exon 5 of 9) 12080 NR_003929 728448 Hs.472508 NR_003929 ENSG00000243970 PPIEL PPIEP1 peptidylprolyl isomerase E like pseudogene pseudo 269.75-29 chr2 36373041 36373803 + 0.75 NA intron (NM_016441, intron 1 of 16) intron (NM_016441, intron 1 of 16) 17644 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 137-95 chr21 36752537 36752888 + 0.75 NA non-coding (NR_148020, exon 11 of 11) non-coding (NR_148020, exon 11 of 11) 53597 NM_005069 6493 Hs.146186 NM_005069 ENSG00000159263 SIM2 HMC13F06|HMC29C01|SIM|bHLHe15 SIM bHLH transcription factor 2 protein-coding 199.25-2 chr1 83091733 83092094 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 7 of 10) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -105705 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 159.75-145 chr5 172065953 172066301 + 0.75 NA intron (NM_005990, intron 12 of 18) intron (NM_005990, intron 12 of 18) -59254 NM_033644 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 178-78 chr5 9036700 9037067 + 0.75 NA 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 17012 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 133.75-13 chr10 12730274 12730592 + 0.75 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) L2a|LINE|L2 -5080 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 129.5-186 chr5 104835947 104836240 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -263381 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 120.25-47 chr12 33857050 33857268 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -165337 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 171.25-97 chr3 60064376 60064638 + 0.75 NA intron (NM_001320901, intron 2 of 6) intron (NM_001320901, intron 2 of 6) 16402 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 176.25-65 chr2 64036714 64037174 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -17516 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 185.5-38 chr12 105967002 105967291 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy 172887 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 128.25-99 chr2 117518429 117518706 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -296124 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 151.75-24 chr10 100768724 100769039 + 0.75 NA intron (NM_003988, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR 23170 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 193.5-110 chr3 123596695 123597189 + 0.75 NA intron (NR_121654, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 11429 NR_038266 100506826 Hs.556600 NR_038266 ENSG00000239523 MYLK-AS1 - MYLK antisense RNA 1 ncRNA 135-63 chr18 7109416 7109630 + 0.75 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) intron (NM_005559, intron 1 of 62) 8274 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 152.25-96 chr20 52844986 52845258 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -127236 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 150.75-14 chr1 105762346 105762584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -143530 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 175.5-61 chr15 65744643 65745008 + 0.75 NA intron (NM_005848, intron 4 of 31) intron (NM_005848, intron 4 of 31) -25493 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 135-162 chr7 7184065 7184439 + 0.75 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) intron (NM_020156, intron 1 of 3) 1637 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 128-120 chr4 137436617 137436848 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 95762 NM_001300828 54510 Hs.591691 NM_019035 ENSG00000189184 PCDH18 PCDH68L protocadherin 18 protein-coding 176.5-54 chr14 57004135 57004416 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 191117 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 243.25-56 chr9 28224228 28224762 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1MA4|LINE|L1 494810 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 183-64 chr3 7195158 7195500 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -301312 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 143.75-41 chr12 104778461 104778751 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179684 NM_001352170 84102 Hs.577463 NM_032148 ENSG00000136052 SLC41A2 SLC41A1-L1 solute carrier family 41 member 2 protein-coding 198.25-56 chr2 55894149 55894548 + 0.75 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) intron (NM_001039349, intron 4 of 10) 29434 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 341-2 chr1 68770316 68770859 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -273505 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 125.75-50 chr14 46205483 46205689 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1MB1|LINE|L1 141427 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 118.5-56 chr14 70401625 70401808 + 0.75 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 15374 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 131.5-124 chr2 139530593 139530792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 633368 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 206.5-14 chr11 108252138 108252579 + 0.75 NA intron (NM_001351834, intron 12 of 63) intron (NM_001351834, intron 12 of 63) 28829 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 183.5-30 chr11 76902738 76903000 + 0.75 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 41951 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 235.75-67 chr7 31026170 31026585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25931 NM_001199637 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 162.75-127 chr6 143488688 143488927 + 0.75 NA intron (NM_003630, intron 11 of 11) intron (NM_003630, intron 11 of 11) 22913 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 152-53 chr14 87688334 87688760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33253 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 150.25-145 chr8 17616403 17616670 + 0.75 NA intron (NM_006207, intron 3 of 6) intron (NM_006207, intron 3 of 6) 40103 NM_006207 5157 Hs.458573 NM_006207 ENSG00000104213 PDGFRL PDGRL|PRLTS platelet derived growth factor receptor like protein-coding 246.75-77 chr8 120482339 120482832 + 0.75 NA intron (NM_022045, intron 11 of 21) intron (NM_022045, intron 11 of 21) 37166 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 118.75-68 chr15 90611242 90611566 + 0.75 NA intron (NM_001042574, intron 6 of 14) intron (NM_001042574, intron 6 of 14) -48830 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 124.25-146 chr4 65460393 65460587 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 5 of 16) MIR|SINE|MIR 208998 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 162.5-65 chr17 66826961 66827246 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -8014 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 249.25-23 chr2 106017615 106018230 + 0.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -47766 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 212.5-88 chr5 120687490 120687834 + 0.75 NA TTS (NM_001300783) TTS (NM_001300783) 156198 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 138-19 chr11 82984608 82984941 + 0.75 NA intron (NM_001286059, intron 4 of 4) L1MC5|LINE|L1 49500 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 120.25-194 chr7 23413677 23413901 + 0.75 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) intron (NM_006547, intron 3 of 14) 17343 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 212.25-7 chr1 209671056 209671513 + 0.75 NA intron (NR_134510, intron 1 of 2) intron (NR_134510, intron 1 of 2) 3965 NR_134511 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 154-97 chr3 131784118 131784369 + 0.75 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) L3|LINE|CR1 201688 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 169.75-143 chr7 53010588 53010878 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -24900 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 251.75-11 chr11 25323930 25324308 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 827066 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 149.5-16 chr1 238136537 238136808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245750 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 131.75-58 chr13 38185964 38186166 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -42833 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 144.5-120 chr20 46885288 46885612 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9174 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 218.75-36 chr2 121917340 121917686 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161862 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 185.5-85 chr2 173438516 173438832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83802 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 179.75-10 chr10 4590256 4590637 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65710 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 184.25-3 chr1 50534931 50535368 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 15 of 18) intron (NM_007051, intron 15 of 18) -111706 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 121.5-74 chr14 21201883 21202137 + 0.75 NA non-coding (NR_038970, exon 1 of 1) non-coding (NR_038970, exon 1 of 1) 3493 NR_038970 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 195.25-52 chr2 80696452 80696898 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 383296 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 271.75-36 chr4 122947684 122948182 + 0.75 NA intron (NM_001317799, intron 9 of 10) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 24855 NM_001345856 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 124.5-211 chr7 73383289 73383521 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -50373 NM_003508 8326 Hs.647029 NM_003508 ENSG00000188763 FZD9 CD349|FZD3 frizzled class receptor 9 protein-coding 183.25-86 chr5 130271682 130271997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 367374 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 169.75-61 chr16 88952141 88952642 + 0.75 NA TTS (NM_001290330) TTS (NM_001290330) -11041 NM_175931 863 Hs.513811 NM_005187 ENSG00000129993 CBFA2T3 ETO2|MTG16|MTGR2|RUNX1T3|ZMYND4 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 3 protein-coding 182.25-135 chr9 117032477 117032780 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 5 of 21) intron (NM_014010, intron 5 of 21) 148573 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 154.25-192 chrX 83159452 83159784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -348672 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 141-63 chr18 13189814 13190079 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -28814 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 161.25-55 chr14 72871438 72871820 + 0.75 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 21020 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 352.75-13 chr4 30844668 30845469 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 124699 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 216.25-33 chr14 77691378 77691896 + 0.75 NA intron (NM_006020, intron 3 of 5) L1ME4c|LINE|L1 16386 NM_006020 8846 Hs.94542 NM_006020 ENSG00000100601 ALKBH1 ABH|ABH1|ALKBH|alkB|hABH alkB homolog 1, histone H2A dioxygenase protein-coding 143.25-170 chr7 21011631 21011895 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 176332 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 112.5-233 chr8 80622170 80622352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136035 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 137-128 chr5 7777534 7777764 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 18 of 24) intron (NM_020546, intron 18 of 24) 73484 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 122-56 chr14 36260803 36261077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59697 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 129.25-128 chr3 94114886 94115172 + 0.75 NA intron (NM_022072, intron 5 of 5) intron (NM_022072, intron 5 of 5) 51968 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 233-57 chr7 47975036 47975535 + 0.75 NA intron (NM_004507, intron 5 of 7) AluY|SINE|Alu 4330 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 120.75-110 chr3 110026501 110026785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 423815 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 118.25-162 chr5 123431999 123432243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8529 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 148-121 chr7 42936400 42936665 + 0.75 NA intron (NM_031903, intron 2 of 2) intron (NM_031903, intron 2 of 2) 4156 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 164.25-155 chr8 118634777 118635160 + 0.75 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -13005 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 199-77 chr6 133790653 133791007 + 0.75 NA intron (NR_109982, intron 2 of 8) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -30317 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 211-16 chr12 65911858 65912270 + 0.75 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -29739 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-206 chr7 141191366 141191605 + 0.75 NA intron (NM_001195278, intron 1 of 3) L1ME4b|LINE|L1 117421 NM_001195278 100507421 Hs.283851 NM_001195278 ENSG00000261115 TMEM178B - transmembrane protein 178B protein-coding 143.25-61 chr15 96105583 96105893 + 0.75 NA intron (NR_158193, intron 4 of 7) intron (NR_158193, intron 4 of 7) 22103 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 176.25-112 chr5 61845178 61845444 + 0.75 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR -109613 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 194.25-72 chr3 71200625 71201102 + 0.75 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) 44214 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 168.25-35 chr12 63183397 63183713 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30745 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 116.5-167 chr3 167848646 167848917 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -47167 NR_033843 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 155.75-92 chr20 45058427 45058772 + 0.75 NA intron (NM_001352385, intron 11 of 11) intron (NM_001352385, intron 11 of 11) 42528 NM_002251 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 269.5-18 chr15 63766243 63766731 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 2 of 77) AluSz|SINE|Alu 67461 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 140.5-81 chr16 80498997 80499234 + 0.75 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR -41619 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 200-47 chr2 157712452 157712815 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -83769 NM_001111033 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 204.75-79 chr4 31698498 31699036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 192223 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 178.5-5 chr1 112911548 112911828 + 0.75 NA TTS (NM_001166496).2 TTS (NM_001166496).2 -11662 NR_002796 246182 Hs.647691 NR_002796 AKR7A2P1 AFARP1 aldo-keto reductase family 7 member A2 pseudogene 1 pseudo 209.25-21 chr11 117550361 117550803 + 0.75 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) MIRb|SINE|MIR 222728 NM_014956 22897 Hs.504009 NM_014956 ENSG00000110274 CEP164 NPHP15 centrosomal protein 164 protein-coding 167.25-23 chr11 74958706 74959004 + 0.75 NA intron (NM_014752, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 9589 NM_014752 9789 Hs.282700 NM_014752 ENSG00000118363 SPCS2 - signal peptidase complex subunit 2 protein-coding 126-138 chr5 31751488 31751803 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 112514 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 121-105 chr2 108035524 108035799 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 17094 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 124.75-17 chr1 194954693 194954898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1133920 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 231-66 chr5 19509677 19510240 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 10 of 12) intron (NM_001349559, intron 10 of 12) 376314 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 207.25-56 chr3 14991205 14991856 + 0.75 NA intron (NM_003298, intron 1 of 14) intron (NM_003298, intron 1 of 14) -43089 NR_046251 100505641 Hs.517821 NR_046251 ENSG00000225733 FGD5-AS1 - FGD5 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-176 chr7 43819851 43820100 + 0.75 NA Intergenic LTR10F|LTR|ERV1 49542 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 181.75-96 chr4 61665667 61665974 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 463648 NM_001371342 234-41 chr3 149282892 149283434 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 50275 NM_001184723 116441 Hs.22026 NM_138786 ENSG00000163762 TM4SF18 L6D transmembrane 4 L six family member 18 protein-coding 117.75-135 chr3 60286498 60286851 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -205765 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 122-126 chr4 31672343 31672640 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 165947 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 124.5-125 chr20 32421174 32421399 + 0.75 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) L1ME2|LINE|L1 62204 NM_080616 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 153.75-65 chr2 65792055 65792420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -359638 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 120.75-98 chr21 29690582 29690879 + 0.75 NA intron (NM_001320618, intron 1 of 13) intron (NM_001320618, intron 1 of 13) -57445 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 129.75-174 chr7 51284392 51284643 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) L1PA16|LINE|L1 32292 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 191.5-114 chr4 139580004 139580507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23486 NM_001306200 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 168-83 chr3 78191414 78191720 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -142604 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 122.25-188 chr8 82574360 82574525 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -337662 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 207.25-27 chr16 71220721 71221199 + 0.75 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) intron (NM_001198543, intron 1 of 18) 9762 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 201.75-10 chr10 62311992 62312394 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -43349 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 212.5-20 chr11 78157073 78157649 + 0.75 NA intron (NR_102281, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 17568 NR_102280 100289388 Hs.628183 NM_203432 ENSG00000246174 KCTD21-AS1 - KCTD21 antisense RNA 1 ncRNA 120-39 chr14 42290124 42290461 + 0.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 683436 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 202-36 chr2 165371926 165372316 + 0.75 NA intron (NM_001040143, intron 21 of 27) intron (NM_001040143, intron 21 of 27) 78066 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 253-32 chr3 40841192 40841585 + 0.75 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 316428 NM_198484 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 221-84 chr9 27836412 27837127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262903 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 156.75-129 chr5 18799896 18800167 + 0.75 NA Intergenic LTR21A|LTR|ERV1 992757 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 152-17 chr1 203297875 203298158 + 0.75 NA TTS (NR_034150) TTS (NR_034150) 7309 NR_034151 730227 Hs.293928 NR_034150 ENSG00000233791 LINC01136 - long intergenic non-protein coding RNA 1136 ncRNA 214.75-50 chr22 28200490 28200919 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -259165 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 195.75-32 chr12 711164 711549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41223 NM_018979 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 210-99 chr8 105072533 105072922 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245711 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 171-112 chr5 104272315 104272627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -709682 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 183.75-19 chr10 83106628 83106940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 570305 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 158-54 chr15 92173070 92173393 + 0.75 NA TTS (NM_001145044) TTS (NM_001145044) -220650 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 247.25-21 chr15 94418703 94419266 + 0.75 NA intron (NM_001159643, intron 16 of 19) intron (NM_001159643, intron 16 of 19) 63054 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 121-89 chr18 42573715 42573889 + 0.75 NA intron (NR_046174, intron 6 of 9) intron (NR_046174, intron 6 of 9) 387134 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 161.75-22 chr10 52768701 52769028 + 0.75 NA intron (NM_000242, intron 3 of 3) intron (NM_000242, intron 3 of 3) 2836 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 182-44 chr16 76041365 76041614 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -235912 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 133-125 chr4 82463473 82463736 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 33014 NM_001292017 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 130.25-216 chr9 34741069 34741404 + 0.75 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -11748 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 122.5-241 chrX 84758935 84759206 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175081 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 191.5-91 chr21 35424147 35424461 + 0.75 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 156460 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 169.25-56 chr2 144319775 144320031 + 0.75 NA intron (NM_001354351, intron 1 of 15) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 12368 NM_001354362 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 215.5-10 chr1 211492191 211492556 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001164688, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_001164688, exon 1 of 3) 544 NM_001164688 343035 Hs.632495 NM_183059 ENSG00000198570 RD3 C1orf36|LCA12 retinal degeneration 3, GUCY2D regulator protein-coding 140.25-142 chr4 179797866 179798165 + 0.75 NA Intergenic Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 1361134 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 146-69 chr2 163696518 163696842 + 0.75 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 39328 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 206.25-14 chr10 21440171 21440697 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 56207 NR_031736 100302129 NR_031736 ENSG00000222071 MIR1915 MIRN1915|hsa-mir-1915 microRNA 1915 ncRNA 195.75-53 chr17 80834915 80835392 + 0.75 NA intron (NM_020761, intron 9 of 33) intron (NM_020761, intron 9 of 33) -29521 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 119.25-78 chr17 68612171 68612360 + 0.75 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -10898 NM_017565 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 134-140 chr5 27488755 27488957 + 0.75 NA intron (NR_038848, intron 3 of 4) intron (NR_038848, intron 3 of 4) 16564 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 130-174 chr8 122288699 122288981 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 279804 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 142.5-204 chr7 28072617 28072882 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) HAL1ME|LINE|L1 -107708 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 200-33 chr15 80862890 80863272 + 0.75 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) intron (NM_018689, intron 1 of 28) -21008 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 168.75-19 chr10 44250550 44250860 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42045 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 133.25-160 chr4 172687981 172688299 + 0.75 NA intron (NR_125894, intron 1 of 2) intron (NR_125894, intron 1 of 2) 777 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 157.75-142 chr5 124084986 124085270 + 0.75 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 353392 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 240.75-31 chr17 39882790 39883641 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 15013 NM_198844 124626 Hs.367245 NM_198844 ENSG00000186075 ZPBP2 ZPBPL zona pellucida binding protein 2 protein-coding 161.5-22 chr10 69966644 69966900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86074 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 124-106 chr22 17712993 17713211 + 0.75 NA intron (NM_001270733, intron 1 of 1) MER5B|DNA|hAT-Charlie 6444 NM_001270733 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 167.75-119 chr5 155825221 155825659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -501317 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 128-21 chr10 93699408 93699705 + 0.75 NA intron (NM_145246, intron 2 of 13) intron (NM_145246, intron 2 of 13) 3016 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 142.75-200 chr9 90168390 90168601 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -126996 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 207.75-76 chr3 69355248 69355640 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) intron (NM_015123, intron 1 of 22) 30644 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 122.5-126 chr2 217194706 217195064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87848 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 155-87 chr3 100937445 100937687 + 0.75 NA intron (NM_001349332, intron 1 of 35) intron (NM_001349332, intron 1 of 35) 55924 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 148.25-60 chr18 3732194 3732584 + 0.75 NA intron (NM_001242762, intron 3 of 9) L1MC5|LINE|L1 112969 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 130.5-240 chr8 72797805 72798053 + 0.75 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 65884 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 159.75-124 chr5 17246062 17246364 + 0.75 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) AluSx3|SINE|Alu 28582 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 171.5-38 chr12 44533626 44534045 + 0.75 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) intron (NM_006159, intron 16 of 20) 341826 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 201.5-48 chr13 112605383 112605953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17483 NM_001286279 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 189.5-58 chr17 44736546 44736882 + 0.75 NA intron (NM_145663, intron 7 of 13) intron (NM_145663, intron 7 of 13) -22274 NM_001318933 4185 Hs.6088 NM_002390 ENSG00000073670 ADAM11 MDC ADAM metallopeptidase domain 11 protein-coding 114-70 chr2 50898924 50899108 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 133116 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 191.25-77 chr4 71597125 71597547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186743 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 176-29 chr17 39220721 39221125 + 0.75 NA intron (NM_001351360, intron 1 of 10) AluY|SINE|Alu 5022 NM_198993 342667 Hs.145068 NM_198993 ENSG00000141750 STAC2 24b2|24b2/STAC2 SH3 and cysteine rich domain 2 protein-coding 128.75-212 chr9 98140577 98140848 + 0.75 NA intron (NM_003389, intron 2 of 11) AluJr4|SINE|Alu -21490 NM_014788 9830 Hs.575631 NM_014788 ENSG00000106785 TRIM14 - tripartite motif containing 14 protein-coding 156-25 chr11 59306610 59307012 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -57648 NM_001004729 390195 Hs.553755 NM_001004729 ENSG00000176495 OR5AN1 OR11-244 olfactory receptor family 5 subfamily AN member 1 protein-coding 246.25-4 chr1 183108668 183109286 + 0.75 NA intron (NM_002293, intron 3 of 27) intron (NM_002293, intron 3 of 27) 32293 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-18 chr10 47242621 47242907 + 0.75 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -57433 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 145.5-165 chr5 152898663 152899020 + 0.75 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 73508 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 132.5-140 chr20 38610215 38610642 + 0.75 NA intron (NM_001164431, intron 1 of 14) MER4D|LTR|ERV1 8619 NM_001164431 343578 NM_001164431 ENSG00000124143 ARHGAP40 C20orf95|dJ1100H13.4 Rho GTPase activating protein 40 protein-coding 223.75-61 chr3 114706557 114706906 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 5 of 10) intron (NM_001348805, intron 5 of 10) 36794 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 194.25-25 chr12 114028963 114029439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62876 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 146-45 chr15 86547394 86547760 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 20 of 24) intron (NM_152336, intron 20 of 24) -230609 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 174.5 chr1 25795047 25795309 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5015 NM_020451 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 112.5-243 chr9 77013150 77013337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6412 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 180-15 chr10 112530409 112530805 + 0.75 NA intron (NM_001365710, intron 4 of 7) intron (NM_001365710, intron 4 of 7) -83004 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 162-116 chr8 87901772 87902077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27909 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 161.25-165 chr7 80489367 80489732 + 0.75 NA intron (NM_001102386, intron 2 of 7) intron (NM_001102386, intron 2 of 7) 22515 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 125.25-82 chr17 69814875 69815139 + 0.75 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MB1|LINE|L1 -146700 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 126.5-18 chr1 207446692 207447023 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -7443 NM_001006658 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 179-92 chr8 124536472 124536892 + 0.75 NA intron (NM_001317889, intron 1 of 12) intron (NM_001317889, intron 1 of 12) 2403 NM_032026 83940 Hs.170568 NM_032026 ENSG00000147687 TATDN1 CDA11 TatD DNase domain containing 1 protein-coding 128.75-107 chr20 18824091 18824365 + 0.75 NA intron (NR_161343, intron 2 of 2) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 5975 NR_161342 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 120.5-158 chr4 40832618 40832886 + 0.75 NA intron (NM_001166051, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 24403 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 176.25-64 chr2 62881994 62882314 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) L1M4a2|LINE|L1 165557 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 115.5-251 chr9 33061314 33061490 + 0.75 NA intron (NM_018225, intron 5 of 11) intron (NM_018225, intron 5 of 11) 15272 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 190.5-102 chr3 110168345 110168814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 565751 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 205.25-49 chr2 28991784 28992259 + 0.75 NA intron (NM_001321538, intron 1 of 18) intron (NM_001321538, intron 1 of 18) 10723 NM_001321538 165186 Hs.525977 NM_199280 ENSG00000189350 TOGARAM2 FAM179A TOG array regulator of axonemal microtubules 2 protein-coding 120-25 chr11 66110475 66110788 + 0.75 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) AluSz6|SINE|Alu 40359 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 270.25-8 chr10 57369224 57369679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64892 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 270.75-33 chr3 88137269 88137893 + 0.75 NA intron (NM_001350135, intron 5 of 6) L2c|LINE|L2 12285 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 131.25-204 chr8 124645381 124645721 + 0.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 82922 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 118.75-67 chr15 71598218 71598414 + 0.75 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) intron (NM_001286429, intron 1 of 11) 51080 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 155.5-84 chr18 78188330 78188580 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -194728 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 121.5-248 chr8 117088638 117088979 + 0.75 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -46187 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 168.25-53 chr16 13903823 13904133 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -16179 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 147.25-30 chr13 36538911 36539300 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 106610 NM_003914 8900 Hs.417050 NM_003914 ENSG00000133101 CCNA1 CT146 cyclin A1 protein-coding 170.25-58 chr17 72577548 72577914 + 0.75 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 15073 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 215.75-78 chr5 71935897 71936287 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -171383 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 189-89 chr5 56720947 56721409 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51693 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 150.5-210 chr8 21109987 21110374 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 136194 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 138-152 chr7 43442709 43442948 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 9 of 27) intron (NM_001287059, intron 9 of 27) 79714 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 170.75-145 chr8 140632063 140632365 + 0.75 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 3419 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 173-34 chr12 32482261 32482549 + 0.75 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) -3567 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 116.25-231 chr8 118943564 118943833 + 0.75 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) intron (NM_002546, intron 1 of 4) 8187 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 139-116 chr5 104332765 104333009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -766587 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 144-89 chr3 184943062 184943464 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 35 of 46) intron (NM_001009921, intron 35 of 46) 130756 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 127.75-107 chr2 155096802 155097113 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 398262 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 144.5-147 chr4 59941194 59941491 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 927769 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 228.75-34 chr18 76225286 76225638 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15952 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 166.5-213 chr9 129121002 129121287 + 0.75 NA intron (NM_001271832, intron 2 of 8) intron (NM_001271832, intron 2 of 8) 9456 NM_001193397 5524 Hs.400740 NM_021131 ENSG00000119383 PTPA PP2A|PPP2R4|PR53 protein phosphatase 2 phosphatase activator protein-coding 144-135 chr8 110691620 110691994 + 0.75 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 335626 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 112.75-69 chr15 62052084 62052351 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 1 of 81) intron (NM_001018088, intron 1 of 81) 8230 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 146-113 chr6 142367329 142367703 + 0.75 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) intron (NM_198569, intron 2 of 24) 65509 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 129.5-217 chr7 100059156 100059401 + 0.75 NA intron (NM_145914, intron 3 of 3) intron (NM_145914, intron 3 of 3) 9484 NM_001362779 7589 Hs.632294 NM_145914 ENSG00000166529 ZSCAN21 NY-REN-21|ZNF38|Zipro1 zinc finger and SCAN domain containing 21 protein-coding 113.75-147 chr5 9088720 9088880 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 16 of 22) intron (NM_003966, intron 16 of 22) -34905 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 145.25-47 chr16 5908272 5908554 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -110611 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 171-34 chr14 35258614 35258995 + 0.75 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) intron (NM_014672, intron 5 of 7) -19754 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 151.25-62 chr16 54552104 54552498 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -181602 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 117.5-170 chr5 15185667 15185941 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 80756 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 188.5-88 chr20 41875811 41876341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257699 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 194-63 chr4 57413190 57413599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12478 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 134.25-111 chr3 57186037 57186238 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 13841 NM_003865 8820 Hs.171980 NM_003865 ENSG00000163666 HESX1 ANF|CPHD5|RPX HESX homeobox 1 protein-coding 172.25-8 chr1 179879154 179879471 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1509 NM_001349931 163590 Hs.571797 NM_022347 ENSG00000169905 TOR1AIP2 IFRG15|LULL1|NET9 torsin 1A interacting protein 2 protein-coding 123.5-127 chr3 18990049 18990346 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158313 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 115.75-111 chr2 127298687 127298964 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006609, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_006609, exon 16 of 16) -4649 NM_000122 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 198-61 chr5 24859784 24860111 + 0.75 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -19364 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 170.5-139 chr5 13212324 13212710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179631 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 272.25-46 chr5 86195945 86196543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86200 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 123.5-72 chr16 35434470 35434715 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 46004 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 147-49 chr17 12209119 12209457 + 0.75 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 127389 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 160.25-43 chr15 65432440 65432923 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9734 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 123.75-199 chr9 12567856 12568075 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -125420 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 121.75-20 chr11 68169278 68169546 + 0.75 NA intron (NR_161380, intron 10 of 10) L2a|LINE|L2 43884 NM_001369433 51111 Hs.632120 NM_016028 ENSG00000110066 KMT5B CGI-85|CGI85|MRD51|SUV420H1 lysine methyltransferase 5B protein-coding 139.75-91 chr2 25616114 25616327 + 0.75 NA intron (NM_033147, intron 4 of 19) intron (NM_033147, intron 4 of 19) 34002 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 122-129 chr4 59623848 59624033 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 610367 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 118.5-240 chrX 118793668 118793904 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001560, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001560, exon 11 of 11) -30038 NM_001312891 170261 Hs.21417 NM_173798 ENSG00000174460 ZCCHC12 PNMA7A|SIZN|SIZN1 zinc finger CCHC-type containing 12 protein-coding 127.75-183 chr7 6145860 6146241 + 0.75 NA intron (NM_032172, intron 10 of 17) AluSz|SINE|Alu 26087 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 166.25-98 chr3 5342880 5343404 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -92887 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 178-64 chr3 126216707 126216992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35663 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 158-68 chr2 16886079 16886359 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -220385 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 194.75-48 chr2 13601778 13602336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -595044 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 127-35 chr11 102510598 102510819 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 20039 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 211.75-100 chr8 122543236 122543614 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L1MA8|LINE|L1 25219 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 143.5-30 chr11 6449677 6449944 + 0.75 NA intron (NM_006458, intron 11 of 12) L2b|LINE|L2 -8823 NM_000613 3263 Hs.426485 NM_000613 ENSG00000110169 HPX HX hemopexin protein-coding 355.25-12 chr5 144108039 144108855 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 62212 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 166.25-24 chr10 68647851 68648191 + 0.75 NA intron (NM_030625, intron 4 of 11) intron (NM_030625, intron 4 of 11) -73218 NM_001282959 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 118.25-99 chr2 39187265 39187573 + 0.75 NA intron (NM_001009565, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu 42169 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 138.25-155 chr7 5190916 5191110 + 0.75 NA intron (NM_016003, intron 1 of 11) AluSz|SINE|Alu 780 NM_016003 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 120.75-168 chr8 99774251 99774529 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 40 of 61) intron (NM_017890, intron 40 of 61) 119317 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 125-40 chr14 54926346 54926543 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -23618 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 115.25-145 chr4 59956505 59956812 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 943085 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 138-129 chr5 67180078 67180273 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005582, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_005582, exon 3 of 3) 16624 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 149.75-29 chr12 26552356 26552678 + 0.75 NA intron (NM_002223, intron 36 of 56) intron (NM_002223, intron 36 of 56) 280677 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 191.5-18 chr10 96481581 96481934 + 0.75 NA intron (NM_012465, intron 1 of 20) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 32169 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 177.25-106 chr4 42520366 42520781 + 0.75 NA intron (NM_001105529, intron 21 of 35) intron (NM_001105529, intron 21 of 35) 123085 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 221.5-26 chr14 52792254 52792620 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_198066) promoter-TSS (NM_198066) -830 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 144.5-5 chr1 30827499 30827753 + 0.75 NA intron (NR_146732, intron 2 of 2) intron (NR_146732, intron 2 of 2) 2974 NR_146732 105378622 Hs.209284 NR_146732 ENSG00000223382 LINC01778 - long intergenic non-protein coding RNA 1778 ncRNA 235-3 chr1 42040440 42040777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4674 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 153-84 chr20 18547070 18547325 + 0.75 NA intron (NM_032986, intron 15 of 19) MIR|SINE|MIR -20223 NM_001348958 388789 Hs.349092 NM_001348957 ENSG00000232388 SMIM26 LINC00493 small integral membrane protein 26 protein-coding 251.25-47 chr6 159949648 159950347 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19102 NM_000876 3482 Hs.487062 NM_000876 ENSG00000197081 IGF2R CD222|CI-M6PR|CIMPR|M6P-R|M6P/IGF2R|MPR 300|MPR1|MPR300|MPRI insulin like growth factor 2 receptor protein-coding 123.75-191 chr8 98859752 98860122 + 0.75 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) -34249 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 169.25-11 chr10 105527408 105527719 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 292770 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 127-12 chr10 10042713 10042912 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15910 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 157.25-154 chr8 105412274 105412612 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 92900 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 159.25-70 chr2 121616291 121616641 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) AluSq2|SINE|Alu 32996 NM_001207051 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 148.75-103 chr22 26110384 26110651 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -58945 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 178.25-110 chr7 64054335 64054642 + 0.75 NA intron (NM_001159522, intron 1 of 3) L1MC4a|LINE|L1 9054 NM_001159522 442319 Hs.640774 NM_001159522 ENSG00000214652 ZNF727 ZNF727P zinc finger protein 727 protein-coding 206.5-57 chr2 134113349 134113790 + 0.75 NA Intergenic LTR103_Mam|LTR|ERV1? -6366 NM_001371457 139-106 chr5 6584920 6585235 + 0.75 NA intron (NR_024424, intron 1 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 1801 NR_024424 255167 Hs.435515 NR_024423 ENSG00000250056 LINC01018 SRHC long intergenic non-protein coding RNA 1018 ncRNA 145.25-131 chr5 43538189 43538502 + 0.75 NA intron (NM_006451, intron 5 of 10) L1MA8|LINE|L1 18732 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 191.75-9 chr1 182884986 182885326 + 0.75 NA intron (NM_001357, intron 27 of 27) intron (NM_001357, intron 27 of 27) -45565 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 174.75-113 chr7 35681222 35681544 + 0.75 NA intron (NM_022373, intron 2 of 8) L1MB7|LINE|L1 13752 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 157.5-79 chr17 54802254 54802554 + 0.75 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -98287 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 139.75-3 chr1 82061866 82062210 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 259585 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 194.75-73 chr4 46318672 46319097 + 0.75 NA intron (NM_001286827, intron 3 of 9) intron (NM_001286827, intron 3 of 9) 70495 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 119.5-59 chr12 9667503 9667664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2130 NM_001197319 29121 Hs.268326 NM_013269 ENSG00000069493 CLEC2D CLAX|LLT1|OCIL C-type lectin domain family 2 member D protein-coding 160.75-144 chr7 30331461 30331694 + 0.75 NA intron (NM_147128, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 -38473 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 211.25-25 chr14 82789249 82789734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146859 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 127.75-42 chr11 45023986 45024319 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 50250 NR_026681 221122 Hs.551656 NR_026681 ENSG00000254654 LINC02685 - long intergenic non-protein coding RNA 2685 ncRNA 140.25-78 chr18 9338327 9338574 + 0.75 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 3677 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 132.25-3 chr1 42650071 42650334 + 0.75 NA intron (NM_001080850, intron 15 of 16) AluJo|SINE|Alu -8221 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 128-135 chr6 52211078 52211298 + 0.75 NA Intergenic ORSL-2a|DNA|hAT-Tip100 24813 NM_002190 3605 Hs.41724 NM_002190 ENSG00000112115 IL17A CTLA-8|CTLA8|IL-17|IL-17A|IL17 interleukin 17A protein-coding 172.5-164 chr6 28449846 28450120 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6492 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 126-77 chr17 69934955 69935204 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26628 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 120.75-57 chr16 19061547 19061801 + 0.75 NA intron (NM_024847, intron 15 of 15) L2a|LINE|L2 5809 NR_119382 102723385 Hs.569608 NR_119379 ENSG00000261465 LOC102723385 - uncharacterized LOC102723385 ncRNA 192.25-16 chr11 80362147 80362490 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 400485 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 164.5-149 chr4 66381915 66382288 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105277 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 167-11 chr1 151974063 151974359 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 19648 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 198.5-84 chr2 202328141 202328559 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35299 NR_003031 692058 NR_003031 ENSG00000238317 SNORD11 HBII-95 small nucleolar RNA, C/D box 11 snoRNA 216.25-28 chr13 25936734 25937210 + 0.75 NA intron (NM_016529, intron 33 of 36) intron (NM_016529, intron 33 of 36) 114088 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 117.25-33 chr10 90426642 90426892 + 0.75 NA intron (NR_110657, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 114038 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 214.5-68 chr20 14244420 14244853 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 92976 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 128.25-40 chr12 65490664 65490914 + 0.75 NA intron (NR_120431, intron 3 of 3) FAM|SINE|Alu 66522 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 157.75-186 chrUn_KI270519v1 67078 67422 + 0.75 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 121.25-110 chr20 20462905 20463251 + 0.75 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 94974 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 225.5-51 chr2 2408976 2409355 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -77890 NM_001329851 23040 Hs.434418 NM_015025 ENSG00000186487 MYT1L MRD39|NZF1|ZC2H2C2|ZC2HC4B|myT1-L myelin transcription factor 1 like protein-coding 166.75-27 chr11 96537062 96537401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28806 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 112.25-97 chr2 80496620 80496829 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 183345 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 138-86 chr20 34301802 34302171 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001322084, exon 1 of 10) 5' UTR (NM_001322084, exon 1 of 10) 1004 NM_001322084 191 Hs.388004 NM_000687 ENSG00000101444 AHCY SAHH|adoHcyase adenosylhomocysteinase protein-coding 199.25-65 chr22 22031741 22032148 + 0.75 NA intron (NR_135291, intron 1 of 6) intron (NR_135291, intron 1 of 6) 11990 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 127.25-19 chr10 50575304 50575590 + 0.75 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu 48509 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 238-28 chr2 168228293 168228832 + 0.75 NA intron (NM_013233, intron 1 of 17) AluSq2|SINE|Alu 19033 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 128.25-72 chr17 59409195 59409618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43323 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 112.5-216 chr6 142733297 142733617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95568 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 202.75-3 chr1 107206507 107207127 + 0.75 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 58748 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 118.25-45 chr11 110270187 110270407 + 0.75 NA intron (NM_001260493, intron 3 of 15) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 26415 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 140.5-3 chr1 44451583 44451794 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) AluSg|SINE|Alu 27687 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 136.75-102 chr2 108252972 108253263 + 0.75 NA intron (NM_001008743, intron 3 of 7) intron (NM_001008743, intron 3 of 7) 13149 NM_001008743 442038 NM_001008743 ENSG00000196228 SULT1C3 ST1C3 sulfotransferase family 1C member 3 protein-coding 140.5-156 chr3 105002632 105002950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -363922 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 153.25-45 chr15 45065901 45066219 + 0.75 NA intron (NM_003104, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 42865 NM_003104 6652 Hs.878 NM_003104 ENSG00000140263 SORD HEL-S-95n|RDH|SDH|SORD1|XDH sorbitol dehydrogenase protein-coding 230-44 chr22 28304174 28304812 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 3 of 22) intron (NM_001145418, intron 3 of 22) -155376 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 217.5-134 chr9 89003164 89003504 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005226, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_005226, exon 2 of 2) 11866 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 115.25-12 chr1 84179757 84180015 + 0.75 NA intron (NM_001300915, intron 5 of 11) L1PA7|LINE|L1 -1746 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 264-26 chr19 38155311 38155740 + 0.75 NA intron (NM_015073, intron 13 of 21) intron (NM_015073, intron 13 of 21) -7571 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 129-94 chr2 133931865 133932113 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -187946 NM_001371457 126.5-104 chr2 13912791 13913024 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 488051 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 115.75-62 chr14 54388739 54388981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8008 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 126.75-165 chr4 33109590 33109909 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 758711 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 116.5-123 chr2 106292365 106292604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77261 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 157-83 chr4 57167854 57168128 + 0.75 NA intron (NR_034081, intron 1 of 4) intron (NR_034081, intron 1 of 4) -57606 NM_001553 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 253-12 chr13 52109859 52110270 + 0.75 NA intron (NM_199289, intron 7 of 21) intron (NM_199289, intron 7 of 21) -18831 NR_110306 101929657 Hs.637461 NR_110306 ENSG00000273523 LOC101929657 - uncharacterized LOC101929657 ncRNA 148.75-130 chr5 24046189 24046486 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 94989 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 187.25-90 chr5 179861487 179861795 + 0.75 NA TTS (NM_015043).2 TTS (NM_015043).2 2638 NR_134283 100996419 Hs.314414 NR_134283 ENSG00000245317 LOC100996419 - uncharacterized LOC100996419 ncRNA 117.5-6 chr1 88300085 88300245 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -383979 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 350-15 chr5 92252281 92252987 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -869317 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 193.5-38 chr12 130556110 130556703 + 0.75 NA intron (NM_001351226, intron 2 of 21) intron (NM_001351226, intron 2 of 21) 72050 NM_015347 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 228.75-54 chr3 97805688 97806001 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16167 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 144.5-100 chr2 34953016 34953319 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 275610 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 118.75-189 chr7 115962615 115962855 + 0.75 NA intron (NM_001018058, intron 2 of 6) L1MB4|LINE|L1 5578 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 174.25-30 chr12 560527 560955 + 0.75 NA intron (NM_173593, intron 19 of 19) intron (NM_173593, intron 19 of 19) 25745 NR_134624 105369595 Hs.504422 NR_134624 LOC105369595 - uncharacterized LOC105369595 ncRNA 116.5-175 chr4 46774884 46775103 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) intron (NM_130902, intron 2 of 2) 134252 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 193.5-140 chr5 173133458 173133785 + 0.75 NA intron (NM_153607, intron 8 of 8) intron (NM_153607, intron 8 of 8) -10910 NM_001205 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 153.75-37 chr14 23274695 23274970 + 0.75 NA 3' UTR (NM_020834, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_020834, exon 2 of 2) 11300 NM_020834 57594 Hs.632332 NM_020834 ENSG00000215271 HOMEZ KIAA1443 homeobox and leucine zipper encoding protein-coding 165.5-119 chr3 139638058 139638450 + 0.75 NA intron (NM_178177, intron 1 of 4) intron (NM_178177, intron 1 of 4) 39718 NM_001320510 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 169.5-121 chr4 52999726 53000016 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 137554 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 115.25-58 chr14 49646776 49646955 + 0.75 NA intron (NM_001348385, intron 18 of 18) intron (NM_001348385, intron 18 of 18) -11635 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 170.25-117 chr4 103745437 103745686 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -25576 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 188.5-153 chr8 111294503 111295017 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -58557 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 159-60 chr22 40747315 40747700 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 66451 NR_039923 100616283 NR_039923 ENSG00000266594 MIR4766 mir-4766 microRNA 4766 ncRNA 173.25-78 chr3 106776680 106777044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 463776 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 148.75-69 chr17 29946712 29947052 + 0.75 NA intron (NR_026738, intron 3 of 15) L1PB3|LINE|L1 5248 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 123-155 chr5 56136423 56136724 + 0.75 NA intron (NM_024669, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 96757 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 169.75-124 chr5 64317737 64318131 + 0.75 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 152091 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 122.25-7 chr1 115851206 115851504 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -10229 NM_005599 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 178.75-9 chr10 7162261 7162669 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001018039, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001018039, exon 21 of 21) 24319 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 206-12 chr10 105240827 105241238 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 20 of 26) L1ME2z|LINE|L1 -574816 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-112 chr2 215096639 215096949 + 0.75 NA intron (NR_103740, intron 2 of 54) intron (NR_103740, intron 2 of 54) 41832 NM_173076 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 131.5-179 chr4 86673255 86673574 + 0.75 NA intron (NM_080685, intron 3 of 47) L2c|LINE|L2 79099 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 146.5-206 chr7 43839904 43840303 + 0.75 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 29414 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 154.25-147 chr6 136025472 136025801 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 2 of 12) intron (NM_018945, intron 2 of 12) 47191 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 247.5-33 chr17 67669662 67670177 + 0.75 NA intron (NM_181671, intron 7 of 9) AluSq2|SINE|Alu -47914 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 160.75-152 chr8 125894640 125894890 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 56432 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 171.25-10 chr10 6788449 6788910 + 0.75 NA intron (NR_038291, intron 2 of 4) intron (NR_038291, intron 2 of 4) 9081 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 143.75-8 chr1 100700062 100700390 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -19414 NM_001199834 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 170.5-151 chr5 135845993 135846349 + 0.75 NA intron (NR_146141, intron 2 of 8) MER1B|DNA|hAT-Charlie 11495 NM_001349336 153328 Hs.412418 NM_145282 ENSG00000145832 SLC25A48 - solute carrier family 25 member 48 protein-coding 127-117 chr3 80643965 80644189 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120820 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 202-34 chr2 114630529 114630891 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) LTR78|LTR|ERV1 169133 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 150-61 chr17 59670136 59670456 + 0.75 NA intron (NM_001288653, intron 14 of 31) L1PA13|LINE|L1 37302 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 146-115 chr6 166133741 166134139 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 33911 NM_001366285 6862 Hs.389457 NM_003181 ENSG00000164458 TBXT SAVA|T|TFT T-box transcription factor T protein-coding 135.75-134 chr3 48402684 48403033 + 0.75 NA TTS (NM_001130082) TTS (NM_001130082) 26605 NM_002673 5364 Hs.476209 NM_002673 ENSG00000164050 PLXNB1 PLEXIN-B1|PLXN5|SEP plexin B1 protein-coding 113.25-76 chr18 27125543 27125807 + 0.75 NA intron (NM_001256316, intron 2 of 4) intron (NM_001256316, intron 2 of 4) 59633 NM_001256316 83539 Hs.44584 NM_031422 ENSG00000154080 CHST9 GALNAC4ST-2|GalNAc4ST2 carbohydrate sulfotransferase 9 protein-coding 124.25-28 chr10 79993729 79993948 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -44733 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 134.75-106 chr2 56245427 56245723 + 0.75 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) L1MA3|LINE|L1 -59805 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 114-136 chr5 87292202 87292392 + 0.75 NA intron (NM_022650, intron 1 of 24) L1MC1|LINE|L1 23373 NM_022650 5921 Hs.664080 NM_002890 ENSG00000145715 RASA1 CM-AVM|CMAVM|CMAVM1|GAP|PKWS|RASA|RASGAP|p120|p120GAP|p120RASGAP RAS p21 protein activator 1 protein-coding 193-36 chr19 747406 747929 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001040134, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001040134, exon 8 of 8) -3445 NR_135168 126353 Hs.439180 NM_173481 ENSG00000099812 MISP C19orf21|MISP1 mitotic spindle positioning protein-coding 127-89 chr18 8642395 8642704 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33104 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 148-50 chr18 67395428 67395673 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -120996 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 237-27 chr2 101912935 101913562 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -70217 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 173.25-73 chr3 34400801 34401089 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 602315 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 129.25-92 chr2 104568374 104568722 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58039 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 138-74 chr2 44494826 44495094 + 0.75 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 133013 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 265-16 chr17 72278491 72279003 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -64064 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 138.5-132 chr3 26166184 26166393 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -292593 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 181-41 chr17 70802292 70802611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 399728 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 140.5-66 chr14 64869170 64869420 + 0.75 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) intron (NM_001355436, intron 1 of 35) 10612 NM_001355436 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 150.25-53 chr14 69444825 69445179 + 0.75 NA intron (NM_001252148, intron 3 of 5) L1MC4a|LINE|L1 -39726 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 134.75-99 chr18 74114583 74114810 + 0.75 NA intron (NM_001142958, intron 8 of 9) intron (NM_001142958, intron 8 of 9) 33138 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 123.25-58 chr14 59382784 59382975 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 82501 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 129-91 chr2 65606547 65606740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -174044 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 141.25-148 chr5 167849011 167849273 + 0.75 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 94213 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 222-68 chr5 126462587 126462954 + 0.75 NA intron (NR_146196, intron 1 of 14) intron (NR_146196, intron 1 of 14) -2380 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 116.25-204 chr7 4822015 4822249 + 0.75 NA intron (NM_018059, intron 6 of 14) intron (NM_018059, intron 6 of 14) 15318 NR_145804 109623455 NR_145804 SNORD165 - small nucleolar RNA, C/D box 165 snoRNA 151.25-84 chr2 45298796 45299072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43993 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 184.25-125 chr8 132923214 132923540 + 0.75 NA exon (NM_003235, exon 22 of 48) exon (NM_003235, exon 22 of 48) 56419 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 118.5-155 chr4_KI270787v1_alt 68620 68931 + 0.75 NA NA Intergenic NA NA 128.5-223 chr8 85496537 85496785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31746 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-197 chr6 62982225 62982567 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 337581 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 166.75-135 chr7 86007653 86007932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 586670 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 171.75-144 chr8 144224267 144224580 + 0.75 NA intron (NM_001288814, intron 13 of 41) AluJo|SINE|Alu 38314 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 182.75-126 chr7 82989581 82989999 + 0.75 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 173094 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 115.75-220 chr8 125372160 125372348 + 0.75 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -58104 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 118.25-109 chr2 187090808 187091152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -241810 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 133.5-76 chr14 44994482 44994700 + 0.75 NA intron (NR_131765, intron 1 of 19) AluJb|SINE|Alu 32401 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 139-111 chr5 24270254 24270495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 319026 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 122.5-146 chr3 23709949 23710191 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -95885 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 257.25-6 chr10 92418687 92419049 + 0.75 NA non-coding (NR_038243, exon 1 of 1) non-coding (NR_038243, exon 1 of 1) 207 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 134.5-142 chr3 171503910 171504175 + 0.75 NA Intergenic LTR91|LTR|ERVL -43634 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 158-136 chr8 64821810 64822118 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23227 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 115.5-136 chr2 169234056 169234239 + 0.75 NA intron (NM_004525, intron 29 of 78) L1PA8|LINE|L1 128387 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 137.25-90 chr22 35069124 35069577 + 0.75 NA intron (NM_001303508, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 3192 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 171.5-155 chr8 120940152 120940552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128306 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 114.75-101 chr2 185549549 185549819 + 0.75 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie 189035 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 159-18 chr10 119210449 119210732 + 0.75 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 3019 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 181.5-19 chr11 37821328 37821850 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -117012 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 148.75-125 chr4 138054156 138054488 + 0.75 NA intron (NR_037866, intron 7 of 10) MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -34692 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 123.75-99 chr2 210726224 210726458 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108770 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 142.5-129 chr21 19433526 19433746 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 466119 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 150.5-49 chr14 51316253 51316614 + 0.75 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 11952 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 223.75-62 chr3 119693897 119694394 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -8877 NM_001320317 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 143.75-76 chr18 61936299 61936533 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -43409 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 215.25-13 chr11 28252304 28252695 + 0.75 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 144111 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 203.75-8 chr10 20241122 20241436 + 0.75 NA intron (NM_032812, intron 12 of 13) intron (NM_032812, intron 12 of 13) -310691 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 198.5-69 chr2 48074552 48074942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -168954 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 230.5-81 chr3 115991288 115991789 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) L1MA7|LINE|L1 -86412 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 217.25-49 chr20 32346620 32347031 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -11519 NM_015338 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 161.5-113 chr2 215198629 215198914 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60145 NR_103740 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 185-26 chr16 5341407 5341788 + 0.75 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -243777 NM_201598 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 120.5-98 chr17 58353677 58353957 + 0.75 NA TTS (NR_038410) TTS (NR_038410) -1616 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 180.25-12 chr11 84816329 84816707 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -95576 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 133.25-193 chr7 3432590 3432878 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 131482 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 221.75-7 chr1 93777720 93778238 + 0.75 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) L1MC5|LINE|L1 -2596 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 116.25-183 chr5 112495234 112495440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75754 NR_027706 54508 Hs.591264 NR_027706 ENSG00000278921 EPB41L4A-DT EPB41L4A-AS2 EPB41L4A divergent transcript ncRNA 152.5-122 chr3 143854045 143854328 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5718 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 120.25-36 chr11 19735104 19735424 + 0.75 NA intron (NM_182964, intron 1 of 37) intron (NM_182964, intron 1 of 37) -20592 NR_015384 100126784 Hs.64341 NR_015384 LOC100126784 - uncharacterized LOC100126784 ncRNA 117.5-196 chr5 139039827 139040035 + 0.75 NA intron (NM_022464, intron 5 of 9) intron (NM_022464, intron 5 of 9) 158437 NM_001037633 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 148.75-49 chr13 98573606 98573930 + 0.75 NA intron (NM_001032296, intron 1 of 10) MIRc|SINE|MIR 3383 NM_001286649 8428 Hs.508514 NM_003576 ENSG00000102572 STK24 HEL-S-95|MST3|MST3B|STE20|STK3 serine/threonine kinase 24 protein-coding 115.25-132 chr3 46095389 46095644 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -68033 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 181.75-106 chr5 26451383 26451698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 587046 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 177.25-75 chr2 201623275 201623583 + 0.75 NA 3' UTR (NM_152388, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_152388, exon 12 of 12) -4251 NM_001168221 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 224.25-44 chr2 70539027 70539500 + 0.75 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14183 NM_001308158 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 213-72 chr4 117346468 117347043 + 0.75 NA intron (NR_147151, intron 3 of 6) intron (NR_147151, intron 3 of 6) 13884 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 131-47 chr14 30770832 30771159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103540 NM_001347720 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 152-13 chr1 177246587 177246962 + 0.75 NA intron (NM_021165, intron 2 of 7) intron (NM_021165, intron 2 of 7) 75816 NM_021165 57795 Hs.495918 NM_021165 ENSG00000198797 BRINP2 DBCCR1L2|FAM5B BMP/retinoic acid inducible neural specific 2 protein-coding 140-10 chr1 169887444 169887764 + 0.75 NA intron (NM_181093, intron 2 of 13) intron (NM_181093, intron 2 of 13) 6292 NM_020423 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 146.75-96 chr3 5404471 5404873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154417 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 136.5-224 chr8 70336014 70336413 + 0.75 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 67177 NM_001321707 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 199.5-160 chr9 125934940 125935291 + 0.75 NA intron (NR_024122, intron 3 of 7) L2|LINE|L2 186932 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 167.25-79 chr2 68937878 68938316 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 14796 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 151.75-33 chr12 44461110 44461479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 414367 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 172.25-138 chr8 59302923 59303278 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 183890 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 216.25-9 chr10 8920880 8921520 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 23211 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 197.25-33 chr15 68533317 68533815 + 0.75 NA intron (NM_001324014, intron 1 of 12) intron (NM_001324014, intron 1 of 12) 15193 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 232.25-71 chr6 129950194 129950556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67994 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 128.75-58 chr15 36788369 36788735 + 0.75 NA intron (NM_032499, intron 11 of 11) intron (NM_032499, intron 11 of 11) 29954 NR_027320 161635 Hs.659822 NR_027320 CSNK1A1P1 CSNK1A1P casein kinase 1 alpha 1 pseudogene 1 pseudo 126-158 chr6 62609571 62609752 + 0.75 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -323434 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 221.5-22 chr13 110862022 110862440 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 8077 NR_027701 283487 Hs.245390 NM_178514 ENSG00000255874 LINC00346 C13orf29|NCRNA00346 long intergenic non-protein coding RNA 346 ncRNA 232.5-73 chr3 172211094 172211559 + 0.75 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 170795 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 142.25-128 chr4 128951408 128951750 + 0.75 NA intron (NM_144643, intron 14 of 20) intron (NM_144643, intron 14 of 20) 139735 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 167.75-45 chr14 54409977 54410385 + 0.75 NA intron (NM_001330173, intron 4 of 8) intron (NM_001330173, intron 4 of 8) 13174 NM_005192 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 153.5-209 chr8 142237115 142237378 + 0.75 NA intron (NM_001366901, intron 12 of 13) intron (NM_001366901, intron 12 of 13) 38890 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 124.5-178 chr5 133899489 133899740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14063 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 182-9 chr1 200658341 200658668 + 0.75 NA intron (NM_001031725, intron 4 of 7) AluJb|SINE|Alu 8247 NM_001320182 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 134-78 chr18 55823929 55824280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42379 NR_145452 100132501 Hs.634003 NR_145452 LINC01415 TCONS_00026208 long intergenic non-protein coding RNA 1415 ncRNA 225.25-40 chr2 28795242 28795581 + 0.75 NA intron (NM_206876, intron 8 of 8) L1PA16|LINE|L1 -15423 NM_182756 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 248.5-43 chr19 21892170 21892731 + 0.75 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -40382 NM_001256653 7594 Hs.534365 NM_003423 ENSG00000198521 ZNF43 HTF6|KOX27|ZNF39L1 zinc finger protein 43 protein-coding 113.75-162 chr6 43299420 43299591 + 0.75 NA intron (NM_153320, intron 2 of 9) intron (NM_153320, intron 2 of 9) 1245 NM_006672 10864 Hs.485438 NM_006672 ENSG00000137204 SLC22A7 NLT|OAT2|hOAT11 solute carrier family 22 member 7 protein-coding 120.75-112 chr3 116389548 116389751 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) 29625 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 170.25-129 chr5 105252051 105252412 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 152757 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 115.5-197 chr5 8659629 8659804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -180016 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 119.25-81 chr18 555914 556156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24345 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 163-15 chr10 62198595 62199015 + 0.75 NA intron (NM_145307, intron 11 of 11) intron (NM_145307, intron 11 of 11) 70039 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 132.5-2 chr1 11487806 11488142 + 0.75 NA intron (NM_020780, intron 1 of 20) intron (NM_020780, intron 1 of 20) 8819 NM_020780 57540 Hs.202355 NM_020780 ENSG00000204624 DISP3 PTCHD2 dispatched RND transporter family member 3 protein-coding 120.25-207 chr8 27665094 27665367 + 0.75 NA intron (NM_182826, intron 5 of 5) MIR3|SINE|MIR 31170 NM_182826 51435 Hs.128856 NM_016240 ENSG00000168077 SCARA3 APC7|CSR|CSR1|MSLR1|MSRL1 scavenger receptor class A member 3 protein-coding 123-202 chr9 132968624 132968829 + 0.75 NA intron (NM_004188, intron 1 of 10) MIR1_Amn|SINE|MIR -9968 NM_001135031 8328 Hs.553160 NM_004188 ENSG00000165702 GFI1B BDPLT17|ZNF163B growth factor independent 1B transcriptional repressor protein-coding 162.5-58 chr16 55978786 55979279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23001 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 140.5-108 chr2 51246790 51247034 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 214311 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 115-84 chr2 71725880 71726150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 259316 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 134.25-17 chr10 88992581 88992981 + 0.75 NA non-coding (NR_028371, exon 1 of 1) non-coding (NR_028371, exon 1 of 1) 194 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 177.25-79 chr20 22188273 22188652 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 94339 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 181.75-75 chr21 29205480 29206006 + 0.75 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) AluYh3|SINE|Alu 12249 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 195.25-59 chr21 29262788 29263198 + 0.75 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -35929 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 123.25-177 chr6 129617736 129617982 + 0.75 NA intron (NM_033515, intron 6 of 14) intron (NM_033515, intron 6 of 14) 92318 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 133-51 chr14 75303527 75303842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9280 NR_038421 731223 Hs.534624 NR_038421 LINC01220 - long intergenic non-protein coding RNA 1220 ncRNA 178.5-125 chr4 82465745 82466082 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 35323 NM_001292017 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 203.25-81 chr5 45480969 45481555 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 215118 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 128.5-37 chr10 119714129 119714333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11816 NM_001243195 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 285-18 chr17 78078023 78078704 + 0.75 NA intron (NM_018996, intron 10 of 20) intron (NM_018996, intron 10 of 20) 33436 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 200.25-53 chr19 29786851 29787217 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24957 NM_001322262 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 258.75-32 chr18 21616376 21616840 + 0.75 NA intron (NM_001291916, intron 1 of 3) AluSq4|SINE|Alu 4294 NM_001291916 6632 Hs.464734 NM_006938 ENSG00000167088 SNRPD1 HsT2456|SMD1|SNRPD|Sm-D1 small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide protein-coding 211.75-11 chr11 7690474 7691081 + 0.75 NA intron (NM_198185, intron 14 of 14) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 15700 NM_198185 341277 Hs.532475 NM_198185 ENSG00000183378 OVCH2 OVTN ovochymase 2 (gene/pseudogene) protein-coding 161-6 chr1 196276017 196276350 + 0.75 NA intron (NM_001287820, intron 23 of 26) HAL1|LINE|L1 -187468 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 150.75-67 chr15 70714837 70715177 + 0.75 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) -12725 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 157.75-158 chr7 26600110 26600366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37633 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 115.25-113 chr2 185374943 185375164 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207981 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 278.25-47 chr5 66586553 66587196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9519 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 237.5-38 chr16 66804492 66804959 + 0.75 NA intron (NM_001018159, intron 20 of 20) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -3105 NM_001136505 283847 Hs.376505 NM_173616 ENSG00000249961 TERB1 CCDC79 telomere repeat binding bouquet formation protein 1 protein-coding 164-140 chr8 133325456 133325740 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -28294 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 157.75-9 chr10 13027780 13028045 + 0.75 NA intron (NM_001282658, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR -26199 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 184.25-118 chr8 43579292 43579791 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 287099 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 156.25-57 chr18 55361389 55361895 + 0.75 NA intron (NM_001348217, intron 5 of 18) intron (NM_001348217, intron 5 of 18) -39801 NM_001348214 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 162.75-62 chr19 14994323 14994597 + 0.75 NA intron (NR_073589, intron 1 of 8) LTR33|LTR|ERVL -14596 NM_001272087 6511 Hs.515217 NM_005071 ENSG00000105143 SLC1A6 EAAT4 solute carrier family 1 member 6 protein-coding 156.25-126 chr5 167707459 167707822 + 0.75 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -47289 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 114.75-14 chr1 177083216 177083439 + 0.75 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) -53882 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 180.25-109 chr6 136657227 136657693 + 0.75 NA intron (NM_005923, intron 9 of 29) intron (NM_005923, intron 9 of 29) 28346 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 125-103 chr3 96539626 96539907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179802 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 145.25-37 chr14 38990521 38990787 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -73772 NR_039982 283547 Hs.675941 NR_039982 ENSG00000259070 LINC00639 - long intergenic non-protein coding RNA 639 ncRNA 136.5-220 chr8 42450665 42451075 + 0.75 NA intron (NM_006749, intron 5 of 10) intron (NM_006749, intron 5 of 10) 50361 NM_001257180 6575 Hs.653173 NM_006749 ENSG00000168575 SLC20A2 GLVR-2|GLVR2|IBGC1|IBGC3|MLVAR|PIT-2|PIT2|RAM1|Ram-1 solute carrier family 20 member 2 protein-coding 152.75-81 chr2 15782671 15783052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92079 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 129.5-104 chr19 52148414 52148654 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -8596 NM_178523 90317 Hs.645225 NM_178523 ENSG00000204611 ZNF616 - zinc finger protein 616 protein-coding 148.5-210 chr7 37169682 37170007 + 0.75 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 172048 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-68 chr18 36496043 36496307 + 0.75 NA intron (NM_001281740, intron 3 of 28) intron (NM_001281740, intron 3 of 28) 167243 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 131.25-175 chr6 52495945 52496321 + 0.75 NA non-coding (NR_033327, exon 10 of 10) non-coding (NR_033327, exon 10 of 10) 75125 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 145.75-87 chr2 171933670 171933946 + 0.75 NA intron (NR_027862, intron 2 of 9) L1ME2|LINE|L1 11347 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 130.5-65 chr11 102654638 102655009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29491 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 121.25-138 chr3 155713854 155714232 + 0.75 NA intron (NM_001349252, intron 1 of 24) intron (NM_001349252, intron 1 of 24) -9779 NM_014996 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 209.5-85 chr21 28905992 28906392 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20819 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 144.25-56 chr14 58635112 58635436 + 0.75 NA intron (NR_046093, intron 1 of 3) intron (NR_046093, intron 1 of 3) 1206 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 209-56 chr4 111158074 111158461 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -297620 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 210.25-25 chr15 61925081 61925628 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 53 of 81) intron (NM_001018088, intron 53 of 81) 135093 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 112.75-124 chr22 18995153 18995367 + 0.75 NA TTS (NR_002733) TTS (NR_002733) -22574 NR_024159 25787 Hs.106311 NR_024159 DGCR9 DGS-A DiGeorge syndrome critical region gene 9 ncRNA 151-81 chr3 706426 706709 + 0.75 NA intron (NR_110118, intron 1 of 3) intron (NR_110118, intron 1 of 3) 114462 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 129.5-48 chr12 7494345 7494616 + 0.75 NA intron (NR_163255, intron 6 of 16) intron (NR_163255, intron 6 of 16) 9297 NR_163255 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 247.75-56 chr6 94467574 94468153 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 749560 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 272.5-57 chr5 165153882 165154497 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 683910 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 202.75-55 chr2 73733307 73733794 + 0.75 NA intron (NM_001330390, intron 2 of 5) intron (NM_001330390, intron 2 of 5) 3711 NM_001330388 51002 Hs.157401 NM_016058 ENSG00000144034 TPRKB CGI-121|CGI121|GAMOS5 TP53RK binding protein protein-coding 178.5-76 chr2 47014528 47015019 + 0.75 NA intron (NM_001288951, intron 11 of 20) intron (NM_001288951, intron 11 of 20) -72918 NM_001171508 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 120.25-192 chr7 12177495 12177681 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -33706 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 125.5-232 chr7 51997566 51997868 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -604461 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 116-119 chr4 143288528 143288732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48246 NM_002039 2549 Hs.80720 NM_002039 ENSG00000109458 GAB1 DFNB26 GRB2 associated binding protein 1 protein-coding 134-170 chr8 102307923 102308214 + 0.75 NA intron (NM_001282873, intron 20 of 58) L2c|LINE|L2 68617 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 140.5-184 chr5 110448609 110448998 + 0.75 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1M6|LINE|L1 65112 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 237.5-85 chr6 36576679 36577204 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -17372 NR_036610 6428 Hs.405144 NM_003017 ENSG00000112081 SRSF3 SFRS3|SRp20 serine and arginine rich splicing factor 3 protein-coding 212-34 chr19 43968078 43968434 + 0.75 NA TTS (NM_001297588) TTS (NM_001297588) -15914 NM_001260487 7711 Hs.279567 NM_003445 ENSG00000204920 ZNF155 pHZ-96 zinc finger protein 155 protein-coding 124.75-156 chr4 70243521 70243845 + 0.75 NA intron (NM_005212, intron 1 of 4) intron (NM_005212, intron 1 of 4) 1067 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 194-76 chr7 18630311 18630683 + 0.75 NA intron (NM_058176, intron 6 of 22) intron (NM_058176, intron 6 of 22) 121227 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 187.75-51 chr2 113919201 113919555 + 0.75 NA intron (NM_005721, intron 3 of 11) L1MC5a|LINE|L1 -28386 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 129.75-101 chr2 206458187 206458558 + 0.75 NA intron (NM_003812, intron 2 of 25) intron (NM_003812, intron 2 of 25) 14840 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 154.25-68 chr17 74220240 74220600 + 0.75 NA intron (NM_001330453, intron 1 of 13) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 4790 NM_001330453 94015 Hs.27935 NM_032646 ENSG00000141540 TTYH2 C17orf29 tweety family member 2 protein-coding 155.5-201 chr7 112633310 112633725 + 0.75 NA intron (NR_110158, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 11136 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 126-73 chr17 8284734 8285006 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3800 NM_001177802 29098 Hs.408233 NM_016492 ENSG00000108961 RANGRF HSPC165|HSPC236|MOG1|RANGNRF RAN guanine nucleotide release factor protein-coding 189.75-31 chr14 55206798 55207224 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15426 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 243.5-54 chr3 194654713 194655067 + 0.75 NA intron (NM_018385, intron 7 of 13) L3|LINE|CR1 17301 NM_018385 55341 Hs.744061 NM_018385 ENSG00000041802 LSG1 - large 60S subunit nuclear export GTPase 1 protein-coding 120.75-3 chr1 77249645 77249885 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -30335 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 159.75-10 chr1 218477795 218478100 + 0.75 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) L3b|LINE|CR1 -32148 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 114.5-102 chr15 71999394 71999687 + 0.75 NA intron (NM_006901, intron 9 of 41) L2|LINE|L2 -114718 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 141-86 chr2 190641922 190642205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6832 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 138.75-16 chr10 13323687 13323951 + 0.75 NA intron (NM_001195602, intron 6 of 7) AluJo|SINE|Alu -23689 NM_001323082 5264 Hs.498732 NM_006214 ENSG00000107537 PHYH LN1|LNAP1|PAHX|PHYH1|RD phytanoyl-CoA 2-hydroxylase protein-coding 158.75-92 chr2 158024109 158024447 + 0.75 NA intron (NM_001135098, intron 2 of 8) intron (NM_001135098, intron 2 of 8) 29099 NM_001135098 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 173.5-139 chr6 38980293 38980554 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 84 of 91) intron (NM_001371, intron 84 of 91) -27316 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 124.25-31 chr11 61193733 61194087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9605 NM_001079807 643834 Hs.601055 NM_001079807 ENSG00000229859 PGA3 - pepsinogen 3, group I (pepsinogen A) protein-coding 189.25-59 chr2 68366013 68366496 + 0.75 NA intron (NM_002664, intron 1 of 8) intron (NM_002664, intron 1 of 8) 972 NM_002664 5341 Hs.468840 NM_002664 ENSG00000115956 PLEK P47 pleckstrin protein-coding 186-67 chr5 1246235 1246599 + 0.75 NA TTS (NM_182632) TTS (NM_182632) 21036 NM_182632 348932 Hs.213284 NM_182632 ENSG00000164363 SLC6A18 Xtrp2 solute carrier family 6 member 18 protein-coding 143.25-91 chr2 101996587 101996855 + 0.75 NA intron (NM_004633, intron 1 of 8) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2240 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 112.25-192 chr6 143927433 143927677 + 0.75 NA intron (NM_001013623, intron 6 of 7) L1PB4|LINE|L1 33855 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 138.5-110 chr2 147003793 147004162 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 416920 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 113.25-52 chr14 81787209 81787436 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -44184 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 138.75-182 chr7 98175937 98176253 + 0.75 NA intron (NM_014916, intron 7 of 13) L1M5|LINE|L1 -36159 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 215.25-83 chr5 91368189 91368521 + 0.75 NA TTS (NM_001329670) TTS (NM_001329670) 11742 NR_138071 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 195.25-83 chr7 17581944 17582248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23187 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 139.5-86 chr18 6889301 6889571 + 0.75 NA intron (NM_001010000, intron 11 of 16) intron (NM_001010000, intron 11 of 16) 40433 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 132-73 chr17 62835636 62835876 + 0.75 NA non-coding (NR_135634, exon 2 of 2) non-coding (NR_135634, exon 2 of 2) 27254 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 189.75-92 chr5 86356763 86357103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74489 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 213.5-116 chr7 43783119 43783810 + 0.75 NA intron (NM_001253823, intron 3 of 8) L1ME4b|LINE|L1 24784 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 190.5-58 chr16 59412266 59412588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 342764 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 128.25-167 chr5 164364431 164364651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102861 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 142.5-235 chr9 10497847 10498096 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) intron (NM_002839, intron 2 of 45) 115031 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 151.5-6 chr1 80293760 80294244 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -241753 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 113-174 chr8 79339862 79340078 + 0.75 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 7782 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 137.75-144 chr3 187625296 187625557 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 44968 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 144.75-18 chr10 77575287 77575517 + 0.75 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 62406 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 154.25-163 chr7 125961346 125961585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -697174 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 130.75-7 chr1 96977376 96977689 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -118391 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 227.5-42 chr16 87156918 87157521 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -54896 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 128.75-46 chr12 111331157 111331414 + 0.75 NA intron (NM_015267, intron 18 of 21) intron (NM_015267, intron 18 of 21) 27143 NR_106818 102465455 NR_106818 ENSG00000273700 MIR6760 hsa-mir-6760 microRNA 6760 ncRNA 157.25-135 chr6 164629086 164629459 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 192791 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 126.5-26 chr10 37568139 37568376 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 34674 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 210-81 chr6 63667469 63667876 + 0.75 NA intron (NM_001370350, intron 2 of 14) L1MC5a|LINE|L1 21146 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 214.5-118 chr7 51252853 51253411 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu 63677 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 122.25-19 chr10 15994584 15994868 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -134193 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 171.25-141 chr7 43739595 43740005 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -10259 NM_001321199 55744 Hs.268887 NM_018224 ENSG00000106603 COA1 C7orf44|MITRAC15 cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog protein-coding 145.25-32 chr12 119486640 119486946 + 0.75 NA intron (NM_178499, intron 4 of 13) intron (NM_178499, intron 4 of 13) -106981 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 239.25-9 chr10 90372896 90373307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 167704 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 117.5-178 chr5 72267088 72267266 + 0.75 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) MIRc|SINE|MIR 53063 NM_015084 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 185.5-139 chr6 10836328 10836716 + 0.75 NA intron (NR_134935, intron 1 of 14) intron (NR_134935, intron 1 of 14) 2017 NR_134935 4117 Hs.446125 NM_005906 ENSG00000111837 MAK RP62 male germ cell associated kinase protein-coding 149.5 chr1 2825403 2825665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24666 NM_001242672 100287898 Hs.632363 NM_001242672 ENSG00000215912 TTC34 - tetratricopeptide repeat domain 34 protein-coding 130.5-173 chr3 120668839 120669056 + 0.75 NA intron (NM_000187, intron 4 of 13) intron (NM_000187, intron 4 of 13) 13292 NM_000187 3081 Hs.368254 NM_000187 ENSG00000113924 HGD AKU|HGO homogentisate 1,2-dioxygenase protein-coding 179.5-154 chr6 38748235 38748554 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 7 of 91) intron (NM_001371, intron 7 of 91) 33083 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 175-76 chr20 4007339 4007593 + 0.75 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) intron (NM_001134338, intron 1 of 6) 8092 NM_001134337 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 157.75-105 chr3 35864964 35865285 + 0.75 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 120648 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 151-132 chr7 105119854 105120209 + 0.75 NA intron (NM_001350746, intron 14 of 14) intron (NM_001350746, intron 14 of 14) 105826 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 140.75-15 chr10 23067837 23068185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27568 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 148.75-33 chr11 78316310 78316684 + 0.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 25383 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 118.75-172 chr6 129736326 129736670 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -26321 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 133.5-160 chr3 51953806 51954132 + 0.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -1412 NM_080865 118442 Hs.232213 NM_080865 ENSG00000180929 GPR62 GPCR8|KPG_005 G protein-coupled receptor 62 protein-coding 210.75-76 chr5 37002063 37002426 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 14 of 45) LTR33|LTR|ERVL 125475 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 137-143 chr5 137349956 137350250 + 0.75 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 149223 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 201.5-29 chr10 100219299 100219680 + 0.75 NA intron (NM_001278, intron 5 of 20) MIRb|SINE|MIR 10107 NM_001278 1147 Hs.198998 NM_001278 ENSG00000213341 CHUK IKBKA|IKK-alpha|IKK1|IKKA|NFKBIKA|TCF16 component of inhibitor of nuclear factor kappa B kinase complex protein-coding 170.25-124 chr5 12773087 12773514 + 0.75 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 105441 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 287.75-32 chr2 216802947 216803538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56822 NM_003284 7141 Hs.3017 NM_003284 ENSG00000118245 TNP1 TP1 transition protein 1 protein-coding 127-19 chr10 100601667 100602067 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65924 NM_017902 55662 Hs.500788 NM_017902 ENSG00000166135 HIF1AN FIH1 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha inhibitor protein-coding 168.75-128 chr6 140101073 140101374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104029 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 160.75-109 chr4 62478870 62479350 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -317345 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 154.25-141 chr6 92289689 92290174 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -599503 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 137.75-87 chr17 75442056 75442423 + 0.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -14396 NM_001351202 9772 Hs.514474 NM_014738 ENSG00000177728 TMEM94 IDDCDF|KIAA0195 transmembrane protein 94 protein-coding 195.25-71 chr5 11281998 11282515 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 306661 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 163.5-194 chr7 105055948 105056221 + 0.75 NA intron (NM_182931, intron 3 of 26) L2c|LINE|L2 41879 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 117.5-34 chr10 81648333 81648674 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -226691 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 123.75-148 chr5 95288972 95289204 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4513 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 124.5-116 chr2 203042801 203043080 + 0.75 NA intron (NM_001114132, intron 3 of 54) MER21C|LTR|ERVL 28061 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 130.5-242 chr8 79899138 79899395 + 0.75 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -27529 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 161.5-120 chr21 25295759 25296208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 135718 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 244.75-47 chr5 78478442 78479145 + 0.75 NA non-coding (NR_110885, exon 8 of 8) non-coding (NR_110885, exon 8 of 8) 118176 NM_004866 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 246.5-51 chr20 63002883 63003354 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 3846 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 156-63 chr17 57322515 57322897 + 0.75 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 65687 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 118.25-163 chr5 155807702 155807895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -518959 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 155.25-18 chr1 208895596 208895859 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -76727 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 114.5-23 chr1 188075974 188076163 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 632440 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 182.75-120 chr6 140589993 140590302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93667 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 121.75-151 chr5 111277682 111277897 + 0.75 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 53405 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 168.5-134 chr4 98814269 98814612 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 114693 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 168-98 chr5 27197284 27197666 + 0.75 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -158889 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 173.25-86 chr4 42660983 42661406 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -4089 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 121-83 chr17 80362323 80362698 + 0.75 NA intron (NM_001256071, intron 39 of 67) L1ME4a|LINE|L1 -52657 NM_001352761 284131 Hs.389678 NM_173627 ENSG00000173818 ENDOV - endonuclease V protein-coding 161-134 chr9 134337052 134337355 + 0.75 NA intron (NM_002957, intron 1 of 9) intron (NM_002957, intron 1 of 9) 10748 NM_002957 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 175.75-21 chr10 84399221 84399706 + 0.75 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) intron (NM_018999, intron 3 of 10) -25476 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 201-32 chr16 11685457 11685854 + 0.75 NA intron (NR_136673, intron 8 of 9) AluY|SINE|Alu 17200 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 161.25-27 chr11 100618922 100619356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68149 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 192-28 chr11 78298728 78299183 + 0.75 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 42925 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 153.25-64 chr2 24081512 24081736 + 0.75 NA intron (NM_147184, intron 3 of 5) intron (NM_147184, intron 3 of 5) 2707 NM_001206802 9540 Hs.50649 NM_004881 ENSG00000115129 TP53I3 PIG3 tumor protein p53 inducible protein 3 protein-coding 290-45 chr8 53926635 53927157 + 0.75 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 46024 NM_003702 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 193-44 chr2 154045190 154045515 + 0.75 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) intron (NM_052917, intron 3 of 12) 100958 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 154-116 chr6 81785072 81785375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28969 NR_126363 101928770 Hs.586239 NR_126363 ENSG00000224995 LINC01526 Lnc-FAM46A-1 long intergenic non-protein coding RNA 1526 ncRNA 171-28 chr12 41306730 41307011 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 118550 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 197-20 chr15 70237944 70238312 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -140211 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 220.5-49 chr2 99380165 99380653 + 0.75 NA intron (NM_015904, intron 12 of 23) L1MC5|LINE|L1 43020 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 118.5-191 chr7 42237140 42237437 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_000168) promoter-TSS (NM_000168) -79 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 116-139 chr6 64521480 64521722 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) LTR33B|LTR|ERVL 714765 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 140.5-174 chr5 7742608 7742924 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 14 of 24) Helitron1Na_Mam|RC|Helitron 108367 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 112.5-154 chr22 28208253 28208452 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -251517 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 117.75 chr1 10534894 10535128 + 0.75 NA intron (NM_004565, intron 2 of 8) intron (NM_004565, intron 2 of 8) 60061 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 177-88 chr7 7903712 7904043 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 64875 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 160.5-176 chr7 95265910 95266260 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 11 of 15) intron (NM_017650, intron 11 of 15) 58447 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 115.25-179 chr7 6687973 6688173 + 0.75 NA TTS (NM_016265) TTS (NM_016265) 18874 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 180.5-30 chr13 46780361 46780676 + 0.75 NA intron (NM_001984, intron 7 of 9) intron (NM_001984, intron 7 of 9) 16643 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 151-29 chr12 127232525 127232840 + 0.75 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL 51601 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 135.5-217 chr9 132874551 132874812 + 0.75 NA intron (NM_001317959, intron 2 of 14) intron (NM_001317959, intron 2 of 14) -3663 NR_133631 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 122-182 chr8 84279309 84279509 + 0.75 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 94743 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 124.5-198 chr7 2544478 2544853 + 0.75 NA intron (NM_001350627, intron 3 of 12) intron (NM_001350627, intron 3 of 12) 10859 NM_001350626 221927 Hs.520623 NM_152743 ENSG00000106009 BRAT1 BAAT1|C7orf27|NEDCAS|RMFSL BRCA1 associated ATM activator 1 protein-coding 136.75-203 chr9 37394753 37395113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27763 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 134.5-217 chr8 61267527 61267823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20295 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 219.75-79 chr7 71870439 71870826 + 0.75 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) L1ME4a|LINE|L1 466759 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 180-117 chr8 142421009 142421345 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -17995 NM_001366902 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 151.25-94 chr2 184815124 184815485 + 0.75 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 216775 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 180-56 chr2 33867649 33867976 + 0.75 NA intron (NR_126403, intron 2 of 5) intron (NR_126403, intron 2 of 5) -139595 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 186-100 chrX 50733081 50733387 + 0.75 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) L1M4b|LINE|L1 80810 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 200.75-6 chr1 176336835 176337399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126058 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 197-62 chr8 70930715 70931294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 261665 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 248-33 chr2 25373416 25373836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31036 NM_175629 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 118.5-185 chr7 28202857 28203064 + 0.75 NA intron (NR_034097, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 -22165 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 128.25-159 chr5 56340270 56340500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107055 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 215.25-105 chr8 46355809 46356175 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 261651 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 141-48 chr14 71479507 71479857 + 0.75 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) AluJo|SINE|Alu -8179 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 244.5-42 chr18 31819948 31820469 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -59328 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 143.75-11 chr1 244871240 244871467 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6810 NM_031844 3192 Hs.106212 NM_004501 ENSG00000153187 HNRNPU EIEE54|GRIP120|HNRNPU-AS1|HNRPU|SAF-A|SAFA|U21.1|hnRNP U|pp120 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U protein-coding 126.5-202 chr6 16773659 16774046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12362 NM_000332 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 232.25-20 chr14 38120018 38120433 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -87679 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 143.75-193 chr8 137305590 137305836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 107875 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 214.75-27 chr15 53036726 53037200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79402 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 182.5-109 chr3 173258342 173258644 + 0.75 NA Intergenic (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -117258 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 163.5-42 chr12 43234448 43234803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79310 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 173.5-71 chr2 80007583 80007829 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -141123 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 201.25-101 chrX 153976126 153976563 + 0.75 NA intron (NM_003492, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 3590 NM_003492 8269 Hs.23119 NM_003492 ENSG00000177854 TMEM187 CXorf12|DXS9878E|ITBA1 transmembrane protein 187 protein-coding 152.25-50 chr14 54231467 54231796 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -165237 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 245-16 chr14 61335811 61336461 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 14693 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 199.5-80 chr2 102028879 102029241 + 0.75 NA TTS (NM_004633) TTS (NM_004633) 30099 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 119.25-96 chr2 97835971 97836172 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 8 of 40) intron (NM_015348, intron 8 of 40) 101665 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 252.5-36 chr19 30208952 30209446 + 0.75 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -163185 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 113.5-81 chr15 57848843 57849154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 142284 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 135.25-109 chr2 180510172 180510467 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -181785 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 171.25-113 chr4 108148380 108148738 + 0.75 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) L2b|LINE|L2 18238 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 112.75-2 chr1 16255209 16255537 + 0.75 NA intron (NM_018994, intron 6 of 9) AluSx|SINE|Alu -18190 NM_030907 79363 Hs.546430 NM_030907 ENSG00000132881 CPLANE2 C1orf89|RSG1 ciliogenesis and planar polarity effector 2 protein-coding 127.5-151 chr3 102086499 102086864 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -77024 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 191.5-4 chr1 46441523 46441801 + 0.75 NA intron (NR_045483, intron 7 of 8) L1ME1|LINE|L1 7835 NR_045483 729041 Hs.170205 NR_045483 FAAHP1 FAAH-OUT|FAAHOUT|LINC00505 fatty acid amide hydrolase pseudogene 1 pseudo 179.75-48 chr16 26961256 26961557 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -105521 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 208.25-56 chr21 31065246 31065619 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -26956 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 236-36 chr20 3969615 3970277 + 0.75 NA intron (NM_001134337, intron 1 of 5) AluSc|SINE|Alu 45612 NM_001134337 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 128.25-152 chr4 149701907 149702095 + 0.75 NA intron (NM_001363507, intron 5 of 13) intron (NM_001363507, intron 5 of 13) 113842 NM_001363507 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 357.25-3 chr14 52616054 52616670 + 0.75 NA intron (NM_001353361, intron 4 of 7) AluSz6|SINE|Alu 63526 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 151-13 chr1 242736466 242736872 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -211972 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 120-96 chr2 176529768 176529991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71173 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 148.25-43 chr14 71040015 71040389 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 19 of 35) L1MEc|LINE|L1 132743 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 121.75-138 chr4 173878265 173878549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18866 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 129-196 chrX 152069376 152069749 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 48377 NM_021049 4104 Hs.18048 NM_021049 MAGEA5 CT1.5|MAGE5|MAGEA4 MAGE family member A5 protein-coding 119-25 chr11 25852363 25852577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -336653 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 218.75-34 chr2 55017452 55017877 + 0.75 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) -7392 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 128.75-121 chr3 39356775 39357016 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -26475 NM_001354798 54977 Hs.369615 NM_017875 ENSG00000144659 SLC25A38 SIDBA2 solute carrier family 25 member 38 protein-coding 114-150 chr7 17688714 17688981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129938 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 118.25-114 chr20 19934281 19934619 + 0.75 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) intron (NM_001242581, intron 2 of 11) 44884 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 233-13 chr13 48648972 48649322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4782 NM_001308469 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 155.75-167 chr8 138586448 138586701 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -88844 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 227.5-40 chr16 64699050 64699622 + 0.75 NA Intergenic Charlie11|DNA|hAT-Charlie 422727 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 204.25-76 chr4 31294939 31295448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 124049 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 161.25-76 chr17 62647220 62647499 + 0.75 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) AluSx|SINE|Alu 19689 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 161.75-12 chr1 240294384 240294826 + 0.75 NA intron (NM_020066, intron 7 of 17) intron (NM_020066, intron 7 of 17) 202722 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 169.75-91 chr20 22792512 22792860 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107342 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 170-35 chr15 38744655 38744941 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48200 NR_160786 148.5-112 chr2 156292156 156292399 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -37346 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 158.5-124 chr22 35033396 35033642 + 0.75 NA Intergenic (ATGCAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32639 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 153.75-155 chr9 30989146 30989386 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 392224 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 165-20 chr10 115123718 115124013 + 0.75 NA intron (NM_001276282, intron 3 of 7) MER1A|DNA|hAT-Charlie 30500 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 119.5-44 chr11 46780497 46780782 + 0.75 NA intron (NM_001008938, intron 18 of 43) AluSz|SINE|Alu -18140 NR_003056 692108 Hs.693252 NR_003056 ENSG00000212135 SNORD67 HBII-166 small nucleolar RNA, C/D box 67 snoRNA 135.5-4 chr1 44246107 44246360 + 0.75 NA intron (NM_001301700, intron 7 of 7) L2b|LINE|L2 -1950 NR_110056 100874278 Hs.132497 NR_046817 ENSG00000233602 ERI3-IT1 - ERI3 intronic transcript 1 ncRNA 204.25-55 chr2 47826640 47826957 + 0.75 NA intron (NM_025133, intron 11 of 22) AluSx3|SINE|Alu 42843 NM_001281494 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 137.25-61 chr18 9101434 9101782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1091 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 175-63 chr2 38668696 38669059 + 0.75 NA intron (NM_138801, intron 1 of 6) intron (NM_138801, intron 1 of 6) 2763 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 150.75-119 chr22 42602932 42603155 + 0.75 NA exon (NM_032311, exon 2 of 9) exon (NM_032311, exon 2 of 9) 11840 NM_032311 84271 Hs.505802 NM_032311 ENSG00000100227 POLDIP3 PDIP3|PDIP46|SKAR DNA polymerase delta interacting protein 3 protein-coding 213.25-14 chr14 26767845 26768355 + 0.75 NA intron (NR_147061, intron 3 of 6) intron (NR_147061, intron 3 of 6) -41248 NR_110556 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 152.5-124 chr3 163163938 163164217 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 139224 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 219.75-2 chr1 40268203 40268651 + 0.75 NA exon (NM_005857, exon 4 of 10) exon (NM_005857, exon 4 of 10) 10191 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 201.25-39 chr17 55037808 55038193 + 0.75 NA intron (NM_178509, intron 10 of 17) intron (NM_178509, intron 10 of 17) -69215 NM_001162861 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 126.5-112 chr2 80359635 80359914 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) L1M5|LINE|L1 46395 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 204.25-104 chr7 7493070 7493668 + 0.75 NA intron (NM_001037763, intron 11 of 34) intron (NM_001037763, intron 11 of 34) 42504 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 193.75-120 chr8 91023922 91024324 + 0.75 NA intron (NM_018710, intron 1 of 6) 7SK|RNA|RNA 16736 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 134-40 chr12 69164093 69164424 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75311 NM_001300947 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 130.25-32 chr10 95936731 95937049 + 0.75 NA intron (NM_001349008, intron 6 of 34) intron (NM_001349008, intron 6 of 34) 28925 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 152.5-60 chr16 17029697 17030005 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -104653 NR_135179 102723692 Hs.737758 NR_135179 ENSG00000261448 LOC102723692 - uncharacterized LOC102723692 ncRNA 138.25-5 chr1 39557086 39557369 + 0.75 NA intron (NR_003929, intron 1 of 8) intron (NR_003929, intron 1 of 8) 2471 NR_003929 728448 Hs.472508 NR_003929 ENSG00000243970 PPIEL PPIEP1 peptidylprolyl isomerase E like pseudogene pseudo 275.5-24 chr15 95820291 95821009 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 307191 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 191.25-63 chr2 227797632 227797992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16030 NM_004591 6364 Hs.75498 NM_004591 ENSG00000115009 CCL20 CKb4|Exodus|LARC|MIP-3-alpha|MIP-3a|MIP3A|SCYA20|ST38 C-C motif chemokine ligand 20 protein-coding 151-82 chr3 17340914 17341266 + 0.75 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 358930 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 125.25-216 chr8 142277817 142278099 + 0.75 NA intron (NM_001366901, intron 11 of 13) intron (NM_001366901, intron 11 of 13) 79602 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 179.5-201 chrX 112742575 112742896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38053 NR_036255 100423009 NR_036255 ENSG00000283775 MIR4329 - microRNA 4329 ncRNA 206.75-97 chr8 126351001 126351349 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 25680 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 140.25-77 chr18 6804039 6804378 + 0.75 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) L1MEc|LINE|L1 -30277 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 170.5-8 chr1 74247821 74248178 + 0.75 NA intron (NM_015978, intron 2 of 24) LTR12C|LTR|ERV1 12612 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 192.75-69 chr20 1893245 1893580 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001040022) promoter-TSS (NM_001040022) -755 NM_001330728 140885 Hs.581021 NM_080792 ENSG00000198053 SIRPA BIT|CD172A|MFR|MYD-1|P84|PTPNS1|SHPS1|SIRP signal regulatory protein alpha protein-coding 181.25-109 chr6 47615366 47615681 + 0.75 NA intron (NM_012120, intron 17 of 17) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -40949 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 120.75-95 chr20 47546774 47547080 + 0.75 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 45040 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 113-92 chr2 116153660 116153991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 810010 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 157.25-142 chr7 108123851 108124123 + 0.75 NA intron (NM_007356, intron 1 of 33) intron (NM_007356, intron 1 of 33) 6374 NM_001318046 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 145.75-21 chr11 21417889 21418211 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) MIRb|SINE|MIR 748464 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 140.5-68 chr14 73964269 73964657 + 0.75 NA TTS (NM_182476) TTS (NM_182476) 14161 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 159.5-29 chr11 10755895 10756212 + 0.75 NA intron (NM_014633, intron 4 of 24) AluJb|SINE|Alu 4807 NM_014633 9646 Hs.725151 NM_014633 ENSG00000198730 CTR9 SH2BP1|TSBP|p150|p150TSP CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 148 chr1 34517076 34517364 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 152474 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 128.25-154 chr5 5059871 5060115 + 0.75 NA intron (NR_026994, intron 4 of 6) intron (NR_026994, intron 4 of 6) 18318 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 180.75-39 chr14 67117235 67117620 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 15 of 21) intron (NM_001024218, intron 15 of 21) -72013 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 119.5-235 chr8 86707343 86707589 + 0.75 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) L2a|LINE|L2 36209 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 119-175 chr7 7664578 7664861 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) intron (NM_002947, intron 4 of 7) 23967 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 127.5-217 chr6 166719651 166719843 + 0.75 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -92496 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 141.5-163 chr4 98588632 98588846 + 0.75 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) intron (NM_005723, intron 1 of 7) 69872 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 116.75-169 chr6 46618262 46618489 + 0.75 NA intron (NM_016593, intron 7 of 11) intron (NM_016593, intron 7 of 11) 34443 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 247-60 chr8 98580571 98581048 + 0.75 NA intron (NM_006281, intron 7 of 10) intron (NM_006281, intron 7 of 10) 153851 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 194.75-96 chr8 120053279 120053563 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -71681 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 124.75-130 chr20 37793993 37794259 + 0.75 NA intron (NM_001281495, intron 11 of 16) L1ME1|LINE|L1 100096 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 126.25-205 chr8 91808015 91808279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 209533 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 139.25-165 chr6 139719840 139720186 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -51060 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 175.75-35 chr14 37878275 37878665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23654 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 195.25-44 chr17 68296729 68297256 + 0.75 NA intron (NM_001352902, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 4857 NM_001352901 22901 Hs.437249 NM_014960 ENSG00000141337 ARSG USH4 arylsulfatase G protein-coding 124-93 chr2 189767414 189767627 + 0.75 NA intron (NM_001371387, intron 3 of 3) intron (NM_001371387, intron 3 of 3) -4322 NM_001354347 64172 Hs.60772 NM_022353 ENSG00000128694 OSGEPL1 OSGEPL|Qri7 O-sialoglycoprotein endopeptidase like 1 protein-coding 230-17 chr13 107740242 107740653 + 0.75 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 95011 NR_046848 100874375 Hs.653972 NR_046848 FAM155A-IT1 - FAM155A intronic transcript 1 ncRNA 195.75-48 chr16 7456497 7456790 + 0.75 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 123798 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 132.5-14 chr1 75617441 75617639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1377 NM_001320283 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 114.25-92 chr2 50940596 50940897 + 0.75 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 91386 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 119-122 chr3 115438319 115438544 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -185079 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 173.75-11 chr1 118106919 118107199 + 0.75 NA intron (NM_206996, intron 4 of 48) MIRb|SINE|MIR 78169 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 233-7 chr10 18133597 18134142 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -6555 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 161.75-43 chr15 66354281 66354609 + 0.75 NA intron (NM_001289986, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 2240 NM_017858 54962 Hs.744308 NM_017858 ENSG00000075131 TIPIN - TIMELESS interacting protein protein-coding 163.5-110 chr20 9856427 9856767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17521 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 199.5-156 chr9 26916224 26916613 + 0.75 NA intron (NM_001321546, intron 9 of 12) intron (NM_001321546, intron 9 of 12) -23590 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 167.5-156 chr6 45780173 45780475 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 157273 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 159.5-219 chr9 38723740 38724237 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 102900 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 177.25-73 chr2 172082234 172082518 + 0.75 NA TTS (NR_136276) TTS (NR_136276) -3131 NM_001038493 1745 Hs.407015 NM_178120 ENSG00000144355 DLX1 - distal-less homeobox 1 protein-coding 354.5-18 chr7 4912623 4913473 + 0.75 NA intron (NM_198403, intron 4 of 6) intron (NM_198403, intron 4 of 6) -29332 NM_018059 55698 Hs.667336 NM_018059 ENSG00000157927 RADIL RASIP2 Rap associating with DIL domain protein-coding 262-8 chr11 3748139 3748625 + 0.75 NA intron (NR_157590, intron 11 of 31) AluSx4|SINE|Alu 49164 NR_157591 4928 Hs.524750 NM_005387 ENSG00000110713 NUP98 ADIR2|NUP196|NUP96 nucleoporin 98 protein-coding 174-102 chr8 110333582 110333836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -357938 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 224.75-36 chr16 86901501 86901881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -156093 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 182.5-161 chr8 75541560 75541956 + 0.75 NA intron (NM_004133, intron 1 of 9) intron (NM_004133, intron 1 of 9) 1790 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 165.25-24 chr11 60947920 60948264 + 0.75 NA intron (NM_016582, intron 1 of 7) intron (NM_016582, intron 1 of 7) 4084 NR_027391 51296 Hs.237856 NM_016582 ENSG00000110446 SLC15A3 OCTP|PHT2|PTR3 solute carrier family 15 member 3 protein-coding 162.75-81 chr20 7582101 7582427 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 210656 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 186.75-113 chr8 125680949 125681265 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 248898 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 176.25-17 chr10 48778329 48778711 + 0.75 NA intron (NM_020945, intron 17 of 61) intron (NM_020945, intron 17 of 61) 93057 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 281.5-16 chr14 62426412 62426937 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -286701 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 181.75-82 chr3 101309863 101310215 + 0.75 NA intron (NM_016247, intron 2 of 18) L1ME2z|LINE|L1 10536 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 146.5-48 chr12 4075454 4075707 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -198182 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 171.25-109 chr4 87461804 87462198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39404 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 159.25-5 chr1 114634928 114635285 + 0.75 NA intron (NM_198459, intron 1 of 17) intron (NM_198459, intron 1 of 17) 34943 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 214.75-57 chr3 192069990 192070383 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -168444 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-73 chr17 2195951 2196160 + 0.75 NA intron (NM_001256827, intron 3 of 11) L1MD2|LINE|L1 -36623 NR_110888 101927839 Hs.665648 NR_110888 ENSG00000225084 LOC101927839 - uncharacterized LOC101927839 ncRNA 130-177 chr9 71933873 71934055 + 0.75 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) LTR39|LTR|ERV1 22325 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 146.5-202 chr7 30156357 30156583 + 0.75 NA intron (NM_152793, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 21484 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 117.25-136 chr3 12565066 12565376 + 0.75 NA intron (NM_001271707, intron 1 of 6) L1MC5a|LINE|L1 8134 NM_014160 23609 Hs.591666 NM_014160 ENSG00000075975 MKRN2 HSPC070|RNF62 makorin ring finger protein 2 protein-coding 133.75-58 chr14 55033361 55033705 + 0.75 NA intron (NM_199421, intron 2 of 2) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 6297 NM_199421 122809 Hs.744302 NM_080867 ENSG00000180008 SOCS4 SOCS7 suppressor of cytokine signaling 4 protein-coding 132.5-219 chr7 3812003 3812220 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -317574 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 232.5-37 chr17 64047249 64047844 + 0.75 NA intron (NM_001433, intron 19 of 21) L1MC5|LINE|L1 -26912 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 142.25-39 chr12 28690227 28690555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -458887 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 130-103 chr3 67740569 67740772 + 0.75 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) L1MA5|LINE|L1 85973 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 224.5-116 chr9 32895184 32895674 + 0.75 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 106147 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 121.25-126 chr3 2852632 2852903 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 7 of 24) intron (NM_175607, intron 7 of 24) -39448 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 123.25-210 chr8 133341282 133341536 + 0.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -44105 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 272.5-63 chr7 8406633 8407145 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -26720 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 242.25-80 chr7 20276970 20277519 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19464 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 112.25-228 chrX 85845702 85845955 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 10048 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 180.5-26 chr12 43876386 43876671 + 0.75 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) intron (NM_001286213, intron 2 of 6) 40447 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 192-5 chr1 81059451 81059812 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -246561 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 131.5-115 chr2 84660701 84660908 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 37 of 76) L1MC4a|LINE|L1 144349 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 158-34 chr11 77825243 77825630 + 0.75 NA intron (NR_133637, intron 1 of 4) intron (NR_133637, intron 1 of 4) 4322 NR_133637 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 197.5-126 chr5 108207192 108207504 + 0.75 NA intron (NM_001163315, intron 5 of 8) L1PA7|LINE|L1 174750 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 215.25-96 chr6 152170965 152171326 + 0.75 NA intron (NM_182961, intron 130 of 145) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -2858 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 186.5-80 chr20 51650259 51650562 + 0.75 NA intron (NM_006045, intron 14 of 27) AluSx4|SINE|Alu -87571 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 239.75-74 chr8 84633292 84633739 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -72412 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 207.75-23 chr12 321674 322208 + 0.75 NA intron (NM_001042603, intron 17 of 27) L2a|LINE|L2 -59068 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 200.25-45 chr17 12178333 12178803 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 96669 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 137-186 chr8 141143822 141144065 + 0.75 NA TTS (NM_001352891) TTS (NM_001352891) 15354 NM_001352890 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 124.25-46 chr12 117992016 117992260 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -23148 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 207-58 chr3 41105636 41106041 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -93667 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 240.5-72 chr4 51871294 51871754 + 0.75 NA intron (NM_001040402, intron 3 of 10) intron (NM_001040402, intron 3 of 10) 27945 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 126.75-105 chr2 47132609 47132797 + 0.75 NA intron (NM_001163561, intron 3 of 6) intron (NM_001163561, intron 3 of 6) 22605 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 134.25-28 chr11 82536310 82536526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132505 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 130.25-145 chr4 33336049 33336255 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 703741 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 245.25-38 chr2 66010793 66011181 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 347341 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 184.25-116 chr8 21354889 21355166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56788 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 139.25-16 chr10 63887137 63887464 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -365410 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 119.75-141 chr3 88846943 88847211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260544 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 130-4 chr1 90314352 90314563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 319347 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 260.75-60 chr7 41485993 41486699 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -207573 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 160.25-125 chr5 52641546 52641875 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -146206 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 171.5-168 chr9 86325996 86326355 + 0.75 NA intron (NM_001185059, intron 11 of 26) MIRb|SINE|MIR 28235 NM_001330718 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 215-28 chr15 94578269 94578851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 222630 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 134.75-86 chr17 20132402 20132726 + 0.75 NA intron (NM_001033553, intron 3 of 14) L1MD|LINE|L1 -23508 NM_001033554 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 268.75-34 chr5 5058401 5058897 + 0.75 NA intron (NR_026994, intron 3 of 6) intron (NR_026994, intron 3 of 6) 19662 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 209.25-73 chr22 28630100 28630723 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 49454 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 140.75-47 chr13 98653655 98653957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76551 NR_046542 100874069 Hs.594160 NR_046542 STK24-AS1 - STK24 antisense RNA 1 ncRNA 169.5-12 chr1 219272193 219272497 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 97376 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 200.25-41 chr15 83305414 83305804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20945 NM_001717 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 137.25-145 chr6 143758682 143758926 + 0.75 NA intron (NM_001100165, intron 4 of 11) intron (NM_001100165, intron 4 of 11) 80839 NM_001100164 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 196.5-136 chr5 152228671 152228975 + 0.75 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 176456 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 126.75-174 chr4 69513546 69513892 + 0.75 NA intron (NM_001297616, intron 1 of 6) L1P3|LINE|L1 12295 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 179.75-135 chr8 123635303 123635592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18354 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 269.75-49 chr6 70628959 70629413 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -38697 NM_021940 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 124.25-122 chr22 21096705 21096967 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -6180 NR_037566 400892 Hs.745077 NM_207474 BCRP2 BCR-2|BCR2|BCRL2 BCR pseudogene 2 pseudo 172.25-25 chr11 58571099 58571441 + 0.75 NA intron (NM_001143995, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 4647 NM_004811 9404 Hs.125474 NM_004811 ENSG00000110031 LPXN LDPL leupaxin protein-coding 116-108 chr3 123879410 123879601 + 0.75 NA intron (NM_001321309, intron 1 of 32) intron (NM_001321309, intron 1 of 32) 4827 NM_053026 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 234.5-68 chr3 193837310 193837680 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 6514 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 125.5-117 chr18 28208168 28208335 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -31121 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 180-105 chr6 143390568 143390955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51916 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 264.75-45 chr6 68683600 68684081 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) MER102a|DNA|hAT-Charlie 48558 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 125.5-267 chr8 140273169 140273534 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 15 of 22) intron (NM_001160372, intron 15 of 22) -172816 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 136.25-185 chr8 69242125 69242452 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -138098 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 186.25-12 chr10 33985424 33985980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213022 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 203-17 chr10 95484252 95484598 + 0.75 NA intron (NM_001290295, intron 2 of 24) MER102a|DNA|hAT-Charlie -43245 NM_006434 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 137-2 chr1 61163384 61163679 + 0.75 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 80970 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 116.75-215 chrX 25319399 25319644 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -303556 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 156.75-51 chr13 94632475 94632837 + 0.75 NA 3' UTR (NM_180989, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_180989, exon 9 of 9) 30799 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 135.5-170 chr6 38819388 38819779 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 25 of 91) L1M5|LINE|L1 104272 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 138-160 chr8 78425848 78426123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90355 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 133.5-87 chr14 97522127 97522376 + 0.75 NA intron (NR_110166, intron 2 of 4) intron (NR_110166, intron 2 of 4) 63435 NR_110165 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 123.75-72 chr16 18854445 18854757 + 0.75 NA intron (NM_015092, intron 30 of 62) intron (NM_015092, intron 30 of 62) -53052 NM_015161 23204 Hs.634882 NM_015161 ENSG00000170540 ARL6IP1 AIP1|ARL6IP|ARMER|SPG61 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 1 protein-coding 185.75-127 chr8 123684034 123684498 + 0.75 NA intron (NM_001003954, intron 11 of 11) intron (NM_001003954, intron 11 of 11) -30465 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 195.25-9 chr1 167919926 167920373 + 0.75 NA intron (NM_001143674, intron 4 of 5) intron (NM_001143674, intron 4 of 5) -6015 NM_001297772 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 116-80 chr2 16862321 16862596 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -196624 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 118.75-85 chr18 65192989 65193239 + 0.75 NA Intergenic MER124|DNA?|DNA? -557138 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 159.5-221 chr9 112616852 112617217 + 0.75 NA intron (NM_133465, intron 2 of 3) intron (NM_133465, intron 2 of 3) 101083 NR_138056 58493 Hs.658575 NM_021218 ENSG00000148153 INIP C9orf80|HSPC043|MISE|SOSSC|SSBIP1|hSSBIP1 INTS3 and NABP interacting protein protein-coding 131.25-79 chr17 58365043 58365253 + 0.75 NA intron (NM_001305544, intron 3 of 9) intron (NM_001305544, intron 3 of 9) -12947 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 220.25-50 chr3 111354400 111354812 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -187591 NM_001318889 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 176-31 chr18 41441439 41441878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79019 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 151.5-46 chr14 36255951 36256261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64531 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 183-91 chr5 122273740 122274032 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37805 NR_131762 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 121.25-111 chr20 20676625 20676994 + 0.75 NA intron (NM_020343, intron 2 of 39) MIRb|SINE|MIR 35835 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 137-84 chr2 146613161 146613491 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 26269 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 256-25 chr2 21477310 21477685 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 233155 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 262-38 chr3 106330942 106331421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -461780 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 233.5-30 chr12 32933136 32933835 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -36639 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 251-13 chr10 51956106 51956567 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -256741 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 164.75-52 chr15 60820231 60820525 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 138809 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 141-136 chr6 51300514 51300979 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -321124 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 165.5-131 chr4 95530085 95530323 + 0.75 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 18769 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 133.75-135 chr3 99466007 99466212 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -172485 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 227.25-54 chr3 87390215 87390704 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -113875 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 128-47 chr15 53344114 53344420 + 0.75 NA Intergenic LTR38|LTR|ERV1 196585 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 112.75-100 chr2 110718408 110718575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14082 NM_001365487 55289 Hs.253320 NM_018308 ENSG00000153093 ACOXL - acyl-CoA oxidase like protein-coding 233-17 chr14 52790890 52791455 + 0.75 NA intron (NM_198066, intron 1 of 5) CpG 435 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 123.5-220 chr9 88519813 88520116 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -15137 NM_001161625 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 200.25-24 chr12 13791330 13791691 + 0.75 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 188846 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 204.75-8 chr1 160830987 160831475 + 0.75 NA 3' UTR (NM_016382, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_016382, exon 9 of 9) 31656 NM_001166663 51744 Hs.157872 NM_016382 ENSG00000122223 CD244 2B4|NAIL|NKR2B4|Nmrk|SLAMF4 CD244 molecule protein-coding 191.25-22 chr11 122878297 122878733 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -4013 NM_001363088 79864 Hs.164705 NM_024806 ENSG00000109944 JHY C11orf63 junctional cadherin complex regulator protein-coding 133.5-228 chr6 40301179 40301526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54654 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 112.75-88 chr2 19328908 19329157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19397 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 137.75-207 chr8 113089843 113090093 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 287184 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 259.5-25 chr12 25507832 25508304 + 0.75 NA intron (NM_152590, intron 7 of 8) intron (NM_152590, intron 7 of 8) 45215 NM_001256266 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 161.75-69 chr2 173222087 173222339 + 0.75 NA 3' UTR (NM_133646, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_133646, exon 12 of 12) 59823 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-15 chr10 35962543 35962824 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 184381 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 194.75-57 chr2 100352538 100352899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29985 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 213-73 chr4 131654136 131654741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -110400 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 114.5-214 chr5 83848030 83848329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -127324 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 140.25-43 chr13 75270482 75270885 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 30095 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 128.25-87 chr2 18201558 18201814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 323019 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 188.25-50 chr16 57846422 57846975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36061 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 190-59 chr5 25813087 25813393 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 622287 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 164-33 chr14 40975831 40976149 + 0.75 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 21279 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 152.75-45 chr12 117400107 117400444 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -38473 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 183.25-6 chr1 187454478 187454828 + 0.75 NA intron (NR_132374, intron 1 of 2) intron (NR_132374, intron 1 of 2) 11025 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 135.5-175 chr6 119132557 119132893 + 0.75 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) MER117|DNA|hAT-Charlie 16468 NM_001288576 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 183.25-115 chr8 131954733 131955188 + 0.75 NA intron (NR_136616, intron 6 of 23) intron (NR_136616, intron 6 of 23) 38187 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 217.25-15 chr10 72078801 72079163 + 0.75 NA intron (NM_014767, intron 2 of 11) MIR|SINE|MIR 9569 NM_001244950 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 236.75-44 chr5 66077360 66077751 + 0.75 NA intron (NM_001253697, intron 25 of 25) MIR|SINE|MIR -66745 NM_001323529 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 212.75-2 chr1 43448042 43448615 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106793) promoter-TSS (NR_106793) -211 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 165.25-89 chr3 100454102 100454487 + 0.75 NA intron (NM_001085451, intron 3 of 3) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -38325 NM_018004 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 227.5-38 chr15 68050987 68051387 + 0.75 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -2992 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 121.25-58 chr14 67167713 67167968 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 19 of 21) MIR3|SINE|MIR -21600 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 152-101 chr22 49876003 49876461 + 0.75 NA intron (NM_014838, intron 1 of 1) L1MEc|LINE|L1 22388 NM_014838 9889 Hs.475208 NM_014838 ENSG00000100426 ZBED4 - zinc finger BED-type containing 4 protein-coding 248.5-8 chr10 65379757 65380448 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -191323 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 135-4 chr1 73493306 73493531 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -181261 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 141.25-108 chr3 69196380 69196588 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 13 of 22) intron (NM_015123, intron 13 of 22) -73889 NM_001304418 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 167.25-128 chr5 104827589 104827886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271737 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 124-59 chr16 84996065 84996374 + 0.75 NA intron (NM_001145548, intron 1 of 8) intron (NM_001145548, intron 1 of 8) 15316 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 131-30 chr11 70361470 70361754 + 0.75 NA intron (NR_045286, intron 20 of 28) intron (NR_045286, intron 20 of 28) -36894 NM_138565 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 158.75-65 chr16 19293391 19293764 + 0.75 NA intron (NM_001256720, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 7846 NM_001256720 728276 Hs.632180 NM_001256720 ENSG00000261210 CLEC19A - C-type lectin domain containing 19A protein-coding 167-26 chr11 24914514 24914984 + 0.75 NA intron (NM_001009909, intron 7 of 11) intron (NM_001009909, intron 7 of 11) 417696 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 170.75-140 chr8 116660429 116660880 + 0.75 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 8554 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 198.5-47 chr14 72289763 72290112 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -226883 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 203.25-66 chr3 19642613 19642949 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 291436 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 190.75-43 chr17 58220004 58220413 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001330397) promoter-TSS (NM_001330397) -603 NM_001165927 54903 Hs.408843 NM_017777 ENSG00000011143 MKS1 BBS13|JBTS28|MES|MKS|POC12 MKS transition zone complex subunit 1 protein-coding 130-64 chr19 30816701 30816973 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -350673 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 282.75-17 chr18 14059367 14060142 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 72681 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 146.25-110 chr4 67132213 67132632 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 289578 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 123-195 chr9 15428864 15429233 + 0.75 NA intron (NR_161434, intron 2 of 8) L1MC4a|LINE|L1 6172 NR_161439 6619 Hs.546299 NM_003084 ENSG00000164975 SNAPC3 PTFbeta|SNAP50 small nuclear RNA activating complex polypeptide 3 protein-coding 168-136 chr9 117926203 117926507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 221952 NM_138554 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 126.75-71 chr15 51889244 51889633 + 0.75 NA intron (NM_014547, intron 5 of 9) intron (NM_014547, intron 5 of 9) 34682 NR_109775 100422556 Hs.664788 NR_109775 LOC100422556 - LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component pseudogene pseudo 177-54 chr20 48882812 48883227 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -38692 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 256-69 chr8 55226303 55226801 + 0.75 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 124524 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 118.75-113 chr20 12797781 12798079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139033 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 169.25-55 chr2 138196488 138196822 + 0.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 94771 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 133-100 chr20 57989753 57990042 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -14007 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 235-79 chr9 69736116 69736571 + 0.75 NA intron (NM_001366935, intron 1 of 4) AluSc|SINE|Alu 23668 NM_001099666 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 134.5-34 chr10 109482958 109483185 + 0.75 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 440175 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 135-56 chr17 27558744 27559071 + 0.75 NA intron (NM_014238, intron 3 of 20) intron (NM_014238, intron 3 of 20) -72281 NR_024043 3965 Hs.81337 NM_002308 ENSG00000168961 LGALS9 HUAT|LGALS9A galectin 9 protein-coding 127-158 chr7 27663008 27663255 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_152740) promoter-TSS (NM_152740) -248 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 157.75-37 chr12 112128025 112128341 + 0.75 NA intron (NM_001143906, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 2623 NM_006700 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 119.5-140 chr22 26876112 26876326 + 0.75 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1ME1|LINE|L1 16008 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 116.5-231 chr7 82397636 82397955 + 0.75 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) MIR|SINE|MIR 45982 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 135.75-65 chr15 60659310 60659548 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -22140 NR_120319 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 122.75-123 chr22 36652217 36652538 + 0.75 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) intron (NM_006078, intron 1 of 3) 50481 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 127-147 chr6 42543752 42543962 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -20165 NM_001363705 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 133.75-188 chr8 82873593 82873796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38410 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 176.25-51 chr17 43131573 43131948 + 0.75 NA intron (NR_003108, intron 2 of 4) intron (NR_003108, intron 2 of 4) 6203 NR_138145 10230 Hs.373818 NM_005821 ENSG00000198496 NBR2 NCRNA00192 neighbor of BRCA1 lncRNA 2 ncRNA 125-152 chr7 100078984 100079171 + 0.75 NA intron (NM_001371212, intron 1 of 4) intron (NM_001371212, intron 1 of 4) 2646 NM_001278292 7551 Hs.435302 NM_017715 ENSG00000166526 ZNF3 A8-51|HF.12|KOX25|PP838|Zfp113 zinc finger protein 3 protein-coding 208.75-89 chr9 37965028 37965521 + 0.75 NA intron (NM_003028, intron 3 of 5) intron (NM_003028, intron 3 of 5) -60921 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 129.5-101 chr19 7561601 7561960 + 0.75 NA TTS (NM_001166112) TTS (NM_001166112) 26063 NM_001166114 10908 Hs.631863 NM_006702 ENSG00000032444 PNPLA6 BNHS|LNMS|NTE|NTEMND|OMCS|SPG39|iPLA2delta|sws patatin like phospholipase domain containing 6 protein-coding 129-14 chr1 218639954 218640140 + 0.75 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 129952 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 179.5-76 chr18 2196033 2196272 + 0.75 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL 375353 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 181.25-3 chr1 60198186 60198567 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -124606 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 189.25-31 chr14 24773877 24774220 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -139858 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 169.75-134 chr6 122621234 122621572 + 0.75 NA intron (NM_181795, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 10998 NM_181795 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 148.5-224 chr8 91917451 91917716 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100097 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 147.25-17 chr10 91748949 91749163 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49140 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 266-50 chr8 142434511 142434900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14944 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 169.5-162 chr7 52028459 52028723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -635335 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 120-134 chr4 66058634 66058898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -218058 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 135-177 chr8 16645882 16646226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 356291 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 122.25-92 chr2 107210316 107210527 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) LTR49-int|LTR|ERV1 139104 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 158-113 chr5 149610967 149611267 + 0.75 NA intron (NM_001001669, intron 4 of 12) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 29619 NM_001001669 389337 Hs.256206 NM_001001669 ENSG00000183111 ARHGEF37 - Rho guanine nucleotide exchange factor 37 protein-coding 203.75-95 chr6 135457583 135458118 + 0.75 NA intron (NM_017651, intron 7 of 27) intron (NM_017651, intron 7 of 27) 39890 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 172.25-51 chr17 59810296 59810561 + 0.75 NA intron (NM_001329400, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu -30838 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 148-26 chr14 56184369 56184688 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 66117 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 120.75-178 chr9 70805556 70805817 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 6 of 25) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 4398 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 136.25-81 chr17 69727893 69728209 + 0.75 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MB2|LINE|L1 134064 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 203.25-48 chr18 77691354 77691933 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 302084 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 196.75-91 chr6 39435374 39435721 + 0.75 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) L1PB3|LINE|L1 -4157 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 146-39 chr14 38044185 38044667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142302 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 130.75-6 chr1 86082409 86082729 + 0.75 NA intron (NM_152890, intron 7 of 59) L2c|LINE|L2 73902 NM_001349955 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 144.5-225 chr8 122426605 122426875 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L1PA14|LINE|L1 141904 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 248-69 chr7 40658097 40658594 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 321594 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 192.5-85 chr21 27355060 27355435 + 0.75 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -367132 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 265.5-43 chr3 15608344 15608814 + 0.75 NA intron (NM_001281725, intron 1 of 3) AluSc5|SINE|Alu 6610 NM_001281725 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 130.25-120 chr21 36020264 36020497 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 15060 NR_110419 100996609 Hs.742062 NR_110419 LINC01436 - long intergenic non-protein coding RNA 1436 ncRNA 184-94 chr8 116812691 116812983 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46313 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 159.25-52 chr17 61404764 61404993 + 0.75 NA intron (NM_005994, intron 5 of 6) CpG-11509 5035 NM_005994 6909 Hs.531085 NM_005994 ENSG00000121068 TBX2 VETD T-box transcription factor 2 protein-coding 218-22 chr16 4005012 4005411 + 0.75 NA intron (NM_001116, intron 3 of 10) MER103C|DNA|hAT-Charlie -54767 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 145.5-18 chr10 13873365 13873635 + 0.75 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) L3|LINE|CR1 98396 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 119-214 chrX 84582996 84583335 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -80712 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 130.5-7 chr1 48300368 48300663 + 0.75 NA intron (NM_019073, intron 12 of 12) L1M2|LINE|L1 77799 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 181.75-90 chr3 178030306 178030736 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 213656 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 198.5-94 chr3 37293700 37294183 + 0.75 NA intron (NM_001172713, intron 6 of 22) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -49746 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 118.5-47 chr13 39789020 39789247 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001145079, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001145079, exon 19 of 19) -124998 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 133.25-94 chr2 37144839 37145081 + 0.75 NA intron (NM_002759, intron 4 of 16) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 2862 NM_001135652 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 240-40 chr4 12318260 12318846 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 95102 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 152.25-166 chr9 34287006 34287341 + 0.75 NA intron (NM_194313, intron 5 of 12) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 42095 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 177.5-10 chr1 196268963 196269338 + 0.75 NA intron (NR_146058, intron 26 of 29) intron (NR_146058, intron 26 of 29) -180435 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 115-117 chr4 30491136 30491331 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -229136 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 141.5-107 chr2 128583699 128583951 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -264957 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 269.5-52 chr7 30147367 30148069 + 0.75 NA intron (NM_152793, intron 2 of 2) L1MEg|LINE|L1 12732 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 136.25-119 chr3 41733346 41733653 + 0.75 NA intron (NR_136342, intron 21 of 34) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 228604 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 144.5-38 chr11 12741858 12742211 + 0.75 NA intron (NM_021961, intron 2 of 12) intron (NM_021961, intron 2 of 12) 67613 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 157.25-28 chr11 94169608 94170014 + 0.75 NA intron (NM_015368, intron 2 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 40970 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 129.5-113 chr2 41920497 41920808 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 13071 NR_110262 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 138.5-164 chr5 140766510 140766894 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -19434 NM_031411 56147 Hs.199343 NM_018900 ENSG00000204970 PCDHA1 PCDH-ALPHA1 protocadherin alpha 1 protein-coding 228.75-81 chr8 90907215 90907570 + 0.75 NA intron (NM_022351, intron 5 of 12) intron (NM_022351, intron 5 of 12) 77685 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 135.5-6 chr1 79553388 79553846 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -546887 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 223-6 chr10 17724717 17725318 + 0.75 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -27184 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 219-75 chr4 59178874 59179304 + 0.75 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 165516 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 135.75-131 chr3 22858941 22859171 + 0.75 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 343522 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 151.25-196 chr8 132429351 132429663 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 17755 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 165-95 chr3 115371922 115372171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -224758 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 141.25-27 chr10 130520889 130521097 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 384584 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 142.25-47 chr12 124156353 124156632 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu -132672 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 213.25-5 chr1 166884424 166884720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8308 NM_053053 117143 Hs.435967 NM_053053 ENSG00000152382 TADA1 ADA1|HFI1|STAF42|TADA1L|hADA1 transcriptional adaptor 1 protein-coding 181.5-55 chr16 81694047 81694393 + 0.75 NA intron (NM_030629, intron 13 of 20) intron (NM_030629, intron 13 of 20) 28866 NR_045112 100129617 Hs.657151 NR_045112 LOC100129617 - uncharacterized LOC100129617 ncRNA 192.75-49 chr18 9916317 9916616 + 0.75 NA intron (NM_194434, intron 1 of 5) intron (NM_194434, intron 1 of 5) 2450 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 133.75-92 chr2 23208066 23208404 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176944 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 270.75-22 chr17 39625825 39626252 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_032192) promoter-TSS (NM_032192) -914 NM_032192 84152 Hs.286192 NM_032192 ENSG00000131771 PPP1R1B DARPP-32|DARPP32 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1B protein-coding 119.5-155 chr3 114585930 114586101 + 0.75 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) 38191 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 119.5-18 chr1 216752845 216753030 + 0.75 NA intron (NM_001243513, intron 1 of 7) intron (NM_001243513, intron 1 of 7) -29465 NM_001243519 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 189.5-83 chr20 55608943 55609294 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -181921 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 124.75-119 chr2 134523429 134523710 + 0.75 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) intron (NM_030923, intron 4 of 7) 195431 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 139.5-105 chr2 144419315 144419674 + 0.75 NA intron (NM_001171653, intron 3 of 8) intron (NM_001171653, intron 3 of 8) -86425 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 242.5-5 chr1 167236926 167237382 + 0.75 NA intron (NM_001198786, intron 1 of 14) intron (NM_001198786, intron 1 of 14) 16268 NR_037163 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 166-79 chr22 37540123 37540401 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -20218 NM_152243 11135 Hs.225356 NM_152243 ENSG00000128283 CDC42EP1 BORG5|CEP1|MSE55 CDC42 effector protein 1 protein-coding 207.5-42 chr18 61378828 61379243 + 0.75 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 45605 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 130.25-176 chr6 115217349 115217552 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 426385 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 146-43 chr15 63651543 63651839 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 52 of 77) intron (NM_003922, intron 52 of 77) -50864 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 132.75-136 chr4 60071512 60071719 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -851004 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 136.5-209 chr7 41276618 41276933 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175171 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 181-70 chr3 48607471 48607798 + 0.75 NA intron (NM_003365, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 2012 NM_003365 7384 Hs.119251 NM_003365 ENSG00000010256 UQCRC1 D3S3191|QCR1|UQCR1 ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1 protein-coding 139-65 chr2 6509307 6509653 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 124307 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 165.5-129 chr4 65390958 65391196 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 278411 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 151.5-51 chr14 68374938 68375213 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 253712 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 152-147 chr7 157339908 157340153 + 0.75 NA intron (NM_005494, intron 1 of 7) intron (NM_005494, intron 1 of 7) 3026 NM_058246 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 158-26 chr10 108482749 108483018 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -413590 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 180.75-12 chr1 192453016 192453432 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122549 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 178.5-185 chr8 111735346 111735752 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 358910 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 135.25-68 chr15 63350471 63350737 + 0.75 NA intron (NR_135511, intron 2 of 9) intron (NR_135511, intron 2 of 9) 31242 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 135.25-197 chr8 92475523 92475858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179804 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 145.5-93 chr2 31545038 31545334 + 0.75 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 35752 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 129.5-36 chr11 30151139 30151311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79789 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 159.5-180 chr6 45198726 45198939 + 0.75 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) -1062 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 117.5-239 chr8 138024956 138025287 + 0.75 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 58424 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 180.75-122 chr5 156857152 156857461 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 7011 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 157.5-190 chr7 41866451 41866812 + 0.75 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -163541 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 147-74 chr2 85820034 85820415 + 0.75 NA intron (NR_038888, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 5094 NR_038888 284950 Hs.570227 NR_038888 LOC284950 - uncharacterized LOC284950 ncRNA 160.25-149 chr7 41386932 41387381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 285552 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 149.25-15 chr1 171105237 171105498 + 0.75 NA intron (NM_001002294, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 -3561 NR_031627 100302178 NR_031627 ENSG00000221390 MIR1295A MIR1295|MIRN1295|hsa-mir-1295|hsa-mir-1295a|mir-1295a microRNA 1295a ncRNA 121.5-65 chr12 119990791 119990993 + 0.75 NA intron (NM_001367886, intron 1 of 9) intron (NM_001367886, intron 1 of 9) 1048 NM_207311 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 182-90 chr5 56220917 56221479 + 0.75 NA intron (NM_024669, intron 2 of 11) intron (NM_024669, intron 2 of 11) 12132 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 190-76 chr7 154984550 154985161 + 0.75 NA intron (NM_007349, intron 4 of 20) intron (NM_007349, intron 4 of 20) 18269 NM_007349 22976 Hs.443881 NM_007349 ENSG00000157212 PAXIP1 CAGF28|CAGF29|PACIP1|PAXIP1L|PTIP|TNRC2 PAX interacting protein 1 protein-coding 150-127 chr7 5567339 5567570 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25362 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 167.5-16 chr1 197130193 197130496 + 0.75 NA intron (NM_001206846, intron 7 of 26) intron (NM_001206846, intron 7 of 26) 16325 NM_018136 259266 Hs.121028 NM_018136 ENSG00000066279 ASPM ASP|Calmbp1|MCPH5 abnormal spindle microtubule assembly protein-coding 226.25-68 chr8 11356634 11357006 + 0.75 NA intron (NR_001578, intron 2 of 8) intron (NR_001578, intron 2 of 8) -9304 NR_147705 100129129 Hs.662094 NR_147705 ENSG00000255020 LOC100129129 - uncharacterized LOC100129129 ncRNA 114.25-140 chr4 59496830 59497020 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 483352 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 166.5-115 chr2 226508762 226509157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 149834 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 145.5-131 chr3 95224910 95225174 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 286779 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 174-76 chr5 55194514 55194835 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21497 NM_001170402 166979 Hs.669184 NM_152623 ENSG00000164287 CDC20B G6VTS76519 cell division cycle 20B protein-coding 149.25-21 chr10 80803747 80804207 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 154180 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 160-113 chr8 96528747 96528980 + 0.75 NA intron (NM_002998, intron 1 of 4) intron (NM_002998, intron 1 of 4) 35050 NM_002998 6383 Hs.1501 NM_002998 ENSG00000169439 SDC2 CD362|HSPG|HSPG1|SYND2 syndecan 2 protein-coding 165.75-67 chr18 34050150 34050440 + 0.75 NA intron (NM_001353233, intron 5 of 11) intron (NM_001353233, intron 5 of 11) -1683 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 153.5-193 chr8 40783262 40783525 + 0.75 NA intron (NM_024645, intron 2 of 6) L1MB7|LINE|L1 114433 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 138.75-122 chr3 181196924 181197251 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1PA11|LINE|L1 21943 NR_075093 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 168.25-137 chr7 101377923 101378257 + 0.75 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) intron (NM_133457, intron 1 of 12) 15215 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 112.75-145 chr4 32070176 32070418 + 0.75 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 -47875 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 192.5-124 chr7 112081185 112081671 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 124971 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 129.75-134 chr4 100354541 100354725 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 40614 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 174.5-9 chr1 152403931 152404386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10105 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 134-28 chr11 77469762 77470083 + 0.75 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) L1MA5|LINE|L1 4141 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 155.25-179 chr8 84105009 84105279 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -77643 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 164.25-113 chr4 59689681 59689939 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 676237 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 124.5-180 chr5 142455282 142455526 + 0.75 NA intron (NR_120664, intron 3 of 3) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 130111 NR_120664 101926941 Hs.658945 NR_120664 ENSG00000231185 SPRY4-AS1 THCAT68 SPRY4 antisense RNA 1 ncRNA 117-148 chr5 63608227 63608468 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 353945 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 225.5-40 chr15 65614578 65615091 + 0.75 NA intron (NM_001301033, intron 2 of 11) intron (NM_001301033, intron 2 of 11) 3484 NM_001301033 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 261-8 chr10 107932997 107933571 + 0.75 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 136009 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 165-70 chr2 81889818 81890092 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -423009 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 119.5-172 chr5 2344642 2344831 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -32535 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 176.75-91 chr4 64406397 64406722 + 0.75 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 2891 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 183.5-52 chr16 65436075 65436466 + 0.75 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 140030 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 121.25-147 chr4 97095409 97095626 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -271409 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 141.75-106 chr2 234589237 234589493 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -92284 NM_001282431 10123 Hs.111554 NM_005737 ENSG00000188042 ARL4C ARL7|LAK ADP ribosylation factor like GTPase 4C protein-coding 225-27 chr15 64114750 64115135 + 0.75 NA intron (NM_148955, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 18960 NM_001242933 6642 Hs.188634 NM_003099 ENSG00000028528 SNX1 HsT17379|VPS5 sorting nexin 1 protein-coding 197.25-57 chr20 4958185 4958651 + 0.75 NA intron (NM_005116, intron 2 of 16) intron (NM_005116, intron 2 of 16) 43092 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 295-9 chr12 88323373 88323888 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 181323 NM_001366574 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 199.75-39 chr18 1146009 1146547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 213351 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 186.5-141 chr9 94684723 94685009 + 0.75 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner -41803 NM_032823 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 184.5-159 chr8 118526596 118527002 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) LTR33|LTR|ERVL -94202 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 320.25-29 chr8 127514383 127515359 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32732 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 133.75-8 chr1 161937115 161937350 + 0.75 NA intron (NM_007348, intron 15 of 15) AluSx|SINE|Alu 87233 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 116-154 chr7 66125277 66125520 + 0.75 NA intron (NM_001040648, intron 1 of 2) intron (NM_001040648, intron 1 of 2) 10551 NM_014478 27297 Hs.300684 NM_014478 ENSG00000241258 CRCP CGRP-RCP|CGRPRCP|RCP|RCP9|RPC9 CGRP receptor component protein-coding 126.5-262 chr9 28685517 28685768 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 33663 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 116.5-126 chr2 137753973 137754215 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 173838 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 212.5-80 chr4 89290238 89290707 + 0.75 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 17328 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 181-36 chr16 68037351 68037814 + 0.75 NA intron (NM_017803, intron 2 of 16) AluSq2|SINE|Alu -13715 NM_018380 55794 Hs.458313 NM_018380 ENSG00000182810 DDX28 MDDX28 DEAD-box helicase 28 protein-coding 179.75-136 chr8 128469204 128469619 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 95268 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 167.5-146 chr5 73218899 73219206 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17091 NR_134291 340090 Hs.434311 NR_134291 LOC340090 - uncharacterized LOC340090 ncRNA 152.25-117 chr4 98389239 98389534 + 0.75 NA intron (NM_021159, intron 5 of 14) intron (NM_021159, intron 5 of 14) 128002 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 139.75-80 chr17 79617511 79617752 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6580 NM_001350453 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 213.5-112 chr6 148896239 148896664 + 0.75 NA intron (NM_005715, intron 2 of 7) intron (NM_005715, intron 2 of 7) 68233 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 119-49 chr14 68040000 68040187 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 216501 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 233.75-9 chr10 83313142 83313688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 363674 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 137.5-217 chr6 169055556 169055854 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -12081 NR_134619 102724357 Hs.129310 NR_134619 ENSG00000234519 LOC102724357 - uncharacterized LOC102724357 ncRNA 231.25-40 chr2 77710193 77710521 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -187924 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 168.5-4 chr1 72041168 72041497 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -204320 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 120.5-126 chr2 184124867 184125132 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -253976 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 115.75-49 chr12 116963776 116964038 + 0.75 NA intron (NM_153348, intron 4 of 10) intron (NM_153348, intron 4 of 10) 23430 NR_103809 100506551 Hs.657861 NR_103809 ENSG00000257279 LOC100506551 - uncharacterized LOC100506551 ncRNA 199.5-147 chr8 108815235 108815607 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -27827 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 115.75-71 chr15 42721768 42722017 + 0.75 NA TTS (NM_020759) TTS (NM_020759) 15236 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 117-93 chr2 104131995 104132333 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 276168 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 202.25-48 chr21 44447176 44447755 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 7819 NR_047476 100861510 Hs.505254 NR_047476 ENSG00000229356 LRRC3-DT LRRC3-AS1 LRRC3 divergent transcript ncRNA 220.5-33 chr16 28569675 28570073 + 0.75 NA intron (NM_138414, intron 1 of 9) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 15954 NM_138414 112869 Hs.655476 NM_138414 ENSG00000176476 SGF29 CCDC101|STAF36|TDRD29 SAGA complex associated factor 29 protein-coding 219.5-132 chr8 133965193 133965618 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 78909 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 188.5-136 chr6 147525937 147526328 + 0.75 NA intron (NM_001030060, intron 1 of 1) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 17442 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 133.75-192 chr8 111485581 111485855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109079 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 143.75-80 chr19 28461368 28461634 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 6 of 9) intron (NR_110759, intron 6 of 9) -145187 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 161.5-35 chr11 101769362 101769732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -145463 NM_020802 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 146.5-49 chr12 4283774 4284197 + 0.75 NA intron (NM_001759, intron 3 of 4) intron (NM_001759, intron 3 of 4) -7801 NR_125790 103752584 Hs.577711 NR_125790 ENSG00000255920 CCND2-AS1 CCND2-AS2 CCND2 antisense RNA 1 ncRNA 231.5-28 chr14 61201415 61201927 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 79667 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 189.5-95 chr3 187902402 187902843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 73785 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 121-162 chr5 133536265 133536529 + 0.75 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) L1ME4a|LINE|L1 76144 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 181.25-75 chr21 15042792 15043189 + 0.75 NA intron (NM_003489, intron 2 of 3) intron (NM_003489, intron 2 of 3) 22010 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 116.25-164 chr4 73973270 73973536 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 8624 NM_002619 5196 Hs.81564 NM_002619 ENSG00000163737 PF4 CXCL4|PF-4|SCYB4 platelet factor 4 protein-coding 152.25-98 chr21 22971966 22972269 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -107167 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 208.75-31 chr16 76003677 76004119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -273503 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 177.5-118 chr3 166279806 166280372 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -442666 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 170-36 chr16 71454723 71455135 + 0.75 NA intron (NM_001304492, intron 2 of 4) intron (NM_001304492, intron 2 of 4) 7318 NM_001304494 7571 Hs.656643 NM_145911 ENSG00000167377 ZNF23 KOX16|ZNF359|ZNF612|Zfp612 zinc finger protein 23 protein-coding 183.75-25 chr11 80379648 80380032 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 382963 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 152.25-130 chr5 89199851 89200215 + 0.75 NA intron (NR_136219, intron 6 of 9) L1M3e|LINE|L1 -295928 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 172.25-91 chr3 98137656 98137985 + 0.75 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 5122 NM_001005338 26341 Hs.537383 NM_001005338 ENSG00000231192 OR5H1 HSHTPCRX14|HTPCRX14 olfactory receptor family 5 subfamily H member 1 protein-coding 233-3 chr1 55061460 55061845 + 0.75 NA intron (NM_174936, intron 11 of 11) intron (NM_174936, intron 11 of 11) 21430 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 164.75-124 chr6 50137807 50138105 + 0.75 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -88027 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 191-41 chr2 165200723 165201212 + 0.75 NA intron (NM_006922, intron 1 of 27) intron (NM_006922, intron 1 of 27) 3083 NM_001081676 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 150.5-99 chr2 137554285 137554657 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 15 of 27) intron (NM_001316349, intron 15 of 27) 373461 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 158.5-156 chr5 43563554 43563886 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -6301 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 181.25-20 chr11 114846514 114846867 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 168163 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 237.5-10 chr1 213529139 213529493 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -395433 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 124.5-73 chr15 78570770 78570988 + 0.75 NA intron (NM_001307945, intron 1 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 5359 NM_001307945 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 137-92 chr20 49556526 49556770 + 0.75 NA intron (NM_000961, intron 1 of 9) MER4-int|LTR|ERV1 11489 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 184.5-153 chr8 74777771 74778104 + 0.75 NA Intergenic LTR86A1|LTR|ERVL -46597 NM_015886 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 142.5-61 chr14 37020250 37020551 + 0.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -68009 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 215.25-77 chr5 29905451 29905777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25054 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 282-5 chr11 23748003 23748579 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -329101 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 240.25-29 chr18 56881971 56882577 + 0.75 NA intron (NM_015285, intron 21 of 27) intron (NM_015285, intron 21 of 27) 189845 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 175.5-159 chr8 80856921 80857383 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) L1M5|LINE|L1 17316 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 160.5-212 chrX 95505178 95505499 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -442112 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 153.75-66 chr2 139167000 139167339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 269845 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 123.5-25 chr10 34440365 34440625 + 0.75 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) intron (NM_001184791, intron 4 of 20) 374801 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 132.75-97 chr2 39051905 39052271 + 0.75 NA intron (NM_005633, intron 5 of 22) L1MB7|LINE|L1 68375 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 119.75-85 chr18 13874613 13874895 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 40782 NM_000529 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 159.5-113 chr2 165519348 165519603 + 0.75 NA intron (NM_001172173, intron 3 of 6) intron (NM_001172173, intron 3 of 6) 49777 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 125.25-119 chr20 15074479 15074841 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) MER21B|LTR|ERVL -122180 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 136.75-83 chr18 13251978 13252185 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) 12538 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 179.5-145 chr5 27497083 27497444 + 0.75 NA TTS (NR_038848) TTS (NR_038848) 24971 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 222.25-22 chr14 82214070 82214550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -428322 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 157.75-73 chr18 1556032 1556355 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -196564 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 155.75-47 chr14 20180567 20180903 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -16601 NM_001005503 390439 Hs.554582 NM_001005503 ENSG00000196832 OR11G2 OR14-34 olfactory receptor family 11 subfamily G member 2 protein-coding 145.75-75 chr2 40784301 40784566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271998 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 134.25-189 chr8 90283124 90283404 + 0.75 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 61776 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 185.75-132 chr9 824601 824988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16903 NM_021951 1761 Hs.98586 NM_021951 ENSG00000137090 DMRT1 CT154|DMT1 doublesex and mab-3 related transcription factor 1 protein-coding 199.25-96 chr8 81492735 81493075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9672 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 188.25-106 chr7 51476817 51477182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83743 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 141-26 chr10 83488392 83488690 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 188548 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 213.5-77 chr3 100092347 100092655 + 0.75 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 22012 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 148-59 chr2 100515269 100515611 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 44958 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 113-19 chr10 11388107 11388368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43563 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 134-62 chr15 90603437 90603734 + 0.75 NA intron (NM_001042574, intron 4 of 14) intron (NM_001042574, intron 4 of 14) -56649 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 132.5-247 chr8 129365816 129366163 + 0.75 NA intron (NR_130920, intron 3 of 3) intron (NR_130920, intron 3 of 3) 118153 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 124-96 chr2 197600296 197600581 + 0.75 NA intron (NM_144629, intron 7 of 8) intron (NM_144629, intron 7 of 8) 75149 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 203.5-127 chr7 33246776 33247184 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) intron (NM_198428, intron 5 of 22) 117416 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 131.75-84 chr16 60483168 60483389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123485 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 265-30 chr4 36681486 36682123 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -39904 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 126.75-196 chr5 102317710 102317905 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -21523 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 153.75-151 chr8 127860844 127861090 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 65005 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 116.75-13 chr1 161335154 161335526 + 0.75 NA intron (NM_003001, intron 3 of 5) L1MC4|LINE|L1 20959 NM_001035511 6391 Hs.444472 NM_003001 ENSG00000143252 SDHC CYB560|CYBL|PGL3|QPS1|SDH3 succinate dehydrogenase complex subunit C protein-coding 178-24 chr13 82282953 82283329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1056158 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 184.5-44 chr14 56470581 56470882 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -43600 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 153-113 chr5 5443521 5443966 + 0.75 NA intron (NM_015325, intron 6 of 18) intron (NM_015325, intron 6 of 18) 21066 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 129.5-235 chr9 12892284 12892622 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -78064 NR_125775 101929467 Hs.586443 NR_125775 ENSG00000235448 LURAP1L-AS1 - LURAP1L antisense RNA 1 ncRNA 157.25-113 chr4 186373901 186374167 + 0.75 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) AluSp|SINE|Alu 107845 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 125.25-180 chr6 168491567 168491888 + 0.75 NA intron (NM_001166412, intron 1 of 12) intron (NM_001166412, intron 1 of 12) 50543 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 186-79 chr6 108210910 108211220 + 0.75 NA TTS (NM_001300928) TTS (NM_001300928) 43042 NM_001286102 7101 Hs.157688 NM_003269 ENSG00000112333 NR2E1 TLL|TLX|XTLL nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 protein-coding 185.25-122 chr8 36677327 36677707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106857 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 194.25-43 chr16 74196262 74196663 + 0.75 NA intron (NR_104657, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 19059 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 140-88 chr20 43293302 43293558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103524 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 131.75-94 chr17 70878746 70879020 + 0.75 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 323296 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 156.5-110 chr3 14360481 14360764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8054 NR_110135 101927565 Hs.306905 NR_110135 ENSG00000251576 LINC01267 - long intergenic non-protein coding RNA 1267 ncRNA 190.25-24 chr12 11631086 11631405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18609 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 217-43 chr21 18345920 18346270 + 0.75 NA intron (NM_002772, intron 10 of 24) intron (NM_002772, intron 10 of 24) 57690 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 155.5-175 chr5 145850039 145850379 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -14867 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 180.75-137 chr6 170122178 170122613 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -38247 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 125.25-40 chr11 107673483 107673714 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 38458 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 230.5-88 chr4 74048675 74049081 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 6521 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 144.25-4 chr1 36435451 36435761 + 0.75 NA intron (NM_001330493, intron 3 of 10) MIR|SINE|MIR 14845 NM_206837 127700 Hs.202207 NM_145047 ENSG00000116885 OSCP1 C1orf102|NOR1 organic solute carrier partner 1 protein-coding 159.25-127 chr6 65641382 65641691 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) LTR33C|LTR|ERVL -61732 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 190.5-12 chr10 20040856 20041303 + 0.75 NA intron (NM_001282736, intron 2 of 12) L1M7|LINE|L1 224647 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 133.75-128 chr3 57751941 57752159 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5206 NM_001304421 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 148.25-98 chr3 133960154 133960482 + 0.75 NA intron (NM_005630, intron 3 of 13) L1MB3|LINE|L1 -30506 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 145.25-20 chr11 25548480 25548761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -640503 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 162.25-82 chr2 127474736 127475008 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -51254 NR_039944 100616187 NR_039944 ENSG00000264075 MIR4783 - microRNA 4783 ncRNA 192.25-22 chr13 46101141 46101457 + 0.75 NA TTS (NR_046226) TTS (NR_046226) 3734 NM_001872 1361 Hs.512937 NM_001872 ENSG00000080618 CPB2 CPU|PCPB|TAFI carboxypeptidase B2 protein-coding 149.25-85 chr2 123694485 123694805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 330529 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 149.75-73 chr2 21709033 21709313 + 0.75 NA intron (NR_038837, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 1479 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 181.25-26 chr12 124064101 124064585 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) LTR78|LTR|ERV1 91128 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 157-21 chr12 22168975 22169305 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 122922 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 121-25 chr10 61148012 61148217 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131839 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 114.75-2 chr1 42901725 42901951 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 44216 NR_104171 339539 Hs.434301 NR_104171 LOC339539 - uncharacterized LOC339539 ncRNA 162.5-128 chr4 55306051 55306437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39998 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 204-47 chr21 25658107 25658530 + 0.75 NA intron (NR_072999, intron 1 of 9) intron (NR_072999, intron 1 of 9) 19036 NM_001270407 58494 Hs.517227 NM_021219 ENSG00000154721 JAM2 C21orf43|CD322|JAM-B|JAMB|PRO245|VE-JAM|VEJAM junctional adhesion molecule 2 protein-coding 187.5-15 chr10 23683446 23683788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11110 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 205-62 chr5 30298776 30299140 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 418398 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 138.5-204 chr8 127723552 127723794 + 0.75 NA intron (NR_117102, intron 1 of 3) intron (NR_117102, intron 1 of 3) 10294 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 192.25-57 chr2 120429317 120429729 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36826 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 186.5-20 chr10 86343545 86343967 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 23039 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 158.75-3 chr1 61597725 61598117 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -56321 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 150.25-27 chr10 112408478 112408678 + 0.75 NA intron (NM_203379, intron 6 of 20) intron (NM_203379, intron 6 of 20) 32380 NM_016234 51703 Hs.11638 NM_016234 ENSG00000197142 ACSL5 ACS2|ACS5|FACL5 acyl-CoA synthetase long chain family member 5 protein-coding 215-20 chr13 48565478 48566114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15105 NR_051983 100129597 Hs.175225 NR_051983 ENSG00000233610 LINC00462 - long intergenic non-protein coding RNA 462 ncRNA 131.75-93 chr17 55136389 55136704 + 0.75 NA intron (NM_178509, intron 16 of 17) MER63B|DNA|hAT-Blackjack -128414 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 124-25 chr11 73532677 73532982 + 0.75 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 65283 NM_001286050 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 153.75-21 chr10 74523482 74523796 + 0.75 NA intron (NR_120673, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 5685 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 153.75-14 chr1 237452157 237452479 + 0.75 NA intron (NM_001035, intron 14 of 104) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18801 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 185.75-19 chr10 113638681 113639085 + 0.75 NA intron (NM_001322945, intron 14 of 40) intron (NM_001322945, intron 14 of 40) 25158 NM_198060 4892 Hs.268788 NM_006175 ENSG00000197893 NRAP N-RAP nebulin related anchoring protein protein-coding 148-143 chrX 98231186 98231510 + 0.75 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -666813 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-126 chr3 21188218 21188462 + 0.75 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -217386 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 179.25 chr1 37150714 37151075 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -10669 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 122-69 chr16 84289213 84289481 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -5531 NM_001282466 58189 Hs.36688 NM_021197 ENSG00000103175 WFDC1 PS20 WAP four-disulfide core domain 1 protein-coding 142.5-212 chr7 98968020 98968291 + 0.75 NA intron (NM_003496, intron 49 of 70) AluSz|SINE|Alu -45010 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 285.25-16 chr2 216961820 216962309 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 91292 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 113.5-26 chr1 226160277 226160545 + 0.75 NA intron (NM_022735, intron 4 of 7) intron (NM_022735, intron 4 of 7) 12408 NR_146443 107985353 Hs.735455 NR_146443 ENSG00000234478 ACBD3-AS1 - ACBD3 antisense RNA 1 ncRNA 146.25-136 chr7 79536239 79536488 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 82403 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 155.25-5 chr1 40413012 40413410 + 0.75 NA intron (NM_022733, intron 5 of 9) intron (NM_022733, intron 5 of 9) 16411 NM_001198980 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 131.25-48 chr13 54187914 54188101 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR -55136 NR_108062 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 137-81 chr2 106985934 106986160 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98938 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 121.25-73 chr16 10744279 10744465 + 0.75 NA intron (NM_002484, intron 2 of 10) intron (NM_002484, intron 2 of 10) 503 NM_001323597 4682 Hs.81469 NM_002484 ENSG00000103274 NUBP1 CIAO5|NBP|NBP1|NBP35 nucleotide binding protein 1 protein-coding 287.75-39 chr4 97662041 97662650 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) L1PA13|LINE|L1 295419 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-190 chr8 40621439 40621669 + 0.75 NA intron (NM_001135731, intron 4 of 5) intron (NM_001135731, intron 4 of 5) 276272 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 114.5-56 chr11 96753971 96754244 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 245682 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 328-35 chr9 33311911 33312463 + 0.75 NA intron (NM_002504, intron 6 of 23) intron (NM_002504, intron 6 of 23) 21671 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 143.5-10 chr1 117122746 117122990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1119 NM_001145635 80263 Hs.301526 NM_025188 ENSG00000134253 TRIM45 RNF99 tripartite motif containing 45 protein-coding 122.25-148 chr5 32721974 32722258 + 0.75 NA intron (NM_000908, intron 1 of 7) MamRep605|LTR?|LTR? 10795 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 141.25-178 chr8 24218876 24219178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75013 NR_130709 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 209-5 chr1 180145310 180145725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9316 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 166.75-92 chr3 106190119 106190410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -320863 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 126-108 chr20 46514778 46515108 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -1371 NM_001353822 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 130-125 chr5 35266353 35266686 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36032 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 143.25-16 chr10 33721300 33721566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51247 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 187.5-50 chr13 85015511 85015917 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 132343 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 146-122 chr7 104994163 104994433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3133 NR_039981 100216546 Hs.369356 NR_039981 LINC01004 - long intergenic non-protein coding RNA 1004 ncRNA 245-73 chr9 32093401 32093857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -290974 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 235.25-3 chr1 115410814 115411218 + 0.75 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -72780 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 120.5-229 chr8 108848474 108848680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60983 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 124-44 chr14 22714770 22715006 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -51800 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 248.25-17 chr12 40329923 40330351 + 0.75 NA intron (NM_198578, intron 39 of 50) HAL1ME|LINE|L1 -63257 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 221-4 chr1 234684459 234684945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38413 NR_125944 101927787 Hs.520658 NR_125944 ENSG00000228044 LOC101927787 - uncharacterized LOC101927787 ncRNA 224-35 chr3 167295814 167296185 + 0.75 NA intron (NM_001199201, intron 18 of 21) L1M3|LINE|L1 84284 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 162.75-17 chr10 75006036 75006334 + 0.75 NA intron (NM_001370144, intron 11 of 15) L1MC5|LINE|L1 -15548 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 129.75-19 chr1 208803643 208803858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75062 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 191.75-24 chr11 84297096 84297382 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) MamRep605|LTR?|LTR? 20100 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 124.25-11 chr1 105771576 105771854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152780 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 128-171 chr9 4537748 4537956 + 0.75 NA intron (NM_004170, intron 1 of 11) L1MB7|LINE|L1 47384 NM_004170 6505 Hs.444915 NM_004170 ENSG00000106688 SLC1A1 DCBXA|EAAC1|EAAT3|SCZD18 solute carrier family 1 member 1 protein-coding 230 chr1 93782567 93783094 + 0.75 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) L1M5|LINE|L1 -7447 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 221.5-14 chr11 129919709 129920010 + 0.75 NA intron (NM_199437, intron 13 of 20) intron (NM_199437, intron 13 of 20) -24281 NM_001143835 4798 Hs.530539 NM_006165 ENSG00000170322 NFRKB INO80G nuclear factor related to kappaB binding protein protein-coding 119.5-178 chr5 56239779 56240024 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6571 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 143.75-179 chr8 53328536 53328763 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76952 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 146.25-99 chr3 65304902 65305206 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -588762 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-23 chr10 55272987 55273235 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -325931 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 210-68 chr3 169702489 169702855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38960 NM_001366466 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 160.25-63 chr18 75997258 75997554 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -125592 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 202.75-42 chr16 35120529 35120910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49672 NR_002837 606551 Hs.646441 NR_002837 UBE2MP1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 M pseudogene 1 pseudo 180-85 chr3 106514758 106515126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -645541 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 141.25-15 chr10 7144497 7144872 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42100 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 114-102 chr3 77454748 77455053 + 0.75 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 356888 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 159.5-112 chr2 162474551 162474945 + 0.75 NA intron (NM_033272, intron 6 of 15) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 130380 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 185-70 chr5 111318883 111319277 + 0.75 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 94696 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 157.25-98 chr3 153844012 153844419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81689 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 260.75-38 chr20 8098355 8098811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33683 NM_182734 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 184.25-41 chr15 93658003 93658438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -198340 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 243.5-25 chr12 32160000 32160500 + 0.75 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 53403 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 195-89 chr8 34617161 34617549 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -166566 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 176.25-151 chrX 66214925 66215295 + 0.75 NA intron (NM_001367241, intron 15 of 18) L1M5|LINE|L1 47360 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 157-131 chrX 47161567 47162016 + 0.75 NA intron (NM_152856, intron 2 of 22) AluJb|SINE|Alu 16570 NM_152856 8241 Hs.401509 NM_005676 ENSG00000182872 RBM10 DXS8237E|GPATC9|GPATCH9|S1-1|TARPS|ZRANB5 RNA binding motif protein 10 protein-coding 159.5-223 chrX 153827271 153827513 + 0.75 NA intron (NM_001303513, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 2504 NM_001303516 57595 Hs.92732 NM_032512 ENSG00000067840 PDZD4 LNX5|LU1|PDZK4|PDZRN4L PDZ domain containing 4 protein-coding 140.75-188 chr8 124838397 124838839 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16560 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 176-36 chr2 211694598 211694915 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 12 of 26) intron (NM_001042599, intron 12 of 26) 731604 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 133.75-141 chr3 161374519 161374762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1690 NM_001320679 165679 Hs.369104 NM_145035 ENSG00000196542 SPTSSB ADMP|C3orf57|SSSPTB serine palmitoyltransferase small subunit B protein-coding 128.75-167 chr6 53995726 53996126 + 0.75 NA non-coding (NR_125842, exon 4 of 4) non-coding (NR_125842, exon 4 of 4) -2964 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 115.5-258 chrX 65603970 65604204 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51666 NR_033742 83957 Hs.652967 NR_033742 ENSG00000227942 FRMD8P1 - FERM domain containing 8 pseudogene 1 pseudo 240.75-68 chr7 4810250 4810723 + 0.75 NA intron (NM_018059, intron 9 of 14) L1ME3A|LINE|L1 -21847 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 116.25-19 chr10 66955232 66955452 + 0.75 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 29306 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 234.75-53 chr3 130782271 130782756 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -35684 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 167.25-91 chr2 163135859 163136115 + 0.75 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -297220 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 112.5-226 chr7 115987393 115987689 + 0.75 NA intron (NM_012252, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 -19228 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 281.25-42 chr8 20729880 20730345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115186 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 196-98 chr8 125124746 125125073 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) AluSx1|SINE|Alu 33049 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 139.5-223 chr8 130516838 130517081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73285 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 126.25-123 chr3 133964370 133964744 + 0.75 NA intron (NM_005630, intron 3 of 13) L3|LINE|CR1 -34745 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 269.5-45 chr5 91497735 91498405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114753 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 114.5-254 chr8 27190277 27190528 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 68002 NM_030795 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 120-24 chr11 34465970 34466230 + 0.75 NA intron (NM_001752, intron 10 of 12) L1MEg|LINE|L1 27166 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 155.5-141 chr4 42855446 42855666 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -37710 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 123.25-104 chr2 84755134 84755503 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 63 of 76) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 125766 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 211.25-88 chr7 123231545 123231969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31786 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 209-66 chr7 81763265 81763786 + 0.75 NA intron (NM_001010933, intron 1 of 7) intron (NM_001010933, intron 1 of 7) 6522 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 123.25-83 chr17 82111991 82112310 + 0.75 NA intron (NM_001367828, intron 16 of 16) AluSz6|SINE|Alu -13914 NM_004104 2194 Hs.83190 NM_004104 ENSG00000169710 FASN FAS|OA-519|SDR27X1 fatty acid synthase protein-coding 260-6 chr10 78810964 78811553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 256190 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-74 chr13 46839382 46839735 + 0.75 NA intron (NM_001165947, intron 2 of 2) intron (NM_001165947, intron 2 of 2) -12582 NR_046612 100874082 Hs.569281 NR_046612 ENSG00000224517 HTR2A-AS1 - HTR2A antisense RNA 1 ncRNA 141.5-124 chr20 591316 591567 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 18825 NM_004609 6939 Hs.437 NM_004609 ENSG00000125878 TCF15 EC2|PARAXIS|bHLHa40 transcription factor 15 protein-coding 156.75-78 chr19 56574846 56575134 + 0.75 NA intron (NM_001001668, intron 5 of 5) intron (NM_001001668, intron 5 of 5) 7522 NM_001001668 388566 Hs.204449 NM_001001668 ENSG00000197016 ZNF470 CZF-1 zinc finger protein 470 protein-coding 329.75-6 chr11 41640140 41640742 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -74127 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 117.75-201 chr7 90406414 90406599 + 0.75 NA intron (NM_001185073, intron 2 of 2) intron (NM_001185073, intron 2 of 2) 3045 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 167.75-149 chr9 32970864 32971241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30524 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 196.25-54 chr19 57642904 57643250 + 0.75 NA non-coding (NR_049752, exon 6 of 6) non-coding (NR_049752, exon 6 of 6) 9909 NR_049753 10520 Hs.590977 NM_006385 ENSG00000121417 ZNF211 C2H2-25|CH2H2-25|ZNF-25 zinc finger protein 211 protein-coding 119.25-153 chr4 107494292 107494526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 225825 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 185.25-86 chr4 28197243 28197672 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -622125 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 152.25-137 chr5 158245136 158245447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164482 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 194.5-75 chr2 159226004 159226349 + 0.75 NA intron (NM_001350065, intron 25 of 27) AluSz6|SINE|Alu 39341 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 150.25-101 chr3 95768778 95769092 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85742 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 138.25-172 chr8 121626740 121626960 + 0.75 NA intron (NM_005328, intron 2 of 3) intron (NM_005328, intron 2 of 3) -12496 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 166-68 chr2 204503496 204503786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41834 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 133.75-59 chr14 55262731 55263022 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -8545 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 171.75-112 chr5 56355862 56356150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122676 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 118.25-5 chr1 49482150 49482412 + 0.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L1PA12|LINE|L1 -10196 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 188.5-156 chr8 126205812 126206158 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -119510 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 126.75-106 chr2 48831459 48831653 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -75832 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 187.75-8 chr1 224967774 224968156 + 0.75 NA TTS (NM_144989) TTS (NM_144989) 38290 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 205.25-26 chr14 67524254 67524585 + 0.75 NA intron (NM_001348546, intron 1 of 2) intron (NM_001348546, intron 1 of 2) -8871 NM_020715 57475 Hs.594236 NM_020715 ENSG00000054690 PLEKHH1 - pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H1 protein-coding 214.25-68 chr5 76318300 76318764 + 0.75 NA intron (NM_001297716, intron 12 of 12) intron (NM_001297716, intron 12 of 12) -84753 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 157.75-127 chr4 124309336 124309722 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 248905 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 156.75-48 chr13 44386746 44387108 + 0.75 NA intron (NM_001010897, intron 2 of 2) intron (NM_001010897, intron 2 of 2) 13085 NR_144535 387923 Hs.377972 NM_001010897 ENSG00000151778 SERP2 C13orf21|bA269C23.1 stress associated endoplasmic reticulum protein family member 2 protein-coding 224.25-81 chr5 154994921 154995466 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18562 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 189.25-9 chr10 33094201 33094619 + 0.75 NA intron (NR_160030, intron 1 of 2) intron (NR_160030, intron 1 of 2) 22397 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 118.5-160 chr5 23680297 23680493 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 172740 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 133.75-112 chr2 238091532 238091865 + 0.75 NA intron (NM_016510, intron 8 of 11) intron (NM_016510, intron 8 of 11) -8642 NM_194312 339768 Hs.127724 NM_194312 ENSG00000144488 ESPNL - espin like protein-coding 213-40 chr18 54737352 54737717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -90943 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 139.25-91 chr2 107774098 107774388 + 0.75 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 20131 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 132.25-197 chrX 137285966 137286311 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -254464 NM_054021 83550 Hs.350569 NM_054021 ENSG00000165370 GPR101 GPCR6|PAGH2|PITA2 G protein-coupled receptor 101 protein-coding 134.25-107 chr3 16976896 16977107 + 0.75 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 43805 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 154-84 chr20 55584927 55585313 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -157923 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 118.75-90 chr19 49767362 49767675 + 0.75 NA intron (NM_130787, intron 1 of 22) intron (NM_130787, intron 1 of 22) 517 NM_130787 160 Hs.467125 NM_014203 ENSG00000196961 AP2A1 ADTAA|AP2-ALPHA|CLAPA1 adaptor related protein complex 2 subunit alpha 1 protein-coding 194.25-79 chr4 36398852 36399397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27304 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 114.5-153 chr2 209911381 209911583 + 0.75 NA intron (NM_032504, intron 28 of 63) intron (NM_032504, intron 28 of 63) -91083 NM_001278289 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 216.25-32 chr14 64260715 64261044 + 0.75 NA intron (NR_073496, intron 4 of 7) intron (NR_073496, intron 4 of 7) 22196 NM_001271876 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 130-61 chr18 31894281 31894575 + 0.75 NA intron (NM_014939, intron 11 of 28) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 48700 NM_014939 22878 Hs.202001 NM_014939 ENSG00000153339 TRAPPC8 GSG1|HsT2706|KIAA1012|TRS85 trafficking protein particle complex 8 protein-coding 121.75-75 chr2 23798964 23799159 + 0.75 NA intron (NR_125717, intron 19 of 28) intron (NR_125717, intron 19 of 28) 128062 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 185.25-100 chr5 52236923 52237233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 229047 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 269.75-54 chr7 134225639 134226077 + 0.75 NA intron (NM_144648, intron 16 of 19) intron (NM_144648, intron 16 of 19) 91072 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 176.5-51 chr14 30623926 30624404 + 0.75 NA intron (NM_001257376, intron 1 of 22) intron (NM_001257376, intron 1 of 22) 1846 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 143-118 chr5 98659347 98659748 + 0.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -109085 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 173.75-2 chr1 27246507 27246958 + 0.75 NA intron (NM_001276252, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu 12100 NM_015023 23038 Hs.469154 NM_015023 ENSG00000142784 WDTC1 ADP|DCAF9 WD and tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 136.75-178 chr7 3513960 3514346 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 212901 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 247.5-25 chr14 80783967 80784354 + 0.75 NA intron (NM_152446, intron 15 of 24) L2a|LINE|L2 157578 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 146.25-166 chrX 66352823 66353054 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 185188 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 119.75-168 chr5 23264533 23264917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -242884 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 156-113 chr4 174253322 174253731 + 0.75 NA intron (NM_012180, intron 3 of 5) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -30378 NM_001145314 80817 Hs.555989 NM_030633 ENSG00000164118 CEP44 KIAA1712|PS1TP3 centrosomal protein 44 protein-coding 216.25-22 chr12 630604 631249 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_122124) promoter-TSS (NR_122124) 35 NR_122124 100049716 Hs.655804 NR_122124 ENSG00000177406 LOC100049716 - uncharacterized LOC100049716 ncRNA 138.75-29 chr11 25438240 25438558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -750724 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 247.75-35 chr22 26445814 26446313 + 0.75 NA intron (NM_001349905, intron 13 of 13) intron (NM_001349905, intron 13 of 13) 16803 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 136.75-173 chr6 146367860 146368167 + 0.75 NA intron (NM_001278065, intron 6 of 9) L1MA4|LINE|L1 -175820 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 138.75-58 chr15 75409336 75409706 + 0.75 NA intron (NM_015477, intron 8 of 20) AluSc8|SINE|Alu -40894 NM_001256494 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 142.75-129 chr3 60742757 60743020 + 0.75 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) intron (NR_148921, intron 4 of 4) -125018 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 174.75-84 chr3 128184710 128185186 + 0.75 NA intron (NM_021937, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu -31034 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 144.5-134 chr3 128283174 128283460 + 0.75 NA intron (NM_021937, intron 4 of 6) intron (NM_021937, intron 4 of 6) -129403 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 138-65 chr18 1676152 1676425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -316659 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 218-56 chr5 45066661 45067287 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258027 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 119.75-29 chr11 6575066 6575320 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 28423 NM_015324 23378 Hs.652255 NM_015324 ENSG00000132275 RRP8 KIAA0409|NML ribosomal RNA processing 8 protein-coding 181.5-90 chr2 181326395 181326722 + 0.75 NA intron (NR_130784, intron 3 of 4) intron (NR_130784, intron 3 of 4) -20906 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 142.75-150 chr4 171201494 171201834 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15480 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 234-29 chr2 223137965 223138387 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 86246 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 163-106 chr6 18121036 18121317 + 0.75 NA 3' UTR (NM_198586, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_198586, exon 1 of 1) 1501 NM_198586 378884 Hs.348351 NM_198586 ENSG00000187566 NHLRC1 EPM2A|EPM2B|MALIN|bA204B7.2 NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 124-124 chr4 82747797 82748083 + 0.75 NA intron (NM_001037582, intron 1 of 4) intron (NM_001037582, intron 1 of 4) 5490 NR_030301 693160 NR_030301 ENSG00000207746 MIR575 MIRN575|hsa-mir-575 microRNA 575 ncRNA 132.5-69 chr14 58263811 58264133 + 0.75 NA intron (NR_038123, intron 6 of 9) MER30|DNA|hAT-Charlie 19129 NM_002788 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 195.5-38 chr14 56412526 56413004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101566 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 159.25-141 chr7 156880315 156880608 + 0.75 NA intron (NR_146958, intron 1 of 14) L1PB1|LINE|L1 12722 NM_001363409 64327 Hs.209989 NM_022458 ENSG00000105983 LMBR1 ACHP|C7orf2|DIF14|LSS|PPD2|THYP|TPT|ZRS limb development membrane protein 1 protein-coding 162.75-18 chr10 78651987 78652265 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 384784 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 149-11 chr10 24649317 24649563 + 0.75 NA intron (NM_001367450, intron 5 of 27) intron (NM_001367450, intron 5 of 27) -26597 NR_160024 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 135-45 chr14 83765151 83765510 + 0.75 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 1122698 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 223.25-8 chr11 59307858 59308276 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56392 NM_001004729 390195 Hs.553755 NM_001004729 ENSG00000176495 OR5AN1 OR11-244 olfactory receptor family 5 subfamily AN member 1 protein-coding 191.25-2 chr1 99024641 99024997 + 0.75 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) L1MC5|LINE|L1 -19958 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 138.25-142 chr5 155821699 155821927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -504944 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 162.25-94 chr20 1532224 1532702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25242 NM_178460 128646 Hs.729560 NM_178460 ENSG00000125900 SIRPD PTPNS1L2|dJ576H24.4 signal regulatory protein delta protein-coding 196.25-44 chr16 50540104 50540535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8077 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 192.25-112 chr9 97731949 97732291 + 0.75 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) L1ME3|LINE|L1 -34711 NM_000380 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 147.75-139 chr7 6216489 6216754 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu -44484 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 316-5 chr10 81026112 81026615 + 0.75 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger 376566 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 169-36 chr16 84637363 84637757 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -10951 NM_024731 79786 Hs.222731 NM_024731 ENSG00000135686 KLHL36 C16orf44 kelch like family member 36 protein-coding 124-139 chr5 142606813 142607085 + 0.75 NA intron (NM_000800, intron 2 of 3) intron (NM_000800, intron 2 of 3) 14385 NM_001257212 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 154.75-161 chrX 131252654 131253080 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 36194 NM_001170963 3547 Hs.22111 NM_001555 ENSG00000147255 IGSF1 CHTE|IGCD1|IGDC1|INHBP|PGSF2|p120 immunoglobulin superfamily member 1 protein-coding 224.5-119 chrX 54364714 54365235 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6928 NM_001002838 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 137.75-179 chr6 68658986 68659193 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 23807 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 140.75-110 chr20 13181875 13182173 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39250 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 227.5-85 chr5 50860493 50860894 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 109494 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 146-106 chr5 45388548 45388878 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 307667 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 121.75-38 chr13 69629332 69629551 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 407095 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 218.5-123 chr8 133017913 133018529 + 0.75 NA intron (NM_003235, intron 38 of 47) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 28360 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 226.75-23 chr17 54508850 54509196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -391668 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 116.75-176 chr6 152289079 152289387 + 0.75 NA intron (NM_182961, intron 95 of 145) intron (NM_182961, intron 95 of 145) -91297 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 189.5-163 chr9 95338242 95338645 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -20734 NM_001243744 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 198-88 chr9 128817997 128818463 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_004435) promoter-TSS (NM_004435) -270 NM_004435 2021 Hs.745161 NM_004435 ENSG00000167136 ENDOG - endonuclease G protein-coding 162.75-64 chr2 9697172 9697453 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -66315 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 203.5-32 chr11 105668304 105668741 + 0.75 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) L1MA9|LINE|L1 57816 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 136.5-67 chr14 33017357 33017585 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 78592 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 144.25-100 chr2 109151560 109152036 + 0.75 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -10210 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 165-24 chr11 65033943 65034286 + 0.75 NA intron (NM_013306, intron 3 of 7) intron (NM_013306, intron 3 of 7) 6675 NM_147777 29907 Hs.80132 NM_013306 ENSG00000110025 SNX15 HSAF001435 sorting nexin 15 protein-coding 148.75-31 chr11 66190043 66190371 + 0.75 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) MER65C|LTR|ERV1 -67087 NM_001134775 64837 Hs.280792 NM_022822 ENSG00000174996 KLC2 - kinesin light chain 2 protein-coding 137-42 chr12 40905630 40906082 + 0.75 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) -2501 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 179.5-173 chr7 109321590 109321991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -437203 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 117.25-105 chr2 38233078 38233284 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102076 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 152-127 chr5 124803887 124804184 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -58923 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 112.5-200 chr5 146638777 146638985 + 0.75 NA intron (NM_181678, intron 7 of 10) intron (NM_181678, intron 7 of 10) -122768 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 147-123 chr6 83471052 83471298 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -40124 NM_002395 4199 Hs.21160 NM_002395 ENSG00000065833 ME1 HUMNDME|MES malic enzyme 1 protein-coding 124.25-82 chr18 13298895 13299073 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 20879 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 149.5-159 chr5 128145102 128145379 + 0.75 NA intron (NM_001046, intron 10 of 26) intron (NM_001046, intron 10 of 26) 61474 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 189.75-133 chrUn_KI270442v1 110103 110557 + 0.75 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 179.5-33 chr11 40276234 40276535 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 16746 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 204.5-50 chr18 32295227 32295594 + 0.75 NA intron (NM_001242409, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 105371 NM_001308171 4225 Hs.194777 NM_005925 ENSG00000141434 MEP1B - meprin A subunit beta protein-coding 218.75-30 chr19 28736345 28736696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8826 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 177.75-104 chr4 56548403 56548786 + 0.75 NA intron (NM_001256475, intron 1 of 8) intron (NM_001256475, intron 1 of 8) 17988 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 136-33 chr12 60533042 60533382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 843842 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 130-47 chr14 91932403 91932629 + 0.75 NA intron (NM_006329, intron 4 of 10) intron (NM_006329, intron 4 of 10) 15186 NM_006329 10516 Hs.332708 NM_006329 ENSG00000140092 FBLN5 ADCL2|ARCL1A|ARMD3|DANCE|EVEC|FIBL-5|HNARMD|UP50 fibulin 5 protein-coding 120-102 chr20 44500460 44500691 + 0.75 NA intron (NM_006811, intron 9 of 9) intron (NM_006811, intron 9 of 9) 21495 NM_006811 10955 Hs.272168 NM_006811 ENSG00000132824 SERINC3 AIGP1|DIFF33|SBBI99|TDE|TDE1|TMS-1 serine incorporator 3 protein-coding 191.75-46 chr17 42582598 42582882 + 0.75 NA non-coding (NR_026697, exon 7 of 8) non-coding (NR_026697, exon 7 of 8) -4909 NM_001256016 29893 Hs.383019 NM_013290 ENSG00000131470 PSMC3IP GT198|HOP2|HUMGT198A|ODG3|TBPIP PSMC3 interacting protein protein-coding 132.25-112 chr20 44930613 44930857 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_134984) promoter-TSS (NR_134984) -827 NR_134987 80336 Hs.641481 NM_001124756 ENSG00000101104 PABPC1L C20orf119|EPAB|PABPC1L1|dJ1069P2.3 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like protein-coding 129-21 chr10 54072749 54072926 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 18 of 34) intron (NM_001354411, intron 18 of 34) -413393 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 210.75-82 chr5 141529787 141530163 + 0.75 NA intron (NM_005219, intron 19 of 27) AluJb|SINE|Alu -28336 NR_038333 100505658 Hs.655458 NR_038333 ENSG00000246422 LOC100505658 - uncharacterized LOC100505658 ncRNA 137.25-94 chr3 44457248 44457557 + 0.75 NA intron (NM_001369454, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 20268 NM_181489 353274 Hs.250481 NM_181489 ENSG00000185219 ZNF445 ZKSCAN15|ZNF168|ZSCAN47 zinc finger protein 445 protein-coding 200.25-18 chr10 114827373 114827673 + 0.75 NA intron (NM_001135051, intron 1 of 16) AluY|SINE|Alu 5743 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 127.25-30 chr11 41592565 41592839 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -121866 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 131.25-97 chr2 24541047 24541385 + 0.75 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) L2a|LINE|L2 -43261 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 126.5-268 chr9 134902368 134902577 + 0.75 NA TTS (NM_002003) TTS (NM_002003) 15440 NM_002003 2219 Hs.440898 NM_002003 ENSG00000085265 FCN1 FCNM ficolin 1 protein-coding 136.75-134 chr3 152418856 152419102 + 0.75 NA intron (NM_207295, intron 2 of 7) AluY|SINE|Alu -77989 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 278.5-39 chr4 45536487 45537115 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 587253 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 117.75-178 chr5 134600478 134600670 + 0.75 NA TTS (NM_016103) TTS (NM_016103) 32254 NM_016103 51128 Hs.432984 NM_016103 ENSG00000152700 SAR1B ANDD|CMRD|GTBPB|SARA2 secretion associated Ras related GTPase 1B protein-coding 137.5-230 chr8 33168307 33168495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 304745 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 148-124 chr7 95118623 95118925 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 3 of 15) AluJb|SINE|Alu 205758 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 151-18 chr10 84966189 84966602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232510 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 113.25-74 chr18 3203803 3204104 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) L1M4a2|LINE|L1 16015 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 200.75-14 chr10 124758070 124758421 + 0.75 NA 3' UTR (NM_212554, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_212554, exon 7 of 7) -13867 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 177.25-16 chr10 69070091 69070490 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17313 NM_001321053 5552 Hs.1908 NM_002727 ENSG00000122862 SRGN PPG|PRG|PRG1 serglycin protein-coding 119-146 chr5 43614529 43614752 + 0.75 NA intron (NM_012343, intron 3 of 21) intron (NM_012343, intron 3 of 21) -11410 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 157.25-9 chr10 17724040 17724382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27990 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 209.5-116 chr5 30803632 30804127 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -389807 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 174.25-112 chr4 69522418 69522902 + 0.75 NA intron (NM_001297616, intron 1 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 3354 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 123.75-47 chr13 33118630 33118819 + 0.75 NA intron (NM_178007, intron 7 of 13) intron (NM_178007, intron 7 of 13) 67367 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 136.25-114 chr21 37354668 37355031 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10724 NM_001396 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 220.25-31 chr2 64072958 64073315 + 0.75 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -53708 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 173-22 chr11 79498042 79498401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57191 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 144.25-122 chr3 2176419 2176701 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) MER113A|DNA|hAT-Charlie -32319 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 124.75-7 chr1 81882315 81882554 + 0.75 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 79981 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 116.25-157 chr3 190227797 190228071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94512 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 166.75-136 chr7 120574328 120574772 + 0.75 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 283594 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 149.5-178 chr6 109662230 109662592 + 0.75 NA intron (NR_138057, intron 6 of 11) L2c|LINE|L2 28801 NR_138057 221264 Hs.205144 NM_145025 ENSG00000155085 AK9 AK 9|AKD1|AKD2|C6orf199|C6orf224|dJ70A9.1 adenylate kinase 9 protein-coding 140.75-132 chr4 36497077 36497323 + 0.75 NA intron (NR_149124, intron 4 of 4) intron (NR_149124, intron 4 of 4) -70772 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 144.5-33 chr10 88333752 88333991 + 0.75 NA intron (NM_018363, intron 5 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 249447 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 125-159 chr8 92325059 92325306 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -221797 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 147.75-86 chr20 38572182 38572513 + 0.75 NA intron (NM_001282917, intron 28 of 29) MIRc|SINE|MIR -8850 NM_001018082 149685 Hs.368028 NM_174906 ENSG00000182035 ADIG SMAF1 adipogenin protein-coding 198.25-71 chr3 177275335 177275801 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -18874 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 167.5-178 chr7 75629052 75629307 + 0.75 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) intron (NM_005338, intron 1 of 30) -101056 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 222.75-84 chr6 136314464 136315021 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24891 NM_001077440 9774 Hs.486542 NM_014739 ENSG00000029363 BCLAF1 BTF|bK211L9.1 BCL2 associated transcription factor 1 protein-coding 113.25-162 chr7 132412770 132412931 + 0.75 NA intron (NM_001105543, intron 3 of 3) intron (NM_001105543, intron 3 of 3) 151989 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 174.5-47 chr12 41200933 41201321 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 12807 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 145.75-29 chr12 85411946 85412230 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 131868 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 146.25-105 chr3 179207674 179208043 + 0.75 NA intron (NM_006218, intron 6 of 20) intron (NM_006218, intron 6 of 20) 43757 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 155.25-35 chr11 25656221 25656461 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -532782 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 139.5-218 chr8 109205775 109206096 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 119307 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 207-25 chr14 24997106 24997659 + 0.75 NA intron (NM_001351940, intron 1 of 6) intron (NM_001351940, intron 1 of 6) 51618 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 184.25-94 chr4 159568454 159568939 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 209088 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 175.25-47 chr14 68293312 68293774 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 335244 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 122-24 chr10 21793265 21793484 + 0.75 NA intron (NM_022365, intron 9 of 11) L1M2a|LINE|L1 210356 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 158.75-122 chr4 36346093 36346330 + 0.75 NA non-coding (NR_160267, exon 10 of 10) non-coding (NR_160267, exon 10 of 10) 64595 NM_001170700 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 115-153 chr6 21303722 21303914 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 208074 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 177.5-101 chr2 234980159 234980463 + 0.75 NA intron (NM_001371303, intron 1 of 5) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -1063 NM_001371305 128.25-121 chr22 37966848 37967056 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106878) promoter-TSS (NR_106878) -611 NR_106878 102465492 NR_106878 ENSG00000284289 MIR6820 hsa-mir-6820 microRNA 6820 ncRNA 173.25-103 chr5 149053744 149054159 + 0.75 NA intron (NM_024577, intron 1 of 16) L1MA3|LINE|L1 8458 NR_030310 693169 NR_030310 ENSG00000207714 MIR584 MIRN584|hsa-mir-584 microRNA 584 ncRNA 164.5-117 chr20 49961366 49961667 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -21464 NM_005985 6615 Hs.48029 NM_005985 ENSG00000124216 SNAI1 SLUGH2|SNA|SNAH|SNAIL|SNAIL1|dJ710H13.1 snail family transcriptional repressor 1 protein-coding 148-71 chr20 61837241 61837556 + 0.75 NA intron (NM_001252339, intron 3 of 14) intron (NM_001252339, intron 3 of 14) 116264 NR_031658 100302168 NR_031658 ENSG00000284193 MIR1257 MIRN1257|hsa-mir-1257 microRNA 1257 ncRNA 177.5-140 chr5 64403810 64404214 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102003 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 152-87 chr2 72194384 72194797 + 0.75 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46728 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 129.75-66 chr15 26554219 26554409 + 0.75 NA intron (NM_001191320, intron 6 of 6) AluJo|SINE|Alu 74776 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 150.25-98 chr3 53067690 53068036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21790 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 209-54 chr4 86355074 86355465 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001318067) promoter-TSS (NM_001318067) -625 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 174-24 chr13 43095591 43095958 + 0.75 NA intron (NM_013238, intron 5 of 5) intron (NM_013238, intron 5 of 5) -17391 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 133.25-99 chr2 108010087 108010481 + 0.75 NA exon (NM_001305007, exon 9 of 9) exon (NM_001305007, exon 9 of 9) 23760 NM_001305007 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 120.75-119 chr4 31571949 31572138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65499 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 151.25-162 chr6 75820545 75820869 + 0.75 NA intron (NR_160539, intron 3 of 9) intron (NR_160539, intron 3 of 9) 71468 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 205-2 chr1 40663567 40663872 + 0.75 NA intron (NM_014747, intron 1 of 7) intron (NM_014747, intron 1 of 7) 1963 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 233.75-51 chr3 126073659 126074124 + 0.75 NA intron (NM_001008486, intron 1 of 10) L1M4|LINE|L1 10400 NM_001008486 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 181-63 chr20 15272186 15272602 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) intron (NM_001351663, intron 6 of 17) 75554 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 144.5-108 chr2 106751686 106752108 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 134131 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 164.5-12 chr1 155379682 155379943 + 0.75 NA intron (NM_018489, intron 8 of 27) intron (NM_018489, intron 8 of 27) -33367 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 130.75-25 chr11 30563697 30563940 + 0.75 NA intron (NM_001584, intron 1 of 5) intron (NM_001584, intron 1 of 5) 16675 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 152-47 chr13 104402720 104403055 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 977687 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 181.75-44 chr17 11760308 11760785 + 0.75 NA intron (NM_001372, intron 35 of 68) AluSc|SINE|Alu -122356 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 138.75-32 chr11 107643776 107644015 + 0.75 NA intron (NM_001308018, intron 7 of 12) intron (NM_001308018, intron 7 of 12) 52748 NM_018712 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 165.75-69 chr18 39073967 39074313 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 548035 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 136-152 chr8 86668033 86668240 + 0.75 NA exon (NM_019098, exon 5 of 18) exon (NM_019098, exon 5 of 18) 75539 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 235.75-51 chr4 46941085 46941649 + 0.75 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR -32122 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 130.75-65 chr16 53497279 53497541 + 0.75 NA intron (NM_022476, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 5799 NM_022476 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 122.25-145 chr4 185406415 185406783 + 0.75 NA intron (NR_144317, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 9758 NM_181726 353322 Hs.508154 NM_181726 ENSG00000186352 ANKRD37 Lrp2bp ankyrin repeat domain 37 protein-coding 261.25-18 chr2 189910515 189910963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 126289 NM_001321049 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 190.75-40 chr17 44892064 44892600 + 0.75 NA intron (NM_001142605, intron 1 of 26) L3|LINE|CR1 7036 NM_001258353 9343 Hs.151787 NM_004247 ENSG00000108883 EFTUD2 MFDGA|MFDM|SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 protein-coding 185-28 chr16 79368104 79368556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232407 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 118.75-86 chr18 68091210 68091403 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -276484 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 137-182 chr8 128465548 128465775 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 99018 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 157.75-139 chr5 109383944 109384400 + 0.75 NA intron (NM_014819, intron 1 of 9) intron (NM_014819, intron 1 of 9) 25802 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 144.75-9 chr1 169073578 169073973 + 0.75 NA intron (NR_104091, intron 1 of 4) intron (NR_104091, intron 1 of 4) 13230 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 308.25-21 chr3 90416339 90417012 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1309054 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 163.25-148 chr9 14009980 14010338 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 82188 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 133.25-201 chr7 66761762 66762106 + 0.75 NA intron (NM_001367731, intron 3 of 10) AluSx1|SINE|Alu 6052 NM_001287061 27342 Hs.530053 NM_014504 ENSG00000154710 RABGEF1 RABEX5|RAP1|rabex-5 RAB guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 180.25-129 chrX 36273910 36274411 + 0.75 NA intron (NM_001304548, intron 49 of 63) intron (NM_001304548, intron 49 of 63) 166132 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 127.75-70 chr15 80518776 80519083 + 0.75 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L1MCa|LINE|L1 44015 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 117.25-146 chr3 145787940 145788184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 281123 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 164.5-94 chr2 50164203 50164442 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 183432 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 134.75-184 chr6 43474843 43475147 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2528 NM_001146018 93643 Hs.520145 NM_080604 ENSG00000137221 TJAP1 PILT|TJP4 tight junction associated protein 1 protein-coding 152.5-118 chr3 102461769 102462052 + 0.75 NA intron (NM_175056, intron 5 of 10) intron (NM_175056, intron 5 of 10) 26895 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 197.25-43 chr18 47597182 47597488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 216839 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 122-136 chr5 31088243 31088516 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -105307 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 181.25-22 chr12 28702674 28703039 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -446422 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 127-164 chr7 82493966 82494343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50198 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 208-67 chr5 126166247 126166691 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -13108 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 152.25-153 chr8 73567461 73567862 + 0.75 NA intron (NM_001164384, intron 10 of 10) AluSz|SINE|Alu 147587 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-167 chr7 66432394 66432600 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32089 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 122.5-132 chr20 47743639 47744040 + 0.75 NA intron (NM_198596, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 42225 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 147.5-223 chrX 112671922 112672158 + 0.75 NA intron (NM_178175, intron 1 of 3) intron (NM_178175, intron 1 of 3) 7898 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 170.25-111 chr4 73416268 73416603 + 0.75 NA intron (NM_000477, intron 10 of 14) intron (NM_000477, intron 10 of 14) 12148 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 201.5-140 chrX 152451755 152452126 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_000808) promoter-TSS (NM_000808) -625 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 154.25-57 chr15 76060745 76061086 + 0.75 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) intron (NM_152335, intron 1 of 10) 930 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 150.5-40 chr12 76934202 76934606 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -55385 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 161.25-89 chr2 48071701 48071974 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166044 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 150-22 chr11 80932582 80932807 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -169891 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 133-58 chr15 69147982 69148291 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12461 NM_001324091 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 140.75-106 chr2 188252583 188252790 + 0.75 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 35005 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 176.25-109 chr5 42308505 42308825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114774 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 125-156 chr8 80859317 80859626 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 14997 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 118.25-101 chr2 64647551 64647892 + 0.75 NA intron (NM_014755, intron 1 of 1) intron (NM_014755, intron 1 of 1) 6192 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 155.75-48 chr14 39406819 39407111 + 0.75 NA intron (NM_203301, intron 1 of 3) L1MEc|LINE|L1 25535 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 232.25-42 chr22 34542210 34542548 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 455537 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 149.25-175 chr8 48973945 48974199 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52643 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 177.25-123 chr5 159880499 159880949 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -9340 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 124.75-140 chr3 4882734 4882930 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 23669 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 213.75-10 chr1 221498863 221499251 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -162761 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 272.75-42 chr5 76834567 76835140 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005242, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_005242, exon 2 of 2) -15161 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 131.25-169 chr5 124343172 124343459 + 0.75 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 95205 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 182.75-53 chr17 35689816 35690309 + 0.75 NA intron (NM_001030006, intron 18 of 21) L1MEf|LINE|L1 -41577 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 137.75-78 chr15 94394975 94395302 + 0.75 NA intron (NM_018349, intron 13 of 21) intron (NM_018349, intron 13 of 21) 39208 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 134.75-190 chr6 126917864 126918153 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -200663 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 133.75-120 chr21 29968606 29968857 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -28679 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 129.5-80 chr15 83247079 83247387 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 36224 NM_001301206 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 124-57 chr16 47506610 47506849 + 0.75 NA intron (NM_001031835, intron 5 of 31) MER30|DNA|hAT-Charlie 45398 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 123.5-128 chr3 28898154 28898360 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 322979 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 182.5-90 chr2 236668362 236668901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98806 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 176.5-56 chr14 60567600 60568049 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 58678 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 180.25-51 chr2 54104737 54105061 + 0.75 NA intron (NM_001320587, intron 3 of 5) intron (NM_001320587, intron 3 of 5) -10716 NM_001320589 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 206.5-76 chr3 153361753 153362115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122561 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 148.75-149 chr6 162030328 162030543 + 0.75 NA intron (NM_013988, intron 2 of 8) intron (NM_013988, intron 2 of 8) 559458 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 128.5-196 chr6 121858979 121859314 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 423500 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 126.75-249 chr8 123613001 123613272 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 40665 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 139.25-43 chr12 119827185 119827577 + 0.75 NA intron (NM_007174, intron 7 of 46) intron (NM_007174, intron 7 of 46) 49939 NM_007174 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 132.25-8 chr1 82540026 82540311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -363015 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 159.75-155 chr6 115101449 115101889 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 542166 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 193.75-19 chr10 60380831 60381143 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 8888 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 119-71 chr18 6763573 6763794 + 0.75 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) L2b|LINE|L2 -33821 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 181.75-142 chrX 75026784 75027184 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -101532 NM_001008537 340533 Hs.124128 NM_001008537 ENSG00000050030 NEXMIF KIAA2022|KIDLIA|MRX98|XPN neurite extension and migration factor protein-coding 228.25 chr1 18273728 18274121 + 0.75 NA intron (NM_032880, intron 2 of 9) intron (NM_032880, intron 2 of 9) 166126 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 183.5-54 chr17 57057196 57057709 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 11974 NR_002818 376412 Hs.132299 NR_002818 ENSG00000261192 RNF126P1 - ring finger protein 126 pseudogene 1 pseudo 191.25-41 chr17 68302442 68302903 + 0.75 NA intron (NM_001352902, intron 1 of 12) intron (NM_001352902, intron 1 of 12) 10537 NM_001352901 22901 Hs.437249 NM_014960 ENSG00000141337 ARSG USH4 arylsulfatase G protein-coding 139.25-185 chr7 104722959 104723211 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 81007 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 137.75-140 chr3 120941417 120941713 + 0.75 NA intron (NR_145517, intron 2 of 8) intron (NR_145517, intron 2 of 8) 32888 NM_001348344 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 209.5-61 chr2 37065079 37065609 + 0.75 NA intron (NM_019024, intron 9 of 35) AluSz|SINE|Alu 19028 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 136.75-168 chr6 75393529 75393870 + 0.75 NA intron (NR_125859, intron 2 of 8) LTR33A|LTR|ERVL 10513 NR_125859 101928540 Hs.526972 NR_125859 LOC101928540 - uncharacterized LOC101928540 ncRNA 112.5-76 chr14 66650072 66650286 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 142772 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 126-165 chr7 44730999 44731276 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -17429 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 213-27 chr14 46759948 46760441 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -108413 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 198.25-83 chr5 65208099 65208473 + 0.75 NA intron (NR_135689, intron 21 of 25) MER5B|DNA|hAT-Charlie 273634 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 178.5-31 chr11 119036685 119037200 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6036 NM_001164277 2542 Hs.719203 NM_001467 ENSG00000137700 SLC37A4 G6PT1|G6PT2|G6PT3|GSD1b|GSD1c|GSD1d|PRO0685|TRG-19|TRG19 solute carrier family 37 member 4 protein-coding 124-14 chr1 236037987 236038300 + 0.75 NA exon (NM_002508, exon 5 of 20) exon (NM_002508, exon 5 of 20) 26947 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 145.25-48 chr16 54925015 54925319 + 0.75 NA non-coding (NR_034105, exon 2 of 5) non-coding (NR_034105, exon 2 of 5) 3611 NM_001308963 643911 Hs.237396 NM_001308963 CRNDE CRNDEP|LINC00180|NCRNA00180|PNAS-108|lincIRX5 colorectal neoplasia differentially expressed protein-coding 156-100 chr3 19942914 19943184 + 0.75 NA intron (NM_001330688, intron 1 of 14) intron (NM_001330688, intron 1 of 14) 3934 NM_001330688 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 139-114 chr5 46115974 46116223 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -419718 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 152-63 chr17 43747069 43747551 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 11481 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 164.75-154 chr9 70964288 70964645 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -95414 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 148.25-151 chr8 140925448 140925753 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001352701, exon 2 of 36) 5' UTR (NM_001352701, exon 2 of 36) 75404 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 164.25-103 chr3 120272148 120272488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28023 NM_153002 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 197.75-76 chr6 63154424 63154847 + 0.75 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 165342 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 140.25-118 chr3 82607370 82607699 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 621392 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 160-30 chr14 50156740 50156953 + 0.75 NA intron (NM_006939, intron 12 of 22) intron (NM_006939, intron 12 of 22) -40274 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 193.75-130 chr9 116404353 116404710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3925 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 258.75-13 chr11 57979180 57979675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44454 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 124.75-171 chr5 81835761 81836137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84696 NM_001256734 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 196-32 chr15 69050936 69051360 + 0.75 NA intron (NM_024505, intron 14 of 15) L1MEc|LINE|L1 -29702 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 215.75-68 chr4 75483458 75484002 + 0.75 NA intron (NM_015436, intron 8 of 8) intron (NM_015436, intron 8 of 8) 25566 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 125-136 chr5 164961259 164961460 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 491080 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 170-8 chr10 33503239 33503586 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -168507 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 114.25-108 chr2 216821846 216822188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38047 NM_003284 7141 Hs.3017 NM_003284 ENSG00000118245 TNP1 TP1 transition protein 1 protein-coding 127.25-34 chr11 80811390 80811593 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -48688 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 204.25-19 chr11 36847281 36847757 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -249240 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 116.5-38 chr11 115928879 115929084 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -168781 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 163.75-118 chr7 44251010 44251244 + 0.75 NA intron (NM_172081, intron 5 of 18) intron (NM_172081, intron 5 of 18) 50149 NM_001363678 10652 Hs.520794 NM_006555 ENSG00000106636 YKT6 - YKT6 v-SNARE homolog protein-coding 315.5-8 chr18 6624789 6625419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104612 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 132.25-117 chr22 34877494 34877792 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 120273 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 140.5-224 chr8 11268669 11268904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16030 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 139.75-192 chrX 20479808 20480119 + 0.75 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -213054 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 139.75-128 chr3 194443139 194443357 + 0.75 NA intron (NM_001367549, intron 15 of 33) intron (NM_001367549, intron 15 of 33) 24991 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 126.75-122 chr2 197738904 197739104 + 0.75 NA intron (NM_033030, intron 10 of 10) intron (NM_033030, intron 10 of 10) 33635 NM_138395 92935 Hs.744330 NM_138395 ENSG00000247626 MARS2 COXPD25|MetRS|mtMetRS methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 135.5-20 chr10 29835922 29836237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99143 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 207-91 chr8 119902690 119903194 + 0.75 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 29220 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 237.5-8 chr1 207445170 207445597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8917 NM_001006658 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 166.25-148 chr9 74858884 74859174 + 0.75 NA intron (NM_017662, intron 1 of 38) intron (NM_017662, intron 1 of 38) 28318 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 113.25-94 chr2 95332818 95333094 + 0.75 NA intron (NM_013434, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR -13702 NM_001034914 30818 Hs.437376 NM_013434 ENSG00000115041 KCNIP3 CSEN|DREAM|KCHIP3 potassium voltage-gated channel interacting protein 3 protein-coding 180.75-139 chr7 12919257 12919678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 231834 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 143.5 chr1 9441992 9442352 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13176 NR_104622 100506022 Hs.131775 NR_104622 ENSG00000284693 LINC02606 - long intergenic non-protein coding RNA 2606 ncRNA 128.75-122 chr3 86193083 86193289 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -288757 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 126.25-107 chr22 47002977 47003281 + 0.75 NA intron (NM_001284305, intron 10 of 12) MER53|DNA|hAT -87087 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 137.25-2 chr1 77397685 77398067 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) AluJo|SINE|Alu 114789 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 134 chr1 34055306 34055581 + 0.75 NA intron (NM_052896, intron 2 of 69) MER21B|LTR|ERVL 109831 NM_001281956 114784 Hs.656915 NM_052896 ENSG00000121904 CSMD2 dJ1007G16.1|dJ1007G16.2|dJ947L8.1 CUB and Sushi multiple domains 2 protein-coding 161.25-87 chr2 34381458 34381767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -295945 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 150-120 chr5 169333170 169333460 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -32176 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 248-65 chr6 120993281 120993611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 341034 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 253.5-36 chr18 75006055 75006577 + 0.75 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) L1MEd|LINE|L1 199197 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 161-112 chr7 28623253 28623653 + 0.75 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -62680 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 130.75-34 chr11 120666377 120666678 + 0.75 NA intron (NM_001282470, intron 2 of 19) intron (NM_001282470, intron 2 of 19) 102091 NM_001282473 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 198.5-8 chr1 217054097 217054411 + 0.75 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 22738 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 203-47 chr2 28700123 28700482 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35903 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 154.5-146 chr5 32793190 32793568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 82058 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 155-44 chr14 88605308 88605630 + 0.75 NA intron (NR_136936, intron 11 of 15) AluJb|SINE|Alu 11049 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 204.5-144 chrX 143378044 143378403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139252 NM_001009609 139067 Hs.447320 NM_001009609 ENSG00000189252 SPANXN3 CT11.8|SPANX-N3 SPANX family member N3 protein-coding 305.25-5 chr1 208236237 208236862 + 0.75 NA intron (NM_025179, intron 1 of 31) intron (NM_025179, intron 1 of 31) 7835 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 152.25-44 chr12 127146551 127146847 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86302 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 150.5-128 chr3 44429698 44429975 + 0.75 NA TTS (NR_144436) TTS (NR_144436) 1914 NR_144436 100506319 Hs.180744 NR_144436 ENSG00000283036 LINC01988 - long intergenic non-protein coding RNA 1988 ncRNA 155.75-78 chr2 41648596 41648837 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -228839 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 137.75-172 chr5 158239561 158239799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170093 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 180-13 chr10 94746279 94746654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16215 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 259.25-18 chr17 52780164 52780773 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -81653 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 148.75-13 chr1 232900986 232901303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49467 NM_032324 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 213-21 chr11 93677714 93678160 + 0.75 NA intron (NM_033395, intron 6 of 29) intron (NM_033395, intron 6 of 29) 16255 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 171.5-50 chr15 32971739 32972046 + 0.75 NA intron (NM_001277313, intron 7 of 20) intron (NM_001277313, intron 7 of 20) 96282 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 160.75-155 chr8 137785095 137785390 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 298303 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 133.25-158 chr4 122025152 122025454 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -73243 NM_001130698 7222 Hs.150981 NM_003305 ENSG00000138741 TRPC3 SCA41|TRP3 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 protein-coding 126.5-30 chr10 112618606 112618878 + 0.75 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) -15428 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 124.5-57 chr13 113797364 113797785 + 0.75 NA intron (NM_182614, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 -18036 NR_044995 650669 Hs.369201 NM_001039799 GAS6-AS1 - GAS6 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-199 chr7 47157730 47157904 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 306986 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 145.75-92 chr20 52176649 52176905 + 0.75 NA intron (NM_199427, intron 2 of 8) AluYb8|SINE|Alu 15002 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 118-83 chr2 55036964 55037197 + 0.75 NA intron (NM_001321904, intron 2 of 9) L1ME2|LINE|L1 10246 NM_001321863 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 158.75-132 chr4 187749540 187750012 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77135 NR_110436 100506272 Hs.508163 NR_110436 ENSG00000250590 LINC02492 - long intergenic non-protein coding RNA 2492 ncRNA 221.5-13 chr11 111088848 111089395 + 0.75 NA Intergenic (AAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8197 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 193.75-88 chr3 108299314 108299666 + 0.75 NA intron (NM_001370244, intron 1 of 9) intron (NM_001370244, intron 1 of 9) 2942 NM_001370244 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 209-14 chr12 43254179 43254603 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 99076 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 126.75-95 chr18 33649617 33649867 + 0.75 NA intron (NM_030632, intron 4 of 11) L2a|LINE|L2 71523 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 162-40 chr14 65155274 65155550 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -52717 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 132.5-88 chr17 20909661 20909958 + 0.75 NA intron (NR_160710, intron 3 of 4) intron (NR_160710, intron 3 of 4) -11219 NR_160711 440416 Hs.661076 NR_104185 ENSG00000233098 CCDC144NL-AS1 - CCDC144NL antisense RNA 1 ncRNA 120.25-49 chr12 39084780 39085058 + 0.75 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -179328 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 237.5 chr1 34690534 34691114 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -21130 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 181.75-50 chr18 9717618 9718003 + 0.75 NA intron (NM_006868, intron 1 of 6) intron (NM_006868, intron 1 of 6) 9509 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 183.25-106 chr7 90551922 90552289 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -44216 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 158.5-197 chr8 125171511 125171951 + 0.75 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) (ATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 79871 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 190-83 chr8 132203757 132204119 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) -98673 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 233-43 chr3 57464940 57465253 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 17 of 73) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 79248 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 113.75-152 chr5 37882178 37882490 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41896 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 183.25-91 chr6 55636035 55636414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57010 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 141.75-128 chr4 78930109 78930473 + 0.75 NA non-coding (NR_146462, exon 3 of 7) non-coding (NR_146462, exon 3 of 7) 9147 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 130.75-113 chr3 39893001 39893280 + 0.75 NA intron (NM_001284424, intron 1 of 15) intron (NM_001284424, intron 1 of 15) 83480 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 150.5-119 chr20 53449273 53449512 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -103378 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 148.25-123 chr5 73980450 73980921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 167139 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 131-110 chr21 25902749 25903124 + 0.75 NA intron (NM_001204301, intron 14 of 16) intron (NM_001204301, intron 14 of 16) -167282 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 182.5-141 chr6 72549920 72550333 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -71717 NM_001160134 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 138.25-133 chr4 125790143 125790466 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 283045 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 140-138 chr5 96195312 96195498 + 0.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 116267 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 156.5-124 chr4 22505949 22506250 + 0.75 NA intron (NM_145290, intron 1 of 18) intron (NM_145290, intron 1 of 18) -9213 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 187.5-36 chr11 96925686 96926180 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 417508 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 127.25-208 chr8 109349531 109349876 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -12758 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 284.5-51 chr5 137249098 137250076 + 0.75 NA intron (NM_004598, intron 3 of 10) HAL1ME|LINE|L1 121390 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 120-13 chr10 22693543 22693765 + 0.75 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 20454 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 229.25-46 chr2 108813141 108813744 + 0.75 NA intron (NM_144978, intron 9 of 14) intron (NM_144978, intron 9 of 14) 26671 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 130.25-66 chr15 60235474 60235854 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 162322 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 199.75-42 chr2 18176030 18176402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 297549 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 139.75-37 chr12 50111957 50112315 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_032901) promoter-TSS (NM_032901) -100 NM_032901 84987 Hs.388645 NM_032901 ENSG00000178449 COX14 C12orf62|PCAG1 cytochrome c oxidase assembly factor COX14 protein-coding 135.5-210 chr9 12740499 12740800 + 0.75 NA intron (NR_125775, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 -34371 NM_203403 286343 Hs.445356 NM_203403 ENSG00000153714 LURAP1L C9orf150|HYST0841|LRAP35b|bA3L8.2 leucine rich adaptor protein 1 like protein-coding 131.5-82 chr16 35341780 35341961 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -21546 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 126.25-10 chr1 186063786 186063998 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 48 of 106) intron (NM_031935, intron 48 of 106) -232381 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 140.5-106 chr2 44627284 44627525 + 0.75 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L1ME2|LINE|L1 265457 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 128.25-30 chr12 14833042 14833288 + 0.75 NA intron (NM_021071, intron 2 of 2) MER112|DNA|hAT-Charlie 10361 NM_021071 420 Hs.591158 NM_021071 ENSG00000111339 ART4 ARTC4|CD297|DO|DO/ART4|DOK1 ADP-ribosyltransferase 4 (Dombrock blood group) protein-coding 113.5-56 chr12 48197054 48197334 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 6098 NM_001004134 121275 Hs.446790 NM_001004134 ENSG00000172640 OR10AD1 OR10AD1P|OR12-1 olfactory receptor family 10 subfamily AD member 1 protein-coding 130.75-88 chr2 54960802 54961011 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 34 of 40) intron (NM_001039753, intron 34 of 40) 49366 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 144.75-34 chr11 111000674 111000915 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96524 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 186.5-130 chr7 128679844 128680244 + 0.75 NA exon (NM_001128926, exon 4 of 5) exon (NM_001128926, exon 4 of 5) 7752 NM_001290254 346653 Hs.445236 NM_001012454 ENSG00000205085 FAM71F2 FAM137B family with sequence similarity 71 member F2 protein-coding 186-61 chr3 165969491 165969928 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -132286 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 143-123 chr5 134133224 134133535 + 0.75 NA intron (NM_001366502, intron 1 of 7) intron (NM_001366502, intron 1 of 7) 9761 NM_001366502 6932 Hs.573153 NM_003202 ENSG00000081059 TCF7 TCF-1 transcription factor 7 protein-coding 251-58 chr8 88318835 88319378 + 0.75 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 8377 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 176.5-174 chr8 123795152 123795610 + 0.75 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 26942 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 137.75-145 chr3 194381212 194381536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11631 NM_001135057 131578 Hs.288467 NM_130830 ENSG00000172061 LRRC15 LIB leucine rich repeat containing 15 protein-coding 153-37 chr14 33505339 33505660 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -203438 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 135-100 chr22 39939744 39940065 + 0.75 NA intron (NM_001291828, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu -6913 NM_001291825 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 168.75-121 chr6 65441687 65441982 + 0.75 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) MIR3|SINE|MIR 137970 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 177.25-108 chr4 123490572 123491011 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 91251 NM_005841 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 170.25-147 chr8 31716900 31717269 + 0.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 77332 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 124.5-157 chr4 151263527 151263762 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -13529 NM_001353611 345062 Hs.651266 NM_183375 ENSG00000189099 PRSS48 ESSPL serine protease 48 protein-coding 156.25-54 chr17 69567691 69568070 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26107 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 150.25-79 chr2 150095214 150095552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161624 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 157.5-186 chr7 25547534 25547905 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115421 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 139.5-36 chr11 122517702 122518013 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -94986 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 145.25-118 chr4 81484797 81485004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12993 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 147.75-121 chr4 151914341 151914640 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -153467 NM_001363341 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 240-47 chr5 19219531 19220056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 666479 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 175.25-107 chr4 88938261 88938523 + 0.75 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) intron (NM_014883, intron 4 of 23) -115031 NM_001015045 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 242.5-46 chr2 97958917 97959527 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) intron (NM_015348, intron 1 of 40) 36726 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 126.75-87 chr17 666068 666305 + 0.75 NA intron (NM_001366254, intron 4 of 19).2 L2a|LINE|L2 48653 NM_001366254 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 123.25-216 chr9 134948388 134948652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30608 NM_002003 2219 Hs.440898 NM_002003 ENSG00000085265 FCN1 FCNM ficolin 1 protein-coding 153-22 chr11 50722870 50723239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313907 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 244.5-35 chr17 31373513 31373866 + 0.75 NA intron (NM_001042492, intron 57 of 57) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -17986 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 125.75-25 chr10 64210737 64211024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -614648 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 137-129 chr5 18003134 18003525 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 196055 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 141.25-6 chr1 58524165 58524420 + 0.75 NA intron (NM_145243, intron 7 of 8) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 22434 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 159.25-39 chr14 56394805 56395125 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -119366 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 135-13 chr10 44633356 44633572 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -248367 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 156.75-2 chr1 34386187 34386410 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 209391 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 142.75-63 chr14 76461278 76461532 + 0.75 NA intron (NM_004452, intron 4 of 10) intron (NM_004452, intron 4 of 10) 90058 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 261.25-22 chr20 55209626 55210097 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -213182 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 245.5-42 chr20 63170523 63170883 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7797 NR_029670 406909 NR_029670 ENSG00000207598 MIR124-3 MIRN124-3|MIRN124A3|mir-124-3 microRNA 124-3 ncRNA 128.75-144 chr4 79936016 79936259 + 0.75 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 108666 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 147.5-111 chr2 168176358 168176646 + 0.75 NA intron (NM_013233, intron 2 of 17) intron (NM_013233, intron 2 of 17) 71093 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 126.25-38 chr12 9827333 9827673 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_016523) promoter-TSS (NM_016523) 22 NR_159361 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 137-101 chr3 60766602 60766872 + 0.75 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) intron (NR_148921, intron 4 of 4) -148867 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 168-94 chr4 180986282 180986618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172699 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 174.5-54 chr13 39083612 39083964 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 45332 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 300.75-41 chr7 31271723 31272401 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68664 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 131-173 chr8 86433361 86433630 + 0.75 NA intron (NM_007013, intron 14 of 24) FLAM_C|SINE|Alu 75191 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 127-175 chr8 120938265 120938561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126367 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 167.25-64 chr17 61897425 61897796 + 0.75 NA intron (NM_001351695, intron 10 of 24) intron (NM_001351695, intron 10 of 24) 30372 NM_001351695 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 164-62 chr2 214694776 214695068 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 114761 NR_104215 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 193.75-4 chr1 70515465 70515845 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104387 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 260.75-35 chr2 162107236 162107762 + 0.75 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -6942 NR_110255 101929532 Hs.639883 NR_110255 ENSG00000236841 LOC101929532 - uncharacterized LOC101929532 ncRNA 131.25-171 chr5 159585764 159586061 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -119636 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 156.5-167 chr6 144414062 144414400 + 0.75 NA intron (NM_007124, intron 2 of 73) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 8576 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 210.25-75 chr7 147941949 147942301 + 0.75 NA intron (NM_014141, intron 13 of 22) intron (NM_014141, intron 13 of 22) 270446 NR_133929 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 204.75-63 chr2 100997554 100997998 + 0.75 NA TTS (NM_002518) TTS (NM_002518) -4453 NM_001098577 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 151.75-32 chr12 44075918 44076228 + 0.75 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 239992 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 156.75-86 chr2 108224468 108224811 + 0.75 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -6798 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 131.5-236 chr8 119649652 119649932 + 0.75 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) L1MB8|LINE|L1 -10953 NM_001040092 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 219-73 chr3 105880731 105881154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11541 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 132.5-60 chr13 45517086 45517309 + 0.75 NA intron (NM_031431, intron 17 of 22) MER105|DNA|hAT-Charlie 52258 NM_031431 83548 Hs.507948 NM_031431 ENSG00000136152 COG3 SEC34 component of oligomeric golgi complex 3 protein-coding 140.25-160 chr6 36450744 36451075 + 0.75 NA intron (NR_104481, intron 1 of 3) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 7909 NM_001286579 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 200.75-68 chr3 111088085 111088423 + 0.75 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 16438 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 125-84 chr20 6169857 6170218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46493 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 137.5-83 chr16 61680347 61680662 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) L2b|LINE|L2 355934 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 195.5-138 chr6 119288847 119289232 + 0.75 NA intron (NM_005907, intron 5 of 12) intron (NM_005907, intron 5 of 12) 60722 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 165.25-29 chr11 109623440 109623698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 201379 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 222-71 chr6 56077260 56077620 + 0.75 NA intron (NM_030820, intron 18 of 29) intron (NM_030820, intron 18 of 29) 14222 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 190-75 chr7 111377611 111378138 + 0.75 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 184417 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 121.75-88 chr2 146059008 146059230 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -527938 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 124.25-68 chr16 13270947 13271139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 369445 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 127.5-6 chr1 34118056 34118285 + 0.75 NA intron (NM_052896, intron 1 of 69) AluSx1|SINE|Alu 47104 NM_001281956 114784 Hs.656915 NM_052896 ENSG00000121904 CSMD2 dJ1007G16.1|dJ1007G16.2|dJ947L8.1 CUB and Sushi multiple domains 2 protein-coding 218.25-28 chr14 60432309 60432680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53569 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 184.75-95 chr7 52538511 52538861 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -496947 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 240-13 chr11 23017745 23018288 + 0.75 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -157542 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 157.75-60 chr16 78876236 78876512 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 724363 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 159.5-39 chr11 113876700 113877078 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1317 NM_001346254 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 143.5-118 chr2 116738210 116738460 + 0.75 NA Intergenic MERX|DNA|TcMar-Tigger -1076356 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 171-58 chr18 937644 937889 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9773 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 172.25-99 chr4 55885557 55885868 + 0.75 NA intron (NM_178237, intron 10 of 17) intron (NM_178237, intron 10 of 17) 32062 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 186.5-102 chr4 118978835 118979170 + 0.75 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 90148 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 294-21 chr2 180615610 180616085 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76257 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 125.75-26 chr10 87636068 87636256 + 0.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -23716 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 132.25-77 chr17 60682597 60682857 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 2 of 25) AluSz|SINE|Alu 4876 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 140-85 chr20 10512380 10512625 + 0.75 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) AluJr4|SINE|Alu 77197 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 165-25 chr11 80299394 80299723 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 463245 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 117.25-197 chr7 30304962 30305232 + 0.75 NA intron (NM_147128, intron 1 of 4) MER63B|DNA|hAT-Blackjack -15207 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 264.25-25 chr2 14025003 14025407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 375753 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 215.25-23 chr12 71052225 71052698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105348 NM_001369760 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 118.25-9 chr1 73233172 73233443 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72863 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 190.75-65 chr3 106722010 106722551 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 518358 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 150.5-13 chr1 246756673 246756931 + 0.75 NA intron (NM_016002, intron 5 of 11) intron (NM_016002, intron 5 of 11) 32393 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 119.5-62 chr12 39133896 39134202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -228458 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 146.75-8 chr1 165849728 165850052 + 0.75 NA intron (NM_012474, intron 1 of 6) intron (NM_012474, intron 1 of 6) 22276 NM_001363568 7371 Hs.458360 NM_012474 ENSG00000143179 UCK2 TSA903|UK|UMPK uridine-cytidine kinase 2 protein-coding 174.5-179 chr7 125954513 125954926 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -690428 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 230.5-57 chr18 14099305 14099704 + 0.75 NA TTS (NM_145287) TTS (NM_145287) 32931 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 176.75-141 chrX 75543299 75543591 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -19943 NM_001146256 158866 Hs.253211 NM_144969 ENSG00000102383 ZDHHC15 DHHC15|MRX91 zinc finger DHHC-type containing 15 protein-coding 175.25-96 chr3 87826182 87826535 + 0.75 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) 33652 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 130.75-84 chr2 7302956 7303287 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -118140 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 133.25-186 chr6 68222265 68222463 + 0.75 NA Intergenic (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 107535 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 125-6 chr1 80774326 80774552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133152 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 136.25-105 chr20 1373624 1373844 + 0.75 NA intron (NR_040049, intron 2 of 2) intron (NR_040049, intron 2 of 2) 19227 NR_106929 102465524 NR_106929 ENSG00000284436 MIR6869 hsa-mir-6869 microRNA 6869 ncRNA 174.25-128 chr6 137505216 137505495 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -10961 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 185-50 chr22 29924067 29924526 + 0.75 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) L1M3|LINE|L1 41122 NM_153051 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 144.5-126 chr22 30712630 30712931 + 0.75 NA intron (NM_030758, intron 1 of 13) intron (NM_030758, intron 1 of 13) 17906 NM_001282739 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 178.25-69 chr2 228611156 228611497 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_151716) promoter-TSS (NR_151716) 69 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 115.25-10 chr1 75776121 75776461 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -9903 NR_073562 5876 Hs.78948 NM_004582 ENSG00000137955 RABGGTB GGTB Rab geranylgeranyltransferase subunit beta protein-coding 150-154 chrX 114927932 114928201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 89550 NM_000640 3598 Hs.336046 NM_000640 ENSG00000123496 IL13RA2 CD213A2|CT19|IL-13R|IL13BP interleukin 13 receptor subunit alpha 2 protein-coding 151-39 chr15 77741516 77741839 + 0.75 NA intron (NM_001301186, intron 2 of 5) intron (NM_001301186, intron 2 of 5) -20926 NM_001301197 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 144.75-186 chr8 121815096 121815510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173863 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 125-16 chr1 226679100 226679285 + 0.75 NA intron (NM_002221, intron 2 of 7) intron (NM_002221, intron 2 of 7) -4124 NR_103784 100506443 Hs.664293 NR_103784 ITPKB-IT1 - ITPKB intronic transcript 1 ncRNA 140.75-117 chr21 16740311 16740585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150211 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 154.75-114 chr5 74148179 74148389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 160041 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 150.75-96 chr2 80438140 80438416 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 124899 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 192.25-40 chr19 39569230 39569725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29316 NM_153232 163126 Hs.18949 NM_153232 ENSG00000176396 EID2 CRI2|EID-2 EP300 interacting inhibitor of differentiation 2 protein-coding 207-29 chr14 102515273 102515672 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5696 NM_001348651 122416 Hs.432945 NM_152326 ENSG00000156381 ANKRD9 - ankyrin repeat domain 9 protein-coding 131.25-221 chr9 124457997 124458363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42738 NM_002799 5695 Hs.213470 NM_002799 ENSG00000136930 PSMB7 Z proteasome subunit beta 7 protein-coding 127.75-148 chr4 95004167 95004477 + 0.75 NA intron (NM_001256792, intron 1 of 10) intron (NM_001256792, intron 1 of 10) 8090 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 121.5-157 chr20 50776947 50777157 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17842 NM_017843 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 177.5-135 chr5 24197585 24197901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 246395 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 125.75-156 chr5 60854336 60854625 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -10206 NM_001104558 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 126.25-216 chr8 136504912 136505204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25740 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 134.75-191 chr6 156447871 156448127 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 69249 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 115-170 chr7 53360304 53360550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 324794 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 261-66 chr8 126111106 126111733 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160222 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 165-78 chr20 32046548 32046916 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5510 NM_001172132 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 171.5-3 chr1 78561133 78561445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59159 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 128.25-214 chr8 139029049 139029318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115142 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 235.25-49 chr4 87593240 87593675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15072 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 199-26 chr15 59499339 59499666 + 0.75 NA intron (NM_152450, intron 4 of 8) L1MB7|LINE|L1 61316 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 170.25-144 chr7 45534846 45535092 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -39171 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 242.75-72 chr8 124337515 124337873 + 0.75 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) intron (NM_194291, intron 1 of 6) 35005 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 199-75 chr6 85437047 85437677 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -12222 NM_001204813 4907 Hs.153952 NM_002526 ENSG00000135318 NT5E CALJA|CD73|E5NT|NT|NT5|NTE|eN|eNT 5'-nucleotidase ecto protein-coding 188.5-137 chr7 11238071 11238448 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 264387 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 167.25-9 chr1 173539149 173539438 + 0.75 NA intron (NM_178527, intron 13 of 27) L2b|LINE|L2 61958 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 228.25-88 chr9 28616938 28617460 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 102106 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 133-41 chr13 111958187 111958485 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13974 NR_120392 100505996 Hs.654853 NR_120392 ENSG00000224243 SOX1-OT LINC00403 SOX1 overlapping transcript ncRNA 125.25-149 chr4 156160887 156161071 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -207113 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 213.5-24 chr11 61583659 61584016 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2761 NM_001370211 9066 Hs.131188 NM_004200 ENSG00000011347 SYT7 IPCA-7|IPCA7|PCANAP7|SYT-VII|SYTVII synaptotagmin 7 protein-coding 118.75-139 chr4 97466285 97466469 + 0.75 NA intron (NR_102713, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 99451 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 145-76 chr2 116657450 116657832 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -1157050 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 113-97 chr2 159392221 159392431 + 0.75 NA intron (NM_001329858, intron 20 of 36) L2c|LINE|L2 -105623 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 221.75-48 chr4 79486993 79487389 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -5402 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 112.25-103 chr2 158827059 158827333 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 31879 NM_001017920 92196 Hs.59761 NM_001017920 ENSG00000163331 DAPL1 - death associated protein like 1 protein-coding 117-78 chr19 28193680 28193952 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -399876 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 122.25-144 chr4 138464505 138464799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 154941 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 201-9 chr1 214793166 214793608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190192 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 123.75-77 chr17 66039644 66039830 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 12 of 26) L1ME3|LINE|L1 152155 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 148-2 chr1 36066492 36066734 + 0.75 NA 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) -17481 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 254-22 chr2 54979615 54980109 + 0.75 NA intron (NM_020532, intron 5 of 8) intron (NM_020532, intron 5 of 8) 30410 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 173.5-174 chr9 77876035 77876342 + 0.75 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) 155623 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 125.5-207 chr5 127363963 127364178 + 0.75 NA intron (NM_001308121, intron 4 of 13) intron (NM_001308121, intron 4 of 13) 73274 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 179.75-99 chr5 43499694 43500072 + 0.75 NA intron (NM_198566, intron 6 of 12) L1ME3G|LINE|L1 15265 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 166.25-9 chr1 83073317 83073693 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) intron (NR_147074, intron 5 of 10) -87297 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 114.25-198 chr8 136882363 136882619 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 351693 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 248.5-30 chr15 62213875 62214387 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10813 NR_148210 107984784 Hs.591131 NR_148210 ENSG00000259697 LOC107984784 - uncharacterized LOC107984784 ncRNA 179.75-85 chr4 63255872 63256189 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -1094265 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 154.25-49 chr14 72795690 72796068 + 0.75 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 96770 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 236-27 chr2 8195193 8195712 + 0.75 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) 132967 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 130.25-45 chr12 19670825 19671058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 230342 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 145-169 chr9 103262468 103262814 + 0.75 NA intron (NR_121578, intron 6 of 9) intron (NR_121578, intron 6 of 9) 62392 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 143.75-87 chr2 56551114 56551317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -365445 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 310-19 chr4 151004084 151004672 + 0.75 NA intron (NM_001367550, intron 2 of 56) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 10889 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 157.75-56 chr15 78515980 78516230 + 0.75 NA intron (NM_001083612, intron 3 of 4) intron (NM_001083612, intron 3 of 4) 8528 NM_001013619 123688 Hs.307962 NM_001013619 ENSG00000188266 HYKK AGPHD1 hydroxylysine kinase protein-coding 119.75-106 chr2 79264064 79264414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104486 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 149.25-111 chr3 1046948 1047202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45949 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 239.75-12 chr11 48540916 48541497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52413 NM_001005512 403253 Hs.554532 NM_001005512 ENSG00000237388 OR4A47 OR11-113 olfactory receptor family 4 subfamily A member 47 protein-coding 251.75-26 chr14 73325585 73326121 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) L1MD2|LINE|L1 -79852 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 116-161 chr8 3161839 3162124 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 38 of 69) intron (NM_033225, intron 38 of 69) -433530 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 187.75-103 chr6 122682099 122682402 + 0.75 NA intron (NM_181795, intron 3 of 4) intron (NM_181795, intron 3 of 4) 29521 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 153.75-80 chr21 23058984 23059262 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -20161 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 153.25-42 chr14 91891869 91892223 + 0.75 NA intron (NM_006329, intron 5 of 10) intron (NM_006329, intron 5 of 10) -24510 NM_001128596 123036 Hs.510262 NM_152332 ENSG00000165929 TC2N C14orf47|C2CD1|MTAC2D1|Tac2-N tandem C2 domains, nuclear protein-coding 230.5-72 chr20 43250312 43250661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60580 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 183.75-6 chr1 147388211 147388669 + 0.75 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L1PA10|LINE|L1 129435 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 210.25-53 chr3 112061170 112061704 + 0.75 NA intron (NR_026734, intron 9 of 16) intron (NR_026734, intron 9 of 16) 18459 NM_001366279 344805 Hs.435490 NM_001042575 ENSG00000176040 TMPRSS7 - transmembrane serine protease 7 protein-coding 114-72 chr2 64918571 64918878 + 0.75 NA intron (NR_036586, intron 1 of 2) MER5A|DNA|hAT-Charlie 13723 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 113.5-43 chr10 123216119 123216402 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 61858 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 203.5-10 chr1 151149973 151150532 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3621 NM_001178062 10500 Hs.516316 NM_030913 ENSG00000143434 SEMA6C SEMAY|m-SemaY|m-SemaY2 semaphorin 6C protein-coding 167.5-140 chr5 29503582 29504097 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -107863 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 159-7 chr1 240890535 240890771 + 0.75 NA intron (NM_001282773, intron 4 of 15) MIR|SINE|MIR -241619 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 136.25-97 chr2 159952197 159952439 + 0.75 NA intron (NM_001007267, intron 23 of 26) intron (NM_001007267, intron 23 of 26) -47562 NM_001198759 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 242-63 chr8 85458734 85459202 + 0.75 NA intron (NR_121633, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 4086 NR_121632 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 128.5-198 chr6 132371641 132372028 + 0.75 NA intron (NM_015529, intron 4 of 11) intron (NM_015529, intron 4 of 11) 29641 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 153.5-57 chr14 58907669 58907914 + 0.75 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) L1PB4|LINE|L1 79503 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 115-7 chr1 83951527 83951814 + 0.75 NA intron (NM_001350215, intron 2 of 19) intron (NM_001350215, intron 2 of 19) 47462 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 128.75-131 chr3 186692409 186692595 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24857 NM_001102416 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 153.25-48 chr15 93699436 93699870 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -156907 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 128.5-76 chr15 91250120 91250349 + 0.75 NA intron (NM_001323033, intron 2 of 10) L1M3|LINE|L1 148438 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 158.75-161 chr8 100186679 100187108 + 0.75 NA intron (NM_003114, intron 7 of 18) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 28558 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 168.75-69 chr2 37866894 37867212 + 0.75 NA intron (NR_110012, intron 1 of 3) intron (NR_110012, intron 1 of 3) 8810 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 151.25-131 chr3 178722943 178723211 + 0.75 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) L1PA17|LINE|L1 137328 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 151-68 chr2 226260015 226260288 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117357 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 168.25-31 chr12 38418130 38418610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101596 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 151.5-97 chr20 31187290 31187594 + 0.75 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -70222 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 128.75-139 chr4 55998757 55999123 + 0.75 NA intron (NM_025009, intron 15 of 25) intron (NM_025009, intron 15 of 25) 49995 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 139.25-13 chr10 20952614 20952987 + 0.75 NA intron (NM_001173484, intron 4 of 6) AluSz6|SINE|Alu -55198 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 140.75-128 chr3 185482290 185482490 + 0.75 NA exon (NM_001242314, exon 15 of 15) exon (NM_001242314, exon 15 of 15) 16645 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 142.5-205 chr7 38466147 38466422 + 0.75 NA intron (NM_001635, intron 7 of 20) intron (NM_001635, intron 7 of 20) 124707 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 130.5-169 chr3 106913781 106913971 + 0.75 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR 326762 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 137.75-119 chr20 57620675 57620989 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_030776) promoter-TSS (NM_030776) -406 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 129-17 chr10 26704504 26704770 + 0.75 NA intron (NM_001321978, intron 2 of 9) intron (NM_001321978, intron 2 of 9) 6936 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 127.25-165 chr5 36781870 36782141 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 94689 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 206.75-36 chr2 76050298 76050635 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -339551 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 182.5-144 chr6 103534091 103534511 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 1325245 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 233.75-74 chr7 9910791 9911379 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 276815 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 134.75-43 chr11 90463633 90463871 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 92105 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 150-76 chr2 146050841 146051113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -536080 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 134.75-117 chr2 161802499 161802736 + 0.75 NA intron (NM_001354453, intron 2 of 24) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 178201 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 147.5-85 chr18 3783102 3783345 + 0.75 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) L1MB7|LINE|L1 62135 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 155.25-124 chr3 175092548 175092831 + 0.75 NA intron (NR_046390, intron 2 of 3) intron (NR_046390, intron 2 of 3) 22553 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 112.5-6 chr1 91652547 91652928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 151629 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 138-3 chr1 202792220 202792485 + 0.75 NA intron (NM_001314042, intron 1 of 27) MER5A|DNA|hAT-Charlie 17118 NM_001347591 10765 Hs.18891 NM_006618 ENSG00000117139 KDM5B CT31|JARID1B|MRT65|PLU-1|PLU1|PPP1R98|PUT1|RBBP2H1A|RBP2-H1 lysine demethylase 5B protein-coding 144.5-183 chr5 143608001 143608363 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -71678 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 128.5-44 chr11 86783461 86783789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7446 NM_001293180 11098 Hs.25338 NM_007173 ENSG00000150687 PRSS23 SIG13|SPUVE|ZSIG13 serine protease 23 protein-coding 169.25-36 chr15 91645159 91645516 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 181998 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 125.25-144 chr4 60121093 60121295 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -801425 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 168-130 chr8 139507485 139507882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 195440 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 185.5-114 chr4 19986627 19986924 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -265130 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 276-10 chr10 123590376 123591001 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -75667 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 222-25 chr14 71381692 71382189 + 0.75 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -16397 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 179.75-87 chr4 73260281 73260668 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1676 NM_032217 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 174.5-134 chr4 61243974 61244273 + 0.75 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 41951 NM_001371342 208.75-88 chr8 144854636 144855088 + 0.75 NA Intergenic LTR2C|LTR|ERV1 -1306 NM_001081003 28991 Hs.493218 NM_014066 ENSG00000170619 COMMD5 HCARG|HT002 COMM domain containing 5 protein-coding 175-37 chr14 61696293 61696751 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_047116) promoter-TSS (NR_047116) -699 NR_047116 100750246 Hs.713476 NR_047116 ENSG00000258777 HIF1A-AS1 5'aHIF-1A|5'aHIF1alpha HIF1A antisense RNA 1 ncRNA 219.5-122 chr7 36520019 36520595 + 0.75 NA intron (NM_001177506, intron 20 of 21) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 79813 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 134.25-92 chr2 188275090 188275520 + 0.75 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 12386 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 141.25-116 chr3 172804818 172805068 + 0.75 NA intron (NM_001349095, intron 20 of 25) intron (NM_001349095, intron 20 of 25) 53941 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 250-30 chr2 189318879 189319410 + 0.75 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -122289 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 183.75-116 chr7 18383192 18383666 + 0.75 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) MER117|DNA|hAT-Charlie 93337 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 167.5-124 chr4 78013851 78014256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43270 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 279.5-5 chr1 185434408 185434875 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -99602 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 123.25-108 chr2 143062315 143062574 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66975 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 143-6 chr1 178376100 178376457 + 0.75 NA intron (NM_004841, intron 1 of 15) L2|LINE|L2 34827 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 118.5-147 chr4 61536304 61536544 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) L1PA17|LINE|L1 334252 NM_001371342 235.75-17 chr11 100524092 100524471 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -163007 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 138.25-134 chr4 132847242 132847479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 256271 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 200.5-94 chr3 169902514 169902936 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8847 NM_182610 344658 Hs.439922 NM_182610 ENSG00000187033 SAMD7 - sterile alpha motif domain containing 7 protein-coding 170.75-121 chr6 149000154 149000538 + 0.75 NA intron (NM_005715, intron 5 of 7) L1MEi|LINE|L1 32315 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 129.5-180 chr5 34921117 34921393 + 0.75 NA intron (NM_018321, intron 3 of 9) intron (NM_018321, intron 3 of 9) 5544 NM_018321 55299 Hs.718510 NM_018321 ENSG00000113460 BRIX1 BRIX|BXDC2 biogenesis of ribosomes BRX1 protein-coding 202-28 chr17_GL000205v2_random 42953 43244 + 0.75 NA Intergenic HERVL66-int|LTR|ERVL 14868 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 282.75-35 chr5 99230881 99231527 + 0.75 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -301490 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 197-25 chr17 12941901 12942268 + 0.75 NA intron (NM_001321164, intron 8 of 20) intron (NM_001321164, intron 8 of 20) -24742 NR_039747 100616494 NR_039747 ENSG00000265503 MIR1269B - microRNA 1269b ncRNA 149.25-128 chr4 39386894 39387184 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -19891 NM_175737 152831 Hs.90756 NM_175737 ENSG00000134962 KLB BKL klotho beta protein-coding 144.5-132 chr3 84316780 84317226 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 552572 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 135.5-105 chr2 103281590 103281851 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -297291 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 127-29 chr11 42815159 42815412 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 454084 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 166.5-130 chr3 40225034 40225418 + 0.75 NA intron (NM_001284424, intron 11 of 15) intron (NM_001284424, intron 11 of 15) 84472 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 142.75-118 chr21 27767151 27767484 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 44938 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 158.75-114 chr3 95336155 95336439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 346896 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 186.75-33 chr14 62559282 62559704 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -419520 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 208.25-16 chr10 79433202 79433604 + 0.75 NA intron (NM_153367, intron 1 of 3) intron (NM_153367, intron 1 of 3) 12221 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 164.5-221 chr9 71858593 71858944 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52477 NM_016014 51104 Hs.380389 NM_016014 ENSG00000107362 ABHD17B C9orf77|CGI-67|FAM108B1 abhydrolase domain containing 17B protein-coding 145.25-158 chr7 35631295 35631708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63634 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 147.5-193 chr7 25802166 25802578 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -12253 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 123.5-41 chr11 74416444 74416654 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 17312 NR_039710 100616215 NR_039710 ENSG00000264402 MIR548AL - microRNA 548al ncRNA 137.75-9 chr1 168866652 168866905 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 79837 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 152-69 chr17 68821551 68821878 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 133678 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 118-72 chr18 8836881 8837214 + 0.75 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 119666 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 368.5-12 chr4 62337202 62338071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175871 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-171 chr4 59427547 59427780 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 414090 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 184.5-61 chr17 80325246 80325530 + 0.75 NA intron (NM_001256071, intron 18 of 67) intron (NM_001256071, intron 18 of 67) 64536 NM_001256071 57674 Hs.195642 NM_020914 ENSG00000173821 RNF213 ALO17|C17orf27|KIAA1618|MYMY2|MYSTR|NET57 ring finger protein 213 protein-coding 123-180 chr8 24322957 24323220 + 0.75 NA intron (NR_130710, intron 8 of 22) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 29019 NR_130710 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 114.5-12 chr1 114857582 114857916 + 0.75 NA intron (NM_001282542, intron 5 of 30) intron (NM_001282542, intron 5 of 30) 2886 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 153.75-107 chr4 103740305 103740709 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -20522 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 170-23 chr12 72017704 72018005 + 0.75 NA intron (NM_173353, intron 8 of 10) intron (NM_173353, intron 8 of 10) 79009 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 133.5-63 chr12 43210464 43210775 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55304 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 196.75-14 chr10 59228484 59228858 + 0.75 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) intron (NM_001143774, intron 1 of 4) 51204 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 123.25-185 chr7 34651141 34651332 + 0.75 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) intron (NR_033664, intron 2 of 4) -6982 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 132-65 chr16 69761890 69762204 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_007014) promoter-TSS (NM_007014) -285 NM_001270455 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 187.5-7 chr1 91120458 91120985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98466 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 130.75-45 chr12 118875138 118875451 + 0.75 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -41758 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 182.25-33 chr13 80974455 80974801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43763 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 142.5-165 chr5 30192106 30192422 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 311704 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 168.5-125 chr4 17987200 17987581 + 0.75 NA intron (NR_158566, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 34365 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 143-3 chr1 95872959 95873274 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -118952 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 189.5-107 chr5 59237787 59238040 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 38202 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 200.25-99 chr7 26681559 26681964 + 0.75 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) intron (NM_003930, intron 11 of 12) 43890 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 138.25-181 chrX 56126062 56126254 + 0.75 NA intron (NM_001324104, intron 2 of 6) intron (NM_001324104, intron 2 of 6) -106198 NM_007250 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 139-115 chr5 52198455 52198649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190521 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 133.5-227 chr6 39042558 39042795 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6105 NR_136562 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 164.25-39 chr14 62918977 62919351 + 0.75 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) L1ME4a|LINE|L1 126294 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 154.25-184 chr9 75573456 75573688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -317072 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 151.25-56 chr14 60030460 60030671 + 0.75 NA intron (NR_075071, intron 28 of 32) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -61346 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 131.5-200 chr6 39707500 39707722 + 0.75 NA intron (NM_001351503, intron 3 of 3) L1MD2|LINE|L1 17797 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 129.5-86 chr16 4709381 4709668 + 0.75 NA intron (NR_040252, intron 6 of 16) L1MA6|LINE|L1 15806 NM_001370587 84309 Hs.513315 NM_032349 ENSG00000168101 NUDT16L1 SDOS|TIRR nudix hydrolase 16 like 1 protein-coding 118.25-81 chr17 27380446 27380661 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -37452 NR_033892 440419 Hs.385755 NR_033892 ENSG00000266433 TBC1D3P5 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 5 pseudo 131-171 chr8 71166071 71166406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190468 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 125.25-208 chr8 113590314 113590535 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -153485 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 139.5-144 chr4 29664095 29664327 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 449919 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 114.5-150 chr2 189146466 189146759 + 0.75 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) CR1_Mam|LINE|CR1 -13501 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 194.5-12 chr1 234317952 234318262 + 0.75 NA intron (NM_173508, intron 5 of 7) intron (NM_173508, intron 5 of 7) 11640 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 210.25-48 chr20 6788202 6788554 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20692 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 135.5-202 chr8 106514222 106514604 + 0.75 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 66489 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 128.5-6 chr1 28800126 28800389 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11913 NM_000911 4985 Hs.372 NM_000911 ENSG00000116329 OPRD1 DOP|DOR|DOR1|OPRD opioid receptor delta 1 protein-coding 197.25-35 chr17 29766691 29767017 + 0.75 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) intron (NM_033389, intron 2 of 14) -5422 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 141.75-179 chrX 47505709 47505963 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -22567 NM_001324148 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 211.25-21 chr13 112735467 112736069 + 0.75 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 18963 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 222.25 chr1 43006998 43007366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48133 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 153.25-16 chr10 58341516 58341774 + 0.75 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) intron (NM_003338, intron 1 of 6) 6639 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 112.5-209 chr6 54861046 54861234 + 0.75 NA intron (NM_001010872, intron 1 of 4) intron (NM_001010872, intron 1 of 4) 14369 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 186.25-39 chr16 4066252 4066560 + 0.75 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) AluJb|SINE|Alu 50036 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 130.5-170 chr3 109193215 109193531 + 0.75 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 15208 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 191.75-107 chr6 19700976 19701413 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 103565 NR_134650 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 122.5-89 chr18 3115082 3115283 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 20 of 36) intron (NM_019856, intron 20 of 36) -103235 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 136.5-90 chr17 49592921 49593264 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17221 NM_007225 11248 Hs.55069 NM_007225 ENSG00000182575 NXPH3 NPH3 neurexophilin 3 protein-coding 194.5-170 chrX 100067250 100067770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 342763 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 125.5-87 chr15 23839248 23839692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135677 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 118.75-4 chr1 43645948 43646184 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4083 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 133.25-154 chr4 103755730 103756162 + 0.75 NA Intergenic Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -35961 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 226-7 chr11 5840396 5840966 + 0.75 NA TTS (NM_001005167) TTS (NM_001005167) 1216 NM_001005167 390078 NM_001005167 ENSG00000205409 OR52E6 OR11-58 olfactory receptor family 52 subfamily E member 6 protein-coding 135.75-122 chr20 49634983 49635253 + 0.75 NA 3' UTR (NM_004776, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_004776, exon 9 of 9) -66981 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 221.25-39 chr2 108123223 108123610 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -70661 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 161.25-175 chr8 119927675 119928124 + 0.75 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 54177 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 129.5-189 chr5 112609347 112609639 + 0.75 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -18943 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 162.25-65 chr16 81482020 81482262 + 0.75 NA intron (NM_198390, intron 1 of 20) AluSz|SINE|Alu -13213 NM_030629 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 116.25-96 chr19 27356241 27356457 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -437082 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 228.75-75 chr7 111480871 111481302 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001350964, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001350964, exon 5 of 5) 81205 NM_001350960 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 167-65 chr2 168442712 168442997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13418 NM_001256126 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 211.25-76 chr5 107374655 107375025 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296097 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 140-33 chr12 99939469 99939831 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 1 of 25) intron (NM_152788, intron 1 of 25) 45004 NM_001352186 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 167.25-113 chr3 190803093 190803359 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59468 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 115.25-144 chr4 51834713 51835013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8137 NM_015115 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 277.75-15 chr2 102424260 102424777 + 0.75 NA intron (NM_003853, intron 5 of 11) intron (NM_003853, intron 5 of 11) 5728 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 142-20 chr10 80594350 80594616 + 0.75 NA intron (NM_207372, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 53664 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 156.75-69 chr17 61902702 61902988 + 0.75 NA intron (NM_001351695, intron 9 of 24) AluJr4|SINE|Alu 25137 NM_001351695 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 210-103 chr9 80528349 80528722 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 553512 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 158.5-148 chr4 170216403 170216659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10060 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 248.75-28 chr18 45189122 45189602 + 0.75 NA intron (NM_001371319, intron 2 of 23) MIRc|SINE|MIR 21399 NM_001371319 136-163 chr9 2694037 2694271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23356 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 123-102 chr2 69832265 69832489 + 0.75 NA intron (NM_178439, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 2717 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 124.5-8 chr1 43514053 43514292 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11865 NM_001329137 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 165-34 chr13 69970582 69970871 + 0.75 NA intron (NM_001286725, intron 1 of 9) intron (NM_001286725, intron 1 of 9) -136487 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 115.75-74 chr15 61922040 61922294 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 54 of 81) intron (NM_001018088, intron 54 of 81) 138280 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 209.5-3 chr1 72048624 72048989 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -211794 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 238.25-11 chr11 25739346 25739732 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -449584 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 178.5-6 chr1 186620952 186621441 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 59227 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 153.5-185 chr7 82998454 82998696 + 0.75 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) L1MCa|LINE|L1 164309 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 195.5-47 chr16 3593480 3593791 + 0.75 NA intron (NM_032444, intron 10 of 14) intron (NM_032444, intron 10 of 14) -16232 NM_178844 197358 Hs.592091 NM_178844 ENSG00000167984 NLRC3 CLR16.2|NOD3 NLR family CARD domain containing 3 protein-coding 272.5-68 chr7 144438488 144439052 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28543 NM_001080413 135935 Hs.558628 NM_001080413 ENSG00000106410 NOBOX OG-2|OG2|OG2X|POF5|TCAG_12042 NOBOX oogenesis homeobox protein-coding 116-31 chr11 119927867 119928059 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 198380 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 135.5-112 chr2 146187724 146188007 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -399192 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 174.75-120 chr7 109270865 109271265 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -386478 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 173-109 chr5 68511033 68511344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 218611 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 135-179 chr8 52875526 52875902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64194 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 131.25-10 chr1 95530893 95531312 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20986 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 207-17 chr11 109912179 109912687 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -180959 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 119-188 chr7 84740484 84740803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 208167 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 230-73 chr8 135812906 135813401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 355697 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 165.75-84 chr2 126078487 126078869 + 0.75 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 39307 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 126.75-41 chr12 97002831 97003214 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 95556 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 180.5-63 chr18 4715302 4715587 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260137 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 152.5-189 chr8 84479608 84479831 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 64235 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 127-20 chr10 107216972 107217191 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -52375 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 192.5-139 chr8 140758218 140758628 + 0.75 NA intron (NR_148037, intron 19 of 34) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -25770 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 147-19 chr10 58622827 58623090 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -92057 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 164.25-35 chr13 29043117 29043362 + 0.75 NA intron (NM_001366651, intron 4 of 14) L1PB1|LINE|L1 18782 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 121-88 chr18 35430196 35430479 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -53000 NM_145756 252884 Hs.351005 NM_145756 ENSG00000186496 ZNF396 ZSCAN14 zinc finger protein 396 protein-coding 188.5-58 chr18 5603580 5603914 + 0.75 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) AluJo|SINE|Alu 25244 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 130-12 chr1 241455388 241455613 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 64285 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 409.75-2 chr10 91709932 91710662 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77226 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 126.75-56 chr14 58461036 58461250 + 0.75 NA exon (NM_001364701, exon 14 of 31) exon (NM_001364701, exon 14 of 31) 21462 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 127.25-43 chr12 16585274 16585457 + 0.75 NA intron (NR_045014, intron 2 of 3) intron (NR_045014, intron 2 of 3) 20014 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 198.5-160 chr9 35663496 35663882 + 0.75 NA intron (NM_032818, intron 4 of 8) intron (NM_032818, intron 4 of 8) 1506 NM_032818 84904 Hs.534579 NM_032818 ENSG00000137135 ARHGEF39 C9orf100 Rho guanine nucleotide exchange factor 39 protein-coding 209-38 chr19 30010108 30010726 + 0.75 NA intron (NM_001252641, intron 8 of 10) intron (NM_001252641, intron 8 of 10) 68178 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 154.5-160 chr6 86604978 86605224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -332427 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 185.75-90 chr4 30747723 30748047 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 27516 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 239.25-63 chr4 61687865 61688312 + 0.75 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 473677 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 198-68 chr6 123650658 123651030 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -13751 NM_001256021 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 197.75-2 chr10 14306936 14307250 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 23791 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 209.75 chr1 51682940 51683440 + 0.75 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) AluSp|SINE|Alu -46660 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 230.5-124 chr9 102389962 102390413 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129450 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 229-49 chr3 26286230 26286783 + 0.75 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -336300 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 266.5-61 chr5 23981501 23982062 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) AluSg|SINE|Alu 30433 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 174-86 chr6 150545668 150546194 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -53954 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 188.25-23 chr11 81585064 81585541 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 305534 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 172.5-57 chr12 124720075 124720443 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 119412 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 168.75-12 chr1 164984865 164985188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -210385 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 167-37 chr14 29006642 29006920 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -220994 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 124.25-214 chrX 67793670 67793895 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 249159 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 160.25-7 chr10 15157972 15158340 + 0.75 NA intron (NM_001308295, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu -2809 NR_036506 100192204 Hs.714691 NR_036506 ENSG00000206448 PPIAP30 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 30 pseudo 123-125 chr3 10435542 10435794 + 0.75 NA intron (NM_001001331, intron 2 of 22) intron (NM_001001331, intron 2 of 22) -41106 NR_030614 100126334 NR_030614 ENSG00000216135 MIR885 MIRN885|hsa-mir-885|mir-885 microRNA 885 ncRNA 221-66 chr5 144841717 144842086 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 636510 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 113.75-157 chr5 88923002 88923202 + 0.75 NA intron (NR_109941, intron 3 of 3) intron (NR_109941, intron 3 of 3) -18997 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 230-37 chr2 157381921 157382353 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -1628 NR_034169 728066 Hs.470311 NR_034169 FAM133DP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 140-23 chr11 26075028 26075379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113920 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 222-89 chr9 92840350 92840780 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 30954 NR_026868 138649 Hs.643597 NM_001010925 ENSG00000187984 ANKRD19P ANKRD19|bA526D8.2 ankyrin repeat domain 19, pseudogene pseudo 231.75-6 chr1 190112918 190113319 + 0.75 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) L1MA9|LINE|L1 362892 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 285.75-19 chr2 79385490 79385876 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 115161 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 141.5-174 chr5 53026872 53027132 + 0.75 NA intron (NR_073106, intron 2 of 29) intron (NR_073106, intron 2 of 29) 37650 NR_073106 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 161.5-114 chr2 223537600 223537826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64648 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 164-97 chr5 36682272 36682587 + 0.75 NA intron (NM_001166695, intron 8 of 8) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 75823 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 165.75-124 chr4 117544253 117544665 + 0.75 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 116061 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 150-106 chr4 53952202 53952748 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 34807 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 137.5-231 chr8 36584162 36584481 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -200053 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 121.5-107 chr17 57432135 57432376 + 0.75 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) MIR3|SINE|MIR 91342 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 178.25-104 chr6 114849492 114849811 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -786774 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 148.5-234 chr8 131564598 131564934 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -339327 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 160.25-41 chr14 65583477 65583773 + 0.75 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) intron (NM_178156, intron 2 of 9) 112523 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 166.75-7 chr1 205129699 205130144 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -7943 NM_005057 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 128.75-73 chr17 58007504 58007728 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_034041) promoter-TSS (NR_034041) -270 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 164-55 chr2 24724501 24724821 + 0.75 NA intron (NM_001362950, intron 14 of 23) intron (NM_001362950, intron 14 of 23) -68454 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 134.25-177 chr7 54647775 54648049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90942 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 131.75-216 chr8 86317198 86317551 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25173 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 157.25-3 chr1 74539304 74539712 + 0.75 NA intron (NM_015978, intron 23 of 24) intron (NM_015978, intron 23 of 24) -26894 NM_001364666 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 227-27 chr16 30438852 30439256 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 6820 NM_012248 22928 Hs.118725 NM_012248 ENSG00000179918 SEPHS2 SPS2 selenophosphate synthetase 2 protein-coding 162.25-41 chr12 126473518 126473975 + 0.75 NA TTS (NR_130748) TTS (NR_130748) -24419 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 201.75-92 chr7 32177105 32177626 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 2 of 17) intron (NM_001322059, intron 2 of 17) -105929 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 126.25-67 chr17 19981384 19981711 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3691 NM_001330152 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 172-49 chr19 47636026 47636455 + 0.75 NA intron (NM_015711, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu 28044 NM_015711 29998 Hs.97244 NM_015711 ENSG00000063169 BICRA GLTSCR1 BRD4 interacting chromatin remodeling complex associated protein protein-coding 194-9 chr1 115189899 115190286 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -92942 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 165-61 chr2 12933237 12933682 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 73554 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 121-126 chr3 15870915 15871211 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -2708 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 213.5-28 chr11 113914587 113915072 + 0.75 NA intron (NM_006028, intron 2 of 8) L1ME2|LINE|L1 5988 NM_001363563 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 164.75-71 chr2 14296190 14296651 + 0.75 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) intron (NR_103814, intron 2 of 3) 104538 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 180.75-155 chr8 136989740 136990150 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 423643 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 193-32 chr16 75250326 75250689 + 0.75 NA intron (NM_001170715, intron 1 of 6) intron (NM_001170715, intron 1 of 6) 1117 NM_014567 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 217-86 chrX 63471367 63471844 + 0.75 NA intron (NR_152612, intron 1 of 2) L1MDb|LINE|L1 89490 NR_152611 92249 Hs.31532 NR_015353 ENSG00000235437 LINC01278 - long intergenic non-protein coding RNA 1278 ncRNA 169-2 chr1 170041504 170041904 + 0.75 NA exon (NM_001204514, exon 4 of 21) exon (NM_001204514, exon 4 of 21) 27211 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 148-48 chr18 13233324 13233650 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) (TGTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6056 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 149-86 chr3 189069920 189070427 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -101798 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 148.25-13 chr1 202654219 202654428 + 0.75 NA intron (NM_177402, intron 1 of 8) intron (NM_177402, intron 1 of 8) -10870 NM_001136504 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 147.25-5 chr1 82762347 82762625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -140697 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 117.5-192 chr5 121878427 121878694 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26678 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 139-108 chr5 13392143 13392450 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -359410 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 113.75-61 chr14 66400465 66400665 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -85806 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 201.25-95 chr9 35346218 35346532 + 0.75 NA intron (NM_001371188, intron 1 of 29) intron (NM_001371188, intron 1 of 29) 4479 NM_001371187 115-31 chr11 65208346 65208661 + 0.75 NA intron (NR_040008, intron 15 of 20) AluJb|SINE|Alu -5337 NR_033396 440044 Hs.532372 NM_001004326 ENSG00000197847 SLC22A20P Oat6|SLC22A20 solute carrier family 22 member 20, pseudogene pseudo 154.5-50 chr12 70785123 70785533 + 0.75 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) intron (NM_002849, intron 2 of 13) 3592 NM_001207015 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 155.75-126 chr4 129680529 129680754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90837 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 139.25-51 chr14 62378639 62378947 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -238820 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 113.75-118 chr21 27021144 27021322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54145 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 143.75-44 chr13 34932029 34932267 + 0.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -10139 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 163-9 chr1 215710020 215710373 + 0.75 NA intron (NM_206933, intron 61 of 71) intron (NM_206933, intron 61 of 71) 142892 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 116.5-194 chr5 32088786 32089040 + 0.75 NA exon (NM_178140, exon 20 of 25) exon (NM_178140, exon 20 of 25) 85406 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 145.25-183 chr9 121751974 121752390 + 0.75 NA intron (NM_138709, intron 1 of 13) intron (NM_138709, intron 1 of 13) 9397 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 154.25-73 chr19 28145183 28145420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -351361 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 121.25-61 chr14 84540917 84541310 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -730819 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 175.75-41 chr14 91379215 91379522 + 0.75 NA intron (NM_001080414, intron 3 of 29) intron (NM_001080414, intron 3 of 29) 38452 NM_001080414 440193 Hs.525536 NM_001080414 ENSG00000015133 CCDC88C DAPLE|HKRP2|HYC1|KIAA1509|SCA40 coiled-coil domain containing 88C protein-coding 124.5-107 chr2 98737438 98737655 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6414 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 124.25-194 chr8 5251801 5252077 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -257025 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 144.25-155 chr5 24375826 24376052 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 269039 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 228.75-22 chr15 68535576 68536009 + 0.75 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) intron (NM_001324014, intron 2 of 12) 17419 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 176-4 chr1 173389379 173389634 + 0.75 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) intron (NR_037845, intron 2 of 2) 71856 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 177-46 chr2 112542588 112542860 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_136321) promoter-TSS (NR_136321) -512 NR_136321 105373562 Hs.599548 NR_136321 LOC105373562 - uncharacterized LOC105373562 ncRNA 210.75-42 chr2 128854961 128855386 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -9427 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 112.5-17 chr10 15780664 15780970 + 0.75 NA intron (NM_024948, intron 14 of 14) intron (NM_024948, intron 14 of 14) -60482 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 170.25-158 chr8 137119539 137119813 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 293912 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 141-101 chr3 53025060 53025404 + 0.75 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) intron (NM_016329, intron 1 of 20) 20841 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 124.75-113 chr2 20537800 20538032 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -36392 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 123.25-204 chr8 102195606 102195894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43081 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 150.75-116 chr22 22201612 22201953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43004 NM_001303509 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 302.5-28 chr4 89045111 89045614 + 0.75 NA intron (NM_014883, intron 1 of 23) L1M7|LINE|L1 11823 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 178.75-61 chr3 94417937 94418351 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 355083 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 123-163 chr5 124767495 124767808 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -22539 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 119.25-220 chr9 37385334 37385568 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -37245 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 237.75-70 chr5 104242800 104243320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -680271 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 152.5-151 chr5 74725015 74725273 + 0.75 NA intron (NR_104006, intron 18 of 19) U6|snRNA|snRNA 39911 NM_000521 3074 Hs.69293 NM_000521 ENSG00000049860 HEXB ENC-1AS|HEL-248|HEL-S-111 hexosaminidase subunit beta protein-coding 180.75-86 chr3 7156997 7157327 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -263145 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 156.25-89 chr21 28785740 28786027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 99484 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 244-45 chr5 106139071 106139614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 871672 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 121-198 chr9 36180994 36181162 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -9778 NM_001184762 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 140.5-51 chr13 29664139 29664441 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 16597 NR_135320 102723345 Hs.121353 NR_135320 LOC102723345 - uncharacterized LOC102723345 ncRNA 114.25-59 chr14 72400844 72401116 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) HAL1b|LINE|L1 -115840 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 158.75-36 chr12 14409049 14409289 + 0.75 NA intron (NM_181352, intron 1 of 14) intron (NM_181352, intron 1 of 14) 23888 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 146-37 chr14 20323022 20323303 + 0.75 NA TTS (NR_145735) TTS (NR_145735) 164 NR_145735 109616976 Hs.742613 NR_145735 ENSG00000222489 SNORA79B - small nucleolar RNA, H/ACA box 79B snoRNA 166.75-18 chr10 98468638 98468959 + 0.75 NA intron (NM_001166246, intron 11 of 12) intron (NM_001166246, intron 11 of 12) -21835 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 136.5-181 chr5 75228804 75229135 + 0.75 NA intron (NM_001164443, intron 2 of 24) intron (NM_001164443, intron 2 of 24) 7909 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 159.5-115 chr2 174822175 174822435 + 0.75 NA intron (NM_001025201, intron 8 of 12) intron (NM_001025201, intron 8 of 12) 25313 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 142.75-182 chr8 55700024 55700370 + 0.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 73181 NM_001363176 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 160.75-142 chr7 20969739 20970023 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 134450 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 204.25-96 chr6 39994403 39994860 + 0.75 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -60169 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 123.75-149 chr5 106007156 106007354 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 907781 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 128.75-149 chr5 7374334 7374625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21659 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 352.5-21 chr4 105531684 105532443 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -20557 NM_017700 54848 Hs.585224 NM_017700 ENSG00000236699 ARHGEF38 - Rho guanine nucleotide exchange factor 38 protein-coding 192-10 chr1 160826211 160826594 + 0.75 NA intron (NM_002348, intron 9 of 9) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 30228 NM_001033667 4063 Hs.403857 NM_002348 ENSG00000122224 LY9 CD229|SLAMF3|hly9|mLY9 lymphocyte antigen 9 protein-coding 162.5-26 chr11 43746038 43746329 + 0.75 NA intron (NM_016142, intron 1 of 10) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 65445 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 164.75-5 chr1 101474983 101475258 + 0.75 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 151283 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 141.75-66 chr16 7243894 7244238 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -88779 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 216.75-4 chr1 86743061 86743494 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001206651, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001206651, exon 10 of 10) 38701 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 232-64 chr5 92464986 92465543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1081947 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 122.25-28 chr10 125664038 125664218 + 0.75 NA intron (NM_001128202, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 19035 NM_001318133 387718 Hs.148259 NM_001128202 ENSG00000175018 TEX36 C10orf122|bA383C5.1 testis expressed 36 protein-coding 172.25-7 chr1 159343373 159343807 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28931 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 184-64 chr4 84086790 84087350 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) intron (NR_125909, intron 7 of 8) 212099 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 209-7 chr10 30511919 30512456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77541 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 164.75-117 chr5 130795800 130796243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 369235 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 123.25-69 chr16 5047057 5047314 + 0.75 NA intron (NM_152459, intron 7 of 7) LTR33A|LTR|ERVL -13250 NM_016256 51172 Hs.21334 NM_016256 ENSG00000103174 NAGPA APAA|UCE N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase protein-coding 130.5-109 chr16 73785012 73785280 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 398341 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 227-19 chr14 41181255 41181732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 226782 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 161.5-36 chr11 102362816 102363129 + 0.75 NA exon (NM_001256166, exon 4 of 9) exon (NM_001256166, exon 4 of 9) 15598 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 180.75-55 chr18 11409530 11409882 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -44772 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 161.5-135 chr3 77908698 77909014 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 140107 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 134.75-144 chr3 88032808 88033030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26077 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 233.75-10 chr10 88290161 88290669 + 0.75 NA intron (NM_001031709, intron 6 of 6) intron (NM_001031709, intron 6 of 6) 292903 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 255.5-47 chr20 16735861 16736431 + 0.75 NA intron (NM_198220, intron 3 of 6) L1ME1|LINE|L1 6120 NM_198220 6629 Hs.280378 NM_003092 ENSG00000125870 SNRPB2 Msl1|U2B'' small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 protein-coding 124.5-170 chr5 105044426 105044629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54947 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 159.75-2 chr1 18873206 18873566 + 0.75 NA intron (NM_001161504, intron 14 of 14) MER21C|LTR|ERVL 9889 NR_039844 100616120 NR_039844 ENSG00000265606 MIR4695 - microRNA 4695 ncRNA 158.25-28 chr11 113943355 113943679 + 0.75 NA intron (NM_006028, intron 7 of 8) AluSx|SINE|Alu -31558 NR_046363 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 126.25-191 chr7 117246208 117246503 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 63674 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 183.5-29 chr11 70633211 70633564 + 0.75 NA intron (NR_046567, intron 2 of 2) intron (NR_046567, intron 2 of 2) 2293 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-214 chr8 121380807 121381096 + 0.75 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -258395 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 181.75-89 chr3 171545055 171545466 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84852 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 150-32 chr12 115186176 115186513 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -502169 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 217-8 chr10 36209243 36209746 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 431192 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 185.5-26 chr11 85430360 85430828 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 196676 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 220.75-55 chr5 74568830 74569333 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -32105 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 261.5-33 chr20 9471974 9472481 + 0.75 NA intron (NM_000933, intron 32 of 35) MER5A|DNA|hAT-Charlie -42131 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 169.75-128 chr5 85058541 85058843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -673812 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 187.25-83 chr4 118360885 118361338 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -8108 NM_003619 8492 Hs.445857 NM_003619 ENSG00000164099 PRSS12 BSSP-3|BSSP3|MRT1 serine protease 12 protein-coding 228.75-82 chr8 91973761 91974175 + 0.75 NA intron (NM_004349, intron 9 of 10) intron (NM_004349, intron 9 of 10) 43712 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 186-54 chr20 51986486 51986837 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 118823 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 311.25-15 chr3 81436622 81437238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 324715 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 135.75-104 chr2 122985707 122986011 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 87622 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 126.75-183 chr4 156843487 156843688 + 0.75 NA intron (NM_016205, intron 2 of 5) intron (NM_016205, intron 2 of 5) 128212 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 112.25-96 chr2 64435780 64435965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18290 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 219-82 chr5 77441923 77442347 + 0.75 NA intron (NM_018268, intron 8 of 12) L1ME4a|LINE|L1 50181 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 180.25-6 chr10 78859048 78859376 + 0.75 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 208236 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 118.75-50 chr12 127893716 127894026 + 0.75 NA non-coding (NR_033987, exon 2 of 3) non-coding (NR_033987, exon 2 of 3) 12254 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 219.5-24 chr12 899143 899776 + 0.75 NA intron (NM_001184985, intron 25 of 27) AluSz6|SINE|Alu 33617 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 196.25-84 chr3 110411712 110412056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 658075 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-23 chr10 126914196 126914580 + 0.75 NA intron (NM_001290223, intron 1 of 51) intron (NM_001290223, intron 1 of 51) 8979 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 138.75-23 chr10 89892350 89892714 + 0.75 NA intron (NR_149079, intron 1 of 1) L1PBb|LINE|L1 4398 NR_149079 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 133.25-78 chr17 74291450 74291693 + 0.75 NA intron (NM_023036, intron 6 of 13) intron (NM_023036, intron 6 of 13) 17337 NM_001172810 64446 Hs.147472 NM_023036 ENSG00000171595 DNAI2 CILD9|DIC2 dynein axonemal intermediate chain 2 protein-coding 160.5-75 chr18 12692684 12693135 + 0.75 NA intron (NM_001271989, intron 5 of 10) AluJr|SINE|Alu 9814 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 114-99 chr3 6931375 6931684 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 -37512 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 201.25-87 chr7 11514213 11514571 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) L2a|LINE|L2 317806 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 220.75-30 chr17 39104272 39104776 + 0.75 NA intron (NM_020405, intron 7 of 13) AluJr|SINE|Alu 47113 NM_020405 57125 Hs.125036 NM_020405 ENSG00000161381 PLXDC1 TEM3|TEM7 plexin domain containing 1 protein-coding 125-143 chr6 152698434 152698712 + 0.75 NA intron (NM_025107, intron 1 of 1) intron (NM_025107, intron 1 of 1) 678 NM_025107 80177 Hs.18160 NM_025107 ENSG00000120279 MYCT1 MTLC MYC target 1 protein-coding 164.75-2 chr1 50947839 50948210 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) L2b|LINE|L2 12243 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 140-2 chr1 83918068 83918307 + 0.75 NA intron (NM_001350215, intron 12 of 19) intron (NM_001350215, intron 12 of 19) -57191 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 217.75-75 chr8 104043059 104043524 + 0.75 NA intron (NM_001348499, intron 19 of 23) intron (NM_001348499, intron 19 of 23) -180044 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 192-82 chr4 170059753 170060168 + 0.75 NA TTS (NM_016228) TTS (NM_016228) -26957 NR_125890 9848 Hs.593942 NM_021647 ENSG00000198948 MFAP3L NYD-sp9 microfibril associated protein 3 like protein-coding 179-85 chr7 130217404 130217787 + 0.75 NA TTS (NM_145268) TTS (NM_145268) 9735 NM_145268 136263 Hs.351816 NM_145268 ENSG00000165120 SSMEM1 C7orf45 serine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 127-184 chr9 28714288 28714483 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 4920 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 116.75-157 chr4 187622490 187622678 + 0.75 NA intron (NR_110436, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 50057 NR_110436 100506272 Hs.508163 NR_110436 ENSG00000250590 LINC02492 - long intergenic non-protein coding RNA 2492 ncRNA 184.75-16 chr11 75652328 75652832 + 0.75 NA intron (NM_207577, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 15854 NM_207577 4135 Hs.585540 NM_033063 ENSG00000171533 MAP6 MAP6-N|MTAP6|N-STOP|STOP microtubule associated protein 6 protein-coding 135.5-67 chr15 94042516 94042790 + 0.75 NA intron (NR_120320, intron 2 of 8) MER72|LTR|ERV1 65285 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 193.75-67 chr2 160375984 160376430 + 0.75 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 31675 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 168.25-9 chr1 211908911 211909281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78135 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 209.75-62 chr3 124649260 124649643 + 0.75 NA intron (NM_007064, intron 4 of 26) intron (NM_007064, intron 4 of 26) 64792 NM_001323000 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 127.25-31 chr11 42291717 42291913 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -38125 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 157.25-143 chr7 108764576 108764923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119838 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 205.75-83 chr8 99672180 99672648 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 35 of 61) L1MA9|LINE|L1 -135553 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 215.75-41 chr15 69570790 69571218 + 0.75 NA non-coding (NR_026979, exon 5 of 5) non-coding (NR_026979, exon 5 of 5) 9284 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 115.25-47 chr12 41194512 41194812 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 6342 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 179.75-122 chr6 157470097 157470511 + 0.75 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu -58828 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 176.75-109 chr6 137525081 137525505 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -30899 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 198.5-43 chr14 48736483 48736814 + 0.75 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 849732 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 113.25-58 chr15 65065737 65066007 + 0.75 NA intron (NM_016563, intron 1 of 4) intron (NM_016563, intron 1 of 4) 2119 NM_001307930 51285 Hs.27018 NM_016563 ENSG00000103710 RASL12 RIS RAS like family 12 protein-coding 159.25-14 chr10 16423698 16423969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13110 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 130.75-135 chr4 30444733 30444949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -275528 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 123.5-58 chr14 38504834 38505105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248876 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 117.5-230 chr8 60921413 60921726 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46179 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 215-51 chr22 19993307 19993750 + 0.75 NA intron (NM_001670, intron 2 of 19) intron (NM_001670, intron 2 of 19) 23295 NM_001670 421 Hs.713616 NM_001670 ENSG00000099889 ARVCF - ARVCF delta catenin family member protein-coding 241.75-17 chr12 6177900 6178331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21831 NM_001330312 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 148.5-10 chr1 119718626 119718969 + 0.75 NA intron (NM_006623, intron 1 of 11) intron (NM_006623, intron 1 of 11) 6863 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 170.75-90 chr3 120135702 120136237 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -41522 NM_001354596 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 163.25-123 chr6 54246088 54246402 + 0.75 NA intron (NM_138569, intron 11 of 12) intron (NM_138569, intron 11 of 12) -62196 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 115-65 chr17 57080092 57080336 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5032 NM_003488 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 123.25-33 chr11 29355049 29355279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -239249 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 415.25-4 chr5 79967465 79968421 + 0.75 NA TTS (NR_131226) TTS (NR_131226) 23319 NM_001010891 345778 Hs.531418 NM_001010891 ENSG00000177034 MTX3 - metaxin 3 protein-coding 154.75-6 chr1 159786997 159787249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6161 NM_001319658 54935 Hs.425801 NM_017823 ENSG00000158716 DUSP23 DUSP25|LDP-3|LDP3|MOSP|VHZ dual specificity phosphatase 23 protein-coding 168.25-15 chr10 58958249 58958556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41116 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 156-80 chr2 44182895 44183334 + 0.75 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) L1M8|LINE|L1 14239 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 150.25-106 chr3 161183110 161183369 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -38051 NM_001320227 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 122.75-2 chr1 18389166 18389460 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -91617 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 197.5-125 chr5 106231267 106231601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 779580 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 159.5-185 chr6 93828731 93829027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110576 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 135.25-8 chr1 86437803 86438031 + 0.75 NA intron (NM_006536, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR 13746 NM_006536 9635 Hs.241551 NM_006536 ENSG00000137975 CLCA2 CACC|CACC3|CLCRG2|CaCC-3 chloride channel accessory 2 protein-coding 143.5-161 chr4 89023185 89023475 + 0.75 NA intron (NM_014883, intron 2 of 23) intron (NM_014883, intron 2 of 23) 33855 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 161.25-112 chr22 39483717 39484007 + 0.75 NA intron (NM_002409, intron 1 of 1) intron (NM_002409, intron 1 of 1) -3362 NM_001098270 4248 Hs.276808 NM_002409 ENSG00000128268 MGAT3 GNT-III|GNT3 mannosyl (beta-1,4-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 176-33 chr2 80199526 80200045 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 104967 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 114-163 chr8 134513611 134513862 + 0.75 NA intron (NM_020863, intron 13 of 15) intron (NM_020863, intron 13 of 15) -84335 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 142-79 chr2 36733630 36733995 + 0.75 NA intron (NM_001177969, intron 3 of 14) intron (NM_001177969, intron 3 of 14) 37105 NM_001177970 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 139.5-84 chr18 2680361 2680608 + 0.75 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) L1MB7|LINE|L1 24597 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 168-137 chr9 132057082 132057325 + 0.75 NA intron (NM_001253881, intron 2 of 6) intron (NM_001253881, intron 2 of 6) 22664 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 133-57 chr15 65626093 65626387 + 0.75 NA intron (NM_001301033, intron 4 of 11) MIRb|SINE|MIR 2285 NM_001301032 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 115.25-124 chr22 27602159 27602331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199511 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 115.25-38 chr11 74275696 74275902 + 0.75 NA intron (NR_110031, intron 8 of 11) L1PB4|LINE|L1 -35563 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 170.25-103 chr4 6164577 6165037 + 0.75 NA intron (NM_144720, intron 1 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 29812 NM_001306134 152789 Hs.479066 NM_144720 ENSG00000152969 JAKMIP1 Gababrbp|JAMIP1|MARLIN1 janus kinase and microtubule interacting protein 1 protein-coding 134.75-225 chr8 127798612 127798939 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 2813 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 142.75-46 chr12 33769115 33769349 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -253264 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 201.25-50 chr2 235864306 235864721 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) intron (NM_001037131, intron 9 of 17) 303873 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 267.75-65 chr9 82969674 82970093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 93259 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 165.25-103 chr4 61453836 61454322 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) MIRb|SINE|MIR 251907 NM_001371342 166-74 chr20 48150064 48150397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160113 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 149.25-138 chr4 188053262 188053631 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52141 NM_001303419 205860 Hs.276429 NM_173553 ENSG00000179046 TRIML2 SPRYD6 tripartite motif family like 2 protein-coding 138.5-77 chr17 57047444 57047733 + 0.75 NA TTS (NR_002818) TTS (NR_002818) 2110 NR_002818 376412 Hs.132299 NR_002818 ENSG00000261192 RNF126P1 - ring finger protein 126 pseudogene 1 pseudo 177-76 chr5 18727605 18727990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 920523 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 208.75-35 chr19 15329101 15329501 + 0.75 NA intron (NM_001330384, intron 1 of 11) intron (NM_001330384, intron 1 of 11) 3238 NM_001330384 23476 Hs.187763 NM_014299 ENSG00000141867 BRD4 CAP|HUNK1|HUNKI|MCAP bromodomain containing 4 protein-coding 150.25-77 chr2 118019192 118019507 + 0.75 NA Intergenic G-rich|Low_complexity|Low_complexity -5279 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 148.5-94 chr2 32410305 32410630 + 0.75 NA intron (NM_016252, intron 9 of 73) intron (NM_016252, intron 9 of 73) 53439 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 167.75-28 chr10 117013125 117013373 + 0.75 NA intron (NM_001258300, intron 2 of 17) AluSx1|SINE|Alu -7672 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 134.25-63 chr17 17408721 17409064 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -68108 NM_018019 55090 Hs.244595 NM_018019 ENSG00000141026 MED9 MED25 mediator complex subunit 9 protein-coding 143.5-5 chr1 40492615 40492883 + 0.75 NA intron (NM_001320178, intron 5 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 15459 NM_198494 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 209.5-70 chr2 143746297 143746648 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 13 of 13) intron (NM_018460, intron 13 of 13) -190595 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 133.75-124 chr22 47754788 47755196 + 0.75 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) AluSx|SINE|Alu 123318 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 165.5-3 chr1 60391275 60391566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 231265 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 135.25-126 chr3 31033486 31033713 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 128188 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 138.5-133 chr3 40191417 40191666 + 0.75 NA intron (NM_001284424, intron 10 of 15) intron (NM_001284424, intron 10 of 15) 91530 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 214.25-87 chr9 100196333 100196827 + 0.75 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) LTR39|LTR|ERV1 97337 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 115.5-166 chr3 78165875 78166149 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -117049 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 203.25-51 chr2 64611414 64611810 + 0.75 NA intron (NR_034023, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 4300 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 192.75-46 chr17 75153443 75153848 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001288610) promoter-TSS (NM_001288610) -352 NM_001288610 51155 Hs.532803 NM_016185 ENSG00000189159 JPT1 ARM2|HN1|HN1A Jupiter microtubule associated homolog 1 protein-coding 147.75-145 chr7 54505857 54506225 + 0.75 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -36284 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 124-129 chr4 162150623 162150958 + 0.75 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) L1M5|LINE|L1 13210 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 219.25-57 chr4 87385061 87385440 + 0.75 NA intron (NM_016245, intron 1 of 6) L1MB3|LINE|L1 5938 NM_016245 51170 Hs.594923 NM_016245 ENSG00000198189 HSD17B11 17-BETA-HSD11|17-BETA-HSDXI|17BHSD11|DHRS8|PAN1B|RETSDR2|SDR16C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11 protein-coding 164.75-6 chr1 102390340 102390776 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -393324 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 160.25-157 chr8 41814173 41814607 + 0.75 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) MER34B-int|LTR|ERV1 -16768 NM_000037 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 258.75-25 chr15 84616486 84616957 + 0.75 NA TTS (NM_001007072) TTS (NM_001007072) -14739 NR_003654 54581 Hs.658114 NM_022050 SCAND2P SCAND2 SCAN domain containing 2 pseudogene pseudo 129.5-75 chr15 60002747 60003037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1419 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 195.25-31 chr14 69181580 69181970 + 0.75 NA Intergenic Charlie10b|DNA|hAT-Charlie -9702 NM_018199 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 140.5-99 chr2 14987279 14987525 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 354685 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 209.25-66 chr20 45046887 45047413 + 0.75 NA intron (NM_006282, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR 53977 NM_002251 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 259.5-100 chr9 86846926 86847465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100311 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 145-47 chr14 72849240 72849646 + 0.75 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 43206 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 118.75-12 chr1 203872052 203872343 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 10350 NM_001328638 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 182.25-17 chr10 97240406 97240728 + 0.75 NA intron (NM_032900, intron 8 of 11) AluSz6|SINE|Alu 30090 NM_001256423 84986 Hs.80305 NM_032900 ENSG00000213390 ARHGAP19 - Rho GTPase activating protein 19 protein-coding 216.25-73 chr3 198030607 198031194 + 0.75 NA intron (NR_026786, intron 15 of 16) intron (NR_026786, intron 15 of 16) 8567 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 175.25-117 chr5 62814331 62814640 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 235666 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 113.75-63 chr14 73918374 73918669 + 0.75 NA intron (NR_040251, intron 8 of 11) L1MB7|LINE|L1 -31413 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 150-146 chr8 104809816 104810277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -221022 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 155.75-9 chr1 59874769 59875062 + 0.75 NA 3' UTR (NM_015888, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_015888, exon 22 of 22) 51858 NM_000775 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 172.75-94 chr5 43409582 43409846 + 0.75 NA intron (NM_001301874, intron 1 of 3) intron (NM_001301874, intron 1 of 3) 2677 NM_001301874 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 144.25-205 chr8 109817439 109817865 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -125861 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 125-86 chr20 59220305 59220618 + 0.75 NA intron (NM_178457, intron 3 of 4) intron (NM_178457, intron 3 of 4) 29441 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 156-112 chr4 172245201 172245420 + 0.75 NA intron (NM_001034845, intron 3 of 12) intron (NM_001034845, intron 3 of 12) -431703 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 124-178 chr9 76663680 76663963 + 0.75 NA intron (NM_001308048, intron 9 of 17) intron (NM_001308048, intron 9 of 17) 28594 NM_001308049 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 189-10 chr1 114652222 114652582 + 0.75 NA intron (NM_001256404, intron 2 of 20) intron (NM_001256404, intron 2 of 20) 17647 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 118-82 chr2 53789522 53789827 + 0.75 NA intron (NM_015701, intron 1 of 13) intron (NM_015701, intron 1 of 13) 2630 NM_015701 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 266.25-33 chr3 116530392 116530757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21899 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 127.25-17 chr10 33537854 33538037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -203040 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 115.5-152 chr20 44881268 44881471 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -4336 NM_003404 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 123.25-118 chr20 38953080 38953379 + 0.75 NA TTS (NM_030919) TTS (NM_030919) -9115 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 214-3 chr1 90943496 90943904 + 0.75 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) intron (NM_201269, intron 2 of 5) 77808 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 272.75-53 chr9 70889287 70889727 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) HAL1|LINE|L1 -20455 NM_206944 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 177.5-174 chr8 118264888 118265145 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -153197 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 124-153 chr6 113864203 113864548 + 0.75 NA TTS (NM_002356) TTS (NM_002356) 7030 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 117.75-86 chr18 13071311 13071557 + 0.75 NA intron (NM_032142, intron 28 of 44) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 80072 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 160.75-103 chr3 99957246 99957642 + 0.75 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6954 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 117.5-59 chr14 54619772 54620000 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 52274 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 285.75-12 chr14 64069834 64070396 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 51 of 114) intron (NM_015180, intron 51 of 114) 25010 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 222.5-48 chr2 65119630 65119961 + 0.75 NA intron (NM_015543, intron 1 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 10311 NM_004161 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 112.75-73 chr16 20433041 20433230 + 0.75 NA intron (NM_017888, intron 10 of 13) AluSz6|SINE|Alu -18386 NM_001308169 123876 Hs.298252 NM_001010845 ENSG00000183747 ACSM2A A-923A4.1|ACSM2 acyl-CoA synthetase medium chain family member 2A protein-coding 124-151 chr6 75397677 75397940 + 0.75 NA intron (NR_125859, intron 2 of 8) intron (NR_125859, intron 2 of 8) 14622 NR_125859 101928540 Hs.526972 NR_125859 LOC101928540 - uncharacterized LOC101928540 ncRNA 124.25-193 chr8 4418355 4418556 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 576459 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 129-24 chr10 62866794 62867107 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -47783 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 128.25-103 chr2 173523358 173523580 + 0.75 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 168597 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 116.25-122 chr20 21330168 21330469 + 0.75 NA intron (NM_001317960, intron 4 of 29) intron (NM_001317960, intron 4 of 29) 26820 NM_001317960 22803 Hs.255932 NM_012255 ENSG00000088930 XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 protein-coding 148.75-10 chr1 164315624 164315995 + 0.75 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -243551 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 113-125 chr3 171538077 171538283 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -77772 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 124-79 chr2 30053927 30054218 + 0.75 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -92935 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 137.75-158 chr4 162076460 162076863 + 0.75 NA intron (NM_020116, intron 2 of 15) intron (NM_020116, intron 2 of 15) 53928 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 250.75-17 chr15 71976826 71977404 + 0.75 NA intron (NM_006901, intron 12 of 41) intron (NM_006901, intron 12 of 41) -137143 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 130.5-46 chr10 76025695 76025972 + 0.75 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 243072 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 317.25-6 chr11 78469432 78470163 + 0.75 NA intron (NM_024678, intron 9 of 13) L2a|LINE|L2 -39961 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 113-14 chr1 206488210 206488403 + 0.75 NA intron (NM_001193321, intron 15 of 20) intron (NM_001193321, intron 15 of 20) 13503 NR_106919 102466202 NR_106919 ENSG00000278465 MIR6769B hsa-mir-6769b microRNA 6769b ncRNA 131-167 chr8 57611581 57611796 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -134461 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 196.25-94 chr4 105194481 105194759 + 0.75 NA intron (NM_001127208, intron 2 of 10) intron (NM_001127208, intron 2 of 10) 47935 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 117-192 chr9 25776663 25776931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3259 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 127.75-180 chr7 3523751 3524127 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 222687 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 145.75-68 chr19 47854079 47854274 + 0.75 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 32139 NM_003167 6822 Hs.515835 NM_003167 ENSG00000105398 SULT2A1 DHEA-ST|DHEAS|HST|ST2|ST2A1|ST2A3|STD|hSTa sulfotransferase family 2A member 1 protein-coding 182.25-59 chr2 31488095 31488535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73573 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 180.5-66 chr19 39755412 39755855 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17604 NM_001828 1178 Hs.889 NM_001828 ENSG00000105205 CLC GAL10|Gal-10|LGALS10|LGALS10A|LPPL_HUMAN Charcot-Leyden crystal galectin protein-coding 143.5-209 chr8 61757287 61757530 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 42620 NR_039680 100616484 NR_039680 ENSG00000264408 MIR4470 mir-4470 microRNA 4470 ncRNA 157.75-172 chr8 114919136 114919459 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 748716 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 141.75-138 chr5 55475432 55475756 + 0.75 NA intron (NM_003711, intron 1 of 5) intron (NM_003711, intron 1 of 5) 33332 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 133.75-172 chr6 137796321 137796560 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -57403 NR_121618 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 175.5-151 chr7 136911234 136911528 + 0.75 NA intron (NR_046103, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 8214 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 115.75-185 chr6 52650640 52650888 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -13637 NR_024405 730101 Hs.7921 NR_024403 ENSG00000216775 LOC730101 - uncharacterized LOC730101 ncRNA 144.5-32 chr10 83599255 83599563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77680 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 205-65 chr5 159442062 159442560 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 23965 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 139.25-152 chr5 92070128 92070436 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -686965 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 182-29 chr14 45605624 45605984 + 0.75 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 109798 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 220.5-34 chr16 85984803 85985314 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66711 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 176-75 chr8 124093917 124094249 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 34 of 40) intron (NM_001039112, intron 34 of 40) -53301 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-83 chr2 126947827 126948129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49088 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 139-9 chr1 214339575 214340002 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 58629 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 112.25-205 chr7 93426409 93426584 + 0.75 NA exon (NM_001164737, exon 16 of 16) exon (NM_001164737, exon 16 of 16) 56359 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 143.25-191 chr8 140285445 140285678 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 13 of 22) intron (NM_001160372, intron 13 of 22) 172183 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 121.25-133 chr3 99438961 99439215 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -199506 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 130.5-221 chr7 9196240 9196628 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -437836 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 137.25-166 chr8 83944299 83944614 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -238331 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 188.5-154 chr8 118177320 118177749 + 0.75 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) AluJo|SINE|Alu -65715 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 166.75-139 chr8 82365560 82365868 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -523428 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 182-87 chr5 43849393 43849795 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -246364 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 158.25-7 chr1 227948916 227949279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1165 NM_003395 7483 Hs.149504 NM_003395 ENSG00000143816 WNT9A WNT14 Wnt family member 9A protein-coding 341 chr1 45420690 45421181 + 0.75 NA intron (NM_007170, intron 3 of 10) intron (NM_007170, intron 3 of 10) 70228 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 158.25 chr1 14169523 14169796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 250314 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 153-119 chr5 64916421 64916814 + 0.75 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 147687 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 267.25-3 chr1 90612176 90612861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45232 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 149-49 chr2 16424944 16425359 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 240683 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 153.5-111 chr2 203971105 203971377 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34493 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 173.25-12 chr1 207832811 207833232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10318 NR_135299 100128537 Hs.445414 NR_135298 MIR29B2CHG C1orf132 MIR29B2 and MIR29C host gene ncRNA 130.5-235 chr7 157397976 157398222 + 0.75 NA intron (NM_058246, intron 8 of 9) intron (NM_058246, intron 8 of 9) 61095 NM_058246 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 139-80 chr2 122312316 122312591 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 556802 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 112.25-130 chr3 89361317 89361504 + 0.75 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 253789 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 172.75-4 chr1 83641816 83642356 + 0.75 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 196032 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 220.75-11 chr10 72363670 72364080 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8956 NR_157570 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 174.25-14 chr10 3308695 3309140 + 0.75 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -9778 NR_131187 105376360 Hs.212226 NR_131187 LOC105376360 - uncharacterized LOC105376360 ncRNA 150.25-28 chr10 115544260 115544580 + 0.75 NA intron (NM_207303, intron 25 of 28) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 451055 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 193.25-21 chr11 77018689 77019119 + 0.75 NA intron (NM_001300953, intron 8 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -15494 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 143.25-146 chr5 108094157 108094504 + 0.75 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 287768 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 133.5-6 chr1 51912174 51912409 + 0.75 NA 3' UTR (NM_002867, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_002867, exon 5 of 5) -33354 NM_001101662 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 249.5-69 chr4 34892361 34892764 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -622815 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 143.5-12 chr1 174418759 174419128 + 0.75 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) AluSz|SINE|Alu -29021 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 140.75-3 chr1 81099618 81099906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -206430 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 138-131 chr5 108344020 108344419 + 0.75 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 37879 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 134.25-41 chr12 132429318 132429660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60662 NM_001142641 57666 Hs.411138 NM_001142641 ENSG00000112787 FBRSL1 - fibrosin like 1 protein-coding 125.75-189 chr8 130747462 130747696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 293330 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 146-2 chr1 78507423 78507771 + 0.75 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 16623 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 264-31 chr2 47554819 47555261 + 0.75 NA intron (NM_022055, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 15291 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 119.5-232 chr8 72051850 72052091 + 0.75 NA intron (NM_007332, intron 14 of 26) L1MA2|LINE|L1 23614 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 141.5-69 chr16 73221424 73221721 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -77125 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 112.25-156 chr4 161065612 161065825 + 0.75 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -957015 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 147.25-120 chr6 42642168 42642474 + 0.75 NA intron (NM_015255, intron 17 of 46) intron (NM_015255, intron 17 of 46) 78292 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 138.75-211 chr9 133340437 133340641 + 0.75 NA TTS (NM_181491) TTS (NM_181491) -4351 NR_103874 6838 Hs.274430 NM_006753 ENSG00000148296 SURF6 RRP14 surfeit 6 protein-coding 192.25-15 chr10 117784429 117784820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -239556 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 148.5-95 chr2 39518195 39518424 + 0.75 NA intron (NR_037875, intron 4 of 5) intron (NR_037875, intron 4 of 5) 80893 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 161-18 chr11 5061921 5062197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2432 NM_001005164 119678 Hs.553557 NM_001005164 ENSG00000176787 OR52E2 - olfactory receptor family 52 subfamily E member 2 protein-coding 221-42 chr2 212729178 212729692 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -65896 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 159.25-90 chr3 112731351 112731721 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -5553 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 240.75-5 chr10 9671762 9672298 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -376437 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 169.25-120 chr8 92685584 92685891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30243 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 192.25-48 chr2 34399470 34399771 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -277937 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 134-189 chrX 57816105 57816295 + 0.75 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 94433 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 137.5-239 chr9 88098895 88099313 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21204 NR_135137 102724156 Hs.633031 NR_135137 LOC102724156 - uncharacterized LOC102724156 ncRNA 121-7 chr1 77292099 77292470 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 2 of 13) intron (NM_012093, intron 2 of 13) 9197 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 126-59 chr14 84612945 84613211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -658854 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 150.5-116 chr20 47326285 47326506 + 0.75 NA intron (NM_001281774, intron 3 of 23) AluSq2|SINE|Alu 7893 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 160.25-95 chr3 80284288 80284657 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -480425 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 217-52 chr3 124524410 124524810 + 0.75 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) intron (NM_001024660, intron 33 of 59) -60048 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 196-47 chr2 33399016 33399335 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001166266, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001166266, exon 29 of 29) -19341 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 167.5-15 chr1 193786414 193786715 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 481819 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 151.75-30 chr11 40378948 40379228 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -85958 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 178-22 chr13 35460512 35460822 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 40 of 57) intron (NM_015678, intron 40 of 57) 16022 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 123.75-71 chr16 12547740 12547973 + 0.75 NA intron (NM_032167, intron 20 of 20) intron (NM_032167, intron 20 of 20) -172465 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 171.75-111 chr5 34052408 34052732 + 0.75 NA intron (NR_146599, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR -9357 NM_181435 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 148.75-180 chr9 85313526 85313737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 428398 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 315.25-18 chr2 194625614 194626217 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104680 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 127.5-38 chr10 127333219 127333553 + 0.75 NA intron (NM_001290223, intron 29 of 51) intron (NM_001290223, intron 29 of 51) -136795 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 171.5-9 chr10 19112807 19113224 + 0.75 NA intron (NM_001142308, intron 5 of 39) intron (NM_001142308, intron 5 of 39) 64214 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 114.5-145 chr2 160121965 160122264 + 0.75 NA intron (NM_001282355, intron 10 of 12) intron (NM_001282355, intron 10 of 12) -59499 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 113-61 chr14 65671554 65671873 + 0.75 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 200611 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 171-2 chr1 21908486 21908829 + 0.75 NA intron (NM_005529, intron 1 of 96) intron (NM_005529, intron 1 of 96) 28653 NM_001291860 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 152-5 chr1 40207177 40207630 + 0.75 NA intron (NM_012421, intron 5 of 7) L3|LINE|CR1 -40534 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 135-42 chr14 54295390 54295599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101374 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 163.75-142 chrX 152097881 152098281 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 19858 NM_021049 4104 Hs.18048 NM_021049 MAGEA5 CT1.5|MAGE5|MAGEA4 MAGE family member A5 protein-coding 131.5-143 chr21 31635919 31636131 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -23597 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 181.25-100 chr5 54392900 54393193 + 0.75 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) L1PREC2|LINE|L1 -62653 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 141-118 chr4 142560948 142561301 + 0.75 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 285411 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 148.25-42 chr14 67898031 67898425 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MA10|LINE|L1 74636 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 122.5-90 chr18 11356264 11356613 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -98040 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 236-65 chr6 141510765 141511271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 577781 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 141.5-49 chr13 69766282 69766549 + 0.75 NA intron (NM_001286725, intron 6 of 9) intron (NM_001286725, intron 6 of 9) -340798 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 203.5-144 chr9 95792928 95793261 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -82597 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 235.75-59 chr5 88871580 88872014 + 0.75 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) 11387 NM_002397 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 117.75-231 chrX 72661946 72662173 + 0.75 NA intron (NM_002637, intron 8 of 31) L1M2|LINE|L1 -26890 NR_110391 101928259 Hs.666679 NR_110391 ENSG00000231944 PHKA1-AS1 - PHKA1 antisense RNA 1 ncRNA 219.5-119 chr7 4777642 4778014 + 0.75 NA intron (NR_157345, intron 1 of 16) intron (NR_157345, intron 1 of 16) 2205 NM_001364858 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 193.25-110 chr7 98913790 98914088 + 0.75 NA intron (NM_003496, intron 18 of 70) intron (NM_003496, intron 18 of 70) 32242 NR_132754 106633801 NR_132754 SCARNA28 ZL1 small Cajal body-specific RNA 28 ncRNA 119.25-169 chr5 164996750 164996971 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 526581 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 131.5-126 chr2 174226960 174227273 + 0.75 NA intron (NM_001011708, intron 2 of 9) AluJr|SINE|Alu 21416 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 115.5-161 chr3 46651942 46652162 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 39527 NM_001195442 100132146 Hs.679623 NM_001195442 ENSG00000283473 FAM240A - family with sequence similarity 240 member A protein-coding 142-27 chr11 24816447 24816769 + 0.75 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 319555 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 142.5-174 chr5 93591796 93592239 + 0.75 NA intron (NM_005654, intron 2 of 2) intron (NM_005654, intron 2 of 2) 8795 NM_005654 7025 Hs.519445 NM_005654 ENSG00000175745 NR2F1 BBOAS|BBSOAS|COUP-TFI|COUPTF1|EAR-3|EAR3|ERBAL3|SVP44|TCFCOUP1|TFCOUP1 nuclear receptor subfamily 2 group F member 1 protein-coding 155.5-133 chr3 118020737 118020951 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -329919 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 147-141 chr8 70412089 70412464 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8059 NM_001321703 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 132.5-70 chr14 61941040 61941342 + 0.75 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) intron (NM_001367663, intron 1 of 7) 13496 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 158.25-24 chr11 80170846 80171295 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 591733 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 216.5-42 chr16 56495974 56496317 + 0.75 NA intron (NM_031885, intron 15 of 16) intron (NM_031885, intron 15 of 16) 23879 NM_031885 583 Hs.333738 NM_031885 ENSG00000125124 BBS2 BBS|RP74 Bardet-Biedl syndrome 2 protein-coding 113.75-27 chr10 112412813 112412992 + 0.75 NA intron (NM_203379, intron 11 of 20) intron (NM_203379, intron 11 of 20) 34012 NM_022494 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 150.25-165 chr9 120215548 120215922 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 29315 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 133.75-15 chr10 23492948 23493167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53788 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 171.5-85 chr2 126628236 126628475 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -27580 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 121.75-3 chr1 45393293 45393501 + 0.75 NA intron (NM_007170, intron 3 of 10) intron (NM_007170, intron 3 of 10) -52927 NM_001293190 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 115.75-196 chr7 13133643 13133827 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 446102 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 142.5-225 chr8 117506100 117506365 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14481 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 190.75-79 chr4 98628244 98628576 + 0.75 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) intron (NM_005723, intron 1 of 7) 30201 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 144.25-45 chr11 115675235 115675497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59396 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 130.25-64 chr15 45431907 45432134 + 0.75 NA intron (NM_032413, intron 2 of 3) intron (NM_032413, intron 2 of 3) -1030 NR_030599 100126311 NR_030599 ENSG00000284386 MIR147B MIRN147B|mir-147b microRNA 147b ncRNA 154.25-117 chr4 95232677 95233053 + 0.75 NA intron (NM_003728, intron 7 of 15) intron (NM_003728, intron 7 of 15) 141374 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 186.5-13 chr1 201474172 201474574 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -5185 NM_012396 23612 Hs.153944 NM_012396 ENSG00000174307 PHLDA3 TIH1 pleckstrin homology like domain family A member 3 protein-coding 137.25-55 chr17 17505461 17505664 + 0.75 NA TTS (NM_007169) TTS (NM_007169) -9167 NM_016084 51655 Hs.25829 NM_016084 ENSG00000108551 RASD1 AGS1|DEXRAS1|MGC:26290 ras related dexamethasone induced 1 protein-coding 196.5-93 chr20 52443615 52443979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -177041 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 161.5-110 chr2 205042177 205042664 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 3 of 21) LTR86A1|LTR|ERVL 496945 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 120.5-155 chr4 24245690 24245905 + 0.75 NA intron (NR_148982, intron 1 of 13) intron (NR_148982, intron 1 of 13) 227108 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 170.5-128 chr3 194796569 194796846 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -27998 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 181.25-106 chr5 180383945 180384412 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -30842 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 190.75-34 chr16 82319123 82319568 + 0.75 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -149121 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 277.25-46 chr8 109408955 109409465 + 0.75 NA intron (NM_177531, intron 18 of 77) intron (NM_177531, intron 18 of 77) 46749 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 148.5-44 chr12 51469673 51469937 + 0.75 NA intron (NM_001039960, intron 12 of 24) intron (NM_001039960, intron 12 of 24) 44688 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 156.75-141 chr6 38633707 38634030 + 0.75 NA intron (NM_052893, intron 1 of 11) intron (NM_052893, intron 1 of 11) 6061 NM_052893 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 136.5-119 chr2 165221104 165221376 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -17190 NM_001081677 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 128-94 chr21 28738635 28738940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146580 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 133.25-93 chr2 35714367 35714769 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 243163 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 120.5-196 chr6 51106037 51106350 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 287322 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 184.25-36 chr13 72306845 72307217 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 420598 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 125.75-116 chr21 26881094 26881396 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -35836 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 220.25-83 chr9 113301495 113301924 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001371235, exon 3 of 4) 5' UTR (NM_001371235, exon 3 of 4) 1667 NM_001371235 208.25-43 chr2 30292061 30292551 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -54340 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 238.25-43 chr2 202636109 202636514 + 0.75 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) intron (NM_173511, intron 1 of 7) 1342 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 180.25 chr1 24810287 24810584 + 0.75 NA intron (NM_013943, intron 2 of 5) L1MC5a|LINE|L1 64988 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 161-114 chr7 116560603 116561005 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001172896, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001172896, exon 2 of 2) 34442 NM_001172896 857 Hs.74034 NM_001753 ENSG00000105974 CAV1 BSCL3|CGL3|LCCNS|MSTP085|PPH3|VIP21 caveolin 1 protein-coding 148.5-218 chr7 152591515 152591843 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 84462 NM_005431 7516 Hs.647093 NM_005431 ENSG00000196584 XRCC2 FANCU X-ray repair cross complementing 2 protein-coding 183-119 chrX 112524645 112525093 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 155069 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 145.25-22 chr11 86729028 86729221 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56488 NR_147829 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 165.5-89 chr2 170829521 170829793 + 0.75 NA intron (NM_013445, intron 4 of 6) intron (NM_013445, intron 4 of 6) 12770 NM_000817 2571 Hs.420036 NM_000817 ENSG00000128683 GAD1 CPSQ1|GAD|SCP glutamate decarboxylase 1 protein-coding 133.25-140 chr3 123733668 123733889 + 0.75 NA exon (NM_053028, exon 10 of 32) exon (NM_053028, exon 10 of 32) 44134 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 140-118 chr3 152358793 152359022 + 0.75 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu -17917 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 192.25-108 chr9 31273491 31273970 + 0.75 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 107760 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 128-167 chr8 102966385 102966682 + 0.75 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) L1ME5|LINE|L1 -54550 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 295.5-57 chr6 132504835 132505457 + 0.75 NA intron (NM_001326579, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 7637 NM_001326578 8417 Hs.593148 NM_003569 ENSG00000079950 STX7 - syntaxin 7 protein-coding 211.75-51 chr2 225450389 225450761 + 0.75 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR 49689 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 154-12 chr1 227855747 227855964 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 40138 NM_183062 339501 Hs.97604 NM_183062 ENSG00000185888 PRSS38 MPN2 serine protease 38 protein-coding 207-26 chr14 47704451 47704868 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -29705 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 192.75-44 chr17 59327494 59327774 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4021 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 118.25-11 chr1 94206389 94206680 + 0.75 NA intron (NM_001328665, intron 4 of 21) MIRb|SINE|MIR 31050 NM_004815 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 124.75-85 chr15 70496798 70497164 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 8947 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 142.25-151 chr7 4253842 4254108 + 0.75 NA intron (NM_001079653, intron 18 of 19) L1MB7|LINE|L1 -119138 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 135-53 chr16 82348279 82348486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -178158 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 139.5-96 chr2 41476177 41476462 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -401236 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 146.25-82 chr2 184402687 184403028 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 23882 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 146.75-113 chr4 68185804 68186139 + 0.75 NA intron (NR_015446, intron 2 of 2) intron (NR_015446, intron 2 of 2) 3679 NR_015446 100130017 Hs.582037 NR_015446 ENSG00000250426 FTLP10 - ferritin light chain pseudogene 10 pseudo 140.25-21 chr10 49439512 49439806 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -43570 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 133.25-25 chr10 110669333 110669611 + 0.75 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 25136 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 166.5-86 chr17 61999328 61999715 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) intron (NM_005121, intron 9 of 29) 65757 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 142.75-66 chr15 57284393 57284860 + 0.75 NA intron (NM_001322157, intron 19 of 19) intron (NM_001322157, intron 19 of 19) -5969 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 152.25-20 chr10 58206210 58206524 + 0.75 NA intron (NM_152230, intron 4 of 5) L1MB8|LINE|L1 61527 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 188-3 chr1 161983655 161984041 + 0.75 NA exon (NM_001297713, exon 8 of 8) exon (NM_001297713, exon 8 of 8) 40617 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 149.75-12 chr10 47391464 47391877 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -7377 NM_153034 118738 Hs.27788 NM_153034 ENSG00000265763 ZNF488 - zinc finger protein 488 protein-coding 139.5-6 chr1 208530083 208530374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -198460 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 162.5-182 chr8 121068466 121068857 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -256615 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 183.25-66 chr21 32169469 32169786 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -83332 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 142.75-165 chr6 34611130 34611507 + 0.75 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) intron (NM_022758, intron 2 of 3) -54985 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 136-84 chr2 222694606 222694895 + 0.75 NA intron (NM_058165, intron 4 of 5) intron (NM_058165, intron 4 of 5) 23092 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 140.25-143 chr5 8700866 8701133 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -138733 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 125.5-4 chr1 60974283 60974536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3633 NR_110618 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 118-34 chr12 40120744 40120993 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -14787 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 118.25-119 chr20 57796381 57796578 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84943 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 161.5-28 chr11 8572878 8573142 + 0.75 NA intron (NM_001289058, intron 1 of 13) L1MEc|LINE|L1 20966 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 136-67 chr2 17627250 17627582 + 0.75 NA intron (NM_001366805, intron 2 of 2) LTR8A|LTR|ERV1 86720 NM_001366805 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 116.5-45 chr12 13421807 13422106 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -45211 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 114-113 chr4 87916304 87916566 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -59215 NM_001040060 6696 Hs.313 NM_000582 ENSG00000118785 SPP1 BNSP|BSPI|ETA-1|OPN secreted phosphoprotein 1 protein-coding 223-80 chr8 97632211 97632719 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11719 NM_001363137 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 125.75-133 chr3 193587459 193587653 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -5588 NM_130833 4976 Hs.594504 NM_015560 ENSG00000198836 OPA1 BERHS|MGM1|MTDPS14|NPG|NTG|largeG OPA1 mitochondrial dynamin like GTPase protein-coding 135-26 chr11 100692829 100693098 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 1 of 25) intron (NM_001367945, intron 1 of 25) -5008 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 117.75-154 chr4 46628709 46628894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -238673 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 190-88 chr9 82303890 82304388 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 315367 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 181.75-79 chr3 90019325 90019801 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 911942 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 165.5-106 chr21 46553699 46554071 + 0.75 NA intron (NM_015151, intron 25 of 37) intron (NM_015151, intron 25 of 37) 51197 NM_006272 6285 Hs.422181 NM_006272 ENSG00000160307 S100B NEF|S100|S100-B|S100beta S100 calcium binding protein B protein-coding 192.75-9 chr1 187626849 187627353 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 183473 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 134.75-57 chr13 42918670 42918898 + 0.75 NA intron (NM_033255, intron 7 of 10) intron (NM_033255, intron 7 of 10) -46040 NR_126389 104355147 Hs.633967 NR_126388 LINC00428 - long intergenic non-protein coding RNA 428 ncRNA 115.25-154 chr4 136655876 136656166 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -537735 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 213.25-52 chr5 33302239 33302618 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 72693 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 152-110 chr4 36750492 36750940 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -108816 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 192.75-34 chr15 45933987 45934460 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 229028 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 144.25-108 chr2 203015029 203015357 + 0.75 NA intron (NM_001114132, intron 1 of 54) intron (NM_001114132, intron 1 of 54) 314 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 158.75-70 chr16 87246801 87247123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34847 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 146.25-118 chr5 57288745 57289002 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 74799 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 161.75-85 chr3 94380708 94381201 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 317893 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 128.75-87 chr18 64902763 64902977 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -642815 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 114.75-145 chr4 142917808 142918100 + 0.75 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -71419 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 142.75-106 chr2 150867944 150868145 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 239147 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 247.25-23 chr17 62066968 62067327 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1869 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 149.5-129 chr4 38521450 38521713 + 0.75 NA intron (NR_110951, intron 1 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 1599 NR_110951 101928776 Hs.586147 NR_110951 ENSG00000249534 LINC01258 - long intergenic non-protein coding RNA 1258 ncRNA 130.5-108 chr16 72672353 72672706 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -7559 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 115.5-9 chr1 109849506 109849753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61220 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 166.5-138 chr3 182960882 182961203 + 0.75 NA intron (NM_020640, intron 4 of 6) intron (NM_020640, intron 4 of 6) 19496 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 155.5-114 chr21 42217882 42218162 + 0.75 NA intron (NM_207629, intron 1 of 14) intron (NM_207629, intron 1 of 14) -1135 NM_004915 9619 Hs.124649 NM_004915 ENSG00000160179 ABCG1 ABC8|WHITE1 ATP binding cassette subfamily G member 1 protein-coding 161.5-76 chr16 65284919 65285414 + 0.75 NA non-coding (NR_027755, exon 9 of 9) non-coding (NR_027755, exon 9 of 9) -108593 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 218.75-87 chr8 87778974 87779355 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 94851 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 168.5-149 chr5 53073085 53073433 + 0.75 NA non-coding (NR_073107, exon 19 of 29) non-coding (NR_073107, exon 19 of 29) 36498 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 179.5-103 chr20 14048818 14049162 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) intron (NM_001351663, intron 2 of 17) 53474 NM_001351661 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 248.25-53 chr5 18970873 18971375 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR 915148 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 115.75-195 chr7 6221819 6222000 + 0.75 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu -49772 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 138.25-63 chr17 19606761 19607043 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -41248 NM_001369137 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 187.5-174 chr8 120475662 120476093 + 0.75 NA intron (NM_022045, intron 11 of 21) intron (NM_022045, intron 11 of 21) 30458 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 118.75-129 chr3 115264490 115264810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117362 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 149-98 chr5 22477324 22477760 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) L1PA13|LINE|L1 -263692 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 126-3 chr1 68860576 68860853 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P2-int|LTR|ERV1 -195184 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 126-95 chr2 76028264 76028605 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -317519 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 146.25-95 chr22 32501963 32502286 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26887 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 122.75-140 chr3 179009132 179009314 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 62586 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 202.5-136 chr7 54898019 54898561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120727 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 176.75-112 chr7 3793246 3793585 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -336270 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 143.5-201 chr7 121887944 121888325 + 0.75 NA intron (NM_001206839, intron 1 of 28) intron (NM_001206839, intron 1 of 28) 14973 NM_001369395 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 141.5-177 chr5 67959160 67959585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 166159 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 239-37 chr3 124114548 124115004 + 0.75 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) LTR88b|LTR|Gypsy? -18153 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 192.25-17 chr12 37876657 37877014 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -439939 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 130-113 chr4 25117120 25117390 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 43194 NM_016955 51091 Hs.253305 NM_016955 ENSG00000109618 SEPSECS LP|PCH2D|SLA|SLA/LP Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase protein-coding 158-141 chr8 103409782 103410248 + 0.75 NA intron (NR_102337, intron 1 of 5) intron (NR_102337, intron 1 of 5) 5092 NM_030780 81034 Hs.532265 NM_030780 ENSG00000164933 SLC25A32 MFT|MFTC|RREI solute carrier family 25 member 32 protein-coding 120.25-80 chr19 57686314 57686615 + 0.75 NA intron (NM_001270938, intron 2 of 2) intron (NM_001270938, intron 2 of 2) 4487 NM_001270938 90233 Hs.109540 NM_138347 ENSG00000204519 ZNF551 - zinc finger protein 551 protein-coding 133.5-235 chr6 91648706 91649042 + 0.75 NA intron (NR_104154, intron 2 of 3) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 41554 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 159.25-29 chr12 13114112 13114486 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10632 NM_001080555 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 147.75-117 chr4 47959503 47959833 + 0.75 NA intron (NR_125879, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 21865 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 133.5-9 chr1 145856339 145856598 + 0.75 NA intron (NM_006099, intron 2 of 13) intron (NM_006099, intron 2 of 13) 2613 NM_006099 10401 Hs.435761 NM_006099 ENSG00000131788 PIAS3 ZMIZ5 protein inhibitor of activated STAT 3 protein-coding 120.25-144 chr4 37000397 37000723 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1219 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 133.25-165 chr5 21012178 21012411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -396759 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 183.5-62 chr2 50253532 50253822 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) L1PA10|LINE|L1 94077 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 230-60 chr7 27976374 27976680 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) -203930 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 217-26 chr17 69456966 69457436 + 0.75 NA intron (NM_002758, intron 1 of 11) intron (NM_002758, intron 1 of 11) 28331 NR_145982 105371880 NR_145982 LOC105371880 - uncharacterized LOC105371880 ncRNA 156-20 chr10 74697621 74697889 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) intron (NM_001369124, intron 9 of 9) -127500 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 145.25-8 chr1 118801211 118801588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186944 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 246.75-81 chr9 32763768 32764275 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19519 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 236.5-88 chr8 54303188 54303734 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -27225 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 175.75-73 chr2 176534428 176534818 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 66429 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 192.75-12 chr10 34957967 34958312 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 116144 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 233.5-83 chr5 26681925 26682251 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 356498 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 125.5-201 chr5 56906186 56906447 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -2944 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 191.75-58 chr2 20469566 20469946 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22682 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 255-49 chr5 23740829 23741364 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -210252 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 139.5-208 chr8 10373915 10374151 + 0.75 NA intron (NM_001199729, intron 6 of 6) intron (NM_001199729, intron 6 of 6) -100532 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 235.5-23 chr11 57086991 57087710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49816 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 148.5-149 chr3 71288141 71288415 + 0.75 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) -1480 NR_126463 104502416 Hs.658538 NR_126463 ENSG00000244203 FOXP1-AS1 - FOXP1 antisense RNA 1 ncRNA 202.25-7 chr1 109820837 109821300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57145 NM_024526 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 210.75-100 chr9 1127702 1128068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76398 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 168.75-20 chr10 75210147 75210463 + 0.75 NA intron (NM_001184823, intron 1 of 9) CpG 151 NM_001324088 7417 Hs.355927 NM_003375 ENSG00000165637 VDAC2 POR voltage dependent anion channel 2 protein-coding 114-54 chr16 76112486 76112707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -164805 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 197.5-86 chr20 31060047 31060364 + 0.75 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -197459 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 151.25-159 chr5 155101620 155102075 + 0.75 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 88092 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 155.25-144 chr5 121342963 121343325 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 20594 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 131.25-81 chr17 66491178 66491486 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -74478 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 172.75-61 chr2 80838539 80838847 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 525314 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 184-44 chr2 155552188 155552501 + 0.75 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 702587 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 164.5-64 chr14 74710060 74710443 + 0.75 NA intron (NM_001039479, intron 1 of 19) intron (NM_001039479, intron 1 of 19) 2829 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 171.5-28 chr11 106966151 106966470 + 0.75 NA intron (NM_001256424, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 52166 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 169.5-171 chr8 87170715 87171231 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA2|LINE|L1 304558 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 154.25-65 chr17 33889410 33889724 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 267239 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 122-112 chr22 33442472 33442699 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) L3|LINE|CR1 -5916 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 116.75-35 chr11 46953423 46953648 + 0.75 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 16774 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 145-69 chr2 18297667 18297998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 262821 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 114.5-183 chr3 125443970 125444261 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -68761 NM_001348427 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 203.5-57 chr18 13332151 13332509 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MC1|LINE|L1 54225 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 116.25-8 chr1 58016496 58016674 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 156004 NR_104365 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 170 chr1 22417710 22418145 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33924 NM_001330398 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 239.75-18 chr13 104413933 104414562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 989047 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 252-61 chr6 70205353 70205729 + 0.75 NA intron (NM_001858, intron 49 of 50) intron (NM_001858, intron 49 of 50) 77656 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 217-20 chr14 48010246 48010681 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -215449 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 116.5-193 chr5 31175777 31175978 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17809 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 212-25 chr15 51089800 51090263 + 0.75 NA intron (NM_001311175, intron 1 of 1) intron (NM_001311175, intron 1 of 1) 4875 NM_001311175 388121 Hs.306343 NM_207381 ENSG00000183578 TNFAIP8L3 TIPE3 TNF alpha induced protein 8 like 3 protein-coding 205.75-26 chr15 62486241 62486571 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 143377 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 235.75-65 chr7 14382268 14382865 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -391141 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 145.5-154 chr5 32241676 32242097 + 0.75 NA intron (NM_001294344, intron 12 of 13) intron (NM_001294344, intron 12 of 13) -67567 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 210.5-96 chr5 58471471 58471828 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -11510 NM_001252226 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 123.5-199 chr7 85523069 85523317 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 102071 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 168.5-74 chr19 28905612 28905865 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59393 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 139.5-156 chr4 89537122 89537308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -229415 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 149.75-38 chr14 42873068 42873374 + 0.75 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 1266365 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 138.5-81 chr17 61310120 61310382 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 57453 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 199.25-15 chr11 59538190 59538670 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 23517 NM_001004711 390199 Hs.553757 NM_001004711 ENSG00000172742 OR4D9 OR11-253 olfactory receptor family 4 subfamily D member 9 protein-coding 132-44 chr13 44492846 44493257 + 0.75 NA intron (NM_183422, intron 1 of 2) L1MB5|LINE|L1 -18750 NM_001243798 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 136.5-180 chr5 69149514 69149729 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -11187 NR_145732 109616958 NR_145732 ENSG00000280894 SNORA50D - small nucleolar RNA, H/ACA box 50D snoRNA 181.5-166 chr9 36397443 36397914 + 0.75 NA intron (NM_194330, intron 1 of 11) intron (NM_194330, intron 1 of 11) 2591 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 112.25-213 chr8 82003796 82004015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161619 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 196-40 chr17 65095265 65095611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5374 NR_110801 100507002 Hs.729924 NR_110801 LOC100507002 - uncharacterized LOC100507002 ncRNA 134-107 chr20 8715501 8715762 + 0.75 NA intron (NM_182734, intron 12 of 32) intron (NM_182734, intron 12 of 32) -115554 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 114.5-259 chr8 80514540 80514719 + 0.75 NA intron (NM_001105539, intron 3 of 5) L1MC4|LINE|L1 28403 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 142.75-159 chr5 124460793 124461107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22430 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 167.5-182 chr8 23622099 23622376 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 60652 NM_001256339 4824 Hs.55999 NM_006167 ENSG00000167034 NKX3-1 BAPX2|NKX3|NKX3.1|NKX3A NK3 homeobox 1 protein-coding 222.25-8 chr10 80411555 80412130 + 0.75 NA intron (NM_001243781, intron 1 of 5) intron (NM_001243781, intron 1 of 5) -1977 NM_001243778 84293 Hs.500333 NM_032333 ENSG00000122378 PRXL2A Adrx|C10orf58|FAM213A|PAMM peroxiredoxin like 2A protein-coding 113.75-94 chr2 28572162 28572404 + 0.75 NA intron (NR_138141, intron 1 of 35) L1MB8|LINE|L1 5926 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 174.5-81 chr17 48234217 48234600 + 0.75 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -59939 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 225.75-67 chr5 114210180 114210663 + 0.75 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -151649 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 116.75-213 chr9 125362249 125362467 + 0.75 NA intron (NM_001282680, intron 27 of 27) MIR3|SINE|MIR 100532 NM_001354294 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 209.5-115 chr5 24153351 24153720 + 0.75 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 202187 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 115.75-32 chr11 110120326 110120571 + 0.75 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 27056 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 143.25-106 chr20 58726770 58727166 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 34168 NM_024663 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 122.25-118 chr22 44071144 44071441 + 0.75 NA intron (NM_001243385, intron 1 of 12) MER103C|DNA|hAT-Charlie 2175 NM_001243385 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 147-128 chr7 30143958 30144205 + 0.75 NA intron (NM_152793, intron 1 of 2) intron (NM_152793, intron 1 of 2) 9095 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 140.75-127 chr3 185131746 185132012 + 0.75 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) L1MEd|LINE|L1 21181 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 182.25-22 chr11 56463556 56464064 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001004743) promoter-TSS (NM_001004743) -409 NM_001004743 390162 Hs.553749 NM_001004743 ENSG00000150269 OR5M9 OR11-190 olfactory receptor family 5 subfamily M member 9 protein-coding 112.25-129 chr3 75127367 75127620 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -86983 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 149.5-157 chr5 117835373 117835735 + 0.75 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 105193 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 148-100 chr5 35338269 35338566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107930 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 117-30 chr11 113093600 113093832 + 0.75 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -130256 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 202-7 chr1 201421020 201421322 + 0.75 NA intron (NM_003281, intron 1 of 7) intron (NM_003281, intron 1 of 7) 559 NM_003281 7135 Hs.320890 NM_003281 ENSG00000159173 TNNI1 SSTNI|TNN1 troponin I1, slow skeletal type protein-coding 123.25-212 chr9 27191803 27192043 + 0.75 NA intron (NM_001290077, intron 9 of 21) intron (NM_001290077, intron 9 of 21) 82782 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 239.25-24 chr13 64549923 64550326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -474113 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 182.75-119 chr6 136567442 136567920 + 0.75 NA exon (NM_005923, exon 26 of 30) exon (NM_005923, exon 26 of 30) -16862 NM_003980 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 172.25-105 chr5 13280402 13280712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247671 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 119.5-256 chr9 92081849 92082114 + 0.75 NA intron (NM_001368273, intron 4 of 15) MIRb|SINE|MIR 33432 NM_001281303 10558 Hs.90458 NM_006415 ENSG00000090054 SPTLC1 HSAN1|HSN1|LBC1|LCB1|SPT1|SPTI serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 protein-coding 114.25-78 chr18 13616206 13616469 + 0.75 NA intron (NM_001003674, intron 1 of 3) intron (NM_001003674, intron 1 of 3) 4573 NM_001276249 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 143.25-108 chr21 20712058 20712350 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90904 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 122.5-149 chr3 63922339 63922589 + 0.75 NA intron (NM_001177387, intron 3 of 12) intron (NM_001177387, intron 3 of 12) -10692 NR_148359 100861563 NR_148359 ENSG00000280620 SCAANT1 ATXN7-AS1 SCA7/ATXN7 antisense RNA 1 ncRNA 163.75-39 chr13 27723862 27724216 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68444 NM_145657 219409 Hs.351785 NM_145657 ENSG00000169840 GSX1 GSH1|Gsh-1 GS homeobox 1 protein-coding 143-107 chr4 92355253 92355562 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 51008 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 122-70 chr17 30333374 30333697 + 0.75 NA intron (NM_001319942, intron 1 of 5) intron (NM_001319942, intron 1 of 5) 522 NM_206832 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 207-78 chr7 15880168 15880476 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 191944 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 140.5-92 chr19 8960192 8960489 + 0.75 NA exon (NM_024690, exon 3 of 84) exon (NM_024690, exon 3 of 84) 21002 NM_024690 94025 Hs.432676 NM_024690 ENSG00000181143 MUC16 CA125 mucin 16, cell surface associated protein-coding 131.5-57 chr14 57505666 57505906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11929 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 133.5-258 chr8 47761482 47761694 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -23424 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 143.25-190 chr8 122231569 122231842 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 336939 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 173-23 chr11 85931329 85931662 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 76394 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 121.25-26 chr10 93279866 93280179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 202312 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 253.25-26 chr17 61101838 61102261 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 265655 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 154-134 chrX 71316442 71316831 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14886 NM_001303277 26548 Hs.109999 NM_012278 ENSG00000147166 ITGB1BP2 CHORDC3|ITGB1BP|MELUSIN|MSTP015 integrin subunit beta 1 binding protein 2 protein-coding 155.25-66 chr14 85411572 85411847 + 0.75 NA intron (NR_102737, intron 2 of 2) intron (NR_102737, intron 2 of 2) 17794 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 182.25-25 chr11 129193913 129194285 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -1901 NM_001142685 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 135.25-78 chr17 60860485 60860736 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) L1PA15|LINE|L1 182759 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 126.75-198 chr5 113692440 113692786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178919 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 178-76 chr4 138641810 138642138 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 332263 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 161.25-69 chr17 12385504 12385925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -164254 NR_034144 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 204.5-36 chr14 55554183 55554647 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 25677 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 184.75-115 chrX 23927625 23928056 + 0.75 NA intron (NM_001169574, intron 6 of 8) L1MB5|LINE|L1 19834 NM_152761 254158 Hs.351265 NM_152761 ENSG00000165182 CXorf58 - chromosome X open reading frame 58 protein-coding 127.25-158 chr5 23162342 23162648 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309151 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 160.5-38 chr12 56385730 56386020 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23018 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 151.75-59 chr19 33934581 33934801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137821 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 113.25-8 chr1 114461412 114461585 + 0.75 NA intron (NM_015906, intron 4 of 19) MER21B|LTR|ERVL 49705 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 208.25-72 chr5 82878827 82879218 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -19186 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 159.25-8 chr1 180527310 180527568 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -24862 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 136-86 chr20 1255682 1255938 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -10484 NM_001318234 9751 Hs.323833 NM_014723 ENSG00000101298 SNPH - syntaphilin protein-coding 153.5-46 chr13 54199085 54199311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66327 NR_108062 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 223-5 chr10 13868822 13869345 + 0.75 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) 102813 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 193.5-55 chr15 71145934 71146435 + 0.75 NA intron (NM_024817, intron 1 of 16) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 4735 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 169.5-101 chr3 23656522 23656803 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -149293 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 142.5-124 chr20 48102916 48103257 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112969 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 159.75-16 chr10 43733808 43734102 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 44870 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 138.75-128 chr4 73946283 73946513 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35629 NM_002619 5196 Hs.81564 NM_002619 ENSG00000163737 PF4 CXCL4|PF-4|SCYB4 platelet factor 4 protein-coding 112.25-126 chr3 53359368 53359632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11957 NM_001290206 55802 Hs.476353 NM_018403 ENSG00000272886 DCP1A HSA275986|Nbla00360|SMAD4IP1|SMIF decapping mRNA 1A protein-coding 118.5-235 chr9 27536204 27536412 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6494 NM_024761 79817 Hs.369022 NM_024761 ENSG00000120162 MOB3B C9orf35|MOB1D|MOBKL2B MOB kinase activator 3B protein-coding 216-52 chr3 10709039 10709365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55007 NR_152730 285370 Hs.157613 NR_027102 ENSG00000226567 LINC00606 - long intergenic non-protein coding RNA 606 ncRNA 114.25-176 chr7 28494324 28494521 + 0.75 NA intron (NM_182898, intron 2 of 10) intron (NM_182898, intron 2 of 10) 58807 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 151.25-132 chr3 179250037 179250271 + 0.75 NA intron (NM_171828, intron 2 of 3) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 1461 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 178.25-83 chr3 43660595 43661012 + 0.75 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) AluSp|SINE|Alu -30067 NM_001365650 51099 Hs.19385 NM_016006 ENSG00000011198 ABHD5 CGI58|IECN2|NCIE2 abhydrolase domain containing 5 protein-coding 209.75-30 chr15 45996456 45996833 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 291449 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 123.5-120 chr20 40469149 40469326 + 0.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 219999 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 132-3 chr1 90177692 90178039 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182755 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 125.5-7 chr1 86188677 86188915 + 0.75 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -31812 NR_146340 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 180.5-45 chr15 53652135 53652508 + 0.75 NA intron (NM_182758, intron 14 of 19) intron (NM_182758, intron 14 of 19) 107342 NM_182758 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 116.5-51 chr12 86982066 86982244 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -143155 NM_001351286 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 143.25-192 chr9 9763007 9763393 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 6 of 45) intron (NM_002839, intron 6 of 45) -36192 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 164.75-22 chr10 97411300 97411604 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10082 NM_001145114 23223 Hs.434251 NM_015179 ENSG00000052749 RRP12 KIAA0690 ribosomal RNA processing 12 homolog protein-coding 119-38 chr12 30677152 30677328 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001190995) promoter-TSS (NM_001190995) 4 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 124.75-102 chr18 53389765 53390075 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 16 of 28) intron (NM_005215, intron 16 of 28) 152819 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 182.5-57 chr15 67309631 67309916 + 0.75 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR -54575 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 196.25-49 chr17 69692158 69692602 + 0.75 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 98393 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 183-104 chr7 12822183 12822604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134760 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 146-14 chr10 43288308 43288591 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -21384 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 126-137 chr5 28442001 28442211 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -154441 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 126.25-158 chr5 68138757 68139054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50971 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 115.5-66 chr14 67227481 67227654 + 0.75 NA intron (NM_173526, intron 8 of 8) intron (NM_173526, intron 8 of 8) -13868 NM_022474 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 164.75-21 chr10 91624299 91624597 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 8623 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 252-33 chr2 20347820 20348274 + 0.75 NA intron (NM_001352920, intron 1 of 19) AluJo|SINE|Alu 2797 NM_015317 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 123-92 chr2 10064463 10064657 + 0.75 NA intron (NM_001037160, intron 2 of 2) intron (NM_001037160, intron 2 of 2) 15851 NM_001037160 192668 Hs.27092 NM_001037160 ENSG00000205795 CYS1 - cystin 1 protein-coding 155.25-146 chr5 128953660 128953880 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -11357 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 206.25-67 chr3 108166680 108166962 + 0.75 NA intron (NM_018010, intron 8 of 10) intron (NM_018010, intron 8 of 10) 41000 NR_110028 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 182.5-28 chr11 26549190 26549544 + 0.75 NA intron (NM_031418, intron 12 of 26) MER131|DNA?|DNA? 22896 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 140.25-37 chr12 38822416 38822787 + 0.75 NA intron (NM_153634, intron 6 of 19) MIRb|SINE|MIR 82990 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 249.25-15 chr17 51295971 51296571 + 0.75 NA intron (NM_016001, intron 12 of 13) intron (NM_016001, intron 12 of 13) 35725 NM_016001 51096 Hs.709327 NM_016001 ENSG00000011260 UTP18 CGI-48|WDR50 UTP18 small subunit processome component protein-coding 120-150 chr5 133836990 133837263 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -76551 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 177.25-111 chr5 18804907 18805230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 997794 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 114-73 chr2 75869509 75869727 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -158703 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 114.25-56 chr14 57703491 57703835 + 0.75 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 161336 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 243.75-23 chr14 58733397 58733755 + 0.75 NA Intergenic Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -94712 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 183-11 chr11 35937098 35937580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6642 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 175.75-81 chr22 25100425 25100793 + 0.75 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) MIRb|SINE|MIR 12083 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 169.5-149 chr6 35293657 35294026 + 0.75 NA exon (NM_003427, exon 12 of 14) exon (NM_003427, exon 12 of 14) -3977 NM_022047 50619 Hs.15476 NM_022047 ENSG00000023892 DEF6 IBP|SLAT|SWAP70L DEF6 guanine nucleotide exchange factor protein-coding 134-116 chr3 46208439 46208710 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001295) promoter-TSS (NM_001295) -261 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 181-25 chr13 112529635 112530108 + 0.75 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) intron (NM_006322, intron 11 of 21) 58282 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 123-32 chr11 33414199 33414460 + 0.75 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) L1ME4a|LINE|L1 38221 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 216.75-26 chr15 27639731 27640067 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 459416 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 161.75-136 chr9 110596006 110596342 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -16433 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 192.75-33 chr14 65853719 65854248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 382881 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 167.25-28 chr12 62455237 62455701 + 0.75 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -11357 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 123.75-188 chr8 87189669 87189882 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 323360 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 145.5-87 chr19 9342010 9342445 + 0.75 NA exon (NM_032497, exon 7 of 7) exon (NM_032497, exon 7 of 7) 17532 NM_001202425 100529215 Hs.728944 NM_001172650 ENSG00000270011 ZNF559-ZNF177 - ZNF559-ZNF177 readthrough protein-coding 112.75-28 chr10 94857980 94858271 + 0.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -80533 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 209.5-148 chr8 139900984 139901343 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 20 of 22) intron (NM_001160372, intron 20 of 22) -198040 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 187.5-16 chr10 24962294 24962749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9915 NM_020200 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 230-10 chr10 77436349 77436720 + 0.75 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MIRb|SINE|MIR 85662 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 215.25-111 chr8 120668957 120669319 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) intron (NM_021021, intron 2 of 6) -92115 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 146.75-73 chr2 55662363 55662681 + 0.75 NA intron (NM_033109, intron 13 of 27) AluSx4|SINE|Alu 31322 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 180-3 chr1 109948165 109948582 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -36392 NM_001242673 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 165.5-108 chr3 4016572 4016911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -215866 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 169-60 chr22 35001569 35001874 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3805 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 234.75-83 chr8 58608651 58609068 + 0.75 NA intron (NM_001144772, intron 10 of 30) intron (NM_001144772, intron 10 of 30) 50548 NM_001144772 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 141.5-117 chr2 191571143 191571378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106812 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 120.25-120 chr21 28146955 28147226 + 0.75 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) intron (NR_126012, intron 5 of 5) 56687 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 149.25-151 chr6 16685680 16685942 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 3 of 8) intron (NM_000332, intron 3 of 8) 74373 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 128.5-143 chr3 65600003 65600254 + 0.75 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -293688 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 118-27 chr11 47046567 47046762 + 0.75 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu 109903 NR_103472 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 127-106 chr2 182358722 182358937 + 0.75 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 68219 NM_001363871 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 154.5-207 chrX 93602587 93602817 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 70876 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 208-40 chr2 103232105 103232470 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247858 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 113.25-181 chr8 140751362 140751528 + 0.75 NA intron (NM_001352748, intron 18 of 18) AluJb|SINE|Alu -18792 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 118.5-127 chr3 77093622 77093887 + 0.75 NA intron (NM_001290039, intron 1 of 26) (TATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4258 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 192.5-76 chr2 168521505 168521935 + 0.75 NA intron (NM_001256126, intron 1 of 10) intron (NM_001256126, intron 1 of 10) -61223 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 209.75-31 chr15 46006022 46006506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 301069 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 115.75-147 chr3 181731079 181731271 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 7 of 7) intron (NR_075091, intron 7 of 7) 19250 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 128-54 chr16 54859724 54860013 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -11635 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 122.5-108 chr2 53199902 53200151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -497411 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 143.75-94 chr2 102282583 102282818 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -28802 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 147.75-129 chr5 103639177 103639591 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76595 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 164.5-15 chr1 208180143 208180526 + 0.75 NA intron (NM_025179, intron 3 of 31) intron (NM_025179, intron 3 of 31) 64050 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 177-99 chr8 138227508 138227826 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) L1MA10|LINE|L1 -144122 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 187.5-139 chr5 91039045 91039476 + 0.75 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 275142 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 198-30 chr17 29956308 29956782 + 0.75 NA intron (NR_026738, intron 3 of 15) MER57B2|LTR|ERV1 14911 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 169-82 chr5 153091045 153091299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118823 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 199.75-85 chr7 73955406 73955820 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -72176 NM_001278918 2006 Hs.647061 NM_000501 ENSG00000049540 ELN ADCL1|SVAS|WBS|WS elastin protein-coding 168.75-138 chr7 87020181 87020462 + 0.75 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) L1MB5|LINE|L1 19913 NM_001291991 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 191-29 chr17 64323791 64324153 + 0.75 NA intron (NM_000442, intron 15 of 15) intron (NM_000442, intron 15 of 15) -60712 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 226.5-52 chr20 16838654 16839035 + 0.75 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 90491 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 170.75-107 chr5 74160949 74161300 + 0.75 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 147201 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 150.25-161 chr9 87076920 87077183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8174 NR_036691 494127 Hs.626316 NR_036691 LOC494127 - NFYC pseudogene pseudo 159.25-147 chr8 81211787 81212175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68555 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 146.25-69 chr2 77628811 77629155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106550 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 184.25-10 chr1 183627613 183628147 + 0.75 NA intron (NM_005717, intron 3 of 3) intron (NM_005717, intron 3 of 3) 7903 NM_001270439 10092 Hs.518609 NM_005717 ENSG00000162704 ARPC5 ARC16|dJ127C7.3|p16-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 5 protein-coding 234.75-41 chr2 206840891 206841465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57870 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 151-143 chrX 70479693 70479948 + 0.75 NA intron (NM_020730, intron 4 of 13) intron (NM_020730, intron 4 of 13) -23826 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 113.25-147 chr6 54413518 54413718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105177 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 269.5-64 chrX 69180704 69181131 + 0.75 NA intron (NR_103715, intron 1 of 4) intron (NR_103715, intron 1 of 4) 1360 NR_103715 100996279 NR_103715 ENSG00000215162 LINC00269 CXorf62|NCRNA00269 long intergenic non-protein coding RNA 269 ncRNA 120.75-37 chr14 38458511 38458741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -202533 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 113.5-151 chr22 44535819 44536057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33402 NR_028411 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 133.5-197 chr5 8795463 8795788 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -44107 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 247.75-18 chr14 97305965 97306394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 151322 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 202-16 chr11 99147737 99148336 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 127087 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 180.25-80 chr3 186389426 186389767 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -27362 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 191.25-100 chr8 71297008 71297347 + 0.75 NA intron (NM_001370336, intron 10 of 17) intron (NM_001370336, intron 10 of 17) 59529 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 180.25-23 chr14 28608538 28609116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 156492 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 142.75-117 chr21 25413507 25413721 + 0.75 NA intron (NR_024027, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 18087 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 118-6 chr1 92061410 92061722 + 0.75 NA intron (NM_173567, intron 6 of 6) L1ME4a|LINE|L1 13906 NM_001287737 646817 NM_001287737 ENSG00000230667 SETSIP SETP18 SET like protein protein-coding 215-32 chr16 73376289 73376637 + 0.75 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -10342 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 207.75-90 chr4 66473769 66474123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197122 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 126.5 chr1 13450998 13451225 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 40661 NM_001099852 645425 NM_001099852 ENSG00000204478 PRAMEF20 PRAMEF21 PRAME family member 20 protein-coding 189.5-4 chr1 59704302 59704719 + 0.75 NA intron (NM_001350790, intron 15 of 16) L1ME3G|LINE|L1 28786 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 145-82 chr2 184308606 184308863 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -70241 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 136-124 chr5 95470163 95470518 + 0.75 NA intron (NM_014639, intron 40 of 42) intron (NM_014639, intron 40 of 42) 78974 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 136.75-136 chr3 163340301 163340514 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -37106 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 126-96 chr2 81989774 81990038 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -522960 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 122.25-45 chr12 77170241 77170614 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -104858 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 122.75-83 chr19 42236201 42236532 + 0.75 NA intron (NM_019884, intron 4 of 10) intron (NM_019884, intron 4 of 10) 6236 NM_019884 2931 Hs.466828 NM_019884 ENSG00000105723 GSK3A - glycogen synthase kinase 3 alpha protein-coding 163-66 chr22 32584686 32584952 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) intron (NM_003490, intron 7 of 13) 109582 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 139.25-90 chr2 103508714 103508957 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -524406 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 120.25-64 chr14 75139038 75139337 + 0.75 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) L1ME3G|LINE|L1 -12139 NM_001329238 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 157-33 chr15 51670229 51670641 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -10918 NM_001165257 29106 Hs.232618 NM_013243 ENSG00000104112 SCG3 SGIII secretogranin III protein-coding 113.5-136 chr20 20987004 20987211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119251 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 144.75-177 chr8 98066246 98066536 + 0.75 NA intron (NM_001170806, intron 1 of 1) intron (NM_001170806, intron 1 of 1) 1823 NM_173549 203111 Hs.171455 NM_173549 ENSG00000177459 ERICH5 C8orf47 glutamate rich 5 protein-coding 188.25-72 chr3 43649371 43649765 + 0.75 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) intron (NM_001346469, intron 1 of 11) -27491 NM_001204833 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 201.25 chr1 14702939 14703385 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) 104445 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 164.75-109 chr4 88416111 88416378 + 0.75 NA intron (NM_001165136, intron 12 of 21) LTR26C|LTR|ERV1 37505 NM_017912 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 140-120 chr4 31703085 31703444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 196720 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 172.5-8 chr1 107568110 107568612 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 120138 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 144.25-73 chr17 31660084 31660283 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84772 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 116.25-181 chr5 85735733 85735917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -546619 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 122-190 chr8 119820677 119821034 + 0.75 NA intron (NM_003184, intron 2 of 25) intron (NM_003184, intron 2 of 25) 11986 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 133-112 chr3 185550157 185550382 + 0.75 NA intron (NM_139248, intron 1 of 9) intron (NM_139248, intron 1 of 9) 2319 NM_139248 200879 Hs.68864 NM_139248 ENSG00000163898 LIPH AH|ARWH2|HYPT7|LAH2|LPDLR|PLA1B|mPA-PLA1 lipase H protein-coding 187-25 chr12 86148432 86148830 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 107760 NM_001351283 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 221.75-67 chr6 64855666 64856001 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) L1MC2|LINE|L1 -445585 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 128-180 chrX 72057619 72057923 + 0.75 NA intron (NM_001013627, intron 1 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 13362 NR_002309 441502 Hs.449523 NR_002309 RPS26P11 RPS26L1|RPS26_22_1784|bA366E13.1 ribosomal protein S26 pseudogene 11 pseudo 134-44 chr12 114944299 114944565 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260257 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 126.75-204 chr5 144648546 144648810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 443287 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 157.25-47 chr15 101473188 101473624 + 0.75 NA intron (NM_138325, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 16301 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 172.75-76 chr22 36245127 36245445 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5332 NM_145637 23780 Hs.474740 NM_030882 ENSG00000128335 APOL2 APOL-II|APOL3 apolipoprotein L2 protein-coding 153.25-9 chr1 234624293 234624660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4835 NR_033927 100302691 Hs.209162 NR_033927 ENSG00000224939 LINC00184 HANC|NCRNA00184 long intergenic non-protein coding RNA 184 ncRNA 169.75-112 chr4 59907472 59907747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 894036 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 126.5-172 chr4 56196941 56197234 + 0.75 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) intron (NM_020722, intron 2 of 10) 26892 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 134.25-30 chr11 116387024 116387285 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -252268 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 133.5-220 chr5 158625646 158625976 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -216038 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 116.5-68 chr14 53279309 53279708 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 126154 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 114.5-107 chr16 56607388 56607742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1019 NM_005953 4502 Hs.534330 NM_005953 ENSG00000125148 MT2A MT-2|MT-II|MT2 metallothionein 2A protein-coding 198.25-100 chr8 113453818 113454106 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -17023 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 228.75-96 chr9 136751162 136751602 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -2857 NM_198946 158062 Hs.522504 NM_198946 ENSG00000267206 LCN6 LCN5|UNQ643|hLcn5 lipocalin 6 protein-coding 121.25-174 chr6 5926202 5926540 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 77673 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 244.5-36 chr17 34986489 34986900 + 0.75 NA intron (NM_013975, intron 3 of 19) intron (NM_013975, intron 3 of 19) 6182 NM_013975 3980 Hs.100299 NM_002311 ENSG00000005156 LIG3 LIG2|LIG3alpha DNA ligase 3 protein-coding 171-75 chr2 182886204 182886639 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19784 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 192-40 chr13 87780083 87780403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30277 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 139.25-87 chr2 81070212 81070518 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 396581 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 116.75-135 chr3 150254227 150254422 + 0.75 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 15624 NR_110167 101927992 Hs.534682 NR_110167 ENSG00000244541 LINC01213 - long intergenic non-protein coding RNA 1213 ncRNA 155.5-14 chr1 115229656 115229989 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -53212 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 133-127 chr4 92998457 92998788 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 694223 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 184.25-82 chr3 105657933 105658284 + 0.75 NA non-coding (NR_135810, exon 21 of 21) non-coding (NR_135810, exon 21 of 21) 209483 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 119-133 chr4 66977021 66977229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 444875 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 182.25-136 chrX 44847797 44848184 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 3969 NM_022076 63904 Hs.534478 NM_022076 ENSG00000189037 DUSP21 LMWDSP21 dual specificity phosphatase 21 protein-coding 231-37 chr18 13292913 13293349 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 15026 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 180.5-69 chr2 19878929 19879431 + 0.75 NA intron (NR_033875, intron 6 of 9) intron (NR_033875, intron 6 of 9) 10326 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 153.75-159 chrX 47281384 47281737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48551 NM_001371072 120.25-104 chr2 202837560 202837772 + 0.75 NA intron (NM_001288622, intron 1 of 12) L1M2|LINE|L1 -8432 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 132.75-24 chr10 60584088 60584447 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -11311 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 149.5-62 chr14 86570628 86570956 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -334986 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 122.75-44 chr14 24702223 24702499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68171 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 199.5-125 chr6 26117781 26118110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5959 NM_003526 8347 Hs.658713 NM_003526 ENSG00000180596 HIST1H2BC H2B.1|H2B/l|H2BFL|dJ221C16.3 histone cluster 1 H2B family member c protein-coding 223-86 chr8 143470097 143470551 + 0.75 NA intron (NM_015117, intron 5 of 11) intron (NM_015117, intron 5 of 11) 35924 NR_145785 109623485 NR_145785 SNORD149 - small nucleolar RNA, C/D box 149 snoRNA 164.5-47 chr13 71043485 71043779 + 0.75 NA intron (NR_047699, intron 1 of 3) intron (NR_047699, intron 1 of 3) 28491 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 125.75-77 chr18 9459200 9459508 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16159 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 140.25-4 chr1 49461101 49461430 + 0.75 NA intron (NR_046839, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 10820 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 118.25-172 chr6 64458417 64458599 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) L1M1|LINE|L1 651672 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 178.25-81 chr3 18364873 18365158 + 0.75 NA intron (NM_001131010, intron 9 of 10) intron (NM_001131010, intron 9 of 10) 60324 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 128-88 chr20 33192101 33192370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1370 NR_026760 317716 Hs.434194 NM_173859 ENSG00000183566 BPIFA4P BASE BPI fold containing family A member 4, pseudogene pseudo 196.25-33 chr14 35536730 35537079 + 0.75 NA 3' UTR (NM_032594, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_032594, exon 1 of 1) 2740 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 251.75-66 chr5 144288064 144288506 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 82894 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 248.75-62 chr9 74509348 74509810 + 0.75 NA intron (NM_006914, intron 1 of 9) intron (NM_006914, intron 1 of 9) -11026 NR_125791 103752585 Hs.635501 NR_125791 RORB-AS1 - RORB antisense RNA 1 ncRNA 152.25-47 chr14 20845014 20845278 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -42302 NM_002933 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 122.25-132 chr3 159179012 159179260 + 0.75 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) -94111 NM_014575 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 136.25-153 chr5 116971805 116972087 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -209737 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 158.5-184 chr7 105587062 105587405 + 0.75 NA Intergenic LTR27|LTR|ERV1 -5691 NM_001355531 100130771 Hs.719432 NM_001355526 ENSG00000185055 EFCAB10 - EF-hand calcium binding domain 10 protein-coding 147.5-34 chr11 79679481 79679811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -238616 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 153.75-148 chr8 9458226 9458604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97497 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 227.5-56 chr2 97820901 97821538 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 11 of 40) LTR12|LTR|ERV1 86813 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 202.5-114 chr5 51380597 51380928 + 0.75 NA intron (NR_046243, intron 1 of 1) intron (NR_046243, intron 1 of 1) 2570 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 160-88 chr5 56272752 56273082 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -39587 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 135.75-30 chr10 88489238 88489623 + 0.75 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 93888 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 173.25-53 chr18 11781116 11781522 + 0.75 NA intron (NM_001369387, intron 4 of 11) intron (NM_001369387, intron 4 of 11) 29234 NM_001369387 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 152.75-108 chr3 108206014 108206245 + 0.75 NA intron (NM_018010, intron 5 of 10) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16295 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 191.75-124 chr8 60317616 60317896 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -36356 NM_004056 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 125-128 chr5 82874657 82874961 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -14973 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 154.25-108 chr3 103179188 103179522 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 344761 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 199-13 chr10 61203669 61204059 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 187589 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 199.75-67 chr3 189472674 189473116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123851 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 190.75-107 chr8 50915288 50915666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 751346 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 235.5-54 chr20 43686178 43686795 + 0.75 NA intron (NM_001278610, intron 3 of 12) intron (NM_001278610, intron 3 of 12) 19372 NM_002466 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 113.5-143 chr20 52053001 52053274 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 52347 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 132.5-95 chr18 5908015 5908257 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -12182 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 169.75-103 chr3 81239119 81239474 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 245428 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 163.25-26 chr11 114582228 114582527 + 0.75 NA exon (NM_001077639, exon 3 of 6) exon (NM_001077639, exon 3 of 6) 13409 NM_001077639 54827 Hs.179100 NM_017678 ENSG00000137634 NXPE4 C11orf33|FAM55D neurexophilin and PC-esterase domain family member 4 protein-coding 170.5-98 chr2 151455637 151455906 + 0.75 NA intron (NM_001177665, intron 21 of 33) MER2|DNA|TcMar-Tigger 45869 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 164.25-106 chr3 197866990 197867219 + 0.75 NA intron (NM_001365717, intron 16 of 19) AluSx1|SINE|Alu 75850 NM_001365715 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 210.75-59 chr3 114954142 114954568 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -53730 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 121.5-113 chr18 9976075 9976322 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 62182 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 162.25-104 chr3 33752369 33752674 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -34267 NM_001365629 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 162.25-147 chr6 146064119 146064413 + 0.75 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) (ATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35068 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 225.5-71 chr3 49081947 49082268 + 0.75 NA intron (NM_001320584, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 11525 NM_001320582 54870 Hs.297389 NM_017730 ENSG00000198218 QRICH1 AB-DIP|VERBRAS glutamine rich 1 protein-coding 163-124 chr9 27145835 27146123 + 0.75 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) intron (NM_001290078, intron 1 of 20) 36838 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 118-140 chr5 16870343 16870578 + 0.75 NA intron (NM_012334, intron 2 of 40) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 65828 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 167.25-57 chr16 67302235 67302529 + 0.75 NA intron (NM_001100915, intron 4 of 15) intron (NM_001100915, intron 4 of 15) 22850 NM_001129729 25894 Hs.188781 NM_015432 ENSG00000196155 PLEKHG4 ARHGEF44|PRTPHN1|SCA4 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4 protein-coding 163.25-95 chr3 87205095 87205513 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 20973 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 125.25-146 chr4 78836916 78837254 + 0.75 NA intron (NM_017593, intron 3 of 13) HAL1|LINE|L1 60707 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 268-49 chr6 47402750 47403185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74822 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 117.25-17 chr1 189689674 189689910 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 786218 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 117.5-202 chr6 27448060 27448338 + 0.75 NA intron (NR_144688, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 24699 NM_001318892 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 225.25-8 chr10 57172332 57172750 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132018 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 214.5-64 chr2 182141085 182141508 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001363871, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001363871, exon 15 of 15) 100767 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 177.25-93 chr3 40465000 40465438 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001034996, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001034996, exon 6 of 6) 7880 NM_003973 9045 Hs.446522 NM_003973 ENSG00000188846 RPL14 CAG-ISL-7|CTG-B33|L14|RL14|hRL14 ribosomal protein L14 protein-coding 123.25-206 chr8 119733019 119733212 + 0.75 NA intron (NM_003184, intron 25 of 25) MER8|DNA|TcMar-Tigger -59725 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 137-76 chr2 57934020 57934285 + 0.75 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1MA9|LINE|L1 26501 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 169-22 chr12 129544094 129544340 + 0.75 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) L1ME4b|LINE|L1 335616 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 161.75-121 chr8 36100293 36100790 + 0.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -390221 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 127.75-161 chr5 126927038 126927356 + 0.75 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) intron (NM_178450, intron 1 of 4) 103361 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 114.25-152 chr5 99995390 99995669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 392725 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 126.25-98 chr20 5409552 5409835 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 36055 NR_038240 100507629 Hs.121383 NR_038239 ENSG00000226995 LINC00658 - long intergenic non-protein coding RNA 658 ncRNA 134.25-85 chr2 115559079 115559375 + 0.75 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 215412 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 199.5-56 chr16 85550150 85550471 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -61099 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 149.75-60 chr16 78881823 78882293 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) AluSz|SINE|Alu 718679 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 219-27 chr13 25094820 25095455 + 0.75 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -1001 NM_030979 5042 Hs.458280 NM_030979 ENSG00000151846 PABPC3 PABP3|PABPL3|tPABP poly(A) binding protein cytoplasmic 3 protein-coding 240.5-82 chr4 162051929 162052317 + 0.75 NA intron (NM_020116, intron 2 of 15) intron (NM_020116, intron 2 of 15) 29390 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 119.25-69 chr16 7387170 7387361 + 0.75 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 54420 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 127-142 chr5 116053364 116053658 + 0.75 NA intron (NM_001195581, intron 1 of 2) intron (NM_001195581, intron 1 of 2) 2045 NM_001195581 644100 Hs.98288 NM_001195581 ENSG00000268223 ARL14EPL - ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein like protein-coding 142.75-100 chr2 81835880 81836179 + 0.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -369083 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 121.75-67 chr18 63714999 63715175 + 0.75 NA intron (NM_001291278, intron 4 of 5) MER11B|LTR|ERVK 12127 NM_001291279 89778 Hs.350958 NM_080475 ENSG00000206072 SERPINB11 EPIPIN|SERPIN11 serpin family B member 11 (gene/pseudogene) protein-coding 205.25-19 chr12 108146129 108146454 + 0.75 NA intron (NM_001304447, intron 1 of 9) intron (NM_001304447, intron 1 of 9) 14505 NM_001304447 9671 Hs.143591 NM_014653 ENSG00000075035 WSCD2 - WSC domain containing 2 protein-coding 168.75-79 chr2 236894594 236894858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161441 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 112.5-44 chr12 10642503 10642724 + 0.75 NA intron (NM_018423, intron 1 of 10) intron (NM_018423, intron 1 of 10) -29004 NR_135120 55110 Hs.104650 NM_018048 ENSG00000111196 MAGOHB MGN2|mago|magoh mago homolog B, exon junction complex subunit protein-coding 144-115 chr6 149649037 149649353 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_007044) promoter-TSS (NM_007044) -391 NM_001204076 11104 Hs.450175 NM_007044 ENSG00000186625 KATNA1 - katanin catalytic subunit A1 protein-coding 197-22 chr15 81634733 81635120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260713 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 180.25-49 chr2 24927916 24928357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7899 NM_004036 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 130.75-48 chr13 27195379 27195665 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 23263 NR_046548 100874071 Hs.735400 NR_046548 USP12-AS2 - USP12 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 160.75-80 chr2 136818553 136818812 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 53137 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 171.5-51 chr15 63763247 63763707 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 3 of 77) HAL1M8|LINE|L1 70471 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 152-92 chr20 23152339 23152694 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19880 NR_034149 200261 Hs.352228 NM_182535 ENSG00000233746 LINC00656 - long intergenic non-protein coding RNA 656 ncRNA 189.75-124 chr8 104622120 104622414 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -33243 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 149.75-116 chr3 155244748 155244984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3921 NR_125399 101928190 Hs.121410 NR_125399 ENSG00000241336 LINC01487 - long intergenic non-protein coding RNA 1487 ncRNA 135-151 chr5 166714430 166714751 + 0.75 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 211780 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 205.75-40 chr2 166345735 166346199 + 0.75 NA intron (NM_001365536, intron 1 of 26) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 29977 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 181.5-25 chr11 109906255 109906583 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -186973 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 173.75-63 chr15 99748494 99748882 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15244 NM_001284420 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 138.5-129 chr3 8002922 8003308 + 0.75 NA intron (NR_110131, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 13192 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 130.5-127 chr2 37928292 37928522 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001170792) promoter-TSS (NM_001170792) -352 NM_001170792 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 129.25-83 chr2 75369 75671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29015 NM_001077710 642273 Hs.8379 NM_001077710 ENSG00000184731 FAM110C - family with sequence similarity 110 member C protein-coding 192-75 chr3 169610532 169611051 + 0.75 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 52921 NM_001366473 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 195.5-35 chr13 113495268 113495621 + 0.75 NA intron (NR_146222, intron 1 of 11) intron (NR_146222, intron 1 of 11) 4423 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 180-108 chr7 7430791 7431178 + 0.75 NA intron (NM_001037763, intron 25 of 34) MIRc|SINE|MIR 104889 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 165.5-43 chr14 40967301 40967669 + 0.75 NA intron (NR_109758, intron 2 of 3) L1ME3D|LINE|L1 12774 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 126.25-140 chr4 142570419 142570641 + 0.75 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 276005 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 212.75-65 chr3 97447300 97447818 + 0.75 NA intron (NM_001278300, intron 2 of 12) intron (NM_001278300, intron 2 of 12) 7952 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 139-29 chr12 43579554 43579785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27466 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 165.25-53 chr17 16578589 16578914 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -9539 NM_001346170 57336 Hs.99724 NM_020653 ENSG00000141040 ZNF287 ZKSCAN13|ZSCAN45 zinc finger protein 287 protein-coding 162.25-10 chr1 180178972 180179385 + 0.75 NA intron (NM_002826, intron 5 of 11) intron (NM_002826, intron 5 of 11) 24309 NM_002826 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 188.5-31 chr13 110915664 110916025 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_104586) promoter-TSS (NR_104586) -775 NR_104586 55608 Hs.525163 NM_017664 ENSG00000088448 ANKRD10 - ankyrin repeat domain 10 protein-coding 156.75-140 chr5 162902248 162902722 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -535086 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 134.5-50 chr12 111701145 111701502 + 0.75 NA intron (NM_025247, intron 2 of 20) intron (NM_025247, intron 2 of 20) 15270 NM_001136538 80724 Hs.331141 NM_025247 ENSG00000111271 ACAD10 - acyl-CoA dehydrogenase family member 10 protein-coding 215.5-31 chr14 58490227 58490750 + 0.75 NA intron (NM_001329947, intron 25 of 29) intron (NM_001329947, intron 25 of 29) 50807 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 173.5-154 chr7 100556770 100557185 + 0.75 NA intron (NM_006076, intron 6 of 11) AluSx1|SINE|Alu 16923 NM_001348677 100316904 Hs.633863 NM_001168682 ENSG00000205307 SAP25 - Sin3A associated protein 25 protein-coding 135.25-70 chr16 5396588 5396828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 219542 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 175.25-17 chr10 4687502 4687803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9582 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 148-82 chr3 94262514 94262868 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199630 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 206.75-24 chr16 80508245 80508592 + 0.75 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu -32316 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 150-107 chr4 57101187 57101524 + 0.75 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) intron (NM_001553, intron 1 of 4) -8407 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 182.75-8 chr1 101073237 101073769 + 0.75 NA intron (NR_109849, intron 1 of 4) intron (NR_109849, intron 1 of 4) 47657 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 179.5-46 chr12 64235306 64235700 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -13207 NM_001300941 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 184.25-45 chr17 49348899 49349297 + 0.75 NA intron (NR_135579, intron 1 of 7) intron (NR_135579, intron 1 of 7) -12067 NR_110884 102724596 Hs.559253 NR_110882 ENSG00000248714 LOC102724596 - uncharacterized LOC102724596 ncRNA 175.75-52 chr17 61600908 61601251 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9860 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 139.5-101 chr2 114474051 114474393 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) AluSx3|SINE|Alu 12645 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 129.75-158 chr6 55977585 55977814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102109 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 205.5-82 chr2 211411820 211412236 + 0.75 NA intron (NM_005235, intron 25 of 27) intron (NM_005235, intron 25 of 27) 794457 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 125.25-210 chr8 122597415 122597705 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28916 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 140.5-85 chr17 71989841 71990103 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 36007 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 182-31 chr14 55198809 55199091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7365 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 119.75-121 chr2 238379613 238379884 + 0.75 NA intron (NM_001139490, intron 13 of 14) intron (NM_001139490, intron 13 of 14) -47179 NM_001330196 51665 Hs.516788 NM_016114 ENSG00000065802 ASB1 ASB-1 ankyrin repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 136.75-79 chr17 74944719 74945016 + 0.75 NA intron (NM_178233, intron 5 of 6) L1MC5a|LINE|L1 8969 NM_001272005 347741 Hs.454407 NM_178233 ENSG00000182938 OTOP3 - otopetrin 3 protein-coding 231.25-75 chr8 123320297 123320769 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014109, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_014109, exon 28 of 28) -27501 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 131.75-8 chr1 67772909 67773141 + 0.75 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -59263 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 175.25-73 chr2 136579709 136580153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185614 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 232.5-36 chr17 47181462 47181990 + 0.75 NA intron (NM_001256, intron 1 of 18) intron (NM_001256, intron 1 of 18) 7569 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 237.75-60 chr4 128453174 128453550 + 0.75 NA intron (NR_125882, intron 1 of 8) intron (NR_125882, intron 1 of 8) 25346 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 113.5-72 chr14 45440745 45440938 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -187639 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 175.25-25 chr11 56179640 56180217 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 3310 NM_001005492 282775 Hs.537145 NM_001005492 ENSG00000174957 OR5J2 OR11-266 olfactory receptor family 5 subfamily J member 2 protein-coding 184-2 chr1 65777262 65777604 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -15077 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 134.75-221 chr8 109585360 109585561 + 0.75 NA intron (NM_001099754, intron 4 of 6) MIR|SINE|MIR 17999 NM_001363032 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 150-115 chr5 42579376 42579668 + 0.75 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 13658 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 138.5-121 chr21 46008523 46008772 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26898 NM_001848 1291 Hs.474053 NM_001848 ENSG00000142156 COL6A1 BTHLM1|OPLL|UCHMD1 collagen type VI alpha 1 chain protein-coding 162.25-68 chr18 13353554 13353802 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 73856 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-151 chr5 67682193 67682459 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -35537 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 191.25-66 chr21 42750152 42750671 + 0.75 NA intron (NM_001001574, intron 6 of 17) L1MC5a|LINE|L1 29583 NR_135517 101928311 Hs.570404 NR_135517 ENSG00000283051 LINC01668 - long intergenic non-protein coding RNA 1668 ncRNA 167.5-120 chr3 180344916 180345201 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -69115 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 174.25-75 chr2 23704637 23704930 + 0.75 NA intron (NM_052920, intron 13 of 13) intron (NM_052920, intron 13 of 13) 222340 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 123-199 chr9 96492014 96492183 + 0.75 NA TTS (NM_014282) TTS (NM_014282) 41929 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 118.5-9 chr1 85572102 85572449 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 1 of 6) intron (NM_001134445, intron 1 of 6) 5925 NM_001134445 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 120.5-174 chr5 10120586 10120897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 129147 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 198-62 chr5 30318453 30318796 + 0.75 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 438064 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 177.5-166 chr8 19953074 19953409 + 0.75 NA intron (NM_000237, intron 3 of 9) (ATTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13988 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 242.25-11 chr10 51110412 51110899 + 0.75 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) L1ME1|LINE|L1 36168 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 174.75-141 chr9 92748571 92748944 + 0.75 NA intron (NM_001003800, intron 1 of 6) intron (NM_001003800, intron 1 of 6) 16076 NM_015250 23299 Hs.436939 NM_015250 ENSG00000185963 BICD2 SMALED2|SMALED2A|SMALED2B|bA526D8.1 BICD cargo adaptor 2 protein-coding 234.5-91 chr7 91838517 91838904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41992 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 157.75-33 chr12 20650042 20650360 + 0.75 NA intron (NM_000921, intron 13 of 15) L1MA2|LINE|L1 -45154 NM_001145945 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 187-108 chr9 85901574 85901996 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -39357 NM_001321881 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 244.25-57 chr9 105330916 105331520 + 0.75 NA intron (NM_001330731, intron 3 of 15) intron (NM_001330731, intron 3 of 15) 86567 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 242.5-30 chr15 57276201 57276668 + 0.75 NA intron (NM_207038, intron 18 of 19) HAL1|LINE|L1 2223 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 116.25-6 chr1 51056839 51057012 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2912 NR_039617 100616189 NR_039617 ENSG00000265538 MIR4421 - microRNA 4421 ncRNA 160.5-174 chr7 73509657 73510070 + 0.75 NA intron (NM_001370402, intron 2 of 18) AluSz|SINE|Alu 12430 NM_032408 9031 Hs.743372 NM_023005 ENSG00000009954 BAZ1B WBSCR10|WBSCR9|WSTF bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B protein-coding 133.5-195 chr5 5984793 5985116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 352338 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 137.75-111 chr2 205652275 205652491 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30117 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 146.25-144 chr8 28398037 28398341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11729 NM_018660 55893 Hs.435535 NM_018660 ENSG00000186918 ZNF395 HDBP-2|HDBP2|HDRF-2|PBF|PRF-1|PRF1|Si-1-8-14 zinc finger protein 395 protein-coding 173-111 chr5 86252934 86253270 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29342 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 146.5-167 chr5 20475921 20476310 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 99598 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 201.25-63 chr3 52319092 52319429 + 0.75 NA intron (NM_015512, intron 1 of 77) intron (NM_015512, intron 1 of 77) 2941 NM_015512 25981 Hs.655469 NM_015512 ENSG00000114841 DNAH1 CILD37|DNAHC1|HDHC7|HL-11|HL11|HSRF-1|SPGF18|XLHSRF-1 dynein axonemal heavy chain 1 protein-coding 151-20 chr11 75264331 75264758 + 0.75 NA 3' UTR (NM_020251, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_020251, exon 15 of 15) 23770 NM_001195528 100507050 Hs.577323 NM_001195528 ENSG00000261594 TPBGL - trophoblast glycoprotein like protein-coding 235.5-40 chr17 35093220 35093645 + 0.75 NA non-coding (NR_037712, exon 8 of 8) non-coding (NR_037712, exon 8 of 8) -4206 NR_037713 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 119.75 chr1 13832234 13832481 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 82942 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 146.75-121 chr5 36612910 36613285 + 0.75 NA intron (NM_001289939, intron 2 of 8) intron (NM_001289939, intron 2 of 8) 6491 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 159.25-146 chr8 78463566 78463884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52615 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 173.5-136 chr5 179316689 179317024 + 0.75 NA intron (NM_014244, intron 2 of 21) AluJo|SINE|Alu 28605 NM_014244 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 118.75-110 chr2 169577200 169577542 + 0.75 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3450 NR_104020 79675 Hs.529276 NM_024622 ENSG00000138399 FASTKD1 - FAST kinase domains 1 protein-coding 164-150 chrX 16329632 16329995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 162332 NM_001277307 645864 Hs.632792 NM_001277307 ENSG00000182798 MAGEB17 - MAGE family member B17 protein-coding 179.5 chr1 13750863 13751179 + 0.75 NA intron (NM_001135610, intron 6 of 7) intron (NM_001135610, intron 6 of 7) 1606 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 122.25-51 chr13 48759032 48759332 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 105253 NM_001308476 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 115-181 chr8 102402246 102402505 + 0.75 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) intron (NM_001282873, intron 1 of 58) 10314 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 130-170 chr8 112572596 112572811 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 22 of 66) intron (NM_001363185, intron 22 of 66) -70790 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 202.25-68 chr5 117076347 117076813 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -314371 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 184-80 chr6 130074023 130074351 + 0.75 NA intron (NM_001007102, intron 12 of 21) intron (NM_001007102, intron 12 of 21) 54543 NM_001346550 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 126-172 chr8 84789258 84789489 + 0.75 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) intron (NM_001354322, intron 3 of 6) 83446 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 173.25-113 chr7 11099244 11099579 + 0.75 NA intron (NR_033436, intron 15 of 16) intron (NR_033436, intron 15 of 16) 125539 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 187.5-37 chr11 103427153 103427558 + 0.75 NA intron (NM_001377, intron 84 of 88) intron (NM_001377, intron 84 of 88) 317929 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 173.25-135 chr9 27157832 27158067 + 0.75 NA exon (NM_000459, exon 2 of 23) exon (NM_000459, exon 2 of 23) 48808 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 145.5-83 chr18 3384054 3384429 + 0.75 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -27686 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 126.25-147 chr5 18989745 18990101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 896349 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 190.75-61 chr22 26846545 26847005 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -13436 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 142.75-207 chrX 64872454 64872732 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 103857 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 276.5-36 chr2 237015914 237016575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39923 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 141.75-155 chr6 135935608 135935905 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) intron (NM_018945, intron 1 of 12) 84055 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 119.25-130 chr3 94915272 94915544 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22855 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 247.25-3 chr1 232384629 232385055 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 130766 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 164.75-25 chr11 2149135 2149394 + 0.75 NA TTS (NR_028043) TTS (NR_028043) 339 NM_001007139 3481 Hs.272259 NM_000612 ENSG00000167244 IGF2 C11orf43|GRDF|IGF-II|PP9974 insulin like growth factor 2 protein-coding 165-72 chr2 149846802 149847266 + 0.75 NA intron (NR_145421, intron 2 of 4) intron (NR_145421, intron 2 of 4) 12157 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 167.25-20 chr10 114962067 114962385 + 0.75 NA intron (NM_139169, intron 4 of 7) AluSx3|SINE|Alu 24031 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 114.75-32 chr11 13123643 13123905 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 114458 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 115.25-51 chr12 120126439 120126745 + 0.75 NA TTS (NM_006836) TTS (NM_006836) -9839 NM_006861 11021 Hs.524788 NM_006861 ENSG00000111737 RAB35 H-ray|RAB1C|RAY RAB35, member RAS oncogene family protein-coding 282-52 chr8 139394573 139395430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 308122 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 113.5-217 chr7 30657403 30657616 + 0.75 NA intron (NM_001202481, intron 10 of 13) intron (NM_001202481, intron 10 of 13) 24947 NM_001883 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 199.25-50 chr18 29009577 29009900 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -832608 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 133.5-213 chr5 96269352 96269696 + 0.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1MA4|LINE|L1 162635 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 146-64 chr2 66371023 66371363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12113 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 133.25-56 chr15 49509424 49509885 + 0.75 NA intron (NM_001330293, intron 9 of 10) intron (NM_001330293, intron 9 of 10) 86412 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 157.25-121 chr5 80402983 80403309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4918 NR_146173 9765 Hs.482660 NM_014733 ENSG00000039319 ZFYVE16 PPP1R69 zinc finger FYVE-type containing 16 protein-coding 177.5-35 chr12 41825288 41825580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61245 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 136-109 chr3 112266484 112266698 + 0.75 NA intron (NR_135297, intron 6 of 22) intron (NR_135297, intron 6 of 22) 27625 NM_183061 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 144.5-143 chr4 44478003 44478240 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -29312 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 133-48 chr14 65877721 65878058 + 0.75 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 406787 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 184.5-77 chr2 94766915 94767242 + 0.75 NA intron (NR_003366, intron 22 of 23) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -5894 NR_038409 90499 Hs.458439 NR_038409 FAM95A - family with sequence similarity 95 member A ncRNA 173.25-9 chr1 175076145 175076541 + 0.75 NA intron (NM_022093, intron 1 of 18) intron (NM_022093, intron 1 of 18) 8510 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 230-32 chr2 21051407 21051784 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -7522 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 114.5-143 chr2 143473271 143473475 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 343954 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 144.25-150 chr4 140740402 140740709 + 0.75 NA intron (NM_015130, intron 1 of 20) LTR34|LTR|ERV1 15830 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 215.5-103 chr8 24356710 24357126 + 0.75 NA non-coding (NR_130710, exon 23 of 23) non-coding (NR_130710, exon 23 of 23) -27367 NM_001145271 27299 Hs.521459 NM_014479 ENSG00000134028 ADAMDEC1 M12.219 ADAM like decysin 1 protein-coding 151.75-38 chr13 26351020 26351319 + 0.75 NA intron (NM_001318368, intron 3 of 12) intron (NM_001318368, intron 3 of 12) 97040 NM_001346501 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 120.5-107 chr2 18264671 18264901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 295867 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 140.25-125 chr4 38392472 38392733 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 25688 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 151-104 chr4 138302036 138302304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7541 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 191.5-71 chr2 49904802 49905099 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 69253 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 222.5-77 chr4 73614105 73614525 + 0.75 NA intron (NM_201431, intron 1 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 6121 NM_177532 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 128.25-27 chr11 127887414 127887771 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -321174 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 230.5-101 chr6 23538002 23538557 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -587936 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 177.25-128 chr6 79153362 79153829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75341 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 270.5-25 chr16 89500345 89500842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7795 NM_001363850 6687 Hs.185597 NM_003119 ENSG00000197912 SPG7 CAR|CMAR|PGN|SPG5C SPG7 matrix AAA peptidase subunit, paraplegin protein-coding 208.5-47 chr16 8585756 8586162 + 0.75 NA intron (NM_001290097, intron 2 of 3) intron (NM_001290097, intron 2 of 3) 3879 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 197.5-22 chr11 95950636 95951167 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26694 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 198.75-9 chr1 218654049 218654387 + 0.75 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 144123 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 116.5-72 chr14 66549837 66550114 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 42568 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 236-53 chr5 11010286 11010852 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 17 of 20) intron (NM_001288715, intron 17 of 20) -249335 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 121-68 chr14 78808084 78808355 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 9 of 20) intron (NR_073547, intron 9 of 20) -391763 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 119.75-70 chr16 56941852 56942111 + 0.75 NA intron (NM_001010989, intron 6 of 7) L2c|LINE|L2 9839 NM_001272103 9709 Hs.146393 NM_014685 ENSG00000051108 HERPUD1 HERP|Mif1|SUP homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 protein-coding 175.25-153 chrX 44740551 44740966 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -103263 NM_022076 63904 Hs.534478 NM_022076 ENSG00000189037 DUSP21 LMWDSP21 dual specificity phosphatase 21 protein-coding 176.75-7 chr1 76070337 76070652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4252 NM_001349107 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 246.25-12 chr11 102591083 102591638 + 0.75 NA intron (NM_004771, intron 8 of 9) intron (NM_004771, intron 8 of 9) 33972 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 216.75-9 chr10 20391244 20391649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160524 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 124.25-107 chr2 186037730 186037996 + 0.75 NA intron (NR_110218, intron 5 of 5) intron (NR_110218, intron 5 of 5) 48454 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 126.5-4 chr1 25443057 25443365 + 0.75 NA intron (NM_018202, intron 1 of 10) intron (NM_018202, intron 1 of 10) 12314 NM_018202 55219 Hs.189782 NM_018202 ENSG00000204178 MACO1 MACOILIN|TMEM57 macoilin 1 protein-coding 205.75-7 chr10 91030648 91031100 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2292 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 141.25-133 chr5 40316200 40316478 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 264048 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 217.75-36 chr2 32479142 32479637 + 0.75 NA intron (NM_016252, intron 36 of 73) intron (NM_016252, intron 36 of 73) -52764 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 268.5-51 chr5 166548709 166549222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 377405 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 251-24 chr15 58961532 58961926 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -25934 NM_001330331 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 134.25-165 chr6 156698670 156698955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79043 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 167-23 chr10 120285184 120285550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69856 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 160-51 chr2 15045751 15046218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 413267 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 193-23 chr15 25035153 25035560 + 0.75 NA non-coding (NR_146168, exon 1 of 1) non-coding (NR_146168, exon 1 of 1) 3483 NR_146168 100506965 Hs.592473 NR_146168 PWAR6 HBT8|PAR-6 Prader Willi/Angelman region RNA 6 ncRNA 139.25-208 chr9 72119150 72119516 + 0.75 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 4738 NM_001242507 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 142.5-75 chr15 83842579 83842944 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 7 of 29) intron (NM_207517, intron 7 of 29) 188638 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 146.75-50 chr15 25451554 25451781 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -12611 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 228.75-60 chr4 120073938 120074373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7307 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 192.25-59 chr2 174996046 174996427 + 0.75 NA intron (NR_038133, intron 1 of 11) intron (NR_038133, intron 1 of 11) 9017 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 262.25-43 chr6 134763916 134764610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 185838 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 135.5-104 chr2 76417062 76417287 + 0.75 NA Intergenic MER88|LTR|ERVL -568791 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 133-188 chr9 104683826 104684164 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10427 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 140.75-151 chr5 92053046 92053365 + 0.75 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -669888 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 251.25-43 chr5 104867900 104868329 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -231360 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 130.75-143 chr4 63079791 63080005 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -918133 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 260.75-22 chr19 24366063 24366458 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -202813 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 137.75-47 chr12 120845782 120846072 + 0.75 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) AluSz6|SINE|Alu 58431 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 167.75-152 chrX 110529206 110529571 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 9076 NR_002718 6998 Hs.592361 NR_002718 ENSG00000225366 TDGF1P3 CR-3|CRIPTO|CRIPTO-3|CRIPTO3|TDGF1|TDGF2|TDGF3 teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 pseudo 140.5-49 chr12 65051877 65052238 + 0.75 NA intron (NM_007191, intron 9 of 9) intron (NM_007191, intron 9 of 9) -59766 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 139.5-111 chr2 208686730 208687025 + 0.75 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 144235 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 200.5-103 chr4 88131858 88132376 + 0.75 NA intron (NM_001257386, intron 3 of 15) intron (NM_001257386, intron 3 of 15) 26522 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 175.5-79 chr18 43049733 43050106 + 0.75 NA intron (NM_001272077, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 65766 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 124.25-188 chr7 78761400 78761690 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) AluSx1|SINE|Alu -247443 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 121.5-54 chr12 9209059 9209346 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_002864) promoter-TSS (NM_002864) -807 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 218-41 chr20 53327638 53328223 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 142647 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 153.75-8 chr1 169571436 169571701 + 0.75 NA intron (NM_000130, intron 3 of 24) MIRb|SINE|MIR 14963 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 220.75-52 chr4 117008607 117009079 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 76733 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 179.5-6 chr1 64018972 64019340 + 0.75 NA intron (NM_005012, intron 2 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 93049 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 157-90 chr4 128422395 128422667 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -5485 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 254.75-6 chr10 70325266 70325634 + 0.75 NA intron (NR_103467, intron 1 of 2) MER45C|DNA|hAT-Tip100 -41446 NM_022146 64106 Hs.302026 NM_022146 ENSG00000148734 NPFFR1 GPR147|NPFF1|NPFF1R1|OT7T022 neuropeptide FF receptor 1 protein-coding 235.5-2 chr1 39744575 39745160 + 0.75 NA intron (NM_001319293, intron 6 of 9) intron (NM_001319293, intron 6 of 9) 6022 NR_036543 10450 Hs.524690 NM_006112 ENSG00000084072 PPIE CYP-33|CYP33 peptidylprolyl isomerase E protein-coding 169.75-25 chr11 26421508 26421877 + 0.75 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) L1PA13|LINE|L1 -52210 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 165.75-7 chr1 151953460 151953896 + 0.75 NA Intergenic LTR66|LTR|ERVL 40181 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 145.5-185 chr7 123170043 123170328 + 0.75 NA intron (NM_022444, intron 3 of 14) intron (NM_022444, intron 3 of 14) 29784 NM_022444 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 186-28 chr14 65256139 65256581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34013 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 263.25-25 chr17 35665901 35666380 + 0.75 NA intron (NM_001282, intron 14 of 20) intron (NM_001282, intron 14 of 20) -65499 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 229.5-137 chr8 136838499 136838923 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) MER57B1|LTR|ERV1 307913 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 137.25-30 chr12 4055539 4055761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -182202 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 158.75-33 chr11 103235196 103235548 + 0.75 NA intron (NM_001377, intron 61 of 88) intron (NM_001377, intron 61 of 88) 125946 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 113.75-23 chr10 48222168 48222415 + 0.75 NA intron (NM_001018071, intron 12 of 28) intron (NM_001018071, intron 12 of 28) 29466 NM_001318191 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 114.75-188 chr8 50893107 50893398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 729121 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 113-12 chr1 195477910 195478155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 610683 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 211.75-57 chr22 46717825 46718293 + 0.75 NA intron (NM_022766, intron 3 of 12) AluSx1|SINE|Alu 20193 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 186.75-48 chr2 37217085 37217430 + 0.75 NA intron (NM_005760, intron 5 of 15) AluJb|SINE|Alu 14339 NM_005760 10153 Hs.135406 NM_005760 ENSG00000115816 CEBPZ CBF|CBF2|HSP-CBF|NOC1 CCAAT enhancer binding protein zeta protein-coding 195.5-79 chr2 170598826 170599215 + 0.75 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) L2b|LINE|L2 115547 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 178.25-108 chr7 27803422 27803753 + 0.75 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 63492 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 139.25-192 chr8 41803836 41804186 + 0.75 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -6389 NM_000037 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 203-26 chr11 87087787 87088187 + 0.75 NA intron (NR_033149, intron 3 of 13) AluSp|SINE|Alu 50053 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 161-86 chr5 6239857 6240213 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 97257 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 148-4 chr1 84509081 84509498 + 0.75 NA intron (NM_001310156, intron 1 of 13) L1MA3|LINE|L1 -2708 NM_005274 2787 Hs.645427 NM_005274 ENSG00000174021 GNG5 - G protein subunit gamma 5 protein-coding 210.75-37 chr2 63385480 63385979 + 0.75 NA intron (NR_148704, intron 11 of 18) L1MEc|LINE|L1 52278 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 238.75-55 chr6 48826252 48826796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 636729 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 115.75-110 chr2 115458108 115458345 + 0.75 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 114411 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 159.75-141 chr5 129159809 129160081 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 62257 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 144.75-13 chr1 221853778 221854203 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13324 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 193.25-47 chr2 4424525 4424786 + 0.75 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 231567 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 161.75-24 chr10 55054857 55055114 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1PA12|LINE|L1 -253694 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 182.25-73 chr3 24302387 24302650 + 0.75 NA intron (NM_001354710, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 151194 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 206-53 chr3 160289878 160290264 + 0.75 NA intron (NM_001190242, intron 11 of 18) MER21-int|LTR|ERVL 64435 NM_001168214 401097 Hs.729755 NM_001168214 ENSG00000180044 C3orf80 - chromosome 3 open reading frame 80 protein-coding 138.25-53 chr14 95100477 95100800 + 0.75 NA intron (NM_001291628, intron 21 of 26) intron (NM_001291628, intron 21 of 26) 32865 NM_001195573 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 223.5-132 chr8 122323097 122323556 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 245318 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 309-24 chr20 56084077 56084552 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -78795 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 200.75-105 chr8 77379599 77379937 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70929 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 143.5-7 chr1 53782636 53782992 + 0.75 NA intron (NR_033142, intron 15 of 16) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -43650 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 145-133 chr6 13046478 13046754 + 0.75 NA intron (NM_001322314, intron 1 of 12) intron (NM_001322314, intron 1 of 12) 33062 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 122-97 chr2 107960678 107960931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25720 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 129.25-120 chr3 8568491 8568808 + 0.75 NA TTS (NM_001278234) TTS (NM_001278234) -3133 NR_024065 29931 Hs.433151 NM_013343 LINC00312 ERR-10|ERR10|LMCD1DN|LOH3CR2A|NAG-7|NAG7|NCRNA00312 long intergenic non-protein coding RNA 312 ncRNA 124.5-121 chr20 9540148 9540432 + 0.75 NA intron (NM_020341, intron 10 of 10) L1ME3|LINE|L1 -25292 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 220.25-70 chr7 30485702 30486135 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -7052 NM_001354849 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 156.25-115 chr5 17712970 17713351 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57522 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 123-97 chr2 41732179 41732395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -145268 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 174-50 chr2 55886637 55886926 + 0.75 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) intron (NM_001039349, intron 4 of 10) 37001 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 256.25-3 chr10 12056931 12057525 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11726 NM_018706 55526 Hs.104980 NM_018706 ENSG00000181192 DHTKD1 AMOXAD|CMT2Q dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1 protein-coding 139.75 chr1 33102571 33102960 + 0.75 NA TTS (NM_001301826) TTS (NM_001301826) 20587 NM_001301825 113451 Hs.101807 NM_052998 ENSG00000142920 AZIN2 ADC|AZI2|AZIB1|ODC-p|ODC1L|ODCp antizyme inhibitor 2 protein-coding 141.75-134 chr5 31928457 31928651 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) AluSx|SINE|Alu 7605 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 144.5-234 chr9 37323204 37323657 + 0.75 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -99266 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 139.75-191 chr9 100837851 100838156 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -190724 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 134.5-117 chr20 60437411 60437696 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 35423 NR_109903 101928048 Hs.572803 NR_109903 LOC101928048 - uncharacterized LOC101928048 ncRNA 174.25-73 chr18 77944355 77944701 + 0.75 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 49199 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 115-95 chr2 236522203 236522409 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14771 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 171.75-69 chr2 182684 183086 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 73455 NM_001282687 26751 Hs.515951 NM_015677 ENSG00000035115 SH3YL1 RAY SH3 and SYLF domain containing 1 protein-coding 212.25-48 chr2 177001085 177001616 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 211061 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 152.5-47 chr14 61043170 61043529 + 0.75 NA intron (NR_033344, intron 9 of 16) intron (NR_033344, intron 9 of 16) -61659 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 134.75-228 chr8 132644142 132644485 + 0.75 NA intron (NR_135912, intron 3 of 11) intron (NR_135912, intron 3 of 11) 31232 NM_001321963 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 149.5-72 chr16 81375871 81376135 + 0.75 NA intron (NM_022041, intron 9 of 10) L1ME2|LINE|L1 -9015 NR_039871 100616150 NR_039871 ENSG00000284473 MIR4720 - microRNA 4720 ncRNA 217-73 chr5 162886684 162887131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -550664 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 150.25-107 chr3 182605290 182605503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98272 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 142.75-79 chr17 29262215 29262627 + 0.75 NA 3' UTR (NM_020772, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_020772, exon 4 of 4) 15564 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 119 chr1 8804443 8804702 + 0.75 NA intron (NM_012102, intron 1 of 23) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 13068 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 116.75-67 chr15 71766124 71766380 + 0.75 NA intron (NM_001286429, intron 10 of 11) intron (NM_001286429, intron 10 of 11) -44302 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 175.5-68 chr16 75149043 75149392 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001318475, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_001318475, exon 1 of 4) 166 NM_001318475 162239 Hs.388813 NM_153688 ENSG00000184517 ZFP1 ZNF475 ZFP1 zinc finger protein protein-coding 161.5-158 chr5 123620901 123621216 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 75641 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 165.5-19 chr10 54627127 54627450 + 0.75 NA intron (NR_134503, intron 4 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -19331 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 113-29 chr10 92070010 92070253 + 0.75 NA intron (NM_001178137, intron 9 of 9) MER103C|DNA|hAT-Charlie 146361 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 141-40 chr13 76518491 76518967 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 367676 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 133-159 chr7 92840553 92840789 + 0.75 NA intron (NR_110088, intron 1 of 1) intron (NR_110088, intron 1 of 1) -4044 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 139.25-133 chr4 35181489 35181835 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -911915 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 248.25-25 chr16 62002386 62002889 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 33801 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 134.5-60 chr14 49966574 49966837 + 0.75 NA TTS (NR_106724) TTS (NR_106724) 306 NR_106724 102464828 NR_106724 ENSG00000278038 MIR6076 hsa-mir-6076 microRNA 6076 ncRNA 142.75-76 chr16 73515603 73515961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128977 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 133.75-25 chr10 103638660 103638884 + 0.75 NA intron (NM_001365079, intron 2 of 8) intron (NM_001365079, intron 2 of 8) 39443 NM_001365079 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 149.75-23 chr11 43310603 43310835 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1277 NM_001243747 8539 Hs.435771 NM_006595 ENSG00000166181 API5 AAC-11|AAC11 apoptosis inhibitor 5 protein-coding 129.25-99 chr2 176667314 176667534 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29670 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 162-6 chr1 161201050 161201307 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001166159) promoter-TSS (NM_001166159) -969 NM_001166159 4720 Hs.173611 NM_004550 ENSG00000158864 NDUFS2 CI-49|MC1DN6 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2 protein-coding 144-6 chr1 86647757 86648071 + 0.75 NA non-coding (NR_024604, exon 11 of 15) non-coding (NR_024604, exon 11 of 15) 13638 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 161.25-71 chr17 35133912 35134202 + 0.75 NA intron (NM_018096, intron 10 of 12) intron (NM_018096, intron 10 of 12) 8194 NM_001014445 54475 Hs.85570 NM_018096 ENSG00000073536 NLE1 NLE notchless homolog 1 protein-coding 113.5-232 chr8 85228869 85229231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8628 NM_001099671 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 159.75-56 chr16 7722509 7722805 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 389812 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 211.25-91 chr8 68753326 68753778 + 0.75 NA intron (NM_001349479, intron 9 of 11) intron (NM_001349479, intron 9 of 11) 350638 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 134.5-238 chr9 34107795 34107983 + 0.75 NA intron (NM_015397, intron 2 of 8) intron (NM_015397, intron 2 of 8) 18809 NM_015397 25853 Hs.493750 NM_015397 ENSG00000198876 DCAF12 CT102|KIAA1892|TCC52|WDR40A DDB1 and CUL4 associated factor 12 protein-coding 183.5-70 chr2 133252117 133252542 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) L3b|LINE|CR1 -13866 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 172-45 chr18 7861518 7861801 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 294343 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 156.25-10 chr1 212137602 212138073 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 60224 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 129.5-97 chr17 73478351 73478579 + 0.75 NA intron (NM_001144952, intron 2 of 44) intron (NM_001144952, intron 2 of 44) -35218 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 120.25-118 chr21 26702868 26703226 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -129761 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 115.25-81 chr17 70133571 70133809 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001291622, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001291622, exon 6 of 6) 28845 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 134.5-130 chr3 81333942 81334188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 340197 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 183.5-81 chr20 7923920 7924219 + 0.75 NA intron (NM_017545, intron 2 of 7) intron (NM_017545, intron 2 of 7) 16389 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 175.25-10 chr1 200359085 200359519 + 0.75 NA intron (NR_040064, intron 4 of 4) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 14490 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 184.5-143 chr7 94582244 94582751 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 72688 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 127.25-54 chr13 90806119 90806326 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 120375 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 132.5-162 chr3 74128526 74128869 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 319453 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 139.5-161 chr4 162112185 162112471 + 0.75 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) AluJr4|SINE|Alu 51672 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 134.75-177 chr5 104142913 104143205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -580270 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 156-6 chr1 157326905 157327191 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -188457 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 142-28 chr11 28032771 28033097 + 0.75 NA intron (NM_031217, intron 15 of 16) L1MA3|LINE|L1 -23881 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 259.25-30 chr4 41455589 41456198 + 0.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) -82264 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 137.5-100 chr17 78163891 78164093 + 0.75 NA intron (NM_001163075, intron 3 of 4) intron (NM_001163075, intron 3 of 4) -4553 NM_004710 9144 Hs.464210 NM_004710 ENSG00000108639 SYNGR2 - synaptogyrin 2 protein-coding 144.25-71 chr16 53170406 53170598 + 0.75 NA intron (NM_001352127, intron 2 of 38) L1MC4|LINE|L1 14576 NM_001308319 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 195.75-17 chr10 16010105 16010661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149850 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 122.5-60 chr14 53528024 53528381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 374848 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 156-102 chr3 108394456 108394727 + 0.75 NA intron (NM_014981, intron 36 of 41) intron (NM_014981, intron 36 of 41) 82806 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 173.25-44 chr15 64232461 64232930 + 0.75 NA intron (NM_001329607, intron 4 of 11) intron (NM_001329607, intron 4 of 11) -69540 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 198.75-22 chr12 85837904 85838387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1736 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 128.75-112 chr21 15193266 15193469 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128367 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 183.5-8 chr1 117365027 117365342 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2265 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 202.25-92 chr8 99214390 99214870 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) intron (NM_017890, intron 17 of 61) 201364 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 176.5-42 chr12 85164173 85164730 + 0.75 NA intron (NM_001079910, intron 24 of 26) MIR|SINE|MIR -115769 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 216.5-133 chrX 105610554 105610912 + 0.75 NA intron (NM_017416, intron 6 of 10) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -211806 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 171.5-2 chr1 67636754 67637034 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -48307 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 155.75-139 chr6 54042498 54042857 + 0.75 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 4917 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 307.75-4 chr14 28685921 28686457 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 79130 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 156-103 chr3 112138598 112138884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5318 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 139.75-73 chr17 32998691 32999016 + 0.75 NA TTS (NM_001317225) TTS (NM_001317225) 6002 NM_001317225 124912 Hs.434112 NM_173847 ENSG00000141316 SPACA3 ALLP17|CT54|LYC3|LYZC|LYZL3|SLLP1 sperm acrosome associated 3 protein-coding 200.25-71 chr20 49866283 49866689 + 0.75 NA intron (NR_048540, intron 8 of 11) L1ME1|LINE|L1 2627 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 114-123 chr5 18397497 18397808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 590378 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 179.75-125 chr7 52221781 52222248 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -813619 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 148.25-53 chr17 55041092 55041554 + 0.75 NA intron (NM_178509, intron 10 of 17) AluJb|SINE|Alu -72538 NM_001162861 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 163-90 chr5 13607335 13607769 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 336928 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 115.75-221 chr8 126426892 126427205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101553 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 121.75-140 chr5 26347972 26348253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 690474 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 128.5-18 chr1 192075584 192075824 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82758 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 153-4 chr1 166614601 166614858 + 0.75 NA intron (NR_002925, intron 3 of 6) L1ME3|LINE|L1 10813 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 175.5-78 chr18 13475052 13475351 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 15254 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 131.75-164 chr5 29892895 29893212 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12493 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 132-60 chr15 77315600 77315887 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 -90339 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 112.5-30 chr11 4917317 4917596 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1793 NM_001005238 81282 Hs.542302 NM_001005238 ENSG00000176893 OR51G2 OR11-28 olfactory receptor family 51 subfamily G member 2 protein-coding 139.25-139 chr4 95784479 95784793 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55457 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 164-119 chr6 129015326 129015663 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 132353 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 140-111 chr3 95069843 95070071 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 131694 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 214-71 chr9 72529331 72529805 + 0.75 NA intron (NM_138691, intron 1 of 23) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7767 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 117.75-88 chr18 52654718 52655003 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 314663 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 222.5-35 chr15 90767917 90768455 + 0.75 NA intron (NM_001287246, intron 11 of 22) AluSx|SINE|Alu 50840 NM_000057 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 229.75-33 chr2 82335827 82336263 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -520758 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 152.5-42 chr14 39842426 39842821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -410123 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 149.25-115 chr3 47246190 47246462 + 0.75 NA intron (NM_001134878, intron 13 of 21) intron (NM_001134878, intron 13 of 21) 4283 NR_145712 109617025 NR_145712 SNORD13J - small nucleolar RNA, C/D box 13J snoRNA 142.5-175 chr5 103324047 103324410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64804 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 171.5-7 chr1 222047987 222048280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69613 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 249.5-94 chr8 99396170 99396775 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 21 of 61) intron (NM_017890, intron 21 of 61) 140258 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 116.75-46 chr12 16209845 16210106 + 0.75 NA intron (NM_001170798, intron 7 of 8) L2a|LINE|L2 67710 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 281.25-19 chr18 9798460 9799036 + 0.75 NA intron (NM_006868, intron 3 of 6) AluJr4|SINE|Alu -87225 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 169-102 chr7 105167790 105168094 + 0.75 NA intron (NM_182692, intron 5 of 15) intron (NM_182692, intron 5 of 15) 101135 NM_001350744 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 116.25-178 chr5 42658989 42659263 + 0.75 NA intron (NM_001242403, intron 3 of 9) intron (NM_001242403, intron 3 of 9) 93262 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 112.25-136 chr3 144375895 144376097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 402915 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 200-12 chr10 54055395 54055714 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) intron (NM_001354411, intron 19 of 34) -430676 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 216-71 chr6 70350788 70351240 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -43188 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 134.5-180 chr5 110350001 110350322 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 163754 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 204-78 chr8 51554815 51555203 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 254436 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 136.5-76 chr14 103307402 103307712 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -9727 NR_135269 105378183 Hs.132624 NR_135269 LOC105378183 - uncharacterized LOC105378183 ncRNA 134-160 chr7 16578630 16578940 + 0.75 NA intron (NM_001195280, intron 7 of 8) intron (NM_001195280, intron 7 of 8) 51960 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 143-85 chr21 28688475 28688822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 149330 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 168.25-18 chr10 85168344 85168725 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 30371 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 138-127 chr5 43785616 43785873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -182514 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 160.5-14 chr10 51635106 51635408 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 64338 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 203.25-100 chr7 103543628 103544044 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 42 of 64) L1MB5|LINE|L1 -97629 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 232.75-60 chr6 148256842 148257370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15222 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 181.75-86 chr3 138221464 138222047 + 0.75 NA intron (NM_213654, intron 3 of 12) intron (NM_213654, intron 3 of 12) 34224 NM_001282342 25852 Hs.744868 NM_014154 ENSG00000114098 ARMC8 GID5|HSPC056|S863-2|VID28 armadillo repeat containing 8 protein-coding 201-74 chr8 59862482 59862918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 418700 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 128-131 chr5 149843767 149844003 + 0.75 NA intron (NM_001172698, intron 9 of 10) L1MB2|LINE|L1 71945 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 145.75-119 chr5 10509130 10509483 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_134290) promoter-TSS (NR_134290) -112 NR_134290 389273 Hs.519206 NR_134289 ENSG00000249160 LINC02213 - long intergenic non-protein coding RNA 2213 ncRNA 188.5-11 chr10 33614722 33615039 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157800 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 151.25-21 chr10 81649334 81649647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -225704 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 336.25-20 chr9 78923720 78924279 + 0.75 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 221667 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 148.25-153 chr9 37304086 37304350 + 0.75 NA exon (NM_032226, exon 4 of 9) exon (NM_032226, exon 4 of 9) -118478 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 230.75-54 chr4 165455760 165456136 + 0.75 NA intron (NM_001873, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 69706 NR_030304 693163 NR_030304 ENSG00000207559 MIR578 MIRN578|hsa-mir-578 microRNA 578 ncRNA 133.25-216 chr8 127542984 127543257 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -60981 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 175-3 chr1 78380627 78380927 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -110197 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 152.25-68 chr17 78681792 78682225 + 0.75 NA intron (NM_001365041, intron 10 of 12) HAL1|LINE|L1 35024 NM_001292019 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 160-79 chr4 94419400 94419790 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32262 NM_001011515 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 173.75-72 chr17 64084797 64085253 + 0.75 NA intron (NM_001433, intron 2 of 21) L2a|LINE|L2 45119 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 172-10 chr1 197119296 197119623 + 0.75 NA intron (NM_001206846, intron 16 of 26) intron (NM_001206846, intron 16 of 26) 27210 NM_018136 259266 Hs.121028 NM_018136 ENSG00000066279 ASPM ASP|Calmbp1|MCPH5 abnormal spindle microtubule assembly protein-coding 178.25-4 chr1 111025105 111025583 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -61400 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 168.75-140 chr7 111709964 111710286 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -98380 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 122.5-122 chr2 187567985 187568178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13576 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 149.75-123 chr5 3459308 3459588 + 0.75 NA intron (NR_147000, intron 2 of 2) intron (NR_147000, intron 2 of 2) 6632 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 133.75-85 chr18 6424327 6424636 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -9222 NM_001365765 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 196.75-16 chr10 79999043 79999525 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -50179 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 206.75-12 chr11 114498278 114498781 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 59062 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 144.25-194 chr7 111959595 111960052 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 8 of 52) intron (NM_001363540, intron 8 of 52) 151318 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 274.75-38 chr4 93426120 93426680 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 9 of 14) intron (NM_001286838, intron 9 of 14) -402353 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 125.25-20 chr10 10333361 10333585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128876 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 121-85 chr18 4593005 4593225 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137808 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 123.5-73 chr16 50292575 50292755 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106829) promoter-TSS (NR_106829) 49 NR_106829 102465462 NR_106829 ENSG00000274969 MIR6771 hsa-mir-6771 microRNA 6771 ncRNA 167-87 chr4 58807510 58807842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176606 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 115-105 chr3 56075955 56076228 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) intron (NR_132749, intron 7 of 17) -223497 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 186.75-59 chr2 216710310 216710824 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15018 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 130.25-124 chr22 27039960 27040275 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 20401 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 145.5-36 chr11 83784389 83784650 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) -102094 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 124.75-106 chr19 29209560 29209763 + 0.75 NA intron (NM_006003, intron 1 of 1) intron (NM_006003, intron 1 of 1) 3490 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 136.75-7 chr1 87999032 87999328 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -627525 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 187-90 chr7 38376989 38377314 + 0.75 NA non-coding (NR_040085, exon 4 of 4) non-coding (NR_040085, exon 4 of 4) 35574 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 129.75-34 chr11 34614090 34614358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6869 NM_001206615 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 166.5-35 chr11 21986909 21987204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -206029 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 137.75-105 chr2 128055421 128055666 + 0.75 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 -27484 NM_001330299 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 124.75-218 chr9 101930787 101931063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -192345 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 145-13 chr1 191013892 191014166 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 214469 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 220-58 chr7 64559031 64559548 + 0.75 NA intron (NM_001130022, intron 1 of 3) intron (NM_001130022, intron 1 of 3) 3782 NM_178558 340252 Hs.520886 NM_178558 ENSG00000173041 ZNF680 - zinc finger protein 680 protein-coding 184.5-146 chr7 139672009 139672290 + 0.75 NA intron (NM_001113239, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 105849 NM_022740 28996 Hs.731417 NM_022740 ENSG00000064393 HIPK2 PRO0593 homeodomain interacting protein kinase 2 protein-coding 237.75-13 chr12 68639139 68639744 + 0.75 NA intron (NM_015646, intron 1 of 7) intron (NM_015646, intron 1 of 7) -12066 NR_033335 100379132 Hs.724530 NR_033335 ENSG00000206650 SNORA70G U70G small nucleolar RNA, H/ACA box 70G snoRNA 295.75-28 chr7 4797610 4798254 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018059, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_018059, exon 15 of 15) -9293 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 128-119 chr4 127543455 127543682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89389 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 132-16 chr10 44255624 44255849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37014 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 138.25-70 chr18 2465144 2465375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106246 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 226.75-15 chr12 131486070 131486517 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 138823 NR_103736 338797 Hs.592007 NM_001025466 LINC02370 - long intergenic non-protein coding RNA 2370 ncRNA 169.25-50 chr2 12951709 12952025 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 55146 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 193.5-47 chr14 26206399 26206709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 346876 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 127.25-102 chr20 7388548 7388804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17068 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 194.25-9 chr10 67472645 67473133 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) MER41B|LTR|ERV1 -69479 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 212.75-63 chr3 46259185 46259641 + 0.75 NA intron (NM_178329, intron 1 of 1) MER31-int|LTR|ERV1 16953 NM_001837 1232 Hs.506190 NM_001837 ENSG00000183625 CCR3 CC-CKR-3|CD193|CKR3|CMKBR3 C-C motif chemokine receptor 3 protein-coding 147-28 chr14 56593762 56594234 + 0.75 NA intron (NM_017799, intron 3 of 15) intron (NM_017799, intron 3 of 15) 14200 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 120.25-107 chr20 3646152 3646385 + 0.75 NA intron (NM_139321, intron 28 of 28) intron (NM_139321, intron 28 of 28) 17131 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 149.5-70 chr16 74083438 74083737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131934 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 140.5-31 chr11 39640232 39640492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 652768 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 137.5-233 chr8 81179557 81179944 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67682 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 124.5-192 chr6 79924812 79925034 + 0.75 NA intron (NM_022726, intron 3 of 5) intron (NM_022726, intron 3 of 5) 22630 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 182.75-82 chr3 140900449 140900867 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -41178 NM_001104647 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 174-90 chr7 35809842 35810112 + 0.75 NA intron (NM_001788, intron 1 of 12) intron (NM_001788, intron 1 of 12) 8758 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 124.5-236 chr9 23370994 23371347 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 301229 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 157.5-50 chr14 28947023 28947390 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -161419 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 146.75-63 chr17 66995360 66995702 + 0.75 NA intron (NM_014405, intron 1 of 3) intron (NM_014405, intron 1 of 3) 30824 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 143.5-13 chr1 191965276 191965711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -192969 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 148.75-171 chr8 121843219 121843503 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -201921 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 117-55 chr14 54491632 54491912 + 0.75 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -2792 NM_004124 2764 Hs.151413 NM_004124 ENSG00000197045 GMFB GMF glia maturation factor beta protein-coding 213-45 chr2 84076656 84077146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213781 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 211.25-4 chr1 84843238 84843728 + 0.75 NA intron (NM_012152, intron 2 of 2) intron (NM_012152, intron 2 of 2) 49723 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 115.5-92 chr17 27974854 27975088 + 0.75 NA intron (NR_146896, intron 2 of 4) intron (NR_146896, intron 2 of 4) 16736 NR_146896 105371708 Hs.385535 NR_146896 LINC01992 - long intergenic non-protein coding RNA 1992 ncRNA 140.25-127 chr4 47644459 47644825 + 0.75 NA intron (NM_006587, intron 14 of 21) L1ME4a|LINE|L1 -8027 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 113-94 chr2 119124317 119124659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34263 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 124.5-51 chr12 106919198 106919387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36430 NM_001319664 90488 Hs.257664 NM_152261 ENSG00000151135 TMEM263 C12orf23 transmembrane protein 263 protein-coding 183.25-41 chr17 32562404 32562720 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) AluJb|SINE|Alu 75569 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 192-90 chr7 6632200 6632587 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4925 NM_001278559 100131017 Hs.112668 NM_001278559 ENSG00000205903 ZNF316 MZF-3 zinc finger protein 316 protein-coding 142-52 chr15 34271933 34272218 + 0.75 NA intron (NM_001042497, intron 1 of 23) AluSg4|SINE|Alu 46745 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 113.5-109 chr18 49811617 49811924 + 0.75 NA intron (NM_006111, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR 1763 NM_006111 10449 Hs.200136 NM_006111 ENSG00000167315 ACAA2 DSAEC acetyl-CoA acyltransferase 2 protein-coding 138-116 chr4 68079388 68079788 + 0.75 NA intron (NM_207407, intron 3 of 9) intron (NM_207407, intron 3 of 9) -16291 NR_027094 401135 Hs.130270 NM_001014372 SYT14P1 CHR415SYT|SYT14L|SYTDEP synaptotagmin 14 pseudogene 1 pseudo 195-18 chr11 5918430 5918926 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 17913 NM_001005166 390082 NM_001005166 ENSG00000277932 OR52E5 OR11-56 olfactory receptor family 52 subfamily E member 5 protein-coding 291-8 chr12 27559056 27559495 + 0.75 NA intron (NM_003622, intron 1 of 29) AluSg|SINE|Alu 35069 NM_003622 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 123-122 chr21 26996175 26996422 + 0.75 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -29210 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 161.5-124 chr22 32612753 32613058 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 137668 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 120-138 chr4 178723073 178723261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -815231 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 165.5-60 chr16 66313828 66314100 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -52727 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 135.75-28 chr10 76950748 76951101 + 0.75 NA intron (NM_001271519, intron 21 of 28) intron (NM_001271519, intron 21 of 28) 62880 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 120.5-139 chr3 30448587 30448764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70193 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 185.25-54 chr2 31985805 31986155 + 0.75 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24684 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 149.5-60 chr14 67645692 67645929 + 0.75 NA intron (NM_001172, intron 4 of 7) intron (NM_001172, intron 4 of 7) 25890 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 131.75-18 chr1 203702683 203702974 + 0.75 NA intron (NM_001001396, intron 7 of 21) intron (NM_001001396, intron 7 of 21) -26753 NR_003019 677843 Hs.676135 NR_003019 ENSG00000221643 SNORA77 ACA63|SNORA77A small nucleolar RNA, H/ACA box 77 snoRNA 127.75-136 chr3 179144762 179144956 + 0.75 NA intron (NR_125401, intron 1 of 2) L1MEf|LINE|L1 3114 NR_125401 101928739 Hs.434553 NR_125401 ENSG00000229102 LOC101928739 - uncharacterized LOC101928739 ncRNA 154.25-34 chr12 17356840 17357171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232073 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 147.5-189 chr6 106567832 106568051 + 0.75 NA intron (NM_001371242, intron 21 of 21) intron (NM_001371242, intron 21 of 21) 56086 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 116.25-33 chr11 26793738 26793941 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71779 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 213-25 chr13 68244213 68244681 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 640878 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 117.25-115 chr2 107194137 107194455 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 155229 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 236.75-69 chrX 64858491 64858979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117715 NR_045044 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 155.75-65 chr17 20763577 20763878 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 51281 NR_073509 100287072 Hs.676308 NR_073509 LOC100287072 - ribosomal protein S6 kinase B1 pseudogene pseudo 172.5-158 chr5 106424502 106424880 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 586323 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 112.5-128 chr2 166334242 166334506 + 0.75 NA intron (NM_001365536, intron 1 of 26) intron (NM_001365536, intron 1 of 26) 41570 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 131.25-157 chr4 143515113 143515399 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_104027) promoter-TSS (NR_104027) -419 NR_104027 100128055 Hs.707570 NR_104027 ENSG00000245112 SMARCA5-AS1 - SMARCA5 antisense RNA 1 ncRNA 186-40 chr18 59376046 59376452 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16984 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 118.75-148 chr5 36862366 36862648 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 14187 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 156-136 chr6 141224783 141225151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 541153 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 198 chr1 29155831 29156322 + 0.75 NA intron (NM_005626, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 25824 NM_005626 6429 Hs.469970 NM_005626 ENSG00000116350 SRSF4 SFRS4|SRP75 serine and arginine rich splicing factor 4 protein-coding 145.25-116 chr4 72948576 72948979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 120939 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 140.75-63 chr16 61504517 61504821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -448903 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 250.25-33 chr3 41362179 41362721 + 0.75 NA intron (NM_001322500, intron 35 of 35) intron (NM_001322500, intron 35 of 35) 162945 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 122.25-52 chr13 73665223 73665434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101084 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 119.5-244 chr8 125337041 125337291 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -93192 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 116-142 chr6 112651878 112652174 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 304696 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 115.25-199 chr8 49119297 49119552 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 47080 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 131.5-145 chr22 26635235 26635507 + 0.75 NA Intergenic MER106B|DNA|hAT-Charlie 13408 NM_001886 1413 Hs.57690 NM_001886 ENSG00000196431 CRYBA4 CTRCT23|CYRBA4|MCOPCT4 crystallin beta A4 protein-coding 121.5-153 chr2 237047607 237047864 + 0.75 NA TTS (NR_135202) TTS (NR_135202) 8432 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 157-94 chr5 68616336 68616616 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 323899 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 175.75-34 chr14 25000336 25000661 + 0.75 NA intron (NM_001351940, intron 1 of 6) MER39B|LTR|ERV1 48502 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 171.25-60 chr17 55588450 55588894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134192 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 122.5-160 chr3 185812995 185813201 + 0.75 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) 8033 NM_001291873 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 128-63 chr18 61541368 61541671 + 0.75 NA intron (NM_031891, intron 9 of 11) intron (NM_031891, intron 9 of 11) -206657 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 145.75-86 chr2 146822275 146822639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 235400 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 157-4 chr1 109609165 109609441 + 0.75 NA intron (NM_005272, intron 3 of 7) intron (NM_005272, intron 3 of 7) 3781 NM_005272 2780 Hs.36973 NM_005272 ENSG00000134183 GNAT2 ACHM4|GNATC G protein subunit alpha transducin 2 protein-coding 144.5-153 chr4 100576572 100576895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58711 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 150-77 chr2 182194084 182194385 + 0.75 NA intron (NM_005019, intron 10 of 14) intron (NM_005019, intron 10 of 14) 47829 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 162-25 chr11 59161580 59161975 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -9653 NM_001300727 23220 Hs.523696 NM_015177 ENSG00000110042 DTX4 RNF155 deltex E3 ubiquitin ligase 4 protein-coding 143-62 chr18 62083706 62084058 + 0.75 NA intron (NM_176787, intron 27 of 30) intron (NM_176787, intron 27 of 30) 103174 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 165.75-47 chr13 111868071 111868370 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -25158 NR_046992 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 226.5-84 chr6 90517876 90518287 + 0.75 NA intron (NM_145332, intron 15 of 15) intron (NM_145332, intron 15 of 15) 68991 NM_003188 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 240.75-43 chr2 88211650 88212155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38763 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 168-57 chr17 22241309 22241692 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 38505 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 133.5-200 chr5 27146102 27146348 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -107639 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 185.75-32 chr12 15468672 15469033 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) -77759 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 286-16 chr19 51706973 51707437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13749 NR_108100 102238594 Hs.640185 NR_108100 ENSG00000269959 SPACA6P-AS LINC01129 SPACA6P antisense RNA ncRNA 178.5-69 chr18 2069094 2069447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 502235 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 149.75-140 chr6 25086594 25086832 + 0.75 NA intron (NR_002174, intron 11 of 12) intron (NR_002174, intron 11 of 12) -44425 NM_001286446 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 138.75-20 chr10 70895588 70895808 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7133 NM_000281 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 115.5-175 chr3 127398010 127398215 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -7442 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 123.75-133 chr4 36178485 36178738 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 8 of 32) intron (NR_146894, intron 8 of 32) 65328 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 183-106 chr7 46362127 46362527 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 334795 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 136.25-188 chr8 122530072 122530348 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 38434 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 144.75-136 chr5 86043251 86043582 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -239028 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 243.75-60 chr4 33894629 33895085 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 145036 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 145.25-23 chr11 110089585 110089815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3692 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 235-44 chr3 88107438 88107906 + 0.75 NA intron (NM_001350135, intron 2 of 6) L1MEd|LINE|L1 42194 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 133.5-175 chr4 33118985 33119255 + 0.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 768082 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 314.75-8 chr18 10477190 10477694 + 0.75 NA intron (NM_153000, intron 3 of 4) intron (NM_153000, intron 3 of 4) 22807 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 145.75-66 chr18 13160086 13160324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58555 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 182.75-14 chr1 189485781 189486255 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 989992 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 132.75-129 chr3 181372583 181372862 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1ME3E|LINE|L1 69764 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 144.75-121 chr4 73080139 73080357 + 0.75 NA intron (NM_032217, intron 30 of 33) intron (NM_032217, intron 30 of 33) -10489 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 187-19 chr10 108322338 108322760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -253256 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 114.75-119 chr3 18205077 18205341 + 0.75 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) LTR78|LTR|ERV1 220130 NM_001195470 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 146.5-105 chr2 99976829 99977064 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) Plat_L3|LINE|CR1 128637 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 161.25-40 chr12 117878645 117878949 + 0.75 NA intron (NM_173598, intron 1 of 19) intron (NM_173598, intron 1 of 19) 90193 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 125.25-188 chr7 40198700 40199034 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) AluSx|SINE|Alu 63891 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 211.5-162 chr8 117212373 117212739 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 77561 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 303-3 chr10 97442108 97442765 + 0.75 NA intron (NM_001318362, intron 2 of 6) MER3|DNA|hAT-Charlie 3570 NM_016046 51013 Hs.632089 NM_016046 ENSG00000171311 EXOSC1 CGI-108|CSL4|Csl4p|SKI4|Ski4p|p13 exosome component 1 protein-coding 148.5-128 chr20 57654392 57654677 + 0.75 NA intron (NM_001255976, intron 2 of 3) intron (NM_001255976, intron 2 of 3) -34108 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 118-185 chr8 92204359 92204588 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -101088 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 169.75-35 chr12 20348691 20348951 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20424 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 185.25-70 chr20 23241558 23242006 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109009 NM_013248 29107 Hs.516933 NM_013248 ENSG00000132661 NXT1 MTR2|P15 nuclear transport factor 2 like export factor 1 protein-coding 116.25-54 chr12 105805864 105806056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 99186 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 147-159 chr9 115038369 115038605 + 0.75 NA intron (NM_002160, intron 19 of 27) MIRc|SINE|MIR 79670 NM_002160 3371 Hs.143250 NM_002160 ENSG00000041982 TNC 150-225|DFNA56|GMEM|GP|HXB|JI|TN|TN-C tenascin C protein-coding 151-51 chr19 3983965 3984308 + 0.75 NA exon (NM_001961, exon 2 of 15) exon (NM_001961, exon 2 of 15) 1327 NM_001961 1938 Hs.515070 NM_001961 ENSG00000167658 EEF2 EEF-2|EF-2|EF2|SCA26 eukaryotic translation elongation factor 2 protein-coding 210.25-35 chr18 45781744 45782072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43767 NM_213602 284266 Hs.287692 NM_213602 ENSG00000197046 SIGLEC15 CD33L3|HsT1361|SIGLEC-15 sialic acid binding Ig like lectin 15 protein-coding 124.5-32 chr11 57428758 57428979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1288 NM_017611 29015 Hs.99962 NM_014096 ENSG00000134802 SLC43A3 EEG1|ENBT1|FOAP-13|PRO1659|SEEEG-1 solute carrier family 43 member 3 protein-coding 124.5-158 chr4 159357071 159357342 + 0.75 NA intron (NM_001351727, intron 24 of 24) AluJr|SINE|Alu 89397 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 140.5-243 chr8 140325282 140325526 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) L1MEg|LINE|L1 132340 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 131.75-140 chr3 109612074 109612358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9388 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 171.5-127 chr6 64058421 64058735 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) intron (NM_001292009, intron 33 of 43) 251742 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 258.25-35 chr3 88174971 88175546 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 25299 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 117.5-66 chr14 98699939 98700218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11535 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 216.25-42 chr16 4194871 4195203 + 0.75 NA intron (NM_001098814, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 47043 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 122.25-67 chr15 80212818 80213012 + 0.75 NA intron (NM_001352888, intron 1 of 2) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 39298 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 273.5-36 chr2 236734907 236735291 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165274 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 233.75-39 chr2 130871863 130872330 + 0.75 NA intron (NM_001367493, intron 1 of 13) intron (NM_001367493, intron 1 of 13) 35182 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 118.5-23 chr10 89247440 89247655 + 0.75 NA exon (NM_000235, exon 2 of 10) exon (NM_000235, exon 2 of 10) 4228 NM_000235 3988 Hs.643030 NM_000235 ENSG00000107798 LIPA CESD|LAL lipase A, lysosomal acid type protein-coding 135.25-33 chr10 102911806 102912098 + 0.75 NA intron (NR_160733, intron 1 of 2) intron (NR_160733, intron 1 of 2) -6342 NM_199076 54805 Hs.643509 NM_017649 ENSG00000148842 CNNM2 ACDP2|HOMG6|HOMGSMR cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2 protein-coding 123-2 chr1 22624143 22624527 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 9031 NR_106742 102466615 NR_106742 ENSG00000276835 MIR6127 hsa-mir-6127 microRNA 6127 ncRNA 209.5-121 chr5 61511287 61511720 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 4 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -126257 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 136.5-92 chr18 6327086 6327419 + 0.75 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 31778 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 123.5-124 chr22 39681709 39681972 + 0.75 NA intron (NM_001003406, intron 33 of 35) intron (NM_001003406, intron 33 of 35) 111087 NM_021096 8911 Hs.125116 NM_021096 ENSG00000100346 CACNA1I Cav3.3|ca(v)3.3 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I protein-coding 136-37 chr14 26151098 26151359 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 402202 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 167.75-17 chr1 248066577 248066921 + 0.75 NA intron (NM_001304535, intron 1 of 1) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 6067 NM_001004687 391192 Hs.690412 NM_001004687 ENSG00000198128 OR2L3 - olfactory receptor family 2 subfamily L member 3 protein-coding 242.25-19 chr12 4063119 4063693 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -189958 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 127-88 chr18 4044304 4044632 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) AluSg4|SINE|Alu 82115 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 148.75-136 chr5 94414007 94414211 + 0.75 NA intron (NM_001145678, intron 15 of 20) intron (NM_001145678, intron 15 of 20) 204495 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 151-17 chr10 44207376 44207607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85259 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 166-71 chr20 2122591 2122872 + 0.75 NA intron (NM_080836, intron 3 of 3) intron (NM_080836, intron 3 of 3) 20904 NM_080836 140901 Hs.100057 NM_080836 ENSG00000125834 STK35 CLIK1|STK35L1 serine/threonine kinase 35 protein-coding 242.75-35 chr20 31074945 31075591 + 0.75 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -182396 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 190.25-89 chr3 196079910 196080341 + 0.75 NA intron (NM_001313966, intron 1 of 16) AluSz|SINE|Alu 1965 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 112.25-14 chr10 13113803 13114136 + 0.75 NA intron (NM_001008213, intron 6 of 15) AluJb|SINE|Alu 13806 NM_001008212 10133 Hs.332706 NM_021980 ENSG00000123240 OPTN ALS12|FIP2|GLC1E|HIP7|HYPL|NRP|TFIIIA-INTP optineurin protein-coding 229.25-54 chr3 97941536 97941890 + 0.75 NA TTS (NM_032778) TTS (NM_032778) 30718 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 258.75-16 chr11 90641584 90642018 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) AluSg7|SINE|Alu -85944 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 224.5-53 chr18 21010437 21010874 + 0.75 NA intron (NM_005406, intron 13 of 32) L1MD2|LINE|L1 101158 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 153.25-83 chr22 27341495 27341845 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 31019 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 122.75-13 chr1 177649084 177649300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51332 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 115.5-201 chr5 36941733 36941953 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 65074 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 136.25-53 chr14 31998906 31999138 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 54169 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 182-53 chr19 52108196 52108539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12602 NM_001369826 284371 Hs.665751 NM_001136499 ENSG00000197608 ZNF841 - zinc finger protein 841 protein-coding 184-86 chr7 54825482 54825815 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 66335 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 144.75-103 chr21 21655554 21655786 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 81649 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 146.5-217 chr8 40840033 40840405 + 0.75 NA intron (NM_024645, intron 1 of 6) LTR16A|LTR|ERVL 57607 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 172.25-80 chr21 26754326 26754723 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 90885 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 125.25-25 chr10 54614760 54615007 + 0.75 NA intron (NR_134503, intron 3 of 5) intron (NR_134503, intron 3 of 5) -6926 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 113.25-164 chr8 13499098 13499393 + 0.75 NA exon (NM_182643, exon 2 of 18) exon (NM_182643, exon 2 of 18) 15606 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 119.75-196 chr8 59364465 59364647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 245346 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 205.25-74 chr3 193356449 193356885 + 0.75 NA intron (NM_198505, intron 5 of 29) intron (NM_198505, intron 5 of 29) 22086 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 138.25-50 chr14 63712955 63713397 + 0.75 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 L2|LINE|L2 14889 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 113.25-15 chr10 5698111 5698297 + 0.75 NA intron (NM_017782, intron 1 of 20) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 13366 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 132-122 chr4 36166899 36167140 + 0.75 NA exon (NM_015230, exon 10 of 33) exon (NM_015230, exon 10 of 33) 76920 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 209.75-57 chr2 160375082 160375460 + 0.75 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 32611 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 118.25-157 chr5 74502977 74503246 + 0.75 NA intron (NR_126354, intron 1 of 2) intron (NR_126354, intron 1 of 2) 33865 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 115.75-18 chr10 59406816 59407054 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -43754 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 164.75-15 chr10 9612697 9613049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -317280 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 209-13 chr12 20396171 20396479 + 0.75 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 27080 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 142.25-28 chr11 58747172 58747420 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15322 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 171.25-125 chr5 117424725 117425072 + 0.75 NA intron (NR_046089, intron 1 of 5) LTR41C|LTR|ERVL 9386 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 241-40 chr5 87805404 87805809 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 143564 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 147.25-133 chr7 96087617 96087876 + 0.75 NA intron (NM_001278422, intron 15 of 15) intron (NM_001278422, intron 15 of 15) 132010 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 148.5-133 chr22 28623050 28623490 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEa|LINE|L1 56595 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 153-7 chr1 186986507 186986787 + 0.75 NA intron (NM_024420, intron 17 of 17) intron (NM_024420, intron 17 of 17) -106195 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 112.25-162 chr5 32723922 32724190 + 0.75 NA intron (NM_000908, intron 1 of 7) L1MC4|LINE|L1 12735 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 126.5-12 chr1 117073523 117073860 + 0.75 NA exon (NM_003594, exon 4 of 23) exon (NM_003594, exon 4 of 23) 13365 NM_003594 8458 Hs.32333 NM_003594 ENSG00000116830 TTF2 HuF2|ZGRF6 transcription termination factor 2 protein-coding 205-77 chr8 86298870 86299228 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -43498 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 123-23 chr10 58912703 58913104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86615 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 163-85 chr4 129074242 129074518 + 0.75 NA intron (NM_001300898, intron 2 of 5) intron (NM_001300898, intron 2 of 5) 19159 NM_001300898 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 216-81 chr8 140292212 140292533 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 11 of 22) MIRb|SINE|MIR 165372 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 113.25-79 chr19 31681617 31682018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 89536 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 164.5-81 chr17 73705796 73706068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31922 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 136.5-93 chr18 11893026 11893333 + 0.75 NA intron (NR_040241, intron 4 of 11) intron (NR_040241, intron 4 of 11) 15138 NR_040241 65258 Hs.712666 NM_023075 ENSG00000154889 MPPE1 PGAP5 metallophosphoesterase 1 protein-coding 112.25-195 chr7 17891103 17891373 + 0.75 NA intron (NM_001350862, intron 4 of 25) intron (NM_001350862, intron 4 of 25) 49256 NM_001350867 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 142.75-53 chr12 127313172 127313670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26651 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 138.75-80 chr2 11400249 11400545 + 0.75 NA non-coding (NR_047499, exon 2 of 3) non-coding (NR_047499, exon 2 of 3) 6416 NR_047499 100874055 Hs.102428 NR_047499 ENSG00000224177 LINC00570 ncRNA-a5 long intergenic non-protein coding RNA 570 ncRNA 120.75-51 chr15 60171721 60171899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 167499 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 113.5-94 chr16 25678745 25678943 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -13115 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 171.25-83 chr2 215479562 215479979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26063 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 133.25-209 chr8 83287409 83287595 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116256 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 196-93 chr7 125908464 125908894 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -644388 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 209.25-36 chr16 9782140 9782570 + 0.75 NA intron (NM_001134408, intron 11 of 13) MER2|DNA|TcMar-Tigger -326850 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 114-19 chr10 73374560 73374766 + 0.75 NA TTS (NM_001320880) TTS (NM_001320880) -15799 NM_001367801 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 139.5-115 chr20 15145272 15145566 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) Charlie25|DNA|hAT-Charlie -51421 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 155.75-156 chr7 118424267 118424522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199690 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 144.5-46 chr12 1841080 1841425 + 0.75 NA intron (NM_172364, intron 25 of 37).2 MamRTE1|LINE|RTE-BovB 20687 NM_001163926 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 164.25-55 chr17 72945845 72946264 + 0.75 NA intron (NM_139177, intron 5 of 9) intron (NM_139177, intron 5 of 9) 146634 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 209.75-37 chr17 57737498 57737862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7619 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 163.25-79 chr20 39746761 39746995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257583 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 146.5-138 chr3 50574327 50574627 + 0.75 NA intron (NM_001317851, intron 4 of 10) intron (NM_001317851, intron 4 of 10) -3450 NM_001171741 51161 Hs.517860 NM_016210 ENSG00000088543 C3orf18 G20 chromosome 3 open reading frame 18 protein-coding 184.75-59 chr20 37886193 37886612 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16725 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 149.25-4 chr1 36181457 36181811 + 0.75 NA TTS (NM_001286365) TTS (NM_001286365) 25474 NM_001286365 55700 Hs.356096 NM_018067 ENSG00000116871 MAP7D1 PARCC1|RPRC1 MAP7 domain containing 1 protein-coding 185.25-57 chr2 74019822 74020247 + 0.75 NA intron (NM_001287491, intron 3 of 11) intron (NM_001287491, intron 3 of 11) 17342 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 152.5-197 chr9 103906060 103906315 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -93522 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 116.5-213 chr6 34727173 34727432 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -29792 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 177-43 chr2 56755507 56755950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -569958 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 138.75-2 chr1 67095471 67095813 + 0.75 NA intron (NM_001276351, intron 6 of 7) intron (NM_001276351, intron 6 of 7) 39328 NR_075077 400757 Hs.666621 NM_001013674 ENSG00000203963 C1orf141 - chromosome 1 open reading frame 141 protein-coding 148.75-164 chr8 48977057 48977330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55764 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 115.5-167 chr3 87906160 87906360 + 0.75 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -76316 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 162.75-108 chr4 108633306 108633826 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 12937 NM_001319234 6164 Hs.438227 NM_000995 ENSG00000109475 RPL34 L34 ribosomal protein L34 protein-coding 217-22 chr14 69042038 69042337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62505 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 193.25-26 chr12 4052130 4052530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -178882 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 113.5-138 chr20 36045468 36045747 + 0.75 NA TTS (NR_027451) TTS (NR_027451) 5353 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 139.5-121 chr21 46316611 46316827 + 0.75 NA intron (NM_001286476, intron 3 of 8) intron (NM_001286476, intron 3 of 8) 1501 NM_001286463 54058 Hs.236572 NM_058180 ENSG00000160298 C21orf58 - chromosome 21 open reading frame 58 protein-coding 200.25-54 chr2 6530374 6530779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 103211 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 115.5-141 chr2 199136792 199137095 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 320996 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 160.25-134 chr5 178366815 178367145 + 0.75 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) L2b|LINE|L2 -134158 NM_001278346 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 160.25-47 chr15 68851644 68851990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30922 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 128.75-71 chr17 29752246 29752471 + 0.75 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) L1M5|LINE|L1 9074 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 138-45 chr14 90127335 90127684 + 0.75 NA intron (NM_022054, intron 1 of 1) intron (NM_022054, intron 1 of 1) 65515 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 142-26 chr11 17190413 17190663 + 0.75 NA intron (NM_002645, intron 1 of 32) AluSx|SINE|Alu 17448 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 129.75-170 chr7 31107239 31107606 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001199635, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001199635, exon 17 of 17) 54961 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 152.75-126 chr4 157830826 157831083 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258464 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 156.5-161 chr6 44063315 44063597 + 0.75 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) intron (NR_125864, intron 1 of 4) 11196 NR_125864 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 122.25-64 chr14 73330801 73331072 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -84935 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 219-93 chr8 91354656 91355029 + 0.75 NA intron (NM_134266, intron 11 of 18) intron (NM_134266, intron 11 of 18) 105523 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 196.25-37 chr14 73032251 73032673 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -5356 NM_021260 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 195-46 chr2 124467418 124467746 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 6 of 23) intron (NM_130773, intron 6 of 23) 442295 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 129-50 chr12 119147335 119147644 + 0.75 NA intron (NM_194286, intron 9 of 12) L1MC1|LINE|L1 28995 NR_134996 105370024 Hs.679286 NR_134996 ENSG00000256884 LOC105370024 - uncharacterized LOC105370024 ncRNA 128.25-100 chr2 129486735 129486996 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -212974 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 184.5-66 chr19 39105058 39105418 + 0.75 NA intron (NM_001363687, intron 10 of 10) AluSq2|SINE|Alu -20548 NM_001014834 10298 Hs.20447 NM_005884 ENSG00000130669 PAK4 - p21 (RAC1) activated kinase 4 protein-coding 130.75-28 chr11 65583009 65583399 + 0.75 NA exon (NM_001099409, exon 9 of 19) exon (NM_001099409, exon 9 of 19) 7151 NM_001099409 254102 Hs.502867 NM_001099409 ENSG00000173442 EHBP1L1 - EH domain binding protein 1 like 1 protein-coding 185-95 chrX 105915892 105916306 + 0.75 NA intron (NM_198465, intron 15 of 28) intron (NM_198465, intron 15 of 28) 93560 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 201.75-31 chr13 112573311 112573740 + 0.75 NA intron (NM_006322, intron 1 of 21) intron (NM_006322, intron 1 of 21) 14628 NM_001286277 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 218-52 chr4 116541327 116541660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 241768 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 210.75-77 chr5 52937346 52937653 + 0.75 NA exon (NM_181501, exon 24 of 29) exon (NM_181501, exon 24 of 29) -51853 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 155.25-119 chr3 82345889 82346182 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 359893 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 160.75-111 chr4 82163913 82164377 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 209846 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 144-62 chr2 161580134 161580519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44009 NM_001354450 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 146.5-61 chr14 44075124 44075475 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 431984 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 182.25-84 chr4 94254974 94255429 + 0.75 NA intron (NM_001254949, intron 1 of 15) intron (NM_001254949, intron 1 of 15) 1892 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 159.25-91 chr3 129464257 129464657 + 0.75 NA intron (NM_052990, intron 4 of 26) intron (NM_052990, intron 4 of 26) 24233 NM_052985 55764 Hs.655284 NM_018262 ENSG00000163913 IFT122 CED|CED1|SPG|WDR10|WDR10p|WDR140 intraflagellar transport 122 protein-coding 184.75-89 chr6 140429048 140429380 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 223962 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 193.25-4 chr1 104644707 104645020 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 571840 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 116-83 chr2 55993822 55994145 + 0.75 NA intron (NR_126406, intron 2 of 2) intron (NR_126406, intron 2 of 2) -4924 NR_029629 406998 NR_029629 ENSG00000207798 MIR216A MIR216|MIRN216|MIRN216A|miRNA216|mir-216|mir-216a microRNA 216a ncRNA 131.5-198 chr5 175524180 175524431 + 0.75 NA intron (NM_001322982, intron 10 of 10) L1ME3F|LINE|L1 45745 NM_001322980 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 136.75-107 chr2 159206857 159207099 + 0.75 NA intron (NM_001350065, intron 20 of 27) intron (NM_001350065, intron 20 of 27) 20143 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 112.5-190 chr5 30090776 30090979 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 210317 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 129.75-15 chr1 154468054 154468308 + 0.75 NA 3' UTR (NM_181359, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_181359, exon 9 of 9) -34038 NM_182499 126668 Hs.387671 NM_182499 ENSG00000163239 TDRD10 - tudor domain containing 10 protein-coding 205-71 chr7 101716789 101717204 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -87700 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 178.5-57 chr15 88725318 88725699 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77928 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 167.75-109 chr5 6485713 6486035 + 0.75 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) intron (NM_001145161, intron 1 of 1) 37015 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 136.75-9 chr1 99631778 99632044 + 0.75 NA intron (NR_031666, intron 1 of 4) intron (NR_031666, intron 1 of 4) -14202 NM_017734 54873 Hs.483993 NM_017734 ENSG00000099260 PALMD C1orf11|PALML palmdelphin protein-coding 152.5-66 chr17 9725614 9725906 + 0.75 NA intron (NM_001267576, intron 14 of 14) intron (NM_001267576, intron 14 of 14) 65832 NM_001220493 201140 Hs.61684 NM_001105571 ENSG00000184544 DHRS7C SDR32C2 dehydrogenase/reductase 7C protein-coding 162.25-120 chr4 167687207 167687460 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -405204 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 196.75-25 chr11 106160858 106161311 + 0.75 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -28968 NR_135099 105369473 Hs.524010 NR_135099 ENSG00000254580 LINC02719 - long intergenic non-protein coding RNA 2719 ncRNA 145-122 chr5 38279183 38279521 + 0.75 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) L1MA8|LINE|L1 11634 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 243.5-50 chr3 43154010 43154433 + 0.75 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -48142 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 185-83 chr8 36859279 36859579 + 0.75 NA intron (NM_001031836, intron 18 of 26) intron (NM_001031836, intron 18 of 26) 75055 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 264-13 chr11 128569935 128570370 + 0.75 NA intron (NM_001143820, intron 2 of 9) intron (NM_001143820, intron 2 of 9) 17406 NM_001143820 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 170-107 chr9 113506463 113506930 + 0.75 NA intron (NM_130795, intron 3 of 15) intron (NM_130795, intron 3 of 15) 5189 NM_130795 5998 Hs.494875 NM_017790 ENSG00000138835 RGS3 C2PA|RGP3 regulator of G protein signaling 3 protein-coding 240-56 chr7 38795422 38795884 + 0.75 NA intron (NM_014396, intron 8 of 28) intron (NM_014396, intron 8 of 28) -108564 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 154-37 chr13 31268281 31268659 + 0.75 NA intron (NM_194318, intron 7 of 14) intron (NM_194318, intron 7 of 14) 68495 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 214-12 chr11 104280707 104281100 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -116756 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 174.5-201 chrX 88821755 88822148 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 74726 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 113.75-20 chr10 19287522 19287698 + 0.75 NA intron (NM_001142308, intron 21 of 39) Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 238809 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 118-135 chr4 121309985 121310227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70912 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 123.75-196 chr8 129217514 129217889 + 0.75 NA intron (NR_033916, intron 2 of 2) intron (NR_033916, intron 2 of 2) 23539 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 159.75-116 chr4 41564206 41564594 + 0.75 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) 26243 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 147.75-31 chr12 96466947 96467336 + 0.75 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -22436 NM_001367885 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 161.75-103 chr5 36914767 36915038 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 38133 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 165.75-100 chr20 56826796 56827170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197677 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 181.5-106 chr3 44711780 44712110 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001134442) promoter-TSS (NM_001134442) -698 NM_001134440 91392 Hs.224843 NM_033210 ENSG00000196653 ZNF502 - zinc finger protein 502 protein-coding 140.75-18 chr10 55285256 55285607 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -313611 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 198.5-16 chr10 43000162 43000485 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 2760 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 123-154 chr5 25237194 25237389 + 0.75 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) intron (NR_136209, intron 1 of 3) 46338 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 152.5-163 chr6 37728524 37728965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30861 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 140.75-174 chr7 129348681 129348973 + 0.75 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -19553 NM_001130723 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 193.5-99 chr21 9760922 9761221 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 59990 NR_038377 441058 Hs.130535 NR_038377 LINC01667 - long intergenic non-protein coding RNA 1667 ncRNA 221-5 chr1 235421112 235421542 + 0.75 NA intron (NM_001287801, intron 5 of 17).2 AluJo|SINE|Alu 53900 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 158.25-10 chr10 48581254 48581640 + 0.75 NA intron (NM_001347736, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 23626 NM_001347735 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 211.5-114 chr4 55105132 55105453 + 0.75 NA intron (NM_002253, intron 12 of 29) intron (NM_002253, intron 12 of 29) 20303 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 127.5-242 chr8 112602822 112603033 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 20 of 66) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -40566 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 131.75-201 chr7 66934125 66934394 + 0.75 NA intron (NM_017994, intron 1 of 6) AluSq|SINE|Alu 13034 NM_017994 55069 Hs.488478 NM_017994 ENSG00000106609 TMEM248 C7orf42 transmembrane protein 248 protein-coding 192.25-34 chr17 63068299 63068587 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L1ME3Cz|LINE|L1 102208 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 174-94 chr7 73635181 73635621 + 0.75 NA Intergenic (CATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10879 NM_032954 51085 Hs.647055 NM_032951 ENSG00000009950 MLXIPL CHREBP|MIO|MLX|MONDOB|WBSCR14|WS-bHLH|bHLHd14 MLX interacting protein like protein-coding 112.75-127 chr22 27420213 27420413 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 109662 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 277.5-7 chr10 33181759 33182337 + 0.75 NA intron (NM_001330068, intron 15 of 15) AluJb|SINE|Alu -65241 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 297-24 chr19 51828699 51829495 + 0.75 NA intron (NR_163433, intron 9 of 11) intron (NR_163433, intron 9 of 11) 33940 NM_002030 2359 Hs.445466 NM_002030 ENSG00000187474 FPR3 FML2_HUMAN|FMLP-R-II|FMLPY|FPRH1|FPRH2|FPRL2|RMLP-R-I formyl peptide receptor 3 protein-coding 181.75-127 chr8 104968209 104968573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -350047 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 179.5-45 chr12 64074378 64074798 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 8 of 21) L2c|LINE|L2 147708 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 124.25-71 chr16 58838689 58838981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104519 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 151.25-2 chr1 39661470 39661911 + 0.75 NA intron (NM_032526, intron 4 of 5) intron (NM_032526, intron 4 of 5) 10348 NM_032526 84618 Hs.307006 NM_032526 ENSG00000116981 NT5C1A CN-I|CN-IA|CN1|CN1A|CNI 5'-nucleotidase, cytosolic IA protein-coding 157-123 chr9 27213802 27214188 + 0.75 NA intron (NM_001290077, intron 17 of 21) intron (NM_001290077, intron 17 of 21) 68798 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 157.5-203 chr8 51185993 51186231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 623333 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 180-46 chr17 40007619 40008072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7595 NM_172219 1440 Hs.2233 NM_000759 ENSG00000108342 CSF3 C17orf33|CSF3OS|GCSF colony stimulating factor 3 protein-coding 138-5 chr1 210472845 210473081 + 0.75 NA intron (NM_001122834, intron 8 of 11) MER4D1|LTR|ERV1 143597 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 142-5 chr1 112782944 112783284 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 62547 NM_182759 284467 Hs.439116 NM_182759 ENSG00000184599 TAFA3 FAM19A3|TAFA-3 TAFA chemokine like family member 3 protein-coding 112.5-80 chr14 90445485 90445687 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 9531 NR_146493 101930294 NR_146492 ENSG00000258678 LINC02317 - long intergenic non-protein coding RNA 2317 ncRNA 194-58 chr3 151772642 151772942 + 0.75 NA intron (NR_026915, intron 1 of 2) intron (NR_026915, intron 1 of 2) 2336 NR_026915 201651 Hs.383050 NR_026915 ENSG00000240602 AADACP1 - arylacetamide deacetylase pseudogene 1 pseudo 135.25-97 chr2 59114197 59114502 + 0.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -103359 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 152.5-175 chr7 6372997 6373405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1326 NM_006908 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 135.75-106 chr2 126431584 126432030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -224128 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 118.25-189 chr7 99896693 99896909 + 0.75 NA intron (NM_033091, intron 5 of 5) HERVL32-int|LTR|ERVL -19768 NM_001005276 81392 Hs.647523 NM_001005276 ENSG00000244623 OR2AE1 OR2AE2 olfactory receptor family 2 subfamily AE member 1 protein-coding 151.75-167 chrX 38399421 38399771 + 0.75 NA intron (NM_000531, intron 4 of 9) AluSx1|SINE|Alu 46992 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 116.5-105 chr19 42364820 42365130 + 0.75 NA intron (NM_001271938, intron 35 of 41) intron (NM_001271938, intron 35 of 41) 13844 NR_107044 102465875 NR_107044 ENSG00000277533 MIR8077 hsa-mir-8077 microRNA 8077 ncRNA 171.75-58 chr17 29841147 29841547 + 0.75 NA intron (NM_033389, intron 1 of 14) intron (NM_033389, intron 1 of 14) -79915 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 126.75-77 chr15 78048286 78048579 + 0.75 NA intron (NM_144572, intron 2 of 12) intron (NM_144572, intron 2 of 12) 29220 NM_144572 23102 Hs.567426 NM_015079 ENSG00000167202 TBC1D2B - TBC1 domain family member 2B protein-coding 160.75-91 chr20 59948413 59948862 + 0.75 NA TTS (NM_022106) TTS (NM_022106) 8248 NM_022106 63939 Hs.54973 NM_022106 ENSG00000196227 FAM217B C20orf177|dJ551D2.5 family with sequence similarity 217 member B protein-coding 155.75-105 chr3 100798294 100798547 + 0.75 NA intron (NM_001349332, intron 20 of 35) intron (NM_001349332, intron 20 of 35) 88878 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 204.5-122 chr7 47763759 47764055 + 0.75 NA intron (NR_038407, intron 2 of 2) intron (NR_038407, intron 2 of 2) 2431 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 131-35 chr11 117295965 117296222 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001207049) promoter-TSS (NM_001207049) -520 NM_001207048 23621 Hs.504003 NM_012104 ENSG00000186318 BACE1 ASP2|BACE|HSPC104 beta-secretase 1 protein-coding 155.75-132 chr5 82761264 82761563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78742 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 142-110 chr3 146161486 146161793 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_000935) promoter-TSS (NM_000935) -144 NM_000935 5352 Hs.477866 NM_000935 ENSG00000152952 PLOD2 BRKS2|LH2|TLH procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 protein-coding 183.25-7 chr1 189027267 189027697 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 1448528 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 194.25-27 chr14 44679240 44679712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119650 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 199-64 chr4 120322120 120322471 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -255447 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 141.75-33 chr11 50801378 50801601 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 392342 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 131.5-163 chr3 150167236 150167506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70928 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 189.5-92 chr3 122007115 122007457 + 0.75 NA intron (NM_001199799, intron 1 of 7) intron (NM_001199799, intron 1 of 7) 14961 NM_001199800 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 150.5-179 chr5 150580221 150580479 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -20726 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 171-61 chr19 43845095 43845488 + 0.75 NA intron (NM_181845, intron 6 of 6) LTR37-int|LTR|ERV1 17970 NM_181845 284349 Hs.652513 NM_181845 ENSG00000167637 ZNF283 HZF19|HZF41 zinc finger protein 283 protein-coding 192.75-64 chr2 193761278 193761622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -582819 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 221-17 chr12 108649414 108649797 + 0.75 NA intron (NM_001105237, intron 8 of 10) intron (NM_001105237, intron 8 of 10) 13795 NR_039717 100616240 NR_039717 ENSG00000284388 MIR4496 - microRNA 4496 ncRNA 199.25-47 chr17 63160101 63160413 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 194022 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 182.75-88 chr4 36463170 36463542 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -36928 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 175.25-70 chr2 86222467 86222723 + 0.75 NA intron (NM_001371279, intron 7 of 8) intron (NM_001371279, intron 7 of 8) 23138 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 199-34 chr2 25806256 25806641 + 0.75 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) intron (NM_018263, intron 2 of 11) -11757 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 143.5-53 chr13 77551442 77551699 + 0.75 NA intron (NM_003843, intron 1 of 31) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 15864 NM_003843 8796 Hs.534699 NM_003843 ENSG00000136155 SCEL - sciellin protein-coding 113.25-18 chr10 95515397 95515645 + 0.75 NA intron (NM_001290295, intron 1 of 24) intron (NM_001290295, intron 1 of 24) 45850 NM_024991 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 277.25-36 chr5 25172081 25172857 + 0.75 NA intron (NR_147006, intron 1 of 4) MER106A|DNA|hAT-Charlie 18187 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 123.25-113 chr2 209813090 209813342 + 0.75 NA intron (NM_032504, intron 7 of 63) L2c|LINE|L2 41223 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 114.5-205 chr5 34589063 34589223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67185 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 149.5-102 chr2 154369357 154369565 + 0.75 NA intron (NM_052917, intron 9 of 12) intron (NM_052917, intron 9 of 12) 87977 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 146.5-47 chr11 110724198 110724561 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -11190 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 127-40 chr12 19802091 19802345 + 0.75 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -212467 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 254.25-54 chr5 167602602 167602984 + 0.75 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) L2a|LINE|L2 29134 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 170.75-101 chr4 163108628 163108994 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15183 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 124.5-206 chr7 39589740 39589985 + 0.75 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) 23458 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 237.25 chr1 8919292 8919970 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -26237 NM_001270500 765 Hs.100322 NM_001215 ENSG00000131686 CA6 CA-VI|GUSTIN carbonic anhydrase 6 protein-coding 229.25-37 chr18 47563222 47563703 + 0.75 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) intron (NR_147192, intron 1 of 2) 182966 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 124.25-173 chr6 6162537 6162901 + 0.75 NA intron (NM_000129, intron 13 of 14) MIR|SINE|MIR -6615 NR_049863 100847034 NR_049863 ENSG00000283616 MIR5683 - microRNA 5683 ncRNA 129.25-212 chr8 131216997 131217307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176243 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 133-120 chr4 43871840 43872109 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -144887 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 148.5-41 chr12 25238624 25238870 + 0.75 NA intron (NM_001369786, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 12182 NM_004985 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 168.5-194 chr8 142289383 142289693 + 0.75 NA intron (NM_001366901, intron 10 of 13) intron (NM_001366901, intron 10 of 13) 91182 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 177-19 chr11 81438953 81439272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 451724 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 140.5-246 chr9 79338986 79339300 + 0.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -193477 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 127.25-105 chr20 17465890 17466202 + 0.75 NA intron (NM_002594, intron 11 of 11) intron (NM_002594, intron 11 of 11) 65333 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 123.5-47 chr11 128328603 128328934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 120002 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 113.75-160 chr5 120302441 120302761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161677 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 155-88 chr3 101760814 101761157 + 0.75 NA intron (NM_024548, intron 9 of 10) AluSq2|SINE|Alu -18226 NM_001348997 91775 Hs.595933 NM_145037 ENSG00000144815 NXPE3 FAM55C|MST115|MSTP115 neurexophilin and PC-esterase domain family member 3 protein-coding 197.25-41 chr18 13072374 13072791 + 0.75 NA intron (NM_032142, intron 28 of 44) intron (NM_032142, intron 28 of 44) 81220 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 150.75-70 chr16 2479875 2480142 + 0.75 NA intron (NM_020705, intron 1 of 6) AluSq|SINE|Alu 4881 NM_001199107 57465 Hs.353087 NM_020705 ENSG00000162065 TBC1D24 DFNA65|DFNB86|DOORS|EIEE16|FIME|TLDC6 TBC1 domain family member 24 protein-coding 163.25-47 chr15 39778210 39778634 + 0.75 NA intron (NM_001324338, intron 1 of 11) intron (NM_001324338, intron 1 of 11) 4419 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 115.25-174 chr6 41364490 41364760 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 29017 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 130.25-150 chr4 48588644 48588984 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 18 of 63) intron (NM_015030, intron 18 of 63) 98562 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 206.25-65 chr3 80106575 80106858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -338718 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 168.25-121 chr5 157973402 157973731 + 0.75 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -114421 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 232.5-32 chr15 97618492 97618896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57996 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 177.5-148 chr5 155372279 155372552 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 358660 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 134-72 chr17 43379067 43379273 + 0.75 NA non-coding (NR_027412, exon 3 of 6) non-coding (NR_027412, exon 3 of 6) 9728 NR_027412 100130581 Hs.546897 NR_027412 ENSG00000188825 LINC00910 - long intergenic non-protein coding RNA 910 ncRNA 122.75-16 chr1 207095198 207095454 + 0.75 NA intron (NM_001017365, intron 4 of 6) intron (NM_001017365, intron 4 of 6) 6043 NM_001017367 725 Hs.99886 NM_000716 ENSG00000123843 C4BPB C4BP complement component 4 binding protein beta protein-coding 139.5-9 chr1 222545155 222545531 + 0.75 NA intron (NM_024746, intron 1 of 8) intron (NM_024746, intron 1 of 8) 2761 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 240-25 chr17 58905810 58906186 + 0.75 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1MCa|LINE|L1 150129 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 117.25-185 chr6 62789219 62789531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -503148 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 167.25-125 chr5 36719984 36720215 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113493 NM_001166695 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 133.5-167 chr3 169261749 169261927 + 0.75 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -114367 NM_001164000 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 142.75-128 chr3 52460587 52460825 + 0.75 NA intron (NM_007184, intron 3 of 20) L1ME4a|LINE|L1 5102 NM_007184 11188 Hs.435290 NM_007184 ENSG00000010322 NISCH I-1|IR1|IRAS|hIRAS nischarin protein-coding 126.75-153 chr3 97092208 97092544 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 277782 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 139.5-85 chr18 3962520 3962760 + 0.75 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) HAL1ME|LINE|L1 287 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 118.5-114 chr20 3144801 3145137 + 0.75 NA intron (NR_038395, intron 6 of 6) intron (NR_038395, intron 6 of 6) 14896 NM_199415 22888 Hs.654646 NM_014948 ENSG00000185019 UBOX5 RNF37|UBCE7IP5|UIP5|hUIP5 U-box domain containing 5 protein-coding 171.75-41 chr14 61292170 61292633 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11063 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 268.25-2 chr10 29352892 29353417 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -56380 NR_110922 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 140.5-115 chr2 122682473 122682829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 390830 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 125.25-16 chr1 217233560 217233788 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -95972 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 203.5-31 chr11 96213154 96213609 + 0.75 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -128057 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 232.25-40 chr21 43850785 43851157 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -14252 NM_001369878 56894 Hs.248785 NM_020132 ENSG00000160216 AGPAT3 1-AGPAT 3|LPAAT-GAMMA1|LPAAT3 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 protein-coding 124-16 chr10 64667908 64668137 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -157506 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 175-80 chr21 26948691 26949140 + 0.75 NA intron (NM_007038, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR -5046 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 164.75-86 chr20 49852696 49853099 + 0.75 NA intron (NM_001260491, intron 7 of 15) MER4A1|LTR|ERV1 -10962 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 134.5-113 chr20 10442081 10442286 + 0.75 NA intron (NM_001009608, intron 1 of 7) intron (NM_001009608, intron 1 of 7) 6878 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 120.5-120 chr2 111944009 111944279 + 0.75 NA intron (NM_006343, intron 2 of 18) AluSx|SINE|Alu 45537 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 223.75-31 chr16 80999204 80999568 + 0.75 NA intron (NM_001351968, intron 1 of 4) L1P4|LINE|L1 -1710 NM_001351973 56942 Hs.55028 NM_020188 ENSG00000103121 CMC2 2310061C15Rik|C16orf61|DC13 C-X9-C motif containing 2 protein-coding 117-136 chr4 86092797 86092964 + 0.75 NA intron (NM_001363657, intron 8 of 13) intron (NM_001363657, intron 8 of 13) -26926 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 119.25 chr1 29676110 29676406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -326144 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 172.25-27 chr11 96254204 96254574 + 0.75 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -87049 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 182-55 chr2 27979335 27979617 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) L1PA15|LINE|L1 -16891 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 130-85 chr2 226120123 226120425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22520 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 122.75-192 chr7 124332423 124332691 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 19539 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 136.75-188 chr8 9174514 9174731 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14377 NR_125431 101929128 NR_125431 ENSG00000248538 LOC101929128 - uncharacterized LOC101929128 ncRNA 270.5-39 chr3 49699331 49699782 + 0.75 NA non-coding (NR_135218, exon 11 of 39) non-coding (NR_135218, exon 11 of 39) 9999 NM_022064 63891 Hs.553723 NM_022064 ENSG00000164068 RNF123 FP1477|KPC1 ring finger protein 123 protein-coding 160-27 chr12 124210248 124210658 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -78711 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 126.5-31 chr10 119278170 119278484 + 0.75 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 70756 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 198-25 chr14 105117278 105117736 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 23360 NR_110546 102723354 Hs.569410 NR_110546 LINC02298 - long intergenic non-protein coding RNA 2298 ncRNA 133.75-66 chr15 77103086 77103326 + 0.75 NA 3' UTR (NM_024776, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_024776, exon 8 of 8) -32097 NM_005724 10099 Hs.744863 NM_005724 ENSG00000140391 TSPAN3 TM4-A|TM4SF8|TSPAN-3 tetraspanin 3 protein-coding 182-99 chr7 7214692 7215007 + 0.75 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) LTR8|LTR|ERV1 32234 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 134-20 chr10 70618354 70618706 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15742 NM_005041 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 183.25-48 chr18 25094000 25094302 + 0.75 NA intron (NM_001308225, intron 4 of 6) intron (NM_001308225, intron 4 of 6) -106172 NR_146903 105372030 NR_146903 LINC01894 - long intergenic non-protein coding RNA 1894 ncRNA 249.75-17 chr12 109812556 109812971 + 0.75 NA intron (NM_001177431, intron 2 of 15) intron (NM_001177431, intron 2 of 15) 2033 NM_001177431 59341 Hs.506713 NM_021625 ENSG00000111199 TRPV4 BCYM3|CMT2C|HMSN2C|OTRPC4|SMAL|SPSMA|SSQTL1|TRP12|VRL2|VROAC transient receptor potential cation channel subfamily V member 4 protein-coding 172.75-123 chr8 5554574 5554838 + 0.75 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -559792 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 141.25-59 chr15 86353025 86353267 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 17 of 24) intron (NM_152336, intron 17 of 24) -36178 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 149.5-130 chr4 55563719 55563999 + 0.75 NA intron (NM_152401, intron 4 of 5) LTR49|LTR|ERV1 -16950 NM_004898 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 158.5 chr1 9078215 9078550 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -6123 NM_001328619 6518 Hs.530003 NM_003039 ENSG00000142583 SLC2A5 GLUT-5|GLUT5 solute carrier family 2 member 5 protein-coding 171.75-121 chr6 127498876 127499122 + 0.75 NA intron (NM_001012279, intron 4 of 11) L1MB7|LINE|L1 20025 NM_001012279 387104 Hs.319247 NM_001012279 ENSG00000255330 SOGA3 C6orf174|dJ403A15.3 SOGA family member 3 protein-coding 182.5-88 chr2 202745890 202746177 + 0.75 NA intron (NM_173511, intron 4 of 7) L1M2|LINE|L1 83201 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 144.75-111 chr3 103630009 103630212 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105994 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 181.75-103 chr5 8647605 8647867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186811 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 161.75-113 chr6 156050764 156051069 + 0.75 NA Intergenic MER127|DNA|TcMar-Tigger 104119 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 124.5-109 chr2 111078834 111079187 + 0.75 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1MD2|LINE|L1 36578 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 178.75-69 chr4 13455060 13455592 + 0.75 NA intron (NM_001017979, intron 4 of 6) L1M2c|LINE|L1 29014 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 145.75-125 chr5 58801653 58801887 + 0.75 NA intron (NM_138453, intron 3 of 4) LTR90A|LTR|LTR 198128 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 139.5-150 chr4 44158097 44158393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141183 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 205.25-86 chr5 90499683 90500391 + 0.75 NA intron (NM_001370352, intron 5 of 7) intron (NM_001370352, intron 5 of 7) 25173 NM_001370353 10622 Hs.282387 NM_006467 ENSG00000113356 POLR3G RPC32|RPC7 RNA polymerase III subunit G protein-coding 124-61 chr17 30923149 30923560 + 0.75 NA intron (NR_144488, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 1409 NM_018404 55803 Hs.514063 NM_018404 ENSG00000184060 ADAP2 CENTA2|HSA272195|cent-b ArfGAP with dual PH domains 2 protein-coding 116.25-182 chr5 89836938 89837181 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 179661 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 235.75-82 chr8 134828392 134828887 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9430 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 126-42 chr12 112668157 112668393 + 0.75 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) 26901 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 112.5-132 chr2 180540155 180540446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151804 NR_104321 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 204.25-105 chr7 19587312 19587887 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 117837 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 130.25-156 chr5 4122431 4122683 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 526725 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 167.25-90 chr2 150055214 150055604 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -196218 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 212-21 chr14 22528965 22529440 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 27860 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 118-55 chr14 75056642 75056814 + 0.75 NA intron (NR_126394, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 -5196 NM_001040108 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 174-15 chr11 37571068 37571401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -367367 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 176.5-81 chr2 15504999 15505317 + 0.75 NA intron (NR_052013, intron 10 of 50) L1MC4|LINE|L1 56176 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 167.75-103 chr4 106945236 106945723 + 0.75 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 90834 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 151.75-17 chr1 237935942 237936167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45132 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 152-106 chr3 161241946 161242245 + 0.75 NA intron (NM_015938, intron 10 of 15) intron (NM_015938, intron 10 of 15) 20805 NM_015938 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 168-86 chr3 168243800 168244025 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5610 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 160 chr1 26588854 26589275 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 34522 NR_031740 100302190 NR_031740 ENSG00000238705 MIR1976 hsa-mir-1976 microRNA 1976 ncRNA 137-64 chr17 63025631 63026047 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 59604 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 261.25-21 chr20 11525765 11526194 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -252596 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 185-43 chr2 65111014 65111311 + 0.75 NA intron (NM_015543, intron 1 of 3) AluSx3|SINE|Alu 18944 NM_004161 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 179.5-160 chr6 140088272 140088584 + 0.75 NA intron (NR_121622, intron 3 of 3) intron (NR_121622, intron 3 of 3) -97167 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 121.5-90 chr15 84656820 84657103 + 0.75 NA intron (NM_021077, intron 2 of 2) intron (NM_021077, intron 2 of 2) 1238 NM_205858 4828 Hs.386470 NM_021077 ENSG00000197696 NMB - neuromedin B protein-coding 123-47 chr14 33036197 33036379 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) intron (NM_001165893, intron 1 of 10) 97409 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 199-27 chr16 8406396 8406862 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 183209 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 188.5-151 chr8 105546525 105546910 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 227174 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 143.75-38 chr12 9256941 9257181 + 0.75 NA intron (NR_137429, intron 5 of 6) intron (NR_137429, intron 5 of 6) 17058 NR_137431 100499405 Hs.182314 NR_036466 ENSG00000237248 LINC00987 - long intergenic non-protein coding RNA 987 ncRNA 126.25-171 chr6 17468102 17468351 + 0.75 NA intron (NM_001363533, intron 4 of 9) intron (NM_001363533, intron 4 of 9) 43039 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 148.25-3 chr1 39275523 39275875 + 0.75 NA intron (NM_012090, intron 5 of 92) L1M5|LINE|L1 -133374 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 202.25-74 chr6 26054741 26055087 + 0.75 NA TTS (NM_005319) TTS (NM_005319) 1557 NM_005319 3006 Hs.7644 NM_005319 ENSG00000187837 HIST1H1C H1.2|H1C|H1F2|H1s-1 histone cluster 1 H1 family member c protein-coding 195.75-101 chr5 180222694 180223116 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -13694 NM_175062 255426 Hs.190559 NM_175062 ENSG00000146090 RASGEF1C - RasGEF domain family member 1C protein-coding 227.5-5 chr1 196215194 196215526 + 0.75 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -126645 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149.5-2 chr1 17115874 17116164 + 0.75 NA intron (NM_007365, intron 1 of 15) intron (NM_007365, intron 1 of 15) 3432 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 210.75-98 chr8 112283557 112284080 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 54 of 66) L1ME4a|LINE|L1 -359675 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 183.75-110 chr6 134916435 134916703 + 0.75 NA TTS (NM_022568) TTS (NM_022568) 33532 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 158.25-139 chr7 94802178 94802496 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -105257 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 162.75-144 chr8 107056563 107056999 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 279734 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 153.5-129 chr3 48292283 48292554 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_134638) promoter-TSS (NR_134638) -740 NR_134638 101060195 Hs.670746 NR_134638 FCF1P2 - FCF1 pseudogene 2 pseudo 155.5-106 chr2 219500243 219500513 + 0.75 NA intron (NM_205847, intron 3 of 12) intron (NM_205847, intron 3 of 12) 1487 NM_205847 29926 Hs.27059 NM_013335 ENSG00000144591 GMPPA AAMR GDP-mannose pyrophosphorylase A protein-coding 294.5-10 chr11 104124024 104124725 + 0.75 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 39773 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 158.25-25 chr11 82703541 82703836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30176 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 120.75-108 chr3 83725546 83725851 + 0.75 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 1143877 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 215.75-20 chr11 95662256 95662649 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 127330 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 133-25 chr11 98139179 98139597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -881561 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 177.5-29 chr11 130197248 130197517 + 0.75 NA intron (NM_021978, intron 11 of 18) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 37600 NM_021978 6768 Hs.504315 NM_021978 ENSG00000149418 ST14 ARCI11|HAI|MT-SP1|MTSP1|PRSS14|SNC19|TADG15|TMPRSS14 suppression of tumorigenicity 14 protein-coding 146.25-116 chr5 29397732 29398161 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -1970 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 181.75-102 chr5 7429432 7429693 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) L1MEc|LINE|L1 33424 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 161.75-91 chr3 122424904 122425300 + 0.75 NA non-coding (NR_026698, exon 15 of 15) non-coding (NR_026698, exon 15 of 15) 8896 NR_125405 102723582 Hs.675056 NR_125405 ENSG00000272758 LOC102723582 - uncharacterized LOC102723582 ncRNA 151.75-80 chr20 39734700 39735050 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -269586 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 116.5-134 chr2 215733102 215733357 + 0.75 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) L1MEd|LINE|L1 15186 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 137.75-177 chr6 50577727 50578084 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -135639 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 116.5-275 chrX 99528643 99528947 + 0.75 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 881478 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 203.5-132 chr7 104778818 104779191 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) 25088 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 147.25-36 chr14 82376531 82376791 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -265971 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 138.5-82 chr17 64454863 64455061 + 0.75 NA intron (NM_001291316, intron 3 of 8) AluJo|SINE|Alu 5847 NM_001291316 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 191-34 chr2 62228600 62228933 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 13245 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 145-95 chr3 15913563 15913808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39914 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 188-20 chr13 109128104 109128510 + 0.75 NA intron (NM_015011, intron 31 of 34) L2a|LINE|L2 38996 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 158.25-41 chr14 84057827 84058146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1213946 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 155.5-197 chr7 55778907 55779192 + 0.75 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -74482 NR_003949 360132 Hs.446691 NM_182827 ENSG00000176826 FKBP9P1 FKBP9L FKBP prolyl isomerase 9 pseudogene 1 pseudo 161.25-189 chrX 57702693 57703000 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -22586 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 118.25-49 chr12 14050734 14050995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70508 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 135.75-135 chr3 51193969 51194274 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 12 of 52) L1M2|LINE|L1 -191170 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 162.75-71 chr2 114995608 114996077 + 0.75 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -68731 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 198.5-13 chr10 30854233 30854564 + 0.75 NA intron (NM_001143766, intron 6 of 7) L2a|LINE|L2 131179 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 176-69 chr7 21149478 21149871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -278409 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 127.25-84 chr2 20855228 20855461 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -32214 NM_001282721 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 116.75-207 chr9 18034148 18034312 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -439923 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 176.75-8 chr1 147782542 147782808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9313 NM_005266 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 138.25-73 chr18 60687416 60687618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -314742 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 124.5-46 chr12 41951477 41951686 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 187392 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 152-158 chr9 95061400 95061650 + 0.75 NA intron (NM_032823, intron 12 of 14) MER33|DNA|hAT-Charlie -3825 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 164-67 chr20 63368691 63369204 + 0.75 NA non-coding (NR_110634, exon 4 of 5) non-coding (NR_110634, exon 4 of 5) -7551 NM_000744 1137 Hs.10734 NM_000744 ENSG00000101204 CHRNA4 BFNC|EBN|EBN1|NACHR|NACHRA4|NACRA4 cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit protein-coding 155-54 chr19 6461616 6461911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1971 NM_024103 79085 Hs.356231 NM_024103 ENSG00000125648 SLC25A23 APC2|MCSC2|SCaMC-3 solute carrier family 25 member 23 protein-coding 124.5-26 chr10 94231142 94231415 + 0.75 NA intron (NM_001165979, intron 4 of 31) intron (NM_001165979, intron 4 of 31) 55792 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 180.75-102 chr4 37256579 37256961 + 0.75 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) intron (NM_001144990, intron 1 of 6) 12027 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 217.5-54 chr18 6068064 6068525 + 0.75 NA intron (NM_173464, intron 16 of 19) L1PB2|LINE|L1 -172340 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 243.5-82 chr8 81745202 81745677 + 0.75 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) intron (NM_152284, intron 1 of 4) 12991 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 193.75-12 chr1 166946518 166946931 + 0.75 NA intron (NM_199351, intron 3 of 9) MIR3|SINE|MIR 28816 NM_199351 387597 Hs.444835 NM_199351 ENSG00000143195 ILDR2 C1orf32|dJ782G3.1 immunoglobulin like domain containing receptor 2 protein-coding 144.75-141 chr5 140808163 140808448 + 0.75 NA exon (NM_018907, exon 1 of 4) exon (NM_018907, exon 1 of 4) 1237 NM_018907 56144 Hs.199343 NM_018907 ENSG00000204967 PCDHA4 CNR1|CNRN1|CRNR1|PCDH-ALPHA4 protocadherin alpha 4 protein-coding 115.5-246 chr9 24275401 24275650 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 270151 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 133-108 chr3 112268508 112268778 + 0.75 NA intron (NR_135297, intron 6 of 22) L1M5|LINE|L1 25573 NM_183061 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 147.25-60 chr2 118848812 118849232 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001426) promoter-TSS (NM_001426) -839 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 130-142 chr6 124046228 124046411 + 0.75 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) MER103C|DNA|hAT-Charlie -236686 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 173.75-39 chr11 108157721 108158004 + 0.75 NA 3' UTR (NM_002519, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_002519, exon 18 of 18) 36295 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 176.75-68 chr2 147905437 147905769 + 0.75 NA intron (NM_001278579, intron 5 of 11) intron (NM_001278579, intron 5 of 11) 60574 NM_001616 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 187.5-64 chr15 64120713 64121120 + 0.75 NA intron (NM_003099, intron 4 of 14) intron (NM_003099, intron 4 of 14) 24934 NM_001242933 6642 Hs.188634 NM_003099 ENSG00000028528 SNX1 HsT17379|VPS5 sorting nexin 1 protein-coding 189.5-171 chrX 72010096 72010424 + 0.75 NA intron (NM_001013627, intron 1 of 7) intron (NM_001013627, intron 1 of 7) -34149 NR_002309 441502 Hs.449523 NR_002309 RPS26P11 RPS26L1|RPS26_22_1784|bA366E13.1 ribosomal protein S26 pseudogene 11 pseudo 154-59 chr2 15933270 15933661 + 0.75 NA intron (NR_125783, intron 2 of 2) intron (NR_125783, intron 2 of 2) -7085 NM_005378 4613 Hs.25960 NM_005378 ENSG00000134323 MYCN MODED|N-myc|NMYC|ODED|bHLHe37 MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 215 chr1 24011548 24012037 + 0.75 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -31329 NR_034035 10772 Hs.3530 NM_006625 ENSG00000188529 SRSF10 FUSIP1|FUSIP2|NSSR|PPP1R149|SFRS13|SFRS13A|SRp38|SRrp40|TASR|TASR1|TASR2 serine and arginine rich splicing factor 10 protein-coding 170.75-116 chr6 51152694 51153070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 334011 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 182.5-80 chr2 86303666 86303995 + 0.75 NA intron (NM_001164730, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 33796 NM_022912 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 162.25-127 chr5 45558987 45559398 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 137188 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 229-50 chr3 55895775 55896253 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 12 of 17) intron (NR_132749, intron 12 of 17) -43420 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 150.25-158 chr9 30855712 30855943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -447373 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 202.5-140 chr7 97208883 97209274 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 92485 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 210.25-83 chr8 135591392 135592024 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 134252 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 138.5-25 chr10 51979970 51980285 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) L1PA13|LINE|L1 -280532 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 236.75-51 chr7 8670890 8671465 + 0.75 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 237568 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 170.75-58 chr18 68927663 68928139 + 0.75 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) intron (NM_001093729, intron 8 of 9) 129821 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 133.25-163 chr5 9772546 9772851 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L1MA3|LINE|L1 -81679 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 114.25-34 chr11 119459033 119459244 + 0.75 NA intron (NR_034160, intron 2 of 3) LTR39|LTR|ERV1 -34153 NM_001311162 7070 Hs.644697 NM_006288 ENSG00000154096 THY1 CD90|CDw90 Thy-1 cell surface antigen protein-coding 157.75-25 chr10 119941173 119941518 + 0.75 NA non-coding (NR_037771, exon 18 of 18) non-coding (NR_037771, exon 18 of 18) -17168 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 126.75-109 chr2 80415074 80415347 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 2 of 11) intron (NM_001282599, intron 2 of 11) 101831 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 125-54 chr16 79850704 79851006 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 55606 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 135.25-196 chr8 84580495 84580891 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -125234 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 199.75-16 chr11 105710117 105710527 + 0.75 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 99616 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 195.5-14 chr10 50637152 50637581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12415 NR_126411 104355295 Hs.450493 NR_126411 SGMS1-AS1 - SGMS1 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-211 chr8 47467095 47467403 + 0.75 NA intron (NM_001080394, intron 8 of 19) L1PA13|LINE|L1 -186839 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 148.5-15 chr1 202272377 202272714 + 0.75 NA intron (NM_001017404, intron 4 of 15) intron (NM_001017404, intron 4 of 15) 58390 NM_001017404 59352 Hs.497402 NM_021636 ENSG00000133067 LGR6 GPCR|VTS20631 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6 protein-coding 127.75-126 chr3 32808328 32808544 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9561 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 223.75-75 chr6 117822682 117823076 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -84385 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 244-42 chr4 179474224 179474549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1566450 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 134.5-17 chr1 213613206 213613480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -311406 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 167.5-173 chr6 159734097 159734560 + 0.75 NA intron (NM_001322817, intron 2 of 7) AluSc|SINE|Alu 6822 NM_001270531 9589 Hs.446091 NM_004906 ENSG00000146457 WTAP Mum2 WT1 associated protein protein-coding 181.25-41 chr16 65240851 65241318 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -64511 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 260-44 chr8 6495013 6495516 + 0.75 NA intron (NM_024596, intron 11 of 13) intron (NM_024596, intron 11 of 13) 67981 NM_001118887 285 Hs.583870 NM_001147 ENSG00000091879 ANGPT2 AGPT2|ANG2 angiopoietin 2 protein-coding 115.5-47 chr12 122151944 122152176 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -15659 NM_152759 254050 Hs.374856 NM_152759 ENSG00000158113 LRRC43 - leucine rich repeat containing 43 protein-coding 276.5-53 chr5 37231096 37231824 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 8 of 51) AluSx1|SINE|Alu -17586 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 152.25-102 chr3 8901828 8902175 + 0.75 NA intron (NM_020165, intron 10 of 12) intron (NM_020165, intron 10 of 12) 61471 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 185.75-48 chr15 68393886 68394267 + 0.75 NA intron (NM_001004439, intron 2 of 29) L1PB|LINE|L1 38087 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 129.5-237 chr9 30482298 30482593 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -73991 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 157.75-149 chr6 55220533 55220877 + 0.75 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) L1MB1|LINE|L1 -106764 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 132.5-35 chr11 17691146 17691511 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 5611 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 117.25-75 chr14 67037013 67037255 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 9 of 21) L1MB2|LINE|L1 -152306 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 143.25-168 chr7 13289335 13289560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 601814 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 164.25-3 chr1 40078518 40079009 + 0.75 NA intron (NM_001363695, intron 6 of 7) intron (NM_001363695, intron 6 of 7) 18489 NM_001363695 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 134.5-31 chr10 88497093 88497357 + 0.75 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 86093 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 172.5-62 chr14 30430304 30430656 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -128643 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 132.75-111 chr20 7628257 7628639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 256840 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 173.25-31 chr13 74914359 74914760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325822 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 239.5-32 chr15 39264442 39265025 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14064 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 133.75-178 chr7 55623283 55623667 + 0.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -50973 NM_001321244 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 129.75-64 chr14 70076935 70077305 + 0.75 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) 3097 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 153.25-67 chr2 43036677 43037018 + 0.75 NA intron (NR_110585, intron 1 of 5) intron (NR_110585, intron 1 of 5) 2696 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 117.5-167 chr4 155244331 155244524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35791 NM_000910 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 113.5-171 chr4 47995881 47996047 + 0.75 NA intron (NM_000087, intron 2 of 10) L1PB1|LINE|L1 -14431 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 231.5-22 chr12 67132276 67132794 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -36251 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 125.5-66 chr13 61962024 61962265 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 67404 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 157.5-72 chr16 17398007 17398366 + 0.75 NA intron (NM_022166, intron 1 of 11) intron (NM_022166, intron 1 of 11) 72774 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 157.5-224 chr9 80893979 80894368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 795362 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 139.75-156 chr6 52381286 52381533 + 0.75 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 19258 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 117.75-32 chr11 62258148 62258345 + 0.75 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 -11912 NM_002411 4250 Hs.46452 NM_002411 ENSG00000110484 SCGB2A2 MGB1|UGB2 secretoglobin family 2A member 2 protein-coding 157.75-161 chr7 54976994 54977296 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -41872 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 128.25-194 chr7 95526457 95526865 + 0.75 NA intron (NM_145872, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 40718 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 126.75-94 chr18 2637325 2637529 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17968 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 115.25-6 chr1 53336567 53336791 + 0.75 NA TTS (NR_131923) TTS (NR_131923) 8446 NR_131923 105378732 Hs.118609 NR_131923 ENSG00000225675 LINC01771 - long intergenic non-protein coding RNA 1771 ncRNA 172.5-182 chr7 36521328 36521567 + 0.75 NA intron (NM_001177506, intron 20 of 21) intron (NM_001177506, intron 20 of 21) 78673 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 162-91 chr5 14849092 14849455 + 0.75 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 22505 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 296-14 chr13 74060909 74061377 + 0.75 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 72786 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 183.75-35 chr12 123975892 123976228 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) intron (NM_001347902, intron 2 of 4) 2845 NM_001204299 100533183 Hs.524828 NM_001204299 ENSG00000178882 ZNF664-RFLNA - ZNF664-RFLNA readthrough protein-coding 183.75-83 chr4 53719181 53719485 + 0.75 NA intron (NR_125918, intron 2 of 2) MER102c|DNA|hAT-Charlie 23432 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 170.25-47 chr16 7664215 7664472 + 0.75 NA intron (NM_145893, intron 9 of 13) intron (NM_145893, intron 9 of 13) 331498 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 147-12 chr1 173930351 173930650 + 0.75 NA TTS (NM_172071) TTS (NM_172071) -13122 NM_000488 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 162.75-122 chr5 142662313 142662650 + 0.75 NA intron (NM_001144935, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -18180 NM_001257210 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 125.5-153 chr20 57910444 57910734 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -93315 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 114.25-124 chr3 51158840 51159044 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 10 of 52) intron (NM_004947, intron 10 of 52) -226349 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 150.5-172 chr5 60600837 60601185 + 0.75 NA intron (NM_018369, intron 9 of 10) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 99155 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 127.25-217 chr9 86813442 86813756 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133907 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 180.75-42 chr15 39884920 39885373 + 0.75 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) intron (NM_001271854, intron 1 of 3) 35746 NM_001271854 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 188.5-96 chr3 6047059 6047494 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 758173 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 136-119 chr5 7929686 7929938 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60664 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 172-92 chr5 92566624 92566977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1004543 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 113-129 chr3 196436338 196436683 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4083 NM_015562 26043 Hs.518524 NM_015562 ENSG00000163960 UBXN7 UBXD7 UBX domain protein 7 protein-coding 125.5-44 chr11 87127780 87128004 + 0.75 NA intron (NM_001168724, intron 4 of 13) intron (NM_001168724, intron 4 of 13) 89958 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 208-79 chr8 102918867 102919382 + 0.75 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) intron (NR_126339, intron 2 of 2) 54853 NR_126339 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 155-151 chr9 91080608 91080901 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -5622 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 207.75-75 chr3 69267894 69268273 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 5 of 22) intron (NM_015123, intron 5 of 22) 118005 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 118.25-179 chr7 20775559 20775778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11218 NM_198956 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 146-18 chr11 37380128 37380370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -558352 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 158-132 chr7 154284493 154284703 + 0.75 NA intron (NM_130797, intron 1 of 25) AluSz|SINE|Alu -20561 NM_001936 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 182.25-37 chr14 54536179 54536449 + 0.75 NA intron (NM_006568, intron 4 of 5) L1MC4|LINE|L1 26408 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 119.25-85 chr19 3419887 3420128 + 0.75 NA intron (NM_001245002, intron 2 of 10) L1M4|LINE|L1 53424 NM_005597 4782 Hs.170131 NM_005597 ENSG00000141905 NFIC CTF|CTF5|NF-I|NFI nuclear factor I C protein-coding 207.5-21 chr14 48108305 48108726 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -313501 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 237-19 chr16 51447277 51447843 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -296288 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 126.5-94 chr17 73043378 73043709 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 3 of 9) intron (NM_001352692, intron 3 of 9) 49145 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 170.75-115 chr6 43175682 43176176 + 0.75 NA exon (NM_003131, exon 3 of 7) exon (NM_003131, exon 3 of 7) 3533 NM_001292001 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 212.75-47 chr19 40130207 40130855 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -39588 NM_001142579 284323 Hs.115140 NM_001010880 ENSG00000197782 ZNF780A ZNF780 zinc finger protein 780A protein-coding 155.75-123 chr4 110826006 110826354 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34467 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 184-39 chr2 31903049 31903361 + 0.75 NA intron (NM_001137602, intron 4 of 7) intron (NM_001137602, intron 4 of 7) -99225 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 184.5-169 chr9 91413292 91413682 + 0.75 NA intron (NM_001290000, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 10345 NM_005384 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 200.5-28 chr12 73231324 73231759 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 72351 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 121.75-162 chr6 94060700 94060963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 342528 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 168.5-27 chr10 59254038 59254436 + 0.75 NA intron (NM_001347852, intron 11 of 12) intron (NM_001347852, intron 11 of 12) 76770 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 141.75-11 chr1 183359643 183359902 + 0.75 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) intron (NM_015039, intron 1 of 10) -54898 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 130-182 chrX 44512889 44513108 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 29861 NM_173794 139341 Hs.7549 NM_173794 ENSG00000069509 FUNDC1 - FUN14 domain containing 1 protein-coding 196.25-98 chr5 27384227 27384534 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87912 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 175.5-108 chr22 27005726 27006180 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 54565 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 179.75-32 chr12 105188314 105188666 + 0.75 NA intron (NM_001251904, intron 16 of 20) intron (NM_001251904, intron 16 of 20) 44915 NM_001251905 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 119-4 chr1 111083108 111083287 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -56186 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 160.5-200 chr9 24629952 24630285 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84221 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 188.75-25 chr14 60437598 60438006 + 0.75 NA intron (NM_174978, intron 17 of 17) L2a|LINE|L2 48261 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 275.5-33 chr2 240542249 240542905 + 0.75 NA intron (NR_148698, intron 3 of 5) LOR1-int|LTR|ERV1 15411 NM_001282771 51281 Hs.656615 NM_016552 ENSG00000144504 ANKMY1 ZMYND13 ankyrin repeat and MYND domain containing 1 protein-coding 136-122 chr5 61305585 61305831 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26550 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 185.75-131 chr8 137113916 137114277 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 299492 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 270.25-37 chr5 27576457 27576926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104399 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 229.75-17 chr14 65488627 65489188 + 0.75 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 17805 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 178.5-49 chr14 60521432 60521749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12444 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 129.75-12 chr1 104185916 104186152 + 0.75 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 113011 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 131.5-169 chr4 27279600 27279927 + 0.75 NA intron (NR_125921, intron 5 of 5) intron (NR_125921, intron 5 of 5) 62284 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 135.25-152 chr5 8435051 8435272 + 0.75 NA intron (NR_039984, intron 2 of 5) L1PB2|LINE|L1 22403 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 197.75-67 chr5 28941061 28941367 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 14344 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 180.25-33 chr16 58778756 58779212 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -44668 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 159-12 chr10 27633602 27633881 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -110874 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 156-162 chr8 140723128 140723423 + 0.75 NA intron (NM_001352718, intron 22 of 32) intron (NM_001352718, intron 22 of 32) -4706 NM_001352749 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 129.75-184 chr8 106626856 106627062 + 0.75 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -30849 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 192.5-125 chr8 19785105 19785605 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -27326 NR_148897 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 113.25-112 chr3 144578791 144578991 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 605810 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 131.25-20 chr1 239818398 239818719 + 0.75 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) 81314 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 149.25-123 chr3 180837446 180837794 + 0.75 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) L1PA12|LINE|L1 32558 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 147.5-106 chr2 123574071 123574446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 450916 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 137-109 chr3 144717310 144717507 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 744327 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 167-90 chr5 13734892 13735156 + 0.75 NA intron (NM_001369, intron 68 of 78) intron (NM_001369, intron 68 of 78) 209456 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 244.25-34 chr3 127458248 127458740 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -67824 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 155.75-141 chr6 134353033 134353273 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35095 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 128.25-186 chr7 31270001 31270367 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 70542 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 146.25-98 chr3 16857835 16858094 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -26991 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 144.5-199 chr7 29822590 29822891 + 0.75 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) L1M7|LINE|L1 16186 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 126.5-110 chr2 52900502 52900709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -197990 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 194.25-24 chr12 87737366 87737683 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -31288 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 176-41 chr21 34134272 34134612 + 0.75 NA intron (NM_032476, intron 2 of 2) intron (NM_032476, intron 2 of 2) -46235 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 214-8 chr10 50315732 50316143 + 0.75 NA intron (NM_147156, intron 8 of 10) intron (NM_147156, intron 8 of 10) -67327 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 113.5-237 chr8 117711830 117712205 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 191304 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 116.25-82 chr16 87427041 87427356 + 0.75 NA intron (NM_015144, intron 3 of 12) intron (NM_015144, intron 3 of 12) 34862 NM_022818 81631 Hs.356061 NM_022818 ENSG00000140941 MAP1LC3B ATG8F|LC3B|MAP1A/1BLC3|MAP1LC3B-a microtubule associated protein 1 light chain 3 beta protein-coding 130-51 chr15 85640951 85641260 + 0.75 NA intron (NM_007200, intron 9 of 36) intron (NM_007200, intron 9 of 36) 21155 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 183.75-128 chr8 113062136 113062424 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 314872 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 187.75-37 chr17 48602529 48603051 + 0.75 NA TTS (NR_033202) TTS (NR_033202) 2196 NM_018952 3216 Hs.98428 NM_018952 ENSG00000108511 HOXB6 HOX2|HOX2B|HU-2|Hox-2.2 homeobox B6 protein-coding 119.5-156 chr3 135722941 135723240 + 0.75 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -242638 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 120-158 chr6 41440658 41440986 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -61622 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 161.75-52 chr18 6335743 6336187 + 0.75 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 23065 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 132.5-232 chr8 14845515 14845837 + 0.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) L1MEc|LINE|L1 7834 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 179.25-71 chr18 79134529 79134814 + 0.75 NA intron (NR_148360, intron 5 of 31) intron (NR_148360, intron 5 of 31) 65277 NM_198531 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 117.25-175 chr5 113338115 113338344 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) -43291 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 207.75-120 chr7 79062496 79062824 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 53672 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 155-129 chr7 28441792 28442162 + 0.75 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) L1MA5|LINE|L1 6362 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 128.25-134 chr3 104636771 104637071 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -729792 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 139.25-112 chr22 39761581 39761899 + 0.75 NA intron (NM_152512, intron 6 of 6) L1MEf|LINE|L1 132020 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 194.5-42 chr15 59183419 59183756 + 0.75 NA intron (NM_004998, intron 18 of 27) L1MA2|LINE|L1 -12325 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 133.75-163 chr5 112976575 112976866 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001242377) promoter-TSS (NM_001242377) -78 NM_001242377 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 133.5-4 chr1 46660495 46660884 + 0.75 NA intron (NM_022745, intron 2 of 8) intron (NM_022745, intron 2 of 8) 5189 NM_001243728 64756 Hs.100874 NM_022745 ENSG00000123472 ATPAF1 ATP11|ATP11p ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 protein-coding 243.5-9 chr1 167989529 167990010 + 0.75 NA intron (NM_001017977, intron 5 of 18) AluSx|SINE|Alu -8891 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 216.75-33 chr18 22356110 22356533 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 61594 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 138-120 chr4 124531251 124531596 + 0.75 NA intron (NR_110838, intron 5 of 8) intron (NR_110838, intron 5 of 8) 27011 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 219.75-36 chr2 71989696 71990075 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 157977 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 115.75-104 chr2 73881736 73881992 + 0.75 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -11144 NM_001615 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 124.75-5 chr1 78197026 78197372 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -32400 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 146.25-42 chr15 67254892 67255317 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_024666) promoter-TSS (NM_024666) 94 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 278.25-32 chr2 158480704 158481265 + 0.75 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) L1MB7|LINE|L1 24032 NM_001005476 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 156-72 chr18 56915817 56916071 + 0.75 NA intron (NM_015285, intron 21 of 27) intron (NM_015285, intron 21 of 27) 156175 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 191.75-91 chr4 52316341 52316716 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 265224 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 113.75-158 chr5 97415619 97415782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -88996 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 166.75-146 chr9 37796626 37797158 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -3662 NM_001286810 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 162.25-70 chr18 51579049 51579291 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 187128 NR_040074 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 120-90 chr2 112700963 112701216 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -20397 NM_001350494 284958 Hs.589714 NM_001350494 ENSG00000144130 NT5DC4 - 5'-nucleotidase domain containing 4 protein-coding 148.5-127 chr20 51734119 51734419 + 0.75 NA intron (NM_006045, intron 1 of 27) AluJb|SINE|Alu 34121 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 173.25-119 chr7 78387567 78387844 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 6 of 20) AluJb|SINE|Alu 40463 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 150.5-114 chr20 19770372 19770618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116026 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 179.5-71 chr17 40356128 40356527 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000964, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_000964, exon 9 of 9) 8410 NM_152219 125111 Hs.444663 NM_152219 ENSG00000183153 GJD3 CX31.9|Cx30.2|GJA11|GJC1 gap junction protein delta 3 protein-coding 208-46 chr20 12694190 12694525 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 242606 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 135.5-56 chr14 56597544 56597731 + 0.75 NA intron (NM_017799, intron 3 of 15) L2c|LINE|L2 17839 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 161.25-155 chr6 81233094 81233433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 519418 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 136.5-141 chr22 36077422 36077621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48697 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 136.75-169 chr6 85940883 85941150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262283 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 272.5-74 chr8 141482020 141482647 + 0.75 NA intron (NR_102364, intron 6 of 26) L1ME2|LINE|L1 24896 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 168.5-129 chr4 48703079 48703451 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) L2c|LINE|L2 77034 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 189.5-84 chr21 16672830 16673265 + 0.75 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 82810 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 185.75-21 chr11 14330870 14331210 + 0.75 NA intron (NM_001177314, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 27445 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 127.25-4 chr1 119982713 119983031 + 0.75 NA intron (NM_001200001, intron 5 of 21) intron (NM_001200001, intron 5 of 21) -86357 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 174.5-153 chr5 123001766 123002142 + 0.75 NA non-coding (NR_146145, exon 7 of 8) non-coding (NR_146145, exon 7 of 8) 34771 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 180-47 chr17 63004282 63004646 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) intron (NM_025185, intron 1 of 25) 38229 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 127-47 chr12 82565505 82565731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -121288 NM_152588 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 167-102 chr6 140884389 140884713 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 200737 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 144.5-43 chr11 81181244 81181668 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -418653 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 230.25-88 chr8 144253786 144254239 + 0.75 NA intron (NM_001288814, intron 31 of 41) L1MEd|LINE|L1 8725 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 236.25-36 chr18 39536174 39536856 + 0.75 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 85660 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 163.25-65 chr2 125273522 125273890 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 844279 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 195.75-28 chr10 116144671 116145040 + 0.75 NA intron (NM_145793, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 49934 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 145.75-30 chr12 99150920 99151229 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 15 of 25) intron (NM_152788, intron 15 of 25) 3692 NM_001352203 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 185-2 chr1 54806801 54807302 + 0.75 NA exon (NM_152607, exon 2 of 11) exon (NM_152607, exon 2 of 11) 988 NM_152607 163747 Hs.376018 NM_152607 ENSG00000162398 LEXM C1orf177|LEM lymphocyte expansion molecule protein-coding 199-66 chr5 4691408 4691849 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -81853 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 132.75-126 chr3 120824685 120824952 + 0.75 NA intron (NR_135570, intron 1 of 1) intron (NR_135570, intron 1 of 1) 11539 NR_135571 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 119.5-2 chr1 39984733 39984978 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 29710 NM_001136493 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 182.75-62 chr19 33841267 33841610 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 44568 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 135.25-54 chr12 46912079 46912331 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -86208 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 219.75-10 chr10 83424154 83424675 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 252675 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 152.75-40 chr11 128957955 128958239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14698 NM_001195195 63970 Hs.160953 NM_022112 ENSG00000120471 TP53AIP1 P53AIP1 tumor protein p53 regulated apoptosis inducing protein 1 protein-coding 140.5-125 chr2 216591722 216591951 + 0.75 NA intron (NR_110392, intron 3 of 3) intron (NR_110392, intron 3 of 3) 15102 NR_110392 101928232 Hs.694592 NR_110392 LINC01280 - long intergenic non-protein coding RNA 1280 ncRNA 339.75-2 chr1 214776206 214777087 + 0.75 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 173451 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 115.25-77 chr17 22233612 22233782 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 30702 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 114.75-152 chr5 35122712 35122974 + 0.75 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -4721 NM_001204317 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 145.75-105 chr3 149839935 149840230 + 0.75 NA intron (NM_007282, intron 2 of 10) intron (NM_007282, intron 2 of 10) 27394 NM_007282 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 136.5-157 chr3 196590864 196591099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22307 NM_001345910 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 133-180 chr8 132246963 132247196 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) -141814 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 114.25-156 chr5 130178900 130179146 + 0.75 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 274558 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 153.25-105 chr5 88092008 88092358 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 176662 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 264.5-47 chr5 30401116 30401602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 520799 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 169.75-97 chr21 32645564 32645861 + 0.75 NA exon (NM_001160306, exon 24 of 28) exon (NM_001160306, exon 24 of 28) -32841 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 158-50 chr14 57663770 57664165 + 0.75 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) MER102b|DNA|hAT-Charlie -170110 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 197-27 chr18 13169274 13169677 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -49285 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 127.25-118 chr3 30319165 30319403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -199584 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 234.25-42 chr20 3493388 3493897 + 0.75 NA intron (NM_001323332, intron 1 of 25) intron (NM_001323332, intron 1 of 25) 22624 NM_001323332 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 136.25-45 chr12 126057991 126058206 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -37894 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 177.75-43 chr14 56743440 56743772 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62061 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 183-35 chr16 13428029 13428349 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -491968 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 152-12 chr1 170625385 170625745 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -38566 NM_006902 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 170.25-100 chr3 180717220 180717569 + 0.75 NA intron (NR_109986, intron 11 of 13) intron (NR_109986, intron 11 of 13) -37905 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 117.25-53 chr12 31616899 31617102 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -25864 NM_001366893 160518 Hs.118166 NM_144973 ENSG00000170456 DENND5B - DENN domain containing 5B protein-coding 141.75-84 chr19 53676421 53676742 + 0.75 NA TTS (NR_030183) TTS (NR_030183) 870 NR_030183 574461 NR_030183 ENSG00000207599 MIR520E MIRN520E microRNA 520e ncRNA 139.25-106 chr20 63517453 63517681 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3174 NR_148427 79144 Hs.79625 NM_024299 ENSG00000125534 PPDPF C20orf149|dJ697K14.9|exdpf pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor protein-coding 148.5-154 chr3 113229868 113230173 + 0.75 NA intron (NM_001301861, intron 2 of 19) MER5B|DNA|hAT-Charlie 17904 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 219.25-16 chr10 79201294 79201661 + 0.75 NA intron (NM_020338, intron 4 of 24) intron (NM_020338, intron 4 of 24) 132511 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 275.75-25 chr2 209864789 209865327 + 0.75 NA intron (NM_032504, intron 22 of 63) L1PA8A|LINE|L1 93065 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 164-54 chr18 33395405 33395863 + 0.75 NA intron (NM_001308126, intron 4 of 23) intron (NM_001308126, intron 4 of 23) 44937 NM_001371121 164.5-174 chr6 26238637 26238926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1645 NM_003540 8361 Hs.247816 NM_003540 ENSG00000274618 HIST1H4F H4|H4/c|H4FC histone cluster 1 H4 family member f protein-coding 186.25-70 chr3 94664771 94665092 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -273332 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 181.75-60 chr2 43889195 43889638 + 0.75 NA intron (NM_133259, intron 37 of 37) intron (NM_133259, intron 37 of 37) 50445 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 137-89 chr20 19372269 19372488 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) intron (NM_020689, intron 2 of 16) -87782 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 139.5-21 chr11 26677559 26677860 + 0.75 NA intron (NM_178498, intron 13 of 14) MamGyp-int|LTR|Gypsy 44351 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 219-48 chr19 34142546 34142852 + 0.75 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -29805 NM_001114093 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 119.75-12 chr1 192498990 192499193 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -76682 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 206.25-50 chr2 37327822 37328234 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10944 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 114.5-146 chr2 162081551 162081767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6802 NR_147697 100131604 NR_147697 LOC100131604 - uncharacterized LOC100131604 ncRNA 143-8 chr10 50406838 50407049 + 0.75 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) AluJr|SINE|Alu -158333 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 148.5-197 chr6 90506780 90507060 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 80152 NM_003188 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 149.5-140 chr4 112472052 112472381 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -43163 NR_161159 105377372 NR_161159 LOC105377372 - uncharacterized LOC105377372 ncRNA 117.5-177 chr5 44943464 44943683 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134626 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 131.25-194 chr8 3525834 3526081 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 10 of 69) MIRb|SINE|MIR -797506 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 135-164 chr7 35835594 35835865 + 0.75 NA intron (NM_001363715, intron 3 of 13) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 34510 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 346-5 chr10 72387951 72388619 + 0.75 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) intron (NM_001195519, intron 5 of 6) -33366 NR_157570 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 135.75-41 chr12 12255133 12255455 + 0.75 NA intron (NM_002336, intron 1 of 22).2 MER92A|LTR|ERV1 11750 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 168.5-128 chr4 38788994 38789272 + 0.75 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -6143 NM_030956 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 130.75-86 chr2 22754128 22754362 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 217766 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 180.75-84 chr3 1259897 1260179 + 0.75 NA intron (NM_001289080, intron 4 of 22) L3b|LINE|CR1 167014 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 149.5-175 chr6 91098351 91098770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -423100 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 141-13 chr1 217750905 217751274 + 0.75 NA intron (NM_138796, intron 6 of 10) intron (NM_138796, intron 6 of 10) 34031 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 210.75-18 chr11 68809711 68810095 + 0.75 NA intron (NM_001031847, intron 3 of 18) AluSz|SINE|Alu 32013 NM_001876 1374 Hs.503043 NM_001876 ENSG00000110090 CPT1A CPT1|CPT1-L|L-CPT1 carnitine palmitoyltransferase 1A protein-coding 219.25-26 chr14 68742409 68742791 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 51314 NM_004926 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 350.5-7 chr10 93753655 93754681 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3641 NM_001308276 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 182.25-69 chr21 15901426 15901896 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -168827 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 206.75-94 chr8 107316941 107317359 + 0.75 NA intron (NM_001199859, intron 4 of 8) L2b|LINE|L2 19365 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 138.25-163 chr7 48840394 48840654 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -84023 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 181.25-55 chr18 39253169 39253607 + 0.75 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) L1M2|LINE|L1 368787 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 164-34 chr14 58271953 58272295 + 0.75 NA TTS (NM_152132) TTS (NM_152132) -15909 NR_146595 55451 NR_146595 ENSG00000279636 LINC00216 C14orf107|NCRNA00216|PRO1617 long intergenic non-protein coding RNA 216 ncRNA 218-23 chr16 57268554 57268972 + 0.75 NA intron (NM_015993, intron 1 of 3) intron (NM_015993, intron 1 of 3) 15909 NM_015993 51090 Hs.632215 NM_015993 ENSG00000102934 PLLP PMLP|TM4SF11 plasmolipin protein-coding 180.75-136 chr6 164575018 164575454 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 246827 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 167.5-110 chr21 30709184 30709464 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9453 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 196.25-90 chr4 30360613 30360961 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -359582 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 201.5-124 chr8 8412269 8412695 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -26043 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 196-96 chr8 84789987 84790324 + 0.75 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) intron (NM_001354322, intron 3 of 6) 84228 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 131-8 chr1 167370784 167371062 + 0.75 NA intron (NM_001198783, intron 4 of 15) intron (NM_001198783, intron 4 of 15) 41853 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 177.25-141 chr8 103224851 103225125 + 0.75 NA intron (NM_001364874, intron 3 of 3) intron (NM_001364874, intron 3 of 3) -52848 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 195.75-22 chr10 54206061 54206367 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 10 of 34) intron (NM_001354411, intron 10 of 34) -280016 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 163.5-177 chr6 141846149 141846387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 242531 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 227-60 chr6 126391155 126391558 + 0.75 NA intron (NR_104462, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 51241 NR_104462 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 234.75-75 chr7 43113910 43114346 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 1 of 27) intron (NM_001287059, intron 1 of 27) 1481 NM_015052 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 154-76 chr2 151135303 151135552 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 126436 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 131.25-130 chr3 31952445 31952731 + 0.75 NA intron (NM_001174060, intron 1 of 10) intron (NM_001174060, intron 1 of 10) -29162 NM_001137674 344787 Hs.585139 NM_001137674 ENSG00000197385 ZNF860 - zinc finger protein 860 protein-coding 126-23 chr10 78619873 78620164 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 352676 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 133.75-209 chrX 48692766 48693140 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2601 NM_001282166 6839 Hs.522639 NM_003173 ENSG00000101945 SUV39H1 H3-K9-HMTase 1|KMT1A|MG44|SUV39H suppressor of variegation 3-9 homolog 1 protein-coding 157.5-28 chr10 84384572 84384993 + 0.75 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) L1PB4|LINE|L1 -40157 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 152.25-157 chr8 110133931 110134196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158292 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 213-95 chr8 64372349 64372916 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_034102) promoter-TSS (NR_034102) -586 NR_034102 100130155 Hs.7023 NR_034102 ENSG00000254377 MIR124-2HG LINC00966 MIR124-2 host gene ncRNA 153.5-212 chr9 29051722 29051975 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 160451 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 218.75-72 chr5 154935248 154935609 + 0.75 NA intron (NM_015465, intron 3 of 27) intron (NM_015465, intron 3 of 27) 2783 NM_015465 25929 Hs.483921 NM_015465 ENSG00000082516 GEMIN5 GEMIN-5 gem nuclear organelle associated protein 5 protein-coding 177.25-113 chr5 27709908 27710308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 237816 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 170.5-167 chr7 7855679 7855972 + 0.75 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 112927 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 145-64 chr17 72228983 72229342 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 108142 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 187.25-10 chr10 37357335 37357825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48394 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 212-15 chr11 92280767 92281173 + 0.75 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) L1ME4a|LINE|L1 55936 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 196.75-41 chr15 60699259 60699587 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 17854 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 121.25-20 chr10 57359022 57359284 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54594 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 128.5-125 chr21 14653405 14653601 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -10396 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 144.5-48 chr12 12719591 12720009 + 0.75 NA intron (NM_004064, intron 2 of 2) intron (NM_004064, intron 2 of 2) 2530 NM_004064 1027 Hs.238990 NM_004064 ENSG00000111276 CDKN1B CDKN4|KIP1|MEN1B|MEN4|P27KIP1 cyclin dependent kinase inhibitor 1B protein-coding 122.25-158 chr6 64782250 64782593 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -518997 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 189.75-54 chr18 74413436 74413972 + 0.75 NA TTS (NR_131977) TTS (NR_131977) 4256 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 120.5-192 chr5 178948867 178949079 + 0.75 NA intron (NM_001178089, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 7775 NM_001323308 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 194.75-72 chr4 24393998 24394409 + 0.75 NA intron (NM_001330752, intron 1 of 13) MER113|DNA|hAT-Charlie 78702 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 153-45 chr14 82532812 82533192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109630 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 183.5-21 chr10 63402393 63402832 + 0.75 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -27963 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 171.5-113 chr3 196434900 196435184 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2615 NM_015562 26043 Hs.518524 NM_015562 ENSG00000163960 UBXN7 UBXD7 UBX domain protein 7 protein-coding 116.5-219 chr6 134869552 134869759 + 0.75 NA Intergenic X7A_LINE|LINE|CR1 80446 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 143.25-120 chr3 77285232 77285596 + 0.75 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 187402 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 159.25-23 chr11 29914694 29915196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67448 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 120-23 chr11 3083976 3084208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26669 NM_001014437 833 Hs.274873 NM_001751 ENSG00000110619 CARS CARS1|CYSRS|MGC:11246 cysteinyl-tRNA synthetase protein-coding 206.25-95 chr6 86801264 86801640 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -136076 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 167.25-15 chr10 33196053 33196488 + 0.75 NA intron (NM_001244973, intron 12 of 16) intron (NM_001244973, intron 12 of 16) -79463 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 190.25-82 chr22 29036208 29036745 + 0.75 NA intron (NM_001206998, intron 2 of 8) intron (NM_001206998, intron 2 of 8) -5000 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 140.5-130 chr20 8149371 8149586 + 0.75 NA intron (NM_182734, intron 1 of 32) intron (NM_182734, intron 1 of 32) 17212 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 176.25-46 chr16 24937583 24937984 + 0.75 NA intron (NM_018054, intron 16 of 18) intron (NM_018054, intron 16 of 18) 77586 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 213-37 chr17 6583919 6584304 + 0.75 NA intron (NR_147088, intron 17 of 17) L1MEg|LINE|L1 -27556 NM_031220 83394 Hs.183983 NM_031220 ENSG00000091622 PITPNM3 ACKR6|CORD5|NIR1|RDGBA3 PITPNM family member 3 protein-coding 114.75-141 chr4 87150407 87150608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69761 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 253.25-46 chr3 101072727 101073143 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79445 NM_001349332 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 160-109 chr8 82492703 82493131 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -419187 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 243-61 chr6 9589772 9590171 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -814531 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 181-90 chr5 155271909 155272262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258330 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 147.25-73 chr21 21349117 21349384 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 9 of 18) L1MA1|LINE|L1 202088 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 124.5-161 chr5 25314134 25314360 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 123294 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 168-63 chr2 30879845 30880079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72516 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 151.5-70 chr18 61676240 61676506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71803 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 242.25-28 chr14 71114447 71114868 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001308160, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_001308160, exon 34 of 34) -205819 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 134.75-4 chr1 40991583 40991885 + 0.75 NA intron (NR_125440, intron 6 of 17) intron (NR_125440, intron 6 of 17) 3215 NM_001301237 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 209-75 chr9 134410585 134411157 + 0.75 NA intron (NM_002957, intron 4 of 9) intron (NM_002957, intron 4 of 9) 4311 NM_001291921 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 136-93 chr21 20927013 20927322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71242 NM_001352596 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 269.5-60 chr8 118281423 118281924 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -169854 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 207-62 chr4 186196277 186196605 + 0.75 NA intron (NM_207352, intron 3 of 10) intron (NM_207352, intron 3 of 10) 4874 NM_207352 285440 Hs.587231 NM_207352 ENSG00000145476 CYP4V2 BCD|CYP4AH1 cytochrome P450 family 4 subfamily V member 2 protein-coding 154-64 chr2 35746210 35746522 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 274961 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 122-42 chr11 83109333 83109687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37444 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 123.75-32 chr11 111969053 111969240 + 0.75 NA intron (NM_001278542, intron 4 of 5) intron (NM_001278542, intron 4 of 5) -8163 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 113.75-207 chr9 98898589 98898808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45209 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 209-37 chr19 24364773 24365225 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -201552 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 172.5-215 chr9 125829646 125829905 + 0.75 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 81592 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 291-6 chr11 19982182 19982836 + 0.75 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) intron (NM_182964, intron 10 of 37) -40047 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 256.5-62 chr5 140459531 140459945 + 0.75 NA intron (NM_001197030, intron 9 of 9) L1MA7|LINE|L1 57905 NM_017978 54882 Hs.594084 NM_017747 ENSG00000131503 ANKHD1 MASK|MASK1|PP2500|VBARP ankyrin repeat and KH domain containing 1 protein-coding 163.75-65 chr2 51728514 51728946 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1ME3A|LINE|L1 -641918 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 206.25-83 chr5 61355662 61356114 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 23630 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 209.5-30 chr12 81693163 81693775 + 0.75 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 65038 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 155-103 chr4 166638473 166638817 + 0.75 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 595781 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 135.5-93 chr19 27727820 27728028 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -65507 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 124.5-50 chr12 95222655 95223029 + 0.75 NA intron (NM_001352117, intron 1 of 11) L1ME3A|LINE|L1 5035 NM_001352117 55591 Hs.24135 NM_017599 ENSG00000028203 VEZT VEZATIN vezatin, adherens junctions transmembrane protein protein-coding 129.75-145 chr5 34988791 34988996 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59056 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 155-16 chr10 57609434 57609799 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -305057 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 126.5-79 chr15 98109836 98110133 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21231 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 179.5-25 chr10 70035094 70035498 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -17550 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 197.5-151 chr7 104922724 104923356 + 0.75 NA intron (NR_027374, intron 1 of 3) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 3605 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 153-80 chr2 201644415 201644646 + 0.75 NA TTS (NM_033066) TTS (NM_033066) -1027 NM_001044385 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 243.75-64 chr4 66954861 66955279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 466930 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 140.25-183 chr7 137260301 137260550 + 0.75 NA intron (NM_001321387, intron 1 of 4) intron (NM_001321387, intron 1 of 4) 8430 NM_001321386 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 167.5-35 chr11 38222505 38222863 + 0.75 NA Intergenic HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 284083 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 164-83 chr3 141861427 141861816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15022 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 247.75-2 chr11 67451271 67451905 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001300896) promoter-TSS (NM_001300896) -815 NM_001300896 57010 Hs.143036 NM_145200 ENSG00000175544 CABP4 CRSD|CSNB2B calcium binding protein 4 protein-coding 197.75-90 chr8 83487652 83488005 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84070 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 130.25-214 chr9 18692211 18692645 + 0.75 NA intron (NM_001040272, intron 13 of 28) intron (NM_001040272, intron 13 of 28) 119122 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 145.5-59 chr14 39340958 39341252 + 0.75 NA intron (NM_001354150, intron 20 of 23) AluSx|SINE|Alu 73720 NM_001354141 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 152.75-22 chr10 75945945 75946305 + 0.75 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 163364 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 178.5-11 chr10 17160136 17160502 + 0.75 NA exon (NM_001351220, exon 6 of 11) exon (NM_001351220, exon 6 of 11) -30502 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 199.25 chr1 42472758 42473363 + 0.75 NA intron (NM_001355227, intron 1 of 18) intron (NM_001355227, intron 1 of 18) 9774 NM_001355224 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 125.25-203 chr8 64896378 64896708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97806 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 214.5-87 chr4 31468413 31468841 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -37917 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 134.25-179 chr7 70819515 70819789 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -312492 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 160-90 chr5 83634059 83634299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71865 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 178.25-78 chr22 25485025 25485363 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 29548 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 151-87 chr3 98637173 98637555 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -43753 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 178-65 chr3 134191635 134191911 + 0.75 NA intron (NM_001005861, intron 8 of 14) intron (NM_001005861, intron 8 of 14) 58971 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 182-74 chr3 88911215 88911634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -196197 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 118.75-62 chr14 65197256 65197466 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 24986 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 146.5-201 chr7 29051914 29052116 + 0.75 NA intron (NM_001371256, intron 15 of 16) L1PA17|LINE|L1 72048 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 193.5-135 chr5 103682389 103682957 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -119884 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 169-78 chr5 68171694 68171922 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18068 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 128.25-38 chr12 57872435 57872727 + 0.75 NA intron (NR_148947, intron 2 of 3) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 23901 NR_148947 283387 Hs.727244 NR_148947 ENSG00000245651 LOC283387 - uncharacterized LOC283387 ncRNA 147.25-59 chr2 100837094 100837420 + 0.75 NA intron (NM_002518, intron 1 of 20) intron (NM_002518, intron 1 of 20) 17118 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 137.75-46 chr12 88517779 88517975 + 0.75 NA intron (NM_000899, intron 4 of 9) intron (NM_000899, intron 4 of 9) 62594 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 145.5-118 chr21 23821989 23822313 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -437316 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 134.5-4 chr1 41036771 41037094 + 0.75 NA intron (NR_135092, intron 13 of 15) L2c|LINE|L2 -15177 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 193.75-64 chr2 97757148 97757564 + 0.75 NA exon (NM_015348, exon 41 of 41) exon (NM_015348, exon 41 of 41) 22950 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 115.75-173 chr5 118351113 118351386 + 0.75 NA non-coding (NR_104610, exon 10 of 10) non-coding (NR_104610, exon 10 of 10) 68675 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 155.5-207 chr8 124362109 124362388 + 0.75 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER57A-int|LTR|ERV1 10451 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 293.75-13 chr15 45888480 45888937 + 0.75 NA intron (NR_135680, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu 183513 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 134.75-231 chr9 72255494 72255805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49787 NR_110952 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 156-87 chr2 126229231 126229535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111398 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 208.25-18 chr11 35902416 35902985 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -41281 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 308-21 chr3 95290435 95291210 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 352559 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 124.5-128 chr20 47767132 47767413 + 0.75 NA intron (NM_198596, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR 18792 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 133-3 chr1 57290666 57290919 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) intron (NM_001353980, intron 5 of 5) 132320 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 123-208 chrX 131885376 131885648 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -54869 NR_026975 286467 Hs.720385 NR_026975 ENSG00000213468 FIRRE LINC01200 firre intergenic repeating RNA element ncRNA 121.75-150 chr5 94967876 94968110 + 0.75 NA intron (NM_001297777, intron 2 of 19) intron (NM_001297777, intron 2 of 19) 113873 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 247.25-30 chr2 100796636 100797124 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23259 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 172-65 chr20 46884834 46885224 + 0.75 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -9595 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 132.5-238 chr8 75748924 75749183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 209085 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 221.75-68 chr6 111784989 111785318 + 0.75 NA intron (NM_153047, intron 2 of 13) intron (NM_153047, intron 2 of 13) -25236 NM_001370529 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 132-54 chr14 88184141 88184476 + 0.75 NA 3' UTR (NM_138318, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_138318, exon 7 of 7) 86603 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 127.75-72 chr15 100549621 100550000 + 0.75 NA non-coding (NR_073405, exon 1 of 1) non-coding (NR_073405, exon 1 of 1) -5127 NM_178842 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 128.5-13 chr1 117128135 117128537 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6587 NM_001145635 80263 Hs.301526 NM_025188 ENSG00000134253 TRIM45 RNF99 tripartite motif containing 45 protein-coding 205.75-70 chr5 143564166 143564494 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -115530 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 166-60 chr2 55671684 55672048 + 0.75 NA intron (NM_033109, intron 10 of 27) intron (NM_033109, intron 10 of 27) 21978 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 236-63 chr6 116580991 116581578 + 0.75 NA intron (NM_015952, intron 2 of 6) intron (NM_015952, intron 2 of 6) 9780 NM_015952 51389 Hs.532164 NM_015952 ENSG00000111832 RWDD1 CGI-24|PTD013 RWD domain containing 1 protein-coding 120.5-128 chr2 188140614 188140898 + 0.75 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) MER20|DNA|hAT-Charlie 146935 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 128.5-38 chr11 28841431 28841712 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -364023 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 195.5-159 chr8 90533529 90533942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72328 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 185-91 chr9 89921644 89922036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47576 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 132-11 chr10 10035754 10035962 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -22864 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 186.25-10 chr1 209494066 209494387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62093 NR_029622 406988 NR_029622 ENSG00000284485 MIR205 MIRN205|mir-205 microRNA 205 ncRNA 292.5-38 chr4 13704984 13705430 + 0.75 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 50028 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 123-6 chr1 57805050 57805265 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -55424 NR_104364 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 137.75 chr1 44806547 44806787 + 0.75 NA TTS (NM_004073) TTS (NM_004073) 618 NM_001013632 343521 Hs.585137 NM_001013632 ENSG00000188396 TCTEX1D4 - Tctex1 domain containing 4 protein-coding 118.75-208 chr9 32710317 32710500 + 0.75 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -73132 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 122.5-76 chr15 89958257 89958453 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42969 NM_198526 374655 Hs.459311 NM_198526 ENSG00000140548 ZNF710 - zinc finger protein 710 protein-coding 117.75-165 chr4 122641357 122641560 + 0.75 NA intron (NR_104126, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 -20392 NM_021803 59067 Hs.567559 NM_021803 ENSG00000138684 IL21 CVID11|IL-21|Za11 interleukin 21 protein-coding 128-142 chr6 130505688 130506083 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 68768 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 214.75-19 chr13 45967078 45967528 + 0.75 NA intron (NM_001330564, intron 15 of 18) intron (NM_001330564, intron 15 of 18) 85443 NM_001330566 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 154.25-186 chr9 87207905 87208350 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59483 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 207.75-15 chr10 69847244 69847543 + 0.75 NA intron (NM_001368898, intron 3 of 33) intron (NM_001368898, intron 3 of 33) 45487 NM_001320951 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 123.75-137 chr4 90837404 90837696 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 8 of 10) MIRb|SINE|MIR 602519 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 134.5-13 chr1 106212082 106212328 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -183952 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 206.25-66 chr3 97680083 97680579 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) LTR88b|LTR|Gypsy? -84190 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 134-129 chr4 60100502 60100724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -822006 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 134.5-112 chr2 215490015 215490244 + 0.75 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 36422 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 153.5-17 chr10 24865704 24865986 + 0.75 NA intron (NM_020200, intron 4 of 8) intron (NM_020200, intron 4 of 8) 86761 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 161.75-117 chr7 32591529 32591809 + 0.75 NA intron (NR_036680, intron 13 of 16) intron (NR_036680, intron 13 of 16) 96180 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 230.75-32 chr19 33831138 33831634 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 34516 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 168.25-111 chr4 182459621 182459867 + 0.75 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 216342 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 124.25-111 chr2 214286390 214286598 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) AluSz6|SINE|Alu -124560 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 138.5-18 chr1 181857863 181858192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 203685 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 177-23 chr12 70959636 70959955 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -39057 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 139-30 chr12 55330914 55331180 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_054104) promoter-TSS (NM_054104) -654 NM_054104 254786 Hs.553653 NM_054104 ENSG00000205329 OR6C3 OST709 olfactory receptor family 6 subfamily C member 3 protein-coding 132.75-162 chr6 34844325 34844673 + 0.75 NA intron (NM_017754, intron 8 of 20) AluSz6|SINE|Alu 43543 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 156.5-190 chr8 67992474 67992882 + 0.75 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) intron (NM_024870, intron 1 of 39) 40632 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 131.75-13 chr1 112336964 112337209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59128 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 164.75-62 chr17 43171664 43171978 + 0.75 NA intron (NM_005899, intron 1 of 20) FLAM_C|SINE|Alu 607 NM_005899 4077 Hs.277721 NM_005899 ENSG00000188554 NBR1 1A1-3B|IAI3B|M17S2|MIG19 NBR1 autophagy cargo receptor protein-coding 203.25-42 chr16 10273688 10273998 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -90935 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 161.25-8 chr1 170022442 170022835 + 0.75 NA intron (NM_014970, intron 9 of 19) MIR3|SINE|MIR 46277 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 195-17 chr10 113860518 113860918 + 0.75 NA intron (NM_198514, intron 2 of 10) L1M4c|LINE|L1 6057 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 213.5-129 chr9 71108660 71109262 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MLT2B4|LTR|ERVL 12660 NM_001366150 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 139.75-147 chr5 86914330 86914616 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 167655 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 116.5-259 chr8 143179998 143180185 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -19437 NM_001130478 4062 Hs.159590 NM_002347 ENSG00000176956 LY6H NMLY6 lymphocyte antigen 6 family member H protein-coding 243.5-26 chr13 60868527 60869081 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 195849 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 116.25-220 chr8 16524083 16524259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -331380 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 231-68 chr5 64429562 64430072 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -76198 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 137.25-21 chr10 105293604 105293860 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 526601 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 171.25-22 chr10 123854548 123854807 + 0.75 NA intron (NM_198148, intron 3 of 13) intron (NM_198148, intron 3 of 13) 37130 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 225-52 chr4 56984653 56985215 + 0.75 NA intron (NM_000938, intron 1 of 24) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 6038 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 164.25-128 chr5 87372697 87372965 + 0.75 NA intron (NM_022650, intron 13 of 24) intron (NM_022650, intron 13 of 24) 40073 NM_001199189 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 140.5-56 chr13 79158542 79158801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 247550 NM_001286631 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 125-61 chr18 2188643 2188828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 382770 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 188.5-168 chr9 84059815 84060253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3409 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 130.5-236 chr8 22313080 22313317 + 0.75 NA intron (NM_001330480, intron 16 of 21) intron (NM_001330480, intron 16 of 21) 37631 NM_001135721 55124 Hs.614809 NM_018068 ENSG00000197181 PIWIL2 CT80|HILI|PIWIL1L|mili piwi like RNA-mediated gene silencing 2 protein-coding 168.25-133 chr7 28164567 28165037 + 0.75 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -15655 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-42 chr12 114215907 114216166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25734 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 178.75-59 chr3 31347753 31348094 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -185002 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 125.75-186 chr8 107602421 107602834 + 0.75 NA Intergenic HERV30-int|LTR|ERV1 -104709 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 120.75-68 chr18 43610430 43610656 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -333053 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 156.5-106 chr22 45846579 45846826 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 86178 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 125-65 chr2 22997187 22997412 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -387880 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 196.75-42 chr15 67848843 67849262 + 0.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -9007 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 145.75-147 chr7 20972983 20973393 + 0.75 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) intron (NR_126381, intron 2 of 5) 137757 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 176-5 chr1 224834828 224835138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94671 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 226.5-65 chr3 142093478 142093893 + 0.75 NA intron (NM_001178139, intron 2 of 12) intron (NM_001178139, intron 2 of 12) 55859 NM_001178139 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 186.75-115 chr8 130186544 130186915 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 7 of 29) MIRb|SINE|MIR -101961 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 167.75-83 chr20 17038957 17039395 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -186931 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 160-104 chr8 13076756 13077100 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 39316 NM_001164271 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 154.5-99 chr2 100444981 100445228 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -25378 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 178.75-32 chr14 79815154 79815599 + 0.75 NA intron (NM_138970, intron 5 of 5) intron (NM_138970, intron 5 of 5) -396043 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 184.5-124 chr5 127327856 127328322 + 0.75 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) intron (NM_001308119, intron 2 of 14) 37293 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 130.25-151 chr4 78974655 78974881 + 0.75 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 3020 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 139.25-145 chr5 26649868 26650212 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 388546 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 155.5-136 chr3 155660645 155660996 + 0.75 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) intron (NM_001349252, intron 2 of 24) 15523 NM_001130961 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 195.25-69 chr4 87805835 87806160 + 0.75 NA intron (NM_004967, intron 4 of 6) intron (NM_004967, intron 4 of 6) 6443 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 132.5-135 chr2 210356563 210356914 + 0.75 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) L1PA4|LINE|L1 32026 NR_110604 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 179.25-27 chr11 5900225 5900645 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001005166) promoter-TSS (NM_001005166) -330 NM_001005166 390082 NM_001005166 ENSG00000277932 OR52E5 OR11-56 olfactory receptor family 52 subfamily E member 5 protein-coding 145.5-64 chr14 59744551 59744913 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 2 of 8) intron (NM_021136, intron 2 of 8) -97712 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 127.25-5 chr1 125170084 125170316 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3651088 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 161.25-24 chr11 38012384 38012722 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 73952 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 190-11 chr10 23214719 23215076 + 0.75 NA intron (NM_001365862, intron 15 of 15) AluSz6|SINE|Alu 22585 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 167.75-128 chr7 5766102 5766517 + 0.75 NA intron (NM_207111, intron 1 of 16) AluJr4|SINE|Alu 15354 NM_207116 54476 Hs.487458 NM_019011 ENSG00000011275 RNF216 CAHH|TRIAD3|U7I1|UBCE7IP1|ZIN ring finger protein 216 protein-coding 120.5-214 chr7 38174724 38174912 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -3427 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 175.25-71 chr2 99835214 99835653 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) 270150 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 133.25-141 chr3 137563742 137563983 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -200453 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 223.5-83 chr3 105265188 105265563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101338 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 132.75-90 chr19 28058651 28059027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -264899 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 162.75-25 chr12 17415759 17416118 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 173140 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 210-9 chr1 186657680 186658062 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 22552 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 225-48 chr3 170138189 170138768 + 0.75 NA intron (NM_024947, intron 6 of 14) AluSx4|SINE|Alu 43255 NM_001308116 80012 Hs.529592 NM_024947 ENSG00000173889 PHC3 EDR3|HPH3 polyhomeotic homolog 3 protein-coding 277.5-62 chr5 31059854 31060377 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133571 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 163.75-133 chr8 144840059 144840468 + 0.75 NA intron (NM_001282796, intron 4 of 4) intron (NM_001282796, intron 4 of 4) 12703 NM_003416 7553 Hs.493218 NM_003416 ENSG00000147789 ZNF7 HF.16|KOX4|zf30 zinc finger protein 7 protein-coding 159.25-113 chr5 19844556 19844817 + 0.75 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 41586 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 144.5-230 chr8 139651316 139651594 + 0.75 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 51668 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 185.5-73 chr2 37034662 37035176 + 0.75 NA intron (NM_019024, intron 21 of 35) intron (NM_019024, intron 21 of 35) 49453 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 117.5-109 chr2 118701379 118701635 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -98541 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 171.5-76 chr2 61068792 61069089 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001330433, exon 2 of 22) 5' UTR (NM_001330433, exon 2 of 22) 2731 NM_032506 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 144.5-129 chr3 27598172 27598436 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -113920 NR_135541 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 130.75-35 chr11 132367470 132367705 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 83285 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 166.75-30 chr11 115014245 115014507 + 0.75 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -319201 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 130.5-95 chr14 80974761 80974998 + 0.75 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) intron (NM_001142626, intron 1 of 8) 19258 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 205.5-3 chr1 45984745 45985192 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 5 of 29) intron (NM_001324320, intron 5 of 29) 120620 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 154.5-49 chr12 65572778 65573003 + 0.75 NA intron (NR_120434, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu -15579 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 199.25-81 chr5 60067681 60068230 + 0.75 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L1MB1|LINE|L1 -174229 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 165.25-38 chr13 35257378 35257667 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 34 of 57) intron (NM_015678, intron 34 of 57) 219167 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 176-57 chr4 147380737 147381207 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -36255 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 142.25-11 chr1 228338915 228339337 + 0.75 NA intron (NM_052843, intron 69 of 80) intron (NM_052843, intron 69 of 80) 57983 NR_106800 102465444 NR_106800 ENSG00000284311 MIR6742 hsa-mir-6742 microRNA 6742 ncRNA 174.25-9 chr1 215123936 215124440 + 0.75 NA intron (NM_001017424, intron 2 of 6) intron (NM_001017424, intron 2 of 6) 41451 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 131-31 chr11 94850134 94850420 + 0.75 NA intron (NM_130847, intron 7 of 12) intron (NM_130847, intron 7 of 12) 81921 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 147-38 chr15 43013222 43013459 + 0.75 NA intron (NM_174916, intron 29 of 46) intron (NM_174916, intron 29 of 46) -92562 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 181.5-8 chr1 204340647 204341065 + 0.75 NA intron (NM_014935, intron 1 of 22) intron (NM_014935, intron 1 of 22) 19073 NM_014935 22874 Hs.253146 NM_014935 ENSG00000143850 PLEKHA6 PEPP-3|PEPP3 pleckstrin homology domain containing A6 protein-coding 188-5 chr1 214660626 214661053 + 0.75 NA intron (NM_016343, intron 19 of 19) L2c|LINE|L2 57644 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 180-44 chr16 79905456 79905724 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110341 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 202.5-141 chr8 27787463 27787937 + 0.75 NA intron (NM_001017420, intron 5 of 10) MIRc|SINE|MIR 13146 NM_001017420 157570 Hs.99480 NM_001017420 ENSG00000171320 ESCO2 2410004I17Rik|EFO2|EFO2p|RBS|hEFO2 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 protein-coding 231.75-19 chr14 26604578 26605023 + 0.75 NA intron (NR_147061, intron 1 of 6) intron (NR_147061, intron 1 of 6) 6153 NR_147061 102725045 Hs.143441 NR_147061 LINC02588 C14orf22|NOVA1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2588 ncRNA 195.75-62 chr2 160220272 160220687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20166 NM_001282354 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 204.25-69 chr3 99959253 99959621 + 0.75 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 4961 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 229-61 chr5 12078593 12079003 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -174352 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 129.5-76 chr15 62615288 62615627 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29724 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 211.5-110 chr4 6196743 6197162 + 0.75 NA intron (NM_144720, intron 1 of 12) intron (NM_144720, intron 1 of 12) -2333 NM_001306133 152789 Hs.479066 NM_144720 ENSG00000152969 JAKMIP1 Gababrbp|JAMIP1|MARLIN1 janus kinase and microtubule interacting protein 1 protein-coding 223.5-136 chr9 34755492 34756141 + 0.75 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -26328 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 171.75-84 chr2 192988626 192988996 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 238966 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 162.5-103 chr22 29096321 29096732 + 0.75 NA intron (NM_001039570, intron 2 of 8) intron (NM_001039570, intron 2 of 8) 23491 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 242-59 chr7 89057999 89058364 + 0.75 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -262444 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 125.75-84 chr2 38823513 38823753 + 0.75 NA intron (NM_001329963, intron 16 of 23) L1MB1|LINE|L1 45423 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 156.25-96 chr3 88785597 88785821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -321912 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 175.75-5 chr1 107054809 107055244 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -1648 NM_018137 55170 Hs.26006 NM_018137 ENSG00000198890 PRMT6 HRMT1L6 protein arginine methyltransferase 6 protein-coding 124.75-52 chr12 22650337 22650551 + 0.75 NA intron (NM_018638, intron 2 of 7) L1MC1|LINE|L1 25273 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 177.75-81 chr2 171805478 171805779 + 0.75 NA intron (NR_047549, intron 12 of 16) intron (NR_047549, intron 12 of 16) 88616 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 123.25-57 chr14 53696225 53696573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 252085 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 232-78 chr9 107955204 107955598 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -465632 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 161-22 chr11 91451163 91451634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -582196 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 130.5-89 chr14 61810410 61810693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1611 NM_001367650 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 183.5-93 chr3 132222268 132222625 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -94961 NM_001134194 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 156.25-75 chr2 118979486 118979854 + 0.75 NA intron (NM_006770, intron 8 of 16) intron (NM_006770, intron 8 of 16) 37501 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 170-52 chr20 13232254 13232709 + 0.75 NA intron (NM_080826, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 7206 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 144.25-90 chr2 11444177 11444465 + 0.75 NA TTS (NM_198256) TTS (NM_198256) 21840 NM_001278276 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 159.75-185 chr9 93503446 93503792 + 0.75 NA intron (NM_001286722, intron 5 of 17) L1MC1|LINE|L1 -50018 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 124.75-167 chr5 14095577 14095855 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -47626 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 134.25-201 chr9 98371435 98371778 + 0.75 NA intron (NM_005458, intron 11 of 18) intron (NM_005458, intron 11 of 18) -115957 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 161.5-68 chr15 70724053 70724415 + 0.75 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) -21952 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 226-53 chr5 62307798 62308109 + 0.75 NA intron (NM_001098511, intron 1 of 20) intron (NM_001098511, intron 1 of 20) 1791 NM_001098511 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 120.25-57 chr13 92465164 92465521 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -24821 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 155.25-169 chr7 111658757 111658991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96357 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 184.5-43 chr14 55263841 55264330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7336 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 184-38 chr18 1500019 1500447 + 0.75 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -140604 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 112.75-155 chr4 125479748 125479980 + 0.75 NA exon (NM_001291285, exon 14 of 17) exon (NM_001291285, exon 14 of 17) -27395 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 170-50 chr20 372606 372877 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7888 NM_021158 57761 Hs.516826 NM_021158 ENSG00000101255 TRIB3 C20orf97|NIPK|SINK|SKIP3|TRB3 tribbles pseudokinase 3 protein-coding 115-53 chr14 96116820 96117123 + 0.75 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 77609 NM_001252507 56967 Hs.6434 NM_020215 ENSG00000227051 C14orf132 C14orf88 chromosome 14 open reading frame 132 protein-coding 117.25-184 chr6 62673794 62673978 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -387659 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 153.75-23 chr10 109017717 109018049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 905363 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 138-125 chr5 22941360 22941604 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -88138 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 119-84 chr2 59744871 59745190 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 527322 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 159.75-157 chr7 40802596 40802982 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 177150 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 126.25-114 chr3 66176376 66176617 + 0.75 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) intron (NM_173471, intron 1 of 10) 42886 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 121.5-246 chr8 111143924 111144223 + 0.75 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 92130 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 174.25-133 chr7 46267988 46268299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -346871 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 138.75-143 chr5 39295840 39296133 + 0.75 NA intron (NM_001737, intron 9 of 10) L1MA5A|LINE|L1 -25337 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 160-119 chr9 134585920 134586289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55701 NM_000093 1289 Hs.210283 NM_000093 ENSG00000130635 COL5A1 EDSC|EDSCL1 collagen type V alpha 1 chain protein-coding 136.75-130 chr3 64384144 64384618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116208 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 179.5-139 chr4 98912365 98912746 + 0.75 NA intron (NM_001331017, intron 1 of 7) AluSc5|SINE|Alu 16578 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 205-41 chr2 162269481 162269938 + 0.75 NA intron (NM_022168, intron 13 of 15) intron (NM_022168, intron 13 of 15) -26264 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 194-33 chr14 51636973 51637417 + 0.75 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) AluJo|SINE|Alu 14549 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 142.75-162 chr5 129702211 129702534 + 0.75 NA intron (NM_133638, intron 20 of 22) intron (NM_133638, intron 20 of 22) -45722 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 114-74 chr2 79416826 79417138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83862 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 151.75-112 chr5 68917365 68917635 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 112427 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 159.5-12 chr1 221731868 221732266 + 0.75 NA intron (NR_111940, intron 1 of 2) intron (NR_111940, intron 1 of 2) 4833 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 130.75-37 chr12 5238681 5238957 + 0.75 NA intron (NR_120477, intron 2 of 2) intron (NR_120477, intron 2 of 2) 4332 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 137-131 chr5 24252518 24252841 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 301331 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 178.5-24 chr11 60133238 60133720 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 44815 NM_000139 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 176.75-89 chr4 43995735 43995991 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -20998 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 254.75-37 chr4 30639401 30639998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80670 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.5-136 chr5 158541854 158542211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132259 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 217-78 chr7 41620851 41621250 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72869 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 169.5-38 chr12 80016847 80017204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81570 NM_001143885 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 122.75-61 chr17 5787949 5788210 + 0.75 NA intron (NR_040000, intron 1 of 3) intron (NR_040000, intron 1 of 3) 15845 NR_040000 339166 Hs.736088 NR_040000 ENSG00000284837 LOC339166 - uncharacterized LOC339166 ncRNA 138.75-133 chr4 161263388 161263706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -759186 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 186-41 chr18 64191488 64191833 + 0.75 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) -42634 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 146 chr1 73498603 73498837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175959 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 135-172 chr7 102874094 102874386 + 0.75 NA intron (NR_105043, intron 17 of 20) intron (NR_105043, intron 17 of 20) -38760 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 117.25-133 chr22 26249283 26249613 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) L1MA5|LINE|L1 79974 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 213.25-34 chr20 20652594 20653012 + 0.75 NA intron (NM_020343, intron 4 of 39) intron (NM_020343, intron 4 of 39) 59841 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 123.5-52 chr12 113006618 113006841 + 0.75 NA intron (NM_002535, intron 8 of 9) intron (NM_002535, intron 8 of 9) 28210 NM_016817 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 176.75-104 chr5 173192697 173193131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42292 NM_001166175 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 138-21 chr11 86329382 86329612 + 0.75 NA intron (NR_136324, intron 3 of 5) L1MEf|LINE|L1 27257 NM_001322407 51501 Hs.283322 NM_016401 ENSG00000149196 HIKESHI C11orf73|HLD13|HSPC138|HSPC179|L7RN6|OPI10 heat shock protein nuclear import factor hikeshi protein-coding 209.5-96 chr3 159422536 159422882 + 0.75 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1ME3A|LINE|L1 140063 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 134.25-181 chr7 103427578 103427810 + 0.75 NA intron (NR_135802, intron 2 of 17) intron (NR_135802, intron 2 of 17) 15517 NR_120441 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 116-2 chr1 49490742 49491031 + 0.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MIR|SINE|MIR -18801 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 160.25-29 chr12 112015651 112016048 + 0.75 NA intron (NM_001034025, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 2423 NM_006817 10961 Hs.75841 NM_006817 ENSG00000089248 ERP29 C12orf8|ERp28|ERp31|HEL-S-107|PDI-DB|PDIA9 endoplasmic reticulum protein 29 protein-coding 133.5-70 chr12 116474412 116474626 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -46201 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 201.5-71 chr2 119319475 119319949 + 0.75 NA intron (NM_001322332, intron 2 of 4) intron (NM_001322332, intron 2 of 4) 47030 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 120.25-37 chr11 30997378 30997642 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) L1MD3|LINE|L1 -4824 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 246.25-39 chr20 9814402 9814743 + 0.75 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 24504 NM_020341 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 195.25-40 chr17 9119814 9120116 + 0.75 NA intron (NM_004822, intron 2 of 6) L1MB7|LINE|L1 59153 NR_110828 101928266 Hs.639880 NR_110828 ENSG00000262966 LOC101928266 - uncharacterized LOC101928266 ncRNA 267-46 chr7 7794536 7795195 + 0.75 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) MER4D|LTR|ERV1 -76258 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 165.75-112 chr3 70726335 70726702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 338406 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 204.25-74 chr3 197007888 197008222 + 0.75 NA intron (NM_005929, intron 13 of 15) intron (NM_005929, intron 13 of 15) 5149 NR_038285 100507057 Hs.666451 NR_038285 ENSG00000228109 MELTF-AS1 MFI2-AS1 MELTF antisense RNA 1 ncRNA 115.75-149 chr4 31199818 31200064 + 0.75 NA intron (NR_125935, intron 4 of 4) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 28797 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 165.25-91 chr3 114670696 114671079 + 0.75 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) -45942 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 185.5-120 chr4 91831645 91831940 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 445510 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 238.25-71 chr5 153839725 153840268 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58991 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 253.75-11 chr14 45833569 45834149 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -118257 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 157.25-146 chr8 41461500 41461755 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28769 NM_001362979 51125 Hs.654773 NM_016099 ENSG00000147533 GOLGA7 GCP16|GOLGA3AP1|GOLGA7A|HSPC041 golgin A7 protein-coding 119.5-122 chr2 64041290 64041589 + 0.75 NA Intergenic SVA_D|Retroposon|SVA -22011 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 156.5-96 chr20 54288823 54289192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80920 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 133.5-141 chr20 57105781 57105996 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107808 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 148.75-3 chr1 51019543 51019783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40174 NR_039617 100616189 NR_039617 ENSG00000265538 MIR4421 - microRNA 4421 ncRNA 235.75-20 chr12 53877505 53877987 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -61085 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 211.25-38 chr2 32278118 32278510 + 0.75 NA intron (NM_032312, intron 1 of 5) CpG 410 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 133.25-76 chr17 49268258 49268599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20026 NR_106745 102465137 NR_106745 ENSG00000273500 MIR6129 hsa-mir-6129 microRNA 6129 ncRNA 176.25-94 chr3 110284383 110284895 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 681811 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 152-120 chr5 6867020 6867287 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -39232 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 117.75-232 chrX 110526649 110526904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6464 NR_002718 6998 Hs.592361 NR_002718 ENSG00000225366 TDGF1P3 CR-3|CRIPTO|CRIPTO-3|CRIPTO3|TDGF1|TDGF2|TDGF3 teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 pseudo 124.5-226 chr8 101364899 101365119 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -3884 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 271.25-3 chr1 93410159 93410695 + 0.75 NA Intergenic LTR23-int|LTR|ERV1 -37691 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 120.5-167 chr4 108574080 108574307 + 0.75 NA intron (NR_026968, intron 1 of 3) intron (NR_026968, intron 1 of 3) 16960 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 214.5-7 chr1 192315443 192315901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1320 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 165-21 chr11 5779722 5780031 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1209 NM_001001922 390075 Hs.690207 NM_001001922 ENSG00000181009 OR52N5 OR11-62|OR52N5Q olfactory receptor family 52 subfamily N member 5 protein-coding 144.5-177 chr5 116933036 116933282 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -170950 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 117.75-57 chr14 73096939 73097131 + 0.75 NA exon (NM_021239, exon 7 of 19) exon (NM_021239, exon 7 of 19) 38501 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 132.25-98 chr2 112830313 112830753 + 0.75 NA exon (NM_000576, exon 7 of 7) exon (NM_000576, exon 7 of 7) 6246 NM_000576 3553 Hs.126256 NM_000576 ENSG00000125538 IL1B IL-1|IL1-BETA|IL1F2 interleukin 1 beta protein-coding 257.25 chr1 53452329 53453009 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6730 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 124-9 chr1 97005998 97006272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89788 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 124.5-101 chr2 37984219 37984610 + 0.75 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) intron (NM_001170793, intron 4 of 9) 33950 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 139.75-32 chr12 15908288 15908575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2901 NM_001300779 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 159.25-111 chr5 8140753 8141066 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 271761 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 164.75-68 chr18 51058413 51058729 + 0.75 NA intron (NM_005359, intron 7 of 11) intron (NM_005359, intron 7 of 11) 28358 NM_005359 4089 Hs.75862 NM_005359 ENSG00000141646 SMAD4 DPC4|JIP|MADH4|MYHRS SMAD family member 4 protein-coding 205-37 chr2 69144298 69144621 + 0.75 NA intron (NM_032208, intron 12 of 17) intron (NM_032208, intron 12 of 17) 40777 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 149.25-190 chr9 12206742 12206953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -486538 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 179.25-50 chr13 80274850 80275320 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64574 NM_001318537 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 127.5-76 chr14 56334573 56334745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179672 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 171-118 chr6 43204871 43205114 + 0.75 NA exon (NM_015089, exon 23 of 41) exon (NM_015089, exon 23 of 41) 22796 NM_015089 23113 Hs.485434 NM_015089 ENSG00000112659 CUL9 H7AP1|PARC cullin 9 protein-coding 128.25-188 chr7 35604213 35604445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90806 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 172-39 chr14 75182489 75182838 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6051 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 125.75-93 chr2 79580554 79580921 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) intron (NM_001282598, intron 1 of 17) 57554 NM_001282598 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 121.5-183 chr3 123732500 123732713 + 0.75 NA intron (NM_053026, intron 10 of 32) intron (NM_053026, intron 10 of 32) 42962 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 143-61 chr18 47093364 47093715 + 0.75 NA intron (NM_001353909, intron 12 of 12) AluJb|SINE|Alu 56961 NM_001318765 84064 Hs.465041 NM_032124 ENSG00000167220 HDHD2 3110052N05Rik|HEL-S-301 haloacid dehalogenase like hydrolase domain containing 2 protein-coding 164-69 chr22 24734533 24734817 + 0.75 NA intron (NM_001008496, intron 13 of 20) L1PB1|LINE|L1 -29826 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 120.25-38 chr11 32560475 32560660 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -23264 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 192.75-130 chr8 132980812 132981274 + 0.75 NA intron (NM_003235, intron 34 of 47) intron (NM_003235, intron 34 of 47) 65538 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 136-45 chr15 61264044 61264287 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -34863 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 141-76 chr2 100488826 100489222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18542 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 130-148 chr7 26824841 26825102 + 0.75 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 32752 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 190.25-116 chr7 12690666 12691059 + 0.75 NA TTS (NM_001037164) TTS (NM_001037164) 3229 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 129-60 chr14 54054795 54055096 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -98054 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 197.75-83 chr7 107594424 107594817 + 0.75 NA intron (NR_163932, intron 3 of 5) AluY|SINE|Alu 14374 NM_001371354 189.5-22 chr10 72644453 72644832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18451 NM_006077 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 286.75-27 chr3 27519200 27519858 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -35145 NR_135541 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 170-56 chr21 16521235 16521592 + 0.75 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) L1PA10|LINE|L1 -14159 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 175.75-40 chr14 67209188 67209477 + 0.75 NA intron (NM_173526, intron 6 of 8) L2a|LINE|L2 19892 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 165.75-64 chr17 75547952 75548235 + 0.75 NA intron (NM_001015002, intron 2 of 9) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 22391 NM_001015002 3993 Hs.514477 NM_004524 ENSG00000073350 LLGL2 HGL|Hugl-2|LGL2 LLGL scribble cell polarity complex component 2 protein-coding 196.5-62 chr16 86161178 86161539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34823 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 175.5-170 chr8 125387142 125387501 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43037 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 255.25-5 chr10 10805954 10806380 + 0.75 NA intron (NM_001326327, intron 1 of 14) intron (NM_001326327, intron 1 of 14) 7442 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 113-70 chr16 35259738 35260009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64114 NR_157261 112268173 Hs.369226 NR_157261 LOC112268173 - uncharacterized LOC112268173 ncRNA 148.5-55 chr13 94143288 94143519 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) 44588 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 159-127 chr9 28297418 28297687 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 421753 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 175.5-93 chr2 174106829 174107149 + 0.75 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) intron (NM_001011708, intron 6 of 9) 81709 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 225.25-42 chr2 64529668 64530256 + 0.75 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 4449 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 114.5-243 chr7 52928682 52928953 + 0.75 NA Intergenic MER105|DNA|hAT-Charlie -106816 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 156-104 chr3 119866350 119866695 + 0.75 NA intron (NM_001354596, intron 8 of 9) intron (NM_001354596, intron 8 of 9) 83812 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 118.25-188 chr7 94498157 94498461 + 0.75 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -11500 NM_001363428 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 133.25-126 chr22 32895490 32895750 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 4 of 13) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 94804 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 119.25-219 chr9 37198719 37199030 + 0.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 78276 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 135.25-133 chr3 180104546 180104796 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -67734 NM_016559 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 169.75-71 chr19 7331512 7331973 + 0.75 NA Intergenic (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17195 NM_001367823 23370 Hs.465761 NM_015318 ENSG00000104880 ARHGEF18 P114-RhoGEF|RP78|SA-RhoGEF|p114RhoGEF Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18 protein-coding 151-42 chr16 70319261 70319525 + 0.75 NA intron (NM_007242, intron 5 of 11) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 20340 NM_001014449 11269 Hs.221761 NM_007242 ENSG00000157349 DDX19B DBP5|DDX19|RNAh DEAD-box helicase 19B protein-coding 222.25-47 chr3 132507347 132507705 + 0.75 NA intron (NM_001329126, intron 44 of 56) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -89744 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 113.75-163 chr6 50163751 50164007 + 0.75 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -113950 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 121.5-216 chr5 178627717 178627907 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_020666) promoter-TSS (NM_020666) -762 NM_020666 57396 Hs.406557 NM_020666 ENSG00000113240 CLK4 - CDC like kinase 4 protein-coding 121.75-137 chr4 170296907 170297119 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 70422 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 158.75-108 chr3 7097399 7097676 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -203520 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 227.5-90 chr6 95583433 95583870 + 0.75 NA intron (NM_024641, intron 1 of 4) L1ME3F|LINE|L1 6116 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 122.75-178 chr6 133954224 133954495 + 0.75 NA intron (NM_004865, intron 1 of 6) intron (NM_004865, intron 1 of 6) 1135 NM_004865 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 154.5-135 chr3 182366083 182366384 + 0.75 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT 120129 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 169.5-3 chr1 40271351 40271811 + 0.75 NA intron (NM_005857, intron 5 of 9) intron (NM_005857, intron 5 of 9) 13345 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 213.5-73 chr22 21711498 21711970 + 0.75 NA intron (NM_013313, intron 1 of 4) L1M4|LINE|L1 24060 NM_013313 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 204.5-96 chr3 173737886 173738217 + 0.75 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) L1MB8|LINE|L1 153617 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 130.25-149 chr4 46257034 46257306 + 0.75 NA intron (NM_001286827, intron 8 of 9) L2c|LINE|L2 132209 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 125.5-241 chr7 136213685 136213971 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236469 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 176-48 chr3 150916239 150916719 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -11040 NM_001351281 646951 Hs.380222 NM_001351281 MINDY4B C3orf76|FAM188B2 MINDY family member 4B protein-coding 141.75-6 chr1 82496455 82496951 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -406480 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 181.75-91 chr3 194800003 194800332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31458 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 112.5-85 chr15 92600348 92600629 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -28225 NR_021493 100144604 Hs.245476 NR_021493 ENSG00000258647 LINC00930 - long intergenic non-protein coding RNA 930 ncRNA 123.5-141 chr3 130906210 130906465 + 0.75 NA intron (NM_001001485, intron 2 of 27) L1ME1|LINE|L1 11747 NM_001001486 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 211.5-44 chr13 57273899 57274299 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 106902 NM_001130407 729250 Hs.525056 NM_001130407 ENSG00000234278 PRR20E PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20C|PRR20D proline rich 20E protein-coding 252.5-73 chr6 158751727 158752151 + 0.75 NA exon (NM_001009991, exon 12 of 17) exon (NM_001009991, exon 12 of 17) 12814 NR_037482 100500851 NR_037482 ENSG00000265558 MIR3918 mir-3918 microRNA 3918 ncRNA 114.5-19 chr1 180498941 180499122 + 0.75 NA intron (NM_032360, intron 1 of 7) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 3546 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 238.5-60 chr4 65370141 65370605 + 0.75 NA intron (NM_182472, intron 8 of 16) intron (NM_182472, intron 8 of 16) 299115 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 184.25-75 chr21 29389399 29389713 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17055 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 142-69 chr17 64538496 64538766 + 0.75 NA TTS (NR_133644) TTS (NR_133644) 31654 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 193.5-164 chr8 135860101 135860398 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 402793 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 217.25-19 chr11 55601365 55601934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 2749 NM_001004700 219429 Hs.553620 NM_001004700 ENSG00000172188 OR4C11 OR11-136|OR4C11P olfactory receptor family 4 subfamily C member 11 protein-coding 114.25-204 chr9 28300207 28300465 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 418969 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 131.5-85 chr17 3955825 3956273 + 0.75 NA intron (NM_174955, intron 1 of 21) AluSx1|SINE|Alu 8388 NM_174954 489 Hs.513870 NM_005173 ENSG00000074370 ATP2A3 SERCA3 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 3 protein-coding 168-112 chr6 85200048 85200364 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 189980 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 145.25-50 chr16 82132071 82132370 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 38004 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 136-108 chr3 110212510 110212845 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 609849 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 170.25-106 chr4 38514142 38514405 + 0.75 NA intron (NR_149076, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 4506 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 115.75-30 chr11 83671448 83671705 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) L2c|LINE|L2 10849 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 182.5-101 chr3 43917344 43917850 + 0.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -196615 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 158.75-67 chr16 74372293 74372601 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4192 NR_026950 283922 Hs.558726 NR_026950 ENSG00000214331 LOC283922 - pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit pseudogene pseudo 135.25-25 chr10 55259311 55259661 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L2|LINE|L2 -339556 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 187-109 chr9 97465806 97466367 + 0.75 NA intron (NM_001302884, intron 7 of 15) intron (NM_001302884, intron 7 of 15) -35094 NM_001166116 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 147-126 chr6 132554424 132554663 + 0.75 NA TTS (NM_053278) TTS (NM_053278) 1859 NM_053278 83551 Hs.350571 NM_053278 ENSG00000146385 TAAR8 GPR102|TA5|TAR5|TRAR5|TaR-5|TaR-8 trace amine associated receptor 8 protein-coding 207.75-63 chr2 227289323 227289817 + 0.75 NA intron (NM_000091, intron 35 of 51) intron (NM_000091, intron 35 of 51) 35594 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 147-55 chr17 77088442 77088764 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_027058) promoter-TSS (NR_027058) -40 NR_027058 654434 Hs.720923 NR_027058 ENSG00000234912 SNHG20 C17orf86|LINC00338|NCRNA00338|SCARNA16HG small nucleolar RNA host gene 20 ncRNA 140.75-147 chr5 64119106 64119310 + 0.75 NA Intergenic UCON55|DNA|TcMar-Tigger -46635 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 171.25-11 chr10 11230836 11231174 + 0.75 NA intron (NM_001025076, intron 3 of 13) intron (NM_001025076, intron 3 of 13) 65975 NM_001025076 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 121.25-69 chr15 77628757 77629010 + 0.75 NA intron (NM_001301195, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 4029 NM_032808 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 168.75-159 chr9 105261921 105262199 + 0.75 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu 17409 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 150.75-42 chr11 114246300 114246658 + 0.75 NA intron (NM_006006, intron 5 of 6) intron (NM_006006, intron 5 of 6) -49334 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 183.75-97 chr5 88467429 88467735 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -28492 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 203-43 chr18 64329234 64329626 + 0.75 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) intron (NR_033881, intron 5 of 9) -69375 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 210.75-97 chr8 91026781 91027142 + 0.75 NA intron (NM_018710, intron 1 of 6) ERVL-E-int|LTR|ERVL 13898 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 196.5-165 chr8 111809280 111809655 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 432828 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 146.75-129 chr5 90481719 90481953 + 0.75 NA intron (NM_001370351, intron 1 of 7) L1MC5a|LINE|L1 6972 NM_001370353 10622 Hs.282387 NM_006467 ENSG00000113356 POLR3G RPC32|RPC7 RNA polymerase III subunit G protein-coding 121-33 chr11 17680280 17680472 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16563 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 139.25-216 chrX 63353785 63354038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2579 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 127.5-180 chr4 168318436 168318629 + 0.75 NA intron (NM_017631, intron 1 of 37) CpG 220 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 122-124 chr3 184646650 184646849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65315 NM_022149 64110 Hs.306123 NM_022149 ENSG00000177383 MAGEF1 MAGE-F1 MAGE family member F1 protein-coding 178-102 chr8 76803703 76804102 + 0.75 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -120627 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 116-144 chr6 129244677 129244876 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 12 of 64) intron (NM_000426, intron 12 of 64) 361635 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 165.5-28 chr12 424594 425040 + 0.75 NA intron (NM_001130148, intron 3 of 10) L1MB3|LINE|L1 23173 NM_001130146 84318 Hs.631656 NM_032358 ENSG00000120647 CCDC77 - coiled-coil domain containing 77 protein-coding 184.25-50 chr18 21153039 21153450 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -41431 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 210.75-38 chr2 88658413 88658897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30826 NR_135540 101928403 Hs.434326 NR_135540 ENSG00000234028 EIF2AK3-DT - EIF2AK3 divergent transcript ncRNA 130.25-130 chr22 44390983 44391308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52182 NR_109966 101927526 Hs.339290 NR_109966 ENSG00000232655 LINC01656 - long intergenic non-protein coding RNA 1656 ncRNA 159.75-51 chr15 61862038 61862416 + 0.75 NA intron (NM_020821, intron 82 of 84) intron (NM_020821, intron 82 of 84) 132309 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 122-77 chr18 6307477 6307778 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 3 of 16) intron (NM_001365769, intron 3 of 16) 50883 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-139 chr3 38149116 38149282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10538 NM_001172566 4615 Hs.82116 NM_002468 ENSG00000172936 MYD88 MYD88D MYD88 innate immune signal transduction adaptor protein-coding 151-79 chr22 46707820 46708167 + 0.75 NA intron (NM_022766, intron 5 of 12) intron (NM_022766, intron 5 of 12) 30259 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 152.25-124 chr5 6381291 6381574 + 0.75 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -2885 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 206.5-24 chr13 110027385 110027754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25716 NR_126387 104355146 Hs.508690 NR_126387 ENSG00000231428 LINC00396 - long intergenic non-protein coding RNA 396 ncRNA 115.25-42 chr11 131530113 131530367 + 0.75 NA intron (NM_001352003, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 10627 NR_110140 101929653 Hs.559159 NR_110140 ENSG00000237654 LOC101929653 - uncharacterized LOC101929653 ncRNA 120.75-127 chr4 104572187 104572437 + 0.75 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -77418 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 142.75-190 chr8 126238282 126238532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87088 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 214.75-54 chr3 94919261 94919638 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18814 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 150.5-214 chr8 48518407 48518676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33026 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 203.25-67 chr3 21295899 21296445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109554 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 131-36 chr12 2510553 2510735 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 8 of 49).2 intron (NM_199460, intron 8 of 49).2 161576 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 145.25-137 chr5 146209643 146209992 + 0.75 NA intron (NM_018989, intron 1 of 20) intron (NM_018989, intron 1 of 20) 6212 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 133.75-20 chr10 60954260 60954541 + 0.75 NA intron (NM_001350906, intron 2 of 12) intron (NM_001350906, intron 2 of 12) -9674 NM_001350911 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 147-122 chr6 71720509 71720761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166068 NM_001350412 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 243-11 chr10 125431259 125431831 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142826 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 175-77 chr20 45887817 45888304 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_080608) promoter-TSS (NM_080608) -438 NM_080608 128497 Hs.128235 NM_080608 ENSG00000149634 SPATA25 C20orf165|TSG23|dJ337O18.8 spermatogenesis associated 25 protein-coding 205-76 chr8 79469297 79469711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137316 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 144.5-39 chr11 12798921 12799147 + 0.75 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 124613 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 166-49 chr17 81888529 81888773 + 0.75 NA intron (NM_005782, intron 3 of 5) intron (NM_005782, intron 3 of 5) -2139 NM_001289414 51529 Hs.534456 NM_016476 ENSG00000141552 ANAPC11 APC11|Apc11p|HSPC214 anaphase promoting complex subunit 11 protein-coding 306.5-2 chr1 151776853 151777464 + 0.75 NA intron (NM_001083965, intron 6 of 12) intron (NM_001083965, intron 6 of 12) 10503 NM_016178 51686 Hs.713789 NM_016178 ENSG00000143450 OAZ3 AZ3|OAZ-t|TISP15 ornithine decarboxylase antizyme 3 protein-coding 172.5-117 chr3 14703359 14703712 + 0.75 NA intron (NM_001184957, intron 6 of 16) MIRb|SINE|MIR 28394 NM_001184958 84077 Hs.661452 NM_032137 ENSG00000131379 C3orf20 - chromosome 3 open reading frame 20 protein-coding 160-31 chr14 50232234 50232579 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006939) promoter-TSS (NM_006939) -828 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 128-152 chr7 62932838 62933047 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 371114 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 215.5-95 chr6 132078037 132078560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36965 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 316.25-6 chr10 100942699 100943151 + 0.75 NA intron (NM_018121, intron 11 of 19) AluSz6|SINE|Alu -29604 NM_001203244 57715 Hs.591923 NM_017893 ENSG00000095539 SEMA4G - semaphorin 4G protein-coding 231.5-75 chr4 100963185 100963673 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 277443 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 142-41 chr13 69818728 69818930 + 0.75 NA intron (NM_001286725, intron 5 of 9) intron (NM_001286725, intron 5 of 9) -288384 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 190.25-126 chr9 11826043 11826449 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -867139 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 183.75-28 chr12 42817377 42817719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125332 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 263.5-68 chr9 31611840 31612317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230588 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 193.75-121 chr8 91427300 91427612 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178137 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 148.25-150 chr8 135220936 135221206 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -13060 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 112.5-5 chr1 56228524 56228782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -186310 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 127.5-152 chr3 112596210 112596518 + 0.75 NA TTS (NR_109779) TTS (NR_109779) 5605 NR_109779 100506621 Hs.86538 NR_109779 LINC01279 - long intergenic non-protein coding RNA 1279 ncRNA 147-48 chr16 52086514 52086770 + 0.75 NA intron (NR_104655, intron 1 of 2) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 1361 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 150-10 chr10 11416386 11416652 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -71845 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 155-72 chr2 224370825 224371129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31017 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 149.75-125 chr5 14722787 14723081 + 0.75 NA intron (NM_054027, intron 8 of 11) L1MC3|LINE|L1 10240 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 172.25-15 chr10 23165359 23165767 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -26749 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 115-39 chr12 26704046 26704276 + 0.75 NA intron (NM_002223, intron 9 of 56) intron (NM_002223, intron 9 of 56) 129033 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 127.75-84 chr18 6468905 6469141 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -42393 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 128.75-36 chr11 109430237 109430502 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8179 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 181.5 chr1 13847308 13847729 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 98103 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 190.25-97 chr5 51292469 51292987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90604 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 217-82 chr9 78790219 78790719 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 355197 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 131.25-36 chr11 116288264 116288617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -350982 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 155.75-161 chr8 87700835 87701115 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 173040 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 171.25-43 chr14 55374667 55374966 + 0.75 NA intron (NM_014924, intron 9 of 9) L1ME4b|LINE|L1 37042 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 149.5-116 chr21 45446397 45446890 + 0.75 NA intron (NM_130445, intron 2 of 42) L1M4|LINE|L1 -8879 NM_130444 80781 Hs.517356 NM_030582 ENSG00000182871 COL18A1 KNO|KNO1|KS collagen type XVIII alpha 1 chain protein-coding 143-10 chr10 69133984 69134362 + 0.75 NA intron (NM_001318944, intron 3 of 9) intron (NM_001318944, intron 3 of 9) 9995 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 131-137 chr5 88564927 88565263 + 0.75 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) intron (NR_152235, intron 2 of 3) 101844 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 120-19 chr10 105172067 105172326 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 13 of 26) intron (NM_014978, intron 13 of 26) -505980 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-115 chr2 67537437 67537664 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 140217 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 196.25-40 chr15 38937615 38937911 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 241165 NR_160786 161-2 chr1 77883069 77883523 + 0.75 NA intron (NR_103535, intron 2 of 2) MER1B|DNA|hAT-Charlie -5219 NM_001172309 91624 Hs.612385 NM_144573 ENSG00000162614 NEXN CMH20|NELIN nexilin F-actin binding protein protein-coding 177.75-60 chr19 17555158 17555621 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_024656) promoter-TSS (NM_024656) -260 NM_024656 79709 Hs.418795 NM_024656 ENSG00000130309 COLGALT1 BSVD3|ColGalT 1|GLT25D1 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 protein-coding 193.5-75 chr18 73028351 73028838 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 159554 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 248.5-108 chr9 131965523 131966200 + 0.75 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) intron (NM_001253881, intron 3 of 6) 114006 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 127.5-231 chr7 50667792 50668038 + 0.75 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) intron (NM_001350816, intron 6 of 17) 37386 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 129-118 chr3 29202142 29202481 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78628 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 114.5-81 chr13 97963717 97964016 + 0.75 NA intron (NM_002271, intron 2 of 28) L1P3|LINE|L1 10191 NM_002271 3843 Hs.712598 NM_002271 ENSG00000065150 IPO5 IMB3|KPNB3|Pse1|RANBP5|imp5 importin 5 protein-coding 135.75-99 chr2 102980284 102980521 + 0.75 NA intron (NR_135530, intron 1 of 3) intron (NR_135530, intron 1 of 3) 4027 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 117.5-243 chr9 35643519 35643736 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2643 NR_135130 101926948 Hs.639412 NR_135130 LOC101926948 - uncharacterized LOC101926948 ncRNA 167.5-133 chr4 181221885 181222252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42961 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 189.25-138 chr9 114636137 114636492 + 0.75 NA intron (NM_153045, intron 6 of 8) intron (NM_153045, intron 6 of 8) 21491 NM_001354645 105376230 Hs.147369 NM_001354645 ENSG00000230054 TEX53 - testis expressed 53 protein-coding 166.75-103 chr4 64116852 64117101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292474 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 232.75-39 chr22 49760377 49760871 + 0.75 NA Intergenic L1M2a1|LINE|L1 63707 NM_001349940 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 148.75-107 chr22 43446072 43446302 + 0.75 NA intron (NM_001362786, intron 3 of 6) L1MEd|LINE|L1 29635 NM_001362786 758 Hs.159538 NM_001044370 ENSG00000186732 MPPED1 239AB|C22orf1|FAM1A metallophosphoesterase domain containing 1 protein-coding 121.25-68 chr15 77363564 77363862 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L1MB8|LINE|L1 56391 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 155-110 chr5 75059376 75059810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7035 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 124.25-95 chr2 50469648 50469907 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 16 of 22) intron (NM_001330093, intron 16 of 22) -122021 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 135.5-86 chr18 12689796 12690006 + 0.75 NA intron (NM_001271989, intron 6 of 10) AluSx1|SINE|Alu 12822 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 161.5-41 chr12 29651472 29651713 + 0.75 NA intron (NM_175861, intron 5 of 17) intron (NM_175861, intron 5 of 17) 132350 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 119.5-20 chr10 13475687 13475865 + 0.75 NA intron (NM_001370075, intron 5 of 8) intron (NM_001370075, intron 5 of 8) 27200 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 174.75-28 chr13 27698270 27698680 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 76583 NM_152705 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 123-127 chr3 17422045 17422268 + 0.75 NA intron (NM_001349091, intron 2 of 19) intron (NM_001349091, intron 2 of 19) 277864 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 228.25-48 chr20 10750045 10750623 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -2756 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 183.75-82 chr4 46365717 46366064 + 0.75 NA intron (NM_001114175, intron 2 of 8) intron (NM_001114175, intron 2 of 8) 23489 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 200.25-14 chr10 51323991 51324404 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) L1MA4|LINE|L1 24624 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 222.25-74 chr5 130880543 130881018 + 0.75 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 284476 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 215.25-104 chr7 134010259 134010900 + 0.75 NA intron (NM_021807, intron 17 of 17) intron (NM_021807, intron 17 of 17) -116761 NM_001365700 136332 Hs.149774 NM_144648 ENSG00000155530 LRGUK CFAP246 leucine rich repeats and guanylate kinase domain containing protein-coding 192-58 chr2 86443300 86443742 + 0.75 NA intron (NM_018433, intron 2 of 25) MIR|SINE|MIR 2060 NM_001146688 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 112.75-113 chr2 201528017 201528211 + 0.75 NA intron (NM_001168216, intron 11 of 12) L1PA15|LINE|L1 76374 NM_001206864 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 282.5-14 chr13 34944654 34945354 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 1 of 57) intron (NM_015678, intron 1 of 57) 2717 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 151.75-76 chr20 19811714 19812013 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -74658 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 159-41 chr16 77637693 77638073 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84609 NM_001243660 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 184.75-40 chr19 29936922 29937408 + 0.75 NA intron (NM_001252641, intron 1 of 10) L1M4|LINE|L1 -5074 NR_045557 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 217.5-136 chr9 115395234 115395662 + 0.75 NA intron (NR_163556, intron 5 of 7) intron (NR_163556, intron 5 of 7) 253630 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 139.75-56 chr15 26656356 26656610 + 0.75 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) -27393 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 173.25-16 chr10 95603053 95603359 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -41835 NM_001290295 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 173-74 chr2 232763942 232764337 + 0.75 NA intron (NM_015575, intron 10 of 30) L3|LINE|CR1 12426 NM_001172417 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 114.75-147 chr4 169164722 169165046 + 0.75 NA intron (NM_020870, intron 2 of 11) intron (NM_020870, intron 2 of 11) 106072 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 127.5-4 chr1 28250022 28250269 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9373 NM_031459 83667 Hs.469543 NM_031459 ENSG00000130766 SESN2 HI95|SES2|SEST2 sestrin 2 protein-coding 141.25-174 chr7 112730839 112731195 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 59376 NM_022484 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 180.5-46 chr15 57191854 57192163 + 0.75 NA intron (NM_001322154, intron 6 of 20) intron (NM_001322154, intron 6 of 20) -27422 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 165.75-141 chr5 175433129 175433529 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 10853 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 183.75-13 chr1 247419684 247420171 + 0.75 NA intron (NM_001127462, intron 1 of 7) L1MB2|LINE|L1 1878 NM_001243133 114548 Hs.159483 NM_004895 ENSG00000162711 NLRP3 AGTAVPRL|AII|AVP|C1orf7|CIAS1|CLR1.1|DFNA34|FCAS|FCAS1|FCU|KEFH|MWS|NALP3|PYPAF1 NLR family pyrin domain containing 3 protein-coding 272.75-25 chr2 122495248 122495681 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 578017 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 131.5-118 chr2 96673500 96673853 + 0.75 NA intron (NM_001293083, intron 19 of 52) (CATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30912 NM_001293083 90342 Hs.534025 NM_001077400 ENSG00000249715 FER1L5 - fer-1 like family member 5 protein-coding 201-75 chr8 84220648 84221037 + 0.75 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 36176 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 115.75-5 chr1 104724190 104724401 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 651272 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 167.5-130 chr4 146192209 146192439 + 0.75 NA TTS (NM_007080) TTS (NM_007080) 16606 NM_007080 11157 Hs.190520 NM_007080 ENSG00000164167 LSM6 YDR378C LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 154-107 chr5 38555074 38555397 + 0.75 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) intron (NM_002310, intron 1 of 19) 1411 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 136-48 chr16 58308613 58308849 + 0.75 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -13684 NM_001080492 221191 Hs.411239 NM_001080492 ENSG00000103023 PRSS54 CT67|KLKBL4 serine protease 54 protein-coding 135-186 chr8 118948113 118948400 + 0.75 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) intron (NM_002546, intron 1 of 4) 3629 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 132-125 chr4 66228848 66229233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47784 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 123.5-82 chr17 59853483 59853722 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12336 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 117.5-184 chr5 94881725 94882039 + 0.75 NA intron (NM_001297777, intron 10 of 19) intron (NM_001297777, intron 10 of 19) 199984 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 112.75-174 chr6 47626618 47626962 + 0.75 NA 3' UTR (NM_012120, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_012120, exon 18 of 18) -29682 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 205.25-24 chr14 50529810 50530140 + 0.75 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) intron (NM_198794, intron 2 of 31) 2594 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 156.25-117 chr5 31592994 31593243 + 0.75 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -46013 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 138.5-32 chr11 15102548 15102855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9723 NM_001031853 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 201.25-60 chr3 26552161 26552683 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70384 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 137.75-125 chr22 38809022 38809344 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -15040 NM_005740 10126 Hs.632766 NM_005740 ENSG00000100246 DNAL4 MRMV3|PIG27 dynein axonemal light chain 4 protein-coding 159.25-139 chr7 81019410 81019891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97261 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 123.75-171 chr7 32350328 32350546 + 0.75 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MC5|LINE|L1 -51109 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 270.75-16 chr14 81569354 81570003 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -35817 NM_001244984 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 185-48 chr20 7512338 7512647 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 140884 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 140-92 chr21 25217406 25217639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 214179 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 179.25-48 chr12 129882286 129882581 + 0.75 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 21592 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 260.75-27 chr2 61256004 61256698 + 0.75 NA intron (NM_014709, intron 48 of 79) intron (NM_014709, intron 48 of 79) 78933 NR_152210 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 157.75-115 chr3 182298597 182298899 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 187614 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 248.5-101 chr8 67102745 67103250 + 0.75 NA intron (NM_001364870, intron 6 of 27) intron (NM_001364870, intron 6 of 27) 19149 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 184-62 chr4 58048235 58048758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 487832 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 273.5-43 chr22 34851709 34852239 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 145942 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 238.25-84 chr8 31958388 31958809 + 0.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -67138 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 168.75-60 chr17 4303986 4304400 + 0.75 NA intron (NM_003342, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu -32299 NR_110982 103021295 Hs.741319 NR_110982 LOC103021295 - uncharacterized LOC103021295 ncRNA 128-8 chr1 152359760 152359966 + 0.75 NA intron (NM_001014342, intron 1 of 2) intron (NM_001014342, intron 1 of 2) 143 NM_001014342 388698 Hs.156124 NM_001014342 ENSG00000143520 FLG2 IFPS|PSS6 filaggrin family member 2 protein-coding 139-25 chr11 95987506 95987731 + 0.75 NA intron (NM_032427, intron 3 of 4) intron (NM_032427, intron 3 of 4) -63411 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 118.25-71 chr15 33867976 33868219 + 0.75 NA intron (NM_020371, intron 4 of 5) intron (NM_020371, intron 4 of 5) -100400 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 198.5-99 chr3 138570588 138571172 + 0.75 NA intron (NM_001320599, intron 5 of 17) intron (NM_001320599, intron 5 of 17) 21076 NM_001320600 80321 Hs.531962 NM_024491 ENSG00000114107 CEP70 BITE centrosomal protein 70 protein-coding 170.5-4 chr1 23368476 23368996 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_033690) promoter-TSS (NR_033690) -235 NR_033690 148898 Hs.61884 NM_138479 ENSG00000249087 ZNF436-AS1 C1orf213 ZNF436 antisense RNA 1 ncRNA 224.5-45 chr15 68025963 68026374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28011 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 122.25-79 chr18 5160787 5161038 + 0.75 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) L1ME3B|LINE|L1 36345 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 136-150 chr8 82828177 82828499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83766 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 246-53 chr6 47453237 47453652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24345 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 149-145 chr9 131597136 131597513 + 0.75 NA intron (NM_198679, intron 13 of 23) intron (NM_198679, intron 13 of 23) 51801 NM_001365666 642515 NM_001365666 ENSG00000283526 PRRT1B DSPD2|IFITMD8 proline rich transmembrane protein 1B protein-coding 187.75-47 chr2 23079408 23079776 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -305587 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 128-91 chr20 56224027 56224330 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24554 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 126.75-85 chr16 74880493 74880794 + 0.75 NA intron (NM_030581, intron 25 of 25) LTR37-int|LTR|ERV1 104480 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 171.75-28 chr11 107013227 107013728 + 0.75 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) intron (NM_001256424, intron 1 of 8) 4999 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 171-15 chr10 67095220 67095561 + 0.75 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) intron (NR_111909, intron 2 of 2) 83124 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 185-79 chr7 47814513 47814949 + 0.75 NA intron (NM_138295, intron 47 of 56) AluSg|SINE|Alu 19440 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 141.75-71 chr17 44223944 44224172 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2754 NR_045058 7343 Hs.89781 NM_014233 ENSG00000108312 UBTF CONDBA|NOR-90|UBF|UBF-1|UBF1|UBF2 upstream binding transcription factor protein-coding 175.5-87 chr2 53798475 53798764 + 0.75 NA intron (NM_015701, intron 5 of 13) intron (NM_015701, intron 5 of 13) 11575 NM_015701 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 142-19 chr10 72766102 72766428 + 0.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 45236 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 126.75-237 chr8 55528352 55528631 + 0.75 NA 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) -7513 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 159.75-158 chr7 49091019 49091242 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 166583 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 162.75-14 chr10 61820296 61820620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81241 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 217.25-3 chr1 59859375 59859755 + 0.75 NA intron (NM_015888, intron 14 of 21) HAL1ME|LINE|L1 44616 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 174.75-49 chr18 63834770 63835237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52702 NM_001143818 5055 Hs.594481 NM_002575 ENSG00000197632 SERPINB2 HsT1201|PAI|PAI-2|PAI2|PLANH2 serpin family B member 2 protein-coding 130-38 chr13 92878744 92878941 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -157228 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 131.25-44 chr12 112141851 112142061 + 0.75 NA intron (NM_006700, intron 5 of 11) intron (NM_006700, intron 5 of 11) 16396 NM_006700 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 246.5-19 chr13 59976770 59977223 + 0.75 NA intron (NM_001258369, intron 14 of 26) intron (NM_001258369, intron 14 of 26) -35722 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 132-112 chr3 85503571 85503905 + 0.75 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -1321 NM_001256503 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 151-137 chr9 23506238 23506615 + 0.75 NA intron (NR_121602, intron 27 of 27) L1MA9|LINE|L1 165973 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 216.25-43 chr16 62374749 62375290 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -338581 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 198.5-153 chr8 135113057 135113376 + 0.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -120915 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 195-47 chr2 168456859 168457209 + 0.75 NA intron (NM_001256126, intron 1 of 10) CpG 762 NM_203463 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 118.5-39 chr12 6872651 6872824 + 0.75 NA exon (NM_032641, exon 2 of 3) exon (NM_032641, exon 2 of 3) 566 NM_001319670 84727 Hs.479856 NM_032641 ENSG00000111671 SPSB2 GRCC9|SSB2 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2 protein-coding 128.5-220 chr8 79028778 79028985 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 191352 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 147-51 chr17 30384457 30384703 + 0.75 NA intron (NM_001199775, intron 1 of 20) FLAM_C|SINE|Alu 4102 NM_001199775 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 182-106 chr8 101902496 101902788 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 4 of 7) intron (NM_001040624, intron 4 of 7) -81790 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 187-36 chr2 10211784 10212138 + 0.75 NA non-coding (NR_161344, exon 4 of 4) non-coding (NR_161344, exon 4 of 4) -19290 NR_036222 100422929 NR_036222 ENSG00000265418 MIR4261 - microRNA 4261 ncRNA 165.75-6 chr1 83980586 83980896 + 0.75 NA intron (NM_001350214, intron 1 of 21) L1MDa|LINE|L1 18391 NM_024686 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 159.5-188 chr6 165127010 165127382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182409 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 188.25-111 chr8 18985111 18985450 + 0.75 NA intron (NM_015310, intron 1 of 15) intron (NM_015310, intron 1 of 15) 28423 NM_015310 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 206.25-60 chr21 33995630 33996125 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 19495 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 193.25-81 chr4 39072165 39072619 + 0.75 NA intron (NM_199039, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 10160 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 127.25-39 chr12 10411523 10411837 + 0.75 NA TTS (NM_002261) TTS (NM_002261) -1534 NM_001199805 100528032 Hs.387787 NM_001199805 KLRC4-KLRK1 - KLRC4-KLRK1 readthrough protein-coding 152.75-68 chr17 58832087 58832445 + 0.75 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 76397 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 248-11 chr11 28983468 28984037 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -506204 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 214.25-46 chr2 185112666 185113079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54200 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 119.75-38 chr12 3329229 3329466 + 0.75 NA intron (NR_148995, intron 1 of 11) intron (NR_148995, intron 1 of 11) 36775 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 158.75-11 chr1 225726699 225727073 + 0.75 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -50927 NM_003133 6726 Hs.511425 NM_003133 ENSG00000143742 SRP9 ALURBP signal recognition particle 9 protein-coding 152-35 chr11 94049434 94049830 + 0.75 NA intron (NM_001098672, intron 2 of 19) L1M4|LINE|L1 28278 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 166.25-115 chr4 103861494 103861894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -141709 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 141.5-139 chr3 9805583 9805984 + 0.75 NA intron (NM_001198780, intron 5 of 5) intron (NM_001198780, intron 5 of 5) -4132 NM_001025930 26140 Hs.726435 NM_015644 ENSG00000214021 TTLL3 HOTTL tubulin tyrosine ligase like 3 protein-coding 114.25-151 chr5 93867121 93867365 + 0.75 NA intron (NM_032042, intron 7 of 10) intron (NM_032042, intron 7 of 10) -125643 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 151-56 chr2 46367998 46368394 + 0.75 NA intron (NM_001430, intron 6 of 15) intron (NM_001430, intron 6 of 15) 25971 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 118.25-192 chr7 154958173 154958390 + 0.75 NA intron (NM_007349, intron 13 of 20) intron (NM_007349, intron 13 of 20) 29764 NR_024476 100132707 Hs.586358 NR_024476 ENSG00000214106 PAXIP1-AS2 PAXIP1OS PAXIP1 antisense RNA 2 ncRNA 203.75-28 chr13 101465211 101465597 + 0.75 NA intron (NM_001271755, intron 2 of 9) intron (NM_001271755, intron 2 of 9) 12729 NM_001271754 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 152.75-153 chr8 116133759 116134039 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 191160 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 251-12 chr10 7224532 7225040 + 0.75 NA intron (NM_001029880, intron 10 of 20) intron (NM_001029880, intron 10 of 20) -38002 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 149.25-71 chr19 42417785 42418024 + 0.75 NA intron (NM_005357, intron 1 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5851 NR_073179 100996307 Hs.466840 NR_073179 ENSG00000213904 LIPE-AS1 - LIPE antisense RNA 1 ncRNA 143-116 chr5 80820457 80820889 + 0.75 NA intron (NM_002439, intron 20 of 23) intron (NM_002439, intron 20 of 23) -139690 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 242.75-41 chr3 5922452 5922948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -672445 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 140.5-11 chr1 228520541 228520807 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -8386 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 176.25-113 chr5 63551042 63551496 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 411023 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 241.5-103 chr8 135702857 135703258 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 245601 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 175.25-21 chr10 120079738 120080102 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 121407 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 165.5-76 chr2 63815474 63815755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25350 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 117.5-4 chr1 78843439 78843720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 163151 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 179.25-65 chr17 80082593 80082910 + 0.75 NA intron (NM_017950, intron 12 of 19) intron (NM_017950, intron 12 of 19) -16077 NR_039607 100616121 NR_039607 ENSG00000265561 MIR1268B - microRNA 1268b ncRNA 149.75-137 chr5 163390233 163390591 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -47159 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 145-10 chr1 160084455 160084726 + 0.75 NA exon (NM_004983, exon 2 of 3) exon (NM_004983, exon 2 of 3) 3052 NM_004983 3765 Hs.66726 NM_004983 ENSG00000162728 KCNJ9 GIRK3|KIR3.3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 9 protein-coding 133.5-149 chr22 38805247 38805467 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -11214 NM_005740 10126 Hs.632766 NM_005740 ENSG00000100246 DNAL4 MRMV3|PIG27 dynein axonemal light chain 4 protein-coding 116-78 chr19 43885542 43885723 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -5496 NM_001033719 342908 Hs.76561 NM_001033719 ENSG00000176222 ZNF404 - zinc finger protein 404 protein-coding 126.25-24 chr10 116663748 116664006 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001330142, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001330142, exon 6 of 6) 6089 NM_001350931 143379 Hs.121347 NM_144661 ENSG00000165863 C10orf82 - chromosome 10 open reading frame 82 protein-coding 117.75-31 chr11 40778991 40779217 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 -485974 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 161.5-164 chr6 45721480 45721787 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 215964 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 243.5-46 chr21 20026464 20026985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126969 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 256.5-25 chr17 51016555 51017076 + 0.75 NA intron (NM_001130527, intron 7 of 29) AluSg|SINE|Alu 30063 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 128.25-51 chr14 62384823 62385065 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -244971 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 232-25 chr17 77583831 77584312 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 37130 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 182.5-9 chr1 175307047 175307453 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114263 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 126.25-19 chr10 82208816 82209178 + 0.75 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 23923 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 155.75-157 chr7 127711489 127711844 + 0.75 NA intron (NM_014390, intron 9 of 23) HAL1|LINE|L1 59472 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 159.25-66 chr2 25139520 25139806 + 0.75 NA intron (NM_014971, intron 16 of 22) intron (NM_014971, intron 16 of 22) 28917 NM_000939 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 115.25-228 chrX 115054925 115055130 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37411 NM_000640 3598 Hs.336046 NM_000640 ENSG00000123496 IL13RA2 CD213A2|CT19|IL-13R|IL13BP interleukin 13 receptor subunit alpha 2 protein-coding 143.5-16 chr1 215525875 215526110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41312 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 132-13 chr10 16395876 16396153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40929 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 115.25-53 chr13 54804232 54804546 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -370065 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 121.75-185 chr8 77690200 77690417 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 239611 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 170.75-134 chr8 91018333 91018771 + 0.75 NA intron (NM_018710, intron 3 of 6) intron (NM_018710, intron 3 of 6) 22307 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 133.25-197 chr7 28487496 28487753 + 0.75 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) intron (NM_004904, intron 1 of 10) 52009 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 128.5-174 chr5 126441692 126441945 + 0.75 NA intron (NR_146196, intron 1 of 14) intron (NR_146196, intron 1 of 14) 18409 NM_001349542 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 158-6 chr1 44076469 44076792 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -42191 NM_173484 128209 Hs.567674 NM_173484 ENSG00000171872 KLF17 ZNF393|Zfp393 Kruppel like factor 17 protein-coding 180-75 chr21 28290360 28290687 + 0.75 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -61856 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 140-165 chr8 9162290 9162636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10924 NM_001201329 79660 Hs.458513 NM_024607 ENSG00000173281 PPP1R3B GL|PPP1R4|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3B protein-coding 135.75-38 chr11 57099918 57100153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62501 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 233.75-70 chr6 119084941 119085357 + 0.75 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -6485 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 169.25-114 chr7 82009471 82009782 + 0.75 NA intron (NR_110077, intron 1 of 3) intron (NR_110077, intron 1 of 3) 449 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 180.75-161 chrX 34999760 35000065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57116 NM_152631 170062 Hs.197801 NM_152631 ENSG00000189132 FAM47B - family with sequence similarity 47 member B protein-coding 143.75-182 chr8 71993770 71994042 + 0.75 NA intron (NR_033652, intron 4 of 4) intron (NR_033652, intron 4 of 4) 81678 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 119.25-42 chr12 12483532 12483727 + 0.75 NA intron (NM_030640, intron 5 of 6).2 intron (NM_030640, intron 5 of 6).2 79234 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 144.75-124 chr4 91546038 91546422 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1MC1|LINE|L1 731072 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 173.25-136 chr9 31199341 31199659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 181990 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 119.25-180 chr6 143398164 143398389 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 44401 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 155.5-213 chr9 27089758 27090054 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -19235 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 210.25-6 chr1 220209432 220209803 + 0.75 NA intron (NM_012414, intron 7 of 34) intron (NM_012414, intron 7 of 34) -8941 NR_002994 677818 Hs.730572 NR_002994 ENSG00000222370 SNORA36B ACA36b small nucleolar RNA, H/ACA box 36B snoRNA 175.75-53 chr17 70981728 70982146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 220242 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 285.75-7 chr10 120776473 120776941 + 0.75 NA intron (NR_033850, intron 2 of 2) intron (NR_033850, intron 2 of 2) 74472 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 235.25-63 chr8 78205520 78205933 + 0.75 NA Intergenic Helitron3Na_Mam|RC|Helitron -310614 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 118.5-48 chr13 47180022 47180331 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -283100 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 143.5-49 chr13 29062696 29063046 + 0.75 NA intron (NM_001366651, intron 4 of 14) intron (NM_001366651, intron 4 of 14) 38414 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 141.75-125 chr4 13527573 13527801 + 0.75 NA non-coding (NR_034054, exon 4 of 4) non-coding (NR_034054, exon 4 of 4) 3730 NR_034054 285547 Hs.381892 NR_034054 ENSG00000281202 LINC01097 - long intergenic non-protein coding RNA 1097 ncRNA 162.5-36 chr12 51525573 51525856 + 0.75 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -65519 NM_014191 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 126.75-47 chr13 85259882 85260083 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103621 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 157.25-103 chr3 186149359 186149697 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001080745, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001080745, exon 24 of 24) -40439 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 175.25-111 chr5 21258384 21258686 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -200945 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 180-39 chr15 56683520 56683940 + 0.75 NA intron (NM_001002843, intron 8 of 20) L1M7|LINE|L1 50356 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 395.25-3 chr18 4095188 4095935 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 133208 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 112.5-41 chr11 113426515 113426763 + 0.75 NA intron (NM_016574, intron 1 of 6) intron (NM_016574, intron 1 of 6) 23449 NR_036183 100422855 NR_036183 ENSG00000265140 MIR4301 - microRNA 4301 ncRNA 211.75-18 chr12 86739078 86739452 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 1 of 7) intron (NM_001351286, intron 1 of 7) 5884 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 260.25-60 chrX 41706560 41706958 + 0.75 NA intron (NM_003688, intron 5 of 26) AluJo|SINE|Alu -17422 NM_080817 27197 Hs.567457 NM_080817 ENSG00000171657 GPR82 - G protein-coupled receptor 82 protein-coding 142.5-148 chr4 17247757 17247984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61813 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 114.75-35 chr11 75803448 75803694 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 11226 NR_144531 100506113 Hs.720913 NR_144531 ENSG00000255507 UVRAG-DT - UVRAG divergent transcript ncRNA 113.5-54 chr12 21392341 21392591 + 0.75 NA intron (NM_134431, intron 1 of 15) LTR78|LTR|ERV1 2971 NM_134431 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 204.5-89 chr3 56163277 56163618 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 4 of 17) L1PA16|LINE|L1 305020 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 222.75-15 chr10 32968624 32969115 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10639 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 137.5-5 chr1 49496422 49496738 + 0.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L1MA8|LINE|L1 -24495 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 152.25-32 chr11 68730495 68730947 + 0.75 NA intron (NM_004923, intron 6 of 9) AluSq2|SINE|Alu 20799 NM_001039656 9633 Hs.145932 NM_004923 ENSG00000132749 TESMIN CXCDC2|MTL5|MTLT testis expressed metallothionein like protein protein-coding 164.5-14 chr1 168168401 168168682 + 0.75 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -10421 NM_152902 261726 Hs.209431 NM_152902 ENSG00000143155 TIPRL TIP|TIP41|TIPRL1 TOR signaling pathway regulator protein-coding 180-14 chr10 97525476 97525864 + 0.75 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) intron (NM_024954, intron 1 of 2) 26746 NM_024954 80019 Hs.500724 NM_024954 ENSG00000165886 UBTD1 - ubiquitin domain containing 1 protein-coding 155.5-29 chr10 89887339 89887607 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_149079) promoter-TSS (NR_149079) -661 NR_149079 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 125.75-43 chr12 65681266 65681638 + 0.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -39080 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 148.25-57 chr17 76047168 76047572 + 0.75 NA intron (NM_001260503, intron 3 of 8) intron (NM_001260503, intron 3 of 8) 6286 NM_001260503 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 182.5-182 chrX 133673522 133673948 + 0.75 NA intron (NM_001164619, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR -223708 NR_148713 110806308 Hs.658628 NR_148713 ENSG00000286096 GPC3-AS1 - GPC3 antisense RNA 1 ncRNA 119-60 chr15 87938140 87938323 + 0.75 NA intron (NM_001320135, intron 13 of 15) intron (NM_001320135, intron 13 of 15) 8037 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 245.75-44 chr4 87372065 87372635 + 0.75 NA intron (NM_016245, intron 4 of 6) intron (NM_016245, intron 4 of 6) 18838 NM_016245 51170 Hs.594923 NM_016245 ENSG00000198189 HSD17B11 17-BETA-HSD11|17-BETA-HSDXI|17BHSD11|DHRS8|PAN1B|RETSDR2|SDR16C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11 protein-coding 259.25-14 chr15 45804400 45805017 + 0.75 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) LTR16E2|LTR|ERVL 99513 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 153-18 chr11 28936689 28936956 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -459274 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 143.5-220 chr8 125605209 125605456 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 173123 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 126-56 chr14 72314383 72314588 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -202335 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 139.75-27 chr11 90659555 90659817 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L1MD1|LINE|L1 -103829 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 254.25-3 chr1 159666056 159666461 + 0.75 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 48331 NM_001329058 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 159.25-19 chr10 109110800 109111211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 812241 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 147.25-9 chr1 192202855 192203291 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 44611 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 123-10 chr1 119492044 119492239 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -15062 NM_001328615 3283 Hs.364941 NM_000862 ENSG00000203857 HSD3B1 3BETAHSD|HSD3B|HSDB3|HSDB3A|SDR11E1 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 protein-coding 149.75-147 chr6 124253316 124253710 + 0.75 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -29492 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 137-154 chr6 108784172 108784406 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 32635 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 175-22 chr11 47056869 47057218 + 0.75 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) intron (NM_001003677, intron 3 of 8) 119836 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 225.25-2 chr1 44490543 44490953 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) L1MB8|LINE|L1 -54745 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 183-65 chr3 19079134 19079392 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -69247 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 164.25-152 chr8 79886846 79887137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15254 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 176 chr1 24066291 24066614 + 0.75 NA intron (NM_152372, intron 28 of 36) intron (NM_152372, intron 28 of 36) 45683 NM_152372 127294 Hs.523413 NM_152372 ENSG00000142661 MYOM3 - myomesin 3 protein-coding 114.75-185 chr8 17295654 17295860 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001363171, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001363171, exon 12 of 12) 48799 NM_001363173 137492 Hs.343873 NM_152415 ENSG00000155975 VPS37A HCRP1|PQBP2|SPG53 VPS37A subunit of ESCRT-I protein-coding 126.25-50 chr14 62134376 62134545 + 0.75 NA TTS (NR_015358) TTS (NR_015358) 5513 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 189-114 chr9 101634193 101634708 + 0.75 NA intron (NM_133445, intron 3 of 8) (AAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -39481 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 152.5-24 chr11 30504956 30505196 + 0.75 NA intron (NM_001584, intron 2 of 5) intron (NM_001584, intron 2 of 5) 75417 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 152-28 chr11 33184576 33184807 + 0.75 NA intron (NR_034027, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 23034 NR_034027 338739 Hs.423476 NR_034027 ENSG00000247151 CSTF3-DT CSTF3-AS1 CSTF3 divergent transcript ncRNA 113.25-89 chr2 70549021 70549320 + 0.75 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) intron (NM_003236, intron 1 of 5) 4276 NM_001308158 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 153.25-96 chr4 8525935 8526439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54050 NR_045511 27201 Hs.740355 NM_080819 ENSG00000155269 GPR78 - G protein-coupled receptor 78 protein-coding 214.5-36 chr14 86742222 86742621 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -163357 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 164-72 chr3 5377381 5377682 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -127276 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 260.25-48 chr7 70423904 70424442 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) MIRb|SINE|MIR -707971 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 118.5-20 chr10 63897457 63897792 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -375734 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 207-65 chr5 60484788 60485120 + 0.75 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) MIRc|SINE|MIR -2759 NR_024617 25859 Hs.146312 NM_001039499 ENSG00000152931 PART1 NCRNA00206 prostate androgen-regulated transcript 1 ncRNA 133.5-37 chr10 86380270 86380543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13611 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 182.75-86 chr4 20274817 20275150 + 0.75 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) 23078 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 183.75-129 chr8 127537804 127538159 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -55842 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 144.25-107 chr2 196637286 196637668 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2238 NM_001080539 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 168.25-43 chr14 60311897 60312363 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11066 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 132.5-110 chr2 26818588 26818808 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29434 NM_020134 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 186-58 chr22 46508552 46508896 + 0.75 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) intron (NM_014246, intron 1 of 34) 28896 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 179.5-84 chr2 8232910 8233298 + 0.75 NA intron (NR_152741, intron 9 of 9) intron (NR_152741, intron 9 of 9) 95315 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 193.5-42 chr13 50933924 50934230 + 0.75 NA intron (NM_001142279, intron 4 of 9) intron (NM_001142279, intron 4 of 9) -23365 NR_046552 100874255 Hs.741501 NR_046552 RNASEH2B-AS1 - RNASEH2B antisense RNA 1 ncRNA 133.5-164 chr3 72691299 72691739 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -27270 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 217.25-85 chr8 129203107 129203669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37852 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 141.75-57 chr14 57442725 57443113 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 50938 NM_001283057 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 171.5-65 chr18 43105798 43106254 + 0.75 NA intron (NM_001272077, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 9659 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 138.5-56 chr14 44621206 44621419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113903 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 175.25-135 chr7 115823695 115824045 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 144443 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 219.75-57 chr4 117515764 117516220 + 0.75 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 87594 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 142-40 chr13 33740104 33740365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63440 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 134.75-49 chr12 14269077 14269273 + 0.75 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL -96457 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 128-27 chr11 102246061 102246318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71295 NM_001165 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 196-61 chr22 39250008 39250362 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5203 NM_002608 5155 Hs.1976 NM_002608 ENSG00000100311 PDGFB IBGC5|PDGF-2|PDGF2|SIS|SSV|c-sis platelet derived growth factor subunit B protein-coding 158.5-59 chr14 28975841 28976240 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190253 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 143.5-65 chr14 54371958 54372270 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24754 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 144.5-128 chr3 26155940 26156185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -282367 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 211.5-86 chr2 211216617 211217003 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 599239 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 114.25-179 chr7 44832040 44832263 + 0.75 NA intron (NM_138635, intron 4 of 4) L1MC5a|LINE|L1 15975 NM_012412 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 226.5-45 chr2 100942979 100943514 + 0.75 NA intron (NM_002518, intron 5 of 20) L1ME3B|LINE|L1 33915 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 140.25-123 chr3 181728765 181729143 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 7 of 7) intron (NR_075091, intron 7 of 7) 17029 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 205.5-51 chr16 65312985 65313420 + 0.75 NA intron (NR_027755, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR -136629 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 147.5-178 chr5 127711761 127711985 + 0.75 NA intron (NM_001317938, intron 2 of 6) intron (NM_001317938, intron 2 of 6) 8484 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 156.75-30 chr11 4037122 4037399 + 0.75 NA intron (NM_001277962, intron 3 of 12) AluSz|SINE|Alu -57425 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 136-97 chr22 35650448 35650687 + 0.75 NA intron (NM_030641, intron 1 of 2) intron (NM_030641, intron 1 of 2) 2121 NM_030641 80830 Hs.257352 NM_030641 ENSG00000221963 APOL6 APOL-VI|APOLVI apolipoprotein L6 protein-coding 119-177 chr7 25233847 25234190 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5532 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 134-31 chr11 95192274 95192542 + 0.75 NA intron (NM_144665, intron 2 of 9) intron (NM_144665, intron 2 of 9) -37778 NR_110295 100129203 Hs.191599 NR_110295 LOC100129203 - uncharacterized LOC100129203 ncRNA 117-60 chr14 73281077 73281355 + 0.75 NA intron (NM_001005743, intron 11 of 12) MIRb|SINE|MIR -35215 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 131.25-15 chr1 187779249 187779449 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 335721 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 118.25-161 chr5 122160693 122161012 + 0.75 NA intron (NM_001195535, intron 1 of 2) intron (NM_001195535, intron 1 of 2) 676 NM_001195535 100505841 Hs.733368 NM_001195535 LOC100505841 - zinc finger protein 474-like protein-coding 215.5-75 chr4 45528206 45528533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 595685 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 139.5-210 chr8 46072849 46073197 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 544620 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 163.5-191 chr7 75880426 75880791 + 0.75 NA intron (NM_001346186, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR 1574 NM_001040456 57414 Hs.488827 NM_020684 ENSG00000005486 RHBDD2 NPD007|RHBDL7 rhomboid domain containing 2 protein-coding 140-108 chr3 69818052 69818331 + 0.75 NA intron (NM_001354607, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 -48033 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 155.75-94 chr20 52649143 52649499 + 0.75 NA non-coding (NR_110038, exon 3 of 3) non-coding (NR_110038, exon 3 of 3) 28483 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 122.75-36 chr12 51586627 51586922 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4459 NM_014191 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 127.5-134 chr2 224997771 224998118 + 0.75 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) 12596 NR_039641 100616207 NR_039641 ENSG00000263828 MIR4439 - microRNA 4439 ncRNA 144.75-115 chr3 193624396 193624674 + 0.75 NA intron (NR_046634, intron 1 of 2) intron (NR_046634, intron 1 of 2) 2797 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 146.5-64 chr14 57684117 57684402 + 0.75 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) 180740 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 160.25-22 chr12 22705098 22705499 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 80127 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 208.75-43 chr20 10907296 10907741 + 0.75 NA intron (NR_109866, intron 1 of 6) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 1754 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 129-116 chr22 31063190 31063429 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18009 NM_006932 6525 Hs.149098 NM_006932 ENSG00000183963 SMTN - smoothelin protein-coding 134.25-74 chr2 19506525 19506784 + 0.75 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 -148031 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 131.5-78 chr15 91791192 91791505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62360 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 123-96 chr2 40432049 40432243 + 0.75 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) -1842 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 183.5-75 chr2 187149074 187149451 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 298990 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 135.25-158 chr5 61453073 61453319 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 120938 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 152.75-43 chr12 23809855 23810144 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 139671 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 130.5-47 chr10 77080052 77080338 + 0.75 NA intron (NM_001271519, intron 12 of 28) MER66B|LTR|ERV1 -60636 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 192-34 chr12 14813733 14814084 + 0.75 NA intron (NM_001013698, intron 1 of 1) intron (NM_001013698, intron 1 of 1) 274 NM_001013698 440087 Hs.220931 NM_001013698 ENSG00000179256 SMCO3 C12orf69 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 3 protein-coding 199.5-161 chr9 132101787 132102104 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -22078 NM_004269 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 172.25-95 chr3 179918165 179918579 + 0.75 NA intron (NR_110061, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 18835 NR_110061 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 192-11 chr1 224304747 224305106 + 0.75 NA intron (NM_002533, intron 7 of 22) intron (NM_002533, intron 7 of 22) 25246 NM_002533 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 246-44 chr4 56846648 56847176 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -25043 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 146.25-28 chr12 130988360 130988658 + 0.75 NA intron (NM_198827, intron 6 of 24) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 5467 NR_131951 105755954 Hs.677534 NR_131950 ADGRD1-AS1 LACAT8 ADGRD1 antisense RNA 1 ncRNA 130.5-219 chr6 166194877 166195119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26329 NM_003181 6862 Hs.389457 NM_003181 ENSG00000164458 TBXT SAVA|T|TFT T-box transcription factor T protein-coding 192-54 chr2 50300659 50301028 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) AluSx1|SINE|Alu 46911 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 150-55 chr15 93860920 93861312 + 0.75 NA intron (NR_120321, intron 1 of 3) intron (NR_120321, intron 1 of 3) 4556 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 116.5-92 chr17 53262747 53263040 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 277388 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 262.5-72 chr8 85881610 85882002 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53864 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 401.5-8 chr2 106351062 106351924 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -18252 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 137.25-45 chr14 64497943 64498288 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001354687) promoter-TSS (NM_001354687) -123 NM_001354687 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 249.75-41 chr3 88710 89387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77297 NR_110824 102723448 Hs.543290 NR_110824 LINC01986 - long intergenic non-protein coding RNA 1986 ncRNA 118.25-169 chr6 42103022 42103250 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001164446, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001164446, exon 5 of 5) 39484 NM_001164446 647024 Hs.444277 NM_001164446 ENSG00000188112 C6orf132 bA7K24.2 chromosome 6 open reading frame 132 protein-coding 163-24 chr11 99360850 99361179 + 0.75 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -195131 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 164-36 chr14 66077209 66077508 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -409013 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 192-38 chr13 55793209 55793562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 618931 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 118.25-177 chr7 6091287 6091557 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13527 NM_001365764 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 185.5-109 chr3 99255803 99256108 + 0.75 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -354260 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 158-71 chr2 35168740 35169098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -302486 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 158-67 chr2 10694566 10695052 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 4799 NR_144555 106479524 Hs.646340 NR_144555 ENSG00000243819 RN7SL832P - RNA, 7SL, cytoplasmic 832, pseudogene pseudo 116.5-144 chr21 28514942 28515259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24218 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 165.5-156 chr5 160447591 160447886 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20513 NR_132748 107075116 Hs.735831 NR_132748 ENSG00000253522 MIR3142HG - MIR3142 host gene ncRNA 147.25-88 chr3 122177029 122177493 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -6407 NM_000388 846 Hs.435615 NM_000388 ENSG00000036828 CASR CAR|EIG8|FHH|FIH|GPRC2A|HHC|HHC1|HYPOC1|NSHPT|PCAR1|hCasR calcium sensing receptor protein-coding 238.75-23 chr15 90733034 90733542 + 0.75 NA intron (NM_001287246, intron 2 of 22) L1MC4a|LINE|L1 15942 NM_000057 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 168.25-8 chr1 174892337 174892575 + 0.75 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) intron (NM_001366451, intron 5 of 12) 16938 NM_001035230 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 198.25-72 chr3 180378191 180378614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35771 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 165-53 chr17 44012620 44012961 + 0.75 NA intron (NM_001304813, intron 4 of 4) intron (NM_001304813, intron 4 of 4) 2173 NM_032376 84336 Hs.514211 NM_032376 ENSG00000091947 TMEM101 - transmembrane protein 101 protein-coding 127.5-51 chr12 4490480 4490746 + 0.75 NA intron (NR_144382, intron 8 of 9) intron (NR_144382, intron 8 of 9) -44999 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 250-32 chr2 230493243 230494063 + 0.75 NA intron (NM_001080391, intron 17 of 28) L1M7|LINE|L1 76897 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 170.5-130 chr4 16131232 16131608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47397 NM_006017 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 121.75-105 chr20 55169297 55169530 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -253630 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 169.75-132 chr6 75912727 75913091 + 0.75 NA intron (NM_001300899, intron 31 of 32) intron (NM_001300899, intron 31 of 32) 159753 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 246-4 chr1 113562085 113562641 + 0.75 NA intron (NM_001142782, intron 2 of 20) AluY|SINE|Alu 171848 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 174.25-20 chr10 95910477 95910908 + 0.75 NA intron (NM_001349008, intron 1 of 34) intron (NM_001349008, intron 1 of 34) 2727 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 142.75-24 chr10 69272572 69272929 + 0.75 NA intron (NM_001322365, intron 2 of 22) L1MEg|LINE|L1 2750 NM_001322364 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 181-102 chr7 47063423 47063743 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -366461 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 133.5-28 chr10 39325833 39326016 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 629328 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 223.25-49 chr22 42833750 42834258 + 0.75 NA intron (NM_001142293, intron 4 of 14) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 23269 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 252-53 chr5 56553211 56553773 + 0.75 NA intron (NR_161255, intron 2 of 5) intron (NR_161255, intron 2 of 5) 52764 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 295.25-11 chr2 112152912 112153475 + 0.75 NA intron (NM_001128165, intron 1 of 6) intron (NM_001128165, intron 1 of 6) 14808 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 158.75-29 chr11 27575472 27575697 + 0.75 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) intron (NR_033315, intron 2 of 6) 59043 NR_102708 101410541 Hs.471439 NR_102708 ENSG00000254934 LINC00678 - long intergenic non-protein coding RNA 678 ncRNA 159.5-126 chr20 47068260 47068503 + 0.75 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) intron (NM_172110, intron 5 of 13) -98586 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 159-111 chr8 84041292 84041572 + 0.75 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -141355 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 124.75-123 chr2 186166627 186166823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -80408 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 203-40 chr16 52903034 52903480 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 149616 NR_147075 105371267 Hs.147562 NR_136518 ENSG00000277639 LOC105371267 PR-lncRNA-1 p53-regulated lncRNA 1 ncRNA 142.5-7 chr1 51846105 51846367 + 0.75 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) AluSz|SINE|Alu -9834 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 124-163 chr8 9466302 9466713 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -89405 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 217-33 chr2 99573193 99573593 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 17 of 23) intron (NM_001025108, intron 17 of 23) -83376 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 148-128 chr8 99835809 99836103 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 54 of 61) intron (NM_017890, intron 54 of 61) 57751 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 149.25-7 chr1 40026238 40026588 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -13652 NM_001350479 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 136.25-3 chr1 44930391 44930700 + 0.75 NA intron (NM_001166588, intron 4 of 9) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 56050 NM_020365 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 139.25-24 chr10 111678841 111679146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 504772 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 132.75-52 chr13 26863732 26864152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103156 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 171.25-5 chr1 115052499 115053005 + 0.75 NA intron (NM_001308316, intron 6 of 6) intron (NM_001308316, intron 6 of 6) 18806 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 135.25-200 chr8 119089419 119089674 + 0.75 NA intron (NM_006438, intron 1 of 5) intron (NM_006438, intron 1 of 5) -20764 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 199.25-59 chr2 112773976 112774325 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000575, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_000575, exon 7 of 7) -9541 NM_001304361 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 245.5-66 chr6 39599718 39600357 + 0.75 NA intron (NM_001289020, intron 6 of 21) intron (NM_001289020, intron 6 of 21) 125371 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 115.25-98 chr2 42701000 42701198 + 0.75 NA intron (NM_001330443, intron 11 of 16) AluJr|SINE|Alu 63162 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 171.5-86 chr2 128649664 128649959 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -214789 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 156.75-55 chr14 33565888 33566255 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -142866 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 153.75-33 chr12 87120539 87120896 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -210022 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 143.75-177 chr8 31523162 31523569 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -116387 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 124.25-129 chr3 25399017 25399295 + 0.75 NA intron (NM_001290300, intron 1 of 7) intron (NM_001290300, intron 1 of 7) -14229 NR_134933 105376997 Hs.536687 NR_134933 RARB-AS1 - RARB antisense RNA 1 ncRNA 190.5-91 chr21 23765738 23766176 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -381122 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 165.75-96 chr20 557987 558240 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14323 NM_177560 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 141.5-34 chr12 14695989 14696369 + 0.75 NA intron (NM_004963, intron 1 of 26) intron (NM_004963, intron 1 of 26) 420 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 246-52 chr6 39657436 39657826 + 0.75 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) intron (NM_001289020, intron 3 of 21) 67777 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 164-121 chr6 140380292 140380611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175199 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 333.75-21 chr5 60756260 60756860 + 0.75 NA intron (NM_024930, intron 8 of 8) L1ME4b|LINE|L1 -56394 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 152.5-90 chr2 125993945 125994324 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 123851 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 135-88 chr2 210911302 210911562 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 293861 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 160-89 chr5 61539762 61540044 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 12 of 13) intron (NM_020928, intron 12 of 13) -97857 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 137.5-154 chr3 22557343 22557577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 600321 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 154.5-164 chr6 135554046 135554320 + 0.75 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 56382 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 157.25-8 chr10 12784378 12784642 + 0.75 NA intron (NM_001351032, intron 7 of 11) intron (NM_001351032, intron 7 of 11) -59157 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 364.25-3 chr1 196604233 196605000 + 0.75 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 3824 NR_146057 343450 Hs.657046 NM_198503 ENSG00000162687 KCNT2 EIEE57|KCa4.2|SLICK|SLO2.1 potassium sodium-activated channel subfamily T member 2 protein-coding 189.75-36 chr14 78856148 78856520 + 0.75 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -343648 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 262.25-38 chr5 66988284 66988913 + 0.75 NA intron (NM_001290226, intron 1 of 26) MIR|SINE|MIR 15556 NR_111908 101928794 Hs.672435 NR_111908 MAST4-AS1 - MAST4 antisense RNA 1 ncRNA 173.25-41 chr15 57887254 57887610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 126591 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 148.75-24 chr10 54616448 54616803 + 0.75 NA intron (NR_134503, intron 3 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie -8668 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 173-99 chr4 114993361 114993767 + 0.75 NA intron (NM_022569, intron 2 of 13) intron (NM_022569, intron 2 of 13) 120056 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 189.75-7 chr1 185116592 185117018 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40148 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 204.75-65 chr2 144201327 144201679 + 0.75 NA intron (NM_001284238, intron 4 of 13) L2a|LINE|L2 10076 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 232.25-56 chr4 131303860 131304232 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -460792 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 125.5-40 chr11 50366118 50366399 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -42889 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 112.75-29 chr10 97534846 97535073 + 0.75 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) intron (NM_024954, intron 1 of 2) 36035 NM_024954 80019 Hs.500724 NM_024954 ENSG00000165886 UBTD1 - ubiquitin domain containing 1 protein-coding 187-82 chr6 90950284 90950591 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -363365 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 143-96 chr3 147372162 147372404 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 20147 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 218.25-96 chr8 81873635 81874163 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31613 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 139.75-180 chr8 136088043 136088280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -442637 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 196.5-78 chr2 19201326 19201750 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -146891 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 154-82 chr20 47561427 47561758 + 0.75 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) AluJr|SINE|Alu 59705 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 165-26 chr11 87733347 87733737 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -14131 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 137.75-132 chr3 63795580 63795968 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -23525 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 312.5-17 chr20 43895492 43896237 + 0.75 NA TTS (NR_134577) TTS (NR_134577) 1146 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 138-132 chr5 111023208 111023437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46758 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 169-110 chr9 616387 616653 + 0.75 NA intron (NM_001256877, intron 2 of 12) intron (NM_001256877, intron 2 of 12) -70247 NM_001354335 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 151.75-57 chr18 75490830 75491059 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63241 NM_001037331 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 136.5-105 chr2 41685415 41685681 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -192007 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 127.5-234 chr8 10058872 10059145 + 0.75 NA intron (NM_001135670, intron 1 of 4) intron (NM_001135670, intron 1 of 4) 4716 NM_012331 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 142-14 chr10 18924943 18925186 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -123737 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 120-86 chr2 44740630 44740867 + 0.75 NA intron (NM_024766, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 198140 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 128-158 chr7 106240502 106240725 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 44370 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 146-12 chr10 32710273 32710691 + 0.75 NA intron (NM_001321115, intron 25 of 43) MER76-int|LTR|ERVL 190990 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 118.75-5 chr1 67269829 67270081 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -37409 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 182-107 chr8 112364432 112364745 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 34 of 66) intron (NM_001363185, intron 34 of 66) -278905 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 116.5-119 chr2 83084634 83084892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 227960 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 169.75-74 chr2 25208064 25208494 + 0.75 NA intron (NR_132378, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 3966 NR_132378 106144568 Hs.580474 NR_132378 ENSG00000230452 LINC01381 DADOT long intergenic non-protein coding RNA 1381 ncRNA 318.75-9 chr17 76918824 76919367 + 0.75 NA intron (NM_144677, intron 8 of 16) MIR3|SINE|MIR 46448 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 150.25-37 chr12 14098530 14098881 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -118349 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 114.25-157 chr5 139947077 139947327 + 0.75 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) L1MB8|LINE|L1 96097 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 168.5-68 chr17 78552514 78552811 + 0.75 NA intron (NM_173628, intron 15 of 80) intron (NM_173628, intron 15 of 80) 24732 NM_173628 8632 Hs.375975 NM_003727 ENSG00000187775 DNAH17 DNAHL1|DNEL2 dynein axonemal heavy chain 17 protein-coding 179.5-132 chr4 37799648 37800112 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26806 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 129.25-144 chr4 140770369 140770699 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14149 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 175-64 chr2 42593183 42593571 + 0.75 NA intron (NM_001330443, intron 3 of 16) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 24745 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 121.75-170 chr7 12048935 12049202 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -162226 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 147.25-128 chr7 26132120 26132572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19852 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 160-22 chr12 26889147 26889425 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 48695 NM_018164 55726 Hs.505077 NM_018164 ENSG00000064102 INTS13 ASUN|C12orf11|GCT1|Mat89Bb|NET48|SPATA30 integrator complex subunit 13 protein-coding 206.5-70 chr3 36578069 36578442 + 0.75 NA Intergenic MER11B|LTR|ERVK 161606 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 136-59 chr18 30059066 30059428 + 0.75 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -239663 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 207.75-42 chr17 40849062 40849402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17991 NM_000223 3859 Hs.66739 NM_000223 ENSG00000187242 KRT12 K12 keratin 12 protein-coding 137.5-50 chr12 25808023 25808266 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 65935 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 156-144 chr7 81752931 81753233 + 0.75 NA intron (NM_001010934, intron 4 of 4) intron (NM_001010934, intron 4 of 4) 16965 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 124.75-139 chr3 1519194 1519459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 426302 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 171-94 chr3 99085833 99086267 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -184355 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 167-99 chr6 54739152 54739655 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -107368 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 248-8 chr10 77489425 77489834 + 0.75 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) AluSq2|SINE|Alu 138757 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 152-33 chr11 58396512 58396773 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 6767 NM_001005469 441608 Hs.553826 NM_001005469 ENSG00000172769 OR5B3 OR11-239|OR5B13|OST129 olfactory receptor family 5 subfamily B member 3 protein-coding 123-54 chr14 66900928 66901185 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MA4|LINE|L1 -288384 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 185.75-65 chr2 134980944 134981445 + 0.75 NA exon (NM_025052, exon 9 of 10) exon (NM_025052, exon 9 of 10) 42455 NM_001321177 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 135.25-35 chr10 116541531 116541871 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4230 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 154.25-18 chr10 94405383 94405726 + 0.75 NA intron (NM_015188, intron 1 of 12) intron (NM_015188, intron 1 of 12) 3013 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 147.75-156 chr8 114837607 114837917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 830251 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 113.5-111 chr19 32050493 32050822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24795 NR_110675 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 188.75-36 chr16 60817774 60818216 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 237771 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 184.75-64 chr3 27920937 27921300 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -86982 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 184.5-158 chr8 115614668 115615060 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 2 of 5) intron (NM_001282902, intron 2 of 5) 53149 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 212.75-16 chr11 87175209 87175591 + 0.75 NA intron (NR_033149, intron 4 of 13) intron (NR_033149, intron 4 of 13) 137466 NR_033149 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 170.75-110 chr5 113240890 113241209 + 0.75 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 53889 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 168-113 chr6 99290761 99291187 + 0.75 NA intron (NR_144463, intron 5 of 5) AluSg|SINE|Alu 58700 NM_032511 84553 Hs.573245 NM_032511 ENSG00000146267 FAXC C6orf168|dJ273F20 failed axon connections homolog, metaxin like GST domain containing protein-coding 150-125 chr7 2117075 2117354 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) intron (NM_001013837, intron 11 of 18) -28162 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 136.75-2 chr1 11957223 11957408 + 0.75 NA intron (NM_001316320, intron 8 of 19) intron (NM_001316320, intron 8 of 19) 22598 NM_001316320 5351 Hs.75093 NM_000302 ENSG00000083444 PLOD1 EDS6|EDSKCL1|LH|LH1|LLH|PLOD procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1 protein-coding 112.5-222 chr7 84720901 84721238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 188593 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 132-114 chr3 117656771 117656983 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 34048 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 232.5-93 chr6 129104858 129105249 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 4 of 64) intron (NM_000426, intron 4 of 64) 221912 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 221-6 chr1 244806698 244807100 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -28407 NM_001312871 116228 Hs.411490 NM_198076 ENSG00000203667 COX20 FAM36A cytochrome c oxidase assembly factor COX20 protein-coding 163.5-165 chr5 115482707 115483018 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 61913 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 171.75-148 chr9 77390652 77390932 + 0.75 NA intron (NM_001018037, intron 67 of 70) AluJr|SINE|Alu -56857 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 193.75-104 chr5 180386048 180386538 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -32957 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 282.75-40 chr7 21524694 21525157 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18114 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 114-17 chr10 36645928 36646107 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -479840 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 143.75-138 chr4 168623093 168623318 + 0.75 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) MIRc|SINE|MIR -8373 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 165-154 chrX 79078712 79079056 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -92088 NM_032553 84636 Hs.326713 NM_032553 ENSG00000147138 GPR174 FKSG79|GPCR17|LYPSR3 G protein-coupled receptor 174 protein-coding 224.75-80 chr9 103523627 103523990 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -198775 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 202.5-127 chr6 41261680 41262245 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 12585 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 121.25-156 chr5 13692181 13692351 + 0.75 NA intron (NM_001369, intron 78 of 78) intron (NM_001369, intron 78 of 78) 252214 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 123-93 chr2 24397435 24397686 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37024 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 247.75-38 chr3 141501478 141501860 + 0.75 NA intron (NM_006506, intron 1 of 23) intron (NM_006506, intron 1 of 23) 14642 NM_001303246 5922 Hs.98445 NM_006506 ENSG00000155903 RASA2 GAP1M RAS p21 protein activator 2 protein-coding 159.5-171 chr5 26788025 26788377 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 250385 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 194.5-155 chr8 83844778 83845231 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -337783 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 205-30 chr19 37197499 37198100 + 0.75 NA intron (NM_152279, intron 2 of 4) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 12737 NM_152279 92285 Hs.390568 NM_152279 ENSG00000245680 ZNF585B SZFP41 zinc finger protein 585B protein-coding 153-24 chr11 86045002 86045343 + 0.75 NA intron (NM_001206947, intron 1 of 18) intron (NM_001206947, intron 1 of 18) 23912 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 259.25-31 chr4 42691304 42691649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34371 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 225.5-78 chr4 41939918 41940417 + 0.75 NA intron (NM_018126, intron 3 of 6) intron (NM_018126, intron 3 of 6) 4738 NM_018126 55161 Hs.31082 NM_018126 ENSG00000109133 TMEM33 1600019D15Rik|Pom33|SHINC-3|SHINC3 transmembrane protein 33 protein-coding 167.75-137 chr8 53272547 53272861 + 0.75 NA Intergenic HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 -21007 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 181.75-129 chr8 122160775 122161107 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 407703 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 123.25-52 chr13 75378336 75378680 + 0.75 NA intron (NM_001286658, intron 1 of 19) intron (NM_001286658, intron 1 of 19) 103660 NM_001286658 9882 Hs.210891 NM_014832 ENSG00000136111 TBC1D4 AS160|NIDDM5 TBC1 domain family member 4 protein-coding 125.75-51 chr14 50033352 50033561 + 0.75 NA intron (NR_131171, intron 6 of 8) AluJr|SINE|Alu -25936 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 253.25-37 chr20 2630917 2631556 + 0.75 NA intron (NM_080751, intron 17 of 19) L1M4|LINE|L1 -21396 NR_145428 10528 Hs.376064 NM_006392 ENSG00000101361 NOP56 NOL5A|SCA36 NOP56 ribonucleoprotein protein-coding 167.75-93 chr3 168683255 168683478 + 0.75 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) L1MA2|LINE|L1 131512 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 125.75-6 chr1 86296971 86297197 + 0.75 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 60603 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 117-168 chr7 5706896 5707084 + 0.75 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) L1MB1|LINE|L1 4920 NR_106934 102466203 NR_106934 ENSG00000283419 MIR6874 hsa-mir-6874 microRNA 6874 ncRNA 184.25-128 chr8 136390002 136390342 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -140626 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 115.5-23 chr10 29113793 29114022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175163 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 197.25-89 chr6 81503762 81504202 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 248699 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 132.25-88 chr19 39712822 39713019 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 8439 NM_203471 56891 Hs.24236 NM_020129 ENSG00000006659 LGALS14 CLC2|PPL13 galectin 14 protein-coding 116-76 chr18 57270104 57270321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82345 NM_015879 51046 Hs.23172 NM_015879 ENSG00000177511 ST8SIA3 SIAT8C|ST8SiaIII ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 protein-coding 223.5-120 chr7 93136323 93136768 + 0.75 NA intron (NM_001303500, intron 3 of 3) intron (NM_001303500, intron 3 of 3) 11840 NM_001303497 219285 Hs.489118 NM_152703 ENSG00000177409 SAMD9L ATXPC|C7orf6|DRIF2|UEF1 sterile alpha motif domain containing 9 like protein-coding 216.5-117 chr8 79814346 79814727 + 0.75 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 46394 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 125.25-136 chr3 118997842 118998133 + 0.75 NA intron (NM_001353319, intron 1 of 7) intron (NM_001353319, intron 1 of 7) 36859 NM_001353318 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 165.75-165 chr8 57652637 57652949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93356 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 254-4 chr1 147155804 147156242 + 0.75 NA non-coding (NR_103871, exon 7 of 7) non-coding (NR_103871, exon 7 of 7) 16447 NR_103870 5565 Hs.50732 NM_005399 ENSG00000131791 PRKAB2 - protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 2 protein-coding 233.25-29 chr16 65102321 65102796 + 0.75 NA intron (NM_001330576, intron 1 of 11) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 19505 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 196.25-120 chr9 25961952 25962279 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -104560 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 142.75-134 chr3 133488563 133488991 + 0.75 NA intron (NR_135276, intron 1 of 4) Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 2369 NR_135277 85003 Hs.659202 NR_135276 ENSG00000249993 BFSP2-AS1 - BFSP2 antisense RNA 1 ncRNA 146.5-157 chr4 99202457 99202755 + 0.75 NA TTS (NM_000672) TTS (NM_000672) 16640 NM_000672 130 Hs.586161 NM_000672 ENSG00000172955 ADH6 ADH-5 alcohol dehydrogenase 6 (class V) protein-coding 157-54 chr2 75642033 75642437 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -4548 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 180-43 chr16 73957270 73957599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 258087 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 118-121 chr3 165858659 165858907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21360 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 132.5-255 chr9 75066877 75067140 + 0.75 NA intron (NM_001330679, intron 8 of 9) intron (NM_001330679, intron 8 of 9) 21147 NM_017881 54981 Hs.494186 NM_017881 ENSG00000106733 NMRK1 C9orf95|NRK1|bA235O14.2 nicotinamide riboside kinase 1 protein-coding 169.25-121 chr8 106046105 106046444 + 0.75 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 14229 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 117.75-171 chr5 21001141 21001382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -385726 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 168.75-105 chr4 107517997 107518361 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 202055 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 249-18 chr18 5679473 5679874 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50682 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 133.5-187 chr4 88255516 88255861 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24062 NM_001348985 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 120.25-193 chr7 17072488 17072832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -190677 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 129.25-127 chr3 63801885 63802191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17261 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 252.75-8 chr11 4365226 4365634 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 2956 NM_001005161 143496 Hs.447463 NM_001005161 ENSG00000221996 OR52B4 OR11-3 olfactory receptor family 52 subfamily B member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 134.25-25 chr11 75615659 75616024 + 0.75 NA intron (NM_207577, intron 1 of 2) intron (NM_207577, intron 1 of 2) 32645 NR_145823 105369391 Hs.689687 NR_145823 ENSG00000255326 LOC105369391 - uncharacterized LOC105369391 ncRNA 237.25-37 chr17 61810870 61811335 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) intron (NM_032043, intron 6 of 19) 52457 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 174.25-101 chr3 105483925 105484333 + 0.75 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 117220 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 168.5-18 chr1 234628034 234628336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1126 NR_033927 100302691 Hs.209162 NR_033927 ENSG00000224939 LINC00184 HANC|NCRNA00184 long intergenic non-protein coding RNA 184 ncRNA 152.5-158 chr5 164654718 164655002 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 184581 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 178.25-3 chr1 75910039 75910307 + 0.75 NA intron (NM_002440, intron 19 of 19) intron (NM_002440, intron 19 of 19) 22231 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 157.25-43 chr14 66207561 66207921 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -278630 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 218.5-118 chr8 65761659 65762204 + 0.75 NA intron (NM_001242318, intron 3 of 12) intron (NM_001242318, intron 3 of 12) 27126 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 244.75-62 chr9 102266480 102266876 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -252959 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 136.5-109 chr2 51202755 51202991 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 170272 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 230.25-19 chr11 89174362 89174722 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3333 NM_000372 7299 Hs.503555 NM_000372 ENSG00000077498 TYR ATN|CMM8|OCA1|OCA1A|OCAIA|SHEP3 tyrosinase protein-coding 142-168 chr8 126580621 126580991 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -22328 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 126-179 chr8 141055270 141055545 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53328 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 133.25-188 chr6 129298652 129298885 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 21 of 64) intron (NM_000426, intron 21 of 64) 411409 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 151.25-101 chr20 5151306 5151670 + 0.75 NA intron (NM_003818, intron 1 of 12) FLAM_A|SINE|Alu 24480 NM_003818 8760 Hs.126857 NM_003818 ENSG00000101290 CDS2 - CDP-diacylglycerol synthase 2 protein-coding 137.25-72 chr2 80340633 80340963 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) MER21C|LTR|ERVL 27419 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 158-109 chr4 119506596 119506921 + 0.75 NA intron (NM_033437, intron 16 of 20) intron (NM_033437, intron 16 of 20) 51975 NR_037630 645513 Hs.677546 NR_037630 ENSG00000245958 LOC645513 - septin 7 pseudogene pseudo 112.75-158 chr4 178586255 178586448 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -678415 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 144.5-12 chr1 117523088 117523285 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006699, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_006699, exon 13 of 13) 82584 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 191-26 chr14 53149904 53150192 + 0.75 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 3275 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 128.75-196 chr8 82115284 82115641 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -273176 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 195.25-39 chr16 54006514 54007138 + 0.75 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) -32567 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 134.5-149 chr4 20965708 20966063 + 0.75 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 18124 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 125-133 chr5 111505211 111505491 + 0.75 NA intron (NM_001308059, intron 3 of 6) intron (NM_001308059, intron 3 of 6) -6875 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 127.5-74 chr14 51490995 51491215 + 0.75 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 1977 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 207.5-117 chr8 87004563 87004970 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 138351 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 159.75-148 chr6 49157545 49157847 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 305557 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 156.25-25 chr11 27656644 27656931 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001143806, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001143806, exon 2 of 2) 2862 NM_001143816 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 122-130 chr4 91313445 91313716 + 0.75 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 963722 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 113.75-164 chr6 70316425 70316748 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13502 NM_001851 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 157.25-149 chr8 84550675 84550939 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) 135323 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 145-19 chr10 8445950 8446304 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 148264 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 172.5-87 chr18 59505778 59506081 + 0.75 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) LTR33|LTR|ERVL -146664 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 313-6 chr12 29742430 29742969 + 0.75 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 41243 NM_001193451 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 211.5-109 chr3 186234039 186234382 + 0.75 NA intron (NM_001346, intron 20 of 24) L3b|LINE|CR1 -125121 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 194-40 chr17 33375769 33376257 + 0.75 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -83025 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 251.25-65 chrX 87523737 87524192 + 0.75 NA intron (NM_057162, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 6162 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 131.75-202 chr7 70806306 70806640 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -325671 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 145.5-124 chr22 24935291 24935693 + 0.75 NA exon (NM_001001663, exon 4 of 4) exon (NM_001001663, exon 4 of 4) 11203 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 182.5-156 chr7 87427523 87427815 + 0.75 NA intron (NM_018849, intron 15 of 27) intron (NM_018849, intron 15 of 27) 48011 NM_000443 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 222.25-17 chr13 62062260 62062676 + 0.75 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -32920 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 199-17 chr11 95647654 95648224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141843 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 238.25-7 chr10 6783192 6783677 + 0.75 NA intron (NR_038291, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 3836 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 115.25-172 chr6 11036481 11036794 + 0.75 NA intron (NM_017770, intron 1 of 7) intron (NM_017770, intron 1 of 7) -7121 NR_038964 100506409 Hs.43818 NR_038962 ELOVL2-AS1 - ELOVL2 antisense RNA 1 ncRNA 126-80 chr18 72463711 72464126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80424 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 163-41 chr14 75509223 75509473 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13121 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 156.75-117 chr3 129955338 129955652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19225 NM_007117 7200 Hs.182231 NM_007117 ENSG00000170893 TRH Pro-TRH|TRF thyrotropin releasing hormone protein-coding 263.5-57 chr5 174241017 174241446 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -95123 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 140-38 chr13 65045571 65045962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -820281 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 174.75-19 chr11 41889501 41889777 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175071 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 238.25-50 chr3 138051885 138052307 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 41931 NM_016369 51208 Hs.655324 NM_016369 ENSG00000066405 CLDN18 SFTA5|SFTPJ claudin 18 protein-coding 233.75-60 chr5 6450536 6450940 + 0.75 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) intron (NM_001145161, intron 1 of 1) 1879 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 121.25-115 chr20 47501560 47501821 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006534) promoter-TSS (NM_006534) -197 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 209.25-2 chr1 30953168 30953508 + 0.75 NA intron (NM_001020658, intron 15 of 21) intron (NM_001020658, intron 15 of 21) -4133 NR_033295 692235 NR_033295 SNORD103B U103B small nucleolar RNA, C/D box 103B snoRNA 219.25-7 chr1 171089847 171090244 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001319173) promoter-TSS (NM_001319173) -860 NM_001002294 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 181-10 chr10 52203503 52203792 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) L1PA15|LINE|L1 110481 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 192.75-76 chr21 29269530 29270163 + 0.75 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) intron (NR_027072, intron 1 of 1) -29076 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 168.25-83 chr2 160588596 160588880 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -94931 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 180-36 chr14 84588304 84588763 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -683399 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 125.5-176 chr3 96419504 96419766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59671 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 126.5-138 chr21 15515599 15515776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -214247 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 145.25-33 chr12 129507513 129507886 + 0.75 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) L1PB1|LINE|L1 299098 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 164.5-89 chr2 12796219 12796501 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 58993 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 151.5-127 chr3 124560232 124560503 + 0.75 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) intron (NM_001024660, intron 33 of 59) -24291 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 180.25-88 chr4 159904941 159905329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -127351 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 214.75-20 chr14 40170477 40170835 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -738156 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 176.25-28 chr11 114836833 114837085 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 158432 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 208.75-70 chr5 133411335 133411917 + 0.75 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 16080 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 131-190 chrX 88926532 88926911 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 179496 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 178.25-56 chr18 35340668 35341142 + 0.75 NA intron (NM_001308123, intron 1 of 3) MER58B|DNA|hAT-Charlie 3515 NM_006965 7572 Hs.514802 NM_006965 ENSG00000172466 ZNF24 KOX17|RSG-A|ZNF191|ZSCAN3|Zfp191 zinc finger protein 24 protein-coding 123.5-20 chr1 242423951 242424242 + 0.75 NA intron (NM_001320272, intron 2 of 10) intron (NM_001320272, intron 2 of 10) 25372 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 156-66 chr18 4712792 4713157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257667 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 173.25-138 chr9 32136411 32136822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247987 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 155.75-145 chr7 1165737 1166006 + 0.75 NA TTS (NR_110065) TTS (NR_110065) 5086 NR_110070 101927021 Hs.529566 NR_110065 LOC101927021 - uncharacterized LOC101927021 ncRNA 264.25-36 chr3 2594094 2594750 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) AluSx|SINE|Alu -297793 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 161.75-34 chr12 108259438 108259881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61003 NM_001142345 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 126-169 chr8 54674184 54674430 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58211 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 165.25-76 chr2 219141986 219142324 + 0.75 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) 18710 NM_024782 79840 Hs.225988 NM_024782 ENSG00000187736 NHEJ1 XLF non-homologous end joining factor 1 protein-coding 140.25-56 chr15 88949748 88949991 + 0.75 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -36490 NM_001310319 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 202-49 chr4 117329799 117330281 + 0.75 NA intron (NR_147151, intron 3 of 6) L1MD|LINE|L1 30599 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 122.25-117 chr22 40620652 40620980 + 0.75 NA intron (NM_020831, intron 1 of 14) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 15903 NM_001282661 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 130.5-193 chr4 169899393 169899629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76391 NR_037878 100506085 Hs.649173 NR_037878 ENSG00000248319 LINC02275 - long intergenic non-protein coding RNA 2275 ncRNA 197.25-37 chr17 71463251 71463733 + 0.75 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -261313 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 128.5-5 chr1 25795582 25795831 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -4487 NM_020451 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 124.25-196 chr8 51841957 51842343 + 0.75 NA intron (NM_001286783, intron 2 of 5) intron (NM_001286783, intron 2 of 5) -32705 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 190.75-35 chr17 9252809 9253158 + 0.75 NA intron (NM_004853, intron 7 of 7) MER58C|DNA|hAT-Charlie -73865 NR_110828 101928266 Hs.639880 NR_110828 ENSG00000262966 LOC101928266 - uncharacterized LOC101928266 ncRNA 193.5-30 chr12 33609058 33609393 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -169406 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 148.5-121 chr20 6961629 6961876 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 194066 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 112.75-91 chr2 54877039 54877270 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 15 of 40) AluJb|SINE|Alu 133118 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 173.5-119 chr4 132828721 132829125 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 237834 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 174.5-173 chr7 38312658 38313041 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28728 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 163.75-33 chr12 43366627 43367002 + 0.75 NA intron (NM_025003, intron 37 of 38) L1M4b|LINE|L1 185389 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 185.25-44 chr16 76604766 76605170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30030 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 168.25-151 chr9 99409499 99409805 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -34395 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 117.25-156 chr4 62826053 62826299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -664411 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 236.75-31 chr2 125177109 125177499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 940681 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 148.25-49 chr16 86198428 86198685 + 0.75 NA intron (NR_103859, intron 1 of 1) intron (NR_103859, intron 1 of 1) 2375 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 126-13 chr1 192649682 192650053 + 0.75 NA intron (NM_144766, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 13720 NM_002927 6003 Hs.497220 NM_002927 ENSG00000127074 RGS13 - regulator of G protein signaling 13 protein-coding 152-10 chr1 109620982 109621375 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_004037) promoter-TSS (NM_004037) 36 NM_004037 271 Hs.82927 NM_004037 ENSG00000116337 AMPD2 PCH9|SPG63 adenosine monophosphate deaminase 2 protein-coding 121.5-41 chr11 65372656 65372945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9171 NM_001278250 283130 Hs.661604 NM_182556 ENSG00000162241 SLC25A45 - solute carrier family 25 member 45 protein-coding 179-47 chr18 22148046 22148321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20785 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 193.25-13 chr10 67965979 67966344 + 0.75 NA intron (NM_001278185, intron 16 of 23) AluSx|SINE|Alu 44722 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 158-16 chr1 185366937 185367292 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -32075 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 140.5-137 chr21 27782250 27782486 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 59989 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 125.5-258 chr8 125592732 125593047 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 160680 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 223.5-63 chr2 158176588 158177226 + 0.75 NA intron (NR_038850, intron 2 of 4) intron (NR_038850, intron 2 of 4) 10257 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 127.5-161 chr3 189604097 189604446 + 0.75 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 7525 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 125.25-28 chr10 65340938 65341231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -230341 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 123-170 chr6 74369432 74369664 + 0.75 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 300097 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 166.75-44 chr14 25565408 25565765 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -515289 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 125.5-114 chr18 622991 623192 + 0.75 NA intron (NM_199167, intron 3 of 8) AluSq2|SINE|Alu 6391 NM_199167 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 164.5-160 chr5 28076260 28076616 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 211227 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 151.25-137 chr4 30442748 30443002 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -277494 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 121.75-152 chr5 114875531 114875825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -102265 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 170.25-12 chr10 75739676 75740040 + 0.75 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 27403 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 152.75-8 chr1 150516586 150517002 + 0.75 NA intron (NR_051960, intron 1 of 1) intron (NR_051960, intron 1 of 1) 1037 NR_051960 100874054 Hs.576460 NR_051960 ENSG00000228126 FALEC FAL1|LINC00568|ncRNA-a1 focally amplified long non-coding RNA in epithelial cancer ncRNA 136.75-125 chr3 9670807 9671046 + 0.75 NA intron (NM_001077525, intron 5 of 18) intron (NM_001077525, intron 5 of 18) 21421 NM_022485 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 173.25-33 chr13 88813015 88813467 + 0.75 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 186388 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 120.25-114 chr20 54746095 54746385 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 270647 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 130-56 chr17 65376682 65377006 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -80697 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 179.5-114 chr22 28489491 28489794 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) FLAM_A|SINE|Alu 29773 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 118.25-124 chr22 50129745 50129928 + 0.75 NA intron (NM_018995, intron 13 of 26) L1ME3F|LINE|L1 -17219 NM_001164106 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 141.75-60 chr15 58386185 58386447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45675 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 129.75-46 chr12 26566595 26566887 + 0.75 NA intron (NM_002223, intron 34 of 56) intron (NM_002223, intron 34 of 56) 266453 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 238.25-40 chr2 149399408 149399888 + 0.75 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 69061 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 118.75-38 chr12 3351963 3352192 + 0.75 NA intron (NR_148995, intron 1 of 11) intron (NR_148995, intron 1 of 11) 14045 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 173.25-128 chr8 120308214 120308601 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 36 of 47) L1ME3G|LINE|L1 136743 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 212.5-5 chr1 163139957 163140337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21528 NR_110699 101928404 Hs.683933 NR_110699 ENSG00000232892 LOC101928404 - uncharacterized LOC101928404 ncRNA 150.5-216 chr8 67062481 67062755 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006837) promoter-TSS (NM_006837) -485 NM_006837 10987 Hs.491912 NM_006837 ENSG00000121022 COPS5 CSN5|JAB1|MOV-34|SGN5 COP9 signalosome subunit 5 protein-coding 207.75-80 chr3 138722028 138722416 + 0.75 NA intron (NM_006219, intron 8 of 23) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14601 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 193.75-46 chr14 68919139 68919661 + 0.75 NA intron (NM_001102, intron 3 of 20) intron (NM_001102, intron 3 of 20) 59902 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 117.5-190 chr5 118303039 118303258 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 20574 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 161.5-26 chr10 115261986 115262413 + 0.75 NA intron (NM_207303, intron 10 of 28) L1MEd|LINE|L1 168834 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 169-80 chr5 81719654 81720129 + 0.75 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) MER74A|LTR|ERVL 31362 NM_012446 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 226-37 chr2 61544576 61545002 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6433 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 155-8 chr1 210009959 210010340 + 0.75 NA intron (NM_001146261, intron 3 of 9) intron (NM_001146261, intron 3 of 9) 71932 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 118.5-38 chr11 115478434 115478595 + 0.75 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 25901 NM_001098517 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 179.25-80 chr2 171399247 171399605 + 0.75 NA intron (NM_024770, intron 1 of 9) intron (NM_024770, intron 1 of 9) 34564 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 130.5-72 chr12 17395129 17395327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 193850 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 154.5-26 chr10 78238606 78238931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9857 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 179-87 chr8 5304661 5305068 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309950 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 126.75-216 chr6 139102193 139102415 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -32776 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 153.25-110 chr6 53604323 53604643 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -23897 NR_125841 101927171 Hs.334005 NR_125841 ENSG00000235899 LINC01564 TCONS_00011314|XLOC_005327 long intergenic non-protein coding RNA 1564 ncRNA 141.25-176 chr8 11080128 11080373 + 0.75 NA intron (NM_173683, intron 1 of 2) intron (NM_173683, intron 1 of 2) -13161 NR_134308 101929269 Hs.680442 NR_134308 ENSG00000254839 LOC101929269 - uncharacterized LOC101929269 ncRNA 187-3 chr1 165804886 165805244 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -22549 NM_012474 7371 Hs.458360 NM_012474 ENSG00000143179 UCK2 TSA903|UK|UMPK uridine-cytidine kinase 2 protein-coding 181.25-137 chr9 18725826 18726185 + 0.75 NA intron (NM_001040272, intron 15 of 28) MIRc|SINE|MIR 152699 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 214.75-63 chr4 96546414 96546880 + 0.75 NA intron (NR_147149, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 235944 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 171-124 chr7 8425335 8425800 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -8042 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 188.25-103 chr6 145579165 145579666 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 107462 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 175.75 chr1 7716596 7716931 + 0.75 NA intron (NM_001349624, intron 1 of 11) L1MA8|LINE|L1 12027 NM_001349626 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 217.25-7 chr1 209724879 209725260 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_134509) promoter-TSS (NR_134509) -944 NR_134509 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 156-151 chr8 67320417 67320799 + 0.75 NA intron (NM_006421, intron 1 of 38) L1ME1|LINE|L1 23173 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 113.5-189 chr4 153915006 153915337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126088 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 229-48 chr3 5738221 5738550 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -488130 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 117.75-168 chr5 2129219 2129503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182840 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 202-38 chr2 211338950 211339272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 721540 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 153.75-158 chrX 38592293 38592591 + 0.75 NA intron (NM_004615, intron 1 of 7) L1MEc|LINE|L1 30964 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 187.5-100 chr20 18777510 18777907 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16274 NR_026884 29075 Hs.584899 NM_014162 LINC00652 HSPC072 long intergenic non-protein coding RNA 652 ncRNA 161.25-123 chr3 81199875 81200213 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 206176 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 149.5-169 chr6 45516756 45517181 + 0.75 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) intron (NM_001015051, intron 7 of 7) 94693 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 122.5-85 chr17 59512780 59512975 + 0.75 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) intron (NR_110813, intron 1 of 2) 13980 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 255-55 chr7 5382600 5383148 + 0.75 NA intron (NM_001080495, intron 5 of 29) intron (NM_001080495, intron 5 of 29) 40672 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 121.5-185 chr3 143064308 143064522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55356 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 205-21 chr14 81349547 81349882 + 0.75 NA intron (NM_001366849, intron 5 of 8) L1MA4A|LINE|L1 78061 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 165-12 chr10 39324798 39325111 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 628358 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 172.5-196 chr8 50714282 50714666 + 0.75 NA intron (NM_001287814, intron 16 of 16) L1PA8|LINE|L1 550343 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 215-35 chr17 59518627 59519141 + 0.75 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) AluSg7|SINE|Alu 7973 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 157.75-153 chr6 136163314 136163546 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 8 of 12) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 86881 NM_001318738 113115 Hs.121536 NM_138419 ENSG00000146410 MTFR2 DUFD1|FAM54A mitochondrial fission regulator 2 protein-coding 112.75-133 chr3 27697276 27697554 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 24908 NM_001278182 8320 Hs.591663 NM_005442 ENSG00000163508 EOMES TBR2 eomesodermin protein-coding 150.5-58 chr15 70076528 70076861 + 0.75 NA intron (NM_020908, intron 4 of 19) intron (NM_020908, intron 4 of 19) 2774 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 196-73 chr4 106125952 106126266 + 0.75 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) L2b|LINE|L2 -103631 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 187.75-30 chr14 51701486 51701832 + 0.75 NA intron (NM_001267046, intron 4 of 13) intron (NM_001267046, intron 4 of 13) -15624 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 261-19 chr15 61285493 61285895 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -56392 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 131-41 chr12 51996675 51997109 + 0.75 NA 3' UTR (NM_020327, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_020327, exon 9 of 9) -10054 NM_181711 160622 Hs.407202 NM_181711 ENSG00000161835 GRASP TAMALIN general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein protein-coding 113.5-58 chr12 103084922 103085115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66824 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 166.5 chr1 6946451 6946720 + 0.75 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) L1MB8|LINE|L1 161131 NM_015215 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 137.25-15 chr10 48340015 48340255 + 0.75 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) L1PA17|LINE|L1 33458 NM_001323328 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 124-109 chr3 5476102 5476326 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -225959 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 177.5-96 chr2 202541035 202541481 + 0.75 NA intron (NM_001204, intron 9 of 12) AluJr4|SINE|Alu -93711 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 136.5-204 chr7 2581897 2582232 + 0.75 NA intron (NM_001287501, intron 6 of 19) intron (NM_001287501, intron 6 of 19) 23085 NM_001287500 23288 Hs.520627 NM_152558 ENSG00000106012 IQCE 1700028P05Rik|PAPA7 IQ motif containing E protein-coding 144.5-77 chr16 48670843 48671162 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60822 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 230.75-52 chr4 105807493 105808089 + 0.75 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) L1MC4|LINE|L1 19381 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 128.5-20 chr1 239451555 239451789 + 0.75 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) intron (NM_001347716, intron 1 of 7) 65104 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 178.5-79 chr2 59668820 59669209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 451306 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 204.5-135 chr8 117575089 117575533 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 54598 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 250.75-38 chr3 95696123 95696580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13158 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 134.5-247 chrX 38540306 38540717 + 0.75 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -20967 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 174.5-28 chr10 115960940 115961344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 233647 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 130.25-16 chr1 167418164 167418546 + 0.75 NA non-coding (NR_037163, exon 17 of 17) non-coding (NR_037163, exon 17 of 17) 89285 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 160-70 chr3 189290604 189290904 + 0.75 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) intron (NM_198485, intron 4 of 5) -50160 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 177.75-102 chr3 108685549 108685827 + 0.75 NA intron (NM_014648, intron 27 of 32) intron (NM_014648, intron 27 of 32) 71595 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 162.75-51 chr17 61997162 61997408 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) intron (NM_005121, intron 9 of 29) 67993 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 185.5-6 chr1 108940166 108940576 + 0.75 NA intron (NM_001048210, intron 7 of 11) intron (NM_001048210, intron 7 of 11) 10077 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 132.75-84 chr18 8054933 8055189 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) L1ME3F|LINE|L1 311973 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 218.5 chr1 6414898 6415417 + 0.75 NA TTS (NM_019089) TTS (NM_019089) 4762 NM_019089 54626 Hs.118727 NM_019089 ENSG00000069812 HES2 bHLHb40 hes family bHLH transcription factor 2 protein-coding 200.75-59 chr2 194517476 194517962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 173450 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 115.25-125 chr22 27725248 27725544 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 76360 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 224.75-16 chr11 13680081 13680588 + 0.75 NA intron (NM_032228, intron 1 of 11) FLAM_A|SINE|Alu 11666 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 143.25-134 chr4 70891647 70891897 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10597 NM_173468 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 130.5-59 chr11 55079553 55079862 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -182448 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 154.5-33 chr10 121433592 121433943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 97547 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 129.75-37 chr11 74524746 74525030 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -31164 NM_001144869 387787 Hs.591971 NM_001144869 ENSG00000175536 LIPT2 - lipoyl(octanoyl) transferase 2 protein-coding 182.5-67 chr17 70682921 70683280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 513565 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 136.25-146 chr5 51023483 51023782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53445 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 120.5-133 chr20 24241648 24241951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42032 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 136.75-202 chr8 143838319 143838575 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106904) promoter-TSS (NR_106904) -631 NR_106904 102466748 NR_106904 ENSG00000284142 MIR6845 hsa-mir-6845 microRNA 6845 ncRNA 124-155 chr7 1923238 1923442 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) intron (NM_001013837, intron 17 of 18) 17231 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 218.25-29 chr14 65294318 65294936 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 40556 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 168.5-12 chr1 157526373 157526770 + 0.75 NA intron (NM_001195388, intron 9 of 16) intron (NM_001195388, intron 9 of 16) 25944 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 194.25-28 chr14 45006334 45006685 + 0.75 NA intron (NR_131765, intron 5 of 19) L1ME4a|LINE|L1 44319 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 172.75-43 chr16 20966300 20966556 + 0.75 NA intron (NM_001347886, intron 52 of 61) intron (NM_001347886, intron 52 of 61) 65166 NR_161432 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 149-4 chr1 93122195 93122598 + 0.75 NA intron (NM_007358, intron 9 of 14) intron (NM_007358, intron 9 of 14) 43113 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 186.25-102 chr6 63989568 63989832 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 34 of 43) intron (NM_001292009, intron 34 of 43) 182864 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 202.75-110 chr8 125208408 125208819 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 116753 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 153.75-16 chr10 31395504 31395865 + 0.75 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) 4071 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 118.5-53 chr14 59392903 59393098 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 72380 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 136.75-40 chr11 59337088 59337347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27242 NM_001004729 390195 Hs.553755 NM_001004729 ENSG00000176495 OR5AN1 OR11-244 olfactory receptor family 5 subfamily AN member 1 protein-coding 123.75-6 chr1 82993748 82994030 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 3 of 10) MLT2B3|LTR|ERVL -7681 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 247-37 chr2 166841841 166842295 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46419 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 113.5-205 chr5 135114233 135114440 + 0.75 NA intron (NR_161235, intron 2 of 5) intron (NR_161235, intron 2 of 5) -74289 NR_105049 101927953 Hs.436898 NR_105049 ENSG00000249082 C5orf66-AS1 Epist C5orf66 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-190 chr7 77908310 77908598 + 0.75 NA intron (NM_001366085, intron 5 of 10) intron (NM_001366085, intron 5 of 10) 68324 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 125.75-47 chr13 26192593 26192783 + 0.75 NA intron (NM_183045, intron 5 of 5) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 29069 NM_183044 6049 Hs.136885 NM_005977 ENSG00000127870 RNF6 - ring finger protein 6 protein-coding 121.75-89 chr2 168816656 168816836 + 0.75 NA intron (NM_001171632, intron 2 of 14) L2c|LINE|L2 14149 NM_052946 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 135.75-125 chr21 28929104 28929367 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001320766, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001320766, exon 29 of 29) -43862 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 148-72 chr21 26924492 26924878 + 0.75 NA intron (NM_007038, intron 7 of 7) intron (NM_007038, intron 7 of 7) -29276 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 113-98 chr2 171310644 171310883 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79470 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 120-6 chr1 113419587 113419893 + 0.75 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 29225 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 120.5-153 chr3 193254413 193254624 + 0.75 NA intron (NM_001366112, intron 2 of 4) intron (NM_001366112, intron 2 of 4) 12739 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 242.25-45 chr2 26977640 26978239 + 0.75 NA intron (NM_012326, intron 1 of 6) intron (NM_012326, intron 1 of 6) 7302 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 148.75-56 chr14 64689656 64689908 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -14642 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 175.5-131 chr4 86553841 86554092 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -11414 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 203.5-95 chr3 136349796 136350158 + 0.75 NA intron (NM_005862, intron 28 of 33) AluSz|SINE|Alu 99637 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 114.75-36 chr11 95290107 95290481 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57819 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 210-72 chr4 75014471 75015023 + 0.75 NA intron (NM_015393, intron 2 of 3) LTR33|LTR|ERVL -44385 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 144-25 chr11 4062168 4062416 + 0.75 NA intron (NM_001277962, intron 5 of 12) L1MB7|LINE|L1 -32393 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 138.25-141 chr5 138063004 138063344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20718 NM_058244 7478 Hs.591274 NM_031933 ENSG00000061492 WNT8A WNT8D Wnt family member 8A protein-coding 260-28 chr4 102978973 102979547 + 0.75 NA intron (NR_047513, intron 3 of 10) intron (NR_047513, intron 3 of 10) 40445 NR_047513 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 217.5-57 chr19 27671853 27672329 + 0.75 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -121340 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 157.25-107 chr4 77035428 77035720 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018243, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_018243, exon 10 of 10) 39336 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 194.25-82 chr4 74451155 74451461 + 0.75 NA intron (NM_001657, intron 4 of 5) intron (NM_001657, intron 4 of 5) 6172 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 137.25-147 chr7 4323182 4323546 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -188527 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 214.25-15 chr12 2201361 2201709 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 21946 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 119.5-165 chr4 66889002 66889353 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 532823 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 220.75-10 chr10 64258572 64258888 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -566798 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 204.75-5 chr1 61222493 61222851 + 0.75 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 30846 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 178-97 chr7 99875096 99875550 + 0.75 NA TTS (NM_001005276) TTS (NM_001005276) 1710 NM_001005276 81392 Hs.647523 NM_001005276 ENSG00000244623 OR2AE1 OR2AE2 olfactory receptor family 2 subfamily AE member 1 protein-coding 171-68 chr2 73815737 73816171 + 0.75 NA exon (NM_001080474, exon 3 of 3) exon (NM_001080474, exon 3 of 3) 7215 NM_001353344 388960 Hs.456833 NM_001080474 ENSG00000187833 C2orf78 COG5373|hCG1989538 chromosome 2 open reading frame 78 protein-coding 140.5-206 chr7 6498311 6498563 + 0.75 NA intron (NM_001145118, intron 20 of 21) L2a|LINE|L2 -14285 NM_006854 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 114.75-135 chr4 37368367 37368583 + 0.75 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -85450 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 190.75-56 chr2 198922123 198922475 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 535640 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 139.75-4 chr1 107596308 107596641 + 0.75 NA intron (NM_006113, intron 24 of 26) intron (NM_006113, intron 24 of 26) 92025 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 139.5-192 chr6 90416422 90416722 + 0.75 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL 103830 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 143.25-54 chr15 66902466 66902907 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 53829 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 219.5-78 chr21 31553544 31554017 + 0.75 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 5307 NM_001353688 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 388-3 chr15 97874479 97875384 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_024172) promoter-TSS (NR_024172) -502 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 121.5-69 chr13 24844668 24844854 + 0.75 NA exon (NM_001184993, exon 21 of 36) exon (NM_001184993, exon 21 of 36) 78100 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 114-118 chr4 154768864 154769150 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12265 NM_001277171 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 132.5-197 chr5 81125115 81125461 + 0.75 NA intron (NM_006909, intron 16 of 26) intron (NM_006909, intron 16 of 26) -108032 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 128-22 chr11 26515241 26515518 + 0.75 NA intron (NM_031418, intron 5 of 26) MER103C|DNA|hAT-Charlie 41477 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 161.5-50 chr13 65057004 65057393 + 0.75 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -808849 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 146.5-96 chr19 29963218 29963475 + 0.75 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) L1MEg|LINE|L1 21107 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 189.5-12 chr1 173598836 173599312 + 0.75 NA intron (NM_178527, intron 3 of 27) intron (NM_178527, intron 3 of 27) 3998 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 150.5-3 chr1 22270214 22270534 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4135 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 197.75-69 chr5 78418158 78418562 + 0.75 NA intron (NR_110885, intron 4 of 7) intron (NR_110885, intron 4 of 7) 57743 NM_004866 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 128.25-138 chr3 183655423 183655741 + 0.75 NA intron (NM_001349428, intron 4 of 8) AluJo|SINE|Alu 19959 NM_001349429 54800 Hs.407709 NM_017644 ENSG00000114796 KLHL24 DRE1|EBSSH|KRIP6 kelch like family member 24 protein-coding 119-159 chr5 175660304 175660582 + 0.75 NA intron (NR_160284, intron 1 of 3) intron (NR_160284, intron 1 of 3) 2372 NM_001131055 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 186.5-10 chr1 172610148 172610527 + 0.75 NA 3' UTR (NM_016227, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_016227, exon 23 of 23) -48671 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 139.25-57 chr15 38979377 38979742 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -271110 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 158.25-142 chr8 33101433 33101704 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 371578 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 181.5-3 chr1 66051518 66051810 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_123718) promoter-TSS (NR_123718) -946 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 178.25-85 chr3 78705254 78705553 + 0.75 NA intron (NM_001145845, intron 6 of 28) intron (NM_001145845, intron 6 of 28) 314056 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 175.5-180 chr9 94685328 94685636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41187 NM_032823 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 261-60 chr8 54417239 54417707 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -40462 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 129.75-157 chr6 48626472 48626702 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -557898 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 145.75-150 chr7 33327541 33327945 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) L2|LINE|L2 198179 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 178.75-95 chr6 154585116 154585662 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -74704 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 168.75-46 chr14 67105089 67105481 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 12 of 21) L1M2a|LINE|L1 -84155 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 174-71 chr4 118841163 118841558 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -5234 NM_001318066 9871 Hs.189641 NM_014822 ENSG00000150961 SEC24D CLCRP2 SEC24 homolog D, COPII coat complex component protein-coding 222-60 chr4 156392156 156392652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -438538 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 122.5-6 chr1 69046034 69046277 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -9743 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 185-86 chr8 86538674 86539180 + 0.75 NA intron (NM_003909, intron 7 of 16) L1MC4|LINE|L1 24492 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 141-117 chr4 134030876 134031270 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170716 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 127.25-42 chr12 14941206 14941463 + 0.75 NA TTS (NM_001321423) TTS (NM_001321423) -2797 NM_152321 121506 Hs.162143 NM_152321 ENSG00000139055 ERP27 C12orf46|PDIA8 endoplasmic reticulum protein 27 protein-coding 145.5-125 chr3 9963834 9964133 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018447, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018447, exon 9 of 9) -11568 NM_001318871 285368 Hs.598147 NM_207351 ENSG00000163704 PRRT3 - proline rich transmembrane protein 3 protein-coding 268.75-45 chr8 117911001 117911588 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 9619 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 141.25-57 chr15 80832396 80832693 + 0.75 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) intron (NM_018689, intron 1 of 28) 9529 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 116.5-198 chr5 46312105 46312326 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -615835 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 205.5-25 chr11 130929900 130930378 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -13652 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 165.5-203 chr8 134113882 134114255 + 0.75 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 227572 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 204.25-43 chr17 8913522 8914022 + 0.75 NA intron (NM_001142633, intron 1 of 18) intron (NM_001142633, intron 1 of 18) -1255 NM_014308 23533 Hs.278901 NM_014308 ENSG00000141506 PIK3R5 F730038I15Rik|FOAP-2|P101-PI3K|p101 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 protein-coding 209.5-124 chr5 67123585 67124100 + 0.75 NA intron (NM_001297651, intron 11 of 25) intron (NM_001297651, intron 11 of 25) 72957 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 118-106 chr22 20935555 20935819 + 0.75 NA intron (NR_156180, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 18280 NR_156180 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 196.5-143 chr6 70696951 70697270 + 0.75 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) L1MA3|LINE|L1 28580 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 120.25-82 chr2 12600487 12600673 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -116292 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 162.5-32 chr12 14302001 14302316 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -63474 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 122.25-81 chr18 7306861 7307064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75858 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 150.75-153 chr5 97653352 97653715 + 0.75 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) L1PREC2|LINE|L1 148837 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 221.5-32 chr16 74212161 74212600 + 0.75 NA intron (NR_104657, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 3141 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 159.75-163 chr7 107112406 107112690 + 0.75 NA intron (NM_002736, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 -56413 NM_001244262 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 113.5-192 chr5 45769697 45769890 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -73413 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 124.75-86 chr15 70670001 70670289 + 0.75 NA intron (NM_018003, intron 15 of 18) MER50|LTR|ERV1 32137 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 201.5-114 chr6 46023664 46024104 + 0.75 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) -7995 NM_001256023 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 165.25-138 chr8 69387325 69387686 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 60739 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 170.75-146 chr9 28358005 28358295 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 361155 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 134.75-128 chr20 18513822 18514125 + 0.75 NA intron (NM_032986, intron 3 of 19) MIR|SINE|MIR 6033 NM_001172745 10483 Hs.369373 NM_006363 ENSG00000101310 SEC23B CDA-II|CDAII|CDAN2|CWS7|HEMPAS|hSec23B SEC23 homolog B, coat complex II component protein-coding 172.5-173 chr6 139582245 139582648 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -107850 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 128.5-3 chr1 17511350 17511639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28204 NR_137288 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 268.25-12 chr14 50845021 50845595 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -14187 NM_182944 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 180.25-20 chr13 102053026 102053398 + 0.75 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) L1M1|LINE|L1 -7208 NR_039854 100616239 NR_039854 ENSG00000264482 MIR4705 - microRNA 4705 ncRNA 113.75-34 chr11 36067765 36068002 + 0.75 NA intron (NR_135064, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 10018 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 157.5-117 chr2 225676373 225676613 + 0.75 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 275607 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 219.5-3 chr1 68872393 68872794 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -183305 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 162.75-80 chr20 5846932 5847371 + 0.75 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) -64359 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 115.25-136 chr3 65347695 65348061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -545938 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 158.5-113 chr20 18672918 18673163 + 0.75 NA intron (NM_080820, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 25668 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 122-181 chr8 82573087 82573379 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -338871 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 160.5-138 chr4 105971111 105971401 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001184691, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001184691, exon 13 of 13) 51222 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 143-154 chr9 4588619 4588987 + 0.75 NA TTS (NR_148445) TTS (NR_148445) 73420 NM_001353490 55064 Hs.179615 NM_017985 ENSG00000106686 SPATA6L C9orf68|bA6J24.2 spermatogenesis associated 6 like protein-coding 136.25-52 chr14 26363094 26363396 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190185 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 153.5-9 chr1 178827900 178828228 + 0.75 NA intron (NM_152663, intron 7 of 19) L1MA9|LINE|L1 43013 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 184.25-68 chr2 208241588 208241935 + 0.75 NA intron (NM_001282386, intron 7 of 9) intron (NM_001282386, intron 7 of 9) 12542 NM_001282387 3417 Hs.593422 NM_005896 ENSG00000138413 IDH1 HEL-216|HEL-S-26|IDCD|IDH|IDP|IDPC|PICD isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 1, cytosolic protein-coding 117.25-88 chr16 76097321 76097485 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -179998 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 170-22 chr12 24313813 24314134 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) L2|LINE|L2 90702 NR_120473 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 232.75-5 chr1 241414953 241415481 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57987 NM_001282775 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 124-68 chr18 3122256 3122562 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 18 of 36) L1ME3B|LINE|L1 97559 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 123.25-137 chr3 115194383 115194630 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47218 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 129-92 chr2 68697489 68697798 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -37168 NM_001007231 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 142.5-50 chr12 81963708 81963996 + 0.75 NA intron (NR_110089, intron 2 of 2) L1P4|LINE|L1 10133 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 125.5-266 chr8 139014711 139014929 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100779 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 182.5-107 chr3 133961075 133961394 + 0.75 NA intron (NM_005630, intron 3 of 13) intron (NM_005630, intron 3 of 13) -31422 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 176.5-98 chr2 111218420 111218745 + 0.75 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) intron (NR_015395, intron 5 of 6) 97668 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 139-34 chr13 79942868 79943185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68051 NR_104138 101515984 Hs.569290 NR_104138 LINC01080 TCONS_00021856 long intergenic non-protein coding RNA 1080 ncRNA 164.25-16 chr1 246336987 246337409 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 2 of 11) intron (NM_022743, intron 2 of 11) 80214 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 159.5-99 chr2 56224869 56225240 + 0.75 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) L1MB8|LINE|L1 -39284 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 120.25-21 chr1 242150695 242150934 + 0.75 NA intron (NM_001320272, intron 6 of 10) L1ME1|LINE|L1 -151716 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 176.25-105 chr4 175033302 175033672 + 0.75 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 115129 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 124.5-230 chr8 119607302 119607561 + 0.75 NA intron (NM_001330600, intron 9 of 25) AluSx3|SINE|Alu -14423 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 188.5-2 chr1 31149739 31150284 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -84294 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 140.25-191 chr8 128475484 128475722 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 89076 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 129.25-8 chr1 145751233 145751479 + 0.75 NA intron (NM_014455, intron 6 of 8) intron (NM_014455, intron 6 of 8) 31857 NR_103845 11126 Hs.488237 NM_007053 ENSG00000117281 CD160 BY55|NK1|NK28 CD160 molecule protein-coding 225.25-82 chr8 47633208 47633790 + 0.75 NA intron (NM_001080394, intron 10 of 19) intron (NM_001080394, intron 10 of 19) -20589 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 129.25-54 chr14 101642170 101642418 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 80943 NM_001362 1735 Hs.49322 NM_001362 ENSG00000197406 DIO3 5DIII|D3|DIOIII|TXDI3 iodothyronine deiodinase 3 protein-coding 118-13 chr10 29929886 29930119 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 129584 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 204.25-15 chr10 127094348 127094766 + 0.75 NA intron (NM_001290223, intron 23 of 51) intron (NM_001290223, intron 23 of 51) 102034 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 174-9 chr10 90913708 90914273 + 0.75 NA intron (NM_014391, intron 8 of 8) intron (NM_014391, intron 8 of 8) 7285 NM_014391 27063 Hs.448589 NM_014391 ENSG00000148677 ANKRD1 ALRP|C-193|CARP|CVARP|MCARP|bA320F15.2 ankyrin repeat domain 1 protein-coding 114.5-231 chr6 144002601 144002845 + 0.75 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) L1ME3|LINE|L1 5536 NM_001289046 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 220.5-13 chr10 126050000 126050361 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 14 of 18) intron (NM_001288974, intron 14 of 18) -76907 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 135.5-90 chr18 62073241 62073469 + 0.75 NA intron (NM_176787, intron 29 of 30) L2b|LINE|L2 113701 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 212.5-109 chr7 99136002 99136298 + 0.75 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) FRAM|SINE|Alu 7958 NM_020429 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 156.25-159 chr9 126348270 126348496 + 0.75 NA intron (NM_033446, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 21554 NM_001011703 89853 Hs.162659 NM_033446 ENSG00000196814 MVB12B C9orf28|FAM125B multivesicular body subunit 12B protein-coding 168-17 chr10 82834403 82834775 + 0.75 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -601669 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-241 chr9 75218317 75218552 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 129920 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 258-38 chr3 167827711 167828332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67927 NR_033843 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 158.75-172 chr9 121047451 121047823 + 0.75 NA intron (NM_001317163, intron 1 of 40) intron (NM_001317163, intron 1 of 40) 2638 NM_001317164 727 Hs.494997 NM_001735 ENSG00000106804 C5 C5D|C5a|C5b|CPAMD4|ECLZB complement C5 protein-coding 157-60 chr2 124116225 124116536 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 91093 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 180-106 chr6 153601196 153601506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -409145 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 161.5-154 chr5 41805217 41805526 + 0.75 NA intron (NR_157114, intron 9 of 15) Helitron2Na_Mam|RC?|Helitron? 38286 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 184.25-97 chr5 16970459 16970857 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -34370 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 164.5-200 chr8 37653839 37654225 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -41750 NM_025069 80139 Hs.288042 NM_025069 ENSG00000183779 ZNF703 NLZ1|ZEPPO1|ZNF503L|ZPO1 zinc finger protein 703 protein-coding 137.75-5 chr1 78717071 78717318 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 67363 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 261.5-18 chr14 76313936 76314489 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57135 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 141.5-244 chrX 114099133 114099349 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -161023 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 124-97 chr2 221490857 221491102 + 0.75 NA intron (NM_001363748, intron 4 of 17) intron (NM_001363748, intron 4 of 17) 81325 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 121.75-100 chr20 44902615 44902941 + 0.75 NA intron (NM_003404, intron 3 of 6) intron (NM_003404, intron 3 of 6) -7282 NM_001124756 80336 Hs.641481 NM_001124756 ENSG00000101104 PABPC1L C20orf119|EPAB|PABPC1L1|dJ1069P2.3 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like protein-coding 171.75-152 chrX 58022798 58023052 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -112292 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 121-118 chr21 19320052 19320237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -560332 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 168.25-34 chr12 55526455 55526812 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24594 NM_001005494 341418 Hs.495021 NM_001005494 ENSG00000179626 OR6C4 OR12-10 olfactory receptor family 6 subfamily C member 4 protein-coding 132.5-152 chr22 25810767 25810958 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) L1MC2|LINE|L1 68674 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 131.25-33 chr11 82607220 82607467 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 126521 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 121-123 chr22 33880539 33880786 + 0.75 NA intron (NM_001362949, intron 1 of 15) intron (NM_001362949, intron 1 of 15) 39766 NM_004737 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 194-65 chr4 116007877 116008380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -291597 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 181.25-67 chr2 138742113 138742432 + 0.75 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 38118 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 142.75-7 chr1 111030726 111031128 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -66983 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 141-42 chr13 113513268 113513630 + 0.75 NA intron (NR_146222, intron 7 of 11) intron (NR_146222, intron 7 of 11) 22428 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 130-13 chr10 17200294 17200565 + 0.75 NA intron (NM_004412, intron 1 of 10) intron (NM_004412, intron 1 of 10) 1243 NM_001351219 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 139.5-62 chr14 30388736 30389064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -170223 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 134.75-50 chr12 16723245 16723479 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -115148 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 227.5-80 chr4 78749214 78749629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26929 NM_017593 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 114.5-101 chr15 67734566 67734741 + 0.75 NA intron (NM_001206804, intron 17 of 21) intron (NM_001206804, intron 17 of 21) -90856 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 118-120 chr3 145543800 145544121 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 525225 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 115-157 chr6 67585844 67586001 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -469429 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 139-68 chr2 19352841 19353149 + 0.75 NA intron (NM_145260, intron 2 of 2) intron (NM_145260, intron 2 of 2) 4566 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 205.5-85 chr20 16217190 16217518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -231472 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 130.5-79 chr12 65938959 65939265 + 0.75 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -56787 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 155.75-35 chr12 1424145 1424482 + 0.75 NA intron (NR_027948, intron 18 of 19) intron (NR_027948, intron 18 of 19) -76178 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 178-69 chr4 33888898 33889286 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150801 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 131.25-105 chr2 97810921 97811124 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 18 of 40) intron (NM_015348, intron 18 of 40) 76616 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 115-87 chr2 89830897 89831136 + 0.75 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -193109 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 175.25-114 chr5 45299974 45300553 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) intron (NM_021072, intron 6 of 7) 396117 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 117-160 chr6 116556443 116556812 + 0.75 NA intron (NM_001366078, intron 1 of 1) intron (NM_001366078, intron 1 of 1) 3496 NM_001366078 221301 Hs.350750 NM_153036 ENSG00000164451 CALHM4 C6orf78|FAM26D calcium homeostasis modulator family member 4 protein-coding 138.5-92 chr19 37165018 37165316 + 0.75 NA TTS (NR_110152) TTS (NR_110152) 7269 NM_199126 199704 Hs.659236 NM_152655 ENSG00000196967 ZNF585A - zinc finger protein 585A protein-coding 150.75-173 chr7 112244412 112244749 + 0.75 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) intron (NM_021994, intron 1 of 11) 37885 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 159.5-54 chr14 56320986 56321328 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193174 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 142.75-22 chr10 65883308 65883634 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 312046 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 137.25-83 chr20 36771395 36771648 + 0.75 NA intron (NM_001145317, intron 1 of 9) intron (NM_001145317, intron 1 of 9) 2230 NM_001145316 79980 Hs.632268 NM_024918 ENSG00000149636 DSN1 C20orf172|KNL3|MIS13|dJ469A13.2|hKNL-3 DSN1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 149-70 chr20 53054386 53054753 + 0.75 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 82211 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 165.75-76 chr2 12300365 12300803 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 101454 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 196.5-83 chr2 66384027 66384427 + 0.75 NA intron (NR_130931, intron 1 of 2) intron (NR_130931, intron 1 of 2) 921 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 126-18 chr10 45674396 45674721 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1745 NR_104256 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 183.75-118 chr7 43833092 43833509 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 36217 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 119-96 chr2 201664394 201664603 + 0.75 NA intron (NM_033066, intron 13 of 21) intron (NM_033066, intron 13 of 21) -20995 NM_001044385 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 114-35 chr12 24156507 24156740 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -55798 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 232.5-106 chr8 126807392 126807976 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -205470 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 163.25-89 chr3 24786683 24786983 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -42490 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 149.75-100 chr20 5113046 5113456 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014145) promoter-TSS (NM_014145) -164 NM_001330984 29058 Hs.472024 NM_014145 ENSG00000089063 TMEM230 C20orf30|HSPC274|dJ1116H23.2.1 transmembrane protein 230 protein-coding 203.25-53 chr2 112471984 112472402 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9963 NM_153712 150465 Hs.358997 NM_153712 ENSG00000114999 TTL - tubulin tyrosine ligase protein-coding 157.5-16 chr1 221424077 221424434 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -87959 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 158.5-13 chr1 213789435 213789728 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135168 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 300-14 chr14 42697192 42697660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1090570 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 169.5-175 chr8 120137796 120138197 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) L1MEb|LINE|L1 12894 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 136.5-42 chr11 42357026 42357235 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103440 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 155.25-37 chr11 65357473 65357766 + 0.75 NA TTS (NM_145719) TTS (NM_145719) 2868 NM_145719 220359 Hs.632121 NM_145719 ENSG00000173825 TIGD3 - tigger transposable element derived 3 protein-coding 128.25-43 chr12 119879818 119880206 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2692 NM_001206999 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 136.5-51 chr12 3904719 3905022 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -31422 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 166-123 chr8 53884596 53884902 + 0.75 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) intron (NR_104579, intron 1 of 3) 3877 NM_003702 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 173.25-124 chr8 79160801 79161043 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -171266 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 120.5-176 chr5 17136509 17136698 + 0.75 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) intron (NR_027253, intron 2 of 2) 19389 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 158.75-89 chr2 106787726 106788076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98127 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 121.75-41 chr13 98987752 98987996 + 0.75 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) intron (NM_015296, intron 1 of 55) -9810 NM_001366683 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 169-5 chr10 21981181 21981567 + 0.75 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 22356 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 116.5-173 chr4 36411389 36411660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14904 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 241.5-41 chr2 63960187 63960685 + 0.75 NA intron (NM_001005739, intron 7 of 22) intron (NM_001005739, intron 7 of 22) 58992 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 288.75-40 chr6 129470606 129471078 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 51 of 64) intron (NM_000426, intron 51 of 64) 239335 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 170-47 chr2 201878003 201878308 + 0.75 NA intron (NM_001366386, intron 11 of 13) intron (NM_001366386, intron 11 of 13) 71576 NM_001366386 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 159.75-154 chr6 108647990 108648346 + 0.75 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) intron (NM_201559, intron 2 of 3) 87251 NM_001455 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 212-81 chr8 61328833 61329193 + 0.75 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) intron (NM_173519, intron 2 of 5) 41043 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 173.75-146 chr8 62846617 62846887 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -131109 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 146-88 chr21 23797584 23797821 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -412867 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 126.5-121 chr2 127953592 127953964 + 0.75 NA intron (NM_001330303, intron 15 of 19) L2a|LINE|L2 -67838 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 187.25-70 chr3 1618890 1619196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -479760 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 134-99 chr2 166925650 166925934 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu 37305 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 212.5-100 chr7 3931224 3931655 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -198246 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 233.25-72 chr8 121900751 121901161 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -259516 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 135.75-117 chr2 241642312 241642515 + 0.75 NA intron (NM_013325, intron 1 of 12) intron (NM_013325, intron 1 of 12) 4720 NM_013325 23192 Hs.283610 NM_013325 ENSG00000168397 ATG4B APG4B|AUTL1 autophagy related 4B cysteine peptidase protein-coding 180-113 chr7 95310722 95311039 + 0.75 NA intron (NM_000446, intron 5 of 8) intron (NM_000446, intron 5 of 8) 13652 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 160.25-116 chr4 138774896 138775396 + 0.75 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 237500 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 131.5-225 chr7 122461899 122462238 + 0.75 NA intron (NM_001167940, intron 14 of 29) L1MEd|LINE|L1 -157318 NM_001024613 389549 Hs.553970 NM_001024613 ENSG00000128610 FEZF1 FEZ|HH22|ZNF312B FEZ family zinc finger 1 protein-coding 131.75-14 chr1 156973344 156973680 + 0.75 NA intron (NM_198236, intron 7 of 40) L2c|LINE|L2 -37268 NR_030527 768220 NR_030527 ENSG00000211581 MIR765 MIRN765|hsa-mir-765|mir-765 microRNA 765 ncRNA 203-8 chr10 10440480 10441003 + 0.75 NA intron (NR_120637, intron 1 of 3) intron (NR_120637, intron 1 of 3) 21608 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 117.25-104 chr2 12436315 12436635 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 237345 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 151-52 chr19 13811409 13811690 + 0.75 NA intron (NM_023072, intron 5 of 12) intron (NM_023072, intron 5 of 12) 16106 NM_001367834 65249 Hs.466015 NM_023072 ENSG00000132003 ZSWIM4 - zinc finger SWIM-type containing 4 protein-coding 175.25-56 chr16 78973131 78973498 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 627423 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 112.25-33 chr11 83135869 83136032 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -21181 NM_015885 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 187.5-131 chr5 4080705 4081135 + 0.75 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 485088 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 114.5-140 chr2 119297915 119298124 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -48948 NR_046721 100874111 Hs.704682 NR_046721 ENSG00000229867 STEAP3-AS1 - STEAP3 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-237 chr9 28625991 28626278 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1M4|LINE|L1 93171 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 193.75-22 chr10 104274182 104274569 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001191015) promoter-TSS (NM_001191015) -791 NM_001191015 119391 Hs.107384 NM_183239 ENSG00000065621 GSTO2 GSTO 2-2|bA127L20.1 glutathione S-transferase omega 2 protein-coding 257-56 chr8 125055207 125055768 + 0.75 NA intron (NM_014846, intron 17 of 28) intron (NM_014846, intron 17 of 28) 36305 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 168.5-146 chr5 29901444 29901936 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21130 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 134.5-96 chr2 27509609 27509835 + 0.75 NA intron (NM_001486, intron 16 of 18) L1ME4a|LINE|L1 12883 NM_001486 2646 Hs.89771 NM_001486 ENSG00000084734 GCKR FGQTL5|GKRP glucokinase regulator protein-coding 203.75-120 chrX 91738421 91738940 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -96781 NM_032968 27328 Hs.655673 NM_014522 ENSG00000102290 PCDH11X PCDH-X|PCDH-Y|PCDH11|PCDH11Y|PCDH22|PCDHX|PPP1R119 protocadherin 11 X-linked protein-coding 121.5-155 chr20 46348732 46348934 + 0.75 NA TTS (NM_001281458) TTS (NM_001281458) 15592 NM_173179 51006 Hs.593344 NM_015945 ENSG00000080189 SLC35C2 BA394O2.1|C20orf5|CGI-15|OVCOV1 solute carrier family 35 member C2 protein-coding 122.75-136 chr3 133063326 133063669 + 0.75 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 25209 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 115.5-238 chr8 10388960 10389294 + 0.75 NA intron (NM_001199729, intron 6 of 6) MER85|DNA|PiggyBac -85438 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 223.75-47 chr2 107244697 107245171 + 0.75 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 104591 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 229.25-42 chr2 65573199 65573711 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -140856 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 146.75-21 chr10 110400757 110400981 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -95949 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 157.5-100 chr2 61358085 61358491 + 0.75 NA intron (NM_014709, intron 10 of 79) L1MB4|LINE|L1 59089 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 145.75-24 chr11 110074703 110075157 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -18462 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 128.25-146 chr4 64532910 64533134 + 0.75 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 -123562 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 199-12 chr10 56058203 56058520 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 302898 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 187.25-68 chr22 43373067 43373446 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -27075 NR_146918 105373054 NR_146918 ENSG00000236117 LINC01639 - long intergenic non-protein coding RNA 1639 ncRNA 141.75-31 chr11 29027776 29028058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -550369 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 206.5-49 chr2 60995386 60995714 + 0.75 NA intron (NM_144709, intron 4 of 17) intron (NM_144709, intron 4 of 17) 21662 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 127-27 chr11 34861587 34861878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54398 NM_001166158 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 132.5-259 chrX 44263094 44263290 + 0.75 NA intron (NM_025184, intron 3 of 14) intron (NM_025184, intron 3 of 14) 80480 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 112.25-168 chr5 104933714 104933970 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -165632 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 221.25-43 chr2 179175403 179175869 + 0.75 NA intron (NM_178123, intron 4 of 17) intron (NM_178123, intron 4 of 17) 89196 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 126.5-259 chr8 144929317 144929630 + 0.75 NA TTS (NM_001029976) TTS (NM_001029976) 21407 NM_001029976 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 225.25-81 chr8 25154154 25154491 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -30367 NM_024940 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 151.25-179 chr7 94220516 94220766 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 171551 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-156 chr4 150467214 150467549 + 0.75 NA intron (NM_001367550, intron 44 of 56) L1MC5|LINE|L1 -111708 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 168.75-109 chr5 45690267 45690554 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 1 of 7) intron (NM_021072, intron 1 of 7) 5970 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 120-143 chr5 30603216 30603453 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -590352 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 156.5-81 chr2 81392183 81392526 + 0.75 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 74592 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 116.75-29 chr11 3635486 3635742 + 0.75 NA intron (NR_002720, intron 5 of 6) intron (NR_002720, intron 5 of 6) 6378 NM_053017 116969 Hs.125680 NM_053017 ENSG00000167311 ART5 ARTC5 ADP-ribosyltransferase 5 protein-coding 148.75-58 chr15 27094469 27094744 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) 66713 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 119.75-97 chr2 40995096 40995304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -482765 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 187.5-56 chr14 46735319 46735620 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -83688 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 157.5-106 chr2 100383627 100383872 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33919 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 153.5-106 chr2 152235493 152235783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59875 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 119.5-144 chr22 45239579 45239752 + 0.75 NA intron (NM_001009880, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 1104 NM_001009880 23313 Hs.592207 NM_015264 ENSG00000100364 KIAA0930 C22orf9|LSC3 KIAA0930 protein-coding 188.5-94 chr22 41586308 41586661 + 0.75 NA intron (NM_002676, intron 1 of 7) AluSx3|SINE|Alu 3356 NM_002676 5372 Hs.75835 NM_002676 ENSG00000100417 PMM1 PMM 1|PMMH-22|Sec53 phosphomannomutase 1 protein-coding 114.5-265 chr8 120548291 120548549 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 5 of 6) intron (NM_021021, intron 5 of 6) 103001 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 160.25-82 chr20 44576194 44576481 + 0.75 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -6242 NM_001281445 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 126-54 chr14 61107299 61107611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125765 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 133.75 chr1 10591384 10591609 + 0.75 NA intron (NM_004565, intron 3 of 8) L1ME4b|LINE|L1 116546 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 124.75-172 chr5 86871920 86872225 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125254 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 130-19 chr10 118375078 118375431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18146 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 191.75-86 chr3 161269031 161269447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 47949 NM_015938 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 118.25-54 chr13 32213705 32213907 + 0.75 NA intron (NM_023037, intron 35 of 60) intron (NM_023037, intron 35 of 60) 98148 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 183.75-117 chr7 30398517 30398815 + 0.75 NA intron (NR_108081, intron 1 of 2) intron (NR_108081, intron 1 of 2) 7781 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 156.75-142 chr6 40838655 40839033 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 184436 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 217-51 chr3 72347681 72348237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98664 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 165.75-49 chr14 34238258 34238564 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 223829 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 128-5 chr1 80769125 80769314 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 127932 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 158-20 chr10 20750132 20750452 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 147310 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 178.25-45 chr16 72907777 72908152 + 0.75 NA intron (NM_001164766, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 140164 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 117.25-217 chr8 128544874 128545164 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 19660 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 165-28 chr11 127026928 127027267 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 24187 NR_040078 283165 Hs.730461 NM_173579 ENSG00000218109 KIRREL3-AS3 NCRNA00288|PRR10 KIRREL3 antisense RNA 3 ncRNA 190-51 chr4 70980658 70980973 + 0.75 NA intron (NM_173468, intron 5 of 5) MER115|DNA|hAT-Tip100 -12834 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 119.25-29 chr10 105789729 105789997 + 0.75 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 30470 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 158-27 chr10 113407792 113408134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142868 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 142.75-201 chr9 98952479 98952696 + 0.75 NA intron (NM_001855, intron 2 of 41) FLAM_C|SINE|Alu 8680 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 115.25-218 chr8 137328649 137328862 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 84833 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 143-18 chr11 36199316 36199619 + 0.75 NA intron (NM_001304264, intron 4 of 5) intron (NM_001304264, intron 4 of 5) 89957 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 162-115 chr8 80002633 80002959 + 0.75 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 27463 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 142.25-156 chr7 34015555 34015874 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 110175 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 128.25-59 chr15 92815047 92815282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19680 NR_033769 728619 Hs.684129 NR_033769 ASB9P1 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 pseudo 126-14 chr10 4399994 4400245 + 0.75 NA intron (NR_108054, intron 2 of 2) intron (NR_108054, intron 2 of 2) -6350 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 117-73 chr17 67237097 67237285 + 0.75 NA intron (NM_001330447, intron 3 of 32) AluSz6|SINE|Alu -7585 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 127-132 chr5 26334809 26335117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 703623 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 151.75-165 chr9 101419267 101419669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16306 NM_000035 229 Hs.530274 NM_000035 ENSG00000136872 ALDOB ALDB|ALDO2 aldolase, fructose-bisphosphate B protein-coding 169.75-118 chr4 107195156 107195617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -159073 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 203.5-69 chr2 62570757 62571158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64762 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 131-131 chr4 136467549 136467797 + 0.75 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -553993 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 136.5-177 chr5 38558947 38559200 + 0.75 NA non-coding (NR_103553, exon 1 of 3) non-coding (NR_103553, exon 1 of 3) -1512 NR_037423 100500824 NR_037423 ENSG00000265304 MIR3650 - microRNA 3650 ncRNA 145.25-75 chr2 126794662 126794870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104124 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 267-19 chr16 48939122 48939586 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -329174 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 197.5-37 chr14 29057350 29057719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271747 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 195 chr1 45807565 45807868 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 1 of 29) AluSx1|SINE|Alu 4103 NM_001319245 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 115.5-61 chr14 50827788 50828059 + 0.75 NA intron (NM_016350, intron 2 of 28) intron (NM_016350, intron 2 of 28) 3198 NM_016350 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 215.5-99 chr7 74191091 74191663 + 0.75 NA TTS (NR_030321) TTS (NR_030321) 179 NR_030321 693175 NR_030321 ENSG00000207741 MIR590 MIRN590|hsa-mir-590|mir-590 microRNA 590 ncRNA 253.5-60 chr5 55730215 55730752 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -7534 NM_001142549 54514 Hs.223581 NM_019039 ENSG00000152670 DDX4 VASA DEAD-box helicase 4 protein-coding 170-54 chr20 46473521 46473786 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8361 NR_026640 7686 Hs.717103 NR_026640 ENSG00000225849 MKRN7P MKRNP3|ZNF127L5|dJ981L23.2 makorin ring finger protein 7, pseudogene pseudo 150.5-195 chr6 159314008 159314369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69343 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 239.75-3 chr1 106296006 106296415 + 0.75 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -267957 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 220.5-92 chr4 115299281 115299653 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -185847 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 117-48 chr13 92366233 92366434 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -14126 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 116-175 chr8 126684615 126684805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126232 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 131-113 chr21 32060272 32060553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25883 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 177.25-50 chr15 87793110 87793465 + 0.75 NA Intergenic (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 152981 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 190-67 chr6 160285412 160285831 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -26800 NM_003058 6582 Hs.436385 NM_003058 ENSG00000112499 SLC22A2 OCT2 solute carrier family 22 member 2 protein-coding 171-8 chr1 239070953 239071197 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -315493 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 113.75-156 chr5 83673169 83673376 + 0.75 NA intron (NM_001884, intron 2 of 4) intron (NM_001884, intron 2 of 4) 47583 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 177.75-125 chr6 57111317 57111617 + 0.75 NA intron (NM_015555, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu 21279 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 150-62 chr17 69008862 69009178 + 0.75 NA intron (NM_080283, intron 23 of 38) intron (NM_080283, intron 23 of 38) 4306 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 123.5-65 chr15 79690072 79690409 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 206757 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 196.25-31 chr13 98479988 98480308 + 0.75 NA intron (NM_001286649, intron 2 of 9) intron (NM_001286649, intron 2 of 9) 41977 NM_003576 8428 Hs.508514 NM_003576 ENSG00000102572 STK24 HEL-S-95|MST3|MST3B|STE20|STK3 serine/threonine kinase 24 protein-coding 171.5-40 chr12 112925959 112926418 + 0.75 NA intron (NM_001320151, intron 5 of 5) AluJr|SINE|Alu -12286 NM_006187 4940 Hs.528634 NM_006187 ENSG00000111331 OAS3 p100|p100OAS 2'-5'-oligoadenylate synthetase 3 protein-coding 199-25 chr15 27017926 27018261 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) intron (NM_001270873, intron 2 of 5) 46912 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 308.75-31 chr5 112175756 112176290 + 0.75 NA intron (NM_001347887, intron 18 of 23) intron (NM_001347887, intron 18 of 23) 14538 NR_002922 654322 Hs.689709 NR_002922 ENSG00000238363 SNORA13 ACA13 small nucleolar RNA, H/ACA box 13 snoRNA 168.5-163 chr6 156830825 156831188 + 0.75 NA intron (NM_017519, intron 2 of 18) intron (NM_017519, intron 2 of 18) -51275 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 131.25-209 chr8 132788860 132789167 + 0.75 NA intron (NM_198513, intron 2 of 7) intron (NM_198513, intron 2 of 7) 13625 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 159.25-9 chr1 195586014 195586489 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 502464 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 156.25-131 chr6 67589374 67589736 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -465796 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 208-71 chr6 75460513 75461063 + 0.75 NA intron (NR_110608, intron 1 of 1) intron (NR_110608, intron 1 of 1) 32381 NR_039670 100616389 NR_039670 ENSG00000263533 MIR4463 - microRNA 4463 ncRNA 171.25-159 chr9 108821764 108822065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34072 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 212.75-14 chr11 10606360 10606874 + 0.75 NA intron (NM_001100163, intron 12 of 20) intron (NM_001100163, intron 12 of 20) -37952 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 161.25-5 chr1 92245371 92245673 + 0.75 NA TTS (NM_001319683) TTS (NM_001319683) 27607 NM_001012425 388649 Hs.558823 NM_001012425 ENSG00000203910 C1orf146 - chromosome 1 open reading frame 146 protein-coding 149.25-140 chr5 27055666 27056044 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -17269 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 239-20 chr15 39686415 39686836 + 0.75 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 96216 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 129.5-210 chr7 34420215 34420445 + 0.75 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -237888 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 123-26 chr10 98820752 98820929 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 103728 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 213.75-15 chr10 83945994 83946488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193268 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 292.75-7 chr11 100556123 100556683 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130885 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 187.75-120 chr8 143200884 143201325 + 0.75 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -12114 NM_178172 338328 Hs.426410 NM_178172 ENSG00000277494 GPIHBP1 GPI-HBP1|HYPL1D glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1 protein-coding 148.5-169 chr4 88119814 88120193 + 0.75 NA intron (NM_001257386, intron 6 of 15) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 38636 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 117.25-39 chr11 77603728 77603952 + 0.75 NA intron (NM_173039, intron 2 of 2) intron (NM_173039, intron 2 of 2) 13887 NM_173039 282679 Hs.503345 NM_173039 ENSG00000178301 AQP11 AQPX1 aquaporin 11 protein-coding 140.25-49 chr14 82887013 82887445 + 0.75 NA Intergenic (ATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 244597 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 171.75-80 chr2 121424551 121424782 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 22 of 38) intron (NM_015282, intron 22 of 38) -106214 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 161.75-104 chr5 45220016 45220414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 411268 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 178.5-148 chr5 152420581 152421060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15541 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 112.5-148 chr20 40699770 40700007 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10652 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 137-14 chr1 186145139 186145407 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 91 of 106) intron (NM_031935, intron 91 of 106) -151000 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 164-31 chr14 32528858 32529189 + 0.75 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) L1MC|LINE|L1 199725 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 131-85 chr2 45615043 45615289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3899 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 141-25 chr10 75031980 75032277 + 0.75 NA 3' UTR (NM_012330, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_012330, exon 18 of 18) 10395 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 125.5-30 chr10 70219502 70219735 + 0.75 NA intron (NM_021129, intron 2 of 10) intron (NM_021129, intron 2 of 10) 13811 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 112.25-206 chr7 108632660 108632877 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62894 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 162.75-82 chr20 11410438 11410899 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -137285 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 251-49 chr7 5239354 5239893 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 25354 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 128-103 chr3 83362047 83362241 + 0.75 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 1376002 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 126.5-52 chr12 90101656 90101882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 154076 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 136.75-36 chr10 110099617 110099842 + 0.75 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -91348 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 196.25-61 chr2 68875787 68876165 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4579 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 128.5-33 chr10 95404295 95404596 + 0.75 NA intron (NM_001034955, intron 9 of 30) intron (NM_001034955, intron 9 of 30) 36735 NM_001290297 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 169.25-66 chr2 225908603 225908913 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -234036 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 194.75-62 chr21 24281829 24282256 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 39335 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 154.25-125 chr5 28820847 28821073 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -105910 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 160.25-119 chr5 5356050 5356349 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66478 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 205.25-25 chr14 64323432 64323822 + 0.75 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) intron (NM_001291712, intron 2 of 13) 14923 NM_001291723 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 118-172 chr7 36294662 36294894 + 0.75 NA intron (NM_030636, intron 6 of 7) L1M5|LINE|L1 72462 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 142-78 chr2 33581628 33581827 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12297 NR_146505 105374454 NR_146505 LOC105374454 - uncharacterized LOC105374454 ncRNA 168.5-40 chr11 87830734 87831083 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -111497 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 137.75-39 chr11 108647587 108647916 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -17318 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 114.5-55 chr11 91570898 91571105 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -654033 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 112.25-7 chr1 94363677 94363932 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -54573 NM_001122674 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 232.5-54 chr2 149882036 149882509 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23081 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 114.5-37 chr10 58762530 58762825 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) intron (NM_001080512, intron 3 of 20) 47662 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 124.25-79 chr17 51718384 51718747 + 0.75 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) MER21B|LTR|ERVL 283138 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 134.25-180 chr7 81587844 81588140 + 0.75 NA intron (NR_126026, intron 5 of 8) intron (NR_126026, intron 5 of 8) -26173 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 200.75-31 chr15 26892299 26892642 + 0.75 NA intron (NM_001165037, intron 6 of 10) intron (NM_001165037, intron 6 of 10) 25344 NM_001165037 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 156.75-73 chr18 2494274 2494611 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 77063 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 271-16 chr16 71900675 71901386 + 0.75 NA intron (NM_001270979, intron 1 of 5) intron (NM_001270979, intron 1 of 5) 5499 NM_001270977 9798 Hs.232194 NM_014761 ENSG00000182149 IST1 CHMP8|OLC1 IST1 factor associated with ESCRT-III protein-coding 179.5-51 chr13 28509614 28509997 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14677 NM_001159920 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 226.25-66 chr7 26596024 26596408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41655 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 142.25-44 chr12 58364894 58365200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -226655 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 173-118 chr6 52372745 52373116 + 0.75 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 10779 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 119-164 chr6 75965032 75965199 + 0.75 NA intron (NM_001563, intron 12 of 16) L1MD1|LINE|L1 107547 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 140.25-3 chr1 43193275 43193522 + 0.75 NA intron (NM_001195831, intron 6 of 23) L1MB7|LINE|L1 -20828 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 139.75-177 chr8 122442529 122442867 + 0.75 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 125946 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 145.75-88 chr2 179987252 179987613 + 0.75 NA intron (NM_020943, intron 3 of 19) intron (NM_020943, intron 3 of 19) 19865 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 141.25-54 chr15 49995691 49995953 + 0.75 NA intron (NR_073597, intron 9 of 26) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 117557 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 215-40 chr2 45380348 45380985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125725 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 113.25-138 chr5 82890421 82890608 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -30678 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 131.25-207 chr8 131661862 131662210 + 0.75 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? -242057 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 198.25-43 chr17 62889571 62889994 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -54433 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 141-163 chr9 70426369 70426630 + 0.75 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -11842 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 162.75-103 chr4 33657592 33657934 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 382130 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 232.75-7 chr10 43180951 43181524 + 0.75 NA intron (NM_018590, intron 7 of 7) L1MCa|LINE|L1 26340 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 116-145 chr6 135464440 135464704 + 0.75 NA intron (NM_017651, intron 6 of 27) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 33168 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 201.25-78 chr6 16342042 16342483 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) intron (NM_000332, intron 7 of 8) 103675 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 118.75-118 chr21 27608903 27609211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113322 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 166.5-183 chr6 142930050 142930476 + 0.75 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 14913 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 170.25-72 chr2 137563464 137563911 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 16 of 27) intron (NM_001316349, intron 16 of 27) 364245 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 120-30 chr12 32340149 32340408 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001363603, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001363603, exon 8 of 8) -59280 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 189.5-118 chr6 35366125 35366548 + 0.75 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) intron (NM_001171819, intron 2 of 6) 23778 NM_177435 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 138-121 chr4 148640167 148640430 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -195600 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 152.25-77 chr2 12683875 12684101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32884 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 232.5-55 chr2 151718449 151718847 + 0.75 NA intron (NM_001271208, intron 9 of 182) intron (NM_001271208, intron 9 of 182) 15828 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 165.25-105 chr4 75613381 75613813 + 0.75 NA intron (NM_003948, intron 3 of 11) intron (NM_003948, intron 3 of 11) 16931 NM_001330724 8999 Hs.591698 NM_003948 ENSG00000138769 CDKL2 KKIAMRE|P56 cyclin dependent kinase like 2 protein-coding 200.75-118 chrX 153753647 153753960 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -10393 NM_001163257 5365 Hs.632833 NM_005393 ENSG00000198753 PLXNB3 PLEXB3|PLEXR|PLXN6 plexin B3 protein-coding 141-15 chr1 229827494 229827852 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 58145 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 115.75-142 chr3 79181820 79182092 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -162497 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 117-159 chr6 92266565 92266786 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -576247 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 256.25-45 chr7 38326746 38327192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14608 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 134.75-129 chr20 55745600 55745813 + 0.75 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 259813 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 148.25-115 chr4 135260510 135260767 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137079 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 144.75-123 chr4 88204541 88204950 + 0.75 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) intron (NM_001257386, intron 1 of 15) 26881 NM_001257386 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 147-13 chr1 183476959 183477287 + 0.75 NA intron (NM_001174061, intron 1 of 21) intron (NM_001174061, intron 1 of 21) 4624 NM_001350222 9887 Hs.591463 NM_014837 ENSG00000116698 SMG7 C1orf16|EST1C|SGA56M SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 216-55 chr3 118734163 118734637 + 0.75 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 76433 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 146-29 chr12 77074827 77075181 + 0.75 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -9435 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 181.75-42 chr16 66095657 66096028 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -270849 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 165.5-109 chr3 45886375 45886707 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001256369) promoter-TSS (NM_001256369) -2 NM_031200 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 135.75-71 chr16 3868810 3869106 + 0.75 NA intron (NM_004380, intron 1 of 30) intron (NM_004380, intron 1 of 30) 11162 NM_001079846 1387 Hs.459759 NM_004380 ENSG00000005339 CREBBP CBP|KAT3A|MKHK1|RSTS|RSTS1 CREB binding protein protein-coding 118-182 chr8 70021232 70021457 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 49908 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 127.25-143 chr4 63704531 63704968 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 704701 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 118.25-50 chr12 77727469 77727734 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -103293 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 129.75-114 chr22 24867661 24867986 + 0.75 NA intron (NM_001098498, intron 10 of 23) MIRb|SINE|MIR 61602 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 157.25-53 chr16 75312704 75313163 + 0.75 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -44926 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 192.5-16 chr10 57573716 57574010 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -269304 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 206.75-13 chr12 7281438 7281740 + 0.75 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -22743 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 192.25-75 chr3 120061425 120061788 + 0.75 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 23042 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 177.75-62 chr2 28511279 28511603 + 0.75 NA intron (NM_001170585, intron 1 of 56) L1MEg|LINE|L1 15370 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 177-104 chrX 37759937 37760381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19858 NM_000397 1536 Hs.292356 NM_000397 ENSG00000165168 CYBB AMCBX2|CGD|GP91-1|GP91-PHOX|GP91PHOX|IMD34|NOX2|p91-PHOX cytochrome b-245 beta chain protein-coding 174.25-6 chr1 94541818 94542320 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001178096) promoter-TSS (NM_001178096) -212 NM_001178096 2152 Hs.62192 NM_001993 ENSG00000117525 F3 CD142|TF|TFA coagulation factor III, tissue factor protein-coding 121.25-167 chr5 119524213 119524504 + 0.75 NA intron (NM_001199291, intron 18 of 24) intron (NM_001199291, intron 18 of 24) 71861 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 149.25-43 chr14 30061780 30062110 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -134098 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 178.75-101 chr7 138651528 138651845 + 0.75 NA intron (NM_174959, intron 3 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 12538 NM_174959 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 124.25-186 chr7 58033169 58033357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 583086 NM_001159279 441234 Hs.533121 NM_001159279 ENSG00000182111 ZNF716 - zinc finger protein 716 protein-coding 142.75-163 chr5 146446564 146446772 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001040006) promoter-TSS (NM_001040006) -665 NM_001040006 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 239.75-37 chr20 9075968 9076521 + 0.75 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) AluSx1|SINE|Alu 7190 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 135.75-126 chr22 26975973 26976248 + 0.75 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 72818 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 168-68 chr2 113231080 113231592 + 0.75 NA intron (NM_013953, intron 7 of 9) intron (NM_013953, intron 7 of 9) -4191 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 172.5-92 chr2 42259232 42259609 + 0.75 NA intron (NM_001145076, intron 3 of 21) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -89189 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 184-49 chr21 32571576 32571883 + 0.75 NA intron (NR_146639, intron 10 of 11) AluSx|SINE|Alu 13794 NM_144659 140290 Hs.728804 NM_018277 ENSG00000242220 TCP10L C21orf77|PRED77|TCP10A-1|TCP10A-2 t-complex 10 like protein-coding 160-37 chr15 55178587 55178923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18186 NM_016304 51187 Hs.274772 NM_016304 ENSG00000137876 RSL24D1 C15orf15|HRP-L30-iso|L30|RLP24|RPL24|RPL24L|TVAS3 ribosomal L24 domain containing 1 protein-coding 209.25-75 chr3 28168675 28169006 + 0.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -72779 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 267.75-55 chr8 39949983 39950369 + 0.75 NA intron (NM_194294, intron 2 of 10) (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15221 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 192.75-45 chr17 72653466 72653795 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) AluSx1|SINE|Alu -13158 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 133.25-205 chr7 90760731 90761071 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 3 of 13) intron (NM_012395, intron 3 of 13) 51085 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 128.5-186 chr6 42140239 42140559 + 0.75 NA intron (NM_001164446, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 2221 NM_001164446 647024 Hs.444277 NM_001164446 ENSG00000188112 C6orf132 bA7K24.2 chromosome 6 open reading frame 132 protein-coding 244-49 chr6 69916726 69917183 + 0.75 NA intron (NM_001858, intron 4 of 50) MIR3|SINE|MIR 50398 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 116.75-214 chr9 128081761 128081945 + 0.75 NA intron (NM_001006641, intron 1 of 9) AluJr|SINE|Alu -9611 NM_001265614 114789 Hs.5476 NM_052901 ENSG00000148339 SLC25A25 MCSC|PCSCL|SCAMC-2 solute carrier family 25 member 25 protein-coding 177.5-122 chr3 185175715 185176064 + 0.75 NA intron (NR_038990, intron 1 of 6) intron (NR_038990, intron 1 of 6) 12988 NR_038990 339926 Hs.567848 NR_038990 ENSG00000223358 EHHADH-AS1 - EHHADH antisense RNA 1 ncRNA 243.75-57 chr3 117548814 117549211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141913 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 132.5-64 chr14 24678935 24679372 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44963 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 182.25-55 chr18 66350045 66350376 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 253880 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 126.5-229 chr7 95988537 95988861 + 0.75 NA intron (NM_004411, intron 9 of 16) intron (NM_004411, intron 9 of 16) 216193 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 229.75-55 chr4 110614554 110614910 + 0.75 NA intron (NR_147204, intron 1 of 3) intron (NR_147204, intron 1 of 3) 726 NR_147203 110231149 Hs.436030 NR_147203 ENSG00000250103 PANCR - PITX2 adjacent non-coding RNA ncRNA 182.75-69 chr2 143910303 143910781 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -26525 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 173.75-40 chr11 109650358 109650680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 228329 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 157.75-55 chr15 76214058 76214307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32696 NR_120360 101929439 Hs.631721 NR_120360 ENSG00000259422 LOC101929439 - uncharacterized LOC101929439 ncRNA 121.25-43 chr12 43565138 43565396 + 0.75 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -13064 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 161.25-29 chr11 110315695 110315994 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -19132 NM_001260492 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 201.25-65 chr3 89223957 89224420 + 0.75 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 116567 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 127.5-212 chr6 63793998 63794240 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 37 of 43) MIRb|SINE|MIR -12717 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 157.5-51 chr14 29211385 29211639 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -425725 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 193.5-35 chr12 85918787 85919420 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 44808 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 141.5-149 chr3 141871172 141871473 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5321 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 156-93 chr20 47608087 47608354 + 0.75 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) AluSq2|SINE|Alu 106333 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 155.75-137 chr6 38157902 38158185 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -323553 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-123 chr22 35330261 35330545 + 0.75 NA exon (NM_005488, exon 8 of 15) exon (NM_005488, exon 8 of 15) -5237 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 216.75-39 chr2 75753817 75754218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43102 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 130-96 chr21 44726900 44727136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15446 NM_001272037 54084 Hs.660703 NM_144991 ENSG00000175894 TSPEAR C21orf29|DFNB98|ECTD14|TSP-EAR thrombospondin type laminin G domain and EAR repeats protein-coding 159.5-65 chr16 9026959 9027401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63274 NM_003470 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 228.5-77 chr4 42500292 42500706 + 0.75 NA intron (NM_001105529, intron 23 of 35) intron (NM_001105529, intron 23 of 35) 103011 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 195-68 chr4 26013835 26014287 + 0.75 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 99869 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 120-59 chr16 30151673 30151918 + 0.75 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -28486 NM_001109891 5595 Hs.861 NM_002746 ENSG00000102882 MAPK3 ERK-1|ERK1|ERT2|HS44KDAP|HUMKER1A|P44ERK1|P44MAPK|PRKM3|p44-ERK1|p44-MAPK mitogen-activated protein kinase 3 protein-coding 152.25-71 chr18 29495682 29495992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -803073 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 112.25-73 chr17 31506624 31506810 + 0.75 NA intron (NM_001346748, intron 1 of 12) L1MA6|LINE|L1 18609 NM_001303542 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 153.75 chr1 37756379 37756687 + 0.75 NA intron (NM_001099439, intron 3 of 16) L3|LINE|CR1 8587 NM_001099439 284656 Hs.129435 NM_173641 ENSG00000183317 EPHA10 - EPH receptor A10 protein-coding 122.75-82 chr19 29268132 29268503 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55166 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 218.75-17 chr12 5269222 5269617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26268 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 158.25-12 chr10 51001632 51001934 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 10895 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 165.25-104 chr4 63298658 63298964 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 1110639 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 123.25-198 chr8 49581642 49581850 + 0.75 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -69566 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 181-45 chr18 58572642 58573002 + 0.75 NA intron (NM_052947, intron 4 of 12) L1MD2|LINE|L1 -27798 NR_132963 106635543 NR_132963 SNORA108 - small nucleolar RNA, H/ACA box 108 snoRNA 127-67 chr15 66314375 66314708 + 0.75 NA intron (NM_001323944, intron 6 of 16) intron (NM_001323944, intron 6 of 16) 20726 NM_001323943 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 117.25-21 chr1 229463045 229463221 + 0.75 NA intron (NM_018230, intron 19 of 25) AluJo|SINE|Alu -29037 NM_001100 58 Hs.1288 NM_001100 ENSG00000143632 ACTA1 ACTA|ASMA|CFTD|CFTD1|CFTDM|MPFD|NEM1|NEM2|NEM3|SHPM actin alpha 1, skeletal muscle protein-coding 163-20 chr11 58418708 58419059 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 4430 NM_001005566 390190 Hs.553753 NM_001005566 ENSG00000172365 OR5B2 OR11-240|OST073 olfactory receptor family 5 subfamily B member 2 protein-coding 113.5-10 chr1 113337825 113337979 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -52613 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 202.25-97 chr9 100697749 100698044 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 119817 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 124.25-131 chr3 50802608 50802911 + 0.75 NA intron (NM_004947, intron 2 of 52) L1M2c|LINE|L1 127679 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 229.25-32 chr17 20292409 20292874 + 0.75 NA intron (NM_001033553, intron 12 of 14) intron (NM_001033553, intron 12 of 14) -28533 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 114-149 chr7 15443637 15443861 + 0.75 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) MER58B|DNA|hAT-Charlie 118266 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 178.25-8 chr1 147520318 147520928 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -2748 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 154.75-151 chr8 142728368 142728828 + 0.75 NA intron (NM_016647, intron 1 of 1) intron (NM_016647, intron 1 of 1) 1375 NM_001363000 51337 Hs.368402 NM_016647 ENSG00000130193 THEM6 C8orf55|DSCD75 thioesterase superfamily member 6 protein-coding 184-30 chr16 51779493 51779829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17142 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 145.5-71 chr15 69862605 69862834 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27485 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 155-53 chr18 5653656 5654000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24837 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 158-23 chr10 54998827 54999190 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) LOR1-int|LTR|ERV1 -197717 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 454.5-7 chrX 74626156 74627217 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12062 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 234-28 chr2 190272593 190272945 + 0.75 NA intron (NM_198047, intron 6 of 12) intron (NM_198047, intron 6 of 12) 47057 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 243-40 chr20 24773738 24774118 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175341 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 176.25-36 chr13 26324734 26325044 + 0.75 NA intron (NM_001318368, intron 1 of 12) intron (NM_001318368, intron 1 of 12) 70760 NM_001346501 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 156.75-7 chr1 99829883 99830170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20335 NM_000642 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 184-46 chr2 179844833 179845391 + 0.75 NA intron (NM_001352808, intron 1 of 10) intron (NM_001352808, intron 1 of 10) 15796 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 132-157 chr7 9586140 9586399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48001 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 166.5-17 chr1 217366603 217367024 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -229111 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 115-138 chr5 105388555 105388835 + 0.75 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL 289221 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 175.5-26 chr10 120318653 120319128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36333 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 120-186 chr8 79639041 79639256 + 0.75 NA intron (NM_007029, intron 2 of 4) intron (NM_007029, intron 2 of 4) 28031 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 201.75-37 chr15 69639931 69640327 + 0.75 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 47929 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 126.5-91 chr17 17029430 17029798 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12843 NM_001364716 23164 Hs.462341 NM_015134 ENSG00000133030 MPRIP M-RIP|MRIP|RHOIP3|RIP3|p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein protein-coding 160.5-62 chr15 61324992 61325249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95818 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 138.75-111 chr22 31695494 31695829 + 0.75 NA intron (NM_173566, intron 7 of 8) LTR41B|LTR|ERVL -33097 NM_001326421 23761 Hs.420559 NM_014338 ENSG00000241878 PISD DJ858B16|PSD|PSDC|PSSC|dJ858B16.2 phosphatidylserine decarboxylase protein-coding 181-81 chr4 138642879 138643343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 333400 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 138.25-176 chr9 24996952 24997286 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -451222 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 207.25-92 chr7 131435606 131436005 + 0.75 NA intron (NM_001321316, intron 9 of 17) L1M5|LINE|L1 107929 NM_001321316 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 263.5-16 chr14 59578197 59578695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1634 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 172-107 chr8 103773819 103774130 + 0.75 NA intron (NM_001348497, intron 3 of 22) AluSz|SINE|Alu -45246 NM_001348506 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 136-63 chr19 1882425 1882700 + 0.75 NA intron (NM_031213, intron 1 of 5) MIR3|SINE|MIR 2934 NM_031213 81926 Hs.465542 NM_031213 ENSG00000129968 ABHD17A C19orf27|FAM108A1 abhydrolase domain containing 17A protein-coding 161.5-92 chr2 31511545 31511842 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 69245 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 200-66 chr4 57026809 57027145 + 0.75 NA intron (NM_001303269, intron 24 of 25) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 48081 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 205.5-10 chr10 11317153 11317530 + 0.75 NA non-coding (NR_126062, exon 3 of 3) non-coding (NR_126062, exon 3 of 3) 27333 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 162.25-34 chr12 42960170 42960461 + 0.75 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -195000 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 185-89 chr9 5734050 5734523 + 0.75 NA intron (NM_001206557, intron 7 of 24) AluSg|SINE|Alu 98831 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 150.75-143 chr4 97219021 97219445 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -147693 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 307.25-17 chr2 116847526 116848190 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -966833 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 132.75-156 chr5 122994234 122994498 + 0.75 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) intron (NM_014035, intron 3 of 6) 42359 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 122-62 chr15 37198429 37198708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -97257 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 137.75-166 chr5 126125630 126125882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53821 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 126.75-51 chr14 45162461 45162756 + 0.75 NA intron (NM_001308133, intron 8 of 21) MER5C|DNA|hAT-Charlie 26669 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 129.25-152 chr5 59333456 59333672 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 23406 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 151.75-157 chr8 139789773 139790259 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -86893 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 179-32 chr14 49117306 49117639 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 468908 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 135.5-134 chr3 80454948 80455162 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -309842 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 129.5-124 chr2 88143542 88143756 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -15587 NM_001443 2168 Hs.380135 NM_001443 ENSG00000163586 FABP1 FABPL|L-FABP fatty acid binding protein 1 protein-coding 136-166 chr9 27120750 27121063 + 0.75 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 11765 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 155.5-135 chr3 150954020 150954406 + 0.75 NA intron (NR_046380, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 -9977 NM_052995 7401 Hs.745448 NM_052995 ENSG00000163646 CLRN1 RP61|USH3|USH3A clarin 1 protein-coding 138.5-76 chr17 5608602 5608860 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24222 NM_033006 22861 Hs.652273 NM_014922 ENSG00000091592 NLRP1 AIADK|CARD7|CIDED|CLR17.1|DEFCAP|DEFCAP-L/S|MSPC|NAC|NALP1|PP1044|SLEV1|VAMAS1 NLR family pyrin domain containing 1 protein-coding 114-109 chr4 44955448 44955700 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -228940 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 160-105 chr8 43784650 43785025 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 492395 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 190.5-96 chr22 46147527 46147832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2847 NM_005036 5465 Hs.103110 NM_005036 ENSG00000186951 PPARA NR1C1|PPAR|PPARalpha|hPPAR peroxisome proliferator activated receptor alpha protein-coding 162-58 chr2 19768583 19768928 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -100099 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 189.25-115 chr8 16563403 16563761 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -370791 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 187 chr1 22111979 22112367 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30924 NM_030761 54361 Hs.25766 NM_030761 ENSG00000162552 WNT4 SERKAL|WNT-4 Wnt family member 4 protein-coding 170.75-29 chr14 29821990 29822305 + 0.75 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 104949 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 177-105 chrX 38141093 38141440 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79605 NM_006307 8406 Hs.15154 NM_006307 ENSG00000101955 SRPX DRS|ETX1|HEL-S-83p|SRPX1 sushi repeat containing protein X-linked protein-coding 137.75-71 chr15 42198666 42198945 + 0.75 NA TTS (NR_030357) TTS (NR_030357) 861 NR_030357 693212 NR_030357 ENSG00000207712 MIR627 MIRN627|hsa-mir-627|mir-627 microRNA 627 ncRNA 128.75-148 chr5 271303 271622 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_073609) promoter-TSS (NR_073609) 62 NR_104613 102467073 Hs.368328 NR_104613 HRAT5 - heart tissue-associated transcript 5 ncRNA 200.25-17 chr10 109301965 109302430 + 0.75 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 621049 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 129.75-42 chr11 106946198 106946520 + 0.75 NA intron (NM_001256424, intron 3 of 8) L1MEj|LINE|L1 72117 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 189.25-27 chr12 122154567 122154978 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -12947 NM_152759 254050 Hs.374856 NM_152759 ENSG00000158113 LRRC43 - leucine rich repeat containing 43 protein-coding 134.25-128 chr4 38417509 38417867 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 50774 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 119.5-101 chr17 58724519 58724764 + 0.75 NA intron (NM_058216, intron 7 of 8) intron (NM_058216, intron 7 of 8) -31213 NM_014906 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 226.25-59 chr5 57145107 57145414 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -28688 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 135.25-204 chr8 131862387 131862595 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -41602 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 191.75-63 chr2 54147487 54148159 + 0.75 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) AluJr4|SINE|Alu 24540 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 114.5-44 chr10 107572301 107572548 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -407718 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 129.5-100 chr18 46648632 46648877 + 0.75 NA intron (NM_144612, intron 2 of 39) intron (NM_144612, intron 2 of 39) 8279 NM_144612 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 157.25-41 chr14 59160643 59160925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27883 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 164.75-57 chr16 22016478 22016718 + 0.75 NA intron (NM_001164579, intron 1 of 2) intron (NM_001164579, intron 1 of 2) 8487 NM_001164579 730094 Hs.498890 NM_173501 ENSG00000185716 MOSMO ATTHOG|BC030336|C16orf52 modulator of smoothened protein-coding 146.75-26 chr11 77688127 77688347 + 0.75 NA intron (NM_016578, intron 9 of 15) AluSz|SINE|Alu -50431 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 140.5-119 chr2 142392419 142392675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -260846 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 188-95 chrX 147931271 147931717 + 0.75 NA intron (NR_033700, intron 7 of 14) intron (NR_033700, intron 7 of 14) 19543 NM_002024 2332 Hs.103183 NM_002024 ENSG00000102081 FMR1 FMRP|FRAXA|POF|POF1 fragile X mental retardation 1 protein-coding 220-27 chr18 8637822 8638263 + 0.75 NA intron (NM_001025300, intron 5 of 5) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 28597 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 149-140 chr9 74855195 74855532 + 0.75 NA intron (NM_017662, intron 3 of 38) intron (NM_017662, intron 3 of 38) 31984 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 172.5-26 chr10 32145143 32145555 + 0.75 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -88924 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 227.25-43 chr2 50099648 50100228 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) -125735 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 140.25-100 chr2 190845436 190845714 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35246 NM_001256310 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 139.25-60 chr15 88426677 88426955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40572 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 141-98 chr3 17391839 17392241 + 0.75 NA intron (NM_014744, intron 8 of 21) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 307980 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 176.75-131 chr9 217612 217904 + 0.75 NA intron (NM_203447, intron 1 of 47) MIRb|SINE|MIR -2008 NR_160804 157983 Hs.190877 NM_152569 ENSG00000183784 DOCK8-AS1 C9orf66 DOCK8 antisense RNA 1 ncRNA 136-94 chr21 27744414 27744779 + 0.75 NA intron (NR_024357, intron 2 of 3) LTR28|LTR|ERV1 22217 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 166.75-45 chr14 28512999 28513248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 252196 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-32 chr11 18329040 18329288 + 0.75 NA intron (NM_001142307, intron 2 of 15) intron (NM_001142307, intron 2 of 15) 6597 NM_005316 2965 Hs.577202 NM_005316 ENSG00000110768 GTF2H1 BTF2|P62|TFB1|TFIIH general transcription factor IIH subunit 1 protein-coding 150.75-32 chr11 17022366 17022624 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8081 NM_175058 144100 Hs.12332 NM_175058 ENSG00000166689 PLEKHA7 - pleckstrin homology domain containing A7 protein-coding 129.75-185 chr8 111925432 111925647 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 548900 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 232-12 chr13 111202070 111202403 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001320853) promoter-TSS (NM_001320853) -824 NM_001320853 8874 Hs.508738 NM_003899 ENSG00000102606 ARHGEF7 BETA-PIX|COOL-1|COOL1|Nbla10314|P50|P50BP|P85|P85COOL1|P85SPR|PAK3|PIXB Rho guanine nucleotide exchange factor 7 protein-coding 126.75-234 chr8 9230475 9230687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41582 NR_125431 101929128 NR_125431 ENSG00000248538 LOC101929128 - uncharacterized LOC101929128 ncRNA 142.75-137 chr4 6777075 6777364 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5508 NM_014743 9778 Hs.79276 NM_014743 ENSG00000170871 KIAA0232 - KIAA0232 protein-coding 121-149 chr4 164860788 164861154 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -16207 NM_001297550 100506013 Hs.105196 NM_001297550 ENSG00000248329 APELA ELA|Ende|tdl apelin receptor early endogenous ligand protein-coding 120.5-58 chr12 79197578 79197781 + 0.75 NA intron (NM_005639, intron 3 of 10) intron (NM_005639, intron 3 of 10) 151987 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 199.75-53 chr2 217268522 217268997 + 0.75 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? -13974 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-57 chr14 26483224 26483472 + 0.75 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 70082 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 162.5-83 chr2 105000586 105000854 + 0.75 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu -37349 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 119-32 chr11 121090922 121091118 + 0.75 NA TTS (NM_001130047) TTS (NM_001130047) -11646 NM_005422 7007 Hs.248162 NM_005422 ENSG00000109927 TECTA DFNA12|DFNA8|DFNB21 tectorin alpha protein-coding 279.75-46 chr5 159746571 159747064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 124567 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 232.75-27 chr16 21680571 21680974 + 0.75 NA intron (NM_144672, intron 5 of 28).2 AluSz6|SINE|Alu -3657 NM_001161683 146183 Hs.408336 NM_144672 ENSG00000155719 OTOA CT108|DFNB22 otoancorin protein-coding 141-33 chr11 94394798 94395097 + 0.75 NA intron (NM_001330345, intron 1 of 2) intron (NM_001330345, intron 1 of 2) 6472 NM_016540 10888 Hs.272385 NM_016540 ENSG00000123901 GPR83 GIR|GPR72 G protein-coupled receptor 83 protein-coding 134-68 chr16 29909275 29909677 + 0.75 NA intron (NM_178863, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 8988 NM_181718 253982 Hs.655761 NM_181718 ENSG00000174939 ASPHD1 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 protein-coding 158.5-78 chr17 31749228 31749483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109607 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 134.25-203 chr9 135040276 135040534 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35100 NM_006334 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 120.25-23 chr10 21195622 21195930 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21474 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 187.25-76 chr3 175676922 175677220 + 0.75 NA intron (NM_207015, intron 11 of 13) L1M6|LINE|L1 99262 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 121-60 chr14 59915566 59915745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4058 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 126.5-20 chr1 214546540 214546783 + 0.75 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 4941 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 200.5-12 chr1 168236649 168237012 + 0.75 NA intron (NM_199344, intron 6 of 7) intron (NM_199344, intron 6 of 7) 10600 NR_026844 84832 Hs.537067 NR_026844 ENSG00000214262 ANKRD36BP1 ANKRD26L1|ANKRD36BL1 ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1 pseudo 242-13 chr11 16567802 16568193 + 0.75 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -91609 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 128-24 chr11 35900832 35901034 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -43048 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 143.25-119 chr3 70990781 70990994 + 0.75 NA intron (NR_146142, intron 12 of 19) MIRb|SINE|MIR 74037 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 119.25-214 chr8 142352880 142353137 + 0.75 NA intron (NM_001366903, intron 2 of 9) intron (NM_001366903, intron 2 of 9) 50174 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 141.25-134 chr5 50935896 50936267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34106 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 113.75-53 chr13 92450242 92450476 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -39804 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 225-30 chr16 13939010 13939446 + 0.75 NA intron (NM_005236, intron 9 of 10) intron (NM_005236, intron 9 of 10) 19071 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 113.5-42 chr10 122467220 122467495 + 0.75 NA intron (NM_002775, intron 1 of 8) MIR3|SINE|MIR 5804 NM_002775 5654 Hs.501280 NM_002775 ENSG00000166033 HTRA1 ARMD7|CADASIL2|CARASIL|HtrA|L56|ORF480|PRSS11 HtrA serine peptidase 1 protein-coding 271-20 chr17 62830494 62830937 + 0.75 NA intron (NR_135634, intron 1 of 1) L1MC3|LINE|L1 22213 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 115.75-182 chr6 22925200 22925507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207429 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 190.75-15 chr11 30199455 30199952 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -31311 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 173.5-172 chr8 138900003 138900414 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) intron (NM_152888, intron 1 of 64) 13833 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 112.75-169 chr5 130380187 130380421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 475839 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 266-15 chr14 102835873 102836485 + 0.75 NA intron (NM_145725, intron 2 of 11) intron (NM_145725, intron 2 of 11) 58700 NM_145725 7187 Hs.510528 NM_003300 ENSG00000131323 TRAF3 CAP-1|CAP1|CD40bp|CRAF1|IIAE5|LAP1|RNF118 TNF receptor associated factor 3 protein-coding 172-86 chr4 177116922 177117296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -192765 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 112.75-4 chr1 48934740 48935022 + 0.75 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) intron (NM_001323575, intron 5 of 12) -157912 NM_001349795 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 128-127 chr5 112060626 112061048 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83905 NM_001142475 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 228-71 chr7 12751073 12751491 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63649 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 220.5-86 chr4 61395488 61395959 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 193551 NM_001371342 190.75-47 chr19 35026355 35026665 + 0.75 NA TTS (NM_020895) TTS (NM_020895) -3960 NM_001037 6324 Hs.436646 NM_001037 ENSG00000105711 SCN1B ATFB13|BRGDA5|EIEE52|GEFSP1 sodium voltage-gated channel beta subunit 1 protein-coding 144.25-182 chr7 21496344 21496596 + 0.75 NA intron (NM_003112, intron 5 of 5) MIR3|SINE|MIR 25412 NR_031594 100302122 NR_031594 ENSG00000221783 MIR1183 MIRN1183|hsa-mir-1183 microRNA 1183 ncRNA 189-20 chr10 86046253 86046681 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) MER66B|LTR|ERV1 218321 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 162-44 chr16 2445995 2446369 + 0.75 NA TTS (NR_106825) TTS (NR_106825) 790 NR_106825 102465459 NR_106825 ENSG00000283180 MIR6767 hsa-mir-6767 microRNA 6767 ncRNA 184.25-55 chr2 63926242 63926691 + 0.75 NA intron (NM_001005739, intron 12 of 22) intron (NM_001005739, intron 12 of 22) 84586 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 213-91 chr7 116397901 116398503 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -101536 NM_001206747 858 Hs.212332 NM_001233 ENSG00000105971 CAV2 CAV caveolin 2 protein-coding 122.5-200 chr6 110884277 110884521 + 0.75 NA intron (NM_001287216, intron 1 of 4) L1MD2|LINE|L1 9615 NR_109768 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 186.25-38 chr15 88257658 88258148 + 0.75 NA intron (NR_038229, intron 1 of 3) intron (NR_038229, intron 1 of 3) -1164 NM_002530 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 171-30 chr12 125378417 125378745 + 0.75 NA intron (NM_052907, intron 2 of 8) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 51965 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 112.25-46 chr12 81551958 81552277 + 0.75 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) intron (NM_001220474, intron 2 of 30) -39726 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 152-40 chr12 28368084 28368428 + 0.75 NA intron (NM_001330367, intron 7 of 11) L1MDa|LINE|L1 -177518 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 145.25-173 chr8 119302782 119303035 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -22263 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 225.25-92 chr9 128942738 128943094 + 0.75 NA TTS (NM_001100876) TTS (NM_001100876) -4783 NM_015354 23511 Hs.308340 NM_015354 ENSG00000095319 NUP188 KIAA0169|hNup188 nucleoporin 188 protein-coding 176.5-14 chr10 35715115 35715449 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -63020 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 121-93 chr19 29153447 29153654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 59601 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 140.5-132 chr20 32774858 32775174 + 0.75 NA intron (NM_175848, intron 1 of 21) AluSq2|SINE|Alu -4836 NM_175850 1789 Hs.643024 NM_006892 ENSG00000088305 DNMT3B ICF|ICF1|M.HsaIIIB DNA methyltransferase 3 beta protein-coding 143.25-72 chr17 72937231 72937608 + 0.75 NA intron (NM_139177, intron 5 of 9) AluSx|SINE|Alu 155269 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 176.75 chr1 22889942 22890253 + 0.75 NA intron (NM_004442, intron 6 of 15) intron (NM_004442, intron 6 of 15) -26871 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 130.5-249 chr8 137651101 137651426 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -237675 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 116-112 chr3 191054774 191054957 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -144376 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 173.75-88 chr2 118734327 118734760 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 113640 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 122.5-75 chr15 80108986 80109231 + 0.75 NA intron (NM_001242916, intron 2 of 6) intron (NM_001242916, intron 2 of 6) 10692 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 164.25-44 chr15 61508868 61509184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -220892 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 120.5-63 chr13 50158568 50158760 + 0.75 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) -13354 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 205.75-50 chr4 35552220 35552800 + 0.75 NA Intergenic MER66D|LTR|ERV1 691429 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 182.25-20 chr10 120392623 120392945 + 0.75 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -37561 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 132-180 chr8 124861550 124861961 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -39697 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 231-29 chr14 99043748 99044178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 228234 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 136.5-237 chr8 135281195 135281444 + 0.75 NA intron (NR_120396, intron 1 of 4) intron (NR_120396, intron 1 of 4) 47188 NR_120396 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 150.5-227 chr8 132014638 132014982 + 0.75 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 44572 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 134.5-14 chr1 200372001 200372283 + 0.75 NA intron (NR_040064, intron 2 of 4) intron (NR_040064, intron 2 of 4) 1650 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 116.5-252 chr8 115839928 115840266 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -171122 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 184.25-79 chr3 67417930 67418258 + 0.75 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) MIRb|SINE|MIR 192630 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 166-69 chr2 227018112 227018524 + 0.75 NA intron (NM_000092, intron 44 of 47) intron (NM_000092, intron 44 of 47) 146241 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 151-57 chr2 48035747 48036162 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -130161 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 189.25-53 chr2 12257185 12257580 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 58252 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 198.25-63 chr2 232500050 232500567 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12474 NM_004826 9427 Hs.26880 NM_004826 ENSG00000171551 ECEL1 DA5D|DINE|ECEX|XCE endothelin converting enzyme like 1 protein-coding 158-58 chr17 43466172 43466433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17563 NM_001322216 1659 Hs.463105 NM_004941 ENSG00000067596 DHX8 DDX8|Dhr2|HRH1|PRP22|PRPF22 DEAH-box helicase 8 protein-coding 156.75-118 chr3 178120654 178121088 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -298330 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 154.25-40 chr13 74683049 74683282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130322 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 120.75-6 chr1 116333771 116334015 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39351 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 164.75-61 chr17 30336851 30337135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2936 NM_001319942 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 112.75-176 chr6 51111480 51111804 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292771 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 163.5-215 chr9 16332105 16332405 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -55942 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 174.75-125 chr8 34243150 34243615 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -540539 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 220.25-43 chr21 37283529 37283927 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -15620 NM_001331022 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 179.75-53 chr2 18021874 18022347 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 143443 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 154.25-172 chr8 124844333 124844585 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -22401 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 151.75-96 chr3 182373165 182373475 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113042 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 138-144 chr6 123406996 123407238 + 0.75 NA intron (NM_001251987, intron 12 of 20) LTR78|LTR|ERV1 -32487 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 178-96 chr7 42418811 42419125 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -181759 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 118.75-149 chr5 41590015 41590247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79530 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 186.75-94 chr5 161411311 161411712 + 0.75 NA intron (NM_000813, intron 5 of 9) intron (NM_000813, intron 5 of 9) 136613 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 156-65 chr18 2229239 2229600 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 342086 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 225.5-31 chr13 76656808 76657175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 229414 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 178.5-155 chr6 54477192 54477521 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 168915 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 179.75-59 chr2 69623174 69623576 + 0.75 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) L2|LINE|L2 20364 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 159.25-38 chr14 56238063 56238485 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 119863 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 114.5-244 chr7 86030587 86030753 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 609548 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 172-14 chr10 63420052 63420479 + 0.75 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -10310 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 135.5-49 chr13 41892059 41892391 + 0.75 NA intron (NM_001009814, intron 4 of 25) intron (NM_001009814, intron 4 of 25) 68860 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 130.5-39 chr10 56977826 56978163 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 326565 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 157-38 chr16 10520905 10521209 + 0.75 NA intron (NR_149081, intron 1 of 1) MER20|DNA|hAT-Charlie 7141 NR_149081 106144584 Hs.531561 NR_149081 ENSG00000260468 LINC01290 - long intergenic non-protein coding RNA 1290 ncRNA 168.25-70 chr2 65018992 65019490 + 0.75 NA intron (NM_003038, intron 7 of 7) intron (NM_003038, intron 7 of 7) 29842 NM_003038 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 220.25-47 chr3 69254642 69255121 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 5 of 22) L1MC4|LINE|L1 131207 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 142.75-194 chr8 133835236 133835540 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51108 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 113-39 chr11 15761928 15762198 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 118178 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 164.75-39 chr12 44210197 44210490 + 0.75 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) intron (NM_001286213, intron 3 of 6) 374262 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 197-42 chr3 37217130 37217504 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -25954 NM_001172713 2803 Hs.344151 NM_002078 ENSG00000144674 GOLGA4 CRPF46|GCP2|GOLG|MU-RMS-40.18|p230 golgin A4 protein-coding 179.25-44 chr12 98658743 98659046 + 0.75 NA intron (NM_001160, intron 4 of 25) intron (NM_001160, intron 4 of 25) 13594 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 194.25-4 chr1 153567517 153567805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1817 NM_001366407 6273 Hs.516484 NM_005978 ENSG00000196754 S100A2 CAN19|S100L S100 calcium binding protein A2 protein-coding 222.25-53 chr3 195924583 195925016 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15790 NM_005781 10188 Hs.518513 NM_005781 ENSG00000061938 TNK2 ACK|ACK-1|ACK1|p21cdc42Hs tyrosine kinase non receptor 2 protein-coding 152-126 chr5 116426554 116426814 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -20814 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 128.75-154 chr5 85524255 85524597 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -758018 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 142-12 chr10 5439360 5439702 + 0.75 NA intron (NM_001047160, intron 3 of 11) ERVL-E-int|LTR|ERVL -7020 NR_073040 10276 Hs.25155 NM_005863 ENSG00000173848 NET1 ARHGEF8|NET1A neuroepithelial cell transforming 1 protein-coding 212.5-37 chr17 34452209 34452504 + 0.75 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -89123 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 132.25-34 chr10 81454645 81454916 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -420414 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 117-36 chr12 46949932 46950187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124062 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 151.75-120 chr5 156473072 156473385 + 0.75 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 146064 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 194.25-45 chr17 26796296 26796688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292749 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 127.5-45 chr11 42778297 42778646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 490898 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 175.5-105 chr21 27069616 27070072 + 0.75 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -102756 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 190.75-80 chr4 105971762 105972073 + 0.75 NA TTS (NM_001184691) TTS (NM_001184691) 50561 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 209.5-69 chr2 142818395 142818790 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -59072 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 274.75-28 chr2 163777810 163778239 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42016 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 164.25-60 chr19 32371915 32372191 + 0.75 NA intron (NM_001136156, intron 5 of 6) L1ME4b|LINE|L1 26443 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 118.5-58 chr14 86348690 86348958 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 414146 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 133.5-146 chr21 31729606 31729871 + 0.75 NA intron (NM_020706, intron 1 of 19) intron (NM_020706, intron 1 of 19) 2380 NM_001145444 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 167.5-72 chr17 59650961 59651370 + 0.75 NA intron (NM_001288653, intron 4 of 31) L1MD1|LINE|L1 31270 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 146.25-8 chr1 203578429 203578709 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -48218 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 153-28 chr12 40030836 40031097 + 0.75 NA intron (NM_052885, intron 2 of 9) intron (NM_052885, intron 2 of 9) 75115 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 162-110 chr7 144814759 144815011 + 0.75 NA intron (NM_001350887, intron 1 of 6) intron (NM_001350887, intron 1 of 6) 21055 NM_001350880 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 113-186 chr9 110813430 110813604 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 85255 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 143.5-73 chr14 83790790 83791091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1148308 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 123.25-139 chr3 130824238 130824467 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -26243 NM_001199180 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 185-76 chr6 122666681 122667103 + 0.75 NA intron (NM_001270395, intron 1 of 4) intron (NM_001270395, intron 1 of 4) 14163 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 173-65 chr2 73018697 73019070 + 0.75 NA intron (NR_138476, intron 6 of 14) intron (NR_138476, intron 6 of 14) 40289 NM_001330411 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 153.25-140 chr8 119241065 119241373 + 0.75 NA intron (NM_052886, intron 3 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie 5638 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 130.75-152 chr4 178387087 178387276 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -479245 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 175.5-121 chr3 124460869 124461191 + 0.75 NA intron (NM_001024660, intron 23 of 59) intron (NM_001024660, intron 23 of 59) 86698 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 234.75-74 chr7 42769301 42769797 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -63102 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 115.75-83 chr17 62023591 62023798 + 0.75 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) LTR33A|LTR|ERVL 41584 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 166.5-83 chr17 58014819 58015258 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -7692 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 228-19 chr12 5458396 5458918 + 0.75 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) 26549 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 144.75-74 chr18 7258452 7258920 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 27582 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 115.75-70 chr15 42477148 42477415 + 0.75 NA intron (NM_001366844, intron 1 of 19) L1MEb|LINE|L1 13860 NM_001284307 64397 Hs.511143 NM_022473 ENSG00000103994 ZNF106 SH3BP3|ZFP106|ZNF474 zinc finger protein 106 protein-coding 148.5-43 chr12 31745485 31745832 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -16484 NR_103522 196394 Hs.585084 NM_001113402 ENSG00000151743 AMN1 - antagonist of mitotic exit network 1 homolog protein-coding 136.5-241 chrX 86512078 86512401 + 0.75 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 249271 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 150-14 chr10 66180692 66180936 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 609389 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 176.75-44 chr15 25037911 25038229 + 0.75 NA intron (NR_146177, intron 23 of 147) L1MC4|LINE|L1 -3904 NR_001289 338429 NR_001289 ENSG00000239169 SNORD109B HBII-438B small nucleolar RNA, C/D box 109B snoRNA 123.75-48 chr13 33160651 33160941 + 0.75 NA intron (NM_178007, intron 3 of 13) L1ME1|LINE|L1 25295 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 146.25-30 chr13 59129187 59129483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -883383 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 273.5-10 chr10 60346847 60347432 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 42736 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 189.5-100 chr4 61423776 61424282 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) LTR18C|LTR|ERVL 221857 NM_001371342 208-16 chr12 33569419 33569748 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -129764 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 137.25-113 chr4 114395923 114396250 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -202316 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 122.5-155 chr3 106274377 106274608 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -405091 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 125-104 chr3 104273419 104273711 + 0.75 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -749449 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 219.25-44 chr20 46168454 46168921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50373 NM_001302753 958 Hs.472860 NM_001250 ENSG00000101017 CD40 Bp50|CDW40|TNFRSF5|p50 CD40 molecule protein-coding 175-71 chr2 124907435 124907908 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 22 of 23) intron (NM_130773, intron 22 of 23) 882384 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 114.75-208 chr9 134133870 134134134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2080 NM_017588 11091 Hs.397638 NM_017588 ENSG00000196363 WDR5 BIG-3|CFAP89|SWD3 WD repeat domain 5 protein-coding 118.75-112 chr20 12278118 12278312 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 360322 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 263.25-31 chr20 51702677 51703149 + 0.75 NA intron (NM_006045, intron 4 of 27) intron (NM_006045, intron 4 of 27) 65477 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 150.5-93 chr2 99920289 99920558 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) L1ME2|LINE|L1 185160 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 224.5-91 chr5 166675295 166675853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 250796 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 146.75-86 chr2 202408434 202408798 + 0.75 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 32289 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 170.75-38 chr14 71946115 71946593 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) intron (NM_001370288, intron 1 of 16) 12827 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 134.5-195 chr6 120768816 120769099 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 565523 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 118-101 chr2 236076327 236076619 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 16 of 17) intron (NM_001037131, intron 16 of 17) 91913 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 215-55 chr3 191523815 191524179 + 0.75 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 62834 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 258.25-32 chr20 59233683 59234179 + 0.75 NA intron (NM_178457, intron 3 of 4) intron (NM_178457, intron 3 of 4) 42911 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 114-41 chr12 126112854 126113109 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 16989 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 112.5-240 chr8 135844090 135844308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 386743 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 130.5-9 chr1 60211526 60211750 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -137868 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 123.5-177 chr5 150158577 150158844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2865 NR_149150 5159 Hs.509067 NM_002609 ENSG00000113721 PDGFRB CD140B|IBGC4|IMF1|JTK12|KOGS|PDGFR|PDGFR-1|PDGFR1|PENTT platelet derived growth factor receptor beta protein-coding 205-70 chr7 52364619 52364926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -670861 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 132.25-95 chr2 96811748 96812019 + 0.75 NA TTS (NM_020184) TTS (NM_020184) 1774 NR_149141 100506036 Hs.656228 NR_149141 ENSG00000273265 CNNM3-DT - CNNM3 divergent transcript ncRNA 129.75-62 chr14 59926705 59927067 + 0.75 NA intron (NR_075071, intron 1 of 32) L1ME3A|LINE|L1 7173 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 127.75-63 chr14 67404212 67404399 + 0.75 NA intron (NM_016445, intron 1 of 8) intron (NM_016445, intron 1 of 8) 7860 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 248.25-19 chr14 28889520 28889976 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -103961 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 124.25-180 chr6 133720304 133720518 + 0.75 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 -100736 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 156.5-208 chr9 95250392 95250621 + 0.75 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) intron (NM_001243744, intron 1 of 13) 66748 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 139.25-121 chr3 65947242 65947454 + 0.75 NA intron (NR_145422, intron 1 of 2) intron (NR_145422, intron 1 of 2) 7210 NR_145422 151877 Hs.476636 NR_145422 ENSG00000272610 MAGI1-IT1 - MAGI1 intronic transcript 1 ncRNA 118-123 chr3 186154720 186154991 + 0.75 NA intron (NM_001346, intron 24 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie -45766 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 119-211 chr9 101527174 101527406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6563 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 168.75-127 chr6 132342508 132342749 + 0.75 NA intron (NM_015529, intron 4 of 11) intron (NM_015529, intron 4 of 11) 58847 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 152.25-86 chr2 85957109 85957418 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67983 NR_110569 101928113 Hs.625888 NR_110569 ST3GAL5-AS1 - ST3GAL5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 171-53 chr17 63177353 63177602 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 211242 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 223-54 chr3 177494647 177495216 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 53010 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 235.75-10 chr10 65240541 65240919 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -316212 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 232-17 chr15 51615888 51616306 + 0.75 NA intron (NM_001174116, intron 1 of 42) intron (NM_001174116, intron 1 of 42) 6674 NM_001174116 23312 Hs.511386 NM_015263 ENSG00000104093 DMXL2 DFNA71|PEPNS|RC3 Dmx like 2 protein-coding 258.75-19 chr12 61303709 61304468 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 888751 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 118.25-22 chr1 191174630 191174894 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 53736 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 192.5-49 chr16 51416244 51416560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -265130 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 299.5-2 chr1 184182974 184183712 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 131613 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 153.75-118 chr5 129355844 129356076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41187 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 221-40 chr2 195801374 195801721 + 0.75 NA intron (NM_018897, intron 54 of 64) intron (NM_018897, intron 54 of 64) 144321 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 190.25-38 chr14 74085658 74086173 + 0.75 NA intron (NM_001024674, intron 1 of 5) intron (NM_001024674, intron 1 of 5) 962 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 183-101 chr6 89047861 89048363 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -32639 NM_006813 10957 Hs.75969 NM_006813 ENSG00000146278 PNRC1 B4-2|PNAS-145|PROL2|PRR2 proline rich nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 156.75-44 chr12 110722263 110722587 + 0.75 NA intron (NM_002710, intron 5 of 6) intron (NM_002710, intron 5 of 6) 20466 NM_001244974 5501 Hs.79081 NM_002710 ENSG00000186298 PPP1CC PP-1G|PP1C|PPP1G protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma protein-coding 155.75-68 chr17 82748565 82748837 + 0.75 NA intron (NM_022158, intron 4 of 5) L1MEc|LINE|L1 -3364 NM_005993 6904 Hs.464391 NM_005993 ENSG00000141556 TBCD PEBAT|SSD-1|tfcD tubulin folding cofactor D protein-coding 159.5-169 chr5 6288086 6288334 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 49082 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 130.25-74 chr16 5338758 5338955 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -241036 NM_201598 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 214.25-55 chr3 51555871 51556384 + 0.75 NA intron (NM_001322253, intron 3 of 23) intron (NM_001322253, intron 3 of 23) 14538 NM_001322257 23132 Hs.105399 NM_015106 ENSG00000164080 RAD54L2 ARIP4|HSPC325|SRISNF2L RAD54 like 2 protein-coding 170.75-44 chr16 2080190 2080476 + 0.75 NA exon (NM_001363528, exon 29 of 40) exon (NM_001363528, exon 29 of 40) 9951 NR_030646 100188847 NR_030646 ENSG00000221656 MIR1225 MIRN1225 microRNA 1225 ncRNA 117-19 chr10 97574802 97575007 + 0.75 NA intron (NM_020349, intron 1 of 8) intron (NM_020349, intron 1 of 8) 2125 NM_001346793 26287 Hs.73708 NM_020349 ENSG00000165887 ANKRD2 ARPP ankyrin repeat domain 2 protein-coding 176.25-53 chr17 78674275 78674546 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001292019, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001292019, exon 13 of 13) -42353 NR_110848 101928710 Hs.464224 NR_110848 ENSG00000267123 SCAT1 LINC02081|XLOC_012582 S-phase cancer associated transcript 1 ncRNA 139.75-43 chr13 58320810 58321018 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -87797 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 196.5-140 chr6 56231323 56231628 + 0.75 NA intron (NM_001318751, intron 1 of 30) MIR3|SINE|MIR 16105 NM_001318751 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 150.5-142 chr4 36238312 36238743 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 1 of 32) intron (NR_146894, intron 1 of 32) 5412 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 173.75-76 chr18 6047884 6048177 + 0.75 NA intron (NM_173464, intron 16 of 19) L1PA16|LINE|L1 -152076 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 195.25-55 chr2 181957480 181957820 + 0.75 NA intron (NR_048567, intron 1 of 4) intron (NR_048567, intron 1 of 4) 3409 NR_048567 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 136.75-195 chr8 86120213 86120555 + 0.75 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 21474 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 133.75-132 chr3 78726471 78726833 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 5 of 30) intron (NM_002941, intron 5 of 30) 292807 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 112.25-15 chr10 27094303 27094554 + 0.75 NA intron (NM_014915, intron 1 of 33) MIR|SINE|MIR 6070 NM_014915 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 125-2 chr1 44277056 44277330 + 0.75 NA intron (NM_001301698, intron 6 of 7) L2b|LINE|L2 -24634 NR_132966 106635545 NR_132966 SNORA110 - small nucleolar RNA, H/ACA box 110 snoRNA 150.25-99 chr3 69323409 69323609 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) AluSx|SINE|Alu 62579 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 129.25-142 chr4 67593601 67593853 + 0.75 NA intron (NM_012108, intron 8 of 8) intron (NM_012108, intron 8 of 8) 35000 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 117.75-158 chr4 81682260 81682494 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -210470 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 117-109 chr21 27760202 27760563 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 38003 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 152.25-13 chr10 14521846 14522140 + 0.75 NA exon (NM_001320741, exon 3 of 4) exon (NM_001320741, exon 3 of 4) 10721 NM_001320741 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 172-71 chr3 47374704 47375012 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -6163 NM_015466 25930 Hs.25524 NM_015466 ENSG00000076201 PTPN23 HD-PTP|HDPTP|PTP-TD14 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 23 protein-coding 166-119 chr7 95604216 95604479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7831 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 148.75-23 chr10 49335690 49336076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36713 NM_001135196 118461 Hs.585480 NM_199459 ENSG00000177354 C10orf71 CEFIP chromosome 10 open reading frame 71 protein-coding 140.75-177 chr8 74725135 74725512 + 0.75 NA intron (NR_033830, intron 4 of 5) intron (NR_033830, intron 4 of 5) 19630 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 153-8 chr1 193672185 193672450 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 367572 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 135.25-22 chr10 9710764 9711051 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -347815 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 164.5-203 chr8 78803921 78804238 + 0.75 NA intron (NM_001199886, intron 1 of 4) intron (NM_001199886, intron 1 of 4) 1384 NM_000880 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 155-101 chr4 116040997 116041425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -258514 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 139.5-70 chr15 76855785 76856063 + 0.75 NA intron (NM_001145923, intron 2 of 31) L1PREC2|LINE|L1 6020 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 155-70 chr2 147190005 147190332 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 603111 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 127-57 chr14 47513868 47514257 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 160892 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 126.75-156 chr3 115180745 115181056 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -33612 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 144.5-165 chr5 10576147 10576430 + 0.75 NA intron (NM_001164440, intron 1 of 3) intron (NM_001164440, intron 1 of 3) 12218 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 174.75-108 chr6 111129677 111129949 + 0.75 NA intron (NM_018593, intron 1 of 5) intron (NM_018593, intron 1 of 5) 15979 NR_145796 109623478 NR_145796 SNORD166 - small nucleolar RNA, C/D box 166 snoRNA 190.5-78 chr2 106160762 106161085 + 0.75 NA intron (NM_025076, intron 4 of 14) intron (NM_025076, intron 4 of 14) -22042 NM_001253876 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 147-118 chr5 167692061 167692420 + 0.75 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) L2a|LINE|L2 -62689 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 152-77 chr19 39418555 39418888 + 0.75 NA intron (NM_022835, intron 9 of 18) intron (NM_022835, intron 9 of 18) 4942 NM_001351694 64857 Hs.631574 NM_022835 ENSG00000090924 PLEKHG2 ARHGEF42|CLG|CTB-60E11.4|LDAMD pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G2 protein-coding 123.75-29 chr11 83927778 83928000 + 0.75 NA intron (NM_001142700, intron 7 of 19) L2b|LINE|L2 -245464 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 117-25 chr11 80979367 80979691 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -216726 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 170.5-121 chr3 95381996 95382324 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 301033 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 114-53 chr16 75247910 75248177 + 0.75 NA intron (NM_001170715, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 108 NM_001170719 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 113.25-116 chr3 186432078 186432263 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8175 NR_151709 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 125.75-177 chr7 112275549 112275723 + 0.75 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) intron (NM_021994, intron 1 of 11) 68941 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 130.75-138 chr4 48467186 48467415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16043 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 247.5-42 chr2 134518458 134518914 + 0.75 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) LTR16E1|LTR|ERVL 200314 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 174.5-20 chr10 65714045 65714483 + 0.75 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) intron (NR_120647, intron 4 of 5) 142839 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 122.25-151 chr5 36235557 36235764 + 0.75 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) intron (NM_001287341, intron 1 of 12) 5731 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 131-37 chr12 6976836 6977063 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006331, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_006331, exon 6 of 6) 6036 NR_135131 10436 Hs.558447 NM_006331 ENSG00000126749 EMG1 C2F|Grcc2f|NEP1 EMG1 N1-specific pseudouridine methyltransferase protein-coding 217-21 chr14 54624633 54625112 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) (GTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 57260 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 178.75-40 chr17 59277055 59277394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54431 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 161.25-117 chr3 11046743 11047023 + 0.75 NA Intergenic (TATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27659 NR_046647 100874090 Hs.628542 NR_046647 ENSG00000232287 SLC6A1-AS1 - SLC6A1 antisense RNA 1 ncRNA 230-14 chr11 17529961 17530407 + 0.75 NA intron (NR_123738, intron 4 of 19) intron (NR_123738, intron 4 of 19) 14232 NM_153676 10083 Hs.502072 NM_005709 ENSG00000006611 USH1C AIE-75|DFNB18|DFNB18A|NY-CO-37|NY-CO-38|PDZ-45|PDZ-73|PDZ-73/NY-CO-38|PDZ73|PDZD7C|ush1cpst USH1 protein network component harmonin protein-coding 140.75-143 chr5 43509960 43510196 + 0.75 NA intron (NM_198566, intron 1 of 12) intron (NM_198566, intron 1 of 12) 5070 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 165.75-157 chr7 52522903 52523318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -512523 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 139.5-134 chr3 96173872 96174101 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -185978 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 239-62 chr9 78475597 78475972 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 178659 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 127.25-133 chr3 184962256 184962566 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 36 of 46) L1ME3Cz|LINE|L1 149904 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 120-33 chr13 21045166 21045412 + 0.75 NA intron (NM_014572, intron 2 of 7) intron (NM_014572, intron 2 of 7) 16297 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 207.25-12 chr11 90804030 90804500 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 4 of 6) L1ME2|LINE|L1 64937 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 154.5-20 chr1 247463921 247464312 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -12134 NM_001004492 127623 Hs.446999 NM_001004492 ENSG00000177535 OR2B11 - olfactory receptor family 2 subfamily B member 11 protein-coding 158-55 chr16 49561664 49562043 + 0.75 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) intron (NM_001271620, intron 5 of 7) -43268 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 145.25-155 chr7 12533878 12534244 + 0.75 NA intron (NR_136263, intron 3 of 3) LTR78B|LTR|ERV1 29664 NR_136263 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 136-143 chr8 40553672 40553990 + 0.75 NA intron (NM_024645, intron 6 of 6) intron (NM_024645, intron 6 of 6) -210468 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 147.75-15 chr10 51876548 51876955 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) LTR16C|LTR|ERVL -177156 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 184.5-163 chr8 138787930 138788369 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 12 of 64) MER5A|DNA|hAT-Charlie 125892 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 136.75-32 chr10 84077183 84077592 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -62122 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 177.25-59 chr17 79240825 79241154 + 0.75 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) AluJr|SINE|Alu 166052 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 135.75-95 chr2 59466532 59466723 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 248919 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 122-122 chr3 104885200 104885399 + 0.75 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -481414 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 129.25-173 chr6 129486540 129486867 + 0.75 NA intron (NM_000426, intron 56 of 64) intron (NM_000426, intron 56 of 64) 223474 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 204.5-123 chr7 54477096 54477419 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65068 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 225-41 chr2 148244226 148244793 + 0.75 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) intron (NM_018328, intron 4 of 14) -222905 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 188-60 chr6 48339464 48339899 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -270992 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 119-102 chr20 45450797 45450995 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18857 NM_006103 10406 Hs.2719 NM_006103 ENSG00000101443 WFDC2 EDDM4|HE4|WAP5|dJ461P17.6 WAP four-disulfide core domain 2 protein-coding 134.25-146 chr5 123828925 123829241 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 283666 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 120.25-91 chr2 56227094 56227393 + 0.75 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -41473 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 162.75-77 chr2 165991424 165991792 + 0.75 NA exon (NM_001202435, exon 28 of 28) exon (NM_001202435, exon 28 of 28) 34190 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 209.25-90 chr5 44537521 44537895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27426 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 150.5-158 chr4 154605528 154605830 + 0.75 NA intron (NM_000509, intron 8 of 9) intron (NM_000509, intron 8 of 9) 6977 NM_021870 2266 Hs.727584 NM_000509 ENSG00000171557 FGG - fibrinogen gamma chain protein-coding 149-128 chr8 20461440 20461897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 153258 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 184-51 chr22 25501511 25501872 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 46045 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 119.5-226 chr8 32498936 32499156 + 0.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) MER34B-int|LTR|ERV1 -49164 NM_001160005 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 211.75-2 chr1 33956305 33956658 + 0.75 NA intron (NM_052896, intron 3 of 69) L1MB3|LINE|L1 87525 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-96 chr18 44188334 44188672 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 343194 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 237.25-17 chr12 47298778 47299401 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 8310 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 145.5-78 chr17 44085034 44085296 + 0.75 NA intron (NM_001015053, intron 14 of 26) intron (NM_001015053, intron 14 of 26) 14254 NR_028581 92579 Hs.294005 NM_138387 ENSG00000141349 G6PC3 SCN4|UGRP glucose-6-phosphatase catalytic subunit 3 protein-coding 143.25-182 chr8 84861189 84861533 + 0.75 NA intron (NM_001287244, intron 4 of 7) intron (NM_001287244, intron 4 of 7) 155434 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 141.25-43 chr14 28759444 28759753 + 0.75 NA intron (NR_125758, intron 2 of 6) intron (NR_125758, intron 2 of 6) 5721 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 122.75-149 chr4 71495367 71495534 + 0.75 NA intron (NM_003759, intron 12 of 22) intron (NM_003759, intron 12 of 22) 156397 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 135.75-173 chr5 83401901 83402106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69671 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 149.75-76 chr2 41526820 41527153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -350569 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 211.5-167 chr9 96664850 96665276 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -9746 NM_153698 195827 Hs.44640 NM_153698 ENSG00000158122 PRXL2C AAED1|C9orf21 peroxiredoxin like 2C protein-coding 209-47 chr20 58622527 58623063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11977 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 140-36 chr13 26879222 26879622 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -118636 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 198.75-34 chr17 9905983 9906277 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_002903) promoter-TSS (NM_002903) -859 NM_002903 5957 Hs.80539 NM_002903 ENSG00000109047 RCVRN RCV1 recoverin protein-coding 129.5-60 chr14 33406757 33407095 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -302011 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 134.75-111 chr2 108867070 108867389 + 0.75 NA intron (NR_147237, intron 13 of 14) MIRc|SINE|MIR 80458 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 157.5-151 chr4 100579816 100580278 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -62025 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 187-32 chr16 79827675 79828052 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 32614 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 118.25-88 chr18 49970674 49970869 + 0.75 NA intron (NM_001080467, intron 10 of 39) intron (NM_001080467, intron 10 of 39) 155792 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 132-137 chr5 72747970 72748267 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -68473 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 126.25-195 chr8 27955537 27955759 + 0.75 NA intron (NM_173833, intron 3 of 8) intron (NM_173833, intron 3 of 8) 37025 NM_173833 286133 Hs.591833 NM_173833 ENSG00000168079 SCARA5 NET33|Tesr scavenger receptor class A member 5 protein-coding 243.25-49 chr6 95933912 95934395 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -81821 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 119.75-25 chr10 93690697 93691057 + 0.75 NA intron (NR_144635, intron 6 of 12) intron (NR_144635, intron 6 of 12) 11695 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 118-107 chr22 40883294 40883563 + 0.75 NA intron (NM_022098, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu -21315 NM_145174 150353 Hs.585042 NM_145174 ENSG00000172404 DNAJB7 DJ5|HSC3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B7 protein-coding 115.25-63 chr14 63747003 63747323 + 0.75 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -19098 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 129.5-82 chr15 92639866 92640092 + 0.75 NA intron (NM_207446, intron 1 of 2) L1MB8|LINE|L1 15796 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 215-33 chr16 81402086 81402613 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 17331 NR_039871 100616150 NR_039871 ENSG00000284473 MIR4720 - microRNA 4720 ncRNA 164.5-157 chr5 18155806 18156275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 348766 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 173.5-67 chr2 53924526 53924880 + 0.75 NA intron (NM_014614, intron 14 of 46) L1PA5|LINE|L1 46290 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 130.25-171 chr6 34781456 34781750 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -10480 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 125.5-18 chr1 205005044 205005255 + 0.75 NA intron (NM_001005388, intron 27 of 29) intron (NM_001005388, intron 27 of 29) -37800 NM_001346083 6900 Hs.519220 NM_005076 ENSG00000184144 CNTN2 AXT|FAME5|TAG-1|TAX|TAX1 contactin 2 protein-coding 127.75-81 chr18 3370979 3371386 + 0.75 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -20623 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 128.75-166 chr6 52631613 52631849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32670 NR_024405 730101 Hs.7921 NR_024403 ENSG00000216775 LOC730101 - uncharacterized LOC730101 ncRNA 139.5-81 chr17 58367423 58367759 + 0.75 NA intron (NM_001305544, intron 3 of 9) L2c|LINE|L2 -15390 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 122-170 chr7 81474472 81474666 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 87250 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 245.75-12 chr12 18727955 18728409 + 0.75 NA intron (NM_001330774, intron 3 of 14) MIRc|SINE|MIR 9327 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 153-163 chr9 34387578 34387861 + 0.75 NA intron (NM_032596, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 -6130 NM_147168 84688 Hs.50334 NM_032596 ENSG00000164972 C9orf24 CBE1|NYD-SP22|SMRP1|bA573M23.4 chromosome 9 open reading frame 24 protein-coding 234.75-54 chr3 131018038 131018587 + 0.75 NA intron (NR_110229, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 8542 NR_110229 28990 Hs.100878 NM_014065 ENSG00000034533 ASTE1 HT001 asteroid homolog 1 protein-coding 152.5-184 chr8 53918803 53919088 + 0.75 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 38073 NM_003702 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 142.25-137 chr5 122539457 122539669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45037 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 290-32 chr21 14899571 14900166 + 0.75 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) intron (NR_146322, intron 1 of 3) 18800 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 199.25-17 chr12 13241369 13241743 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44830 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 122.75-52 chr15 62010901 62011256 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 12 of 81) intron (NM_001018088, intron 12 of 81) 49369 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 190.75-77 chr4 76818010 76818278 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 80000 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 174.75-107 chr6 102666274 102666698 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 1267501 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 215-34 chr17 57923545 57924041 + 0.75 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR -20404 NM_001292025 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 222.25-64 chr5 16364716 16365358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76065 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 115.5-44 chr12 107569922 107570137 + 0.75 NA intron (NM_001018072, intron 3 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -10845 NM_001017523 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 151-38 chr14 94562112 94562386 + 0.75 NA intron (NM_001289032, intron 1 of 4) MER58B|DNA|hAT-Charlie 807 NM_001289033 5267 Hs.719893 NM_006215 ENSG00000100665 SERPINA4 KAL|KLST|KST|PI-4|PI4|kallistatin serpin family A member 4 protein-coding 154.5-11 chr1 102687722 102688187 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 420542 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 115.75-230 chr9 87514644 87514942 + 0.75 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) L3|LINE|CR1 16258 NM_001288729 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 158.75-169 chr9 32984671 32984957 + 0.75 NA exon (NM_175069, exon 6 of 8) exon (NM_175069, exon 6 of 8) 16762 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 130.5-42 chr10 68128929 68129232 + 0.75 NA intron (NR_045663, intron 2 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie 19592 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 217.5-16 chr10 81273565 81274114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -601355 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 131.5-178 chr4 86178303 86178540 + 0.75 NA intron (NM_001318069, intron 3 of 13) intron (NM_001318069, intron 3 of 13) 58615 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 186-23 chr13 30899353 30899753 + 0.75 NA intron (NR_038287, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 -6718 NM_032849 84935 Hs.147880 NM_032849 ENSG00000102802 MEDAG AWMS3|C13orf33|MEDA-4|MEDA4|hAWMS3 mesenteric estrogen dependent adipogenesis protein-coding 116-81 chr2 28209494 28209707 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) intron (NM_199193, intron 8 of 13) -2639 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 133-121 chr4 48835395 48835700 + 0.75 NA intron (NM_001079839, intron 3 of 8) intron (NM_001079839, intron 3 of 8) 4241 NM_001168254 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 192.75-7 chr1 151321170 151321553 + 0.75 NA intron (NM_001369626, intron 1 of 12) intron (NM_001369626, intron 1 of 12) 6055 NM_001330721 5298 Hs.632465 NM_002651 ENSG00000143393 PI4KB NPIK|PI4K-BETA|PI4K92|PI4KBETA|PI4KIIIBETA|PIK4CB phosphatidylinositol 4-kinase beta protein-coding 141.75-143 chr5 127013888 127014242 + 0.75 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) L1MA5A|LINE|L1 16493 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 121.5-76 chr14 47275489 47275671 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 67666 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 187.5-71 chr17 61715333 61715701 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 17 of 19) intron (NM_032043, intron 17 of 19) -124298 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 228.75-25 chr16 36233422 36233930 + 0.75 NA Intergenic (TTCGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 487124 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 139.75-146 chr5 60634046 60634301 + 0.75 NA intron (NM_001145208, intron 7 of 9) intron (NM_001145208, intron 7 of 9) 65993 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 119.75-198 chr8 107913961 107914323 + 0.75 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) intron (NM_001282863, intron 4 of 4) 167797 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 132.25-53 chr13 110120264 110120579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1281 NR_148221 105370361 Hs.134728 NR_148221 LOC105370361 - uncharacterized LOC105370361 ncRNA 153.25-91 chr3 102116880 102117135 + 0.75 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -46698 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 114.25-45 chr13 24611077 24611292 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30976 NR_002815 374491 Hs.406779 NR_002815 TPTE2P6 - transmembrane phosphoinositide 3-phosphatase and tensin homolog 2 pseudogene 6 pseudo 222.75-75 chr4 92661601 92661954 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 357378 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 156.5-150 chr5 57754847 57755084 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 104305 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 133.25-159 chr4 145920222 145920492 + 0.75 NA intron (NM_178835, intron 1 of 14) intron (NM_178835, intron 1 of 14) 18466 NM_001306215 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 244.5-18 chr11 82052733 82053129 + 0.75 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) L1MA1|LINE|L1 -162095 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 118.5-36 chr11 86021322 86021592 + 0.75 NA intron (NM_001008660, intron 4 of 19) L1MB7|LINE|L1 47627 NM_007166 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 165.25-106 chr4 76790949 76791291 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 107024 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 147-97 chr3 129724597 129724874 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001349274) promoter-TSS (NM_001349274) -622 NM_001349274 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 216.5-38 chr15 84858147 84858788 + 0.75 NA exon (NM_020778, exon 6 of 14) exon (NM_020778, exon 6 of 14) -26194 NM_001287761 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 129-139 chr5 30671622 30671857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -521947 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 125.75-152 chr5 40882134 40882360 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -27250 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 176.25-136 chr8 88224208 88224610 + 0.75 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 103074 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 165-83 chr21 28570982 28571276 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31811 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 146.75-150 chr7 24370686 24370985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86645 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 142-99 chr22 38498065 38498393 + 0.75 NA intron (NM_006386, intron 4 of 12) intron (NM_006386, intron 4 of 12) 8082 NM_001098504 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 170.25-114 chr4 86147805 86148243 + 0.75 NA intron (NR_110879, intron 3 of 3) intron (NR_110879, intron 3 of 3) 28218 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 192.5-10 chr1 233871123 233871410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33410 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 160.75-56 chr17 27402072 27402383 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15778 NR_033892 440419 Hs.385755 NR_033892 ENSG00000266433 TBC1D3P5 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 5 pseudo 139-84 chr2 208769147 208769532 + 0.75 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) LTR103_Mam|LTR|ERV1? 226697 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 160.25-135 chr6 38838014 38838367 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 32 of 91) intron (NM_001371, intron 32 of 91) 114917 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 256-9 chr11 83197520 83197894 + 0.75 NA intron (NM_001300975, intron 1 of 10) intron (NM_001300975, intron 1 of 10) 3995 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 170.5-79 chr19 31843126 31843518 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -182540 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 209.75-96 chr8 15669787 15670445 + 0.75 NA intron (NM_001356429, intron 5 of 10) L1MEg1|LINE|L1 129853 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 132.25-155 chr5 72126760 72126995 + 0.75 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) intron (NM_005909, intron 2 of 6) 19402 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 183.75-63 chr20 6908871 6909256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141377 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 122.5-22 chr10 44746025 44746302 + 0.75 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -165153 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 240.5-48 chr2 3613627 3614032 + 0.75 NA intron (NM_001255988, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 7777 NM_001255989 78989 Hs.32603 NM_024027 ENSG00000118004 COLEC11 3MC2|CL-K1-I|CL-K1-II|CL-K1-IIa|CL-K1-IIb|CLK1 collectin subfamily member 11 protein-coding 131.5-104 chr2 26625988 26626420 + 0.75 NA intron (NM_001029881, intron 3 of 6) MIRc|SINE|MIR 15162 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 119.75-173 chr5 154593445 154593738 + 0.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 2481 NR_036094 100422950 NR_036094 ENSG00000264760 MIR3141 mir-3141 microRNA 3141 ncRNA 212.25-91 chr8 14079572 14079888 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 450040 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 182.25-86 chr4 163163877 163164164 + 0.75 NA intron (NM_138386, intron 2 of 7) MIR3|SINE|MIR 2870 NM_138386 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 119-181 chr7 30053948 30054161 + 0.75 NA intron (NM_001363473, intron 7 of 12) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 8969 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 127.25-63 chr15 62823984 62824358 + 0.75 NA TTS (NR_029709) TTS (NR_029709) 214 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 138.75-31 chr11 93360233 93360611 + 0.75 NA intron (NM_181645, intron 4 of 13) L1MDa|LINE|L1 29705 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 122.25-157 chr6 49158084 49158366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 305028 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 127-22 chr10 126036079 126036270 + 0.75 NA exon (NM_001288973, exon 21 of 23) exon (NM_001288973, exon 21 of 23) -62901 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-95 chr2 53395642 53395931 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -371997 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 163-123 chr8 136580261 136580574 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 49619 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 198.5-23 chr11 125063257 125063662 + 0.75 NA intron (NM_001145290, intron 1 of 17) CpG 154 NM_001145290 219855 Hs.352661 NM_198277 ENSG00000134955 SLC37A2 pp11662 solute carrier family 37 member 2 protein-coding 132-89 chr2 82396717 82397082 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -459904 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 189.75 chr1 40345066 40345390 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -27942 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 125-85 chr20 48129353 48129645 + 0.75 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 -139382 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 175.5-81 chr19 19467654 19467955 + 0.75 NA intron (NM_001359631, intron 2 of 10) intron (NM_001359631, intron 2 of 10) 32741 NR_030370 693225 NR_030370 ENSG00000207821 MIR640 MIRN640|hsa-mir-640 microRNA 640 ncRNA 132.75-169 chr6 131890102 131890323 + 0.75 NA intron (NM_006208, intron 24 of 24) intron (NM_006208, intron 24 of 24) 61160 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 154.25-48 chr14 71332260 71332566 + 0.75 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 11937 NM_001354285 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 137.75-94 chr2 34595596 34595891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81814 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 159.75-79 chr2 70934544 70934807 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1225 NM_001692 525 Hs.64173 NM_001692 ENSG00000116039 ATP6V1B1 ATP6B1|RTA1B|VATB|VMA2|VPP3 ATPase H+ transporting V1 subunit B1 protein-coding 171-20 chr11 62350662 62350959 + 0.75 NA intron (NM_025080, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 13362 NM_001083926 80150 Hs.535326 NM_025080 ENSG00000162174 ASRGL1 ALP|ALP1|CRASH asparaginase like 1 protein-coding 118.5-113 chr2 210718240 210718494 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100796 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 125.5-226 chr7 8281177 8281502 + 0.75 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 -18727 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 171.25-136 chr6 71366235 71366614 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10607 NR_029598 407032 NR_029598 ENSG00000199094 MIR30C2 MIRN30C2|mir-30c-2 microRNA 30c-2 ncRNA 214.75-89 chr8 116240548 116241001 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 84285 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 129.5-178 chr5 31601709 31602071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37241 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 142.5-64 chr14 56800570 56800834 + 0.75 NA non-coding (NR_073036, exon 2 of 2) non-coding (NR_073036, exon 2 of 2) 4965 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 123-196 chr9 28480772 28481109 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 238365 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 204.25-88 chr5 20066534 20066930 + 0.75 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -78532 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 184.25-63 chr2 182541775 182542391 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19238 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 138.5-108 chr2 110647453 110647790 + 0.75 NA intron (NM_001278616, intron 18 of 23) L1MC2|LINE|L1 10628 NR_132975 106635550 NR_132975 SNORD132 - small nucleolar RNA, C/D box 132 snoRNA 124.5-244 chr9 86016072 86016345 + 0.75 NA intron (NM_024635, intron 17 of 22) intron (NM_024635, intron 17 of 22) 74679 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 152-91 chr2 190381891 190382237 + 0.75 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -26291 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 288.75-29 chr2 48621285 48621764 + 0.75 NA intron (NM_001198594, intron 4 of 7) intron (NM_001198594, intron 4 of 7) 3668 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 154.25-5 chr1 69512499 69512918 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -54626 NM_001366839 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 132-29 chr11 63942058 63942333 + 0.75 NA intron (NM_001300800, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 2864 NM_001300800 79829 Hs.523753 NM_024771 ENSG00000110583 NAA40 NAT11|NatD|PATT1|hNatD N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit protein-coding 185.5-96 chr20 52470407 52470804 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -150233 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 166.75-117 chr5 91964394 91964718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -581239 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 136-144 chr8 59113111 59113493 + 0.75 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 5845 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 148.5-215 chr7 90240562 90240826 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4480 NM_001160138 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 153.25-148 chr9 136874556 136874996 + 0.75 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -8440 NM_153200 8721 Hs.174050 NM_003792 ENSG00000107223 EDF1 CFAP280|EDF-1|MBF1 endothelial differentiation related factor 1 protein-coding 202-78 chr9 6404090 6404552 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -8830 NR_046386 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 115-58 chr15 88658953 88659259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20090 NM_002201 3669 Hs.459265 NM_002201 ENSG00000172183 ISG20 CD25|HEM45 interferon stimulated exonuclease gene 20 protein-coding 167.75-139 chr8 75916441 75916761 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 376633 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 118.75-100 chr2 82441214 82441552 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -415420 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 143.75 chr1 23830156 23830397 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -4817 NM_001166059 3155 Hs.533444 NM_000191 ENSG00000117305 HMGCL HL 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase protein-coding 240.75-8 chr10 38814529 38814998 + 0.75 NA Intergenic (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118167 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 166.5-33 chr10 105817491 105817854 + 0.75 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 2661 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 125.25-111 chr2 162236361 162236581 + 0.75 NA intron (NM_004460, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 6974 NM_001291807 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 141.5-113 chr2 169931852 169932068 + 0.75 NA intron (NM_172070, intron 18 of 38) intron (NM_172070, intron 18 of 38) 104452 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 180-110 chr7 34192381 34192943 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 287123 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 121-196 chr8 131746512 131746825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157425 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 171.75-129 chr7 34684499 34684881 + 0.75 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) intron (NM_001300934, intron 2 of 6) 26451 NM_001300934 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 183.25-9 chr1 234093708 234094218 + 0.75 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -120248 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 148.75-114 chr3 167920688 167921054 + 0.75 NA intron (NR_033843, intron 6 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 24923 NR_145443 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 160.5-146 chr5 15026554 15026889 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154943 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 149.75-143 chr6 40648468 40648705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61222 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 188-21 chr14 44878147 44878472 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -18966 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 120-139 chr5 5736641 5736940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 314113 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 175.25-102 chr4 23673349 23673689 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 207773 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 165.25-119 chr5 71777488 71778041 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 58489 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 203-11 chr10 32088638 32088985 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -32386 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 165.75-30 chr11 85787890 85788216 + 0.75 NA intron (NM_001365826, intron 1 of 18) intron (NM_001365826, intron 1 of 18) 23088 NM_206927 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 123.25-62 chr15 58321227 58321436 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -110660 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 139.5-95 chr2 33366328 33366632 + 0.75 NA intron (NM_206943, intron 31 of 33) intron (NM_206943, intron 31 of 33) -52036 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 129.75-8 chr1 65843579 65843907 + 0.75 NA intron (NM_002600, intron 1 of 16) intron (NM_002600, intron 1 of 16) 50848 NM_002600 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 201-76 chr8 105030232 105030632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -288006 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 130.5-75 chr12 40735778 40736018 + 0.75 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1M7|LINE|L1 43456 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 218.5-13 chr1 145840887 145841344 + 0.75 NA intron (NM_006468, intron 14 of 14) intron (NM_006468, intron 14 of 14) -4515 NM_001012758 200035 Hs.585066 NM_001012758 ENSG00000186364 NUDT17 - nudix hydrolase 17 protein-coding 132-179 chr8 119597448 119597739 + 0.75 NA intron (NM_006209, intron 11 of 25) intron (NM_006209, intron 11 of 25) -4585 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 136-55 chr17 48168650 48168901 + 0.75 NA intron (NM_003726, intron 10 of 12) intron (NM_003726, intron 10 of 12) -12264 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 132.5-33 chr10 93157227 93157476 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83458 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 140-105 chr3 53191865 53192098 + 0.75 NA intron (NM_006254, intron 18 of 18) intron (NM_006254, intron 18 of 18) 23278 NM_001354676 5580 Hs.155342 NM_006254 ENSG00000163932 PRKCD ALPS3|CVID9|MAY1|PKCD|nPKC-delta protein kinase C delta protein-coding 125.5-210 chr5 133447884 133448164 + 0.75 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -20318 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 161.25-159 chr7 17038262 17038580 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -156438 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 153.75-120 chr5 130598822 130599156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 566267 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 304-32 chr8 80657401 80658022 + 0.75 NA intron (NM_001033723, intron 7 of 8) intron (NM_001033723, intron 7 of 8) 171485 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 142.75-35 chr11 45516365 45516758 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 145164 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 167.75-126 chr6 147300516 147300995 + 0.75 NA intron (NM_139244, intron 9 of 25) L1M2|LINE|L1 -96141 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 149.25-187 chr8 119121797 119122043 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -53138 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 167.25-87 chr2 129082350 129082903 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 191265 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 142.75-185 chr8 88311789 88312157 + 0.75 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 15510 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 122-121 chr3 96261451 96261716 + 0.75 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -98381 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 152.5-194 chr8 121276460 121276743 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -362745 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 159.75 chr1 5335220 5335468 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 527397 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 142.5-29 chr10 31832310 31832614 + 0.75 NA intron (NM_001270696, intron 7 of 17) intron (NM_001270696, intron 7 of 17) 76464 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 134.25-113 chr3 67973960 67974203 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -17511 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 168.5-160 chr6 65174058 65174594 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -127092 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 124.5-82 chr17 67643104 67643331 + 0.75 NA intron (NM_181671, intron 6 of 9) AluSz6|SINE|Alu -74616 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 135.5-31 chr10 132764042 132764267 + 0.75 NA intron (NM_005539, intron 11 of 15) intron (NM_005539, intron 11 of 15) 21993 NM_177400 84504 Hs.134013 NM_177400 ENSG00000148826 NKX6-2 GTX|NKX6.2|NKX6B|SPAX8 NK6 homeobox 2 protein-coding 121.5-173 chr3 34893674 34893961 + 0.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 500206 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 121.75-201 chrX 15173563 15173820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96392 NM_001031739 140462 Hs.19404 NM_024087 ENSG00000102048 ASB9 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 protein-coding 175.75-105 chr5 40371431 40371852 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -308274 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 145.25-39 chr14 49077524 49077892 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 508672 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 231-74 chr7 12692383 12692961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5039 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 135.75-91 chr2 35744980 35745347 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 273758 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 141.75-158 chr7 7830334 7830618 + 0.75 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -111869 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 129.25-125 chr3 52971014 52971194 + 0.75 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) AluJb|SINE|Alu -73556 NM_198563 375346 Hs.744189 NM_198563 ENSG00000213533 STIMATE TMEM110 STIM activating enhancer protein-coding 224.25-84 chr6 63386917 63387444 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67197 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 138-22 chr11 126995722 126995966 + 0.75 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) 4926 NM_032531 84623 Hs.376015 NM_032531 ENSG00000149571 KIRREL3 KIRRE|MRD4|NEPH2|PRO4502 kirre like nephrin family adhesion molecule 3 protein-coding 141.25-166 chr7 15164292 15164549 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -189562 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 287.75-4 chr1 161870668 161871263 + 0.75 NA intron (NM_007348, intron 14 of 15) intron (NM_007348, intron 14 of 15) 104645 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 123.25-86 chr18 13646009 13646208 + 0.75 NA 3' UTR (NM_181481, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_181481, exon 6 of 6) 4350 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 197.5-81 chr2 179457409 179457702 + 0.75 NA intron (NR_148054, intron 5 of 8) L1ME3|LINE|L1 105033 NR_148055 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 249-31 chr22 50739940 50740465 + 0.75 NA intron (NM_001097, intron 3 of 4).2 intron (NM_001097, intron 3 of 4).2 1998 NM_001097 49 Hs.370870 NM_001097 ENSG00000100312 ACR - acrosin protein-coding 140.25-66 chr16 76354530 76354780 + 0.75 NA intron (NM_001322191, intron 2 of 22) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 44803 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 188.5-102 chr3 98735374 98735737 + 0.75 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) intron (NM_001323366, intron 1 of 11) 2099 NM_001323366 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 150-13 chr10 35035073 35035357 + 0.75 NA exon (NM_001198777, exon 10 of 21) exon (NM_001198777, exon 10 of 21) 39068 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 140-182 chr9 134798684 134799056 + 0.75 NA intron (NM_001278074, intron 37 of 65) intron (NM_001278074, intron 37 of 65) 50499 NR_039691 100616333 NR_039691 ENSG00000264744 MIR3689C - microRNA 3689c ncRNA 131-45 chr13 31976721 31976948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54805 NR_103839 100507099 Hs.536364 NR_103839 FRY-AS1 - FRY antisense RNA 1 ncRNA 158.5-38 chr11 32684917 32685203 + 0.75 NA intron (NM_001008391, intron 6 of 17) intron (NM_001008391, intron 6 of 17) 101229 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 234.75-59 chr4 79612427 79612793 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 120017 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 112.5-37 chr11 87473056 87473403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 246182 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 155.75-3 chr1 35668604 35668933 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27242 NM_001199779 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 171.25-9 chr1 227394444 227394692 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -76076 NM_001366019 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 218.25-42 chr2 109022831 109023392 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33891 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 204.25-113 chr7 83000987 83001355 + 0.75 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 161713 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 142.25-99 chr21 24909967 24910341 + 0.75 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 69604 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 123.5-112 chr2 189414658 189415054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26577 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 150.25-114 chr4 118803350 118803665 + 0.75 NA intron (NM_014822, intron 7 of 22) L2c|LINE|L2 32619 NM_014822 9871 Hs.189641 NM_014822 ENSG00000150961 SEC24D CLCRP2 SEC24 homolog D, COPII coat complex component protein-coding 189.25-107 chr6 94314792 94315228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 596707 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 127.25-210 chr8 112497862 112498177 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 28 of 66) intron (NM_001363185, intron 28 of 66) -145474 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 140.75-16 chr10 45645782 45646139 + 0.75 NA intron (NR_104256, intron 5 of 6) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 26772 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 121.5-38 chr11 25954630 25954827 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -234395 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 134.5-122 chr22 28231878 28232207 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -227827 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 271-53 chr9 85036925 85037357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 331240 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 174.75-53 chr2 13247189 13247496 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -240329 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 198.5-83 chr2 200495563 200495880 + 0.75 NA intron (NM_001321550, intron 5 of 6) L1ME4a|LINE|L1 14347 NM_001321548 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 236.75-35 chr3 19052026 19052458 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -96268 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 157.5-94 chr2 34465056 34465359 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -212350 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 135-150 chr5 127763452 127763742 + 0.75 NA intron (NM_001317938, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 60208 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 129-158 chr6 147639359 147639624 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130801 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 191-73 chr7 40242025 40242320 + 0.75 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) AluSz|SINE|Alu 107196 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 251.5-35 chr2 118082426 118082969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5721 NM_001321331 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 194.25-40 chr16 49522088 49522569 + 0.75 NA intron (NM_001271620, intron 7 of 7) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -3743 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 121-75 chr16 52772558 52772784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -165696 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 165.25-3 chr1 74013732 74014246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 184187 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 183-109 chr7 113203077 113203401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84657 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 169.75-104 chr3 85516424 85516690 + 0.75 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 11498 NM_001256502 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 204.75-53 chr17 68899325 68899839 + 0.75 NA intron (NM_001288985, intron 21 of 39) L1MB8|LINE|L1 55810 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 115.75-59 chr14 33751504 33751798 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 6 of 10) intron (NM_001165893, intron 6 of 10) 42714 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 243.75-83 chr8 128147080 128147599 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -2777 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 130.5-202 chr5 55289518 55289847 + 0.75 NA intron (NR_144323, intron 7 of 26) intron (NR_144323, intron 7 of 26) 18012 NR_144325 54505 Hs.593268 NM_019030 ENSG00000067248 DHX29 DDX29 DExH-box helicase 29 protein-coding 191 chr1 65946457 65946827 + 0.75 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 33397 NM_001297441 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 124.75-188 chr7 13988028 13988367 + 0.75 NA intron (NM_001370555, intron 2 of 12) intron (NM_001370555, intron 2 of 12) 1469 NM_004956 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 148.75-179 chr9 75191346 75191572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102945 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 145.75-131 chr5 112584626 112584843 + 0.75 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -43702 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 128.75-132 chr3 193120282 193120500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120831 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 113.5-70 chr14 27036520 27036788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128012 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 125.75-49 chr13 43240777 43241058 + 0.75 NA intron (NM_001347966, intron 15 of 17) LTR40c|LTR|ERVL 127752 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 151.5-83 chr2 85052717 85053169 + 0.75 NA intron (NM_020122, intron 6 of 6) intron (NM_020122, intron 6 of 6) 14404 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 128-124 chr5 40531891 40532276 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -147832 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 153-50 chr16 9970564 9970977 + 0.75 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 211297 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 156-142 chr7 62155307 62155563 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1148621 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 116.5-96 chr18 586167 586469 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 5938 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 154.5-129 chr3 150093094 150093358 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -3217 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 161-84 chr4 183251905 183252240 + 0.75 NA intron (NM_024949, intron 8 of 22) intron (NM_024949, intron 8 of 22) -11438 NR_126473 101928734 Hs.570713 NR_126473 ENSG00000251128 WWC2-AS1 - WWC2 antisense RNA 1 ncRNA 204.75-31 chr12 19856649 19857021 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -157850 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 213-55 chr20 51281971 51282366 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 170809 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 145-109 chr4 62734990 62735277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -573368 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 182.5-102 chr3 82001355 82001648 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 15359 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 287.25-34 chr4 86691617 86692402 + 0.75 NA intron (NM_080685, intron 5 of 47) intron (NM_080685, intron 5 of 47) 97694 NM_080685 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 176.25-99 chr4 39987533 39987819 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -9720 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 201-89 chrX 43840324 43840783 + 0.75 NA intron (NM_000898, intron 2 of 14) L1P3|LINE|L1 41897 NM_000898 4129 Hs.654473 NM_000898 ENSG00000069535 MAOB - monoamine oxidase B protein-coding 177.75-19 chr11 9800910 9801235 + 0.75 NA intron (NM_030962, intron 32 of 39) intron (NM_030962, intron 32 of 39) -38070 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 174.75-80 chr3 38251405 38251724 + 0.75 NA intron (NM_005109, intron 16 of 17) intron (NM_005109, intron 16 of 17) -14248 NM_004256 9390 Hs.225941 NM_004256 ENSG00000172940 SLC22A13 OAT10|OCTL1|OCTL3|ORCTL-3|ORCTL3 solute carrier family 22 member 13 protein-coding 133.75-64 chr14 86683303 86683697 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -222278 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 143.75-6 chr1 91808476 91808697 + 0.75 NA intron (NR_036634, intron 2 of 17) AluSx|SINE|Alu 77565 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 226.75-14 chr12 91300480 91300925 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -117885 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 223.5-140 chrX 57869168 57869585 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 41257 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 164.5-143 chr3 168107796 168108118 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -12033 NM_014498 27333 Hs.143600 NM_014498 ENSG00000173905 GOLIM4 GIMPC|GOLPH4|GPP130|P138 golgi integral membrane protein 4 protein-coding 222.5-4 chr1 59415009 59415512 + 0.75 NA intron (NM_001350794, intron 5 of 14) intron (NM_001350794, intron 5 of 14) -100370 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 219.25-3 chr1 62190611 62191022 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4033 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 124.5-234 chr8 130414718 130414937 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) AluSx|SINE|Alu 28833 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 186.75-118 chr9 33664770 33665126 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12320 NR_103745 101243555 Hs.598470 NR_103745 ENSG00000281128 PTENP1-AS PTENP1as|PTENpg1-asRNA PTENP1 antisense RNA ncRNA 132.5-163 chr3 82404085 82404319 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 418060 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 112.75-79 chr18 9577299 9577505 + 0.75 NA intron (NR_052003, intron 8 of 19) AluJb|SINE|Alu 37157 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 149-115 chr6 90859073 90859385 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -272157 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 117.25-187 chr6 73012055 73012366 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 2 of 13) L1MB3|LINE|L1 -44457 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 197.75-87 chr8 54069024 54069317 + 0.75 NA intron (NM_001279356, intron 2 of 7) L1MA5|LINE|L1 32384 NM_001279360 10434 Hs.744046 NM_006330 ENSG00000120992 LYPLA1 APT-1|APT1|LPL-I|LPL1|hAPT1 lysophospholipase 1 protein-coding 144-103 chr5 87668510 87668755 + 0.75 NA intron (NR_149089, intron 1 of 1) intron (NR_149089, intron 1 of 1) 6590 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 124.5-223 chr8 86295460 86295775 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -46930 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 131-23 chr10 92399817 92400053 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -18726 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 127.5-169 chr4 64025475 64025722 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 383852 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 153-161 chr8 140240002 140240323 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 16 of 22) intron (NM_001160372, intron 16 of 22) -139627 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 241.5-91 chr7 102146491 102147162 + 0.75 NA intron (NM_001913, intron 8 of 22) AluSz|SINE|Alu -138315 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 167.75 chr1 1190203 1190567 + 0.75 NA intron (NM_001130045, intron 13 of 15) L1MB8|LINE|L1 10704 NM_153254 254173 Hs.454835 NM_153254 ENSG00000162571 TTLL10 TTLL5 tubulin tyrosine ligase like 10 protein-coding 180-10 chr10 12988372 12988702 + 0.75 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu 13176 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 134.5-62 chr14 59547566 59547894 + 0.75 NA intron (NM_001164399, intron 8 of 19) L1MEd|LINE|L1 29082 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 168.75-18 chr10 18548870 18549236 + 0.75 NA intron (NM_182543, intron 9 of 10) L2a|LINE|L2 102534 NM_001351117 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 160.75-64 chr19 47668712 47668957 + 0.75 NA intron (NM_015711, intron 1 of 14) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -44588 NM_014601 30846 Hs.744963 NM_014601 ENSG00000024422 EHD2 PAST2 EH domain containing 2 protein-coding 209-4 chr1 107715357 107715830 + 0.75 NA intron (NM_006113, intron 15 of 26) intron (NM_006113, intron 15 of 26) -27094 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 182.75-132 chr8 43608237 43608571 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 315962 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 244.75-21 chr15 71085735 71086202 + 0.75 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -55481 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 151.25-43 chr12 119048441 119048697 + 0.75 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 67028 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 163.5-100 chr2 168623116 168623392 + 0.75 NA intron (NM_001256126, intron 3 of 10) L1MA9|LINE|L1 40311 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 211.5-82 chr2 163556512 163556942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179281 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 145-131 chr5 152305362 152305645 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 99776 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 131.25-158 chr4 151134923 151135182 + 0.75 NA intron (NM_001009555, intron 16 of 20) intron (NM_001009555, intron 16 of 20) 31225 NR_000007 8944 NR_000007 ENSG00000208797 SNORD73A RNU73|RNU73A|U73|U73a small nucleolar RNA, C/D box 73A snoRNA 162.5-76 chr19 37394728 37394978 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 23754 NM_032453 84503 Hs.590940 NM_032453 ENSG00000189164 ZNF527 - zinc finger protein 527 protein-coding 127-39 chr11 128000983 128001364 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -207593 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 122.5-70 chr15 51879087 51879331 + 0.75 NA intron (NM_014547, intron 3 of 9) intron (NM_014547, intron 3 of 9) 44911 NR_109775 100422556 Hs.664788 NR_109775 LOC100422556 - LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component pseudogene pseudo 162-23 chr11 40242189 40242436 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) intron (NM_001258419, intron 4 of 6) 50818 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 183-69 chr3 88781817 88782318 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -325554 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 145.25-70 chr2 56452985 56453295 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -267370 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 112.5-75 chr14 54596638 54596933 + 0.75 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) LTR33|LTR|ERVL 29173 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 145.25-170 chr8 88726652 88726911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -399298 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 168.5-11 chr1 114957950 114958356 + 0.75 NA intron (NM_001282541, intron 27 of 31) L1MA4|LINE|L1 -71671 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 160.75-63 chr19 29346554 29346972 + 0.75 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L1MB3|LINE|L1 -133612 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 202.5-120 chr5 116286432 116286745 + 0.75 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) L1M4c|LINE|L1 30845 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 121.5-21 chr1 217021715 217021988 + 0.75 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 55141 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 158.25-15 chr10 104552913 104553232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72797 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 145.25-60 chr18 9844283 9844619 + 0.75 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) intron (NM_006868, intron 5 of 6) -41522 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 232.5-24 chr14 61073995 61074384 + 0.75 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -92499 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 136-17 chr10 75250435 75250646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14583 NM_144589 118881 Hs.355333 NM_144589 ENSG00000165644 COMTD1 - catechol-O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 175-42 chr15 57609113 57609504 + 0.75 NA intron (NM_001018100, intron 2 of 12) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 17404 NR_104371 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 151.75-74 chr2 235832127 235832501 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -314393 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 142-88 chr2 118604945 118605348 + 0.75 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -2180 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 154.75-140 chr8 23263398 23263885 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17000 NM_001317899 91782 Hs.5019 NM_152272 ENSG00000147457 CHMP7 - charged multivesicular body protein 7 protein-coding 143-71 chr2 52577497 52577687 + 0.75 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 125023 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 161.75-126 chr8 110244762 110244978 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -269099 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 114-36 chr12 28961269 28961435 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -187926 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 135.25-114 chr2 224868475 224868715 + 0.75 NA intron (NM_001290263, intron 11 of 55) intron (NM_001290263, intron 11 of 55) 78454 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 122.25-159 chr6 72975172 72975432 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) -7549 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 165.5-157 chr6 1258911 1259357 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -52964 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 227.75-49 chr22 45421338 45421811 + 0.75 NA intron (NM_015653, intron 3 of 6) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7881 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 159.25-69 chr2 101254910 101255284 + 0.75 NA intron (NM_017546, intron 1 of 6) intron (NM_017546, intron 1 of 6) 2211 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 198.75-7 chr1 191671073 191671403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -442740 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 125.5-28 chr10 65695899 65696150 + 0.75 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) intron (NR_120647, intron 4 of 5) 124599 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 112.5-246 chr9 92467373 92467634 + 0.75 NA intron (NM_017680, intron 4 of 8) intron (NM_017680, intron 4 of 8) 15003 NM_017680 54829 Hs.435655 NM_017680 ENSG00000106819 ASPN OS3|PLAP-1|PLAP1|SLRR1C asporin protein-coding 172.25-148 chrX 41126022 41126279 + 0.75 NA intron (NM_001039591, intron 2 of 44) intron (NM_001039591, intron 2 of 44) 40705 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 168-15 chr10 66932352 66932648 + 0.75 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) intron (NM_178011, intron 2 of 2) 6464 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 137.5-183 chr5 18021149 18021460 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 214030 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 171.75-29 chr11 110863375 110863705 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -150351 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 218.25-15 chr10 115673592 115673965 + 0.75 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 521011 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 142.75-186 chr8 89979288 89979671 + 0.75 NA intron (NM_001024688, intron 5 of 16) intron (NM_001024688, intron 5 of 16) 5192 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 239.5-83 chr8 136242369 136243009 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -288109 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 176.25-37 chr13 39804642 39805136 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -140754 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 137.5-157 chr3 37849349 37849672 + 0.75 NA intron (NR_110531, intron 1 of 3) intron (NR_110531, intron 1 of 3) 12270 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-243 chr9 134790786 134791178 + 0.75 NA intron (NM_001278074, intron 32 of 65) intron (NM_001278074, intron 32 of 65) 58387 NR_039691 100616333 NR_039691 ENSG00000264744 MIR3689C - microRNA 3689c ncRNA 144.25-20 chr10 15796970 15797312 + 0.75 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) intron (NM_024948, intron 10 of 14) 63366 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 182.5-8 chr1 173976121 173976681 + 0.75 NA intron (NM_001300852, intron 6 of 18) AluSx|SINE|Alu 16671 NM_001300851 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 142.25-107 chr3 42617604 42618014 + 0.75 NA intron (NM_001349126, intron 3 of 18) intron (NM_001349126, intron 3 of 18) -16731 NM_001201572 9117 Hs.445892 NM_004206 ENSG00000093183 SEC22C SEC22L3 SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein protein-coding 135.5-3 chr1 38350045 38350265 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -125041 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 209.25-115 chr8 143352766 143353170 + 0.75 NA intron (NM_001258447, intron 1 of 13) L1MB5|LINE|L1 7009 NM_001258447 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 171.5-107 chr3 165243856 165244090 + 0.75 NA intron (NR_125764, intron 1 of 5) MER101-int|LTR|ERV1 37013 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 176.25-145 chr9 20380573 20380861 + 0.75 NA intron (NM_001286691, intron 5 of 10) intron (NM_001286691, intron 5 of 10) 30521 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 167.5-74 chr17 63786759 63787227 + 0.75 NA intron (NM_007372, intron 2 of 18) intron (NM_007372, intron 2 of 18) 12804 NM_007372 11325 Hs.702010 NM_007372 ENSG00000198231 DDX42 DDX42P|RHELP|RNAHP|SF3B8|SF3b125 DEAD-box helicase 42 protein-coding 157.5-57 chr14 57245171 57245431 + 0.75 NA intron (NM_006544, intron 3 of 17) intron (NM_006544, intron 3 of 17) 23604 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 203.75-52 chr19 6041867 6042475 + 0.75 NA intron (NM_000635, intron 3 of 17) intron (NM_000635, intron 3 of 17) 63768 NR_046376 100128568 Hs.624525 NR_046376 ENSG00000266983 LOC100128568 - uncharacterized LOC100128568 ncRNA 183.25-60 chr2 138683265 138683622 + 0.75 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 96947 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 149-123 chr7 71848937 71849211 + 0.75 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) L1M4|LINE|L1 488317 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 170-101 chr8 139849775 139850158 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -146843 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 124.5-130 chr20 62982700 62982961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24134 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 319.5-33 chr3 182104946 182105838 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 153028 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 126.25-196 chr8 31619995 31620317 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19596 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 206.75-85 chr7 82286439 82286803 + 0.75 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 157156 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 159.5-82 chr18 12846455 12846749 + 0.75 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) L1MC4|LINE|L1 -5640 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 195-34 chr16 57205815 57206221 + 0.75 NA TTS (NM_001305182) TTS (NM_001305182) 19689 NM_001305164 89970 Hs.460885 NM_133368 ENSG00000159579 RSPRY1 SEMDFA ring finger and SPRY domain containing 1 protein-coding 193-25 chr15 59348816 59349176 + 0.75 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) intron (NM_004998, intron 1 of 27) 23875 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 175.5-124 chr3 140528884 140529152 + 0.75 NA intron (NM_022131, intron 8 of 16) intron (NM_022131, intron 8 of 16) -20229 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-92 chr17 82861430 82861693 + 0.75 NA intron (NM_005993, intron 13 of 38) intron (NM_005993, intron 13 of 38) -21539 NM_024702 79755 Hs.464391 NM_024702 ENSG00000141579 ZNF750 ZFP750 zinc finger protein 750 protein-coding 221.5-15 chr12 53395246 53395742 + 0.75 NA intron (NM_003109, intron 3 of 5) intron (NM_003109, intron 3 of 5) 14850 NM_003109 6667 Hs.620754 NM_003109 ENSG00000185591 SP1 - Sp1 transcription factor protein-coding 165-127 chr7 24365771 24366242 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 81816 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 182.75-17 chr1 212888191 212888566 + 0.75 NA intron (NM_014053, intron 6 of 9) intron (NM_014053, intron 6 of 9) 30103 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 114.75-195 chr8 105830728 105831072 + 0.75 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) intron (NR_125796, intron 2 of 7) 229603 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 128-138 chr6 96918884 96919147 + 0.75 NA intron (NM_001323258, intron 2 of 7) intron (NM_001323258, intron 2 of 7) -5605 NM_001323260 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 125.25-5 chr1 60884778 60885026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59318 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 190-41 chr3 56245441 56245896 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) AluSz|SINE|Alu 222799 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 233.5-90 chr5 121533933 121534407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 211620 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 180.25-46 chr19 28111878 28112360 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -318179 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 128.75-45 chr12 110986035 110986211 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28305 NR_135001 105369980 Hs.564357 NR_135001 ENSG00000258240 LOC105369980 - uncharacterized LOC105369980 ncRNA 219-77 chr4 92922696 92923050 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L1ME3A|LINE|L1 618474 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 200.75-70 chr3 168415558 168416098 + 0.75 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -136026 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 144.5 chr1 3821302 3821631 + 0.75 NA intron (NM_014704, intron 20 of 21) L1MC5|LINE|L1 -24968 NM_020710 57470 Hs.268488 NM_020710 ENSG00000130764 LRRC47 - leucine rich repeat containing 47 protein-coding 125.5-115 chr18 3079833 3080152 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 32 of 36) intron (NM_019856, intron 32 of 36) -68045 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 141.25-170 chr7 42941876 42942269 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9696 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 142.25-117 chr4 36115261 36115576 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 25 of 32) intron (NR_146894, intron 25 of 32) 128521 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 206.5-47 chr2 49471390 49471700 + 0.75 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger -317018 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 159.25-125 chr6 40439927 40440317 + 0.75 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 61785 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 240-58 chr7 41541533 41541947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152179 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 224.5-43 chr14 75720118 75720505 + 0.75 NA intron (NM_015072, intron 11 of 31) intron (NM_015072, intron 11 of 31) 59065 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 145.5-16 chr1 238391519 238391881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94317 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 129-146 chr5 137342341 137342652 + 0.75 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 156830 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 124-71 chr18 10953512 10953723 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) L1ME1|LINE|L1 -193968 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 201-33 chr16 27266451 27266757 + 0.75 NA intron (NM_145080, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu -1601 NR_037184 400512 Hs.434412 NR_037184 ENSG00000245888 NSMCE1-DT - NSMCE1 divergent transcript ncRNA 195.75-102 chr6 108946647 108947021 + 0.75 NA intron (NM_001286609, intron 11 of 16) intron (NM_001286609, intron 11 of 16) -22731 NR_104137 101929716 NR_104137 ARMC2-AS1 - ARMC2 antisense RNA 1 ncRNA 149.25-69 chr19 16011925 16012181 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -3581 NR_026828 126536 Hs.131824 NR_026828 ENSG00000205396 LINC00661 - long intergenic non-protein coding RNA 661 ncRNA 268.5-67 chr9 137678058 137678655 + 0.75 NA intron (NM_001354612, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 59351 NM_001354259 79813 Hs.495511 NM_024757 ENSG00000181090 EHMT1 EHMT1-IT1|EUHMTASE1|Eu-HMTase1|FP13812|GLP|GLP1|KLEFS1|KMT1D euchromatic histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 171.5-135 chr7 10655661 10656043 + 0.75 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) -46824 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 113.75-68 chr15 37396307 37396482 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -295083 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 279-50 chr8 67950425 67950929 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1369 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 116.25-97 chr2 3722151 3722362 + 0.75 NA intron (NM_001287444, intron 2 of 10) intron (NM_001287444, intron 2 of 10) 15414 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 116.5-61 chr14 28541581 28541904 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 223577 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-166 chr7 54845287 54845530 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 86095 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 282.25-39 chr9 102799508 102800043 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -195558 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 132.25-14 chr1 157017267 157017538 + 0.75 NA intron (NM_014784, intron 1 of 39) intron (NM_014784, intron 1 of 39) 28340 NM_198236 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 180.75-123 chr6 13895891 13896281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28360 NM_001165034 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 122.25-153 chr5 64115706 64116062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49959 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 134.75-150 chr3 147363803 147364157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28450 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 154-112 chr5 157891233 157891611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32277 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 171.25-18 chr10 89235706 89236124 + 0.75 NA intron (NM_001288979, intron 1 of 7) intron (NM_001288979, intron 1 of 7) 15860 NM_000235 3988 Hs.643030 NM_000235 ENSG00000107798 LIPA CESD|LAL lipase A, lysosomal acid type protein-coding 162.75-55 chr17 77134318 77134610 + 0.75 NA intron (NM_001204410, intron 2 of 17) AluSz|SINE|Alu -6505 NM_001143998 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 179-18 chr10 89417609 89417974 + 0.75 NA exon (NM_012420, exon 2 of 2) exon (NM_012420, exon 2 of 2) 3223 NM_012420 24138 Hs.252839 NM_012420 ENSG00000152778 IFIT5 ISG58|P58|RI58 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5 protein-coding 134.5-119 chr21 28238973 28239285 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10462 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 220-8 chr10 8100089 8100415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45564 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 112.75-26 chr10 83839797 83839975 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -162797 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 213.5-126 chr8 139453941 139454277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 249014 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 117.5-172 chr5 26430177 26430461 + 0.75 NA Intergenic MER74C|LTR|ERVL 608267 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 181-8 chr10 10828169 10828595 + 0.75 NA intron (NM_001326327, intron 1 of 14) L1MB3|LINE|L1 29657 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 147-66 chr2 27386760 27387056 + 0.75 NA intron (NM_177983, intron 2 of 9) intron (NM_177983, intron 2 of 9) -6174 NM_144631 130557 Hs.515872 NM_144631 ENSG00000163795 ZNF513 HMFT0656|RP58 zinc finger protein 513 protein-coding 116.5-60 chr13 108259036 108259311 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10456 NM_001145645 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 174.25-98 chr3 78222381 78222689 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173572 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 266.25-3 chr1 174410824 174411423 + 0.75 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) L1PA16|LINE|L1 -36841 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 219.75-71 chr6 152609398 152609924 + 0.75 NA intron (NM_182961, intron 3 of 145) L1PA6|LINE|L1 27190 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 154.75-66 chr18 65820925 65821305 + 0.75 NA intron (NM_001362438, intron 4 of 11) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 70103 NM_004361 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 145.75-9 chr1 240858726 240859031 + 0.75 NA intron (NM_001350116, intron 9 of 16) L1MC2|LINE|L1 -246723 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 243.25-6 chr12 91547601 91548018 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -364992 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 218-48 chr3 176175955 176176412 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68368 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 173-82 chr3 33214148 33214537 + 0.75 NA intron (NM_015551, intron 1 of 4) intron (NM_015551, intron 1 of 4) 4468 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 121-194 chr8 121826018 121826315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -184726 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 192.5-123 chr7 95073837 95074221 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) MIR|SINE|MIR 164131 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 164.75-156 chr9 116634920 116635257 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 16 of 21) MIRb|SINE|MIR 52127 NM_198186 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 217.5-111 chr6 109156541 109157070 + 0.75 NA TTS (NM_001350665) TTS (NM_001350665) -9026 NR_152435 221262 Hs.373914 NM_173671 ENSG00000203799 CCDC162P C6orf183|C6orf184|C6orf185|CCDC162 coiled-coil domain containing 162, pseudogene pseudo 198-74 chr8 20768092 20768457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153348 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 159-91 chr5 180323921 180324393 + 0.75 NA intron (NM_005110, intron 9 of 18) intron (NM_005110, intron 9 of 18) 29179 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 176.5-50 chr13 109279689 109279987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112535 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 258.25-16 chr12 87289510 87289945 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -41012 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 126.5-98 chr18 21398022 21398294 + 0.75 NA intron (NM_001142966, intron 5 of 32) intron (NM_001142966, intron 5 of 32) 155916 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 156-171 chrX 140647070 140647322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62563 NR_028345 286411 Hs.317627 NR_028344 ENSG00000203930 LINC00632 ASINC long intergenic non-protein coding RNA 632 ncRNA 172-7 chr1 89928529 89929003 + 0.75 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 66200 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 123.5-37 chr11 45828886 45829091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18130 NM_001127457 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 130-175 chr9 5582815 5583072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46164 NM_001135920 57589 Hs.211520 NM_020829 ENSG00000107036 RIC1 CIP150|KIAA1432|bA207C16.1 RIC1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1 protein-coding 173.5-32 chr11 108423321 108423608 + 0.75 NA intron (NM_001351110, intron 2 of 8) L1PA7|LINE|L1 44065 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 133.25-6 chr1 160993599 160993887 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27409 NM_016946 50848 Hs.517293 NM_016946 ENSG00000158769 F11R CD321|JAM|JAM1|JAMA|JCAM|KAT|PAM-1 F11 receptor protein-coding 157-88 chr4 94677228 94677625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 80107 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 219-57 chr2 220228326 220228859 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -322027 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 122.5-44 chr12 21166823 21167111 + 0.75 NA intron (NM_006446, intron 2 of 14) L1MC2|LINE|L1 35773 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 158.25-160 chrX 109177652 109177911 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 304305 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 151.25-35 chr11 115942963 115943300 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -182931 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 155.25-72 chr16 55191947 55192393 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -132389 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 178.75-94 chr6 148699286 148699672 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -47551 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 153.75-31 chr12 58258047 58258384 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170323 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 163.25-127 chr6 150333715 150334004 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -35153 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 202.5-51 chr15 67148666 67149139 + 0.75 NA intron (NM_001145103, intron 1 of 8) intron (NM_001145103, intron 1 of 8) 10881 NM_001145103 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 190.25-44 chr16 250266 250565 + 0.75 NA intron (NM_001284497, intron 2 of 12) intron (NM_001284497, intron 2 of 12) 15594 NM_001284497 83986 Hs.513225 NM_032039 ENSG00000167930 FAM234A C16orf9|ITFG3|gs19 family with sequence similarity 234 member A protein-coding 233.75-53 chr4 27988161 27988550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 770876 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 130.25-14 chr1 161277525 161277811 + 0.75 NA intron (NM_001102566, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 18923 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 119.5-43 chr11 26714018 26714211 + 0.75 NA intron (NM_178498, intron 1 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7946 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 175-136 chr9 79837493 79837753 + 0.75 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 13093 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 185.75-128 chr8 125335783 125336234 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -94350 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 142.75-138 chr4 26380317 26380679 + 0.75 NA intron (NM_203284, intron 2 of 11) intron (NM_203284, intron 2 of 11) 59270 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 148.5-204 chr7 6698616 6698967 + 0.75 NA intron (NM_006956, intron 2 of 5) intron (NM_006956, intron 2 of 5) 8156 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 234.25-38 chr2 203655329 203655686 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -50968 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 161-89 chr5 23633924 23634184 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 126399 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 129.25-179 chr7 3585199 3585472 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 284083 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 229.25-10 chr10 106759328 106759672 + 0.75 NA intron (NM_001206569, intron 5 of 25) intron (NM_001206569, intron 5 of 25) 405206 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 247-61 chr8 113019600 113020015 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 357345 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 143.75-59 chr15 101105435 101105793 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146434 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 135-147 chr5 122939053 122939295 + 0.75 NA intron (NM_014035, intron 2 of 6) intron (NM_014035, intron 2 of 6) 93561 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 146.75-27 chr11 102410272 102410502 + 0.75 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) intron (NM_052932, intron 2 of 4) 42378 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 209.25-12 chr1 195658482 195658907 + 0.75 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR 430021 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 118.25-84 chr17 80730369 80730618 + 0.75 NA intron (NM_020761, intron 4 of 33) intron (NM_020761, intron 4 of 33) 75139 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 199-23 chr14 71592607 71593243 + 0.75 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) intron (NM_001354286, intron 6 of 24) 6627 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 179.75-74 chr3 103070424 103070959 + 0.75 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 453425 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 209-20 chr14 57700798 57701257 + 0.75 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 163972 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 130.75-172 chr6 150970711 150970910 + 0.75 NA intron (NM_001350486, intron 19 of 27) intron (NM_001350486, intron 19 of 27) -36198 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 120.75-180 chrX 9943713 9944011 + 0.75 NA intron (NM_001320664, intron 4 of 5) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23496 NM_001195081 100288814 NM_001195081 ENSG00000234469 CLDN34 - claudin 34 protein-coding 144-109 chr6 39188125 39188410 + 0.75 NA TTS (NM_003740) TTS (NM_003740) 41208 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 119-19 chr10 92349980 92350161 + 0.75 NA intron (NM_017824, intron 5 of 5) intron (NM_017824, intron 5 of 5) 58903 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 131.5-251 chr9 133023298 133023582 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3010 NR_132981 106635684 NR_132981 SNORD141B - small nucleolar RNA, C/D box 141B snoRNA 153.25-136 chr8 99201323 99201577 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) intron (NM_017890, intron 17 of 61) 188184 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 161.5-88 chr2 8874128 8874376 + 0.75 NA intron (NR_135606, intron 7 of 12) intron (NR_135606, intron 7 of 12) -36639 NM_020738 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 149.75-94 chr2 185186080 185186521 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -19228 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 154.75-79 chr2 210497164 210497438 + 0.75 NA intron (NM_001122633, intron 1 of 38) intron (NM_001122633, intron 1 of 38) 19616 NM_001122633 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 171-76 chr2 218786584 218786977 + 0.75 NA intron (NM_000784, intron 1 of 8) (ATGTATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4633 NM_000784 1593 Hs.516700 NM_000784 ENSG00000135929 CYP27A1 CP27|CTX|CYP27 cytochrome P450 family 27 subfamily A member 1 protein-coding 188-54 chr5 33297632 33298214 + 0.75 NA Intergenic MER48|LTR|ERV1 68188 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 164.25-157 chr8 130104927 130105261 + 0.75 NA intron (NM_018482, intron 24 of 29) intron (NM_018482, intron 24 of 29) -20326 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 220.5-59 chr2 201597849 201598304 + 0.75 NA intron (NM_001168221, intron 4 of 15) intron (NM_001168221, intron 4 of 15) 21102 NM_152525 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 231-33 chr16 51867412 51867844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105109 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 258.5-75 chr8 135484273 135484798 + 0.75 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) MER72B|LTR|ERV1 27079 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 174.5-178 chr7 92197168 92197537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6746 NR_031616 100302218 NR_031616 ENSG00000221520 MIR1285-1 MIRN1285-1|hsa-mir-1285-1 microRNA 1285-1 ncRNA 183.75-58 chr2 166568679 166569131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81934 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 140.25-58 chr15 100835782 100836251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13736 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 173.25-67 chr21 32088907 32089286 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2801 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 190.5-36 chr12 65461383 65461820 + 0.75 NA intron (NM_001031679, intron 6 of 6) intron (NM_001031679, intron 6 of 6) 95710 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 129-25 chr10 73139975 73140212 + 0.75 NA intron (NM_007265, intron 9 of 13) AluSx4|SINE|Alu -13886 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 201.75-7 chr1 238697817 238698106 + 0.75 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -211944 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 186.25-117 chr8 40215866 40216166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62534 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 235.25-26 chr17 60224617 60225279 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 13 of 33) intron (NM_032582, intron 13 of 33) 6697 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 183.25-67 chr21 37069108 37069438 + 0.75 NA intron (NM_153682, intron 3 of 4) HAL1|LINE|L1 3530 NM_153681 51227 Hs.656565 NM_016430 ENSG00000185808 PIGP DCRC|DCRC-S|DSCR5|DSRC|EIEE55|PIG-P phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class P protein-coding 118-179 chr8 42163043 42163297 + 0.75 NA intron (NM_006803, intron 4 of 8) FAM|SINE|Alu 10107 NM_006803 10947 Hs.654529 NM_006803 ENSG00000070718 AP3M2 AP47B|CLA20|P47B adaptor related protein complex 3 subunit mu 2 protein-coding 122.25-83 chr19 5595355 5595617 + 0.75 NA exon (NM_014649, exon 14 of 21) exon (NM_014649, exon 14 of 21) 27290 NM_014649 9667 Hs.655392 NM_014649 ENSG00000130254 SAFB2 - scaffold attachment factor B2 protein-coding 162.75-118 chr5 102235684 102236077 + 0.75 NA 3' UTR (NM_180991, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_180991, exon 13 of 13) 60404 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 305-12 chr15 58481842 58482459 + 0.75 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 16585 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 182.5-157 chr7 96131245 96131641 + 0.75 NA intron (NM_001160210, intron 15 of 17) intron (NM_001160210, intron 15 of 17) 88313 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 132.75-31 chr10 100032337 100032601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22522 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 205.75-65 chr5 78336984 78337528 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23285 NR_105014 728769 Hs.586193 NR_105014 ENSG00000245556 SCAMP1-AS1 - SCAMP1 antisense RNA 1 ncRNA 163.75-75 chr2 198464221 198464567 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -89297 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 423.75-2 chr12 77548746 77549879 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -281582 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 186.75-53 chr2 99051202 99051708 + 0.75 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1MA9|LINE|L1 89725 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 170.5-73 chr17 29909313 29909680 + 0.75 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) intron (NM_001282129, intron 1 of 15) -20407 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 119.5-221 chr7 131002371 131002603 + 0.75 NA intron (NR_109850, intron 3 of 5) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 89023 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 159.5-127 chr20 61587581 61587953 + 0.75 NA intron (NM_001252338, intron 1 of 14) intron (NM_001252338, intron 1 of 14) -11994 NM_001252339 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 128.5-232 chr9 21498773 21499032 + 0.75 NA intron (NR_152877, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 13283 NR_029505 407035 NR_029505 ENSG00000199177 MIR31 MIRN31|hsa-mir-31|miR-31 microRNA 31 ncRNA 148.25-140 chr7 110328832 110329236 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -368821 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 159.5-96 chr2 42362209 42362608 + 0.75 NA intron (NM_001319036, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -1165 NM_001319040 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 152.25-90 chr2 149390187 149390531 + 0.75 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 59772 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 117.5-183 chr5 94492447 94492727 + 0.75 NA intron (NM_001145678, intron 5 of 20) L2c|LINE|L2 126017 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 132.25-42 chr11 46326908 46327204 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5870 NM_201532 8525 Hs.502461 NM_003646 ENSG00000149091 DGKZ DAGK5|DAGK6|DGK-ZETA|hDGKzeta diacylglycerol kinase zeta protein-coding 133-151 chr6 75883255 75883480 + 0.75 NA intron (NM_001300899, intron 23 of 32) Ricksha_a|DNA|MULE-MuDR 134128 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 255.25-36 chr4 30336095 30336436 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -384104 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 182-84 chr4 129427137 129427488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 331160 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 127-156 chr7 10348397 10348682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -354137 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 421.25-10 chr3 14744977 14745888 + 0.75 NA intron (NM_001184957, intron 12 of 16) L1ME4b|LINE|L1 65982 NR_135245 152274 Hs.434128 NR_135245 ENSG00000260902 LINC02011 - long intergenic non-protein coding RNA 2011 ncRNA 114-10 chr1 147086128 147086357 + 0.75 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -1486 NR_121645 101447996 NR_121645 ENSG00000286172 RNVU1-8 RNU1-145|vU1.8 RNA, variant U1 small nuclear 8 snRNA 196.25-50 chr17 76288480 76288798 + 0.75 NA intron (NM_032134, intron 5 of 18) AluSx|SINE|Alu 19041 NM_032134 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 131.25-31 chr11 66545400 66545741 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001258371) promoter-TSS (NM_001258371) 478 NM_207340 254359 Hs.209587 NM_207340 ENSG00000174165 ZDHHC24 - zinc finger DHHC-type containing 24 protein-coding 166.25-62 chr17 42878557 42879023 + 0.75 NA non-coding (NR_027254, exon 4 of 6) non-coding (NR_027254, exon 4 of 6) 11645 NR_002773 90586 Hs.367781 NR_002773 ENSG00000260105 AOC4P AOC4|UPAT amine oxidase copper containing 4, pseudogene pseudo 137-110 chr3 181365674 181365872 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 76713 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 131.25-214 chr9 37178745 37179029 + 0.75 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 58289 NM_001289121 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 115-28 chr11 27458121 27458348 + 0.75 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) L1ME1|LINE|L1 -13497 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 149-94 chr4 123318019 123318436 + 0.75 NA 3' UTR (NM_145207, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_145207, exon 16 of 16) -78568 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 116-15 chr10 52161485 52161674 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 8 of 17) intron (NM_001098512, intron 8 of 17) 152549 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 167-66 chr2 196440934 196441333 + 0.75 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) -78956 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 149.25-34 chr12 47321930 47322260 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -14696 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 140.75-142 chr5 41595429 41595655 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -84941 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 135-123 chr4 44933128 44933347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -206603 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 174.5-22 chr10 78935354 78935695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131924 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 178.25-105 chr6 145682388 145682769 + 0.75 NA intron (NM_001368129, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 4299 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 122.25-54 chr14 21297363 21297573 + 0.75 NA intron (NM_020366, intron 2 of 23) intron (NM_020366, intron 2 of 23) 9491 NM_020366 57096 Hs.126035 NM_020366 ENSG00000092200 RPGRIP1 CORD13|LCA6|RGI1|RGRIP|RPGRIP|RPGRIP1d RPGR interacting protein 1 protein-coding 116.75-89 chr2 26276064 26276236 + 0.75 NA intron (NM_001281512, intron 5 of 14) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 31211 NM_000183 3032 Hs.515848 NM_000183 ENSG00000138029 HADHB ECHB|MSTP029|MTPB|TP-BETA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit beta protein-coding 163.5-31 chr11 22877952 22878226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17615 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 189.5-117 chr6 13665162 13665472 + 0.75 NA intron (NM_005493, intron 2 of 13) L1ME2z|LINE|L1 46518 NM_005493 10048 Hs.708182 NM_005493 ENSG00000010017 RANBP9 BPM-L|BPM90|RANBPM|RanBP7 RAN binding protein 9 protein-coding 137.75-38 chr11 107742953 107743200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31020 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 189-70 chr2 236756378 236756729 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 186728 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 125.25-152 chr5 17972329 17972765 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165273 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 119.25-97 chr2 116483238 116483588 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 1139598 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 127.5-103 chr18 5823519 5823834 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17019 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 179.75-129 chr8 21624215 21624476 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 164530 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 178-37 chr17 75785641 75786034 + 0.75 NA intron (NM_001080419, intron 1 of 15) intron (NM_001080419, intron 1 of 15) 998 NR_038131 85451 Hs.584768 NM_001080419 ENSG00000132478 UNK UNKEMPT|ZC3H5|ZC3HDC5 unk zinc finger protein-coding 155.5-200 chr7 95223556 95223923 + 0.75 NA intron (NM_001166160, intron 7 of 19) intron (NM_001166160, intron 7 of 19) 100793 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 171.75-60 chr17 53819460 53819754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3320 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 143.5-93 chr17 69186034 69186306 + 0.75 NA intron (NM_080282, intron 20 of 39) intron (NM_080282, intron 20 of 39) -44275 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 183.75-11 chr1 219906889 219907164 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21625 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 203.75-110 chr8 76930050 76930440 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 36605 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 137.75-219 chrX 80430718 80431003 + 0.75 NA intron (NM_152630, intron 1 of 2) LTR25-int|LTR|ERV1 10413 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 191.25-11 chr10 60236698 60237183 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 8 of 43) MER58A|DNA|hAT-Charlie -95924 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 156.75-173 chr9 135233254 135233535 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 51785 NR_046107 401557 Hs.640138 NR_046107 LOC401557 - uncharacterized LOC401557 ncRNA 145.5-179 chr7 31133972 31134335 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 81692 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 143.25-35 chr12 26928320 26928543 + 0.75 NA intron (NM_018164, intron 4 of 16) intron (NM_018164, intron 4 of 16) 9550 NM_018164 55726 Hs.505077 NM_018164 ENSG00000064102 INTS13 ASUN|C12orf11|GCT1|Mat89Bb|NET48|SPATA30 integrator complex subunit 13 protein-coding 208.75-24 chr12 80799838 80800164 + 0.75 NA intron (NM_004664, intron 5 of 5) L1MC|LINE|L1 32628 NR_030348 693202 NR_030348 ENSG00000207763 MIR617 MIRN617|hsa-mir-617 microRNA 617 ncRNA 156.75-50 chr13 84729700 84729970 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53819 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 199.25-84 chr5 98294748 98295112 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -133691 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 120-117 chr3 55771910 55772202 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) MIRb|SINE|MIR 80538 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 120-124 chr3 148727438 148727668 + 0.75 NA intron (NM_000685, intron 2 of 2) intron (NM_000685, intron 2 of 2) -2627 NM_032049 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 177.25-72 chr2 168766096 168766342 + 0.75 NA intron (NM_203463, intron 9 of 9) intron (NM_203463, intron 9 of 9) 20210 NR_045787 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 113-48 chr12 13424620 13424882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48006 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 196-76 chr5 23737101 23737447 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -214074 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 135.25-187 chr7 4615838 4616157 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -66298 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 232.25-88 chr9 82721421 82721822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 341521 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 115.25-31 chr10 97086931 97087140 + 0.75 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) L1MC1|LINE|L1 -15721 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 184.25-24 chr11 65910385 65910771 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 8484 NM_031450 83638 Hs.433573 NM_031450 ENSG00000175573 C11orf68 BLES03|P5326 chromosome 11 open reading frame 68 protein-coding 185.75-116 chr7 33080177 33080508 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -17545 NM_001002009 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 152-60 chr16 76479538 76479785 + 0.75 NA intron (NR_136210, intron 12 of 24) intron (NR_136210, intron 12 of 24) -155337 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 191.75-7 chr1 169886486 169886959 + 0.75 NA intron (NM_181093, intron 2 of 13) intron (NM_181093, intron 2 of 13) 7174 NM_020423 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 172.5-124 chr3 87000775 87001089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9783 NM_001320493 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 199.5-69 chr2 19027268 19027610 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_135287) promoter-TSS (NR_135287) -468 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 218-33 chr2 66996695 66997283 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -74499 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 224.75-22 chr12 29360042 29360510 + 0.75 NA intron (NM_016570, intron 6 of 13) L1ME3G|LINE|L1 20896 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 150.75-15 chr1 109643933 109644299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11960 NR_024538 2948 Hs.348387 NM_000850 ENSG00000168765 GSTM4 GSTM4-4|GTM4 glutathione S-transferase mu 4 protein-coding 288.5-10 chr13 26498554 26498984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58914 NM_006646 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 143.75-97 chr2 148805845 148806139 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -69235 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 140-140 chr5 105752476 105752887 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 653207 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 138.5-37 chr11 84563962 84564171 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 156876 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 223.25-7 chr11 18466292 18466727 + 0.75 NA intron (NM_001144071, intron 4 of 7) AluJb|SINE|Alu 10653 NM_144972 160287 Hs.668877 NM_144972 ENSG00000166800 LDHAL6A LDH6A lactate dehydrogenase A like 6A protein-coding 142.5-218 chr8 84332825 84333080 + 0.75 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) -82532 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 114.5-261 chr8 87455367 87455610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 418527 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 151.75-58 chr18 80101039 80101346 + 0.75 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -8070 NM_014913 22850 Hs.131915 NM_014913 ENSG00000101544 ADNP2 ZNF508 ADNP homeobox 2 protein-coding 143.25-15 chr10 29032586 29032844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 186307 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 145.5-110 chr2 211003255 211003510 + 0.75 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 385811 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 155.5-191 chr7 10857294 10857613 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -77509 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 130.5-253 chr9 72493312 72493687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28302 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 205.25-2 chr1 86530333 86530652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16586 NM_012128 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 118-118 chr3 133393978 133394280 + 0.75 NA intron (NM_023943, intron 5 of 5) intron (NM_023943, intron 5 of 5) -5927 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 132.25-103 chr2 161910165 161910386 + 0.75 NA intron (NM_001354443, intron 15 of 25) intron (NM_001354443, intron 15 of 25) 163940 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 125.25-26 chr10 61213253 61213575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197139 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 165.75-44 chr13 27675754 27676154 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 54062 NM_152705 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 146.5-222 chr8 85054135 85054412 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -52965 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 161.5-132 chr3 58704972 58705217 + 0.75 NA Intergenic LTR103_Mam|LTR|ERV1? -38320 NM_138805 131177 Hs.61265 NM_138805 ENSG00000198643 FAM3D EF7|OIT1 family with sequence similarity 3 member D protein-coding 157.75-126 chr4 115097910 115098128 + 0.75 NA intron (NM_022569, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 15601 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 165.75-52 chr14 55831708 55831984 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -35172 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 256.5-13 chr11 113251532 113251959 + 0.75 NA intron (NM_001076682, intron 16 of 18) intron (NM_001076682, intron 16 of 18) 22156 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 138.75-117 chr3 59758127 59758380 + 0.75 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) -99756 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 223.75-16 chr12 44893460 44893801 + 0.75 NA intron (NM_001145110, intron 1 of 20) intron (NM_001145110, intron 1 of 20) -16780 NM_001145107 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 127.5-218 chr7 2742749 2742936 + 0.75 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 20298 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 132.5-45 chr11 105623989 105624255 + 0.75 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 13416 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 164.25-95 chr3 8487369 8487723 + 0.75 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) AluY|SINE|Alu 14112 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 159-117 chr8 117090393 117090665 + 0.75 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -44466 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 137.75-198 chr7 89177797 89178051 + 0.75 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) AluYc|SINE|Alu -382187 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 158.5-180 chr7 43694027 43694380 + 0.75 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 35320 NR_135581 55744 Hs.268887 NM_018224 ENSG00000106603 COA1 C7orf44|MITRAC15 cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog protein-coding 191.75-68 chr2 127078211 127078527 + 0.75 NA intron (NM_001320633, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 3696 NM_001320634 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 175.25-130 chr7 11369045 11369312 + 0.75 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 395306 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 140.25-131 chr4 78706521 78706849 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 60691 NR_038305 100505702 Hs.235795 NR_038303 LINC01094 - long intergenic non-protein coding RNA 1094 ncRNA 142-103 chr3 32358654 32358867 + 0.75 NA intron (NM_178868, intron 2 of 3) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -33093 NM_181472 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 114.5-277 chr9 76677510 76677776 + 0.75 NA intron (NM_001308048, intron 9 of 17) intron (NM_001308048, intron 9 of 17) 14772 NM_001308049 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 117-35 chr12 7179194 7179401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9388 NM_001351124 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 209.25-72 chr22 25946517 25946830 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 35 of 43) intron (NM_001318245, intron 35 of 43) 204485 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 211.75-106 chrX 99815174 99815490 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 594941 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 231.5-93 chr7 53370300 53370725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 334879 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 170-84 chr5 151375984 151376422 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -28644 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 116.75-159 chr5 12572528 12572821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2183 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 142.25-56 chr14 57139753 57140071 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 128993 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 148.25-141 chr8 36819352 36819598 + 0.75 NA intron (NM_001031836, intron 10 of 26) intron (NM_001031836, intron 10 of 26) 35101 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 141.75-103 chr2 196325851 196326062 + 0.75 NA intron (NM_020760, intron 5 of 28) intron (NM_020760, intron 5 of 28) 36221 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 208.25-50 chr2 226010040 226010556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132496 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 132.5-187 chr4 161507322 161507604 + 0.75 NA intron (NM_001128428, intron 10 of 14) intron (NM_001128428, intron 10 of 14) -515270 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 201.5-34 chr11 50538144 50538444 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 129147 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 165.25-88 chr3 31755258 31755536 + 0.75 NA intron (NM_001174060, intron 3 of 10) intron (NM_001174060, intron 3 of 10) 51184 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 231.75-73 chr8 89518222 89518663 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 239269 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 121.75-56 chr16 30904321 30904574 + 0.75 NA TTS (NM_001142544) TTS (NM_001142544) 7833 NM_001142544 1489 Hs.483811 NM_001330 ENSG00000150281 CTF1 CT-1|CT1 cardiotrophin 1 protein-coding 158.25-99 chr4 26225831 26226116 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -93737 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 157-77 chr3 95842241 95842600 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -159227 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 200.25-78 chr3 123633787 123634209 + 0.75 NA intron (NM_001321309, intron 28 of 32) intron (NM_001321309, intron 28 of 32) -13450 NM_053031 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 129.75-32 chr10 104753875 104754090 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -87766 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 199.5-21 chr11 13738244 13738583 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45973 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 147.25-66 chr2 168965196 168965590 + 0.75 NA intron (NM_003742, intron 17 of 27) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 64102 NM_021176 57818 Hs.283963 NM_021176 ENSG00000152254 G6PC2 IGRP glucose-6-phosphatase catalytic subunit 2 protein-coding 165.75-135 chr5 61503513 61504058 + 0.75 NA intron (NM_020928, intron 4 of 13) intron (NM_020928, intron 4 of 13) -133975 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 181.75-3 chr1 35084354 35084725 + 0.75 NA intron (NM_001319955, intron 1 of 8) L1MEg|LINE|L1 5154 NM_024772 79830 Hs.471243 NM_024772 ENSG00000197056 ZMYM1 MYM zinc finger MYM-type containing 1 protein-coding 163.75-113 chr5 168036234 168036556 + 0.75 NA intron (NM_001080428, intron 3 of 24) AluSq2|SINE|Alu -129450 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 116.5-196 chr5 40281508 40281844 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 229385 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 148.75-7 chr1 105472169 105472588 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 146557 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 183 chr1 44497914 44498302 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -47385 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 137.25-68 chr2 63853108 63853322 + 0.75 NA intron (NM_006759, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 11335 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 178.5-55 chr15 83809384 83809655 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 5 of 29) MER83C|LTR|ERV1 155396 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 146-102 chr4 163842103 163842370 + 0.75 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) intron (NM_001166373, intron 3 of 7) -228702 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 176.25-78 chr2 200932535 200933006 + 0.75 NA intron (NR_033915, intron 10 of 16) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 30890 NR_033915 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 213-19 chr11 55926477 55926989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9667 NM_006637 10798 Hs.533706 NM_006637 ENSG00000167825 OR5I1 HSOlf1|OLF1 olfactory receptor family 5 subfamily I member 1 protein-coding 167-31 chr12 61874748 61875097 + 0.75 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 317917 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 127.25-55 chr14 25952706 25952974 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 600590 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 187.75-13 chr10 95600244 95600720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39111 NM_001290295 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 126.5-242 chr8 90782146 90782439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9483 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 142.5-21 chr1 232730064 232730331 + 0.75 NA intron (NR_110683, intron 3 of 3) AluSc|SINE|Alu 12126 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 174.25-31 chr12 4971025 4971315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61265 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 144.5-133 chr3 96391013 96391389 + 0.75 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 31237 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 114.75-177 chr7 93419775 93420008 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 62964 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 226.25-49 chr3 157701884 157702411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158803 NM_001243729 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 152-137 chr6 133369414 133369676 + 0.75 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 128046 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 123.75-198 chr9 4389029 4389343 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -89118 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 141.5-56 chr14 61860867 61861188 + 0.75 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 48324 NM_001367656 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 146-60 chr2 14989939 14990219 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 357362 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 211-22 chr15 71152713 71153074 + 0.75 NA intron (NM_024817, intron 1 of 16) LTR78|LTR|ERV1 11444 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 157.5-45 chr12 42368927 42369182 + 0.75 NA intron (NM_001364830, intron 3 of 6) MER58A|DNA|hAT-Charlie 37256 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 222.5-64 chr22 39897793 39898180 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3098 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 116-153 chr7 50640168 50640456 + 0.75 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) intron (NM_001350816, intron 6 of 17) 64989 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 122.25-2 chr1 61505523 61505867 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -148547 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 139.5-203 chr7 86043029 86043376 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -600707 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 174.75-51 chr2 3749381 3749685 + 0.75 NA intron (NM_001287444, intron 4 of 10) intron (NM_001287444, intron 4 of 10) 42691 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 129.75-148 chr5 62907643 62907955 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 328980 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 156.25-38 chr14 48095107 48095465 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -300272 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 157.5-177 chr6 48441861 48442113 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -373298 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 124.75-141 chr3 27857200 27857500 + 0.75 NA intron (NR_146630, intron 4 of 4) L1PA11|LINE|L1 -23214 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 125.25-96 chr2 40865357 40865710 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -353098 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 284.25-3 chr1 112987843 112988501 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 31757 NR_103744 100506392 Hs.418285 NR_103743 ENSG00000226419 SLC16A1-AS1 - SLC16A1 antisense RNA 1 ncRNA 129.5-244 chrX 38655647 38655873 + 0.75 NA intron (NM_004615, intron 1 of 7) intron (NM_004615, intron 1 of 7) 94282 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 197 chr1 18770171 18770750 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 89201 NM_152232 80834 Hs.553548 NM_152232 ENSG00000179002 TAS1R2 GPR71|T1R2|TR2 taste 1 receptor member 2 protein-coding 195.75-103 chr6 111717416 111717925 + 0.75 NA intron (NM_153047, intron 4 of 13) AluSq2|SINE|Alu 41461 NM_153048 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 165.75-21 chr10 100393261 100393517 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 19813 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 188.5-93 chr22 26332071 26332476 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 9 of 14) AluSx|SINE|Alu -96987 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 124.75-37 chr10 117284060 117284267 + 0.75 NA exon (NM_173791, exon 5 of 5) exon (NM_173791, exon 5 of 5) 43049 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 215.5-38 chr16 9760007 9760374 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000833, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_000833, exon 14 of 14) -304685 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 296.75-3 chr10 41823015 41823506 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 544785 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 136.75-190 chr8 48191109 48191424 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 182835 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 118-153 chr5 80860036 80860369 + 0.75 NA intron (NM_002439, intron 21 of 23) L1MCa|LINE|L1 -100161 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 285.25-27 chr5 4328967 4329584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -444206 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 183.25-57 chr2 88541180 88541465 + 0.75 NA intron (NR_110236, intron 2 of 2) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 2602 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 156.75-79 chr2 6466301 6466656 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -91056 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 142.75-38 chr11 70579836 70580112 + 0.75 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -51120 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 161.25-183 chr9 76822202 76822609 + 0.75 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) intron (NM_001308048, intron 6 of 17) 57969 NR_132312 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 204-56 chr4 74030346 74030691 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 8171 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 164.25-135 chr5 180181291 180181557 + 0.75 NA intron (NM_175062, intron 1 of 13) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 27787 NM_175062 255426 Hs.190559 NM_175062 ENSG00000146090 RASGEF1C - RasGEF domain family member 1C protein-coding 135.25-202 chr8 128232236 128232601 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 82302 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 132.25-105 chr2 187056569 187056897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207563 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 181.75-140 chr9 78036135 78036433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4473 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 169.75-38 chr12 48294168 48294500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34646 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 207.5-114 chr8 74579503 74579875 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -20177 NR_033830 441355 Hs.647162 NR_033830 ENSG00000254349 MIR2052HG - MIR2052 host gene ncRNA 121.5-218 chr6 38479545 38479867 + 0.75 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) -1890 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-34 chr12 87057348 87057536 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -218442 NM_001351286 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 115.75-181 chr6 15687029 15687311 + 0.75 NA Intergenic MER68C|LTR|ERVL -24112 NM_001271667 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 187-6 chr1 208277312 208277787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33165 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 123-43 chr13 74018135 74018403 + 0.75 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) L1MA8|LINE|L1 115660 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 171.5-130 chr6 116123196 116123598 + 0.75 NA intron (NM_000493, intron 2 of 2) intron (NM_000493, intron 2 of 2) 2735 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 143.5-59 chr14 42196155 42196400 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 589421 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 152-131 chr6 47599418 47599703 + 0.75 NA intron (NM_012120, intron 13 of 17) intron (NM_012120, intron 13 of 17) -56912 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 113.5-241 chr8 132313164 132313437 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L1M6|LINE|L1 133962 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 143.75-191 chr8 118928051 118928256 + 0.75 NA intron (NM_002546, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu 23732 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 202-24 chr14 21907814 21908289 + 0.75 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -237034 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 188-78 chr8 80532766 80533187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46750 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 158.75-101 chr20 44446352 44446672 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 4045 NR_109893 101927242 Hs.143307 NR_109893 ENSG00000168746 LINC01430 - long intergenic non-protein coding RNA 1430 ncRNA 180.5-146 chr7 114948931 114949298 + 0.75 NA intron (NM_001166345, intron 3 of 4) (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26960 NM_001166346 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 138.75-189 chr8 59401018 59401333 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 281965 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 150-67 chr18 54527208 54527480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60415 NM_001307955 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 162.75-88 chr20 44168113 44168563 + 0.75 NA intron (NM_020433, intron 1 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 18850 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 159.5-69 chr16 59734588 59734940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20427 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 148.5-216 chr7 107297314 107297724 + 0.75 NA intron (NM_181733, intron 12 of 20) AluSg|SINE|Alu 128516 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 123.75-182 chr8 32533592 32533917 + 0.75 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -14456 NM_001160005 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 143.25-44 chr13 71234331 71234610 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 219329 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 144-76 chr20 48007062 48007369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17098 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 124.75-147 chr3 128243754 128243951 + 0.75 NA intron (NM_021937, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR -89938 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 249-21 chr2 99974313 99974985 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 130934 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 198.5-129 chr7 24667160 24667604 + 0.75 NA intron (NM_016447, intron 9 of 12) intron (NM_016447, intron 9 of 12) 90082 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 118.5-163 chr5 33199149 33199457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30432 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 186.5-140 chr9 72717262 72717584 + 0.75 NA intron (NM_138691, intron 8 of 23) L1PBa|LINE|L1 156686 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 132.25-23 chr1 233570508 233570732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43486 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 183.75-113 chr7 3461509 3461831 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L2|LINE|L2 160418 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 167.5-172 chr6 158891603 158891924 + 0.75 NA intron (NR_160979, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 3286 NR_160979 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 229.5-56 chr19 11642666 11643096 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 24208 NR_002944 664709 Hs.534822 NR_002944 HNRNPA1P10 HNRPA1L-2 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 10 pseudo 175.75-58 chr18 22480416 22480788 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -62687 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 189-105 chr8 117626219 117626558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105675 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 130.25-223 chr9 120580278 120580677 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_018249) promoter-TSS (NM_018249) -307 NM_001272039 55755 Hs.269560 NM_018249 ENSG00000136861 CDK5RAP2 C48|Cep215|MCPH3 CDK5 regulatory subunit associated protein 2 protein-coding 193.5-9 chr1 93141487 93141783 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 38778 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 113-57 chr13 49138050 49138295 + 0.75 NA intron (NM_001079673, intron 6 of 25) intron (NM_001079673, intron 6 of 25) 27855 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 149-25 chr13 81988581 81988922 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -761768 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 139.5-212 chr8 82412762 82413050 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -499198 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 305.5-48 chr8 19209480 19210272 + 0.75 NA intron (NR_038919, intron 3 of 4) intron (NR_038919, intron 3 of 4) 35646 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 143.75-48 chr14 54002843 54003084 + 0.75 NA Intergenic X9_LINE|LINE|L1 -46072 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 188-70 chr7 84434855 84435195 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -97451 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 213.75-2 chr1 17937010 17937479 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -128413 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 182-30 chr14 53763770 53764234 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 184482 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 150.25-147 chr8 91686608 91686843 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 330955 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 196.5-15 chr10 25647964 25648451 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -3505 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 168-104 chr5 64434442 64434784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71402 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 209.25-43 chr17 62579821 62580315 + 0.75 NA intron (NM_001284363, intron 12 of 19) intron (NM_001284363, intron 12 of 19) -47602 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 213.75-18 chr10 111889639 111890089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 293901 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 153.75-111 chr5 2053444 2053709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 166245 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 127.5-209 chr6 52133812 52134255 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10316 NR_029713 406989 NR_029713 ENSG00000207604 MIR206 MIRN206|miRNA206|mir-206 microRNA 206 ncRNA 161.5-33 chr11 74745339 74745652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3354 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 192.5-104 chr5 6456879 6457267 + 0.75 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) intron (NM_001145161, intron 1 of 1) 8214 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 160.75-52 chr15 86293655 86293995 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 16 of 24) intron (NM_152336, intron 16 of 24) 23143 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 158-154 chr9 88067720 88068022 + 0.75 NA intron (NR_135138, intron 1 of 1) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 10029 NR_135138 102724156 Hs.633031 NR_135137 LOC102724156 - uncharacterized LOC102724156 ncRNA 152.5-103 chr21 29321106 29321451 + 0.75 NA non-coding (NR_027655, exon 2 of 8) non-coding (NR_027655, exon 2 of 8) 16074 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 151-50 chr18 4651467 4651686 + 0.75 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -196269 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 124.5-150 chr4 63112181 63112373 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -950512 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-202 chr5 62980670 62980963 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 401997 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 254.5-22 chr12 41651803 41652185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112195 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 145-152 chr8 3466002 3466481 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 12 of 69) MIR|SINE|MIR -737790 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 156-149 chr8 55761494 55761957 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001286660, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001286660, exon 3 of 3) 11653 NM_001363176 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 199.5-127 chr6 46079131 46079623 + 0.75 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) 971 NM_001114086 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 118-161 chr6 13089486 13089661 + 0.75 NA intron (NM_001322308, intron 4 of 13) MIR3|SINE|MIR 76019 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 152.25-80 chr2 43368597 43368908 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 141541 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 145-91 chr20 52667344 52667717 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46692 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 152.5-36 chr12 60846536 60846925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1157360 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 129.5-107 chr2 19705336 19705549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -163412 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 140.75-32 chr11 110823335 110823571 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -110264 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 161.25-100 chr2 169824829 169825137 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014168) promoter-TSS (NM_014168) -52 NM_001293186 29081 Hs.470553 NM_014168 ENSG00000138382 METTL5 HSPC133 methyltransferase like 5 protein-coding 255.25-40 chr5 84763825 84764276 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -379170 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 204.5-137 chr8 137452441 137452819 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39042 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 183.5-124 chr6 49056198 49056516 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 406896 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 195.25-105 chrX 20899027 20899401 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -475204 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 124.5-66 chr14 82207226 82207504 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -435267 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 134-138 chr4 184141904 184142265 + 0.75 NA intron (NM_153343, intron 2 of 7) intron (NM_153343, intron 2 of 7) 75789 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 113.5-65 chr13 56518419 56518570 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -622424 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 147.25-144 chr8 101407667 101408045 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38963 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 137.5-178 chr4 118107569 118107817 + 0.75 NA intron (NM_004784, intron 3 of 13) intron (NM_004784, intron 3 of 13) 73207 NR_146514 9348 Hs.480596 NM_004784 ENSG00000164100 NDST3 HSST3 N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 protein-coding 206-44 chr2 156520973 156521425 + 0.75 NA intron (NM_000408, intron 6 of 16) L1ME3F|LINE|L1 84820 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 173-58 chr19 14073951 14074261 + 0.75 NA TTS (NR_106715) TTS (NR_106715) 745 NR_106715 102466515 NR_106715 ENSG00000284081 MIR1199 hsa-mir-1199 microRNA 1199 ncRNA 250-55 chr7 77468518 77469317 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -52568 NM_001350896 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 128.75-92 chr2 25129494 25129717 + 0.75 NA intron (NM_014971, intron 6 of 22) intron (NM_014971, intron 6 of 22) 38975 NM_000939 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 196-8 chr1 173246331 173246639 + 0.75 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) L1P3|LINE|L1 -39154 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 133.75-102 chr2 123000698 123000940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72662 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 121.5-59 chr12 57466867 57467064 + 0.75 NA intron (NM_005269, intron 8 of 11) ORSL|DNA|hAT-Tip100 6814 NM_001167609 2735 Hs.632702 NM_005269 ENSG00000111087 GLI1 GLI|PAPA8|PPD1 GLI family zinc finger 1 protein-coding 184.25-105 chr5 136214897 136215266 + 0.75 NA intron (NM_020389, intron 11 of 11) MER5A|DNA|hAT-Charlie -11574 NR_133682 106478968 Hs.637713 NR_133682 ENSG00000250947 TRPC7-AS2 CTB-28J9.2 TRPC7 antisense RNA 2 ncRNA 135-140 chr5 35550363 35550749 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -67307 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 137.5-167 chr3 184940316 184940642 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 35 of 46) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 127972 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 217.75-59 chr5 98119976 98120357 + 0.75 NA intron (NR_146477, intron 3 of 4) intron (NR_146477, intron 3 of 4) 41073 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 152-83 chr2 44119879 44120159 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48784 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 199.25-108 chrX 20853360 20853852 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -520812 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 119.25-224 chrX 100311320 100311619 + 0.75 NA intron (NM_020766, intron 4 of 4) intron (NM_020766, intron 4 of 4) 98804 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 170.5-150 chr5 106014268 106014583 + 0.75 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 914951 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 147.75-108 chr3 94576429 94576666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -361716 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 124.25-16 chr1 196062885 196063193 + 0.75 NA intron (NR_146895, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 25676 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 120.5-104 chr19 28245551 28245848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -360989 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 224-54 chr7 2238141 2238665 + 0.75 NA intron (NM_013393, intron 2 of 2) intron (NM_013393, intron 2 of 2) 3802 NM_013393 29960 Hs.279877 NM_013393 ENSG00000122687 MRM2 FJH1|FTSJ2|HEL97|RRMJ2 mitochondrial rRNA methyltransferase 2 protein-coding 203.25-9 chr1 180653090 180653499 + 0.75 NA intron (NR_137330, intron 1 of 12) intron (NR_137330, intron 1 of 12) 21272 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 149-31 chr14 43617548 43617909 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 889555 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 144.5-21 chr1 189646225 189646548 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 829624 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 154.5-123 chr3 16481065 16481308 + 0.75 NA intron (NM_015150, intron 2 of 9) intron (NM_015150, intron 2 of 9) 32513 NM_015150 23180 Hs.98910 NM_015150 ENSG00000131378 RFTN1 MIG2|PIB10|PIG9|RAFTLIN raftlin, lipid raft linker 1 protein-coding 179.25-60 chr16 78395680 78396057 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 5 of 7) intron (NM_001291997, intron 5 of 7) 296214 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 172.25-96 chr4 34940110 34940541 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -670578 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 195-3 chr1 165302672 165303032 + 0.75 NA intron (NM_177398, intron 3 of 8) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 53389 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 141.5-206 chr7 5707982 5708312 + 0.75 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) L1MB1|LINE|L1 3763 NR_106934 102466203 NR_106934 ENSG00000283419 MIR6874 hsa-mir-6874 microRNA 6874 ncRNA 310.5-39 chr8 101496754 101497427 + 0.75 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) intron (NM_001330593, intron 1 of 15) 4651 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 149.5-28 chr10 62278160 62278512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9492 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 244.75-64 chrX 36952348 36952765 + 0.75 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -55803 NM_001013736 442444 Hs.535216 NM_001013736 ENSG00000198173 FAM47C - family with sequence similarity 47 member C protein-coding 133.75-35 chr11 100586514 100586799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100632 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 218.75-39 chr2 159316598 159317009 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -30100 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 129.75-16 chr1 172016624 172017013 + 0.75 NA intron (NM_001278252, intron 4 of 14) L1MC1|LINE|L1 -121990 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 116.5-271 chrX 44122884 44123084 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -149594 NM_000266 4693 Hs.522615 NM_000266 ENSG00000124479 NDP EVR2|FEVR|ND norrin cystine knot growth factor NDP protein-coding 150-132 chr7 72752725 72753088 + 0.75 NA intron (NM_001145440, intron 7 of 13) L1MC5a|LINE|L1 55003 NR_039793 100616310 NR_039793 ENSG00000266525 MIR4650-1 - microRNA 4650-1 ncRNA 116.25-31 chr11 21532625 21532938 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) -660304 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 187.75-79 chr4 59152704 59153025 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 139291 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 153-23 chr11 60410528 60410745 + 0.75 NA intron (NR_049734, intron 6 of 6) L1MA6|LINE|L1 14177 NR_049732 84689 Hs.709736 NM_032597 ENSG00000166928 MS4A14 MS4A16|NYD-SP21 membrane spanning 4-domains A14 protein-coding 157.25-119 chr5 63438633 63438961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 523495 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 167-80 chr3 102911889 102912208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 477033 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 159.75-15 chr10 35020502 35020851 + 0.75 NA intron (NM_003591, intron 17 of 20) intron (NM_003591, intron 17 of 20) 53607 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 172.75-58 chr2 24561289 24561703 + 0.75 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) -22981 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 211-63 chr6 163955230 163955585 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -283923 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 149.75-35 chr12 124252471 124252732 + 0.75 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -36563 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 138.75-136 chr5 19543514 19543759 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 9 of 12) intron (NM_001349559, intron 9 of 12) 342636 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 275.75-15 chr14 59963046 59963579 + 0.75 NA intron (NR_075071, intron 10 of 32) intron (NR_075071, intron 10 of 32) 43599 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 140.75-66 chr17 3863099 3863330 + 0.75 NA intron (NM_172206, intron 15 of 15) AluSq|SINE|Alu -16968 NM_001114118 55421 Hs.120963 NM_018553 ENSG00000074356 NCBP3 C17orf85|ELG|HSA277841 nuclear cap binding subunit 3 protein-coding 174.25-62 chr16 723487 723780 + 0.75 NA intron (NM_001031737, intron 11 of 13) intron (NM_001031737, intron 11 of 13) 2487 NM_023933 65990 Hs.166244 NM_023933 ENSG00000103254 FAM173A C16orf24 family with sequence similarity 173 member A protein-coding 121.75-153 chr5 153617261 153617516 + 0.75 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) intron (NM_001258020, intron 3 of 16) 125216 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 133-32 chr12 52347721 52347898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16813 NM_001300810 3891 Hs.182507 NM_002283 ENSG00000135443 KRT85 ECTD4|HB5|Hb-5|K85|KRTHB5|hHb5 keratin 85 protein-coding 132.5-125 chr2 106828982 106829242 + 0.75 NA intron (NM_001142352, intron 5 of 5) intron (NM_001142352, intron 5 of 5) 56916 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 133-90 chr2 194742460 194742669 + 0.75 NA intron (NR_110223, intron 2 of 3) intron (NR_110223, intron 2 of 3) 11969 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 149.5-215 chr9 11851528 11851775 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -841734 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 115.75-197 chr7 16961851 16962089 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79987 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 162.5-186 chr8 142872192 142872547 + 0.75 NA TTS (NM_000497) TTS (NM_000497) 7451 NM_000497 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 143.25-121 chr3 88147472 88147820 + 0.75 NA intron (NM_001195308, intron 1 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie 2220 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 151.5-195 chr8 125149454 125149703 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) intron (NM_001349486, intron 3 of 7) 57718 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 114-45 chr14 52805086 52805363 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13617 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 218.25-65 chr5 14615362 14616078 + 0.75 NA 3' UTR (NM_019018, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_019018, exon 8 of 8) 33928 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 162-59 chr2 40078334 40078606 + 0.75 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 160836 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 219.25-25 chr14 63319387 63319928 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_145171) promoter-TSS (NM_145171) -722 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 255-32 chr20 31408035 31408405 + 0.75 NA intron (NM_001171832, intron 1 of 1) AluJr4|SINE|Alu -2005 NM_001011878 245934 Hs.272294 NM_001011878 ENSG00000204548 DEFB121 DEFB21|ESC42RELC defensin beta 121 protein-coding 223.25-57 chr4 101240880 101241215 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_107033) promoter-TSS (NR_107033) -175 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 139.5-129 chr3 13671396 13671826 + 0.75 NA intron (NR_027103, intron 1 of 5) intron (NR_027103, intron 1 of 5) 20890 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 124-156 chr7 8045721 8045979 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) intron (NM_138426, intron 3 of 7) 77054 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 156.75-137 chr5 141752862 141753115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70758 NM_022481 64411 Hs.726187 NM_022481 ENSG00000120318 ARAP3 CENTD3|DRAG1 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 protein-coding 137.5-174 chr4 61027157 61027384 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 104651 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 118.25-143 chr4 155614418 155614725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52139 NM_001130687 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 132-22 chr10 91743079 91743439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54937 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 173.75-122 chr5 13723620 13723896 + 0.75 NA intron (NM_001369, intron 70 of 78) MER58B|DNA|hAT-Charlie 220722 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 260.75-61 chr7 106182778 106183211 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -70418 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 234.75-55 chr3 134566331 134566715 + 0.75 NA intron (NM_001353123, intron 11 of 11) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 80350 NR_148353 80254 Hs.443301 NM_025180 ENSG00000182923 CEP63 SCKL6 centrosomal protein 63 protein-coding 205-26 chr17 57947865 57948351 + 0.75 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 7304 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 193-48 chr22 27716195 27716650 + 0.75 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 85334 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 159.25-126 chr6 56970944 56971181 + 0.75 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) L1MB3|LINE|L1 15955 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 117.5-74 chr16 47995200 47995561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29691 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 193-31 chr16 74283358 74283798 + 0.75 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -13236 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 173-89 chr3 132734353 132734814 + 0.75 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) LTR49-int|LTR|ERV1 -12124 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 143.5-131 chr20 52246508 52246792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54665 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 174-69 chr4 73884519 73884925 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 15329 NM_001511 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 160.75-78 chr2 129307778 129308187 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -34091 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 141.5-224 chr8 71343070 71343432 + 0.75 NA intron (NM_001370336, intron 4 of 17) MER65C|LTR|ERV1 13455 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 131-164 chr7 133769269 133769615 + 0.75 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 55446 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 195.25-104 chr9 99882323 99882685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24097 NR_038853 441461 Hs.163155 NR_038853 ENSG00000255145 STX17-AS1 - STX17 antisense RNA 1 ncRNA 151.75-39 chr13 58979086 58979521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -746186 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 137.75-116 chr20 40077559 40077901 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 73269 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 218.5-29 chr11 125609295 125609824 + 0.75 NA exon (NM_001278504, exon 9 of 17) exon (NM_001278504, exon 9 of 17) -15577 NM_001244846 1111 Hs.24529 NM_001274 ENSG00000149554 CHEK1 CHK1 checkpoint kinase 1 protein-coding 166.75-37 chr13 21636435 21636827 + 0.75 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -32461 NM_152726 221154 Hs.412103 NM_152726 ENSG00000165487 MICU2 1110008L20Rik|EFHA1 mitochondrial calcium uptake 2 protein-coding 137-53 chr15 48916906 48917237 + 0.75 NA intron (NM_203349, intron 2 of 11) intron (NM_203349, intron 2 of 11) 38937 NM_014335 23741 Hs.255973 NM_014335 ENSG00000255302 EID1 C15orf3|CRI1|EID-1|IRO45620|PNAS-22|PTD014|RBP21 EP300 interacting inhibitor of differentiation 1 protein-coding 190.25-22 chr11 106146242 106146528 + 0.75 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 -14269 NR_135099 105369473 Hs.524010 NR_135099 ENSG00000254580 LINC02719 - long intergenic non-protein coding RNA 2719 ncRNA 169.75-115 chr4 77892604 77892902 + 0.75 NA intron (NM_020236, intron 5 of 8) MIR|SINE|MIR 29923 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 135.25-130 chr3 88908656 88909018 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -198784 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 212-87 chr9 31180546 31181061 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 200687 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 288.5-3 chr10 41809394 41809821 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 558438 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 227.25-76 chr8 20609177 20609567 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5554 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 182-64 chr2 210120562 210120951 + 0.75 NA intron (NM_001307976, intron 3 of 13) L1PA13|LINE|L1 50653 NM_001307976 151050 Hs.282260 NM_152519 ENSG00000144445 KANSL1L C2orf67|MSL1v2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like protein-coding 137.25-148 chr7 10858515 10858864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78745 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 150.25-170 chrX 102129906 102130125 + 0.75 NA Intergenic MER68C|LTR|ERVL 4336 NM_080390 140597 Hs.401835 NM_080390 ENSG00000184905 TCEAL2 MY0876G05|WEX1|my048 transcription elongation factor A like 2 protein-coding 207.25-104 chr9 27952729 27953287 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -379142 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 124.25-24 chr10 53785814 53786093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -700277 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 235.25-19 chr14 28402774 28403211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 362327 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 132.75-23 chr10 35354419 35354607 + 0.75 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 17639 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 183.75-17 chr10 71112416 71112910 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -99907 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 122-179 chr8 64074520 64074800 + 0.75 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 293898 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 114.75-44 chr12 65795427 65795667 + 0.75 NA intron (NR_026825, intron 1 of 1) intron (NR_026825, intron 1 of 1) -28913 NM_001330190 8091 Hs.505924 NM_003483 ENSG00000149948 HMGA2 BABL|HMGI-C|HMGIC|LIPO|STQTL9 high mobility group AT-hook 2 protein-coding 168-115 chr7 1409248 1409502 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 50095 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 132.75-89 chr18 72918011 72918239 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 49085 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 120.25-44 chr12 2499562 2499781 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 7 of 49).2 intron (NM_199460, intron 7 of 49).2 172549 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 220.25-25 chr17_GL000205v2_random 6328 6784 + 0.75 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 51410 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 116.5-149 chr22 28331982 28332288 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -127734 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 145.25-72 chr2 82554118 82554406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -302541 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 178-66 chr3 163169282 163169894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133713 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 122.25-149 chr5 33640374 33640568 + 0.75 NA intron (NM_001324512, intron 11 of 21) intron (NM_001324512, intron 11 of 21) 199695 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 119.25-151 chr4 79784432 79784756 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42877 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 174.75-23 chr12 7009434 7009681 + 0.75 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 8919 NM_005768 10162 Hs.655248 NM_005768 ENSG00000111684 LPCAT3 C3F|LPCAT|LPLAT 5|LPSAT|MBOAT5|OACT5|nessy lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 protein-coding 131.5-209 chr6 135144116 135144335 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37083 NM_001161659 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 185.75-125 chr8 86677320 86677790 + 0.75 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 66120 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 117-106 chr20 52781135 52781361 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 160410 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 114-55 chr16 77463414 77463613 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -28479 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 143.5-62 chr14 46153054 46153353 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 89044 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 187.5-173 chr8 119795383 119795828 + 0.75 NA exon (NM_003184, exon 9 of 26) exon (NM_003184, exon 9 of 26) 37236 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 120-193 chr8 126856646 126856925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -156369 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 136.75-90 chr2 38817577 38817964 + 0.75 NA intron (NM_001329963, intron 19 of 23) AluJb|SINE|Alu 39560 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 124.5-6 chr1 39732747 39732960 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -5992 NM_001195007 10450 Hs.524690 NM_006112 ENSG00000084072 PPIE CYP-33|CYP33 peptidylprolyl isomerase E protein-coding 264.5-55 chr6 140754100 140754522 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70497 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 169-14 chr11 55017179 55017718 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -244707 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 115.75-12 chr1 244468399 244468560 + 0.75 NA intron (NM_001130957, intron 2 of 21) intron (NM_001130957, intron 2 of 21) 7108 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 115.5-162 chr3 47081701 47081914 + 0.75 NA intron (NR_146158, intron 12 of 21) intron (NR_146158, intron 12 of 21) 70265 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 180.75-7 chr1 118017887 118018170 + 0.75 NA intron (NM_206996, intron 28 of 48) L1MEd|LINE|L1 88289 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 194.75-26 chr14 50345398 50345860 + 0.75 NA intron (NM_001282236, intron 3 of 8) intron (NM_001282236, intron 3 of 8) 33305 NM_015684 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 176.5-41 chr12 74947765 74948227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 261752 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 220.5-52 chr2 103965297 103965889 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 442739 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 169.25-130 chr9 81424268 81424622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 265090 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 155.25-46 chr12 14593842 14594144 + 0.75 NA intron (NR_120465, intron 2 of 5) L1PREC2|LINE|L1 -26110 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 160.25-117 chr4 142501760 142502060 + 0.75 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) LTR39|LTR|ERV1 344625 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 115.75-91 chr18 34927880 34928124 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -48926 NM_001143826 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 153-55 chr16 78489467 78489776 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 389967 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 156.25-22 chr10 120729055 120729338 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121983 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 130.25-91 chr2 28433183 28433404 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -38621 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 145.5-128 chr3 30233535 30233818 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -285192 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 140-34 chr12 113214591 113214844 + 0.75 NA intron (NM_001330452, intron 1 of 4) intron (NM_001330452, intron 1 of 4) 6377 NM_138451 115811 Hs.568276 NM_138451 ENSG00000166578 IQCD 4933433C09Rik|CFAP84|DRC10 IQ motif containing D protein-coding 130.75-96 chr2 142358037 142358257 + 0.75 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -226446 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 181.25-48 chr17 71212172 71212441 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -10127 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 196.25-101 chr5 172601248 172601666 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -39806 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 112.75-58 chr14 56409439 56409681 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -104771 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 148.75-94 chr2 196400480 196400736 + 0.75 NA intron (NM_020760, intron 2 of 28) intron (NM_020760, intron 2 of 28) -38431 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 113.5-236 chr8 104007438 104007711 + 0.75 NA intron (NM_001348500, intron 15 of 20) L1MCc|LINE|L1 188354 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 168.25-45 chr15 26554834 26555207 + 0.75 NA intron (NM_001191320, intron 6 of 6) AluSc8|SINE|Alu 74070 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 121.75-179 chr7 54699496 54699752 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 59587 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 137.25-158 chr8 24179296 24179526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114629 NR_130709 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 118.25-219 chr9 101708583 101708847 + 0.75 NA intron (NM_133445, intron 1 of 8) intron (NM_133445, intron 1 of 8) 29865 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 119.25-168 chr5 150126604 150126840 + 0.75 NA intron (NM_002609, intron 10 of 22) intron (NM_002609, intron 10 of 22) -13350 NM_005211 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 125.75-149 chr5 31531627 31531810 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_018356) promoter-TSS (NM_018356) 375 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 201.25-92 chr8 125950808 125951162 + 0.75 NA non-coding (NR_038447, exon 1 of 4) non-coding (NR_038447, exon 1 of 4) 212 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 116.5-36 chr11 84367226 84367435 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) MER58A|DNA|hAT-Charlie -49991 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 176.5-103 chr2 188264023 188264340 + 0.75 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) L1MA8|LINE|L1 23510 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 194.25-19 chr11 114012728 114013090 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 35409 NM_001161772 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 160.75-160 chr9 86491948 86492341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137734 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 135.25-188 chr7 6419980 6420179 + 0.75 NA intron (NM_001142936, intron 7 of 12) AluJo|SINE|Alu 27875 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 130.5-160 chr22 38686671 38687045 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014876, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014876, exon 5 of 5) 4901 NM_020243 56993 Hs.595072 NM_020243 ENSG00000100216 TOMM22 1C9-2|MST065|MSTP065|TOM22 translocase of outer mitochondrial membrane 22 protein-coding 152.5-39 chr12 111595499 111595897 + 0.75 NA intron (NM_001310121, intron 1 of 25) intron (NM_001310121, intron 1 of 25) 3617 NM_002973 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 144.75-142 chr5 149162719 149162945 + 0.75 NA intron (NM_001370418, intron 1 of 18) intron (NM_001370418, intron 1 of 18) 21101 NM_001301028 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 118-41 chr14 24114101 24114283 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_028099) promoter-TSS (NR_028099) -505 NM_001163484 80344 Hs.525251 NM_025230 ENSG00000100897 DCAF11 GL014|PRO2389|WDR23 DDB1 and CUL4 associated factor 11 protein-coding 142-38 chr12 87272491 87272741 + 0.75 NA Intergenic (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -58123 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 209.75-113 chr9 130247016 130247398 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 5820 NR_162140 113219459 NR_162140 MIR12126 - microRNA 12126 ncRNA 118.5-40 chr12 8824909 8825234 + 0.75 NA intron (NM_144670, intron 3 of 35) L1MA3|LINE|L1 2450 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 157.75-69 chr17 61795584 61795855 + 0.75 NA intron (NM_032043, intron 9 of 19) L1MA2|LINE|L1 67840 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 114.5-171 chr3 15789914 15790164 + 0.75 NA intron (NM_001349284, intron 2 of 2) L1MA1|LINE|L1 7940 NM_001349277 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 149.5-73 chr17 11441359 11441630 + 0.75 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) intron (NM_001173462, intron 3 of 4) -156976 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 117-69 chr16 78548453 78548779 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 448962 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 115-4 chr1 68690017 68690259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193056 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 178.75-58 chr22 46755996 46756450 + 0.75 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -6394 NM_001284304 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 220.75-19 chr12 14670429 14670855 + 0.75 NA intron (NM_004963, intron 9 of 26) THE1A|LTR|ERVL-MaLR 25957 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 151.25-114 chr21 45282465 45282724 + 0.75 NA intron (NR_004858, intron 3 of 9) intron (NR_004858, intron 3 of 9) 5301 NM_133635 23275 Hs.592164 NM_015227 ENSG00000186866 POFUT2 C21orf80|FUT13 protein O-fucosyltransferase 2 protein-coding 118.25-158 chr5 96836506 96836678 + 0.75 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -22447 NM_001198541 51752 Hs.666524 NM_016442 ENSG00000164307 ERAP1 A-LAP|ALAP|APPILS|ARTS-1|ARTS1|ERAAP|ERAAP1|PILS-AP|PILSAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 protein-coding 127.25-33 chr11 59552789 59553012 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37987 NM_001004711 390199 Hs.553757 NM_001004711 ENSG00000172742 OR4D9 OR11-253 olfactory receptor family 4 subfamily D member 9 protein-coding 140.75-107 chr2 211202029 211202335 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 584611 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 167.25-156 chr8 127067364 127067705 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -12340 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 164.5-56 chr14 54420391 54420758 + 0.75 NA TTS (NM_001130851) TTS (NM_001130851) 20800 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 204.5-141 chr9 136208513 136208866 + 0.75 NA 3' UTR (NM_181701, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_181701, exon 12 of 12) -3561 NM_178138 8022 Hs.148427 NM_014564 ENSG00000107187 LHX3 CPHD3|LIM3|M2-LHX3 LIM homeobox 3 protein-coding 114.75-34 chr11 59934396 59934654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8354 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 175.25-16 chr1 238532371 238532789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46563 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 117.5-87 chr17 73470464 73470674 + 0.75 NA intron (NM_001144952, intron 3 of 44) intron (NM_001144952, intron 3 of 44) -43114 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 123.75-124 chr3 112971071 112971317 + 0.75 NA intron (NM_138806, intron 1 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 3909 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 142-73 chr18 62886863 62887140 + 0.75 NA intron (NM_194449, intron 4 of 16) intron (NM_194449, intron 4 of 16) 171460 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 158.75-95 chr2 206557546 206557913 + 0.75 NA intron (NM_003812, intron 10 of 25) intron (NM_003812, intron 10 of 25) -86498 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 128-12 chr1 178024671 178024924 + 0.75 NA intron (NR_151492, intron 4 of 22) intron (NR_151492, intron 4 of 22) 13179 NR_151492 111240474 NM_001356505 CRYZL2P-SEC16B - CRYZL2P-SEC16B readthrough protein-coding 141.5-144 chr3 84034334 84034642 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 835087 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 192.25-56 chr2 80617109 80617522 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 11 of 11) intron (NM_001282599, intron 11 of 11) 303936 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 188.5-43 chr15 61462512 61462862 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -233385 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 116-25 chr11 45351710 45351883 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3575 NR_120558 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 158.25-105 chr5 19129924 19130152 + 0.75 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 756234 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 142.5-97 chr18 71539107 71539555 + 0.75 NA intron (NR_038326, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 39625 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 117.75-186 chr6 90613592 90613952 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26700 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 241-54 chr8 108634307 108634964 + 0.75 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 152959 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 172.25-83 chr22 19254783 19255146 + 0.75 NA intron (NM_007098, intron 2 of 32) intron (NM_007098, intron 2 of 32) 36755 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 149-119 chr7 45160206 45160590 + 0.75 NA intron (NM_005856, intron 1 of 2) intron (NM_005856, intron 1 of 2) 2607 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 148-11 chr11 39064049 39064427 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 415380 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 136.25-190 chr8 129833565 129833853 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -47085 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 142.75-132 chr3 117786753 117787085 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95994 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 180.75-152 chr8 122305011 122305376 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 263451 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 141.5-118 chr2 196210682 196211008 + 0.75 NA intron (NM_020760, intron 28 of 28) AluSz|SINE|Alu -39267 NM_004226 9262 Hs.88297 NM_004226 ENSG00000081320 STK17B DRAK2 serine/threonine kinase 17b protein-coding 131-55 chr14 73229039 73229408 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8283 NR_158678 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 150.5-96 chr2 122096293 122096669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 340830 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 217.75-69 chr7 70375251 70375606 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) -756716 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 186.75-41 chr17 74103912 74104313 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -99566 NM_000999 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 162.75-48 chr16 78672651 78673098 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 573220 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 136.75-10 chr1 115844238 115844488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3237 NM_005599 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 112.5-33 chr11 33590684 33590844 + 0.75 NA intron (NM_012194, intron 11 of 20) MIRc|SINE|MIR 109976 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 127.25-113 chr21 40067120 40067369 + 0.75 NA intron (NR_073202, intron 27 of 32) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 145187 NR_039917 100616148 NR_039917 ENSG00000263973 MIR4760 - microRNA 4760 ncRNA 157-76 chr3 94869692 94869995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68420 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 134.25 chr1 2097549 2097785 + 0.75 NA intron (NM_001242874, intron 1 of 14) intron (NM_001242874, intron 1 of 14) -7049 NM_001033582 5590 Hs.496255 NM_002744 ENSG00000067606 PRKCZ PKC-ZETA|PKC2 protein kinase C zeta protein-coding 113.25-150 chr6 124910010 124910292 + 0.75 NA non-coding (NR_026876, exon 7 of 7) non-coding (NR_026876, exon 7 of 7) -52394 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 180-103 chr6 107366093 107366466 + 0.75 NA intron (NM_020381, intron 1 of 7) L1M4a2|LINE|L1 93285 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 148-39 chr16 47819479 47819843 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -38920 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 157.75-86 chr2 66089430 66089726 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 268750 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 248.75-57 chr7 29476832 29477364 + 0.75 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -2614 NM_001293075 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 211.5-25 chr11 76452713 76453169 + 0.75 NA intron (NM_001300942, intron 3 of 21) L3|LINE|CR1 7916 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 406.75-6 chr17 65655097 65656233 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) intron (NM_001353129, intron 24 of 26) -94017 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 125.5-212 chr5 146383079 146383355 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 44378 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 180.25-54 chr2 158541107 158541421 + 0.75 NA intron (NM_001005476, intron 2 of 20) intron (NM_001005476, intron 2 of 20) 84312 NM_001005476 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 114.5-122 chr18 69633127 69633444 + 0.75 NA intron (NM_152721, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR 163354 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 152.25-33 chr11 109292687 109293020 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -129337 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 143-27 chr12 41492768 41492975 + 0.75 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 55132 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 227.25-80 chr8 88598454 88598851 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -271169 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 174.25-61 chr15 88645609 88646115 + 0.75 NA intron (NM_001303237, intron 2 of 3) intron (NM_001303237, intron 2 of 3) 6846 NM_002201 3669 Hs.459265 NM_002201 ENSG00000172183 ISG20 CD25|HEM45 interferon stimulated exonuclease gene 20 protein-coding 173.5-126 chr5 43667187 43667465 + 0.75 NA intron (NM_012343, intron 17 of 21) L1PA5|LINE|L1 -64096 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 210-13 chr10 94030811 94031230 + 0.75 NA 5' UTR (NM_016341, exon 2 of 33) 5' UTR (NM_016341, exon 2 of 33) 37089 NM_001288989 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 113.75-111 chr20 38854123 38854300 + 0.75 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) intron (NM_015568, intron 2 of 10) 48514 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 228.75-72 chr7 23909775 23910197 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 199767 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 148.75-85 chr2 74821530 74821945 + 0.75 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -10918 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 141-166 chr9 96309680 96310096 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7712 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 121.75-148 chr5 54646022 54646339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57144 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 187.5-116 chr3 84244261 84244676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 625107 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 238-15 chr13 108327755 108328111 + 0.75 NA Intergenic X7B_LINE|LINE|CR1 58304 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 178.25-15 chr11 36180383 36180722 + 0.75 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -102651 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 126.5-189 chr5 68598575 68598892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 306156 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 142.25-144 chr6 95619827 95620057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42407 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 133.75-177 chr7 51939570 51939931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -546494 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 192.75-132 chr9 73415135 73415445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 263425 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 185-35 chr18 56767721 56768272 + 0.75 NA intron (NM_052834, intron 16 of 26) intron (NM_052834, intron 16 of 26) 116611 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 126-97 chr2 82089964 82090339 + 0.75 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -623205 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 160.5-169 chr7 12775050 12775398 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 87591 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 158.25-159 chrX 102768473 102768747 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_038988) promoter-TSS (NR_038988) -543 NR_146593 100287765 Hs.556850 NR_038988 LINC00630 - long intergenic non-protein coding RNA 630 ncRNA 119.25-142 chr4 52886522 52886742 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 7 of 8) LTR27C|LTR|ERV1 24315 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 127-48 chr12 99312006 99312275 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) intron (NM_152788, intron 12 of 25) -157050 NM_001352190 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 187.75-101 chr6 74129291 74129568 + 0.75 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 59978 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 191.75-126 chr8 111396581 111396899 + 0.75 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) intron (NR_146282, intron 2 of 3) 20101 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 155.75-120 chr4 88201917 88202309 + 0.75 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) intron (NM_001257386, intron 1 of 15) 29513 NM_001257386 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 189.25-44 chr16 86974673 86975064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82916 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 209.5-22 chr11 81021680 81022065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -259069 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 201.75-58 chr3 25615709 25616198 + 0.75 NA intron (NM_001330700, intron 25 of 35) intron (NM_001330700, intron 25 of 35) 48419 NM_001068 7155 Hs.475733 NM_001068 ENSG00000077097 TOP2B TOPIIB|top2beta DNA topoisomerase II beta protein-coding 156.75-21 chr10 45042249 45042536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41469 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 183-37 chr16 28918727 28919012 + 0.75 NA intron (NM_024816, intron 3 of 12) AluJr|SINE|Alu 6369 NM_024816 79874 Hs.555978 NM_024816 ENSG00000177548 RABEP2 FRA rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 2 protein-coding 121.5-197 chr4 97893501 97893819 + 0.75 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) intron (NM_174952, intron 8 of 10) 249816 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 129-89 chr2 47138311 47138660 + 0.75 NA intron (NM_001163561, intron 3 of 6) AluSx1|SINE|Alu 16823 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 302.25-29 chr8 120929874 120930475 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -118128 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 200.5-149 chrX 121651528 121652059 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 280821 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 187.5-181 chrX 30418483 30418897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109300 NM_000475 190 Hs.268490 NM_000475 ENSG00000169297 NR0B1 AHC|AHCH|AHX|DAX-1|DAX1|DSS|GTD|HHG|NROB1|SRXY2 nuclear receptor subfamily 0 group B member 1 protein-coding 130.75-2 chr1 49507160 49507486 + 0.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -35238 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 166.5-150 chr4 102708627 102709016 + 0.75 NA intron (NM_005908, intron 5 of 16) L1MA6|LINE|L1 52147 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 192-84 chr5 10770134 10770397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9031 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 273.75-4 chr1 220100826 220101437 + 0.75 NA intron (NM_018060, intron 3 of 22) intron (NM_018060, intron 3 of 22) 6999 NM_018060 55699 Hs.262823 NM_018060 ENSG00000067704 IARS2 CAGSSS|ILERS isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 120.5-130 chr2 195475990 195476178 + 0.75 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -180874 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 187-51 chr20 33250515 33250854 + 0.75 NA Intergenic MER70-int|LTR|ERVL 14688 NM_001243193 51297 Hs.211092 NM_016583 ENSG00000198183 BPIFA1 LUNX|NASG|PLUNC|SPLUNC1|SPURT|bA49G10.5 BPI fold containing family A member 1 protein-coding 295.75-25 chr5 143675328 143675868 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4262 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 170.5-38 chr11 69351092 69351404 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 57093 NM_138768 26579 Hs.523848 NM_138768 ENSG00000172927 MYEOV OCIM myeloma overexpressed protein-coding 127.5-10 chr1 72836633 72836964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -469372 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 177.5-112 chr3 54103820 54104143 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -18571 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 162-103 chr7 7102228 7102529 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5592 NR_034022 100131257 Hs.551110 NR_034022 LOC100131257 - zinc finger protein 655 pseudogene pseudo 161.25-120 chr3 23686578 23686958 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -119187 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 143.75-165 chr7 3146311 3146584 + 0.75 NA intron (NR_126024, intron 3 of 3) intron (NR_126024, intron 3 of 3) 12126 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 126.5-214 chr6 145358276 145358444 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 328517 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 225.5-45 chr17 55254107 55254684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10565 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 125-77 chr2 174184421 174184617 + 0.75 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) L1MD3|LINE|L1 64013 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 128.75-20 chr10 61292239 61292526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -160257 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 206.25-62 chr22 27801847 27802292 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_002430) promoter-TSS (NM_002430) -313 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 174.75-26 chr12 77639179 77639592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191509 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 138.5-36 chr11 70557544 70557919 + 0.75 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) intron (NM_133266, intron 2 of 10) -73363 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 184-81 chr6 150912098 150912505 + 0.75 NA intron (NM_001350486, intron 8 of 27) intron (NM_001350486, intron 8 of 27) 45815 NM_001350491 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 194.5-35 chr13 88355953 88356433 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -184636 NR_047021 100874168 Hs.126406 NR_047021 LINC00433 - long intergenic non-protein coding RNA 433 ncRNA 143-68 chr2 14063985 14064210 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 336861 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 200.25-88 chr5 50694135 50694654 + 0.75 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) L1ME4a|LINE|L1 26980 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 125-132 chr5 105834380 105834568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 735000 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 151-7 chr1 158370728 158371073 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 17006 NM_001185115 913 Hs.249217 NM_030893 ENSG00000158488 CD1E CD1A|R2 CD1e molecule protein-coding 217.5-97 chr5 37165840 37166245 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 35 of 51) intron (NM_023073, intron 35 of 51) -83004 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 115.25-114 chr2 208411298 208411530 + 0.75 NA intron (NM_005048, intron 1 of 12) intron (NM_005048, intron 1 of 12) 4584 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 154-94 chr3 107006401 107006731 + 0.75 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 234072 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 151.5-14 chr10 62006334 62006654 + 0.75 NA intron (NM_032199, intron 4 of 9) intron (NM_032199, intron 4 of 9) -42863 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 254.25-57 chr7 4564374 4564780 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -117718 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 118.5-96 chr2 53634221 53634399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -133473 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 131.25-94 chr2 3251403 3251766 + 0.75 NA intron (NM_001330531, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR -125558 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 172.5-160 chr5 130391312 130391625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 487003 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 117-51 chr14 39534062 39534295 + 0.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -101678 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 149.5-30 chr10 75229815 75230020 + 0.75 NA intron (NM_001324090, intron 11 of 11) intron (NM_001324090, intron 11 of 11) 6040 NM_144589 118881 Hs.355333 NM_144589 ENSG00000165644 COMTD1 - catechol-O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 177.25-78 chr20 19636776 19637051 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 6 of 16) HAL1ME|LINE|L1 -249608 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 142.25-16 chr10 27764165 27764417 + 0.75 NA intron (NR_121652, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 -18472 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 185.75-115 chr7 24321825 24322119 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 37782 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 251.5-80 chr7 81095805 81096248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173637 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 141.25-80 chr2 72491174 72491552 + 0.75 NA intron (NR_135774, intron 16 of 19) intron (NR_135774, intron 16 of 19) 334670 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 179.25-140 chr7 108584607 108584945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14902 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 193.75-23 chr10 125371404 125371739 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -202800 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 164-132 chr8 8580044 8580345 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -121743 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 263.5-15 chr14 55293720 55294216 + 0.75 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 21814 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 127.75-34 chr10 108921521 108921810 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -852372 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 231.75-48 chr3 96964331 96964834 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) L1ME5|LINE|L1 149988 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 173.75-38 chr11 108111159 108111503 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -10236 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 115.75-190 chr6 139736319 139736535 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34646 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 172.25-118 chr5 149884493 149884883 + 0.75 NA intron (NM_000440, intron 15 of 21) intron (NM_000440, intron 15 of 21) 48289 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 192.75-15 chr10 94424842 94425445 + 0.75 NA intron (NM_015188, intron 1 of 12) intron (NM_015188, intron 1 of 12) 22602 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 156.5-112 chr3 27159946 27160217 + 0.75 NA intron (NM_001304384, intron 10 of 16) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 56442 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 114.5-113 chr17 45020760 45021005 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30750 NM_001128631 79877 Hs.463148 NM_024819 ENSG00000172992 DCAKD - dephospho-CoA kinase domain containing protein-coding 151-16 chr10 31282453 31282718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35832 NM_001323643 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 222-69 chr6 25816028 25816425 + 0.75 NA intron (NM_005074, intron 6 of 12) intron (NM_005074, intron 6 of 12) 15826 NM_005074 6568 Hs.205816 NM_005074 ENSG00000124568 SLC17A1 NAPI-1|NPT-1|NPT1 solute carrier family 17 member 1 protein-coding 211.25 chr1 49949982 49950501 + 0.75 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) L1PB1|LINE|L1 73713 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 286.25-26 chr7 25551519 25552220 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 111271 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 117.75-76 chr16 61878792 61878968 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 3 of 11) intron (NM_001796, intron 3 of 11) 157558 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 134-143 chr5 109793421 109793751 + 0.75 NA intron (NM_002372, intron 12 of 21) intron (NM_002372, intron 12 of 21) -89596 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 198.75-64 chr3 182379919 182380238 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106284 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 148.75 chr1 43429175 43429460 + 0.75 NA intron (NM_015284, intron 27 of 70) AluJb|SINE|Alu -19222 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 153.5-210 chr9 6648918 6649247 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -3390 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 122.75-151 chr4 122065422 122065645 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -105070 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 274.25-29 chr3 31125695 31126134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35873 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 133.75-14 chr10 16759333 16759805 + 0.75 NA intron (NM_152724, intron 3 of 7) intron (NM_152724, intron 3 of 7) 57855 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 150.75-177 chr8 48048936 48049203 + 0.75 NA intron (NM_003350, intron 2 of 3) intron (NM_003350, intron 2 of 3) 40638 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 172.75-142 chr9 126266625 126266973 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9116 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 176.75-16 chr10 58528611 58529146 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 16006 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 145-27 chr10 81900152 81900452 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 22615 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 302.5-10 chr14 28291471 28291995 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 473586 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 214.75-16 chr12 42762095 42762561 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70112 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 115.75-211 chr8 62724628 62724903 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) L1MA3|LINE|L1 -253096 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 133.25-210 chr8 83373155 83373343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30509 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 136.75-67 chr15 83921958 83922328 + 0.75 NA intron (NM_207517, intron 16 of 29) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -158044 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 120.25-73 chr17 44475014 44475213 + 0.75 NA intron (NM_001002909, intron 1 of 7) AluSx3|SINE|Alu 28293 NM_001304942 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 132.75-63 chr14 65605173 65605450 + 0.75 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 134209 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 128.25-120 chr22 35387337 35387719 + 0.75 NA intron (NM_002133, intron 3 of 4) intron (NM_002133, intron 3 of 4) 6432 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 135.25-84 chr18 61359022 61359272 + 0.75 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 25717 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 182-67 chr20 35322346 35322596 + 0.75 NA intron (NM_001184977, intron 5 of 7) AluSx3|SINE|Alu -30046 NM_178468 128876 Hs.592149 NM_178468 ENSG00000125998 FAM83C C20orf128|dJ614O4.7 family with sequence similarity 83 member C protein-coding 119.75-142 chr3 94791442 94791698 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -146693 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 129.25 chr1 15217698 15218015 + 0.75 NA intron (NM_001319665, intron 3 of 3) MLT2B1|LTR|ERVL -29369 NM_052929 114827 Hs.659997 NM_052929 ENSG00000142621 FHAD1 - forkhead associated phosphopeptide binding domain 1 protein-coding 183.5-120 chr5 166486369 166486818 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 439777 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 153.25-34 chr13 95445672 95445923 + 0.75 NA intron (NM_182848, intron 1 of 4) L3|LINE|CR1 12198 NM_001160100 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 283.5-63 chr9 104881394 104881846 + 0.75 NA intron (NM_005502, intron 5 of 49) intron (NM_005502, intron 5 of 49) 46535 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 147-119 chr6 50465316 50465641 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -248066 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 234.5-75 chr5 33211159 33211572 + 0.75 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -18370 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 174.25-115 chr4 106250703 106251024 + 0.75 NA intron (NM_001163437, intron 6 of 25) intron (NM_001163437, intron 6 of 25) -64747 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 163.75-66 chr2 54408389 54408814 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -47726 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 158-64 chr18 46906198 46906484 + 0.75 NA intron (NR_148703, intron 1 of 16) L1ME3A|LINE|L1 11166 NM_001354033 9063 Hs.57769 NM_004671 ENSG00000078043 PIAS2 ARIP3|DIP|MIZ1|PIASX|SIZ2|ZMIZ4 protein inhibitor of activated STAT 2 protein-coding 113.25-174 chr8 115522243 115522441 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) LTR37-int|LTR|ERV1 145671 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 134.75-135 chr22 33907349 33907644 + 0.75 NA intron (NM_001362949, intron 1 of 15) intron (NM_001362949, intron 1 of 15) 12932 NM_004737 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 164-79 chr3 85870089 85870455 + 0.75 NA intron (NM_001256502, intron 3 of 10) L1PREC2|LINE|L1 -42222 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 129.25-176 chr6 137963268 137963563 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17615 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 179.25-13 chr1 241845678 241846059 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2323 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 203-80 chr5 41934888 41935239 + 0.75 NA TTS (NM_033484) TTS (NM_033484) 9782 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 125.25-103 chr2 102402449 102402879 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -16126 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 244-58 chr8 91432781 91433179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 183661 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 133.25-148 chr4 48504012 48504208 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 60 of 63) intron (NM_015030, intron 60 of 63) 13858 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 120.25-98 chr2 112855235 112855480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18578 NM_000576 3553 Hs.126256 NM_000576 ENSG00000125538 IL1B IL-1|IL1-BETA|IL1F2 interleukin 1 beta protein-coding 182.75-121 chr7 9394968 9395395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -239089 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 152-51 chr14 54736477 54736725 + 0.75 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -18232 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 121.75-79 chr2 54610221 54610530 + 0.75 NA intron (NM_178313, intron 2 of 30) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 51981 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 137.25-102 chr3 111053877 111054295 + 0.75 NA intron (NR_045114, intron 2 of 3) intron (NR_045114, intron 2 of 3) 15873 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 151.5-69 chr18 12962146 12962435 + 0.75 NA intron (NM_031216, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 14279 NM_001013437 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 229.75-45 chr22 37916385 37917071 + 0.75 NA intron (NM_033386, intron 3 of 15) intron (NM_033386, intron 3 of 15) 10431 NM_033386 85377 Hs.517610 NM_033386 ENSG00000100139 MICALL1 MICAL-L1|MIRAB13 MICAL like 1 protein-coding 123.25-153 chr4 149927668 149927990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -111986 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 209.75-58 chr2 183086058 183086589 + 0.75 NA intron (NM_001142314, intron 2 of 2) intron (NM_001142314, intron 2 of 2) 7576 NR_135688 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 160-28 chr13 34706574 34706916 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -66060 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 208.5-13 chr10 84091733 84092281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47502 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 156-124 chr5 129226309 129226614 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 128773 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 162-56 chr19 53930228 53930609 + 0.75 NA intron (NM_031896, intron 3 of 4) AluSc8|SINE|Alu 17681 NM_031896 59284 Hs.631597 NM_031896 ENSG00000105605 CACNG7 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 7 protein-coding 114-103 chr3 97433908 97434111 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) intron (NM_001080448, intron 6 of 17) -5598 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 166.5-156 chr5 12401646 12402081 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -172994 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 124.25-159 chr5 23094295 23094579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -241093 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 252.75-79 chr9 82210328 82210917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 221850 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 298.5-30 chr5 8134393 8135136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 265616 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 114.25-206 chr9 93479324 93479639 + 0.75 NA intron (NM_001286723, intron 3 of 9) intron (NM_001286723, intron 3 of 9) -25880 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 285.5-44 chr4 616536 617048 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -8782 NM_001145291 5158 Hs.623810 NM_000283 ENSG00000133256 PDE6B CSNB3|CSNBAD2|GMP-PDEbeta|PDEB|RP40|rd1 phosphodiesterase 6B protein-coding 365.25 chr1 64305800 64306753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102653 NM_001366234 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 150.75-175 chr8 25803738 25804033 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 241528 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 288.25-27 chr7 112425554 112426154 + 0.75 NA intron (NM_001197080, intron 1 of 11) intron (NM_001197080, intron 1 of 11) 2710 NM_001007245 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 190.25-88 chr3 135014712 135015201 + 0.75 NA intron (NM_004441, intron 3 of 15) intron (NM_004441, intron 3 of 15) 219696 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 126.25-27 chr11 29042310 29042559 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -551979 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 141.75-23 chr10 83865402 83865607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188415 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 232.75-15 chr11 115062979 115063343 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -270416 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 126.75-6 chr1 114201301 114201532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47547 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 120.5-61 chr12 116505321 116505590 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -27967 NR_027345 100287569 Hs.441601 NM_207436 ENSG00000196668 LINC00173 NCRNA00173 long intergenic non-protein coding RNA 173 ncRNA 187.75-119 chr8 139034473 139034993 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -120692 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 143.25-111 chr22 43299397 43299638 + 0.75 NA intron (NM_173050, intron 3 of 21) L3|LINE|CR1 23575 NR_134582 101927447 Hs.621227 NR_134582 ENSG00000203527 LOC101927447 - uncharacterized LOC101927447 ncRNA 128-92 chr21 18537939 18538131 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -134250 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 139.5-49 chr12 78976333 78976636 + 0.75 NA intron (NM_001291901, intron 1 of 9) intron (NM_001291901, intron 1 of 9) -69208 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 133-14 chr10 18297311 18297606 + 0.75 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 36736 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 136.75-181 chr7 12575658 12575942 + 0.75 NA intron (NR_156701, intron 1 of 14) intron (NR_156701, intron 1 of 14) 5080 NM_001112706 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 164.5-120 chr21 15162125 15162444 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -97284 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 129.25-73 chr18 5836296 5836486 + 0.75 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 -4304 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 168.5-142 chr5 8611475 8611772 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 150698 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 293.5-38 chr7 44958289 44958811 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 20465 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 155.75-14 chr10 37711753 37712133 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83232 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 204.75-35 chr14 36183012 36183400 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -6555 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 147.5-52 chr12 77047435 77047736 + 0.75 NA intron (NM_203394, intron 4 of 12) intron (NM_203394, intron 4 of 12) 17984 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 114.75-169 chr7 7306935 7307157 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 51892 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 128.5 chr1 7851304 7851533 + 0.75 NA intron (NM_021995, intron 2 of 4) intron (NM_021995, intron 2 of 4) 1647 NM_006786 10911 Hs.715862 NM_006786 ENSG00000049247 UTS2 PRO1068|U-II|UCN2|UII urotensin 2 protein-coding 128-60 chr17 67075953 67076200 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014877, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_014877, exon 33 of 33) 31522 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 178.75-42 chr18 77016808 77017151 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001025092) promoter-TSS (NM_001025092) 76 NM_001025081 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 163-112 chr7 81308338 81308634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 253333 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 176.25-111 chr5 44746135 44746395 + 0.75 NA intron (NR_109865, intron 1 of 2) intron (NR_109865, intron 1 of 2) 62528 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 145.5-82 chr17 80496970 80497241 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -20498 NM_002522 4884 Hs.514556 NM_002522 ENSG00000171246 NPTX1 NP1 neuronal pentraxin 1 protein-coding 177.75-91 chr20 49053705 49054010 + 0.75 NA intron (NM_001362762, intron 1 of 24) AluJo|SINE|Alu 7545 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 197.75-46 chr2 140780052 140780380 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 32 of 90) intron (NM_018557, intron 32 of 90) -193531 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 113-114 chr3 25496274 25496455 + 0.75 NA intron (NR_110892, intron 2 of 6) intron (NR_110892, intron 2 of 6) 38054 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 157.25-74 chr2 47206514 47206882 + 0.75 NA intron (NR_110208, intron 3 of 4) intron (NR_110208, intron 3 of 4) -29762 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 116-121 chr4 186217166 186217450 + 0.75 NA Intergenic (GTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10199 NM_001318394 3818 Hs.237642 NM_000892 ENSG00000164344 KLKB1 KLK3|PKK|PKKD|PPK kallikrein B1 protein-coding 256.75-2 chr1 209340021 209340613 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14861 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 188.25-77 chr3 128047835 128048117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4461 NM_013336 29927 Hs.518236 NM_013336 ENSG00000058262 SEC61A1 HNFJ4|HSEC61|SEC61|SEC61A SEC61 translocon alpha 1 subunit protein-coding 131.5-64 chr14 72810666 72810891 + 0.75 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 81871 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 143.25-57 chr15 79874321 79874557 + 0.75 NA intron (NR_037654, intron 2 of 2) L1M4|LINE|L1 22558 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 145.75-67 chr19 41685000 41685226 + 0.75 NA intron (NM_006890, intron 2 of 4) intron (NM_006890, intron 2 of 4) 3157 NM_006890 1087 Hs.74466 NM_006890 ENSG00000007306 CEACAM7 CGM2 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 7 protein-coding 124.5-69 chr15 42458811 42459165 + 0.75 NA intron (NM_001366845, intron 3 of 21) intron (NM_001366845, intron 3 of 21) -1421 NM_001284306 64397 Hs.511143 NM_022473 ENSG00000103994 ZNF106 SH3BP3|ZFP106|ZNF474 zinc finger protein 106 protein-coding 184.75-76 chr4 122533275 122533616 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -76950 NM_000586 3558 Hs.89679 NM_000586 ENSG00000109471 IL2 IL-2|TCGF|lymphokine interleukin 2 protein-coding 194-14 chr1 241268699 241269042 + 0.75 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) HAL1|LINE|L1 86956 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 178.75-60 chr3 89448030 89448344 + 0.75 NA intron (NM_005233, intron 13 of 16) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 340566 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 154-67 chr2 66012470 66012720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 345733 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 303.25-31 chr9 93458883 93459536 + 0.75 NA intron (NM_001286723, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 -5608 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 203.25-108 chr8 124754556 124754972 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -26257 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 239.25-13 chr11 79901676 79902071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -460843 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 131-183 chr9 37995631 37996056 + 0.75 NA intron (NM_003028, intron 2 of 5) intron (NM_003028, intron 2 of 5) 73384 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 194.75-68 chr3 101914516 101914881 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -26161 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 185.5-163 chr8 119529637 119530151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63114 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 114.25-191 chr8 102467253 102467528 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54690 NM_015902 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 137.75-134 chr3 78008054 78008520 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40676 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 137.25-16 chr10 66326614 66326823 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -599318 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 154.5-69 chr15 77382297 77382632 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 37640 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 122.5-152 chr3 88666933 88667177 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 328599 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 134.25-32 chr12 4569014 4569266 + 0.75 NA intron (NM_001371301, intron 2 of 14) intron (NM_001371301, intron 2 of 14) 6932 NM_001371301 151-77 chr22 30773433 30773892 + 0.75 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) intron (NM_001282740, intron 1 of 12) 9409 NM_001282740 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 162.25-29 chr11 75165408 75165711 + 0.75 NA intron (NM_007256, intron 3 of 13) intron (NM_007256, intron 3 of 13) 5727 NM_001145211 11309 Hs.7884 NM_007256 ENSG00000137491 SLCO2B1 OATP-B|OATP2B1|OATPB|SLC21A9 solute carrier organic anion transporter family member 2B1 protein-coding 158.75-62 chr16 3729820 3730232 + 0.75 NA intron (NM_004380, intron 30 of 30) intron (NM_004380, intron 30 of 30) -12502 NM_001272049 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 211.25-56 chr3 17841960 17842394 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 99233 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 139.75-93 chr2 35674121 35674348 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 202829 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 160.75-42 chr14 22115948 22116394 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 316582 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 151.25-186 chr8 59281723 59282038 + 0.75 NA Intergenic (TTCCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 162670 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 176-40 chr21 33788516 33788941 + 0.75 NA intron (NM_001001132, intron 16 of 29) AluSz|SINE|Alu 127076 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 138.5-187 chr8 26017235 26017583 + 0.75 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 28004 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 132.75-163 chr6 40002295 40002519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67945 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 128.25-3 chr1 14750154 14750359 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) 151539 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 195.5-91 chr22 30979831 30980317 + 0.75 NA TTS (NR_152867) TTS (NR_152867) 10863 NR_152871 55000 Hs.554829 NR_002323 ENSG00000253352 TUG1 LINC00080|NCRNA00080|TI-227H taurine up-regulated 1 ncRNA 241.75-4 chr10 19742964 19743481 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14672 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 118.5-159 chr5 14750305 14750501 + 0.75 NA intron (NM_054027, intron 5 of 11) L2c|LINE|L2 37709 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 129-126 chr3 189144175 189144573 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27597 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 123.5-149 chr4 30579611 30579990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -140569 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 162.25-8 chr1 99185100 99185504 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78990 NM_001166252 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 182.25-27 chr12 41065710 41066165 + 0.75 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) -122383 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 198.5-106 chr4 89570742 89571157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -263149 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 186.25-86 chr4 178120358 178120678 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -212582 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 164.25-121 chr4 120966103 120966436 + 0.75 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -43403 NM_001300823 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 148.5-67 chr15 71834006 71834328 + 0.75 NA intron (NM_006901, intron 39 of 41) L1ME3B|LINE|L1 23613 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 172.25-77 chr20 61088496 61088840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9604 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 185-68 chr5 72609580 72610005 + 0.75 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) intron (NR_105007, intron 1 of 2) 50877 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 170-83 chr5 128474469 128474775 + 0.75 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) intron (NM_001999, intron 5 of 64) 63623 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 156.25-128 chr6 44815311 44815587 + 0.75 NA intron (NR_146632, intron 11 of 11) L1MEg|LINE|L1 -263568 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 144.5-82 chr17 54485286 54485524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -415286 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 199-3 chr1 79261658 79262063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -255130 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 184.25-48 chr18 3367740 3368087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17354 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 116-114 chr4 41447173 41447389 + 0.75 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 86474 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 132.75-135 chr4 46601882 46602226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -211926 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 173.25-127 chr8 120201252 120201605 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 8 of 47) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 76326 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 218.5-120 chr8 72806868 72807542 + 0.75 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 75160 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 130-33 chr12 41363245 41363453 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -74390 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 148.5-104 chr2 77543889 77544152 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -21587 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 154.75-89 chr3 52334164 52334412 + 0.75 NA intron (NM_015512, intron 8 of 77) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 17969 NM_015512 25981 Hs.655469 NM_015512 ENSG00000114841 DNAH1 CILD37|DNAHC1|HDHC7|HL-11|HL11|HSRF-1|SPGF18|XLHSRF-1 dynein axonemal heavy chain 1 protein-coding 216.5-39 chr15 100480616 100480961 + 0.75 NA intron (NM_001290341, intron 7 of 13) L1MC5|LINE|L1 63498 NM_001290342 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 179.25-109 chr4 36313623 36313956 + 0.75 NA intron (NM_001170700, intron 7 of 9) intron (NM_001170700, intron 7 of 9) 32173 NM_001170700 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 189.25-75 chr3 45116968 45117389 + 0.75 NA intron (NM_178181, intron 2 of 3) intron (NM_178181, intron 2 of 3) 29200 NM_022842 64866 Hs.476093 NM_022842 ENSG00000163814 CDCP1 CD318|SIMA135|TRASK CUB domain containing protein 1 protein-coding 120.5-92 chr16 79809211 79809397 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 14055 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 144.25-10 chr1 95809385 95809786 + 0.75 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -182483 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 158.5-93 chr2 50155850 50156245 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) L1ME4a|LINE|L1 -181844 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 140-7 chr1 115746081 115746381 + 0.75 NA intron (NM_001232, intron 1 of 10) L1MD1|LINE|L1 22574 NM_001232 845 Hs.57975 NM_001232 ENSG00000118729 CASQ2 PDIB2 calsequestrin 2 protein-coding 131-100 chr2 187783912 187784201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -229551 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 143.25-115 chr3 45895854 45896099 + 0.75 NA intron (NM_031200, intron 2 of 2) intron (NM_031200, intron 2 of 2) 9433 NM_006641 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 118-2 chr1 50694267 50694637 + 0.75 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) intron (NM_007051, intron 7 of 18) 265815 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 155.25-21 chr10 11495667 11495977 + 0.75 NA intron (NM_014688, intron 7 of 14) HAL1|LINE|L1 36458 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 114-20 chr10 79598003 79598176 + 0.75 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -12850 NM_001164644 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 200-29 chr14 65273224 65273579 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -51054 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 158.25-18 chr11 20616132 20616425 + 0.75 NA intron (NM_004211, intron 6 of 15) intron (NM_004211, intron 6 of 15) 16878 NM_001318369 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 163.5-123 chr3 17015534 17015833 + 0.75 NA intron (NM_015184, intron 3 of 5) intron (NM_015184, intron 3 of 5) 82487 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 176.25-74 chr2 183041865 183042278 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3614 NM_013436 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 282.25-21 chr21 14933045 14933838 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14773 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 206.25-5 chr1 79282875 79283170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -276292 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 117-156 chr6 46137365 46137524 + 0.75 NA intron (NM_014936, intron 1 of 3) intron (NM_014936, intron 1 of 3) 7455 NM_014936 22875 Hs.643497 NM_014936 ENSG00000001561 ENPP4 NPP4 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 protein-coding 225.25-28 chr17 57118650 57119031 + 0.75 NA intron (NM_003488, intron 9 of 10) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 23351 NM_001370427 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 155.25-175 chr8 52635956 52636303 + 0.75 NA intron (NM_001083617, intron 18 of 23) intron (NM_001083617, intron 18 of 23) -70699 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 123.5-69 chr15 92205183 92205368 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -188606 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 150.5-121 chr20 63195204 63195570 + 0.75 NA TTS (NM_017798) TTS (NM_017798) 16887 NR_029670 406909 NR_029670 ENSG00000207598 MIR124-3 MIRN124-3|MIRN124A3|mir-124-3 microRNA 124-3 ncRNA 141.25-188 chr9 12021420 12021687 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -671832 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 133.75-81 chr17 73153269 73153675 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11538 NM_001050 6752 Hs.514451 NM_001050 ENSG00000180616 SSTR2 - somatostatin receptor 2 protein-coding 225.5-93 chr6 507867 508460 + 0.75 NA intron (NM_018303, intron 23 of 27) L1MC1|LINE|L1 116411 NR_046000 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 136-74 chr2 97991671 97991897 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) intron (NM_015348, intron 1 of 40) 4164 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 153.5-95 chr2 37492915 37493271 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 148463 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 136.5-14 chr1 195430128 195430507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 658398 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 181.5-104 chr3 31153598 31153944 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 8016 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 183-29 chr14 71532013 71532376 + 0.75 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) 44333 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 126.75-132 chr20 25413625 25413869 + 0.75 NA intron (NM_021067, intron 1 of 6) intron (NM_021067, intron 1 of 6) 6064 NR_134574 9837 Hs.658464 NM_021067 ENSG00000101003 GINS1 IMD55|PSF1 GINS complex subunit 1 protein-coding 114.75-132 chr3 162124228 162124414 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 627513 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 116-29 chr11 107405469 107405671 + 0.75 NA intron (NM_152434, intron 10 of 17) L1MEc|LINE|L1 52276 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 149.5-21 chr10 19896685 19896998 + 0.75 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 80409 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 117.75-77 chr16 68998971 68999150 + 0.75 NA intron (NM_024562, intron 15 of 17) AluJb|SINE|Alu -106593 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 191.25-64 chr20 18997698 18998143 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -167717 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 123.5-89 chr2 163311 163603 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92883 NM_001282687 26751 Hs.515951 NM_015677 ENSG00000035115 SH3YL1 RAY SH3 and SYLF domain containing 1 protein-coding 222.25-26 chr17 49844904 49845283 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001242791) promoter-TSS (NM_001242791) -817 NM_001242791 729220 Hs.434138 NM_001242791 FLJ45513 - uncharacterized LOC729220 protein-coding 180.25-91 chr5 33998532 33998857 + 0.75 NA exon (NM_014324, exon 4 of 5) exon (NM_014324, exon 4 of 5) 9356 NM_014324 23600 Hs.508343 NM_014324 ENSG00000242110 AMACR AMACRD|CBAS4|P504S|RACE|RM alpha-methylacyl-CoA racemase protein-coding 145.75-130 chr5 108499311 108499660 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -117387 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 164.5-146 chr4 14705966 14706440 + 0.75 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) intron (NR_126435, intron 2 of 6) 181966 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 146.25-167 chrX 83790344 83790611 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -70649 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 166.5-205 chr8 123377533 123377912 + 0.75 NA intron (NM_014109, intron 2 of 27) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 18725 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 169.75-109 chr3 171436954 171437412 + 0.75 NA intron (NM_001161563, intron 1 of 31) intron (NM_001161563, intron 1 of 31) 23222 NM_001161562 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 112.25-41 chr12 16275673 16275916 + 0.75 NA intron (NM_001170798, intron 1 of 8) intron (NM_001170798, intron 1 of 8) 1891 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 131-189 chrX 88644686 88645063 + 0.75 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -102351 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 165.75-129 chr5 6148488 6148859 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 188619 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 186.25-14 chr11 40485056 40485361 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 -192078 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 117.5-45 chr11 90634320 90634524 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L1MB5|LINE|L1 -78565 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 258.5-41 chr2 150442190 150442682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45259 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 188-25 chr14 67138144 67138603 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 16 of 21) intron (NM_001024218, intron 16 of 21) -51067 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 186.25-72 chr3 114207868 114208266 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -8660 NM_001282563 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 134-150 chr6 79088284 79088522 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10149 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 125.25-61 chr14 45686733 45687020 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 28726 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 196.5-122 chr5 28315482 28315935 + 0.75 NA Intergenic (ATAGTAGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28043 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 141-123 chr5 35688002 35688297 + 0.75 NA intron (NM_024867, intron 10 of 36) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 70286 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 117.75-111 chr2 139039431 139039685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 142234 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 226-54 chr5 63968571 63968971 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -6479 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 149-56 chr2 85329023 85329342 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -1193 NM_001368096 10618 Hs.593382 NM_006464 ENSG00000152291 TGOLN2 TGN38|TGN46|TGN48|TGN51|TTGN2 trans-golgi network protein 2 protein-coding 190.25-12 chr1 246253373 246253643 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) L1PA16|LINE|L1 163904 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 113.75-115 chr20 55322742 55322988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -100178 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 153-44 chr14 74278224 74278553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24546 NM_001353607 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 192.25-33 chr17 42657809 42658191 + 0.75 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -1284 NM_001320509 27175 Hs.279669 NM_016437 ENSG00000037042 TUBG2 - tubulin gamma 2 protein-coding 146.5-36 chr10 98744043 98744362 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 180366 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 165.75-70 chr18 68086380 68086733 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -271734 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 168.5-48 chr12 61035357 61035626 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 1157348 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 157.5-65 chr15 52606825 52607112 + 0.75 NA intron (NM_001286495, intron 5 of 11) intron (NM_001286495, intron 5 of 11) -37522 NM_001306191 10776 Hs.512908 NM_006628 ENSG00000128989 ARPP19 ARPP-16|ARPP-19|ARPP16|ENSAL cAMP regulated phosphoprotein 19 protein-coding 164-10 chr1 220228423 220228864 + 0.75 NA intron (NM_012414, intron 2 of 34) intron (NM_012414, intron 2 of 34) -27967 NR_002994 677818 Hs.730572 NR_002994 ENSG00000222370 SNORA36B ACA36b small nucleolar RNA, H/ACA box 36B snoRNA 120-64 chr16 72080005 72080358 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 13439 NM_001324354 54957 Hs.134406 NM_017853 ENSG00000140830 TXNL4B DLP|Dim2 thioredoxin like 4B protein-coding 218.75-77 chr6 39742925 39743304 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -17691 NM_001351503 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 217.75-16 chr10 100161034 100161461 + 0.75 NA intron (NR_144757, intron 7 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 24782 NM_001347860 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 131.25-104 chr2 88161330 88161682 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -8789 NM_001244676 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 138.25-89 chr2 169201366 169201671 + 0.75 NA intron (NM_004525, intron 44 of 78) intron (NM_004525, intron 44 of 78) 120411 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 164-43 chr15 86984564 86984841 + 0.75 NA intron (NR_135683, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 3724 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 134.75-204 chr7 101557296 101557595 + 0.75 NA exon (NM_001278563, exon 13 of 13) exon (NM_001278563, exon 13 of 13) 11561 NR_103749 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 119.25-80 chr17 81628624 81628885 + 0.75 NA intron (NM_001369698, intron 2 of 16) L1MEf|LINE|L1 8358 NM_001369698 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 176.75-32 chr14 20263685 20264104 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21102 NM_001004479 390442 Hs.553767 NM_001004479 ENSG00000176198 OR11H4 OR14-36 olfactory receptor family 11 subfamily H member 4 protein-coding 151.5-157 chr5 120742718 120742943 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 211366 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 135 chr1 44190691 44190921 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -22665 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 180.75-8 chr1 165927359 165927795 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 19656 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 118.75-151 chr5 59429889 59430137 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -73043 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 145.75-98 chr3 60625299 60625593 + 0.75 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) L1MB8|LINE|L1 -7576 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 153-25 chr11 90251545 90251887 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) MER51E|LTR|ERV1 484 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 170-2 chr1 77295786 77296167 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 3 of 13) intron (NM_012093, intron 3 of 13) 12889 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 168-2 chr1 28639571 28639956 + 0.75 NA intron (NM_005644, intron 1 of 5) intron (NM_005644, intron 1 of 5) 3304 NM_001135218 6883 Hs.530251 NM_005644 ENSG00000120656 TAF12 TAF2J|TAFII20 TATA-box binding protein associated factor 12 protein-coding 214.5-115 chr7 1327676 1328020 + 0.75 NA Intergenic LTR2C|LTR|ERV1 94976 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 125.75-59 chr15 76902284 76902556 + 0.75 NA intron (NR_148227, intron 1 of 32) L1PA16|LINE|L1 2920 NM_001353011 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 172.25-62 chr2 62141078 62141380 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54886 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 172-54 chr2 127433978 127434258 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10500 NR_039944 100616187 NR_039944 ENSG00000264075 MIR4783 - microRNA 4783 ncRNA 164-131 chr7 141239186 141239530 + 0.75 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) LTR16|LTR|ERVL 165294 NM_001195278 100507421 Hs.283851 NM_001195278 ENSG00000261115 TMEM178B - transmembrane protein 178B protein-coding 170.75-81 chr21 35334301 35334583 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 246322 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 213.75-3 chr1 38154435 38154929 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60085 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 164-21 chr11 85478470 85478975 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 148548 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 179.25-149 chr9 6345865 6346149 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 17632 NM_001001874 89882 Hs.351815 NM_033516 ENSG00000170777 TPD52L3 D55|NYDSP25|hD55 TPD52 like 3 protein-coding 212.25-71 chr5 32678944 32679355 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -11723 NM_001364458 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 160.5-177 chr7 105125291 105125769 + 0.75 NA intron (NM_001350746, intron 14 of 14) intron (NM_001350746, intron 14 of 14) 111325 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 168-46 chr14 47684281 47684576 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -9474 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 174-8 chr10 53766857 53767157 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -719223 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 235.75-75 chr8 15081708 15082270 + 0.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 156442 NM_001322881 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 170.75-69 chr2 111882546 111882947 + 0.75 NA intron (NM_022662, intron 1 of 47) AluSq2|SINE|Alu 1447 NM_022662 64682 Hs.436527 NM_022662 ENSG00000153107 ANAPC1 APC1|MCPR|TSG24 anaphase promoting complex subunit 1 protein-coding 146-121 chr7 92725306 92725583 + 0.75 NA intron (NM_001259, intron 4 of 7) intron (NM_001259, intron 4 of 7) 108515 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 126.5-193 chr5 76533099 76533367 + 0.75 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) LTR78|LTR|ERV1 -14176 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 148.25-34 chr12 115267675 115268021 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -583673 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 170.75-73 chr2 166838980 166839300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49347 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 144.75-81 chr2 30482477 30482728 + 0.75 NA intron (NM_001304445, intron 3 of 7) intron (NM_001304445, intron 3 of 7) 35356 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 170-95 chr8 17981184 17981480 + 0.75 NA intron (NM_001352653, intron 26 of 40) intron (NM_001352653, intron 26 of 40) 58344 NM_001352636 5108 Hs.491148 NM_006197 ENSG00000078674 PCM1 PTC4|RET/PCM-1 pericentriolar material 1 protein-coding 158.5-106 chr2 157770134 157770454 + 0.75 NA intron (NM_001111067, intron 7 of 10) intron (NM_001111067, intron 7 of 10) 68336 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 161.75-15 chr10 34883623 34884058 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 68072 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 344.5-22 chr5 21833624 21834480 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) intron (NM_004061, intron 8 of 14) -50402 NR_132788 106635540 NR_132788 SNORA105B - small nucleolar RNA, H/ACA box 105B snoRNA 188.75-100 chr7 7691819 7692241 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) intron (NM_002947, intron 2 of 7) 26577 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 165.5-141 chr4 177280426 177280866 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29228 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 122.5-135 chr21 27262896 27263227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -295973 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 156-45 chr14 56473903 56474246 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40257 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 140.75-100 chr2 142596353 142596609 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -281183 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 180-54 chr19 41260643 41260940 + 0.75 NA 3' UTR (NM_021913, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_021913, exon 20 of 20) -1766 NM_144732 11100 Hs.155218 NM_007040 ENSG00000105323 HNRNPUL1 E1B-AP5|E1BAP5|HNRPUL1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1 protein-coding 142.75-34 chr11 40240395 40240625 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 52620 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 144-46 chr16 87615928 87616195 + 0.75 NA intron (NM_020655, intron 1 of 4) intron (NM_020655, intron 1 of 4) 13553 NM_020655 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 204-89 chr9 80529527 80530008 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 554744 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 142.25-17 chr10 31207345 31207658 + 0.75 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 19618 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 147.75-84 chr2 226906806 226907075 + 0.75 NA intron (NM_001349069, intron 6 of 8) intron (NM_001349069, intron 6 of 8) 70886 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 133.25-33 chr11 94490156 94490422 + 0.75 NA intron (NM_001330347, intron 3 of 19) intron (NM_001330347, intron 3 of 19) 3555 NM_001330347 4361 Hs.192649 NM_005590 ENSG00000020922 MRE11 ATLD|HNGS1|MRE11A|MRE11B MRE11 homolog, double strand break repair nuclease protein-coding 147.25-122 chr6 94754413 94754720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 822885 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 162.25-88 chr2 161196213 161196530 + 0.75 NA intron (NM_001199135, intron 2 of 7) intron (NM_001199135, intron 2 of 7) 35943 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 125-13 chr1 207482451 207482737 + 0.75 NA intron (NM_001006658, intron 18 of 19) L2c|LINE|L2 -13534 NM_000651 1378 Hs.334019 NM_000573 ENSG00000203710 CR1 C3BR|C4BR|CD35|KN complement C3b/C4b receptor 1 (Knops blood group) protein-coding 157-86 chr4 80173721 80174141 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -11339 NM_020226 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 156.5-101 chr21 29571810 29572193 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 14 of 16) intron (NM_000830, intron 14 of 16) -24039 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 139.25-119 chr3 59012208 59012483 + 0.75 NA intron (NR_147235, intron 4 of 6) L2c|LINE|L2 37680 NM_001351531 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 200.75-33 chr15 75204483 75204987 + 0.75 NA intron (NM_015492, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 2853 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 122.5-233 chr9 94967125 94967434 + 0.75 NA intron (NM_032823, intron 7 of 14) intron (NM_032823, intron 7 of 14) -21725 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 124.25-109 chr2 188060894 188061186 + 0.75 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) intron (NR_126396, intron 2 of 2) 226651 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 208-80 chr8 109024490 109024963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61902 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 163.5-185 chr7 3777246 3777500 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) MIRc|SINE|MIR -352312 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 141.75-140 chr5 80404706 80405048 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3187 NR_146173 9765 Hs.482660 NM_014733 ENSG00000039319 ZFYVE16 PPP1R69 zinc finger FYVE-type containing 16 protein-coding 125.5-33 chr10 99958349 99958597 + 0.75 NA non-coding (NR_024130, exon 5 of 5) non-coding (NR_024130, exon 5 of 5) -27566 NM_001318326 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 156.75-149 chr6 87094034 87094478 + 0.75 NA intron (NM_001252383, intron 1 of 4) intron (NM_001252383, intron 1 of 4) 850 NM_000735 1081 Hs.119689 NM_000735 ENSG00000135346 CGA CG-ALPHA|FSHA|GPA1|GPHA1|GPHa|HCG|LHA|TSHA glycoprotein hormones, alpha polypeptide protein-coding 187.5-72 chr17 66189723 66190087 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 1 of 26) AluJb|SINE|Alu 1987 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 174-4 chr1 217882495 217882816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10245 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 202.5-32 chr12 49906021 49906393 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2307 NM_012306 23017 Hs.567424 NM_012306 ENSG00000135472 FAIM2 LFG|LFG2|NGP35|NMP35|TMBIM2 Fas apoptotic inhibitory molecule 2 protein-coding 205.75-82 chr8 89753117 89753618 + 0.75 NA intron (NR_125822, intron 1 of 4) L1MC4a|LINE|L1 4344 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 261.75-51 chr8 79154671 79155262 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -177222 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 160-19 chr11 36814649 36814963 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -216527 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 256.5-85 chr9 76239154 76239670 + 0.75 NA intron (NM_001190482, intron 23 of 36) intron (NM_001190482, intron 23 of 36) 155014 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 125-15 chr1 219202810 219203011 + 0.75 NA intron (NM_001300770, intron 3 of 4) AluJr4|SINE|Alu 27941 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 181.75-43 chr17 11079140 11079533 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -161877 NM_001173462 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 135.5-184 chr7 41262723 41262954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161234 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 123.5-53 chr12 121343914 121344184 + 0.75 NA intron (NM_001137559, intron 4 of 16) LTR16E2|LTR|ERVL 8362 NM_016237 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 158-138 chr8 91020334 91020725 + 0.75 NA intron (NM_018710, intron 2 of 6) intron (NM_018710, intron 2 of 6) 20330 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 193.5-105 chr3 39710139 39710719 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -98485 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 140.5-239 chr8 128357542 128357889 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 206964 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 199.5-152 chr8 124659230 124659649 + 0.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 69034 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 181.5-161 chr8 119207083 119207433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1105 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 182.5-155 chr7 70776948 70777321 + 0.75 NA exon (NM_001127231, exon 13 of 18) exon (NM_001127231, exon 13 of 18) -355010 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 217.75-18 chr11 45034127 45034706 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -59597 NM_001359633 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 112.75-56 chr14 52214554 52214744 + 0.75 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -53049 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 193.75-50 chr14 90688831 90689164 + 0.75 NA intron (NM_001320421, intron 7 of 20) intron (NM_001320421, intron 7 of 20) -8336 NR_135190 105370622 Hs.662373 NR_135190 ENSG00000258716 LOC105370622 - uncharacterized LOC105370622 ncRNA 182.75-20 chr10 8146634 8147113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92185 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 166.25-19 chr1 228429944 228430420 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4857 NM_003493 8290 Hs.248171 NM_003493 ENSG00000168148 HIST3H3 H3.4|H3/g|H3FT|H3t histone cluster 3 H3 protein-coding 171.75-145 chr9 3449142 3449414 + 0.75 NA intron (NM_001282116, intron 1 of 16) intron (NM_001282116, intron 1 of 16) 40209 NM_001282117 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 137.75-187 chr7 5830584 5830830 + 0.75 NA intron (NR_023382, intron 1 of 6) intron (NR_023382, intron 1 of 6) 7547 NR_023382 401303 Hs.372707 NR_023382 ZNF815P ZNF815 zinc finger protein 815, pseudogene pseudo 122.25-165 chr6 134386881 134387154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50699 NR_038217 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 142-142 chr6 72715904 72716210 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 85562 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 145-46 chr14 65483932 65484256 + 0.75 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1MEc|LINE|L1 12992 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 188.25-66 chr22 17359618 17359945 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001290046) promoter-TSS (NM_001290046) -168 NM_001290046 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 226.5-62 chr3 72389145 72389569 + 0.75 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 57266 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 114.25-202 chr9 14905429 14905672 + 0.75 NA intron (NM_001370065, intron 1 of 7) intron (NM_001370065, intron 1 of 7) 4878 NR_163240 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 114-106 chr3 120241807 120242193 + 0.75 NA intron (NM_001168271, intron 2 of 8) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 2295 NM_001168271 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 152-132 chr6 48331826 48332090 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -263269 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 151-88 chr3 114427409 114427627 + 0.75 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -26075 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 171.5-163 chr9 26922952 26923325 + 0.75 NA intron (NM_001321546, intron 7 of 12) intron (NM_001321546, intron 7 of 12) -23852 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 214.5-27 chr12 87216536 87216965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113989 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 126.5-164 chr3 194972567 194972825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -121892 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 131-56 chr14 75174022 75174293 + 0.75 NA intron (NM_006827, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 2455 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 148.75-118 chr4 31478704 31478975 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -27705 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 146.75-164 chr8 117796467 117796857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 124251 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 206.5-17 chr12 60885630 60885938 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 1196414 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 160.75-31 chr12 34636420 34636812 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 614120 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 145.75-101 chr3 98162041 98162290 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -6535 NM_001005515 403274 Hs.554713 NM_001005515 ENSG00000233412 OR5H15 - olfactory receptor family 5 subfamily H member 15 protein-coding 172.5-151 chr4 157129205 157129662 + 0.75 NA intron (NM_000824, intron 4 of 9) intron (NM_000824, intron 4 of 9) 53030 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 175.25-61 chr19 53161897 53162335 + 0.75 NA TTS (NM_001353459) TTS (NM_001353459) -3056 NM_001172674 84671 Hs.467239 NM_032584 ENSG00000197937 ZNF347 ZNF1111 zinc finger protein 347 protein-coding 172.5-16 chr1 180788548 180788936 + 0.75 NA intron (NR_137330, intron 3 of 12) intron (NR_137330, intron 3 of 12) -124155 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 131-19 chr10 43912135 43912371 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_136148) promoter-TSS (NR_136148) -149 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 120-128 chr3 192249442 192249657 + 0.75 NA intron (NR_046596, intron 1 of 4) intron (NR_046596, intron 1 of 4) 10919 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-43 chr13 113824647 113824866 + 0.75 NA intron (NM_000820, intron 12 of 14) intron (NM_000820, intron 12 of 14) 9146 NR_044995 650669 Hs.369201 NM_001039799 GAS6-AS1 - GAS6 antisense RNA 1 ncRNA 156-155 chr8 118188544 118188805 + 0.75 NA TTS (NM_001349811) TTS (NM_001349811) -76855 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 201.75-44 chr2 13230416 13231033 + 0.75 NA Intergenic (TTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -223711 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 138.75-53 chr14 68289645 68290021 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 338954 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 163.5-182 chr7 2037265 2037656 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 51592 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 206.5-148 chrX 16996784 16997135 + 0.75 NA intron (NM_001080975, intron 1 of 17) intron (NM_001080975, intron 1 of 17) 50301 NM_001080975 9185 Hs.186810 NM_004726 ENSG00000169891 REPS2 POB1 RALBP1 associated Eps domain containing 2 protein-coding 186-84 chr7 3352694 3353228 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 51709 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 187.75-59 chr2 220985467 220985987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 586577 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 204.25-75 chr4 4497468 4497808 + 0.75 NA intron (NM_001346282, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR -15938 NR_126434 104472519 Hs.691848 NR_126434 ENSG00000248221 STX18-IT1 - STX18 intronic transcript 1 ncRNA 152.75-21 chr10 75877717 75878103 + 0.75 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 95149 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 165.25-125 chr6 70740955 70741394 + 0.75 NA intron (NM_001044305, intron 2 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 72644 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 113.25-109 chr3 67685464 67685739 + 0.75 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) intron (NR_109992, intron 3 of 6) 30904 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165.75-116 chr3 191610392 191610714 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 149390 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 120-53 chr15 83081645 83081910 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 14442 NR_039740 100616404 NR_039740 ENSG00000263643 MIR4515 mir-4515 microRNA 4515 ncRNA 189.5-89 chr3 7776121 7776473 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 240010 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 175-50 chr17 35742094 35742573 + 0.75 NA 3' UTR (NM_033315, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_033315, exon 4 of 4) 10545 NM_139285 246176 Hs.591194 NM_139285 ENSG00000270765 GAS2L2 CILD41|GAR17 growth arrest specific 2 like 2 protein-coding 132-171 chr8 31106839 31107075 + 0.75 NA intron (NM_000553, intron 18 of 34) intron (NM_000553, intron 18 of 34) -73601 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 161.75-77 chr21 24816025 24816398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24339 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 189.75-14 chr10 119195965 119196285 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11446 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 189.25-117 chr8 24588911 24589311 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -40493 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 143.25-63 chr16 54590420 54590762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -219892 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 142.25-116 chr4 32726642 32726977 + 0.75 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 375771 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 151-103 chr4 100975012 100975436 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 265648 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 161.25-142 chr5 133065741 133066022 + 0.75 NA intron (NM_002154, intron 2 of 18) intron (NM_002154, intron 2 of 18) 13868 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 121.75-84 chr2 114658253 114658486 + 0.75 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 175179 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 261-16 chr14 48118812 48119256 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -324020 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 192-71 chr20 38396700 38397040 + 0.75 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 28460 NR_002910 26776 Hs.400876 NR_002910 ENSG00000235408 SNORA71B RNU71B|U71b small nucleolar RNA, H/ACA box 71B snoRNA 154.25-119 chr4 115469260 115469465 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -355742 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 113.75-38 chr11 74168169 74168414 + 0.75 NA intron (NM_001286577, intron 2 of 32) intron (NM_001286577, intron 2 of 32) 2711 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 116.5-103 chr19 33348796 33349060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24781 NM_001806 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 151-91 chr3 182956635 182957065 + 0.75 NA intron (NM_020640, intron 4 of 6) L3|LINE|CR1 23688 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 165.25-33 chr12 21496036 21496451 + 0.75 NA intron (NM_002907, intron 2 of 14) ERVL-E-int|LTR|ERVL 5392 NM_002907 5965 Hs.235069 NM_002907 ENSG00000004700 RECQL RECQL1|RecQ1 RecQ like helicase protein-coding 134.75-54 chr12 84479757 84479962 + 0.75 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 432940 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 132.25-133 chr3 147087214 147087498 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165433 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 164.5-129 chr3 33336059 33336424 + 0.75 NA intron (NR_146129, intron 4 of 15) L1MEf|LINE|L1 58799 NM_001349324 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 120-195 chr8 137208944 137209247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 204493 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 193.5-61 chr16 78321721 78322127 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 222270 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 276.75-42 chr6 3415298 3415787 + 0.75 NA intron (NM_021945, intron 3 of 10) intron (NM_021945, intron 3 of 10) 29471 NM_001286455 63027 Hs.713588 NM_015482 ENSG00000137266 SLC22A23 C6orf85 solute carrier family 22 member 23 protein-coding 132-174 chr8 86465318 86465495 + 0.75 NA intron (NM_007013, intron 24 of 24) L2c|LINE|L2 43280 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 168.75-131 chr7 14129777 14130098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138512 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 197.75-36 chr19 10754709 10755080 + 0.75 NA intron (NM_001005362, intron 1 of 19) L1ME3|LINE|L1 -25360 NR_039903 100616425 NR_039903 ENSG00000265879 MIR4748 mir-4748 microRNA 4748 ncRNA 124.75-29 chr10 71988127 71988392 + 0.75 NA intron (NM_004273, intron 1 of 2) intron (NM_004273, intron 1 of 2) 23864 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 275.75-32 chr3 171935149 171935619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34644 NR_046852 100874219 Hs.730556 NR_046852 ENSG00000234717 TMEM212-AS1 - TMEM212 antisense RNA 1 ncRNA 118.75-193 chr8 74533444 74533798 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14922 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 200.25-74 chr21 34627721 34628314 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -12904 NM_004414 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 166.25-2 chr1 30010255 30010519 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 27225 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 171.75-7 chr1 114870719 114871116 + 0.75 NA intron (NM_001282542, intron 8 of 30) L1MCa|LINE|L1 16054 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 158.5-101 chr2 112945560 112945802 + 0.75 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 30488 NM_173205 27178 Hs.166371 NM_014439 ENSG00000125571 IL37 FIL1|FIL1(ZETA)|FIL1Z|IL-1F7|IL-1H|IL-1H4|IL-1RP1|IL-37|IL1F7|IL1H4|IL1RP1 interleukin 37 protein-coding 130.25-136 chr3 75148058 75148347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66274 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 225.25-73 chr7 3972492 3972935 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 12 of 44) intron (NM_152744, intron 12 of 44) -156972 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 119.25-94 chr2 85625349 85625761 + 0.75 NA exon (NM_001256725, exon 5 of 14) exon (NM_001256725, exon 5 of 14) 9369 NM_001256726 10713 Hs.654745 NM_006590 ENSG00000168883 USP39 65K|CGI-21|HSPC332|SAD1|SNRNP65 ubiquitin specific peptidase 39 protein-coding 210.25-66 chr5 150883898 150884227 + 0.75 NA intron (NM_001346557, intron 3 of 3) L1M1|LINE|L1 20921 NM_001172832 91975 Hs.134885 NM_052860 ENSG00000145908 ZNF300 - zinc finger protein 300 protein-coding 203.5-88 chr3 24270672 24271173 + 0.75 NA intron (NM_001354708, intron 2 of 9) intron (NM_001354708, intron 2 of 9) 119598 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 177.75-48 chr14 104242988 104243345 + 0.75 NA non-coding (NR_146611, exon 2 of 2) non-coding (NR_146611, exon 2 of 2) 19582 NR_146612 145195 Hs.534297 NR_146611 ENSG00000258913 LINC02691 C14orf144 long intergenic non-protein coding RNA 2691 ncRNA 179.25-59 chr16 77385259 77385697 + 0.75 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 49556 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 137.25-106 chr3 178312958 178313280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106082 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 153.5-79 chr17 66476618 66476952 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -59931 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 237.5-39 chr16 76748274 76748729 + 0.75 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 113503 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 190.5-138 chr6 136283403 136283783 + 0.75 NA intron (NM_001363659, intron 1 of 11) intron (NM_001363659, intron 1 of 11) 6253 NM_001301038 9774 Hs.486542 NM_014739 ENSG00000029363 BCLAF1 BTF|bK211L9.1 BCL2 associated transcription factor 1 protein-coding 148-118 chr7 13116240 13116535 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 428754 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 154-96 chr3 113295855 113296264 + 0.75 NA intron (NM_001164496, intron 33 of 34) L1PA17|LINE|L1 83943 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 194.25-37 chr15 84696873 84697334 + 0.75 NA intron (NM_014300, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 19036 NM_014300 23478 Hs.9534 NM_014300 ENSG00000140612 SEC11A 1810012E07Rik|SEC11L1|SPC18|SPCS4A|sid2895 SEC11 homolog A, signal peptidase complex subunit protein-coding 119.25-108 chr20 34044309 34044630 + 0.75 NA intron (NM_007367, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu -4650 NR_039911 100616434 NR_039911 ENSG00000264616 MIR4755 mir-4755 microRNA 4755 ncRNA 188.75-95 chr6 27674256 27674633 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -19591 NR_038294 100507173 Hs.635987 NR_038292 ENSG00000281706 LINC01012 - long intergenic non-protein coding RNA 1012 ncRNA 149.25-114 chr3 46824848 46825186 + 0.75 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 8806 NR_148409 339906 Hs.585127 NM_182702 ENSG00000178055 PRSS42P PRSS42|TESSP2 serine protease 42, pseudogene pseudo 163.5-92 chr2 74358951 74359353 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15583 NM_023019 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 236.75-66 chr9 90658810 90659270 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -16216 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 122.5-26 chr10 70846705 70846941 + 0.75 NA intron (NM_003901, intron 3 of 14) L1MA8|LINE|L1 30875 NM_003901 8879 Hs.499984 NM_003901 ENSG00000166224 SGPL1 NPHS14|S1PL|SPL sphingosine-1-phosphate lyase 1 protein-coding 147.75-51 chr17 56904266 56904536 + 0.75 NA exon (NM_005082, exon 3 of 9) exon (NM_005082, exon 3 of 9) 9648 NM_005082 7706 Hs.528952 NM_005082 ENSG00000121060 TRIM25 EFP|RNF147|Z147|ZNF147 tripartite motif containing 25 protein-coding 229-72 chr7 85204643 85205141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82961 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 131.25-143 chr3 121424071 121424287 + 0.75 NA non-coding (NR_145516, exon 29 of 29) non-coding (NR_145516, exon 29 of 29) 121809 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 120.5-39 chr11 55809038 55809306 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2195 NM_001004738 219437 Hs.553623 NM_001004738 ENSG00000279395 OR5L1 OR11-151|OST262 olfactory receptor family 5 subfamily L member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 117-161 chr6 136922623 136922862 + 0.75 NA exon (NM_001008783, exon 1 of 2) exon (NM_001008783, exon 1 of 2) 441 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 137-191 chrX 36841912 36842151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166328 NM_001013736 442444 Hs.535216 NM_001013736 ENSG00000198173 FAM47C - family with sequence similarity 47 member C protein-coding 169.75-77 chr2 63951811 63952091 + 0.75 NA intron (NM_001005739, intron 7 of 22) intron (NM_001005739, intron 7 of 22) 67477 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 243.5-66 chr5 144098903 144099398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71509 NM_030799 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 207.25-22 chr14 52291501 52291817 + 0.75 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -22653 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 121.75-63 chr18 2788380 2788627 + 0.75 NA intron (NM_015295, intron 45 of 47) intron (NM_015295, intron 45 of 47) -58503 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 189.25-73 chr3 6997773 6998261 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) AluSq2|SINE|Alu -104000 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 181.75-51 chr18 10447622 10448033 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6808 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 121.5-64 chr12 116107426 116107648 + 0.75 NA intron (NM_015335, intron 3 of 30) intron (NM_015335, intron 3 of 30) 41117 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 127-101 chr2 114241136 114241497 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -201325 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 172.5-199 chr8 83388839 83389311 + 0.75 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -14683 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 225-68 chr7 10952872 10953515 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -13040 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 119.75-98 chr2 41716614 41717024 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -160736 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 190.5-154 chr7 140825830 140826271 + 0.75 NA intron (NR_148928, intron 3 of 17) L1MEd|LINE|L1 98879 NR_148928 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 118.25-91 chr19 31663945 31664180 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 71781 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 173.75-36 chr11 104060764 104061090 + 0.75 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) L1MB4|LINE|L1 24287 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 163.25-137 chr8 29430066 29430312 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -79505 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 113.75-31 chr11 16943590 16943883 + 0.75 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) MIRc|SINE|MIR -17714 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 139.5-140 chr3 145994126 145994366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74939 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 154-106 chr5 31620865 31621187 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -18105 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 228.75-30 chr17 72259237 72259642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83372 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 214-19 chr14 60894993 60895301 + 0.75 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) intron (NM_001177963, intron 6 of 6) 85932 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 152.5-193 chr8 120860456 120860831 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -48597 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 127.75-67 chr14 100853013 100853214 + 0.75 NA TTS (NR_030528) TTS (NR_030528) 723 NR_030528 768222 NR_030528 ENSG00000211574 MIR770 MIRN770|hsa-mir-770 microRNA 770 ncRNA 112.75-53 chr14 21585318 21585552 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14691 NM_001005465 26533 Hs.554581 NM_001005465 ENSG00000169208 OR10G3 OR14-40 olfactory receptor family 10 subfamily G member 3 protein-coding 213.25-72 chrX 75774225 75774681 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 10801 NM_138703 139599 Hs.356869 NM_138703 ENSG00000186675 MAGEE2 HCA3 MAGE family member E2 protein-coding 178.75-34 chr15 101454735 101454979 + 0.75 NA intron (NM_138325, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 34850 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 128.75-176 chr6 132522503 132522721 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -9140 NM_001326579 8417 Hs.593148 NM_003569 ENSG00000079950 STX7 - syntaxin 7 protein-coding 143.5-96 chr18 13708315 13708610 + 0.75 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) MER21C|LTR|ERVL 18096 NM_001098801 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 179.25-10 chr1 198358651 198358984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182128 NM_133326 127124 Hs.127743 NM_133262 ENSG00000151418 ATP6V1G3 ATP6G3|Vma10 ATPase H+ transporting V1 subunit G3 protein-coding 154.5-120 chr22 24346223 24346644 + 0.75 NA intron (NM_001254733, intron 2 of 8) intron (NM_001254733, intron 2 of 8) 4325 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 225.5-95 chr6 52378979 52379496 + 0.75 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) L1MB2|LINE|L1 17086 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 169.75-145 chr7 68892322 68892629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 705149 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 124.5-194 chr6 97192016 97192293 + 0.75 NA intron (NM_001350600, intron 13 of 23) intron (NM_001350600, intron 13 of 23) 91062 NM_001350599 253714 Hs.444292 NM_198468 ENSG00000146263 MMS22L C6orf167|dJ39B17.2 MMS22 like, DNA repair protein protein-coding 138.75-158 chr5 136171251 136171611 + 0.75 NA intron (NM_001001420, intron 4 of 6) intron (NM_001001420, intron 4 of 6) 21731 NM_001350994 389332 Hs.127680 NM_001350994 ENSG00000271824 SMIM32 - small integral membrane protein 32 protein-coding 152-7 chr1 90190247 90190513 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 195270 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 159.5-13 chr1 225619658 225619974 + 0.75 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) L1PB3|LINE|L1 33307 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 200-48 chr2 200274696 200275079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30992 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 138.5-58 chr14 61616509 61616874 + 0.75 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -46038 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 142-120 chr4 61409003 61409406 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 207032 NM_001371342 158-11 chr1 165202300 165202777 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001174069, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001174069, exon 9 of 9) 153703 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 170-78 chr5 30074804 30075171 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 194427 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 148.25-122 chr5 66943288 66943525 + 0.75 NA intron (NM_015183, intron 3 of 27) intron (NM_015183, intron 3 of 27) -15667 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 166.5-7 chr1 52673854 52674301 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24270 NM_023077 65260 Hs.349905 NM_023077 ENSG00000162377 COA7 C1orf163|RESA1|SCAN3|SELRC1 cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) protein-coding 134.25-35 chr12 57036377 57036746 + 0.75 NA intron (NM_005379, intron 21 of 27) intron (NM_005379, intron 21 of 27) 13568 NM_005379 4640 Hs.5394 NM_005379 ENSG00000166866 MYO1A BBMI|DFNA48|MIHC|MYHL myosin IA protein-coding 161.75-134 chr9 82117055 82117375 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128443 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 172.75-119 chr7 101896725 101897092 + 0.75 NA intron (NM_181552, intron 1 of 23) intron (NM_181552, intron 1 of 23) 79282 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 117-14 chr10 56606882 56607082 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245709 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 203.75-96 chr6 161247342 161247688 + 0.75 NA intron (NM_020133, intron 1 of 8) L1PA13|LINE|L1 26546 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 128-145 chr6 159946534 159946879 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22393 NM_000876 3482 Hs.487062 NM_000876 ENSG00000197081 IGF2R CD222|CI-M6PR|CIMPR|M6P-R|M6P/IGF2R|MPR 300|MPR1|MPR300|MPRI insulin like growth factor 2 receptor protein-coding 156.25-129 chr6 47068953 47069453 + 0.75 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -26871 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 158.25-44 chr15 86492014 86492410 + 0.75 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) L2c|LINE|L2 -175244 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 122.75-45 chr14 43489490 43489756 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1017660 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 229.25-45 chr2 99495501 99495927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5697 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 172-81 chr4 52473421 52473803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182927 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 172.25-37 chr14 65182665 65183082 + 0.75 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 39474 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 245.75-34 chr3 6800258 6800652 + 0.75 NA intron (NR_110125, intron 1 of 3) intron (NR_110125, intron 1 of 3) 4994 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 156.5-9 chr1 184940783 184941128 + 0.75 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) intron (NM_052966, intron 1 of 13) 33553 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 217.25-28 chr15 70203587 70204038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105895 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 243.5-23 chr11 114373986 114374387 + 0.75 NA intron (NR_120567, intron 2 of 2) intron (NR_120567, intron 2 of 2) 5853 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 126.25-145 chr5 16485110 16485492 + 0.75 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -19501 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 123.5-105 chr2 101003614 101003848 + 0.75 NA intron (NM_000993, intron 2 of 4) intron (NM_000993, intron 2 of 4) 1442 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 136.75-111 chr2 226537163 226537421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121501 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 188.75-64 chr2 188543588 188543940 + 0.75 NA intron (NM_016315, intron 7 of 11) MIR3|SINE|MIR 246272 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 192.75-2 chr1 30972959 30973438 + 0.75 NA intron (NM_001020658, intron 10 of 21) intron (NM_001020658, intron 10 of 21) -4961 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 131-86 chr2 50301214 50301443 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MIR|SINE|MIR 46426 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 153.25-40 chr14 59443011 59443247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22251 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 117-144 chr5 51147133 51147412 + 0.75 NA Intergenic AluYk11|SINE|Alu -177085 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 137.5-105 chr18 70988808 70989061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -337980 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 167.25-97 chr20 35537159 35537441 + 0.75 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -4778 NM_198398 51614 Hs.472558 NM_015966 ENSG00000125991 ERGIC3 C20orf47|C2orf47|CGI-54|Erv46|NY-BR-84|PRO0989|SDBCAG84|dJ477O4.2 ERGIC and golgi 3 protein-coding 209.5-136 chr7 13382733 13383038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 603629 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 167.25-141 chr7 22315968 22316250 + 0.75 NA intron (NM_012294, intron 2 of 25) intron (NM_012294, intron 2 of 25) 41045 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 143.5-188 chr6 65373597 65373962 + 0.75 NA intron (NM_198283, intron 7 of 9) L1ME4a|LINE|L1 72361 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 239.25-73 chr5 142326168 142326572 + 0.75 NA intron (NR_120664, intron 1 of 3) intron (NR_120664, intron 1 of 3) 1077 NR_120664 101926941 Hs.658945 NR_120664 ENSG00000231185 SPRY4-AS1 THCAT68 SPRY4 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-184 chr5 150173728 150173991 + 0.75 NA intron (NM_001804, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 7081 NM_001804 1044 Hs.1545 NM_001804 ENSG00000113722 CDX1 - caudal type homeobox 1 protein-coding 253.25-21 chr14 28032395 28032869 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -359411 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 137.25-87 chr20 62854321 62854703 + 0.75 NA intron (NM_001301726, intron 4 of 5) intron (NM_001301726, intron 4 of 5) 7310 NM_006602 10732 Hs.126248 NM_006602 ENSG00000101190 TCFL5 CHA|E2BP-1|Figlb|SOSF1|bHLHe82 transcription factor like 5 protein-coding 165-115 chr5 140531600 140531893 + 0.75 NA intron (NM_020690, intron 29 of 35) L1MB7|LINE|L1 -15916 NM_003732 8637 Hs.594084 NM_003732 ENSG00000243056 EIF4EBP3 4E-BP3|4EBP3 eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3 protein-coding 142-127 chr5 59145289 59145759 + 0.75 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -106048 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 239.25-57 chr22 28282067 28282739 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MER3|DNA|hAT-Charlie -177466 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 112.25-21 chr10 70302972 70303233 + 0.75 NA intron (NM_018205, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 -19098 NM_022146 64106 Hs.302026 NM_022146 ENSG00000148734 NPFFR1 GPR147|NPFF1|NPFF1R1|OT7T022 neuropeptide FF receptor 1 protein-coding 132-101 chr22 27822294 27822566 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -20674 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 129.5-103 chr19 47706405 47706577 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6931 NM_014601 30846 Hs.744963 NM_014601 ENSG00000024422 EHD2 PAST2 EH domain containing 2 protein-coding 128.75-72 chr17 29862349 29862600 + 0.75 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -67429 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 186.25-123 chr8 127124662 127124968 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -42594 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 215.75-45 chr17 47148376 47148782 + 0.75 NA intron (NM_001256, intron 9 of 18) L1MEc|LINE|L1 40716 NM_001353050 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 247-39 chr20 51237317 51237703 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -214403 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 157.75-70 chr17 61938588 61938991 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10807 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 131-3 chr1 101928206 101928501 + 0.75 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 56341 NR_033424 94236 Hs.606193 NR_033424 DNAJA1P5 HEJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 pseudogene 5 pseudo 155-106 chr5 19152885 19153370 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 733145 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 155.5-9 chr1 60917912 60918228 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 52706 NR_110617 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 132.5-165 chr3 101759140 101759414 + 0.75 NA intron (NM_024548, intron 9 of 10) MER77|LTR|ERVL -19934 NM_001348997 91775 Hs.595933 NM_145037 ENSG00000144815 NXPE3 FAM55C|MST115|MSTP115 neurexophilin and PC-esterase domain family member 3 protein-coding 148.75-52 chr14 48729048 48729413 + 0.75 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X 857150 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 123-46 chr14 24476830 24477163 + 0.75 NA intron (NR_110032, intron 2 of 2) intron (NR_110032, intron 2 of 2) 31269 NM_001308083 1215 Hs.135626 NM_001836 ENSG00000092009 CMA1 CYH|MCT1|chymase chymase 1 protein-coding 140-8 chr1 155150764 155151030 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10366 NM_153741 54344 Hs.110477 NM_018973 ENSG00000179085 DPM3 CDG1O dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatory protein-coding 126-182 chr9 26936443 26936663 + 0.75 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) L1M4c|LINE|L1 -10437 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 152-61 chr16 79260415 79260713 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 340173 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 226.75-2 chr1 202296282 202296641 + 0.75 NA intron (NM_001017403, intron 6 of 17) intron (NM_001017403, intron 6 of 17) 45475 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 178.5-87 chr2 181265096 181265394 + 0.75 NA intron (NR_130784, intron 3 of 4) intron (NR_130784, intron 3 of 4) 40407 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 162.25-85 chr2 135681146 135681367 + 0.75 NA intron (NM_001282798, intron 20 of 25) LTR31|LTR|ERV1 15859 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 246.25-32 chr2 102349365 102349730 + 0.75 NA intron (NM_016232, intron 10 of 10) intron (NM_016232, intron 10 of 10) -6249 NM_001371418 122-52 chr12 125576978 125577201 + 0.75 NA intron (NM_052907, intron 4 of 8) L1MB8|LINE|L1 -45363 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 133-177 chr8 126269686 126270001 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -55652 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 214.25-67 chr5 41922143 41922523 + 0.75 NA TTS (NM_175921) TTS (NM_175921) -2919 NM_001297437 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 131.75-154 chr4 87524210 87524589 + 0.75 NA intron (NM_001128310, intron 1 of 11) LOR1b|LTR|ERV1 5104 NM_001128310 8404 Hs.62886 NM_004684 ENSG00000152583 SPARCL1 MAST 9|MAST9|PIG33|SC1 SPARC like 1 protein-coding 142.25-160 chr7 127336909 127337166 + 0.75 NA Intergenic MER5C1|DNA|hAT-Charlie 55671 NM_176814 168850 Hs.159006 NM_176814 ENSG00000048405 ZNF800 - zinc finger protein 800 protein-coding 219.5-56 chr19 31104320 31104931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62885 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 258.25-3 chr1 119826972 119827586 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15819 NM_001159353 83998 Hs.660883 NM_032044 ENSG00000134193 REG4 GISP|REG-IV|RELP regenerating family member 4 protein-coding 143-42 chr14 86766696 86767113 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -138874 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 236.25-65 chr4 184780242 184780670 + 0.75 NA intron (NM_001995, intron 4 of 20) intron (NM_001995, intron 4 of 20) 18590 NR_003542 643036 Hs.689630 NR_003542 ENSG00000249138 SLED1 - proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 pseudogene pseudo 130-157 chr7 105087881 105088249 + 0.75 NA intron (NM_182931, intron 13 of 26) intron (NM_182931, intron 13 of 26) 73860 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 132.5-209 chr6 39760940 39761295 + 0.75 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -31259 NM_001201427 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 204.25-54 chr2 45957801 45958343 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) MER5A|DNA|hAT-Charlie 306397 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 152.25-138 chr5 169579985 169580377 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -3592 NM_001329639 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 147.25-87 chr3 116144831 116145120 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) L1MEd|LINE|L1 -215049 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 260.5-25 chr19 3902248 3902943 + 0.75 NA intron (NM_033064, intron 3 of 12) intron (NM_033064, intron 3 of 12) 21910 NM_033064 85300 Hs.418055 NM_033064 ENSG00000167654 ATCAY BNIP-H|CLAC ATCAY kinesin light chain interacting caytaxin protein-coding 126.75-200 chr5 119402376 119402555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46446 NM_014350 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 172-37 chr14 68060211 68060771 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 236899 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 224-8 chr10 11104607 11105094 + 0.75 NA intron (NR_046108, intron 1 of 6) intron (NR_046108, intron 1 of 6) 638 NR_046108 439950 Hs.568157 NR_046108 CELF2-AS2 - CELF2 antisense RNA 2 ncRNA 132-97 chr20 50852202 50852449 + 0.75 NA intron (NM_198799, intron 4 of 4) intron (NM_198799, intron 4 of 4) 57431 NM_001010974 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 122.25-62 chr14 61323609 61323984 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 2353 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 138.75-47 chr13 113114805 113115139 + 0.75 NA intron (NR_051961, intron 3 of 6) intron (NR_051961, intron 3 of 6) -7827 NM_000504 2159 Hs.361463 NM_000504 ENSG00000126218 F10 FX|FXA coagulation factor X protein-coding 154.75-144 chr8 86711608 86712068 + 0.75 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31837 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 150.75-48 chr12 119028654 119029037 + 0.75 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) intron (NM_194286, intron 1 of 12) 47304 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 200.25-117 chr9 68443442 68443769 + 0.75 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) intron (NM_021965, intron 6 of 10) -85739 NR_015423 572558 Hs.552819 NR_015423 ENSG00000224958 PGM5-AS1 FAM233A PGM5 antisense RNA 1 ncRNA 161-128 chr9 29426805 29427110 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -213356 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 221.25-42 chr2 137171299 137171661 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 405935 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 131.25-142 chr3 120369281 120369618 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -20095 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 212.25-43 chr2 23982870 23983207 + 0.75 NA intron (NM_181713, intron 5 of 6) intron (NM_181713, intron 5 of 6) -27047 NM_001346880 388931 Hs.407482 NM_001080473 ENSG00000205639 MFSD2B - major facilitator superfamily domain containing 2B protein-coding 239.75-15 chr12 58865807 58866300 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 53493 NM_001136051 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 112.75-104 chr2 146398926 146399198 + 0.75 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -187995 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 136.75-11 chr1 115878188 115878444 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37190 NM_005599 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 139.25-196 chr8 60620866 60621083 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001242644, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001242644, exon 7 of 7) -57766 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 264-20 chr16 71254001 71254834 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -23695 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 116.25-29 chr11 14097200 14097460 + 0.75 NA intron (NM_006108, intron 5 of 15) intron (NM_006108, intron 5 of 15) 134607 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 189.5-21 chr10 54360497 54360774 + 0.75 NA intron (NM_001354411, intron 5 of 34) intron (NM_001354411, intron 5 of 34) -125595 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 160-64 chr22 32586068 32586338 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 110966 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 124.75-195 chr7 85863092 85863409 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 442128 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 137.75-69 chr15 39361273 39361687 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 110811 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 163.25-115 chr5 67032215 67032561 + 0.75 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 27733 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 128.75-191 chr7 111904144 111904390 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 13 of 52) L2a|LINE|L2 95762 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 251-32 chr2 133323006 133323422 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 57019 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 167.5-104 chr20 47465838 47466106 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -35915 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 203.25-3 chr1 70202370 70202800 + 0.75 NA intron (NM_017768, intron 1 of 14) L1MC2|LINE|L1 2994 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 127.25-3 chr1 117786790 117787094 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 142679 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 215.5-2 chr1 39830463 39830802 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 41656 NR_135805 101929536 Hs.552820 NR_135805 ENSG00000261798 LOC101929536 - uncharacterized LOC101929536 ncRNA 150.75-180 chr8 78400601 78401013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115533 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 201-19 chr11 105629218 105629721 + 0.75 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 18763 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 117.75-104 chr2 62313957 62314309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98612 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 149.75-165 chr8 88921807 88922103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -594472 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 156.75-109 chr3 36174485 36174949 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -205770 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 192-94 chr7 48993897 48994240 + 0.75 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 69521 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 176.25-48 chr17 28180764 28181209 + 0.75 NA intron (NM_016231, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu -45577 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 120.5-146 chr3 102421785 102421990 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13128 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 141.25-124 chr4 87339113 87339320 + 0.75 NA intron (NM_016245, intron 6 of 6) intron (NM_016245, intron 6 of 6) -16334 NM_178135 345275 Hs.284414 NM_178135 ENSG00000170509 HSD17B13 HMFN0376|NIIL497|SCDR9|SDR16C3 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 13 protein-coding 115.25-62 chr14 58355232 58355437 + 0.75 NA intron (NM_002892, intron 17 of 23) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -40596 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 150.5-155 chr4 107447803 107448178 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 272244 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 135.25-11 chr1 154573159 154573526 + 0.75 NA intron (NM_000748, intron 5 of 5) L2b|LINE|L2 5564 NM_000748 1141 Hs.2306 NM_000748 ENSG00000160716 CHRNB2 EFNL3|nAChRB2 cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit protein-coding 192.75-125 chr8 83079562 83079998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 167676 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 215.5-77 chr4 87269494 87269824 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30924 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 143.75-35 chr11 86549218 86549604 + 0.75 NA intron (NM_001014811, intron 3 of 13) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 122787 NM_001014811 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 157-36 chr15 78898424 78898771 + 0.75 NA TTS (NM_001265605) TTS (NM_001265605) 25608 NM_001265604 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 136.25-5 chr1 55674591 55674794 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 270271 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 186.25-109 chr6 169310907 169311261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56970 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 168-118 chr7 81904666 81905168 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -104260 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 232.25-6 chr1 224161644 224162099 + 0.75 NA non-coding (NR_049764, exon 4 of 4) non-coding (NR_049764, exon 4 of 4) -21369 NM_003676 8560 Hs.299878 NM_003676 ENSG00000143753 DEGS1 DEGS|DEGS-1|DES1|Des-1|FADS7|HLD18|MIG15|MLD delta 4-desaturase, sphingolipid 1 protein-coding 171.75-63 chr17 77678404 77678727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49994 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 179-26 chr11 132115492 132115805 + 0.75 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) intron (NR_147849, intron 2 of 6) -168654 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 182-92 chr5 65263021 65263334 + 0.75 NA intron (NR_135689, intron 13 of 25) intron (NR_135689, intron 13 of 25) 218743 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 262-53 chr8 62033986 62034595 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 144451 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 154-48 chr17 31898351 31898786 + 0.75 NA intron (NM_018428, intron 2 of 18) intron (NM_018428, intron 2 of 18) 3140 NM_018428 55813 Hs.589862 NM_018428 ENSG00000108651 UTP6 C17orf40|HCA66 UTP6 small subunit processome component protein-coding 179.25-104 chr3 100809293 100809548 + 0.75 NA intron (NM_001349332, intron 18 of 35) intron (NM_001349332, intron 18 of 35) 99878 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 129.25-148 chr5 25390921 25391235 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 200125 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 140.5-118 chr2 138814837 138815251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34654 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 199-55 chr3 146651425 146651870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45431 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 263.5-53 chr5 76292943 76293389 + 0.75 NA intron (NM_014979, intron 8 of 12) MIR3|SINE|MIR -110119 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 238.5-41 chr2 36645165 36645797 + 0.75 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -47313 NM_001042548 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 136.5-129 chr20 13925591 13925876 + 0.75 NA intron (NR_073206, intron 3 of 20) L1MEd|LINE|L1 64881 NM_001271539 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 203.75-90 chr5 154498657 154499145 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20674 NM_004821 9421 Hs.152531 NM_004821 ENSG00000113196 HAND1 Hxt|Thing1|bHLHa27|eHand heart and neural crest derivatives expressed 1 protein-coding 120-78 chr18 59137321 59137514 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -2467 NM_033280 90701 Hs.45107 NM_033280 ENSG00000166562 SEC11C SEC11L3|SPC21|SPCS4C SEC11 homolog C, signal peptidase complex subunit protein-coding 230.75-31 chr17 79251772 79252168 + 0.75 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) intron (NM_001082575, intron 3 of 14) 177033 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 158-61 chr18 6370897 6371162 + 0.75 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) -3346 NM_001365770 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 138-58 chr16 86860065 86860351 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 138117 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 130.75-173 chr7 4483658 4483903 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -198515 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 116.25-123 chr20 36120511 36120823 + 0.75 NA intron (NM_001258329, intron 2 of 22) intron (NM_001258329, intron 2 of 22) 27957 NM_001258329 2036 Hs.437422 NM_012156 ENSG00000088367 EPB41L1 4.1N|MRD11 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1 protein-coding 158.5-188 chr8 65953785 65954063 + 0.75 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -61054 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 136.75-160 chr5 105695300 105695640 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 595996 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 262.25-37 chr5 44127202 44127705 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -261279 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 187.75-60 chr20 15994083 15994389 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) intron (NM_001351663, intron 15 of 17) -8354 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 151-105 chr5 14549092 14549411 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -32541 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 140-61 chr17 69934500 69934741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27087 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 164-103 chr5 98764111 98764432 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4361 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 120.5-94 chr17 19352096 19352310 + 0.75 NA intron (NM_001243473, intron 3 of 5) L1ME3B|LINE|L1 -7629 NR_031591 100302256 NR_031591 ENSG00000221540 MIR1180 MIRN1180|hsa-mir-1180|mir-1180 microRNA 1180 ncRNA 230.25-30 chr16 68139690 68140113 + 0.75 NA intron (NM_004555, intron 3 of 10) intron (NM_004555, intron 3 of 10) 54531 NM_004555 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 193-68 chr4 155377126 155377490 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001039580) promoter-TSS (NM_001039580) -343 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 115-113 chr3 140347304 140347499 + 0.75 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) intron (NM_022131, intron 2 of 16) 161388 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 175.5-107 chr22 26363446 26363870 + 0.75 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -65602 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 142.25-118 chr4 48913973 48914407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7362 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 210.75-26 chr14 52289694 52290120 + 0.75 NA Intergenic Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 22209 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 121-113 chr2 203288906 203289107 + 0.75 NA intron (NM_177538, intron 9 of 12) L1M5|LINE|L1 -39233 NM_001282932 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 215.75-11 chr10 21701497 21702052 + 0.75 NA intron (NM_004641, intron 14 of 23) AluSx|SINE|Alu 167602 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 127-69 chr15 68589763 68590036 + 0.75 NA intron (NM_006091, intron 1 of 11) intron (NM_006091, intron 1 of 11) 10906 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 196.25-100 chr5 159343424 159343882 + 0.75 NA intron (NR_037889, intron 2 of 4) intron (NR_037889, intron 2 of 4) 12135 NR_037889 285626 Hs.449275 NR_037889 ENSG00000249738 LOC285626 - uncharacterized LOC285626 ncRNA 112.25-181 chr6 47126585 47126891 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -84406 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 156.5-125 chr4 28722507 28722882 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -96888 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 208.25-60 chr3 95229431 95229852 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 291378 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 197.25-34 chr15 97976970 97977414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16489 NM_183376 91947 Hs.6093 NM_183376 ENSG00000140450 ARRDC4 - arrestin domain containing 4 protein-coding 125-66 chr2 41986169 41986381 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -32469 NR_161189 400950 Hs.738713 NM_001242815 ENSG00000205086 C2orf91 - chromosome 2 open reading frame 91 ncRNA 129.5-236 chr9 27509258 27509663 + 0.75 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu -14854 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 139.25-157 chr5 163418394 163418629 + 0.75 NA Intergenic MER11B|LTR|ERVK -19060 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 173.75-157 chr8 134689295 134689588 + 0.75 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) MER66A|LTR|ERV1 7114 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 166.75-58 chr16 77646393 77646648 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75972 NM_001243660 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 163.75-45 chr14 68468621 68468899 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) (TCCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 160027 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 115-137 chr5 101470308 101470557 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -567150 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 189-100 chr7 84534182 84534698 + 0.75 NA intron (NR_110079, intron 1 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 1964 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 161.75-111 chr6 36674021 36674335 + 0.75 NA non-coding (NR_109836, exon 1 of 1) non-coding (NR_109836, exon 1 of 1) 948 NR_109836 101154753 Hs.741557 NR_109836 ENSG00000281450 PANDAR PANDA promoter of CDKN1A antisense DNA damage activated RNA ncRNA 209.75-94 chr7 130203340 130203764 + 0.75 NA intron (NR_156699, intron 3 of 14) L2a|LINE|L2 1854 NR_156699 84928 Hs.267245 NM_032842 ENSG00000146842 TMEM209 NET31 transmembrane protein 209 protein-coding 133.5-103 chr19 7741663 7741941 + 0.75 NA non-coding (NR_026692, exon 6 of 6) non-coding (NR_026692, exon 6 of 6) 5732 NM_001144893 30835 Hs.278694 NM_021155 ENSG00000090659 CD209 CDSIGN|CLEC4L|DC-SIGN|DC-SIGN1 CD209 molecule protein-coding 209.75-7 chr1 229986454 229986913 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16034 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 134.75-192 chr7 24994306 24994534 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14242 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 259-24 chr22 33463073 33463733 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) L1ME3E|LINE|L1 -26734 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 209.75-49 chr2 39609950 39610318 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55364 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 124.5-187 chr6 49904554 49904861 + 0.75 NA Intergenic MER92D|LTR|ERV1 -27611 NM_001205220 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 150.25-169 chrX 65418788 65419043 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -69820 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 169-105 chr8 108526359 108526632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 82871 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 124.75-20 chr1 214689852 214690184 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 86823 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 299-16 chr2 34275186 34275728 + 0.75 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 208231 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 190.5-88 chr20 33304218 33304494 + 0.75 NA intron (NM_033197, intron 12 of 15) intron (NM_033197, intron 12 of 15) 21142 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 203.75-91 chr6 56482342 56482681 + 0.75 NA intron (NM_001144770, intron 81 of 94) intron (NM_001144770, intron 81 of 94) -88383 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 249-59 chr9 131812836 131813258 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73103 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 178-89 chr6 124583034 124583364 + 0.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L1MA3|LINE|L1 300194 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 122.75-157 chr5 7402457 7402808 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 1 of 24) intron (NM_020546, intron 1 of 24) 6494 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 193-58 chr3 188344803 188345176 + 0.75 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 119584 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 181.5-137 chr5 152579495 152579948 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -174442 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 117-80 chr19 36464115 36464469 + 0.75 NA intron (NM_001145345, intron 4 of 4) L1MEf|LINE|L1 25143 NM_032838 84924 Hs.533939 NM_032838 ENSG00000186017 ZNF566 - zinc finger protein 566 protein-coding 118.5-168 chr5 103857872 103858121 + 0.75 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -295207 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 164-52 chr18 1513392 1513643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153888 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 195-69 chr5 67535719 67536115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110872 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 158.75-82 chr2 13907028 13907332 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 493778 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 165.25-84 chr21 33969538 33969948 + 0.75 NA non-coding (NR_038883, exon 3 of 3) non-coding (NR_038883, exon 3 of 3) -6639 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 122.5-224 chr8 88551358 88551625 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -224008 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 173.25-110 chr6 117461433 117461715 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -21030 NM_173674 285761 Hs.658304 NM_173674 ENSG00000164465 DCBLD1 dJ94G16.1 discoidin, CUB and LCCL domain containing 1 protein-coding 199.75-78 chr5 53389766 53390242 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -90625 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 245-22 chr17 78804830 78805317 + 0.75 NA intron (NM_001321291, intron 15 of 20) intron (NM_001321291, intron 15 of 20) -22731 NM_004762 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 327-17 chr2 129154775 129155519 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 118744 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 144.5-19 chr1 183863597 183863825 + 0.75 NA intron (NM_001297669, intron 4 of 18) L2a|LINE|L2 58591 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 168.75-158 chr8 143269210 143269499 + 0.75 NA intron (NM_138465, intron 1 of 3) intron (NM_138465, intron 1 of 3) 1909 NM_138465 2738 Hs.400533 NM_138465 ENSG00000250571 GLI4 HKR4|ZNF928 GLI family zinc finger 4 protein-coding 148.75-6 chr1 101672987 101673432 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 173871 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 126.25-93 chr2 147264565 147264859 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -579805 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 217.25-6 chr1 175653193 175653794 + 0.75 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) L1ME5|LINE|L1 90102 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 118-61 chr16 35375068 35375444 + 0.75 NA intron (NR_027079, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 11725 NR_027079 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 199.5-154 chr8 134018213 134018665 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 131943 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 136.75-92 chr2 43567694 43567915 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 14 of 37) L2b|LINE|L2 28170 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 127.5-196 chr5 106646970 106647152 + 0.75 NA Intergenic MER97d|DNA|hAT-Tip100 363953 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 147-98 chr4 11075731 11075999 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -292962 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 153.5-133 chr3 110132073 110132486 + 0.75 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 529451 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 185.75-53 chr16 55977932 55978271 + 0.75 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -22070 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 214.25-22 chr13 50568288 50568778 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -41084 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-76 chr3 96188721 96189138 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -171035 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 146.25-75 chr2 146106571 146107102 + 0.75 NA Intergenic LTR38|LTR|ERV1 -480221 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 208.25-93 chr8 123631886 123632306 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 21705 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 122.5-15 chr1 224402781 224403030 + 0.75 NA intron (NM_025160, intron 8 of 13) L1MC5a|LINE|L1 -4594 NR_039896 100616468 NR_039896 ENSG00000266618 MIR4742 mir-4742 microRNA 4742 ncRNA 185.25-52 chr2 2587891 2588294 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -256817 NM_001329851 23040 Hs.434418 NM_015025 ENSG00000186487 MYT1L MRD39|NZF1|ZC2H2C2|ZC2HC4B|myT1-L myelin transcription factor 1 like protein-coding 133.75-61 chr14 61162152 61162364 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 119080 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 136.5-7 chr1 84400583 84400875 + 0.75 NA intron (NM_021233, intron 1 of 5) intron (NM_021233, intron 1 of 5) 2197 NM_021233 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 227.75-11 chr10 96874486 96874948 + 0.75 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) AluSc8|SINE|Alu 41772 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 119.75-182 chr6 53975046 53975336 + 0.75 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -23699 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 283.25-8 chr10 92142744 92143416 + 0.75 NA exon (NM_014912, exon 6 of 10) exon (NM_014912, exon 6 of 10) 100199 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 176-51 chr4 15540961 15541487 + 0.75 NA intron (NM_001080522, intron 18 of 37) AluSz6|SINE|Alu 71342 NM_001164720 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 124.25-208 chr9 31405677 31405869 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -24283 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 124.75-95 chr17 31249269 31249513 + 0.75 NA intron (NM_000267, intron 30 of 56) intron (NM_000267, intron 30 of 56) 47848 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 204.75-91 chr5 10362138 10362532 + 0.75 NA intron (NM_001270661, intron 1 of 22) intron (NM_001270661, intron 1 of 22) 8640 NM_005885 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 124-170 chr8 131712575 131712745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -191433 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 125.25-198 chr7 91814033 91814262 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 66555 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 144-138 chr8 124591966 124592219 + 0.75 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 52969 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 164.5-137 chr3 115245619 115245916 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98479 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 191-30 chr17 72511710 72512263 + 0.75 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 80818 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 120.25-211 chr8 64737840 64738020 + 0.75 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) LTR37-int|LTR|ERV1 60807 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 132-173 chr8 80992004 80992261 + 0.75 NA intron (NM_018440, intron 4 of 8) intron (NM_018440, intron 4 of 8) -117351 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 153.5-18 chr10 51720726 51721023 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -21279 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 194.25 chr1 56032782 56033208 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 87908 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 135.25-52 chr12 30852723 30853081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57221 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 177.75-64 chr2 36071008 36071317 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 284408 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 154.25-6 chr1 113927723 113927982 + 0.75 NA intron (NR_110725, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 1406 NR_110725 101928846 Hs.232534 NR_110725 ENSG00000235527 HIPK1-AS1 - HIPK1 antisense RNA 1 ncRNA 118.5-69 chr17 12014277 12014464 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6507 NM_001281435 6416 Hs.514681 NM_003010 ENSG00000065559 MAP2K4 JNKK|JNKK1|MAPKK4|MEK4|MKK4|PRKMK4|SAPKK-1|SAPKK1|SEK1|SERK1|SKK1 mitogen-activated protein kinase kinase 4 protein-coding 142-94 chr20 15809356 15809649 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 113812 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 166.5-212 chr9 79456181 79456629 + 0.75 NA Intergenic (TATTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -115368 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 147.75-24 chr11 82179375 82179684 + 0.75 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 224384 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 200.5-71 chr2 121356055 121356607 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 36 of 38) intron (NM_015282, intron 36 of 38) -71129 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 119-79 chr2 37031098 37031300 + 0.75 NA intron (NM_019024, intron 22 of 35) MER68|LTR|ERVL 53173 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 118-45 chr14 43834739 43835058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 672385 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 138.25-109 chr3 2264486 2264796 + 0.75 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) L1MA4|LINE|L1 25812 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 137.25-179 chrX 50787732 50787951 + 0.75 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) L1MB1|LINE|L1 26203 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 136.5-82 chr15 87850399 87850818 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 95660 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 145.25-67 chr2 23726166 23726379 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 200851 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 150.25-48 chr13 113240084 113240544 + 0.75 NA intron (NM_001008895, intron 10 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie -22606 NR_107042 102465874 NR_107042 ENSG00000277942 MIR8075 hsa-mir-8075 microRNA 8075 ncRNA 151.25-61 chr16 46639429 46639685 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18178 NM_001324319 79801 Hs.123253 NM_024745 ENSG00000171241 SHCBP1 PAL SHC binding and spindle associated 1 protein-coding 168.75-139 chr7 94595915 94596203 + 0.75 NA intron (NM_001346717, intron 8 of 9) intron (NM_001346717, intron 8 of 9) 60074 NM_001362807 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 253.25-47 chr3 121699262 121699630 + 0.75 NA intron (NM_001256486, intron 12 of 21) intron (NM_001256486, intron 12 of 21) -38543 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 246.5-2 chr1 99011673 99012382 + 0.75 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) intron (NR_033940, intron 1 of 2) -7166 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 115-154 chr6 61560284 61560465 + 0.75 NA intron (NR_146870, intron 14 of 15) L1M1|LINE|L1 -13756 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 210.5-120 chr7 31442402 31442857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71442 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 199-67 chr5 25744740 25745091 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 553962 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 117-99 chr2 175547432 175547626 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -365819 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 217.75-24 chr12 83289968 83290483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 603070 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 186.25-122 chr8 121957224 121957744 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -316044 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 157.5-88 chr18 31174185 31174584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11528 NM_024421 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 138.25-9 chr1 98719994 98720288 + 0.75 NA intron (NR_033716, intron 8 of 8) L1M5|LINE|L1 58420 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 160-9 chr10 32373164 32373567 + 0.75 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) intron (NR_104163, intron 1 of 1) 5404 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 198.25-85 chr5 108985975 108986460 + 0.75 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) L1PB1|LINE|L1 61611 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 161-132 chr9 108461322 108461754 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 394448 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 233-2 chr1 34358491 34358966 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 181821 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 175.5-113 chr3 4714791 4715056 + 0.75 NA intron (NM_001099952, intron 39 of 58) intron (NM_001099952, intron 39 of 58) 36667 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 143-67 chr2 8905904 8906249 + 0.75 NA intron (NR_135606, intron 4 of 12) AluSx3|SINE|Alu -68463 NM_020738 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 113.75-50 chr13 35399824 35400138 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 38 of 57) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 76708 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 135.75-167 chr4 146194499 146194885 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18974 NM_007080 11157 Hs.190520 NM_007080 ENSG00000164167 LSM6 YDR378C LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 120.75-47 chr15 26010471 26010687 + 0.75 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 -105234 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 198-70 chr7 14272275 14272713 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -281069 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 147.25-51 chr18 49474801 49475007 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 12330 NM_001035005 497661 Hs.603040 NM_001035005 ENSG00000177576 C18orf32 - chromosome 18 open reading frame 32 protein-coding 145.5-9 chr1 71432752 71433161 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) LTR29|LTR|ERV1 351632 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 125.5-89 chr15 63642941 63643219 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 58 of 77) intron (NM_003922, intron 58 of 77) -42253 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 215-2 chr1 24866686 24867205 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 52471 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 124.25-64 chr15 70457894 70458167 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 47898 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 136-177 chrX 85232277 85232522 + 0.75 NA intron (NM_001367858, intron 1 of 11) L1MA3|LINE|L1 11380 NM_001367858 340562 Hs.640783 NM_001012980 ENSG00000184788 SATL1 - spermidine/spermine N1-acetyl transferase like 1 protein-coding 171.25-72 chr2 28665642 28666093 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 70338 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 131.5-93 chr18 4176495 4176821 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -87944 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 229-29 chr2 7650212 7650917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 229303 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 137.75-24 chr10 61285428 61285695 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -167078 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 205.75-3 chr1 87910692 87911172 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -539277 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 144.25-208 chr8 120514162 120514558 + 0.75 NA intron (NM_022045, intron 17 of 21) L1MA9|LINE|L1 68941 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 191-22 chr12 122800787 122801045 + 0.75 NA intron (NR_027918, intron 8 of 12) intron (NR_027918, intron 8 of 12) 26344 NR_027918 84660 Hs.592008 NM_032573 ENSG00000130783 CCDC62 CT109|ERAP75|TSP-NY coiled-coil domain containing 62 protein-coding 152.75-73 chr17 73568277 73568633 + 0.75 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 54772 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 140.5-73 chr15 34927831 34928058 + 0.75 NA intron (NM_014691, intron 12 of 34) intron (NM_014691, intron 12 of 34) 41798 NM_014691 9716 Hs.510958 NM_014691 ENSG00000021776 AQR IBP160|fSAP164 aquarius intron-binding spliceosomal factor protein-coding 174.75-15 chr10 114883561 114883951 + 0.75 NA intron (NM_001135051, intron 16 of 16) AluSx3|SINE|Alu -54439 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 150-147 chr8 122896242 122896493 + 0.75 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 114712 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 146.5-150 chr4 30752062 30752307 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 31815 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 149.5-121 chr3 58163607 58163844 + 0.75 NA non-coding (NR_135534, exon 2 of 2) non-coding (NR_135534, exon 2 of 2) 6910 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 227.75-23 chr14 66936381 66936823 + 0.75 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) L3|LINE|CR1 -252838 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 126-4 chr1 70135832 70136099 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 69614 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 162-47 chr16 86065797 86066154 + 0.75 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -130206 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 172.5-200 chr8 101909910 101910337 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 4 of 7) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -74309 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 138.5-107 chr2 72997336 72997637 + 0.75 NA intron (NR_138476, intron 9 of 14) FLAM_A|SINE|Alu 61686 NM_001330411 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 118.5-188 chr7 34072194 34072414 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 12 of 15) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 166765 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 178.5-111 chr3 183310149 183310588 + 0.75 NA intron (NM_015078, intron 9 of 29) AluSc8|SINE|Alu 57115 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 132.75-35 chr10 130941081 130941260 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 21498 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 190.25-99 chr5 102610667 102610951 + 0.75 NA intron (NR_103756, intron 1 of 1) intron (NR_103756, intron 1 of 1) 29441 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 144.25-79 chr18 1771206 1771587 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -411767 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 214.5-95 chr4 145960264 145960559 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -21588 NM_178835 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 139-90 chr21 37585912 37586179 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 165746 NM_130438 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 160.75-41 chr14 20318683 20319125 + 0.75 NA intron (NM_182852, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu 4422 NR_145735 109616976 Hs.742613 NR_145735 ENSG00000222489 SNORA79B - small nucleolar RNA, H/ACA box 79B snoRNA 156.25-20 chr10 96525475 96525742 + 0.75 NA intron (NM_020123, intron 14 of 14) intron (NM_020123, intron 14 of 14) -11682 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 170-17 chr11 71988464 71988755 + 0.75 NA intron (NM_018320, intron 5 of 8) AluJr|SINE|Alu -10300 NM_001039660 10068 Hs.591967 NM_005699 ENSG00000137496 IL18BP IL18BPa interleukin 18 binding protein protein-coding 265.25-2 chr1 80363929 80364566 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -171508 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 215.75-76 chr5 39521277 39521718 + 0.75 NA intron (NR_104632, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 1066 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 171.75-38 chr14 23714981 23715241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78747 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 187.75-75 chr4 31186955 31187379 + 0.75 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) L3|LINE|CR1 16023 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 122.5-210 chr7 43360910 43361073 + 0.75 NA intron (NM_001287059, intron 5 of 27) intron (NM_001287059, intron 5 of 27) 161551 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 123.75-197 chr8 131684760 131684989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -219219 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 160-92 chr5 126708771 126709177 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 67512 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 135-20 chr10 98844187 98844478 + 0.75 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 80236 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 113.5-170 chr4 35437510 35437803 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 806283 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 192.5-51 chr16 72355991 72356315 + 0.75 NA intron (NR_126330, intron 8 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 -183703 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 201-82 chr8 144153232 144153678 + 0.75 NA intron (NM_001288814, intron 1 of 41) AluSq2|SINE|Alu 4810 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 155.5-13 chr1 91857418 91857821 + 0.75 NA intron (NR_036634, intron 2 of 17) intron (NR_036634, intron 2 of 17) 28532 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 129-115 chr22 27854634 27854917 + 0.75 NA intron (NM_001284277, intron 10 of 10) intron (NM_001284277, intron 10 of 10) -53019 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 150.75-31 chr10 123031628 123031925 + 0.75 NA intron (NM_001609, intron 1 of 10) intron (NM_001609, intron 1 of 10) 22770 NM_001330174 36 Hs.81934 NM_001609 ENSG00000196177 ACADSB 2-MEBCAD|ACAD7|SBCAD acyl-CoA dehydrogenase short/branched chain protein-coding 223.75-33 chr17 28128106 28128593 + 0.75 NA intron (NM_016231, intron 2 of 10) intron (NM_016231, intron 2 of 10) 85672 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 121.25-31 chr11 9680808 9681052 + 0.75 NA intron (NM_015055, intron 1 of 11) 7SK|RNA|RNA 16853 NM_015055 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 132-9 chr1 195057532 195057731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1031084 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 114.25-17 chr10 56549904 56550142 + 0.75 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -188750 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 139.75-103 chr2 214223319 214223615 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -187587 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 140.5-100 chr2 16540713 16541000 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 124978 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 139-40 chr14 65026751 65026948 + 0.75 NA intron (NM_002028, intron 4 of 11) AluSz|SINE|Alu -17839 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 172.5-190 chr7 70232471 70232874 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) AluSz6|SINE|Alu 634197 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 130-25 chr11 34694970 34695366 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 62602 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 149.75-110 chr3 52475679 52476038 + 0.75 NA intron (NM_007184, intron 7 of 20) AluSx|SINE|Alu -19480 NM_015136 23166 Hs.301989 NM_015136 ENSG00000010327 STAB1 CLEVER-1|FEEL-1|FELE-1|FEX1|SCARH2|STAB-1 stabilin 1 protein-coding 167.25-75 chr2 13880761 13881023 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 520066 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 142-143 chr6 122069680 122070099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -329662 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 163.5-70 chr17 26815940 26816289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 273127 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 179-17 chr10 72822586 72822990 + 0.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluJb|SINE|Alu -70951 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 280-36 chr3 95880886 95881457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -197978 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 137.75-110 chr2 185206796 185207116 + 0.75 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -39884 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 169.5-179 chr8 143881388 143881681 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -3070 NM_031308 83481 Hs.200412 NM_031308 ENSG00000261150 EPPK1 EPIPL|EPIPL1 epiplakin 1 protein-coding 119.75-156 chr4 73805458 73805691 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -31104 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 279.75-11 chr12 9960206 9960862 + 0.75 NA intron (NM_001207010, intron 1 of 6) LOR1-int|LTR|ERV1 -7197 NR_135047 400002 NR_135047 ENSG00000231560 CLEC12A-AS1 - CLEC12A antisense RNA 1 ncRNA 147.75-166 chr9 7736672 7737049 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 62918 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 266.75-35 chr4 56353562 56354349 + 0.75 NA intron (NM_001286670, intron 5 of 11) intron (NM_001286670, intron 5 of 11) 33536 NM_001323892 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 122.25-103 chr2 173846056 173846247 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 117729 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 155.25-181 chr8 117739692 117739997 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 181069 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 132.5-128 chr2 110851257 110851433 + 0.75 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 118772 NM_001371254 126.25-43 chr12 123031462 123031731 + 0.75 NA intron (NM_020845, intron 2 of 24) intron (NM_020845, intron 2 of 24) -20868 NR_036187 100422931 NR_036187 ENSG00000265526 MIR4304 - microRNA 4304 ncRNA 187.75-9 chr10 12351149 12351483 + 0.75 NA intron (NM_153498, intron 1 of 10) intron (NM_153498, intron 1 of 10) 1769 NM_020397 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 138.75-66 chr16 62668605 62668903 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -632316 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 241.5-4 chr1 242239437 242239825 + 0.75 NA intron (NM_001320272, intron 5 of 10) intron (NM_001320272, intron 5 of 10) 209837 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 245.5-46 chr3 46171254 46171748 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 36812 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 161-53 chr17 39834002 39834370 + 0.75 NA intron (NM_012481, intron 1 of 7) L1ME2z|LINE|L1 30002 NM_001284514 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 203.5-91 chr3 54158110 54158500 + 0.75 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 35753 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 129.75-140 chr4 176373771 176373986 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 53912 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 155.25-70 chr15 89406779 89407158 + 0.75 NA intron (NR_160724, intron 1 of 2) CpG 6797 NR_160724 105371031 NR_160724 LOC105371031 - uncharacterized LOC105371031 ncRNA 236.25-38 chr18 77300593 77301171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51034 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 239.25-4 chr1 72627917 72628374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -345606 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 119.75-191 chr7 5466480 5466751 + 0.75 NA intron (NM_001363441, intron 4 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 29302 NR_030318 693174 NR_030318 ENSG00000207973 MIR589 MIRN589|hsa-mir-589|mir-589 microRNA 589 ncRNA 142.5-159 chr4 153341084 153341513 + 0.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -3351 NM_001253861 84057 Hs.294088 NM_032117 ENSG00000121211 MND1 GAJ meiotic nuclear divisions 1 protein-coding 114.5-89 chr14 47642280 47642634 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 32497 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 154.5-84 chr18 9984409 9984684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70530 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 131.75-67 chr14 69799411 69799677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2303 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 230-8 chr10 57968777 57969113 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 298949 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 181.5-54 chr16 79523210 79523460 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77402 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 149.75-162 chr8 67528560 67528828 + 0.75 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) MER92B|LTR|ERV1 184860 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 157.25-37 chr13 99068376 99068751 + 0.75 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) AluSx1|SINE|Alu 18131 NM_001130049 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 205.5-58 chr17 76566569 76567067 + 0.75 NA intron (NM_006456, intron 8 of 8) AluJb|SINE|Alu 5185 NR_004395 677848 NR_004395 ENSG00000278261 SNORD1A R38A|snR38A small nucleolar RNA, C/D box 1A snoRNA 115-161 chr6 148218256 148218477 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53962 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 189.25-83 chr3 142481386 142481810 + 0.75 NA intron (NM_001354579, intron 35 of 45) intron (NM_001354579, intron 35 of 45) -33536 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 172-74 chr3 165817137 165817470 + 0.75 NA intron (NR_137635, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 20120 NR_137636 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 120-44 chr14 59338609 59338824 + 0.75 NA intron (NM_014992, intron 15 of 24) intron (NM_014992, intron 15 of 24) 75275 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 146.5-58 chr14 23225709 23226025 + 0.75 NA intron (NM_001370218, intron 2 of 15) L1MA2|LINE|L1 -12069 NM_001282322 100507650 NM_001282322 ENSG00000215277 RNF212B C14orf164 ring finger protein 212B protein-coding 197-28 chr19 36980785 36981150 + 0.75 NA intron (NM_001204839, intron 6 of 8) MER77B|LTR|ERVL 64635 NM_001204836 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 367.75-3 chr10 93890171 93890818 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -3484 NM_153226 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 225.5-59 chr2 164883011 164883478 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -41168 NM_001365671 22837 Hs.470457 NM_014900 ENSG00000082438 COBLL1 COBLR1 cordon-bleu WH2 repeat protein like 1 protein-coding 192.25-21 chr13 28955616 28956020 + 0.75 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) -68639 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 125.5-12 chr1 168534988 168535410 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 8798 NM_003175 6846 Hs.458346 NM_003175 ENSG00000143185 XCL2 SCM-1b|SCM1B|SCYC2 X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 132.25-41 chr11 28209658 28209905 + 0.75 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) intron (NM_001113528, intron 3 of 6) 101393 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 239.25-82 chr7 27193912 27194413 + 0.75 NA TTS (NM_000522) TTS (NM_000522) 5929 NM_000522 3209 Hs.592172 NM_000522 ENSG00000106031 HOXA13 HOX1|HOX1J homeobox A13 protein-coding 199.5-150 chr8 113739061 113739538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -302360 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 189.75-9 chr10 27033661 27034011 + 0.75 NA intron (NM_014915, intron 24 of 33) L2|LINE|L2 66662 NM_014915 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 198-9 chr1 245881711 245882226 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 8 of 11) intron (NM_022743, intron 8 of 11) 535444 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 124.75-107 chr19 52221797 52222068 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106859) promoter-TSS (NR_106859) -88 NR_106859 102466984 NR_106859 ENSG00000274380 MIR6801 hsa-mir-6801 microRNA 6801 ncRNA 170.75-138 chr8 109268277 109268747 + 0.75 NA intron (NM_032869, intron 8 of 9) intron (NM_032869, intron 8 of 9) 61421 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 213.5-61 chr2 101983786 101984307 + 0.75 NA intron (NR_103791, intron 2 of 3) intron (NR_103791, intron 2 of 3) 581 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 185-18 chr13 94301394 94301904 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 5 of 8) MIR|SINE|MIR -113658 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-17 chr1 214899889 214900222 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -105487 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 209.75-64 chr3 157223324 157223810 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -62807 NM_020307 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 162.25-145 chr6 105931481 105931905 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154643 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 123.75-204 chr9 119734132 119734428 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -200780 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 206-6 chr10 21714223 21714714 + 0.75 NA intron (NM_001195626, intron 14 of 22) intron (NM_001195626, intron 14 of 22) 180296 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 246.25-66 chr8 84031840 84032247 + 0.75 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -150744 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 138.75-125 chr4 40585669 40586050 + 0.75 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 44005 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 123.25-158 chr5 43693700 43694019 + 0.75 NA intron (NM_012343, intron 19 of 21) X5B_LINE|LINE|CR1 -90629 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 130.25-164 chr5 141415463 141415691 + 0.75 NA exon (NM_018913, exon 1 of 4) exon (NM_018913, exon 1 of 4) -2100 NM_032101 56099 Hs.368160 NM_018927 ENSG00000254122 PCDHGB7 ME6|PCDH-GAMMA-B7 protocadherin gamma subfamily B, 7 protein-coding 159.75-9 chr1 208186733 208187097 + 0.75 NA intron (NM_025179, intron 3 of 31) AluYb8|SINE|Alu 57469 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 124.25-13 chr1 157874951 157875292 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33313 NM_005894 922 Hs.134035 NM_005894 ENSG00000073754 CD5L AIM|API6|CT-2|PRO229|SP-ALPHA|Spalpha|hAIM CD5 molecule like protein-coding 214.25-29 chr17 21075331 21075681 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_110895) promoter-TSS (NR_110895) -50 NR_110895 101060544 Hs.585812 NR_110895 ENSG00000236819 LINC01563 HP08942 long intergenic non-protein coding RNA 1563 ncRNA 119-168 chr6 108643431 108643755 + 0.75 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) intron (NM_201559, intron 2 of 3) 82676 NM_001455 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 129.75-97 chr2 139069315 139069507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 172087 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 150-50 chr15 59535081 59535484 + 0.75 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -76501 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 135.5-97 chr2 18208244 18208429 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 329669 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 125.25-153 chr5 18831414 18831667 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1024266 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 210.75-24 chr14 43824891 43825345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 682165 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 246.5-73 chr8 66359354 66359918 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69341 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 258.25-38 chr4 38915868 38916498 + 0.75 NA intron (NM_001350633, intron 6 of 12) intron (NM_001350633, intron 6 of 12) 48151 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 237-23 chr19 51228166 51228565 + 0.75 NA intron (NM_001772, intron 4 of 6) L1MA5A|LINE|L1 3285 NM_001772 945 Hs.83731 NM_001772 ENSG00000105383 CD33 SIGLEC-3|SIGLEC3|p67 CD33 molecule protein-coding 180-109 chr7 19746341 19746903 + 0.75 NA intron (NM_001366627, intron 1 of 4) intron (NM_001366627, intron 1 of 4) 26159 NM_152774 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 112.75-87 chr2 13126664 13126882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -119760 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 148.5-26 chr10 59034607 59034850 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35210 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 139.5-159 chr4 114342590 114342931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -255642 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 146.5-146 chr3 188381396 188381677 + 0.75 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 156131 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 220-16 chr12 71653195 71653726 + 0.75 NA intron (NM_144982, intron 2 of 34) L1ME1|LINE|L1 10388 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 153.25-80 chr22 24735527 24735963 + 0.75 NA non-coding (NR_045648, exon 14 of 22) non-coding (NR_045648, exon 14 of 22) -28756 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 125.25-87 chr18 7770485 7770758 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) MIRb|SINE|MIR 203305 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 139.5-230 chr9 90199111 90199342 + 0.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -157727 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 196-29 chr14 67986539 67986925 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 163140 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 166-18 chr11 18801420 18801893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8935 NM_001278236 84867 Hs.79092 NM_006906 ENSG00000110786 PTPN5 PTPSTEP|STEP|STEP61 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 5 protein-coding 153.75-74 chr20 5834325 5834800 + 0.75 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) -76948 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 214-16 chr12 76605646 76606002 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -46053 NM_001319652 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 167-122 chr9 92476951 92477287 + 0.75 NA intron (NM_017680, intron 1 of 8) intron (NM_017680, intron 1 of 8) 5387 NM_017680 54829 Hs.435655 NM_017680 ENSG00000106819 ASPN OS3|PLAP-1|PLAP1|SLRR1C asporin protein-coding 179.5-82 chr18 67781218 67781535 + 0.75 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 33446 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 121.75-16 chr11 8042002 8042171 + 0.75 NA intron (NM_003320, intron 2 of 12) L1MB8|LINE|L1 3453 NM_003320 7275 Hs.568986 NM_003320 ENSG00000166402 TUB RDOB|rd5 TUB bipartite transcription factor protein-coding 173.25-5 chr1 95957792 95958202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34071 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 222.75-65 chr2 211113086 211113548 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 495746 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 130.75-59 chr14 83357544 83357849 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 715064 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 150.25-19 chr10 73195518 73195882 + 0.75 NA intron (NM_173348, intron 5 of 13) intron (NM_173348, intron 5 of 13) 27581 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 267-16 chr12 112086556 112087180 + 0.75 NA intron (NM_024953, intron 4 of 23) AluSp|SINE|Alu 21915 NM_024953 80018 Hs.530941 NM_024953 ENSG00000111300 NAA25 C12orf30|MDM20|NAP1 N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit protein-coding 135-158 chr6 104581112 104581496 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 278242 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 133-140 chr5 108050386 108050666 + 0.75 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) L1PA8A|LINE|L1 331572 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 154.25-44 chr14 49810247 49810626 + 0.75 NA intron (NM_001301732, intron 17 of 31) L1MB7|LINE|L1 42283 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 165.25-82 chr21 28239993 28240243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11451 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 163.5-128 chr3 97955798 97956167 + 0.75 NA intron (NM_001042533, intron 4 of 9) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 16449 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 139.5-153 chr4 69479666 69479884 + 0.75 NA TTS (NM_001297615) TTS (NM_001297615) 16130 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 122.75-42 chr13 109601370 109601624 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -126777 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 217.75-12 chr10 34060689 34061164 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -288246 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 171.25-95 chr3 25910828 25911267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37352 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 211-61 chr6 96629265 96629791 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66403 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 140.5-53 chr13 37576413 37576629 + 0.75 NA intron (NM_001330517, intron 16 of 21) intron (NM_001330517, intron 16 of 21) 22247 NM_006475 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 213.25-7 chr1 248836812 248837357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1140 NM_024836 79894 Hs.521151 NM_024836 ENSG00000171161 ZNF672 - zinc finger protein 672 protein-coding 168-120 chr8 33065209 33065611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 343575 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 212-83 chr8 98239672 98240247 + 0.75 NA intron (NR_135747, intron 3 of 11) intron (NR_135747, intron 3 of 11) 54276 NR_135747 79815 Hs.309489 NM_024759 ENSG00000104361 NIPAL2 NPAL2 NIPA like domain containing 2 protein-coding 114-100 chr3 8844843 8845159 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -75387 NM_001354654 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 171.5-24 chr11 86213798 86214071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30450 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 159-14 chr10 60522527 60522822 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) MIRc|SINE|MIR 50282 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 195.25-33 chr14 79812169 79812547 + 0.75 NA intron (NM_138970, intron 5 of 5) intron (NM_138970, intron 5 of 5) -399061 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 212-10 chr10 78083377 78083730 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 49690 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 203-45 chr2 18555280 18555859 + 0.75 NA exon (NM_001199103, exon 9 of 9) exon (NM_001199103, exon 9 of 9) 5084 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 156.25-122 chr5 118059817 118060171 + 0.75 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -222580 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 154.5-136 chr4 34097454 34097749 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -57708 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 124-13 chr1 235589751 235589977 + 0.75 NA intron (NM_004485, intron 1 of 2) intron (NM_004485, intron 1 of 2) 59920 NM_001098722 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 191-90 chr9 128460708 128461104 + 0.75 NA intron (NM_002540, intron 5 of 22) intron (NM_002540, intron 5 of 22) 3999 NM_153437 4957 Hs.129055 NM_002540 ENSG00000136811 ODF2 CT134|ODF2/1|ODF2/2|ODF84 outer dense fiber of sperm tails 2 protein-coding 143.75-137 chr4 163117923 163118177 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -24422 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 190.5-116 chr4 92649966 92650278 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 345723 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 200.5-33 chr14 46383162 46383497 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -88030 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 249.25-20 chr19 29110058 29110726 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 102759 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 197.25-29 chr14 63588285 63588590 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -45042 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 127.5-47 chr11 79523996 79524366 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -83151 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 123-94 chr2 26580725 26581005 + 0.75 NA TTS (NM_001029881) TTS (NM_001029881) 18278 NM_001322426 339778 Hs.407083 NM_001105519 ENSG00000173557 C2orf70 - chromosome 2 open reading frame 70 protein-coding 128.75-76 chr17 62070693 62070929 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5533 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 116.25-35 chr11 35909932 35910226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33902 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 161.75-125 chr8 102006606 102006923 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) LTR33|LTR|ERVL 22332 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 123-82 chr17 60355163 60355460 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) L1ME2|LINE|L1 36822 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 291.75-2 chr1 150502417 150502837 + 0.75 NA intron (NR_073513, intron 9 of 13) AluSx1|SINE|Alu -5482 NM_022664 1893 Hs.81071 NM_004425 ENSG00000143369 ECM1 URBWD extracellular matrix protein 1 protein-coding 118-158 chr5 148110036 148110235 + 0.75 NA intron (NM_006846, intron 18 of 32) MIR|SINE|MIR 46155 NM_001127698 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 126.25-42 chr12 88807736 88807948 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 211850 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 148-38 chr16 13177765 13178112 + 0.75 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) AluSg|SINE|Alu 276340 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 184.5-12 chr1 152928324 152928872 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 20053 NM_005547 3713 Hs.516439 NM_005547 ENSG00000163207 IVL - involucrin protein-coding 209.25-99 chr6 55601529 55602099 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22600 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 169.5-86 chr20 11456797 11457097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -183564 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 142.25-136 chr5 110590714 110591048 + 0.75 NA intron (NM_001039763, intron 10 of 13) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -76966 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 156-17 chr10 59545639 59546038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 164053 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 146-97 chr4 87857859 87858111 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 23282 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 150.25-71 chr2 4064700 4065106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90742 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 173-141 chr8 82409410 82409818 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -502490 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 167.5-47 chr12 42602098 42602383 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12494 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 140-160 chr7 66325579 66325811 + 0.75 NA intron (NM_003596, intron 3 of 5) AluSg|SINE|Alu 74713 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 149.25-79 chr2 33526855 33527162 + 0.75 NA intron (NM_015376, intron 8 of 16) intron (NM_015376, intron 8 of 16) 13133 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 144.75-87 chr2 110967161 110967417 + 0.75 NA intron (NM_001371254, intron 13 of 18) L1MDb|LINE|L1 148299 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 149.25-199 chrX 112006729 112006999 + 0.75 NA intron (NM_012471, intron 1 of 10) MER45A|DNA|hAT-Tip100 75912 NM_012471 7224 Hs.657709 NM_012471 ENSG00000072315 TRPC5 PPP1R159|TRP5 transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 protein-coding 128.5-114 chr2 142032781 142033121 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 98750 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 173.25-83 chr3 187948687 187949105 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 27511 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 161.5-61 chr15 36420936 36421211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158553 NM_001321758 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 239.25-50 chr2 123138247 123138941 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65113 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 199.5-155 chr8 140556748 140557275 + 0.75 NA intron (NM_001164623, intron 8 of 17) intron (NM_001164623, intron 8 of 17) 45015 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 115-68 chr17 66658720 66658950 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 5 of 16) intron (NM_002737, intron 5 of 16) -128237 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 228.75-67 chr6 77945519 77945953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 292697 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 232.5-109 chr9 90741075 90741706 + 0.75 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -60210 NM_001174168 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 267.75-54 chr7 95226468 95227192 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 7 of 15) intron (NM_017650, intron 7 of 15) 97702 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 142.25-165 chr8 88534404 88534815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207126 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 249.75-14 chr12 24134411 24134965 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -77733 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 149.25-101 chr21 23048864 23049239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30233 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 143.75-125 chr3 157074367 157074611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7352 NR_135546 105374177 Hs.634263 NR_135546 ENSG00000241544 LINC02029 - long intergenic non-protein coding RNA 2029 ncRNA 150.75-87 chr2 7522650 7522945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101536 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 112.25-190 chr6 127025834 127026141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92684 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 147.5-154 chr4 26334793 26335063 + 0.75 NA intron (NM_001363577, intron 1 of 10) intron (NM_001363577, intron 1 of 10) 13700 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 240.75-45 chr2 161983081 161983515 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001354441, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001354441, exon 28 of 28) 90917 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 153-137 chr7 23314512 23314784 + 0.75 NA intron (NM_006547, intron 12 of 14) intron (NM_006547, intron 12 of 14) 15309 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 122-3 chr1 48399647 48399865 + 0.75 NA intron (NM_019073, intron 6 of 12) intron (NM_019073, intron 6 of 12) 72448 NM_019073 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 130.5-226 chr7 52569330 52569682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -466127 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 232.5-35 chr17 35146906 35147265 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001267052) promoter-TSS (NM_001267052) -732 NM_001033576 146862 Hs.379636 NM_173167 ENSG00000141161 UNC45B CMYA4|CTRCT43|SMUNC45|UNC-45B|UNC45 unc-45 myosin chaperone B protein-coding 272-4 chr10 31177462 31177933 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10186 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 202.75-12 chr10 71399190 71399544 + 0.75 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) intron (NM_052836, intron 1 of 12) 2433 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 171-17 chr11 4925849 4926153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1662 NM_001005237 79324 Hs.554541 NM_001005237 ENSG00000278870 OR51G1 OR11-29|OR51G3P olfactory receptor family 51 subfamily G member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 154.75-69 chr2 13901354 13901742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 499410 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 204.75-51 chr17 34989550 34990002 + 0.75 NA intron (NM_013975, intron 4 of 19) MER45A|DNA|hAT-Tip100 9264 NM_013975 3980 Hs.100299 NM_002311 ENSG00000005156 LIG3 LIG2|LIG3alpha DNA ligase 3 protein-coding 202.5-111 chr5 27416755 27417146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55342 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 181.5-156 chr8 48929256 48929550 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7974 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 259.25-10 chr14 48285645 48286346 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -490981 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 193-83 chr6 165799863 165800203 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137753 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 168.25-33 chr12 47388879 47389431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24886 NR_039715 100616478 NR_039715 ENSG00000264906 MIR4494 - microRNA 4494 ncRNA 187.25-101 chr8 26692446 26692818 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 114227 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 122.5-37 chr11 96187016 96187207 + 0.75 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -154327 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 153.5-146 chr4 127158444 127158745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -474363 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 161-30 chr13 38547242 38547617 + 0.75 NA intron (NR_126377, intron 2 of 2) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -20295 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 131.75-119 chr20 54542888 54543188 + 0.75 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 67445 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 143.75-103 chr20 8899300 8899689 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 68309 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 140-150 chr6 68587541 68587937 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 46585 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 155-118 chr6 39583757 39584263 + 0.75 NA intron (NM_001289020, intron 9 of 21) intron (NM_001289020, intron 9 of 21) 141398 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 142-158 chr8 62586337 62586560 + 0.75 NA intron (NM_001304533, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 337594 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 161.25-169 chr8 58398739 58399079 + 0.75 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -12355 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 156.75-24 chr10 58772196 58772486 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) intron (NM_001080512, intron 3 of 20) 57326 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 170.5-91 chr2 45379877 45380232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125113 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 117-100 chr2 176040110 176040384 + 0.75 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -37427 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 167.75-44 chr13 111390768 111391058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 70271 NM_152324 121793 Hs.210677 NM_152324 ENSG00000153495 TEX29 C13orf16|bA474D23.1 testis expressed 29 protein-coding 163.75-50 chr15 84950706 84950960 + 0.75 NA intron (NM_001321722, intron 18 of 18) MER58A|DNA|hAT-Charlie -29634 NM_001243137 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 199.5-81 chr2 103250941 103251330 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -266706 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 177.25-44 chr14 53893030 53893342 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 55298 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 167.25 chr1 5454835 5455242 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 407703 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 131.5-156 chr3 70604754 70604932 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -292205 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 214.75-80 chr8 4030351 4030682 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 4 of 69) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 964398 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 131.75-22 chr10 11667413 11667762 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -55798 NR_125732 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 115-123 chr4 74265509 74265700 + 0.75 NA intron (NR_147097, intron 8 of 9) MIR|SINE|MIR -42866 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 117.75-2 chr1 24233088 24233393 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 33000 NR_027087 284632 Hs.638906 NR_027087 ENSG00000230023 LINC02800 - long intergenic non-protein coding RNA 2800 ncRNA 192.75-27 chr12 56092869 56093378 + 0.75 NA intron (NM_001982, intron 11 of 27) intron (NM_001982, intron 11 of 27) -11436 NM_006191 5036 Hs.524498 NM_006191 ENSG00000170515 PA2G4 EBP1|HG4-1|p38-2G4 proliferation-associated 2G4 protein-coding 252.75-61 chr6 24391529 24391962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8453 NM_001195610 51473 Hs.61345 NM_016356 ENSG00000146038 DCDC2 DCDC2A|DFNB66|NPHP19|NSC|RU2|RU2S doublecortin domain containing 2 protein-coding 207-48 chr2 202905064 202905403 + 0.75 NA intron (NM_018256, intron 2 of 12) AluSg4|SINE|Alu -6985 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 128.75-192 chr7 127765897 127766244 + 0.75 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 113876 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 125.25-3 chr1 48615824 48616128 + 0.75 NA intron (NM_001323575, intron 9 of 12) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -143768 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 120.25-221 chr9 21330392 21330603 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018847, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_018847, exon 1 of 1) 4907 NM_018847 55958 Hs.701778 NM_018847 ENSG00000198642 KLHL9 - kelch like family member 9 protein-coding 230.5-91 chr4 159234740 159235160 + 0.75 NA intron (NM_001351725, intron 1 of 26) AluSx1|SINE|Alu 6467 NM_001351725 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 130-90 chr20 14439694 14440017 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -102188 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 138-57 chr16 83657538 83657823 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) intron (NM_001220489, intron 7 of 12) 146296 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 211.75-60 chr3 55161828 55162387 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16065 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 184-61 chr4 48208180 48208632 + 0.75 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) L2a|LINE|L2 61432 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 140.75-196 chr9 21636965 21637229 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -77299 NR_152878 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 118-178 chr8 15691490 15691751 + 0.75 NA intron (NM_001356429, intron 6 of 10) L1PA15|LINE|L1 151357 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 140.25-157 chr5 175859495 175859827 + 0.75 NA intron (NM_006650, intron 2 of 4) intron (NM_006650, intron 2 of 4) -11917 NM_001008220 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 172.5-25 chr10 26924612 26924968 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 17211 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 171.25-65 chr18 5939332 5939692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43558 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 112.25-114 chr20 56770756 56770986 + 0.75 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 141565 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 266.75-38 chr4 77301069 77301686 + 0.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 144170 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 118.75-197 chr8 99916080 99916292 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -22479 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 180.5-134 chr6 151286136 151286589 + 0.75 NA intron (NM_005100, intron 2 of 4) intron (NM_005100, intron 2 of 4) -39169 NM_144497 9590 Hs.371240 NM_005100 ENSG00000131016 AKAP12 AKAP250|SSeCKS A-kinase anchoring protein 12 protein-coding 199.75-45 chr2 48554339 48554672 + 0.75 NA intron (NM_001198595, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu -14273 NM_172311 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 229.5-77 chr20 5644205 5644609 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33401 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 173.5-175 chr9 94084811 94085056 + 0.75 NA intron (NM_001253829, intron 1 of 8) intron (NM_001253829, intron 1 of 8) 469 NM_001253829 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 121.75-82 chr2 104767691 104767926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10089 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 187.5-180 chr9 77547049 77547326 + 0.75 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 99538 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 142.5-132 chr21 31253559 31253884 + 0.75 NA intron (NM_001353686, intron 4 of 27) intron (NM_001353686, intron 4 of 27) 90633 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 129.25-170 chr6 76636201 76636407 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42681 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 246.5-72 chr8 4882222 4882693 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 112457 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 144.25-156 chr5 25818136 25818413 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 627321 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 134-131 chr4 69525123 69525418 + 0.75 NA intron (NM_001297616, intron 1 of 6) intron (NM_001297616, intron 1 of 6) 744 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 174.25-76 chr2 41641699 41642030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -235691 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 141.75-38 chr11 88572206 88572415 + 0.75 NA intron (NM_001143831, intron 6 of 8) intron (NM_001143831, intron 6 of 8) 67734 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 132.5-123 chr2 96173707 96174003 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28415 NM_004418 1844 Hs.1183 NM_004418 ENSG00000158050 DUSP2 PAC-1|PAC1 dual specificity phosphatase 2 protein-coding 216.5-48 chr17 53009610 53010071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24335 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 139.25-64 chr16 69654277 69654509 + 0.75 NA intron (NM_173215, intron 5 of 13) intron (NM_173215, intron 5 of 13) 54282 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 129.5-26 chr10 86525124 86525358 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3449 NM_015045 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 139.75-26 chr11 75840410 75840720 + 0.75 NA intron (NM_003369, intron 1 of 14) intron (NM_003369, intron 1 of 14) 25355 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 114-129 chr5 43929199 43929537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -326138 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 142.75-188 chr8 122709512 122709765 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -15532 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 157.25-31 chr11 111789946 111790375 + 0.75 NA intron (NM_001352420, intron 14 of 15) AluSx1|SINE|Alu -23771 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 160.25-99 chr3 108683734 108684114 + 0.75 NA intron (NM_014648, intron 26 of 32) MIR3|SINE|MIR 73359 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 202.25-25 chr14 73142494 73142788 + 0.75 NA intron (NM_000021, intron 1 of 11) intron (NM_000021, intron 1 of 11) 6134 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 248.5-42 chr19 16739945 16740625 + 0.75 NA intron (NM_001347994, intron 3 of 18) AluJo|SINE|Alu 9093 NM_001347994 284434 Hs.406014 NM_001007525 ENSG00000188039 NWD1 - NACHT and WD repeat domain containing 1 protein-coding 213.75-36 chr14 64101334 64101922 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 63 of 114) intron (NM_015180, intron 63 of 114) -6503 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 152.25-168 chr9 114881002 114881321 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 49434 NM_001252290 944 Hs.494901 NM_001244 ENSG00000106952 TNFSF8 CD153|CD30L|CD30LG|TNLG3A TNF superfamily member 8 protein-coding 122.75-154 chr4 144736271 144736441 + 0.75 NA intron (NM_022475, intron 12 of 12) AluSx1|SINE|Alu 90200 NM_022475 64399 Hs.507991 NM_022475 ENSG00000164161 HHIP HIP hedgehog interacting protein protein-coding 177.75-40 chr14 38603270 38603620 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -279151 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 120.75-139 chr5 163622038 163622243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 116521 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 141.75-74 chr18 352431 352762 + 0.75 NA intron (NM_130386, intron 3 of 9) intron (NM_130386, intron 3 of 9) -84549 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 156.25-130 chr6 48314897 48315231 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -246375 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 146.5-37 chr10 102593564 102593888 + 0.75 NA intron (NM_001178133, intron 5 of 10) intron (NM_001178133, intron 5 of 10) -50769 NM_030912 81603 Hs.336810 NM_030912 ENSG00000171206 TRIM8 GERP|RNF27 tripartite motif containing 8 protein-coding 164-6 chr1 95068692 95069087 + 0.75 NA intron (NM_144988, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 4062 NM_144988 199857 Hs.408927 NM_144988 ENSG00000172339 ALG14 CMS15 ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit protein-coding 135.5-62 chr14 82889710 82889944 + 0.75 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 247195 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 139.75-179 chr8 131301957 131302252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -261195 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 122.75-170 chr5 132128924 132129198 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 55272 NM_000758 1437 Hs.1349 NM_000758 ENSG00000164400 CSF2 CSF|GMCSF colony stimulating factor 2 protein-coding 120-65 chr16 75032334 75032517 + 0.75 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 33401 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 115-104 chr3 46769920 46770102 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -13156 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 194-84 chr9 33277662 33278044 + 0.75 NA intron (NM_001195536, intron 6 of 6) intron (NM_001195536, intron 6 of 6) -12663 NM_147134 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 197.5-108 chr4 55103150 55103627 + 0.75 NA intron (NM_002253, intron 13 of 29) intron (NM_002253, intron 13 of 29) 22207 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 146.25-141 chr7 134021642 134022124 + 0.75 NA intron (NM_021807, intron 17 of 17) intron (NM_021807, intron 17 of 17) -105457 NM_001365700 136332 Hs.149774 NM_144648 ENSG00000155530 LRGUK CFAP246 leucine rich repeats and guanylate kinase domain containing protein-coding 131-101 chr2 190653504 190653747 + 0.75 NA intron (NM_005966, intron 2 of 9) intron (NM_005966, intron 2 of 9) 4542 NM_005966 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 113.25-12 chr1 189866897 189867181 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 608971 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 135.5-201 chr8 106468188 106468428 + 0.75 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 20384 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 155.25-133 chr4 100565692 100566050 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -47849 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 167-73 chr21 40676361 40676835 + 0.75 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) intron (NR_073202, intron 3 of 32) -45831 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 122.75-102 chr2 204226089 204226425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 289509 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 184.5-104 chr3 147601972 147602356 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 180837 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 163-130 chr9 131030986 131031263 + 0.75 NA intron (NM_006059, intron 2 of 27) intron (NM_006059, intron 2 of 27) 21950 NM_006059 10319 Hs.201805 NM_006059 ENSG00000050555 LAMC3 OCCM laminin subunit gamma 3 protein-coding 120.5-182 chr5 56122102 56122363 + 0.75 NA intron (NM_024669, intron 8 of 11) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 111098 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 143.5-232 chr9 112753158 112753604 + 0.75 NA intron (NM_001012994, intron 1 of 8) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 2621 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 225.25-17 chr13 48155649 48156128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60747 NM_001270629 29079 Hs.181112 NM_014166 ENSG00000136146 MED4 ARC36|DRIP36|HSPC126|TRAP36|VDRIP mediator complex subunit 4 protein-coding 155.25-22 chr10 15967822 15968246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107501 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 154.75-117 chr5 103798396 103798875 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -235846 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 241-61 chrX 57664092 57664528 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 15950 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 284.75-38 chr7 101397564 101398319 + 0.75 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) L1ME3|LINE|L1 35066 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 159.75-98 chr22 19408827 19409168 + 0.75 NA intron (NM_003325, intron 2 of 24) MIR3|SINE|MIR 22736 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 203-22 chr11 40871698 40872181 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) MER54B|LTR|ERVL -578809 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 154.75-131 chr7 12525577 12525821 + 0.75 NA intron (NR_136263, intron 1 of 3) intron (NR_136263, intron 1 of 3) 21302 NR_136263 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 130-124 chr5 31473690 31474042 + 0.75 NA intron (NM_013235, intron 15 of 34) L2a|LINE|L2 58227 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 142-89 chr2 146146312 146146738 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -440532 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 279.25-34 chr6 68164981 68165653 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109966 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 186.75-69 chr3 81173556 81173882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179851 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 220.5-46 chr2 75000090 75000486 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 41645 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 123.25-67 chr15 88940209 88940615 + 0.75 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -27033 NM_001310319 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 124.5-28 chr10 110517220 110517583 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 19494 NM_004419 1847 Hs.2128 NM_004419 ENSG00000138166 DUSP5 DUSP|HVH3 dual specificity phosphatase 5 protein-coding 169-34 chr16 6743896 6744137 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) intron (NM_018723, intron 3 of 15) -29793 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 148-123 chr7 55591471 55591770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19118 NM_001321244 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 179.75-89 chr4 90283063 90283485 + 0.75 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) intron (NM_207491, intron 1 of 7) 48243 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 173.75-158 chr8 142986976 142987404 + 0.75 NA intron (NR_026913, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 -8638 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 192.75-26 chr12 53913307 53913583 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -25386 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 136.75-99 chr2 80841355 80841702 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 528149 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 137.5-22 chr1 245801722 245802144 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 10 of 11) intron (NM_022743, intron 10 of 11) -567416 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 131-103 chr2 212901537 212901868 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24555 NR_039935 100616267 NR_039935 ENSG00000266354 MIR4776-1 mir-4776-1 microRNA 4776-1 ncRNA 135.25-167 chr5 116000256 116000478 + 0.75 NA intron (NM_173800, intron 7 of 19) intron (NM_173800, intron 7 of 19) 37892 NM_173800 206338 Hs.98288 NM_173800 ENSG00000172901 LVRN APQ|AQPEP|TAQPEP laeverin protein-coding 333.5-15 chr5 166020157 166021000 + 0.75 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 905792 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 173-6 chr1 110699883 110700289 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -25146 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 123.5-79 chr17 45291111 45291367 + 0.75 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) intron (NM_003954, intron 1 of 15) 25781 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 261-31 chr22 17636933 17637495 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1370 NM_001270732 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 149.75-84 chr2 76848206 76848594 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -137565 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 144-16 chr1 225957624 225957900 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16270 NM_001172425 7044 Hs.520187 NM_003240 ENSG00000143768 LEFTY2 EBAF|LEFTA|LEFTYA|TGFB4 left-right determination factor 2 protein-coding 114.75-88 chr2 66389157 66389364 + 0.75 NA intron (NR_130931, intron 1 of 2) intron (NR_130931, intron 1 of 2) 5954 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 227.25-2 chr1 45898175 45898663 + 0.75 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) MER21-int|LTR|ERVL 34071 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 175.25-81 chr20 33933911 33934197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59857 NM_007367 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 225-45 chr3 80486301 80486721 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -278386 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 193-87 chr8 41416472 41416889 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -9975 NR_145746 109616980 NR_145746 ENSG00000238936 SNORD65B - small nucleolar RNA, C/D box 65B snoRNA 169-10 chr10 52067394 52067672 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 7 of 17) intron (NM_001098512, intron 7 of 17) 246595 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 174.25-132 chr7 37875020 37875325 + 0.75 NA intron (NM_016616, intron 11 of 17) L1MC4|LINE|L1 26575 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 117.75-144 chr3 179065422 179065734 + 0.75 NA intron (NM_152240, intron 3 of 6) intron (NM_152240, intron 3 of 6) 6231 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 162-32 chr12 50182983 50183276 + 0.75 NA intron (NM_001243775, intron 3 of 4) AluSg|SINE|Alu -15596 NM_001281731 91012 Hs.270525 NM_147190 ENSG00000139624 CERS5 LASS5|Trh4 ceramide synthase 5 protein-coding 171.75-122 chr6 135706287 135706549 + 0.75 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) L1PA17|LINE|L1 -145283 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 152.25-10 chr1 238132158 238132399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -241356 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 184-3 chr1 71692332 71692623 + 0.75 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) intron (NM_173808, intron 4 of 6) 144535 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 184.75-96 chr7 77956805 77957153 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001127358, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001127358, exon 18 of 18) 116849 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 125.5-133 chr2 158181984 158182200 + 0.75 NA intron (NM_138803, intron 11 of 13) intron (NM_138803, intron 11 of 13) 15442 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 193.75-17 chr10 38518133 38518760 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90300 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 148.25 chr1 34519571 34519918 + 0.75 NA Intergenic (CACATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 149950 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 163.25-64 chr2 120391884 120392200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45906 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 236-47 chr4 39508774 39509151 + 0.75 NA intron (NM_003359, intron 6 of 11) intron (NM_003359, intron 6 of 11) 18477 NM_001184701 7358 Hs.572518 NM_003359 ENSG00000109814 UGDH GDH|UDP-GlcDH|UDPGDH|UGD UDP-glucose 6-dehydrogenase protein-coding 285-20 chr2 12397684 12398402 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 198913 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 125.25-12 chr1 156152972 156153314 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_022367) promoter-TSS (NM_022367) -435 NM_001193302 64218 Hs.408846 NM_022367 ENSG00000196189 SEMA4A CORD10|RP35|SEMAB|SEMB semaphorin 4A protein-coding 170.75-154 chrX 43289539 43289780 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 112665 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 138.75-163 chr6 63596218 63596504 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24349 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 148.25-63 chr18 71006156 71006577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -355412 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 120.75-29 chr12 830282 830520 + 0.75 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) intron (NM_001184985, intron 4 of 27) 77478 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 154.25-135 chr6 12153625 12153930 + 0.75 NA intron (NM_002114, intron 7 of 8) intron (NM_002114, intron 7 of 8) -136584 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 248.5-14 chr12 9263949 9264326 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -19520 NR_024374 642846 Hs.447869 NR_024374 LOC642846 - DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11-like ncRNA 159.75-83 chr2 110725240 110725657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7125 NM_001365487 55289 Hs.253320 NM_018308 ENSG00000153093 ACOXL - acyl-CoA oxidase like protein-coding 132.75-93 chr2 25738312 25738661 + 0.75 NA 3' UTR (NM_018263, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_018263, exon 12 of 12) 56205 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 161.25-10 chr1 209739355 209739593 + 0.75 NA intron (NR_134510, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 3088 NR_134510 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-4 chr1 98705204 98705520 + 0.75 NA intron (NR_033716, intron 8 of 8) MIRb|SINE|MIR 43641 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 195.5-78 chr2 162514320 162514725 + 0.75 NA intron (NM_033272, intron 4 of 15) MER5C|DNA|hAT-Charlie 170154 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 114.5-97 chr14 75989232 75989453 + 0.75 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) intron (NM_001102564, intron 2 of 8) 3579 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 215.25-67 chr4 30559864 30560189 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -160343 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 128.25-19 chr10 105364338 105364626 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 455851 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 121.75-120 chr3 108564195 108564494 + 0.75 NA intron (NM_020890, intron 12 of 20) intron (NM_020890, intron 12 of 20) 25094 NM_020890 57650 Hs.591308 NM_020890 ENSG00000163507 CIP2A KIAA1524|p90 cell proliferation regulating inhibitor of protein phosphatase 2A protein-coding 116.5-81 chr15 88306885 88307168 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50287 NM_002530 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 268-36 chr21 35286207 35286821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -237216 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 193.75-11 chr1 155090645 155091085 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 12028 NM_004952 1944 Hs.516656 NM_004952 ENSG00000143590 EFNA3 EFL2|EPLG3|Ehk1-L|LERK3 ephrin A3 protein-coding 129-52 chr13 21679260 21679465 + 0.75 NA intron (NM_002010, intron 1 of 2) intron (NM_002010, intron 1 of 2) 8289 NM_002010 2254 Hs.111 NM_002010 ENSG00000102678 FGF9 FGF-9|GAF|HBFG-9|HBGF-9|SYNS3 fibroblast growth factor 9 protein-coding 169.5-143 chr5 119722309 119722590 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 92890 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 118.5-71 chr17 58483692 58483868 + 0.75 NA intron (NM_001080439, intron 1 of 5) intron (NM_001080439, intron 1 of 5) 4628 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 113.5-60 chr12 123357873 123358090 + 0.75 NA intron (NM_018183, intron 1 of 31) intron (NM_018183, intron 1 of 31) 6862 NR_107039 102466877 NR_107039 ENSG00000284425 MIR8072 hsa-mir-8072 microRNA 8072 ncRNA 112.5-162 chr22 47775700 47775961 + 0.75 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) L1ME1|LINE|L1 144156 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 149.25-100 chr20 57134473 57134776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79072 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-70 chr15 57311515 57311817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7472 NR_120337 101928611 Hs.569495 NR_120337 LINC01413 - long intergenic non-protein coding RNA 1413 ncRNA 131.5-41 chr12 20083187 20083491 + 0.75 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 44562 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 120.75-131 chr4 188834639 188834926 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 58125 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 129-59 chr14 50958930 50959193 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14578 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 156-16 chr10 35313066 35313458 + 0.75 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) intron (NM_181698, intron 3 of 11) -23247 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 141.25-7 chr1 58752828 58753050 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 31108 NM_002228 3725 Hs.696684 NM_002228 ENSG00000177606 JUN AP-1|AP1|c-Jun|p39 Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 180-67 chr2 182666628 182667017 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -49435 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 125.5-54 chr12 28258471 28258757 + 0.75 NA intron (NM_001352082, intron 3 of 13) intron (NM_001352082, intron 3 of 13) -67876 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 229.5-71 chr2 167151055 167151561 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 3 of 10) intron (NM_152381, intron 3 of 10) -10353 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 134-174 chr8 127548623 127548892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66618 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 148.5-198 chr6 136675323 136675652 + 0.75 NA intron (NM_005923, intron 7 of 29) L1MEg|LINE|L1 46373 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 204.5-119 chr7 40718123 40718539 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 261608 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 125.5-196 chr5 8256060 8256341 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 201364 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 124.25-189 chr7 96883611 96883906 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -121795 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 189-54 chr2 29103441 29103870 + 0.75 NA intron (NM_001287528, intron 1 of 14) MER81|DNA|hAT-Blackjack 5979 NM_001287528 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 132.75-64 chr14 68408403 68408597 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 220287 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 133.5-90 chr15 69980993 69981220 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98362 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 143-56 chr17 63348114 63348341 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 11 of 25) intron (NM_025185, intron 11 of 25) 92040 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 158.25-16 chr10 113868854 113869092 + 0.75 NA intron (NM_198514, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 14312 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 116.75-108 chr20 17401914 17402258 + 0.75 NA intron (NM_002594, intron 5 of 11) intron (NM_002594, intron 5 of 11) 129293 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 158.5-20 chr10 50981995 50982352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8715 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 236.5-55 chr21 20283603 20283920 + 0.75 NA Intergenic (TATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -25076 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 141.25-71 chr18 3185519 3185729 + 0.75 NA intron (NM_019856, intron 5 of 36) intron (NM_019856, intron 5 of 36) 34344 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 256.5-21 chr15 59361647 59362222 + 0.75 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu 10937 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 137.5-24 chr10 14557304 14557557 + 0.75 NA intron (NM_001320736, intron 1 of 4) Charlie26a|DNA|hAT-Charlie -1250 NM_001320738 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 194.25-20 chr12 21895075 21895381 + 0.75 NA intron (NM_005691, intron 11 of 37) intron (NM_005691, intron 11 of 37) 41466 NM_020297 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 164-3 chr1 59086612 59086961 + 0.75 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) MIR3|SINE|MIR 60021 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 146.75-147 chr7 10205628 10205938 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -496893 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 232-30 chr2 32178514 32179058 + 0.75 NA intron (NM_001193513, intron 5 of 14) L1M4|LINE|L1 12922 NM_001330476 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 162.75-126 chr6 98861397 98861700 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26974 NM_005604 5454 Hs.182505 NM_005604 ENSG00000184486 POU3F2 BRN2|N-Oct3|OCT7|OTF-7|OTF7|POUF3|brn-2|oct-7 POU class 3 homeobox 2 protein-coding 156.25 chr1 4877965 4878304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 223525 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 234.5-34 chr18 9705409 9705897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2648 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 198.5-108 chr4 114566540 114566818 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31723 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 156-59 chr16 74104538 74104891 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 110807 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 113-81 chr18 73433134 73433374 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 108313 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 114.5-253 chr8 27008390 27008679 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40429 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 134.5-147 chr3 195038909 195039206 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -55531 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 193.25-53 chr2 62390668 62391227 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 115248 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 167-112 chr8 42790247 42790540 + 0.75 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -21607 NM_004198 8973 Hs.103128 NM_004198 ENSG00000147434 CHRNA6 CHNRA6 cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit protein-coding 195.25-7 chr1 91449412 91449734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44736 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 166-30 chr14 53729674 53730031 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 218632 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 160.75-67 chr2 44547473 44547868 + 0.75 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 185723 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 164.75-128 chr6 94835890 94836165 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 741424 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 154.25-112 chr3 189676050 189676508 + 0.75 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L1MA9|LINE|L1 44890 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 120-87 chr2 68543164 68543453 + 0.75 NA intron (NM_173545, intron 7 of 9) L1MB2|LINE|L1 75723 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 139.5-12 chr1 241785788 241786063 + 0.75 NA intron (NM_001367482, intron 23 of 27) intron (NM_001367482, intron 23 of 27) -62266 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 242.75-80 chrX 105951305 105951831 + 0.75 NA intron (NM_198465, intron 27 of 28) intron (NM_198465, intron 27 of 28) 87159 NM_000354 6906 Hs.76838 NM_000354 ENSG00000123561 SERPINA7 TBG|TBGQTL serpin family A member 7 protein-coding 224.25-39 chr2 19699291 19699657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -169380 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 167-69 chr20 47277802 47278027 + 0.75 NA intron (NM_001281774, intron 11 of 23) AluSx4|SINE|Alu -40588 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 159-130 chr9 78566306 78566770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 269413 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 195.5-50 chr16 57719616 57719898 + 0.75 NA intron (NM_032269, intron 8 of 17) AluJo|SINE|Alu -16013 NM_005886 10300 Hs.275675 NM_005886 ENSG00000140854 KATNB1 KAT|LIS6 katanin regulatory subunit B1 protein-coding 166.25-66 chr18 3287922 3288310 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 25397 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 219-34 chr14 42691197 42691664 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1084574 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 218-27 chr18 14016579 14017098 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -101131 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 281-26 chr4 168259601 168260211 + 0.75 NA intron (NM_017631, intron 25 of 37) intron (NM_017631, intron 25 of 37) 58846 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 145-107 chr4 41170059 41170270 + 0.75 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 44378 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 182.75-70 chr2 147143826 147144222 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 556967 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 115.75-113 chr2 144352033 144352305 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19100 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 216.5-119 chr8 101671078 101671596 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 119632 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 143.5-215 chr8 116907970 116908173 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30136 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 235.75-83 chr9 76257948 76258477 + 0.75 NA intron (NM_001190482, intron 24 of 36) intron (NM_001190482, intron 24 of 36) 136214 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 158.5-77 chr15 94438020 94438321 + 0.75 NA intron (NM_001159643, intron 16 of 19) intron (NM_001159643, intron 16 of 19) 82240 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 151.75-52 chr17 59306553 59306804 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24977 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 138.75-162 chr6 51949909 51950164 + 0.75 NA intron (NM_138694, intron 36 of 66) intron (NM_138694, intron 36 of 66) 137577 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 219.5-126 chr8 70074913 70075375 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3892 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 160.25-110 chr4 53317979 53318281 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 2 of 8) intron (NM_152540, intron 2 of 8) 47931 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 181-100 chr7 15602242 15602699 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40455 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 334.5-3 chr1 108793671 108794703 + 0.75 NA intron (NM_007269, intron 12 of 18) intron (NM_007269, intron 12 of 18) 47513 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 122.75-35 chr12 43113246 43113506 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41939 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 184-65 chr4 107149829 107150117 + 0.75 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -113660 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 168-13 chr10 48367583 48367965 + 0.75 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -33838 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 149.75-17 chr10 118593707 118594081 + 0.75 NA 3' UTR (NM_004248, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004248, exon 2 of 2) 1754 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 135.75-158 chr4 52760214 52760423 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8678 NM_024534 100288413 Hs.363087 NM_024534 ENSG00000226887 ERVMER34-1 HEMO|envMER34 endogenous retrovirus group MER34 member 1, envelope protein-coding 188.75-102 chr7 26169060 26169635 + 0.75 NA intron (NM_004289, intron 1 of 3) LTR16A|LTR|ERVL 17149 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 166-133 chr9 87292920 87293299 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 144465 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 130.5-135 chr2 116998158 116998494 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -816365 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 150.5-18 chr10 63665040 63665560 + 0.75 NA Intergenic LTR17|LTR|ERV1 -143410 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 131-49 chr14 48875590 48875789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 710691 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 113-165 chr7 7729153 7729439 + 0.75 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 -10689 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 112.25-66 chr14 86006876 86007085 + 0.75 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) intron (NR_110155, intron 1 of 3) 72302 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 152.75-14 chr1 233575811 233576056 + 0.75 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -38173 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 113.25-47 chr14 61384499 61384829 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 63221 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 212.25-25 chr14 22861140 22861554 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -10393 NM_001329226 26020 Hs.525232 NM_014045 ENSG00000197324 LRP10 LRP-10|LRP9|MST087|MSTP087 LDL receptor related protein 10 protein-coding 149.25-186 chr8 112449659 112449897 + 0.75 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) AluSx1|SINE|Alu -193715 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 120.25-140 chr3 196223415 196223732 + 0.75 NA intron (NM_152672, intron 2 of 8) intron (NM_152672, intron 2 of 8) 7039 NM_152672 200931 Hs.630585 NM_152672 ENSG00000163959 SLC51A OSTA|OSTalpha solute carrier family 51 alpha subunit protein-coding 245.25-67 chr7 11190263 11190911 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 216715 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 135.5-181 chr7 27269581 27269901 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22512 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 159.75-55 chr15 101197227 101197516 + 0.75 NA intron (NM_014918, intron 2 of 2) intron (NM_014918, intron 2 of 2) 54677 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 135.75-74 chr16 78622600 78622961 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 523126 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 154-18 chr10 52919819 52920267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -148343 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 206.5-64 chr2 209576187 209576548 + 0.75 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu -2969 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 130.5-172 chr3 120477200 120477392 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -26304 NM_007085 11167 Hs.269512 NM_007085 ENSG00000163430 FSTL1 FRP|FSL1|MIR198|OCC-1|OCC1|tsc36 follistatin like 1 protein-coding 232.25-85 chr8 131276556 131276943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -235840 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 117.5-97 chr2 13668741 13668992 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -661853 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 143.75-54 chr15 64441116 64441469 + 0.75 NA intron (NM_001321924, intron 11 of 12) AluY|SINE|Alu 53456 NM_001321924 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 139.5-128 chr3 5933516 5933855 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -683430 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 124.25-36 chr11 112706775 112706983 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -151077 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 151-62 chr2 88946132 88946449 + 0.75 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 133920 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 138.25-38 chr12 41592720 41592945 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 155093 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 124.75-96 chr17 57741324 57741629 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 3823 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 135.25-91 chr2 32821387 32821647 + 0.75 NA TTS (NM_001193509) TTS (NM_001193509) -3916 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 141.25-135 chr5 51862020 51862276 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -145883 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 169.75-139 chr7 30629570 30629877 + 0.75 NA intron (NM_002047, intron 14 of 16) intron (NM_002047, intron 14 of 16) 34845 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 147.25-45 chr16 73265735 73266004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120936 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 230.75-75 chr8 126562568 126562964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4288 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 182.25-127 chr8 131826327 131826659 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -77600 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 200.5-61 chr19 41225143 41225661 + 0.75 NA intron (NM_001699, intron 4 of 18) intron (NM_001699, intron 4 of 18) -1353 NM_001278599 558 Hs.590970 NM_001699 ENSG00000167601 AXL ARK|JTK11|Tyro7|UFO AXL receptor tyrosine kinase protein-coding 184.75-73 chr3 161375100 161375398 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2299 NM_001320679 165679 Hs.369104 NM_145035 ENSG00000196542 SPTSSB ADMP|C3orf57|SSSPTB serine palmitoyltransferase small subunit B protein-coding 185-54 chr3 55744041 55744454 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) AluSq|SINE|Alu -84778 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 194.5-146 chr7 112121499 112121825 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) L3|LINE|CR1 84737 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 162-54 chr19 2148966 2149240 + 0.75 NA intron (NM_003938, intron 1 of 29) intron (NM_003938, intron 1 of 29) 2463 NM_001261826 8943 Hs.512815 NM_003938 ENSG00000065000 AP3D1 ADTD|HPS10|hBLVR adaptor related protein complex 3 subunit delta 1 protein-coding 136.25-173 chr7 21671633 21671963 + 0.75 NA intron (NM_001277115, intron 30 of 81) L1MC|LINE|L1 128759 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 121.75-122 chr3 149864872 149865088 + 0.75 NA intron (NM_183383, intron 2 of 8) intron (NM_183383, intron 2 of 8) 52292 NM_007282 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 154.25-58 chr16 8119434 8119796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 470223 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 114.75-112 chr21 34369495 34369739 + 0.75 NA intron (NM_172201, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 5593 NM_172201 9992 Hs.551521 NM_172201 ENSG00000159197 KCNE2 ATFB4|LQT5|LQT6|MIRP1 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 2 protein-coding 167.5-40 chr11 82821826 82822189 + 0.75 NA TTS (NM_001319214) TTS (NM_001319214) 78423 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 142.75-56 chr13 57410789 57411103 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -220798 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 157-87 chr4 84352286 84352775 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -53361 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 263.75-35 chr22 46295388 46295786 + 0.75 NA non-coding (NR_024009, exon 1 of 1) non-coding (NR_024009, exon 1 of 1) 1073 NR_024009 150384 Hs.348663 NR_024009 ENSG00000277232 GTSE1-DT CN5H6.4|GTSE1-AS1|LL22NC03-5H6.6 GTSE1 divergent transcript ncRNA 234.75-71 chr6 158594640 158595027 + 0.75 NA intron (NM_020823, intron 6 of 16) AluSq2|SINE|Alu -14874 NR_106981 102465694 NR_106981 ENSG00000278571 MIR7161 hsa-mir-7161 microRNA 7161 ncRNA 144.75-67 chr17 42883829 42884094 + 0.75 NA intron (NR_027254, intron 3 of 5) MIRb|SINE|MIR 14773 NR_027254 388387 Hs.632257 NM_207388 ENSG00000213373 LINC00671 - long intergenic non-protein coding RNA 671 ncRNA 176-84 chrX 39150011 39150245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 177234 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 240.75-70 chr7 85002046 85002644 + 0.75 NA intron (NM_152754, intron 16 of 16) intron (NM_152754, intron 16 of 16) 119586 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 175.75-100 chr5 4125078 4125537 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 529475 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 312.75-26 chr4 100268519 100269300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78441 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 185.75-92 chr4 102568369 102568738 + 0.75 NA intron (NM_003998, intron 6 of 23) intron (NM_003998, intron 6 of 23) -66067 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 119.75-24 chr10 93588442 93588656 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001195755, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001195755, exon 3 of 3) 12686 NM_006744 5950 Hs.50223 NM_006744 ENSG00000138207 RBP4 MCOPCB10|RDCCAS retinol binding protein 4 protein-coding 133-179 chr8 130397507 130397710 + 0.75 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) intron (NM_001247996, intron 2 of 30) 46052 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 129.75-14 chr1 152735651 152735998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16302 NM_001024679 100129271 Hs.601077 NM_001024679 ENSG00000198854 C1orf68 LEP7|XP32 chromosome 1 open reading frame 68 protein-coding 155.25-109 chr20 62314707 62315059 + 0.75 NA exon (NM_005560, exon 60 of 80) exon (NM_005560, exon 60 of 80) 11886 NM_007002 11047 Hs.90107 NM_007002 ENSG00000130706 ADRM1 ARM-1|ARM1|GP110 adhesion regulating molecule 1 protein-coding 128.5-230 chr9 8459081 8459393 + 0.75 NA intron (NM_130392, intron 17 of 30) intron (NM_130392, intron 17 of 30) 274709 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 129-61 chr14 59267069 59267297 + 0.75 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 3742 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 212.5-61 chr20 45735911 45736397 + 0.75 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 13807 NM_178455 391253 Hs.677891 NM_178455 ENSG00000149651 SPINT4 C20orf137|SPINT3|dJ601O1.1 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 protein-coding 238.25-57 chr4 66104008 66104426 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172607 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 120.25-199 chr7 49407002 49407183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -366546 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 130-39 chr14 26718506 26718751 + 0.75 NA intron (NR_147061, intron 2 of 6) L3|LINE|CR1 -90720 NR_110556 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 141.75-169 chr8 85506463 85506669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41651 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 150-141 chr8 28413238 28413451 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26884 NM_018660 55893 Hs.435535 NM_018660 ENSG00000186918 ZNF395 HDBP-2|HDBP2|HDRF-2|PBF|PRF-1|PRF1|Si-1-8-14 zinc finger protein 395 protein-coding 201.25-73 chr5 32855482 32855898 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -91753 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 133-144 chr5 133131815 133132000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79894 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 177.5-16 chr10 89266832 89267163 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14958 NM_001288979 3988 Hs.643030 NM_000235 ENSG00000107798 LIPA CESD|LAL lipase A, lysosomal acid type protein-coding 188.5-22 chr12 10449684 10450073 + 0.75 NA intron (NM_213657, intron 4 of 6) intron (NM_213657, intron 4 of 6) 3499 NM_007328 3821 Hs.512576 NM_002259 ENSG00000134545 KLRC1 CD159A|NKG2|NKG2A killer cell lectin like receptor C1 protein-coding 149.5-223 chrX 12478738 12479127 + 0.75 NA intron (NM_001368402, intron 2 of 17) intron (NM_001368402, intron 2 of 17) -19748 NM_001368400 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 142.75-110 chr2 235846303 235846631 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) AluSz|SINE|Alu 321919 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 276-9 chr10 108976334 108976951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -907349 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 275.75-40 chr6 160140376 160140872 + 0.75 NA intron (NM_153187, intron 7 of 9) AluJo|SINE|Alu 18793 NM_153187 6580 Hs.117367 NM_003057 ENSG00000175003 SLC22A1 HOCT1|OCT1|oct1_cds solute carrier family 22 member 1 protein-coding 122.75-133 chr3 121511618 121511962 + 0.75 NA intron (NM_199420, intron 10 of 29) AluSx|SINE|Alu 34198 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 144.5-50 chr12 81144466 81144793 + 0.75 NA intron (NM_024560, intron 5 of 15) intron (NM_024560, intron 5 of 15) -13759 NR_039848 100616133 NR_039848 ENSG00000265227 MIR4699 - microRNA 4699 ncRNA 258.25-37 chr3 159579471 159579969 + 0.75 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 188892 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 263.5-42 chr3 177463337 177463807 + 0.75 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 21651 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 240.75-51 chr3 18138743 18139333 + 0.75 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) intron (NR_161333, intron 4 of 4) 176486 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 121-71 chr15 64968715 64968878 + 0.75 NA intron (NM_001127889, intron 7 of 8) intron (NM_001127889, intron 7 of 8) 20674 NM_001127889 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 142.25-146 chr6 147239897 147240344 + 0.75 NA intron (NM_139244, intron 4 of 25) AluSz|SINE|Alu -35506 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 127.75-54 chr12 60523841 60524107 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 834604 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 193.5-34 chr12 56383379 56383670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20667 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 175 chr1 23679437 23679757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12182 NM_001199802 6135 Hs.719951 NM_000975 ENSG00000142676 RPL11 DBA7|GIG34|L11|uL5 ribosomal protein L11 protein-coding 130.5-251 chr9 16313746 16314113 + 0.75 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -37616 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 131.25-106 chr2 118864232 118864601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16233 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 120.5-4 chr1 53635893 53636136 + 0.75 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 98190 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 155-145 chr8 122745266 122745540 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -36252 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 131-68 chr17 51594003 51594244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158696 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 238.5-92 chr8 121037530 121037995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -225716 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 207.25-46 chr2 145138107 145138671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 470422 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 129.25-159 chr5 155684087 155684353 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -642537 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 186.25-47 chr19 28021375 28021739 + 0.75 NA intron (NR_146733, intron 6 of 6) intron (NR_146733, intron 6 of 6) -227617 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 124.5-202 chr7 19862082 19862447 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -88647 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 200.5-60 chr19 36636672 36636968 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001322826, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001322826, exon 5 of 5) 30017 NM_001322825 92283 Hs.590972 NM_153257 ENSG00000197808 ZNF461 GIOT-1|GIOT1|HZF28 zinc finger protein 461 protein-coding 174.75-24 chr12 43880079 43880555 + 0.75 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) intron (NM_001286213, intron 2 of 6) 44236 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 169.25-38 chr15 96496967 96497335 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 163386 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 128.5-52 chr12 70977911 70978143 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57289 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 156-75 chr19 36899596 36899840 + 0.75 NA intron (NM_001037232, intron 5 of 5) L1MA9|LINE|L1 16321 NM_001171979 374899 Hs.720312 NM_001037232 ENSG00000185869 ZNF829 - zinc finger protein 829 protein-coding 133.75-26 chr10 113611319 113611508 + 0.75 NA intron (NM_001322945, intron 29 of 40) intron (NM_001322945, intron 29 of 40) 52628 NM_198060 4892 Hs.268788 NM_006175 ENSG00000197893 NRAP N-RAP nebulin related anchoring protein protein-coding 197-61 chr8 11994091 11994729 + 0.75 NA intron (NM_001302695, intron 2 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 6342 NM_001302695 613211 Hs.98232 NM_001033019 ENSG00000205882 DEFB134 - defensin beta 134 protein-coding 129.75-146 chr5 36968066 36968404 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 6 of 45) L1M5|LINE|L1 91466 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 141-46 chr14 63605608 63605817 + 0.75 NA intron (NM_080666, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 36159 NM_001258272 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 113-117 chr3 76147752 76148112 + 0.75 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -362383 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 115-11 chr1 113749173 113749436 + 0.75 NA intron (NM_001323043, intron 3 of 18) HAL1|LINE|L1 9851 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 221.75-16 chr11 44424494 44424926 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -114571 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 252.75-14 chr12 53368084 53368475 + 0.75 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -11897 NM_001251825 6667 Hs.620754 NM_003109 ENSG00000185591 SP1 - Sp1 transcription factor protein-coding 144.5-222 chr8 109341238 109341614 + 0.75 NA intron (NM_001193557, intron 4 of 4) intron (NM_001193557, intron 4 of 4) 7079 NM_001193557 56943 Hs.492555 NM_020189 ENSG00000120533 ENY2 DC6|Sus1|e(y)2 ENY2 transcription and export complex 2 subunit protein-coding 169.75-56 chr16 21214692 21214988 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001290104) promoter-TSS (NM_001290104) -330 NM_003460 7783 Hs.73982 NM_003460 ENSG00000103310 ZP2 OOMD6|ZPA|Zp-2 zona pellucida glycoprotein 2 protein-coding 150.75-89 chr2 21258616 21258977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134810 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 131.75-172 chr5 87737702 87737966 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75792 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 113-176 chr8 83158237 83158496 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -245392 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 117-22 chr11 32592728 32593053 + 0.75 NA intron (NM_006360, intron 5 of 10) FAM|SINE|Alu 9059 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 136.25-124 chr3 98144004 98144236 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -5266 NM_001005514 403273 Hs.554714 NM_001005514 ENSG00000236032 OR5H14 - olfactory receptor family 5 subfamily H member 14 protein-coding 204.75-46 chr16 57195911 57196304 + 0.75 NA intron (NM_001305163, intron 1 of 14) intron (NM_001305163, intron 1 of 14) 9778 NM_001305164 89970 Hs.460885 NM_133368 ENSG00000159579 RSPRY1 SEMDFA ring finger and SPRY domain containing 1 protein-coding 189-33 chr13 44513266 44513619 + 0.75 NA intron (NM_183422, intron 1 of 2) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -39141 NM_001243798 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 181.75-10 chr1 223401775 223402045 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 8495 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 252.25-48 chr5 54770742 54771272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26749 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 217.5-91 chr4 89127736 89128154 + 0.75 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 15128 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 198.25-37 chr15 83043192 83043664 + 0.75 NA intron (NM_001011885, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 23824 NM_025238 53339 Hs.459149 NM_025238 ENSG00000064726 BTBD1 C15orf1|NS5ATP8 BTB domain containing 1 protein-coding 174.75-92 chr4 102188441 102188771 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 135706 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 121-156 chr5 35148985 35149306 + 0.75 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -31023 NM_001204317 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 119-103 chr20 51340688 51340961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 112153 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 123.25-174 chr6 17418277 17418564 + 0.75 NA intron (NM_006366, intron 1 of 12) intron (NM_006366, intron 1 of 12) 24825 NM_006366 10486 Hs.132902 NM_006366 ENSG00000112186 CAP2 - cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 2 protein-coding 168.25-105 chr4 38469358 38469597 + 0.75 NA intron (NR_110951, intron 2 of 7) intron (NR_110951, intron 2 of 7) -40290 NR_149076 106144599 Hs.582017 NR_149076 ENSG00000249667 LINC01259 TCONS_00007515 long intergenic non-protein coding RNA 1259 ncRNA 162.5-34 chr12 40165513 40165863 + 0.75 NA intron (NR_146526, intron 1 of 1) intron (NR_146526, intron 1 of 1) 9449 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 181-50 chr19 45392580 45392986 + 0.75 NA intron (NM_006663, intron 7 of 12) intron (NM_006663, intron 7 of 12) 12286 NM_006663 10848 Hs.466937 NM_006663 ENSG00000104881 PPP1R13L IASPP|NKIP1|RAI|RAI4 protein phosphatase 1 regulatory subunit 13 like protein-coding 156-138 chr7 6453710 6454034 + 0.75 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -5860 NM_001142936 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 162.75-30 chr12 125301880 125302157 + 0.75 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) AluSg|SINE|Alu -24598 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 163-71 chr3 98981494 98981761 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -79932 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 187-11 chr10 26723727 26724188 + 0.75 NA intron (NM_001321978, intron 7 of 9) intron (NM_001321978, intron 7 of 9) 26256 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 197.75-5 chr10 66301928 66302243 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) L1MEd|LINE|L1 -623951 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 186.25-98 chr6 12169494 12169934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120647 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 141-151 chr7 101300763 101301000 + 0.75 NA non-coding (NR_146480, exon 2 of 2) non-coding (NR_146480, exon 2 of 2) 1268 NR_146480 101927721 Hs.148659 NR_146480 ENSG00000232301 LNCPRESS1 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 1 ncRNA 140.5-172 chr5 4135783 4136066 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 540092 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 121.5-172 chr3 22505275 22505496 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 548246 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 199.75-68 chr4 7959006 7959479 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19316 NM_001134647 60312 Hs.529369 NM_021638 ENSG00000196526 AFAP1 AFAP|AFAP-110|AFAP110 actin filament associated protein 1 protein-coding 243-67 chr7 4553296 4553737 + 0.75 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -128779 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 166.5-153 chr5 5042754 5043098 + 0.75 NA intron (NR_026994, intron 2 of 6) intron (NR_026994, intron 2 of 6) 8567 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 255-54 chr6 145720260 145720729 + 0.75 NA intron (NM_001360064, intron 1 of 3) intron (NM_001360064, intron 1 of 3) -14375 NR_038246 100507557 Hs.124537 NR_038244 ENSG00000235652 LOC100507557 - uncharacterized LOC100507557 ncRNA 151.25-51 chr14 25468389 25468814 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -418304 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 219.75-3 chr1 67608135 67608595 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -76836 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 194-35 chr14 62986977 62987253 + 0.75 NA exon (NM_172375, exon 5 of 10) exon (NM_172375, exon 5 of 10) 58343 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 120.5-95 chr17 30217021 30217325 + 0.75 NA exon (NM_001045, exon 6 of 15) exon (NM_001045, exon 6 of 15) 18524 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 132.75-17 chr1 229339895 229340221 + 0.75 NA intron (NM_145257, intron 2 of 3) intron (NM_145257, intron 2 of 3) 2989 NM_145257 126731 Hs.585011 NM_145257 ENSG00000154429 CCSAP C1orf96|CSAP centriole, cilia and spindle associated protein protein-coding 175.75-6 chr1 113439021 113439341 + 0.75 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 48666 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 127.75-10 chr1 47451801 47452000 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14583 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 231.5-3 chr1 103896273 103896820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146705 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 137-66 chr17 73695465 73695840 + 0.75 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -42202 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 117.5-166 chr4 148308494 148308746 + 0.75 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) L1MA5A|LINE|L1 133794 NR_148974 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 118.75-165 chr6 54379551 54379793 + 0.75 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) intron (NM_014464, intron 9 of 10) 71231 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 205.25-16 chr12 27456086 27456607 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -9712 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 168.75-59 chr15 78281223 78281630 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001130183, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001130183, exon 7 of 7) 15208 NM_001130183 55466 Hs.513053 NM_018602 ENSG00000140403 DNAJA4 MST104|MSTP104|PRO1472 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A4 protein-coding 135.25-193 chr8 26618381 26618630 + 0.75 NA intron (NM_001244604, intron 3 of 13) AluJr|SINE|Alu 40100 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 185.25-2 chr1 80010290 80010658 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -525281 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 156-152 chr8 74093736 74094029 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102490 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 145.75-77 chr2 52085589 52085851 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -284928 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 132-185 chr9 69532402 69532823 + 0.75 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 139759 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 147-158 chr9 76002189 76002597 + 0.75 NA intron (NR_120409, intron 3 of 19) intron (NR_120409, intron 3 of 19) 111720 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 171-130 chr8 117613743 117614146 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 93231 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 137-28 chr10 111193957 111194195 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 79785 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 169-33 chr15 89875418 89875783 + 0.75 NA intron (NM_001199058, intron 7 of 9) intron (NM_001199058, intron 7 of 9) 8430 NR_049807 100846993 NR_049807 ENSG00000264796 MIR5009 - microRNA 5009 ncRNA 134.75-118 chr2 173087301 173087555 + 0.75 NA intron (NM_133646, intron 1 of 11) intron (NM_133646, intron 1 of 11) 11582 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 185-59 chr3 181581391 181581822 + 0.75 NA intron (NR_075091, intron 4 of 7) MIR|SINE|MIR -28728 NR_075090 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 225.25-74 chr7 7035876 7036385 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 30915 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 112.75-137 chr3 115677283 115677504 + 0.75 NA intron (NM_002045, intron 2 of 2) intron (NM_002045, intron 2 of 2) 53883 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 143.75-149 chr6 10968019 10968327 + 0.75 NA intron (NM_001040274, intron 29 of 29) L2c|LINE|L2 -14084 NR_125851 101928191 Hs.638939 NR_125851 LOC101928191 - uncharacterized LOC101928191 ncRNA 155-120 chr6 50036546 50036762 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 13275 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 139-136 chr7 27790667 27790915 + 0.75 NA intron (NM_001362794, intron 8 of 16) L1ME4a|LINE|L1 50696 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 184.75-70 chr3 88511959 88512353 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 173700 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 185.75-66 chr2 135179896 135180389 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 43514 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 148.5-177 chr4 175742814 175743051 + 0.75 NA intron (NM_201592, intron 1 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 44744 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 159.75-140 chr5 124940769 124941115 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -95889 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 125.75-87 chr2 53229625 53229873 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -527134 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 160-106 chr8 59964006 59964419 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 317188 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 117.25-24 chr10 12882827 12883171 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 118714 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 129-66 chr14 70092467 70092828 + 0.75 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -12430 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 124-37 chr13 42261208 42261475 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -10811 NM_016248 11215 Hs.105105 NM_016248 ENSG00000023516 AKAP11 AKAP-11|AKAP220|PPP1R44|PRKA11 A-kinase anchoring protein 11 protein-coding 148.25-68 chr2 31775407 31775663 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 28445 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 121-29 chr10 107929815 107930019 + 0.75 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 139376 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 114.5-48 chr11 29947765 29947992 + 0.75 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 34515 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 236-41 chr3 3734061 3734659 + 0.75 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) intron (NR_149025, intron 5 of 5) -65071 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 122-86 chr2 40196793 40197056 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 233380 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 148.75-5 chr1 99700315 99700568 + 0.75 NA intron (NR_031666, intron 1 of 4) L1MB2|LINE|L1 12512 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 193.25-102 chr6 130002243 130002771 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15862 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 212.5-106 chr7 52060559 52061062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -667554 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 213.5-13 chr1 240653970 240654529 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42094 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 272.5-7 chr1 221635793 221636402 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 100803 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 149.75-130 chr5 116249796 116250035 + 0.75 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) -5828 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 188-77 chr8 80077357 80077680 + 0.75 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) 3312 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 210.25-50 chr3 10466049 10466399 + 0.75 NA intron (NM_001353564, intron 2 of 20) intron (NM_001353564, intron 2 of 20) 39360 NM_001363862 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 191-83 chr8 117075036 117075495 + 0.75 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -59730 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 113-50 chr12 17433779 17433994 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 155192 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 194-73 chr6 107505817 107506164 + 0.75 NA intron (NM_018013, intron 2 of 6) intron (NM_018013, intron 2 of 6) 15873 NM_018013 55084 Hs.445244 NM_018013 ENSG00000112320 SOBP JXC1|MRAMS sine oculis binding protein homolog protein-coding 132-118 chr3 160656429 160656641 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -20625 NM_025047 80117 Hs.287702 NM_025047 ENSG00000179674 ARL14 ARF7 ADP ribosylation factor like GTPase 14 protein-coding 195.5-52 chr17 61935961 61936476 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -8236 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 130.5-261 chrX 101884950 101885175 + 0.75 NA intron (NM_001282401, intron 8 of 8) intron (NM_001282401, intron 8 of 8) -27485 NM_032946 55998 Hs.307077 NM_032946 ENSG00000126952 NXF5 - nuclear RNA export factor 5 protein-coding 178.5-77 chr2 52202915 52203216 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1MA5A|LINE|L1 -167583 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 137-178 chr8 113724695 113725006 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -287911 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 113.75-86 chr18 7954705 7954903 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 6 of 30) intron (NM_002845, intron 6 of 30) 387488 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 133.75-68 chr16 10088170 10088488 + 0.75 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 93738 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 137.5-160 chr3 103877925 103878336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -354014 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 126.75-27 chr11 41371126 41371359 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 88394 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 138.5-169 chr6 11948821 11949130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52269 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 215.25-22 chr12 55352563 55352941 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12359 NM_001005497 390323 Hs.554554 NM_001005497 ENSG00000187857 OR6C75 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 75 protein-coding 174.75-130 chr8 120894473 120894810 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -82595 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 122.25-63 chr14 61642682 61642930 + 0.75 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -52707 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 211.25-81 chr7 31155880 31156228 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 103593 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 134.75-27 chr10 71849066 71849443 + 0.75 NA intron (NM_001042465, intron 1 of 14) intron (NM_001042465, intron 1 of 14) 1997 NM_001042465 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 112.25-42 chr12 19844708 19844974 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -169844 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 150-111 chr4 146920233 146920446 + 0.75 NA intron (NR_133922, intron 4 of 13) intron (NR_133922, intron 4 of 13) 25525 NM_001317806 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 144.25-158 chr5 36125100 36125389 + 0.75 NA intron (NM_001007527, intron 6 of 17) intron (NM_001007527, intron 6 of 17) 22744 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 173.75-82 chr2 22811055 22811513 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 274805 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 138.25-81 chr2 45514593 45514875 + 0.75 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 96533 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 196-16 chr11 124705859 124706139 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -29696 NM_001199922 54414 Hs.10056 NM_018978 ENSG00000110013 SIAE AIS6|CSE-C|CSEC|LSE|YSG2 sialic acid acetylesterase protein-coding 137.5-84 chr16 61814109 61814414 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 7 of 11) intron (NM_001796, intron 7 of 11) 222177 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 202.25-83 chr7 3311801 3312330 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MEd|LINE|L1 10813 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 137.75-18 chr1 238394384 238394630 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 91510 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 151.75-19 chr10 6250029 6250300 + 0.75 NA intron (NM_001363545, intron 14 of 14) L2c|LINE|L2 47232 NM_001323017 5209 Hs.195471 NM_004566 ENSG00000170525 PFKFB3 IPFK2|PFK2|iPFK-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 protein-coding 125.75-178 chr7 145768881 145769097 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -932936 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 161-129 chr9 32419935 32420242 + 0.75 NA intron (NM_001278352, intron 8 of 21) intron (NM_001278352, intron 8 of 21) 35445 NM_002197 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 205.75-56 chr4 92653417 92653887 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 349253 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 170.75-147 chr9 30134982 30135236 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 273345 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 115-160 chr6 137477320 137477504 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 16982 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 165-137 chr8 50677191 50677454 + 0.75 NA intron (NR_135797, intron 17 of 20) intron (NR_135797, intron 17 of 20) 513191 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 122-61 chr14_GL000225v1_random 108139 108396 + 0.75 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 175.5-50 chr14 50735077 50735442 + 0.75 NA intron (NM_016350, intron 27 of 28) intron (NM_016350, intron 27 of 28) -66953 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 133-6 chr1 96503974 96504215 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -129969 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 132-168 chr8 14130559 14130830 + 0.75 NA intron (NM_001322880, intron 4 of 6) LTR9D|LTR|ERV1 501004 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 160.5-112 chr3 30033741 30034045 + 0.75 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -99737 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 228.5-65 chr20 43409234 43409741 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -48409 NM_006275 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 127.75-33 chr10 85803695 85803915 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1MA3|LINE|L1 226074 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 188.25-18 chr11 32330243 32330707 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 69925 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 158-62 chr18 13506687 13507119 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 46956 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 162-24 chr11 41953541 41953829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 131773 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 150.5-218 chr8 87365444 87365735 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 10 of 10) intron (NM_173538, intron 10 of 10) 499174 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 155-155 chrX 36506015 36506321 + 0.75 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner -65876 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 186.5-94 chr3 94063834 94064228 + 0.75 NA intron (NM_022072, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 970 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 188-64 chr6 162142255 162142563 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) MIR|SINE|MIR -584723 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 114.75-179 chr7 104475748 104476085 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 147260 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 176.25-79 chr20 8439114 8439574 + 0.75 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) 190640 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 164.75-148 chr8 123810470 123810707 + 0.75 NA TTS (NM_001317918) TTS (NM_001317918) -41399 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 178.25-55 chr18 21331588 21332040 + 0.75 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 89572 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 155.5-94 chr2 76632221 76632489 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -353610 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 261.5-42 chr3 133395730 133396291 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001136469, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001136469, exon 6 of 6) -4046 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 131.25-135 chr3 72061862 72062182 + 0.75 NA intron (NR_104116, intron 2 of 6) intron (NR_104116, intron 2 of 6) 38433 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 166.25-106 chr3 133098654 133098927 + 0.75 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -26031 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 173.5-66 chr2 48904415 48904841 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -148904 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 128.5-19 chr1 200680104 200680314 + 0.75 NA intron (NR_110787, intron 1 of 2) intron (NR_110787, intron 1 of 2) -10211 NM_001349803 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 175-27 chr11 116119233 116119488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -359160 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 124.5-142 chr3 100326782 100327035 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -7849 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 238.25-20 chr14 52079565 52079945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10696 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 116-74 chr18 44326603 44326779 + 0.75 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) intron (NR_110792, intron 2 of 4) 205006 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 472.25-3 chr8 92472789 92473757 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182221 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 195.25-20 chr11 107854643 107854962 + 0.75 NA intron (NM_017515, intron 1 of 7) intron (NM_017515, intron 1 of 7) 3985 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 140-177 chr9 95986542 95986852 + 0.75 NA intron (NM_020207, intron 17 of 18) AluSx|SINE|Alu 35114 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 116.5-109 chr2 16401929 16402109 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 263815 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 165.75-17 chr10 64831288 64831754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5993 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 234.5-70 chr4 58369312 58369872 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 166736 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 157.75-68 chr17 59464584 59464928 + 0.75 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 62101 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 150.25-41 chr12 55395715 55396069 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4637 NM_001005518 403282 Hs.554553 NM_001005518 ENSG00000205328 OR6C65 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 65 protein-coding 119-174 chr6 166062093 166062369 + 0.75 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -35489 NR_147704 729681 Hs.520550 NR_147704 LOC729681 - uncharacterized LOC729681 ncRNA 140.75-146 chr5 55871966 55872201 + 0.75 NA intron (NM_001242636, intron 3 of 14) intron (NM_001242636, intron 3 of 14) 18761 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 123-129 chr3 28707118 28707341 + 0.75 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) MER5B|DNA|hAT-Charlie 131951 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 147.75-16 chr10 78927160 78927623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140057 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-244 chr9 117400033 117400264 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 1 of 21) intron (NM_014010, intron 1 of 21) 14909 NM_001365068 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 151-28 chr12 116439408 116439815 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11293 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 157.75-7 chr1 231897890 231898234 + 0.75 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) -27772 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 132.75-48 chr12 42357879 42358091 + 0.75 NA intron (NM_001364830, intron 3 of 6) L1PB4|LINE|L1 26187 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 165-62 chr2 29398228 29398592 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) 76967 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 190-86 chr9 34618870 34619208 + 0.75 NA intron (NM_007234, intron 1 of 6) intron (NM_007234, intron 1 of 6) 1456 NM_024348 11258 Hs.511768 NM_007234 ENSG00000137100 DCTN3 DCTN-22|DCTN22 dynactin subunit 3 protein-coding 122.75-209 chr8 130207647 130207861 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 88779 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 182-66 chr20 9474919 9475278 + 0.75 NA intron (NM_182797, intron 35 of 35) intron (NM_182797, intron 35 of 35) -39260 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 227.5-113 chr8 144803975 144804338 + 0.75 NA exon (NM_213605, exon 4 of 5) exon (NM_213605, exon 4 of 5) 5280 NR_134285 340385 Hs.521942 NM_213605 ENSG00000197363 ZNF517 - zinc finger protein 517 protein-coding 253.75-8 chr13 44953198 44953616 + 0.75 NA intron (NM_012345, intron 7 of 9) L1MD3|LINE|L1 36064 NM_012345 26747 Hs.525006 NM_012345 ENSG00000083635 NUFIP1 NUFIP|bA540M5.1 nuclear FMR1 interacting protein 1 protein-coding 134.5-209 chr7 119791342 119791712 + 0.75 NA intron (NR_131963, intron 2 of 2) intron (NR_131963, intron 2 of 2) 115848 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 175.25-148 chr9 11242345 11242711 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 629322 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 204.5-83 chr22 30615175 30615702 + 0.75 NA exon (NM_001184726, exon 5 of 9) exon (NM_001184726, exon 5 of 9) 8264 NM_000355 6948 Hs.417948 NM_000355 ENSG00000185339 TCN2 D22S676|D22S750|II|TC|TC II|TC-2|TC2|TCII transcobalamin 2 protein-coding 127-161 chr7 52187227 52187514 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -794114 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 133-63 chr17 53362047 53362310 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 376673 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 165.75-132 chr5 36874057 36874395 + 0.75 NA non-coding (NR_046262, exon 1 of 1) non-coding (NR_046262, exon 1 of 1) 2468 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 148.5-24 chr10 32924251 32924498 + 0.75 NA intron (NM_002211, intron 6 of 15) intron (NM_002211, intron 6 of 15) 11184 NM_033668 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 120.5-181 chr5 46245340 46245607 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -549093 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 130.75-197 chr8 125276059 125276379 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -154139 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 123.75-181 chr8 18505259 18505471 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114083 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 190-38 chr21 31716114 31716568 + 0.75 NA intron (NM_020706, intron 1 of 19) intron (NM_020706, intron 1 of 19) 15777 NM_001145444 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 128.75-126 chr3 121534543 121534850 + 0.75 NA intron (NM_199420, intron 5 of 29) L1M5|LINE|L1 11292 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 137.75-22 chr10 27659590 27659944 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84848 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 124.75-60 chr12 62517560 62517870 + 0.75 NA intron (NM_001278469, intron 8 of 35) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 50889 NM_001278470 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 264.75-28 chr22 45721241 45721811 + 0.75 NA intron (NM_013236, intron 6 of 11) intron (NM_013236, intron 6 of 11) -38998 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 139-22 chr11 1938848 1939038 + 0.75 NA TTS (NM_001367844) TTS (NM_001367844) -8389 NM_021134 6150 Hs.3254 NM_021134 ENSG00000214026 MRPL23 L23MRP|RPL23|RPL23L mitochondrial ribosomal protein L23 protein-coding 130.5-96 chr14 81452306 81452625 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -2308 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 143-49 chr16 77726240 77726498 + 0.75 NA intron (NM_001243661, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 3855 NM_001105663 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 231.75-23 chr14 49292112 49292687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 293981 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 169-42 chr2 28088435 28088733 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 92217 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 139.75-169 chr7 91993756 91994105 + 0.75 NA intron (NM_147185, intron 5 of 49) AluJo|SINE|Alu 53055 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 217.75-78 chr8 140699057 140699488 + 0.75 NA intron (NR_148037, intron 28 of 34) intron (NR_148037, intron 28 of 34) 19297 NM_001352751 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 183.75-111 chr6 145949237 145949597 + 0.75 NA intron (NM_001370328, intron 5 of 31) L1PB3|LINE|L1 14680 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 200.5-144 chr9 28073686 28074134 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -500044 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 181.25-101 chr5 80352550 80352971 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_003665) promoter-TSS (NR_003665) -794 NR_003665 441089 Hs.568291 NR_003665 CRSP8P - mediator complex subunit 27 pseudogene pseudo 179-65 chr3 115434916 115435182 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -188461 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 127-15 chr10 53173767 53174075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -402221 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 185.75-73 chr20 39599265 39599669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -374719 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 126.75-84 chr16 74687250 74687633 + 0.75 NA intron (NM_152649, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 13421 NM_001142497 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 119.75-4 chr1 46760625 46761018 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -38225 NR_135003 1580 Hs.436317 NM_000779 ENSG00000142973 CYP4B1 CYPIVB1|P-450HP cytochrome P450 family 4 subfamily B member 1 protein-coding 130.5-113 chr17 31792661 31793013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66125 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 288-30 chr22 24864494 24865225 + 0.75 NA intron (NM_001098498, intron 9 of 23) intron (NM_001098498, intron 9 of 23) 58638 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 204.75-116 chr8 26035330 26035801 + 0.75 NA intron (NM_022659, intron 5 of 15) intron (NM_022659, intron 5 of 15) 9848 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 127.25-138 chr4 36360479 36360756 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 65811 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 121-164 chr6 25521787 25522099 + 0.75 NA intron (NM_001173977, intron 23 of 36) LTR51|LTR|ERV1 -130272 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 284-13 chr16 77368436 77369242 + 0.75 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 66195 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 114.75-63 chr16 6302883 6303186 + 0.75 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 283331 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 132.75-192 chr8 125921050 125921328 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 30008 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 320-23 chr21 26787299 26787951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57784 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 142-54 chr15 75131982 75132246 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -69768 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 117.25-202 chr7 111168102 111168293 + 0.75 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 77070 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 234-10 chr11 35016000 35016571 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74448 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 138.75-159 chr5 143918851 143919042 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 106785 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 126.75 chr1 4955039 4955267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 300544 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 143.75-154 chr6 47723260 47723562 + 0.75 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 24831 NM_153838 221393 Hs.150131 NM_153838 ENSG00000153294 ADGRF4 GPR115|PGR18 adhesion G protein-coupled receptor F4 protein-coding 172-29 chr12 26609996 26610321 + 0.75 NA intron (NM_002223, intron 26 of 56) intron (NM_002223, intron 26 of 56) 223036 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 131.75-182 chr6 38812733 38812959 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 23 of 91) MIR|SINE|MIR 97535 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 192.5-114 chr6 41628899 41629348 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -7895 NM_001300804 4188 Hs.520119 NM_005586 ENSG00000112559 MDFI I-MF|I-mfa MyoD family inhibitor protein-coding 140.25-92 chr2 76530822 76531046 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -455031 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 202.25-27 chr15 60706811 60707199 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 25436 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 219.75-33 chr2 37973793 37974217 + 0.75 NA intron (NR_102712, intron 2 of 3) intron (NR_102712, intron 2 of 3) 23541 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 219.75-19 chr14 56270898 56271250 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 152663 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 124-141 chr5 155559156 155559424 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 545535 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 201.5-51 chr14 33580371 33580847 + 0.75 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -128328 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 258.5-23 chr15 57274098 57274767 + 0.75 NA intron (NM_207038, intron 18 of 19) intron (NM_207038, intron 18 of 19) 4225 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 250-47 chr5 66154088 66154465 + 0.75 NA intron (NM_001323529, intron 2 of 11) intron (NM_001323529, intron 2 of 11) 9441 NM_139168 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 158-19 chr1 211729811 211730093 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 54190 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 175.5-9 chr1 195505470 195505810 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 583075 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 215.5-48 chr2 66618233 66618780 + 0.75 NA intron (NR_110156, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 44476 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 124-21 chr10 125745439 125745702 + 0.75 NA non-coding (NR_120633, exon 4 of 5) non-coding (NR_120633, exon 4 of 5) 6490 NR_120633 101927983 Hs.634269 NR_120633 ENSG00000236991 EDRF1-AS1 - EDRF1 antisense RNA 1 ncRNA 116.25-227 chr8 91879619 91879829 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137956 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 264.25-26 chr2 18337838 18338324 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 222572 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 144-87 chr3 123256078 123256299 + 0.75 NA intron (NM_012430, intron 5 of 6) intron (NM_012430, intron 5 of 6) 54245 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 137.25-98 chr3 85315053 85315414 + 0.75 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) FAM|SINE|Alu -70477 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 115.5-192 chr4 133499101 133499309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 349911 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 176.75-108 chr6 129608556 129608958 + 0.75 NA intron (NM_033515, intron 8 of 14) intron (NM_033515, intron 8 of 14) 101420 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 124.5-138 chr3 2201352 2201612 + 0.75 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -37347 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 155.5-226 chrX 150089212 150089706 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -138545 NR_031748 100313839 NR_031748 ENSG00000252454 MIR2114 - microRNA 2114 ncRNA 169.5-49 chr14 55755341 55755798 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10676 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 126-122 chr4 18017019 18017334 + 0.75 NA intron (NR_158566, intron 1 of 5) L1MC4|LINE|L1 4579 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 219.75-39 chr2 85226246 85226769 + 0.75 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) MIRb|SINE|MIR 12855 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 224.5-120 chrX 70388199 70388636 + 0.75 NA intron (NM_012310, intron 20 of 30) L1ME1|LINE|L1 -34614 NM_001171193 54857 Hs.438712 NM_017711 ENSG00000130055 GDPD2 GDE3|OBDPF glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 2 protein-coding 121.25-4 chr1 70730538 70730790 + 0.75 NA intron (NR_125938, intron 5 of 6) intron (NR_125938, intron 5 of 6) 24211 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 236.25-23 chr13 31642058 31642511 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -97242 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 214.25-3 chr1 33389289 33389709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13906 NM_198040 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 158.25-152 chr9 11658355 11658569 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1034923 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 123.25-59 chr14 60181923 60182129 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -12162 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 169.25-49 chr2 11640611 11640926 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014668, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_014668, exon 33 of 33) 29427 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 141.5-131 chr22 16819689 16820161 + 0.75 NA intron (NM_001318251, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 1774 NM_001318251 150165 Hs.356069 NM_175878 ENSG00000172967 XKR3 XRG3|XTES XK related 3 protein-coding 197.5-4 chr1 78970206 78970619 + 0.75 NA intron (NM_022159, intron 2 of 14) MER61-int|LTR|ERV1 36318 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 155.75-20 chr10 76130206 76130464 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 347574 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 123-75 chr16 79644046 79644357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43464 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 139-39 chr14 60157868 60158117 + 0.75 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) AluSz6|SINE|Alu 7406 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 241.5-38 chr2 49942950 49943337 + 0.75 NA intron (NM_001330097, intron 5 of 5) intron (NM_001330097, intron 5 of 5) 31060 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 162.75-145 chr8 107899538 107899857 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001317942, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001317942, exon 5 of 5) 182242 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 179.75-127 chr7 73943051 73943476 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 82104 NM_182504 135886 Hs.647026 NM_182504 ENSG00000175877 TMEM270 WBSCR28 transmembrane protein 270 protein-coding 181.75-105 chr5 24738975 24739261 + 0.75 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -94140 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 153.75-10 chr1 185449692 185450072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114843 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 214.5-102 chr5 98336900 98337528 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175975 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 166.5-12 chr1 109094210 109094651 + 0.75 NA non-coding (NR_136243, exon 2 of 2) non-coding (NR_136243, exon 2 of 2) 3666 NM_020141 56900 Hs.82933 NM_020141 ENSG00000215717 TMEM167B AD-020|C1orf119 transmembrane protein 167B protein-coding 168-91 chr4 110552387 110552844 + 0.75 NA intron (NM_001977, intron 17 of 19) intron (NM_001977, intron 17 of 19) 62843 NR_147203 110231149 Hs.436030 NR_147203 ENSG00000250103 PANCR - PITX2 adjacent non-coding RNA ncRNA 251-46 chr5 149224931 149225469 + 0.75 NA intron (NM_001370418, intron 7 of 18) L1MB5|LINE|L1 -46638 NM_001323063 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 117.5-152 chr4 3840482 3840814 + 0.75 NA Intergenic MLT1N2-int|LTR|ERVL-MaLR 74263 NM_000683 152 Hs.123022 NM_000683 ENSG00000184160 ADRA2C ADRA2L2|ADRA2RL2|ADRARL2|ALPHA2CAR adrenoceptor alpha 2C protein-coding 114.75-98 chr2 163528694 163528876 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 207223 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 128.25-108 chr2 200633628 200633910 + 0.75 NA intron (NM_001159, intron 20 of 34) L1MDa|LINE|L1 47755 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 221.5-55 chr20 25656536 25656973 + 0.75 NA intron (NR_126465, intron 2 of 3) AluSq|SINE|Alu 30185 NM_001290261 26152 Hs.61881 NM_015655 ENSG00000130684 ZNF337 - zinc finger protein 337 protein-coding 124.25-203 chr8 108600552 108600784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157044 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 178.25-20 chr11 123052690 123053061 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 5281 NR_003125 85391 NR_003125 ENSG00000200879 SNORD14E - small nucleolar RNA, C/D box 14E snoRNA 165.75-85 chr2 128323318 128323576 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4579 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 178-51 chr20 18961016 18961321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130965 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 163.75-137 chr9 126585329 126585753 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -28902 NM_002316 4010 Hs.129133 NM_002316 ENSG00000136944 LMX1B LMX1.2|NPS1 LIM homeobox transcription factor 1 beta protein-coding 115.5-132 chr2 143449649 143449922 + 0.75 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 320366 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 218.75-75 chr6 19327743 19328106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -121897 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 188.5-19 chr11 49289314 49289587 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -80848 NM_001193471 2346 Hs.551896 NM_004476 ENSG00000086205 FOLH1 FGCP|FOLH|GCP2|GCPII|NAALAD1|NAALAdase|PSM|PSMA|mGCP folate hydrolase 1 protein-coding 185.75-56 chr18 63841401 63841836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46087 NM_001143818 5055 Hs.594481 NM_002575 ENSG00000197632 SERPINB2 HsT1201|PAI|PAI-2|PAI2|PLANH2 serpin family B member 2 protein-coding 112.75-31 chr10 124821703 124821927 + 0.75 NA intron (NM_032182, intron 4 of 8) L1ME3G|LINE|L1 19996 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 123.75-12 chr10 11980186 11980502 + 0.75 NA intron (NM_080599, intron 8 of 21) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 62465 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 118.75-144 chr5 18527340 18527593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 720192 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 123.25-203 chr8 93425556 93425771 + 0.75 NA intron (NR_033858, intron 7 of 10) intron (NR_033858, intron 7 of 10) -258813 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 156-71 chr18 41731060 41731347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -210526 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 114.75-210 chrX 78001415 78001679 + 0.75 NA intron (NM_001282224, intron 5 of 21) L1MA2|LINE|L1 -31909 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 194.5-87 chr3 4017890 4018325 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -217232 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 115.5-156 chr21 29952846 29953110 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12926 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 154.25-106 chr3 87796968 87797195 + 0.75 NA intron (NM_001322208, intron 1 of 2) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 4375 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 114.25-13 chr1 231186210 231186577 + 0.75 NA intron (NM_001256615, intron 1 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 1234 NM_001256615 149373 Hs.632505 NM_001256615 ENSG00000235710 LOC149373 - uncharacterized LOC149373 protein-coding 128.25-88 chr2 21772938 21773163 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -62398 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 162-118 chr8 117661679 117661931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141092 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 179.75-106 chr5 100875362 100875702 + 0.75 NA intron (NM_005668, intron 3 of 4) intron (NM_005668, intron 3 of 4) 27750 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 132-71 chr17 58974513 58974927 + 0.75 NA intron (NM_014906, intron 6 of 6) intron (NM_014906, intron 6 of 6) 132160 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 128.25-182 chr7 15529397 15529698 + 0.75 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) intron (NM_001004320, intron 3 of 12) 32468 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 190.75-92 chr6 35310415 35310695 + 0.75 NA exon (NM_022047, exon 3 of 11) exon (NM_022047, exon 3 of 11) 12737 NM_022047 50619 Hs.15476 NM_022047 ENSG00000023892 DEF6 IBP|SLAT|SWAP70L DEF6 guanine nucleotide exchange factor protein-coding 152.5-50 chr14 80911298 80911717 + 0.75 NA intron (NM_152446, intron 4 of 24) AluJo|SINE|Alu 30231 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 128-65 chr18 73196158 73196529 + 0.75 NA intron (NR_034133, intron 3 of 5) intron (NR_034133, intron 3 of 5) 68155 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 253.25-43 chr3 51436288 51436661 + 0.75 NA intron (NR_146065, intron 8 of 25) intron (NR_146065, intron 8 of 25) 45189 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 152.25-25 chr10 83050154 83050429 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 626798 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 126.25-21 chr10 94508763 94509033 + 0.75 NA intron (NM_015188, intron 7 of 12) L1MEg2|LINE|L1 -36869 NM_001289070 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 132.75-184 chr8 51343435 51343770 + 0.75 NA intron (NM_144651, intron 20 of 22) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 465843 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 127.75-135 chr3 149816859 149817121 + 0.75 NA intron (NM_007282, intron 2 of 10) intron (NM_007282, intron 2 of 10) 4302 NM_007282 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 150.75-81 chr17 39309392 39309706 + 0.75 NA intron (NM_001370209, intron 2 of 13) AluYg6|SINE|Alu 12149 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 285.75-14 chr14 85617304 85617837 + 0.75 NA intron (NM_001346143, intron 1 of 1) intron (NM_001346143, intron 1 of 1) 84221 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 125.25-128 chr22 34841214 34841536 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) MIR3|SINE|MIR 156541 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 186.5-25 chr11 80941403 80941859 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -178828 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 155.75-166 chr8 130655093 130655385 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -211565 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 221.75-42 chr2 215627698 215628111 + 0.75 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) L1MC3|LINE|L1 -90139 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 134.25-93 chr2 197755993 197756222 + 0.75 NA intron (NM_033030, intron 9 of 10) intron (NM_033030, intron 9 of 10) 29212 NM_001284362 66037 Hs.169797 NM_033030 ENSG00000152430 BOLL BOULE boule homolog, RNA binding protein protein-coding 161.5-89 chr2 9662713 9662944 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -31831 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 129.5-99 chr18 3606506 3606769 + 0.75 NA non-coding (NR_119377, exon 2 of 3) non-coding (NR_119377, exon 2 of 3) 2900 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 159-135 chrX 53399559 53400019 + 0.75 NA intron (NM_001281463, intron 16 of 25) L1ME4a|LINE|L1 5976 NR_106916 102465516 NR_106916 ENSG00000278204 MIR6857 hsa-mir-6857 microRNA 6857 ncRNA 130.25-87 chr19 29058767 29059143 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 56400 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 155-83 chr3 4415206 4415601 + 0.75 NA intron (NM_001164674, intron 5 of 7) intron (NM_001164674, intron 5 of 7) 51866 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 137.25-34 chr12 55415406 55415828 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -10637 NM_001005183 390326 Hs.553764 NM_001005183 ENSG00000185821 OR6C76 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 76 protein-coding 140.5-143 chr3 2001760 2002120 + 0.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -96863 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 212.25-2 chr1 94475594 94476069 + 0.75 NA intron (NM_002858, intron 7 of 22) intron (NM_002858, intron 7 of 22) 57442 NM_002858 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 185.75-51 chr15 95193788 95194390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133011 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 133-27 chr11 119747766 119748061 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18330 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 268.5-31 chr2 174449414 174449880 + 0.75 NA intron (NM_001267051, intron 10 of 14) AluJb|SINE|Alu 37382 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 112.75-197 chr8 83858205 83858445 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -324462 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 145.5-89 chr2 8040222 8040523 + 0.75 NA intron (NR_034135, intron 8 of 8) intron (NR_034135, intron 8 of 8) -63558 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 145.75-15 chr10 75920447 75920784 + 0.75 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 137854 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 125-45 chr15 59210757 59211038 + 0.75 NA intron (NM_004998, intron 12 of 27) intron (NM_004998, intron 12 of 27) 4054 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 124-150 chr6 66819881 66820096 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1032109 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 294 chr1 111636397 111637151 + 0.75 NA intron (NM_001010935, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu -16376 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 127.5-12 chr1 94018753 94018987 + 0.75 NA intron (NM_000350, intron 36 of 49) intron (NM_000350, intron 36 of 49) 102278 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 206.5-42 chr2 12019141 12019684 + 0.75 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) 12296 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 286.25-13 chr18 9084764 9085557 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -17539 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 156-7 chr1 170231061 170231391 + 0.75 NA intron (NR_146891, intron 2 of 4) intron (NR_146891, intron 2 of 4) 52982 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 216-54 chr3 89953518 89954071 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 846173 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 128.75-118 chr3 21113098 21113303 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -292526 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 143.25-87 chr2 66105292 66105537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 252914 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 210.25-34 chr18 11605356 11605852 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3954 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 233.5-84 chr5 50578615 50579164 + 0.75 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -87042 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 162.5-113 chr3 78253363 78253639 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -204538 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 156.5-119 chr3 125320928 125321210 + 0.75 NA intron (NM_001348436, intron 3 of 8) intron (NM_001348436, intron 3 of 8) 36211 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 135.75-123 chr20 59883650 59883958 + 0.75 NA intron (NM_014258, intron 26 of 44) L1MA9|LINE|L1 49833 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 140.25-145 chr5 26156652 26156890 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 881815 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 204-7 chr11 71997677 71997949 + 0.75 NA TTS (NR_024147) TTS (NR_024147) -1096 NM_001039660 10068 Hs.591967 NM_005699 ENSG00000137496 IL18BP IL18BPa interleukin 18 binding protein protein-coding 209.5-71 chr2 178879739 178880150 + 0.75 NA intron (NM_001316745, intron 11 of 11) intron (NM_001316745, intron 11 of 11) -72521 NM_003319 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 117.5-195 chr5 137001415 137001676 + 0.75 NA intron (NM_004598, intron 6 of 10) intron (NM_004598, intron 6 of 10) -126652 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 115.5-65 chr14 65645620 65645929 + 0.75 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 174672 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 159.25-35 chr13 29017864 29018120 + 0.75 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) -6465 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 146-126 chr8 54004802 54005193 + 0.75 NA intron (NR_109901, intron 2 of 11) intron (NR_109901, intron 2 of 11) 17451 NR_109901 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 142-125 chr5 39563089 39563339 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42783 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 159-51 chr2 67800630 67800893 + 0.75 NA intron (NR_110271, intron 2 of 2) L1ME4a|LINE|L1 24801 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 117-103 chr20 36023545 36023846 + 0.75 NA exon (NM_080834, exon 11 of 12) exon (NM_080834, exon 11 of 12) 27265 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 181.25-71 chr2 195180463 195180946 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 450109 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 168.25-57 chr16 71296470 71296753 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6889 NM_001324377 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 213.75-7 chr1 185131633 185132033 + 0.75 NA intron (NM_030934, intron 10 of 14) HAL1|LINE|L1 25120 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 181-53 chr2 31788374 31788650 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15468 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 174-2 chr1 108006086 108006513 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -41119 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 211.75-45 chr2 55477206 55477586 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42199 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 168.75-94 chr3 65101126 65101453 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -413289 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 185-20 chr14 45821466 45821768 + 0.75 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -106015 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 119.5-73 chr13 101898973 101899246 + 0.75 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 17536 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 130.5-162 chr3 6493389 6493677 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 311916 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 156.5-17 chr10 86874248 86874639 + 0.75 NA intron (NM_004329, intron 2 of 12) AluY|SINE|Alu -81316 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 163.75-2 chr1 40579456 40579741 + 0.75 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 47961 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 202.5-106 chr4 128368848 128369213 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -58986 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 115-168 chr7 29163748 29164046 + 0.75 NA intron (NM_001293069, intron 2 of 13) L1ME1|LINE|L1 17350 NM_001293069 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 152.25-105 chr3 108248296 108248657 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -26052 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 203.25-103 chr8 28058301 28058665 + 0.75 NA intron (NM_001010906, intron 8 of 18) intron (NM_001010906, intron 8 of 18) 25453 NM_001010906 389643 Hs.370129 NM_001010906 ENSG00000189233 NUGGC C8orf80|HMFN0672|SLIP-GC nuclear GTPase, germinal center associated protein-coding 123.5-94 chr2 41264999 41265268 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -612422 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 156.25-119 chr5 60687258 60687744 + 0.75 NA intron (NM_001145208, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 12665 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 200.75-89 chr5 156832070 156832656 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17932 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 137.75-81 chr16 27982044 27982248 + 0.75 NA intron (NM_001109763, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 81568 NM_001323901 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 178.25-89 chr4 26036856 26037385 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 122928 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 159.75-106 chr3 63041532 63041863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60991 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 113.25-91 chr2 83744786 83745024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 222091 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 146.75-133 chr5 137981478 137981785 + 0.75 NA intron (NM_001101801, intron 9 of 21) AluSz|SINE|Alu -51143 NR_037900 100130172 Hs.616629 NR_037900 LOC100130172 - uncharacterized LOC100130172 ncRNA 194-80 chr7 105483092 105483350 + 0.75 NA intron (NM_001318164, intron 7 of 15) AluSx|SINE|Alu 25299 NM_001318163 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 151.5-107 chr22 34979540 34979965 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 18164 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 183.75-36 chr13 99255268 99255614 + 0.75 NA exon (NM_005292, exon 3 of 3) exon (NM_005292, exon 3 of 3) 2987 NM_005292 2841 Hs.741589 NM_005292 ENSG00000125245 GPR18 - G protein-coupled receptor 18 protein-coding 153.25-49 chr15 98884915 98885158 + 0.75 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 100610 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 205-15 chr11 65403202 65403617 + 0.75 NA intron (NM_001300832, intron 8 of 9) AluSx1|SINE|Alu 16772 NM_031904 83786 Hs.578433 NM_031904 ENSG00000126391 FRMD8 FKSG44|iTAP FERM domain containing 8 protein-coding 133.5-61 chr12 39010222 39010589 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -104814 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 155-11 chr10 19535086 19535358 + 0.75 NA intron (NM_001142308, intron 32 of 39) intron (NM_001142308, intron 32 of 39) 193328 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 151.5-141 chr4 82948440 82948751 + 0.75 NA intron (NM_001288996, intron 2 of 10) L1MA9|LINE|L1 -47679 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 212.25-20 chr12 6582024 6582372 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_003012) promoter-TSS (NR_003012) -589 NR_003012 677780 Hs.689692 NR_003012 ENSG00000251898 SCARNA11 ACA57 small Cajal body-specific RNA 11 ncRNA 199.5-54 chr16 49611626 49612152 + 0.75 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) L1MD1|LINE|L1 52435 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 175.5-187 chrX 72219395 72219783 + 0.75 NA intron (NM_017669, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 19438 NM_017669 54821 Hs.47558 NM_017669 ENSG00000186871 ERCC6L PICH|RAD26L ERCC excision repair 6 like, spindle assembly checkpoint helicase protein-coding 162.5-112 chr3 77222443 77222880 + 0.75 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 124649 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 161-126 chr9 6868330 6868555 + 0.75 NA intron (NR_148680, intron 5 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger 111092 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 172-87 chr5 16575463 16575884 + 0.75 NA intron (NM_001034850, intron 1 of 8) intron (NM_001034850, intron 1 of 8) -40253 NR_109946 101929524 Hs.734029 NR_109946 ENSG00000246214 LOC101929524 - uncharacterized LOC101929524 ncRNA 207.75-72 chr3 57369561 57370238 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 55 of 73) intron (NM_001366028, intron 55 of 73) -77214 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 182.25-137 chrX 68111118 68111445 + 0.75 NA intron (NM_002547, intron 18 of 24) intron (NM_002547, intron 18 of 24) 322214 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 137.75-112 chr2 208982575 208982822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 440056 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 119.75-108 chr2 118374034 118374340 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -187801 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 123-99 chr2 42266873 42267074 + 0.75 NA intron (NM_001145076, intron 5 of 21) L2|LINE|L2 93065 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 137-165 chr7 87864060 87864310 + 0.75 NA intron (NM_018843, intron 1 of 11) L1MA4|LINE|L1 12175 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 124.25-175 chr6 36905808 36906038 + 0.75 NA intron (NM_152734, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 19971 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 167-88 chr4 67102575 67102874 + 0.75 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 319276 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 275.25-47 chr8 134116990 134117621 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 230809 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 114.25-66 chr16 22663595 22663794 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117996 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 176-63 chr6 2258151 2258636 + 0.75 NA intron (NR_046229, intron 2 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 12640 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 200-51 chr20 23437926 23438262 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1591 NM_138283 128817 Hs.352134 NM_138283 ENSG00000125823 CSTL1 CTES1|RCET11|dJ322G13.4 cystatin like 1 protein-coding 195-44 chr2 82821184 82821636 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35393 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 167.75-58 chr17 76064753 76065161 + 0.75 NA intron (NM_001260502, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR 7560 NM_014230 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 164.5-158 chr5 23925926 23926342 + 0.75 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -25214 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 262-37 chr3 44587024 44587467 + 0.75 NA intron (NM_001351734, intron 2 of 6).2 intron (NM_001351734, intron 2 of 6).2 2281 NR_147691 110354863 Hs.157035 NM_001351732 ZNF660-ZNF197 - ZNF660-ZNF197 readthrough protein-coding 138-104 chr3 96553298 96553617 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 193493 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 161.25-98 chr2 152983707 152983949 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 265191 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 143.5-58 chr14 39805978 39806217 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -373597 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 197.25-11 chr10 71025581 71025917 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86696 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 145.5-166 chr5 155785885 155786229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -540700 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 181.5-62 chr17 79587089 79587470 + 0.75 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) intron (NM_001350451, intron 1 of 14) 23772 NM_001350451 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 172-60 chr20 16827190 16827687 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 79085 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 120.25-105 chr2 217649568 217649804 + 0.75 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 106907 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 119-178 chr7 25615964 25616208 + 0.75 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 47054 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 144.5-166 chr5 15490749 15491043 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9284 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 133.25-198 chr7 34571575 34571937 + 0.75 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) intron (NR_033664, intron 2 of 4) -86462 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 139.5-92 chr19 32013098 32013323 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12652 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 191-65 chr4 187868355 187868680 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -127254 NM_174900 132625 Hs.335787 NM_174900 ENSG00000179059 ZFP42 REX-1|REX1|ZNF754|zfp-42 ZFP42 zinc finger protein protein-coding 225.5-88 chr5 37510175 37510730 + 0.75 NA intron (NM_001345998, intron 8 of 17) L1MC4|LINE|L1 131134 NM_001345998 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 145-60 chr17 55714785 55715077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7933 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 327-21 chr3 149043962 149044682 + 0.75 NA intron (NM_001318935, intron 18 of 25) intron (NM_001318935, intron 18 of 25) -42010 NR_046648 100873945 Hs.742423 NR_046648 ENSG00000239718 HLTF-AS1 - HLTF antisense RNA 1 ncRNA 152-133 chr6 51911516 51911781 + 0.75 NA intron (NM_138694, intron 39 of 66) intron (NM_138694, intron 39 of 66) 175965 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 127.75-89 chr19 41694988 41695230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6839 NM_001291485 1087 Hs.74466 NM_006890 ENSG00000007306 CEACAM7 CGM2 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 7 protein-coding 175.5-49 chr14 47080790 47081201 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 262251 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 203-93 chr7 28283975 28284427 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15120 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 113.75-79 chr17 52275042 52275374 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -115191 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 126-136 chr5 27460498 27460823 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11632 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 122.5-20 chr10 34622040 34622453 + 0.75 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 193050 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 139-35 chr13 110933067 110933384 + 0.75 NA Intergenic LTR71B|LTR|ERV1 -18156 NR_104586 55608 Hs.525163 NM_017664 ENSG00000088448 ANKRD10 - ankyrin repeat domain 10 protein-coding 161-10 chr10 20820812 20821151 + 0.75 NA intron (NM_006393, intron 19 of 27) intron (NM_006393, intron 19 of 27) 76621 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 160.75 chr1 5528799 5529159 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 333762 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 142.5-87 chr17 29668010 29668351 + 0.75 NA intron (NM_033389, intron 8 of 14) intron (NM_033389, intron 8 of 14) -46757 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 121.25-21 chr10 57988624 57988815 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 279175 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 239.5-50 chr3 109572271 109572707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30339 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 194.75-75 chr4 93173484 93173983 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) AluJo|SINE|Alu -655020 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 168.5-81 chr2 57580629 57581011 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -326831 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 126.75-23 chr10 79262241 79262506 + 0.75 NA intron (NM_020338, intron 7 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie -85096 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 120.75-177 chr9 38107957 38108155 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -38829 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 153.25-20 chr10 116476577 116476802 + 0.75 NA exon (NM_001011709, exon 11 of 12) exon (NM_001011709, exon 11 of 12) 48842 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 125.5-35 chr10 103968317 103968598 + 0.75 NA intron (NM_001304743, intron 1 of 17) intron (NM_001304743, intron 1 of 17) 1317 NM_014720 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 158.5-44 chr11 110958096 110958369 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 139086 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 185-37 chr2 7263059 7263378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158043 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 115.5-115 chr2 30226476 30226654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4969 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 201.75-15 chr10 101027936 101028336 + 0.75 NA intron (NM_001351044, intron 2 of 9) intron (NM_001351044, intron 2 of 9) 2993 NM_001195263 79955 Hs.438245 NM_024895 ENSG00000186862 PDZD7 DFNB57|PDZK7 PDZ domain containing 7 protein-coding 150.25-76 chr2 73903973 73904235 + 0.75 NA intron (NM_001615, intron 3 of 8) AluJb|SINE|Alu 11096 NM_001199893 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 133.25-77 chr17 73249913 73250254 + 0.75 NA intron (NM_001129885, intron 5 of 5) intron (NM_001129885, intron 5 of 5) 11797 NM_001129885 642843 Hs.534707 NM_001129885 ENSG00000187959 CPSF4L - cleavage and polyadenylation specific factor 4 like protein-coding 117.25-101 chr18 76831336 76831666 + 0.75 NA intron (NM_007345, intron 1 of 30) L1MC2|LINE|L1 7341 NM_007345 7776 Hs.719137 NM_007345 ENSG00000130856 ZNF236 ZNF236A|ZNF236B zinc finger protein 236 protein-coding 136.75-194 chr8 83666134 83666441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 262529 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 180.5-126 chr6 37396085 37396539 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -36909 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 180.75-17 chr10 71309985 71310550 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -8986 NR_033413 55315 Hs.438419 NM_018344 ENSG00000198246 SLC29A3 ENT3|HCLAP|HJCD|PHID solute carrier family 29 member 3 protein-coding 138.25-105 chr22 24557051 24557260 + 0.75 NA intron (NR_103819, intron 1 of 2) MER3|DNA|hAT-Charlie 1156 NM_004175 6634 Hs.356549 NM_004175 ENSG00000100028 SNRPD3 SMD3|Sm-D3 small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide protein-coding 134.75-83 chr16 82922682 82922924 + 0.75 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 67495 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 119.25-10 chr1 89996360 89996619 + 0.75 NA intron (NM_001320185, intron 1 of 11) intron (NM_001320185, intron 1 of 11) 1379 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 221.75-38 chr2 115158598 115159009 + 0.75 NA intron (NR_036580, intron 1 of 2) intron (NR_036580, intron 1 of 2) 2540 NR_036580 389023 Hs.97540 NR_036580 ENSG00000235026 DPP10-AS1 - DPP10 antisense RNA 1 ncRNA 177.75-73 chr2 114352416 114352750 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -90058 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 152-119 chr4 140952409 140952656 + 0.75 NA intron (NM_020724, intron 2 of 6) intron (NM_020724, intron 2 of 6) 180937 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 155-10 chr1 227657819 227658079 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001367910, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001367910, exon 5 of 5) 39758 NR_036753 401983 Hs.681816 NR_036753 ZNF847P gm127 zinc finger protein 847, pseudogene pseudo 112.75-97 chr2 100353455 100353719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30854 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 202.75-103 chr6 159918270 159918825 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 27559 NM_001366704 4142 Hs.99900 NM_002377 ENSG00000130368 MAS1 MAS|MGRA MAS1 proto-oncogene, G protein-coupled receptor protein-coding 232.25 chr1 43008420 43008754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49538 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 193.75-41 chr14 51012528 51012924 + 0.75 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) L1MB3|LINE|L1 -68243 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 145.25-144 chr6 63351565 63351819 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -31709 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 114.5-86 chr14 36396601 36396770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76009 NM_001144891 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 142.5-241 chr9 96292377 96292681 + 0.75 NA intron (NM_000197, intron 2 of 10) AluSq2|SINE|Alu 9647 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 151.5-200 chr8 132482371 132482656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1418 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 127.5-21 chr1 222612147 222612369 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5839 NM_198551 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 162-88 chr4 80950963 80951367 + 0.75 NA intron (NM_152770, intron 5 of 5) intron (NM_152770, intron 5 of 5) -79543 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 191.25-98 chr7 94862191 94862578 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -45210 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 267.5-13 chr11 35808282 35808802 + 0.75 NA 3' UTR (NM_017583, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_017583, exon 5 of 5) -135439 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 227.75-67 chr5 42198287 42198680 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -23138 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 139.25-200 chr8 108653635 108653906 + 0.75 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 133824 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 162.25-12 chr1 211571364 211571780 + 0.75 NA TTS (NM_021194) TTS (NM_021194) 7589 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 119-50 chr14 71964826 71965030 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 31401 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 120.25-48 chr12 39051851 39052069 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -146369 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 130.5-69 chr12 12323377 12323645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26731 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 116.25-81 chr16 86313010 86313336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26742 NR_038438 146513 Hs.434338 NR_038438 ENSG00000268532 LINC02135 - long intergenic non-protein coding RNA 2135 ncRNA 122.75-128 chr3 105793540 105793740 + 0.75 NA intron (NR_135809, intron 3 of 18) intron (NR_135809, intron 3 of 18) 73951 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 121.5-35 chr10 98100015 98100370 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -34432 NM_001256620 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 159.75-4 chr1 63218642 63218927 + 0.75 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) intron (NR_038252, intron 4 of 11) 98473 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 164.75-14 chr1 239209675 239209989 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176736 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 184.25-121 chr8 82808862 82809151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103098 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 145.75-59 chr17 18119003 18119397 + 0.75 NA exon (NM_016239, exon 2 of 65) exon (NM_016239, exon 2 of 65) 10444 NM_016239 51168 Hs.462390 NM_016239 ENSG00000091536 MYO15A DFNB3|MYO15 myosin XVA protein-coding 117.75-35 chr11 93179451 93179759 + 0.75 NA intron (NM_152313, intron 6 of 10) intron (NM_152313, intron 6 of 10) 17821 NM_001286139 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 208.5-111 chr5 79306432 79306842 + 0.75 NA intron (NM_152405, intron 7 of 10) L1MC1|LINE|L1 70506 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 243.75-44 chr2 233560792 233561364 + 0.75 NA intron (NM_001365479, intron 3 of 31) intron (NM_001365479, intron 3 of 31) 4495 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 126-31 chr11 43885666 43885848 + 0.75 NA intron (NM_139178, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 4926 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 254-34 chr4 88729453 88730062 + 0.75 NA non-coding (NR_002806, exon 5 of 5) non-coding (NR_002806, exon 5 of 5) 19968 NR_002806 285512 Hs.744957 NR_002806 ENSG00000248019 FAM13A-AS1 FAM13A1OS|FAM13AOS|NCRNA00039 FAM13A antisense RNA 1 ncRNA 175.5-95 chr2 182785367 182785752 + 0.75 NA non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) 69302 NM_018981 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 131.5-167 chr3 185895866 185896095 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 42034 NM_001243879 6434 Hs.533122 NM_004593 ENSG00000136527 TRA2B Htra2-beta|PPP1R156|SFRS10|SRFS10|TRA2-BETA|TRAN2B transformer 2 beta homolog protein-coding 113.25-123 chr4 103352257 103352457 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -72685 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 174.25-16 chr10 24366235 24366607 + 0.75 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) AluSx1|SINE|Alu -82993 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 218.25-52 chr3 45278998 45279405 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -52914 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 195.5-113 chr5 3144904 3145316 + 0.75 NA Intergenic MLT1-int|LTR|ERVL-MaLR -32725 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 163.5-102 chr2 178703780 178704212 + 0.75 NA intron (NM_001256850, intron 104 of 312) intron (NM_001256850, intron 104 of 312) -72930 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 132.5-164 chr3 99712055 99712311 + 0.75 NA intron (NM_001850, intron 2 of 4) intron (NM_001850, intron 2 of 4) 73589 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 168.5-55 chr14 50762497 50762804 + 0.75 NA intron (NM_016350, intron 15 of 28) intron (NM_016350, intron 15 of 28) -59147 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 142.5-209 chr7 73850949 73851155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8536 NM_152559 155368 Hs.647042 NM_152559 ENSG00000165171 METTL27 WBSCR27 methyltransferase like 27 protein-coding 273.75-36 chr6 65970063 65970851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182578 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 250-17 chr17 54097109 54097536 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 274395 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 160.75-151 chr8 89659167 89659593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98331 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 186.25-58 chr20 22159094 22159362 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105138 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 169-45 chr2 51449176 51449575 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) MER34B-int|LTR|ERV1 416774 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 178.75-119 chrX 37378396 37378649 + 0.75 NA intron (NM_001173490, intron 1 of 3) intron (NM_001173490, intron 1 of 3) 29158 NM_001173486 5638 Hs.190341 NM_000950 ENSG00000130962 PRRG1 PRGP1 proline rich and Gla domain 1 protein-coding 157.5-119 chr20 5960334 5960607 + 0.75 NA intron (NM_182802, intron 7 of 18) L1ME3C|LINE|L1 9818 NM_001281522 84515 Hs.597484 NM_032485 ENSG00000125885 MCM8 C20orf154|POF10|dJ967N21.5 minichromosome maintenance 8 homologous recombination repair factor protein-coding 164.75-53 chr15 63341647 63342053 + 0.75 NA intron (NR_135511, intron 5 of 9) intron (NR_135511, intron 5 of 9) 39996 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 196.75-103 chr7 95626293 95626615 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -29938 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 113.75-165 chr6 79452244 79452406 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 85105 NM_001122769 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 197.5-105 chr4 34477947 34478300 + 0.75 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL -208376 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 319.25-11 chr21 42503312 42503898 + 0.75 NA intron (NM_018964, intron 2 of 20) intron (NM_018964, intron 2 of 20) 3983 NM_018964 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 241.75-67 chr6 53526737 53527329 + 0.75 NA intron (NM_001498, intron 1 of 15) intron (NM_001498, intron 1 of 15) 18068 NM_001197115 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 141.75-141 chr5 89342873 89343221 + 0.75 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -438942 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 192.25-94 chr6 34806842 34807503 + 0.75 NA intron (NM_017754, intron 1 of 20) intron (NM_017754, intron 1 of 20) 15089 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 141.5-240 chr9 15899376 15899718 + 0.75 NA intron (NM_001355547, intron 23 of 24) L1MD2|LINE|L1 335569 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 201.75-54 chr20 43985512 43985895 + 0.75 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) intron (NM_001098797, intron 2 of 8) 39807 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 133-93 chr2 223658227 223658456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55980 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 128.25-174 chr6 63975070 63975387 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 168392 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 141.25-14 chr1 206840796 206841110 + 0.75 NA intron (NM_013371, intron 5 of 6) intron (NM_013371, intron 5 of 6) 6604 NM_001369605 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 142.5-95 chr18 50745500 50745849 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 74342 NM_001127176 83876 Hs.30495 NM_031939 ENSG00000134042 MRO B29|C18orf3 maestro protein-coding 155.75-133 chr5 98621272 98621642 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -147175 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 118.75-59 chr14 24700366 24700592 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66289 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 141.5-96 chr2 55431997 55432249 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12267 NM_018084 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 113.75-39 chr11 97429339 97429570 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 921029 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 134.25-2 chr1 31110216 31110586 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -44684 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 148.75-35 chr11 103832799 103833163 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -16925 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 225.25-46 chr2 161664922 161665399 + 0.75 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 40744 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 131.25-98 chr2 37532621 37532982 + 0.75 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie 139398 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 128.25-48 chr14 29238532 29238727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -452842 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 141.25-81 chr2 73548177 73548455 + 0.75 NA intron (NM_015120, intron 12 of 22) intron (NM_015120, intron 12 of 22) 91213 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 134-3 chr1 51737846 51738065 + 0.75 NA intron (NM_148905, intron 1 of 18) MER94|DNA|hAT-Blackjack 8105 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 278.5-45 chr6 36414112 36414539 + 0.75 NA intron (NM_152990, intron 3 of 4) HAL1|LINE|L1 -26525 NM_001207036 51513 Hs.272398 NM_016135 ENSG00000010030 ETV7 TEL-2|TEL2|TELB ETS variant 7 protein-coding 187.75-82 chr5 27401542 27401873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70585 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 126.75-140 chr21 21434134 21434440 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 13 of 18) MamRep605|LTR?|LTR? 287125 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 139.5-18 chr10 92311266 92311590 + 0.75 NA intron (NM_017824, intron 2 of 5) intron (NM_017824, intron 2 of 5) 20261 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 127.75-61 chr14 49229114 49229352 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 357147 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 166.5-168 chr5 105894161 105894470 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 794841 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 143.25-7 chr1 95650965 95651187 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 140960 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 156-141 chr7 42163631 42163994 + 0.75 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 73397 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 165.5-88 chr2 165745781 165746196 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48259 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 144.25-127 chr3 37300578 37300843 + 0.75 NA intron (NM_001172713, intron 10 of 22) L1MC5|LINE|L1 -56515 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 241.5-58 chr20 11199818 11200384 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 73282 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 172-40 chr15 66368004 66368553 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11562 NM_001289986 54962 Hs.744308 NM_017858 ENSG00000075131 TIPIN - TIMELESS interacting protein protein-coding 159.25-43 chr15 69792533 69792940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42498 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 298.75-38 chr9 25898271 25898842 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 118500 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 184-47 chr20 19566507 19566972 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 3 of 16) intron (NM_020689, intron 3 of 16) -282143 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 122.25-91 chr2 102010699 102011077 + 0.75 NA intron (NR_048564, intron 3 of 8) L1MB3|LINE|L1 11927 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 132.75-46 chr12 4912948 4913173 + 0.75 NA 3' UTR (NM_000217, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_000217, exon 2 of 2) 3155 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 175-43 chr15 77014538 77014992 + 0.75 NA intron (NM_001321136, intron 2 of 15) intron (NM_001321136, intron 2 of 15) 19639 NM_001321136 9051 Hs.129758 NM_003978 ENSG00000140368 PSTPIP1 CD2BP1|CD2BP1L|CD2BP1S|H-PIP|PAPAS|PSTPIP proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 1 protein-coding 210-35 chr17 26884769 26885079 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 204317 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 184.5-85 chr2 238785558 238785985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62136 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 148.75-77 chr19 56581494 56581876 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001001668, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001001668, exon 6 of 6) -13611 NM_021216 58491 Hs.301431 NM_021216 ENSG00000197951 ZNF71 EZFIT zinc finger protein 71 protein-coding 188.5-23 chr12 16421138 16421457 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 67880 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 112.5-63 chr12 127350779 127351137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10886 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 167.5-93 chr2 109551295 109551581 + 0.75 NA intron (NM_001321508, intron 5 of 5) L1MC4|LINE|L1 62229 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 127.5-41 chr11 13536101 13536372 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40061 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 169.25-104 chr6 107627368 107627692 + 0.75 NA intron (NM_018013, intron 5 of 6) intron (NM_018013, intron 5 of 6) 104620 NM_001286409 256380 Hs.486109 NM_198081 ENSG00000146285 SCML4 dJ47M23.1 Scm polycomb group protein like 4 protein-coding 196.75-96 chr7 7798287 7798680 + 0.75 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -79876 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 131.75-68 chr14 73683004 73683253 + 0.75 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) AluSp|SINE|Alu 31256 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 168.75-75 chr2 177647663 177648060 + 0.75 NA intron (NM_001077197, intron 20 of 20) AluJr4|SINE|Alu -25461 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 114.25-130 chr3 124456968 124457178 + 0.75 NA intron (NM_001024660, intron 23 of 59) AluSz|SINE|Alu 82741 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 121-107 chr2 155224612 155224846 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 526034 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 160.75-141 chr7 11483061 11483548 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) intron (NM_015204, intron 6 of 26) 348894 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 153-86 chr20 46702998 46703337 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6482 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 161.25-60 chr15 62008497 62008801 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 14 of 81) intron (NM_001018088, intron 14 of 81) 51798 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 182.75-101 chr5 36336576 36336925 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34848 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 134.75-230 chr8 137211622 137211970 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 201792 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 247-36 chr2 132547405 132547859 + 0.75 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 113921 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 155.25-160 chr7 25269049 25269282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40679 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 131.75-152 chr4 53457398 53457700 + 0.75 NA intron (NM_001134938, intron 13 of 14) intron (NM_001134938, intron 13 of 14) -42528 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 245.25-32 chr19 56359450 56359942 + 0.75 NA intron (NM_001322072, intron 2 of 6) L1PA10|LINE|L1 -8403 NR_003127 147947 Hs.467326 NM_194319 ENSG00000240225 ZNF542P ZNF542 zinc finger protein 542, pseudogene pseudo 162.5-181 chr8 119012255 119012563 + 0.75 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L1MC1|LINE|L1 -54838 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 112.25-16 chr10 35363449 35363661 + 0.75 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) intron (NM_001282852, intron 1 of 8) 26681 NM_001282853 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 219-64 chr22 35081402 35081812 + 0.75 NA intron (NM_001303508, intron 2 of 4) intron (NM_001303508, intron 2 of 4) 15449 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 170.25-136 chr6 35669837 35670310 + 0.75 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) -5284 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 143.25-189 chr8 116044576 116044864 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 280339 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 140-146 chr5 164837267 164837519 + 0.75 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 367114 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 165.25-112 chr5 6041711 6042047 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 295413 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 204.5-109 chr5 110918793 110919273 + 0.75 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -151047 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 113.5-167 chr3 193477254 193477434 + 0.75 NA intron (NM_032279, intron 8 of 29) L1MC5|LINE|L1 -75869 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 162.75-68 chr2 67755828 67756241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69528 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 161.5-37 chr11 119177047 119177290 + 0.75 NA intron (NM_001282144, intron 6 of 9) AluSx1|SINE|Alu -8307 NR_033122 79849 Hs.374726 NM_024791 ENSG00000172367 PDZD3 IKEPP|NHERF4|PDZK2 PDZ domain containing 3 protein-coding 159-114 chr8 101381895 101382243 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 13176 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 144.25-64 chr15 72588702 72589035 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 1651 NR_030359 693215 NR_030359 ENSG00000283798 MIR630 MIRN630|hsa-mir-630 microRNA 630 ncRNA 214.75-70 chr6 50979791 50980144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161096 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 187.75-95 chr5 158561495 158561816 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151882 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 121.25-210 chrX 71026328 71026517 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41912 NM_013346 29934 Hs.260750 NM_013346 ENSG00000147164 SNX12 - sorting nexin 12 protein-coding 123-117 chr20 6738672 6738927 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2663 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 113-184 chr8 139400721 139400964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 302281 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 224.5-80 chr3 187755104 187755591 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9879 NM_001706 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 165-125 chr7 1157818 1158142 + 0.75 NA intron (NM_001365381, intron 2 of 4) intron (NM_001365381, intron 2 of 4) 2216 NM_001365381 90637 Hs.648111 NM_182491 ENSG00000178381 ZFAND2A AIRAP zinc finger AN1-type containing 2A protein-coding 144-70 chr20 3532801 3533162 + 0.75 NA intron (NM_001323332, intron 1 of 25) AluY|SINE|Alu 61963 NM_001323332 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 131.75-108 chr2 130823858 130824051 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12960 NM_001367493 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 160.25-21 chr12 20274879 20275158 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -94227 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 133.75-148 chr4 44258366 44258760 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 190246 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 250.5-22 chr12 101519936 101520473 + 0.75 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 44868 NM_152323 121599 Hs.577097 NM_152323 ENSG00000166211 SPIC SPI-C Spi-C transcription factor protein-coding 329.5-9 chr2 40997640 40998369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -485569 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 118.5-97 chr2 56873441 56873660 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -687780 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 214.5-44 chr18 10881107 10881662 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) intron (NM_022068, intron 4 of 51) -121735 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 284-25 chr2 70078344 70078819 + 0.75 NA intron (NR_033872, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 8434 NR_033872 400960 Hs.683864 NR_033872 ENSG00000179818 PCBP1-AS1 - PCBP1 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-142 chr4 66333094 66333299 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56372 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 193.25-59 chr2 114073955 114074343 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94165 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 146-123 chr8 32634786 32634998 + 0.75 NA intron (NM_013960, intron 5 of 12) MIRb|SINE|MIR -11840 NM_013959 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 185.25-25 chr12 119674095 119674665 + 0.75 NA exon (NM_006253, exon 4 of 7) exon (NM_006253, exon 4 of 7) 6247 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 131-130 chr4 47748141 47748443 + 0.75 NA intron (NM_006587, intron 4 of 21) intron (NM_006587, intron 4 of 21) -83053 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 139.25-182 chr7 87636202 87636516 + 0.75 NA intron (NM_138290, intron 1 of 11) L1ME3A|LINE|L1 7961 NM_138290 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 154.25-139 chr6 46180397 46180668 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -9522 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 131.75-55 chr12 95569205 95569438 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -17845 NM_032147 84101 Hs.646421 NM_032147 ENSG00000136014 USP44 - ubiquitin specific peptidase 44 protein-coding 150-92 chr3 98985025 98985396 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83515 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 155.5-31 chr10 101824552 101824892 + 0.75 NA intron (NR_045118, intron 1 of 2) intron (NR_045118, intron 1 of 2) 5654 NR_045118 100289509 Hs.568881 NR_045118 ENSG00000226009 KCNIP2-AS1 - KCNIP2 antisense RNA 1 ncRNA 185.75-93 chr4 113515961 113516413 + 0.75 NA intron (NM_001221, intron 9 of 18) intron (NM_001221, intron 9 of 18) 223348 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 179.5-17 chr10 7321192 7321631 + 0.75 NA intron (NM_001029880, intron 4 of 20) AluY|SINE|Alu 87930 NM_001018039 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 176.25-81 chr20 21140037 21140465 + 0.75 NA intron (NM_018474, intron 3 of 12) intron (NM_018474, intron 3 of 12) 14169 NM_001352435 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 126-110 chr20 49052183 49052452 + 0.75 NA intron (NM_001362762, intron 1 of 24) L2a|LINE|L2 6005 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 136-78 chr2 125778280 125778564 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 339563 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 149-146 chrX 88081520 88081980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 563948 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 121-28 chr10 99423264 99423621 + 0.75 NA intron (NM_002079, intron 1 of 8) intron (NM_002079, intron 1 of 8) 7182 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 144-96 chr5 20317124 20317366 + 0.75 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 11694 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 121.5-105 chr17 42232215 42232422 + 0.75 NA intron (NM_012448, intron 1 of 18) AluSz|SINE|Alu -37824 NM_032484 84514 Hs.38039 NM_032484 ENSG00000167925 GHDC D11LGP1|LGP1 GH3 domain containing protein-coding 207.5-80 chr5 3008170 3008538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90500 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 128-36 chr13 73930117 73930455 + 0.75 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 203643 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 133.5-176 chr4 33775729 33776036 + 0.75 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 264011 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 136.25-43 chr12 83342433 83342631 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 655377 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 181.5-147 chr7 29975606 29976005 + 0.75 NA intron (NM_001145514, intron 1 of 7) intron (NM_001145514, intron 1 of 7) 13996 NM_014766 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 133.5-111 chr2 54427515 54427866 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -28637 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 224.25-27 chr12 132724644 132725339 + 0.75 NA TTS (NM_015114) TTS (NM_015114) 14149 NM_138575 192111 Hs.102558 NM_138575 ENSG00000247077 PGAM5 BXLBV68 PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase protein-coding 264-5 chr1 197050180 197050875 + 0.75 NA intron (NM_001994, intron 10 of 11) intron (NM_001994, intron 10 of 11) 16740 NM_001994 2165 Hs.435782 NM_001994 ENSG00000143278 F13B FXIIIB coagulation factor XIII B chain protein-coding 160.25 chr1 7478598 7479059 + 0.75 NA intron (NM_001349608, intron 5 of 21) intron (NM_001349608, intron 5 of 21) -89074 NR_146201 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 186.5-35 chr14 45219905 45220342 + 0.75 NA intron (NM_018353, intron 11 of 16) AluJo|SINE|Alu 33079 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 166-4 chr1 65837441 65837833 + 0.75 NA intron (NM_002600, intron 1 of 16) intron (NM_002600, intron 1 of 16) 44742 NM_002600 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 131.5-183 chr4 146732016 146732219 + 0.75 NA intron (NR_133922, intron 12 of 13) MER99|DNA|hAT? 93224 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 124-38 chr13 52960858 52961209 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -67780 NM_006418 10562 Hs.508113 NM_006418 ENSG00000102837 OLFM4 GC1|GW112|OLM4|OlfD|UNQ362|bA209J19.1|hGC-1|hOLfD olfactomedin 4 protein-coding 187.25-28 chr13 113773431 113773865 + 0.75 NA intron (NM_182614, intron 3 of 8) intron (NM_182614, intron 3 of 8) 14405 NM_001348663 348013 Hs.280805 NM_182614 ENSG00000184497 TMEM255B FAM70B transmembrane protein 255B protein-coding 193.75-117 chr8 67138093 67138488 + 0.75 NA intron (NM_001363133, intron 15 of 27) MER2|DNA|TcMar-Tigger 54442 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 141.75-34 chr11 56546819 56547288 + 0.75 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 -3796 NM_001005245 219487 Hs.553632 NM_001005245 ENSG00000255223 OR5M11 OR11-199 olfactory receptor family 5 subfamily M member 11 protein-coding 148.5-144 chr3 32444325 32444692 + 0.75 NA intron (NM_181472, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 52655 NM_138410 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 228.75-92 chr9 37687787 37688309 + 0.75 NA intron (NM_001371223, intron 1 of 15) intron (NM_001371223, intron 1 of 15) 20039 NM_001371223 134-175 chr8 127905508 127905775 + 0.75 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 43082 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 153-108 chr4 109530056 109530523 + 0.75 NA exon (NM_001318085, exon 19 of 24) exon (NM_001318085, exon 19 of 24) -29957 NM_017918 55013 Hs.234149 NM_017918 ENSG00000005059 MCUB CCDC109B mitochondrial calcium uniporter dominant negative beta subunit protein-coding 159-20 chr11 26203322 26203669 + 0.75 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) MER34|LTR|ERV1 14372 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 159.75-5 chr1 64592592 64593129 + 0.75 NA intron (NM_020925, intron 3 of 26) intron (NM_020925, intron 3 of 26) 13013 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 269-4 chr1 86748697 86749148 + 0.75 NA TTS (NM_001206651) TTS (NM_001206651) 44346 NM_016009 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 117-94 chr2 124995572 124995843 + 0.75 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 970420 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 148-103 chr5 83764276 83764483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43524 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 239-9 chr10 14852208 14852602 + 0.75 NA exon (NM_016299, exon 8 of 14) exon (NM_016299, exon 8 of 14) 14099 NM_016299 51182 Hs.534169 NM_016299 ENSG00000187522 HSPA14 HSP70-4|HSP70L1 heat shock protein family A (Hsp70) member 14 protein-coding 118.5-210 chr8 36483795 36484054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -300450 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 160.75-17 chr10 51816472 51816949 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -117115 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 126.5-179 chr4 99528264 99528475 + 0.75 NA intron (NM_032149, intron 4 of 8) L1M5|LINE|L1 17348 NM_032149 84103 Hs.97501 NM_032149 ENSG00000138813 C4orf17 - chromosome 4 open reading frame 17 protein-coding 143.75-140 chr5 23004356 23004597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151132 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 178-26 chr14 33329740 33330245 + 0.75 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) -378945 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 187.5-157 chr7 49332341 49332727 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 407987 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 138.25-178 chr9 90032462 90032748 + 0.75 NA intron (NR_038882, intron 2 of 3) intron (NR_038882, intron 2 of 3) 8894 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 153.5-153 chr5 22422954 22423384 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -209319 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 184.25-114 chr7 36127295 36127720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25747 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 142-76 chr19 33049492 33049792 + 0.75 NA intron (NM_033103, intron 1 of 14) intron (NM_033103, intron 1 of 14) 15246 NM_033103 85415 Hs.466435 NM_033103 ENSG00000131941 RHPN2 P76RBE|RHOBP rhophilin Rho GTPase binding protein 2 protein-coding 166.5-108 chr2 132624520 132624980 + 0.75 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) L1ME3A|LINE|L1 45455 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 141.75-61 chr15 62688227 62688469 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 9 of 55) L1MDa|LINE|L1 41037 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 115-50 chr14 71727732 71727971 + 0.75 NA intron (NM_001354286, intron 20 of 24) intron (NM_001354286, intron 20 of 24) 141553 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 168.25-97 chr3 48230643 48230876 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 7264 NM_004345 820 Hs.51120 NM_004345 ENSG00000164047 CAMP CAP-18|CAP18|CRAMP|FALL-39|FALL39|HSD26|LL37 cathelicidin antimicrobial peptide protein-coding 224.25-37 chr17 50551381 50551761 + 0.75 NA exon (NM_001258373, exon 13 of 17) exon (NM_001258373, exon 13 of 17) 4397 NM_022827 64847 Hs.103147 NM_022827 ENSG00000006282 SPATA20 HEL-S-98|SSP411|Tisp78 spermatogenesis associated 20 protein-coding 141.25-161 chr6 111076665 111076916 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10713 NM_018593 117247 Hs.591327 NM_018593 ENSG00000112394 SLC16A10 MCT10|PRO0813|TAT1 solute carrier family 16 member 10 protein-coding 165-153 chr9 93952749 93953049 + 0.75 NA exon (NM_021570, exon 2 of 4) exon (NM_021570, exon 2 of 4) 2456 NM_021570 56033 Hs.164960 NM_021570 ENSG00000131668 BARX1 - BARX homeobox 1 protein-coding 161.25-181 chr9 37560528 37560886 + 0.75 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) intron (NM_012166, intron 1 of 10) 15673 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 123.75-35 chr12 21065973 21066192 + 0.75 NA intron (NM_001009562, intron 10 of 12) intron (NM_001009562, intron 10 of 12) 50386 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 134.75-66 chr14 55966700 55966903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -151610 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 119-207 chr9 81399066 81399358 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 290323 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 132.25-13 chr1 155383006 155383282 + 0.75 NA intron (NM_001366177, intron 7 of 27) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -36699 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 159.75-113 chr3 185831621 185831946 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -6741 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 168-4 chr1 64858074 64858517 + 0.75 NA intron (NM_002227, intron 9 of 24) L2b|LINE|L2 108254 NM_001321855 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 115.5-27 chr10 106522140 106522439 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 382124 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 183.75-94 chr5 28058339 28058799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 229096 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 227.75-32 chr2 38775146 38775567 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2854 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 145-100 chr3 123266775 123267160 + 0.75 NA intron (NM_012430, intron 6 of 6) L1MD1|LINE|L1 65024 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 244.5-69 chr3 111985111 111985588 + 0.75 NA intron (NM_001272069, intron 2 of 5) intron (NM_001272069, intron 2 of 5) 6323 NM_001272069 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 175.25-97 chr3 132717215 132717514 + 0.75 NA intron (NR_037804, intron 3 of 44) intron (NR_037804, intron 3 of 44) -4386 NR_152743 348808 Hs.586111 NR_002811 ENSG00000248724 NPHP3-AS1 NCRNA00119 NPHP3 antisense RNA 1 ncRNA 137-63 chr17 62894306 62894542 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49791 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 138.5-184 chr7 56126549 56126742 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10228 NM_001145712 389493 Hs.177948 NM_001145712 ENSG00000185290 NUPR2 NUPR1L nuclear protein 2, transcriptional regulator protein-coding 128.5-126 chr21 17065006 17065245 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -373765 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 139-10 chr1 244131160 244131483 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 78116 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 192.75-54 chr2 16400900 16401306 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 264731 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 122-10 chr1 96193180 96193457 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 180807 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 200.5-52 chr17 29083773 29084096 + 0.75 NA intron (NM_001346767, intron 38 of 39) intron (NM_001346767, intron 38 of 39) -8325 NM_004740 9220 Hs.462590 NM_004740 ENSG00000221995 TIAF1 MAJN|SPR210 TGFB1-induced anti-apoptotic factor 1 protein-coding 116.75-54 chr13 109875058 109875282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -88587 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 187-45 chr2 154498517 154498916 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -41278 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 132.75-11 chr1 151921414 151921598 + 0.75 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -11995 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 224.25-65 chr4 46617105 46617628 + 0.75 NA Intergenic MER107|DNA|hAT-Charlie -227238 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 114.25-203 chr9 27586192 27586456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12458 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 123-166 chr5 166302644 166302881 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 623608 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 150.25-42 chr12 66084779 66085201 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 45760 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 170.5-186 chr8 86380520 86381024 + 0.75 NA exon (NM_007013, exon 4 of 25) exon (NM_007013, exon 4 of 25) 38225 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 132.5-102 chr19 755196 755401 + 0.75 NA intron (NR_135168, intron 1 of 3) intron (NR_135168, intron 1 of 3) 4186 NM_173481 126353 Hs.439180 NM_173481 ENSG00000099812 MISP C19orf21|MISP1 mitotic spindle positioning protein-coding 182.25-102 chr6 96626961 96627272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63991 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 269.5-58 chr8 61009600 61010188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42146 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 177.75-113 chr5 68640247 68640627 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 347860 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 228-84 chr8 117608544 117608895 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 88006 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 129.75-81 chr18 8431933 8432275 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65070 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 153.5-164 chr5 144288844 144289095 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 83578 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 191-9 chr10 89347973 89348414 + 0.75 NA Intergenic MER68-int|LTR|ERVL 15664 NM_001031683 3437 Hs.47338 NM_001549 ENSG00000119917 IFIT3 CIG-49|GARG-49|IFI60|IFIT4|IRG2|ISG60|P60|RIG-G|cig41 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 protein-coding 128-31 chr12 51956834 51957039 + 0.75 NA intron (NM_020327, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 3556 NM_020327 91 Hs.438918 NM_004302 ENSG00000135503 ACVR1B ACTRIB|ACVRLK4|ALK4|SKR2 activin A receptor type 1B protein-coding 223.75-2 chr1 119195583 119195909 + 0.75 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -55074 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 172.75-122 chr7 151914834 151915185 + 0.75 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -37894 NM_016203 51422 Hs.647072 NM_016203 ENSG00000106617 PRKAG2 AAKG|AAKG2|CMH6|H91620p|WPWS protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 2 protein-coding 183.5-31 chr11 85405860 85406190 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 221245 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 164.25-69 chr2 76112488 76112734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -401696 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 193-35 chr18 77215345 77215774 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -34289 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 166.5-14 chr1 168987280 168987637 + 0.75 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) intron (NR_104091, intron 3 of 4) 99547 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 170.75-100 chr4 74686501 74686884 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 107831 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 251.5-26 chr15 42447468 42447955 + 0.75 NA intron (NM_001366844, intron 4 of 19) intron (NM_001366844, intron 4 of 19) 9856 NM_022473 64397 Hs.511143 NM_022473 ENSG00000103994 ZNF106 SH3BP3|ZFP106|ZNF474 zinc finger protein 106 protein-coding 122.5-236 chr9 127031117 127031344 + 0.75 NA intron (NM_001190729, intron 4 of 17) intron (NM_001190729, intron 4 of 17) 69005 NM_001366401 9649 Hs.432842 NM_014636 ENSG00000136828 RALGPS1 RALGEF2|RALGPS1A Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 protein-coding 218.75-68 chr5 35491832 35492345 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -125775 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 152.25-49 chr14 47228412 47228826 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 114627 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 178.5-42 chr13 84104478 84104891 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35918 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 147.25-97 chr4 92330560 92330876 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26319 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 173.5-93 chr3 5074141 5074530 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47957 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 172.25-12 chr1 232345471 232345913 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 169916 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 213.25-30 chr2 56341340 56341767 + 0.75 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -155783 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 120.25-179 chr6 26861989 26862213 + 0.75 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 94453 NR_003504 387036 Hs.675815 NM_001033523 ENSG00000241549 GUSBP2 GUSBL1|GUSBP4|SMA3-L|SMAC3L|SMAC3L2|b55C20.1|bA239L20.1|bA239L20.5|bGLU-Lp GUSB pseudogene 2 pseudo 171.5-166 chr9 73984958 73985388 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -386358 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 189.5-27 chr11 15373873 15374275 + 0.75 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 224972 NM_001278314 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 165.25-52 chr16 78772049 78772389 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) L1PREC2|LINE|L1 672565 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 146.75-135 chr5 153549253 153549518 + 0.75 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) intron (NM_001258020, intron 3 of 16) 57213 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 143.25-74 chr18 6948740 6949017 + 0.75 NA intron (NM_005559, intron 59 of 62) intron (NM_005559, intron 59 of 62) -5799 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 154.5-16 chr1 210821244 210821508 + 0.75 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 311998 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 159.25-160 chr9 31487254 31487593 + 0.75 NA Intergenic L1P4b|LINE|L1 -105933 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 149.5-120 chr3 37346609 37346929 + 0.75 NA intron (NM_001172713, intron 20 of 22) L1ME3E|LINE|L1 -39500 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 135.75-108 chr2 137036686 137037001 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 271298 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 254.75-4 chr10 5188510 5188931 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3533 NR_027916 340811 Hs.282513 NM_001007536 ENSG00000264006 AKR1C8P AKR1CL1 aldo-keto reductase family 1 member C8, pseudogene pseudo 169-113 chr9 94673229 94673667 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -33199 NM_001127628 2203 Hs.494496 NM_000507 ENSG00000165140 FBP1 FBP fructose-bisphosphatase 1 protein-coding 147-33 chr14 69585394 69585721 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10686 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 217-24 chr15 63423114 63423678 + 0.75 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) intron (NR_120375, intron 4 of 6) 33166 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 182 chr1 5040972 5041257 + 0.75 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 386505 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 148.25-61 chr18 33251818 33252109 + 0.75 NA intron (NM_001308126, intron 14 of 23) L2|LINE|L2 188608 NM_001371121 141.25-74 chr18 64240665 64240960 + 0.75 NA intron (NR_033983, intron 2 of 2) intron (NR_033983, intron 2 of 2) 19243 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 154.5-90 chr2 13819893 13820209 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 580907 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 155.25-56 chr14 40154563 40155020 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -722291 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 170.5-154 chr6 36314758 36315030 + 0.75 NA TTS (NM_001010903) TTS (NM_001010903) 21994 NM_001010903 389384 Hs.162104 NM_001010903 ENSG00000189325 BNIP5 C6orf222 BCL2 interacting protein 5 protein-coding 157.25-102 chr3 182494821 182495085 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8591 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 137.25-173 chr8 127615147 127615369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118709 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 181.5-135 chr5 145101065 145101518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 734051 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 149.5-75 chr17 35150116 35150456 + 0.75 NA intron (NM_001033576, intron 4 of 19) intron (NM_001033576, intron 4 of 19) 2022 NM_173167 146862 Hs.379636 NM_173167 ENSG00000141161 UNC45B CMYA4|CTRCT43|SMUNC45|UNC-45B|UNC45 unc-45 myosin chaperone B protein-coding 189.5-60 chr17 79636722 79637029 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -25824 NM_001350453 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 130.5-197 chr5 25537203 25537457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 346377 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 157-114 chr7 80755750 80756142 + 0.75 NA intron (NM_006379, intron 15 of 17) intron (NM_006379, intron 15 of 17) 109293 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 124-172 chr8 133397730 133397985 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -100553 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 169.75-6 chr1 192178926 192179376 + 0.75 NA intron (NM_130782, intron 3 of 4) intron (NM_130782, intron 3 of 4) 20689 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 203.5-114 chr5 67504863 67505398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 141659 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 153.5-168 chr6 10598263 10598700 + 0.75 NA intron (NM_145655, intron 1 of 2).2 intron (NM_145655, intron 1 of 2).2 12721 NM_145655 2651 Hs.519884 NM_001491 ENSG00000111846 GCNT2 CCAT|CTRCT13|GCNT2C|GCNT5|IGNT|II|NACGT1|NAGCT1|ULG3|bA360O19.2|bA421M1.1 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2 (I blood group) protein-coding 166.75-48 chr14 62020700 62021071 + 0.75 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) 93190 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 122.25-22 chr10 42729070 42729331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25942 NR_134498 105378269 Hs.448616 NR_134498 LOC105378269 - uncharacterized LOC105378269 ncRNA 138.25-40 chr12 59357075 59357291 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -238846 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 116.25-184 chr5 118780525 118780779 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 184464 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 112.5-237 chr8 123595023 123595281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53946 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 224.25-101 chr7 108581501 108581960 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 11856 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 152-64 chr17 47817956 47818353 + 0.75 NA intron (NM_145798, intron 7 of 22) intron (NM_145798, intron 7 of 22) 3640 NM_145798 114881 Hs.463320 NM_017731 ENSG00000006025 OSBPL7 ORP7 oxysterol binding protein like 7 protein-coding 141-70 chr2 22202121 22202340 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -334249 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 135.5-8 chr1 96109441 96109686 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 117495 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 221.25-8 chr1 207470640 207471030 + 0.75 NA exon (NM_001877, exon 7 of 19) exon (NM_001877, exon 7 of 19) 16507 NM_001877 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 173.75-114 chr4 30156567 30156822 + 0.75 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -563675 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 139-48 chr16 51484723 51485077 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -277619 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 167.25-35 chr14 42727720 42727983 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1120995 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 142.25-133 chr5 20535764 20536018 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1MEc|LINE|L1 39822 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 172.75-110 chr6 73170562 73171008 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 11 of 13) AluSx1|SINE|Alu -27271 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 137.75-161 chr5 11312884 11313188 + 0.75 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 275881 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 217.75-42 chr20 9017751 9018125 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51116 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 190-23 chr17 60463881 60464275 + 0.75 NA exon (NM_001282476, exon 5 of 12) exon (NM_001282476, exon 5 of 12) 41589 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 148.5-191 chr5 158012019 158012409 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -153069 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 171.5-8 chr1 246011375 246011824 + 0.75 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 405813 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 149-37 chr15 69225771 69226114 + 0.75 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) intron (NM_001324092, intron 2 of 3) 65307 NM_001324094 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 152-157 chr9 37097798 37098033 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 18019 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 121.75-161 chr6 89898570 89898950 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 4291 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 129.75-80 chr18 5943400 5943604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47548 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 183-33 chr14 96978975 96979256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35536 NR_104113 145249 Hs.592323 NR_104113 ENSG00000225163 LINC00618 C14orf63 long intergenic non-protein coding RNA 618 ncRNA 124.75-131 chr20 52828050 52828376 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -144145 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 133.75-22 chr10 70420398 70420720 + 0.75 NA intron (NM_004096, intron 2 of 2) intron (NM_004096, intron 2 of 2) 16414 NM_004096 1979 Hs.621200 NM_004096 ENSG00000148730 EIF4EBP2 4EBP2|PHASII eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 protein-coding 201.25-32 chr14 65490461 65490872 + 0.75 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 19564 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 148.75-144 chr6 41584559 41584825 + 0.75 NA intron (NM_001012427, intron 3 of 16) intron (NM_001012427, intron 3 of 16) -14031 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 168-126 chr8 101900978 101901299 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 4 of 7) L1MD2|LINE|L1 -83294 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 144-92 chr4 55864765 55865101 + 0.75 NA intron (NM_001024924, intron 4 of 18) MIR|SINE|MIR 11283 NM_018261 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 126.25-112 chr3 41201060 41201254 + 0.75 NA intron (NM_001904, intron 1 of 14) intron (NM_001904, intron 1 of 14) 1652 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 122.25-208 chr9 83038555 83038885 + 0.75 NA intron (NM_152573, intron 1 of 16) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 24422 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 343-10 chr17 60158838 60159489 + 0.75 NA intron (NR_137422, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR 9190 NM_000717 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 154.5-44 chr12 16495238 16495667 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 109927 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 213.25-24 chr17 60229223 60229695 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 12 of 33) intron (NM_032582, intron 12 of 33) 2186 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 155-15 chr10 53392112 53392495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -620603 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 174.25-44 chr13 110588340 110588604 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -26750 NM_017817 55647 Hs.743563 NM_017817 ENSG00000139832 RAB20 - RAB20, member RAS oncogene family protein-coding 149.75-111 chr3 75172803 75173067 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41541 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 146.5-120 chr2 205395229 205395453 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) L2a|LINE|L2 -287159 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 131.25-223 chrX 48083617 48083945 + 0.75 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL -12123 NM_001282201 57232 Hs.650883 NM_001037735 ENSG00000221994 ZNF630 dJ54B20.2 zinc finger protein 630 protein-coding 170.25-67 chr2 86423875 86424318 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -17275 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 157-26 chr12 99611945 99612202 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 9 of 25) intron (NM_152788, intron 9 of 25) -35680 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 175.5-126 chr3 158064920 158065390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41008 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 132.75-198 chr9 32516246 32516569 + 0.75 NA intron (NM_014314, intron 1 of 17) LOR1b|LTR|ERV1 9789 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 191-86 chr8 139655231 139655560 + 0.75 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 47728 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 191.75-118 chr7 67844122 67844494 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -175945 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 124.25-201 chr8 99075705 99076104 + 0.75 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) L1M2|LINE|L1 62638 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 151.25-9 chr1 192013913 192014199 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -144406 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 216-40 chr2 68591396 68591820 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51980 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 163.25-145 chr8 144558393 144558684 + 0.75 NA intron (NM_025251, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu -29427 NM_001001795 414919 Hs.105685 NM_001001795 ENSG00000213563 C8orf82 - chromosome 8 open reading frame 82 protein-coding 112.5-9 chr1 158840653 158840917 + 0.75 NA intron (NM_002432, intron 1 of 6) L1MEh|LINE|L1 9434 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 185-38 chr2 9387498 9388022 + 0.75 NA intron (NM_003887, intron 21 of 27) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 34831 NR_134951 9270 Hs.467662 NM_004763 ENSG00000119185 ITGB1BP1 ICAP-1A|ICAP-1B|ICAP-1alpha|ICAP1|ICAP1A|ICAP1B integrin subunit beta 1 binding protein 1 protein-coding 212-76 chr7 29512059 29512348 + 0.75 NA intron (NM_001293081, intron 6 of 6) intron (NM_001293081, intron 6 of 6) 28387 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 212.75-80 chr5 100649708 100650214 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 114587 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 216.5-40 chr16 19128774 19129139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14992 NR_028028 162073 Hs.530899 NM_001034841 ENSG00000205730 ITPRIPL2 - ITPRIP like 2 protein-coding 250.5-51 chr2 197680478 197680991 + 0.75 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -5147 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 192.75-51 chr18 75956829 75957174 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -165997 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 150-44 chr14 70327183 70327420 + 0.75 NA intron (NM_016468, intron 3 of 3) MIR3|SINE|MIR 32382 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 145.75-56 chr16 73853627 73853891 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 361762 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 212.75-44 chr17 71501651 71501977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -299635 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 147-84 chr20 31498639 31498889 + 0.75 NA Intergenic (CAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12986 NR_024358 140875 Hs.283478 NR_024358 ENSG00000233354 LINC00028 C20orf93|NCRNA00028|dJ1093G12.6 long intergenic non-protein coding RNA 28 ncRNA 236.5-94 chr8 85852182 85852579 + 0.75 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -24438 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 212.75-93 chr7 49278126 49278621 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 353826 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 153-26 chr12 15466869 15467084 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR -79635 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 208.5-82 chr20 59578888 59579339 + 0.75 NA intron (NM_001199505, intron 1 of 12) intron (NM_001199505, intron 1 of 12) 1604 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 138.5-111 chr2 202483608 202484012 + 0.75 NA intron (NM_001204, intron 3 of 12) AluJr|SINE|Alu 107483 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 144.5-101 chr2 37822294 37822588 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 7270 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 170.25-79 chr2 196052044 196052333 + 0.75 NA intron (NM_018897, intron 2 of 64) LTR41C|LTR|ERVL 16649 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 228-88 chr9 112087714 112088288 + 0.75 NA intron (NM_022486, intron 10 of 16) L1MC4|LINE|L1 87296 NM_001282643 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 156-135 chr6 133827189 133827536 + 0.75 NA intron (NR_027030, intron 1 of 2) intron (NR_027030, intron 1 of 2) 6215 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 153-13 chr10 75074346 75074625 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -15902 NM_001003892 338599 Hs.535090 NM_001003892 ENSG00000188716 DUPD1 DUSP27|FMDSP dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 protein-coding 160.75-146 chr7 52744962 52745384 + 0.75 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -290460 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 158.25-54 chr2 7523748 7524106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102666 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 116.5-168 chr3 187710122 187710377 + 0.75 NA intron (NR_034062, intron 1 of 2) MLT2B1|LTR|ERVL -7692 NM_001004312 344892 Hs.567872 NM_001004312 ENSG00000198471 RTP2 Z3CXXC2 receptor transporter protein 2 protein-coding 146.25-158 chr8 124045348 124045674 + 0.75 NA TTS (NR_103547) TTS (NR_103547) -4729 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 224.5-2 chr1 15874701 15875167 + 0.75 NA intron (NM_015001, intron 2 of 14) intron (NM_015001, intron 2 of 14) -26787 NR_024279 729614 Hs.119298 NR_024279 ENSG00000179743 FLJ37453 - uncharacterized LOC729614 ncRNA 218.25-33 chr17 55440930 55441529 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19394 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 158-125 chr7 3170055 3170343 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11626 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 231.25-37 chr2 54889812 54890254 + 0.75 NA intron (NM_001039753, intron 16 of 40) intron (NM_001039753, intron 16 of 40) 120239 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 196.5-49 chr14 56212408 56212866 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) LSU-rRNA_Hsa|rRNA|rRNA 94226 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 184-99 chr8 139470191 139470697 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 232679 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 124.5-89 chr18 44503346 44503771 + 0.75 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) intron (NR_110792, intron 2 of 4) 28139 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 160.25-141 chr6 71976232 71976593 + 0.75 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 89709 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 135.5-197 chr8 76773884 76774193 + 0.75 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -90763 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 129.25-149 chr5 31668927 31669236 + 0.75 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) MER20|DNA|hAT-Charlie 29950 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 141.25-98 chr20 52115488 52115790 + 0.75 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu -10155 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 227.75-43 chr2 158259028 158259448 + 0.75 NA intron (NM_138803, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 92588 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 121-97 chr2 16930383 16930654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -264684 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 165-23 chr11 38463501 38463780 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182716 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 122.5-202 chr6 152898678 152898969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84218 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 130.25-75 chr16 6828752 6828987 + 0.75 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) MER41E|LTR|ERV1 55060 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 120-205 chrX 42582095 42582390 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 195921 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 168.75-54 chr15 68883612 68883940 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -46724 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 181.75-100 chr5 2573941 2574247 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -138497 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 119.25-110 chr20 39811342 39811656 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -192962 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 167-78 chr3 71082925 71083188 + 0.75 NA intron (NR_146142, intron 7 of 19) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -18132 NM_001244813 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 166.25-57 chr16 64443734 64444178 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 678107 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 177-5 chr1 186717057 186717351 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36550 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 183.5-15 chr1 236762180 236762570 + 0.75 NA intron (NM_001278344, intron 22 of 22) intron (NM_001278344, intron 22 of 22) -32906 NM_001291939 4548 Hs.498187 NM_000254 ENSG00000116984 MTR HMAG|MS|cblG 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase protein-coding 228.25-16 chr12 17055129 17055559 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 66597 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 124.5-159 chr4 179004218 179004527 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1096436 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 142.25-21 chr10 82209774 82210153 + 0.75 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 22957 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 272.75-7 chr11 109748196 109748673 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 326244 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 141-52 chr15 87967390 87967629 + 0.75 NA intron (NM_001320135, intron 12 of 15) intron (NM_001320135, intron 12 of 15) -21241 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 118.5-171 chr5 162620453 162620737 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 552953 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 180.25-85 chr4 74813448 74813838 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19120 NM_001316963 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 136-49 chr16 71293501 71293874 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3965 NM_001324377 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 231.75-27 chr17 61226683 61227145 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 140790 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 127.5-92 chr15 89136038 89136309 + 0.75 NA intron (NM_007011, intron 7 of 14) AluSq2|SINE|Alu 47717 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 146.75-57 chr16 58022263 58022573 + 0.75 NA TTS (NM_024598) TTS (NM_024598) -3336 NM_002428 4324 Hs.80343 NM_002428 ENSG00000102996 MMP15 MMP-15|MT2-MMP|MT2MMP|MTMMP2|SMCP-2 matrix metallopeptidase 15 protein-coding 138.5-177 chr6 141216872 141217168 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 533206 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 138-79 chr2 86395853 86396106 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45392 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 241-43 chr6 34942127 34942577 + 0.75 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 53097 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 132.75-40 chr11 101621415 101621611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37506 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 260-13 chr18 80011916 80012335 + 0.75 NA intron (NM_001305564, intron 1 of 2) LTR14C|LTR|ERVK 21811 NM_001305563 10907 Hs.465498 NM_006701 ENSG00000141759 TXNL4A BMKS|DIB1|DIM1|SNRNP15|TXNL4|U5-15kD thioredoxin like 4A protein-coding 125.25-22 chr10 16442958 16443296 + 0.75 NA intron (NM_001261837, intron 2 of 4) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 6184 NM_001261838 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 143.75-163 chr6 161912725 161913146 + 0.75 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) AluSq|SINE|Alu 441958 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 128.25-17 chr10 72638783 72639128 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -12764 NM_006077 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 249-14 chr15 62807639 62808220 + 0.75 NA intron (NM_015059, intron 48 of 55) intron (NM_015059, intron 48 of 55) -16028 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 193.75-53 chr15 100293423 100293887 + 0.75 NA intron (NM_139057, intron 3 of 21) intron (NM_139057, intron 3 of 21) 48320 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 114.75-131 chr3 147131815 147132030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 209999 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 160.25-54 chr17 55765945 55766229 + 0.75 NA intron (NM_001102402, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 14982 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 116.75-158 chr5 2933062 2933316 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15335 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 227.5-57 chr2 105974850 105975259 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -90634 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 130.25-209 chr8 130570983 130571285 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -127460 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 173.75-67 chr17 45226417 45226862 + 0.75 NA intron (NM_005892, intron 1 of 26) MIR|SINE|MIR 4754 NM_005892 752 Hs.100217 NM_005892 ENSG00000184922 FMNL1 C17orf1|C17orf1B|FHOD4|FMNL|KW-13 formin like 1 protein-coding 137-132 chr5 26001754 26002051 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 810949 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 131.25-201 chr8 118300056 118300307 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L1MA5A|LINE|L1 -188362 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 169-63 chr3 156734087 156734398 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 57578 NM_001184718 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 175-24 chr11 95764240 95764584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25370 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 200.5-146 chr9 106503337 106503712 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -97404 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 125.75-62 chr16 8791147 8791409 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 6361 NM_015421 25880 Hs.513330 NM_015421 ENSG00000184857 TMEM186 C16orf51 transmembrane protein 186 protein-coding 135.75-102 chr2 118705798 118706226 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -103046 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 169.75-82 chr2 116560951 116561394 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 1217357 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 187.5-57 chr14 52354359 52354798 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 40266 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 175.5-154 chr8 28138144 28138528 + 0.75 NA intron (NM_018091, intron 10 of 14) intron (NM_018091, intron 10 of 14) 45197 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 195.75-19 chr10 28679384 28679727 + 0.75 NA intron (NM_012342, intron 1 of 2) intron (NM_012342, intron 1 of 2) 2034 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 138.5-2 chr1 23261668 23261910 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 23729 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 232.25-74 chr7 88807333 88807750 + 0.75 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -11804 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 174.75-50 chr18 71085009 71085392 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -434246 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 145-163 chr8 140006404 140006713 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) L1MB8|LINE|L1 93977 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 159.25-98 chr4 31164712 31165151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6213 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 183.75-56 chr2 70709681 70710106 + 0.75 NA intron (NM_001185055, intron 1 of 11) intron (NM_001185055, intron 1 of 11) 57822 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 179-86 chr8 4516584 4517056 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) intron (NM_033225, intron 2 of 69) 478094 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 225.75-63 chr5 90283527 90283863 + 0.75 NA intron (NR_120601, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 6376 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 192.75-56 chr2 40963804 40964229 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -451581 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 138-61 chr17 61359679 61359894 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluSx|SINE|Alu 7918 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 158.25-36 chr13 23467766 23468020 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1619 NR_038995 100506697 Hs.50118 NR_038995 ENSG00000232977 LINC00327 NCRNA00327 long intergenic non-protein coding RNA 327 ncRNA 156.75-155 chr7 33866266 33866642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38461 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 120.5-75 chr14 87749315 87749547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94137 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 201.5-104 chr5 15174652 15174989 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 91740 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 135-24 chr11 56466253 56466519 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -2985 NM_001004743 390162 Hs.553749 NM_001004743 ENSG00000150269 OR5M9 OR11-190 olfactory receptor family 5 subfamily M member 9 protein-coding 145.25-63 chr18 50911036 50911229 + 0.75 NA intron (NM_002396, intron 3 of 15) intron (NM_002396, intron 3 of 15) 32014 NM_001168335 4200 Hs.233119 NM_002396 ENSG00000082212 ME2 ODS1 malic enzyme 2 protein-coding 291.25-30 chr7 88135905 88136456 + 0.75 NA intron (NM_001324421, intron 14 of 28) intron (NM_001324421, intron 14 of 28) -80480 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 115.5-133 chr2 144221001 144221271 + 0.75 NA intron (NM_001164629, intron 2 of 11) intron (NM_001164629, intron 2 of 11) -9557 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 175.75-128 chr9 18056541 18056991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -417387 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 133.5-225 chr6 37520533 37520729 + 0.75 NA intron (NR_126057, intron 1 of 3) AluSc8|SINE|Alu 13283 NR_126057 100505530 Hs.582978 NM_001039791 LINC02520 - long intergenic non-protein coding RNA 2520 ncRNA 205-48 chr3 32065003 32065570 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41225 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 166.5-31 chr10 70962333 70962708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23467 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 128.25-50 chr14 50176484 50176721 + 0.75 NA intron (NM_006939, intron 7 of 22) MIRb|SINE|MIR 54976 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 247.5-52 chr3 31166418 31166841 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -4842 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 183-7 chr10 11889061 11889528 + 0.75 NA intron (NR_038222, intron 1 of 5) L1MC4|LINE|L1 5416 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-187 chr8 126037795 126038281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86841 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 286-13 chr17 57708538 57709218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36421 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 182.75-138 chr8 129199357 129199774 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 41675 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 237.75-44 chr2 162197463 162197991 + 0.75 NA intron (NM_004460, intron 16 of 25) intron (NM_004460, intron 16 of 25) -45480 NM_002054 2641 Hs.516494 NM_002054 ENSG00000115263 GCG GLP-1|GLP1|GLP2|GRPP glucagon protein-coding 126.75-123 chr2 215276111 215276304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -35852 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 134.75-138 chr3 13284029 13284437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136089 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 163-129 chr9 128872767 128873172 + 0.75 NA intron (NM_001352997, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 8981 NM_004059 883 Hs.495250 NM_004059 ENSG00000171097 KYAT1 CCBL1|GTK|KAT1|KATI kynurenine aminotransferase 1 protein-coding 123.75-65 chr14 80231925 80232153 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_000793) promoter-TSS (NM_000793) -982 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 172.25-42 chr15 83275141 83275375 + 0.75 NA intron (NM_001717, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 8199 NM_001301206 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 118-54 chr14 72262286 72262621 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -254367 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 129.5-120 chr2 68176254 68176477 + 0.75 NA TTS (NM_001329916) TTS (NM_001329916) 18477 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 126.75-203 chr5 141129814 141130021 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -5289 NM_015669 26167 Hs.119693 NM_015669 ENSG00000113209 PCDHB5 PCDH-BETA5 protocadherin beta 5 protein-coding 238-56 chr5 110743042 110743551 + 0.75 NA intron (NM_138773, intron 2 of 7) intron (NM_138773, intron 2 of 7) 4289 NM_138773 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 162.25-9 chr1 105399674 105399982 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 219107 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 210.5-133 chr8 105066995 105067477 + 0.75 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 -251202 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 114.75-37 chr11 99810413 99810608 + 0.75 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 254365 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 130.75-105 chr20 16613268 16613604 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39988 NM_024704 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 197-45 chr3 99802460 99802843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15211 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 143.75-200 chr9 111761237 111761691 + 0.75 NA intron (NM_173521, intron 3 of 25) AluSx1|SINE|Alu -1928 NM_001080551 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 118.75-137 chr4 79387584 79387810 + 0.75 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 20531 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 201.75-115 chrX 99869765 99870113 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 540334 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 124.5-243 chr9 83992686 83992896 + 0.75 NA intron (NM_001358293, intron 2 of 3) L1MD|LINE|L1 11986 NM_024945 80010 Hs.726327 NM_024945 ENSG00000178966 RMI1 BLAP75|C9orf76|FAAP75 RecQ mediated genome instability 1 protein-coding 247.75-36 chr22 28457454 28457850 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -2217 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 145.5-119 chr21 31702957 31703213 + 0.75 NA intron (NM_020706, intron 4 of 19) intron (NM_020706, intron 4 of 19) 29033 NM_001145444 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 196.25-99 chr5 114491994 114492444 + 0.75 NA intron (NR_130785, intron 4 of 12) intron (NR_130785, intron 4 of 12) 58708 NM_170775 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 147-104 chr4 113754720 113754931 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001321592, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001321592, exon 3 of 3) 6913 NM_001321567 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 117-158 chr6 54187770 54188022 + 0.75 NA intron (NM_001281746, intron 9 of 11) AluSc|SINE|Alu 76453 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 206.5-89 chr5 7689321 7689704 + 0.75 NA intron (NM_020546, intron 4 of 24) intron (NM_020546, intron 4 of 24) 161621 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 145.25-84 chr2 225880062 225880280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262623 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 141.25-51 chr14 57045602 57045831 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 223189 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 124-22 chr11 14498775 14499033 + 0.75 NA exon (NM_001144062, exon 2 of 22) exon (NM_001144062, exon 2 of 22) 954 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 145.25-139 chr5 158321263 158321663 + 0.75 NA non-coding (NR_109888, exon 7 of 7) non-coding (NR_109888, exon 7 of 7) 88310 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 221.25-72 chr5 96882108 96882616 + 0.75 NA intron (NM_001329229, intron 2 of 17) intron (NM_001329229, intron 2 of 17) 6423 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 135.5-34 chr11 43961396 43961759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18940 NM_001145033 387763 Hs.530443 NM_001145033 ENSG00000187479 C11orf96 AG2 chromosome 11 open reading frame 96 protein-coding 153.75-57 chr18 5811812 5812034 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28772 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 139.5-202 chr7 73737188 73737485 + 0.75 NA exon (NM_148912, exon 4 of 6) exon (NM_148912, exon 4 of 6) 1531 NR_135627 83451 Hs.647045 NM_148912 ENSG00000106077 ABHD11 PP1226|WBSCR21 abhydrolase domain containing 11 protein-coding 183.75-90 chr4 147354952 147355364 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10441 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 135-157 chr6 86508588 86508928 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -428770 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 115.5-107 chr19 46651962 46652242 + 0.75 NA intron (NM_001301046, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 2616 NM_001301046 147906 Hs.515490 NM_145056 ENSG00000197380 DACT3 DAPPER3|RRR1 dishevelled binding antagonist of beta catenin 3 protein-coding 125.75-145 chr5 8695670 8696076 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -143859 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 158.25-149 chr8 133213354 133213631 + 0.75 NA intron (NM_001204869, intron 2 of 2) intron (NM_001204869, intron 2 of 2) 22453 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 123.5-222 chr9 114712845 114713053 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -30860 NR_133056 100505478 Hs.200101 NM_001199233 ENSG00000230601 TEX48 - testis expressed 48 protein-coding 188.75-101 chr7 8210374 8210783 + 0.75 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 51474 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 149.5-216 chr9 26793338 26793578 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 99344 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 146.5-229 chr8 134033956 134034209 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147586 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 154.75-130 chr7 7499772 7500180 + 0.75 NA intron (NM_001037763, intron 11 of 34) intron (NM_001037763, intron 11 of 34) 35897 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 182.5-111 chr3 187731885 187732396 + 0.75 NA intron (NM_001706, intron 3 of 9) MIRb|SINE|MIR 2767 NM_001134738 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 208.5-59 chr18 46150516 46150964 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -23282 NM_001008239 147339 Hs.116486 NM_145055 ENSG00000152242 C18orf25 ARKL1|Ark2N|RNF111L1 chromosome 18 open reading frame 25 protein-coding 194.25-75 chr3 148853602 148854084 + 0.75 NA intron (NM_001871, intron 9 of 10) MIRc|SINE|MIR -11453 NM_001870 1359 Hs.646 NM_001870 ENSG00000163751 CPA3 MC-CPA carboxypeptidase A3 protein-coding 119.75-58 chr14 52392307 52392645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78164 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 119.75-76 chr17 48367168 48367364 + 0.75 NA intron (NM_001075099, intron 2 of 12) intron (NM_001075099, intron 2 of 12) 62948 NM_001075099 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 142.75-131 chr3 88344083 88344287 + 0.75 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) intron (NM_001368167, intron 2 of 2) 5729 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 166.25-5 chr1 52735960 52736341 + 0.75 NA intron (NM_024646, intron 1 of 13) intron (NM_024646, intron 1 of 13) 9697 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 141.75-178 chr9 133345635 133346027 + 0.75 NA intron (NM_181491, intron 2 of 3) intron (NM_181491, intron 2 of 3) 2300 NM_133640 6837 Hs.78354 NM_006752 ENSG00000148297 MED22 MED24|SRB6|SURF5|surf-5 mediator complex subunit 22 protein-coding 150.25-57 chr15 65294307 65294739 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1528 NR_002756 26831 NR_002756 ENSG00000199568 RNU5A-1 RNU5|RNU5A|RNU5C|U5A|U5B1 RNA, U5A small nuclear 1 snRNA 172.25-93 chr3 122811847 122812164 + 0.75 NA intron (NM_032839, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu 16936 NM_032839 84925 Hs.477346 NM_032839 ENSG00000138463 SLC49A4 DIRC2|RCC4 solute carrier family 49 member 4 protein-coding 120-130 chr4 30785627 30785849 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 65369 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 174.75-97 chr5 20051184 20051444 + 0.75 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -63114 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 112.75-60 chr14 57170403 57170643 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 98382 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 193.25-65 chr21 20097560 20098077 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 160867 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 278-36 chr7 74040619 74041091 + 0.75 NA intron (NM_001278913, intron 4 of 28) intron (NM_001278913, intron 4 of 28) 12682 NM_001081752 2006 Hs.647061 NM_000501 ENSG00000049540 ELN ADCL1|SVAS|WBS|WS elastin protein-coding 173.75-12 chr1 119337254 119337692 + 0.75 NA intron (NR_146623, intron 2 of 3) intron (NR_146623, intron 2 of 3) 9221 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 200.5-80 chr21 30431197 30431639 + 0.75 NA TTS (NM_181600) TTS (NM_181600) 1164 NM_181600 284827 Hs.553677 NM_181600 ENSG00000186971 KRTAP13-4 KAP13.4 keratin associated protein 13-4 protein-coding 150.75-155 chr5 167345726 167345964 + 0.75 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) intron (NM_001122679, intron 2 of 29) -177444 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 272.25-29 chr2 174916007 174916677 + 0.75 NA intron (NM_001025201, intron 5 of 12) MER34A|LTR|ERV1 -68724 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 134.75-21 chr10 24996776 24997205 + 0.75 NA intron (NM_001270383, intron 2 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 19168 NM_145010 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 191.5-150 chr8 128521574 128521877 + 0.75 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 42954 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 187.25-42 chr17 60809335 60809630 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 131631 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 253.25-31 chr2 85819340 85819869 + 0.75 NA intron (NR_038888, intron 2 of 2) L1MC|LINE|L1 4474 NR_038888 284950 Hs.570227 NR_038888 LOC284950 - uncharacterized LOC284950 ncRNA 133.5-223 chr6 6094318 6094600 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -74875 NR_049863 100847034 NR_049863 ENSG00000283616 MIR5683 - microRNA 5683 ncRNA 180.75-125 chr6 46117828 46118226 + 0.75 NA intron (NM_001370650, intron 1 of 6) intron (NM_001370650, intron 1 of 6) 11792 NM_001370649 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 136-64 chr19 17016085 17016410 + 0.75 NA intron (NM_015692, intron 3 of 41) AluJr|SINE|Alu 10563 NM_015692 27151 Hs.631644 NM_015692 ENSG00000160111 CPAMD8 ASGD8|K-CAP|VIP C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8 protein-coding 119.75-7 chr1 79970832 79971136 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -564771 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 152-3 chr1 21267298 21267566 + 0.75 NA intron (NM_001113347, intron 2 of 16) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 12183 NM_001113347 1889 Hs.195080 NM_001397 ENSG00000117298 ECE1 ECE endothelin converting enzyme 1 protein-coding 201.75-98 chr7 118789475 118789824 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 564945 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 118.25-112 chr2 239302795 239303059 + 0.75 NA intron (NM_006037, intron 2 of 26) intron (NM_006037, intron 2 of 26) -2535 NR_036229 100423043 NR_036229 ENSG00000265215 MIR4269 - microRNA 4269 ncRNA 169.25-33 chr15 67371583 67371941 + 0.75 NA intron (NM_001284348, intron 6 of 16) intron (NM_001284348, intron 6 of 16) -116564 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 156-139 chr7 11627918 11628296 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 2 of 26) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 204091 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 120.5-87 chr16 17821061 17821435 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -350288 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 146.25-156 chr8 120619495 120619705 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -141653 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 145.5-50 chr12 115500789 115501128 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 647696 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 191.25-55 chr2 101742508 101742949 + 0.75 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 45021 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 258-27 chr2 227486059 227486607 + 0.75 NA intron (NM_004504, intron 1 of 12) intron (NM_004504, intron 1 of 12) 14161 NM_001135188 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 141-21 chr10 13017121 13017351 + 0.75 NA intron (NM_001282658, intron 5 of 6) AluSx1|SINE|Alu -15523 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 145.5-73 chr16 76052926 76053307 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -224285 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 148-17 chr12 729631 729855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22836 NM_018979 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 210.5-141 chr9 68442915 68443229 + 0.75 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) L1ME1|LINE|L1 -85206 NR_015423 572558 Hs.552819 NR_015423 ENSG00000224958 PGM5-AS1 FAM233A PGM5 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-59 chr15 78025742 78026150 + 0.75 NA intron (NM_144572, intron 4 of 12) intron (NM_144572, intron 4 of 12) -31721 NR_026998 91450 Hs.406766 NR_026998 LOC91450 - uncharacterized LOC91450 ncRNA 257.5-35 chr2 136542478 136543137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222738 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 137-61 chr17 42403008 42403275 + 0.75 NA 3' UTR (NM_012232, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_012232, exon 2 of 2) -14646 NM_139276 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 201.25-36 chr15 68225583 68225982 + 0.75 NA intron (NM_017882, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 3946 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 175-96 chr5 22073684 22074000 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 5 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -68510 NR_003921 5369 Hs.247975 NM_031887 ENSG00000168967 PMCHL1 - pro-melanin concentrating hormone like 1 (pseudogene) pseudo 137.25-118 chr5 15081823 15082232 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 184533 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 149.25-109 chr22 43545217 43545563 + 0.75 NA intron (NM_198856, intron 25 of 29) intron (NM_198856, intron 25 of 29) 29136 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 211-58 chr6 41534202 41534677 + 0.75 NA intron (NR_126415, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 11804 NR_126417 101060264 Hs.571099 NR_126415 ENSG00000234753 FOXP4-AS1 - FOXP4 antisense RNA 1 ncRNA 169-43 chr2 34527487 34527818 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -149905 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 152.25-91 chr2 151307702 151307999 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18182 NM_004688 9111 Hs.54483 NM_004688 ENSG00000123609 NMI - N-myc and STAT interactor protein-coding 219.5-22 chr11 89496626 89497205 + 0.75 NA intron (NM_001143837, intron 3 of 20) MIRc|SINE|MIR -4696 NM_001300995 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 156.25-53 chr17 65817212 65817480 + 0.75 NA intron (NR_126542, intron 1 of 5) intron (NR_126542, intron 1 of 5) 9105 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 194.75-27 chr14 68017205 68017524 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluSx|SINE|Alu 193772 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 124.5-88 chr18 13969382 13969610 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -53789 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 182.75-28 chr10 88927151 88927547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5335 NR_125373 100132116 NR_125373 ENSG00000180139 ACTA2-AS1 UC001kfo|ZXF1|uc001kfo.1 ACTA2 antisense RNA 1 ncRNA 212.25-29 chr14 102045617 102046019 + 0.75 NA intron (NM_001376, intron 72 of 77) MER5A|DNA|hAT-Charlie 41226 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 121-6 chr1 62859253 62859449 + 0.75 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 75219 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 225.25-68 chr5 153539049 153539551 + 0.75 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) MER113|DNA|hAT-Charlie 47128 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 139.25-215 chrX 43760659 43760921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 105883 NM_001270458 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 122.25-171 chr7 25307081 25307352 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -78730 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 175.75-72 chr2 174521855 174522130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34904 NM_001267051 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 194.5-24 chr11 102393302 102393776 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46165 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 125.5-94 chr15 94603215 94603526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 247440 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 282-20 chr17 60721450 60721975 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) intron (NM_001330413, intron 5 of 25) 43861 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 146-95 chr4 44686377 44686650 + 0.75 NA exon (NM_021927, exon 8 of 17) exon (NM_021927, exon 8 of 17) 8093 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 115.25-117 chr20 49973833 49974020 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9054 NM_005985 6615 Hs.48029 NM_005985 ENSG00000124216 SNAI1 SLUGH2|SNA|SNAH|SNAIL|SNAIL1|dJ710H13.1 snail family transcriptional repressor 1 protein-coding 141.5-189 chr5 165091529 165091890 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 621430 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 194.25-105 chr7 26830786 26831188 + 0.75 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 26736 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 210.5-127 chr8 34273588 34273916 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -510169 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 235.75-21 chr14 53282485 53282822 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 129299 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 191.25-105 chr8 88665680 88666081 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -338397 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 168.75-151 chr8 107777311 107777771 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -279623 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 191-68 chr5 56953795 56954302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1918 NM_001297599 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 139-156 chr9 71957128 71957447 + 0.75 NA intron (NM_001365057, intron 2 of 2) intron (NM_001365057, intron 2 of 2) 45648 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 194.75-66 chr3 20757682 20758131 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 415438 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 199.75-92 chr9 130965467 130965790 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -26381 NM_032843 84929 Hs.133205 NM_032843 ENSG00000130720 FIBCD1 - fibrinogen C domain containing 1 protein-coding 122.5-88 chr18 2984099 2984351 + 0.75 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 27722 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 174.25-19 chr10 89278224 89278625 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23622 NM_001547 3433 Hs.437609 NM_001547 ENSG00000119922 IFIT2 G10P2|GARG-39|IFI-54|IFI-54K|IFI54|IFIT-2|ISG-54 K|ISG-54K|ISG54|P54|cig42 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2 protein-coding 134-126 chr4 18682620 18682854 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -660862 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 179-23 chr11 46069760 46070145 + 0.75 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 50867 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 199-22 chr14 38468521 38468885 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -212610 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 177.5-63 chr17 75759270 75759568 + 0.75 NA intron (NM_000154, intron 5 of 7) AluSx1|SINE|Alu 5773 NM_000154 2584 Hs.407966 NM_000154 ENSG00000108479 GALK1 GALK|GK1|HEL-S-19 galactokinase 1 protein-coding 194-20 chr10 116413954 116414417 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13662 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 139.5-149 chr4 44043970 44044249 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 27047 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 126-63 chr15 65205479 65205670 + 0.75 NA intron (NM_003613, intron 4 of 8) MER91B|DNA|hAT-Tip100 5899 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 190.75-105 chr8 16586276 16586579 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -393636 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 182.75-12 chr1 168031687 168032080 + 0.75 NA intron (NM_001198956, intron 12 of 21) intron (NM_001198956, intron 12 of 21) 33223 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 163-102 chr5 144230304 144230719 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 25120 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 205.75-71 chr6 41686741 41687171 + 0.75 NA intron (NM_001271944, intron 7 of 8) intron (NM_001271944, intron 7 of 8) 46654 NR_162107 113218489 NR_162107 MIR10398 - microRNA 10398 ncRNA 125.75-36 chr11 28160543 28160727 + 0.75 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) intron (NM_001113528, intron 3 of 6) 52247 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 168.5-110 chr3 35898294 35898658 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 154000 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 151.5-41 chr14 19959601 19960114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15662 NM_001005486 81127 Hs.554583 NM_001005486 ENSG00000169488 OR4K15 OR14-20|OR4K15Q olfactory receptor family 4 subfamily K member 15 protein-coding 171.25-63 chr17 60362394 60362838 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) intron (NM_032582, intron 1 of 33) 29517 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 179.75-103 chr5 81010829 81011191 + 0.75 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -50103 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 180.5-147 chr8 10434384 10434753 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -39997 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 124-135 chr5 100926289 100926495 + 0.75 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -23110 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 209.5-14 chr10 82330298 82330620 + 0.75 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) L1ME4c|LINE|L1 -97539 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-38 chr13 80873138 80873529 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -145058 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 166.5-104 chr2 65975065 65975306 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 383143 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 152-37 chr11 111871050 111871486 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001077692) promoter-TSS (NM_001077692) 13 NM_001352416 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 157-23 chr12 65424229 65424462 + 0.75 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) L1MA8|LINE|L1 132966 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 120.5-194 chr6 13838273 13838513 + 0.75 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -23833 NM_001031713 63933 Hs.214043 NM_022102 ENSG00000050393 MCUR1 C6orf79|CCDC90A|FMP32 mitochondrial calcium uniporter regulator 1 protein-coding 252.75-16 chr12 126170837 126171244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75048 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 255.5-51 chr22 39121167 39121723 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 24201 NM_001166002 164668 Hs.440515 NM_181773 ENSG00000100298 APOBEC3H A3H|ARP-10|ARP10 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H protein-coding 142.5-234 chr9 7972833 7973081 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173179 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 134-137 chr4 156485348 156485630 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 486310 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 209.25-45 chr18 6558192 6558589 + 0.75 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 46974 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 124.75-174 chr5 116778785 116778998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16682 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 300.75-49 chr9 7367267 7367882 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 432204 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 129-136 chr5 14388224 14388628 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 23 of 56) intron (NM_007118, intron 23 of 56) -75557 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 122-39 chr11 31819637 31819855 + 0.75 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) intron (NR_033971, intron 1 of 2) -1785 NR_160917 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 128.75-24 chr10 100430532 100430703 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32392 NM_003393 7479 Hs.421281 NM_003393 ENSG00000075290 WNT8B - Wnt family member 8B protein-coding 253-30 chr22 35501844 35502393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38376 NM_001366725 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 142-62 chr16 53809914 53810181 + 0.75 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 105891 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 198-38 chr2 80514014 80514511 + 0.75 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) LTR28B|LTR|ERV1 200883 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 112.25-55 chr14 47282136 47282360 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 60998 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 204-53 chr3 56898907 56899271 + 0.75 NA intron (NM_001128615, intron 3 of 12) LTR16C|LTR|ERVL 17347 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 239-24 chr18 66217430 66217956 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 386397 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 141.5-185 chr5 135773539 135773912 + 0.75 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) SATR1|Satellite|Satellite 29350 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 236-69 chr8 116541525 116541980 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -110348 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 166.25-111 chr4 22481566 22481896 + 0.75 NA intron (NM_145290, intron 1 of 18) MER58B|DNA|hAT-Charlie -33581 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 179.75-83 chr4 60400915 60401252 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -521536 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 163.5-59 chr15 78160518 78160940 + 0.75 NA intron (NM_005530, intron 4 of 10) AluJo|SINE|Alu 11367 NM_005530 3419 Hs.591110 NM_005530 ENSG00000166411 IDH3A - isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 alpha protein-coding 151.5-60 chr15 81139013 81139380 + 0.75 NA intron (NM_173528, intron 4 of 6) AluJr|SINE|Alu 4926 NM_173528 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 132-66 chr17 9214291 9214566 + 0.75 NA intron (NM_004822, intron 5 of 6) L1M6|LINE|L1 -35310 NR_110828 101928266 Hs.639880 NR_110828 ENSG00000262966 LOC101928266 - uncharacterized LOC101928266 ncRNA 250.25-11 chr14 71524632 71525165 + 0.75 NA intron (NM_001354286, intron 4 of 24) L2c|LINE|L2 37037 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 112.25-201 chr7 33367493 33367775 + 0.75 NA intron (NM_198428, intron 16 of 22) intron (NM_198428, intron 16 of 22) 238070 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 224.25-78 chr5 67288462 67288846 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -91855 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 144-27 chr11 31907976 31908278 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 81560 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 155.25-143 chr5 99090761 99091119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161226 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 210-2 chr1 28738127 28738454 + 0.75 NA exon (NM_016258, exon 3 of 5) exon (NM_016258, exon 3 of 5) 1350 NM_001172828 51441 Hs.532286 NM_016258 ENSG00000198492 YTHDF2 CAHL|HGRG8|NY-REN-2 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2 protein-coding 186.5 chr1 51438326 51438750 + 0.75 NA intron (NM_001981, intron 12 of 24) intron (NM_001981, intron 12 of 24) -16443 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 230.25-31 chr17 57999756 58000090 + 0.75 NA TTS (NR_034041) TTS (NR_034041) 7323 NM_006924 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 162.25-157 chr8 79130195 79130450 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -201866 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 189.75-13 chr10 113789809 113790163 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -11932 NR_039703 100616162 NR_039703 ENSG00000283656 MIR4483 - microRNA 4483 ncRNA 162-83 chr4 52730844 52731145 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 17745 NR_003016 677810 Hs.635034 NR_003016 ENSG00000212588 SNORA26 HBI-6 small nucleolar RNA, H/ACA box 26 snoRNA 145-114 chr4 119665589 119665984 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -36982 NM_001083 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 182.5-50 chr14 59481880 59482264 + 0.75 NA intron (NM_144581, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 1503 NM_001331159 112849 Hs.729061 NM_144581 ENSG00000126790 L3HYPDH C14orf149 trans-L-3-hydroxyproline dehydratase protein-coding 200.25-36 chr14 53348212 53348596 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 195050 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 188.75-126 chrX 149140132 149140665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 364908 NR_104128 3423 Hs.6795 NM_000202 ENSG00000010404 IDS MPS2|SIDS iduronate 2-sulfatase protein-coding 148.5-193 chr6 43606410 43606773 + 0.75 NA intron (NM_006502, intron 9 of 10) AluSx1|SINE|Alu 20762 NM_001286216 54676 Hs.485449 NM_019096 ENSG00000172432 GTPBP2 JABELS GTP binding protein 2 protein-coding 157.5-118 chr2 235877031 235877257 + 0.75 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) AluSq2|SINE|Alu 291242 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 121.75-8 chr1 185303258 185303464 + 0.75 NA intron (NM_006469, intron 8 of 14) L2|LINE|L2 13882 NM_006469 10625 Hs.497183 NM_006469 ENSG00000116679 IVNS1ABP ARA3|FLARA3|HSPC068|KLHL39|ND1|NS-1|NS1-BP|NS1BP influenza virus NS1A binding protein protein-coding 137.25-139 chr6 73225595 73225935 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001126063) promoter-TSS (NM_001126063) -269 NM_001126063 100129128 Hs.663639 NM_001126063 ENSG00000256980 KHDC1L - KH domain containing 1 like protein-coding 189.25-30 chr13 113921233 113921602 + 0.75 NA TTS (NM_001278674) TTS (NM_001278674) 7574 NR_047495 100861555 Hs.353773 NR_047495 ENSG00000260910 LINC00565 - long intergenic non-protein coding RNA 565 ncRNA 144-121 chr7 37939234 37939561 + 0.75 NA intron (NM_001242948, intron 1 of 2) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 18078 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 185.5-94 chr20 49284513 49284941 + 0.75 NA intron (NR_003604, intron 4 of 4) AluSg4|SINE|Alu 4044 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 164.5-73 chr15 85167302 85167602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 67329 NR_158179 101929479 Hs.681665 NR_158179 LOC101929479 - golgin A2 pseudogene pseudo 165.5-143 chr4 184343026 184343337 + 0.75 NA intron (NR_040108, intron 2 of 2) intron (NR_040108, intron 2 of 2) 10796 NR_040108 728175 Hs.590107 NR_040108 ENSG00000180712 LINC02363 - long intergenic non-protein coding RNA 2363 ncRNA 122.25-95 chr2 124562423 124562632 + 0.75 NA intron (NM_130773, intron 10 of 23) L1ME4a|LINE|L1 537240 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 166.25-42 chr12 99220030 99220366 + 0.75 NA intron (NM_152788, intron 14 of 25) AluSg|SINE|Alu -65108 NM_001352190 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 161-91 chr5 42956248 42956518 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 36950 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 154.75-49 chr16 13193049 13193305 + 0.75 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 291579 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 159-124 chr8 136668959 136669340 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MER94|DNA|hAT-Blackjack 138351 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 151.5-129 chr3 132087321 132087682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47895 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 131.25-67 chr15 25282511 25282814 + 0.75 NA intron (NR_146177, intron 146 of 147) intron (NR_146177, intron 146 of 147) 4319 NR_001289 338429 NR_001289 ENSG00000239169 SNORD109B HBII-438B small nucleolar RNA, C/D box 109B snoRNA 126.5-92 chr17 58299489 58299741 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18680 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 162-81 chr4 28009766 28010215 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 792511 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 135-149 chr5 127479662 127479894 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -37862 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 169.25-125 chr8 128187717 128188047 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37766 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 118.75-81 chr18 7875087 7875364 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 307909 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 249.5-91 chr7 88883267 88883833 + 0.75 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -87813 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 156-10 chr1 182316595 182316803 + 0.75 NA Intergenic (AGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2638 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 115.75-88 chr18 21248626 21248921 + 0.75 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) MER3|DNA|hAT-Charlie 6531 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 135.25-64 chr14 57550307 57550588 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -56590 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 143-82 chr20 54569342 54569754 + 0.75 NA intron (NM_018431, intron 2 of 7) L1ME3G|LINE|L1 93955 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 224.75-21 chr12 18706676 18707315 + 0.75 NA intron (NM_001330769, intron 2 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 30514 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 130.75-78 chr18 4620009 4620331 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -164863 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 180.5-145 chr7 103937718 103938020 + 0.75 NA intron (NM_005045, intron 1 of 64) intron (NM_005045, intron 1 of 64) 51647 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 186.75-78 chr4 71109988 71110332 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -77099 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 119-129 chr4 24508794 24509081 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 11353 NR_030299 693158 NR_030299 ENSG00000207697 MIR573 MIRN573|hsa-mir-573|mir-573 microRNA 573 ncRNA 231-10 chr10 113947288 113947719 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 92842 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 115.75-198 chr7 38189257 38189430 + 0.75 NA intron (NM_001363344, intron 2 of 8) intron (NM_001363344, intron 2 of 8) 11098 NM_001363343 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 172.25-145 chr9 93390615 93391023 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -44405 NM_001098808 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 149.75 chr1 18674233 18674612 + 0.75 NA intron (NM_001135254, intron 4 of 8) intron (NM_001135254, intron 4 of 8) 43576 NM_013945 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 243.75-41 chr2 76503508 76504079 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -482172 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 145.25-132 chr5 52905717 52905963 + 0.75 NA exon (NM_181501, exon 12 of 29) exon (NM_181501, exon 12 of 29) -83512 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 115.5-219 chr6 108899299 108899556 + 0.75 NA intron (NM_001286609, intron 5 of 16) intron (NM_001286609, intron 5 of 16) 24676 NR_104137 101929716 NR_104137 ARMC2-AS1 - ARMC2 antisense RNA 1 ncRNA 126-134 chr5 24261526 24261787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 310308 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 117.75-40 chr11 110898560 110898753 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -185467 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 176.25-144 chr9 7581007 7581406 + 0.75 NA Intergenic MER87|LTR|ERV1 218572 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 273-13 chr11 55387433 55388137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19901 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 210.25-62 chr5 5468570 5468865 + 0.75 NA intron (NM_015325, intron 14 of 18) intron (NM_015325, intron 14 of 18) 46040 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 189.5-138 chr7 92912743 92913153 + 0.75 NA intron (NR_110086, intron 4 of 4) intron (NR_110086, intron 4 of 4) -76321 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 154.25-69 chr18 47497821 47498285 + 0.75 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) LTR88a|LTR|Gypsy? 117557 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 134.75-183 chr6 40102096 40102315 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -167743 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 118.25-196 chr8 57031779 57032090 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38067 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 243.5-41 chr2 226900486 226900819 + 0.75 NA intron (NM_001349069, intron 5 of 8) intron (NM_001349069, intron 5 of 8) 64598 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 135.75-166 chr4 140151763 140152152 + 0.75 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) CpG 2227 NM_018717 55534 Hs.586165 NM_018717 ENSG00000196782 MAML3 CAGH3|ERDA3|GDN|MAM-2|MAM2|TNRC3|mam-3 mastermind like transcriptional coactivator 3 protein-coding 115-60 chr16 64529632 64529954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 592270 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 226.5-13 chr11 26434908 26435450 + 0.75 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) L1PREC2|LINE|L1 -38723 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 182.5-86 chr2 190500030 190500524 + 0.75 NA 3' UTR (NM_017694, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_017694, exon 8 of 8) 34445 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 120.75-111 chr3 114179589 114179773 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_033663) promoter-TSS (NM_033663) -629 NM_033663 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 182-37 chr14 80502742 80503066 + 0.75 NA intron (NM_152446, intron 24 of 24) intron (NM_152446, intron 24 of 24) -271847 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 112.75-164 chr5 95705375 95705666 + 0.75 NA intron (NM_001349303, intron 3 of 8) intron (NM_001349303, intron 3 of 8) -22510 NR_125328 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 210.5-129 chr8 66242558 66243051 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50690 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 118.5-2 chr1 17274339 17274644 + 0.75 NA intron (NM_016233, intron 10 of 15) intron (NM_016233, intron 10 of 15) -3398 NR_039768 100616188 NR_039768 ENSG00000266634 MIR3972 - microRNA 3972 ncRNA 163-19 chr11 42973032 42973331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 296188 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 138.25-121 chr3 126855124 126855512 + 0.75 NA intron (NM_032343, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -133276 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 173-115 chr5 157193825 157194119 + 0.75 NA intron (NM_005546, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 13076 NM_005546 3702 Hs.558348 NM_005546 ENSG00000113263 ITK EMT|LPFS1|LYK|PSCTK2 IL2 inducible T cell kinase protein-coding 160.25-111 chr4 61146537 61146935 + 0.75 NA intron (NR_147148, intron 2 of 3) AluSx3|SINE|Alu 3080 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 153.5-170 chr6 48055661 48056040 + 0.75 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 12839 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 200.5-126 chr7 67872079 67872456 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -147986 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 135.75-40 chr11 113753338 113753544 + 0.75 NA intron (NM_004724, intron 7 of 15) AluSz|SINE|Alu 20251 NM_004724 9183 Hs.503886 NM_004724 ENSG00000086827 ZW10 HZW10|KNTC1AP zw10 kinetochore protein protein-coding 144.75-65 chr16 8333879 8334243 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 255777 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 282.5-10 chr10 110954999 110955765 + 0.75 NA intron (NM_001324337, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 -18127 NR_026715 644511 Hs.632083 NR_026715 ENSG00000234118 RPL13AP6 RPL13A_7_1096|bA348N5.5 ribosomal protein L13a pseudogene 6 pseudo 165-110 chr4 158690572 158690968 + 0.75 NA intron (NM_001281737, intron 5 of 11) AluJb|SINE|Alu 8662 NM_001281738 2110 Hs.155729 NM_004453 ENSG00000171503 ETFDH ETFQO|MADD electron transfer flavoprotein dehydrogenase protein-coding 216.25-80 chr4 126162737 126163405 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 655812 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 127.5-183 chr5 24772394 24772761 + 0.75 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 68006 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 113.5-224 chr7 157306633 157306837 + 0.75 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 -30269 NM_001363676 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 124.5-112 chr2 165668153 165668320 + 0.75 NA intron (NM_024969, intron 3 of 4) intron (NM_024969, intron 3 of 4) 95900 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 114.25-129 chr3 102311515 102311738 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -123389 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 278.75-37 chr7 37456778 37457411 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -7768 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 149.5-112 chr21 24762028 24762298 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78387 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 203.5-76 chr2 178934067 178934574 + 0.75 NA intron (NM_001316745, intron 6 of 11) intron (NM_001316745, intron 6 of 11) 115817 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 180.75-159 chr9 131864670 131864982 + 0.75 NA intron (NM_001253881, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR -124882 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 168.5-189 chr8 132590458 132590763 + 0.75 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) intron (NR_135913, intron 9 of 10) -29131 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 122.5-219 chr8 53989697 53990002 + 0.75 NA intron (NM_201437, intron 3 of 8) AluJo|SINE|Alu 32599 NR_109901 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 170.5-42 chr11 117518839 117519180 + 0.75 NA intron (NM_020693, intron 6 of 32) MIR|SINE|MIR 191155 NM_014956 22897 Hs.504009 NM_014956 ENSG00000110274 CEP164 NPHP15 centrosomal protein 164 protein-coding 204-23 chr17 78906031 78906391 + 0.75 NA intron (NM_003255, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu -3010 NM_001243540 100653515 Hs.734636 NM_001243540 ENSG00000178404 CEP295NL DDC8|KIAA1731NL CEP295 N-terminal like protein-coding 123.5-150 chr4 38878132 38878377 + 0.75 NA exon (NM_138389, exon 3 of 15) exon (NM_138389, exon 3 of 15) 10222 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 132-14 chr10 31295444 31295673 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -22859 NM_001323643 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 139.5-188 chr6 57122549 57122902 + 0.75 NA intron (NR_110742, intron 2 of 3) L1PA17|LINE|L1 32537 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 217.25-32 chr16 34572828 34573312 + 0.75 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite -191590 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 119.75-44 chr12 45288208 45288449 + 0.75 NA intron (NM_001204803, intron 2 of 20) L1MB3|LINE|L1 -4362 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 152.25-152 chr8 66080808 66081184 + 0.75 NA intron (NM_001349432, intron 5 of 5) intron (NM_001349432, intron 5 of 5) -46133 NM_184085 84675 Hs.85524 NM_033058 ENSG00000147573 TRIM55 MURF-2|RNF29|muRF2 tripartite motif containing 55 protein-coding 235.5-10 chr10 61651878 61652415 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -10783 NM_001366909 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 137.75-218 chrX 52167880 52168158 + 0.75 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -16804 NM_001272061 728239 Hs.522650 NM_001098800 ENSG00000154545 MAGED4 MAGE-D4|MAGE-E1|MAGE1|MAGEE1 MAGE family member D4 protein-coding 154.75-18 chr11 32149296 32149564 + 0.75 NA Intergenic LTR72|LTR|ERV1 -5518 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 133.5-174 chr4 31983394 31983706 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -13829 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 164-125 chr7 29939317 29939586 + 0.75 NA intron (NM_001145514, intron 5 of 7) AluJr|SINE|Alu 50350 NM_014766 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 148.5-136 chr22 36163261 36163527 + 0.75 NA intron (NM_145641, intron 1 of 4) intron (NM_145641, intron 1 of 4) -2465 NM_145640 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 202.75-37 chr14 88321322 88321642 + 0.75 NA intron (NM_021161, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 1787 NM_138317 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 147.5-27 chr10 103718386 103718648 + 0.75 NA intron (NM_014631, intron 5 of 13) MIRb|SINE|MIR -28262 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 129.5-34 chr11 6753340 6753553 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 15511 NM_001004490 338755 Hs.534614 NM_001004490 ENSG00000188124 OR2AG2 OR11-76|OR2AG2P olfactory receptor family 2 subfamily AG member 2 protein-coding 144.25-83 chr18 63232953 63233358 + 0.75 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 86225 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 262.25-19 chr2 45691795 45692274 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 40359 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 144-116 chr7 5233591 5233992 + 0.75 NA TTS (NM_001033518) TTS (NM_001033518) 19522 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 142.75-195 chr8 134850417 134850725 + 0.75 NA non-coding (NR_125427, exon 1 of 3) non-coding (NR_125427, exon 1 of 3) 636 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 188.25-35 chr13 86734957 86735245 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -176819 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 125-107 chr3 191160703 191161000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38390 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 115-142 chr5 127484773 127485103 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -32702 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 174.5-43 chr11 134079595 134080024 + 0.75 NA intron (NM_001205329, intron 1 of 7) intron (NM_001205329, intron 1 of 7) 10737 NM_032801 83700 Hs.150718 NM_032801 ENSG00000166086 JAM3 JAM-2|JAM-3|JAM-C|JAMC junctional adhesion molecule 3 protein-coding 153.75-150 chr8 96783272 96783692 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 138240 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 197-58 chr6 88921219 88921628 + 0.75 NA intron (NM_001286428, intron 3 of 13) intron (NM_001286428, intron 3 of 13) 42195 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 164.75-113 chr4 130978928 130979279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 602742 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 152-76 chr19 36971091 36971490 + 0.75 NA intron (NM_001204839, intron 5 of 8) L1M5|LINE|L1 54958 NM_001204836 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 169.5-50 chr14 63885461 63885814 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) AluJo|SINE|Alu 32633 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 144.75-51 chr13 65728609 65728950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -137268 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 136.75-87 chr2 13542139 13542335 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -535224 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 193-28 chr15 89850061 89850543 + 0.75 NA TTS (NR_049817) TTS (NR_049817) 419 NR_049817 100847059 NR_049817 ENSG00000264966 MIR5094 - microRNA 5094 ncRNA 135.75-26 chr10 68965259 68965527 + 0.75 NA exon (NM_004728, exon 5 of 15) exon (NM_004728, exon 5 of 15) 8953 NM_001256910 9188 Hs.223141 NM_004728 ENSG00000165732 DDX21 GUA|GURDB|RH-II/GU|RH-II/GuA DExD-box helicase 21 protein-coding 179.75-117 chr6 55610462 55610834 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -31434 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 141-145 chr7 52802940 52803227 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -232550 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 125-56 chr17 30827511 30827720 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -2855 NR_073118 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 221.25-50 chr3 779700 780124 + 0.75 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 187807 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 311.75-13 chr2 164646857 164647411 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -25652 NM_004490 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 113-132 chr4 54713044 54713277 + 0.75 NA intron (NM_000222, intron 7 of 20) L1PB2|LINE|L1 55232 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 129.75-119 chr3 5271240 5271538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21134 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 214.5-37 chr14 96833731 96834129 + 0.75 NA intron (NM_003384, intron 2 of 12) intron (NM_003384, intron 2 of 12) 36548 NM_003384 7443 Hs.422662 NM_003384 ENSG00000100749 VRK1 PCH1|PCH1A VRK serine/threonine kinase 1 protein-coding 119.5-253 chr9 71356256 71356533 + 0.75 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 90577 NM_001366143 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 154.25-101 chr21 28151459 28151927 + 0.75 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 61290 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 126-19 chr10 55680835 55681017 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -52984 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 114.25-169 chr6 112993998 112994235 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 439331 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 133-75 chr18 21660160 21660488 + 0.75 NA intron (NM_001308256, intron 3 of 6) intron (NM_001308256, intron 3 of 6) 3890 NM_001308257 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 118.5-12 chr1 161149325 161149527 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4552 NM_016406 51506 Hs.301412 NM_016406 ENSG00000143222 UFC1 HSPC155|NEDSG ubiquitin-fold modifier conjugating enzyme 1 protein-coding 167-70 chr20 57510990 57511303 + 0.75 NA intron (NM_001269048, intron 4 of 5) AluJo|SINE|Alu 13721 NR_072975 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 156.25-73 chr2 79436173 79436460 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64528 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 147.5-110 chr2 167092231 167092576 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 48552 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 249.25-31 chr22 28795236 28795926 + 0.75 NA exon (NM_001079539, exon 6 of 6) exon (NM_001079539, exon 6 of 6) 4991 NM_005080 7494 Hs.437638 NM_005080 ENSG00000100219 XBP1 TREB-5|TREB5|XBP-1|XBP2 X-box binding protein 1 protein-coding 113-136 chr4 99973396 99973572 + 0.75 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 22990 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 128-146 chr7 19250045 19250446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -104824 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 156.75-106 chr3 15861635 15862056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2031 NM_001349279 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 139.75-170 chr7 96132986 96133232 + 0.75 NA intron (NM_001160210, intron 14 of 17) L3|LINE|CR1 86647 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 231.75-42 chr2 150963176 150963672 + 0.75 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 298439 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 159.25-121 chr5 90669169 90669399 + 0.75 NA intron (NR_003149, intron 21 of 89) L2c|LINE|L2 110487 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 120.75-4 chr1 90896904 90897086 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45236 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 149-34 chr14 75650265 75650499 + 0.75 NA 3' UTR (NM_007176, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_007176, exon 5 of 5) 10494 NM_007176 11161 Hs.15106 NM_007176 ENSG00000133935 ERG28 C14orf1|NET51 ergosterol biosynthesis 28 homolog protein-coding 129-123 chr3 163381209 163381460 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78033 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 142.75-3 chr1 70168150 70168524 + 0.75 NA intron (NM_017768, intron 9 of 14) L1M4b|LINE|L1 37242 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 205.5-19 chr11 43908018 43908510 + 0.75 NA intron (NM_139178, intron 8 of 9) L2|LINE|L2 10961 NR_026952 729799 Hs.368920 NR_026952 ENSG00000213693 SEC14L1P1 - SEC14 like 1 pseudogene 1 pseudo 121.5-235 chr7 30033248 30033501 + 0.75 NA intron (NM_001363473, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 4962 NM_001350973 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 176.5-6 chr1 74144126 74144386 + 0.75 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) intron (NM_001105659, intron 4 of 7) 53920 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 212.75-60 chr21 31836673 31837106 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -36131 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 115-33 chr11 89225166 89225375 + 0.75 NA intron (NM_000372, intron 2 of 4) L1MA8|LINE|L1 47395 NM_000372 7299 Hs.503555 NM_000372 ENSG00000077498 TYR ATN|CMM8|OCA1|OCA1A|OCAIA|SHEP3 tyrosinase protein-coding 179.75-78 chr3 180886124 180886528 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -16148 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 146.25-32 chr14 55058597 55058873 + 0.75 NA intron (NM_144578, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 7088 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 245.75-61 chr8 106741343 106742017 + 0.75 NA intron (NM_181354, intron 11 of 13) intron (NM_181354, intron 11 of 13) 15573 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 170.75-142 chr8 124073020 124073426 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 31 of 40) intron (NM_001039112, intron 31 of 40) -32441 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 142.5-74 chr15 83077485 83077765 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10290 NR_039740 100616404 NR_039740 ENSG00000263643 MIR4515 mir-4515 microRNA 4515 ncRNA 158-30 chr11 22038933 22039190 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154024 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 211.75-24 chr14 61718721 61719287 + 0.75 NA intron (NR_144368, intron 1 of 2) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 21382 NM_001243084 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 258.75-77 chr9 131306851 131307255 + 0.75 NA intron (NM_032728, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 17330 NM_032728 84814 Hs.134292 NM_032728 ENSG00000160539 PLPP7 C9orf67|NET39|PPAPDC3 phospholipid phosphatase 7 (inactive) protein-coding 178-17 chr12 38538420 38538863 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 221867 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 112.75-76 chr17 47734207 47734437 + 0.75 NA intron (NM_013351, intron 1 of 5) intron (NM_013351, intron 1 of 5) 1086 NM_013351 30009 Hs.272409 NM_013351 ENSG00000073861 TBX21 T-PET|T-bet|TBET|TBLYM T-box transcription factor 21 protein-coding 144.75-57 chr14 46505145 46505369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33898 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 342-13 chr7 51821255 51821791 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -428267 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 155.5-190 chr7 10805813 10806127 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -26026 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 170.25-149 chr8 58476604 58476991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23366 NM_000780 1581 Hs.1644 NM_000780 ENSG00000167910 CYP7A1 CP7A|CYP7|CYPVII cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 protein-coding 129.75-39 chr11 96440842 96441112 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 50964 NM_003772 8690 Hs.105940 NM_003772 ENSG00000183340 JRKL HHMJG JRK like protein-coding 167.25-62 chr17 58063200 58063537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19836 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 127.75-213 chr9 127583152 127583322 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -4206 NM_001035534 64855 Hs.522401 NM_022833 ENSG00000136830 NIBAN2 C9orf88|FAM129B|MEG-3|MINERVA|OC58|bA356B19.6 niban apoptosis regulator 2 protein-coding 128-83 chr2 161095575 161095789 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -41273 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 246-71 chr9 91003646 91004173 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71223 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 143.25-90 chr2 100604809 100605067 + 0.75 NA intron (NR_146956, intron 1 of 2) L1ME3G|LINE|L1 1199 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 140.5-231 chr8 105449242 105449571 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 129863 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 157.75-78 chr18 68186676 68187011 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -372021 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 163.25-120 chr5 118756083 118756389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 160048 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 229.5-19 chr10 78002248 78002634 + 0.75 NA intron (NM_007055, intron 16 of 30) intron (NM_007055, intron 16 of 30) 27074 NM_007055 11128 Hs.436896 NM_007055 ENSG00000148606 POLR3A ADDH|HLD7|RPC1|RPC155|WDRTS|hRPC155 RNA polymerase III subunit A protein-coding 137.25-144 chr6 141650230 141650449 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 438460 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 141.25-76 chr2 15054035 15054430 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 421515 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 203 chr1 32567280 32567710 + 0.75 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) intron (NR_111980, intron 2 of 3) 28068 NM_001040441 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 148.25-130 chr6 35709126 35709460 + 0.75 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 19290 NM_001145775 2289 Hs.407190 NM_004117 ENSG00000096060 FKBP5 AIG6|FKBP51|FKBP54|P54|PPIase|Ptg-10 FKBP prolyl isomerase 5 protein-coding 127.75-174 chr6 104012940 104013139 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 846507 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 207.5-76 chr4 70097120 70097535 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 29941 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 293.75-21 chr2 20266740 20267400 + 0.75 NA intron (NM_001282790, intron 11 of 18) AluSz|SINE|Alu -41637 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 149.25-23 chr10 105054493 105054947 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) intron (NM_014978, intron 5 of 26) -388504 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 144.5-240 chrX 68396985 68397227 + 0.75 NA intron (NM_002547, intron 2 of 24) intron (NM_002547, intron 2 of 24) 36389 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 157.25-117 chr5 59746123 59746342 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 22616 NM_001364602 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 140.5-26 chr11 16717637 16717931 + 0.75 NA intron (NM_001367872, intron 1 of 16) intron (NM_001367872, intron 1 of 16) 20693 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 230.25-92 chrX 81136394 81136902 + 0.75 NA intron (NM_030763, intron 1 of 6) L1MDa|LINE|L1 65265 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 140.25-98 chr2 142784814 142785202 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92656 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 129.5-141 chr2 236952651 236952960 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 103362 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 123.25-123 chr21 17849625 17849894 + 0.75 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) LTR16E1|LTR|ERVL -30403 NM_001100420 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 189.5-155 chr8 132121805 132122173 + 0.75 NA 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) -16724 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 171.75-33 chr12 19878314 19878638 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -136209 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 190.25-6 chr1 119100900 119101342 + 0.75 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) L1MA4A|LINE|L1 -39275 NR_125977 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-67 chr17 65120702 65121128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16423 NM_001165933 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 144.75-114 chr3 191310699 191311056 + 0.75 NA intron (NM_198152, intron 3 of 8) HERVL-int|LTR|ERVL -18517 NM_178335 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 219.5-131 chr8 126507832 126508287 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 50419 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 218-46 chr3 83744727 83745165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1124629 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 156-161 chr8 139264954 139265342 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -351107 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 116.25-92 chr18 70658291 70658547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7465 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 137.25-180 chrX 103094747 103094970 + 0.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -1715 NM_022052 56000 Hs.60386 NM_022052 ENSG00000147206 NXF3 - nuclear RNA export factor 3 protein-coding 177.5-168 chr8 52646590 52646852 + 0.75 NA intron (NM_001083617, intron 15 of 23) intron (NM_001083617, intron 15 of 23) 67714 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 136-99 chr3 5472416 5472630 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222268 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 160.25-8 chr10 18095915 18096296 + 0.75 NA Intergenic (TATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -44319 NM_201596 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 140-91 chr20 56573997 56574226 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3452 NR_136537 105372682 Hs.517135 NR_136537 ENSG00000225657 LINC01716 - long intergenic non-protein coding RNA 1716 ncRNA 170.25-4 chr1 72378956 72379307 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -96592 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 208.25-86 chr7 131084970 131085379 + 0.75 NA intron (NR_109850, intron 2 of 5) L1MC4|LINE|L1 21856 NR_024153 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 116.75-42 chr11 107306872 107307190 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 150815 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 138.5-39 chr12 5228244 5228474 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14792 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 129.25-50 chr14 59974712 59975016 + 0.75 NA intron (NR_075071, intron 13 of 32) intron (NR_075071, intron 13 of 32) 55151 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 151.25-139 chr4 36140519 36140909 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 19 of 32) intron (NR_146894, intron 19 of 32) 103225 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 216.25-20 chr11 109579205 109579600 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 157212 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 146-77 chr20 6574364 6574735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147817 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 273.25-40 chr9 103117025 103117651 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 122005 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 135.25-102 chr2 122747813 122748087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 325531 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 137-144 chr5 139644105 139644558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2968 NM_001317201 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 159.75-94 chr20 14558639 14559001 + 0.75 NA intron (NR_104193, intron 1 of 4) intron (NR_104193, intron 1 of 4) 4436 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 161-77 chr3 122980905 122981258 + 0.75 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) intron (NR_046079, intron 1 of 22) -4947 NM_001256347 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 279.75-39 chr4 110644231 110644863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2424 NM_001204397 5308 Hs.643588 NM_000325 ENSG00000164093 PITX2 ARP1|ASGD4|Brx1|IDG2|IGDS|IGDS2|IHG2|IRID2|Otlx2|PTX2|RGS|RIEG|RIEG1|RS paired like homeodomain 2 protein-coding 131.25-54 chr14 20342189 20342548 + 0.75 NA TTS (NR_002312) TTS (NR_002312) 1043 NR_002312 85495 Hs.613102 NR_002312 ENSG00000277209 RPPH1 H1RNA|RPPH1-1 ribonuclease P RNA component H1 ncRNA 138.25-85 chr2 79630288 79630606 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) intron (NM_001282598, intron 1 of 17) 18912 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 169.5-139 chr5 96257081 96257375 + 0.75 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 174931 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 249.75-64 chr9 70526703 70527223 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112306 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 234.25-18 chr12 20510619 20510978 + 0.75 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) L2|LINE|L2 -61066 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 228.5-56 chr2 57110646 57111027 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -796815 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 117.5-209 chr6 154122881 154123145 + 0.75 NA non-coding (NR_104348, exon 5 of 5) non-coding (NR_104348, exon 5 of 5) 33251 NM_001285527 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 173.75-152 chr8 123032289 123032652 + 0.75 NA intron (NM_024295, intron 1 of 7) intron (NM_024295, intron 1 of 7) -6698 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 261-7 chr10 93034458 93034920 + 0.75 NA intron (NM_001319195, intron 20 of 21) intron (NM_001319195, intron 20 of 21) -26109 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 145-71 chr2 37472876 37473165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128390 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 161.75-25 chr10 58613718 58614064 + 0.75 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 101019 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 136.75-196 chr8 112734790 112735201 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 91502 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 121.75-92 chr2 193229894 193230270 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 480237 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 152.75-39 chr11 102125503 102125863 + 0.75 NA intron (NM_001130145, intron 2 of 8) HAL1|LINE|L1 13235 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 196.5-147 chr6 132752580 132753082 + 0.75 NA intron (NM_004665, intron 3 of 6) intron (NM_004665, intron 3 of 6) 5073 NM_004665 8875 Hs.293130 NM_004665 ENSG00000112303 VNN2 FOAP-4|GPI-80 vanin 2 protein-coding 156.25-97 chr3 99410865 99411203 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -227560 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 183.25-33 chr14 37137762 37138090 + 0.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -34100 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 242.75-2 chr1 52693455 52693872 + 0.75 NA intron (NM_023077, intron 1 of 2) intron (NM_023077, intron 1 of 2) 4684 NM_023077 65260 Hs.349905 NM_023077 ENSG00000162377 COA7 C1orf163|RESA1|SCAN3|SELRC1 cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) protein-coding 184-42 chr2 82159623 82160054 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -692892 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 166.25-17 chr1 197858721 197859001 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43769 NM_001024594 388722 Hs.61329 NM_001024594 ENSG00000203724 C1orf53 - chromosome 1 open reading frame 53 protein-coding 213-12 chr10 73577988 73578507 + 0.75 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) intron (NM_001350995, intron 1 of 21) -2572 NM_152586 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 113.75-15 chr1 213382208 213382395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 331060 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 258.5-76 chr8 136197769 136198188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -332820 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 178.5-68 chr17 78898841 78899258 + 0.75 NA intron (NM_001243541, intron 2 of 2) intron (NM_001243541, intron 2 of 2) 4152 NM_001243541 100653515 Hs.734636 NM_001243540 ENSG00000178404 CEP295NL DDC8|KIAA1731NL CEP295 N-terminal like protein-coding 180.5-9 chr10 24638117 24638469 + 0.75 NA intron (NM_001367447, intron 4 of 24) intron (NM_001367447, intron 4 of 24) -15450 NR_160024 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 182-51 chr18 2887835 2888182 + 0.75 NA intron (NM_032048, intron 3 of 7) L1ME4a|LINE|L1 41002 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 167.5-202 chrX 26878379 26878718 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 320211 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 166.5-203 chr8 108478761 108479159 + 0.75 NA intron (NR_138033, intron 8 of 9) intron (NR_138033, intron 8 of 9) 35336 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 216.25-39 chr15 79981734 79982154 + 0.75 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -10748 NM_001114735 597 Hs.227817 NM_004049 ENSG00000140379 BCL2A1 ACC-1|ACC-2|ACC1|ACC2|BCL2L5|BFL1|GRS|HBPA1 BCL2 related protein A1 protein-coding 196.75-97 chr7 30145383 30145787 + 0.75 NA intron (NM_152793, intron 1 of 2) intron (NM_152793, intron 1 of 2) 10599 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 190.25-58 chr18 52622326 52622800 + 0.75 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 282366 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 184.25-5 chr1 109600308 109600608 + 0.75 NA TTS (NM_006496) TTS (NM_006496) 1565 NR_029583 406974 NR_029583 ENSG00000284443 MIR197 MIRN197|miR-197|miRNA197 microRNA 197 ncRNA 151.5-44 chr14 32929748 32930157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8927 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 205-56 chr4 91899858 91900280 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 377233 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 188.75 chr1 11131891 11132214 + 0.75 NA intron (NM_004958, intron 38 of 57) L2a|LINE|L2 -11846 NR_046600 100873935 Hs.679133 NR_046600 ENSG00000225602 MTOR-AS1 - MTOR antisense RNA 1 ncRNA 134.75-80 chr16 49195678 49195964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86017 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 168-79 chr22 36904594 36904947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8858 NM_000395 1439 Hs.592192 NM_000395 ENSG00000100368 CSF2RB CD131|CDw131|IL3RB|IL5RB|SMDP5|betaGMR colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit protein-coding 173.25-14 chr10 72691975 72692303 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_073062) promoter-TSS (NR_073062) 8 NM_138357 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 136-22 chr11 17134984 17135269 + 0.75 NA exon (NM_002645, exon 10 of 33) exon (NM_002645, exon 10 of 33) -57459 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 149-22 chr12 40931773 40932099 + 0.75 NA intron (NM_001256064, intron 7 of 15) L2|LINE|L2 23579 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 166.5-122 chr21 21623927 21624279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113216 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 134.5-111 chr2 212313181 212313392 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 113074 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 259.25-15 chr15 81268379 81269040 + 0.75 NA intron (NM_001352685, intron 5 of 19) intron (NM_001352685, intron 5 of 19) -28261 NM_004513 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 127.75-24 chr1 226758297 226758485 + 0.75 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -19216 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 206.75-66 chr4 123848129 123848536 + 0.75 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) intron (NR_027105, intron 4 of 5) 74068 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 221.75-58 chr5 59493636 59493993 + 0.75 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 92684 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 141.5-219 chr8 37737573 37737905 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_125821) promoter-TSS (NR_125821) -313 NR_125821 102723701 Hs.588388 NR_125821 ENSG00000183154 LOC102723701 - uncharacterized LOC102723701 ncRNA 138-114 chr4 54802286 54802622 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 144526 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 219-44 chr17 71068331 71068692 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133668 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 122-5 chr1 56638963 56639192 + 0.75 NA intron (NR_135111, intron 2 of 2) intron (NR_135111, intron 2 of 2) -6237 NM_006252 5563 Hs.437039 NM_006252 ENSG00000162409 PRKAA2 AMPK|AMPK2|AMPKa2|PRKAA protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 2 protein-coding 180.75-130 chr6 102998662 102999167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1599929 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 129-87 chr2 15694953 15695216 + 0.75 NA intron (NR_110201, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 4302 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 127-124 chr4 57651190 57651409 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 225427 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 182.75-110 chr5 136371968 136372532 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6774 NM_020389 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 256.5-82 chr9 26131382 26131760 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 64896 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 146.25-115 chr5 22540573 22540814 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 312651 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 121.25-100 chr2 178467332 178467718 + 0.75 NA intron (NM_001135212, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 11075 NM_001135212 51661 Hs.410378 NM_016105 ENSG00000079150 FKBP7 FKBP23|PPIase FKBP prolyl isomerase 7 protein-coding 162.25-14 chr1 238983863 238984224 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -402525 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 163.25-91 chr3 29917002 29917344 + 0.75 NA intron (NM_001003793, intron 10 of 14) L2a|LINE|L2 16983 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-68 chr18 24948335 24948717 + 0.75 NA intron (NR_146903, intron 1 of 1) intron (NR_146903, intron 1 of 1) 39453 NR_146903 105372030 NR_146903 LINC01894 - long intergenic non-protein coding RNA 1894 ncRNA 192.5-12 chr10 18578909 18579335 + 0.75 NA intron (NM_182543, intron 8 of 10) intron (NM_182543, intron 8 of 10) 72465 NM_001351117 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 113.75-46 chr12 64518918 64519125 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66901 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 121.75-112 chr3 27578224 27578532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -93994 NR_135541 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 133-162 chr7 113630431 113630645 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 288471 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 163.75-94 chr3 118376375 118376865 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -265148 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 178.25-26 chr13 48784765 48785154 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 131030 NM_001308476 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 159.5-93 chr2 20439390 20439610 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -7574 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 167.25-48 chr14 80987367 80987637 + 0.75 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) intron (NM_001142626, intron 1 of 8) 31881 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 201.5-16 chr1 200792810 200793327 + 0.75 NA intron (NM_001297707, intron 2 of 17) intron (NM_001297707, intron 2 of 17) 53496 NM_001297708 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 202.25-18 chr12 46256461 46256821 + 0.75 NA intron (NM_001278387, intron 1 of 17) (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9875 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 129.5-175 chr5 17172918 17173128 + 0.75 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 -17031 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 218-68 chr8 71551213 71551601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3313 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 157.75-96 chr2 226051517 226051755 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91158 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 133.5-127 chr2 157000791 157001026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -256797 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 127.5-62 chr12 116223894 116224117 + 0.75 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) U6|snRNA|snRNA 53181 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 130.75-106 chr21 14376476 14376779 + 0.75 NA intron (NM_006948, intron 3 of 4) intron (NM_006948, intron 3 of 4) 6519 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 125-151 chr7 98209632 98209867 + 0.75 NA TTS (NM_014916) TTS (NM_014916) -2505 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 116.5-27 chr10 91945537 91945794 + 0.75 NA intron (NM_003972, intron 4 of 37) L1MB2|LINE|L1 21895 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 158.75-106 chr21 28462041 28462271 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77162 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 127.75-77 chr17 31109252 31109587 + 0.75 NA intron (NM_001042492, intron 1 of 57) AluSq2|SINE|Alu 14442 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 120.5-15 chr1 208089635 208089974 + 0.75 NA intron (NM_025179, intron 9 of 31) intron (NM_025179, intron 9 of 31) 154580 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 112.25-62 chr14 64203201 64203445 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 100 of 114) intron (NM_015180, intron 100 of 114) -10821 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 182.5-68 chr17 70874508 70874783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 327534 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 136.5-68 chr14 50791299 50791540 + 0.75 NA intron (NM_016350, intron 5 of 28) intron (NM_016350, intron 5 of 28) -30378 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 162-35 chr13 82074427 82074688 + 0.75 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -847574 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 180-79 chr3 24920023 24920363 + 0.75 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 90870 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 156.75-112 chr3 64326332 64326724 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -58355 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 256.5-6 chr10 27167219 27167816 + 0.75 NA intron (NM_001320757, intron 7 of 12) intron (NM_001320757, intron 7 of 12) 12693 NM_001172304 84930 Hs.276905 NM_032844 ENSG00000120539 MASTL GREATWALL|GW|GWL|MAST-L|THC2 microtubule associated serine/threonine kinase like protein-coding 145.5-127 chr3 28478472 28478711 + 0.75 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) intron (NM_001324170, intron 3 of 6) -96687 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 118.5-32 chr11 40199690 40199893 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 93339 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 152-156 chr9 31201413 31201782 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 179893 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 250.5-3 chr1 105667474 105667946 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48775 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 165.75-25 chr11 15048324 15048716 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25073 NM_000728 797 Hs.534305 NM_000728 ENSG00000175868 CALCB CALC2|CGRP-II|CGRP2 calcitonin related polypeptide beta protein-coding 141.5-195 chr6 57192248 57192439 + 0.75 NA intron (NR_103822, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 20017 NM_004282 9532 Hs.745046 NM_004282 ENSG00000112208 BAG2 BAG-2|dJ417I1.2 BCL2 associated athanogene 2 protein-coding 197.5-131 chr5 134983681 134984047 + 0.75 NA intron (NM_178019, intron 2 of 7) L1PB3|LINE|L1 15957 NM_178019 347732 Hs.631804 NM_178019 ENSG00000152705 CATSPER3 CACRC cation channel sperm associated 3 protein-coding 157.5-67 chr15 61997031 61997250 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 16 of 81) L2a|LINE|L2 63307 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 112.75-114 chr2 214065905 214066184 + 0.75 NA intron (NR_047660, intron 12 of 14) intron (NR_047660, intron 12 of 14) 307977 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 180-8 chr1 226761545 226761903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22549 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 149.5-153 chr5 74493464 74493785 + 0.75 NA intron (NR_126354, intron 1 of 2) intron (NR_126354, intron 1 of 2) 43352 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 120 chr1 53093395 53093642 + 0.75 NA exon (NM_001287595, exon 6 of 11) exon (NM_001287595, exon 6 of 11) 31305 NM_001199080 127435 Hs.586141 NM_153703 ENSG00000174348 PODN PCAN|SLRR5A podocan protein-coding 193-22 chr14 77031514 77031832 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2965 NM_024496 64207 Hs.179260 NM_024496 ENSG00000119669 IRF2BPL C14orf4|EAP1|NEDAMSS interferon regulatory factor 2 binding protein like protein-coding 192.25-76 chr3 122631281 122631728 + 0.75 NA intron (NM_152615, intron 5 of 7) intron (NM_152615, intron 5 of 7) 15889 NM_001308321 165631 Hs.120250 NM_152615 ENSG00000173200 PARP15 ARTD7|BAL3|pART7 poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 protein-coding 137-174 chr8 74299697 74299920 + 0.75 NA intron (NM_020647, intron 2 of 5) intron (NM_020647, intron 2 of 5) 21553 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 213.75-97 chr6 127284933 127285504 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001242846, exon 3 of 5) 5' UTR (NM_001242846, exon 3 of 5) 18380 NM_001242846 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 179-25 chr11 105511251 105511631 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -98632 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 114.5-228 chr6 62049244 62049554 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) L1M4|LINE|L1 236826 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 230.75-62 chr5 128675025 128675373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -136954 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 181.75-32 chr12 69519357 69519715 + 0.75 NA intron (NM_001278354, intron 2 of 9) L1PREC2|LINE|L1 4096 NR_145803 109623461 NR_145803 SNORA113 - small nucleolar RNA, H/ACA box 113 snoRNA 224.75-34 chr16 12651544 12652137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68481 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 115.75-60 chr14 34605010 34605272 + 0.75 NA intron (NM_001366519, intron 4 of 12) intron (NM_001366519, intron 4 of 12) 25007 NM_001366519 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 135.5-46 chr12 41923698 41923984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 159652 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 141.25-146 chr5 163322953 163323356 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -114417 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 164-94 chr4 178800930 178801197 + 0.75 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -893127 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 154-33 chr11 116553512 116553799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85767 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 146.75-79 chr2 114980611 114980980 + 0.75 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -83778 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 183-74 chr3 115644652 115645061 + 0.75 NA intron (NM_002045, intron 1 of 2) intron (NM_002045, intron 1 of 2) 21346 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 167.75-145 chr8 130861200 130861670 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1MC3|LINE|L1 179474 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 161.5-137 chr3 118246289 118246697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -395275 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 195-52 chr20 40540102 40540628 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148871 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 131.25-187 chr7 43039876 43040087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -72666 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 124.75-197 chr7 125696955 125697260 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -432816 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 209.75-2 chr1 52170314 52170839 + 0.75 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) L1M1|LINE|L1 28482 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 156-89 chr2 173684291 173684684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 279393 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 155.5-193 chr7 26563985 26564226 + 0.75 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -25280 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 203.25-21 chr11 36811437 36811753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -213316 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 154.25-61 chr16 81549099 81549446 + 0.75 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) intron (NM_030629, intron 1 of 20) 15370 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 217-54 chr3 160148946 160149241 + 0.75 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 57999 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 162.5-104 chr22 34829558 34829949 + 0.75 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 168163 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 149.75-101 chr20 5653757 5654078 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -42911 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 164-143 chr8 142906009 142906434 + 0.75 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 11622 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 177.75-86 chr2 235179041 235179441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 151506 NM_001371306 278.5-9 chr10 60916838 60917307 + 0.75 NA intron (NM_001350908, intron 2 of 11) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 27113 NM_001242359 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 152.5-19 chr10 78854570 78854892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 212717 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 316.5-13 chr14 73115370 73116078 + 0.75 NA intron (NM_021239, intron 18 of 18) intron (NM_021239, intron 18 of 18) -20783 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 125.5-62 chr12 122821906 122822270 + 0.75 NA intron (NR_027918, intron 11 of 12) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12660 NM_001303099 9026 Hs.524815 NM_003959 ENSG00000130787 HIP1R HIP12|HIP3|ILWEQ huntingtin interacting protein 1 related protein-coding 118-126 chr3 197738584 197738800 + 0.75 NA intron (NM_001145642, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu -1766 NM_001346873 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 128.5-166 chr4 181892752 181893027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62916 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 185.25-10 chr10 68042423 68042737 + 0.75 NA intron (NM_001278186, intron 3 of 22) AluJb|SINE|Alu -31697 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 135.5-135 chr3 82352052 82352305 + 0.75 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 366036 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 124-4 chr1 49870094 49870355 + 0.75 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) intron (NM_001323575, intron 1 of 12) 153730 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 127-139 chr5 102919393 102919752 + 0.75 NA intron (NR_157231, intron 6 of 14) intron (NR_157231, intron 6 of 14) 53749 NM_138821 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 185.5-129 chr5 66961962 66962405 + 0.75 NA intron (NM_001290226, intron 1 of 26) intron (NM_001290226, intron 1 of 26) 3110 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 158-97 chr3 38121295 38121634 + 0.75 NA intron (NM_007335, intron 34 of 36) intron (NM_007335, intron 34 of 36) 15663 NM_001607 30 Hs.643487 NM_001607 ENSG00000060971 ACAA1 ACAA|PTHIO|THIO acetyl-CoA acyltransferase 1 protein-coding 112.5-29 chr10 125165674 125165910 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4762 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 140.5-54 chr13 47967239 47967548 + 0.75 NA intron (NM_003850, intron 6 of 10) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 33933 NM_003850 8803 Hs.743361 NM_003850 ENSG00000136143 SUCLA2 A-BETA|A-SCS|MTDPS5|SCS-betaA succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit protein-coding 200.5-35 chr14 57432859 57433509 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 42598 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 131.25-21 chr10 43607682 43607956 + 0.75 NA intron (NM_001318143, intron 2 of 2) intron (NM_001318143, intron 2 of 2) 1381 NM_145312 220992 Hs.147440 NM_145312 ENSG00000198298 ZNF485 - zinc finger protein 485 protein-coding 200.5-137 chr8 83480524 83480791 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 76899 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 134.25-119 chr3 135540750 135541122 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -424792 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 159.25-55 chr18 9559976 9560407 + 0.75 NA intron (NR_052003, intron 13 of 19) AluJb|SINE|Alu 54368 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 144.75-47 chr12 115222815 115223138 + 0.75 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -538801 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 140-109 chr3 85705251 85705508 + 0.75 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR -21103 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 187.25-36 chr15 100650767 100651128 + 0.75 NA 3' UTR (NM_198243, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_198243, exon 6 of 6) 48358 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 145.25-85 chr20 18815078 18815345 + 0.75 NA TTS (NM_178483) TTS (NM_178483) 1428 NM_178483 140856 Hs.112794 NM_178483 ENSG00000132631 SCP2D1 C20orf79|HSD22|dJ1068E13.2 SCP2 sterol binding domain containing 1 protein-coding 169-52 chr20 1119777 1120337 + 0.75 NA intron (NM_006814, intron 1 of 6) intron (NM_006814, intron 1 of 6) 1455 NM_001323410 9491 Hs.471917 NM_006814 ENSG00000125818 PSMF1 PI31 proteasome inhibitor subunit 1 protein-coding 121.5-120 chr18 73338186 73338536 + 0.75 NA intron (NR_038340, intron 2 of 2) L1MC5|LINE|L1 13420 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 149.5-205 chr8 96786590 96786964 + 0.75 NA intron (NM_016134, intron 2 of 7) L1MB8|LINE|L1 141535 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 168.75-56 chr15 70002194 70002622 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 77060 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 203.75-37 chr15 61008767 61009164 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) MIRc|SINE|MIR 220337 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 249.25-14 chr17 49312446 49312918 + 0.75 NA intron (NM_014897, intron 3 of 5) intron (NM_014897, intron 3 of 5) -24228 NR_106745 102465137 NR_106745 ENSG00000273500 MIR6129 hsa-mir-6129 microRNA 6129 ncRNA 213-99 chr9 35925690 35926037 + 0.75 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 16373 NM_001348107 158376 Hs.302677 NM_001348107 ENSG00000235387 SPAAR LINC00961|SPAR small regulatory polypeptide of amino acid response protein-coding 198.75-29 chr16 72054069 72054585 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001126102) promoter-TSS (NM_001126102) -178 NM_001318138 3240 Hs.513711 NM_005143 ENSG00000257017 HP BP|HP2ALPHA2|HPA1S haptoglobin protein-coding 194-18 chr10 86795411 86795852 + 0.75 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) intron (NM_004329, intron 1 of 12) 38992 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 228.5-3 chr1 42827120 42827488 + 0.75 NA intron (NM_001017922, intron 2 of 11) AluJb|SINE|Alu 1726 NM_018538 114625 Hs.439437 NM_018538 ENSG00000164010 ERMAP BTN5|PRO2801|RD|SC erythroblast membrane associated protein (Scianna blood group) protein-coding 125.75-166 chr6 131561162 131561524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11883 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 198.75-19 chr12 39484630 39484976 + 0.75 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -41683 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 130.75-70 chr17 63999652 63999951 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_126169) promoter-TSS (NR_126169) 98 NR_126169 400612 Hs.591170 NR_126169 ENSG00000264954 PRR29-AS1 - PRR29 antisense RNA 1 ncRNA 147.75-32 chr13 60094212 60094586 + 0.75 NA intron (NM_001258368, intron 1 of 25) intron (NM_001258368, intron 1 of 25) -50299 NR_046540 100874196 Hs.662188 NR_046540 ENSG00000223815 DIAPH3-AS2 DIPAH3-AS2 DIAPH3 antisense RNA 2 ncRNA 264.75-51 chr6 163610648 163611072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60624 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 192-50 chr16 48824949 48825322 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -214955 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 264.25-50 chr7 70336375 70336802 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 738113 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 220.25-71 chr7 97376087 97376410 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 259655 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 132.5-98 chr18 56980409 56980685 + 0.75 NA intron (NM_015285, intron 26 of 27) L2a|LINE|L2 91572 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 233.5-25 chr11 98195233 98195634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -825516 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 212.25-73 chr5 44536176 44536734 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26173 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 144.75-156 chr7 51155817 51156145 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) intron (NM_015198, intron 5 of 12) 160828 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 128.25-151 chr4 131465908 131466173 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -298798 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 112.75-182 chr6 148385476 148385734 + 0.75 NA intron (NM_001346506, intron 1 of 20) MER21B|LTR|ERVL 42767 NM_001346506 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 172-55 chr2 186120545 186120939 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34425 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 175.25-129 chr7 7966908 7967268 + 0.75 NA intron (NR_110018, intron 1 of 4) intron (NR_110018, intron 1 of 4) 1664 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 248-76 chr8 132267589 132268180 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L1MC1|LINE|L1 -162619 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 211.75-65 chr4 44427993 44428564 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 20531 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 139.5-145 chr4 30859111 30859351 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 138862 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 175.75-96 chr4 160130103 160130478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -352506 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 265.5-16 chr12 26731588 26732204 + 0.75 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) intron (NM_002223, intron 2 of 56) 101298 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 179.75-47 chr16 25474315 25474591 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -216608 NM_001012981 342357 Hs.513451 NM_001012981 ENSG00000155592 ZKSCAN2 ZNF694|ZSCAN31|ZSCAN34 zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 protein-coding 197.25-68 chr3 18099196 18099632 + 0.75 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) intron (NR_161333, intron 4 of 4) 136862 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 233.25-12 chr11 31221444 31221801 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 148117 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 223.5-128 chr8 109484883 109485280 + 0.75 NA exon (NM_177531, exon 58 of 78) exon (NM_177531, exon 58 of 78) -54619 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 187.75 chr1 31619522 31619855 + 0.75 NA exon (NM_001525, exon 4 of 9) exon (NM_001525, exon 4 of 9) 1988 NM_001525 3061 Hs.388226 NM_001525 ENSG00000121764 HCRTR1 OX1R hypocretin receptor 1 protein-coding 117.75-190 chr7 14301148 14301408 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -309853 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 238.5-10 chr10 35569192 35569634 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001282852, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001282852, exon 9 of 9) -35928 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 142.5-157 chr4 139513892 139514139 + 0.75 NA intron (NM_030648, intron 7 of 7) AluSx3|SINE|Alu 42754 NM_030648 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 143.5-11 chr1 166185592 166185965 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -19023 NM_001017961 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 130.25-179 chr6 140831780 140831998 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 148075 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 113-120 chr3 96842339 96842539 + 0.75 NA intron (NM_001080448, intron 1 of 17) intron (NM_001080448, intron 1 of 17) 27845 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 134-49 chr13 112759836 112760128 + 0.75 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) -5251 NR_109811 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 129.5-95 chr17 57722268 57722523 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 22904 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 212-18 chr12 22183378 22183726 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 137334 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 118-67 chr17 74984384 74984595 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -3143 NM_014603 30850 Hs.78358 NM_014603 ENSG00000109089 CDR2L HUMPPA cerebellar degeneration related protein 2 like protein-coding 172.25-150 chrX 64504346 64504889 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -109165 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 146.75-95 chr22 36273780 36273991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13022 NR_106877 102465491 NR_106877 ENSG00000278420 MIR6819 hsa-mir-6819 microRNA 6819 ncRNA 181-83 chr5 8338297 8338699 + 0.75 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) intron (NR_039984, intron 3 of 5) 119066 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 197-10 chr12 41425316 41425691 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -12236 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 135-17 chr10 77634120 77634344 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001271522, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001271522, exon 2 of 2) 3576 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 164.25-116 chr4 70284477 70284753 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 41999 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 138.5-11 chr1 82859359 82859615 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43696 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 234.5-98 chr8 116869294 116869837 + 0.75 NA intron (NM_006265, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu -4859 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-97 chr2 39008791 39009079 + 0.75 NA intron (NM_005633, intron 15 of 22) L1M4b|LINE|L1 -48591 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 115.75-53 chr13 79530107 79530317 + 0.75 NA intron (NM_019080, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu -36515 NR_125772 103724388 Hs.434862 NR_125772 ENSG00000227676 LINC01068 - long intergenic non-protein coding RNA 1068 ncRNA 162.25-163 chr9 12296077 12296314 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -397190 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 220.75-54 chr5 58649571 58650134 + 0.75 NA intron (NM_138453, intron 2 of 4) intron (NM_138453, intron 2 of 4) 66777 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 141.25-175 chr7 113765707 113765996 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 153158 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 115.75-95 chr2 13208376 13208674 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -201512 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 159.5-184 chr6 77235022 77235325 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 228849 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 247.25-39 chr3 37290881 37291320 + 0.75 NA intron (NM_001172713, intron 6 of 22) intron (NM_001172713, intron 6 of 22) -46905 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 278.5-22 chr17 66047061 66047511 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 12 of 26) AluSz|SINE|Alu 144606 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 212.75-105 chrX 5304052 5304390 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -670649 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 207.5-33 chr16 75107637 75108145 + 0.75 NA 3' UTR (NM_032268, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_032268, exon 5 of 5) 8881 NM_194436 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 346.25-5 chr15 94431393 94432216 + 0.75 NA intron (NM_001159643, intron 16 of 19) intron (NM_001159643, intron 16 of 19) 75874 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 203-90 chr6 71204508 71204926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84094 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 133-86 chr2 128265326 128265580 + 0.75 NA TTS (NM_004807) TTS (NM_004807) 53415 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 151-2 chr1 25996656 25996903 + 0.75 NA intron (NM_000437, intron 1 of 10) intron (NM_000437, intron 1 of 10) 1284 NM_000437 5051 Hs.477083 NM_000437 ENSG00000158006 PAFAH2 HSD-PLA2 platelet activating factor acetylhydrolase 2 protein-coding 192.75-128 chr8 122377122 122377575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 191296 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 128.75-145 chr4 92667764 92667979 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 363472 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 136.5-38 chr11 19256576 19256844 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15055 NM_001256372 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 117.75-140 chr3 136895434 136895693 + 0.75 NA intron (NM_001291999, intron 1 of 3) AluSz6|SINE|Alu 33355 NM_006153 4690 Hs.126889 NM_006153 ENSG00000158092 NCK1 NCK|NCKalpha|nck-1 NCK adaptor protein 1 protein-coding 125-60 chr17 76892417 76892730 + 0.75 NA intron (NM_144677, intron 3 of 16) MER77|LTR|ERVL 19926 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 114.5-159 chr20 7855851 7856140 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 84463 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 176-6 chr10 10477326 10477751 + 0.75 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 14988 NM_001326317 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 116.5-53 chr12 112556306 112556578 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18794 NM_001347952 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 142.5-85 chr16 89336002 89336311 + 0.75 NA intron (NR_045839, intron 2 of 9) intron (NR_045839, intron 2 of 9) 15023 NM_001242885 100287036 Hs.656995 NM_001242885 LOC100287036 - uncharacterized LOC100287036 protein-coding 147.5-2 chr1 10861900 10862233 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65420 NM_017766 54897 Hs.439894 NM_017766 ENSG00000130940 CASZ1 CAS11|CST|SRG|ZNF693|dJ734G22.1 castor zinc finger 1 protein-coding 170.5-64 chr14 66197063 66197296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -289192 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 158.5-141 chr4 63671856 63672214 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 737415 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 154-39 chr14 39351274 39351733 + 0.75 NA TTS (NM_001354140) TTS (NM_001354140) 80997 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 145.5-168 chr5 178926117 178926512 + 0.75 NA intron (NM_030613, intron 4 of 4) intron (NM_030613, intron 4 of 4) -14884 NM_001178090 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 162.75-63 chr2 3367966 3368233 + 0.75 NA intron (NM_003310, intron 1 of 8) intron (NM_003310, intron 1 of 8) 9719 NM_001330530 7260 Hs.502770 NM_003310 ENSG00000032389 EIPR1 EIPR-1|TSSC1 EARP complex and GARP complex interacting protein 1 protein-coding 129.75-27 chr10 78946122 78946432 + 0.75 NA intron (NR_024429, intron 6 of 7) intron (NR_024429, intron 6 of 7) 121171 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 228-45 chr21 28568000 28568671 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 29017 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 118-152 chr5 80812207 80812436 + 0.75 NA intron (NM_002439, intron 19 of 23) intron (NM_002439, intron 19 of 23) -148042 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 138.5-112 chr2 219753372 219753641 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 125876 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 172.5-152 chr5 12670436 12670835 + 0.75 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) intron (NR_033383, intron 2 of 3) 2776 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 140.5-40 chr11 98570497 98570821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -450290 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 114-29 chr11 69890099 69890355 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -70811 NM_005247 2248 Hs.37092 NM_005247 ENSG00000186895 FGF3 HBGF-3|INT2 fibroblast growth factor 3 protein-coding 125.75-75 chr18 6835527 6835782 + 0.75 NA intron (NM_001010000, intron 1 of 16) intron (NM_001010000, intron 1 of 16) 1169 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 115-136 chr5 85788037 85788230 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -494311 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 150.25-23 chr10 99239530 99239893 + 0.75 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -3836 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 155.75-12 chr1 170736283 170736650 + 0.75 NA 3' UTR (NM_006902, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_006902, exon 5 of 5) 72335 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 152.5-71 chr17 71878060 71878441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147729 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 129.25-24 chr10 96714533 96714751 + 0.75 NA intron (NM_152309, intron 1 of 16) L1MC3|LINE|L1 5872 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 205.75-23 chr14 75996081 75996525 + 0.75 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 10540 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 181-85 chr5 40333549 40333839 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 281403 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 157-42 chr16 74043285 74043632 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 172063 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 132.5-134 chr2 206545132 206545585 + 0.75 NA intron (NM_003812, intron 6 of 25) AluSx4|SINE|Alu -98869 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 132.25-130 chr3 112531767 112531989 + 0.75 NA TTS (NM_022488) TTS (NM_022488) -29442 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 117.5-163 chr4 104678486 104678699 + 0.75 NA intron (NR_125926, intron 8 of 9) CR1-3_Croc|LINE|CR1 -183698 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 183.5-16 chr10 28842218 28842560 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4019 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 119.75-41 chr12 22095390 22095619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 49286 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 165.75-102 chr21 24442982 24443320 + 0.75 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) L1PA3|LINE|L1 14411 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 148.25-155 chr9 75718110 75718414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -172382 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 146.5-77 chr16 57150665 57151051 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31692 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 142-97 chr22 28453374 28453594 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 -6385 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 161-69 chr2 145378867 145379154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 711043 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 214.25-40 chr2 39949029 39949367 + 0.75 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 31564 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-83 chr18 27966090 27966367 + 0.75 NA intron (NM_001308176, intron 13 of 14) intron (NM_001308176, intron 13 of 14) 70413 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 123-100 chr2 43522531 43522837 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) intron (NM_001083953, intron 22 of 37) 73290 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 121.75-113 chr3 27738283 27738449 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15651 NM_001278183 8320 Hs.591663 NM_005442 ENSG00000163508 EOMES TBR2 eomesodermin protein-coding 166.75-36 chr12 111156826 111157284 + 0.75 NA intron (NM_001370598, intron 1 of 21) intron (NM_001370598, intron 1 of 21) 57051 NM_001370598 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 163.5-6 chr1 54848181 54848524 + 0.75 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 38843 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 145-7 chr1 84324497 84324808 + 0.75 NA intron (NM_001134663, intron 2 of 3) intron (NM_001134663, intron 2 of 3) 22001 NM_001134664 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 188.5-8 chr1 151851072 151851448 + 0.75 NA non-coding (NR_024237, exon 5 of 5) non-coding (NR_024237, exon 5 of 5) 2452 NM_182578 284486 Hs.132648 NM_182578 ENSG00000196407 THEM5 ACOT15 thioesterase superfamily member 5 protein-coding 171.25-28 chr11 100185533 100185922 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -501561 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 163.75-59 chr18 40974577 40974876 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 545951 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 137.5-245 chrX 7740461 7740728 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101668 NM_013452 26609 Hs.278906 NM_013452 ENSG00000182583 VCX VCX-10r|VCX-B1|VCX1|VCX10R|VCXB1 variable charge X-linked protein-coding 183-77 chr3 158320186 158320579 + 0.75 NA intron (NM_001271838, intron 5 of 9) (TTGTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -206326 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 216.5-3 chr1 147288570 147288897 + 0.75 NA intron (NM_001348462, intron 19 of 22) intron (NM_001348462, intron 19 of 22) 45591 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 176.5-85 chr2 28293407 28293661 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) intron (NM_199193, intron 11 of 13) 16925 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 137.5-71 chr15 42037423 42037818 + 0.75 NA intron (NM_001206670, intron 1 of 19) MER52A|LTR|ERV1 13083 NM_001206670 123745 Hs.668060 NM_001080490 ENSG00000188089 PLA2G4E - phospholipase A2 group IVE protein-coding 278-2 chr1 90006292 90006756 + 0.75 NA TTS (NM_182975) TTS (NM_182975) 11414 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 113.25-177 chr8 130817289 130817614 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 13 of 17) L1MC5|LINE|L1 223458 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 147.75-150 chr8 27682517 27682763 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -19037 NR_037417 100500858 NR_037417 ENSG00000284351 MIR3622A mir-3622a microRNA 3622a ncRNA 159.25-24 chr11 110070893 110071252 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22320 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 169.75-120 chr4 114000775 114001177 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21329 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 154.75-19 chr11 38367646 38368009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 278529 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 129.5-92 chr16 65337912 65338179 + 0.75 NA intron (NR_027755, intron 7 of 8) L1MB8|LINE|L1 -161472 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 112.25-158 chr5 8623612 8623808 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 162785 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 188-55 chr5 33478979 33479241 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 38334 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 132-117 chr3 124089402 124089725 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5118 NM_001024660 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 187.25-2 chr1 33074289 33074653 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6682 NM_001350401 113451 Hs.101807 NM_052998 ENSG00000142920 AZIN2 ADC|AZI2|AZIB1|ODC-p|ODC1L|ODCp antizyme inhibitor 2 protein-coding 194.5-9 chr1 224897234 224897707 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -32184 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 114.25-104 chr2 156642802 156643047 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 206545 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 132.25-54 chr14 21636023 21636244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1193 NM_001005466 26534 Hs.554580 NM_001005466 ENSG00000255582 OR10G2 OR14-41 olfactory receptor family 10 subfamily G member 2 protein-coding 156-96 chr21 30647761 30648057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5045 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 160.5-119 chr3 79866744 79867103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98925 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 246.75-82 chr9 71455758 71456446 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9131 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 204.25-45 chr18 2677241 2677715 + 0.75 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) L1MB7|LINE|L1 21591 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 182.25-90 chr5 33648104 33648417 + 0.75 NA intron (NM_001324512, intron 9 of 21) intron (NM_001324512, intron 9 of 21) 207484 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 229.75-14 chr12 27316923 27317387 + 0.75 NA intron (NM_015000, intron 9 of 13) intron (NM_015000, intron 9 of 13) -15681 NM_001248005 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 128.25-60 chr15 94519709 94519899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 163874 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 112.75-149 chr4 47874423 47874653 + 0.75 NA intron (NR_103795, intron 19 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -36432 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 163-113 chr7 86477877 86478322 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -165810 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 174.75-101 chr5 101896267 101896806 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 399748 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 187.25-52 chr2 21349041 21349333 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 225201 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 126.25-51 chr14 64165745 64166023 + 0.75 NA intron (NM_015180, intron 90 of 114) intron (NM_015180, intron 90 of 114) -48260 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 142-157 chr8 30101039 30101309 + 0.75 NA intron (NM_015344, intron 1 of 3) intron (NM_015344, intron 1 of 3) 5766 NM_015344 23484 Hs.146585 NM_015344 ENSG00000104660 LEPROTL1 HSPC112|Vps55|my047 leptin receptor overlapping transcript like 1 protein-coding 121.75-9 chr1 211551921 211552173 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27114 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 114.25-161 chr5 161187600 161187823 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -249085 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 166.5-128 chr3 19957427 19957826 + 0.75 NA intron (NM_001292048, intron 2 of 5) AluSz6|SINE|Alu 10529 NM_004162 5868 Hs.475663 NM_004162 ENSG00000144566 RAB5A RAB5 RAB5A, member RAS oncogene family protein-coding 176.25-66 chr2 74219814 74220309 + 0.75 NA intron (NM_133478, intron 30 of 30) CR1_Mam|LINE|CR1 21446 NM_006636 10797 Hs.469030 NM_006636 ENSG00000065911 MTHFD2 NMDMC methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase protein-coding 143.5-160 chr4 80712906 80713229 + 0.75 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -317641 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 189-8 chr1 101995214 101995684 + 0.75 NA intron (NR_110210, intron 1 of 7) intron (NR_110210, intron 1 of 7) 1785 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 124.25-90 chr2 15556085 15556457 + 0.75 NA intron (NR_052013, intron 3 of 50) intron (NR_052013, intron 3 of 50) 5063 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 196.5-125 chr5 67947641 67948062 + 0.75 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 154638 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 172-111 chr9 36537839 36538207 + 0.75 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -34839 NM_001256693 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 133.5-104 chr19 37625970 37626266 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 29347 NM_001320670 22835 Hs.668737 NM_014898 ENSG00000120784 ZFP30 ZNF745 ZFP30 zinc finger protein protein-coding 204.25-17 chr11 12391448 12391851 + 0.75 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 14078 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 147.25-118 chr6 38500705 38500923 + 0.75 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) 19218 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 163-117 chr8 79239205 79239523 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92824 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 245.25-39 chr2 98686402 98686835 + 0.75 NA intron (NM_012214, intron 2 of 15) AluSz|SINE|Alu -23145 NM_001160154 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 135.5-74 chr16 89540154 89540534 + 0.75 NA intron (NM_001363850, intron 9 of 17) AluJb|SINE|Alu -20313 NM_001243131 6137 Hs.410817 NM_000977 ENSG00000167526 RPL13 BBC1|D16S444E|D16S44E|L13 ribosomal protein L13 protein-coding 163.25-85 chr22 42265560 42265960 + 0.75 NA intron (NM_005650, intron 1 of 5) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -3993 NR_036498 388906 Hs.730075 NR_036498 OGFRP1 - opioid growth factor receptor pseudogene 1 pseudo 219-20 chr12 15493552 15493982 + 0.75 NA intron (NM_030667, intron 2 of 26) L1ME3C|LINE|L1 -52844 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 203-54 chr2 196793600 196794016 + 0.75 NA intron (NM_012086, intron 2 of 17) intron (NM_012086, intron 2 of 17) 5875 NM_012086 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 114.5-75 chr12 128299491 128299801 + 0.75 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 5554 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 184.75-2 chr1 98363600 98363976 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 153077 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 172-56 chr2 193458961 193459382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 709326 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 121.25-123 chr22 17198102 17198331 + 0.75 NA intron (NM_001282229, intron 3 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 1439 NM_177405 51816 Hs.170310 NM_017424 ENSG00000093072 ADA2 ADGF|CECR1|IDGFL|PAN|SNEDS|VAIHS adenosine deaminase 2 protein-coding 119.25-128 chr3 87254521 87254838 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001244644, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001244644, exon 5 of 5) 21905 NM_001122757 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 131.5-107 chr2 41212256 41212500 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -665177 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 139.5-66 chr14 57556586 57556825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62848 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 138.5-35 chr11 64909627 64909908 + 0.75 NA exon (NM_001367971, exon 14 of 41) exon (NM_001367971, exon 14 of 41) -7312 NR_106807 102466727 NR_106807 ENSG00000274314 MIR6749 hsa-mir-6749 microRNA 6749 ncRNA 141-62 chr18 5108985 5109248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27934 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 181-71 chr3 64080775 64081130 + 0.75 NA intron (NR_033978, intron 2 of 3) intron (NR_033978, intron 2 of 3) 6411 NR_033978 100287879 Hs.452789 NR_033978 ENSG00000189196 LINC00994 - long intergenic non-protein coding RNA 994 ncRNA 139.75-143 chr4 189149617 189150005 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 373154 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 141-5 chr1 116554535 116554757 + 0.75 NA intron (NM_001779, intron 1 of 5) intron (NM_001779, intron 1 of 5) 5465 NR_039621 100616384 NR_039621 ENSG00000264419 MIR548AC - microRNA 548ac ncRNA 144-38 chr14 71100354 71100722 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 30 of 35) L1PA16|LINE|L1 193079 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 185.5-61 chr15 83348608 83348930 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -64105 NM_001717 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 184.25-89 chr4 51852446 51852775 + 0.75 NA intron (NM_001287757, intron 2 of 11) intron (NM_001287757, intron 2 of 11) 9031 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 120-85 chr2 35091745 35091959 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -379553 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 264.25-54 chr8 125362525 125363130 + 0.75 NA intron (NM_001349486, intron 7 of 7) intron (NM_001349486, intron 7 of 7) -67531 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 175.5-83 chr2 29856275 29856573 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) MIRb|SINE|MIR 65162 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 130.25-68 chr15 67805238 67805542 + 0.75 NA intron (NM_001206804, intron 21 of 21) intron (NM_001206804, intron 21 of 21) -20119 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 153.5-54 chr14 48420841 48421056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -625934 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 132.25-44 chr11 114236405 114236746 + 0.75 NA intron (NM_006006, intron 4 of 6) intron (NM_006006, intron 4 of 6) -59238 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 131.25-202 chr8 122058777 122059048 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -417472 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 162.75-99 chr3 105495216 105495475 + 0.75 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 128436 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 191.75-44 chr16 47295831 47296304 + 0.75 NA intron (NM_030790, intron 10 of 17) AluJr|SINE|Alu 151999 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 210.5-28 chr12 86804662 86805272 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 1 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 34033 NM_013244 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 166.5-218 chrX 97328792 97329165 + 0.75 NA intron (NM_007309, intron 23 of 26) intron (NM_007309, intron 23 of 26) 235557 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 164.75-50 chr14 69892265 69892548 + 0.75 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 12990 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 157.5-102 chr2 70967550 70967835 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -10753 NM_001369683 79998 Hs.512744 NM_024933 ENSG00000144031 ANKRD53 - ankyrin repeat domain 53 protein-coding 140.25-176 chr7 27734692 27735034 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4510 NM_001206901 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 114.5-29 chr1 238163538 238163851 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -272772 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 167.75-116 chr5 139714274 139714758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31707 NR_105053 101929696 Hs.147408 NR_105052 ENSG00000249131 PSD2-AS1 - PSD2 antisense RNA 1 ncRNA 156.5-104 chr21 42235827 42236256 + 0.75 NA intron (NM_207627, intron 3 of 15) intron (NM_207627, intron 3 of 15) 16143 NM_207174 9619 Hs.124649 NM_004915 ENSG00000160179 ABCG1 ABC8|WHITE1 ATP binding cassette subfamily G member 1 protein-coding 274.75-27 chr2 108393124 108393701 + 0.75 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 15458 NR_135776 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 250.5-16 chr11 100007772 100008394 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 8 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 451938 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 187.75-41 chr17 64287878 64288300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24829 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 268-15 chr12 2844258 2844829 + 0.75 NA intron (NR_147202, intron 14 of 15) AluSx|SINE|Alu -9508 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 144.75-137 chr5 108904324 108904673 + 0.75 NA intron (NR_146155, intron 10 of 19) L2a|LINE|L2 -20108 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 178.25-22 chr12 16163034 16163367 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 114485 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 165.75-86 chr2 141670411 141670743 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 461124 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 173-149 chr9 91765233 91765708 + 0.75 NA intron (NM_001318204, intron 2 of 7) intron (NM_001318204, intron 2 of 7) -129125 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 116.25-91 chr18 37721800 37721967 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64748 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 113-105 chr20 62024181 62024466 + 0.75 NA intron (NM_003185, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 -40479 NR_130463 100422838 NR_130463 ENSG00000265306 MIR3195 - microRNA 3195 ncRNA 151-60 chr2 76913099 76913509 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 -72661 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 195.75-100 chr5 179989031 179989418 + 0.75 NA intron (NM_001280801, intron 3 of 7) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 26173 NR_029885 442908 NR_029885 ENSG00000198995 MIR340 MIRN340|hsa-mir-340|mir-340 microRNA 340 ncRNA 153.25-103 chr5 83929624 83929934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -208924 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 150.5-131 chr3 90448699 90448939 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1341198 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 173-116 chr5 167440995 167441389 + 0.75 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -132467 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 292.75-27 chr4 36210955 36211429 + 0.75 NA intron (NR_146894, intron 5 of 32) intron (NR_146894, intron 5 of 32) 32747 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 150.25-70 chr19 27762912 27763355 + 0.75 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -30298 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 119.75-158 chr4 77691301 77691593 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 127617 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 203.25-5 chr1 72968431 72968896 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -337507 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 202.25-49 chr22 27175628 27176094 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11655 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 123.75-167 chr7 3339278 3339600 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MD1|LINE|L1 38187 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 237.25-26 chr14 64393962 64394594 + 0.75 NA intron (NM_005956, intron 1 of 27) MIRc|SINE|MIR 5925 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 243.75-11 chr11 31605270 31605783 + 0.75 NA intron (NM_001288725, intron 5 of 10) intron (NM_001288725, intron 5 of 10) 95759 NM_001288726 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 135.25-66 chr15 34805549 34805792 + 0.75 NA intron (NR_120329, intron 2 of 2) L3b|LINE|CR1 -10121 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 180.5-115 chr4 107191360 107191651 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -155192 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 221.5-75 chr5 9791551 9792033 + 0.75 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) MER5B|DNA|hAT-Charlie -62585 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 185.25-7 chr10 14152349 14152789 + 0.75 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 78285 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 158.75-37 chr12 15524672 15525014 + 0.75 NA exon (NM_002848, exon 11 of 26) exon (NM_002848, exon 11 of 26) -21768 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 239.25-66 chr4 129618221 129618823 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 152956 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 204.25-42 chr16 68552680 68553064 + 0.75 NA intron (NR_130976, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 13581 NR_130976 146198 Hs.461074 NM_133458 ENSG00000184939 ZFP90 FIK|NK10|ZNF756|zfp-90 ZFP90 zinc finger protein protein-coding 122.75-125 chr3 42762569 42762861 + 0.75 NA intron (NM_144719, intron 1 of 15) MER77|LTR|ERVL -7897 NR_122070 729083 Hs.713395 NR_122070 ENSG00000225611 LINC02158 - long intergenic non-protein coding RNA 2158 ncRNA 246.5-66 chr6 149241806 149242251 + 0.75 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) intron (NM_001292035, intron 2 of 6) 15523 NR_149096 105378049 Hs.615624 NR_149096 ENSG00000225924 TAB2-AS1 - TAB2 antisense RNA 1 ncRNA 214.25-30 chr18 1255066 1255595 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 104299 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 228-6 chr1 225617959 225618522 + 0.75 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) intron (NM_001008493, intron 1 of 14) 34883 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 182-12 chr10 74147562 74147837 + 0.75 NA intron (NM_207012, intron 1 of 9) intron (NM_207012, intron 1 of 9) 3129 NM_207012 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 179.5-10 chr1 171740990 171741443 + 0.75 NA intron (NM_001185127, intron 1 of 7) intron (NM_001185127, intron 1 of 7) 849 NM_003762 8674 Hs.6651 NM_003762 ENSG00000117533 VAMP4 VAMP-4|VAMP24 vesicle associated membrane protein 4 protein-coding 210.5-112 chr6 64464215 64464733 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) L1MA8|LINE|L1 657638 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 145.25-177 chr9 18330363 18330609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -143667 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 175.5-176 chr8 140875355 140875688 + 0.75 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) L2a|LINE|L2 125483 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 153.5-23 chr10 65073073 65073416 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -148726 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 229.5-112 chr5 155591331 155591975 + 0.75 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 577898 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 158.25-158 chrX 74729382 74729696 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -114915 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 169.5-150 chr6 38917650 38918083 + 0.75 NA intron (NM_001371, intron 68 of 91) intron (NM_001371, intron 68 of 91) 35241 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 198.25-88 chr6 51152189 51152607 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 333527 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 212.5-71 chr3 94401007 94401441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 338163 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 123.75-59 chr14 61731090 61731302 + 0.75 NA intron (NM_181054, intron 6 of 13) intron (NM_181054, intron 6 of 13) 17893 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 163.5-33 chr11 96367049 96367584 + 0.75 NA intron (NM_024725, intron 7 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22500 NM_001363594 79780 Hs.525088 NM_014148 ENSG00000149231 CCDC82 HSPC048 coiled-coil domain containing 82 protein-coding 125.75-11 chr1 167268621 167269003 + 0.75 NA intron (NM_001365848, intron 2 of 17) intron (NM_001365848, intron 2 of 17) 47926 NR_037163 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 197.5-35 chr13 72431995 72432311 + 0.75 NA Intergenic Eulor6B|DNA?|DNA? 295476 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 173.25-4 chr1 82934737 82935020 + 0.75 NA intron (NR_147074, intron 2 of 10) L1ME4a|LINE|L1 31695 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 119.75-201 chr8 122163325 122163578 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 405193 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 152.25-56 chr14 86667817 86668259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -237740 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 164-137 chr8 85406153 85406537 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -28232 NM_001128831 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 178.5-108 chr3 115718107 115718472 + 0.75 NA intron (NM_002045, intron 2 of 2) intron (NM_002045, intron 2 of 2) 94779 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 176.25-24 chr11 40673086 40673654 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) (ATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -380240 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 259.25-36 chr5 29742094 29742485 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -138271 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 119.5-9 chr1 69280759 69280918 + 0.75 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger -152417 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 225.25-32 chr17 66098680 66099137 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 6 of 26) intron (NM_001353129, intron 6 of 26) 92984 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 132.5-130 chr2 163312779 163313026 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 423106 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 265-33 chr5 25883974 25884566 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 693317 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 136.75-187 chr7 96253568 96253882 + 0.75 NA intron (NM_001160210, intron 3 of 17) intron (NM_001160210, intron 3 of 17) -33969 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 170.5-125 chr3 163027015 163027329 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 276129 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 258.25-63 chr8 135658387 135659279 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 201377 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 200.5-131 chr7 101662180 101662532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33060 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 124.75-34 chr10 90733943 90734157 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 123989 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 145.75-155 chr7 91473847 91474188 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 209584 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 184.75-28 chr14 66696489 66696931 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) L1MDa|LINE|L1 189303 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 264.25 chr1 14859588 14859982 + 0.75 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) -64344 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 215.75-5 chr1 80832694 80833138 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 191629 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 125.75-182 chr8 53636453 53636787 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -112655 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 127-97 chr2 41901241 41901470 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 23800 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 119.75-59 chr14 53628854 53629174 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 319470 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 207.25-72 chr5 59951917 59952300 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -58382 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 179.75-57 chr2 53945533 53945888 + 0.75 NA intron (NM_014614, intron 3 of 46) intron (NM_014614, intron 3 of 46) 25283 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 117.25-119 chr2 123637553 123637842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 387477 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 185-77 chr7 19659291 19659734 + 0.75 NA Intergenic HERV9-int|LTR|ERV1 45924 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 161-80 chr4 24096545 24096778 + 0.75 NA intron (NR_148982, intron 1 of 13) intron (NR_148982, intron 1 of 13) -206614 NR_148984 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 136.75-109 chr2 211312754 211313105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 695358 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 189-9 chr1 114553805 114554090 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 27668 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 256.5-7 chr10 59679777 59680311 + 0.75 NA intron (NM_194298, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 29847 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 162.25-25 chr11 20029137 20029557 + 0.75 NA intron (NM_001111019, intron 2 of 27) MIR3|SINE|MIR 6791 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 146.75-53 chr15 95366279 95366610 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39344 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 117.25-111 chr2 82279792 82280002 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -576906 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 166.25-142 chr8 122714681 122715049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20759 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 163.75-55 chr17 82416131 82416500 + 0.75 NA intron (NR_033265, intron 1 of 9) intron (NR_033265, intron 1 of 9) -2032 NM_173620 284004 Hs.744207 NM_173620 ENSG00000169660 HEXD HEXDC hexosaminidase D protein-coding 173.5-7 chr1 115455760 115456216 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117752 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 167.25-53 chr15 69677726 69678059 + 0.75 NA intron (NR_126438, intron 3 of 3) intron (NR_126438, intron 3 of 3) 85692 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 178.5-37 chr12 103712156 103712577 + 0.75 NA intron (NM_017564, intron 40 of 68) intron (NM_017564, intron 40 of 68) 125093 NM_017564 55576 Hs.408249 NM_017564 ENSG00000136011 STAB2 FEEL2|FELE-2|FELL2|FEX2|HARE|SCARH1 stabilin 2 protein-coding 129.5-218 chr7 120146620 120146823 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -126454 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 119.25-45 chr12 33760233 33760441 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262159 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 163.5-25 chr10 83858871 83859309 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -182001 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 211.25-96 chr8 107159471 107159806 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 176877 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 202.75-114 chr9 77249621 77250051 + 0.75 NA intron (NM_001018038, intron 20 of 68) intron (NM_001018038, intron 20 of 68) -71919 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 179.5-32 chr11 38523950 38524203 + 0.75 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 122280 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 141.75-89 chr2 56466154 56466504 + 0.75 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -280559 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 171.25-66 chr18 59902151 59902458 + 0.75 NA intron (NM_021127, intron 1 of 1) intron (NM_021127, intron 1 of 1) 2308 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 173-143 chr8 124474577 124474883 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_007218) promoter-TSS (NM_007218) -37 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 177.5-80 chr2 83755356 83755675 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232701 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 152.5-116 chr3 90117878 90118229 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 1010432 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 135.5-114 chr2 183165580 183165953 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 41323 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 122-53 chr13 91373340 91373565 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 22138 NR_029508 407048 Hs.24115 NR_029508 ENSG00000283705 MIR92A1 C13orf25|MIR17HG|MIR92-1|MIRH1|MIRHG1|MIRN92-1|MIRN92A-1|MIRN92A1|miRNA92-1|mir-92a-1 microRNA 92a-1 ncRNA 181.75-4 chr1 58353040 58353521 + 0.75 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -102733 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 166.25-101 chr3 47562195 47562492 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001206943, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001206943, exon 5 of 5) 16522 NM_001206943 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 125.5-170 chr3 52933478 52933833 + 0.75 NA intron (NM_016329, intron 5 of 20) L2b|LINE|L2 -36107 NM_198563 375346 Hs.744189 NM_198563 ENSG00000213533 STIMATE TMEM110 STIM activating enhancer protein-coding 123-201 chr9 116442262 116442582 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 20 of 21) intron (NM_014010, intron 20 of 21) -41816 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 126-157 chr6 61714708 61714954 + 0.75 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) L1PB4|LINE|L1 140701 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 175.75-39 chr14 51286197 51286538 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 42018 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 169.75-31 chr11 103109376 103109639 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001080463) promoter-TSS (NM_001080463) 81 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 115.75-63 chr14 55816643 55816857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20076 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 181.5-133 chr5 123184191 123184571 + 0.75 NA intron (NM_001136239, intron 7 of 7) intron (NM_001136239, intron 7 of 7) -94065 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 232.25-44 chr3 22547997 22548366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 591042 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 161.75-49 chr17 30311366 30311807 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19642 NM_000386 642 Hs.371914 NM_000386 ENSG00000108578 BLMH BH|BMH bleomycin hydrolase protein-coding 254.75-58 chrX 70596256 70596698 + 0.75 NA intron (NM_001003811, intron 25 of 30) L1MB8|LINE|L1 -140483 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 154-118 chr6 102937552 102937818 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 1538700 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 115.75-143 chr3 86563347 86563649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 81555 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 196.75-35 chr13 79929436 79929932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57098 NR_120413 101927195 Hs.342412 NR_120413 ENSG00000229175 LINC00382 TCONS_00021500 long intergenic non-protein coding RNA 382 ncRNA 123-90 chr19 12348590 12348859 + 0.75 NA TTS (NM_001363774) TTS (NM_001363774) -15091 NM_001363608 147837 Hs.663510 NM_145276 ENSG00000188868 ZNF563 - zinc finger protein 563 protein-coding 135.75-178 chr6 23825794 23826027 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -300305 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 119-87 chr2 71671027 71671257 + 0.75 NA intron (NM_001130985, intron 50 of 54) intron (NM_001130985, intron 50 of 54) 204443 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 115.5-182 chr4 30485844 30486042 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -234426 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 252-22 chr14 67492654 67493146 + 0.75 NA intron (NM_001348546, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -4179 NM_001348541 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 118-168 chr6 131609885 131610087 + 0.75 NA intron (NM_015979, intron 12 of 30) intron (NM_015979, intron 12 of 30) 18256 NM_001270521 9439 Hs.29679 NM_004830 ENSG00000112282 MED23 ARC130|CRSP130|CRSP133|CRSP3|DRIP130|MRT18|SUR-2|SUR2 mediator complex subunit 23 protein-coding 137-83 chr2 133610176 133610584 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41917 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 124.25-183 chr7 14172594 14172812 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 24 of 24) intron (NM_001350717, intron 24 of 24) -181278 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 118-90 chr2 135650612 135650853 + 0.75 NA intron (NM_001354199, intron 16 of 25) intron (NM_001354199, intron 16 of 25) -14665 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 125-125 chr5 23754144 23754401 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -197076 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 167.25-85 chr2 123044542 123044965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28728 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 162.5-49 chr14 47168538 47168934 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 174510 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 131.5-59 chr14 58495798 58496183 + 0.75 NA intron (NM_001329944, intron 26 of 31) intron (NM_001329944, intron 26 of 31) 56309 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 262.5-42 chr20 52358903 52359314 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -167123 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 124-80 chr2 35923109 35923433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 432299 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 153.5-117 chr20 58849998 58850272 + 0.75 NA intron (NR_002785, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 768 NR_002785 149775 Hs.122718 NR_002785 ENSG00000235590 GNAS-AS1 GNAS-AS|GNAS1AS|GNASAS|NCRNA00075|NESP-AS|NESPAS|SANG GNAS antisense RNA 1 ncRNA 125.75-101 chr2 149094463 149094751 + 0.75 NA intron (NM_001317004, intron 1 of 6) intron (NM_001317004, intron 1 of 6) 17085 NM_001317004 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 157.25-35 chr12 115311820 115312127 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -627798 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 188-49 chr3 195432133 195432463 + 0.75 NA intron (NM_012287, intron 1 of 22) L1MB7|LINE|L1 10722 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 137.25-44 chr14 56917121 56917431 + 0.75 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 104118 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 138.5-127 chr22 45828042 45828252 + 0.75 NA intron (NM_013236, intron 10 of 11) AluJb|SINE|Alu 67623 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 237.75-66 chr5 81243210 81243633 + 0.75 NA intron (NR_034122, intron 3 of 3) intron (NR_034122, intron 3 of 3) 10099 NM_001099735 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 114-26 chr10 127423633 127423927 + 0.75 NA intron (NM_001290223, intron 46 of 51) intron (NM_001290223, intron 46 of 51) -125569 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 209-21 chr14 57728505 57728966 + 0.75 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 136264 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 235.5-4 chr1 83774760 83775257 + 0.75 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) MER58A|DNA|hAT-Charlie 85538 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 215.75-75 chr5 37202958 37203511 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 18 of 51) L1ME1|LINE|L1 -45812 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 119.5-66 chr12 120001903 120002151 + 0.75 NA intron (NR_147894, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 12183 NM_207311 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 194.25-81 chr4 65323833 65324132 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001281766, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001281766, exon 17 of 17) -319482 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 186.75-124 chrX 67748747 67749127 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 204314 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 133.25-161 chr5 6474422 6474698 + 0.75 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 25701 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 200.25-51 chr19 12479285 12479768 + 0.75 NA intron (NM_152601, intron 1 of 3) intron (NM_152601, intron 1 of 3) 5290 NM_152601 163051 Hs.631623 NM_152601 ENSG00000242852 ZNF709 - zinc finger protein 709 protein-coding 134.75-212 chr8 83746077 83746455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 342508 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 142-8 chr1 188719594 188719879 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 1276108 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 120.5-161 chr4 56168312 56168623 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -1728 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 121.5-160 chr21 16855518 16855865 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 265454 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 272.5-65 chr7 78106177 78106790 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 19 of 20) L1MA3|LINE|L1 -240759 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 146.5-14 chr1 119909266 119909568 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -12902 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 132.5-129 chr2 112875746 112876032 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37082 NM_173204 27178 Hs.166371 NM_014439 ENSG00000125571 IL37 FIL1|FIL1(ZETA)|FIL1Z|IL-1F7|IL-1H|IL-1H4|IL-1RP1|IL-37|IL1F7|IL1H4|IL1RP1 interleukin 37 protein-coding 195.25-98 chr8 130737721 130738048 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -294210 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 112.75-116 chr20 6032581 6032811 + 0.75 NA intron (NR_136617, intron 4 of 5) intron (NR_136617, intron 4 of 5) 21364 NM_152611 164312 Hs.149133 NM_152611 ENSG00000125872 LRRN4 C20orf75|NLRR-4|NLRR4|dJ1056H1.1 leucine rich repeat neuronal 4 protein-coding 169.25-80 chr4 41332465 41332722 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27014 NM_001289124 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 202-64 chr6 150553392 150553809 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -46285 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 225.75-60 chr4 71557136 71557657 + 0.75 NA intron (NM_003759, intron 18 of 22) MIR1_Amn|SINE|MIR 218343 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 115.75-139 chr3 30298698 30298999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -220020 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 237.75-82 chr8 127647752 127648481 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 85851 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 212.25-79 chr6 63400583 63401065 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -80841 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 194.75-33 chr16 68993992 68994407 + 0.75 NA intron (NM_024562, intron 15 of 17) intron (NM_024562, intron 15 of 17) -111454 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 128-134 chr6 48199098 48199385 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -130552 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 245.25-47 chr3 111682470 111682988 + 0.75 NA intron (NM_001185106, intron 1 of 4) intron (NM_001185106, intron 1 of 4) -5296 NR_046733 100874115 Hs.626740 NR_046733 PLCXD2-AS1 - PLCXD2 antisense RNA 1 ncRNA 166.5-23 chr10 17643897 17644154 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_110370) promoter-TSS (NR_110370) -107 NR_110370 102723166 Hs.547311 NR_110370 ENSG00000260589 STAM-AS1 locus3182 STAM antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 218.25-7 chr10 8783207 8783611 + 0.75 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -114580 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 114.75-115 chr22 28051570 28051744 + 0.75 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -131045 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 145.25-112 chr4 48685964 48686351 + 0.75 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) intron (NM_015030, intron 2 of 63) 94142 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 210.5-139 chr9 13441816 13442154 + 0.75 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -10656 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 268.25-48 chr8 138072612 138073091 + 0.75 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) L1PA16|LINE|L1 10694 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 214.25-60 chr4 61703212 61703658 + 0.75 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 458330 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-47 chr17 64035057 64035564 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14676 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 160.25-33 chr13 46940401 46940710 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -43479 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 121-168 chr6 77289582 77289790 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 174336 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 153.5-202 chr8 119138451 119138885 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -69695 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 181-57 chr2 172185264 172185653 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 82452 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 149.25-181 chr8 83477101 83477318 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 73451 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 125-140 chr6 89172459 89172668 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26508 NM_001010853 135293 Hs.356247 NM_001010853 ENSG00000146281 PM20D2 ACY1L2 peptidase M20 domain containing 2 protein-coding 125.5-101 chr16 72561126 72561371 + 0.75 NA intron (NR_159370, intron 2 of 5) intron (NR_159370, intron 2 of 5) 103722 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 151.5-120 chr3 71879622 71879987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94656 NM_021935 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 156.25-161 chrX 11109011 11109220 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2217 NM_001122608 3052 Hs.211571 NM_005333 ENSG00000004961 HCCS CCHL|LSDMCA1|MCOPS7|MLS holocytochrome c synthase protein-coding 133-45 chr14 42330266 42330496 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 723525 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 123.25-197 chr8 39060970 39061250 + 0.75 NA intron (NR_027638, intron 14 of 20) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -42425 NR_145988 109616979 NR_145736 ENSG00000207199 SNORD38D - small nucleolar RNA, C/D box 38D snoRNA 114.75-190 chr8 73811006 73811209 + 0.75 NA intron (NR_073119, intron 2 of 5) intron (NR_073119, intron 2 of 5) -63399 NM_001164384 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 231-27 chr14 75960779 75961300 + 0.75 NA exon (NM_003239, exon 6 of 7) exon (NM_003239, exon 6 of 7) 20956 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 205.25-103 chr7 113843947 113844401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74835 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 162.25-52 chr14 70953689 70954004 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 2 of 35) AluSq2|SINE|Alu 46387 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 133.5-156 chr3 16974476 16974733 + 0.75 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 41408 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 120.25-210 chr8 51083494 51083758 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 725819 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 176.25-42 chr15 24617956 24618407 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -57213 NM_018958 23742 Hs.649663 NM_018958 ENSG00000185823 NPAP1 C15orf2 nuclear pore associated protein 1 protein-coding 139.75-55 chr14 89026369 89026747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 201907 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 223-24 chr14 50682347 50682760 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -14247 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 165.5-72 chr2 9725158 9725568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94366 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 241-52 chr8 85919207 85919892 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -91607 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 141.5-159 chr4 52027219 52027584 + 0.75 NA intron (NM_000232, intron 5 of 5) intron (NM_000232, intron 5 of 5) -7038 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 125.25-10 chr1 106410136 106410348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -381989 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 138.5-159 chr5 124354491 124354741 + 0.75 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 83904 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 176.5-47 chr13 32839106 32839606 + 0.75 NA intron (NR_047020, intron 4 of 4) intron (NR_047020, intron 4 of 4) 72296 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 121.75-190 chr8 99380505 99380787 + 0.75 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 156084 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 133.5-185 chr4 71832043 71832328 + 0.75 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -26665 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 114-172 chrX 100824483 100824697 + 0.75 NA intron (NM_001306209, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR 4227 NM_001306209 1478 Hs.132370 NM_001325 ENSG00000101811 CSTF2 CstF-64 cleavage stimulation factor subunit 2 protein-coding 140.25-79 chr18 68998451 68998668 + 0.75 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) MLT2A2|LTR|ERVL 200479 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 116-40 chr13 66691761 66692001 + 0.75 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -133288 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 145.75-36 chr14 50321945 50322324 + 0.75 NA intron (NM_001370605, intron 3 of 5) intron (NM_001370605, intron 3 of 5) 9810 NM_015684 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 152-108 chr4 30493964 30494259 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -226258 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 166.5-211 chr9 32885189 32885667 + 0.75 NA Intergenic ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 101888 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 123-33 chr11 46369063 46369227 + 0.75 NA intron (NM_201533, intron 4 of 30) AluSx|SINE|Alu -7257 NR_039837 100616368 NR_039837 ENSG00000264102 MIR4688 mir-4688 microRNA 4688 ncRNA 176.5-31 chr11 95115544 95115965 + 0.75 NA intron (NM_015036, intron 1 of 1) L1MA2|LINE|L1 25908 NM_015036 23052 Hs.167115 NM_015036 ENSG00000149218 ENDOD1 - endonuclease domain containing 1 protein-coding 127.25-141 chr4 52920771 52921075 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 58606 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 132.5-189 chr4 163452203 163452504 + 0.75 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 21401 NM_032136 84076 Hs.303923 NM_032136 ENSG00000151005 TKTL2 - transketolase like 2 protein-coding 194-53 chr22 40228917 40229215 + 0.75 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) intron (NM_015088, intron 1 of 20) 51141 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 132.75-95 chr2 31848146 31848469 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -44327 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 162.5-59 chr16 83405652 83405951 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -102545 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 171-137 chr9 113290285 113290591 + 0.75 NA intron (NR_136266, intron 10 of 13) intron (NR_136266, intron 10 of 13) 8427 NM_001371234 188.5-6 chr1 103001274 103001611 + 0.75 NA intron (NM_001854, intron 24 of 66) intron (NM_001854, intron 24 of 66) 107054 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 193.75-42 chr14 52348818 52349232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34713 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 216.75-80 chr8 134764973 134765418 + 0.75 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 35412 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 328.75-7 chr17 67566111 67566725 + 0.75 NA intron (NM_181671, intron 4 of 9) AluSz6|SINE|Alu -94833 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 229.25-70 chr6 125328229 125328613 + 0.75 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR -26454 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 314.5-24 chr6 48889934 48890721 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 572926 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 147.75-2 chr1 27273748 27274055 + 0.75 NA intron (NM_001276252, intron 3 of 15) L1MC4|LINE|L1 39269 NM_015023 23038 Hs.469154 NM_015023 ENSG00000142784 WDTC1 ADP|DCAF9 WD and tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 145.75-128 chr5 95740774 95741184 + 0.75 NA intron (NM_014899, intron 3 of 11) L1MC4|LINE|L1 -8877 NM_001349303 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 156.5-115 chr3 76788643 76788980 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -251288 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 171.5-111 chr3 186734640 186734910 + 0.75 NA intron (NM_001102416, intron 7 of 9) AluSx|SINE|Alu 17416 NM_000893 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 121-181 chr7 107680965 107681172 + 0.75 NA intron (NM_000441, intron 6 of 20) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -19270 NR_028137 286002 Hs.512611 NR_028137 SLC26A4-AS1 - SLC26A4 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-174 chr6 104131541 104131820 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 727866 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 238-18 chr15 52503406 52503847 + 0.75 NA intron (NM_001142495, intron 1 of 39) AluJr|SINE|Alu 25254 NM_001142495 4644 Hs.21213 NM_000259 ENSG00000197535 MYO5A GS1|MYH12|MYO5|MYR12 myosin VA protein-coding 160.75-40 chr13 110124924 110125312 + 0.75 NA non-coding (NR_148221, exon 3 of 3) non-coding (NR_148221, exon 3 of 3) 3416 NR_148221 105370361 Hs.134728 NR_148221 LOC105370361 - uncharacterized LOC105370361 ncRNA 144-151 chrX 49937449 49937931 + 0.75 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) intron (NM_001127899, intron 3 of 14) 15094 NM_001127899 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 169-104 chr8 10955347 10955624 + 0.75 NA intron (NM_173683, intron 1 of 2) intron (NM_173683, intron 1 of 2) 79817 NR_030328 693183 NR_030328 ENSG00000207600 MIR598 MIRN598|hsa-mir-598|mir-598 microRNA 598 ncRNA 157.5-160 chr5 44056479 44056924 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -332031 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 141-94 chr22 23323283 23323685 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3132 NR_149133 102724679 Hs.517462 NR_149133 ENSG00000236611 LINC02556 - long intergenic non-protein coding RNA 2556 ncRNA 198-72 chr7 90693388 90693863 + 0.75 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -15773 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 138-94 chr22 25862723 25863093 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) L1M4a2|LINE|L1 120720 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 189-78 chr3 101523459 101523922 + 0.75 NA non-coding (NR_036433, exon 2 of 2) non-coding (NR_036433, exon 2 of 2) 4823 NR_036433 131909 Hs.518125 NR_036433 FAM172BP FAM172B family with sequence similarity 172 member B, pseudogene pseudo 211.5-49 chr14 50635579 50636022 + 0.75 NA intron (NM_021818, intron 4 of 4) AluSc5|SINE|Alu 32506 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 126.75-39 chr12 96225866 96226095 + 0.75 NA intron (NM_005230, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu -29518 NM_001303511 2004 Hs.46523 NM_005230 ENSG00000111145 ELK3 ERP|NET|SAP-2|SAP2 ETS transcription factor ELK3 protein-coding 133.5-12 chr1 163955476 163955698 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -532396 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 208.75-63 chr5 15507786 15508360 + 0.75 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 6635 NM_001278317 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 257.25-18 chr18 9670243 9670653 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37853 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 181-86 chr5 105976628 105976962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 877321 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 122-11 chr1 101736560 101736840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110380 NR_110212 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 155-84 chr3 14709794 14710230 + 0.75 NA intron (NM_001184957, intron 7 of 16) L1M4|LINE|L1 34871 NM_001184958 84077 Hs.661452 NM_032137 ENSG00000131379 C3orf20 - chromosome 3 open reading frame 20 protein-coding 155.25-12 chr1 147894470 147894759 + 0.75 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger -8181 NM_005267 2703 Hs.632441 NM_005267 ENSG00000121634 GJA8 CAE|CAE1|CTRCT1|CX50|CZP1|MP70 gap junction protein alpha 8 protein-coding 114-82 chr2 182627234 182627450 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -88915 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 227-63 chr7 7046457 7046792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20421 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 121-167 chr6 50129288 50129637 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -79533 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 146.5-83 chr17 59758500 59758781 + 0.75 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) AluJo|SINE|Alu 50986 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 124.75-178 chr6 39408554 39408776 + 0.75 NA intron (NM_001289024, intron 2 of 9) L1ME3G|LINE|L1 22725 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 217.75-65 chr6 43839202 43839657 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12904 NR_149142 285857 Hs.582798 NR_149142 ENSG00000283215 LINC02537 - long intergenic non-protein coding RNA 2537 ncRNA 206.5-6 chr10 10614877 10615241 + 0.75 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 152509 NM_001326317 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 275.5-34 chr20 31534261 31534876 + 0.75 NA intron (NM_178580, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu 20126 NM_178582 81502 Hs.373741 NM_030789 ENSG00000101294 HM13 H13|IMP1|IMPAS|IMPAS-1|MSTP086|PSENL3|PSL3|SPP|SPPL1 histocompatibility minor 13 protein-coding 126.25-73 chr18 12456573 12456925 + 0.75 NA intron (NM_020148, intron 11 of 15) intron (NM_020148, intron 11 of 15) 23975 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 186.5-44 chr16 3320808 3321120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14752 NM_001324041 7627 Hs.513292 NM_153028 ENSG00000162086 ZNF75A - zinc finger protein 75a protein-coding 149-103 chr5 75451235 75451572 + 0.75 NA intron (NM_031361, intron 3 of 16) intron (NM_031361, intron 3 of 16) 60226 NM_031361 10087 Hs.270437 NM_005713 ENSG00000113163 CERT1 CERT|CERTL|COL4A3BP|GPBP|MRD34|STARD11 ceramide transporter 1 protein-coding 176.25-124 chr7 38916494 38916814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7454 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 114-114 chr4 89143949 89144199 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 31257 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 209.25-102 chr6 129998106 129998616 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -20008 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 115.5-3 chr1 49357290 49357532 + 0.75 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) intron (NR_136623, intron 2 of 12) 100000 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 146.5-212 chr7 94610519 94610786 + 0.75 NA intron (NM_001346717, intron 5 of 9) L1MB8|LINE|L1 45481 NM_001362807 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 178.5-33 chr12 23981424 23981837 + 0.75 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -30598 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 122.5-81 chr17 49865422 49865749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17568 NM_001077506 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 154.25-90 chr2 180874165 180874411 + 0.75 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) L1MA3|LINE|L1 -106097 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 222-34 chr19 29313469 29313825 + 0.75 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) MIRc|SINE|MIR -100496 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 141.25-171 chr7 50436441 50436768 + 0.75 NA TTS (NM_001346564) TTS (NM_001346564) 13746 NM_001287492 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 135-94 chr20 45433159 45433376 + 0.75 NA intron (NR_159957, intron 2 of 3) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 5845 NR_159957 105372631 Hs.729907 NR_159957 LOC105372631 - uncharacterized LOC105372631 ncRNA 156.75-162 chr8 84325144 84325389 + 0.75 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) -90218 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 205.25-51 chr2 80253354 80253719 + 0.75 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 51216 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 270-34 chr3 15787908 15788528 + 0.75 NA intron (NM_001349284, intron 2 of 2) intron (NM_001349284, intron 2 of 2) 9761 NM_001349277 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 239.75-16 chr13 43010579 43010978 + 0.75 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -12808 NM_013238 29103 Hs.438830 NM_013238 ENSG00000120675 DNAJC15 DNAJD1|HSD18|MCJ DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C15 protein-coding 213-51 chr2 227281761 227282148 + 0.75 NA intron (NR_102371, intron 2 of 13) intron (NR_102371, intron 2 of 13) 43210 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 216.5-102 chr6 83858183 83858536 + 0.75 NA TTS (NM_001009994) TTS (NM_001009994) -1330 NM_016230 51167 Hs.5741 NM_016230 ENSG00000065615 CYB5R4 NCB5OR|cb5/cb5R|dJ676J13.1 cytochrome b5 reductase 4 protein-coding 134.5-123 chr22 31833251 31833556 + 0.75 NA intron (NR_146296, intron 24 of 42) intron (NR_146296, intron 24 of 42) 79380 NM_001369903 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 112.25-6 chr1 90192161 90192355 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197148 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 128.5-92 chr18 24179680 24179998 + 0.75 NA intron (NM_001242508, intron 7 of 15) intron (NM_001242508, intron 7 of 15) 40355 NM_138644 26256 Hs.511983 NM_012189 ENSG00000154040 CABYR CABYRa|CABYRc|CABYRc/d|CABYRe|CBP86|CT88|FSP-2|FSP2 calcium binding tyrosine phosphorylation regulated protein-coding 134.25-20 chr10 124883282 124883581 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -58692 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 123.5-207 chr8 81529151 81529383 + 0.75 NA intron (NM_001105281, intron 2 of 3) intron (NM_001105281, intron 2 of 3) 2123 NR_144370 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 175.75-120 chr7 38134479 38134739 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -43636 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 148.5 chr1 5945079 5945493 + 0.75 NA intron (NR_111987, intron 9 of 32) intron (NR_111987, intron 9 of 32) 47139 NM_001291593 261734 Hs.462348 NM_015102 ENSG00000131697 NPHP4 POC10|SLSN4 nephrocystin 4 protein-coding 178.75-6 chr1 207184222 207184498 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 80127 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 148.25-6 chr1 105651923 105652218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33135 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 150.25-26 chr10 110573775 110574052 + 0.75 NA intron (NM_005445, intron 3 of 28) MIRc|SINE|MIR 6222 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 115-148 chr5 150760154 150760358 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1161 NM_016221 51164 Hs.675564 NM_016221 ENSG00000132912 DCTN4 DYN4|P62 dynactin subunit 4 protein-coding 116.5-20 chr10 31383613 31383935 + 0.75 NA intron (NM_001323638, intron 4 of 12) MER3|DNA|hAT-Charlie 15981 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 115.25-84 chr17 81548180 81548445 + 0.75 NA intron (NR_033338, intron 4 of 8) intron (NR_033338, intron 4 of 8) 4041 NM_025161 80233 Hs.313905 NM_025161 ENSG00000185504 FAAP100 C17orf70 FA core complex associated protein 100 protein-coding 188.25-116 chr8 87201557 87201956 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 335341 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 201.5-60 chr15 65230969 65231373 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19698 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 217.75-53 chr4 69811797 69812347 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48073 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 170-109 chrX 23405219 23405478 + 0.75 NA TTS (NM_173495) TTS (NM_173495) 70499 NM_173495 139411 Hs.319503 NM_173495 ENSG00000165186 PTCHD1 AUTSX4 patched domain containing 1 protein-coding 128.25-141 chr4 48804627 48804965 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -24497 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 166.25-55 chr16 19166810 19167093 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001330509) promoter-TSS (NM_001330509) -883 NM_001330509 51760 Hs.258326 NM_016524 ENSG00000103528 SYT17 sytXVII synaptotagmin 17 protein-coding 114.5-263 chr8 113301488 113301843 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 75487 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 183.5-19 chr10 60963638 60964076 + 0.75 NA intron (NM_001350906, intron 2 of 12) intron (NM_001350906, intron 2 of 12) -19131 NM_001350911 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 132.25-194 chr9 93273887 93274111 + 0.75 NA intron (NM_001282394, intron 19 of 29) L1ME1|LINE|L1 72304 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 186.25-81 chr4 111136356 111136689 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -275875 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 197.5-147 chr7 39491110 39491410 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75144 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 122.5-185 chr5 107294948 107295263 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -284091 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 252.25-44 chr4 92550498 92551058 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 246379 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 132.5-144 chr21 24174855 24175144 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146378 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 134.5-63 chr14 63149086 63149376 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -55212 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 119.5-110 chr19 27920559 27920834 + 0.75 NA intron (NR_146733, intron 2 of 6) intron (NR_146733, intron 2 of 6) -126756 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 182-83 chr4 99868957 99869351 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014395, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_014395, exon 9 of 9) 25273 NM_021970 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 130-181 chr9 109226399 109226611 + 0.75 NA intron (NM_019114, intron 15 of 25) LTR33A|LTR|ERVL -59214 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 134.75-121 chr2 204848813 204849137 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 303500 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 197.25-63 chr21 31786307 31786894 + 0.75 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -54482 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 218.5-48 chr17 79316781 79317307 + 0.75 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 199104 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 144.75-46 chr12 97252720 97253062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -209885 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 200-58 chr3 99123965 99124357 + 0.75 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -222466 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 139.25-63 chr16 57159731 57159951 + 0.75 NA intron (NM_001354088, intron 7 of 7) intron (NM_001354088, intron 7 of 7) 22709 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 143-38 chr14 66486565 66487006 + 0.75 NA non-coding (NR_024338, exon 2 of 11) non-coding (NR_024338, exon 2 of 11) 414 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 132.5-18 chr1 173000299 173000638 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 50495 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 138.5-63 chr14 74149060 74149281 + 0.75 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) intron (NM_001024674, intron 5 of 5) 64217 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 184.5-20 chr10 66670970 66671307 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -254898 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 129-96 chr2 174449054 174449267 + 0.75 NA intron (NM_001267051, intron 10 of 14) L1PA16|LINE|L1 37869 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 179.25-87 chr2 232412185 232412562 + 0.75 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 5529 NM_031313 251 Hs.333509 NM_031313 ENSG00000163286 ALPG ALPPL|ALPPL2|GCAP alkaline phosphatase, germ cell protein-coding 115.75 chr1 8732220 8732554 + 0.75 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) L1MC2|LINE|L1 85253 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 129.25-45 chr14 29119752 29119982 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -334080 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 153.75-132 chr6 76104329 76104687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31830 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 161.5-197 chr9 29850025 29850519 + 0.75 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 558182 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 180.25-87 chr4 140138934 140139339 + 0.75 NA TTS (NR_147610) TTS (NR_147610) 11121 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 194.25-64 chr2 183024260 183024689 + 0.75 NA intron (NM_013436, intron 1 of 30) intron (NM_013436, intron 1 of 30) 13983 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 228-78 chr8 81722334 81722850 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1288 NR_033196 79752 Hs.655453 NM_024699 ENSG00000104231 ZFAND1 - zinc finger AN1-type containing 1 protein-coding 164-98 chr5 42569423 42569718 + 0.75 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 3706 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 264.75-7 chr11 61611102 61611510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3730 NR_002775 113157 Hs.502733 NR_002775 ENSG00000243742 RPLP0P2 RPLP0L2|RPLP0_3_1146 ribosomal protein lateral stalk subunit P0 pseudogene 2 pseudo 139.25-111 chr22 26209834 26210065 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 40475 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 159.5-138 chr3 3715151 3715475 + 0.75 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) intron (NR_149025, intron 5 of 5) -84118 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 119.25-44 chr12 23560460 23560680 + 0.75 NA intron (NM_001261414, intron 13 of 16) intron (NM_001261414, intron 13 of 16) 24016 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 142-96 chr21 28124993 28125384 + 0.75 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) intron (NR_126012, intron 5 of 5) 34785 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 138.25-156 chr7 8465325 8465543 + 0.75 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 31825 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 215-79 chr8 140392220 140392740 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) intron (NM_001160372, intron 7 of 22) 65264 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 184-9 chr10 28682687 28683020 + 0.75 NA TTS (NM_012342) TTS (NM_012342) 5332 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 197-31 chr2 129238348 129238754 + 0.75 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 35340 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 161.75 chr1 39875478 39875883 + 0.75 NA intron (NM_017646, intron 1 of 10) intron (NM_017646, intron 1 of 10) 7824 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 143.75-47 chr14 34432992 34433276 + 0.75 NA 3' UTR (NM_138288, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_138288, exon 2 of 2) 29106 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 133.75-154 chr4 89804186 89804455 + 0.75 NA intron (NM_001146054, intron 4 of 5) intron (NM_001146054, intron 4 of 5) -32081 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 158.75-111 chr3 39822504 39822831 + 0.75 NA intron (NM_001284424, intron 1 of 15) L1MA5A|LINE|L1 13007 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 238.75-41 chr4 53523721 53524097 + 0.75 NA TTS (NR_046622) TTS (NR_046622) 23832 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-33 chr11 115959633 115959932 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -199582 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 266.75-12 chr17 30358063 30358667 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -20562 NM_001304 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 135.5-130 chr3 26605412 26605773 + 0.75 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -17214 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 174.5-101 chr2 119137841 119138144 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 20759 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 118.75-145 chr5 23137311 23137537 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -284080 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 211-36 chr2 223168696 223169150 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 116993 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 201-29 chr14 66692745 66693128 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 185529 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 255.25-58 chrX 23553350 23553967 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -113835 NM_006406 10549 Hs.83383 NM_006406 ENSG00000123131 PRDX4 AOE37-2|AOE372|HEL-S-97n|PRX-4 peroxiredoxin 4 protein-coding 213-22 chr11 116416663 116417060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222561 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 162.5-161 chr7 40781404 40781659 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 198408 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 184.75-103 chr8 10819944 10820521 + 0.75 NA exon (NM_017884, exon 6 of 7) exon (NM_017884, exon 6 of 7) 5211 NR_031711 100302166 NR_031711 ENSG00000283210 MIR1322 MIRN1322|hsa-mir-1322 microRNA 1322 ncRNA 158-130 chr7 86598841 86599180 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -44899 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 232.25-70 chr6 90711735 90712158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124874 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 295.5-11 chr13 35331981 35332518 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 36 of 57) intron (NM_015678, intron 36 of 57) 144440 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 157.5-81 chr17 69815435 69815703 + 0.75 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MB1|LINE|L1 -146138 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 128.75-18 chr10 22388474 22388812 + 0.75 NA intron (NM_172242, intron 6 of 9) intron (NM_172242, intron 6 of 9) 43147 NM_012443 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 201.75-3 chr1 151231593 151231938 + 0.75 NA exon (NM_003557, exon 4 of 15) exon (NM_003557, exon 4 of 15) -22969 NM_001330692 5710 Hs.505059 NM_002810 ENSG00000159352 PSMD4 AF|AF-1|ASF|MCB1|Rpn10|S5A|pUB-R5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 4 protein-coding 186-19 chr11 92624099 92624440 + 0.75 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) L2c|LINE|L2 272173 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 137.5-10 chr1 116408360 116408601 + 0.75 NA intron (NR_024125, intron 1 of 2) intron (NR_024125, intron 1 of 2) 10079 NR_024126 84852 Hs.664752 NM_032766 ENSG00000203865 ATP1A1-AS1 ATP1A1OS|C1orf203 ATP1A1 antisense RNA 1 ncRNA 168.75-125 chr6 102219171 102219567 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 820384 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 167-28 chr11 59180334 59180724 + 0.75 NA intron (NM_015177, intron 1 of 8) intron (NM_015177, intron 1 of 8) 8397 NM_015177 23220 Hs.523696 NM_015177 ENSG00000110042 DTX4 RNF155 deltex E3 ubiquitin ligase 4 protein-coding 138-9 chr10 59934573 59934934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26160 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 230-39 chr20 53829514 53829893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46006 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 154.75-42 chr14 82704903 82705129 + 0.75 NA intron (NR_146650, intron 5 of 5) L1PA13|LINE|L1 62384 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 158.5-65 chr14 67376768 67376999 + 0.75 NA intron (NM_004094, intron 4 of 7) L2b|LINE|L2 16555 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 123.75-185 chr8 73091672 73091979 + 0.75 NA intron (NM_153225, intron 1 of 4) intron (NM_153225, intron 1 of 4) 1347 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 188-23 chr14 59416584 59416865 + 0.75 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 48656 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 202.5-7 chr1 169295837 169296326 + 0.75 NA intron (NR_104229, intron 6 of 12) L2|LINE|L2 71716 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 234.25-55 chr4 165508638 165509142 + 0.75 NA Intergenic (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 122648 NR_030304 693163 NR_030304 ENSG00000207559 MIR578 MIRN578|hsa-mir-578 microRNA 578 ncRNA 236.75-19 chr14 23612061 23612632 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17769 NM_001318835 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 150-21 chr11 72042005 72042283 + 0.75 NA intron (NR_104476, intron 2 of 24) intron (NR_104476, intron 2 of 24) 27853 NR_104178 100128494 Hs.713607 NR_104178 ENSG00000251143 LOC100128494 - uncharacterized LOC100128494 ncRNA 113.5-27 chr1 233275048 233275340 + 0.75 NA intron (NM_014801, intron 1 of 33) intron (NM_014801, intron 1 of 33) 20531 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 171-86 chr21 37046383 37046633 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17558 NR_131189 105372795 Hs.528019 NR_131189 LOC105372795 - uncharacterized LOC105372795 ncRNA 205-57 chr4 167402639 167403109 + 0.75 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -168284 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 179-36 chr14 73043624 73043929 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14758 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 163.5-14 chr1 211303903 211304192 + 0.75 NA intron (NM_018254, intron 8 of 10) intron (NM_018254, intron 8 of 10) -22568 NM_004619 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 189.5-123 chr6 130011018 130011333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7194 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 114.75-164 chr6 126599914 126600093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115372 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 133.5-281 chr9 83982920 83983357 + 0.75 NA intron (NM_024945, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 2333 NM_024945 80010 Hs.726327 NM_024945 ENSG00000178966 RMI1 BLAP75|C9orf76|FAAP75 RecQ mediated genome instability 1 protein-coding 147.75-56 chr18 1290635 1291089 + 0.75 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 68767 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 184.5-45 chr14 58536187 58536487 + 0.75 NA intron (NM_001329945, intron 29 of 29) L1PA17|LINE|L1 96656 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 150.75-194 chr9 115435473 115435842 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 293839 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 122.25-37 chr11 115960139 115960327 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -200033 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 156.25-124 chr5 159304904 159305186 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25428 NM_002187 3593 Hs.674 NM_002187 ENSG00000113302 IL12B CLMF|CLMF2|IL-12B|IMD28|IMD29|NKSF|NKSF2 interleukin 12B protein-coding 126.75-120 chr2 171949157 171949473 + 0.75 NA intron (NM_003642, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu 26854 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 144.25-109 chr2 210594486 210594720 + 0.75 NA exon (NM_001122633, exon 13 of 39) exon (NM_001122633, exon 13 of 39) 1248 NR_163592 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 137.75-216 chr9 13182891 13183243 + 0.75 NA intron (NM_003829, intron 19 of 45) intron (NM_003829, intron 19 of 45) 96497 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 161.25-167 chr7 117373863 117374112 + 0.75 NA intron (NM_001301821, intron 10 of 12) intron (NM_001301821, intron 10 of 12) -50929 NM_003391 7472 Hs.567356 NM_003391 ENSG00000105989 WNT2 INT1L1|IRP Wnt family member 2 protein-coding 178-75 chr4 97306251 97306542 + 0.75 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -60530 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 182-23 chr12 38888309 38888736 + 0.75 NA intron (NM_153634, intron 1 of 19) intron (NM_153634, intron 1 of 19) 17069 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 128.75-209 chr8 141125813 141126082 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2642 NM_001362798 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 112.75-141 chr3 180114659 180114815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77800 NM_016559 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 114.25-155 chr5 127136545 127136812 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -63186 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 244.75-18 chr13 89768716 89769134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204512 NR_046991 100874139 Hs.742173 NR_046991 LINC00353 - long intergenic non-protein coding RNA 353 ncRNA 181.75-94 chr4 45628713 45629079 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 495158 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 307.75-10 chr2 96089471 96090189 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26741 NM_000682 151 Hs.247686 NM_000682 ENSG00000274286 ADRA2B ADRA2L1|ADRA2RL1|ADRARL1|ALPHA2BAR|FAME2|alpha-2BAR adrenoceptor alpha 2B protein-coding 121-145 chr4 98795020 98795279 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 133984 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 246-48 chr5 7905448 7906007 + 0.75 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 36579 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 157-129 chr9 130177904 130178263 + 0.75 NA intron (NM_014286, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 5679 NM_014286 23413 Hs.642946 NM_014286 ENSG00000107130 NCS1 FLUP|FREQ neuronal calcium sensor 1 protein-coding 136-41 chr14 69341523 69341846 + 0.75 NA exon (NM_001168368, exon 12 of 15) exon (NM_001168368, exon 12 of 15) 56615 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 252.75-29 chr2 43701086 43701645 + 0.75 NA intron (NM_172069, intron 8 of 29) LTR79|LTR|ERVL -24936 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 119.5-75 chr14 40813565 40813742 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -141058 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 180-90 chr4 42994985 42995240 + 0.75 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) intron (NM_001080476, intron 2 of 3) 101846 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 251-3 chr1 74652564 74653123 + 0.75 NA intron (NM_001002912, intron 1 of 14) intron (NM_001002912, intron 1 of 14) 20949 NM_001002912 127254 Hs.531182 NM_001002912 ENSG00000178965 ERICH3 C1orf173 glutamate rich 3 protein-coding 141.75-54 chr14 47740653 47740948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20304 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 201-36 chr17 29243587 29244074 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -3027 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 146.75-3 chr1 78512592 78512815 + 0.75 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 21729 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 143.75-61 chr16 57348719 57348986 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9931 NM_002990 6367 Hs.534347 NM_002990 ENSG00000102962 CCL22 A-152E5.1|ABCD-1|DC/B-CK|MDC|SCYA22|STCP-1 C-C motif chemokine ligand 22 protein-coding 115.5-148 chr20 2556797 2557007 + 0.75 NA intron (NM_080751, intron 2 of 19) L1MC2|LINE|L1 20295 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 155.75-53 chr14 88360557 88360972 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -24880 NM_001040428 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 181.25-69 chr2 185922779 185923232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -122854 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 139-134 chr7 8265045 8265348 + 0.75 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L1MB7|LINE|L1 -2584 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 179.75-118 chr6 70522679 70522948 + 0.75 NA intron (NM_001331004, intron 13 of 20) intron (NM_001331004, intron 13 of 20) -44117 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 135.5-192 chr7 92212437 92212666 + 0.75 NA intron (NM_001013406, intron 15 of 16) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -8453 NR_031616 100302218 NR_031616 ENSG00000221520 MIR1285-1 MIRN1285-1|hsa-mir-1285-1 microRNA 1285-1 ncRNA 142.5-142 chr3 116021583 116021949 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -116640 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 132.5-116 chr2 63006332 63006560 + 0.75 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 41265 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 115.75-151 chr4 33461325 33461614 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 578424 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 215.25-70 chr4 91868049 91868373 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 409091 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 155.5-206 chr8 118731657 118731909 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -109820 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 124.5-139 chr3 17664201 17664570 + 0.75 NA intron (NM_001134381, intron 1 of 23) intron (NM_001134381, intron 1 of 23) 35635 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 223-48 chr20 49218047 49218577 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001348187) promoter-TSS (NM_001348187) -983 NM_017895 55661 Hs.65234 NM_017895 ENSG00000124228 DDX27 DRS1|Drs1p|HSPC259|PP3241|RHLP|dJ686N3.1 DEAD-box helicase 27 protein-coding 290.75-10 chr13 31563912 31564415 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175363 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 128.25-117 chr21 29700212 29700500 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -47819 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-86 chr17 80786205 80786395 + 0.75 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 19332 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 120.75-9 chr1 166742981 166743265 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96352 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 133.25-125 chr22 30455633 30455827 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16317 NM_001257378 266629 Hs.505601 NM_174975 ENSG00000100012 SEC14L3 TAP2 SEC14 like lipid binding 3 protein-coding 134-163 chr7 80595647 80596016 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6376 NM_001371074 112.75-14 chr1 169203924 169204192 + 0.75 NA intron (NR_104229, intron 10 of 12) AluJr|SINE|Alu 97368 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 129-9 chr1 147351960 147352177 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 108926 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 156.25-34 chr12 46979766 46980040 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -99700 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 148.75-121 chr4 104656447 104656826 + 0.75 NA intron (NR_125926, intron 4 of 9) intron (NR_125926, intron 4 of 9) -161742 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 115-103 chr3 4339529 4339829 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 36375 NM_001276325 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 132-6 chr1 174705951 174706133 + 0.75 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) 5047 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 163.25 chr1 33024195 33024503 + 0.75 NA intron (NM_001319142, intron 1 of 5) MER3|DNA|hAT-Charlie 12534 NM_013411 204 Hs.470907 NM_001625 ENSG00000004455 AK2 ADK2 adenylate kinase 2 protein-coding 194-44 chr19 57451766 57452141 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 4786 NM_020633 57191 Hs.677423 NM_020633 ENSG00000178201 VN1R1 V1RL1|VNR19I1|ZVNH1|ZVNR1 vomeronasal 1 receptor 1 protein-coding 277-31 chr6 358965 359509 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32515 NM_001195286 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 169-49 chr2 88491440 88491701 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33079 NM_152670 200523 Hs.132104 NM_152670 ENSG00000172073 TEX37 C2orf51|TSC21 testis expressed 37 protein-coding 173-54 chr17 31183358 31183719 + 0.75 NA intron (NM_001042492, intron 8 of 57) intron (NM_001042492, intron 8 of 57) 88561 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 233.5-42 chr18 815298 815707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3260 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 263.25-13 chr10 95750862 95751348 + 0.75 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 -4547 NM_001164178 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 136.5-201 chr6 137138970 137139194 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 34562 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 202.25-87 chr7 41591843 41592341 + 0.75 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -101827 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 184.25-113 chr7 21443338 21443711 + 0.75 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) intron (NM_003112, intron 3 of 5) 15441 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 145.25-14 chr10 87676979 87677327 + 0.75 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 17275 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 173-76 chr20 46261180 46261457 + 0.75 NA intron (NM_021248, intron 1 of 11) intron (NM_021248, intron 1 of 11) 47180 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 151.5-202 chr8 136456882 136457200 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73757 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 288.75-26 chr2 10582443 10582932 + 0.75 NA intron (NR_048552, intron 18 of 19) intron (NR_048552, intron 18 of 19) 107288 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 158.25-57 chr2 56593764 56594004 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -408114 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 218.75-89 chr8 125007206 125007517 + 0.75 NA intron (NM_003129, intron 3 of 10) intron (NM_003129, intron 3 of 10) 8856 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 184.5-115 chr5 6772533 6772953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23137 NR_146281 109729133 Hs.582455 NR_146281 ENSG00000251365 LINC02236 - long intergenic non-protein coding RNA 2236 ncRNA 167.5-188 chr8 126092602 126092920 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -141564 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 120.25-109 chr20 25165378 25165583 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -16690 NR_027091 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 174.5-102 chr2 166924871 166925180 + 0.75 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 36538 NM_152381 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 365.5-11 chr21 15957365 15958054 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -112779 NR_136542 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 133.75-185 chr8 66928827 66929182 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -3463 NR_152598 641638 Hs.372680 NR_002599 ENSG00000245910 SNHG6 HBII-276HG|NCRNA00058|U87HG small nucleolar RNA host gene 6 ncRNA 119.75-177 chr6 39760273 39760543 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31968 NM_001201427 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 147.75-98 chr22 46522502 46522875 + 0.75 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) intron (NM_014246, intron 1 of 34) 14932 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 123-68 chr16 17045617 17045950 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -88721 NR_135179 102723692 Hs.737758 NR_135179 ENSG00000261448 LOC102723692 - uncharacterized LOC102723692 ncRNA 253.75-65 chr9 35226470 35226956 + 0.75 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) MLT2A2|LTR|ERVL 64704 NM_006377 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 150.25-14 chr10 8512805 8513155 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 81411 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 226.75-48 chr22 45443437 45443774 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 29912 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 151.75-122 chr5 161349156 161349411 + 0.75 NA intron (NM_000813, intron 6 of 9) intron (NM_000813, intron 6 of 9) 198841 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 206-62 chr5 103745360 103745741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -182761 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 174.75-35 chr14 76700616 76701116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60602 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 240.25-45 chr3 194287643 194288239 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 24863 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 146.5-230 chr8 140997732 140998018 + 0.75 NA intron (NM_001352737, intron 1 of 32) AluJr|SINE|Alu 3129 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 129-31 chr11 16686904 16687276 + 0.75 NA intron (NM_001367872, intron 2 of 16) AluSz6|SINE|Alu 51387 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 151.5-99 chr20 39767597 39767924 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -236701 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 155.25-8 chr1 110085918 110086228 + 0.75 NA intron (NR_126382, intron 1 of 3) intron (NR_126382, intron 1 of 3) 3385 NR_126382 104355139 Hs.628193 NR_126382 ENSG00000258673 LINC01397 - long intergenic non-protein coding RNA 1397 ncRNA 135.75-143 chr3 93863086 93863431 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 110823 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 125-168 chr9 81258548 81258760 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 430881 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 139.75-70 chr16 71707875 71708186 + 0.75 NA intron (NM_015020, intron 2 of 18) AluSg4|SINE|Alu 7810 NM_001289003 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 205.75-33 chr18 37547372 37547924 + 0.75 NA intron (NM_001353701, intron 1 of 1) intron (NM_001353701, intron 1 of 1) 18150 NM_001025089 56853 Hs.435976 NM_020180 ENSG00000101489 CELF4 BRUNOL4|CELF-4 CUGBP Elav-like family member 4 protein-coding 139.25-146 chr5 26927295 26927589 + 0.75 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) intron (NM_016279, intron 2 of 11) 111144 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 159.5-195 chr7 86972879 86973260 + 0.75 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) L2|LINE|L2 -7170 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 123-160 chr5 112215056 112215361 + 0.75 NA intron (NM_001347887, intron 12 of 23) intron (NM_001347887, intron 12 of 23) -13075 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 119.5-201 chr6 97288244 97288421 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5116 NM_198468 253714 Hs.444292 NM_198468 ENSG00000146263 MMS22L C6orf167|dJ39B17.2 MMS22 like, DNA repair protein protein-coding 157-19 chr11 83248343 83248577 + 0.75 NA 3' UTR (NM_182603, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_182603, exon 10 of 10) 37947 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 113.25-110 chr3 112408702 112408884 + 0.75 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 75637 NM_005944 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 206-60 chr5 76979728 76980080 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 26859 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 120.75-135 chr5 53659079 53659324 + 0.75 NA intron (NR_134474, intron 5 of 5) L3|LINE|CR1 98562 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 168.5-60 chr16 69770681 69771080 + 0.75 NA intron (NM_001270455, intron 1 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 8548 NM_007014 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 188-18 chr13 47607866 47608197 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 324591 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 204.5-90 chr3 63760207 63760684 + 0.75 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -58854 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 246.5-77 chr8 128323684 128324146 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 173799 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 216.5-58 chr2 126983017 126983502 + 0.75 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 84369 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 207.75-103 chr5 147074506 147074920 + 0.75 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) intron (NM_181677, intron 2 of 10) 6757 NM_181677 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 124.5-10 chr1 77463370 77463683 + 0.75 NA intron (NM_012093, intron 8 of 13) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 180439 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 142.75-191 chr8 127120007 127120383 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37974 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 133-68 chr17 79429321 79429701 + 0.75 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 86637 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 171-89 chr3 48552202 48552547 + 0.75 NA intron (NM_001317136, intron 1 of 13) intron (NM_001317136, intron 1 of 13) -2353 NR_106881 102465494 NR_106881 ENSG00000278799 MIR6823 hsa-mir-6823 microRNA 6823 ncRNA 165.25-96 chr3 178427605 178427963 + 0.75 NA intron (NR_046786, intron 1 of 2) L1MA4|LINE|L1 8583 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 175.25-64 chr2 35867155 35867598 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 395971 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 158.5-204 chrX 86078352 86078674 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -30955 NM_001145414 1121 Hs.496449 NM_000390 ENSG00000188419 CHM DXS540|GGTA|HSD-32|REP-1|TCD CHM Rab escort protein protein-coding 117-59 chr14 67281943 67282123 + 0.75 NA intron (NM_001256550, intron 3 of 14) intron (NM_001256550, intron 3 of 14) 40598 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 178-84 chr6 36625779 36626215 + 0.75 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3485 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 116-124 chr5 78247828 78248019 + 0.75 NA intron (NM_003664, intron 2 of 26) L1MEf|LINE|L1 46775 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 193.25-19 chr11 22113440 22113907 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -79412 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 128-161 chr7 146472303 146472673 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -301783 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 123.75-52 chr13 101815071 101815441 + 0.75 NA intron (NM_175929, intron 3 of 4) (TGGAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 101389 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 163.25-70 chr2 162550349 162550640 + 0.75 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) LTR33|LTR|ERVL 206126 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 128.25-57 chr15 77728701 77728919 + 0.75 NA intron (NM_001301192, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR -8059 NM_001301197 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 203.75-51 chr18 75061332 75061838 + 0.75 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 143928 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 122-192 chr8 128133732 128134004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16248 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 122-103 chr2 185016561 185016892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150346 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 137.25-97 chr3 68521437 68521704 + 0.75 NA intron (NM_001252216, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 20933 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 146-67 chr2 111964519 111964789 + 0.75 NA intron (NM_006343, intron 4 of 18) intron (NM_006343, intron 4 of 18) 66047 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 114.5-132 chr2 51908688 51909023 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -461793 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 168.25-29 chr11 91238109 91238577 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -369141 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 121-30 chr10 117855245 117855540 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -191429 NR_026941 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 159-110 chr8 81799101 81799513 + 0.75 NA TTS (NM_022133) TTS (NM_022133) 42878 NR_145474 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 199.5-101 chr3 40969670 40969960 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -229690 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 113-150 chr5 98228174 98228401 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -67048 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 168.5-53 chr14 37012272 37012581 + 0.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -60035 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 123.5-218 chr9 37931437 37931722 + 0.75 NA intron (NM_003028, intron 5 of 5) L1MA9|LINE|L1 -27226 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 161.5-160 chr5 143722984 143723243 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 43253 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 161-49 chr16 78309450 78309724 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) MER4D1|LTR|ERV1 209933 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 123.25-181 chr7 1573312 1573571 + 0.75 NA intron (NR_021487, intron 1 of 5) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 3368 NR_021487 114796 Hs.436146 NR_021487 ENSG00000230487 PSMG3-AS1 - PSMG3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 151-122 chr6 142896791 142897036 + 0.75 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 48263 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 118.5-162 chr5 30281558 30281777 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 401107 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 213.5-63 chr2 167184839 167185225 + 0.75 NA intron (NM_001199143, intron 4 of 10) intron (NM_001199143, intron 4 of 10) -2340 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 153.5-42 chr12 15069088 15069367 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 67394 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 134.5-175 chr5 80724402 80724734 + 0.75 NA intron (NM_002439, intron 8 of 23) intron (NM_002439, intron 8 of 23) -69585 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 121.25-23 chr10 76844658 76844952 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -43239 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 154.75-5 chr1 154752420 154752800 + 0.75 NA intron (NM_001204087, intron 3 of 8) intron (NM_001204087, intron 3 of 8) 107266 NM_170782 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 209.5-99 chr4 33499499 33499878 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 540205 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 179.5-190 chr9 27603546 27603969 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -29891 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 220.75-39 chr2 80800471 80801099 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 487406 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 173.75-142 chr7 68820427 68820732 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 777045 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 143-46 chr15 99725705 99726035 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7567 NM_001284419 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 166-93 chr5 8015729 8015991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146712 NM_001364440 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 127.25-136 chr4 30900249 30900541 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 180026 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 149-45 chr19 9761403 9761692 + 0.75 NA intron (NM_001353799, intron 4 of 5) AluSx3|SINE|Alu 7191 NM_001353798 162993 Hs.665717 NM_001077624 ENSG00000196605 ZNF846 - zinc finger protein 846 protein-coding 208.5-99 chr4 79285114 79285550 + 0.75 NA intron (NR_038342, intron 4 of 5) intron (NR_038342, intron 4 of 5) 40729 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 176.75-19 chr11 43600333 43600902 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 19223 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 127-70 chr15 68940357 68940628 + 0.75 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) L1MC5|LINE|L1 9967 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 173.5-170 chr8 119721062 119721484 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47883 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 114.25-186 chr8 31494090 31494294 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -145560 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 131.75-16 chr1 189494725 189494984 + 0.75 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 981156 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 167.75-134 chr7 81596628 81597010 + 0.75 NA intron (NR_126025, intron 5 of 10) L2b|LINE|L2 29397 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 121.25-204 chr9 76548055 76548264 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 47526 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 258-50 chr7 32570011 32570476 + 0.75 NA intron (NM_015060, intron 11 of 15) MIR|SINE|MIR 74754 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 151.5-4 chr1 64621252 64621661 + 0.75 NA intron (NM_020925, intron 4 of 26) intron (NM_020925, intron 4 of 26) 41609 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 164-135 chr8 40998907 40999342 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -101298 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 119.25-48 chr12 69018851 69019104 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -55737 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 203-24 chr11 48941352 48941655 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -90097 NM_001206626 283116 Hs.448644 NM_001206626 ENSG00000182053 TRIM49B - tripartite motif containing 49B protein-coding 189.75-85 chr4 109449036 109449446 + 0.75 NA intron (NM_001042734, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu -15424 NR_039978 100533182 Hs.518927 NR_039978 ENSG00000247950 SEC24B-AS1 1/2-SBSRNA4 SEC24B antisense RNA 1 ncRNA 135.75-133 chr3 33829755 33830091 + 0.75 NA intron (NM_001162429, intron 7 of 17) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 31293 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 124-50 chr15 58482532 58482732 + 0.75 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) intron (NR_120338, intron 2 of 2) 16103 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 207-39 chr19 34976948 34977333 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12911 NM_175872 126375 Hs.50405 NM_175872 ENSG00000180884 ZNF792 - zinc finger protein 792 protein-coding 127.75-117 chr20 11962531 11962884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44814 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 156.5-71 chr19 28359039 28359317 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -247510 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 132.5-245 chr8 118795132 118795417 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 156611 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 166.5-136 chr3 132197010 132197307 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120249 NM_001134194 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 217.5-90 chr4 70833000 70833311 + 0.75 NA exon (NM_002092, exon 3 of 10) exon (NM_002092, exon 3 of 10) 6348 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 217.25-20 chr12 2660399 2660974 + 0.75 NA intron (NM_199460, intron 36 of 49).2 AluSg4|SINE|Alu 11534 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 136-77 chr2 117384434 117384709 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -430120 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 116.5-239 chr8 13065604 13065788 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50548 NM_001164271 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 169.75-79 chr2 76750234 76750501 + 0.75 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) LTR50|LTR|ERVL -235598 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 126.5-233 chr7 122976606 122976894 + 0.75 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 18950 NM_016945 50833 Hs.272395 NM_016945 ENSG00000128519 TAS2R16 BGLPT|T2R16 taste 2 receptor member 16 protein-coding 122.25-33 chr11 94108847 94109060 + 0.75 NA intron (NM_001098672, intron 17 of 19) L1ME1|LINE|L1 -19888 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 127-42 chr12 28299195 28299593 + 0.75 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) L1MC4a|LINE|L1 -108656 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 123-49 chr14 49120327 49120623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 465905 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 119-204 chr8 141483210 141483439 + 0.75 NA intron (NR_102364, intron 6 of 26) L1ME2|LINE|L1 23905 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 141.5-173 chr5 37306098 37306443 + 0.75 NA intron (NM_001278312, intron 24 of 33) AluJo|SINE|Alu -56842 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 255.5-31 chr16 76754792 76755314 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -113883 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 125.75-132 chr3 189691924 189692200 + 0.75 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) intron (NM_003722, intron 1 of 13) 60673 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 187.25-58 chr2 149419721 149420060 + 0.75 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 89303 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 113.25-21 chr10 112670063 112670393 + 0.75 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 36058 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 171.25-155 chr9 31067674 31068006 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 313650 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 137.75-139 chr3 116570123 116570334 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 17755 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 188.5-113 chr4 84190064 84190560 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 108857 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 164.5-100 chr2 128115079 128115335 + 0.75 NA exon (NM_020120, exon 7 of 41) exon (NM_020120, exon 7 of 41) 24007 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 226.75-25 chr17 66701017 66701540 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 8 of 16) L1MA9|LINE|L1 -85794 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 176.5-158 chr7 94868328 94868712 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -39074 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 187-49 chr20 8415652 8415934 + 0.75 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) 167089 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 169-32 chr15 78488110 78488455 + 0.75 NA exon (NM_001320941, exon 14 of 21) exon (NM_001320941, exon 14 of 21) -19282 NM_001083612 123688 Hs.307962 NM_001013619 ENSG00000188266 HYKK AGPHD1 hydroxylysine kinase protein-coding 135.75-23 chr10 51910418 51910630 + 0.75 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) MER67D|LTR|ERV1 -210929 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 165.75-72 chr18 73181665 73182009 + 0.75 NA intron (NR_034133, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 82661 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 173-7 chr1 150123940 150124354 + 0.75 NA intron (NR_103998, intron 13 of 13) L1ME4a|LINE|L1 -25287 NM_001304724 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 170-31 chr14 60706407 60706705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17795 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 179.75-147 chrX 120402507 120402925 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 40627 NM_001142447 23439 Hs.292599 NM_012069 ENSG00000101892 ATP1B4 - ATPase Na+/K+ transporting family member beta 4 protein-coding 153.25-108 chr6 34762806 34763108 + 0.75 NA intron (NR_029472, intron 2 of 4) intron (NR_029472, intron 2 of 4) 5452 NM_003093 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 117.75-105 chr2 76068183 76068483 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -357418 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 144.75-152 chr7 7033597 7033929 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 33282 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 140.25-86 chr2 22766767 22766962 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 230385 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 268-5 chr1 101954795 101955523 + 0.75 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 42075 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 122.75-158 chr5 31558940 31559197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26767 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 189-22 chr10 127913311 127913648 + 0.75 NA intron (NM_001323356, intron 1 of 19) intron (NM_001323356, intron 1 of 19) 6376 NM_001316676 5791 Hs.127022 NM_006504 ENSG00000132334 PTPRE HPTPE|PTPE|R-PTP-EPSILON protein tyrosine phosphatase receptor type E protein-coding 133.25-9 chr1 194740551 194740782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1348049 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 213.5-120 chr8 55137936 55138343 + 0.75 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 36111 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 112.25-198 chr7 22004062 22004319 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -58291 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 119.75-15 chr1 221636699 221636951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100075 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 117.25-206 chr8 14693689 14693926 + 0.75 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 159703 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 230.25-87 chr8 142497693 142498350 + 0.75 NA intron (NM_001702, intron 17 of 30) intron (NM_001702, intron 17 of 30) 48372 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 202.25-81 chr6 160167507 160167939 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 45892 NM_153187 6580 Hs.117367 NM_003057 ENSG00000175003 SLC22A1 HOCT1|OCT1|oct1_cds solute carrier family 22 member 1 protein-coding 115-182 chr8 114862577 114862881 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 805284 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 182.25-13 chr10 60295477 60295810 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 94232 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 127-114 chr3 23539682 23540024 + 0.75 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -266102 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 119.25-77 chr17 67593474 67593791 + 0.75 NA intron (NM_181671, intron 5 of 9) AluSz|SINE|Alu -122047 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 142.25-181 chrX 128913782 128914024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 609587 NM_001282875 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 133.75-146 chr4 30878390 30878593 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 158122 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 136.25-103 chr2 215377492 215377837 + 0.75 NA intron (NM_212482, intron 35 of 45) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 58404 NM_001365522 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 172.5-27 chr10 33910207 33910753 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -137800 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 121-55 chr13 70536601 70536918 + 0.75 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -428266 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 232-3 chr1 111630820 111631268 + 0.75 NA intron (NM_001010935, intron 2 of 8) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -10646 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 162-46 chr16 77882615 77883015 + 0.75 NA intron (NM_020927, intron 6 of 8) intron (NM_020927, intron 6 of 8) 94251 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 151.25-18 chr10 64853233 64853670 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27923 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 188.75-22 chr14 40615410 40615739 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -339137 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 139.25-141 chr4 136402965 136403193 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -489399 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 148.5-4 chr1 78474838 78475060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16025 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 179.75-79 chr4 34498983 34499269 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -229379 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 162.5-33 chr12 30919023 30919322 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7576 NM_001370302 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 124.5-9 chr1 69375592 69375855 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57532 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 166.25-91 chr20 1446340 1446672 + 0.75 NA intron (NM_018839, intron 6 of 7) intron (NM_018839, intron 6 of 7) 21186 NM_018839 55968 Hs.12865 NM_016143 ENSG00000088833 NSFL1C P47|UBX1|UBXD10|UBXN2C|dJ776F14.1 NSFL1 cofactor protein-coding 186.25-9 chr1 181675370 181675718 + 0.75 NA intron (NM_001205293, intron 7 of 47) intron (NM_001205293, intron 7 of 47) 192027 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 141.75-86 chr2 40630897 40631132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118579 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 173-71 chr2 187128883 187129270 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -279906 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 249.25-49 chr7 1629571 1630065 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 15348 NR_001288 260341 Hs.534596 NR_001288 TFAMP1 MTTF1|TCF6L1 transcription factor A, mitochondrial pseudogene 1 pseudo 186.5-128 chr7 89839729 89840041 + 0.75 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -279515 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 175-89 chr4 95533513 95533839 + 0.75 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 15297 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 127.75-46 chr11 83253835 83254064 + 0.75 NA intron (NM_001300972, intron 11 of 11) intron (NM_001300972, intron 11 of 11) 32458 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 121-78 chr16 75182438 75182637 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 24624 NM_001025200 440387 Hs.610926 NM_001025200 ENSG00000168928 CTRB2 - chymotrypsinogen B2 protein-coding 202.25-90 chr7 125249721 125250197 + 0.75 NA intron (NR_110183, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 14332 NR_110182 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 184.75-51 chr2 63877076 63877470 + 0.75 NA intron (NM_001001521, intron 3 of 9) intron (NM_001001521, intron 3 of 9) 35393 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 162.75-44 chr16 31317677 31318014 + 0.75 NA intron (NM_001145808, intron 14 of 29) L1M4c|LINE|L1 -37331 NM_000887 3687 Hs.248472 NM_000887 ENSG00000140678 ITGAX CD11C|SLEB6 integrin subunit alpha X protein-coding 172-41 chr15 100234022 100234540 + 0.75 NA intron (NM_139057, intron 7 of 21) intron (NM_139057, intron 7 of 21) 107694 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 187.5-60 chr15 33180936 33181307 + 0.75 NA intron (NM_001277313, intron 2 of 20) L2b|LINE|L2 13593 NM_001277314 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 160.5-102 chr20 43778354 43778752 + 0.75 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -51551 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 167.25-22 chr11 12598547 12598833 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -75731 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 114-169 chr9 76507441 76507615 + 0.75 NA TTS (NM_001490) TTS (NM_001490) 6895 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 127-62 chr14 72858459 72858778 + 0.75 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 34031 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 225.25-5 chr1 200486322 200486792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76521 NM_001281293 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 170.5-187 chr8 88405736 88406060 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78415 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 246.5-7 chr10 32953457 32953811 + 0.75 NA intron (NM_002211, intron 1 of 15) intron (NM_002211, intron 1 of 15) 4260 NM_133376 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 156.75-43 chr12 74523034 74523264 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14686 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 180.5-157 chr8 123849185 123849553 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2618 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 168.75-135 chr7 74661544 74661790 + 0.75 NA intron (NM_001163636, intron 1 of 33) AluSx|SINE|Alu 3949 NM_001518 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 133.25-103 chr2 126113568 126113850 + 0.75 NA intron (NR_146970, intron 2 of 3) intron (NR_146970, intron 2 of 3) 4276 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 206.25-93 chr6 51726324 51726808 + 0.75 NA intron (NM_170724, intron 60 of 60) intron (NM_170724, intron 60 of 60) 104696 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 248.25-34 chr2 81402858 81403251 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63892 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 135-81 chr2 121576713 121576991 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) L1MC5|LINE|L1 45972 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 117.75-197 chr7 38806065 38806256 + 0.75 NA intron (NM_014396, intron 7 of 28) L1ME4a|LINE|L1 103031 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 160.25-90 chr3 26890668 26890944 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 196249 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 236.5-75 chr5 81395221 81395699 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -1326 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 172.25-45 chr16 20882140 20882458 + 0.75 NA intron (NM_173475, intron 1 of 2) AluSp|SINE|Alu -17583 NM_001369632 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 132.25-127 chr3 58543149 58543479 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -6124 NM_003500 8309 Hs.444959 NM_003500 ENSG00000168306 ACOX2 BCOX|BRCACOX|BRCOX|CBAS6|THCCox acyl-CoA oxidase 2 protein-coding 144-145 chr9 21534639 21534912 + 0.75 NA intron (NR_152877, intron 1 of 3) intron (NR_152877, intron 1 of 3) -22590 NR_029505 407035 NR_029505 ENSG00000199177 MIR31 MIRN31|hsa-mir-31|miR-31 microRNA 31 ncRNA 155.25-48 chr12 30204354 30204603 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -419719 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 152.25-52 chr14 57489447 57489711 + 0.75 NA intron (NM_001283060, intron 2 of 5) intron (NM_001283060, intron 2 of 5) 4278 NM_001283057 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 128.75-105 chr2 239107727 239108061 + 0.75 NA intron (NM_006037, intron 15 of 26) intron (NM_006037, intron 15 of 26) -21968 NR_039643 100616493 NR_039643 ENSG00000264810 MIR4441 - microRNA 4441 ncRNA 125.25-52 chr13 37320567 37320839 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 164081 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 212.75-20 chr12 2931627 2932081 + 0.75 NA intron (NM_003324, intron 6 of 10) MIRb|SINE|MIR -27543 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 126.75-116 chr2 154652851 154653219 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -45546 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 126.75-210 chr5 181061480 181061738 + 0.75 NA TTS (NM_152547) TTS (NM_152547) -18125 NR_107056 102465882 NR_107056 ENSG00000277912 MIR8089 hsa-mir-8089 microRNA 8089 ncRNA 174.75-18 chr11 39374918 39375239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 726220 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 185.75-36 chr13 71259053 71259488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 244129 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 153.5-199 chr8 88421866 88422148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -94524 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 142.5-73 chr15 81982763 81983132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63071 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 175-90 chr4 161076605 161077116 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -945873 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 131-27 chr11 12116529 12116796 + 0.75 NA intron (NM_001346294, intron 1 of 25) intron (NM_001346294, intron 1 of 25) 6072 NM_014632 9645 Hs.501928 NM_014632 ENSG00000133816 MICAL2 MICAL-2|MICAL2PV1|MICAL2PV2 microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2 protein-coding 120.5-67 chr14 22158958 22159195 + 0.75 NA Intergenic MLT2E|LTR|ERVL 273677 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 118.75-56 chr13 98371643 98372000 + 0.75 NA intron (NM_005766, intron 5 of 26) intron (NM_005766, intron 5 of 26) 150304 NM_003576 8428 Hs.508514 NM_003576 ENSG00000102572 STK24 HEL-S-95|MST3|MST3B|STE20|STK3 serine/threonine kinase 24 protein-coding 204.5-112 chr5 174011043 174011465 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 22084 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 150.5-163 chr5 12225594 12226017 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -321359 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 125.25-145 chr4 67623301 67623549 + 0.75 NA intron (NM_018227, intron 30 of 32) intron (NM_018227, intron 30 of 32) 64698 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 182-11 chr10 72377780 72378115 + 0.75 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -23028 NR_157570 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 115.75-191 chr6 155375364 155375625 + 0.75 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -61010 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 133-189 chr9 112534462 112534708 + 0.75 NA intron (NM_133465, intron 1 of 3) AluSq|SINE|Alu -46941 NM_001350649 100133204 Hs.662552 NM_001350649 C9orf147 - chromosome 9 open reading frame 147 protein-coding 153.5-59 chr14 82611393 82611690 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -31091 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 289.25-19 chr21 29953663 29954253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13906 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 301.75-12 chr14 71362926 71363521 + 0.75 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -35114 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 159.5-204 chr8 87351696 87351951 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 9 of 10) intron (NM_173538, intron 9 of 10) 485408 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 193.75-119 chr8 86750614 86751135 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7199 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 234.25-46 chr3 76638787 76639309 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -401051 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 123.75-166 chr7 3137948 3138211 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 20494 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 125.25-76 chr16 51363857 51364087 + 0.75 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -212700 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 145.5-161 chr5 112887790 112888069 + 0.75 NA intron (NM_005669, intron 3 of 4) intron (NM_005669, intron 3 of 4) 26642 NM_001204199 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 117.5-108 chr2 110729065 110729337 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3372 NM_001365487 55289 Hs.253320 NM_018308 ENSG00000153093 ACOXL - acyl-CoA oxidase like protein-coding 165.5-110 chr3 69310983 69311272 + 0.75 NA intron (NM_015123, intron 3 of 22) intron (NM_015123, intron 3 of 22) 74961 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 224-42 chr5 25249506 25249860 + 0.75 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) L1PA13|LINE|L1 58730 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 203.75-56 chr2 50475891 50476427 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 15 of 22) intron (NM_001330093, intron 15 of 22) -128403 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 118.25-191 chr7 146709911 146710086 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64273 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 131.75-189 chr6 76614186 76614426 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -20683 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 121-108 chr2 156580509 156580854 + 0.75 NA intron (NM_000408, intron 16 of 16) intron (NM_000408, intron 16 of 16) 144302 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 118-14 chr10 46518314 46518613 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37608 NM_014696 9721 Hs.523375 NM_014696 ENSG00000204175 GPRIN2 GRIN2|KIAA0514 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 protein-coding 195.25-27 chr13 75492455 75492815 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10466 NM_014832 9882 Hs.210891 NM_014832 ENSG00000136111 TBC1D4 AS160|NIDDM5 TBC1 domain family member 4 protein-coding 182.5-2 chr1 73391660 73392069 + 0.75 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 85694 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 134.5-114 chr20 14239565 14239846 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1PA15|LINE|L1 97907 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 142.75-193 chr8 129879436 129879668 + 0.75 NA intron (NM_001353257, intron 2 of 11) intron (NM_001353257, intron 2 of 11) 60259 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 147.5-222 chrX 10877272 10877603 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -43754 NM_033290 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 251.75-8 chr10 20789992 20790487 + 0.75 NA intron (NM_001173484, intron 5 of 6) intron (NM_001173484, intron 5 of 6) 107363 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 177.25-54 chr16 7978715 7979085 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 610938 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 197-64 chr8 129006610 129007024 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40816 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 139.25-95 chr2 180788835 180789192 + 0.75 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) MIR3|SINE|MIR 96909 NR_104319 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 134.75-60 chr14 30403301 30403541 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -155702 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 151.25-75 chr18 68571161 68571559 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 143748 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 131-73 chr19 9825777 9826139 + 0.75 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 -1960 NM_024292 59286 Hs.534477 NM_024292 ENSG00000198258 UBL5 HUB1 ubiquitin like 5 protein-coding 116.25-37 chr11 40220937 40221239 + 0.75 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu 72042 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 156.75-72 chr17 82908512 82908815 + 0.75 NA intron (NM_005993, intron 21 of 38) intron (NM_005993, intron 21 of 38) -68641 NM_024702 79755 Hs.464391 NM_024702 ENSG00000141579 ZNF750 ZFP750 zinc finger protein 750 protein-coding 173-64 chr2 59047306 59047639 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 12 of 13) intron (NR_033873, intron 12 of 13) -170236 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 206.5-102 chr5 149341228 149341705 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001146337, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001146337, exon 18 of 18) -4033 NM_152407 134266 Hs.511816 NM_152407 ENSG00000164284 GRPEL2 Mt-GrpE#2 GrpE like 2, mitochondrial protein-coding 200.25-116 chr9 479348 479916 + 0.75 NA intron (NM_001256876, intron 3 of 15) intron (NM_001256876, intron 3 of 15) 9341 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 140-76 chr2 101022360 101022713 + 0.75 NA intron (NM_001102426, intron 15 of 19) intron (NM_001102426, intron 15 of 19) 20247 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 199.25-101 chr9 16310154 16310623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34075 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 175.5-138 chr5 129412507 129412880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15546 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 158.75-94 chr2 184943871 184944175 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 223049 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 190.5-94 chr22 35300870 35301314 + 0.75 NA intron (NR_156428, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 1198 NM_005488 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 200.25-3 chr1 114660413 114661022 + 0.75 NA intron (NM_001256404, intron 1 of 20) Charlie9|DNA|hAT-Charlie 9332 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 136.75-56 chr14 50309923 50310169 + 0.75 NA intron (NM_024884, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 2183 NM_024884 79944 Hs.256034 NM_024884 ENSG00000087299 L2HGDH C14orf160|L2HGA L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase protein-coding 145-48 chr14 85554046 85554485 + 0.75 NA intron (NR_144387, intron 3 of 4) intron (NR_144387, intron 3 of 4) 20916 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 174.75-116 chr7 47087307 47087857 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 377221 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 156-115 chr5 17362344 17362718 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 24779 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 187.5-113 chr3 66342037 66342616 + 0.75 NA intron (NR_028475, intron 5 of 9) intron (NR_028475, intron 5 of 9) 121323 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 166.75-54 chr15 80003162 80003535 + 0.75 NA Intergenic LTR10B1|LTR|ERV1 -32152 NM_001114735 597 Hs.227817 NM_004049 ENSG00000140379 BCL2A1 ACC-1|ACC-2|ACC1|ACC2|BCL2L5|BFL1|GRS|HBPA1 BCL2 related protein A1 protein-coding 146-120 chr7 46685135 46685499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11805 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 112.75-173 chr5 175637410 175637711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20511 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 143.25-8 chr1 109464360 109464666 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -2033 NM_001040709 284612 Hs.528366 NM_001006603 ENSG00000143028 SYPL2 MG29 synaptophysin like 2 protein-coding 120.5-10 chr1 98919997 98920359 + 0.75 NA intron (NM_001037317, intron 4 of 5) intron (NM_001037317, intron 4 of 5) -84098 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 141.75-29 chr11 24794849 24795095 + 0.75 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 297919 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 144.25-142 chr4 68182611 68182929 + 0.75 NA non-coding (NR_015446, exon 1 of 3) non-coding (NR_015446, exon 1 of 3) 478 NR_015446 100130017 Hs.582037 NR_015446 ENSG00000250426 FTLP10 - ferritin light chain pseudogene 10 pseudo 143.5-26 chr10 75899491 75899822 + 0.75 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 116895 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 202-29 chr18 40340307 40340843 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 274289 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 186-14 chr10 128257535 128257837 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28264 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 208.5-95 chr4 35458608 35459106 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 785082 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 207.75-4 chr1 78884636 78885089 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 121868 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 142.25-53 chr14 23334696 23334935 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 12809 NM_001360552 8106 Hs.707712 NM_004643 ENSG00000100836 PABPN1 OPMD|PAB2|PABII|PABP-2|PABP2 poly(A) binding protein nuclear 1 protein-coding 133-34 chr12 87126573 87126794 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -204056 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 234.75-64 chr5 71644575 71645005 + 0.75 NA intron (NM_022132, intron 12 of 16) intron (NM_022132, intron 12 of 16) 57450 NM_022132 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 130.75-91 chr2 108193295 108193586 + 0.75 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) L1ME3A|LINE|L1 24401 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 135-103 chr3 36708303 36708597 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31411 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 113 chr1 50093502 50093682 + 0.75 NA intron (NM_001324208, intron 1 of 6) MER94|DNA|hAT-Blackjack -10317 NM_001144776 1996 Hs.213050 NM_021952 ENSG00000162374 ELAVL4 HUD|PNEM ELAV like RNA binding protein 4 protein-coding 206.5-71 chr3 54606271 54606719 + 0.75 NA intron (NM_018398, intron 9 of 37) L2a|LINE|L2 33362 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 174-95 chr7 91206967 91207325 + 0.75 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -57287 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 147.5-16 chr10 21993534 21993864 + 0.75 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 10031 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 201.75-26 chr12 107000798 107001370 + 0.75 NA intron (NM_004075, intron 5 of 12) intron (NM_004075, intron 5 of 12) -13918 NM_025198 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 130-88 chr20 1379196 1379473 + 0.75 NA TTS (NR_040047) TTS (NR_040047) 13627 NR_106929 102465524 NR_106929 ENSG00000284436 MIR6869 hsa-mir-6869 microRNA 6869 ncRNA 159.75-131 chr5 39192735 39193161 + 0.75 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) intron (NM_001243093, intron 2 of 18) 26615 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 201.75-23 chr12 68306682 68307136 + 0.75 NA intron (NM_001368282, intron 11 of 13) L1PA17|LINE|L1 25453 NM_001368282 56890 Hs.655702 NM_017440 ENSG00000111554 MDM1 - Mdm1 nuclear protein protein-coding 279-21 chr2 141878679 141879172 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 252776 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 204-45 chr20 59304600 59305092 + 0.75 NA intron (NM_207032, intron 2 of 4) intron (NM_207032, intron 2 of 4) 4235 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 150.25-95 chr3 32794651 32794949 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23197 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 132.75-87 chr18 61832301 61832569 + 0.75 NA intron (NM_173557, intron 1 of 1) intron (NM_173557, intron 1 of 1) 60572 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 150-23 chr11 104190839 104191166 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26855 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 122-18 chr1 167110568 167110981 + 0.75 NA intron (NM_001080426, intron 2 of 5) intron (NM_001080426, intron 2 of 5) 16699 NM_001080426 92235 Hs.632462 NM_001080426 ENSG00000198842 DUSP27 - dual specificity phosphatase 27, atypical protein-coding 206-3 chr1 159299268 159299546 + 0.75 NA intron (NM_002001, intron 1 of 5) intron (NM_002001, intron 1 of 5) 9693 NM_002001 2205 Hs.897 NM_002001 ENSG00000179639 FCER1A FCE1A|FcERI Fc fragment of IgE receptor Ia protein-coding 217-50 chr22 41746959 41747427 + 0.75 NA intron (NM_152513, intron 14 of 30) MIRc|SINE|MIR 47690 NM_152513 150365 Hs.116419 NM_152513 ENSG00000167077 MEI1 HYDM3|SPATA38 meiotic double-stranded break formation protein 1 protein-coding 212.5-59 chr2 194084773 194085132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -259317 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 128-110 chr4 41215223 41215481 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_004307) promoter-TSS (NM_004307) -810 NM_001330658 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 143.75-130 chr4 38215362 38215677 + 0.75 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 95565 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 113.75-88 chr18 35427137 35427512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49987 NM_145756 252884 Hs.351005 NM_145756 ENSG00000186496 ZNF396 ZSCAN14 zinc finger protein 396 protein-coding 124.75-13 chr1 147371683 147371914 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128656 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 180.5-12 chr10 50924641 50925021 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39156 NM_001198820 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 229-63 chr5 37311843 37312226 + 0.75 NA intron (NM_004298, intron 22 of 34) AluSx|SINE|Alu 59072 NM_153485 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 188.75-47 chr17 73682162 73682416 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -37844 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 279.25-8 chr10 31403506 31404014 + 0.75 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -4005 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 161-82 chr4 82319880 82320250 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 53926 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 222.25-44 chr3 55130129 55130558 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47829 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 139.25-125 chr3 139179841 139180080 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 53562 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 113-179 chr8 103330259 103330571 + 0.75 NA intron (NM_003506, intron 6 of 6) intron (NM_003506, intron 6 of 6) 21437 NR_145795 109623480 NR_145795 SNORD173 - small nucleolar RNA, C/D box 173 snoRNA 177.75-7 chr1 93218126 93218635 + 0.75 NA intron (NM_001306076, intron 14 of 28) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 37664 NM_206886 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 205.5-23 chr11 99149928 99150395 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 129212 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 193.75-6 chr1 76369475 76369774 + 0.75 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 294878 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 164-116 chr6 92116456 92116700 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -426150 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 225.75-62 chr5 84346921 84347319 + 0.75 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 37747 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 157.75-12 chr10 58882754 58883065 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -116609 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 233.5-73 chr3 139033628 139034051 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 11053 NM_001134657 389152 Hs.531377 NM_001004315 ENSG00000233701 PRR23C - proline rich 23C protein-coding 194.75-11 chr1 214525343 214525818 + 0.75 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) intron (NM_005401, intron 1 of 18) 26022 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 224.25-89 chr7 18095894 18096412 + 0.75 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) intron (NM_001204144, intron 1 of 12) 9328 NM_001321869 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 119.75-129 chr21 30869161 30869321 + 0.75 NA Intergenic Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 12339 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 158.75-32 chr11 96697644 96697935 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 189364 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 262.25-26 chr21 16641292 16641870 + 0.75 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 51344 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 129-53 chr13 24771859 24772076 + 0.75 NA intron (NM_031277, intron 2 of 35) AluSp|SINE|Alu 7798 NM_031277 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 165.25-102 chr4 53466001 53466325 + 0.75 NA intron (NM_001126328, intron 9 of 10) Charlie10|DNA|hAT-Charlie -33914 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 224.75-50 chr4 12657135 12657505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 433869 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 131.25-108 chr2 130313033 130313308 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28938 NM_001321119 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 188.25-83 chr4 67183908 67184332 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 237880 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 130.5-187 chr4 53269870 53270145 + 0.75 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) AluSz|SINE|Alu 96054 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 136.5-75 chr14 95608230 95608441 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 34773 NR_146450 100506999 Hs.112858 NR_146449 ENSG00000258390 LINC02318 - long intergenic non-protein coding RNA 2318 ncRNA 162.25-5 chr1 60412298 60412577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 210248 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 128.25-196 chr7 136693837 136694215 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -174626 NM_001006627 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 200.25-84 chr4 54680330 54680693 + 0.75 NA intron (NM_000222, intron 1 of 20) AluSq|SINE|Alu 22583 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 140.75-166 chr6 163753516 163753848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -82198 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 159.5-164 chr4 87789229 87789620 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10130 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 113.75-153 chr5 44319884 44320083 + 0.75 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) Charlie3|DNA|hAT-Charlie -68749 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 119.75-60 chr14 58930258 58930498 + 0.75 NA intron (NR_110547, intron 3 of 5) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 102090 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 281.75-13 chr12 60883016 60883667 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 1193971 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 137-62 chr17 48767661 48767886 + 0.75 NA intron (NM_001366314, intron 13 of 13) intron (NM_001366314, intron 13 of 13) 26551 NM_173623 284076 Hs.91930 NM_173623 ENSG00000170703 TTLL6 TTL.6 tubulin tyrosine ligase like 6 protein-coding 139.25-102 chr20 47810296 47810682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23873 NM_198596 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 142.25-162 chr8 30693979 30694318 + 0.75 NA intron (NM_000637, intron 7 of 12) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 33698 NM_000637 2936 Hs.271510 NM_000637 ENSG00000104687 GSR GR|HEL-75|HEL-S-122m glutathione-disulfide reductase protein-coding 212.75-28 chr13 48991135 48991537 + 0.75 NA intron (NR_103528, intron 1 of 25) L1MEc|LINE|L1 14674 NR_103528 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 127.75-44 chr11 71990309 71990600 + 0.75 NA intron (NM_018320, intron 5 of 8) MER58D|DNA|hAT-Charlie -8455 NM_001039660 10068 Hs.591967 NM_005699 ENSG00000137496 IL18BP IL18BPa interleukin 18 binding protein protein-coding 165-10 chr1 242466493 242466853 + 0.75 NA intron (NM_001320272, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu -17191 NM_001195811 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 164-89 chr4 55303317 55303725 + 0.75 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -42721 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 164.75-127 chr6 84832809 84833184 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -68398 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 172-105 chr8 81449862 81450184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2584 NM_002677 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 426.5-2 chr17 61032905 61033620 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 17 of 25) MER5A|DNA|hAT-Charlie 334442 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 155.75-33 chr11 90528927 90529240 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 26774 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 282.75-19 chr2 44890114 44890570 + 0.75 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X 48546 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 241.25-27 chr18 6193245 6193782 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 12 of 16) L2a|LINE|L2 -63231 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 122.25-209 chr9 95416931 95417147 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -46570 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 117.75-82 chr17 60323592 60323880 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) intron (NM_032582, intron 2 of 33) 68397 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 192.25-18 chr12 40319169 40319579 + 0.75 NA intron (NM_198578, intron 33 of 50) intron (NM_198578, intron 33 of 50) -74020 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 127.75-208 chr9 84202758 84202963 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 137898 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 186.75-119 chr9 73636374 73636738 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 484691 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 184.75-84 chr6 42971914 42972328 + 0.75 NA intron (NM_001316313, intron 3 of 16) intron (NM_001316313, intron 3 of 16) 7060 NM_000287 5190 Hs.656425 NM_000287 ENSG00000124587 PEX6 HMLR2|PAF-2|PAF2|PBD4A|PDB4B|PXAAA1 peroxisomal biogenesis factor 6 protein-coding 211-37 chr20 14292406 14293025 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) AluSq2|SINE|Alu 44897 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 157.5-108 chr2 121012335 121012665 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 220219 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 129.25-26 chr10 117060776 117061136 + 0.75 NA intron (NM_001258300, intron 1 of 17) intron (NM_001258300, intron 1 of 17) -55379 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 291-31 chr7 135205676 135206162 + 0.75 NA intron (NR_156131, intron 5 of 13) intron (NR_156131, intron 5 of 13) 1159 NR_106764 102465254 NR_106764 ENSG00000277138 MIR6509 hsa-mir-6509 microRNA 6509 ncRNA 150.25-81 chr2 176131463 176131702 + 0.75 NA exon (NM_001199746, exon 2 of 2) exon (NM_001199746, exon 2 of 2) 1877 NM_001199747 3234 Hs.301963 NM_019558 ENSG00000175879 HOXD8 HOX4|HOX4E|HOX5.4 homeobox D8 protein-coding 132.5-138 chr20 36384500 36384821 + 0.75 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) intron (NM_001365621, intron 2 of 12) -76808 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 113-110 chr22 31198155 31198359 + 0.75 NA intron (NR_024210, intron 5 of 6) L1ME4c|LINE|L1 -14041 NM_005569 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 133.75-65 chr15 59035473 59035779 + 0.75 NA intron (NM_001270529, intron 2 of 13) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 47480 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 137.5-72 chr15 50338482 50338768 + 0.75 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu -15549 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 140-14 chr1 212498056 212498296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47518 NR_125985 101929565 NR_125985 ENSG00000228067 LINC01740 - long intergenic non-protein coding RNA 1740 ncRNA 141-167 chr9 126811522 126811786 + 0.75 NA intron (NM_014007, intron 2 of 2) AluSx4|SINE|Alu 6614 NM_014007 23099 Hs.355581 NM_014007 ENSG00000169155 ZBTB43 ZBTB22B|ZNF-X|ZNF297B zinc finger and BTB domain containing 43 protein-coding 197.5-163 chr8 120243348 120243820 + 0.75 NA intron (NM_021110, intron 19 of 47) intron (NM_021110, intron 19 of 47) 118482 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 127.75-37 chr10 126075330 126075544 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 11 of 18) L2a|LINE|L2 -102164 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 126.5-106 chr2 22322098 22322366 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -214247 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 169.75-83 chr2 120616408 120616911 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -119209 NM_001371271 170.75-26 chr12 76958274 76958644 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -79440 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 141 chr1 27166404 27166819 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11486 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 189.25-37 chr14 100272801 100273077 + 0.75 NA intron (NM_003403, intron 2 of 4) L1PB2|LINE|L1 -4418 NR_106822 102466730 NR_106822 ENSG00000283840 MIR6764 hsa-mir-6764 microRNA 6764 ncRNA 173.25-34 chr14 25456073 25456397 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -405938 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 118.5-238 chrX 5973085 5973282 + 0.75 NA intron (NM_001282145, intron 4 of 6) MER58A|DNA|hAT-Charlie -253175 NR_136577 105373156 Hs.21107 NR_136577 LOC105373156 - uncharacterized LOC105373156 ncRNA 123.75-116 chr3 53431878 53432213 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -62566 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 142.25-3 chr1 33228632 33228962 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -27695 NM_152493 149076 Hs.743358 NM_152493 ENSG00000160094 ZNF362 RN|lin-29 zinc finger protein 362 protein-coding 223-35 chr18 72374564 72375115 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 169503 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 121.25-177 chr6 57116073 57116273 + 0.75 NA intron (NR_110742, intron 2 of 3) intron (NR_110742, intron 2 of 3) 25985 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 168-99 chr5 28136492 28136962 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 150938 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 124.75-220 chrX 15931821 15932057 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -77126 NM_001272071 8905 Hs.121592 NM_003916 ENSG00000182287 AP1S2 DC22|MRX59|MRXS21|MRXS5|MRXSF|PGS|SIGMA1B adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2 protein-coding 137.25-167 chr8 91598717 91598992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 349535 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 122.5-238 chrX 46814529 46814763 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22397 NM_006915 6102 Hs.44766 NM_006915 ENSG00000102218 RP2 DELXp11.3|NM23-H10|NME10|TBCCD2|XRP2 RP2 activator of ARL3 GTPase protein-coding 116.75-193 chr8 35951467 35951705 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -241266 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 278.25-43 chr4 104617191 104617770 + 0.75 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -122586 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 128.5-48 chr12 11793662 11793953 + 0.75 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 143953 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 158.25-118 chr6 27374037 27374495 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001322288) promoter-TSS (NM_001322288) -369 NM_001322288 346157 Hs.651176 NM_001013719 ENSG00000124613 ZNF391 dJ153G14.3 zinc finger protein 391 protein-coding 155-136 chr8 24348205 24348597 + 0.75 NA intron (NR_130710, intron 18 of 22) L1MC1|LINE|L1 -35884 NM_001145271 27299 Hs.521459 NM_014479 ENSG00000134028 ADAMDEC1 M12.219 ADAM like decysin 1 protein-coding 142.75-164 chr5 153829585 153829815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 69287 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 132-160 chr7 40349678 40350071 + 0.75 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) AluJo|SINE|Alu 214898 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 147.75-152 chr8 88972226 88972611 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -644935 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 273.5-42 chr22 34511494 34511957 + 0.75 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 486191 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 266.5-23 chr15 81913489 81913971 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132288 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 223.5-13 chr10 19802204 19802605 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14028 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 116.25-242 chr9 37032329 37032517 + 0.75 NA intron (NM_001280548, intron 1 of 8) intron (NM_001280548, intron 1 of 8) 1845 NM_001280554 5079 Hs.654464 NM_016734 ENSG00000196092 PAX5 ALL3|BSAP paired box 5 protein-coding 210.25-14 chr11 82405289 82405796 + 0.75 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -1629 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 241.75-57 chr4 82919716 82920304 + 0.75 NA TTS (NM_024672) TTS (NM_024672) -19094 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 152.75-98 chr20 37404607 37404891 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005417, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005417, exon 14 of 14) 58621 NM_198291 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 202.25-45 chr20 44995699 44996079 + 0.75 NA intron (NM_001352385, intron 6 of 11) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 29377 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 274.75-52 chr8 120623954 120624646 + 0.75 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -136953 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 220.5-48 chr2 81752749 81753093 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -285975 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 197.25-49 chr2 60623312 60623836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69920 NM_022893 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 180-25 chr13 44601717 44601987 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25287 NM_001243799 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 149.25-89 chr2 155336074 155336322 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 637503 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 183.75-12 chr1 232385159 232385637 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130210 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 211-3 chr1 160108766 160109288 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6732 NM_000702 477 Hs.34114 NM_000702 ENSG00000018625 ATP1A2 FHM2|MHP2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2 protein-coding 117.75-100 chr2 31908193 31908462 + 0.75 NA intron (NM_001137602, intron 4 of 7) intron (NM_001137602, intron 4 of 7) 102337 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 230.25-85 chr8 127526207 127526565 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44247 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 133-185 chr9 14544398 14544615 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12429 NM_001369462 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 197.75-42 chr2 98308712 98309000 + 0.75 NA intron (NM_001345864, intron 20 of 21) intron (NM_001345864, intron 20 of 21) -37299 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 134.5-245 chr9 116500764 116501149 + 0.75 NA intron (NM_014010, intron 18 of 21) intron (NM_014010, intron 18 of 21) -3327 NR_033973 100128505 Hs.675821 NR_033973 ENSG00000229105 ASTN2-AS1 - ASTN2 antisense RNA 1 ncRNA 144-65 chr2 187425946 187426206 + 0.75 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 22176 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 178.25-112 chr7 129490646 129490933 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -11742 NM_001195243 100287482 Hs.178144 NM_001195243 ENSG00000240204 SMKR1 - small lysine rich protein 1 protein-coding 157-57 chr2 79481131 79481547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 19505 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 218.25-30 chr15 58424893 58425388 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6851 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 186.25-3 chr1 63084196 63084505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -71879 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 127.5-88 chr15 57839063 57839369 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 132502 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 190.75-64 chr3 98833125 98833401 + 0.75 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) L1PREC2|LINE|L1 68432 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 204.75-82 chr4 80572939 80573344 + 0.75 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L1MA3|LINE|L1 237421 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 120.75-81 chr2 147096126 147096304 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 509158 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 131.25-66 chr14 97323772 97324103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -134879 NR_110166 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 160.5-142 chr5 3582540 3582927 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13099 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 150.25-144 chr7 91805643 91805988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 74887 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 128.5-167 chr5 2259137 2259365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 52950 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 129-51 chr13 20276426 20276698 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -44167 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 159.5-56 chr14 86799221 86799433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -106451 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 164.25-117 chr4 79130784 79131072 + 0.75 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) L1M3|LINE|L1 159180 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 298-9 chr15 58860415 58861299 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001040453, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001040453, exon 9 of 9) 72822 NR_135043 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 173-62 chr2 22244639 22244906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -291707 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 169.75-63 chr17 42143453 42143756 + 0.75 NA intron (NM_201434, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 11385 NM_001252039 5878 Hs.650382 NM_004583 ENSG00000108774 RAB5C L1880|RAB5CL|RAB5L|RABL RAB5C, member RAS oncogene family protein-coding 206-77 chr8 123757320 123757743 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -10908 NM_001317918 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 178.75-84 chr5 76974972 76975250 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22066 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 153.5-154 chr5 25620907 25621114 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 430057 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 369-16 chr8 107597192 107598147 + 0.75 NA Intergenic LTR30|LTR|ERV1 -99751 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 128.5-157 chr4 52549677 52549909 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106746 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 211.25-10 chr10 26979777 26980368 + 0.75 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -38071 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 135.25-163 chr5 91517417 91517752 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -134267 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 144.75-38 chr12 13098596 13098853 + 0.75 NA intron (NM_001080555, intron 1 of 6) intron (NM_001080555, intron 1 of 6) -3049 NM_001206845 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 151-66 chr2 165062763 165063253 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -107483 NM_173512 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 137.25-162 chr8 67221001 67221192 + 0.75 NA intron (NM_006421, intron 29 of 38) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 122685 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 135.75 chr1 1878287 1878585 + 0.75 NA intron (NM_001282538, intron 1 of 9) intron (NM_001282538, intron 1 of 9) 12651 NM_002074 2782 Hs.430425 NM_002074 ENSG00000078369 GNB1 MRD42 G protein subunit beta 1 protein-coding 119.25-201 chr8 33311485 33311796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161506 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 155.5-30 chr10 94124304 94124619 + 0.75 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) MIR3|SINE|MIR -15667 NR_120616 101927049 Hs.144492 NR_120615 ENSG00000232913 PLCE1-AS2 - PLCE1 antisense RNA 2 ncRNA 207.25-23 chr14 56170370 56170780 + 0.75 NA intron (NM_021255, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 52164 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 204.75-67 chr2 192691209 192691588 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58447 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 127.25-91 chr2 81834445 81834800 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -367676 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 124.75-149 chr3 158061933 158062239 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44077 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 242-2 chr1 41696530 41696989 + 0.75 NA intron (NM_001127714, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 -212076 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 143.75-136 chr4 81178294 81178512 + 0.75 NA intron (NR_125908, intron 3 of 4) L1ME3A|LINE|L1 13463 NR_125908 101928942 Hs.664002 NR_125908 ENSG00000251059 LOC101928942 - uncharacterized LOC101928942 ncRNA 126-38 chr12 17282026 17282234 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 293383 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 138-149 chr7 15452007 15452340 + 0.75 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) L1MB7|LINE|L1 109842 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 116.75-28 chr10 84851904 84852175 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 346866 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 141-97 chr3 13489495 13489834 + 0.75 NA intron (NM_001330636, intron 3 of 6) AluSz|SINE|Alu 9358 NM_024827 79885 Hs.744132 NM_024827 ENSG00000163517 HDAC11 HD11 histone deacetylase 11 protein-coding 266.75-26 chr2 111129868 111130287 + 0.75 NA intron (NM_001204111, intron 3 of 3) L1MD2|LINE|L1 9163 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 204-54 chr3 116551153 116551518 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -1138 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 177.75-26 chr12 18277559 18277914 + 0.75 NA intron (NM_001288774, intron 1 of 32) intron (NM_001288774, intron 1 of 32) 16196 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 120.25-131 chr3 58076797 58076991 + 0.75 NA intron (NM_001164318, intron 1 of 45) L1MC5a|LINE|L1 68472 NM_001164319 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 119.5-72 chr13 101299989 101300313 + 0.75 NA intron (NM_001350749, intron 7 of 43) intron (NM_001350749, intron 7 of 43) 116357 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 162.5-115 chr3 126099462 126099764 + 0.75 NA intron (NM_001164475, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu 1935 NM_001164475 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 139.25-163 chr6 51249517 51249747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -372238 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 232.5-40 chr18 2320083 2320616 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 251156 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 125-36 chr12 66685268 66685434 + 0.75 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) -6275 NM_001178074 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 120.25-200 chr7 50257354 50257539 + 0.75 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -46618 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 183.5-65 chr2 60061340 60061712 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 321510 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 146.5-21 chr1 196724287 196724634 + 0.75 NA intron (NM_000186, intron 11 of 21) L1PA15-16|LINE|L1 -50340 NM_001166624 10878 Hs.709217 NM_021023 ENSG00000116785 CFHR3 CFHL3|DOWN16|FHR-3|FHR3|HLF4 complement factor H related 3 protein-coding 136-127 chr6 23629116 23629534 + 0.75 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -496890 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 126.25-12 chr1 212648059 212648245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23678 NM_153606 149647 Hs.129293 NM_153606 ENSG00000162771 FAM71A GARI-L4 family with sequence similarity 71 member A protein-coding 148.25-16 chr1 221858958 221859245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18435 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 142-61 chr16 51033449 51033850 + 0.75 NA intron (NR_110913, intron 2 of 2) L1ME4a|LINE|L1 15891 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 312.75-16 chr2 166112293 166112894 + 0.75 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) MER21C|LTR|ERVL 15427 NM_001353952 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 165.75-131 chr5 22580120 22580632 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 272968 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 178.25-109 chr7 53182998 53183445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 147588 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 144.75-118 chr4 39865063 39865287 + 0.75 NA intron (NM_001100399, intron 23 of 32) intron (NM_001100399, intron 23 of 32) 112736 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 126.75-235 chr8 11285650 11285945 + 0.75 NA intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 981 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 189-29 chr12 68151545 68151859 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8038 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 133.5-266 chr8 102201267 102201635 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 37380 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 149.75-62 chr17 53868666 53868998 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 45905 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 240.5-4 chr10 3526964 3527363 + 0.75 NA intron (NR_131187, intron 1 of 1) intron (NR_131187, intron 1 of 1) -24325 NR_155744 101927880 NR_155743 LINC02669 - long intergenic non-protein coding RNA 2669 ncRNA 207.25-73 chr5 65201429 65201870 + 0.75 NA intron (NR_135689, intron 21 of 25) intron (NR_135689, intron 21 of 25) 280271 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 161.5-129 chr3 33242353 33242624 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -23678 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 151-92 chr3 184914563 184914862 + 0.75 NA intron (NM_001009921, intron 25 of 46) intron (NM_001009921, intron 25 of 46) 102205 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 133.25-225 chr9 115672029 115672466 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71992 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 284.5-24 chr17 49854899 49855542 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7203 NM_001077506 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 117.75-205 chr8 52277083 52277415 + 0.75 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) (CATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22757 NM_001352841 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 216.5-125 chr8 127323354 127323740 + 0.75 NA intron (NR_117099, intron 2 of 3) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -76852 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 399-9 chr8 118334568 118335616 + 0.75 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L3b|LINE|CR1 -223273 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 150-83 chr20 40856890 40857145 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -123696 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 209-40 chr2 15617052 15617336 + 0.75 NA intron (NM_004939, intron 14 of 25) intron (NM_004939, intron 14 of 25) 25326 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 145-127 chr5 122331742 122332055 + 0.75 NA intron (NM_001308107, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 19661 NM_001308109 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 193.25-39 chr16 27605531 27605854 + 0.75 NA intron (NM_015202, intron 2 of 27) intron (NM_015202, intron 2 of 27) 55548 NM_015202 23247 Hs.460459 NM_015202 ENSG00000047578 KIAA0556 JBTS26 KIAA0556 protein-coding 142.25-83 chr2 37525838 37526101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146230 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 232.75-67 chr9 31622088 31622492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -240800 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 128.75-117 chr3 7946816 7947126 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 69336 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 152.75-103 chr3 5965850 5966083 + 0.75 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -715711 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 170.25-23 chr11 125691663 125691947 + 0.75 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -10958 NM_020107 56 Hs.169222 NM_001612 ENSG00000134940 ACRV1 D11S4365|SP-10|SPACA2 acrosomal vesicle protein 1 protein-coding 132.5-257 chr9 105306171 105306440 + 0.75 NA intron (NM_001330731, intron 2 of 15) intron (NM_001330731, intron 2 of 15) 61654 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 174.75-121 chr7 129191092 129191578 + 0.75 NA intron (NM_005631, intron 1 of 11) intron (NM_005631, intron 1 of 11) 2702 NM_005631 6608 Hs.437846 NM_005631 ENSG00000128602 SMO CRJS|FZD11|Gx|SMOH smoothened, frizzled class receptor protein-coding 139.75-36 chr12 48085668 48085910 + 0.75 NA intron (NR_051992, intron 6 of 18) intron (NR_051992, intron 6 of 18) -19464 NM_001354742 5213 Hs.75160 NM_000289 ENSG00000152556 PFKM ATP-PFK|GSD7|PFK-1|PFK-A|PFK1|PFKA|PFKX|PPP1R122 phosphofructokinase, muscle protein-coding 175.25-150 chr9 27070579 27070860 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -38422 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 186.25-118 chr8 43736991 43737422 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 444764 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 141-67 chr19 56828333 56828826 + 0.75 NA intron (NM_001369723, intron 2 of 10) intron (NM_001369723, intron 2 of 10) 9229 NM_001369733 5178 Hs.731875 NM_006210 ENSG00000198300 PEG3 PW1|ZKSCAN22|ZNF904|ZSCAN24 paternally expressed 3 protein-coding 160.75-73 chr2 84773986 84774462 + 0.75 NA intron (NM_001370, intron 64 of 76) L1PA16|LINE|L1 106860 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 126.5-59 chr14 45127530 45127796 + 0.75 NA intron (NM_002013, intron 3 of 6) MER33|DNA|hAT-Charlie 6818 NM_002013 2287 Hs.509226 NM_002013 ENSG00000100442 FKBP3 FKBP-25|FKBP-3|FKBP25|PPIase FKBP prolyl isomerase 3 protein-coding 117.75-109 chr2 130750724 130750978 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4689 NM_001105193 205147 Hs.369289 NM_152698 ENSG00000178171 AMER3 FAM123C APC membrane recruitment protein 3 protein-coding 133-101 chr21 14486472 14486719 + 0.75 NA intron (NM_022136, intron 7 of 7) intron (NM_022136, intron 7 of 7) 59720 NM_022136 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 191.5-115 chr4 175154099 175154504 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 235943 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 120-82 chr19 44323451 44323640 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -18520 NM_004234 9310 Hs.613424 NM_004234 ENSG00000159917 ZNF235 ANF270|HZF6|ZFP93|ZNF270 zinc finger protein 235 protein-coding 194.5-151 chr8 56573122 56573619 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13547 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 149.25-189 chr8 126347687 126347907 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 22302 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 144-129 chr8 82914606 82914878 + 0.75 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) intron (NR_134295, intron 2 of 3) 2638 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 157-25 chr12 98347085 98347300 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109953 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 133-36 chr12 127652325 127652557 + 0.75 NA intron (NR_134995, intron 1 of 3) intron (NR_134995, intron 1 of 3) 3147 NR_134995 105370068 Hs.524845 NR_134995 LOC105370068 - uncharacterized LOC105370068 ncRNA 151.25-200 chr9 84670763 84671185 + 0.75 NA intron (NM_001018064, intron 2 of 17) intron (NM_001018064, intron 2 of 17) 625 NM_001369549 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 141-56 chr17 1847497 1847790 + 0.75 NA intron (NM_001355120, intron 4 of 16) intron (NM_001355120, intron 4 of 16) 17638 NM_001355121 6117 Hs.461925 NM_002945 ENSG00000132383 RPA1 HSSB|MST075|REPA1|RF-A|RP-A|RPA70 replication protein A1 protein-coding 140.25-26 chr10 100252290 100252621 + 0.75 NA intron (NM_001303404, intron 6 of 12) intron (NM_001303404, intron 6 of 12) -15153 NR_002954 677800 Hs.662165 NR_002954 ENSG00000212464 SNORA12 U108 small nucleolar RNA, H/ACA box 12 snoRNA 243.5-42 chr2 233694262 233694896 + 0.75 NA intron (NM_205862, intron 2 of 5) intron (NM_205862, intron 2 of 5) 1689 NM_001072 54578 Hs.554822 NM_001072 ENSG00000167165 UGT1A6 GNT1|HLUGP|HLUGP1|UDPGT|UDPGT 1-6|UGT-1A|UGT-1C|UGT-1E|UGT1|UGT1-01|UGT1-03|UGT1-05|UGT1.1|UGT1.3|UGT1.5|UGT1A|UGT1A1|UGT1A3|UGT1A5|UGT1A6S|UGT1C|UGT1E|UGT1F|hUG-BR1 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A6 protein-coding 180.75-151 chr8 114800436 114800749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 867421 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 137.5-66 chr14 53083196 53083577 + 0.75 NA intron (NM_030637, intron 4 of 11) intron (NM_030637, intron 4 of 11) 69937 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 129.5-109 chr2 30460866 30461252 + 0.75 NA intron (NM_182551, intron 2 of 6) MER21C|LTR|ERVL 13813 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 218.5-69 chr22 26221781 26222343 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 52588 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 145.5-54 chr13 71440615 71440859 + 0.75 NA intron (NM_080759, intron 10 of 10) intron (NM_080759, intron 10 of 10) 425596 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 144.25-139 chr4 47435509 47435851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 28022 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 178.25-36 chr14 72003699 72003950 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) LTR16A|LTR|ERVL 70297 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 175.5-153 chr8 4407774 4408072 + 0.75 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 586991 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 162.75-121 chr5 126258132 126258479 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 26870 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 145.25-3 chr1 39272704 39273122 + 0.75 NA intron (NM_012090, intron 5 of 92) intron (NM_012090, intron 5 of 92) -136160 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 175.75-132 chrX 132590490 132590811 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76992 NR_046691 100874102 Hs.619341 NR_046691 ENSG00000235849 HS6ST2-AS1 - HS6ST2 antisense RNA 1 ncRNA 245.5-75 chr7 78528929 78529315 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 181880 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 205.75-35 chr18 74368848 74369464 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40292 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 142.75-147 chr4 103729125 103729544 + 0.75 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -9349 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 173.75-78 chr18 57819748 57820168 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16643 NM_005603 5205 Hs.216623 NM_005603 ENSG00000081923 ATP8B1 ATPIC|BRIC|FIC1|ICP1|PFIC|PFIC1 ATPase phospholipid transporting 8B1 protein-coding 247.75-8 chr12 103641487 103641965 + 0.75 NA intron (NM_017564, intron 9 of 68) intron (NM_017564, intron 9 of 68) 54453 NM_017564 55576 Hs.408249 NM_017564 ENSG00000136011 STAB2 FEEL2|FELE-2|FELL2|FEX2|HARE|SCARH1 stabilin 2 protein-coding 179-22 chr11 20773723 20774017 + 0.75 NA intron (NM_201551, intron 2 of 18) intron (NM_201551, intron 2 of 18) 104284 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 188.5-5 chr1 98726679 98727012 + 0.75 NA intron (NR_033716, intron 8 of 8) L2a|LINE|L2 65124 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 144-126 chr8 27504779 27505188 + 0.75 NA exon (NM_001256482, exon 4 of 19) exon (NM_001256482, exon 4 of 19) 13840 NM_001256482 2053 Hs.212088 NM_001979 ENSG00000120915 EPHX2 ABHD20|CEH|SEH epoxide hydrolase 2 protein-coding 160.5-109 chr22 40141236 40141486 + 0.75 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) AluSz|SINE|Alu -36564 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 165.25-51 chr16 70653303 70653706 + 0.75 NA intron (NM_152456, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 29512 NM_001172772 146433 Hs.461214 NM_152456 ENSG00000157368 IL34 C16orf77|IL-34 interleukin 34 protein-coding 124-177 chr9 30081194 30081359 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 327178 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 144.5-131 chr3 76839853 76840159 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -200093 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 171.25-139 chr7 16387604 16387901 + 0.75 NA intron (NM_001101426, intron 2 of 9) L1M4b|LINE|L1 33786 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 113.25-90 chr2 80752596 80752860 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 439349 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 206.5-61 chr2 176542607 176543172 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 58163 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 203.25-62 chr22 26932216 26932803 + 0.75 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 29217 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 115.25-40 chr11 124071306 124071495 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32399 NM_001004463 390265 Hs.553761 NM_001004463 ENSG00000182634 OR10G7 OR11-283 olfactory receptor family 10 subfamily G member 7 protein-coding 138.25-3 chr1 24622682 24622991 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -20466 NM_001366593 10250 Hs.18192 NM_005839 ENSG00000133226 SRRM1 160-KD|POP101|SRM160 serine and arginine repetitive matrix 1 protein-coding 196.25-19 chr11 41317840 41318137 + 0.75 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L1ME4a|LINE|L1 141648 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 118-8 chr1 156987792 156987970 + 0.75 NA intron (NM_014784, intron 1 of 39) intron (NM_014784, intron 1 of 39) -51637 NR_030527 768220 NR_030527 ENSG00000211581 MIR765 MIRN765|hsa-mir-765|mir-765 microRNA 765 ncRNA 141-106 chr3 122683217 122683454 + 0.75 NA intron (NM_017554, intron 1 of 16) intron (NM_017554, intron 1 of 16) 2496 NM_017554 54625 Hs.518203 NM_017554 ENSG00000173193 PARP14 ARTD8|BAL2|PARP-14|pART8 poly(ADP-ribose) polymerase family member 14 protein-coding 179.5-37 chr12 4764873 4765337 + 0.75 NA intron (NM_017417, intron 9 of 10) intron (NM_017417, intron 9 of 10) -44071 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 161.25-143 chr5 138350260 138350594 + 0.75 NA TTS (NM_016605) TTS (NM_016605) -2258 NM_016604 51780 Hs.483486 NM_016604 ENSG00000120733 KDM3B 5qNCA|C5orf7|JMJD1B|NET22 lysine demethylase 3B protein-coding 224.5-88 chr5 18547870 18548350 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 740836 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 146-80 chr20 35853101 35853345 + 0.75 NA intron (NM_016436, intron 4 of 17) AluSx|SINE|Alu 81208 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 158.25-20 chr11 32195707 32196048 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -51965 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 125-97 chr3 7493603 7493944 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) L1MDb|LINE|L1 41511 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 121-163 chr6 8624181 8624381 + 0.75 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) intron (NR_038980, intron 3 of 4) -27928 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 241.25-11 chr10 93645652 93646118 + 0.75 NA intron (NM_006204, intron 14 of 21) intron (NM_006204, intron 14 of 21) 33348 NM_006204 5146 Hs.658121 NM_006204 ENSG00000095464 PDE6C ACHM5|COD4|PDEA2 phosphodiesterase 6C protein-coding 136-131 chr7 20625623 20625902 + 0.75 NA intron (NM_001163941, intron 2 of 27) L1MB3|LINE|L1 10095 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 125.25-104 chr2 103746447 103746757 + 0.75 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 661730 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 125.5-67 chr13 71655632 71655990 + 0.75 NA intron (NM_080759, intron 2 of 10) intron (NM_080759, intron 2 of 10) 211381 NM_080760 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 154-127 chr8 101890994 101891378 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 4 of 7) L1MD2|LINE|L1 -93246 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 117.5-95 chr19 42086034 42086260 + 0.75 NA TTS (NM_001207025) TTS (NM_001207025) 9981 NM_022752 64763 Hs.13323 NM_022752 ENSG00000105732 ZNF574 FP972 zinc finger protein 574 protein-coding 114.5-33 chr10 35774666 35774948 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3495 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 146.25-46 chr16 49331937 49332143 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41764 NM_144602 123970 Hs.125875 NM_144602 ENSG00000166152 C16orf78 - chromosome 16 open reading frame 78 protein-coding 163.5-121 chr22 50323604 50323871 + 0.75 NA intron (NM_001001794, intron 1 of 19) AluJr|SINE|Alu 3275 NM_001001794 414918 Hs.530380 NM_001001794 ENSG00000205593 DENND6B AFI1B|FAM116B DENN domain containing 6B protein-coding 182.25-98 chr5 168861489 168861935 + 0.75 NA intron (NM_003062, intron 5 of 35) intron (NM_003062, intron 5 of 35) -93457 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 184-76 chr5 151649388 151649828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27337 NR_109873 101927096 Hs.571023 NR_109873 ENSG00000249035 CLMAT3 CTB-113P19.1|SPARC-AS1 colorectal liver metastasis associated transcript 3 ncRNA 152.75-115 chr3 188114842 188115135 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38910 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 149-124 chr7 92458049 92458444 + 0.75 NA non-coding (NR_052016, exon 6 of 6) non-coding (NR_052016, exon 6 of 6) 10764 NR_052016 57798 Hs.21145 NM_021167 ENSG00000157259 GATAD1 CMD2B|ODAG|RG083M05.2 GATA zinc finger domain containing 1 protein-coding 149.5-101 chr2 147447923 147448170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -396471 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 170-89 chr7 20192677 20192974 + 0.75 NA intron (NM_182762, intron 1 of 6) intron (NM_182762, intron 1 of 6) 24559 NM_182762 346389 Hs.598388 NM_182762 ENSG00000183742 MACC1 7A5|SH3BP4L MET transcriptional regulator MACC1 protein-coding 140.25-83 chr19 36607262 36607474 + 0.75 NA intron (NM_001256838, intron 1 of 4) intron (NM_001256838, intron 1 of 4) 2055 NM_001256838 84911 Hs.631591 NM_032825 ENSG00000161298 ZNF382 KS1 zinc finger protein 382 protein-coding 318.25-9 chr4 102735802 102736571 + 0.75 NA intron (NM_005908, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR 24782 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 252.25-23 chr17 32131646 32132198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10532 NM_001033566 55288 Hs.655325 NM_018307 ENSG00000126858 RHOT1 ARHT1|MIRO-1|MIRO1 ras homolog family member T1 protein-coding 171.25-102 chr3 144300503 144300811 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 327576 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 171-126 chr7 68330099 68330544 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 310068 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 158.25-89 chr3 94536817 94537078 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -401316 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 155.25-43 chr11 124258075 124258437 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6571 NM_001005198 219865 Hs.722725 NM_001005198 ENSG00000255298 OR8G5 OR11-298|OR8G5P|OR8G6 olfactory receptor family 8 subfamily G member 5 protein-coding 188.75-58 chr2 128029991 128030376 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2124 NM_001330299 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 139.5-48 chr12 63293462 63293797 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -140819 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 113.75-211 chrX 68624827 68625106 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -22703 NM_001142503 9754 Hs.95140 NM_014725 ENSG00000130052 STARD8 ARHGAP38|DLC3|STARTGAP3 StAR related lipid transfer domain containing 8 protein-coding 208-8 chr10 61101316 61101696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 85231 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 203.75-30 chr14 31728903 31729374 + 0.75 NA intron (NM_001201574, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 14569 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 121.5-82 chr14 89741411 89741649 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -122365 NM_001085471 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 161.75-79 chr21 46274914 46275316 + 0.75 NA intron (NM_003906, intron 6 of 27) intron (NM_003906, intron 6 of 27) 10496 NM_003906 8888 Hs.389037 NM_003906 ENSG00000160294 MCM3AP GANP|MAP80|PNRIID|SAC3 minichromosome maintenance complex component 3 associated protein protein-coding 194.25-73 chr3 74440809 74441363 + 0.75 NA intron (NM_020872, intron 3 of 21) intron (NM_020872, intron 3 of 21) 80054 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 180-57 chr2 36403913 36404200 + 0.75 NA intron (NM_016441, intron 2 of 16) intron (NM_016441, intron 2 of 16) 48278 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 116.25-89 chr18 5934989 5935197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -39139 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 168.25-136 chr7 72158411 72158750 + 0.75 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 178811 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 127.5-32 chr10 76342926 76343262 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -544950 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 323-4 chr10 103460429 103461321 + 0.75 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -1984 NM_001001412 255022 Hs.680365 NM_001001412 ENSG00000185933 CALHM1 FAM26C calcium homeostasis modulator 1 protein-coding 195.5-62 chr19 55848416 55848744 + 0.75 NA intron (NM_134444, intron 1 of 9) AluSc|SINE|Alu -11818 NM_145007 204801 Hs.375039 NM_145007 ENSG00000179873 NLRP11 CLR19.6|NALP11|NOD17|PAN10|PYPAF6|PYPAF7 NLR family pyrin domain containing 11 protein-coding 123-135 chr3 182548221 182548498 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41235 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 120.75-105 chr3 34953942 34954214 + 0.75 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MER110A|LTR|ERV1 439945 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 164.25-37 chr13 67001909 67002207 + 0.75 NA TTS (NR_046637) TTS (NR_046637) 11172 NR_046637 100874087 Hs.606903 NR_046637 ENSG00000233840 PCDH9-AS4 - PCDH9 antisense RNA 4 ncRNA 137.5-58 chr13 93922056 93922406 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 3 of 8) intron (NM_005708, intron 3 of 8) -63758 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 140.75-81 chr2 39332816 39333106 + 0.75 NA intron (NM_003618, intron 7 of 33) intron (NM_003618, intron 7 of 33) -88978 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 112.25-178 chr6 36909273 36909609 + 0.75 NA intron (NM_152734, intron 3 of 7) L1ME3G|LINE|L1 23489 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 217.5-135 chr9 100359288 100359765 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -6584 NM_017746 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 130.75-13 chr1 237135211 237135470 + 0.75 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) intron (NM_001035, intron 1 of 104) 93156 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 174.25-21 chr10 126152768 126153160 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 4 of 18) L1MEd|LINE|L1 -179691 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 220.5-126 chr8 139748881 139749325 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -45980 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 166-88 chr4 45944125 45944349 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 179817 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 208-85 chr9 108142104 108142397 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -652481 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 259.75-9 chr11 75808522 75808930 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 6071 NR_144531 100506113 Hs.720913 NR_144531 ENSG00000255507 UVRAG-DT - UVRAG divergent transcript ncRNA 115.75-188 chr6 72069805 72070063 + 0.75 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) intron (NM_001350411, intron 2 of 3) -142959 NM_001350455 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 169.75-12 chr10 22249124 22249465 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -2778 NR_038921 100130992 Hs.48501 NR_038921 LOC100130992 - uncharacterized LOC100130992 ncRNA 133.5-147 chr22 32736729 32736995 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -63954 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 161.5-108 chr2 190266196 190266632 + 0.75 NA intron (NM_198047, intron 6 of 12) intron (NM_198047, intron 6 of 12) 53412 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 116.75-189 chr7 113247160 113247457 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -128726 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 123-108 chr2 139744790 139745004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 841788 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 196-3 chr1 52477043 52477387 + 0.75 NA intron (NM_001009881, intron 12 of 29) intron (NM_001009881, intron 12 of 29) 72613 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 192.5-33 chr12 86079773 86080160 + 0.75 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 176425 NM_001351283 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 133-191 chrX 41607132 41607364 + 0.75 NA intron (NM_003688, intron 12 of 26) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -81725 NM_005300 2857 Hs.495989 NM_005300 ENSG00000171659 GPR34 LYPSR1 G protein-coupled receptor 34 protein-coding 367.5-4 chr1 156270561 156271358 + 0.75 NA intron (NM_015327, intron 7 of 21) AluSp|SINE|Alu 11866 NM_015327 23381 Hs.516837 NM_015327 ENSG00000198952 SMG5 EST1B|LPTS-RP1|LPTSRP1|SMG-5 SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 182.5-95 chr22 25968876 25969228 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 39 of 43) L3|LINE|CR1 -200410 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 151.25-16 chr10 59420993 59421277 + 0.75 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -57954 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 130-106 chr3 112763167 112763465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13997 NR_110017 101929694 Hs.385630 NR_110017 ENSG00000240893 LINC02042 - long intergenic non-protein coding RNA 2042 ncRNA 227.5-69 chr3 39011323 39011734 + 0.75 NA intron (NM_001349253, intron 2 of 29) LTR39|LTR|ERV1 40416 NM_001349253 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 162.75-66 chr2 51364825 51365093 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 332358 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 321.75-17 chr2 28130879 28131544 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) AluYa5|SINE|Alu 75750 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 165.75-41 chr12 90903089 90903637 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14660 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 158.75-74 chr18 5189110 5189398 + 0.75 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 8003 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 116-104 chr3 34006875 34007194 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 208404 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 187.5-5 chr1 69028969 69029514 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -26657 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 183.75-91 chr4 162154922 162155313 + 0.75 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 8883 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 159-11 chr10 22454390 22454676 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -16604 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 154-119 chr6 141671999 141672261 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 416669 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 127.75-128 chr3 78600487 78600710 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 29 of 30) MIRb|SINE|MIR 418861 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 152.5-43 chr14 43399692 43400080 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1107397 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 332.25-26 chr5 12815776 12816391 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 148224 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 159.5-46 chr12 86866848 86867192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28020 NM_001351286 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 169.75-76 chr2 53013362 53013892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -311012 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 278.75-40 chr9 11791891 11792313 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -901283 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 141.25-120 chr4 44378302 44378662 + 0.75 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 70327 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 121.75-126 chr4 14554563 14554853 + 0.75 NA intron (NR_126435, intron 5 of 6) intron (NR_126435, intron 5 of 6) 333461 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 182.75-5 chr1 85366219 85366837 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 37978 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 115.5-54 chr13 110018143 110018475 + 0.75 NA Intergenic (CAGCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -34976 NR_126387 104355146 Hs.508690 NR_126387 ENSG00000231428 LINC00396 - long intergenic non-protein coding RNA 396 ncRNA 154.25-95 chr20 20108828 20109051 + 0.75 NA intron (NM_015585, intron 8 of 26) L1MC4|LINE|L1 52293 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 152.25-145 chr7 18688144 18688596 + 0.75 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 179100 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 135.5-22 chr10 32111320 32111600 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55035 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 120-127 chr3 191231195 191231374 + 0.75 NA intron (NR_133663, intron 1 of 5) intron (NR_133663, intron 1 of 5) 3321 NR_133663 106480738 NR_133663 ENSG00000233308 OSTN-AS1 - OSTN antisense RNA 1 ncRNA 113.75-206 chr9 82250981 82251165 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 262301 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 122-101 chr2 175607145 175607434 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 394978 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 131.75-109 chr2 132973941 132974150 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 7 of 17) intron (NM_207481, intron 7 of 17) 58488 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 239.25-79 chr6 68916568 68917090 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L2b|LINE|L2 281547 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 156.75-97 chr2 170864813 170865103 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 48071 NM_000817 2571 Hs.420036 NM_000817 ENSG00000128683 GAD1 CPSQ1|GAD|SCP glutamate decarboxylase 1 protein-coding 160.5-12 chr10 32317460 32317929 + 0.75 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) intron (NM_001282391, intron 1 of 13) 29464 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 207.25-51 chr2 237721410 237721821 + 0.75 NA intron (NM_004735, intron 4 of 9) intron (NM_004735, intron 4 of 9) 29410 NM_001137553 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 237.25-56 chr4 112870256 112870847 + 0.75 NA intron (NM_001354271, intron 1 of 42) L1M4|LINE|L1 9564 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 117-54 chr14 46656490 46656737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4832 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 200.75-11 chr10 17700746 17701192 + 0.75 NA intron (NM_001324284, intron 10 of 14) intron (NM_001324284, intron 10 of 14) -51232 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 275.25-40 chr6 152298445 152299003 + 0.75 NA intron (NM_182961, intron 93 of 145) intron (NM_182961, intron 93 of 145) -81806 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 190.75-90 chr5 132810821 132811318 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2233 NM_175873 134548 Hs.13308 NM_175873 ENSG00000198944 SOWAHA ANKRD43 sosondowah ankyrin repeat domain family member A protein-coding 138.75-34 chr11 111241940 111242228 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3641 NM_198498 341032 Hs.298685 NM_198498 ENSG00000150750 C11orf53 - chromosome 11 open reading frame 53 protein-coding 208.75-78 chr7 6487867 6488230 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3896 NM_006854 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 118-10 chr1 224324493 224324725 + 0.75 NA intron (NM_206840, intron 1 of 21) AluJr|SINE|Alu 5563 NM_002533 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 133-81 chr2 73153180 73153581 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -40432 NM_001371272 162-55 chr19 49234019 49234385 + 0.75 NA Intergenic (ATGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 74666 NR_036209 100422979 NR_036209 ENSG00000265407 MIR4324 mir-4324 microRNA 4324 ncRNA 127-125 chr4 67925270 67925488 + 0.75 NA intron (NM_001114387, intron 5 of 9) intron (NM_001114387, intron 5 of 9) 38114 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 152.25-70 chr18 27936290 27936516 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 100238 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 115.25-183 chr7 28839656 28839835 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118585 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 157.5-171 chr6 1453673 1453979 + 0.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -63415 NR_106778 102466720 NR_106778 ENSG00000275859 MIR6720 hsa-mir-6720|mir-6720 microRNA 6720 ncRNA 154.5-106 chr2 147752241 147752524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92135 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 186.5-2 chr1 73749629 73749947 + 0.75 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 75109 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 142-91 chr2 204808516 204808839 + 0.75 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) L1PREC2|LINE|L1 263202 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 134.75-28 chr10 76294490 76294803 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) L3|LINE|CR1 511885 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 180.75-162 chrX 35031834 35032174 + 0.75 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 89208 NM_152631 170062 Hs.197801 NM_152631 ENSG00000189132 FAM47B - family with sequence similarity 47 member B protein-coding 146-35 chr13 92426851 92427157 + 0.75 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -63159 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 129.25-189 chr7 83395924 83396127 + 0.75 NA intron (NM_001178129, intron 12 of 16) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -233141 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 178.75-117 chr9 108578840 108579308 + 0.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 276912 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 183.5-150 chr8 91362187 91362470 + 0.75 NA intron (NM_134266, intron 11 of 18) intron (NM_134266, intron 11 of 18) 113009 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 169.75-122 chr5 25347155 25347446 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 156347 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 171.5-18 chr10 73347037 73347476 + 0.75 NA intron (NM_001350934, intron 3 of 25) L2a|LINE|L2 11498 NM_001350934 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 172-110 chr9 27628780 27629171 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55109 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 137.5-228 chr8 14852538 14852794 + 0.75 NA TTS (NR_029875) TTS (NR_029875) 844 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 173.75-74 chr17 82050629 82050944 + 0.75 NA intron (NM_002917, intron 2 of 7) CpG-11938 1025 NM_002917 5986 Hs.569700 NM_002917 ENSG00000169733 RFNG - RFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 127-34 chr11 84358423 84358655 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -41200 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 168.25-134 chr7 40925311 40925673 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54447 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 124.25-3 chr1 25039954 25040244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16596 NR_039623 100616365 NR_039623 ENSG00000264371 MIR4425 - microRNA 4425 ncRNA 127.75-105 chr2 150552259 150552524 + 0.75 NA TTS (NR_110241) TTS (NR_110241) 19830 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 168-27 chr11 102782165 102782693 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -1247 NR_038390 100288077 Hs.661772 NR_038390 ENSG00000255282 WTAPP1 - Wilms tumor 1 associated protein pseudogene 1 pseudo 151.25-144 chr4 120455019 120455341 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -388332 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 147.75-65 chr2 50417862 50418143 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) L2b|LINE|L2 -70246 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 148.25-8 chr1 164466301 164466519 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92950 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 134.5-100 chr2 108772490 108772854 + 0.75 NA intron (NM_006267, intron 22 of 28) intron (NM_006267, intron 22 of 28) -14078 NR_130121 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 156.5-76 chr2 44716057 44716291 + 0.75 NA intron (NM_024766, intron 7 of 10) intron (NM_024766, intron 7 of 10) 222714 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 204.25-89 chr5 26329116 26329542 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 709257 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 131-95 chr2 142766774 142767125 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -110715 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 130.5-194 chr5 12196070 12196394 + 0.75 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -291786 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 177.5-99 chr2 230478020 230478293 + 0.75 NA intron (NM_001080391, intron 17 of 28) intron (NM_001080391, intron 17 of 28) 61400 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 135.75-81 chr17 75260464 75260680 + 0.75 NA intron (NM_001291641, intron 1 of 17) intron (NM_001291641, intron 1 of 17) 1034 NM_014001 23163 Hs.87726 NM_014001 ENSG00000125447 GGA3 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3 protein-coding 125.75-105 chr2 187687819 187688027 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -133418 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 132.75-83 chr18 7519456 7519824 + 0.75 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -47676 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 145.5-100 chr2 107931122 107931557 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55185 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 181.75-101 chr5 4287972 4288377 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -485307 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 131.25-25 chr10 63816781 63817070 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -295035 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 158.25-56 chr2 20472630 20472915 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25698 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 273.25-16 chr19 52034191 52034744 + 0.75 NA exon (NM_014650, exon 5 of 5) exon (NM_014650, exon 5 of 5) -6088 NM_025040 80110 Hs.292336 NM_025040 ENSG00000142556 ZNF614 - zinc finger protein 614 protein-coding 117.75-185 chr6 45875405 45875619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62085 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 301.5-9 chr10 7952202 7952788 + 0.75 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 99996 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 180.75-105 chr4 81430977 81431491 + 0.75 NA intron (NM_152545, intron 13 of 13) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40673 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 179.75-22 chr11 9712880 9713230 + 0.75 NA intron (NM_001297714, intron 2 of 10) intron (NM_001297714, intron 2 of 10) -45238 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 113.5-195 chr5 66766465 66766678 + 0.75 NA intron (NM_001290228, intron 2 of 4) intron (NM_001290228, intron 2 of 4) -62202 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 132-70 chr17 47212089 47212463 + 0.75 NA intron (NM_001002841, intron 2 of 7) intron (NM_001002841, intron 2 of 7) 2928 NM_002476 4635 Hs.463300 NM_002476 ENSG00000198336 MYL4 ALC1|AMLC|GT1|PRO1957 myosin light chain 4 protein-coding 198.75-74 chr5 4265336 4265687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -507970 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 376.25-9 chr18 7959940 7960841 + 0.75 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) L2a|LINE|L2 393074 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 156.25-51 chr16 84076173 84076533 + 0.75 NA intron (NM_003791, intron 11 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -34196 NM_001080442 146167 NM_001080442 ENSG00000166558 SLC38A8 FVH2 solute carrier family 38 member 8 protein-coding 196.75-60 chr2 88573325 88573642 + 0.75 NA intron (NM_004836, intron 13 of 16) intron (NM_004836, intron 13 of 16) 34763 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 138.75-108 chr21 19330126 19330358 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 569513 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 169.5-43 chr13 86951059 86951352 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39285 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 120.25-24 chr10 26070820 26071019 + 0.75 NA intron (NM_017433, intron 14 of 34) L1ME1|LINE|L1 136690 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 165.75-138 chr5 101093434 101093680 + 0.75 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -190275 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 209.75-95 chr7 159267765 159268098 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -122974 NR_130758 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 134.25-117 chr3 117949613 117949878 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -258820 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 171-80 chr20 20799633 20799961 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -87153 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 263.25-4 chr1 110225774 110226297 + 0.75 NA exon (NM_001039574, exon 3 of 4) exon (NM_001039574, exon 3 of 4) 15721 NR_036437 3749 Hs.153521 NM_004978 ENSG00000116396 KCNC4 C1orf30|HKSHIIIC|KSHIIIC|KV3.4 potassium voltage-gated channel subfamily C member 4 protein-coding 115.25-202 chr8 78127590 78127836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -388627 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 129.75-75 chr17 60145058 60145282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4803 NR_137422 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 250.25-47 chr8 136500624 136501024 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -29974 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 114.5-193 chr4 104886687 104886872 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -259096 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 138.75-28 chr11 20351704 20351985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11841 NM_006410 10553 Hs.90753 NM_006410 ENSG00000109854 HTATIP2 CC3|SDR44U1|TIP30 HIV-1 Tat interactive protein 2 protein-coding 364.25-11 chr14 65098328 65099048 + 0.75 NA intron (NR_073137, intron 1 of 3) intron (NR_073137, intron 1 of 3) 3829 NM_145113 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 150.75-167 chr7 29652107 29652513 + 0.75 NA intron (NR_024278, intron 1 of 1) L1MB5|LINE|L1 28518 NR_039600 100616354 NR_039600 ENSG00000212024 MIR550A3 mir-550a-3 microRNA 550a-3 ncRNA 208-26 chr16 4556181 4556557 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001145011) promoter-TSS (NM_001145011) -121 NM_001145011 342346 Hs.684212 NM_001145011 ENSG00000205832 C16orf96 - chromosome 16 open reading frame 96 protein-coding 128.75-169 chr6 61245318 61245644 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -328649 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 143.5-227 chr9 72902076 72902289 + 0.75 NA intron (NM_000689, intron 12 of 12) intron (NM_000689, intron 12 of 12) -28073 NR_121180 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 169.75-28 chr11 47630645 47630912 + 0.75 NA intron (NM_014342, intron 7 of 12) intron (NM_014342, intron 7 of 12) 11781 NM_014342 23788 Hs.269944 NM_014342 ENSG00000109919 MTCH2 HSPC032|MIMP|SLC25A50 mitochondrial carrier 2 protein-coding 166.5-5 chr1 36653842 36654177 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -170695 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 171.75-68 chr19 28670254 28670597 + 0.75 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) MIRb|SINE|MIR 57269 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 167.75-47 chr14 61280425 61280712 + 0.75 NA exon (NM_001017970, exon 1 of 1) exon (NM_001017970, exon 1 of 1) 770 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 215.5-29 chr14 20501359 20501784 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -8901 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 166.25-52 chr15 89543599 89543864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19697 NR_027076 283761 Hs.459288 NR_027074 LINC00928 - long intergenic non-protein coding RNA 928 ncRNA 192.25-73 chr3 8938012 8938364 + 0.75 NA intron (NM_020165, intron 6 of 12) intron (NM_020165, intron 6 of 12) 25284 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 166.5-198 chr8 68499864 68500275 + 0.75 NA intron (NR_146187, intron 4 of 13) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -168578 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 184.25 chr1 11953400 11953807 + 0.75 NA intron (NM_001316320, intron 6 of 19) AluSq2|SINE|Alu 18886 NM_001316320 5351 Hs.75093 NM_000302 ENSG00000083444 PLOD1 EDS6|EDSKCL1|LH|LH1|LLH|PLOD procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1 protein-coding 204.75-95 chr5 119555215 119555654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74124 NM_001367956 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 162-31 chr12 45430177 45430430 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001204803, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001204803, exon 21 of 21) 137613 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 230.75-39 chr20 18896873 18897368 + 0.75 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -66917 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 125.75-118 chr21 31427637 31427843 + 0.75 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) AluJr|SINE|Alu -83386 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 213.75-110 chrX 46359456 46359866 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -31987 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 180.75-132 chr6 133737783 133738117 + 0.75 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) intron (NR_109982, intron 4 of 8) -83197 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 130.25-169 chr6 10198596 10198788 + 0.75 NA Intergenic (AATTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -205810 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 121.5-249 chr8 117551656 117551921 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 31075 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 207.75-111 chr6 54721929 54722244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -124685 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 138.5-195 chr8 109198475 109198848 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 112033 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 127-10 chr1 217757526 217757796 + 0.75 NA intron (NM_138796, intron 6 of 10) intron (NM_138796, intron 6 of 10) 27459 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 165.5 chr1 38222076 38222499 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7520 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 192-72 chr3 45054418 45054893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24512 NM_001308394 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 169.25-48 chr19 53547200 53547612 + 0.75 NA intron (NM_001317113, intron 2 of 4) L1MA7|LINE|L1 -7093 NM_001253801 55422 Hs.185674 NM_018555 ENSG00000130844 ZNF331 RITA|ZNF361|ZNF463 zinc finger protein 331 protein-coding 151.25-208 chrX 95413305 95413548 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -350200 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 194-19 chr10 109130766 109131181 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 792273 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 170.25-68 chr2 103248471 103248843 + 0.75 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -264228 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 249.5-64 chr3 57470983 57471435 + 0.75 NA intron (NM_001366028, intron 15 of 73) AluJb|SINE|Alu 73135 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 127.75-2 chr1 14476422 14476806 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56641 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 137.25-137 chr6 40963889 40964117 + 0.75 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) LTR16E1|LTR|ERVL 59277 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 121.75-167 chr6 139799339 139799587 + 0.75 NA intron (NR_038399, intron 1 of 2) intron (NR_038399, intron 1 of 2) 28390 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 140.75-29 chr11 100583502 100583747 + 0.75 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -103664 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 129.25-41 chr13 93941827 93942040 + 0.75 NA intron (NM_005708, intron 3 of 8) intron (NM_005708, intron 3 of 8) -83460 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 157-43 chr16 82999366 82999597 + 0.75 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) L1M5|LINE|L1 -9183 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 161.5-30 chr11 29284393 29284698 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309868 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 116.5-70 chr14 55974016 55974211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -144298 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 131.75-225 chr9 78348916 78349182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 51924 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 192.75-86 chr3 88912662 88913087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -194747 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 168.25-71 chr2 69214300 69214672 + 0.75 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) LTR78|LTR|ERV1 110804 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 279-37 chr5 98570562 98571130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -197786 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 156-120 chr5 74400606 74400862 + 0.75 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 78248 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 145-98 chr3 65614051 65614402 + 0.75 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -279590 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 181.25-36 chr15 76485923 76486263 + 0.75 NA intron (NR_148227, intron 24 of 32) AluY|SINE|Alu -100554 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 219-76 chr4 90282241 90282740 + 0.75 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) intron (NM_207491, intron 1 of 7) 47459 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 121-2 chr1 23468930 23469142 + 0.75 NA intron (NM_001143778, intron 1 of 23).2 AluJo|SINE|Alu 15143 NM_001143778 55616 Hs.437379 NM_017707 ENSG00000088280 ASAP3 ACAP4|CENTB6|DDEFL1|UPLC1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 3 protein-coding 203.25-46 chr18 39300464 39300979 + 0.75 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) intron (NR_024391, intron 3 of 3) 321454 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 150.25-152 chr8 115343431 115343825 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 324385 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 112.5-78 chr14 88594601 88594816 + 0.75 NA 5' UTR (NM_207662, exon 1 of 7) 5' UTR (NM_207662, exon 1 of 7) 288 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 241-11 chr11 121694807 121695229 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 242704 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 164.5-127 chr22 36060673 36061066 + 0.75 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -32045 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 247.5-51 chr21 19024544 19025111 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -265015 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 126.5-65 chr14 59142371 59142743 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -46110 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 149.25-29 chr11 32787148 32787518 + 0.75 NA intron (NM_001008391, intron 1 of 17) intron (NM_001008391, intron 1 of 17) 7325 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 174.5-83 chr17 62949706 62950000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5638 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 147.25-54 chr2 6313813 6314051 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 61490 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 128-129 chr5 142050703 142050923 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -37786 NM_005471 10007 Hs.633853 NM_005471 ENSG00000113552 GNPDA1 GNP1|GNPDA|GNPI|GPI|HLN glucosamine-6-phosphate deaminase 1 protein-coding 191-92 chrX 50809017 50809350 + 0.75 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) intron (NR_027121, intron 1 of 9) 4861 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 154.75-142 chr8 78217314 78217562 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -298902 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 160-23 chr12 32290191 32290697 + 0.75 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) -109114 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 117.5-99 chr2 26263471 26263689 + 0.75 NA intron (NM_001281512, intron 4 of 14) intron (NM_001281512, intron 4 of 14) 18641 NM_000183 3032 Hs.515848 NM_000183 ENSG00000138029 HADHB ECHB|MSTP029|MTPB|TP-BETA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit beta protein-coding 187-5 chr1 201722737 201723186 + 0.75 NA intron (NM_020443, intron 3 of 29) AluSz|SINE|Alu 3453 NR_049823 100847050 NR_049823 ENSG00000264802 MIR5191 - microRNA 5191 ncRNA 166.75-104 chr4 79175698 79176012 + 0.75 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) intron (NR_038342, intron 3 of 5) 150206 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 185.25-130 chr8 144033098 144033472 + 0.75 NA intron (NM_198572, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu -16113 NR_158554 392275 NR_158554 SMPD5 MA-nSMase sphingomyelin phosphodiesterase 5 pseudo 144-105 chr5 101419585 101419868 + 0.75 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -516444 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 121.5-208 chr5 36973267 36973498 + 0.75 NA intron (NM_015384, intron 8 of 45) L1PA8|LINE|L1 96613 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 254.25-45 chr3 182799645 182800161 + 0.75 NA intron (NM_014616, intron 1 of 29) AluJr|SINE|Alu 6399 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 258.25-60 chr8 30891787 30892269 + 0.75 NA intron (NM_001350162, intron 2 of 10) L1MEd|LINE|L1 -3322 NR_146525 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 190.5-37 chr12 93305774 93306132 + 0.75 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) L1MDa|LINE|L1 71783 NR_040096 643339 Hs.741299 NR_040096 LOC643339 - uncharacterized LOC643339 ncRNA 181-4 chr1 85458142 85458647 + 0.75 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 6765 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 174.25-123 chr6 38519698 38520007 + 0.75 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 38256 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 189.25-35 chr14 67615349 67615843 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4324 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 189.5-109 chr5 81514296 81514739 + 0.75 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) -120383 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 338.5-3 chr1 172972142 172972873 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 78456 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 165-109 chr4 148475636 148475967 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -31103 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 182.75-41 chr12 117991558 117991953 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22765 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 163.5-52 chr14 71308818 71309075 + 0.75 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -11530 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 227.75-63 chr5 21252527 21253117 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -206658 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 131.75-138 chr3 66534065 66534311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33767 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 239.75-24 chr15 59391608 59392042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18954 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 138.5-15 chr1 118728942 118729250 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 259247 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 174.5-188 chr8 115997515 115997828 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) L1PA14|LINE|L1 327388 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 130-95 chr21 30855741 30856046 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 25687 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 178.75-15 chr10 119098686 119099036 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -5252 NM_207009 404636 Hs.434241 NM_207009 ENSG00000119979 DENND10 FAM45A DENN domain containing 10 protein-coding 122.25-112 chr21 36358208 36358437 + 0.75 NA intron (NM_015358, intron 10 of 16) AluSq2|SINE|Alu -27070 NM_005441 8208 Hs.75238 NM_005441 ENSG00000159259 CHAF1B CAF-1|CAF-IP60|CAF1|CAF1A|CAF1P60|MPHOSPH7|MPP7 chromatin assembly factor 1 subunit B protein-coding 132.5-205 chr5 174212458 174212686 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -123782 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 198.75-58 chr21 31155171 31155474 + 0.75 NA intron (NM_001353690, intron 16 of 27) MER5B|DNA|hAT-Charlie 5618 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 137.5-170 chr4 34416580 34416899 + 0.75 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -146992 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 120.25-45 chr12 18102264 18102489 + 0.75 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -12183 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 114.25-159 chr5 147264722 147264925 + 0.75 NA intron (NM_001112724, intron 2 of 12) HAL1|LINE|L1 29797 NM_001287740 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 159-106 chr7 131518480 131518968 + 0.75 NA intron (NM_001018111, intron 1 of 8) ERVL-E-int|LTR|ERVL 37904 NM_001018111 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 147.25-39 chr15 60856818 60857082 + 0.75 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 175381 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 244.25-5 chr10 109664124 109664495 + 0.75 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 258937 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 123.25-120 chr20 49360645 49360914 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 80096 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 296-10 chr11 121609665 121610128 + 0.75 NA intron (NM_003105, intron 38 of 47) MIRb|SINE|MIR 157582 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 190.5-168 chr9 73102087 73102399 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -49622 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 133-40 chr13 87449534 87449770 + 0.75 NA intron (NR_033829, intron 4 of 5) L1MA8|LINE|L1 169088 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 168.25-59 chr16 84663435 84663735 + 0.75 NA 3' UTR (NM_024731, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_024731, exon 5 of 5) 15074 NM_001303451 79786 Hs.222731 NM_024731 ENSG00000135686 KLHL36 C16orf44 kelch like family member 36 protein-coding 116-24 chr11 42072143 42072360 + 0.75 NA intron (NR_135065, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 13207 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 170.75-105 chr5 51330056 51330364 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 53122 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 155.25-9 chr1 110556291 110556541 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37241 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 152.5-170 chr6 128873738 128873997 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -9271 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 172.25-134 chr7 79330795 79331046 + 0.75 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -122037 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 148.5-140 chr3 2302625 2302884 + 0.75 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) intron (NM_001206955, intron 1 of 23) 63925 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 125.25-195 chr7 72152927 72153118 + 0.75 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) intron (NM_001363460, intron 2 of 5) 184369 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 148-68 chr2 230204968 230205326 + 0.75 NA intron (NM_080424, intron 8 of 18) intron (NM_080424, intron 8 of 18) 14837 NM_004509 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 208-65 chr5 12311758 12312224 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -262866 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 125.5-135 chr2 163867976 163868245 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -132102 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 119.5-60 chr12 30757517 30757755 + 0.75 NA intron (NR_135046, intron 1 of 1) (CAAGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2562 NR_135046 645485 Hs.232332 NR_135046 ENSG00000246331 LOC645485 - uncharacterized LOC645485 ncRNA 126.75-242 chr8 91619418 91619713 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 370246 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 126.75-89 chr17 49013172 49013387 + 0.75 NA intron (NM_001160423, intron 2 of 12) intron (NM_001160423, intron 2 of 12) 15894 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 180.75-50 chr17 40804474 40804912 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4734 NM_181535 162605 Hs.59736 NM_181535 ENSG00000173908 KRT28 K25IRS4|KRT25D keratin 28 protein-coding 155.5-21 chr10 36864937 36865233 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -260772 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 118.75-95 chr2 50181561 50181871 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 166038 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 163.75-84 chr20 56508210 56508752 + 0.75 NA intron (NR_160308, intron 3 of 6) intron (NR_160308, intron 3 of 6) -16248 NM_001012971 200232 Hs.504907 NM_001012971 ENSG00000124103 FAM209A C20orf106|dJ1153D9.3 family with sequence similarity 209 member A protein-coding 151.75-41 chr14 46709362 46709692 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -57746 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 169.75-155 chr8 115186262 115186624 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 481570 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 207.25-87 chr7 14530241 14530688 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) intron (NM_001350717, intron 19 of 24) 310986 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 219-79 chr5 19775692 19776043 + 0.75 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 110405 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 304.75-34 chr8 90724878 90725385 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -66644 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 246-7 chr11 33111045 33111622 + 0.75 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) L1ME4b|LINE|L1 35183 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 166-46 chr17 47387795 47388284 + 0.75 NA intron (NM_001195192, intron 12 of 21) L1M3f|LINE|L1 64084 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 161.5-105 chr2 150685297 150685680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56591 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 191.5-58 chr17 60320277 60320781 + 0.75 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 71604 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 164.5-208 chr8 91621032 91621328 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 371861 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 116-11 chr10 28027845 28028007 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -28847 NM_018076 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 159.75-120 chr4 158555183 158555433 + 0.75 NA intron (NR_045579, intron 2 of 17) intron (NR_045579, intron 2 of 17) 33426 NM_001253728 59350 Hs.591686 NM_021634 ENSG00000171509 RXFP1 LGR7|RXFPR1 relaxin family peptide receptor 1 protein-coding 178.75-116 chr8 135906173 135906623 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 448942 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 329.75-3 chr10 16103901 16104488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -243661 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 186.25-66 chr3 3802726 3803151 + 0.75 NA intron (NM_001324188, intron 2 of 2) intron (NM_001324188, intron 2 of 2) -2063 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 233.75-19 chr12 64088217 64088620 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 11 of 21) MamRep605|LTR?|LTR? 133878 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 179.5-75 chr17 66174498 66174927 + 0.75 NA intron (NM_001353129, intron 4 of 26) intron (NM_001353129, intron 4 of 26) 17180 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 205.75-46 chr3 118654080 118654450 + 0.75 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) 12497 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 121.75-65 chr18 10869792 10870058 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 5 of 51) AluSx|SINE|Alu -110276 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 200.25-19 chr11 61407434 61407878 + 0.75 NA intron (NM_001136040, intron 9 of 9) intron (NM_001136040, intron 9 of 9) 15069 NM_001173990 51259 Hs.26745 NM_016499 ENSG00000187049 TMEM216 HSPC244 transmembrane protein 216 protein-coding 130-24 chr11 31010185 31010578 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -17695 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 155.25-185 chr9 28824066 28824321 + 0.75 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 39513 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 126.75-226 chr7 80295174 80295433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 79136 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 122.25-199 chr8 124162176 124162422 + 0.75 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 9223 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 196.5-31 chr11 70901110 70901656 + 0.75 NA intron (NM_012309, intron 9 of 24) intron (NM_012309, intron 9 of 24) -29015 NR_037437 100500844 NR_037437 ENSG00000263744 MIR3664 mir-3664 microRNA 3664 ncRNA 215-48 chr2 187317201 187317659 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 130822 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 159-2 chr1 66803281 66803671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2217 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 134.5-51 chr13 66372042 66372375 + 0.75 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 153958 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 199.25-91 chr7 67718092 67718422 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -301996 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 138.75-139 chr5 25779328 25779524 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 588473 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 242.75-53 chr4 147334120 147334721 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 10297 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 199.5-110 chr4 111431562 111431947 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -571107 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 120.5-154 chr4 16862486 16862816 + 0.75 NA intron (NM_001304435, intron 1 of 7) AluSp|SINE|Alu 35994 NM_001304434 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 143-79 chr20 7991953 7992239 + 0.75 NA intron (NM_021156, intron 5 of 7) intron (NM_021156, intron 5 of 7) 27665 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 162.25-73 chr2 25295111 25295387 + 0.75 NA intron (NR_135490, intron 3 of 23) intron (NR_135490, intron 3 of 23) 33472 NR_031570 100302246 NR_031570 ENSG00000221445 MIR1301 MIRN1301|hsa-mir-1301|mir-1301 microRNA 1301 ncRNA 115.75-43 chr12 43195066 43195284 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39860 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 190.75-41 chr17 46910545 46910945 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12372 NM_001353115 9570 Hs.463278 NM_004287 ENSG00000108433 GOSR2 Bos1|EPM6|GS27 golgi SNAP receptor complex member 2 protein-coding 130.75-186 chr7 112251142 112251378 + 0.75 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) intron (NM_021994, intron 1 of 11) 44565 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 120.5-228 chr8 98892482 98892738 + 0.75 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 50000 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 122.75-186 chr7 74676703 74676921 + 0.75 NA intron (NM_001163636, intron 1 of 33) AluSx1|SINE|Alu 19094 NM_001518 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 172.25-130 chr6 166368023 166368433 + 0.75 NA intron (NM_001270879, intron 1 of 4) intron (NM_001270879, intron 1 of 4) 14712 NM_016098 51660 Hs.172755 NM_016098 ENSG00000060762 MPC1 BRP44L|CGI-129|MPYCD|SLC54A1 mitochondrial pyruvate carrier 1 protein-coding 175-110 chr6 51475477 51475773 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -146245 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 131.5-226 chr7 138591944 138592346 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 72079 NM_174959 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 161.5-59 chr14 67233701 67234098 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -7536 NM_022474 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 134.5-203 chr7 31674484 31674716 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -12417 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 124.25-4 chr1 29846912 29847108 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 190602 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 278.25-30 chr2 97855836 97856350 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 5 of 40) intron (NM_015348, intron 5 of 40) 121687 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 175-125 chr7 103067220 103067523 + 0.75 NA intron (NR_105043, intron 1 of 20) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 7197 NM_145032 222235 Hs.660029 NM_145032 ENSG00000161040 FBXL13 DRC6|Fbl13 F-box and leucine rich repeat protein 13 protein-coding 188-47 chr3 184089974 184090368 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6893 NM_001256613 285242 Hs.449179 NM_182589 ENSG00000186038 HTR3E 5-HT3-E|5-HT3E|5-HT3c1 5-hydroxytryptamine receptor 3E protein-coding 118.75-79 chr17 64756045 64756257 + 0.75 NA intron (NR_026899, intron 8 of 12) intron (NR_026899, intron 8 of 12) -24608 NR_106728 102464831 NR_106728 ENSG00000278581 MIR6080 hsa-mir-6080 microRNA 6080 ncRNA 112.75-82 chr18 70654547 70654754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3696 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 120-144 chr5 38231889 38232090 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26570 NM_001205301 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 179.5-178 chr8 33583705 33584116 + 0.75 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 13887 NM_001305116 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 178-45 chr2 96390808 96391238 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 55257 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 188.25-62 chr2 224086798 224087323 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47741 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 236-73 chrX 147139269 147139803 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 50251 NR_031709 100302114 NR_031709 ENSG00000216171 MIR513C MIRN513C|hsa-mir-513c microRNA 513c ncRNA 123.25-146 chr4 61587578 61587772 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 385503 NM_001371342 130.5-153 chr20 62420990 62421349 + 0.75 NA intron (NM_080833, intron 1 of 13) intron (NM_080833, intron 1 of 13) 6370 NM_080833 140893 Hs.180374 NM_080833 ENSG00000130701 RBBP8NL C20orf151 RBBP8 N-terminal like protein-coding 114-22 chr10 86486566 86486826 + 0.75 NA intron (NM_001318328, intron 4 of 18) AluJb|SINE|Alu 35088 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 166-20 chr11 35659470 35659948 + 0.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -3066 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 235.25 chr1 74765818 74766228 + 0.75 NA non-coding (NR_027962, exon 6 of 6) non-coding (NR_027962, exon 6 of 6) -32615 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 143-113 chr5 37164186 37164470 + 0.75 NA intron (NM_023073, intron 36 of 51) intron (NM_023073, intron 36 of 51) -84718 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 171.5-69 chr19 48422688 48423038 + 0.75 NA intron (NM_000836, intron 10 of 12) AluSz|SINE|Alu -23120 NM_031485 83743 Hs.400625 NM_031485 ENSG00000105447 GRWD1 CDW4|GRWD|RRB1|WDR28 glutamate rich WD repeat containing 1 protein-coding 180.75-9 chr1 171775103 171775514 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6352 NM_015935 51603 Hs.494705 NM_014955 ENSG00000010165 EEF1AKNMT 5630401D24Rik|CGI-01|DFNB26|DFNB26M|KIAA0859|METTL13|feat eEF1A lysine and N-terminal methyltransferase protein-coding 152-15 chr1 190413375 190413672 + 0.75 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 62487 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 115.25-151 chr4 81318342 81318574 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -103236 NM_001363401 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 171.75-93 chr21 29891598 29892044 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 48175 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 170.25-138 chr6 55476663 55477193 + 0.75 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) intron (NR_109869, intron 3 of 4) 102286 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 149.75-33 chr12 87833677 87834080 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -49167 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 135.75-88 chr2 10735296 10735556 + 0.75 NA intron (NM_001039362, intron 3 of 13) AluSx|SINE|Alu 13796 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 145.5-79 chr17 45157310 45157665 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2687 NM_001303439 124790 Hs.56382 NM_144608 ENSG00000168517 HEXIM2 L3 HEXIM P-TEFb complex subunit 2 protein-coding 134.25-57 chr15 59375579 59375853 + 0.75 NA Intergenic X7A_LINE|LINE|CR1 -2845 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 281.5-48 chr7 7689067 7689488 + 0.75 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 29330 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 125-72 chr2 118344956 118345276 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -158730 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 135.25-159 chr5 75371745 75372154 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001130105, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001130105, exon 19 of 19) 34729 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 261-65 chr8 116004349 116004732 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) L1MC1|LINE|L1 320519 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 157.5-207 chr8 82074709 82075070 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -232603 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 256.75-8 chr12 49755951 49756401 + 0.75 NA intron (NM_001098576, intron 4 of 9) AluSc|SINE|Alu 14367 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 187.75-63 chr20 58270979 58271293 + 0.75 NA intron (NR_003505, intron 4 of 16) L1MC5a|LINE|L1 38303 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 124.5-229 chr8 117257335 117257609 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 122477 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 158.25-6 chr1 163343326 163343700 + 0.75 NA intron (NM_145697, intron 9 of 13) L2|LINE|L2 21559 NM_145697 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 119-212 chr9 116139840 116140143 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13800 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 184.5-123 chr5 109637902 109638228 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -51301 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 163.25-83 chr21 40588461 40588735 + 0.75 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) intron (NR_073202, intron 3 of 32) 42169 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 186.25-33 chr15 38589808 38590221 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -25200 NM_001128602 10125 Hs.591127 NM_005739 ENSG00000172575 RASGRP1 CALDAG-GEFI|CALDAG-GEFII|RASGRP RAS guanyl releasing protein 1 protein-coding 317-9 chr11 100130898 100131650 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) L2b|LINE|L2 -556014 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 142.25-120 chr4 63827732 63828134 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 581517 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 160.5-158 chr6 12238500 12238902 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51660 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 126.75-238 chr8 74368513 74368709 + 0.75 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 18208 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 172-90 chr5 64028760 64029188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -66682 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 183.5-152 chr8 105324233 105324570 + 0.75 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 4858 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 112.25-19 chr10 57120905 57121263 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 183475 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 179.5-189 chr8 140145823 140146205 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -45479 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 123.75-129 chr3 189825359 189825634 + 0.75 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) intron (NM_003722, intron 4 of 13) -4426 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 136-56 chr17 61089954 61090444 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 277505 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 131.25-144 chr3 121628350 121628618 + 0.75 NA 3' UTR (NM_016298, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_016298, exon 4 of 4) 32419 NM_005335 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 178.25-18 chr11 112973228 112973725 + 0.75 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -10016 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 127.25-47 chr12 49639766 49640058 + 0.75 NA 3' UTR (NM_198900, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_198900, exon 25 of 25) 9368 NM_001363607 25766 Hs.706827 NM_012272 ENSG00000110844 PRPF40B HYPC pre-mRNA processing factor 40 homolog B protein-coding 152.25-107 chr3 149727808 149728078 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3155 NM_001348362 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 179.25-39 chr12 10556241 10556568 + 0.75 NA intron (NR_146456, intron 1 of 2) intron (NR_146456, intron 1 of 2) 3025 NR_146455 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 117.25-141 chr3 96760723 96760975 + 0.75 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -53745 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 143-77 chr2 177140116 177140368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72169 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 120.25-79 chr19 35147127 35147387 + 0.75 NA intron (NM_022006, intron 1 of 5) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 4002 NM_022006 53822 Hs.134729 NM_022006 ENSG00000221946 FXYD7 - FXYD domain containing ion transport regulator 7 protein-coding 167-50 chr17 64303442 64303769 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40345 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 176-80 chr9 16796934 16797374 + 0.75 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 70340 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 141-10 chr1 195660731 195661064 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 427818 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 173-130 chr7 6559352 6559913 + 0.75 NA Intergenic (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8196 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 187.5-76 chr18 68410468 68410939 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 304405 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 166.25-67 chr18 6692661 6693030 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36871 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 153.5-87 chr18 13875848 13876072 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39576 NM_000529 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 124-3 chr1 32509100 32509294 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30230 NM_001291496 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 124-29 chr12 30867606 30867848 + 0.75 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -59021 NM_001370302 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 159.75-48 chr14 71538451 71538841 + 0.75 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -47652 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 183.75-60 chr2 170011889 170012282 + 0.75 NA intron (NM_172070, intron 29 of 38) intron (NM_172070, intron 29 of 38) -166062 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 174.5-192 chr8 122948675 122948959 + 0.75 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) L1ME4a|LINE|L1 76955 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 165-150 chr8 131764281 131764518 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -139694 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 129.25-191 chr7 137941831 137942113 + 0.75 NA intron (NM_001253775, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 -8984 NM_001318246 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 119.25-147 chr4 65607945 65608226 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) L1PA7|LINE|L1 61403 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 145.5-187 chr7 127890763 127891158 + 0.75 NA intron (NM_014390, intron 13 of 23) intron (NM_014390, intron 13 of 23) -106549 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 130.5-181 chr4 16209811 16210033 + 0.75 NA intron (NM_153365, intron 2 of 13) intron (NM_153365, intron 2 of 13) 16549 NM_153365 202018 Hs.479223 NM_153365 ENSG00000169762 TAPT1 CMVFR|OCLSBG transmembrane anterior posterior transformation 1 protein-coding 262.75-5 chr10 70554136 70554849 + 0.75 NA intron (NM_014431, intron 18 of 19) intron (NM_014431, intron 18 of 19) 48249 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 184.25-86 chr4 35742424 35742820 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 501317 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 155.25-103 chr2 206835121 206835428 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51966 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 142.5-114 chr2 159253007 159253317 + 0.75 NA intron (NM_001330279, intron 8 of 9) intron (NM_001330279, intron 8 of 9) 33541 NM_001330278 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 137-161 chr7 39952306 39952554 + 0.75 NA intron (NM_003718, intron 1 of 13) intron (NM_003718, intron 1 of 13) 2070 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 157-74 chr3 3562700 3562988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -236587 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 137.75-157 chr4 118953424 118953663 + 0.75 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 64689 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 214-55 chr6 41168893 41169318 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5919 NM_018965 54209 Hs.435295 NM_018965 ENSG00000095970 TREM2 PLOSL2|TREM-2|Trem2a|Trem2b|Trem2c triggering receptor expressed on myeloid cells 2 protein-coding 132.5-239 chr8 76357216 76357575 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -49259 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 194.75-78 chr5 16714712 16715045 + 0.75 NA intron (NM_012334, intron 19 of 40) L1MA2|LINE|L1 -97820 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 192.5-103 chr4 166208564 166208824 + 0.75 NA Intergenic (TTTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 335457 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 193.75-31 chr11 114066097 114066452 + 0.75 NA intron (NM_006006, intron 2 of 6) intron (NM_006006, intron 2 of 6) 3063 NM_001354752 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 122.25-53 chr13 85070068 85070313 + 0.75 NA intron (NR_126383, intron 4 of 5) intron (NR_126383, intron 4 of 5) 77867 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 128.5-180 chr6 16619701 16619996 + 0.75 NA intron (NM_000332, intron 4 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 140336 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 191.25-39 chr16 55250993 55251471 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -73327 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 178.75-16 chr11 30867766 30868143 + 0.75 NA intron (NM_001367979, intron 38 of 38) intron (NM_001367979, intron 38 of 38) 124732 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 147-137 chr7 99487345 99487629 + 0.75 NA exon (NM_213603, exon 5 of 5) exon (NM_213603, exon 5 of 5) 12794 NM_001345967 84124 Hs.386324 NM_032164 ENSG00000160908 ZNF394 ZKSCAN14|ZSCAN46 zinc finger protein 394 protein-coding 156-160 chr8 138744518 138744789 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 22 of 64) MIRb|SINE|MIR 169388 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 164.5-136 chr3 100645759 100646091 + 0.75 NA intron (NM_032787, intron 8 of 15) intron (NM_032787, intron 8 of 15) 10387 NM_001308362 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 154.25-42 chr14 20576178 20576568 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -11851 NR_122043 254028 Hs.652569 NR_122043 ENSG00000258573 LOC254028 - uncharacterized LOC254028 ncRNA 154.75 chr1 4854104 4854378 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 199632 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 190.25-112 chr6 154389642 154390052 + 0.75 NA 3' UTR (NM_173515, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_173515, exon 13 of 13) -33081 NM_001130700 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 173-25 chr11 99238897 99239219 + 0.75 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) L1M5|LINE|L1 218109 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 149.5-149 chr5 24698123 24698485 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -53326 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 118.25-183 chr7 53944925 53945233 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -133148 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 197.75-82 chr7 49952429 49952731 + 0.75 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) intron (NM_001159878, intron 7 of 7) 140666 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 155-27 chr12 25408508 25408833 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 144613 NM_001256266 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 170.5-16 chr1 182623455 182623711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 8443 NR_036490 284648 Hs.253475 NR_036490 ENSG00000261504 LINC01686 - long intergenic non-protein coding RNA 1686 ncRNA 193.25-64 chr20 63217561 63218093 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1696 NM_017798 54915 Hs.744852 NM_017798 ENSG00000149658 YTHDF1 C20orf21 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 protein-coding 179-10 chr10 17410259 17410781 + 0.75 NA intron (NM_001004470, intron 2 of 7) intron (NM_001004470, intron 2 of 7) 23584 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 129.25-197 chr8 71335117 71335350 + 0.75 NA intron (NM_001370336, intron 4 of 17) intron (NM_001370336, intron 4 of 17) 21473 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 150.75-77 chr17 12252507 12252742 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170725 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 168.75-25 chr11 14956048 14956398 + 0.75 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 16063 NM_001033952 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 175.5-71 chr17 28157878 28158284 + 0.75 NA intron (NM_016231, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 -68482 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 143-153 chr8 142123090 142123335 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53127 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 163.5-60 chr15 79324343 79324691 + 0.75 NA intron (NM_001330376, intron 2 of 2) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 13405 NM_001301203 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 150.5-189 chr6 107035566 107035813 + 0.75 NA intron (NM_001142470, intron 2 of 4) AluSq2|SINE|Alu 7490 NM_001142468 51250 Hs.486084 NM_016487 ENSG00000130349 C6orf203 HSPC230|PRED31 chromosome 6 open reading frame 203 protein-coding 147.75-76 chr2 144672318 144672648 + 0.75 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 4516 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 135.5-19 chr10 25408783 25409069 + 0.75 NA intron (NM_020752, intron 3 of 10) intron (NM_020752, intron 3 of 10) -232650 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 168.5-114 chr3 70975275 70975672 + 0.75 NA intron (NR_146142, intron 16 of 19) intron (NR_146142, intron 16 of 19) 89451 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 255.75-24 chr19 33073093 33073698 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7485 NR_135270 55094 Hs.466436 NM_018025 ENSG00000076650 GPATCH1 ECGP|GPATC1 G-patch domain containing 1 protein-coding 175.25-26 chr11 77716619 77716921 + 0.75 NA intron (NM_016578, intron 5 of 15) L1MA8|LINE|L1 -78964 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 135.75-70 chr16 3822762 3823208 + 0.75 NA intron (NM_004380, intron 2 of 30) intron (NM_004380, intron 2 of 30) 57135 NM_001079846 1387 Hs.459759 NM_004380 ENSG00000005339 CREBBP CBP|KAT3A|MKHK1|RSTS|RSTS1 CREB binding protein protein-coding 250.75-37 chr3 84696652 84697040 + 0.75 NA intron (NR_033860, intron 11 of 20) intron (NR_033860, intron 11 of 20) 172729 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 207.25-86 chr6 115214837 115215191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 428821 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 116.75-149 chr4 73800188 73800438 + 0.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -36365 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 206.5-98 chr5 92603729 92604143 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 967407 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 225.5-34 chr14 50323790 50324279 + 0.75 NA exon (NM_001003803, exon 4 of 5) exon (NM_001003803, exon 4 of 5) 11710 NM_015684 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 160.25-57 chr17 77739424 77739690 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10998 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 121-49 chr12 126794001 126794375 + 0.75 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -21926 NR_033878 387895 Hs.534660 NR_033878 LINC00944 - long intergenic non-protein coding RNA 944 ncRNA 162.75-21 chr11 20384467 20384887 + 0.75 NA TTS (NM_001098520) TTS (NM_001098520) -2853 NM_001145166 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 169.5-127 chr4 100804716 100805276 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -129883 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 170-48 chr2 211424846 211425138 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 22 of 26) intron (NM_001042599, intron 22 of 26) 807421 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 135-166 chr7 46116931 46117175 + 0.75 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -195781 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 221.75-34 chr18 63086383 63086746 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 232816 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 144.25-198 chr8 77787090 77787407 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 336551 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 160.75-45 chr14 76685542 76685834 + 0.75 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -75780 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 169.5-169 chr8 29944356 29944681 + 0.75 NA intron (NR_024473, intron 2 of 2) intron (NR_024473, intron 2 of 2) 12830 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 149.75-136 chr5 163386578 163386916 + 0.75 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -50824 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 155.5-224 chr9 134770369 134770682 + 0.75 NA intron (NM_001278074, intron 25 of 65) L1ME4a|LINE|L1 78844 NR_039691 100616333 NR_039691 ENSG00000264744 MIR3689C - microRNA 3689c ncRNA 127.25-184 chr6 143687229 143687493 + 0.75 NA intron (NM_001100165, intron 1 of 11) intron (NM_001100165, intron 1 of 11) 9396 NM_001100164 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 128.25-94 chr2 55962014 55962272 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20933 NR_029630 406999 NR_029630 ENSG00000207548 MIR217 MIRN217|mir-217 microRNA 217 ncRNA 178-35 chr17 59245144 59245581 + 0.75 NA intron (NM_182569, intron 2 of 9) intron (NM_182569, intron 2 of 9) 24851 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 228.75-56 chr4 42337023 42337408 + 0.75 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) intron (NR_134668, intron 1 of 1) 54053 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 131.75 chr1 11222945 11223195 + 0.75 NA intron (NM_004958, intron 19 of 57) L1MC5a|LINE|L1 33715 NM_021146 10218 Hs.146559 NM_021146 ENSG00000171819 ANGPTL7 AngX|CDT6|dJ647M16.1 angiopoietin like 7 protein-coding 230.25-67 chr5 27451523 27452188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20437 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 220.5-75 chr3 95498759 95499301 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 184163 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 151.25-44 chr12 125032768 125033197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5559 NR_110375 102659353 Hs.596464 NR_110375 ENSG00000280634 THRIL BRI3BP-AS1|BRI3BPAS1|Linc1992|TCONS_00020260 TNF and HNRNPL related immunoregulatory long non-coding RNA ncRNA 135.25-131 chr3 103450865 103451131 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 73118 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 221.75-89 chr9 100202051 100202457 + 0.75 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) LTR67B|LTR|ERVL 103011 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 291.5-27 chr22 31638877 31639536 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_178022) promoter-TSS (NM_178022) -683 NM_178022 23761 Hs.420559 NM_014338 ENSG00000241878 PISD DJ858B16|PSD|PSDC|PSSC|dJ858B16.2 phosphatidylserine decarboxylase protein-coding 149.25-64 chr17 69131395 69131675 + 0.75 NA intron (NM_080284, intron 6 of 38) intron (NM_080284, intron 6 of 38) 10360 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 129.5-18 chr10 32469358 32469676 + 0.75 NA intron (NR_109827, intron 6 of 8) LTR41|LTR|ERVL 23377 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 153.25-31 chr12 76459803 76460334 + 0.75 NA intron (NM_020841, intron 2 of 23) intron (NM_020841, intron 2 of 23) -36783 NM_001319655 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 157.75-11 chr10 44211351 44211575 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -81287 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 205.75-76 chr7 2041885 2042544 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) intron (NM_001013837, intron 12 of 18) 46838 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 187-17 chr10 81872615 81873062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2356 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 228.5-12 chr1 190275104 190275530 + 0.75 NA intron (NM_001317188, intron 2 of 6) intron (NM_001317188, intron 2 of 6) 200693 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 118-142 chr5 24782688 24783010 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 57734 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 196-46 chr2 7369609 7369931 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51491 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 137.75-101 chr2 95557108 95557348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34773 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 160.75-34 chr12 52777606 52777977 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_015848) promoter-TSS (NM_015848) -446 NM_015848 51350 Hs.654392 NM_015848 ENSG00000185069 KRT76 HUMCYT2A|KRT2B|KRT2P keratin 76 protein-coding 113.25-87 chr2 60801056 60801311 + 0.75 NA 3' UTR (NM_022894, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_022894, exon 22 of 22) 44915 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 213.5-72 chr21 32086880 32087373 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_038033) promoter-TSS (NR_038033) -831 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 137.25-49 chr15 53504352 53504662 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 36345 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 286.5-35 chr2 31955009 31955506 + 0.75 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 55407 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 119.75-200 chr8 118645821 118646068 + 0.75 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -23981 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 153-106 chr4 96584787 96585014 + 0.75 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 274197 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 197.75-62 chr4 115291359 115291671 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -177895 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 341.25-18 chr21 25169414 25170283 + 0.75 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 261853 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 134.25-13 chr10 36868072 36868361 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -257641 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 112.5-120 chr2 99969983 99970189 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 135497 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 129.75-108 chr20 14313953 14314201 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 23535 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 208.25-66 chr4 59047056 59047463 + 0.75 NA TTS (NR_133942) TTS (NR_133942) 33686 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 228.25-4 chr1 84738362 84738815 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48120 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 199.25-72 chr4 61622776 61623129 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 420780 NM_001371342 126.25-76 chr19 8156226 8156453 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -6747 NM_032447 84467 Hs.370362 NM_032447 ENSG00000142449 FBN3 - fibrillin 3 protein-coding 155.75-50 chr14 61930800 61931055 + 0.75 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 3232 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 133.5-242 chr6 160671906 160672257 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -7822 NM_005577 4018 Hs.520120 NM_005577 ENSG00000198670 LPA AK38|APOA|LP lipoprotein(a) protein-coding 126.25-121 chr3 122017421 122017637 + 0.75 NA intron (NM_001199799, intron 1 of 7) intron (NM_001199799, intron 1 of 7) 4718 NM_001199800 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 134.25-148 chr5 132692896 132693112 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001300791, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001300791, exon 19 of 19) -10375 NR_134248 105379176 Hs.73917 NR_134248 LOC105379176 - uncharacterized LOC105379176 ncRNA 204.5-114 chr6 54930927 54931283 + 0.75 NA intron (NM_001010872, intron 4 of 4) L1M4|LINE|L1 84334 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 165.75-36 chr12 3938204 3938606 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -64957 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 145.5-60 chr14 41628291 41628722 + 0.75 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 21650 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 252.25-24 chr17 74418035 74418576 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -13783 NM_022036 55890 Hs.446438 NM_018653 ENSG00000170412 GPRC5C RAIG-3|RAIG3 G protein-coupled receptor class C group 5 member C protein-coding 193.75-116 chr8 40240089 40240581 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 86853 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 131.75-209 chr7 119301820 119302207 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 605362 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 177-33 chr15 27172655 27173020 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -11518 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 266.5-19 chr14 55652089 55652521 + 0.75 NA intron (NR_073129, intron 26 of 45) intron (NR_073129, intron 26 of 45) 72098 NM_001271014 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 130.25-175 chr6 68669060 68669324 + 0.75 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L1MA1|LINE|L1 33910 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 140.75-153 chr5 97760379 97760595 + 0.75 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -80271 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 318-37 chr8 84762297 84763005 + 0.75 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 56724 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 112.5-72 chr14 46029701 46029974 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -34322 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 208.25-30 chr15 60098569 60098950 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 94448 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 293.5-14 chr14 53002943 53003584 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -52166 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 141.5-217 chr7 133229482 133229762 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23445 NM_001037126 60412 Hs.321273 NM_021807 ENSG00000131558 EXOC4 SEC8|SEC8L1|Sec8p exocyst complex component 4 protein-coding 210-14 chr10 103804727 103805147 + 0.75 NA intron (NM_014631, intron 1 of 13) intron (NM_014631, intron 1 of 13) 50469 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 172.75-96 chr5 58327023 58327394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132878 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 147.75-168 chr9 9854279 9854491 + 0.75 NA intron (NM_002839, intron 5 of 45) intron (NM_002839, intron 5 of 45) 54993 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 115-190 chr9 16107331 16107549 + 0.75 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie 145667 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 117.75-224 chr9 87147440 87147655 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1097 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 192.75-47 chr17 82180553 82180969 + 0.75 NA intron (NM_198082, intron 8 of 16) AluSc8|SINE|Alu 32081 NM_001316321 284001 Hs.631724 NM_152675 ENSG00000176155 CCDC57 - coiled-coil domain containing 57 protein-coding 144.5-36 chr11 5471071 5471409 + 0.75 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -17445 NM_001005163 390066 Hs.553734 NM_001005163 ENSG00000181609 OR52D1 OR11-43 olfactory receptor family 52 subfamily D member 1 protein-coding 126.5-57 chr13 26429752 26429939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -127838 NM_006646 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 221.5 chr1 38268791 38269289 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -54273 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 112.75-147 chr4 35486997 35487182 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 756850 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 143.75-42 chr12 120809208 120809514 + 0.75 NA intron (NM_139015, intron 2 of 10) AluY|SINE|Alu 83535 NM_000017 35 Hs.507076 NM_000017 ENSG00000122971 ACADS ACAD3|SCAD acyl-CoA dehydrogenase short chain protein-coding 145.25-71 chr2 57324184 57324619 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -583250 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 129.5-55 chr12 42394869 42395060 + 0.75 NA intron (NM_001364830, intron 6 of 6) intron (NM_001364830, intron 6 of 6) 63166 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 160.75-82 chr2 153808730 153809037 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -63039 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 136.25-197 chr9 91964336 91964625 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -14252 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 147.75-107 chr3 86321301 86321723 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -160431 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 124.75-212 chr9 24038928 24039101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188413 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 144-106 chr5 137680341 137680717 + 0.75 NA intron (NM_017415, intron 5 of 14) intron (NM_017415, intron 5 of 14) 25898 NM_001257195 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 132.25-91 chr2 44083142 44083526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85469 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 195.5-34 chr12 81827047 81827337 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -67842 NM_003625 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 162.25-125 chr5 15240517 15240795 + 0.75 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 25904 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 179-94 chr9 88681138 88681504 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64584 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 160-67 chr3 126302200 126302623 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 54997 NM_014079 28999 Hs.272215 NM_014079 ENSG00000163884 KLF15 KKLF Kruppel like factor 15 protein-coding 116.25-188 chr5 150708727 150708967 + 0.75 NA TTS (NM_016221) TTS (NM_016221) -7785 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 155.75-41 chr12 58761722 58762136 + 0.75 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) L3b|LINE|CR1 19787 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 137-102 chr3 83695630 83695832 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 1173844 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 183.25-70 chr3 7339431 7339718 + 0.75 NA intron (NM_000844, intron 4 of 9) intron (NM_000844, intron 4 of 9) 195710 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 211.25-53 chr22 26525818 26526289 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001362922, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001362922, exon 6 of 6) 13521 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 129-166 chr7 41289865 41290183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 188420 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 146-129 chr8 112410948 112411166 + 0.75 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) intron (NM_052900, intron 31 of 68) -232436 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 141.5-141 chr3 62925373 62925646 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -50093 NM_183393 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 182.75-45 chr14 21224483 21224777 + 0.75 NA intron (NM_031314, intron 5 of 8) intron (NM_031314, intron 5 of 8) -17730 NR_038971 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 158-2 chr1 19534761 19535130 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49406 NM_001206541 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 144.5-149 chr4 65943703 65943988 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -273350 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 154.25-179 chr9 31192138 31192447 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 189198 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 211.25-90 chr8 34577257 34577723 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -206431 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 280.25-22 chr15 81719177 81719629 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 326615 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 155.5-211 chr8 137028429 137028802 + 0.75 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 384973 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 145-104 chr3 172195313 172195676 + 0.75 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 154963 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 158.75-129 chr4 137110936 137111232 + 0.75 NA intron (NR_149105, intron 1 of 3) L1MA6|LINE|L1 -82672 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 122.5-23 chr10 53628072 53628296 + 0.75 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -856484 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 133.75-169 chr6 88302312 88302696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135155 NM_001370546 1268 Hs.75110 NM_016083 ENSG00000118432 CNR1 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR cannabinoid receptor 1 protein-coding 184.5-47 chr14 74819840 74820447 + 0.75 NA intron (NM_019589, intron 16 of 20) L2|LINE|L2 43691 NM_001080408 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 172.75-114 chr7 6346033 6346307 + 0.75 NA intron (NM_001037163, intron 1 of 1) MER102b|DNA|hAT-Charlie 2797 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 228.25-76 chr7 6277319 6278074 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5072 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 156.75-148 chr6 65156151 65156502 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -145092 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 220-7 chr10 5738999 5739470 + 0.75 NA intron (NM_017782, intron 12 of 20) L2a|LINE|L2 54396 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 242-24 chr17 41510953 41511414 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -5571 NM_002274 3860 Hs.654550 NM_002274 ENSG00000171401 KRT13 CK13|K13|WSN2 keratin 13 protein-coding 134.25-193 chr8 110355261 110355524 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -379621 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 194-52 chr22 25924054 25924498 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) intron (NM_001318245, intron 34 of 43) 182088 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 208.5-39 chr14 91226821 91227297 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 17645 NM_001177676 8111 Hs.8882 NM_003485 ENSG00000119714 GPR68 AI2A6|GPR12A|OGR1 G protein-coupled receptor 68 protein-coding 145.25-13 chr10 79194601 79194923 + 0.75 NA intron (NM_020338, intron 4 of 24) intron (NM_020338, intron 4 of 24) 125796 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 141-158 chr8 140602042 140602323 + 0.75 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 33451 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 223.75-32 chr16 88381557 88381929 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45728 NM_001367624 84627 Hs.54925 NM_001127464 ENSG00000225614 ZNF469 BCS|BCS1 zinc finger protein 469 protein-coding 228.5-15 chr10 45563431 45564043 + 0.75 NA intron (NM_145021, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 -28366 NM_001002266 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 113.75-12 chr1 170127232 170127477 + 0.75 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -18693 NM_001136107 149281 Hs.553612 NM_001136107 ENSG00000203740 METTL11B C1orf184|HOMT1B|NTM1B methyltransferase like 11B protein-coding 169-12 chr10 78722167 78722490 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 345120 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 118.25-20 chr1 186216051 186216291 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -80102 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 177-63 chr3 87685045 87685284 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -107542 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 224.25-74 chr4 183936943 183937302 + 0.75 NA intron (NM_020225, intron 1 of 3) intron (NM_020225, intron 1 of 3) 31815 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 245.25-4 chr1 113403564 113404026 + 0.75 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) LTR67B|LTR|ERVL 13280 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 122.75-55 chr16 58369313 58369685 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22972 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 222.75-83 chr6 111731033 111731513 + 0.75 NA intron (NM_153047, intron 3 of 13) intron (NM_153047, intron 3 of 13) 27858 NM_153048 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 160.25-130 chr5 106549593 106549954 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 461241 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 196-39 chr17 27632298 27632622 + 0.75 NA intron (NR_024043, intron 1 of 9) intron (NR_024043, intron 1 of 9) 1272 NM_009587 3965 Hs.81337 NM_002308 ENSG00000168961 LGALS9 HUAT|LGALS9A galectin 9 protein-coding 128.5-168 chr5 9211940 9212235 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 8 of 22) intron (NM_003966, intron 8 of 22) -158192 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 175.25-89 chr22 30309735 30310048 + 0.75 NA intron (NM_001204240, intron 1 of 8) intron (NM_001204240, intron 1 of 8) 17050 NM_001204240 83874 Hs.655273 NM_031937 ENSG00000099992 TBC1D10A EPI64|TBC1D10|dJ130H16.1|dJ130H16.2 TBC1 domain family member 10A protein-coding 122.75-135 chr3 132576715 132577075 + 0.75 NA intron (NM_032169, intron 16 of 19) intron (NM_032169, intron 16 of 19) -20375 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 129.75-70 chr16 50913758 50914031 + 0.75 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) intron (NR_039672, intron 2 of 6) 35121 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 117-28 chr11 92424605 92424907 + 0.75 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) intron (NM_001008781, intron 1 of 24) 72660 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 152.75-132 chr5 74867429 74867790 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_015566) promoter-TSS (NM_015566) -643 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 177.5-89 chr2 172362512 172362799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64681 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 198.5-150 chr8 117272072 117272498 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 137290 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 183.25-71 chr3 45479485 45479773 + 0.75 NA intron (NM_001368263, intron 9 of 20) intron (NM_001368263, intron 9 of 20) 29916 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 119-163 chr6 63820573 63820782 + 0.75 NA intron (NR_157848, intron 1 of 1) L1ME3G|LINE|L1 13841 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 117.75-90 chr18 70928146 70928394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -277316 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 134.25-103 chr21 26275359 26275715 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -104409 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 135-77 chr2 57328779 57328985 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -578769 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 206.75-28 chr18 338323 338829 + 0.75 NA intron (NM_130386, intron 5 of 9) intron (NM_130386, intron 5 of 9) -70529 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 136.5-61 chr13 49412838 49413150 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001287339, exon 2 of 10) 5' UTR (NM_001287339, exon 2 of 10) 757 NM_001287339 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 233.75-36 chr2 49700680 49701153 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 273287 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 138.75-207 chr9 32601222 32601666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28260 NM_001199987 4712 Hs.493668 NM_002493 ENSG00000165264 NDUFB6 B17|CI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B6 protein-coding 233.75-28 chr15 59088076 59088440 + 0.75 NA intron (NM_001270529, intron 10 of 13) intron (NM_001270529, intron 10 of 13) -16888 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 128.25-55 chr15 60391977 60392342 + 0.75 NA intron (NM_001136015, intron 1 of 13) intron (NM_001136015, intron 1 of 13) 5827 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 172.75-92 chr4 148043964 148044277 + 0.75 NA intron (NM_024605, intron 19 of 22) intron (NM_024605, intron 19 of 22) 261525 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 235.75-69 chr7 51270863 51271394 + 0.75 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) intron (NM_015198, intron 1 of 12) 45681 NM_001287438 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 179.5-109 chr20 64055723 64056279 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_198723) promoter-TSS (NM_198723) -971 NM_198723 6919 Hs.505004 NM_003195 ENSG00000171703 TCEA2 TFIIS transcription elongation factor A2 protein-coding 159-99 chr7 34812889 34813304 + 0.75 NA intron (NM_207172, intron 4 of 8) L1ME3G|LINE|L1 21235 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 186.75-42 chr18 74013626 74013926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134058 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 126.5-49 chr12 38843662 38844009 + 0.75 NA intron (NM_153634, intron 4 of 19) intron (NM_153634, intron 4 of 19) 61756 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 114.75-193 chr8 84742779 84743075 + 0.75 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 37000 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 211.5-76 chr2 68012873 68013272 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 49932 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 172.75-26 chr12 31455418 31455936 + 0.75 NA intron (NM_144973, intron 4 of 20) intron (NM_144973, intron 4 of 20) -86376 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 167.75-75 chr2 114710343 114710579 + 0.75 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 123087 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 138.25-13 chr1 111453424 111453702 + 0.75 NA intron (NM_001688, intron 2 of 6) L3b|LINE|CR1 4099 NM_001688 515 Hs.514870 NM_001688 ENSG00000116459 ATP5PB ATP5F1|PIG47 ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b protein-coding 131.5-180 chr4 89139196 89139404 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 26483 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 160-2 chr1 44361789 44362203 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -6717 NM_001301701 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 156.75-19 chr10 35181678 35182007 + 0.75 NA intron (NM_183012, intron 4 of 5) AluJr|SINE|Alu 6249 NM_001267567 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 123.25-36 chr11 65663993 65664218 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1133 NM_001243985 5970 Hs.502875 NM_021975 ENSG00000173039 RELA CMCU|NFKB3|p65 RELA proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 205.75-18 chr13 113302704 113303289 + 0.75 NA intron (NM_005561, intron 1 of 8) intron (NM_005561, intron 1 of 8) 5757 NM_005561 3916 Hs.494419 NM_005561 ENSG00000185896 LAMP1 CD107a|LAMPA|LGP120 lysosomal associated membrane protein 1 protein-coding 173-93 chr4 56179717 56180057 + 0.75 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 9692 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 130.5-163 chr3 16623570 16623907 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -18315 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 124-138 chr5 140637099 140637411 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2172 NM_001300980 55374 Hs.534333 NM_018502 ENSG00000113119 TMCO6 PRO1580 transmembrane and coiled-coil domains 6 protein-coding 133-16 chr10 72401268 72401491 + 0.75 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) AluSz6|SINE|Alu -46460 NR_157570 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 118-31 chr11 91668381 91668591 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -556548 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 237.5-61 chr3 74768282 74768749 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -247375 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 169.5-21 chr10 116675959 116676269 + 0.75 NA intron (NM_001330164, intron 12 of 12) intron (NM_001330164, intron 12 of 12) -5832 NM_001330142 143379 Hs.121347 NM_144661 ENSG00000165863 C10orf82 - chromosome 10 open reading frame 82 protein-coding 125.25-68 chr15 45721354 45721537 + 0.75 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) intron (NR_135680, intron 1 of 4) 16250 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 234.75-25 chr15 50426354 50426761 + 0.75 NA intron (NM_001128610, intron 1 of 19) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 2152 NM_001283049 9101 Hs.443731 NM_005154 ENSG00000138592 USP8 HumORF8|PITA4|SPG59|UBPY ubiquitin specific peptidase 8 protein-coding 141.25-52 chr14 58900887 58901188 + 0.75 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 72749 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 158.75-69 chr16 84980998 84981347 + 0.75 NA intron (NM_001145548, intron 5 of 8) intron (NM_001145548, intron 5 of 8) 30363 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 134.25-120 chr3 141096057 141096391 + 0.75 NA intron (NM_080862, intron 2 of 2) intron (NM_080862, intron 2 of 2) 44877 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 227.25-85 chrX 27868326 27868750 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60548 NM_182506 139422 Hs.447363 NM_182506 ENSG00000177689 MAGEB10 - MAGE family member B10 protein-coding 196.25-5 chr1 182932907 182933321 + 0.75 NA intron (NM_030933, intron 5 of 9) AluSg|SINE|Alu 20052 NM_030933 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 136.75-132 chr3 107440051 107440395 + 0.75 NA intron (NR_110039, intron 1 of 2) MamRep38|DNA|hAT 9293 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 182.25-10 chr1 245188995 245189411 + 0.75 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) L1MB3|LINE|L1 34218 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 225.5-17 chr11 7458839 7459266 + 0.75 NA intron (NR_103855, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 6783 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 194.75-101 chrX 50317561 50317999 + 0.75 NA intron (NM_033031, intron 8 of 12) AluSq2|SINE|Alu 33238 NM_033670 85417 Hs.130310 NM_033031 ENSG00000147082 CCNB3 - cyclin B3 protein-coding 132.75-77 chr17 32504259 32504688 + 0.75 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) intron (NM_015194, intron 21 of 21) 17480 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 158.75-41 chr12 49055252 49055592 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_003482) promoter-TSS (NM_003482) -98 NM_003482 8085 Hs.731384 NM_003482 ENSG00000167548 KMT2D AAD10|ALR|CAGL114|KABUK1|KMS|MLL2|MLL4|TNRC21 lysine methyltransferase 2D protein-coding 114.25-158 chr5 143950519 143950801 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 138499 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 191.75-41 chr15 89954581 89955003 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -41840 NM_182616 348110 Hs.6734 NM_182616 ENSG00000242498 ARPIN C15orf38 actin related protein 2/3 complex inhibitor protein-coding 158.25-120 chr6 38659074 38659365 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19290 NM_001099272 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 116.75-90 chr2 28501373 28501706 + 0.75 NA intron (NM_001170585, intron 1 of 56) L1MC5a|LINE|L1 5468 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 121.25-158 chr5 33423648 33423942 + 0.75 NA Intergenic (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16901 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 164.5-220 chr9 24097561 24097922 + 0.75 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -247140 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 186.75-95 chr6 18802736 18803060 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 231114 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 212-60 chr3 141513466 141513772 + 0.75 NA intron (NM_006506, intron 2 of 23) intron (NM_006506, intron 2 of 23) 26592 NM_001303246 5922 Hs.98445 NM_006506 ENSG00000155903 RASA2 GAP1M RAS p21 protein activator 2 protein-coding 195.25-80 chr5 148709871 148710241 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -55529 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 133-56 chr15 47260498 47260787 + 0.75 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) L1MDa|LINE|L1 76553 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 133.25-174 chr5 62004770 62004999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -269186 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 243.25-17 chr16 71866014 71866518 + 0.75 NA intron (NM_001201554, intron 3 of 6) intron (NM_001201554, intron 3 of 6) 14210 NM_001318239 55565 Hs.744055 NM_017530 ENSG00000102984 ZNF821 - zinc finger protein 821 protein-coding 263.5-23 chr17 60470208 60470727 + 0.75 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) AluJr|SINE|Alu 47978 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 181.25-31 chr14 71424234 71424600 + 0.75 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) L1MB3|LINE|L1 -14522 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 203-6 chr1 68598652 68599112 + 0.75 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -101800 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 362.5-15 chr3 118389149 118389840 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -252274 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 146-109 chr5 144281450 144281811 + 0.75 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) L1MD2|LINE|L1 76239 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 169.25-22 chr13 54788520 54788784 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -385802 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 127.75-143 chr4 53599470 53599853 + 0.75 NA intron (NR_046827, intron 1 of 1) intron (NR_046827, intron 1 of 1) 6705 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 173.5-9 chr1 158779161 158779548 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1719 NM_001005278 81442 Hs.554487 NM_001005278 ENSG00000188340 OR6N2 OR1-23 olfactory receptor family 6 subfamily N member 2 protein-coding 140.5-250 chrX 45796418 45796688 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49429 NR_029636 407007 NR_029636 ENSG00000207725 MIR222 MIRN222|miRNA222|mir-222 microRNA 222 ncRNA 112.25-85 chr18 38298691 38298943 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 641682 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 125.75-45 chr12 115929386 115929662 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 219130 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 156-123 chr5 93646902 93647255 + 0.75 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) L1MC4|LINE|L1 -26290 NR_031754 100313887 NR_031754 ENSG00000284336 MIR2277 mir-2277 microRNA 2277 ncRNA 158.5-34 chr11 8676959 8677395 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5615 NM_000990 6157 Hs.523463 NM_000990 ENSG00000166441 RPL27A L27A ribosomal protein L27a protein-coding 186.75-76 chr4 47441828 47442361 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 21608 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 126.75-243 chr8 94200857 94201068 + 0.75 NA intron (NM_001144663, intron 1 of 17) MIR|SINE|MIR 7593 NM_004063 1015 Hs.591853 NM_004063 ENSG00000079112 CDH17 CDH16|HPT-1|HPT1 cadherin 17 protein-coding 206.75-71 chr5 80875790 80876246 + 0.75 NA 3' UTR (NM_002439, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_002439, exon 24 of 24) -84345 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 123.25-65 chr15 76382859 76383177 + 0.75 NA intron (NR_148227, intron 28 of 32) intron (NR_148227, intron 28 of 32) 46245 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 199.25-106 chr9 84276724 84277087 + 0.75 NA non-coding (NR_037638, exon 19 of 19) non-coding (NR_037638, exon 19 of 19) 63853 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 118.5-121 chr22 50114542 50114904 + 0.75 NA intron (NM_018995, intron 7 of 26) intron (NM_018995, intron 7 of 26) 24467 NM_001164105 54456 Hs.62880 NM_018995 ENSG00000073146 MOV10L1 CHAMP|DJ402G11.8 Mov10 like RISC complex RNA helicase 1 protein-coding 167-117 chr8 106496587 106497009 + 0.75 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) MamGypLTR1a|LTR|Gypsy 48874 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 160-29 chr13 108092607 108092962 + 0.75 NA Intergenic (AGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 121998 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 117.25-194 chr7 25010169 25010553 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -30183 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 119.75-92 chr2 21131426 21131688 + 0.75 NA intron (NM_001306137, intron 2 of 3) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 7571 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 305.75-25 chr6 80174361 80175057 + 0.75 NA intron (NR_134945, intron 7 of 10) intron (NR_134945, intron 7 of 10) 68038 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 260.75-17 chr17 43410985 43411443 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 12221 NM_001661 379 Hs.183153 NM_001661 ENSG00000175906 ARL4D ARF4L|ARL6 ADP ribosylation factor like GTPase 4D protein-coding 182.5-153 chr7 37955130 37955394 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 33943 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 265.75-24 chr17 56697239 56697922 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 103881 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 147.5-97 chr2 55276189 55276506 + 0.75 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -5972 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 126.75-208 chr5 165064177 165064464 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 594041 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 127.25-67 chr16 48605329 48605541 + 0.75 NA intron (NM_153029, intron 1 of 6) intron (NM_153029, intron 1 of 6) 4745 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 154-13 chr1 233912504 233912781 + 0.75 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 7966 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 194-30 chr12 111435419 111435768 + 0.75 NA intron (NM_001291424, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 731 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 155.5-187 chr6 148498589 148498867 + 0.75 NA intron (NM_001346506, intron 9 of 20) intron (NM_001346506, intron 9 of 20) -9771 NM_001346508 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 140.75-9 chr1 200562839 200563183 + 0.75 NA intron (NM_014875, intron 25 of 29) L2c|LINE|L2 55827 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 160.25-75 chr2 109448095 109448573 + 0.75 NA intron (NM_001099289, intron 7 of 9) MER1A|DNA|hAT-Charlie -134709 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 227.5-103 chr8 78943042 78943432 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 105708 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 127-182 chr8 140930052 140930406 + 0.75 NA intron (NM_001352699, intron 1 of 35) intron (NM_001352699, intron 1 of 35) 70775 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 141-124 chr5 36335549 36335899 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33822 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 141.5-114 chr2 182090447 182090861 + 0.75 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) intron (NM_001261425, intron 4 of 5) 104801 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 233.75-65 chr5 122096849 122097230 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -18780 NM_002317 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 175.5-120 chr3 103891106 103891491 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -367182 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 159-24 chr12 7751307 7751546 + 0.75 NA Intergenic LTR12E|LTR|ERV1 -1885 NM_203503 170482 Hs.351812 NM_130441 ENSG00000198178 CLEC4C BDCA2|CD303|CLECSF11|CLECSF7|DLEC|HECL|PRO34150 C-type lectin domain family 4 member C protein-coding 177.25-48 chr14 87819331 87819727 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -164235 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 143.25-163 chr6 159081532 159081753 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36490 NM_152133 117289 Hs.529984 NM_054114 ENSG00000164691 TAGAP ARHGAP47|FKSG15|IDDM21|TAGAP1 T cell activation RhoGTPase activating protein protein-coding 170.75-122 chr6 151371510 151371911 + 0.75 NA intron (NM_020861, intron 2 of 2) intron (NM_020861, intron 2 of 2) 19849 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 248.5-76 chr4 151279394 151280037 + 0.75 NA intron (NM_183375, intron 1 of 4) intron (NM_183375, intron 1 of 4) 2542 NM_183375 345062 Hs.651266 NM_183375 ENSG00000189099 PRSS48 ESSPL serine protease 48 protein-coding 133-28 chr11 127644339 127644612 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 373405 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 205.75-68 chr5 116027759 116028074 + 0.75 NA TTS (NM_173800) TTS (NM_173800) -23550 NM_001195581 644100 Hs.98288 NM_001195581 ENSG00000268223 ARL14EPL - ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein like protein-coding 114.25-184 chr7 95077069 95077312 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) L1M7|LINE|L1 167292 NM_001166162 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 115.5-34 chr12 13120864 13121037 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17283 NM_001080555 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 176.5-108 chr20 17040028 17040425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -185881 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 112.5-61 chr12 114648449 114648744 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 35579 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 199.75-57 chr20 43921400 43921873 + 0.75 NA intron (NM_001098796, intron 1 of 8) intron (NM_001098796, intron 1 of 8) 5506 NM_001098796 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 184.25-108 chr6 62359945 62360273 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -73882 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 182-93 chr5 79207519 79207773 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28485 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 231.5-40 chr2 15576837 15577316 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14792 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 169-56 chr21 18253115 18253432 + 0.75 NA intron (NM_001204174, intron 1 of 5) intron (NM_001204174, intron 1 of 5) 7398 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 142-115 chr3 187665340 187665634 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 4907 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 242-61 chr7 134647216 134647684 + 0.75 NA intron (NM_001293085, intron 2 of 3) intron (NM_001293085, intron 2 of 3) 597 NM_001724 669 Hs.198365 NM_001724 ENSG00000172331 BPGM DPGM|ECYT8 bisphosphoglycerate mutase protein-coding 114.25-46 chr13 32359435 32359705 + 0.75 NA intron (NM_000059, intron 16 of 26) intron (NM_000059, intron 16 of 26) 44090 NM_000059 675 Hs.34012 NM_000059 ENSG00000139618 BRCA2 BRCC2|BROVCA2|FACD|FAD|FAD1|FANCD|FANCD1|GLM3|PNCA2|XRCC11 BRCA2 DNA repair associated protein-coding 138.25-116 chr3 98710372 98710628 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21736 NM_001271142 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 177.25-81 chr20 48063891 48064167 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -73912 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 113.75-200 chr8 136692433 136692704 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR 161770 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 140.75-95 chr2 133217613 133217902 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -48438 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 114.75-48 chr14 47435445 47435622 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -92287 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 195.75-91 chr5 40733788 40734218 + 0.75 NA intron (NM_012382, intron 2 of 4) intron (NM_012382, intron 2 of 4) 21958 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 116.75-204 chr8 134234876 134235150 + 0.75 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 348517 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 140.25-185 chr8 102076172 102076373 + 0.75 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 48062 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 155-102 chr4 117801405 117801704 + 0.75 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger -32847 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 137.25-160 chr8 52062003 52062247 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -132237 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 147-106 chr4 166305253 166305536 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 432157 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 194-71 chr6 25453848 25454215 + 0.75 NA intron (NM_001173977, intron 8 of 36) intron (NM_001173977, intron 8 of 36) 174657 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 183.25-109 chr7 112359998 112360333 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -62979 NM_001197080 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 269.5-35 chr4 30339893 30340459 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -380193 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 147.75-111 chr3 145800051 145800267 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 269026 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 127-188 chr9 91461338 91461584 + 0.75 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -36835 NM_001289999 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 136.25-104 chr2 235434774 235435030 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -59141 NM_001244888 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 201.25-100 chrX 65665513 65665877 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1959 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 123.75-61 chr14 68640586 68640876 + 0.75 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) L2c|LINE|L2 -11944 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 123.25-135 chr3 103820649 103820989 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -296703 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 149.5-163 chr5 165117724 165118058 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 647612 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 179.5-149 chr5 67314076 67314368 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -117423 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 124.25-140 chr3 131610751 131611111 + 0.75 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -107960 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 195-94 chr8 127678569 127678918 + 0.75 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 55224 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 138.75-175 chr7 40101658 40101988 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32799 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 160.5-162 chr6 151183387 151183686 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44921 NR_125868 102723831 Hs.684425 NR_125868 LOC102723831 - uncharacterized LOC102723831 ncRNA 127.5-191 chr5 72270608 72270901 + 0.75 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) L1M5|LINE|L1 49486 NM_015084 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 148-136 chr9 16390949 16391184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -114753 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 213.75-9 chr1 216093812 216094163 + 0.75 NA intron (NM_206933, intron 22 of 71) MIRc|SINE|MIR 21522 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 184.5-140 chr7 65931825 65932236 + 0.75 NA intron (NM_001284342, intron 1 of 1) L1MEf|LINE|L1 50183 NM_000181 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 155.25-177 chr8 80489836 80490124 + 0.75 NA intron (NM_001105539, intron 1 of 5) intron (NM_001105539, intron 1 of 5) 3754 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 124.5-95 chr19 58103067 58103457 + 0.75 NA intron (NM_001145542, intron 1 of 6) intron (NM_001145542, intron 1 of 6) -4899 NM_023926 65982 Hs.235390 NM_023926 ENSG00000121413 ZSCAN18 ZNF447 zinc finger and SCAN domain containing 18 protein-coding 136.5-179 chr5 67694453 67694792 + 0.75 NA Intergenic (TTCTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -47833 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 119.75-145 chr3 113745117 113745340 + 0.75 NA intron (NM_025146, intron 1 of 4) intron (NM_025146, intron 1 of 4) 1021 NM_025146 80218 Hs.372378 NM_025146 ENSG00000121579 NAA50 MAK3|NAT13|NAT13P|NAT5|NAT5P|SAN|hNaa50p N(alpha)-acetyltransferase 50, NatE catalytic subunit protein-coding 157.5-75 chr16 69572781 69573101 + 0.75 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) AluSc|SINE|Alu 6975 NM_006599 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 118.25-175 chr6 130444390 130444708 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 7432 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 162.75-120 chr5 123460609 123460915 + 0.75 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -37170 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 120.5-168 chr4 120817419 120817784 + 0.75 NA intron (NM_018699, intron 5 of 15) intron (NM_018699, intron 5 of 15) 105265 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 137.5-145 chr21 17816134 17816329 + 0.75 NA intron (NM_001100420, intron 2 of 4) intron (NM_001100420, intron 2 of 4) 3125 NM_017447 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 126-120 chr3 129132557 129132768 + 0.75 NA intron (NM_001204890, intron 9 of 12) L2b|LINE|L2 -10512 NM_001204883 339122 Hs.381132 NM_198490 ENSG00000172780 RAB43 RAB11B|RAB41 RAB43, member RAS oncogene family protein-coding 116.5-64 chr14 35991611 35991894 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -78675 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 148.75-156 chr7 36183759 36184143 + 0.75 NA intron (NM_030636, intron 2 of 7) intron (NM_030636, intron 2 of 7) 30697 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 129.75-47 chr12 27287686 27287991 + 0.75 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) intron (NM_015000, intron 1 of 13) 43552 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 121.5-114 chr18 10226949 10227153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 187319 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 144.75-147 chr6 48568935 48569227 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -500392 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 150.75-117 chr22 35443693 35444000 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 43706 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 183-81 chr3 194323075 194323432 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10449 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 126.5-97 chr18 10957897 10958172 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) L1MA7|LINE|L1 190728 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 125.25-67 chr15 34009113 34009374 + 0.75 NA intron (NM_020371, intron 1 of 5) L1M4b|LINE|L1 29961 NM_020371 57099 Hs.555966 NM_020371 ENSG00000169857 AVEN PDCD12 apoptosis and caspase activation inhibitor protein-coding 147.75-165 chr8 142947711 142948037 + 0.75 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -30031 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 166.5-167 chr5 99685230 99685568 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 151409 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 159-21 chr11 115169496 115169880 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001301043, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001301043, exon 12 of 12) -163889 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 140.5-74 chr15 69367328 69367636 + 0.75 NA intron (NM_001104554, intron 3 of 8) intron (NM_001104554, intron 3 of 8) -46867 NR_160296 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 168.75-7 chr1 79445234 79445708 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -438741 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 219.25-67 chr6 99785448 99785879 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 178889 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 211.25-33 chr17 21384330 21384929 + 0.75 NA intron (NM_021012, intron 1 of 2) intron (NM_021012, intron 1 of 2) 8272 NM_021012 3768 Hs.200629 NM_021012 ENSG00000184185 KCNJ12 IRK-2|IRK2|KCNJN1|Kir2.2|Kir2.2v|hIRK|hIRK1|hkir2.2x|kcnj12x potassium voltage-gated channel subfamily J member 12 protein-coding 226-18 chr14 20650014 20650498 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -8565 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 206.25-90 chr5 157392330 157392756 + 0.75 NA intron (NM_001037333, intron 30 of 30) L1MB3|LINE|L1 -46866 NM_001001343 408263 Hs.437066 NM_001001343 ENSG00000172568 FNDC9 C5orf40 fibronectin type III domain containing 9 protein-coding 116.5-107 chr2 4541629 4541898 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 114459 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 203.5-70 chr2 65064822 65065354 + 0.75 NA intron (NR_134966, intron 1 of 5) intron (NR_134966, intron 1 of 5) 8672 NM_001319101 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 138-170 chr9 38513769 38514001 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 31487 NR_047651 100289137 Hs.644630 NR_047651 ENSG00000283486 FAM95C - family with sequence similarity 95 member C ncRNA 139.25-193 chr8 48920938 48921184 + 0.75 NA intron (NM_003068, intron 1 of 2) intron (NM_003068, intron 1 of 2) 368 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 143.5-24 chr10 55559578 55559907 + 0.75 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -39300 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 130-63 chr19 9221904 9222244 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -7203 NM_001005191 125958 Hs.446910 NM_001005191 ENSG00000174667 OR7D4 OR19-7|OR19-B|OR19B|OR7D4P|hg105 olfactory receptor family 7 subfamily D member 4 protein-coding 135-50 chr15 88370496 88370745 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96768 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 188-87 chr9 13725252 13725528 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -202581 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 137-172 chr8 51170074 51170303 + 0.75 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 639257 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 124.75-36 chr10 108304816 108305098 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -235664 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 117-187 chr8 92542560 92542851 + 0.75 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 112789 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 166-80 chr22 45549577 45550052 + 0.75 NA intron (NM_006487, intron 13 of 14) intron (NM_006487, intron 13 of 14) 46931 NM_001996 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 122.75-204 chr8 108356769 108357025 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -86686 NR_138033 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 210-33 chr16 50186693 50187071 + 0.75 NA intron (NM_001365324, intron 1 of 11) AluJr4|SINE|Alu 33401 NM_001365324 64282 Hs.514342 NM_022447 ENSG00000121274 TENT4B PAPD5|TRF4-2|TUT3 terminal nucleotidyltransferase 4B protein-coding 137.5-99 chr17 71174306 71174619 + 0.75 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 27717 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 265-25 chr22 19813311 19813707 + 0.75 NA intron (NM_053004, intron 4 of 7) AluSx|SINE|Alu 41365 NM_053004 54584 Hs.105642 NM_053004 ENSG00000185838 GNB1L DGCRK3|FKSG1|GY2|WDR14|WDVCF G protein subunit beta 1 like protein-coding 145.25-175 chr8 133919754 133920176 + 0.75 NA Intergenic MLT1K-int|LTR|ERVL-MaLR 33469 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 126.25-220 chr9 83934367 83934591 + 0.75 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -12935 NM_001271927 55582 Hs.697514 NM_017576 ENSG00000165115 KIF27 - kinesin family member 27 protein-coding 122.5-62 chr14 60459867 60460082 + 0.75 NA intron (NM_174978, intron 13 of 17) L1ME3B|LINE|L1 26089 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 160-53 chr2 74399796 74400236 + 0.75 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL -7929 NM_001190836 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 151-34 chr14 25475945 25476278 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -425814 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 135-195 chr9 34781282 34781518 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -51912 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 174.75-45 chr17 69904927 69905383 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56552 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 143.75-64 chr17 22287273 22287500 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -11378 NR_028336 284123 Hs.348578 NM_203392 ENSG00000178130 FAM27E5 FAM27L family with sequence similarity E5 ncRNA 235.75-6 chr10 9661644 9662293 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -366375 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 235-78 chr9 68939707 68940234 + 0.75 NA intron (NM_003558, intron 13 of 15) intron (NM_003558, intron 13 of 15) 35871 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 115-172 chr7 84609269 84609598 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 76957 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 172-79 chr4 41042917 41043214 + 0.75 NA intron (NM_001330658, intron 3 of 15) intron (NM_001330658, intron 3 of 15) 171477 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 147-24 chr12 87317063 87317382 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13517 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 300.25 chr1 112495242 112495715 + 0.75 NA intron (NM_004185, intron 2 of 5) AluY|SINE|Alu -13487 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 153.5-38 chr11 120200514 120200737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10407 NM_178507 220323 Hs.445081 NM_178507 ENSG00000184232 OAF NS5ATP13TP2 out at first homolog protein-coding 174.5-91 chr19 42299325 42299570 + 0.75 NA intron (NM_001145940, intron 5 of 5) AluY|SINE|Alu -2685 NM_199285 284338 Hs.585901 NM_199285 ENSG00000188368 PRR19 - proline rich 19 protein-coding 126.5-176 chr4 92210463 92210880 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66631 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 177-78 chr5 60908105 60908489 + 0.75 NA intron (NM_001007234, intron 4 of 5) intron (NM_001007234, intron 4 of 5) 36773 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 140.5-144 chr3 2264153 2264409 + 0.75 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) L1MA4|LINE|L1 25452 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 129-40 chr11 84651830 84652139 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 68958 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 206.25-84 chr5 91378275 91378605 + 0.75 NA intron (NR_138072, intron 2 of 7) intron (NR_138072, intron 2 of 7) 1657 NR_138071 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 126.5-166 chr4 35379328 35379709 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 864421 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 246.75-51 chr5 6276344 6276794 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 60723 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 145.5-158 chr5 78521390 78521661 + 0.75 NA intron (NM_005779, intron 3 of 4) intron (NM_005779, intron 3 of 4) 127247 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 192-95 chr7 97693478 97693792 + 0.75 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -38451 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 199.75-73 chr4 114424091 114424511 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -174101 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 119-47 chr14 52095690 52096025 + 0.75 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -26798 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 176.75-90 chr4 56011389 56011665 + 0.75 NA intron (NM_025009, intron 20 of 25) intron (NM_025009, intron 20 of 25) 62582 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 159.75-46 chr14 67370771 67371255 + 0.75 NA intron (NM_004094, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 10685 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 145.75-32 chr13 86526061 86526398 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -385691 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 197.5-30 chr12 21714833 21715247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57185 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 154.5-18 chr1 233779323 233779621 + 0.75 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -125204 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 202.75-32 chr14 46343279 46343581 + 0.75 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MC4a|LINE|L1 -127929 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 156.5-162 chr6 45453830 45454122 + 0.75 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 31701 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 130.25-2 chr1 18427735 18427956 + 0.75 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -53085 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 131.5-12 chr1 171432707 171432999 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52677 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 207.5-84 chr5 55609806 55610330 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -74990 NR_103485 8611 Hs.696231 NM_003711 ENSG00000067113 PLPP1 LLP1a|LPP1|PAP-2a|PAP2|PPAP2A phospholipid phosphatase 1 protein-coding 190.25-68 chr2 135758179 135758524 + 0.75 NA intron (NM_014607, intron 5 of 12) AluSp|SINE|Alu -15707 NR_163478 107985946 Hs.591242 NM_001365239 LOC107985946 - uncharacterized LOC107985946 ncRNA 223-18 chr12 28185313 28185732 + 0.75 NA TTS (NR_148936) TTS (NR_148936) -4934 NM_001352081 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 279.75-20 chr2 10925685 10926140 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 13978 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 212.25-51 chr21 24402903 24403249 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -25664 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 174-32 chr15 67635130 67635536 + 0.75 NA intron (NM_001206804, intron 9 of 21) AluY|SINE|Alu 86239 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 159.75-161 chr7 80495138 80495384 + 0.75 NA intron (NM_001102386, intron 1 of 7) L1PB4|LINE|L1 16803 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 152-99 chr22 39972419 39972776 + 0.75 NA 3' UTR (NM_004810, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_004810, exon 8 of 8) -22357 NM_138435 113828 Hs.26192 NM_138435 ENSG00000133477 FAM83F - family with sequence similarity 83 member F protein-coding 148.5-70 chr16 8176766 8177034 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 412938 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 158.25-76 chr20 31067299 31067588 + 0.75 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -190221 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 148-80 chr3 37975472 37975848 + 0.75 NA intron (NM_001008392, intron 6 of 7) intron (NM_001008392, intron 6 of 7) 6256 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 151.5-138 chr4 46738130 46738409 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) intron (NM_130902, intron 2 of 2) 170976 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 200-44 chr2 77986233 77986541 + 0.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 -31361 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 194.75-14 chr10 71072209 71072553 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 133328 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 113-158 chr6 48652890 48653092 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -584302 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 392.75-8 chr19 57577978 57579022 + 0.75 NA intron (NM_001353405, intron 1 of 2) CpG 411 NM_017879 55659 Hs.247711 NM_017879 ENSG00000083817 ZNF416 - zinc finger protein 416 protein-coding 168.5-185 chr8 117657440 117657819 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 136916 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 156.75-6 chr1 93877281 93877551 + 0.75 NA exon (NM_014597, exon 2 of 7) exon (NM_014597, exon 2 of 7) 1790 NM_014597 30836 Hs.85769 NM_014597 ENSG00000067334 DNTTIP2 ERBP|FCF2|HSU15552|LPTS-RP2|TdIF2 deoxynucleotidyltransferase terminal interacting protein 2 protein-coding 203.75-77 chr4 31422282 31422632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84087 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 112.5-87 chr16 1341366 1341526 + 0.75 NA exon (NM_001199098, exon 8 of 34) exon (NM_001199098, exon 8 of 34) 5249 NM_001199096 8938 Hs.458427 NM_003933 ENSG00000007516 BAIAP3 BAP3 BAI1 associated protein 3 protein-coding 245-11 chr12 3652352 3652974 + 0.75 NA intron (NM_001144958, intron 10 of 19) intron (NM_001144958, intron 10 of 19) 100446 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 170.5-13 chr1 164874028 164874363 + 0.75 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) intron (NM_001353131, intron 7 of 7) -99554 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 143-104 chr4 45746999 45747222 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 376944 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 140.25-159 chr6 35675590 35675823 + 0.75 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) -10917 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 144-4 chr1 80886907 80887172 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 245752 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 131.25-28 chr10 120976365 120976744 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 125192 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 163.25-76 chr20 31055934 31056317 + 0.75 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -201539 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 124.75-204 chr8 123529657 123529876 + 0.75 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 2377 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 176.75-95 chr4 115218959 115219290 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -105504 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 185.5-151 chr7 47924445 47924889 + 0.75 NA intron (NM_138295, intron 7 of 56) LTR8B|LTR|ERV1 23824 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 156.5-54 chr14 62362201 62362612 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -222433 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 156.5-59 chr15 81252881 81253264 + 0.75 NA intron (NM_001352686, intron 2 of 18) L1MB8|LINE|L1 -43898 NM_004513 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 141-129 chr5 87499290 87499563 + 0.75 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -86393 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 264.5-21 chr15 49191972 49192490 + 0.75 NA intron (NM_002044, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 21984 NR_147895 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 204.25-86 chr5 11830653 11831196 + 0.75 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) L1ME1|LINE|L1 73522 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 130.75-171 chr6 142068526 142068893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20090 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 119.75-42 chr12 33845765 33845990 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -176619 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 220.75-65 chr7 12261971 12262345 + 0.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 50864 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 113.25-172 chr8 104084617 104084897 + 0.75 NA intron (NR_145711, intron 17 of 21) MIRb|SINE|MIR -138578 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 120.75-158 chr7 50601297 50601507 + 0.75 NA intron (NM_001350816, intron 16 of 17) L1MC5a|LINE|L1 -35997 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 154.5-126 chr3 70206174 70206471 + 0.75 NA intron (NM_001364677, intron 3 of 3) intron (NM_001364677, intron 3 of 3) 106316 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 112.25-65 chr14 82687790 82687952 + 0.75 NA intron (NR_146650, intron 4 of 5) L1MEc|LINE|L1 45239 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 164.75-134 chr7 61957835 61958206 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1346036 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 147.25-22 chr11 112453491 112453748 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28613 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 239.5-66 chr6 68598684 68599127 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 35419 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 149.75-14 chr10 58012980 58013284 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 254762 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 120.5-29 chr10 107493150 107493335 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -328536 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 152-54 chr15 27269164 27269433 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -107979 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 165.25-26 chr11 90502908 90503138 + 0.75 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 52834 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 126.25-41 chr12 60005095 60005355 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 315855 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 229-7 chr11 28228415 28228807 + 0.75 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) MER112|DNA|hAT-Charlie 120223 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 148.75-162 chr8 17076716 17076989 + 0.75 NA intron (NR_146233, intron 3 of 15) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 49614 NM_001349810 286097 Hs.403594 NM_181723 ENSG00000155970 MICU3 EFHA2 mitochondrial calcium uptake family member 3 protein-coding 207.25-54 chr22 20954985 20955481 + 0.75 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -1859 NR_110537 101928891 Hs.648264 NR_110537 ENSG00000237476 LINC01637 - long intergenic non-protein coding RNA 1637 ncRNA 158.25-147 chr8 114786136 114786427 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 881732 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 207.75-97 chr5 33193525 33193927 + 0.75 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -36009 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 150.5-182 chr6 10136960 10137224 + 0.75 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -267410 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 262.5-51 chr3 193879447 193879917 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -35673 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 115.5-40 chr12 65512943 65513136 + 0.75 NA intron (NR_120431, intron 2 of 3) intron (NR_120431, intron 2 of 3) 44272 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 240.5-99 chr7 38017298 38017866 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 96263 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 143-80 chr20 14943712 14944010 + 0.75 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -14343 NR_037841 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 143-97 chr3 151578481 151578817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12654 NR_049818 100847036 NR_049818 ENSG00000264330 MIR5186 - microRNA 5186 ncRNA 164.25-56 chr18 37158598 37158916 + 0.75 NA intron (NR_136303, intron 8 of 13) intron (NR_136303, intron 8 of 13) -115703 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 207.25-108 chrX 15815830 15816109 + 0.75 NA intron (NM_005089, intron 8 of 10) intron (NM_005089, intron 8 of 10) 25518 NM_005089 8233 Hs.171909 NM_005089 ENSG00000169249 ZRSR2 U2AF1-RS2|U2AF1L2|U2AF1RS2|URP|ZC3H22 zinc finger CCCH-type, RNA binding motif and serine/arginine rich 2 protein-coding 250-68 chr9 105843440 105843972 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 149165 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 222.75-28 chr12 41518627 41519045 + 0.75 NA intron (NM_001164595, intron 5 of 9) AluJr|SINE|Alu 81097 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 128.5-111 chr2 99724526 99724828 + 0.75 NA intron (NM_001025108, intron 10 of 23) MIRc|SINE|MIR -234660 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 168-33 chr12 6522030 6522463 + 0.75 NA intron (NM_014865, intron 15 of 31) intron (NM_014865, intron 15 of 31) 12024 NR_004387 692148 NR_004387 ENSG00000239002 SCARNA10 U85 small Cajal body-specific RNA 10 ncRNA 147.5-100 chr2 78469291 78469735 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76018 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 129-93 chr2 83936989 83937282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -353547 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 188.5-107 chr3 132751710 132752136 + 0.75 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) intron (NR_002811, intron 3 of 10) -29464 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 185.5-116 chr4 72077393 72077804 + 0.75 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 38466 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 167-119 chr8 132116164 132116507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11070 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 164-136 chr8 42375385 42375748 + 0.75 NA intron (NM_014420, intron 2 of 3) intron (NM_014420, intron 2 of 3) 1663 NM_014420 27121 Hs.159311 NM_014420 ENSG00000104371 DKK4 DKK-4 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 4 protein-coding 166.5-6 chr1 44600316 44600795 + 0.75 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 55062 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 162.75-149 chr8 122651337 122651663 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 42606 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 154.25-22 chr11 19274628 19275013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33165 NM_001256372 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 117.75-137 chr3 86677808 86677984 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 195953 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 159.5-213 chr8 129980012 129980324 + 0.75 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) AluSx3|SINE|Alu 28285 NR_049826 100847051 NR_049826 ENSG00000264653 MIR5194 mir-5194 microRNA 5194 ncRNA 150.75-7 chr1 50077749 50078053 + 0.75 NA intron (NM_001324208, intron 1 of 6) intron (NM_001324208, intron 1 of 6) -26008 NM_001144776 1996 Hs.213050 NM_021952 ENSG00000162374 ELAVL4 HUD|PNEM ELAV like RNA binding protein 4 protein-coding 181-15 chr11 67550548 67551009 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -27332 NM_016366 51475 Hs.278984 NM_016366 ENSG00000167791 CABP2 DFNB93 calcium binding protein 2 protein-coding 164.5-194 chr7 91219650 91220027 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44595 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 132.75-166 chr6 126487499 126487726 + 0.75 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 2981 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 133.25-207 chr7 112452212 112452506 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001197079, exon 1 of 12) 5' UTR (NM_001197079, exon 1 of 12) 301 NM_001197079 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 121.5-99 chr16 71924536 71924733 + 0.75 NA intron (NM_014761, intron 8 of 9) intron (NM_014761, intron 8 of 9) 29103 NM_001270977 9798 Hs.232194 NM_014761 ENSG00000182149 IST1 CHMP8|OLC1 IST1 factor associated with ESCRT-III protein-coding 125.75-192 chr9 13332945 13333369 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53444 NM_001330637 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 207.75-122 chr7 116266045 116266480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20402 NR_130921 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 147.5-194 chr7 46670598 46670940 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 26353 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 118-198 chr8 144326312 144326528 + 0.75 NA intron (NM_012079, intron 1 of 16) CpG 432 NM_012079 8694 Hs.521954 NM_012079 ENSG00000185000 DGAT1 ARAT|ARGP1|DGAT|DIAR7 diacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 206-38 chr18 13329135 13329482 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 51203 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 220.75-76 chr8 78437656 78438028 + 0.75 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -78498 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 167.25-107 chr3 87430619 87431049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -154250 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 157.25-108 chr4 87282023 87282297 + 0.75 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 18423 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 222.5-59 chr2 216646904 216647583 + 0.75 NA intron (NM_000597, intron 1 of 3) intron (NM_000597, intron 1 of 3) -12324 NM_001313990 3485 Hs.438102 NM_000597 ENSG00000115457 IGFBP2 IBP2|IGF-BP53 insulin like growth factor binding protein 2 protein-coding 152.5-152 chr5 81445455 81445701 + 0.75 NA intron (NM_012446, intron 12 of 16) intron (NM_012446, intron 12 of 16) -51444 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 129.5-135 chr2 142832167 142832468 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -45347 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 194.5-128 chr6 52680004 52680304 + 0.75 NA intron (NM_014051, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 9041 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 192-45 chr14 71028515 71028880 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 15 of 35) intron (NM_014982, intron 15 of 35) 121238 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 149.25-127 chr4 38285456 38285828 + 0.75 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -81272 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 177.75-97 chr21 29989178 29989493 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -49283 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 163-3 chr1 99433036 99433303 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 54635 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 177.25-9 chr1 233313143 233313555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -14375 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 126-106 chr2 209338449 209338627 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -85509 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 145.75-34 chr14 45850715 45851028 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -135269 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 273.5-28 chr18 13515111 13515523 + 0.75 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 55370 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 149.25-162 chr7 455270 455576 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64421 NM_002607 5154 Hs.535898 NM_002607 ENSG00000197461 PDGFA PDGF-A|PDGF1 platelet derived growth factor subunit A protein-coding 141.75-177 chr9 115887774 115887989 + 0.75 NA TTS (NR_024032) TTS (NR_024032) 37326 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 188.25-45 chr14 85801711 85801992 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132827 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 160.75-135 chr6 90862528 90862856 + 0.75 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -275620 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 146.5-9 chr1 76406128 76406395 + 0.75 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 331515 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 145.75-35 chr14 47881627 47881891 + 0.75 NA Intergenic CR1-16_AMi|LINE|CR1 -86745 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 170.25-97 chr3 72794578 72794861 + 0.75 NA intron (NM_018130, intron 9 of 10) intron (NM_018130, intron 9 of 10) 53726 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 218.25-50 chr20 39465127 39465602 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -240616 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 132.5-118 chr2 70779076 70779404 + 0.75 NA intron (NM_001004311, intron 3 of 4) intron (NM_001004311, intron 3 of 4) -11040 NM_001617 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 137.75-70 chr15 41991305 41991512 + 0.75 NA intron (NM_001206670, intron 13 of 19) MIRb|SINE|MIR 18645 NR_120334 101928388 Hs.738043 NR_120334 ENSG00000246740 PLA2G4E-AS1 - PLA2G4E antisense RNA 1 ncRNA 136.5-123 chr2 189531525 189531820 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 49139 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 122.75-73 chr17 76646961 76647206 + 0.75 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -3326 NM_001289107 55808 Hs.105352 NM_018414 ENSG00000070526 ST6GALNAC1 HSY11339|SIAT7A|ST6GalNAcI|STYI ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 143.25-45 chr13 89454536 89454951 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45766 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 170.75-41 chr15 62019857 62020227 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 9 of 81) intron (NM_001018088, intron 9 of 81) 40405 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 115.75-106 chr2 100687709 100687941 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 84086 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 236.25-22 chr12 20875677 20876064 + 0.75 NA intron (NM_019844, intron 9 of 15) intron (NM_019844, intron 9 of 15) 53322 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 146.25-36 chr14 75054747 75055047 + 0.75 NA intron (NR_126394, intron 1 of 1) intron (NR_126394, intron 1 of 1) -3365 NM_001040108 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 153.5-15 chr1 232881583 232881985 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -68827 NM_032324 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 171.5-84 chr2 116390565 116390811 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 1046873 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 114.5-131 chr2 44240707 44240921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34666 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 359.75-20 chr7 41798443 41799312 + 0.75 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -95787 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 201.25-99 chrX 13321075 13321584 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001135995) promoter-TSS (NM_001135995) -930 NM_001135995 92552 Hs.382641 NM_001135995 ENSG00000123594 ATXN3L MJDL ataxin 3 like protein-coding 241.5-59 chr20 19473434 19473893 + 0.75 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) intron (NM_020689, intron 2 of 16) -189067 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 121-51 chr13 26568650 26568830 + 0.75 NA intron (NM_006646, intron 1 of 9) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 11037 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 121-66 chr14 72032963 72033239 + 0.75 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 99574 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 181.25-97 chr5 27168478 27168849 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -130077 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 204.75-62 chr2 72855480 72855932 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -29673 NM_001321729 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 139.5-83 chr18 424402 424735 + 0.75 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 76133 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 165.75-89 chr2 172618194 172618463 + 0.75 NA intron (NR_103731, intron 11 of 13) L3|LINE|CR1 62238 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 167-7 chr1 114044030 114044434 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64758 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 192.25-7 chr1 180044128 180044525 + 0.75 NA intron (NM_014810, intron 21 of 37) intron (NM_014810, intron 21 of 37) 89516 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 152-89 chr2 133902185 133902580 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -217553 NM_001371457 146.5-6 chr1 45740799 45741114 + 0.75 NA exon (NM_005897, exon 3 of 9) exon (NM_005897, exon 3 of 9) 9697 NM_005897 3652 Hs.744252 NM_005897 ENSG00000197429 IPP KLHL27 intracisternal A particle-promoted polypeptide protein-coding 176.5-2 chr1 30707987 30708311 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10623 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 163 chr1 30087250 30087759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49892 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 118.75-80 chr17 66722603 66722941 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 8 of 16) intron (NM_002737, intron 8 of 16) -64300 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 115.75-209 chr8 58419054 58419297 + 0.75 NA intron (NM_001077619, intron 2 of 7) intron (NM_001077619, intron 2 of 7) 7814 NM_001077619 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 209-6 chr1 209524391 209524842 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -59098 NM_020439 57172 Hs.199068 NM_020439 ENSG00000008118 CAMK1G CLICK3|CLICKIII|VWS1|dJ272L16.1 calcium/calmodulin dependent protein kinase IG protein-coding 140-103 chr3 48416761 48417015 + 0.75 NA intron (NM_002673, intron 16 of 37) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger 12575 NM_002673 5364 Hs.476209 NM_002673 ENSG00000164050 PLXNB1 PLEXIN-B1|PLXN5|SEP plexin B1 protein-coding 112.25-76 chr17 58335762 58336066 + 0.75 NA TTS (NR_039889) TTS (NR_039889) 108 NR_039889 100616220 NR_039889 ENSG00000264399 MIR4736 - microRNA 4736 ncRNA 184.75-26 chr13 82442778 82443276 + 0.75 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -1216044 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 153-128 chr6 27164719 27165043 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 17255 NR_036096 100422934 NR_036096 ENSG00000265565 MIR3143 mir-3143 microRNA 3143 ncRNA 224.75-60 chr5 125933556 125934034 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -245782 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 142.25-102 chr22 28926638 28926904 + 0.75 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 9382 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 371.25-11 chr4 42406573 42407130 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9363 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 121.75-30 chr12 26120339 26120549 + 0.75 NA 3' UTR (NM_030762, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_030762, exon 5 of 5) 4593 NM_030762 79365 Hs.177841 NM_030762 ENSG00000123095 BHLHE41 BHLHB3|DEC2|SHARP1|hDEC2 basic helix-loop-helix family member e41 protein-coding 203.5-136 chr8 83738793 83739129 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 335203 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 119.5-54 chr11 110258598 110258821 + 0.75 NA intron (NM_001260494, intron 3 of 11) intron (NM_001260494, intron 3 of 11) 38003 NM_001260495 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 181-76 chr3 196394864 196395356 + 0.75 NA intron (NM_015562, intron 3 of 10) intron (NM_015562, intron 3 of 10) -36275 NR_046745 100874034 Hs.617990 NR_046745 UBXN7-AS1 - UBXN7 antisense RNA 1 ncRNA 164-66 chr20 61640190 61640493 + 0.75 NA intron (NM_001252339, intron 1 of 14) intron (NM_001252339, intron 1 of 14) 40580 NM_001252339 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 226.25-33 chr2 2956006 2956428 + 0.75 NA intron (NR_110228, intron 5 of 6) L1MB7|LINE|L1 169809 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 128.75-17 chr10 14692615 14692943 + 0.75 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) 82118 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 130-137 chr6 13316453 13316650 + 0.75 NA intron (NM_001258457, intron 4 of 6) intron (NM_001258457, intron 4 of 6) 11986 NM_001318806 51256 Hs.484678 NM_016495 ENSG00000145979 TBC1D7 MGCPH|PIG51|TBC7 TBC1 domain family member 7 protein-coding 113.75-199 chr8 135671219 135671472 + 0.75 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 213889 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 208.5-119 chr6 53254552 53254982 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22226 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 120-71 chr17 34741778 34742072 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 161176 NM_001304438 124842 Hs.310482 NM_207313 ENSG00000181291 TMEM132E DFNB99 transmembrane protein 132E protein-coding 127-189 chr9 96559507 96559844 + 0.75 NA intron (NR_147239, intron 4 of 14) intron (NR_147239, intron 4 of 14) 7156 NM_001351569 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 162.75-15 chr10 64631852 64632132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193536 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 117-163 chr6 150625368 150625619 + 0.75 NA intron (NM_001329799, intron 1 of 15) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -7471 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 127-154 chr6 157158093 157158273 + 0.75 NA intron (NM_020732, intron 9 of 19) intron (NM_020732, intron 9 of 19) 121756 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 210.25-45 chr2 186240722 186241102 + 0.75 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -154595 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 161.75-28 chr11 11484990 11485266 + 0.75 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) intron (NM_001363464, intron 1 of 9) -131878 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 142.5-167 chr5 41168521 41168766 + 0.75 NA intron (NM_000065, intron 9 of 17) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 44889 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 140.25-90 chr2 58726618 58726942 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 206027 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 154-83 chr20 55020324 55020605 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -402579 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 169.5-16 chr10 66067200 66067523 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) MER39B|LTR|ERV1 495936 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 237.75-55 chr3 197842713 197843184 + 0.75 NA intron (NM_001365717, intron 10 of 19) AluSx|SINE|Alu 51694 NM_001365715 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 144-141 chr8 132704815 132705081 + 0.75 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -29403 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 230-43 chr22 18124295 18124973 + 0.75 NA intron (NM_001193414, intron 3 of 4) intron (NM_001193414, intron 3 of 4) 13825 NM_018943 51807 Hs.137400 NM_018943 ENSG00000183785 TUBA8 CDCBM8|TUBAL2 tubulin alpha 8 protein-coding 257.25-2 chr1 93772089 93772594 + 0.75 NA intron (NR_148965, intron 1 of 1) L3|LINE|CR1 3042 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 222.75-91 chr7 75886060 75886556 + 0.75 NA intron (NM_001040456, intron 3 of 3) intron (NM_001040456, intron 3 of 3) 7274 NM_001040456 57414 Hs.488827 NM_020684 ENSG00000005486 RHBDD2 NPD007|RHBDL7 rhomboid domain containing 2 protein-coding 129.25-31 chr11 82873105 82873416 + 0.75 NA intron (NM_005040, intron 1 of 8) intron (NM_005040, intron 1 of 8) 27170 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 116.5-189 chr5 20560709 20560870 + 0.75 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 14924 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 122.25-181 chr8 30225999 30226185 + 0.75 NA Intergenic LTR17|LTR|ERV1 69723 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 174.5-15 chr1 218150070 218150473 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 106766 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 185.5-161 chr8 79495732 79496223 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -115140 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 255.75-45 chr6 54617795 54618327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -228710 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 136-142 chr8 8828216 8828482 + 0.75 NA intron (NM_004225, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 65281 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 122.75-76 chr18 7504078 7504302 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -43184 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 178.25-38 chr15 63695703 63696063 + 0.75 NA intron (NM_003922, intron 27 of 77) intron (NM_003922, intron 27 of 77) -95056 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 155.75-159 chr7 150502768 150503141 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11918 NM_153236 168537 Hs.647074 NM_153236 ENSG00000179144 GIMAP7 IAN7|hIAN7 GTPase, IMAP family member 7 protein-coding 156.25-52 chr17 48724949 48725279 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_036150) promoter-TSS (NR_036150) -639 NR_036150 100422978 NR_036150 ENSG00000263602 MIR3185 - microRNA 3185 ncRNA 146.25-134 chr7 32879255 32879675 + 0.75 NA exon (NM_015483, exon 2 of 4) exon (NM_015483, exon 2 of 4) 12295 NM_015483 25948 Hs.372541 NM_015483 ENSG00000170852 KBTBD2 BKLHD1 kelch repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 173-3 chr1 96004281 96004818 + 0.75 NA intron (NR_125991, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 12481 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 161.25-85 chr2 25301960 25302233 + 0.75 NA intron (NR_135490, intron 2 of 23) intron (NR_135490, intron 2 of 23) 26625 NR_031570 100302246 NR_031570 ENSG00000221445 MIR1301 MIRN1301|hsa-mir-1301|mir-1301 microRNA 1301 ncRNA 191.75-50 chr17 73003932 73004400 + 0.75 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) L1MEg|LINE|L1 88522 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 130-143 chr6 136102639 136102914 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 2 of 12) intron (NM_018945, intron 2 of 12) -29949 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 139.75-195 chrX 82459299 82459524 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1048879 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 204.5-136 chr8 136055942 136056481 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -474587 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 267.5-51 chr4 47651059 47651700 + 0.75 NA intron (NM_006587, intron 13 of 21) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -1290 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 144-82 chr3 56080271 56080615 + 0.75 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) intron (NR_132749, intron 7 of 17) -227849 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 119.25-76 chr17 20190149 20190459 + 0.75 NA intron (NM_001033554, intron 1 of 5) intron (NM_001033554, intron 1 of 5) 34232 NM_001033555 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 247.75-65 chr8 53963773 53964159 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 58482 NR_109901 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 115-192 chr9 27332500 27332721 + 0.75 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR -35460 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 174.25-143 chr8 85164483 85164811 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 12394 NR_134311 102723322 Hs.535913 NR_134311 ENSG00000260493 LOC102723322 - uncharacterized LOC102723322 ncRNA 212.5-21 chr11 106477880 106478286 + 0.75 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 226676 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 194-48 chr2 226880305 226880705 + 0.75 NA intron (NM_001349069, intron 5 of 8) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 44451 NM_001349071 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 148.5-247 chr9 125001470 125001692 + 0.75 NA intron (NM_173690, intron 13 of 18) intron (NM_173690, intron 13 of 18) -60498 NM_002077 2800 Hs.59504 NM_002077 ENSG00000136935 GOLGA1 golgin-97 golgin A1 protein-coding 186.25-41 chr16 62210028 62210478 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -173815 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 153.5-109 chr2 171051162 171051587 + 0.75 NA intron (NM_001136555, intron 6 of 18) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 15599 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 129-101 chr2 191905814 191906021 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58829 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 170.75-2 chr1 53240987 53241431 + 0.75 NA intron (NR_038953, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 2599 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 243.75-9 chr10 84421738 84422222 + 0.75 NA intron (NM_018999, intron 4 of 10) MER39|LTR|ERV1 -2959 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 212.25-18 chr11 82996114 82996704 + 0.75 NA intron (NM_001286059, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 37865 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 145.75-107 chr4 4720855 4721092 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -40787 NR_125892 101928279 Hs.586152 NR_125892 LOC101928279 - uncharacterized LOC101928279 ncRNA 131-43 chr12 115417933 115418317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 730529 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 114.5-206 chr5 35931779 35932038 + 0.75 NA intron (NM_144647, intron 1 of 4) intron (NM_144647, intron 1 of 4) 6714 NM_001042625 133690 Hs.55150 NM_144647 ENSG00000152611 CAPSL - calcyphosine like protein-coding 225-20 chr12 4945744 4946219 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 36076 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 119-53 chr15 34046889 34047176 + 0.75 NA intron (NM_012125, intron 2 of 2) L1PA11|LINE|L1 -7828 NM_020371 57099 Hs.555966 NM_020371 ENSG00000169857 AVEN PDCD12 apoptosis and caspase activation inhibitor protein-coding 199.75-90 chr8 113494277 113494653 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -57526 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 137.5-247 chrX 65403309 65403594 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -85284 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 261.75-19 chr19 33813684 33814075 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001129995, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001129995, exon 7 of 7) 17009 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 167.75-59 chr17 76102936 76103337 + 0.75 NA intron (NM_001145298, intron 2 of 18) intron (NM_001145298, intron 2 of 18) 435 NM_001282313 23265 Hs.514496 NM_015219 ENSG00000182473 EXOC7 2-5-3p|BLOM4|EX070|EXO70|EXOC1|Exo70p|YJL085W exocyst complex component 7 protein-coding 161.75-74 chr20 19251070 19251426 + 0.75 NA intron (NR_024564, intron 6 of 7) intron (NR_024564, intron 6 of 7) 33348 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 146.25-96 chr22 32748208 32748442 + 0.75 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR -52491 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 245.5-88 chr9 92213333 92213814 + 0.75 NA intron (NR_073446, intron 32 of 32) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -22417 NM_001350291 138652 Hs.742918 NM_001350291 PRSS47 - serine protease 47 protein-coding 153.25-143 chr8 139581057 139581364 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 121913 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 132.5-74 chr14 72724561 72724878 + 0.75 NA intron (NM_001280544, intron 4 of 9) AluJb|SINE|Alu 167930 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 121-200 chr9 102611646 102611989 + 0.75 NA intron (NR_103830, intron 3 of 4) intron (NR_103830, intron 3 of 4) 92180 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 201.75-95 chr7 70034973 70035551 + 0.75 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) MIRc|SINE|MIR 436787 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 116.75-57 chr14 48533889 48534183 + 0.75 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -739022 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 138.75-51 chr14 59254664 59254949 + 0.75 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -8635 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 126.25-22 chr10 96418528 96418760 + 0.75 NA intron (NM_012465, intron 7 of 20) L2b|LINE|L2 -59279 NM_001040102 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 236-9 chr11 24043196 24043730 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -453590 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 112.25-155 chr4 93838106 93838389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9494 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 169-48 chr2 88218952 88219429 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 46051 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 151.5-93 chr2 211579827 211580074 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 19 of 26) L1PA10|LINE|L1 846410 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 216-59 chr3 196589689 196590170 + 0.75 NA TTS (NM_001105573) TTS (NM_001105573) -21255 NM_001345910 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 159.25-26 chr11 112336060 112336436 + 0.75 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 65499 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 179-75 chr4 81628446 81628766 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -156699 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 129.75-10 chr1 71325493 71325715 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 244280 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 186.75-12 chr10 78028597 78029065 + 0.75 NA intron (NM_007055, intron 1 of 30) intron (NM_007055, intron 1 of 30) 684 NM_007055 11128 Hs.436896 NM_007055 ENSG00000148606 POLR3A ADDH|HLD7|RPC1|RPC155|WDRTS|hRPC155 RNA polymerase III subunit A protein-coding 130.75-201 chr9 85584481 85584770 + 0.75 NA intron (NM_015239, intron 23 of 25) HAL1|LINE|L1 157404 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 113.25-173 chr8 108938422 108938708 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -148063 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 161.25-4 chr1 91993723 91994065 + 0.75 NA intron (NM_001726, intron 14 of 18) MIRc|SINE|MIR -36091 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 220.5-5 chr1 114588584 114588999 + 0.75 NA intron (NM_001256404, intron 18 of 20) AluJo|SINE|Alu -7176 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 173-112 chr5 91672358 91672632 + 0.75 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -289178 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 143.25-65 chr16 76097982 76098298 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -179261 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 216.75-42 chr2 156130639 156131041 + 0.75 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 124091 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 257.25-35 chr4 59605444 59605886 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 592092 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 185.5-25 chr11 84167766 84168159 + 0.75 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) AluSq2|SINE|Alu 105318 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 221.5-34 chr17 13038746 13039190 + 0.75 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -20904 NM_001165962 60528 Hs.434232 NM_018127 ENSG00000006744 ELAC2 COXPD17|ELC2|HPC2 elaC ribonuclease Z 2 protein-coding 190.25-94 chr4 92983571 92984053 + 0.75 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 679413 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 166.75-53 chr14 87650435 87650670 + 0.75 NA intron (NR_146551, intron 1 of 2) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 4742 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 117.75-141 chr3 137805682 137805950 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 33905 NR_109987 100507274 Hs.360349 NR_109987 ENSG00000239513 LINC01210 - long intergenic non-protein coding RNA 1210 ncRNA 130.5-241 chr8 77510106 77510493 + 0.75 NA Intergenic CR1-16_AMi|LINE|CR1 59602 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 119.5-125 chr2 71754406 71754613 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 287810 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 148.25-55 chr17 75265843 75266214 + 0.75 NA TTS (NM_001363806) TTS (NM_001363806) -3665 NM_001172703 23163 Hs.87726 NM_014001 ENSG00000125447 GGA3 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3 protein-coding 155.75-96 chr21 24320550 24320829 + 0.75 NA intron (NR_109963, intron 1 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 688 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 124.75-100 chr18 3434987 3435178 + 0.75 NA intron (NM_001278686, intron 2 of 3) intron (NM_001278686, intron 2 of 3) -12460 NM_173207 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 188-27 chr15 62628811 62629295 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 16128 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 167.5-184 chr8 105148521 105148925 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -169715 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 258-56 chr8 72611443 72611992 + 0.75 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 74492 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 152.25-29 chr11 14812900 14813169 + 0.75 NA intron (NM_000922, intron 5 of 15) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 79171 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 213.5-95 chr4 160191614 160192009 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -414027 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 123-84 chr17 71104690 71104893 + 0.75 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 97388 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 129.75-6 chr1 54944092 54944346 + 0.75 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -36409 NM_182532 199964 Hs.663950 NM_182532 ENSG00000143001 TMEM61 - transmembrane protein 61 protein-coding 240.5-108 chr9 134269281 134269741 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 25886 NR_146518 105376310 Hs.573484 NR_146518 ENSG00000223729 LINC02247 - long intergenic non-protein coding RNA 2247 ncRNA 265-27 chr3 5077853 5078299 + 0.75 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -44216 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 113.75-66 chr14 87070911 87071101 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165228 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 150.5-153 chr4 93092971 93093258 + 0.75 NA intron (NM_001510, intron 3 of 15) intron (NM_001510, intron 3 of 15) -735639 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 151.25-30 chr11 48004467 48004793 + 0.75 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 24071 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 161.25-93 chr2 97837747 97838039 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 7 of 40) L1ME1|LINE|L1 103487 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 144.5-57 chr13 104173037 104173258 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 747947 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 120-182 chr7 104582701 104582914 + 0.75 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1ME2z|LINE|L1 221285 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 171.5-72 chr2 21725754 21726158 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15304 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 159.5-191 chr7 12638663 12638947 + 0.75 NA intron (NR_156701, intron 10 of 14) intron (NR_156701, intron 10 of 14) -48022 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 119.5-68 chr13 34881908 34882188 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60239 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 131.75-157 chr4 108460547 108460956 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -96482 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 137.75-55 chr14 26088713 26088994 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 464577 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 170-11 chr10 66838695 66839026 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -87176 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 187.25-18 chr10 114008010 114008312 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -35705 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 116.75-38 chr11 72274058 72274226 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -29966 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 149-27 chr13 109180367 109180632 + 0.75 NA intron (NM_015011, intron 34 of 34) intron (NM_015011, intron 34 of 34) -13196 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-153 chr4 75901995 75902255 + 0.75 NA intron (NM_006239, intron 1 of 16) intron (NM_006239, intron 1 of 16) 327 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 134.75-216 chr8 95041481 95041761 + 0.75 NA exon (NM_001354516, exon 6 of 11) exon (NM_001354516, exon 6 of 11) 16632 NM_152416 137682 Hs.435500 NM_152416 ENSG00000156170 NDUFAF6 C8orf38|MC1DN17 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6 protein-coding 208.5 chr1 10444126 10444464 + 0.75 NA intron (NM_001270517, intron 5 of 5) AluSx|SINE|Alu -5736 NM_001302 1325 Hs.412311 NM_001302 ENSG00000241563 CORT CST-14|CST-17|CST-29 cortistatin protein-coding 150.5-20 chr10 92693255 92693636 + 0.75 NA intron (NM_002729, intron 3 of 3) intron (NM_002729, intron 3 of 3) 3490 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 167.5-45 chr12 25580252 25580540 + 0.75 NA intron (NM_001352234, intron 1 of 8) MamRep1894|DNA|hAT -27113 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 332.5-24 chr6 4983438 4984245 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19975 NR_126015 100129461 Hs.131700 NR_126015 ENSG00000272142 LYRM4-AS1 - LYRM4 antisense RNA 1 ncRNA 133-37 chr13 41653189 41653450 + 0.75 NA intron (NM_015058, intron 37 of 44) L1P4|LINE|L1 -84924 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 114.5-65 chr12 28626859 28627042 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -436212 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 127-108 chr20 4554171 4554366 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -132188 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 141.75-36 chr11 68437671 68438073 + 0.75 NA intron (NM_002335, intron 19 of 22) intron (NM_002335, intron 19 of 22) -22880 NM_001352361 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 129.5-126 chr2 98781263 98781520 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9493 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 227.75-73 chr6 132839022 132839579 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22081 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 167.75-21 chr10 50817875 50818223 + 0.75 NA intron (NM_001370131, intron 7 of 11) intron (NM_001370131, intron 7 of 11) 67578 NM_001370131 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 135.75-54 chr14 48465737 48465980 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -670844 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 118.25-7 chr1 55822109 55822321 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 122748 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 187-13 chr10 44049608 44050015 + 0.75 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 137409 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 169.25-47 chr19 45685323 45685657 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 6463 NM_001369752 6633 Hs.515472 NM_004597 ENSG00000125743 SNRPD2 SMD2|SNRPD1|Sm-D2 small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide protein-coding 148-12 chr11 43083821 43084080 + 0.75 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 185419 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 131.75-76 chr15 79484341 79484656 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 51982 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 234.25-7 chr1 184933196 184933858 + 0.75 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 40981 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 205.5-75 chr2 126857740 126858219 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -40911 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 117.25-169 chr5 39445631 39445905 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20535 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 121-155 chr5 27922254 27922469 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 365304 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 145.75-55 chr16 68233471 68233689 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_106831) promoter-TSS (NR_106831) -81 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 134.5-84 chr16 73929488 73929789 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 285883 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 138.25-153 chr6 158486203 158486457 + 0.75 NA intron (NM_020245, intron 8 of 13) AluY|SINE|Alu -50106 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 188-59 chr6 35187272 35187619 + 0.75 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -26511 NM_001303136 222663 Hs.12923 NM_152753 ENSG00000146197 SCUBE3 CEGF3 signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 protein-coding 134.5-121 chr22 26072894 26073117 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96457 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 116.75-112 chr21 18156474 18156629 + 0.75 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -88282 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 226.25-35 chr2 54622487 54622919 + 0.75 NA intron (NM_178313, intron 8 of 30) intron (NM_178313, intron 8 of 30) 64309 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 189.5-160 chr9 69684300 69684576 + 0.75 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -12067 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 155.25-168 chr7 106179611 106180004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67231 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 144.25-129 chr3 43793037 43793335 + 0.75 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -101592 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 187-94 chr8 25346119 25346531 + 0.75 NA TTS (NR_106936) TTS (NR_106936) 923 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 234.25-82 chr9 105741315 105741900 + 0.75 NA intron (NM_018112, intron 4 of 5) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 47066 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 140-15 chr1 213542482 213542867 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -382075 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 141.75-73 chr17 57427948 57428156 + 0.75 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) LTR5B|LTR|ERVK 95545 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 223.5-110 chr6 117710787 117711333 + 0.75 NA TTS (NM_138459) TTS (NM_138459) 35591 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 133-161 chr7 107645695 107646027 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14967 NM_000441 5172 Hs.571246 NM_000441 ENSG00000091137 SLC26A4 DFNB4|EVA|PDS|TDH2B solute carrier family 26 member 4 protein-coding 167.5-60 chr14 68107600 68108101 + 0.75 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MB7|LINE|L1 284258 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 134.75-92 chr17 75365678 75365914 + 0.75 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) intron (NM_002086, intron 2 of 5) 39882 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 330.25-14 chr2 204330972 204331660 + 0.75 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -214159 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 141.25-158 chr6 85522727 85523036 + 0.75 NA intron (NM_001350538, intron 21 of 28) L2c|LINE|L2 70977 NM_153816 57231 Hs.485871 NM_020468 ENSG00000135317 SNX14 RGS-PX2|SCAR20 sorting nexin 14 protein-coding 248-30 chr17 66326661 66327173 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 24304 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 122.75-131 chr3 116908604 116908942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -12658 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 262.25-16 chr14 64027558 64027987 + 0.75 NA exon (NM_182914, exon 43 of 116) exon (NM_182914, exon 43 of 116) 67353 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 189.25-51 chr18 49144622 49145114 + 0.75 NA intron (NM_001353210, intron 14 of 16) AluJr|SINE|Alu -95100 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 123-183 chr8 84552918 84553111 + 0.75 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) 137530 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 186.25-36 chr15 67868757 67869065 + 0.75 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -28866 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 149.5-172 chr6 61873082 61873323 + 0.75 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) L1MEd|LINE|L1 299072 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 125.75-88 chr2 55859426 55859644 + 0.75 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 64247 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 191-25 chr14 50299487 50299883 + 0.75 NA TTS (NR_039726) TTS (NR_039726) 261 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 114.5-257 chr8 50095448 50095738 + 0.75 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) -68538 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 115.75-167 chr5 57492994 57493243 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10307 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 138.25-160 chr7 37720113 37720420 + 0.75 NA intron (NM_001329994, intron 3 of 3) intron (NM_001329994, intron 3 of 3) 36500 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 215.25-17 chr11 93843147 93843535 + 0.75 NA intron (NM_001144871, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 7277 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 114-92 chr22 25954488 25954723 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 38 of 43) MIR|SINE|MIR 212417 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 229.25-17 chr12 41474961 41475384 + 0.75 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 37433 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 137.75-10 chr1 173985590 173985830 + 0.75 NA intron (NM_001300852, intron 1 of 18) L1MA7|LINE|L1 7362 NM_001300851 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 252.5-7 chr10 31802391 31802779 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106341 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 138.75-38 chr12 49268581 49268870 + 0.75 NA intron (NM_032704, intron 1 of 3) intron (NM_032704, intron 1 of 3) 3643 NM_032704 84790 Hs.652390 NM_032704 ENSG00000167553 TUBA1C TUBA6|bcm948 tubulin alpha 1c protein-coding 121.75-114 chr3 32582890 32583183 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -12112 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 169.25-64 chr2 188749317 188749660 + 0.75 NA intron (NR_161166, intron 1 of 1) intron (NR_161166, intron 1 of 1) 40635 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 192.5-26 chr11 27456362 27456901 + 0.75 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) intron (NM_018490, intron 1 of 17) -15100 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 141.25-33 chr12 9126702 9127063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10653 NM_001347423 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 147.5-67 chr15 27409811 27410098 + 0.75 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) L1M4|LINE|L1 -248635 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-116 chr20 43538029 43538524 + 0.75 NA intron (NM_032107, intron 19 of 21) intron (NM_032107, intron 19 of 21) -20751 NM_170693 10110 Hs.300863 NM_016276 ENSG00000101049 SGK2 H-SGK2|dJ138B7.2 serum/glucocorticoid regulated kinase 2 protein-coding 246.25-59 chr6 146617646 146618073 + 0.75 NA intron (NM_024694, intron 1 of 35) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 18887 NM_024694 79747 Hs.720870 NM_024694 ENSG00000118492 ADGB C6orf103|CAPN16 androglobin protein-coding 224.75 chr1 21529481 21529883 + 0.75 NA intron (NM_001177520, intron 1 of 9) L1MEh|LINE|L1 20259 NM_001177520 249 Hs.75431 NM_000478 ENSG00000162551 ALPL AP-TNAP|APTNAP|HOPS|TNALP|TNAP|TNSALP alkaline phosphatase, biomineralization associated protein-coding 125-162 chr8 115085228 115085510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 582644 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 152.75-75 chr18 21276458 21276762 + 0.75 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 34368 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 197.25-52 chr2 116464692 116465067 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 1121064 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 171.25-62 chr17 59117223 59117685 + 0.75 NA intron (NM_001100595, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu -10574 NM_001320990 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 188.5-120 chr4 173413629 173413934 + 0.75 NA intron (NM_001329597, intron 2 of 3) intron (NM_001329597, intron 2 of 3) -14665 NM_007281 11341 Hs.7122 NM_007281 ENSG00000164106 SCRG1 SCRG-1 stimulator of chondrogenesis 1 protein-coding 167-72 chr21 34515170 34515556 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3153 NM_000219 3753 Hs.121495 NM_000219 ENSG00000180509 KCNE1 ISK|JLNS|JLNS2|LQT2/5|LQT5|MinK potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1 protein-coding 131-13 chr1 198790309 198790526 + 0.75 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 68565 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 228.25-21 chr14 21942675 21943071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271856 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 232-31 chr2 36017840 36018461 + 0.75 NA Intergenic (TGTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 337420 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 156-27 chr11 100860706 100861040 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 6 of 25) intron (NM_001367945, intron 6 of 25) -73401 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 141.5-201 chr6 134256536 134256765 + 0.75 NA intron (NM_001143676, intron 2 of 13) intron (NM_001143676, intron 2 of 13) 61408 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 120-101 chr20 38687541 38687870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -36781 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 117.75-85 chr18 12625932 12626242 + 0.75 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 30645 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 140.5-113 chr2 116532474 116532687 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1188765 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 144.5-18 chr1 180881911 180882308 + 0.75 NA intron (NR_137330, intron 12 of 12) intron (NR_137330, intron 12 of 12) -30788 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 202.5-139 chr7 94080305 94080716 + 0.75 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -76155 NR_133908 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 141-11 chr1 201715519 201715758 + 0.75 NA intron (NM_020443, intron 2 of 29) intron (NM_020443, intron 2 of 29) -3870 NR_049823 100847050 NR_049823 ENSG00000264802 MIR5191 - microRNA 5191 ncRNA 153.25 chr1 6302885 6303128 + 0.75 NA intron (NM_181866, intron 6 of 8) intron (NM_181866, intron 6 of 8) -41908 NM_207370 387509 Hs.531581 NM_207370 ENSG00000158292 GPR153 PGR1 G protein-coupled receptor 153 protein-coding 206.75-63 chr4 57375300 57375949 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -50248 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 200.25-79 chr3 159805020 159805455 + 0.75 NA intron (NM_001197113, intron 5 of 10) intron (NM_001197113, intron 5 of 10) -34624 NM_001197109 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 174.75-77 chr3 16131186 16131599 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -43288 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 141.75-123 chr3 193755150 193755549 + 0.75 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 88660 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 151.5-125 chr3 116371708 116372011 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 11835 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 148.5-161 chr4 20558615 20558924 + 0.75 NA intron (NM_001289135, intron 25 of 35) intron (NM_001289135, intron 25 of 35) 30494 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 140.25-28 chr10 110884908 110885207 + 0.75 NA intron (NM_001199492, intron 4 of 11) AluJr4|SINE|Alu -13033 NR_039828 100616113 NR_039828 ENSG00000284482 MIR4680 - microRNA 4680 ncRNA 149.75-156 chr7 68201373 68201629 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 181248 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 119.5-40 chr10 123306469 123306773 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 152219 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 159-89 chr5 54582503 54582890 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 64937 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 174.5-39 chr11 104306443 104306720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -142434 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 280.75-7 chr10 66528148 66528799 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -397563 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 223.75-4 chr1 189899600 189900001 + 0.75 NA Intergenic UCON1|Unknown|Unknown 576210 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 171.25-118 chr5 45319857 45320267 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) intron (NM_021072, intron 5 of 7) 376318 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 258.75-33 chr2 21232799 21233201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 109014 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 151.5-67 chr17 67013305 67013650 + 0.75 NA intron (NM_014405, intron 1 of 3) HAL1b|LINE|L1 -31077 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 112.5-164 chr3 5608597 5608805 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -358446 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 152.75-137 chr6 124603963 124604233 + 0.75 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 321093 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 202.75-63 chr2 224003684 224004071 + 0.75 NA intron (NM_006216, intron 1 of 8) intron (NM_006216, intron 1 of 8) 27601 NR_073116 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 184.75-30 chr14 85395370 85395930 + 0.75 NA intron (NR_102738, intron 1 of 1) L1PA13|LINE|L1 1735 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 141.5-63 chr15 71814767 71815222 + 0.75 NA TTS (NM_016346) TTS (NM_016346) 4440 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 120-9 chr1 179749949 179750267 + 0.75 NA intron (NM_001329719, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 6817 NM_001329718 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 115.5-78 chr15 65342910 65343185 + 0.75 NA intron (NM_004884, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 34955 NM_004884 9543 Hs.128292 NM_004884 ENSG00000174498 IGDCC3 HsT18880|PUNC immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3 protein-coding 149-9 chr1 203233364 203233647 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3832 NM_001256125 1118 Hs.201688 NM_003465 ENSG00000133063 CHIT1 CHI3|CHIT|CHITD chitinase 1 protein-coding 116.5-77 chr15 56691057 56691384 + 0.75 NA intron (NM_001002843, intron 6 of 20) intron (NM_001002843, intron 6 of 20) 42866 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 146.75-41 chr14 53258571 53258872 + 0.75 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 105367 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 116.75-172 chr6 64533236 64533428 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) L1MEf|LINE|L1 726496 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 119.5-56 chr11 112043153 112043353 + 0.75 NA intron (NM_001931, intron 7 of 13) intron (NM_001931, intron 7 of 13) 18439 NM_001931 1737 Hs.335551 NM_001931 ENSG00000150768 DLAT DLTA|E2|PDC-E2|PDCE2 dihydrolipoamide S-acetyltransferase protein-coding 189.75-25 chr13 33796592 33796887 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -21330 NM_181558 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 153.75-125 chr6 2457609 2457859 + 0.75 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -176766 NR_149119 105374885 NR_149118 LINC02521 - long intergenic non-protein coding RNA 2521 ncRNA 159-19 chr11 14144523 14144804 + 0.75 NA intron (NM_006108, intron 6 of 15) (AAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 181940 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 244.75-29 chr2 77802528 77803020 + 0.75 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) L3|LINE|CR1 -113160 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 245.75-60 chr8 52184332 52185024 + 0.75 NA intron (NM_014682, intron 8 of 25) intron (NM_014682, intron 8 of 25) -9684 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 118-159 chr5 153816841 153817049 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 82042 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 246.5-8 chr10 43453037 43453734 + 0.75 NA intron (NM_001355444, intron 1 of 3) MER67B|LTR|ERV1 16274 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 155.5-2 chr1 27951350 27951797 + 0.75 NA intron (NM_001009568, intron 3 of 6) AluJr4|SINE|Alu -7889 NM_018053 55113 Hs.55024 NM_018053 ENSG00000158156 XKR8 XRG8|hXkr8 XK related 8 protein-coding 124.25-19 chr1 213035930 213036191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15173 NM_001349671 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 163.25-66 chr2 125953076 125953411 + 0.75 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 164742 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 134-100 chr2 167294152 167294538 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 106973 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 143-36 chr14 62298040 62298478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158286 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 114.25-128 chr3 102146674 102146838 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -16949 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 195.25-91 chr8 42743466 42743852 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 25127 NM_001199279 8973 Hs.103128 NM_004198 ENSG00000147434 CHRNA6 CHNRA6 cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit protein-coding 121.5-61 chr12 62426734 62427010 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -39954 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 164-78 chr3 80825135 80825489 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 54608 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 152.25-87 chr2 103011403 103011628 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27086 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 134-21 chr10 75010625 75010875 + 0.75 NA intron (NM_001370144, intron 11 of 15) intron (NM_001370144, intron 11 of 15) -10983 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 142.25-86 chr2 52235001 52235208 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1PA6|LINE|L1 -135544 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 140.25-6 chr1 68835751 68836017 + 0.75 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -220014 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 150.5-19 chr10 75434611 75434888 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 3125 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 173.5-91 chr22 33344975 33345266 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 9 of 14) MIR|SINE|MIR 91549 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 126.25-3 chr1 23021041 23021341 + 0.75 NA intron (NM_015013, intron 1 of 18) intron (NM_015013, intron 1 of 18) 1723 NM_001363654 23028 Hs.591518 NM_015013 ENSG00000004487 KDM1A AOF2|BHC110|CPRF|KDM1|LSD1 lysine demethylase 1A protein-coding 201.5-31 chr11 27798095 27798577 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -76306 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 148.75-9 chr1 114223598 114223912 + 0.75 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -69886 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 121-39 chr11 47852099 47852370 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3690 NM_001318399 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 169-46 chr2 73466738 73467098 + 0.75 NA intron (NM_015120, intron 9 of 22) L1ME3|LINE|L1 9815 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 127.25-211 chr8 118072886 118073154 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 38799 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 135.25-95 chr2 54327084 54327333 + 0.75 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -3676 NM_001100396 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 165.75-99 chr20 42002850 42003336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -384716 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 161.25-92 chr2 81808020 81808315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -341221 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 146.5-10 chr1 79910569 79910972 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -624985 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 245.75-38 chr3 116225616 116226046 + 0.75 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -134193 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 189-19 chr10 73233926 73234328 + 0.75 NA intron (NM_173348, intron 10 of 13) intron (NM_173348, intron 10 of 13) 13128 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 166.5-69 chr14 83567290 83567549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 924787 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 131.5-125 chr2 161083161 161083445 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53652 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 158-101 chr3 132972818 132973119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65320 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 154-14 chr10 10896902 10897227 + 0.75 NA intron (NM_001326328, intron 2 of 15) MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 55099 NR_024411 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 177.5-65 chr18 40066438 40066713 + 0.75 NA non-coding (NR_110791, exon 1 of 4) non-coding (NR_110791, exon 1 of 4) 289 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 204.25-73 chr3 186159585 186160209 + 0.75 NA intron (NM_001346, intron 24 of 24) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -50808 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 160.25-19 chr12 5977742 5978195 + 0.75 NA intron (NM_000552, intron 42 of 51) L1MC5a|LINE|L1 -31736 NM_001278597 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 145.75-144 chr7 8252513 8252775 + 0.75 NA intron (NM_001350826, intron 1 of 14) intron (NM_001350826, intron 1 of 14) 9408 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 133.25-15 chr10 25361055 25361287 + 0.75 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L1MB2|LINE|L1 -184895 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 241.25-62 chr7 33788264 33788771 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -116398 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 121.5-213 chr5 145956118 145956427 + 0.75 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) AluSz|SINE|Alu 19694 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 177.5-48 chr14 71379902 71380295 + 0.75 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -18239 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 117.5-33 chr10 71007992 71008198 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 69042 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 210.25-67 chr6 78843877 78844235 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23495 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 216-69 chr5 163821058 163821546 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 315683 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 184-84 chr7 9543983 9544429 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -90064 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 224.5-77 chr3 173175680 173176065 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -34637 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 196.5-29 chr11 34147844 34148314 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 42450 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 199-9 chr10 32711434 32711733 + 0.75 NA intron (NM_001321115, intron 25 of 43) intron (NM_001321115, intron 25 of 43) 189889 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 131.5-189 chr5 53283740 53284138 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 174097 NR_104654 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 199.75-82 chr6 51465120 51465492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -156564 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 142.5-223 chr8 115302733 115303052 + 0.75 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 365121 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 158-83 chr2 193950324 193950595 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -393810 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 114.25-37 chr12 15669244 15669549 + 0.75 NA exon (NM_004447, exon 6 of 21) exon (NM_004447, exon 6 of 21) 119992 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 176.25-43 chr15 43886368 43886787 + 0.75 NA intron (NM_032892, intron 10 of 13) intron (NM_032892, intron 10 of 13) -8406 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 212.75-25 chr12 78495417 78495767 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -135846 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 207.75-16 chr11 22293189 22293681 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -44946 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 186.25-126 chr9 100943120 100943492 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -85421 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 193.75-127 chr9 20513426 20513824 + 0.75 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) MER54A|LTR|ERVL -11283 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 149-82 chr3 155860978 155861346 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6703 NM_001190992 9197 Hs.478031 NM_004733 ENSG00000169359 SLC33A1 ACATN|AT-1|AT1|CCHLND|SPG42 solute carrier family 33 member 1 protein-coding 132.75-92 chr19 29221580 29221864 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8571 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 123.25-90 chr19 56698963 56699297 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -27373 NM_001005850 90485 Hs.458438 NM_001005850 ENSG00000127903 ZNF835 BC37295_3 zinc finger protein 835 protein-coding 191.5-158 chrX 42862409 42862682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84382 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 154.25-100 chr20 55133482 55133744 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -289430 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 125.25-212 chr8 123583744 123584062 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42697 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 258.25-27 chr2 55504204 55504870 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15058 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 142-35 chr12 17096291 17096669 + 0.75 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 107733 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 171.25-114 chr4 135772356 135772768 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 115531 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 157.75-21 chr10 82602165 82602489 + 0.75 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -369407 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 133.25-226 chrX 51549522 51549772 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -42206 NR_110654 102723426 Hs.584513 NR_110654 LINC01496 - long intergenic non-protein coding RNA 1496 ncRNA 250.75-18 chr16 76405606 76406222 + 0.75 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) intron (NR_136213, intron 3 of 23) 96062 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 128.75-53 chr13 86548425 86548759 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -363328 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 137-126 chr4 151509295 151509619 + 0.75 NA intron (NM_001109977, intron 3 of 13) AluY|SINE|Alu 100281 NM_001348694 729830 Hs.633810 NM_001109977 ENSG00000164142 FAM160A1 - family with sequence similarity 160 member A1 protein-coding 161.75-57 chr2 24653062 24653494 + 0.75 NA intron (NM_001362950, intron 4 of 23) intron (NM_001362950, intron 4 of 23) 68801 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 170.25-127 chr5 59415033 59415267 + 0.75 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) L2b|LINE|L2 -58180 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 154.25-36 chr12 40635624 40635977 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56639 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 222.25-61 chr4 156615164 156615526 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 356454 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 146.75-67 chr18 12675801 12676091 + 0.75 NA intron (NM_001271989, intron 9 of 10) AluSx1|SINE|Alu 17207 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 156.75-35 chr11 63899996 63900333 + 0.75 NA intron (NM_001163296, intron 8 of 16) intron (NM_001163296, intron 8 of 16) 11627 NM_017490 2011 Hs.567261 NM_004954 ENSG00000072518 MARK2 EMK-1|EMK1|PAR-1|Par-1b|Par1b microtubule affinity regulating kinase 2 protein-coding 163.75-68 chr2 73285909 73286192 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1572 NM_001080410 150726 Hs.23158 NM_001080410 ENSG00000163013 FBXO41 FBX41 F-box protein 41 protein-coding 251.25-6 chr1 192374086 192374599 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 57350 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 283.25-21 chr2 171469071 171469538 + 0.75 NA intron (NM_001164821, intron 9 of 11) intron (NM_001164821, intron 9 of 11) -34501 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 139.75-125 chr3 157303351 157303593 + 0.75 NA intron (NM_001167911, intron 10 of 12) intron (NM_001167911, intron 10 of 12) -133378 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 130-162 chr8 21457580 21457865 + 0.75 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 159483 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 244-4 chr10 20163315 20163806 + 0.75 NA intron (NM_032812, intron 6 of 13) intron (NM_032812, intron 6 of 13) 347128 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 114.75-104 chr20 44353505 44353737 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2078 NM_001287182 3172 Hs.116462 NM_000457 ENSG00000101076 HNF4A FRTS4|HNF4|HNF4a7|HNF4a8|HNF4a9|HNF4alpha|MODY|MODY1|NR2A1|NR2A21|TCF|TCF14 hepatocyte nuclear factor 4 alpha protein-coding 147.75-133 chr6 10319734 10319973 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -84649 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 198.5-48 chr14 74667958 74668441 + 0.75 NA intron (NM_001039479, intron 15 of 19) intron (NM_001039479, intron 15 of 19) 44881 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 115.5-56 chr13 113183614 113183854 + 0.75 NA intron (NM_001127202, intron 9 of 13) intron (NM_001127202, intron 9 of 13) -24459 NM_001278513 8451 Hs.339735 NM_003589 ENSG00000139842 CUL4A - cullin 4A protein-coding 234.75-77 chr7 86700825 86701250 + 0.75 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 57123 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 148-140 chr9 106552518 106552843 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -48248 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 118-103 chr20 39845667 39845906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158675 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 129.75-167 chr7 14817962 14818275 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 23332 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 136.25-32 chr11 39097916 39098213 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 449206 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 118.25-59 chr13 100390793 100391009 + 0.75 NA intron (NR_148027, intron 20 of 23) L2|LINE|L2 90114 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 153.25-88 chr3 43724451 43724831 + 0.75 NA intron (NM_001355186, intron 7 of 7) L1MC5a|LINE|L1 -33047 NM_001346469 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 175.75-61 chr19 29967827 29968228 + 0.75 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) intron (NR_045557, intron 1 of 9) 25788 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 123.75-192 chr8 104980341 104980654 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -337941 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 131.75-118 chr20 52347290 52347556 + 0.75 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -155438 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 213.75-77 chr4 58102234 58102593 + 0.75 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu 433915 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 119-152 chr5 137848548 137848846 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19159 NM_006790 9499 Hs.84665 NM_006790 ENSG00000120729 MYOT LGMD1|LGMD1A|MFM3|TTID|TTOD myotilin protein-coding 127-105 chr2 174665770 174666009 + 0.75 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) 17010 NM_001077269 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 154-95 chr3 107307087 107307371 + 0.75 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) MER39B|LTR|ERV1 66537 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 192.75-100 chr4 86265439 86265919 + 0.75 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) intron (NM_001363657, intron 2 of 13) 88965 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 113.25-45 chr14 58753709 58753955 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -74456 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 135.75-17 chr10 17550073 17550342 + 0.75 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 67167 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 126.5-226 chr7 49850470 49850813 + 0.75 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) intron (NR_136188, intron 2 of 3) 75308 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 192.5-24 chr10 126866828 126867236 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38377 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 123.75-24 chr11 45095495 45095864 + 0.75 NA intron (NM_001359633, intron 1 of 7) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 1666 NM_001359633 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 244.5-100 chr8 126051603 126052136 + 0.75 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -100672 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 119.25-61 chr15 57419353 57419567 + 0.75 NA intron (NM_032866, intron 1 of 18) L1MC3|LINE|L1 42955 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 124.5-162 chr5 34799249 34799532 + 0.75 NA intron (NM_015577, intron 4 of 17) intron (NM_015577, intron 4 of 17) -39774 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 190.25-4 chr1 95915973 95916351 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -75906 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 116.75-202 chr8 121086388 121086594 + 0.75 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -274445 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 146-46 chr15 95546144 95546436 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 113197 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 139-38 chr14 52945906 52946232 + 0.75 NA intron (NM_006832, intron 2 of 14) AluSx4|SINE|Alu 4981 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 121.25-127 chr3 21272833 21273028 + 0.75 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -132796 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 153.5-172 chr6 110735360 110735569 + 0.75 NA intron (NM_001300963, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 -79157 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 168-37 chr12 39496308 39496717 + 0.75 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -53392 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 135-152 chr6 34878159 34878529 + 0.75 NA TTS (NM_017754) TTS (NM_017754) 9698 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 173-94 chr4 62490165 62490521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -328578 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 203.75-40 chr16 3029722 3030186 + 0.75 NA intron (NM_001103175, intron 4 of 8) intron (NM_001103175, intron 4 of 8) -2527 NR_047572 100128770 Hs.666223 NR_047572 ENSG00000205890 LOC100128770 - uncharacterized LOC100128770 ncRNA 144.5-4 chr1 23291374 23291693 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6015 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 264-33 chr2 59225190 59225721 + 0.75 NA intron (NR_110219, intron 1 of 2) intron (NR_110219, intron 1 of 2) 7747 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 152-85 chr2 63351399 63351780 + 0.75 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) L1PA16|LINE|L1 86418 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 134.5-10 chr1 82212548 82212928 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 410285 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 187.5-162 chr8 25867011 25867481 + 0.75 NA intron (NM_022659, intron 10 of 15) intron (NM_022659, intron 10 of 15) 178167 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 141-113 chr4 53580244 53580537 + 0.75 NA intron (NM_001126328, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 11096 NM_001126328 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 129.75-142 chr5 26558878 26559080 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 479607 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 164.25-83 chr20 39123692 39124008 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100898 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 162.75-136 chr7 107283045 107283293 + 0.75 NA intron (NM_181733, intron 13 of 20) MIR1_Amn|SINE|MIR 114166 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 147-161 chrX 30921511 30921789 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32396 NM_152787 257397 Hs.188256 NM_152787 ENSG00000157625 TAB3 MAP3K7IP3|NAP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 3 protein-coding 133.25-84 chr18 57561830 57562123 + 0.75 NA intron (NM_001371095, intron 7 of 11) intron (NM_001371095, intron 7 of 11) 24726 NM_001012515 2235 Hs.365365 NM_000140 ENSG00000066926 FECH EPP|EPP1|FCE ferrochelatase protein-coding 189.5-152 chr8 126566093 126566526 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7831 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 244-38 chr3 197256149 197256638 + 0.75 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) 37555 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 186.25-68 chr3 70031975 70032313 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32400 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 171.75-50 chr15 53375559 53375884 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 165131 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 133.75-77 chr17 44680495 44680762 + 0.75 NA exon (NM_144609, exon 4 of 5) exon (NM_144609, exon 4 of 5) 9148 NM_144609 124808 Hs.579115 NM_144609 ENSG00000180329 CCDC43 - coiled-coil domain containing 43 protein-coding 198-79 chr8 104687344 104687666 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98481 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 139-73 chr2 55660301 55660698 + 0.75 NA intron (NM_033109, intron 14 of 27) intron (NM_033109, intron 14 of 27) 33345 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 133.25-185 chr6 63787787 63788039 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 39 of 43) AluSp|SINE|Alu -18923 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 123.5-184 chr6 22269786 22270036 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 27125 NM_000948 5617 Hs.1905 NM_000948 ENSG00000172179 PRL GHA1 prolactin protein-coding 235-33 chr2 161781283 161781745 + 0.75 NA intron (NM_001354453, intron 2 of 24) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 157098 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 257.5-6 chr10 26738393 26738901 + 0.75 NA intron (NM_014317, intron 10 of 11) intron (NM_014317, intron 10 of 11) 40946 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 183.25-37 chr14 86433466 86433805 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -472143 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 140-142 chr5 135609676 135609938 + 0.75 NA intron (NM_001349335, intron 1 of 10) L1ME4b|LINE|L1 -30528 NM_004887 9547 Hs.483444 NM_004887 ENSG00000145824 CXCL14 BMAC|BRAK|KEC|KS1|MIP-2g|MIP2G|NJAC|SCYB14 C-X-C motif chemokine ligand 14 protein-coding 203.5-109 chr4 95729173 95729715 + 0.75 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -110649 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 214.25-54 chr3 13590910 13591326 + 0.75 NA intron (NM_001004019, intron 2 of 17) L1ME3|LINE|L1 22378 NM_001165035 2199 Hs.198862 NM_001998 ENSG00000163520 FBLN2 - fibulin 2 protein-coding 146.25-6 chr1 199158339 199158655 + 0.75 NA intron (NR_147896, intron 1 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9899 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 120.5-179 chr5 45155953 45156189 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 347124 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 191.5-160 chrX 86691455 86691919 + 0.75 NA intron (NM_001139515, intron 4 of 11) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 428719 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 143-16 chr11 18058631 18058866 + 0.75 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -17960 NM_004179 7166 Hs.591999 NM_004179 ENSG00000129167 TPH1 TPRH|TRPH tryptophan hydroxylase 1 protein-coding 123.75-200 chr9 29783825 29784045 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -570334 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 206-45 chr2 181112252 181112652 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11385 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 117-53 chr14 45174636 45174963 + 0.75 NA intron (NM_001308133, intron 12 of 21) L2c|LINE|L2 38860 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 137.5-122 chr2 88614623 88614938 + 0.75 NA intron (NM_004836, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 10149 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 137.25-62 chr18 57128295 57128631 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18624 NM_001257964 284257 Hs.127882 NM_001257964 ENSG00000228075 BOD1L2 BOD1P|FAM44C biorientation of chromosomes in cell division 1 like 2 protein-coding 242.75-75 chr8 142142535 142143128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33508 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 125.5-158 chr22 24228945 24229241 + 0.75 NA intron (NM_001099781, intron 6 of 11) AluSq2|SINE|Alu 16049 NM_001099781 2687 Hs.437156 NM_004121 ENSG00000099998 GGT5 GGL|GGT 5|GGT-REL|GGTLA1 gamma-glutamyltransferase 5 protein-coding 136.5-148 chr3 79553235 79553453 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 45457 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 134.5-86 chr16 83411903 83412108 + 0.75 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -96341 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 286.5-39 chr22 29103119 29103726 + 0.75 NA intron (NM_001039570, intron 3 of 8) intron (NM_001039570, intron 3 of 8) 30387 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 122.25-189 chr8 85045591 85045958 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -61464 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 117.5-18 chr1 210792309 210792626 + 0.75 NA intron (NM_002238, intron 9 of 10) L2c|LINE|L2 340907 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 208-51 chr22 36385610 36385972 + 0.75 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) intron (NM_002473, intron 1 of 40) 2276 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 252-52 chr5 44575502 44576151 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -65544 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 158-52 chr14 74813506 74813807 + 0.75 NA intron (NM_019589, intron 11 of 20) L1PA17|LINE|L1 50178 NM_001080408 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 144-81 chr3 40006487 40006775 + 0.75 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) intron (NM_001284424, intron 2 of 15) -93380 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 135.75-24 chr10 58325765 58326098 + 0.75 NA non-coding (NR_158219, exon 1 of 1) non-coding (NR_158219, exon 1 of 1) 3748 NR_158219 112268068 Hs.586671 NR_158219 LOC112268068 - uncharacterized LOC112268068 ncRNA 210-100 chr8 129589115 129589524 + 0.75 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -14301 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 131.25-96 chr2 22271002 22271275 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -265341 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 182-42 chr16 63157037 63157432 + 0.75 NA Intergenic MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR -1120796 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 138.75-134 chr4 182618182 182618460 + 0.75 NA intron (NM_001080477, intron 4 of 27) intron (NM_001080477, intron 4 of 27) 298932 NM_001351743 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 134.75-17 chr1 212986081 212986314 + 0.75 NA intron (NM_001301056, intron 7 of 7) intron (NM_001301056, intron 7 of 7) 29312 NM_001300755 90806 Hs.157078 NM_144567 ENSG00000174606 ANGEL2 Ccr4d|KIAA0759L angel homolog 2 protein-coding 259-42 chrX 62804366 62804759 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 546770 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 171.25-64 chr17 61167333 61167722 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 200177 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 210.75-60 chr3 116725333 116725783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15770 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 128-81 chr2 126807959 126808194 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -90814 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 183-113 chr8 113068212 113068499 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 308797 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 130.75-115 chr3 56519729 56520105 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37239 NR_148376 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 178-109 chr9 104857667 104858050 + 0.75 NA intron (NM_005502, intron 7 of 49) intron (NM_005502, intron 7 of 49) 70297 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 148.5-59 chr14 51696939 51697186 + 0.75 NA intron (NM_001042481, intron 3 of 14) L1MA8|LINE|L1 -20221 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 124.25-176 chr6 39171231 39171477 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -56168 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 148-21 chr13 47903058 47903403 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 29392 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 250.5-34 chr15 68124932 68125493 + 0.75 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) HAL1|LINE|L1 70636 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 243.75-33 chr16 63563708 63564255 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -1527543 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 151.25-89 chr2 108839051 108839478 + 0.75 NA exon (NM_001351544, exon 11 of 15) exon (NM_001351544, exon 11 of 15) 52493 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 141-72 chr2 44998197 44998544 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 11082 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 175.5-27 chr10 123129911 123130236 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5897 NM_001105574 340784 Hs.531194 NM_001105574 ENSG00000188620 HMX3 NKX-5.1|NKX5.1|Nkx5-1 H6 family homeobox 3 protein-coding 128.25-210 chr8 116311089 116311272 + 0.75 NA intron (NR_046215, intron 1 of 13) intron (NR_046215, intron 1 of 13) 13879 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 130.25-215 chr9 33154329 33154554 + 0.75 NA intron (NM_001497, intron 1 of 5) L1M4|LINE|L1 -12507 NR_108110 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 294.25-5 chr10 51112372 51113165 + 0.75 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) intron (NM_006258, intron 1 of 17) 38281 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 131.25-93 chr19 29300989 29301344 + 0.75 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) MIRb|SINE|MIR -88015 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 259.5-2 chr1 25827597 25827997 + 0.75 NA intron (NM_001099627, intron 5 of 6) AluSz6|SINE|Alu -4191 NR_024498 646471 Hs.727271 NR_024498 LOC646471 - uncharacterized LOC646471 ncRNA 118.75-76 chr17 42363936 42364111 + 0.75 NA intron (NM_213662, intron 1 of 23) intron (NM_213662, intron 1 of 23) 24419 NM_001369518 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 258.25-33 chr20 61717670 61718148 + 0.75 NA non-coding (NR_147702, exon 2 of 2) non-coding (NR_147702, exon 2 of 2) 1839 NR_147702 100128310 Hs.683806 NR_147702 ENSG00000179253 LOC100128310 - uncharacterized LOC100128310 ncRNA 248.5-11 chr10 72830574 72830983 + 0.75 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) L1M7|LINE|L1 -62961 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 165.75-111 chr3 37169071 37169497 + 0.75 NA intron (NM_001348298, intron 2 of 21) L1MB3|LINE|L1 5298 NM_006309 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 129.25-164 chr6 23961087 23961348 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -164998 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 117-140 chr5 4198400 4198712 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -574925 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 154.5-7 chr1 84958498 84958813 + 0.75 NA exon (NM_001330647, exon 4 of 15) exon (NM_001330647, exon 4 of 15) 38458 NM_001330647 255231 Hs.591446 NM_153259 ENSG00000153898 MCOLN2 TRP-ML2|TRPML2 mucolipin 2 protein-coding 161.25-188 chrX 46779609 46779878 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20625 NM_032591 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 116.75-185 chr7 53950323 53950584 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -138522 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 130.75-52 chr14 47537662 47537905 + 0.75 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 137171 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 261.5-40 chr3 4582445 4583002 + 0.75 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 89375 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 178-82 chr5 138549454 138549707 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -6344 NM_004730 2107 Hs.483494 NM_004730 ENSG00000120705 ETF1 D5S1995|ERF|ERF1|RF1|SUP45L1|TB3-1 eukaryotic translation termination factor 1 protein-coding 123.25-143 chr3 188751893 188752211 + 0.75 NA intron (NM_001167672, intron 6 of 9) intron (NM_001167672, intron 6 of 9) 63271 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 220.25-77 chr8 129818366 129818716 + 0.75 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -31917 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 131-21 chr10 74993680 74993986 + 0.75 NA intron (NM_001370144, intron 11 of 15) L1MC4a|LINE|L1 -27900 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 128.25-123 chr22 46676440 46676682 + 0.75 NA intron (NM_001366660, intron 17 of 17) intron (NM_001366660, intron 17 of 17) 56175 NM_015124 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 201.25-72 chr4 173210580 173210991 + 0.75 NA intron (NM_017423, intron 1 of 11) intron (NM_017423, intron 1 of 11) -41133 NR_134241 101930370 Hs.563191 NR_134241 ENSG00000245213 LOC101930370 - uncharacterized LOC101930370 ncRNA 176.5-172 chr8 118582222 118582480 + 0.75 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) intron (NR_109794, intron 1 of 4) -38650 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 143.5-120 chr2 118672398 118672650 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -69558 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 127.5-216 chr6 148691503 148691782 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55388 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 130.5-227 chr7 55185191 55185560 + 0.75 NA intron (NR_047551, intron 1 of 1) intron (NR_047551, intron 1 of 1) 3574 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 261.5-47 chr4 42236337 42236790 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83908 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 144.75-10 chr1 181635269 181635606 + 0.75 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) intron (NM_001205293, intron 6 of 47) 151920 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 156.5-176 chr7 90190656 90190965 + 0.75 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) LOR1-int|LTR|ERV1 20825 NR_110029 100874100 Hs.573339 NR_110029 ENSG00000227646 STEAP2-AS1 - STEAP2 antisense RNA 1 ncRNA 153.5-208 chr8 140316446 140316732 + 0.75 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) L1MA6|LINE|L1 141155 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 225-17 chr11 101467329 101467684 + 0.75 NA intron (NM_004621, intron 10 of 12) MIR|SINE|MIR 52399 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 208.25-91 chr8 110880198 110880680 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146994 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 115.5-203 chr5 85569378 85569575 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -712968 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 128-37 chr13 74293498 74293783 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 62196 NR_144451 100507612 Hs.447508 NR_144451 ENSG00000235532 LINC00402 - long intergenic non-protein coding RNA 402 ncRNA 178.25-116 chr8 74581479 74581744 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -18255 NR_033830 441355 Hs.647162 NR_033830 ENSG00000254349 MIR2052HG - MIR2052 host gene ncRNA 162.75-135 chr7 98692321 98692817 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 75284 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 142-108 chr3 118217970 118218212 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -423677 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 116.25-156 chr3 184720783 184720975 + 0.75 NA intron (NR_160768, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 8636 NR_160768 107986163 NR_160768 LOC107986163 - uncharacterized LOC107986163 ncRNA 164.25-78 chr2 226447640 226447961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 210993 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 123.5-187 chr6 64735769 64736005 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -565531 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 175.5-44 chr13 37872586 37872863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2299 NM_003306 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 173.5-57 chr17 78289138 78289429 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10791 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 168-3 chr1 53032218 53032555 + 0.75 NA intron (NM_001007250, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 17448 NM_001007250 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 135-37 chr13 84375258 84375498 + 0.75 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) L1M3|LINE|L1 234776 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 117.25-109 chr2 64705577 64705853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -51802 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 169.5-112 chr3 84476537 84476850 + 0.75 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 392882 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 178.75-54 chr21 22518331 22518621 + 0.75 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 419859 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 176.25-142 chr8 138716574 138716890 + 0.75 NA intron (NM_152888, intron 28 of 64) L2c|LINE|L2 197309 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 197.75-60 chr4 100972291 100972642 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 268406 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 180.75-109 chr4 133341528 133341900 + 0.75 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 192420 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 126.75-167 chr4 41918076 41918319 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -17232 NM_018126 55161 Hs.31082 NM_018126 ENSG00000109133 TMEM33 1600019D15Rik|Pom33|SHINC-3|SHINC3 transmembrane protein 33 protein-coding 206.25-30 chr12 108061456 108061763 + 0.75 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -67679 NM_014653 9671 Hs.143591 NM_014653 ENSG00000075035 WSCD2 - WSC domain containing 2 protein-coding 151.5-119 chr3 64699584 64699971 + 0.75 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) MLT2B4|LTR|ERVL -11777 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 118.5-77 chr18 4940859 4941152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -140177 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 134.75-72 chr14 88759756 88760013 + 0.75 NA intron (NM_183387, intron 1 of 42) L1MEf|LINE|L1 33069 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 204.75-127 chr9 69905644 69905926 + 0.75 NA intron (NM_001308086, intron 5 of 5) intron (NM_001308086, intron 5 of 5) 84968 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 131.5-181 chr4 100167213 100167532 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -22661 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 187.5-123 chr4 42952772 42953129 + 0.75 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) MamRep605|LTR?|LTR? 59684 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 149.25-102 chr21 27638603 27638878 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83639 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 144-26 chr11 17806104 17806321 + 0.75 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 70264 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 140.75-185 chr8 116582530 116582944 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -69363 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 230-34 chr2 102173997 102174487 + 0.75 NA intron (NM_001320978, intron 9 of 11) intron (NM_001320978, intron 9 of 11) -12731 NM_001351448 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 206.75-58 chr3 149527118 149527601 + 0.75 NA intron (NM_001348362, intron 8 of 9) AluSp|SINE|Alu 52662 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 227-22 chr14 65591315 65591820 + 0.75 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) intron (NM_178156, intron 2 of 9) 120465 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 162.5-20 chr10 89101136 89101493 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -37903 NR_039827 100616192 NR_039827 ENSG00000265375 MIR4679-2 - microRNA 4679-2 ncRNA 135-137 chr5 14923175 14923424 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -51521 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 139-157 chr9 78861318 78861737 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 284139 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 145.5-28 chr10 104710030 104710323 + 0.75 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -43960 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 123-169 chr6 49008765 49008995 + 0.75 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 454373 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 202.25 chr1 37675976 37676325 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 14379 NM_001303031 54955 Hs.272673 NM_017850 ENSG00000116922 C1orf109 - chromosome 1 open reading frame 109 protein-coding 146.25-31 chr14 22500100 22500341 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -17261 NR_148361 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 228-42 chr20 5601147 5601629 + 0.75 NA intron (NM_019593, intron 2 of 19) AluSx|SINE|Alu 9618 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 168-81 chr3 63644420 63644707 + 0.75 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -8112 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 126.25-100 chr20 39640496 39640731 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -363848 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 115.25-37 chr11 73172773 73172966 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -30551 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 159.25-22 chr10 126109675 126109973 + 0.75 NA exon (NM_021641, exon 7 of 19) exon (NM_021641, exon 7 of 19) -136551 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 122.25-109 chr20 33259720 33259970 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -23369 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 140.25-168 chr6 118734903 118735179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24966 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 129-86 chr2 8825491 8825725 + 0.75 NA intron (NM_001348732, intron 2 of 28) intron (NM_001348732, intron 2 of 28) 12005 NM_001348734 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 129.5-66 chr14 52104267 52104505 + 0.75 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -35327 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 199-8 chr10 12789491 12789917 + 0.75 NA intron (NM_001351032, intron 7 of 11) MIR|SINE|MIR -64351 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 194.25-48 chr17 64426977 64427368 + 0.75 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -21943 NM_001369493 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 123.75-139 chr4 96382290 96382543 + 0.75 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 71713 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 194.25-107 chr7 72022780 72023294 + 0.75 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 314354 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 185-24 chr15 89845213 89845554 + 0.75 NA intron (NR_023361, intron 5 of 6) intron (NR_023361, intron 5 of 6) 5338 NR_049817 100847059 NR_049817 ENSG00000264966 MIR5094 - microRNA 5094 ncRNA 226.25-32 chr17 8306321 8306783 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3689 NM_173728 22899 Hs.443109 NM_025014 ENSG00000198844 ARHGEF15 ARGEF15|E5|Ephexin5|Vsm-RhoGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 15 protein-coding 167.5-139 chr5 28411680 28412061 + 0.75 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -124205 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 212.75-30 chr14 41465902 41466282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -140764 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 129.5-118 chr2 60657302 60657609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -98813 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 191.75-40 chr15 58546388 58546743 + 0.75 NA intron (NM_000236, intron 5 of 8) intron (NM_000236, intron 5 of 8) -47830 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 152-141 chr7 39116203 39116507 + 0.75 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu -102788 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 164.5-216 chr8 135445797 135446247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11434 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 168.5-38 chr11 82618152 82618454 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115561 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 132.75-204 chr9 99482608 99482824 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -107459 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 219 chr1 38252111 38252608 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -37592 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 236.75-48 chr6 61809785 61810405 + 0.75 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) intron (NR_146874, intron 6 of 13) 235965 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 196.75-5 chr1 76261358 76261670 + 0.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 186768 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 158.5-179 chr7 41128200 41128519 + 0.75 NA intron (NR_110832, intron 4 of 5) LTR33A_|LTR|ERVL 26755 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 211.5-104 chr3 133465823 133466154 + 0.75 NA intron (NR_135276, intron 1 of 4) L1ME4b|LINE|L1 -10212 NR_135278 85003 Hs.659202 NR_135276 ENSG00000249993 BFSP2-AS1 - BFSP2 antisense RNA 1 ncRNA 147.25-91 chr3 155059327 155059547 + 0.75 NA intron (NM_001354642, intron 1 of 22) MIR|SINE|MIR -20235 NM_000902 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 118.25-14 chr1 110096411 110096651 + 0.75 NA intron (NR_126382, intron 1 of 3) intron (NR_126382, intron 1 of 3) 13843 NR_126382 104355139 Hs.628193 NR_126382 ENSG00000258673 LINC01397 - long intergenic non-protein coding RNA 1397 ncRNA 242.25-72 chr5 160285721 160286091 + 0.75 NA intron (NR_131769, intron 2 of 7) intron (NR_131769, intron 2 of 7) 26658 NM_024565 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 240.5-68 chr3 116616489 116616934 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64238 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 141-75 chr2 97983104 97983456 + 0.75 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) LTR3B_|LTR|ERVK 12668 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 205.5-89 chr21 21717168 21717471 + 0.75 NA Intergenic (ACTATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20000 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 132.25-72 chr16 77565169 77565421 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -130261 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 113-55 chr12 118363402 118363616 + 0.75 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) -3804 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 229.5-57 chr19 46471089 46471681 + 0.75 NA 5' UTR (NM_001103149, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_001103149, exon 1 of 3) 178 NM_001103149 55228 Hs.8395 NM_018215 ENSG00000182013 PNMA8A PNMAL1 PNMA family member 8A protein-coding 156.25-77 chr2 169407566 169407821 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -45159 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 149.5-160 chr5 128359499 128359877 + 0.75 NA intron (NM_001999, intron 19 of 64) intron (NM_001999, intron 19 of 64) 178557 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 182.75-105 chr5 87305964 87306285 + 0.75 NA intron (NM_022650, intron 1 of 24) L1PA13|LINE|L1 17504 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 191-2 chr1 88262293 88262684 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -421656 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 145.25-163 chr7 46885016 46885234 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -188003 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 133.25-40 chr12 29458337 29458644 + 0.75 NA intron (NM_001353179, intron 19 of 25) L1MA3|LINE|L1 41203 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 133.5-204 chr5 42422001 42422357 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -1260 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 198.5-55 chr16 27465786 27466259 + 0.75 NA intron (NM_001520, intron 32 of 36) intron (NM_001520, intron 32 of 36) -12629 NR_037158 283888 Hs.660935 NR_037158 ENSG00000259954 IL21R-AS1 - IL21R antisense RNA 1 ncRNA 221.5-11 chr11 25398771 25399280 + 0.75 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -790098 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 156.75-40 chr12 22197532 22197996 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001304450, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001304450, exon 4 of 4) 136950 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 165-84 chr22 22112000 22112323 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -68227 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 145.25-98 chr3 27120246 27120513 + 0.75 NA intron (NM_001304384, intron 13 of 16) AluSx1|SINE|Alu 96144 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 166.75 chr1 45358917 45359248 + 0.75 NA intron (NM_007170, intron 4 of 10) intron (NM_007170, intron 4 of 10) -18612 NM_001293190 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 236-51 chr4 124714894 124715420 + 0.75 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -2425 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 219.5-67 chr2 69697818 69698293 + 0.75 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -44079 NM_001153 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 132.75-62 chr14 61522074 61522261 + 0.75 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) L2c|LINE|L2 48027 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 117.75-132 chr3 39714612 39714932 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -94142 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 238.5-22 chr13 68936962 68937344 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -51828 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 120.25-69 chr16 24824670 24824942 + 0.75 NA 3' UTR (NM_001351850, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001351850, exon 24 of 24) -21057 NM_001258414 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 205-27 chr17 74689704 74690313 + 0.75 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 18877 NM_175738 326624 Hs.351413 NM_175738 ENSG00000172794 RAB37 - RAB37, member RAS oncogene family protein-coding 306.25-29 chr4 37506995 37507620 + 0.75 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) L1M1|LINE|L1 53382 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 216.25-84 chr5 11863275 11863704 + 0.75 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 40957 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 114-93 chr22 29450453 29450665 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -8430 NR_002727 10740 Hs.167750 NR_002727 RFPL1S NCRNA00006|RFPL1-AS|RFPL1-AS1|RFPL1AS RFPL1 antisense RNA 1 ncRNA 114.25-210 chrX 46191276 46191455 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 136309 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 112.25-221 chr8 125424488 125424696 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5766 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 112.5-12 chr1 183024312 183024561 + 0.75 NA intron (NM_002293, intron 1 of 27) intron (NM_002293, intron 1 of 27) 1016 NM_002293 3915 Hs.609663 NM_002293 ENSG00000135862 LAMC1 LAMB2 laminin subunit gamma 1 protein-coding 174-33 chr15 68464687 68465090 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32725 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 205-31 chr2 10473201 10473478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 23611 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 160.5-9 chr1 222748906 222749172 + 0.75 NA non-coding (NR_136691, exon 5 of 6) non-coding (NR_136691, exon 5 of 6) 9355 NM_001324080 400823 Hs.697608 NM_207468 ENSG00000197520 FAM177B - family with sequence similarity 177 member B protein-coding 124.5-191 chr6 73075299 73075670 + 0.75 NA intron (NM_001160132, intron 3 of 13) AluSc5|SINE|Alu 68030 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 115-30 chr11 45840600 45840859 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -6389 NM_001127457 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 343.25-10 chr2 62525283 62525965 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -19429 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 251.25-49 chr7 11578112 11578694 + 0.75 NA intron (NM_015204, intron 4 of 26) intron (NM_015204, intron 4 of 26) 253795 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 120-204 chrX 8376304 8376511 + 0.75 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -88423 NM_001001888 425054 Hs.279737 NM_001001888 ENSG00000205642 VCX3B VCX-C|VCXC variable charge X-linked 3B protein-coding 147.25-117 chr6 34898379 34898910 + 0.75 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) L1ME4a|LINE|L1 9389 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 168-28 chr11 103402613 103402994 + 0.75 NA intron (NM_001377, intron 84 of 88) intron (NM_001377, intron 84 of 88) 293377 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 152.5-106 chr22 25203807 25204044 + 0.75 NA intron (NM_004076, intron 4 of 5) intron (NM_004076, intron 4 of 5) 4067 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 136.25-20 chr10 78351394 78351632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 84171 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 221-7 chr10 25981737 25982103 + 0.75 NA intron (NM_001368265, intron 4 of 7) L1PBa|LINE|L1 47691 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 140-158 chr7 39573751 39574173 + 0.75 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) 7558 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 133.5-7 chr1 54859524 54859900 + 0.75 NA intron (NM_014762, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 27483 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 160.25-56 chr17 74526191 74526449 + 0.75 NA intron (NM_174892, intron 1 of 3) intron (NM_174892, intron 1 of 3) 5155 NM_174892 124599 Hs.313343 NM_174892 ENSG00000178789 CD300LB CD300b|CLM-7|CLM7|CMRF35-A2|IREM-3|IREM3|TREM-5|TREM5 CD300 molecule like family member b protein-coding 123.75-56 chr14 37946027 37946324 + 0.75 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -44051 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 122-44 chr11 116315632 116315847 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -323683 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 118.75-11 chr1 184774207 184774479 + 0.75 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -19485 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 113.25-156 chr7 41489227 41489461 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -204575 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 117.5-84 chr17 62665082 62665346 + 0.75 NA intron (NM_006039, intron 2 of 29) AluSz|SINE|Alu 37544 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 230.25-21 chr12 48218789 48219293 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -15749 NM_001004134 121275 Hs.446790 NM_001004134 ENSG00000172640 OR10AD1 OR10AD1P|OR12-1 olfactory receptor family 10 subfamily AD member 1 protein-coding 133-113 chr3 194343434 194343665 + 0.75 NA intron (NM_001080513, intron 1 of 1) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 7779 NM_001080513 1370 Hs.528368 NM_001309 ENSG00000178772 CPN2 ACBP carboxypeptidase N subunit 2 protein-coding 140.75-6 chr1 109802117 109802510 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -38390 NM_024526 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 122.5-121 chr2 186966513 186966711 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117442 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 140.25-114 chr3 20692354 20692682 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 350050 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 113-56 chr12 124320780 124320960 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16372 NR_106940 102466204 NR_106940 ENSG00000275967 MIR6880 hsa-mir-6880 microRNA 6880 ncRNA 123.75-132 chr4 30452728 30453021 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -267495 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 143.5-9 chr1 109064255 109064656 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005645, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_005645, exon 4 of 4) 11548 NM_005645 6884 Hs.632426 NM_005645 ENSG00000197780 TAF13 MRT60|TAF(II)18|TAF2K|TAFII-18|TAFII18 TATA-box binding protein associated factor 13 protein-coding 116.75-178 chr6 156159159 156159492 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 212528 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 127.5-5 chr1 30510828 30511047 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207835 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 139-128 chr6 56355294 56355576 + 0.75 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) L1MC5|LINE|L1 38693 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 207.25 chr1 45557804 45558226 + 0.75 NA intron (NM_001202414, intron 3 of 10) AluSz|SINE|Alu 7189 NM_006066 10327 Hs.474584 NM_006066 ENSG00000117448 AKR1A1 ALDR1|ALR|ARM|DD3|HEL-S-6 aldo-keto reductase family 1 member A1 protein-coding 247.75-7 chr12 50452843 50453308 + 0.75 NA intron (NM_001352308, intron 8 of 14) AluJo|SINE|Alu -3496 NR_132753 106633800 NR_132753 SNORD133 ZL142|ZL42|ggn68 small nucleolar RNA, C/D box 133 snoRNA 200-38 chr17 61429916 61430250 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 18332 NR_160788 388407 Hs.434459 NM_203425 C17orf82 - chromosome 17 open reading frame 82 ncRNA 155.25-81 chr17 53752425 53752739 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -70345 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 130.25-200 chr8 88919068 88919336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -591719 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 112.75-172 chr5 159326930 159327172 + 0.75 NA intron (NM_002187, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 3422 NM_002187 3593 Hs.674 NM_002187 ENSG00000113302 IL12B CLMF|CLMF2|IL-12B|IMD28|IMD29|NKSF|NKSF2 interleukin 12B protein-coding 213.5-64 chr2 174351371 174351753 + 0.75 NA intron (NM_004882, intron 8 of 9) intron (NM_004882, intron 8 of 9) 16608 NM_001145250 100131390 NM_001145250 ENSG00000217236 SP9 ZNF990 Sp9 transcription factor protein-coding 155.5-54 chr14 71412860 71413101 + 0.75 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 14643 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 165-143 chr8 88383265 88383618 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55958 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 125.5-231 chr7 44586484 44586685 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4289 NM_001303060 222068 Hs.598832 NM_182547 ENSG00000158604 TMED4 ERS25|GMP25iso|HNLF|p24a3|p24alpha3 transmembrane p24 trafficking protein 4 protein-coding 173.75-154 chr8 130819369 130819699 + 0.75 NA intron (NM_001115, intron 13 of 17) intron (NM_001115, intron 13 of 17) 221375 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 211.75-62 chr3 147345265 147345592 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 47002 NR_033118 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 131.75-123 chr21 44452244 44452518 + 0.75 NA intron (NR_047476, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 2903 NR_047476 100861510 Hs.505254 NR_047476 ENSG00000229356 LRRC3-DT LRRC3-AS1 LRRC3 divergent transcript ncRNA 192.75-20 chr11 39380357 39380723 + 0.75 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 731682 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 115.25-176 chr6 68172920 68173132 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 117675 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 202.5-88 chr22 37870063 37870408 + 0.75 NA exon (NM_016091, exon 8 of 13) exon (NM_016091, exon 8 of 13) 20816 NM_001363785 51386 Hs.446852 NM_016091 ENSG00000100129 EIF3L EIF3EIP|EIF3S11|EIF3S6IP|HSPC021|HSPC025|MSTP005 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L protein-coding 289.5-28 chr2 158770784 158771401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -24225 NM_001017920 92196 Hs.59761 NM_001017920 ENSG00000163331 DAPL1 - death associated protein like 1 protein-coding 119.75-103 chr2 73943169 73943429 + 0.75 NA intron (NM_080918, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 16419 NM_001318863 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 128.25-65 chr16 63027757 63027956 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -991418 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 135-198 chr9 86561705 86561961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -207423 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 138.5-115 chr20 39948734 39949078 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55555 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 165-29 chr12 6070295 6070564 + 0.75 NA intron (NM_000552, intron 10 of 51) intron (NM_000552, intron 10 of 51) -30246 NR_145989 109729112 NR_145989 SNORA120 - small nucleolar RNA, H/ACA box 120 snoRNA 124-32 chr12 62760836 62761061 + 0.75 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 157262 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 175.5-118 chr3 68641796 68642135 + 0.75 NA Intergenic L1P4e|LINE|L1 141328 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 122.25-32 chr11 74112588 74112822 + 0.75 NA intron (NM_001286577, intron 11 of 32) L1MB7|LINE|L1 58297 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 122.5-165 chr4 41709211 41709488 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 39621 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 145.25-100 chr3 35586520 35586814 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52858 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 161-113 chr7 38484944 38485215 + 0.75 NA intron (NM_001635, intron 5 of 20) L1MB1|LINE|L1 143502 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 163.75-135 chr9 24200311 24200564 + 0.75 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 345239 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 135.25-178 chr6 54308240 54308494 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_014464) promoter-TSS (NM_014464) -74 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 193-39 chr2 50143749 50144071 + 0.75 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) -169707 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 197.5-63 chr2 17427948 17428282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 90325 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 114.25-38 chr12 17831295 17831461 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 158079 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 156.25-87 chr20 47496828 47497087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4930 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 161-97 chr5 118103785 118104036 + 0.75 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -178664 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 240-2 chr1 57485334 57485846 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -60669 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 150-131 chr7 54824244 54824559 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 65088 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 148.25-64 chr19 56192562 56192773 + 0.75 NA intron (NM_001080456, intron 1 of 3) intron (NM_001080456, intron 1 of 3) 385 NM_001080456 342933 Hs.132130 NM_001080456 ENSG00000197213 ZSCAN5B ZNF371|ZNF495B zinc finger and SCAN domain containing 5B protein-coding 214.25-4 chr1 84729347 84729741 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -39076 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 134-87 chr2 35280463 35280665 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -190841 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 240.75-37 chr18 66809033 66809507 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -205180 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 159.5-4 chr1 76295887 76296152 + 0.75 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) MER34|LTR|ERV1 221273 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 138.75-6 chr1 105503755 105504165 + 0.75 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 114975 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 164.75-95 chr3 9042896 9043307 + 0.75 NA intron (NM_014850, intron 10 of 21) intron (NM_014850, intron 10 of 21) -79629 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 134.75-63 chr14 47754744 47754971 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 6247 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 123.75-178 chr7 81407752 81407957 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 153965 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 126.75-107 chr2 56545199 56545433 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -359546 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 166.25-61 chr17 35485086 35485397 + 0.75 NA intron (NM_001363830, intron 2 of 4) L1P4|LINE|L1 2498 NM_001195790 100506736 Hs.447559 NM_001145027 ENSG00000205045 SLFN12L - schlafen family member 12 like protein-coding 116.75-170 chr6 53595831 53596008 + 0.75 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -22644 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 121.5-123 chr2 9038229 9038445 + 0.75 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -34653 NR_135598 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 227.25-58 chr4 46305370 46305870 + 0.75 NA exon (NM_001330690, exon 7 of 11) exon (NM_001330690, exon 7 of 11) 83759 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 134.25-99 chr20 23008403 23008739 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26849 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 160.75-60 chr18 72737952 72738268 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115272 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 222-37 chr2 61335491 61336038 + 0.75 NA intron (NM_014709, intron 18 of 79) intron (NM_014709, intron 18 of 79) 81613 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 239.75-32 chr19 18774039 18774615 + 0.75 NA intron (NM_015321, intron 11 of 13) intron (NM_015321, intron 11 of 13) 16978 NM_000095 1311 Hs.1584 NM_000095 ENSG00000105664 COMP EDM1|EPD1|MED|PSACH|THBS5|TSP5 cartilage oligomeric matrix protein protein-coding 128.5-183 chr6 37510437 37510616 + 0.75 NA intron (NR_126057, intron 1 of 3) L1ME3E|LINE|L1 3178 NR_126057 100505530 Hs.582978 NM_001039791 LINC02520 - long intergenic non-protein coding RNA 2520 ncRNA 201-10 chr1 234520635 234521048 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 10938 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 166-5 chr1 115313798 115314099 + 0.75 NA intron (NM_002506, intron 1 of 2) intron (NM_002506, intron 1 of 2) 24288 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 174.75-13 chr10 59202622 59203042 + 0.75 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) intron (NM_001143774, intron 1 of 4) 25365 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 122.75-85 chr2 15582942 15583248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8773 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 119.25-125 chr3 39494244 39494479 + 0.75 NA intron (NR_103506, intron 2 of 2) intron (NR_103506, intron 2 of 2) -7705 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 166-19 chr11 29434773 29435044 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -159505 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 173-8 chr1 172511544 172512075 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20540 NM_016227 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 136-46 chr16 47194551 47194846 + 0.75 NA intron (NM_030790, intron 14 of 17) intron (NM_030790, intron 14 of 17) 50630 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 263.25-36 chr3 127111756 127112190 + 0.75 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -81158 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 281.5-59 chr9 114089901 114090659 + 0.75 NA Intergenic (TGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8777 NM_138424 113220 Hs.28149 NM_138424 ENSG00000136883 KIF12 - kinesin family member 12 protein-coding 208-22 chr14 69423748 69424107 + 0.75 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) intron (NM_001330185, intron 1 of 5) 25235 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 127.25-221 chrX 46404309 46404516 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -42777 NM_017776 55634 Hs.632800 NM_017776 ENSG00000147121 KRBOX4 ZNF673 KRAB box domain containing 4 protein-coding 138.25-24 chr10 121967797 121968018 + 0.75 NA intron (NM_001167865, intron 3 of 10) intron (NM_001167865, intron 3 of 10) 7310 NM_001167865 54780 Hs.258798 NM_017615 ENSG00000107672 NSMCE4A C10orf86|NS4EA|NSE4A NSE4 homolog A, SMC5-SMC6 complex component protein-coding 179.5-11 chr1 183207251 183207528 + 0.75 NA intron (NM_005562, intron 1 of 22) intron (NM_005562, intron 1 of 22) 21125 NM_005562 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 173-67 chr2 152871817 152872277 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 153410 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 121.5-81 chr14 86608193 86608388 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -297488 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 242.5-27 chr14 66810591 66810932 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 303354 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 126.5-203 chr6 43548578 43548817 + 0.75 NA intron (NR_144392, intron 17 of 32) intron (NR_144392, intron 17 of 32) 27341 NM_020750 57510 Hs.203206 NM_020750 ENSG00000124571 XPO5 exp5 exportin 5 protein-coding 147.75-63 chr2 35925195 35925493 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 430226 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 286.75-36 chr5 57956340 57956926 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57471 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 188-58 chr5 146542399 146542897 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26535 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 205.25-54 chr2 115874611 115875149 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 531065 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 128.75-138 chr4 52554847 52555191 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 101520 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 177.25-33 chr11 112068093 112068398 + 0.75 NA intron (NM_138789, intron 5 of 5) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 5926 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 177.25-142 chr8 115448169 115448647 + 0.75 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 219605 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 199-68 chr5 27336571 27336976 + 0.75 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -135519 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 149.75-160 chr8 47379295 47379636 + 0.75 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) AluSz6|SINE|Alu 118527 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 154.25-55 chr15 33318727 33319107 + 0.75 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 7950 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 220.75-31 chr17 60745387 60745798 + 0.75 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) intron (NM_001330413, intron 5 of 25) 67741 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 149.75-118 chr3 191730132 191730456 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 269131 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 112.75-54 chr14 44379170 44379368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 128014 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 119.75-63 chr14 83544988 83545235 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 902479 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 186-77 chr6 49159372 49159853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 303641 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 181.5-164 chr9 16002677 16002982 + 0.75 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 250278 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 165.5-112 chr3 87756227 87756518 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -36334 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 220.5-99 chr5 77190843 77191223 + 0.75 NA intron (NM_001349752, intron 1 of 21) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 10729 NM_001349750 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 141.5-226 chr8 78752120 78752373 + 0.75 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1MA5|LINE|L1 -27872 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 162-107 chr7 25785386 25785721 + 0.75 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 4566 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 266.5-43 chr2 218938187 218938891 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7902 NR_110238 101928537 Hs.611129 NR_110238 ENSG00000228135 LINC01494 - long intergenic non-protein coding RNA 1494 ncRNA 125.25 chr1 5371947 5372285 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 490625 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 170.5-156 chr6 42792205 42792657 + 0.75 NA intron (NM_001318819, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu 8935 NR_134654 401261 Hs.656652 NM_001004322 LOC401261 - uncharacterized LOC401261 ncRNA 154.75-37 chr13 99251428 99251686 + 0.75 NA intron (NR_026644, intron 4 of 8) L2|LINE|L2 6871 NM_005292 2841 Hs.741589 NM_005292 ENSG00000125245 GPR18 - G protein-coupled receptor 18 protein-coding 222.5-107 chr8 87106728 87107101 + 0.75 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) AluSg7|SINE|Alu 240499 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 141-37 chr12 62261912 62262272 + 0.75 NA intron (NR_147080, intron 1 of 19) AluJb|SINE|Alu 1688 NM_001252078 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 178.75-13 chr10 101652284 101652704 + 0.75 NA intron (NR_136613, intron 4 of 7) intron (NR_136613, intron 4 of 7) 42676 NR_136613 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 116.25-229 chr8 93940635 93940813 + 0.75 NA Intergenic LTR27B|LTR|ERV1 23777 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 177.5-156 chr6 156117035 156117521 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 170481 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 224.5-110 chr8 119282835 119283268 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 -36194 NR_149112 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-34 chr11 100930239 100930470 + 0.75 NA intron (NM_001367945, intron 8 of 25) intron (NM_001367945, intron 8 of 25) -3920 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 127.75-185 chr7 14719342 14719636 + 0.75 NA intron (NM_001350717, intron 5 of 24) intron (NM_001350717, intron 5 of 24) 121961 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 124.75-160 chr4 107635300 107635645 + 0.75 NA intron (NM_005443, intron 10 of 11) intron (NM_005443, intron 10 of 11) 84762 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 201.5-95 chr4 32264714 32265331 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86016 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 160-93 chr5 140124397 140124788 + 0.75 NA 3' UTR (NM_005859, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_005859, exon 1 of 1) -1345 NM_001007189 492311 Hs.696360 NM_001007189 ENSG00000182700 IGIP C5orf53 IgA inducing protein protein-coding 195.5-102 chr3 150298543 150298992 + 0.75 NA intron (NR_110186, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 24980 NR_110186 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 121.75-80 chr2 57012283 57012475 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -826609 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 178.75-92 chr6 44970486 44970834 + 0.75 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) intron (NM_181356, intron 8 of 12) 227110 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 198.25-9 chr1 235330582 235330874 + 0.75 NA intron (NR_036605, intron 1 of 2) intron (NR_036605, intron 1 of 2) 2158 NR_036605 9453 Hs.730768 NM_004837 ENSG00000152904 GGPS1 GGPPS|GGPPS1 geranylgeranyl diphosphate synthase 1 protein-coding 235.25-7 chr10 67620863 67621295 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 2 of 17) intron (NM_001127384, intron 2 of 17) 44581 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 125.25-15 chr1 213900731 213901063 + 0.75 NA intron (NR_037850, intron 2 of 5) intron (NR_037850, intron 2 of 5) -23852 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 190.75-57 chr2 211195631 211196064 + 0.75 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 578276 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 138.75-141 chr5 31582864 31583211 + 0.75 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 50736 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 190.5-70 chr18 59245562 59245896 + 0.75 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 25571 NM_002091 2922 Hs.153444 NM_002091 ENSG00000134443 GRP BN|GRP-10|preproGRP|proGRP gastrin releasing peptide protein-coding 140.75-27 chr11 84598239 84598448 + 0.75 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MER5B|DNA|hAT-Charlie 122599 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 188-85 chr8 133110538 133110909 + 0.75 NA intron (NM_003235, intron 43 of 47) MIRb|SINE|MIR -8121 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 118.75-153 chr5 78280167 78280480 + 0.75 NA intron (NM_003664, intron 1 of 26) intron (NM_003664, intron 1 of 26) 14375 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 151.5-159 chr5 124669870 124670230 + 0.75 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) intron (NM_020747, intron 2 of 8) 75062 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 146.75-28 chr11 102922915 102923153 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 32698 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 182-95 chr6 36541032 36541463 + 0.75 NA intron (NM_007271, intron 1 of 13) L1ME5|LINE|L1 6232 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 146.5-29 chr10 63123031 63123414 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10025 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 115.75-158 chr4 107126074 107126314 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89881 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 152.75-150 chr8 98823195 98823555 + 0.75 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) 2296 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 139.75-44 chr13 105695820 105696113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10864 NR_120418 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 149-85 chr3 181855880 181856113 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -96368 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 190.75-11 chr10 107739834 107740325 + 0.75 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 329214 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 122.5-48 chr12 100272572 100272817 + 0.75 NA intron (NM_017988, intron 1 of 17) intron (NM_017988, intron 1 of 17) 5310 NM_001330253 55681 Hs.506481 NM_017988 ENSG00000136021 SCYL2 CVAK104 SCY1 like pseudokinase 2 protein-coding 119-210 chr9 92251090 92251413 + 0.75 NA intron (NR_073446, intron 21 of 32) intron (NR_073446, intron 21 of 32) 41296 NR_037424 100500918 NR_037424 ENSG00000281156 MIR3651 mir-3651 microRNA 3651 ncRNA 132.25-161 chr5 151308178 151308512 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -4579 NM_001145017 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 116.75-156 chr4 169292871 169293079 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -22019 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 165.5-125 chr4 44493086 44493436 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44452 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 146.5-72 chr15 69953979 69954280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118895 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 167.75-10 chr1 117801313 117801701 + 0.75 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 128114 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 125-48 chr15 96552417 96552697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 218792 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 123-174 chr7 92563183 92563453 + 0.75 NA intron (NM_152789, intron 10 of 10) intron (NM_152789, intron 10 of 10) 26731 NM_001288584 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 170.5-201 chr9 30085238 30085555 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 323058 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 182.25-65 chr2 121636543 121636847 + 0.75 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) intron (NM_015282, intron 1 of 38) 12767 NM_001207051 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 150.5-208 chr7 49356717 49357071 + 0.75 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -416744 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 117.5-205 chr6 46824026 46824321 + 0.75 NA intron (NM_005588, intron 7 of 13) intron (NM_005588, intron 7 of 13) 30784 NM_005588 4224 Hs.179704 NM_005588 ENSG00000112818 MEP1A PPHA meprin A subunit alpha protein-coding 143-103 chr4 42341011 42341272 + 0.75 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) intron (NR_134668, intron 1 of 1) 50127 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 138.25-71 chr18 13873740 13873944 + 0.75 NA Intergenic MER57E1|LTR|ERV1 41694 NM_000529 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 120.75-116 chr3 186391886 186392120 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -29769 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 116.25-55 chr12 113680996 113681196 + 0.75 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 92587 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 242.25-36 chr17 59011255 59011747 + 0.75 NA intron (NR_148346, intron 22 of 23) intron (NR_148346, intron 22 of 23) 95379 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 176.75-56 chr2 13323168 13323514 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -316328 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 151.75-100 chr4 55175055 55175409 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -49637 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 117.5-113 chr2 132735810 132736074 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 14 of 17) intron (NM_207481, intron 14 of 17) -64416 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 149.25-40 chr13 69391201 69391562 + 0.75 NA Intergenic L2|LINE|L2 169035 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 147-27 chr14 51850947 51851327 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9475 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 127.75-65 chr14 71762799 71763148 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -169198 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 231.5-97 chr7 129253869 129254495 + 0.75 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) L2|LINE|L2 29152 NM_015328 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 193.5-14 chr10 11195051 11195454 + 0.75 NA intron (NM_001326339, intron 2 of 11) intron (NM_001326339, intron 2 of 11) 30222 NM_001025076 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 163.25-71 chr2 193024849 193025333 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 275246 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 158.25-145 chr8 78543503 78543859 + 0.75 NA intron (NR_125389, intron 2 of 2) intron (NR_125389, intron 2 of 2) 14822 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 142.5-210 chr7 80497672 80497876 + 0.75 NA intron (NM_001102386, intron 1 of 7) intron (NM_001102386, intron 1 of 7) 14290 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 186.75-97 chr6 90648384 90648740 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61490 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 120.75-115 chr3 186326540 186326819 + 0.75 NA intron (NM_001346, intron 1 of 24) L1MC4a|LINE|L1 35555 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 128.75-10 chr1 162949820 162950084 + 0.75 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -81137 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 128.5-204 chr7 36419537 36419797 + 0.75 NA intron (NM_001284302, intron 9 of 22) L2b|LINE|L2 -29310 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 121.75-25 chr12 666113 666362 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2792 NM_016533 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 140-95 chr22 29107351 29107687 + 0.75 NA intron (NM_001039570, intron 3 of 8) intron (NM_001039570, intron 3 of 8) 34484 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 171.25-30 chr11 105377842 105378244 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -232030 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 122-33 chr10 87063419 87063736 + 0.75 NA intron (NM_001318905, intron 8 of 15) intron (NM_001318905, intron 8 of 15) 30510 NM_001318902 2746 Hs.500409 NM_005271 ENSG00000148672 GLUD1 GDH|GDH1|GLUD glutamate dehydrogenase 1 protein-coding 114.5-165 chr22 25691054 25691282 + 0.75 NA intron (NM_001362778, intron 11 of 19) intron (NM_001362778, intron 11 of 19) -51020 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 297.25-24 chr5 119902468 119903072 + 0.75 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 273211 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 308.75-10 chr11 114477903 114478547 + 0.75 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 38758 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 157.25-71 chr2 38586957 38587309 + 0.75 NA intron (NM_138394, intron 2 of 12) intron (NM_138394, intron 2 of 12) 15795 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 112.25-43 chr12 39374770 39375012 + 0.75 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 68229 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 180.75-140 chr7 29890004 29890558 + 0.75 NA intron (NM_001080529, intron 7 of 8) AluJr|SINE|Alu 83727 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 212.75-36 chr15 56977979 56978285 + 0.75 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) intron (NM_207038, intron 3 of 19) 58687 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 171.5-129 chr6 92987819 92988087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 431606 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 137.25-39 chr13 30328131 30328336 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -20682 NM_032116 84056 Hs.243596 NM_032116 ENSG00000102781 KATNAL1 - katanin catalytic subunit A1 like 1 protein-coding 141-128 chr5 83509824 83510193 + 0.75 NA intron (NM_001164098, intron 5 of 13) L2b|LINE|L2 38264 NM_001126336 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 230.5-75 chr21 21407691 21408040 + 0.75 NA intron (NM_001352592, intron 10 of 18) intron (NM_001352592, intron 10 of 18) 260703 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 131-32 chr11 101034145 101034410 + 0.75 NA non-coding (NR_073142, exon 7 of 7) non-coding (NR_073142, exon 7 of 7) 94786 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 172.75-115 chr7 20587535 20587848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -27976 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 148.75-89 chr2 140709630 140709965 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 37 of 90) intron (NM_018557, intron 37 of 90) -123112 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 112.25-133 chr3 118346977 118347180 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -294690 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 136-126 chr5 149878741 149878942 + 0.75 NA intron (NM_000440, intron 17 of 21) L1ME4b|LINE|L1 54136 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 133-138 chr5 72501253 72501520 + 0.75 NA intron (NM_152625, intron 1 of 4) intron (NM_152625, intron 1 of 4) 6024 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 136.25-46 chr13 35498074 35498385 + 0.75 NA intron (NM_001204197, intron 1 of 17) intron (NM_001204197, intron 1 of 17) 21480 NM_001204197 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 124-89 chr2 133228861 133229225 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -37152 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 158-92 chr21 36459687 36459921 + 0.75 NA TTS (NM_001146078) TTS (NM_001146078) 6663 NM_012130 23562 Hs.660278 NM_012130 ENSG00000159261 CLDN14 DFNB29 claudin 14 protein-coding 146.5-109 chr2 118517068 118517366 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 85749 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 197.5-5 chr1 87009114 87009486 + 0.75 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) intron (NM_012262, intron 1 of 6) 94665 NM_012262 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 180-102 chr6 5178029 5178346 + 0.75 NA intron (NM_001164841, intron 2 of 3) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -29865 NR_037462 100500900 NR_037462 ENSG00000265083 MIR3691 mir-3691 microRNA 3691 ncRNA 123.75-101 chr2 221345881 221346125 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 226301 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 146-84 chr20 49941060 49941317 + 0.75 NA intron (NM_018683, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 4791 NM_018683 55905 Hs.144949 NM_018683 ENSG00000124226 RNF114 PSORS12|ZNF313 ring finger protein 114 protein-coding 149.5-207 chr8 101755580 101755925 + 0.75 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) intron (NM_001040625, intron 4 of 6) 35217 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 158.25-72 chr2 204372225 204372517 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173104 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 115-174 chr7 92065800 92066045 + 0.75 NA intron (NM_147185, intron 25 of 49) intron (NM_147185, intron 25 of 49) 68555 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 313.75-3 chr11 97361741 97362505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 853698 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 143.5-154 chr4 44919970 44920211 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -193456 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 150.75-138 chr4 30753036 30753304 + 0.75 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 32801 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 143-29 chr13 38315836 38316039 + 0.75 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -33914 NM_001286704 51569 Hs.643655 NM_016617 ENSG00000120686 UFM1 BM-002|C13orf20|HLD14 ubiquitin fold modifier 1 protein-coding 183.5-4 chr1 81090758 81091198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -215214 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 128-93 chr21 20824327 20824610 + 0.75 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -21360 NR_109787 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 209-60 chr7 3165284 3165848 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6993 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 180-50 chr17 76817355 76817774 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 18520 NR_110837 101928514 Hs.617206 NR_110837 ENSG00000267065 LINC02080 - long intergenic non-protein coding RNA 2080 ncRNA 147.75-4 chr1 43326144 43326456 + 0.75 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -11504 NM_005373 4352 Hs.82906 NM_005373 ENSG00000117400 MPL C-MPL|CD110|MPLV|THCYT2|THPOR|TPOR MPL proto-oncogene, thrombopoietin receptor protein-coding 148.75-170 chr8 119798353 119798659 + 0.75 NA intron (NM_003184, intron 6 of 25) intron (NM_003184, intron 6 of 25) 34335 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 165.25-71 chr2 151719568 151719932 + 0.75 NA intron (NM_001271208, intron 9 of 182) AluJb|SINE|Alu 14726 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 163.75-52 chr16 49091749 49092102 + 0.75 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 189913 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 163.25-12 chr10 20490436 20490819 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -61343 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 146-53 chr17 41949613 41950010 + 0.75 NA intron (NM_001350319, intron 9 of 10) AluSq|SINE|Alu -16984 NM_033133 1267 Hs.273621 NM_033133 ENSG00000173786 CNP CNP1 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase protein-coding 188-65 chr7 3732520 3732899 + 0.75 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -396976 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 149-30 chr14 36915436 36915892 + 0.75 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) 36727 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 131.75-188 chr6 70750419 70750691 + 0.75 NA intron (NM_001044305, intron 2 of 10) intron (NM_001044305, intron 2 of 10) 82025 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 121.75-141 chr5 26411053 26411252 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 627434 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 170-30 chr14 56839368 56839740 + 0.75 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 26396 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 112.75-123 chr21 28111518 28111738 + 0.75 NA intron (NR_126010, intron 2 of 4) intron (NR_126010, intron 2 of 4) 21225 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 140.75-135 chr4 74426081 74426399 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -18896 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 167.25-33 chr13 94636921 94637321 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 35264 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 168.25-123 chr6 86711976 86712353 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -225364 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 114.5-14 chr1 151153034 151153216 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3524 NM_001204848 100534012 Hs.732060 NM_001204848 ENSG00000163156 TNFAIP8L2-SCNM1 SCNM1 TNFAIP8L2-SCNM1 readthrough protein-coding 144.25-47 chr12 25361540 25361827 + 0.75 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -110754 NM_001369787 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 125.5-96 chr16 29671412 29671618 + 0.75 NA TTS (NM_003123) TTS (NM_003123) -7493 NM_001318250 23475 Hs.513484 NM_014298 ENSG00000103485 QPRT HEL-S-90n|QPRTase quinolinate phosphoribosyltransferase protein-coding 157.75-148 chr6 38316175 38316422 + 0.75 NA intron (NM_052893, intron 8 of 11) L1MA3|LINE|L1 -165298 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 170.75-109 chr5 111570868 111571233 + 0.75 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) LTR83|LTR|ERVL -58453 NM_001308057 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 141.5-204 chr6 154812880 154813323 + 0.75 NA intron (NM_014892, intron 12 of 19) AluJr|SINE|Alu -40259 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 120.5-83 chr15 87134479 87134802 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -146214 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 204.75-69 chr21 20431395 20431705 + 0.75 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -172865 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 150-103 chr4 41989399 41989666 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006345) promoter-TSS (NM_006345) -998 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 182-52 chr18 62987797 62988282 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 272498 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 262-31 chr2 102200934 102201350 + 0.75 NA intron (NM_003854, intron 4 of 11) intron (NM_003854, intron 4 of 11) 13828 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 115.25-34 chr11 13604035 13604221 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -64540 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 186.25-84 chr4 159351570 159351900 + 0.75 NA intron (NM_001351728, intron 21 of 24) AluSx|SINE|Alu 83926 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 120-28 chr12 9936667 9936855 + 0.75 NA non-coding (NR_104634, exon 5 of 5) non-coding (NR_104634, exon 5 of 5) -4391 NM_207375 387836 Hs.527665 NM_207375 ENSG00000188393 CLEC2A INPE5792|KACL|PILAR|UNQ5792 C-type lectin domain family 2 member A protein-coding 123-111 chr2 164365864 164366181 + 0.75 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 202473 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 115.75-73 chr15 61570839 61571017 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -158990 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 132.5-29 chr10 45676218 45676407 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2204 NR_160521 653234 NR_160521 AGAP10P AGAP10|CTGLF10P|CTGLF7|bA144G6.2|bA358L16.1 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 10, pseudogene pseudo 193.75-26 chr11 36114137 36114483 + 0.75 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) intron (NM_001304263, intron 3 of 4) -36409 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 150.75-54 chr13 113530622 113530871 + 0.75 NA intron (NR_146222, intron 8 of 11) intron (NR_146222, intron 8 of 11) 39725 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 179.5-9 chr1 119913446 119913833 + 0.75 NA 3' UTR (NM_024408, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_024408, exon 34 of 34) -17124 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 145.25-148 chr6 143552069 143552362 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 9836 NR_027114 285740 Hs.432656 NR_027113 ENSG00000235740 PHACTR2-AS1 - PHACTR2 antisense RNA 1 ncRNA 160.25-173 chrX 152022934 152023197 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48389 NM_004961 2564 Hs.22785 NM_004961 ENSG00000102287 GABRE - gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit protein-coding 176.5-99 chr2 113136379 113136644 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 8913 NM_173842 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 218-24 chr16 75137103 75137592 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11177 NM_001318473 162239 Hs.388813 NM_153688 ENSG00000184517 ZFP1 ZNF475 ZFP1 zinc finger protein protein-coding 154.5-115 chr20 39685362 39685840 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -318860 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 118-57 chr15 34340547 34340778 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 2499 NM_018648 55505 Hs.14317 NM_018648 ENSG00000182117 NOP10 DKCB1|NOLA3|NOP10P NOP10 ribonucleoprotein protein-coding 152.5-113 chr3 33140286 33140492 + 0.75 NA intron (NM_006371, intron 6 of 6) intron (NM_006371, intron 6 of 6) 26431 NM_006371 10491 Hs.517888 NM_006371 ENSG00000170275 CRTAP CASP|LEPREL3|OI7|P3H5 cartilage associated protein protein-coding 149.75-66 chr17 63059196 63059546 + 0.75 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) HAL1M8|LINE|L1 93136 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 154.75-133 chr7 41820283 41820641 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -117372 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 116.5-132 chr2 178486371 178486592 + 0.75 NA intron (NM_019091, intron 2 of 7) intron (NM_019091, intron 2 of 7) 6024 NM_019091 65977 Hs.41086 NM_019091 ENSG00000116095 PLEKHA3 FAPP1 pleckstrin homology domain containing A3 protein-coding 143.25-102 chr20 42485254 42485505 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -200104 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 129.75-24 chr10 60247846 60248113 + 0.75 NA intron (NM_001204403, intron 8 of 43) L1MB2|LINE|L1 -106963 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 210-78 chr5 167307829 167308162 + 0.75 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) intron (NM_001122679, intron 2 of 29) -139594 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 169.75-158 chr8 123933186 123933518 + 0.75 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 81365 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 126.25-70 chr17 70002177 70002396 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 40579 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 165-41 chr14 66158976 66159256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -327255 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 148.25-11 chr1 178031333 178031709 + 0.75 NA intron (NR_151484, intron 2 of 3) intron (NR_151484, intron 2 of 3) 6455 NR_151492 111240474 NM_001356505 CRYZL2P-SEC16B - CRYZL2P-SEC16B readthrough protein-coding 167.75-51 chr15 75562166 75562448 + 0.75 NA intron (NM_002833, intron 1 of 12) intron (NM_002833, intron 1 of 12) 17008 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 161.25-12 chr1 244671312 244671689 + 0.75 NA intron (NM_016076, intron 1 of 4) intron (NM_016076, intron 1 of 4) 18374 NM_001297746 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 161-4 chr1 96868582 96868971 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 146138 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 120.75-33 chr13 23613421 23613805 + 0.75 NA intron (NM_001354985, intron 3 of 8) intron (NM_001354985, intron 3 of 8) 34253 NM_001354985 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 129.5-65 chr14 48023513 48023714 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -228599 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 205.75-38 chr2 61029056 61029553 + 0.75 NA intron (NM_002618, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 -11045 NM_001322127 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 211.75-16 chr12 55571841 55572258 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -2366 NM_001258285 121129 Hs.742584 NM_001258285 ENSG00000179615 OR2AP1 OR2AP1P olfactory receptor family 2 subfamily AP member 1 protein-coding 117.5-238 chr8 127015411 127015671 + 0.75 NA intron (NR_045262, intron 1 of 1) intron (NR_045262, intron 1 of 1) 2387 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 154.5-97 chr2 65156381 65156720 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26249 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 119-67 chr17 70809566 70809965 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 392414 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 209.5-23 chr12 1082748 1083098 + 0.75 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) intron (NR_027949, intron 2 of 15) 55175 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 174.5-145 chr5 38685454 38685805 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34644 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 131-180 chr9 12640636 12640828 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52653 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 115.25-22 chr1 240376906 240377155 + 0.75 NA intron (NM_020066, intron 14 of 17) L1MEc|LINE|L1 235125 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 150.75-92 chr2 34502988 34503350 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -174388 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 149.75-138 chr5 174757334 174757703 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5784 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 216.5-97 chr5 126801706 126802046 + 0.75 NA intron (NR_134488, intron 1 of 11) intron (NR_134488, intron 1 of 11) 24740 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 158.75-140 chr5 86657515 86657871 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 37187 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 246.75-37 chr20 42824991 42825741 + 0.75 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) L1ME4a|LINE|L1 139883 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 125.25-131 chr3 31137235 31137533 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24403 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 151.75-135 chr7 13344672 13344921 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 641718 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 197.5-2 chr1 55455688 55456232 + 0.75 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 230319 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 127-71 chr15 82756557 82756883 + 0.75 NA TTS (NR_003011) TTS (NR_003011) 775 NR_003011 677778 Hs.743895 NR_003011 ENSG00000277864 SCARNA15 ACA45 small Cajal body-specific RNA 15 ncRNA 303-28 chr7 40003421 40004109 + 0.75 NA intron (NM_003718, intron 5 of 13) intron (NM_003718, intron 5 of 13) 53405 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 119-215 chrX 122386752 122386942 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -797396 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 192.25-43 chr2 8458481 8458991 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 125056 NR_110257 101929567 Hs.634706 NR_110257 ENSG00000236008 LINC01814 - long intergenic non-protein coding RNA 1814 ncRNA 200.75-108 chr8 142570800 142571143 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 43508 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 176.25-115 chr5 76849759 76850214 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_130772) promoter-TSS (NM_130772) -28 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 117-37 chr12 49558929 49559213 + 0.75 NA TTS (NM_001314030) TTS (NM_001314030) 7368 NM_001012300 10445 Hs.25313 NM_006337 ENSG00000187778 MCRS1 ICP22BP|INO80Q|MCRS2|MSP58|P78 microspherule protein 1 protein-coding 134.5-95 chr2 19455197 19455602 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -96776 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 120.5-79 chr15 61632246 61632503 + 0.75 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -97544 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 151.25-174 chr7 43051606 43051881 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -60904 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 209.75-59 chr20 31983869 31984257 + 0.75 NA intron (NM_001011718, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 15912 NM_001011718 343702 Hs.666444 NM_001011718 ENSG00000260903 XKR7 C20orf159|dJ310O13.4 XK related 7 protein-coding 117.75-172 chr5 21918487 21918664 + 0.75 NA intron (NM_004061, intron 6 of 14) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -28728 NM_001364109 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 126.75-26 chr10 117720839 117721232 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -175967 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 150-90 chr3 58171112 58171549 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_135534) promoter-TSS (NR_135534) -695 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 139-113 chr5 45392059 45392368 + 0.75 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 304167 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 121.75-77 chr2 40415976 40416159 + 0.75 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) AluSx1|SINE|Alu 14237 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 117-18 chr10 74479263 74479472 + 0.75 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 49957 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 149.5-119 chr3 23685638 23686074 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120099 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 114-134 chr5 65928805 65929116 + 0.75 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) intron (NM_001253697, intron 1 of 25) 2385 NM_001253697 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 130.25-88 chr19 52084139 52084473 + 0.75 NA intron (NM_001369827, intron 4 of 6) intron (NM_001369827, intron 4 of 6) 9965 NM_001369825 284371 Hs.665751 NM_001136499 ENSG00000197608 ZNF841 - zinc finger protein 841 protein-coding 145.75-118 chr4 168486215 168486465 + 0.75 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -5826 NM_001012967 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 158.5-82 chr17 75758204 75758474 + 0.75 NA TTS (NM_000213) TTS (NM_000213) 6853 NM_000154 2584 Hs.407966 NM_000154 ENSG00000108479 GALK1 GALK|GK1|HEL-S-19 galactokinase 1 protein-coding 182-41 chr16 60344609 60344964 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15007 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 163.75-58 chr18 38608442 38608719 + 0.75 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 951445 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 135-27 chr11 108041083 108041364 + 0.75 NA intron (NM_003478, intron 2 of 18) LTR16B2|LTR|ERVL 32325 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 151.25-126 chr3 79217681 79218074 + 0.75 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -193850 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 133.75-131 chr3 76231530 76231860 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -446146 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 283.75-30 chr7 8036956 8037508 + 0.75 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L1PB4|LINE|L1 68436 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 186-85 chr7 32453178 32453549 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 5131 NR_038454 100130673 Hs.609282 NR_038454 LOC100130673 - phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 pseudogene pseudo 116-63 chr17 34652720 34652895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 72058 NM_001304438 124842 Hs.310482 NM_207313 ENSG00000181291 TMEM132E DFNB99 transmembrane protein 132E protein-coding 154.75-58 chr17 75522363 75522653 + 0.75 NA intron (NM_207346, intron 8 of 10) intron (NM_207346, intron 8 of 10) -3189 NM_001031803 3993 Hs.514477 NM_004524 ENSG00000073350 LLGL2 HGL|Hugl-2|LGL2 LLGL scribble cell polarity complex component 2 protein-coding 237.5-66 chr4 43135996 43136455 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 242959 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 118.5-192 chr7 42753833 42754004 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -47471 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 139.25-159 chr5 166694543 166694885 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 231656 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 177.25-105 chr4 38326562 38326835 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40216 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 162.75-134 chr7 85132754 85133038 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -10965 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 161.75-37 chr14 58245764 58246066 + 0.75 NA intron (NR_038123, intron 1 of 9) intron (NR_038123, intron 1 of 9) 1072 NM_002788 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 181.5-132 chr5 55649015 55649349 + 0.75 NA intron (NM_001258287, intron 9 of 13) intron (NM_001258287, intron 9 of 13) 43871 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 157.75-65 chr17 28156689 28157078 + 0.75 NA intron (NM_016231, intron 3 of 10) L1MC5a|LINE|L1 -69680 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 130.25-61 chr14 71050243 71050539 + 0.75 NA intron (NM_014982, intron 22 of 35) intron (NM_014982, intron 22 of 35) 142932 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 186-92 chr8 117538545 117538876 + 0.75 NA TTS (NM_001363182) TTS (NM_001363182) 17997 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 206.25-71 chr3 196053644 196054058 + 0.75 NA intron (NM_001313966, intron 15 of 16) intron (NM_001313966, intron 15 of 16) 28239 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 145.5-151 chr4 167950495 167950784 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -141898 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 187.5-132 chr5 5194862 5195168 + 0.75 NA intron (NM_139056, intron 8 of 22) intron (NM_139056, intron 8 of 22) 54685 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 167-6 chr1 108773483 108773848 + 0.75 NA intron (NM_007269, intron 7 of 18) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 26991 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 136.25-177 chr7 45969630 45969939 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -48512 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 133.25-44 chr12 100580492 100580745 + 0.75 NA intron (NM_001303130, intron 1 of 8) intron (NM_001303130, intron 1 of 8) 6934 NM_001303130 283431 Hs.20575 NM_174942 ENSG00000139354 GAS2L3 G2L3 growth arrest specific 2 like 3 protein-coding 129.5-221 chr8 9622714 9622984 + 0.75 NA intron (NM_003747, intron 3 of 26) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 66937 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 152.25-24 chr10 80716044 80716366 + 0.75 NA Intergenic L2b|LINE|L2 66408 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 195-49 chr2 210286838 210287170 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 16611 NM_079422 4632 Hs.187338 NM_079420 ENSG00000168530 MYL1 MLC1F|MLC3F|MYOFTA myosin light chain 1 protein-coding 147.25-20 chr11 23996357 23996787 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -500481 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 167.25-114 chr4 33918656 33918954 + 0.75 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) intron (NR_125902, intron 4 of 4) 121088 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 222.25-72 chr5 108234305 108234780 + 0.75 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 147556 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 174.5-25 chr10 91513993 91514334 + 0.75 NA non-coding (NR_104291, exon 21 of 21) non-coding (NR_104291, exon 21 of 21) 97297 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 203-27 chr11 101588013 101588344 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4171 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 131.25-12 chr1 175731838 175732180 + 0.75 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 11586 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 135.75-186 chr7 84579483 84579733 + 0.75 NA intron (NR_110080, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 47132 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 227.5-15 chr10 83468534 83469001 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 208322 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 130.25-100 chr2 98614981 98615403 + 0.75 NA intron (NM_001330354, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 6603 NM_001330353 25972 Hs.13370 NM_014044 ENSG00000115446 UNC50 GMH1|HSD23|PDLs22|UNCL|URP unc-50 inner nuclear membrane RNA binding protein protein-coding 196.75-50 chr18 71992848 71993189 + 0.75 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -210792 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 121.25-112 chr20 23191371 23191625 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -58862 NR_034149 200261 Hs.352228 NM_182535 ENSG00000233746 LINC00656 - long intergenic non-protein coding RNA 656 ncRNA 133-181 chr8 133895409 133895778 + 0.75 NA intron (NR_125424, intron 1 of 3) intron (NR_125424, intron 1 of 3) 9097 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 179-49 chr19 17693987 17694246 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5917 NM_001080421 23025 Hs.164502 NM_001080421 ENSG00000130477 UNC13A Munc13-1 unc-13 homolog A protein-coding 182.25-12 chr10 54578643 54578990 + 0.75 NA intron (NR_134503, intron 2 of 5) L1PA15-16|LINE|L1 29141 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 124.75-4 chr1 74969106 74969393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -159185 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 119-45 chr14 25946943 25947163 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 606377 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 126.75-29 chr11 66602551 66602890 + 0.75 NA intron (NM_005125, intron 5 of 7) intron (NM_005125, intron 5 of 7) 9535 NM_005125 9973 Hs.502917 NM_005125 ENSG00000173992 CCS - copper chaperone for superoxide dismutase protein-coding 185.5-72 chr2 21434795 21435111 + 0.75 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 275699 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 161.25-7 chr1 169542944 169543331 + 0.75 NA intron (NM_000130, intron 12 of 24) (ACAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43394 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 231.75-14 chr11 101691847 101692261 + 0.75 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -108047 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 157.75-75 chr18 11983116 11983478 + 0.75 NA intron (NM_014214, intron 1 of 7) (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1790 NM_014214 3613 Hs.743311 NM_014214 ENSG00000141401 IMPA2 - inositol monophosphatase 2 protein-coding 129-77 chr16 67551249 67551569 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 10900 NR_158165 107984813 Hs.385760 NR_158165 LOC107984813 - uncharacterized LOC107984813 ncRNA 115.5-222 chr6 135858553 135858743 + 0.75 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) MIR3|SINE|MIR 6947 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 123-4 chr1 37610422 37610654 + 0.75 NA TTS (NM_001242909) TTS (NM_001242909) -14553 NM_001323623 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 129.5-194 chr5 168827266 168827588 + 0.75 NA intron (NM_003062, intron 6 of 35) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -59172 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 168.75-152 chr8 112557297 112557699 + 0.75 NA intron (NM_001363185, intron 22 of 66) MER21C|LTR|ERVL -85995 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 124.25-153 chr4 119864643 119864839 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -60226 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 146.25-163 chr9 36751446 36751764 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 71994 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 206-80 chr8 144408639 144408971 + 0.75 NA intron (NM_013291, intron 2 of 37).2 intron (NM_013291, intron 2 of 37).2 530 NM_013291 29894 Hs.493202 NM_013291 ENSG00000071894 CPSF1 CPSF160|HSU37012|P/cl.18 cleavage and polyadenylation specific factor 1 protein-coding 179.75-26 chr11 100362796 100363204 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -324288 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 183.25-26 chr12 73340905 73341178 + 0.75 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 181851 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 142.75-50 chr12 64124460 64124853 + 0.75 NA intron (NM_001346201, intron 18 of 21) intron (NM_001346201, intron 18 of 21) 97640 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 151.25-33 chr11 111823529 111823924 + 0.75 NA intron (NR_147984, intron 13 of 15) intron (NR_147984, intron 13 of 15) 47555 NM_001352416 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 243.75-65 chr4 120124411 120124799 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -57757 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 183.5-168 chrX 105876642 105877016 + 0.75 NA intron (NM_198465, intron 2 of 28) intron (NM_198465, intron 2 of 28) 54290 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 199.5-52 chr16 13494575 13495095 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -425322 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 125.75-79 chr18 67740378 67740694 + 0.75 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 74286 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 200.75-92 chr6 12427755 12428237 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 137635 NM_001955 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 163.75-102 chr4 12646848 12647155 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 423550 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 147.5-129 chr22 23157593 23157940 + 0.75 NA intron (NM_001349878, intron 6 of 10) MIRb|SINE|MIR 12289 NR_146295 9609 Hs.353024 NM_004914 ENSG00000100228 RAB36 - RAB36, member RAS oncogene family protein-coding 244-5 chr10 52723069 52723514 + 0.75 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 32113 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 138.5-158 chr5 100253397 100253581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 134765 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 180-64 chr2 135860716 135861098 + 0.75 NA intron (NM_005915, intron 8 of 16) L1M4|LINE|L1 15536 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 161.75-112 chr6 41248033 41248394 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1164 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 182.5-18 chr10 43733165 43733665 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 45410 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 188.75-62 chr2 154575366 154575754 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -118122 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 191.5-92 chr21 39646990 39647361 + 0.75 NA intron (NM_001356336, intron 2 of 3) intron (NM_001356336, intron 2 of 3) 4779 NM_001356338 10317 Hs.733638 NM_006057 ENSG00000183778 B3GALT5 B3GalT-V|B3GalTx|B3T5|GLCT5|beta-1,3-GalTase 5|beta-3-Gx-T5|beta3Gal-T5 beta-1,3-galactosyltransferase 5 protein-coding 223.75-37 chr17 70142553 70142919 + 0.75 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 26666 NR_036534 400617 Hs.225661 NR_036534 ENSG00000267365 KCNJ2-AS1 - KCNJ2 antisense RNA 1 ncRNA 218-17 chr14 55328095 55328542 + 0.75 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 56164 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 149.25-106 chr22 26261669 26262026 + 0.75 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 92373 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 242.5-73 chr6 151935503 151935965 + 0.75 NA intron (NM_001122741, intron 4 of 8) intron (NM_001122741, intron 4 of 8) 126627 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 119.25-178 chr6 97449505 97449832 + 0.75 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) MER68|LTR|ERVL 144082 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 195.75-6 chr1 66471692 66472216 + 0.75 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -61639 NM_001308203 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 156-128 chr6 34969687 34970052 + 0.75 NA intron (NM_015245, intron 2 of 23) intron (NM_015245, intron 2 of 23) 80614 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 197.25-100 chr8 114560632 114561097 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 1107149 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 137-16 chr1 210200537 210200903 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -32076 NM_001354173 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 235-66 chr7 34223801 34224261 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 318492 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 134.5-193 chr6 114265832 114266187 + 0.75 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) L2|LINE|L2 -203132 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 129.5-226 chr8 98021458 98021839 + 0.75 NA intron (NM_002380, intron 13 of 18) L3b|LINE|CR1 20569 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 175-82 chr22 33676482 33676893 + 0.75 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) MER58A|DNA|hAT-Charlie 28233 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 189-73 chr22 43160465 43160859 + 0.75 NA intron (NM_000714, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 8727 NM_001256530 706 Hs.202 NM_000714 ENSG00000100300 TSPO BPBS|BZRP|DBI|IBP|MBR|PBR|PBS|PKBS|PTBR|mDRC|pk18 translocator protein protein-coding 211.5-59 chr17 59732256 59732744 + 0.75 NA intron (NM_001329402, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 24846 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 198.5-58 chr18 4657045 4657480 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -201955 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 200.5-102 chr4 83912251 83912564 + 0.75 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 376299 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 192.25-46 chr2 30293680 30294020 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -52796 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 191-50 chr21 32260225 32260707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18583 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 188.75-87 chr5 33663587 33663879 + 0.75 NA intron (NM_001324512, intron 5 of 21) intron (NM_001324512, intron 5 of 21) 222957 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 140.5-240 chr8 130237729 130238129 + 0.75 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 58604 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 190.25-54 chr18 5833772 5834296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6661 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 176.75-124 chr8 100575357 100575752 + 0.75 NA intron (NM_152628, intron 13 of 13) intron (NM_152628, intron 13 of 13) -15795 NM_198401 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 190.5-119 chr4 146425077 146425502 + 0.75 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) intron (NM_001317816, intron 4 of 10) 16706 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 147.5-122 chr20 34974249 34974587 + 0.75 NA intron (NM_020884, intron 2 of 44) intron (NM_020884, intron 2 of 44) -15958 NR_030223 574501 NR_030223 ENSG00000207635 MIR499A MIR499|MIRN499|hsa-mir-499a|mir-499a microRNA 499a ncRNA 227-13 chr12 28288155 28288628 + 0.75 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) L1PA13|LINE|L1 -97653 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 125.75-67 chr16 89765934 89766172 + 0.75 NA intron (NM_000135, intron 27 of 42) AluSg|SINE|Alu 44516 NM_001113525 92822 Hs.290154 NM_152287 ENSG00000158805 ZNF276 CENP-Z|CENPZ|ZADT|ZFP276|ZNF477 zinc finger protein 276 protein-coding 136.25-201 chrX 32355225 32355629 + 0.75 NA intron (NM_000109, intron 37 of 78) intron (NM_000109, intron 37 of 78) 56801 NM_004011 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 186-31 chr16 14202442 14202868 + 0.75 NA intron (NM_001365411, intron 1 of 14) (TAATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15969 NM_001365413 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 142.75-95 chr2 43575217 43575543 + 0.75 NA intron (NM_001083953, intron 10 of 37) AluJr|SINE|Alu 20594 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 144.5-54 chr13 27869603 27869898 + 0.75 NA intron (NR_047484, intron 1 of 4) intron (NR_047484, intron 1 of 4) 47541 NR_047484 100861550 Hs.416201 NR_047484 PLUT HI-LNC71|PDX1-AS1|PLUTO PDX1 associated lncRNA, upregulator of transcription ncRNA 254.5-17 chr11 74432457 74433076 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 33529 NR_039710 100616215 NR_039710 ENSG00000264402 MIR548AL - microRNA 548al ncRNA 190.25-34 chr13 27036013 27036443 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -89305 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 158-66 chr18 58702544 58702827 + 0.75 NA intron (NM_006785, intron 4 of 16) intron (NM_006785, intron 4 of 16) -30812 NM_001289967 101927322 Hs.644875 NM_001289967 LOC101927322 - uncharacterized LOC101927322 protein-coding 150.5-205 chr7 34106036 34106460 + 0.75 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) intron (NM_133468, intron 14 of 15) 200709 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 112.75-105 chr2 161313633 161313806 + 0.75 NA intron (NM_005805, intron 1 of 11) Looper|DNA|PiggyBac 5294 NM_005805 10213 Hs.740477 NM_005805 ENSG00000115233 PSMD14 PAD1|POH1|RPN11 proteasome 26S subunit, non-ATPase 14 protein-coding 180.75-27 chr12 8465050 8465362 + 0.75 NA intron (NM_001007033, intron 3 of 5) intron (NM_001007033, intron 3 of 5) 9244 NM_001007033 93978 Hs.591147 NM_001007033 ENSG00000205846 CLEC6A CLEC4N|CLECSF10|dectin-2 C-type lectin domain containing 6A protein-coding 150.75-168 chr7 31083588 31084010 + 0.75 NA intron (NM_001199636, intron 6 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 31338 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 145.5-70 chr15 44013438 44013665 + 0.75 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -135380 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 118.75-168 chr6 98985025 98985381 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37197 NM_012160 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 202.75-13 chr10 86008417 86008954 + 0.75 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) L1ME3G|LINE|L1 256103 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 191.25-46 chr19 28426144 28426606 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -180313 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 118.25-10 chr1 79356448 79356781 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -349884 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 203-12 chr10 56310648 56311018 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 50426 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 182.5-105 chr3 127659880 127660187 + 0.75 NA intron (NM_015720, intron 2 of 7) intron (NM_015720, intron 2 of 7) -12905 NM_032548 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 157.75-183 chr9 87871494 87871932 + 0.75 NA intron (NR_149022, intron 3 of 3) intron (NR_149022, intron 3 of 3) -11164 NM_178828 286234 Hs.130672 NM_178828 ENSG00000177992 SPATA31E1 C9orf79|FAM75E1 SPATA31 subfamily E member 1 protein-coding 127.25-12 chr10 5962436 5962658 + 0.75 NA intron (NR_046362, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 6381 NM_001351096 3601 Hs.445124 NM_002189 ENSG00000134470 IL15RA CD215 interleukin 15 receptor subunit alpha protein-coding 128-7 chr1 107624920 107625182 + 0.75 NA intron (NM_006113, intron 20 of 26) MIR3|SINE|MIR 63448 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 230.75-10 chr10 66466599 66467064 + 0.75 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -459205 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 125-67 chr2 64156191 64156478 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11914 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 270.5-32 chr2 141846367 141846809 + 0.75 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) L1M5|LINE|L1 285113 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 198.5-68 chr2 35846367 35846703 + 0.75 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 375130 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 153.5-11 chr1 181612989 181613215 + 0.75 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) L1MEc|LINE|L1 129585 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 128.25-44 chr12 123639413 123639750 + 0.75 NA intron (NM_001271866, intron 2 of 10) L1MB7|LINE|L1 5752 NM_001271867 2967 Hs.355348 NM_001516 ENSG00000111358 GTF2H3 BTF2|P34|TFB4|TFIIH general transcription factor IIH subunit 3 protein-coding 215-31 chr16 62541447 62541782 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -505176 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 147-29 chr14 59506644 59506905 + 0.75 NA intron (NM_001164399, intron 19 of 19) intron (NM_001164399, intron 19 of 19) 22257 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 199.25-40 chr16 26928353 26928818 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -138342 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 217.5-132 chr9 80037702 80038131 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 62893 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 239-53 chr6 163496249 163496790 + 0.75 NA intron (NM_206853, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 81801 NM_006775 9444 Hs.510324 NM_006775 ENSG00000112531 QKI Hqk|QK|QK1|QK3|hqkI QKI, KH domain containing RNA binding protein-coding 141-147 chr7 74485068 74485317 + 0.75 NA intron (NM_016328, intron 1 of 26) intron (NM_016328, intron 1 of 26) 31286 NM_016328 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 130-176 chr9 29484640 29485071 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -271254 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 134.75-132 chr21 24123268 24123661 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 197913 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 129.25-57 chr15 59978167 59978386 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -26035 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 183.5-33 chr11 102409074 102409397 + 0.75 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) intron (NM_052932, intron 2 of 4) 43530 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 188.25-29 chr12 64393805 64394137 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3213 NM_001170633 115749 Hs.535190 NM_001099676 ENSG00000185306 C12orf56 - chromosome 12 open reading frame 56 protein-coding 205.5 chr1 16414491 16414862 + 0.75 NA intron (NM_001353349, intron 2 of 10) AluSp|SINE|Alu 22748 NR_148413 374955 Hs.705501 NM_198546 ENSG00000187144 SPATA21 spergen-2|spergen2 spermatogenesis associated 21 protein-coding 174.75-78 chr3 21800930 21801395 + 0.75 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -49952 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 181.5-134 chr5 127649848 127650168 + 0.75 NA intron (NM_001048252, intron 1 of 2) intron (NM_001048252, intron 1 of 2) 987 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 140.25-129 chr4 58668177 58668419 + 0.75 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -131970 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 242.75-45 chr4 17505045 17505550 + 0.75 NA intron (NM_001306140, intron 1 of 5) AluSq2|SINE|Alu 6793 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 157-7 chr1 190412830 190413077 + 0.75 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 63057 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 134.75-220 chr8 104397138 104397420 + 0.75 NA intron (NM_001385, intron 7 of 9) intron (NM_001385, intron 7 of 9) 57453 NM_030788 81501 Hs.652230 NM_030788 ENSG00000164935 DCSTAMP FIND|TM7SF4|hDC-STAMP dendrocyte expressed seven transmembrane protein protein-coding 207-28 chr14 75956857 75957247 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 24943 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 150-151 chr9 114176709 114176984 + 0.75 NA intron (NM_032888, intron 3 of 60) intron (NM_032888, intron 3 of 60) 21309 NM_032888 85301 Hs.494892 NM_032161 ENSG00000196739 COL27A1 STLS collagen type XXVII alpha 1 chain protein-coding 188.5-48 chr15 97887988 97888512 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13821 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 125.5-63 chr13 35231009 35231333 + 0.75 NA intron (NM_015678, intron 33 of 57) intron (NM_015678, intron 33 of 57) 245518 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 119-23 chr11 11288371 11288653 + 0.75 NA intron (NM_001363464, intron 9 of 9) L2c|LINE|L2 64738 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 138-75 chr2 53934776 53935011 + 0.75 NA intron (NM_014614, intron 7 of 46) intron (NM_014614, intron 7 of 46) 36100 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 140-125 chr4 65622320 65622697 + 0.75 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 46980 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 214-65 chr8 85589391 85589741 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 66110 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 147.75-164 chr8 142847937 142848189 + 0.75 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 13262 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 138.75-40 chr12 76493436 76493679 + 0.75 NA intron (NM_001003712, intron 1 of 22) L1M2|LINE|L1 66214 NM_001319653 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 230-30 chr2 15306135 15306541 + 0.75 NA intron (NR_052013, intron 40 of 50) intron (NR_052013, intron 40 of 50) 254996 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 130-69 chr2 51688530 51688761 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1MEg|LINE|L1 656044 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 148-45 chr17 62851903 62852222 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 43560 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 169.25-46 chr18 48118031 48118301 + 0.75 NA intron (NM_001371291, intron 4 of 6) AluSz|SINE|Alu 18982 NM_001039360 201501 Hs.515388 NM_001039360 ENSG00000184828 ZBTB7C APM-1|APM1|ZBTB36|ZNF857C zinc finger and BTB domain containing 7C protein-coding 176.75-12 chr1 234956190 234956569 + 0.75 NA TTS (NR_125945) TTS (NR_125945) 7620 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 124-142 chr6 20357277 20357480 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -44501 NM_001949 1871 Hs.269408 NM_001949 ENSG00000112242 E2F3 E2F-3 E2F transcription factor 3 protein-coding 159.5-107 chr2 100106716 100107007 + 0.75 NA intron (NM_002285, intron 1 of 23) intron (NM_002285, intron 1 of 23) -1278 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 217-66 chr4 167210427 167210756 + 0.75 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) intron (NM_001204352, intron 2 of 11) 23835 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 124.25-106 chr2 182789626 182789953 + 0.75 NA non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) 73532 NM_018981 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 187-48 chr20 4238666 4239155 + 0.75 NA intron (NM_000678, intron 1 of 1) intron (NM_000678, intron 1 of 1) 10377 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 135.25-89 chr2 14463505 14463853 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -62721 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 120.5-80 chr15 61977217 61977446 + 0.75 NA intron (NM_001018088, intron 23 of 81) intron (NM_001018088, intron 23 of 81) 83116 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 129.75-135 chr4 106784611 106784956 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 251530 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 164-15 chr10 69704812 69705324 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 74821 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 192.25-62 chr2 204254558 204254886 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -290753 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 177-6 chr1 213615364 213615851 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -309142 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 200.25-5 chr1 158392449 158392921 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 6781 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 174.25-12 chr1 241474992 241475368 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44605 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 156.25-103 chr3 169672947 169673276 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -9399 NM_001366466 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 152.25-89 chr2 136783806 136784217 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 18466 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 125.25-122 chr20 52208792 52209009 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16915 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 155-17 chr10 69023084 69023465 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 34471 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 210-101 chr8 140412673 140413160 + 0.75 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) intron (NM_001321646, intron 4 of 21) 44828 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 173.5-24 chr10 95644188 95644487 + 0.75 NA intron (NM_001323414, intron 2 of 17) intron (NM_001323414, intron 2 of 17) 12374 NM_001323413 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 205.25-55 chr2 122972465 122972895 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 100801 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 132-146 chr6 41588217 41588567 + 0.75 NA intron (NM_001012427, intron 8 of 16) intron (NM_001012427, intron 8 of 16) -10331 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 138-39 chr14 53458674 53458984 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 305475 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 146.75-87 chr20 1712873 1713187 + 0.75 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -55251 NM_018556 55423 Hs.590883 NM_018556 ENSG00000089012 SIRPG CD172g|SIRP-B2|SIRPB2|SIRPgamma|bA77C3.1 signal regulatory protein gamma protein-coding 123-51 chr14 54845748 54846049 + 0.75 NA intron (NM_001024071, intron 4 of 5) intron (NM_001024071, intron 4 of 5) 32295 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 145-155 chr8 117111904 117112169 + 0.75 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -22959 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 214.5-14 chr10 65793770 65794144 + 0.75 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 222532 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 149.5-6 chr1 66041865 66042175 + 0.75 NA TTS (NR_123718) TTS (NR_123718) 8698 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 117.5-53 chr12 118301118 118301399 + 0.75 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 58447 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 136.25-38 chr11 133208277 133208639 + 0.75 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -264690 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 153.75-92 chr3 103914842 103915237 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -390923 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 136.5-45 chr11 76872479 76872774 + 0.75 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) intron (NM_001300953, intron 1 of 9) 11708 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 129.5-250 chrX 130936103 130936326 + 0.75 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -32897 NM_006375 10495 Hs.171458 NM_006375 ENSG00000165675 ENOX2 APK1|COVA1|tNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 2 protein-coding 118.5-228 chr8 127060308 127060546 + 0.75 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -19447 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 266-18 chr16 83014902 83015385 + 0.75 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) -24845 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 113.75-108 chr2 178001418 178001610 + 0.75 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) LTR82A|LTR|ERVL 71263 NM_016953 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 152.75-37 chr11 85461185 85461595 + 0.75 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 165880 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 296.75-21 chr3 95268269 95268746 + 0.75 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 330244 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 132.5-143 chr21 21543591 21543820 + 0.75 NA TTS (NM_001352591) TTS (NM_001352591) 193614 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 199.5-11 chr1 200489294 200489892 + 0.75 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -79557 NM_001281293 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 155.25-59 chr14 61305084 61305350 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16226 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 179.25-93 chr20 44972186 44972502 + 0.75 NA non-coding (NR_147975, exon 2 of 2) non-coding (NR_147975, exon 2 of 2) 5832 NR_147975 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 137.25-38 chr12 102302059 102302310 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -104351 NM_002674 5367 Hs.707990 NM_002674 ENSG00000183395 PMCH MCH|ppMCH pro-melanin concentrating hormone protein-coding 190.5-68 chr18 42303839 42304268 + 0.75 NA intron (NR_046457, intron 4 of 6) intron (NR_046457, intron 4 of 6) 117385 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 174.75-144 chr9 96759278 96759656 + 0.75 NA exon (NM_014930, exon 6 of 6) exon (NM_014930, exon 6 of 6) 18620 NM_001314059 22869 Hs.75264 NM_014930 ENSG00000081386 ZNF510 - zinc finger protein 510 protein-coding 195.75-24 chr10 76119442 76120000 + 0.75 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 336960 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 121.5-205 chr5 27810790 27811063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 338634 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 150.75-26 chr10 56619303 56619609 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -258183 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 139.5-123 chr22 20811296 20811563 + 0.75 NA intron (NM_058004, intron 8 of 54) intron (NM_058004, intron 8 of 54) 37316 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 139-83 chr2 203872146 203872446 + 0.75 NA intron (NM_005214, intron 3 of 3) intron (NM_005214, intron 3 of 3) 4525 NM_001037631 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 117-189 chr8 101619558 101619779 + 0.75 NA exon (NM_001330593, exon 9 of 16) exon (NM_001330593, exon 9 of 16) 127229 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 150-35 chr14 29864793 29865168 + 0.75 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 62116 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 126.75-101 chr2 30164974 30165220 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 18090 NM_016061 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 168.25-85 chr2 195642440 195642732 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14372 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 147.5-210 chr8 118405706 118405967 + 0.75 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) CR1_Mam|LINE|CR1 -215165 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 180.25-105 chr6 91030528 91030892 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -443638 NM_145333 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 126.25-149 chr5 28453924 28454248 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -166421 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 124-20 chr10 120305735 120305988 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 49362 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 157.25-151 chr8 88004261 88004665 + 0.75 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -130448 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 152-50 chr14 51950039 51950404 + 0.75 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -31650 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 185.75-80 chr21 29797182 29797505 + 0.75 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 49168 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 144-136 chr8 120120274 120120492 + 0.75 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -4719 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 221-13 chr11 85701560 85702072 + 0.75 NA intron (NM_001365832, intron 3 of 6) L1MEg|LINE|L1 -15621 NM_152723 220388 Hs.376241 NM_152723 ENSG00000179071 CCDC89 - coiled-coil domain containing 89 protein-coding 250.75-66 chr8 52435971 52436541 + 0.75 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -26377 NM_001352837 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 141.75-18 chr10 23565406 23565624 + 0.75 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 126246 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 227.25-7 chr1 167804970 167805406 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83206 NM_003953 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 138.25-161 chr7 38735102 38735460 + 0.75 NA intron (NM_014396, intron 25 of 28) intron (NM_014396, intron 25 of 28) -48192 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 145.75-164 chr9 26545188 26545546 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 347435 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 145.5-103 chr2 136828674 136829005 + 0.75 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) L2c|LINE|L2 63294 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 176.25-89 chr3 8304429 8304832 + 0.75 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 197028 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 153-156 chr8 89287409 89287792 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 470111 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 112.5-187 chr4 118892155 118892531 + 0.75 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 3489 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 145.5-80 chr17 66306270 66306560 + 0.75 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 3802 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 129.75-155 chr5 180620092 180620389 + 0.75 NA exon (NM_182925, exon 17 of 30) exon (NM_182925, exon 17 of 30) -28741 NM_052863 92304 Hs.62492 NM_052863 ENSG00000161055 SCGB3A1 HIN-1|HIN1|LU105|PnSP-2|UGRP2 secretoglobin family 3A member 1 protein-coding 130.75-100 chr2 192663051 192663401 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -86619 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 153-145 chr7 156557434 156557799 + 0.75 NA intron (NR_026865, intron 2 of 3) intron (NR_026865, intron 2 of 3) 17125 NR_024119 64433 Hs.404170 NR_024119 ENSG00000279418 LINC00244 C7orf4|NCRNA00244 long intergenic non-protein coding RNA 244 ncRNA 187-111 chrUn_KI270411v1 1130 1550 + 0.75 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 136.25-50 chr14 19801972 19802228 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -1670 NM_001004723 390429 Hs.512490 NM_001004723 ENSG00000176294 OR4N2 OR14-13|OR14-8 olfactory receptor family 4 subfamily N member 2 protein-coding 150-135 chr7 111728961 111729433 + 0.75 NA intron (NM_001363540, intron 52 of 52) intron (NM_001363540, intron 52 of 52) -79308 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 116.25-34 chr11 27449268 27449650 + 0.75 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) AluJo|SINE|Alu -22272 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 134-142 chr5 64413756 64413959 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -92158 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 113-60 chr14 45554763 45555020 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 160711 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 161.25-173 chr8 85470341 85470617 + 0.75 NA intron (NM_001293675, intron 2 of 5) intron (NM_001293675, intron 2 of 5) -5564 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 163-47 chr16 72217847 72218081 + 0.75 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -45514 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 159-42 chr17 29227447 29227918 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19175 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 122.5-144 chr22 47635105 47635496 + 0.75 NA non-coding (NR_122046, exon 2 of 9) non-coding (NR_122046, exon 2 of 9) 3626 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 184.75-37 chr18 6155096 6155596 + 0.75 NA intron (NM_001365769, intron 13 of 16) intron (NM_001365769, intron 13 of 16) -101398 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-164 chr3 117840710 117841049 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -149954 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 121.5-269 chrX 67618485 67618707 + 0.75 NA intron (NM_001011645, intron 2 of 8) intron (NM_001011645, intron 2 of 8) 73973 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 173.25-56 chr2 28307598 28308018 + 0.75 NA non-coding (NR_038319, exon 3 of 3) non-coding (NR_038319, exon 3 of 3) 2651 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 157.5-82 chr17 70014033 70014436 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -37037 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 123.75-69 chr15 93333908 93334179 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 127977 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 234.75-44 chr22_KI270732v1_random 15278 15750 + 0.75 NA NA L1HS|LINE|L1 NA NA 125-124 chr5 18987730 18987973 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 898421 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 192.75-90 chr3 129144302 129144589 + 0.75 NA intron (NM_001204890, intron 6 of 12) intron (NM_001204890, intron 6 of 12) 16618 NM_001199469 57461 Hs.512661 NM_020701 ENSG00000240682 ISY1 FSAP33 ISY1 splicing factor homolog protein-coding 125-73 chr2 118532199 118532435 + 0.75 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 70649 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 198-76 chr8 81755582 81756053 + 0.75 NA intron (NM_152284, intron 3 of 4) intron (NM_152284, intron 3 of 4) 23369 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 214.5-73 chr22 19967678 19968027 + 0.75 NA intron (NM_007310, intron 3 of 3) intron (NM_007310, intron 3 of 3) 4099 NR_039918 100616414 NR_039918 ENSG00000284031 MIR4761 - microRNA 4761 ncRNA 152.75-84 chr2 78216616 78216890 + 0.75 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 73978 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 130-84 chr2 225427288 225427735 + 0.75 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) intron (NM_001371273, intron 3 of 7) 26625 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 272.25-57 chr8 19243196 19243807 + 0.75 NA intron (NR_038919, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 2021 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 149.75-5 chr1 105617831 105618065 + 0.75 NA intron (NR_125955, intron 1 of 3) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 987 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 193.25-75 chr3 111775769 111776157 + 0.75 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) 43467 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 155.5-154 chr4 168519234 168519593 + 0.75 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) intron (NM_001166108, intron 2 of 21) 22361 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 302-5 chr10 126108709 126109295 + 0.75 NA intron (NM_001288974, intron 7 of 18) intron (NM_001288974, intron 7 of 18) -135729 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 221.75-79 chr8 80556085 80556689 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 70161 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 154.5-83 chr17 78790660 78791053 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -8514 NM_004762 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 116-67 chr17 59654867 59655058 + 0.75 NA intron (NM_001288653, intron 5 of 31) intron (NM_001288653, intron 5 of 31) 35067 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 247-18 chr12 126571983 126572425 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 118114 NR_110034 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 182.75-2 chr1 31118766 31119056 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -53194 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 141.5-176 chr5 63719754 63720013 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 242409 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 143.5-205 chr8 29164367 29164632 + 0.75 NA intron (NM_015254, intron 12 of 39) MIR|SINE|MIR 98571 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 131.5-35 chr11 79414632 79414923 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) 7449 NR_049841 100847000 NR_049841 ENSG00000266570 MIR5579 - microRNA 5579 ncRNA 117-61 chr14 86176986 86177189 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 242409 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 119.5-30 chr10 70005668 70005856 + 0.75 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -47084 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 204.5-113 chr6 37506228 37506604 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_126057) promoter-TSS (NR_126057) -932 NR_126057 100505530 Hs.582978 NM_001039791 LINC02520 - long intergenic non-protein coding RNA 2520 ncRNA 143.5-184 chr5 174346822 174347139 + 0.75 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 10626 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 207.5-29 chr16 54816514 54816830 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31561 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 168.5-23 chr10 8203245 8203572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 64897 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 292.75-5 chr1 218717506 218718059 + 0.75 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 200729 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 153.75-115 chr5 66393810 66394154 + 0.75 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 117622 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 155.75-39 chr12 31995645 31996121 + 0.75 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 36468 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 185.5-48 chr14 61249308 61249562 + 0.75 NA Intergenic U6|snRNA|snRNA 31903 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 205.5-98 chr3 135315450 135315865 + 0.75 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 520397 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 161.25-72 chr17 45065267 45065557 + 0.75 NA intron (NM_021079, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 4095 NM_021079 4836 Hs.532790 NM_021079 ENSG00000136448 NMT1 NMT N-myristoyltransferase 1 protein-coding 220.75-41 chr2 127161253 127161611 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 44335 NM_001001665 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 122.5-69 chr14 103987857 103988120 + 0.75 NA intron (NM_153046, intron 8 of 35) L1M4b|LINE|L1 -45459 NM_001257268 647286 Hs.632325 NM_001257268 ENSG00000227729 RD3L TDRD9-AS1|TDRD9AS1 retinal degeneration 3 like protein-coding 235.5-82 chr7 128101874 128102338 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20245 NR_030324 693178 NR_030324 ENSG00000207588 MIR593 MIRN593|hsa-mir-593 microRNA 593 ncRNA 146.5-169 chr5 54450892 54451198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4654 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 116-160 chr7 144903611 144903893 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -67699 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 114.5-13 chr1 118044947 118045155 + 0.75 NA intron (NM_206996, intron 20 of 48) L1MEd|LINE|L1 115312 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 130.75-17 chr10 43568250 43568511 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_005674) promoter-TSS (NM_005674) 79 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 114.5-186 chr4 43013560 43013777 + 0.75 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) intron (NM_001080476, intron 2 of 3) 120402 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 151.25-90 chr2 117192586 117192971 + 0.75 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -621913 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 170.25-108 chr4 45266069 45266393 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -539597 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 154.25-94 chr20 15978763 15979046 + 0.75 NA intron (NM_001351664, intron 10 of 14) intron (NM_001351664, intron 10 of 14) 6978 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 145.25-129 chr5 36359285 36359571 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -57526 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 165.75-60 chr16 79153740 79154139 + 0.75 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 446798 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 155.5-199 chr7 94568977 94569256 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 59307 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 142-153 chr7 111042806 111043290 + 0.75 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) -47958 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 199.5-141 chr7 110973020 110973450 + 0.75 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 -117771 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 135.25-47 chr11 131460102 131460318 + 0.75 NA intron (NM_001352003, intron 1 of 8) L3b|LINE|CR1 80657 NR_110140 101929653 Hs.559159 NR_110140 ENSG00000237654 LOC101929653 - uncharacterized LOC101929653 ncRNA 250.5-36 chr16 73023078 73023462 + 0.75 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) intron (NM_006885, intron 1 of 9) 24858 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 230-28 chr18 22298270 22298770 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 119395 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 163.5-54 chr14 79507261 79507651 + 0.75 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 228076 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 129-103 chr2 211946786 211947064 + 0.75 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 479435 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 201.25-10 chr10 16268617 16268948 + 0.75 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -168161 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 150-139 chr8 16989989 16990281 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 12210 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 236.5-25 chr14 57269311 57269757 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_006544) promoter-TSS (NM_006544) 563 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 160-118 chr9 86417725 86418087 + 0.75 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -63496 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 160.5-47 chr14 25202220 25202695 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -152160 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 124-168 chr8 117866430 117866691 + 0.75 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 54353 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 180.5-120 chr5 42040521 42040898 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 115428 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 136.25-183 chr7 121040078 121040313 + 0.75 NA intron (NM_001105533, intron 2 of 17) intron (NM_001105533, intron 2 of 17) 50804 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 180.5-85 chr21 43709197 43709448 + 0.75 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -9807 NM_003681 8566 Hs.284491 NM_003681 ENSG00000160209 PDXK C21orf124|C21orf97|HEL-S-1a|PKH|PNK|PRED79 pyridoxal kinase protein-coding 126.5-212 chr6 138702495 138702762 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 10960 NR_033896 441172 Hs.92290 NR_033896 FLJ46906 - uncharacterized LOC441172 ncRNA 150.25 chr1 30960981 30961181 + 0.75 NA intron (NM_001020658, intron 14 of 21) AluSx|SINE|Alu 7156 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 156.5-19 chr10 107903579 107903862 + 0.75 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 165573 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 163.25-110 chr5 36295195 36295623 + 0.75 NA intron (NM_001323279, intron 1 of 12) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 6493 NM_001323273 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 138-153 chr7 62866685 62866968 + 0.75 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 437230 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 131.75-227 chr9 95934376 95934752 + 0.75 NA intron (NM_020207, intron 11 of 18) intron (NM_020207, intron 11 of 18) 58556 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 180.25-35 chr17 13457405 13457883 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 86002 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 129.5-240 chr9 90246263 90246569 + 0.75 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 187073 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 166.5-70 chr15 59011336 59011687 + 0.75 NA intron (NM_001270530, intron 1 of 13) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 23365 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 146.25-157 chr8 121991076 121991291 + 0.75 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -349743 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 160.5-202 chr9 27234990 27235370 + 0.75 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 47613 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 131-92 chr2 74489059 74489290 + 0.75 NA intron (NR_027749, intron 2 of 11) intron (NR_027749, intron 2 of 11) 6093 NR_027749 64427 Hs.557709 NM_022492 ENSG00000115282 TTC31 - tetratricopeptide repeat domain 31 protein-coding 174.5-138 chr4 121794699 121795128 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -6410 NM_001034194 5393 Hs.91728 NM_005033 ENSG00000123737 EXOSC9 PCH1D|PM/Scl-75|PMSCL1|RRP45|Rrp45p|p5|p6 exosome component 9 protein-coding 268-55 chr7 25917839 25918246 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 31944 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 194.5-119 chr5 83203658 83203946 + 0.75 NA intron (NM_001318012, intron 5 of 7) intron (NM_001318012, intron 5 of 7) 126255 NM_003401 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 209.25-86 chr4 114759493 114759981 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 102978 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 168.25-154 chr9 105398202 105398504 + 0.75 NA intron (NM_001330731, intron 15 of 15) intron (NM_001330731, intron 15 of 15) -49681 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 132.25-21 chr1 204593358 204593632 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 77089 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 161.5-98 chr2 100759980 100760315 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -59992 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 161-38 chr14 53138672 53138958 + 0.75 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) L1MCc|LINE|L1 14508 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 200.5-14 chr10 34016716 34017280 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -244318 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 131.25-42 chr12 56648905 56649147 + 0.75 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3042 NM_001686 506 Hs.406510 NM_001686 ENSG00000110955 ATP5F1B ATP5B|ATPMB|ATPSB|HEL-S-271 ATP synthase F1 subunit beta protein-coding 147.75-95 chr21 25541536 25541961 + 0.75 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -20397 NR_001458 114614 Hs.697120 NR_001458 ENSG00000234883 MIR155HG BIC|MIRHG2|NCRNA00172 MIR155 host gene ncRNA 223.5-40 chr14 69311293 69311674 + 0.75 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) intron (NM_020692, intron 1 of 15) 51325 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 156-53 chr15 61728772 61729230 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_146448) promoter-TSS (NR_146448) -917 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 125.25-71 chr15 65868573 65868831 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001206836) promoter-TSS (NM_001206836) -789 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 179.75-56 chr2 48140606 48140952 + 0.75 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -173903 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 114.5-280 chr9 103628365 103628574 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -303436 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 223.5-18 chr10 130702993 130703601 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 259371 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 119-213 chrX 13911747 13912100 + 0.75 NA intron (NM_001318729, intron 1 of 6) intron (NM_001318729, intron 1 of 6) 26715 NM_001001994 2824 Hs.495710 NM_005278 ENSG00000046653 GPM6B M6B glycoprotein M6B protein-coding 130.5-30 chr10 17598288 17598638 + 0.75 NA intron (NM_014241, intron 5 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 18911 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 157.5-124 chr21 19538527 19538858 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 361063 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 123.25-178 chr6 145227193 145227500 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 459531 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 165.25-60 chr19 10263069 10263320 + 0.75 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7926 NM_000201 3383 Hs.643447 NM_000201 ENSG00000090339 ICAM1 BB2|CD54|P3.58 intercellular adhesion molecule 1 protein-coding 181.5-16 chr10 101067033 101067386 + 0.75 NA intron (NR_135068, intron 1 of 1) CpG 910 NR_135068 81621 Hs.534859 NM_030929 ENSG00000107821 KAZALD1 BONO1|FKSG28|FKSG40|IGFBP-rP10 Kazal type serine peptidase inhibitor domain 1 protein-coding 141.75-107 chr20 8316053 8316346 + 0.75 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 67495 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 192-9 chr1 118268849 118269296 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -83844 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 224.75-38 chr2 46046577 46047071 + 0.75 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) UCON55|DNA|TcMar-Tigger -250583 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 184-35 chr17 33066195 33066552 + 0.75 NA intron (NM_183377, intron 3 of 9) intron (NM_183377, intron 3 of 9) 73522 NM_001317225 124912 Hs.434112 NM_173847 ENSG00000141316 SPACA3 ALLP17|CT54|LYC3|LYZC|LYZL3|SLLP1 sperm acrosome associated 3 protein-coding 185-13 chr11 104104248 104104528 + 0.75 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 59759 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 156.75-146 chr6 62303876 62304231 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -17826 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 212-36 chr2 37329219 37329526 + 0.75 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -12288 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 144.75-104 chr21 37090742 37091106 + 0.75 NA intron (NM_003316, intron 6 of 45) intron (NM_003316, intron 6 of 45) 7977 NM_003316 7267 Hs.368214 NM_003316 ENSG00000182670 TTC3 DCRR1|RNF105|TPRDIII tetratricopeptide repeat domain 3 protein-coding 145.25-149 chr6 149055990 149056388 + 0.75 NA intron (NM_005715, intron 7 of 7) AluSz|SINE|Alu -23528 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 185-57 chr3 103702527 103702906 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -178600 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 154.5-142 chr4 178773357 178773671 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -865578 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 148.25-72 chr2 132799978 132800238 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) intron (NM_207481, intron 11 of 17) -115449 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 156.5-85 chr2 113836345 113836652 + 0.75 NA intron (NR_110174, intron 3 of 4) intron (NR_110174, intron 3 of 4) -53436 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 161.5-11 chr1 187356649 187357087 + 0.75 NA intron (NR_126347, intron 3 of 3) L1ME1|LINE|L1 -86760 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 124.25-17 chr1 196709284 196709611 + 0.75 NA intron (NM_000186, intron 9 of 21) intron (NM_000186, intron 9 of 21) 57569 NM_000186 3075 Hs.363396 NM_000186 ENSG00000000971 CFH AHUS1|AMBP1|ARMD4|ARMS1|CFHL3|FH|FHL1|HF|HF1|HF2|HUS complement factor H protein-coding 144-8 chr1 108776326 108776562 + 0.75 NA intron (NM_007269, intron 8 of 18) intron (NM_007269, intron 8 of 18) 29770 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 252.25-53 chr6 48891228 48891744 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 571767 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 141.25-109 chr3 73264622 73264946 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 169211 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 157.5-71 chr16 5807340 5807707 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 175056 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 248-2 chr1 180579243 180579704 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 20499 NR_125716 148756 NR_125716 ENSG00000236719 OVAAL LINC01131|OVAL ovarian adenocarcinoma amplified long non-coding RNA ncRNA 188.5-81 chr2 175012869 175013369 + 0.75 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7740 NM_001025201 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 168.5-83 chr2 84377390 84377675 + 0.75 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 81748 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 178-16 chr12 28288806 28289285 + 0.75 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) L1PA13|LINE|L1 -98307 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 141.5-102 chr2 100584418 100584720 + 0.75 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -19170 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 192.75-37 chr15 89611926 89612286 + 0.75 NA intron (NM_001308025, intron 15 of 21) L1M4|LINE|L1 36519 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 143.5-52 chr13 75808588 75808939 + 0.75 NA intron (NM_001366636, intron 7 of 27) intron (NM_001366636, intron 7 of 27) 48102 NM_015842 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 136.5-167 chr4 164226865 164227196 + 0.75 NA intron (NM_001166373, intron 1 of 7) intron (NM_001166373, intron 1 of 7) -29319 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 155.5-3 chr1 31397622 31397968 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11982 NM_001199038 347735 Hs.270655 NM_018565 ENSG00000168528 SERINC2 FKSG84|PRO0899|TDE2|TDE2L serine incorporator 2 protein-coding 160.25-113 chr4 95617500 95617891 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -68722 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 193.75-34 chr12 8129757 8130146 + 0.75 NA intron (NM_194447, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 4901 NR_036440 642559 Hs.646545 NR_036440 ENSG00000235602 POU5F1P3 OCT3|OCT4|OCT4-pg3|OTF-3|OTF3|OTF3L|Oct-3|Oct-4|POU5F1|POU5F1L|POU5FLC12 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 3 pseudo 144.75-19 chr10 83406832 83407252 + 0.75 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 270047 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 139.75-13 chr1 237913247 237913651 + 0.75 NA intron (NR_027247, intron 8 of 11) intron (NR_027247, intron 8 of 11) -22527 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 128-33 chr12 66688401 66688645 + 0.75 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) -9447 NM_001178074 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 147.5-108 chr2 144999049 144999307 + 0.75 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 331211 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 233.75-17 chr12 32500819 32501183 + 0.75 NA intron (NM_001304481, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 -1042 NM_001304484 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 131.25-89 chr18 60533869 60534087 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -161203 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 131.25-166 chr5 91470248 91470649 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -87131 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 163.5-50 chr14 29159955 29160388 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -374384 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 173-150 chr9 95021526 95021975 + 0.75 NA intron (NM_032823, intron 11 of 14) intron (NM_032823, intron 11 of 14) -43600 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 132-27 chr11 12182612 12182851 + 0.75 NA intron (NR_144420, intron 3 of 27) intron (NR_144420, intron 3 of 27) 19048 NR_106739 102466906 NR_106739 ENSG00000275373 MIR6124 hsa-mir-6124 microRNA 6124 ncRNA 119.25-145 chr4 57573948 57574200 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 148202 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 211.5-145 chr7 48484616 48485163 + 0.75 NA intron (NM_152701, intron 47 of 61) intron (NM_152701, intron 47 of 61) 313431 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 177-55 chr21 27427775 27428066 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -294459 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 227.75-36 chr2 76327049 76327438 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -616328 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 226.75-9 chr10 80928437 80928858 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 278850 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 128.25-46 chr13 111109525 111109887 + 0.75 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -4913 NM_001354048 8874 Hs.508738 NM_003899 ENSG00000102606 ARHGEF7 BETA-PIX|COOL-1|COOL1|Nbla10314|P50|P50BP|P85|P85COOL1|P85SPR|PAK3|PIXB Rho guanine nucleotide exchange factor 7 protein-coding 150.75-62 chr14 88201765 88202101 + 0.75 NA intron (NM_138317, intron 4 of 6) intron (NM_138317, intron 4 of 6) 68978 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 182.75-3 chr1 38710062 38710404 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 149539 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 237-5 chr1 186174853 186175173 + 0.75 NA intron (NM_031935, intron 103 of 106) intron (NM_031935, intron 103 of 106) -121260 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 188.25-15 chr10 114100172 114100581 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 56510 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 155.25-102 chr2 201522019 201522241 + 0.75 NA intron (NM_001168216, intron 11 of 12) L1MA7|LINE|L1 70390 NM_001206864 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 306.5-38 chr9 37310032 37310656 + 0.75 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -112352 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 127.25-16 chr10 23998247 23998437 + 0.75 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) -210449 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 114-24 chr10 103610362 103610592 + 0.75 NA intron (NM_001365079, intron 7 of 8) intron (NM_001365079, intron 7 of 8) 67738 NM_001365079 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 220.5-30 chr15 79735522 79735915 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 161279 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 130 chr1 17897356 17897531 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 142110 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 194.25-106 chr7 42434488 42434806 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -197438 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 288.5-41 chr6 144920981 144921685 + 0.75 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 515678 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 129.25-55 chr15 37261712 37262066 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -160578 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 128.5-41 chr11 78453638 78453849 + 0.75 NA intron (NM_024678, intron 11 of 13) intron (NM_024678, intron 11 of 13) -23907 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 279.25-3 chr1 154459458 154460122 + 0.75 NA intron (NM_000565, intron 9 of 9) intron (NM_000565, intron 9 of 9) -42429 NM_182499 126668 Hs.387671 NM_182499 ENSG00000163239 TDRD10 - tudor domain containing 10 protein-coding 204.75-83 chr4 82215079 82215572 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 158666 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 131.5-130 chr2 200347249 200347460 + 0.75 NA intron (NM_001282743, intron 2 of 11) intron (NM_001282743, intron 2 of 11) 38404 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 125.25-73 chr15 77317030 77317311 + 0.75 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 -91766 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 208-25 chr15 87891331 87891753 + 0.75 NA intron (NM_001012338, intron 17 of 19) L1MC5a|LINE|L1 54726 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 152-45 chr13 75071613 75072123 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 168513 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 147.5-173 chr5 52225625 52225933 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 217748 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 171.5-83 chr2 103538149 103538412 + 0.75 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -553851 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 157.25-131 chr6 120780085 120780505 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 554185 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 169-27 chr14 40157525 40157786 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -725155 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 180.5-94 chr3 32206091 32206630 + 0.75 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -32319 NM_001320308 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 125.25-84 chr18 3883321 3883571 + 0.75 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -1907 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 127.75-142 chr4 46884492 46884685 + 0.75 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 24657 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 210.75-33 chr19 15167464 15167827 + 0.75 NA intron (NM_000435, intron 28 of 32) AluSx|SINE|Alu 11705 NR_106853 102465476 NR_106853 ENSG00000275711 MIR6795 hsa-mir-6795 microRNA 6795 ncRNA 130-37 chr13 82591986 82592185 + 0.75 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 1290308 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 145-147 chr7 44512049 44512308 + 0.75 NA TTS (NM_001101648) TTS (NM_001101648) -21520 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 172-57 chr2 195305296 195305692 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -351464 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 221.5-41 chr2 29633069 29633496 + 0.75 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -157905 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 238.75-5 chr10 69172106 69172514 + 0.75 NA 3' UTR (NM_004896, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_004896, exon 9 of 9) -7924 NR_136626 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 201-65 chr6 42838150 42838585 + 0.75 NA intron (NM_001318819, intron 7 of 13) intron (NM_001318819, intron 7 of 13) 17311 NM_015349 23506 Hs.658033 NM_015349 ENSG00000112624 BICRAL GLTSCR1L|KIAA0240 BRD4 interacting chromatin remodeling complex associated protein like protein-coding 135.5-137 chr3 103042601 103042818 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 481407 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 127.5-254 chr8 137459935 137460152 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -46455 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 163.25-146 chr9 3268844 3269295 + 0.75 NA intron (NM_134428, intron 12 of 17) intron (NM_134428, intron 12 of 17) 87480 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 135.25-50 chr12 18391032 18391288 + 0.75 NA exon (NM_004570, exon 14 of 32) exon (NM_004570, exon 14 of 32) 129620 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 113.5-107 chr18 30477724 30478063 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 178983 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 199.75-89 chr8 111872484 111873008 + 0.75 NA Intergenic (ATACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 496107 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 182-49 chr17 70168121 70168398 + 0.75 NA non-coding (NR_036534, exon 1 of 1) non-coding (NR_036534, exon 1 of 1) 1143 NR_036534 400617 Hs.225661 NR_036534 ENSG00000267365 KCNJ2-AS1 - KCNJ2 antisense RNA 1 ncRNA 113.5-95 chr16 61710748 61710992 + 0.75 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) intron (NM_001796, intron 10 of 11) 325568 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 218.5-32 chr12 62424801 62425329 + 0.75 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -41761 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 114.75-7 chr1 74849854 74850162 + 0.75 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -116600 NM_001134759 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 210.25-21 chr14 35707814 35708202 + 0.75 NA intron (NM_001346245, intron 16 of 41) L1MA3|LINE|L1 54923 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 187.75-70 chr3 106689700 106690183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 550697 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 176.5-134 chr4 66151701 66152006 + 0.75 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -124971 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 179.5-112 chr21 45239416 45239720 + 0.75 NA intron (NR_135279, intron 1 of 2) L1M1|LINE|L1 5228 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 175.75-16 chr10 33683705 33684198 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 88729 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 128.5-147 chr3 81655261 81655594 + 0.75 NA intron (NM_000158, intron 3 of 15) intron (NM_000158, intron 3 of 15) 106218 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 144.75-189 chr8 136876495 136876883 + 0.75 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 345891 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 173-77 chr20 57220668 57221017 + 0.75 NA intron (NM_001719, intron 2 of 6) intron (NM_001719, intron 2 of 6) 7146 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-95 chr22 25661137 25661573 + 0.75 NA intron (NM_005160, intron 3 of 20) intron (NM_005160, intron 3 of 20) -80833 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 159.75-172 chr8 103878955 103879321 + 0.75 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 59918 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 132.5-212 chr6 52470100 52470393 + 0.75 NA intron (NR_033327, intron 6 of 9) intron (NR_033327, intron 6 of 9) 49238 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 139.75-96 chr2 54538078 54538477 + 0.75 NA intron (NM_003128, intron 2 of 35) intron (NM_003128, intron 2 of 35) 9055 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 168.75-64 chr17 58027711 58028049 + 0.75 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -20534 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 247.5-89 chr9 31686914 31687384 + 0.75 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -305659 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 121.5-221 chr6 67605464 67605697 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -449771 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 140.25-132 chr4 99537957 99538211 + 0.75 NA intron (NM_032149, intron 6 of 8) intron (NM_032149, intron 6 of 8) 25639 NM_152292 93587 Hs.380412 NM_152292 ENSG00000145331 TRMT10A HEL-S-88|MSSGM|MSSGM1|RG9MTD2|TRM10 tRNA methyltransferase 10A protein-coding 142.75-33 chr11 29524733 29524933 + 0.75 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -69580 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 209.25-98 chr5 179432919 179433246 + 0.75 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 83629 NR_149047 100128340 Hs.710582 NR_149047 LOC100128340 - uncharacterized LOC100128340 ncRNA 206.75-45 chr2 216609334 216609816 + 0.75 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -2637 NR_110392 101928232 Hs.694592 NR_110392 LINC01280 - long intergenic non-protein coding RNA 1280 ncRNA 128.25-133 chr3 99349784 99350017 + 0.75 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -288694 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 134-64 chr15 100763980 100764185 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -85670 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 163.25-121 chr5 154582473 154582766 + 0.75 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 13453 NR_036094 100422950 NR_036094 ENSG00000264760 MIR3141 mir-3141 microRNA 3141 ncRNA 153.25-112 chr6 82530766 82531207 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 166742 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 141-14 chr1 224932126 224932417 + 0.75 NA intron (NM_001349912, intron 1 of 5) L1MA4A|LINE|L1 2596 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 121.5-236 chr7 31559135 31559326 + 0.75 NA intron (NM_194300, intron 3 of 12) intron (NM_194300, intron 3 of 12) 6228 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 138-20 chr11 83007677 83008024 + 0.75 NA intron (NM_001286060, intron 1 of 4) intron (NM_001286060, intron 1 of 4) 26424 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 155-34 chr14 32422803 32423047 + 0.75 NA intron (NM_004274, intron 1 of 13) HAL1|LINE|L1 93627 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 150 chr1 13567100 13567335 + 0.75 NA Intergenic LTR7B|LTR|ERV1 -16540 NM_006474 10630 Hs.468675 NM_006474 ENSG00000162493 PDPN AGGRUS|GP36|GP40|Gp38|HT1A-1|OTS8|PA2.26|T1A|T1A-2|T1A2|TI1A podoplanin protein-coding 131-115 chr3 64109032 64109243 + 0.75 NA intron (NM_001370528, intron 7 of 7) intron (NM_001370528, intron 7 of 7) 5667 NR_046701 100874242 Hs.668874 NR_046701 PRICKLE2-AS2 - PRICKLE2 antisense RNA 2 ncRNA 141.5-53 chr14 43826085 43826562 + 0.75 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 680960 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 183.25-45 chr17 74713676 74714044 + 0.75 NA promoter-TSS (NM_001289083) promoter-TSS (NM_001289083) -937 NM_001289082 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 163.75-57 chr18 10986377 10986784 + 0.75 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) L1MA10|LINE|L1 162182 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 131-179 chr8 134734292 134734540 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -21385 NM_001289394 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 119-184 chr7 38970443 38970731 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -7322 NM_001370959 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 114-46 chr14 59796974 59797249 + 0.75 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 73665 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 157.5-222 chr9 38095406 38095690 + 0.75 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -26321 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 138.5-49 chr13 64814944 64815176 + 0.75 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -739049 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 164.25-108 chr4 11222517 11222822 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -146158 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 155.25-159 chr6 136789475 136789816 + 0.75 NA intron (NM_005923, intron 1 of 29) intron (NM_005923, intron 1 of 29) 2832 NM_005923 4217 Hs.186486 NM_005923 ENSG00000197442 MAP3K5 ASK1|MAPKKK5|MEKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 protein-coding 223.75-20 chr12 126069853 126070246 + 0.75 NA Intergenic LTR55|LTR|ERVL? -25943 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 119.75-207 chr8 140594472 140594708 + 0.75 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) AluJb|SINE|Alu 41043 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 134.75-130 chr20 63529540 63529904 + 0.75 NA exon (NM_005975, exon 8 of 8) exon (NM_005975, exon 8 of 8) 7648 NM_001256358 5753 Hs.51133 NM_005975 ENSG00000101213 PTK6 BRK protein tyrosine kinase 6 protein-coding 267.5-10 chr10 23878096 23878777 + 0.75 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 183709 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 118.75-102 chr2 100754804 100755075 + 0.75 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -65200 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 190.25-77 chr20 53716617 53716995 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 108452 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 154-10 chr1 182792675 182792975 + 0.75 NA intron (NM_001200056, intron 2 of 12) intron (NM_001200056, intron 2 of 12) 3052 NM_001200051 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 180.5-170 chrX 147716720 147717156 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 194879 NR_024502 100126270 Hs.561999 NR_024499 ENSG00000268066 FMR1-AS1 ASFMR1|FMR1-AS|FMR1AS|FMR4 FMR1 antisense RNA 1 ncRNA 209.5-138 chr7 53886604 53887045 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -74893 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 132-47 chr14 40243801 40244014 + 0.75 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -710804 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 126.25-87 chr2 72902301 72902619 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15052 NM_003124 6697 Hs.301540 NM_003124 ENSG00000116096 SPR SDR38C1 sepiapterin reductase protein-coding 155.25-172 chr7 122186282 122186561 + 0.75 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -42172 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 115.75-41 chr12 42751140 42751433 + 0.75 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 59070 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 203.25-89 chr5 173298615 173298961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -4942 NR_162132 113219469 NR_162132 MIR12118 - microRNA 12118 ncRNA 176.75-71 chr2 211257324 211257657 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 639919 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 138.75-206 chr8 138247845 138248082 + 0.75 NA intron (NM_015912, intron 6 of 19) intron (NM_015912, intron 6 of 19) -164418 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 131.5-100 chr19 12930380 12930609 + 0.75 NA promoter-TSS (NR_149078) promoter-TSS (NR_149078) -28 NR_149078 106144598 Hs.579870 NR_149078 ENSG00000266975 FARSA-AS1 - FARSA antisense RNA 1 ncRNA 250.75-32 chr22 30661218 30661604 + 0.75 NA TTS (NM_152511) TTS (NM_152511) 6464 NM_001304796 150290 Hs.517544 NM_152511 ENSG00000167065 DUSP18 DSP18|DUSP20|LMWDSP20 dual specificity phosphatase 18 protein-coding 196.5-154 chr7 34826179 34826482 + 0.75 NA intron (NM_207172, intron 4 of 8) intron (NM_207172, intron 4 of 8) 8001 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 152.25-43 chr12 123737622 123738005 + 0.75 NA intron (NM_012463, intron 9 of 19) L1ME4b|LINE|L1 -24682 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 131.5-69 chr14 102710424 102710643 + 0.75 NA intron (NM_015156, intron 6 of 11) intron (NM_015156, intron 6 of 11) -66916 NM_003300 7187 Hs.510528 NM_003300 ENSG00000131323 TRAF3 CAP-1|CAP1|CD40bp|CRAF1|IIAE5|LAP1|RNF118 TNF receptor associated factor 3 protein-coding 125-17 chr1 241211172 241211575 + 0.75 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) 79101 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 209.75-77 chr5 123826245 123826609 + 0.75 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 281010 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 177-13 chr10 103632122 103632415 + 0.75 NA intron (NM_001365079, intron 2 of 8) intron (NM_001365079, intron 2 of 8) 45947 NM_001365079 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 120.75-182 chrX 94750634 94750867 + 0.75 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 312476 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 177.5-185 chrX 10846830 10847184 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -13324 NM_033290 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 191.5-143 chr7 136132743 136133247 + 0.75 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -155636 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 138-12 chr10 85252663 85252908 + 0.75 NA Intergenic Eulor6D|DNA?|DNA? -53847 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 195.5-106 chr4 84211210 84211645 + 0.75 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) L1PB|LINE|L1 87742 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 142-172 chr9 68785556 68785972 + 0.75 NA TTS (NM_138333) TTS (NM_138333) 5699 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 225.25-33 chr17 79258108 79258562 + 0.75 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) intron (NM_001082575, intron 3 of 14) 183398 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 163.5-77 chr18 11314589 11314924 + 0.75 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -139722 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 145-124 chr5 52997534 52997739 + 0.75 NA intron (NR_073107, intron 1 of 28) intron (NR_073107, intron 1 of 28) 8284 NR_073106 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 165.75-119 chr4 71269930 71270226 + 0.75 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) MIR|SINE|MIR -68975 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 138.75-181 chr7 95268804 95269210 + 0.75 NA intron (NM_017650, intron 12 of 15) intron (NM_017650, intron 12 of 15) 55525 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 154-102 chr4 168294936 168295304 + 0.75 NA intron (NM_017631, intron 6 of 37) L1MA7|LINE|L1 23632 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 151.75-34 chr12 48356763 48357154 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5712 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 207-30 chr15 26360382 26360785 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 244770 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 117.25-210 chr8 78594976 78595315 + 0.75 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) intron (NM_006823, intron 2 of 3) -36642 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 200-43 chr2 42008026 42008427 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -39795 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 215-44 chr2 150064090 150064547 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 192689 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 209.75-10 chr10 65394528 65394956 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -176683 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 141.25-26 chr10 115009611 115009836 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 15066 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 164.75-35 chr11 116400979 116401284 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -238291 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 168.75-76 chr2 190963141 190963424 + 0.75 NA 3' UTR (NM_014905, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_014905, exon 18 of 18) 50968 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 140.75-61 chr16 6780895 6781228 + 0.75 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) L1MA4|LINE|L1 7252 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 136-171 chr9 96315129 96315432 + 0.75 NA intron (NR_104627, intron 12 of 12) AluJb|SINE|Alu -13104 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 114.5-172 chr3 36007069 36007261 + 0.75 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 262689 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 149.75-79 chr2 50923192 50923553 + 0.75 NA intron (NM_001330088, intron 2 of 17) intron (NM_001330088, intron 2 of 17) 108760 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 143.5-180 chr5 160933501 160933924 + 0.75 NA non-coding (NR_027111, exon 3 of 3) non-coding (NR_027111, exon 3 of 3) 4914 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 250.25-45 chr8 79499742 79500319 + 0.75 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -111087 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 150-78 chr2 197354575 197354912 + 0.75 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -43963 NM_153697 91526 Hs.432706 NM_153697 ENSG00000065413 ANKRD44 PP6-ARS-B ankyrin repeat domain 44 protein-coding 143.75-55 chr15 66478060 66478281 + 0.75 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 18864 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 169.25-29 chr14 59535390 59535789 + 0.75 NA intron (NM_001164399, intron 13 of 19) L2a|LINE|L2 41223 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 149.5-136 chr4 88246022 88246401 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14585 NM_001348985 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 112.75-92 chr2 81020202 81020370 + 0.75 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 446660 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 166.75-109 chr5 14166772 14167139 + 0.75 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 23613 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 122.25-141 chr4 71476462 71476707 + 0.75 NA intron (NM_003759, intron 11 of 22) intron (NM_003759, intron 11 of 22) 137531 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 144.5-150 chr4 69637752 69638131 + 0.75 NA intron (NM_001252275, intron 2 of 6) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 1701 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 117.5-139 chr3 56747733 56747932 + 0.75 NA intron (NM_001128615, intron 9 of 12) intron (NM_001128615, intron 9 of 12) 27885 NM_001128616 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 135.25-137 chr4 45103937 45104229 + 0.75 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -377449 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 154.75-67 chr18 66312687 66313183 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 291155 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 196.75-51 chr19 29722403 29722801 + 0.75 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6813 NM_001256047 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 296.5-44 chr8 138071650 138072102 + 0.75 NA intron (NR_161374, intron 1 of 7) L1MD2|LINE|L1 11669 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 233.5-67 chr21 30564571 30565121 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -3533 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 206.5-140 chr8 131355837 131356182 + 0.75 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -315100 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 133.25-145 chr4 36815005 36815317 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -173261 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 131.5-19 chr1 219913377 219913696 + 0.75 NA TTS (NR_046437) TTS (NR_046437) 15115 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 145.25-178 chr9 28425784 28426105 + 0.75 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 293361 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 150.25-56 chr15 65070788 65071169 + 0.75 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2987 NM_016563 51285 Hs.27018 NM_016563 ENSG00000103710 RASL12 RIS RAS like family 12 protein-coding 210.75-5 chr1 85610412 85610863 + 0.75 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 29876 NM_001554 3491 Hs.8867 NM_001554 ENSG00000142871 CCN1 CYR61|GIG1|IGFBP10 cellular communication network factor 1 protein-coding 198.25-61 chr2 151916462 151916938 + 0.75 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) 55352 NM_001330118 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 126.5-124 chr2 200536112 200536372 + 0.75 NA intron (NM_001160046, intron 4 of 8) intron (NM_001160046, intron 4 of 8) 10035 NM_152524 151246 Hs.655182 NM_152524 ENSG00000163535 SGO2 SGOL2|TRIPIN shugoshin 2 protein-coding 133-80 chr2 28120258 28120624 + 0.75 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 86520 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 116.75-3 chr1 44367140 44367389 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -11985 NM_001301701 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 247.75-31 chr2 118966445 118967269 + 0.75 NA intron (NM_006770, intron 1 of 16) intron (NM_006770, intron 1 of 16) 24688 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 158.5-64 chr14 66636599 66636852 + 0.75 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 129318 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 131-14 chr1 206978713 206978974 + 0.75 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8218 NM_032029 83953 Hs.145519 NM_032029 ENSG00000162897 FCAMR CD351|FCA/MR|FKSG87 Fc fragment of IgA and IgM receptor protein-coding 182.5-33 chr11 93228934 93229286 + 0.75 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -31119 NM_152313 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 150-8 chr1 115957729 115958078 + 0.75 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 -18610 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 132.25-50 chr13 57679837 57680190 + 0.75 NA intron (NM_001040429, intron 3 of 3) intron (NM_001040429, intron 3 of 3) 48269 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 138.25-30 chr11 43262777 43263015 + 0.75 NA non-coding (NR_033868, exon 2 of 2) non-coding (NR_033868, exon 2 of 2) 6473 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 162.5-6 chr1 162854749 162855218 + 0.75 NA exon (NM_178550, exon 4 of 4) exon (NM_178550, exon 4 of 4) 13832 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 246.25-68 chr8 108995184 108995796 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -91138 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 191-32 chr2 33447904 33448240 + 0.75 NA intron (NM_170672, intron 2 of 18) intron (NM_170672, intron 2 of 18) -9983 NM_001349979 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 139.75-144 chr5 3617713 3617961 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 22005 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 124-175 chr8 142951026 142951256 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -33298 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 245-36 chr21 24487720 24488138 + 0.75 NA intron (NR_135520, intron 5 of 5) intron (NR_135520, intron 5 of 5) 59189 NR_135519 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 180.75-31 chr12 100079750 100080077 + 0.75 NA intron (NM_001006947, intron 11 of 12) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 62961 NM_015054 23074 Hs.572154 NM_015054 ENSG00000111647 UHRF1BP1L SHIP164 UHRF1 binding protein 1 like protein-coding 142.5-137 chr22 25875744 25876174 + 0.75 NA intron (NM_001318245, intron 23 of 43) intron (NM_001318245, intron 23 of 43) 133771 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 182-113 chr9 131111550 131111878 + 0.75 NA intron (NM_001185096, intron 3 of 5) intron (NM_001185096, intron 3 of 5) -13872 NM_005085 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 164.75-91 chr22 25078364 25078807 + 0.75 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 34107 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 127.75-157 chr5 63117661 63117955 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 538989 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 174-85 chr6 124243523 124243874 + 0.75 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -39307 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 176.25-4 chr1 91077603 91077863 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -55478 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 148-113 chr6 114324517 114324846 + 0.75 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -261804 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 210.75-55 chr22 47963951 47964569 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -310104 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 130.25-174 chr6 64841782 64842010 + 0.75 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -459522 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 158.5-108 chr2 170748209 170748497 + 0.75 NA intron (NR_110185, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu -22329 NR_110644 285141 Hs.443729 NM_001289947 ENSG00000204334 ERICH2 - glutamate rich 2 protein-coding 150.25-146 chr8 72958952 72959310 + 0.75 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -49733 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 119.25-95 chr2 88236842 88237174 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 63869 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 112.5-205 chr6 16171920 16172119 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 30463 NR_039782 100616269 NR_039782 ENSG00000263712 MIR4639 - microRNA 4639 ncRNA 237.5-50 chr2 108101724 108102086 + 0.75 NA Intergenic LTR19A|LTR|ERV1 -49150 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 181-92 chr6 50261286 50261794 + 0.75 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -211611 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 172-94 chr5 176339404 176339918 + 0.75 NA intron (NM_001308200, intron 6 of 6) intron (NM_001308200, intron 6 of 6) 22103 NM_020444 57179 Hs.743257 NM_020444 ENSG00000122203 KIAA1191 p33MONOX|p60MONOX KIAA1191 protein-coding 178.5-140 chr5 77657115 77657558 + 0.75 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -18639 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 161.75-140 chrX 78374184 78374460 + 0.75 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -46631 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 195.75-79 chr3 126962731 126963120 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -25669 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 114.75-38 chr11 113963682 113963950 + 0.75 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11259 NR_046363 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 119.25-160 chr5 67684190 67684466 + 0.75 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -37539 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 137.75-200 chr8 54706804 54707148 + 0.75 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 90880 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 240.75-63 chr5 42651910 42652285 + 0.75 NA intron (NM_001242403, intron 3 of 9) intron (NM_001242403, intron 3 of 9) 86233 NM_001242460 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 177.5-85 chr2 132860121 132860430 + 0.75 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) intron (NM_207481, intron 11 of 17) -55282 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 123.25-209 chr8 132434842 132435150 + 0.75 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 12266 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 213.75-44 chr17 76882940 76883464 + 0.75 NA intron (NM_144677, intron 3 of 16) AluSx|SINE|Alu 10555 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 130.25-190 chr7 88765381 88765597 + 0.75 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) 5789 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 144.25-76 chr17 55204029 55204389 + 0.75 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -60751 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 205 chr1 13860341 13860701 + 0.75 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 111106 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 163.25-24 chr11 79000480 79000851 + 0.75 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) L1M4a2|LINE|L1 401444 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 263.5-49 chr4 181925309 181926033 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -95698 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 166.75-84 chr20 62945208 62945649 + 0.75 NA 3' UTR (NM_017896, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_017896, exon 5 of 5) 7281 NM_017896 54994 Hs.353013 NM_017896 ENSG00000101193 GID8 C20orf11|TWA1 GID complex subunit 8 homolog protein-coding 120.75-52 chr15 63013775 63014011 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -28854 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 274.75-49 chr7 112296796 112297328 + 0.75 NA intron (NM_021994, intron 4 of 11) AluY|SINE|Alu 90367 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 212.75-22 chr12 48882616 48883164 + 0.75 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17020 NM_014470 27289 Hs.124940 NM_014470 ENSG00000172602 RND1 ARHS|RHO6|RHOS Rho family GTPase 1 protein-coding 160.25-4 chr1 57397425 57397871 + 0.75 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) L3|LINE|CR1 25464 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 117.25-9 chr1 74726338 74726638 + 0.75 NA intron (NM_001889, intron 1 of 8) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 6562 NM_001889 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 246.25-29 chr2 51814162 51814563 + 0.75 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -556286 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 150.25-86 chr20 6008235 6008494 + 0.75 NA intron (NM_001323561, intron 1 of 6) intron (NM_001323561, intron 1 of 6) 1115 NM_001127458 54675 Hs.743956 NM_019095 ENSG00000088766 CRLS1 C20orf155|CLS|CLS1|GCD10|dJ967N21.6 cardiolipin synthase 1 protein-coding 127.75-13 chr1 74221147 74221347 + 0.75 NA intron (NM_001112808, intron 3 of 26) intron (NM_001112808, intron 3 of 26) -14140 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 155.75-127 chr5 9351257 9351705 + 0.75 NA intron (NM_003966, intron 3 of 22) intron (NM_003966, intron 3 of 22) -159852 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 236.5-31 chr15 58084685 58085201 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -19020 NM_001206897 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 120-185 chr8 69691718 69692045 + 0.75 NA intron (NM_001146009, intron 4 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 98981 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 207.25-100 chr8 126895545 126895924 + 0.75 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -117420 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 213.25-59 chr6 134106619 134107023 + 0.75 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 10859 NR_037938 387065 Hs.571061 NR_037938 HMGA1P7 HMGA1L7 high mobility group AT-hook 1 pseudogene 7 pseudo 160.75-93 chr21 20196063 20196294 + 0.75 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL 62507 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 117.5-117 chr2 175819921 175820205 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 182204 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 227.75-57 chr4 47344569 47345022 + 0.75 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) AluSx|SINE|Alu 118907 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 173.5-116 chr4 75204632 75204923 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -120069 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 131-184 chr9 88985112 88985435 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -5590 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 158.25-133 chr7 34330429 34330747 + 0.75 NA Intergenic Intergenic -327630 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 149.25-119 chr3 127876721 127876950 + 0.75 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -38397 NM_001370224 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 191-72 chr7 1900427 1900735 + 0.75 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) intron (NM_001013837, intron 17 of 18) 39990 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 214.25-64 chr5 26861233 26861669 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 177135 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 118-201 chr9 38043955 38044152 + 0.75 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) intron (NM_003028, intron 1 of 5) 25174 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 186.75-125 chrX 74381783 74382263 + 0.75 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie -39470 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 126.75-117 chr2 157375243 157375527 + 0.75 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 5124 NR_034169 728066 Hs.470311 NR_034169 FAM133DP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 188.5-105 chr3 116695224 116695725 + 0.75 NA Intergenic AmnSINE2|SINE|tRNA-Deu -14314 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 125.25-171 chr6 75588919 75589330 + 0.75 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -12385 NM_001304792 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 142.25-45 chr12 65861000 65861279 + 0.75 NA intron (NR_158984, intron 2 of 2) AluSx3|SINE|Alu 20439 NR_120478 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 248-20 chr14 40774991 40775508 + 0.75 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -179462 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 115.75-152 chr4 38830567 38830925 + 0.75 NA intron (NM_006068, intron 1 of 1) L1MC2|LINE|L1 -25955 NM_003263 7096 Hs.621817 NM_003263 ENSG00000174125 TLR1 CD281|TIL|TIL. LPRS5|rsc786 toll like receptor 1 protein-coding 120-11 chr1 219307295 219307539 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 132448 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 199.25-103 chr9 26960084 26960412 + 0.75 NA intron (NM_001099224, intron 1 of 13) L2|LINE|L2 3836 NM_025103 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 197-52 chr5 79025937 79026560 + 0.75 NA intron (NM_013391, intron 13 of 15) intron (NM_013391, intron 13 of 15) -40290 NM_198709 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 245.5-51 chr3 118618148 118618650 + 0.75 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -23369 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 119.5-164 chr4 61560610 61560980 + 0.75 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 358623 NM_001371342 161-42 chr15 53456754 53457082 + 0.75 NA Intergenic Intergenic 83934 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 139.25-89 chr2 102891770 102892150 + 0.75 NA intron (NR_135562, intron 2 of 3) intron (NR_135562, intron 2 of 3) 3762 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 144.25-209 chr8 121500609 121500954 + 0.75 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -138565 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 225-37 chr2 58784086 58784496 + 0.75 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) AluSx1|SINE|Alu 263538 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 175-5 chr1 147452688 147452954 + 0.75 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) intron (NR_038423, intron 3 of 3) 65054 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 115.75-38 chr12 12175855 12176283 + 0.5 NA intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 64117 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 128.25-75 chr17 64055481 64055881 + 0.5 NA exon (NM_001433, exon 13 of 22) exon (NM_001433, exon 13 of 22) -35047 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 168.75-141 chr7 159012602 159013097 + 0.5 NA intron (NR_024394, intron 1 of 4) intron (NR_024394, intron 1 of 4) 4495 NR_024394 154822 Hs.544783 NM_198345 ENSG00000231419 LINC00689 - long intergenic non-protein coding RNA 689 ncRNA 153.5-98 chr2 52901537 52901969 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -199138 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 127.5-93 chr16 7404843 7405315 + 0.5 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 72234 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 120.25-152 chr4 76863401 76863687 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 34600 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 129.5-93 chr16 79196792 79197279 + 0.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MIRb|SINE|MIR 403702 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 113-148 chr5 85717829 85718126 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -564467 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 117-130 chr4 33281370 33281817 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 758300 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 145.25-93 chr21 21382345 21382748 + 0.5 NA intron (NM_001352592, intron 10 of 18) AluSx3|SINE|Alu 235384 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 123.25-70 chr16 12321539 12321914 + 0.5 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) 344992 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 148.75-152 chr7 14077950 14078355 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -86727 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 127.75-110 chr2 161965148 161965559 + 0.5 NA intron (NM_001354443, intron 23 of 25) intron (NM_001354443, intron 23 of 25) 108862 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 131.75-92 chr17 35317161 35317505 + 0.5 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 56288 NM_001104588 91607 Hs.745059 NM_152270 ENSG00000172716 SLFN11 SLFN8/9 schlafen family member 11 protein-coding 197.25-70 chr3 73883489 73884052 + 0.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 74526 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 135.5-44 chr12 1211076 1211421 + 0.5 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) AluSp|SINE|Alu 183500 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 122.75-43 chr13 110617692 110618111 + 0.5 NA intron (NM_018210, intron 1 of 9) intron (NM_018210, intron 1 of 9) 2317 NM_001242881 55739 Hs.408324 NM_018210 ENSG00000213995 NAXD CARKD|LP3298|PEBEL2 NAD(P)HX dehydratase protein-coding 155.5-225 chrX 81768847 81769434 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 567038 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 143.75-204 chrX 46251119 46251584 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 76323 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 172.5-21 chr1 212412642 212413058 + 0.5 NA intron (NM_018252, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 2036 NM_018252 55248 Hs.445386 NM_018252 ENSG00000065600 PACC1 C1orf75|PAC|TMEM206 proton activated chloride channel 1 protein-coding 122-29 chr10 63650340 63650642 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -128601 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 142-80 chr2 41711895 41712364 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165426 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 115.75-69 chr15 25715116 25715497 + 0.5 NA intron (NM_024490, intron 9 of 20) intron (NM_024490, intron 9 of 20) 133519 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 163-54 chr2 17060137 17060666 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -394567 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 129-57 chr13 110055679 110056137 + 0.5 NA TTS (NR_126387) TTS (NR_126387) 2623 NR_126387 104355146 Hs.508690 NR_126387 ENSG00000231428 LINC00396 - long intergenic non-protein coding RNA 396 ncRNA 126-153 chr6 40188600 40189044 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 167184 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 170.5-53 chr14 19940420 19940927 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 5065 NM_001004063 79544 Hs.554584 NM_001004063 ENSG00000155249 OR4K1 OR14-19 olfactory receptor family 4 subfamily K member 1 protein-coding 114-96 chr22 48421125 48421468 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -68257 NM_001082967 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 112.75-10 chr1 103533380 103533742 + 0.5 NA intron (NM_017619, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 7862 NM_017619 55599 Hs.632423 NM_017619 ENSG00000185946 RNPC3 IGHD5|RBM40|RNP|SNRNP65 RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3 protein-coding 149.75-8 chr1 116526741 116527246 + 0.5 NA intron (NM_001779, intron 3 of 5) L1MC1|LINE|L1 33118 NR_039621 100616384 NR_039621 ENSG00000264419 MIR548AC - microRNA 548ac ncRNA 126.25-146 chr5 18519112 18519596 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 712080 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 181-3 chr1 70396369 70396824 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14622 NM_153742 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 117.5-28 chr10 14033012 14033421 + 0.5 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) AluSx|SINE|Alu -24666 NM_001318336 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 153.25-129 chr8 61523789 61524202 + 0.5 NA intron (NM_004318, intron 22 of 24) AluJr|SINE|Alu 165816 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 123.5-39 chr11 56600259 56600537 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 13104 NM_001004740 390168 Hs.553751 NM_001004740 ENSG00000255012 OR5M1 OR11-208|OST050 olfactory receptor family 5 subfamily M member 1 protein-coding 140.25-59 chr16 6388185 6388692 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) 368735 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 124.75-72 chr14 34838488 34838915 + 0.5 NA intron (NM_013448, intron 3 of 26) AluSx1|SINE|Alu -35490 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 152.75-56 chr14 71998390 71998897 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) LTR67B|LTR|ERVL 65116 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 131.75-83 chr16 60420386 60420676 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60738 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 173.25-61 chr2 214545913 214546448 + 0.5 NA intron (NR_159945, intron 4 of 4) intron (NR_159945, intron 4 of 4) 35998 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 113-188 chrX 23998866 23999160 + 0.5 NA intron (NM_030624, intron 3 of 3) AluSq|SINE|Alu 28173 NM_030624 80311 Hs.495854 NM_030624 ENSG00000174010 KLHL15 HEL-S-305 kelch like family member 15 protein-coding 113-93 chr2 119024715 119025039 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 82708 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 175.5-64 chr15 98365325 98365930 + 0.5 NA intron (NR_146567, intron 1 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -34069 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 156.25-66 chr2 43781633 43781991 + 0.5 NA intron (NM_016008, intron 2 of 12) AluY|SINE|Alu 7773 NM_016008 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 130.25-73 chr15 99657780 99658229 + 0.5 NA intron (NM_001365201, intron 4 of 11) L1ME3B|LINE|L1 25026 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 116.25-195 chr6 55825970 55826335 + 0.5 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 49438 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 114.25-83 chr19 50389562 50389927 + 0.5 NA intron (NR_046402, intron 1 of 25) AluSx|SINE|Alu 5397 NR_046402 5424 Hs.279413 NM_002691 ENSG00000062822 POLD1 CDC2|CRCS10|MDPL|POLD DNA polymerase delta 1, catalytic subunit protein-coding 154.75-152 chr8_KI270820v1_alt 14785 15215 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7681 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 130.5-82 chr12 96866832 96867208 + 0.5 NA intron (NM_001306084, intron 67 of 67) intron (NM_001306084, intron 67 of 67) -40237 NM_001135176 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 113.75-42 chr12 12802505 12802910 + 0.5 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -10639 NM_016355 51202 Hs.719938 NM_016355 ENSG00000213782 DDX47 E4-DBP|HQ0256|MSTP162|RRP3 DEAD-box helicase 47 protein-coding 118.25-89 chr18 69756708 69757142 + 0.5 NA intron (NM_152721, intron 6 of 7) intron (NM_152721, intron 6 of 7) 190948 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 128.75-26 chr10 111869123 111869527 + 0.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 314440 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 135.25-142 chr4 60723798 60724204 + 0.5 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -198618 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 144-149 chr9 124025688 124026180 + 0.5 NA intron (NM_004789, intron 4 of 4) AluSz|SINE|Alu 14166 NM_004789 9355 Hs.696425 NM_004789 ENSG00000106689 LHX2 LH2|hLhx2 LIM homeobox 2 protein-coding 122.75-198 chr8 73396093 73396402 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -23827 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 142-121 chr4 71387453 71387972 + 0.5 NA intron (NM_003759, intron 3 of 22) AluSp|SINE|Alu 48659 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 131.75-148 chr4 37223764 37224035 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18092 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 135.25-3 chr1 71106038 71106504 + 0.5 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 24947 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 118.5-44 chr12 62725272 62725656 + 0.5 NA intron (NM_020700, intron 5 of 9) MER39|LTR|ERV1 121778 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 112.75-8 chr1 87103848 87104272 + 0.5 NA intron (NM_012262, intron 6 of 6) intron (NM_012262, intron 6 of 6) -25705 NR_026988 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 122-32 chr10 86599204 86599545 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -55173 NM_033282 94233 Hs.283922 NM_033282 ENSG00000122375 OPN4 MOP opsin 4 protein-coding 138.25-93 chr2 202757013 202757503 + 0.5 NA exon (NM_173511, exon 6 of 8) exon (NM_173511, exon 6 of 8) 71976 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 152.75-145 chr8 34552129 34552537 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -231588 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 118.75-162 chr6 37468028 37468368 + 0.5 NA intron (NM_015050, intron 13 of 23) L1MEf|LINE|L1 31695 NM_138493 154467 Hs.284207 NM_138493 ENSG00000198937 CCDC167 C6orf129|HSPC265 coiled-coil domain containing 167 protein-coding 117.5-181 chr5 91576316 91576667 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -193174 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 143-102 chr4 37952501 37952863 + 0.5 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) L1PA10|LINE|L1 -7716 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 117.5-69 chr15 63863908 63864202 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 6964 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 149.75-129 chr5 75208875 75209248 + 0.5 NA intron (NM_001164443, intron 4 of 24) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 27817 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 139-131 chr6 141792005 141792344 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 296625 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 166.25-112 chr4 40555575 40555957 + 0.5 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) intron (NM_001371114, intron 1 of 5) -39781 NM_019027 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 161.5-40 chr12 13240008 13240523 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 43539 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 120.75-48 chr15 39402851 39403143 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 152328 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 123-42 chr13 31696788 31697173 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42546 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 143-92 chr3 103128382 103128838 + 0.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 395506 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 131.25-85 chr18 12566491 12566857 + 0.5 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) L1MCa|LINE|L1 90058 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 115.75-6 chr1 113846242 113846564 + 0.5 NA intron (NM_012411, intron 9 of 18) L1MDa|LINE|L1 -10232 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 114.25-44 chr12 132637048 132637417 + 0.5 NA intron (NM_006231, intron 41 of 48) intron (NM_006231, intron 41 of 48) 18456 NM_174872 22953 Hs.258580 NM_012226 ENSG00000187848 P2RX2 DFNA41|P2X2 purinergic receptor P2X 2 protein-coding 115.75-193 chr7 6219492 6219728 + 0.5 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -47473 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 142.75-206 chrX 39565026 39565496 + 0.5 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -95955 NR_037501 100500822 NR_037501 ENSG00000263730 MIR3937 - microRNA 3937 ncRNA 157-126 chr9 35392056 35392469 + 0.5 NA intron (NM_006377, intron 25 of 38) L2c|LINE|L2 -14493 NR_110320 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 151.75-87 chr3 58163909 58164361 + 0.5 NA non-coding (NR_135534, exon 2 of 2) non-coding (NR_135534, exon 2 of 2) 6500 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 125.25-135 chr3 110283612 110284091 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 681023 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 138-48 chr15 83763666 83764115 + 0.5 NA intron (NM_207517, intron 3 of 29) intron (NM_207517, intron 3 of 29) 109767 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 163-13 chr10 49017585 49018123 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001031746, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001031746, exon 8 of 8) -32267 NR_036182 100422895 NR_036182 ENSG00000264800 MIR4294 - microRNA 4294 ncRNA 157.75-100 chr20 29705857 29706480 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 157449 NR_133643 105379478 Hs.98121 NR_133643 FAM242B - family with sequence similarity 242 member B ncRNA 121.5-19 chr1 207828119 207828569 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5641 NR_135299 100128537 Hs.445414 NR_135298 MIR29B2CHG C1orf132 MIR29B2 and MIR29C host gene ncRNA 130.25-153 chr4 114478745 114479089 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -119485 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 124-72 chr18 12597751 12598068 + 0.5 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 58823 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 113-49 chr12 15060060 15060473 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 58433 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 122-9 chr1 95284615 95284940 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 33486 NR_135588 100996630 Hs.662270 NR_135588 ENSG00000228504 LINC01760 - long intergenic non-protein coding RNA 1760 ncRNA 141.75-15 chr1 219318668 219319193 + 0.5 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 143961 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 144.25-60 chr14 81791518 81792024 + 0.5 NA Intergenic LTR26B|LTR|ERV1 -48633 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 170.75-14 chr10 72631279 72631688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5292 NM_006077 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 221.25-20 chr12 105326943 105327415 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_131986) promoter-TSS (NR_131986) -162 NR_131986 105369954 Hs.368938 NR_131986 ENSG00000257642 KCCAT198 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 198 ncRNA 141.25-94 chr2 234279152 234279544 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 175247 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 119.25-194 chr7 78281039 78281387 + 0.5 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) L3|LINE|CR1 -66029 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 151.5-66 chr17 60897647 60898100 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) AluJo|SINE|Alu 220022 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 117-195 chr9 35265287 35265599 + 0.5 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -76453 NM_001371188 114.25 chr1 14255164 14255606 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 164588 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 130.75-18 chr10 47131287 47131597 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168755 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 296.25-30 chr7 47206492 47207443 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 257836 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 161.75-47 chr16 70796864 70797481 + 0.5 NA intron (NM_018052, intron 1 of 18) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 3986 NM_018052 55697 Hs.445061 NM_018052 ENSG00000103043 VAC14 ArPIKfyve|TAX1BP2|TRX VAC14 component of PIKFYVE complex protein-coding 129.5-69 chr14 87808797 87809125 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153667 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 167.75-100 chr4 84501667 84502318 + 0.5 NA Intergenic CpG -3758 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 123.75-147 chr5 89550968 89551338 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 465567 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 184.75-6 chr1 174458851 174459280 + 0.5 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) intron (NM_001366446, intron 13 of 25) 11101 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 137.75-100 chr2 83993256 83993660 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -297224 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 124.75-184 chr6 132321972 132322269 + 0.5 NA intron (NM_015529, intron 8 of 11) intron (NM_015529, intron 8 of 11) 79355 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 147.5-37 chr11 111322335 111322790 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17514 NM_001302644 399948 Hs.729225 NM_207429 COLCA1 C11orf92|CASC12|LOH11CR1F colorectal cancer associated 1 protein-coding 164.25-125 chr5 16280305 16280858 + 0.5 NA Intergenic MER97c|DNA|hAT-Tip100 100340 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 113.25-70 chr17 58489479 58489806 + 0.5 NA 3' UTR (NM_004687, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_004687, exon 19 of 19) -1234 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 156.5-147 chr5 44787558 44788160 + 0.5 NA intron (NR_109863, intron 1 of 3) MER41-int|LTR|ERV1 20934 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 120-17 chr10 68265375 68265792 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -33470 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 170.75-119 chr6 139809467 139810083 + 0.5 NA intron (NR_038399, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 38702 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 116.25-199 chr6 128648595 128649005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -128201 NM_001291984 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 129.5-136 chr2 144708815 144709170 + 0.5 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 41025 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 170.25-49 chr16 8657602 8658119 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16757 NM_020686 18 Hs.336768 NM_000663 ENSG00000183044 ABAT GABA-AT|GABAT|NPD009 4-aminobutyrate aminotransferase protein-coding 180.25-47 chr2 5466021 5466536 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 224840 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 168.25-38 chr14 39642652 39643144 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -210398 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 166.25-94 chr20 62466785 62467372 + 0.5 NA intron (NM_080473, intron 3 of 6) intron (NM_080473, intron 3 of 6) 8917 NM_080473 140628 Hs.352250 NM_080473 ENSG00000130700 GATA5 CHTD5|GATAS|bB379O24.1 GATA binding protein 5 protein-coding 178.5-3 chr1 77743838 77744289 + 0.5 NA intron (NM_201624, intron 1 of 23) AluSc|SINE|Alu 15789 NM_201626 23032 Hs.480597 NM_015017 ENSG00000077254 USP33 VDU1 ubiquitin specific peptidase 33 protein-coding 129.25-4 chr1 77018336 77018746 + 0.5 NA intron (NM_001320274, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -41602 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 123.75-19 chr10 99120820 99121280 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1PA13|LINE|L1 114825 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 180.5-14 chr10 70095104 70095667 + 0.5 NA intron (NM_018649, intron 5 of 8) intron (NM_018649, intron 5 of 8) 37440 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 128.5-177 chr5 166608020 166608382 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 318169 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 134-16 chr10 31992502 31992852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63748 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 146.25 chr1 63767770 63768138 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6063 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 125-19 chr10 47370129 47370601 + 0.5 NA intron (NM_153034, intron 1 of 1) intron (NM_153034, intron 1 of 1) 13928 NM_001346933 118738 Hs.27788 NM_153034 ENSG00000265763 ZNF488 - zinc finger protein 488 protein-coding 168-49 chr14 61002414 61003064 + 0.5 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) intron (NR_033344, intron 3 of 16) -21049 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 125.25-29 chr10 85331391 85331746 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 101204 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 116.75-55 chr14 39697317 39697618 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -264967 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 125.5-236 chr7 93546744 93547128 + 0.5 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) 12874 NM_001164738 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 145.5-122 chr22 19653252 19653655 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -61050 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 123-140 chr3 191987935 191988238 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -250544 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 186.75-114 chr8 129742690 129743139 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 43710 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 151.25-181 chr7 111300597 111300942 + 0.5 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 209642 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 116-151 chr7 20134373 20134834 + 0.5 NA TTS (NM_182762) TTS (NM_182762) 5823 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 138.75-35 chr11 113599754 113600069 + 0.5 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 106397 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 170.5-131 chr4 44520158 44520693 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -71616 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 155-31 chr13 66004130 66004579 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37925 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 148.25-152 chr9 33995043 33995396 + 0.5 NA intron (NR_163243, intron 3 of 24) AluSx|SINE|Alu -42365 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 124-136 chr5 109702861 109703183 + 0.5 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 13656 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 156.25-145 chr8 27439502 27439994 + 0.5 NA intron (NM_173175, intron 20 of 29) intron (NM_173175, intron 20 of 29) 6378 NR_106901 102465507 NR_106901 ENSG00000273836 MIR6842 hsa-mir-6842 microRNA 6842 ncRNA 124.5-36 chr11 72918065 72918378 + 0.5 NA intron (NM_014824, intron 9 of 19) L1M4|LINE|L1 103810 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 146-103 chr5 6116381 6116828 + 0.5 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger 220688 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 121.75-117 chr3 84576720 84577155 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 292638 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 136.5-110 chr2 55421243 55421680 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1605 NM_018084 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 146-62 chr2 51012937 51013447 + 0.5 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 18940 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 218.25-23 chr12 75361761 75362397 + 0.5 NA intron (NM_001304964, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 27409 NM_001304964 256710 Hs.567788 NM_152779 ENSG00000173401 GLIPR1L1 ALKN2972|PRO7434 GLIPR1 like 1 protein-coding 189.25-52 chr2 4055903 4056302 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 81941 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 124.5-232 chr8 124277219 124277508 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29965 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 119.5-137 chr20 18685400 18685776 + 0.5 NA intron (NR_109955, intron 2 of 3) intron (NR_109955, intron 2 of 3) 13120 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 125.75-60 chr15 79680764 79681074 + 0.5 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 216078 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 130.25-92 chr2 29706228 29706605 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 2 of 28) intron (NM_004304, intron 2 of 28) 215170 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 151.75-152 chr8 102592607 102592992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41210 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 114-143 chr6 34544256 34544632 + 0.5 NA exon (NM_001252294, exon 2 of 5) exon (NM_001252294, exon 2 of 5) 11885 NM_012391 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 180.25-98 chr5 91640421 91640965 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -257376 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 138-138 chr6 49727454 49727833 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001190986, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001190986, exon 8 of 8) -14053 NM_001261822 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 143.25-107 chr21 14174592 14175101 + 0.5 NA intron (NM_198996, intron 4 of 9) AluSx3|SINE|Alu 32103 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 112.5-24 chr10 76293020 76293328 + 0.5 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) AluSz6|SINE|Alu 510413 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 114-107 chr3 122271155 122271456 + 0.5 NA intron (NM_001178065, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 -53943 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 119.5-111 chr2 5703913 5704157 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11651 NM_003108 6664 Hs.432638 NM_003108 ENSG00000176887 SOX11 MRD27 SRY-box transcription factor 11 protein-coding 123-105 chr2 83338604 83338893 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -184066 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 124.25-174 chr6 13623236 13623576 + 0.5 NA intron (NM_005493, intron 13 of 13) intron (NM_005493, intron 13 of 13) 8071 NM_016167 51406 Hs.306242 NM_016167 ENSG00000225921 NOL7 C6orf90|PQBP3|RARG-1|dJ223E5.2 nucleolar protein 7 protein-coding 125.75-129 chr3 106608227 106608555 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 632247 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 143.75-202 chr9 126068624 126069139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 207034 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 124.5-85 chr18 3965372 3965651 + 0.5 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 3158 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 140.25-188 chr8 109578542 109579037 + 0.5 NA intron (NM_001099754, intron 5 of 6) intron (NM_001099754, intron 5 of 6) 24670 NM_001363032 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 140.75-193 chr9 5528230 5528586 + 0.5 NA intron (NM_025239, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 17877 NM_025239 80380 Hs.532279 NM_025239 ENSG00000197646 PDCD1LG2 B7DC|Btdc|CD273|PD-L2|PDCD1L2|PDL2|bA574F11.2 programmed cell death 1 ligand 2 protein-coding 145.75-114 chr4 111449260 111449601 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -588783 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 162-109 chr7 93288252 93288884 + 0.5 NA intron (NM_001257998, intron 13 of 28) L1MC5a|LINE|L1 56202 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 211.75-52 chr20 6534910 6535592 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 108519 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 191.75-123 chr8 19564502 19565119 + 0.5 NA intron (NM_001354497, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 37735 NM_001354491 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 122-141 chr5 106931378 106931725 + 0.5 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 79463 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 112.25-32 chr11 81052825 81053083 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -290151 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 149.25-165 chr7 31456738 31457285 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57060 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 121.75-187 chr8 79675890 79676213 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 64934 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 210.75-83 chr5 148309190 148309841 + 0.5 NA intron (NR_105057, intron 2 of 4) intron (NR_105057, intron 2 of 4) -2908 NM_032566 84651 Hs.244569 NM_032566 ENSG00000145879 SPINK7 ECG2|ECRG2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) protein-coding 139-63 chr19 38503272 38503823 + 0.5 NA intron (NM_001042723, intron 49 of 104) AluSz|SINE|Alu 69847 NM_000540 6261 Hs.466664 NM_000540 ENSG00000196218 RYR1 CCO|MHS|MHS1|PPP1R137|RYDR|RYR|RYR-1|SKRR ryanodine receptor 1 protein-coding 119.5-150 chr3 41223796 41224254 + 0.5 NA 5' UTR (NM_001330729, exon 2 of 17) 5' UTR (NM_001330729, exon 2 of 17) 24520 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 120-136 chr4 161157456 161157809 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -865101 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 128.75-74 chr17 59628758 59629117 + 0.5 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) AluSx1|SINE|Alu 9042 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 116.5-48 chr12 21597114 21597399 + 0.5 NA intron (NM_021957, intron 1 of 15) L1MA4A|LINE|L1 7591 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 149.25-62 chr17 58401416 58401975 + 0.5 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) intron (NM_001305544, intron 2 of 9) 1026 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 175-18 chr10 119350619 119351069 + 0.5 NA intron (NM_005308, intron 2 of 15) intron (NM_005308, intron 2 of 15) -27128 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 130-144 chr6 141109881 141110260 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 426256 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 145.75-153 chr7 77364453 77364892 + 0.5 NA intron (NR_146937, intron 12 of 31) L1PA3|LINE|L1 -50526 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 127.5-176 chr4 98315753 98316163 + 0.5 NA intron (NM_021159, intron 2 of 14) intron (NM_021159, intron 2 of 14) 54574 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 122.25-192 chr8 88714302 88714690 + 0.5 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -387013 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 167.5-75 chr17 65006657 65007149 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -31318 NR_026903 201283 Hs.396447 NM_153032 ENSG00000214174 AMZ2P1 - archaelysin family metallopeptidase 2 pseudogene 1 pseudo 161.75-44 chr15 99666022 99666664 + 0.5 NA intron (NM_001365201, intron 4 of 11) L1PA7|LINE|L1 33365 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 139.75-107 chr20 40450416 40450897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 238580 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 130.5-257 chr9 89360950 89361341 + 0.5 NA non-coding (NR_163884, exon 17 of 17) non-coding (NR_163884, exon 17 of 17) 42294 NM_001282690 79048 Hs.59804 NM_024077 ENSG00000187742 SECISBP2 SBP2 SECIS binding protein 2 protein-coding 121.25-116 chr20 49865720 49866138 + 0.5 NA intron (NR_048540, intron 8 of 11) intron (NR_048540, intron 8 of 11) 2070 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 130-18 chr10 110758318 110758658 + 0.5 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 112416 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 155-19 chr10 89537004 89537480 + 0.5 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -1648 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 133.75-171 chr6 134836709 134837149 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113172 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 134.5-118 chr21 27653624 27654090 + 0.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -68522 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 124.25-168 chr5 113110818 113111206 + 0.5 NA intron (NM_001085377, intron 6 of 18) intron (NM_001085377, intron 6 of 18) 134214 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 142.75-72 chr16 60995282 60995734 + 0.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 60258 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 115.75-51 chr13 26195485 26195813 + 0.5 NA intron (NM_183045, intron 5 of 5) L1MCa|LINE|L1 26108 NM_183044 6049 Hs.136885 NM_005977 ENSG00000127870 RNF6 - ring finger protein 6 protein-coding 169.25-52 chr2 62184127 62184703 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11700 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 129.5-30 chr10 106716702 106717067 + 0.5 NA intron (NM_001206569, intron 6 of 25) AluSz6|SINE|Alu 447822 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 140.75-17 chr10 50032013 50032314 + 0.5 NA intron (NR_038275, intron 6 of 6) AluY|SINE|Alu 35640 NR_038275 100421577 Hs.712902 NR_038275 ENSG00000235618 FAM21EP - family with sequence similarity 21, member A pseudogene pseudo 147-64 chr19 33334245 33334649 + 0.5 NA Intergenic (TAATTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31626 NR_026887 80054 Hs.287521 NR_026887 ENSG00000267296 CEBPA-DT CEBPA-AS1 CEBPA divergent transcript ncRNA 114.5-248 chr8 17522949 17523401 + 0.5 NA intron (NM_001370338, intron 2 of 12) intron (NM_001370338, intron 2 of 12) -15602 NM_003046 6542 Hs.448520 NM_003046 ENSG00000003989 SLC7A2 ATRC2|CAT2|HCAT2 solute carrier family 7 member 2 protein-coding 129-172 chr7 105769956 105770408 + 0.5 NA intron (NM_152749, intron 3 of 3) intron (NM_152749, intron 3 of 3) -91020 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 119.75-153 chr3 196748757 196749027 + 0.5 NA intron (NM_002577, intron 1 of 14) L1MB2|LINE|L1 9035 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 115.75-27 chr11 32641705 32642124 + 0.5 NA intron (NM_001008391, intron 13 of 17) intron (NM_001008391, intron 13 of 17) 58083 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 112.75-42 chr12 93694424 93694771 + 0.5 NA intron (NM_001320100, intron 2 of 2) L1MA8|LINE|L1 15828 NM_001330126 8738 Hs.38533 NM_003805 ENSG00000169372 CRADD MRT34|RAIDD CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with death domain protein-coding 144.75-62 chr15 98033358 98033708 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 30495 NR_146563 105371008 NR_146563 LINC02251 - long intergenic non-protein coding RNA 2251 ncRNA 154.5-63 chr14 82587602 82588161 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -54751 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 132-31 chr11 86481413 86481832 + 0.5 NA intron (NM_001014811, intron 6 of 13) intron (NM_001014811, intron 6 of 13) 106735 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 137-96 chr22 25796246 25796668 + 0.5 NA intron (NM_001318245, intron 11 of 43) AluJr|SINE|Alu 54269 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 189.5-124 chr6 140677450 140677853 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6163 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 148-88 chr3 192494044 192494559 + 0.5 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 -20721 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 147.25-81 chr3 62864904 62865273 + 0.5 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) intron (NM_003716, intron 1 of 29) 10328 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 132.5-156 chr3 15808433 15808874 + 0.5 NA intron (NM_015199, intron 1 of 27) intron (NM_015199, intron 1 of 27) -10469 NM_001195098 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 150-129 chr7 42338052 42338603 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -101118 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 124.75-40 chr11 28386926 28387195 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 90488 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 124.5-59 chr14 36219505 36219905 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -43054 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 115.5-144 chr2 201542019 201542318 + 0.5 NA intron (NM_001168221, intron 11 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 77010 NM_152525 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 113.25-4 chr1 65335297 65335667 + 0.5 NA intron (NM_001256864, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 25939 NM_001256864 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 132.75-203 chr9 93926581 93926941 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28594 NM_021570 56033 Hs.164960 NM_021570 ENSG00000131668 BARX1 - BARX homeobox 1 protein-coding 137.75-33 chr10 126140780 126141235 + 0.5 NA intron (NM_001288974, intron 4 of 18) intron (NM_001288974, intron 4 of 18) -167734 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 154.25-92 chr2 213507248 213507799 + 0.5 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) MIRb|SINE|MIR 223059 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 164.5-29 chr11 45891919 45892413 + 0.5 NA intron (NM_005456, intron 1 of 11) intron (NM_005456, intron 1 of 11) 6515 NM_005456 9479 Hs.234249 NM_005456 ENSG00000121653 MAPK8IP1 IB1|JIP-1|JIP1|PRKM8IP mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 protein-coding 142.75-198 chr9 37031350 37031749 + 0.5 NA intron (NM_001280548, intron 1 of 8) intron (NM_001280548, intron 1 of 8) 2719 NM_001280554 5079 Hs.654464 NM_016734 ENSG00000196092 PAX5 ALL3|BSAP paired box 5 protein-coding 113.75-83 chr17 81992529 81992877 + 0.5 NA intron (NR_045351, intron 3 of 14) intron (NR_045351, intron 3 of 14) 15074 NM_024083 79058 Hs.298351 NM_024083 ENSG00000169696 ASPSCR1 ASPCR1|ASPL|ASPS|RCC17|TUG|UBXD9|UBXN9 ASPSCR1 tether for SLC2A4, UBX domain containing protein-coding 115.5-59 chr14 33926290 33926741 + 0.5 NA intron (NM_001308103, intron 4 of 4) intron (NM_001308103, intron 4 of 4) 24559 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 162-48 chr17 7888854 7889374 + 0.5 NA intron (NM_001005273, intron 1 of 39) intron (NM_001005273, intron 1 of 39) 263 NM_001005273 1107 Hs.25601 NM_005852 ENSG00000170004 CHD3 Mi-2a|Mi2-ALPHA|SNIBCPS|ZFH chromodomain helicase DNA binding protein 3 protein-coding 169.75-15 chr10 54671715 54672129 + 0.5 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) MER1A|DNA|hAT-Charlie -63965 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 151.5-34 chr12 39651257 39651848 + 0.5 NA intron (NM_001031748, intron 7 of 12) L2|LINE|L2 25369 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 166.25-31 chr11 44763833 44764338 + 0.5 NA intron (NM_130783, intron 1 of 9) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 37123 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 120.75-55 chr15 77654660 77654987 + 0.5 NA intron (NM_001301195, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR -5228 NR_120362 101929478 Hs.569510 NR_120361 ENSG00000259281 LINGO1-AS2 - LINGO1 antisense RNA 2 ncRNA 150.5-102 chr2 153339838 153340178 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 138754 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 143.75-167 chr7 7434315 7434705 + 0.5 NA intron (NM_001037763, intron 23 of 34) intron (NM_001037763, intron 23 of 34) 101363 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 175.25-88 chr22 27167675 27168197 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19580 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 136.75-69 chr16 8319300 8319826 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 270275 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 139-53 chr17 57983903 57984342 + 0.5 NA intron (NM_007146, intron 1 of 5) intron (NM_007146, intron 1 of 5) 4132 NM_001330393 7716 Hs.463569 NM_007146 ENSG00000136451 VEZF1 DB1|ZNF161 vascular endothelial zinc finger 1 protein-coding 168-100 chr5 35022876 35023479 + 0.5 NA intron (NM_031900, intron 9 of 13) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24772 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 146-27 chr12 33855092 33855408 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -167246 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 128.5-228 chr8 138534696 138535200 + 0.5 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -37218 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 149.5-151 chr5 33356179 33356655 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84279 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 141.5-78 chr18 7952532 7952840 + 0.5 NA intron (NM_002845, intron 6 of 30) AluY|SINE|Alu 385370 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 133.75-11 chr1 222981663 222982151 + 0.5 NA intron (NM_001369594, intron 2 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 53483 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 118.5-37 chr11 108528020 108528398 + 0.5 NA intron (NM_015065, intron 3 of 5) intron (NM_015065, intron 3 of 5) 9968 NM_001144764 23086 Hs.28540 NM_015065 ENSG00000110723 EXPH5 SLAC2-B|SLAC2B exophilin 5 protein-coding 123.75-173 chr7 39060620 39061025 + 0.5 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) FAM|SINE|Alu -47255 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 126.5-238 chr8 70172757 70173102 + 0.5 NA intron (NM_001321713, intron 4 of 21) intron (NM_001321713, intron 4 of 21) -101677 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 132.25-113 chr20 46662150 46662624 + 0.5 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) intron (NM_001193340, intron 2 of 12) -10928 NM_001193342 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 188.25-80 chr4 55986548 55987002 + 0.5 NA intron (NM_025009, intron 14 of 25) L1PA16|LINE|L1 37830 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 176.5-62 chr14 101248707 101249178 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 128086 NR_146490 101929422 NR_146490 ENSG00000259004 LINC02285 - long intergenic non-protein coding RNA 2285 ncRNA 160-77 chr4 74315154 74315580 + 0.5 NA non-coding (NR_073117, exon 3 of 3) non-coding (NR_073117, exon 3 of 3) 6897 NR_073117 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 150-64 chr17 74849814 74850259 + 0.5 NA intron (NM_001278553, intron 6 of 11) intron (NM_001278553, intron 6 of 11) 9848 NR_103735 2905 Hs.436980 NM_000835 ENSG00000161509 GRIN2C GluN2C|NMDAR2C|NR2C glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C protein-coding 130.75-190 chr8 88663181 88663587 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -335901 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 168.25-117 chr5 102342755 102343338 + 0.5 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 -46762 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 115-77 chr2 20605914 20606198 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -13508 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 132-103 chr22 39710638 39710937 + 0.5 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 140034 NM_021096 8911 Hs.125116 NM_021096 ENSG00000100346 CACNA1I Cav3.3|ca(v)3.3 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I protein-coding 155-114 chr5 164272557 164272950 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 194649 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 179-62 chr21 29322004 29322631 + 0.5 NA intron (NM_206866, intron 2 of 4) intron (NM_206866, intron 2 of 4) 17113 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 123.75-9 chr1 119935980 119936416 + 0.5 NA intron (NM_001200001, intron 21 of 21) LTR55|LTR|ERVL? -39683 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 203.25-76 chr4 147036312 147037012 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -90776 NM_031956 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 130.75-179 chr7 61742645 61743019 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1561224 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 179-9 chr1 195020230 195020626 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1068287 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 133.75-19 chr10 56014994 56015307 + 0.5 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 346109 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 171.25-149 chr8 86011781 86012386 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57585 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 150.75-185 chr8 106161556 106161945 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -101247 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-49 chr13 98693646 98694130 + 0.5 NA intron (NM_005073, intron 18 of 22) MER4CL34|LTR|ERV1 58784 NM_005073 6564 Hs.436893 NM_005073 ENSG00000088386 SLC15A1 HPECT1|HPEPT1|PEPT1 solute carrier family 15 member 1 protein-coding 141.25-184 chr8 133856765 133857204 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29512 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 154.75-62 chr18 8363797 8364259 + 0.5 NA intron (NR_024419, intron 3 of 3) intron (NR_024419, intron 3 of 3) 3006 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 124.75-19 chr1 207647650 207648116 + 0.5 NA intron (NM_175710, intron 1 of 11) intron (NM_175710, intron 1 of 11) 2750 NM_175710 1379 Hs.628568 NM_175710 ENSG00000197721 CR1L - complement C3b/C4b receptor 1 like protein-coding 148.75-143 chr6 27125806 27126281 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 6753 NM_021058 8970 Hs.591807 NM_021058 ENSG00000124635 HIST1H2BJ H2B/r|H2BFR|H2BJ histone cluster 1 H2B family member j protein-coding 135-122 chr4 39646106 39646534 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -7455 NM_174921 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 139.5-54 chr12 130121090 130121542 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 40362 NR_033834 440119 Hs.288262 NR_033834 ENSG00000250208 FZD10-AS1 FZD10-DT FZD10 antisense divergent transcript ncRNA 119-179 chr7 29492348 29492735 + 0.5 NA intron (NM_001293081, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 8725 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 161.25-38 chr12 60056066 60056602 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 366964 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 132.75-209 chrX 93791658 93792014 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 117630 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 113.75-110 chr20 508945 509262 + 0.5 NA intron (NM_001362771, intron 1 of 13) intron (NM_001362771, intron 1 of 13) 34687 NM_001895 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 172.5-46 chr12 23882368 23882992 + 0.5 NA intron (NM_001330785, intron 2 of 14) intron (NM_001330785, intron 2 of 14) 66990 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 184-26 chr15 33610745 33611148 + 0.5 NA intron (NM_001243996, intron 18 of 102) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 299979 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 140-69 chr2 37998417 37998922 + 0.5 NA intron (NM_001170793, intron 7 of 9) intron (NM_001170793, intron 7 of 9) 37672 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-228 chr9 65411441 65411887 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -126455 NM_001126334 653427 Hs.714683 NM_001126334 ENSG00000204779 FOXD4L5 bA15J10.2 forkhead box D4 like 5 protein-coding 125.75-154 chr5 56490432 56490783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8838 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 165.25-6 chr1 104321761 104322397 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 249056 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 184-34 chr16 65810277 65810735 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -234206 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 138.75-210 chr9 96534405 96534765 + 0.5 NA intron (NR_147239, intron 7 of 14) intron (NR_147239, intron 7 of 14) 32246 NM_001351569 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 120.25-178 chr6 12820738 12821074 + 0.5 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) 102207 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 132.5-106 chr2 4606445 4606845 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 49577 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 144-47 chr17 35091778 35092342 + 0.5 NA TTS (NR_037712) TTS (NR_037712) -2834 NR_037713 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 148.5-135 chr22 35157135 35157557 + 0.5 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 73710 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 146-71 chr2 168304317 168304711 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -56919 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 134-149 chr6 77363082 77363534 + 0.5 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu 100714 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 132-170 chr8 19797918 19798375 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -19003 NR_148458 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 127.25-174 chr5 161463989 161464302 + 0.5 NA intron (NM_000813, intron 4 of 9) L1ME1|LINE|L1 83979 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 136.75-52 chr13 88992085 88992462 + 0.5 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -243018 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 141.75-64 chr15 76582438 76582933 + 0.5 NA intron (NR_148227, intron 22 of 32) L1MA3|LINE|L1 -3962 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 120.5-163 chr4 59148532 59148885 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 135135 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 124.75-133 chr21 25012509 25012920 + 0.5 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 172164 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 174.75-127 chr8 101552221 101552716 + 0.5 NA intron (NM_024915, intron 2 of 15) intron (NM_024915, intron 2 of 15) 60029 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 212.75-32 chr14 61046498 61047088 + 0.5 NA intron (NR_033344, intron 12 of 16) intron (NR_033344, intron 12 of 16) -65103 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 145.75-93 chr21 31368254 31368746 + 0.5 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -24146 NM_001353694 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 133.75-51 chr14 31172039 31172487 + 0.5 NA intron (NM_015382, intron 6 of 42) intron (NM_015382, intron 6 of 42) 35530 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 141.75-67 chr16 26443729 26444216 + 0.5 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu 418735 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 116.5-112 chr2 51412576 51412879 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) intron (NR_135237, intron 4 of 10) 380126 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 132.25-99 chr2 136504773 136505133 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -260592 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 129.5-203 chr6 99156450 99156928 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32080 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 163-122 chr8 134663224 134663664 + 0.5 NA intron (NM_020863, intron 1 of 15) L1ME4a|LINE|L1 33111 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 189-48 chr18 68835643 68836197 + 0.5 NA intron (NM_024781, intron 1 of 7) intron (NM_024781, intron 1 of 7) 37840 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 127-2 chr1 95415702 95416139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58817 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 120-108 chr22 32583999 32584451 + 0.5 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) LTR26E|LTR|ERV1 108988 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 145.75-136 chr6 72432026 72432572 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 65553 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 135-34 chr12 94898517 94899043 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 64326 NR_036685 160313 Hs.527883 NR_036685 ENSG00000216306 KRT19P2 KRT19P5 keratin 19 pseudogene 2 pseudo 206-71 chr7 89263583 89264170 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -468139 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 183.25-42 chr17 33672696 33673100 + 0.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR -139138 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 157.25-90 chr21 33543976 33544477 + 0.5 NA intron (NM_001291412, intron 1 of 10) intron (NM_001291412, intron 1 of 10) 1188 NM_032195 6651 Hs.517262 NM_003103 ENSG00000159140 SON BASS1|C21orf50|DBP-5|NREBP|SON3|TOKIMS SON DNA binding protein protein-coding 152.25-62 chr16 80350379 80350967 + 0.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu -190061 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 245.25-65 chr6 161826934 161827473 + 0.5 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 356226 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 123-13 chr1 172902334 172902792 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 148400 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 129.5-61 chr14 33850106 33850527 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 100758 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 114.25-182 chr7 84002752 84003099 + 0.5 NA intron (NM_006080, intron 11 of 16) intron (NM_006080, intron 11 of 16) 191864 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 149.25-197 chrX 40856829 40857287 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -23862 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 151.25-71 chr18 2337092 2337416 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 234251 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 121.5-128 chr2 48839286 48839699 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -83768 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 152.5-148 chr5 43283141 43283604 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 29809 NM_001364188 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 122.75-205 chr8 110281591 110281863 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -305956 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 155.5-109 chr20 7672272 7672841 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 267902 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 136.75-103 chr2 121842858 121843360 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 87458 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 145.25-24 chr11 112953597 112954083 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7580 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 161-31 chr13 45652421 45652957 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -36950 NM_182542 220081 Hs.668747 NM_182542 ENSG00000165837 ERICH6B FAM194B glutamate rich 6B protein-coding 112.25-173 chr5 132213534 132213881 + 0.5 NA intron (NM_001365681, intron 5 of 13) intron (NM_001365681, intron 5 of 13) 4211 NR_106888 102465498 NR_106888 ENSG00000283678 MIR6830 hsa-mir-6830 microRNA 6830 ncRNA 135-141 chr5 44010052 44010343 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -378535 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 149.25-136 chr4 106075337 106075723 + 0.5 NA intron (NM_001290768, intron 26 of 26) intron (NM_001290768, intron 26 of 26) -53052 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 127-68 chr15 66445668 66446067 + 0.5 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) L1ME1|LINE|L1 51167 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 171.75-146 chr9 7006000 7006445 + 0.5 NA intron (NR_148680, intron 13 of 21) intron (NR_148680, intron 13 of 21) 248872 NM_001304341 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 116.75-177 chr6 152434802 152435126 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 33 of 145) intron (NM_182961, intron 33 of 145) 54434 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 118-7 chr1 100971222 100971639 + 0.5 NA intron (NM_133496, intron 10 of 10) intron (NM_133496, intron 10 of 10) 54354 NM_015958 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 163.75-70 chr2 79074775 79075339 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12936 NM_006507 5968 Hs.4158 NM_006507 ENSG00000172023 REG1B PSPS2|REGH|REGI-BETA|REGL regenerating family member 1 beta protein-coding 156.5-136 chr4 90688849 90689414 + 0.5 NA intron (NM_207491, intron 6 of 7) intron (NM_207491, intron 6 of 7) 454100 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 132-138 chr5 87158811 87159218 + 0.5 NA intron (NR_105018, intron 2 of 3) intron (NR_105018, intron 2 of 3) 38866 NR_105018 101929380 NR_105018 LOC101929380 - uncharacterized LOC101929380 ncRNA 113.5-50 chr11 84666680 84667023 + 0.5 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIRb|SINE|MIR 54091 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 115-83 chr2 69307595 69307890 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 79485 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 122.5-36 chr11 87538806 87539125 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 180446 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 131.75-51 chr12 55217253 55217597 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3600 NM_001005280 121364 Hs.554557 NM_001005280 ENSG00000179919 OR10A7 OR12-6 olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 protein-coding 119.5-42 chr11 23463979 23464455 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -45027 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 143-20 chr11 71347468 71347883 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 75679 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 122.25-193 chr8 89622811 89623262 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 134675 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 127.25-198 chr7 102868414 102868712 + 0.5 NA intron (NR_105043, intron 17 of 20) L1MA6|LINE|L1 -44437 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 135.5-120 chr2 204322322 204322858 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -222885 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 123.75-107 chr21 32717792 32718146 + 0.5 NA intron (NM_203446, intron 2 of 32) L1MEc|LINE|L1 9952 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 120.5-244 chrX 45483855 45484271 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -21325 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 116.5-227 chr7 22058723 22059103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -113014 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 134-90 chr2 79929147 79929627 + 0.5 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) L3|LINE|CR1 -62804 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 157.75-160 chr7 37127695 37128147 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) AluSx|SINE|Alu 130125 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-15 chr10 52423277 52423711 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31778 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 128.5-29 chr10 77176950 77177307 + 0.5 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 36297 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 116.25-98 chr2 9036127 9036510 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -32634 NR_135598 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 141.75-87 chr2 49436247 49436763 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -281978 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 142.75-123 chr22 33410575 33410989 + 0.5 NA intron (NM_133642, intron 7 of 14) MIRc|SINE|MIR 25887 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 146.5-45 chr11 81799767 81800205 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 90850 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 153.25-147 chr9 88608439 88609042 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 73562 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 174-88 chr7 14584934 14585399 + 0.5 NA intron (NM_001350717, intron 16 of 24) intron (NM_001350717, intron 16 of 24) 256284 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 136.75-165 chr6 51528282 51528608 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -93425 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 126-74 chr17 9514804 9515305 + 0.5 NA intron (NR_033656, intron 2 of 5) intron (NR_033656, intron 2 of 5) 60766 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 131-170 chr8 64202620 64203134 + 0.5 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 165681 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 115-151 chr5 166992430 166992820 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66255 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 207-6 chr1 219200813 219201489 + 0.5 NA intron (NM_001300770, intron 3 of 4) intron (NM_001300770, intron 3 of 4) 26182 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 164-105 chr5 113237303 113237795 + 0.5 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 57389 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 198.5-44 chr14 49772575 49773170 + 0.5 NA intron (NM_014315, intron 2 of 12) AluSx1|SINE|Alu 4719 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 123.25-24 chr10 72173884 72174331 + 0.5 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) intron (NM_001369110, intron 5 of 8) 41849 NM_001369111 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 119-134 chr4 90733818 90734201 + 0.5 NA intron (NM_001145065, intron 7 of 10) L1MA3|LINE|L1 498978 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 133.75-129 chr3 61650182 61650479 + 0.5 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) intron (NM_002841, intron 1 of 29) 88759 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 140.75-98 chr2 138499243 138499609 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2344 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 122.5-230 chr8 133800458 133800786 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23270 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 126.75-240 chr8 79799061 79799542 + 0.5 NA intron (NR_125410, intron 3 of 3) intron (NR_125410, intron 3 of 3) 31159 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 126.25-194 chr8 15805068 15805492 + 0.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 265017 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 114-80 chr2 124015141 124015486 + 0.5 NA intron (NR_147976, intron 2 of 2) intron (NR_147976, intron 2 of 2) 9861 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 143-122 chr5 126523195 126523587 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 58241 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 149.75-58 chr16 71376136 71376649 + 0.5 NA intron (NM_001740, intron 3 of 10) intron (NM_001740, intron 3 of 10) 17669 NR_027910 794 Hs.106857 NM_001740 ENSG00000172137 CALB2 CAB29|CAL2|CR calbindin 2 protein-coding 115.25-205 chr8 80784082 80784420 + 0.5 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) L1MC1|LINE|L1 90217 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 126.5-100 chr19 37521626 37522074 + 0.5 NA intron (NM_001013659, intron 3 of 7) intron (NM_001013659, intron 3 of 7) -14763 NR_110723 101927720 Hs.18070 NR_110723 ENSG00000266916 ZNF793-AS1 - ZNF793 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 155.75-151 chr7 82051884 82052471 + 0.5 NA intron (NM_001302890, intron 10 of 10) intron (NM_001302890, intron 10 of 10) 43000 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 118.75-75 chr17 28409085 28409440 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -3050 NM_080669 113235 Hs.446689 NM_080669 ENSG00000076351 SLC46A1 G21|HCP1|PCFT solute carrier family 46 member 1 protein-coding 113-24 chr10 62297244 62297617 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28586 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 143.75-178 chr8 51386652 51387180 + 0.5 NA intron (NM_144651, intron 17 of 22) intron (NM_144651, intron 17 of 22) 422529 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 121.5-100 chr16 71985841 71986157 + 0.5 NA intron (NM_181536, intron 5 of 29) intron (NM_181536, intron 5 of 29) 13979 NM_181536 342372 Hs.675286 NM_181536 ENSG00000277481 PKD1L3 - polycystin 1 like 3, transient receptor potential channel interacting protein-coding 115-8 chr1 95854854 95855254 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -137014 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 115.5-98 chr18 6981501 6981840 + 0.5 NA intron (NM_005559, intron 41 of 62) intron (NM_005559, intron 41 of 62) 26993 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 114.25-43 chr12 105380392 105380729 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49869 NM_001145199 387882 Hs.368938 NM_207376 ENSG00000235162 C12orf75 AGD3|OCC-1|OCC1 chromosome 12 open reading frame 75 protein-coding 137.25-50 chr15 85625037 85625521 + 0.5 NA intron (NM_001270546, intron 1 of 28) intron (NM_001270546, intron 1 of 28) 5329 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 185.5-143 chr6 75212653 75213173 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6860 NM_080645 1303 Hs.101302 NM_004370 ENSG00000111799 COL12A1 BA209D8.1|BTHLM2|COL12A1L|DJ234P15.1|EDSMYP|UCMD2 collagen type XII alpha 1 chain protein-coding 121.25-143 chr4 47264165 47264440 + 0.5 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) HAL1|LINE|L1 199400 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 172.5-70 chr14 65133833 65134370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31406 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 188.5-118 chr4 147510776 147511298 + 0.5 NA intron (NM_001166055, intron 2 of 5) intron (NM_001166055, intron 2 of 5) 29940 NM_001957 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 140-30 chr12 39919067 39919512 + 0.5 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 186792 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 115.5-228 chr7 39631222 39631661 + 0.5 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 7869 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 148-96 chr5 4800285 4800648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26985 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 125.25-81 chr17 58924337 58924661 + 0.5 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 168630 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 179-41 chr16 24206970 24207435 + 0.5 NA intron (NM_212535, intron 16 of 16) intron (NM_212535, intron 16 of 16) 4086 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 155.25-78 chr16 82418231 82418833 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -208437 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 126-117 chr3 67012613 67013032 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 14515 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 149.25-57 chr16 30696310 30696716 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 1958 NM_001256932 730183 Hs.535456 NM_001256932 ENSG00000261840 LOC730183 - uncharacterized LOC730183 protein-coding 116.25-42 chr12 2169455 2169710 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 53899 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 215.75-49 chr2 13639887 13640609 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -633235 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 125.5-6 chr1 71164193 71164588 + 0.5 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 83066 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 227.25-64 chr6 19446420 19447263 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -2980 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 114.75-75 chr18 37506547 37506827 + 0.5 NA intron (NM_001353724, intron 1 of 12) intron (NM_001353724, intron 1 of 12) -20895 NM_001353757 56853 Hs.435976 NM_020180 ENSG00000101489 CELF4 BRUNOL4|CELF-4 CUGBP Elav-like family member 4 protein-coding 157.75-140 chr5 111165479 111165887 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57900 NM_001323375 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 138.5-120 chr21 36974025 36974438 + 0.5 NA intron (NM_001352515, intron 1 of 10) LTR33A_|LTR|ERVL 6666 NM_001352516 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 122.75-59 chr16 89651748 89652136 + 0.5 NA intron (NM_001083314, intron 1 of 5) intron (NM_001083314, intron 1 of 5) 5766 NR_046418 5119 Hs.589427 NM_002768 ENSG00000131165 CHMP1A CHMP1|PCH8|PCOLN3|PRSM1|VPS46-1|VPS46A charged multivesicular body protein 1A protein-coding 134.5-68 chr14 79980414 79980754 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -230835 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 121-179 chr7 91370970 91371299 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106701 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 180.25-36 chr17 41812831 41813399 + 0.5 NA exon (NM_021939, exon 1 of 10) exon (NM_021939, exon 1 of 10) 405 NM_021939 60681 Hs.463035 NM_021939 ENSG00000141756 FKBP10 BRKS1|FKBP65|OI11|OI6|PPIASE|hFKBP65 FKBP prolyl isomerase 10 protein-coding 113-35 chr10 126829544 126829917 + 0.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -75679 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 119-62 chr16 60677445 60677905 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -317882 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 134.5-131 chr3 81445589 81446079 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 315811 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 155-24 chr11 103367297 103367803 + 0.5 NA intron (NM_001377, intron 83 of 88) L1MA6|LINE|L1 258124 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 155.5-22 chr10 52617139 52617478 + 0.5 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 138096 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 115.5-113 chr2 29180983 29181406 + 0.5 NA intron (NM_024692, intron 15 of 15) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 42706 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 124.75 chr1 66797726 66798081 + 0.5 NA 3' UTR (NM_005478, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_005478, exon 2 of 2) 3356 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 133.5-289 chrX 146274619 146274968 + 0.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -246921 NR_030581 100126341 NR_030581 ENSG00000216056 MIR891A MIRN891A microRNA 891a ncRNA 113.5-80 chr15 41060439 41060886 + 0.5 NA intron (NM_017553, intron 14 of 35) L1MEg|LINE|L1 55584 NR_104038 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 170-39 chr17 79818369 79818925 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4805 NR_146504 105371919 NR_146504 ENSG00000262772 LINC01977 - long intergenic non-protein coding RNA 1977 ncRNA 136.5-143 chr22 43324102 43324411 + 0.5 NA intron (NM_173050, intron 2 of 21) intron (NM_173050, intron 2 of 21) 19116 NM_173050 80274 Hs.133995 NM_152514 ENSG00000159307 SCUBE1 - signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 1 protein-coding 193-77 chr6 38089517 38090076 + 0.5 NA intron (NM_021943, intron 4 of 5) intron (NM_021943, intron 4 of 5) 270069 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 197-37 chr2 232211801 232212354 + 0.5 NA intron (NR_046477, intron 9 of 18) intron (NR_046477, intron 9 of 18) 39424 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 139.25-199 chr8 105285736 105286117 + 0.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -32512 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 121-103 chr2 88412961 88413285 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 39570 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 117.25-108 chr2 63882121 63882490 + 0.5 NA intron (NM_001001521, intron 3 of 9) intron (NM_001001521, intron 3 of 9) 40425 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 145.75-113 chr4 83767166 83767584 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 231267 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 125.75-34 chr11 23745814 23746142 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -326788 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 158.25-151 chr9 4500106 4500547 + 0.5 NA intron (NM_004170, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 9858 NM_004170 6505 Hs.444915 NM_004170 ENSG00000106688 SLC1A1 DCBXA|EAAC1|EAAT3|SCZD18 solute carrier family 1 member 1 protein-coding 148.25-137 chr7 26781306 26781794 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 76173 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 120-5 chr1 94579194 94579666 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 35728 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 170-86 chr6 50606056 50606412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107310 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 149.75-28 chr12 6620132 6620533 + 0.5 NA exon (NM_001142961, exon 2 of 2) exon (NM_001142961, exon 2 of 2) 11317 NM_001142961 57121 Hs.155538 NM_020400 ENSG00000184574 LPAR5 GPR92|GPR93|KPG_010|LPA5 lysophosphatidic acid receptor 5 protein-coding 186.25-31 chr14 63250454 63251040 + 0.5 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 46304 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 117.75-214 chr8 128091671 128092135 + 0.5 NA intron (NR_003367, intron 6 of 8) intron (NR_003367, intron 6 of 8) 42751 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 112.75-181 chr6 101130039 101130482 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -248888 NM_001284271 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 124.5-7 chr1 43420537 43420854 + 0.5 NA intron (NM_015284, intron 9 of 70) intron (NM_015284, intron 9 of 70) -27844 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 119.25-196 chr7 85360895 85361314 + 0.5 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -60018 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 157-71 chr22 26889011 26889348 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -14113 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 134.75-206 chr7 125420931 125421233 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -156791 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 138.75-156 chr5 132266468 132266824 + 0.5 NA intron (NM_001131027, intron 3 of 5) intron (NM_001131027, intron 3 of 5) 8950 NM_003687 8572 Hs.424312 NM_003687 ENSG00000131435 PDLIM4 RIL PDZ and LIM domain 4 protein-coding 112.75-110 chr2 186595280 186595683 + 0.5 NA intron (NM_001145000, intron 1 of 27) (CTCTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4724 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 139.25-136 chr4 61083071 61083606 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60318 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 127.25-77 chr18 73363944 73364311 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 39186 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 148-74 chr21 31332255 31332622 + 0.5 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) intron (NM_001353686, intron 2 of 27) 11916 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 175.5-80 chr18 75909485 75909983 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -197331 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 127-82 chr17 60271448 60271909 + 0.5 NA intron (NM_032582, intron 5 of 33) intron (NM_032582, intron 5 of 33) -40033 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 138.5-50 chr13 103581462 103581988 + 0.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 156525 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 128.5-86 chr16 86921513 86921926 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -136065 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 132-84 chr2 34325284 34325649 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 258240 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 134-18 chr10 60994334 60994824 + 0.5 NA intron (NM_001350902, intron 1 of 11) intron (NM_001350902, intron 1 of 11) 6418 NM_001350903 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 123.5-190 chr6 144142600 144142988 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -7723 NM_003764 8676 Hs.118958 NM_003764 ENSG00000135604 STX11 FHL4|HLH4|HPLH4 syntaxin 11 protein-coding 140-128 chr4 107284448 107285006 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -248414 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 136.25-149 chr5 85069964 85070462 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -685333 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 133.25-211 chr8 106889231 106889654 + 0.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -119198 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 127.25-46 chr12 48497680 48497978 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 15331 NM_152319 121273 Hs.98202 NM_152319 ENSG00000177627 C12orf54 HSD-29|HSD-30 chromosome 12 open reading frame 54 protein-coding 134-73 chr17 50756718 50757019 + 0.5 NA TTS (NM_016424) TTS (NM_016424) 10650 NM_001358683 55018 Hs.389460 NM_017928 ENSG00000167117 ANKRD40CL C17orf73|LINC00483 ANKRD40 C-terminal like protein-coding 128.75-208 chr8 132874314 132874675 + 0.5 NA intron (NM_003235, intron 5 of 47) intron (NM_003235, intron 5 of 47) 7536 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 119-35 chr12 8733087 8733399 + 0.5 NA intron (NR_147950, intron 2 of 8) MER20|DNA|hAT-Charlie 35252 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 162.25-50 chr14 58875467 58875907 + 0.5 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 47399 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 130.25-102 chr2 114157745 114158164 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -177970 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 129.25-104 chr2 205437151 205437499 + 0.5 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) intron (NM_205863, intron 19 of 21) -245175 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 120.25-66 chr15 79683708 79683952 + 0.5 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 213167 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 115.25-103 chr2 122090571 122090947 + 0.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 335108 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 152-96 chr22 25617755 25618323 + 0.5 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) AluSx1|SINE|Alu 53364 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 132.5-236 chr8 70347599 70348096 + 0.5 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) intron (NM_001321703, intron 1 of 22) 55543 NM_001321707 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 140-153 chr6 102360867 102361372 + 0.5 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 962134 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 116.75-10 chr1 158244119 158244418 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -4068 NM_001320652 909 Hs.1309 NM_001763 ENSG00000158477 CD1A CD1|FCB6|HTA1|R4|T6 CD1a molecule protein-coding 147-105 chr4 114873792 114874099 + 0.5 NA intron (NM_022569, intron 6 of 13) L1MB3|LINE|L1 217186 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 121.5-150 chr2 208366731 208366994 + 0.5 NA intron (NM_001309516, intron 1 of 12) MER57B1|LTR|ERV1 7170 NM_001309516 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 142-48 chr14 54090216 54090686 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -133560 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 120-203 chrUn_KI270438v1 106398 106755 + 0.5 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 151.75-64 chr2 50247229 50247732 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) L1MC4a|LINE|L1 100274 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 129-195 chrX 112985184 112985504 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57383 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 120.75-76 chr2 23752222 23752496 + 0.5 NA intron (NR_125717, intron 28 of 28) intron (NR_125717, intron 28 of 28) 174764 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 142.5-109 chr2 115173956 115174402 + 0.5 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 12024 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 245-20 chr17 51186270 51187108 + 0.5 NA intron (NM_017643, intron 16 of 16) AluY|SINE|Alu 19967 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 122.25-71 chr17 35533694 35534130 + 0.5 NA intron (NM_001363830, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 3949 NM_001363830 100506736 Hs.447559 NM_001145027 ENSG00000205045 SLFN12L - schlafen family member 12 like protein-coding 116.75-143 chr4 31325375 31325763 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 154425 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 163.75-87 chr22 25884693 25885219 + 0.5 NA intron (NM_001318245, intron 25 of 43) intron (NM_001318245, intron 25 of 43) 142768 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 119.25-51 chr13 60077775 60078053 + 0.5 NA intron (NM_001258367, intron 2 of 25) MamRep605|LTR?|LTR? 64611 NR_051994 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 148-114 chr6 131746109 131746593 + 0.5 NA intron (NR_133007, intron 23 of 23) L1ME3Cz|LINE|L1 -35334 NM_001145659 643854 Hs.632613 NM_001145659 ENSG00000236761 CTAGE9 - CTAGE family member 9 protein-coding 199.25-32 chr14 104416093 104416837 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -163299 NM_001008404 400258 Hs.153827 NM_001008404 ENSG00000184601 C14orf180 C14orf77|NRAC chromosome 14 open reading frame 180 protein-coding 135-31 chr12 65575635 65576122 + 0.5 NA intron (NR_120434, intron 3 of 4) AluYa5|SINE|Alu -18567 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 135.25-98 chr2 76278301 76278618 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -567544 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 133.5-133 chr20 4692983 4693438 + 0.5 NA intron (NM_001080123, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 6754 NM_183079 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 136-88 chr20 36727458 36727886 + 0.5 NA intron (NM_032013, intron 1 of 15) AluY|SINE|Alu 18418 NR_038370 57446 Hs.437338 NM_022477 ENSG00000101079 NDRG3 - NDRG family member 3 protein-coding 133.5-107 chr2 18580468 18580851 + 0.5 NA intron (NM_001199104, intron 7 of 10) L1PA15|LINE|L1 8910 NM_001199086 93034 Hs.744358 NM_033253 ENSG00000185013 NT5C1B AIRP|CN-IB|CN1B 5'-nucleotidase, cytosolic IB protein-coding 137.25-122 chr5 28623049 28623554 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -303569 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 115-114 chr3 152346313 152346670 + 0.5 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) -5501 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 152.5-81 chr2 30993255 30993737 + 0.5 NA intron (NM_024572, intron 1 of 14) intron (NM_024572, intron 1 of 14) 136144 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 114.75-138 chr4 48546109 48546559 + 0.5 NA intron (NM_015030, intron 41 of 63) intron (NM_015030, intron 41 of 63) 56082 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 160.75-48 chr14 101051413 101051942 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_030162) promoter-TSS (NR_030162) -769 NR_030162 619555 NR_030162 ENSG00000207742 MIR487A MIRN487|MIRN487A|hsa-mir-487|mir-487a microRNA 487a ncRNA 130.5-126 chr2 19815689 19816111 + 0.5 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -52954 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 139.5-152 chr4 53604075 53604461 + 0.5 NA non-coding (NR_046827, exon 2 of 2) non-coding (NR_046827, exon 2 of 2) 11312 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 113-83 chr19 33864563 33865003 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 67913 NM_001129994 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 138.75-112 chr22 42675540 42676036 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26396 NM_000398 1727 Hs.561064 NM_000398 ENSG00000100243 CYB5R3 B5R|DIA1 cytochrome b5 reductase 3 protein-coding 117-45 chr12 118940844 118941304 + 0.5 NA Intergenic (ATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -40467 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 116.5-234 chr7 110833996 110834355 + 0.5 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -256831 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 136.75-21 chr10 16695318 16695689 + 0.5 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) intron (NM_152724, intron 6 of 7) 121921 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 137.5-210 chr6 119984472 119984977 + 0.5 NA Intergenic AluYf1|SINE|Alu -30455 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 143-139 chr8 20807423 20807798 + 0.5 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -146023 NR_130773 102467222 Hs.444226 NR_130773 ENSG00000253147 LOC102467222 - uncharacterized LOC102467222 ncRNA 144-83 chr3 75024878 75025426 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -189324 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 147.5-209 chr8 88926073 88926440 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -598773 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 135.5-140 chr3 139242542 139243012 + 0.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -9255 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 131.25-77 chr17 13164375 13164797 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 142174 NR_146885 105371541 NR_146885 ENSG00000234634 LINC02093 - long intergenic non-protein coding RNA 2093 ncRNA 118.25-126 chr3 36535879 36536249 + 0.5 NA intron (NM_001292049, intron 8 of 8) L1PA10|LINE|L1 155577 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 115.25-167 chr5 114504647 114505003 + 0.5 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -71216 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 148-65 chr2 220720219 220720624 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -813856 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 164.5-147 chr4 30503415 30503907 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -216708 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 159-31 chr12 116931891 116932470 + 0.5 NA intron (NM_153348, intron 2 of 10) intron (NM_153348, intron 2 of 10) 21224 NM_012174 26259 Hs.624537 NM_012174 ENSG00000174989 FBXW8 FBW6|FBW8|FBX29|FBXO29|FBXW6 F-box and WD repeat domain containing 8 protein-coding 126.25-49 chr14 54190494 54190828 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -206207 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 123.25-101 chr2 62456084 62456394 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 49956 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 139-103 chr4 106823718 106824252 + 0.5 NA Intergenic THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 212328 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 116-55 chr15 99239501 99239865 + 0.5 NA intron (NM_001288615, intron 3 of 13) intron (NM_001288615, intron 3 of 13) 9898 NR_109947 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 135-142 chr5 45696675 45696991 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_021072) promoter-TSS (NM_021072) -453 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 158-121 chr6 116995694 116996056 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 118633 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 145.5-175 chr6 121899933 121900469 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 464555 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 153.75-71 chr2 186245427 186245870 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -159331 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 130.25-3 chr1 39463601 39463944 + 0.5 NA intron (NM_012090, intron 89 of 92) intron (NM_012090, intron 89 of 92) -27864 NM_181809 353500 Hs.472497 NM_181809 ENSG00000183682 BMP8A - bone morphogenetic protein 8a protein-coding 114-111 chr4 80808357 80808805 + 0.5 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -222127 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 126.25-215 chr8 135759356 135759720 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 302082 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 140-149 chr6 63909895 63910295 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 103259 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 127.25-88 chr2 59832433 59832825 + 0.5 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 550407 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 147-80 chr2 146438887 146439402 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -147913 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 132.75-153 chr5 80329977 80330505 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 10239 NM_032567 84654 Hs.519403 NM_032567 ENSG00000164299 SPZ1 CILD38|NYD-TSP1|PPP1R148 spermatogenic leucine zipper 1 protein-coding 144-125 chr8 6098202 6098634 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 308130 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 126.75-59 chr14 62096123 62096461 + 0.5 NA intron (NM_001367661, intron 8 of 8) L1MEd|LINE|L1 -21065 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 196.25-39 chr14 81604006 81604497 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 18810 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 138.25-49 chr14 54012093 54012590 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -55450 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 116.75-72 chr17 47287205 47287553 + 0.5 NA intron (NM_000212, intron 6 of 14) intron (NM_000212, intron 6 of 14) 33537 NM_000212 3690 Hs.218040 NM_000212 ENSG00000259207 ITGB3 BDPLT16|BDPLT2|CD61|GP3A|GPIIIa|GT integrin subunit beta 3 protein-coding 136.75-157 chr5 57162446 57162917 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11267 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 152.25-9 chr1 218542735 218543132 + 0.5 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) intron (NR_031644, intron 2 of 6) 32838 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 115-164 chr6 170557107 170557499 + 0.5 NA intron (NM_003194, intron 2 of 7) intron (NM_003194, intron 2 of 7) 2934 NM_003194 6908 Hs.590872 NM_003194 ENSG00000112592 TBP GTF2D|GTF2D1|HDL4|SCA17|TFIID TATA-box binding protein protein-coding 119.75-166 chr5 20292170 20292641 + 0.5 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) intron (NM_001349556, intron 1 of 13) -13146 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 181.75-57 chr2 27459230 27459879 + 0.5 NA intron (NM_015662, intron 24 of 47) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 17173 NM_001321325 200634 Hs.59509 NM_173853 ENSG00000157992 KRTCAP3 KCP3 keratinocyte associated protein 3 protein-coding 127.25-25 chr10 66108571 66108867 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L2a|LINE|L2 537294 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 151.75-132 chr6 143768505 143769040 + 0.5 NA intron (NM_001100165, intron 5 of 11) L3b|LINE|CR1 -74501 NM_001329953 84946 Hs.185675 NM_032860 ENSG00000135521 LTV1 C6orf93|dJ468K18.4 LTV1 ribosome biogenesis factor protein-coding 122.5-239 chrX 53211716 53212070 + 0.5 NA non-coding (NR_148672, exon 9 of 27) non-coding (NR_148672, exon 9 of 27) -12948 NR_106954 102466759 NR_106954 ENSG00000277474 MIR6894 hsa-mir-6894 microRNA 6894 ncRNA 131.75-116 chr20 14238276 14238622 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1PA15|LINE|L1 99163 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 161.5-23 chr10 83151004 83151617 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 525779 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 112.5-93 chr17 64302855 64303161 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39748 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 151.75-99 chr4 40805201 40805745 + 0.5 NA intron (NM_001330648, intron 10 of 10) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 51682 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 163.25-37 chr13 92823268 92823903 + 0.5 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -101971 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 152.5-67 chr17 14367063 14367412 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 63497 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 125.75-171 chr7 33082542 33082817 + 0.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -19882 NM_001002009 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 153.5-119 chr20 63810212 63810634 + 0.5 NA intron (NR_110081, intron 1 of 2) intron (NR_110081, intron 1 of 2) 2347 NR_110081 101928604 Hs.676054 NR_110081 ZBTB46-AS1 - ZBTB46 antisense RNA 1 ncRNA 148.75-32 chr11 76446962 76447374 + 0.5 NA intron (NM_001300942, intron 2 of 21) L2b|LINE|L2 2143 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 126.25-78 chr2 16152211 16152538 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 101947 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 128.25-155 chr5 20344846 20345303 + 0.5 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 39523 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-83 chr18 30608853 30609144 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 310088 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 144.25-180 chr7 16346712 16347048 + 0.5 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) intron (NM_001101417, intron 2 of 8) 74658 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 137-192 chrX 87722174 87722516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 204543 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 135.5-37 chr11 75716042 75716370 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -1632 NM_025098 80168 Hs.288568 NM_025098 ENSG00000166391 MOGAT2 DGAT2L5|DGAT2L5.|MGAT2|hDC5 monoacylglycerol O-acyltransferase 2 protein-coding 122.25-36 chr11 114440446 114440843 + 0.5 NA intron (NM_015523, intron 1 of 6) intron (NM_015523, intron 1 of 6) 1177 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 146.25-44 chr15 78045475 78045839 + 0.5 NA intron (NM_144572, intron 2 of 12) intron (NM_144572, intron 2 of 12) 31995 NM_144572 23102 Hs.567426 NM_015079 ENSG00000167202 TBC1D2B - TBC1 domain family member 2B protein-coding 123.75-165 chr6 154618501 154618970 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -108050 NM_173515 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 124.5-167 chr5 84403435 84403850 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18762 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 124-34 chr12 123114996 123115431 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4724 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 137.25-71 chr2 78075509 78075978 + 0.5 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu -12987 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 149.25-53 chr15 53196774 53197254 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 80649 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 124-143 chr6 36076958 36077362 + 0.5 NA intron (NM_001315, intron 8 of 11) intron (NM_001315, intron 8 of 11) 49352 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 112.5-217 chr6 151586225 151586581 + 0.5 NA intron (NM_025059, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 92386 NM_025059 80129 Hs.660044 NM_025059 ENSG00000120262 CCDC170 C6orf97|bA282P11.1 coiled-coil domain containing 170 protein-coding 154-55 chr18 78395936 78396478 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -402480 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 113.25-152 chr6 151236671 151236930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3167 NM_005100 9590 Hs.371240 NM_005100 ENSG00000131016 AKAP12 AKAP250|SSeCKS A-kinase anchoring protein 12 protein-coding 151.25-27 chr11 5005135 5005497 + 0.5 NA Intergenic LTR34|LTR|ERV1 6333 NM_001004755 119682 Hs.553559 NM_001004755 ENSG00000176798 OR51L1 OR11-31 olfactory receptor family 51 subfamily L member 1 protein-coding 169-72 chr5 20168768 20169263 + 0.5 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MA1|LINE|L1 -136536 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 119-111 chr22 34240004 34240392 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -317310 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 128-50 chr15 64278846 64279334 + 0.5 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) intron (NM_001329607, intron 2 of 11) 77083 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 206.25-99 chr6 157494499 157495244 + 0.5 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) -34261 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 144-53 chr19 28413346 28413777 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -193127 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 134.25-38 chr12 122512376 122512906 + 0.5 NA intron (NM_023012, intron 6 of 9) AluSq|SINE|Alu -11709 NM_001350935 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 116-150 chr7 19425972 19426263 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 279319 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 165-135 chr7 111672755 111673245 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -110483 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 137.75-171 chr5 157335740 157336280 + 0.5 NA intron (NM_001037333, intron 21 of 30) intron (NM_001037333, intron 21 of 30) 9667 NM_001001343 408263 Hs.437066 NM_001001343 ENSG00000172568 FNDC9 C5orf40 fibronectin type III domain containing 9 protein-coding 150.75-187 chr8 121520344 121520926 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -118711 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 152.25-65 chr17 63029875 63030425 + 0.5 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 63915 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 150.25-151 chr8 111249310 111249772 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13338 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 145.25-184 chrX 151387044 151387535 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9306 NM_001363810 203547 Hs.58633 NM_001017980 ENSG00000160131 VMA21 MEAX|XMEA vacuolar ATPase assembly factor VMA21 protein-coding 168-18 chr10 100190974 100191327 + 0.5 NA intron (NM_001320928, intron 19 of 20) intron (NM_001320928, intron 19 of 20) -5121 NM_001347859 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 231.25-61 chr4 99463813 99464506 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -28649 NM_000673 131 Hs.389 NM_000673 ENSG00000196344 ADH7 ADH4 alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide protein-coding 139.5-233 chrX 41367986 41368373 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 34013 NM_001363819 1654 Hs.728563 NM_001356 ENSG00000215301 DDX3X CAP-Rf|DBX|DDX14|DDX3|HLP2|MRX102 DEAD-box helicase 3 X-linked protein-coding 170.75-3 chr1 66355679 66356068 + 0.5 NA intron (NM_001037339, intron 2 of 9) intron (NM_001037339, intron 2 of 9) 1338 NM_001297442 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 115.5-16 chr1 188916993 188917224 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 1473480 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 193.75-77 chr20 53033970 53034649 + 0.5 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 61951 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 119-192 chr8 37832091 37832501 + 0.5 NA intron (NM_032777, intron 8 of 18) AluSz|SINE|Alu 17565 NM_018310 55290 Hs.709301 NM_018310 ENSG00000104221 BRF2 BRFU|TFIIIB50 BRF2 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit protein-coding 184.25-71 chr20 62992326 62993002 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14300 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 159.75-182 chr9 37302331 37302663 + 0.5 NA intron (NR_110317, intron 2 of 7) intron (NR_110317, intron 2 of 7) -120199 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 129-155 chr6 62097646 62097990 + 0.5 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) L1MA6|LINE|L1 188407 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 116-65 chr17 51462336 51462710 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27096 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 140.5-41 chr11 108215488 108215933 + 0.5 NA intron (NM_001321307, intron 1 of 17) intron (NM_001321307, intron 1 of 17) 6928 NM_002519 4863 Hs.171061 NM_002519 ENSG00000149308 NPAT E14|E14/NPAT|p220 nuclear protein, coactivator of histone transcription protein-coding 149-50 chr2 38973243 38973597 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001367623, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001367623, exon 17 of 17) -13076 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 134.25-97 chr2 237461155 237461626 + 0.5 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -25020 NM_001281474 79083 Hs.102406 NM_024101 ENSG00000115648 MLPH SLAC2-A melanophilin protein-coding 142.5-149 chr4 53701299 53701709 + 0.5 NA intron (NR_125918, intron 1 of 2) THE1A|LTR|ERVL-MaLR 5603 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 174-64 chr3 89625065 89625536 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 517679 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 133.5-246 chr7 38904954 38905356 + 0.5 NA intron (NM_014396, intron 1 of 28) L2c|LINE|L2 4036 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 152.75-128 chr5 43165733 43166335 + 0.5 NA intron (NM_003432, intron 6 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -26191 NM_153361 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 113.75-184 chr8 23604971 23605332 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 76195 NM_016612 51312 Hs.596025 NM_016612 ENSG00000147454 SLC25A37 HT015|MFRN|MFRN1|MSC|MSCP|PRO1278|PRO1584|PRO2217 solute carrier family 25 member 37 protein-coding 151-101 chr4 90842622 90843188 + 0.5 NA intron (NM_001145065, intron 8 of 10) intron (NM_001145065, intron 8 of 10) 607874 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 122-198 chr9 137910651 137911113 + 0.5 NA intron (NM_001243812, intron 3 of 45) L1MB4|LINE|L1 -18312 NR_121583 100133077 Hs.640081 NR_121583 ENSG00000203987 LOC100133077 - uncharacterized LOC100133077 ncRNA 126-43 chr12 115103520 115103973 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -419571 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 113.5-220 chr7 55199827 55200244 + 0.5 NA intron (NM_001346941, intron 17 of 21) intron (NM_001346941, intron 17 of 21) -11086 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 150-60 chr17 54145938 54146393 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 323238 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 118.75-155 chr5 87363281 87363682 + 0.5 NA exon (NM_002890, exon 11 of 25) exon (NM_002890, exon 11 of 25) -39853 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 129.25-199 chr8 87936422 87936720 + 0.5 NA Intergenic LTR1|LTR|ERV1 -62556 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 160.75-28 chr12 19098860 19099470 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30568 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 125.25-129 chr22 50376146 50376551 + 0.5 NA intron (NM_001242899, intron 2 of 22) L1MEd|LINE|L1 -31094 NR_162128 113218480 NR_162128 MIR12114 - microRNA 12114 ncRNA 133-163 chr7 116033471 116033760 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2852 NM_001018058 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 159.25-33 chr12 116722130 116722581 + 0.5 NA intron (NM_001353623, intron 1 of 3) intron (NM_001353623, intron 1 of 3) 15714 NM_001353623 79794 Hs.120170 NM_024738 ENSG00000111412 C12orf49 - chromosome 12 open reading frame 49 protein-coding 117.5-221 chr7 52958951 52959311 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -76502 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 173.5-108 chr4 35659759 35660249 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 583935 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 147.75-159 chr8 123309725 123310259 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -34451 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 139.25-70 chr17 69264465 69264830 + 0.5 NA intron (NM_018672, intron 23 of 37) intron (NM_018672, intron 23 of 37) -19832 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 138-82 chr2 181501887 181502384 + 0.5 NA intron (NM_000885, intron 15 of 27) L2a|LINE|L2 44749 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 225.25-48 chr20 3037599 3038216 + 0.5 NA intron (NM_080841, intron 22 of 22) intron (NM_080841, intron 22 of 22) -5715 NM_178331 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 152.5-18 chr10 78494248 78494798 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 227181 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 122.75-99 chr2 139085123 139085551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 188013 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 120.25-190 chr7 6214749 6215058 + 0.5 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) -42766 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 128-74 chr2 70634246 70634733 + 0.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -80663 NM_003236 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 167 chr1 8731537 8732157 + 0.5 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) AluYj4|SINE|Alu 85793 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 156.25-16 chr10 44404239 44404725 + 0.5 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19385 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 140.25-173 chr6 156008819 156009171 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 62198 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 145-18 chr10 1822006 1822461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84708 NM_018702 105 Hs.586663 NM_018702 ENSG00000185736 ADARB2 ADAR3|RED2 adenosine deaminase RNA specific B2 (inactive) protein-coding 128.75-153 chr5 79623776 79624098 + 0.5 NA intron (NM_001349553, intron 6 of 16) intron (NM_001349553, intron 6 of 16) 11496 NM_001114393 167153 Hs.418198 NM_173797 ENSG00000164329 TENT2 APD4|GLD2|PAPD4|TUT2 terminal nucleotidyltransferase 2 protein-coding 134.75-120 chr2 191834242 191834683 + 0.5 NA 3' UTR (NM_004657, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004657, exon 2 of 2) 12626 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 129.25-62 chr15 96404097 96404471 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 70519 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 125.75-20 chr10 29067191 29067533 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 220954 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 164.5-99 chr2 120523827 120524443 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -57786 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 155-58 chr2 26784525 26784909 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1298 NM_001042426 1058 Hs.1594 NM_001809 ENSG00000115163 CENPA CENP-A|CenH3 centromere protein A protein-coding 144.25-215 chr8 133386573 133386896 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -89430 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 118.75-13 chr1 213239968 213240438 + 0.5 NA intron (NM_001136138, intron 9 of 13) intron (NM_001136138, intron 9 of 13) 188962 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 115-149 chr5 153115363 153115763 + 0.5 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -143214 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 160.25-154 chr7 122603712 122604110 + 0.5 NA intron (NM_001167940, intron 6 of 29) L1MA9|LINE|L1 95206 NM_139175 168433 Hs.126730 NM_139175 ENSG00000188050 RNF133 - ring finger protein 133 protein-coding 121-16 chr10 8153527 8153900 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 99025 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 267.75-17 chr14 82139972 82140824 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -397260 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 139-72 chr2 38863287 38863819 + 0.5 NA intron (NM_001329963, intron 2 of 23) intron (NM_001329963, intron 2 of 23) 12381 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 188-74 chr8 57518690 57519128 + 0.5 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 175122 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 114.75-59 chr15 61048649 61048947 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 180504 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 161.25-124 chr3 86076271 86076875 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -248523 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 122-64 chr15 77333168 77333479 + 0.5 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 86781 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 125.5-126 chr2 69311375 69311832 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75624 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 150.5-32 chr11 97790679 97790999 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1230110 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 136-98 chr22 41500619 41501009 + 0.5 NA intron (NM_001098, intron 2 of 17) AluSx3|SINE|Alu 31697 NM_001098 50 Hs.643610 NM_001098 ENSG00000100412 ACO2 ACONM|HEL-S-284|ICRD|OCA8|OPA9 aconitase 2 protein-coding 136.75-8 chr1 93110670 93111027 + 0.5 NA intron (NM_007358, intron 3 of 14) intron (NM_007358, intron 3 of 14) 31565 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 200.5-13 chr1 212821781 212822506 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25506 NM_001024601 149643 Hs.153274 NM_001024601 ENSG00000185523 SPATA45 C1orf227 spermatogenesis associated 45 protein-coding 181-105 chr7 83764873 83765357 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -115976 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 124.75-120 chr2 148174157 148174542 + 0.5 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) L1MA7|LINE|L1 -152745 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 113.25-71 chr17 61375919 61376323 + 0.5 NA intron (NM_001099432, intron 24 of 24) intron (NM_001099432, intron 24 of 24) -8417 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 149-69 chr20 46429449 46429846 + 0.5 NA intron (NR_146919, intron 2 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -22596 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 130.75-33 chr11 114367968 114368330 + 0.5 NA intron (NR_120567, intron 2 of 2) intron (NR_120567, intron 2 of 2) 11890 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 113.5-139 chr20 36455894 36456264 + 0.5 NA intron (NM_001365621, intron 7 of 12) intron (NM_001365621, intron 7 of 12) -5389 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 112.5-109 chr2 45366626 45367027 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -111885 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 114.5-130 chr2 38533214 38533569 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17651 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 138.25-37 chr12 30635355 30635669 + 0.5 NA intron (NM_006390, intron 22 of 24) intron (NM_006390, intron 22 of 24) 41732 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 118.5-177 chr6 71416264 71416731 + 0.5 NA non-coding (NR_121614, exon 3 of 3) non-coding (NR_121614, exon 3 of 3) 4248 NR_121612 79940 Hs.368337 NR_026807 ENSG00000233237 LINC00472 C6orf155|P53RRA long intergenic non-protein coding RNA 472 ncRNA 116.75-188 chr7 110863990 110864373 + 0.5 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -226825 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 116.5-75 chr14 98329657 98329993 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -351701 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 149-84 chr3 162606897 162607328 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 696189 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 143.25-28 chr11 76893666 76894002 + 0.5 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) intron (NM_001300953, intron 1 of 9) 32916 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 116.5-39 chr11 126837352 126837658 + 0.5 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -103241 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 120.75-15 chr10 34032563 34032918 + 0.5 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -260060 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 132.5-115 chr2 56452078 56452379 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -266458 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 216.25-81 chr4 183579614 183580414 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 73932 NM_001291959 3622 Hs.107153 NM_001564 ENSG00000168556 ING2 ING1L|p33ING2 inhibitor of growth family member 2 protein-coding 203.75-81 chr4 143779627 143780411 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 49329 NR_134680 105377458 Hs.738046 NR_134680 LOC105377458 - uncharacterized LOC105377458 ncRNA 168.5-98 chr2 227937839 227938249 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 66413 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 149.75-86 chr2 102757516 102758029 + 0.5 NA intron (NM_001321343, intron 2 of 6) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -4259 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 138-166 chr8 130500072 130500584 + 0.5 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -56654 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 132.75-6 chr1 41123199 41123515 + 0.5 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) intron (NM_001172218, intron 7 of 15) 38075 NR_135092 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 133.75-6 chr1 113270688 113271128 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -64655 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 119.25-83 chr18 52241738 52242025 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -98316 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 113.75-91 chr19 45452229 45452483 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001369412) promoter-TSS (NM_001369412) -809 NM_001369413 2067 Hs.435981 NM_001983 ENSG00000012061 ERCC1 COFS4|RAD10|UV20 ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit protein-coding 143.75-107 chr22 25030990 25031505 + 0.5 NA intron (NM_001145206, intron 1 of 10) AluYj4|SINE|Alu 3273 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 153.75-119 chr5 130069332 130069842 + 0.5 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 165122 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 216.25-24 chr12 17550044 17550858 + 0.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 38627 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 154.75-83 chr20 53164180 53164655 + 0.5 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -20866 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 135-57 chr17 35651028 35651537 + 0.5 NA intron (NM_001030006, intron 13 of 21) intron (NM_001030006, intron 13 of 21) 63960 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 122.25-31 chr11 68167996 68168293 + 0.5 NA intron (NR_161380, intron 10 of 10) AluSc|SINE|Alu 45152 NM_001369433 51111 Hs.632120 NM_016028 ENSG00000110066 KMT5B CGI-85|CGI85|MRD51|SUV420H1 lysine methyltransferase 5B protein-coding 113.5-166 chr3 192820836 192821220 + 0.5 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) intron (NM_178496, intron 1 of 1) -93487 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 130.25-18 chr1 190159047 190159376 + 0.5 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) L1MB7|LINE|L1 316799 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 130.5-62 chr11 73112165 73112580 + 0.5 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) L1MA3|LINE|L1 29946 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 123.75-50 chr13 57636222 57636712 + 0.5 NA intron (NM_001040429, intron 1 of 3) intron (NM_001040429, intron 1 of 3) 4723 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 128.25-137 chr3 178837344 178837827 + 0.5 NA intron (NM_181361, intron 4 of 4) intron (NM_181361, intron 4 of 4) 22820 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 141.25-46 chr14 43817239 43817641 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 689843 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 156-28 chr11 125989085 125989584 + 0.5 NA intron (NM_016952, intron 15 of 19) AluSx|SINE|Alu 43278 NM_001365077 338667 Hs.730137 NM_001365077 VSIG10L2 - V-set and immunoglobulin domain containing 10 like 2 protein-coding 157-28 chr14 65506855 65507183 + 0.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) LTR22B|LTR|ERVK 35917 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 121.75-24 chr11 100593870 100594258 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93224 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 142-63 chr16 65393421 65393872 + 0.5 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 182654 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 118.5-154 chr4 147568419 147568869 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -48753 NM_018241 55751 Hs.203896 NM_018241 ENSG00000164168 TMEM184C TMEM34 transmembrane protein 184C protein-coding 140.5-6 chr1 114322824 114323228 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -169157 NM_001253772 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 118.5-142 chr4 5042165 5042536 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9130 NM_001306082 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 152-86 chr2 69479481 69480028 + 0.5 NA intron (NM_014911, intron 19 of 21) intron (NM_014911, intron 19 of 21) 40417 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 128.25-98 chr2 116137217 116137603 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 793595 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 143.75-115 chr3 47867098 47867670 + 0.5 NA intron (NM_002375, intron 14 of 18) intron (NM_002375, intron 14 of 18) 17829 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 117-174 chr7 88833184 88833490 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR -37600 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 138.75-75 chr18 372227 372652 + 0.5 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) AluJo|SINE|Alu -104392 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 164.25-49 chr15 95828605 95829037 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 299020 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 146.75-159 chr8 99619897 99620300 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) L1ME2z|LINE|L1 -83237 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 151.5-102 chr21 24021089 24021478 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 300094 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 121.75-195 chr8 123223807 123224218 + 0.5 NA intron (NM_032847, intron 5 of 5) L1MB4|LINE|L1 -8149 NR_039808 100616260 NR_039808 ENSG00000266324 MIR4663 - microRNA 4663 ncRNA 138.25-177 chr9 27266189 27266723 + 0.5 NA intron (NR_026679, intron 10 of 16) intron (NR_026679, intron 10 of 16) 16337 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 165.75-106 chr22 27089745 27090314 + 0.5 NA Intergenic (AATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29511 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 201.75-56 chr22 37413282 37413782 + 0.5 NA intron (NM_052906, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 13938 NR_110512 114794 Hs.344170 NM_052906 ENSG00000166897 ELFN2 LRRC62|PPP1R29 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 144.25-43 chr11 81945521 81946054 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -54951 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 154.75-34 chr13 73595849 73596386 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31873 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 171.25-21 chr10 121394966 121395478 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 136092 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 118-114 chr3 100082810 100083098 + 0.5 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 31559 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 128.75-34 chr11 79182917 79183330 + 0.5 NA intron (NM_001098816, intron 3 of 33) L1MC1|LINE|L1 218986 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 128.5-184 chr6 39194831 39195203 + 0.5 NA intron (NM_003740, intron 2 of 4) intron (NM_003740, intron 2 of 4) 34458 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 178.25-23 chr12 32771918 32772519 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16321 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 203.5-7 chr1 82594101 82594662 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -308802 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 199.25-3 chr1 96714899 96715493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6409 NM_021190 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 228.25-51 chr3 109859896 109860513 + 0.5 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 257376 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 141-49 chr14 84318425 84318746 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -953347 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 122-16 chr1 116213670 116213940 + 0.5 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 102050 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 126.75-82 chr16 67100287 67100765 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001368710, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001368710, exon 5 of 5) -9415 NM_001320543 80262 Hs.513666 NM_025187 ENSG00000125149 C16orf70 C16orf6|LIN10|lin-10 chromosome 16 open reading frame 70 protein-coding 113.25-26 chr11 74789502 74789920 + 0.5 NA intron (NM_001098638, intron 2 of 5) intron (NM_001098638, intron 2 of 5) 40862 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 114.5-95 chr14 70556270 70556617 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21439 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 125.75-23 chr10 59987167 59987418 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -26379 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 130-100 chr3 19143776 19144218 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4513 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 115.25-197 chr8 32845932 32846204 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 124233 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 156-52 chr14 81031311 81031803 + 0.5 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) intron (NM_001142626, intron 1 of 8) 75936 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 137.5-238 chr9 33334702 33335165 + 0.5 NA intron (NM_002504, intron 11 of 23) L1MC5a|LINE|L1 44417 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 136-82 chr2 199965893 199966274 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10592 NM_001039693 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 134.25-82 chr2 62808512 62809024 + 0.5 NA intron (NM_001142615, intron 5 of 22) L1MCa|LINE|L1 101871 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 123.5-70 chr16 34240331 34240747 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 76961 NR_162093 113218496 NR_162093 MIR9901 - microRNA 9901 ncRNA 144.5-170 chr5 39397038 39397561 + 0.5 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) LTR50|LTR|ERVL 27681 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 121.25-169 chr5 156148449 156148884 + 0.5 NA Intergenic PABL_B|LTR|ERV1 -178091 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 131.25-29 chr10 123548273 123548660 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -117889 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 113-54 chr12 62432970 62433222 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -33730 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 127.5-28 chr10 29514259 29514735 + 0.5 NA intron (NM_001323599, intron 17 of 38) AluJo|SINE|Alu 30600 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 136-141 chr7 146093743 146094016 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -680392 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 132.25-70 chr16 71710068 71710480 + 0.5 NA intron (NM_015020, intron 2 of 18) intron (NM_015020, intron 2 of 18) 5566 NM_001289003 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 165-101 chr4 19374939 19375428 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -876722 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 206.25-54 chr2 132710518 132711146 + 0.5 NA intron (NM_207481, intron 17 of 17) intron (NM_207481, intron 17 of 17) -39306 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 189.5-23 chr10 86234181 86234919 + 0.5 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 30238 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 131.5-86 chr17 7664535 7665004 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 10475 NM_001276697 7157 Hs.437460 NM_000546 ENSG00000141510 TP53 BCC7|BMFS5|LFS1|P53|TRP53 tumor protein p53 protein-coding 133.5-46 chr11 13112124 13112446 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 102969 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 114.75-187 chr8 37519324 37519625 + 0.5 NA intron (NR_121621, intron 1 of 2) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 1912 NR_121621 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 234.5-33 chr18 3668347 3669047 + 0.5 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 64960 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 137.5-155 chr3 29348270 29348755 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 67200 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 118.75-99 chr2 79937313 79937635 + 0.5 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) MER113|DNA|hAT-Charlie -70891 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 157.75-80 chr19 36687690 36688147 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110707) promoter-TSS (NR_110707) 306 NM_001322920 163081 Hs.412517 NM_152603 ENSG00000189042 ZNF567 - zinc finger protein 567 protein-coding 132.25-181 chr8 108739186 108739540 + 0.5 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 48231 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 130.75-153 chr5 5047169 5047619 + 0.5 NA intron (NR_026994, intron 2 of 6) intron (NR_026994, intron 2 of 6) 13035 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 117.5-68 chr15 54356315 54356738 + 0.5 NA intron (NM_001329919, intron 16 of 31) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 343878 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 171.25-140 chr7 25654131 25654791 + 0.5 NA TTS (NR_157811) TTS (NR_157811) 8679 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 123.5-102 chr2 84976789 84977277 + 0.5 NA intron (NM_020122, intron 1 of 6) intron (NM_020122, intron 1 of 6) 5872 NM_020122 56888 Hs.654968 NM_020122 ENSG00000176407 KCMF1 DEBT91|FIGC|PCMF|ZZZ1 potassium channel modulatory factor 1 protein-coding 187-86 chr7 14146733 14147229 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001350716, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001350716, exon 25 of 25) -155556 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 114.25-110 chr20 7303585 7303884 + 0.5 NA non-coding (NR_135005, exon 2 of 2) non-coding (NR_135005, exon 2 of 2) 3698 NR_135005 101929288 Hs.738005 NR_135005 ENSG00000261249 LINC01751 - long intergenic non-protein coding RNA 1751 ncRNA 132.5-190 chr5 9248885 9249174 + 0.5 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) intron (NM_003966, intron 5 of 22) -195134 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 126.5-116 chr2 107078487 107078822 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -191545 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 116.75-119 chr22 34730833 34731216 + 0.5 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 266892 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 157-55 chr2 77809603 77810026 + 0.5 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) L1M4|LINE|L1 -106120 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 116-183 chr9 32004107 32004495 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -380302 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 120.25-126 chr3 291821 292173 + 0.5 NA intron (NM_001253387, intron 2 of 26) intron (NM_001253387, intron 2 of 26) -27686 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 154 chr1 46455142 46455540 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5637 NR_121680 101929651 Hs.638707 NR_121680 ENSG00000224863 LINC01398 - long intergenic non-protein coding RNA 1398 ncRNA 123.75-180 chr7 110146515 110146965 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -186527 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 187-30 chr15 95398170 95398668 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -34674 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 179.25-30 chr11 29244558 29245086 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -349591 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 113.5-105 chr18 12818948 12819216 + 0.5 NA intron (NM_080423, intron 5 of 8) AluSp|SINE|Alu 21880 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 126-129 chr4 93972852 93973178 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 144262 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 131-64 chr16 4713354 4713861 + 0.5 NA intron (NR_040252, intron 6 of 16) L1M4|LINE|L1 19889 NM_001370587 84309 Hs.513315 NM_032349 ENSG00000168101 NUDT16L1 SDOS|TIRR nudix hydrolase 16 like 1 protein-coding 123.75-68 chr15 61549023 61549330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -180742 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 114.25-209 chrX 44919156 44919440 + 0.5 NA intron (NR_111960, intron 2 of 27) L1MC3|LINE|L1 46123 NM_001291418 7403 Hs.522616 NM_021140 ENSG00000147050 KDM6A KABUK2|UTX|bA386N14.2 lysine demethylase 6A protein-coding 139.5-158 chr4 112140391 112140716 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -4901 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 126.25-163 chr5 105972384 105972870 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 873153 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 145.5-189 chr8 75593709 75594242 + 0.5 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 54007 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 135-12 chr10 44289259 44289659 + 0.5 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -3291 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 112.75-35 chr11 98298700 98299109 + 0.5 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -722045 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 143.25-122 chr3 95652054 95652536 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 30898 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 143.5-108 chr2 29827327 29827691 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 94077 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 137.75-159 chr4 164401787 164402253 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18765 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 122-183 chr8 89865887 89866302 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35774 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 154.25-180 chr9 31266588 31267028 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 114682 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 138.75-195 chr8 101941292 101941820 + 0.5 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) -42876 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 116.75-197 chr8 79476661 79476911 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -134331 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 124.5-210 chr7 71432140 71432610 + 0.5 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) MER77|LTR|ERVL -124605 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 116.75-36 chr11 50775833 50776234 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 366886 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 123.75-110 chr22 37573196 37573606 + 0.5 NA intron (NM_006498, intron 1 of 3) intron (NM_006498, intron 1 of 3) 6686 NM_006498 3957 Hs.531776 NM_006498 ENSG00000100079 LGALS2 HL14 galectin 2 protein-coding 114.75-10 chr1 154391591 154392008 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13394 NM_001206866 3570 Hs.135087 NM_000565 ENSG00000160712 IL6R CD126|IL-6R-1|IL-6RA|IL6Q|IL6RA|IL6RQ|gp80 interleukin 6 receptor protein-coding 135.75-171 chr5 37146173 37146699 + 0.5 NA intron (NM_023073, intron 42 of 51) AluSg4|SINE|Alu -102610 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 158-78 chr2 143816365 143816739 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -120515 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 176.75-35 chr14 47258670 47259320 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 84251 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 147.75-144 chr7 52290446 52290792 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -745014 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 160.75-21 chr10 82339421 82340049 + 0.5 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -106815 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-206 chr5 150389352 150389812 + 0.5 NA intron (NM_001135244, intron 18 of 25) intron (NM_001135244, intron 18 of 25) 23174 NM_001364083 972 Hs.436568 NM_004355 ENSG00000019582 CD74 DHLAG|HLADG|II|Ia-GAMMA|p33 CD74 molecule protein-coding 125.75-72 chr18 1868264 1868589 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -508797 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 131-129 chr4 45344872 45345390 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -618497 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 122-75 chr18 4291809 4292262 + 0.5 NA intron (NR_036489, intron 2 of 2) intron (NR_036489, intron 2 of 2) 27433 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 126-94 chr2 72629444 72629877 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L3|LINE|CR1 196373 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 172.75-37 chr14 105517171 105517850 + 0.5 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -9073 NM_025268 80757 Hs.157527 NM_025268 ENSG00000184986 TMEM121 TMEM121A|hole transmembrane protein 121 protein-coding 126.5-86 chr16 56373174 56373551 + 0.5 NA intron (NM_001144, intron 10 of 13) L1MC1|LINE|L1 51627 NM_001323511 267 Hs.295137 NM_001144 ENSG00000159461 AMFR GP78|RNF45 autocrine motility factor receptor protein-coding 130.5-87 chr14 34639999 34640474 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -10088 NM_152233 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 136-29 chr12 1352504 1352892 + 0.5 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) intron (NR_027948, intron 15 of 19) -147793 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 150-110 chr4 93989583 93989962 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 161019 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 124-94 chr2 191208255 191208746 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -36904 NM_001330237 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 121.5-181 chr3 106635080 106635480 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 605358 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 137.75-68 chr15 39005686 39006065 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -244794 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 151-54 chr2 30643591 30644009 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001002257, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001002257, exon 6 of 6) 163646 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 130.25-94 chr2 34565129 34565476 + 0.5 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -112255 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 151.75-166 chr9 125700662 125701078 + 0.5 NA intron (NM_001006619, intron 1 of 10) intron (NM_001006619, intron 1 of 10) 6338 NM_001006618 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 117-120 chr3 71865216 71865628 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -80274 NM_021935 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 114.75-46 chr12 124669000 124669352 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -101564 NM_001077261 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 138.75-17 chr10 16033425 16033821 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -173090 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 126.25-37 chr12 5624815 5625155 + 0.5 NA intron (NM_001278596, intron 17 of 25) L2a|LINE|L2 130853 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 128.75-66 chr16 29976888 29977359 + 0.5 NA intron (NM_004783, intron 1 of 18) intron (NM_004783, intron 1 of 18) 3255 NM_001252043 9344 Hs.291623 NM_004783 ENSG00000149930 TAOK2 MAP3K17|PSK|PSK1|PSK1-BETA|TAO1|TAO2 TAO kinase 2 protein-coding 157-124 chr9 29935436 29935906 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 472783 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 131-91 chr2 71603978 71604460 + 0.5 NA intron (NM_001130985, intron 36 of 54) intron (NM_001130985, intron 36 of 54) 137520 NM_001130985 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 157.75-34 chr12 28774294 28774695 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -374784 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 126-98 chr2 116426758 116427020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1083074 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 141.5-150 chr3 153846849 153847300 + 0.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -84548 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 137-157 chr7 17587518 17587858 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -28779 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 116.25-78 chr16 3715301 3715667 + 0.5 NA intron (NM_016292, intron 1 of 17) HAL1ME|LINE|L1 2040 NM_016292 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 152-113 chr4 63678551 63679038 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 730656 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 158-24 chr10 59625842 59626288 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 83826 NM_001323978 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 126.5-210 chr6 106565116 106565579 + 0.5 NA intron (NM_001371242, intron 21 of 21) intron (NM_001371242, intron 21 of 21) 53492 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 196.25-8 chr1 220266117 220266591 + 0.5 NA non-coding (NR_001587, exon 1 of 1) non-coding (NR_001587, exon 1 of 1) 1361 NR_001587 6791 Hs.654849 NR_001587 AURKAP1 AURKAPS1|AurAps1|STK6P aurora kinase A pseudogene 1 pseudo 125-59 chr17 66763136 66763463 + 0.5 NA intron (NM_002737, intron 13 of 16) intron (NM_002737, intron 13 of 16) -23773 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 153-129 chr6 36962295 36962831 + 0.5 NA intron (NM_001199159, intron 5 of 7) AluSp|SINE|Alu 7825 NM_153370 221476 Hs.25391 NM_153370 ENSG00000164530 PI16 CD364|CRISP9|MSMBBP|PSPBP peptidase inhibitor 16 protein-coding 161.5-167 chr7 24346764 24347380 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 62882 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 118.25-193 chr8 23713064 23713498 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -6683 NM_001136271 137814 Hs.532654 NM_001136271 ENSG00000180053 NKX2-6 CSX2|CTHM|NKX2F|NKX4-2 NK2 homeobox 6 protein-coding 129-190 chr9 31565712 31566050 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -184391 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 132.75-177 chr7 49516065 49516427 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -257392 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 206-79 chr8 137003604 137004243 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 409665 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 142.75-202 chr9 111524397 111524690 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001007169) promoter-TSS (NM_001007169) -636 NM_001007169 158399 Hs.584864 NM_133464 ENSG00000173258 ZNF483 ZKSCAN16|ZSCAN48 zinc finger protein 483 protein-coding 165.25-59 chr18 1048271 1048729 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -120507 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 133.5-172 chr4 1959372 1959882 + 0.5 NA exon (NM_133335, exon 17 of 22) exon (NM_133335, exon 17 of 22) -15009 NR_003004 677770 Hs.676951 NR_003004 ENSG00000249784 SCARNA22 ACA11 small Cajal body-specific RNA 22 ncRNA 158.75-34 chr11 113045121 113045679 + 0.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -81940 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 133-85 chr2 125892832 125893239 + 0.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 224950 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 116.25-174 chr5 27470151 27470530 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1952 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 125-57 chr17 58357748 58358071 + 0.5 NA exon (NM_001305545, exon 8 of 9) exon (NM_001305545, exon 8 of 9) -5708 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 119.25-87 chr2 2245624 2245943 + 0.5 NA intron (NM_015025, intron 2 of 24) intron (NM_015025, intron 2 of 24) -73449 NR_024468 730811 Hs.629472 NR_024468 ENSG00000225619 MYT1L-AS1 - MYT1L antisense RNA 1 ncRNA 120.5-224 chr8 81001963 81002306 + 0.5 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) intron (NM_018440, intron 3 of 8) 109934 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 117-177 chr8 20709678 20710043 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -94934 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 114.5-281 chrX 84617508 84617943 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -115272 NM_001177478 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 140.25-147 chr5 36100754 36101229 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001007527, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001007527, exon 18 of 18) -34109 NM_174914 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 135.5-133 chr3 57221098 57221493 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6434 NM_012096 26060 Hs.476415 NM_012096 ENSG00000157500 APPL1 APPL|DIP13alpha|MODY14 adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1 protein-coding 126.25-185 chr7 37442541 37442924 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) intron (NM_001206480, intron 1 of 21) 6220 NM_014800 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 146.25-89 chr20 45170537 45171053 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -4107 NM_002638 5266 Hs.112341 NM_002638 ENSG00000124102 PI3 ESI|SKALP|WAP3|WFDC14|cementoin peptidase inhibitor 3 protein-coding 134.5-221 chr8 82516262 82516617 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -395665 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 200-94 chr8 140421541 140422263 + 0.5 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) intron (NM_001321646, intron 4 of 21) 35842 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 122-22 chr1 209318809 209319181 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6461 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 135.75-140 chr3 73551156 73551642 + 0.5 NA intron (NR_121660, intron 1 of 1) intron (NR_121660, intron 1 of 1) 10181 NM_001303140 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 157.25-64 chr19 43657811 43658172 + 0.5 NA intron (NM_001005376, intron 3 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 12178 NM_001301037 5329 Hs.466871 NM_002659 ENSG00000011422 PLAUR CD87|U-PAR|UPAR|URKR plasminogen activator, urokinase receptor protein-coding 146-73 chr2 176937001 176937369 + 0.5 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 275226 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 155.75-89 chr2 240437935 240438496 + 0.5 NA intron (NM_002081, intron 1 of 8) intron (NM_002081, intron 1 of 8) 2552 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 125.5-233 chr7 54261231 54261594 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -69285 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 112.25-184 chr6 64086685 64087123 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) LTR101_Mam|LTR|ERVL 280068 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 138-41 chr14 58168346 58168800 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16360 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 130-49 chr15 63244072 63244437 + 0.5 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) intron (NM_016530, intron 1 of 7) -33296 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 134.5-85 chr16 74149502 74149991 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 65775 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 141-122 chr5 14847295 14847698 + 0.5 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) -21484 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 180.75-128 chr6 61030778 61031273 + 0.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -543105 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 120.5-43 chr11 82376139 82376500 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 27594 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 164.25-140 chr6 115284995 115285620 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 358528 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 189-49 chr19 39132247 39132913 + 0.5 NA intron (NM_001014834, intron 1 of 7) intron (NM_001014834, intron 1 of 7) 6794 NM_001014831 10298 Hs.20447 NM_005884 ENSG00000130669 PAK4 - p21 (RAC1) activated kinase 4 protein-coding 139-36 chr14 29579357 29579859 + 0.5 NA intron (NM_001330069, intron 17 of 18) intron (NM_001330069, intron 17 of 18) 347488 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 128.75-161 chr6 11486464 11486811 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -51112 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 135-144 chr5 109814590 109815049 + 0.5 NA intron (NM_002372, intron 12 of 21) intron (NM_002372, intron 12 of 21) -68363 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 130-147 chr7 25681381 25681719 + 0.5 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) -10819 NR_157816 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 305.5-43 chr6 127061270 127062155 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -56959 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 158.75-104 chr21 27627501 27627983 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -94637 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 116.75-30 chr11 6833664 6833951 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11876 NM_178168 144124 Hs.447478 NM_178168 ENSG00000166363 OR10A5 JCG6|OR10A1|OR11-403 olfactory receptor family 10 subfamily A member 5 protein-coding 116.5-220 chr6 153839972 153840355 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -170333 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 117-74 chr17 71924896 71925211 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 100926 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 162.75-91 chr3 37123224 37123623 + 0.5 NA intron (NM_001348303, intron 4 of 16) AluSx1|SINE|Alu 51159 NM_006309 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 134.25-136 chr5 3358297 3358757 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -94289 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 140-37 chr13 49701253 49701706 + 0.5 NA 3' UTR (NM_002267, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_002267, exon 17 of 17) -9992 NR_103802 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 140-13 chr1 203952295 203952752 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 88741 NR_027902 284573 Hs.406979 NR_027902 ENSG00000176754 LINC00303 C1orf157|NCRNA00303 long intergenic non-protein coding RNA 303 ncRNA 140.25-67 chr17 22203524 22203821 + 0.5 NA intron (NR_144546, intron 1 of 1) intron (NR_144546, intron 1 of 1) 677 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 131.5-133 chr2 241290880 241291256 + 0.5 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) intron (NM_005336, intron 1 of 27) -18182 NM_001243900 3069 Hs.471851 NM_005336 ENSG00000115677 HDLBP HBP|PRO2900|VGL high density lipoprotein binding protein protein-coding 123.25-17 chr1 219943559 219943906 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -15081 NR_046437 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 151.5-188 chr8 30142875 30143326 + 0.5 NA intron (NM_001100916, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 1565 NM_001100916 619373 Hs.627194 NM_001100916 ENSG00000177669 MBOAT4 FKSG89|GOAT|OACT4 membrane bound O-acyltransferase domain containing 4 protein-coding 133-55 chr15 38671516 38671889 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24896 NR_160786 113.25-51 chr14 81416568 81416996 + 0.5 NA intron (NM_001366850, intron 2 of 7) intron (NM_001366850, intron 2 of 7) 10993 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 159.25-157 chr8 129572720 129573200 + 0.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 2058 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 123.75-64 chr14 77115397 77115688 + 0.5 NA 3' UTR (NM_033426, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_033426, exon 4 of 4) 17284 NM_033426 85457 Hs.709066 NM_033426 ENSG00000198894 CIPC KIAA1737 CLOCK interacting pacemaker protein-coding 145.75-84 chr2 114248188 114248625 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -194235 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155.5-73 chr17 61728916 61729440 + 0.5 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) AluSp|SINE|Alu 134381 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 188.75-16 chr11 87411684 87412246 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 307446 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 146.75-127 chr5 75191969 75192460 + 0.5 NA intron (NM_001164443, intron 9 of 24) L1MC4|LINE|L1 44664 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 236-64 chr6 117403135 117403801 + 0.5 NA intron (NM_002944, intron 5 of 42) intron (NM_002944, intron 5 of 42) 22387 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 162.25-114 chr4 87252249 87252684 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31848 NM_020803 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 148-132 chr8 121612226 121612719 + 0.5 NA 3' UTR (NM_005328, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_005328, exon 4 of 4) -26874 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-15 chr10 44496327 44496795 + 0.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -111464 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 118.25-128 chr3 97299910 97300231 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -139537 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 138.75-50 chr14 55412700 55413096 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1040 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 213-34 chr15 97222630 97223087 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 298953 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 120.25-163 chr5 58579085 58579550 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2835 NM_001317915 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 140.75-43 chr13 59298654 59298986 + 0.5 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -713898 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 158.75-39 chr12 28567147 28567709 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -376690 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 123.5-119 chr20 33631410 33631741 + 0.5 NA intron (NM_001039709, intron 8 of 10) intron (NM_001039709, intron 8 of 10) -30752 NM_080825 128864 Hs.324104 NM_080825 ENSG00000149609 C20orf144 dJ63M2.6 chromosome 20 open reading frame 144 protein-coding 157.25-19 chr10 119221079 119221530 + 0.5 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) L1ME4a|LINE|L1 13733 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 117-198 chrX 122665948 122666307 + 0.5 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -518116 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 118.5-131 chr3 121322626 121323059 + 0.5 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) L1PA16|LINE|L1 223146 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 134.25-167 chr7 2706597 2707111 + 0.5 NA intron (NM_133463, intron 3 of 6) (ATCATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18652 NM_001321766 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 124.25-50 chr14 36619305 36619756 + 0.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -36916 NM_014360 26257 Hs.234763 NM_014360 ENSG00000136327 NKX2-8 NKX2.8|NKX2H|Nkx2-9 NK2 homeobox 8 protein-coding 154.75-3 chr1 94917712 94918124 + 0.5 NA intron (NM_001839, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 7890 NM_001286056 1266 Hs.483454 NM_001839 ENSG00000117519 CNN3 - calponin 3 protein-coding 195.75-26 chr10 92634411 92634917 + 0.5 NA intron (NM_004523, intron 14 of 21) intron (NM_004523, intron 14 of 21) 41534 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 172.5-119 chr3 41112557 41113241 + 0.5 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -86606 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 136.25-144 chr5 28011842 28012185 + 0.5 NA Intergenic LTR9C|LTR|ERV1 275652 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 114.75-28 chr10 110810909 110811291 + 0.5 NA intron (NM_001134363, intron 8 of 13) intron (NM_001134363, intron 8 of 13) 59804 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 167.25-45 chr14 67585263 67585696 + 0.5 NA intron (NM_020715, intron 26 of 28) intron (NM_020715, intron 26 of 28) 14789 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 143.25-139 chr4 140258510 140258905 + 0.5 NA intron (NM_032547, intron 1 of 4) intron (NM_032547, intron 1 of 4) 1399 NM_032547 60592 Hs.480815 NM_032547 ENSG00000153130 SCOC HRIHFB2072|SCOCO|UNC-69 short coiled-coil protein protein-coding 114.75-151 chr5 29532509 29532861 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -136709 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 134.25-64 chr17 61778502 61778937 + 0.5 NA intron (NM_032043, intron 13 of 19) intron (NM_032043, intron 13 of 19) 84840 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 156.5-103 chr21 34831308 34831911 + 0.5 NA intron (NM_001122607, intron 4 of 4) intron (NM_001122607, intron 4 of 4) 57090 NM_001122607 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 115-144 chr5 133402840 133403160 + 0.5 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 24706 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 193.75-89 chr3 113231433 113232091 + 0.5 NA intron (NM_001301861, intron 2 of 19) intron (NM_001301861, intron 2 of 19) 19646 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 152.75-18 chr10 39140904 39141410 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 444561 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 136.75-53 chr13 114283482 114283763 + 0.5 NA intron (NR_148495, intron 2 of 3) X5B_LINE|LINE|CR1 1227 NM_001353648 65110 Hs.533855 NM_023011 ENSG00000169062 UPF3A HUPF3A|RENT3A|UPF3 UPF3A regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 195.75-11 chr1 152854848 152855572 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12354 NM_001128600 448835 Hs.62927 NM_001128600 ENSG00000235942 LCE6A C1orf44 late cornified envelope 6A protein-coding 180.75-22 chr11 54598193 54598628 + 0.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 5588 NM_001004703 119749 Hs.553564 NM_001004703 ENSG00000185926 OR4C46 - olfactory receptor family 4 subfamily C member 46 protein-coding 134.5-92 chr18 13463232 13463620 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 3479 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 142-135 chr5 147924066 147924445 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -17717 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 146.5-213 chr7 106893828 106894394 + 0.5 NA intron (NM_001282426, intron 10 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 28632 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 128-151 chr7 51605397 51605855 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -212370 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 153.5-219 chrX 115604946 115605412 + 0.5 NA intron (NM_001136025, intron 1 of 15) intron (NM_001136025, intron 1 of 15) 11628 NM_001282338 5358 Hs.496622 NM_005032 ENSG00000102024 PLS3 BMND18|T-plastin plastin 3 protein-coding 171.5-79 chr2 72786150 72786520 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 39698 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 150.5-105 chr2 169027069 169027466 + 0.5 NA intron (NM_003742, intron 1 of 27) intron (NM_003742, intron 1 of 27) 4057 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 128.75-32 chr11 45219140 45219531 + 0.5 NA intron (NM_001256695, intron 5 of 7) MIRc|SINE|MIR 67006 NM_001247987 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 203.25-38 chr14 76727097 76727746 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -34047 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 142.5-28 chr10 25380748 25381200 + 0.5 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -204698 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 113-172 chr8 54474340 54474715 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16592 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 119-130 chr4 29953888 29954157 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 739730 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 119-30 chr11 112155651 112156063 + 0.5 NA intron (NM_001243211, intron 1 of 4) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 8237 NM_001243211 3606 Hs.83077 NM_001562 ENSG00000150782 IL18 IGIF|IL-18|IL-1g|IL1F4 interleukin 18 protein-coding 118.5-229 chr8 129499712 129500044 + 0.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -15736 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 119.5-180 chr5 67474640 67474949 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 171995 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 112.75-120 chr20 50544134 50544452 + 0.5 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 33910 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 118.75-61 chr14 65103013 65103413 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_145114) promoter-TSS (NM_145114) -518 NR_073138 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 140-17 chr10 31416593 31417113 + 0.5 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -17098 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 147-162 chrX 67534149 67534552 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9671 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 219-97 chr9 78982468 78983235 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 162815 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 121.25-163 chr5 74377052 74377304 + 0.5 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 54692 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 169.5-56 chr14 99034398 99034977 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 237510 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 129-29 chr11 5086727 5087139 + 0.5 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 17561 NR_145505 79296 NM_001348221 ENSG00000273085 OR52E1 OR52E1P olfactory receptor family 52 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 154-108 chr5 40781700 40782208 + 0.5 NA intron (NM_001355028, intron 1 of 9) intron (NM_001355028, intron 1 of 9) 16223 NM_001355036 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 140-27 chr11 79464765 79465317 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24011 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 120.75-129 chr4 132317775 132318188 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -273108 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 143-35 chr14 55150271 55150798 + 0.5 NA intron (NM_001146015, intron 18 of 19) intron (NM_001146015, intron 18 of 19) 13551 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 134.25-22 chr11 50383358 50383732 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -25602 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 149.5-8 chr1 162686586 162686891 + 0.5 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) L1PA8|LINE|L1 54274 NM_006182 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 134-111 chr22 34741246 34741741 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 256423 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 130.5-67 chr11 107019828 107020089 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1482 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 128.75-104 chr2 216991482 216991988 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 120963 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 175.5-90 chr2 118173668 118174177 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12464 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 131-152 chr7 24611037 24611340 + 0.5 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) intron (NM_001303037, intron 1 of 11) 37736 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 123.75-138 chr4 95164057 95164412 + 0.5 NA 3' UTR (NM_003728, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_003728, exon 16 of 16) 72743 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 120.75-45 chr14 71115714 71116114 + 0.5 NA TTS (NM_001308160) TTS (NM_001308160) -204562 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 130-138 chr6 47757837 47758190 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24026 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 201.25-57 chr21 36069642 36070117 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001286789) promoter-TSS (NM_001286789) -145 NM_001757 873 Hs.88778 NM_001757 ENSG00000159228 CBR1 CBR|SDR21C1|hCBR1 carbonyl reductase 1 protein-coding 179.25-82 chr2 191148710 191149196 + 0.5 NA intron (NM_001243835, intron 1 of 23) intron (NM_001243835, intron 1 of 23) 2041 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 196-79 chr5 82704953 82705562 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -134898 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 144-21 chr10 64049054 64049419 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -527346 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 138-23 chr12 49090311 49090663 + 0.5 NA intron (NM_021044, intron 2 of 2) intron (NM_021044, intron 2 of 2) 4314 NM_021044 50846 Hs.524382 NM_021044 ENSG00000139549 DHH GDXYM|HHG-3|SRXY7 desert hedgehog signaling molecule protein-coding 146.5-135 chr22 47737133 47737623 + 0.5 NA intron (NR_122046, intron 7 of 8) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 105704 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 113-159 chr6 50287211 50287601 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -237477 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 135.75-73 chr16 46413639 46414024 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 155266 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 172.75-11 chr10 29666118 29666744 + 0.5 NA intron (NM_001323599, intron 2 of 38) intron (NM_001323599, intron 2 of 38) -31460 NM_021738 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 132.25-82 chr18 12817650 12817958 + 0.5 NA intron (NM_080423, intron 5 of 8) intron (NM_080423, intron 5 of 8) 23158 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 123.25-20 chr10 43585487 43585910 + 0.5 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -11080 NM_001099283 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 181-80 chr4 84938755 84939364 + 0.5 NA intron (NM_014991, intron 1 of 67) L1MC4|LINE|L1 -26557 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 137-114 chr4 21274459 21274878 + 0.5 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 29238 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 153.25-121 chr7 22301869 22302250 + 0.5 NA intron (NM_012294, intron 5 of 25) intron (NM_012294, intron 5 of 25) 55095 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 231.5-84 chr5 130845714 130846280 + 0.5 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 319259 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 179.75-91 chr4 150328609 150329096 + 0.5 NA intron (NM_001367550, intron 48 of 56) intron (NM_001367550, intron 48 of 56) -250237 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 125.5-129 chr2 106624288 106624599 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 137079 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 134.75-125 chr2 241215049 241215534 + 0.5 NA intron (NM_001370694, intron 18 of 24) intron (NM_001370694, intron 18 of 24) 26614 NM_001001666 50636 Hs.163909 NM_001001666 ENSG00000146205 ANO7 D-TMPP|DTMPP|IPCA-5|IPCA5|NGEP|PCANAP5|PCANAP5L|TMEM16G anoctamin 7 protein-coding 129-149 chr6 35865629 35865988 + 0.5 NA intron (NM_003137, intron 12 of 15) L1PB4|LINE|L1 55290 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 130.25-186 chr7 35599101 35599600 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95785 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 162 chr1 20334186 20334766 + 0.5 NA intron (NM_001039500, intron 12 of 21) L1ME4c|LINE|L1 43601 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 117.5-188 chr5 112077135 112077443 + 0.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -83237 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 119.5-193 chr6 35752551 35752939 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 15713 NM_001286574 221481 Hs.533066 NM_145028 ENSG00000157343 ARMC12 C6orf81 armadillo repeat containing 12 protein-coding 145-120 chr5 35309785 35310304 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -79557 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 136-115 chr4 157127638 157128129 + 0.5 NA intron (NM_000824, intron 4 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 51480 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 136.25-65 chr15 25914288 25914650 + 0.5 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) L1MA10|LINE|L1 12109 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 120-18 chr10 72889767 72890212 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3750 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 148-54 chr2 34589083 34589500 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -88266 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 130-31 chr11 94523213 94523728 + 0.5 NA intron (NM_001190462, intron 2 of 3) intron (NM_001190462, intron 2 of 3) 11009 NM_001190462 643037 NM_001190462 ENSG00000257057 C11orf97 LINC01171 chromosome 11 open reading frame 97 protein-coding 123-79 chr16 82448411 82448758 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -178385 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 124.25-63 chr15 65874927 65875307 + 0.5 NA intron (NM_004663, intron 1 of 4) AluSc|SINE|Alu 5626 NM_001206836 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 140.25-139 chr4 153341637 153341950 + 0.5 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -2856 NM_001253861 84057 Hs.294088 NM_032117 ENSG00000121211 MND1 GAJ meiotic nuclear divisions 1 protein-coding 123.25-54 chr14 24143992 24144356 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_106990) promoter-TSS (NR_106990) -609 NR_106990 102465801 NR_106990 ENSG00000283856 MIR7703 hsa-mir-7703 microRNA 7703 ncRNA 164.5-178 chr6 97839267 97839716 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -185040 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 198.25-39 chr16 13654362 13654832 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -265560 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 168.25-22 chr11 23084655 23085277 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -224492 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 132-79 chr18 69914776 69915180 + 0.5 NA intron (NM_001303619, intron 1 of 4) MER20B|DNA|hAT-Charlie 32895 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 164-113 chr6 50426562 50427138 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -286694 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 133.25-189 chr6 144774664 144775026 + 0.5 NA intron (NM_007124, intron 59 of 73) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 369190 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 112.25-27 chr11 31616255 31616502 + 0.5 NA intron (NM_001288725, intron 5 of 10) L1MB2|LINE|L1 106611 NM_001288726 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 182-60 chr2 126429930 126430444 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -225748 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 116.5-165 chr3 136528623 136528998 + 0.5 NA intron (NM_005862, intron 6 of 33) AluSz6|SINE|Alu 223568 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 124.75-183 chr6 70849419 70849784 + 0.5 NA intron (NM_001044305, intron 7 of 10) intron (NM_001044305, intron 7 of 10) 107459 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 126.75-2 chr1 39226087 39226540 + 0.5 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) intron (NM_012090, intron 1 of 92) 142146 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 150.25-54 chr14 72063643 72064111 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 130350 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 140.75-73 chr18 12781171 12781524 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -31925 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 125.25-9 chr1 104840692 104841051 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 767848 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 187.5-144 chr5 174178236 174178796 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132810 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 159.5-186 chr6 115374344 115374971 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 269178 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 131.25-213 chr9 27515735 27516185 + 0.5 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -8354 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 117-182 chr8 71189553 71189942 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 166959 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 124.5-177 chr5 132033922 132034243 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -22014 NM_001205250 23305 Hs.14945 NM_015256 ENSG00000164398 ACSL6 ACS2|FACL6|LACS 6|LACS2|LACS5 acyl-CoA synthetase long chain family member 6 protein-coding 179.25-146 chr8 127567603 127568124 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -85724 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 148-31 chr14 69352765 69353135 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001168368, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001168368, exon 15 of 15) 45349 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 148-33 chr14 88020870 88021348 + 0.5 NA intron (NR_110121, intron 2 of 2) intron (NR_110121, intron 2 of 2) -3441 NR_046094 283587 Hs.525513 NR_046094 ENSG00000258867 LINC01146 - long intergenic non-protein coding RNA 1146 ncRNA 119.75-150 chr3 162760377 162760705 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 542760 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 123.75-58 chr14 60248190 60248573 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_177951) promoter-TSS (NM_177951) -840 NM_177951 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 186-48 chr2 104325747 104326483 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 82217 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 113.75-186 chr8 36954120 36954468 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 169920 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 183-57 chr2 223352289 223352815 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 249809 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 141.25-63 chr16 65164783 65165189 + 0.5 NA intron (NR_110918, intron 3 of 3) HAL1|LINE|L1 11587 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 130.5-234 chr7 138876006 138876520 + 0.5 NA intron (NM_020910, intron 12 of 19) intron (NM_020910, intron 12 of 19) -78067 NM_020632 50617 Hs.98967 NM_020632 ENSG00000105929 ATP6V0A4 A4|ATP6N1B|ATP6N2|RDRTA2|RTA1C|RTADR|STV1|VPH1|VPP2 ATPase H+ transporting V0 subunit a4 protein-coding 117.25-161 chr4 163390648 163391006 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 46725 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 121.5-154 chr20 1643672 1644133 + 0.5 NA intron (NR_110090, intron 2 of 2) L1PA8|LINE|L1 10394 NR_110090 101929010 Hs.570358 NR_110090 ENSG00000237914 SIRPG-AS1 - SIRPG antisense RNA 1 ncRNA 219-78 chr5 12395059 12395675 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -179490 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 141.25-100 chr21 27539734 27540182 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -182421 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 188.75-20 chr12 26799174 26799710 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 1 of 56) intron (NM_002223, intron 1 of 56) 33752 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 132-105 chr22 42894146 42894633 + 0.5 NA intron (NM_001349974, intron 1 of 9) AluSc|SINE|Alu -37116 NM_001142293 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 132.75-211 chrX 98334655 98335157 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -770371 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 195-57 chr22 28102546 28103012 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 8 of 22) intron (NM_001145418, intron 8 of 22) -182167 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 156.5-134 chr4 67822995 67823590 + 0.5 NA intron (NM_004262, intron 9 of 9) intron (NM_004262, intron 9 of 9) 60710 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 117-138 chr4 125531236 125531559 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 24138 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 145-119 chr5 31627442 31627970 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -11425 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 122.25-156 chr5 132101129 132101453 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27502 NM_000758 1437 Hs.1349 NM_000758 ENSG00000164400 CSF2 CSF|GMCSF colony stimulating factor 2 protein-coding 159-16 chr10 83324142 83324692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 352672 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 120.25-132 chr3 58131140 58131405 + 0.5 NA intron (NM_001164318, intron 25 of 45) intron (NM_001164318, intron 25 of 45) 39363 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 143.5-129 chr20 38788768 38789160 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16733 NM_015568 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 161.75-98 chr4 70836273 70836682 + 0.5 NA intron (NM_002092, intron 1 of 9) intron (NM_002092, intron 1 of 9) 3026 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 147-59 chr18 5651157 5651533 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22354 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 123.75-202 chr9 97431374 97431861 + 0.5 NA intron (NM_001302884, intron 2 of 15) intron (NM_001302884, intron 2 of 15) 19521 NM_014290 23424 Hs.193842 NM_014290 ENSG00000196116 TDRD7 CATC4|PCTAIRE2BP|TRAP tudor domain containing 7 protein-coding 157.25-112 chr4 179650788 179651247 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1508132 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 118.75-58 chr13 106740159 106740559 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 86479 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 126.75-201 chr5 122792048 122792473 + 0.5 NA intron (NM_001278199, intron 1 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 17180 NM_003100 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 140-155 chr6 161140895 161141352 + 0.5 NA intron (NM_020133, intron 7 of 8) intron (NM_020133, intron 7 of 8) 20859 NR_024277 79992 Hs.664873 NM_024929 ENSG00000279355 AGPAT4-IT1 C6orf59|NCRNA00241 AGPAT4 intronic transcript 1 ncRNA 151.5-45 chr14 35925995 35926530 + 0.5 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL 99924 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 213.25-63 chr8 27737139 27737657 + 0.5 NA intron (NR_130761, intron 6 of 6) intron (NR_130761, intron 6 of 6) 35242 NR_156432 55246 Hs.445512 NM_018246 ENSG00000147419 CCDC25 - coiled-coil domain containing 25 protein-coding 237-36 chr3 119300498 119301298 + 0.5 NA intron (NM_020754, intron 1 of 11) intron (NM_020754, intron 1 of 11) 6515 NM_020754 57514 Hs.668218 NM_020754 ENSG00000031081 ARHGAP31 AOS1|CDGAP Rho GTPase activating protein 31 protein-coding 117-154 chr5 166949627 166950044 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -23465 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 122.5-16 chr1 244391212 244391651 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 38796 NM_001012970 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 127.75-156 chr5 60690196 60690638 + 0.5 NA intron (NM_001145208, intron 1 of 9) intron (NM_001145208, intron 1 of 9) 9749 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 119.75-133 chr22 27969412 27969787 + 0.5 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1ME2|LINE|L1 -48987 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 146.25-138 chr7 89988291 89988691 + 0.5 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) LTR34|LTR|ERV1 -130909 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 112.25-108 chr2 220948399 220948801 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 623704 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 114.25-31 chr11 103232698 103233016 + 0.5 NA intron (NM_001377, intron 60 of 88) MER3|DNA|hAT-Charlie 123431 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 132.75-107 chr2 190549843 190550288 + 0.5 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -15343 NR_136298 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 135-113 chr3 106531014 106531370 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -661791 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 133.25-221 chr9 29279469 29279915 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -66091 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 141.25-22 chr10 62305521 62305845 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36839 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 153-90 chr22 24094904 24095324 + 0.5 NA intron (NM_012295, intron 24 of 36) intron (NM_012295, intron 24 of 36) 83744 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 120.25-169 chr5 117729587 117730064 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_104997) promoter-TSS (NR_104997) -536 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 116.75-24 chr10 73120596 73120997 + 0.5 NA intron (NM_001283015, intron 3 of 7) AluY|SINE|Alu 5411 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 215.5-12 chr10 64905624 64906279 + 0.5 NA intron (NR_134456, intron 1 of 1) intron (NR_134456, intron 1 of 1) 18567 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 137.75-156 chr4 85741635 85742136 + 0.5 NA intron (NM_001025616, intron 3 of 9) intron (NM_001025616, intron 3 of 9) 19417 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 115-135 chr5 85243008 85243407 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -858327 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 155-79 chr21 30270843 30271424 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 11817 NM_001085455 643803 Hs.580883 NM_001085455 ENSG00000188694 KRTAP24-1 KAP24.1 keratin associated protein 24-1 protein-coding 171.75-81 chr2 125102835 125103285 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1014925 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 119-100 chr2 230867839 230868173 + 0.5 NA intron (NM_001012514, intron 1 of 4) intron (NM_001012514, intron 1 of 4) 3056 NM_001012516 81618 Hs.111577 NM_030926 ENSG00000135916 ITM2C BRI3|BRICD2C|E25|E25C|ITM3 integral membrane protein 2C protein-coding 127.75-98 chr2 74088298 74088636 + 0.5 NA intron (NM_001287491, intron 7 of 11) AluSx4|SINE|Alu 59445 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 120.5-134 chr20 33270657 33270980 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12396 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 178-77 chr4 141087804 141088361 + 0.5 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 45387 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 166-116 chr7 28299158 28299656 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_182899) promoter-TSS (NM_182899) 86 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 122.5-3 chr1 41871222 41871599 + 0.5 NA intron (NR_038261, intron 2 of 3) intron (NR_038261, intron 2 of 3) 47512 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 119.75-99 chr2 48201832 48202132 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -112700 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 136.5-55 chr12 49510847 49511164 + 0.5 NA intron (NM_001293285, intron 10 of 14) AluSz6|SINE|Alu -28025 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 123.75-115 chr3 45011011 45011371 + 0.5 NA intron (NR_023353, intron 5 of 6) intron (NR_023353, intron 5 of 6) -15112 NM_003278 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 191.25-81 chr4 131556185 131556616 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -208438 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 162-117 chr8 104942541 104943134 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -353813 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 171-46 chr15 92653927 92654512 + 0.5 NA intron (NM_207446, intron 1 of 2) intron (NM_207446, intron 1 of 2) 1556 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 116.5-244 chr8 79466490 79466889 + 0.5 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 134501 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 141.5-87 chr19 27394788 27395246 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -398414 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 144.25-78 chr17 71418111 71418503 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -216128 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 174.25-110 chr4 40093263 40093782 + 0.5 NA intron (NM_001318359, intron 2 of 18) AluSz|SINE|Alu -36323 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 114-119 chr5 6265255 6265600 + 0.5 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 71865 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 112.25-211 chr8 66300590 66300843 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 108602 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 128.75-173 chr6 71409588 71410068 + 0.5 NA non-coding (NR_121614, exon 3 of 3) non-coding (NR_121614, exon 3 of 3) -6207 NR_029504 407029 NR_029504 ENSG00000207827 MIR30A MIRN30A|mir-30a microRNA 30a ncRNA 255.25-12 chr12 3799312 3800034 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46564 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 143.5-177 chr5 131538219 131538748 + 0.5 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 96746 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 160.25-46 chr15 68690014 68690448 + 0.5 NA intron (NM_006091, intron 2 of 11) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 48728 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 136.75-93 chr2 46396701 46397042 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -2704 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 124.5-228 chr8 111119830 111120164 + 0.5 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 -92564 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 118.75-63 chr14 70678144 70678538 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -20357 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 183.75-47 chr18 37752578 37753085 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95696 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 113.75-189 chr8 68599441 68599887 + 0.5 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) L1M5|LINE|L1 -268173 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 123.75-74 chr17 35217043 35217339 + 0.5 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -22798 NM_152462 146861 Hs.514814 NM_152462 ENSG00000164729 SLC35G3 AMAC1|TMEM21A solute carrier family 35 member G3 protein-coding 113.75-130 chr3 87217225 87217645 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 8842 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 140.5-209 chr7 15817016 15817554 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 128907 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 114.75-69 chr17 32914905 32915204 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12856 NM_001301746 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 112.25-203 chr7 49938984 49939325 + 0.5 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) intron (NM_001159878, intron 7 of 7) 154092 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 124.75-83 chr15 58954616 58954943 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21100 NR_135042 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 129.5-225 chr8 92785181 92785588 + 0.5 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) L1M4|LINE|L1 676 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 132-24 chr10 129364329 129364786 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -102684 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 129.75-152 chr5 102070970 102071408 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 225095 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 146.5-56 chr12 111662332 111662712 + 0.5 NA intron (NM_006768, intron 6 of 11) AluSp|SINE|Alu 23434 NM_006768 8315 Hs.530940 NM_006768 ENSG00000089234 BRAP BRAP2|IMP|RNF52 BRCA1 associated protein protein-coding 113-166 chr7 46151788 46152154 + 0.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -230699 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 114-69 chr2 38421645 38421912 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9516 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 142-42 chr13 74656409 74656965 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 103844 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 141.75-112 chr22 25795256 25795674 + 0.5 NA intron (NM_001318245, intron 11 of 43) intron (NM_001318245, intron 11 of 43) 53277 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 133.75-108 chr2 200402940 200403441 + 0.5 NA intron (NM_001100423, intron 3 of 12) L3|LINE|CR1 94240 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 189.5-91 chr3 37717755 37718200 + 0.5 NA intron (NM_002207, intron 18 of 27) intron (NM_002207, intron 18 of 27) 143803 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-233 chr7 91140595 91140906 + 0.5 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) MIR|SINE|MIR -123683 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 133.75-42 chr12 98949030 98949341 + 0.5 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) AluSc8|SINE|Alu -53894 NM_001352211 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 141.5-178 chr5 73707998 73708485 + 0.5 NA intron (NM_001177693, intron 2 of 35) L1PA16|LINE|L1 82083 NM_001177693 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 156.25-98 chr3 99415914 99416440 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -222417 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 125-50 chr16 22614999 22615464 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 69533 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 151.75-145 chr7 139682734 139683268 + 0.5 NA intron (NM_001113239, intron 2 of 14) intron (NM_001113239, intron 2 of 14) 94997 NM_022740 28996 Hs.731417 NM_022740 ENSG00000064393 HIPK2 PRO0593 homeodomain interacting protein kinase 2 protein-coding 131.75-180 chr6 28175445 28175718 + 0.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 13820 NR_103448 651302 Hs.172143 NM_001145129 ENSG00000226314 ZNF192P1 ZNF389|ZNF389P|dJ265C24.4 zinc finger protein 192 pseudogene 1 pseudo 183.25-72 chr3 109547407 109548101 + 0.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -55074 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 133-110 chr3 163123601 163124068 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 179467 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 159-37 chr15 85739933 85740394 + 0.5 NA intron (NM_007200, intron 33 of 36) intron (NM_007200, intron 33 of 36) 18562 NR_120366 101929679 Hs.513112 NR_120366 LOC101929679 - uncharacterized LOC101929679 ncRNA 121-188 chr8 86357774 86358110 + 0.5 NA intron (NM_007013, intron 1 of 24) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 15395 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 146.5-73 chr15 70505998 70506398 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_146562) promoter-TSS (NR_146562) -270 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 161.5-121 chr21 25901545 25902133 + 0.5 NA intron (NM_001204301, intron 14 of 16) intron (NM_001204301, intron 14 of 16) -166185 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 175.75-95 chr4 122672823 122673298 + 0.5 NA intron (NR_104126, intron 10 of 10) intron (NR_104126, intron 10 of 10) -51994 NM_021803 59067 Hs.567559 NM_021803 ENSG00000138684 IL21 CVID11|IL-21|Za11 interleukin 21 protein-coding 122.75-172 chr6 9729009 9729414 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -675291 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 145.75-40 chr14 71282809 71283184 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -37480 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 157.75-32 chr12 8752090 8752701 + 0.5 NA intron (NR_147950, intron 4 of 8) AluSx|SINE|Alu 54404 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 114.5-184 chr3 175799009 175799414 + 0.5 NA intron (NM_207015, intron 13 of 13) intron (NM_207015, intron 13 of 13) -22878 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 124.25-163 chr5 57345852 57346204 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 131954 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 127.25-9 chr1 197729825 197730181 + 0.5 NA intron (NR_125340, intron 2 of 19) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 45477 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 146-127 chr8 91476071 91476427 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 226930 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 121-184 chr8 51851316 51851621 + 0.5 NA intron (NM_001286783, intron 1 of 5) intron (NM_001286783, intron 1 of 5) -42023 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 164.5-26 chr10 126513679 126514222 + 0.5 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) intron (NM_001350922, intron 2 of 8) 7543 NM_001004298 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 129.25-201 chr8 105678361 105678641 + 0.5 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 358958 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 182.25-46 chr16 47215539 47216196 + 0.5 NA intron (NM_030790, intron 14 of 17) intron (NM_030790, intron 14 of 17) 71799 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 144.75-66 chr16 62718424 62718931 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -682239 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 144.25-25 chr10 34683256 34683687 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) MIR|SINE|MIR 131825 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 112.75-47 chr13 29586434 29586659 + 0.5 NA intron (NM_003045, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 9142 NM_003045 6541 Hs.14846 NM_003045 ENSG00000139514 SLC7A1 ATRC1|CAT-1|ERR|HCAT1|REC1L solute carrier family 7 member 1 protein-coding 182.5-134 chr5 113010933 113011659 + 0.5 NA intron (NR_038352, intron 8 of 8) intron (NR_038352, intron 8 of 8) 34498 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 160.5-98 chr2 212414296 212414790 + 0.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) Eulor4|Unknown|Unknown 11817 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 175.5-24 chr10 93607286 93607941 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -4924 NM_006204 5146 Hs.658121 NM_006204 ENSG00000095464 PDE6C ACHM5|COD4|PDEA2 phosphodiesterase 6C protein-coding 154.25-158 chr7 96992016 96992477 + 0.5 NA intron (NR_015448, intron 1 of 2) intron (NR_015448, intron 1 of 2) -13307 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 172.5-2 chr1 23255251 23255651 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 30067 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 117.75-107 chr2 96784050 96784344 + 0.5 NA intron (NM_020184, intron 1 of 6) FRAM|SINE|Alu -14081 NR_036074 100422928 NR_036074 ENSG00000264157 MIR3127 mir-3127 microRNA 3127 ncRNA 122-180 chr8 80089724 80090128 + 0.5 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) -9095 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 123.25-78 chr17 56179858 56180272 + 0.5 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) intron (NM_153228, intron 1 of 16) 26590 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 158-79 chr2 151237032 151237486 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 24604 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 137.5-203 chr6 39168479 39168841 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53474 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 114.5-6 chr1 59607273 59607586 + 0.5 NA intron (NM_001350794, intron 8 of 14) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 91799 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 132.25-124 chr3 26072784 26073212 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -199303 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 193.5-62 chr16 80383318 80383917 + 0.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -157117 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 120-73 chr17 61139206 61139584 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 228309 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 131-153 chr7 26918768 26919047 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -54317 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 142.25-84 chr2 45633210 45633617 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18262 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 112.25-161 chr5 17968369 17968802 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 161311 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 191.5-94 chr3 3740388 3740895 + 0.5 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR -58790 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 151.75-40 chr13 63869898 63870366 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26007 NR_130763 102723968 Hs.551671 NR_130763 ENSG00000219926 LOC102723968 - uncharacterized LOC102723968 ncRNA 167.75-98 chr4 66122340 66122768 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -154270 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 154.75-44 chr15 40657249 40657645 + 0.5 NA exon (NM_170589, exon 25 of 27) exon (NM_170589, exon 25 of 27) 37658 NR_040058 100505648 Hs.586876 NR_040058 ENSG00000245849 RAD51-AS1 TODRA RAD51 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-176 chr8 121631613 121632130 + 0.5 NA intron (NM_005328, intron 1 of 3) intron (NM_005328, intron 1 of 3) -7475 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 114.75-15 chr1 182730891 182731296 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18231 NR_146548 105371644 Hs.496952 NR_146548 ENSG00000227181 LINC01688 - long intergenic non-protein coding RNA 1688 ncRNA 164-129 chr7 90255644 90256199 + 0.5 NA intron (NM_001039706, intron 2 of 22) intron (NM_001039706, intron 2 of 22) 10747 NM_001363438 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 133.5-142 chr21 21539039 21539409 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001352591, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001352591, exon 18 of 18) 198095 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 115-133 chr5 62997235 62997592 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 418594 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 112.25-49 chr12 115280851 115281153 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -596827 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 155-32 chr13 79831548 79832090 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27433 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 174.5-2 chr1 29292376 29293042 + 0.5 NA intron (NM_133177, intron 15 of 30) L1ME3E|LINE|L1 56187 NM_133177 10076 Hs.19718 NM_005704 ENSG00000060656 PTPRU FMI|PCP-2|PTP|PTP-J|PTP-PI|PTP-RO|PTPPSI|PTPRO|PTPU2|R-PTP-PSI|R-PTP-U|hPTP-J protein tyrosine phosphatase receptor type U protein-coding 151.25-207 chrX 51982005 51982512 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 81215 NR_102368 101340250 NR_102368 ENSG00000221705 SNORA11E - small nucleolar RNA, H/ACA box 11E snoRNA 115.25-11 chr1 82116821 82117214 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 314564 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 136-125 chr5 116622673 116623055 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48041 NM_020796 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 175.75-108 chr5 178254540 178255118 + 0.5 NA intron (NM_173465, intron 16 of 28) intron (NM_173465, intron 16 of 28) -22007 NM_001278346 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 165.5-99 chr20 23910630 23911095 + 0.5 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -31114 NM_001900 1473 Hs.121489 NM_001900 ENSG00000170367 CST5 - cystatin D protein-coding 116.75-192 chr8 29824880 29825326 + 0.5 NA intron (NR_125817, intron 1 of 2) intron (NR_125817, intron 1 of 2) 3401 NR_125817 101929470 Hs.204721 NR_125817 ENSG00000248964 LOC101929470 - uncharacterized LOC101929470 ncRNA 136.25-186 chr8 85223596 85224061 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3406 NM_001099671 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 112.75-131 chr3 5192253 5192582 + 0.5 NA intron (NM_014674, intron 1 of 11) intron (NM_014674, intron 1 of 11) 4710 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 114.25-21 chr10 107014164 107014397 + 0.5 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) AluSc|SINE|Alu 150426 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 127.5-60 chr12 98689200 98689455 + 0.5 NA intron (NM_001160, intron 16 of 25) intron (NM_001160, intron 16 of 25) 44027 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 147-108 chr5 53505769 53506262 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 25386 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 143.25-27 chr11 75189100 75189649 + 0.5 NA intron (NM_007256, intron 8 of 13) MIRc|SINE|MIR 29542 NM_001145211 11309 Hs.7884 NM_007256 ENSG00000137491 SLCO2B1 OATP-B|OATP2B1|OATPB|SLC21A9 solute carrier organic anion transporter family member 2B1 protein-coding 120.75-89 chr20 7275455 7275897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21474 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 144-9 chr1 159209369 159209849 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 4734 NM_001122951 2532 Hs.153381 NM_002036 ENSG00000213088 ACKR1 CCBP1|CD234|DARC|DARC/ACKR1|Dfy|FY|GPD|GpFy|WBCQ1 atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group) protein-coding 127.75-160 chr5 108158534 108158924 + 0.5 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 223369 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 128.25-70 chr17 52652608 52652952 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -209341 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 126-168 chr7 127912727 127913172 + 0.5 NA intron (NM_014390, intron 14 of 23) intron (NM_014390, intron 14 of 23) -84560 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 136.25-87 chr18 7044678 7045197 + 0.5 NA intron (NM_005559, intron 6 of 62) intron (NM_005559, intron 6 of 62) 72860 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 136.75-62 chr14 83811678 83812061 + 0.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1169237 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 133.5-189 chr4 132448244 132448759 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -142588 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 171.75-95 chr22 26574225 26574662 + 0.5 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR -9102 NM_001008566 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 134.25-87 chr2 123592376 123592721 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 432626 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 162.25-77 chr2 58086508 58087039 + 0.5 NA intron (NM_001130483, intron 5 of 13) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 40061 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 159.75-167 chr8 28468008 28468361 + 0.5 NA intron (NM_001258211, intron 2 of 7) intron (NM_001258211, intron 2 of 7) 22045 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 149.5-104 chr2 200318285 200318871 + 0.5 NA intron (NM_001282744, intron 1 of 12) intron (NM_001282744, intron 1 of 12) 9628 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 115.75-129 chr20 54969530 54969839 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -453359 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 159.75-53 chr15 82753147 82753633 + 0.5 NA intron (NR_110098, intron 1 of 2) MERX|DNA|TcMar-Tigger -2555 NR_003011 677778 Hs.743895 NR_003011 ENSG00000277864 SCARNA15 ACA45 small Cajal body-specific RNA 15 ncRNA 159-65 chr3 90041585 90042106 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 934224 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 135-19 chr10 93692568 93693033 + 0.5 NA intron (NM_145246, intron 5 of 13) intron (NM_145246, intron 5 of 13) 9772 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 173-131 chr7 29187521 29187965 + 0.5 NA intron (NM_001371264, intron 1 of 15) AluSp|SINE|Alu 2314 NM_001371262 142.25-41 chr12 38635867 38636265 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 269525 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 138-171 chr9 81655966 81656420 + 0.5 NA intron (NM_005077, intron 4 of 19) intron (NM_005077, intron 4 of 19) 33342 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 122.25-200 chr8 130583218 130583620 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -139745 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 186-69 chr5 40397917 40398468 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -281723 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 113.5-177 chr4 67198230 67198554 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 223608 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 167.75-43 chr13 98029779 98030274 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 76351 NM_002271 3843 Hs.712598 NM_002271 ENSG00000065150 IPO5 IMB3|KPNB3|Pse1|RANBP5|imp5 importin 5 protein-coding 118.75-19 chr10 27604647 27604937 + 0.5 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 100488 NM_001256411 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 160.75-57 chr17 80017792 80018243 + 0.5 NA intron (NM_019020, intron 1 of 11) intron (NM_019020, intron 1 of 11) 17855 NM_019020 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 112.5-115 chr2 69781560 69781807 + 0.5 NA intron (NM_001320702, intron 2 of 12) intron (NM_001320702, intron 2 of 12) 39549 NM_001320700 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 129-71 chr15 61579452 61579776 + 0.5 NA Intergenic AluYk3|SINE|Alu -150304 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 171-31 chr13 39605347 39605740 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2350 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 154-52 chr17 60689348 60689756 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 3 of 25) intron (NM_001330413, intron 3 of 25) 11701 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 143-32 chr13 65982234 65982715 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16045 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 155.75-97 chr22 27413377 27413837 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102956 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 133.5-154 chr3 4489610 4490020 + 0.5 NA TTS (NR_108075) TTS (NR_108075) 3348 NR_108075 100996539 Hs.190365 NR_108075 ITPR1-DT ITPR1-AS1 ITPR1 divergent transcript ncRNA 174.5-34 chr11 75003961 75004649 + 0.5 NA exon (NM_001367866, exon 3 of 4) exon (NM_001367866, exon 3 of 4) 15372 NM_001367867 10825 Hs.191074 NM_006656 ENSG00000162139 NEU3 SIAL3 neuraminidase 3 protein-coding 170.75-50 chr17 44546867 44547269 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10416 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 135.25-145 chr4 83785737 83786060 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 249790 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 121-192 chr8 117206716 117206983 + 0.5 NA Intergenic MER58D|DNA|hAT-Charlie 71854 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 181.5-53 chr16 67878936 67879387 + 0.5 NA intron (NM_014329, intron 12 of 28) intron (NM_014329, intron 12 of 28) -5724 NM_001348682 123904 Hs.435464 NM_198443 ENSG00000188038 NRN1L MRCC2446|UNQ2446|cpg15-2 neuritin 1 like protein-coding 126-180 chr8 144027846 144028233 + 0.5 NA intron (NM_198572, intron 1 of 4) L1PA10|LINE|L1 15759 NM_001134374 375686 Hs.97726 NM_198572 ENSG00000186583 SPATC1 SPATA15 spermatogenesis and centriole associated 1 protein-coding 134.75-69 chr14 66535268 66535661 + 0.5 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1ME3|LINE|L1 28057 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 177.5-74 chr2 15094493 15095108 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 462083 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 161.25-23 chr11 25917330 25917691 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -271613 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 125.75-142 chr4 128692681 128693052 + 0.5 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -116834 NM_024900 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 114.25-29 chr11 97974939 97975382 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1045789 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 229.25-29 chr15 47321205 47322029 + 0.5 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) intron (NM_001198999, intron 1 of 19) 137528 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 116.25-233 chr8 123001091 123001379 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 24537 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 172.75-116 chr7 30817042 30817530 + 0.5 NA intron (NR_037598, intron 7 of 19) intron (NR_037598, intron 7 of 19) 45869 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 113.25-62 chr16 13027186 13027474 + 0.5 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 125732 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 130.75-109 chr22 24230606 24231001 + 0.5 NA intron (NM_001099781, intron 6 of 11) MER65A|LTR|ERV1 14339 NM_001099781 2687 Hs.437156 NM_004121 ENSG00000099998 GGT5 GGL|GGT 5|GGT-REL|GGTLA1 gamma-glutamyltransferase 5 protein-coding 150-58 chr16 24333147 24333652 + 0.5 NA intron (NM_006539, intron 1 of 3) intron (NM_006539, intron 1 of 3) 77846 NM_006539 10368 Hs.7235 NM_006539 ENSG00000006116 CACNG3 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 3 protein-coding 146-41 chr14 53478908 53479425 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 325812 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 155.5-216 chr9 73434653 73435249 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 283086 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 153-49 chr16 5843590 5844003 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -175228 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 145-105 chr3 182015684 182015974 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63465 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 128.75-155 chr5 107829897 107830326 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -159174 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 138.5-125 chr22 36341664 36342069 + 0.5 NA intron (NM_002473, intron 2 of 40) intron (NM_002473, intron 2 of 40) 46201 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 130.5-246 chr8 120168171 120168662 + 0.5 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 43314 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 197.5-50 chr16 52730714 52731223 + 0.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -123993 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 190-74 chr7 97768445 97769179 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 36726 NM_013998 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 126.5-272 chrX 80332753 80333185 + 0.5 NA intron (NR_110646, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 2349 NR_110646 101060146 Hs.546064 NR_110646 ENSG00000278530 CHMP1B2P - charged multivesicular body protein 1B2, pseudogene pseudo 177-98 chr8 129620137 129620706 + 0.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -45403 NR_130918 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 158.25-8 chr10 22220885 22221392 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11155 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 115.25-169 chr5 160836884 160837268 + 0.5 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) intron (NM_001366652, intron 1 of 24) 15135 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 135-171 chr7 92103907 92104392 + 0.5 NA intron (NM_147185, intron 46 of 49) intron (NM_147185, intron 46 of 49) 30328 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 116-22 chr11 22723373 22723792 + 0.5 NA intron (NM_005256, intron 2 of 6) intron (NM_005256, intron 2 of 6) 48808 NM_005256 2620 Hs.711297 NM_005256 ENSG00000148935 GAS2 GAS-2 growth arrest specific 2 protein-coding 121-11 chr1 167671354 167671667 + 0.5 NA intron (NM_001322923, intron 1 of 5) intron (NM_001322923, intron 1 of 5) 41278 NR_136519 92241 Hs.493867 NM_052862 ENSG00000198771 RCSD1 CAPZIP|MK2S4 RCSD domain containing 1 protein-coding 117-6 chr1 148355240 148355579 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 7124 NR_104082 101954273 NR_104082 ENSG00000207340 RNVU1-1 RNU1-10P|RNU1-53|RNU1P10|RNVU1-10|U1.4|U1P14|vU1.1|vU1.10 RNA, variant U1 small nuclear 1 snRNA 130.75-51 chr14 47479835 47480316 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -136829 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 133.25-122 chr21 28246744 28247018 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -18214 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 130.75-121 chr3 124257081 124257461 + 0.5 NA intron (NM_001024660, intron 3 of 59) intron (NM_001024660, intron 3 of 59) -117061 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 161-51 chr16 84386421 84386896 + 0.5 NA intron (NM_014861, intron 1 of 26) intron (NM_014861, intron 1 of 26) 18135 NM_001286527 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 176.75-78 chr3 3017631 3018155 + 0.5 NA intron (NM_175607, intron 14 of 24) L1MEd|LINE|L1 43252 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-23 chr10 25949161 25949588 + 0.5 NA intron (NM_001368265, intron 2 of 7) intron (NM_001368265, intron 2 of 7) 15145 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 115.5-86 chr16 50402903 50403232 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7934 NR_146572 105371248 NR_146572 ENSG00000261092 LINC02178 - long intergenic non-protein coding RNA 2178 ncRNA 144.75-112 chr3 126520702 126521266 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3171 NM_152889 166012 Hs.292375 NM_152889 ENSG00000180767 CHST13 C4ST3 carbohydrate sulfotransferase 13 protein-coding 119-105 chr21 27345519 27345922 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -376659 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 121.5-209 chr5 37764306 37764770 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 70284 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 147.75-162 chr8 130162323 130162816 + 0.5 NA intron (NM_001362925, intron 11 of 29) AluY|SINE|Alu -77801 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 114.75-200 chr8 139301979 139302365 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -388131 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 116.25-24 chr10 99953012 99953403 + 0.5 NA intron (NR_024130, intron 2 of 4) intron (NR_024130, intron 2 of 4) -22300 NM_001318326 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 112.5-8 chr1 153197780 153198032 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5524 NM_001010857 149018 Hs.125785 NM_001010857 ENSG00000203784 LELP1 - late cornified envelope like proline rich 1 protein-coding 154.75-160 chrX 119155329 119155897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5034 NM_020721 57481 Hs.97594 NM_020721 ENSG00000250423 KIAA1210 - KIAA1210 protein-coding 161-104 chr6 9225898 9226461 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 573970 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 134.5-164 chr4 174807410 174807936 + 0.5 NA intron (NM_006529, intron 1 of 9) HAL1|LINE|L1 21574 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 141.25-44 chr14 35245265 35245653 + 0.5 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) AluJb|SINE|Alu -33099 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 128.75-27 chr11 9268831 9269222 + 0.5 NA Intergenic AluYf1|SINE|Alu -3676 NM_015213 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 128.5-109 chr2 63398778 63399130 + 0.5 NA intron (NR_148704, intron 11 of 18) intron (NR_148704, intron 11 of 18) 39053 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 147.5-205 chr8 17317482 17317850 + 0.5 NA intron (NM_004686, intron 7 of 13) HAL1|LINE|L1 70708 NM_001363173 137492 Hs.343873 NM_152415 ENSG00000155975 VPS37A HCRP1|PQBP2|SPG53 VPS37A subunit of ESCRT-I protein-coding 185.25-78 chr22 35330870 35331574 + 0.5 NA intron (NR_156428, intron 7 of 13) AluJr|SINE|Alu -4418 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 112.25-91 chr2 30565724 30566089 + 0.5 NA intron (NM_182551, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 118660 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 148.5-35 chr11 24844083 24844468 + 0.5 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 347222 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 143.75-66 chr17 39402630 39403035 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001370208) promoter-TSS (NM_001370208) -276 NM_001370208 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 141.5-62 chr15 46709462 46709865 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -474426 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 134.75-199 chr7 53572682 53573125 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 239028 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 125.75-32 chr10 117390670 117391096 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -15443 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 195-31 chr15 60192760 60193393 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 188765 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 144-31 chr12 30031518 30032013 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -247006 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 163.25-81 chr21 21194690 21195120 + 0.5 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) L1MA9|LINE|L1 47743 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 133.75-208 chr9 137925648 137926041 + 0.5 NA intron (NM_001243812, intron 6 of 45) AluY|SINE|Alu 21216 NR_132977 105376331 NR_132977 LOC105376331 - uncharacterized LOC105376331 ncRNA 121.75-83 chr2 112744533 112744837 + 0.5 NA intron (NR_130712, intron 7 of 9) HAL1|LINE|L1 19924 NM_152515 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 117.25-87 chr16 54295593 54295903 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -8961 NM_024336 79191 Hs.499205 NM_024336 ENSG00000177508 IRX3 IRX-1|IRXB1 iroquois homeobox 3 protein-coding 178.5-165 chr7 25914162 25914714 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35548 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 145.5-65 chr14 63781616 63782075 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -53780 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 141.25-157 chr6 66616611 66616981 + 0.5 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 828917 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 120-93 chr2 122356098 122356390 + 0.5 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 600593 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 161.25-119 chr3 20713694 20714181 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 371469 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 151-67 chr2 211471240 211471569 + 0.5 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) intron (NM_001042599, intron 20 of 26) 853833 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 163.5-4 chr1 49419483 49420093 + 0.5 NA intron (NR_046839, intron 3 of 3) intron (NR_046839, intron 3 of 3) 52297 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 213.5-32 chr12 65248461 65249025 + 0.5 NA TTS (NM_001167614) TTS (NM_001167614) -29940 NM_001031679 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 113-189 chrX 42829183 42829529 + 0.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -51193 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 142.75-155 chr5 77943123 77943578 + 0.5 NA intron (NR_105012, intron 1 of 1) intron (NR_105012, intron 1 of 1) -14897 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 120-183 chr7 155521689 155521963 + 0.5 NA intron (NM_001369813, intron 2 of 4) intron (NM_001369813, intron 2 of 4) -11664 NR_163161 285888 Hs.146751 NM_001103176 ENSG00000146910 CNPY1 - canopy FGF signaling regulator 1 protein-coding 133.75-88 chr18 21540077 21540589 + 0.5 NA intron (NM_052911, intron 8 of 11) intron (NM_052911, intron 8 of 11) 60371 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 154.75-139 chr7 114615054 114615446 + 0.5 NA intron (NM_148898, intron 4 of 17) L2a|LINE|L2 -38095 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 123.5-35 chr11 30224653 30225025 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6175 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 117.25-35 chr10 132850671 132851096 + 0.5 NA intron (NM_001200049, intron 40 of 57) intron (NM_001200049, intron 40 of 57) -64736 NM_177400 84504 Hs.134013 NM_177400 ENSG00000148826 NKX6-2 GTX|NKX6.2|NKX6B|SPAX8 NK6 homeobox 2 protein-coding 167-3 chr1 43430193 43430791 + 0.5 NA intron (NM_015284, intron 30 of 70) intron (NM_015284, intron 30 of 70) -18047 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 206.25-26 chr12 8712080 8712848 + 0.5 NA intron (NM_001352271, intron 2 of 6) intron (NM_001352271, intron 2 of 6) 14473 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 130-112 chr4 22163949 22164266 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 175559 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 157.5-19 chr10 18216549 18217008 + 0.5 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) -43944 NM_000724 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 124.5-24 chr10 83577968 83578242 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 98984 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 140-21 chr10 126602311 126602815 + 0.5 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) intron (NM_001350922, intron 2 of 8) 67947 NM_001350921 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 133.25-24 chr10 106268993 106269403 + 0.5 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 129033 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 131.25-203 chr8 122818520 122818849 + 0.5 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) MER131|DNA?|DNA? 37029 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 116.75-145 chr4 36963563 36963913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38041 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 132.75-21 chr10 27115278 27115616 + 0.5 NA intron (NM_139312, intron 18 of 19) AluJb|SINE|Alu -14949 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 157.75-72 chr17 79399297 79399813 + 0.5 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 116593 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 137-45 chr14 21000307 21000703 + 0.5 NA intron (NM_014579, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu 1212 NM_014579 29986 Hs.175783 NM_014579 ENSG00000165794 SLC39A2 6A1|ETI-1|ZIP-2|ZIP2 solute carrier family 39 member 2 protein-coding 113.5-152 chr3 2697827 2698193 + 0.5 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MLT2D|LTR|ERVL -194205 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 125-129 chr5 88763630 88763991 + 0.5 NA intron (NM_001364333, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu 21701 NM_001364357 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 186.75-108 chr8 30882279 30882774 + 0.5 NA intron (NR_146525, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 6180 NR_146525 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 137.25-142 chr6 105677296 105677722 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -274427 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 161.25-134 chr5 3874430 3874912 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 278839 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 152.5-172 chr7 1215396 1215748 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -17300 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 129-184 chr8 127783236 127783680 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11075 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 115.5-220 chr6 133295621 133295873 + 0.5 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) MIRb|SINE|MIR 54248 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 153-67 chr2 35007965 35008407 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 330629 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 128-109 chr4 30290715 30291119 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -429452 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 140.25-120 chr3 126777899 126778455 + 0.5 NA intron (NM_032343, intron 4 of 7) L1MB8|LINE|L1 73937 NM_032343 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 195.5-26 chr11 130060524 130060993 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -9136 NM_001328686 334 Hs.370247 NM_001642 ENSG00000084234 APLP2 APLP-2|APPH|APPL2|CDEBP amyloid beta precursor like protein 2 protein-coding 120.25-67 chr16 6409988 6410416 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -363607 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 207.75-119 chr7 77758408 77759169 + 0.5 NA intron (NM_198467, intron 3 of 7) intron (NM_198467, intron 3 of 7) 39646 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 113.5-240 chr8 131247350 131247701 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -206616 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 115.75-11 chr1 230379576 230379891 + 0.5 NA intron (NM_001258311, intron 1 of 6) intron (NM_001258311, intron 1 of 6) 46599 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 117-90 chr2 71903746 71904149 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 243915 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 155-23 chr11 82152655 82153071 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1ME2z|LINE|L1 251050 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 113.25-134 chr5 43937771 43938153 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -334732 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 269-2 chr1 74120857 74121489 + 0.5 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) intron (NM_001105659, intron 4 of 7) 77003 NM_001322315 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 116.5-79 chr15 70373474 70373858 + 0.5 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 132262 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 129.25-136 chr3 185103990 185104298 + 0.5 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) MER61F|LTR|ERV1 48916 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 175-104 chr5 116552019 116552468 + 0.5 NA intron (NM_001300780, intron 1 of 19) intron (NM_001300780, intron 1 of 19) -22175 NR_147170 105379132 NR_147170 SEMA6A-AS2 - SEMA6A antisense RNA 2 ncRNA 168.5-91 chr2 174016309 174016842 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -8705 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 162.25-46 chr13 113769814 113770306 + 0.5 NA intron (NM_182614, intron 3 of 8) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 10817 NM_001348663 348013 Hs.280805 NM_182614 ENSG00000184497 TMEM255B FAM70B transmembrane protein 255B protein-coding 135-65 chr18 21204998 21205329 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37079 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 142.5-201 chr7 4296891 4297406 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -162311 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 117.75-67 chr15 63679640 63679949 + 0.5 NA intron (NM_003922, intron 36 of 77) intron (NM_003922, intron 36 of 77) -78967 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 229-9 chr11 69587437 69588192 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53291 NM_053056 595 Hs.523852 NM_053056 ENSG00000110092 CCND1 BCL1|D11S287E|PRAD1|U21B31 cyclin D1 protein-coding 162.25-90 chr2 181790027 181790530 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -101452 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 140.25-54 chr15 72830551 72831016 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -47025 NM_001365224 83440 Hs.562587 NM_031284 ENSG00000159322 ADPGK 2610017G09Rik|ADP-GK ADP dependent glucokinase protein-coding 138.5-134 chr3 40883017 40883553 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -316220 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 121.25-98 chr2 149158563 149158805 + 0.5 NA intron (NM_001317004, intron 3 of 6) L1MB4|LINE|L1 40510 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 125.5-159 chr22 25922899 25923248 + 0.5 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) L1MD3|LINE|L1 180885 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 136.25-49 chr13 92266364 92266798 + 0.5 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) L1MDa|LINE|L1 85626 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 118.5-54 chr14 65028386 65028844 + 0.5 NA intron (NM_002028, intron 6 of 11) intron (NM_002028, intron 6 of 11) -16073 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 127.75-123 chr22 43667154 43667514 + 0.5 NA intron (NM_198856, intron 14 of 29) intron (NM_198856, intron 14 of 29) 144971 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 195.75-127 chr9 86333598 86334162 + 0.5 NA intron (NM_001185074, intron 6 of 19) L1MCb|LINE|L1 20530 NM_001330718 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 186.25-43 chr17 47806827 47807386 + 0.5 NA TTS (NM_145798) TTS (NM_145798) 14688 NM_145798 114881 Hs.463320 NM_017731 ENSG00000006025 OSBPL7 ORP7 oxysterol binding protein like 7 protein-coding 147-31 chr14 62776147 62776661 + 0.5 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 269054 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 114.5-216 chr5 99125455 99125761 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -195894 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 120.25-133 chr3 96906621 96906998 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 92215 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 117.5-73 chr16 2760694 2761030 + 0.5 NA intron (NM_016333, intron 10 of 14) intron (NM_016333, intron 10 of 14) 8224 NM_016333 23524 Hs.433343 NM_016333 ENSG00000167978 SRRM2 300-KD|CWF21|Cwc21|HSPC075|SRL300|SRm300 serine/arginine repetitive matrix 2 protein-coding 172.5-189 chr7 64192858 64193370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14089 NM_001159524 730291 Hs.723116 NM_001159524 ENSG00000223614 ZNF735 ZNF735P zinc finger protein 735 protein-coding 114.25-58 chr14 67148028 67148460 + 0.5 NA intron (NM_001024218, intron 17 of 21) intron (NM_001024218, intron 17 of 21) -41196 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 132.25-45 chr11 124961466 124961931 + 0.5 NA intron (NM_025004, intron 4 of 15) AluSx1|SINE|Alu 7496 NM_025004 80071 Hs.287555 NM_025004 ENSG00000149548 CCDC15 - coiled-coil domain containing 15 protein-coding 130.5-142 chr2 156941593 156941946 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -315936 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 112.5-98 chr18 23757877 23758182 + 0.5 NA intron (NM_001127717, intron 6 of 73) intron (NM_001127717, intron 6 of 73) 68576 NM_001302996 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 115.5-245 chr9 20470012 20470400 + 0.5 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) 32136 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 138.5-179 chr6 159785931 159786471 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_002965) promoter-TSS (NR_002965) -468 NR_002965 677812 Hs.363137 NR_002965 ENSG00000206910 SNORA29 ACA29 small nucleolar RNA, H/ACA box 29 snoRNA 157-110 chr7 10914740 10915261 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 25153 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 127-176 chr8 123341360 123341752 + 0.5 NA intron (NM_014109, intron 19 of 27) L3b|LINE|CR1 -6478 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 139.5-164 chr5 10854004 10854472 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93004 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 130.75-68 chr16 89942322 89942759 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6191 NM_001242821 54849 Hs.62771 NM_017702 ENSG00000140995 DEF8 - differentially expressed in FDCP 8 homolog protein-coding 130.25-113 chr2 206366859 206367364 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -76421 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 153.25-77 chr20 51646765 51647179 + 0.5 NA intron (NM_006045, intron 14 of 27) AluSx1|SINE|Alu -84133 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 122.25-61 chr14 61070463 61070802 + 0.5 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) L1MB1|LINE|L1 -88942 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 140.25-64 chr16 65798797 65799242 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -222719 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 113.25-166 chr8 62874262 62874673 + 0.5 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L1PA8A|LINE|L1 -103394 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 141.75-5 chr1 63935758 63936178 + 0.5 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 161951 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 165.5-23 chr10 114854477 114854868 + 0.5 NA intron (NM_001135051, intron 13 of 16) MER5C|DNA|hAT-Charlie 32892 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 148-6 chr1 219990022 219990576 + 0.5 NA intron (NM_004446, intron 18 of 31) intron (NM_004446, intron 18 of 31) 56206 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 167.25-162 chrX 51897994 51898402 + 0.5 NA intron (NM_006986, intron 8 of 12) intron (NM_006986, intron 8 of 12) 4575 NM_006986 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 151.75-71 chr2 201360300 201360650 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3077 NM_139163 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 120.25-206 chr7 133107859 133108326 + 0.5 NA intron (NR_133931, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 419 NR_133931 105375512 Hs.521205 NR_133931 LOC105375512 - uncharacterized LOC105375512 ncRNA 149.75-4 chr1 76602885 76603343 + 0.5 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) L1ME3E|LINE|L1 176153 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 122-108 chr20 16728475 16728910 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1334 NM_003092 6629 Hs.280378 NM_003092 ENSG00000125870 SNRPB2 Msl1|U2B'' small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 protein-coding 123.5-96 chr2 66234989 66235353 + 0.5 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL 123157 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 139.75-109 chr20 58884199 58884647 + 0.5 NA intron (NR_126334, intron 1 of 4) intron (NR_126334, intron 1 of 4) -3990 NR_132273 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 171.25-16 chr10 73163417 73164014 + 0.5 NA intron (NR_024203, intron 1 of 11) intron (NR_024203, intron 1 of 11) 4293 NM_007265 11319 Hs.631822 NM_007265 ENSG00000122882 ECD GCR2|HSGT1|SGT1 ecdysoneless cell cycle regulator protein-coding 164-64 chr20 49017416 49017818 + 0.5 NA intron (NM_006420, intron 33 of 38) intron (NM_006420, intron 33 of 38) 28439 NR_110624 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 121-202 chrX 66116680 66117110 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45776 NM_138737 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 118-151 chr5 65591250 65591496 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001656, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001656, exon 11 of 11) 28077 NM_001278927 23398 Hs.121432 NM_015342 ENSG00000113593 PPWD1 - peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 protein-coding 112.75-188 chr7 56282399 56282696 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 165828 NR_029420 650226 Hs.448401 NR_029420 LOC650226 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene pseudo 139.25-74 chr19 18963164 18963657 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -22193 NM_004838 9454 Hs.720208 NM_004838 ENSG00000051128 HOMER3 HOMER-3|VESL3 homer scaffold protein 3 protein-coding 193.25-43 chr17 48514458 48514877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16344 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 112.5-28 chr10 109479006 109479269 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 444109 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 126.25-189 chr7 83681413 83681776 + 0.5 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 -32455 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 126.75-46 chr13 81328436 81328900 + 0.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -101685 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 184.25-69 chr2 220742470 220743160 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 829489 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 158.5-200 chr9 112999038 112999495 + 0.5 NA intron (NM_001101338, intron 4 of 4) intron (NM_001101338, intron 4 of 4) 12926 NM_001101338 169834 Hs.192877 NM_001101338 ENSG00000285447 ZNF883 - zinc finger protein 883 protein-coding 138.75-105 chr20 1702827 1703336 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45302 NM_018556 55423 Hs.590883 NM_018556 ENSG00000089012 SIRPG CD172g|SIRP-B2|SIRPB2|SIRPgamma|bA77C3.1 signal regulatory protein gamma protein-coding 170.5-5 chr1 36448323 36448757 + 0.5 NA intron (NM_001330493, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 1911 NM_206837 127700 Hs.202207 NM_145047 ENSG00000116885 OSCP1 C1orf102|NOR1 organic solute carrier partner 1 protein-coding 118.75-152 chr5 74411693 74411963 + 0.5 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 89342 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 193.75-57 chr18 2852795 2853540 + 0.5 NA intron (NM_032048, intron 2 of 7) intron (NM_032048, intron 2 of 7) 6161 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 130.25-222 chr9 108462574 108462923 + 0.5 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 393238 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 141.25-65 chr17 29728686 29729162 + 0.5 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) L1MA3|LINE|L1 32508 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 132.25-138 chr4 25698628 25699084 + 0.5 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 42392 NM_001177999 10568 Hs.479372 NM_006424 ENSG00000157765 SLC34A2 NAPI-3B|NAPI-IIb|NPTIIb solute carrier family 34 member 2 protein-coding 149.75-87 chr2 108134692 108135068 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -82125 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 146.25-41 chr15 56999039 56999471 + 0.5 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) L1MDa|LINE|L1 79810 NM_001322164 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 131.25-102 chr2 77655499 77655832 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -133232 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 114-112 chr4 86393085 86393385 + 0.5 NA intron (NM_002753, intron 1 of 13) intron (NM_002753, intron 1 of 13) -22368 NM_001318068 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 114.5-3 chr1 48673653 48674005 + 0.5 NA intron (NM_001323575, intron 6 of 12) intron (NM_001323575, intron 6 of 12) 103062 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 121.75-118 chr3 89850773 89851063 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 743297 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 114.5-255 chr8 46054069 46054489 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 563364 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 126.5-67 chr14 61150768 61151206 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 130351 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 128.75-19 chr10 46063928 46064365 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17877 NM_002443 4477 Hs.255462 NM_002443 ENSG00000263639 MSMB HPC13|IGBF|MSP|MSPB|PN44|PRPS|PSP|PSP-94|PSP57|PSP94 microseminoprotein beta protein-coding 125-106 chr3 170346515 170346886 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11015 NM_005414 6498 Hs.536655 NM_005414 ENSG00000136603 SKIL SNO|SnoA|SnoI|SnoN SKI like proto-oncogene protein-coding 114-91 chr21 17849050 17849366 + 0.5 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) MER33|DNA|hAT-Charlie -29852 NM_001100420 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 130.25-212 chr8 144327734 144328044 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -1037 NM_012079 8694 Hs.521954 NM_012079 ENSG00000185000 DGAT1 ARAT|ARGP1|DGAT|DIAR7 diacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 129-95 chr2 173815754 173816054 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 147976 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 121.5-3 chr1 40266343 40266661 + 0.5 NA intron (NM_005857, intron 2 of 9) intron (NM_005857, intron 2 of 9) 8266 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 127.25-152 chr4 164052067 164052509 + 0.5 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu 145423 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 222-77 chr8 83134856 83135676 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 223162 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 147.75-172 chrX 86606539 86606907 + 0.5 NA intron (NM_001139515, intron 3 of 11) L1M1|LINE|L1 343755 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 125.75-8 chr1 109441387 109441832 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15161 NM_001199773 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 211.75-92 chr7 123222697 123223410 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -23082 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 139.5-30 chr11 83047953 83048463 + 0.5 NA intron (NM_014488, intron 1 of 5) intron (NM_014488, intron 1 of 5) -6610 NR_033347 100379250 Hs.725115 NR_033347 ENSG00000207221 SNORA70E U70E small nucleolar RNA, H/ACA box 70E snoRNA 176-64 chr6 28105044 28105714 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14572 NR_024063 221584 Hs.634723 NR_024063 ZSCAN12P1 ZNF187p1|ZNF305P1|ZNF96L1|ZNF96P1|ZSCAN12L1|dJ313I6.7 zinc finger and SCAN domain containing 12 pseudogene 1 pseudo 120.5-2 chr1 26451733 26452129 + 0.5 NA intron (NM_205861, intron 6 of 8) AluSz|SINE|Alu 15606 NR_125953 101928324 Hs.663256 NR_125952 LOC101928324 - uncharacterized LOC101928324 ncRNA 138.5-61 chr14 68304496 68304869 + 0.5 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) MIR3|SINE|MIR 324105 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 122.75-155 chr4 152097046 152097357 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3552 NR_121628 100996286 Hs.322462 NR_121627 ENSG00000245954 LINC02273 - long intergenic non-protein coding RNA 2273 ncRNA 155.5-210 chr8 133683751 133684233 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_134462) promoter-TSS (NR_134462) 74 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 135-114 chr3 142922367 142922825 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -4079 NR_038455 100507389 Hs.38715 NR_038455 ENSG00000243818 LOC100507389 - uncharacterized LOC100507389 ncRNA 139-69 chr2 20453232 20453616 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 6350 NM_004040 388 Hs.502876 NM_004040 ENSG00000143878 RHOB ARH6|ARHB|MST081|MSTP081|RHOH6 ras homolog family member B protein-coding 156-62 chr17 32955955 32956411 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 28030 NM_015544 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 123-130 chr3 28792139 28792568 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 217075 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 120.75-107 chr3 70183862 70184271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 128572 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 125-81 chr2 200954800 200955179 + 0.5 NA intron (NR_033915, intron 4 of 16) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 8671 NR_033915 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 123.25-214 chr9 88870139 88870623 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -120482 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 133.25-61 chr15 80446944 80447281 + 0.5 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) L1ME4a|LINE|L1 42730 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 134.75-90 chr17 60539105 60539465 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13043 NM_006380 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 130.75-123 chr3 131687614 131687991 + 0.5 NA intron (NM_130808, intron 5 of 15) L2b|LINE|L2 -184831 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 137-18 chr1 240153548 240154028 + 0.5 NA intron (NM_020066, intron 2 of 17) intron (NM_020066, intron 2 of 17) 61905 NM_020066 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 170-16 chr11 44027649 44028139 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -20087 NM_001363113 390110 Hs.558851 NM_001031854 ENSG00000205126 ACCSL - 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) like protein-coding 129.75-103 chr2 220765345 220765739 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 806762 NM_004438 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 113-63 chr14 92360100 92360463 + 0.5 NA intron (NM_153647, intron 3 of 17) FRAM|SINE|Alu 36473 NM_153646 123041 Hs.385530 NM_153646 ENSG00000140090 SLC24A4 AI2A5|NCKX4|SHEP6|SLC24A2 solute carrier family 24 member 4 protein-coding 125.25-35 chr11 18635726 18636206 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -1624 NM_194285 144108 Hs.738650 NM_194285 ENSG00000179119 SPTY2D1 Spt2 SPT2 chromatin protein domain containing 1 protein-coding 122.25-178 chr7 84167785 84168234 + 0.5 NA intron (NM_006080, intron 1 of 16) intron (NM_006080, intron 1 of 16) 26780 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 130.75-199 chr9 2931041 2931441 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -87146 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 139.25-166 chr6 153728514 153728987 + 0.5 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu -281746 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 139.75-52 chr14 73739538 73740044 + 0.5 NA exon (NM_194278, exon 2 of 12) exon (NM_194278, exon 2 of 12) -18956 NR_039727 100616158 NR_039727 ENSG00000264741 MIR4505 mir-4505 microRNA 4505 ncRNA 120.25-85 chr2 17107436 17107792 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 410826 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 147.5 chr1 6041201 6041707 + 0.5 NA intron (NM_172130, intron 2 of 14) intron (NM_172130, intron 2 of 14) -4434 NM_001199863 8514 Hs.440497 NM_003636 ENSG00000069424 KCNAB2 AKR6A5|HKvbeta2|HKvbeta2.1|HKvbeta2.2|KCNA2B|KV-BETA-2 potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2 protein-coding 117.25-81 chr15 60632996 60633437 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -5686 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 121.5-268 chrX 47899130 47899413 + 0.5 NA intron (NM_007137, intron 4 of 4) L1ME1|LINE|L1 62369 NM_007137 347344 Hs.114246 NM_007137 ENSG00000197779 ZNF81 HFZ20|MRX45|dJ54B20.6 zinc finger protein 81 protein-coding 125.5-113 chr18 256649 257070 + 0.5 NA intron (NM_005131, intron 7 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11188 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 174.75-38 chr15 80196179 80196557 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001352888, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001352888, exon 3 of 3) 43369 NM_000137 2184 Hs.73875 NM_000137 ENSG00000103876 FAH - fumarylacetoacetate hydrolase protein-coding 157-92 chr5 33206067 33206562 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23421 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 121-130 chr3 95279621 95279948 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 341521 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 137-49 chr14 72073029 72073440 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 139707 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 126.25-207 chr8 119854627 119855106 + 0.5 NA intron (NM_024094, intron 1 of 8) intron (NM_024094, intron 1 of 8) 1028 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 134.5-28 chr10 73451825 73452262 + 0.5 NA intron (NM_001142353, intron 10 of 13) AluY|SINE|Alu -18482 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 132.75-164 chr6 49538753 49539197 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11693 NR_146860 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 139-133 chr7 6472024 6472484 + 0.5 NA intron (NM_001100603, intron 2 of 3) intron (NM_001100603, intron 2 of 3) 11898 NM_001100603 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 127-177 chr8 123769912 123770373 + 0.5 NA intron (NM_144963, intron 1 of 23) AluSg|SINE|Alu 1703 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 179.25-135 chr7 11775462 11776110 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L1MB3|LINE|L1 56412 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 147.5-79 chr16 73100263 73100762 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 8163 NR_027756 283902 Hs.382776 NM_001101347 ENSG00000260880 HCCAT5 FJ222407|HTA hepatocellular carcinoma associated transcript 5 ncRNA 128-125 chr5 51081379 51081787 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -111396 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 116.75-70 chr16 77227195 77227610 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 27994 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 123.75-81 chr18 13735960 13736280 + 0.5 NA intron (NM_003799, intron 4 of 11) intron (NM_003799, intron 4 of 11) 9447 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 121.25-202 chr8 139190474 139190852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -276622 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 121.25-104 chr2 214183756 214184019 + 0.5 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -227167 NR_159945 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 113.5-78 chr14 64179216 64179625 + 0.5 NA intron (NM_015180, intron 96 of 114) AluSz6|SINE|Alu -34724 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 118.75-6 chr1 100540787 100541187 + 0.5 NA 3' UTR (NM_022049, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_022049, exon 2 of 2) 2848 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 124-27 chr12 21568249 21568743 + 0.5 NA intron (NM_021957, intron 5 of 15) intron (NM_021957, intron 5 of 15) 36351 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 151.5-147 chr5 12169862 12170217 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -265593 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 160.75-137 chr6 149751074 149751677 + 0.5 NA intron (NM_001252051, intron 1 of 6) intron (NM_001252051, intron 1 of 6) 1634 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 132.5-86 chr16 58447243 58447728 + 0.5 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -16160 NM_020465 65009 Hs.322430 NM_020465 ENSG00000103034 NDRG4 BDM1|SMAP-8|SMAP8 NDRG family member 4 protein-coding 149.5-213 chr8 128482423 128482769 + 0.5 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 82083 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 137-31 chr10 124874181 124874517 + 0.5 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -67774 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 206.75-68 chr5 52984652 52985285 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4384 NM_002203 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 119.5-124 chr2 68270282 68270608 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17913 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 134-61 chr15 70338113 70338555 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 167594 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 116-163 chr8 13030039 13030346 + 0.5 NA TTS (NM_001099677) TTS (NM_001099677) 17928 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 140.75-77 chr19 35636692 35637055 + 0.5 NA intron (NM_001319113, intron 7 of 8) MIR|SINE|MIR -4872 NM_001300974 2116 Hs.194061 NM_014209 ENSG00000105672 ETV2 ER71|ETSRP71 ETS variant 2 protein-coding 129-156 chr6 71390760 71391177 + 0.5 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 12653 NR_029504 407029 NR_029504 ENSG00000207827 MIR30A MIRN30A|mir-30a microRNA 30a ncRNA 119.25-34 chr11 27001907 27002168 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 7925 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 116-87 chr2 126819925 126820254 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -78801 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 134.5-250 chrX 93748215 93748498 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 74150 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 170.5-133 chr4 74018419 74019037 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 19961 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 193.25-41 chr16 76702829 76703335 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 68084 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 147.25-160 chr9 80356057 80356511 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 381261 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 113-74 chr17 48453612 48453890 + 0.5 NA intron (NR_110804, intron 2 of 5) intron (NR_110804, intron 2 of 5) 8918 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 132.5-97 chr18 44688945 44689342 + 0.5 NA intron (NM_015559, intron 1 of 5) intron (NM_015559, intron 1 of 5) 8255 NM_015559 26040 Hs.435458 NM_015559 ENSG00000152217 SETBP1 MRD29|SEB SET binding protein 1 protein-coding 115.75-162 chr4 172794786 172795140 + 0.5 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) -68085 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 140.5-248 chr9 115107277 115107758 + 0.5 NA intron (NM_002160, intron 1 of 27) MIRb|SINE|MIR 10640 NM_002160 3371 Hs.143250 NM_002160 ENSG00000041982 TNC 150-225|DFNA56|GMEM|GP|HXB|JI|TN|TN-C tenascin C protein-coding 131.5-28 chr10 100370073 100370387 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3346 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 169.75-72 chr19 28128934 28129402 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -335228 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 178.5-193 chr9 130680892 130681487 + 0.5 NA intron (NM_021619, intron 4 of 4) CpG -12571 NM_001282708 23404 Hs.654643 NM_014285 ENSG00000130713 EXOSC2 RRP4|Rrp4p|SHRF|hRrp4p|p7 exosome component 2 protein-coding 122-111 chr20 54246704 54247125 + 0.5 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 38827 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 135-121 chr4 32055319 32055693 + 0.5 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -33084 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 151.25-5 chr1 84519358 84519876 + 0.5 NA intron (NM_001310156, intron 2 of 13) intron (NM_001310156, intron 2 of 13) -13036 NM_005274 2787 Hs.645427 NM_005274 ENSG00000174021 GNG5 - G protein subunit gamma 5 protein-coding 129.75-187 chr8 125603063 125603493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 171069 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 124.75-136 chr21 44609320 44609744 + 0.5 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) HAL1|LINE|L1 -2547 NM_198695 386681 Hs.528021 NM_198695 ENSG00000187766 KRTAP10-8 KAP10.8|KRTAP18-8|KRTAP18.8 keratin associated protein 10-8 protein-coding 121-153 chr5 18266801 18267127 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 459690 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 176-30 chr17 77653470 77654013 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 74818 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 137-147 chr6 28047209 28047587 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25918 NM_001355425 442179 NM_001355425 OR1F12 OR1F12P|OR1F12Q|OR6-12|hs6M1-35P olfactory receptor family 1 subfamily F member 12 protein-coding 120.5-18 chr1 242105805 242106145 + 0.5 NA intron (NM_001320272, intron 9 of 10) MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR -106877 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 156-107 chr4 16391399 16391913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 164993 NR_027696 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 121.5-251 chr8 122527026 122527467 + 0.5 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) LTR33|LTR|ERVL 41398 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 120.25-96 chr2 98334386 98334669 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11628 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 113.75-90 chr19 28916776 28917162 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -48162 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 120.75-64 chr18 6681114 6681517 + 0.5 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -48401 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 128.5-226 chr8 111917554 111918016 + 0.5 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 541146 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 120.5-7 chr1 85701195 85701645 + 0.5 NA intron (NM_017953, intron 5 of 9) intron (NM_017953, intron 5 of 9) 7013 NM_001170670 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 114.25-134 chr4 22222460 22222850 + 0.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 117011 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 136.25-112 chr21 33940865 33941259 + 0.5 NA intron (NR_038883, intron 1 of 2) intron (NR_038883, intron 1 of 2) 9848 NR_134558 100506334 Hs.532855 NM_207472 ENSG00000237945 LINC00649 - long intergenic non-protein coding RNA 649 ncRNA 202.5-128 chr6 66695625 66696401 + 0.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 908134 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 117.25-193 chr6 164642406 164642749 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 179486 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 147-95 chr3 101161027 101161469 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 159327 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 143.75-146 chr5 80696867 80697334 + 0.5 NA intron (NM_002439, intron 8 of 23) intron (NM_002439, intron 8 of 23) -42117 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 113.5-206 chr5 145938750 145939011 + 0.5 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) intron (NM_152550, intron 2 of 9) 2302 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 177.75-4 chr1 65838160 65838670 + 0.5 NA intron (NM_002600, intron 1 of 16) intron (NM_002600, intron 1 of 16) 45520 NM_002600 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 123.75-37 chr12 24088019 24088339 + 0.5 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -124242 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 137-137 chr5 63759177 63759695 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 202856 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 121-160 chr5 84595969 84596279 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -211244 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 118.5-64 chr15_KI270905v1_alt 1842053 1842290 + 0.5 NA intron (NM_015307, intron 1 of 10) intron (NM_015307, intron 1 of 10) 12733 NM_015307 23359 Hs.383564 NM_015307 ENSG00000104059 FAM189A1 TMEM228 family with sequence similarity 189 member A1 protein-coding 210.25-85 chr9 613665 614166 + 0.5 NA intron (NM_001256877, intron 2 of 12) intron (NM_001256877, intron 2 of 12) -72852 NM_001354335 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 149.75-49 chr15 55749173 55749710 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6289 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 117-183 chr8 71712134 71712571 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -130771 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 238.25-33 chr2 29824748 29825441 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 96492 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 118.5-4 chr1 48652731 48652999 + 0.5 NA intron (NM_001323575, intron 8 of 12) intron (NM_001323575, intron 8 of 12) 124026 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 189.25-7 chr1 224848493 224849106 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -80855 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 113.5-29 chr1 244184768 244185158 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 131758 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 145.5-196 chr9 35400710 35401116 + 0.5 NA intron (NM_006377, intron 36 of 38) intron (NM_006377, intron 36 of 38) -5842 NR_110320 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 132.25-26 chr10 8426378 8426783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -158275 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 213.75-57 chr20 2044473 2045245 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -50574 NM_001190899 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 129.75-129 chr4 17212088 17212428 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26201 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 256.75-10 chr14 51404575 51405283 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -7794 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 115.25-168 chr5 155418153 155418442 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 404542 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 115.5-72 chr15 49124845 49125293 + 0.5 NA 3' UTR (NM_004236, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_004236, exon 13 of 13) 30530 NM_004236 9318 Hs.369614 NM_004236 ENSG00000166200 COPS2 ALIEN|CSN2|SGN2|TRIP15 COP9 signalosome subunit 2 protein-coding 155-116 chr6 35147356 35147832 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6184 NM_001261818 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 112.75-143 chr3 192934283 192934675 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -16623 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 127-45 chr12 51127764 51128265 + 0.5 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu -44418 NM_030809 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 115.25-96 chr2 21143766 21144176 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001306137, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001306137, exon 4 of 4) 19985 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 127.25-58 chr14 43092517 43092907 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 1414571 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 150.5-156 chr4 122537140 122537469 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80809 NM_000586 3558 Hs.89679 NM_000586 ENSG00000109471 IL2 IL-2|TCGF|lymphokine interleukin 2 protein-coding 153.5-44 chr12 116026433 116026823 + 0.5 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) MER5A|DNA|hAT-Charlie 122026 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 151.75-109 chr5 33657907 33658407 + 0.5 NA intron (NM_001324512, intron 7 of 21) intron (NM_001324512, intron 7 of 21) 217381 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 147-112 chr5 115789603 115790046 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 26833 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 113.25-129 chr4 181418071 181418413 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153213 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 147.25-64 chr2 151844990 151845456 + 0.5 NA intron (NM_000726, intron 12 of 13) intron (NM_000726, intron 12 of 13) -16802 NM_177985 26225 Hs.470233 NM_012097 ENSG00000162980 ARL5A ARFLP5|ARL5 ADP ribosylation factor like GTPase 5A protein-coding 135-102 chr3 16768445 16768953 + 0.5 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -116256 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 136.5-182 chr5 78734546 78735044 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -86023 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 138.5-16 chr1 161796562 161796917 + 0.5 NA intron (NM_007348, intron 6 of 15) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie 30419 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 118.25-43 chr11 91535577 91535840 + 0.5 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -666506 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 172.5-83 chr17 62882341 62882723 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61683 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 112.25-137 chr3 148343071 148343413 + 0.5 NA intron (NR_146712, intron 3 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 62351 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 112.75-212 chr9 120473261 120473597 + 0.5 NA intron (NR_073558, intron 15 of 37) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 106738 NM_018249 55755 Hs.269560 NM_018249 ENSG00000136861 CDK5RAP2 C48|Cep215|MCPH3 CDK5 regulatory subunit associated protein 2 protein-coding 138.75-18 chr10 32603007 32603530 + 0.5 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1MA4A|LINE|L1 157128 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 125.5-20 chr1 238068082 238068577 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -177407 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 112.75-140 chr3 172535115 172535390 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -11822 NM_001190942 8743 Hs.478275 NM_003810 ENSG00000121858 TNFSF10 APO2L|Apo-2L|CD253|TL2|TNLG6A|TRAIL TNF superfamily member 10 protein-coding 113-80 chr18 58406229 58406561 + 0.5 NA Intergenic UCON132b|DNA|hAT-Tip100 -44679 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 112.25-140 chr3 152695083 152695428 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -139876 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 180.5-62 chr18 2750879 2751487 + 0.5 NA intron (NM_015295, intron 32 of 47) intron (NM_015295, intron 32 of 47) 95296 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 131-42 chr12 66897325 66897745 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93266 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 162.25-121 chr4 168546038 168546491 + 0.5 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) intron (NM_001166108, intron 2 of 21) 49212 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 134.25-108 chr3 18877198 18877722 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -271050 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 127.5-98 chr16 86995216 86995551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -62401 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 132.75-172 chr7 26672539 26673005 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) intron (NM_003930, intron 11 of 12) 34901 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 138.5-6 chr1 43376395 43376907 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8577 NM_001256401 64834 Hs.25597 NM_022821 ENSG00000066322 ELOVL1 CGI-88|Ssc1 ELOVL fatty acid elongase 1 protein-coding 123.25-133 chr3 102296302 102296793 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132842 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 135.75-128 chr22 30027835 30028221 + 0.5 NA 3' UTR (NM_153050, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_153050, exon 20 of 20) 20979 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 129.25-130 chr3 101343077 101343436 + 0.5 NA intron (NM_020654, intron 14 of 23) L1MC4a|LINE|L1 -22681 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 123.5-117 chr20 6009776 6010062 + 0.5 NA intron (NR_136617, intron 2 of 5) intron (NR_136617, intron 2 of 5) 2670 NM_001127458 54675 Hs.743956 NM_019095 ENSG00000088766 CRLS1 C20orf155|CLS|CLS1|GCD10|dJ967N21.6 cardiolipin synthase 1 protein-coding 143.5-140 chr3 48298189 48298658 + 0.5 NA intron (NM_001308434, intron 1 of 4) intron (NM_001308434, intron 1 of 4) 2988 NM_001308428 10201 Hs.465558 NM_005793 ENSG00000172113 NME6 IPIA-ALPHA|NDK 6|NM23-H6 NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 6 protein-coding 154.25-155 chr7 30272617 30273079 + 0.5 NA intron (NR_136267, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu -11749 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 144-130 chr8 83992907 83993343 + 0.5 NA Intergenic Charlie22a|DNA|hAT-Charlie -189662 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 152.25-133 chr5 130136073 130136502 + 0.5 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 231822 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 141-95 chr22 24014194 24014644 + 0.5 NA intron (NM_001199281, intron 1 of 36) L1MC4a|LINE|L1 3049 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 140.25-138 chr4 112330407 112330821 + 0.5 NA intron (NM_001102406, intron 2 of 15) ERVL-E-int|LTR|ERVL 33245 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 186-55 chr20 52348705 52349234 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -156984 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 155.75-115 chr4 18174134 18174445 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -152414 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 163.75-138 chr9 137988335 137988928 + 0.5 NA intron (NM_001243812, intron 15 of 45) intron (NM_001243812, intron 15 of 45) -41571 NR_132978 105376331 NR_132977 LOC105376331 - uncharacterized LOC105376331 ncRNA 124.75-10 chr1 108761548 108761973 + 0.5 NA intron (NM_007269, intron 6 of 18) AluSx3|SINE|Alu 15086 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 131.75-171 chr5 84253184 84253615 + 0.5 NA intron (NM_005711, intron 2 of 10) intron (NM_005711, intron 2 of 10) 131468 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 115.25-118 chr21 15190669 15190980 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -125824 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 156.75-60 chr14 94594298 94594707 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 13076 NM_000624 5104 Hs.159628 NM_000624 ENSG00000188488 SERPINA5 PAI-3|PAI3|PCI|PCI-B|PLANH3|PROCI serpin family A member 5 protein-coding 127-157 chr7 26685616 26686120 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 10 of 12) intron (NM_003930, intron 10 of 12) 47997 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 139.25-214 chrX 40828509 40828968 + 0.5 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 4458 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 127.5-239 chr8 98807441 98807861 + 0.5 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) 18020 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 128-34 chr12 129881766 129882221 + 0.5 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 22032 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 161-44 chr15 67909951 67910458 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -70159 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 115-118 chr4 33785984 33786312 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 253745 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 123.25-152 chr4 145562689 145563134 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45717 NR_126371 104326058 Hs.714527 NR_126371 ENSG00000250902 SMAD1-AS1 - SMAD1 antisense RNA 1 ncRNA 141.75-53 chr14 37334003 37334553 + 0.5 NA intron (NM_138731, intron 10 of 13) L1ME2|LINE|L1 136341 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 140.75-114 chr20 60182133 60182477 + 0.5 NA intron (NR_046099, intron 3 of 4) intron (NR_046099, intron 3 of 4) 43813 NR_046099 284757 Hs.542528 NM_001004305 ENSG00000228340 MIR646HG - MIR646 host gene ncRNA 128-182 chrX 154747822 154748209 + 0.5 NA intron (NR_104114, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 3062 NM_001282283 139716 Hs.496982 NM_080612 ENSG00000160219 GAB3 - GRB2 associated binding protein 3 protein-coding 114.25-49 chr13 57078985 57079346 + 0.5 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 -61753 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 131-83 chr2 38819203 38819652 + 0.5 NA intron (NM_001329963, intron 17 of 23) AluJo|SINE|Alu 41217 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 131.5-233 chr8 102384961 102385311 + 0.5 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) intron (NM_001282873, intron 1 of 58) 27553 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 130.75-56 chr14 61111689 61112054 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -130181 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 126.5-181 chr4 173564929 173565411 + 0.5 NA intron (NR_136196, intron 3 of 4) intron (NR_136196, intron 3 of 4) 34712 NR_003679 79804 Hs.61435 NR_003679 ENSG00000237125 HAND2-AS1 DEIN|NBLA00301|UPH HAND2 antisense RNA 1 ncRNA 155.5-185 chr6 135403389 135403858 + 0.5 NA intron (NM_017651, intron 21 of 27) intron (NM_017651, intron 21 of 27) 94117 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 118.75-156 chr5 91103828 91104131 + 0.5 NA intron (NR_003149, intron 87 of 89) intron (NR_003149, intron 87 of 89) 210423 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 163.25-67 chr2 133414860 133415480 + 0.5 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 148975 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 244.5-8 chr1 189820517 189821197 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 655153 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 127.5-34 chr10 90764895 90765398 + 0.5 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) L1MA9|LINE|L1 92893 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 177-57 chr22 25028741 25029242 + 0.5 NA exon (NM_001145206, exon 1 of 11) exon (NM_001145206, exon 1 of 11) 1017 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 128.25-184 chr7 27555344 27555690 + 0.5 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -60457 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 133.75-52 chr14 32018256 32018702 + 0.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 58220 NR_027263 84837 Hs.496755 NM_032751 ARHGAP5-AS1 C14orf128 ARHGAP5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 138.5-166 chr5 147888258 147888728 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 9782 NM_054023 117156 Hs.483765 NM_054023 ENSG00000164265 SCGB3A2 LU103|PNSP1|UGRP1|pnSP-1 secretoglobin family 3A member 2 protein-coding 122.5-111 chr2 108022559 108022848 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 30052 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 154.25-14 chr1 212895115 212895496 + 0.5 NA 3' UTR (NM_014053, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_014053, exon 10 of 10) 37030 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 148.75-101 chr22 21937941 21938464 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_147620) promoter-TSS (NR_147620) -35 NR_147620 100286925 Hs.659180 NR_147620 LOC100286925 - uncharacterized LOC100286925 ncRNA 116.75-118 chr22 34416016 34416360 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -493300 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 127.5-170 chr4 64160319 64160757 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 248912 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 157.5-145 chr4 31182274 31182685 + 0.5 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 11335 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 156.25-49 chr16 27041757 27042241 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24928 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 121.25-186 chr7 37686886 37687228 + 0.5 NA intron (NM_001329994, intron 3 of 3) intron (NM_001329994, intron 3 of 3) 3291 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 148.5-89 chr17 76231335 76231885 + 0.5 NA intron (NM_052916, intron 1 of 18) FLAM_A|SINE|Alu 8883 NM_001330501 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 120-104 chr21 25260520 25260952 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 170965 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 155.75-62 chr16 69710656 69711123 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001025433, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001025433, exon 5 of 5) -2214 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 141.25-99 chr21 26518429 26518730 + 0.5 NA TTS (NR_135516) TTS (NR_135516) 54707 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 129-177 chr8 88990391 88990704 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -663064 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 114.75-146 chr4 147773148 147773495 + 0.5 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) intron (NM_024605, intron 1 of 22) -9274 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 122.5-214 chr7 106356545 106356942 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -71760 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 133.75-87 chr18 13634097 13634435 + 0.5 NA intron (NM_001003675, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 -7492 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 149.5-193 chr7 128449831 128450229 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5800 NM_001098786 29923 Hs.706124 NM_013332 ENSG00000135245 HILPDA C7orf68|HIG-2|HIG2 hypoxia inducible lipid droplet associated protein-coding 140.75-157 chr5 130298241 130298747 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 394029 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 162.25-119 chr4 142753412 142753856 + 0.5 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) intron (NM_001331040, intron 1 of 25) 92901 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 119.5-92 chr16 31207040 31207512 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4500 NM_145182 29108 Hs.499094 NM_013258 ENSG00000103490 PYCARD ASC|CARD5|TMS|TMS-1|TMS1 PYD and CARD domain containing protein-coding 144.25-138 chr4 44710265 44710775 + 0.5 NA intron (NR_073095, intron 2 of 3) intron (NR_073095, intron 2 of 3) 16036 NM_138335 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 157.25-127 chr6 18801459 18802084 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 229987 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 153-33 chr13 19688464 19688827 + 0.5 NA intron (NR_044998, intron 6 of 7) intron (NR_044998, intron 6 of 7) 54986 NM_017520 54737 Hs.269654 NM_017520 ENSG00000196199 MPHOSPH8 HSMPP8|TWA3|mpp8 M-phase phosphoprotein 8 protein-coding 150.25-111 chr4 48030995 48031342 + 0.5 NA intron (NM_207330, intron 3 of 5) AluSx|SINE|Alu 14396 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 216.5-89 chr5 6055750 6056202 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 281316 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 207-10 chr10 57811980 57812574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 455617 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 138-8 chr10 55832973 55833322 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -205205 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 124-23 chr11 18518393 18518742 + 0.5 NA intron (NM_006292, intron 2 of 9) intron (NM_006292, intron 2 of 9) 8375 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 153.5-31 chr11 32036170 32036571 + 0.5 NA intron (NR_120526, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 4948 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 138.25-54 chr15 86089412 86089937 + 0.5 NA intron (NR_120368, intron 3 of 5) intron (NR_120368, intron 3 of 5) 10054 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 112.25-111 chr20 39545074 39545491 + 0.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -320534 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 164.75-159 chrX 131505459 131506105 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38292 NM_001004486 347468 Hs.553711 NM_001004486 ENSG00000171054 OR13H1 ORX1 olfactory receptor family 13 subfamily H member 1 protein-coding 162-21 chr11 26015296 26015755 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -173598 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 146.75-99 chr3 48170530 48170984 + 0.5 NA intron (NM_201567, intron 8 of 13) MER21B|LTR|ERVL 17660 NM_001789 993 Hs.437705 NM_001789 ENSG00000164045 CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25A protein-coding 138.75-199 chr8 126101063 126101364 + 0.5 NA Intergenic (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -150016 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 160.25-84 chr21 31800985 31801446 + 0.5 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -69097 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 147-99 chr4 47255956 47256395 + 0.5 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) L2|LINE|L2 207527 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 145.5-106 chr2 172884023 172884432 + 0.5 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) intron (NM_001282899, intron 1 of 27) 24189 NM_001282899 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 119.5-160 chr3 176851619 176851924 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34770 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 134-45 chr12 128135094 128135622 + 0.5 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 17141 NR_104648 101927694 Hs.524849 NR_104648 ENSG00000256659 LINC02368 - long intergenic non-protein coding RNA 2368 ncRNA 153.5-25 chr10 76853217 76853572 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -34650 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-64 chr12 43280702 43281138 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 125605 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 133.5-79 chr14 63820686 63821058 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -32093 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 138.75-167 chr6 140849688 140850170 + 0.5 NA Intergenic (TTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 166115 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 127-78 chr17 28318496 28318845 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_014573) promoter-TSS (NM_014573) -530 NM_014573 27346 Hs.199695 NM_014573 ENSG00000109084 TMEM97 MAC30 transmembrane protein 97 protein-coding 114.75-66 chr16 83035714 83036073 + 0.5 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) intron (NM_001220489, intron 3 of 12) -45595 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 115-145 chr5 142250276 142250582 + 0.5 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 67893 NR_131221 100642175 Hs.684549 NR_131221 SPRY4-IT1 SPRIGHTLY SPRY4 intronic transcript 1 ncRNA 119-54 chr15 41490460 41490877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3206 NM_002220 3706 Hs.2722 NM_002220 ENSG00000137825 ITPKA IP3-3KA|IP3KA inositol-trisphosphate 3-kinase A protein-coding 142.5-182 chr5 149713468 149714018 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16567 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 124.75-45 chr11 76251991 76252345 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45666 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 122.5-33 chr11 39421810 39422283 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 773188 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 141.5-125 chr20 38151253 38151618 + 0.5 NA intron (NM_001323317, intron 2 of 11) MIRc|SINE|MIR 13835 NM_004613 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 145.25-56 chr17 80321426 80321891 + 0.5 NA TTS (NM_020954) TTS (NM_020954) 60806 NM_001256071 57674 Hs.195642 NM_020914 ENSG00000173821 RNF213 ALO17|C17orf27|KIAA1618|MYMY2|MYSTR|NET57 ring finger protein 213 protein-coding 154.25-51 chr14 76031883 76032331 + 0.5 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 46344 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 167.25-25 chr12 22484559 22484992 + 0.5 NA exon (NM_001286175, exon 14 of 28) exon (NM_001286175, exon 14 of 28) 59422 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 125.25-120 chr20 36241296 36241777 + 0.5 NA intron (NM_015511, intron 2 of 3) AluSq2|SINE|Alu 5058 NM_001271874 25980 Hs.11314 NM_015511 ENSG00000131043 AAR2 C20orf4|CGI-23 AAR2 splicing factor protein-coding 131.25-51 chr13 94225941 94226461 + 0.5 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) -38210 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 134.25-123 chr3 194048967 194049340 + 0.5 NA non-coding (NR_136181, exon 4 of 4) non-coding (NR_136181, exon 4 of 4) 20376 NR_136181 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 168.75-145 chr8 73974635 73975011 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1319 NR_033334 54968 Hs.106650 NM_017866 ENSG00000175606 TMEM70 MC5DN2 transmembrane protein 70 protein-coding 119.25-18 chr1 235754375 235754640 + 0.5 NA intron (NM_000081, intron 25 of 52) AluSq2|SINE|Alu 98553 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 162.5-114 chr3 97026727 97027338 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1PA13|LINE|L1 212438 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 116-16 chr10 60414557 60414860 + 0.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -24833 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 125.75-103 chr2 172042783 172043229 + 0.5 NA intron (NM_001322279, intron 1 of 9) intron (NM_001322279, intron 1 of 9) -42501 NM_001038493 1745 Hs.407015 NM_178120 ENSG00000144355 DLX1 - distal-less homeobox 1 protein-coding 144.25-169 chr6 67212597 67213094 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -842506 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 137.25-58 chr17 71328486 71328953 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -126540 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 119.25-124 chr3 25015532 25015888 + 0.5 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 186387 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 127.25-59 chr14 59868851 59869335 + 0.5 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 1683 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 155.75-91 chr20 31541271 31541650 + 0.5 NA 3' UTR (NM_178582, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_178582, exon 3 of 3) 27018 NM_178582 81502 Hs.373741 NM_030789 ENSG00000101294 HM13 H13|IMP1|IMPAS|IMPAS-1|MSTP086|PSENL3|PSL3|SPP|SPPL1 histocompatibility minor 13 protein-coding 159.25-164 chr9 111517269 111517687 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7701 NM_001007169 158399 Hs.584864 NM_133464 ENSG00000173258 ZNF483 ZKSCAN16|ZSCAN48 zinc finger protein 483 protein-coding 132.75-59 chr14 46906485 46906901 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) L2a|LINE|L2 -254912 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 117.25-26 chr10 30956918 30957310 + 0.5 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) L1MA6|LINE|L1 42403 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 116-49 chr14 87526480 87526754 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 128677 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 149-55 chr2 82662381 82662747 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -194239 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 129.25-121 chr3 16027069 16027518 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -147387 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 158.5-7 chr1 112342306 112342760 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53681 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 132.5-207 chr6 38566591 38567027 + 0.5 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) (TACACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 29258 NM_152733 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 139-18 chr10 72666946 72667363 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -24977 NM_001270679 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 115.75-22 chr10 92606450 92606771 + 0.5 NA intron (NM_004523, intron 2 of 21) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13480 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 133.5-253 chr7 123310785 123311075 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -110959 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 144.25-65 chr15 78629599 78630095 + 0.5 NA exon (NM_000750, exon 5 of 6) exon (NM_000750, exon 5 of 6) -8851 NM_001166694 1136 Hs.89605 NM_000743 ENSG00000080644 CHRNA3 LNCR2|NACHRA3|PAOD2 cholinergic receptor nicotinic alpha 3 subunit protein-coding 133-82 chr2 82239783 82240149 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -616837 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 130.25-51 chr13 80320336 80320620 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 19181 NM_001318537 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 124.75-105 chr19 28618117 28618456 + 0.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 11598 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 136.5-203 chr6 161719670 161720087 + 0.5 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) AluJr4|SINE|Alu 248901 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 200.25-57 chr2 24825959 24826605 + 0.5 NA intron (NM_001320613, intron 15 of 21) intron (NM_001320613, intron 15 of 21) 32857 NM_001322101 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 142-163 chr8 107458297 107458770 + 0.5 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 39385 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 149.75-57 chr16 53892260 53892653 + 0.5 NA intron (NM_001363903, intron 7 of 7) intron (NM_001363903, intron 7 of 7) -146937 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 150.75-30 chr10 98586597 98587119 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 9 of 11) MER113|DNA|hAT-Charlie -139895 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 140-104 chr3 51953035 51953533 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2097 NM_080865 118442 Hs.232213 NM_080865 ENSG00000180929 GPR62 GPCR8|KPG_005 G protein-coupled receptor 62 protein-coding 142.25-43 chr12 47677548 47677901 + 0.5 NA intron (NM_001146075, intron 11 of 15) L1PA6|LINE|L1 28306 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 145.25-101 chr3 56891428 56891956 + 0.5 NA intron (NM_001128615, intron 3 of 12) MIR|SINE|MIR 24744 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 194.5-39 chr14 69056995 69057512 + 0.5 NA intron (NM_003861, intron 8 of 8) intron (NM_003861, intron 8 of 8) 77571 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 126-92 chr2 43827819 43828309 + 0.5 NA exon (NM_022436, exon 5 of 13) exon (NM_022436, exon 5 of 13) 10775 NM_022436 64240 Hs.132992 NM_022436 ENSG00000138075 ABCG5 STSL ATP binding cassette subfamily G member 5 protein-coding 125-32 chr12 11616627 11616987 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -33047 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 215.75-19 chr11 82772729 82773438 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -39219 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 166-129 chr8 131138604 131139045 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -97915 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 132.75-117 chr21 32272151 32272492 + 0.5 NA intron (NM_018944, intron 2 of 4) intron (NM_018944, intron 2 of 4) 6728 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 134-67 chr16 22734530 22734948 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79423 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 113.5-119 chr2 34056085 34056409 + 0.5 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L1M1|LINE|L1 -10979 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 132.5-76 chr14 75713549 75714052 + 0.5 NA intron (NM_015072, intron 9 of 31) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 52554 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 201.75-100 chr8 80588240 80588770 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102279 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 115.5-221 chr6 135560173 135560517 + 0.5 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) L1PA8|LINE|L1 62544 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 224.25-5 chr1 114137716 114138559 + 0.5 NA intron (NM_001366223, intron 2 of 7) intron (NM_001366223, intron 2 of 7) 14303 NM_205848 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 158-53 chr15 62648777 62649117 + 0.5 NA intron (NM_015059, intron 1 of 55) AluJb|SINE|Alu 1636 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 115.75-93 chr2 7752615 7753003 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 146846 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 112.75-75 chr17 32175995 32176418 + 0.5 NA non-coding (NR_110083, exon 6 of 21) non-coding (NR_110083, exon 6 of 21) -24635 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 177.25-66 chr2 5196422 5196832 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 494491 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 136.25-116 chr22 28436351 28436651 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -23368 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 113.75-85 chr18 6808503 6808789 + 0.5 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -25839 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 170.25-154 chr8 82172939 82173382 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -330874 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 124.75-126 chr2 229817465 229817881 + 0.5 NA intron (NM_001348330, intron 9 of 41) AluSq|SINE|Alu -103118 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 116.25-234 chr8 123241126 123241425 + 0.5 NA exon (NM_032847, exon 1 of 6) exon (NM_032847, exon 1 of 6) 102 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 183.75-132 chr9 73500567 73501242 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 349039 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 136.5-207 chr7 32325552 32325982 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L2|LINE|L2 -26439 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 166.75-140 chr8 92051944 92052574 + 0.5 NA intron (NM_001198633, intron 1 of 10) intron (NM_001198633, intron 1 of 10) 10375 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 122.75-29 chr11 35297879 35298242 + 0.5 NA intron (NM_001252652, intron 7 of 11) MIR|SINE|MIR 121498 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 129.25-140 chr4 48896126 48896469 + 0.5 NA intron (NR_104589, intron 2 of 3) intron (NR_104589, intron 2 of 3) 10477 NM_001014446 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 154.25-31 chr11 121926117 121926578 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 173497 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 129-42 chr11 109549569 109549920 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 127554 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 119.5-118 chr2 51141754 51142144 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 109348 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 130-139 chr6 94817632 94817943 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 759664 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 130-102 chr3 28228111 28228452 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13338 NM_001331189 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 238.75-8 chr11 18550533 18551059 + 0.5 NA intron (NM_001040697, intron 7 of 11) intron (NM_001040697, intron 7 of 11) -23854 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 118-79 chr2 27534255 27534684 + 0.5 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 37630 NM_001486 2646 Hs.89771 NM_001486 ENSG00000084734 GCKR FGQTL5|GKRP glucokinase regulator protein-coding 153.75-157 chr9 115062193 115062558 + 0.5 NA intron (NM_002160, intron 13 of 27) AluJo|SINE|Alu 55782 NM_002160 3371 Hs.143250 NM_002160 ENSG00000041982 TNC 150-225|DFNA56|GMEM|GP|HXB|JI|TN|TN-C tenascin C protein-coding 162.75-138 chr8 42540108 42540588 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001135676) promoter-TSS (NM_001135676) -800 NM_001135676 114926 Hs.655320 NM_138436 ENSG00000176209 SMIM19 C8orf40 small integral membrane protein 19 protein-coding 147.25-26 chr12 12017031 12017460 + 0.5 NA Intergenic UCON31|Unknown|Unknown -32616 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 147-85 chr20 47443341 47443910 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -31481 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 115.5-235 chr7 109283931 109284326 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -399541 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 131-48 chr14 43864141 43864421 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 643002 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 129-141 chr5 53253823 53254199 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 144169 NR_104654 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 131.25-3 chr1 26113899 26114254 + 0.5 NA intron (NM_001243533, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 2252 NM_152835 149420 Hs.468801 NM_152835 ENSG00000175087 PDIK1L CLIK1L|STK35L2 PDLIM1 interacting kinase 1 like protein-coding 138.25-46 chr14 32763839 32764243 + 0.5 NA intron (NM_004274, intron 11 of 13) intron (NM_004274, intron 11 of 13) -174838 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 134.5-73 chr15 61665797 61666170 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -63935 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 195.25-14 chr1 217028556 217029242 + 0.5 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 48093 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 208-5 chr1 188430455 188431034 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 987116 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 143-24 chr12 2583871 2584383 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 15 of 49).2 intron (NM_199460, intron 15 of 49).2 88093 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 115.5-62 chr14 54514223 54514554 + 0.5 NA intron (NM_006568, intron 1 of 5) intron (NM_006568, intron 1 of 5) 4482 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 118-175 chr7 111918630 111919069 + 0.5 NA intron (NM_001363540, intron 12 of 52) intron (NM_001363540, intron 12 of 52) 110344 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 113-8 chr1 152982157 152982473 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1766 NM_001199828 6698 Hs.46320 NM_005987 ENSG00000169474 SPRR1A SPRK small proline rich protein 1A protein-coding 135.5-7 chr1 86450106 86450522 + 0.5 NA intron (NM_006536, intron 11 of 13) intron (NM_006536, intron 11 of 13) -18613 NM_001285 1179 Hs.194659 NM_001285 ENSG00000016490 CLCA1 CACC|CACC1|CLCRG1|CaCC-1|GOB5|hCLCA1|hCaCC-1 chloride channel accessory 1 protein-coding 113.5-196 chr5 76081185 76081477 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2052 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 142-156 chr7 157849085 157849509 + 0.5 NA intron (NM_130843, intron 11 of 21) intron (NM_130843, intron 11 of 21) -5288 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 122.25-30 chr11 67607400 67607810 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_130935) promoter-TSS (NR_130935) 669 NM_007103 4723 Hs.7744 NM_007103 ENSG00000167792 NDUFV1 CI-51K|CI51KD|MC1DN4|UQOR1 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V1 protein-coding 143-99 chr3 185539297 185539685 + 0.5 NA intron (NM_139248, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 13097 NM_139248 200879 Hs.68864 NM_139248 ENSG00000163898 LIPH AH|ARWH2|HYPT7|LAH2|LPDLR|PLA1B|mPA-PLA1 lipase H protein-coding 151.25-66 chr16 78240032 78240628 + 0.5 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 140676 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 125-165 chr9 32142360 32142833 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -242007 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 145.75-81 chr2 80927387 80927756 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 539375 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 174.5-75 chr15 93644324 93644826 + 0.5 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -211985 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 140.5-14 chr10 16966151 16966445 + 0.5 NA intron (NM_001081, intron 31 of 66) intron (NM_001081, intron 31 of 66) -148844 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 171.25-49 chr15 71361987 71362465 + 0.5 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) AluSz|SINE|Alu -173167 NR_120348 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 198.5-54 chr16 21326247 21326778 + 0.5 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -22851 NR_045011 100652781 Hs.443656 NM_001012391 SNX29P1 RUNDC2B|RUNDC2L sorting nexin 29 pseudogene 1 pseudo 156.5-24 chr11 31843332 31843787 + 0.5 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) L1MD3|LINE|L1 16992 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 137.75-36 chr11 35192005 35192458 + 0.5 NA intron (NM_001202556, intron 5 of 7) intron (NM_001202556, intron 5 of 7) 29281 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 118.25-120 chr21 21659968 21660351 + 0.5 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 77160 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 150.75-174 chr7 159083436 159083831 + 0.5 NA intron (NR_130758, intron 4 of 12) intron (NR_130758, intron 4 of 12) 13571 NM_001308259 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 119.25-75 chr17 6341885 6342290 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 93034 NM_001033054 23746 Hs.279887 NM_014336 ENSG00000129221 AIPL1 AIPL2|LCA4 aryl hydrocarbon receptor interacting protein like 1 protein-coding 122-40 chr11 32966147 32966508 + 0.5 NA exon (NM_001076786, exon 9 of 13) exon (NM_001076786, exon 9 of 13) -49551 NM_001077242 91614 Hs.280990 NM_139160 ENSG00000121690 DEPDC7 TR2|dJ85M6.4 DEP domain containing 7 protein-coding 125.5-65 chr13 39790072 39790441 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001145079, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001145079, exon 19 of 19) -126121 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 114.5-11 chr1 105231913 105232205 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 386876 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 123.5-131 chr3 41781091 41781505 + 0.5 NA intron (NR_136342, intron 20 of 34) AluY|SINE|Alu 180805 NM_017886 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 153.5-115 chr20 31060571 31060993 + 0.5 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -196882 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 136.25-54 chr14 33574712 33575060 + 0.5 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -134051 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 201.75-40 chr17 40477812 40478411 + 0.5 NA intron (NM_032865, intron 12 of 12) intron (NM_032865, intron 12 of 12) 23512 NM_032865 84951 Hs.438292 NM_032865 ENSG00000131746 TNS4 CTEN|PP14434 tensin 4 protein-coding 155-119 chr6 49746174 49746599 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1931 NM_001190986 10321 Hs.404466 NM_006061 ENSG00000096006 CRISP3 Aeg2|CRISP-3|CRS3|SGP28|dJ442L6.3 cysteine rich secretory protein 3 protein-coding 121.5-67 chr12 130253146 130253533 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84548 NM_004764 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 177.25-8 chr1 206524933 206525425 + 0.5 NA intron (NM_182664, intron 1 of 4) intron (NM_182664, intron 1 of 4) 17648 NM_182664 83593 Hs.497579 NM_031437 ENSG00000266094 RASSF5 Maxp1|NORE1|NORE1A|NORE1B|RAPL|RASSF3 Ras association domain family member 5 protein-coding 162-97 chr6 17174578 17175067 + 0.5 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 72564 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 126.25-4 chr1 23785621 23786035 + 0.5 NA intron (NM_020362, intron 4 of 5) intron (NM_020362, intron 4 of 5) -5317 NM_007260 11313 Hs.533479 NM_007260 ENSG00000011009 LYPLA2 APT-2|APT2|DJ886K2.4 lysophospholipase 2 protein-coding 124.5-239 chr9 42388099 42388474 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 181063 NR_126050 103908605 Hs.721139 NR_126050 LOC103908605 - uncharacterized LOC103908605 ncRNA 134.75-84 chr16 86226365 86226888 + 0.5 NA intron (NR_104139, intron 4 of 5) intron (NR_104139, intron 4 of 5) 30445 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 136.5-46 chr11 83711756 83712228 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) L1PA11|LINE|L1 -29567 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 113.75-22 chr10 30899345 30899737 + 0.5 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) intron (NM_001143766, intron 5 of 7) 99976 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 118.25-69 chr14 84861240 84861511 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -410557 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 130-145 chr6 148317847 148318313 + 0.5 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) intron (NM_001346505, intron 1 of 19) -24758 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 128-101 chr3 68712757 68713089 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 212286 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 140-131 chr4 148537588 148537988 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93090 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 160-98 chr6 122298926 122299390 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -100393 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 144-94 chr4 98039109 98039674 + 0.5 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) intron (NM_174952, intron 5 of 10) 104085 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 126.5-111 chr2 59276143 59276528 + 0.5 NA intron (NR_110219, intron 2 of 2) intron (NR_110219, intron 2 of 2) 58627 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 152-111 chr4 58104288 58104813 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 431778 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 123.25-95 chr2 41321785 41322222 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -555552 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 118-160 chr5 171379581 171379960 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 6990 NR_037474 100500831 NR_037474 ENSG00000264249 MIR3912 mir-3912 microRNA 3912 ncRNA 168.5-31 chr10 99000673 99001130 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) -76333 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 113-154 chr5 154114161 154114527 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75377 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 131.75-206 chr7 99048397 99048832 + 0.5 NA intron (NM_020429, intron 10 of 18) intron (NM_020429, intron 10 of 18) 35449 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 127.75-171 chr6 48016603 48017033 + 0.5 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 51871 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 112.5-106 chr2 15474569 15474904 + 0.5 NA intron (NR_052013, intron 14 of 50) AluSx1|SINE|Alu 86598 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 126.75-233 chr7 130368331 130368649 + 0.5 NA exon (NM_001127441, exon 14 of 14) exon (NM_001127441, exon 14 of 14) -1363 NR_133928 105375504 Hs.436058 NR_133928 LOC105375504 - uncharacterized LOC105375504 ncRNA 113-122 chr3 134906957 134907250 + 0.5 NA intron (NM_004441, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 111843 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 116.25-12 chr1 215206232 215206514 + 0.5 NA intron (NM_001017424, intron 6 of 6) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 123636 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 141.5-41 chr12 61512652 61513133 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 679947 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 149-137 chr9 21249061 21249536 + 0.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -9293 NM_002172 3448 Hs.93907 NM_002172 ENSG00000228083 IFNA14 IFN-alphaH|LEIF2H interferon alpha 14 protein-coding 140.25-194 chr9 78017226 78017639 + 0.5 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) intron (NM_002072, intron 1 of 6) 14379 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 118.25-72 chr15 60736452 60736764 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 55039 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 115-73 chr18 29617357 29617709 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -681377 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 172.75-18 chr10 120531267 120531839 + 0.5 NA intron (NM_001030059, intron 5 of 6) L1ME2z|LINE|L1 -66396 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 134.75-164 chr4 116290646 116290957 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8924 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 166.25-84 chr2 189375059 189375610 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66099 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 132.25-12 chr1 154920122 154920386 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 16465 NM_001348696 10654 Hs.30954 NM_006556 ENSG00000163344 PMVK HUMPMKI|PMK|PMKA|PMKASE|POROK1 phosphomevalonate kinase protein-coding 127.5-72 chr14 45933275 45933674 + 0.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -130685 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 123.5-91 chr2 17862697 17863036 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14981 NM_001282428 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 139.5-45 chr12 43479036 43479483 + 0.5 NA intron (NM_025003, intron 7 of 38) intron (NM_025003, intron 7 of 38) 72944 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 153.75-46 chr15 58319455 58320040 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -112244 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 229.75-3 chr1 63825719 63826576 + 0.5 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) L1PA13|LINE|L1 52130 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 116.75-31 chr11 7703560 7703842 + 0.5 NA exon (NM_001367963, exon 3 of 7) exon (NM_001367963, exon 3 of 7) 2776 NM_198185 341277 Hs.532475 NM_198185 ENSG00000183378 OVCH2 OVTN ovochymase 2 (gene/pseudogene) protein-coding 159.25-82 chr3 45202030 45202487 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 24029 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 174.25-57 chr15 68846906 68847410 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -26263 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 160.25-69 chr2 49624378 49624833 + 0.5 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 349598 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 135-52 chr16 75088226 75088561 + 0.5 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 28379 NM_194436 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 129.5-238 chr9 36097683 36098002 + 0.5 NA intron (NM_021111, intron 10 of 20) L1MA8|LINE|L1 -38694 NR_104640 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 167-79 chr3 89367306 89367879 + 0.5 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 259971 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 190 chr1 18732371 18732867 + 0.5 NA intron (NM_001135254, intron 7 of 8) intron (NM_001135254, intron 7 of 8) 101773 NM_013945 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 119-171 chr6 139696459 139696788 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -74450 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 197.75-66 chr5 26506909 26507351 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 531456 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 126.25-28 chr11 30952340 30952654 + 0.5 NA exon (NM_001367979, exon 21 of 39) exon (NM_001367979, exon 21 of 39) 40189 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 128.25-18 chr10 92772147 92772552 + 0.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -54482 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 122-186 chr8 106268590 106269027 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1370 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 132-18 chr10 62957783 62958177 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -138813 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 134.5-153 chr4 57591829 57592218 + 0.5 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 166151 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 130-73 chr2 113211542 113212035 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23739 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 161.75-75 chr20 24882481 24882883 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -66587 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 126-37 chr11 130832040 130832490 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 29845 NR_125383 100507431 Hs.375101 NR_125383 LINC02551 - long intergenic non-protein coding RNA 2551 ncRNA 126-166 chr7 47221846 47222315 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 242723 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 137.5-73 chr15 57369550 57369978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6741 NM_001252335 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 129.25-124 chr3 36290059 36290446 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -90235 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 167.75-96 chr4 31247524 31248111 + 0.5 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 76673 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 119.5-131 chr2 177661487 177661963 + 0.5 NA intron (NM_001077197, intron 20 of 20) intron (NM_001077197, intron 20 of 20) -11597 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 127.5-7 chr1 53261186 53261628 + 0.5 NA intron (NM_004631, intron 12 of 18) intron (NM_004631, intron 12 of 18) 22797 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 121.5-200 chr4 127832252 127832680 + 0.5 NA intron (NM_001317383, intron 17 of 17) intron (NM_001317383, intron 17 of 17) -48427 NM_014264 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 176.75-64 chr2 109402895 109403531 + 0.5 NA intron (NM_001099289, intron 4 of 9) intron (NM_001099289, intron 4 of 9) -89588 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 145.25-31 chr12 115381675 115382108 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -697716 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 190.75-110 chr8 114758389 114758902 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 909368 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 115.5-80 chr15 75552459 75552731 + 0.5 NA intron (NM_002833, intron 1 of 12) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 26720 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 126.25-160 chr5 91721500 91721888 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -338377 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 168-105 chr5 111379778 111380186 + 0.5 NA intron (NM_001744, intron 4 of 10) intron (NM_001744, intron 4 of 10) -132244 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 119.75-167 chr5 21125542 21125922 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -333748 NR_027028 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 128-71 chr2 37079062 37079352 + 0.5 NA exon (NM_019024, exon 3 of 36) exon (NM_019024, exon 3 of 36) 5165 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 143.5-226 chr9 29740309 29740633 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -526870 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 116.5-264 chr9 81295305 81295761 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 394002 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 141.75-26 chr11 7022119 7022507 + 0.5 NA intron (NM_176822, intron 1 of 11) L1PA15-16|LINE|L1 1844 NM_176822 338323 Hs.449637 NM_176822 ENSG00000158077 NLRP14 CLR11.2|GC-LRR|NALP14|NOD5|PAN8 NLR family pyrin domain containing 14 protein-coding 138.75-178 chr7 66343261 66343721 + 0.5 NA intron (NM_003596, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 56917 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 140-79 chr2 147292213 147292595 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -552113 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 158.25-132 chr7 33751864 33752319 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -152824 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 183.5-71 chr2 147094116 147094828 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 507415 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 279.5-11 chr11 12959783 12960696 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 29309 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 141-162 chr9 36809791 36810133 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 13637 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 164.75-7 chr1 104823079 104823704 + 0.5 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL 750368 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 171-48 chr16 76800786 76801237 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67925 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 129-134 chr5 8848228 8848588 + 0.5 NA intron (NR_109932, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 8676 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 126.75-147 chr22 47878018 47878315 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 246492 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 232-45 chr20 28813301 28813942 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -210956 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 185.25-28 chr14 26144212 26144603 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 409023 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 150-15 chr10 78315195 78315540 + 0.5 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 48025 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 134-122 chr3 118899506 118900009 + 0.5 NA TTS (NM_001353318) TTS (NM_001353318) -43319 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 243.75-7 chr10 51089664 51090448 + 0.5 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 15569 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 125.5-234 chr7 77780513 77780878 + 0.5 NA 3' UTR (NM_198467, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_198467, exon 8 of 8) 17739 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 121.5-162 chr21 27530501 27530818 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -191720 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 124.75-48 chr12 5158229 5158549 + 0.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 84762 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 135-61 chr17 69551030 69551372 + 0.5 NA 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) -42786 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 136-170 chr9 73626970 73627337 + 0.5 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 475288 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 126-150 chr6 1251541 1251946 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60355 NM_033260 94234 Hs.591352 NM_033260 ENSG00000164379 FOXQ1 HFH1 forkhead box Q1 protein-coding 117.75-191 chr7 18024327 18024662 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3352 NM_175886 221823 Hs.169284 NM_175886 ENSG00000229937 PRPS1L1 PRPS1|PRPS3|PRPSL|PRS-III phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 like 1 protein-coding 152.25-147 chr7 24966516 24967007 + 0.5 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) 13417 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 161.75-107 chr5 114623229 114623722 + 0.5 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 47434 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 126.5-44 chr11 120756204 120756486 + 0.5 NA intron (NM_001282470, intron 2 of 19) intron (NM_001282470, intron 2 of 19) 62770 NR_133008 105369532 Hs.694510 NR_133008 LOC105369532 - uncharacterized LOC105369532 ncRNA 147.5-211 chr8 122314892 122315312 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 253542 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 134-51 chr14 50939458 50939902 + 0.5 NA intron (NM_002863, intron 1 of 19) intron (NM_002863, intron 1 of 19) 4803 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 123.25 chr1 16178393 16178742 + 0.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -22498 NM_004431 1969 Hs.171596 NM_004431 ENSG00000142627 EPHA2 ARCC2|CTPA|CTPP1|CTRCT6|ECK EPH receptor A2 protein-coding 149.25-20 chr10 78231467 78231979 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16902 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 162.25-102 chr22 23697851 23698351 + 0.5 NA intron (NM_001329424, intron 9 of 11) intron (NM_001329424, intron 9 of 11) 1685 NM_001329425 266747 Hs.658997 NM_153615 ENSG00000159496 RGL4 Rgr ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 4 protein-coding 176-32 chr2 24463446 24464078 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -27492 NM_001362950 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 160.5-93 chr2 189124495 189125015 + 0.5 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) 8356 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 170.5-102 chr2 186714117 186714765 + 0.5 NA intron (NM_177454, intron 1 of 7) intron (NM_177454, intron 1 of 7) 20381 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 188.25-42 chr14 78500656 78501100 + 0.5 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 97159 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 125.5-127 chr2 72648597 72648979 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MA3|LINE|L1 177245 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 200-30 chr14 72402158 72402859 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1MA5|LINE|L1 -114312 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 218.75-11 chr10 125528947 125529692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45052 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 177-12 chr10 92319565 92320270 + 0.5 NA intron (NM_017824, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 28750 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 162.25-40 chr12 126413132 126413477 + 0.5 NA intron (NR_147498, intron 2 of 3) intron (NR_147498, intron 2 of 3) -12842 NR_146291 105370059 NR_146291 LINC02350 - long intergenic non-protein coding RNA 2350 ncRNA 113.5-169 chr4 28726765 28727155 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -92622 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 136-25 chr11 47589226 47589565 + 0.5 NA TTS (NM_001367966) TTS (NM_001367966) 2744 NM_001367966 399888 Hs.502529 NM_001164379 ENSG00000196666 FAM180B - family with sequence similarity 180 member B protein-coding 134.75-167 chr4 159078451 159078720 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25466 NM_001351724 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 146-4 chr1 88820409 88820836 + 0.5 NA intron (NM_006256, intron 16 of 21) intron (NM_006256, intron 16 of 21) 70945 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 155.25-69 chr15 81042964 81043580 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 42349 NM_022566 59274 Hs.513071 NM_022566 ENSG00000140406 TLNRD1 MESDC1 talin rod domain containing 1 protein-coding 175.25-127 chr6 118009938 118010611 + 0.5 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) -75629 NR_134601 105377967 Hs.692865 NR_134601 LOC105377967 - uncharacterized LOC105377967 ncRNA 135-69 chr18 50774512 50774843 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 45339 NM_001127176 83876 Hs.30495 NM_031939 ENSG00000134042 MRO B29|C18orf3 maestro protein-coding 195-63 chr3 62295785 62296462 + 0.5 NA 3' UTR (NM_002841, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_002841, exon 30 of 30) 22824 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 118.75-43 chr12 28700685 28701009 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -448431 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 151.5-61 chr15 93121075 93121649 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -32151 NM_020211 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 136.75-81 chr18 648016 648500 + 0.5 NA intron (NM_199167, intron 8 of 8) intron (NM_199167, intron 8 of 8) -9395 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 183.75-14 chr10 32621561 32622191 + 0.5 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) MLT2B2|LTR|ERVL 175736 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 118.75-117 chr21 24645124 24645498 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -195239 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 153.25-55 chr18 3081955 3082351 + 0.5 NA intron (NM_019856, intron 32 of 36) MER1B|DNA|hAT-Charlie -70206 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 123.25-10 chr1 171593660 171594014 + 0.5 NA TTS (NM_015172) TTS (NM_015172) -25926 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 130.5-199 chr5 31955344 31955644 + 0.5 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) AluSx|SINE|Alu -19335 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 161.25-43 chr13 53575024 53575637 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -240089 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 147.75-14 chr10 18895400 18895877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153163 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 134.25-199 chr9 70359422 70359808 + 0.5 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 55042 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 177.5-95 chr2 196337369 196338036 + 0.5 NA intron (NM_020760, intron 3 of 28) intron (NM_020760, intron 3 of 28) 24475 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 189.5-104 chr4 177904217 177904702 + 0.5 NA intron (NR_108093, intron 1 of 1) intron (NR_108093, intron 1 of 1) 3477 NR_108093 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 124.75-84 chr15 59365961 59366429 + 0.5 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluSq2|SINE|Alu 6676 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 150.5-78 chr19 18095920 18096378 + 0.5 NA intron (NM_001290024, intron 1 of 17) AluJb|SINE|Alu -1629 NM_015016 23031 Hs.466184 NM_015016 ENSG00000099308 MAST3 - microtubule associated serine/threonine kinase 3 protein-coding 207.25-64 chr4 35944843 35945502 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 298767 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 120.25-130 chr3 44844103 44844443 + 0.5 NA intron (NM_020242, intron 30 of 34).2 intron (NM_020242, intron 30 of 34).2 -17615 NR_030290 693149 NR_030290 ENSG00000284498 MIR564 MIRN564|hsa-mir-564 microRNA 564 ncRNA 114.5-47 chr11 12374996 12375396 + 0.5 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -2375 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 171-98 chr4 30843943 30844430 + 0.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 123817 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 114.5-270 chr8 140616584 140616858 + 0.5 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 18912 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 127.5-149 chr3 86660539 86660995 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 178824 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 127.25-144 chr4 65670033 65670401 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001318761) promoter-TSS (NM_001318761) 256 NR_034138 100144602 Hs.201854 NR_034138 ENSG00000250846 EPHA5-AS1 - EPHA5 antisense RNA 1 ncRNA 118.5-50 chr13 83877152 83877527 + 0.5 NA 3' UTR (NM_052910, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_052910, exon 1 of 1) 5054 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 180.75-76 chr2 231152191 231152666 + 0.5 NA intron (NM_001191037, intron 18 of 23) MIRb|SINE|MIR -27386 NM_000867 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 132.5-171 chr3 150305839 150306313 + 0.5 NA intron (NR_110186, intron 1 of 3) intron (NR_110186, intron 1 of 3) 17671 NR_110186 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 143-141 chr8 38813633 38814075 + 0.5 NA intron (NM_001352791, intron 1 of 11) intron (NM_001352791, intron 1 of 11) 8404 NM_001352791 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 146-117 chr7 21988704 21989154 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -43030 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 121.5-104 chr17 40631783 40632156 + 0.5 NA intron (NM_003079, intron 8 of 10) intron (NM_003079, intron 8 of 10) 15849 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 130-133 chr5 146118894 146119334 + 0.5 NA intron (NM_016460, intron 30 of 30) L2c|LINE|L2 -13537 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 153-143 chr7 90178597 90179011 + 0.5 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) 24335 NM_012449 26872 Hs.61635 NM_012449 ENSG00000164647 STEAP1 PRSS24|STEAP STEAP family member 1 protein-coding 141.5-190 chr6 6710252 6710790 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87695 NR_026970 285780 Hs.655737 NM_173675 ENSG00000216863 LY86-AS1 LY86-AS|LY86AS LY86 antisense RNA 1 ncRNA 128.25-96 chr2 80794943 80795244 + 0.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 481714 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 120.25-12 chr1 105609095 105609447 + 0.5 NA intron (NR_125955, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 9664 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 118.25-141 chr4 94853478 94853874 + 0.5 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) intron (NM_001203, intron 1 of 12) 95721 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 127-85 chr18 956754 957095 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28931 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 137.75-202 chr8 72142143 72142644 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66809 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 122-185 chr8 104868503 104868966 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -279710 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 114.25-75 chr17 57971249 57971497 + 0.5 NA TTS (NM_007146) TTS (NM_007146) -15961 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 113.75-74 chr16 20047636 20047950 + 0.5 NA intron (NM_001002911, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 25985 NM_001318483 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 200.75-112 chr9 71968452 71968949 + 0.5 NA intron (NM_001365057, intron 2 of 2) LTR10A|LTR|ERV1 57061 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 117.75-89 chr18 64852292 64852607 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -592394 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 153-123 chr5 100804812 100805302 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11508 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 158.5-137 chr3 193595059 193595501 + 0.5 NA intron (NM_130831, intron 1 of 27) intron (NM_130831, intron 1 of 27) 2072 NM_001354663 4976 Hs.594504 NM_015560 ENSG00000198836 OPA1 BERHS|MGM1|MTDPS14|NPG|NTG|largeG OPA1 mitochondrial dynamin like GTPase protein-coding 181.25-62 chr2 55709393 55709758 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15731 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 116.5-140 chr20 18814349 18814673 + 0.5 NA TTS (NM_178483) TTS (NM_178483) 728 NM_178483 140856 Hs.112794 NM_178483 ENSG00000132631 SCP2D1 C20orf79|HSD22|dJ1068E13.2 SCP2 sterol binding domain containing 1 protein-coding 173-16 chr10 63550393 63550920 + 0.5 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) intron (NM_001001330, intron 1 of 7) -28766 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 149.25-6 chr1 39299053 39299442 + 0.5 NA intron (NM_012090, intron 20 of 92) intron (NM_012090, intron 20 of 92) -109826 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 204.75-7 chr1 155145208 155145950 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5048 NM_153741 54344 Hs.110477 NM_018973 ENSG00000179085 DPM3 CDG1O dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatory protein-coding 124.75-110 chr2 12772131 12772481 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 34939 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 116.75-209 chr9 74983769 74984107 + 0.5 NA intron (NR_135282, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 30973 NR_121183 101927380 Hs.257556 NR_121183 CARNMT1-AS1 C9orf41-AS1 CARNMT1 antisense RNA 1 ncRNA 124-46 chr14 70450542 70450973 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1417 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 124.5-246 chr9 100246561 100246821 + 0.5 NA exon (NM_001318381, exon 9 of 18) exon (NM_001318381, exon 9 of 18) 105880 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 122-199 chrX 54369218 54369615 + 0.5 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -11370 NM_001002838 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 122.25-78 chr18 1327657 1328141 + 0.5 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 31730 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 116.25-50 chr12 49152082 49152376 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20834 NM_006082 10376 Hs.524390 NM_006082 ENSG00000123416 TUBA1B K-ALPHA-1 tubulin alpha 1b protein-coding 125.25-33 chr11 3845430 3845856 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4684 NM_001665 391 Hs.501728 NM_001665 ENSG00000177105 RHOG ARHG ras homolog family member G protein-coding 124-183 chrX 50910933 50911291 + 0.5 NA intron (NM_005448, intron 1 of 1) intron (NM_005448, intron 1 of 1) 377 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 129.25-7 chr1 125179557 125179834 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3660583 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 144.25-91 chr2 13977812 13978283 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 422911 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 146-124 chr8 47286385 47286904 + 0.5 NA intron (NM_001080394, intron 3 of 19) intron (NM_001080394, intron 3 of 19) 25706 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 168.25-114 chr5 28957534 28957938 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 30866 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 115.25-173 chr6 34601302 34601611 + 0.5 NA intron (NM_022758, intron 3 of 3) intron (NM_022758, intron 3 of 3) -45123 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 145.75-43 chr14 81570938 81571331 + 0.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -37273 NM_001244984 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 153.25-125 chr8 27126643 27127027 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -77872 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 138.5-196 chr8 109633406 109633763 + 0.5 NA intron (NM_001099746, intron 1 of 5) intron (NM_001099746, intron 1 of 5) 9606 NM_001099756 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 124-12 chr1 230754439 230754824 + 0.5 NA intron (NM_001319676, intron 1 of 17) AluJr|SINE|Alu 7243 NM_006615 10753 Hs.498021 NM_006615 ENSG00000135773 CAPN9 GC36|nCL-4 calpain 9 protein-coding 116.25-65 chr14 51731378 51731827 + 0.5 NA TTS (NM_152330) TTS (NM_152330) 14319 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 117-15 chr10 56947185 56947462 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 357236 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 137.75-59 chr14 58546134 58546518 + 0.5 NA intron (NM_001329944, intron 31 of 31) intron (NM_001329944, intron 31 of 31) -87742 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 148.5-220 chr8 23946620 23947104 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -92056 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 117.75-44 chr12 71693929 71694333 + 0.5 NA intron (NM_018279, intron 2 of 5) intron (NM_018279, intron 2 of 5) 8049 NM_018279 55266 Hs.644802 NM_018279 ENSG00000139291 TMEM19 - transmembrane protein 19 protein-coding 168.75-30 chr11 97999922 98000285 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1020846 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 143.5-45 chr12 66078771 66079230 + 0.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -47934 NR_146530 105369810 NR_146530 ENSG00000256259 LINC02425 - long intergenic non-protein coding RNA 2425 ncRNA 145.5-202 chrX 86800075 86800631 + 0.5 NA intron (NM_001139515, intron 7 of 11) intron (NM_001139515, intron 7 of 11) 537385 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 130.75-183 chr7 85180381 85180829 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -58674 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 190-65 chr6 40582769 40583250 + 0.5 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 4355 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 138.25-135 chr4 151150811 151151361 + 0.5 NA intron (NM_001009555, intron 9 of 20) AluSz|SINE|Alu 24466 NM_001128924 152503 Hs.744983 NM_001009555 ENSG00000109686 SH3D19 EBP|EVE1|Eve-1|Kryn|SH3P19 SH3 domain containing 19 protein-coding 169.5-26 chr11 79327253 79327734 + 0.5 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) 74616 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 197.5-16 chr11 21492967 21493631 + 0.5 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L1MA4A|LINE|L1 -699786 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 180-65 chr2 141557655 141558250 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 573749 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 149-59 chr2 101588868 101589424 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -108557 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 140.75-69 chr17 57821169 57821662 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28629 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 128.25-45 chr13 85400863 85401297 + 0.5 NA intron (NR_046989, intron 1 of 3) L1PA12|LINE|L1 37477 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 127-127 chr4 100710994 100711406 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36087 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 142.75-32 chr11 26240276 26240634 + 0.5 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 47552 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-202 chr9 83107368 83107755 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -44419 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 231-55 chr3 188684565 188685354 + 0.5 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) intron (NM_005578, intron 6 of 10) -3822 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 141.75-121 chr3 169693467 169693867 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29955 NM_001366466 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 176.25-133 chr8 13096897 13097482 + 0.5 NA intron (NM_001348083, intron 6 of 13) intron (NM_001348083, intron 6 of 13) 19055 NM_001164271 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 149.25-84 chr2 122217621 122218015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 462167 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 127.5-199 chr5 124128110 124128560 + 0.5 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 310185 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 120.25-119 chr21 27361097 27361529 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -361066 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 120.75-151 chr6 151738341 151738791 + 0.5 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) L1M3|LINE|L1 48070 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 112.25-59 chr14 55236078 55236397 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -35184 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 132.25-176 chr7 119346888 119347341 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 560261 NR_131961 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 115.25-92 chr19 46918506 46918787 + 0.5 NA 5' UTR (NM_004491, exon 2 of 7) 5' UTR (NM_004491, exon 2 of 7) 57649 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 150-122 chr6 20094215 20094739 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 117992 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 178.5-2 chr1 29171205 29171711 + 0.5 NA intron (NM_005626, intron 1 of 5) MIR1_Amn|SINE|MIR 10442 NM_005626 6429 Hs.469970 NM_005626 ENSG00000116350 SRSF4 SFRS4|SRP75 serine and arginine rich splicing factor 4 protein-coding 183.75-88 chr4 126677281 126677977 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -955328 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 162.5-185 chr8 127930455 127931031 + 0.5 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 17980 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 131-107 chr20 39627216 39627567 + 0.5 NA Intergenic MER125|DNA|DNA -377070 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 174.5-12 chr1 173390196 173390654 + 0.5 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) L1MEd|LINE|L1 70937 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 127.75-68 chr15 59287564 59288056 + 0.5 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) MER6|DNA|TcMar-Tigger 80967 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 164.75-98 chr3 80060209 80060707 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -292460 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 135.5-136 chr3 84216677 84217088 + 0.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 652693 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 177.5-26 chr11 78486055 78486413 + 0.5 NA intron (NM_024678, intron 7 of 13) L1MEf|LINE|L1 -46942 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 169.75-90 chr2 221712435 221712931 + 0.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -138481 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 165-58 chr17 72289184 72289666 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53386 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 145-56 chr16 85988959 85989452 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 70858 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 144.75-26 chr11 6510559 6510971 + 0.5 NA intron (NM_144666, intron 6 of 42) intron (NM_144666, intron 6 of 42) 13469 NM_144666 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 129.75-117 chr22 33649745 33650161 + 0.5 NA intron (NM_133642, intron 3 of 14) intron (NM_133642, intron 3 of 14) 54967 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 142.25-142 chr6 75282588 75282921 + 0.5 NA intron (NM_018247, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 2038 NM_018247 55754 Hs.108530 NM_018247 ENSG00000112697 TMEM30A C6orf67|CDC50A transmembrane protein 30A protein-coding 168.5-123 chr3 184747037 184747681 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 25796 NR_110043 101928992 Hs.507129 NR_110043 ENSG00000229433 LINC02069 - long intergenic non-protein coding RNA 2069 ncRNA 138.25-75 chr19 15067991 15068500 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18765 NM_012114 23581 Hs.466057 NM_012114 ENSG00000105141 CASP14 ARCI12 caspase 14 protein-coding 176.5-183 chr8 142554522 142555111 + 0.5 NA Intergenic MER66A|LTR|ERV1 59663 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 121.5-24 chr10 14811152 14811462 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26730 NM_001029954 441549 Hs.559067 NM_001029954 ENSG00000185267 CDNF ARMETL1 cerebral dopamine neurotrophic factor protein-coding 131.25-195 chr8 29882192 29882548 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39143 NR_024473 286135 Hs.376840 NR_024473 ENSG00000253279 LINC02209 FAM183CP long intergenic non-protein coding RNA 2209 ncRNA 202.5-113 chr5 46236139 46236724 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -540051 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 139-3 chr1 27185505 27185895 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -30575 NR_046474 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 137-43 chr12 58871765 58872178 + 0.5 NA TTS (NM_001136051) TTS (NM_001136051) 47575 NM_001136051 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 180.75-112 chr5 28601543 28602040 + 0.5 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -314126 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 118-64 chr17 5895276 5895615 + 0.5 NA intron (NR_040000, intron 3 of 3) LTR9B|LTR|ERV1 123211 NR_040000 339166 Hs.736088 NR_040000 ENSG00000284837 LOC339166 - uncharacterized LOC339166 ncRNA 130.75-150 chr4 122741561 122741988 + 0.5 NA intron (NM_001178007, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 9070 NM_152618 166379 Hs.400698 NM_152618 ENSG00000181004 BBS12 C4orf24 Bardet-Biedl syndrome 12 protein-coding 124-171 chr8 133225357 133225688 + 0.5 NA non-coding (NR_037944, exon 2 of 3) non-coding (NR_037944, exon 2 of 3) 34483 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 125-55 chr17 19643297 19643633 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4685 NM_001369137 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 132.5-65 chr14 24745369 24745774 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -111381 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 146.25-39 chr15 33352760 33353162 + 0.5 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 41994 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 140.25-35 chr12 24792540 24793043 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 109431 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 142.75-181 chr8 26420524 26420875 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 30286 NM_001330491 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 170.25-66 chr2 63755800 63756337 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84896 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 154-126 chr8 5693071 5693582 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -698412 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 133-96 chr20 13063561 13063918 + 0.5 NA intron (NM_001349945, intron 3 of 12) AluSz6|SINE|Alu 54767 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 168.25-130 chr7 14833231 14833884 + 0.5 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 7893 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 193-57 chr3 183506367 183506889 + 0.5 NA intron (NM_130446, intron 3 of 6) AluJb|SINE|Alu -42107 NR_046687 100874019 NR_046687 ENSG00000242522 KLHL6-AS1 - KLHL6 antisense RNA 1 ncRNA 116-23 chr11 25463511 25463774 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -725481 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 138.25-182 chrX 100391570 100392003 + 0.5 NA intron (NM_020766, intron 2 of 4) intron (NM_020766, intron 2 of 4) 18487 NM_020766 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 157.5-136 chr3 112950788 112951245 + 0.5 NA intron (NM_138806, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 24087 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 116.5-191 chr5 27693476 27693801 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 221346 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 122-105 chr2 223944329 223944763 + 0.5 NA intron (NM_020830, intron 1 of 11) CpG 789 NM_020830 57590 Hs.368359 NM_020830 ENSG00000085449 WDFY1 FENS-1|FENS1|WDF1|ZFYVE17 WD repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 177.25-34 chr11 118502489 118503014 + 0.5 NA exon (NM_001197104, exon 27 of 36) exon (NM_001197104, exon 27 of 36) -24682 NM_001346096 143941 Hs.653449 NM_001080441 ENSG00000172425 TTC36 HBP21 tetratricopeptide repeat domain 36 protein-coding 149.25-166 chr7 46758295 46758664 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61357 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 133.25-191 chr7 1692092 1692519 + 0.5 NA intron (NM_001128636, intron 1 of 2) intron (NM_001128636, intron 1 of 2) 4186 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 184-100 chr9 12586036 12586702 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107016 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 141.25-172 chr7 52507469 52507865 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -527966 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 128.5-75 chr15 86306198 86306520 + 0.5 NA intron (NR_046012, intron 2 of 3) L1MA1|LINE|L1 10609 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-39 chr14 50810635 50811085 + 0.5 NA intron (NM_016350, intron 3 of 28) AluY|SINE|Alu -10937 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 118.75-171 chr6 129718553 129718959 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8579 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 141.25-127 chr5 14979056 14979566 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -107533 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 187.25-113 chr9 114928054 114928491 + 0.5 NA intron (NM_001252290, intron 1 of 4) intron (NM_001252290, intron 1 of 4) 2323 NM_001252290 944 Hs.494901 NM_001244 ENSG00000106952 TNFSF8 CD153|CD30L|CD30LG|TNLG3A TNF superfamily member 8 protein-coding 118.75-53 chr13 75835840 75836248 + 0.5 NA intron (NM_005358, intron 17 of 29) intron (NM_005358, intron 17 of 29) -34994 NM_001257995 729420 Hs.586820 NM_001257995 LMO7DN C13orf45 LMO7 downstream neighbor protein-coding 153-147 chr8 60991158 60991523 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -23592 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 179-74 chr4 81422179 81422867 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 49384 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 120.5-215 chr7 42643920 42644283 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 62346 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 193.75-62 chr2 46861357 46861794 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 33711 NR_024452 100134259 Hs.114449 NR_024452 ENSG00000239332 LINC01119 - long intergenic non-protein coding RNA 1119 ncRNA 280.25-7 chr10 68307379 68308246 + 0.5 NA intron (NM_001033083, intron 1 of 8) intron (NM_001033083, intron 1 of 8) -23881 NM_001322438 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 113.75-106 chr2 176738454 176738862 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 100904 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 152.5-190 chr8 90697505 90698029 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51684 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 165.5-41 chr14 26456858 26457211 + 0.5 NA intron (NM_006489, intron 3 of 3) intron (NM_006489, intron 3 of 3) 96396 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 161-24 chr12 2800414 2800967 + 0.5 NA intron (NM_002014, intron 8 of 9) intron (NM_002014, intron 8 of 9) 5720 NM_002014 2288 Hs.524183 NM_002014 ENSG00000004478 FKBP4 FKBP51|FKBP52|FKBP59|HBI|Hsp56|PPIase|p52 FKBP prolyl isomerase 4 protein-coding 148-44 chr17 58180167 58180544 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 10699 NM_001004707 124538 Hs.446879 NM_001004707 ENSG00000255713 OR4D2 BC2009|OR17-24 olfactory receptor family 4 subfamily D member 2 protein-coding 140.5-191 chr6 35097086 35097507 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 44043 NM_001366325 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 128.75-80 chr18 6935978 6936397 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6318 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 191-20 chr12 84813006 84813667 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 99463 NM_182767 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 172.75-22 chr11 103287824 103288261 + 0.5 NA intron (NM_001377, intron 75 of 88) LTR8|LTR|ERV1 178616 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 136.5-27 chr10 60932330 60932735 + 0.5 NA intron (NM_001350908, intron 2 of 11) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 11653 NM_001242359 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 141.75-114 chr3 37688416 37688807 + 0.5 NA intron (NM_002207, intron 18 of 27) intron (NM_002207, intron 18 of 27) 173169 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 133-139 chr5 94305657 94306025 + 0.5 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -194142 NM_001163417 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 116.5-174 chr4 39466346 39466717 + 0.5 NA intron (NM_001278590, intron 6 of 9) AluJr4|SINE|Alu 7475 NM_001363700 11019 Hs.550502 NM_006859 ENSG00000121897 LIAS HGCLAS|HUSSY-01|LAS|LIP1|LS|PDHLD lipoic acid synthetase protein-coding 164.5-183 chr6 164747810 164748276 + 0.5 NA Intergenic LTR27C|LTR|ERV1 74020 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 118.75-170 chr6 124357194 124357505 + 0.5 NA intron (NM_153355, intron 3 of 5) intron (NM_153355, intron 3 of 5) 74344 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 154-109 chr5 42291727 42292136 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -116586 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 116.5-116 chr2 60917787 60918222 + 0.5 NA intron (NM_002908, intron 5 of 10) intron (NM_002908, intron 5 of 10) 36430 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 150.5-211 chr8 28254546 28254985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -62503 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 137.25-75 chr2 107374292 107374693 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -24967 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 152.75-20 chr10 55169767 55170141 + 0.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -368663 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 132.5-127 chr2 107619947 107620343 + 0.5 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 90726 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 179.25-46 chr12 117240660 117241256 + 0.5 NA intron (NM_001204213, intron 19 of 27) AluSg|SINE|Alu -50488 NM_015002 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 175.25-40 chr12 104876755 104877288 + 0.5 NA intron (NM_032148, intron 7 of 11) L1MA9|LINE|L1 81269 NM_001352170 84102 Hs.577463 NM_032148 ENSG00000136052 SLC41A2 SLC41A1-L1 solute carrier family 41 member 2 protein-coding 171.25-32 chr11 111255680 111256147 + 0.5 NA intron (NM_198498, intron 1 of 4) intron (NM_198498, intron 1 of 4) 10188 NM_198498 341032 Hs.298685 NM_198498 ENSG00000150750 C11orf53 - chromosome 11 open reading frame 53 protein-coding 113-5 chr1 109124670 109124972 + 0.5 NA intron (NM_001284352, intron 1 of 20) intron (NM_001284352, intron 1 of 20) 10706 NM_001267048 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 130.5-255 chr9 76435261 76435751 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -6160 NM_001097634 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 241.5-98 chr8 120977199 120977838 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165472 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 189.75-68 chr22 24832114 24832589 + 0.5 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 26130 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 152-104 chr3 68067359 68067775 + 0.5 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 63320 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 128.75-129 chr3 182914800 182915212 + 0.5 NA intron (NM_014616, intron 29 of 29) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 65532 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 142.75-44 chr12 28210431 28210987 + 0.5 NA intron (NM_001352079, intron 2 of 14) MER57-int|LTR|ERV1 -19971 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 153.75-25 chr11 74401774 74402294 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 2797 NR_039710 100616215 NR_039710 ENSG00000264402 MIR548AL - microRNA 548al ncRNA 116.5-101 chr18 13424170 13424450 + 0.5 NA intron (NR_040031, intron 2 of 3) intron (NR_040031, intron 2 of 3) 3224 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 163.5-13 chr1 207177890 207178330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 73877 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 117.25-207 chr8 32914265 32914565 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 192580 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 176.75-20 chr11 64746403 64747036 + 0.5 NA exon (NM_001164716, exon 18 of 18) exon (NM_001164716, exon 18 of 18) -1263 NM_153819 10235 Hs.99491 NM_005825 ENSG00000068831 RASGRP2 CALDAG-GEFI|CDC25L RAS guanyl releasing protein 2 protein-coding 203.25-85 chr5 93252618 93253188 + 0.5 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy 318440 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 141.25-126 chr5 14620622 14621007 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31568 NR_132981 106635684 NR_132981 SNORD141B - small nucleolar RNA, C/D box 141B snoRNA 122-148 chr5 155929861 155930241 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -396706 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 126.25-178 chr6 80602595 80602961 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 496107 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 128.25-207 chr8 88833933 88834322 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -506644 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 184.5-134 chr6 139588885 139589401 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -114547 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 129.25-20 chr10 68026757 68027021 + 0.5 NA intron (NM_001278186, intron 5 of 22) AluSx1|SINE|Alu -16006 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 136-92 chr21 15606395 15606895 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -123289 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 142-155 chr7 138097272 138097744 + 0.5 NA intron (NM_001190907, intron 3 of 7) LTR16A2|LTR|ERVL 21049 NM_005989 6718 Hs.201667 NM_005989 ENSG00000122787 AKR1D1 3o5bred|CBAS2|SRD5B1 aldo-keto reductase family 1 member D1 protein-coding 133.5-264 chr8 96668824 96669300 + 0.5 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) L1MDa|LINE|L1 23820 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 164.5-44 chr12 106766832 106767254 + 0.5 NA intron (NR_040246, intron 1 of 3) intron (NR_040246, intron 1 of 3) -7639 NR_147132 55188 Hs.131306 NM_018157 ENSG00000111785 RIC8B RIC8|hSyn RIC8 guanine nucleotide exchange factor B protein-coding 237.5-98 chr7 55403949 55404864 + 0.5 NA intron (NM_018697, intron 5 of 8) intron (NM_018697, intron 5 of 8) 38958 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 128.25-29 chr12 3681845 3682251 + 0.5 NA intron (NM_001144958, intron 4 of 19) intron (NM_001144958, intron 4 of 19) 71061 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 137.75-42 chr12 64141971 64142375 + 0.5 NA intron (NM_001346201, intron 21 of 21) intron (NM_001346201, intron 21 of 21) 80123 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 123-86 chr18 7227595 7227976 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3319 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 136.25-174 chr7 28820626 28821008 + 0.5 NA 3' UTR (NM_004904, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004904, exon 11 of 11) 134684 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 166.25-145 chr8 142888019 142888496 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -8437 NM_001026213 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 123-91 chr19 51833099 51833449 + 0.5 NA intron (NR_163433, intron 9 of 11) L1MEc|LINE|L1 38117 NM_002030 2359 Hs.445466 NM_002030 ENSG00000187474 FPR3 FML2_HUMAN|FMLP-R-II|FMLPY|FPRH1|FPRH2|FPRL2|RMLP-R-I formyl peptide receptor 3 protein-coding 116-14 chr10 51625222 51625654 + 0.5 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) AluSx1|SINE|Alu 74157 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 121-32 chr11 15822462 15822930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 146925 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 125.75-28 chr10 99889488 99889800 + 0.5 NA intron (NM_015221, intron 11 of 16) intron (NM_015221, intron 11 of 16) 24448 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 145-41 chr12 113574383 113574749 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 102563 NR_126425 104355219 Hs.641707 NR_126425 LHX5-AS1 locus 4010|locus4010 LHX5 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-71 chr13 99640751 99641215 + 0.5 NA intron (NR_104592, intron 1 of 9) intron (NR_104592, intron 1 of 9) -2076 NR_036191 100422861 NR_036191 ENSG00000263615 MIR4306 mir-4306 microRNA 4306 ncRNA 162.25-130 chr5 63340126 63340606 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 621926 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 156.75-8 chr1 104366787 104367315 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 294028 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 135.75-184 chr6 126569470 126569864 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 85036 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 131.5-7 chr1 105089003 105089387 + 0.5 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 529740 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 158.75-166 chr8 142337951 142338444 + 0.5 NA intron (NM_001291931, intron 2 of 10) intron (NM_001291931, intron 2 of 10) 64985 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 135.75-39 chr11 84294918 84295255 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -21806 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 124.75-198 chr8 64974636 64975014 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -176088 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 194.75-13 chr10 67297089 67297635 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) ERVL-E-int|LTR|ERVL 106048 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 144.25-12 chr1 107417148 107417665 + 0.5 NA intron (NM_014917, intron 5 of 5) intron (NM_014917, intron 5 of 5) 269337 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 112.75-161 chr5 38553165 38553489 + 0.5 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 3319 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 121.75-121 chr3 113017204 113017548 + 0.5 NA intron (NM_001319110, intron 1 of 5) intron (NM_001319110, intron 1 of 5) 2295 NM_001319109 25871 Hs.591288 NM_015412 ENSG00000163608 NEPRO C3orf17|NET17 nucleolus and neural progenitor protein protein-coding 201.5-21 chr10 34599428 34600230 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 215467 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 171-97 chr3 194507344 194507863 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20463 NR_033929 401106 Hs.407087 NR_033929 LINC00884 - long intergenic non-protein coding RNA 884 ncRNA 125.25-211 chr8 122988555 122988943 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 37023 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 135.75-199 chr8 98373690 98374179 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 19804 NR_162095 113218497 NR_162095 MIR9903 - microRNA 9903 ncRNA 112.5-197 chr5 137746990 137747284 + 0.5 NA 3' UTR (NM_006805, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_006805, exon 1 of 1) 7226 NM_006805 10949 Hs.96996 NM_006805 ENSG00000177733 HNRNPA0 HNRPA0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 protein-coding 176.25-132 chr7 94698550 94699049 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 42429 NM_001172438 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 123.5-197 chr7 29073403 29073677 + 0.5 NA intron (NM_001371264, intron 10 of 15) L2a|LINE|L2 -51493 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 164-138 chr8 100630579 100631108 + 0.5 NA intron (NM_152628, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu -12438 NM_001363720 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 251.75-33 chr19 51424449 51425184 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7174 NM_001171161 89790 Hs.284813 NM_033130 ENSG00000142512 SIGLEC10 PRO940|SIGLEC-10|SLG2 sialic acid binding Ig like lectin 10 protein-coding 130.75-129 chr4 6745095 6745532 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 29139 NM_018366 55330 Hs.7570 NM_018366 ENSG00000186222 BLOC1S4 BCAS4L|BLOS4|CNO biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 4 protein-coding 136.25-187 chr8 108926979 108927453 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -139622 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 157.25-7 chr1 208333498 208333921 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -89325 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 122.75-156 chr5 2254810 2255290 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57151 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 131.75-175 chr5 107714122 107714460 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -43354 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 164.5-138 chr3 116670757 116671277 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38771 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 117.25-164 chr5 11243548 11243982 + 0.5 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 345152 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 150-3 chr1 58134032 58134420 + 0.5 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 116277 NM_021080 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 116.25-57 chr12 127689633 127690077 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34267 NR_134995 105370068 Hs.524845 NR_134995 LOC105370068 - uncharacterized LOC105370068 ncRNA 246.25-28 chr2 26882550 26883280 + 0.5 NA intron (NM_001253724, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 34491 NM_001253724 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 127.5-232 chr7 79614404 79614701 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 160592 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 114.75-181 chr7 110260350 110260697 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -300310 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 113.5-174 chr4 60183886 60184179 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -738587 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 143.5-168 chr5 10890080 10890390 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -129001 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 153-85 chr20 21816700 21817200 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 111286 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 161-29 chr13 35310236 35310754 + 0.5 NA intron (NM_015678, intron 36 of 57) intron (NM_015678, intron 36 of 57) 166194 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 135.25-132 chr3 121009474 121009915 + 0.5 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -39946 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 122.5-21 chr10 42367309 42367646 + 0.5 NA intron (NR_024380, intron 1 of 2) intron (NR_024380, intron 1 of 2) 568 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 117.5-203 chr6 40001470 40001749 + 0.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -67147 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 123.5-121 chr21 16506682 16506995 + 0.5 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) intron (NR_136546, intron 2 of 2) -28734 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 155-36 chr14 52274379 52274743 + 0.5 NA intron (NM_001281469, intron 2 of 2) intron (NM_001281469, intron 2 of 2) 6863 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 145.25-146 chr6 129394790 129395219 + 0.5 NA intron (NM_000426, intron 37 of 64) intron (NM_000426, intron 37 of 64) 315173 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 152-58 chr15 89880995 89881490 + 0.5 NA intron (NR_023361, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 2788 NR_049807 100846993 NR_049807 ENSG00000264796 MIR5009 - microRNA 5009 ncRNA 112.25-197 chr7 20006866 20007211 + 0.5 NA intron (NR_110114, intron 3 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 133388 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 129.25-202 chr8 105814824 105815198 + 0.5 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1MD3|LINE|L1 245492 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-179 chr6 110352769 110353153 + 0.5 NA intron (NM_001123364, intron 1 of 4) intron (NM_001123364, intron 1 of 4) 5311 NM_001354594 728464 Hs.634429 NM_001123364 ENSG00000053328 METTL24 C6orf186 methyltransferase like 24 protein-coding 116.25-3 chr1 26368135 26368413 + 0.5 NA intron (NM_001114759, intron 2 of 5) intron (NM_001114759, intron 2 of 5) 4520 NM_173574 257101 Hs.353208 NM_173574 ENSG00000176083 ZNF683 Hobit zinc finger protein 683 protein-coding 158.25-23 chr11 66265352 66265770 + 0.5 NA intron (NM_001134775, intron 11 of 15) intron (NM_001134775, intron 11 of 15) -3078 NM_030981 81876 Hs.300816 NM_030981 ENSG00000174903 RAB1B - RAB1B, member RAS oncogene family protein-coding 117.75-41 chr12 8713246 8713649 + 0.5 NA intron (NM_001352271, intron 2 of 6) intron (NM_001352271, intron 2 of 6) 15456 NM_001297776 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 167.75-125 chr6 118874665 118875173 + 0.5 NA intron (NM_017696, intron 6 of 11) AluSq2|SINE|Alu -19233 NM_014034 25842 Hs.292316 NM_014034 ENSG00000111875 ASF1A CGI-98|CIA|HSPC146 anti-silencing function 1A histone chaperone protein-coding 155.25-174 chr8 25366119 25366570 + 0.5 NA intron (NM_024940, intron 30 of 51) AluSx1|SINE|Alu -4832 NR_159962 105379331 NR_159962 LOC105379331 - uncharacterized LOC105379331 ncRNA 179-72 chr4 54665889 54666454 + 0.5 NA intron (NM_000222, intron 1 of 20) Plat_L3|LINE|CR1 8243 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 114.5-67 chr12 41553712 41554052 + 0.5 NA intron (NM_001164595, intron 6 of 9) MIRc|SINE|MIR 116143 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 115.25-184 chr7 32539442 32539826 + 0.5 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) L1ME3G|LINE|L1 44145 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 148.25-119 chr5 9852392 9852824 + 0.5 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) intron (NR_027112, intron 4 of 12) -1769 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 145.25-179 chr9 29914702 29915097 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 493555 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 127.25-101 chr2 239049717 239050221 + 0.5 NA 3' UTR (NM_006037, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_006037, exon 27 of 27) 18945 NR_039642 100616397 NR_039642 ENSG00000266109 MIR4440 mir-4440 microRNA 4440 ncRNA 157-72 chr22 28786572 28787010 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001284265, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001284265, exon 5 of 5) 13654 NM_001284265 150275 Hs.406460 NM_173510 ENSG00000159873 CCDC117 dJ366L4.1 coiled-coil domain containing 117 protein-coding 159.25-27 chr12 8957135 8957524 + 0.5 NA intron (NR_137427, intron 1 of 2) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 7285 NR_137427 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 159.25-95 chr3 180793860 180794281 + 0.5 NA intron (NR_109986, intron 3 of 13) L1M1|LINE|L1 76108 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 150.75-120 chr22 44216496 44216834 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35740 NM_022141 64098 Hs.658995 NM_022141 ENSG00000138964 PARVG - parvin gamma protein-coding 154-32 chr11 109390137 109390616 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31814 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 149.25-92 chr2 177239326 177239768 + 0.5 NA intron (NM_001313903, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 16463 NR_036075 100422824 NR_036075 ENSG00000265396 MIR3128 mir-3128 microRNA 3128 ncRNA 162.25-84 chr2 132409343 132409916 + 0.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -7176 NM_001508 2863 Hs.432395 NM_001508 ENSG00000183840 GPR39 - G protein-coupled receptor 39 protein-coding 118-147 chr5 52991288 52991622 + 0.5 NA intron (NR_073107, intron 1 of 28) intron (NR_073107, intron 1 of 28) 2103 NR_073106 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 143-65 chr19 28629911 28630481 + 0.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MA5A|LINE|L1 23508 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 116-103 chr3 32288972 32289354 + 0.5 NA intron (NM_001320308, intron 1 of 2) MER102c|DNA|hAT-Charlie 50483 NM_178868 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 115.5-39 chr12 64182518 64182774 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 39650 NM_152440 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 146.75-109 chr4 26897441 26897890 + 0.5 NA intron (NM_001169118, intron 1 of 12) L1MC5a|LINE|L1 36824 NM_020860 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 129-153 chr6 47354612 47354965 + 0.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -44883 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 117.5-37 chr11 28920582 28921028 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -443257 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 154.5-112 chr2 208449081 208449496 + 0.5 NA intron (NM_005048, intron 7 of 12) L2a|LINE|L2 42458 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 148.25-82 chr20 38904413 38904806 + 0.5 NA intron (NM_001172735, intron 6 of 9) intron (NM_001172735, intron 6 of 9) -21808 NM_030919 81610 Hs.726442 NM_030919 ENSG00000101447 FAM83D C20orf129|CHICA|dJ616B8.3 family with sequence similarity 83 member D protein-coding 169-41 chr2 25450446 25451035 + 0.5 NA intron (NM_033147, intron 12 of 19) L1ME2|LINE|L1 -108150 NM_175629 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 157.25-148 chr8 84312092 84312514 + 0.5 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -103181 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 157-50 chr2 12471011 12471617 + 0.5 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) L1MEd|LINE|L1 -245558 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 124.5-123 chr20 18881983 18882466 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -52021 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 143-70 chr2 30225801 30226154 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5557 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 116.75-22 chr10 52367402 52367797 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 53318 NM_012242 22943 Hs.40499 NM_012242 ENSG00000107984 DKK1 DKK-1|SK dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 protein-coding 141.25-163 chr6 154656265 154656817 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -76837 NM_001286194 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 176-22 chr14 57900750 57901274 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -34920 NM_001352011 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 119.5-33 chr10 80760005 80760310 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 110360 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 137.25-146 chr6 164023201 164023733 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -351983 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 125.25-47 chr12 28803802 28804196 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -345279 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 180.5-74 chr2 117017332 117017889 + 0.5 NA Intergenic Tigger1a_Art|DNA|TcMar-Tigger -797081 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 126.25-135 chr4 115770123 115770447 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -529440 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 128.25-216 chr9 27573877 27574270 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_018325) promoter-TSS (NM_018325) -207 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 160.75-101 chr3 88560358 88560842 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 222144 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 154.5-107 chr2 148496411 148496800 + 0.5 NA intron (NM_018328, intron 12 of 14) intron (NM_018328, intron 12 of 14) -148146 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 134.25-110 chr3 52191640 52192095 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6216 NM_199166 211 Hs.476308 NM_000688 ENSG00000023330 ALAS1 ALAS|ALAS-H|ALAS3|ALASH|MIG4 5'-aminolevulinate synthase 1 protein-coding 153.75-123 chr5 162127185 162127686 + 0.5 NA intron (NM_198904, intron 6 of 9) intron (NM_198904, intron 6 of 9) 59793 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 121.25-140 chr4 31139174 31139448 + 0.5 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -31833 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 133.5-173 chr4 30695267 30695694 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -24889 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 152 chr1 8972919 8973336 + 0.5 NA intron (NM_001270501, intron 6 of 6) AluSx|SINE|Alu 27259 NM_001215 765 Hs.100322 NM_001215 ENSG00000131686 CA6 CA-VI|GUSTIN carbonic anhydrase 6 protein-coding 142.5-44 chr11 82801224 82801539 + 0.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -67517 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 116.75-164 chr5 64319073 64319329 + 0.5 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) intron (NM_001113561, intron 5 of 7) 153358 NM_001323291 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 166.25-7 chr1 71748966 71749620 + 0.5 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) intron (NM_173808, intron 3 of 6) 87719 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 126-187 chrX 145736391 145736772 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -81248 NM_001144005 84631 Hs.106688 NM_032539 ENSG00000185985 SLITRK2 CXorf1|CXorf2|SLITL1|TMEM257 SLIT and NTRK like family member 2 protein-coding 126.75-24 chr10 91845264 91845687 + 0.5 NA intron (NM_025235, intron 17 of 26) intron (NM_025235, intron 17 of 26) 47049 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 130.5-129 chr2 44500635 44501053 + 0.5 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) AluSz|SINE|Alu 138897 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 128.5-40 chr11 46804402 46804691 + 0.5 NA intron (NM_001008938, intron 8 of 43) intron (NM_001008938, intron 8 of 43) 41734 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 157-61 chr2 142703328 142703701 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -174150 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 163.25-19 chr10 89472155 89472483 + 0.5 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 16328 NR_120614 101926906 Hs.568874 NR_120614 ENSG00000234452 SLC16A12-AS1 - SLC16A12 antisense RNA 1 ncRNA 154-88 chr22 41467440 41467820 + 0.5 NA intron (NM_032758, intron 2 of 3) intron (NM_032758, intron 2 of 3) 1062 NM_032758 84844 Hs.474980 NM_032758 ENSG00000100410 PHF5A INI|Rds3|SAP14b|SF3B7|SF3b14b|bK223H9.2 PHD finger protein 5A protein-coding 161.5-117 chr20 46824584 46824974 + 0.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -69845 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 144.5-173 chr5 80645718 80646270 + 0.5 NA intron (NM_000791, intron 3 of 5) intron (NM_000791, intron 3 of 5) 5014 NM_001190470 100462981 NM_001190470 MTRNR2L2 HN2 MT-RNR2 like 2 protein-coding 122-43 chr11 113322191 113322530 + 0.5 NA intron (NM_001318533, intron 2 of 21) L2b|LINE|L2 7777 NM_001352037 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 162-29 chr12 6264751 6265300 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45411 NM_018173 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 167-4 chr1 102404514 102404922 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -407484 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 132.25-30 chr10 57530861 57531144 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -226443 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 127-162 chr7 73510444 73510792 + 0.5 NA intron (NM_001370402, intron 2 of 18) intron (NM_001370402, intron 2 of 18) 11675 NM_032408 9031 Hs.743372 NM_023005 ENSG00000009954 BAZ1B WBSCR10|WBSCR9|WSTF bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B protein-coding 152-73 chr19 14402562 14403009 + 0.5 NA exon (NM_078481, exon 12 of 20) exon (NM_078481, exon 12 of 20) 16556 NM_005804 10212 Hs.311609 NM_005804 ENSG00000123136 DDX39A BAT1|BAT1L|DDX39|DDXL|URH49 DExD-box helicase 39A protein-coding 115.5-199 chr5 31523009 31523343 + 0.5 NA intron (NM_013235, intron 4 of 34) intron (NM_013235, intron 4 of 34) 8917 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 160-47 chr18 30417761 30418196 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 119068 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 117-157 chr6 50062815 50063054 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -13005 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 189-92 chr5 144763897 144764359 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 558737 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 133.75-207 chr9 120732700 120733117 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -18438 NM_001080497 1955 Hs.744903 NM_001080497 ENSG00000106780 MEGF9 EGFL5 multiple EGF like domains 9 protein-coding 146.25-114 chr5 18863217 18863770 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1022779 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 116.5-32 chr10 124487897 124488248 + 0.5 NA intron (NM_001318332, intron 2 of 5) intron (NM_001318332, intron 2 of 5) 26249 NM_001318331 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 146.5-208 chr7 48270003 48270370 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 16 of 61) MIRc|SINE|MIR 98728 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 128.75-158 chr5 133620516 133620979 + 0.5 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -8206 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 158-32 chr11 43944245 43944735 + 0.5 NA TTS (NM_001145033) TTS (NM_001145033) 1853 NM_001145033 387763 Hs.530443 NM_001145033 ENSG00000187479 C11orf96 AG2 chromosome 11 open reading frame 96 protein-coding 130.25-22 chr1 227076707 227077080 + 0.5 NA intron (NM_001366019, intron 17 of 36) intron (NM_001366019, intron 17 of 36) 136599 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 135.75-207 chr8 137967145 137967569 + 0.5 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 116188 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 141.25-144 chr5 138804967 138805504 + 0.5 NA intron (NM_001323985, intron 3 of 17) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -51311 NR_134244 105379194 Hs.445981 NR_134244 ENSG00000253404 LOC105379194 - uncharacterized LOC105379194 ncRNA 140-41 chr14 30180950 30181260 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -253258 NM_002742 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 136.25-126 chr3 186699279 186699689 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17875 NM_001102416 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 131.5-227 chr7 145023524 145023905 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -187661 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 116.25-171 chr5 3486382 3486732 + 0.5 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) L1MB5|LINE|L1 17447 NR_104618 102467075 Hs.652949 NR_104618 ENSG00000250716 LINC01017 - long intergenic non-protein coding RNA 1017 ncRNA 157.25-140 chr7 91695064 91695616 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 185362 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 144.25-187 chr7 43574710 43574999 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -8254 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 118.5-148 chr4 64959618 64959908 + 0.5 NA intron (NR_033976, intron 2 of 6) AluSx3|SINE|Alu 44737 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 126.25-65 chr17 5454377 5454850 + 0.5 NA intron (NM_001199699, intron 5 of 10) intron (NM_001199699, intron 5 of 10) 14369 NM_020162 56919 Hs.250456 NM_020162 ENSG00000005100 DHX33 DDX33 DEAH-box helicase 33 protein-coding 166.5-132 chr3 68531081 68531592 + 0.5 NA intron (NM_001252216, intron 3 of 4) MER50|LTR|ERV1 30699 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 131-172 chr8 81763698 81764158 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31480 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 124.5-240 chr9 70366183 70366626 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 48253 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 127.5-99 chr17 59239236 59239644 + 0.5 NA intron (NM_182569, intron 2 of 9) intron (NM_182569, intron 2 of 9) 18929 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 143-40 chr14 70717669 70718168 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19220 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 146.75-13 chr10 8156332 8156721 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 101838 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 130.25-160 chr5 84898358 84898718 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -513658 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 164.25-114 chr4 63725026 63725445 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 684215 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 138-71 chr19 47529001 47529406 + 0.5 NA intron (NM_001277075, intron 13 of 16) MIR|SINE|MIR -14140 NR_038457 8775 Hs.126938 NM_003827 ENSG00000105402 NAPA SNAPA NSF attachment protein alpha protein-coding 141.75-156 chr6 152254006 152254452 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 104 of 145) intron (NM_182961, intron 104 of 145) -68851 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 115-175 chr7 113350914 113351206 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -232478 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 126.75-211 chr6 12774600 12775040 + 0.5 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) 56121 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 135.5-83 chr18 10520886 10521366 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4901 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 116.5-253 chr8 117847616 117847901 + 0.5 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 73155 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 116.75-14 chr1 177430129 177430537 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 78747 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 123-150 chr4 126788617 126789106 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -844096 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 116-178 chr8 133103202 133103513 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001282964) promoter-TSS (NM_001282964) -755 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 125-157 chr8 86790006 86790404 + 0.5 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -46530 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 134.25-145 chr5 97638487 97638985 + 0.5 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) intron (NR_105028, intron 2 of 3) 134040 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 140.5-150 chr3 48144806 48145275 + 0.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 43377 NM_001789 993 Hs.437705 NM_001789 ENSG00000164045 CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25A protein-coding 137.5-140 chr20 34937356 34937728 + 0.5 NA intron (NM_000178, intron 6 of 12) intron (NM_000178, intron 6 of 12) 18093 NM_001322495 2937 Hs.82327 NM_000178 ENSG00000100983 GSS GSHS|HEL-S-64p|HEL-S-88n glutathione synthetase protein-coding 142.75-146 chr4 89070028 89070368 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -13013 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 115.25-186 chr7 42599454 42599851 + 0.5 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 106795 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 119.5-119 chr2 51236032 51236425 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 203627 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 189-86 chr4 161951352 161951762 + 0.5 NA intron (NM_001128428, intron 3 of 14) intron (NM_001128428, intron 3 of 14) -71176 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 200.75-75 chr4 73602687 73603164 + 0.5 NA intron (NM_001270391, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 17511 NM_177532 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 125.75-57 chr15 60400505 60400802 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2667 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 208.75-90 chr9 99043937 99044412 + 0.5 NA intron (NM_001855, intron 24 of 41) intron (NM_001855, intron 24 of 41) -60939 NM_001306210 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 143.75-184 chr8 76997895 76998324 + 0.5 NA intron (NM_001172086, intron 2 of 4) intron (NM_001172086, intron 2 of 4) 1969 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 114.25-118 chr22 26397904 26398173 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -31222 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 142-131 chr5 115045343 115045773 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 124350 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 114.75-170 chr7 8293223 8293589 + 0.5 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -30794 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 112.5-117 chr2 84365301 84365710 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 74823 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 160.25-53 chr17 51666093 51666455 + 0.5 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) intron (NM_001082533, intron 5 of 9) 230847 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 130.75-20 chr10 72227221 72227662 + 0.5 NA intron (NM_001242548, intron 2 of 2) intron (NM_001242548, intron 2 of 2) -10307 NM_001369085 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 135-18 chr10 83975354 83975744 + 0.5 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -163960 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 120-89 chr2 103707973 103708273 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 700209 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 120.75-146 chr6 74235880 74236202 + 0.5 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) L1MEg|LINE|L1 166590 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 164.25-4 chr1 48532285 48532701 + 0.5 NA TTS (NM_032785) TTS (NM_032785) -60285 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 116.75-120 chr3 33191097 33191522 + 0.5 NA intron (NM_015551, intron 3 of 4) AluY|SINE|Alu 27501 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 135.75-84 chr19 27781481 27781930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11726 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 133.5-75 chr14 32603334 32603818 + 0.5 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) MER5A|DNA|hAT-Charlie 274278 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 121-5 chr1 62460239 62460599 + 0.5 NA intron (NM_001367561, intron 48 of 49) MER2|DNA|TcMar-Tigger 23370 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 114.75-204 chr9 98879862 98880105 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -63924 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 181-48 chr19 23884322 23885041 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -30205 NM_001348688 730087 Hs.655305 NM_001190829 ENSG00000213967 ZNF726 ZNF92P3 zinc finger protein 726 protein-coding 154.75-28 chr12 90526419 90526786 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 233284 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 157-102 chr5 159092832 159093395 + 0.5 NA intron (NM_001324107, intron 4 of 15) intron (NM_001324107, intron 4 of 15) 4843 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 124-51 chr15 62635531 62635888 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 9472 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 116.25-139 chr3 52769740 52770057 + 0.5 NA intron (NM_003157, intron 1 of 15) L2|LINE|L2 1042 NM_001348413 6787 Hs.631921 NM_003157 ENSG00000114904 NEK4 NRK2|STK2|pp12301 NIMA related kinase 4 protein-coding 139.25-36 chr12 15495891 15496433 + 0.5 NA intron (NM_030667, intron 2 of 26) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50449 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 185-46 chr2 163757636 163758171 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21895 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 114.25-144 chr4 141730308 141730741 + 0.5 NA intron (NR_037840, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR 93941 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 124-10 chr1 200373313 200373652 + 0.5 NA intron (NR_040064, intron 1 of 4) intron (NR_040064, intron 1 of 4) 310 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 132.5-131 chr2 178273720 178274118 + 0.5 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) intron (NM_001201480, intron 1 of 25) -46323 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 135.75-13 chr1 170716454 170716876 + 0.5 NA intron (NM_022716, intron 1 of 3) intron (NM_022716, intron 1 of 3) 52534 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 200.75-41 chr18 7511626 7512391 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51002 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 115.5-49 chr13 25561098 25561558 + 0.5 NA intron (NM_016529, intron 15 of 36) HAL1|LINE|L1 92554 NM_001313741 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 132.5-242 chr8 98762599 98762922 + 0.5 NA intron (NM_006281, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 62911 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 177.25-147 chr9 132905196 132905683 + 0.5 NA intron (NM_000368, intron 15 of 22) intron (NM_000368, intron 15 of 22) 26541 NM_001316897 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 223.5-62 chr2 134932356 134933109 + 0.5 NA intron (NR_135468, intron 2 of 9) intron (NR_135468, intron 2 of 9) 13910 NM_001320748 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 113.5-36 chr10 85539643 85539991 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -37914 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-24 chr10 120519969 120520506 + 0.5 NA intron (NM_001318166, intron 4 of 5) intron (NM_001318166, intron 4 of 5) 63283 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 126.25-177 chr6 73945488 73945807 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -123804 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 164.75-129 chr6 148581013 148581461 + 0.5 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 72086 NM_001346509 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 115.5-71 chr14 82904310 82904734 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 261890 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 223.5-100 chr5 113585882 113586384 + 0.5 NA intron (NM_001345975, intron 25 of 28) L1ME2|LINE|L1 72439 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 133.5-166 chr3 105925359 105925794 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56175 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 125-28 chr11 29923782 29924254 + 0.5 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 58375 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 186-6 chr1 174396109 174396546 + 0.5 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) intron (NM_001366446, intron 13 of 25) -51637 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 145.75-8 chr1 208631801 208632262 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -96657 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 144.25-126 chr3 23165387 23165852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 36959 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 114.5-43 chr10 96579575 96579884 + 0.5 NA intron (NM_020123, intron 1 of 14) intron (NM_020123, intron 1 of 14) 7283 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 117.5-119 chr2 222115508 222115799 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -182494 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 122.75-64 chr17 42259631 42259938 + 0.5 NA intron (NM_012448, intron 1 of 18) AluSx1|SINE|Alu 16622 NM_012448 6777 Hs.595276 NM_012448 ENSG00000173757 STAT5B STAT5 signal transducer and activator of transcription 5B protein-coding 132.25-163 chr5 164469144 164469475 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_105065) promoter-TSS (NR_105065) -970 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 119-82 chr2 58814388 58814741 + 0.5 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 293811 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 142.75-71 chr16 57320843 57321313 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -36406 NM_015993 51090 Hs.632215 NM_015993 ENSG00000102934 PLLP PMLP|TM4SF11 plasmolipin protein-coding 116.25-40 chr11 81326777 81327117 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 563889 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 147.75-89 chr20 48689903 48690292 + 0.5 NA intron (NM_020820, intron 9 of 39) L2|LINE|L2 137902 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 132.5-208 chr6 38686556 38686911 + 0.5 NA intron (NM_006708, intron 2 of 5) intron (NM_006708, intron 2 of 5) 16412 NM_006708 2739 Hs.268849 NM_006708 ENSG00000124767 GLO1 GLOD1|GLYI|HEL-S-74 glyoxalase I protein-coding 120.5-41 chr11 74242119 74242508 + 0.5 NA intron (NM_016147, intron 9 of 13) L1MB8|LINE|L1 -69049 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 166.75-90 chr3 57724380 57724782 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31376 NR_135550 101929159 Hs.434396 NR_135550 ENSG00000241933 DENND6A-DT - DENND6A divergent transcript ncRNA 121.5-68 chr13 22783166 22783518 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 114839 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 134.75-163 chr4 107374363 107374756 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -338246 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 171.25-13 chr10 26727100 26727759 + 0.5 NA intron (NM_001321978, intron 8 of 9) intron (NM_001321978, intron 8 of 9) 29728 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 142.25-167 chr8 106359329 106359689 + 0.5 NA 5' UTR (NM_001198533, exon 2 of 17) 5' UTR (NM_001198533, exon 2 of 17) -88415 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 127.75-104 chr2 143840674 143841105 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -96178 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 121-42 chr11 76453331 76453666 + 0.5 NA intron (NM_020193, intron 4 of 20) intron (NM_020193, intron 4 of 20) 8473 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 168-12 chr10 45171468 45171995 + 0.5 NA intron (NR_033891, intron 3 of 7) intron (NR_033891, intron 3 of 7) 7717 NR_036112 100422988 NR_036112 ENSG00000263476 MIR3156-1 mir-3156-1 microRNA 3156-1 ncRNA 130.25-141 chr3 134175779 134176199 + 0.5 NA exon (NM_002958, exon 12 of 15) exon (NM_002958, exon 12 of 15) 74755 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 129-109 chr20 31321711 31321975 + 0.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -13258 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 118.5-202 chr7 107495910 107496265 + 0.5 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) L1MB1|LINE|L1 26030 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 123.25-112 chr2 209647480 209647870 + 0.5 NA intron (NM_001039538, intron 4 of 14) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 67996 NM_002374 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 124.75-76 chr14 48525459 48525807 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -730619 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 112.5-242 chr9 74436558 74436963 + 0.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -60575 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 120.75-159 chr7 81414469 81414871 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 147149 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 144.75-32 chr11 82583332 82583905 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 150246 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 153-103 chr4 30536207 30536695 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -183918 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 153.75-143 chr7 75713939 75714477 + 0.5 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) AluSx|SINE|Alu 24733 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 148.5-79 chr17 17571472 17571832 + 0.5 NA intron (NM_148173, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 5844 NM_148173 10400 Hs.714193 NM_007169 ENSG00000133027 PEMT PEAMT|PEMPT|PEMT2|PLMT|PNMT phosphatidylethanolamine N-methyltransferase protein-coding 166-94 chr5 19446102 19446591 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 439926 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 124.25-75 chr17 14380302 14380591 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 76706 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 153.25-23 chr11 8088369 8088886 + 0.5 NA intron (NM_177972, intron 1 of 11) intron (NM_177972, intron 1 of 11) 7265 NM_177972 7275 Hs.568986 NM_003320 ENSG00000166402 TUB RDOB|rd5 TUB bipartite transcription factor protein-coding 139-44 chr15 24877933 24878284 + 0.5 NA intron (NM_001349461, intron 1 of 12) intron (NM_001349461, intron 1 of 12) 21596 NM_001349461 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 158.5-28 chr10 84237288 84237899 + 0.5 NA exon (NM_015613, exon 2 of 4) exon (NM_015613, exon 2 of 4) 3953 NM_015613 26103 Hs.226000 NM_015613 ENSG00000148602 LRIT1 FIGLER9|LRRC21|PAL leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 1 protein-coding 127.5-133 chr2 210919884 210920336 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 302539 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 136-21 chr11 3913197 3913545 + 0.5 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 57309 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 172.5-116 chr22 29779342 29780004 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12304 NM_001003684 29796 Hs.284292 NM_013387 ENSG00000184076 UQCR10 HSPC051|HSPC119|HSPC151|QCR9|UCCR7.2|UCRC ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X protein-coding 113.75-209 chr9 137603592 137603907 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1891 NM_001317968 92714 Hs.12999 NM_152285 ENSG00000197070 ARRDC1 - arrestin domain containing 1 protein-coding 131.5-239 chr8 123511952 123512411 + 0.5 NA intron (NM_001242463, intron 4 of 6) intron (NM_001242463, intron 4 of 6) 19962 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 172-36 chr14 63714786 63715230 + 0.5 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 AluJb|SINE|Alu 13057 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 126.25-63 chr16 83959589 83959875 + 0.5 NA intron (NM_182981, intron 3 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 6492 NM_182981 29948 Hs.128055 NM_013370 ENSG00000140961 OSGIN1 BDGI|OKL38 oxidative stress induced growth inhibitor 1 protein-coding 155.75-21 chr10 78474905 78475348 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 207784 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 113.5-6 chr1 58755759 58756191 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28072 NM_002228 3725 Hs.696684 NM_002228 ENSG00000177606 JUN AP-1|AP1|c-Jun|p39 Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 188.25-115 chr8 85082227 85082730 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -24760 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 156.25-65 chr2 36620349 36620873 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22443 NM_001042548 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 122.75-9 chr1 81961813 81962122 + 0.5 NA intron (NM_001366002, intron 10 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 159514 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 188.25-125 chrX 89001839 89002561 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 254975 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 132.25-92 chr2 50853263 50853670 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -157204 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 144.75-135 chr5 67456983 67457422 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 189587 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 156.5-25 chr11 72817156 72817615 + 0.5 NA intron (NM_001318766, intron 2 of 17) AluSc|SINE|Alu 2974 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 113.5-234 chr8 90065193 90065519 + 0.5 NA intron (NM_001366795, intron 5 of 9) intron (NM_001366795, intron 5 of 9) 17523 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 113-13 chr1 204740106 204740542 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -54586 NM_006338 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 143.5-41 chr12 22639608 22640052 + 0.5 NA intron (NM_001039481, intron 1 of 2) L1MC5a|LINE|L1 14659 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 210.75-11 chr10 33929237 33929930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -156903 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 126.25-126 chr4 36487589 36487914 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61323 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 132.25-192 chr9 28228080 28228585 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L3|LINE|CR1 490973 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 115.5-43 chr12 102967449 102967778 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9172 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 112.75-63 chr14 70611023 70611407 + 0.5 NA non-coding (NR_110071, exon 3 of 3) non-coding (NR_110071, exon 3 of 3) -10525 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 142.5-183 chr6 4390438 4390873 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -98143 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 140.5-178 chr5 36937751 36938248 + 0.5 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 61230 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 193.25-66 chr22 26976845 26977606 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 73933 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 164-92 chr4 107690172 107690556 + 0.5 NA intron (NM_005443, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 29870 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 118.25-16 chr1 150567674 150568087 + 0.5 NA intron (NR_104133, intron 2 of 3) intron (NR_104133, intron 2 of 3) 6672 NR_104133 574406 Hs.516243 NM_001025493 ENSG00000203804 ADAMTSL4-AS1 C1orf138 ADAMTSL4 antisense RNA 1 ncRNA 116.5-47 chr12 21051261 21051591 + 0.5 NA intron (NM_001009562, intron 8 of 12) intron (NM_001009562, intron 8 of 12) 35730 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 114-104 chr3 97489304 97489618 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 10 of 17) AluY|SINE|Alu 49854 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 145-25 chr10 50244228 50244552 + 0.5 NA intron (NM_001143974, intron 2 of 18) intron (NM_001143974, intron 2 of 18) 4220 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 142-71 chr18 4854449 4854879 + 0.5 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -226518 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 132-175 chr8 90611199 90611635 + 0.5 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -5354 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 119.75-56 chr14 22809482 22809814 + 0.5 NA intron (NM_001126105, intron 3 of 10) AluSx1|SINE|Alu 5787 NR_040448 9056 Hs.513147 NM_003982 ENSG00000155465 SLC7A7 LAT3|LPI|MOP-2|Y+LAT1|y+LAT-1 solute carrier family 7 member 7 protein-coding 168.5-58 chr15 88381914 88382442 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 85210 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 117.75-48 chr12 117096327 117096687 + 0.5 NA intron (NR_031766, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 2909 NR_031766 54997 Hs.525709 NM_017899 ENSG00000088992 TESC CHP3|TSC tescalcin protein-coding 134-15 chr10 13020818 13021114 + 0.5 NA intron (NM_001282658, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 -19253 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 123.75-190 chr8 95049851 95050262 + 0.5 NA intron (NR_148914, intron 8 of 11) intron (NR_148914, intron 8 of 11) -22858 NR_036105 100422964 NR_036105 ENSG00000283522 MIR3150A MIR3150|mir-3150a microRNA 3150a ncRNA 177.75-18 chr10 93372871 93373439 + 0.5 NA intron (NM_013451, intron 23 of 53) intron (NM_013451, intron 23 of 53) 109179 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 152.25-155 chr8 83837375 83837695 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -345252 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 120.25-89 chr2 28089527 28089869 + 0.5 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) MIRb|SINE|MIR 93331 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 118.25-190 chr7 108473669 108474059 + 0.5 NA intron (NM_001256010, intron 9 of 9) AluJo|SINE|Alu -17144 NM_001371119 113-52 chr12 41711981 41712245 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52076 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 113-72 chr17 34445827 34446186 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -82773 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 120.5-42 chr11 81675346 81675611 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 215358 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 131.5-157 chr3 105153129 105153490 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -213404 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 125.5-238 chr7 121094912 121095217 + 0.5 NA intron (NM_001105533, intron 4 of 17) intron (NM_001105533, intron 4 of 17) 105673 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 141.75-80 chr18 12412515 12413028 + 0.5 NA intron (NM_001142405, intron 1 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 4842 NM_006553 10650 Hs.514718 NM_006553 ENSG00000141391 PRELID3A C18orf43|HFL-EDDG1|SLMO1 PRELI domain containing 3A protein-coding 124.5-129 chr20 50499279 50499687 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -10838 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 163-91 chr5 14300748 14301172 + 0.5 NA intron (NM_007118, intron 7 of 56) intron (NM_007118, intron 7 of 56) 157618 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 147.5-183 chr6 28223305 28223805 + 0.5 NA Intergenic Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -1720 NM_006299 7746 Hs.100921 NM_006299 ENSG00000137185 ZSCAN9 PRD51|ZNF193 zinc finger and SCAN domain containing 9 protein-coding 135.75-44 chr12 38605411 38605748 + 0.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 288805 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 118.5-66 chr16 12924394 12924685 + 0.5 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 22941 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 144-91 chr4 39167731 39168197 + 0.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -14565 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 121.5-168 chr3 511070 511511 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80815 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 112.5-166 chr3 46196345 46196763 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 11759 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 112.75-22 chr10 26473752 26474165 + 0.5 NA intron (NM_019043, intron 2 of 14) AluSz6|SINE|Alu 35617 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 133.75-43 chr12 122427898 122428392 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5476 NM_198240 6249 Hs.524809 NM_002956 ENSG00000130779 CLIP1 CLIP|CLIP-170|CLIP170|CYLN1|RSN CAP-Gly domain containing linker protein 1 protein-coding 115.75-145 chr3 103178033 103178416 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 345892 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 120.5-97 chr17 49726806 49727240 + 0.5 NA intron (NM_030802, intron 2 of 7) intron (NM_030802, intron 2 of 7) -19059 NM_005827 10237 Hs.154073 NM_005827 ENSG00000121073 SLC35B1 UGTREL1 solute carrier family 35 member B1 protein-coding 133-122 chr4 49146892 49147376 + 0.5 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 160492 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 175-94 chr5 12651270 12651944 + 0.5 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) intron (NR_033383, intron 2 of 3) -16252 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 127.75-139 chr4 23136341 23136716 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 422439 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 155.75-129 chr5 17021044 17021520 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84994 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 119.75-67 chr15 79916744 79917183 + 0.5 NA intron (NR_037653, intron 1 of 2) HERVI-int|LTR|ERV1 -5808 NR_028330 283687 Hs.722219 NM_175898 ST20-AS1 C15orf37 ST20 antisense RNA 1 ncRNA 140.25-136 chr4 107874929 107875270 + 0.5 NA intron (NR_125929, intron 3 of 6) intron (NR_125929, intron 3 of 6) -18165 NM_001136257 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 138.25-108 chr22 48077363 48077894 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -196736 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 153.5-36 chr11 102768275 102768762 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 12110 NM_002425 4319 Hs.2258 NM_002425 ENSG00000166670 MMP10 SL-2|STMY2 matrix metallopeptidase 10 protein-coding 143.25-95 chr2 194098618 194099020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -245450 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 119-124 chr3 122322567 122322917 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2506 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 146.75-89 chr20 43493765 43494235 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13697 NM_032107 26013 Hs.709356 NM_015478 ENSG00000185513 L3MBTL1 H-L(3)MBT|L3MBTL|ZC2HC3|dJ138B7.3 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 1 protein-coding 170-100 chr8 139840444 139840908 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -137553 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 116-171 chr8 115325709 115326075 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 342121 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 132.75-74 chr16 13599695 13600003 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -320308 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 137.25-66 chr2 43459050 43459373 + 0.5 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) intron (NM_001083953, intron 26 of 37) 136763 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 132.75-116 chr21 31012949 31013428 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25288 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 137.5-226 chr7 112439615 112440163 + 0.5 NA intron (NM_001197080, intron 1 of 11) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -10539 NM_001550 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 156.5-22 chr11 5289973 5290378 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11771 NM_033179 79339 Hs.679499 NM_033179 ENSG00000183251 OR51B4 HOR5'Beta1 olfactory receptor family 51 subfamily B member 4 protein-coding 192.25-14 chr10 86214810 86215563 + 0.5 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 49602 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 125.5-36 chr10 115548693 115549019 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 25 of 28) MER20|DNA|hAT-Charlie 455491 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 117.25-67 chr14 51181657 51182005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58416 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 120.5-12 chr1 119427491 119427868 + 0.5 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 12529 NM_000198 3284 Hs.654399 NM_000198 ENSG00000203859 HSD3B2 HSD3B|HSDB|SDR11E2 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 protein-coding 141.5-135 chr22 36572433 36572888 + 0.5 NA intron (NM_006078, intron 2 of 3) AluSz|SINE|Alu -43494 NM_003753 8664 Hs.55682 NM_003753 ENSG00000100353 EIF3D EIF3S7|eIF3-p66|eIF3-zeta eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D protein-coding 161.25-151 chr6 50128052 50128539 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -78366 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 117.25-23 chr10 9260097 9260497 + 0.5 NA intron (NR_120635, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 -15316 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 117.75-106 chr2 96216231 96216553 + 0.5 NA intron (NR_046322, intron 1 of 3) MER2|DNA|TcMar-Tigger 1753 NR_145789 109623481 NR_145789 SNORA112 - small nucleolar RNA, H/ACA box 112 snoRNA 113.75-204 chr9 29658918 29659279 + 0.5 NA Intergenic HERVK14-int|LTR|ERVK -445497 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 152.25-146 chr7 24725987 24726326 + 0.5 NA intron (NM_004403, intron 3 of 9) intron (NM_004403, intron 3 of 9) 31308 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 131.75-105 chr2 29826108 29826487 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 95289 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 139.5-216 chr8 105457234 105457694 + 0.5 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 137921 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 149.5-56 chr14 43348434 43348822 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1158655 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 122-76 chr18 6096223 6096681 + 0.5 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) intron (NM_001365769, intron 14 of 16) -160292 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 115.25-36 chr11 41286446 41286850 + 0.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 172988 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 136-91 chr20 62490984 62491337 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -15165 NM_080473 140628 Hs.352250 NM_080473 ENSG00000130700 GATA5 CHTD5|GATAS|bB379O24.1 GATA binding protein 5 protein-coding 176-25 chr15 42750823 42751414 + 0.5 NA intron (NM_173500, intron 14 of 14) L1M4c|LINE|L1 -13990 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 118.5-49 chr13 73255803 73256190 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 196991 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 158.25-148 chr8 120022720 120023289 + 0.5 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -102098 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 120.25-22 chr10 6417786 6418147 + 0.5 NA intron (NM_001323267, intron 17 of 17) intron (NM_001323267, intron 17 of 17) 67650 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 143.75-203 chr9 129156976 129157374 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 21086 NM_203434 389792 Hs.529857 NM_203434 ENSG00000188483 IER5L bA247A12.2 immediate early response 5 like protein-coding 126.75-22 chr10 75795051 75795456 + 0.5 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) AluSg|SINE|Alu 12492 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 173.75-10 chr1 116269719 116270238 + 0.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -103266 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 138.75-45 chr13 64476798 64477151 + 0.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -400963 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 112.25-165 chr5 65667235 65667565 + 0.5 NA 3' UTR (NM_019072, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_019072, exon 11 of 11) 42373 NM_024941 80006 Hs.591760 NM_024941 ENSG00000113597 TRAPPC13 C5orf44|SHLD3 trafficking protein particle complex 13 protein-coding 131.25-107 chr2 125457869 125458255 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 659923 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 122-137 chr5 44690434 44690785 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 118184 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 177.5-33 chr12 15921298 15921769 + 0.5 NA intron (NM_015954, intron 1 of 8) intron (NM_015954, intron 1 of 8) 10201 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 131.75-98 chr18 21107481 21108004 + 0.5 NA intron (NM_005406, intron 1 of 32) intron (NM_005406, intron 1 of 32) 4071 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 151-140 chr9 73630134 73630507 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 478455 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 154.5-154 chr6 3914121 3914573 + 0.5 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 64974 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 184.5-96 chr22 42628585 42629119 + 0.5 NA intron (NM_007326, intron 4 of 8) intron (NM_007326, intron 4 of 8) 11749 NM_001165877 267020 Hs.664737 NM_001165877 ENSG00000249222 ATP5MGL ATP5K2|ATP5L2 ATP synthase membrane subunit g like protein-coding 149.75-64 chr17 60474747 60475065 + 0.5 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) intron (NM_006380, intron 4 of 12) 51334 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 123.5-160 chr5 38107489 38107932 + 0.5 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -40770 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 126.25-91 chr2 108591005 108591412 + 0.5 NA intron (NM_001193488, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 2902 NM_004987 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 210.5-26 chr12 80256618 80257206 + 0.5 NA intron (NM_001368062, intron 22 of 62) L2c|LINE|L2 47459 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 128-130 chr5 148709399 148709826 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -55085 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 127.75-40 chr11 10679225 10679557 + 0.5 NA intron (NM_130385, intron 1 of 20) L1MB5|LINE|L1 14183 NM_001100167 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 149.5-206 chr8 100988937 100989416 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35794 NM_003406 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 118.25-145 chr5 5099329 5099702 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21204 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 113.5-37 chr10 97593357 97593748 + 0.5 NA intron (NM_001134670, intron 1 of 2) intron (NM_001134670, intron 1 of 2) 3831 NM_001009997 414157 Hs.662302 NM_001009997 ENSG00000203942 C10orf62 bA548K23.1 chromosome 10 open reading frame 62 protein-coding 151.25-85 chr2 64555129 64555563 + 0.5 NA intron (NM_001002243, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 29833 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 131.75-221 chr8 129494480 129494786 + 0.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -10491 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 165.5-79 chr2 79908727 79909244 + 0.5 NA intron (NM_001282598, intron 6 of 17) intron (NM_001282598, intron 6 of 17) -42402 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 160.5-61 chr15 52797975 52798341 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7822 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 132.25-29 chr10 22786863 22787206 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -72456 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 150-133 chr7 90812866 90813285 + 0.5 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) L1ME1|LINE|L1 103259 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 154.75-106 chr4 4723781 4724258 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37741 NR_125892 101928279 Hs.586152 NR_125892 LOC101928279 - uncharacterized LOC101928279 ncRNA 133.75-113 chr20 20807995 20808371 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95539 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 199.25-83 chr5 96695290 96696058 + 0.5 NA intron (NM_001330629, intron 2 of 30) intron (NM_001330629, intron 2 of 30) -6986 NM_001042443 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 123.5-179 chr5 174204105 174204471 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -132066 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 140.75-87 chr2 72682029 72682487 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 143775 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 129.25-217 chr9 71062939 71063314 + 0.5 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 58495 NM_001366150 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 116.5-273 chrX 57285951 57286277 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_174912) promoter-TSS (NM_174912) -563 NM_001353840 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 130-119 chr4 84973556 84974066 + 0.5 NA intron (NR_152782, intron 2 of 3) intron (NR_152782, intron 2 of 3) 6327 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 127-33 chr11 73612364 73612668 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -14404 NM_001286051 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 118-25 chr11 38314775 38315177 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 331380 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 117.25-182 chr6 45356657 45356986 + 0.5 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) intron (NM_001015051, intron 2 of 7) 20697 NR_146635 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 120.25-222 chr9 24811506 24811958 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -265835 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 215-27 chr15 75663706 75664342 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 15017 NM_153271 257364 Hs.8705 NM_153271 ENSG00000173548 SNX33 SH3PX3|SH3PXD3C|SNX30 sorting nexin 33 protein-coding 115.75-14 chr10 29704840 29705260 + 0.5 NA intron (NM_001323599, intron 1 of 38) intron (NM_001323599, intron 1 of 38) 30751 NM_003174 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 130.5-148 chr20 9488229 9488745 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25871 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 140.5-94 chr19 28035470 28035817 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -241703 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 118.5-141 chr3 193737898 193738327 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 105897 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 132.25-195 chr9 98876730 98877192 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -66946 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 131-18 chr10 42657921 42658324 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -19285 NR_130949 7582 Hs.435774 NM_006955 ENSG00000196693 ZNF33B KOX2|KOX31|ZNF11B zinc finger protein 33B protein-coding 149.5-111 chr20 64072894 64073216 + 0.5 NA TTS (NM_001039467) TTS (NM_001039467) 3955 NR_106871 102466741 NR_106871 ENSG00000274034 MIR6813 hsa-mir-6813 microRNA 6813 ncRNA 113.5-85 chr15 65487797 65488162 + 0.5 NA intron (NR_135485, intron 6 of 20) intron (NR_135485, intron 6 of 20) 29295 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 116-130 chr5 120125469 120125834 + 0.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -338627 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 140.25-109 chr21 17104291 17104645 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -334422 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 126.25-197 chr8 32658683 32659115 + 0.5 NA intron (NM_001322205, intron 1 of 8) intron (NM_001322205, intron 1 of 8) 11810 NM_001322207 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 181-34 chr16 1698536 1699233 + 0.5 NA exon (NM_144570, exon 5 of 5) exon (NM_144570, exon 5 of 5) -7299 NM_001318852 23162 Hs.207763 NM_015133 ENSG00000138834 MAPK8IP3 JIP-3|JIP3|JSAP1|NEDBA|SYD2|syd mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 3 protein-coding 133-4 chr1 61556929 61557292 + 0.5 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -97132 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 120.25-43 chr11 118769773 118770129 + 0.5 NA intron (NM_001257191, intron 4 of 13) AluY|SINE|Alu 20997 NM_001257191 1656 Hs.408461 NM_004397 ENSG00000110367 DDX6 HLR2|P54|RCK DEAD-box helicase 6 protein-coding 141.75-150 chr6 34892012 34892383 + 0.5 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 2942 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 153-135 chr6 145274521 145275052 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 412091 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 117.75-64 chr15 61534890 61535268 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -194839 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 155-67 chr2 123222010 123222485 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -148766 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 143.5-207 chr8 57107788 57108290 + 0.5 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -110237 NR_038235 100507651 Hs.371831 NR_038235 ENSG00000253301 LINC01606 - long intergenic non-protein coding RNA 1606 ncRNA 132.5-234 chr8 35279163 35279592 + 0.5 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) 43902 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 121.25-8 chr1 114004948 114005382 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25691 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 112.25-127 chr3 59869883 59870235 + 0.5 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR 210850 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 149.25-61 chr17 47365174 47365685 + 0.5 NA intron (NM_152347, intron 10 of 24) LTR85c|LTR|Gypsy? 41474 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 186.5-61 chr2 47675165 47675732 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -105117 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 137.5-52 chr12 51988177 51988616 + 0.5 NA intron (NM_004302, intron 7 of 8) AluSc|SINE|Alu -18550 NM_181711 160622 Hs.407202 NM_181711 ENSG00000161835 GRASP TAMALIN general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein protein-coding 125.5-78 chr14 54439210 54439658 + 0.5 NA intron (NM_005776, intron 1 of 4) intron (NM_005776, intron 1 of 4) 1940 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 117.25-116 chr2 112147788 112148219 + 0.5 NA intron (NM_001128165, intron 1 of 6) intron (NM_001128165, intron 1 of 6) 9618 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 139.75-120 chr3 47786193 47786740 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4573 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 125-5 chr1 70197235 70197530 + 0.5 NA intron (NM_017768, intron 1 of 14) AluJo|SINE|Alu 8197 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 140.25-130 chr4 67779349 67779657 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23417 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 124-145 chr6 44014549 44015038 + 0.5 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu -11143 NR_125865 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 148.5-28 chr10 73442748 73443173 + 0.5 NA TTS (NM_001289969) TTS (NM_001289969) -9399 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 119.25-73 chr16 81334756 81335157 + 0.5 NA intron (NM_022041, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 19990 NM_022041 8139 Hs.112569 NM_022041 ENSG00000261609 GAN GAN1|KLHL16 gigaxonin protein-coding 122.5-147 chr3 49981864 49982155 + 0.5 NA intron (NM_001349190, intron 4 of 18) intron (NM_001349190, intron 4 of 18) 41859 NM_001349191 10180 Hs.696735 NM_005777 ENSG00000004534 RBM6 3G2|DEF-3|DEF3|HLC-11|NY-LU-12|g16 RNA binding motif protein 6 protein-coding 113-31 chr10 102883759 102884119 + 0.5 NA intron (NM_020682, intron 9 of 10) L1MA8|LINE|L1 14469 NM_020682 57412 Hs.720370 NM_020682 ENSG00000214435 AS3MT CYT19 arsenite methyltransferase protein-coding 117-173 chr7 77559760 77560210 + 0.5 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 21942 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 129.75-48 chr12 40567110 40567437 + 0.5 NA intron (NM_173600, intron 170 of 173) intron (NM_173600, intron 170 of 173) -125166 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 123-142 chr3 197372773 197373187 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -73659 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 140.75-97 chr2 137305737 137306200 + 0.5 NA intron (NM_001316349, intron 12 of 27) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 540423 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 147.75-61 chr2 25544407 25544848 + 0.5 NA intron (NM_033147, intron 8 of 19) intron (NM_033147, intron 8 of 19) 105595 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 164-45 chr16 8634865 8635311 + 0.5 NA intron (NM_024109, intron 4 of 10) intron (NM_024109, intron 4 of 10) 13390 NM_024109 79091 Hs.306380 NM_024109 ENSG00000067365 METTL22 C16orf68 methyltransferase like 22 protein-coding 157.75-144 chr5 157076116 157076527 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17205 NM_001173393 26762 Hs.129711 NM_012206 ENSG00000113249 HAVCR1 CD365|HAVCR|HAVCR-1|KIM-1|KIM1|TIM|TIM-1|TIM1|TIMD-1|TIMD1 hepatitis A virus cellular receptor 1 protein-coding 219-26 chr12 117870905 117871587 + 0.5 NA intron (NM_173598, intron 1 of 19) MIRb|SINE|MIR 97744 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 129.5-117 chr2 58816421 58816926 + 0.5 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) LTR85c|LTR|Gypsy? 295920 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 133.25-150 chr4 63024881 63025399 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -863375 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-186 chr7 77556066 77556349 + 0.5 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) AluJr|SINE|Alu 18164 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 122.75-4 chr1 47298424 47298800 + 0.5 NA intron (NM_001282938, intron 8 of 18) intron (NM_001282938, intron 8 of 18) 15535 NM_001282936 6491 Hs.525198 NM_003035 ENSG00000123473 STIL MCPH7|SIL STIL centriolar assembly protein protein-coding 159.25-77 chr22 24777675 24778015 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3125 NR_045649 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 133.25-127 chr22 46656825 46657313 + 0.5 NA intron (NM_015124, intron 3 of 18) intron (NM_015124, intron 3 of 18) 36683 NM_015124 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 128.25-139 chr3 189617537 189618003 + 0.5 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -13619 NM_001329144 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 161.25-108 chr21 31101646 31102086 + 0.5 NA Intergenic LTR1F1|LTR|ERV1 59074 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 129-13 chr1 201201197 201201493 + 0.5 NA intron (NM_001164586, intron 8 of 23) L3b|LINE|CR1 10520 NM_001164586 91156 Hs.519024 NM_178275 ENSG00000163395 IGFN1 EEF1A2BP1 immunoglobulin like and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 113.25-107 chr3 45329263 45329577 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -59156 NM_015340 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 112.5-50 chr12 26800001 26800390 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 1 of 56) L1MEb|LINE|L1 32999 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 146.75 chr1 44189354 44189767 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23911 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 139.25-30 chr11 50521415 50521782 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 112451 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 127.5-140 chr21 22378506 22378875 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 280073 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 165-100 chr4 11853429 11853864 + 0.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 70468 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 126.25-5 chr1 69010701 69011028 + 0.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -45034 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 165-55 chr17 48477445 48477945 + 0.5 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 32862 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 120.25-112 chr20 43623370 43623752 + 0.5 NA intron (NM_001323578, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 32624 NM_001323580 51098 Hs.444332 NM_016004 ENSG00000101052 IFT52 C20orf9|CGI-53|NGD2|NGD5 intraflagellar transport 52 protein-coding 194.5-107 chr4 72218633 72219233 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 179801 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 117-142 chr5 13590805 13591060 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 353548 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 131.75-69 chr14 74932341 74932777 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9299 NM_001370258 83694 Hs.414481 NM_031464 ENSG00000198208 RPS6KL1 RSKL2 ribosomal protein S6 kinase like 1 protein-coding 144-10 chr1 164637033 164637455 + 0.5 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 77522 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 134.25-67 chr18 41985515 41985944 + 0.5 NA intron (NM_001308020, intron 3 of 23) intron (NM_001308020, intron 3 of 23) 30495 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 148.75-22 chr10 48446212 48446630 + 0.5 NA non-coding (NR_144645, exon 10 of 10) non-coding (NR_144645, exon 10 of 10) 44809 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 147.5-104 chr2 109207305 109207703 + 0.5 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -65916 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 192.5-81 chr2 233323787 233324410 + 0.5 NA intron (NM_000541, intron 6 of 15) L2a|LINE|L2 16282 NM_000541 6295 Hs.32721 NM_000541 ENSG00000130561 SAG RP47|S-AG S-antigen visual arrestin protein-coding 164.75-63 chr17 60036486 60036990 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 6367 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 158.75-14 chr10 21450032 21450507 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 46372 NR_031736 100302129 NR_031736 ENSG00000222071 MIR1915 MIRN1915|hsa-mir-1915 microRNA 1915 ncRNA 151.5-121 chr3 104144057 104144575 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -620200 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 137.5-232 chr8 52317308 52317712 + 0.5 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -63018 NM_001352841 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 144.5-235 chr9 77880531 77881055 + 0.5 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) 151018 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 124.75-117 chr2 105415932 105416360 + 0.5 NA intron (NM_201557, intron 1 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -16479 NM_001318894 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 146.75-75 chr2 71281277 71281689 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -50272 NM_001252612 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 123.75-150 chr5 120384338 120384713 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -79753 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 146.25-117 chr5 38791270 38791574 + 0.5 NA intron (NR_109951, intron 2 of 3) intron (NR_109951, intron 2 of 3) 54407 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 128.25-227 chrX 10629085 10629582 + 0.5 NA intron (NM_033290, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu -8748 NM_033289 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 119.5-147 chr3 23371878 23372325 + 0.5 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 168774 NM_001370228 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 123.25-96 chr2 43344216 43344510 + 0.5 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 117152 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 138-40 chr14 57617864 57618242 + 0.5 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -124196 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 154.75-124 chr6 45637925 45638291 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 215833 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 129-169 chr7 48354932 48355332 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 31 of 61) L2a|LINE|L2 183674 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 122.75-194 chr8 41465779 41466191 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -24411 NM_001362979 51125 Hs.654773 NM_016099 ENSG00000147533 GOLGA7 GCP16|GOLGA3AP1|GOLGA7A|HSPC041 golgin A7 protein-coding 128.5-108 chr2 61215268 61215739 + 0.5 NA intron (NM_014709, intron 67 of 79) intron (NM_014709, intron 67 of 79) 38085 NR_152210 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 127-109 chr20 35920833 35921160 + 0.5 NA intron (NM_016436, intron 13 of 17) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 33630 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 115.5-169 chr3 110856629 110856901 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 213194 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 194-42 chr19 28343502 28343954 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -262960 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 138-109 chr3 168342015 168342356 + 0.5 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) MER20|DNA|hAT-Charlie 92663 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 131.5-196 chr5 167918994 167919340 + 0.5 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 164238 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 118.75-126 chr3 66293687 66293959 + 0.5 NA intron (NM_001350992, intron 4 of 8) L1PA13|LINE|L1 72820 NM_001350991 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 114.25-178 chr7 41747607 41747977 + 0.5 NA intron (NR_027118, intron 2 of 3) MER41-int|LTR|ERV1 -44702 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 144.25-101 chr2 126322076 126322447 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -204276 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 137.75-165 chr5 110536822 110537182 + 0.5 NA intron (NM_001039763, intron 11 of 13) HERV4_I-int|LTR|ERV1 -23087 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 125.5-270 chr9 90137260 90137722 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -95992 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 151.5-153 chr5 87437199 87437683 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -24408 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 162.75-117 chr5 77454810 77455341 + 0.5 NA intron (NM_018268, intron 5 of 12) L1MB8|LINE|L1 37241 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 144-11 chr1 186653221 186653670 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26978 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 162-125 chr8 140533173 140533673 + 0.5 NA intron (NM_001164623, intron 16 of 17) intron (NM_001164623, intron 16 of 17) 21427 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 126.75-239 chr8 78839436 78839846 + 0.5 NA non-coding (NR_157588, exon 1 of 1) non-coding (NR_157588, exon 1 of 1) 2112 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 138.75-104 chr2 240299233 240299585 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -136254 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 150.25-80 chr2 155991013 155991407 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 263721 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 157-64 chr2 177138812 177139281 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 73365 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 122-107 chr20 4597507 4597888 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -88759 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 148.5-130 chr21 44093516 44093958 + 0.5 NA intron (NM_001351709, intron 12 of 15) AluSx3|SINE|Alu -13662 NM_005049 5822 Hs.449076 NM_005049 ENSG00000241945 PWP2 EHOC-17|PWP2H|UTP1 PWP2 small subunit processome component protein-coding 113-145 chr5 51236228 51236488 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 146974 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 136.25-189 chr8 126536072 126536604 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 22140 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 115.25-142 chr4 38562190 38562631 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1593 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 165.5-2 chr1 39255890 39256327 + 0.5 NA intron (NM_012090, intron 4 of 92) intron (NM_012090, intron 4 of 92) -152965 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 163-33 chr13 66563679 66564204 + 0.5 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 -261228 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 177.25-24 chr10 114606267 114606802 + 0.5 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) 7202 NM_001352442 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 157.5-30 chr10 106454571 106455012 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 314626 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 189.25-32 chr14 35615769 35616276 + 0.5 NA intron (NM_014990, intron 34 of 40) intron (NM_014990, intron 34 of 40) 81858 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 134.25-200 chr9 79364228 79364623 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -207348 NM_001282760 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 123-204 chrX 43313152 43313486 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 136325 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 122.25-25 chr10 80661214 80661564 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11592 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 140.25-164 chr6 51479775 51480129 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -141918 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 164.5-152 chr5 3459843 3460225 + 0.5 NA intron (NR_147000, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 7218 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 112.5-67 chr13 102278914 102279188 + 0.5 NA intron (NM_001321940, intron 1 of 5) intron (NM_001321940, intron 1 of 5) 31635 NM_001321932 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 174.5-114 chr22 23761737 23762202 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1045 NM_001331041 150248 Hs.116254 NM_182520 ENSG00000169314 C22orf15 N27C7-3 chromosome 22 open reading frame 15 protein-coding 117.75-147 chr3 197200249 197200550 + 0.5 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) -16268 NM_001204387 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 134-173 chr8 125813633 125814065 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 137348 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 128-102 chr3 78032029 78032516 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 16691 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 148-99 chr5 33713747 33714266 + 0.5 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) intron (NM_001324512, intron 3 of 21) 177984 NM_030955 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 122.25-90 chr2 99053138 99053519 + 0.5 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1MA9|LINE|L1 87852 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 115.5-17 chr1 201520823 201521233 + 0.5 NA TTS (NR_026667) TTS (NR_026667) 1124 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 151-120 chr6 118683618 118684015 + 0.5 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) 26259 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 128.5-105 chr2 53959842 53960160 + 0.5 NA intron (NM_014614, intron 1 of 46) intron (NM_014614, intron 1 of 46) 10992 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 118-176 chr7 123769475 123769805 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -20637 NM_003941 8976 Hs.143728 NM_003941 ENSG00000106299 WASL N-WASP|NWASP|WASPB WASP like actin nucleation promoting factor protein-coding 192-46 chr14 73495737 73496254 + 0.5 NA intron (NM_001220484, intron 15 of 17) AluSz6|SINE|Alu 5062 NM_024644 79697 Hs.509916 NM_024644 ENSG00000170468 RIOX1 C14orf169|JMJD9|MAPJD|NO66|ROX|URLC2|hsNO66 ribosomal oxygenase 1 protein-coding 122.5-201 chr6 123734773 123735092 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -68914 NM_001300738 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 166-101 chr5 85503098 85503713 + 0.5 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 -779039 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 154.25-146 chr6 134998437 134998915 + 0.5 NA intron (NM_006620, intron 5 of 17) intron (NM_006620, intron 5 of 17) -19244 NR_037435 100500880 NR_037435 ENSG00000283409 MIR3662 mir-3662 microRNA 3662 ncRNA 137-139 chr5 74092513 74092920 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 215609 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 116.75-17 chr1 220350995 220351398 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -78743 NM_012414 25782 Hs.654849 NM_012414 ENSG00000118873 RAB3GAP2 RAB3-GAP150|RAB3GAP150|SPG69|WARBM2|p150 RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2 protein-coding 161.25-44 chr13 67089242 67089699 + 0.5 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) 98584 NR_046637 100874087 Hs.606903 NR_046637 ENSG00000233840 PCDH9-AS4 - PCDH9 antisense RNA 4 ncRNA 141.5-182 chr5 116669183 116669683 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 92776 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 119.5-167 chr4 89405477 89405934 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -97905 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 167-92 chr5 19341084 19341689 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 544886 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 121.25-89 chr2 36755460 36755879 + 0.5 NA intron (NM_001177969, intron 5 of 14) L1MC4|LINE|L1 58962 NM_001177970 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 141.25-101 chr21 27722978 27723400 + 0.5 NA intron (NR_024357, intron 1 of 3) MER50-int|LTR|ERV1 810 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 175.5-149 chr7 93421921 93422389 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 60700 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 113.75-19 chr1 239673799 239674191 + 0.5 NA intron (NM_001347716, intron 4 of 7) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 44922 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 199.75-26 chr14 64079208 64079907 + 0.5 NA intron (NM_015180, intron 55 of 114) intron (NM_015180, intron 55 of 114) 15568 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 166-106 chr6 28360316 28360768 + 0.5 NA intron (NM_024493, intron 2 of 5) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -4271 NM_001135215 64288 Hs.656413 NM_030899 ENSG00000235109 ZSCAN31 ZNF20-Lp|ZNF310P|ZNF323 zinc finger and SCAN domain containing 31 protein-coding 113.5-20 chr1 186969681 186969921 + 0.5 NA intron (NM_024420, intron 15 of 17) L1MA4|LINE|L1 -123041 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 166.75-107 chr4 108114649 108115112 + 0.5 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 51917 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 139.25-160 chr5 179180878 179181365 + 0.5 NA exon (NM_021599, exon 5 of 11) exon (NM_021599, exon 5 of 11) 120748 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 131.75-212 chr8 78216660 78217184 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -299418 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 123.5-75 chr16 84800388 84800695 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19444 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 117.5-220 chr7 52794587 52794869 + 0.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -240905 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 141.75-91 chr2 70294544 70294952 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001317171) promoter-TSS (NM_001317171) -977 NM_001317165 6637 Hs.465167 NM_003096 ENSG00000143977 SNRPG SMG|Sm-G small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G protein-coding 143.5-119 chr2 118631237 118631738 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28521 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 132.25-122 chr3 7765500 7765866 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -230399 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 145.25-102 chr3 76756672 76757135 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -283196 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 137.75-7 chr1 93896218 93896540 + 0.5 NA intron (NM_001308253, intron 4 of 5) intron (NM_001308253, intron 4 of 5) 13051 NM_002061 2730 Hs.315562 NM_002061 ENSG00000023909 GCLM GLCLR glutamate-cysteine ligase modifier subunit protein-coding 134.5-239 chr9 34782186 34782561 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52885 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 119-18 chr10 83201591 83202022 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 475283 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 146.25-33 chr14 66661190 66661619 + 0.5 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1PA12|LINE|L1 153997 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 143.25-17 chr10 59293501 59293939 + 0.5 NA intron (NM_001347852, intron 5 of 12) intron (NM_001347852, intron 5 of 12) 68829 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 155.75-32 chr11 60721705 60722218 + 0.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -2048 NM_001354471 728588 Hs.739039 NM_001310141 ENSG00000214782 MS4A18 - membrane spanning 4-domains A18 protein-coding 120.75-128 chr4 122079675 122079991 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -90770 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 155.25-118 chr3 68696604 68697168 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 196249 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 169.5-109 chr3 42097318 42097832 + 0.5 NA intron (NM_001349247, intron 1 of 16) intron (NM_001349247, intron 1 of 16) 6218 NM_001265608 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 119.25-60 chr14 90996677 90996989 + 0.5 NA intron (NM_182398, intron 2 of 12) intron (NM_182398, intron 2 of 12) 63291 NM_001322238 9252 Hs.510225 NM_004755 ENSG00000100784 RPS6KA5 MSK1|MSPK1|RLPK ribosomal protein S6 kinase A5 protein-coding 143.75-30 chr11 10970502 10970855 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 112461 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 168.75-107 chr4 171692928 171693579 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -54490 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 181.5-42 chr14 64933202 64933668 + 0.5 NA 3' UTR (NM_145165, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_145165, exon 4 of 4) 9310 NR_046321 2877 Hs.2704 NM_002083 ENSG00000176153 GPX2 GI-GPx|GPRP|GPRP-2|GPx-2|GPx-GI|GSHPX-GI|GSHPx-2 glutathione peroxidase 2 protein-coding 117.25-178 chr5 157646043 157646326 + 0.5 NA intron (NM_001308165, intron 4 of 5) intron (NM_001308165, intron 4 of 5) 6236 NM_007017 11063 Hs.529462 NM_007017 ENSG00000039600 SOX30 - SRY-box transcription factor 30 protein-coding 119-41 chr12 118509281 118509581 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132876 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 152-78 chr19 40069665 40070164 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001142579, exon 9 of 9).2 3' UTR (NM_001142579, exon 9 of 9).2 -13683 NM_001005851 163131 Hs.101139 NM_001005851 ENSG00000128000 ZNF780B ZNF779 zinc finger protein 780B protein-coding 152.25-81 chr2 49304560 49305059 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -150282 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 154.25-120 chr4 167591737 167592330 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -357443 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 158-148 chr8 130442067 130442592 + 0.5 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) MIR3|SINE|MIR 1331 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 129.25-169 chr6 74982729 74983188 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 145824 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 121.75-23 chr11 92277433 92277677 + 0.5 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) L1PA16|LINE|L1 52521 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 144.5-118 chr2 211022335 211022732 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 404962 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 116.75-48 chr12 30269121 30269501 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 407933 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 174-57 chr20 36350731 36351374 + 0.5 NA intron (NM_001365621, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 44713 NM_014902 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 117.25-171 chr5 68709262 68709712 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 320440 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 113.5-248 chr9 80944856 80945221 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 744497 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 130.75-140 chr4 55415076 55415487 + 0.5 NA intron (NR_073070, intron 3 of 6) L1MC4|LINE|L1 19324 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 117.5-54 chr13 46524127 46524461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28876 NM_001164211 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 131-53 chr14 65741523 65741891 + 0.5 NA intron (NM_004480, intron 9 of 9) L2c|LINE|L2 270605 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 128.75-179 chr7 3032852 3033173 + 0.5 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) L2|LINE|L2 10855 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 121.25-106 chr2 239378569 239379039 + 0.5 NA intron (NM_006037, intron 1 of 26) intron (NM_006037, intron 1 of 26) 22145 NM_006037 9759 Hs.20516 NM_006037 ENSG00000068024 HDAC4 AHO3|BDMR|HA6116|HD4|HDAC-4|HDAC-A|HDACA histone deacetylase 4 protein-coding 186.25-71 chr3 107163401 107164031 + 0.5 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) intron (NR_028303, intron 1 of 3) 76922 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 177.5-6 chr1 66876154 66876661 + 0.5 NA intron (NM_024763, intron 4 of 16) intron (NM_024763, intron 4 of 16) 48449 NM_207014 79819 Hs.49421 NM_024763 ENSG00000152763 WDR78 DIC4 WD repeat domain 78 protein-coding 182.5-54 chr15 54786342 54786909 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -270122 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 116.75-68 chr15 81194324 81194624 + 0.5 NA Intergenic (AATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2405 NM_001352685 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 145-99 chr3 65721579 65722095 + 0.5 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -171979 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 181-78 chr4 54875065 54875493 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 217351 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 152.75-29 chr10 113468585 113469028 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -82025 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 122.25-182 chr8 41053923 41054249 + 0.5 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -156260 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 181-115 chr9 71924149 71924535 + 0.5 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) intron (NM_001365055, intron 2 of 4) 12703 NR_157410 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 175.25-85 chr21 31828466 31829049 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44263 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 182.25-123 chr8 68869393 68870009 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 234489 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 180.5-42 chr14 99075745 99076360 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 196145 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 154.75-112 chr5 20118362 20118732 + 0.5 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -130347 NM_001349563 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 121.25-162 chr5 67386431 67386862 + 0.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -189847 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 113-28 chr10 86374639 86374982 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8015 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 130.75-3 chr1 52742631 52742990 + 0.5 NA intron (NM_024646, intron 1 of 13) AluY|SINE|Alu 16357 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 139-109 chr5 18251955 18252453 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 444930 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 121.75-13 chr10 14375280 14375648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7813 NR_036181 100422843 NR_036181 ENSG00000266321 MIR4293 - microRNA 4293 ncRNA 159.75-11 chr1 235348014 235348538 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -19084 NM_001287802 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 155-152 chr9 92430105 92430699 + 0.5 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) intron (NM_001286969, intron 4 of 6) -5848 NM_005014 4958 Hs.94070 NM_005014 ENSG00000127083 OMD OSAD|SLRR2C osteomodulin protein-coding 136.5-120 chr2 165438098 165438484 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31407 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 117.75-59 chr14 81598366 81598720 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 24518 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 162.25-89 chr2 179724818 179725336 + 0.5 NA intron (NM_001352815, intron 1 of 8) intron (NM_001352815, intron 1 of 8) 20589 NM_001352813 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 150.5-25 chr11 19882334 19882707 + 0.5 NA intron (NM_182964, intron 5 of 37) MER103C|DNA|hAT-Charlie -122437 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 144-150 chr9 128532972 128533319 + 0.5 NA intron (NM_001499, intron 9 of 13) AluSx1|SINE|Alu -19442 NM_001363765 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 124.5-182 chr5 160772454 160772778 + 0.5 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) MER1B|DNA|hAT-Charlie 79595 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 128-55 chr16 65990864 65991204 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -375657 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 139.75-136 chr4 84687117 84687612 + 0.5 NA intron (NM_014991, intron 62 of 67) AluSx1|SINE|Alu 104237 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 129-168 chr7 48024279 48024569 + 0.5 NA intron (NM_001284350, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 4683 NM_001030019 256979 Hs.406741 NM_152782 ENSG00000164744 SUN3 SUNC1 Sad1 and UNC84 domain containing 3 protein-coding 112.5-90 chr16 82467932 82468206 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -158900 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 122-54 chr13 94142802 94143163 + 0.5 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) AluSc|SINE|Alu 45009 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 190.25-55 chr18 10812115 10812768 + 0.5 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) L1PA15|LINE|L1 -52792 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 130.25-195 chr8 47879204 47879679 + 0.5 NA intron (NM_001081640, intron 39 of 84) intron (NM_001081640, intron 39 of 84) 80695 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 179.25-49 chr13 24910732 24911253 + 0.5 NA intron (NR_047594, intron 3 of 17) intron (NR_047594, intron 3 of 17) 11869 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 134.25-52 chr14 72934559 72935017 + 0.5 NA intron (NM_181340, intron 1 of 12) L2c|LINE|L2 8324 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 130.75-167 chr6 54761246 54761658 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -85319 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 116.25-169 chr4 176791532 176791878 + 0.5 NA intron (NM_005429, intron 1 of 6) intron (NM_005429, intron 1 of 6) 1217 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 114.25-36 chr12 4705641 4706055 + 0.5 NA intron (NR_110112, intron 1 of 3) L1MCa|LINE|L1 14254 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 155.5-95 chr2 77272473 77273030 + 0.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 249625 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 136.25-166 chr6 62849359 62849778 + 0.5 NA Intergenic LTR22|LTR|ERVK 470409 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 146.5-63 chr14 53011737 53012139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60841 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 135.25-186 chr7 3782367 3782781 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MA7|LINE|L1 -347111 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 135-104 chr3 45797272 45797621 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_020208) promoter-TSS (NM_020208) -910 NM_020208 54716 Hs.413095 NM_020208 ENSG00000163817 SLC6A20 SIT1|XT3|Xtrp3 solute carrier family 6 member 20 protein-coding 135.25-211 chr9 124538109 124538484 + 0.5 NA exon (NM_033334, exon 6 of 10) exon (NM_033334, exon 6 of 10) -30897 NM_004959 2516 Hs.495108 NM_004959 ENSG00000136931 NR5A1 AD4BP|ELP|FTZ1|FTZF1|POF7|SF-1|SF1|SPGF8|SRXX4|SRXY3|hSF-1 nuclear receptor subfamily 5 group A member 1 protein-coding 126.75-3 chr1 74687874 74688300 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14295 NM_001002912 127254 Hs.531182 NM_001002912 ENSG00000178965 ERICH3 C1orf173 glutamate rich 3 protein-coding 152.75-154 chr8 118672706 118673121 + 0.5 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -50950 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 117.5-81 chr17 51523474 51523900 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 88260 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 142-44 chr13 109256160 109256586 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -89070 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-30 chr12 15631991 15632519 + 0.5 NA intron (NM_004447, intron 17 of 20) intron (NM_004447, intron 17 of 20) 85644 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 172.25-60 chr2 49423249 49423661 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -268928 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 132.5-241 chr8 90936697 90936989 + 0.5 NA intron (NM_022351, intron 9 of 12) MIRb|SINE|MIR 48234 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 169.5-102 chr3 31246532 31247176 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -85067 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 137.75-19 chr10 6195581 6195936 + 0.5 NA intron (NM_001282630, intron 1 of 14) intron (NM_001282630, intron 1 of 14) -7174 NM_001363545 5209 Hs.195471 NM_004566 ENSG00000170525 PFKFB3 IPFK2|PFK2|iPFK-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 protein-coding 129.25-196 chr8 61628774 61629153 + 0.5 NA intron (NM_032468, intron 14 of 14) intron (NM_032468, intron 14 of 14) 60848 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 128-178 chr9 88417078 88417385 + 0.5 NA intron (NM_006717, intron 1 of 5) intron (NM_006717, intron 1 of 5) 28787 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 120.25-84 chr2 16298102 16298557 + 0.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 247902 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 138.5-194 chr8 108606749 108607180 + 0.5 NA non-coding (NR_136411, exon 4 of 4) non-coding (NR_136411, exon 4 of 4) 163340 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 189-32 chr13 28399752 28400171 + 0.5 NA intron (NM_001160031, intron 11 of 11) MIRb|SINE|MIR 95167 NM_001160030 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 132-87 chr2 67292493 67292785 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77320 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 119.5-121 chr2 58309147 58309560 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 33476 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 162-62 chr2 78210462 78210981 + 0.5 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 80010 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 125.75-138 chr4 53226694 53227133 + 0.5 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 139148 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 161.75-4 chr1 68403979 68404337 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 45796 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 168-129 chr8 131386633 131387172 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -345993 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 152-134 chr6 71714361 71714915 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -172065 NM_001350412 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 127-46 chr12 53009620 53009972 + 0.5 NA intron (NM_001330654, intron 1 of 13) intron (NM_001330654, intron 1 of 13) 3340 NM_001417 1975 Hs.648394 NM_001417 ENSG00000063046 EIF4B EIF-4B|PRO1843 eukaryotic translation initiation factor 4B protein-coding 113-20 chr10 14394586 14394991 + 0.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -11511 NR_036181 100422843 NR_036181 ENSG00000266321 MIR4293 - microRNA 4293 ncRNA 155.5-82 chr18 68295534 68296043 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 419320 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 242-68 chr8 133844062 133844592 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42169 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 150-70 chr2 55855421 55855802 + 0.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 68171 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 159.5-193 chr7 17063542 17064117 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -181846 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 121.75-110 chr21 45786812 45787122 + 0.5 NA intron (NM_001348243, intron 3 of 15) intron (NM_001348243, intron 3 of 15) 38953 NM_001348243 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 123-175 chr7 108751639 108751994 + 0.5 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 132771 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 123-34 chr11 57504860 57505284 + 0.5 NA intron (NM_001198810, intron 2 of 14) intron (NM_001198810, intron 2 of 14) 9837 NM_001198810 8501 Hs.591952 NM_003627 ENSG00000149150 SLC43A1 LAT3|PB39|POV1|R00504 solute carrier family 43 member 1 protein-coding 133.5-152 chr22 46757334 46757750 + 0.5 NA Intergenic MER70B|LTR|ERVL -5075 NM_001284304 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 174-11 chr10 113366540 113367103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -184010 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 134-161 chr7 24194156 24194592 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -89816 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 131.5-216 chr7 32032587 32032929 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 37649 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 197.75-33 chr18 9901344 9901875 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -12407 NM_194434 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 153-48 chr15 91773956 91774369 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79546 NM_001145044 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 140-97 chr22 32568365 32568901 + 0.5 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 93396 NM_001033024 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 113.5-77 chr14 60735731 60736078 + 0.5 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 1143 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 125.25-80 chr17 52214433 52214770 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54584 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 138-97 chr22 34939718 34940053 + 0.5 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) AluSx4|SINE|Alu 58031 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 141.25-112 chr3 105462572 105463012 + 0.5 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 95883 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 163.25-41 chr14 36620492 36621010 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36817 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 115.75-160 chr4 148096679 148097114 + 0.5 NA intron (NM_000901, intron 8 of 8) MER58B|DNA|hAT-Charlie 314301 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 123.5-174 chr5 133493520 133493822 + 0.5 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) L1MEd|LINE|L1 -65965 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 132-121 chr4 1732482 1732916 + 0.5 NA intron (NM_006342, intron 6 of 15) intron (NM_006342, intron 6 of 15) 11178 NM_006342 10460 Hs.104019 NM_006342 ENSG00000013810 TACC3 ERIC-1|ERIC1 transforming acidic coiled-coil containing protein 3 protein-coding 144.25-200 chr8 79345979 79346430 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14016 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 235.25-9 chr10 120335610 120336302 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19267 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 125.75-35 chr11 23804401 23804769 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -385395 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 146.5-139 chr3 63480655 63481115 + 0.5 NA exon (NM_144642, exon 2 of 5) exon (NM_144642, exon 2 of 5) 37573 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 121.5-40 chr11 47783835 47784298 + 0.5 NA intron (NM_015231, intron 33 of 35) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -16725 NM_001318339 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 158-41 chr12 58565984 58566453 + 0.5 NA non-coding (NR_120452, exon 8 of 8) non-coding (NR_120452, exon 8 of 8) -25484 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 150.75-64 chr15 58135936 58136503 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1950 NM_001320636 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 164.5-123 chr21 28639109 28639458 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 99965 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 142.25-112 chr3 174519764 174520150 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -339377 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 146.25-135 chr7 42270265 42270800 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33323 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 217.25-33 chr17 58579834 58580425 + 0.5 NA intron (NM_031272, intron 19 of 31) L1ME3A|LINE|L1 -35801 NM_001368771 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 160.75-139 chr6 166891779 166892103 + 0.5 NA Intergenic HERV17-int|LTR|ERV1 -11757 NR_046644 100861523 Hs.634640 NR_046644 RPS6KA2-AS1 - RPS6KA2 antisense RNA 1 ncRNA 136.5-200 chr6 134492971 134493410 + 0.5 NA intron (NR_038219, intron 4 of 4) MER21B|LTR|ERVL -14293 NR_125852 101928231 Hs.634168 NR_125852 CT69 - cancer/testis associated transcript 69 ncRNA 193-2 chr1 44684776 44685369 + 0.5 NA intron (NM_001145636, intron 1 of 11) intron (NM_001145636, intron 1 of 11) 10358 NM_001145636 339541 Hs.173679 NM_001004307 ENSG00000198520 ARMH1 C1orf228|NCRNA00082|p40 armadillo like helical domain containing 1 protein-coding 142-83 chr2 51121800 51122184 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) HERVL-int|LTR|ERVL 89391 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 150-142 chr8 30474337 30474895 + 0.5 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -89215 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 136.25-73 chr16 57527827 57528186 + 0.5 NA intron (NM_033212, intron 2 of 8) FRAM|SINE|Alu 8565 NM_033212 92922 Hs.644611 NM_033212 ENSG00000135736 CCDC102A - coiled-coil domain containing 102A protein-coding 116.5-95 chr17 71977687 71978098 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 48087 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 126.25-219 chr9 26515938 26516347 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 376660 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 124.75-8 chr1 82914372 82914836 + 0.5 NA intron (NR_147074, intron 2 of 10) MIRc|SINE|MIR 11421 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 132.75-189 chr8 101354012 101354391 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -14692 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 132.75-208 chrX 51612389 51612799 + 0.5 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 6324 NM_001355276 347549 NM_001355276 ENSG00000224109 CENPVL3 CENPVP3 centromere protein V like 3 protein-coding 135.75-147 chr3 124993352 124993862 + 0.5 NA intron (NM_020733, intron 12 of 16) intron (NM_020733, intron 12 of 16) -58856 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 146.75-98 chr3 24328765 24329252 + 0.5 NA intron (NM_001252634, intron 2 of 11) AluJr|SINE|Alu -165079 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 195.5-72 chr2 81729573 81730205 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -262943 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 124.75-11 chr1 110936573 110936901 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 27185 NM_018372 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 169.75-42 chr13 83560596 83561025 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 321583 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 148.75-25 chr10 83977784 83978247 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -161494 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 159.75-152 chr6 73606724 73607128 + 0.5 NA intron (NM_012434, intron 9 of 10) L3|LINE|CR1 47066 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 156.75-12 chr1 167533437 167533881 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15049 NM_198053 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 129.25-131 chr3 141843886 141844191 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32605 NM_001679 483 Hs.477789 NM_001679 ENSG00000069849 ATP1B3 ATPB-3|CD298 ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 protein-coding 181-60 chr2 202925592 202926252 + 0.5 NA intron (NM_001352677, intron 3 of 13) intron (NM_001352677, intron 3 of 13) 13647 NM_001352678 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 156-147 chr8 38753047 38753522 + 0.5 NA intron (NM_001352786, intron 3 of 14) AluJo|SINE|Alu -3991 NM_001352784 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 201.25-98 chr9 132190742 132191268 + 0.5 NA intron (NM_032536, intron 2 of 7) intron (NM_032536, intron 2 of 7) 28947 NM_032536 84628 Hs.163642 NM_032536 ENSG00000196358 NTNG2 LHLL9381|Lmnt2|NTNG1|bA479K20.1 netrin G2 protein-coding 139.75-63 chr16 6921733 6922221 + 0.5 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 148168 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 157.75-143 chr5 133640720 133641160 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28399 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 113-69 chr15 80574530 80574945 + 0.5 NA intron (NM_014862, intron 13 of 18) intron (NM_014862, intron 13 of 18) -6366 NR_049837 100847042 NR_049837 ENSG00000284059 MIR5572 - microRNA 5572 ncRNA 153.75-62 chr2 42091005 42091553 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 43258 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 120.25-75 chr17 71882645 71883067 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 143123 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 138.75-73 chr17 70533569 70534114 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 364306 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 205.25-9 chr10 123078720 123079373 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -56924 NM_001105574 340784 Hs.531194 NM_001105574 ENSG00000188620 HMX3 NKX-5.1|NKX5.1|Nkx5-1 H6 family homeobox 3 protein-coding 139-70 chr2 34526338 34526696 + 0.5 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -151040 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 138.75-90 chr2 76065289 76065650 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -354554 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 117.5-120 chr2 225391737 225392129 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7777 NM_001371273 126.25-106 chr22 40813917 40814311 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_039923) promoter-TSS (NR_039923) -156 NR_039923 100616283 NR_039923 ENSG00000266594 MIR4766 mir-4766 microRNA 4766 ncRNA 178.75-83 chr5 69040198 69040711 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -10527 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 114.5-167 chr22 27377378 27377833 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 66954 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 160.5-33 chr12 22744955 22745436 + 0.5 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 120024 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 146-125 chr8 53910800 53911217 + 0.5 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 30136 NM_003702 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 176-38 chr20 48945033 48945485 + 0.5 NA intron (NM_006420, intron 3 of 38) MER58A|DNA|hAT-Charlie 23548 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 179.5-67 chr15 91305193 91305749 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -157868 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 119.75-147 chr3 124546011 124546477 + 0.5 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) AluJb|SINE|Alu -38414 NM_001322998 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 123.5-169 chr5 113615679 113615992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102141 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 120.25-125 chr22 41604803 41605076 + 0.5 NA intron (NM_015704, intron 3 of 5) intron (NM_015704, intron 3 of 5) -15099 NM_002676 5372 Hs.75835 NM_002676 ENSG00000100417 PMM1 PMM 1|PMMH-22|Sec53 phosphomannomutase 1 protein-coding 119.5-246 chr8 133378920 133379378 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -81845 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 139.5-215 chr8 102393247 102393606 + 0.5 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) AluSx3|SINE|Alu 19263 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 114.75-49 chr14 52000289 52000746 + 0.5 NA intron (NM_016039, intron 5 of 7) intron (NM_016039, intron 5 of 7) 10971 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 121.25-159 chr5 42020946 42021390 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 95887 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 125.5-9 chr1 93414836 93415104 + 0.5 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -33148 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 138.5-99 chr2 42516358 42516841 + 0.5 NA intron (NM_001282755, intron 2 of 17) intron (NM_001282755, intron 2 of 17) 22030 NM_001282755 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 139-146 chr7 121669775 121670139 + 0.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -203204 NM_001206839 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 207.5-74 chr4 37173033 37173687 + 0.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 68631 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 128.75-3 chr1 18423156 18423537 + 0.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -57584 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 126.25-122 chr3 128799523 128799988 + 0.5 NA intron (NM_004637, intron 3 of 5) intron (NM_004637, intron 3 of 5) -47053 NR_162138 113219457 NR_162138 MIR12124 - microRNA 12124 ncRNA 173-44 chr14 58838937 58839378 + 0.5 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 10869 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 117-127 chr3 192958613 192958977 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40939 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 115.75-233 chr9 135996958 135997321 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35766 NM_016172 10422 Hs.9194 NM_016172 ENSG00000130560 UBAC1 GBDR1|KPC2|UBADC1 UBA domain containing 1 protein-coding 147.5-44 chr12 18635100 18635497 + 0.5 NA intron (NM_001288774, intron 31 of 32) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 102211 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 127.5-106 chr19 29297043 29297467 + 0.5 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L2|LINE|L2 -84104 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 117.75-227 chr9 102826631 102827033 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168501 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 161-7 chr1 218247066 218247579 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37971 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 154.5-78 chr17 32320667 32321072 + 0.5 NA intron (NM_001363836, intron 8 of 8) intron (NM_001363836, intron 8 of 8) 21304 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 123-107 chr2 98507211 98507563 + 0.5 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 61377 NM_001351428 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 137.25-100 chr3 95818732 95819108 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -135727 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 121-77 chr16 68019374 68019675 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3613 NM_001282442 100131303 Hs.655900 NM_001282442 ENSG00000263201 DPEP2NB - DPEP2 neighbor protein-coding 112.5-45 chr12 11948331 11948741 + 0.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -101325 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 124-167 chr8 117444409 117444712 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -76153 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 114.25-107 chr2 177291736 177292166 + 0.5 NA intron (NR_026966, intron 8 of 8) intron (NR_026966, intron 8 of 8) 21931 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 117.5-179 chr5 74111031 74111345 + 0.5 NA Intergenic (ATATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 197137 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 126.75-228 chr7 85154070 85154548 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32378 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 147-34 chr14 72767842 72768280 + 0.5 NA intron (NM_001280544, intron 2 of 9) L1MDa|LINE|L1 124588 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 152.5-63 chr16 57567585 57567977 + 0.5 NA intron (NM_001304376, intron 8 of 11) intron (NM_001304376, intron 8 of 11) 25138 NM_001304376 221188 Hs.187884 NM_153837 ENSG00000159618 ADGRG5 GPR114|PGR27 adhesion G protein-coupled receptor G5 protein-coding 160-24 chr12 40397754 40398191 + 0.5 NA intron (NM_173600, intron 2 of 173) intron (NM_173600, intron 2 of 173) 4578 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 119.25-158 chr4 184703214 184703582 + 0.5 NA intron (NR_104593, intron 8 of 11) intron (NR_104593, intron 8 of 11) 30698 NR_104593 79682 Hs.575032 NM_024629 ENSG00000151725 CENPU CENP50|CENPU50|KLIP1|MLF1IP|PBIP1 centromere protein U protein-coding 112.75-175 chr6 50100421 50100701 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50632 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 114-171 chrX 74048891 74049261 + 0.5 NA intron (NR_028379, intron 5 of 6) L1PREC2|LINE|L1 104752 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 137.5-144 chr20 56993129 56993523 + 0.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -220370 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 154-72 chr2 111071413 111071910 + 0.5 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) intron (NM_001371254, intron 17 of 18) 43927 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 138.5-69 chr15 80907791 80908175 + 0.5 NA intron (NM_001293304, intron 13 of 29) MER20B|DNA|hAT-Charlie -65910 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 138.25-78 chr2 9977290 9977670 + 0.5 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) AluSz|SINE|Alu 25787 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 138-13 chr10 110032855 110033246 + 0.5 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -24669 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 139-123 chr5 173918986 173919411 + 0.5 NA intron (NM_001308193, intron 2 of 7) intron (NM_001308193, intron 2 of 7) 26147 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 118.5-230 chr8 130825694 130826011 + 0.5 NA intron (NM_001115, intron 12 of 17) LTR86C|LTR|ERVL 215057 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 137.75-28 chr10 95406173 95406650 + 0.5 NA intron (NM_001034955, intron 8 of 30) intron (NM_001034955, intron 8 of 30) 34769 NM_001290297 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 127.25-194 chr7 52183615 52184025 + 0.5 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -790564 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 162-16 chr10 90097901 90098369 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -140762 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 186-64 chr4 78369048 78369632 + 0.5 NA intron (NM_001166133, intron 22 of 41) intron (NM_001166133, intron 22 of 41) 80355 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 133.25-109 chr2 172294930 172295267 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -132238 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 168.25-103 chr3 162220409 162220907 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 723850 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 125.75-65 chr16 89098296 89098722 + 0.5 NA intron (NM_001127214, intron 1 of 9) intron (NM_001127214, intron 1 of 9) 4657 NR_147929 197322 Hs.461727 NM_174917 ENSG00000176715 ACSF3 - acyl-CoA synthetase family member 3 protein-coding 156.5-78 chr2 58526185 58526611 + 0.5 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 5645 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 117.75-169 chr5 12168337 12168622 + 0.5 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -264033 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 141.5-29 chr11 100279315 100279673 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 17 of 23) L1MA2|LINE|L1 -407794 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 206.5-136 chr8 120809099 120809570 + 0.5 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) 2712 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 128-72 chr2 61281375 61281778 + 0.5 NA intron (NM_014709, intron 37 of 79) AluSz6|SINE|Alu 104158 NR_152210 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 133-187 chr9 74649440 74649718 + 0.5 NA intron (NM_006914, intron 4 of 9) intron (NM_006914, intron 4 of 9) 34045 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 114.25-81 chr18 54521195 54521575 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66374 NM_001307955 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 154.5-47 chr12 58175978 58176427 + 0.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 88310 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 134.5-76 chr15 63720736 63721206 + 0.5 NA intron (NM_003922, intron 19 of 77) intron (NM_003922, intron 19 of 77) 112977 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 117.25-118 chr2 121014092 121014435 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 221982 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 119.25-179 chr6 118481267 118481610 + 0.5 NA intron (NM_001042475, intron 8 of 12) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -19935 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 120.5-112 chr2 35247935 35248303 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -223286 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 127-32 chr11 68927881 68928226 + 0.5 NA intron (NM_002180, intron 7 of 14) L1M4|LINE|L1 24202 NM_002180 3508 Hs.503048 NM_002180 ENSG00000132740 IGHMBP2 CATF1|CMT2S|HCSA|HMN6|SMARD1|SMUBP2|ZFAND7 immunoglobulin mu DNA binding protein 2 protein-coding 133.5-190 chr4 138578046 138578575 + 0.5 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 268599 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 145.25-12 chr10 31124378 31124878 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -63255 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 118.25-93 chr19 47305060 47305307 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4678 NM_001736 728 Hs.2161 NM_001736 ENSG00000197405 C5AR1 C5A|C5AR|C5R1|CD88 complement C5a receptor 1 protein-coding 114.25-10 chr1 181744547 181744937 + 0.5 NA intron (NM_001205293, intron 25 of 47) intron (NM_001205293, intron 25 of 47) 261225 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 112.75-213 chrX 28448388 28448777 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 47081 NR_106750 102465140 NR_106750 ENSG00000277569 MIR6134 hsa-mir-6134 microRNA 6134 ncRNA 141.75-147 chr5 168176978 168177284 + 0.5 NA intron (NM_001368145, intron 12 of 26) intron (NM_001368145, intron 12 of 26) 11286 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 126.25-129 chr4 75967370 75967862 + 0.5 NA intron (NM_001288984, intron 11 of 21) intron (NM_001288984, intron 11 of 21) -13174 NR_125906 101928809 Hs.637575 NR_125906 ENSG00000245928 LOC101928809 - uncharacterized LOC101928809 ncRNA 156-84 chr2 112255743 112256352 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1005 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 118.5-87 chr2 18602215 18602608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12831 NM_001199103 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 137.75-169 chr5 146388397 146388793 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49756 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 183-67 chr3 76935580 76936041 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -104289 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 192.75-120 chr7 66962677 66963269 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 32613 NM_016038 51119 Hs.110445 NM_016038 ENSG00000126524 SBDS CGI-97|SDS|SWDS SBDS ribosome maturation factor protein-coding 126.5-216 chr6 155931741 155932065 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14894 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 134-145 chr5 135804981 135805420 + 0.5 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) SATR2|Satellite|Satellite -2125 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 175-112 chr6 86116822 86117418 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -438387 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 131.5-129 chr2 198793445 198793911 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -418581 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 151.25-17 chr10 61502922 61503280 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23060 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-173 chr3 121541621 121541945 + 0.5 NA intron (NM_199420, intron 2 of 29) intron (NM_199420, intron 2 of 29) 4205 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 130.5-198 chr5 30272296 30272783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 391979 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 132.5-124 chr2 100815970 100816401 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3954 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 134-183 chr9 30695331 30695848 + 0.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -287135 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 144.5-14 chr1 162016302 162016646 + 0.5 NA intron (NM_001347700, intron 3 of 7) intron (NM_001347700, intron 3 of 7) 7991 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 135.25-151 chr4 185464414 185464871 + 0.5 NA intron (NM_001145411, intron 2 of 5) HAL1b|LINE|L1 -6789 NR_133944 105377590 Hs.563183 NR_133944 ENSG00000249679 LOC105377590 - uncharacterized LOC105377590 ncRNA 128.5-53 chr12 76851291 76851743 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001359626, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001359626, exon 17 of 17) 27502 NM_001321 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 139.5-80 chr17 43635583 43635909 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 25817 NM_013999 4222 Hs.438 NM_004527 ENSG00000005102 MEOX1 KFS2|MOX1 mesenchyme homeobox 1 protein-coding 136-121 chr5 51529867 51530307 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 146639 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 133-176 chr8 124668208 124668582 + 0.5 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 60078 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 115.75-25 chr10 124753582 124754004 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9415 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 190.75-83 chr5 37770028 37770685 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 64466 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 135.75-163 chr4 85197638 85198137 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 230403 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 144.25-31 chr10 87053631 87053979 + 0.5 NA intron (NM_001318905, intron 14 of 15) intron (NM_001318905, intron 14 of 15) 33511 NM_001146157 643161 Hs.729945 NM_001146157 ENSG00000188100 FAM25A bA96C23.5 family with sequence similarity 25 member A protein-coding 119.75-152 chr3 182549896 182550371 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43009 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 119.25-166 chr5 143502790 143503153 + 0.5 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -67459 NM_001018074 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 167.75-37 chr12 48385571 48386109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34594 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 177-37 chr18 22052916 22053571 + 0.5 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 115725 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 149.25-51 chr15 23523008 23523379 + 0.5 NA Intergenic MER74C|LTR|ERVL 38938 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 181.75-116 chr7 33202271 33202798 + 0.5 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 72970 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 116.75 chr1 7971213 7971484 + 0.5 NA intron (NM_001123377, intron 5 of 6) intron (NM_001123377, intron 5 of 6) 9637 NM_007262 11315 Hs.419640 NM_007262 ENSG00000116288 PARK7 DJ-1|DJ1|GATD2|HEL-S-67p Parkinsonism associated deglycase protein-coding 115.25-76 chr17 18164542 18164775 + 0.5 NA intron (NM_016239, intron 59 of 64) AluSz6|SINE|Alu -19170 NM_017758 54890 Hs.744130 NM_017758 ENSG00000091542 ALKBH5 ABH5|OFOXD|OFOXD1 alkB homolog 5, RNA demethylase protein-coding 146.75-14 chr10 29339028 29339533 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 50210 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 160.5-70 chr17 54939946 54940540 + 0.5 NA intron (NM_001321176, intron 12 of 16) L1MC5a|LINE|L1 28411 NR_027942 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 123.75-120 chr3 100398512 100398872 + 0.5 NA intron (NM_014820, intron 1 of 11) MIR3|SINE|MIR 2397 NM_014820 9868 Hs.227253 NM_014820 ENSG00000154174 TOMM70 TOMM70A|Tom70 translocase of outer mitochondrial membrane 70 protein-coding 132.5-84 chr16 8599623 8600092 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9346 NM_001290097 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 122.5-130 chr20 2674678 2675121 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10676 NM_001258384 3420 Hs.436405 NM_006899 ENSG00000101365 IDH3B RP46 isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 beta protein-coding 166.75-2 chr1 60047820 60048181 + 0.5 NA intron (NM_152377, intron 3 of 11) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 25770 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 114.25-208 chr9 124392140 124392481 + 0.5 NA intron (NM_002799, intron 5 of 7) intron (NM_002799, intron 5 of 7) 23132 NM_002799 5695 Hs.213470 NM_002799 ENSG00000136930 PSMB7 Z proteasome subunit beta 7 protein-coding 118.5-99 chr2 86621254 86621627 + 0.5 NA intron (NM_001198954, intron 2 of 7) intron (NM_001198954, intron 2 of 7) 2425 NM_005667 7844 Hs.469199 NM_005667 ENSG00000239305 RNF103 HKF-1|KF-1|KF1|ZFP-103|ZFP103 ring finger protein 103 protein-coding 152.25-160 chr8 121260576 121261103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -378507 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 153-141 chr7 47818298 47818700 + 0.5 NA intron (NR_161269, intron 3 of 3) intron (NR_161269, intron 3 of 3) 23208 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 138.75-22 chr10 80324133 80324516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20421 NR_070308 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 124-35 chr13 31518336 31518705 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -221006 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 149-122 chr7 62920561 62920928 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 383312 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 129-4 chr1 72834181 72834506 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -471827 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 138-64 chr18 108460 108943 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_033770) promoter-TSS (NR_033770) -364 NR_033770 727758 Hs.585843 NR_033770 ENSG00000263006 ROCK1P1 ROCK1P Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 pseudogene 1 pseudo 132.5-218 chr7 2709288 2709766 + 0.5 NA intron (NM_133463, intron 5 of 6) intron (NM_133463, intron 5 of 6) 21325 NM_001321766 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 129-67 chr14 72019721 72020060 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 86363 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 159-6 chr1 222316341 222316812 + 0.5 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 231528 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 148.75-139 chr5 127621941 127622458 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26822 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 135.5-38 chr11 97247146 97247477 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 738886 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 150-88 chr3 34578201 34578788 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 779864 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 113.5-63 chr13 32511888 32512179 + 0.5 NA 3' UTR (NM_014887, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014887, exon 6 of 6) -2638 NR_026928 116828 Hs.658751 NR_026928 ENSG00000281026 N4BP2L2-IT2 CG030 N4BPL2 intronic transcript 2 ncRNA 113.5-146 chr21 27611140 27611480 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -111069 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 137-3 chr1 79175703 79176051 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -169147 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 141-156 chr8 104032634 104032963 + 0.5 NA intron (NR_145710, intron 24 of 29) intron (NR_145710, intron 24 of 29) -190537 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 143.75-180 chr8 55892714 55893212 + 0.5 NA intron (NM_002350, intron 1 of 12) intron (NM_002350, intron 1 of 12) 9892 NR_145767 109617001 NR_145767 ENSG00000199405 SNORA1B - small nucleolar RNA, H/ACA box 1B snoRNA 146.75-48 chr14 76431069 76431411 + 0.5 NA intron (NM_004452, intron 3 of 10) AluSx|SINE|Alu 59893 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 153.25-30 chr12 76343053 76343452 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 5163 NM_024685 79738 Hs.96322 NM_024685 ENSG00000179941 BBS10 C12orf58 Bardet-Biedl syndrome 10 protein-coding 198.5-74 chr2 70019513 70020042 + 0.5 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) L1MA8|LINE|L1 -57512 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 183-92 chr5 135316261 135316859 + 0.5 NA intron (NR_161235, intron 3 of 5) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -68383 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 114.75-9 chr1 114459818 114460141 + 0.5 NA intron (NM_015906, intron 4 of 19) intron (NM_015906, intron 4 of 19) 51224 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 204.75-52 chr17 50352205 50352854 + 0.5 NA intron (NR_110010, intron 1 of 9) intron (NR_110010, intron 1 of 9) 6403 NM_022167 64132 Hs.463416 NM_022167 ENSG00000015532 XYLT2 PXYLT2|SOS|XT-II|XT2|xylT-II xylosyltransferase 2 protein-coding 133.5-219 chr5 126415916 126416266 + 0.5 NA intron (NM_001146319, intron 1 of 13) intron (NM_001146319, intron 1 of 13) -7055 NM_001146321 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 137.75-41 chr12 39406216 39406623 + 0.5 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 36701 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 145.75-165 chr9 27879518 27879901 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -305843 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 182.25-101 chr6 83042515 83043044 + 0.5 NA intron (NR_146807, intron 4 of 10) intron (NR_146807, intron 4 of 10) 23062 NM_001350603 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 154.5-32 chr10 119902689 119903060 + 0.5 NA non-coding (NR_037771, exon 2 of 18) non-coding (NR_037771, exon 2 of 18) 10144 NM_007190 11196 Hs.435004 NM_007190 ENSG00000107651 SEC23IP MSTP053|P125|P125A SEC23 interacting protein protein-coding 221.5-56 chr20 33602108 33602687 + 0.5 NA intron (NM_005093, intron 2 of 11) intron (NM_005093, intron 2 of 11) 40032 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 129-15 chr1 219877098 219877567 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 51319 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 142.75-36 chr11 48110318 48110880 + 0.5 NA intron (NM_001098503, intron 2 of 8) intron (NM_001098503, intron 2 of 8) 13817 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 184-71 chr5 42911664 42912344 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 81329 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 131.5-66 chr14 81411616 81412053 + 0.5 NA intron (NM_001366850, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 15941 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 165-151 chr8 132370304 132370741 + 0.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 76740 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 118.5-25 chr10 93092674 93092927 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18907 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 134-38 chr12 25360757 25361175 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -110037 NM_001369787 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 143.25-171 chr7 42845856 42846402 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 65714 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 117-170 chr7 43867936 43868363 + 0.5 NA intron (NM_001204871, intron 6 of 6) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 1368 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 118.5-28 chr10 113688766 113689120 + 0.5 NA intron (NM_001227, intron 1 of 6) L1PBb|LINE|L1 9031 NM_001227 840 Hs.9216 NM_001227 ENSG00000165806 CASP7 CASP-7|CMH-1|ICE-LAP3|LICE2|MCH3 caspase 7 protein-coding 178.25-14 chr11 25829790 25830254 + 0.5 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -359101 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 134-177 chr8 133742882 133743257 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 34283 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 176.75-116 chr7 127078114 127078668 + 0.5 NA intron (NM_001371085, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 -20207 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 178.75-50 chr2 204360858 204361434 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -184329 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 150.25-38 chr12 14189939 14190337 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -175494 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 154-135 chrX 104445980 104446594 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -119912 NM_017416 26280 Hs.675519 NM_017416 ENSG00000189108 IL1RAPL2 IL-1R9|IL1R9|IL1RAPL-2|TIGIRR-1 interleukin 1 receptor accessory protein like 2 protein-coding 136-130 chr7 5676214 5676576 + 0.5 NA intron (NR_046834, intron 1 of 2) intron (NR_046834, intron 1 of 2) 4066 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 133.5-50 chr11 30634019 30634354 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47833 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 140-44 chr14 89115040 89115442 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 290590 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 146.25-22 chr12 10682587 10682998 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8740 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 148.75-95 chr2 205656656 205657042 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25651 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 121.75-21 chr11 72255576 72255847 + 0.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -11535 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 118.5-214 chr8 77466528 77466979 + 0.5 NA intron (NR_125830, intron 2 of 2) intron (NR_125830, intron 2 of 2) 16056 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 122.75-147 chr4 62113824 62114259 + 0.5 NA intron (NR_110595, intron 6 of 7) L1MEd|LINE|L1 47724 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 163.5-221 chrX 43017233 43017808 + 0.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -159474 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 114.5-24 chr1 192470590 192470989 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -104984 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 120.75-41 chr14 60630503 60630890 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8520 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 141-9 chr1 156564866 156565287 + 0.5 NA intron (NM_178229, intron 4 of 37) intron (NM_178229, intron 4 of 37) 7489 NM_178229 128239 Hs.591495 NM_178229 ENSG00000183856 IQGAP3 - IQ motif containing GTPase activating protein 3 protein-coding 154.75-81 chr20 440514 440928 + 0.5 NA intron (NR_111901, intron 5 of 9) intron (NR_111901, intron 5 of 9) 21812 NR_111901 128637 Hs.590876 NM_144628 ENSG00000125875 TBC1D20 C20orf140|WARBM4 TBC1 domain family member 20 protein-coding 113-22 chr10 56627758 56628019 + 0.5 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -266615 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 125.75-69 chr17 61152296 61152745 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 215184 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 115-177 chr8 36341020 36341404 + 0.5 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -443162 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 133-157 chr7 78484965 78485380 + 0.5 NA intron (NM_001301128, intron 6 of 20) intron (NM_001301128, intron 6 of 20) 137930 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 113.75-125 chr3 34302428 34302666 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 503917 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 115.25-88 chr19 28278103 28278523 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -328375 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 130.75-94 chr2 123900931 123901236 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 124091 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 183.25-49 chr18 34195582 34196112 + 0.5 NA intron (NM_001353232, intron 1 of 9) intron (NM_001353232, intron 1 of 9) 26623 NM_001353235 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 169.25-108 chr7 32490418 32490883 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_012322) promoter-TSS (NM_012322) -270 NR_024466 23658 Hs.424908 NM_012322 ENSG00000106355 LSM5 YER146W LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 119.75-149 chr3 133182139 133182560 + 0.5 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 57528 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 127.75-111 chr2 170176195 170176688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1706 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 158.75-10 chr1 212597017 212597379 + 0.5 NA intron (NM_001030287, intron 1 of 3) intron (NM_001030287, intron 1 of 3) -11563 NM_001674 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 176.5-12 chr10 33861148 33861648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -88718 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 126.5-245 chr8 105692729 105693181 + 0.5 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 367548 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 141-58 chr17 59924933 59925383 + 0.5 NA intron (NR_161455, intron 4 of 13) L1MC5a|LINE|L1 32037 NR_161459 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 164.75-115 chr5 91829448 91830054 + 0.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -446434 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 132-164 chr7 67600427 67600825 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 264650 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 117.75-204 chr8 51615993 51616395 + 0.5 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) intron (NM_144651, intron 2 of 22) 193251 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 127.5-8 chr1 53441469 53441878 + 0.5 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -1653 NR_002314 163742 Hs.99394 NR_002314 ENSG00000236253 SLC25A3P1 - solute carrier family 25 member 3 pseudogene 1 pseudo 164.75-136 chr7 89499438 89500052 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -619655 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 162-92 chr5 121062760 121063381 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -259480 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 119.5-45 chr11 61699899 61700224 + 0.5 NA intron (NM_006133, intron 1 of 19) intron (NM_006133, intron 1 of 19) 19670 NM_006133 747 Hs.241564 NM_006133 ENSG00000134780 DAGLA C11orf11|DAGL(ALPHA)|DAGLALPHA|NSDDR diacylglycerol lipase alpha protein-coding 124-164 chr8 51388997 51389269 + 0.5 NA intron (NM_144651, intron 17 of 22) intron (NM_144651, intron 17 of 22) 420312 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 121.25-151 chr4 113399199 113399584 + 0.5 NA Intergenic (ACACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 106552 NM_001354279 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 129-194 chrX 94543965 94544428 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 519030 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 135.5-207 chr8 136640621 136641007 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 110016 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 113.25-145 chr6 41753142 41753480 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -5910 NM_001166424 5225 Hs.1867 NM_002630 ENSG00000096088 PGC PEPC|PGII progastricsin protein-coding 119.5-99 chr17 33687485 33687892 + 0.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -153928 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 147.75-62 chr2 26971818 26972304 + 0.5 NA intron (NM_012326, intron 1 of 6) intron (NM_012326, intron 1 of 6) 1424 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 131.25-83 chr18 6662595 6662876 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -66981 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 125.5-164 chr3 7833014 7833371 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 183115 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 130.5-19 chr1 168879349 168879753 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 92610 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 145-138 chr6 122972290 122972705 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -23738 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 142-132 chr5 125632959 125633317 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 139877 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 116.5-206 chr5 162240350 162240707 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 172886 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 179.5-69 chr16 51997217 51997858 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 76398 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 128.25-215 chr8 142841584 142842048 + 0.5 NA intron (NM_002066, intron 3 of 3) intron (NM_002066, intron 3 of 3) 7015 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 122.75-41 chr13 96316269 96316684 + 0.5 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) -110753 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 117.75-118 chr2 234336848 234337187 + 0.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 117578 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 140.25-152 chr5 117008459 117008947 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -246494 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 144.75-45 chr12 48529115 48529500 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3675 NM_001005203 341568 Hs.524373 NM_001005203 ENSG00000284723 OR8S1 - olfactory receptor family 8 subfamily S member 1 protein-coding 156.25-110 chr4 41268927 41269314 + 0.5 NA TTS (NM_004181) TTS (NM_004181) 12192 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 136.5-206 chr7 23417860 23418206 + 0.5 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) intron (NM_006547, intron 3 of 14) 21587 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 131.75-125 chr22 28414024 28414474 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -45620 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 195.75-56 chr2 4539635 4540309 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 116250 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 122-145 chr5 148510378 148510681 + 0.5 NA intron (NM_001040172, intron 4 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 126532 NM_001040173 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 112.5-15 chr1 205783662 205784025 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8361 NM_001135664 8934 Hs.115325 NM_003929 ENSG00000117280 RAB29 RAB7L|RAB7L1 RAB29, member RAS oncogene family protein-coding 146.5-16 chr1 160188437 160188819 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1947 NM_001231 844 Hs.632476 NM_001231 ENSG00000143318 CASQ1 CASQ|PDIB1|VMCQA calsequestrin 1 protein-coding 172.5-85 chr17 81135797 81136363 + 0.5 NA intron (NM_001080395, intron 1 of 13) CpG -2772 NR_031652 100302229 NR_031652 ENSG00000221025 MIR1250 MIRN1250|hsa-mir-1250|mir-1250 microRNA 1250 ncRNA 118.25-13 chr1 109425669 109426094 + 0.5 NA intron (NM_001199774, intron 1 of 8) intron (NM_001199774, intron 1 of 8) 567 NM_001199774 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 149.75-18 chr10 128549997 128550565 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 264331 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 164.5-118 chr20 51620978 51621394 + 0.5 NA intron (NM_006045, intron 19 of 27) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -58347 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 140-148 chr6 42891424 42891839 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001008739) promoter-TSS (NM_001008739) -810 NM_001008739 441150 Hs.571098 NM_001008739 ENSG00000221821 C6orf226 - chromosome 6 open reading frame 226 protein-coding 173.25-36 chr14 50960260 50960854 + 0.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -16074 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 156.5-196 chr8 120560596 120561203 + 0.5 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 115480 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 158.25-113 chr5 117596778 117597327 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -133309 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 124.75-69 chr13 103720159 103720549 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 295154 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 143.75-106 chr21 34111051 34111478 + 0.5 NA intron (NM_032476, intron 1 of 2) intron (NM_032476, intron 1 of 2) 37686 NM_032476 64968 Hs.302742 NM_032476 ENSG00000243927 MRPS6 C21orf101|MRP-S6|RPMS6|S6mt mitochondrial ribosomal protein S6 protein-coding 167.5-171 chr6 158851200 158851698 + 0.5 NA intron (NR_028496, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 6183 NR_028496 202459 Hs.487035 NM_145303 ENSG00000243775 OSTCP1 DC2L|OSTCL oligosaccharyltransferase complex subunit pseudogene 1 pseudo 200.25-73 chr20 62264819 62265253 + 0.5 NA intron (NM_001363878, intron 5 of 14) L1MC4a|LINE|L1 26515 NM_144498 9885 Hs.473254 NM_014835 ENSG00000130703 OSBPL2 DFNA67|DNFA67|ORP-2|ORP2 oxysterol binding protein like 2 protein-coding 115.5-204 chr5 91971830 91972120 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -588658 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 138.25-67 chr17 79816382 79816785 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -6869 NR_146504 105371919 NR_146504 ENSG00000262772 LINC01977 - long intergenic non-protein coding RNA 1977 ncRNA 181-52 chr2 30086238 30086723 + 0.5 NA Intergenic PABL_A|LTR|ERV1 -60527 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 252.75-52 chr4 90757479 90758233 + 0.5 NA intron (NM_001145065, intron 7 of 10) intron (NM_001145065, intron 7 of 10) 522825 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 155.5-71 chr17 60510057 60510460 + 0.5 NA intron (NM_006380, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 15982 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 175.25-137 chr7 132854170 132854672 + 0.5 NA intron (NR_133671, intron 6 of 10) intron (NR_133671, intron 6 of 10) 95451 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 134-80 chr18 77002386 77002905 + 0.5 NA intron (NM_001025090, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 14410 NM_001025081 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 126.75-21 chr10 59866371 59866764 + 0.5 NA intron (NM_005436, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 39989 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 135.25-62 chr14 52672369 52672718 + 0.5 NA intron (NM_014584, intron 4 of 15) AluJr4|SINE|Alu 23015 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 156.75-87 chr2 120545023 120545483 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -78904 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 145.5-11 chr1 119971021 119971505 + 0.5 NA intron (NM_001200001, intron 5 of 21) intron (NM_001200001, intron 5 of 21) -74748 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 133.75-4 chr1 75308679 75309099 + 0.5 NA intron (NM_001320283, intron 2 of 21) intron (NM_001320283, intron 2 of 21) 174501 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 131.25-218 chr9 105938688 105939195 + 0.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 244400 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 133-107 chr3 62053637 62054150 + 0.5 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) L1ME3|LINE|L1 265054 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 120.25-219 chr8 136553681 136554072 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 23078 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 124-92 chr2 154913880 154914268 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 215379 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 126.25-61 chr16 8540900 8541304 + 0.5 NA intron (NM_001290098, intron 2 of 2) intron (NM_001290098, intron 2 of 2) 48736 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 178.5-19 chr10 124641627 124642112 + 0.5 NA intron (NM_014661, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -62159 NR_120631 101927944 Hs.437448 NR_120630 FAM53B-AS1 - FAM53B antisense RNA 1 ncRNA 137-146 chr5 175523043 175523479 + 0.5 NA intron (NM_001322982, intron 10 of 10) intron (NM_001322982, intron 10 of 10) 44701 NM_001322980 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 159.75-36 chr13 101911840 101912395 + 0.5 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) 4528 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 133.5-161 chr3 53070850 53071275 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24989 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 149.25-149 chr5 160111253 160111803 + 0.5 NA intron (NM_001349734, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 7922 NM_001130864 114825 Hs.744960 NM_052927 ENSG00000170234 PWWP2A MST101 PWWP domain containing 2A protein-coding 174.5-163 chr6 121668371 121668959 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 233019 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 117.5-23 chr1 238379770 238380084 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106090 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 145.25-104 chr3 115010911 115011338 + 0.5 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) L1MA3|LINE|L1 60290 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 134-86 chr2 16322755 16323224 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 272562 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 215.25-65 chr3 166162613 166163123 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -325445 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 150-11 chr10 25279225 25279641 + 0.5 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) LTR15|LTR|ERV1 -103157 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 131.25-46 chr13 43357685 43358122 + 0.5 NA intron (NM_001347966, intron 8 of 17) intron (NM_001347966, intron 8 of 17) -90949 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 173.5-27 chr10 128490951 128491465 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 205258 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 113.5-221 chr7 87372800 87373228 + 0.5 NA intron (NM_021151, intron 7 of 17) L1MB7|LINE|L1 27350 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 143.25-123 chr3 107258454 107258942 + 0.5 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) intron (NR_028302, intron 1 of 3) 18006 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 119.5-224 chr8 16890080 16890340 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 112135 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 138-54 chr16 72207472 72207806 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35189 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 164-127 chr7 42932856 42933315 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_002787) promoter-TSS (NM_002787) 709 NM_031903 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 116-135 chr5 171642477 171642818 + 0.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -143225 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 180.75-15 chr10 58730087 58730640 + 0.5 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 15348 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 157.5-200 chr8 22344008 22344539 + 0.5 NA intron (NM_001330480, intron 20 of 21) L1MC2|LINE|L1 -23005 NM_001135154 23516 Hs.491232 NM_015359 ENSG00000104635 SLC39A14 HCIN|HMNDYT2|LZT-Hs4|NET34|ZIP14|cig19 solute carrier family 39 member 14 protein-coding 121-86 chr18 5209853 5210119 + 0.5 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -12234 NM_001330553 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 202-6 chr1 198938464 198939213 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1409 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 159.75-14 chr10 18790065 18790484 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 130843 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 170.5-41 chr11 99634352 99634852 + 0.5 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 78457 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 114.75-74 chr18 6135802 6136110 + 0.5 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) THE1A|LTR|ERVL-MaLR -120788 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 129.75-31 chr10 94885326 94885704 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -53143 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 177.25-100 chr3 185502489 185503002 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3710 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 161.5-185 chr8 122576944 122577322 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8489 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 119.5-234 chr8 85243091 85243526 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -2150 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 126.25-48 chr14 48330937 48331374 + 0.5 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -536141 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 147.5-48 chr12 49767639 49768106 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26063 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 199.25-99 chr8 124142689 124143356 + 0.5 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) intron (NR_103547, intron 1 of 4) 28500 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 154.5-171 chr7 42234816 42235266 + 0.5 NA intron (NM_000168, intron 1 of 14) intron (NM_000168, intron 1 of 14) 2168 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 112.25-187 chr6 83226875 83227181 + 0.5 NA intron (NM_002395, intron 11 of 13) intron (NM_002395, intron 11 of 13) -33128 NM_001199917 5238 Hs.661665 NM_015599 ENSG00000013375 PGM3 AGM1|IMD23|PAGM|PGM 3 phosphoglucomutase 3 protein-coding 118.25-32 chr10 125220752 125221172 + 0.5 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -59932 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 150.75-27 chr10 58814072 58814559 + 0.5 NA intron (NM_001080512, intron 18 of 20) intron (NM_001080512, intron 18 of 20) 99300 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 161-5 chr1 154270481 154271012 + 0.5 NA 3' UTR (NM_014847, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_014847, exon 27 of 27) -1817 NM_006118 10456 Hs.199625 NM_006118 ENSG00000143575 HAX1 HCLSBP1|HS1BP1|SCN3 HCLS1 associated protein X-1 protein-coding 120.75-80 chr2 136407852 136408265 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -289903 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 131.5-131 chr2 207721547 207721990 + 0.5 NA intron (NM_001330218, intron 1 of 9) AluSc|SINE|Alu 10228 NM_152523 151195 Hs.471234 NM_152523 ENSG00000163249 CCNYL1 - cyclin Y like 1 protein-coding 113-101 chr2 229681231 229681570 + 0.5 NA intron (NM_139072, intron 1 of 12) intron (NM_139072, intron 1 of 12) 33155 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 120.5-101 chr18 4444015 4444322 + 0.5 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 11098 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 187-112 chrX 49772570 49773169 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -56391 NM_001318877 9506 Hs.441038 NM_007003 ENSG00000101951 PAGE4 CT16.7|GAGE-9|GAGEC1|JM-27|JM27|PAGE-1|PAGE-4 PAGE family member 4 protein-coding 187.75-93 chr5 121698214 121698907 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153322 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 118.75-28 chr10 118767367 118767790 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12608 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 170.75-141 chr8 119960745 119961172 + 0.5 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) AluSq2|SINE|Alu 87236 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 156.75-145 chr6 54950918 54951532 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 104454 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 127.25-27 chr10 100896182 100896519 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16613 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 125.75-38 chr11 127130864 127131143 + 0.5 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 64001 NR_120578 101929473 Hs.737523 NR_120578 ENSG00000255087 LOC101929473 - uncharacterized LOC101929473 ncRNA 126-127 chr4 72302251 72302690 + 0.5 NA intron (NM_014243, intron 17 of 21) L1ME4b|LINE|L1 263338 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 126.5-207 chr6 86778885 86779251 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -158460 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 123.75-8 chr1 115937731 115938192 + 0.5 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) intron (NR_125970, intron 2 of 4) 18585 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 117-122 chr3 88683053 88683444 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 344792 NM_001368165 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 135.25 chr1 43916766 43917047 + 0.5 NA intron (NM_001270461, intron 8 of 8) L1ME4c|LINE|L1 -16414 NM_057090 9048 Hs.632404 NM_003976 ENSG00000117407 ARTN ART|ENOVIN|EVN|NBN artemin protein-coding 157.25-138 chr7 38494472 38495007 + 0.5 NA intron (NM_001635, intron 3 of 20) intron (NM_001635, intron 3 of 20) 136634 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 201.5-92 chr3 182666368 182667044 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -126798 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 143.25-104 chr20 47299536 47299987 + 0.5 NA intron (NM_001281774, intron 4 of 23) AluSc8|SINE|Alu -18741 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 131.75-174 chr5 100315067 100315477 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 72982 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 134.75-179 chr5 115576818 115577238 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25127 NR_109875 101927100 Hs.745340 NR_109874 LOC101927100 - uncharacterized LOC101927100 ncRNA 118.25-170 chr6 50212104 50212479 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -162362 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 127-143 chr5 120435970 120436397 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28095 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 145-33 chr12 9188853 9189218 + 0.5 NA intron (NM_002864, intron 13 of 35) L1PREC2|LINE|L1 19360 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 113.75-129 chr3 86565571 86565851 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 83768 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 146.75-47 chr14 72904699 72905274 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10870 NM_001280543 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 123-114 chr2 210936055 210936414 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 318663 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 129.75-193 chr9 16615493 16615885 + 0.5 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) MER34|LTR|ERV1 -111125 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 181.25-112 chr6 76703852 76704283 + 0.5 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -110444 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 169.75-65 chr18 2267812 2268390 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 303404 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 119.25-16 chr1 178067294 178067679 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 26507 NR_027982 100302401 Hs.736117 NR_027982 ENSG00000224687 RASAL2-AS1 - RASAL2 antisense RNA 1 ncRNA 217.25-35 chr18 11683369 11683959 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -5600 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 131-128 chr3 195064212 195064627 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -30169 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 134.5-49 chr12 40344833 40345230 + 0.5 NA intron (NM_198578, intron 41 of 50) intron (NM_198578, intron 41 of 50) -48363 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 125.5-169 chr3 49313269 49313739 + 0.5 NA intron (NM_001251877, intron 6 of 6) AluSq2|SINE|Alu 26549 NM_001251877 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 157-11 chr10 100084965 100085438 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3332 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 126.75-13 chr10 24381395 24381815 + 0.5 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) MER1B|DNA|hAT-Charlie -67809 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 136.75-162 chr5 128387962 128388491 + 0.5 NA intron (NM_001999, intron 11 of 64) L1PA15|LINE|L1 150019 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 113.25-143 chr5 128446210 128446624 + 0.5 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) intron (NM_001999, intron 7 of 64) 91828 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 123.5-208 chr8 96205113 96205542 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 30307 NR_045639 7381 Hs.131255 NM_006294 ENSG00000156467 UQCRB MC3DN3|QCR7|QP-C|QPC|UQBC|UQBP|UQCR6|UQPC ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein protein-coding 126.25-125 chr4 13161924 13162307 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 322225 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 124.75-47 chr11 81584168 81584593 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 306456 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 128-89 chr20 35662083 35662467 + 0.5 NA intron (NM_001198838, intron 1 of 2) intron (NM_001198838, intron 1 of 2) 2625 NM_152927 8904 Hs.246413 NM_003915 ENSG00000214078 CPNE1 COPN1|CPN1 copine 1 protein-coding 125.5-220 chr6 70575209 70575560 + 0.5 NA intron (NM_145267, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 8454 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 188.5-171 chrX 72190615 72191141 + 0.5 NA intron (NM_006223, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 9121 NR_033187 5303 Hs.655623 NM_006223 ENSG00000102309 PIN4 EPVH|PAR14|PAR17 peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 protein-coding 119.25-148 chr4 66427508 66427825 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 150842 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 115-6 chr1 73886170 73886543 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 211677 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 135-130 chr4 121825754 121826085 + 0.5 NA exon (NM_176824, exon 19 of 19) exon (NM_176824, exon 19 of 19) -2036 NM_001237 890 Hs.58974 NM_001237 ENSG00000145386 CCNA2 CCN1|CCNA cyclin A2 protein-coding 145.5-201 chrX 84432020 84432485 + 0.5 NA intron (NM_001177478, intron 4 of 9) L1PA15|LINE|L1 70201 NM_144657 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 174.25-145 chr8 101211205 101211646 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5361 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 154-75 chr2 144531663 144532243 + 0.5 NA intron (NR_110570, intron 1 of 2) intron (NR_110570, intron 1 of 2) -7509 NR_136320 105373656 Hs.734683 NR_136320 LOC105373656 - uncharacterized LOC105373656 ncRNA 167.25-50 chr14 102911866 102912465 + 0.5 NA TTS (NM_003300) TTS (NM_003300) -10491 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 148.75-76 chr19 19051790 19052200 + 0.5 NA exon (NM_033415, exon 4 of 8) exon (NM_033415, exon 4 of 8) -11999 NM_001321544 284439 Hs.303669 NM_178526 ENSG00000181035 SLC25A42 MECREN solute carrier family 25 member 42 protein-coding 147-5 chr1 70113014 70113384 + 0.5 NA intron (NM_001370785, intron 26 of 26) intron (NM_001370785, intron 26 of 26) 92380 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 147.5-203 chr7 109619540 109619934 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 340476 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 118.75-27 chr10 118069912 118070149 + 0.5 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -23089 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 163.75-128 chr8 121190725 121191262 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -378947 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 157-70 chr22 17337416 17337995 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -22244 NM_001290046 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 133-174 chr8 119692622 119693112 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -19477 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 113-106 chr21 27259736 27260121 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -292840 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 115.5-147 chr2 229655826 229656107 + 0.5 NA intron (NM_139072, intron 1 of 12) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 58589 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 125.75-9 chr1 154480986 154481370 + 0.5 NA non-coding (NR_135169, exon 6 of 6) non-coding (NR_135169, exon 6 of 6) -21041 NM_182499 126668 Hs.387671 NM_182499 ENSG00000163239 TDRD10 - tudor domain containing 10 protein-coding 119.75-2 chr1 37104570 37104912 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56822 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 151.25-80 chr2 22533239 22533749 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2985 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 122.75-20 chr10 21186490 21186915 + 0.5 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 12400 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 141.25-167 chr7 27415093 27415635 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168135 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 120.5-169 chr4 127919177 127919568 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001363521, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001363521, exon 9 of 9) 38128 NM_001190801 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 215.25-69 chr4 89585603 89586070 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -250565 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 181.75-113 chr6 131023815 131024371 + 0.5 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 -10484 NM_001350309 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 130.5-3 chr1 32778672 32779172 + 0.5 NA intron (NM_003680, intron 12 of 12) AluSq2|SINE|Alu 13295 NM_001198972 57648 Hs.591502 NM_020888 ENSG00000162522 KIAA1522 - KIAA1522 protein-coding 171.75-110 chr5 18252651 18253195 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 445649 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 114-145 chr6 97778104 97778457 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -246251 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 130-10 chr1 210125456 210125763 + 0.5 NA intron (NM_153262, intron 6 of 7) LTR67B|LTR|ERVL -107187 NM_001354173 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 139.5-213 chr8 87731818 87732322 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 141945 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 124.25-29 chr11 10796802 10797132 + 0.5 NA TTS (NM_001418) TTS (NM_001418) 4641 NR_004403 692223 Hs.723086 NR_004403 ENSG00000238622 SNORD97 U97 small nucleolar RNA, C/D box 97 snoRNA 121.75-62 chr17 81287449 81287713 + 0.5 NA intron (NM_001037984, intron 2 of 15) intron (NM_001037984, intron 2 of 15) 7726 NM_001037984 124565 Hs.352240 NM_138570 ENSG00000157637 SLC38A10 PP1744 solute carrier family 38 member 10 protein-coding 126-62 chr15 64601203 64601566 + 0.5 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 101897 NM_001301302 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 121.5-203 chr5 4131702 4132029 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 536033 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 130.25-129 chr22 41249822 41250112 + 0.5 NA intron (NM_001317930, intron 13 of 15) intron (NM_001317930, intron 13 of 15) 3083 NR_106949 102466758 NR_106949 ENSG00000274552 MIR6889 hsa-mir-6889 microRNA 6889 ncRNA 113.5-79 chr14 67958822 67959208 + 0.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 135423 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 142.25-5 chr1 160961874 160962315 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -7285 NM_080878 142683 Hs.385631 NM_080878 ENSG00000158764 ITLN2 HL-2|HL2 intelectin 2 protein-coding 173.75-71 chr17 61223542 61224070 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 143898 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 148.5-105 chr2 82866856 82867394 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 10322 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 136.5-48 chr11 87820664 87821139 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -101490 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 120.25-143 chr4 33787588 33787962 + 0.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 252118 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 138.25-146 chr6 24975978 24976254 + 0.5 NA intron (NM_001286446, intron 1 of 13) L1ME4a|LINE|L1 -40156 NM_001286445 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 121-170 chr6 141884762 141885157 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 203840 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 117.25-45 chr11 128501072 128501416 + 0.5 NA intron (NM_001143820, intron 3 of 9) intron (NM_001143820, intron 3 of 9) 21066 NM_001162422 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 132-30 chr11 67044421 67044889 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_106920) promoter-TSS (NR_106920) -988 NR_106920 102465518 NR_106920 ENSG00000283326 MIR6860 hsa-mir-6860 microRNA 6860 ncRNA 128.5-9 chr1 52197324 52197817 + 0.5 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) L2|LINE|L2 55476 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 129-192 chr9 113630034 113630448 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 36112 NM_001276262 5998 Hs.494875 NM_017790 ENSG00000138835 RGS3 C2PA|RGP3 regulator of G protein signaling 3 protein-coding 117.5-110 chr2 122190305 122190697 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 434850 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 123.5-9 chr1 183594341 183594710 + 0.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -3611 NM_001127651 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 137-24 chr10 39537688 39538081 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 841288 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 128.5-134 chr22 27242139 27242585 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -17683 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 134.5-204 chr7 31864727 31865241 + 0.5 NA exon (NM_001322058, exon 8 of 18) exon (NM_001322058, exon 8 of 18) 177769 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 148.75-99 chr20 12168345 12168736 + 0.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 250647 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 127.75-184 chr7 12232588 12233007 + 0.5 NA 3' UTR (NM_018374, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018374, exon 9 of 9) 21503 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 140.75-144 chr5 43845674 43846008 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -242611 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 135-73 chr19 44861625 44861940 + 0.5 NA intron (NM_001042724, intron 1 of 8) L1PA10|LINE|L1 15485 NM_002856 5819 Hs.655455 NM_002856 ENSG00000130202 NECTIN2 CD112|HVEB|PRR2|PVRL2|PVRR2 nectin cell adhesion molecule 2 protein-coding 194-37 chr14_GL000225v1_random 74613 75309 + 0.5 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 134.75-219 chr8 103610416 103610794 + 0.5 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1PREC2|LINE|L1 -108695 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 119.75-134 chr22 29118303 29118752 + 0.5 NA intron (NM_001039570, intron 3 of 8) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 45492 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 147.5-99 chr2 78010802 78011237 + 0.5 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) LTR79|LTR|ERVL -55993 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 151.25-158 chr5 153285998 153286372 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -204339 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 112.25-143 chr3 193463081 193463513 + 0.5 NA intron (NM_032279, intron 12 of 29) MIRc|SINE|MIR -84544 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 125.5-271 chr9 90373082 90373410 + 0.5 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 60243 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 125.75-111 chr20 32496764 32497100 + 0.5 NA intron (NM_001256798, intron 4 of 10) intron (NM_001256798, intron 4 of 10) -13027 NR_110619 101929698 Hs.638392 NR_110619 ENSG00000277301 LOC101929698 - uncharacterized LOC101929698 ncRNA 157.75-98 chr2 231129239 231129673 + 0.5 NA intron (NM_001191037, intron 16 of 23) intron (NM_001191037, intron 16 of 23) -4414 NM_000867 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 134.75-45 chr11 92830883 92831175 + 0.5 NA intron (NM_001008781, intron 12 of 24) L2a|LINE|L2 84599 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 120.75-34 chr13 37494028 37494269 + 0.5 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -9364 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 115.25-50 chr12 62935911 62936184 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_020700) promoter-TSS (NM_020700) -897 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 141-66 chr19 15047025 15047383 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2276 NM_012114 23581 Hs.466057 NM_012114 ENSG00000105141 CASP14 ARCI12 caspase 14 protein-coding 163.25-3 chr1 44632523 44632952 + 0.5 NA intron (NM_001319957, intron 5 of 13) intron (NM_001319957, intron 5 of 13) 38319 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 119.5-215 chr7 48709562 48710015 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -214759 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 146.25-112 chr4 121328517 121328938 + 0.5 NA TTS (NM_198179) TTS (NM_198179) 52291 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 188.5-46 chr15 78905601 78906090 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 32856 NM_001265604 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 163-121 chr8 127360734 127361138 + 0.5 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) L1MA10|LINE|L1 -39463 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 122.75-46 chr14 45199071 45199471 + 0.5 NA intron (NM_001308133, intron 21 of 21) intron (NM_001308133, intron 21 of 21) 53931 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 119.5-84 chr15 44511559 44511936 + 0.5 NA intron (NM_016396, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu 25153 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 131-142 chr6 45452362 45452735 + 0.5 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 30273 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 163.5-7 chr1 76559117 76559596 + 0.5 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 219911 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 128.75-30 chr11 42948597 42949109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 320516 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 116-147 chr6 146714078 146714419 + 0.5 NA intron (NM_024694, intron 13 of 35) HAL1|LINE|L1 89576 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 119.5-47 chr11 86344867 86345312 + 0.5 NA intron (NR_136324, intron 5 of 5) intron (NR_136324, intron 5 of 5) -29647 NM_021827 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 124.25-215 chrX 132406004 132406367 + 0.5 NA intron (NM_001170704, intron 3 of 8) intron (NM_001170704, intron 3 of 8) 7390 NM_001170702 55796 Hs.105134 NM_018388 ENSG00000076770 MBNL3 CHCR|MBLX|MBLX39|MBXL muscleblind like splicing regulator 3 protein-coding 117.5-185 chr5 104497225 104497613 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -602055 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 121.5-186 chr3 156642767 156643165 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31624 NM_015508 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 118-22 chr11 5836987 5837440 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 4684 NM_001005167 390078 NM_001005167 ENSG00000205409 OR52E6 OR11-58 olfactory receptor family 52 subfamily E member 6 protein-coding 150-24 chr11 110084095 110084612 + 0.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9039 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 168.5-153 chr5 143653754 143654338 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25814 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 117.75-23 chr10 32188791 32189189 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -132565 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 185-12 chr11 102563300 102563969 + 0.5 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -32887 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 202.5-31 chr12 47968131 47968782 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001143841, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001143841, exon 8 of 8) 4860 NM_001143842 79022 Hs.596726 NM_024056 ENSG00000134291 TMEM106C - transmembrane protein 106C protein-coding 139.75-99 chr2 100171142 100171465 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28713 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 119.75-100 chr2 48219459 48219857 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95024 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 138.75-166 chr6 108872289 108872716 + 0.5 NA intron (NM_001286609, intron 3 of 16) intron (NM_001286609, intron 3 of 16) 24080 NM_032131 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 138.75-14 chr1 218090256 218090806 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 47026 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 113-177 chr8 91886331 91886619 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 131205 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 113.25-97 chr2 225690493 225690942 + 0.5 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) intron (NM_001371273, intron 7 of 7) 289831 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 182.75-127 chr7 89123938 89124594 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) LTR108a_Mam|LTR|ERVL -328529 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 149.75-104 chr20 60587820 60588196 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23446 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 185.5-40 chr12 131760383 131760928 + 0.5 NA intron (NM_004592, intron 11 of 17) intron (NM_004592, intron 11 of 17) 49565 NM_001261411 6433 Hs.308171 NM_004592 ENSG00000061936 SFSWAP SFRS8|SWAP splicing factor SWAP protein-coding 152-11 chr1 155923068 155923480 + 0.5 NA intron (NM_014949, intron 8 of 13) intron (NM_014949, intron 8 of 13) 2812 NR_003005 677771 Hs.678903 NR_003005 ENSG00000281394 SCARNA4 ACA26 small Cajal body-specific RNA 4 ncRNA 166.75-73 chr2 13220912 13221313 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -214099 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 113.5-141 chr20 44032545 44032885 + 0.5 NA intron (NM_001098797, intron 3 of 8) intron (NM_001098797, intron 3 of 8) 86819 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 142.5-41 chr11 16166777 16167289 + 0.5 NA intron (NM_033326, intron 6 of 15) L2a|LINE|L2 189513 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 113.25-6 chr1 103011710 103012126 + 0.5 NA intron (NM_001854, intron 14 of 66) intron (NM_001854, intron 14 of 66) 96578 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 142.5-216 chr8 31848417 31848893 + 0.5 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) MER1A|DNA|hAT-Charlie -177081 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 122.75-119 chr22 26290826 26291088 + 0.5 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 121483 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 127.75-93 chr2 43296243 43296625 + 0.5 NA intron (NM_001083953, intron 31 of 37) AluSx|SINE|Alu 69223 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 117.25-177 chr5 153790442 153790726 + 0.5 NA intron (NR_047578, intron 12 of 13) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 108403 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 114.5-124 chr2 14447453 14447786 + 0.5 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -46661 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 136-85 chr2 238396597 238396973 + 0.5 NA intron (NM_001139490, intron 13 of 14) (TGGCCCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -30142 NM_001330196 51665 Hs.516788 NM_016114 ENSG00000065802 ASB1 ASB-1 ankyrin repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 211.75-54 chr20 35732441 35733149 + 0.5 NA intron (NR_040722, intron 4 of 17) intron (NR_040722, intron 4 of 17) 9465 NM_004902 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 139.25-42 chr12 101286162 101286570 + 0.5 NA exon (NM_014503, exon 5 of 62) exon (NM_014503, exon 5 of 62) 6261 NM_014503 27340 Hs.295732 NM_014503 ENSG00000120800 UTP20 1A6/DRIM|DRIM UTP20 small subunit processome component protein-coding 163.25-129 chr6 158922966 158923292 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 34652 NR_160979 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 135.75-217 chrX 110879647 110880016 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -64410 NM_001128166 5063 Hs.593599 NM_002578 ENSG00000077264 PAK3 ARA|MRX30|MRX47|OPHN3|PAK-3|PAK3beta|bPAK|beta-PAK p21 (RAC1) activated kinase 3 protein-coding 183.75-46 chr17 80060949 80061370 + 0.5 NA intron (NM_001330508, intron 9 of 10) AluSx|SINE|Alu 24517 NM_017950 55036 Hs.202542 NM_017950 ENSG00000141519 CCDC40 CILD15|FAP172 coiled-coil domain containing 40 protein-coding 137.25-81 chr2 195047252 195047626 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 316844 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 150.5-124 chr22 43569973 43570410 + 0.5 NA intron (NM_198856, intron 24 of 29) intron (NM_198856, intron 24 of 29) 53937 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 127.25-189 chr7 11747904 11748261 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 84116 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 158.5-98 chr2 82268063 82268460 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -588542 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 130.25-225 chrX 66244668 66244982 + 0.5 NA intron (NM_001367241, intron 15 of 18) L1PA14|LINE|L1 77075 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 132-142 chr5 141134768 141135237 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_015669) promoter-TSS (NM_015669) -204 NM_015669 26167 Hs.119693 NM_015669 ENSG00000113209 PCDHB5 PCDH-BETA5 protocadherin beta 5 protein-coding 270.75-25 chr2 20358311 20359356 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -6580 NM_001352925 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 140-47 chr15 77334555 77335062 + 0.5 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 85296 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 116.25-102 chr2 28641364 28641683 + 0.5 NA intron (NR_138141, intron 35 of 35) AluSx1|SINE|Alu 75166 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 148.5-206 chr7 28805396 28805859 + 0.5 NA intron (NM_001011666, intron 4 of 6) intron (NM_001011666, intron 4 of 6) 119494 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 203.25-8 chr1 104760532 104761133 + 0.5 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 687809 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 142.5-115 chr2 163709581 163709997 + 0.5 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 26219 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 120-162 chr6 73112060 73112451 + 0.5 NA intron (NM_001160132, intron 7 of 13) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 31259 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 143.75-175 chr7 86235975 86236401 + 0.5 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie -407721 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 129.75-30 chr10 85160635 85160976 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 38100 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 122.75-60 chr17 2474271 2474648 + 0.5 NA intron (NM_024086, intron 3 of 9) intron (NM_024086, intron 3 of 9) 37429 NM_024086 79066 Hs.632237 NM_024086 ENSG00000127804 METTL16 METT10D methyltransferase like 16 protein-coding 128.75-130 chr3 186105240 186105660 + 0.5 NA exon (NM_004454, exon 4 of 13) exon (NM_004454, exon 4 of 13) 3639 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 132.25-43 chr11 74824117 74824517 + 0.5 NA intron (NM_001098638, intron 4 of 5) L1PA11|LINE|L1 75468 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 149.25-42 chr13 76060902 76061272 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -125955 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 223.75-83 chr9 84246597 84247149 + 0.5 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 93885 NM_001199633 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 186.5-83 chr21 31841412 31841980 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -31324 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 139.75-116 chr3 2482062 2482507 + 0.5 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 243455 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 119-209 chr9 82892560 82892949 + 0.5 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 170388 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 197.5-149 chr7 68292964 68293461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 272959 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 134.5-167 chr5 26610580 26611096 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 427748 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 167.25-127 chr5 90484297 90484703 + 0.5 NA intron (NM_001370351, intron 1 of 7) intron (NM_001370351, intron 1 of 7) 9636 NM_001370353 10622 Hs.282387 NM_006467 ENSG00000113356 POLR3G RPC32|RPC7 RNA polymerase III subunit G protein-coding 149.75-122 chr4 97377835 97378236 + 0.5 NA intron (NR_102713, intron 1 of 5) intron (NR_102713, intron 1 of 5) 11109 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 153-101 chr3 178472222 178472549 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 53184 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 158-117 chr5 180318461 180319059 + 0.5 NA intron (NM_005110, intron 10 of 18) intron (NM_005110, intron 10 of 18) -26677 NM_001364609 5601 Hs.484371 NM_002752 ENSG00000050748 MAPK9 JNK-55|JNK2|JNK2A|JNK2ALPHA|JNK2B|JNK2BETA|PRKM9|SAPK|SAPK1a|p54a|p54aSAPK mitogen-activated protein kinase 9 protein-coding 148.5-152 chr3 94424703 94425085 + 0.5 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 361833 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 119.5-143 chr22 44819893 44820276 + 0.5 NA intron (NM_181335, intron 5 of 11) intron (NM_181335, intron 5 of 11) 67526 NM_181335 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 154.75-31 chr12 132934946 132935414 + 0.5 NA intron (NM_001164715, intron 2 of 4) intron (NM_001164715, intron 2 of 4) 21126 NM_001164715 100289635 Hs.29698 NM_183238 ENSG00000196458 ZNF605 - zinc finger protein 605 protein-coding 154.5-176 chr7 122336199 122336631 + 0.5 NA intron (NM_001167940, intron 28 of 29) intron (NM_001167940, intron 28 of 29) -31665 NM_001024613 389549 Hs.553970 NM_001024613 ENSG00000128610 FEZF1 FEZ|HH22|ZNF312B FEZ family zinc finger 1 protein-coding 129-80 chr17 66311585 66312037 + 0.5 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 9198 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 118.75-109 chr2 162714139 162714593 + 0.5 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -54570 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 117.25-167 chr5 31535383 31535697 + 0.5 NA intron (NR_134298, intron 2 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 3239 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 144-54 chr19 44281783 44282328 + 0.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 22141 NM_181756 353355 Hs.466891 NM_181756 ENSG00000159915 ZNF233 - zinc finger protein 233 protein-coding 159-88 chr5 52121112 52121559 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113304 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 124.5-23 chr10 37055623 37056052 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -70020 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 121.25-95 chr2 121599973 121600444 + 0.5 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) L2b|LINE|L2 49254 NM_001207051 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 113.5-45 chr11 26423615 26424013 + 0.5 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR -50088 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 117.5-148 chr3 144758613 144758942 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 785696 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 184.75-74 chr3 197030702 197031400 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1234 NM_005929 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 130.5-132 chr2 63519575 63519996 + 0.5 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) L1PA13|LINE|L1 68692 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 126.75-182 chr4 148024855 148025263 + 0.5 NA intron (NM_024605, intron 19 of 22) intron (NM_024605, intron 19 of 22) 242464 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 172.25-22 chr10 89353626 89354225 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 21396 NM_001031683 3437 Hs.47338 NM_001549 ENSG00000119917 IFIT3 CIG-49|GARG-49|IFI60|IFIT4|IRG2|ISG60|P60|RIG-G|cig41 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 protein-coding 124.75-32 chr10 84315429 84315845 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12952 NM_001351290 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 190.75-18 chr11 133755810 133756452 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 54245 NR_120444 646522 Hs.560000 NR_120444 ENSG00000255258 LINC02743 - long intergenic non-protein coding RNA 2743 ncRNA 137-112 chr3 188985075 188985410 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -37603 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 167.5-125 chr4 92572616 92573119 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) L1PA11|LINE|L1 268468 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 175.75-23 chr11 61839871 61840316 + 0.5 NA intron (NM_001281502, intron 2 of 11) intron (NM_001281502, intron 2 of 11) 11793 NM_004265 9415 Hs.502745 NM_004265 ENSG00000134824 FADS2 D6D|DES6|FADSD6|LLCDL2|SLL0262|TU13 fatty acid desaturase 2 protein-coding 156.75-25 chr10 63775318 63775901 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -253719 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 173-75 chr20 43813589 43814092 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -80878 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 125.75-196 chr9 123092116 123092487 + 0.5 NA intron (NM_012197, intron 21 of 25) intron (NM_012197, intron 21 of 25) 19342 NR_030331 693185 NR_030331 ENSG00000283941 MIR600 MIRN600|hsa-mir-600 microRNA 600 ncRNA 142.5-151 chr4 76585311 76585849 + 0.5 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 10029 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 112.5-125 chr2 116585774 116586094 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1228757 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 159.75-170 chr8 66220023 66220481 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28138 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 126.75-74 chr15 58341633 58341929 + 0.5 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -90210 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 150.5-162 chr5 7841290 7841774 + 0.5 NA intron (NM_001089584, intron 1 of 2) L1PA11|LINE|L1 9601 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 118-167 chr6 129165323 129165612 + 0.5 NA intron (NM_000426, intron 8 of 64) intron (NM_000426, intron 8 of 64) 282326 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 117.5-223 chr7 82487979 82488412 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -44239 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 135.5-85 chr18 11434522 11434900 + 0.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -19767 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 144.75-23 chr10 110264499 110264834 + 0.5 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) intron (NM_005962, intron 3 of 5) 38670 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 150.25-88 chr20 41516115 41516483 + 0.5 NA intron (NM_032221, intron 3 of 36) AluSx1|SINE|Alu 102078 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 133-170 chr8 76339579 76340103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66813 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 119.5-233 chr8 78746646 78747060 + 0.5 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) intron (NM_001199886, intron 2 of 4) -22479 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 137.5-216 chr6 150856045 150856373 + 0.5 NA Intergenic LTR12_|LTR|ERV1 -9470 NR_146719 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 130.25-60 chr14 69783234 69783583 + 0.5 NA intron (NM_003049, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 13833 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 112.5-71 chr14 26599328 26599634 + 0.5 NA non-coding (NR_147061, exon 1 of 7) non-coding (NR_147061, exon 1 of 7) 834 NR_147061 102725045 Hs.143441 NR_147061 LINC02588 C14orf22|NOVA1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2588 ncRNA 123.25-184 chr7 15451359 15451650 + 0.5 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 110511 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 126.5-43 chr11 99262219 99262668 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 241494 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 126-39 chr12 18978282 18978677 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -151254 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 141.75-148 chr6 24895893 24896298 + 0.5 NA intron (NM_001286446, intron 1 of 13) intron (NM_001286446, intron 1 of 13) 14639 NM_001346032 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 114.25-172 chr6 147464752 147465091 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -43769 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 188.75-34 chr15 63651898 63652539 + 0.5 NA intron (NM_003922, intron 52 of 77) intron (NM_003922, intron 52 of 77) -51391 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 138.25-18 chr10 37951890 37952421 + 0.5 NA non-coding (NR_138068, exon 7 of 7) non-coding (NR_138068, exon 7 of 7) 23825 NR_138069 219749 Hs.499429 NM_145011 ENSG00000175395 ZNF25 KOX19|Zfp9 zinc finger protein 25 protein-coding 124.5-200 chr7 9221564 9221976 + 0.5 NA Intergenic LTR75B|LTR|ERVL -412500 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 156.75-108 chr3 29744137 29744619 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 5 of 13) intron (NM_001003792, intron 5 of 13) 189778 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 137-183 chr8 130845481 130845917 + 0.5 NA intron (NM_001115, intron 11 of 17) intron (NM_001115, intron 11 of 17) 195210 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 137.75-50 chr13 43647036 43647393 + 0.5 NA intron (NM_001347964, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR -17737 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 133-42 chr14 19923762 19924229 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3388 NM_001005483 79317 Hs.554585 NM_001005483 ENSG00000176281 OR4K5 OR14-16 olfactory receptor family 4 subfamily K member 5 protein-coding 154.25-80 chr2 70717738 70718186 + 0.5 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) intron (NM_017482, intron 1 of 12) 49753 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 135.5-94 chr19 30231398 30231684 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -140843 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 136.25-178 chr7 90799783 90800259 + 0.5 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) intron (NM_012395, intron 4 of 13) 90205 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 116-167 chr8 77639273 77639706 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 188792 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 212.75-21 chr12 19299944 19300716 + 0.5 NA intron (NM_001143821, intron 14 of 27) intron (NM_001143821, intron 14 of 27) 95005 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 135.5-153 chr4 161970222 161970730 + 0.5 NA intron (NM_001128428, intron 3 of 14) intron (NM_001128428, intron 3 of 14) -52257 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 199.5-126 chr6 38626845 38627335 + 0.5 NA intron (NM_052893, intron 1 of 11) intron (NM_052893, intron 1 of 11) 12839 NM_052893 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 132-183 chr9 8959344 8959775 + 0.5 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) intron (NM_002839, intron 11 of 45) 101541 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 165.5-75 chr2 46186030 46186517 + 0.5 NA 3' UTR (NM_005400, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_005400, exon 15 of 15) -111134 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 176.5-179 chr8 132711292 132711944 + 0.5 NA intron (NM_144649, intron 9 of 9) intron (NM_144649, intron 9 of 9) -36073 NM_001321966 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 133.5-284 chr9 117246801 117247185 + 0.5 NA intron (NM_014010, intron 2 of 21) intron (NM_014010, intron 2 of 21) -65792 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 118.5-43 chr12 41849891 41850351 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 85932 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 121.5-171 chr3 19700946 19701264 + 0.5 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 233112 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 161.25-64 chr16 10124529 10125108 + 0.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 57249 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 184.25-37 chr14 55847883 55848414 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51474 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 116.25-214 chr7 53327219 53327647 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 291800 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 144.25-191 chr7 95177642 95178140 + 0.5 NA intron (NM_017650, intron 5 of 15) L1PB1|LINE|L1 146641 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 153.5-60 chr14 87501451 87501967 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 153585 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 134.25-11 chr10 7478703 7479035 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67383 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 112.25-152 chr4 63229475 63229889 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1067917 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 138.75-200 chr8 126729735 126730136 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -171457 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 174-51 chr2 134404743 134405109 + 0.5 NA intron (NM_001371457, intron 12 of 16) intron (NM_001371457, intron 12 of 16) 150854 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 118.25-70 chr14 90037926 90038358 + 0.5 NA intron (NM_001008744, intron 15 of 15) L1MC4|LINE|L1 -23852 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 173.25-35 chr14 46191951 46192499 + 0.5 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1M1|LINE|L1 128066 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 138-59 chr17 33160330 33160753 + 0.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 132447 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 149-48 chr2 10993800 10994299 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 82115 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 133.5-19 chr1 214499513 214499984 + 0.5 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) intron (NM_005401, intron 1 of 18) 51854 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 179.25-20 chr10 58038747 58039297 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 228872 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 135.5-145 chr4 32703574 32703946 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 352722 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 122.5-120 chr2 160881377 160881722 + 0.5 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -255406 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 119-160 chr6 40884993 40885335 + 0.5 NA intron (NR_110873, intron 4 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie 138116 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 138.5-87 chr18 23779803 23780265 + 0.5 NA intron (NM_001127717, intron 11 of 73) intron (NM_001127717, intron 11 of 73) 90581 NM_001302996 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 149.5-23 chr10 24013032 24013529 + 0.5 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -195511 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 166.75-13 chr10 33645985 33646602 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 126387 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 147-62 chr18 46167992 46168512 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5770 NM_001008239 147339 Hs.116486 NM_145055 ENSG00000152242 C18orf25 ARKL1|Ark2N|RNF111L1 chromosome 18 open reading frame 25 protein-coding 145-70 chr2 25582792 25583200 + 0.5 NA intron (NM_001320935, intron 4 of 17) AluSx1|SINE|Alu 67226 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 131.5-158 chr3 112532363 112532791 + 0.5 NA TTS (NM_022488) TTS (NM_022488) -28743 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 141.5-7 chr1 85910703 85911240 + 0.5 NA intron (NM_152890, intron 25 of 59) intron (NM_152890, intron 25 of 59) -202538 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 125.5-192 chr4 121970552 121970824 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18628 NM_001130698 7222 Hs.150981 NM_003305 ENSG00000138741 TRPC3 SCA41|TRP3 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 protein-coding 120.25-51 chr12 50407209 50407552 + 0.5 NA intron (NM_001352306, intron 2 of 15) intron (NM_001352306, intron 2 of 15) 5973 NM_001352314 113251 Hs.26613 NM_052879 ENSG00000161813 LARP4 PP13296 La ribonucleoprotein domain family member 4 protein-coding 182.5-173 chr9 32277064 32277680 + 0.5 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -107231 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 164-114 chr6 56903817 56904348 + 0.5 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) MIR|SINE|MIR 50748 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 117.5-145 chr3 134274952 134275241 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -24352 NM_001005861 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 130.5-61 chr11 69615317 69615820 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25537 NM_053056 595 Hs.523852 NM_053056 ENSG00000110092 CCND1 BCL1|D11S287E|PRAD1|U21B31 cyclin D1 protein-coding 118.75-30 chr11 12523788 12524043 + 0.5 NA intron (NM_018222, intron 12 of 12) intron (NM_018222, intron 12 of 12) 146344 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 149.25-194 chr9 90675938 90676500 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -33395 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 197.25-72 chr3 121447194 121447695 + 0.5 NA intron (NM_199420, intron 26 of 29) AluSx1|SINE|Alu 98544 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 133-103 chr3 4530514 4530875 + 0.5 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) AluJo|SINE|Alu 37346 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 115.5-139 chr2 189603541 189603814 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22866 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 117.75-181 chr6 9231739 9232145 + 0.5 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 579733 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 138.5-182 chr7 41997262 41997739 + 0.5 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) intron (NM_000168, intron 10 of 14) 239709 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 150-53 chr15 91117473 91118039 + 0.5 NA intron (NM_001323039, intron 1 of 12) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 15960 NM_001323039 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 151.25-141 chr4 103757124 103757635 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37394 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 133.5-251 chr7 108678882 108679234 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 109184 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 285.5-6 chr10 71894970 71895744 + 0.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -44106 NM_001042466 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 122-173 chr7 97248450 97248907 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132085 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 151-119 chr6 101716466 101716888 + 0.5 NA intron (NM_001166247, intron 6 of 16) L1PA5|LINE|L1 317692 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 130.75-63 chr15 99598370 99598686 + 0.5 NA intron (NM_001319206, intron 2 of 11) intron (NM_001319206, intron 2 of 11) 32045 NM_001352616 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 127-26 chr11 32716308 32716705 + 0.5 NA intron (NM_001008391, intron 3 of 17) L1M5|LINE|L1 78152 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 136.75-131 chr3 82258782 82259231 + 0.5 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) L1PA7|LINE|L1 272864 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 118.5-151 chr4 93961430 93961715 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132819 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 140.25-112 chr22 34987506 34987909 + 0.5 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 10209 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 164.25-150 chr7 52861017 52861467 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -174391 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 128-90 chr20 42430679 42430966 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) intron (NM_133170, intron 9 of 31) -254661 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 129-105 chr2 216140945 216141321 + 0.5 NA intron (NM_021141, intron 12 of 20) intron (NM_021141, intron 12 of 20) 31785 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 148.5-6 chr1 93051171 93051631 + 0.5 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -27834 NM_001164393 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 132.75-20 chr10 24928343 24928684 + 0.5 NA intron (NM_020200, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 24093 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 118-127 chr4 19047958 19048229 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1026218 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 144.5-125 chr22 27247587 27247988 + 0.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -23108 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 168.5-132 chr4 92821362 92821843 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 517203 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 126.75-143 chr22 33374641 33375095 + 0.5 NA intron (NM_133642, intron 9 of 14) MER101-int|LTR|ERV1 61801 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 128.75-106 chr20 12924183 12924598 + 0.5 NA intron (NR_109868, intron 5 of 11) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 12573 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 253.75-16 chr18 10799471 10800197 + 0.5 NA intron (NM_022068, intron 11 of 51) AluSx1|SINE|Alu -40185 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 128.25-143 chr4 55902273 55902607 + 0.5 NA exon (NM_018261, exon 18 of 19) exon (NM_018261, exon 18 of 19) -46505 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 123.5-27 chr10 66270459 66270865 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L2a|LINE|L2 -655374 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 160.5-143 chr5 5437507 5437965 + 0.5 NA intron (NM_015325, intron 3 of 18) intron (NM_015325, intron 3 of 18) 15059 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 156.5-3 chr1 58372608 58372970 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -122242 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 217.25-70 chr5 117808033 117808568 + 0.5 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 77939 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 136.75-13 chr1 186020533 186020960 + 0.5 NA intron (NM_031935, intron 35 of 106) intron (NM_031935, intron 35 of 106) -275527 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 112.5-31 chr11 8590974 8591363 + 0.5 NA intron (NM_001289058, intron 1 of 13) intron (NM_001289058, intron 1 of 13) 2808 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 127.5-210 chr6 63225441 63225905 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 94304 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 142.75-108 chr2 205758598 205758941 + 0.5 NA intron (NM_018534, intron 12 of 15) intron (NM_018534, intron 12 of 15) 76268 NM_201267 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 178.75-49 chr2 134586213 134586910 + 0.5 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 132439 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 196.75-10 chr1 235132115 235132857 + 0.5 NA intron (NR_144492, intron 8 of 8) AluSc|SINE|Alu -3649 NM_014765 9804 Hs.533192 NM_014765 ENSG00000173726 TOMM20 MAS20|MOM19|TOM20 translocase of outer mitochondrial membrane 20 protein-coding 126.25-35 chr11 126566706 126567156 + 0.5 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR -85847 NR_120532 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 136.25-161 chr6 16993791 16994216 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -108255 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 112.75-184 chr7 15914518 15914957 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 226359 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 119.25-74 chr16 84933079 84933382 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 78305 NM_017740 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 163-40 chr14 74893054 74893571 + 0.5 NA intron (NR_045209, intron 7 of 13) intron (NR_045209, intron 7 of 13) 11396 NR_045209 1743 Hs.525459 NM_001933 ENSG00000119689 DLST DLTS dihydrolipoamide S-succinyltransferase protein-coding 131.25-176 chr6 53697306 53697667 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31730 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 205-7 chr1 226150735 226151302 + 0.5 NA intron (NR_146443, intron 1 of 1) intron (NR_146443, intron 1 of 1) 3015 NR_146443 107985353 Hs.735455 NR_146443 ENSG00000234478 ACBD3-AS1 - ACBD3 antisense RNA 1 ncRNA 120.5 chr1 14191522 14191864 + 0.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 228280 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 151.5-50 chr14 68252723 68253202 + 0.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluSx|SINE|Alu 375825 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 113.25-155 chr7 30252572 30252901 + 0.5 NA intron (NR_136267, intron 3 of 3) intron (NR_136267, intron 3 of 3) -31861 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 123.75-179 chr7 106606125 106606469 + 0.5 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 54861 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 144.5-7 chr1 64147086 64147610 + 0.5 NA intron (NM_005012, intron 7 of 8) intron (NM_005012, intron 7 of 8) -33557 NR_110665 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-22 chr10 15771471 15771927 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -51364 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 147.25-41 chr15 81411261 81411818 + 0.5 NA intron (NR_120365, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -37326 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 130.5-116 chr17 59439195 59439650 + 0.5 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) FRAM|SINE|Alu 73339 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 134-128 chr4 47996681 47997046 + 0.5 NA intron (NM_000087, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu -15330 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 113.5-246 chr9 38098728 38099099 + 0.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -29686 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 150.25-46 chr13 58648222 58648716 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -415352 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 188.5-132 chr6 55878435 55879117 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3186 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 130.5-218 chr6 163406264 163406677 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7480 NR_037593 100526820 Hs.644159 NR_037593 ENSG00000270419 CAHM LINC00468 colon adenocarcinoma hypermethylated ncRNA 126.25-161 chr5 92494079 92494418 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 1077095 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 242.25-60 chr3 128045314 128045925 + 0.5 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -6818 NM_013336 29927 Hs.518236 NM_013336 ENSG00000058262 SEC61A1 HNFJ4|HSEC61|SEC61|SEC61A SEC61 translocon alpha 1 subunit protein-coding 125.5-15 chr1 181750217 181750716 + 0.5 NA intron (NM_001205293, intron 25 of 47) intron (NM_001205293, intron 25 of 47) 266949 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 221-59 chr4 106361343 106361879 + 0.5 NA intron (NM_001195138, intron 1 of 1) MamRep38|DNA|hAT 5824 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 130.75-32 chr11 100292589 100292987 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 17 of 23) intron (NM_001243270, intron 17 of 23) -394500 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 158.75-90 chr2 111993782 111994195 + 0.5 NA intron (NM_006343, intron 8 of 18) intron (NM_006343, intron 8 of 18) -61281 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 133.75-155 chr4 94588398 94588838 + 0.5 NA TTS (NM_001011515) TTS (NM_001011515) 136676 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 117-176 chr8 10848949 10849271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 9084 NR_125432 101929229 Hs.129800 NR_125432 LOC101929229 - uncharacterized LOC101929229 ncRNA 113.75-99 chr2 101286189 101286555 + 0.5 NA intron (NM_173647, intron 4 of 6) intron (NM_173647, intron 4 of 6) -13323 NR_003070 692205 Hs.656503 NR_003070 ENSG00000212283 SNORD89 HBII-289 small nucleolar RNA, C/D box 89 snoRNA 112.75-48 chr13 33376771 33377028 + 0.5 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) L2a|LINE|L2 -41633 NR_146541 105370154 NR_146541 LINC02344 - long intergenic non-protein coding RNA 2344 ncRNA 133.25-17 chr10 33236440 33236864 + 0.5 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 98015 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 200-46 chr2 143560654 143561422 + 0.5 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -376029 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 134-84 chr2 8967877 8968293 + 0.5 NA intron (NR_135606, intron 1 of 12) L1PA5|LINE|L1 35599 NM_138799 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 130.5-133 chr2 64778277 64778631 + 0.5 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 85177 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 151.75-140 chr7 62888018 62888494 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 415800 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 136.75-48 chr12 65722639 65723121 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80508 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 121.25-142 chr4 46103343 46103674 + 0.5 NA intron (NM_173536, intron 1 of 8) intron (NM_173536, intron 1 of 8) 20546 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 131.75-149 chr4 39774774 39775086 + 0.5 NA exon (NM_001111113, exon 3 of 5) exon (NM_001111113, exon 3 of 5) 76794 NM_001111113 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 118-75 chr19 28373865 28374250 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -232631 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 135.25-12 chr1 154988061 154988393 + 0.5 NA exon (NM_001184892, exon 3 of 3) exon (NM_001184892, exon 3 of 3) 4883 NM_001184892 80308 Hs.118666 NM_025207 ENSG00000160688 FLAD1 FAD1|FADS|LSMFLAD|PP591 flavin adenine dinucleotide synthetase 1 protein-coding 133-173 chr8 102723699 102724175 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 67689 NR_160673 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 153.75-112 chr5 30179340 30179830 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 299025 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 153.5-37 chr11 119039052 119039491 + 0.5 NA Intergenic LTR38|LTR|ERV1 -8365 NM_001164277 2542 Hs.719203 NM_001467 ENSG00000137700 SLC37A4 G6PT1|G6PT2|G6PT3|GSD1b|GSD1c|GSD1d|PRO0685|TRG-19|TRG19 solute carrier family 37 member 4 protein-coding 133.5-43 chr10 112177546 112177892 + 0.5 NA intron (NM_001244949, intron 5 of 21) intron (NM_001244949, intron 5 of 21) 6046 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 132-50 chr14 71295636 71296110 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24603 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 122-55 chr14 20530819 20531216 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 20545 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 115.75-78 chr16 83498119 83498382 + 0.5 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) intron (NM_001220489, intron 6 of 12) -10096 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 202-33 chr2 105190238 105190873 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 46442 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 116.5-30 chr10 110769546 110769882 + 0.5 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 101190 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 118.5-7 chr1 83739699 83740083 + 0.5 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 120655 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 112.25-74 chr17 34433066 34433490 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70045 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 135.25-140 chr4 52751629 52752032 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001242690) promoter-TSS (NM_001242690) -190 NM_024534 100288413 Hs.363087 NM_024534 ENSG00000226887 ERVMER34-1 HEMO|envMER34 endogenous retrovirus group MER34 member 1, envelope protein-coding 139.75-17 chr10 68626225 68626691 + 0.5 NA intron (NM_030625, intron 3 of 11) AluJr|SINE|Alu 66121 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 123.75-205 chr9 133106241 133106689 + 0.5 NA intron (NM_001271775, intron 8 of 17) intron (NM_001271775, intron 8 of 17) 14775 NM_006266 5900 Hs.106185 NM_006266 ENSG00000160271 RALGDS RGDS|RGF|RalGEF ral guanine nucleotide dissociation stimulator protein-coding 158.5-14 chr1 230597933 230598425 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -2596 NR_146479 101927553 Hs.680219 NR_146479 ENSG00000232964 LINC01737 - long intergenic non-protein coding RNA 1737 ncRNA 257-41 chr4 64395793 64396582 + 0.5 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) L1PA15|LINE|L1 13263 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 137-60 chr17 31780635 31781114 + 0.5 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 78088 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 158-21 chr10 32525075 32525675 + 0.5 NA intron (NR_109826, intron 11 of 16) L1MA2|LINE|L1 79235 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 116.5-14 chr1 189578029 189578404 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 897794 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 127.5-79 chr14 64762167 64762625 + 0.5 NA intron (NM_001024858, intron 31 of 34) intron (NM_001024858, intron 31 of 34) 23290 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 133-46 chr14 49740938 49741309 + 0.5 NA intron (NM_172193, intron 11 of 12) L1ME3E|LINE|L1 -27030 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 124.5 chr1 12572106 12572361 + 0.5 NA intron (NM_001324370, intron 5 of 5) AluY|SINE|Alu 6790 NR_106788 102466722 NR_106788 ENSG00000276830 MIR6730 hsa-mir-6730 microRNA 6730 ncRNA 114-94 chr22 46693044 46693426 + 0.5 NA intron (NM_022766, intron 10 of 12) intron (NM_022766, intron 10 of 12) 45017 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 127.5-22 chr1 223499882 223500318 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106685 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 155.75-165 chr8 128496234 128496808 + 0.5 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MER91B|DNA|hAT-Tip100 68158 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 117.5-71 chr15 89976240 89976659 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24875 NM_198526 374655 Hs.459311 NM_198526 ENSG00000140548 ZNF710 - zinc finger protein 710 protein-coding 112.75-128 chr22 28514564 28514891 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 54858 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 126.25-168 chr5 173970962 173971329 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18025 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 113.75-113 chr20 51353511 51353753 + 0.5 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 99345 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 118.25-40 chr11 42152168 42152486 + 0.5 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -66869 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 148.25-136 chr7 12205573 12205945 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -5535 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 144.75-48 chr12 121966498 121966820 + 0.5 NA intron (NM_001178003, intron 15 of 17) AluSg|SINE|Alu 48067 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 144-56 chr2 48081283 48081660 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -175678 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 196.5-168 chr8 119894090 119894873 + 0.5 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) AluYh3|SINE|Alu 20759 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 122-119 chr3 68384206 68384681 + 0.5 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L1PREC2|LINE|L1 -116194 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 137.5-106 chr19 2379396 2379672 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10237 NM_182973 360200 Hs.465560 NM_182973 ENSG00000178297 TMPRSS9 - transmembrane serine protease 9 protein-coding 126.5-131 chr20 32838353 32838749 + 0.5 NA intron (NM_012325, intron 4 of 6) L1MB8|LINE|L1 18597 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 143-87 chr22 24831277 24831772 + 0.5 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 25303 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 114-40 chr12 123621735 123622086 + 0.5 NA TTS (NR_135105) TTS (NR_135105) 5200 NR_145743 109616977 NR_145743 ENSG00000206897 SNORA9B - small nucleolar RNA, H/ACA box 9B snoRNA 125-80 chr2 196451915 196452259 + 0.5 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) -89910 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 151.5-186 chr7 132143277 132143680 + 0.5 NA intron (NM_020911, intron 29 of 31) intron (NM_020911, intron 29 of 31) -117383 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 158-74 chr2 63547505 63547898 + 0.5 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) L1MA4|LINE|L1 40776 NR_148705 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 133.5-169 chr3 185112951 185113273 + 0.5 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) intron (NM_001025266, intron 1 of 1) 39948 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 126-86 chr19 51934770 51935193 + 0.5 NA intron (NM_024840, intron 3 of 5) intron (NM_024840, intron 3 of 5) 7509 NM_001031721 79898 Hs.183390 NM_024840 ENSG00000176024 ZNF613 - zinc finger protein 613 protein-coding 116.25-250 chr9 133629190 133629523 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7007 NM_000787 1621 Hs.591890 NM_000787 ENSG00000123454 DBH DBM|ORTHYP1 dopamine beta-hydroxylase protein-coding 115.25-70 chr16 6240227 6240652 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 220736 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 195.25-77 chr5 116898070 116898589 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -136120 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 123-126 chr3 10523329 10523669 + 0.5 NA intron (NM_001353564, intron 2 of 20) intron (NM_001353564, intron 2 of 20) -17913 NM_001683 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 157.75-92 chr2 161711041 161711391 + 0.5 NA intron (NM_001354443, intron 2 of 25) intron (NM_001354443, intron 2 of 25) 86800 NM_001354460 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 129.5-78 chr15 67343347 67343692 + 0.5 NA intron (NM_001031715, intron 5 of 20) intron (NM_001031715, intron 5 of 20) -88321 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 130.75-141 chr4 59305033 59305445 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 291666 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 162-108 chr7 90474896 90475492 + 0.5 NA intron (NM_001365443, intron 1 of 6) LTR40b|LTR|ERVL 5555 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 119.75-179 chr6 41076479 41076920 + 0.5 NA intron (NM_001329684, intron 1 of 7) intron (NM_001329684, intron 1 of 7) 3725 NM_021705 4800 Hs.10441 NM_002505 ENSG00000001167 NFYA CBF-A|CBF-B|HAP2|NF-YA nuclear transcription factor Y subunit alpha protein-coding 115.75-103 chr2 72676352 72676713 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 149501 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 142.5-42 chr11 23932254 23932676 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -513275 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 127-49 chr12 111896006 111896317 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2902 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 115-24 chr10 125838728 125839138 + 0.5 NA intron (NM_018180, intron 9 of 10) intron (NM_018180, intron 9 of 10) 15387 NM_078468 56647 Hs.370292 NM_016567 ENSG00000107949 BCCIP TOK-1|TOK1 BRCA2 and CDKN1A interacting protein protein-coding 230.5-65 chr2 164709766 164710541 + 0.5 NA intron (NM_001365670, intron 7 of 13) intron (NM_001365670, intron 7 of 13) -22376 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 134-23 chr10 93858372 93858855 + 0.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -35365 NM_153226 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 138.75-25 chr10 125236772 125237166 + 0.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -75939 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 134.75-176 chr5 102522286 102522717 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -23500 NM_001289002 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 170.75-88 chr3 86805854 86806234 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 185105 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 128.5-14 chr1 158208033 158208372 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 28255 NM_001766 912 Hs.1799 NM_001766 ENSG00000158473 CD1D CD1A|R3|R3G1 CD1d molecule protein-coding 115.5-187 chr4 55968998 55969333 + 0.5 NA intron (NM_025009, intron 9 of 25) intron (NM_025009, intron 9 of 25) 20220 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 125.25-24 chr10 29440954 29441255 + 0.5 NA intron (NR_110927, intron 2 of 2) intron (NR_110927, intron 2 of 2) 30861 NR_110928 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 114-75 chr2 82136079 82136516 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -669351 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 128.25-198 chr8 16114856 16115308 + 0.5 NA intron (NM_138716, intron 8 of 8) AluSp|SINE|Alu 71190 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 155-86 chr3 42940438 42940983 + 0.5 NA intron (NM_001205272, intron 2 of 4) intron (NM_001205272, intron 2 of 4) -3925 NR_122033 100506275 Hs.517918 NR_122033 ENSG00000206552 KRBOX1-AS1 - KRBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 129.75-71 chr16 53580512 53580975 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77439 NM_001308325 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 145.25-115 chr4 65393014 65393563 + 0.5 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 276200 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 146.25-76 chr2 154593366 154593762 + 0.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -105017 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 115-129 chr5 31470154 31470388 + 0.5 NA intron (NM_013235, intron 16 of 34) intron (NM_013235, intron 16 of 34) 61822 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 139-87 chr20 50092991 50093474 + 0.5 NA intron (NM_022442, intron 2 of 3) L1ME4b|LINE|L1 19918 NM_001282577 7335 Hs.420529 NM_021988 ENSG00000244687 UBE2V1 CIR1|CROC-1|CROC1|UBE2V|UEV-1|UEV1|UEV1A ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 protein-coding 114.25-180 chr7 55487360 55487665 + 0.5 NA intron (NM_001321243, intron 4 of 5) FAM|SINE|Alu 39368 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 150-57 chr16 23043863 23044341 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 105168 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 129.25-42 chr13 112080555 112080860 + 0.5 NA intron (NR_120392, intron 1 of 3) intron (NR_120392, intron 1 of 3) 13558 NM_005986 6656 NM_005986 ENSG00000182968 SOX1 - SRY-box transcription factor 1 protein-coding 126-32 chr11 88570400 88570832 + 0.5 NA intron (NM_001143831, intron 6 of 8) AluSx1|SINE|Alu 66040 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-214 chr8 89425483 89425818 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 332061 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 135-2 chr1 63883032 63883433 + 0.5 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 109215 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 135.25-170 chr5 167681211 167681610 + 0.5 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) L1ME3G|LINE|L1 -73519 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 149.75-31 chr12 39992816 39993246 + 0.5 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) (TACATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 113050 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 116.5-71 chr14 58264200 58264472 + 0.5 NA intron (NR_038123, intron 6 of 9) intron (NR_038123, intron 6 of 9) 19493 NM_002788 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 180-97 chr5 11747611 11748095 + 0.5 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 156593 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 127-113 chr3 22632682 22633109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 569683 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 164.5-155 chr5 15745797 15746164 + 0.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -130978 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 127.25-7 chr1 171371408 171371812 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 32714 NR_002719 7151 Hs.661092 NR_002719 TOP1P1 - DNA topoisomerase I pseudogene 1 pseudo 132.75-2 chr1 12281094 12281434 + 0.5 NA intron (NM_015378, intron 20 of 69) L1MC5a|LINE|L1 51234 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 142.5-196 chr6 146744203 146744571 + 0.5 NA intron (NM_024694, intron 25 of 35) L3b|LINE|CR1 59437 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 133.25-118 chr20 44595745 44596265 + 0.5 NA intron (NM_007066, intron 2 of 3) intron (NM_007066, intron 2 of 3) 13426 NM_001281445 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 174.5-33 chr11 65111477 65112133 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001277233) promoter-TSS (NM_001277233) -49 NM_001277233 7108 Hs.31130 NM_003273 ENSG00000149809 TM7SF2 ANG1|C14SR|DHCR14A|NET47 transmembrane 7 superfamily member 2 protein-coding 175.25-5 chr1 98062695 98063194 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13251 NR_046105 400765 Hs.451802 NM_001001688 ENSG00000225206 MIR137HG - MIR137 host gene ncRNA 127.75-182 chr7 6074630 6074988 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15580 NM_001134335 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 177-64 chr3 95669967 95670560 + 0.5 NA intron (NR_077228, intron 2 of 4) intron (NR_077228, intron 2 of 4) 12930 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 159.75-108 chr3 77127525 77127935 + 0.5 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 29718 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 125-22 chr10 69029318 69029744 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 40728 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 136.75-205 chr9 88721415 88721810 + 0.5 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 24293 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 125-30 chr11 47858072 47858450 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9717 NM_001318399 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 127.75-80 chr17 81802432 81802766 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1551 NM_000160 2642 Hs.208 NM_000160 ENSG00000215644 GCGR GGR|GL-R glucagon receptor protein-coding 153.25-82 chr22 25523527 25523933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40945 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 127.75-146 chr4 83676182 83676544 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 140255 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 125.5-272 chr9 104549237 104549698 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -12654 NM_001001961 138803 Hs.553600 NM_001001961 ENSG00000204246 OR13C3 OR37G|OR9-8 olfactory receptor family 13 subfamily C member 3 protein-coding 126.75-146 chr22 43770625 43770897 + 0.5 NA intron (NM_198856, intron 2 of 29) L1MEf|LINE|L1 41544 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 192-91 chr7 28873751 28874164 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 84373 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 128-106 chr3 177504435 177504789 + 0.5 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 62691 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 191.75-8 chr1 177930502 177930980 + 0.5 NA intron (NM_033127, intron 24 of 25) L1PB3|LINE|L1 39181 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 136.75-22 chr10 22753026 22753508 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38689 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 161-106 chr6 41521941 41522423 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 19738 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 124.5-225 chr8 92676284 92676648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20972 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 128.5-142 chr3 63659403 63659871 + 0.5 NA intron (NM_001348756, intron 2 of 4) intron (NM_001348756, intron 2 of 4) 6962 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 159-3 chr1 68939045 68939433 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116659 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 130-78 chr2 159182262 159182656 + 0.5 NA intron (NM_001350065, intron 15 of 27) L1MC5|LINE|L1 -4376 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 160.25-78 chr2 195906678 195907171 + 0.5 NA exon (NM_018897, exon 26 of 65) exon (NM_018897, exon 26 of 65) 161913 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 131-76 chr19 48744924 48745209 + 0.5 NA intron (NM_182575, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR 866 NM_001321865 284359 Hs.400688 NM_182575 ENSG00000182264 IZUMO1 IZUMO|OBF izumo sperm-egg fusion 1 protein-coding 160-14 chr10 76245312 76245845 + 0.5 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR 462817 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 118.25-77 chr16 65828616 65828980 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -252498 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 123.75-119 chr3 99838257 99838743 + 0.5 NA intron (NM_001282794, intron 2 of 2) intron (NM_001282794, intron 2 of 2) -14635 NR_110821 101929357 Hs.741615 NR_110821 HP09053 - uncharacterized LOC101929357 ncRNA 195.5-51 chr16 60465522 60466002 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -105969 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 112.75-193 chr7 86934187 86934563 + 0.5 NA intron (NM_001291991, intron 7 of 20) intron (NM_001291991, intron 7 of 20) 31524 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 113.5-164 chr3 152937822 152938089 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102824 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 141-161 chr9 33962981 33963346 + 0.5 NA intron (NR_163243, intron 6 of 24) intron (NR_163243, intron 6 of 24) -10309 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 150-121 chr5 170170357 170170725 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 28600 NR_108022 100507267 Hs.634846 NR_108022 LINC01187 CTB-27N1.1|KIDR long intergenic non-protein coding RNA 1187 ncRNA 123.25-105 chr2 103739157 103739619 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 668944 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 165.75-80 chr2 46192009 46192611 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -105097 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 149.25-169 chr7 77410145 77410537 + 0.5 NA intron (NR_146937, intron 1 of 31) intron (NR_146937, intron 1 of 31) -4857 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 148.25-38 chr14 30909794 30910219 + 0.5 NA intron (NM_001083893, intron 13 of 17) L2a|LINE|L2 -20198 NR_038356 100506071 Hs.729195 NR_038356 ENSG00000258525 LOC100506071 - uncharacterized LOC100506071 ncRNA 125.5-21 chr10 6078962 6079358 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -9874 NM_032905 84991 Hs.498548 NM_032905 ENSG00000134453 RBM17 SPF45 RNA binding motif protein 17 protein-coding 199.75-18 chr12 4669082 4669588 + 0.5 NA intron (NM_005002, intron 7 of 10) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 20221 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 121-139 chr3 178655275 178655674 + 0.5 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 96624 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 130.25-187 chr7 45329328 45329846 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 171796 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 141.25-159 chr6 102933154 102933511 + 0.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 1534347 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 122.75-105 chr2 224700127 224700525 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -114929 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 117.5-150 chr3 167704879 167705197 + 0.5 NA intron (NM_145859, intron 3 of 8) intron (NM_145859, intron 3 of 8) 29804 NM_145860 11235 Hs.478150 NM_007217 ENSG00000114209 PDCD10 CCM3|TFAR15 programmed cell death 10 protein-coding 183.25-52 chr19 45636287 45636784 + 0.5 NA intron (NR_147901, intron 6 of 20) L2b|LINE|L2 2552 NR_029886 442902 NR_029886 ENSG00000284544 MIR330 MIRN330|hsa-mir-330|mir-330 microRNA 330 ncRNA 154-47 chr16 75194101 75194579 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12821 NM_001025200 440387 Hs.610926 NM_001025200 ENSG00000168928 CTRB2 - chymotrypsinogen B2 protein-coding 143.75-13 chr10 48850607 48850956 + 0.5 NA intron (NM_020945, intron 39 of 61) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 63454 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 135-58 chr17 44437112 44437416 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001304943) promoter-TSS (NM_001304943) -413 NM_001304943 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 204.75-40 chr15 74227871 74228368 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8207 NM_025055 80125 Hs.383206 NM_025055 ENSG00000140481 CCDC33 CT61|HP11097 coiled-coil domain containing 33 protein-coding 184.5-98 chr3 4056260 4056725 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -246812 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 166.25-143 chr8 125154893 125155402 + 0.5 NA intron (NM_001349486, intron 4 of 7) intron (NM_001349486, intron 4 of 7) 63287 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 117.25-92 chr17 64270790 64271046 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7658 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 152-34 chr11 62844757 62845123 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3131 NM_001369451 54663 Hs.654620 NM_018093 ENSG00000133316 WDR74 Nsa1 WD repeat domain 74 protein-coding 130-67 chr2 29230345 29230626 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 15 of 28) intron (NM_004304, intron 15 of 28) -6585 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 153-99 chr3 116313403 116313846 + 0.5 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -46400 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 157.25-72 chr2 45458713 45459171 + 0.5 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) 152325 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 125.25-204 chr8 73677362 73677755 + 0.5 NA intron (NM_001164382, intron 3 of 13) L1ME3A|LINE|L1 69282 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 186.75-66 chr21 42523921 42524328 + 0.5 NA intron (NM_001320537, intron 2 of 19) intron (NM_001320537, intron 2 of 19) 10272 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 146-36 chr13 92938058 92938356 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107134 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 122.5-166 chr4 65153191 65153512 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -148851 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 136.25-128 chr4 59259159 59259589 + 0.5 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 245801 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 115.75-203 chr7 88105624 88105936 + 0.5 NA intron (NM_001324421, intron 4 of 28) MIRb|SINE|MIR -110880 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 117-44 chr12 98449712 98449972 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 7303 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 130.25-35 chr10 129622313 129622690 + 0.5 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) intron (NM_002412, intron 2 of 4) 155260 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 117-46 chr12 121081746 121082116 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -42689 NM_198213 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 123-145 chr4 42392543 42392871 + 0.5 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -1439 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 130.75-206 chr9 119693156 119693657 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -241654 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 156.75-66 chr17 53234526 53234978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 249247 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 212.75-72 chr4 57421991 57422781 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -3486 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 160.5-165 chr6 161363413 161363816 + 0.5 NA intron (NM_004562, intron 10 of 11) L1MEd|LINE|L1 -89553 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 115-37 chr12 13047813 13048215 + 0.5 NA intron (NM_020853, intron 1 of 12) intron (NM_020853, intron 1 of 12) 3633 NM_020853 57613 Hs.132660 NM_020853 ENSG00000084444 FAM234B KIAA1467 family with sequence similarity 234 member B protein-coding 122.5-96 chr18 79405476 79405741 + 0.5 NA intron (NM_001278673, intron 1 of 8) intron (NM_001278673, intron 1 of 8) 5309 NM_172389 4772 Hs.534074 NM_006162 ENSG00000131196 NFATC1 NF-ATC|NF-ATc1.2|NFAT2|NFATc nuclear factor of activated T cells 1 protein-coding 115.25-216 chr8 129182964 129183257 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 58130 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 179.75-45 chr14 73122624 73123027 + 0.5 NA 3' UTR (NM_021239, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_021239, exon 19 of 19) -13682 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 148.75-17 chr10 26762827 26763362 + 0.5 NA intron (NM_001012752, intron 6 of 9) intron (NM_001012752, intron 6 of 9) 65393 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 119.25-19 chr10 24005224 24005540 + 0.5 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) -203409 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 116.25-224 chr8 52003719 52003977 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -104662 NM_001286782 115294 Hs.671268 NM_052937 ENSG00000168300 PCMTD1 - protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 150.25-52 chr14 62768865 62769231 + 0.5 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 276410 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 112.5-207 chr6 39222000 39222382 + 0.5 NA intron (NM_003740, intron 1 of 4) intron (NM_003740, intron 1 of 4) 7284 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 118.25-67 chr14 71780869 71781297 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -151088 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 203.75-70 chr3 113167784 113168375 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110823) promoter-TSS (NR_110823) -348 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 168.5-120 chr3 128296392 128296968 + 0.5 NA intron (NM_021937, intron 4 of 6) intron (NM_021937, intron 4 of 6) -142766 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 118.75-179 chr7 45412188 45412653 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -161720 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 118.5-93 chr2 44349149 44349531 + 0.5 NA intron (NM_001171617, intron 1 of 13) L1MC4|LINE|L1 10409 NM_001042385 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 119-76 chr2 665848 666236 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001352681, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001352681, exon 5 of 5) 10662 NM_001352681 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 157.75-136 chr5 74183402 74183997 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 124626 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 182-38 chr15 39100033 39100435 + 0.5 NA Intergenic MER124|DNA?|DNA? -150435 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 147.25-31 chr14 44250656 44251001 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 256455 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 130-17 chr10 103718956 103719291 + 0.5 NA intron (NM_014631, intron 5 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -27656 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 113-23 chr10 60786596 60786905 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001170406, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001170406, exon 4 of 4) 8272 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 136.5-73 chr14 86014567 86014952 + 0.5 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) intron (NR_110155, intron 1 of 3) 80081 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 119-66 chr17 66136880 66137260 + 0.5 NA intron (NM_001353129, intron 4 of 26) L1M4c|LINE|L1 54822 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 165.75-159 chr7 92498175 92498526 + 0.5 NA intron (NM_001282677, intron 15 of 22) AluSz|SINE|Alu -20404 NM_001130925 30816 NM_014590 ENSG00000242950 ERVW-1 ENV|ENVW|ERVWE1|HERV-7q|HERV-W-ENV|HERV7Q|HERVW|HERVWENV endogenous retrovirus group W member 1, envelope protein-coding 136.5-198 chr6 112640838 112641271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 293724 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 189-77 chr3 73949372 73950097 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 140490 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 170-61 chr3 58418086 58418589 + 0.5 NA intron (NM_017771, intron 17 of 17) MIRb|SINE|MIR 15495 NM_000925 5162 Hs.161357 NM_000925 ENSG00000168291 PDHB PDHBD|PDHE1-B|PDHE1B|PHE1B pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit protein-coding 226.5-4 chr1 108575899 108576539 + 0.5 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) intron (NM_001010883, intron 1 of 10) 16119 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 145.5-146 chr4 91643343 91643797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 633732 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 127.5-46 chr11 74504041 74504481 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10537 NM_001144869 387787 Hs.591971 NM_001144869 ENSG00000175536 LIPT2 - lipoyl(octanoyl) transferase 2 protein-coding 152.25-57 chr14 87377923 87378441 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 277112 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 129.25-137 chr3 188758549 188758921 + 0.5 NA intron (NM_001167672, intron 6 of 9) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 69954 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 139.5-234 chrX 89086750 89087202 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 339751 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 176-43 chr3 72858277 72858799 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10093 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 137.75-149 chr4 47855012 47855512 + 0.5 NA intron (NR_103795, intron 20 of 23) intron (NR_103795, intron 20 of 23) -17156 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 129.75-125 chr3 124850108 124850594 + 0.5 NA intron (NM_001354766, intron 3 of 13) intron (NM_001354766, intron 3 of 13) 37014 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 163-5 chr1 113553792 113554268 + 0.5 NA intron (NM_001142782, intron 2 of 20) AluSc|SINE|Alu 163515 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 119.75-26 chr10 99110498 99110932 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) UCON33|DNA|TcMar-Tigger 125160 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 123.25-126 chr22 24821217 24821694 + 0.5 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) L2a|LINE|L2 15234 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 167.5-191 chr8 130528794 130529392 + 0.5 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -85419 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 175.75-26 chr12 31595541 31596013 + 0.5 NA intron (NR_046909, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 -4641 NM_001366893 160518 Hs.118166 NM_144973 ENSG00000170456 DENND5B - DENN domain containing 5B protein-coding 115.5-137 chr2 176609080 176609474 + 0.5 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -8225 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 152.25-5 chr1 150759616 150760006 + 0.5 NA intron (NM_001199739, intron 2 of 6) intron (NM_001199739, intron 2 of 6) 5967 NM_004079 1520 Hs.181301 NM_004079 ENSG00000163131 CTSS - cathepsin S protein-coding 123.5-210 chr8 117260766 117261138 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 125957 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 127.25-6 chr1 170829227 170829653 + 0.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -106031 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 129.5-81 chr15 85073720 85074181 + 0.5 NA intron (NM_001243137, intron 3 of 21) intron (NM_001243137, intron 3 of 21) 91976 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 116-92 chr20 9560174 9560632 + 0.5 NA intron (NM_020341, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu -45405 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 147.5-7 chr1 37001250 37001724 + 0.5 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 33028 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 180-61 chr2 96619489 96620078 + 0.5 NA intron (NR_047654, intron 3 of 20) intron (NR_047654, intron 3 of 20) 18208 NR_047658 55683 Hs.516341 NM_017991 ENSG00000114982 KANSL3 KIAA1310|NSL3|Rcd1 KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 protein-coding 117-124 chr3 119727490 119727870 + 0.5 NA intron (NM_033364, intron 7 of 17) intron (NM_033364, intron 7 of 17) 24658 NM_033364 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 124.5-122 chr20 10580039 10580411 + 0.5 NA intron (NM_001009608, intron 4 of 7) intron (NM_001009608, intron 4 of 7) 69470 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 114.5-40 chr10 78338120 78338410 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 70923 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 121.75-7 chr1 150269002 150269430 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_045033) promoter-TSS (NR_045033) -7 NM_001243771 51107 Hs.108408 NM_016022 ENSG00000117362 APH1A 6530402N02Rik|APH-1|APH-1A|CGI-78 aph-1 homolog A, gamma-secretase subunit protein-coding 236.5-81 chr6 120870059 120870777 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 464062 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 133-33 chr12 62160558 62161080 + 0.5 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) MER6|DNA|TcMar-Tigger 32020 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 113-181 chr8 118547987 118548336 + 0.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -72840 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 207.5-116 chr8 79965175 79965608 + 0.5 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 64868 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 140.5-59 chr13 95901546 95901921 + 0.5 NA intron (NM_020121, intron 21 of 38) MER3|DNA|hAT-Charlie 151668 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 117-111 chr22 34244273 34244531 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -321514 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 181.5-27 chr11 120593858 120594285 + 0.5 NA intron (NM_001282470, intron 1 of 19) L2c|LINE|L2 29635 NM_001282473 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 132.25-68 chr16 54484165 54484472 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -113619 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 136.25-94 chr2 132925222 132925749 + 0.5 NA intron (NR_135572, intron 1 of 1) AluY|SINE|Alu 9928 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 113-27 chr10 79185802 79186138 + 0.5 NA intron (NM_020338, intron 4 of 24) intron (NM_020338, intron 4 of 24) 117004 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 116.75-34 chr11 30842502 30842878 + 0.5 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 149996 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 135.25-83 chr18 58071687 58072027 + 0.5 NA intron (NM_001144964, intron 1 of 30) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 24631 NM_001144964 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 162.5-87 chr2 147127950 147128422 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 541129 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 140.75-14 chr1 240411872 240412362 + 0.5 NA intron (NM_020066, intron 15 of 17) L2|LINE|L2 200038 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 142-7 chr1 117800481 117800996 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 128883 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 134.5-79 chr15 72330036 72330433 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10077 NM_052840 60677 Hs.348342 NM_052840 ENSG00000140488 CELF6 BRUNOL6 CUGBP Elav-like family member 6 protein-coding 132.75-26 chr10 86305646 86306076 + 0.5 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR -41073 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 179.25-34 chr11 83321104 83321645 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -34967 NM_001286116 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 217-15 chr12 2170838 2171671 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 52227 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 113.25-149 chr6 75314060 75314320 + 0.5 NA exon (NM_001289987, exon 6 of 7) exon (NM_001289987, exon 6 of 7) 29176 NR_040081 100506804 Hs.743708 NR_040081 LOC100506804 - uncharacterized LOC100506804 ncRNA 124.75-108 chr2 3538348 3538727 + 0.5 NA intron (NR_148534, intron 8 of 11) L1MC4a|LINE|L1 -19006 NM_018269 55256 Hs.502773 NM_018269 ENSG00000182551 ADI1 APL1|ARD|Fe-ARD|HMFT1638|MTCBP1|Ni-ARD|SIPL|mtnD acireductone dioxygenase 1 protein-coding 147.25-86 chr3 99173294 99173836 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -271870 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 172.25-48 chr16 83574481 83575093 + 0.5 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) intron (NM_001220489, intron 6 of 12) 66441 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 129-23 chr10 62194136 62194627 + 0.5 NA 3' UTR (NM_145307, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_145307, exon 12 of 12) 74463 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 147.5-190 chr6 130397246 130397654 + 0.5 NA intron (NM_001258277, intron 2 of 2) L1MEd|LINE|L1 -23646 NM_001258278 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 150.75-85 chr18 53980319 53980762 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 241872 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 120.5-118 chr2 88876494 88876953 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 64353 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 131.5-203 chr6 56562083 56562495 + 0.5 NA intron (NM_001144770, intron 47 of 94) intron (NM_001144770, intron 47 of 94) 80600 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 113.75-161 chr5 146101788 146102221 + 0.5 NA intron (NM_001029869, intron 1 of 3) intron (NM_001029869, intron 1 of 3) 3573 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 122-98 chr2 108248992 108249289 + 0.5 NA intron (NM_001008743, intron 2 of 7) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 9172 NM_001008743 442038 NM_001008743 ENSG00000196228 SULT1C3 ST1C3 sulfotransferase family 1C member 3 protein-coding 119.5-113 chr2 27793007 27793383 + 0.5 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) L1MC4|LINE|L1 21476 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 135.75-16 chr1 237351487 237351855 + 0.5 NA intron (NM_001035, intron 3 of 104) L1MEg|LINE|L1 -119448 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 129.75-29 chr10 84878189 84878549 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 320536 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 121.5-14 chr1 93633089 93633516 + 0.5 NA intron (NM_001261409, intron 3 of 11) intron (NM_001261409, intron 3 of 11) -19205 NM_001261410 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 115.5-135 chr2 159994636 159995046 + 0.5 NA intron (NM_001007267, intron 11 of 26) intron (NM_001007267, intron 11 of 26) 67774 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 117.75-198 chr7 46132389 46132769 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -211307 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 147.5-188 chr6 100932341 100932781 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -51189 NM_001284271 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 112.75-101 chr2 127995651 127995986 + 0.5 NA intron (NM_001330303, intron 11 of 19) L1MC4|LINE|L1 31477 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 141.5-61 chr15 26377447 26377916 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 251409 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 129.5-185 chr5 97803708 97804221 + 0.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -36794 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 168.75-113 chr5 94390138 94390723 + 0.5 NA intron (NM_001145678, intron 18 of 20) intron (NM_001145678, intron 18 of 20) 228174 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 132-123 chr4 40708766 40709138 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -41003 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 210.25-87 chr9 31944476 31944931 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -439900 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 119.25-155 chr4 150190633 150191031 + 0.5 NA intron (NM_001040260, intron 2 of 15) intron (NM_001040260, intron 2 of 15) 112387 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 113.25-118 chr4 45136655 45137015 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -410201 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 181-106 chr8 19123203 19123753 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -109775 NM_015310 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 159.75-114 chr4 13155522 13155900 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 328629 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 179.5-195 chr9 97439934 97440376 + 0.5 NA intron (NM_001302884, intron 4 of 15) intron (NM_001302884, intron 4 of 15) 28059 NM_014290 23424 Hs.193842 NM_014290 ENSG00000196116 TDRD7 CATC4|PCTAIRE2BP|TRAP tudor domain containing 7 protein-coding 140-71 chr2 67284222 67284643 + 0.5 NA intron (NR_110564, intron 3 of 4) intron (NR_110564, intron 3 of 4) -69113 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 216.5-31 chr14 54955845 54956460 + 0.5 NA intron (NM_007086, intron 23 of 25) intron (NM_007086, intron 23 of 25) -53326 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 146.5-231 chr8 141614330 141614704 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107287 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 118.5-201 chr7 94889354 94889706 + 0.5 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -18064 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 163.75-47 chr15 44118902 44119446 + 0.5 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 75272 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 127.5-207 chr5 176875181 176875649 + 0.5 NA intron (NM_133369, intron 8 of 14) L2c|LINE|L2 23931 NM_002115 3101 Hs.411695 NM_002115 ENSG00000160883 HK3 HKIII|HXK3 hexokinase 3 protein-coding 180.25-53 chr2 146693581 146694231 + 0.5 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 106849 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 136-123 chr5 74862388 74862892 + 0.5 NA intron (NM_015566, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 -3253 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 150-124 chr6 143111640 143112052 + 0.5 NA intron (NM_001366344, intron 2 of 6) L2|LINE|L2 -14293 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 117.25-137 chr3 12957272 12957739 + 0.5 NA intron (NM_001134382, intron 1 of 13) intron (NM_001134382, intron 1 of 13) 10225 NM_014869 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 177-35 chr16 72070147 72070708 + 0.5 NA intron (NM_020995, intron 1 of 4) HERVI-int|LTR|ERV1 7201 NM_020995 3250 Hs.655361 NM_020995 ENSG00000261701 HPR A-259H10.2|HP haptoglobin-related protein protein-coding 124.25-73 chr16 85165861 85166298 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 28929 NR_033984 400548 Hs.592054 NR_033984 ENSG00000278214 LINC02139 - long intergenic non-protein coding RNA 2139 ncRNA 120.5-45 chr11 98666356 98666833 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -354355 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 117-72 chr17 60691520 60691821 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) L1MB2|LINE|L1 13819 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 135.25-164 chr5 99242471 99243010 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -291250 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 183.25-47 chr18 9043678 9044266 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -58727 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 165.5-190 chr8 57440898 57441361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 97342 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 119.75-30 chr11 11301979 11302296 + 0.5 NA intron (NM_001363464, intron 8 of 9) intron (NM_001363464, intron 8 of 9) 51113 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 167.75-22 chr10 65024432 65025042 + 0.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -100219 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 118.5-34 chr11 74342747 74343144 + 0.5 NA exon (NM_173582, exon 11 of 14) exon (NM_173582, exon 11 of 14) -31305 NM_182904 283208 Hs.660541 NM_182904 ENSG00000149380 P4HA3 - prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 3 protein-coding 142.5-90 chr17 51703200 51703675 + 0.5 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) MIRc|SINE|MIR 268010 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 127-179 chr8 133085067 133085408 + 0.5 NA intron (NM_001045556, intron 1 of 8) intron (NM_001045556, intron 1 of 8) 17365 NM_001045557 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 126.5-55 chr12 110450880 110451229 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001287222) promoter-TSS (NM_001287222) -643 NM_001287222 10094 Hs.524741 NM_001278556 ENSG00000111229 ARPC3 ARC21|p21-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 3 protein-coding 128.75-133 chr4 29001323 29001752 + 0.5 NA intron (NR_146499, intron 1 of 2) intron (NR_146499, intron 1 of 2) 4753 NR_146499 102723764 NR_146499 LINC02364 - long intergenic non-protein coding RNA 2364 ncRNA 128.25-212 chr8 129817801 129818191 + 0.5 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -31372 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 145-128 chr5 128976901 128977322 + 0.5 NA intron (NM_001017372, intron 1 of 9) intron (NM_001017372, intron 1 of 9) 11623 NM_001017372 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 138-47 chr15 75069589 75070024 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26520 NM_001301104 60490 Hs.458922 NM_021823 ENSG00000138621 PPCDC MDS018|PPC-DC|coaC phosphopantothenoylcysteine decarboxylase protein-coding 141.5-207 chr7 26738295 26738723 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 6 of 12) intron (NM_003930, intron 6 of 12) 100638 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 171.25-142 chr7 50485227 50485749 + 0.5 NA intron (NM_001242888, intron 7 of 12) intron (NM_001242888, intron 7 of 12) -35082 NM_001287495 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 116-173 chr8 121662201 121662502 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20911 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 150.25-29 chr10 119014072 119014455 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15451 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 113-15 chr1 229622288 229622638 + 0.5 NA intron (NM_001025247, intron 1 of 3) intron (NM_001025247, intron 1 of 3) 3584 NM_014409 27097 Hs.270621 NM_014409 ENSG00000135801 TAF5L PAF65B TATA-box binding protein associated factor 5 like protein-coding 122.25-84 chr2 2344679 2345074 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13601 NM_001329851 23040 Hs.434418 NM_015025 ENSG00000186487 MYT1L MRD39|NZF1|ZC2H2C2|ZC2HC4B|myT1-L myelin transcription factor 1 like protein-coding 131.5-15 chr1 180122176 180122694 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -32398 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 162.25-93 chr2 207735098 207735545 + 0.5 NA intron (NM_001330218, intron 4 of 9) intron (NM_001330218, intron 4 of 9) -19486 NR_039934 100616361 NR_039934 ENSG00000284079 MIR4775 - microRNA 4775 ncRNA 140.25-104 chr2 234210056 234210613 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 159632 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 128-80 chr2 122781211 122781639 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 292056 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 168.5-150 chr5 61442637 61443171 + 0.5 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) LOR1-int|LTR|ERV1 110646 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 113-104 chr20 59694002 59694341 + 0.5 NA intron (NM_001199506, intron 1 of 12) intron (NM_001199506, intron 1 of 12) 17510 NM_001199506 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 128.75-84 chr18 13196581 13197047 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -21946 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 137-77 chr2 66385934 66386337 + 0.5 NA intron (NR_130931, intron 1 of 2) intron (NR_130931, intron 1 of 2) 2829 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 230.25-29 chr16 63562280 63563106 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -1526255 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 122.5-184 chr5 94864928 94865301 + 0.5 NA intron (NM_001002796, intron 17 of 22) intron (NM_001002796, intron 17 of 22) 216752 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 162.25-21 chr10 119579799 119580335 + 0.5 NA intron (NM_001323970, intron 6 of 12) intron (NM_001323970, intron 6 of 12) 16962 NM_001323969 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 179.25-66 chr18 21381524 21382086 + 0.5 NA intron (NM_001142966, intron 2 of 32) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 139563 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 144-39 chr14 74495917 74496360 + 0.5 NA TTS (NM_001272007) TTS (NM_001272007) 2373 NM_194279 122961 Hs.291079 NM_194279 ENSG00000165898 ISCA2 HBLD1|ISA2|MMDS4|c14_5557 iron-sulfur cluster assembly 2 protein-coding 183.5-88 chr3 83021082 83021555 + 0.5 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy 1035176 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 113.25-103 chr21 36297465 36297895 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -22509 NM_001320446 23515 Hs.421150 NM_015358 ENSG00000159256 MORC3 NXP2|ZCW5|ZCWCC3 MORC family CW-type zinc finger 3 protein-coding 129.75-197 chr9 123308714 123309142 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40342 NM_018387 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 164.25-32 chr12 59216542 59217173 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -296319 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 139.75-110 chr20 58913478 58913964 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 21558 NR_132272 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 137.25-57 chr17 65129286 65129760 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7815 NM_001165933 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 140.5-23 chr10 123693603 123694039 + 0.5 NA 3' UTR (NM_153442, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_153442, exon 3 of 3) 27466 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 133.25-171 chr5 56145210 56145678 + 0.5 NA intron (NM_024669, intron 6 of 11) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 87886 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 150.25-164 chr9 116705048 116705611 + 0.5 NA intron (NM_014010, intron 15 of 21) intron (NM_014010, intron 15 of 21) 18024 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 134.5-128 chr3 49283884 49284309 + 0.5 NA exon (NM_003363, exon 19 of 22) exon (NM_003363, exon 19 of 22) -6864 NM_198562 375341 Hs.403828 NM_198562 ENSG00000188315 C3orf62 - chromosome 3 open reading frame 62 protein-coding 155.25-44 chr12 881248 881698 + 0.5 NA intron (NM_001184985, intron 12 of 27) intron (NM_001184985, intron 12 of 27) 51603 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 117.5-138 chr3 20851831 20852214 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 509554 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 121.5-229 chr6 120737344 120737668 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 596974 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 136-155 chr8 124822826 124823367 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1038 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 124.25-42 chr12 41936804 41937162 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 172794 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 113.5-173 chr4 51925698 51926026 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 82283 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 262.5-65 chr6 73953728 73954409 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -115383 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 147.5-49 chr12 63846038 63846460 + 0.5 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 1549 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 133.25-217 chr8 130166333 130166748 + 0.5 NA intron (NM_001362925, intron 11 of 29) intron (NM_001362925, intron 11 of 29) -81772 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 131.5-67 chr14 85820960 85821283 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -113557 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 142.25-52 chr13 113545360 113545799 + 0.5 NA intron (NR_146221, intron 9 of 10) intron (NR_146221, intron 9 of 10) -39109 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 121-96 chr19 57021573 57021946 + 0.5 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -98382 NM_020903 57663 Hs.515632 NM_020903 ENSG00000131864 USP29 HOM-TES-84/86 ubiquitin specific peptidase 29 protein-coding 129-163 chr7 36283508 36283833 + 0.5 NA intron (NM_030636, intron 4 of 7) intron (NM_030636, intron 4 of 7) 83570 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 137.75-153 chr4 62486372 62486804 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -324823 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 135-85 chr2 175933138 175933623 + 0.5 NA intron (NR_130941, intron 13 of 14) intron (NR_130941, intron 13 of 14) 68887 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 123-28 chr10 114066949 114067267 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23242 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 140.25-201 chrX 101443261 101443750 + 0.5 NA intron (NR_028407, intron 2 of 15) intron (NR_028407, intron 2 of 15) 25227 NR_028407 100131755 Hs.729062 NM_152583 ENSG00000196440 ARMCX4 CXorf35|GASP4 armadillo repeat containing X-linked 4 protein-coding 132-108 chr3 45012408 45012932 + 0.5 NA TTS (NR_023353) TTS (NR_023353) -13633 NM_003278 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 162.25-106 chr3 69604350 69604828 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -134875 NM_001354604 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 146.5-111 chr2 139355013 139355589 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 457977 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 134.5-220 chr8 76398309 76398690 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8155 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 126-124 chr4 42715191 42715567 + 0.5 NA Intergenic MER41C|LTR|ERV1 -58274 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 129.5-116 chr2 54268055 54268484 + 0.5 NA intron (NM_001320589, intron 4 of 4) intron (NM_001320589, intron 4 of 4) -12040 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 115.5-10 chr1 113304411 113304681 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -85969 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 170.75-68 chr2 108873084 108873683 + 0.5 NA intron (NR_147237, intron 13 of 14) intron (NR_147237, intron 13 of 14) 86612 NR_147236 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 126.5-170 chr4 49096123 49096465 + 0.5 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 109652 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 118-85 chr2 84346313 84346645 + 0.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 55797 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 126-139 chr5 33306282 33306775 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 76793 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 146.25-63 chr2 11196623 11197014 + 0.5 NA intron (NM_001321643, intron 27 of 32) intron (NM_001321643, intron 27 of 32) 41351 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 121.25-79 chr17 48287744 48288195 + 0.5 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -6378 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 129-98 chr2 184714205 184714574 + 0.5 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 115860 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 114-170 chrX 27001331 27001698 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 443177 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 112.75-16 chr1 237686404 237686748 + 0.5 NA intron (NM_001035, intron 62 of 104) intron (NM_001035, intron 62 of 104) -175599 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 172.75-138 chr9 72267001 72267392 + 0.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -38240 NR_110952 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 171.75-55 chr16 24470108 24470663 + 0.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -69181 NM_006910 5930 Hs.188553 NM_006910 ENSG00000122257 RBBP6 MY038|P2P-R|PACT|RBQ-1|SNAMA RB binding protein 6, ubiquitin ligase protein-coding 208-39 chr2 65171669 65172394 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -41730 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 120.25-202 chr7 68848376 68848849 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 749012 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 139.25-96 chr2 187205767 187206254 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 242242 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 118.5-63 chr15 86517411 86517840 + 0.5 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -200657 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 165.75-150 chr6 140393959 140394381 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 188918 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 140.25 chr1 2858678 2858978 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -57960 NM_001242672 100287898 Hs.632363 NM_001242672 ENSG00000215912 TTC34 - tetratricopeptide repeat domain 34 protein-coding 114.5-227 chr6 50793290 50793574 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25439 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 212.5-51 chr2 88401027 88401773 + 0.5 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 51293 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 116.25-38 chr11 43588638 43588964 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7407 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 181.75-65 chr2 135647749 135648312 + 0.5 NA intron (NM_001354199, intron 16 of 25) intron (NM_001354199, intron 16 of 25) -17367 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 124.25-128 chr3 16156299 16156615 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -18223 NM_054110 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 159.5-202 chr8 40611841 40612160 + 0.5 NA intron (NM_001135731, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -268637 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 113-141 chr5 12341034 12341391 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -233645 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 132-8 chr1 190238310 190238646 + 0.5 NA intron (NM_199051, intron 4 of 7) L1ME3A|LINE|L1 237532 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 150.5-157 chr4 147619170 147619599 + 0.5 NA intron (NM_018241, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 1987 NM_018241 55751 Hs.203896 NM_018241 ENSG00000164168 TMEM184C TMEM34 transmembrane protein 184C protein-coding 124-133 chr5 59993742 59994076 + 0.5 NA intron (NM_001165899, intron 2 of 16) intron (NM_001165899, intron 2 of 16) -100183 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 153-38 chr14 43670612 43671205 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 836375 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 122.5-203 chr6 158395710 158396062 + 0.5 NA intron (NM_020245, intron 1 of 13) intron (NM_020245, intron 1 of 13) 72904 NR_145798 109623462 NR_145798 SNORA116 - small nucleolar RNA, H/ACA box 116 snoRNA 121-36 chr11 30992140 30992501 + 0.5 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) intron (NM_001367979, intron 20 of 38) 366 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 121-76 chr16 62356363 62356834 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -320160 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 125.75-4 chr1 76150484 76150936 + 0.5 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 75964 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 113-6 chr1 151382025 151382329 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9472 NM_003944 8991 Hs.632460 NM_003944 ENSG00000143416 SELENBP1 EHMTO|HEL-S-134P|LPSB|MTO|SBP56|SP56|hSBP selenium binding protein 1 protein-coding 164.25-136 chr6 55725981 55726467 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -147010 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 180-120 chrX 125069831 125070496 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -106346 NM_014253 10178 Hs.23796 NM_014253 ENSG00000009694 TENM1 ODZ1|ODZ3|TEN-M1|TNM|TNM1|ten-1 teneurin transmembrane protein 1 protein-coding 122.5-91 chr18 33137332 33137735 + 0.5 NA intron (NM_001308126, intron 20 of 23) intron (NM_001308126, intron 20 of 23) 303038 NM_001371121 158.5-32 chr10 122344526 122345020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29935 NM_001330178 59338 Hs.643512 NM_021622 ENSG00000107679 PLEKHA1 TAPP1 pleckstrin homology domain containing A1 protein-coding 157.75-150 chr6 110064785 110065253 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 86708 NM_005284 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 112.75-159 chr5 12805041 12805482 + 0.5 NA TTS (NR_033383) TTS (NR_033383) 137402 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 113.5-178 chr4 68067654 68067920 + 0.5 NA intron (NM_207407, intron 7 of 9) MamGypLTR3|LTR|Gypsy -4490 NR_027094 401135 Hs.130270 NM_001014372 SYT14P1 CHR415SYT|SYT14L|SYTDEP synaptotagmin 14 pseudogene 1 pseudo 115.75-231 chr9 104397077 104397392 + 0.5 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL -107029 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 113.25-61 chr16 8992645 8992933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28883 NM_003470 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 129.25-208 chr8 123681314 123681761 + 0.5 NA intron (NM_001003954, intron 11 of 11) intron (NM_001003954, intron 11 of 11) -27736 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 129.25-213 chr8 138487406 138487815 + 0.5 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 9651 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 118.25-142 chr4 147547574 147547978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 66679 NM_001957 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 159.5-124 chr20 33327321 33327779 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 44336 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 129.5-63 chr14 38871146 38871527 + 0.5 NA intron (NR_039982, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu -11260 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 156.25-142 chr7 115505634 115506188 + 0.5 NA Intergenic MER121|DNA|hAT? 75530 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 118.75-71 chr16 22358376 22358830 + 0.5 NA intron (NM_001802, intron 2 of 4).2 intron (NM_001802, intron 2 of 4).2 16016 NM_001802 1039 Hs.513430 NM_001802 ENSG00000140743 CDR2 CDR62|Yo cerebellar degeneration related protein 2 protein-coding 116.5-22 chr10 34228481 34228853 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) L1MB7|LINE|L1 -455987 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 150.75-91 chr2 33331050 33331439 + 0.5 NA intron (NM_001166264, intron 20 of 28) L1ME3|LINE|L1 -87272 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 140.25-151 chr5 100205425 100205783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 182650 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 114-137 chr5 127196604 127197009 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -93958 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 123.75-206 chrX 53566469 53566762 + 0.5 NA intron (NM_031407, intron 49 of 83) AluJo|SINE|Alu -9341 NR_029484 406889 NR_029484 ENSG00000208012 MIRLET7F2 LET7F2|MIRNLET7F2|let-7f-2 microRNA let-7f-2 ncRNA 130.25-36 chr10 130758012 130758346 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 204489 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 113-78 chr18 28131534 28131815 + 0.5 NA intron (NM_001792, intron 2 of 15) intron (NM_001792, intron 2 of 15) 45456 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 138.75-56 chr15 60851263 60851590 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 169857 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 119.75-6 chr1 77682011 77682435 + 0.5 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) intron (NM_001308237, intron 1 of 13) 435 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 127.75-8 chr1 41763211 41763534 + 0.5 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) intron (NM_024503, intron 1 of 8) 155550 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 116.75-121 chr3 34624402 34624755 + 0.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 769445 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 130.25-33 chr10 103349067 103349544 + 0.5 NA intron (NM_001011663, intron 1 of 9) AluSx|SINE|Alu 1835 NM_001011663 84108 Hs.335808 NM_032154 ENSG00000156374 PCGF6 MBLR|RNF134 polycomb group ring finger 6 protein-coding 119.5-91 chr16 11128584 11129027 + 0.5 NA intron (NM_015226, intron 21 of 22) intron (NM_015226, intron 21 of 22) 127377 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 149-17 chr11 13694734 13695048 + 0.5 NA exon (NM_032228, exon 2 of 12) exon (NM_032228, exon 2 of 12) 26223 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 127-170 chr8 33302024 33302326 + 0.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 170971 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 139.25-183 chr7 90083709 90084104 + 0.5 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR -35494 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 144-33 chr12 58565112 58565522 + 0.5 NA TTS (NR_120452) TTS (NR_120452) -26385 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 126.75-131 chr20 24996415 24996784 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3848 NM_020531 57136 Hs.472330 NM_020531 ENSG00000101474 APMAP BSCv|C20orf3 adipocyte plasma membrane associated protein protein-coding 132.75-205 chr9 125599100 125599460 + 0.5 NA intron (NM_001006619, intron 4 of 10) L3|LINE|CR1 107928 NM_001006618 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 216-49 chr20 38234321 38234903 + 0.5 NA intron (NR_145960, intron 2 of 10) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -25563 NR_104170 149684 Hs.628250 NR_104170 ENSG00000285347 LOC149684 - uncharacterized LOC149684 ncRNA 126.25-227 chrX 57347374 57347626 + 0.5 NA intron (NR_148564, intron 5 of 11) L1PA16|LINE|L1 60646 NR_148564 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 136.25-63 chr14 92412915 92413280 + 0.5 NA intron (NM_153647, intron 3 of 17) MER58B|DNA|hAT-Charlie 89289 NM_153646 123041 Hs.385530 NM_153646 ENSG00000140090 SLC24A4 AI2A5|NCKX4|SHEP6|SLC24A2 solute carrier family 24 member 4 protein-coding 120.75 chr1 22701587 22702056 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9017 NM_004442 2048 Hs.380705 NM_004442 ENSG00000133216 EPHB2 CAPB|DRT|EK5|EPHT3|ERK|Hek5|PCBC|Tyro5 EPH receptor B2 protein-coding 156.75-53 chr14 27253168 27253743 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 344813 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 148-37 chr16 2592528 2593037 + 0.5 NA intron (NM_001261816, intron 11 of 11) intron (NM_001261816, intron 11 of 11) -10602 NR_015441 652276 Hs.720448 NR_015441 ENSG00000215154 LOC652276 - potassium channel tetramerization domain containing 5 pseudogene pseudo 117.25-151 chr4 25987856 25988191 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 73831 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 122.25-13 chr1 189253132 189253607 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1222641 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 125.75-68 chr17 17376450 17376852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 73278 NM_020201 56953 Hs.513977 NM_020201 ENSG00000205309 NT5M dNT-2|dNT2|mdN 5',3'-nucleotidase, mitochondrial protein-coding 114-59 chr17 72485677 72485972 + 0.5 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 106980 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 145.25-94 chr21 32091892 32092438 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5870 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 117.5-35 chr11 14352779 14353158 + 0.5 NA intron (NM_001177314, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 5517 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 164.75-84 chr2 216441137 216441678 + 0.5 NA intron (NM_001127207, intron 10 of 17) intron (NM_001127207, intron 10 of 17) 28642 NM_001127207 50485 Hs.516674 NM_014140 ENSG00000138375 SMARCAL1 HARP|HHARP SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1 protein-coding 131.75-122 chr21 31604019 31604529 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 45041 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 125.75-30 chr10 111002729 111003158 + 0.5 NA intron (NM_007373, intron 4 of 8) Charlie26a|DNA|hAT-Charlie 14017 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 134.75-188 chr6 110299035 110299552 + 0.5 NA intron (NM_001354594, intron 2 of 3) intron (NM_001354594, intron 2 of 3) 30765 NM_001354595 728464 Hs.634429 NM_001123364 ENSG00000053328 METTL24 C6orf186 methyltransferase like 24 protein-coding 207-37 chr18 58758173 58758951 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -55318 NR_146904 105372147 Hs.210837 NR_146904 ENSG00000267593 LINC01926 - long intergenic non-protein coding RNA 1926 ncRNA 201.25-83 chr6 138004848 138005514 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -59381 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 160-33 chr14 59007395 59007926 + 0.5 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 179372 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 139.75-45 chr14 34494640 34495000 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -32580 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 113-40 chr11 21610619 21610909 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -582321 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 123-190 chr8 128085899 128086228 + 0.5 NA intron (NR_003367, intron 6 of 8) intron (NR_003367, intron 6 of 8) 36911 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 183-54 chr2 191849779 191850271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2937 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 136.5-221 chr8 49794457 49794815 + 0.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -115160 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 114.5-158 chr20 3695668 3696001 + 0.5 NA intron (NM_023068, intron 11 of 21) AluSx1|SINE|Alu 11400 NM_001367089 6614 Hs.31869 NM_023068 ENSG00000088827 SIGLEC1 CD169|SIGLEC-1|SN sialic acid binding Ig like lectin 1 protein-coding 143.5-167 chr4 165813867 165814363 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -59122 NM_001204760 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 128.25-149 chr4 84593604 84594041 + 0.5 NA intron (NM_001263, intron 1 of 12) LTR23|LTR|ERV1 10695 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 169.25-42 chr17 70229007 70229431 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59684 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 117.75-58 chr14 73455924 73456282 + 0.5 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 2477 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 123.25-31 chr11 12767458 12767756 + 0.5 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 93186 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 183.5-163 chr9 121740889 121741523 + 0.5 NA intron (NM_032552, intron 3 of 16) intron (NM_032552, intron 3 of 16) -1579 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 224-20 chr15 65769276 65769977 + 0.5 NA intron (NM_005848, intron 1 of 31) intron (NM_005848, intron 1 of 31) 22667 NM_001320835 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 118.25-154 chr5 44459288 44459708 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 50784 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 113.5-5 chr1 41620011 41620341 + 0.5 NA intron (NM_024503, intron 3 of 8) intron (NM_024503, intron 3 of 8) -135493 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 164.25-21 chr10 97699434 97699839 + 0.5 NA Intergenic (GCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12395 NM_021732 60370 Hs.23918 NM_021732 ENSG00000119986 AVPI1 PP5395|VIP32|VIT32 arginine vasopressin induced 1 protein-coding 190.5-145 chr7 49982902 49983505 + 0.5 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) intron (NM_001159878, intron 7 of 7) 110043 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 117.25-170 chr5 40462498 40462931 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -217201 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 129.5-67 chr14 77068743 77069120 + 0.5 NA TTS (NR_110553) TTS (NR_110553) 7260 NR_110553 102724190 Hs.562528 NR_110553 ENSG00000258819 LINC02289 - long intergenic non-protein coding RNA 2289 ncRNA 144.75-14 chr1 225115382 225115782 + 0.5 NA intron (NM_001367479, intron 23 of 85) intron (NM_001367479, intron 23 of 85) 185907 NM_001145154 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 116.5-25 chr10 70573882 70574236 + 0.5 NA Intergenic LTR31|LTR|ERV1 28682 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 142-75 chr19 30229516 30230060 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -142596 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 133.5-252 chr7 114603077 114603449 + 0.5 NA intron (NM_148898, intron 4 of 17) intron (NM_148898, intron 4 of 17) -50082 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 205.25-17 chr12 46371404 46371901 + 0.5 NA intron (NM_001307936, intron 1 of 14) CpG 1121 NM_018976 54407 Hs.221847 NM_018976 ENSG00000134294 SLC38A2 ATA2|PRO1068|SAT2|SNAT2 solute carrier family 38 member 2 protein-coding 134.75-51 chr12 21770443 21770933 + 0.5 NA intron (NM_004982, intron 2 of 2) MER5B|DNA|hAT-Charlie 4018 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 171.5-32 chr11 120971021 120971520 + 0.5 NA intron (NM_001282470, intron 18 of 19) L2c|LINE|L2 -13231 NR_133004 101929208 Hs.662310 NR_133004 LOC101929208 - uncharacterized LOC101929208 ncRNA 233.25-78 chr9 71585685 71586412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -139077 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 135-178 chr8 30287548 30288052 + 0.5 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -96701 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 131-162 chr7 93833190 93833703 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57307 NM_006528 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 132-163 chr7 46785479 46785825 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -88530 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 120-50 chr15 33223062 33223413 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 24318 NR_046005 100652857 Hs.439998 NR_046005 TMCO5B - transmembrane and coiled-coil domains 5B (pseudogene) pseudo 128.5-54 chr12 107285865 107286336 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32334 NM_001018072 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 123-41 chr13 20900628 20900923 + 0.5 NA intron (NM_022459, intron 1 of 22) AluSx1|SINE|Alu 1999 NM_022459 64328 Hs.507452 NM_022459 ENSG00000132953 XPO4 exp4 exportin 4 protein-coding 175.5-58 chr15 59970973 59971533 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -33058 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 178.25-115 chr8 71536413 71537058 + 0.5 NA intron (NM_001370336, intron 1 of 17) intron (NM_001370336, intron 1 of 17) 10969 NM_172059 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 115.25-222 chr9 31367009 31367239 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14366 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 118-125 chr3 195307387 195307729 + 0.5 NA intron (NM_012287, intron 11 of 22) MIR|SINE|MIR -36399 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 147-78 chr2 118791643 118792066 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56329 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 150.5-184 chr6 56881720 56882093 + 0.5 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -29990 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 129.25-209 chr8 124176959 124177294 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5604 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 118.5-237 chr9 36789706 36790045 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 33724 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 120.75-75 chr2 14414380 14414829 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13646 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 148.25-101 chr4 11919785 11920296 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 136862 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 125-83 chr20 5647098 5647507 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36296 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 113.5-200 chr5 115796534 115796832 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19974 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 135.5-176 chr6 130552477 130552815 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 115529 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 147.25-43 chr16 14093673 14094077 + 0.5 NA intron (NM_001365418, intron 3 of 5) intron (NM_001365418, intron 3 of 5) 22556 NM_001365412 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 113.75-208 chr9 102095681 102095971 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -357246 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 137.5-248 chrX 95944516 95944930 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 393179 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 141.75-180 chrX 74018464 74018873 + 0.5 NA intron (NR_024582, intron 3 of 4) intron (NR_024582, intron 3 of 4) 74344 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 151.25-99 chr2 233984377 233984799 + 0.5 NA intron (NM_024080, intron 20 of 25) L2c|LINE|L2 -66114 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 131.5-31 chr11 17877671 17878034 + 0.5 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 135195 NM_012139 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 172.75-125 chr8 73200511 73201076 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 58709 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 130.5-125 chr2 15130459 15130930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 430640 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 196.5-84 chr2 76761983 76762574 + 0.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -223687 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 172.25-73 chr2 168811458 168812029 + 0.5 NA intron (NM_001171632, intron 2 of 14) intron (NM_001171632, intron 2 of 14) 9146 NM_052946 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 113.25-105 chr22 28915991 28916263 + 0.5 NA intron (NM_001206998, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu -1262 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 123-39 chr12 98111682 98112107 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116446 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 150-101 chr3 189046311 189046749 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -98891 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 121.25-160 chr5 54262177 54262475 + 0.5 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 48247 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 133-134 chr5 39730052 39730358 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 209774 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 155.75-121 chr4 97226539 97226998 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -140158 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 201.25-79 chr6 27790448 27790862 + 0.5 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 17276 NM_003519 8340 Hs.137594 NM_003519 ENSG00000185130 HIST1H2BL H2B/c|H2BFC|dJ97D16.4 histone cluster 1 H2B family member l protein-coding 180.25-16 chr12 13365696 13366307 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 10744 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 120.5-99 chr17 82582516 82582825 + 0.5 NA intron (NM_004514, intron 4 of 8) intron (NM_004514, intron 4 of 8) 62938 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 117.5-156 chr4 37621446 37621880 + 0.5 NA intron (NM_001085400, intron 6 of 6) intron (NM_001085400, intron 6 of 6) 37430 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 179-43 chr16 87759847 87760515 + 0.5 NA intron (NM_001184856, intron 2 of 10) intron (NM_001184856, intron 2 of 10) 5805 NM_017566 54758 Hs.123450 NM_017566 ENSG00000104731 KLHDC4 - kelch domain containing 4 protein-coding 137.5-103 chr18 9823835 9824275 + 0.5 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) intron (NM_006868, intron 5 of 6) -61918 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 124.25-161 chr5 45359241 45359636 + 0.5 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 336942 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 114.5-85 chr14 31063809 31064112 + 0.5 NA intron (NM_001254728, intron 1 of 5) intron (NM_001254728, intron 1 of 5) 37317 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 121-14 chr1 232464392 232464799 + 0.5 NA intron (NM_020808, intron 7 of 20) intron (NM_020808, intron 7 of 20) 51013 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 126.5-9 chr1 69160674 69161059 + 0.5 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) intron (NR_146608, intron 3 of 4) 104968 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 117.75-6 chr1 85710443 85710707 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -2142 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 138-83 chr2 213870020 213870404 + 0.5 NA intron (NR_047660, intron 10 of 14) intron (NR_047660, intron 10 of 14) 112145 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 163-4 chr1 113437146 113437629 + 0.5 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 46872 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 121.5-22 chr1 233597011 233597341 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16930 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 119.5-74 chr14 32575319 32575598 + 0.5 NA intron (NM_004274, intron 4 of 13) intron (NM_004274, intron 4 of 13) 246160 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 168-110 chr6 71527367 71527834 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 106573 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 118.5-76 chr18 2529737 2530121 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 41576 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 175.25-119 chr5 103090002 103090600 + 0.5 NA intron (NR_134299, intron 4 of 4) intron (NR_134299, intron 4 of 4) 29837 NR_134299 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 116-165 chr8 63337838 63338157 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -127852 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 134.75-143 chr3 74269350 74269805 + 0.5 NA intron (NM_020872, intron 19 of 21) intron (NM_020872, intron 19 of 21) 251563 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 146.25-150 chr8 92006169 92006632 + 0.5 NA intron (NM_004349, intron 4 of 10) intron (NM_004349, intron 4 of 10) 11280 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 115.5-224 chr6 169653454 169653805 + 0.5 NA intron (NM_182552, intron 13 of 25) intron (NM_182552, intron 13 of 25) 48400 NM_001350623 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 143.75-31 chr11 23358442 23358817 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 60561 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 171.75-102 chr4 74486567 74487014 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41654 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 150.75-198 chrX 93771199 93771568 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 97177 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 133.75-143 chr3 172329143 172329660 + 0.5 NA intron (NM_001135095, intron 12 of 25) intron (NM_001135095, intron 12 of 25) 119055 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 122-178 chr8 30510250 30510687 + 0.5 NA intron (NM_001008710, intron 5 of 8) intron (NM_001008710, intron 5 of 8) -125067 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 134.25-168 chr7 3195182 3195525 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -36780 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 125.25-206 chr8 82848073 82848391 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -63872 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 142.5-229 chr8 127643207 127643739 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90494 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 146.25-84 chr2 233994368 233994715 + 0.5 NA intron (NM_024080, intron 21 of 25) intron (NM_024080, intron 21 of 25) -56161 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 116.25-248 chr9 114401908 114402271 + 0.5 NA TTS (NM_001173425) TTS (NM_001173425) -7684 NM_001317952 80709 Hs.494895 NM_030767 ENSG00000106948 AKNA - AT-hook transcription factor protein-coding 135-79 chr2 107580510 107580904 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 51288 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 136.5-37 chr11 11210490 11210904 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 142553 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 140.75-148 chr5 74981374 74981873 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 70935 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 134.75-222 chr8 110569074 110569608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 458092 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 122.5-129 chr2 239163777 239164158 + 0.5 NA intron (NM_006037, intron 5 of 26) intron (NM_006037, intron 5 of 26) 31490 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 115-66 chr17 64407737 64408159 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17088 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 117-38 chr12 53680165 53680544 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4024 NM_001369755 517 Hs.524464 NM_005176 ENSG00000135390 ATP5MC2 ATP5A|ATP5G2 ATP synthase membrane subunit c locus 2 protein-coding 130.25-138 chr3 107252185 107252595 + 0.5 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) intron (NR_028302, intron 1 of 3) 11698 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 137.5-80 chr16 9416873 9417244 + 0.5 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 27927 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 170.5-15 chr1 180799526 180799912 + 0.5 NA intron (NR_137330, intron 3 of 12) ERVL-E-int|LTR|ERVL -113178 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 116.25-137 chr3 45207634 45207953 + 0.5 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy 18494 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 159.75-86 chr2 136146039 136146394 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -28061 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 165.5-45 chr14 61248753 61249185 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 32369 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 149.5-187 chr7 83194988 83195352 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32286 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 138.25-101 chr20 57647026 57647535 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26854 NR_136660 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 139-31 chr12 126507268 126507567 + 0.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -58090 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 137.5-218 chr7 19497891 19498306 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 207338 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 160.75-86 chr2 222592842 222593407 + 0.5 NA intron (NR_130154, intron 17 of 17) intron (NR_130154, intron 17 of 17) 62968 NM_005687 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 113.5-252 chr9 110739484 110739862 + 0.5 NA intron (NM_001369398, intron 2 of 8) MER77|LTR|ERVL 11411 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 112.5-248 chrX 77788983 77789281 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2916 NM_138270 546 Hs.533526 NM_000489 ENSG00000085224 ATRX JMS|MRX52|RAD54|RAD54L|XH2|XNP|ZNF-HX ATRX chromatin remodeler protein-coding 133.25-199 chr7 44668615 44669100 + 0.5 NA intron (NM_002541, intron 5 of 22) MER33|DNA|hAT-Charlie 62230 NM_001003941 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 131-156 chr7 42706115 42706518 + 0.5 NA non-coding (NR_110833, exon 1 of 3) non-coding (NR_110833, exon 1 of 3) 131 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 136.75-159 chr5 61549917 61550363 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87620 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 131.5-26 chr10 77512515 77512885 + 0.5 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 125108 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 147.75-114 chr4 31335298 31335859 + 0.5 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 164434 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 147.25-65 chr2 166070164 166070684 + 0.5 NA intron (NR_148667, intron 3 of 28) intron (NR_148667, intron 3 of 28) -11107 NR_110260 101929680 Hs.662210 NR_110260 ENSG00000236107 SCN1A-AS1 - SCN1A and SCN9A antisense RNA 1 ncRNA 156.75-171 chr9 78355262 78355838 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 58425 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 122.75-49 chr14 52543179 52543626 + 0.5 NA exon (NM_020784, exon 3 of 21) exon (NM_020784, exon 3 of 21) 9103 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 146.5-85 chr17 71126247 71126657 + 0.5 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 75727 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 123-205 chrX 46349504 46349882 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -22019 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 130-52 chr16 2737632 2738043 + 0.5 NA intron (NR_027275, intron 4 of 5) intron (NR_027275, intron 4 of 5) 6960 NR_027274 100128788 Hs.311208 NR_027274 ENSG00000205913 SRRM2-AS1 - SRRM2 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-9 chr1 96443455 96443759 + 0.5 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -69482 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 212.5-67 chr3 7497989 7498749 + 0.5 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) intron (NM_000844, intron 7 of 9) 36915 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 178.5-113 chr3 193355522 193356141 + 0.5 NA intron (NM_198505, intron 5 of 29) intron (NM_198505, intron 5 of 29) 22922 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 157.5-9 chr1 93348513 93349062 + 0.5 NA intron (NM_001938, intron 1 of 2) intron (NM_001938, intron 1 of 2) 2880 NM_001938 1810 Hs.348418 NM_001938 ENSG00000117505 DR1 NC2|NC2-BETA|NC2B|NCB2 down-regulator of transcription 1 protein-coding 129-128 chr4 13563734 13564070 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16078 NR_015450 285548 Hs.529284 NR_015450 LINC01096 - long intergenic non-protein coding RNA 1096 ncRNA 146.5-42 chr11 58124498 58124949 + 0.5 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -5279 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 115.75-138 chr3 23166390 23166848 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 35959 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 175.5-182 chrX 3407890 3408302 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -61444 NM_015419 25878 Hs.369422 NM_015419 ENSG00000101825 MXRA5 - matrix remodeling associated 5 protein-coding 154.25-182 chr9 36439932 36440359 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -38947 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 143.5-46 chr12 67158200 67158620 + 0.5 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -62126 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 151.25-202 chr9 104684897 104685414 + 0.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -9267 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 132-150 chr6 113799073 113799482 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58068 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 119.75-54 chr13 113092970 113093315 + 0.5 NA intron (NM_001320815, intron 27 of 30) intron (NM_001320815, intron 27 of 30) -12646 NM_000131 2155 Hs.36989 NM_000131 ENSG00000057593 F7 SPCA coagulation factor VII protein-coding 113.75-89 chr18 60429841 60430239 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57265 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 123.5-153 chr4 111301767 111302207 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -441340 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 122.75-144 chr4 37188511 37188846 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 53313 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 120.5-17 chr1 228721526 228721890 + 0.5 NA intron (NR_037962, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu -13771 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 127.25-164 chr5 33782517 33783018 + 0.5 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 109223 NM_030955 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 117-31 chr11 116806113 116806530 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -13901 NM_052968 116519 Hs.283923 NM_052968 ENSG00000110243 APOA5 APOAV|RAP3 apolipoprotein A5 protein-coding 147.75-147 chr7 94578621 94579070 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 69036 NM_001363427 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 163.5-117 chr21 30224088 30224624 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8259 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 119.25-111 chr20 39868737 39869106 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -135540 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 141.25-39 chr12 72666123 72666642 + 0.5 NA TTS (NM_013381) TTS (NM_013381) -392873 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 114.5-175 chr3 51218313 51218607 + 0.5 NA intron (NM_004947, intron 14 of 52) AluSx|SINE|Alu -166831 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 117-62 chr14 97990431 97990875 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12529 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 177.5-115 chr3 94404622 94405067 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 341783 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 115.5-184 chr4 45132628 45132988 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -406174 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 117.75-230 chrX 70331532 70331896 + 0.5 NA intron (NM_012310, intron 9 of 30) intron (NM_012310, intron 9 of 30) 41610 NM_012310 24137 Hs.648326 NM_012310 ENSG00000090889 KIF4A KIF4|KIF4G1|MRX100 kinesin family member 4A protein-coding 119.75-9 chr1 121506321 121506772 + 0.5 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -12566 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 132.25-106 chr2 187763922 187764308 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -209610 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 112.25-216 chr8 108692644 108692989 + 0.5 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 94778 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 222.5-41 chr17 64061939 64062427 + 0.5 NA intron (NM_001433, intron 10 of 21) MER5A|DNA|hAT-Charlie -41549 NM_001099786 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 119.75-57 chr14 36274450 36274754 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 46035 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 171.25-127 chr5 122703536 122704104 + 0.5 NA intron (NR_109881, intron 6 of 11) intron (NR_109881, intron 6 of 11) 26740 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 115-167 chr7 11488320 11488727 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) intron (NM_015204, intron 6 of 26) 343675 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 159.25-137 chr7 66209245 66209631 + 0.5 NA intron (NM_003596, intron 1 of 5) intron (NM_003596, intron 1 of 5) 4104 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 126 chr1 48105015 48105352 + 0.5 NA intron (NR_026749, intron 9 of 9) intron (NR_026749, intron 9 of 9) 77245 NR_026749 391037 Hs.585393 NR_026749 SKINT1L BTN12|SKINT1|SKINTL|SKINTP Skint1 like (pseudogene) pseudo 129.25-187 chr7 72496558 72496905 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49588 NM_001363460 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 139.25-118 chr3 22973008 22973472 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 229338 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 114.5-149 chr2 185453582 185453954 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 284951 NR_110215 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 146.5-59 chr14 24380959 24381391 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12093 NM_001198966 4776 Hs.77810 NM_004554 ENSG00000100968 NFATC4 NF-AT3|NF-ATC4|NFAT3 nuclear factor of activated T cells 4 protein-coding 126.5-260 chr9 14393329 14393709 + 0.5 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) 5464 NM_001190738 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 126.75-20 chr10 51038053 51038452 + 0.5 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) L1MA3|LINE|L1 30300 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 124.25-10 chr1 105102448 105102783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 516320 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 118.25-56 chr13 46187180 46187588 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -5207 NM_002298 3936 Hs.381099 NM_002298 ENSG00000136167 LCP1 CP64|HEL-S-37|L-PLASTIN|LC64P|LPL|PLS2 lymphocyte cytosolic protein 1 protein-coding 190.75-23 chr12 107694299 107694734 + 0.5 NA intron (NM_007062, intron 5 of 14) intron (NM_007062, intron 5 of 14) 8474 NM_001317962 11137 Hs.506652 NM_007062 ENSG00000136045 PWP1 IEF-SSP-9502 PWP1 homolog, endonuclein protein-coding 185.5-50 chr14 68591476 68592109 + 0.5 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 36995 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 155.75-103 chr3 57006167 57006623 + 0.5 NA intron (NM_001128615, intron 2 of 12) intron (NM_001128615, intron 2 of 12) -54269 NM_181727 353324 Hs.129794 NM_181727 ENSG00000186451 SPATA12 SRG5 spermatogenesis associated 12 protein-coding 168-80 chr22 37429948 37430527 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2758 NM_052906 114794 Hs.344170 NM_052906 ENSG00000166897 ELFN2 LRRC62|PPP1R29 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 122-168 chr7 61045250 61045676 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 2258593 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 122.5-119 chr2 159440264 159440589 + 0.5 NA intron (NM_001329858, intron 6 of 36) intron (NM_001329858, intron 6 of 36) -153723 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 138-36 chr13 109814990 109815424 + 0.5 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -28624 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 255.25-18 chr16 77415004 77415663 + 0.5 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 19701 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 114.75-70 chr17 49653604 49653950 + 0.5 NA intron (NM_001007229, intron 1 of 10) intron (NM_001007229, intron 1 of 10) -7259 NM_001370730 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 117.75-217 chr8 139043719 139044109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -129873 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 158.25-59 chr2 95261693 95262123 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12541 NM_001165978 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 135.25-104 chr2 143183546 143183960 + 0.5 NA intron (NM_018460, intron 2 of 13) intron (NM_018460, intron 2 of 13) 54334 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 134-36 chr11 113051481 113051837 + 0.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) L1ME4a|LINE|L1 -88199 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 116.75-103 chr2 178040502 178040928 + 0.5 NA intron (NM_001077197, intron 2 of 20) intron (NM_001077197, intron 2 of 20) 32062 NM_016953 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 130-146 chr7 5237439 5237805 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23353 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 130.25-76 chr16 80880097 80880596 + 0.5 NA intron (NR_131948, intron 1 of 2) AluJr4|SINE|Alu 12250 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 137.5-196 chr5 120258113 120258469 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -205987 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 160.75-43 chr14 47093367 47093871 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 249627 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 133-128 chr4 116696714 116697066 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 388686 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 177-74 chr4 78495467 78496028 + 0.5 NA intron (NM_025074, intron 59 of 73) intron (NM_025074, intron 59 of 73) -56023 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 123-200 chr9 109235842 109236246 + 0.5 NA intron (NM_019114, intron 15 of 25) intron (NM_019114, intron 15 of 25) -68753 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 155.25-189 chr9 115286857 115287326 + 0.5 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) intron (NR_163556, intron 2 of 7) 145273 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 166.25-83 chr2 171138790 171139370 + 0.5 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) intron (NM_001136554, intron 1 of 20) 21813 NM_012290 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 125.25-65 chr14 60620004 60620373 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19028 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 161-54 chr17 65501712 65502321 + 0.5 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 44475 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 156.25-35 chr12 57818233 57818728 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2411 NM_006576 10677 Hs.584854 NM_006576 ENSG00000135407 AVIL ADVIL|DOC6|p92 advillin protein-coding 123.25-71 chr16 14290924 14291256 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11198 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 156-117 chr5 36333142 36333618 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -31478 NM_001323278 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 126.25-213 chr8 130300474 130300836 + 0.5 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -4122 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 126.25-209 chr8 124511715 124512125 + 0.5 NA intron (NM_001317891, intron 3 of 8) MIRb|SINE|MIR -3344 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 119.75-124 chr20 31244997 31245353 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12489 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 122.5-148 chr3 63179525 63179880 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 77014 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 121.75-178 chr7 47032781 47033123 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -335830 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 180.5-92 chr3 17016378 17016743 + 0.5 NA intron (NM_015184, intron 3 of 5) intron (NM_015184, intron 3 of 5) 83364 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 158.5-201 chr9 135308666 135309137 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -34348 NM_173520 157927 Hs.559511 NM_173520 C9orf62 - chromosome 9 open reading frame 62 protein-coding 116.5-129 chr2 160651994 160652436 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -158408 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 172.25-52 chr17 81835340 81835961 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001007533) promoter-TSS (NM_001007533) -600 NM_001007533 116729 Hs.454720 NM_001007533 ENSG00000182676 PPP1R27 DYSFIP1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 27 protein-coding 127-64 chr14 95621494 95621816 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -30442 NR_152604 27004 Hs.510368 NM_012468 TCL6 TNG1|TNG2 T cell leukemia/lymphoma 6 ncRNA 141.5-30 chr11 113629969 113630343 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 76152 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 116.25-75 chr15 58436595 58437015 + 0.5 NA non-coding (NR_120338, exon 3 of 3) non-coding (NR_120338, exon 3 of 3) 4814 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 137.75-189 chr7 10442882 10443239 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -259616 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 120-163 chr6 80310152 80310453 + 0.5 NA intron (NR_134945, intron 10 of 10) L1PA11|LINE|L1 203631 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 129.5-91 chr16 60874449 60874766 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 181159 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 116-176 chr8 131036880 131037189 + 0.5 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 3875 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 119.25-25 chr10 78080021 78080283 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 46289 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 120.25-137 chr3 166751640 166752024 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -146851 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 152.5-82 chr2 38729727 38730060 + 0.5 NA intron (NM_138801, intron 5 of 6) intron (NM_138801, intron 5 of 6) 21468 NM_001031684 6432 Hs.309090 NM_006276 ENSG00000115875 SRSF7 9G8|AAG3|SFRS7 serine and arginine rich splicing factor 7 protein-coding 141.75-51 chr13 108142391 108142726 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 72224 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 122.75-165 chr5 92396431 92396795 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1013296 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 139.75-196 chrX 132707800 132708228 + 0.5 NA intron (NM_001077188, intron 4 of 5) intron (NM_001077188, intron 4 of 5) 40372 NR_046691 100874102 Hs.619341 NR_046691 ENSG00000235849 HS6ST2-AS1 - HS6ST2 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-118 chr2 214999786 215000164 + 0.5 NA intron (NR_103740, intron 23 of 54) intron (NR_103740, intron 23 of 54) 32111 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 161.5-171 chr7 46542182 46542612 + 0.5 NA Intergenic LTR38-int|LTR|ERV1 154725 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 127-31 chr11 62060026 62060391 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -63803 NM_020238 3619 Hs.142179 NM_020238 ENSG00000149503 INCENP - inner centromere protein protein-coding 145.5-102 chr2 126388307 126388814 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -267375 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 123.5-204 chr7 154290670 154291034 + 0.5 NA intron (NM_130797, intron 1 of 25) L2c|LINE|L2 -14307 NM_001936 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 115.75-107 chr2 104607360 104607636 + 0.5 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 -96989 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 132.75-146 chr5 3674675 3675135 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 79073 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 130.75-175 chr7 23359058 23359538 + 0.5 NA intron (NM_006547, intron 5 of 14) intron (NM_006547, intron 5 of 14) -37148 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 127.5-243 chr8 115549831 115550135 + 0.5 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) AluSx1|SINE|Alu 118030 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 145.5-171 chr6 39982608 39983094 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -48389 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 148-81 chr3 42203837 42204291 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001265610, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001265610, exon 12 of 12) 43871 NM_014965 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 115.75-82 chr17 60656999 60657406 + 0.5 NA intron (NM_003620, intron 5 of 5) MIRc|SINE|MIR -20649 NM_017679 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 163-100 chr5 91203742 91204241 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 110411 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 146-118 chr7 27979245 27979676 + 0.5 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) FRAM|SINE|Alu -200997 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 123.5-44 chr11 114752625 114753045 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 74308 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 119.75-161 chr4 114603235 114603610 + 0.5 NA intron (NM_001322114, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 4137 NM_001322114 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 113.75-58 chr14 55042323 55042595 + 0.5 NA intron (NM_199421, intron 2 of 2) intron (NM_199421, intron 2 of 2) -9188 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 196.75-33 chr13 58985014 58985785 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -752282 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 131.5-81 chr15 97102181 97102582 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 318946 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 254.5-11 chr10 50499339 50499990 + 0.5 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) intron (NM_147156, intron 3 of 10) 124292 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 166-31 chr14 64469579 64470065 + 0.5 NA 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 4323 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 121.75-45 chr14 50880019 50880361 + 0.5 NA intron (NM_001206673, intron 3 of 12) intron (NM_001206673, intron 3 of 12) 8030 NM_181814 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 129-133 chr4 148698305 148698727 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 243862 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 126.25-204 chr8 87655629 87656072 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 218165 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 124.5-18 chr1 199561304 199561759 + 0.5 NA Intergenic (CCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 412933 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 167-25 chr11 9690896 9691423 + 0.5 NA intron (NM_015055, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 27082 NM_015055 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 157-39 chr16 21262806 21263205 + 0.5 NA intron (NM_001888, intron 7 of 9).2 intron (NM_001888, intron 7 of 9).2 29306 NM_145865 257629 Hs.115959 NM_145865 ENSG00000175311 ANKS4B HARP ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 4B protein-coding 144.25-17 chr1 174764059 174764536 + 0.5 NA intron (NM_001366451, intron 3 of 12) L1MB7|LINE|L1 -35441 NM_001330989 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 131.75-131 chr3 10555324 10555836 + 0.5 NA intron (NM_001353564, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR -49994 NM_001683 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 168.25-4 chr1 77912648 77913221 + 0.5 NA intron (NM_001172309, intron 1 of 11) L1MC1|LINE|L1 -23395 NR_103535 374987 Hs.632414 NM_199343 ENSG00000235927 NEXN-AS1 C1orf118 NEXN antisense RNA 1 ncRNA 126.75-25 chr10 92405425 92405862 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13018 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 121-159 chr5 61381545 61381846 + 0.5 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 49437 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 146.5-3 chr1 10611118 10611529 + 0.5 NA intron (NM_004565, intron 4 of 8) MER58C|DNA|hAT-Charlie 136373 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 134.75-218 chr8 101257063 101257558 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -51246 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 114.5-191 chr4 92492572 92492959 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 188366 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 138-172 chr9 98264825 98265274 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9400 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 116.75-210 chr9 80581772 80582175 + 0.5 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 606950 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 145.75-78 chr2 55564640 55565073 + 0.5 NA intron (NM_020463, intron 12 of 14) intron (NM_020463, intron 12 of 14) 45261 NM_001282761 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 139.5-130 chr3 48659501 48659887 + 0.5 NA exon (NM_001407, exon 1 of 35) exon (NM_001407, exon 1 of 35) 3192 NM_001407 1951 Hs.631926 NM_001407 ENSG00000008300 CELSR3 ADGRC3|CDHF11|EGFL1|FMI1|HFMI1|MEGF2|RESDA1 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 protein-coding 151.5-65 chr17 35051030 35051450 + 0.5 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) intron (NR_037713, intron 1 of 6) 12467 NM_001017368 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 133-79 chr2 10957695 10958103 + 0.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 45965 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 123.25-125 chr22 20239037 20239367 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 10009 NR_031618 100302118 NR_031618 ENSG00000221039 MIR1286 MIRN1286|hsa-mir-1286|mir-1286 microRNA 1286 ncRNA 119.75-120 chr2 236436253 236436600 + 0.5 NA intron (NR_073043, intron 7 of 19) intron (NR_073043, intron 7 of 19) 67271 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 114.75-133 chr3 182221259 182221603 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 264931 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 181-38 chr17 48718401 48718841 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3897 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 114-11 chr1 177836928 177837301 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132808 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 122-6 chr1 69826278 69826609 + 0.5 NA intron (NM_001370785, intron 5 of 26) intron (NM_001370785, intron 5 of 26) -92879 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 159.25-144 chr8 29179243 29179716 + 0.5 NA intron (NM_015254, intron 8 of 39) intron (NM_015254, intron 8 of 39) 83591 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 133.5-35 chr10 78532103 78532475 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 264947 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 143.25-10 chr1 145794101 145794580 + 0.5 NA intron (NM_014455, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 29755 NM_014455 27246 Hs.523550 NM_014455 ENSG00000265491 RNF115 BCA2|ZNF364 ring finger protein 115 protein-coding 115-194 chr9 114607906 114608310 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3183 NM_153045 203197 Hs.522357 NM_153045 ENSG00000157693 TMEM268 C9orf91 transmembrane protein 268 protein-coding 177.5-62 chr17 71044016 71044604 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 157869 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 164.5-104 chr2 164513587 164513963 + 0.5 NA intron (NM_004490, intron 6 of 13) L1MEi|LINE|L1 54720 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 144.25-16 chr1 174752826 174753376 + 0.5 NA intron (NM_001366451, intron 3 of 12) MIR|SINE|MIR -46637 NM_001330989 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 117.25-55 chr12 57298118 57298435 + 0.5 NA intron (NM_001351215, intron 5 of 22) intron (NM_001351215, intron 5 of 22) 43498 NM_001351215 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 128.75 chr1 9642840 9643254 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8684 NM_005026 5293 Hs.518451 NM_005026 ENSG00000171608 PIK3CD APDS|IMD14|P110DELTA|PI3K|p110D phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta protein-coding 135.25-90 chr2 27802432 27802770 + 0.5 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) intron (NM_022128, intron 7 of 7) 30882 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 191.75-125 chr8 109960802 109961481 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14630 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 121-53 chr13 50162664 50163040 + 0.5 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) -9166 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 129.75-65 chr14 84899762 84900212 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -371945 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 123-164 chr5 126269998 126270363 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14995 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 140.5-183 chr5 106463129 106463597 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 547651 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 126.5-63 chr14 56053329 56053716 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -64889 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 113.75-114 chr20 51771440 51771842 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3251 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 147.25-3 chr1 64671512 64671880 + 0.5 NA intron (NM_020925, intron 17 of 26) intron (NM_020925, intron 17 of 26) -73277 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 118-154 chr5 109188806 109189047 + 0.5 NA non-coding (NR_146155, exon 20 of 20) non-coding (NR_146155, exon 20 of 20) 137443 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 153-66 chr2 27855303 27855759 + 0.5 NA intron (NM_022128, intron 2 of 7) intron (NM_022128, intron 2 of 7) -33178 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 129.75-131 chr4 75740987 75741482 + 0.5 NA intron (NM_003715, intron 1 of 23) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 16712 NM_003715 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 118.25-76 chr16 56052961 56053405 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -97152 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 114.25-196 chr8 133606120 133606565 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34455 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 139.75-31 chr12 15449322 15449738 + 0.5 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1MA9|LINE|L1 -97081 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 115-5 chr1 69635420 69635871 + 0.5 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 66304 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 199.25-46 chr17 42214131 42214583 + 0.5 NA intron (NM_012448, intron 12 of 18) intron (NM_012448, intron 12 of 18) -19863 NM_032484 84514 Hs.38039 NM_032484 ENSG00000167925 GHDC D11LGP1|LGP1 GH3 domain containing protein-coding 120-46 chr14 70980070 70980521 + 0.5 NA intron (NM_001308160, intron 6 of 33) intron (NM_001308160, intron 6 of 33) 72836 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 169.75-162 chr9 34481059 34481607 + 0.5 NA intron (NM_001281428, intron 1 of 19) intron (NM_001281428, intron 1 of 19) 22528 NM_012144 27019 Hs.112667 NM_012144 ENSG00000122735 DNAI1 CILD1|DIC1|ICS1|PCD dynein axonemal intermediate chain 1 protein-coding 126-90 chr2 29269100 29269488 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 11 of 28) intron (NM_004304, intron 11 of 28) -45394 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 112.5-195 chr5 129978415 129978759 + 0.5 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 74122 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 113.5-22 chr1 200699786 200700182 + 0.5 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -29986 NM_001349803 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 133.75-17 chr10 33341700 33341991 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6940 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 207-53 chr21 38865984 38866735 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 8820 NR_109926 101928398 Hs.122403 NR_109926 LOC101928398 - uncharacterized LOC101928398 ncRNA 129.5-16 chr1 241454722 241455184 + 0.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 64832 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 181.75-117 chr7 46530470 46530968 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 166403 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 121.5-85 chr15 60535944 60536245 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) 56432 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 126-41 chr12 64010302 64010688 + 0.5 NA intron (NM_001346201, intron 3 of 21) intron (NM_001346201, intron 3 of 21) 165795 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 141-103 chr3 80729377 80729870 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35274 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 143.5-130 chr20 41314536 41314915 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14605 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 134-127 chr4 39005319 39005690 + 0.5 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 26905 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 177.5-7 chr1 98112709 98113198 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -63260 NR_046105 400765 Hs.451802 NM_001001688 ENSG00000225206 MIR137HG - MIR137 host gene ncRNA 155.5-208 chr8 125365806 125366227 + 0.5 NA intron (NM_001349486, intron 7 of 7) L2a|LINE|L2 -64342 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 150.25-12 chr1 178146397 178146797 + 0.5 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) intron (NM_170692, intron 1 of 17) 52493 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 124.75-35 chr10 92111556 92112033 + 0.5 NA intron (NM_001178137, intron 6 of 9) L1MB7|LINE|L1 131485 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 195.5-111 chr4 167634537 167635075 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -400216 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 171.25-87 chr21 27308827 27309371 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -342011 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 119.5-238 chr8 116075225 116075584 + 0.5 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) L1ME2z|LINE|L1 249655 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 159.5-120 chr2 216111941 216112317 + 0.5 NA intron (NM_021141, intron 1 of 20) L3|LINE|CR1 2781 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 132.5-183 chr4 106796402 106796692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 239766 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 170-32 chr14 79240797 79241225 + 0.5 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -38369 NM_138970 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 116.25-16 chr10 17931734 17932176 + 0.5 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -19884 NM_001282734 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 116.25-46 chr12 26465293 26465639 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 45 of 56) L2c|LINE|L2 269893 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 132-90 chr2 100191155 100191577 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16888 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 137.5-213 chr6 145512597 145513091 + 0.5 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 174033 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 140.75-24 chr11 19044746 19045266 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 15011 NM_001303615 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 160.25-16 chr11 78503556 78503938 + 0.5 NA intron (NM_024678, intron 6 of 13) intron (NM_024678, intron 6 of 13) -29429 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 124.75-12 chr1 115469798 115470238 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -131782 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 193.5-10 chr1 111235359 111235793 + 0.5 NA intron (NM_001025199, intron 4 of 9) intron (NM_001025199, intron 4 of 9) 5840 NM_001025199 1117 Hs.514840 NM_004000 ENSG00000064886 CHI3L2 CHIL2|YKL-39|YKL39 chitinase 3 like 2 protein-coding 113.25-54 chr14 102038302 102038743 + 0.5 NA exon (NM_001376, exon 58 of 78) exon (NM_001376, exon 58 of 78) 48522 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 144.25-213 chr8 129208244 129208654 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 32791 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 127.25-21 chr10 60002056 60002548 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -41389 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 118.5-65 chr16 12354104 12354513 + 0.5 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) -366013 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 126.75-30 chr11 80786320 80786770 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23742 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 113.25-178 chr8 130926495 130926854 + 0.5 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) L1MA8|LINE|L1 114235 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 119.25-86 chr19 29341049 29341420 + 0.5 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L1M4|LINE|L1 -128083 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 152.25-83 chr2 64615833 64616358 + 0.5 NA non-coding (NR_034023, exon 4 of 4) non-coding (NR_034023, exon 4 of 4) 8783 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 126-89 chr2 26313016 26313292 + 0.5 NA intron (NR_135916, intron 6 of 12) intron (NR_135916, intron 6 of 12) 5895 NM_001145168 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 153.25-38 chr14 45223223 45223561 + 0.5 NA intron (NM_018353, intron 11 of 16) AluSg|SINE|Alu 29810 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 152-149 chr8 84217004 84217547 + 0.5 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 32609 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 113.75-30 chr11 7303748 7303988 + 0.5 NA intron (NM_175733, intron 2 of 6) intron (NM_175733, intron 2 of 6) 51964 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 149-73 chr22 23060906 23061500 + 0.5 NA intron (NM_014433, intron 6 of 6) intron (NM_014433, intron 6 of 6) -9316 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 125.5-13 chr1 172804660 172805146 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 145800 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 161.75-90 chr3 118622108 118622715 + 0.5 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -19357 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 129.25-40 chr12 127952312 127952806 + 0.5 NA intron (NR_126452, intron 2 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 31332 NR_126452 104472718 Hs.628661 NR_126452 LINC00508 - long intergenic non-protein coding RNA 508 ncRNA 116.75-19 chr10 13784515 13784958 + 0.5 NA intron (NM_001318336, intron 4 of 23) AluSx1|SINE|Alu -77169 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 163.75-19 chr10 41883143 41883568 + 0.5 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 484690 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 126.5-227 chr7 68142498 68142998 + 0.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 122495 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 127.25-51 chr13 36198962 36199439 + 0.5 NA intron (NM_001198910, intron 7 of 15) X7A_LINE|LINE|CR1 15356 NM_017826 54937 Hs.124519 NM_017826 ENSG00000120669 SOHLH2 SOSF2|SPATA28|TEB1|bHLHe81 spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 protein-coding 122.25-50 chr13 28642324 28642776 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16580 NM_015932 51371 Hs.268742 NM_015932 ENSG00000132963 POMP C13orf12|HSPC014|PNAS-110|PRAAS2|UMP1 proteasome maturation protein protein-coding 176.75-53 chr19 30292997 30293442 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79165 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 136.5-126 chr2 220284991 220285523 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -378692 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 145-93 chr22 49140346 49140746 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 273776 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 123.25-27 chr10 91249956 91250334 + 0.5 NA intron (NM_001256549, intron 5 of 9) intron (NM_001256549, intron 5 of 9) 29482 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 130-158 chr7 124918991 124919429 + 0.5 NA intron (NM_001042594, intron 2 of 17) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 10615 NM_015450 25913 Hs.31968 NM_015450 ENSG00000128513 POT1 CMM10|GLM9|HPOT1 protection of telomeres 1 protein-coding 166-24 chr11 101105126 101105705 + 0.5 NA intron (NM_000926, intron 2 of 7) L2|LINE|L2 23648 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 133.25-55 chr14 53410603 53411100 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 257497 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 150.5-60 chr15 88291765 88292162 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -35224 NM_002530 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 121-67 chr14 74192977 74193407 + 0.5 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) intron (NM_001024674, intron 5 of 5) -46257 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 122-74 chr17 76077457 76077915 + 0.5 NA TTS (NM_003857) TTS (NM_003857) -1496 NM_180990 353174 Hs.714919 NM_180990 ENSG00000186919 ZACN L2|LGICZ|LGICZ1|ZAC|ZAC1 zinc activated ion channel protein-coding 215.25-7 chr10 70304327 70305026 + 0.5 NA intron (NM_018205, intron 3 of 3) L1MB2|LINE|L1 -20672 NM_022146 64106 Hs.302026 NM_022146 ENSG00000148734 NPFFR1 GPR147|NPFF1|NPFF1R1|OT7T022 neuropeptide FF receptor 1 protein-coding 168.75-6 chr1 69684901 69685472 + 0.5 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) L1MDa|LINE|L1 115845 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 112.5-153 chr21 34298242 34298601 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -65603 NM_172201 9992 Hs.551521 NM_172201 ENSG00000159197 KCNE2 ATFB4|LQT5|LQT6|MIRP1 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 2 protein-coding 246.5-31 chr17 47621021 47621680 + 0.5 NA intron (NM_001330257, intron 23 of 23) MIRb|SINE|MIR -28569 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 176.5-169 chr8 109430888 109431313 + 0.5 NA intron (NM_177531, intron 27 of 77) AluSc|SINE|Alu 68639 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 134.5-196 chr6 126836687 126837127 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -281764 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 129.5-208 chr7 24135538 24135970 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -148436 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 126.75-152 chr3 85422923 85423378 + 0.5 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) LTR1F|LTR|ERV1 37440 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 177.5-143 chr5 66901676 66902211 + 0.5 NA intron (NM_001164664, intron 4 of 28) intron (NM_001164664, intron 4 of 28) -57130 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 128.5-55 chr13 29585558 29586015 + 0.5 NA intron (NM_003045, intron 1 of 12) intron (NM_003045, intron 1 of 12) 9902 NM_003045 6541 Hs.14846 NM_003045 ENSG00000139514 SLC7A1 ATRC1|CAT-1|ERR|HCAT1|REC1L solute carrier family 7 member 1 protein-coding 131-40 chr12 45583163 45583500 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 144590 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 176-37 chr2 218907014 218907556 + 0.5 NA intron (NR_110238, intron 3 of 4) L1ME3A|LINE|L1 23352 NR_110238 101928537 Hs.611129 NR_110238 ENSG00000228135 LINC01494 - long intergenic non-protein coding RNA 1494 ncRNA 151.75-35 chr12 52345735 52346218 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 18646 NM_001300810 3891 Hs.182507 NM_002283 ENSG00000135443 KRT85 ECTD4|HB5|Hb-5|K85|KRTHB5|hHb5 keratin 85 protein-coding 128-73 chr2 65592780 65593093 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -160337 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 121-124 chr3 4185908 4186370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -117165 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 137.5-53 chr12 53847358 53847733 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -90511 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 125.75-29 chr10 110189433 110189781 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -17998 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 114.75-139 chr4 54511900 54512331 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95016 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 120.5-186 chr5 108963037 108963509 + 0.5 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) intron (NR_146155, intron 13 of 19) 38667 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 115.75-177 chr5 145016095 145016444 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 810878 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 135.75-75 chr16 79607539 79608040 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -7052 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 116.25-64 chr14 51205965 51206287 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -34121 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 154.75-125 chr6 48275925 48276351 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -207449 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 198.25-84 chr5 66978388 66979071 + 0.5 NA intron (NM_001290226, intron 1 of 26) intron (NM_001290226, intron 1 of 26) 19656 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 115.5-249 chr9 26905089 26905409 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001031689, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001031689, exon 14 of 14) -12421 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 136.75-207 chr9 107310774 107311309 + 0.5 NA intron (NM_001244724, intron 4 of 9) intron (NM_001244724, intron 4 of 9) 26272 NM_001244713 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 129.5-223 chr8 60107055 60107427 + 0.5 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 174159 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 141.5-152 chr3 165032933 165033246 + 0.5 NA intron (NM_001041, intron 23 of 47) intron (NM_001041, intron 23 of 47) 45407 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 162.25-23 chr11 8043342 8043820 + 0.5 NA intron (NM_003320, intron 2 of 12) L1MB8|LINE|L1 4948 NM_003320 7275 Hs.568986 NM_003320 ENSG00000166402 TUB RDOB|rd5 TUB bipartite transcription factor protein-coding 122.75-94 chr2 80700807 80701189 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 387619 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 124.75-51 chr12 20754645 20755035 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -55865 NM_019844 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 175.5-66 chr16 31840562 31841223 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -32039 NM_174980 317702 Hs.257746 NM_174980 VN1R3 FKSG46|V1RL3|V1RL3p vomeronasal 1 receptor 3 (gene/pseudogene) protein-coding 191-31 chr2 20925354 20925954 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -102524 NM_001282721 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 120.5-223 chr8 53584173 53584448 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60345 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 144.25-69 chr16 7276720 7277080 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -55945 NM_145893 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 113.75-135 chr4 47953267 47953675 + 0.5 NA intron (NM_000087, intron 3 of 10) intron (NM_000087, intron 3 of 10) 28062 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 173-30 chr12 8960853 8961282 + 0.5 NA intron (NR_137427, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 11023 NR_137427 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 218.25-78 chr6 46211335 46211847 + 0.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -40581 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 112.25-208 chr8 40347541 40347886 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4350 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 190-58 chr5 24132556 24132969 + 0.5 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 181414 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 133.5-131 chr2 224035853 224036367 + 0.5 NA intron (NM_006216, intron 1 of 8) intron (NM_006216, intron 1 of 8) 2530 NM_001136530 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 145.25-54 chr17 43849114 43849528 + 0.5 NA intron (NM_001168324, intron 2 of 5) intron (NM_001168324, intron 2 of 5) 2145 NM_001168322 146894 Hs.147313 NM_145273 ENSG00000161649 CD300LG CLM-9|CLM9|NEPMUCIN|TREM-4|TREM4 CD300 molecule like family member g protein-coding 133-149 chr6 51377957 51378370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -243707 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 119.25-17 chr1 195661538 195661819 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 427037 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 142.5-215 chr8 28701878 28702407 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_126027) promoter-TSS (NR_126027) 641 NM_001440 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 113.75-47 chr12 90896120 90896441 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -21743 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 151.25-11 chr1 217283078 217283556 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -145615 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 112.5-208 chr6 49386420 49386792 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 76647 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 136.75-199 chr8 128229166 128229618 + 0.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 79276 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 130-129 chr5 60921539 60921899 + 0.5 NA intron (NM_001007234, intron 3 of 5) intron (NM_001007234, intron 3 of 5) 23351 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 127.75-35 chr10 117315617 117316017 + 0.5 NA intron (NM_173791, intron 3 of 4) hAT-N1_Mam|DNA|hAT-Tip100? 59623 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 123.25-93 chr2 37184955 37185273 + 0.5 NA intron (NM_001367551, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 3556 NM_001367551 391365 Hs.631892 NM_001032377 ENSG00000138068 SULT6B1 ST6B1 sulfotransferase family 6B member 1 protein-coding 181-47 chr19 6908409 6908830 + 0.5 NA intron (NM_001974, intron 9 of 20) intron (NM_001974, intron 9 of 20) 21040 NM_001256252 2015 Hs.2375 NM_001974 ENSG00000174837 ADGRE1 EMR1|TM7LN3 adhesion G protein-coupled receptor E1 protein-coding 120.25-142 chr4 30697289 30697675 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -22887 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 209.75-50 chr2 65752743 65753231 + 0.5 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -320388 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 171.25-110 chr4 96900351 96900835 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -466333 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-215 chr8 84743750 84744140 + 0.5 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 38018 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 116.25-111 chr2 109716405 109716730 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -76191 NM_001123363 729540 Hs.535589 NM_001037866 ENSG00000183054 RGPD6 RGP6|RGPD7|RanBP2L1|RanBP2L2 RANBP2 like and GRIP domain containing 6 protein-coding 130.5-143 chr2 173063250 173063552 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12445 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 116.25-127 chr21 40516114 40516540 + 0.5 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) intron (NR_073202, intron 3 of 32) 114440 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 134.75 chr1 9674712 9675227 + 0.5 NA intron (NR_126367, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 12605 NR_126368 101929074 Hs.661762 NR_126366 ENSG00000231789 PIK3CD-AS2 - PIK3CD antisense RNA 2 ncRNA 114.5-225 chr6 34481863 34482195 + 0.5 NA intron (NM_020804, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 15953 NM_020804 29993 Hs.520087 NM_020804 ENSG00000124507 PACSIN1 SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 protein-coding 134.75-41 chr11 50537534 50538010 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 128625 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 189.75-20 chr11 109530030 109530544 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 108097 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 121-185 chr8 73199323 73199700 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59991 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 125.75-86 chr2 46002242 46002557 + 0.5 NA intron (NM_005400, intron 7 of 14) intron (NM_005400, intron 7 of 14) -295008 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 139.75-172 chr8 5639542 5639999 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -644856 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 128.5-21 chr10 13005457 13005834 + 0.5 NA intron (NM_001282658, intron 5 of 6) ERVL-E-int|LTR|ERVL -3932 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 143.75-25 chr10 105016325 105016697 + 0.5 NA intron (NM_014978, intron 4 of 26) intron (NM_014978, intron 4 of 26) -350295 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 121.25-85 chr18 6946399 6946765 + 0.5 NA intron (NM_005559, intron 61 of 62) AluSq2|SINE|Alu -8095 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 154.25-177 chr9 8519522 8520112 + 0.5 NA intron (NM_130392, intron 9 of 30) intron (NM_130392, intron 9 of 30) 214129 NM_130391 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 136.75-38 chr11 10626137 10626559 + 0.5 NA exon (NM_001206881, exon 7 of 19) exon (NM_001206881, exon 7 of 19) 25953 NM_001098579 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 129.25-162 chr5 178103999 178104297 + 0.5 NA Intergenic LTR2|LTR|ERV1 -9384 NM_015111 23138 Hs.101761 NM_015111 ENSG00000145911 N4BP3 LZTS4 NEDD4 binding protein 3 protein-coding 119.25-99 chr2 153658028 153658447 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -179475 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 143.75-132 chr4 47727855 47728393 + 0.5 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 75455 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 171-117 chr6 25490772 25491361 + 0.5 NA intron (NM_001173977, intron 13 of 36) intron (NM_001173977, intron 13 of 36) -161149 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 142-77 chr19 34768868 34769350 + 0.5 NA intron (NM_001007248, intron 2 of 3) intron (NM_001007248, intron 2 of 3) 4106 NM_001007248 148103 Hs.590961 NM_001007247 ENSG00000153896 ZNF599 - zinc finger protein 599 protein-coding 125-166 chr9 32505723 32506070 + 0.5 NA intron (NM_014314, intron 1 of 17) intron (NM_014314, intron 1 of 17) 20300 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 121.5-131 chr2 57162319 57162687 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -745148 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 121-37 chr11 38607864 38608200 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 38324 NR_120555 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 127-116 chr3 71025656 71025936 + 0.5 NA intron (NR_146142, intron 11 of 19) intron (NR_146142, intron 11 of 19) 39128 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 137.75-173 chr5 158505958 158506449 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -96430 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 122.5-193 chr6 1370733 1371168 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18626 NM_001452 2295 Hs.484423 NM_001452 ENSG00000137273 FOXF2 FKHL6|FREAC-2|FREAC2 forkhead box F2 protein-coding 175.75-131 chrX 128054127 128054637 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -1979 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 122.25-73 chr17 59371169 59371596 + 0.5 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) intron (NM_001005404, intron 2 of 4) 5299 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 120-173 chr7 51463407 51463808 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70351 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 178.5-22 chr11 28550881 28551574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -73679 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 156.25-64 chr2 34012723 34013095 + 0.5 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -54317 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 118-12 chr10 19812416 19812845 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3802 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 118.5-215 chr8 79900534 79901004 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29032 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 144.5-226 chr8 122528566 122528984 + 0.5 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 39869 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 120-190 chr8 110190421 110190754 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -214816 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 183.25-63 chr2 228911878 228912369 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -300728 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 135-107 chr3 64318238 64318753 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50322 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 114.25-153 chr5 105353515 105353845 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 254206 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 114-152 chr7 34082525 34082904 + 0.5 NA intron (NM_133468, intron 13 of 15) intron (NM_133468, intron 13 of 15) 177175 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 173-17 chr10 74023210 74023636 + 0.5 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 25307 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 148-133 chr8 126686635 126687037 + 0.5 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -128358 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 151.25-201 chr9 86486891 86487347 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -132709 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 116.75-151 chr4 87559085 87559427 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29753 NM_004684 8404 Hs.62886 NM_004684 ENSG00000152583 SPARCL1 MAST 9|MAST9|PIG33|SC1 SPARC like 1 protein-coding 144.5-139 chr3 195464774 195465177 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21955 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 235.5-20 chr10 117520365 117521035 + 0.5 NA intron (NR_002791, intron 2 of 3) intron (NR_002791, intron 2 of 3) -21745 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 135-38 chr13 101262758 101263208 + 0.5 NA intron (NM_001350750, intron 9 of 42) intron (NM_001350750, intron 9 of 42) 153525 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 143.5-8 chr1 108606942 108607308 + 0.5 NA intron (NM_001010883, intron 3 of 10) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 47025 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 207-70 chr6 54778587 54779185 + 0.5 NA Intergenic LTR45|LTR|ERV1 -67885 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 126.25-110 chr3 10773001 10773439 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9011 NR_027102 285370 Hs.157613 NR_027102 ENSG00000226567 LINC00606 - long intergenic non-protein coding RNA 606 ncRNA 123-73 chr16 59791620 59791989 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -36613 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 151.25-155 chr5 109735941 109736258 + 0.5 NA intron (NM_002372, intron 4 of 21) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 46733 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 127.5-118 chr2 88140531 88140859 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -12633 NM_001443 2168 Hs.380135 NM_001443 ENSG00000163586 FABP1 FABPL|L-FABP fatty acid binding protein 1 protein-coding 133.75-150 chr4 46647195 46647488 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -257213 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 135-5 chr1 98563977 98564254 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -97606 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 135-101 chr3 2632565 2632932 + 0.5 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MIR|SINE|MIR -259467 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 182.75-26 chr10 41914429 41914836 + 0.5 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 453413 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 140.25-103 chr2 215905303 215905633 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61932 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 121.5-23 chr1 238063212 238063602 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -172485 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 143.75-110 chr3 5658218 5658715 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -408211 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 155.25-190 chr9 118134191 118134785 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 430085 NM_138554 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 148.5-165 chr4 44682892 44683260 + 0.5 NA intron (NM_001345867, intron 5 of 16) intron (NM_001345867, intron 5 of 16) 4656 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 166.25-34 chr11 98265608 98266145 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -755073 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 239.75-76 chr8 129312294 129312939 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -71376 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 123-134 chr3 122034214 122034602 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -12161 NM_001199799 286676 Hs.98484 NM_175924 ENSG00000145103 ILDR1 DFNB42|ILDR1alpha|ILDR1alpha'|ILDR1beta immunoglobulin like domain containing receptor 1 protein-coding 132-5 chr1 112663076 112663537 + 0.5 NA intron (NM_006135, intron 7 of 9) intron (NM_006135, intron 7 of 9) -11006 NM_020963 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 120-109 chr22 33595142 33595507 + 0.5 NA intron (NM_133642, intron 5 of 14) L3|LINE|CR1 109596 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 157.75-94 chr2 188956289 188956740 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17859 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 120.5-193 chr6 6485384 6485844 + 0.5 NA intron (NR_026970, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 -103106 NM_004271 9450 Hs.653138 NM_004271 ENSG00000112799 LY86 MD-1|MD1|MMD-1|dJ80N2.1 lymphocyte antigen 86 protein-coding 143-105 chr4 55163553 55164087 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38225 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 148.25-31 chr12 62272292 62272689 + 0.5 NA intron (NR_147080, intron 1 of 19) intron (NR_147080, intron 1 of 19) 12086 NM_001252078 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 121.75-90 chr2 170340164 170340457 + 0.5 NA TTS (NR_110576) TTS (NR_110576) 10633 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 123-57 chr15 39430737 39431136 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -150143 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 131-11 chr1 186264420 186264830 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -31648 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 141.25-104 chr22 50320398 50320894 + 0.5 NA intron (NM_001001794, intron 1 of 19) intron (NM_001001794, intron 1 of 19) 6366 NM_001001794 414918 Hs.530380 NM_001001794 ENSG00000205593 DENND6B AFI1B|FAM116B DENN domain containing 6B protein-coding 143-86 chr21 28694102 28694454 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 154960 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 128-75 chr2 82293033 82293382 + 0.5 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -563596 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 122.75-184 chr7 50809808 50810186 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16544 NM_001371008 116.25-247 chr9 99423547 99423800 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48416 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 161-108 chr6 74610556 74611126 + 0.5 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 517941 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 220-77 chr9 70461111 70461925 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -46861 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 155.5-138 chr3 191464962 191465424 + 0.5 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) L1PA3|LINE|L1 4030 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 115.5-126 chr2 85494432 85494801 + 0.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 44270 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 160.25-93 chr3 72068245 72068686 + 0.5 NA intron (NR_104116, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR 31990 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 125.25-64 chr14 55349512 55349867 + 0.5 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 62169 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 123.25-15 chr1 208261534 208261921 + 0.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -17343 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 143.5-126 chr2 210600404 210600786 + 0.5 NA exon (NM_001122633, exon 16 of 39) exon (NM_001122633, exon 16 of 39) 7240 NR_163592 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 154.75-50 chr16 19927406 19927916 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42027 NM_001304771 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 143.75-98 chr2 162775869 162776266 + 0.5 NA intron (NR_110258, intron 2 of 4) intron (NR_110258, intron 2 of 4) 7131 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 125.25-66 chr15 27237662 27238020 + 0.5 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -76522 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 126.25-200 chr8 64659179 64659596 + 0.5 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) L1ME3G|LINE|L1 -77495 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 118.75-23 chr10 64202088 64202383 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -623293 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 123-45 chr13 96125294 96125542 + 0.5 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 34579 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 242-19 chr13 92844270 92845212 + 0.5 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -123127 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 137.5-60 chr13 108380922 108381467 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 111565 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 137.5-86 chr16 68266707 68267099 + 0.5 NA intron (NM_003983, intron 2 of 10) intron (NM_003983, intron 2 of 10) 2377 NM_003983 9057 Hs.679580 NM_003983 ENSG00000103064 SLC7A6 LAT-2|LAT3|y+LAT-2 solute carrier family 7 member 6 protein-coding 164-13 chr10 22105956 22106432 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -102464 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 144.5-215 chr8 77071391 77071892 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -70597 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 129.75-118 chr3 2834373 2834765 + 0.5 NA intron (NM_175607, intron 7 of 24) AluSz|SINE|Alu -57646 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 140.5-79 chr16 54691521 54691888 + 0.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 156529 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 135.25-168 chr5 144771463 144771798 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 566239 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 137.75-130 chr3 23818663 23818997 + 0.5 NA intron (NM_003341, intron 3 of 5) intron (NM_003341, intron 3 of 5) 8376 NM_001202476 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 113.5-223 chr7 122099915 122100363 + 0.5 NA intron (NM_005763, intron 13 of 23) intron (NM_005763, intron 13 of 23) 44110 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 120.5-156 chr4 28090040 28090369 + 0.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -729378 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 165-106 chr4 64936849 64937214 + 0.5 NA intron (NR_033976, intron 5 of 6) L1MB1|LINE|L1 67469 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 188-31 chr18 1868658 1869404 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -509402 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 143.25-175 chr8 47915757 47916280 + 0.5 NA intron (NM_001081640, intron 22 of 84) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 44118 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 115.75-116 chr2 215070180 215070542 + 0.5 NA intron (NR_103740, intron 2 of 54) intron (NR_103740, intron 2 of 54) -38275 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 167.75-108 chr5 3242072 3242515 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 64458 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 129.25-56 chr15 59262773 59263129 + 0.5 NA intron (NM_004998, intron 2 of 27) L2a|LINE|L2 56108 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 141.5-6 chr1 76973387 76973921 + 0.5 NA intron (NM_001320274, intron 2 of 2) intron (NM_001320274, intron 2 of 2) -86489 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 148.5-141 chr3 7358507 7358952 + 0.5 NA intron (NM_000844, intron 4 of 9) intron (NM_000844, intron 4 of 9) 176555 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 195.5-165 chr9 68563273 68563908 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -16988 NR_109769 101927015 Hs.406454 NR_109769 ENSG00000234506 LINC01506 - long intergenic non-protein coding RNA 1506 ncRNA 117.25-124 chr2 176113971 176114329 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2614 NM_002148 3236 Hs.123070 NM_002148 ENSG00000128710 HOXD10 HOX4|HOX4D|HOX4E|Hox-4.4 homeobox D10 protein-coding 178.25-88 chr4 24271896 24272569 + 0.5 NA intron (NM_001330752, intron 1 of 13) LTR10D|LTR|ERV1 200673 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 211-69 chr9 26801301 26801904 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 91200 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 128.75-99 chr2 88599360 88599825 + 0.5 NA intron (NM_004836, intron 2 of 16) intron (NM_004836, intron 2 of 16) 25337 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 149.25-96 chr2 235002244 235002821 + 0.5 NA intron (NM_001371304, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu 21158 NM_001371305 151.25-93 chr2 135950754 135951288 + 0.5 NA intron (NM_001293312, intron 3 of 14) intron (NM_001293312, intron 3 of 14) -34155 NR_110200 101928243 Hs.602178 NR_110199 ENSG00000231890 DARS-AS1 - DARS antisense RNA 1 ncRNA 123.25-213 chr9 37589399 37589714 + 0.5 NA intron (NM_001001790, intron 1 of 1) intron (NM_001001790, intron 1 of 1) 3041 NM_001001790 401505 Hs.130774 NM_001001790 ENSG00000175768 TOMM5 C9orf105|Tom5|bA613M10.3 translocase of outer mitochondrial membrane 5 protein-coding 185.5-76 chr2 55994906 55995491 + 0.5 NA intron (NR_126406, intron 2 of 2) intron (NR_126406, intron 2 of 2) 5597 NR_030623 100126319 NR_030623 ENSG00000211520 MIR216B MIRN216B|mir-216b microRNA 216b ncRNA 116.25-115 chr2 154761147 154761510 + 0.5 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 62633 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 178.5-173 chr7 108115600 108116230 + 0.5 NA intron (NM_001318048, intron 3 of 17) intron (NM_001318048, intron 3 of 17) 14446 NM_001318046 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 122-51 chr12 105910106 105910524 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 203541 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 135.75-172 chr5 76141188 76141526 + 0.5 NA intron (NM_014979, intron 2 of 12) intron (NM_014979, intron 2 of 12) 57974 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 134-121 chr3 115473131 115473556 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -150167 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 156.75-88 chr2 126375575 126375996 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -257800 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 161.25-178 chr8 130672980 130673407 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -229519 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 145-90 chr20 42164986 42165331 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 17 of 31) intron (NM_133170, intron 17 of 31) -520325 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 126.5-72 chr14 73466462 73466784 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2981 NR_135251 101928143 Hs.654609 NR_135251 ENSG00000284930 LOC101928143 - uncharacterized LOC101928143 ncRNA 201.5-20 chr10 33261009 33261510 + 0.5 NA intron (NM_001244973, intron 4 of 16) intron (NM_001244973, intron 4 of 16) 73408 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 118.75-18 chr10 26444459 26444865 + 0.5 NA intron (NM_019043, intron 2 of 14) intron (NM_019043, intron 2 of 14) 6321 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 157.75-41 chr14 26474936 26475407 + 0.5 NA intron (NM_001366391, intron 4 of 5) (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 78259 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 124-73 chr18 36408201 36408584 + 0.5 NA intron (NM_001281740, intron 3 of 28) intron (NM_001281740, intron 3 of 28) 110679 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 132.25-166 chr6 48857096 48857389 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 606011 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 120.75-78 chr2 96323392 96323765 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1746 NM_001008949 150771 Hs.65009 NM_178495 ENSG00000198885 ITPRIPL1 KIAA1754L ITPRIP like 1 protein-coding 122.5-204 chr6 167038766 167039082 + 0.5 NA intron (NM_001278690, intron 10 of 10) L1PB1|LINE|L1 39527 NM_194429 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 161.25-145 chr5 158328851 158329297 + 0.5 NA intron (NR_109888, intron 5 of 6) L1MC2|LINE|L1 80699 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 117.25-103 chr19 33429136 33429591 + 0.5 NA intron (NM_001166056, intron 7 of 12) intron (NM_001166056, intron 7 of 12) 54839 NM_001252296 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 117-121 chr3 74663707 74664172 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -142799 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 115.5-2 chr1 31095952 31096324 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -30421 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 138-164 chr8 118386295 118386699 + 0.5 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -234504 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 112.5-230 chr8 49712670 49713055 + 0.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -196934 NM_001287813 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 119.25-216 chr9 13730578 13730990 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -197187 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 150.5-223 chr8 111324442 111324909 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -51964 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 144-72 chr20 22415062 22415566 + 0.5 NA intron (NR_027089, intron 1 of 3) MER110|LTR|ERV1 5329 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 134-151 chr6 112521385 112521878 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 174301 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 168-7 chr1 105626527 105627001 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7829 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 140.5-194 chr6 44728565 44728916 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -176859 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 157-91 chr4 159382323 159382679 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 114692 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 130.5-71 chr12 15647147 15647631 + 0.5 NA intron (NM_004447, intron 14 of 20) intron (NM_004447, intron 14 of 20) 100778 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 123-187 chr8 88761605 88762080 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -434359 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 125.75-117 chr21 27350909 27351403 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -371223 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 349-2 chr1 235956579 235957556 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -73354 NR_102436 1130 Hs.532411 NM_000081 ENSG00000143669 LYST CHS|CHS1 lysosomal trafficking regulator protein-coding 117.25-38 chr11 65719788 65720159 + 0.5 NA TTS (NM_182709) TTS (NM_182709) 965 NM_032193 84153 Hs.718438 NM_032193 ENSG00000172922 RNASEH2C AGS3|AYP1 ribonuclease H2 subunit C protein-coding 135-21 chr11 20237086 20237536 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -76836 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 127-50 chr12 132040194 132040640 + 0.5 NA intron (NM_015409, intron 32 of 52) L1M2|LINE|L1 9193 NR_002979 677829 Hs.742405 NR_002979 ENSG00000208892 SNORA49 ACA49 small nucleolar RNA, H/ACA box 49 snoRNA 130-183 chrX 83661216 83661547 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 153091 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 112.5-142 chr2 232976914 232977316 + 0.5 NA intron (NM_019850, intron 1 of 14) L3b|LINE|CR1 -35499 NR_136325 101928881 Hs.570311 NR_136325 ENSG00000222001 LOC101928881 - uncharacterized LOC101928881 ncRNA 139.25-78 chr2 18107708 18108156 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 229265 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 112.25-176 chr5 178345653 178345977 + 0.5 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) AluY|SINE|Alu -112993 NM_001278346 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 155.5-204 chr8 88179346 88179753 + 0.5 NA intron (NM_005941, intron 3 of 9) L1MC2|LINE|L1 147934 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 196-48 chr2 50897628 50898120 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) L1ME1|LINE|L1 134258 NM_001330078 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 134.5-71 chr15 37877549 37877831 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56917 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 123.5-48 chr12 20582869 20583203 + 0.5 NA intron (NM_001244683, intron 1 of 14) intron (NM_001244683, intron 1 of 14) 11172 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 159-115 chr8 111567657 111568085 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 191232 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 124.5-126 chr20 33467078 33467573 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22771 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 146.5-113 chr2 161304472 161304956 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3711 NM_005805 10213 Hs.740477 NM_005805 ENSG00000115233 PSMD14 PAD1|POH1|RPN11 proteasome 26S subunit, non-ATPase 14 protein-coding 124.75-111 chr2 17217722 17218203 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 300478 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 115.5-67 chr14 71817707 71818106 + 0.5 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -114265 NM_001370289 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 124.75-134 chr21 28599540 28600006 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 60455 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 134-55 chr14 65467352 65467703 + 0.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu -3575 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 167.75-146 chr8 132322224 132322652 + 0.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 124824 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 137.25-76 chr2 109182046 109182511 + 0.5 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -40690 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 131-139 chr6 27823484 27823855 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_021968) promoter-TSS (NM_021968) -456 NM_021968 8363 Hs.278483 NM_021968 ENSG00000197238 HIST1H4J H4/e|H4F2iv|H4FE|dJ160A22.2 histone cluster 1 H4 family member j protein-coding 144-120 chr7 32134475 32134788 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) L1PA8|LINE|L1 -63195 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 166.25-72 chr19 30871023 30871359 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -296319 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 153-166 chrX 45305544 45305965 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -104878 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 128.75-152 chr5 64604399 64604733 + 0.5 NA intron (NR_073511, intron 4 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 28916 NM_001271891 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 142.5-110 chr2 115845228 115845640 + 0.5 NA TTS (NM_001178034) TTS (NM_001178034) 501619 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 149.5-191 chr7 95696730 95697169 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75557 NM_004411 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 132.25-179 chr8 89929473 89929794 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 27063 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 134-155 chr6 152409369 152409799 + 0.5 NA exon (NM_033071, exon 43 of 146) exon (NM_033071, exon 43 of 146) 29054 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 114-146 chr6 114022472 114022851 + 0.5 NA intron (NR_125845, intron 4 of 9) intron (NR_125845, intron 4 of 9) 40216 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 149.25-134 chr4 97930574 97931103 + 0.5 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) L1PA14|LINE|L1 212638 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 118-202 chr9 133103977 133104393 + 0.5 NA intron (NM_001271775, intron 10 of 17) intron (NM_001271775, intron 10 of 17) 17055 NM_006266 5900 Hs.106185 NM_006266 ENSG00000160271 RALGDS RGDS|RGF|RalGEF ral guanine nucleotide dissociation stimulator protein-coding 130.5-159 chr22 34770456 34770778 + 0.5 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 227299 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 175.5-82 chr2 6236122 6236619 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 139052 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 129.5-190 chr5 119883354 119883641 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 253938 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 120.75-130 chr4 178495768 178496093 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -587994 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 114.75-128 chr3 127113757 127114078 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -79214 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 189.75-123 chr8 99353181 99353772 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 183254 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 119.75-34 chr11 96348531 96348921 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -5531 NM_032427 84441 Hs.428214 NM_032427 ENSG00000184384 MAML2 MAM-3|MAM2|MAM3|MLL-MAML2 mastermind like transcriptional coactivator 2 protein-coding 139-141 chr7 62958101 62958623 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 345694 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 120.75-70 chr18 59759496 59759795 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -62222 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 135-96 chr20 57598027 57598403 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 22211 NM_001160418 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 134.75-226 chr8 132528979 132529418 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 32281 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 122-171 chr7 93146972 93147324 + 0.5 NA intron (NM_001303496, intron 1 of 4) intron (NM_001303496, intron 1 of 4) 1237 NM_001303497 219285 Hs.489118 NM_152703 ENSG00000177409 SAMD9L ATXPC|C7orf6|DRIF2|UEF1 sterile alpha motif domain containing 9 like protein-coding 234.25-22 chr14 62688332 62689064 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 356760 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 160-42 chr16 72589323 72589728 + 0.5 NA intron (NR_159372, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu 75445 NR_126330 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 123.5-144 chr3 164216121 164216528 + 0.5 NA Intergenic HERVK22-int|LTR|ERVK -44768 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 146.5-114 chr2 174451001 174451385 + 0.5 NA intron (NM_001267051, intron 10 of 14) AluSx1|SINE|Alu 35836 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 167.75-87 chr20 54310696 54311307 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 102914 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 152.75-157 chr8 142327733 142328200 + 0.5 NA intron (NM_001366903, intron 6 of 9) intron (NM_001366903, intron 6 of 9) 75216 NM_001366901 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 119.75-33 chr11 78142267 78142727 + 0.5 NA intron (NR_102280, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 2704 NR_102280 100289388 Hs.628183 NM_203432 ENSG00000246174 KCTD21-AS1 - KCTD21 antisense RNA 1 ncRNA 119.25-183 chr7 3026005 3026363 + 0.5 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) AluJo|SINE|Alu 17683 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 141.75-102 chr2 173380076 173380465 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 25398 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 156-64 chr18 1735953 1736447 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -376571 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 131.5-36 chr12 2311182 2311577 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 41603 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 119.5-168 chr4 92701810 92702264 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 397638 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 125-87 chr21 26341602 26342031 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51819 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 127-129 chr4 133891449 133891830 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 310150 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 126.5-71 chr14 72386221 72386706 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) AluSx3|SINE|Alu -130357 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 228.5-49 chr2 7470037 7470578 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 49046 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 125.25-27 chr10 65233347 65233655 + 0.5 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -308983 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 119.25-109 chr20 35417795 35418264 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5887 NM_001184977 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 153.25-97 chr4 13528960 13529405 + 0.5 NA intron (NR_034054, intron 1 of 3) intron (NR_034054, intron 1 of 3) 2235 NR_034054 285547 Hs.381892 NR_034054 ENSG00000281202 LINC01097 - long intergenic non-protein coding RNA 1097 ncRNA 114.75-61 chr15 66541589 66541941 + 0.5 NA intron (NM_001287823, intron 16 of 17) intron (NM_001287823, intron 16 of 17) 23732 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 157.5-233 chrX 56554949 56555381 + 0.5 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -8428 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 114-7 chr1 60627688 60627980 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -5149 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 116.75-181 chr7 30867378 30867679 + 0.5 NA intron (NR_037598, intron 15 of 19) MIRb|SINE|MIR -44166 NM_198098 358 Hs.76152 NM_000385 ENSG00000240583 AQP1 AQP-CHIP|CHIP28|CO aquaporin 1 (Colton blood group) protein-coding 115.75-10 chr1 227122725 227123087 + 0.5 NA intron (NM_001366019, intron 11 of 36) intron (NM_001366019, intron 11 of 36) 182612 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 133.5-97 chr16 82572881 82573261 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -53898 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 134.5-2 chr1 36831470 36831782 + 0.5 NA intron (NM_000831, intron 10 of 15) MER3|DNA|hAT-Charlie 202889 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 116.25-206 chr7 11522933 11523376 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) intron (NM_015204, intron 6 of 26) 309044 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 193.25 chr1 9628234 9628620 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23304 NM_005026 5293 Hs.518451 NM_005026 ENSG00000171608 PIK3CD APDS|IMD14|P110DELTA|PI3K|p110D phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta protein-coding 117.75-69 chr15 93233258 93233575 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27350 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 167.25-144 chr7 90241496 90242011 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3421 NM_001160138 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 237.25-68 chr7 55428900 55429598 + 0.5 NA intron (NM_018697, intron 8 of 8) L1MD|LINE|L1 63801 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 124.75-88 chr15 81541924 81542291 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -167894 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 146.25-65 chr2 20141333 20141792 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 83568 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 149.5-221 chr9 90172973 90173398 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -131686 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 133.25-65 chr16 4046689 4047004 + 0.5 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu 69596 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 116.25-165 chr4 75826707 75827116 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75541 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 150.25-155 chr8 132876630 132877032 + 0.5 NA intron (NM_003235, intron 5 of 47) intron (NM_003235, intron 5 of 47) 9873 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 159.25-74 chr2 215809710 215810337 + 0.5 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) L1MC5a|LINE|L1 33513 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 116.5-143 chr20 56849594 56849969 + 0.5 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 220475 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 148.75-54 chr14 57799358 57799838 + 0.5 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1PA11|LINE|L1 65401 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 149.25-93 chr2 190799838 190800348 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80728 NM_001256310 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 174.75-118 chr7 89042379 89042932 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -246918 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 168.25-125 chr6 135701394 135701930 + 0.5 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 -150039 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 117.5-30 chr10 48461244 48461604 + 0.5 NA intron (NR_144644, intron 3 of 8) L1ME3A|LINE|L1 32226 NM_001256026 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 144.5-141 chr4 31651687 31652121 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 145360 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 132.5-222 chr7 19019426 19019798 + 0.5 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 98024 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 141.5-115 chr2 186715072 186715522 + 0.5 NA intron (NM_177454, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 21237 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 193.25-36 chr15 63205653 63206170 + 0.5 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) intron (NM_016530, intron 1 of 7) 16305 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 184.25-58 chr2 71974509 71975020 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 173098 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 129-73 chr15 88148346 88148857 + 0.5 NA intron (NM_001007156, intron 5 of 15) L2b|LINE|L2 57373 NM_001320135 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 115.5-127 chr2 86784991 86785412 + 0.5 NA non-coding (NR_027353, exon 7 of 7) non-coding (NR_027353, exon 7 of 7) 6513 NM_001768 925 Hs.85258 NM_001768 ENSG00000153563 CD8A CD8|Leu2|p32 CD8a molecule protein-coding 124.5-15 chr1 178329691 178330160 + 0.5 NA intron (NM_170692, intron 3 of 17) HAL1|LINE|L1 -11526 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 127.75-12 chr1 70670433 70670829 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35822 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 149.5-150 chr5 25107565 25107940 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 82904 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 166.25-70 chr19 16975951 16976572 + 0.5 NA intron (NM_015692, intron 15 of 41) AluSq2|SINE|Alu 50549 NM_015692 27151 Hs.631644 NM_015692 ENSG00000160111 CPAMD8 ASGD8|K-CAP|VIP C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8 protein-coding 188.5-54 chr17 39026570 39027097 + 0.5 NA non-coding (NR_135645, exon 2 of 2) non-coding (NR_135645, exon 2 of 2) 277 NR_135645 105371766 Hs.311469 NR_135645 ENSG00000266013 LINC02079 - long intergenic non-protein coding RNA 2079 ncRNA 137.5-88 chr17 10806518 10806951 + 0.5 NA intron (NR_073458, intron 3 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2635 NR_036581 100289255 Hs.306721 NR_036581 ENSG00000263429 TMEM238L LINC00675 transmembrane protein 238 like ncRNA 117-9 chr1 212799812 212800133 + 0.5 NA intron (NM_001146170, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 8078 NM_001146169 128387 Hs.530538 NM_001042552 ENSG00000203705 TATDN3 - TatD DNase domain containing 3 protein-coding 128.5-64 chr14 76424086 76424406 + 0.5 NA intron (NM_004452, intron 3 of 10) intron (NM_004452, intron 3 of 10) 52899 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 136.75-183 chr7 33769121 33769612 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -135549 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 124.75-169 chr5 18107196 18107483 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 300065 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 165-107 chr4 88320143 88320513 + 0.5 NA intron (NR_134237, intron 3 of 3) intron (NR_134237, intron 3 of 3) 35398 NR_134238 105369192 Hs.733660 NR_134236 ENSG00000246375 PPM1K-DT - PPM1K divergent transcript ncRNA 118.5-140 chr3 192895668 192895934 + 0.5 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) AluSc8|SINE|Alu 22055 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 128.75-16 chr10 13521246 13521657 + 0.5 NA intron (NM_001370075, intron 1 of 8) intron (NM_001370075, intron 1 of 8) 4770 NM_001370075 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 142-128 chr5 72489476 72489975 + 0.5 NA intron (NM_152625, intron 1 of 4) intron (NM_152625, intron 1 of 4) 17685 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 114.25-192 chr8 103503082 103503435 + 0.5 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -1348 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 138.75-74 chr17 74674824 74675269 + 0.5 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 3915 NM_175738 326624 Hs.351413 NM_175738 ENSG00000172794 RAB37 - RAB37, member RAS oncogene family protein-coding 143.5-61 chr14 45172997 45173429 + 0.5 NA intron (NM_001308133, intron 12 of 21) intron (NM_001308133, intron 12 of 21) 37274 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 247.75-68 chr8 73293678 73294257 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_000971) promoter-TSS (NM_000971) -334 NM_000971 6129 Hs.421257 NM_000971 ENSG00000147604 RPL7 L7|humL7-1 ribosomal protein L7 protein-coding 155.75-2 chr1 25858911 25859517 + 0.5 NA intron (NM_024037, intron 1 of 2) CpG 243 NM_024037 79000 Hs.149305 NM_024037 ENSG00000127423 AUNIP AIBP|C1orf135 aurora kinase A and ninein interacting protein protein-coding 183.25 chr1 26744449 26744938 + 0.5 NA intron (NM_139135, intron 4 of 19) intron (NM_139135, intron 4 of 19) -43270 NM_017837 55650 Hs.259605 NM_017837 ENSG00000060642 PIGV GPI-MT-II|HPMRS1|PIG-V phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V protein-coding 139.25-123 chr3 104200509 104200932 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -676604 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 131-166 chr8 46026928 46027327 + 0.5 NA Intergenic GSATX|Satellite|centr 590516 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 125.5-130 chr2 106988050 106988374 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -101103 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 113.25-32 chr12 12104878 12105280 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6873 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 122-35 chr10 107614254 107614624 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -449733 NM_001013031 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 116.5-54 chr13 33821361 33821821 + 0.5 NA intron (NM_002915, intron 2 of 8) intron (NM_002915, intron 2 of 8) 3442 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 113.5-137 chr20 31312038 31312404 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3636 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 122.5-190 chr5 174852018 174852344 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 100447 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 161.25-34 chr12 21907950 21908413 + 0.5 NA exon (NM_020297, exon 9 of 38) exon (NM_020297, exon 9 of 38) 28513 NM_020297 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 117.5-132 chr20 50673957 50674283 + 0.5 NA intron (NM_001290268, intron 1 of 21) intron (NM_001290268, intron 1 of 21) 17422 NM_001290268 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 118.75-130 chr3 142952208 142952544 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11298 NM_198504 344838 Hs.408385 NM_198504 ENSG00000188582 PAQR9 - progestin and adipoQ receptor family member 9 protein-coding 124.5-58 chr14 29783564 29783868 + 0.5 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) L1MA4|LINE|L1 143380 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 155.5-86 chr2 16336438 16336964 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 286274 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 128.25-80 chr18 38589516 38589946 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 932596 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 124-126 chr4 87975518 87975905 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001251829) promoter-TSS (NM_001251829) -3 NM_001040058 6696 Hs.313 NM_000582 ENSG00000118785 SPP1 BNSP|BSPI|ETA-1|OPN secreted phosphoprotein 1 protein-coding 140.5-223 chr8 4981160 4981644 + 0.5 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 13512 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 136-24 chr11 33558315 33558656 + 0.5 NA intron (NM_012194, intron 6 of 20) LTR33|LTR|ERVL 142255 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 120.25-13 chr1 107971373 107971739 + 0.5 NA intron (NR_046653, intron 1 of 2) intron (NR_046653, intron 1 of 2) -6376 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 181-26 chr14 41643896 41644454 + 0.5 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) intron (NM_001346173, intron 1 of 4) 37319 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 228.75-23 chr16 17278870 17279545 + 0.5 NA intron (NM_022166, intron 2 of 11) MIR|SINE|MIR 144703 NR_135179 102723692 Hs.737758 NR_135179 ENSG00000261448 LOC102723692 - uncharacterized LOC102723692 ncRNA 187.75-61 chr20 47612703 47613303 + 0.5 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) intron (NM_181659, intron 2 of 22) 111116 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 116.5-266 chr9 108998821 108999133 + 0.5 NA intron (NM_003798, intron 2 of 18) intron (NM_003798, intron 2 of 18) 14522 NM_001286974 8727 Hs.58488 NM_003798 ENSG00000119326 CTNNAL1 ACRP|CLLP|alpha-CATU catenin alpha like 1 protein-coding 157.25-91 chr22 34851203 34851580 + 0.5 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) AluSc|SINE|Alu 146525 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 156.75-169 chr9 68427405 68427887 + 0.5 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) intron (NM_021965, intron 6 of 10) -69780 NR_015423 572558 Hs.552819 NR_015423 ENSG00000224958 PGM5-AS1 FAM233A PGM5 antisense RNA 1 ncRNA 137.25-53 chr16 58316716 58317141 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21881 NM_001080492 221191 Hs.411239 NM_001080492 ENSG00000103023 PRSS54 CT67|KLKBL4 serine protease 54 protein-coding 135.75-107 chr2 134166924 134167421 + 0.5 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) 40047 NR_037450 100500878 NR_037450 ENSG00000263813 MIR3679 mir-3679 microRNA 3679 ncRNA 131-176 chr8 115412152 115412451 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001282903, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001282903, exon 7 of 7) 255712 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 133.5-226 chr6 37715997 37716490 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -18360 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 119.5 chr1 37238969 37239293 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 77568 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 138-67 chr18 9234173 9234648 + 0.5 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) L1MA4A|LINE|L1 96847 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 116.75-154 chr4 139478255 139478659 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 24336 NM_031296 83452 Hs.591679 NM_031296 ENSG00000172007 RAB33B SMC2 RAB33B, member RAS oncogene family protein-coding 146-9 chr1 217913368 217913883 + 0.5 NA intron (NR_048550, intron 2 of 3) intron (NR_048550, intron 2 of 3) 20725 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 154.5-190 chr8 120432308 120432761 + 0.5 NA intron (NM_014078, intron 2 of 6) intron (NM_014078, intron 2 of 6) 12616 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 120.5-113 chr2 57020069 57020372 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -834450 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 155.5-87 chr2 35811859 35812350 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 340699 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 133.25-68 chr16 24958839 24959259 + 0.5 NA intron (NM_001006634, intron 9 of 19) intron (NM_001006634, intron 9 of 19) 56320 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 114.5-63 chr12 14191504 14191817 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -173972 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 124.25-48 chr13 62666622 62667062 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 129850 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 137.75-57 chr14 42655096 42655544 + 0.5 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 1048464 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 115.75-164 chr5 16202985 16203370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 22936 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 154.75-36 chr13 93108877 93109360 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63777 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 162-95 chr5 128795978 128796555 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168861 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 121-100 chr2 54988621 54989010 + 0.5 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) 21457 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 165.5-56 chr15 81119515 81119954 + 0.5 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -14536 NM_001353365 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 222.5-86 chr5 86854381 86855184 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 107964 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 150-29 chr12 19553191 19553648 + 0.5 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 112820 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 134.75-7 chr1 80887477 80887934 + 0.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 246418 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 152.25-134 chr5 144582416 144582989 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 377311 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 116.25-32 chr11 26582027 26582416 + 0.5 NA intron (NM_031418, intron 14 of 26) intron (NM_031418, intron 14 of 26) -9958 NM_001135091 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 168.25-81 chr2 153607523 153608146 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -129072 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 118.5-216 chr8 82903688 82904134 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -8193 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 129.75-165 chr6 136806550 136806809 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14202 NM_005923 4217 Hs.186486 NM_005923 ENSG00000197442 MAP3K5 ASK1|MAPKKK5|MEKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 protein-coding 201.5-69 chr2 49288240 49288953 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -134069 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 135-9 chr10 32955906 32956412 + 0.5 NA intron (NM_002211, intron 1 of 15) intron (NM_002211, intron 1 of 15) 1735 NM_133376 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 121-63 chr14 61273801 61274266 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7305 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 135-48 chr14 103504969 103505486 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17603 NM_001362531 1152 Hs.173724 NM_001823 ENSG00000166165 CKB B-CK|BCK|CKBB|CPK-B|HEL-211|HEL-S-29 creatine kinase B protein-coding 180.5-72 chr2 72860114 72860754 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -26974 NM_003124 6697 Hs.301540 NM_003124 ENSG00000116096 SPR SDR38C1 sepiapterin reductase protein-coding 164.25-58 chr18 77080231 77080599 + 0.5 NA intron (NM_001025100, intron 2 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie 52368 NM_001025101 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 118.25-98 chr2 37890398 37890767 + 0.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -14719 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 209.5-135 chr6 167105797 167106473 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5672 NM_004367 1235 Hs.46468 NM_004367 ENSG00000112486 CCR6 BN-1|C-C CKR-6|CC-CKR-6|CCR-6|CD196|CKR-L3|CKRL3|CMKBR6|DCR2|DRY6|GPR29|GPRCY4|STRL22 C-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 134.75-75 chr15 57115109 57115530 + 0.5 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -104111 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 151-96 chr4 53592300 53592742 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_046827) promoter-TSS (NR_046827) -435 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 147-52 chr17 60646978 60647352 + 0.5 NA intron (NM_003620, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 -30686 NM_017679 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 125.75-188 chr8 122788042 122788301 + 0.5 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 6516 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 118.75-82 chr18 8666670 8667134 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 40719 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 140.5-254 chrX 138726913 138727372 + 0.5 NA intron (NM_001139498, intron 2 of 5) intron (NM_001139498, intron 2 of 5) 12211 NM_033642 2258 Hs.6540 NM_004114 ENSG00000129682 FGF13 FGF-13|FGF2|FHF-2|FHF2|LINC00889 fibroblast growth factor 13 protein-coding 140-115 chr3 144031920 144032279 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59018 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 150.75-158 chr6 47568676 47569075 + 0.5 NA intron (NM_012120, intron 5 of 17) L2a|LINE|L2 -87597 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 128.25-83 chr18 64794340 64794676 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -534453 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 114.75-65 chr16 17321464 17321905 + 0.5 NA intron (NM_022166, intron 2 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie 149276 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 118.75-32 chr11 28545085 28545466 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -67727 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 153.25-29 chr12 37666513 37666985 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -650025 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 159.5-215 chr8 130849255 130849690 + 0.5 NA intron (NM_001115, intron 10 of 17) intron (NM_001115, intron 10 of 17) 191437 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 174-103 chr8 111211020 111211455 + 0.5 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 24966 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 139-132 chr6 143767776 143768109 + 0.5 NA intron (NM_001100165, intron 5 of 11) AluSx4|SINE|Alu -75331 NM_001329953 84946 Hs.185675 NM_032860 ENSG00000135521 LTV1 C6orf93|dJ468K18.4 LTV1 ribosome biogenesis factor protein-coding 161.75-106 chr5 80634204 80634790 + 0.5 NA intron (NR_110936, intron 2 of 3) intron (NR_110936, intron 2 of 3) -11973 NR_125754 103689917 Hs.740035 NR_125754 ENSG00000251221 LINC01337 TCONS_00009713 long intergenic non-protein coding RNA 1337 ncRNA 166.75-11 chr10 16276521 16277019 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -160173 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 141.75-113 chr22 27230794 27231184 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -6310 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 142-59 chr16 8189095 8189481 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 400550 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 114.25-62 chr15 77372717 77373037 + 0.5 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 47227 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 117.75-162 chr4 109630039 109630483 + 0.5 NA intron (NM_017918, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 70015 NM_017918 55013 Hs.234149 NM_017918 ENSG00000005059 MCUB CCDC109B mitochondrial calcium uniporter dominant negative beta subunit protein-coding 176-39 chr20 52397454 52398097 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -205790 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 162-100 chr6 45081669 45082069 + 0.5 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 115901 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 129.25-175 chr6 130932582 130932922 + 0.5 NA intron (NR_146620, intron 1 of 12) intron (NR_146620, intron 1 of 12) 37731 NM_001350310 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 137.75-123 chr22 25674828 25675272 + 0.5 NA intron (NM_001362778, intron 7 of 19) intron (NM_001362778, intron 7 of 19) -67138 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 123-119 chr20 48754103 48754580 + 0.5 NA intron (NM_020820, intron 1 of 39) MIR|SINE|MIR 73658 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 127.75-78 chr17 32907760 32908163 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19949 NM_001301746 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 118.75-52 chr13 74018816 74019284 + 0.5 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) intron (NM_007249, intron 1 of 7) 114879 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 118.5-120 chr22 21824039 21824427 + 0.5 NA intron (NM_002745, intron 1 of 8) intron (NM_002745, intron 1 of 8) 43447 NM_002745 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 139.75-154 chr6 39425681 39426152 + 0.5 NA intron (NM_001289020, intron 14 of 21) intron (NM_001289020, intron 14 of 21) 5474 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 162.5-194 chrX 11797006 11797479 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -25197 NM_001368398 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 168.25-78 chr2 142960377 142960800 + 0.5 NA intron (NM_001199241, intron 8 of 14) intron (NM_001199241, intron 8 of 14) 82924 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 129.75-156 chr6 8317969 8318269 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 117426 NM_001370478 51000 Hs.285847 NM_015948 ENSG00000124786 SLC35B3 C6orf196|CGI-19|PAPST2 solute carrier family 35 member B3 protein-coding 159-69 chr3 197918403 197918876 + 0.5 NA intron (NM_001323030, intron 7 of 7) intron (NM_001323030, intron 7 of 7) 31286 NM_001134435 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 165.75-139 chr5 115558692 115559258 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14200 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 175.5-128 chr4 47305953 47306519 + 0.5 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) L1PA8|LINE|L1 157466 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 113.25-63 chr16 27553456 27553861 + 0.5 NA intron (NM_015202, intron 1 of 27) (TAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3514 NM_015202 23247 Hs.460459 NM_015202 ENSG00000047578 KIAA0556 JBTS26 KIAA0556 protein-coding 114.75-108 chr20 53707372 53707755 + 0.5 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 99209 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 117-191 chr9 25179618 25179974 + 0.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 499062 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 155-74 chr20 10303911 10304311 + 0.5 NA intron (NM_001322907, intron 9 of 9) MIR|SINE|MIR -84605 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 135-25 chr11 80846424 80846797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -83807 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 116-75 chr18 55000530 55000873 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41240 NM_025214 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 159.75-160 chr7 72032347 72032743 + 0.5 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) intron (NM_001363460, intron 3 of 5) 304846 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 141.5-236 chr8 126547380 126547854 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 10861 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 141.75-7 chr1 89162289 89162754 + 0.5 NA intron (NM_207398, intron 3 of 10) L1PA13|LINE|L1 13482 NM_207398 388646 Hs.591450 NM_207398 ENSG00000213512 GBP7 GBP4L guanylate binding protein 7 protein-coding 117.75-92 chr19 30154494 30154814 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 212415 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 163-92 chr5 34715325 34715679 + 0.5 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) MER41E|LTR|ERV1 27943 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 134.5-110 chr2 199667821 199668191 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59938 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 114.75-52 chr14 62334220 62334669 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -194471 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 113.5-11 chr1 151917140 151917376 + 0.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -7747 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 142.5-176 chr5 105344885 105345363 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 245650 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 132.25-93 chr2 76431215 76431563 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -554576 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 220.75-38 chr2 30899290 30900015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -92206 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 180.75-129 chr6 67349142 67349607 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -705977 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 128.75-64 chr15 67395769 67396084 + 0.5 NA intron (NM_001031715, intron 13 of 20) AluSz|SINE|Alu 125047 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 129.75-7 chr1 57357988 57358408 + 0.5 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) L1MA8|LINE|L1 64914 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 169.5-119 chr4 30663364 30663950 + 0.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -56712 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 142-70 chr17 76667484 76667851 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4261 NR_130916 105274304 Hs.572495 NR_130916 ENSG00000261335 LOC105274304 - uncharacterized LOC105274304 ncRNA 173.75-49 chr12 129329996 129330475 + 0.5 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) LTR101_Mam|LTR|ERVL 121634 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 134.5-37 chr10 119682512 119682975 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 31373 NM_004281 9531 Hs.523309 NM_004281 ENSG00000151929 BAG3 BAG-3|BIS|CAIR-1|MFM6 BCL2 associated athanogene 3 protein-coding 118.75-177 chr7 25285020 25285364 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56706 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 119.25-28 chr10 105572510 105572912 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 247622 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 202.75-39 chr15 59433580 59434252 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -4270 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 143.5-135 chr21 42990120 42990579 + 0.5 NA intron (NM_004571, intron 1 of 10) intron (NM_004571, intron 1 of 10) 15787 NM_004571 5316 Hs.431043 NM_004571 ENSG00000160199 PKNOX1 PREP1|pkonx1c PBX/knotted 1 homeobox 1 protein-coding 164.25-43 chr15 24895709 24896286 + 0.5 NA intron (NM_001349456, intron 2 of 12) intron (NM_001349456, intron 2 of 12) 39485 NM_001349461 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 147.75-49 chr17 28567166 28567648 + 0.5 NA intron (NM_033198, intron 3 of 11) L1MC5a|LINE|L1 4117 NM_033198 94005 Hs.462550 NM_033198 ENSG00000087111 PIGS GPIBD18 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class S protein-coding 136.75-60 chr14 70969612 70969975 + 0.5 NA intron (NM_014982, intron 5 of 35) AluSz6|SINE|Alu 62334 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 148.5-75 chr16 57218969 57219491 + 0.5 NA intron (NM_001305164, intron 8 of 14) L1MA3|LINE|L1 -26029 NM_012106 23568 Hs.632873 NM_012106 ENSG00000102931 ARL2BP BART|BART1|RP66 ADP ribosylation factor like GTPase 2 binding protein protein-coding 123.75-43 chr12 111183786 111184258 + 0.5 NA intron (NM_001370598, intron 1 of 21) intron (NM_001370598, intron 1 of 21) 84018 NM_001370598 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 153.75-43 chr14 88345721 88346096 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18996 NM_021161 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 130.5-52 chr10 108716862 108717205 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -647740 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 112.25-128 chr3 70533878 70534270 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -221436 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 141.5-123 chr2 238732931 238733250 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 114817 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 122-84 chr2 14376294 14376613 + 0.5 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 24505 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 126.5-205 chr6 63394479 63394955 + 0.5 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -74734 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 150.5-171 chr5 58164513 58164920 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -42375 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 128.75-11 chr1 174793011 174793411 + 0.5 NA intron (NM_001366451, intron 3 of 12) intron (NM_001366451, intron 3 of 12) -6527 NM_001330989 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 139.75-86 chr18 78912210 78912615 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67863 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 113.25-9 chr1 118094262 118094703 + 0.5 NA intron (NM_206996, intron 7 of 48) intron (NM_206996, intron 7 of 48) 90746 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 202.25-22 chr14 39734641 39735239 + 0.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -302440 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 140.25-45 chr14 20311258 20311754 + 0.5 NA 3' UTR (NM_021178, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_021178, exon 7 of 7) -5555 NM_138376 91875 Hs.98553 NM_138376 ENSG00000136319 TTC5 Strap tetratricopeptide repeat domain 5 protein-coding 172.25-123 chr6 66755078 66755731 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 967525 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 112.25-125 chr3 52844720 52845050 + 0.5 NA exon (NM_198563, exon 5 of 9) exon (NM_198563, exon 5 of 9) 1667 NR_107031 102465866 NR_107031 ENSG00000275789 MIR8064 hsa-mir-8064 microRNA 8064 ncRNA 125.75-39 chr12 18139961 18140293 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49934 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 146.75-118 chr4 148965791 148966198 + 0.5 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -23616 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 114.25-64 chr15 79492676 79493030 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 60337 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 123-133 chr3 109709411 109709872 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 106813 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 143.25-32 chr12 6693426 6693829 + 0.5 NA TTS (NM_001244014) TTS (NM_001244014) -4055 NM_001039920 171017 Hs.103315 NM_133476 ENSG00000126746 ZNF384 CAGH1|CAGH1A|CIZ|ERDA2|NMP4|NP|TNRC1 zinc finger protein 384 protein-coding 137.25-25 chr11 44638611 44639033 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 73159 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 159.5-117 chr2 182046822 182047383 + 0.5 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 61249 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 134.5-199 chr6 157804740 157805155 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18299 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 126-167 chr7 83600752 83601085 + 0.5 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 40513 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 123-179 chr8 9605225 9605558 + 0.5 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) L1ME2|LINE|L1 49479 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 143.25-169 chr7 16517962 16518372 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8658 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 117.25-186 chr6 71650533 71650817 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 229648 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 127.5-121 chr2 105548533 105549012 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 61787 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 181.5-113 chr3 119744587 119745135 + 0.5 NA intron (NM_033364, intron 14 of 17) intron (NM_033364, intron 14 of 17) -35623 NM_003889 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 116-66 chr17 59537978 59538274 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11269 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 179.25-32 chr11 50378171 50378735 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -30694 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 145-9 chr1 154247909 154248239 + 0.5 NA intron (NM_001127320, intron 11 of 24) AluSq2|SINE|Alu -11653 NR_145714 109617023 NR_145714 ENSG00000201129 SNORA58B - small nucleolar RNA, H/ACA box 58B snoRNA 121.75-196 chr8 125865853 125866228 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 85157 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 124.75-94 chr17 7060042 7060466 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16162 NM_001370549 162515 Hs.336564 NM_153357 ENSG00000174326 SLC16A11 MCT 11|MCT11 solute carrier family 16 member 11 protein-coding 190.25-16 chr10 121724365 121725094 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -126271 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 165.5-47 chr14 65369302 65369791 + 0.5 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -34363 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 142.75-174 chr7 38842490 38842796 + 0.5 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) intron (NM_014396, intron 4 of 28) 66548 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 135.75-180 chr6 52948862 52949223 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -39344 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 122.75-122 chr22 31336255 31336653 + 0.5 NA intron (NM_032050, intron 2 of 3) intron (NM_032050, intron 2 of 3) 1105 NR_110542 101929760 Hs.661718 NR_110542 ENSG00000228839 PIK3IP1-AS1 - PIK3IP1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 112.75-102 chr2 139484368 139484736 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 587228 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 162.25-56 chr15 64560844 64561318 + 0.5 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 61661 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 187-2 chr1 163337944 163338623 + 0.5 NA intron (NM_145697, intron 7 of 13) intron (NM_145697, intron 7 of 13) 16329 NM_145697 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 158-44 chr13 67934800 67935228 + 0.5 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 562627 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 134.5-202 chr7 26812957 26813438 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 44526 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 140.5-71 chr14 86604366 86604795 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -301198 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 173.25-24 chr12 23735726 23736291 + 0.5 NA intron (NM_152989, intron 8 of 17) L2a|LINE|L2 -151422 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 136-42 chr14 86359854 86360214 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 425356 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 181.75-121 chr7 70262655 70263160 + 0.5 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 664432 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 137.5-121 chr2 83825394 83825901 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 302833 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 121.5-138 chr2 103730242 103730683 + 0.5 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 677870 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 172.25-85 chr3 35380974 35381476 + 0.5 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 12798 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 116-149 chr7 17097128 17097502 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -201337 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 139.75-84 chr18 35311170 35311558 + 0.5 NA TTS (NR_024565) TTS (NR_024565) 21092 NR_024565 10778 Hs.314246 NM_006629 ENSG00000257267 ZNF271P CT-ZFP48|HZF7|ZNF-EB|ZNF-dp|ZNF271|ZNFEB zinc finger protein 271, pseudogene pseudo 114-156 chr7 80294627 80294913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 79669 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 117.25-189 chr6 131853433 131853753 + 0.5 NA intron (NM_006208, intron 5 of 24) intron (NM_006208, intron 5 of 24) 45573 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 214-20 chr14 70437226 70437703 + 0.5 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -14710 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 141-120 chr5 5171860 5172321 + 0.5 NA intron (NM_139056, intron 3 of 22) L1M1|LINE|L1 31760 NM_139056 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 114.5-135 chr2 59873074 59873498 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 509750 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 113.25-81 chr2 6732955 6733342 + 0.5 NA intron (NR_038369, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR 37163 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 119-36 chr12 21472416 21472753 + 0.5 NA intron (NM_002907, intron 12 of 14) MER66D|LTR|ERV1 29051 NM_002907 5965 Hs.235069 NM_002907 ENSG00000004700 RECQL RECQL1|RecQ1 RecQ like helicase protein-coding 143-51 chr17 6858289 6858793 + 0.5 NA intron (NR_002710, intron 2 of 13) L1PA15|LINE|L1 4965 NR_002710 245 Hs.378695 NR_002710 ENSG00000262943 ALOX12P2 ALOX12E arachidonate 12-lipoxygenase pseudogene 2 pseudo 160-16 chr11 9516183 9516690 + 0.5 NA intron (NM_001282656, intron 14 of 15) intron (NM_001282656, intron 14 of 15) 55424 NM_003442 7702 Hs.523471 NM_003442 ENSG00000166478 ZNF143 SBF|STAF|pHZ-1 zinc finger protein 143 protein-coding 152-70 chr17 76072879 76073275 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001260502) promoter-TSS (NM_001260502) -551 NM_001260502 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 116.25-79 chr16 77568255 77568598 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -133392 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 119-200 chr8 118397332 118397682 + 0.5 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -223494 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 169.25-53 chr2 78693622 78694048 + 0.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 148304 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 120.5-54 chr12 39344324 39344745 + 0.5 NA intron (NM_017641, intron 11 of 36) intron (NM_017641, intron 11 of 36) 98586 NM_001173464 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 172.75-107 chr5 171165923 171166339 + 0.5 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) L2c|LINE|L2 -143117 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 115.25-26 chr10 57937162 57937452 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 330587 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 166.25-151 chr9 88391915 88392313 + 0.5 NA intron (NM_006717, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 3670 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 188.25-73 chr3 46973572 46974027 + 0.5 NA intron (NM_144716, intron 2 of 7) AluY|SINE|Alu 2702 NR_102269 151903 Hs.631918 NM_144716 ENSG00000160799 CCDC12 - coiled-coil domain containing 12 protein-coding 170.25-91 chr22 25268549 25269073 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 49172 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 117.25-44 chr11 110920016 110920344 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 177138 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 146.5-33 chr10 76979911 76980251 + 0.5 NA intron (NM_001322838, intron 19 of 29) intron (NM_001322838, intron 19 of 29) 92037 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-96 chr2 28439949 28440422 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45513 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 135-7 chr1 245048150 245048541 + 0.5 NA intron (NM_032328, intron 3 of 7) intron (NM_032328, intron 3 of 7) -77476 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 223.75-45 chr2 74955085 74955910 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3146 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 117.75-110 chr2 134761578 134761919 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42748 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 123.25-47 chr12 123161775 123162125 + 0.5 NA intron (NR_103517, intron 21 of 23) MIR|SINE|MIR -51461 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 154.75-51 chr16 49110219 49110706 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 171376 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 131.75-177 chr5 166779757 166780139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 146422 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 116.75-113 chr21 26490092 26490386 + 0.5 NA intron (NM_052954, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu 83047 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 114.5-136 chr2 65337796 65338170 + 0.5 NA intron (NM_001128210, intron 2 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 28795 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 144-69 chr2 238626287 238626638 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70963 NR_037809 151171 Hs.652076 NR_037809 ENSG00000225493 LINC01107 - long intergenic non-protein coding RNA 1107 ncRNA 134.5-26 chr10 62243637 62244112 + 0.5 NA intron (NM_001282941, intron 3 of 4) intron (NM_001282941, intron 3 of 4) 24970 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 129.5-184 chr5 91815908 91816232 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -432753 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 150.5-53 chr14 76130148 76130702 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21460 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 178.25-86 chr3 122441970 122442491 + 0.5 NA intron (NR_026698, intron 10 of 14) intron (NR_026698, intron 10 of 14) 26024 NR_125405 102723582 Hs.675056 NR_125405 ENSG00000272758 LOC102723582 - uncharacterized LOC102723582 ncRNA 132.5-195 chr5 54430925 54431268 + 0.5 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR -24603 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 168.75-92 chr3 12518726 12519309 + 0.5 NA intron (NM_025265, intron 7 of 11) intron (NM_025265, intron 7 of 11) 26447 NM_001195279 100129480 Hs.572974 NM_001195279 ENSG00000225526 MKRN2OS C3orf83|MKRN2-AS1 MKRN2 opposite strand protein-coding 116.5-133 chr2 182660233 182660610 + 0.5 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -55836 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 115.75-81 chr17 60329740 60330068 + 0.5 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) intron (NM_032582, intron 2 of 33) 62229 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 138.25-103 chr21 32184497 32185031 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 94285 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 145-126 chr5 85681774 85682333 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -600391 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 119-51 chr15 27372158 27372460 + 0.5 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) intron (NM_001270873, intron 5 of 5) -210990 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 174.5-16 chr1 238925586 238926112 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -439832 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 210-29 chr14 86612076 86612620 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -293430 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 129.25-174 chr6 130418281 130418744 + 0.5 NA intron (NM_001258277, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR -2584 NM_001258278 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 156-21 chr10 78096064 78096445 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 62391 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 122.5-93 chr18 52409403 52409718 + 0.5 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) MIRc|SINE|MIR 69363 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 164-130 chr7 95594008 95594390 + 0.5 NA intron (NM_002612, intron 2 of 10) intron (NM_002612, intron 2 of 10) 2317 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 166.75-151 chrX 136643995 136644519 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3920 NM_000074 959 Hs.592244 NM_000074 ENSG00000102245 CD40LG CD154|CD40L|HIGM1|IGM|IMD3|T-BAM|TNFSF5|TRAP|gp39|hCD40L CD40 ligand protein-coding 123-116 chr2 231443787 231444096 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 11995 NR_002921 654321 Hs.674388 NR_002921 ENSG00000206885 SNORA75 SNORA75A|U23 small nucleolar RNA, H/ACA box 75 snoRNA 121.5-70 chr13 55389240 55389685 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 215008 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 117.5-101 chr2 35407945 35408344 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -63261 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 157.25-24 chr11 44710628 44710980 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16158 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 223.5-7 chr1 88785046 88785564 + 0.5 NA intron (NM_006256, intron 7 of 21) AluJo|SINE|Alu -100101 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 119.5-57 chr11 120480624 120481095 + 0.5 NA intron (NM_015313, intron 38 of 40) L2a|LINE|L2 -30887 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 114-139 chr5 162204369 162204720 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 136902 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 114.25-188 chr8 53202382 53202814 + 0.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 49039 NM_000912 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 172-22 chr11 110673163 110673794 + 0.5 NA intron (NM_020809, intron 3 of 15) intron (NM_020809, intron 3 of 15) 38347 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 146.75-146 chr6 165043118 165043648 + 0.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -221320 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 174.5-72 chr15 67733834 67734497 + 0.5 NA intron (NM_001206804, intron 17 of 21) intron (NM_001206804, intron 17 of 21) -91344 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 116-127 chr5 92681846 92682296 + 0.5 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 889272 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-212 chr7 8481073 8481479 + 0.5 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 47667 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 136.75-89 chr2 33655611 33655945 + 0.5 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 -51108 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 139.5-72 chr15 85013035 85013412 + 0.5 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) intron (NM_173454, intron 1 of 20) 31249 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 114.25-187 chr8 34949882 34950226 + 0.5 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 166133 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 177.25-28 chr11 88546361 88547002 + 0.5 NA intron (NM_001143831, intron 7 of 8) intron (NM_001143831, intron 7 of 8) 42105 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 139.5-224 chr8 131801779 131802138 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -102135 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 115.75-100 chr2 64141927 64142260 + 0.5 NA intron (NM_020651, intron 1 of 6) intron (NM_020651, intron 1 of 6) 2327 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 157.5-202 chr8 32446966 32447524 + 0.5 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) AluSx3|SINE|Alu 6499 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 114.5-41 chr10 88521989 88522349 + 0.5 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 61149 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 153-34 chr13 28674051 28674473 + 0.5 NA intron (NM_015932, intron 5 of 5) LTR40b|LTR|ERVL 15132 NM_015932 51371 Hs.268742 NM_015932 ENSG00000132963 POMP C13orf12|HSPC014|PNAS-110|PRAAS2|UMP1 proteasome maturation protein protein-coding 160.25-76 chr2 109549634 109550209 + 0.5 NA intron (NM_001321508, intron 5 of 5) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 63746 NM_001321515 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 118.75-123 chr3 28754029 28754372 + 0.5 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) L1PA11|LINE|L1 178922 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 130.25-85 chr18 28393467 28393762 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -216484 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 157 chr1 34865182 34865616 + 0.5 NA TTS (NM_001080418) TTS (NM_001080418) -5650 NM_138428 113444 Hs.27160 NM_138428 ENSG00000163866 SMIM12 C1orf212 small integral membrane protein 12 protein-coding 126-173 chr8 86492479 86492803 + 0.5 NA intron (NM_001286719, intron 2 of 8) AluSx1|SINE|Alu 16045 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 135.5-55 chr14 49583001 49583387 + 0.5 NA TTS (NM_001351375) TTS (NM_001351375) 3186 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 127-6 chr1 172429131 172429461 + 0.5 NA intron (NM_139240, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 8611 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 132.5-216 chr6 97594975 97595424 + 0.5 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) LTR16E1|LTR|ERVL 289613 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 125.5-180 chr3 101565939 101566281 + 0.5 NA 3' UTR (NM_017819, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_017819, exon 2 of 2) 4242 NM_017819 54931 Hs.594839 NM_017819 ENSG00000174173 TRMT10C COXPD30|HNYA|MRPP1|RG9MTD1 tRNA methyltransferase 10C, mitochondrial RNase P subunit protein-coding 118-65 chr17 17033099 17033443 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9186 NM_001364716 23164 Hs.462341 NM_015134 ENSG00000133030 MPRIP M-RIP|MRIP|RHOIP3|RIP3|p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein protein-coding 145-156 chr8 117668006 117668574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 147577 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 139.75-113 chr22 27653451 27653866 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 148098 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 136.25-145 chr5 34408617 34408978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -164073 NR_146599 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 113.5-242 chr8 133907441 133907809 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 21129 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 143-33 chr14 39436796 39437103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4449 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 121.5-254 chr8 127066970 127067296 + 0.5 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -12741 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 138-173 chr9 121616830 121617181 + 0.5 NA intron (NM_032552, intron 1 of 16) intron (NM_032552, intron 1 of 16) 49903 NM_032552 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 114.5-144 chr2 154266851 154267112 + 0.5 NA intron (NM_052917, intron 8 of 12) L1ME2z|LINE|L1 190457 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 114.25-30 chr11 98085937 98086215 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -934873 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 173.75-42 chr12 55186556 55187185 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34155 NM_001005280 121364 Hs.554557 NM_001005280 ENSG00000179919 OR10A7 OR12-6 olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 protein-coding 127-53 chr13 95633919 95634189 + 0.5 NA intron (NM_014934, intron 5 of 21) intron (NM_014934, intron 5 of 21) 10652 NM_014934 22873 Hs.656580 NM_014934 ENSG00000134874 DZIP1 DZIP|DZIPt1 DAZ interacting zinc finger protein 1 protein-coding 148.25-28 chr11 103670619 103671138 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -179028 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 116.25-132 chr22 44420678 44420969 + 0.5 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -22504 NR_109966 101927526 Hs.339290 NR_109966 ENSG00000232655 LINC01656 - long intergenic non-protein coding RNA 1656 ncRNA 152.75-89 chr2 176987806 176988339 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 224339 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 118.25-132 chr3 145702639 145702972 + 0.5 NA Intergenic MER70-int|LTR|ERVL 366380 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 135.75-15 chr1 187089012 187089383 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3645 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 157.75-20 chr10 82242568 82243002 + 0.5 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -9865 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 167.75-13 chr1 180660177 180660828 + 0.5 NA intron (NR_137330, intron 1 of 12) L1MA3|LINE|L1 28480 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 147.75-11 chr1 168639658 168640247 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 63347 NM_002995 6375 Hs.546295 NM_002995 ENSG00000143184 XCL1 ATAC|LPTN|LTN|SCM-1|SCM-1a|SCM1|SCM1A|SCYC1 X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 133.5-239 chr6 152431664 152432134 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 34 of 145) intron (NM_182961, intron 34 of 145) 51369 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 142.75-52 chr12 108497311 108497736 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17754 NM_007076 11153 Hs.661891 NM_007076 ENSG00000198855 FICD HIP13|HYPE|UNQ3041 FIC domain containing protein-coding 154.75-22 chr11 76306381 76306774 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 74388 NR_130898 5612 Hs.503315 NM_004705 ENSG00000137492 THAP12 DAP4|P52rIPK|PRKRIR|THAP0 THAP domain containing 12 protein-coding 142.75-20 chr10 60009491 60010022 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48843 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 142.75-87 chr18 12334168 12334660 + 0.5 NA intron (NM_006796, intron 16 of 16) intron (NM_006796, intron 16 of 16) 26173 NM_001303530 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 150.75-52 chr13 48343685 48344284 + 0.5 NA intron (NM_000321, intron 3 of 26) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 40237 NM_000321 5925 Hs.408528 NM_000321 ENSG00000139687 RB1 OSRC|PPP1R130|RB|p105-Rb|pRb|pp110 RB transcriptional corepressor 1 protein-coding 136.25-30 chr11 28680852 28681284 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -203520 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 127.5-174 chr4 76535977 76536320 + 0.5 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) intron (NM_020859, intron 1 of 10) -37420 NR_039654 100616299 NR_039654 ENSG00000263445 MIR4450 mir-4450 microRNA 4450 ncRNA 116.25-203 chr6 145945964 145946303 + 0.5 NA intron (NM_001370328, intron 8 of 31) intron (NM_001370328, intron 8 of 31) 17964 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 158.25-125 chr6 118785434 118785942 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 2980 NR_037662 100287632 Hs.334026 NR_037662 SELENOKP3 - selenoprotein K pseudogene 3 pseudo 124.5-16 chr1 184326755 184327101 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -60101 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 113.25-11 chr1 170883737 170884089 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51558 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 171.5-153 chr8 112342725 112343219 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 37 of 66) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -300521 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 112.75-201 chr8 110779498 110779854 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 247757 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 139.5-181 chr5 142655659 142656030 + 0.5 NA intron (NM_001144935, intron 1 of 3) intron (NM_001144935, intron 1 of 3) -11543 NM_001257210 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 174.25-142 chr8 83885652 83886194 + 0.5 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -296864 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 158.5-36 chr11 18025308 18025765 + 0.5 NA intron (NM_004179, intron 7 of 9) intron (NM_004179, intron 7 of 9) -12374 NR_104041 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 117.5-15 chr1 184736831 184737187 + 0.5 NA intron (NM_025191, intron 4 of 19) intron (NM_025191, intron 4 of 19) 17849 NM_025191 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 150.5-69 chr18 10811128 10811635 + 0.5 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) intron (NM_022068, intron 7 of 51) -51732 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 113.5-183 chr4 76583272 76583549 + 0.5 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 7859 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 144-122 chr7 102032319 102032756 + 0.5 NA intron (NM_001913, intron 3 of 22) AluSx|SINE|Alu 214911 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 125.5-264 chr8 136357383 136357876 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -173169 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 146.5-204 chr7 36530626 36531054 + 0.5 NA intron (NM_001177507, intron 17 of 19) L1ME4b|LINE|L1 69280 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 131-79 chr2 16215850 16216207 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 165601 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 144.75-163 chr7 93540814 93541172 + 0.5 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) 18817 NM_001164738 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 138.75-192 chr8 85958427 85958958 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 110976 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 115.25-41 chr11 126935244 126935643 + 0.5 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) L1MC1|LINE|L1 -5303 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 156.5-139 chr4 145127255 145127616 + 0.5 NA intron (NM_002940, intron 17 of 17) intron (NM_002940, intron 17 of 17) -28894 NM_001256708 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 155-150 chr9 27315745 27316174 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18809 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 137.75-206 chr8 110868167 110868570 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 159065 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 117.25-59 chr12 95268764 95269112 + 0.5 NA intron (NR_147922, intron 6 of 12) intron (NR_147922, intron 6 of 12) -39482 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 147.5-196 chr7 52025763 52026117 + 0.5 NA Intergenic MER67A|LTR|ERV1 -632684 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 150.5-132 chr3 110893380 110893776 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 176381 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 138-91 chr20 62516143 62516644 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34060 NM_178463 128826 Hs.86507 NM_178463 MIR1-1HG C20orf166|MIR133A2HG MIR1-1 host gene protein-coding 125.25-187 chr7 37000772 37001189 + 0.5 NA intron (NR_104120, intron 1 of 2) intron (NR_104120, intron 1 of 2) 3184 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 134.25-66 chr18 13266248 13266614 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) -11674 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 133.75-84 chr18 5264979 5265426 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 27102 NR_015389 339290 Hs.643553 NR_015389 ENSG00000263753 LINC00667 - long intergenic non-protein coding RNA 667 ncRNA 139-152 chr8 127133535 127133971 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51532 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 134.5-229 chr8 121949338 121949840 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -308149 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 123.25-179 chr6 166542560 166542946 + 0.5 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) 1937 NM_001318938 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 143.25-179 chr8 78072767 78073071 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -443421 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 126.25-119 chr3 107654607 107655008 + 0.5 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR 131845 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 134-114 chr3 24575834 24576176 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80297 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 147.75-80 chr2 187577331 187577742 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -23031 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 135.25-31 chr10 101037117 101037457 + 0.5 NA intron (NM_030971, intron 8 of 11) intron (NM_030971, intron 8 of 11) 6048 NM_030971 81855 Hs.283844 NM_030971 ENSG00000107819 SFXN3 BA108L7.2|SFX3|SLC56A3 sideroflexin 3 protein-coding 123.75-62 chr14 69747938 69748322 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -19012 NM_001039465 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 160.75-87 chr2 241439603 241440052 + 0.5 NA intron (NM_014808, intron 12 of 26) AluSq2|SINE|Alu -38078 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 124.25-61 chr15 53466485 53466750 + 0.5 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 74235 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 115.25-187 chr7 50321659 50322085 + 0.5 NA intron (NM_001220771, intron 1 of 3) intron (NM_001220771, intron 1 of 3) 2824 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 147.5-90 chr2 8381967 8382386 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53757 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 169-11 chr10 71896354 71896829 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45340 NM_001042466 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 160.75-131 chr6 44108146 44108779 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17805 NM_001318770 64928 Hs.311190 NM_032111 ENSG00000180992 MRPL14 L14mt|L32mt|MRP-L14|MRP-L32|MRPL32|RMPL32|RPML32 mitochondrial ribosomal protein L14 protein-coding 149.25-66 chr17 82595209 82595762 + 0.5 NA intron (NM_004514, intron 8 of 8) AluJo|SINE|Alu 52959 NM_019613 56270 Hs.132161 NM_019613 ENSG00000141580 WDR45B NEDSBAS|WDR45L|WIPI-3|WIPI3 WD repeat domain 45B protein-coding 166.75-122 chr6 10382730 10383239 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21518 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 139-67 chr2 19096052 19096593 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -69351 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 172.5-54 chr12 95815474 95816098 + 0.5 NA intron (NR_135016, intron 1 of 1) intron (NR_135016, intron 1 of 1) 12689 NR_135016 105369920 Hs.145556 NR_135016 ENSG00000258292 LINC02410 - long intergenic non-protein coding RNA 2410 ncRNA 114 chr1 6197557 6197997 + 0.5 NA intron (NM_000983, intron 1 of 3) intron (NM_000983, intron 1 of 3) 1818 NM_000983 6146 Hs.515329 NM_000983 ENSG00000116251 RPL22 EAP|HBP15|HBP15/L22|L22 ribosomal protein L22 protein-coding 178-50 chr2 183494824 183495375 + 0.5 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 370656 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 160.25-13 chr10 114495622 114495943 + 0.5 NA intron (NM_001352440, intron 6 of 20) MIR|SINE|MIR 31131 NM_001322894 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 116.25-45 chr12 23900113 23900498 + 0.5 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) 49365 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 166.75-62 chr17 79478017 79478585 + 0.5 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 37847 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 119.75-126 chr20 51278873 51279172 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 173955 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 197.5-116 chr4 140229132 140229629 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -27928 NM_032547 60592 Hs.480815 NM_032547 ENSG00000153130 SCOC HRIHFB2072|SCOCO|UNC-69 short coiled-coil protein protein-coding 169-6 chr10 24859369 24859800 + 0.5 NA intron (NM_020200, intron 4 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 93022 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 121.25-36 chr11 82204390 82204819 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MEg|LINE|L1 199309 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 219.25-5 chr1 113351283 113351843 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38952 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 146-89 chr22 45452456 45452801 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 38935 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 132-129 chr5 4694210 4694513 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -79120 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 160.25-160 chr8 89594535 89595066 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 162911 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 117.25 chr1 17711357 17711709 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43800 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 135-54 chr17 8177004 8177298 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_147092) promoter-TSS (NR_147092) -771 NM_001351280 84314 Hs.513933 NM_032354 ENSG00000179029 TMEM107 GRVS638|JBTS29|MKS13|PRO1268 transmembrane protein 107 protein-coding 195.25-29 chr14 53155928 53156493 + 0.5 NA intron (NR_110062, intron 1 of 2) intron (NR_110062, intron 1 of 2) 2856 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 132.75-158 chr5 146558444 146558835 + 0.5 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -42526 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 140.25-80 chr19 12863770 12864098 + 0.5 NA intron (NM_014975, intron 12 of 25) AluSx1|SINE|Alu 11674 NR_106852 102466196 NR_106852 ENSG00000276181 MIR6794 hsa-mir-6794 microRNA 6794 ncRNA 256-4 chr1 197449643 197450221 + 0.5 NA intron (NR_047564, intron 11 of 11) L1MEb|LINE|L1 181680 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 152.75-25 chr10 86636418 86636810 + 0.5 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -17933 NM_033282 94233 Hs.283922 NM_033282 ENSG00000122375 OPN4 MOP opsin 4 protein-coding 193.25-87 chr5 12905933 12906409 + 0.5 NA intron (NR_147005, intron 3 of 4) intron (NR_147005, intron 3 of 4) 126715 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 128.5-156 chr4 30898212 30898490 + 0.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 177982 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 117-98 chr2 154283522 154283887 + 0.5 NA intron (NM_052917, intron 8 of 12) (ATACAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 173734 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 140.5-245 chr9 16356588 16357141 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80551 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 142.5-213 chr7 146805336 146805727 + 0.5 NA intron (NM_014141, intron 1 of 22) intron (NM_014141, intron 1 of 22) 31260 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 123.5-59 chr14 60768734 60769002 + 0.5 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 34107 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 136.5-211 chr7 45672105 45672386 + 0.5 NA intron (NM_021116, intron 8 of 19) L1MD1|LINE|L1 96773 NR_024271 641977 Hs.723477 NR_024271 ENSG00000214765 SEPTIN7P2 SEPT13|SEPT7B|SEPT7P2 septin 7 pseudogene 2 pseudo 112.5-151 chr21 27251600 27251938 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -284681 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 143.25-43 chr13 64410338 64410804 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -334560 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 191.5-56 chr17 35764010 35764774 + 0.5 NA intron (NM_145272, intron 2 of 2) CpG 3505 NM_145272 146853 Hs.127194 NM_145272 ENSG00000270806 C17orf50 - chromosome 17 open reading frame 50 protein-coding 200.75-88 chr5 154434703 154435309 + 0.5 NA intron (NR_037897, intron 2 of 2) L1MB8|LINE|L1 10816 NR_037897 386627 Hs.652021 NR_037897 SAP30L-AS1 GALNT10-AS1 SAP30L antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 116.25-152 chr3 149890748 149891117 + 0.5 NA intron (NM_183383, intron 3 of 8) intron (NM_183383, intron 3 of 8) 78244 NM_007282 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 168.25-138 chr8 67023124 67023615 + 0.5 NA intron (NM_001364910, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 5182 NM_001348563 286187 Hs.583933 NM_001013626 ENSG00000178125 PPP1R42 LRRC67|TLLR|TLRR|dtr protein phosphatase 1 regulatory subunit 42 protein-coding 115.75-85 chr17 78463527 78463872 + 0.5 NA intron (NM_173628, intron 56 of 80) intron (NM_173628, intron 56 of 80) -21211 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 135-72 chr19 31328176 31328609 + 0.5 NA intron (NR_138034, intron 1 of 1) intron (NR_138034, intron 1 of 1) 21044 NR_138035 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 119.5-139 chr20 62319130 62319456 + 0.5 NA intron (NM_005560, intron 51 of 79) intron (NM_005560, intron 51 of 79) 13264 NR_039915 100616340 NR_039915 ENSG00000284074 MIR4758 - microRNA 4758 ncRNA 152.25-26 chr10 95225536 95226047 + 0.5 NA intron (NM_207321, intron 10 of 10) L1MC4|LINE|L1 31591 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 146.5-92 chr18 50845724 50846291 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20627 NM_001369510 83876 Hs.30495 NM_031939 ENSG00000134042 MRO B29|C18orf3 maestro protein-coding 119-11 chr1 238180354 238180692 + 0.5 NA Intergenic MER84-int|LTR|ERV1 -289601 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 149-7 chr1 160264284 160264799 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1992 NR_028103 50717 Hs.632447 NM_015726 ENSG00000132716 DCAF8 GAN2|H326|WDR42A DDB1 and CUL4 associated factor 8 protein-coding 121.5-66 chr12 123180616 123181029 + 0.5 NA intron (NR_103517, intron 14 of 23) AluSz|SINE|Alu 52319 NM_022782 10198 Hs.577404 NM_022782 ENSG00000051825 MPHOSPH9 MPP-9|MPP9 M-phase phosphoprotein 9 protein-coding 113.5-51 chr11 102728140 102728412 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3322 NM_001304441 4317 Hs.161839 NM_002424 ENSG00000118113 MMP8 CLG1|HNC|MMP-8|PMNL-CL matrix metallopeptidase 8 protein-coding 117.75-95 chr19 45190132 45190499 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 11570 NM_212550 388552 Hs.103902 NM_212550 ENSG00000189114 BLOC1S3 BLOS3|HPS8|RP biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 3 protein-coding 136.75-198 chr8 126599247 126599702 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -40996 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 153.5-215 chr9 77533904 77534334 + 0.5 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) MER113B|DNA|hAT-Charlie 86470 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 151.25-67 chr17 51551958 51552508 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 116806 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 128-69 chr2 31922428 31922763 + 0.5 NA intron (NM_001137602, intron 2 of 7) L1PA15|LINE|L1 88069 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 119-90 chr2 109244086 109244466 + 0.5 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 69349 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 157.5-159 chr5 37059114 37059501 + 0.5 NA intron (NM_015384, intron 44 of 45) AluSx|SINE|Alu 182538 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 136.5-72 chr14 66130848 66131282 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -355306 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 146.5-188 chr6 55742243 55742760 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 133089 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 125.25-139 chr3 146779138 146779574 + 0.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -142567 NR_135561 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 161.25-3 chr1 55879908 55880341 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 64839 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 113.5-145 chr20 57280470 57280871 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14029 NM_001719 655 Hs.473163 NM_001719 ENSG00000101144 BMP7 OP-1 bone morphogenetic protein 7 protein-coding 120.5-149 chr3 149946887 149947251 + 0.5 NA intron (NM_183383, intron 7 of 8) L1PA5|LINE|L1 23826 NM_053024 5217 Hs.91747 NM_002628 ENSG00000070087 PFN2 D3S1319E|PFL profilin 2 protein-coding 112.75-153 chr4 113971351 113971740 + 0.5 NA intron (NM_001354211, intron 2 of 6) intron (NM_001354211, intron 2 of 6) 8102 NM_001354210 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 122-8 chr1 92269931 92270296 + 0.5 NA intron (NR_135089, intron 8 of 17) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 28874 NM_053274 11146 Hs.49105 NM_007070 ENSG00000174842 GLMN FAP|FAP48|FAP68|FKBPAP|GLML|GVM|VMGLOM glomulin, FKBP associated protein protein-coding 130-178 chr9 73931091 73931442 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -440265 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 146.75-24 chr11 56054076 56054549 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23893 NM_001001921 219447 Hs.553625 NM_001001921 ENSG00000181785 OR5AS1 OR11-168 olfactory receptor family 5 subfamily AS member 1 protein-coding 123-9 chr1 114999363 114999747 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30269 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 131.5-249 chr9 127851696 127852062 + 0.5 NA intron (NM_001114753, intron 1 of 14) AluSg|SINE|Alu 2894 NM_000118 2022 Hs.76753 NM_000118 ENSG00000106991 ENG END|HHT1|ORW1 endoglin protein-coding 125.5-124 chr2 63719354 63719708 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -121433 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 114.5-199 chr4 187085253 187085706 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116507 NR_147159 105377600 Hs.641158 NR_147159 LINC02374 - long intergenic non-protein coding RNA 2374 ncRNA 118.25-131 chr3 145141424 145141874 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 927536 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 136.25-180 chr7 99092957 99093451 + 0.5 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) intron (NM_020429, intron 1 of 18) 50904 NM_020429 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 153.25-78 chr20 51769505 51769929 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1327 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 114-122 chr5 13402672 13403064 + 0.5 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -369982 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 205.5-2 chr1 41249634 41250217 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7619 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 134.75-161 chr4 75023088 75023427 + 0.5 NA intron (NM_015393, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR -52895 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 160.25-152 chr7 52285728 52286118 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -749710 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 112.75-72 chr16 9952937 9953289 + 0.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) L2|LINE|L2 228954 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 149.25-148 chr5 150366185 150366607 + 0.5 NA intron (NM_001008657, intron 3 of 17) L1MC5a|LINE|L1 8699 NM_001195141 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 121.75-19 chr11 36363832 36364270 + 0.5 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR -11934 NM_024841 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 117-4 chr1 88300802 88301119 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -383184 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 118.5-205 chr8 4618425 4618694 + 0.5 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) intron (NM_033225, intron 2 of 69) 376355 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 147.25-146 chr8 110780429 110780888 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 246775 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 132.75-210 chrX 94979886 94980278 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 83144 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 147-43 chr15 92202581 92202935 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -191123 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 142.75-149 chr4 144915451 144915933 + 0.5 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 181690 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 133.75-165 chr5 130832305 130832699 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 332754 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 119.25-21 chr10 52188247 52188668 + 0.5 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) AluJr|SINE|Alu 125671 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 196.25-66 chr2 107301475 107302052 + 0.5 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) MER34|LTR|ERV1 47762 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 159.75-57 chr16 82454410 82454872 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -172328 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 130.25-172 chr6 52425431 52425824 + 0.5 NA intron (NR_033327, intron 2 of 9) intron (NR_033327, intron 2 of 9) 4619 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 132.75-108 chr2 228329154 228329571 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -147675 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 154.5-39 chr11 96967494 96967806 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 459225 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 112.25-2 chr1 7242907 7243206 + 0.5 NA intron (NM_001349608, intron 3 of 21) L1M5|LINE|L1 146698 NR_146199 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 123.75-103 chr2 239485727 239486086 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 84158 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-223 chr6 143867465 143867871 + 0.5 NA intron (NM_001013623, intron 1 of 7) intron (NM_001013623, intron 1 of 7) 3194 NM_001013623 153918 Hs.121188 NM_001013623 ENSG00000118491 ZC2HC1B C6orf94|FAM164B|dJ468K18.5 zinc finger C2HC-type containing 1B protein-coding 115.25-185 chr7 39474267 39474602 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68088 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 125-142 chr6 146095189 146095598 + 0.5 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) intron (NM_001278065, intron 2 of 9) 66195 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 157-93 chr5 52729999 52730503 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -57665 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 142.25-138 chr5 142482822 142483141 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 138353 NM_001257212 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 231.25-56 chr3 181329661 181330424 + 0.5 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1ME4b|LINE|L1 98305 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 146.75-132 chr5 137138873 137139258 + 0.5 NA intron (NM_004598, intron 4 of 10) MIRb|SINE|MIR 10868 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 119.75-93 chr2 26847637 26847939 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001253724) promoter-TSS (NM_001253724) -344 NM_020134 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 128.5-62 chr14 53008959 53009333 + 0.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -58049 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 126.25-25 chr10 120900168 120900650 + 0.5 NA intron (NM_018117, intron 20 of 28) intron (NM_018117, intron 20 of 28) 49047 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 157.5-54 chr14 41027643 41028165 + 0.5 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 73193 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 123.5-17 chr1 225302519 225302958 + 0.5 NA intron (NM_001367479, intron 56 of 85) intron (NM_001367479, intron 56 of 85) 125300 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 117.25-144 chr3 123949576 123949953 + 0.5 NA intron (NM_001366336, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 11465 NM_022757 64770 Hs.645028 NM_022757 ENSG00000175455 CCDC14 - coiled-coil domain containing 14 protein-coding 155.5-80 chr18 40994433 40994922 + 0.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 526000 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 117-17 chr10 72716471 72716779 + 0.5 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu -4404 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 130-161 chr7 140410073 140410415 + 0.5 NA intron (NM_001008749, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 6186 NM_001008749 401409 Hs.583545 NM_001008749 ENSG00000146955 RAB19 RAB19B RAB19, member RAS oncogene family protein-coding 164.5-71 chr15 58180011 58180593 + 0.5 NA intron (NM_020980, intron 5 of 5) intron (NM_020980, intron 5 of 5) 41921 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 193.5-2 chr1 31954486 31955096 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16423 NM_001195101 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 126.5-266 chr9 95834758 95835110 + 0.5 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) intron (NR_023390, intron 2 of 2) -40757 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 141.5-157 chr4 30120712 30121100 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -599463 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 129-120 chr3 65640048 65640378 + 0.5 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) MLT2B4|LTR|ERVL -253603 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-127 chr3 153968871 153969364 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -151886 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 163.5-142 chr4 55287278 55287771 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -58718 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 117.75-28 chr10 122516626 122516992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43856 NM_004406 1755 Hs.279611 NM_004406 ENSG00000187908 DMBT1 GP340|SAG|SALSA|muclin deleted in malignant brain tumors 1 protein-coding 140.25-134 chr4 101200894 101201384 + 0.5 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) MER33|DNA|hAT-Charlie 39733 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 121.25-37 chr11 84444320 84444635 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -127138 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 144.5-93 chr19 39416087 39416457 + 0.5 NA intron (NM_022835, intron 4 of 18) intron (NM_022835, intron 4 of 18) 2493 NM_001351694 64857 Hs.631574 NM_022835 ENSG00000090924 PLEKHG2 ARHGEF42|CLG|CTB-60E11.4|LDAMD pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G2 protein-coding 131-109 chr21 17435286 17435740 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3377 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 156.75-32 chr11 9550705 9551212 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22712 NM_003390 7465 Hs.249441 NM_003390 ENSG00000166483 WEE1 WEE1A|WEE1hu WEE1 G2 checkpoint kinase protein-coding 136.5-228 chr8 82952093 82952631 + 0.5 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) intron (NR_134295, intron 2 of 3) 40258 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 164.25-76 chr2 205501815 205502227 + 0.5 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) intron (NM_205863, intron 20 of 21) -180479 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 189.25-101 chr6 33947038 33947575 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 48171 NR_106982 102466816 NR_106982 ENSG00000276824 MIR7159 hsa-mir-7159 microRNA 7159 ncRNA 135-188 chr8 134102599 134102935 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 216271 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 172-11 chr1 201179753 201180266 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -8427 NM_001288564 252839 Hs.181444 NM_016456 ENSG00000116857 TMEM9 DERM4|TMEM9A transmembrane protein 9 protein-coding 148-63 chr2 186057747 186058233 + 0.5 NA intron (NR_110218, intron 3 of 5) intron (NR_110218, intron 3 of 5) 28327 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 114.25-98 chr2 112584086 112584363 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001304354) promoter-TSS (NM_001304354) -223 NR_163920 153.75-48 chr15 81964972 81965481 + 0.5 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 80792 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 143-121 chr5 125901602 125901976 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -277788 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 181-31 chr15 38344064 38344721 + 0.5 NA intron (NM_152594, intron 5 of 6) intron (NM_152594, intron 5 of 6) 91556 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 156.75-17 chr10 23280843 23281288 + 0.5 NA intron (NM_001365862, intron 8 of 15) intron (NM_001365862, intron 8 of 15) -62892 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 161.75-14 chr10 34252896 34253347 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -480441 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 153.75-11 chr1 189976273 189976783 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 499482 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 113.5-120 chr2 46999732 47000045 + 0.5 NA intron (NM_001288951, intron 8 of 20) intron (NM_001288951, intron 8 of 20) -58033 NM_001171508 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 133.5-224 chr6 16004499 16004861 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -124406 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 120-3 chr1 67133421 67133796 + 0.5 NA intron (NM_001276352, intron 1 of 8) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 1362 NR_075077 400757 Hs.666621 NM_001013674 ENSG00000203963 C1orf141 - chromosome 1 open reading frame 141 protein-coding 116.5-241 chr8 57840531 57840898 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 94565 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 197-7 chr11 70524087 70524675 + 0.5 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) ERVL-E-int|LTR|ERVL -106713 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 156.5-89 chr2 177485795 177486378 + 0.5 NA intron (NM_003659, intron 11 of 19) intron (NM_003659, intron 11 of 19) 66710 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 129-33 chr11 32282004 32282327 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 118235 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 143.25-9 chr1 110720467 110720885 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45736 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 204.25-41 chr15 24858645 24859332 + 0.5 NA intron (NM_001349461, intron 1 of 12) LTR10D|LTR|ERV1 2476 NM_001349461 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 148.5-54 chr13 92866943 92867492 + 0.5 NA TTS (NM_004466) TTS (NM_004466) -145603 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 125.75-195 chr9 106457698 106458114 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -143022 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 142.25-158 chr7 44859362 44859713 + 0.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -11411 NM_138635 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 155.75-5 chr1 50658282 50658649 + 0.5 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) intron (NM_007051, intron 7 of 18) -235022 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 132.25-11 chr1 118997975 118998450 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3193 NR_135035 105378933 Hs.599652 NR_135034 ENSG00000226172 LOC105378933 - uncharacterized LOC105378933 ncRNA 119.5-250 chr9 27634264 27634690 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60611 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 121.75-64 chr18 6877276 6877720 + 0.5 NA intron (NM_001010000, intron 9 of 16) intron (NM_001010000, intron 9 of 16) 43013 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 146.75-167 chr8 127674080 127674660 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59597 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 114.75-127 chr3 120190659 120191022 + 0.5 NA intron (NM_001168271, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 53455 NM_001168271 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 151.5-151 chr5 63865442 63865853 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 96645 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 116.25-238 chr8 138992484 138992909 + 0.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -78655 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 113.5-117 chr2 30404644 30404973 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42438 NM_001304446 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 124-162 chr7 130666417 130666803 + 0.5 NA intron (NM_001290033, intron 3 of 19) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 2138 NM_012133 26958 Hs.6421 NM_012133 ENSG00000158623 COPG2 2-COP|gamma-2-COP coatomer protein complex subunit gamma 2 protein-coding 122-25 chr10 34908986 34909266 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 93358 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 136-102 chr3 60315108 60315437 + 0.5 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -234363 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 165-46 chr15 78390749 78391403 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46355 NM_001354994 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 115.5-96 chr17 79899049 79899357 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -20154 NR_110851 101928738 Hs.399280 NR_110851 ENSG00000262188 LINC01978 - long intergenic non-protein coding RNA 1978 ncRNA 120.75-136 chr5 82501374 82501658 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 222054 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 128.75-160 chr5 173252321 173252750 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17329 NM_004387 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 115.75-202 chr7 74262943 74263278 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8652 NM_001278792 5982 Hs.647062 NM_002914 ENSG00000049541 RFC2 RFC40 replication factor C subunit 2 protein-coding 179.25-45 chr12 106842529 106843086 + 0.5 NA non-coding (NR_147134, exon 5 of 11) non-coding (NR_147134, exon 5 of 11) -67976 NR_040246 100287944 Hs.742087 NR_040246 ENSG00000257545 LOC100287944 - uncharacterized LOC100287944 ncRNA 118.25-66 chr14 70319886 70320251 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 39615 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 127-107 chr2 224253912 224254232 + 0.5 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 147922 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 120.75-91 chr20 14207237 14207564 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 130212 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 131.5-159 chr3 112669646 112670059 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28709 NM_199511 151887 Hs.477128 NM_199511 ENSG00000091986 CCDC80 CL2|DRO1|SSG1|URB|okuribin coiled-coil domain containing 80 protein-coding 135.5-123 chr20 44559302 44559739 + 0.5 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) intron (NM_007066, intron 1 of 3) -23059 NM_001281445 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 139.5-69 chr14 76980229 76980654 + 0.5 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 20803 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 123-184 chr8 85060560 85060960 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -46478 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 142.75-49 chr12 58638844 58639210 + 0.5 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 47325 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 112.25-102 chr2 142484093 142484412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -352551 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 174.25-59 chr15 86426109 86426690 + 0.5 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -109431 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 116.5-18 chr1 234968581 234968918 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4750 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 176.5-71 chr17 60951090 60951593 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) intron (NM_001330413, intron 14 of 25) 273490 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 140.75-163 chr6 51382163 51382612 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -239483 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 132.5-93 chr17 66535393 66535773 + 0.5 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -118729 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 146.75-71 chr2 23466090 23466450 + 0.5 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 81091 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 149.75-139 chr5 177410487 177410947 + 0.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -1141 NM_000505 2161 Hs.1321 NM_000505 ENSG00000131187 F12 HAE3|HAEX|HAF coagulation factor XII protein-coding 119.25-149 chr4 67640915 67641360 + 0.5 NA intron (NM_018227, intron 18 of 32) intron (NM_018227, intron 18 of 32) 60018 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 114-76 chr2 82163306 82163564 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -693368 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 117.25-117 chr2 112791416 112791880 + 0.5 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -6250 NM_000575 3552 Hs.1722 NM_000575 ENSG00000115008 IL1A IL-1A|IL1|IL1-ALPHA|IL1F1 interleukin 1 alpha protein-coding 141.5-76 chr17 82916479 82916789 + 0.5 NA intron (NM_005993, intron 23 of 38) L1MEg|LINE|L1 -76612 NM_024702 79755 Hs.464391 NM_024702 ENSG00000141579 ZNF750 ZFP750 zinc finger protein 750 protein-coding 186-49 chr2 121754057 121754496 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -1269 NR_048556 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 129.75-199 chrX 49800379 49800802 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -28670 NM_001318877 9506 Hs.441038 NM_007003 ENSG00000101951 PAGE4 CT16.7|GAGE-9|GAGEC1|JM-27|JM27|PAGE-1|PAGE-4 PAGE family member 4 protein-coding 140.5-216 chr7 79578495 79579006 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 124790 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 140.25-96 chr2 111084915 111085363 + 0.5 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1PREC2|LINE|L1 30449 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 119.75-37 chr11 118408019 118408386 + 0.5 NA intron (NM_006476, intron 2 of 2) intron (NM_006476, intron 2 of 2) 6596 NM_006476 10632 Hs.486360 NM_006476 ENSG00000167283 ATP5MG ATP5JG|ATP5L ATP synthase membrane subunit g protein-coding 119.25-66 chr15 90883434 90883734 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001143785) promoter-TSS (NM_001143785) -920 NM_001143785 2242 Hs.7636 NM_002005 ENSG00000182511 FES FPS FES proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 192.5-129 chr8 79547786 79548401 + 0.5 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -63024 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 126.25-9 chr1 159615629 159615961 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27969 NM_001639 325 Hs.507080 NM_001639 ENSG00000132703 APCS HEL-S-92n|PTX2|SAP amyloid P component, serum protein-coding 144.5-174 chr5 106831029 106831588 + 0.5 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 179706 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 177.5-146 chr5 123607494 123607960 + 0.5 NA intron (NM_001044723, intron 12 of 12) L1MB7|LINE|L1 62310 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 117.75-34 chr11 88792644 88793023 + 0.5 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 255239 NM_001143831 2915 Hs.147361 NM_000842 ENSG00000168959 GRM5 GPRC1E|MGLUR5|PPP1R86|mGlu5 glutamate metabotropic receptor 5 protein-coding 115.25-60 chr14 53737329 53737699 + 0.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 210970 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 143-150 chr8 124180938 124181337 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9615 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 180.75-59 chr19 36602857 36603454 + 0.5 NA intron (NM_001145650, intron 1 of 4) intron (NM_001145650, intron 1 of 4) 2102 NM_001145650 57711 Hs.654960 NM_020951 ENSG00000186020 ZNF529 - zinc finger protein 529 protein-coding 134.75-136 chr22 34843073 34843588 + 0.5 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 154586 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 137.25-60 chr18 6139907 6140324 + 0.5 NA intron (NM_001365769, intron 13 of 16) intron (NM_001365769, intron 13 of 16) -116629 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-241 chr6 155489406 155489688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25297 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 116.5-128 chr2 158195241 158195592 + 0.5 NA intron (NM_138803, intron 11 of 13) intron (NM_138803, intron 11 of 13) 28766 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-23 chr10 19891294 19891637 + 0.5 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 75033 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 125.5-225 chr7 4468875 4469209 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -213253 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 127.5-31 chr10 74869613 74870021 + 0.5 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) -42969 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 116-59 chr16 30421284 30421608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1687 NR_145731 109616959 NR_145731 ENSG00000199787 SNORA80C - small nucleolar RNA, H/ACA box 80C snoRNA 128.5-121 chr20 13139846 13140251 + 0.5 NA intron (NM_001349945, intron 10 of 12) intron (NM_001349945, intron 10 of 12) -81226 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 118.25-15 chr1 125001069 125001448 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 3482146 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 124.25-45 chr12 102969637 102969960 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11357 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 169.5-177 chr8 124331722 124332206 + 0.5 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) intron (NM_194291, intron 1 of 6) 40735 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 117.75-195 chr7 31380684 31381031 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40131 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 115.25-195 chr8 3281133 3281539 + 0.5 NA intron (NM_033225, intron 26 of 69) AluSx|SINE|Alu -552885 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 125-76 chr2 153161981 153162363 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 316590 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 119.5-199 chr6 62434301 62434579 + 0.5 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -148213 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 135.25-28 chr10 70364373 70364894 + 0.5 NA intron (NR_103468, intron 1 of 2) intron (NR_103468, intron 1 of 2) 12146 NM_001278213 55222 Hs.7778 NM_018205 ENSG00000172731 LRRC20 - leucine rich repeat containing 20 protein-coding 121.75-103 chr20 50556788 50557246 + 0.5 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) MER33|DNA|hAT-Charlie -28769 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 156.5-170 chr7 18665932 18666442 + 0.5 NA intron (NM_001321878, intron 13 of 13) intron (NM_001321878, intron 13 of 13) 156917 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 144.25-207 chr8 118637521 118637877 + 0.5 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -15736 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 128.25-135 chr3 113417520 113417880 + 0.5 NA intron (NR_046728, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 13702 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 173.75-160 chr9 96750893 96751569 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 25410 NR_026792 441455 Hs.229613 NR_026792 LOC441455 - makorin ring finger protein 1 pseudogene pseudo 116.5-237 chr7 116607979 116608384 + 0.5 NA intron (NR_120506, intron 1 of 4) AluSp|SINE|Alu 6639 NR_120506 100996266 Hs.552122 NR_120506 LINC01510 - long intergenic non-protein coding RNA 1510 ncRNA 115.25-221 chr9 31352881 31353196 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 28452 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 153-61 chr17 63055407 63055856 + 0.5 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) intron (NM_025185, intron 2 of 25) 89396 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 133.75-153 chr4 73850523 73850899 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -2585 NM_002620 5197 Hs.72933 NM_002620 ENSG00000109272 PF4V1 CXCL4L1|CXCL4V1|PF4-ALT|PF4A|SCYB4V1 platelet factor 4 variant 1 protein-coding 210.5-40 chr14 88834928 88835571 + 0.5 NA intron (NM_144596, intron 3 of 15) intron (NM_144596, intron 3 of 15) 10598 NM_001366536 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 142.25-33 chr11 106641252 106641560 + 0.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 377070 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 117.5-98 chr2 21184381 21184675 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 60542 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 137-122 chr4 93895503 93895970 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 66983 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 220.75-21 chr12 78877712 78878344 + 0.5 NA intron (NM_001291901, intron 1 of 9) intron (NM_001291901, intron 1 of 9) 13254 NM_001291901 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 181.75-52 chr18 13366260 13366701 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 61054 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 142.25-97 chr2 237358684 237359009 + 0.5 NA intron (NM_057166, intron 17 of 40) L2b|LINE|L2 55318 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 209.25-26 chr12 130987077 130987792 + 0.5 NA intron (NM_198827, intron 6 of 24) intron (NM_198827, intron 6 of 24) 6542 NR_131951 105755954 Hs.677534 NR_131950 ADGRD1-AS1 LACAT8 ADGRD1 antisense RNA 1 ncRNA 128.25-111 chr20 23964587 23965011 + 0.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 22076 NM_178312 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 126.5-61 chr14 54043839 54044156 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87106 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 123-207 chrX 72344578 72344963 + 0.5 NA intron (NR_051952, intron 9 of 9) intron (NR_051952, intron 9 of 9) -37613 NM_001144886 4435 Hs.40403 NM_004143 ENSG00000125931 CITED1 MSG1 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1 protein-coding 132.25-4 chr1 42813757 42814174 + 0.5 NA intron (NM_199342, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -3157 NM_001017922 114625 Hs.439437 NM_018538 ENSG00000164010 ERMAP BTN5|PRO2801|RD|SC erythroblast membrane associated protein (Scianna blood group) protein-coding 119.25-162 chr5 75442040 75442448 + 0.5 NA intron (NM_031361, intron 3 of 16) L1M4c|LINE|L1 69385 NM_031361 10087 Hs.270437 NM_005713 ENSG00000113163 CERT1 CERT|CERTL|COL4A3BP|GPBP|MRD34|STARD11 ceramide transporter 1 protein-coding 162.25-133 chr5 109201105 109201653 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 124990 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 124.75-205 chr8 124277709 124278109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30511 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 119.5-239 chr8 116320764 116321039 + 0.5 NA intron (NR_046215, intron 1 of 13) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 4158 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 122.5-31 chr10 115628705 115629076 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) L1MB5|LINE|L1 535525 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 117.75-209 chr8 81020149 81020505 + 0.5 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 91741 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 113.25-28 chr11 95784169 95784405 + 0.5 NA intron (NM_001330357, intron 4 of 9) L1PA13|LINE|L1 5495 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 115.25-220 chr9 21699579 21699880 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -102907 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 121.25-114 chr20 46539026 46539486 + 0.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 11398 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 112.5-181 chr4 65532931 65533305 + 0.5 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 136370 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 145-68 chr19 50317883 50318430 + 0.5 NA intron (NR_110912, intron 2 of 3) (CTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11221 NM_004977 3748 Hs.467146 NM_004977 ENSG00000131398 KCNC3 KSHIIID|KV3.3|SCA13 potassium voltage-gated channel subfamily C member 3 protein-coding 156.5-200 chr8 140440591 140440974 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 2 of 22) L2b|LINE|L2 16962 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 151.5-25 chr11 37880133 37880644 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -58213 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 141.25-62 chr16 60695657 60696003 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -336037 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 151.25-173 chr7 41608663 41608990 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -85093 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 181-58 chr2 173030696 173031255 + 0.5 NA intron (NM_001282901, intron 20 of 24) intron (NM_001282901, intron 20 of 24) -44871 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 128.5-224 chr8 87831549 87831966 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 42258 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 115-100 chr21 30110707 30111026 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 55939 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 114.25-190 chr8 79015340 79015772 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 178027 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 237.75-5 chr10 16241044 16241603 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -195620 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 133.25-214 chr8 124299501 124299860 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -52282 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 131.5-2 chr1 31856114 31856556 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40284 NM_144569 90853 Hs.62604 NM_144569 ENSG00000134668 SPOCD1 PPP1R146 SPOC domain containing 1 protein-coding 119.25-6 chr1 68214551 68215002 + 0.5 NA intron (NM_024911, intron 1 of 11) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 17747 NM_024911 79971 Hs.647659 NM_024911 ENSG00000116729 WLS C1orf139|EVI|GPR177|MRP|mig-14 Wnt ligand secretion mediator protein-coding 174.25-64 chr16 35625138 35625658 + 0.5 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -118228 NR_034018 100130700 Hs.97712 NR_034018 TP53TG3HP - TP53 target 3 family member H, pseudogene pseudo 144.25-14 chr1 159374260 159374651 + 0.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -23010 NM_001363557 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 146.75-80 chr2 120822835 120823279 + 0.5 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) intron (NM_005270, intron 2 of 13) 30776 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 154.5-53 chr12 125166092 125166515 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -20083 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 135-184 chr8 96207383 96207889 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 27998 NR_045639 7381 Hs.131255 NM_006294 ENSG00000156467 UQCRB MC3DN3|QCR7|QP-C|QPC|UQBC|UQBP|UQCR6|UQPC ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein protein-coding 142.75-96 chr2 68750644 68751211 + 0.5 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) intron (NM_001364821, intron 1 of 10) 15550 NM_001364821 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 158.25-124 chr6 84535839 84536455 + 0.5 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -61218 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 165-51 chr16 46755499 46755862 + 0.5 NA intron (NM_001308301, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR -7336 NM_182493 91807 Hs.130465 NM_182493 ENSG00000140795 MYLK3 MLCK|MLCK2|caMLCK myosin light chain kinase 3 protein-coding 123.5-31 chr10 115450669 115451096 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) L1PA14|LINE|L1 357517 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 147.25-21 chr11 42331712 42332215 + 0.5 NA Intergenic X6A_LINE|LINE|CR1 -78273 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 146.75-59 chr16 79422322 79422796 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 178178 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 167.75-9 chr1 111579976 111580479 + 0.5 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -16224 NM_001081976 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 115-85 chr2 79945241 79945636 + 0.5 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -78855 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 138-25 chr12 67991942 67992241 + 0.5 NA intron (NR_104124, intron 1 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 2646 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 220-2 chr1 68408622 68409396 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 40945 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 124-121 chr4 42597850 42598321 + 0.5 NA intron (NM_001105529, intron 6 of 35) intron (NM_001105529, intron 6 of 35) 59020 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 161.75-48 chr17 14588940 14589535 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 285497 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 131.75-111 chr2 172853772 172854137 + 0.5 NA intron (NM_001100397, intron 1 of 27) L1MEf|LINE|L1 -6084 NM_001282900 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 181.75-130 chr8 122974535 122975201 + 0.5 NA TTS (NM_014943) TTS (NM_014943) 50904 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 131.25-78 chr17 57594927 57595289 + 0.5 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) intron (NM_001322250, intron 7 of 13) 13304 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 133-61 chr16 9946060 9946427 + 0.5 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 235824 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 114.75-117 chr3 2015891 2016291 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -82712 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 167.25-134 chr5 181166433 181167072 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 11809 NM_206880 285659 Hs.553681 NM_206880 ENSG00000182613 OR2V2 OR2V3|OST713 olfactory receptor family 2 subfamily V member 2 protein-coding 127.25-222 chrX 55274345 55274739 + 0.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -5546 NR_130179 100421746 Hs.662612 NR_130179 ENSG00000232765 LOC100421746 - PAGE family member 5 pseudogene pseudo 115-61 chr16 72091534 72091856 + 0.5 NA intron (NM_001142318, intron 1 of 3) L1MC5|LINE|L1 1925 NM_001324354 54957 Hs.134406 NM_017853 ENSG00000140830 TXNL4B DLP|Dim2 thioredoxin like 4B protein-coding 135.5-205 chr8 118560915 118561263 + 0.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -59912 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-88 chr16 75732372 75732730 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6061 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 185.5 chr1 10312293 10312706 + 0.5 NA intron (NM_001365951, intron 22 of 48) L2b|LINE|L2 13533 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 181.5-47 chr15 62258363 62258945 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -9859 NR_136885 255180 Hs.370479 NM_173805 GOLGA2P11 - GOLGA2 pseudogene 11 pseudo 208-52 chr22 48010199 48010744 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -263893 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 121.75-26 chr12 7097162 7097547 + 0.5 NA intron (NM_001297642, intron 5 of 5) AluSq|SINE|Alu -4909 NM_001733 715 Hs.524224 NM_001733 ENSG00000159403 C1R EDSPD1 complement C1r protein-coding 133.5-255 chr8 15573707 15574160 + 0.5 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) intron (NM_001356429, intron 1 of 10) 33670 NM_001356429 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 221.25-91 chr8 107156952 107157732 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 179173 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 165.75-97 chr20 5226440 5226866 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90079 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 123.75-130 chr4 18732955 18733297 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -711251 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 124.5-235 chr8 139971098 139971559 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 129207 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 121.75-81 chr2 88060288 88060655 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4688 NM_001304526 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 112.5-169 chr3 64018892 64019301 + 0.5 NA intron (NM_014814, intron 3 of 7) intron (NM_014814, intron 3 of 7) 4376 NM_001271781 9861 Hs.152536 NM_014814 ENSG00000163636 PSMD6 Rpn7|S10|SGA-113M|p42A|p44S10 proteasome 26S subunit, non-ATPase 6 protein-coding 145.25-18 chr10 129132754 129133257 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 220172 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 116.75-122 chr3 38880058 38880487 + 0.5 NA intron (NM_014139, intron 18 of 25) intron (NM_014139, intron 18 of 25) 70289 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 160.5-154 chr5 154885923 154886349 + 0.5 NA Intergenic LTR10B2|LTR|ERV1 27509 NM_001301075 9337 Hs.26703 NM_004779 ENSG00000155508 CNOT8 CAF1|CALIF|Caf1b|POP2|hCAF1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 protein-coding 123-193 chr8 140760084 140760348 + 0.5 NA intron (NR_148037, intron 19 of 34) AluSc|SINE|Alu -27563 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 143.75-197 chr9 31939362 31939770 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -445037 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 157.25-152 chr8 96643433 96644019 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1516 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 118.5-218 chr8 89407731 89408016 + 0.5 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 349838 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 117.5-214 chr7 23769213 23769579 + 0.5 NA intron (NM_031414, intron 12 of 23) intron (NM_031414, intron 12 of 23) 59177 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 193.5-100 chr21 25488683 25489193 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57237 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 131-132 chr5 5555019 5555423 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132544 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 120-63 chr16 68837924 68838286 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -5426 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 123.75-73 chr16 84533900 84534331 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -29456 NM_020947 57707 Hs.288274 NM_020947 ENSG00000140950 MEAK7 KIAA1609|TLDC1|mEAK-7 MTOR associated protein, eak-7 homolog protein-coding 113.5-31 chr10 20665079 20665475 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113307 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 124-131 chr5 31286798 31287146 + 0.5 NA intron (NM_001362435, intron 2 of 10) L2b|LINE|L2 93286 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 138.75-76 chr18 420644 421037 + 0.5 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) MER74B|LTR|ERVL 79861 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 128.75-194 chr8 38266443 38266748 + 0.5 NA TTS (NR_148894) TTS (NR_148894) 2625 NM_032483 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 115-16 chr10 48480403 48480785 + 0.5 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) intron (NR_144642, intron 3 of 9) 13056 NM_001256026 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 131-108 chr20 40034050 40034438 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 29783 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 137.75-90 chr18 6505519 6506009 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5652 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 126-152 chr6 40128757 40129255 + 0.5 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -194544 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 115.5-150 chr20 16510033 16510424 + 0.5 NA intron (NM_001199866, intron 6 of 22) intron (NM_001199866, intron 6 of 22) 63220 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 171-77 chr2 231810270 231810790 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 24085 NM_001282950 64708 Hs.335061 NM_022730 ENSG00000144524 COPS7B CSN7B|SGN7b COP9 signalosome subunit 7B protein-coding 144.75-190 chr8 140190807 140191307 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -90522 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 162.75-131 chr7 27315137 27315654 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68166 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 129-68 chr14 75698721 75699064 + 0.5 NA intron (NM_015072, intron 6 of 31) AluJr|SINE|Alu 37646 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 175.75-60 chr18 57293865 57294471 + 0.5 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -58389 NM_015879 51046 Hs.23172 NM_015879 ENSG00000177511 ST8SIA3 SIAT8C|ST8SiaIII ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 protein-coding 124.5-13 chr1 114092214 114092622 + 0.5 NA intron (NM_001366226, intron 6 of 6) intron (NM_001366226, intron 6 of 6) 60022 NM_205848 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 129.5-213 chr7 44644907 44645234 + 0.5 NA intron (NM_002541, intron 2 of 22) intron (NM_002541, intron 2 of 22) 38443 NM_001003941 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 173.5-38 chr14 42502526 42503029 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 895921 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 138-35 chr13 102782781 102783119 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -9129 NR_104590 93081 Hs.398111 NM_138779 ENSG00000151287 TEX30 C13orf27 testis expressed 30 protein-coding 131.25-210 chr8 136181112 136181424 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -349530 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 122-159 chr6 94658947 94659372 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 918292 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 169.25-103 chr5 175044388 175045046 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -48986 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 135.75-187 chr7 112311114 112311593 + 0.5 NA intron (NM_021994, intron 4 of 11) intron (NM_021994, intron 4 of 11) 104658 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 123.25-175 chr6 75873396 75873708 + 0.5 NA intron (NM_001300899, intron 20 of 32) FLAM_A|SINE|Alu 124313 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 140.75-141 chr5 31117006 31117362 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -76502 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 158.75-109 chr3 16594107 16594665 + 0.5 NA intron (NM_001351, intron 8 of 10) intron (NM_001351, intron 8 of 10) 10404 NM_001190811 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 174.75-145 chr9 105367201 105367758 + 0.5 NA intron (NM_001330731, intron 12 of 15) intron (NM_001330731, intron 12 of 15) -80555 NM_031919 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 135.75-4 chr1 43534403 43534731 + 0.5 NA intron (NM_002840, intron 1 of 33) L2|LINE|L2 3684 NM_002840 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 115.25-219 chr9 6755394 6755650 + 0.5 NA intron (NM_001146696, intron 1 of 17) AluSz6|SINE|Alu -1828 NR_130707 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 121-125 chr3 11548313 11548690 + 0.5 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) intron (NM_001349238, intron 17 of 17) 20297 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 180.5-55 chr16 74131033 74131553 + 0.5 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 84228 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 134-12 chr1 209230122 209230580 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95105 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 154.75-56 chr17 57523451 57524039 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110808) promoter-TSS (NR_110808) -148 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 119.75-189 chr6 154760702 154760998 + 0.5 NA intron (NM_001286189, intron 3 of 21) AluJr|SINE|Alu 27472 NM_014892 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 130.75-46 chr12 119322459 119322888 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -12056 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 153.75-6 chr1 112623895 112624468 + 0.5 NA intron (NM_006135, intron 1 of 9) intron (NM_006135, intron 1 of 9) 4349 NM_006135 829 Hs.744974 NM_006135 ENSG00000116489 CAPZA1 CAPPA1|CAPZ|CAZ1 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1 protein-coding 161.75-35 chr12 123293252 123293600 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001167856, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_001167856, exon 32 of 32) -21186 NR_073007 8099 Hs.433201 NM_004642 ENSG00000111328 CDK2AP1 DOC1|DORC1|ST19|doc-1|p12DOC-1 cyclin dependent kinase 2 associated protein 1 protein-coding 135.75-132 chr3 30257611 30258059 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -261033 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 114-48 chr15 23550235 23550601 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 11713 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 138.25-150 chr6 68770772 68771151 + 0.5 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 135679 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 153.25-4 chr1 77962180 77962647 + 0.5 NA intron (NM_003902, intron 14 of 19) intron (NM_003902, intron 14 of 19) 16659 NR_146539 8880 Hs.567380 NM_003902 ENSG00000162613 FUBP1 FBP|FUBP|hDH V far upstream element binding protein 1 protein-coding 148.75-48 chr13 74104618 74104943 + 0.5 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) intron (NM_007249, intron 1 of 7) 29149 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 124-173 chr8 133628038 133628443 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 55826 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 129.25-34 chr11 114962310 114962627 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 283941 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 128-104 chr3 112998069 112998462 + 0.5 NA intron (NM_014170, intron 4 of 5) MER21A|LTR|ERVL 7281 NM_014170 29083 Hs.127496 NM_014170 ENSG00000163607 GTPBP8 HSPC135 GTP binding protein 8 (putative) protein-coding 148.75-84 chr2 63190649 63191057 + 0.5 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) intron (NR_148705, intron 13 of 16) -71311 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 159.25-163 chr9 100842742 100843303 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -185705 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 150.5-73 chr18 57912354 57912728 + 0.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -109226 NM_005603 5205 Hs.216623 NM_005603 ENSG00000081923 ATP8B1 ATPIC|BRIC|FIC1|ICP1|PFIC|PFIC1 ATPase phospholipid transporting 8B1 protein-coding 180.5-139 chr7 40462467 40462861 + 0.5 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) L2a|LINE|L2 327688 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 118.75-182 chr7 79007651 79008009 + 0.5 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -1158 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 145-65 chr17 74547882 74548304 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1978 NM_006678 10871 Hs.2605 NM_006678 ENSG00000167850 CD300C CLM-6|CMRF-35|CMRF-35A|CMRF35|CMRF35-A1|CMRF35A|CMRF35A1|IGSF16|LIR CD300c molecule protein-coding 113.75-198 chr8 132496594 132496947 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -15675 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 116.5-178 chr4 63934088 63934373 + 0.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 475220 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 114.25-60 chr14 82495292 82495646 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -147163 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 126.5-14 chr1 157262318 157262668 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -123902 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 142.5-121 chr20 9326426 9326922 + 0.5 NA intron (NM_000933, intron 1 of 35) intron (NM_000933, intron 1 of 35) 18874 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 123.75-106 chr21 26311747 26312063 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -81730 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 179.75-5 chr1 97129083 97129629 + 0.5 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) AluSx3|SINE|Alu 33433 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 149.25-2 chr1 30090857 30091350 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53491 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 134.5-230 chr8 122499999 122500384 + 0.5 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 68453 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 138.25-113 chr3 32777021 32777448 + 0.5 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -40763 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 133.25-116 chr2 228124734 228125080 + 0.5 NA intron (NM_030623, intron 2 of 10) intron (NM_030623, intron 2 of 10) 56738 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 122.75-93 chr2 77564444 77564689 + 0.5 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -42133 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 128-153 chr7 83757030 83757332 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -108042 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 155.25-93 chr2 79514186 79514693 + 0.5 NA intron (NM_001164883, intron 1 of 16) intron (NM_001164883, intron 1 of 16) 1505 NM_001164883 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 168-97 chr5 22437629 22438035 + 0.5 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -223982 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 213.25-4 chr1 152810615 152811304 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1012 NM_178349 353132 Hs.375103 NM_178349 ENSG00000196734 LCE1B LEP2|SPRL2A late cornified envelope 1B protein-coding 126.75-49 chr14 35439577 35440053 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35061 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 212.75-106 chrX 103647822 103648519 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 19195 NM_004780 9338 Hs.95243 NM_004780 ENSG00000172465 TCEAL1 SIIR|WEX9|p21|pp21 transcription elongation factor A like 1 protein-coding 122-71 chr17 50329654 50330109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16245 NR_110010 64132 Hs.463416 NM_022167 ENSG00000015532 XYLT2 PXYLT2|SOS|XT-II|XT2|xylT-II xylosyltransferase 2 protein-coding 120-202 chr9 112923611 112923937 + 0.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -32898 NM_033051 57864 Hs.512668 NM_033051 ENSG00000119457 SLC46A2 Ly110|TSCOT solute carrier family 46 member 2 protein-coding 172.75-49 chr17 62385133 62385717 + 0.5 NA intron (NM_001144933, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu 4872 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 134.5-29 chr10 73521728 73522073 + 0.5 NA intron (NM_001320437, intron 15 of 21) intron (NM_001320437, intron 15 of 21) -25876 NM_021132 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 134.75-39 chr11 30272835 30273283 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 42045 NM_000510 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 132.75-53 chr13 80620588 80620942 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -279639 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 132.5-180 chr4 74234829 74235262 + 0.5 NA intron (NM_001144978, intron 6 of 7) intron (NM_001144978, intron 6 of 7) -73425 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 116.25-251 chrX 56170830 56171118 + 0.5 NA intron (NM_001324104, intron 2 of 6) L1MA3|LINE|L1 -61382 NM_007250 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 119.5-49 chr11 94934173 94934604 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 39168 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 113.75-145 chr5 5572685 5572998 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 150164 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 138.5-180 chr7 13150591 13150916 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 463120 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 129.75-143 chr5 34044725 34045164 + 0.5 NA intron (NR_146599, intron 7 of 11) intron (NR_146599, intron 7 of 11) -1731 NM_181435 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 152-115 chr4 92527022 92527545 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 222884 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 121.25-22 chr10 58822700 58823126 + 0.5 NA intron (NM_001080512, intron 20 of 20) intron (NM_001080512, intron 20 of 20) 107898 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 130-160 chr7 132751533 132751863 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -7272 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 125.75-130 chr3 124105670 124106018 + 0.5 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 11137 NM_001322992 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 141.25-150 chr5 170022025 170022471 + 0.5 NA intron (NR_156756, intron 34 of 52) intron (NR_156756, intron 34 of 52) -6240 NR_039609 100616498 NR_039609 ENSG00000263831 MIR378E mir-378e microRNA 378e ncRNA 115-55 chr15 57620849 57621169 + 0.5 NA intron (NM_001018100, intron 3 of 12) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 29105 NR_104371 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 198.25-3 chr1 67816945 67817495 + 0.5 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 -15068 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 207.75-79 chr3 113631340 113631910 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 36749 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 173.25-140 chr9 38258342 38258837 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -134113 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 122.5-14 chr1 166454091 166454513 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 35737 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 144.75-36 chr12 5122895 5123320 + 0.5 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL 79228 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 200-18 chr11 93869767 93870331 + 0.5 NA Intergenic MER48|LTR|ERV1 -19431 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 127.5-160 chr3 186727378 186727675 + 0.5 NA intron (NM_001102416, intron 5 of 9) intron (NM_001102416, intron 5 of 9) 10167 NM_000893 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 119-156 chr5 159007142 159007532 + 0.5 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 90619 NM_001364157 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 117.75-66 chr15 62889091 62889433 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 65305 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 159-72 chr4 31922641 31923025 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -74546 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 158.75-144 chr6 34903870 34904405 + 0.5 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) MER2|DNA|TcMar-Tigger 14882 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 112.25-48 chr12 96220017 96220308 + 0.5 NA intron (NM_005230, intron 1 of 4) intron (NM_005230, intron 1 of 4) 25787 NM_005230 2004 Hs.46523 NM_005230 ENSG00000111145 ELK3 ERP|NET|SAP-2|SAP2 ETS transcription factor ELK3 protein-coding 117-167 chr7 1458062 1458470 + 0.5 NA intron (NM_182924, intron 1 of 16) intron (NM_182924, intron 1 of 16) 1204 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 116.5-145 chr21 32042148 32042425 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 44009 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 120.5-172 chr5 3932703 3933049 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 337044 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 135-175 chr8 5040977 5041460 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46304 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 172.75-62 chr2 105123904 105124456 + 0.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -19933 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 126-17 chr10 34274588 34274957 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 19 of 22) intron (NM_001184789, intron 19 of 22) -502092 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 130-128 chr5 56098490 56098894 + 0.5 NA TTS (NM_024669) TTS (NM_024669) 103525 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 123.5-15 chr1 219658685 219659026 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45710 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 129.25-101 chr2 182749744 182750160 + 0.5 NA intron (NR_073367, intron 12 of 22) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 33695 NM_018981 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 116.5-57 chr13 72397799 72398230 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 329615 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 136.5-156 chr3 186336753 186337102 + 0.5 NA intron (NM_001346, intron 1 of 24) L1M5|LINE|L1 25307 NM_001346 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 144.25-57 chr14 63179440 63179934 + 0.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -24756 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 175.75-64 chr2 16835515 16836077 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -169962 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 112.5-27 chr10 101109282 101109718 + 0.5 NA intron (NR_130723, intron 2 of 2) intron (NR_130723, intron 2 of 2) 21646 NR_130723 100038246 Hs.368784 NM_001085398 ENSG00000236311 TLX1NB APT-B7|TD1|TDI TLX1 neighbor ncRNA 134.75-29 chr10 84193491 84193921 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001171971) promoter-TSS (NM_001171971) -831 NM_001171971 92211 Hs.137556 NM_033100 ENSG00000148600 CDHR1 CORD15|PCDH21|PRCAD|RP65 cadherin related family member 1 protein-coding 127.5-164 chr4 42470944 42471328 + 0.5 NA intron (NM_001105529, intron 24 of 35) intron (NM_001105529, intron 24 of 35) 73648 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 133-155 chr7 37893697 37894109 + 0.5 NA intron (NM_016616, intron 15 of 17) intron (NM_016616, intron 15 of 17) 22914 NM_003014 6424 Hs.658169 NM_003014 ENSG00000106483 SFRP4 FRP-4|FRPHE|FRZB-2|PYL|sFRP-4 secreted frizzled related protein 4 protein-coding 211.25-72 chr5 36996264 36996800 + 0.5 NA intron (NM_015384, intron 11 of 45) intron (NM_015384, intron 11 of 45) 119763 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 134.75-36 chr10 124810238 124810595 + 0.5 NA intron (NM_032182, intron 2 of 8) AluJr4|SINE|Alu 8597 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 119.25-136 chr3 144450713 144451135 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 477843 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 112.5-241 chr9 33309788 33310153 + 0.5 NA intron (NM_002504, intron 5 of 23) intron (NM_002504, intron 5 of 23) 19454 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 172.5-30 chr10 62914653 62915082 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95700 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 150.5-64 chr16 85917065 85917656 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_106832) promoter-TSS (NR_106832) -987 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 114.5-100 chr15 46276738 46277165 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 571756 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 133.5-56 chr11 107878652 107879094 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -20086 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 125.75-122 chr22 35148759 35149234 + 0.5 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) intron (NR_126356, intron 4 of 5) 82060 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 124-2 chr1 29864143 29864551 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 173265 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 123-31 chr11 27914915 27915283 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -141716 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 147.75-50 chr17 32657476 32657925 + 0.5 NA intron (NM_015194, intron 17 of 21) L2a|LINE|L2 170707 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 117.5-160 chr4 84169680 84169938 + 0.5 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 129360 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 168.5-179 chr8 66306225 66306741 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 114369 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 125.5-251 chr8 83210112 83210418 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -193493 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 266-26 chr20 52942663 52943353 + 0.5 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -29350 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 137.5-20 chr1 217217795 217218162 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80276 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 139.25-3 chr1 66284477 66284987 + 0.5 NA intron (NM_001037340, intron 5 of 14) intron (NM_001037340, intron 5 of 14) -47376 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 135.25-184 chr6 159744097 159744448 + 0.5 NA intron (NM_152857, intron 5 of 5) intron (NM_152857, intron 5 of 5) 16766 NM_001270531 9589 Hs.446091 NM_004906 ENSG00000146457 WTAP Mum2 WT1 associated protein protein-coding 143-73 chr2 58018894 58019259 + 0.5 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 -27566 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 155.5-130 chr3 104146812 104147304 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -622942 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 117.75-17 chr1 203621278 203621675 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5311 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 134.75-115 chr2 154004610 154004998 + 0.5 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) intron (NM_052917, intron 3 of 12) 60410 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 113.75-98 chr2 61141140 61141522 + 0.5 NA TTS (NR_036496) TTS (NR_036496) 3644 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 115-69 chr17 68749782 68750129 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 121801 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 128.25-91 chr2 30089829 30090178 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57004 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 191.75-42 chr15 91549621 91550250 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 86596 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 159-74 chr4 47662051 47662460 + 0.5 NA intron (NM_006587, intron 11 of 21) intron (NM_006587, intron 11 of 21) 9586 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 113-139 chr5 3772762 3773085 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 177091 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 114.75-8 chr1 94119788 94120133 + 0.5 NA intron (NM_000350, intron 1 of 49) intron (NM_000350, intron 1 of 49) 1188 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 141.25-93 chr2 216098027 216098496 + 0.5 NA intron (NM_138390, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -11087 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 131.25-45 chr13 37677656 37678093 + 0.5 NA intron (NM_001354806, intron 3 of 9) L1MEc|LINE|L1 -79030 NM_001286666 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 157.75-64 chr16 83131010 83131388 + 0.5 NA intron (NM_001220490, intron 3 of 12) (C)n|Simple_repeat|Simple_repeat -140901 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 134.25-157 chr6 74933757 74934135 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 194836 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 155.75-26 chr10 119757149 119757706 + 0.5 NA intron (NM_014937, intron 2 of 19) intron (NM_014937, intron 2 of 19) 31377 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 192.75-32 chr14 56492629 56493160 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21437 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 126-125 chr4 42754421 42754719 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -97465 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 171.25-4 chr1 105232298 105232827 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 386373 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 133-47 chr14 52995561 52995999 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44683 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 162.25-117 chr4 122805488 122805975 + 0.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -20977 NM_002006 2247 Hs.284244 NM_002006 ENSG00000138685 FGF2 BFGF|FGF-2|FGFB|HBGF-2 fibroblast growth factor 2 protein-coding 125.25-92 chr2 14399960 14400270 + 0.5 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 843 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 171-103 chr4 52011947 52012452 + 0.5 NA intron (NM_001024611, intron 2 of 4) AluSx1|SINE|Alu 8164 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 115.75-23 chr10 112693472 112693771 + 0.5 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 59451 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 155.25-28 chr10 89038204 89038625 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -24922 NR_039826 100616128 NR_039826 ENSG00000283664 MIR4679-1 - microRNA 4679-1 ncRNA 127-128 chr4 113774625 113775020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12895 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 139-158 chrUn_KI270516v1 416 849 + 0.5 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 158.75-50 chr14 20594752 20595144 + 0.5 NA intron (NR_122043, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 -4125 NM_001024822 493901 Hs.729466 NM_001024822 ENSG00000258436 RNASE12 HEL-S-85p|RAI1 ribonuclease A family member 12 (inactive) protein-coding 131.25-139 chr3 102354619 102355056 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -80178 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 113.75-102 chr2 124387278 124387584 + 0.5 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) LTR7B|LTR|ERV1 362144 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 129.75-179 chr8 30181048 30181463 + 0.5 NA intron (NM_006571, intron 6 of 6) intron (NM_006571, intron 6 of 6) 24886 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 127.5-226 chr7 43418607 43418946 + 0.5 NA intron (NM_001287059, intron 7 of 27) L1MEf|LINE|L1 103766 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 134.75-139 chr3 31193063 31193531 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -31510 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 126.5-76 chr15 62752275 62752767 + 0.5 NA intron (NM_015059, intron 32 of 55) intron (NM_015059, intron 32 of 55) -71436 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 142.75-173 chr7 32259105 32259535 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 40008 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 116-13 chr10 44930810 44931095 + 0.5 NA intron (NM_001123376, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 19615 NM_001123376 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 287.75-41 chr5 61706212 61707279 + 0.5 NA TTS (NR_126523) TTS (NR_126523) -8313 NR_109910 101928651 Hs.662309 NR_109910 ENSG00000248529 LOC101928651 - uncharacterized LOC101928651 ncRNA 119.75-88 chr19 40431450 40431783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5624 NM_013376 29950 Hs.269898 NM_013376 ENSG00000197019 SERTAD1 SEI1|TRIP-Br1|TRIPBR1 SERTA domain containing 1 protein-coding 120.25-68 chr16 7679378 7679790 + 0.5 NA intron (NM_145892, intron 11 of 12) intron (NM_145892, intron 11 of 12) 346739 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 161.5-151 chr5 6408107 6408510 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29761 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 209.75-19 chr12 14774784 14775409 + 0.5 NA 3' UTR (NM_177925, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_177925, exon 1 of 1) 760 NR_027716 55766 Hs.524280 NM_018267 ENSG00000246705 H2AFJ H2AJ H2A histone family member J protein-coding 143.75-109 chr3 5473974 5474392 + 0.5 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -223928 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 131.25-140 chr3 103525291 103525612 + 0.5 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -1335 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 120.25-52 chr13 21977059 21977397 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -99068 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 117.75-51 chr13 53007466 53007918 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21121 NM_006418 10562 Hs.508113 NM_006418 ENSG00000102837 OLFM4 GC1|GW112|OLM4|OlfD|UNQ362|bA209J19.1|hGC-1|hOLfD olfactomedin 4 protein-coding 139.25-194 chr8 57378997 57379547 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35485 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 173.25-13 chr1 213777833 213778294 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -146686 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 171-54 chr17 69040903 69041398 + 0.5 NA intron (NM_080283, intron 6 of 38) intron (NM_080283, intron 6 of 38) 19777 NM_080283 10350 Hs.131686 NM_080283 ENSG00000154258 ABCA9 EST640918 ATP binding cassette subfamily A member 9 protein-coding 112.5-131 chr2 176557377 176557808 + 0.5 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 43460 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 118.75-140 chr4 113283376 113283791 + 0.5 NA intron (NM_001354275, intron 19 of 43) intron (NM_001354275, intron 19 of 43) -9256 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 141.5-186 chr5 146266468 146266914 + 0.5 NA intron (NM_018989, intron 14 of 20) AluJb|SINE|Alu 63086 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 147-57 chr17 81237953 81238275 + 0.5 NA intron (NM_144679, intron 1 of 11) intron (NM_144679, intron 1 of 11) 941 NM_144679 146705 Hs.631761 NM_144679 ENSG00000167302 TEPSIN C17orf56|ENTHD2 TEPSIN adaptor related protein complex 4 accessory protein protein-coding 159.5-210 chr8 123473503 123473983 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56969 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 127.5-181 chr4 180656575 180657079 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 502322 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 149.75-159 chr7 125885719 125886160 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -621648 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 115.5-252 chr9 36123796 36124097 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001316345, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_001316345, exon 23 of 23) -12590 NR_104640 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 118-3 chr1 67714125 67714578 + 0.5 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 29150 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 121.75-58 chr17 8639941 8640265 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9342 NM_001256095 4628 Hs.16355 NM_005964 ENSG00000133026 MYH10 NMMHC-IIB|NMMHCB myosin heavy chain 10 protein-coding 164.25-9 chr1 159085882 159086458 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9269 NM_001348247 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 120.25-186 chr6 93531533 93531883 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -112126 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 178.75-36 chr17 29317665 29318350 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -23859 NM_020772 57532 Hs.462598 NM_020772 ENSG00000108256 NUFIP2 182-FIP|82-FIP|FIP-82|PIG1 nuclear FMR1 interacting protein 2 protein-coding 121-38 chr11 42854963 42855304 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 414236 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 148.5-124 chr20 38485066 38485440 + 0.5 NA intron (NM_020336, intron 1 of 29) MER20B|DNA|hAT-Charlie 12410 NM_001282917 57148 Hs.598850 NM_020336 ENSG00000170471 RALGAPB KIAA1219|RalGAPbeta Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit protein-coding 119.25-215 chr9 7908332 7908807 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -108791 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 141.25-122 chr4 74347215 74347661 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -17707 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 135.75-150 chr3 148476848 148477363 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 196214 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 126.75-170 chr4 57642427 57642759 + 0.5 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 216721 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 174.25-23 chr11 67160852 67161501 + 0.5 NA intron (NR_027473, intron 2 of 20) AluJr|SINE|Alu 41913 NR_027473 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 127.75-55 chr12 63802551 63803044 + 0.5 NA intron (NM_014254, intron 4 of 5) intron (NM_014254, intron 4 of 5) 19359 NR_126167 104169670 Hs.735874 NR_126167 ENSG00000255850 RXYLT1-AS1 TMEM5-AS1 RXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 126-33 chr11 91023595 91024080 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -154635 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 184.75-17 chr11 77764528 77765108 + 0.5 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) intron (NM_016578, intron 1 of 15) 56016 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 134.25-5 chr1 47498541 47498933 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -61420 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 164.75-75 chr2 79822803 79823374 + 0.5 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 43495 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 125.5-250 chr8 80847109 80847574 + 0.5 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) L1MD2|LINE|L1 27127 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 113.75-71 chr15 71468636 71468992 + 0.5 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -78422 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 146.5-88 chr18 4547841 4548179 + 0.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -92703 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 115.5-5 chr1 69278488 69278856 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -154583 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 213.5-78 chr3 107405091 107405781 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23277 NR_126332 101929579 Hs.552750 NR_126332 LOC101929579 - uncharacterized LOC101929579 ncRNA 121-151 chr5 9122623 9122976 + 0.5 NA exon (NM_003966, exon 14 of 23) exon (NM_003966, exon 14 of 23) -68904 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 129-159 chr6 154886232 154886693 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 33102 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 130.25-109 chr2 186138506 186138828 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52350 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 128.25-47 chr13 113049216 113049605 + 0.5 NA intron (NM_001366646, intron 2 of 27) intron (NM_001366646, intron 2 of 27) 4764 NM_001366645 23263 Hs.170422 NM_024979 ENSG00000126217 MCF2L ARHGEF14|DBS|OST MCF.2 cell line derived transforming sequence like protein-coding 130.25-20 chr1 216737050 216737506 + 0.5 NA intron (NM_001243513, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR -13806 NM_001243519 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 115-72 chr18 2897264 2897558 + 0.5 NA intron (NM_032048, intron 4 of 7) intron (NM_032048, intron 4 of 7) 49212 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 140-143 chr5 142943084 142943380 + 0.5 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) intron (NR_146198, intron 11 of 22) -74322 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 118.75-121 chr22 35282147 35282599 + 0.5 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) AluY|SINE|Alu -16902 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 114.5-128 chr2 26871388 26871672 + 0.5 NA intron (NM_001253724, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 23106 NM_001253724 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 161.75-89 chr3 114261475 114261929 + 0.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -24124 NM_007136 7634 Hs.271079 NM_007136 ENSG00000174255 ZNF80 pT17 zinc finger protein 80 protein-coding 138.75-152 chr5 98268963 98269473 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -107979 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 114.75-209 chr9 135049908 135050332 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25385 NM_006334 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 172.75-23 chr11 107012569 107013056 + 0.5 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) intron (NM_001256424, intron 1 of 8) 5664 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 144.25-193 chr7 99094812 99095103 + 0.5 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) intron (NM_020429, intron 1 of 18) 49151 NM_020429 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 137-44 chr12 68008846 68009340 + 0.5 NA intron (NR_104125, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 19648 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 170.75-48 chr16 83312770 83313357 + 0.5 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) intron (NM_001220489, intron 4 of 12) -195283 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 114-63 chr18 33131472 33131851 + 0.5 NA intron (NM_001308126, intron 20 of 23) intron (NM_001308126, intron 20 of 23) 308910 NM_001371121 112.75-94 chr2 83209435 83209715 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -313239 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 129-12 chr1 186709983 186710361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 29518 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 129.25-117 chr22 43592550 43592941 + 0.5 NA intron (NM_198856, intron 21 of 29) intron (NM_198856, intron 21 of 29) 76491 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 131.25-19 chr1 238741011 238741469 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -255223 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 131.5-245 chr9 28178754 28179169 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 540344 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 169.75-94 chr20 54610203 54610644 + 0.5 NA exon (NM_177959, exon 6 of 8) exon (NM_177959, exon 6 of 8) 134830 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 160-4 chr1 52250286 52250839 + 0.5 NA intron (NM_007324, intron 4 of 17) L1MB3|LINE|L1 108468 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 137-65 chr17 72820788 72821132 + 0.5 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -180488 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 154.25-103 chr3 37244854 37245206 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_149029) promoter-TSS (NR_149029) -835 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 124.25-135 chr3 90471276 90471577 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1363805 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 114.75-85 chr2 42178192 42178513 + 0.5 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) AluJr|SINE|Alu -8121 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 157.75-24 chr10 115745690 115746122 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) intron (NM_207303, intron 27 of 28) 448883 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 143.25-132 chr4 46783643 46783980 + 0.5 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) intron (NM_130902, intron 2 of 2) 125434 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 113.5-194 chr5 65988276 65988550 + 0.5 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) intron (NM_001253697, intron 1 of 25) -42840 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 153.75-94 chr3 117588535 117589064 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102126 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 116.5-270 chrX 42391307 42391758 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 386631 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 169.75-4 chr1 84455670 84456137 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23363 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 115.25-121 chr21 20352275 20352576 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93740 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 124.75-92 chr16 6220066 6220329 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 200494 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 147.75-148 chr7 108246847 108247425 + 0.5 NA intron (NM_001371133, intron 3 of 28) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -3751 NM_001371181 165.5-36 chr12 124205128 124205698 + 0.5 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -83751 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 117.5-43 chr11 64371660 64372063 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001300802, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001300802, exon 17 of 17) 3259 NR_031602 100302280 NR_031602 ENSG00000221273 MIR1237 MIRN1237|hsa-mir-1237 microRNA 1237 ncRNA 123.25-94 chr2 40106704 40107144 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001112802, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001112802, exon 8 of 8) 189290 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 138.25-57 chr16 11547783 11548173 + 0.5 NA non-coding (NR_024320, exon 4 of 4) non-coding (NR_024320, exon 4 of 4) -20731 NM_001370704 400499 Hs.459937 NM_001370704 ENSG00000188897 LOC400499 - putative uncharacterized protein LOC400499 protein-coding 150.25-171 chrX 108120523 108120873 + 0.5 NA intron (NM_001321287, intron 1 of 13) intron (NM_001321287, intron 1 of 13) 28920 NM_052936 115201 Hs.8763 NM_052936 ENSG00000101844 ATG4A APG4A|AUTL2 autophagy related 4A cysteine peptidase protein-coding 113.25-126 chr4 150323422 150323808 + 0.5 NA intron (NM_001367550, intron 49 of 56) intron (NM_001367550, intron 49 of 56) 245170 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 117.25-50 chr12 8970722 8971183 + 0.5 NA intron (NR_137427, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 -18594 NM_005810 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 112.75-186 chr7 42735012 42735370 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -28744 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 126-112 chr22 27414637 27415015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 104175 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 214.75-39 chr2 72743506 72744141 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 82210 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 116.75-179 chr7 3079969 3080359 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -36297 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 166.25-39 chr12 12997909 12998406 + 0.5 NA intron (NM_015987, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 2108 NM_015987 50865 Hs.642618 NM_015987 ENSG00000013583 HEBP1 HBP|HEBP heme binding protein 1 protein-coding 144.75-89 chr2 123967828 123968310 + 0.5 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? 57105 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 151.75-139 chr7 45698191 45698709 + 0.5 NA intron (NM_021116, intron 14 of 19) intron (NM_021116, intron 14 of 19) 70568 NR_024271 641977 Hs.723477 NR_024271 ENSG00000214765 SEPTIN7P2 SEPT13|SEPT7B|SEPT7P2 septin 7 pseudogene 2 pseudo 138.75-171 chr7 22955749 22956166 + 0.5 NA intron (NM_001363467, intron 10 of 11) intron (NM_001363467, intron 10 of 11) 58173 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 137.5-55 chr12 73185226 73185557 + 0.5 NA intron (NR_110130, intron 2 of 3) L1PA10|LINE|L1 26201 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 120.25-162 chr5 58314511 58314912 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 145375 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 121-81 chr17 58461364 58461706 + 0.5 NA intron (NM_001080439, intron 4 of 5) intron (NM_001080439, intron 4 of 5) 26873 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 117.5-52 chr12 114284296 114284678 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42717 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 161.5-202 chrX 102928668 102929251 + 0.5 NA intron (NR_146589, intron 10 of 11) intron (NR_146589, intron 10 of 11) -8313 NM_001031834 282808 Hs.449517 NM_001031834 ENSG00000102128 RAB40AL MRXSMP|RAR2|RLGP RAB40A like protein-coding 118.75-146 chr5 32296188 32296528 + 0.5 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 16581 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 112.5-105 chr19 55873394 55873772 + 0.5 NA intron (NM_134444, intron 7 of 9) L1MB5|LINE|L1 -36821 NM_145007 204801 Hs.375039 NM_145007 ENSG00000179873 NLRP11 CLR19.6|NALP11|NOD17|PAN10|PYPAF6|PYPAF7 NLR family pyrin domain containing 11 protein-coding 149-139 chr9 34630051 34630551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2287 NM_001017363 138715 Hs.534549 NM_001017363 ENSG00000205143 ARID3C - AT-rich interaction domain 3C protein-coding 124.75-216 chr9 85404908 85405198 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 336976 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 139.25-176 chr7 41644170 41644628 + 0.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -49520 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 130.75-76 chr18 531426 531927 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -16382 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 135.5-89 chr18 35945164 35945634 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11257 NR_037497 100500864 NR_037497 ENSG00000265641 MIR3929 - microRNA 3929 ncRNA 115-26 chr11 10040193 10040527 + 0.5 NA intron (NM_030962, intron 3 of 39) L1MC4|LINE|L1 201218 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 150.25-108 chr3 193900652 193901186 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56910 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 159.75-31 chr12 12970427 12970784 + 0.5 NA intron (NR_149063, intron 2 of 3) intron (NR_149063, intron 2 of 3) -9232 NR_038920 100506314 Hs.127718 NR_038920 ENSG00000247498 GPRC5D-AS1 - GPRC5D and HEBP1 antisense RNA 1 ncRNA 146.5-124 chr20 31346234 31346717 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22126 NM_054112 117285 Hs.274124 NM_054112 ENSG00000131068 DEFB118 C20orf63|DEFB-18|ESC42|ESP13.6 defensin beta 118 protein-coding 118.75-213 chr9 108776727 108777069 + 0.5 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 79088 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 179.25-81 chr2 171717862 171718360 + 0.5 NA intron (NM_001271787, intron 5 of 15) AluSz6|SINE|Alu 30356 NM_001271787 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 118-16 chr10 67854774 67855186 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16792 NM_021800 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 122.75-25 chr10 91836754 91837204 + 0.5 NA exon (NM_025235, exon 13 of 27) exon (NM_025235, exon 13 of 27) 38553 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 175.25-18 chr10 29682544 29683116 + 0.5 NA intron (NM_001323599, intron 2 of 38) intron (NM_001323599, intron 2 of 38) -47859 NM_021738 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 181.25-108 chr6 46725720 46726326 + 0.5 NA intron (NM_001168357, intron 1 of 11) MER39B|LTR|ERV1 9352 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 125.5-32 chr10 91628946 91629208 + 0.5 NA 3' UTR (NM_005398, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_005398, exon 2 of 2) 3994 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 153.25-86 chr3 14916261 14916602 + 0.5 NA intron (NM_152536, intron 11 of 19) L2b|LINE|L2 31074 NR_046254 100505641 Hs.517821 NR_046251 ENSG00000225733 FGD5-AS1 - FGD5 antisense RNA 1 ncRNA 174-47 chr18 34005895 34006320 + 0.5 NA intron (NM_001353232, intron 6 of 9) intron (NM_001353232, intron 6 of 9) 42505 NM_001353236 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 126.25-130 chr4 81553084 81553406 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -81338 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 141.5-116 chr2 190120398 190120869 + 0.5 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger -17144 NM_001042521 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 125.75-172 chr7 33401962 33402406 + 0.5 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 272620 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 132-113 chr3 116538596 116539013 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -13669 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 179.5-12 chr1 187979352 187979985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 536040 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 132-154 chr6 154718652 154719105 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -14500 NM_001286194 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 205.5-26 chr12 10647988 10648757 + 0.5 NA intron (NM_018423, intron 1 of 10) intron (NM_018423, intron 1 of 10) 25680 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 201-21 chr12 12543677 12544248 + 0.5 NA intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 18901 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 118.5-178 chr6 104222031 104222411 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 637325 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 122.5-209 chr7 26991514 26991911 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 104288 NM_153620 3198 Hs.67397 NM_005522 ENSG00000105991 HOXA1 BSAS|HOX1|HOX1F homeobox A1 protein-coding 114.5-182 chr3 124729011 124729326 + 0.5 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -1198 NR_033434 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 249.5-53 chr2 189111715 189112384 + 0.5 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) AluSq2|SINE|Alu 21062 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 117.25-127 chr20 5782606 5782885 + 0.5 NA intron (NM_152504, intron 2 of 2) intron (NM_152504, intron 2 of 2) 32344 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 159-90 chr5 126173383 126173849 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -5961 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 167.5-131 chr4 161581782 161582256 + 0.5 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) intron (NM_001128428, intron 8 of 14) -440714 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 196.5-102 chr3 56574565 56574982 + 0.5 NA intron (NR_148375, intron 7 of 17) AluJo|SINE|Alu 17598 NM_001141947 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 120.25-212 chr8 66272059 66272390 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 80110 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 151.75-106 chr4 169722392 169722818 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001243372, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001243372, exon 12 of 12) 35339 NM_017867 54969 Hs.406756 NM_017867 ENSG00000056050 HPF1 C4orf27 histone PARylation factor 1 protein-coding 148.5-19 chr1 215798176 215798667 + 0.5 NA intron (NM_206933, intron 50 of 71) MIR|SINE|MIR 231117 NM_001319295 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 144.5-102 chr2 39437442 39437992 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001270425) promoter-TSS (NM_001270425) 301 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 162.75-132 chr7 36574300 36574935 + 0.5 NA intron (NM_001177507, intron 12 of 19) intron (NM_001177507, intron 12 of 19) 25503 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 134.25-36 chr12 65689827 65690264 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47673 NR_120433 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 116.25-155 chr3 182594465 182594834 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87525 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 175.5-17 chr10 57962323 57962859 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 305303 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 113-37 chr11 5641013 5641300 + 0.5 NA intron (NM_001003819, intron 10 of 13) intron (NM_001003819, intron 10 of 13) 8901 NM_130390 53840 Hs.729048 NM_021616 ENSG00000258659 TRIM34 IFP1|RNF21 tripartite motif containing 34 protein-coding 119.5-37 chr10 107144951 107145363 + 0.5 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 19549 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 118-23 chr11 11086703 11087051 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 228660 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 130.25-166 chr5 180750354 180750689 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -10463 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 114.25-42 chr12 90568518 90568849 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 275365 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 129.25-160 chr5 168871733 168872170 + 0.5 NA intron (NM_003062, intron 5 of 35) intron (NM_003062, intron 5 of 35) -103696 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 112.5-130 chr2 175812104 175812372 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 190029 NM_030650 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 112.75-64 chr14 76691671 76692052 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -69607 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 145-164 chr8 143326216 143326613 + 0.5 NA intron (NM_052963, intron 3 of 13) intron (NM_052963, intron 3 of 13) 8466 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 120-197 chr9 15871676 15872093 + 0.5 NA intron (NM_001355547, intron 22 of 24) intron (NM_001355547, intron 22 of 24) 307906 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 139.5-40 chr12 13514115 13514442 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -137533 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 156.5-97 chr20 58658095 58658537 + 0.5 NA intron (NM_001134772, intron 1 of 7) intron (NM_001134772, intron 1 of 7) 7033 NM_001134772 8675 Hs.307913 NM_003763 ENSG00000124222 STX16 SYN16 syntaxin 16 protein-coding 122-106 chr2 228007622 228007943 + 0.5 NA intron (NM_030623, intron 7 of 10) L1M3|LINE|L1 136151 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 118-186 chr8 97503094 97503390 + 0.5 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -56745 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 112.75-195 chr7 134289221 134289532 + 0.5 NA TTS (NM_032826) TTS (NM_032826) 27554 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 136.75-55 chr14 49181915 49182275 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 404285 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 128.5-68 chr15 40128964 40129369 + 0.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -20287 NM_001003943 90427 Hs.591104 NM_033503 ENSG00000104081 BMF - Bcl2 modifying factor protein-coding 125-158 chr8 88666277 88666715 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -339013 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 171.75-139 chr8 88000934 88001372 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -127138 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 139.75-140 chr4 127709701 127710064 + 0.5 NA intron (NM_015693, intron 13 of 15) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -20518 NM_031291 83447 Hs.149030 NM_031291 ENSG00000151475 SLC25A31 AAC4|ANT 4|ANT4|SFEC35kDa solute carrier family 25 member 31 protein-coding 156.5-151 chr5 65553556 65553926 + 0.5 NA intron (NM_001349369, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 9427 NM_022145 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 170.25-71 chr2 127606866 127607463 + 0.5 NA intron (NM_001080527, intron 20 of 46) intron (NM_001080527, intron 20 of 46) -36202 NR_132317 105373609 Hs.677195 NR_132317 LOC105373609 - uncharacterized LOC105373609 ncRNA 157-8 chr10 30520637 30521088 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 86216 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 123.75-90 chr2 56179625 56180089 + 0.5 NA intron (NR_125368, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 -4133 NM_001080433 114800 Hs.117136 NM_001080433 ENSG00000055813 CCDC85A - coiled-coil domain containing 85A protein-coding 124.25-100 chr2 137792435 137792816 + 0.5 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL 135307 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 134.25-19 chr10 121804297 121804662 + 0.5 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) intron (NM_001001976, intron 10 of 11) 123552 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 199.75-52 chr2 212626564 212627097 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -88028 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 138.25-10 chr1 100169006 100169446 + 0.5 NA intron (NM_001256387, intron 1 of 8) intron (NM_001256387, intron 1 of 8) 9047 NM_001256387 127495 Hs.44277 NM_144620 ENSG00000122477 LRRC39 - leucine rich repeat containing 39 protein-coding 129.75-21 chr10 21883478 21883927 + 0.5 NA intron (NM_022365, intron 7 of 11) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 120028 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 120-60 chr16 49478947 49479312 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 39456 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 135.25-29 chr10 92662599 92663129 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -27091 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 121.25-108 chr20 2767511 2767805 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32969 NM_019609 56265 Hs.659346 NM_019609 ENSG00000088882 CPXM1 CPX1|CPXM carboxypeptidase X, M14 family member 1 protein-coding 122.5-145 chr3 15596212 15596626 + 0.5 NA exon (NM_001284416, exon 3 of 14) exon (NM_001284416, exon 3 of 14) -4933 NM_001281723 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 139.75-157 chr6 80665705 80666176 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 559269 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 137.25-143 chr6 127570657 127571048 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -6322 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 174.25-136 chr7 105463839 105464373 + 0.5 NA intron (NM_001318164, intron 13 of 15) L3|LINE|CR1 44414 NM_001318163 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 133.25-28 chr11 16961602 16962131 + 0.5 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) MIR|SINE|MIR -35844 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 217.75-26 chr14 88600099 88600652 + 0.5 NA intron (NM_207662, intron 2 of 6) intron (NM_207662, intron 2 of 6) 5955 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 112.25-116 chr21 18663289 18663633 + 0.5 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 22703 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 136.75-86 chr2 8400996 8401289 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -72723 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 153-12 chr10 74863845 74864330 + 0.5 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) AluJo|SINE|Alu 37487 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 142.75 chr1 10488132 10488608 + 0.5 NA intron (NM_004565, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 13420 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 116.5-247 chr8 96550964 96551322 + 0.5 NA intron (NM_002998, intron 1 of 4) intron (NM_002998, intron 1 of 4) 57330 NM_002998 6383 Hs.1501 NM_002998 ENSG00000169439 SDC2 CD362|HSPG|HSPG1|SYND2 syndecan 2 protein-coding 139.25-105 chr20 59289696 59290079 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10724 NM_207032 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 135.25-5 chr1 81700183 81700690 + 0.5 NA intron (NM_001297704, intron 1 of 20) intron (NM_001297704, intron 1 of 20) 666 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 141-24 chr10 74535084 74535513 + 0.5 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) AluJr|SINE|Alu -5974 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 138.75-11 chr1 181405574 181406015 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -77723 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 115.25-137 chr3 100742822 100743244 + 0.5 NA intron (NM_001007565, intron 6 of 7) intron (NM_001007565, intron 6 of 7) 33491 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 130.5-31 chr10 32519087 32519537 + 0.5 NA intron (NR_109826, intron 11 of 16) intron (NR_109826, intron 11 of 16) 73172 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 113.75-104 chr2 151813983 151814272 + 0.5 NA intron (NM_001037174, intron 3 of 5) intron (NM_001037174, intron 3 of 5) 14294 NM_012097 26225 Hs.470233 NM_012097 ENSG00000162980 ARL5A ARFLP5|ARL5 ADP ribosylation factor like GTPase 5A protein-coding 155-85 chr3 24828623 24829206 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001290216) promoter-TSS (NM_001290216) -409 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 161.5-170 chr7 35368360 35368950 + 0.5 NA intron (NR_038864, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 54800 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 144.75-162 chr7 88575865 88576400 + 0.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -183568 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 142.5-23 chr1 238949905 238950285 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -436473 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 119.5-117 chr2 45009859 45010105 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_016932) promoter-TSS (NM_016932) -530 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 118.5-108 chr2 182060017 182060369 + 0.5 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 74340 NM_001261424 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 119-117 chr3 76449939 76450221 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -590019 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 185.75-33 chr12 79821067 79821598 + 0.5 NA intron (NM_001244990, intron 7 of 24) intron (NM_001244990, intron 7 of 24) 92579 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 150.75-162 chr6 162962043 162962525 + 0.5 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 91877 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 153-62 chr18 37253296 37253729 + 0.5 NA intron (NR_148521, intron 12 of 13) intron (NR_148521, intron 12 of 13) -20948 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 144.75-79 chr2 12204818 12205245 + 0.5 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 5901 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 114.5-20 chr1 184798372 184798809 + 0.5 NA intron (NM_052966, intron 12 of 13) intron (NM_052966, intron 12 of 13) -43732 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 128.5-150 chr3 89572828 89573218 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 465402 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 126.25-152 chr5 50345968 50346429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95090 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 119.5-216 chr7 53760462 53760783 + 0.5 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) intron (NR_038371, intron 4 of 5) 51309 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 131-157 chr7 44966043 44966526 + 0.5 NA intron (NM_033054, intron 15 of 21) intron (NM_033054, intron 15 of 21) 12731 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 127.75-39 chr11 10565045 10565359 + 0.5 NA intron (NM_006691, intron 1 of 5) intron (NM_006691, intron 1 of 5) 3463 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 184-53 chr3 18644219 18644741 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -198888 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 171-13 chr10 61496981 61497490 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17194 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-108 chr2 109660607 109661024 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 46451 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 126.25-95 chr2 158965202 158965592 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3237 NM_001350065 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 142.5-133 chr21 37737521 37737825 + 0.5 NA intron (NM_002240, intron 2 of 3) intron (NM_002240, intron 2 of 3) 178784 NM_002240 3763 Hs.626242 NM_002240 ENSG00000157542 KCNJ6 BIR1|GIRK-2|GIRK2|KATP-2|KATP2|KCNJ7|KIR3.2|KPLBS|hiGIRK2 potassium voltage-gated channel subfamily J member 6 protein-coding 116.5-152 chr22 47026759 47027138 + 0.5 NA intron (NM_001284305, intron 10 of 12) L1MEc|LINE|L1 -110906 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 119.75-80 chr17 76068488 76068797 + 0.5 NA intron (NR_048541, intron 1 of 14) intron (NR_048541, intron 1 of 14) 3875 NM_014230 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 141-96 chr22 43112732 43113187 + 0.5 NA intron (NM_001197, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 2209 NM_001197 638 Hs.475055 NM_001197 ENSG00000100290 BIK BIP1|BP4|NBK BCL2 interacting killer protein-coding 149.5-171 chr6 48348485 48348985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -280046 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 116.5-43 chr12 8655525 8655832 + 0.5 NA intron (NR_123734, intron 4 of 9) intron (NR_123734, intron 4 of 9) 7148 NR_123734 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 150.75-170 chr7 86471230 86471755 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -172417 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 117.75-52 chr13 80509475 80509915 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168569 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 114.25-131 chr3 151313882 151314289 + 0.5 NA intron (NM_023915, intron 1 of 2) intron (NM_023915, intron 1 of 2) 2735 NM_023915 53836 Hs.591292 NM_023915 ENSG00000138271 GPR87 FKSG78|GPR95|KPG_002 G protein-coupled receptor 87 protein-coding 115-92 chr2 175525394 175525691 + 0.5 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -343832 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 161.75-45 chr16 3148934 3149494 + 0.5 NA intron (NR_132322, intron 9 of 9) LTR53B|LTR|ERVL 4923 NR_132322 197350 Hs.434132 NR_132322 ENSG00000228146 CASP16P CASP16 caspase 16, pseudogene pseudo 116-126 chr5 85110993 85111395 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -726314 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 142.75-51 chr12 90655119 90655598 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -262665 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 125.5-79 chr14 55266154 55266573 + 0.5 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -5058 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 196.25-62 chr2 70542021 70542708 + 0.5 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) intron (NM_003236, intron 1 of 5) 11082 NM_001308158 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 188-67 chr7 29847288 29847708 + 0.5 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) MER39B|LTR|ERV1 40944 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 127-187 chr9 87812656 87812952 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31941 NR_033405 1518 Hs.726015 NR_033405 CTSLP8 CTSL1P8 cathepsin L pseudogene 8 pseudo 130.5-117 chr17 60090645 60091027 + 0.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -2369 NR_030732 645638 Hs.463652 NR_030732 ENSG00000261040 WFDC21P LNCDC|linc-DC|lnc-DC WAP four-disulfide core domain 21, pseudogene pseudo 123-143 chr4 20072663 20073111 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -179018 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 134.5-19 chr1 240808413 240808714 + 0.5 NA intron (NM_001350116, intron 14 of 16) MIR|SINE|MIR -196408 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 198.25-28 chr13 87704019 87704663 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 31726 NM_015567 26050 Hs.591208 NM_015567 ENSG00000165300 SLITRK5 LRRC11|bA364G4.2 SLIT and NTRK like family member 5 protein-coding 140.5-114 chr2 120540996 120541422 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -74860 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 152-112 chr4 61822115 61822467 + 0.5 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 339474 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 112.5-201 chr5 156588293 156588699 + 0.5 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) MER58B|DNA|hAT-Charlie 261332 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 204.5-84 chr3 102749 103423 + 0.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 91335 NR_110824 102723448 Hs.543290 NR_110824 LINC01986 - long intergenic non-protein coding RNA 1986 ncRNA 155.75-79 chr2 61449006 61449567 + 0.5 NA intron (NM_014709, intron 1 of 79) L1MB8|LINE|L1 21801 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 168.5-64 chr17 57742629 57743249 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 2360 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 117-181 chr8 68396767 68397146 + 0.5 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -65465 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 133.75-184 chr8 50366229 50366585 + 0.5 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) intron (NR_135797, intron 2 of 20) 202276 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 130.75-19 chr10 55449633 55450154 + 0.5 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -149149 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 138-133 chr5 167381013 167381519 + 0.5 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -192393 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 118.5-186 chr7 32288440 32288887 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 10665 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 146-52 chr17 29260826 29261181 + 0.5 NA 3' UTR (NM_020772, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_020772, exon 4 of 4) 14146 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 149.75-75 chr2 36678726 36679179 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17738 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 114.75-17 chr1 192068418 192068694 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -89906 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 126-27 chr10 106901121 106901472 + 0.5 NA intron (NM_001206569, intron 2 of 25) intron (NM_001206569, intron 2 of 25) 263410 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 130.5-35 chr10 52091980 52092492 + 0.5 NA intron (NM_001098512, intron 7 of 17) intron (NM_001098512, intron 7 of 17) 221892 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 118-11 chr1 235177173 235177541 + 0.5 NA intron (NR_135074, intron 21 of 24) intron (NR_135074, intron 21 of 24) 12759 NR_039908 100616224 NR_039908 ENSG00000263439 MIR4753 mir-4753 microRNA 4753 ncRNA 129.25-17 chr10 49144489 49144820 + 0.5 NA intron (NR_038973, intron 4 of 5) intron (NR_038973, intron 4 of 5) -10634 NM_001164484 170370 Hs.646291 NM_001164484 ENSG00000172538 FAM170B C10orf73 family with sequence similarity 170 member B protein-coding 140-53 chr16 46812787 46813157 + 0.5 NA intron (NM_001001436, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 18076 NR_145837 388272 Hs.406551 NM_001001436 ENSG00000155330 C16orf87 - chromosome 16 open reading frame 87 protein-coding 141-27 chr10 99030916 99031340 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MA1|LINE|L1 -106560 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 154.5-9 chr1 97719452 97719851 + 0.5 NA TTS (NM_001160301) TTS (NM_001160301) -77270 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 161-125 chr9 1131739 1132267 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 80516 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 126-183 chr9 33222434 33222810 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -17545 NM_014471 27290 Hs.555934 NM_014471 ENSG00000122711 SPINK4 HEL136|PEC-60|PEC60 serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 protein-coding 121.25-16 chr10 32779121 32779464 + 0.5 NA intron (NM_001321115, intron 30 of 43) intron (NM_001321115, intron 30 of 43) 122180 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 139.5-133 chr3 95101202 95101568 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 163122 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 120.75-14 chr10 10217287 10217555 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 158699 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 123-189 chr8 116142787 116143161 + 0.5 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) L3|LINE|CR1 182085 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 122.25-55 chr14 22172076 22172404 + 0.5 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 260513 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 116.75-60 chr14 77252659 77253042 + 0.5 NA intron (NM_020431, intron 22 of 23) intron (NM_020431, intron 22 of 23) -13368 NR_031661 100302236 NR_031661 ENSG00000221754 MIR1260A MIR1260|MIRN1260|hsa-mir-1260|hsa-mir-1260a|mir-1260a microRNA 1260a ncRNA 123.75-21 chr11 12569353 12569712 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -104889 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 119.75-138 chr3 341112 341468 + 0.5 NA intron (NM_001253388, intron 4 of 24) intron (NM_001253388, intron 4 of 24) 21607 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 117.5-215 chr7 25530547 25531014 + 0.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 132360 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 116.25-126 chr21 30750164 30750585 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -3115 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 154-63 chr2 26581766 26582358 + 0.5 NA intron (NM_001029881, intron 6 of 6) intron (NM_001029881, intron 6 of 6) 19475 NM_001322426 339778 Hs.407083 NM_001105519 ENSG00000173557 C2orf70 - chromosome 2 open reading frame 70 protein-coding 158.5-68 chr14 76223964 76224401 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 69828 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 140-113 chr3 127072498 127072885 + 0.5 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 84097 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 115.5-232 chr7 57997413 57997806 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 547432 NM_001159279 441234 Hs.533121 NM_001159279 ENSG00000182111 ZNF716 - zinc finger protein 716 protein-coding 156.75-157 chr7 44201853 44202213 + 0.5 NA intron (NM_006555, intron 1 of 6) intron (NM_006555, intron 1 of 6) 1055 NM_001363678 10652 Hs.520794 NM_006555 ENSG00000106636 YKT6 - YKT6 v-SNARE homolog protein-coding 195.75-31 chr11 63326379 63326877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 36725 NR_134874 387775 Hs.188982 NM_001039752 ENSG00000184999 SLC22A10 OAT5|hOAT5 solute carrier family 22 member 10 protein-coding 114.75-150 chr5 26603824 26604161 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 434594 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 137.25-4 chr1 110574513 110574863 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 31670 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 174.25-70 chr17 67541740 67542234 + 0.5 NA intron (NM_181671, intron 2 of 9) L3|LINE|CR1 -70402 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 132.25-120 chr22 46883439 46883909 + 0.5 NA intron (NM_001284305, intron 5 of 12) intron (NM_001284305, intron 5 of 12) 32368 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 114.5-99 chr15 39456560 39457015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -124292 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 132.5-75 chr14 73807088 73807609 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 19988 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 153-157 chr8 101416366 101416755 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 47667 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 119.5-204 chr6 167240019 167240293 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11856 NR_157263 112590798 NR_157263 HPAT5 - human pluripotency-associated transcript 5 ncRNA 118.75-41 chr12 19951256 19951709 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -63203 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 165.5-194 chr8 63002824 63003276 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25189 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 125.25-157 chr5 79551364 79551797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37446 NM_004272 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 143.5-47 chr12 74779031 74779337 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 241349 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 112.25-3 chr1 12305404 12305760 + 0.5 NA intron (NM_015378, intron 26 of 69) AluJb|SINE|Alu 75552 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 129.25-150 chr5 33559487 33559890 + 0.5 NA intron (NM_001324512, intron 18 of 21) AluSz|SINE|Alu 118912 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 138-76 chr2 62086843 62087148 + 0.5 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu -109120 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 130.25-134 chr3 67194397 67194777 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30877 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 118-195 chr8 133718478 133718923 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34634 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 126.75-69 chr15 40374503 40374908 + 0.5 NA 3' UTR (NM_033510, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_033510, exon 8 of 8) -8016 NM_001142761 90417 Hs.525796 NM_033286 ENSG00000128944 KNSTRN C15orf23|HSD11|SKAP|TRAF4AF1 kinetochore localized astrin (SPAG5) binding protein protein-coding 124.5-154 chr4 88232307 88232746 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001348985) promoter-TSS (NM_001348985) -900 NM_001348985 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 121.5-196 chr4 83958629 83959023 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 340343 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 236.75-17 chr13 47504793 47505471 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 427490 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 152.75-146 chr8 36527122 36527506 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -257060 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 112.25-31 chr11 71445478 71445866 + 0.5 NA intron (NM_001360, intron 2 of 8) intron (NM_001360, intron 2 of 8) 2721 NM_001163817 1717 Hs.503134 NM_001360 ENSG00000172893 DHCR7 SLOS 7-dehydrocholesterol reductase protein-coding 139.5-67 chr14 59902247 59902655 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17262 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 112.5-144 chr20 16887967 16888375 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 139818 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 122.75-159 chr5 35907497 35907826 + 0.5 NA intron (NM_001042625, intron 4 of 4) intron (NM_001042625, intron 4 of 4) 30961 NM_001042625 133690 Hs.55150 NM_144647 ENSG00000152611 CAPSL - calcyphosine like protein-coding 120.5-110 chr2 25765338 25765690 + 0.5 NA intron (NM_001369346, intron 6 of 10) intron (NM_001369346, intron 6 of 10) 29177 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 113.75-10 chr1 157753502 157753911 + 0.5 NA intron (NM_001159488, intron 7 of 8) MER21C|LTR|ERVL 23426 NR_125358 79368 Hs.437393 NM_030764 ENSG00000132704 FCRL2 CD307b|FCRH2|IFGP4|IRTA4|SPAP1|SPAP1A|SPAP1B|SPAP1C Fc receptor like 2 protein-coding 120.75-157 chr7 39727361 39727635 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -6070 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 132-74 chr17 63668307 63668653 + 0.5 NA intron (NM_203351, intron 7 of 16) intron (NM_203351, intron 7 of 16) 31645 NM_030576 80774 Hs.591166 NM_030576 ENSG00000136490 LIMD2 - LIM domain containing 2 protein-coding 118.5-103 chr2 118801957 118802301 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 46054 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 115.5-102 chr18 65587872 65588296 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -162168 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 124.5-188 chr6 50066027 50066456 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16312 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 185.25-26 chr13 50364104 50364696 + 0.5 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) L1MEc|LINE|L1 163049 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 120-36 chr13 100271180 100271631 + 0.5 NA intron (NR_148031, intron 11 of 22) L1MC5a|LINE|L1 182312 NM_000282 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 119-40 chr12 61668597 61668884 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 524099 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 126.75-96 chr19 11183812 11184196 + 0.5 NA intron (NM_001136191, intron 4 of 12) AluJo|SINE|Alu 10586 NM_015493 25959 Hs.284208 NM_015493 ENSG00000197256 KANK2 ANKRD25|MXRA3|NPHS16|PPKWH|SIP KN motif and ankyrin repeat domains 2 protein-coding 128.5-162 chr4 108839311 108839715 + 0.5 NA intron (NM_001256074, intron 27 of 31) intron (NM_001256074, intron 27 of 31) -76460 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 172.75-134 chr8 124530524 124530986 + 0.5 NA intron (NM_001317889, intron 1 of 12) intron (NM_001317889, intron 1 of 12) 8330 NM_032026 83940 Hs.170568 NM_032026 ENSG00000147687 TATDN1 CDA11 TatD DNase domain containing 1 protein-coding 182-91 chr5 61899833 61900411 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -164424 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 117.75-126 chr21 29390896 29391175 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18534 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 131.5-242 chr8 133582743 133583075 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11022 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 124.5-181 chr5 143602198 143602475 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77524 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 135.75-63 chr15 26387056 26387414 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 241855 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 117.75-54 chr14 37083185 37083629 + 0.5 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -88619 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 160.75-130 chr6 7548339 7548930 + 0.5 NA intron (NM_001008844, intron 1 of 23) intron (NM_001008844, intron 1 of 23) 6963 NM_001319034 1832 Hs.519873 NM_004415 ENSG00000096696 DSP DCWHKTA|DP desmoplakin protein-coding 131.5-162 chr3 148989613 148990012 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1596 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 131.75-214 chr8 80470501 80470912 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -14887 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 140-67 chr18 64007492 64007977 + 0.5 NA intron (NM_001348367, intron 7 of 7) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 37653 NM_001366198 5271 Hs.368077 NM_002640 ENSG00000166401 SERPINB8 C18orf53|CAP2|PI-8|PI8|PSS5 serpin family B member 8 protein-coding 157.5-74 chr16 56007187 56007782 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51453 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 139.5-56 chr13 55299670 55300132 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 125447 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 168.5-80 chr2 53235481 53236091 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -531997 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 129-125 chr3 187627389 187627763 + 0.5 NA Intergenic (GATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 42818 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 171-127 chr7 76353590 76354053 + 0.5 NA intron (NM_012479, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 5170 NM_012479 7532 Hs.744840 NM_012479 ENSG00000170027 YWHAG 14-3-3GAMMA|EIEE56|PPP1R170 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein gamma protein-coding 124.5-156 chr4 148140319 148140779 + 0.5 NA intron (NR_148974, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu 301865 NR_148974 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 127-23 chr11 21438111 21438518 + 0.5 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L1MA5|LINE|L1 -754771 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 114-125 chr5 22601421 22601843 + 0.5 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 251712 NM_001364104 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 118-102 chr20 12827720 12828032 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 109087 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 173.25-11 chr1 203924934 203925378 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 63309 NM_001328638 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 139.75-171 chr7 100798472 100798867 + 0.5 NA TTS (NM_173059) TTS (NM_173059) -28200 NM_001363494 56996 Hs.521087 NM_020246 ENSG00000146828 SLC12A9 CCC6|CIP1|WO3.3|hCCC6 solute carrier family 12 member 9 protein-coding 139.25-134 chr4 36126154 36126614 + 0.5 NA intron (NR_146894, intron 21 of 32) intron (NR_146894, intron 21 of 32) 117555 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 141.25-179 chr8 39007160 39007631 + 0.5 NA intron (NR_027638, intron 1 of 20) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 10409 NR_027878 8754 Hs.591852 NM_003816 ENSG00000168615 ADAM9 CORD9|MCMP|MDC9|Mltng ADAM metallopeptidase domain 9 protein-coding 117-32 chr11 131061477 131061833 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -145168 NM_001347920 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 136-40 chr14 60110753 60111203 + 0.5 NA intron (NM_001330177, intron 2 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 19055 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 136.25-16 chr10 59283668 59284073 + 0.5 NA intron (NM_001347852, intron 5 of 12) intron (NM_001347852, intron 5 of 12) 78679 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 160.5-95 chr2 204268953 204269469 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -276264 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 141.25-30 chr11 34563069 34563385 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49433 NM_001422 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 143.5-192 chr6 148054756 148055169 + 0.5 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR -217366 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 112.5-25 chr10 91468728 91469038 + 0.5 NA intron (NM_182765, intron 5 of 20) AluJr|SINE|Alu 58598 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 126.5-96 chr18 2407923 2408406 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 163341 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 195.75-95 chr5 81985012 81985665 + 0.5 NA intron (NM_001131028, intron 2 of 8) intron (NM_001131028, intron 2 of 8) 13315 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 129.25-36 chr12 58587980 58588429 + 0.5 NA intron (NR_120452, intron 3 of 7) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -3498 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 149.5-167 chr6 39440595 39441073 + 0.5 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) intron (NM_001289021, intron 12 of 21) -9444 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 113.5-40 chr10 111963103 111963378 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 220525 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 128.75-89 chr19 53564623 53564994 + 0.5 NA intron (NM_001317120, intron 4 of 6) L1MD2|LINE|L1 9501 NM_001079907 55422 Hs.185674 NM_018555 ENSG00000130844 ZNF331 RITA|ZNF361|ZNF463 zinc finger protein 331 protein-coding 115.25-68 chr15 26907508 26907854 + 0.5 NA intron (NM_001165037, intron 6 of 10) intron (NM_001165037, intron 6 of 10) 40555 NM_001165037 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 155.25 chr1 27734125 27734563 + 0.5 NA intron (NM_001143914, intron 4 of 7) AluSc8|SINE|Alu 8383 NM_001143912 199870 Hs.469359 NM_152660 ENSG00000009780 FAM76A - family with sequence similarity 76 member A protein-coding 141.75-3 chr1 43381431 43381859 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 8155 NM_201542 112950 Hs.301756 NM_052877 ENSG00000159479 MED8 ARC32 mediator complex subunit 8 protein-coding 143-75 chr2 118832098 118832555 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 15857 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 121-138 chr3 160790923 160791217 + 0.5 NA intron (NM_139245, intron 1 of 3) intron (NM_139245, intron 1 of 3) 34839 NM_139245 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 163.75-71 chr2 79176678 79177136 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17154 NM_002580 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 136.25-182 chr7 116063012 116063420 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32453 NM_001018058 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 123.5-97 chr2 66982593 66982902 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60257 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 112.25-227 chrUn_KI270465v1 241 684 + 0.5 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 172.5-23 chr10 17370615 17371233 + 0.5 NA intron (NM_001004470, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 -16012 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 163.25-63 chr2 113887952 113888385 + 0.5 NA intron (NR_110174, intron 1 of 4) intron (NR_110174, intron 1 of 4) -1766 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 116.25-222 chr8 28146175 28146458 + 0.5 NA intron (NM_018091, intron 10 of 14) intron (NM_018091, intron 10 of 14) 53177 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 114-86 chr20 8730889 8731217 + 0.5 NA intron (NM_182734, intron 18 of 32) intron (NM_182734, intron 18 of 32) -100132 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 114.75-172 chr7 33449881 33450192 + 0.5 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) L1MB2|LINE|L1 320472 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 121.5-16 chr1 155732414 155732839 + 0.5 NA intron (NM_001199850, intron 10 of 11) L1MC4|LINE|L1 -13142 NR_024117 100129405 Hs.656361 NR_024117 MSTO2P MSTO2 misato family member 2, pseudogene pseudo 135-29 chr12 11570019 11570442 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 22200 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 135.25-124 chr3 8370480 8370993 + 0.5 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 130922 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 164.75-13 chr1 235490586 235491173 + 0.5 NA intron (NM_152490, intron 2 of 11) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 13573 NM_152490 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 117.75-12 chr1 150250603 150251066 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6940 NM_012113 23632 Hs.528988 NM_012113 ENSG00000118298 CA14 CAXiV carbonic anhydrase 14 protein-coding 131.75-28 chr10 60679753 60680168 + 0.5 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) AluSx1|SINE|Alu 53568 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 157.5-59 chr14 65070554 65071027 + 0.5 NA intron (NM_197957, intron 3 of 3) intron (NM_197957, intron 3 of 3) -19128 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 126.75-139 chr21 15874262 15874594 + 0.5 NA exon (NM_001352561, exon 22 of 24) exon (NM_001352561, exon 22 of 24) 144446 NM_001352560 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 125.5-72 chr13 101352706 101353028 + 0.5 NA intron (NM_001350749, intron 6 of 43) intron (NM_001350749, intron 6 of 43) 63641 NM_001350751 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 128.25-81 chr18 46395149 46395490 + 0.5 NA intron (NM_001256758, intron 1 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 61095 NM_001256758 494470 Hs.501114 NM_152470 ENSG00000141622 RNF165 ARKL2|Ark2C|RNF111L2 ring finger protein 165 protein-coding 147.5-134 chr22 27107823 27108349 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -47568 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 208.25-32 chr16 59530407 59531005 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 224485 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 134-17 chr10 49451763 49452140 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -55862 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 159-58 chr21 44053275 44053600 + 0.5 NA intron (NM_003274, intron 4 of 22) L1ME4a|LINE|L1 -20887 NM_001351709 7109 Hs.126221 NM_003274 ENSG00000160218 TRAPPC10 EHOC-1|EHOC1|GT334|TMEM1|TRS130|TRS30 trafficking protein particle complex 10 protein-coding 162.25-27 chr11 28229530 28230168 + 0.5 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) intron (NM_001113528, intron 4 of 6) 121461 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 141.25-32 chr12 1556396 1556934 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -24473 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 195.25-45 chr19 44972380 44973064 + 0.5 NA intron (NM_001282175, intron 2 of 13) intron (NM_001282175, intron 2 of 13) 17342 NM_001294 1209 Hs.444441 NM_001294 ENSG00000104853 CLPTM1 - CLPTM1 regulator of GABA type A receptor forward trafficking protein-coding 141.75-40 chr11 102431968 102432307 + 0.5 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 20628 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 130.75-108 chr21 33318425 33318877 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -6319 NM_000629 3454 Hs.529400 NM_000629 ENSG00000142166 IFNAR1 AVP|IFN-alpha-REC|IFNAR|IFNBR|IFRC interferon alpha and beta receptor subunit 1 protein-coding 145.25-107 chr3 143247528 143248051 + 0.5 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -94457 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 120.75-140 chr5 172201254 172201670 + 0.5 NA intron (NM_001171183, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 7290 NM_001171183 285588 Hs.716824 NM_001171183 ENSG00000214360 EFCAB9 - EF-hand calcium binding domain 9 protein-coding 138-103 chr3 79352316 79352759 + 0.5 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L1MD2|LINE|L1 -59190 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 157.75-145 chr5 157424308 157424623 + 0.5 NA intron (NR_136204, intron 1 of 3) L1PA6|LINE|L1 -35554 NM_001172292 348938 Hs.4285 NM_001099287 ENSG00000172548 NIPAL4 ARCI6|ICHTHYIN|ICHYN NIPA like domain containing 4 protein-coding 122.75-202 chr8 99503954 99504366 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 27 of 61) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 32570 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 114.5-179 chr3 101614746 101615124 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 40755 NM_020357 57092 Hs.732633 NM_020357 ENSG00000081154 PCNP - PEST proteolytic signal containing nuclear protein protein-coding 113.5-101 chr17 67887193 67887545 + 0.5 NA intron (NM_004459, intron 6 of 29) intron (NM_004459, intron 6 of 29) 61866 NM_004459 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 130.75-97 chr2 158015252 158015560 + 0.5 NA intron (NM_001135098, intron 1 of 8) L1MB2|LINE|L1 20227 NM_001135098 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 124.75-44 chr11 74288189 74288608 + 0.5 NA intron (NR_110031, intron 5 of 11) intron (NR_110031, intron 5 of 11) -22964 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 120-159 chr6 42066618 42067022 + 0.5 NA intron (NM_138572, intron 6 of 8) intron (NM_138572, intron 6 of 8) 16296 NM_138572 129685 Hs.520122 NM_138572 ENSG00000137413 TAF8 II|TAF|TAF(II)43|TAFII-43|TAFII43|TBN TATA-box binding protein associated factor 8 protein-coding 152.5-9 chr1 192580134 192580549 + 0.5 NA TTS (NM_002922) TTS (NM_002922) 4568 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 147-70 chr2 69766994 69767461 + 0.5 NA intron (NM_001365496, intron 2 of 13) intron (NM_001365496, intron 2 of 13) 25093 NM_001320700 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 115-162 chr6 160990496 160990874 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1042 NM_006724 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 123.25-200 chr8 84797172 84797549 + 0.5 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 91433 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 116.5-261 chr9 18187722 18188137 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -286224 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 142.75-144 chr4 69583937 69584453 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 55447 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 163.75-132 chr8 140143875 140144294 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1M5|LINE|L1 -43549 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 139-60 chr18 34272787 34273095 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -49390 NM_001353232 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 117.25-107 chr2 61637580 61638028 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -99448 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 125.25-6 chr1 76053068 76053467 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21479 NM_001349107 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 178-67 chr3 173699210 173699659 + 0.5 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 115000 NM_001365927 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 122.25-134 chr3 183415044 183415351 + 0.5 NA intron (NM_015078, intron 1 of 29) AluSx1|SINE|Alu 13072 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 113.75-195 chr8 117176840 117177162 + 0.5 NA TTS (NM_001172813) TTS (NM_001172813) 42006 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 120-75 chr18 6434617 6434935 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19517 NM_001365765 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 112.75-146 chr4 33186398 33186748 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 835535 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 129.5-106 chr2 9799302 9799650 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43966 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 128-14 chr1 206490116 206490533 + 0.5 NA intron (NM_001193321, intron 15 of 20) intron (NM_001193321, intron 15 of 20) 15521 NR_106919 102466202 NR_106919 ENSG00000278465 MIR6769B hsa-mir-6769b microRNA 6769b ncRNA 160.5-15 chr10 67768941 67769554 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 68932 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 190.5-75 chr2 68482548 68483047 + 0.5 NA intron (NM_173545, intron 1 of 9) L1M2c|LINE|L1 15212 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 115.5-217 chr6 92801311 92801678 + 0.5 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 618065 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 198-19 chr13 63614860 63615381 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -122315 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 120-77 chr18 57213612 57213964 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42594 NR_149129 105372138 Hs.574448 NR_149129 ENSG00000267726 LINC02565 - long intergenic non-protein coding RNA 2565 ncRNA 182-2 chr1 19072739 19073264 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116325 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 126-163 chr7 23730547 23730829 + 0.5 NA intron (NM_031414, intron 6 of 23) intron (NM_031414, intron 6 of 23) 20469 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 154.5-177 chr7 138104742 138105143 + 0.5 NA intron (NM_001190906, intron 4 of 7) AluJo|SINE|Alu -18816 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 135.75-19 chr10 34270951 34271259 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 19 of 22) intron (NM_001184789, intron 19 of 22) -498425 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 116.75-148 chr4 60977726 60978081 + 0.5 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 55284 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 130.25-98 chr2 72950721 72951175 + 0.5 NA intron (NM_001330402, intron 12 of 12) intron (NM_001330402, intron 12 of 12) 33429 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 115-150 chr5 163084148 163084496 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -353249 NR_157054 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 157-89 chr4 121264812 121265381 + 0.5 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -37613 NM_001244764 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 133.75-23 chr10 70589195 70589594 + 0.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 13347 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 129.25-58 chr15 68626084 68626517 + 0.5 NA intron (NM_001190456, intron 1 of 11) Charlie8|DNA|hAT-Charlie -5688 NM_001190457 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 159.75-186 chrX 45199288 45199887 + 0.5 NA intron (NM_176819, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 1289 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 130.5-212 chr6 22037154 22037665 + 0.5 NA intron (NR_015410, intron 7 of 11) AluSg|SINE|Alu 109784 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 136-100 chr3 34999374 34999811 + 0.5 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 394431 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 145-17 chr1 241376311 241376688 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -19269 NM_001282775 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 116.5-114 chr2 60454616 60454978 + 0.5 NA intron (NM_138559, intron 4 of 4) intron (NM_138559, intron 4 of 4) -63422 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 146.75-78 chr2 110749886 110750346 + 0.5 NA intron (NM_001371254, intron 1 of 18) L1MC3|LINE|L1 17543 NM_001371254 164-32 chr14 36648833 36649331 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8486 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 146.5-176 chr5 92732936 92733321 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 838215 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 153.5-182 chr7 45400328 45400659 + 0.5 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -173647 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 157.5-70 chr16 4664083 4664661 + 0.5 NA intron (NM_001142290, intron 5 of 16) L1MB5|LINE|L1 -6946 NR_106827 102466731 NR_106827 ENSG00000276641 MIR6769A hsa-mir-6769a microRNA 6769a ncRNA 130.5-252 chr9 22435364 22435699 + 0.5 NA Intergenic HERV9NC-int|LTR|ERV1 -11293 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 126-49 chr14 42762584 42762943 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 1155907 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 126.25-108 chr3 4049280 4049727 + 0.5 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 -248628 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 117.5-131 chr20 50588102 50588526 + 0.5 NA intron (NM_001290268, intron 20 of 21) intron (NM_001290268, intron 20 of 21) 2528 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 139.5-116 chr20 18435367 18435900 + 0.5 NA intron (NM_001367611, intron 8 of 20) L1PA8|LINE|L1 31397 NM_001367612 55184 Hs.472225 NM_018152 ENSG00000089091 DZANK1 ANKRD64|C20orf12|C20orf84 double zinc ribbon and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 143.5-100 chr18 68334430 68334794 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 380496 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 193-86 chr8 16058494 16059031 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 127510 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 129-28 chr10 106547023 106547492 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 407092 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 114.25-84 chr2 9383432 9383862 + 0.5 NA intron (NM_003887, intron 20 of 27) LTR8B|LTR|ERV1 38944 NR_134951 9270 Hs.467662 NM_004763 ENSG00000119185 ITGB1BP1 ICAP-1A|ICAP-1B|ICAP-1alpha|ICAP1|ICAP1A|ICAP1B integrin subunit beta 1 binding protein 1 protein-coding 149.25-103 chr21 29312806 29313210 + 0.5 NA intron (NR_027655, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 7804 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 129-70 chr15 60212256 60212629 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 185544 NM_001002857 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 133.25-71 chr16 80228655 80228974 + 0.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 -311920 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 115.5-70 chr14 82583119 82583529 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -59308 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 117-166 chr6 166665137 166665467 + 0.5 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -38051 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 208.5-65 chr19 44969948 44970569 + 0.5 NA intron (NM_001282175, intron 2 of 13) intron (NM_001282175, intron 2 of 13) 14878 NM_001294 1209 Hs.444441 NM_001294 ENSG00000104853 CLPTM1 - CLPTM1 regulator of GABA type A receptor forward trafficking protein-coding 148.75-177 chr9 23816425 23816889 + 0.5 NA intron (NM_001351456, intron 2 of 8) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 4652 NM_001351476 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 118-53 chr14 65057969 65058362 + 0.5 NA intron (NM_002028, intron 11 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 13477 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 121.5-180 chr3 105533617 105534015 + 0.5 NA intron (NM_001243280, intron 5 of 14) MER1A|DNA|hAT-Charlie 166907 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 167.5-157 chr6 54129829 54130397 + 0.5 NA intron (NM_138569, intron 3 of 12) intron (NM_138569, intron 3 of 12) 18670 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 157.25-160 chr9 77435076 77435481 + 0.5 NA intron (NM_004297, intron 2 of 6) AluSg|SINE|Alu -12371 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 136.75-115 chr20 17588757 17589197 + 0.5 NA intron (NM_006870, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 18902 NM_006870 11034 Hs.304192 NM_006870 ENSG00000125868 DSTN ACTDP|ADF|HEL32|bA462D18.2 destrin, actin depolymerizing factor protein-coding 134.75-133 chr21 28443508 28443950 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95589 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 114.75-121 chr3 56842643 56842958 + 0.5 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) intron (NM_001128615, intron 4 of 12) -40851 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 150-41 chr14 60581569 60582080 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -57392 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 172.75-101 chr5 109588044 109588551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -101069 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 115.5-159 chr3 8807388 8807841 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -38000 NM_001354654 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 140-112 chr3 123627012 123627474 + 0.5 NA intron (NM_053027, intron 29 of 32) intron (NM_053027, intron 29 of 32) -6695 NM_053031 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 132.25-154 chr5 61263172 61263519 + 0.5 NA intron (NR_146624, intron 1 of 2) intron (NR_146624, intron 1 of 2) 1584 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 207.25-6 chr10 14914459 14914921 + 0.5 NA intron (NR_110297, intron 15 of 16) AluSx|SINE|Alu 35790 NM_024670 79723 Hs.554883 NM_024670 ENSG00000152455 SUV39H2 KMT1B suppressor of variegation 3-9 homolog 2 protein-coding 126.75-202 chr5 139710308 139710770 + 0.5 NA Intergenic CpG 35096 NM_001317210 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 135-136 chr5 14761332 14761759 + 0.5 NA intron (NM_054027, intron 2 of 11) LTR56|LTR|ERV1 48851 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 120.5-122 chr2 120166990 120167350 + 0.5 NA intron (NM_001330310, intron 22 of 24) intron (NM_001330310, intron 22 of 24) 56230 NM_024121 79134 Hs.376722 NM_024121 ENSG00000226479 TMEM185B FAM11B transmembrane protein 185B protein-coding 115.25-170 chr5 170198899 170199222 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_108022) promoter-TSS (NR_108022) 81 NR_108022 100507267 Hs.634846 NR_108022 LINC01187 CTB-27N1.1|KIDR long intergenic non-protein coding RNA 1187 ncRNA 118.25-73 chr15 79811532 79811885 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 85289 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 127.5-159 chr3 185603030 185603525 + 0.5 NA intron (NM_021627, intron 5 of 16) L1MC4|LINE|L1 16982 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 119-61 chr15 92637399 92637711 + 0.5 NA intron (NM_207446, intron 1 of 2) intron (NM_207446, intron 1 of 2) 18220 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 128-23 chr11 32724263 32724667 + 0.5 NA intron (NM_001008391, intron 2 of 17) intron (NM_001008391, intron 2 of 17) 70193 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 194.5-14 chr10 25483826 25484343 + 0.5 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) intron (NM_020752, intron 5 of 10) -167628 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 117-50 chr14 28000771 28001132 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -327730 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 112.5-168 chr3 62565527 62565821 + 0.5 NA intron (NM_003716, intron 9 of 29) intron (NM_003716, intron 9 of 29) -192124 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 128.5-165 chr4 126812311 126812748 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -820428 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 114.75-68 chr17 28681590 28681987 + 0.5 NA intron (NM_003170, intron 12 of 36) intron (NM_003170, intron 12 of 36) 19583 NM_001320755 6830 Hs.250429 NM_003170 ENSG00000109111 SUPT6H SPT6|SPT6H|emb-5 SPT6 homolog, histone chaperone and transcription elongation factor protein-coding 154.75-41 chr14 73753053 73753434 + 0.5 NA intron (NM_001043318, intron 1 of 11) intron (NM_001043318, intron 1 of 11) -5504 NR_039727 100616158 NR_039727 ENSG00000264741 MIR4505 mir-4505 microRNA 4505 ncRNA 222-14 chr10 109474196 109474968 + 0.5 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 448664 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 126-8 chr1 111393194 111393650 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3571 NR_029429 441897 Hs.568387 NR_029429 ENSG00000227179 PGCP1 - progastricsin pseudogene 1 pseudo 143-101 chr4 26734773 26735137 + 0.5 NA intron (NM_001292054, intron 12 of 17) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 125289 NR_134675 105374546 Hs.548859 NR_134673 STIM2-AS1 - STIM2 antisense RNA 1 ncRNA 171.25-148 chr8 81461465 81462032 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001080526) promoter-TSS (NM_001080526) -225 NM_001080526 646480 Hs.653176 NM_001080526 ENSG00000205186 FABP9 PERF|PERF15|T-FABP|TLBP fatty acid binding protein 9 protein-coding 118.75-77 chr17 56552532 56552918 + 0.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -40974 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 120.5-147 chr3 107433285 107433639 + 0.5 NA intron (NR_110039, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 2532 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 115.75-75 chr15 82809205 82809644 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001080435) promoter-TSS (NM_001080435) -204 NM_001080435 123720 Hs.377360 NM_001080435 ENSG00000156232 WHAMM WHAMM1|WHDC1 WASP homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules protein-coding 123.25-186 chr7 36025789 36026110 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -69361 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 124.75-54 chr12 26598402 26598728 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 30 of 56) intron (NM_002223, intron 30 of 56) 234629 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 157.25-123 chr5 102697791 102698259 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -26561 NR_103756 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 167.75-11 chr1 157353589 157354073 + 0.5 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 198684 NM_001195388 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 129.75-175 chr7 109881194 109881493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 78870 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 166.25-107 chr3 143884104 143884529 + 0.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -35848 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 160.5-4 chr1 179900070 179900547 + 0.5 NA intron (NM_001267578, intron 4 of 9) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 18266 NM_001267578 26092 Hs.496459 NM_015602 ENSG00000143337 TOR1AIP1 LAP1|LAP1B|LGMD2Y torsin 1A interacting protein 1 protein-coding 141.5-28 chr11 87607163 87607560 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 112050 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 119.75-77 chr17 56130549 56130948 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22727 NM_153228 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 144.25-74 chr17 39144018 39144338 + 0.5 NA intron (NM_020405, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 7459 NM_020405 57125 Hs.125036 NM_020405 ENSG00000161381 PLXDC1 TEM3|TEM7 plexin domain containing 1 protein-coding 115.5-237 chr7 159125810 159126238 + 0.5 NA intron (NR_130758, intron 2 of 12) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 18843 NM_003382 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 201.75-19 chr12 3411464 3411951 + 0.5 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 30358 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 117.25-195 chr7 25620939 25621337 + 0.5 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 42002 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 169.25-62 chr2 177378670 177379141 + 0.5 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) intron (NR_026966, intron 1 of 8) 13786 NR_026966 100130691 Hs.707723 NM_182585 ENSG00000213963 LOC100130691 - uncharacterized LOC100130691 ncRNA 157.25-55 chr16 88066219 88066642 + 0.5 NA intron (NM_001173540, intron 11 of 12) intron (NM_001173540, intron 11 of 12) 34555 NR_120310 400553 Hs.592071 NR_120310 ENSG00000205037 LOC400553 - uncharacterized LOC400553 ncRNA 180-111 chr7 41026889 41027451 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47231 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 141.25-132 chr5 37301420 37301834 + 0.5 NA intron (NM_001278312, intron 28 of 33) intron (NM_001278312, intron 28 of 33) -52199 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 115.75-61 chr14 41299390 41299798 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -307262 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 117-134 chr4 70085063 70085363 + 0.5 NA TTS (NR_003720) TTS (NR_003720) 17827 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 247-6 chr10 62894510 62895298 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -75737 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 165.5-103 chr21 24811127 24811520 + 0.5 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -29227 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 182.25-15 chr10 63825457 63826074 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -303875 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 132.25-74 chr17 655386 655892 + 0.5 NA intron (NM_001366254, intron 6 of 19).2 intron (NM_001366254, intron 6 of 19).2 59200 NM_001366254 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 122.75-56 chr16 70424808 70425209 + 0.5 NA intron (NM_006927, intron 1 of 6) intron (NM_006927, intron 1 of 6) 14092 NM_006927 6483 Hs.368611 NM_006927 ENSG00000157350 ST3GAL2 Gal-NAc6S|SIAT4B|ST3GALII|ST3GalA.2 ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 protein-coding 149-14 chr10 73395440 73395771 + 0.5 NA intron (NM_001156, intron 5 of 12) AluSq2|SINE|Alu 18453 NM_001320879 310 Hs.631827 NM_001156 ENSG00000138279 ANXA7 ANX7|SNX|SYNEXIN annexin A7 protein-coding 115.5-250 chr9 32092895 32093316 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -291498 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 125.25-197 chr7 83652799 83653279 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3900 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 114-27 chr11 46590883 46591236 + 0.5 NA intron (NM_001267782, intron 1 of 19) intron (NM_001267782, intron 1 of 19) 305 NM_001367468 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 123.25-207 chr8 124419591 124419975 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31037 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 117.25-8 chr1 73700837 73701214 + 0.5 NA intron (NR_146300, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 26346 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 162-69 chr2 223958143 223958631 + 0.5 NA intron (NM_022915, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 924 NM_022915 65080 Hs.203559 NM_022915 ENSG00000135900 MRPL44 COXPD16|L44MT|MRP-L44 mitochondrial ribosomal protein L44 protein-coding 138-2 chr1 113914272 113914682 + 0.5 NA TTS (NM_022836) TTS (NM_022836) 9151 NM_001363690 64858 Hs.591412 NM_022836 ENSG00000118655 DCLRE1B APOLLO|SNM1B|SNMIB DNA cross-link repair 1B protein-coding 115-139 chr5 109574923 109575290 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -114260 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 179.75-17 chr10 82901690 82902306 + 0.5 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) (TAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -669078 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 128.5-84 chr16 79379462 79379842 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 221085 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 156.25-55 chr17 75479883 75480217 + 0.5 NA intron (NM_001321148, intron 1 of 30) AluJo|SINE|Alu 3513 NM_001321148 9772 Hs.514474 NM_014738 ENSG00000177728 TMEM94 IDDCDF|KIAA0195 transmembrane protein 94 protein-coding 133.5-72 chr13 19636825 19637193 + 0.5 NA intron (NM_017520, intron 1 of 13) intron (NM_017520, intron 1 of 13) 3350 NM_017520 54737 Hs.269654 NM_017520 ENSG00000196199 MPHOSPH8 HSMPP8|TWA3|mpp8 M-phase phosphoprotein 8 protein-coding 127-173 chr8 79089347 79089656 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -242687 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 126.5-80 chr16 6324661 6325043 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) 305149 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 125.5-215 chr6 5475477 5475834 + 0.5 NA intron (NM_006567, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 -17580 NR_125848 101927972 Hs.668417 NR_125846 ENSG00000269985 LOC101927972 - uncharacterized LOC101927972 ncRNA 138.5-149 chr4 183642321 183642689 + 0.5 NA intron (NM_152682, intron 6 of 6) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 16680 NM_001307922 201965 Hs.133337 NM_152682 ENSG00000182552 RWDD4 FAM28A|RWDD4A RWD domain containing 4 protein-coding 181.75-67 chr2 149938443 149938861 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79461 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 126.5-267 chr9 130512875 130513295 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 66409 NR_027440 100272217 Hs.601255 NR_027440 LOC100272217 - uncharacterized LOC100272217 ncRNA 151.75-123 chr6 6894221 6894700 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -213283 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 116-73 chr18 2240608 2240869 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 330767 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 132.75-80 chr17 67699608 67700045 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18007 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 121.25-205 chr9 78459406 78459759 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 162457 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 154.5-130 chr3 152258818 152259271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9885 NM_001314057 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 144-102 chr5 83264771 83265258 + 0.5 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) intron (NM_022550, intron 7 of 7) 187467 NM_003401 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 115.25-102 chr2 110216448 110216708 + 0.5 NA intron (NM_001355251, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 -11565 NM_001128179 4867 Hs.280388 NM_000272 ENSG00000144061 NPHP1 JBTS4|NPH1|SLSN1 nephrocystin 1 protein-coding 116.5-150 chr22 28952427 28952793 + 0.5 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 35221 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 189.5-147 chr8 101247626 101248109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41803 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 129.5-83 chr15 92897902 92898359 + 0.5 NA non-coding (NR_037600, exon 5 of 5) non-coding (NR_037600, exon 5 of 5) -2194 NM_001042572 1106 Hs.220864 NM_001271 ENSG00000173575 CHD2 EEOC chromodomain helicase DNA binding protein 2 protein-coding 126.25-183 chr6 162638938 162639354 + 0.5 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -87986 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 124.5-33 chr11 57635493 57635977 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -5463 NR_029673 406919 NR_029673 ENSG00000208009 MIR130A MIRN130A|miRNA130A|mir-130a microRNA 130a ncRNA 135.75-175 chr5 110220889 110221376 + 0.5 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 292783 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 137.75-102 chr2 110668185 110668608 + 0.5 NA intron (NM_001278616, intron 5 of 23) intron (NM_001278616, intron 5 of 23) 9667 NM_004336 699 Hs.469649 NM_004336 ENSG00000169679 BUB1 BUB1A|BUB1L|hBUB1 BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase protein-coding 134.25-178 chr7 57173370 57173793 + 0.5 NA intron (NR_030766, intron 3 of 3) intron (NR_030766, intron 3 of 3) 6575 NR_030766 642006 Hs.562648 NR_030766 GUSBP10 - GUSB pseudogene 10 pseudo 141.5-205 chr6 157472157 157472581 + 0.5 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) -56763 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 114.75-178 chr7 97155972 97156371 + 0.5 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) L1MC3|LINE|L1 39578 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 145.5-31 chr11 41356290 41356702 + 0.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 103140 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 118.75-199 chr8 117900956 117901229 + 0.5 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 19821 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 174-58 chr20 59696234 59696731 + 0.5 NA intron (NM_001199506, intron 1 of 12) intron (NM_001199506, intron 1 of 12) 19821 NM_001199506 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 120.5-32 chr11 16989709 16990077 + 0.5 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) 24521 NM_001329631 144100 Hs.12332 NM_175058 ENSG00000166689 PLEKHA7 - pleckstrin homology domain containing A7 protein-coding 120.75-21 chr10 101916912 101917263 + 0.5 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) MLT2B2|LTR|ERVL -73167 NM_173192 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 163.25-55 chr17 71175503 71175833 + 0.5 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) L1MEd|LINE|L1 26511 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 138-15 chr10 129495317 129495660 + 0.5 NA intron (NM_002412, intron 1 of 4) intron (NM_002412, intron 1 of 4) 28247 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 133.5-94 chr16 2458316 2458739 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001323538, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001323538, exon 16 of 16) -1582 NM_025108 80178 Hs.534491 NM_025108 ENSG00000162062 TEDC2 C16orf59 tubulin epsilon and delta complex 2 protein-coding 130.75-57 chr14 66413970 66414318 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -72227 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 200.5-19 chr10 80772326 80772989 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 122860 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 113.75-202 chr8 138168217 138168602 + 0.5 NA intron (NM_015912, intron 11 of 19) intron (NM_015912, intron 11 of 19) -84864 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 142.25-18 chr10 32452649 32453067 + 0.5 NA intron (NR_109827, intron 2 of 8) intron (NR_109827, intron 2 of 8) 6718 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 126.5-5 chr1 35270288 35270612 + 0.5 NA intron (NM_005095, intron 1 of 29) L1ME2z|LINE|L1 1741 NM_005095 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 164.5-79 chr17 32828119 32828646 + 0.5 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) AluY|SINE|Alu 48742 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 200.5-18 chr10 75717465 75718247 + 0.5 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 5401 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 115.75-55 chr13 88087901 88088254 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54790 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 114.5-80 chr13 93602765 93603102 + 0.5 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 255540 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 131.75-190 chr6 81789943 81790327 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 24057 NR_126363 101928770 Hs.586239 NR_126363 ENSG00000224995 LINC01526 Lnc-FAM46A-1 long intergenic non-protein coding RNA 1526 ncRNA 124.75-154 chr4 60468653 60469137 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -453724 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 173.25-76 chr3 78021127 78021518 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27641 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 180.25-76 chr3 123115827 123116237 + 0.5 NA intron (NM_006810, intron 7 of 16) L2a|LINE|L2 -45762 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 120.5-114 chr2 64198465 64198882 + 0.5 NA intron (NR_033837, intron 3 of 5) intron (NR_033837, intron 3 of 5) 6812 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 129.75-22 chr10 28262897 28263262 + 0.5 NA intron (NM_173496, intron 2 of 18) AluSz|SINE|Alu 19044 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 117-132 chr4 57484805 57485190 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59125 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 211.25-9 chr10 23276307 23276843 + 0.5 NA intron (NM_001365862, intron 8 of 15) intron (NM_001365862, intron 8 of 15) -67382 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 122.75-180 chr6 165055704 165055959 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -233768 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 164.5-105 chr2 165244915 165245476 + 0.5 NA intron (NM_001371247, intron 1 of 26) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 4135 NM_001371247 112.25-71 chr15 100873244 100873497 + 0.5 NA non-coding (NR_160707, exon 3 of 3) non-coding (NR_160707, exon 3 of 3) -6461 NM_000693 220 Hs.459538 NM_000693 ENSG00000184254 ALDH1A3 ALDH1A6|ALDH6|MCOP8|RALDH3 aldehyde dehydrogenase 1 family member A3 protein-coding 158.5-72 chr15 64783093 64783535 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7725 NM_194272 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 154.5-178 chr7 153240741 153241158 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 171285 NR_125776 103724390 Hs.614280 NR_125776 ENSG00000234722 LINC01287 TCONS_l2_00027522 long intergenic non-protein coding RNA 1287 ncRNA 128-45 chr14 64787721 64788031 + 0.5 NA intron (NM_001024858, intron 14 of 34) intron (NM_001024858, intron 14 of 34) -2190 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 123.5-223 chrX 82235030 82235382 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 1033104 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 118.75-198 chr8 104357854 104358308 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18255 NM_030788 81501 Hs.652230 NM_030788 ENSG00000164935 DCSTAMP FIND|TM7SF4|hDC-STAMP dendrocyte expressed seven transmembrane protein protein-coding 130.5-24 chr1 217370360 217370801 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -232878 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 117.25-135 chr3 5297701 5298040 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47615 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 164.25-29 chr12 34627265 34627634 + 0.5 NA Intergenic HERVK-int|LTR|ERVK 604953 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 117.75-68 chr15 64246737 64247159 + 0.5 NA intron (NM_001329607, intron 4 of 11) intron (NM_001329607, intron 4 of 11) -83793 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 114.25-121 chr22 48683229 48683577 + 0.5 NA intron (NM_001082967, intron 2 of 3) intron (NM_001082967, intron 2 of 3) -96892 NR_039761 100616415 NR_039761 ENSG00000266887 MIR4535 - microRNA 4535 ncRNA 173-55 chr17 66481000 66481507 + 0.5 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 -64399 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 126.5-37 chr11 71970405 71970688 + 0.5 NA intron (NR_024148, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu -28363 NM_001039660 10068 Hs.591967 NM_005699 ENSG00000137496 IL18BP IL18BPa interleukin 18 binding protein protein-coding 152-6 chr1 75118633 75119099 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9568 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 163.5-17 chr10 4301726 4302162 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58032 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 113.75-5 chr1 44382003 44382452 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22933 NM_001319956 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 205.75-87 chr8 135809505 135810270 + 0.5 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 352431 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 112.25 chr1 3223601 3223942 + 0.5 NA intron (NM_022114, intron 2 of 16) intron (NM_022114, intron 2 of 16) 95796 NR_036215 100422968 NR_036215 ENSG00000283572 MIR4251 - microRNA 4251 ncRNA 115.75-184 chr6 37083818 37084136 + 0.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 78322 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 121.25-35 chr11 77694789 77695262 + 0.5 NA intron (NM_016578, intron 7 of 15) L1MD3|LINE|L1 -57219 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 156.25-46 chr15 77813333 77813760 + 0.5 NA intron (NM_001301186, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 5906 NM_001301192 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 113-118 chr3 76738428 76738815 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -301478 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 114.5-32 chr10 32242397 32242690 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 104615 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 116.5-127 chr2 145936685 145937078 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -650176 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 132.75-39 chr11 82284625 82285058 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) MER70A|LTR|ERVL 119072 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 159.5-89 chr19 33214048 33214450 + 0.5 NA intron (NM_019849, intron 2 of 10) intron (NM_019849, intron 2 of 10) 11601 NM_019849 56301 Hs.58679 NM_019849 ENSG00000130876 SLC7A10 ASC1|HASC-1|asc-1 solute carrier family 7 member 10 protein-coding 115.75-2 chr1 66936815 66937122 + 0.5 NA intron (NM_001077701, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu 6712 NM_001077704 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 138.5-131 chr3 23973193 23973680 + 0.5 NA intron (NM_005126, intron 7 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 27315 NM_001145425 9975 Hs.37288 NM_005126 ENSG00000174738 NR1D2 BD73|EAR-1R|REVERBB|REVERBbeta|RVR nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 protein-coding 112.25-171 chr5 124104141 124104551 + 0.5 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 334174 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 144.25-44 chr11 82804359 82804812 + 0.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -70721 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 178.75-55 chr21 28529164 28529708 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9882 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 217.25-31 chr16 1337059 1337779 + 0.5 NA intron (NM_001199096, intron 1 of 32) AluSx1|SINE|Alu 1222 NM_001199096 8938 Hs.458427 NM_003933 ENSG00000007516 BAIAP3 BAP3 BAI1 associated protein 3 protein-coding 122.75-121 chr22 31224728 31225000 + 0.5 NA intron (NM_005569, intron 1 of 15) MER1B|DNA|hAT-Charlie 12566 NM_005569 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 136.25-98 chr2 174644019 174644515 + 0.5 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) -9662 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 151-94 chr4 46999458 46999885 + 0.5 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 -6090 NM_000809 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 112.5-32 chr11 16013951 16014278 + 0.5 NA intron (NM_017508, intron 12 of 14) intron (NM_017508, intron 12 of 14) -44493 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 150.75-172 chr7 109435309 109435688 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 524715 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 113.5-127 chr2 121263876 121264212 + 0.5 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) intron (NM_014553, intron 2 of 14) 21158 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 122.25-10 chr1 176150296 176150743 + 0.5 NA intron (NM_001286644, intron 3 of 17) intron (NM_001286644, intron 3 of 17) 56725 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 142-176 chr9 119178860 119179397 + 0.5 NA intron (NM_014618, intron 7 of 7) intron (NM_014618, intron 7 of 7) 190307 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 120.25-155 chr4 97517775 97518176 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 151049 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 116-170 chr8 112523035 112523286 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 25 of 66) intron (NM_001363185, intron 25 of 66) -120333 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 115-121 chr4 70581301 70581689 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10761 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 160.25-107 chr4 33359855 33360403 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 679764 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 121.5-265 chr9 103957157 103957549 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42356 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 120.5-242 chr9 112845671 112845982 + 0.5 NA intron (NM_001012994, intron 6 of 8) HAL1|LINE|L1 45050 NM_033051 57864 Hs.512668 NM_033051 ENSG00000119457 SLC46A2 Ly110|TSCOT solute carrier family 46 member 2 protein-coding 129.75-51 chr12 69727066 69727526 + 0.5 NA intron (NR_159971, intron 1 of 2) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 11254 NR_159971 101928002 Hs.569096 NR_110072 LOC101928002 - uncharacterized LOC101928002 ncRNA 121.25-57 chr14 63441266 63441747 + 0.5 NA intron (NR_104104, intron 2 of 12) intron (NR_104104, intron 2 of 12) 66732 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 119.25-114 chr21 23665795 23666247 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -281186 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 112.25-139 chr3 150805486 150805862 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42505 NM_005067 6478 Hs.477959 NM_005067 ENSG00000181788 SIAH2 hSiah2 siah E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 116.5-215 chr6 70408056 70408433 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5160 NM_001331000 57579 Hs.211700 NM_020819 ENSG00000082269 FAM135A KIAA1411 family with sequence similarity 135 member A protein-coding 131-26 chr10 126096347 126096765 + 0.5 NA intron (NM_001288974, intron 10 of 18) intron (NM_001288974, intron 10 of 18) -123283 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 149.75-41 chr14 54431916 54432396 + 0.5 NA exon (NM_005776, exon 3 of 5) exon (NM_005776, exon 3 of 5) 9218 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 153-70 chr2 61291045 61291595 + 0.5 NA intron (NM_014709, intron 33 of 79) L1M4|LINE|L1 113902 NR_152210 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 115-112 chr3 127052333 127052751 + 0.5 NA Intergenic (CTGTGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 63948 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 116.75-12 chr1 160883048 160883335 + 0.5 NA intron (NM_017625, intron 3 of 7) L1MB4|LINE|L1 1989 NM_017625 55600 Hs.50813 NM_017625 ENSG00000179914 ITLN1 HL-1|HL1|INTL|ITLN|LFR|hIntL|omentin intelectin 1 protein-coding 121.5-244 chr8 85378448 85378776 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001128829) promoter-TSS (NM_001128829) -499 NM_001128831 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 175-56 chr18 5598191 5598764 + 0.5 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 30514 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 125.75-139 chr4 70274993 70275254 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32507 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 133.75-190 chr8 98968910 98969308 + 0.5 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 24667 NM_001142462 116039 Hs.253247 NM_053001 ENSG00000164920 OSR2 - odd-skipped related transciption factor 2 protein-coding 155-90 chr4 17958168 17958608 + 0.5 NA intron (NR_158563, intron 4 of 5) intron (NR_158563, intron 4 of 5) 63367 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 137-164 chr7 54570732 54571191 + 0.5 NA non-coding (NR_133927, exon 4 of 4) non-coding (NR_133927, exon 4 of 4) 13991 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 148.75-21 chr10 38511652 38512148 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 83754 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 123.75-86 chr19 28604421 28604829 + 0.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) AluJr|SINE|Alu -2063 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 116-106 chr3 97639620 97639882 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -124770 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 134.5-43 chr11 83666431 83666839 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) L3|LINE|CR1 15790 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 116.25-20 chr10 71361120 71361494 + 0.5 NA intron (NM_001174098, intron 5 of 5) AluJo|SINE|Alu -35613 NM_001171930 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 132.75-149 chr5 15415818 15416250 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84146 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 132-124 chr4 60247686 60248075 + 0.5 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -674739 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 154.25-30 chr11 110163784 110164157 + 0.5 NA intron (NM_033390, intron 5 of 5) AluSz6|SINE|Alu 70578 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 140.75-48 chr14 26577440 26577799 + 0.5 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) 18478 NM_001366397 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 113.75-17 chr1 231309133 231309511 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 28530 NM_175876 149371 Hs.356198 NM_175876 ENSG00000116903 EXOC8 EXO84|Exo84p|SEC84 exocyst complex component 8 protein-coding 145-74 chr2 88567852 88568361 + 0.5 NA intron (NM_004836, intron 14 of 16) intron (NM_004836, intron 14 of 16) 29386 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 131-67 chr17 28094671 28095034 + 0.5 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) intron (NM_016231, intron 1 of 10) 52175 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 120.75-44 chr14 70878222 70878592 + 0.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -29052 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 133-44 chr14 38489880 38490366 + 0.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -234030 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 150.75-8 chr1 51727528 51727985 + 0.5 NA intron (NM_148906, intron 3 of 22) FLAM_A|SINE|Alu -2094 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 134-139 chr5 14640884 14641334 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 11273 NR_132981 106635684 NR_132981 SNORD141B - small nucleolar RNA, C/D box 141B snoRNA 165-130 chr7 37885488 37885961 + 0.5 NA intron (NM_016616, intron 14 of 17) intron (NM_016616, intron 14 of 17) 31093 NM_003014 6424 Hs.658169 NM_003014 ENSG00000106483 SFRP4 FRP-4|FRPHE|FRZB-2|PYL|sFRP-4 secreted frizzled related protein 4 protein-coding 124.25-37 chr11 122965325 122965608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16368 NM_001098169 390259 Hs.449687 NM_001098169 ENSG00000188909 BSX BSX1 brain specific homeobox protein-coding 114.25-205 chr9 36805149 36805587 + 0.5 NA Intergenic hAT-N1_Mam|DNA|hAT-Tip100? 18231 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 150.25-123 chr5 108330453 108330860 + 0.5 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 51442 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 134.75-81 chr16 58904089 58904606 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -170031 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 115.25-163 chr5 54636536 54636941 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 66586 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 118.75-35 chr11 59918186 59918516 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24528 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 141.5-27 chr11 81934515 81934941 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -43892 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 202-12 chr10 75370595 75371051 + 0.5 NA intron (NR_120651, intron 1 of 3) intron (NR_120651, intron 1 of 3) -30705 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 189.75-4 chr1 96925135 96925782 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -170465 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 116.75-86 chr2 450794 451125 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41696 NR_146437 727944 NR_146436 ENSG00000223985 LINC01874 - long intergenic non-protein coding RNA 1874 ncRNA 141.5-237 chr8 126925669 126926095 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87272 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 188.25-84 chr4 95405079 95405586 + 0.5 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) LTR1B|LTR|ERV1 143641 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 158-131 chr7 87619856 87620441 + 0.5 NA intron (NM_001348945, intron 2 of 31) intron (NM_001348945, intron 2 of 31) -8250 NM_001134405 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 120-147 chr5 87462626 87462916 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -49738 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 174.25-71 chr17 74348474 74348992 + 0.5 NA intron (NM_153209, intron 9 of 19) intron (NM_153209, intron 9 of 19) 13135 NM_001080466 388419 NM_001080466 ENSG00000204347 BTBD17 BTBD17A|LGALS3BPL|TANGO10A BTB domain containing 17 protein-coding 155.25-116 chr3 49318112 49318516 + 0.5 NA intron (NM_001251877, intron 6 of 6) intron (NM_001251877, intron 6 of 6) 21739 NM_001251877 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 139.5-172 chr5 38520720 38521129 + 0.5 NA intron (NM_001127671, intron 5 of 19) L1MA4A|LINE|L1 35722 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 114.75-129 chr3 134128239 134128568 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -70755 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 134.5-169 chr5 36253263 36253734 + 0.5 NA intron (NM_001323279, intron 11 of 12) intron (NM_001323279, intron 11 of 12) -11219 NM_001287341 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 113.75-11 chr1 166133378 166133783 + 0.5 NA intron (NR_163271, intron 1 of 2) intron (NR_163271, intron 1 of 2) 21218 NR_030626 100126349 NR_030626 ENSG00000215952 MIR921 MIRN921|hsa-mir-921 microRNA 921 ncRNA 122.75-21 chr10 33368491 33368906 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33793 NM_001244973 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 120.75-153 chr7 7770064 7770377 + 0.5 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -51613 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 126.75-78 chr15 96117239 96117608 + 0.5 NA intron (NR_158193, intron 4 of 7) L1MA9|LINE|L1 10418 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 121.25-19 chr10 56681121 56681530 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -320052 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 123.5-186 chr6 50077560 50077955 + 0.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27828 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 116-99 chr22 48473216 48473540 + 0.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -16175 NM_001082967 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 125.75-165 chr6 116618495 116618807 + 0.5 NA intron (NM_001010892, intron 1 of 5) AluSg4|SINE|Alu 2172 NM_001010892 345895 Hs.160380 NM_001010892 ENSG00000111834 RSPH4A CILD11|RSHL3|RSPH6B|dJ412I7.1 radial spoke head component 4A protein-coding 142.75-160 chr5 124799123 124799610 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54254 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 201.75-73 chr5 39591199 39591767 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71052 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 154.25-3 chr1 54896388 54896808 + 0.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -9403 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 173.25-47 chr17 52603152 52603643 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 212875 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 121.75-125 chr3 185961830 185962308 + 0.5 NA intron (NR_151491, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 2126 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 137.25-22 chr10 122992531 122993005 + 0.5 NA non-coding (NR_073479, exon 6 of 6) non-coding (NR_073479, exon 6 of 6) 12367 NM_001363531 118672 Hs.281004 NM_153336 ENSG00000179988 PSTK C10orf89 phosphoseryl-tRNA kinase protein-coding 173.25-43 chr15 63238866 63239314 + 0.5 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -38460 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 203-99 chr8 66424659 66425210 + 0.5 NA intron (NR_040434, intron 2 of 2) LTR33|LTR|ERVL 4043 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 144.75-155 chr7 48441192 48441655 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 42 of 61) intron (NM_152701, intron 42 of 61) 269965 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 121-150 chr4 175049107 175049513 + 0.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 130952 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 202.5-129 chr6 71329980 71330563 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41460 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 141.25-67 chr17 43310349 43310812 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -10349 NR_002716 6066 NR_002716 ENSG00000274585 RNU2-1 RNU2|U2 RNA, U2 small nuclear 1 snRNA 126.75-258 chrX 40079505 40079980 + 0.5 NA intron (NM_001123384, intron 1 of 13) intron (NM_001123384, intron 1 of 13) 17724 NM_001123385 54880 Hs.659681 NM_017745 ENSG00000183337 BCOR ANOP2|MAA2|MCOPS2 BCL6 corepressor protein-coding 169-69 chr4 151720525 151720915 + 0.5 NA intron (NM_001363341, intron 2 of 11) MIRc|SINE|MIR 40287 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 154.5-181 chr8 42843941 42844317 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_199003) promoter-TSS (NM_199003) -798 NM_199003 55145 Hs.7432 NM_018105 ENSG00000131931 THAP1 DYT6 THAP domain containing 1 protein-coding 134.75-178 chr5 105122289 105122621 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 22981 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 129.25-59 chr15 71226467 71226864 + 0.5 NA intron (NM_024817, intron 3 of 16) intron (NM_024817, intron 3 of 16) -37606 NR_120348 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 128-117 chr4 116391747 116392042 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 92169 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 136.75-155 chr5 25927028 25927370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 736246 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 169.25-95 chr5 36224957 36225394 + 0.5 NA intron (NM_001085411, intron 4 of 11) intron (NM_001085411, intron 4 of 11) 16216 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 147.5-19 chr10 36666812 36667168 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -458867 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 133.5-62 chr12 42381325 42381800 + 0.5 NA intron (NM_001364830, intron 4 of 6) intron (NM_001364830, intron 4 of 6) 49764 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 113.75-37 chr11 64094459 64094793 + 0.5 NA intron (NM_014067, intron 3 of 10) intron (NM_014067, intron 3 of 10) -9264 NM_013280 23769 Hs.584876 NM_013280 ENSG00000126500 FLRT1 SPG68 fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 protein-coding 132.5-199 chr5 86678770 86679290 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 58524 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 118.25-106 chr2 151514162 151514437 + 0.5 NA intron (NM_001271208, intron 160 of 182) intron (NM_001271208, intron 160 of 182) 104397 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 139.75-60 chr15 66607008 66607319 + 0.5 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) intron (NR_110372, intron 1 of 4) 24973 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 132.25-149 chr5 26193262 26193675 + 0.5 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 845118 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 162.5-178 chr8 113180807 113181311 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 196093 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 118.5-130 chr3 110935824 110936217 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 133939 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 118.75-2 chr1 38544173 38544588 + 0.5 NA Intergenic LTR88a|LTR|Gypsy? 69184 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 196.5-167 chr8 115601860 115602415 + 0.5 NA intron (NM_001282902, intron 3 of 5) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 65876 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 141.5-60 chr14 91971487 91972028 + 0.5 NA intron (NM_004239, intron 20 of 20) intron (NM_004239, intron 20 of 20) -24055 NM_006329 10516 Hs.332708 NM_006329 ENSG00000140092 FBLN5 ADCL2|ARCL1A|ARMD3|DANCE|EVEC|FIBL-5|HNARMD|UP50 fibulin 5 protein-coding 130-48 chr15 60857478 60857820 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 176080 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 114.5-250 chr8 21953892 21954324 + 0.5 NA intron (NM_015024, intron 1 of 27) intron (NM_015024, intron 1 of 27) 34446 NR_156173 23039 Hs.172685 NM_015024 ENSG00000130227 XPO7 EXP7|RANBP16 exportin 7 protein-coding 112.25-64 chr14 71364129 71364452 + 0.5 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) L1ME1|LINE|L1 -34047 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 119-78 chr2 19979973 19980436 + 0.5 NA intron (NM_001006657, intron 4 of 27) L2b|LINE|L2 9901 NM_020779 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 161-48 chr16 71861211 71861785 + 0.5 NA intron (NM_001201556, intron 6 of 6) intron (NM_001201556, intron 6 of 6) 15522 NM_001137675 342371 Hs.743239 NM_001137675 ENSG00000224470 ATXN1L BOAT|BOAT1 ataxin 1 like protein-coding 148-139 chr9 82659211 82659783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 403645 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 112.75-139 chr3 152168937 152169226 + 0.5 NA intron (NR_136178, intron 2 of 2) intron (NR_136178, intron 2 of 2) 36348 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 132.5-225 chr7 33425817 33426251 + 0.5 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 296470 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 130-74 chr2 126050730 126051135 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 67053 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 215.5-113 chr9 31136307 31137034 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 244820 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 130.5-220 chr7 3998844 3999214 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 14 of 44) intron (NM_152744, intron 14 of 44) -130656 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 127.5-2 chr1 16372272 16372616 + 0.5 NA intron (NR_073500, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 5202 NM_001114600 26099 Hs.252967 NM_001114600 ENSG00000055070 SZRD1 C1orf144 SUZ RNA binding domain containing 1 protein-coding 129.5-54 chr12 42256129 42256507 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -17950 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 153-2 chr1 111039078 111039566 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -75378 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 114.5-278 chr9 81895909 81896356 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -17305 NR_026851 347127 Hs.215235 NM_198509 ENSG00000240632 SPATA31D5P FAM75D5|FAM75D5P SPATA31 subfamily D member 5, pseudogene pseudo 117.5-63 chr14 65640933 65641189 + 0.5 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) L1ME1|LINE|L1 169959 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 124.75-97 chr17 59125287 59125647 + 0.5 NA intron (NM_182620, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 12405 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 134.75-170 chr5 6177515 6177859 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 159605 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 178-87 chr6 73109026 73109505 + 0.5 NA intron (NM_001160132, intron 6 of 13) intron (NM_001160132, intron 6 of 13) 34249 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 132.5-66 chr14 35525561 35525980 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8394 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 132.5-3 chr1 11823878 11824366 + 0.5 NA intron (NM_001286, intron 7 of 22) MER58D|DNA|hAT-Charlie -16197 NR_037806 100379251 Hs.710015 NR_037806 NPPA-AS1 NPPA-AS|NPPAAS NPPA antisense RNA 1 ncRNA 181-51 chr2 26373765 26374441 + 0.5 NA intron (NR_137633, intron 5 of 9) L1MC5|LINE|L1 -27314 NM_153835 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 146-128 chr8 100371636 100371989 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -10951 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 116-93 chr20 14783085 14783391 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 146280 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 155-117 chr6 37067927 37068384 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 62500 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 126-20 chr10 57543860 57544204 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -239473 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 119.5-245 chr8 132922159 132922604 + 0.5 NA intron (NM_003235, intron 21 of 47) L2a|LINE|L2 55423 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 151.25-142 chr4 104891249 104891734 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -254384 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 128.25-203 chr8 53859707 53860192 + 0.5 NA intron (NM_001286674, intron 1 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 8154 NM_170587 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 137-151 chr6 63570183 63570637 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1602 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 114.5-176 chr3 63915117 63915396 + 0.5 NA intron (NM_001177387, intron 3 of 12) intron (NM_001177387, intron 3 of 12) -3484 NR_148359 100861563 NR_148359 ENSG00000280620 SCAANT1 ATXN7-AS1 SCA7/ATXN7 antisense RNA 1 ncRNA 248.25-18 chr13 57718321 57719090 + 0.5 NA intron (NM_001040429, intron 3 of 3) intron (NM_001040429, intron 3 of 3) 86961 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 168-116 chr7 2992504 2993094 + 0.5 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) AluJb|SINE|Alu 51068 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 114.75-175 chr7 47886836 47887236 + 0.5 NA intron (NM_138295, intron 17 of 56) intron (NM_138295, intron 17 of 56) 61455 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 147.25-127 chr7 23635597 23636026 + 0.5 NA intron (NM_138771, intron 3 of 3) intron (NM_138771, intron 3 of 3) 38429 NM_138771 90693 Hs.232296 NM_138771 ENSG00000169193 CCDC126 - coiled-coil domain containing 126 protein-coding 148-117 chr7 7591128 7591683 + 0.5 NA intron (NR_163250, intron 8 of 11) AluJb|SINE|Alu 23379 NM_001370078 54468 Hs.520215 NM_019005 ENSG00000164654 MIOS MIO|Sea4|Yulink meiosis regulator for oocyte development protein-coding 115.75-157 chr4 90339157 90339527 + 0.5 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 104311 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 154.75-77 chr2 131108651 131109105 + 0.5 NA intron (NM_001309448, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 4031 NM_001267063 55041 Hs.469944 NM_017958 ENSG00000115762 PLEKHB2 EVT2 pleckstrin homology domain containing B2 protein-coding 124.5-67 chr14 88018208 88018670 + 0.5 NA TTS (NR_110121) TTS (NR_110121) -6111 NR_046094 283587 Hs.525513 NR_046094 ENSG00000258867 LINC01146 - long intergenic non-protein coding RNA 1146 ncRNA 202.75-31 chr13 42038647 42039170 + 0.5 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 -1128 NM_001204504 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 141.75-69 chr16 71983196 71983626 + 0.5 NA intron (NM_181536, intron 6 of 29) AluJb|SINE|Alu 16567 NM_181536 342372 Hs.675286 NM_181536 ENSG00000277481 PKD1L3 - polycystin 1 like 3, transient receptor potential channel interacting protein-coding 136.75-37 chr10 122475745 122476224 + 0.5 NA intron (NM_002775, intron 1 of 8) intron (NM_002775, intron 1 of 8) 14431 NM_002775 5654 Hs.501280 NM_002775 ENSG00000166033 HTRA1 ARMD7|CADASIL2|CARASIL|HtrA|L56|ORF480|PRSS11 HtrA serine peptidase 1 protein-coding 223-70 chr6 37136229 37136907 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33584 NM_002648 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 124-28 chr12 22911630 22912074 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -263784 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 126-5 chr1 78827993 78828365 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 178348 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 154.25-96 chr20 28842357 28842788 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -237818 NR_132316 102723316 NR_132316 FRG1DP - FSHD region gene 1 family member D, pseudogene pseudo 169.5-136 chr5 57305923 57306441 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 92108 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 152.5-88 chr2 82017423 82017884 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -550707 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 157-104 chr6 40461319 40461724 + 0.5 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 83184 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 124.5-71 chr15 59223668 59224038 + 0.5 NA intron (NM_004998, intron 8 of 27) intron (NM_004998, intron 8 of 27) 17010 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 129-78 chr17 59704437 59704824 + 0.5 NA intron (NM_001015509, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 2968 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 133.25-100 chr2 112520513 112520978 + 0.5 NA intron (NM_153712, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu -21170 NM_001137604 84172 Hs.745127 NM_019014 ENSG00000125630 POLR1B RPA135|RPA2|Rpo1-2 RNA polymerase I subunit B protein-coding 195.75-118 chr8 106967366 106967972 + 0.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -197425 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 167-13 chr1 197006295 197006797 + 0.5 NA intron (NM_030787, intron 9 of 9) AluSp|SINE|Alu 29009 NM_030787 81494 Hs.282594 NM_030787 ENSG00000134389 CFHR5 CFHL5|CFHR5D|FHR-5|FHR5 complement factor H related 5 protein-coding 116.25-77 chr15 81387460 81387780 + 0.5 NA intron (NR_120365, intron 6 of 6) intron (NR_120365, intron 6 of 6) -13407 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 155.75-163 chr8 113841712 113842240 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -405037 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 126.5-58 chr14 35647165 35647559 + 0.5 NA intron (NM_014990, intron 30 of 40) intron (NM_014990, intron 30 of 40) 113198 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 134.75-214 chr8 88971057 88971527 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -643809 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 136.5-108 chr2 50163105 50163537 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 184433 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 157.75-36 chr12 107305533 107306040 + 0.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -12648 NM_001018072 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 122-176 chr7 110310238 110310627 + 0.5 NA Intergenic (AGAGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -350219 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 146-90 chr3 22630886 22631261 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 571505 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 132.5-210 chr6 43587018 43587437 + 0.5 NA intron (NM_001291969, intron 2 of 8) intron (NM_001291969, intron 2 of 8) 11042 NM_001291970 5429 Hs.655467 NM_006502 ENSG00000170734 POLH RAD30|RAD30A|XP-V|XPV DNA polymerase eta protein-coding 178.5-36 chr12 91582776 91583220 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -400181 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 142-117 chr4 16127203 16127590 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43373 NM_006017 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 114.75-11 chr1 154947305 154947643 + 0.5 NA exon (NM_001317734, exon 8 of 10) exon (NM_001317734, exon 8 of 10) -4816 NM_001323012 10654 Hs.30954 NM_006556 ENSG00000163344 PMVK HUMPMKI|PMK|PMKA|PMKASE|POROK1 phosphomevalonate kinase protein-coding 132.75-34 chr10 118598602 118599092 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3199 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 156.75-64 chr15 94404869 94405277 + 0.5 NA intron (NM_001159643, intron 16 of 19) intron (NM_001159643, intron 16 of 19) 49143 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 130.5-154 chr21 14598465 14598871 + 0.5 NA TTS (NR_046512) TTS (NR_046512) -15266 NM_001256370 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 170.5-169 chr7 9123538 9123958 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -510522 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 140.5-181 chr5 90154226 90154688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 135614 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 137.75-104 chr2 116076264 116076688 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 732661 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 177-103 chr9 102254908 102255379 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -264494 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 164.25-119 chr4 113269343 113269892 + 0.5 NA intron (NM_001354275, intron 15 of 43) L1PA7|LINE|L1 -23222 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 130.25-55 chr14 31044390 31044849 + 0.5 NA intron (NM_001254728, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 17976 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 140.25-99 chr2 173542478 173542885 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 187809 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 123-74 chr16 61067656 61068098 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12111 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 186.75-74 chr3 140214042 140214769 + 0.5 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 279220 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 116.5-130 chr2 169985806 169986210 + 0.5 NA intron (NM_172070, intron 24 of 38) intron (NM_172070, intron 24 of 38) 158500 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 175.25-37 chr12 40029046 40029660 + 0.5 NA intron (NM_052885, intron 2 of 9) intron (NM_052885, intron 2 of 9) 76728 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 151.25-20 chr10 78592468 78592913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 325348 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 140.5-18 chr10 91725433 91725872 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 72544 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 121.75-155 chr6 4360832 4361294 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -127735 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 144.25-165 chr5 172359042 172359438 + 0.5 NA intron (NM_001017995, intron 7 of 12) AluJr|SINE|Alu 73643 NR_130933 100288254 Hs.531911 NM_001007542 LOC100288254 - uncharacterized LOC100288254 ncRNA 164.5-16 chr10 34759170 34759606 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 55908 NM_001184785 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 160.75-162 chrX 136830739 136831060 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 48372 NR_002735 26787 NR_002735 ENSG00000206979 SNORD61 HBII-342|RNU61|U61 small nucleolar RNA, C/D box 61 snoRNA 112.25-58 chr14 55222885 55223313 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31514 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 175-114 chr7 3200332 3200922 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42054 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 123.25-163 chr5 76963283 76963676 + 0.5 NA intron (NM_001882, intron 6 of 6) intron (NM_001882, intron 6 of 6) 10434 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 179.25-9 chr1 182821308 182821924 + 0.5 NA intron (NM_001200052, intron 10 of 11) intron (NM_001200052, intron 10 of 11) -17731 NR_033302 1660 Hs.191518 NM_001357 ENSG00000135829 DHX9 DDX9|LKP|NDH2|NDHII|RHA DExH-box helicase 9 protein-coding 117-133 chr4 62066995 62067430 + 0.5 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) intron (NM_001371343, intron 23 of 23) 94553 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 116.75-5 chr1 70166165 70166440 + 0.5 NA intron (NM_017768, intron 9 of 14) intron (NM_017768, intron 9 of 14) 39277 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 159.5-132 chr22 32766714 32767066 + 0.5 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -33926 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 118.5-217 chr8 83582206 83582518 + 0.5 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 178604 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 116.5-84 chr16 8379092 8379508 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 210538 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 141.75-32 chr11 44993680 44994100 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19988 NR_026681 221122 Hs.551656 NR_026681 ENSG00000254654 LINC02685 - long intergenic non-protein coding RNA 2685 ncRNA 122.25-57 chr14 46464091 46464450 + 0.5 NA intron (NR_102701, intron 5 of 5) intron (NR_102701, intron 5 of 5) -7089 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 133.75-37 chr12 13087606 13088023 + 0.5 NA intron (NM_001367362, intron 5 of 6) intron (NM_001367362, intron 5 of 6) 7861 NM_001368007 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 173.75-135 chr6 99624400 99624870 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 17861 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 134.75-104 chr2 19407240 19407734 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -48864 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 146.75-165 chr8 126228270 126228777 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -96972 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 117.25-84 chr15 72120708 72120992 + 0.5 NA intron (NM_145204, intron 1 of 1) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 2447 NM_001172111 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 120-61 chr16 51002652 51003038 + 0.5 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu -14913 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 116-38 chr12 100257376 100257719 + 0.5 NA intron (NM_152317, intron 3 of 4) AluSp|SINE|Alu 9532 NR_135073 120863 Hs.653118 NM_152317 ENSG00000166153 DEPDC4 DEP.4 DEP domain containing 4 protein-coding 143.5-15 chr1 205305734 205306295 + 0.5 NA intron (NM_030952, intron 5 of 6) MIRc|SINE|MIR 15731 NM_030952 81788 Hs.497512 NM_030952 ENSG00000163545 NUAK2 SNARK NUAK family kinase 2 protein-coding 190-73 chr7 43217463 43218074 + 0.5 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) intron (NM_015052, intron 2 of 29) 66873 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 153.75-162 chrX 149060933 149061372 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 342061 NM_001170628 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 112.75-81 chr18 49388558 49388833 + 0.5 NA intron (NM_001353210, intron 3 of 16) L1MB3|LINE|L1 71950 NM_001353210 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 161-98 chr5 126632317 126632849 + 0.5 NA exon (NM_207408, exon 2 of 3) exon (NM_207408, exon 2 of 3) 878 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 168.25-61 chr17 44250757 44251354 + 0.5 NA intron (NM_000342, intron 19 of 19) MIR|SINE|MIR 17080 NM_000342 6521 Hs.210751 NM_000342 ENSG00000004939 SLC4A1 AE1|BND3|CD233|CHC|DI|EMPB3|EPB3|FR|RTA1A|SAO|SPH4|SW|WD|WD1|WR solute carrier family 4 member 1 (Diego blood group) protein-coding 166-55 chr19 31137023 31137611 + 0.5 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -30193 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 152.5-27 chr11 80852622 80853079 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -90047 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 126.5-117 chr2 107549090 107549432 + 0.5 NA intron (NR_146968, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 19842 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 126-99 chr2 119314732 119315119 + 0.5 NA intron (NM_001322332, intron 3 of 4) L1ME2|LINE|L1 51817 NM_001322330 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 210.75-87 chr6 106655838 106656634 + 0.5 NA intron (NM_018292, intron 9 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger -25745 NM_001318746 84816 Hs.155839 NM_032730 ENSG00000130347 RTN4IP1 NIMP|OPA10 reticulon 4 interacting protein 1 protein-coding 149.75-70 chr18 49743034 49743551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 70241 NM_006111 10449 Hs.200136 NM_006111 ENSG00000167315 ACAA2 DSAEC acetyl-CoA acyltransferase 2 protein-coding 165-74 chr2 169867870 169868278 + 0.5 NA intron (NM_172070, intron 1 of 38) intron (NM_172070, intron 1 of 38) 40566 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 154.25-170 chr8 103907671 103908050 + 0.5 NA intron (NM_001282881, intron 2 of 20) AluY|SINE|Alu 88640 NM_014677 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 151.75-9 chr1 152873412 152873882 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -4675 NM_030663 4184 Hs.111850 NM_030663 ENSG00000163206 SMCP HSMCSGEN1|MCS|MCSP sperm mitochondria associated cysteine rich protein protein-coding 124.25-15 chr1 191099685 191100052 + 0.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 128630 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 120.75-93 chr20 37527898 37528146 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_006698) promoter-TSS (NM_006698) -91 NM_001167820 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 112.25-56 chr14 48497812 48498108 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -702946 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 121-12 chr1 174689013 174689491 + 0.5 NA intron (NM_001366446, intron 15 of 25) intron (NM_001366446, intron 15 of 25) -11287 NM_001366451 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 205.25-85 chr5 61282150 61282741 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17516 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 188-26 chr14 86883597 86884330 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -21815 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 149.25-22 chr10 96248460 96248862 + 0.5 NA intron (NM_013314, intron 1 of 16) L1M5|LINE|L1 22855 NR_047681 29760 Hs.665244 NM_013314 ENSG00000095585 BLNK AGM4|BASH|BLNK-S|LY57|SLP-65|SLP65|bca B cell linker protein-coding 144-20 chr10 62250374 62250794 + 0.5 NA intron (NM_001282941, intron 2 of 4) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 18260 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 148.5-29 chr10 73467711 73468075 + 0.5 NA intron (NM_001142353, intron 8 of 13) intron (NM_001142353, intron 8 of 13) -27859 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 137.5-192 chr5 83945451 83945799 + 0.5 NA intron (NM_001278642, intron 9 of 9) intron (NM_001278642, intron 9 of 9) -224770 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 114-97 chr22 49990851 49991280 + 0.5 NA TTS (NM_001371417) TTS (NM_001371417) 21700 NM_001371416 119.5-214 chr7 46320143 46320567 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 376767 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 169-103 chr7 121241519 121241918 + 0.5 NA intron (NM_001105533, intron 16 of 17) intron (NM_001105533, intron 16 of 17) -83649 NM_016087 51384 Hs.272375 NM_016087 ENSG00000002745 WNT16 - Wnt family member 16 protein-coding 167.75-4 chr1 44425111 44425670 + 0.5 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 1389 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 140.5-86 chr17 74426424 74426797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5478 NM_022036 55890 Hs.446438 NM_018653 ENSG00000170412 GPRC5C RAIG-3|RAIG3 G protein-coupled receptor class C group 5 member C protein-coding 133.25-51 chr13 108146545 108146948 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 68036 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 119.75-11 chr1 188319226 188319517 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 875743 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 154-123 chr7 85625370 85625904 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 204515 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 141.75-58 chr14 72139446 72139936 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 206164 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 132.25-64 chr15 66287976 66288401 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5121 NM_001323937 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 136.25-12 chr10 53535564 53536100 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -764132 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 159.5-77 chr17 56332576 56333064 + 0.5 NA intron (NM_001370326, intron 4 of 20) L1M5|LINE|L1 179345 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 201.75-20 chr12 31434042 31434739 + 0.5 NA intron (NM_144973, intron 7 of 20) intron (NM_144973, intron 7 of 20) -65089 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 123.5-129 chr3 36602633 36603000 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 137045 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 130.25-154 chr4 163478035 163478521 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -4524 NM_032136 84076 Hs.303923 NM_032136 ENSG00000151005 TKTL2 - transketolase like 2 protein-coding 148.5-213 chr7 82207910 82208338 + 0.5 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 198947 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 144-108 chr5 162361370 162361742 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 293914 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 149.75-80 chr2 54336632 54337074 + 0.5 NA intron (NM_001100396, intron 2 of 4) intron (NM_001100396, intron 2 of 4) 5969 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 130-42 chr14 64139382 64139737 + 0.5 NA intron (NM_015180, intron 79 of 114) AluSx1|SINE|Alu -44434 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 122.5-218 chr8 53575538 53575847 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -51727 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 112.75-107 chr2 170414607 170414984 + 0.5 NA intron (NM_001083615, intron 22 of 33) L1MD|LINE|L1 -63852 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 152.5-176 chr7 29953561 29954059 + 0.5 NA intron (NM_001145514, intron 3 of 7) intron (NM_001145514, intron 3 of 7) 35991 NM_014766 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 153-83 chr20 11760722 11761242 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 109733 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 167.75-85 chr20 50164316 50164865 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -7980 NR_109943 101927541 Hs.570391 NR_109943 ENSG00000231742 LINC01273 - long intergenic non-protein coding RNA 1273 ncRNA 125.75-176 chr7 109662130 109662551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 297873 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 142-141 chr6 55622114 55622505 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -43095 NM_001287753 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 136.25-62 chr14 81729432 81729846 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 13499 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 133.5-95 chr16 10377575 10378058 + 0.5 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -8245 NR_147927 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 162.25-30 chr11 82367205 82367743 + 0.5 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) intron (NR_120571, intron 1 of 7) 36439 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 155.25-88 chr2 31296681 31297033 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 62705 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 129-30 chr11 13153374 13153740 + 0.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -123095 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 121-158 chr5 58265783 58266195 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -143648 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 118.5-161 chr5 25686441 25686860 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 495697 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 128.25-190 chr7 38566219 38566518 + 0.5 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) FLAM_A|SINE|Alu 65005 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 115-131 chr5 39432403 39432811 + 0.5 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -7374 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 173.5-106 chr3 185895449 185895815 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42382 NM_001243879 6434 Hs.533122 NM_004593 ENSG00000136527 TRA2B Htra2-beta|PPP1R156|SFRS10|SRFS10|TRA2-BETA|TRAN2B transformer 2 beta homolog protein-coding 214.25-73 chr6 93996171 93996801 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 278183 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 191.25-87 chr5 66801138 66801661 + 0.5 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) intron (NM_001290228, intron 3 of 4) -27374 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 164 chr1 24954861 24955489 + 0.5 NA intron (NM_001320672, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 9835 NM_001031680 864 Hs.170019 NM_004350 ENSG00000020633 RUNX3 AML2|CBFA3|PEBP2aC RUNX family transcription factor 3 protein-coding 127.25-171 chr5 107610930 107611325 + 0.5 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 59810 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 138-137 chr6 42135098 42135574 + 0.5 NA intron (NM_001164446, intron 1 of 4) intron (NM_001164446, intron 1 of 4) 7284 NM_001164446 647024 Hs.444277 NM_001164446 ENSG00000188112 C6orf132 bA7K24.2 chromosome 6 open reading frame 132 protein-coding 155.5-166 chr5 53789718 53790168 + 0.5 NA intron (NR_147168, intron 1 of 3) L1PA5|LINE|L1 29739 NR_147167 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 121.75-163 chr6 112840812 112841297 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 493724 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 122-196 chr9 101547674 101548010 + 0.5 NA intron (NM_019592, intron 9 of 19) L1MA9|LINE|L1 13989 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 147.5-138 chr3 24139862 24140216 + 0.5 NA intron (NM_001354708, intron 7 of 9) intron (NM_001354708, intron 7 of 9) -11285 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 209.75-101 chr8 123175006 123175636 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3726 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 122.75-57 chr16 74821085 74821505 + 0.5 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -46475 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 156.75-22 chr10 52458643 52459021 + 0.5 NA intron (NR_120641, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR -3560 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 163.5-129 chr3 106726902 106727405 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 513485 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 135-173 chr7 113765043 113765570 + 0.5 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 153703 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 120.75-28 chr11 114483426 114483725 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 44108 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 145.75-121 chr5 27781231 27781632 + 0.5 NA Intergenic MER54B|LTR|ERVL 309139 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 181.25-125 chr8 77824497 77825060 + 0.5 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL 374081 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 121-175 chr7 17698228 17698594 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -139502 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 170.25-53 chr16 53128184 53128524 + 0.5 NA intron (NM_025134, intron 1 of 38) AluSx|SINE|Alu -2658 NM_001352127 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 156.5-210 chr9 131533148 131533520 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2059 NM_001135954 83549 Hs.9597 NM_031432 ENSG00000130717 UCK1 URK1 uridine-cytidine kinase 1 protein-coding 158.5-54 chr13 52473779 52474205 + 0.5 NA exon (NM_001286686, exon 8 of 9) exon (NM_001286686, exon 8 of 9) -15001 NR_002793 220115 Hs.528448 NR_002793 TPTE2P3 TPTEps1 transmembrane phosphoinositide 3-phosphatase and tensin homolog 2 pseudogene 3 pseudo 122.5-139 chr22 26496348 26496607 + 0.5 NA intron (NM_001346861, intron 11 of 14) intron (NM_001346861, intron 11 of 14) 12600 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 114.25-168 chr6 94372255 94372612 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 654130 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 118.5-19 chr10 38155421 38155844 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -20039 NR_024524 100129055 Hs.148265 NR_024524 LOC100129055 - cyclin Y like 1 pseudogene pseudo 114.5-148 chr2 173489135 173489549 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 134470 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 115-47 chr14 59037796 59038125 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -150707 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 154.5-19 chr1 236507785 236508262 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10191 NM_201545 3964 Hs.4082 NM_006499 ENSG00000116977 LGALS8 Gal-8|PCTA-1|PCTA1|Po66-CBP galectin 8 protein-coding 132.25-153 chr5 54550247 54550593 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32661 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 143.75-123 chr3 128595891 128596355 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -20037 NR_125802 23434 Hs.194283 NM_007354 ENSG00000198685 LINC01565 C3orf27|GR6 long intergenic non-protein coding RNA 1565 ncRNA 132.5-181 chr4 84295625 84295978 + 0.5 NA intron (NR_125909, intron 1 of 8) intron (NR_125909, intron 1 of 8) 3368 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 152.5-34 chr12 55824085 55824474 + 0.5 NA intron (NM_032364, intron 2 of 6) intron (NM_032364, intron 2 of 6) -5329 NR_036476 440104 Hs.731828 NM_001013700 ENSG00000182796 TMEM198B - transmembrane protein 198B (pseudogene) pseudo 125.5-100 chr16 67587601 67587992 + 0.5 NA intron (NM_001191022, intron 2 of 9) intron (NM_001191022, intron 2 of 9) 17023 NM_001363916 10664 Hs.368367 NM_006565 ENSG00000102974 CTCF MRD21 CCCTC-binding factor protein-coding 130.75 chr1 28926719 28927074 + 0.5 NA intron (NM_001166006, intron 1 of 14) intron (NM_001166006, intron 1 of 14) 12320 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 156.25-21 chr10 102783019 102783511 + 0.5 NA intron (NM_017787, intron 1 of 3) intron (NM_017787, intron 1 of 3) 7044 NM_017787 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 112.25-45 chr12 51434905 51435313 + 0.5 NA intron (NM_001258403, intron 1 of 16) L1MC5|LINE|L1 9992 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 129.5-248 chrX 74193589 74194090 + 0.5 NA intron (NR_028379, intron 5 of 6) L1MA8|LINE|L1 24622 NR_030398 693122 NR_030398 ENSG00000202566 MIR421 MIRN421|hsa-mir-421 microRNA 421 ncRNA 166-62 chr2 89001100 89001719 + 0.5 NA Intergenic MER70-int|LTR|ERVL 189039 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 181.25-8 chr1 118567881 118568592 + 0.5 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -383008 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 116.75-191 chr8 13923869 13924255 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 294372 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 124.25-113 chr2 229766002 229766297 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001284215, exon 41 of 41) 3' UTR (NM_001284215, exon 41 of 41) -51594 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 151.5-183 chr7 105128400 105128916 + 0.5 NA intron (NM_182692, intron 13 of 15) intron (NM_182692, intron 13 of 15) 114453 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 125.25-89 chr18 42519026 42519368 + 0.5 NA intron (NR_046454, intron 6 of 6) intron (NR_046454, intron 6 of 6) 332529 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 114.5-195 chr4 119007958 119008314 + 0.5 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 119282 NM_133477 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 122.75-171 chr5 154066849 154067327 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28121 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 128-168 chr8 131912971 131913369 + 0.5 NA intron (NM_001323555, intron 1 of 22) intron (NM_001323555, intron 1 of 22) -3603 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 120.5-100 chr18 402737 403010 + 0.5 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 97828 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 158.5-39 chr11 33076638 33076999 + 0.5 NA non-coding (NR_015451, exon 1 of 1) non-coding (NR_015451, exon 1 of 1) 668 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 122.5-116 chr2 151494788 151495183 + 0.5 NA intron (NM_001271208, intron 174 of 182) intron (NM_001271208, intron 174 of 182) 85083 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 142.25-12 chr1 228436121 228436663 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -11067 NM_003493 8290 Hs.248171 NM_003493 ENSG00000168148 HIST3H3 H3.4|H3/g|H3FT|H3t histone cluster 3 H3 protein-coding 151.75-13 chr1 188765787 188766266 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1322398 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 170.25-96 chr3 67683225 67683901 + 0.5 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) intron (NR_109992, intron 3 of 6) 28866 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 125-146 chr7 2780852 2781298 + 0.5 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) intron (NM_007353, intron 2 of 3) -17935 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 162.75-57 chr18 13205516 13205956 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13024 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 144.25-30 chr10 85482243 85482660 + 0.5 NA intron (NR_120671, intron 5 of 5) L1MB1|LINE|L1 32859 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 118-144 chr5 31241783 31242075 + 0.5 NA intron (NM_001362435, intron 1 of 10) ERVL-E-int|LTR|ERVL 48243 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 143.25-113 chr3 5153093 5153543 + 0.5 NA intron (NM_018184, intron 1 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 31026 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 117.75-25 chr10 56500048 56500423 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -138962 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 143.75-105 chr20 60249492 60250027 + 0.5 NA intron (NR_046099, intron 3 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie -58715 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 120.5-170 chr4 143505055 143505448 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8451 NM_003601 8467 Hs.558422 NM_003601 ENSG00000153147 SMARCA5 ISWI|SNF2H|WCRF135|hISWI|hSNF2H SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 protein-coding 130.75-15 chr10 16694052 16694501 + 0.5 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) intron (NM_152724, intron 7 of 7) 123148 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 128.25-23 chr11 87521159 87521612 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 198026 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 188.5-111 chr4 54133599 54134239 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 33756 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 129.25-168 chr6 64753799 64754280 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) L1PB4|LINE|L1 -547379 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 172.25-111 chr5 67205329 67205942 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8836 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 121.5-135 chr2 98552912 98553322 + 0.5 NA intron (NM_001351428, intron 14 of 24) MIR3|SINE|MIR 55395 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 176.25-18 chr10 69165275 69165860 + 0.5 NA intron (NM_001035260, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu -14667 NR_136626 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 164.25-71 chr2 123527256 123527717 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -454005 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 130.25-211 chr8 135115334 135115735 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -118597 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 129-154 chr6 50065572 50065973 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15843 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 148.25-126 chr5 91817876 91818241 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -434741 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 163.75-106 chr4 111013205 111013619 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -152765 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 119.25-202 chr8 48284733 48285204 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -266599 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 134.75-155 chr4 20012343 20012773 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -239347 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 169.25-2 chr1 71230292 71230908 + 0.5 NA intron (NR_046217, intron 3 of 3) intron (NR_046217, intron 3 of 3) 149276 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 120.25-8 chr1 76827685 76828101 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39587 NM_030965 81849 Hs.149201 NM_030965 ENSG00000117069 ST6GALNAC5 SIAT7-E|SIAT7E|ST6GalNAcV ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5 protein-coding 112.5-13 chr1 189696105 189696460 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 779728 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 133.75-197 chr8 135791540 135791904 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 334266 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 136.75-47 chr12 58407848 58408358 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -183599 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 123.5-5 chr1 82667625 82667980 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -235381 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 145.75-122 chr5 41141181 41141663 + 0.5 NA TTS (NM_001115131) TTS (NM_001115131) -70080 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 114-44 chr14 49829584 49829980 + 0.5 NA intron (NM_001301732, intron 11 of 31) FLAM_C|SINE|Alu 23006 NM_004713 9147 Hs.655964 NM_004713 ENSG00000165525 NEMF NY-CO-1|SDCCAG1 nuclear export mediator factor protein-coding 148.5-199 chr6 138765021 138765442 + 0.5 NA intron (NR_161205, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu -8289 NM_015439 25901 Hs.412019 NM_015439 ENSG00000024862 CCDC28A C6orf80|CCRL1AP coiled-coil domain containing 28A protein-coding 115.75-44 chr12 46313785 46314224 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -44961 NM_001278387 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 151.5-199 chr8 130996466 130996910 + 0.5 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) L1ME4a|LINE|L1 44221 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 160-85 chr5 24144911 24145399 + 0.5 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 193807 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 137-37 chr11 102569654 102570076 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -39118 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 123.75-141 chr5 2511777 2512080 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -199727 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 116.25-129 chr22 27325917 27326172 + 0.5 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 15393 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 131.5-91 chr17 81810848 81811238 + 0.5 NA exon (NM_000160, exon 5 of 14) exon (NM_000160, exon 5 of 14) 6893 NM_000160 2642 Hs.208 NM_000160 ENSG00000215644 GCGR GGR|GL-R glucagon receptor protein-coding 191.5-137 chr7 51637938 51638360 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -244893 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 116.75-32 chr11 21664120 21664397 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -528827 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 158.75-54 chr14 60186772 60187201 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17122 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 125.75-2 chr1 25674807 25675293 + 0.5 NA intron (NM_020379, intron 1 of 11) intron (NM_020379, intron 1 of 11) 57582 NM_001289010 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 142.25-93 chr2 163577548 163577986 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 158241 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 138.5-102 chr2 48720458 48720765 + 0.5 NA intron (NM_000233, intron 6 of 10) intron (NM_000233, intron 6 of 10) 35113 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 157.5-199 chr8 21474942 21475469 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 176966 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 195-75 chr7 12012049 12012674 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -180163 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 164-102 chr5 88284866 88285285 + 0.5 NA intron (NR_105019, intron 3 of 7) intron (NR_105019, intron 3 of 7) 16059 NR_039994 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 138.75-27 chr11 9326754 9327233 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -12400 NM_015012 440026 Hs.594563 NM_015012 ENSG00000166471 TMEM41B - transmembrane protein 41B protein-coding 161.75-2 chr1 46598939 46599502 + 0.5 NA intron (NM_198973, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 5048 NR_146512 8569 Hs.371594 NM_003684 ENSG00000079277 MKNK1 MNK1 MAPK interacting serine/threonine kinase 1 protein-coding 144.5-138 chr3 177423478 177423881 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18242 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 164.25-51 chr17 18098208 18098807 + 0.5 NA intron (NM_001388, intron 3 of 12) intron (NM_001388, intron 3 of 12) -10249 NM_016239 51168 Hs.462390 NM_016239 ENSG00000091536 MYO15A DFNB3|MYO15 myosin XVA protein-coding 129.75-124 chr3 111918272 111918777 + 0.5 NA intron (NM_001134437, intron 4 of 17) intron (NM_001134437, intron 4 of 17) 58697 NM_001134439 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 118.25-24 chr1 231656331 231656647 + 0.5 NA intron (NM_001164556, intron 1 of 4) L1PB3|LINE|L1 29674 NM_001164544 27185 Hs.13318 NM_018662 ENSG00000162946 DISC1 C1orf136|SCZD9 DISC1 scaffold protein protein-coding 159.25-134 chr7 6623776 6624144 + 0.5 NA 3' UTR (NM_017560, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_017560, exon 3 of 3) 8350 NM_017560 54753 Hs.592170 NM_017560 ENSG00000236609 ZNF853 - zinc finger protein 853 protein-coding 132-62 chr16 5679153 5679606 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 46912 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 204.5-29 chr13 84583939 84584432 + 0.5 NA intron (NR_046871, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -199469 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 161.25-80 chr18 70055253 70055744 + 0.5 NA intron (NM_001318520, intron 36 of 47) intron (NM_001318520, intron 36 of 47) -98699 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 146.25-120 chr5 125195645 125196101 + 0.5 NA intron (NR_109882, intron 4 of 5) intron (NR_109882, intron 4 of 5) 159042 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 130-169 chr8 108010320 108010729 + 0.5 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) MamGypLTR2b|LTR|Gypsy 71415 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 116-100 chr3 5109313 5109609 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -12831 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 132.25-49 chr12 43504291 43504768 + 0.5 NA intron (NM_025003, intron 3 of 38) intron (NM_025003, intron 3 of 38) 47674 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 118.5-165 chr5 43355831 43356144 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 41150 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 116.75-99 chr2 107530216 107530652 + 0.5 NA intron (NR_146968, intron 1 of 2) intron (NR_146968, intron 1 of 2) 1015 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 116.5-190 chr5 23998186 23998554 + 0.5 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) AluSz6|SINE|Alu 47022 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 172.75-98 chr5 76447044 76447573 + 0.5 NA intron (NM_006633, intron 1 of 35) LTR17|LTR|ERV1 44023 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 219.75-81 chr7 138213146 138213585 + 0.5 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 89607 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 168.5-105 chr20 63404512 63404909 + 0.5 NA 3' UTR (NM_172108, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_172108, exon 16 of 16) -43314 NM_000744 1137 Hs.10734 NM_000744 ENSG00000101204 CHRNA4 BFNC|EBN|EBN1|NACHR|NACHRA4|NACRA4 cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit protein-coding 146.75-138 chr6 8177783 8178132 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75362 NR_037618 100526837 Hs.719272 NR_037618 EEF1E1-BLOC1S5 EEF1E1-MUTED EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate) ncRNA 121.5-147 chr2 177386397 177386770 + 0.5 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) L1ME3B|LINE|L1 6108 NR_026966 100130691 Hs.707723 NM_182585 ENSG00000213963 LOC100130691 - uncharacterized LOC100130691 ncRNA 132.25-85 chr18 30033947 30034322 + 0.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -264776 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 115.25-79 chr17 65969244 65969680 + 0.5 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) intron (NM_001353129, intron 17 of 26) -142919 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 125.5-112 chr17 78733506 78733999 + 0.5 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) intron (NM_004762, intron 1 of 12) 3150 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 155-9 chr1 223338911 223339369 + 0.5 NA intron (NM_017982, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 25036 NM_017982 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 171-110 chr5 77124936 77125555 + 0.5 NA intron (NR_024398, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu -37960 NM_032367 84327 Hs.584988 NM_032367 ENSG00000132846 ZBED3 - zinc finger BED-type containing 3 protein-coding 118.75-191 chr7 130912513 130912923 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_109780) promoter-TSS (NR_109780) 592 NR_110472 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 137.75-72 chr15 58509862 58510231 + 0.5 NA intron (NM_000236, intron 1 of 8) intron (NM_000236, intron 1 of 8) -11311 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 162.25-138 chr5 155687536 155687959 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -639010 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 158.25-121 chr6 42005810 42006185 + 0.5 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 42897 NM_001287434 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 124.5-145 chr3 191365907 191366225 + 0.5 NA intron (NM_178335, intron 4 of 11) intron (NM_178335, intron 4 of 11) -35530 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 117.75-78 chr17 6811390 6811777 + 0.5 NA intron (NM_053285, intron 6 of 7) intron (NM_053285, intron 6 of 7) 20146 NM_053285 83659 Hs.462108 NM_053285 ENSG00000167858 TEKT1 - tektin 1 protein-coding 134-41 chr12 76711586 76711929 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52317 NM_015336 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 116.25-18 chr10 44194977 44195405 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -97559 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 200.5-56 chr17 63720619 63721401 + 0.5 NA intron (NM_153335, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 20672 NR_046273 729683 Hs.534931 NR_046273 LOC729683 - uncharacterized LOC729683 ncRNA 137.75-82 chr16 86769999 86770427 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 48122 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 162.75-31 chr13 73287947 73288277 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 229107 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 118.25-39 chr11 39062823 39063211 + 0.5 NA Intergenic (TT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 414159 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 169.25-65 chr2 195978625 195979142 + 0.5 NA intron (NM_018897, intron 15 of 64) L1MA3|LINE|L1 89954 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 140.25-193 chr9 70270341 70270865 + 0.5 NA intron (NM_015110, intron 3 of 24) MER21C|LTR|ERVL 11625 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 188.75-73 chr22 19403355 19403981 + 0.5 NA intron (NM_003325, intron 5 of 24) L1M5|LINE|L1 28065 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 128.25 chr1 13950547 13950884 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 201300 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 122-197 chr9 120389959 120390215 + 0.5 NA intron (NR_073558, intron 36 of 37) intron (NR_073558, intron 36 of 37) -145037 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 141.25-121 chr4 58717908 58718314 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -181783 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 158.25-48 chr17 2504455 2504818 + 0.5 NA intron (NM_024086, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu 7252 NM_024086 79066 Hs.632237 NM_024086 ENSG00000127804 METTL16 METT10D methyltransferase like 16 protein-coding 140.25-89 chr2 55141548 55141925 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3905 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 164.25-77 chr2 212278633 212279140 + 0.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 147474 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 154-16 chr10 26528018 26528587 + 0.5 NA intron (NM_019043, intron 8 of 14) intron (NM_019043, intron 8 of 14) 51005 NR_134472 101929117 Hs.127031 NR_134472 LOC101929117 - uncharacterized LOC101929117 ncRNA 117.5-146 chr3 137626615 137626983 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -137516 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 158.5-60 chr14 44621868 44622322 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 114686 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 114-4 chr1 49352581 49352995 + 0.5 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 95377 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 115.5-191 chr4 93014550 93014872 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 710312 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 139.75-89 chr2 17026849 17027275 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -361228 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 146.5-235 chr9 132121854 132122353 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39955 NM_032536 84628 Hs.163642 NM_032536 ENSG00000196358 NTNG2 LHLL9381|Lmnt2|NTNG1|bA479K20.1 netrin G2 protein-coding 128.25-205 chr8 75120151 75120591 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 120216 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 124.75-79 chr14 63412662 63412973 + 0.5 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) intron (NR_104104, intron 4 of 12) -93882 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 138.25-44 chr13 56130957 56131438 + 0.5 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 956743 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 187.75-84 chr5 34987478 34987995 + 0.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 58143 NM_001348420 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 157.75-99 chr20 9411154 9411665 + 0.5 NA intron (NM_000933, intron 21 of 35) intron (NM_000933, intron 21 of 35) -102949 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 123.25-41 chr11 116264228 116264642 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -374987 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 124.25-92 chr2 27954123 27954613 + 0.5 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) intron (NM_199193, intron 4 of 13) -41999 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 129.25-153 chr5 61500496 61500906 + 0.5 NA intron (NM_020928, intron 4 of 13) intron (NM_020928, intron 4 of 13) -137059 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 150.5-41 chr12 85827009 85827399 + 0.5 NA intron (NM_005447, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 9205 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 123.75-57 chr14 44143032 44143439 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 364048 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 157.5-150 chr4 97823540 97824051 + 0.5 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) MER41-int|LTR|ERV1 319681 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 148.25-125 chr5 83011243 83011759 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 52836 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 127.25-13 chr10 8297844 8298200 + 0.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -29717 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 138.5-46 chr12 85727146 85727448 + 0.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 109112 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 162-87 chr4 76227707 76228222 + 0.5 NA intron (NM_001242936, intron 2 of 7) L1PB1|LINE|L1 13924 NM_001242936 100129583 Hs.720509 NM_001136570 ENSG00000189157 FAM47E - family with sequence similarity 47 member E protein-coding 148.75-72 chr17 51231896 51232426 + 0.5 NA intron (NM_017643, intron 2 of 16) L1ME1|LINE|L1 27888 NM_017643 54799 Hs.656803 NM_017643 ENSG00000011258 MBTD1 SA49P01 mbt domain containing 1 protein-coding 118-173 chr7 76024488 76024911 + 0.5 NA intron (NM_016086, intron 3 of 8) AluSx4|SINE|Alu 5825 NR_134487 51657 Hs.11615 NM_016086 ENSG00000127952 STYXL1 DUSP24|MK-STYX|MKSTYX serine/threonine/tyrosine interacting like 1 protein-coding 137.75-190 chr7 18283709 18284239 + 0.5 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -6118 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 120.25-146 chr4 51873071 51873533 + 0.5 NA intron (NM_001040402, intron 3 of 10) MIRc|SINE|MIR 29723 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 130.5-138 chr2 128173005 128173473 + 0.5 NA intron (NR_027671, intron 29 of 40) L1MB7|LINE|L1 82039 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 133.25-46 chr13 25380287 25380602 + 0.5 NA intron (NM_016529, intron 1 of 36) MER33|DNA|hAT-Charlie 8470 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 127.25-61 chr14 89220667 89220984 + 0.5 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 196408 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 118.5-8 chr1 84770644 84771046 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -80377 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 117.25-46 chr12 3192495 3192798 + 0.5 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 115267 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 143.5-64 chr14 53144474 53144924 + 0.5 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 8624 NM_001160147 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 124.25-105 chr2 182626603 182627053 + 0.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -89429 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 200.75-114 chr9 77104494 77105051 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -72673 NM_015186 23230 Hs.459790 NM_015186 ENSG00000197969 VPS13A CHAC|CHOREIN vacuolar protein sorting 13 homolog A protein-coding 146-107 chr5 54830655 54831199 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -86669 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 114.75-110 chr21 23100367 23100694 + 0.5 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 21246 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 118.75-183 chr7 79746182 79746642 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 292452 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 114.75-91 chr2 73220328 73220656 + 0.5 NA intron (NM_006062, intron 3 of 12) intron (NM_006062, intron 3 of 12) 6247 NM_006062 10322 Hs.631882 NM_006062 ENSG00000135632 SMYD5 NN8-4AG|RAI15|RRG1|ZMYND23 SMYD family member 5 protein-coding 165.5-192 chr8 60394135 60394717 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19392 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 120.75-150 chr6 132537163 132537466 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_175057) promoter-TSS (NM_175057) -974 NM_175057 134860 Hs.434116 NM_175057 ENSG00000237110 TAAR9 TA3|TAR3|TAR9|TRAR3 trace amine associated receptor 9 (gene/pseudogene) protein-coding 132-75 chr17 71553608 71553937 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -351593 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 124.75-80 chr14 63687768 63688160 + 0.5 NA intron (NM_030791, intron 2 of 2).2 AluSq2|SINE|Alu 40101 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 188.75-82 chr4 26939887 26940280 + 0.5 NA intron (NM_001169118, intron 2 of 12) intron (NM_001169118, intron 2 of 12) 79242 NM_020860 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 172.25-137 chr7 144135519 144135897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 6595 NM_001001659 135941 Hs.534547 NM_001001659 ENSG00000221938 OR2A14 OR2A14P|OR2A6|OST182 olfactory receptor family 2 subfamily A member 14 protein-coding 117.5-129 chr20 49212991 49213226 + 0.5 NA intron (NM_001319135, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu -6187 NM_017895 55661 Hs.65234 NM_017895 ENSG00000124228 DDX27 DRS1|Drs1p|HSPC259|PP3241|RHLP|dJ686N3.1 DEAD-box helicase 27 protein-coding 144.75-22 chr10 95923295 95923619 + 0.5 NA intron (NM_001349008, intron 3 of 34) intron (NM_001349008, intron 3 of 34) 15492 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 114.5-18 chr1 173632163 173632492 + 0.5 NA intron (NM_198493, intron 3 of 5) L1M1|LINE|L1 -3011 NM_001195190 730159 Hs.647757 NM_001195190 ENSG00000232113 TEX50 - testis expressed 50 protein-coding 131.25-145 chr3 128615541 128615915 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35090 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 120.5-47 chr11 125460995 125461472 + 0.5 NA intron (NM_005103, intron 4 of 9) intron (NM_005103, intron 4 of 9) -33981 NM_001301851 403312 Hs.450611 NM_203452 LOC403312 - putative uncharacterized protein MGC39545 protein-coding 183-99 chr6 35638534 35639010 + 0.5 NA intron (NM_001145775, intron 3 of 11) intron (NM_001145775, intron 3 of 11) 26017 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 136.75-33 chr10 90420850 90421306 + 0.5 NA intron (NR_110657, intron 3 of 6) L2b|LINE|L2 119727 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 151.75-42 chr14 71950811 71951197 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) L1PA10|LINE|L1 17477 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 139.25-10 chr1 212959336 212959791 + 0.5 NA intron (NM_001301056, intron 2 of 7) intron (NM_001301056, intron 2 of 7) 9022 NM_001136475 79805 Hs.96885 NM_024749 ENSG00000143494 VASH2 - vasohibin 2 protein-coding 189-62 chr2 162726014 162726633 + 0.5 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) L1MC5|LINE|L1 -42613 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 143.5-211 chr8 90128855 90129287 + 0.5 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -46192 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 148.5-84 chr17 43918705 43919130 + 0.5 NA TTS (NR_026770) TTS (NR_026770) 1709 NR_026770 23591 Hs.721804 NR_026770 ENSG00000267496 FAM215A APR-2|C17orf88|LINC00530 family with sequence similarity 215 member A ncRNA 158.25-162 chrX 140124483 140124878 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 33013 NM_001271560 389895 Hs.127679 NM_001271560 LOC389895 - chromosome 16 open reading frame 72-like protein-coding 127-159 chr7 35352711 35353195 + 0.5 NA intron (NR_038864, intron 2 of 2) intron (NR_038864, intron 2 of 2) 39098 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 127.75-51 chr12 1043607 1043973 + 0.5 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) MER20B|DNA|hAT-Charlie 16042 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 130.5-250 chr9 455899 456281 + 0.5 NA intron (NM_001193536, intron 45 of 46) intron (NM_001193536, intron 45 of 46) -14201 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 169.5-166 chr7 137713154 137713819 + 0.5 NA intron (NM_001321708, intron 1 of 32) L3|LINE|CR1 132846 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 165-91 chr3 65013069 65013684 + 0.5 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger -325376 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 135.25-123 chr22 31854788 31855087 + 0.5 NA intron (NR_146296, intron 31 of 42) L1MC5|LINE|L1 83517 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 120.25-189 chr7 3129787 3130193 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28583 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 148.5-88 chr17 68709880 68710209 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 81890 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 112.25-10 chr1 156612760 156613132 + 0.5 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -6469 NM_021817 60484 Hs.410719 NM_021817 ENSG00000132702 HAPLN2 BRAL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 2 protein-coding 113.75-122 chr22 45636742 45637123 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31285 NR_131244 100506737 Hs.517692 NR_131244 ENSG00000238120 LINC01589 TCONS_00029353 long intergenic non-protein coding RNA 1589 ncRNA 148.25-22 chr10 95267166 95267602 + 0.5 NA intron (NM_020992, intron 3 of 6) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 23619 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 191.75-60 chr2 27347971 27348355 + 0.5 NA intron (NM_001035521, intron 1 of 18) AluSg|SINE|Alu 8329 NM_001318909 2976 Hs.75782 NM_001521 ENSG00000115207 GTF3C2 TFIIIC-BETA|TFIIIC110 general transcription factor IIIC subunit 2 protein-coding 143-17 chr11 26259734 26260199 + 0.5 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) MER70C|LTR|ERVL 28041 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-92 chr2 32803699 32803960 + 0.5 NA intron (NM_017735, intron 16 of 19) AluSx|SINE|Alu -21604 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 131.75-5 chr1 64338573 64338923 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -131381 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 150-145 chr8 82975088 82975457 + 0.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 63168 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 152.25-162 chr8 130479518 130480076 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -36123 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 171.5-91 chr2 206351934 206352330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 77122 NM_001285549 57683 Hs.110489 NM_020923 ENSG00000204186 ZDBF2 Slx9 zinc finger DBF-type containing 2 protein-coding 119.5-32 chr10 80371969 80372398 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 15402 NM_032372 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 126.75-145 chr22 37876801 37877149 + 0.5 NA intron (NM_001242923, intron 8 of 10) intron (NM_001242923, intron 8 of 10) 27556 NM_001363785 51386 Hs.446852 NM_016091 ENSG00000100129 EIF3L EIF3EIP|EIF3S11|EIF3S6IP|HSPC021|HSPC025|MSTP005 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L protein-coding 126-66 chr15 98375345 98375640 + 0.5 NA intron (NR_146567, intron 1 of 2) intron (NR_146567, intron 1 of 2) -43934 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 162.5-127 chr4 52643548 52644068 + 0.5 NA intron (NM_001286767, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 12731 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 118-170 chr7 11688949 11689296 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 143076 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 128.25-178 chr6 127125818 127126225 + 0.5 NA intron (NM_032784, intron 1 of 4) intron (NM_032784, intron 1 of 4) 7350 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 120-16 chr10 62789293 62789633 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15257 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 149-77 chr3 73590744 73591124 + 0.5 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) -21419 NM_001303139 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 162-17 chr10 109089116 109089560 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 833908 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 238-39 chr22 28043452 28044037 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -123132 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 153.75-160 chrX 84292158 84292516 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -66509 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 123.75-125 chr3 120410603 120411064 + 0.5 NA intron (NM_007085, intron 5 of 10) intron (NM_007085, intron 5 of 10) -15104 NR_029584 406975 NR_029584 ENSG00000284121 MIR198 MIRN198|miR-198 microRNA 198 ncRNA 130.5-238 chr8 35022869 35023154 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -212464 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 124.5-102 chr2 38144475 38144927 + 0.5 NA intron (NR_027252, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 13596 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 146-59 chr2 12434713 12435115 + 0.5 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 235784 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 150.5-120 chr20 59307037 59307551 + 0.5 NA intron (NM_207032, intron 2 of 4) intron (NM_207032, intron 2 of 4) 6683 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 119-95 chr2 200698237 200698677 + 0.5 NA intron (NR_135012, intron 1 of 30) intron (NR_135012, intron 1 of 30) 2734 NR_135012 107161151 Hs.148269 NR_135011 AOX3P-AOX2P AOX3/AOX3L1 AOX3P-AOX2P readthrough, transcribed pseudogene pseudo 136.75-166 chr6 53653074 53653592 + 0.5 NA intron (NM_001003760, intron 2 of 2) intron (NM_001003760, intron 2 of 2) 12423 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 137.5 chr1 13591435 13591787 + 0.5 NA intron (NM_001006624, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 6151 NM_001006624 10630 Hs.468675 NM_006474 ENSG00000162493 PDPN AGGRUS|GP36|GP40|Gp38|HT1A-1|OTS8|PA2.26|T1A|T1A-2|T1A2|TI1A podoplanin protein-coding 156-106 chr3 182661076 182661562 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -132185 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 138.25-22 chr10 105202072 105202557 + 0.5 NA intron (NM_014978, intron 16 of 26) L2a|LINE|L2 -536098 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 129-187 chr8 139637219 139637588 + 0.5 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 65720 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 131.25-193 chr7 98383441 98383955 + 0.5 NA intron (NM_018842, intron 1 of 13) intron (NM_018842, intron 1 of 13) 17392 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 112.5-189 chr5 7575163 7575518 + 0.5 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) intron (NM_020546, intron 3 of 24) 179202 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 165.25-25 chr11 88693737 88694230 + 0.5 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 189407 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 163.75-139 chrX 63445307 63445904 + 0.5 NA intron (NR_152612, intron 1 of 2) L1ME3|LINE|L1 -94273 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 123.25-28 chr10 119636136 119636436 + 0.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -15084 NM_004281 9531 Hs.523309 NM_004281 ENSG00000151929 BAG3 BAG-3|BIS|CAIR-1|MFM6 BCL2 associated athanogene 3 protein-coding 209.75-103 chr8 139524821 139525355 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 178035 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 136.5-208 chr7 32996805 32997224 + 0.5 NA intron (NM_007270, intron 7 of 9) AluYb9|SINE|Alu 17540 NM_001284343 11328 Hs.103934 NM_007270 ENSG00000122642 FKBP9 FKBP60|FKBP63|PPIase FKBP prolyl isomerase 9 protein-coding 172.25-67 chr2 116819381 116819955 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -995023 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 145.75-123 chr5 43359420 43359845 + 0.5 NA Intergenic MER9a3|LTR|ERVK 37505 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 119.5-237 chr8 114222877 114223229 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -786114 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 119-131 chr4 30744113 30744550 + 0.5 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 23962 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 124 chr1 27517379 27517832 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -27438 NM_006990 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 136.25-41 chr12 20014221 20014721 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_040098) promoter-TSS (NR_040098) -214 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 113.75-105 chr2 171444043 171444482 + 0.5 NA intron (NM_001164821, intron 3 of 11) MER103C|DNA|hAT-Charlie -9459 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 128.25-128 chr3 47115186 47115503 + 0.5 NA intron (NR_146158, intron 4 of 21) intron (NR_146158, intron 4 of 21) 48633 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 178-6 chr10 19571672 19572119 + 0.5 NA intron (NM_001142308, intron 33 of 39) intron (NM_001142308, intron 33 of 39) 156655 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 144.5-65 chr14 70566835 70567303 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -32065 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 152.5-133 chr4 58384502 58384885 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 151635 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 125.75-174 chr7 79753109 79753601 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 299395 NR_038344 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 142-51 chr14 71984739 71985251 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME4c|LINE|L1 51468 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 174.5-38 chr11 91788684 91789128 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -436128 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 128.5-95 chr18 75884847 75885294 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -172667 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 151-80 chr22 47086933 47087396 + 0.5 NA intron (NM_001284305, intron 11 of 12) L1MC5a|LINE|L1 -171122 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 125.75-106 chr2 198209942 198210306 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 164973 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 118-180 chr8 60475846 60476213 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40881 NM_001242644 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 122.75-191 chr7 110921565 110921839 + 0.5 NA intron (NM_032549, intron 4 of 5) intron (NM_032549, intron 4 of 5) -169304 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 115.25-57 chr14 48597301 48597590 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -802431 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 112.5-53 chr12 49167549 49167997 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 21307 NM_006009 7846 Hs.654422 NM_006009 ENSG00000167552 TUBA1A B-ALPHA-1|LIS3|TUBA3 tubulin alpha 1a protein-coding 146-11 chr1 246921476 246921964 + 0.5 NA intron (NR_136586, intron 1 of 36) L1MEg|LINE|L1 9638 NM_015446 25909 Hs.300887 NM_015446 ENSG00000153207 AHCTF1 ELYS|MST108|MSTP108|TMBS62 AT-hook containing transcription factor 1 protein-coding 175-53 chr17 59125770 59126245 + 0.5 NA intron (NM_182620, intron 2 of 3) AluYh3|SINE|Alu 11865 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 175.5-161 chr8 83995374 83995906 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -187147 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 132.5-213 chr6 54827668 54828083 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -18896 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 190-49 chr4 22845051 22845502 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 131187 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 138.75-184 chr7 107459473 107459750 + 0.5 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) AluJo|SINE|Alu -10446 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 127.5-122 chr2 119616392 119616736 + 0.5 NA intron (NR_073132, intron 15 of 24) intron (NR_073132, intron 15 of 24) -62603 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 122.5-143 chr22 29112389 29112713 + 0.5 NA intron (NM_001039570, intron 3 of 8) intron (NM_001039570, intron 3 of 8) 39516 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 139.5-198 chr7 51016481 51016810 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001346441, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001346441, exon 13 of 13) -223192 NM_001371008 161.5-147 chr4 86855175 86855668 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -6037 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 136.75-74 chr17 49822008 49822361 + 0.5 NA intron (NM_007067, intron 11 of 14) intron (NM_007067, intron 11 of 14) -23726 NM_001242791 729220 Hs.434138 NM_001242791 FLJ45513 - uncharacterized LOC729220 protein-coding 117.25-148 chr3 162299682 162300094 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 803080 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 133.5-186 chr4 79445034 79445515 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37046 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 149.75-120 chr4 2820318 2820669 + 0.5 NA intron (NM_003023, intron 1 of 12) intron (NM_003023, intron 1 of 12) 1679 NM_003023 6452 Hs.167679 NM_003023 ENSG00000087266 SH3BP2 3BP-2|3BP2|CRBM|CRPM|RES4-23 SH3 domain binding protein 2 protein-coding 171.5-78 chr2 65627536 65628093 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -195215 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 124.25-39 chr12 7986684 7987141 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -45804 NM_018416 55810 Hs.120844 NM_018416 ENSG00000065970 FOXJ2 FHX forkhead box J2 protein-coding 141.75-157 chr7 6237933 6238252 + 0.5 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 34532 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 207.5-26 chr15 68534848 68535411 + 0.5 NA intron (NM_001324014, intron 1 of 12) intron (NM_001324014, intron 1 of 12) 16756 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 137.5-130 chr2 148490895 148491405 + 0.5 NA intron (NM_018328, intron 12 of 14) intron (NM_018328, intron 12 of 14) -153601 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 139-119 chr5 114222716 114223109 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -139158 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 117.25-165 chr5 15494977 15495329 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5027 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 140-86 chr20 12136272 12136799 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 218642 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 137.25-99 chr3 93957135 93957525 + 0.5 NA intron (NM_001314077, intron 1 of 15) L1ME4a|LINE|L1 16751 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 184.25-29 chr11 130619873 130620561 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46518 NR_107019 102466873 NR_107019 ENSG00000274999 MIR8052 hsa-mir-8052 microRNA 8052 ncRNA 214.75-84 chr8 78346659 78347448 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -169287 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 135.75-151 chr3 164494714 164495044 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -323323 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 138.75-43 chr12 116348920 116349259 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -71903 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 200.75-40 chr17 70009838 70010481 + 0.5 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -41112 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 129.5-79 chr15 68997165 68997602 + 0.5 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -17312 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 112.25-215 chr8 106232604 106232961 + 0.5 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR -37396 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 127.25-135 chr4 22360244 22360591 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -20751 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 148-29 chr14 61916525 61917002 + 0.5 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) L1MA4|LINE|L1 -10932 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 143.75-156 chr6 55954997 55955362 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79589 NM_021073 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 120.75-38 chr14 42003048 42003318 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 396327 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 139.75-85 chr18 73144025 73144367 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 120302 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 169.25-92 chr5 13601917 13602550 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 342247 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 116.25-176 chr5 40138140 40138479 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 86018 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 120.25-209 chr8 48477003 48477410 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -74361 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 159-128 chr9 72122908 72123274 + 0.5 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) HAL1ME|LINE|L1 8496 NM_001242507 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 117.75-87 chr18 13309420 13309881 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 31545 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 148-129 chr8 114960288 114960707 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 707516 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 131.25-206 chr8 129537099 129537465 + 0.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 37736 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 197.75-10 chr11 39663675 39664364 + 0.5 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 629111 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 133.5-231 chr6 56004195 56004686 + 0.5 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 87222 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 119.5-69 chr13 51665151 51665476 + 0.5 NA intron (NM_052950, intron 2 of 11) intron (NM_052950, intron 2 of 11) 80851 NM_052950 115825 Hs.46506 NM_052950 ENSG00000139668 WDFY2 PROF|WDF2|ZFYVE22 WD repeat and FYVE domain containing 2 protein-coding 126.75-212 chr6 54717635 54718135 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -128886 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 184.25-30 chr12 10748157 10748679 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1816 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 161-70 chr20 46856288 46856856 + 0.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -38052 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 118.5-105 chr2 165716067 165716463 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 77982 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 117.75-7 chr1 100569559 100570008 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 31644 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 142.75-136 chr3 195532079 195532641 + 0.5 NA intron (NR_133014, intron 1 of 4) intron (NR_133014, intron 1 of 4) 10965 NM_001291504 5504 Hs.535731 NM_006241 ENSG00000184203 PPP1R2 IPP-2|IPP2|PPP1R2A protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 protein-coding 115.75-47 chr12 78089874 78090295 + 0.5 NA intron (NM_001024383, intron 12 of 39) intron (NM_001024383, intron 12 of 39) 259190 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 169.25-79 chr3 178569875 178570412 + 0.5 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 11293 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 123.75-123 chr3 107915403 107915693 + 0.5 NA intron (NR_015394, intron 1 of 2) intron (NR_015394, intron 1 of 2) 32343 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 147-91 chr3 25508015 25508420 + 0.5 NA intron (NR_110892, intron 3 of 6) intron (NR_110892, intron 3 of 6) 49907 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 182.25-72 chr3 15524396 15524860 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2922 NM_005677 8292 Hs.146735 NM_005677 ENSG00000206561 COLQ CMS5|EAD collagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesterase protein-coding 131.75-107 chr2 97955698 97956055 + 0.5 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) L1MDa|LINE|L1 40072 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 117.5-100 chr2 30582754 30583082 + 0.5 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 135672 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 121-109 chr2 156728327 156728600 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 292084 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 115.5-230 chr7 51685815 51686155 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -292729 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 129.25-122 chr3 16807397 16807910 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77302 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 126.5-36 chr11 46688329 46688783 + 0.5 NA intron (NM_004308, intron 3 of 12) AluJr4|SINE|Alu 12063 NM_004308 392 Hs.138860 NM_004308 ENSG00000175220 ARHGAP1 CDC42GAP|RHOGAP|RHOGAP1|p50rhoGAP Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 168-132 chr9 70565988 70566538 + 0.5 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) L2a|LINE|L2 -151606 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 122.25-99 chr2 155612474 155612947 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 642221 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 142.5-228 chr8 120917154 120917561 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -105311 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 173.75-115 chr4 34029946 34030395 + 0.5 NA intron (NR_125902, intron 1 of 4) HERV16-int|LTR|ERVL 9723 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 122.5-92 chr18 40703547 40703894 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 637434 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 124.75-158 chr4 83788176 83788644 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 252302 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 129.5-195 chr6 12172871 12173361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -117245 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 354.25-3 chr14 76508498 76509555 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 137679 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 141.75-90 chr2 65072614 65073085 + 0.5 NA exon (NM_001319100, exon 3 of 7) exon (NM_001319100, exon 3 of 7) 16433 NM_001319101 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 149.5-174 chr6 88071898 88072335 + 0.5 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 24275 NM_030960 81833 Hs.161241 NM_030960 ENSG00000118434 SPACA1 SAMP32 sperm acrosome associated 1 protein-coding 117.75-10 chr1 118115210 118115547 + 0.5 NA exon (NM_206996, exon 4 of 49) exon (NM_206996, exon 4 of 49) 69850 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 130.5-101 chr15 64692805 64693321 + 0.5 NA intron (NM_002537, intron 1 of 4) intron (NM_002537, intron 1 of 4) 10218 NM_001301302 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 139.75-153 chr5 178595458 178595859 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5265 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 120-62 chr16 59386174 59386491 + 0.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 368859 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 149.5-218 chr9 28169211 28169678 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 549861 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 114-9 chr1 113428228 113428646 + 0.5 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L1M5|LINE|L1 37922 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 169-67 chr4 111155687 111156146 + 0.5 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -295269 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 159.5-199 chr7 153687351 153687851 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60532 NM_001364499 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 126.75-227 chr7 84039864 84040190 + 0.5 NA intron (NM_006080, intron 6 of 16) intron (NM_006080, intron 6 of 16) 154762 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 113.25-125 chr4 114979491 114979791 + 0.5 NA intron (NM_022569, intron 2 of 13) intron (NM_022569, intron 2 of 13) 133979 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 160.5-123 chr3 89907287 89907788 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 799916 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 126.5-74 chr14 79250590 79250885 + 0.5 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L2c|LINE|L2 -28643 NM_138970 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 114.25-52 chr14 40114950 40115249 + 0.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -682599 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 124.75-206 chr8 126733518 126733917 + 0.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -175239 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 143-15 chr11 14991707 14992032 + 0.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -19518 NR_125898 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 147-144 chr8 77810991 77811412 + 0.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 360504 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 131.75-229 chrX 38942887 38943304 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -139212 NR_046706 100874211 Hs.662789 NR_046706 MID1IP1-AS1 - MID1IP1 antisense RNA 1 ncRNA 112.75-66 chr15 42760859 42761138 + 0.5 NA intron (NM_173500, intron 13 of 14) L1MA5A|LINE|L1 -23870 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 119-198 chr8 100248196 100248612 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 53789 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 130.25-139 chr3 115318618 115319060 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -171551 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 119-6 chr1 153360681 153361080 + 0.5 NA 3' UTR (NM_002965, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_002965, exon 3 of 3) 3026 NM_002965 6280 Hs.112405 NM_002965 ENSG00000163220 S100A9 60B8AG|CAGB|CFAG|CGLB|L1AG|LIAG|MAC387|MIF|MRP14|NIF|P14 S100 calcium binding protein A9 protein-coding 114.75-136 chr4 46927207 46927619 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001204266, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001204266, exon 9 of 9) -18168 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 133.25-32 chr11 92761200 92761549 + 0.5 NA intron (NM_001008781, intron 3 of 24) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 154254 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 149.5-182 chr7 40661553 40662061 + 0.5 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) L2a|LINE|L2 318132 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 148-9 chr11 13799128 13799716 + 0.5 NA intron (NR_149108, intron 3 of 3) L1ME3B|LINE|L1 15036 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 140.5-12 chr1 231113867 231114288 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -48851 NM_001300889 440730 Hs.655089 NM_001004342 ENSG00000119283 TRIM67 TNL tripartite motif containing 67 protein-coding 145-31 chr11 91349269 91349842 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -480353 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 167.5-26 chr10 74290755 74291405 + 0.5 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) intron (NM_001369124, intron 3 of 9) 114317 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 147-148 chr8 121952501 121952971 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -311296 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 136.5-53 chr12 25328001 25328493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77318 NM_001369787 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 211-68 chr8 129973481 129974237 + 0.5 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 -34048 NM_001353296 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 126.75-223 chr7 19968533 19968963 + 0.5 NA intron (NR_110114, intron 3 of 5) (TGTGTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 171678 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 149.5-103 chr2 189444007 189444476 + 0.5 NA intron (NM_001303096, intron 1 of 21) intron (NM_001303096, intron 1 of 21) 2767 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 146.25-92 chr22 24955625 24956025 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -9130 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 128.25-102 chr2 172478039 172478435 + 0.5 NA intron (NM_001365530, intron 9 of 25) intron (NM_001365530, intron 9 of 25) -12215 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 185.5-9 chr1 174729600 174730111 + 0.5 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) L1PA16|LINE|L1 28860 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 122.25-183 chr8 43087028 43087385 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6300 NM_001277971 84197 Hs.491646 NM_032237 ENSG00000185900 POMK MDDGA12|MDDGC12|SGK196 protein O-mannose kinase protein-coding 115.25-204 chr8 80601898 80602331 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 115888 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 129.75-181 chr8 82766489 82766986 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -145367 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 135.25-39 chr11 8177472 8177746 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8584 NM_001346692 79608 Hs.231850 NM_024557 ENSG00000166405 RIC3 AYST720|PRO1385 RIC3 acetylcholine receptor chaperone protein-coding 151-30 chr13 32094745 32095252 + 0.5 NA intron (NM_023037, intron 2 of 60) L1MA2|LINE|L1 63224 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 139.5-221 chr8 124282313 124282749 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35133 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 151.75-125 chr6 65020719 65021183 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 13 of 43) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -280467 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 214-66 chr8 88339998 88340795 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12913 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 112.25-200 chr7 31637913 31638179 + 0.5 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) intron (NM_194300, intron 8 of 12) -48971 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 162-2 chr1 34732362 34732821 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22456 NM_005268 2709 Hs.198249 NM_005268 ENSG00000189280 GJB5 CX31.1 gap junction protein beta 5 protein-coding 131.25-73 chr16 55501031 55501347 + 0.5 NA intron (NM_001127891, intron 11 of 12) MIRb|SINE|MIR -7883 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 124.75-73 chr14 36758738 36759028 + 0.5 NA intron (NM_001171170, intron 3 of 10) intron (NM_001171170, intron 3 of 10) 101315 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 129.25-147 chr5 5966943 5967307 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 370167 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 139-107 chr5 11607506 11607983 + 0.5 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -18678 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 119.25-150 chr4 78931765 78932225 + 0.5 NA intron (NR_146465, intron 2 of 6) intron (NR_146465, intron 2 of 6) 7443 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 133-22 chr11 65500767 65501111 + 0.5 NA non-coding (NR_145459, exon 1 of 1) non-coding (NR_145459, exon 1 of 1) 3201 NR_144567 378938 Hs.621695 NR_002819 ENSG00000251562 MALAT1 HCN|LINC00047|NCRNA00047|NEAT2|PRO2853 metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1 ncRNA 123.25-128 chr3 33824674 33825076 + 0.5 NA intron (NM_001256192, intron 4 of 5) intron (NM_001256192, intron 4 of 5) 26245 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 130-71 chr2 101553886 101554340 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79001 NM_001367509 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 150.5-83 chr2 9974692 9975126 + 0.5 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) intron (NM_198182, intron 8 of 15) 23216 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 170.25-99 chr3 106219581 106219985 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -350382 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 141.75-126 chr4 37400386 37400881 + 0.5 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -53292 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 174.75-137 chr9 35499943 35500482 + 0.5 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 10101 NR_052015 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 128.5-221 chr8 80763391 80763759 + 0.5 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 110893 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 138.75-106 chr20 49085011 49085324 + 0.5 NA intron (NM_001362762, intron 15 of 24) intron (NM_001362762, intron 15 of 24) 38855 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 139-42 chr14 73589956 73590357 + 0.5 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -1550 NM_152331 122970 Hs.49433 NM_152331 ENSG00000177465 ACOT4 PTE-Ib|PTE1B|PTE2B acyl-CoA thioesterase 4 protein-coding 140.5-120 chr2 150377425 150377925 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 110020 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 118-99 chr2 228432388 228432817 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 178793 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 120.5-106 chr2 9430530 9430977 + 0.5 NA exon (NM_001321834, exon 4 of 18) exon (NM_001321834, exon 4 of 18) 7099 NM_016207 51692 Hs.515972 NM_016207 ENSG00000119203 CPSF3 CPSF-73|CPSF73 cleavage and polyadenylation specific factor 3 protein-coding 126.75-180 chr4 103646866 103647356 + 0.5 NA intron (NM_001059, intron 3 of 4) intron (NM_001059, intron 3 of 4) 72874 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 128.5-141 chr3 63207053 63207449 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -71057 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 192.25-92 chr6 3755007 3755486 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3234 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 123-62 chr15 70540322 70540700 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34583 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 113.5-130 chr2 181662151 181662468 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5202 NR_027690 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 113.25-115 chr3 182664562 182665005 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -128721 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 117.5-222 chr7 70480178 70480572 + 0.5 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -651769 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 123-158 chr5 107044392 107044851 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33607 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 322.5-26 chr5 21611324 21612230 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 152297 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 163-114 chr7 87835630 87836122 + 0.5 NA 3' UTR (NM_018843, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_018843, exon 12 of 12) 40484 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 138.5-207 chr9 31233062 31233432 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 148243 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 125.75-180 chr8 14070420 14070801 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 440920 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 188.75-24 chr14 52580892 52581370 + 0.5 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 28295 NM_001353361 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 115.5-12 chr1 154375277 154375689 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -29710 NM_001206866 3570 Hs.135087 NM_000565 ENSG00000160712 IL6R CD126|IL-6R-1|IL-6RA|IL6Q|IL6RA|IL6RQ|gp80 interleukin 6 receptor protein-coding 116.5-169 chr3 190643312 190643740 + 0.5 NA intron (NM_001364881, intron 9 of 11) intron (NM_001364881, intron 9 of 11) 129441 NM_001167928 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 149.5-80 chr18 37052769 37053322 + 0.5 NA intron (NM_001353920, intron 7 of 10) L1PA17|LINE|L1 -129231 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 126.25-34 chr11 113953971 113954430 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20875 NR_046363 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 137.75-120 chr20 59566394 59566878 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10873 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 120-137 chr4 161719602 161720077 + 0.5 NA intron (NM_001128428, intron 6 of 14) L1MB1|LINE|L1 -302894 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 118-93 chr2 172252057 172252493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 149269 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 193-17 chr12 52343119 52343875 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 21125 NM_001300810 3891 Hs.182507 NM_002283 ENSG00000135443 KRT85 ECTD4|HB5|Hb-5|K85|KRTHB5|hHb5 keratin 85 protein-coding 170.5-58 chr14 43838067 43838436 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 669032 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 137-79 chr2 82186315 82186706 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -670293 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 139.5-61 chr13 94281169 94281481 + 0.5 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) L1PA8|LINE|L1 -93334 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 167.75-70 chr2 59651627 59652235 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 434223 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 125.25-186 chr7 27217091 27217590 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16919 NR_037843 100316868 Hs.199486 NR_037843 HOTTIP HOXA-AS6|HOXA13-AS1|NCRNA00213 HOXA distal transcript antisense RNA ncRNA 115.75-159 chr4 139787734 139788130 + 0.5 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 122113 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 142.5-233 chr8 144041132 144041625 + 0.5 NA intron (NM_198572, intron 4 of 4) intron (NM_198572, intron 4 of 4) -8020 NR_158554 392275 NR_158554 SMPD5 MA-nSMase sphingomyelin phosphodiesterase 5 pseudo 127.25-60 chr14 66261562 66261849 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -224666 NR_024338 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 144.75-20 chr10 88950754 88951043 + 0.5 NA intron (NM_001320855, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 1875 NM_001613 59 Hs.500483 NM_001613 ENSG00000107796 ACTA2 ACTSA actin alpha 2, smooth muscle protein-coding 131.5-173 chr4 48808184 48808688 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22607 NM_001079840 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 157-120 chr8 132888884 132889509 + 0.5 NA intron (NM_003235, intron 10 of 47) intron (NM_003235, intron 10 of 47) 22238 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 115.25-112 chr2 181615222 181615645 + 0.5 NA intron (NR_027690, intron 1 of 11) intron (NR_027690, intron 1 of 11) 41672 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 154.25-64 chr17 21049292 21049738 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -6504 NM_015276 23326 Hs.462492 NM_015276 ENSG00000124422 USP22 USP3L ubiquitin specific peptidase 22 protein-coding 127.25-22 chr10 60576724 60577179 + 0.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -3995 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 114.5-30 chr10 14020118 14020517 + 0.5 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) -11767 NM_001318336 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 126-45 chr13 45963506 45963921 + 0.5 NA 3' UTR (NM_015070, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_015070, exon 17 of 17) 89033 NM_001330566 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 156.75-18 chr10 27709301 27709688 + 0.5 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) intron (NM_001242702, intron 5 of 6) -35121 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 120.5-82 chr15 70781838 70782160 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -18441 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 151.75-138 chr7 36347857 36348431 + 0.5 NA intron (NM_001300956, intron 1 of 5) intron (NM_001300956, intron 1 of 5) 19096 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 138-87 chr20 44386875 44387190 + 0.5 NA intron (NR_109949, intron 2 of 3) AluSq2|SINE|Alu 8674 NR_109949 101927219 Hs.655919 NR_109949 ENSG00000229005 HNF4A-AS1 uc002xlx HNF4A antisense RNA 1 ncRNA 199.75-77 chr5 40331966 40332500 + 0.5 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 279942 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 146.75-70 chr2 20494428 20494904 + 0.5 NA intron (NR_157978, intron 1 of 3) intron (NR_157978, intron 1 of 3) 6858 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 113.75-26 chr10 104879147 104879438 + 0.5 NA intron (NM_014978, intron 2 of 26) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -213076 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 165.5-90 chr2 182802172 182802647 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 64228 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 116-138 chr6 44822242 44822610 + 0.5 NA intron (NR_146632, intron 11 of 11) intron (NR_146632, intron 11 of 11) -270545 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 130-121 chr5 2205956 2206447 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106000 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 118.5-213 chr8 59992879 59993238 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 288342 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 137.75-56 chr14 26563686 26564098 + 0.5 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) -10462 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 114.25-101 chr2 127348483 127348915 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -5470 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 114.5-218 chr5 114977864 114978183 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 191885 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 120.75-88 chr2 227951196 227951667 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 79800 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 169-51 chr2 236301373 236301746 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -37214 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 154-62 chr2 24502175 24502579 + 0.5 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) 10500 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 154.75-155 chr9 91545995 91546538 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -89985 NR_037472 100500821 NR_037472 ENSG00000266855 MIR3910-1 mir-3910-1 microRNA 3910-1 ncRNA 135.75-76 chr16 87067593 87068097 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 10061 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 120.25-70 chr16 57534455 57534720 + 0.5 NA intron (NM_033212, intron 1 of 8) intron (NM_033212, intron 1 of 8) 1984 NM_033212 92922 Hs.644611 NM_033212 ENSG00000135736 CCDC102A - coiled-coil domain containing 102A protein-coding 145.75-83 chr2 107976785 107977298 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -9483 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 140.25-2 chr1 35810754 35811189 + 0.5 NA intron (NM_017629, intron 1 of 17) AluSz|SINE|Alu 2955 NM_017629 192670 Hs.744858 NM_017629 ENSG00000134698 AGO4 EIF2C4 argonaute RISC component 4 protein-coding 142.75-80 chr17 44452088 44452606 + 0.5 NA intron (NM_001304942, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR -15496 NM_001304943 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 120.75-31 chr12 16713017 16713297 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -104943 NM_001001395 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 115.25-107 chr2 159507861 159508208 + 0.5 NA intron (NM_001329858, intron 2 of 36) AluSz6|SINE|Alu -107260 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 113-185 chr9 87825806 87826052 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18816 NR_033405 1518 Hs.726015 NR_033405 CTSLP8 CTSL1P8 cathepsin L pseudogene 8 pseudo 122.5-77 chr15 93151958 93152431 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53872 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 123-172 chr7 52134297 52134758 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -741271 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 165-82 chr21 28308641 28309177 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -80242 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 152.25-4 chr1 109161578 109161990 + 0.5 NA intron (NM_001284352, intron 1 of 20) intron (NM_001284352, intron 1 of 20) -24765 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 125.5-118 chr18 29761248 29761725 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -537424 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 114.75-176 chr7 80453845 80454152 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 58066 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 118.25-19 chr1 174835788 174836249 + 0.5 NA intron (NM_001366446, intron 19 of 25) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 36280 NM_001366455 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 120.75-66 chr18 13048310 13048691 + 0.5 NA intron (NM_032142, intron 15 of 44) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 57138 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 134-74 chr17 62806420 62806918 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001100875) promoter-TSS (NM_001100875) -29 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 125.25-51 chr13 28449108 28449459 + 0.5 NA intron (NM_002019, intron 3 of 29) AluJr|SINE|Alu 45845 NM_001160030 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 126.5-156 chr3 108586838 108587135 + 0.5 NA intron (NM_020890, intron 1 of 20) intron (NM_020890, intron 1 of 20) 2452 NM_020890 57650 Hs.591308 NM_020890 ENSG00000163507 CIP2A KIAA1524|p90 cell proliferation regulating inhibitor of protein phosphatase 2A protein-coding 216.75-45 chr2 198661144 198661650 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -286300 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 143.25-178 chr8 65523667 65524109 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 38778 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 125.75-175 chr7 95683278 95683571 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -86908 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 131.5-217 chr7 50017987 50018487 + 0.5 NA intron (NM_001159878, intron 6 of 7) intron (NM_001159878, intron 6 of 7) 75009 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 141-89 chr20 46493992 46494373 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19390 NM_001353813 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 164-30 chr13 91077544 91078096 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11797 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 135.25-46 chr11 103092825 103093266 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_032299) promoter-TSS (NM_032299) -885 NM_001318739 84259 Hs.503716 NM_032299 ENSG00000137692 DCUN1D5 SCCRO5 defective in cullin neddylation 1 domain containing 5 protein-coding 126.75-115 chr2 110792436 110792800 + 0.5 NA intron (NM_001371254, intron 3 of 18) AluJo|SINE|Alu 60045 NM_001371254 134-35 chr11 112519774 112520250 + 0.5 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 35667 NR_120560 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 142-161 chr8 99927881 99928248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34357 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 146.5-17 chr1 163694689 163695053 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -271680 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 116.25-192 chr6 16565772 16566222 + 0.5 NA intron (NM_000332, intron 5 of 8) intron (NM_000332, intron 5 of 8) 194187 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 113.75-24 chr10 60469093 60469409 + 0.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -79376 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 133.25-63 chr15 87682897 87683345 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106192 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 126.25-103 chr21 29849064 29849525 + 0.5 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 90702 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 144-51 chr18 3862528 3863015 + 0.5 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) MIRb|SINE|MIR 11531 NM_001242764 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 142-149 chr7 43597574 43598040 + 0.5 NA intron (NM_004760, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 14699 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 124-166 chr8 84611168 84611574 + 0.5 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) MER81|DNA|hAT-Blackjack -94556 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 112.75-12 chr1 155078263 155078571 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_004952) promoter-TSS (NM_004952) -420 NM_004952 1944 Hs.516656 NM_004952 ENSG00000143590 EFNA3 EFL2|EPLG3|Ehk1-L|LERK3 ephrin A3 protein-coding 145.5-105 chr2 154511913 154512220 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54628 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 147.25-132 chr7 84741516 84741856 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 209210 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 156.25-3 chr1 88118001 88118543 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -565872 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 114.5-64 chr12 28414124 28414438 + 0.5 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -223543 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 137.5-111 chr2 36658587 36659068 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37863 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 124.5-43 chr12 2207082 2207412 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 16234 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 135.5-186 chr7 53584979 53585500 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 226692 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 190.5-153 chr7 131771466 131771974 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -138500 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 114.5-202 chr5 24680584 24680958 + 0.5 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -35793 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 122-31 chr10 75153273 75153697 + 0.5 NA intron (NM_001174156, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 41829 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 153.5-220 chrX 129043645 129044011 + 0.5 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 479662 NM_001282875 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 209.75-23 chr12 117023559 117024058 + 0.5 NA intron (NM_153348, intron 8 of 10) intron (NM_153348, intron 8 of 10) -36471 NR_103809 100506551 Hs.657861 NR_103809 ENSG00000257279 LOC100506551 - uncharacterized LOC100506551 ncRNA 238.25-82 chr7 51590345 51591117 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -197475 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 194.75-53 chr2 63026728 63027159 + 0.5 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 20768 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 145-2 chr1 21625650 21626155 + 0.5 NA intron (NM_001350526, intron 6 of 28) MIRb|SINE|MIR 25996 NM_001145658 5909 Hs.148178 NM_002885 ENSG00000076864 RAP1GAP RAP1GA1|RAP1GAP1|RAP1GAPII|RAPGAP RAP1 GTPase activating protein protein-coding 112.75-210 chr9 96815366 96815749 + 0.5 NA TTS (NM_001346991) TTS (NM_001346991) -37428 NM_014930 22869 Hs.75264 NM_014930 ENSG00000081386 ZNF510 - zinc finger protein 510 protein-coding 188.5-71 chr2 69158669 69159260 + 0.5 NA intron (NM_032208, intron 13 of 17) intron (NM_032208, intron 13 of 17) 55282 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 115-128 chr5 27564103 27564416 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 91967 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 167.5-147 chr5 73490625 73491248 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -7489 NM_001207 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 155-12 chr10 25417468 25417915 + 0.5 NA intron (NM_020752, intron 4 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -234021 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 190.5-104 chr3 195098578 195099134 + 0.5 NA intron (NM_152531, intron 3 of 3) intron (NM_152531, intron 3 of 3) 4268 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 128-2 chr1 53451075 53451516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8104 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 126.5-60 chr14 47733758 47734208 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27121 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 126.5-165 chr4 33572779 33573083 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 466962 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 117.25-166 chr5 29312933 29313393 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 82813 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 118.25-53 chr12 125969660 125970116 + 0.5 NA non-coding (NR_034132, exon 2 of 6) non-coding (NR_034132, exon 2 of 6) 13486 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 117-33 chr11 131989001 131989454 + 0.5 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) intron (NR_147849, intron 2 of 6) 78409 NR_147851 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 185-41 chr2 27827454 27828165 + 0.5 NA intron (NM_022128, intron 6 of 7) intron (NM_022128, intron 6 of 7) 56090 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 123-176 chr7 123696219 123696705 + 0.5 NA intron (NM_003941, intron 6 of 10) intron (NM_003941, intron 6 of 10) 40596 NM_207163 442721 Hs.592260 NM_207163 ENSG00000170807 LMOD2 C-LMOD|CLMOD leiomodin 2 protein-coding 229.25-58 chr4 114856797 114857583 + 0.5 NA intron (NM_022569, intron 7 of 13) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 200431 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 146-119 chr7 43877047 43877468 + 0.5 NA exon (NM_017920, exon 5 of 5) exon (NM_017920, exon 5 of 5) -7740 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 161-124 chr8 136791461 136791888 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 3 of 5) intron (NR_147196, intron 3 of 5) 260876 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 112.5-36 chr11 79108254 79108540 + 0.5 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) MLT2C1|LTR|ERVL 293712 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 132-28 chr11 48285127 48285511 + 0.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -20904 NM_001004725 256148 Hs.553657 NM_001004725 ENSG00000176555 OR4S1 OR11-100 olfactory receptor family 4 subfamily S member 1 protein-coding 118.5-183 chr7 13800471 13800927 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 185815 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 134-185 chr9 37574045 37574423 + 0.5 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) intron (NM_012166, intron 1 of 10) 2146 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 130.75-182 chr7 74286426 74286730 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -2829 NM_032421 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 125.5-204 chr5 76901467 76901874 + 0.5 NA intron (NM_130772, intron 4 of 4) L1MA1|LINE|L1 -51375 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 128.75-60 chr15 49888922 49889380 + 0.5 NA intron (NR_073597, intron 22 of 26) intron (NR_073597, intron 22 of 26) 224228 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 155.75-28 chr11 27690840 27691288 + 0.5 NA intron (NR_033315, intron 6 of 6) intron (NR_033315, intron 6 of 6) 8603 NM_170734 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 122-140 chr5 98567444 98567917 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -200952 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 126.75-136 chr20 55366931 55367244 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -55956 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 154.5-145 chr5 27509229 27509772 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 37208 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 114.75-41 chr12 687522 687821 + 0.5 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -24226 NM_016533 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 141-127 chr5 79695946 79696305 + 0.5 NA intron (NM_153610, intron 1 of 12) intron (NM_153610, intron 1 of 12) 6289 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 139.75-42 chr13 30112823 30113288 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4180 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 132.75-173 chr7 36848084 36848433 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71174 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 127.5-136 chr20 11887265 11887720 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3231 NM_001282552 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 150.75-111 chr2 241311776 241312145 + 0.5 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) HAL1|LINE|L1 -3227 NM_001349306 4735 Hs.721234 NM_004404 ENSG00000168385 SEPTIN2 DIFF6|NEDD-5|NEDD5|Pnutl3|SEPT2|hNedd5 septin 2 protein-coding 127.75-199 chr8 83213822 83214192 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -189751 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 113.5-67 chr13 86886569 86886991 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -25140 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 122.25-23 chr10 61800422 61800745 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -101116 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 143.25-164 chr6 168445117 168445431 + 0.5 NA intron (NM_001166412, intron 1 of 12) intron (NM_001166412, intron 1 of 12) 4090 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 133.75-198 chr9 24076474 24076787 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -226029 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 117-5 chr1 118974520 118974789 + 0.5 NA intron (NM_152380, intron 1 of 7) intron (NM_152380, intron 1 of 7) 13689 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 131.5-113 chr2 67374217 67374555 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22947 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 115.5-178 chr3 146741210 146741503 + 0.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -135140 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 135.75-42 chr12 14430034 14430472 + 0.5 NA intron (NM_001286515, intron 2 of 12) L2|LINE|L2 44972 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 217.75-19 chr11 46309075 46309682 + 0.5 NA intron (NM_052854, intron 3 of 11) intron (NM_052854, intron 3 of 11) -23548 NM_201532 8525 Hs.502461 NM_003646 ENSG00000149091 DGKZ DAGK5|DAGK6|DGK-ZETA|hDGKzeta diacylglycerol kinase zeta protein-coding 136.25-77 chr17 31876910 31877277 + 0.5 NA intron (NM_018428, intron 13 of 18) L1M5|LINE|L1 -17849 NM_018405 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 148.5-202 chr7 2464684 2465240 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 11421 NM_001291784 402635 NM_001291784 GRIFIN - galectin-related inter-fiber protein protein-coding 126.75-37 chr12 23902952 23903340 + 0.5 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) 46524 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 126.75-251 chr9 31625555 31625959 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -244267 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 112.5-174 chr3 160018896 160019147 + 0.5 NA intron (NR_108088, intron 4 of 9) intron (NR_108088, intron 4 of 9) -1628 NR_104132 730109 Hs.99333 NR_104132 LINC01100 - long intergenic non-protein coding RNA 1100 ncRNA 175.25-69 chr2 82453584 82454015 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -403004 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 151-69 chr20 15996123 15996648 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) L1M3|LINE|L1 -10503 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 115.25-73 chr16 69567242 69567652 + 0.5 NA intron (NM_173215, intron 1 of 13) intron (NM_173215, intron 1 of 13) 1481 NM_006599 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 147.5-145 chr3 118728238 118728619 + 0.5 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 82405 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 191.25-62 chr2 187141721 187142317 + 0.5 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -292849 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 117-196 chr9 98277742 98278140 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -22292 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 120.5-93 chr17 10981667 10982063 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -143778 NM_001101387 644139 Hs.553909 NM_001101387 ENSG00000233670 PIRT - phosphoinositide interacting regulator of transient receptor potential channels protein-coding 134.5-166 chr5 11456228 11456600 + 0.5 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 132503 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 200.25-105 chr8 6468905 6469565 + 0.5 NA intron (NM_001363980, intron 9 of 10) intron (NM_001363980, intron 9 of 10) 62082 NM_001322045 79648 Hs.593807 NM_024596 ENSG00000147316 MCPH1 BRIT1|MCT microcephalin 1 protein-coding 181-93 chr6 60668680 60669378 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -905101 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 188.5-66 chr2 47508166 47508587 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19161 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 140.75-51 chr14 61572346 61572801 + 0.5 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -1920 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 119.75-87 chr18 66328659 66328902 + 0.5 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 275310 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 160.5-5 chr1 195252016 195252548 + 0.5 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 836433 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 115.5-45 chr12 113016086 113016510 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 37779 NM_016817 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 139.25-138 chr4 80597941 80598313 + 0.5 NA intron (NM_152770, intron 3 of 5) L2|LINE|L2 262407 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 112.5-204 chr5 170948477 170948808 + 0.5 NA intron (NM_022897, intron 12 of 27) L1M4|LINE|L1 86624 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 125-93 chr21 46671055 46671381 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35544 NM_001242866 3275 Hs.154163 NM_001535 ENSG00000160310 PRMT2 HRMT1L1 protein arginine methyltransferase 2 protein-coding 185.25-124 chr8 107204992 107205555 + 0.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 131242 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 144.75-70 chr17 79049000 79049446 + 0.5 NA non-coding (NR_049769, exon 4 of 4) non-coding (NR_049769, exon 4 of 4) 14924 NM_198593 114897 Hs.201398 NM_030968 ENSG00000173918 C1QTNF1 CTRP1|GIP|ZSIG37 C1q and TNF related 1 protein-coding 168.5-106 chr21 41971652 41972078 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -17847 NM_015500 25966 Hs.473894 NM_015500 ENSG00000157617 C2CD2 C21orf25|C21orf258|TMEM24L C2 calcium dependent domain containing 2 protein-coding 122.5-12 chr1 153179455 153179822 + 0.5 NA intron (NR_110685, intron 2 of 2) L2|LINE|L2 5120 NR_110685 101928009 Hs.385720 NR_110685 ENSG00000229699 LOC101928009 - uncharacterized LOC101928009 ncRNA 192.5-140 chr9 69872049 69872581 + 0.5 NA intron (NM_001308084, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR 51498 NM_001308085 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 141.75-136 chr5 34660766 34661245 + 0.5 NA intron (NM_001145520, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 4514 NM_001145520 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 187.5-70 chr16 81556762 81557322 + 0.5 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) L1MD3|LINE|L1 23140 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 137.5-26 chr10 51685177 51685538 + 0.5 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 14238 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 112.75-209 chr9 95243132 95243380 + 0.5 NA intron (NM_001243744, intron 3 of 13) intron (NM_001243744, intron 3 of 13) 73998 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 140.75-101 chr2 150887266 150887756 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 258614 NR_110246 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 113.75-52 chr13 76198811 76199192 + 0.5 NA Intergenic (CATTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -263869 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 145.5-101 chr2 121738286 121738850 + 0.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -1693 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 119.25-173 chr6 38018595 38018854 + 0.5 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 198997 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 153-46 chr14 83844840 83845286 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 1202431 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 123.25-66 chr15 83843976 83844466 + 0.5 NA intron (NM_207517, intron 7 of 29) intron (NM_207517, intron 7 of 29) 190098 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 129.25-105 chr2 208586478 208586738 + 0.5 NA intron (NR_136588, intron 2 of 5) L1ME3F|LINE|L1 43966 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 202.25-2 chr1 44661051 44661586 + 0.5 NA intron (NM_001300748, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 9738 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 135.75-68 chr15 80775194 80775647 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -3950 NM_018689 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 142-29 chr11 46424516 46424855 + 0.5 NA intron (NM_001267782, intron 16 of 19) AluJr4|SINE|Alu -27122 NR_036118 100422825 NR_036118 ENSG00000283497 MIR3160-2 mir-3160-2 microRNA 3160-2 ncRNA 150.75-56 chr14 46944697 46945112 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 9 of 16) L1ME2|LINE|L1 -293123 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 145-115 chr4 169291666 169292225 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20989 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 136-2 chr1 42029275 42029736 + 0.5 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) intron (NR_038261, intron 1 of 3) 6429 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 118.25-100 chr2 47204714 47205127 + 0.5 NA intron (NR_110208, intron 3 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -27984 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 131.75-48 chr12 28479550 28479848 + 0.5 NA intron (NM_001352082, intron 12 of 13) intron (NM_001352082, intron 12 of 13) -288961 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 150.5-113 chr20 11546028 11546547 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -272904 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 134.25-115 chr3 80569553 80569927 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -195157 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 128-44 chr14 60261521 60261928 + 0.5 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 12503 NM_021003 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 122.75-113 chr20 63716016 63716436 + 0.5 NA intron (NM_181485, intron 2 of 6) AluSx|SINE|Alu 8198 NM_001195653 84619 Hs.590868 NM_032527 ENSG00000197114 ZGPAT GPATC6|GPATCH6|KIAA1847|ZC3H9|ZC3HDC9|ZIP zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing protein-coding 153-29 chr12 45998071 45998585 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -7754 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 140.5-9 chr1 165699118 165699655 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_000696) promoter-TSS (NM_000696) 636 NR_036683 440700 Hs.568703 NR_036683 ENSG00000215838 LOC440700 - carbonic anhydrase 14 pseudogene pseudo 161.5-21 chr10 68496018 68496467 + 0.5 NA intron (NM_001324314, intron 5 of 9) intron (NM_001324314, intron 5 of 9) 21976 NR_136737 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 121.75-128 chr4 44988326 44988586 + 0.5 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -261822 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 142.75-133 chr3 130524916 130525309 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35222 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 171.25-98 chr3 63980885 63981476 + 0.5 NA intron (NM_001177387, intron 5 of 12) intron (NM_001177387, intron 5 of 12) 13386 NM_001128149 6314 Hs.476595 NM_000333 ENSG00000163635 ATXN7 ADCAII|OPCA3|SCA7|SGF73 ataxin 7 protein-coding 137.25-70 chr2 76078660 76079100 + 0.5 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -367965 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 180-63 chr2 101982194 101982896 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_103791) promoter-TSS (NR_103791) -920 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 134-26 chr11 35171892 35172173 + 0.5 NA intron (NM_001001389, intron 1 of 16) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 9082 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 114.5-138 chr2 95228456 95228771 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -45836 NM_001165978 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 112.5 chr1 7473113 7473369 + 0.5 NA intron (NM_001349608, intron 5 of 21) intron (NM_001349608, intron 5 of 21) -83487 NR_146201 102725193 Hs.666120 NR_146199 ENSG00000237728 LOC102725193 - uncharacterized LOC102725193 ncRNA 136.25-11 chr10 50960653 50961007 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -30058 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 113.25-38 chr12 77967565 77967908 + 0.5 NA intron (NM_001024383, intron 4 of 39) intron (NM_001024383, intron 4 of 39) 136842 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 146-96 chr4 64150725 64151213 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 258481 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 128.25-16 chr10 61023922 61024353 + 0.5 NA intron (NR_108052, intron 1 of 1) intron (NR_108052, intron 1 of 1) 7862 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 127.25-179 chr6 75874484 75874759 + 0.5 NA intron (NM_001300899, intron 20 of 32) L2b|LINE|L2 125382 NM_001368140 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 138.75-164 chr6 63772047 63772589 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 40 of 43) L1MC5a|LINE|L1 -34518 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 137.5-161 chr3 107631514 107631863 + 0.5 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 108726 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 137-57 chr16 50766080 50766473 + 0.5 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 23971 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 132.25-119 chr22 46814265 46814641 + 0.5 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) MIRb|SINE|MIR 40526 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 120.75-181 chrX 85282203 85282498 + 0.5 NA intron (NM_001307940, intron 15 of 15) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 38359 NM_001330574 7552 Hs.326801 NM_021998 ENSG00000147180 ZNF711 CMPX1|MRX97|ZNF4|ZNF5|ZNF6|Zfp711|dJ75N13.1 zinc finger protein 711 protein-coding 164.5-111 chr20 15396484 15397131 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) intron (NM_001351663, intron 6 of 17) 199967 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 129.5-72 chr15 25105266 25105720 + 0.5 NA TTS (NR_003361) TTS (NR_003361) 852 NR_003361 100033820 NR_003361 ENSG00000278123 SNORD116-28 HBII-85-28 small nucleolar RNA, C/D box 116-28 snoRNA 117.25-10 chr1 82342955 82343197 + 0.5 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 540623 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 165-152 chr9 36326048 36326582 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49259 NM_001190388 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 121.75-15 chr10 105811852 105812312 + 0.5 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 8251 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 167.75-120 chr5 164337126 164337609 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 130035 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 137.75-142 chr3 159501290 159501721 + 0.5 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 218859 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 123-17 chr10 9717485 9717951 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -341004 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 205.75-85 chr8 109082423 109083127 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3853 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 150.5-194 chr6 151798824 151799274 + 0.5 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) intron (NM_001122742, intron 2 of 9) -6624 NM_001122741 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 136.75-49 chr12 95735057 95735548 + 0.5 NA intron (NM_001329701, intron 3 of 9) intron (NM_001329701, intron 3 of 9) 54893 NM_001329702 59277 Hs.201034 NM_021229 ENSG00000074527 NTN4 PRO3091 netrin 4 protein-coding 150.25-15 chr10 11004512 11004874 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001025077) promoter-TSS (NM_001025077) 45 NM_001326329 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 113-58 chr13 69576936 69577317 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 354780 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 129.75-109 chr20 43893008 43893517 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1456 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 113.5-233 chr8 86311456 86311756 + 0.5 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -30941 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 133.25-144 chr4 22169231 22169511 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 170295 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 114.5-192 chr4 101994010 101994328 + 0.5 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 180327 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 126.25-151 chr5 41128335 41128662 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57156 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 114.25-181 chr7 77925676 77925962 + 0.5 NA intron (NM_001366085, intron 9 of 10) AluSc|SINE|Alu 85689 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 135.25-69 chr15 69835060 69835337 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_026764) promoter-TSS (NR_026764) -36 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 118.5-181 chr6 135602092 135602499 + 0.5 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 104494 NR_152845 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 168-8 chr1 179356220 179356759 + 0.5 NA non-coding (NR_045530, exon 14 of 14) non-coding (NR_045530, exon 14 of 14) -9482 NM_144696 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 169.5-57 chr15 25579181 25579762 + 0.5 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -140415 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 115-70 chr17 72810618 72810984 + 0.5 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) AluSx|SINE|Alu -170329 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 129.25-139 chr4 36158432 36158783 + 0.5 NA intron (NR_146894, intron 15 of 32) intron (NR_146894, intron 15 of 32) 85332 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 117.75-50 chr13 49238113 49238504 + 0.5 NA intron (NR_135318, intron 1 of 1) L1MC1|LINE|L1 9532 NR_135318 105370203 Hs.569238 NR_135318 LOC105370203 - uncharacterized LOC105370203 ncRNA 113.75-3 chr1 36844070 36844478 + 0.5 NA intron (NM_000831, intron 9 of 15) intron (NM_000831, intron 9 of 15) 190241 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 131.75-60 chr13 46843145 46843599 + 0.5 NA intron (NM_001165947, intron 2 of 2) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -8768 NR_046612 100874082 Hs.569281 NR_046612 ENSG00000224517 HTR2A-AS1 - HTR2A antisense RNA 1 ncRNA 132-106 chr3 16535019 16535434 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1092 NR_103843 100996597 Hs.599432 NR_103843 ENSG00000233570 LINC00690 - long intergenic non-protein coding RNA 690 ncRNA 193.5-39 chr13 22825961 22826616 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 71893 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 129.75-194 chr9 37397447 37397892 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -25027 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 116.25-69 chr14 62602810 62603258 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 442424 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 142.75-120 chr22 24888318 24888758 + 0.5 NA intron (NM_001098498, intron 16 of 23) AluSx1|SINE|Alu 58157 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 116.5-180 chr4 80686934 80687377 + 0.5 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -343553 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 129.25-210 chr8 127807425 127807815 + 0.5 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 11658 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 158.75-93 chr2 166607946 166608503 + 0.5 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -121253 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 151.25-64 chr16 71184717 71185217 + 0.5 NA exon (NM_001198542, exon 3 of 19) exon (NM_001198542, exon 3 of 19) 45755 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 191-82 chr8 103281113 103281605 + 0.5 NA intron (NR_148213, intron 2 of 3) intron (NR_148213, intron 2 of 3) -17135 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 165.5-35 chr12 117432488 117432915 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70899 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 127 chr1 19096047 19096523 + 0.5 NA intron (NM_020765, intron 92 of 105) intron (NM_020765, intron 92 of 105) 113981 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 128-159 chr7 107203004 107203369 + 0.5 NA TTS (NM_012257).2 TTS (NM_012257).2 34183 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 137.5-222 chr7 89432873 89433354 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -637376 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 164-47 chr16 66957181 66957656 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3848 NM_001185177 23491 Hs.268700 NM_012122 ENSG00000172828 CES3 ES31 carboxylesterase 3 protein-coding 128.25-119 chr22 34981027 34981497 + 0.5 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 16654 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 125-69 chr2 80483004 80483393 + 0.5 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 169819 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 119-169 chr6 110972748 110973169 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9059 NM_001289111 84154 Hs.372265 NM_032194 ENSG00000197498 RPF2 BXDC1|bA397G5.4 ribosome production factor 2 homolog protein-coding 125.75-48 chr13 33601274 33601539 + 0.5 NA intron (NM_001243476, intron 3 of 17) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 75388 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 136.25-76 chr16 87194478 87194879 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -17437 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 175.5-186 chrX 72157104 72157647 + 0.5 NA intron (NM_207422, intron 1 of 1) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 13191 NM_207422 392490 Hs.660859 NM_207422 FLJ44635 - TPT1-like protein protein-coding 127.5-145 chr22 31736345 31736803 + 0.5 NA intron (NM_173566, intron 2 of 8) intron (NM_173566, intron 2 of 8) 13558 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 119.75-157 chr4 74261030 74261367 + 0.5 NA non-coding (NR_147097, exon 8 of 10) non-coding (NR_147097, exon 8 of 10) -47272 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 144.5-29 chr10 49526159 49526567 + 0.5 NA intron (NM_001277058, intron 4 of 5) L1ME3A|LINE|L1 -2082 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 133.5-24 chr10 15259821 15260308 + 0.5 NA intron (NM_001010924, intron 3 of 7) AluJb|SINE|Alu -91371 NM_001308295 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 113.25-139 chr5 102977195 102977553 + 0.5 NA intron (NM_001364590, intron 16 of 25) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 111551 NM_138821 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 115.75-84 chr17 74765079 74765513 + 0.5 NA intron (NM_004252, intron 3 of 5) AluSc|SINE|Alu 11049 NM_001305081 26151 Hs.144058 NM_015654 ENSG00000109065 NAT9 EBSP, hNATL N-acetyltransferase 9 (putative) protein-coding 138.75-123 chr4 22192062 22192524 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 147373 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 127.5-58 chr12 63880951 63881316 + 0.5 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 36433 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 117.25-191 chr6 135963131 135963541 + 0.5 NA intron (NM_018945, intron 2 of 12) intron (NM_018945, intron 2 of 12) 109491 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 122.75-127 chr3 97652510 97652869 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -111832 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 125.5-242 chr7 139560594 139561088 + 0.5 NA TTS (NM_022740) TTS (NM_022740) 37156 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 157.5-217 chr8 123311069 123311604 + 0.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -35795 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 151.25-6 chr1 100989049 100989534 + 0.5 NA TTS (NM_001077395) TTS (NM_001077395) 36493 NM_015958 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 160.75-12 chr1 235457560 235457963 + 0.5 NA intron (NM_152490, intron 8 of 11) intron (NM_152490, intron 8 of 11) 46691 NM_152490 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 169-98 chr7 47361031 47361508 + 0.5 NA intron (NM_022748, intron 17 of 30) intron (NM_022748, intron 17 of 30) 103534 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 136.25-85 chr18 3180402 3180872 + 0.5 NA intron (NM_019856, intron 5 of 36) intron (NM_019856, intron 5 of 36) 39331 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 130.25-63 chr15 39551968 39552460 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28865 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 112.5-40 chr11 107169676 107170003 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -151363 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 114.5-168 chr22 46844686 46845050 + 0.5 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) intron (NM_001284305, intron 4 of 12) 70941 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 112.5-140 chr2 217899007 217899288 + 0.5 NA intron (NM_001308023, intron 4 of 29) intron (NM_001308023, intron 4 of 29) 1481 NR_106867 102465485 NR_106867 ENSG00000275458 MIR6809 hsa-mir-6809 microRNA 6809 ncRNA 120.25-99 chr2 118053723 118054042 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34536 NM_001321331 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 132.25-183 chr8 117685728 117686226 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 165264 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 137-25 chr10 52829182 52829554 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -57668 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 132.5-94 chr17 83200128 83200593 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26537 NR_029406 388574 Hs.546918 NR_029406 ENSG00000232938 RPL23AP87 - ribosomal protein L23a pseudogene 87 pseudo 112.25-37 chr11 96707478 96707827 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 199227 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 135.5-43 chr11 128044068 128044421 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -164522 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 129-108 chr20 10484100 10484595 + 0.5 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) intron (NM_001009608, intron 2 of 7) 49042 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 120.5-234 chr8 132272613 132272987 + 0.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -167535 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 131.25-164 chr5 72084087 72084467 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -23198 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 115.25-17 chr1 181643129 181643470 + 0.5 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) intron (NM_001205293, intron 6 of 47) 159782 NM_001205294 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 134.25-138 chr5 35948525 35949009 + 0.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 9966 NR_104630 100506406 Hs.116864 NR_104630 ENSG00000249748 LOC100506406 - uncharacterized LOC100506406 ncRNA 160.75-119 chr5 17110958 17111384 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 44821 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 201-14 chr10 102502000 102502575 + 0.5 NA intron (NM_005736, intron 1 of 10) intron (NM_005736, intron 1 of 10) 425 NM_005736 10121 Hs.153961 NM_005736 ENSG00000138107 ACTR1A ARP1|Arp1A|CTRN1 actin related protein 1A protein-coding 121.5-17 chr1 184054506 184054909 + 0.5 NA intron (NR_125335, intron 2 of 5) intron (NR_125335, intron 2 of 5) 2977 NM_001363643 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 251-36 chr20 63135853 63136490 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -33852 NR_003245 768097 Hs.635159 NR_003245 ENSG00000231133 HAR1B HAR1R|LINC00065|NCRNA00065 highly accelerated region 1B ncRNA 112.75-198 chr8 101008309 101008589 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43605 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 147.75 chr1 26944630 26944998 + 0.5 NA intron (NM_006600, intron 6 of 8) AluSq|SINE|Alu 15654 NM_152365 126695 Hs.188881 NM_152365 ENSG00000175707 KDF1 C1orf172|ECTD12 keratinocyte differentiation factor 1 protein-coding 124.75-221 chrX 30909330 30909748 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20285 NM_152787 257397 Hs.188256 NM_152787 ENSG00000157625 TAB3 MAP3K7IP3|NAP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 3 protein-coding 136.5-40 chr11 21718567 21718951 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -474326 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 127-93 chr2 7186382 7186723 + 0.5 NA Intergenic MER91B|DNA|hAT-Tip100 -108672 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 196.25-38 chr14 74034503 74034898 + 0.5 NA intron (NM_025057, intron 4 of 11) intron (NM_025057, intron 4 of 11) 15351 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 140-22 chr10 131243853 131244316 + 0.5 NA intron (NM_174937, intron 4 of 11) intron (NM_174937, intron 4 of 11) 67637 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 114.25-133 chr4 11605598 11605986 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 163676 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 135.25-96 chr2 55317709 55318154 + 0.5 NA intron (NM_001254943, intron 19 of 33) intron (NM_001254943, intron 19 of 33) 35612 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 151.25-73 chr18 42646626 42647178 + 0.5 NA intron (NR_046174, intron 7 of 9) intron (NR_046174, intron 7 of 9) 460234 NR_046457 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 121-176 chr7 27555972 27556351 + 0.5 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR -59813 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 129.25-52 chr14 74342465 74342789 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5844 NM_018228 55237 Hs.578167 NM_018228 ENSG00000133980 VRTN C14orf115|vertnin vertebrae development associated protein-coding 154.5-29 chr10 106031603 106032155 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -108286 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 200.25-95 chr6 120184894 120185624 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 170080 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 118-9 chr1 205591843 205592264 + 0.5 NA intron (NM_181644, intron 6 of 9) CpG -22748 NR_027086 284578 Hs.537020 NR_027086 MFSD4A-AS1 - MFSD4A antisense RNA 1 ncRNA 115.5-153 chr21 19796633 19796933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102972 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 157-100 chr5 137676352 137676871 + 0.5 NA intron (NM_017415, intron 6 of 14) MIRb|SINE|MIR -28962 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 144.25-50 chr13 44408220 44408514 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2383 NR_104174 400128 Hs.438480 NR_104174 ENSG00000237361 TUSC8 LINC01071|XLOC_010588 tumor suppressor candidate 8 ncRNA 157.25-78 chr2 81308586 81308973 + 0.5 NA Intergenic LTR108e_Mam|LTR|ERVL 158167 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 115.5-128 chr2 88209521 88209824 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 36533 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 151.25-167 chr7 11605933 11606426 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 2 of 26) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 226019 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 159.75-72 chr2 23778811 23779148 + 0.5 NA intron (NR_125717, intron 23 of 28) MER91A|DNA|hAT-Tip100 148144 NM_001242338 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 230-50 chr5 113117029 113117924 + 0.5 NA intron (NM_001085377, intron 6 of 18) intron (NM_001085377, intron 6 of 18) 140678 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 131.5-44 chr12 34335457 34335926 + 0.5 NA Intergenic CpG 313195 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 117-64 chr15 37981983 37982447 + 0.5 NA intron (NM_001370737, intron 12 of 13) intron (NM_001370737, intron 12 of 13) 47573 NM_001370736 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 112.75-43 chr12 115203498 115203835 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -519491 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 215.75-17 chr10 114930580 114931243 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -7284 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 160.25-168 chr9 89730440 89730881 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90877 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 128.5-85 chr16 79537434 79537913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63064 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 121.5-257 chr8 140018848 140019322 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) L1ME2|LINE|L1 81450 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 120.75-26 chr11 86327766 86328224 + 0.5 NA intron (NR_136324, intron 3 of 5) intron (NR_136324, intron 3 of 5) 25755 NM_001322407 51501 Hs.283322 NM_016401 ENSG00000149196 HIKESHI C11orf73|HLD13|HSPC138|HSPC179|L7RN6|OPI10 heat shock protein nuclear import factor hikeshi protein-coding 119-142 chr5 12135980 12136390 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -231739 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 151.25-45 chr12 132012226 132012597 + 0.5 NA intron (NM_015409, intron 16 of 52) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -18813 NR_002979 677829 Hs.742405 NR_002979 ENSG00000208892 SNORA49 ACA49 small nucleolar RNA, H/ACA box 49 snoRNA 116.5-88 chr17 12067206 12067590 + 0.5 NA intron (NM_001281435, intron 3 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie -14501 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 130-55 chr17 60265750 60266096 + 0.5 NA intron (NM_032582, intron 8 of 33) intron (NM_032582, intron 8 of 33) -34278 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 136.75-84 chr18 44140932 44141260 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 390601 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 121.5-217 chr6 27295310 27295664 + 0.5 NA Intergenic tRNA-Gln-CAG|tRNA|tRNA 16745 NM_033482 94026 Hs.729955 NM_033482 ENSG00000158553 POM121L2 POM121-L|POM121L POM121 transmembrane nucleoporin like 2 protein-coding 141.25-153 chr6 45391423 45391957 + 0.5 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -13756 NM_001350325 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 120.5-197 chr6 64799149 64799587 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) L2c|LINE|L2 -502050 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 116.5-254 chr8 120214418 120214755 + 0.5 NA intron (NM_021110, intron 13 of 47) intron (NM_021110, intron 13 of 47) 89484 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 133.25-7 chr1 166722608 166722935 + 0.5 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -116704 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 119.25-121 chr3 15579380 15579757 + 0.5 NA intron (NM_001284413, intron 8 of 15) L1MEf|LINE|L1 -21784 NM_001281723 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 128-46 chr14 65478874 65479201 + 0.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 7935 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 163.25-39 chr13 110872338 110872851 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2286 NR_027701 283487 Hs.245390 NM_178514 ENSG00000255874 LINC00346 C13orf29|NCRNA00346 long intergenic non-protein coding RNA 346 ncRNA 122.75-173 chr6 13914570 13914991 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9666 NM_001165034 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 124-180 chr9 115655181 115655621 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 88838 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 130.25-226 chrX 72206137 72206608 + 0.5 NA exon (NM_017669, exon 2 of 2) exon (NM_017669, exon 2 of 2) 24615 NR_033187 5303 Hs.655623 NM_006223 ENSG00000102309 PIN4 EPVH|PAR14|PAR17 peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 protein-coding 129.25-14 chr10 7634599 7634982 + 0.5 NA intron (NM_001001851, intron 5 of 11) intron (NM_001001851, intron 5 of 11) -15117 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 169.5-174 chr8 113392103 113392570 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) -15184 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 154-99 chr3 159199294 159199781 + 0.5 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -73710 NM_014575 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 155.75-84 chr2 151449095 151449616 + 0.5 NA intron (NM_001177665, intron 19 of 33) intron (NM_001177665, intron 19 of 33) 39453 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 153.75-58 chr18 46543143 46543683 + 0.5 NA intron (NM_001145472, intron 5 of 23) intron (NM_001145472, intron 5 of 23) 13356 NM_001308013 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 175.5-179 chr9 33854596 33855249 + 0.5 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 37762 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 162.25-43 chr13 95574279 95574744 + 0.5 NA intron (NM_001160100, intron 3 of 4) AluSx|SINE|Alu 21791 NM_006984 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 127-96 chr2 39218713 39219208 + 0.5 NA intron (NM_001009565, intron 2 of 7) MLT2B2|LTR|ERVL 10628 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 141.75-21 chr10 57428780 57429117 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -124389 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 154.25-109 chr3 149495056 149495512 + 0.5 NA intron (NM_004617, intron 3 of 4) intron (NM_004617, intron 3 of 4) 20587 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 114-52 chr16 63413108 63413525 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1376878 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 152-84 chr2 50628221 50628771 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 5 of 22) intron (NM_001330093, intron 5 of 22) 67766 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 128.5-199 chr7 7286862 7287174 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 31864 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 119.25-204 chr8 71220474 71220826 + 0.5 NA intron (NM_001370336, intron 12 of 17) L2a|LINE|L2 136056 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 154.75-135 chr7 56008003 56008413 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 43236 NM_001370511 5723 Hs.512656 NM_004577 ENSG00000146733 PSPH PSP|PSPHD phosphoserine phosphatase protein-coding 155-92 chr4 36141159 36141615 + 0.5 NA intron (NR_146894, intron 19 of 32) intron (NR_146894, intron 19 of 32) 102552 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 119.75-190 chr7 1774907 1775343 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -32815 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 156.75-23 chr10 58117217 58117778 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 150397 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 116-69 chr17 61830607 61830860 + 0.5 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) L1MEc|LINE|L1 32826 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 135-76 chr2 37830004 37830502 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110011) promoter-TSS (NR_110011) -542 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 142-21 chr10 95092404 95092783 + 0.5 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -23096 NM_000770 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 152-36 chr11 99887293 99887893 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) MLT2A2|LTR|ERVL 331448 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 137-184 chr8 133303286 133303596 + 0.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -6137 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 131.25-131 chr3 33223161 33223612 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4576 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 174.25-25 chr11 77515184 77515865 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41461 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 124.5-222 chr8 81937737 81938040 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -95602 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 123.25-149 chr4 103330877 103331295 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93956 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 140-183 chrX 79533936 79534289 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -166560 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 127.25-177 chr6 55053574 55054050 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52648 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 169.25-7 chr1 201115859 201116290 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001270601) promoter-TSS (NM_001270601) -702 NM_001270601 647219 Hs.143949 NM_001270601 ENSG00000232237 ASCL5 bHLHa47 achaete-scute family bHLH transcription factor 5 protein-coding 156-13 chr1 215290909 215291510 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 208472 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 149.5-126 chr3 146084425 146084870 + 0.5 NA intron (NM_182943, intron 11 of 19) intron (NM_182943, intron 11 of 19) -15462 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 121.75-106 chr20 58393429 58393728 + 0.5 NA intron (NR_036633, intron 1 of 3) intron (NR_036633, intron 1 of 3) 4349 NM_001195677 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 131.5-114 chr2 72043807 72044147 + 0.5 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 103885 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 148.5-20 chr10 9339159 9339659 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -43816 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 192.75-41 chr16 70417957 70418597 + 0.5 NA intron (NM_006927, intron 1 of 6) intron (NM_006927, intron 1 of 6) 20823 NM_006927 6483 Hs.368611 NM_006927 ENSG00000157350 ST3GAL2 Gal-NAc6S|SIAT4B|ST3GALII|ST3GalA.2 ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 protein-coding 115.25-8 chr1 62738135 62738472 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45803 NM_178221 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 137.75-152 chr4 56426889 56427365 + 0.5 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 8488 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 165.75-10 chr10 12044122 12044700 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1241 NM_080599 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 145.75-110 chr4 34257465 34257921 + 0.5 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) intron (NR_147184, intron 2 of 3) 12054 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 120-83 chr2 19050163 19050424 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23322 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 209.25-16 chr10 104630101 104630718 + 0.5 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -10881 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 179.75-94 chr5 6404727 6405199 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -26416 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 113-99 chr2 174230233 174230566 + 0.5 NA intron (NM_001011708, intron 1 of 9) L1MC5|LINE|L1 18133 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 137.75-89 chr18 6402822 6403177 + 0.5 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 11912 NM_001365768 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 114.5-166 chr22 26413712 26414151 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15329 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 151.5-29 chr11 102191998 102192466 + 0.5 NA intron (NM_001130145, intron 4 of 8) intron (NM_001130145, intron 4 of 8) 79784 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 122.25-9 chr1 164038880 164039291 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -520275 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 200.5-17 chr10 66895636 66896306 + 0.5 NA intron (NR_111911, intron 6 of 6) AluSp|SINE|Alu -30065 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 135-40 chr13 104170865 104171197 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 745831 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 115.75-224 chr8 132320065 132320475 + 0.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 126992 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 117-56 chr14 56518539 56518934 + 0.5 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 4405 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 122.75-32 chr11 104395293 104395738 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 213787 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 129.75-50 chr12 50840161 50840576 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2558 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 139.25-144 chr5 17364365 17364846 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 22705 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 120.25-174 chr5 132891961 132892295 + 0.5 NA intron (NM_014423, intron 13 of 20) intron (NM_014423, intron 13 of 20) 18460 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 161.25-20 chr10 114189071 114189461 + 0.5 NA intron (NM_198795, intron 2 of 25) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 9913 NM_001365891 56165 Hs.333132 NM_198795 ENSG00000095627 TDRD1 CT41.1 tudor domain containing 1 protein-coding 128.25-71 chr17 58584081 58584556 + 0.5 NA intron (NM_198393, intron 19 of 32) intron (NM_198393, intron 19 of 32) -39990 NM_001368771 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 115.75-170 chr5 90673138 90673405 + 0.5 NA intron (NR_003149, intron 22 of 89) intron (NR_003149, intron 22 of 89) 114474 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 154.75-110 chr4 121195309 121195808 + 0.5 NA intron (NM_001128843, intron 2 of 12) intron (NM_001128843, intron 2 of 12) 21069 NM_001128843 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 155.5-119 chr22 46322726 46323276 + 0.5 NA intron (NM_016426, intron 7 of 11) intron (NM_016426, intron 7 of 11) -12400 NR_104240 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 150-95 chr3 101731822 101732404 + 0.5 NA intron (NM_024548, intron 5 of 10) intron (NM_024548, intron 5 of 10) 7499 NM_024548 79598 Hs.444135 NM_024548 ENSG00000182504 CEP97 2810403B08Rik|LRRIQ2 centrosomal protein 97 protein-coding 123.75-154 chr6 22287453 22287924 + 0.5 NA intron (NM_001163558, intron 5 of 5) intron (NM_001163558, intron 5 of 5) 9348 NM_000948 5617 Hs.1905 NM_000948 ENSG00000172179 PRL GHA1 prolactin protein-coding 119.5-217 chr7 80308946 80309237 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 65348 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 126-151 chr6 36425926 36426198 + 0.5 NA exon (NM_152990, exon 3 of 5) exon (NM_152990, exon 3 of 5) -16705 NM_001286580 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 117.75-151 chr4 42099488 42099757 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 53033 NM_001159547 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 138.75-208 chr9 34031656 34032157 + 0.5 NA intron (NM_001370059, intron 1 of 28) AluJo|SINE|Alu 16981 NM_001370064 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 130.5-192 chr4 168133952 168134397 + 0.5 NA intron (NM_007193, intron 2 of 11) intron (NM_007193, intron 2 of 11) 41637 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 126.75-129 chr20 8240436 8240849 + 0.5 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) L1ME3G|LINE|L1 -8062 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 119.5-154 chr3 111097508 111097816 + 0.5 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 25846 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 140-29 chr11 125979379 125979832 + 0.5 NA intron (NM_016952, intron 17 of 19) intron (NM_016952, intron 17 of 19) 33549 NM_001365077 338667 Hs.730137 NM_001365077 VSIG10L2 - V-set and immunoglobulin domain containing 10 like 2 protein-coding 159-79 chr4 88994325 88994857 + 0.5 NA intron (NM_014883, intron 3 of 23) AluJo|SINE|Alu 62594 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 228-70 chr7 3553821 3554498 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MDb|LINE|L1 252907 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 174.25-117 chr4 112786562 112786999 + 0.5 NA intron (NM_001354269, intron 1 of 43) AluSz6|SINE|Alu -31217 NM_001127493 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 140.5-225 chr8 16870289 16870732 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 131835 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 130.25-110 chr2 189166936 189167407 + 0.5 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) 12590 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 117.25-48 chr12 8578535 8578905 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 34139 NM_020661 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 125.75-102 chr2 160728286 160728771 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -234721 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 120.25-32 chr10 115181909 115182318 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) intron (NM_207303, intron 8 of 28) 88748 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 119.25-217 chr9 17748368 17748647 + 0.5 NA intron (NM_003026, intron 2 of 8) intron (NM_003026, intron 2 of 8) 169441 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 146.75-38 chr13 49866698 49867075 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -23523 NR_003268 220429 Hs.448219 NR_003268 ENSG00000181358 CTAGE10P - CTAGE family member 10, pseudogene pseudo 164-87 chr4 37156024 37156484 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 85737 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 126-107 chr2 232320459 232320938 + 0.5 NA intron (NR_046476, intron 14 of 20) intron (NR_046476, intron 14 of 20) -58053 NM_001632 250 Hs.284255 NM_001632 ENSG00000163283 ALPP ALP|ALPI|IAP|PALP|PLAP|PLAP-1 alkaline phosphatase, placental protein-coding 124-45 chr14 57737174 57737469 + 0.5 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 127678 NM_001352012 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 125.5-202 chr5 57501900 57502395 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19336 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 128.25-136 chr3 163417521 163417974 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -114446 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 141.5-64 chr15 78858888 78859294 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13690 NM_001265603 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 152.25-21 chr10 67468462 67468903 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -65272 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 113.75-121 chr22 29270622 29270964 + 0.5 NA intron (NM_013986, intron 1 of 17) intron (NM_013986, intron 1 of 17) 2525 NM_001163286 2130 Hs.374477 NM_005243 ENSG00000182944 EWSR1 EWS|EWS-FLI1|bK984G1.4 EWS RNA binding protein 1 protein-coding 154.75-40 chr14 58639938 58640332 + 0.5 NA intron (NR_046095, intron 1 of 3) intron (NR_046095, intron 1 of 3) 1298 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 184.75-86 chr6 86969958 86970416 + 0.5 NA intron (NM_000865, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 32659 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 121.75-192 chr8 118453605 118453967 + 0.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu -167215 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 147-16 chr10 19094309 19094768 + 0.5 NA intron (NM_001142308, intron 4 of 39) L1HS|LINE|L1 45737 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 140.5-185 chr5 113091657 113092142 + 0.5 NA intron (NM_001085377, intron 8 of 18) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 115101 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 115.5-25 chr10 95443998 95444456 + 0.5 NA intron (NM_001290295, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu -3047 NM_006434 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 124.5-90 chr18 59454060 59454513 + 0.5 NA intron (NM_133459, intron 6 of 10) AluSq2|SINE|Alu -95021 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 152.25-119 chr4 125945166 125945625 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 438136 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 147-10 chr1 103791696 103792085 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 42049 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 141-57 chr17 50009578 50010019 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -14574 NM_005220 1747 Hs.134194 NM_005220 ENSG00000064195 DLX3 AI4|TDO distal-less homeobox 3 protein-coding 198.25-76 chr4 93896824 93897424 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 68371 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 176-65 chr6 67547554 67548005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -507572 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 155.25-89 chr2 51220009 51220449 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 187628 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 114.5-234 chr7 2421286 2421633 + 0.5 NA intron (NM_018641, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 17848 NM_001243794 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 121.75-204 chrX 102750504 102750951 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001142526, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001142526, exon 4 of 4) 4748 NM_001142530 80823 Hs.4276 NM_030639 ENSG00000198908 BHLHB9 GASP3|p60TRP basic helix-loop-helix family member b9 protein-coding 121.5-239 chr7 55904011 55904293 + 0.5 NA intron (NM_182633, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 16696 NM_001366796 349075 Hs.660834 NM_182633 ENSG00000178665 ZNF713 - zinc finger protein 713 protein-coding 129-69 chr15 26573054 26573363 + 0.5 NA intron (NM_001191320, intron 4 of 6) intron (NM_001191320, intron 4 of 6) 55882 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 171.5-161 chr9 11452003 11452516 + 0.5 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 839053 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 158.5-155 chr5 38440728 38441109 + 0.5 NA intron (NM_182798, intron 12 of 16) intron (NM_182798, intron 12 of 16) -4628 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 149-16 chr10 113508874 113509453 + 0.5 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner -41668 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 123.25-173 chr5 172605361 172605701 + 0.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -35732 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 169.5-85 chr2 212384784 212385228 + 0.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 41354 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 143-158 chrX 83217052 83217391 + 0.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -291069 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 123.25-63 chr15 59482724 59482977 + 0.5 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) intron (NM_152450, intron 3 of 8) 44664 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 127.75-201 chr8 120143124 120143509 + 0.5 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) intron (NM_021110, intron 1 of 47) 18214 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 114.5-60 chr11 112087475 112087921 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_028383) promoter-TSS (NR_028383) 825 NM_001276506 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 123.25-30 chr11 12323910 12324351 + 0.5 NA intron (NM_032867, intron 5 of 8) intron (NM_032867, intron 5 of 8) 37230 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 150-116 chr5 90109434 90109817 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -92905 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 137.75-151 chr4 53131657 53132009 + 0.5 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 234228 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 126.25-58 chr15 62238519 62238933 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 10069 NR_136885 255180 Hs.370479 NM_173805 GOLGA2P11 - GOLGA2 pseudogene 11 pseudo 129.5-59 chr12 130863918 130864410 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7830 NM_001300796 5901 Hs.10842 NM_006325 ENSG00000132341 RAN ARA24|Gsp1|TC4 RAN, member RAS oncogene family protein-coding 168.25-91 chr20 51649021 51649579 + 0.5 NA intron (NM_006045, intron 14 of 27) MIR|SINE|MIR -86461 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 123.5-99 chr2 74139644 74139956 + 0.5 NA intron (NM_001035505, intron 2 of 2) intron (NM_001035505, intron 2 of 2) 8112 NM_212552 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 144.5-61 chr14 54545517 54545902 + 0.5 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -21903 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 141-20 chr10 9881872 9882253 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -176660 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 116.75-206 chr9 13359829 13360276 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71277 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 125-79 chr2 184815735 184816141 + 0.5 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 217409 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 122.5-71 chr15 55490054 55490436 + 0.5 NA intron (NM_001033560, intron 4 of 8) L1MB8|LINE|L1 8339 NR_037923 100533483 Hs.285051 NR_037923 ENSG00000261771 DNAAF4-CCPG1 DYX1C1-CCPG1 DNAAF4-CCPG1 readthrough (NMD candidate) ncRNA 133-142 chr5 124841196 124841726 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -96349 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 113.75-6 chr1 55361417 55361773 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 135954 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 133-21 chr11 55902338 55902666 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12080 NM_001001960 390148 Hs.554526 NM_001001960 ENSG00000187612 OR5W2 OR5W2P|OR5W3P olfactory receptor family 5 subfamily W member 2 protein-coding 120.75-30 chr12 9046797 9047055 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 18144 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 138.25-42 chr13 36585627 36585986 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -88214 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 122-110 chr20 35823860 35824222 + 0.5 NA intron (NM_016436, intron 2 of 17) L1ME1|LINE|L1 52026 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 126.5-184 chr5 10875456 10875832 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -114410 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 173.25-65 chr20 59450088 59450510 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -127210 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 114.75-126 chr3 106922198 106922509 + 0.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 318285 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 116-30 chr11 112112371 112112673 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 25649 NM_001276506 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 124-137 chr5 132016746 132017084 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4847 NM_001205250 23305 Hs.14945 NM_015256 ENSG00000164398 ACSL6 ACS2|FACL6|LACS 6|LACS2|LACS5 acyl-CoA synthetase long chain family member 6 protein-coding 133-62 chr16 49535279 49535702 + 0.5 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) intron (NM_001271620, intron 5 of 7) -16905 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 135.25-26 chr10 60570502 60570900 + 0.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 2255 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 141.5-221 chr8 49932940 49933485 + 0.5 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) L1MB7|LINE|L1 21805 NR_135794 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 125.25-50 chr12 117119941 117120301 + 0.5 NA intron (NR_120464, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 20654 NR_120464 101928244 Hs.742266 NR_120464 TESC-AS1 - TESC antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 130.75-162 chr5 176157989 176158466 + 0.5 NA intron (NR_036494, intron 17 of 25) intron (NR_036494, intron 17 of 25) 38678 NR_038402 100507387 Hs.368516 NR_038402 ENSG00000251623 LOC100507387 - uncharacterized LOC100507387 ncRNA 123.75-93 chr2 123078263 123078646 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4973 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 142.5-220 chr8 93636794 93637109 + 0.5 NA intron (NR_033858, intron 5 of 10) intron (NR_033858, intron 5 of 10) 63482 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 129.5-130 chr2 125719273 125719564 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 398567 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 114.25-79 chr18 27644526 27644769 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -301991 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 118.25-202 chr8 119721945 119722295 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48730 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 119.25-119 chr3 1256111 1256497 + 0.5 NA intron (NM_001289080, intron 4 of 22) L2a|LINE|L2 163280 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 131.75-2 chr1 25578453 25578878 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 35080 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 148.75-46 chr12 124796739 124797178 + 0.5 NA intron (NM_001367988, intron 5 of 9) MER68|LTR|ERVL 42713 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 136-90 chr20 48846346 48846731 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18539 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 150.75-49 chr13 23757542 23757930 + 0.5 NA intron (NM_005932, intron 17 of 18) intron (NM_005932, intron 17 of 18) -131132 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 147.25-7 chr1 95723689 95724036 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 213746 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 130.25-217 chr9 35662126 35662502 + 0.5 NA TTS (NM_174923) TTS (NM_174923) 2881 NM_032818 84904 Hs.534579 NM_032818 ENSG00000137135 ARHGEF39 C9orf100 Rho guanine nucleotide exchange factor 39 protein-coding 178.25-50 chr17 56554069 56554702 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39314 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 154.25-15 chr1 238805223 238805563 + 0.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -319376 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 140-179 chr9 125761437 125761958 + 0.5 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 13514 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 140.25-105 chr20 17149632 17150144 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -76219 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 168.25-118 chr5 105887773 105888295 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 788560 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 147.25-163 chrX 91368071 91368562 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -66523 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 112.25-110 chr2 233494169 233494573 + 0.5 NA intron (NM_001365479, intron 24 of 31) L1ME4b|LINE|L1 71202 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 169-54 chr20 24463584 24464036 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5389 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 123-110 chr2 157169770 157170171 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -87735 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 177-101 chr9 91945290 91945661 + 0.5 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) intron (NM_001318204, intron 1 of 7) 4753 NM_001318204 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 118.75-160 chr5 149119588 149119954 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -21676 NM_014945 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 160.5-163 chr6 151391923 151392328 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_020861) promoter-TSS (NM_020861) -566 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 193.5-90 chr2 149540659 149541414 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -46322 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 179.75-93 chr4 185770770 185771368 + 0.5 NA intron (NM_001145672, intron 1 of 20) AluSq2|SINE|Alu 4785 NM_001145673 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 119-127 chr3 160926555 160926872 + 0.5 NA intron (NR_134243, intron 2 of 5) intron (NR_134243, intron 2 of 5) 56115 NR_134243 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 169-109 chr8 117014652 117015199 + 0.5 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) LOR1b|LTR|ERV1 63950 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 117.25-22 chr1 248608859 248609226 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15274 NM_001004693 127069 Hs.553585 NM_001004693 ENSG00000184022 OR2T10 OR1-64 olfactory receptor family 2 subfamily T member 10 protein-coding 119.5-209 chr7 30467616 30467877 + 0.5 NA intron (NM_006092, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 11038 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 214.5-56 chr2 66865612 66866274 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38493 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 126.25-57 chr15 23871526 23871892 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -103438 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 165.25-13 chr10 29972777 29973260 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 86568 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 142.25-73 chr17 74333930 74334448 + 0.5 NA intron (NM_153209, intron 2 of 19) L1MB8|LINE|L1 7963 NM_153209 124602 Hs.372773 NM_153209 ENSG00000196169 KIF19 KIF19A kinesin family member 19 protein-coding 159-33 chr13 56593226 56593685 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -547463 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 134.75-127 chr20 17759257 17759603 + 0.5 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 59482 NM_001014977 140836 Hs.115366 NM_178477 ENSG00000125888 BANF2 BAF-L|BAF2|BAFL|C20orf179 barrier to autointegration factor 2 protein-coding 132.5-105 chr19 53123205 53123728 + 0.5 NA intron (NM_018355, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 6243 NM_001352135 55786 Hs.147765 NM_018355 ENSG00000170954 ZNF415 Pact|ZfLp zinc finger protein 415 protein-coding 124.25-136 chr3 94435472 94435864 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 372607 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 195.5-96 chr3 30918787 30919321 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24393 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 118.25-78 chr16 73258964 73259322 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -114696 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 131-127 chr3 186721990 186722279 + 0.5 NA intron (NM_001102416, intron 2 of 9) AluSq2|SINE|Alu 4775 NM_000893 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 127.5-33 chr10 88107654 88107959 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 244181 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 148.75-123 chr4 114043977 114044471 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -64577 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 170.25-38 chr14 74740897 74741304 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22216 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 112.25-120 chr3 6925431 6925750 + 0.5 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 -31573 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 114.25-117 chr21 43012666 43012988 + 0.5 NA intron (NM_004571, intron 4 of 10) intron (NM_004571, intron 4 of 10) 38265 NM_004571 5316 Hs.431043 NM_004571 ENSG00000160199 PKNOX1 PREP1|pkonx1c PBX/knotted 1 homeobox 1 protein-coding 159.5-62 chr15 79251304 79251717 + 0.5 NA intron (NR_038997, intron 1 of 1) L1MC4|LINE|L1 -31212 NM_001146341 390616 Hs.531231 NM_001146341 ENSG00000235711 ANKRD34C - ankyrin repeat domain 34C protein-coding 136-81 chr2 197137808 197138329 + 0.5 NA intron (NM_153697, intron 3 of 9) MIRc|SINE|MIR -59923 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 186.5-63 chr2 52461660 52462171 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 91267 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 191.5-39 chr14 68694524 68695147 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66048 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 127.25-146 chr4 72024412 72024914 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7141 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 123-197 chr9 93200389 93200765 + 0.5 NA intron (NM_006648, intron 1 of 28) intron (NM_006648, intron 1 of 28) 15647 NM_001282394 65268 Hs.654856 NM_006648 ENSG00000165238 WNK2 NY-CO-43|P/OKcl.13|PRKWNK2|SDCCAG43 WNK lysine deficient protein kinase 2 protein-coding 117.75-177 chr5 117457934 117458303 + 0.5 NA intron (NR_046089, intron 2 of 5) intron (NR_046089, intron 2 of 5) 42606 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 114.5-239 chr7 39359024 39359455 + 0.5 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) intron (NM_001370959, intron 5 of 9) -30105 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 128.75-62 chr15 63408869 63409258 + 0.5 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) MLT2B1|LTR|ERVL 18833 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 119.5-21 chr10 16707143 16707498 + 0.5 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) L1MA6|LINE|L1 110104 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 162.25-31 chr11 86326842 86327238 + 0.5 NA intron (NR_136324, intron 3 of 5) FLAM_A|SINE|Alu 24800 NM_001322407 51501 Hs.283322 NM_016401 ENSG00000149196 HIKESHI C11orf73|HLD13|HSPC138|HSPC179|L7RN6|OPI10 heat shock protein nuclear import factor hikeshi protein-coding 205.25-73 chr3 180839897 180840479 + 0.5 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) L1MA8|LINE|L1 29990 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 112.75-36 chr11 107769248 107769574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57355 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 129.75-45 chr12 15895965 15896387 + 0.5 NA intron (NM_007178, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu 13789 NM_007178 11171 Hs.743971 NM_007178 ENSG00000023734 STRAP MAWD|PT-WD|UNRIP serine/threonine kinase receptor associated protein protein-coding 162-37 chr14 56185371 56185758 + 0.5 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 67153 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 137.75-203 chr8 73650173 73650604 + 0.5 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) MER112|DNA|hAT-Charlie 96452 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 115.25-101 chr2 86484987 86485367 + 0.5 NA intron (NM_018433, intron 20 of 25) intron (NM_018433, intron 20 of 25) 43716 NM_001146688 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 116.75-167 chr5 160083753 160084170 + 0.5 NA intron (NM_001349733, intron 3 of 4) intron (NM_001349733, intron 3 of 4) 35489 NM_001130864 114825 Hs.744960 NM_052927 ENSG00000170234 PWWP2A MST101 PWWP domain containing 2A protein-coding 119-197 chr8 90866464 90866808 + 0.5 NA intron (NM_022351, intron 3 of 12) intron (NM_022351, intron 3 of 12) 74861 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 120.75-164 chr8 27870587 27871026 + 0.5 NA 3' UTR (NM_173833, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_173833, exon 9 of 9) 15310 NR_036249 100422828 NR_036249 ENSG00000265847 MIR4287 - microRNA 4287 ncRNA 127.5-131 chr2 184952561 184953000 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 214292 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 137.75-49 chr13 36466238 36466653 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 33950 NM_003914 8900 Hs.417050 NM_003914 ENSG00000133101 CCNA1 CT146 cyclin A1 protein-coding 153.25-50 chr16 5332542 5332984 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -234943 NM_201598 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 170.5-75 chr18 48815317 48815857 + 0.5 NA intron (NM_014772, intron 9 of 11) intron (NM_014772, intron 9 of 11) 127220 NM_001190823 4092 Hs.465087 NM_005904 ENSG00000101665 SMAD7 CRCS3|MADH7|MADH8 SMAD family member 7 protein-coding 156.25-82 chr20 475547 475971 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001895, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001895, exon 13 of 13) -13226 NM_144628 128637 Hs.590876 NM_144628 ENSG00000125875 TBC1D20 C20orf140|WARBM4 TBC1 domain family member 20 protein-coding 134.75-74 chr15 50538864 50539224 + 0.5 NA intron (NM_203494, intron 4 of 6) intron (NM_203494, intron 4 of 6) 7622 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 115.5-114 chr2 29473121 29473380 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) L1ME3|LINE|L1 2127 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 122-149 chr5 168272964 168273247 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18540 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 122.75-195 chr8 53536225 53536574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12434 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 123.75-189 chr8 91118702 91119075 + 0.5 NA intron (NR_148895, intron 2 of 10) intron (NR_148895, intron 2 of 10) 16269 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 125-41 chr14 65588538 65588983 + 0.5 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 117658 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 112.5-165 chr3 36553176 36553412 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 172807 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 141-79 chr2 125589852 125590234 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 527942 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 121-84 chr18 1743345 1743819 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -383953 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 130.25-43 chr11 115949179 115949647 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -189213 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 220.5-80 chr3 175247661 175248240 + 0.5 NA intron (NR_046713, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 23146 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 165-118 chr5 150351945 150352472 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5431 NM_001135243 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 168-128 chr8 122561100 122561730 + 0.5 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 7229 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 137-119 chr4 54258430 54258945 + 0.5 NA intron (NM_001347828, intron 2 of 23) intron (NM_001347828, intron 2 of 23) 24727 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 133-126 chr4 86316394 86316860 + 0.5 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) intron (NM_001363657, intron 2 of 13) 38017 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 138.75-44 chr12 123666927 123667397 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -3951 NM_001143850 79867 Hs.167165 NM_024809 ENSG00000168778 TCTN2 C12orf38|JBTS24|MKS8|TECT2 tectonic family member 2 protein-coding 166.25-60 chr17 17191571 17192104 + 0.5 NA 3' UTR (NM_015134, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_015134, exon 23 of 23) 14496 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 115.25-66 chr14 74078535 74078993 + 0.5 NA intron (NM_001278593, intron 1 of 11) AluSz|SINE|Alu 5689 NM_005589 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 171.5-10 chr10 24711549 24712210 + 0.5 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 10869 NM_001367453 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 155.25-30 chr10 96967786 96968202 + 0.5 NA intron (NM_001346516, intron 7 of 7) MER5B|DNA|hAT-Charlie -134762 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 177.25-91 chr3 15646879 15647480 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001281724, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001281724, exon 6 of 6) 45210 NM_001281725 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 158.25-129 chr7 9491902 9492427 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -142106 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 154.75-88 chr3 19480400 19480778 + 0.5 NA intron (NM_144633, intron 11 of 15) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -165658 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 124.25-212 chr9 109630570 109630992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10007 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 181.75-34 chr14 50032467 50032991 + 0.5 NA intron (NR_131171, intron 6 of 8) AluSx1|SINE|Alu -25209 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 149.25-112 chr3 1854774 1855256 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -243788 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 148-108 chr5 119908980 119909532 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 279697 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 121.25-196 chr8 120567521 120567870 + 0.5 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu 122276 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 131.25-4 chr1 40617535 40617979 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 47925 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 130.75-47 chr12 128925273 128925759 + 0.5 NA intron (NM_001366886, intron 6 of 11) L1PA11|LINE|L1 72038 NM_001366889 144423 Hs.655668 NM_144669 ENSG00000151948 GLT1D1 - glycosyltransferase 1 domain containing 1 protein-coding 188.5-16 chr10 111945640 111946360 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 237765 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 151.5-91 chr2 190284629 190285017 + 0.5 NA intron (NM_198047, intron 6 of 12) L1M6|LINE|L1 35003 NM_014362 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 122.75-199 chr8 82872972 82873396 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -38920 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 114.25-135 chr4 32739499 32739855 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 388639 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 132.5-176 chr4 1109516 1109958 + 0.5 NA intron (NM_001366918, intron 1 of 10) intron (NM_001366918, intron 1 of 10) 3827 NR_159497 285498 Hs.248290 NM_194439 ENSG00000178222 RNF212 ZHP3 ring finger protein 212 protein-coding 153-53 chr16 31247951 31248530 + 0.5 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -11735 NM_000632 3684 Hs.172631 NM_000632 ENSG00000169896 ITGAM CD11B|CR3A|MAC-1|MAC1A|MO1A|SLEB6 integrin subunit alpha M protein-coding 199-94 chrX 96737443 96738192 + 0.5 NA intron (NM_007309, intron 2 of 26) intron (NM_007309, intron 2 of 26) 52975 NM_006729 1730 Hs.226483 NM_006729 ENSG00000147202 DIAPH2 DIA|DIA2|DRF2|POF|POF2|POF2A diaphanous related formin 2 protein-coding 196.25-27 chr12 125804572 125805189 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 178494 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 206.5-88 chr4 166867065 166867691 + 0.5 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) intron (NM_001040159, intron 6 of 10) 367048 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 138.25-115 chr3 94094481 94094794 + 0.5 NA intron (NM_022072, intron 4 of 5) intron (NM_022072, intron 4 of 5) 31576 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 214.75-74 chr7 1597824 1598429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16344 NR_001288 260341 Hs.534596 NR_001288 TFAMP1 MTTF1|TCF6L1 transcription factor A, mitochondrial pseudogene 1 pseudo 157.5-174 chr6 11699199 11699738 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 79579 NM_001143948 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 160.25-12 chr10 71847199 71847630 + 0.5 NA intron (NM_001042465, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu 3837 NM_001042465 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 124.5-219 chr8 78276908 78277280 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -239246 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 151.25-199 chr8 144775487 144776057 + 0.5 NA intron (NM_001286770, intron 4 of 4) intron (NM_001286770, intron 4 of 4) 11573 NM_001286769 80778 Hs.631854 NM_030580 ENSG00000196378 ZNF34 KOX32 zinc finger protein 34 protein-coding 122-113 chr3 30789715 30790139 + 0.5 NA intron (NM_207359, intron 12 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 104734 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 127.5-258 chr9 32074987 32075356 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -309432 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 162.25-20 chr10 103169361 103169870 + 0.5 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) AluJo|SINE|Alu 7442 NM_001351189 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 121.5-50 chr11 111037668 111038141 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 59414 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 126.5-8 chr1 67674655 67675001 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10373 NM_001924 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 136-105 chr3 100728316 100728702 + 0.5 NA intron (NM_001007565, intron 3 of 7) intron (NM_001007565, intron 3 of 7) 18967 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 157.5-148 chr4 79398379 79398909 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 9584 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 129.5-199 chr6 56831971 56832385 + 0.5 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 11487 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 206-49 chr22 40440665 40441361 + 0.5 NA intron (NM_020831, intron 4 of 14) intron (NM_020831, intron 4 of 14) 22427 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 149.75-10 chr10 30042066 30042466 + 0.5 NA intron (NM_020848, intron 2 of 3) intron (NM_020848, intron 2 of 3) 17320 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 124.5-29 chr10 116945637 116945941 + 0.5 NA intron (NM_001127211, intron 7 of 16) L1ME3D|LINE|L1 59398 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 117.5-90 chr18 13443088 13443538 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -15779 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 122-150 chr5 169109151 169109554 + 0.5 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 96125 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 155.25-25 chr10 64486923 64487427 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -338353 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 126.5-119 chr2 120768123 120768476 + 0.5 NA intron (NM_001371271, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR -23982 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 118-89 chr2 127809705 127810000 + 0.5 NA intron (NM_001006622, intron 1 of 5) intron (NM_001006622, intron 1 of 5) 1319 NM_001006623 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 193.25-95 chr5 61742182 61742720 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6753 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-129 chr4 31223879 31224380 + 0.5 NA Intergenic (TCTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 52985 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 126-22 chr10 76404837 76405152 + 0.5 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -483050 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 176.75-70 chr2 172208689 172209328 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106002 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 168-44 chr14 29144748 29145221 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -359197 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 165-54 chr17 44506140 44506640 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2984 NM_001304941 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 182.75-85 chr3 196038718 196039441 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 43011 NM_001313966 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 152.5-114 chr3 45669599 45670048 + 0.5 NA intron (NM_014240, intron 4 of 7) L1ME3|LINE|L1 19059 NR_033947 644714 Hs.712889 NR_033947 LIMD1-AS1 - LIMD1 antisense RNA 1 ncRNA 120.75-142 chr5 179046871 179047312 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -13282 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 142.25-29 chr11 69419636 69419993 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5841 NM_001319657 102724265 Hs.448669 NM_001319657 LOC102724265 - uncharacterized LOC102724265 protein-coding 135-70 chr19 27774710 27775161 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18496 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 112.5-118 chr2 88085298 88085680 + 0.5 NA intron (NM_001330364, intron 2 of 8) intron (NM_001330364, intron 2 of 8) -2890 NR_039940 100616447 NR_039940 ENSG00000265003 MIR4780 - microRNA 4780 ncRNA 141-19 chr10 7227495 7228037 + 0.5 NA intron (NM_001029880, intron 10 of 20) intron (NM_001029880, intron 10 of 20) -40982 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 115-79 chr2 45202057 45202408 + 0.5 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) L1M2|LINE|L1 52709 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 190.5-73 chr2 49362745 49363242 + 0.5 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -208466 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 131.25-132 chr3 54582967 54583398 + 0.5 NA intron (NM_018398, intron 9 of 37) intron (NM_018398, intron 9 of 37) 56675 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 131.5-116 chr2 88135498 88135965 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -7669 NM_001443 2168 Hs.380135 NM_001443 ENSG00000163586 FABP1 FABPL|L-FABP fatty acid binding protein 1 protein-coding 123-203 chrX 42305274 42305706 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -381936 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 158.5-193 chr8 94759391 94759919 + 0.5 NA intron (NM_181787, intron 7 of 18) AluSp|SINE|Alu 39755 NM_181787 286148 Hs.567828 NM_181787 ENSG00000156162 DPY19L4 - dpy-19 like 4 protein-coding 133-89 chr2 146007963 146008433 + 0.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -578859 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 116.25-60 chr14 29249537 29249769 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -463866 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 138.25-29 chr11 32872797 32873239 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -19793 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 133.5 chr1 16391257 16391785 + 0.5 NA intron (NM_001271869, intron 2 of 3) intron (NM_001271869, intron 2 of 3) 24279 NM_001114600 26099 Hs.252967 NM_001114600 ENSG00000055070 SZRD1 C1orf144 SUZ RNA binding domain containing 1 protein-coding 150.25-89 chr20 48931815 48932223 + 0.5 NA intron (NM_006420, intron 1 of 38) L2a|LINE|L2 10308 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 128-41 chr14 46263570 46263919 + 0.5 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 199585 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 116-98 chr22 34411254 34411579 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -488528 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 144-119 chr7 29294438 29294802 + 0.5 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) intron (NM_001293070, intron 2 of 13) -85650 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 132.25-83 chr18 13229724 13230192 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 -9585 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 113.5-13 chr1 163457821 163458125 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34782 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 137.5-219 chr7 25844539 25844838 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54569 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 158.5-171 chr6 110212138 110212632 + 0.5 NA intron (NM_015891, intron 7 of 14) intron (NM_015891, intron 7 of 14) 31958 NM_015891 51362 Hs.428147 NM_015891 ENSG00000168438 CDC40 EHB3|PRP17|PRPF17 cell division cycle 40 protein-coding 118.25-130 chr3 134663472 134663847 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12637 NM_001350859 339855 Hs.146730 NM_178554 ENSG00000174611 KY MFM7 kyphoscoliosis peptidase protein-coding 165.5-146 chr5 12252193 12252544 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -322489 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 137-124 chr4 99143709 99144162 + 0.5 NA intron (NM_001306172, intron 1 of 9) intron (NM_001306172, intron 1 of 9) 363 NM_000670 127 Hs.1219 NM_000670 ENSG00000198099 ADH4 ADH-2|HEL-S-4 alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide protein-coding 120.25-116 chr20 63100617 63100992 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_003244) promoter-TSS (NR_003244) -488 NR_003244 768096 Hs.549606 NR_003244 HAR1A HAR1F|LINC00064|NCRNA00064 highly accelerated region 1A ncRNA 124.5-48 chr12 59085228 59085585 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -164868 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 136.5-80 chr15 76073623 76074043 + 0.5 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) intron (NM_152335, intron 1 of 10) 13848 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 118.75-141 chr4 168350606 168350955 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -32028 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 184.5-57 chr17 58809291 58809747 + 0.5 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 53650 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 141.75-101 chr2 138816719 138817111 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36525 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 132.5-103 chr19 28904150 28904635 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60739 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 131-150 chr7 1498714 1499163 + 0.5 NA intron (NM_001080453, intron 8 of 47) CpG-25349 5451 NM_001080453 26173 Hs.532188 NM_001080453 ENSG00000164880 INTS1 INT1|NET28 integrator complex subunit 1 protein-coding 172.75-28 chr12 51173705 51174208 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001173452) promoter-TSS (NM_001173452) -821 NM_001173452 7024 Hs.48849 NM_005653 ENSG00000135457 TFCP2 LBP1C|LSF|LSF1D|SEF|TFCP2C transcription factor CP2 protein-coding 146-3 chr1 86306035 86306476 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 51432 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 146.75-97 chr3 24042800 24043219 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 60238 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 114.75-182 chr7 111683324 111683696 + 0.5 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -120993 NM_001350963 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 155-123 chr6 117451203 117451796 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25644 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 133.5-92 chr15 93614192 93614550 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -242189 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 112.5-146 chr20 34668924 34669293 + 0.5 NA intron (NM_080476, intron 1 of 11) AluJo|SINE|Alu 8177 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 121.25-34 chr11 66083179 66083553 + 0.5 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) intron (NM_018026, intron 1 of 23) 13094 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 118.25-92 chr19 40163547 40163985 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -27660 NM_002446 4294 Hs.466743 NM_002446 ENSG00000130758 MAP3K10 MEKK10|MLK2|MST mitogen-activated protein kinase kinase kinase 10 protein-coding 140.5-173 chr5 5816448 5816829 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 393961 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 124.75-165 chr4 167603792 167604190 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -369401 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 141.75-16 chr1 234500457 234500883 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -21491 NM_005646 6894 Hs.498115 NM_005646 ENSG00000059588 TARBP1 TRM3|TRMT3|TRP-185|TRP185 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 protein-coding 150.75-139 chr4 40354933 40355330 + 0.5 NA TTS (NM_017581) TTS (NM_017581) 19798 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 117.75-38 chr11 105635321 105635770 + 0.5 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 24839 NM_001112812 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 120.75-171 chr9 8259555 8259876 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -459937 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 140-159 chr7 44331541 44332097 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6188 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 140-46 chr15 76029540 76030015 + 0.5 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -17353 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 168.25-12 chr10 5353161 5353723 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11524 NM_053049 114131 Hs.511775 NM_053049 ENSG00000178473 UCN3 SCP|SPC|UCNIII urocortin 3 protein-coding 125.5-56 chr12 47158444 47158816 + 0.5 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) L1MB3|LINE|L1 -29182 NR_039847 100616486 NR_039847 ENSG00000263838 MIR4698 - microRNA 4698 ncRNA 170.5-66 chr15 23796682 23797279 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -109675 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 139.25-202 chr8 114964454 114964903 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 703335 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 115.75-216 chr8 95251270 95251644 + 0.5 NA intron (NM_001363260, intron 4 of 4) intron (NM_001363260, intron 4 of 4) -17379 NR_038201 100616530 Hs.554328 NR_038201 ENSG00000253773 C8orf37-AS1 - C8orf37 antisense RNA 1 ncRNA 124.5-131 chr20 63914892 63915310 + 0.5 NA intron (NM_025219, intron 1 of 4) intron (NM_025219, intron 1 of 4) -4348 NR_030637 100126329 NR_030637 ENSG00000283206 MIR941-1 MIRN941-1|mir-941-1 microRNA 941-1 ncRNA 115.75-137 chr3 11455412 11455703 + 0.5 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) intron (NM_001349238, intron 17 of 17) 113241 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 127.25-131 chr3 178176250 178176661 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -242746 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 118-48 chr14 51839139 51839485 + 0.5 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -21300 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 124.75-3 chr1 71025937 71026314 + 0.5 NA intron (NM_198719, intron 1 of 3) intron (NM_198719, intron 1 of 3) -20381 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 116-177 chr8 133098236 133098531 + 0.5 NA intron (NM_003235, intron 43 of 47) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 4219 NM_001045557 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 139.5-27 chr11 68734848 68735390 + 0.5 NA intron (NM_004923, intron 6 of 9) intron (NM_004923, intron 6 of 9) 16401 NM_001039656 9633 Hs.145932 NM_004923 ENSG00000132749 TESMIN CXCDC2|MTL5|MTLT testis expressed metallothionein like protein protein-coding 144-144 chr9 14032297 14032813 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 104584 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 125-11 chr1 108734457 108734789 + 0.5 NA intron (NM_001144937, intron 10 of 12) intron (NM_001144937, intron 10 of 12) -12051 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 126.5-201 chr5 161396725 161397139 + 0.5 NA intron (NM_000813, intron 6 of 9) MIRb|SINE|MIR 151192 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 118-177 chr8 9508044 9508479 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47651 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 117-143 chr5 18084836 18085297 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 277792 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 122.75 chr1 17924483 17924960 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -140936 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 142-3 chr1 73190602 73190939 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -115400 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 118-133 chr4 93956378 93956739 + 0.5 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 127805 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 123-113 chr2 199898700 199899148 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -12369 NM_153689 205327 Hs.154494 NM_153689 ENSG00000178074 C2orf69 - chromosome 2 open reading frame 69 protein-coding 123-66 chr15 98606571 98606875 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41816 NM_001291858 3480 Hs.643120 NM_000875 ENSG00000140443 IGF1R CD221|IGFIR|IGFR|JTK13 insulin like growth factor 1 receptor protein-coding 126.25-188 chr7 50380599 50381054 + 0.5 NA intron (NM_001220771, intron 3 of 3) intron (NM_001220771, intron 3 of 3) 61778 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 118.25-165 chr6 22536647 22536985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32750 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 122.75-24 chr10 89996298 89996681 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39116 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 144.75-75 chr18 55992938 55993399 + 0.5 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR -49110 NR_146511 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 121.75-123 chr3 154306939 154307356 + 0.5 NA intron (NM_001114397, intron 5 of 24) intron (NM_001114397, intron 5 of 24) 17340 NM_020865 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 139.25-86 chr2 76839751 76840191 + 0.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 -145994 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 175-98 chr5 43682720 43683270 + 0.5 NA intron (NM_012343, intron 19 of 21) intron (NM_012343, intron 19 of 21) -79765 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 133.25-45 chr12 105266476 105266952 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -30484 NM_001251904 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 123.5-8 chr1 158765143 158765498 + 0.5 NA TTS (NM_001005185) TTS (NM_001005185) 1362 NM_001005185 128372 Hs.553592 NM_001005185 ENSG00000197403 OR6N1 OR1-22 olfactory receptor family 6 subfamily N member 1 protein-coding 159.75-60 chr17 51694623 51695037 + 0.5 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) L1PA16|LINE|L1 259403 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 117.25-42 chr11 104417947 104418355 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 191151 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 181.5-114 chr3 123458695 123459370 + 0.5 NA Intergenic (GGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10487 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 114.25-171 chr6 126910098 126910374 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -208435 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 131.25-82 chr17 70938623 70939038 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 263349 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 113.75-32 chr11 22390888 22391238 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 52682 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 113.5-15 chr1 170961401 170961831 + 0.5 NA intron (NM_001163629, intron 5 of 21) intron (NM_001163629, intron 5 of 21) 26082 NM_025063 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 125.5-120 chr19 31253588 31254070 + 0.5 NA intron (NR_138036, intron 1 of 4) intron (NR_138036, intron 1 of 4) 86319 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 152.5-174 chr7 5640790 5641374 + 0.5 NA intron (NM_207111, intron 15 of 16) L1MD|LINE|L1 39379 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 134.5-163 chr4 152150771 152151193 + 0.5 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 50164 NR_121627 100996286 Hs.322462 NR_121627 ENSG00000245954 LINC02273 - long intergenic non-protein coding RNA 2273 ncRNA 113.75-140 chr4 101809585 101809872 + 0.5 NA intron (NM_001127507, intron 1 of 15) intron (NM_001127507, intron 1 of 15) -4114 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 136-156 chr8 126655497 126655979 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -97260 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 142.25-175 chr9 33353159 33353547 + 0.5 NA intron (NM_002504, intron 17 of 23) intron (NM_002504, intron 17 of 23) 49215 NM_001170 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 183.5-43 chr14 50233182 50233669 + 0.5 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -1847 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 136.25-75 chr16 85687964 85688372 + 0.5 NA intron (NM_016095, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 786 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 112.5-21 chr10 48385137 48385511 + 0.5 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -16288 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 118.75-163 chr6 44173858 44174188 + 0.5 NA intron (NM_007058, intron 7 of 22) L2a|LINE|L2 15203 NM_007058 11131 Hs.225953 NM_007058 ENSG00000137225 CAPN11 calpain11 calpain 11 protein-coding 120-172 chr7 47182775 47183026 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 281903 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 117-110 chr22 22676390 22676652 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 30209 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 118.5-117 chr20 60770321 60770665 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 205931 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 139.5-196 chr7 30731482 30731958 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20415 NM_006774 11185 Hs.632629 NM_006774 ENSG00000241644 INMT TEMT indolethylamine N-methyltransferase protein-coding 132.75-160 chr5 166628607 166628993 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 297570 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 118-77 chr19 39275762 39276070 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 7399 NM_172138 282616 Hs.567792 NM_172138 ENSG00000183709 IFNL2 IL-28A|IL28A interferon lambda 2 protein-coding 227-32 chr2 70213024 70213806 + 0.5 NA intron (NR_147232, intron 10 of 10) AluJb|SINE|Alu -22396 NM_001348762 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 142.25-42 chr12 46974272 46974743 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -105096 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 155.25-134 chr4 125260726 125261175 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -55462 NM_001291303 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 144.75-148 chr6 131252727 131253075 + 0.5 NA intron (NM_004842, intron 1 of 1) intron (NM_004842, intron 1 of 1) 2497 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 151.5-162 chr5 139964490 139965075 + 0.5 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 78517 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 157-51 chr2 60510480 60510920 + 0.5 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 42798 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 128.25-191 chr7 42683221 42683709 + 0.5 NA intron (NR_110833, intron 1 of 2) intron (NR_110833, intron 1 of 2) 22982 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 146.75-77 chr2 105160192 105160665 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 16315 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 117.5-180 chr5 84260563 84260947 + 0.5 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 124112 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 126-121 chr3 182374969 182375327 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 111214 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 144.75-93 chr2 152652074 152652456 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001365597, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001365597, exon 26 of 26) 65196 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 125.75-131 chr3 186226244 186226706 + 0.5 NA intron (NM_001346, intron 20 of 24) intron (NM_001346, intron 20 of 24) -117386 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 129.25-53 chr14 77667791 77668154 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 40051 NM_006020 8846 Hs.94542 NM_006020 ENSG00000100601 ALKBH1 ABH|ABH1|ALKBH|alkB|hABH alkB homolog 1, histone H2A dioxygenase protein-coding 145.25-52 chr17 35157138 35157658 + 0.5 NA intron (NM_001033576, intron 7 of 19) AluSx|SINE|Alu 9134 NM_173167 146862 Hs.379636 NM_173167 ENSG00000141161 UNC45B CMYA4|CTRCT43|SMUNC45|UNC-45B|UNC45 unc-45 myosin chaperone B protein-coding 117.75-153 chr4 46296756 46297143 + 0.5 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) HERVL-int|LTR|ERVL 92430 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 133.25-54 chr14 45826239 45826672 + 0.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -110853 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 125.5-25 chr10 31301906 31302265 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -16332 NM_001323643 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 133.5-250 chr7 101225786 101226317 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 7886 NM_006349 10467 Hs.211079 NM_006349 ENSG00000106400 ZNHIT1 CG1I|ZNFN4A1 zinc finger HIT-type containing 1 protein-coding 224.75-26 chr12 115421366 115421935 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 727004 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 248.5-80 chr5 31323221 31324029 + 0.5 NA 3' UTR (NM_004932, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_004932, exon 12 of 12) 129939 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 124.5-52 chr12 118570450 118570856 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 191026 NR_134999 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 144.5-3 chr1 22900747 22901247 + 0.5 NA intron (NM_004442, intron 9 of 15) MIR|SINE|MIR -37771 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 121.5-207 chr5 32996562 32996962 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 49319 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 142.75-183 chr8 73868465 73868854 + 0.5 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) MER21C|LTR|ERVL 10203 NR_073121 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 134-82 chr19 7622156 7622482 + 0.5 NA intron (NM_020196, intron 12 of 18) intron (NM_020196, intron 12 of 18) 4880 NR_106850 102465475 NR_106850 ENSG00000273657 MIR6792 hsa-mir-6792 microRNA 6792 ncRNA 150.25-61 chr16 30696834 30697334 + 0.5 NA TTS (NM_001256932) TTS (NM_001256932) 1387 NM_001256932 730183 Hs.535456 NM_001256932 ENSG00000261840 LOC730183 - uncharacterized LOC730183 protein-coding 133.5-256 chr8 26581473 26581909 + 0.5 NA intron (NM_001244604, intron 1 of 13) intron (NM_001244604, intron 1 of 13) 3286 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 153.5-76 chr17 52136728 52137285 + 0.5 NA intron (NM_001082533, intron 2 of 9) intron (NM_001082533, intron 2 of 9) 21708 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 113.25-22 chr10 116910309 116910628 + 0.5 NA intron (NM_001127211, intron 14 of 16) intron (NM_001127211, intron 14 of 16) -60746 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 154.25-115 chr4 66912229 66912790 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 509491 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 173.75-118 chr4 87804917 87805328 + 0.5 NA intron (NM_004967, intron 4 of 6) intron (NM_004967, intron 4 of 6) 5568 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 121-143 chr4 44325535 44325981 + 0.5 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 123051 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 184.75-79 chr5 54065651 54066199 + 0.5 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) MER33|DNA|hAT-Charlie -114326 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 131.75-80 chr16 24037115 24037590 + 0.5 NA intron (NM_002738, intron 5 of 16) MIR|SINE|MIR -165764 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 116.25-108 chr2 82385529 82385889 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -471094 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 144.5-89 chr18 72397832 72398307 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 146273 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 136.25-59 chr14 65700553 65701028 + 0.5 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) CR1_Mam|LINE|CR1 229688 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 136.75-208 chrX 17954519 17954929 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -93387 NM_001172739 10742 Hs.446680 NM_021785 ENSG00000131831 RAI2 - retinoic acid induced 2 protein-coding 141.25-2 chr1 28997242 28997539 + 0.5 NA intron (NM_001166007, intron 4 of 17) intron (NM_001166007, intron 4 of 17) 82814 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 132.5-56 chr12 115277605 115278086 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -593670 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 143.25-6 chr1 94858434 94858852 + 0.5 NA intron (NM_001258340, intron 10 of 14) intron (NM_001258340, intron 10 of 14) 34150 NM_001350223 126969 Hs.483423 NM_152369 ENSG00000143036 SLC44A3 CTL3 solute carrier family 44 member 3 protein-coding 141.5-155 chr3 191919579 191920011 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -318835 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 119-91 chr2 113850603 113850993 + 0.5 NA intron (NR_110174, intron 2 of 4) intron (NR_110174, intron 2 of 4) -39136 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 162.75-28 chr12 76459238 76459763 + 0.5 NA intron (NM_001319652, intron 5 of 25) intron (NM_001319652, intron 5 of 25) -36215 NM_001319655 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 123.25-148 chr4 70954147 70954431 + 0.5 NA intron (NM_001244766, intron 2 of 6) intron (NM_001244766, intron 2 of 6) -39360 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 141-114 chr4 57320005 57320493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -105623 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 138-60 chr17 34904467 34904821 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56816 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 186.75-120 chr9 94182156 94182545 + 0.5 NA intron (NR_160773, intron 2 of 2) intron (NR_160773, intron 2 of 2) 3516 NR_029481 406886 NR_029481 ENSG00000199133 MIRLET7D LET7D|MIRNLET7D|hsa-let-7d|let-7d microRNA let-7d ncRNA 164.25-144 chr6 131011046 131011537 + 0.5 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) 2318 NM_001350309 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 134-124 chr3 193217506 193217901 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -23519 NM_020386 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 145.75-63 chr17 53364569 53365040 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 379299 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 112.25-119 chr3 4666762 4667158 + 0.5 NA intron (NM_001168272, intron 16 of 60) intron (NM_001168272, intron 16 of 60) 84630 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 132.75-159 chr5 157215562 157216010 + 0.5 NA intron (NM_005546, intron 4 of 16) MIR3|SINE|MIR 34890 NM_005546 3702 Hs.558348 NM_005546 ENSG00000113263 ITK EMT|LPFS1|LYK|PSCTK2 IL2 inducible T cell kinase protein-coding 127-155 chr6 157214590 157215069 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 109430 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 269-45 chr7 47669346 47670175 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14516 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 119.25-58 chr14 61505104 61505376 + 0.5 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 64954 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 145.25-134 chr5 83646207 83646771 + 0.5 NA intron (NM_001884, intron 3 of 4) intron (NM_001884, intron 3 of 4) 74366 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 131.5-229 chr8 21740648 21741094 + 0.5 NA intron (NM_001495, intron 4 of 8) L2-1_AMi|LINE|L2 48004 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 183.75-52 chr19 39186028 39186705 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10598 NM_001001414 342897 Hs.726934 NM_001001414 ENSG00000188505 NCCRP1 FBXO50|NCCRP-1 non-specific cytotoxic cell receptor protein 1 homolog (zebrafish) protein-coding 119-81 chr2 56952348 56952792 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -766800 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 124-11 chr1 213815434 213815766 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -109149 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 118-157 chr5 147354296 147354763 + 0.5 NA intron (NM_001112724, intron 7 of 12) intron (NM_001112724, intron 7 of 12) 99163 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 119.75-204 chr8 130566396 130566735 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -122891 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 129.75-190 chr8 137116838 137117283 + 0.5 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 296528 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 183.5-102 chr4 113945843 113946506 + 0.5 NA intron (NM_001354211, intron 4 of 6) intron (NM_001354211, intron 4 of 6) 33473 NM_001354210 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 132.75-12 chr1 179382514 179382875 + 0.5 NA intron (NR_073544, intron 6 of 25) intron (NR_073544, intron 6 of 25) 16650 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 215.75-42 chr15 70224200 70224707 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -126536 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 123-177 chr7 139240745 139241122 + 0.5 NA intron (NM_173569, intron 2 of 17) intron (NM_173569, intron 2 of 17) 9696 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 153.75-73 chr2 220726919 220727513 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -820651 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 195.75-74 chr3 72461689 72462207 + 0.5 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -15325 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 116.25-130 chr22 29669661 29670052 + 0.5 NA intron (NR_156186, intron 11 of 16) MIRc|SINE|MIR -50147 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 120.5-6 chr1 75654825 75655201 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38850 NM_001320283 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 152.5-109 chr22 40330858 40331307 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001024843, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001024843, exon 24 of 24) -15418 NM_000026 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 115.5-88 chr16 65719778 65720059 + 0.5 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -143618 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 157.5-135 chr3 104354195 104354558 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -830260 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 135-174 chr7 116253248 116253640 + 0.5 NA intron (NM_015641, intron 6 of 6) intron (NM_015641, intron 6 of 6) 30491 NM_152829 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 175.25-15 chr1 233794100 233794640 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -110306 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 136.5-26 chr10 60819537 60819988 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41284 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 138.75-49 chr14 45299809 45300256 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -46830 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 120-145 chr5 65593687 65594162 + 0.5 NA intron (NM_001656, intron 10 of 10) intron (NM_001656, intron 10 of 10) 30409 NM_033228 373 Hs.792 NM_001656 ENSG00000113595 TRIM23 ARD1|ARFD1|RNF46 tripartite motif containing 23 protein-coding 121.75-186 chr8 78743733 78744162 + 0.5 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1PA12|LINE|L1 -19573 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 143.5-57 chr14 23095574 23095992 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001164815) promoter-TSS (NM_001164815) -169 NM_001164814 22985 Hs.124490 NM_014977 ENSG00000100813 ACIN1 ACINUS|ACN|fSAP152 apoptotic chromatin condensation inducer 1 protein-coding 116-70 chr17 69734350 69734673 + 0.5 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 140524 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 114.5-249 chr8 18822807 18823036 + 0.5 NA intron (NM_015310, intron 4 of 15) intron (NM_015310, intron 4 of 15) -14054 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 154.25-47 chr14 64241174 64241649 + 0.5 NA intron (NM_001271877, intron 4 of 5) L1MEc|LINE|L1 25457 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 140.25-202 chrX 142220713 142221177 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15655 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 133.25-203 chr7 86321618 86322085 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -322058 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 149.75-46 chr14 78988536 78989059 + 0.5 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) (TGTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -211185 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 131-90 chr2 60414994 60415513 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -23878 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 113.25-165 chr8 22978471 22978801 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8615 NM_001160036 23221 Hs.372688 NM_015178 ENSG00000008853 RHOBTB2 DBC2|EIEE64 Rho related BTB domain containing 2 protein-coding 151.5-15 chr10 65314799 65315310 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -256371 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 153.5-152 chr5 22250816 22251313 + 0.5 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -37214 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 144-100 chr5 45411941 45412499 + 0.5 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 284160 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 114.25-48 chr13 47143788 47144044 + 0.5 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -246840 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 158.25-161 chrX 122293259 122293721 + 0.5 NA Intergenic (ATATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -890753 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 114.75-87 chr2 56233127 56233392 + 0.5 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR -47489 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 125.5-69 chr13 90922545 90922798 + 0.5 NA intron (NR_027039, intron 1 of 5) intron (NR_027039, intron 1 of 5) 3926 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 130-114 chr4 47221788 47222242 + 0.5 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 190448 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 163.25-92 chr3 44018452 44018904 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95534 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 180.75-79 chr20 63000738 63001225 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 5983 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 118-192 chr8 122281973 122282226 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 286545 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 154-11 chr1 200760292 200760680 + 0.5 NA intron (NM_001297707, intron 1 of 17) intron (NM_001297707, intron 1 of 17) 20914 NM_001297708 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 124.25 chr1 14813664 14814015 + 0.5 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR -110290 NM_001370229 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 129.75-144 chr5 34795426 34795796 + 0.5 NA intron (NM_015577, intron 3 of 17) intron (NM_015577, intron 3 of 17) -43553 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 116.75-95 chr2 68558587 68558866 + 0.5 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) L1PA11|LINE|L1 -84862 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 122.5-52 chr13 68238682 68239010 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 646479 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 134.25-172 chr7 28973299 28973806 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -6415 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 135-145 chr5 115803229 115803651 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 13217 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 115.5-149 chr20 4201269 4201516 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 8302 NR_033917 728228 Hs.636379 NR_033917 ENSG00000230176 LINC01433 - long intergenic non-protein coding RNA 1433 ncRNA 128-97 chr3 5819018 5819522 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -569015 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 123.75-117 chr3 69507252 69507665 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -121370 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 168-51 chr14 80670120 80670753 + 0.5 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) L1PB4|LINE|L1 271302 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 118-131 chr4 69768900 69769220 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8440 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 114.75-31 chr11 3724288 3724676 + 0.5 NA intron (NR_157590, intron 15 of 31) intron (NR_157590, intron 15 of 31) -53098 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 115.75-234 chrX 51758863 51759205 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 15592 NM_018094 23708 Hs.59523 NM_018094 ENSG00000189369 GSPT2 ERF3B|GST2 G1 to S phase transition 2 protein-coding 140-26 chr11 47906280 47906800 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -57996 NM_001318399 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 178.25-59 chr2 13786708 13787291 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 613959 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 171.25-26 chr11 78544520 78545161 + 0.5 NA intron (NR_120566, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 11664 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 163.75-22 chr10 110345215 110345776 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40575 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 132.75-86 chr18 36433188 36433641 + 0.5 NA intron (NM_001281740, intron 3 of 28) intron (NM_001281740, intron 3 of 28) 135701 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 202.75-59 chr2 117037869 117038514 + 0.5 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -776500 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 112.5-155 chr22 28590336 28590750 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluJr|SINE|Alu 89322 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 143-131 chr7 52345855 52346313 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -689549 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 115.75-144 chr3 98111322 98111553 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21261 NM_001005338 26341 Hs.537383 NM_001005338 ENSG00000231192 OR5H1 HSHTPCRX14|HTPCRX14 olfactory receptor family 5 subfamily H member 1 protein-coding 119.25-89 chr2 26419676 26420085 + 0.5 NA intron (NM_145038, intron 2 of 16) intron (NM_145038, intron 2 of 16) 17960 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 191-87 chr8 139805130 139805829 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) MIRc|SINE|MIR -102356 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 117.25-226 chr9 124377549 124377803 + 0.5 NA intron (NM_002799, intron 6 of 7) intron (NM_002799, intron 6 of 7) 24203 NR_027406 100129034 Hs.654980 NR_027406 LOC100129034 - uncharacterized LOC100129034 ncRNA 135.5-174 chr6 94876832 94877225 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 700423 NR_047502 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 143.5-133 chr21 25726870 25727216 + 0.5 NA intron (NM_001003703, intron 2 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie -7929 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 120.75-17 chr10 72384625 72384973 + 0.5 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) intron (NM_001195519, intron 5 of 6) -29880 NR_157570 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 216.75-13 chr10 93496831 93497639 + 0.5 NA intron (NM_018131, intron 1 of 8) intron (NM_018131, intron 1 of 8) 623 NM_001127182 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 130.5-17 chr1 118106361 118106735 + 0.5 NA intron (NM_206996, intron 4 of 48) MamRep605|LTR?|LTR? 78680 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 172.5-90 chr2 27421485 27421957 + 0.5 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -6069 NM_001321357 29959 Hs.515876 NM_013392 ENSG00000115216 NRBP1 BCON3|MADM|MUDPNP|NRBP nuclear receptor binding protein 1 protein-coding 114-105 chr3 98085403 98085832 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -1556 NM_054106 81050 Hs.554715 NM_054106 ENSG00000196578 OR5AC2 HSA1 olfactory receptor family 5 subfamily AC member 2 protein-coding 112.25-175 chr5 174503875 174504305 + 0.5 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) intron (NR_125806, intron 2 of 5) 167736 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 152-55 chr15 60841836 60842282 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 160490 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 137-29 chr10 119797033 119797420 + 0.5 NA intron (NM_014937, intron 7 of 19) intron (NM_014937, intron 7 of 19) -22031 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 217.5-126 chr8 102113552 102114367 + 0.5 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 10375 NM_001040626 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 206.75-50 chr3 26274650 26275315 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -347824 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 120.25-71 chr16 85037757 85038033 + 0.5 NA intron (NM_001286566, intron 1 of 11) intron (NM_001286566, intron 1 of 11) 10144 NM_001286566 9764 Hs.301658 NM_014732 ENSG00000135709 KIAA0513 - KIAA0513 protein-coding 150.75-12 chr1 102260422 102260978 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -263466 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 135.75-216 chrX 87335317 87335629 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -182329 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 131-98 chr2 164599311 164599631 + 0.5 NA intron (NM_004490, intron 2 of 13) intron (NM_004490, intron 2 of 13) 22011 NM_004490 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 134.5-155 chr4 59470830 59471252 + 0.5 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 457468 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 166.5-164 chr5 87574052 87574662 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -87685 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 131.75-82 chr16 53996422 53996931 + 0.5 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -42717 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 136.75-26 chr10 56626083 56626568 + 0.5 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -265052 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 130.25-26 chr10 61954453 61954910 + 0.5 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) intron (NM_032199, intron 3 of 9) 52982 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 153.5-68 chr15 62468972 62469342 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 126128 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 201-24 chr12 54679130 54679623 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31011 NM_053283 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 135-11 chr10 43215187 43215602 + 0.5 NA intron (NM_145313, intron 1 of 12) intron (NM_145313, intron 1 of 12) 14345 NM_001282862 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 146.5-170 chr5 58660328 58660903 + 0.5 NA intron (NM_138453, intron 2 of 4) intron (NM_138453, intron 2 of 4) 77540 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 143.5-31 chr11 12738320 12738734 + 0.5 NA intron (NM_021961, intron 2 of 12) intron (NM_021961, intron 2 of 12) 64106 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 123-37 chr12 30646731 30647005 + 0.5 NA intron (NM_006390, intron 20 of 24) L1MB8|LINE|L1 30376 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 181.5-153 chr7 128895489 128895963 + 0.5 NA intron (NM_001366122, intron 8 of 39) MER41A|LTR|ERV1 14983 NM_001366122 375616 Hs.371746 NM_199349 ENSG00000135253 KCP CRIM2|KCP1|NET67 kielin cysteine rich BMP regulator protein-coding 119.75-90 chr2 10757826 10758286 + 0.5 NA intron (NM_001039362, intron 4 of 13) intron (NM_001039362, intron 4 of 13) 36426 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 119-149 chr5 87009567 87009945 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 105198 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 124.5-80 chr17 57502055 57502525 + 0.5 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR 21307 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 134.5-41 chr11 76569280 76569632 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 100482 NR_163259 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 130.25-180 chr6 163136808 163137305 + 0.5 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) 54946 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 165.75-38 chr12 42840296 42840757 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 148310 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 126.5-225 chr7 48969162 48969605 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 44836 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 146.25-109 chr4 62949810 62950305 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -788292 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 116.25-170 chr4 179893878 179894330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1265045 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 131.5-184 chr4 164375217 164375557 + 0.5 NA intron (NM_001166373, intron 1 of 7) intron (NM_001166373, intron 1 of 7) 7868 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 129.5-243 chr9 129150073 129150464 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 27993 NM_203434 389792 Hs.529857 NM_203434 ENSG00000188483 IER5L bA247A12.2 immediate early response 5 like protein-coding 162.5-159 chr7 8169401 8169804 + 0.5 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) L1ME1|LINE|L1 92450 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 117-185 chr8 76010819 76011083 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -395703 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 166.5-120 chr20 44082452 44083018 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 104453 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 131.75-170 chr5 77392413 77392905 + 0.5 NA intron (NM_001029854, intron 9 of 20) LTR47A|LTR|ERVL 99657 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 115.25-225 chr9 93900866 93901161 + 0.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 54342 NM_021570 56033 Hs.164960 NM_021570 ENSG00000131668 BARX1 - BARX homeobox 1 protein-coding 131.75-53 chr12 68141236 68141682 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18281 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 167-14 chr1 204809734 204810235 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -18668 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 345.5-25 chr5 115809301 115810172 + 0.5 NA intron (NR_136619, intron 3 of 5) intron (NR_136619, intron 3 of 5) 6921 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 155.75-111 chr3 177562434 177562933 + 0.5 NA intron (NR_047568, intron 2 of 3) intron (NR_047568, intron 2 of 3) 120762 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 138.75-77 chr18 7093122 7093453 + 0.5 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) AluYf1|SINE|Alu 24510 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 117-151 chr5 118671859 118672198 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 75840 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 125.75-17 chr1 234119867 234120314 + 0.5 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -94121 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 115.25-178 chr6 158773637 158774025 + 0.5 NA intron (NM_003379, intron 7 of 12) intron (NM_003379, intron 7 of 12) -9078 NR_037482 100500851 NR_037482 ENSG00000265558 MIR3918 mir-3918 microRNA 3918 ncRNA 203-98 chr8 50924192 50924749 + 0.5 NA Intergenic (ACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 760339 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 205.25 chr1 30604978 30605617 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -113475 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-91 chr2 179614399 179614801 + 0.5 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) -28694 NR_104234 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 113.5 chr1 9502485 9502787 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -36829 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 125-18 chr10 12609079 12609547 + 0.5 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) MER1A|DNA|hAT-Charlie 30560 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 119.25-203 chr8 57145744 57145982 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -72413 NR_038235 100507651 Hs.371831 NR_038235 ENSG00000253301 LINC01606 - long intergenic non-protein coding RNA 1606 ncRNA 141.75-30 chr11 27213041 27213438 + 0.5 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) intron (NR_125767, intron 2 of 4) 5529 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 128.25-226 chrUn_KI270538v1 24164 24563 + 0.5 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 116-131 chr5 135157478 135157858 + 0.5 NA intron (NR_161235, intron 2 of 5) intron (NR_161235, intron 2 of 5) 90509 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 192.25-98 chr6 159412830 159413242 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 29505 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 169-93 chr6 129936093 129936651 + 0.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -75057 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 173-59 chr19 33219560 33220070 + 0.5 NA intron (NM_019849, intron 1 of 10) intron (NM_019849, intron 1 of 10) 6035 NM_019849 56301 Hs.58679 NM_019849 ENSG00000130876 SLC7A10 ASC1|HASC-1|asc-1 solute carrier family 7 member 10 protein-coding 133-165 chr7 131217862 131218264 + 0.5 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) LTR8B|LTR|ERV1 107969 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 127.75-121 chr21 35940247 35940665 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 54011 NR_144547 54036 Hs.228809 NR_144547 PPP1R2P2 - protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 2 pseudo 136.25-47 chr13 46375852 46376246 + 0.5 NA intron (NM_001286761, intron 2 of 14) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 11203 NM_001349772 80183 Hs.98117 NM_025113 ENSG00000102445 RUBCNL C13orf18|KIAA0226L|PACER rubicon like autophagy enhancer protein-coding 132.5-68 chr14 55323738 55324251 + 0.5 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 51840 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 139.25-177 chr7 43572550 43572932 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10367 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 126-64 chr15 83383018 83383347 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -64046 NM_001324185 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 119-176 chr7 9643036 9643509 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 9002 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 120.75-73 chr19 2521256 2521699 + 0.5 NA intron (NM_052847, intron 3 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie 45350 NM_015675 4616 Hs.110571 NM_015675 ENSG00000099860 GADD45B GADD45BETA|MYD118 growth arrest and DNA damage inducible beta protein-coding 149-120 chr7 50550073 50550480 + 0.5 NA intron (NM_001082971, intron 1 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10795 NM_001242886 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 116.5-120 chr2 98208808 98209134 + 0.5 NA intron (NR_144297, intron 12 of 18) L1MDa|LINE|L1 59438 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 116-120 chr4 175947543 175947999 + 0.5 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) intron (NR_048571, intron 1 of 5) 54920 NM_001261447 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 143.75-173 chr7 73463116 73463526 + 0.5 NA intron (NM_001370402, intron 11 of 18) AluJr|SINE|Alu 29543 NM_003508 8326 Hs.647029 NM_003508 ENSG00000188763 FZD9 CD349|FZD3 frizzled class receptor 9 protein-coding 124.5-104 chr2 71211201 71211532 + 0.5 NA intron (NM_020459, intron 1 of 3) MER5A|DNA|hAT-Charlie 15737 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 132-33 chr11 106859864 106860284 + 0.5 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) intron (NM_001256424, intron 4 of 8) 158402 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 173-148 chr9 75792704 75793276 + 0.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -97654 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 138.75-93 chr2 122727381 122727658 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 345962 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 115.5-225 chr6 170034363 170034707 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71912 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 128.25-49 chr14 42894988 42895440 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 1288358 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 152.5-74 chr18 28292254 28292626 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -115310 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 119.25-218 chr9 36625954 36626202 + 0.5 NA intron (NM_001256691, intron 6 of 15) PABL_A|LTR|ERV1 53183 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 168.25-113 chr5 24442782 24443309 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 201933 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 117.5-31 chr10 60583445 60583785 + 0.5 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) Alu|SINE|Alu -10659 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 195.75-78 chr3 105856243 105856882 + 0.5 NA intron (NR_135809, intron 2 of 18) intron (NR_135809, intron 2 of 18) 11029 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 182.75-91 chr4 72204583 72205311 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 165815 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 137.25-135 chr6 25266384 25266867 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5218 NR_110862 101928663 Hs.561600 NR_110862 LOC101928663 - uncharacterized LOC101928663 ncRNA 115.5-138 chr2 187414008 187414369 + 0.5 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) intron (NM_005795, intron 1 of 14) 34064 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 129.75-78 chr17 80685657 80685996 + 0.5 NA intron (NM_020761, intron 3 of 33) intron (NM_020761, intron 3 of 33) 119806 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 115.25-162 chr5 51800782 51801215 + 0.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -207033 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 130.75-178 chr7 51545999 51546374 + 0.5 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -152930 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 170.5-72 chr16 79080039 79080530 + 0.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 520453 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 136.75-153 chr5 15619211 15619627 + 0.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) MER50B|LTR|ERV1 -4417 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 131.25-18 chr1 203688320 203688635 + 0.5 NA intron (NM_001001396, intron 2 of 21) AluJb|SINE|Alu -41104 NR_003019 677843 Hs.676135 NR_003019 ENSG00000221643 SNORA77 ACA63|SNORA77A small nucleolar RNA, H/ACA box 77 snoRNA 112.5-91 chr17 812425 812650 + 0.5 NA intron (NM_001205319, intron 5 of 7) intron (NM_001205319, intron 5 of 7) 30184 NM_018146 55178 Hs.182729 NM_018146 ENSG00000171861 MRM3 RMTL1|RNMTL1 mitochondrial rRNA methyltransferase 3 protein-coding 136-176 chrX 45176287 45176741 + 0.5 NA intron (NM_024689, intron 2 of 2) intron (NM_024689, intron 2 of 2) 24362 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 124.25-56 chr14 72542246 72542658 + 0.5 NA intron (NM_001370281, intron 18 of 18) intron (NM_001370281, intron 18 of 18) 25632 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 164.25-112 chr4 46994868 46995243 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -1474 NM_000809 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 130-150 chr7 44064615 44065109 + 0.5 NA exon (NM_000290, exon 2 of 3) exon (NM_000290, exon 2 of 3) 705 NM_000290 5224 Hs.632642 NM_000290 ENSG00000164708 PGAM2 GSD10|PGAM-M|PGAMM phosphoglycerate mutase 2 protein-coding 162.5-157 chr7 4575181 4575692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -106859 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 122.75-182 chr7 34385321 34385745 + 0.5 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) MER51B|LTR|ERV1 -272685 NM_001300933 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 139.5-148 chr4 41792831 41793363 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44127 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 145.75-112 chr4 55829457 55829933 + 0.5 NA intron (NM_001351574, intron 1 of 2) intron (NM_001351574, intron 1 of 2) 9692 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 141.5-67 chr16 53414985 53415410 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19274 NM_001323608 5934 Hs.513609 NM_005611 ENSG00000103479 RBL2 P130|Rb2 RB transcriptional corepressor like 2 protein-coding 113.5-98 chr17 31657553 31657903 + 0.5 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 82317 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 176.5-7 chr1 102876842 102877416 + 0.5 NA non-coding (NR_134980, exon 68 of 68) non-coding (NR_134980, exon 68 of 68) 231367 NM_001190709 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 113-112 chr3 924442 924714 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168446 NM_001349350 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 164.75-48 chr14 58339708 58340177 + 0.5 NA intron (NM_002892, intron 11 of 23) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 41387 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 145-161 chr8 138543967 138544335 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -46421 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 114.25-138 chr4 57996854 57997181 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 539311 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 162.75-78 chr2 171988294 171988943 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11335 NM_199227 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 116.5-49 chr12 40679607 40679983 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12644 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 133.5-102 chr18 71364630 71365032 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 214125 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 149.5-32 chr10 86727042 86727503 + 0.5 NA intron (NM_001368066, intron 14 of 14) AluSq|SINE|Alu -29367 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 130-26 chr11 36336610 36337032 + 0.5 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) intron (NM_001160167, intron 1 of 8) -39164 NM_024841 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 198.25-86 chr6 4785725 4786454 + 0.5 NA intron (NM_001368127, intron 1 of 5) intron (NM_001368127, intron 1 of 5) 9685 NM_001368127 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 180.5-160 chr8 129440110 129440577 + 0.5 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 43799 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 194.5-112 chr4 127103745 127104393 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -528888 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 143.5-28 chr10 89623247 89623748 + 0.5 NA intron (NM_148977, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu 20419 NM_148978 53354 Hs.163555 NM_138316 ENSG00000152782 PANK1 PANK pantothenate kinase 1 protein-coding 139.5-108 chr2 165701597 165701955 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 92471 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 163.75-117 chr7 28188669 28189094 + 0.5 NA intron (NR_034097, intron 2 of 3) intron (NR_034097, intron 2 of 3) -8086 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 137.5-35 chr10 98074394 98074698 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43718 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 131.75-75 chr15 69458139 69458453 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 5478 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 120.75-12 chr1 227050081 227050496 + 0.5 NA intron (NM_003607, intron 21 of 35) L1ME3Cz|LINE|L1 109994 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 120-47 chr14 73483683 73484001 + 0.5 NA intron (NM_001220484, intron 17 of 17) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -7091 NM_024644 79697 Hs.509916 NM_024644 ENSG00000170468 RIOX1 C14orf169|JMJD9|MAPJD|NO66|ROX|URLC2|hsNO66 ribosomal oxygenase 1 protein-coding 146.5-65 chr14 68628151 68628578 + 0.5 NA non-coding (NR_135816, exon 1 of 2) non-coding (NR_135816, exon 1 of 2) 423 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 128.25-115 chr20 52238880 52239218 + 0.5 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy -47064 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 126.75-184 chr5 2240004 2240430 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71984 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 125.5-221 chr6 124577879 124578375 + 0.5 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L1MA3|LINE|L1 295122 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 217-56 chr3 180263391 180263863 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -150546 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 122.25-111 chr20 62999378 62999850 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7350 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 144-3 chr1 53911341 53911723 + 0.5 NA TTS (NM_000792) TTS (NM_000792) 17345 NM_001324316 1733 Hs.251415 NM_000792 ENSG00000211452 DIO1 5DI|TXDI1 iodothyronine deiodinase 1 protein-coding 133.25-62 chr15 82152696 82153067 + 0.5 NA intron (NM_001040610, intron 15 of 17) intron (NM_001040610, intron 15 of 17) 64287 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 128.25-172 chr6 46720709 46721041 + 0.5 NA intron (NM_005084, intron 2 of 11) intron (NM_005084, intron 2 of 11) 14500 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 125-130 chr5 93121624 93121989 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 449537 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 115-10 chr1 109149866 109150217 + 0.5 NA intron (NM_001284352, intron 1 of 20) intron (NM_001284352, intron 1 of 20) 35926 NM_001267048 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 134.5-146 chr3 192327367 192327780 + 0.5 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) 81476 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 124.75-193 chr7 62635114 62635386 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 668806 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 117-75 chr17 83160310 83160671 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66407 NR_029406 388574 Hs.546918 NR_029406 ENSG00000232938 RPL23AP87 - ribosomal protein L23a pseudogene 87 pseudo 209.5-139 chr8 47139127 47139688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49900 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 203-75 chr4 145024505 145025240 + 0.5 NA intron (NM_001256710, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 72510 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 229.5-67 chr2 120175787 120176505 + 0.5 NA 3' UTR (NM_020909, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_020909, exon 25 of 25) 47254 NM_024121 79134 Hs.376722 NM_024121 ENSG00000226479 TMEM185B FAM11B transmembrane protein 185B protein-coding 127.5-184 chr5 29005372 29005877 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -59620 NR_109948 101929645 Hs.531878 NR_109948 LOC101929645 - uncharacterized LOC101929645 ncRNA 122.5-154 chr3 101706256 101706703 + 0.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -5955 NR_002941 285359 Hs.720825 NR_002941 PDCL3P4 - PDCL3 pseudogene 4 pseudo 132.5-19 chr1 175572727 175573202 + 0.5 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 170631 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 117.5-210 chr7 3140305 3140634 + 0.5 NA TTS (NR_126024) TTS (NR_126024) 18104 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 147-54 chr17 69878267 69878790 + 0.5 NA intron (NR_109972, intron 4 of 4) L1MB7|LINE|L1 -83179 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 122.75-47 chr14 46695340 46695768 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43773 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 170.5-175 chr7 42348785 42349194 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -111780 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 130.5-204 chr5 56424684 56424946 + 0.5 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 56954 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 116.25-88 chr18 2002338 2002613 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 569030 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 169-87 chr6 67245030 67245564 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -810054 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 171-85 chr21 35476753 35477219 + 0.5 NA intron (NR_073512, intron 1 of 2) intron (NR_073512, intron 1 of 2) 103778 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 119.75-23 chr10 80118979 80119403 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12470 NR_138551 219348 Hs.204947 NM_001012973 ENSG00000189129 PLAC9 - placenta associated 9 protein-coding 114.5-212 chr5 65911127 65911386 + 0.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15298 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 130.25-128 chr22 36439643 36440054 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41792 NM_012473 25828 Hs.211929 NM_012473 ENSG00000100348 TXN2 COXPD29|MT-TRX|MTRX|TRX2|TXN thioredoxin 2 protein-coding 141.5-181 chr5 111101655 111102140 + 0.5 NA intron (NM_139281, intron 5 of 22) intron (NM_139281, intron 5 of 22) 9725 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 138.75-172 chr7 25974245 25974687 + 0.5 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -24480 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 131-114 chr22 30991606 30992054 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 22619 NR_152871 55000 Hs.554829 NR_002323 ENSG00000253352 TUG1 LINC00080|NCRNA00080|TI-227H taurine up-regulated 1 ncRNA 126.25-198 chr8 56709095 56709577 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -149513 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 116.5-141 chr20 31966258 31966491 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1777 NM_001011718 343702 Hs.666444 NM_001011718 ENSG00000260903 XKR7 C20orf159|dJ310O13.4 XK related 7 protein-coding 116.5-69 chr14 55959573 55959933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -158658 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 157-9 chr10 72735380 72735865 + 0.5 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 14593 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 117.5-78 chr16 74644312 74644718 + 0.5 NA intron (NM_001370543, intron 5 of 12) intron (NM_001370543, intron 5 of 12) 22362 NM_001370534 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 183-111 chr8 85166740 85167270 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 10036 NR_134311 102723322 Hs.535913 NR_134311 ENSG00000260493 LOC102723322 - uncharacterized LOC102723322 ncRNA 188.25-92 chr5 59549650 59550322 + 0.5 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) MIR3|SINE|MIR 36512 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 150.25-82 chr2 191494629 191495206 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -183155 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 137.25-131 chr5 111846650 111847087 + 0.5 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -65640 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 113.75-35 chr11 45868003 45868285 + 0.5 NA intron (NM_001127457, intron 6 of 11) intron (NM_001127457, intron 6 of 11) -17507 NM_005456 9479 Hs.234249 NM_005456 ENSG00000121653 MAPK8IP1 IB1|JIP-1|JIP1|PRKM8IP mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 protein-coding 148.25-81 chr20 20464596 20465058 + 0.5 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 96723 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 175.5-33 chr11 88623463 88624114 + 0.5 NA intron (NM_001143831, intron 3 of 8) intron (NM_001143831, intron 3 of 8) 119212 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 127-104 chr2 153695142 153695493 + 0.5 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -176605 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 157.5-206 chr8 76663046 76663572 + 0.5 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) intron (NR_024360, intron 2 of 3) -17938 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 127-21 chr10 110597508 110597856 + 0.5 NA intron (NM_005445, intron 19 of 28) intron (NM_005445, intron 19 of 28) 29991 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 122.75-89 chr2 39815449 39815911 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -36404 NM_001321474 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 117.5-186 chr5 105670232 105670577 + 0.5 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 570930 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 119.5-95 chr17 17402578 17402970 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -74226 NM_018019 55090 Hs.244595 NM_018019 ENSG00000141026 MED9 MED25 mediator complex subunit 9 protein-coding 130.5-40 chr10 63999418 63999915 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -477776 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 112.75-77 chr17 61030126 61030427 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 17 of 25) intron (NM_001330413, intron 17 of 25) 337428 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 112.5-149 chr20 42112256 42112593 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 23 of 31) MER81|DNA|hAT-Blackjack -494047 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 122.25-75 chr17 68991890 68992263 + 0.5 NA intron (NM_080283, intron 28 of 38) intron (NM_080283, intron 28 of 38) -12638 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-198 chr5 19248581 19249020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 637472 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 117-113 chr3 7668098 7668462 + 0.5 NA intron (NM_000844, intron 8 of 9) intron (NM_000844, intron 8 of 9) -132996 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 120.5-76 chr15 42479552 42479878 + 0.5 NA intron (NM_001366844, intron 1 of 19) AluSq|SINE|Alu 11426 NM_001284307 64397 Hs.511143 NM_022473 ENSG00000103994 ZNF106 SH3BP3|ZFP106|ZNF474 zinc finger protein 106 protein-coding 150-59 chr16 50517847 50518211 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -30367 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 158-13 chr1 171325194 171325662 + 0.5 NA intron (NM_002022, intron 5 of 9) intron (NM_002022, intron 5 of 9) 11245 NM_002022 2329 Hs.386502 NM_002022 ENSG00000076258 FMO4 FMO2 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 4 protein-coding 118.5-132 chr3 129047771 129048091 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12836 NM_000174 2815 Hs.1144 NM_000174 ENSG00000169704 GP9 CD42a|GPIX glycoprotein IX platelet protein-coding 192.75-73 chr20 42712519 42712996 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 6 of 31) L1ME4b|LINE|L1 27274 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 137.5-70 chr14 88206154 88206604 + 0.5 NA intron (NM_138317, intron 4 of 6) MER20B|DNA|hAT-Charlie 64532 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 119.25-15 chr1 175236002 175236407 + 0.5 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 -43217 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 131.75-208 chr7 117799414 117799767 + 0.5 NA intron (NM_001363351, intron 3 of 22) L1ME2z|LINE|L1 72630 NM_001363349 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 137.5-186 chr5 28777698 28778141 + 0.5 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -148951 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 153-78 chr2 156498871 156499406 + 0.5 NA intron (NM_000408, intron 3 of 16) intron (NM_000408, intron 3 of 16) 62759 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 211-23 chr16 20953522 20954217 + 0.5 NA intron (NM_001347886, intron 55 of 61) AluJr|SINE|Alu 52607 NR_161432 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 132-91 chr2 102343854 102344193 + 0.5 NA non-coding (NR_104167, exon 9 of 9) non-coding (NR_104167, exon 9 of 9) 6766 NR_104167 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 169.5-123 chr4 61017858 61018358 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 95489 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 152-74 chr19 32380442 32380981 + 0.5 NA intron (NM_001136156, intron 5 of 6) L1MC2|LINE|L1 24828 NR_046201 400684 Hs.438766 NR_046201 ENSG00000267213 LOC400684 - uncharacterized LOC400684 ncRNA 126.75-154 chr3 105976043 105976369 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -106805 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 221.25-16 chr11 131431514 131432123 + 0.5 NA intron (NM_001352003, intron 1 of 8) intron (NM_001352003, intron 1 of 8) 61203 NM_001352007 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 112.5-47 chr12 21425158 21425529 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12312 NM_024854 79912 Hs.709545 NM_024854 ENSG00000121350 PYROXD1 MFM8 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 protein-coding 132.75-102 chr2 125265266 125265771 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 852467 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 140.75-113 chr20 40531667 40532028 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 157389 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 133-118 chr4 32253958 32254429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -96845 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 144.75-43 chr12 39660821 39661348 + 0.5 NA intron (NM_001031748, intron 7 of 12) L1MA4A|LINE|L1 34901 NM_001319247 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 166.5-13 chr1 151192878 151193311 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2897 NM_001271087 6944 Hs.2430 NM_005997 ENSG00000163159 VPS72 CFL1|Swc2|TCFL1|YL-1|YL1 vacuolar protein sorting 72 homolog protein-coding 119.75-139 chr3 65887685 65888118 + 0.5 NA intron (NR_145422, intron 2 of 2) intron (NR_145422, intron 2 of 2) -5915 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-214 chr5 151299897 151300228 + 0.5 NA intron (NM_181774, intron 1 of 9) intron (NM_181774, intron 1 of 9) 3704 NM_181774 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 147.5-61 chr14 58976246 58976774 + 0.5 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) L1ME4b|LINE|L1 148222 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 199.5-75 chr2 51567093 51567653 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1MA6|LINE|L1 534772 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 127.75-206 chr9 71530494 71530868 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -83710 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 170.5-196 chr8 135783969 135784486 + 0.5 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 326771 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 112.5-86 chr15 98695019 98695456 + 0.5 NA intron (NM_000875, intron 1 of 20) intron (NM_000875, intron 1 of 20) -44016 NR_126453 104472848 Hs.349049 NR_126453 IRAIN IGF1R-AS IGF1R antisense imprinted non-protein coding RNA ncRNA 133-123 chr4 56510446 56510951 + 0.5 NA intron (NM_001363794, intron 1 of 3) intron (NM_001363794, intron 1 of 3) 4945 NM_001363794 132946 Hs.444449 NM_206919 ENSG00000196503 ARL9 - ADP ribosylation factor like GTPase 9 protein-coding 114.25-12 chr1 201202290 201202670 + 0.5 NA intron (NM_001164586, intron 9 of 23) L2b|LINE|L2 11655 NM_001164586 91156 Hs.519024 NM_178275 ENSG00000163395 IGFN1 EEF1A2BP1 immunoglobulin like and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 138.25-7 chr1 83578627 83579086 + 0.5 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 132802 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 151.75-55 chr18 3851996 3852527 + 0.5 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) L1M7|LINE|L1 -6903 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 180.25-5 chr10 25735224 25735796 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 83798 NR_108068 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 154.5-143 chr5 7367985 7368546 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -20288 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 156-165 chr9 73278742 73279159 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 127085 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 139.75-100 chr2 126318818 126319288 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -201068 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 154.75-96 chr3 114562022 114562482 + 0.5 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) AluSc|SINE|Alu 61954 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 154-100 chr4 67967251 67967606 + 0.5 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -3935 NM_182606 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 138-98 chr22 36482482 36482877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1039 NM_012473 25828 Hs.211929 NM_012473 ENSG00000100348 TXN2 COXPD29|MT-TRX|MTRX|TRX2|TXN thioredoxin 2 protein-coding 116.75-25 chr10 75082821 75083231 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16460 NM_001363514 51207 Hs.178170 NM_016364 ENSG00000079393 DUSP13 BEDP|DUSP13A|DUSP13B|MDSP|SKRP4|TMDP dual specificity phosphatase 13 protein-coding 142.25-32 chr11 103732095 103732458 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -117630 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 244.75-38 chr3 46310806 46311601 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42541 NM_001123041 729230 Hs.511794 NM_001123041 ENSG00000121807 CCR2 CC-CKR-2|CCR-2|CCR2A|CCR2B|CD192|CKR2|CKR2A|CKR2B|CMKBR2|MCP-1-R C-C motif chemokine receptor 2 protein-coding 140.75-133 chr4 45097922 45098468 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -371561 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 133-184 chr9 10053881 10054236 + 0.5 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) intron (NM_002839, intron 3 of 45) 254666 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 126-52 chr14 49061466 49061792 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 524751 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 126.75-86 chr16 76652509 76652938 + 0.5 NA intron (NR_110934, intron 2 of 3) intron (NR_110934, intron 2 of 3) 17725 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 181-39 chr17 54911638 54912249 + 0.5 NA intron (NM_001321176, intron 4 of 16) intron (NM_001321176, intron 4 of 16) 11091 NM_005486 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 131-7 chr1 165233107 165233501 + 0.5 NA intron (NM_177398, intron 4 of 8) AluJo|SINE|Alu 122937 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 232.75-34 chr2 179082837 179083452 + 0.5 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -33007 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 170.5-27 chr10 61312684 61313230 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -139682 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 155.5-139 chr3 192621946 192622453 + 0.5 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 105342 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 147.5-166 chr4 89422282 89422685 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -114683 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 209-17 chr13 63615616 63616274 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -121490 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 130.25-19 chr1 209792876 209793360 + 0.5 NA intron (NM_006147, intron 5 of 8) intron (NM_006147, intron 5 of 8) -8559 NM_152485 148304 Hs.497642 NM_152485 ENSG00000162757 C1orf74 URLC4 chromosome 1 open reading frame 74 protein-coding 118.5-209 chr8 29441899 29442331 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -91431 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 153-56 chr16 80437995 80438546 + 0.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -102464 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 134.75-217 chr8 101108452 101108900 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56622 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 191.75-57 chr19 49596230 49596776 + 0.5 NA exon (NM_020719, exon 4 of 14) exon (NM_020719, exon 4 of 14) 5321 NM_020719 57479 Hs.590971 NM_020719 ENSG00000126464 PRR12 KIAA1205 proline rich 12 protein-coding 130.75-204 chr9 102568861 102569193 + 0.5 NA intron (NR_103830, intron 1 of 4) intron (NR_103830, intron 1 of 4) 49390 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 119.75-10 chr1 147527567 147527970 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9893 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 151.75-70 chr2 182647850 182648258 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -68203 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 121-142 chr4 33202470 33202922 + 0.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 837197 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 115.75-40 chr12 42077717 42078003 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 67014 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 138.5-38 chr11 125118572 125118876 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6961 NR_047587 219854 Hs.7626 NM_001080546 ENSG00000150433 TMEM218 - transmembrane protein 218 protein-coding 114.5-79 chr13 92602742 92603136 + 0.5 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MER68|LTR|ERVL 112776 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 112.5-161 chr22 40508544 40508912 + 0.5 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) intron (NM_020831, intron 3 of 14) -13072 NR_109965 101927257 Hs.662725 NR_109965 ENSG00000232564 MRTFA-AS1 - MRTFA antisense RNA 1 ncRNA 167-38 chr14 43042416 43043074 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1435889 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 123.5-188 chr6 73098950 73099307 + 0.5 NA intron (NM_001160132, intron 5 of 13) L1MA3|LINE|L1 44386 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 120.25-3 chr1 43990454 43990798 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001349127) promoter-TSS (NM_001349127) -970 NM_001349127 149473 Hs.632394 NM_152499 ENSG00000159214 CCDC24 - coiled-coil domain containing 24 protein-coding 143.25-71 chr17 67479258 67479742 + 0.5 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) -7915 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 145.25-153 chr7 762959 763395 + 0.5 NA intron (NR_075098, intron 7 of 12) intron (NR_075098, intron 7 of 12) -35501 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 112.75-34 chr11 25975152 25975489 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -213803 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 186.25-63 chr21 20690361 20691069 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 112393 NR_109786 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 133-141 chr5 121349189 121349673 + 0.5 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 26881 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 112.75-67 chr15 50701424 50701686 + 0.5 NA TTS (NM_032802) TTS (NM_032802) -14758 NM_001301212 54822 Hs.512894 NM_017672 ENSG00000092439 TRPM7 ALSPDC|CHAK|CHAK1|LTRPC7|LTrpC-7|TRP-PLIK transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 protein-coding 134.25-143 chr5 65522616 65523123 + 0.5 NA intron (NM_001349369, intron 9 of 10) L3|LINE|CR1 40299 NM_022145 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 125.75-21 chr10 49291137 49291561 + 0.5 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 7544 NR_108038 100506769 Hs.562293 NR_108038 C10orf71-AS1 - C10orf71 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-69 chr15 96490024 96490487 + 0.5 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 156490 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 161.25-9 chr1 176775852 176776367 + 0.5 NA intron (NM_020318, intron 17 of 22) intron (NM_020318, intron 17 of 22) 253336 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 183.5-77 chr2 192516312 192516954 + 0.5 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -233212 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 139-99 chr4 41089968 41090459 + 0.5 NA intron (NM_173075, intron 3 of 16) intron (NM_173075, intron 3 of 16) 124329 NM_004307 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 120.25-15 chr1 119397808 119398211 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16922 NM_001166120 3284 Hs.654399 NM_000198 ENSG00000203859 HSD3B2 HSD3B|HSDB|SDR11E2 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 protein-coding 145-103 chr3 170573036 170573423 + 0.5 NA intron (NM_020949, intron 1 of 7) intron (NM_020949, intron 1 of 7) 12846 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 140.25-119 chr3 124124300 124124679 + 0.5 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -8440 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 173.5-163 chr8 88828832 88829394 + 0.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -501630 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 127-18 chr10 100005649 100005925 + 0.5 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) L1ME5|LINE|L1 4160 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 174.25-45 chr13 113096044 113096579 + 0.5 NA intron (NM_001366646, intron 25 of 27) CpG -9477 NM_000131 2155 Hs.36989 NM_000131 ENSG00000057593 F7 SPCA coagulation factor VII protein-coding 125.25-174 chr6 126576341 126576771 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 91925 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 188.25-20 chr11 39943627 39944172 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 349231 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 114.25-16 chr10 42774519 42774795 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8138 NM_014753 9790 Hs.10848 NM_014753 ENSG00000165733 BMS1 ACC|BMS1L BMS1 ribosome biogenesis factor protein-coding 145.75-117 chr4 157559196 157559646 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13069 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 188.25-57 chr2 39149866 39150376 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29658 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 146-91 chr3 123936488 123936923 + 0.5 NA intron (NM_001366336, intron 5 of 8) L1PA14|LINE|L1 24524 NM_022757 64770 Hs.645028 NM_022757 ENSG00000175455 CCDC14 - coiled-coil domain containing 14 protein-coding 134-97 chr2 138438394 138438756 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -63195 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 112.75-126 chr22 26698556 26698941 + 0.5 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) intron (NR_110543, intron 1 of 5) 25905 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 150.75-47 chr12 45438876 45439266 + 0.5 NA intron (NM_001142679, intron 19 of 19) intron (NM_001142679, intron 19 of 19) 146381 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 112.25-193 chr6 168686613 168686878 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 245561 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 112.25-38 chr11 113017961 113018257 + 0.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -54649 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 127-3 chr1 113131152 113131602 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001312686, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001312686, exon 19 of 19) 58179 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 120-54 chr15 98088265 98088626 + 0.5 NA intron (NR_120325, intron 1 of 3) intron (NR_120325, intron 1 of 3) 308 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 113.75-128 chr3 57102181 57102478 + 0.5 NA intron (NM_001318864, intron 11 of 13) intron (NM_001318864, intron 11 of 13) -23061 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 126.75-168 chr4 43733061 43733524 + 0.5 NA Intergenic LTR22E|LTR|ERVK -240749 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 206.75-16 chr12 39112426 39112885 + 0.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -207064 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 151.75-6 chr1 93140578 93141020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 39614 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 124.25-115 chr20 11871427 11871889 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110635) promoter-TSS (NR_110635) -943 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 177-28 chr13 110254249 110254711 + 0.5 NA intron (NM_001845, intron 1 of 51) intron (NM_001845, intron 1 of 51) 52677 NM_001303110 1282 Hs.17441 NM_001845 ENSG00000187498 COL4A1 BSVD|BSVD1|RATOR collagen type IV alpha 1 chain protein-coding 172.75-10 chr10 27049524 27050058 + 0.5 NA intron (NM_014915, intron 16 of 33) intron (NM_014915, intron 16 of 33) 50707 NM_014915 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 116.75-88 chr2 14923232 14923694 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 290746 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 133-168 chr8 52505961 52506291 + 0.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 59304 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 175-79 chr20 56420336 56420846 + 0.5 NA intron (NM_001164116, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 8331 NM_001164114 57091 Hs.473144 NM_020356 ENSG00000087589 CASS4 C20orf32|CAS4|HEFL|HEPL Cas scaffold protein family member 4 protein-coding 129-83 chr19 39402410 39402792 + 0.5 NA Intergenic CpG -4246 NM_003407 7538 Hs.534052 NM_003407 ENSG00000128016 ZFP36 G0S24|GOS24|NUP475|RNF162A|TIS11|TTP|zfp-36 ZFP36 ring finger protein protein-coding 128.75-213 chr9 135057928 135058325 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17379 NM_006334 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 172-20 chr11 78025223 78025777 + 0.5 NA intron (NM_001203261, intron 2 of 2) MLT2A1|LTR|ERVL -2224 NM_023930 65987 Hs.709780 NM_023930 ENSG00000151364 KCTD14 - potassium channel tetramerization domain containing 14 protein-coding 133.5-119 chr2 84772932 84773295 + 0.5 NA intron (NM_001370, intron 64 of 76) L1PA16|LINE|L1 107971 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 123.5-43 chr11 113164857 113165347 + 0.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 108799 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 128-143 chr6 146973390 146973779 + 0.5 NA intron (NR_034115, intron 6 of 10) intron (NR_034115, intron 6 of 10) -169760 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 124.5-106 chr2 96384865 96385256 + 0.5 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 49294 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 134.75-172 chr5 9752435 9752790 + 0.5 NA intron (NR_027112, intron 5 of 12) L1PA4|LINE|L1 -101765 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 134.25-86 chr2 122321464 122321982 + 0.5 NA Intergenic MER105|DNA|hAT-Charlie 566072 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 121.75-139 chr5 16962791 16963107 + 0.5 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -26661 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 131.25-147 chr3 134260999 134261453 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -10482 NM_001005861 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 168.25-141 chr8 91766224 91766700 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 251218 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 122.25-123 chr3 63610259 63610699 + 0.5 NA intron (NM_001130003, intron 5 of 5) intron (NM_001130003, intron 5 of 5) -42196 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 126.25-32 chr11 95547299 95547729 + 0.5 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 242268 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 142.25-141 chr6 68516396 68516862 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 117695 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 124.75-90 chr15 86631035 86631340 + 0.5 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) MER48|LTR|ERV1 -301693 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 141-60 chr17 72106990 72107383 + 0.5 NA intron (NR_103738, intron 2 of 6) intron (NR_103738, intron 2 of 6) 8830 NR_103738 400618 Hs.657374 NR_103737 ENSG00000234899 SOX9-AS1 - SOX9 antisense RNA 1 ncRNA 154.5-163 chr6 115572069 115572598 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71502 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 112.5-79 chr14 89845564 89845876 + 0.5 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) intron (NM_001284269, intron 5 of 5) 108816 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 148.75-40 chr12 33595884 33596339 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -156292 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 130.5-33 chr10 46287361 46287664 + 0.5 NA intron (NM_001278688, intron 1 of 16) intron (NM_001278688, intron 1 of 16) 515 NM_001354208 195977 Hs.538515 NM_001278688 ENSG00000274209 ANTXRL - ANTXR like protein-coding 202.75-106 chr7 56101064 56101611 + 0.5 NA TTS (NM_016139) TTS (NM_016139) 5139 NM_016139 51142 Hs.389996 NM_016139 ENSG00000106153 CHCHD2 C7orf17|MIX17B|MNRR1|NS2TP|PARK22 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 protein-coding 148-85 chr3 114147465 114148000 + 0.5 NA intron (NM_000796, intron 3 of 6) AluJr|SINE|Alu 31044 NM_001290809 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 158-36 chr11 121996642 121997007 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 103020 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 125.75-66 chr16 89569908 89570299 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5655 NM_153636 27132 Hs.461775 NM_014427 ENSG00000178773 CPNE7 - copine 7 protein-coding 147.5-139 chr3 37802136 37802564 + 0.5 NA intron (NR_110532, intron 4 of 5) intron (NR_110532, intron 4 of 5) 59430 NR_110531 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 132.5-6 chr1 41961193 41961530 + 0.5 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -42439 NR_038260 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 113.75-59 chr14 56704623 56705061 + 0.5 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 100825 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 130.75-103 chr2 207334890 207335295 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -65668 NR_031633 100302130 NR_031633 ENSG00000221628 MIR1302-4 MIRN1302-4|hsa-mir-1302-4 microRNA 1302-4 ncRNA 137-118 chr4 46857579 46857990 + 0.5 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) intron (NM_130902, intron 1 of 2) 51461 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 154-17 chr10 42661343 42661825 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22747 NR_130949 7582 Hs.435774 NM_006955 ENSG00000196693 ZNF33B KOX2|KOX31|ZNF11B zinc finger protein 33B protein-coding 163.75-89 chr3 7838270 7838912 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 177716 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 190-19 chr15 81771867 81772318 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 273926 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 216.75-5 chr1 117674156 117674619 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 68339 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 135-129 chr4 119635225 119635558 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -6587 NM_001083 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 115.75-161 chr4 168988107 168988381 + 0.5 NA 3' UTR (NM_032783, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_032783, exon 5 of 5) 22011 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 119.5-55 chr11 111922115 111922591 + 0.5 NA intron (NM_080659, intron 1 of 3) intron (NM_080659, intron 1 of 3) 1387 NM_001368245 1410 Hs.53454 NM_001885 ENSG00000109846 CRYAB CMD1II|CRYA2|CTPP2|CTRCT16|HEL-S-101|HSPB5|MFM2 crystallin alpha B protein-coding 178.75-35 chr16 66418530 66418947 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8557 NM_001197224 146227 Hs.97805 NM_001136106 ENSG00000166546 BEAN1 BEAN|SCA31 brain expressed associated with NEDD4 1 protein-coding 136.25-195 chr9 86467789 86468164 + 0.5 NA Intergenic LTR31|LTR|ERV1 -113566 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 137.75-60 chr14 61603648 61604174 + 0.5 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) MER57E1|LTR|ERV1 -33258 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 114.5-252 chr8 22684125 22684564 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 8020 NM_001199880 1960 Hs.534313 NM_004430 ENSG00000179388 EGR3 EGR-3|PILOT early growth response 3 protein-coding 125.25-59 chr14 26898810 26899179 + 0.5 NA intron (NR_110041, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR -9648 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 117-8 chr1 183335124 183335583 + 0.5 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) intron (NM_015039, intron 1 of 10) -30479 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 122.5-180 chr5 18167476 18167828 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 360378 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 141.25-88 chr2 142994487 142994922 + 0.5 NA intron (NM_001199241, intron 11 of 14) intron (NM_001199241, intron 11 of 14) 117040 NM_001032998 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 156.75-103 chr20 24448589 24449170 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -20320 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 132-48 chr14 55443932 55444275 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3558 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 122-12 chr1 107992242 107992670 + 0.5 NA intron (NR_046653, intron 1 of 2) intron (NR_046653, intron 1 of 2) -27276 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 125.25-213 chr8 126797637 126797960 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -215356 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 119-195 chr8 79543641 79544051 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -67271 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 186.5-137 chr8 113850338 113850828 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -413644 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 142.75-65 chr15 47965196 47965659 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -119191 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 149-29 chr14 24785906 24786376 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -151951 NM_004131 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 138.25-94 chr2 213156499 213156966 + 0.5 NA intron (NR_146974, intron 3 of 3) intron (NR_146974, intron 3 of 3) -4276 NM_001371277 152.75-16 chr10 7989975 7990304 + 0.5 NA intron (NM_031923, intron 4 of 6) intron (NM_031923, intron 4 of 6) 62352 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-189 chr8 87593845 87594172 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 280007 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 193.5-149 chr7 38755414 38755938 + 0.5 NA intron (NM_014396, intron 19 of 28) MIR3|SINE|MIR -68587 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 119.75-215 chrX 58519644 58520045 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -609211 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 121.25-175 chr6 11275794 11276168 + 0.5 NA intron (NM_001142393, intron 2 of 7) intron (NM_001142393, intron 2 of 7) -43299 NM_001271033 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 121.25-191 chr8 23160161 23160416 + 0.5 NA intron (NM_003840, intron 1 of 8) L1MEc|LINE|L1 3739 NM_003840 8793 Hs.213467 NM_003840 ENSG00000173530 TNFRSF10D CD264|DCR2|TRAIL-R4|TRAILR4|TRUNDD TNF receptor superfamily member 10d protein-coding 158.5-159 chr5 133947892 133948351 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 20504 NM_020199 56951 Hs.744034 NM_020199 ENSG00000113583 C5orf15 HTGN29|KCT2 chromosome 5 open reading frame 15 protein-coding 189-53 chr2 17295437 17295898 + 0.5 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 222773 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 117.5-217 chr7 37751284 37751676 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 67714 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 138.75-19 chr10 62865009 62865390 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46032 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 115.25-78 chr17 39598000 39598424 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 9708 NM_006160 4761 Hs.322431 NM_006160 ENSG00000171532 NEUROD2 EIEE72|NDRF|bHLHa1 neuronal differentiation 2 protein-coding 114.25-6 chr1 162379470 162379835 + 0.5 NA intron (NM_001135240, intron 1 of 2) intron (NM_001135240, intron 1 of 2) 811 NM_001135240 400793 Hs.447011 NM_001085375 ENSG00000239887 C1orf226 - chromosome 1 open reading frame 226 protein-coding 152.75-13 chr1 220321399 220321913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49203 NM_012414 25782 Hs.654849 NM_012414 ENSG00000118873 RAB3GAP2 RAB3-GAP150|RAB3GAP150|SPG69|WARBM2|p150 RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2 protein-coding 145-66 chr19 30967489 30967869 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -199831 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 172-89 chr5 35594558 35595177 + 0.5 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -22996 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 115-101 chr22 20468284 20468611 + 0.5 NA intron (NR_033825, intron 2 of 5) MIR1_Amn|SINE|MIR 27348 NR_033825 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 116.75-138 chr3 163558259 163558618 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -255137 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 136-172 chr9 106138764 106139174 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 444428 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 138.75-140 chr5 26357530 26357876 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 680883 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 143.25-40 chr12 116638366 116638828 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 79216 NM_001085481 643246 Hs.356061 NM_001085481 ENSG00000258102 MAP1LC3B2 ATG8G microtubule associated protein 1 light chain 3 beta 2 protein-coding 135.25-13 chr1 196067883 196068327 + 0.5 NA intron (NR_146895, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 20610 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 130.25-119 chr20 53285035 53285526 + 0.5 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 99997 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 119.5-225 chr8 29439288 29439568 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -88744 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 152.25-173 chrX 48083033 48083527 + 0.5 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL -11622 NM_001282201 57232 Hs.650883 NM_001037735 ENSG00000221994 ZNF630 dJ54B20.2 zinc finger protein 630 protein-coding 136.25-40 chr12 10583080 10583485 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 16553 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 122.75-98 chr2 139005970 139006292 + 0.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 108807 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 122.5-100 chr19 45992584 45992910 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2720 NM_001267723 729440 Hs.515479 NM_001080402 ENSG00000104983 CCDC61 - coiled-coil domain containing 61 protein-coding 127.25-186 chr7 317558 317852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61720 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 134.75-215 chr8 90029093 90029523 + 0.5 NA intron (NM_001330575, intron 7 of 11) intron (NM_001330575, intron 7 of 11) 27831 NM_001359 1666 Hs.492212 NM_001359 ENSG00000104325 DECR1 DECR|NADPH|SDR18C1 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 protein-coding 113.5-134 chr20 7197193 7197623 + 0.5 NA intron (NR_110609, intron 3 of 7) intron (NR_110609, intron 3 of 7) 56794 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 173-92 chr4 49096731 49097328 + 0.5 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 110387 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 127.25-80 chr2 475134 475499 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 17339 NR_146437 727944 NR_146436 ENSG00000223985 LINC01874 - long intergenic non-protein coding RNA 1874 ncRNA 190-32 chr2 108581987 108582499 + 0.5 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) intron (NM_001193483, intron 1 of 9) -6063 NM_001193488 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 166-66 chr2 152455390 152455914 + 0.5 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 120478 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 116.75-66 chr15 68433776 68434194 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1822 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 168.25-17 chr10 79358392 79358992 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 11223 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 117.25-51 chr12 14825899 14826300 + 0.5 NA 3' UTR (NM_021071, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_021071, exon 3 of 3) -11917 NM_001013698 440087 Hs.220931 NM_001013698 ENSG00000179256 SMCO3 C12orf69 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 3 protein-coding 210.5-58 chr19 56515044 56515629 + 0.5 NA intron (NM_001321768, intron 2 of 3) intron (NM_001321768, intron 2 of 3) 7481 NM_001321768 57573 Hs.230188 NM_020813 ENSG00000196263 ZNF471 ERP1|Z1971 zinc finger protein 471 protein-coding 150.75-24 chr10 35922094 35922537 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 144013 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 149-43 chr16 73322526 73322914 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -64085 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 129-180 chr8 104091816 104092321 + 0.5 NA intron (NR_145711, intron 17 of 21) intron (NR_145711, intron 17 of 21) -131267 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 123.5-42 chr11 78380904 78381151 + 0.5 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) LTR24|LTR|ERV1 36793 NM_080491 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 131.5-10 chr1 117393826 117394285 + 0.5 NA intron (NM_006699, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 26606 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 156.75-147 chr6 64378008 64378498 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 571417 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 112.25-180 chr6 45370351 45370692 + 0.5 NA intron (NM_181356, intron 1 of 12) intron (NM_181356, intron 1 of 12) 6997 NR_146635 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 114.75-202 chr8 142273087 142273523 + 0.5 NA intron (NM_001366904, intron 12 of 12) intron (NM_001366904, intron 12 of 12) 74949 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 116.25-210 chr7 31842549 31842998 + 0.5 NA intron (NM_001191059, intron 10 of 18) L1ME2|LINE|L1 155558 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 125-171 chrX 80159008 80159440 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 136164 NM_001303475 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 135.75-208 chr9 11827154 11827457 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -866080 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 117.25-143 chr3 120043290 120043727 + 0.5 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 41140 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 116.75-212 chr9 125248916 125249243 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7736 NM_005347 3309 Hs.743241 NM_005347 ENSG00000044574 HSPA5 BIP|GRP78|HEL-S-89n|MIF2 heat shock protein family A (Hsp70) member 5 protein-coding 133.5-66 chr12 66816601 66817111 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12587 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 116-19 chr10 76538289 76538626 + 0.5 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -349587 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 146-65 chr2 68028084 68028402 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 34761 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 121-20 chr10 44209141 44209504 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -83428 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 127.5-250 chr8 134326770 134327081 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -271146 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 118.5-180 chr6 122636941 122637298 + 0.5 NA intron (NM_032471, intron 2 of 3) intron (NM_032471, intron 2 of 3) -15610 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 113-167 chr7 64843394 64843679 + 0.5 NA intron (NR_160269, intron 2 of 3) L1MA8|LINE|L1 49108 NM_001271640 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 150.25-163 chr9 114189687 114190042 + 0.5 NA intron (NM_032888, intron 5 of 60) L1ME4a|LINE|L1 -19570 NR_030255 619556 NR_030255 ENSG00000207726 MIR455 MIRN455|hsa-mir-455|mir-455 microRNA 455 ncRNA 126.75-75 chr15 72816566 72816999 + 0.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -33024 NM_001365224 83440 Hs.562587 NM_031284 ENSG00000159322 ADPGK 2610017G09Rik|ADP-GK ADP dependent glucokinase protein-coding 113.75-78 chr17 19515995 19516434 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -17640 NM_018242 55244 Hs.232054 NM_018242 ENSG00000142494 SLC47A1 MATE1 solute carrier family 47 member 1 protein-coding 163.75-13 chr1 197525715 197526197 + 0.5 NA intron (NR_125340, intron 17 of 19) intron (NR_125340, intron 17 of 19) 249524 NR_125340 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 140-127 chr4 101418415 101418857 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 70859 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 124.5-144 chr3 134267654 134267973 + 0.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -17069 NM_001005861 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 135-23 chr11 47746717 47747191 + 0.5 NA intron (NM_001318339, intron 6 of 16) intron (NM_001318339, intron 6 of 16) 20387 NM_015308 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 123.5-68 chr15 86404664 86405083 + 0.5 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -87905 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 155.5-113 chr21 29904049 29904482 + 0.5 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) L1PA7|LINE|L1 35731 NM_001330994 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 121.5-166 chr22 36597438 36597892 + 0.5 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -68499 NM_003753 8664 Hs.55682 NM_003753 ENSG00000100353 EIF3D EIF3S7|eIF3-p66|eIF3-zeta eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D protein-coding 116.5-87 chr16 89586319 89586632 + 0.5 NA intron (NM_153636, intron 7 of 14) intron (NM_153636, intron 7 of 14) 10717 NM_014427 27132 Hs.461775 NM_014427 ENSG00000178773 CPNE7 - copine 7 protein-coding 149.25-27 chr11 29992245 29992733 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10096 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 128.25-142 chr4 55176170 55176661 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50820 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 118-138 chr5 14572403 14572752 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -9215 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 136.75-156 chr5 30745793 30746215 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -447682 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 140.75-39 chr12 42159532 42159922 + 0.5 NA non-coding (NR_135139, exon 7 of 7) non-coding (NR_135139, exon 7 of 7) -14853 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 143.25-69 chr17 51764444 51764915 + 0.5 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) intron (NM_001082533, intron 4 of 9) 329252 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 112.5-239 chr8 129565773 129566045 + 0.5 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 9109 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 133-24 chr11 97126621 97126972 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 618371 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 116-109 chr3 153973360 153973698 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -147474 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 134-125 chr3 197603815 197604128 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23910 NR_003266 220729 Hs.478854 NR_003266 ENSG00000214135 LOC220729 - succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A pseudogene pseudo 170-55 chr20 59903424 59903931 + 0.5 NA intron (NM_014258, intron 15 of 44) L2|LINE|L2 29960 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 120-100 chr20 5827779 5828141 + 0.5 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) 77559 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 205.5-153 chr8 127176723 127177394 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20569 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 166.25 chr1 12779090 12779461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 4427 NM_001080830 390999 Hs.156406 NM_001080830 ENSG00000116726 PRAMEF12 - PRAME family member 12 protein-coding 112.5-55 chr12 63023870 63024232 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -88901 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 153.75-152 chr8 128057445 128057896 + 0.5 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) intron (NR_003367, intron 5 of 8) 8518 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 189.75-56 chr2 21693944 21694341 + 0.5 NA intron (NR_038837, intron 2 of 2) intron (NR_038837, intron 2 of 2) 16510 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 146.5-149 chr4 30731147 30731571 + 0.5 NA 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 10990 NM_001173523 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 133.25-79 chr17 77215449 77215837 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001143998, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001143998, exon 17 of 17) 30430 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 155.25-94 chr2 106672971 106673325 + 0.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 185784 NM_001368307 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 114-158 chr7 127320569 127320978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67832 NM_001371085 132-153 chr6 139823425 139823850 + 0.5 NA intron (NR_038399, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 -31213 NR_138541 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 134-112 chr3 3976576 3976919 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -175872 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 116.75-201 chr8 118711379 118711816 + 0.5 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -89634 NR_109794 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 119-120 chr3 108200195 108200536 + 0.5 NA intron (NM_018010, intron 5 of 10) intron (NM_018010, intron 5 of 10) 22059 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 129.75-153 chr5 139474405 139474806 + 0.5 NA TTS (NM_001367258) TTS (NM_001367258) 3601 NM_001365197 111064649 NM_001365197 ENSG00000283288 SMIM33 - small integral membrane protein 33 protein-coding 163.5-146 chr4 101062665 101063275 + 0.5 NA intron (NM_001130692, intron 8 of 11) intron (NM_001130692, intron 8 of 11) 177902 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 176.25-108 chr5 3806828 3807259 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 211211 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 119.25-207 chr8 90271170 90271531 + 0.5 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 49862 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 142.5-120 chr2 224971077 224971629 + 0.5 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) 11074 NM_001363762 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 116.25-128 chr22 26703567 26703907 + 0.5 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) L1ME4b|LINE|L1 30894 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 124.5-83 chr17 70162180 70162511 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7057 NR_036534 400617 Hs.225661 NR_036534 ENSG00000267365 KCNJ2-AS1 - KCNJ2 antisense RNA 1 ncRNA 152-29 chr11 42729472 42729918 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -476005 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 180-94 chr4 108175982 108176554 + 0.5 NA non-coding (NR_029374, exon 3 of 3) non-coding (NR_029374, exon 3 of 3) 4148 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 152.75-141 chr7 25476906 25477459 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 185958 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 139.25-88 chr2 99831621 99832041 + 0.5 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) LTR50|LTR|ERVL 273752 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 143.5-174 chr5 120868472 120868854 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 337199 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 118-92 chr2 170570300 170570743 + 0.5 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) MIRb|SINE|MIR 144046 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 121.5-240 chr7 88513491 88513845 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -206774 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 171.5-172 chrX 86886540 86887043 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 623823 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 232.75-20 chr14 24954698 24955461 + 0.5 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 93921 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 123.75-66 chr14 81482893 81483212 + 0.5 NA intron (NM_005065, intron 19 of 20) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -32895 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 112.5-22 chr10 55997079 55997377 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 364031 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 179.25-115 chr5 11511553 11512020 + 0.5 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 77131 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 209.25-83 chr3 167472177 167472849 + 0.5 NA intron (NM_006217, intron 1 of 8) L1PA16|LINE|L1 1619 NM_006217 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 226-25 chr16 8381020 8381560 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 208548 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 119-59 chr15 81723387 81723735 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 322457 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 118.5-10 chr1 100611614 100612040 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35177 NR_038914 100128787 Hs.536050 NR_038914 LINC01349 - long intergenic non-protein coding RNA 1349 ncRNA 137.25-96 chr3 55957485 55957991 + 0.5 NA intron (NR_132749, intron 11 of 17) MER52A|LTR|ERV1 -105144 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 124-101 chr20 36303067 36303418 + 0.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -3097 NM_001365621 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 149.25-49 chr14 79445864 79446332 + 0.5 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 166718 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 114.5-201 chr5 12182651 12183048 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -278403 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 113-160 chr6 53299576 53299921 + 0.5 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) intron (NM_001242830, intron 1 of 6) 22755 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 119.25-175 chr6 76462678 76463049 + 0.5 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 130760 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 157.75-169 chr8 71619508 71620006 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -71663 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 202.75-89 chr5 59172974 59173511 + 0.5 NA intron (NM_001364602, intron 5 of 5) intron (NM_001364602, intron 5 of 5) 102873 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 114.25-80 chr18 47404979 47405397 + 0.5 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 24692 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 187.75-110 chr8 9141377 9141780 + 0.5 NA exon (NM_001201329, exon 2 of 2) exon (NM_001201329, exon 2 of 2) 9080 NM_024607 79660 Hs.458513 NM_024607 ENSG00000173281 PPP1R3B GL|PPP1R4|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3B protein-coding 144.5-106 chr2 100495789 100496296 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25560 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 120.25-2 chr1 42168127 42168505 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3571 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 154.25-178 chr9 28274035 28274620 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 444978 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 153.75-105 chr4 82048645 82049230 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 325054 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 139.5-167 chr5 16987239 16987697 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51180 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 119.75-65 chr15 39692238 39692620 + 0.5 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 90412 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 148.25-89 chr3 1840860 1841245 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -257751 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 171.5-29 chr11 111536399 111536864 + 0.5 NA intron (NM_001100388, intron 5 of 5) intron (NM_001100388, intron 5 of 5) -3649 NM_001318799 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 141.75-55 chr14 50988398 50988945 + 0.5 NA intron (NM_015163, intron 7 of 9) intron (NM_015163, intron 7 of 9) -44188 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 236.25-41 chr2 35070943 35071721 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 393775 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 121-61 chr14 60166781 60167237 + 0.5 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) L1MA2|LINE|L1 -1516 NM_001322282 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 128.25-218 chr9 34600565 34600851 + 0.5 NA Intergenic (TCTCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10568 NM_001207011 1271 Hs.129966 NM_001842 ENSG00000122756 CNTFR - ciliary neurotrophic factor receptor protein-coding 123.25-88 chr18 49143958 49144438 + 0.5 NA intron (NM_001353210, intron 14 of 16) L1MC5a|LINE|L1 -94430 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 135.75-152 chr3 192618380 192618796 + 0.5 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 103566 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 139-58 chr18 8987262 8987637 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -115250 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 116-34 chr12 42688621 42688982 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3415 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 122.25-106 chr2 231935675 231936103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9493 NM_024409 4880 Hs.247916 NM_024409 ENSG00000163273 NPPC CNP|CNP2 natriuretic peptide C protein-coding 245.5-2 chr1 50287283 50287891 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 135856 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 141.5-8 chr1 88068439 88068784 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -615533 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 130.5-4 chr1 33364610 33365024 + 0.5 NA intron (NM_198040, intron 6 of 13) intron (NM_198040, intron 6 of 13) 10776 NM_001330488 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 152.25-170 chr9 132461115 132461554 + 0.5 NA intron (NM_001282957, intron 1 of 5) intron (NM_001282957, intron 1 of 5) 51123 NM_207417 389799 Hs.201709 NM_207417 ENSG00000188523 CFAP77 C9orf171 cilia and flagella associated protein 77 protein-coding 142.75-26 chr10 78071272 78071688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 37617 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 152.25-125 chr5 22996002 22996373 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -142843 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 115-130 chr5 37952373 37952708 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 4049 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 157.25-139 chr7 48337177 48337755 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 28 of 61) intron (NM_152701, intron 28 of 61) 166008 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 118.75 chr1 30081833 30082258 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44433 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 161-36 chr14 48714093 48714625 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 872021 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 130-83 chr2 209115176 209115473 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -308723 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 167-48 chr17 15298246 15298701 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33147 NM_001281456 5376 Hs.372031 NM_000304 ENSG00000109099 PMP22 CIDP|CMT1A|CMT1E|DSS|GAS-3|GAS3|HMSNIA|HNPP|Sp110 peripheral myelin protein 22 protein-coding 128.75-183 chr7 52801581 52801939 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -233873 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 154.5-77 chr17 30867540 30867957 + 0.5 NA intron (NM_024857, intron 11 of 22) AluJb|SINE|Alu 35782 NM_024857 79915 Hs.528902 NM_024857 ENSG00000176208 ATAD5 C17orf41|ELG1|FRAG1 ATPase family AAA domain containing 5 protein-coding 142.75-9 chr1 173870607 173871084 + 0.5 NA exon (NM_001346115, exon 3 of 4) exon (NM_001346115, exon 3 of 4) -1963 NR_152521 60674 Hs.531856 NR_002578 ENSG00000234741 GAS5 NCRNA00030|SNHG2 growth arrest specific 5 ncRNA 145-150 chr7 100920644 100920939 + 0.5 NA Intergenic MER83|LTR|ERV1 -23797 NM_001367919 43 Hs.154495 NM_000665 ENSG00000087085 ACHE ACEE|ARACHE|N-ACHE|YT acetylcholinesterase (Cartwright blood group) protein-coding 169.25-90 chr4 185964260 185964670 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8093 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 181-2 chr1 54159083 54159746 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6233 NM_001353655 200008 NM_201546 ENSG00000157211 CDCP2 - CUB domain containing protein 2 protein-coding 114.25-103 chr2 152432355 152432638 + 0.5 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 97322 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 112.75-157 chr4 152101078 152101418 + 0.5 NA intron (NR_121627, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 430 NR_121627 100996286 Hs.322462 NR_121627 ENSG00000245954 LINC02273 - long intergenic non-protein coding RNA 2273 ncRNA 120.75-97 chr21 28464942 28465207 + 0.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -74244 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 141-29 chr11 36984403 36984813 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -386329 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 119-9 chr1 175307742 175308216 + 0.5 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -114992 NM_001319230 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 130-130 chr5 74168496 74168890 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 139632 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 132.75-195 chr8 139121847 139122281 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -208023 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 115.25-140 chr4 23191149 23191487 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 477229 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 130.5-190 chr4 100150372 100150791 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -39452 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 210-46 chr2 26619471 26620307 + 0.5 NA intron (NM_001029881, intron 3 of 6) HAL1|LINE|L1 21477 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 122-162 chr6 152185081 152185437 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 128 of 145) intron (NM_182961, intron 128 of 145) 119 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 135.5-189 chr7 68007968 68008426 + 0.5 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -12056 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 113.75-93 chr2 23394467 23394718 + 0.5 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 9413 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 123.5-171 chr5 126134819 126135121 + 0.5 NA Intergenic LTR1F|LTR|ERV1 -44607 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 138-14 chr10 116339050 116339433 + 0.5 NA intron (NM_198515, intron 3 of 8) MIR3|SINE|MIR 14793 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 122.25-184 chr8 59378998 59379354 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 259966 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 176.75-107 chr6 87198224 87198834 + 0.5 NA intron (NM_015021, intron 1 of 7) intron (NM_015021, intron 1 of 7) 42964 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 168.5-22 chr1 243937156 243937637 + 0.5 NA intron (NR_033883, intron 1 of 11) intron (NR_033883, intron 1 of 11) 19994 NR_033883 339529 Hs.209374 NR_033883 ENSG00000226828 LINC02774 - long intergenic non-protein coding RNA 2774 ncRNA 129.25-216 chr9 30795799 30796280 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -387585 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 138.75-198 chr8 120394442 120394767 + 0.5 NA TTS (NM_014078) TTS (NM_014078) 50546 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 129.75-186 chr8 121158964 121159377 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -347124 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 122.5-229 chr8 120694017 120694388 + 0.5 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -67051 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 138-85 chr20 16878540 16878958 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 130396 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 112.5-221 chr7 79305579 79305947 + 0.5 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) AluJo|SINE|Alu -147194 NR_038345 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 143-84 chr21 19148814 19149282 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -389236 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 136-34 chr12 67758797 67759240 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29543 NR_110063 101927901 Hs.369609 NR_110063 ENSG00000255970 LINC02421 - long intergenic non-protein coding RNA 2421 ncRNA 192.75-115 chr7 10996861 10997621 + 0.5 NA intron (NR_033436, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 23369 NM_014660 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 113-96 chr2 153521718 153521997 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -43095 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 112.5-173 chr3 115250856 115251137 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -103708 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 118.75-114 chr20 43459812 43460092 + 0.5 NA intron (NM_006275, intron 3 of 5) intron (NM_006275, intron 3 of 5) 2056 NR_034009 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 137.75-174 chr6 38547692 38547995 + 0.5 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 48224 NM_152733 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 130.75-180 chr7 65984902 65985394 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2935 NM_001293105 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 122.5-49 chr12 132410301 132410670 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79666 NM_001142641 57666 Hs.411138 NM_001142641 ENSG00000112787 FBRSL1 - fibrosin like 1 protein-coding 125.5-256 chr8 105685819 105686279 + 0.5 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 366506 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 118.25-108 chr2 172942433 172942815 + 0.5 NA intron (NM_001282901, intron 1 of 24) L2b|LINE|L2 14419 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 139-16 chr10 54329407 54329795 + 0.5 NA exon (NM_001354420, exon 7 of 34) exon (NM_001354420, exon 7 of 34) -156629 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 119.25-24 chr10 69623681 69624072 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -6371 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 114.5-188 chr4 56720335 56720680 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -38801 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 129.75-60 chr14 48100999 48101516 + 0.5 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -306243 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 114.5-36 chr10 54481848 54482247 + 0.5 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) intron (NM_001142773, intron 2 of 31) -4183 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 179.5-2 chr1 20810761 20811168 + 0.5 NA intron (NM_003760, intron 30 of 31) AluSx1|SINE|Alu -24276 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 121-56 chr13 93826368 93826732 + 0.5 NA intron (NR_046536, intron 5 of 6) intron (NR_046536, intron 5 of 6) 31923 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 120.25-40 chr11 61109874 61110340 + 0.5 NA intron (NM_014207, intron 1 of 10) intron (NM_014207, intron 1 of 10) 7618 NM_014207 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 165.25-110 chr4 122734832 122735277 + 0.5 NA intron (NM_001178007, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 2350 NM_152618 166379 Hs.400698 NM_152618 ENSG00000181004 BBS12 C4orf24 Bardet-Biedl syndrome 12 protein-coding 138.5-135 chr3 41383268 41383604 + 0.5 NA intron (NM_001322500, intron 35 of 35) intron (NM_001322500, intron 35 of 35) 183931 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 135-105 chr3 54545132 54545618 + 0.5 NA intron (NM_018398, intron 5 of 37) intron (NM_018398, intron 5 of 37) 94482 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 140.75-179 chr8 90176430 90176872 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -44837 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 144-97 chr5 25389496 25389829 + 0.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 198709 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 169.75-2 chr1 32797431 32797905 + 0.5 NA intron (NM_003680, intron 5 of 12) intron (NM_003680, intron 5 of 12) -19774 NM_001256121 64766 Hs.440880 NM_022753 ENSG00000116497 S100PBP S100PBPR S100P binding protein protein-coding 136-10 chr10 14135904 14136409 + 0.5 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 61872 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 115.75-206 chr7 138672373 138672780 + 0.5 NA intron (NM_001139456, intron 2 of 14) intron (NM_001139456, intron 2 of 14) 6469 NM_001139456 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 119.75-137 chr22 45383675 45384136 + 0.5 NA intron (NM_148674, intron 11 of 24) L1ME4b|LINE|L1 29694 NM_001291501 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 122.25-172 chr7 28982184 28982584 + 0.5 NA intron (NR_038965, intron 1 of 4) intron (NR_038965, intron 1 of 4) 2417 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 142.25-27 chr11 44510750 44511223 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54677 NM_001024844 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 124.75-71 chr14 22783588 22783955 + 0.5 NA intron (NM_001126105, intron 3 of 10) intron (NM_001126105, intron 3 of 10) 17083 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 153-21 chr11 41976344 41976713 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 108930 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 169.25-83 chr4 55092774 55093276 + 0.5 NA intron (NM_002253, intron 21 of 29) intron (NM_002253, intron 21 of 29) 32570 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 163-45 chr16 52311784 52312161 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 53408 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 117-2 chr1 31217089 31217527 + 0.5 NA intron (NM_024522, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 22579 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 140.25-140 chr4 170702288 170702639 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41272 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 122-4 chr1 52113937 52114304 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -27969 NM_007324 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 150.25-110 chr4 33157958 33158501 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 807191 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 116.25-148 chr3 133152773 133153213 + 0.5 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 28172 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 252.75-56 chr5 15676398 15677111 + 0.5 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -61752 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 123.25-121 chr20 53878995 53879426 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3501 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 169-55 chr20 56012440 56013055 + 0.5 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -7228 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 115-97 chr20 31666020 31666449 + 0.5 NA intron (NM_001191, intron 2 of 2) intron (NM_001191, intron 2 of 2) 28322 NM_032609 84701 Hs.277101 NM_032609 ENSG00000131055 COX4I2 COX4|COX4-2|COX4B|COX4L2|COXIV-2|dJ857M17.2 cytochrome c oxidase subunit 4I2 protein-coding 153-110 chr4 169241450 169241798 + 0.5 NA intron (NM_020870, intron 2 of 11) intron (NM_020870, intron 2 of 11) 29332 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 146-13 chr10 39413023 39413451 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 716641 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 132.75-120 chr22 40926757 40927127 + 0.5 NA 3' UTR (NM_022098, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_022098, exon 10 of 10) -24436 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 130.25-185 chr7 27951631 27951949 + 0.5 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 211695 NM_001362794 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 180.5-5 chr1 168403129 168403625 + 0.5 NA intron (NR_037851, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 19279 NR_037851 100505918 Hs.568494 NR_037851 LOC100505918 - uncharacterized LOC100505918 ncRNA 132.25-71 chr16 77241819 77242294 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 42648 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 131.25-162 chr5 38098656 38099027 + 0.5 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -49639 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 124.25-59 chr15 44591216 44591595 + 0.5 NA intron (NM_025137, intron 27 of 39) intron (NM_025137, intron 27 of 39) 54258 NM_003758 8669 Hs.404056 NM_003758 ENSG00000104131 EIF3J EIF3S1|eIF3-alpha|eIF3-p35 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J protein-coding 166-109 chr6 73751593 73752096 + 0.5 NA intron (NM_001159588, intron 4 of 31) LTR78|LTR|ERV1 55641 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 181.25-37 chr15 89816753 89817183 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2116 NM_001150 290 Hs.1239 NM_001150 ENSG00000166825 ANPEP APN|CD13|GP150|LAP1|P150|PEPN alanyl aminopeptidase, membrane protein-coding 145.75-70 chr2 8070617 8071011 + 0.5 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) -94000 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 155.5-212 chr9 24897127 24897702 + 0.5 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 -351517 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 124.5-11 chr1 100698827 100699314 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20570 NM_001199834 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 122.5-39 chr11 111935089 111935497 + 0.5 NA intron (NM_001278542, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR -2050 NM_001037954 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 141.5-9 chr1 115134390 115134903 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45143 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 158-116 chr5 179981220 179981832 + 0.5 NA intron (NM_001280801, intron 3 of 7) L1MC5a|LINE|L1 33871 NR_029885 442908 NR_029885 ENSG00000198995 MIR340 MIRN340|hsa-mir-340|mir-340 microRNA 340 ncRNA 134.75-101 chr19 47023793 47024297 + 0.5 NA intron (NM_002517, intron 3 of 11) AluSx3|SINE|Alu 4208 NM_002517 4861 Hs.79564 NM_002517 ENSG00000130751 NPAS1 MOP5|PASD5|bHLHe11 neuronal PAS domain protein 1 protein-coding 112.25-182 chr6 48963166 48963548 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 499896 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 131.75-21 chr10 8464596 8464961 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 129613 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 154.25-77 chr2 54721566 54722071 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3194 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 116.75-115 chr21 29762061 29762336 + 0.5 NA intron (NR_027021, intron 4 of 4) intron (NR_027021, intron 4 of 4) 14023 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 121.25-141 chr4 33914363 33914689 + 0.5 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) MER66-int|LTR|ERV1 125367 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 138.75-95 chr2 140322095 140322466 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 81 of 90) intron (NM_018557, intron 81 of 90) 264405 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 136-6 chr1 91470737 91471183 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -29887 NM_001134419 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 142-105 chr3 75218412 75218797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 4128 NR_039646 100616394 NR_039646 ENSG00000284252 MIR4444-1 MIR4444|hsa-mir-4444-1|miR-4444-1 microRNA 4444-1 ncRNA 123.25-116 chr20 2072563 2072920 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -29086 NM_080836 140901 Hs.100057 NM_080836 ENSG00000125834 STK35 CLIK1|STK35L1 serine/threonine kinase 35 protein-coding 130.75-55 chr14 51019314 51019754 + 0.5 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) intron (NM_015163, intron 3 of 9) -75051 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 156.25-68 chr2 51125265 51125715 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 92889 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 188.25-96 chr5 121927938 121928537 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33738 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 121.75-97 chr20 158141 158463 + 0.5 NA intron (NM_139074, intron 1 of 1) intron (NM_139074, intron 1 of 1) 848 NM_139074 140850 Hs.99362 NM_139074 ENSG00000088782 DEFB127 C20orf73|DEF-27|DEFB-27|DEFB27|bA530N10.2|hBD-27 defensin beta 127 protein-coding 144.75-157 chr7 52436817 52437183 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -598633 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 121-173 chr7 4305651 4306065 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -171021 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 130.5 chr1 18864466 18864826 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4985 NM_152232 80834 Hs.553548 NM_152232 ENSG00000179002 TAS1R2 GPR71|T1R2|TR2 taste 1 receptor member 2 protein-coding 202.75-14 chr10 95787267 95787932 + 0.5 NA intron (NR_038444, intron 4 of 5) L3|LINE|CR1 31436 NM_001164183 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 193-53 chr3 60174756 60175421 + 0.5 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -94179 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 137.75-208 chr8 117265458 117265938 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 130703 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 136.75-27 chr10 56630638 56630957 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -269524 NM_001005413 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 152.5-198 chrX 5130465 5131050 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -497185 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 129.5-207 chr7 6424501 6424884 + 0.5 NA intron (NM_001142936, intron 6 of 12) intron (NM_001142936, intron 6 of 12) 23262 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 198-89 chrX 41099250 41099898 + 0.5 NA intron (NM_001039591, intron 1 of 44) L1ME3|LINE|L1 14129 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 121.5-55 chr12 17983477 17983909 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106500 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 193.75-100 chr5 77558265 77558723 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66178 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 156.25-143 chr7 138859337 138859821 + 0.5 NA intron (NM_020910, intron 16 of 19) L1MEc|LINE|L1 -61383 NM_020632 50617 Hs.98967 NM_020632 ENSG00000105929 ATP6V0A4 A4|ATP6N1B|ATP6N2|RDRTA2|RTA1C|RTADR|STV1|VPH1|VPP2 ATPase H+ transporting V0 subunit a4 protein-coding 123.25-100 chr2 57393950 57394301 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -513526 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 140-100 chr22 45146494 45146935 + 0.5 NA intron (NR_038956, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 5870 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 115.5-190 chr4 74291485 74291732 + 0.5 NA intron (NM_001144978, intron 7 of 7) L2a|LINE|L2 -16862 NM_001270990 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 136.25 chr1 28372523 28372836 + 0.5 NA intron (NM_001048183, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 2939 NM_001048183 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 121.5-189 chr4 35257168 35257610 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 986550 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 116.75-195 chr8 61075288 61075672 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107732 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 143.5-55 chr13 97228497 97228897 + 0.5 NA intron (NM_144778, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 6364 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 183.75-65 chr21 19928447 19929089 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29013 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 143.5-234 chrX 122103973 122104427 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 733228 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 116.75-63 chr15 58589985 58590307 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) -91411 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 121.5-163 chr22 20407347 20407634 + 0.5 NA non-coding (NR_046282, exon 6 of 6) non-coding (NR_046282, exon 6 of 6) 13339 NM_001256525 7625 Hs.517418 NM_003426 ENSG00000185252 ZNF74 COS52|ZFP520|ZNF520|hZNF7 zinc finger protein 74 protein-coding 118-98 chr2 226344583 226344861 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 201928 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 183.75-48 chr18 53140202 53140659 + 0.5 NA intron (NM_005215, intron 7 of 28) intron (NM_005215, intron 7 of 28) -96671 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 170.5-129 chr4 10905732 10906269 + 0.5 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -221232 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 132.5-40 chr11 65751359 65751800 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 29397 NM_138368 91056 Hs.591957 NM_138368 ENSG00000254470 AP5B1 AP-5|PP1030 adaptor related protein complex 5 subunit beta 1 protein-coding 136.75-57 chr14 58186647 58187054 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13299 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 121-131 chr3 99870528 99870836 + 0.5 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) intron (NM_001042459, intron 4 of 4) 5491 NM_001370247 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 160.25-25 chr12 55621052 55621584 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15574 NM_206899 121130 Hs.554551 NM_206899 ENSG00000175398 OR10P1 OR10P1P|OR10P2P|OR10P3P|OR12-7|OST701 olfactory receptor family 10 subfamily P member 1 protein-coding 124.25-33 chr11 82843193 82843662 + 0.5 NA intron (NM_199418, intron 7 of 9) MADE2|DNA|TcMar-Mariner 57003 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 122-63 chr15 51639637 51640105 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -17100 NM_001174117 23312 Hs.511386 NM_015263 ENSG00000104093 DMXL2 DFNA71|PEPNS|RC3 Dmx like 2 protein-coding 126.5-136 chr20 52186915 52187323 + 0.5 NA intron (NM_199427, intron 1 of 8) intron (NM_199427, intron 1 of 8) 4660 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 135-64 chr18 10039168 10039698 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 125417 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 116.75-71 chr17 43812363 43812687 + 0.5 NA intron (NM_001932, intron 16 of 19) L2c|LINE|L2 20669 NR_148342 4356 Hs.396566 NM_001932 ENSG00000161647 MPP3 DLG3 membrane palmitoylated protein 3 protein-coding 163.5-79 chr18 57638739 57639118 + 0.5 NA intron (NM_001242804, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 8597 NM_001242804 100505549 Hs.660645 NM_001242804 LOC100505549 - uncharacterized LOC100505549 protein-coding 116-60 chr16 51913683 51913935 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 151290 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 198-48 chr3 5487919 5488445 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -237927 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 159.5-86 chr18 63029554 63029921 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 289643 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 175.5-60 chr15 64488169 64488767 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10952 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 164-107 chr5 129946777 129947303 + 0.5 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 42575 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 209.25-54 chr2 43209096 43209699 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17209 NM_006887 678 Hs.503093 NM_006887 ENSG00000152518 ZFP36L2 BRF2|ERF-2|ERF2|RNF162C|TIS11D ZFP36 ring finger protein like 2 protein-coding 125.25-4 chr1 54345283 54345618 + 0.5 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) intron (NM_001009955, intron 4 of 16) 60944 NM_001009955 23648 Hs.476706 NM_018070 ENSG00000157216 SSBP3 CSDP|SSDP|SSDP1 single stranded DNA binding protein 3 protein-coding 118.25-58 chr13 100130183 100130481 + 0.5 NA intron (NR_148031, intron 4 of 22) intron (NR_148031, intron 4 of 22) 41239 NM_000282 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 113.75-82 chr17 64540926 64541222 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 34097 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 127.75-194 chr7 134374642 134374953 + 0.5 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -57867 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 152.75-64 chr15 83057787 83058151 + 0.5 NA intron (NM_001011885, intron 1 of 6) intron (NM_001011885, intron 1 of 6) 9283 NM_025238 53339 Hs.459149 NM_025238 ENSG00000064726 BTBD1 C15orf1|NS5ATP8 BTB domain containing 1 protein-coding 249.5-19 chr11 76907949 76908877 + 0.5 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) L1PA7|LINE|L1 47495 NM_001300955 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 188.5-138 chr7 24647540 24648041 + 0.5 NA intron (NM_016447, intron 4 of 12) L1MC5a|LINE|L1 74338 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 145.5-58 chr14 35240388 35240890 + 0.5 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) intron (NM_014672, intron 5 of 7) -37919 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 125.25-183 chr7 4293081 4293544 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -158475 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 119.25-171 chr6 8856017 8856400 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 203999 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 170.75-17 chr10 99727567 99728136 + 0.5 NA intron (NM_004376, intron 2 of 8) intron (NM_004376, intron 2 of 8) -4383 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 142.25-76 chr18 5437262 5437763 + 0.5 NA intron (NM_001281535, intron 8 of 21) intron (NM_001281535, intron 8 of 21) 103044 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 114-18 chr10 65118952 65119405 + 0.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -194660 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 176.75-134 chr9 75386832 75387431 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 298617 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 159-87 chr5 51920713 51921122 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87114 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 145-57 chr17 7816937 7817390 + 0.5 NA intron (NM_020877, intron 64 of 85) intron (NM_020877, intron 64 of 85) -22743 NM_001348716 23135 Hs.223678 NM_001080424 ENSG00000132510 KDM6B JMJD3 lysine demethylase 6B protein-coding 161.75-7 chr1 158008884 158009485 + 0.5 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) intron (NM_001286349, intron 1 of 12) 15539 NM_018240 55243 Hs.272234 NM_018240 ENSG00000183853 KIRREL1 KIRREL|NEPH1 kirre like nephrin family adhesion molecule 1 protein-coding 190.5-40 chr13 59521403 59521969 + 0.5 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -491032 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-117 chr20 49487094 49487442 + 0.5 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -4600 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 188.5-67 chr2 47739082 47739793 + 0.5 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -43645 NM_001281493 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 128-156 chr7 100211930 100212393 + 0.5 NA intron (NR_028038, intron 6 of 6) intron (NR_028038, intron 6 of 6) -7087 NM_024070 79037 Hs.729356 NM_024070 ENSG00000213413 PVRIG C7orf15|CD112R PVR related immunoglobulin domain containing protein-coding 124.75-28 chr10 65011487 65011897 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -87174 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 122.25-66 chr15 75129096 75129486 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -72591 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 119.25-144 chr4 57094527 57094793 + 0.5 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) intron (NM_001553, intron 1 of 4) -15102 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 125-58 chr17 61797728 61798111 + 0.5 NA intron (NM_032043, intron 9 of 19) L1ME4b|LINE|L1 65640 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 117.75-75 chr16 35369667 35370034 + 0.5 NA intron (NR_027079, intron 1 of 8) BSR/Beta|Satellite|Satellite 6319 NR_027079 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 204-12 chr13 35260432 35261139 + 0.5 NA intron (NM_015678, intron 34 of 57) L1ME1|LINE|L1 215904 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 156-154 chr8 100770365 100770794 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48491 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 118-174 chr7 91385639 91385995 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 121384 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 141-139 chr6 102506481 102506933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1107722 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 242-25 chr18 109146 109878 + 0.5 NA intron (NR_033770, intron 1 of 4) BSR/Beta|Satellite|Satellite 447 NR_033770 727758 Hs.585843 NR_033770 ENSG00000263006 ROCK1P1 ROCK1P Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 pseudogene 1 pseudo 131.25-6 chr1 63705586 63706061 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -68194 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 173.5-6 chr1 111500638 111501093 + 0.5 NA intron (NM_001302678, intron 1 of 1) intron (NM_001302678, intron 1 of 1) 2768 NM_001302678 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 130.75-127 chr3 185585593 185585986 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_021627) promoter-TSS (NM_021627) -506 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 116.25-51 chr12 69772230 69772564 + 0.5 NA intron (NR_103519, intron 3 of 8) L1MA6|LINE|L1 -6555 NM_001024647 117177 Hs.258209 NM_022456 ENSG00000127328 RAB3IP RABIN3|RABIN8 RAB3A interacting protein protein-coding 229.25-44 chr2 99267364 99268115 + 0.5 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -12632 NM_175735 254773 Hs.436468 NM_175735 ENSG00000185674 LYG2 LYGH|LYSG2 lysozyme g2 protein-coding 113.75-177 chr7 55812165 55812556 + 0.5 NA intron (NM_207366, intron 7 of 9) L1MA7|LINE|L1 50392 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 119.25-7 chr1 71446551 71446953 + 0.5 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) L1ME3A|LINE|L1 365428 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 136-51 chr16 78055924 78056370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 33599 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 120.25-216 chr8 119686210 119686574 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -13002 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 112.25-50 chr13 29434982 29435206 + 0.5 NA intron (NM_015233, intron 1 of 8) intron (NM_015233, intron 1 of 8) 6434 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 126.5-32 chr11 13829641 13830135 + 0.5 NA intron (NR_149108, intron 3 of 3) intron (NR_149108, intron 3 of 3) 40728 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 199-44 chr20 38073373 38074074 + 0.5 NA intron (NM_021215, intron 6 of 6) intron (NM_021215, intron 6 of 6) 39977 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 157.25-15 chr10 66294246 66294710 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -631558 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 125.5-102 chr16 73795265 73795625 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 408640 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 184.25-92 chr4 72923925 72924479 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 145514 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 138.25-164 chr7 67925188 67925700 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -94809 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 152.75-136 chr6 39307894 39308456 + 0.5 NA intron (NM_001135111, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 6244 NM_001135111 89822 Hs.162282 NM_031460 ENSG00000124780 KCNK17 K2p17.1|TALK-2|TALK2|TASK-4|TASK4 potassium two pore domain channel subfamily K member 17 protein-coding 125-7 chr1 87758741 87759182 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -387306 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 133.5-17 chr1 212757152 212757429 + 0.5 NA intron (NM_015471, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 34487 NM_001297737 25936 Hs.497692 NM_015471 ENSG00000117697 NSL1 C1orf48|DC8|MIS14 NSL1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 127.75-85 chr18 9581365 9581703 + 0.5 NA intron (NR_052003, intron 8 of 19) L1M4b|LINE|L1 33025 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 153.5-166 chr5 162315401 162315769 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 247943 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 125.25-163 chr5 150719941 150720405 + 0.5 NA intron (NM_001135643, intron 10 of 13) MIR|SINE|MIR -19111 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 206.75-34 chr2 51441606 51442099 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 409251 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 151-72 chr22 23028768 23029328 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -41471 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 116.5-184 chr4 154999048 154999358 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -209433 NM_001370180 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 147-65 chr2 8347685 8348257 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19552 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 128.5-66 chr14 90756101 90756424 + 0.5 NA intron (NM_001320421, intron 3 of 20) intron (NM_001320421, intron 3 of 20) 58929 NR_135190 105370622 Hs.662373 NR_135190 ENSG00000258716 LOC105370622 - uncharacterized LOC105370622 ncRNA 133.75-211 chrX 76103446 76103892 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -69260 NM_001300888 51260 Hs.370100 NM_016500 ENSG00000102390 PBDC1 CXorf26 polysaccharide biosynthesis domain containing 1 protein-coding 128.5-32 chr10 95213623 95214008 + 0.5 NA intron (NM_207321, intron 7 of 10) intron (NM_207321, intron 7 of 10) 19615 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 115-106 chr3 64195659 64195927 + 0.5 NA intron (NR_046702, intron 3 of 3) intron (NR_046702, intron 3 of 3) 8249 NR_046702 100874243 Hs.670840 NR_046702 ENSG00000226017 PRICKLE2-AS3 - PRICKLE2 antisense RNA 3 ncRNA 148.5-46 chr12 82411692 82411994 + 0.5 NA intron (NR_144941, intron 6 of 11) intron (NR_144941, intron 6 of 11) -53038 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 126.75-19 chr10 50474388 50474704 + 0.5 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) intron (NM_147156, intron 3 of 10) 149410 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 117.75-47 chr12 112022734 112023021 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001034025, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001034025, exon 2 of 2) 9451 NM_006817 10961 Hs.75841 NM_006817 ENSG00000089248 ERP29 C12orf8|ERp28|ERp31|HEL-S-107|PDI-DB|PDIA9 endoplasmic reticulum protein 29 protein-coding 114.5-200 chr4 188610378 188610786 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 155004 NR_033869 401164 Hs.435756 NR_033869 ENSG00000249378 LINC01060 - long intergenic non-protein coding RNA 1060 ncRNA 135.5-132 chr3 45404248 45404638 + 0.5 NA intron (NM_001368263, intron 3 of 20) intron (NM_001368263, intron 3 of 20) 15867 NM_001368263 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 113-137 chr4 115968276 115968643 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -331266 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 150.5-84 chr2 10876384 10876833 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -1659 NR_110575 101929733 Hs.736697 NR_110575 ENSG00000271952 LINC01954 - long intergenic non-protein coding RNA 1954 ncRNA 204.5-23 chr12 33627535 33628209 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -188053 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 143.25-181 chr8 83363499 83363974 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -40022 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 121-64 chr14 63470847 63471168 + 0.5 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 37231 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 142.25-30 chr11 85944464 85944850 + 0.5 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 89556 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 199.25-93 chr8 21598242 21598843 + 0.5 NA Intergenic LSU-rRNA_Hsa|rRNA|rRNA 190333 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 123-35 chr11 132002378 132002693 + 0.5 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) intron (NR_147849, intron 2 of 6) 91717 NR_147851 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 142.5-77 chr15 97784667 97785090 + 0.5 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) intron (NR_024172, intron 1 of 2) 89551 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 149-21 chr12 13863957 13864464 + 0.5 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 116146 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 139.25-113 chr22 40009766 40010146 + 0.5 NA intron (NM_138435, intron 1 of 4) intron (NM_138435, intron 1 of 4) 15002 NM_138435 113828 Hs.26192 NM_138435 ENSG00000133477 FAM83F - family with sequence similarity 83 member F protein-coding 148.5-115 chr2 177530563 177531032 + 0.5 NA intron (NM_003659, intron 19 of 19) intron (NM_003659, intron 19 of 19) 21999 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 151.75-104 chr4 109260918 109261434 + 0.5 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 41482 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 143.25-79 chr19 40208856 40209387 + 0.5 NA exon (NM_002446, exon 6 of 10) exon (NM_002446, exon 6 of 10) 9278 NM_152479 148014 Hs.631572 NM_152479 ENSG00000174521 TTC9B - tetratricopeptide repeat domain 9B protein-coding 116.75-155 chr4 167263817 167264156 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29396 NM_001204355 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 125.25-147 chr4 81171482 81171866 + 0.5 NA intron (NM_006259, intron 4 of 18) intron (NM_006259, intron 4 of 18) 6734 NR_125908 101928942 Hs.664002 NR_125908 ENSG00000251059 LOC101928942 - uncharacterized LOC101928942 ncRNA 113.25-148 chr6 64369830 64370251 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) L1PA15|LINE|L1 563204 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 136-30 chr12 9009439 9009775 + 0.5 NA non-coding (NR_137428, exon 4 of 4) non-coding (NR_137428, exon 4 of 4) 19982 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 121-197 chr9 3911466 3911930 + 0.5 NA intron (NM_001042413, intron 6 of 10) MIR|SINE|MIR 13052 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 114.5-7 chr1 60546210 60546563 + 0.5 NA intron (NR_146508, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 76299 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 134.25-114 chr3 79777766 79778098 + 0.5 NA Intergenic HERVE_a-int|LTR|ERV1 -9934 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 166.75-21 chr11 31655210 31655817 + 0.5 NA intron (NM_019040, intron 9 of 9) intron (NM_019040, intron 9 of 9) 145148 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 191.25-68 chr3 69774418 69774965 + 0.5 NA intron (NM_006722, intron 1 of 9) intron (NM_006722, intron 1 of 9) 10880 NM_006722 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 127.75-163 chr5 133510199 133510641 + 0.5 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -82714 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 127-13 chr10 14735079 14735516 + 0.5 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) MER30|DNA|hAT-Charlie 39600 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 122.75-62 chr17 20275262 20275592 + 0.5 NA intron (NM_001033553, intron 12 of 14) intron (NM_001033553, intron 12 of 14) -45747 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 159.5-5 chr1 111309416 111309823 + 0.5 NA intron (NM_021797, intron 1 of 8) intron (NM_021797, intron 1 of 8) 18768 NM_001258003 27159 Hs.128814 NM_021797 ENSG00000134216 CHIA AMCASE|CHIT2|TSA1902 chitinase acidic protein-coding 112.5-143 chr2 233073006 233073281 + 0.5 NA intron (NM_001017915, intron 1 of 26).2 intron (NM_001017915, intron 1 of 26).2 12801 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 129.75-4 chr1 48672895 48673262 + 0.5 NA intron (NM_001323575, intron 6 of 12) intron (NM_001323575, intron 6 of 12) 103813 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 121-54 chr13 50643948 50644240 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -116645 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 138.25-68 chr17 82536891 82537191 + 0.5 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) intron (NM_004514, intron 1 of 8) 17309 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 151-93 chr3 190445056 190445608 + 0.5 NA intron (NM_207316, intron 2 of 4) intron (NM_207316, intron 2 of 4) 4544 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 148.25-90 chr3 18476888 18477407 + 0.5 NA intron (NR_125803, intron 4 of 6) L1MEd|LINE|L1 -31555 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 119.25-191 chr7 55890820 55891203 + 0.5 NA intron (NM_182633, intron 1 of 6) AluSx|SINE|Alu 3555 NM_001366796 349075 Hs.660834 NM_182633 ENSG00000178665 ZNF713 - zinc finger protein 713 protein-coding 123.75-92 chr2 62345863 62346243 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 130532 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 157.25-51 chr16 50442247 50442751 + 0.5 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -47366 NR_146572 105371248 NR_146572 ENSG00000261092 LINC02178 - long intergenic non-protein coding RNA 2178 ncRNA 143-66 chr19 43925813 43926188 + 0.5 NA intron (NM_003425, intron 3 of 9) intron (NM_003425, intron 3 of 9) 9282 NM_003425 7596 Hs.381285 NM_003425 ENSG00000124459 ZNF45 KOX5|ZNF13 zinc finger protein 45 protein-coding 163.25-105 chr3 196736635 196737198 + 0.5 NA TTS (NM_001166304) TTS (NM_001166304) -2941 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 123.25-48 chr12 130191931 130192292 + 0.5 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 29652 NM_007197 11211 Hs.31664 NM_007197 ENSG00000111432 FZD10 CD350|FZ-10|Fz10|FzE7|hFz10 frizzled class receptor 10 protein-coding 154.25-130 chr5 56934577 56935140 + 0.5 NA intron (NM_001297598, intron 7 of 12) intron (NM_001297598, intron 7 of 12) 17272 NM_152622 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 126.25-224 chr9 106283883 106284372 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -316801 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 136.75-204 chr9 76384968 76385461 + 0.5 NA TTS (NM_018339) TTS (NM_018339) 9212 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 125.25-194 chr7 72095461 72095793 + 0.5 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) intron (NM_001363460, intron 3 of 5) 241764 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 193.5-13 chr1 222856017 222856480 + 0.5 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) intron (NM_032890, intron 1 of 9) 41209 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 126-154 chr6 46612625 46613011 + 0.5 NA intron (NM_016593, intron 7 of 11) intron (NM_016593, intron 7 of 11) 40000 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 159.5-194 chr7 30767799 30768231 + 0.5 NA intron (NR_037598, intron 3 of 19) MER6A|DNA|TcMar-Tigger -3402 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 115-19 chr10 57468018 57468415 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -163657 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 151.25-59 chr15 64335248 64335732 + 0.5 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) intron (NM_001329606, intron 1 of 11) 20683 NM_001329605 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 208.25-61 chr3 100431253 100431810 + 0.5 NA intron (NM_001085451, intron 2 of 3) intron (NM_001085451, intron 2 of 3) 29992 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 117.25-190 chr6 134844422 134844683 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 105549 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 163.25-118 chr5 103214667 103215174 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -43843 NM_033211 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 127.5-3 chr1 19696071 19696479 + 0.5 NA intron (NM_001349112, intron 13 of 14) AluJo|SINE|Alu 31400 NM_000871 3362 Hs.22180 NM_000871 ENSG00000158748 HTR6 5-HT6|5-HT6R 5-hydroxytryptamine receptor 6 protein-coding 145.5-91 chr2 24354453 24354935 + 0.5 NA intron (NM_001348182, intron 1 of 38) MIR|SINE|MIR 5842 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 143-34 chr14 43931699 43932191 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 575338 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 132.75-70 chr15 72592633 72593020 + 0.5 NA 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 5609 NR_030359 693215 NR_030359 ENSG00000283798 MIR630 MIRN630|hsa-mir-630 microRNA 630 ncRNA 180-18 chr12 2293581 2294072 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 L2a|LINE|L2 24050 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 127.75-137 chr3 182557609 182557948 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -50654 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 162-63 chr2 85003527 85003948 + 0.5 NA intron (NM_020122, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 32576 NM_020122 56888 Hs.654968 NM_020122 ENSG00000176407 KCMF1 DEBT91|FIGC|PCMF|ZZZ1 potassium channel modulatory factor 1 protein-coding 115.5-101 chr18 63214187 63214556 + 0.5 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) intron (NM_000633, intron 2 of 2) 105009 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 114.25-99 chr2 115761022 115761430 + 0.5 NA intron (NM_001321907, intron 10 of 23) AluJr|SINE|Alu 417411 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 140.5-148 chr3 41433123 41433425 + 0.5 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) L1ME3G|LINE|L1 233769 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 119.75-213 chrX 17014682 17015046 + 0.5 NA intron (NM_001080975, intron 2 of 17) MIR3|SINE|MIR 68206 NM_001080975 9185 Hs.186810 NM_004726 ENSG00000169891 REPS2 POB1 RALBP1 associated Eps domain containing 2 protein-coding 120-106 chr21 43727150 43727573 + 0.5 NA intron (NM_003681, intron 1 of 10) intron (NM_003681, intron 1 of 10) 8232 NM_003681 8566 Hs.284491 NM_003681 ENSG00000160209 PDXK C21orf124|C21orf97|HEL-S-1a|PKH|PNK|PRED79 pyridoxal kinase protein-coding 160.75-29 chr12 28219216 28219785 + 0.5 NA intron (NM_001352080, intron 2 of 13) AluY|SINE|Alu -28762 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 186.25-56 chr2 208579863 208580454 + 0.5 NA intron (NR_136588, intron 2 of 5) intron (NR_136588, intron 2 of 5) 37516 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 143.5-136 chr22 16940796 16941187 + 0.5 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 67231 NR_159481 128954 Hs.434113 NM_001037814 ENSG00000215568 GAB4 - GRB2 associated binding protein family member 4 protein-coding 119.75-107 chr2 106908764 106909141 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21843 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 177.25-17 chr10 78649429 78649927 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 382336 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 149.5-198 chr8 30462386 30462727 + 0.5 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu -77155 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 203-83 chr5 79668360 79668808 + 0.5 NA intron (NM_001349553, intron 13 of 16) intron (NM_001349553, intron 13 of 16) -21252 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 177.75-21 chr11 26874520 26875097 + 0.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -119304 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 187.25-63 chr20 54357561 54358174 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -117726 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 172.25-6 chr1 113766061 113766722 + 0.5 NA exon (NM_018364, exon 7 of 7) exon (NM_018364, exon 7 of 7) -6503 NM_001323042 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 149.25-99 chr20 40463138 40463608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 225863 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 138.75-69 chr16 87011227 87011658 + 0.5 NA Intergenic MER99|DNA|hAT? -46342 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 137.5-59 chr13 96756328 96756701 + 0.5 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 227658 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 119.5-90 chr16 9843436 9843751 + 0.5 NA intron (NM_001134408, intron 5 of 13) intron (NM_001134408, intron 5 of 13) 338474 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 147.5-197 chr7 52456137 52456658 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -579236 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 142.25-87 chr2 57536435 57536852 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -371008 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 128.5-239 chr9 86736886 86737308 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 210409 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 112.75-51 chr13 107692497 107692872 + 0.5 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 142774 NR_046848 100874375 Hs.653972 NR_046848 FAM155A-IT1 - FAM155A intronic transcript 1 ncRNA 150.75-65 chr15 59745147 59745550 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -56028 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 192.25-105 chr8 121938710 121939219 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -297524 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 139.75-19 chr10 97736502 97736879 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001002262) promoter-TSS (NM_001002262) -431 NM_001174122 118813 Hs.744075 NM_144588 ENSG00000155256 ZFYVE27 PROTRUDIN|SPG33 zinc finger FYVE-type containing 27 protein-coding 165.75-98 chr20 40844367 40844839 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -129980 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 134.25-153 chr5 177354261 177354592 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2758 NM_006816 10960 Hs.75864 NM_006816 ENSG00000169223 LMAN2 C5orf8|GP36B|VIP36 lectin, mannose binding 2 protein-coding 122.25-212 chr9 136994362 136994750 + 0.5 NA TTS (NM_001329678) TTS (NM_001329678) 2012 NM_004669 9022 Hs.64746 NM_004669 ENSG00000169583 CLIC3 - chloride intracellular channel 3 protein-coding 183.25-53 chr2 40115084 40115514 + 0.5 NA exon (NM_001112802, exon 8 of 8) exon (NM_001112802, exon 8 of 8) 197665 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-79 chr2 24268307 24268612 + 0.5 NA intron (NM_001348182, intron 19 of 38) intron (NM_001348182, intron 19 of 38) 92077 NM_001348186 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 148.5-250 chrX 77865277 77865827 + 0.5 NA intron (NM_032121, intron 3 of 9) AluY|SINE|Alu 29883 NM_001367916 84061 Hs.323562 NM_032121 ENSG00000102158 MAGT1 IAP|MRX95|OST3B|PRO0756|SLC58A1|XMEN|bA217H1.1 magnesium transporter 1 protein-coding 160.5-144 chr5 8778366 8778978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61060 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 133-23 chr11 80985717 80986071 + 0.5 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -223091 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 127.25-98 chr2 192341792 192342112 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -147019 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 257.5-82 chr9 115971150 115971876 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -46306 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 157.5-182 chr6 150726001 150726530 + 0.5 NA intron (NM_001329803, intron 1 of 13) L1MA10|LINE|L1 5166 NM_001329806 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 142.5-185 chr6 51257227 51257740 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -364387 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 137.75-83 chr17 28479116 28479520 + 0.5 NA intron (NM_001145975, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 5674 NM_003984 9058 Hs.102307 NM_003984 ENSG00000007216 SLC13A2 NADC1|NaCT|NaDC-1|SDCT1 solute carrier family 13 member 2 protein-coding 189-17 chr10 59091590 59092182 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 84578 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 131.5-51 chr13 61731688 61732026 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 297691 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 112.25-99 chr2 116505944 116506335 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1162324 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 113.25-25 chr11 55177704 55178065 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -84271 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 138-113 chr4 34310437 34310865 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -40904 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 137.5-85 chr16 62275703 62276093 + 0.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -239460 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 131.75-85 chr16 66708111 66708410 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11517 NM_181521 146223 Hs.643961 NM_178818 ENSG00000183723 CMTM4 CKLFSF4 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4 protein-coding 186.25-15 chr11 45514735 45515271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 143606 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 146.5-98 chr2 18406159 18406664 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 154242 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 129.75-74 chr16 90031765 90032072 + 0.5 NA intron (NM_001286205, intron 3 of 10) intron (NM_001286205, intron 3 of 10) -2017 NR_122031 750 Hs.633032 NM_001214 ENSG00000221819 GAS8-AS1 C16orf3 GAS8 antisense RNA 1 ncRNA 207.75-12 chr1 236813568 236814334 + 0.5 NA intron (NM_000254, intron 6 of 32) intron (NM_000254, intron 6 of 32) 18659 NM_001291940 4548 Hs.498187 NM_000254 ENSG00000116984 MTR HMAG|MS|cblG 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase protein-coding 198.75-54 chr20 31364289 31365071 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -3921 NM_054112 117285 Hs.274124 NM_054112 ENSG00000131068 DEFB118 C20orf63|DEFB-18|ESC42|ESP13.6 defensin beta 118 protein-coding 134.5-53 chr13 84889961 84890485 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106569 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 144.5-112 chr2 141730869 141731245 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 400644 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 120-169 chr7 8426595 8426955 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6834 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 142.75-93 chr2 31997187 31997635 + 0.5 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) AluSx|SINE|Alu 13253 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 121.25-81 chr17 56169504 56169872 + 0.5 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 16213 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 119.5-96 chr17 20066179 20066573 + 0.5 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) intron (NM_001243439, intron 1 of 14) -20646 NM_152904 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 123.25-89 chr18 68883890 68884265 + 0.5 NA intron (NM_001093729, intron 7 of 9) L1MA9|LINE|L1 85997 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 200.5-88 chr3 71732518 71733232 + 0.5 NA intron (NM_173359, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR -3757 NM_001134650 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 162.5-168 chr8 39947970 39948560 + 0.5 NA intron (NM_194294, intron 1 of 10) intron (NM_194294, intron 1 of 10) 13310 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 195.25-73 chr5 68988563 68988978 + 0.5 NA intron (NR_130778, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 41157 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 172.25-30 chr12 21343545 21344130 + 0.5 NA intron (NM_134431, intron 2 of 15) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -8920 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 121.25-13 chr1 241934078 241934384 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23536 NM_001290693 441925 Hs.731347 NM_001290693 ENSG00000196289 BECN2 BECN1L1|BECN1P1 beclin 2 protein-coding 185.5-89 chr2 220327972 220328505 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -421673 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 125-35 chr12 60835436 60835831 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1146263 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 116-21 chr10 118832944 118833351 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -78177 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 114.25-4 chr1 76241955 76242233 + 0.5 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 167348 NM_001160011 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 115.5-208 chr5 167776940 167777222 + 0.5 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 22152 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 147.75-81 chr2 189589546 189590112 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -9018 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 112.25-149 chr4 41494945 41495307 + 0.5 NA intron (NM_001289122, intron 2 of 25) intron (NM_001289122, intron 2 of 25) -43031 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 286-6 chr11 36350906 36351500 + 0.5 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) intron (NM_001160167, intron 1 of 8) -24782 NM_024841 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 143.5-179 chr5 160848132 160848564 + 0.5 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) MIRb|SINE|MIR 3863 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 117.5-176 chr5 43005130 43005505 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11984 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 146.75-134 chr5 152302085 152302567 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 102953 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 131.25-47 chr13 45085041 45085381 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21068 NR_120424 101929259 Hs.638490 NR_120424 LOC101929259 - uncharacterized LOC101929259 ncRNA 130.25-162 chr5 96315001 96315374 + 0.5 NA intron (NR_130776, intron 2 of 4) intron (NR_130776, intron 2 of 4) 116972 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 119-123 chr3 119952673 119952956 + 0.5 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) L1M4a1|LINE|L1 131834 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 142.5-236 chr9 12250377 12250838 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -442778 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 130.25-173 chr6 59013417 59013809 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1052167 NR_003660 106660613 Hs.561539 NR_003660 ENSG00000283352 LINC00680-GUSBP4 - LINC00680-GUSBP4 readthrough pseudo 119-39 chr12 49226365 49226822 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -1333 NM_001303114 84790 Hs.652390 NM_032704 ENSG00000167553 TUBA1C TUBA6|bcm948 tubulin alpha 1c protein-coding 112.5-210 chr6 62430354 62430674 + 0.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -144287 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 121.5-220 chr6 45125248 45125552 + 0.5 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 72370 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 115-189 chr8 140849038 140849473 + 0.5 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -116602 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 114.75-107 chr20 49464151 49464522 + 0.5 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 18332 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 121.25-119 chr21 28990691 28990991 + 0.5 NA intron (NM_015565, intron 1 of 29) L1MC4|LINE|L1 2036 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 134.5-40 chr11 65355703 65356145 + 0.5 NA exon (NM_145719, exon 2 of 2) exon (NM_145719, exon 2 of 2) 1173 NM_145719 220359 Hs.632121 NM_145719 ENSG00000173825 TIGD3 - tigger transposable element derived 3 protein-coding 113-73 chr17 39732947 39733239 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2530 NM_001330206 84299 Hs.333526 NM_032339 ENSG00000141741 MIEN1 C17orf37|C35|ORB3|RDX12|XTP4 migration and invasion enhancer 1 protein-coding 118.75-65 chr14 77798863 77799230 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -1063 NR_158988 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 119.5-148 chr3 26982008 26982324 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 234357 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 174.5-10 chr1 153477976 153478667 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17670 NM_002963 6278 Hs.112408 NM_002963 ENSG00000143556 S100A7 PSOR1|S100A7c S100 calcium binding protein A7 protein-coding 224-51 chr6 130741583 130742364 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -85432 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 113-84 chr2 6978356 6978697 + 0.5 NA intron (NM_001349186, intron 2 of 7) intron (NM_001349186, intron 2 of 7) 45442 NM_001349183 9781 Hs.22146 NM_014746 ENSG00000151692 RNF144A RNF144|UBCE7IP4|hUIP4 ring finger protein 144A protein-coding 117.75-212 chr8 109426604 109426993 + 0.5 NA intron (NM_177531, intron 24 of 77) AluSx|SINE|Alu 64337 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 129.25-87 chr2 31125404 31125792 + 0.5 NA intron (NM_001329096, intron 1 of 16) intron (NM_001329096, intron 1 of 16) 4042 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 142.25-37 chr12 12135772 12136267 + 0.5 NA intron (NM_002336, intron 16 of 22).2 AluSx|SINE|Alu 24067 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 140.25-148 chr5 42289019 42289501 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -113915 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 128.75-193 chr7 146545023 146545411 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -229054 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 127.75-52 chr12 1954650 1955098 + 0.5 NA intron (NR_135060, intron 7 of 10) AluJr4|SINE|Alu -18298 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 154.25-126 chr5 44729253 44729718 + 0.5 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 79308 NR_109865 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 114.5-279 chr9 92973682 92974056 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_033086) promoter-TSS (NM_033086) -567 NM_033086 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 126.5-64 chr14 56182988 56183358 + 0.5 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 64762 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 116.75-187 chr7 89234924 89235188 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -439319 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 143.25-52 chr14 92588878 92589386 + 0.5 NA intron (NM_024832, intron 3 of 9) intron (NM_024832, intron 3 of 9) 12898 NM_001319987 79890 Hs.326822 NM_024832 ENSG00000100599 RIN3 - Ras and Rab interactor 3 protein-coding 138-155 chr7 67919583 67919968 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -100478 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 115.5-36 chr12 22709723 22710090 + 0.5 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 84735 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 132.75-100 chr2 111167378 111167643 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001204112, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001204112, exon 5 of 5) 46596 NM_138622 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 134-37 chr12 12318894 12319263 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31164 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 156.75-84 chr2 75539548 75540074 + 0.5 NA intron (NM_001369524, intron 2 of 5) intron (NM_001369524, intron 2 of 5) 15743 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 241.25-59 chr6 12560907 12561560 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 24171 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 123.5-159 chr5 29972213 29972575 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 91834 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 130.5-28 chr1 235389332 235389820 + 0.5 NA intron (NM_001287802, intron 2 of 15) AluSq2|SINE|Alu 22149 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 131.5-166 chr3 171642739 171643032 + 0.5 NA exon (NM_001130081, exon 22 of 26) exon (NM_001130081, exon 22 of 26) 167598 NM_001130081 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 128.5-30 chr10 77423734 77424034 + 0.5 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 73012 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 188.5-30 chr12 119578191 119578596 + 0.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -15381 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 165.75-32 chr11 105056470 105056937 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11368 NM_001017534 114769 Hs.348365 NM_052889 ENSG00000204397 CARD16 COP|COP1|PSEUDO-ICE caspase recruitment domain family member 16 protein-coding 171-45 chr15 76325210 76325869 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -11234 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 114.25-154 chr5 117815440 117815815 + 0.5 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu 85266 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 117.5-204 chr6 42049284 42049700 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001136017) promoter-TSS (NM_001136017) -598 NM_001136126 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 122.75-80 chr18 66357839 66358257 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 246042 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 127.25-121 chr3 62278017 62278480 + 0.5 NA intron (NM_002841, intron 26 of 29) intron (NM_002841, intron 26 of 29) 40699 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 115.25-72 chr16 35505693 35506079 + 0.5 NA non-coding (NR_034018, exon 2 of 3) non-coding (NR_034018, exon 2 of 3) 1284 NR_034019 100130700 Hs.97712 NR_034018 TP53TG3HP - TP53 target 3 family member H, pseudogene pseudo 136.75-116 chr20 37003102 37003576 + 0.5 NA TTS (NM_183404) TTS (NM_183404) -51496 NM_015474 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 139-138 chr7 33474152 33474659 + 0.5 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 344841 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 125.75-64 chr16 35634555 35634888 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -111831 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 128.75-147 chr4 152066416 152066890 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34100 NR_121628 100996286 Hs.322462 NR_121627 ENSG00000245954 LINC02273 - long intergenic non-protein coding RNA 2273 ncRNA 129.75-59 chr14 44421248 44421747 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 85786 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 121.25-55 chr14 43046434 43046860 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 1439791 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 126-133 chr5 15589302 15589584 + 0.5 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 25559 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 141-80 chr2 128843842 128844328 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -20515 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 125.25-200 chr8 19643233 19643666 + 0.5 NA intron (NR_148898, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu 39134 NM_018371 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 131.75-220 chr8 129316701 129317226 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75723 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 197.75-52 chr21 18259770 18260232 + 0.5 NA intron (NM_001204174, intron 3 of 5) intron (NM_001204174, intron 3 of 5) 14126 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 221.75-8 chr1 105405229 105405806 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 213418 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 122.75-143 chr4 32905716 32906033 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 554836 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 113.75-2 chr1 21011767 21012092 + 0.5 NA intron (NM_003760, intron 2 of 31) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -23497 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 156.5-23 chr11 11448059 11448546 + 0.5 NA intron (NM_001363464, intron 2 of 9) intron (NM_001363464, intron 2 of 9) -95052 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 136-57 chr17 82459400 82459812 + 0.5 NA intron (NM_031968, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 865 NM_012336 26502 Hs.256526 NM_012336 ENSG00000141562 NARF IOP2 nuclear prelamin A recognition factor protein-coding 132.75-113 chr20 35678908 35679322 + 0.5 NA intron (NR_037570, intron 8 of 13) intron (NR_037570, intron 8 of 13) -14215 NM_006047 10137 Hs.700188 NM_006047 ENSG00000244462 RBM12 HRIHFB2091|SCZD19|SWAN RNA binding motif protein 12 protein-coding 163.75-15 chr1 230009761 230010245 + 0.5 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 7286 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 125.75-184 chr8 92445034 92445367 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 210294 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 143.75-158 chr6 63495896 63496330 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -75899 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 122.75-69 chr17 59412999 59413375 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 47104 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 132.5-177 chr4 17902904 17903257 + 0.5 NA intron (NM_001365661, intron 5 of 5) L2b|LINE|L2 92101 NM_022346 64151 Hs.567567 NM_022346 ENSG00000109805 NCAPG CAPG|CHCG|NY-MEL-3|YCG1 non-SMC condensin I complex subunit G protein-coding 135-167 chr7 55589618 55590004 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17309 NM_001321244 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 124.5-74 chr15 91389443 91389906 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -73665 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 155-42 chr14 78715374 78715914 + 0.5 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) MIR|SINE|MIR 311925 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 122.25-60 chr14 57647974 57648353 + 0.5 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -154306 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 143-151 chr8 132161279 132161718 + 0.5 NA intron (NM_001204824, intron 9 of 14) AluSx|SINE|Alu -56233 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 170.25-36 chr14 69557371 69557992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17190 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 137-4 chr1 80845305 80845741 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 204236 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 125-135 chr5 137744368 137744782 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8486 NM_017415 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 151.25-53 chr14 54347390 54347796 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -49275 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 121.5-234 chr7 25834134 25834523 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -44209 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 119.25-88 chr2 3693371 3693663 + 0.5 NA intron (NM_018436, intron 7 of 11) intron (NM_018436, intron 7 of 11) -10058 NM_001287444 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 127-141 chr5 112969120 112969451 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7513 NM_001242377 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 139.75-194 chrX 64069995 64070370 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 135526 NM_152424 139285 Hs.314225 NM_152424 ENSG00000184675 AMER1 FAM123B|OSCS|WTX APC membrane recruitment protein 1 protein-coding 158.25-68 chr2 159703431 159703856 + 0.5 NA intron (NR_110586, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 8799 NR_110586 29994 Hs.470369 NM_013450 ENSG00000123636 BAZ2B WALp4 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B protein-coding 113.5-128 chr2 141550961 141551322 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 580560 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 149.25-56 chr15 81644202 81644758 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -270267 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 153.5-139 chr4 30593651 30594124 + 0.5 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -126482 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 171.5-49 chr14 105050213 105050648 + 0.5 NA 3' UTR (NM_013345, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_013345, exon 4 of 4) 15000 NM_013345 29933 Hs.532504 NM_013345 ENSG00000183484 GPR132 G2A G protein-coupled receptor 132 protein-coding 164-11 chr1 228916374 228917007 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 181211 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 152.5-41 chr14 33942809 33943167 + 0.5 NA intron (NM_001308103, intron 1 of 4) intron (NM_001308103, intron 1 of 4) 8086 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 117.75-13 chr1 152563587 152563951 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3011 NM_178435 353145 Hs.490208 NM_178435 ENSG00000185966 LCE3E LEP17 late cornified envelope 3E protein-coding 232-6 chr1 212891519 212892086 + 0.5 NA intron (NM_014053, intron 8 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 33527 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 116.75-160 chr5 13562599 13562948 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 381707 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 171.75-53 chr15 81906175 81906850 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 139506 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 119.25-212 chr8 131943150 131943545 + 0.5 NA intron (NM_001323557, intron 2 of 22) L1ME2|LINE|L1 26574 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 116 chr1 14170592 14170986 + 0.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 249184 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 120.5-3 chr1 28006869 28007343 + 0.5 NA intron (NM_001282562, intron 9 of 16) AluSx|SINE|Alu 47644 NM_018053 55113 Hs.55024 NM_018053 ENSG00000158156 XKR8 XRG8|hXkr8 XK related 8 protein-coding 173.5-81 chr2 214767228 214767728 + 0.5 NA intron (NM_001282548, intron 1 of 5) intron (NM_001282548, intron 1 of 5) 42205 NR_104215 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 131.75-27 chr10 59376806 59377279 + 0.5 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -13861 NM_001347840 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 124.75-187 chr7 1586724 1587074 + 0.5 NA non-coding (NR_027328, exon 4 of 4) non-coding (NR_027328, exon 4 of 4) 16826 NR_021487 114796 Hs.436146 NR_021487 ENSG00000230487 PSMG3-AS1 - PSMG3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 157.75-66 chr17 35438442 35439024 + 0.5 NA 3' UTR (NM_144682, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_144682, exon 6 of 6) -5559 NM_001289009 55106 Hs.663548 NM_018042 ENSG00000172123 SLFN12 SLFN3 schlafen family member 12 protein-coding 180.5-27 chr12 57066697 57067157 + 0.5 NA intron (NM_015257, intron 3 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 11864 NM_015257 23306 Hs.591040 NM_015257 ENSG00000166881 NEMP1 TMEM194|TMEM194A nuclear envelope integral membrane protein 1 protein-coding 125-46 chr15 64216488 64216919 + 0.5 NA exon (NM_001329605, exon 5 of 13) exon (NM_001329605, exon 5 of 13) -53548 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 165.75-2 chr1 43915327 43915786 + 0.5 NA intron (NM_001270461, intron 8 of 8) intron (NM_001270461, intron 8 of 8) -17764 NM_057090 9048 Hs.632404 NM_003976 ENSG00000117407 ARTN ART|ENOVIN|EVN|NBN artemin protein-coding 159.5-130 chr21 42721455 42721981 + 0.5 NA intron (NM_001001578, intron 3 of 16) intron (NM_001001578, intron 3 of 16) 58276 NR_135517 101928311 Hs.570404 NR_135517 ENSG00000283051 LINC01668 - long intergenic non-protein coding RNA 1668 ncRNA 170-108 chr9 123015076 123015590 + 0.5 NA intron (NM_012197, intron 11 of 25) intron (NM_012197, intron 11 of 25) -18310 NM_005294 2844 Hs.722039 NM_005294 ENSG00000011454 GPR21 - G protein-coupled receptor 21 protein-coding 168.5-176 chr7 131494714 131495308 + 0.5 NA 3' UTR (NM_013255, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_013255, exon 18 of 18) 61617 NM_001018111 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 112.75-148 chr4 42351633 42351938 + 0.5 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 39483 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 175-121 chr7 78956832 78957483 + 0.5 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) AluSx1|SINE|Alu -51831 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 146.5-185 chr6 38927824 38928234 + 0.5 NA intron (NM_001371, intron 73 of 91) intron (NM_001371, intron 73 of 91) 25078 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 136.75-50 chr12 100723417 100723853 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -71141 NM_001286615 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 123.75-161 chr6 105376036 105376308 + 0.5 NA exon (NM_002726, exon 4 of 15) exon (NM_002726, exon 4 of 15) 26910 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 154.75-30 chr12 109492291 109492761 + 0.5 NA intron (NM_130466, intron 9 of 27) AluJb|SINE|Alu 14892 NM_183415 89910 Hs.374067 NM_130466 ENSG00000151148 UBE3B BPIDS|KOS ubiquitin protein ligase E3B protein-coding 120-8 chr1 119921702 119922058 + 0.5 NA intron (NM_024408, intron 28 of 33) intron (NM_024408, intron 28 of 33) -25365 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 177.25-121 chr5 105536661 105537211 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 437462 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 156-148 chr8 41368918 41369385 + 0.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -57504 NR_145746 109616980 NR_145746 ENSG00000238936 SNORD65B - small nucleolar RNA, C/D box 65B snoRNA 150.5-220 chr8 107301167 107301603 + 0.5 NA intron (NM_001199859, intron 5 of 8) intron (NM_001199859, intron 5 of 8) 35130 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 160-5 chr1 54708150 54708623 + 0.5 NA intron (NR_037639, intron 23 of 32) AluJr|SINE|Alu -7436 NM_001291333 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 122.25-169 chr7 16449461 16449847 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16084 NM_015464 25928 Hs.648106 NM_015464 ENSG00000171243 SOSTDC1 CDA019|DAND7|ECTODIN|USAG1 sclerostin domain containing 1 protein-coding 136-104 chr3 96592575 96592948 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -221833 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 156.25-152 chr8 133279223 133279808 + 0.5 NA intron (NM_001258432, intron 1 of 13) intron (NM_001258432, intron 1 of 13) 17737 NM_001135242 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 138.25-66 chr17 78579424 78579864 + 0.5 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -2250 NM_173628 8632 Hs.375975 NM_003727 ENSG00000187775 DNAH17 DNAHL1|DNEL2 dynein axonemal heavy chain 17 protein-coding 121.75-17 chr11 14608880 14609136 + 0.5 NA intron (NM_148976, intron 2 of 10) intron (NM_148976, intron 2 of 10) 34626 NM_148976 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 152.5-156 chr5 146320810 146321279 + 0.5 NA Intergenic BC200|scRNA|scRNA -17795 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 121.25-207 chr9 86076758 86077141 + 0.5 NA intron (NM_016548, intron 3 of 9) intron (NM_016548, intron 3 of 9) 22609 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 116-56 chr16 11190488 11190867 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 65505 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 179.75-121 chr6 143191211 143191799 + 0.5 NA TTS (NM_001286588) TTS (NM_001286588) 26723 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 133.25-195 chr7 19054570 19054998 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 62852 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 132.5-36 chr11 25740827 25741273 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -448073 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 164.75-138 chr8 56247872 56248488 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 36391 NM_001011671 79145 Hs.436913 NM_024300 ENSG00000170791 CHCHD7 COX23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 7 protein-coding 135-138 chr5 22231106 22231591 + 0.5 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -17498 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 118-38 chr13 40522598 40522964 + 0.5 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -41775 NR_024506 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 129.75-11 chr1 98260927 98261295 + 0.5 NA intron (NR_046088, intron 2 of 2) AluSp|SINE|Alu 50400 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 150.75-43 chr12 1971435 1971849 + 0.5 NA intron (NM_152640, intron 3 of 8) intron (NM_152640, intron 3 of 8) 32815 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 174.5-13 chr1 183984045 183984453 + 0.5 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 53479 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 181.25-103 chr5 105619879 105620596 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 520763 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 131.5-231 chr8 51556534 51556942 + 0.5 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) intron (NM_144651, intron 4 of 22) 252707 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 153-10 chr10 44452759 44453141 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -67853 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 118-115 chr3 120653794 120654119 + 0.5 NA intron (NM_000187, intron 4 of 13) MER20|DNA|hAT-Charlie 28283 NM_000187 3081 Hs.368254 NM_000187 ENSG00000113924 HGD AKU|HGO homogentisate 1,2-dioxygenase protein-coding 131.75-104 chr2 15029352 15029783 + 0.5 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 396850 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 127-58 chr14 55905192 55905680 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -108762 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 133.5-91 chr15 90800642 90801001 + 0.5 NA intron (NM_001287247, intron 17 of 19) intron (NM_001287247, intron 17 of 19) -67767 NM_002569 5045 Hs.513153 NM_002569 ENSG00000140564 FURIN FUR|PACE|PCSK3|SPC1 furin, paired basic amino acid cleaving enzyme protein-coding 143.25-47 chr14 63004629 63004981 + 0.5 NA intron (NM_139318, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu 40653 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 277.75-36 chr8 126726921 126727670 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -168817 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 132-15 chr10 31949047 31949366 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -20330 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 146.25-87 chr20 24148261 24148785 + 0.5 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -51244 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 122-91 chr2 45786484 45786789 + 0.5 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 134961 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 138.75-193 chr8 86404127 86404565 + 0.5 NA intron (NM_007013, intron 8 of 24) intron (NM_007013, intron 8 of 24) 61799 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 149.75-95 chr2 186742111 186742524 + 0.5 NA intron (NM_177454, intron 2 of 7) intron (NM_177454, intron 2 of 7) 48257 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 123.25-74 chr16 86809919 86810360 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 88048 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 143.25-174 chr8 35370916 35371284 + 0.5 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 135625 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 131-70 chr18 5435464 5435943 + 0.5 NA intron (NM_001281535, intron 8 of 21) intron (NM_001281535, intron 8 of 21) 104853 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 186.75-44 chr19 38689396 38689979 + 0.5 NA intron (NM_001322033, intron 1 of 20).2 AluSg|SINE|Alu 42038 NM_001322033 81 Hs.270291 NM_004924 ENSG00000130402 ACTN4 ACTININ-4|FSGS|FSGS1 actinin alpha 4 protein-coding 177.5-5 chr1 66680013 66680658 + 0.5 NA intron (NM_001350218, intron 13 of 22) intron (NM_001350218, intron 13 of 22) 51895 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 141.25-50 chr14 55129345 55129830 + 0.5 NA intron (NM_002306, intron 1 of 5) CpG 335 NM_002306 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 170.25-76 chr2 165842646 165843112 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 29062 NR_045375 100506124 Hs.709870 NR_045375 LOC100506124 - uncharacterized LOC100506124 ncRNA 216.5-122 chr8 118103630 118104452 + 0.5 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 7778 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 135.25-53 chr12 33704748 33705158 + 0.5 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -265134 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 147-68 chr2 46157743 46158276 + 0.5 NA intron (NM_005400, intron 13 of 14) intron (NM_005400, intron 13 of 14) -139398 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 117.75-175 chr5 74818032 74818439 + 0.5 NA intron (NR_046462, intron 4 of 11) L1MB7|LINE|L1 -47658 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 115.75-227 chr9 76010142 76010542 + 0.5 NA intron (NR_120409, intron 3 of 19) intron (NR_120409, intron 3 of 19) 119669 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 112.5-66 chr13 73682565 73682925 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 118501 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 125.75-90 chr2 65837913 65838291 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -405503 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 144.75-143 chr5 171014839 171015362 + 0.5 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) L1MEf|LINE|L1 153082 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 148.75-14 chr1 244474977 244475457 + 0.5 NA intron (NM_001130957, intron 2 of 21) intron (NM_001130957, intron 2 of 21) 13846 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 168.75-155 chr8 120568555 120569109 + 0.5 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) intron (NM_021021, intron 4 of 6) 123413 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 124.25-72 chr16 67134047 67134459 + 0.5 NA exon (NM_001320540, exon 8 of 17) exon (NM_001320540, exon 8 of 17) 16745 NM_033309 84752 Hs.744158 NM_033309 ENSG00000237172 B3GNT9 - UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 protein-coding 140.5-211 chr7 24315778 24316238 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31818 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 203.75-13 chr10 96589609 96590308 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2946 NM_020123 56889 Hs.500674 NM_020123 ENSG00000077147 TM9SF3 EP70-P-iso|SMBP transmembrane 9 superfamily member 3 protein-coding 130.75-64 chr16 8886526 8887005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17753 NM_001278260 23589 Hs.632184 NM_014316 ENSG00000153048 CARHSP1 CRHSP-24|CRHSP24|CSDC1 calcium regulated heat stable protein 1 protein-coding 146-85 chr20 51115397 51115900 + 0.5 NA Intergenic (AAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -92541 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 124.5-84 chr18 3573610 3573924 + 0.5 NA intron (NM_001242762, intron 5 of 9) AluJo|SINE|Alu -20347 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 138.25-83 chr2 51156846 51157344 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 124494 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 191.25-45 chr18 13260847 13261479 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) -16942 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 164.5-86 chr19 3668981 3669551 + 0.5 NA intron (NM_001195733, intron 1 of 16) intron (NM_001195733, intron 1 of 16) 31202 NM_001195733 23396 Hs.282177 NM_012398 ENSG00000186111 PIP5K1C LCCS3|PIP5K-GAMMA|PIP5K1-gamma|PIP5Kgamma phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 gamma protein-coding 129-179 chr8 102265576 102265908 + 0.5 NA intron (NM_015902, intron 52 of 58) L1MEf|LINE|L1 26291 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 131.25-177 chr6 127529541 127530058 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10775 NM_001012279 387104 Hs.319247 NM_001012279 ENSG00000255330 SOGA3 C6orf174|dJ403A15.3 SOGA family member 3 protein-coding 135.75-45 chr12 46378137 46378663 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5276 NR_125380 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 123-121 chr21 23448304 23448693 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -63663 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 119.5-51 chr11 104535568 104535887 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 73575 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 124.5-64 chr14 69274138 69274502 + 0.5 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 14162 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 113.5-251 chr9 95752040 95752458 + 0.5 NA Intergenic CpG -123442 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 128.5-225 chr8 105611369 105611761 + 0.5 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 292022 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 180.25-110 chr6 137785364 137785979 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -46634 NR_121618 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 147.75-169 chr9 33001030 33001453 + 0.5 NA intron (NM_001369005, intron 1 of 8) CpG 335 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 139.5-139 chr3 124838177 124838637 + 0.5 NA intron (NM_001354766, intron 5 of 13) intron (NM_001354766, intron 5 of 13) 48958 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 138.75-110 chr22 25407510 25407958 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26157 NM_001135772 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 154.25-153 chr7 22182676 22183267 + 0.5 NA intron (NM_001367603, intron 1 of 5) intron (NM_001367603, intron 1 of 5) 10774 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 119.75-206 chr8 139701012 139701274 + 0.5 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 1980 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 131.25-72 chr16 47030605 47031092 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57174 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 127.5-132 chr2 191529844 191530207 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -148047 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 168.5-104 chr20 37605376 37605849 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17507 NR_047461 100861522 Hs.580680 NR_047461 ENSG00000225759 LINC00489 - long intergenic non-protein coding RNA 489 ncRNA 158.5-120 chr20 60795042 60795433 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 230675 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 120.5-8 chr1 87897100 87897429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -525609 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 132-35 chr12 13600130 13600551 + 0.5 NA intron (NM_000834, intron 9 of 12) intron (NM_000834, intron 9 of 12) -223595 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 114.25-72 chr17 17354186 17354529 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 50984 NM_020201 56953 Hs.513977 NM_020201 ENSG00000205309 NT5M dNT-2|dNT2|mdN 5',3'-nucleotidase, mitochondrial protein-coding 139-122 chr5 143865798 143866113 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 53794 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 164-76 chr3 35239009 35239376 + 0.5 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 154831 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 117.25-52 chr12 28894237 28894621 + 0.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -254849 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 137.25-109 chr4 72997788 72998315 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71665 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 112.5-238 chr8 127762458 127762799 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26397 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 124.5-124 chr20 21786627 21787027 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 81163 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 166-72 chr20 18413937 18414538 + 0.5 NA intron (NM_001367611, intron 12 of 20) intron (NM_001367611, intron 12 of 20) 35188 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 146.5-20 chr1 187619082 187619574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 175700 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 137-145 chr5 156033550 156034095 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -292935 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 114.75-186 chr8 21390316 21390750 + 0.5 NA Intergenic LTR60B|LTR|ERV1 92294 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 118.25-176 chr6 170161107 170161563 + 0.5 NA intron (NR_125878, intron 1 of 2) intron (NR_125878, intron 1 of 2) 693 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 156-70 chr18 34503672 34504177 + 0.5 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) AluY|SINE|Alu 10612 NM_001198945 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 120.75-96 chr21 23706565 23706926 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -321910 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 153.75-7 chr1 156755967 156756507 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3789 NM_001319186 3068 Hs.743948 NM_004494 ENSG00000143321 HDGF HMG1L2 heparin binding growth factor protein-coding 167-101 chr6 112748422 112748837 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 401299 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 113.5-147 chr21 39424539 39424929 + 0.5 NA intron (NM_152505, intron 4 of 9) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 19468 NM_152505 150082 Hs.517284 NM_152505 ENSG00000157578 LCA5L C21orf13 lebercilin LCA5 like protein-coding 136-151 chr8 85573522 85573901 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 81965 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 123.5-45 chr11 116563637 116564011 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75598 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 131.5-62 chr14 64352385 64352722 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4942 NR_033777 441687 Hs.685242 NR_033777 TEX21P - testis expressed 21, pseudogene pseudo 115.5-155 chr21 25287562 25287895 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 143973 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 166.25-134 chr6 38827018 38827510 + 0.5 NA intron (NM_001371, intron 28 of 91) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 111953 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 140.75-58 chr15 61707493 61707882 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -22231 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 119-104 chr21 21376977 21377413 + 0.5 NA intron (NM_001352592, intron 10 of 18) L1ME1|LINE|L1 230033 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 124-100 chr20 7302597 7302924 + 0.5 NA non-coding (NR_135005, exon 2 of 2) non-coding (NR_135005, exon 2 of 2) 4672 NR_135005 101929288 Hs.738005 NR_135005 ENSG00000261249 LINC01751 - long intergenic non-protein coding RNA 1751 ncRNA 167.75-104 chr4 114115079 114115457 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -135621 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 120-110 chr3 2097577 2097973 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1028 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 145.5-30 chr11 38021653 38022003 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 83227 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 117.25-6 chr1 54166754 54167146 + 0.5 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -13769 NM_001353655 200008 NM_201546 ENSG00000157211 CDCP2 - CUB domain containing protein 2 protein-coding 131-141 chr6 41135033 41135352 + 0.5 NA non-coding (NR_026938, exon 19 of 23) non-coding (NR_026938, exon 19 of 23) 19157 NM_178174 340205 Hs.117331 NM_178174 ENSG00000161911 TREML1 GLTL1825|PRO3438|TLT-1|TLT1|dJ238O23.3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 1 protein-coding 164-57 chr2 40229634 40230171 + 0.5 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 200402 NM_021097 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 200.75 chr1 42295295 42295900 + 0.5 NA intron (NM_001198850, intron 2 of 12) AluSx|SINE|Alu 39358 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 123.75-151 chr5 131602118 131602451 + 0.5 NA intron (NM_016340, intron 3 of 27) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 32945 NM_001164389 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 141.5-24 chr11 45861138 45861581 + 0.5 NA intron (NM_001127457, intron 4 of 11) intron (NM_001127457, intron 4 of 11) 13884 NM_021117 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 119-148 chr5 81481057 81481459 + 0.5 NA intron (NM_001256733, intron 5 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -87124 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 122.5-213 chr7 90910251 90910679 + 0.5 NA intron (NM_012395, intron 6 of 13) intron (NM_012395, intron 6 of 13) 200649 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 148.25-134 chr6 127073505 127074007 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44915 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 134.75-53 chr12 55802278 55802749 + 0.5 NA intron (NM_033082, intron 2 of 10) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 15211 NM_033082 84324 Hs.505676 NM_033082 ENSG00000205323 SARNP CIP29|HCC1|HSPC316|THO1 SAP domain containing ribonucleoprotein protein-coding 164.25-151 chr7 113212817 113213471 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -94562 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 118.25-127 chr3 57657483 57657886 + 0.5 NA exon (NM_152678, exon 9 of 20) exon (NM_152678, exon 9 of 20) 35393 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 139-139 chr7 42031021 42031477 + 0.5 NA intron (NM_000168, intron 7 of 14) intron (NM_000168, intron 7 of 14) 205960 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 126.25-60 chr16 6421050 6421369 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -352600 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 159-46 chr18 23004903 23005320 + 0.5 NA intron (NM_002894, intron 15 of 18) AluSc8|SINE|Alu 71235 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 172.5-130 chr3 130302410 130302915 + 0.5 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -42854 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 113.5-92 chr15 96335725 96336020 + 0.5 NA intron (NM_021005, intron 2 of 2) intron (NM_021005, intron 2 of 2) 2107 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 138.25-51 chr14 68006126 68006661 + 0.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1ME3A|LINE|L1 182801 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 126.75-91 chr17 62922858 62923194 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21189 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 121.75-154 chr5 173995625 173996006 + 0.5 NA intron (NM_001144954, intron 1 of 4) intron (NM_001144954, intron 1 of 4) 6645 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 112.25-115 chr21 15538167 15538485 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -191608 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 123.25-43 chr11 118568333 118568643 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2412 NM_020153 56912 Hs.533738 NM_020153 ENSG00000118096 IFT46 C11orf2|C11orf60|CFAP32 intraflagellar transport 46 protein-coding 120.5-40 chr11 61064952 61065336 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -28819 NM_001346456 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 114-16 chr10 29532022 29532415 + 0.5 NA intron (NM_001323599, intron 9 of 38) intron (NM_001323599, intron 9 of 38) 12879 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 138.5-47 chr12 107111206 107111739 + 0.5 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -17923 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 137.75-34 chr11 12397327 12397803 + 0.5 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) intron (NM_018222, intron 1 of 12) 19994 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 113.25-10 chr1 151736246 151736537 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 14869 NM_001144956 284485 Hs.297967 NM_001144956 ENSG00000178796 RIIAD1 C1orf230|NCRNA00166 regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 protein-coding 145.25-64 chr18 70154676 70155112 + 0.5 NA intron (NM_001318520, intron 14 of 47) intron (NM_001318520, intron 14 of 47) 50793 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 143.5-89 chr17 62848330 62848662 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 39994 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 176.75-13 chr10 6463977 6464434 + 0.5 NA intron (NM_001282644, intron 13 of 17) intron (NM_001282644, intron 13 of 17) 113889 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 113.25-153 chr7 5801305 5801559 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -19769 NM_207111 54476 Hs.487458 NM_019011 ENSG00000011275 RNF216 CAHH|TRIAD3|U7I1|UBCE7IP1|ZIN ring finger protein 216 protein-coding 119.75-116 chr2 195467330 195467701 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -189443 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 135-125 chr4 87578093 87578546 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -30210 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 120.5-151 chr3 177510094 177510459 + 0.5 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 68355 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 124.75-114 chr2 28404405 28404728 + 0.5 NA intron (NM_005253, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR -9894 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 173.75-52 chr14 32883470 32884039 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -55125 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 130.75-155 chr5 74745543 74745843 + 0.5 NA exon (NM_170691, exon 10 of 20) exon (NM_170691, exon 10 of 20) 21424 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 129.5-137 chr2 148492695 148493149 + 0.5 NA intron (NM_018328, intron 12 of 14) intron (NM_018328, intron 12 of 14) -151829 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 131-66 chr17 14790133 14790420 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -224529 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 133.25-105 chr2 151816059 151816462 + 0.5 NA intron (NM_177985, intron 1 of 5) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 12161 NM_012097 26225 Hs.470233 NM_012097 ENSG00000162980 ARL5A ARFLP5|ARL5 ADP ribosylation factor like GTPase 5A protein-coding 211.5-140 chr7 27258679 27259407 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -11814 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 116-102 chr3 29540978 29541406 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 259880 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 153-69 chr2 50243391 50243892 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 104113 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 132.75-121 chr3 5182829 5183275 + 0.5 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -4655 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 129-107 chr2 236991024 236991438 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 64936 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 167.5-181 chr7 132000651 132000987 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90599 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 149-132 chr8 120025147 120025493 + 0.5 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) intron (NM_022783, intron 8 of 8) -99782 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 144.5-186 chr6 45021143 45021581 + 0.5 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 176408 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 131.5-110 chr2 52193020 52193312 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) MER4E|LTR|ERV1 -177482 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 130-36 chr12 123631381 123631852 + 0.5 NA intron (NM_001414, intron 2 of 8) AluY|SINE|Alu 2070 NM_001414 1967 Hs.741273 NM_001414 ENSG00000111361 EIF2B1 EIF2B|EIF2BA eukaryotic translation initiation factor 2B subunit alpha protein-coding 136.25-136 chr4 171515658 171516106 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 122881 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 125.5-85 chr14 68340157 68340479 + 0.5 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) LTR49|LTR|ERV1 288469 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 133.25-206 chr7 103510389 103510716 + 0.5 NA intron (NR_110141, intron 3 of 3) L1PA7|LINE|L1 -64345 NR_135802 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 126.75-206 chr5 148061804 148062240 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1950 NM_006846 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 126.75-60 chr14 63878635 63878953 + 0.5 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) AluSx1|SINE|Alu 25790 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 136.75-212 chrX 128326812 128327178 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -274592 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 118.5-15 chr10 4314115 4314516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -69931 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 140.25-169 chr6 129697748 129698117 + 0.5 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) intron (NM_033515, intron 1 of 14) 12245 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 150.75-57 chr14 48968051 48968438 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 618136 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 118.75-209 chr9 32955334 32955601 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 46109 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 118.25-220 chrX 46944057 46944431 + 0.5 NA intron (NM_014735, intron 1 of 10) L1PA16|LINE|L1 31823 NM_014735 9767 Hs.371977 NM_014735 ENSG00000102221 JADE3 JADE-3|PHF16 jade family PHD finger 3 protein-coding 129-54 chr13 26320726 26321052 + 0.5 NA intron (NM_001318368, intron 1 of 12) L1MB3|LINE|L1 66760 NM_001346501 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 129.75-180 chr8 82419014 82419317 + 0.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -492939 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 154-38 chr13 41739639 41740068 + 0.5 NA intron (NM_001009814, intron 21 of 25) AluY|SINE|Alu -171458 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 139.75-117 chr3 6262592 6262921 + 0.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 542693 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 168.75-50 chr15 59508201 59508737 + 0.5 NA intron (NM_152450, intron 5 of 8) intron (NM_152450, intron 5 of 8) 70283 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 157-73 chr22 35173292 35173717 + 0.5 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) intron (NR_126356, intron 2 of 5) 57552 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 122-154 chr6 47711811 47712217 + 0.5 NA intron (NM_001347855, intron 4 of 9) intron (NM_001347855, intron 4 of 9) 13434 NM_153838 221393 Hs.150131 NM_153838 ENSG00000153294 ADGRF4 GPR115|PGR18 adhesion G protein-coupled receptor F4 protein-coding 124.5-17 chr1 189985654 189985974 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 490196 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 136-65 chr19 29669757 29670111 + 0.5 NA intron (NM_024310, intron 1 of 1) L1MB2|LINE|L1 4473 NM_024310 79156 Hs.466383 NM_024310 ENSG00000166289 PLEKHF1 APPD|LAPF|PHAFIN1|ZFYVE15 pleckstrin homology and FYVE domain containing 1 protein-coding 131.25-199 chr8 78207982 78208325 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -308187 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 164.5-108 chr2 192042580 192043106 + 0.5 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 152090 NM_001305145 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 171.75-82 chr2 156639973 156640605 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 203910 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 167.5-21 chr10 10703548 10704074 + 0.5 NA intron (NM_001326317, intron 2 of 14) intron (NM_001326317, intron 2 of 14) 91103 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 126.5-145 chr22 33573129 33573464 + 0.5 NA intron (NM_133642, intron 5 of 14) AluSx|SINE|Alu 131624 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 127.25-161 chr5 29990138 29990449 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 109733 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 129.25-132 chr3 150113466 150113966 + 0.5 NA intron (NR_136187, intron 1 of 2) intron (NR_136187, intron 1 of 2) 17273 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 135.75-165 chr4 106656563 106656937 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 223126 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 113.5-148 chr22 22720687 22721005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 74534 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 115.25 chr1 6484262 6484630 + 0.5 NA intron (NM_001042663, intron 2 of 21) intron (NM_001042663, intron 2 of 21) 1023 NM_001265593 57449 Hs.284232 NM_020631 ENSG00000171680 PLEKHG5 CMTRIC|DSMA4|GEF720|Syx|Tech pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G5 protein-coding 115.5-53 chr13 105046020 105046426 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -419644 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 146.75-123 chr5 44453956 44454408 + 0.5 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 56100 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 132.5-202 chr5 126334999 126335458 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24892 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 114.75-82 chr2 21031755 21032099 + 0.5 NA intron (NM_000384, intron 10 of 28) L1ME2z|LINE|L1 12146 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 131.5-95 chr18 43892134 43892634 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -614894 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 130.25-41 chr11 88144688 88145097 + 0.5 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) intron (NM_022337, intron 2 of 2) 30551 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 133.25-120 chr21 15013929 15014315 + 0.5 NA intron (NM_003489, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 50878 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 139.75-12 chr1 235127251 235127800 + 0.5 NA TTS (NR_002956) TTS (NR_002956) 412 NR_002956 677802 Hs.744743 NR_002956 ENSG00000207181 SNORA14B ACA14b small nucleolar RNA, H/ACA box 14B snoRNA 212-89 chr9 128101806 128102485 + 0.5 NA intron (NM_001330988, intron 4 of 10) intron (NM_001330988, intron 4 of 10) 3663 NR_049766 114789 Hs.5476 NM_052901 ENSG00000148339 SLC25A25 MCSC|PCSCL|SCAMC-2 solute carrier family 25 member 25 protein-coding 145.25-91 chr21 19200645 19200985 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -441003 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 137.25-134 chr6 21500370 21500760 + 0.5 NA intron (NR_103790, intron 2 of 3) intron (NR_103790, intron 2 of 3) 11327 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 139-110 chr5 19096118 19096481 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 789973 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 118-18 chr10 92572507 92572783 + 0.5 NA intron (NM_001322795, intron 1 of 25) intron (NM_001322795, intron 1 of 25) 861 NM_001322796 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 191.75-90 chr4 45452546 45453192 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 671185 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 122.25-206 chr9 28192898 28193298 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 526207 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 178.75-11 chr10 70708158 70708712 + 0.5 NA intron (NM_080722, intron 3 of 21) intron (NM_080722, intron 3 of 21) 35929 NM_139155 140766 Hs.352156 NM_080722 ENSG00000138316 ADAMTS14 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 14 protein-coding 121.5-178 chr3 86836873 86837234 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 154096 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 151-141 chr9 92925346 92925785 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -21958 NM_001083536 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 113-111 chr22 46406028 46406268 + 0.5 NA intron (NM_014246, intron 9 of 34) intron (NM_014246, intron 9 of 34) 70434 NM_001282782 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 115-147 chr5 146050166 146050511 + 0.5 NA intron (NM_152550, intron 7 of 9) intron (NM_152550, intron 7 of 9) 55239 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 125.75-7 chr1 101354814 101355313 + 0.5 NA intron (NR_126402, intron 4 of 4) intron (NR_126402, intron 4 of 4) 31226 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 160.25-136 chr6 44867104 44867489 + 0.5 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) AluSz|SINE|Alu -315415 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 157.75-190 chrX 111770190 111770759 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 88817 NM_001324294 79868 Hs.443061 NM_018466 ENSG00000101901 ALG13 CDG1S|CXorf45|EIEE36|GLT28D1|MDS031|TDRD13|YGL047W ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit protein-coding 132.5-211 chr6 50020347 50020787 + 0.5 NA intron (NM_001037497, intron 1 of 1) intron (NM_001037497, intron 1 of 1) 1414 NM_001037728 245913 Hs.571093 NM_001037497 ENSG00000203970 DEFB110 DEFB-10|DEFB-11|DEFB111 defensin beta 110 protein-coding 141.25-173 chr7 83948825 83949224 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 245765 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 158.75-21 chr10 113654923 113655392 + 0.5 NA intron (NM_001322945, intron 4 of 40) L1ME3G|LINE|L1 8884 NM_198060 4892 Hs.268788 NM_006175 ENSG00000197893 NRAP N-RAP nebulin related anchoring protein protein-coding 118.75-207 chr8 140318094 140318498 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) L1MA7|LINE|L1 139448 NM_001160372 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 183.25-92 chr6 55867470 55868044 + 0.5 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) MER45A|DNA|hAT-Tip100 7833 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 164.5-206 chr8 84982547 84982952 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -124489 NM_001349637 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 137.25-36 chr12 65774251 65774688 + 0.5 NA intron (NR_026825, intron 1 of 1) intron (NR_026825, intron 1 of 1) -49991 NM_001330190 8091 Hs.505924 NM_003483 ENSG00000149948 HMGA2 BABL|HMGI-C|HMGIC|LIPO|STQTL9 high mobility group AT-hook 2 protein-coding 114-85 chr2 226333391 226333796 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 190799 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 138.25-97 chr2 241684208 241684555 + 0.5 NA intron (NM_001320905, intron 2 of 5) intron (NM_001320905, intron 2 of 5) 2434 NM_001320902 1841 Hs.471873 NM_012145 ENSG00000168393 DTYMK CDC8|PP3731|TMPK|TYMK deoxythymidylate kinase protein-coding 144.25-152 chr4 162417782 162418245 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -253979 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 133.25-147 chr4 44138481 44138990 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 121673 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 132.5-215 chr6 70756472 70756993 + 0.5 NA intron (NM_001044305, intron 3 of 10) L1PA2|LINE|L1 88202 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 171.75-140 chr8 102509723 102510286 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41585 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 179.75-115 chr6 45534763 45535210 + 0.5 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) L1PA13|LINE|L1 112711 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 122.5-206 chr7 10760608 10761086 + 0.5 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 19097 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 142.5-25 chr1 246514223 246514735 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7200 NM_001167740 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 165.5-204 chr9 34975862 34976264 + 0.5 NA intron (NM_015297, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 13316 NR_109756 101926900 Hs.545814 NR_109756 ENSG00000281491 DNAJB5-DT DNAJB5-AS1 DNAJB5 divergent transcript ncRNA 127-103 chr2 134197194 134197601 + 0.5 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -56675 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 143.5-81 chr15 83880006 83880532 + 0.5 NA intron (NM_207517, intron 9 of 29) L1MEg|LINE|L1 -199918 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 146.25-83 chr2 207577793 207578188 + 0.5 NA intron (NR_163947, intron 7 of 8) intron (NR_163947, intron 7 of 8) 18868 NM_001371428 126-82 chr19 29548526 29548807 + 0.5 NA intron (NM_001146339, intron 4 of 4) intron (NM_001146339, intron 4 of 4) 22082 NM_001146339 342865 Hs.451618 NM_001146339 ENSG00000187135 VSTM2B - V-set and transmembrane domain containing 2B protein-coding 143-59 chr18 10041381 10041818 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 127583 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 126.5-87 chr16 61236017 61236347 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -180416 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 151-3 chr1 52145679 52146256 + 0.5 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) intron (NM_007324, intron 1 of 17) 3873 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 157.5-194 chr7 108017324 108017896 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14449 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 129-127 chr4 10497429 10497928 + 0.5 NA intron (NM_052964, intron 18 of 18) intron (NM_052964, intron 18 of 18) -40252 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 119.5-260 chrX 27600372 27600758 + 0.5 NA intron (NM_001353450, intron 1 of 4) intron (NM_001353450, intron 1 of 4) 10221 NM_001353449 347442 Hs.720885 NM_001136533 ENSG00000189186 DCAF8L2 WDR42C DDB1 and CUL4 associated factor 8 like 2 protein-coding 152.25-8 chr1 209384457 209384833 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12590 NR_146491 101929476 Hs.568721 NR_146491 LINC01698 - long intergenic non-protein coding RNA 1698 ncRNA 112.5-139 chr2 206704743 206705132 + 0.5 NA exon (NM_001093730, exon 5 of 12) exon (NM_001093730, exon 5 of 12) 13459 NM_001093730 391475 Hs.640667 NM_001093730 ENSG00000232125 DYTN - dystrotelin protein-coding 158.5-133 chr3 160578923 160579484 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13632 NM_002268 3840 Hs.467866 NM_002268 ENSG00000186432 KPNA4 IPOA3|QIP1|SRP3 karyopherin subunit alpha 4 protein-coding 124.5-173 chr5 127354497 127354934 + 0.5 NA intron (NM_001308121, intron 4 of 13) intron (NM_001308121, intron 4 of 13) 63919 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 117.75-62 chr15 56695598 56695987 + 0.5 NA intron (NM_001002843, intron 5 of 20) AluSc|SINE|Alu 38294 NM_017661 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 124.25-35 chr11 111838405 111838843 + 0.5 NA intron (NR_147984, intron 10 of 15) intron (NR_147984, intron 10 of 15) 32657 NM_001352416 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 112.25-148 chr4 41322808 41323125 + 0.5 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 -36641 NM_001289124 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 193.5-24 chr11 80749510 80750107 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 12995 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 160.5-18 chr10 110399214 110399735 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -94554 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 178-85 chr6 46249110 46249620 + 0.5 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu -26959 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 116.75-50 chr12 46842457 46842887 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16675 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 115.5-180 chr3 156595918 156596192 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40855 NM_001308197 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 116-117 chr4 56583118 56583534 + 0.5 NA intron (NM_001256475, intron 5 of 8) L1MB7|LINE|L1 52720 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 120-55 chr15 100652317 100652685 + 0.5 NA TTS (NM_198243) TTS (NM_198243) 49912 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 124.25-152 chr4 113867520 113867928 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -105797 NM_172115 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 145-43 chr13 71908419 71908765 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -41388 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 166.5-103 chr2 65909804 65910189 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 448332 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 130.25-181 chr7 1259642 1260072 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26985 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 171-102 chr4 47122821 47123307 + 0.5 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 91497 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 144-55 chr2 37808711 37809141 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20785 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 137-171 chr8 26010891 26011211 + 0.5 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 34362 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 116.25-193 chr6 20195765 20196127 + 0.5 NA intron (NM_001080480, intron 1 of 12) intron (NM_001080480, intron 1 of 12) 16523 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 142-37 chr12 31549051 31549375 + 0.5 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -40710 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 128-28 chr11 109037067 109037573 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 372251 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 119-22 chr10 131927483 131927852 + 0.5 NA intron (NM_001291310, intron 3 of 9) intron (NM_001291310, intron 3 of 9) 26659 NR_033191 55844 Hs.380372 NM_018461 ENSG00000175470 PPP2R2D B55D|B55delta|MDS026 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bdelta protein-coding 119.25-46 chr12 44472864 44473277 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 402591 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 137.5-127 chr2 127717070 127717561 + 0.5 NA intron (NM_018383, intron 16 of 21) intron (NM_018383, intron 16 of 21) 15818 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 152.25-76 chr19 34733080 34733640 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001145665) promoter-TSS (NM_001145665) -883 NM_001145665 339318 Hs.720472 NM_001029997 ENSG00000197841 ZNF181 HHZ181 zinc finger protein 181 protein-coding 119-57 chr15 75471110 75471576 + 0.5 NA intron (NM_002833, intron 10 of 12) intron (NM_002833, intron 10 of 12) -15528 NM_001145357 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 121.75-168 chr6 148784584 148784970 + 0.5 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 37747 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 120.25-5 chr1 61140020 61140260 + 0.5 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 57579 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 169-17 chr12 32593008 32593492 + 0.5 NA intron (NM_001370298, intron 4 of 16) MIR|SINE|MIR 58957 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 191.5-109 chr4 61004559 61005123 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 82222 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 173-72 chr2 191322008 191322469 + 0.5 NA intron (NM_012223, intron 3 of 28) intron (NM_012223, intron 3 of 28) 76834 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 185-88 chr8 112554742 112555317 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 23 of 66) intron (NM_001363185, intron 23 of 66) -88464 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 125.75-78 chr18 31647021 31647371 + 0.5 NA intron (NM_001330570, intron 2 of 7) hAT-N1_Mam|DNA|hAT-Tip100? 37549 NM_004775 9331 Hs.591063 NM_004775 ENSG00000118276 B4GALT6 B4Gal-T6|beta4Gal-T6 beta-1,4-galactosyltransferase 6 protein-coding 178-7 chr10 28001241 28001878 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2480 NM_018076 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 152.5-23 chr11 11932761 11933340 + 0.5 NA exon (NM_017944, exon 14 of 27) exon (NM_017944, exon 14 of 27) 75589 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 153.75-56 chr17 48513761 48514145 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17058 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 160.5-134 chr4 57541982 57542447 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 116342 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 142.25-94 chr2 178346273 178346742 + 0.5 NA intron (NM_001201480, intron 12 of 25) intron (NM_001201480, intron 12 of 25) 26265 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 115-90 chr2 164506410 164506808 + 0.5 NA intron (NM_004490, intron 8 of 13) L1MB5|LINE|L1 61886 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 119.5-15 chr1 199291909 199292197 + 0.5 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 143455 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 118-46 chr14 44912412 44912677 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110050) promoter-TSS (NR_110050) -627 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 117.5-134 chr21 27334793 27335213 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -367915 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 166.75-141 chr8 98354177 98354585 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 39357 NR_162095 113218497 NR_162095 MIR9903 - microRNA 9903 ncRNA 125.5-88 chr15 63340216 63340605 + 0.5 NA exon (NM_001293642, exon 6 of 9) exon (NM_001293642, exon 6 of 9) 41436 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 120.5-16 chr1 224315846 224316264 + 0.5 NA intron (NM_002533, intron 4 of 22) AluJo|SINE|Alu 14117 NM_002533 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 119.25-105 chr2 232610308 232610585 + 0.5 NA intron (NM_001243252, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 4389 NM_001243252 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 121-8 chr1 81170016 81170495 + 0.5 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -135937 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 153-125 chr5 140180664 140181226 + 0.5 NA intron (NM_032412, intron 1 of 2) intron (NM_032412, intron 1 of 2) 5757 NM_032412 84418 Hs.529798 NM_032412 ENSG00000120306 CYSTM1 C5orf32|ORF1-FL49 cysteine rich transmembrane module containing 1 protein-coding 131.75-130 chr3 7839099 7839539 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 176988 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 127.5-144 chr22 27243855 27244119 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19308 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 112.5-235 chr8 117920308 117920641 + 0.5 NA TTS (NR_145799) TTS (NR_145799) 439 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 129.25-103 chr2 202862768 202863255 + 0.5 NA intron (NM_001288622, intron 1 of 12) L1MEc|LINE|L1 8461 NM_001288623 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 147.5-115 chr2 191331921 191332347 + 0.5 NA intron (NM_012223, intron 4 of 28) AluSq2|SINE|Alu 86730 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 141.25-72 chr18 10103844 10104182 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 189997 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 152.5-70 chr17 66227474 66227844 + 0.5 NA intron (NM_000042, intron 2 of 7) intron (NM_000042, intron 2 of 7) 1756 NM_000042 350 Hs.445358 NM_000042 ENSG00000091583 APOH B2G1|B2GP1|BG apolipoprotein H protein-coding 119.75-123 chr20 28816713 28817121 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -214252 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 184.75-55 chr2 114629137 114629556 + 0.5 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 167769 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 148.75-15 chr10 21698247 21698632 + 0.5 NA intron (NM_004641, intron 14 of 23) L1MA4A|LINE|L1 164267 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 115.5-151 chr20 31967233 31967513 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001011718) promoter-TSS (NM_001011718) -778 NM_001011718 343702 Hs.666444 NM_001011718 ENSG00000260903 XKR7 C20orf159|dJ310O13.4 XK related 7 protein-coding 132.25-56 chr14 44106442 44106943 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 400591 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 174.25-13 chr1 248606339 248606900 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12851 NM_001004693 127069 Hs.553585 NM_001004693 ENSG00000184022 OR2T10 OR1-64 olfactory receptor family 2 subfamily T member 10 protein-coding 140.25-72 chr17 55661122 55661516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 61545 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 119-173 chr6 147920646 147921112 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -351449 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 158.25-107 chr5 27376331 27376685 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95784 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 122.75-126 chr3 69392880 69393259 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6981 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 166.75-100 chr4 60718266 60718736 + 0.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -204118 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 135.5-52 chr13 107491475 107491908 + 0.5 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 39557 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 120.5-64 chr13 67245542 67246016 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -15443 NM_001318373 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 113.5-201 chr5 119270331 119270628 + 0.5 NA intron (NM_001077654, intron 1 of 1) FLAM_C|SINE|Alu 1720 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 118-128 chr4 25769238 25769591 + 0.5 NA intron (NM_001297592, intron 17 of 23) intron (NM_001297592, intron 17 of 23) 93574 NM_015187 23231 Hs.479384 NM_015187 ENSG00000091490 SEL1L3 Sel-1L3 SEL1L family member 3 protein-coding 182-116 chrX 67601606 67602093 + 0.5 NA intron (NM_001011645, intron 2 of 8) MIR3|SINE|MIR 57226 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 123-120 chr20 56761353 56761707 + 0.5 NA Intergenic (ATGATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 132224 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 141-130 chr5 95916976 95917329 + 0.5 NA intron (NM_012081, intron 3 of 11) intron (NM_012081, intron 3 of 11) 44699 NM_012081 22936 Hs.192221 NM_012081 ENSG00000118985 ELL2 MRCCAT1 elongation factor for RNA polymerase II 2 protein-coding 170.5-135 chr4 121071119 121071607 + 0.5 NA intron (NM_024574, intron 1 of 3) CpG 1172 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 115.25-209 chr8 104717280 104717721 + 0.5 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -128476 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 162.5-130 chr4 65711775 65712402 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -41593 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 119-34 chr12 1769133 1769443 + 0.5 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -50979 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 114-89 chr20 57152300 57152556 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -61268 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 140.25-181 chr7 98821133 98821538 + 0.5 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 48679 NM_001134451 222865 Hs.270753 NM_152913 ENSG00000166448 TMEM130 - transmembrane protein 130 protein-coding 117.75-15 chr1 190133684 190134149 + 0.5 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 342094 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 204.25-59 chr2 170444113 170444906 + 0.5 NA intron (NM_001083615, intron 23 of 33) intron (NM_001083615, intron 23 of 33) -93566 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 113.75-107 chr2 177698256 177698644 + 0.5 NA non-coding (NR_136171, exon 2 of 5) non-coding (NR_136171, exon 2 of 5) 25128 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 117.5-162 chr4 103288003 103288326 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -89821 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 130.25-182 chr7 13034885 13035387 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 347503 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 120.25-113 chr20 49770043 49770395 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -42494 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 114-58 chr17 58209939 58210326 + 0.5 NA intron (NM_001321269, intron 11 of 16) L2a|LINE|L2 9123 NM_001321269 54903 Hs.408843 NM_017777 ENSG00000011143 MKS1 BBS13|JBTS28|MES|MKS|POC12 MKS transition zone complex subunit 1 protein-coding 145.25-7 chr1 111365439 111365882 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19038 NM_181643 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 168.75-67 chr18 5876259 5876782 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 19434 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 165.25-100 chr4 45694569 45695118 + 0.5 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 429211 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 139-66 chr2 9758945 9759392 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84274 NM_001318977 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 137.75-186 chr7 2272455 2273004 + 0.5 NA intron (NM_013321, intron 3 of 10) intron (NM_013321, intron 3 of 10) -15152 NR_106895 102465503 NR_106895 ENSG00000284047 MIR6836 hsa-mir-6836 microRNA 6836 ncRNA 182.25-130 chr9 30309510 30309979 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 98710 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 132.25-52 chr13 89400636 89400954 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 99714 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 153.5-83 chr18 7169408 7170007 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51910 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 207.25-11 chr11 42901198 42901843 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 367849 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 142.25-78 chr19 37892734 37893090 + 0.5 NA exon (NM_001291088, exon 4 of 6) exon (NM_001291088, exon 4 of 6) 13682 NM_031951 83889 Hs.664194 NM_031951 ENSG00000171804 WDR87 NYD-SP11 WD repeat domain 87 protein-coding 128-149 chr7 47809366 47809629 + 0.5 NA exon (NM_138295, exon 51 of 57) exon (NM_138295, exon 51 of 57) 14206 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 120.25-10 chr1 90456744 90457209 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -200774 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 140-81 chr2 161572691 161573246 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -51367 NM_001354450 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 130.75-104 chr20 9428095 9428607 + 0.5 NA intron (NM_000933, intron 24 of 35) intron (NM_000933, intron 24 of 35) -86007 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 114.75-13 chr1 158775710 158776148 + 0.5 NA TTS (NM_001005278) TTS (NM_001005278) 1706 NM_001005278 81442 Hs.554487 NM_001005278 ENSG00000188340 OR6N2 OR1-23 olfactory receptor family 6 subfamily N member 2 protein-coding 172.75-53 chr18 13060160 13060564 + 0.5 NA intron (NM_032142, intron 21 of 44) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 69000 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 150.25-21 chr10 81217989 81218415 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 568405 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 149.75-164 chr8 87026735 87027216 + 0.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) LOR1-int|LTR|ERV1 160560 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 161-59 chr2 20632864 20633461 + 0.5 NA intron (NM_022460, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 17936 NM_022460 64342 Hs.531785 NM_022460 ENSG00000118960 HS1BP3 ETM2|HS1-BP3 HCLS1 binding protein 3 protein-coding 122.5-47 chr12 44814070 44814403 + 0.5 NA intron (NM_006159, intron 4 of 20) L3|LINE|CR1 61425 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 112.25-60 chr14 56287114 56287425 + 0.5 NA intron (NM_021255, intron 3 of 5) intron (NM_021255, intron 3 of 5) 168858 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 114.5-275 chr9 33942408 33942682 + 0.5 NA intron (NR_163243, intron 11 of 24) AluSz|SINE|Alu -8170 NR_102370 101340252 NR_102370 ENSG00000238300 SNORD121B - small nucleolar RNA, C/D box 121B snoRNA 131.25-219 chr9 108894240 108894558 + 0.5 NA intron (NM_001330749, intron 23 of 34) intron (NM_001330749, intron 23 of 34) 32133 NM_006687 10881 Hs.123530 NM_006687 ENSG00000187003 ACTL7A - actin like 7A protein-coding 154-80 chr2 199973090 199973648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17878 NM_001039693 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 147.75-8 chr1 92251071 92251470 + 0.5 NA intron (NR_135089, intron 15 of 17) L1M5|LINE|L1 33355 NM_001012425 388649 Hs.558823 NM_001012425 ENSG00000203910 C1orf146 - chromosome 1 open reading frame 146 protein-coding 137.75-93 chr2 27078862 27079327 + 0.5 NA exon (NM_007046, exon 1 of 8) exon (NM_007046, exon 1 of 8) 479 NM_007046 11117 Hs.63348 NM_007046 ENSG00000138080 EMILIN1 EMI|EMILIN|gp115 elastin microfibril interfacer 1 protein-coding 140.75-52 chr14 74708651 74709061 + 0.5 NA intron (NM_001039479, intron 1 of 19) intron (NM_001039479, intron 1 of 19) 4224 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 125-26 chr10 131204162 131204579 + 0.5 NA intron (NM_174937, intron 4 of 11) intron (NM_174937, intron 4 of 11) 107351 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 143.25-29 chr11 100499614 100500116 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -187423 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 116-51 chr15 40326640 40327070 + 0.5 NA TTS (NM_001301268) TTS (NM_001301268) 3163 NM_001301268 100505573 Hs.530791 NM_001301268 ENSG00000259330 INAFM2 LINC00984|OGU1 InaF motif containing 2 protein-coding 127.25-216 chr9 72214011 72214420 + 0.5 NA intron (NM_001351573, intron 5 of 14) MIRc|SINE|MIR 64775 NM_001351573 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 119.25-152 chr4 103933230 103933593 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -213426 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 122.5-82 chr17 52708395 52708860 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153494 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 130.25-81 chr18 3299641 3300112 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 37157 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 124.75-182 chr6 54740488 54740754 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -106150 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 119.75-20 chr10 39092677 39093122 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 396303 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 123.25-64 chr15 70790202 70790642 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -26864 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 114-160 chr8 27400532 27400980 + 0.5 NA intron (NM_173175, intron 2 of 29) L2a|LINE|L2 -32614 NR_106901 102465507 NR_106901 ENSG00000273836 MIR6842 hsa-mir-6842 microRNA 6842 ncRNA 142.75-112 chr20 40335158 40335565 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 330900 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 131.5-154 chr3 61222528 61222856 + 0.5 NA intron (NM_001320900, intron 1 of 9) intron (NM_001320900, intron 1 of 9) 28760 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 132.75-68 chr15 50004802 50005109 + 0.5 NA intron (NR_073597, intron 7 of 26) L2c|LINE|L2 108424 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 148.5-168 chr4 87117068 87117531 + 0.5 NA intron (NM_005935, intron 11 of 19) intron (NM_005935, intron 11 of 19) 102969 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 223.25-26 chr18 430145 431009 + 0.5 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 70124 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 117.5-42 chr11 50235236 50235548 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63070 NR_003034 441601 Hs.144683 NR_003034 ENSG00000255042 LOC441601 - septin 7 pseudogene pseudo 135.25-108 chr2 167252705 167253118 + 0.5 NA intron (NM_001199144, intron 7 of 8) intron (NM_001199144, intron 7 of 8) 65539 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 173-49 chr15 75484231 75484629 + 0.5 NA intron (NM_002833, intron 8 of 12) intron (NM_002833, intron 8 of 12) -28615 NM_001145357 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 130-28 chr11 46491903 46492285 + 0.5 NA intron (NM_001267782, intron 13 of 19) intron (NM_001267782, intron 13 of 19) -40205 NR_036117 100422827 NR_036117 ENSG00000265014 MIR3160-1 mir-3160-1 microRNA 3160-1 ncRNA 117.25-218 chr8 129269251 129269617 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -28194 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 281-2 chr1 77646851 77647583 + 0.5 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) MER63D|DNA|hAT-Blackjack 35441 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 120-113 chr3 32428695 32429032 + 0.5 NA intron (NM_138410, intron 1 of 4) intron (NM_138410, intron 1 of 4) 37010 NM_138410 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 122.75-70 chr17 63107959 63108353 + 0.5 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) MER85|DNA|PiggyBac 141921 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 133.25-35 chr11 115868215 115868585 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -108200 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 148.75-26 chr10 93703100 93703522 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_144635) promoter-TSS (NR_144635) -352 NM_001347714 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 164.25-14 chr1 214597269 214597783 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -5669 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 112.5-152 chr21 27679979 27680390 + 0.5 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -42195 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 120-66 chr16 76262313 76262657 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14916 NR_136216 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 179.25-47 chr12 119585387 119585955 + 0.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -8103 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 151.75-89 chr3 98600061 98600640 + 0.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -6739 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 163.5-132 chr3 167240997 167241495 + 0.5 NA intron (NM_001199202, intron 20 of 20) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 139037 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 162.25-78 chr2 59647136 59647606 + 0.5 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 429663 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 131.5-191 chr5 57785529 57785807 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113494 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 150.5-4 chr1 65541161 65541611 + 0.5 NA intron (NM_001198687, intron 1 of 18) intron (NM_001198687, intron 1 of 18) 15697 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 125.25-115 chr2 184846715 184847000 + 0.5 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 248328 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 158-60 chr18 1464362 1464707 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -104905 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 158.5-62 chr14 63032143 63032521 + 0.5 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) intron (NM_139318, intron 1 of 10) 13126 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 176.25-19 chr10 89191684 89192097 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 15427 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 119.25-197 chr7 86253421 86253729 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -390334 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 130.25-39 chr11 29703628 29703988 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 85006 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 123.75-121 chr3 101892627 101893003 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 43301 NM_031419 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 133.25-3 chr1 64898069 64898551 + 0.5 NA intron (NM_001321852, intron 1 of 24) intron (NM_001321852, intron 1 of 24) 68239 NM_001321855 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 113.25-43 chr14 20435215 20435649 + 0.5 NA exon (NM_001365790, exon 2 of 5) exon (NM_001365790, exon 2 of 5) 398 NM_001109997 123103 Hs.556014 NM_001109997 ENSG00000185271 KLHL33 - kelch like family member 33 protein-coding 147.25-32 chr14 46068805 46069215 + 0.5 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 4851 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 116.5-217 chr6 112540091 112540451 + 0.5 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 192941 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 115.75-126 chr20 42246881 42247268 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 15 of 31) intron (NM_133170, intron 15 of 31) -438409 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 166.5-166 chr5 99110823 99111349 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -181372 NR_157079 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 126.5-148 chr3 5682926 5683370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -432893 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 120.25-139 chr3 184636668 184636973 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75035 NM_004443 2049 Hs.2913 NM_004443 ENSG00000182580 EPHB3 EK2|ETK2|HEK2|TYRO6 EPH receptor B3 protein-coding 122.25-205 chr9 24500991 24501447 + 0.5 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 44457 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 131.75-127 chr22 35670235 35670582 + 0.5 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 21962 NM_030641 80830 Hs.257352 NM_030641 ENSG00000221963 APOL6 APOL-VI|APOLVI apolipoprotein L6 protein-coding 157.5-132 chr3 41228024 41228596 + 0.5 NA intron (NM_001904, intron 7 of 14) L1PA15|LINE|L1 28805 NM_001904 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 134.25-129 chr4 66087728 66088232 + 0.5 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -188844 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 141-100 chr3 52116588 52116897 + 0.5 NA intron (NM_015426, intron 9 of 10) intron (NM_015426, intron 9 of 10) 37681 NM_001161580 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 145-148 chr7 46502710 46503065 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 194235 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 117-49 chr14 21302702 21303140 + 0.5 NA intron (NM_020366, intron 4 of 23) AluSg|SINE|Alu 14944 NM_020366 57096 Hs.126035 NM_020366 ENSG00000092200 RPGRIP1 CORD13|LCA6|RGI1|RGRIP|RPGRIP|RPGRIP1d RPGR interacting protein 1 protein-coding 134.25-131 chr4 121643298 121643802 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 53430 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 116.25-62 chr14 42270092 42270473 + 0.5 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 663426 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 135-187 chr8 124159598 124160046 + 0.5 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) MIR1_Amn|SINE|MIR 11700 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 173.5-74 chr2 144002499 144003169 + 0.5 NA intron (NM_001354353, intron 7 of 9) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 65767 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 152.5-101 chr2 234402553 234403016 + 0.5 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 51811 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 151.5-203 chr9 27839642 27840168 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -266039 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 129.75-149 chr5 63407988 63408394 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 554101 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 115-54 chr15 33442585 33442878 + 0.5 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 131764 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 148.75-129 chr5 6442222 6442608 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -6444 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 179.25-38 chr12 9036530 9037036 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28287 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 141.75-95 chr2 98943706 98944178 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -7717 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 137.75-106 chr2 135584888 135585390 + 0.5 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) intron (NM_001282799, intron 1 of 22) -1213 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 144.25-113 chr20 4503520 4503866 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -182763 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 125.25-90 chr18 51521362 51521665 + 0.5 NA intron (NR_040074, intron 1 of 2) L1ME5|LINE|L1 129471 NR_040074 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 169.75-170 chrX 88912573 88913023 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 165573 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 150-81 chr20 38071541 38072028 + 0.5 NA intron (NM_021215, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 38038 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 116-46 chr14 53959924 53960163 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3152 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 154.75-20 chr11 47853882 47854458 + 0.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -5626 NM_001318399 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 126.5-6 chr1 42610158 42610652 + 0.5 NA intron (NM_001080850, intron 10 of 16) LTR33B|LTR|ERVL -48018 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 126.25-90 chr2 79442314 79442704 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 58335 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 182.25-83 chr3 133327104 133327629 + 0.5 NA intron (NM_001282865, intron 2 of 3) intron (NM_001282865, intron 2 of 3) -70245 NR_110812 101927455 Hs.570550 NR_110812 ENSG00000251011 TMEM108-AS1 - TMEM108 antisense RNA 1 ncRNA 136.25-199 chr9 123299103 123299437 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -30684 NM_018387 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 117.25-3 chr1 37273099 37273503 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 111738 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 262-42 chr5 21831512 21832244 + 0.5 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) intron (NM_004061, intron 8 of 14) -52576 NR_132788 106635540 NR_132788 SNORA105B - small nucleolar RNA, H/ACA box 105B snoRNA 121-203 chrX 153884856 153885211 + 0.5 NA intron (NR_130768, intron 3 of 6) intron (NR_130768, intron 3 of 6) 1140 NM_001278116 3897 Hs.522818 NM_000425 ENSG00000198910 L1CAM CAML1|CD171|HSAS|HSAS1|MASA|MIC5|N-CAM-L1|N-CAML1|NCAM-L1|S10|SPG1 L1 cell adhesion molecule protein-coding 125.25-130 chr3 7002487 7002903 + 0.5 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) L1MA7|LINE|L1 -108678 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 133.5-145 chr21 30210712 30211120 + 0.5 NA intron (NR_038855, intron 1 of 2) intron (NR_038855, intron 1 of 2) 867 NR_038855 266919 Hs.561028 NR_038855 ENSG00000227342 LINC00307 D21S2091E|NCRNA00307 long intergenic non-protein coding RNA 307 ncRNA 133.5-192 chr4 160998308 160998600 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -1024279 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 134.5-106 chr2 173753255 173753562 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 210472 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 151.5-54 chr14 84021115 84021607 + 0.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -1250571 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 127.75-108 chr2 159380859 159381163 + 0.5 NA intron (NM_001329858, intron 25 of 36) MER68|LTR|ERVL -94308 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 126.25-85 chr2 63258029 63258315 + 0.5 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) intron (NR_148705, intron 13 of 16) -138630 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 178-27 chr14 45529519 45529934 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 185876 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 117.5-121 chr20 1484715 1485166 + 0.5 NA intron (NM_001122962, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 6480 NM_001134836 284759 Hs.721685 NM_001122962 ENSG00000196209 SIRPB2 PTPN1L|PTPNS1L3|dJ776F14.2 signal regulatory protein beta 2 protein-coding 147.75-149 chr7 130292435 130292875 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001163446) promoter-TSS (NM_001163446) -479 NM_016352 51200 Hs.93764 NM_016352 ENSG00000128510 CPA4 CPA3 carboxypeptidase A4 protein-coding 120.75-54 chr15 69604177 69604513 + 0.5 NA intron (NR_126438, intron 1 of 3) intron (NR_126438, intron 1 of 3) 12145 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 137.75-217 chr9 129760037 129760355 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7154 NM_004878 9536 Hs.146688 NM_004878 ENSG00000148344 PTGES MGST-IV|MGST1-L1|MGST1L1|MPGES|PGES|PIG12|PP102|PP1294|TP53I12|mPGES-1 prostaglandin E synthase protein-coding 121.25-145 chr4 85845466 85845809 + 0.5 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) 17700 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 124-36 chr13 38013620 38014032 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 129406 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 144.25-199 chr8 77843087 77843483 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 392588 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 139.75-187 chr9 71772000 71772357 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -3665 NM_001349784 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 196.5-101 chr3 25153627 25154205 + 0.5 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) intron (NM_001290216, intron 3 of 10) -186886 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 112.25-88 chr19 48108167 48108545 + 0.5 NA intron (NM_001159323, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 2461 NM_003706 8605 Hs.631562 NM_003706 ENSG00000105499 PLA2G4C CPLA2-gamma phospholipase A2 group IVC protein-coding 122.5-178 chr5 15337489 15337870 + 0.5 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -71119 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 128.25-224 chr9 110770394 110770799 + 0.5 NA intron (NM_001369398, intron 4 of 8) L1M6|LINE|L1 42334 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 144.75-188 chr8 133200012 133200435 + 0.5 NA intron (NM_001204870, intron 1 of 1) intron (NM_001204870, intron 1 of 1) 9184 NR_037944 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 117.5-105 chr2 72026378 72026745 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 121301 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 113.25-170 chr8 81804288 81804588 + 0.5 NA intron (NR_145472, intron 4 of 6) intron (NR_145472, intron 4 of 6) 37747 NR_145474 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 147-58 chr17 81407455 81408030 + 0.5 NA intron (NM_001291324, intron 1 of 27) intron (NM_001291324, intron 1 of 27) -6964 NR_039894 100616294 NR_039894 ENSG00000266392 MIR4740 - microRNA 4740 ncRNA 176-21 chr14 33460362 33460881 + 0.5 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -248316 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 167.5-70 chr16 51693750 51694136 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -68576 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 168-48 chr14 56535540 56536062 + 0.5 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 21470 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 144.75-129 chr5 4400167 4400595 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -373100 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 179.75-104 chr5 83503994 83504595 + 0.5 NA intron (NM_001164098, intron 5 of 13) intron (NM_001164098, intron 5 of 13) 32550 NM_001126336 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 156-43 chr14 48511458 48511876 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -716653 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 181.25-129 chr8 125750079 125750615 + 0.5 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 200850 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 140.5-104 chr2 40782921 40783421 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -270736 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 158-133 chr8 28465899 28466306 + 0.5 NA intron (NM_001258211, intron 2 of 7) AluSp|SINE|Alu 24127 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 124.25-77 chr17 44240378 44240768 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19269 NR_045058 7343 Hs.89781 NM_014233 ENSG00000108312 UBTF CONDBA|NOR-90|UBF|UBF-1|UBF1|UBF2 upstream binding transcription factor protein-coding 146.5-187 chr6 48743501 48743982 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -675052 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 171.5-53 chr16 63734313 63734738 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1387538 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 114.25-197 chr8 135387038 135387435 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70220 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 132.25-131 chr3 116232411 116232913 + 0.5 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -127362 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 130.5-205 chr5 58338918 58339330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 120962 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 117.5-76 chr16 63196441 63196816 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1160190 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 119.5-70 chr13 79941217 79941613 + 0.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 68829 NR_120413 101927195 Hs.342412 NR_120413 ENSG00000229175 LINC00382 TCONS_00021500 long intergenic non-protein coding RNA 382 ncRNA 145-118 chr5 24335513 24335889 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 309277 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 207.75-10 chr1 199899473 199900054 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -127947 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 115.75-120 chr2 234923054 234923334 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -28823 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 154.75-12 chr10 72938816 72939373 + 0.5 NA intron (NM_001318125, intron 2 of 2) L1MB8|LINE|L1 15712 NM_001318125 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 125-119 chr4 114897547 114897925 + 0.5 NA intron (NM_022569, intron 6 of 13) L1MC1|LINE|L1 215884 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 133 chr1 30157070 30157575 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -119710 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 136-111 chr3 191169850 191170296 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29168 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 113.25-113 chr3 159932848 159933219 + 0.5 NA intron (NR_108088, intron 9 of 9) intron (NR_108088, intron 9 of 9) -55802 NM_000882 3592 Hs.673 NM_000882 ENSG00000168811 IL12A CLMF|IL-12A|NFSK|NKSF1|P35 interleukin 12A protein-coding 123-61 chr15 68270760 68271153 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6789 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 120.75-59 chr16 68043539 68043878 + 0.5 NA intron (NM_017803, intron 3 of 16) AluSz6|SINE|Alu -19841 NM_018380 55794 Hs.458313 NM_018380 ENSG00000182810 DDX28 MDDX28 DEAD-box helicase 28 protein-coding 116-146 chr6 146258283 146258685 + 0.5 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 229286 NM_001278066 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 128-160 chr7 124353580 124353960 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1674 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 148.75-74 chr18 1865219 1865654 + 0.5 NA Intergenic LTR27E|LTR|ERV1 -505807 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 159.5-206 chr8 101767712 101768228 + 0.5 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 22999 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 126.75-36 chr12 2047605 2047975 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_046768) promoter-TSS (NR_046768) -562 NR_046768 100874369 Hs.208723 NR_046768 ENSG00000256257 CACNA1C-IT2 - CACNA1C intronic transcript 2 ncRNA 126.5-161 chr3 175766731 175767103 + 0.5 NA intron (NM_207015, intron 13 of 13) intron (NM_207015, intron 13 of 13) 9416 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 179.25-105 chr3 101469068 101469561 + 0.5 NA intron (NM_020654, intron 3 of 23) L1PA6|LINE|L1 43898 NM_001282801 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 114.75-159 chr5 142706899 142707254 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9006 NM_001257205 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 167-32 chr12 66495109 66495605 + 0.5 NA intron (NM_001366722, intron 7 of 24) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 183719 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 148-110 chr5 132368222 132368708 + 0.5 NA intron (NR_110997, intron 1 of 7) AluJo|SINE|Alu -1244 NM_001308122 6584 Hs.443572 NM_003060 ENSG00000197375 SLC22A5 CDSP|OCTN2 solute carrier family 22 member 5 protein-coding 138.25-128 chr4 44229602 44229959 + 0.5 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) MER50B|LTR|ERV1 212718 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 116-7 chr1 155156447 155156902 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -16143 NM_153741 54344 Hs.110477 NM_018973 ENSG00000179085 DPM3 CDG1O dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatory protein-coding 125.5-260 chr8 127727110 127727534 + 0.5 NA intron (NR_117102, intron 1 of 3) MER102a|DNA|hAT-Charlie 6645 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 158.5-100 chr2 103388977 103389411 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -404765 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 136.5-99 chr19 57155867 57156244 + 0.5 NA intron (NM_001012729, intron 4 of 5) intron (NM_001012729, intron 4 of 5) -10853 NM_052882 114026 Hs.348622 NM_052882 ENSG00000141946 ZIM3 ZNF264|ZNF657 zinc finger imprinted 3 protein-coding 151.25-47 chr13 59887402 59887929 + 0.5 NA intron (NM_001258369, intron 20 of 26) L1ME2|LINE|L1 -125053 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 225-80 chr8 131996958 131997721 + 0.5 NA intron (NM_015137, intron 19 of 22) intron (NM_015137, intron 19 of 22) 62043 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 158.5-95 chr2 67363048 67363497 + 0.5 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -34061 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 136.25-132 chr4 114310883 114311316 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -287303 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 133.25-107 chr2 159554589 159554996 + 0.5 NA intron (NM_001329858, intron 2 of 36) intron (NM_001329858, intron 2 of 36) -60502 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 127.75-49 chr11 119892082 119892569 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 162742 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 147.75-136 chr6 154136690 154137011 + 0.5 NA intron (NM_001008503, intron 3 of 3) intron (NM_001008503, intron 3 of 3) 47088 NM_001285527 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 144.25-162 chr5 139624628 139625082 + 0.5 NA intron (NM_181838, intron 7 of 7) intron (NM_181838, intron 7 of 7) -22444 NM_001317201 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 191.5-124 chr6 27071412 27071847 + 0.5 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -51323 NR_026776 100270746 Hs.590428 NR_026776 LOC100270746 - uncharacterized LOC100270746 ncRNA 115.25-206 chr8 85556461 85556868 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -91749 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 118.75-192 chr7 155599563 155599938 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -29004 NM_001369813 285888 Hs.146751 NM_001103176 ENSG00000146910 CNPY1 - canopy FGF signaling regulator 1 protein-coding 173-104 chr5 15433829 15434442 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -66045 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 132.5-137 chr2 240398803 240399216 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36654 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 113.25-185 chr9 88418021 88418465 + 0.5 NA intron (NM_006717, intron 1 of 5) MER21C|LTR|ERVL 29799 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 132.25-162 chr5 155548251 155548660 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 534700 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 131.5-9 chr1 116119799 116120282 + 0.5 NA intron (NM_152367, intron 2 of 6) intron (NM_152367, intron 2 of 6) 8285 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 166.5-92 chr19 38620277 38620638 + 0.5 NA intron (NM_013234, intron 2 of 7).2 intron (NM_013234, intron 2 of 7).2 1269 NM_001300992 27335 Hs.314359 NM_013234 ENSG00000178982 EIF3K ARG134|EIF3-p28|EIF3S12|HSPC029|M9|MSTP001|PLAC-24|PLAC24|PRO1474|PTD001 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K protein-coding 126.25-182 chr6 143523267 143523761 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -11794 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 166-29 chr14 47927835 47928257 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -133032 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 113-43 chr11 83844891 83845266 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) intron (NM_001142699, intron 16 of 27) -162653 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 115-82 chr2 66719888 66720205 + 0.5 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -16819 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 191.75-17 chr10 73405122 73405830 + 0.5 NA intron (NM_004034, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 8582 NM_001320879 310 Hs.631827 NM_001156 ENSG00000138279 ANXA7 ANX7|SNX|SYNEXIN annexin A7 protein-coding 197.25-10 chr10 31827418 31827927 + 0.5 NA intron (NM_001270696, intron 8 of 17) AluY|SINE|Alu 81254 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 133.75-72 chr16 89131716 89132124 + 0.5 NA intron (NR_104293, intron 7 of 10) intron (NR_104293, intron 7 of 10) -4628 NR_045667 197322 Hs.461727 NM_174917 ENSG00000176715 ACSF3 - acyl-CoA synthetase family member 3 protein-coding 223.75-55 chr20 35708255 35708987 + 0.5 NA intron (NR_040722, intron 14 of 17) intron (NR_040722, intron 14 of 17) 9216 NM_080748 140823 Hs.472564 NM_080748 ENSG00000125995 ROMO1 C20orf52|MTGM|MTGMP|bA353C18.2 reactive oxygen species modulator 1 protein-coding 155.25-176 chr8 71187480 71187891 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 169021 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 151.25-108 chr20 52173669 52174270 + 0.5 NA intron (NM_199427, intron 2 of 8) intron (NM_199427, intron 2 of 8) 17810 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 142.75-103 chr2 121023251 121023763 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 231226 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 173-107 chr5 33281481 33282145 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 52078 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 136-120 chr5 10359664 10360022 + 0.5 NA intron (NM_001270661, intron 1 of 22) AluSx1|SINE|Alu 6148 NM_005885 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 159.75-47 chr14 69634237 69634738 + 0.5 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 22891 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 141.25-85 chr2 125163800 125164277 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 953947 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 127.5-165 chr4 45469210 45469575 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 654662 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 161.25-79 chr18 58740253 58740762 + 0.5 NA intron (NM_006785, intron 13 of 16) L1ME3F|LINE|L1 -68634 NM_001289967 101927322 Hs.644875 NM_001289967 LOC101927322 - uncharacterized LOC101927322 protein-coding 182-8 chr1 199383096 199383526 + 0.5 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) L1MB7|LINE|L1 234713 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 120.75-144 chr6 49581511 49581759 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 30967 NR_146864 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 158.25-9 chr10 43307731 43308108 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -40854 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 113-38 chr11 7338237 7338683 + 0.5 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) L1PREC2|LINE|L1 86556 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 113-16 chr1 238655367 238655739 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -169536 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 126-128 chr4 75904488 75904943 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2263 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 130.5-56 chr11 24780565 24780989 + 0.5 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 283724 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 155.25-80 chr17 49877925 49878355 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30123 NM_001077506 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 130-163 chr8 38523556 38524068 + 0.5 NA intron (NM_207412, intron 1 of 2) intron (NM_207412, intron 1 of 2) 4850 NM_001369353 389649 Hs.546586 NM_207412 ENSG00000196166 C8orf86 - chromosome 8 open reading frame 86 protein-coding 163.75-141 chrX 91391526 91391992 + 0.5 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -43080 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 188.75-72 chr21 31247758 31248187 + 0.5 NA intron (NM_001353686, intron 5 of 27) MER20|DNA|hAT-Charlie -87032 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 146.5-122 chr2 222638893 222639309 + 0.5 NA intron (NR_130154, intron 6 of 17) intron (NR_130154, intron 6 of 17) 16991 NM_005687 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 116.5-263 chr9 30323461 30323852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 84798 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 150.5-159 chr4 166981384 166981809 + 0.5 NA intron (NM_001204355, intron 2 of 8) MER52A|LTR|ERV1 252830 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 125.25-45 chr12 21616017 21616291 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11307 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 160.5-2 chr1 117543984 117544476 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 61540 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 162.25-131 chr5 81783894 81784378 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32883 NM_001256734 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 116-85 chr2 76504191 76504579 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -481580 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 125.5-163 chr22 35091269 35091756 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 25354 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 149.75-157 chr7 77264960 77265422 + 0.5 NA intron (NM_020879, intron 9 of 18) intron (NM_020879, intron 9 of 18) -65372 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 172.5-179 chr7 17594671 17595172 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36012 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 176-70 chr7 28427516 28428095 + 0.5 NA intron (NM_182898, intron 1 of 10) intron (NM_182898, intron 1 of 10) -7810 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 163.5-181 chr6 163113389 163113766 + 0.5 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) L1M4c|LINE|L1 -59416 NR_110871 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 132.25-2 chr1 36912560 36913002 + 0.5 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 121734 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 115.25-46 chr12 29633431 29633808 + 0.5 NA intron (NM_175861, intron 5 of 17) intron (NM_175861, intron 5 of 17) -133926 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 120.75-122 chr4 45975125 45975564 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 148710 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 113.75-138 chr4 59932386 59932642 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 918941 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 220.5-23 chr14 20529713 20530407 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 19588 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 155.5-10 chr1 69802412 69802809 + 0.5 NA intron (NM_001370785, intron 4 of 26) L1PA14|LINE|L1 -116712 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 173-51 chr16 8572119 8572636 + 0.5 NA intron (NM_001290097, intron 2 of 3) intron (NM_001290097, intron 2 of 3) 17461 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 206.5-9 chr11 8394939 8395450 + 0.5 NA intron (NM_001352399, intron 11 of 11) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -126407 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 113-121 chr3 107117816 107118166 + 0.5 NA intron (NR_028303, intron 2 of 3) intron (NR_028303, intron 2 of 3) 122647 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 123.25-75 chr16 89609187 89609611 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3909 NM_001128141 1800 Hs.109 NM_004413 ENSG00000015413 DPEP1 MBD1|MDP|RDP dipeptidase 1 protein-coding 141.25-130 chr5 27362338 27362754 + 0.5 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -109746 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 139.25-181 chr7 70854526 70854947 + 0.5 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 -277408 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 216-61 chr4 67597319 67597884 + 0.5 NA intron (NM_012108, intron 8 of 8) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 38874 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 127.75-144 chr4 63127978 63128361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -966404 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 115.75-46 chr12 65243468 65243890 + 0.5 NA intron (NM_014319, intron 10 of 12) intron (NM_014319, intron 10 of 12) -35004 NM_001031679 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 115.25-194 chr7 115309480 115309765 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -78267 NR_126407 104355291 NR_126407 ENSG00000233607 LINC01392 - long intergenic non-protein coding RNA 1392 ncRNA 150.75-93 chr2 57805352 57805746 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -102102 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 146-34 chr13 75122019 75122541 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 118101 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 117.5-229 chr8 55473682 55474110 + 0.5 NA intron (NM_052898, intron 2 of 2) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18575 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 130.75-36 chr12 2732010 2732456 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41076 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 130.25-108 chr2 186089785 186090207 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3679 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 158.25-43 chr15 71871132 71871642 + 0.5 NA intron (NM_006901, intron 32 of 41) AluJb|SINE|Alu 60833 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 113.75-92 chr19 55443489 55443853 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001145176) promoter-TSS (NM_001145176) -808 NM_001145176 729956 Hs.6664 NM_175908 ENSG00000187902 SHISA7 - shisa family member 7 protein-coding 140.75-57 chr15 60175143 60175641 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 171081 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 130.25-152 chr4 95931471 95931833 + 0.5 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 91559 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 120.25-34 chr10 125798849 125799223 + 0.5 NA intron (NR_136676, intron 6 of 10) intron (NR_136676, intron 6 of 10) -20704 NR_039704 100616327 NR_039704 ENSG00000265092 MIR4484 mir-4484 microRNA 4484 ncRNA 162.5-158 chr7 6284158 6284648 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -11779 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 121-178 chr7 72300524 72300972 + 0.5 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 36643 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 127.25-10 chr1 237910671 237911105 + 0.5 NA intron (NR_027247, intron 8 of 11) intron (NR_027247, intron 8 of 11) -19966 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 131.75-37 chr11 55021557 55021963 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -240395 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 122.5-59 chr14 43884263 43884660 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 622822 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 138-81 chr2 135265737 135266222 + 0.5 NA intron (NM_001286569, intron 12 of 21) AluSx1|SINE|Alu 129351 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 127-130 chr5 17201142 17201432 + 0.5 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu -15536 NM_001271606 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 168.5-200 chr9 81195881 81196325 + 0.5 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 493432 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 112.75-9 chr1 92551992 92552343 + 0.5 NA intron (NM_001350198, intron 19 of 19) L1MC4|LINE|L1 -65242 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 134.75-103 chr2 3855978 3856430 + 0.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 117828 NR_037881 100505964 Hs.190267 NR_037881 ENSG00000237401 LINC01304 - long intergenic non-protein coding RNA 1304 ncRNA 142.5-6 chr1 35564456 35564862 + 0.5 NA intron (NM_014284, intron 6 of 6) intron (NM_014284, intron 6 of 6) 6860 NM_014284 23154 Hs.121870 NM_014284 ENSG00000020129 NCDN - neurochondrin protein-coding 156-50 chr14 78533785 78534151 + 0.5 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 130249 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 133-7 chr1 172459777 172460169 + 0.5 NA intron (NM_139240, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 7080 NM_001300760 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 120.75-94 chr20 43433608 43433994 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24095 NM_006275 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 155.5-56 chr14 86777163 86777606 + 0.5 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -128394 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 144.25-13 chr1 125013595 125014035 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 3494703 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 150.25-93 chr3 8777402 8777931 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -8052 NM_001354654 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 112.5-110 chr2 49868595 49868840 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 105486 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 187-60 chr3 103596953 103597568 + 0.5 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -73144 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 180.5-84 chr21 33376049 33376626 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26559 NM_005534 3460 Hs.634632 NM_005534 ENSG00000159128 IFNGR2 AF-1|IFGR2|IFNGT1|IMD28 interferon gamma receptor 2 protein-coding 119-141 chr5 2472116 2472462 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -160088 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 114.5-31 chr10 28349368 28349761 + 0.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -46500 NR_134517 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 157.25-76 chr2 59810292 59810770 + 0.5 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 572505 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 155-5 chr1 147455276 147455801 + 0.5 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) intron (NR_038423, intron 3 of 3) 62337 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 135-155 chr6 50178776 50179255 + 0.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -129086 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 148.5-102 chr2 61012223 61012750 + 0.5 NA intron (NM_144709, intron 1 of 17) MER39B|LTR|ERV1 4726 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 117-193 chr9 27052623 27053069 + 0.5 NA intron (NM_025103, intron 16 of 19) intron (NM_025103, intron 16 of 19) -47174 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 167-43 chr14 84927918 84928505 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -343721 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 124-15 chr10 49197443 49197845 + 0.5 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -9253 NM_001288741 170371 Hs.385493 NM_001010863 ENSG00000204161 TMEM273 C10orf128 transmembrane protein 273 protein-coding 159.25-103 chr4 60083668 60084225 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -838673 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 179.5-65 chr15 77195404 77195893 + 0.5 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 29756 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 156.25-86 chr20 45361849 45362395 + 0.5 NA intron (NM_001197129, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 173 NM_001197129 90196 Hs.655055 NM_033542 ENSG00000204070 SYS1 C20orf169|dJ453C12.4|dJ453C12.4.1 SYS1 golgi trafficking protein protein-coding 132.25-16 chr1 162645550 162646015 + 0.5 NA intron (NM_006182, intron 1 of 17) intron (NM_006182, intron 1 of 17) 13318 NM_006182 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 128.25-2 chr1 14273973 14274412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 145781 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 114.25-94 chr2 77299712 77300087 + 0.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) AluSc|SINE|Alu 222477 NM_024993 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 149.75-108 chr22 30125952 30126439 + 0.5 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) AluY|SINE|Alu 45731 NM_152510 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 130-14 chr10 59035548 59035948 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 36230 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 127.5-123 chr2 123547347 123547797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -474091 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 158.75-83 chr2 28347894 28348391 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37683 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 150.75-88 chr2 7587687 7588232 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 166698 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 160.5-105 chr21 30744372 30744779 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 2684 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 128.75-23 chr10 84521954 84522255 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 96935 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 153.75-78 chr20 51366868 51367280 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 85903 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 126.25-20 chr10 84397943 84398257 + 0.5 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -26839 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 178-103 chr8 102477337 102477850 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -64893 NM_015902 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 147-9 chr1 98308212 98308694 + 0.5 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 97742 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 142-159 chr8 81393899 81394266 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 53357 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 130.5-29 chr10 9012178 9012658 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 114429 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 124-42 chr13 105406989 105407353 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58696 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 195-50 chr20 15201420 15202009 + 0.5 NA intron (NM_001033087, intron 1 of 13) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 4874 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 124.75-39 chr11 21162636 21162899 + 0.5 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) intron (NM_201551, intron 13 of 18) 493181 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 152.75-11 chr1 194248678 194249028 + 0.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 944108 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 116.25-14 chr1 228811188 228811490 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75860 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 136-47 chr16 48802985 48803317 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -192971 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 154.25 chr1 36923491 36924095 + 0.5 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) intron (NM_000831, intron 1 of 15) 110722 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 146.75-114 chr4 71118302 71118753 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -68732 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 134.75-33 chr10 108567478 108568001 + 0.5 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -498446 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 126.75-67 chr14 103776416 103776914 + 0.5 NA intron (NM_015316, intron 4 of 16) AluY|SINE|Alu 60921 NM_001198953 79038 Hs.592322 NM_024071 ENSG00000100711 ZFYVE21 HCVP7TP1|ZF21 zinc finger FYVE-type containing 21 protein-coding 123.75-54 chr14 23901630 23902089 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51911 NM_021004 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 159.25-7 chr1 151407737 151408289 + 0.5 NA intron (NM_001194938, intron 14 of 17) AluSx|SINE|Alu 8440 NM_002796 5692 Hs.89545 NM_002796 ENSG00000159377 PSMB4 HN3|HsN3|PRAAS3|PROS-26|PROS26 proteasome subunit beta 4 protein-coding 130.5-260 chrX 45704390 45704831 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26478 NR_102268 392452 Hs.745266 NR_102268 LOC392452 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 134.75-165 chr4 128613454 128613806 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 185614 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 126.75-53 chr14 45687903 45688262 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 27520 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 144.25-154 chr5 5288375 5288833 + 0.5 NA intron (NM_139056, intron 18 of 22) intron (NM_139056, intron 18 of 22) -134073 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 152.75-93 chr2 227657230 227657773 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24181 NM_001162483 56918 Hs.283092 NM_020161 ENSG00000042304 C2orf83 - chromosome 2 open reading frame 83 protein-coding 121.75-146 chr5 43484321 43484627 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_022483) promoter-TSS (NM_022483) -609 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 115-75 chr19 46421229 46421578 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7839 NM_032040 83987 Hs.97876 NM_032040 ENSG00000169515 CCDC8 3M3|PPP1R20|p90 coiled-coil domain containing 8 protein-coding 173.75-105 chr3 17385728 17386290 + 0.5 NA intron (NM_014744, intron 8 of 21) intron (NM_014744, intron 8 of 21) 314011 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 119.25-200 chr7 154260789 154261069 + 0.5 NA intron (NM_130797, intron 1 of 25) AluSx4|SINE|Alu -44230 NM_001936 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 123.25-72 chr16 71437958 71438407 + 0.5 NA intron (NM_001367365, intron 1 of 9) AluSx|SINE|Alu 3872 NM_001367365 143.25 chr1 21851656 21852025 + 0.5 NA exon (NM_001291860, exon 54 of 97) exon (NM_001291860, exon 54 of 97) 39575 NM_001013693 401944 Hs.745158 NM_001013693 ENSG00000187942 LDLRAD2 - low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 protein-coding 133-35 chr12 94008803 94009141 + 0.5 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA -65366 NR_135017 105369911 Hs.577495 NR_135017 ENSG00000257283 LOC105369911 - uncharacterized LOC105369911 ncRNA 119.25-223 chr9 104789207 104789620 + 0.5 NA intron (NM_005502, intron 44 of 49) intron (NM_005502, intron 44 of 49) 25284 NM_018376 55335 Hs.429294 NM_018376 ENSG00000165028 NIPSNAP3B FP944|NIPSNAP3|SNAP1 nipsnap homolog 3B protein-coding 148.25-147 chr8 104163200 104163729 + 0.5 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -59871 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 136.75-35 chr10 91767787 91768306 + 0.5 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 30150 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 142.75-196 chr8 144437786 144438161 + 0.5 NA intron (NR_109770, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu -2354 NR_106953 102466271 NR_106953 ENSG00000276598 MIR6893 hsa-mir-6893 microRNA 6893 ncRNA 156-38 chr13 67941441 67941981 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 569324 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 137.25-13 chr10 13493210 13493558 + 0.5 NA intron (NM_001370075, intron 3 of 8) intron (NM_001370075, intron 3 of 8) 9592 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 130-156 chr7 89300968 89301352 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -505423 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 166.75-39 chr13 42926571 42927160 + 0.5 NA intron (NM_033255, intron 6 of 10) intron (NM_033255, intron 6 of 10) -54121 NR_126389 104355147 Hs.633967 NR_126388 LINC00428 - long intergenic non-protein coding RNA 428 ncRNA 134.5-20 chr10 6480101 6480481 + 0.5 NA intron (NM_001282644, intron 11 of 17) MIRb|SINE|MIR 99985 NM_001282644 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 121-112 chr2 193594675 193595123 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -749370 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 121.25-74 chr16 56187015 56187477 + 0.5 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) intron (NR_027078, intron 2 of 4) 3848 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 158.5-189 chr8 71198989 71199620 + 0.5 NA 3' UTR (NM_000503, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_000503, exon 18 of 18) 157402 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 117.5-50 chr12 90584141 90584561 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 291033 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 185.5-14 chr1 228769857 228770328 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 34613 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 149.25-58 chr17 32298045 32298366 + 0.5 NA intron (NM_001363835, intron 6 of 7) intron (NM_001363835, intron 6 of 7) 32029 NM_001363834 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 145.5-147 chr4 93074508 93075050 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L1MCc|LINE|L1 -753974 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 128.75-125 chr3 113393994 113394458 + 0.5 NA intron (NM_001164496, intron 15 of 34) L1MD2|LINE|L1 -9772 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 120.75-61 chr17 31414101 31414503 + 0.5 NA intron (NM_032932, intron 1 of 14) intron (NM_032932, intron 1 of 14) 22627 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 172.25-131 chr7 26779738 26780145 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 77782 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 112.75-98 chr2 102323017 102323438 + 0.5 NA intron (NM_001282408, intron 1 of 6) L1ME2|LINE|L1 11664 NM_016232 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 120.75-162 chr7 112903377 112903815 + 0.5 NA intron (NM_152556, intron 2 of 4) L1MC4|LINE|L1 36279 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 135.5-115 chr2 190184556 190185085 + 0.5 NA intron (NM_032321, intron 1 of 1) intron (NM_032321, intron 1 of 1) 3957 NM_032321 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 124.75-215 chr9 84492605 84492984 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -124067 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 114.25-143 chr4 134921449 134921877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 201896 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 128.25-202 chr8 52664930 52665217 + 0.5 NA intron (NM_001083617, intron 8 of 23) intron (NM_001083617, intron 8 of 23) 49362 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 139.25-184 chr7 98168391 98168803 + 0.5 NA intron (NM_014916, intron 6 of 13) intron (NM_014916, intron 6 of 13) -43657 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 130.75-189 chr8 74277552 74277989 + 0.5 NA intron (NM_020647, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 43591 NM_001363051 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 144.25-151 chr4 144380568 144380996 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -240064 NM_001308187 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 149.75-82 chr2 66490652 66491064 + 0.5 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -50528 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 118.25-159 chr5 101948954 101949378 + 0.5 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 347118 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 139.5-38 chr12 5690242 5690758 + 0.5 NA intron (NM_001278596, intron 15 of 25) intron (NM_001278596, intron 15 of 25) 196368 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 116.5-181 chr4 133642892 133643334 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 493819 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 142.5-166 chr5 31052139 31052669 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -141282 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 140.75-200 chrX 86506991 86507319 + 0.5 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 244187 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 114.5-87 chr14 37126273 37126618 + 0.5 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -45581 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 171.75-85 chr2 222168815 222169337 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -129071 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 134-22 chr10 77630014 77630523 + 0.5 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 7540 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 137.75-148 chr4 40079077 40079477 + 0.5 NA intron (NM_001318359, intron 2 of 18) intron (NM_001318359, intron 2 of 18) -22078 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 115-180 chr8 92769122 92769557 + 0.5 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) HERVL-int|LTR|ERVL 16721 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 121.25-91 chr2 67496781 67497166 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 99640 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 151.5-111 chr3 4271680 4272018 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31455 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 133.75-99 chr2 107440507 107440850 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -88741 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 130.25-126 chr22 32889416 32889676 + 0.5 NA intron (NM_003490, intron 4 of 13) intron (NM_003490, intron 4 of 13) 88730 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 130.25-72 chr15 85656573 85656888 + 0.5 NA intron (NM_001270546, intron 4 of 28) AluY|SINE|Alu 36780 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 124-19 chr10 110059507 110059905 + 0.5 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) AluSx4|SINE|Alu -51325 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 146.25-56 chr17 78852653 78853195 + 0.5 NA TTS (NM_003255) TTS (NM_003255) -12397 NM_001321291 57602 Hs.464243 NM_025090 ENSG00000055483 USP36 DUB1 ubiquitin specific peptidase 36 protein-coding 129.5-45 chr11 98357072 98357351 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -663738 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 126.25-99 chr20 11195615 11196009 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 77571 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 164-17 chr11 21518583 21519223 + 0.5 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -674182 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 141.75-47 chr12 95687540 95688076 + 0.5 NA intron (NM_001329701, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 38553 NR_077225 100132594 Hs.676211 NR_077225 ENSG00000257150 PGAM1P5 - phosphoglycerate mutase 1 pseudogene 5 pseudo 121-111 chr2 178438063 178438445 + 0.5 NA intron (NM_001139517, intron 5 of 6) L1P1|LINE|L1 12374 NM_001139518 8575 Hs.570274 NM_003690 ENSG00000180228 PRKRA DYT16|HSD14|PACT|RAX protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2 protein-coding 129.75-67 chr15 44091682 44092115 + 0.5 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) 102548 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 114.75-111 chr21 30207272 30207681 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 4307 NR_038855 266919 Hs.561028 NR_038855 ENSG00000227342 LINC00307 D21S2091E|NCRNA00307 long intergenic non-protein coding RNA 307 ncRNA 153.5-144 chr4 61948398 61948765 + 0.5 NA intron (NM_001371343, intron 16 of 23) intron (NM_001371343, intron 16 of 23) 213184 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 148.25-65 chr2 1809202 1809736 + 0.5 NA intron (NM_015025, intron 21 of 24) intron (NM_015025, intron 21 of 24) -64954 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 127.75-20 chr1 177704690 177704957 + 0.5 NA intron (NR_110722, intron 2 of 3) intron (NR_110722, intron 2 of 3) 4299 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 146.75-117 chr4 128274749 128275207 + 0.5 NA intron (NM_006320, intron 1 of 2) MIR1_Amn|SINE|MIR 12835 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 136.5-218 chr8 33605365 33605894 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5523 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 125.75-54 chr14 68010052 68010355 + 0.5 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 186611 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 138.25-19 chr10 47049923 47050229 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 138354 NM_001320683 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 121-169 chr6 129628530 129628950 + 0.5 NA intron (NM_033515, intron 5 of 14) L1MC4|LINE|L1 81437 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 121.5-95 chr16 11736441 11736799 + 0.5 NA intron (NR_136673, intron 1 of 9) intron (NR_136673, intron 1 of 9) 6237 NM_001303447 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 218.5-93 chr4 153834806 153835459 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -46049 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 115.5-29 chr10 125721162 125721555 + 0.5 NA exon (NM_015608, exon 2 of 24) exon (NM_015608, exon 2 of 24) 1649 NR_110859 26098 Hs.468688 NM_015608 ENSG00000107938 EDRF1 C10orf137 erythroid differentiation regulatory factor 1 protein-coding 117.25-121 chr2 130373261 130373717 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001142370, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001142370, exon 11 of 11) 17433 NM_014369 26469 Hs.516390 NM_014369 ENSG00000072135 PTPN18 BDP1|PTP-HSCF protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18 protein-coding 141.75-42 chr12 14480540 14480839 + 0.5 NA intron (NM_181352, intron 12 of 14) intron (NM_181352, intron 12 of 14) -87043 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 133.25-86 chr18 79954250 79954759 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2851 NM_025078 80148 Hs.288284 NM_025078 ENSG00000122490 SLC66A2 PQLC1 solute carrier family 66 member 2 protein-coding 151-130 chr7 84231617 84232017 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37028 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 137-46 chr14 47212791 47213105 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) HAL1|LINE|L1 130298 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 192.75-13 chr10 56024331 56025017 + 0.5 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 336585 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 131-57 chr14 77519707 77520181 + 0.5 NA intron (NM_004863, intron 10 of 11) MER57A-int|LTR|ERV1 -21128 NM_182509 145501 Hs.29742 NM_182509 ENSG00000100593 ISM2 TAIL1|THSD3 isthmin 2 protein-coding 161.5 chr1 20967113 20967600 + 0.5 NA intron (NM_003760, intron 7 of 31) intron (NM_003760, intron 7 of 31) 21076 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 180-60 chr2 80520322 80520841 + 0.5 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 207202 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 124.75-82 chr15 37914686 37915164 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19682 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 119.5-105 chr18 2541955 2542233 + 0.5 NA intron (NM_001308401, intron 7 of 7) intron (NM_001308401, intron 7 of 7) 29411 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 134.25-173 chr7 43600653 43601044 + 0.5 NA intron (NM_004760, intron 2 of 6) SVA_A|Retroposon|SVA 17740 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 133-54 chr15 37635639 37635977 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -298799 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 119.75-52 chr13 94540571 94540907 + 0.5 NA intron (NM_001322186, intron 1 of 9) L1MA4|LINE|L1 8667 NM_001322183 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 122-116 chr3 58005938 58006315 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2296 NM_001164317 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 138.25-12 chr1 109890267 109890696 + 0.5 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? -20368 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 130.25-24 chr10 29250372 29250759 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38505 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 142.75-140 chr4 43013009 43013479 + 0.5 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) L1PA8A|LINE|L1 119978 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 173.75-20 chr10 23394101 23394577 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -44930 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 128-87 chr20 20185897 20186375 + 0.5 NA intron (NM_015585, intron 13 of 26) L1MB7|LINE|L1 129490 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 156.5-171 chr7 28766223 28766818 + 0.5 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 80387 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 137.25-33 chr12 51408111 51408537 + 0.5 NA intron (NM_001258401, intron 1 of 24) AluSx|SINE|Alu -16507 NR_047672 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 161.5-8 chr1 172977972 172978444 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 72755 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 186-29 chr14 70847565 70848268 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -38403 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 130.75-62 chr15 85589470 85589939 + 0.5 NA intron (NM_007200, intron 8 of 36) AluSz6|SINE|Alu -30246 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 112.75-25 chr10 74861335 74861723 + 0.5 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) MIR|SINE|MIR 34929 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 121-101 chr2 56419947 56420257 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -234332 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 121.75-72 chr2 4293161 4293611 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 319225 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 130-134 chr5 147849850 147850189 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10788 NM_003122 6690 Hs.407856 NM_003122 ENSG00000164266 SPINK1 PCTT|PSTI|Spink3|TATI|TCP serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 protein-coding 120.75-19 chr10 90390549 90390976 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 150043 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 137.5-165 chr3 118952967 118953503 + 0.5 NA intron (NM_001353325, intron 1 of 7) L1PB1|LINE|L1 10159 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 113-64 chr15 52720197 52720546 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -41737 NR_104457 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 178.5-149 chr5 159318336 159318927 + 0.5 NA intron (NM_002187, intron 6 of 7) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 11842 NM_002187 3593 Hs.674 NM_002187 ENSG00000113302 IL12B CLMF|CLMF2|IL-12B|IMD28|IMD29|NKSF|NKSF2 interleukin 12B protein-coding 116.5-153 chr3 356608 357002 + 0.5 NA intron (NM_001253388, intron 9 of 24) L2a|LINE|L2 28990 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-112 chr20 46027172 46027413 + 0.5 NA intron (NM_001134771, intron 1 of 25) intron (NM_001134771, intron 1 of 25) -1923 NM_020708 57468 Hs.21413 NM_020708 ENSG00000124140 SLC12A5 EIEE34|EIG14|KCC2|hKCC2 solute carrier family 12 member 5 protein-coding 120.25-205 chr7 112531590 112531851 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 50729 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 126.25-83 chr2 56213455 56213845 + 0.5 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -27880 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 119.75-83 chr18 3941163 3941439 + 0.5 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -21052 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 114.75-81 chr19 38146035 38146381 + 0.5 NA intron (NM_015073, intron 12 of 21) L1MD2|LINE|L1 -16888 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 143.75-135 chr4 66093342 66093663 + 0.5 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -183322 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 152-20 chr1 221104711 221105317 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -224874 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 198.75-91 chr7 53052104 53052574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16706 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 147.25-121 chr6 89666765 89667123 + 0.5 NA intron (NM_014611, intron 84 of 101) L1ME3G|LINE|L1 -28197 NM_020466 57226 Hs.177275 NM_020466 ENSG00000083099 LYRM2 DJ122O8.2 LYR motif containing 2 protein-coding 119.5-23 chr10 44454347 44454755 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -69454 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 219-12 chr10 72799122 72799810 + 0.5 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 78437 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 116.25-59 chr13 72292040 72292411 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -425021 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 135-75 chr2 33251931 33252252 + 0.5 NA intron (NM_206943, intron 10 of 33) intron (NM_206943, intron 10 of 33) 117494 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 165.25-126 chr6 72048991 72049436 + 0.5 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) intron (NM_001350411, intron 2 of 3) 162510 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 120-178 chr7 85986334 85986688 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 565389 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 136.25-118 chr3 19528748 19529220 + 0.5 NA intron (NM_144633, intron 15 of 15) intron (NM_144633, intron 15 of 15) -214053 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 117.5-5 chr1 85124183 85124464 + 0.5 NA intron (NM_001288563, intron 18 of 21) intron (NM_001288563, intron 18 of 21) -9471 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 149.25-135 chr4 104049387 104049856 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -329636 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 144.75-176 chr8 88960921 88961429 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -633692 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 173.25-58 chr2 62724845 62725331 + 0.5 NA intron (NM_001142615, intron 2 of 22) L1PA13|LINE|L1 18191 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 166.25-128 chr5 76004778 76005232 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -78378 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 124-99 chr20 3449034 3449297 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21853 NM_139321 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 138-29 chr12 105793052 105793512 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 86508 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 115.75-114 chr2 175488454 175488831 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -306932 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 141-12 chr1 208199571 208199931 + 0.5 NA intron (NM_025179, intron 3 of 31) MIRc|SINE|MIR 44633 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 135.25-206 chr8 136708439 136708883 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 177863 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 190.75-112 chr8 124257903 124258429 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10768 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 145-153 chr8 56208285 56208741 + 0.5 NA intron (NM_002655, intron 1 of 4) intron (NM_002655, intron 1 of 4) 2760 NM_001114635 5324 Hs.14968 NM_002655 ENSG00000181690 PLAG1 PSA|SGPA|ZNF912 PLAG1 zinc finger protein-coding 198.25-102 chr8 125102869 125103336 + 0.5 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) AluSx3|SINE|Alu 11242 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 160.75-76 chr2 116845619 116846045 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -968859 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 157.75-84 chr2 62756694 62757251 + 0.5 NA intron (NM_001142615, intron 3 of 22) intron (NM_001142615, intron 3 of 22) 50075 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 119.75-27 chr10 113947818 113948193 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 93344 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 115.25-5 chr1 40992070 40992366 + 0.5 NA intron (NR_125440, intron 7 of 17) L2c|LINE|L2 3699 NM_001301237 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 137-80 chr2 101204278 101204787 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -48354 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 152.25-110 chr4 61351841 61352353 + 0.5 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 149925 NM_001371342 119-10 chr1 203062573 203062991 + 0.5 NA intron (NM_001304331, intron 24 of 29) L1ME3F|LINE|L1 -21013 NR_160550 114004358 NR_160550 MYOPARR - myogenin promoter associated myogenic regulatory antisense long non coding RNA ncRNA 157.75-5 chr1 208231274 208231722 + 0.5 NA intron (NM_025179, intron 1 of 31) intron (NM_025179, intron 1 of 31) 12886 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 123.75-70 chr16 8933475 8933814 + 0.5 NA intron (NM_003470, intron 1 of 30) FLAM_C|SINE|Alu 2995 NM_001286458 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 166-83 chr3 88762049 88762678 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -345258 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 128.75-116 chr22 50699369 50699698 + 0.5 NA intron (NM_033517, intron 12 of 21).2 intron (NM_033517, intron 12 of 21).2 24891 NM_033517 85358 Hs.149035 NM_033517 ENSG00000251322 SHANK3 DEL22q13.3|PROSAP2|PSAP2|SCZD15|SPANK-2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3 protein-coding 142 chr1 5761520 5761984 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 100989 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 120.25-226 chr9 124619949 124620314 + 0.5 NA intron (NM_033334, intron 2 of 9) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -38305 NR_038975 100379345 Hs.660412 NR_038975 ENSG00000224020 MIR181A2HG - MIR181A2 host gene ncRNA 155-141 chr8 114429731 114430130 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -992991 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 154.75-85 chr21 16765789 16766392 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 175853 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 133.75-193 chr8 112076154 112076671 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -567081 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 123.25-136 chr3 113895551 113895881 + 0.5 NA intron (NM_017577, intron 6 of 17) intron (NM_017577, intron 6 of 17) -1784 NM_001172105 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 141-138 chr6 63259070 63259417 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 60734 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 141-64 chr18 65566385 65566766 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -183677 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 166.25-59 chr16 75697346 75697789 + 0.5 NA intron (NM_001351309, intron 1 of 3) intron (NM_001351309, intron 1 of 3) 3894 NM_001351308 100033411 NM_001351307 ENSG00000282757 DUXB - double homeobox B protein-coding 203.75-5 chr1 190192201 190192946 + 0.5 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) intron (NM_199051, intron 6 of 7) 283437 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 123.5-32 chr10 117122606 117122971 + 0.5 NA intron (NM_001258300, intron 1 of 17) intron (NM_001258300, intron 1 of 17) 3798 NM_001258300 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 135.75-109 chr2 138630912 138631237 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 129304 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 135.75-82 chr18 80139583 80139924 + 0.5 NA 3' UTR (NM_014913, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_014913, exon 4 of 4) -8171 NR_028340 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 140.25-85 chr2 11420990 11421538 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 27283 NR_047499 100874055 Hs.102428 NR_047499 ENSG00000224177 LINC00570 ncRNA-a5 long intergenic non-protein coding RNA 570 ncRNA 133.75-16 chr10 30588527 30588913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41033 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 153.75-5 chr1 111529703 111530263 + 0.5 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) SVA_D|Retroposon|SVA -12026 NM_001370216 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 207.25-95 chr8 85230856 85231434 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10723 NM_001099671 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 140.5-153 chr3 82878468 82878808 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 892496 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 124-86 chr2 120896974 120897454 + 0.5 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) intron (NM_005270, intron 2 of 13) 104933 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 112.25-212 chr8 67392784 67393079 + 0.5 NA intron (NR_136224, intron 1 of 4) intron (NR_136224, intron 1 of 4) 49097 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 194.25-102 chr6 18974362 18974969 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 205815 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 165.25-107 chr4 90001819 90002451 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 107281 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 115.25-182 chr7 25629445 25629741 + 0.5 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 33547 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 168.5-169 chr7 34734174 34734591 + 0.5 NA intron (NR_015356, intron 2 of 4) intron (NR_015356, intron 2 of 4) 23890 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 119-20 chr10 120974605 120974933 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 123407 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 113-127 chr3 194766242 194766649 + 0.5 NA intron (NR_146990, intron 2 of 2) L1PB3|LINE|L1 2264 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 141.75-135 chr5 32560590 32560994 + 0.5 NA Intergenic LTR62|LTR|ERVL -24765 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 168.25-90 chr20 48157909 48158487 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168081 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 133.25-176 chr5 73347458 73347936 + 0.5 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 9791 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 166.25-51 chr15 73750828 73751197 + 0.5 NA exon (NM_001303254, exon 2 of 3) exon (NM_001303254, exon 2 of 3) 463 NM_001039614 388135 Hs.40794 NM_001039614 ENSG00000205363 INSYN1 C15orf59 inhibitory synaptic factor 1 protein-coding 128.25-169 chr6 21714483 21714851 + 0.5 NA intron (NR_015410, intron 2 of 11) L1MB1|LINE|L1 48254 NR_015410 401237 Hs.712707 NR_015410 CASC15 CANT|LINC00340|lnc-SOX4-1 cancer susceptibility 15 ncRNA 138.75-5 chr1 98502563 98503022 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -158929 NM_152238 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 156.5-7 chr1 182851769 182852156 + 0.5 NA intron (NM_001357, intron 3 of 27) MER5C|DNA|hAT-Charlie -12371 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 234.5-47 chr2 127671564 127672205 + 0.5 NA intron (NM_001161404, intron 1 of 9) intron (NM_001161404, intron 1 of 9) 3646 NM_001136037 55679 Hs.469881 NM_017980 ENSG00000072163 LIMS2 LGMD2W|MDRCMTT|PINCH-2|PINCH2 LIM zinc finger domain containing 2 protein-coding 124.25-88 chr19 36759742 36760201 + 0.5 NA intron (NM_001267779, intron 3 of 3) intron (NM_001267779, intron 3 of 3) 12836 NM_001193552 342892 Hs.406307 NM_001193552 ENSG00000267041 ZNF850 ZNF850P zinc finger protein 850 protein-coding 129.5-71 chr15 24003582 24004036 + 0.5 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 28662 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 114-2 chr1 27911095 27911498 + 0.5 NA intron (NM_001355128, intron 1 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 3279 NM_002946 6118 Hs.79411 NM_002946 ENSG00000117748 RPA2 REPA2|RP-A p32|RP-A p34|RPA32 replication protein A2 protein-coding 154.25-63 chr17 19952452 19952925 + 0.5 NA intron (NM_007202, intron 4 of 14) L1MDb|LINE|L1 25140 NM_007202 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 167.25-146 chr8 6130195 6130827 + 0.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 276037 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 130-154 chr7 77887647 77888007 + 0.5 NA intron (NM_001366089, intron 2 of 18) intron (NM_001366089, intron 2 of 18) 47697 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 161.5-16 chr1 234587450 234588005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 21798 NM_182972 359948 Hs.350268 NM_182972 ENSG00000168264 IRF2BP2 CVID14 interferon regulatory factor 2 binding protein 2 protein-coding 118.25-38 chr11 38758995 38759259 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 110269 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 156.75-45 chr12 117467540 117468036 + 0.5 NA intron (NM_173598, intron 19 of 19) L2a|LINE|L2 -105986 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 168.5-17 chr1 229642027 229642449 + 0.5 NA intron (NM_014777, intron 4 of 9) intron (NM_014777, intron 4 of 9) 15991 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 171.75-72 chr2 36164391 36164824 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 190963 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 141-154 chr8 29607634 29608194 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 140195 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 138.5-172 chr6 67337059 67337426 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -718109 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 115.25-69 chr15 62980143 62980432 + 0.5 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -62460 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 116.75-125 chr3 65608944 65609393 + 0.5 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) L1ME3|LINE|L1 -284648 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 119-208 chr9 82368549 82368976 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 379990 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 164.75-72 chr2 52583068 52583495 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 119334 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 160.25-139 chr6 53436964 53437391 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87998 NM_001242830 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 156-73 chr18 65341149 65341658 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -408849 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 168-31 chr12 2951484 2951996 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -7657 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 150-38 chr14 51290254 51290811 + 0.5 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie 37853 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 166.5-202 chr8 96092138 96092717 + 0.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 68379 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 140.75-20 chr10 58215550 58216000 + 0.5 NA intron (NM_152230, intron 4 of 5) intron (NM_152230, intron 4 of 5) 52119 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 112.25-123 chr3 43191436 43191678 + 0.5 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -85478 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 145.75-3 chr1 49770382 49770810 + 0.5 NA intron (NM_001323575, intron 2 of 12) L1M2|LINE|L1 253358 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 130-132 chr5 145132480 145132828 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 702688 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 148-86 chr3 137606684 137607087 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -157430 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 141.75-161 chr7 34785727 34786058 + 0.5 NA intron (NM_207172, intron 3 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -27620 NR_033665 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 114-88 chr20 49457882 49458325 + 0.5 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) intron (NM_004975, intron 1 of 1) 24565 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 159.75-180 chr8 144856220 144856668 + 0.5 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL -2888 NM_001081003 28991 Hs.493218 NM_014066 ENSG00000170619 COMMD5 HCARG|HT002 COMM domain containing 5 protein-coding 112.75-39 chr12 26740187 26740595 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) L1MC5|LINE|L1 92803 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 128.25-132 chr3 97707584 97707991 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -56734 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 155.25-34 chr10 132933285 132933764 + 0.5 NA intron (NM_001200049, intron 8 of 57) intron (NM_001200049, intron 8 of 57) 9046 NM_001200049 54777 Hs.298038 NM_017609 ENSG00000171811 CFAP46 C10orf123|C10orf124|C10orf92|C10orf93|TTC40|bA288G11.4|bA288G11.5|bB137A17.2|bB137A17.3 cilia and flagella associated protein 46 protein-coding 113-175 chr8 79666265 79666609 + 0.5 NA TTS (NM_001199214) TTS (NM_001199214) 55320 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 167.5-2 chr1 21632527 21633097 + 0.5 NA intron (NM_001350526, intron 5 of 28) AluJr|SINE|Alu 19086 NM_001145658 5909 Hs.148178 NM_002885 ENSG00000076864 RAP1GAP RAP1GA1|RAP1GAP1|RAP1GAPII|RAPGAP RAP1 GTPase activating protein protein-coding 183.75-126 chr8 105101470 105101992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -216707 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 130-9 chr1 200484444 200484880 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -74626 NM_001281293 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 147.75-68 chr2 75177685 75178177 + 0.5 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 21589 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 114.25-148 chr5 43805836 43806177 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -202776 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 137-141 chr5 103654453 103654897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -91886 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 117.25-54 chr12 43038446 43038883 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116651 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 131-93 chr2 88233874 88234179 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 60887 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 129.25-109 chr20 42788464 42788936 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 3 of 31) intron (NM_133170, intron 3 of 31) 103217 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 156-105 chr3 180317367 180317755 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -96612 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 118-51 chr14 60614067 60614535 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -24915 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 114-33 chr11 129951618 129951901 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001367896) promoter-TSS (NM_001367896) -113 NM_001367897 56980 Hs.275086 NM_020228 ENSG00000170325 PRDM10 PFM7|TRIS PR/SET domain 10 protein-coding 148.5-23 chr10 25303371 25303876 + 0.5 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -127347 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 113.25-135 chr5 51010500 51010814 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40470 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 142.75-89 chr18 77741324 77741648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 252241 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 134.25-45 chr13 94585020 94585425 + 0.5 NA intron (NR_130732, intron 3 of 10) AluSx1|SINE|Alu 10930 NM_014305 23483 Hs.12393 NM_014305 ENSG00000088451 TGDS CATMANS|SDR2E1|TDPGD TDP-glucose 4,6-dehydratase protein-coding 126.75-214 chr6 94547776 94548183 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 829676 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 122.75-181 chr6 170204949 170205323 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 44494 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 130.5-195 chr5 13220214 13220602 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -187522 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 115-63 chr16 75753750 75754080 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -27425 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 146.25-50 chr17 10691067 10691475 + 0.5 NA intron (NM_004589, intron 4 of 5) AluSx|SINE|Alu 6262 NM_004589 6341 Hs.14511 NM_004589 ENSG00000133028 SCO1 SCOD1 SCO cytochrome c oxidase assembly protein 1 protein-coding 118-15 chr10 58336284 58336653 + 0.5 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) intron (NM_003338, intron 1 of 6) 1462 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 157.75-6 chr1 219567480 219568008 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10420 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-197 chr8 143324708 143325090 + 0.5 NA intron (NM_052963, intron 5 of 13) intron (NM_052963, intron 5 of 13) 9981 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 132.5-73 chr14 64444920 64445321 + 0.5 NA intron (NM_005956, intron 22 of 27) MER20|DNA|hAT-Charlie -20379 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 125.5-244 chr8 23478443 23478897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20939 NM_001128930 9583 Hs.444389 NM_004901 ENSG00000197217 ENTPD4 LALP70|LAP70|LYSAL1|NTPDase-4|UDPase ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 protein-coding 127-98 chr2 46643540 46643801 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26455 NM_014171 9419 Hs.133998 NM_014171 ENSG00000119878 CRIPT HSPC139|SSMDF CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain protein-coding 117.5-40 chr11 47687992 47688302 + 0.5 NA intron (NM_024783, intron 10 of 18).2 AluJo|SINE|Alu 27222 NM_024783 79841 Hs.147377 NM_024783 ENSG00000165923 AGBL2 CCP2 ATP/GTP binding protein like 2 protein-coding 123.5-13 chr1 202901285 202901585 + 0.5 NA intron (NM_021633, intron 6 of 11) AluJb|SINE|Alu -12286 NM_002871 5877 Hs.90875 NM_002871 ENSG00000183155 RABIF MSS4|RASGFR3|RASGRF3 RAB interacting factor protein-coding 252.5-85 chr8 136904470 136905113 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 373993 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 121.5-122 chr19 56826151 56826596 + 0.5 NA intron (NM_001146184, intron 2 of 8) intron (NM_001146184, intron 2 of 8) 11435 NM_001369733 5178 Hs.731875 NM_006210 ENSG00000198300 PEG3 PW1|ZKSCAN22|ZNF904|ZSCAN24 paternally expressed 3 protein-coding 122-83 chr2 3332258 3332617 + 0.5 NA intron (NM_001330530, intron 3 of 9) intron (NM_001330530, intron 3 of 9) 45381 NM_001330530 7260 Hs.502770 NM_003310 ENSG00000032389 EIPR1 EIPR-1|TSSC1 EARP complex and GARP complex interacting protein 1 protein-coding 114.25-142 chr4 108417615 108417930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -139461 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 137.75-184 chr6 150350213 150350584 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18614 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 115.5-24 chr10 57573164 57573423 + 0.5 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -268734 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 192.75-106 chr5 83684365 83685016 + 0.5 NA intron (NM_001884, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 36165 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 125.5-132 chr2 146795365 146795665 + 0.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 208458 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 220.5-63 chr20 32111192 32112052 + 0.5 NA intron (NM_001363731, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 1894 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 128.25-208 chr8 103178435 103178817 + 0.5 NA intron (NM_001024372, intron 1 of 1) AluSg|SINE|Alu -6486 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 133.25-227 chrX 79533078 79533533 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -165753 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 161.25-52 chr14 66776730 66777260 + 0.5 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) L1PA3|LINE|L1 269588 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 114-140 chr5 167877921 167878303 + 0.5 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 123183 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 127.5-221 chr7 19627386 19627738 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 77874 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 114.5-170 chr3 13884280 13884643 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4390 NM_004625 7476 Hs.72290 NM_004625 ENSG00000154764 WNT7A Wnt-7a Wnt family member 7A protein-coding 151.5-94 chr2 218416649 218417132 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2233 NM_007127 7429 Hs.654595 NM_007127 ENSG00000127831 VIL1 D2S1471|VIL villin 1 protein-coding 124.5-35 chr11 72114565 72114872 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1942 NM_001278488 25906 Hs.38044 NM_014042 ENSG00000110200 ANAPC15 APC15|C11orf51|HSPC020 anaphase promoting complex subunit 15 protein-coding 118-91 chr2 169151064 169151377 + 0.5 NA intron (NM_004525, intron 67 of 78) intron (NM_004525, intron 67 of 78) 70113 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 116.75-7 chr1 90257100 90257333 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 262106 NM_001320185 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 115-109 chr3 107201959 107202341 + 0.5 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 38488 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 116.25-144 chr3 119739101 119739502 + 0.5 NA exon (NM_001320316, exon 12 of 18) exon (NM_001320316, exon 12 of 18) 36279 NM_033364 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 120-22 chr10 121872579 121872892 + 0.5 NA intron (NM_001001976, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 55296 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 136.75-120 chr20 58678251 58678564 + 0.5 NA non-coding (NR_037941, exon 8 of 8) non-coding (NR_037941, exon 8 of 8) -10724 NM_001204873 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 119.75-176 chr5 174502005 174502386 + 0.5 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) intron (NR_125806, intron 2 of 5) 165841 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 122.75-27 chr11 19983805 19984055 + 0.5 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) intron (NM_182964, intron 10 of 37) -38626 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 141-91 chr20 55471795 55472300 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44850 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 144.5-223 chr8 110535668 110536119 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 491540 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 127.5-190 chr5 45209883 45210290 + 0.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 401139 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 133-70 chr18 2706387 2706683 + 0.5 NA intron (NM_015295, intron 15 of 47) intron (NM_015295, intron 15 of 47) 50648 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 182.75-131 chr8 26308374 26308831 + 0.5 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 15386 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 127-52 chr13 64595432 64595872 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -519641 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 161-17 chr10 108961551 108961929 + 0.5 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -892447 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 178.25-13 chr11 15953560 15954126 + 0.5 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 15778 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 142.75-28 chr10 111803738 111804194 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 379799 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 118.5-109 chr2 182569298 182569580 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -46594 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 118.5-14 chr1 248598512 248598880 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4928 NM_001004693 127069 Hs.553585 NM_001004693 ENSG00000184022 OR2T10 OR1-64 olfactory receptor family 2 subfamily T member 10 protein-coding 119.5-163 chr4 17443847 17444258 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 68038 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 121-70 chr15 57285880 57286344 + 0.5 NA intron (NM_001322157, intron 19 of 19) intron (NM_001322157, intron 19 of 19) -7455 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 128.75-69 chr17 8125715 8126072 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1787 NM_001165967 84667 Hs.434828 NM_032580 ENSG00000179111 HES7 SCDO4|bHLHb37 hes family bHLH transcription factor 7 protein-coding 137.75-118 chr20 50729882 50730234 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1522 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 177-92 chr7 20292223 20292859 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -4167 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 146.75-45 chr14 65843723 65844263 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 372891 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 113.5-30 chr10 15170519 15170843 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1988 NM_001308295 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 151.5-9 chr1 114040861 114041277 + 0.5 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 61595 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 167.25-19 chr10 98072797 98073319 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42230 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 114.25-73 chr17 44874360 44874749 + 0.5 NA intron (NM_001142605, intron 9 of 26) intron (NM_001142605, intron 9 of 26) 24814 NM_001258353 9343 Hs.151787 NM_004247 ENSG00000108883 EFTUD2 MFDGA|MFDM|SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 protein-coding 126.5-160 chr3 150952759 150953237 + 0.5 NA intron (NR_046380, intron 1 of 4) intron (NR_046380, intron 1 of 4) -8762 NM_052995 7401 Hs.745448 NM_052995 ENSG00000163646 CLRN1 RP61|USH3|USH3A clarin 1 protein-coding 129.25-84 chr2 9229166 9229535 + 0.5 NA intron (NM_003887, intron 1 of 27) intron (NM_003887, intron 1 of 27) 22538 NM_003887 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 123.5-200 chr7 105698999 105699476 + 0.5 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) AluSx|SINE|Alu -20075 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 159-32 chr13 51637903 51638370 + 0.5 NA intron (NM_052950, intron 1 of 11) L2|LINE|L2 53674 NM_052950 115825 Hs.46506 NM_052950 ENSG00000139668 WDFY2 PROF|WDF2|ZFYVE22 WD repeat and FYVE domain containing 2 protein-coding 168.25-36 chr12 129563051 129563570 + 0.5 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) intron (NM_133448, intron 2 of 8) 340715 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 124.25-199 chr8 89615909 89616260 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 141627 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 112.5-121 chr2 107815202 107815630 + 0.5 NA intron (NR_126370, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 11353 NR_024439 729121 Hs.386155 NR_024439 ENSG00000230651 RGPD4-AS1 - RGPD4 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 120.75-126 chr4 86966167 86966446 + 0.5 NA intron (NM_001166693, intron 2 of 20) intron (NM_001166693, intron 2 of 20) 31304 NM_001166693 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 116.25-219 chr7 137172218 137172597 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8066 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 121.25-18 chr10 38010872 38011235 + 0.5 NA intron (NM_001278170, intron 1 of 3) CpG 378 NM_001278175 7581 Hs.435774 NM_006954 ENSG00000189180 ZNF33A KOX2|KOX31|KOX5|NF11A|ZNF11|ZNF11A|ZNF33|ZZAPK zinc finger protein 33A protein-coding 148.25-95 chr3 74022833 74023303 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 213824 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 117.75-203 chr8 35839379 35839813 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -129276 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 153.75-4 chr1 107642614 107643055 + 0.5 NA intron (NM_006113, intron 19 of 26) intron (NM_006113, intron 19 of 26) 45665 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 141.75-25 chr10 130836857 130837306 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 125587 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 114.25-51 chr14 37901144 37901451 + 0.5 NA intron (NR_135286, intron 1 of 1) intron (NR_135286, intron 1 of 1) 827 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 112.75-96 chr2 99288213 99288549 + 0.5 NA intron (NM_174898, intron 5 of 6) L1MEd|LINE|L1 12816 NM_174898 129530 Hs.164589 NM_174898 ENSG00000144214 LYG1 SALW1939 lysozyme g1 protein-coding 229.75-23 chr15 74747174 74748070 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -1223 NM_000761 1544 Hs.1361 NM_000761 ENSG00000140505 CYP1A2 CP12|CYPIA2|P3-450|P450(PA) cytochrome P450 family 1 subfamily A member 2 protein-coding 129.5-173 chr4 154819970 154820424 + 0.5 NA intron (NM_144979, intron 4 of 4) intron (NM_144979, intron 4 of 4) 38692 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 151.25-50 chr14 22660386 22660838 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -25768 NM_001348233 79549 NM_001348233 ENSG00000255804 OR6J1 OR6J1P|OR6J2 olfactory receptor family 6 subfamily J member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 124.25-181 chr6 168567358 168567786 + 0.5 NA intron (NM_001166412, intron 7 of 12) intron (NM_001166412, intron 7 of 12) 126388 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 115.5-97 chr17 79978081 79978333 + 0.5 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) CpG -27354 NM_001271845 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 204.75-126 chr9 37075527 37075992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4137 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 186.25-55 chr2 192830669 192831206 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 81092 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 122.25-190 chr8 85521632 85521957 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56879 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 127-30 chr11 56481848 56482265 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9314 NM_001005282 219484 Hs.554522 NM_001005282 ENSG00000181371 OR5M8 OR11-194 olfactory receptor family 5 subfamily M member 8 protein-coding 117-85 chr2 31267659 31268043 + 0.5 NA 3' UTR (NM_014600, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014600, exon 6 of 6) 33699 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 149.75-105 chr20 64020779 64021260 + 0.5 NA intron (NM_012469, intron 12 of 20) AluSx|SINE|Alu -12708 NM_001348090 284739 Hs.97840 NM_207349 ENSG00000196421 C20orf204 LINC00176|NCRNA00176|PRR17 chromosome 20 open reading frame 204 protein-coding 131.75-89 chr16 83769805 83770301 + 0.5 NA intron (NM_001220489, intron 10 of 12) LTR26D|LTR|ERV1 33923 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 121.25-86 chr19 11255916 11256331 + 0.5 NA intron (NM_001367830, intron 1 of 48) intron (NM_001367830, intron 1 of 48) 6401 NM_001367830 57572 Hs.591002 NM_020812 ENSG00000130158 DOCK6 AOS2|ZIR1 dedicator of cytokinesis 6 protein-coding 129.5-10 chr1 156352556 156352929 + 0.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 13840 NM_001304820 128229 Hs.534539 NM_144627 ENSG00000163467 TSACC C1orf182|SIP|SSTK-IP TSSK6 activating cochaperone protein-coding 144.75-102 chr21 18116987 18117339 + 0.5 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -127670 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 147.25-136 chr8 25562232 25562739 + 0.5 NA Intergenic LTR28|LTR|ERV1 103252 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 183.25-65 chr20 16106199 16106762 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -120598 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 112.5-123 chr2 111707340 111707742 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 63593 NR_039928 100616370 NR_039928 ENSG00000264793 MIR4771-1 - microRNA 4771-1 ncRNA 136.5-187 chr5 106779297 106779744 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 231494 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 145.5-192 chr8 112703192 112703605 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 59905 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 163.75-67 chr2 68772417 68772865 + 0.5 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) intron (NM_001364821, intron 1 of 10) -2269 NM_014882 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 175.5-72 chr17 28542862 28543487 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 9450 NM_001330166 9094 Hs.410455 NM_005148 ENSG00000109103 UNC119 HRG4|IMD13|POC7|POC7A unc-119 lipid binding chaperone protein-coding 135.25-207 chr9 73238711 73239067 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 87024 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 124.75-179 chr6 40855594 40856055 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 167456 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 163.75-30 chr11 112003865 112004449 + 0.5 NA intron (NM_001037954, intron 17 of 19) L1MA4|LINE|L1 -20657 NM_001931 1737 Hs.335551 NM_001931 ENSG00000150768 DLAT DLTA|E2|PDC-E2|PDCE2 dihydrolipoamide S-acetyltransferase protein-coding 143.75-22 chr10 89823067 89823412 + 0.5 NA Intergenic MER92D|LTR|ERV1 -6254 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 118.75-70 chr16 11685997 11686369 + 0.5 NA intron (NR_136673, intron 8 of 9) AluSx|SINE|Alu 17728 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 119.25-65 chr15 85854471 85854854 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 29027 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 137-23 chr10 32350893 32351326 + 0.5 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) intron (NR_104163, intron 1 of 1) 3745 NR_104163 102031319 Hs.128132 NR_104163 ENSG00000229327 LOC102031319 - uncharacterized LOC102031319 ncRNA 120.75-167 chr8 79991279 79991680 + 0.5 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 38780 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 140.5-210 chr7 21724915 21725412 + 0.5 NA intron (NM_001277115, intron 44 of 81) intron (NM_001277115, intron 44 of 81) 182124 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 169-73 chr5 23205489 23206040 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -301845 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 137.25 chr1 38897004 38897306 + 0.5 NA intron (NM_001304746, intron 4 of 7) AluY|SINE|Alu -15529 NR_037636 100527950 Hs.591506 NR_037633 GJA9-MYCBP Cx58|Cx59|GJA10|GJA9 GJA9-MYCBP readthrough ncRNA 113-90 chr2 88681857 88682264 + 0.5 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -9613 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 116.25-107 chr2 72314544 72314977 + 0.5 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -166898 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 140.25-150 chr5 68261050 68261537 + 0.5 NA intron (NM_181523, intron 2 of 15) MIR3|SINE|MIR -27226 NM_181524 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 127.25-71 chr17 32168499 32168890 + 0.5 NA intron (NM_001288755, intron 1 of 18) intron (NM_001288755, intron 1 of 18) -17123 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 135.5-169 chr5 159762523 159763010 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 108618 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 140.25-198 chr9 128604225 128604578 + 0.5 NA exon (NM_001130438, exon 29 of 57) exon (NM_001130438, exon 29 of 57) 51814 NM_001195532 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 127.25-153 chr4 177626604 177627042 + 0.5 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 -101934 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 127.5-114 chr2 58802827 58803240 + 0.5 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 282280 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 115-43 chr12 92609127 92609512 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -93524 NM_001037671 338809 Hs.326303 NM_001037671 ENSG00000187510 C12orf74 - chromosome 12 open reading frame 74 protein-coding 156.75-125 chr4 93656233 93656666 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -172304 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 128.25-74 chr17 63683280 63683784 + 0.5 NA intron (NM_203351, intron 8 of 16) intron (NM_203351, intron 8 of 16) 16593 NM_030576 80774 Hs.591166 NM_030576 ENSG00000136490 LIMD2 - LIM domain containing 2 protein-coding 128.5-214 chr7 106509569 106509974 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 151387 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 126.25-77 chr2 11619891 11620344 + 0.5 NA intron (NM_014668, intron 22 of 32) AluSc|SINE|Alu 50078 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 113.5-123 chr2 104880315 104880646 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7885 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 117.75-145 chr3 190022212 190022461 + 0.5 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 98561 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 114-28 chr11 50063946 50064248 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 31223 NM_001005513 403257 Hs.554533 NM_001005513 ENSG00000260811 OR4C45 - olfactory receptor family 4 subfamily C member 45 (gene/pseudogene) protein-coding 140.5-129 chr20 6942616 6943075 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 175159 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 173.75-98 chr20 34715698 34716381 + 0.5 NA intron (NM_001242539, intron 11 of 11) AluSx|SINE|Alu 11320 NM_001329431 58476 Hs.516994 NM_021202 ENSG00000078804 TP53INP2 C20orf110|DOR|PIG-U|PIGU|PINH|dJ1181N3.1 tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 protein-coding 152-32 chr11 47370505 47370969 + 0.5 NA intron (NM_001080547, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 7810 NM_001080547 6688 Hs.502511 NM_003120 ENSG00000066336 SPI1 OF|PU.1|SFPI1|SPI-1|SPI-A Spi-1 proto-oncogene protein-coding 130-70 chr2 70002367 70002729 + 0.5 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) intron (NR_033872, intron 7 of 10) -40283 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 119-92 chr2 129839875 129840285 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 37411 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 152.25-75 chr19 29983456 29983913 + 0.5 NA intron (NM_001252641, intron 2 of 10) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 41445 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 126.25-181 chr6 141146834 141147194 + 0.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 463200 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 123.5-176 chr5 143165465 143165784 + 0.5 NA intron (NM_001349547, intron 20 of 21) L1PA17|LINE|L1 -26876 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 131.5-99 chr19 5147883 5148379 + 0.5 NA intron (NM_015015, intron 21 of 22) CpG 179018 NM_001370094 23030 Hs.654816 NM_015015 ENSG00000127663 KDM4B JMJD2B|TDRD14B lysine demethylase 4B protein-coding 182.75-46 chr14 43330646 43331218 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 1176351 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 123-67 chr16 12283551 12283945 + 0.5 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) L2c|LINE|L2 307014 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 129.5-102 chr19 24367768 24368137 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -204505 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 140-11 chr1 181906537 181906974 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 154957 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 119.5-5 chr1 43051145 43051454 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 92250 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-166 chr4 145193909 145194284 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13507 NM_001366057 54726 Hs.270851 NM_017493 ENSG00000164164 OTUD4 DUBA6|HIN1|HSHIN1 OTU deubiquitinase 4 protein-coding 134.5-168 chr5 30019793 30020188 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 139430 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 140.75-45 chr13 66978700 66979179 + 0.5 NA intron (NR_046636, intron 2 of 2) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1550 NR_046636 100874086 Hs.577908 NR_046636 ENSG00000225263 PCDH9-AS3 - PCDH9 antisense RNA 3 ncRNA 140.25-111 chr22 28978245 28978690 + 0.5 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 53009 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 122-92 chr2 61003957 61004407 + 0.5 NA intron (NM_144709, intron 4 of 17) intron (NM_144709, intron 4 of 17) 13030 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 140.75-31 chr11 105142337 105142710 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2754 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 147-72 chr2 77898653 77899147 + 0.5 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 -17034 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 144-134 chr8 107761314 107761722 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -263600 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 154.25-76 chr2 50840811 50841322 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -144804 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 138.75-118 chr3 70759045 70759540 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 305632 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 131.25-24 chr10 62916227 62916642 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -97267 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 149.5-125 chr3 98785062 98785489 + 0.5 NA intron (NM_001323367, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 21968 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 186.5-39 chr14 58267394 58267990 + 0.5 NA intron (NR_038123, intron 7 of 9) intron (NR_038123, intron 7 of 9) -20341 NR_146595 55451 NR_146595 ENSG00000279636 LINC00216 C14orf107|NCRNA00216|PRO1617 long intergenic non-protein coding RNA 216 ncRNA 192.25-54 chr2 73280841 73281288 + 0.5 NA 5' UTR (NM_001080410, exon 2 of 17) 5' UTR (NM_001080410, exon 2 of 17) 3414 NM_001371389 139-52 chr17 50613916 50614433 + 0.5 NA intron (NR_046057, intron 25 of 34) intron (NR_046057, intron 25 of 34) -20707 NM_001144070 8714 Hs.463421 NM_003786 ENSG00000108846 ABCC3 ABC31|EST90757|MLP2|MOAT-D|MRP3|cMOAT2 ATP binding cassette subfamily C member 3 protein-coding 130.5-147 chr20 4560217 4560549 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -126073 NM_000311 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 212.25-59 chr3 146787635 146788126 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -134043 NR_135561 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 181.5-155 chr8 35595063 35595705 + 0.5 NA intron (NM_001322818, intron 3 of 16) intron (NM_001322818, intron 3 of 16) 50992 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 139.75-51 chr14 71431528 71432056 + 0.5 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) MER39B|LTR|ERV1 -7147 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 144.25-157 chr5 30355473 30356027 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 475190 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 148-119 chr7 19169146 19169619 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23961 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 120.5-241 chr9 104623773 104624183 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5774 NM_001001956 286362 Hs.553682 NM_001001956 ENSG00000136839 OR13C9 OR37L|OR9-13 olfactory receptor family 13 subfamily C member 9 protein-coding 223.75-15 chr12 26529192 26529843 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) L2a|LINE|L2 303677 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 174.5-35 chr11 77233923 77234532 + 0.5 NA intron (NM_182833, intron 13 of 16) intron (NM_182833, intron 13 of 16) 67439 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 115-14 chr1 230254057 230254490 + 0.5 NA intron (NM_004481, intron 10 of 15) intron (NM_004481, intron 10 of 15) 172059 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 126.75-17 chr10 43622172 43622532 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6465 NR_038867 414201 Hs.666576 NR_038867 ENSG00000223910 ZNF32-AS3 C10orf44|ZNF32-OT1|bA402L1.3 ZNF32 antisense RNA 3 ncRNA 129-75 chr16 62386441 62386902 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -350233 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 128-95 chr21 31694163 31694590 + 0.5 NA intron (NM_020706, intron 10 of 19) intron (NM_020706, intron 10 of 19) 34754 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 116.5-76 chr14 103060602 103061010 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3257 NM_006035 9578 Hs.654634 NM_006035 ENSG00000198752 CDC42BPB MRCKB CDC42 binding protein kinase beta protein-coding 137.5-27 chr10 58317859 58318316 + 0.5 NA Intergenic MER97c|DNA|hAT-Tip100 11592 NR_158219 112268068 Hs.586671 NR_158219 LOC112268068 - uncharacterized LOC112268068 ncRNA 210-3 chr1 50379008 50379467 + 0.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 44206 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 146-33 chr13 74425300 74425673 + 0.5 NA intron (NR_047005, intron 2 of 4) intron (NR_047005, intron 2 of 4) 6313 NR_047005 100874151 Hs.564552 NR_047005 ENSG00000226240 LINC00381 - long intergenic non-protein coding RNA 381 ncRNA 119-109 chr21 46340041 46340433 + 0.5 NA intron (NM_001315529, intron 3 of 46) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 15570 NM_001315529 5116 Hs.474069 NM_006031 ENSG00000160299 PCNT KEN|MOPD2|PCN|PCNT2|PCNTB|PCTN2|SCKL4 pericentrin protein-coding 181.75-2 chr1 30940772 30941342 + 0.5 NA intron (NM_001020658, intron 20 of 21) (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -5281 NR_004054 692234 NR_004054 SNORD103A U103 small nucleolar RNA, C/D box 103A snoRNA 171.75-30 chr12 1057422 1058004 + 0.5 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) AluSc5|SINE|Alu 29965 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 135.75-56 chr14 55737656 55737947 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28444 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 128.5-35 chr10 103721833 103722210 + 0.5 NA intron (NM_014631, intron 5 of 13) AluSz|SINE|Alu -24758 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 117.75-229 chrUn_KI270757v1 60058 60459 + 0.5 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 127.5-44 chr11 42428011 42428458 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -174544 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 156-78 chr2 19599345 19599798 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -240948 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 220.75-42 chr2 149363720 149364209 + 0.5 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 33377 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 139-74 chr2 64934282 64934582 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1985 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 151.25-185 chr8 57914150 57914716 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -63925 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 145.75-126 chr5 84660995 84661456 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -276345 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 204-25 chr18 9287058 9287541 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47474 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 113.5-21 chr1 194958688 194959051 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 1129846 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 170.5-126 chr3 177282307 177282956 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -11811 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 149.75-98 chr2 219917779 219918172 + 0.5 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -11410 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 196.25-108 chr6 70414362 70414919 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_147708) promoter-TSS (NR_147708) -682 NR_147708 105377849 Hs.669000 NR_147708 ENSG00000224349 LOC105377849 - uncharacterized LOC105377849 ncRNA 122.75-208 chr8 129415493 129415822 + 0.5 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) LTR16E2|LTR|ERVL 68485 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 125.25-220 chr9 86641961 86642456 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -287798 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 140-171 chr9 20739739 20740237 + 0.5 NA intron (NM_017794, intron 6 of 45) intron (NM_017794, intron 6 of 45) 23883 NR_030166 574444 NR_030166 ENSG00000207609 MIR491 MIRN491|hsa-mir-491|mir-491 microRNA 491 ncRNA 114.5-17 chr1 165458749 165459028 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -13533 NM_001256570 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 113.75-134 chr4 42882746 42883095 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -10346 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 148.5-235 chr8 132245107 132245516 + 0.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) -140046 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 122.75-63 chr17 32481742 32482087 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001270482, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001270482, exon 13 of 13) -5079 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 135.25-21 chr1 227033570 227033963 + 0.5 NA intron (NM_001366019, intron 26 of 36) intron (NM_001366019, intron 26 of 36) 93472 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 159.25-78 chr22 27495737 27496322 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 185378 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 124.25-182 chr7 3289195 3289688 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11811 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 115.75-175 chr5 141256733 141257144 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 11543 NM_018935 56121 Hs.130757 NM_018935 ENSG00000113248 PCDHB15 PCDH-BETA15 protocadherin beta 15 protein-coding 141.75-35 chr11 65011735 65012235 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2128 NR_037650 100528018 Hs.80132 NR_037650 ENSG00000273003 ARL2-SNX15 - ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate) ncRNA 133.25-113 chr2 198264177 198264586 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 110716 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 177.75-84 chr2 205358735 205359424 + 0.5 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) L3|LINE|CR1 -323421 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 133.5-232 chr6 57127805 57128268 + 0.5 NA intron (NM_015555, intron 4 of 13) MER58A|DNA|hAT-Charlie 37848 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 123.75-134 chr4 39678710 39679153 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -19205 NM_001312646 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 124.25-132 chr3 53939155 53939432 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47434 NM_021237 58515 Hs.58471 NM_021237 ENSG00000113811 SELENOK HSPC030|HSPC297|SELK selenoprotein K protein-coding 123.5-123 chr21 30996182 30996476 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 42147 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 130.5-217 chr6 152436414 152436700 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 32 of 145) AluJo|SINE|Alu 56027 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 144-24 chr10 127412911 127413397 + 0.5 NA intron (NM_001290223, intron 43 of 51) MIRb|SINE|MIR -136195 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 138.5-27 chr10 88829384 88829815 + 0.5 NA intron (NM_144590, intron 2 of 5) L1ME4a|LINE|L1 22245 NM_144590 118932 Hs.217484 NM_144590 ENSG00000152766 ANKRD22 - ankyrin repeat domain 22 protein-coding 113.5-135 chr20 10642754 10643131 + 0.5 NA intron (NM_000214, intron 20 of 25) MER58A|DNA|hAT-Charlie 6753 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 151.75-60 chr2 32201078 32201436 + 0.5 NA intron (NM_001330476, intron 7 of 10) intron (NM_001330476, intron 7 of 10) 35393 NM_001330476 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 130-23 chr11 10350629 10351014 + 0.5 NA intron (NR_103765, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 42508 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 144.25-188 chr7 47426012 47426479 + 0.5 NA intron (NM_022748, intron 9 of 30) AluSx3|SINE|Alu 38558 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 120.25-58 chr14 41440693 41441064 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165978 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 119.25-165 chr5 128908433 128908817 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -56502 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 117.5-91 chr18 58926959 58927214 + 0.5 NA intron (NM_001353538, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 62209 NM_001353527 55205 Hs.529023 NM_018181 ENSG00000074657 ZNF532 - zinc finger protein 532 protein-coding 150-48 chr15 36916732 36917267 + 0.5 NA intron (NR_051953, intron 8 of 11) intron (NR_051953, intron 8 of 11) -30466 NR_024264 145845 Hs.302693 NM_001101327 LOC145845 - uncharacterized LOC145845 ncRNA 168-76 chr20 54788256 54788670 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 312870 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 128.25-31 chr12 17070055 17070374 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 81467 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 117.75-123 chr20 17307696 17308031 + 0.5 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 80823 NM_002594 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 153-115 chr5 23232583 23233049 + 0.5 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -274793 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 124.75-190 chr7 18940304 18940792 + 0.5 NA intron (NM_058176, intron 22 of 22) intron (NM_058176, intron 22 of 22) 177088 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 117.25-145 chr3 131388749 131389168 + 0.5 NA TTS (NM_152395) TTS (NM_152395) 7184 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 127.5-223 chr7 20772663 20773020 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14045 NM_198956 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 151.25-203 chrX 39339638 39340190 + 0.5 NA Intergenic (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12552 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 137.75-65 chr14 81753964 81754500 + 0.5 NA Intergenic Charlie13b|DNA|hAT-Charlie -11094 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 120.75-27 chr11 92166207 92166669 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58596 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 166-120 chr7 97430908 97431506 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -300879 NM_013996 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 149.75-133 chr5 132131616 132132045 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -53046 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 137.25-152 chr7 75722264 75722626 + 0.5 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) MIR3|SINE|MIR 16496 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 174.5-158 chr6 40016636 40017276 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -82494 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 137.5-115 chr2 54565127 54565527 + 0.5 NA intron (NM_178313, intron 1 of 30) intron (NM_178313, intron 1 of 30) 6933 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 122.25-150 chr5 35781404 35781879 + 0.5 NA intron (NM_024867, intron 30 of 36) intron (NM_024867, intron 30 of 36) -75250 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 114-141 chr5 175639513 175639785 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -18422 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 120-99 chr2 239207338 239207811 + 0.5 NA intron (NM_006037, intron 3 of 26) L1ME3Cz|LINE|L1 -12117 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 135.25-121 chr22 25176059 25176410 + 0.5 NA intron (NM_001145206, intron 6 of 10) intron (NM_001145206, intron 6 of 10) -23624 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 157.5-114 chr2 205404388 205404839 + 0.5 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) L1ME4a|LINE|L1 -277887 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 114.5-109 chr16 82608007 82608373 + 0.5 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -18779 NM_001220490 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 148-60 chr2 101220869 101221382 + 0.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -31761 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 146.25-104 chr3 157269913 157270260 + 0.5 NA intron (NM_024621, intron 12 of 13) AluJr|SINE|Alu -109326 NM_020307 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 135.75-27 chr10 73035416 73035687 + 0.5 NA intron (NM_001017962, intron 9 of 14) intron (NM_001017962, intron 9 of 14) 61423 NM_001142596 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 122.75-175 chr6 73236754 73237121 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11441 NM_001126063 100129128 Hs.663639 NM_001126063 ENSG00000256980 KHDC1L - KH domain containing 1 like protein-coding 134-65 chr16 1796879 1797206 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -2134 NR_027389 3483 Hs.839 NM_004970 ENSG00000099769 IGFALS ACLSD|ALS insulin like growth factor binding protein acid labile subunit protein-coding 165-103 chr4 35022650 35023147 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -753151 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 132.5-142 chr21 17825641 17826076 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -6502 NM_001100420 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 122-151 chr5 179402692 179402938 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -57354 NM_021599 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 162.75-86 chr20 33079024 33079521 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -2240 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 123.75-75 chr17 40630551 40630964 + 0.5 NA exon (NM_003079, exon 10 of 11) exon (NM_003079, exon 10 of 11) 17061 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 160.25-45 chr15 67493728 67494105 + 0.5 NA intron (NM_001031715, intron 19 of 20) L1PA5|LINE|L1 27057 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 152.25-54 chr14 75144005 75144323 + 0.5 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) intron (NM_006827, intron 3 of 4) -17116 NM_001329238 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 137-7 chr1 93179716 93180183 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_206886) promoter-TSS (NM_206886) 464 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 133.75-90 chr2 17747934 17748442 + 0.5 NA intron (NM_024624, intron 1 of 26) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 5622 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 116.75-101 chr2 130938342 130938628 + 0.5 NA intron (NM_001367493, intron 3 of 13) L1MEf|LINE|L1 101571 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 137.75-126 chr22 41000868 41001336 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 49724 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 141-168 chr9 129654438 129654720 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11068 NM_016307 51450 Hs.660115 NM_016307 ENSG00000167157 PRRX2 PMX2|PRX2 paired related homeobox 2 protein-coding 186.25-29 chr14 43434713 43435443 + 0.5 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 1072205 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 154-124 chr7 136919266 136919619 + 0.5 NA intron (NR_046103, intron 2 of 3) intron (NR_046103, intron 2 of 3) 16275 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 136.5-29 chr10 83754407 83754865 + 0.5 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -77547 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 131.25-205 chr8 126661432 126661718 + 0.5 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -103097 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 156.5-16 chr10 86353576 86353935 + 0.5 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 13040 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 113-180 chr8 105275583 105275841 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42726 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 134-59 chr14 83736609 83736970 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 1094157 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 112.5-215 chr6 75626864 75627235 + 0.5 NA intron (NM_001100409, intron 3 of 22) AluSx|SINE|Alu 25169 NM_001100409 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 149-23 chr12 116932522 116933062 + 0.5 NA intron (NM_153348, intron 2 of 10) AluSc|SINE|Alu 21836 NM_012174 26259 Hs.624537 NM_012174 ENSG00000174989 FBXW8 FBW6|FBW8|FBX29|FBXO29|FBXW6 F-box and WD repeat domain containing 8 protein-coding 124.25-54 chr14 62614577 62614970 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 430685 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 132.25-57 chr14 47711121 47711566 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -36389 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 143.25-194 chr9 38263192 38263693 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -129260 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 151.75-51 chr17 4742062 4742539 + 0.5 NA intron (NM_001136046, intron 4 of 13) intron (NM_001136046, intron 4 of 13) 2285 NM_001267822 84225 Hs.47223 NM_032265 ENSG00000141497 ZMYND15 SPGF14 zinc finger MYND-type containing 15 protein-coding 146-137 chr9 126017880 126018334 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 257808 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 113.25-111 chr3 114565660 114565969 + 0.5 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 58392 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 112.25-72 chr17 16002853 16003218 + 0.5 NA intron (NM_017775, intron 4 of 9) intron (NM_017775, intron 4 of 9) 3211 NM_001271420 54902 Hs.462316 NM_017775 ENSG00000011295 TTC19 2010204O13Rik|MC3DN2 tetratricopeptide repeat domain 19 protein-coding 142.75-126 chr3 48558882 48559368 + 0.5 NA intron (NM_001317136, intron 1 of 13) intron (NM_001317136, intron 1 of 13) 2004 NM_001317136 5210 Hs.476217 NM_004567 ENSG00000114268 PFKFB4 - 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 4 protein-coding 144.75-80 chr2 22539284 22539843 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3084 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 166.25-80 chr2 102630630 102631237 + 0.5 NA intron (NM_003048, intron 1 of 11) L1MEd|LINE|L1 11380 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 124.5-249 chr9 135319016 135319463 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -24010 NM_173520 157927 Hs.559511 NM_173520 C9orf62 - chromosome 9 open reading frame 62 protein-coding 147.25-85 chr3 89496603 89497057 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 389209 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 122-2 chr1 27977910 27978232 + 0.5 NA intron (NM_001282560, intron 16 of 16) intron (NM_001282560, intron 16 of 16) 18609 NM_018053 55113 Hs.55024 NM_018053 ENSG00000158156 XKR8 XRG8|hXkr8 XK related 8 protein-coding 127.75-114 chr2 203205152 203205604 + 0.5 NA intron (NM_001114132, intron 50 of 54) L1MC4|LINE|L1 -33063 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 156.5-31 chr11 102798438 102798972 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_002421) promoter-TSS (NM_002421) -545 NM_001145938 4312 Hs.83169 NM_002421 ENSG00000196611 MMP1 CLG|CLGN matrix metallopeptidase 1 protein-coding 113.25-36 chr12 54386155 54386444 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001290002) promoter-TSS (NM_001290002) -520 NM_001290004 25946 Hs.505653 NM_015481 ENSG00000161642 ZNF385A HZF|RZF|ZFP385|ZNF385 zinc finger protein 385A protein-coding 137-67 chr17 74700816 74701174 + 0.5 NA intron (NM_001289083, intron 3 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 11928 NM_139018 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 160.75-22 chr10 101714578 101715137 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -19562 NM_001323541 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 136.5-28 chr10 77052964 77053405 + 0.5 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) intron (NM_001271519, intron 14 of 28) -87647 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 120.5-209 chr7 4119750 4120047 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 25 of 44) L1MEd|LINE|L1 -9787 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 126-118 chr3 82027443 82027839 + 0.5 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 41499 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 133-190 chr9 119326570 119326943 + 0.5 NA intron (NM_014618, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 42679 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 118-30 chr11 79107596 79108003 + 0.5 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) MIRb|SINE|MIR 294310 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 125.75-167 chr6 152501354 152501728 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 10 of 145) AluSz|SINE|Alu 121011 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 112.5-59 chr12 106193643 106194059 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -53818 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 148.5-208 chr7 33335700 33336243 + 0.5 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 206407 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 122.5-115 chr2 148058697 148059176 + 0.5 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -37332 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 117.25-65 chr14 39214416 39214851 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19282 NM_001329214 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 133.5-168 chr3 182686116 182686412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107240 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 116.25-53 chr12 105797020 105797429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90450 NR_110111 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 145.75-26 chr12 26623860 26624239 + 0.5 NA intron (NM_002223, intron 24 of 56) intron (NM_002223, intron 24 of 56) 209145 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 146.75-82 chr2 174111971 174112337 + 0.5 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) intron (NM_001011708, intron 6 of 9) 86874 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 123.25-196 chr8 14233029 14233423 + 0.5 NA intron (NM_139167, intron 4 of 7) intron (NM_139167, intron 4 of 7) 603536 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 191.5-157 chrX 41186131 41186862 + 0.5 NA intron (NM_001039591, intron 23 of 44) intron (NM_001039591, intron 23 of 44) -89243 NR_135616 105373185 Hs.546119 NR_135616 ENSG00000223714 LINC02601 - long intergenic non-protein coding RNA 2601 ncRNA 148.5-194 chr6 44280001 44280420 + 0.5 NA TTS (NM_001137560) TTS (NM_001137560) 9760 NM_001137560 441151 Hs.632851 NM_001039704 ENSG00000178233 TMEM151B C6orf137|TMEM193|bA444E17.5 transmembrane protein 151B protein-coding 122.75-37 chr12 59437388 59437689 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -158491 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 118.5-92 chr2 42221560 42221978 + 0.5 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) AluSq|SINE|Alu -51538 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 131.25-200 chr8 93181125 93181401 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14413 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 139.25-41 chr12 62326983 62327512 + 0.5 NA intron (NR_147082, intron 6 of 21) intron (NR_147082, intron 6 of 21) 66843 NM_001252078 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 133-111 chr3 180063761 180064156 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -27021 NM_016559 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 125.75-144 chr4 174812729 174813112 + 0.5 NA intron (NM_006529, intron 1 of 9) intron (NM_006529, intron 1 of 9) 16327 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 113-71 chr16 70656842 70657228 + 0.5 NA exon (NM_001172771, exon 5 of 7) exon (NM_001172771, exon 5 of 7) 29018 NM_138383 92154 Hs.432387 NM_138383 ENSG00000132613 MTSS2 ABBA|ABBA-1|ABBA1|MTSS1L MTSS I-BAR domain containing 2 protein-coding 124-90 chr2 145909540 145909867 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -677354 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 161.75-13 chr10 19082882 19083451 + 0.5 NA intron (NM_001142308, intron 2 of 39) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 34365 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 152.25-141 chr6 147965926 147966407 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -306162 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 143.75-19 chr10 73501601 73502101 + 0.5 NA intron (NR_135249, intron 20 of 21) L2a|LINE|L2 -5827 NM_021132 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 116.25-167 chr4 148844029 148844372 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 98178 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 134.75-119 chr2 185332767 185333287 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165955 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 139.25-162 chr6 51116627 51117108 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 297996 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 139.5-151 chr4 52366656 52367113 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 289655 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 126.75-35 chr12 457644 458074 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2080 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 134.75-232 chrX 95113534 95113973 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -50527 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 162.5-27 chr11 61385531 61385937 + 0.5 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -6626 NM_001330285 51259 Hs.26745 NM_016499 ENSG00000187049 TMEM216 HSPC244 transmembrane protein 216 protein-coding 154.5-67 chr15 58380358 58380837 + 0.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -51394 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 122.75-177 chr6 108701509 108701872 + 0.5 NA Intergenic (TTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -49964 NR_033376 387111 Hs.520310 NR_033376 ENSG00000203801 LINC00222 C6orf181|NCRNA00222|dJ354J5.2 long intergenic non-protein coding RNA 222 ncRNA 127.5-167 chr4 56157066 56157541 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -12892 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 196.5-90 chr20 24428156 24428812 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -40715 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 122-99 chr2 126330374 126330826 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -212615 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 131.75-57 chr12 125784475 125784980 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 162275 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 154.25-156 chr7 47569994 47570326 + 0.5 NA intron (NM_022748, intron 1 of 30) AluSq2|SINE|Alu 11951 NM_022748 64759 Hs.520814 NM_022748 ENSG00000136205 TNS3 TEM6|TENS1 tensin 3 protein-coding 115.75-166 chr5 45635308 45635717 + 0.5 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 60868 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 150.25-122 chr5 64075384 64075970 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -90166 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 126.75-190 chr5 33486141 33486576 + 0.5 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 45582 NM_001258438 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 129.5-132 chr2 133351462 133351797 + 0.5 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 85434 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 114.5-142 chr2 142036283 142036723 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 95198 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 117.5-226 chr8 19182489 19182736 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 62910 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 116.75-107 chr20 7370842 7371172 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_107029) promoter-TSS (NR_107029) -601 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 157.5-115 chr2 207272126 207272615 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2946 NR_031633 100302130 NR_031633 ENSG00000221628 MIR1302-4 MIRN1302-4|hsa-mir-1302-4 microRNA 1302-4 ncRNA 121-187 chr8 85469108 85469384 + 0.5 NA intron (NM_001293675, intron 2 of 5) intron (NM_001293675, intron 2 of 5) -4331 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 122-157 chr6 62179395 62179881 + 0.5 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) Plat_L3|LINE|CR1 106587 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 114-71 chr2 51249735 51250140 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 217336 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 151.75-115 chr5 121941074 121941453 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20712 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 118.5-176 chr6 50339470 50339891 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -289751 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 113.5-227 chr8 35433161 35433556 + 0.5 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) -111034 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 112.25-117 chr21 27823285 27823584 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 101055 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 172.75-48 chr17 57944867 57945439 + 0.5 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) intron (NM_001271875, intron 1 of 10) 10259 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 134.75-162 chr4 81590620 81591033 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -118919 NM_001300736 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 127.25-187 chr7 3851040 3851496 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -278417 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 186.25-62 chr20 62677419 62677899 + 0.5 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -11038 NR_024470 100127888 Hs.671273 NR_024470 ENSG00000232803 SLCO4A1-AS1 - SLCO4A1 antisense RNA 1 ncRNA 159.75-67 chr18 78346325 78346806 + 0.5 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -352838 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 121-122 chr22 31907581 31907973 + 0.5 NA TTS (NM_001369903) TTS (NM_001369903) 30677 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 137.75-11 chr1 185750824 185751252 + 0.5 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) L1MEd|LINE|L1 16647 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 120.75-165 chr8 47266485 47266958 + 0.5 NA intron (NM_001352942, intron 1 of 17) L1MD2|LINE|L1 5783 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 159.5-177 chr5 161955836 161956247 + 0.5 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 45155 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 144.25-144 chr4 71946801 71947371 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84718 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 161.25-179 chr9 26379860 26380278 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 313394 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 134.25-152 chr5 173871176 173871689 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16917 NM_030627 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 112.75-125 chr22 19958594 19958854 + 0.5 NA intron (NM_001135162, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu -3829 NM_007310 1312 Hs.370408 NM_000754 ENSG00000093010 COMT HEL-S-98n catechol-O-methyltransferase protein-coding 124.75-217 chr9 101850336 101850816 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -111996 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 119.75-53 chr13 96844825 96845184 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 139168 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 171.75-88 chr20 36845090 36845685 + 0.5 NA intron (NM_080627, intron 1 of 14) intron (NM_080627, intron 1 of 14) 14486 NM_199181 140710 Hs.460807 NM_080627 ENSG00000149639 SOGA1 C20orf117|KIAA0889|SOGA suppressor of glucose, autophagy associated 1 protein-coding 159.75-85 chr2 125371299 125371782 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 746445 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 143.75-134 chr4 64663250 64663705 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -254017 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 134-10 chr1 201530757 201531244 + 0.5 NA intron (NR_160748, intron 2 of 2) intron (NR_160748, intron 2 of 2) 11096 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 138-123 chr4 176432780 176433198 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113023 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 139-153 chr8 135427757 135428100 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29528 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 127-9 chr1 216312098 216312402 + 0.5 NA intron (NM_206933, intron 9 of 71) L1MCa|LINE|L1 111146 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 119-170 chr6 138322745 138323056 + 0.5 NA intron (NM_020340, intron 29 of 33) intron (NM_020340, intron 29 of 33) -54743 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 191-53 chr3 88002326 88003018 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 20096 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 129.5-134 chr2 138533158 138533520 + 0.5 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) intron (NM_001001664, intron 1 of 10) 31569 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 113.5-118 chr2 32910663 32911008 + 0.5 NA intron (NR_027099, intron 10 of 10) intron (NR_027099, intron 10 of 10) -16292 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 131.75-40 chr11 113556543 113557055 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -81401 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 143.5-185 chr5 177508743 177509233 + 0.5 NA intron (NM_001308235, intron 2 of 5) intron (NM_001308235, intron 2 of 5) 869 NM_024872 79930 Hs.720849 NM_024872 ENSG00000146094 DOK3 DOKL docking protein 3 protein-coding 114.75-53 chr14 63564144 63564493 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -20923 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 322-17 chr20 59803404 59804442 + 0.5 NA intron (NM_080672, intron 7 of 12) intron (NM_080672, intron 7 of 12) 82713 NM_183244 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 130.75-144 chr4 75391959 75392445 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 38126 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 152.5-107 chr22 28356577 28356984 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER45C|DNA|hAT-Tip100 -103089 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 115.75-122 chr20 12076033 12076400 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 158323 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 121-26 chr10 63599475 63599861 + 0.5 NA intron (NM_001001330, intron 5 of 7) intron (NM_001001330, intron 5 of 7) -77778 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 135.5-148 chr4 59868003 59868500 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 854678 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 129.25-82 chr19 46765427 46765820 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19173 NM_013403 29888 Hs.631590 NM_013403 ENSG00000090372 STRN4 PPP2R6C|ZIN|zinedin striatin 4 protein-coding 136.5-43 chr11 62544999 62545314 + 0.5 NA intron (NM_024060, intron 1 of 5) intron (NM_024060, intron 1 of 5) 508 NM_001346446 79026 Hs.502756 NM_001620 ENSG00000124942 AHNAK AHNAKRS|PM227 AHNAK nucleoprotein protein-coding 119.25-127 chr3 53940059 53940465 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48403 NM_021237 58515 Hs.58471 NM_021237 ENSG00000113811 SELENOK HSPC030|HSPC297|SELK selenoprotein K protein-coding 116-62 chr17 27203223 27203552 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90609 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 136.25-102 chr2 202115067 202115517 + 0.5 NA non-coding (NR_135244, exon 2 of 4) non-coding (NR_135244, exon 2 of 4) 1766 NR_135244 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 159.25-129 chr6 108423514 108424071 + 0.5 NA intron (NM_145315, intron 7 of 12) intron (NM_145315, intron 7 of 12) 128738 NM_001323005 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 182.5-125 chr5 56846 57358 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -35066 NM_052909 153478 Hs.535800 NM_052909 ENSG00000153404 PLEKHG4B - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B protein-coding 129.25-143 chr4 78896318 78896765 + 0.5 NA intron (NM_198892, intron 15 of 15) MIR|SINE|MIR 42897 NM_001350105 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 128-99 chr3 40995917 40996423 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -203335 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 123.5-29 chr10 71155271 71155519 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57175 NM_001244889 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 123 chr1 15508902 15509293 + 0.5 NA intron (NR_102733, intron 2 of 8) LTR9A1|LTR|ERV1 15118 NM_001229 842 Hs.329502 NM_001229 ENSG00000132906 CASP9 APAF-3|APAF3|ICE-LAP6|MCH6|PPP1R56 caspase 9 protein-coding 128-20 chr10 67531590 67532082 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 4 of 17) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -128426 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 164.5-20 chr10 63901634 63902189 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -380021 NM_001318154 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 175.25-94 chr3 46375895 46376423 + 0.5 NA TTS (NM_001100168) TTS (NM_001100168) 6017 NM_001100168 1234 Hs.450802 NM_000579 ENSG00000160791 CCR5 CC-CKR-5|CCCKR5|CCR-5|CD195|CKR-5|CKR5|CMKBR5|IDDM22 C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene) protein-coding 129.25-145 chr4 162159538 162159952 + 0.5 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) intron (NM_001128428, intron 1 of 14) 4255 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 157.75-113 chr3 160512339 160512684 + 0.5 NA intron (NM_002268, intron 13 of 16) L1MC5a|LINE|L1 2725 NR_003001 677767 Hs.675953 NR_003001 ENSG00000238741 SCARNA7 U90 small Cajal body-specific RNA 7 ncRNA 189-110 chr9 69142264 69142777 + 0.5 NA intron (NM_001369871, intron 1 of 24) intron (NM_001369871, intron 1 of 24) 19505 NM_001369871 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 144.25-40 chr11 38841211 38841692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 192593 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 138-63 chr17 78044202 78044638 + 0.5 NA intron (NM_018996, intron 3 of 20) L2a|LINE|L2 40183 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 135.5-70 chr16 48331690 48332139 + 0.5 NA intron (NM_031490, intron 11 of 14) intron (NM_031490, intron 11 of 14) 33973 NM_001006610 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 168.25-26 chr11 74151128 74151638 + 0.5 NA intron (NM_001286577, intron 3 of 32) AluSz6|SINE|Alu 19619 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 159-121 chr8 129913583 129913987 + 0.5 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 26026 NM_001353264 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 116-35 chr12 59482116 59482528 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -113707 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 117.25-34 chr10 127295491 127295952 + 0.5 NA intron (NM_001290223, intron 29 of 51) intron (NM_001290223, intron 29 of 51) -99130 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 126.5-204 chr6 51168402 51168674 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 349667 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 152.75-96 chr20 8182944 8183497 + 0.5 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) MIRc|SINE|MIR 50954 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 131-161 chr7 80104719 80105024 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29960 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 136.25-89 chr18 71102717 71103187 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -451998 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 129-48 chr12 49116647 49117081 + 0.5 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -5964 NM_001352161 55716 Hs.272838 NM_018113 ENSG00000139636 LMBR1L LIMR limb development membrane protein 1 like protein-coding 141-144 chr7 47238771 47239167 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 225834 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 126-181 chr9 1093302 1093799 + 0.5 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 42063 NR_163472 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 209.25-49 chr18 73877980 73878717 + 0.5 NA Intergenic LTR52-int|LTR|ERVL 269486 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 163.75-27 chr11 72200400 72200911 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 8515 NM_016729 2348 Hs.73769 NM_000802 ENSG00000110195 FOLR1 FBP|FOLR|FRalpha folate receptor alpha protein-coding 114-148 chr6 135385630 135385880 + 0.5 NA intron (NM_017651, intron 22 of 27) intron (NM_017651, intron 22 of 27) 111985 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 130.25-40 chr11 43826731 43827190 + 0.5 NA intron (NM_016142, intron 6 of 10) intron (NM_016142, intron 6 of 10) -53871 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 112.25-225 chr8 140761669 140761915 + 0.5 NA intron (NM_001352718, intron 15 of 32) intron (NM_001352718, intron 15 of 32) -29139 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 114.75-153 chr5 57115626 57115940 + 0.5 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -58165 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 168.75-40 chr14 34811484 34812152 + 0.5 NA intron (NM_013448, intron 4 of 26) intron (NM_013448, intron 4 of 26) -62373 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 172.25-24 chr11 27166413 27166929 + 0.5 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) L1MC4a|LINE|L1 52097 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 143.75-91 chr2 88326263 88326676 + 0.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 126224 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 193.25-34 chr14 72949335 72949974 + 0.5 NA intron (NM_001352448, intron 8 of 13) AluSz|SINE|Alu 23190 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 120-151 chr5 147503050 147503453 + 0.5 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 6817 NM_001197294 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 128.25-199 chr8 21988397 21988852 + 0.5 NA intron (NM_015024, intron 15 of 27) intron (NM_015024, intron 15 of 27) -35510 NM_001286680 10361 Hs.131055 NM_182795 ENSG00000158806 NPM2 - nucleophosmin/nucleoplasmin 2 protein-coding 127.5-11 chr1 92582612 92583082 + 0.5 NA intron (NM_001350198, intron 18 of 19) intron (NM_001350198, intron 18 of 19) -95922 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 157.5-78 chr17 5569104 5569651 + 0.5 NA intron (NM_014922, intron 3 of 15) L1PA15|LINE|L1 15132 NM_014922 22861 Hs.652273 NM_014922 ENSG00000091592 NLRP1 AIADK|CARD7|CIDED|CLR17.1|DEFCAP|DEFCAP-L/S|MSPC|NAC|NALP1|PP1044|SLEV1|VAMAS1 NLR family pyrin domain containing 1 protein-coding 138.5-161 chr5 129631764 129632124 + 0.5 NA intron (NM_133638, intron 10 of 22) L1MEf|LINE|L1 -116150 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 121.25-199 chr8 129238680 129239014 + 0.5 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) LTR78|LTR|ERV1 2393 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 129.5-231 chr8 122207404 122207727 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 361079 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 180-52 chr18 8865014 8865434 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 147843 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 157-127 chr9 102207255 102207772 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -312124 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 132.25-63 chr15 64071815 64072167 + 0.5 NA TTS (NR_110310) TTS (NR_110310) 21847 NM_032231 84191 Hs.439548 NM_032231 ENSG00000166797 CIAO2A CIA2A|FAM96A cytosolic iron-sulfur assembly component 2A protein-coding 215.5-114 chr9 34564230 34564748 + 0.5 NA intron (NM_001207011, intron 4 of 9) intron (NM_001207011, intron 4 of 9) -3523 NR_024369 415056 Hs.734229 NR_024369 CNTFR-AS1 - CNTFR antisense RNA 1 ncRNA 149.25-74 chr2 5842870 5843309 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30493 NR_146954 105373400 Hs.97467 NR_146954 ENSG00000237266 LINC01810 - long intergenic non-protein coding RNA 1810 ncRNA 116.5-56 chr13 63301138 63301455 + 0.5 NA intron (NR_126409, intron 2 of 6) intron (NR_126409, intron 2 of 6) 26798 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 131.25-22 chr10 56299720 56300078 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 61360 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 129.5-200 chr6 68945271 68945530 + 0.5 NA intron (NM_001704, intron 6 of 31) intron (NM_001704, intron 6 of 31) 310118 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 138.5-147 chr4 79739303 79739738 + 0.5 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -87951 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 113.75-172 chr7 13966172 13966538 + 0.5 NA intron (NM_001163148, intron 5 of 12) AluJo|SINE|Alu 20159 NM_001163152 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 126-146 chr5 114033881 114034178 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -328041 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 139.25-110 chr22 24990820 24991202 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -36963 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 118.25-37 chr11 29492318 29492656 + 0.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -101926 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 119.25-3 chr1 33777851 33778156 + 0.5 NA intron (NM_052896, intron 12 of 69) intron (NM_052896, intron 12 of 69) -82472 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 118.5-231 chr8 135844362 135844611 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 387030 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 144.5-195 chr7 4520977 4521283 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -161165 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 114.25-9 chr1 180233919 180234169 + 0.5 NA intron (NM_033343, intron 1 of 5) CpG-2007 3780 NM_033343 89884 Hs.658487 NM_033343 ENSG00000121454 LHX4 CPHD4 LIM homeobox 4 protein-coding 129.5-90 chr16 58526300 58526661 + 0.5 NA intron (NM_016284, intron 44 of 48) intron (NM_016284, intron 44 of 48) 11001 NM_024860 79918 Hs.731691 NM_024860 ENSG00000103037 SETD6 - SET domain containing 6, protein lysine methyltransferase protein-coding 185.25-98 chr5 23473148 23473693 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34189 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 145.25-161 chr7 43245560 43245903 + 0.5 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) intron (NM_001287059, intron 2 of 27) 94836 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 220.75-44 chr2 181567749 181568274 + 0.5 NA intron (NM_001160277, intron 2 of 12) intron (NM_001160277, intron 2 of 12) 89094 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 143.75-170 chr7 18193685 18194111 + 0.5 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -66589 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 185.5-123 chr4 183886308 183886887 + 0.5 NA intron (NR_132761, intron 1 of 2) intron (NR_132761, intron 1 of 2) -18710 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 116.25-116 chr2 162474077 162474515 + 0.5 NA intron (NM_033272, intron 6 of 15) intron (NM_033272, intron 6 of 15) 129928 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 119.5-138 chr20 46466907 46467317 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1820 NR_026640 7686 Hs.717103 NR_026640 ENSG00000225849 MKRN7P MKRNP3|ZNF127L5|dJ981L23.2 makorin ring finger protein 7, pseudogene pseudo 123.25-19 chr10 30963523 30963798 + 0.5 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) AluSg4|SINE|Alu 35857 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 120.5-38 chr11 54826062 54826464 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 119431 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 130.25-165 chr5 151030754 151031150 + 0.5 NA intron (NM_001258456, intron 14 of 14) MIRb|SINE|MIR 10361 NM_001329790 2878 Hs.386793 NM_002084 ENSG00000211445 GPX3 GPx-P|GSHPx-3|GSHPx-P glutathione peroxidase 3 protein-coding 162.25-60 chr15 88232129 88232573 + 0.5 NA intron (NM_001007156, intron 3 of 15) intron (NM_001007156, intron 3 of 15) -20379 NR_038229 283738 Hs.578429 NR_038229 ENSG00000260305 NTRK3-AS1 - NTRK3 antisense RNA 1 ncRNA 113.75-191 chr8 100618875 100619278 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001363720) promoter-TSS (NM_001363720) -671 NM_001363720 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 151.5-30 chr12 488372 488866 + 0.5 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) AluJr|SINE|Alu 28680 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 119.75-125 chr20 47134289 47134637 + 0.5 NA intron (NM_172110, intron 9 of 13) MIR|SINE|MIR -32504 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 122.75-197 chr8 57598034 57598318 + 0.5 NA Intergenic MER11B|LTR|ERVK -147973 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 144.25-190 chr7 92788626 92789125 + 0.5 NA intron (NM_001259, intron 2 of 7) AluJr4|SINE|Alu 45084 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 113.75-150 chr5 32972482 32972715 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25155 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 185.75-41 chr14 38648379 38648892 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -233961 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 138.75-170 chr7 8452359 8452740 + 0.5 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 18940 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 117-112 chr22 37610647 37611054 + 0.5 NA intron (NM_001172688, intron 1 of 17) intron (NM_001172688, intron 1 of 17) 1810 NM_001172688 26088 Hs.499158 NM_013365 ENSG00000100083 GGA1 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1 protein-coding 174.25-54 chr15 41209196 41209819 + 0.5 NA exon (NM_001286441, exon 7 of 12) exon (NM_001286441, exon 7 of 12) 21250 NM_001286441 161829 Hs.307999 NM_152596 ENSG00000178997 EXD1 EXDL1 exonuclease 3'-5' domain containing 1 protein-coding 127-91 chr19 8167928 8168240 + 0.5 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -18492 NM_032447 84467 Hs.370362 NM_032447 ENSG00000142449 FBN3 - fibrillin 3 protein-coding 154-49 chr17 34365210 34365697 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2220 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 151-95 chr4 48206141 48206519 + 0.5 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) L1MB5|LINE|L1 63508 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 264.25-38 chr3 124233169 124233939 + 0.5 NA intron (NM_001024660, intron 2 of 59) intron (NM_001024660, intron 2 of 59) 100625 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 123-149 chr4 70947253 70947741 + 0.5 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) L1MC|LINE|L1 45128 NM_001244767 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 112.25-138 chr3 148655935 148656337 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -41735 NM_004835 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 116.5-46 chr12 14913063 14913453 + 0.5 NA TTS (NM_001300784) TTS (NM_001300784) 15867 NM_001300784 121506 Hs.162143 NM_152321 ENSG00000139055 ERP27 C12orf46|PDIA8 endoplasmic reticulum protein 27 protein-coding 152.5-149 chr5 64016144 64016553 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54056 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 134.5-240 chr9 71465100 71465479 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18318 NM_001366142 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 175-54 chr17 63581814 63582212 + 0.5 NA intron (NR_073585, intron 4 of 7) intron (NR_073585, intron 4 of 7) -18882 NM_016360 51204 Hs.174134 NM_016360 ENSG00000136463 TACO1 CCDC44 translational activator of cytochrome c oxidase I protein-coding 146.25-140 chr7 109768415 109768783 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 191614 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 118.5-88 chr2 22167747 22168012 + 0.5 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -368600 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 137.5-78 chr16 1339093 1339503 + 0.5 NA intron (NM_001199099, intron 4 of 33) intron (NM_001199099, intron 4 of 33) 3101 NM_001199096 8938 Hs.458427 NM_003933 ENSG00000007516 BAIAP3 BAP3 BAI1 associated protein 3 protein-coding 112.75-59 chr14 56808487 56808892 + 0.5 NA intron (NR_073034, intron 2 of 3) CpG 1790 NR_073034 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 191.25-13 chr10 95279990 95280478 + 0.5 NA intron (NM_020992, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 10769 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 136.25-23 chr10 86810178 86810645 + 0.5 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 53772 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 186.75-19 chr11 115548126 115548692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43994 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 153.25-58 chr18 57422921 57423233 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -12297 NM_004852 9480 Hs.194725 NM_004852 ENSG00000119547 ONECUT2 OC-2|OC2 one cut homeobox 2 protein-coding 233.75-21 chr13 84614060 84614712 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -169268 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 113.25-163 chr7 135821398 135821733 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -72752 NM_001369697 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 112.25-54 chr14 39542627 39543005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -110316 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 142.25-75 chr17 81075957 81076433 + 0.5 NA intron (NM_001144888, intron 3 of 13) intron (NM_001144888, intron 3 of 13) 41044 NM_017450 10458 Hs.128316 NM_006340 ENSG00000175866 BAIAP2 BAP2|FLAF3|IRSP53 BAI1 associated protein 2 protein-coding 126.25-92 chr2 119478175 119478498 + 0.5 NA intron (NR_147847, intron 1 of 1) intron (NR_147847, intron 1 of 1) 1882 NR_147846 107105282 Hs.670673 NR_147846 ENSG00000231013 LOC107105282 - uncharacterized LOC107105282 ncRNA 162.75-33 chr14 53450731 53451226 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 297624 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 119-186 chr7 78594351 78594811 + 0.5 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) AluSc|SINE|Alu 247339 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 140-110 chr3 88728122 88728515 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR -379303 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 116.5-229 chr7 48339050 48339503 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 29 of 61) intron (NM_152701, intron 29 of 61) 167818 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 138.75-65 chr16 57633760 57634244 + 0.5 NA intron (NM_001145772, intron 1 of 14) intron (NM_001145772, intron 1 of 14) 5372 NM_201524 9289 Hs.513633 NM_005682 ENSG00000205336 ADGRG1 BFPP|BPPR|GPR56|TM7LN4|TM7XN1 adhesion G protein-coupled receptor G1 protein-coding 151.75-136 chr7 19980492 19980883 + 0.5 NA intron (NR_110114, intron 3 of 5) L1MA1|LINE|L1 159739 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 135-106 chr3 54767426 54767789 + 0.5 NA intron (NM_018398, intron 13 of 37) L1MC5a|LINE|L1 -127750 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 175.5-47 chr13 98323356 98323879 + 0.5 NA intron (NM_005766, intron 2 of 26) intron (NM_005766, intron 2 of 26) 115093 NR_036129 100422881 NR_036129 ENSG00000263399 MIR3170 mir-3170 microRNA 3170 ncRNA 134.5-186 chr6 22148632 22149106 + 0.5 NA intron (NR_015410, intron 9 of 11) intron (NR_015410, intron 9 of 11) -1676 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 164-27 chr12 45724185 45724732 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 3463 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 184.5-19 chr10 58356363 58357035 + 0.5 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) L1ME3G|LINE|L1 21693 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 133.25-177 chr5 87369763 87370049 + 0.5 NA intron (NM_022650, intron 12 of 24) intron (NM_022650, intron 12 of 24) 42998 NM_001199189 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 136.75-17 chr1 234705896 234706236 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17976 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 125.25-79 chr16 86664131 86664478 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57655 NR_135181 101928614 Hs.399823 NR_135181 ENSG00000260026 LINC02189 - long intergenic non-protein coding RNA 2189 ncRNA 119.25-68 chr15 100561582 100562029 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2522 NR_073405 441733 Hs.12250 NR_073405 PRKXP1 - PRKX pseudogene 1 pseudo 145-106 chr3 194717857 194718227 + 0.5 NA intron (NR_037891, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 9621 NR_037891 100507391 Hs.590099 NR_037891 ENSG00000237222 LINC01968 - long intergenic non-protein coding RNA 1968 ncRNA 134.5-211 chr8 23325792 23326204 + 0.5 NA intron (NM_002318, intron 6 of 13) MIR3|SINE|MIR -10210 NR_038323 100507156 Hs.661130 NR_038323 ENSG00000253837 LOC100507156 - uncharacterized LOC100507156 ncRNA 158.25-140 chr7 114188115 114188500 + 0.5 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 101980 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 132.25-89 chr2 22657721 22658015 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 121389 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 112.5-228 chr7 143944316 143944559 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 9204 NM_001004685 135948 Hs.553596 NM_001004685 ENSG00000221910 OR2F2 OR7-1 olfactory receptor family 2 subfamily F member 2 protein-coding 138.75-185 chr7 108067854 108068382 + 0.5 NA exon (NM_001318047, exon 19 of 23) exon (NM_001318047, exon 19 of 23) 62243 NM_001318046 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 132.75-42 chr11 108926227 108926707 + 0.5 NA intron (NM_004398, intron 17 of 17) intron (NM_004398, intron 17 of 17) 261398 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 129.25-178 chr7 2845104 2845500 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_007353) promoter-TSS (NM_007353) -994 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 155.5-182 chr6 63997987 63998537 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 34 of 43) MIRc|SINE|MIR 191426 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 120.75-149 chr6 104325754 104326208 + 0.5 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 533565 NM_001321084 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 134-148 chr6 65665348 65665820 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) intron (NM_001292009, intron 1 of 43) 41641 NM_001292009 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 121.5-187 chr3 190762166 190762538 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 100342 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 156.75-163 chr8 88803511 88803857 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -476201 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 116.25-105 chr2 60428461 60428848 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -37279 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 115.25-190 chr7 82304113 82304378 + 0.5 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) L1MA4A|LINE|L1 139532 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 137.5-65 chr14 50791945 50792273 + 0.5 NA intron (NM_016350, intron 5 of 28) intron (NM_016350, intron 5 of 28) -29688 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 120.75-166 chr8 77127814 77128261 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -126993 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 159.25-131 chr6 136766309 136766933 + 0.5 NA intron (NM_005923, intron 1 of 29) L5|LINE|RTE-X -17426 NR_134635 101928429 Hs.672896 NR_134635 LOC101928429 - uncharacterized LOC101928429 ncRNA 169.25-27 chr14 55794745 55795347 + 0.5 NA intron (NR_026796, intron 1 of 3) intron (NR_026796, intron 1 of 3) 1628 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 129.25-30 chr11 64932881 64933311 + 0.5 NA intron (NM_006244, intron 12 of 13) intron (NM_006244, intron 12 of 13) 2797 NM_130769 170589 Hs.436119 NM_130769 ENSG00000149735 GPHA2 A2|GPA2|ZSIG51 glycoprotein hormone subunit alpha 2 protein-coding 157.75-151 chr6 125637890 125638469 + 0.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -36174 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 150.75-50 chr13 24046863 24047285 + 0.5 NA intron (NM_001286792, intron 3 of 14) LTR8B|LTR|ERV1 67272 NR_104595 221178 Hs.434298 NM_153023 ENSG00000182957 SPATA13 ARHGEF29|ASEF2 spermatogenesis associated 13 protein-coding 144.75-59 chr14 59086562 59087066 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -101853 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 188.5-61 chr18 55662539 55663286 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26955 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 147.75-78 chr2 183615346 183615867 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 491163 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 136.5-136 chr21 23698510 23698974 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -313907 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 121.5-42 chr11 74122479 74122936 + 0.5 NA intron (NM_001286577, intron 8 of 32) MIRb|SINE|MIR 48295 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 185.75-137 chr9 105118713 105119350 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -125574 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 140-62 chr17 71369233 71369708 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -167291 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 171-74 chr2 171135486 171135843 + 0.5 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) AluSx1|SINE|Alu 25229 NM_012290 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 148-18 chr12 6986051 6986405 + 0.5 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 15315 NR_135131 10436 Hs.558447 NM_006331 ENSG00000126749 EMG1 C2F|Grcc2f|NEP1 EMG1 N1-specific pseudouridine methyltransferase protein-coding 136.5-34 chr10 120289200 120289671 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 65788 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 131.75-228 chr9 137044659 137044983 + 0.5 NA intron (NM_015392, intron 1 of 8) intron (NM_015392, intron 1 of 8) 1356 NM_015392 56654 Hs.719906 NM_015392 ENSG00000107281 NPDC1 CAB|CAB-|CAB-1|CAB1|NPDC-1 neural proliferation, differentiation and control 1 protein-coding 133.75-97 chr2 72615834 72616326 + 0.5 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 209953 NM_001321730 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 153-127 chr6 7082901 7083343 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24621 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 129.75-172 chr7 36532048 36532543 + 0.5 NA exon (NM_001177506, exon 17 of 22) exon (NM_001177506, exon 17 of 22) 67825 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 276.25-40 chr7 22687358 22688258 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22275 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 131.5-30 chr10 109260669 109261077 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 662373 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 216.75-3 chr1 69814025 69814731 + 0.5 NA intron (NM_001370785, intron 4 of 26) intron (NM_001370785, intron 4 of 26) -104944 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 125.75 chr1 22464400 22464831 + 0.5 NA intron (NM_001083621, intron 2 of 18) L1ME4a|LINE|L1 12764 NM_014870 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 127.5-253 chr8 136568886 136569390 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 38340 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 161.25-132 chr4 58446198 58446597 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 89931 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 162.5-92 chr2 179562270 179562722 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_148055) promoter-TSS (NR_148055) 92 NR_148055 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 121.75-165 chr6 129802012 129802423 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59098 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 176.5-83 chr2 24527222 24527708 + 0.5 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) L1MA9|LINE|L1 35588 NM_001362952 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 153.25-13 chr10 43044528 43044953 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32287 NM_020630 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 118.75-158 chr5 131241775 131242213 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -22015 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 163.5-197 chr7 146537432 146537911 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -236600 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 120.5-132 chr2 213304832 213305187 + 0.5 NA intron (NR_047660, intron 3 of 14) L1MA3|LINE|L1 20545 NR_047659 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 145.5-194 chr8 121473167 121473708 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165909 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 131.75-70 chr14 76251084 76251436 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 96906 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 118.25-156 chr5 61880763 61881175 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -145271 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 177.5-100 chr2 233370722 233371293 + 0.5 NA intron (NM_152879, intron 1 of 29) AluJo|SINE|Alu 16513 NM_152879 8527 Hs.471675 NM_003648 ENSG00000077044 DGKD DGKdelta|dgkd-2 diacylglycerol kinase delta protein-coding 156.25-42 chr14 71342844 71343331 + 0.5 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 22611 NM_001354285 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 141.75-17 chr1 246550064 246550455 + 0.5 NA intron (NM_022366, intron 5 of 7) intron (NM_022366, intron 5 of 7) 16002 NM_022366 64216 Hs.7395 NM_022366 ENSG00000162851 TFB2M Hkp1|mtTFB2 transcription factor B2, mitochondrial protein-coding 122.75-152 chr4 122549921 122550303 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -68871 NR_104126 100996941 Hs.439487 NR_104126 ENSG00000227145 IL21-AS1 - IL21 antisense RNA 1 ncRNA 210.25-88 chr9 35059985 35060584 + 0.5 NA intron (NM_001354927, intron 13 of 16) intron (NM_001354927, intron 13 of 16) 12024 NM_001354928 7415 Hs.529782 NM_007126 ENSG00000165280 VCP CDC48|TERA|p97 valosin containing protein protein-coding 167-24 chr10 122655774 122656359 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16816 NM_001364461 112577516 NM_001364461 LOC112577516 - carbohydrate-binding protein AQN-1-like protein-coding 154.75-78 chr2 175249489 175249876 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67972 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 116.5-2 chr1 13906707 13906940 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 157408 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 155.75-101 chr3 32469104 32469484 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 33558 NM_017801 54918 Hs.380627 NM_017801 ENSG00000091317 CMTM6 CKLFSF6|PRO2219 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 6 protein-coding 134.25-174 chr7 44196731 44197099 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -4063 NM_006555 10652 Hs.520794 NM_006555 ENSG00000106636 YKT6 - YKT6 v-SNARE homolog protein-coding 115.25-213 chr8 123953151 123953512 + 0.5 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 87451 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-82 chr17 56969456 56969807 + 0.5 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 -8476 NM_021626 59342 Hs.514950 NM_021626 ENSG00000121064 SCPEP1 HSCP1|RISC serine carboxypeptidase 1 protein-coding 127.25-214 chr9 25194427 25194772 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 484259 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 147.75-19 chr10 111333774 111334095 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 219643 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 163.75-88 chr22 43168050 43168384 + 0.5 NA intron (NM_015140, intron 13 of 13) intron (NM_015140, intron 13 of 13) 16282 NM_001256530 706 Hs.202 NM_000714 ENSG00000100300 TSPO BPBS|BZRP|DBI|IBP|MBR|PBR|PBS|PKBS|PTBR|mDRC|pk18 translocator protein protein-coding 131.5-40 chr12 13533696 13534220 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -157213 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 127-152 chr6 124622644 124623081 + 0.5 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) LTR1B|LTR|ERV1 -339683 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 165-6 chr1 183711052 183711482 + 0.5 NA intron (NM_001297669, intron 2 of 18) intron (NM_001297669, intron 2 of 18) -57951 NM_203454 403314 Hs.97335 NM_203454 ENSG00000173627 APOBEC4 C1orf169 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4 protein-coding 114.75-143 chr4 105989896 105990310 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32375 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 163.75-54 chr17 44832033 44832454 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -1432 NM_001080383 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 133.25-124 chr21 31695487 31695950 + 0.5 NA intron (NM_020706, intron 9 of 19) intron (NM_020706, intron 9 of 19) 36096 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 142.25-67 chr16 80360774 80361170 + 0.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -179762 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 179.75-100 chr5 57745450 57745941 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95035 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 117.5-197 chr5 143765400 143765665 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46629 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 147.75-23 chr11 55400975 55401429 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 33318 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 120.25-161 chr5 55383110 55383503 + 0.5 NA intron (NM_015360, intron 18 of 26) L1M4b|LINE|L1 75317 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 126.25-33 chr11 100092364 100092768 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) intron (NM_001243270, intron 12 of 23) 536421 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 134.5-30 chr10 82187515 82187840 + 0.5 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 45243 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 113.25-160 chr7 111314486 111314819 + 0.5 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 223525 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 114.5-210 chr5 59943527 59943891 + 0.5 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -49983 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 154-24 chr10 126782218 126782664 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -111931 NR_146939 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 147.25-40 chr15 64574772 64575312 + 0.5 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 75622 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 142.75-58 chr14 24901197 24901637 + 0.5 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) L1ME3|LINE|L1 147583 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 166.75-34 chr12 72342469 72343021 + 0.5 NA intron (NM_013381, intron 2 of 18) intron (NM_013381, intron 2 of 18) -69236 NR_026837 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 170-29 chr14 52744891 52745530 + 0.5 NA intron (NM_001130701, intron 3 of 11) AluSp|SINE|Alu 15044 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 117.75-120 chr20 941468 941918 + 0.5 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 -25359 NM_015985 51378 Hs.278973 NM_015985 ENSG00000101280 ANGPT4 ANG3|ANG4 angiopoietin 4 protein-coding 143.25-195 chrX 45494229 45494611 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -10968 NR_104644 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 122.75-50 chr14 57407035 57407424 + 0.5 NA intron (NM_001011713, intron 4 of 4) intron (NM_001011713, intron 4 of 4) 16643 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 122-65 chr15 100428049 100428514 + 0.5 NA intron (NR_120374, intron 4 of 4) intron (NR_120374, intron 4 of 4) 55342 NR_120374 102723320 Hs.416099 NR_120374 CERS3-AS1 - CERS3 antisense RNA 1 ncRNA 135.75-168 chr5 12658507 12658916 + 0.5 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) intron (NR_033383, intron 2 of 3) -9148 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 143-55 chr17 61769441 61769887 + 0.5 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) L1MCb|LINE|L1 93895 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 138.5-59 chr14 63843006 63843311 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9807 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 136.75-124 chr3 9433280 9433817 + 0.5 NA intron (NM_001349451, intron 4 of 25) intron (NM_001349451, intron 4 of 25) 35848 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 125.5-2 chr1 36312068 36312407 + 0.5 NA intron (NM_001162530, intron 10 of 15) AluY|SINE|Alu 5130 NM_024676 79729 Hs.524496 NM_024676 ENSG00000214193 SH3D21 C1orf113 SH3 domain containing 21 protein-coding 180.25-42 chr17 80513734 80514252 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30845 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 181.75-23 chr11 17092140 17092589 + 0.5 NA intron (NM_001321380, intron 27 of 31) intron (NM_001321380, intron 27 of 31) -14697 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 121.5-112 chr18 9937623 9938063 + 0.5 NA intron (NM_194434, intron 4 of 5) intron (NM_194434, intron 4 of 5) 23827 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 140.5-171 chr4 153687171 153687659 + 0.5 NA intron (NM_001318791, intron 1 of 2) L1MEd|LINE|L1 3135 NM_001318790 7097 Hs.519033 NM_003264 ENSG00000137462 TLR2 CD282|TIL4 toll like receptor 2 protein-coding 182-112 chr9 38072357 38072891 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3397 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 154.25-123 chr5 13946580 13947045 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2332 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 125-108 chr3 194290752 194291238 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 21809 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 134.25-29 chr11 110877705 110878068 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -164697 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 164.75-96 chr3 37949636 37950137 + 0.5 NA intron (NM_005808, intron 2 of 6) intron (NM_005808, intron 2 of 6) -19518 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 116.5-156 chr3 22667041 22667475 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 535320 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 118.5-95 chr2 48771806 48772215 + 0.5 NA intron (NM_001198593, intron 10 of 10) intron (NM_001198593, intron 10 of 10) -16286 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 114.75-160 chr6 3287657 3287967 + 0.5 NA intron (NM_021945, intron 7 of 10) AluSx1|SINE|Alu 28865 NM_001128591 389362 Hs.207069 NM_001128591 ENSG00000180822 PSMG4 C6orf86|PAC4|bA506K6.2 proteasome assembly chaperone 4 protein-coding 118.75-196 chr8 83799538 83799836 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -383100 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 129.5-196 chr6 14171853 14172174 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 54241 NM_004233 9308 Hs.595133 NM_004233 ENSG00000112149 CD83 BL11|HB15 CD83 molecule protein-coding 119.25-98 chr2 123677512 123677784 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 347526 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 156.25-23 chr11 5242037 5242521 + 0.5 NA intron (NR_001589, intron 2 of 2) intron (NR_001589, intron 2 of 2) 1313 NR_001589 3044 Hs.20205 NR_001589 HBBP1 HBH1|HBHP hemoglobin subunit beta pseudogene 1 pseudo 141.5-203 chr6 147810216 147810640 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 301738 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 141.25-91 chr2 201734636 201735081 + 0.5 NA intron (NM_020919, intron 12 of 33) intron (NM_020919, intron 12 of 33) -36214 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 191.5-85 chr20 45161814 45162437 + 0.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -12777 NM_002638 5266 Hs.112341 NM_002638 ENSG00000124102 PI3 ESI|SKALP|WAP3|WFDC14|cementoin peptidase inhibitor 3 protein-coding 140.25-93 chr2 80837639 80838033 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 524457 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 115.25-201 chr8 63569954 63570261 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 104258 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 123.5-192 chr6 152261123 152261606 + 0.5 NA intron (NM_182961, intron 101 of 145) intron (NM_182961, intron 101 of 145) -75986 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 159.75-104 chr3 57492493 57492942 + 0.5 NA intron (NM_001366028, intron 11 of 73) intron (NM_001366028, intron 11 of 73) 51627 NM_001366028 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 183.75-22 chr10 117575145 117575628 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30318 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 123-141 chr3 196364801 196365220 + 0.5 NA intron (NM_015562, intron 8 of 10) intron (NM_015562, intron 8 of 10) -26590 NR_037950 100534611 Hs.733180 NR_037950 TM4SF19-TCTEX1D2 - TM4SF19-TCTEX1D2 readthrough (NMD candidate) ncRNA 150.75-59 chr14 63386797 63387153 + 0.5 NA intron (NR_104104, intron 10 of 12) intron (NR_104104, intron 10 of 12) -68040 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 188-80 chr8 109908651 109909284 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 66804 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 118.25-117 chr20 40374061 40374339 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 315036 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 142.75-121 chr22 26424662 26425114 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4372 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 130.75-73 chr17 71037295 71037793 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 164635 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 194.75-7 chr1 111325838 111326389 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -20447 NR_125338 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 119.25-159 chr5 8246697 8246939 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 210746 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 115.75-8 chr1 173548802 173549207 + 0.5 NA intron (NM_178527, intron 11 of 27) intron (NM_178527, intron 11 of 27) 54068 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 187.25-17 chr10 97901751 97902280 + 0.5 NA intron (NM_001206528, intron 7 of 14) MIRc|SINE|MIR -26118 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 131.25-5 chr1 53876313 53876743 + 0.5 NA intron (NR_036639, intron 6 of 11) intron (NR_036639, intron 6 of 11) 13269 NR_036639 54432 Hs.11923 NM_018982 ENSG00000058799 YIPF1 DJ167A19.1|FinGER1 Yip1 domain family member 1 protein-coding 125 chr1 39359575 39359979 + 0.5 NA intron (NM_012090, intron 41 of 92) AluY|SINE|Alu -49296 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 157.25-153 chr8 99780682 99781158 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 42 of 61) intron (NM_017890, intron 42 of 61) 112787 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 153.25-106 chr5 152885123 152885684 + 0.5 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 86946 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 150.75-78 chr17 33566337 33566856 + 0.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -32836 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 140.75-158 chr5 131718579 131718986 + 0.5 NA intron (NM_133372, intron 5 of 17) intron (NM_133372, intron 5 of 17) 78235 NM_001008738 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 122.5-35 chr11 78504334 78504803 + 0.5 NA intron (NM_024678, intron 6 of 13) intron (NM_024678, intron 6 of 13) -28608 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 137.75-67 chr15 35667010 35667330 + 0.5 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) intron (NR_038251, intron 1 of 2) 120975 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 123-182 chr8 60791057 60791520 + 0.5 NA intron (NM_017780, intron 3 of 37) intron (NM_017780, intron 3 of 37) 50029 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 141.75-81 chr18 12808349 12808703 + 0.5 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) AluSc8|SINE|Alu 32436 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 117-42 chr12 90701136 90701490 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -216710 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 171.5-27 chr11 98018688 98019108 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1002051 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 125.5-206 chr5 106045130 106045620 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 945901 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 159-102 chr7 69313748 69314309 + 0.5 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 283596 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 112.25-179 chr6 41828934 41829216 + 0.5 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 41632 NM_001134493 100188893 Hs.731633 NM_001134493 ENSG00000214736 TOMM6 OBTP|TOM6 translocase of outer mitochondrial membrane 6 protein-coding 146.75-88 chr20 14867486 14868003 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) LTR85c|LTR|Gypsy? 61774 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 141.5-228 chr8 80363329 80363760 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -122049 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 140.75-115 chr20 60552721 60553111 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11646 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 126.75-151 chr3 66138914 66139349 + 0.5 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) intron (NM_173471, intron 1 of 10) 5521 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 114.25-8 chr1 173505317 173505728 + 0.5 NA intron (NM_178527, intron 25 of 27) intron (NM_178527, intron 25 of 27) 28187 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 118.75-131 chr3 166605562 166605982 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -292911 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 126.75-15 chr10 31496774 31497212 + 0.5 NA intron (NM_001323658, intron 3 of 8) intron (NM_001323658, intron 3 of 8) -97238 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 159.25-41 chr14 62956033 62956432 + 0.5 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) L1ME3A|LINE|L1 89226 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 161.25-174 chr8 99142295 99142815 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 12 of 61) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 129289 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 144.25-18 chr1 231198456 231198875 + 0.5 NA intron (NM_001300889, intron 4 of 11) AluSp|SINE|Alu -11038 NM_001256615 149373 Hs.632505 NM_001256615 ENSG00000235710 LOC149373 - uncharacterized LOC149373 protein-coding 143.75-60 chr16 5315585 5316134 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -218039 NM_201598 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 122-133 chr4 134134136 134134551 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 67446 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 114.5-283 chrX 155298068 155298403 + 0.5 NA intron (NM_001289, intron 3 of 5) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -33744 NM_171998 116442 Hs.632832 NM_171998 ENSG00000155961 RAB39B BGMR|MRX72|WSMN|WSN RAB39B, member RAS oncogene family protein-coding 141.25-114 chr3 149426369 149426678 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48174 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 256-18 chr16 57010876 57011818 + 0.5 NA intron (NM_001330552, intron 1 of 47) AluSx1|SINE|Alu -5727 NM_032206 84166 Hs.528836 NM_032206 ENSG00000140853 NLRC5 CLR16.1|NOD27|NOD4 NLR family CARD domain containing 5 protein-coding 114.75-29 chr10 116020358 116020701 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 174260 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 147.5-218 chr9 11448011 11448496 + 0.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 835047 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 131.75-213 chr8 79859665 79860047 + 0.5 NA intron (NR_110954, intron 2 of 5) intron (NR_110954, intron 2 of 5) 11881 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 144.5-187 chr6 48663947 48664257 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -595413 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 135.5-21 chr10 31423644 31424182 + 0.5 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -24158 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 123.5-106 chr2 101714832 101715192 + 0.5 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 17305 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 123.75-51 chr13 74872341 74872796 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 319725 NR_034024 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 128-126 chr5 87781205 87781512 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 119316 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 183.25-28 chr13 34194870 34195516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -152850 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 126.75-76 chr15 76383736 76384186 + 0.5 NA intron (NR_148227, intron 28 of 32) intron (NR_148227, intron 28 of 32) 47188 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 141.5-40 chr12 61504379 61504922 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 688189 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 138.25-104 chr21 46487622 46488025 + 0.5 NA intron (NM_001146115, intron 2 of 19) L1M5|LINE|L1 25352 NR_046400 100862692 Hs.737163 NR_046400 ENSG00000223692 DIP2A-IT1 - DIP2A intronic transcript 1 ncRNA 129-151 chr6 36502129 36502495 + 0.5 NA intron (NM_007271, intron 9 of 13) L1ME3C|LINE|L1 45167 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 127.25-94 chr2 147044529 147044986 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 457700 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 123-16 chr1 243999248 243999675 + 0.5 NA intron (NR_033883, intron 2 of 11) intron (NR_033883, intron 2 of 11) -49478 NM_001278196 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 201.75-113 chrX 78799271 78799826 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 51828 NM_005296 2846 Hs.522701 NM_005296 ENSG00000147145 LPAR4 GPR23|LPA4|P2RY9|P2Y5-LIKE|P2Y9 lysophosphatidic acid receptor 4 protein-coding 156-18 chr10 63086071 63086650 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -46887 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 130.75-12 chr1 220798319 220798762 + 0.5 NA intron (NM_022746, intron 4 of 6) intron (NM_022746, intron 4 of 6) 11627 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 134-108 chr20 15292361 15292827 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) MIR3|SINE|MIR 95754 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 301-7 chr17 66685087 66686063 + 0.5 NA intron (NM_002737, intron 5 of 16) intron (NM_002737, intron 5 of 16) -101497 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 120.25-65 chr14 97957783 97958242 + 0.5 NA TTS (NR_152746) TTS (NR_152746) 20112 NR_152747 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 113.5-76 chr14 55116511 55116873 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12560 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 115-196 chrX 94180129 94180455 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 506086 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 129-5 chr1 101234982 101235302 + 0.5 NA non-coding (NR_104626, exon 2 of 2) non-coding (NR_104626, exon 2 of 2) 1386 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 113.5-19 chr1 182759171 182759431 + 0.5 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -30148 NM_001200050 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 121-174 chr7 11755061 11755395 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) MER20|DNA|hAT-Charlie 76970 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 180-55 chr2 31924809 31925287 + 0.5 NA intron (NM_001137602, intron 2 of 7) L2b|LINE|L2 85616 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 120.75-154 chr7 16985054 16985431 + 0.5 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -103259 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 128.5-2 chr1 9304115 9304435 + 0.5 NA intron (NM_025106, intron 1 of 2) MLT2B5|LTR|ERVL 11381 NM_025106 80176 Hs.8261 NM_025106 ENSG00000171621 SPSB1 SSB-1|SSB1 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 protein-coding 135-92 chr20 34052639 34053082 + 0.5 NA intron (NM_007367, intron 2 of 8) intron (NM_007367, intron 2 of 8) 3741 NR_039911 100616434 NR_039911 ENSG00000264616 MIR4755 mir-4755 microRNA 4755 ncRNA 125-51 chr16 53724470 53724879 + 0.5 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 20518 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 123.75-94 chr2 126680852 126681297 + 0.5 NA intron (NM_016815, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 24916 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 118-100 chr2 234141325 234141611 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 90766 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 121.5-271 chrX 120541808 120542148 + 0.5 NA intron (NM_001369145, intron 9 of 19) AluJr|SINE|Alu 17920 NM_001369145 8450 Hs.102914 NM_003588 ENSG00000158290 CUL4B CUL-4B|MRXHF2|MRXS15|MRXSC|SFM2 cullin 4B protein-coding 130.75-27 chr11 41816356 41816802 + 0.5 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) MER101-int|LTR|ERV1 102011 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 136-107 chr3 103146979 103147334 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 376960 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 126.5-53 chr12 93233159 93233630 + 0.5 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) intron (NR_040096, intron 2 of 4) 59028 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 122-46 chr12 7193393 7193822 + 0.5 NA intron (NM_001351131, intron 5 of 15) intron (NM_001351131, intron 5 of 15) 3245 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 113.25-67 chr17 7426856 7427180 + 0.5 NA exon (NM_175734, exon 3 of 3).2 exon (NM_175734, exon 3 of 3).2 1402 NM_175734 201243 Hs.380704 NM_175734 ENSG00000184560 SPEM2 C17orf74 SPEM family member 2 protein-coding 163.75-16 chr10 21312394 21312833 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 60337 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 211.75-27 chr15 71250262 71250918 + 0.5 NA intron (NM_024817, intron 4 of 16) AluJo|SINE|Alu -61531 NR_120348 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 199.25-52 chr19 43817255 43817892 + 0.5 NA intron (NM_182573, intron 1 of 4) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 3083 NM_182573 284348 Hs.44289 NM_182573 ENSG00000159871 LYPD5 PRO4356 LY6/PLAUR domain containing 5 protein-coding 147-107 chr5 29707232 29707783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -173053 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 152-8 chr1 91728788 91729104 + 0.5 NA intron (NR_036634, intron 7 of 17) intron (NR_036634, intron 7 of 17) 157205 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 117.75-99 chr2 29606859 29607229 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -131667 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 138-56 chr16 82796389 82796848 + 0.5 NA intron (NR_110938, intron 1 of 2) intron (NR_110938, intron 1 of 2) 23299 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 116.25-30 chr11 17649024 17649402 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 47726 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 150.5-47 chr14 31422175 31422682 + 0.5 NA intron (NR_110045, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 1670 NR_110045 101927124 Hs.647561 NR_110045 ENSG00000250365 LOC101927124 - uncharacterized LOC101927124 ncRNA 116.5-37 chr11 95768455 95768764 + 0.5 NA TTS (NM_144664) TTS (NM_144664) 21173 NM_144664 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 137-73 chr2 44463610 44463938 + 0.5 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L1MA5A|LINE|L1 101827 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 119.5-206 chr7 4774665 4775018 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_014855) promoter-TSS (NM_014855) -782 NM_014855 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 197.5-52 chr16 80059349 80059890 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 264370 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 181.5-23 chr11 100993809 100994300 + 0.5 NA TTS (NM_152432) TTS (NM_152432) 59780 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 131.5-253 chrX 132528531 132528989 + 0.5 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -38725 NM_001170704 55796 Hs.105134 NM_018388 ENSG00000076770 MBNL3 CHCR|MBLX|MBLX39|MBXL muscleblind like splicing regulator 3 protein-coding 133.75-204 chr9 89760008 89760458 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 120450 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 184.25-131 chr9 68843073 68843473 + 0.5 NA intron (NM_003558, intron 4 of 15) intron (NM_003558, intron 4 of 15) 63208 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 125.25-58 chr14 26808238 26808731 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_110556) promoter-TSS (NR_110556) -864 NR_110556 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 183-6 chr10 7118721 7119240 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 67804 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 118.75-49 chr12 112421919 112422215 + 0.5 NA intron (NM_001330437, intron 1 of 15) intron (NM_001330437, intron 1 of 15) 3120 NM_080601 5781 Hs.506852 NM_002834 ENSG00000179295 PTPN11 BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 protein-coding 181.5-143 chr6 158166501 158166982 + 0.5 NA intron (NM_032861, intron 1 of 16) L1M5|LINE|L1 1521 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 154.5-66 chr15 33711023 33711553 + 0.5 NA intron (NM_001243996, intron 43 of 102) AluY|SINE|Alu -257209 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 134.75-11 chr1 112257824 112258264 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -138170 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 136.25-196 chr9 91893804 91894149 + 0.5 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 56252 NM_001318204 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 201-77 chr8 114145532 114145955 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -708804 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 166-47 chr17 59126789 59127418 + 0.5 NA intron (NM_182620, intron 2 of 3) L1MB3|LINE|L1 10769 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 142.25-48 chr13 53037594 53037999 + 0.5 NA intron (NM_006418, intron 2 of 4) intron (NM_006418, intron 2 of 4) 8983 NM_006418 10562 Hs.508113 NM_006418 ENSG00000102837 OLFM4 GC1|GW112|OLM4|OlfD|UNQ362|bA209J19.1|hGC-1|hOLfD olfactomedin 4 protein-coding 121.5-52 chr11 125772970 125773437 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 5625 NM_212555 399967 Hs.369185 NM_212555 ENSG00000196844 PATE2 C11orf38|PATE-M|UNQ3112 prostate and testis expressed 2 protein-coding 140.25-57 chr15 90492908 90493397 + 0.5 NA intron (NM_003870, intron 35 of 37) AluSz|SINE|Alu -36771 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 158-69 chr2 23299667 23300062 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -85315 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 195.5-55 chr17 76195985 76196724 + 0.5 NA intron (NM_052916, intron 2 of 18) L1ME3A|LINE|L1 44139 NM_001330501 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 169.25-14 chr11 29849985 29850419 + 0.5 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 132191 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 167.25-154 chr8 113146620 113147076 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 230304 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 142.75-43 chr12 16984514 16984958 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -4011 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 135-39 chr13 103881075 103881458 + 0.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 456066 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 117.75-211 chr8 103023677 103024119 + 0.5 NA intron (NM_001695, intron 1 of 12) intron (NM_001695, intron 1 of 12) 2815 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 147.25-92 chr3 178248724 178249301 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -170189 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 154-78 chr2 182281950 182282403 + 0.5 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -40113 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 154.25-28 chr11 100263075 100263599 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 16 of 23) intron (NM_001243270, intron 16 of 23) -423951 NM_001367945 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 129-167 chr7 44975049 44975486 + 0.5 NA intron (NM_033054, intron 4 of 21) intron (NM_033054, intron 4 of 21) 3748 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 155.5-79 chr18 31922723 31923128 + 0.5 NA intron (NM_014939, intron 2 of 28) AluJb|SINE|Alu 20203 NM_014939 22878 Hs.202001 NM_014939 ENSG00000153339 TRAPPC8 GSG1|HsT2706|KIAA1012|TRS85 trafficking protein particle complex 8 protein-coding 159.75-162 chr7 92303671 92304173 + 0.5 NA intron (NM_019004, intron 2 of 19) intron (NM_019004, intron 2 of 19) -57822 NM_001350679 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 129.5-144 chr20 31998124 31998535 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001011718, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001011718, exon 3 of 3) -12109 NM_080625 140706 Hs.382151 NM_080625 ENSG00000101331 CCM2L C20orf160|dJ310O13.5 CCM2 like scaffold protein protein-coding 119.5-158 chr3 144046623 144046967 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 73714 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 120.75-63 chr18 2772126 2772550 + 0.5 NA exon (NM_015295, exon 41 of 48) exon (NM_015295, exon 41 of 48) -74668 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 116.25-52 chr12 88491783 88492137 + 0.5 NA TTS (NM_003994) TTS (NM_003994) 88511 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 131.5-8 chr1 115525551 115525899 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116245 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 131.25-57 chr14 53258973 53259283 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 105774 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 115-116 chr4 3721018 3721361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43334 NR_034136 100133461 Hs.554274 NR_034136 ENSG00000250632 LINC02171 - long intergenic non-protein coding RNA 2171 ncRNA 123-88 chr18 13509616 13509913 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 49817 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 190.75-3 chr1 170555949 170556405 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23568 NR_125958 101928650 Hs.676662 NR_125958 GORAB-AS1 - GORAB antisense RNA 1 ncRNA 144.25 chr1 15923663 15924113 + 0.5 NA intron (NM_015001, intron 10 of 14) AluSx4|SINE|Alu 52244 NM_001324138 7709 Hs.433764 NM_003443 ENSG00000116809 ZBTB17 MIZ-1|ZNF151|ZNF60|pHZ-67 zinc finger and BTB domain containing 17 protein-coding 115-91 chr2 164545908 164546356 + 0.5 NA intron (NM_004490, intron 3 of 13) intron (NM_004490, intron 3 of 13) 22363 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 196.5 chr1 2197500 2198070 + 0.5 NA intron (NM_001282670, intron 5 of 7) intron (NM_001282670, intron 5 of 7) -3010 NM_001282672 199990 Hs.107101 NM_182533 ENSG00000162585 FAAP20 C1orf86|FP7162 FA core complex associated protein 20 protein-coding 112.5-156 chr22 29182034 29182357 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -23701 NM_133455 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 116.75-45 chr12 15673095 15673531 + 0.5 NA intron (NM_004447, intron 3 of 20) intron (NM_004447, intron 3 of 20) 116075 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 189.75-15 chr10 121050009 121050632 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 198958 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 140.25-70 chr17 39310071 39310482 + 0.5 NA intron (NM_001370209, intron 2 of 13) LTR45C|LTR|ERV1 12876 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 123.75-195 chr8 125543105 125543419 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 111053 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 138-27 chr12 77033643 77034046 + 0.5 NA intron (NM_203394, intron 8 of 12) intron (NM_203394, intron 8 of 12) 31725 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 124-140 chr5 154543083 154543460 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 52801 NR_036094 100422950 NR_036094 ENSG00000264760 MIR3141 mir-3141 microRNA 3141 ncRNA 126.25-11 chr1 203121089 203121424 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6470 NM_000674 134 Hs.77867 NM_000674 ENSG00000163485 ADORA1 RDC7 adenosine A1 receptor protein-coding 127.5-108 chr2 35218628 35219053 + 0.5 NA Intergenic LTR77|LTR|ERV1 -252565 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 154-86 chr22 21088416 21088904 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -14356 NR_037566 400892 Hs.745077 NM_207474 BCRP2 BCR-2|BCR2|BCRL2 BCR pseudogene 2 pseudo 121.75 chr1 5232466 5232847 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 578047 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 122-41 chr11 43534079 43534480 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25377 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 162.5-40 chr12 66277246 66277714 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -25013 NM_001370285 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 115.5-11 chr1 114998045 114998393 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31605 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 121-147 chr4 122685022 122685433 + 0.5 NA intron (NR_104126, intron 10 of 10) LTR26|LTR|ERV1 47231 NR_024041 729338 Hs.647968 NR_024041 CETN4P - centrin 4, pseudogene pseudo 148-46 chr17 73252869 73253344 + 0.5 NA intron (NM_001129885, intron 4 of 5) AluSz|SINE|Alu 8774 NM_001129885 642843 Hs.534707 NM_001129885 ENSG00000187959 CPSF4L - cleavage and polyadenylation specific factor 4 like protein-coding 133-30 chr12 785739 786239 + 0.5 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) intron (NM_001184985, intron 1 of 27) 33066 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 112.75-180 chr6 83622017 83622455 + 0.5 NA intron (NM_001242794, intron 8 of 19) intron (NM_001242794, intron 8 of 19) 86323 NM_001363677 9892 Hs.368046 NM_014841 ENSG00000065609 SNAP91 AP180|CALM synaptosome associated protein 91 protein-coding 158.25-32 chr12 38670849 38671233 + 0.5 NA intron (NM_153634, intron 18 of 19) intron (NM_153634, intron 18 of 19) 234550 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 124.25-38 chr12 2129602 2129868 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 76450 NM_001167624 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 121.75-2 chr1 16616669 16617031 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3245 NM_017940 55672 Hs.467587 NM_017940 ENSG00000219481 NBPF1 AB13|AB14|AB23|AD2|NBG|NBPF NBPF member 1 protein-coding 135.75-94 chr2 56745386 56745692 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -559769 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 137.25-63 chr2 17234428 17234802 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 283825 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 147.25-137 chr8 31118889 31119378 + 0.5 NA intron (NM_000553, intron 20 of 34) intron (NM_000553, intron 20 of 34) -85777 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 118.75-185 chr7 86701748 86702053 + 0.5 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 57986 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 122.5-164 chr4 16064118 16064517 + 0.5 NA intron (NM_001371408, intron 2 of 24) L1ME3A|LINE|L1 11801 NM_001145851 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 132-61 chr15 93716872 93717268 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -139490 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 129.25-123 chr3 28819368 28819700 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 244256 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 135.75-196 chr8 82251083 82251578 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -409044 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 227.75-17 chr12 2567480 2568373 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 13 of 49).2 intron (NM_199460, intron 13 of 49).2 104294 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 113.75-174 chr7 42008286 42008659 + 0.5 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) FAM|SINE|Alu 228737 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 128.5-73 chr15 77329367 77329751 + 0.5 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 90545 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 149.5-197 chr8 18465618 18465967 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 74510 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 129.75-168 chr7 26350241 26350692 + 0.5 NA intron (NM_001318199, intron 2 of 6) intron (NM_001318199, intron 2 of 6) -10418 NM_001199837 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 114.75-67 chr17 27873155 27873454 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 20061 NM_001076680 201229 Hs.687951 NM_001076680 ENSG00000232859 LYRM9 C17orf108|HSD24 LYR motif containing 9 protein-coding 164.5-124 chr22 20851887 20852294 + 0.5 NA intron (NM_058004, intron 1 of 54) AluY|SINE|Alu 6721 NM_058004 5297 Hs.529438 NM_002650 ENSG00000241973 PI4KA PI4K-ALPHA|PIK4CA|PMGYCHA|pi4K230 phosphatidylinositol 4-kinase alpha protein-coding 125.75-127 chr3 81673767 81674245 + 0.5 NA intron (NM_000158, intron 2 of 15) intron (NM_000158, intron 2 of 15) 87639 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 154.5-100 chr2 101767969 101768425 + 0.5 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 70490 NM_145687 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 127.5-200 chr5 129130636 129130949 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 33104 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 143.5-156 chr4 56456404 56456814 + 0.5 NA intron (NM_001079525, intron 9 of 9) AluJr|SINE|Alu -11008 NM_006947 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 112.5-214 chr6 73481395 73481729 + 0.5 NA intron (NM_001123226, intron 8 of 12) AluJr|SINE|Alu 19825 NM_012123 25821 Hs.347614 NM_012123 ENSG00000135297 MTO1 CGI-02|COXPD10 mitochondrial tRNA translation optimization 1 protein-coding 143.75-40 chr12 53473687 53474212 + 0.5 NA intron (NM_001128912, intron 14 of 14) intron (NM_001128912, intron 14 of 14) 9481 NR_109828 102157401 NR_109828 ENSG00000282977 PCBP2-OT1 TUC.338|TUC338|uc.338 PCBP2 overlapping transcript 1 ncRNA 120.5-22 chr10 34102869 34103231 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -330370 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 133.25-38 chr12 22777793 22778247 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 152849 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 132.25-158 chr5 122322872 122323367 + 0.5 NA intron (NM_001308107, intron 1 of 8) intron (NM_001308107, intron 1 of 8) 10882 NM_001308109 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 157.75-117 chr3 193567346 193567817 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12686 NM_032279 84239 Hs.674423 NM_032279 ENSG00000127249 ATP13A4 - ATPase 13A4 protein-coding 238.75-45 chr5 27200379 27201144 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -162175 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 119.75-19 chr10 22872589 22872887 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55286 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 118.25-4 chr1 39227106 39227362 + 0.5 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) intron (NM_012090, intron 1 of 92) 143067 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 170.5-89 chr2 23104873 23105433 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -280026 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 159-43 chr17 33933414 33933901 + 0.5 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 223149 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 146.5-196 chr7 6465366 6465809 + 0.5 NA intron (NM_001100603, intron 3 of 3) L1ME4a|LINE|L1 -17575 NM_001142936 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 120.5-143 chr3 95257082 95257434 + 0.5 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 318995 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 117-188 chr8 99566613 99566995 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 31 of 61) intron (NM_017890, intron 31 of 61) -29943 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 158.5-140 chr4 60618560 60619062 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -303808 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 135.25-171 chr5 171962490 171962918 + 0.5 NA intron (NM_012300, intron 1 of 12) intron (NM_012300, intron 1 of 12) 44169 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 116-111 chr3 175580851 175581276 + 0.5 NA intron (NM_207015, intron 10 of 13) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 195270 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 136-83 chr2 203161895 203162212 + 0.5 NA intron (NM_001114132, intron 35 of 54) AluSz|SINE|Alu -76388 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 118.5-126 chr3 76666927 76667216 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -373028 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 127.25-99 chr2 194274365 194274634 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -69770 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 131.5-56 chr14 55286338 55286768 + 0.5 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 14399 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 116.5-55 chr13 39095092 39095438 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56809 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 156.75-107 chr3 23823822 23824235 + 0.5 NA intron (NM_003341, intron 3 of 5) intron (NM_003341, intron 3 of 5) 13574 NM_001202476 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 124.25-149 chr4 83737448 83737825 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 201528 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 112.75-165 chr5 95991636 95991977 + 0.5 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 29805 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 112.25-164 chr5 39301093 39301455 + 0.5 NA intron (NM_001737, intron 9 of 10) L1MC4a|LINE|L1 -30625 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 154.25-24 chr11 62766400 62766881 + 0.5 NA TTS (NM_002696) TTS (NM_002696) -4756 NM_006473 10629 Hs.714400 NM_006473 ENSG00000162227 TAF6L PAF65A TATA-box binding protein associated factor 6 like protein-coding 128.25-12 chr1 227913520 227913834 + 0.5 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 28006 NR_049806 100847072 NR_049806 ENSG00000264483 MIR5008 - microRNA 5008 ncRNA 145.25-117 chr4 79306152 79306666 + 0.5 NA intron (NR_038342, intron 4 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 19652 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 135.25-10 chr1 114835892 114836428 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -18643 NM_001282542 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 137-185 chr8 138684667 138685133 + 0.5 NA intron (NM_152888, intron 38 of 64) L2c|LINE|L2 -187170 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 132-130 chr5 8359540 8359861 + 0.5 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) intron (NR_039984, intron 3 of 5) 97864 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 155.25-92 chr2 68490471 68491000 + 0.5 NA intron (NM_173545, intron 2 of 9) intron (NM_173545, intron 2 of 9) 23150 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 129-79 chr17 64260625 64261033 + 0.5 NA intron (NM_018469, intron 1 of 11) intron (NM_018469, intron 1 of 11) 2431 NM_001288732 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 129-162 chr7 34240987 34241413 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 335661 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 173-83 chr3 47397269 47397952 + 0.5 NA intron (NM_001304482, intron 2 of 23) intron (NM_001304482, intron 2 of 23) 16589 NM_001304482 25930 Hs.25524 NM_015466 ENSG00000076201 PTPN23 HD-PTP|HDPTP|PTP-TD14 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 23 protein-coding 162.25-17 chr10 62991548 62991967 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -141490 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 118.25-118 chr20 43302003 43302412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -112301 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 118.75-44 chr12 30001452 30001849 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -216891 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 132-148 chr6 65275934 65276336 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -25283 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 112.25-4 chr1 55378221 55378532 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 152735 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 123.5-38 chr11 48101043 48101335 + 0.5 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 4407 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 121.25-25 chr10 88734613 88734979 + 0.5 NA intron (NM_001080518, intron 5 of 8) intron (NM_001080518, intron 5 of 8) 10252 NM_001080518 643414 Hs.632092 NM_001080518 ENSG00000204021 LIPK LIPL2|bA186O14.2 lipase family member K protein-coding 182.75-92 chr4 92743606 92743976 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 439392 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 152.5-155 chr5 117650515 117650928 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79640 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 114.5-35 chr10 54142246 54142604 + 0.5 NA intron (NM_001354411, intron 15 of 34) LOR1-int|LTR|ERV1 -343805 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 115.25-2 chr1 8096493 8096834 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70354 NM_018948 54206 Hs.605445 NM_018948 ENSG00000116285 ERRFI1 GENE-33|MIG-6|MIG6|RALT ERBB receptor feedback inhibitor 1 protein-coding 126.5-17 chr1 202065623 202066086 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 55267 NM_004433 1999 Hs.603657 NM_004433 ENSG00000163435 ELF3 EPR-1|ERT|ESE-1|ESX E74 like ETS transcription factor 3 protein-coding 134.5-145 chr3 190403812 190404174 + 0.5 NA intron (NM_006580, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 16121 NM_006580 10686 Hs.251391 NM_006580 ENSG00000113946 CLDN16 HOMG3|PCLN1 claudin 16 protein-coding 126.75-215 chr6 124796453 124796899 + 0.5 NA intron (NM_001040214, intron 5 of 6) intron (NM_001040214, intron 5 of 6) -165869 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 140.25-156 chr5 173292566 173293049 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10923 NR_162132 113219469 NR_162132 MIR12118 - microRNA 12118 ncRNA 121.25-105 chr2 220644159 220644545 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -737787 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 118.75-173 chr6 133639713 133640056 + 0.5 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) intron (NR_109982, intron 4 of 8) -181263 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 147.5-93 chr2 39741828 39742160 + 0.5 NA intron (NR_135664, intron 11 of 11) MIR|SINE|MIR 37264 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 122.25-185 chr8 62899625 62899988 + 0.5 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L1MA2|LINE|L1 -78055 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 185.75-12 chr1 226400775 226401264 + 0.5 NA intron (NM_001618, intron 2 of 22) LTR16D|LTR|ERVL 7074 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 126.5-73 chr14 77779013 77779444 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -18072 NM_012245 22938 Hs.445498 NM_012245 ENSG00000100603 SNW1 Bx42|FUN20|NCOA-62|PRPF45|Prp45|SKIIP|SKIP|SKIP1 SNW domain containing 1 protein-coding 135.75-110 chr2 138671848 138672293 + 0.5 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 108320 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 140.75-76 chr19 17293818 17294197 + 0.5 NA intron (NM_024527, intron 4 of 4) MER91C|DNA|hAT-Tip100 9418 NM_024527 79575 Hs.515664 NM_024527 ENSG00000127220 ABHD8 - abhydrolase domain containing 8 protein-coding 156.5-118 chr3 119249127 119249536 + 0.5 NA intron (NR_046574, intron 3 of 3) L1PB2|LINE|L1 -8453 NM_003778 8702 Hs.13225 NM_003778 ENSG00000121578 B4GALT4 B4Gal-T4|beta4Gal-T4 beta-1,4-galactosyltransferase 4 protein-coding 202.75-33 chr14 55122850 55123313 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6171 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 145-52 chr16 3244470 3244857 + 0.5 NA intron (NM_001198536, intron 5 of 8) intron (NM_001198536, intron 5 of 8) -9505 NM_001145446 7752 Hs.632222 NM_003454 ENSG00000010539 ZNF200 - zinc finger protein 200 protein-coding 143.25-25 chr11 17911581 17912144 + 0.5 NA intron (NR_104041, intron 8 of 9) intron (NR_104041, intron 8 of 9) 101185 NM_012139 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 126.75-99 chr2 12016023 12016436 + 0.5 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) MLT2B4|LTR|ERVL 9113 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 114.75-125 chr3 98599283 98599512 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5786 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 194.75-76 chr4 108016196 108016796 + 0.5 NA intron (NM_005327, intron 3 of 7) intron (NM_005327, intron 3 of 7) 11832 NM_001331027 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 140-180 chr9 127773900 127774385 + 0.5 NA exon (NM_170600, exon 2 of 12) exon (NM_170600, exon 2 of 12) -2773 NM_001252334 10044 Hs.306412 NM_005489 ENSG00000095370 SH2D3C CHAT|NSP3|PRO34088|SHEP1 SH2 domain containing 3C protein-coding 181.25-24 chr12 34212167 34212731 + 0.5 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 189953 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 153.25-149 chrX 44054741 44055239 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -81600 NM_000266 4693 Hs.522615 NM_000266 ENSG00000124479 NDP EVR2|FEVR|ND norrin cystine knot growth factor NDP protein-coding 149-57 chr2 96367186 96367511 + 0.5 NA exon (NM_001281710, exon 15 of 18) exon (NM_001281710, exon 15 of 18) 31582 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 128-150 chr7 49612840 49613319 + 0.5 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -160559 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 172-15 chr10 83624989 83625668 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 51761 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 117.5-240 chr8 139788903 139789261 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -85959 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 148.25-132 chr6 62023070 62023495 + 0.5 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 262943 NR_146874 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 139.25-117 chr3 20456104 20456648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113908 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 179.25-110 chr4 45421606 45422214 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -695276 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 144-74 chr20 34937809 34938378 + 0.5 NA intron (NM_000178, intron 6 of 12) AluSx|SINE|Alu 17542 NM_001322495 2937 Hs.82327 NM_000178 ENSG00000100983 GSS GSHS|HEL-S-64p|HEL-S-88n glutathione synthetase protein-coding 119.75-48 chr12 81540791 81541150 + 0.5 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) L1ME3Cz|LINE|L1 -28579 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 133-53 chr14 103368503 103368918 + 0.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -16654 NM_002376 4140 Hs.35828 NM_002376 ENSG00000075413 MARK3 CTAK1|KP78|PAR1A|Par-1a|VIPB microtubule affinity regulating kinase 3 protein-coding 136.5-78 chr15 67644008 67644540 + 0.5 NA intron (NM_001206804, intron 9 of 21) AluSx1|SINE|Alu 95180 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 118.75-211 chr9 103498416 103498784 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -173567 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 158.25-50 chr17 53010261 53010675 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 24963 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 114.5-154 chr2 212451735 212452065 + 0.5 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) -25540 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 160.75-117 chr5 13728929 13729424 + 0.5 NA intron (NM_001369, intron 69 of 78) intron (NM_001369, intron 69 of 78) 215304 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 153.75-61 chr2 22901817 22902248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 365553 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 125.5-122 chr2 23259876 23260198 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -125142 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 168-135 chr9 89296753 89297288 + 0.5 NA Intergenic LTR19-int|LTR|ERV1 -14175 NM_001827 1164 Hs.83758 NM_001827 ENSG00000123975 CKS2 CKSHS2 CDC28 protein kinase regulatory subunit 2 protein-coding 134-95 chr2 113924760 113925120 + 0.5 NA intron (NM_005721, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu -33948 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 155.5-174 chr5 143504032 143504593 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68800 NM_001018074 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 160.5-128 chr3 126903016 126903581 + 0.5 NA intron (NM_032343, intron 5 of 7) intron (NM_032343, intron 5 of 7) -85296 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 134.5-159 chr4 101990511 101991016 + 0.5 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 176921 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 179.25-63 chr17 65439059 65439616 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18204 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 137.25-169 chr8 100553804 100554299 + 0.5 NA intron (NM_001270377, intron 1 of 4) intron (NM_001270377, intron 1 of 4) 5708 NM_001270377 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 140-52 chr16 21570543 21570880 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -26510 NM_001288659 51108 Hs.279583 NM_016025 ENSG00000197006 METTL9 CGI-81|DREV|DREV1|PAP1 methyltransferase like 9 protein-coding 117.25-201 chr7 83566485 83566787 + 0.5 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 74795 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 135.25-119 chr20 58539453 58539887 + 0.5 NA intron (NR_034147, intron 5 of 6) L1MC5|LINE|L1 -24271 NM_153360 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 147-20 chr10 83990358 83990873 + 0.5 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -148894 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 136.5-168 chr5 3494391 3494892 + 0.5 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) L1MD2|LINE|L1 9363 NR_104618 102467075 Hs.652949 NR_104618 ENSG00000250716 LINC01017 - long intergenic non-protein coding RNA 1017 ncRNA 121-94 chr19 47215220 47215587 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -11539 NR_036158 100422899 NR_036158 ENSG00000265134 MIR3190 mir-3190 microRNA 3190 ncRNA 133-158 chr7 82864925 82865289 + 0.5 NA intron (NM_033026, intron 10 of 24) intron (NM_033026, intron 10 of 24) 297777 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 136.75-129 chr3 46864080 46864440 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_000258) promoter-TSS (NM_000258) -777 NM_000258 4634 Hs.517939 NM_000258 ENSG00000160808 MYL3 CMH8|MLC-lV/sb|MLC1SB|MLC1V|VLC1|VLCl myosin light chain 3 protein-coding 122-47 chr12 24645314 24645754 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -61366 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 128.75-25 chr10 111482261 111482635 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 368157 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 133.25-215 chr8 126101777 126102051 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -150717 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 112.75-121 chr20 52956382 52956724 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15805 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 124.25-114 chr20 6640596 6640992 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95342 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 149-129 chr8 81829831 81830381 + 0.5 NA intron (NM_001348189, intron 4 of 9) L1PA16|LINE|L1 12079 NR_145474 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 152-43 chr13 19711004 19711516 + 0.5 NA intron (NM_001042414, intron 7 of 9) AluSq2|SINE|Alu 71685 NR_003272 55269 Hs.213198 NM_001042414 ENSG00000121390 PSPC1 PSP1 paraspeckle component 1 protein-coding 154.5-31 chr10 115321301 115321830 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 18 of 28) L1M2|LINE|L1 228200 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 117.75-108 chr2 111090264 111090669 + 0.5 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) intron (NM_001371254, intron 17 of 18) 25122 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 161.25-54 chr14 70216962 70217497 + 0.5 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) intron (NR_135825, intron 2 of 3) -28159 NM_033262 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 115.75-187 chr6 71549980 71550293 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 129109 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 124.25-6 chr1 58785719 58786195 + 0.5 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 806 NR_034014 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 134.5-42 chr11 77653101 77653628 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -15558 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 113.75-117 chr21 25422318 25422735 + 0.5 NA intron (NR_024027, intron 3 of 4) intron (NR_024027, intron 3 of 4) 9175 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 143-144 chr8 83960682 83961121 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -221886 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 137.5-74 chr15 59825873 59826198 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -136715 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 154.75-159 chr9 134187392 134187740 + 0.5 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu -23002 NR_023344 100151684 Hs.545589 NR_023344 ENSG00000221676 RNU6ATAC RNU6ATAC1|U6ATAC RNA, U6atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 140.25-102 chr2 204662035 204662334 + 0.5 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 116709 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 112.75-18 chr1 246988003 246988396 + 0.5 NA non-coding (NR_037894, exon 4 of 7) non-coding (NR_037894, exon 4 of 7) 19858 NR_037892 57116 Hs.669893 NM_020394 ENSG00000197472 ZNF695 SBZF3 zinc finger protein 695 protein-coding 135.75-197 chr8 89100857 89101237 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 656664 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 132.25-81 chr17 71446953 71447425 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -245010 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 116.75-180 chr7 21998810 21999176 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -53094 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 126-102 chr2 135042575 135042889 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9560 NM_001172435 22930 Hs.306327 NM_012233 ENSG00000115839 RAB3GAP1 P130|RAB3GAP|RAB3GAP130|WARBM1 RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1 protein-coding 195.5-54 chr17 76172203 76172799 + 0.5 NA intron (NM_052916, intron 3 of 18) AluSp|SINE|Alu -31256 NM_001454 2302 Hs.651204 NM_001454 ENSG00000129654 FOXJ1 FKHL13|HFH-4|HFH4 forkhead box J1 protein-coding 149.5-77 chr17 59145074 59145478 + 0.5 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) intron (NM_182620, intron 1 of 3) 5945 NR_029842 407027 NR_029842 ENSG00000207996 MIR301A MIR301|MIRN301|MIRN301A|mir-301a microRNA 301a ncRNA 172-96 chr6 17892426 17893100 + 0.5 NA intron (NM_001105567, intron 3 of 36) MER21C|LTR|ERVL 94872 NM_001243423 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 160.5-160 chr6 82231298 82231773 + 0.5 NA intron (NM_015525, intron 4 of 28).2 intron (NM_015525, intron 4 of 28).2 16209 NM_015525 25998 Hs.306425 NM_015525 ENSG00000005700 IBTK BTBD26|BTKI inhibitor of Bruton tyrosine kinase protein-coding 127-81 chr17 50879838 50880293 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12087 NM_001243877 10140 Hs.703321 NM_005749 ENSG00000141232 TOB1 APRO5|APRO6|PIG49|TOB|TROB|TROB1 transducer of ERBB2, 1 protein-coding 132.25-129 chr3 97654225 97654692 + 0.5 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) L2a|LINE|L2 -110063 NM_032146 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 171.75-13 chr10 18808707 18809148 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 149496 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 113.25-46 chr14 59033316 59033652 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -155183 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 121.75-98 chr20 6523923 6524251 + 0.5 NA intron (NR_109953, intron 3 of 3) L1M2|LINE|L1 97355 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 113.25-167 chr8 65801557 65801874 + 0.5 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) intron (NM_001242318, intron 1 of 12) -12658 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 117.5-174 chr5 30461276 30461722 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 580939 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 170.5-152 chr5 144263521 144263897 + 0.5 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 58318 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 187.5-104 chr20 48612742 48613417 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 214920 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 143.5-152 chr3 175169139 175169652 + 0.5 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) MIRc|SINE|MIR -54153 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 112.75-74 chr16 71754888 71755307 + 0.5 NA intron (NM_001128, intron 12 of 22) intron (NM_001128, intron 12 of 22) 3390 NR_003059 692111 NR_003059 ENSG00000223224 SNORD71 HBII-239|MIRN768|hsa-mir-768 small nucleolar RNA, C/D box 71 snoRNA 136.5-184 chr5 88516486 88516975 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77640 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 148.5-60 chr14 54892835 54893249 + 0.5 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 9782 NM_001024024 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 113.75-212 chrX 75296977 75297347 + 0.5 NA intron (NR_030774, intron 4 of 7) intron (NR_030774, intron 4 of 7) 23077 NM_145052 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 130.75-132 chr4 20483094 20483456 + 0.5 NA intron (NM_001289135, intron 6 of 35) intron (NM_001289135, intron 6 of 35) -45000 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 127.5-70 chr14 36098818 36099144 + 0.5 NA intron (NR_073454, intron 1 of 2) intron (NR_073454, intron 1 of 2) 28554 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 132.75-197 chr9 24852877 24853348 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -307215 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 178.5-98 chr22 24228298 24228840 + 0.5 NA intron (NM_001099781, intron 6 of 11) AluY|SINE|Alu 16573 NM_001099781 2687 Hs.437156 NM_004121 ENSG00000099998 GGT5 GGL|GGT 5|GGT-REL|GGTLA1 gamma-glutamyltransferase 5 protein-coding 128.75-190 chr7 101728015 101728382 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -87809 NM_001202543 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 130.5-258 chr9 114073946 114074419 + 0.5 NA intron (NM_001633, intron 3 of 9) intron (NM_001633, intron 3 of 9) 4118 NM_001633 259 Hs.436911 NM_001633 ENSG00000106927 AMBP A1M|EDC1|HCP|HI30|IATIL|ITI|ITIL|ITILC|UTI alpha-1-microglobulin/bikunin precursor protein-coding 148-53 chr2 18425214 18425670 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 135211 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 166.75-29 chr11 110651131 110651552 + 0.5 NA intron (NM_020809, intron 3 of 15) L1PA10|LINE|L1 60484 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 147.25-83 chr3 67175285 67175683 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49980 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 122.75-74 chr17 82144251 82144694 + 0.5 NA intron (NM_001367828, intron 13 of 16) intron (NM_001367828, intron 13 of 16) -46236 NM_004104 2194 Hs.83190 NM_004104 ENSG00000169710 FASN FAS|OA-519|SDR27X1 fatty acid synthase protein-coding 138.25-118 chr3 107557773 107558270 + 0.5 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 35059 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 153.5-24 chr10 71506236 71506675 + 0.5 NA intron (NM_052836, intron 3 of 12) intron (NM_052836, intron 3 of 12) 5465 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 140.75-89 chr2 77716520 77716876 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -194265 NM_001134745 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 159.25-49 chr16 68113996 68114431 + 0.5 NA intron (NM_004555, intron 1 of 10) L1PA10|LINE|L1 28843 NM_004555 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 121.75-61 chr17 80205898 80206380 + 0.5 NA intron (NM_024110, intron 19 of 20) intron (NM_024110, intron 19 of 20) 14194 NM_001352922 6448 Hs.31074 NM_000199 ENSG00000181523 SGSH HSS|MPS3A|SFMD N-sulfoglucosamine sulfohydrolase protein-coding 149.75-9 chr1 202996303 202996631 + 0.5 NA intron (NR_036557, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 10798 NR_036557 100506747 Hs.642024 NR_036557 LOC100506747 - alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog pseudo 188 chr1 29497972 29498540 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -148142 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 116.75-41 chr11 105851998 105852434 + 0.5 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 170024 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 130-35 chr12 57456106 57456455 + 0.5 NA exon (NM_031479, exon 2 of 2) exon (NM_031479, exon 2 of 2) 973 NM_031479 83729 Hs.632713 NM_031479 ENSG00000139269 INHBE - inhibin subunit beta E protein-coding 143-127 chr6 97844807 97845327 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -179464 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 168-59 chr17 73719099 73719531 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18539 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 192.75-58 chr2 58700993 58701586 + 0.5 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 180536 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 133.5-58 chr12 8100542 8100943 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 18468 NM_015509 25977 Hs.555927 NM_015509 ENSG00000089818 NECAP1 EIEE21 NECAP endocytosis associated 1 protein-coding 153-95 chr3 89742273 89742880 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 634955 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 125-120 chr4 127776796 127777237 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4780 NM_001317381 22824 Hs.135554 NM_014278 ENSG00000164070 HSPA4L APG-1|HSPH3|Osp94 heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like protein-coding 132-133 chr5 12446067 12446437 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -128605 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 114.5-207 chr5 39398723 39399095 + 0.5 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) intron (NM_001343, intron 1 of 14) 26071 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 151.25-76 chr19 2126936 2127388 + 0.5 NA exon (NM_001261826, exon 9 of 32) exon (NM_001261826, exon 9 of 32) 24404 NM_001261826 8943 Hs.512815 NM_003938 ENSG00000065000 AP3D1 ADTD|HPS10|hBLVR adaptor related protein complex 3 subunit delta 1 protein-coding 127.5-96 chr16 73948383 73948790 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 266935 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 125.75-85 chr2 40981347 40981752 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -469114 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 154-130 chr8 137201346 137201830 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 212000 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 142.75-111 chr20 39380661 39380994 + 0.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -156079 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 132.5-51 chr12 39505993 39506360 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -63056 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 122.25-85 chr2 19281673 19282104 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -66541 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 136-133 chr7 43050852 43051391 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -61526 NM_001287059 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 150-17 chr10 102876828 102877268 + 0.5 NA intron (NM_020682, intron 7 of 10) intron (NM_020682, intron 7 of 10) 7578 NM_020682 57412 Hs.720370 NM_020682 ENSG00000214435 AS3MT CYT19 arsenite methyltransferase protein-coding 118-163 chr6 66060983 66061283 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 273254 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 138.75-160 chr5 180181775 180182142 + 0.5 NA intron (NM_175062, intron 1 of 13) AluYg6|SINE|Alu 27253 NM_175062 255426 Hs.190559 NM_175062 ENSG00000146090 RASGEF1C - RasGEF domain family member 1C protein-coding 139.25-210 chr9 84839219 84839567 + 0.5 NA intron (NM_001018064, intron 12 of 17) L2b|LINE|L2 133492 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 149-93 chr4 99725221 99725647 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70755 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 117-139 chr4 142643786 142644035 + 0.5 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 202625 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 117.5-64 chr14 71272362 71272722 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -47934 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 125-96 chr3 1973416 1973794 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -125198 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 121.25-101 chr2 179075028 179075505 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25129 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 113.75-96 chr2 47641141 47641441 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70960 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 122.5-8 chr1 98923728 98924063 + 0.5 NA intron (NM_001037317, intron 3 of 5) intron (NM_001037317, intron 3 of 5) -80381 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 148-66 chr2 226060325 226060719 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -82272 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 133.5-272 chr8 132943999 132944377 + 0.5 NA intron (NM_003235, intron 26 of 47) intron (NM_003235, intron 26 of 47) 77230 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 120.75-148 chr6 91167116 91167448 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -354378 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 113.25-119 chr4 54172253 54172622 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56856 NM_001347827 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 119-27 chr11 42302757 42303069 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -49223 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 114.25-137 chr4 51965531 51965776 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 54710 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 128.75-82 chr18 9448550 9448958 + 0.5 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL -26759 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 137.75-35 chr11 29989618 29989914 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7373 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 141.5-104 chr2 108285336 108285888 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3283 NM_001056 6819 Hs.436123 NM_001056 ENSG00000198203 SULT1C2 ST1C1|ST1C2|SULT1C1|humSULTC2 sulfotransferase family 1C member 2 protein-coding 115.5-109 chr19 47833908 47834237 + 0.5 NA intron (NM_000554, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 12135 NM_000554 1406 Hs.617342 NM_000554 ENSG00000105392 CRX CORD2|CRD|LCA7|OTX3 cone-rod homeobox protein-coding 115-94 chr2 222024257 222024673 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -273682 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 310-21 chr5 14610671 14611445 + 0.5 NA 3' UTR (NM_019018, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_019018, exon 8 of 8) 29266 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 114-133 chr5 65147754 65148019 + 0.5 NA TTS (NM_197941) TTS (NM_197941) 334034 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 176-35 chr2 209355051 209355661 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68691 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 200.75-23 chr12 49281392 49282140 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13381 NM_006262 5630 Hs.37044 NM_006262 ENSG00000135406 PRPH NEF4|PRPH1 peripherin protein-coding 158.75-27 chr10 131877864 131878279 + 0.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -22937 NM_018461 55844 Hs.380372 NM_018461 ENSG00000175470 PPP2R2D B55D|B55delta|MDS026 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bdelta protein-coding 139.5-94 chr2 7368742 7369115 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52333 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 173.25-48 chr17 57795928 57796329 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -50829 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 131.5-237 chr8 120926444 120926817 + 0.5 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -114584 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 116-20 chr10 108804472 108804841 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -735363 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 154.5-132 chr3 164767992 164768594 + 0.5 NA intron (NR_126405, intron 1 of 3) intron (NR_126405, intron 1 of 3) 63187 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 116-152 chr7 26845069 26845398 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 3 of 12) intron (NM_003930, intron 3 of 12) 12490 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 117.5-151 chr3 181861421 181861880 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -90714 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 166.25-25 chr10 77111892 77112405 + 0.5 NA intron (NM_001271519, intron 7 of 28) intron (NM_001271519, intron 7 of 28) -28683 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 168.75-153 chr8 113261312 113261929 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 115532 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 130.75-125 chr3 143302719 143303143 + 0.5 NA intron (NM_173653, intron 14 of 15) intron (NM_173653, intron 14 of 15) -39315 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 117.25-86 chr16 46575573 46575975 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6677 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 133-64 chr17 70753439 70753802 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 448559 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 116.75-123 chr3 53742466 53742821 + 0.5 NA intron (NM_001128840, intron 21 of 47) intron (NM_001128840, intron 21 of 47) 103776 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 146-56 chr17 63387503 63387904 + 0.5 NA intron (NM_025185, intron 14 of 25) intron (NM_025185, intron 14 of 25) 52564 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 143.25-184 chr8 87578937 87579332 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 294881 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 148.5-147 chr3 60491175 60491628 + 0.5 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 126469 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 166.25-13 chr1 167338170 167338816 + 0.5 NA intron (NM_001365849, intron 3 of 16) intron (NM_001365849, intron 3 of 16) 9423 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 118.75-194 chr8 78260334 78260706 + 0.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -255820 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 145.75-31 chr12 121200326 121200888 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -9522 NM_001261397 5025 Hs.321709 NM_002560 ENSG00000135124 P2RX4 P2X4|P2X4R purinergic receptor P2X 4 protein-coding 119.5-254 chr9 86486451 86486756 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -132193 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 147.5-30 chr11 17624423 17624871 + 0.5 NA intron (NM_001277269, intron 38 of 54) L1PA13|LINE|L1 72292 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 166.75-70 chr19 10081096 10081526 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5006 NM_001308277 55337 Hs.655613 NM_018381 ENSG00000130813 SHFL C19orf66|IRAV|RyDEN|SFL shiftless antiviral inhibitor of ribosomal frameshifting protein-coding 113.75-120 chr22 26733136 26733482 + 0.5 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) intron (NR_110543, intron 2 of 5) 60466 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 150.25-22 chr10 81602440 81602835 + 0.5 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -272557 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 118-94 chr2 189770699 189771067 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001128150, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001128150, exon 4 of 4) -7685 NM_001354347 64172 Hs.60772 NM_022353 ENSG00000128694 OSGEPL1 OSGEPL|Qri7 O-sialoglycoprotein endopeptidase like 1 protein-coding 115.5-83 chr16 23035011 23035286 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 114122 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 117.75-134 chr3 54134616 54135004 + 0.5 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 12258 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 113.25-158 chr7 87870931 87871233 + 0.5 NA intron (NM_018843, intron 1 of 11) LTR1E|LTR|ERV1 5278 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 153-164 chr9 96849180 96849536 + 0.5 NA intron (NM_001346993, intron 1 of 3) MER1B|DNA|hAT-Charlie 5156 NM_001346995 158431 Hs.30567 NM_001001662 ENSG00000196597 ZNF782 - zinc finger protein 782 protein-coding 140.75-198 chr9 87322595 87322912 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 174109 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 128-108 chr3 188205948 188206391 + 0.5 NA intron (NM_001167672, intron 1 of 9) intron (NM_001167672, intron 1 of 9) -6764 NM_005578 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 139.25-14 chr10 34223218 34223771 + 0.5 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -450814 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 172.25-104 chr5 11634803 11635217 + 0.5 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L2|LINE|L2 -45944 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 118.25-85 chr18 2382469 2382873 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 188834 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 146.25-5 chr1 174139809 174140292 + 0.5 NA intron (NR_121197, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 19237 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 119.25-172 chr6 27267380 27267804 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19891 NM_005865 10279 Hs.274407 NM_005865 ENSG00000112812 PRSS16 TSSP serine protease 16 protein-coding 131.25-225 chrX 149152820 149153082 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 352355 NR_104128 3423 Hs.6795 NM_000202 ENSG00000010404 IDS MPS2|SIDS iduronate 2-sulfatase protein-coding 125.25-219 chr9 75854462 75854859 + 0.5 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -35984 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 152.75-33 chr11 44633436 44633939 + 0.5 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 68024 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 131.5-90 chr17 77538446 77538905 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -8266 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 118.25-181 chr7 36938485 36938801 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -19211 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 126.75-102 chr2 30365448 30365845 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 19000 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 149-81 chr3 142758585 142758989 + 0.5 NA intron (NM_001251845, intron 4 of 12) L1PA5|LINE|L1 34363 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 166-87 chr4 42707275 42707737 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50401 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 116.5-276 chrX 119912289 119912713 + 0.5 NA intron (NM_001008534, intron 4 of 5) L2|LINE|L2 16528 NM_001008534 158798 Hs.592245 NM_178813 ENSG00000186471 AKAP14 AKAP28|PRKA14 A-kinase anchoring protein 14 protein-coding 168.5-30 chr10 97751565 97752115 + 0.5 NA intron (NM_001174121, intron 6 of 9) intron (NM_001174121, intron 6 of 9) 13363 NM_001002261 118813 Hs.744075 NM_144588 ENSG00000155256 ZFYVE27 PROTRUDIN|SPG33 zinc finger FYVE-type containing 27 protein-coding 121-106 chr2 141124230 141124610 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -537735 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 178.75-8 chr1 241451724 241452306 + 0.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 67770 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 117.75-174 chr5 54366992 54367453 + 0.5 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 46278 NR_126379 104355136 Hs.559024 NR_126379 ENSG00000249069 LINC01033 - long intergenic non-protein coding RNA 1033 ncRNA 165.25-35 chr12 33179509 33179896 + 0.5 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 260117 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 131.75-191 chr6 91229766 91230211 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -291672 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 137.75-195 chr7 46019708 46020194 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -98679 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 172.75-86 chr3 125548371 125548802 + 0.5 NA intron (NM_022776, intron 9 of 12) intron (NM_022776, intron 9 of 12) -28384 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 145.5-200 chrX 70831241 70831706 + 0.5 NA intron (NM_001003811, intron 9 of 30) AluJb|SINE|Alu 14822 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 139.75-131 chr4 38926510 38926954 + 0.5 NA intron (NM_001350633, intron 7 of 12) AluSz|SINE|Alu 58700 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 124-83 chr2 62622461 62622914 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -51191 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 152.25-72 chr18 62843495 62843969 + 0.5 NA intron (NM_194449, intron 3 of 16) intron (NM_194449, intron 3 of 16) 128191 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 137.5-180 chr4 179497401 179497787 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1589658 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 118.75-64 chr14 72451510 72451891 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -65120 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 157.5-196 chr7 114355080 114355494 + 0.5 NA intron (NR_033766, intron 2 of 19) intron (NR_033766, intron 2 of 19) -59528 NR_033767 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 169.75-30 chr11 99881004 99881410 + 0.5 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) intron (NM_001243270, intron 5 of 23) 325062 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 121-133 chr3 124052669 124053113 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -41790 NM_001024660 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 113.25-29 chr11 105584468 105584779 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25450 NM_001077243 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 151.5-78 chr2 42567412 42567835 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_020744) promoter-TSS (NM_020744) -422 NM_001282756 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 118.75-195 chr8 81752480 81752865 + 0.5 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 20224 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 131.25-92 chr19 28628665 28629136 + 0.5 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) AluYa5|SINE|Alu 22212 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 117-81 chr19 52145520 52145902 + 0.5 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -5773 NM_178523 90317 Hs.645225 NM_178523 ENSG00000204611 ZNF616 - zinc finger protein 616 protein-coding 206-16 chr11 111880985 111881537 + 0.5 NA intron (NM_022761, intron 1 of 3) intron (NM_022761, intron 1 of 3) 1720 NM_022761 64776 Hs.17546 NM_022761 ENSG00000137720 C11orf1 - chromosome 11 open reading frame 1 protein-coding 140.5-57 chr13 90892909 90893287 + 0.5 NA intron (NR_027039, intron 5 of 5) L1P2|LINE|L1 33499 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 150.5-52 chr14 74789591 74790145 + 0.5 NA intron (NM_019589, intron 4 of 20) AluJo|SINE|Alu 26552 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 146.25-129 chr6 152810515 152811014 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59967 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 132.75-33 chr10 107898774 107899172 + 0.5 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 170320 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 171-36 chr14 49197334 49197742 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 388842 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 130.5-76 chr12 44062209 44062589 + 0.5 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 226318 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 116-184 chr9 81539223 81539674 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 150087 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 133.75-111 chr2 219324468 219324978 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 8454 NM_001007089 389075 Hs.290551 NM_001007089 ENSG00000182698 RESP18 - regulated endocrine specific protein 18 protein-coding 127.5-235 chr8 16826041 16826429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 176110 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 129.5-188 chr5 111425833 111426168 + 0.5 NA intron (NM_001744, intron 5 of 10) intron (NM_001744, intron 5 of 10) -86226 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-156 chr5 58183183 58183732 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61116 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 125-109 chr3 196348535 196348992 + 0.5 NA 3' UTR (NM_015562, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_015562, exon 11 of 11) -10343 NR_037950 100534611 Hs.733180 NR_037950 TM4SF19-TCTEX1D2 - TM4SF19-TCTEX1D2 readthrough (NMD candidate) ncRNA 130-20 chr10 119311359 119311748 + 0.5 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu -66419 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 125.5-152 chr20 56654338 56654737 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 25231 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 122.75-33 chr12 2721583 2721894 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -30581 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 151-53 chr2 25069303 25069686 + 0.5 NA intron (NM_001319099, intron 1 of 22) MER66B|LTR|ERV1 27031 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 123.5-180 chr6 12086448 12086801 + 0.5 NA intron (NM_002114, intron 2 of 8) intron (NM_002114, intron 2 of 8) 74312 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 154-25 chr11 16152705 16153083 + 0.5 NA intron (NM_033326, intron 6 of 15) AluSc|SINE|Alu -183273 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 235.25-53 chr5 122698252 122698812 + 0.5 NA intron (NR_109881, intron 7 of 11) AluSg|SINE|Alu 32028 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 148.5-123 chr20 21928656 21929055 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -125235 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 114.25-93 chr2 51347493 51347904 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) L1ME1|LINE|L1 315097 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 178-63 chr3 121621002 121621533 + 0.5 NA intron (NM_016298, intron 2 of 3) intron (NM_016298, intron 2 of 3) 27888 NM_016298 51725 Hs.272564 NM_016298 ENSG00000163833 FBXO40 FBX40 F-box protein 40 protein-coding 163-108 chr6 96673232 96673634 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 110308 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 199.75-70 chr4 59482187 59482687 + 0.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 468864 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 172.25-38 chr14 72341494 72342020 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -175063 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 136-7 chr1 97793468 97793789 + 0.5 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) L1M4|LINE|L1 -3293 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 138-105 chr3 114041612 114042048 + 0.5 NA intron (NR_148531, intron 2 of 14) intron (NR_148531, intron 2 of 14) 14696 NR_148531 57577 Hs.477159 NM_020817 ENSG00000163617 CCDC191 KIAA1407 coiled-coil domain containing 191 protein-coding 126.25-26 chr11 3997245 3997497 + 0.5 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) intron (NM_001277962, intron 2 of 12) -97314 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 180.25-121 chr8 133373079 133373673 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -76072 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 153.75-76 chr20 35728209 35728593 + 0.5 NA intron (NR_040722, intron 7 of 17) L1MA5|LINE|L1 13859 NM_004902 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 119.75-159 chr4 79138307 79138672 + 0.5 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) AluY|SINE|Alu 166741 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 144.25-119 chr22 21915862 21916336 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22138 NR_147620 100286925 Hs.659180 NR_147620 LOC100286925 - uncharacterized LOC100286925 ncRNA 145-135 chr6 20678878 20679443 + 0.5 NA intron (NM_017774, intron 5 of 15) AluJr4|SINE|Alu 144703 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 136.25-83 chr17 71202027 71202499 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_104152) promoter-TSS (NR_104152) -84 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 133.5-196 chr5 7054058 7054412 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 215119 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 150.75-90 chr2 24250556 24250897 + 0.5 NA intron (NM_001348182, intron 24 of 38) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 75673 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 122.75-216 chr9 87054855 87055176 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12889 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 170.75-18 chr10 119152292 119152943 + 0.5 NA intron (NM_213649, intron 11 of 13) intron (NM_213649, intron 11 of 13) 13075 NR_110305 119559 Hs.655168 NM_178867 ENSG00000183605 SFXN4 BCRM1|COXPD18|SLC56A4 sideroflexin 4 protein-coding 126.75-231 chr7 118788949 118789386 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 564463 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 188.75-76 chr22 28227834 28228497 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1MB3|LINE|L1 -231704 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 122-132 chr4 98735902 98736258 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 77178 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 113.5-165 chr3 185342175 185342456 + 0.5 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -20821 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 167-114 chr8 102012373 102012795 + 0.5 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) 28152 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 119.25-205 chr8 82791838 82792216 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -120077 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 121.75-119 chr3 104679902 104680217 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -686654 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 184-75 chr5 137596014 137596530 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 51377 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 122-155 chr6 52070123 52070544 + 0.5 NA intron (NM_138694, intron 10 of 66) L1MC5|LINE|L1 17280 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 129.25-211 chr8 128250500 128250962 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 100615 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 122-189 chr8 116953320 116953587 + 0.5 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) HAL1|LINE|L1 2478 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 148.25-52 chr17 52252099 52252647 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -92356 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 126.75-44 chr12 125352709 125353036 + 0.5 NA intron (NM_052907, intron 2 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 26256 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 213-74 chr4 139860603 139861081 + 0.5 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 195023 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 137.25-159 chr8 47674362 47674801 + 0.5 NA intron (NR_148204, intron 11 of 19) intron (NR_148204, intron 11 of 19) 14917 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 119.75-172 chr5 126136699 126137047 + 0.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -42704 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 137.25-5 chr1 112467392 112467745 + 0.5 NA exon (NM_004185, exon 1 of 6) exon (NM_004185, exon 1 of 6) 1027 NM_001291880 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 128.25-4 chr1 27546398 27546723 + 0.5 NA intron (NM_001029882, intron 6 of 6) intron (NM_001029882, intron 6 of 6) -56393 NM_006990 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 128.5-81 chr16 61909790 61910097 + 0.5 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) MamRep605|LTR?|LTR? 126495 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 139.5-226 chr8 138752804 138753336 + 0.5 NA intron (NM_152888, intron 21 of 64) MIRc|SINE|MIR 160971 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 116.5-104 chr19 38066475 38066853 + 0.5 NA intron (NM_015073, intron 2 of 21) AluSz|SINE|Alu -96432 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 112.75-151 chr4 85961847 85962252 + 0.5 NA intron (NM_031305, intron 2 of 6) intron (NM_031305, intron 2 of 6) 32033 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 129.75-163 chr6 117688245 117688585 + 0.5 NA intron (NM_138459, intron 1 of 4) intron (NM_138459, intron 1 of 4) 12946 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 164-81 chr3 110175595 110176217 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 573078 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 114.5-92 chr14 61547231 61547516 + 0.5 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) intron (NM_006255, intron 12 of 13) 22821 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 139.25-122 chr3 78744529 78744926 + 0.5 NA intron (NM_002941, intron 5 of 30) L2a|LINE|L2 274732 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 173.5-98 chr3 51655897 51656317 + 0.5 NA exon (NM_001322256, exon 19 of 22) exon (NM_001322256, exon 19 of 22) -15068 NM_001129884 51368 Hs.517864 NM_015926 ENSG00000164081 TEX264 ZSIG11 testis expressed 264, ER-phagy receptor protein-coding 127.25-32 chr11 46266037 46266423 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -11432 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 119-137 chr4 127070023 127070466 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -562713 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 147.5-45 chr12 23801578 23802041 + 0.5 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 147861 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 123.25-39 chr11 93317632 93318079 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12862 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 124.5-99 chr2 25895356 25895741 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17061 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 130.5-188 chr4 65517707 65518083 + 0.5 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 151593 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 240.5-106 chr8 141740303 141741016 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 45654 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 175-102 chr5 93012584 93012976 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 558563 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 157.25-2 chr1 66768778 66769391 + 0.5 NA intron (NM_152665, intron 2 of 4) intron (NM_152665, intron 2 of 4) 16625 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 154.25-111 chr3 155029300 155029761 + 0.5 NA intron (NM_001354642, intron 1 of 22) MER57A-int|LTR|ERV1 5406 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 130.25-203 chr8 114943633 114943961 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 724216 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 142.5-78 chr16 55091061 55091544 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 160103 NM_001252197 10265 Hs.435730 NM_005853 ENSG00000176842 IRX5 HMMS|IRX-2a|IRXB2 iroquois homeobox 5 protein-coding 124-31 chr12 41307649 41308094 + 0.5 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) MIRb|SINE|MIR 119551 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 122-100 chr2 163426516 163426824 + 0.5 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 309338 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 198.75-60 chr3 39053523 39053972 + 0.5 NA intron (NM_001346228, intron 1 of 18) intron (NM_001346228, intron 1 of 18) 1455 NM_001346228 57599 Hs.109778 NM_020839 ENSG00000114742 WDR48 P80|SPG60|UAF1 WD repeat domain 48 protein-coding 135.75-67 chr15 78038088 78038382 + 0.5 NA intron (NM_144572, intron 3 of 12) L2b|LINE|L2 39417 NM_144572 23102 Hs.567426 NM_015079 ENSG00000167202 TBC1D2B - TBC1 domain family member 2B protein-coding 133.25-70 chr16 52582462 52582925 + 0.5 NA intron (NR_033920, intron 2 of 3) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 24282 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 136.5-243 chrY 56832523 56832912 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -121538 NM_005840 10251 Hs.381912 NM_005840 ENSG00000168939 SPRY3 spry-3 sprouty RTK signaling antagonist 3 protein-coding 136.5-60 chr13 30805192 30805523 + 0.5 NA intron (NR_047012, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 2151 NR_047012 100874158 Hs.577982 NR_047012 ENSG00000237879 LINC00398 - long intergenic non-protein coding RNA 398 ncRNA 125.25-189 chr7 40473371 40473726 + 0.5 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) intron (NM_024728, intron 11 of 14) 338572 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 140.25-60 chr16 35921658 35922180 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 175367 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 123-36 chr12 18616026 18616477 + 0.5 NA intron (NM_001288774, intron 31 of 32) intron (NM_001288774, intron 31 of 32) 121258 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 162-51 chr18 5022583 5023000 + 0.5 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -58391 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 128.5-210 chr7 80764363 80764678 + 0.5 NA intron (NM_006379, intron 13 of 17) intron (NM_006379, intron 13 of 17) 117867 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 144.5-184 chr5 153195391 153195966 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -223329 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 188.75-124 chrX 56906980 56907532 + 0.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 88285 NM_001010862 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 154.25-66 chr17 61173545 61173960 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluJr4|SINE|Alu 193952 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 113.75-205 chr9 78639540 78639955 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 342622 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 130.75-158 chr5 120013775 120014245 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 384451 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 167.25-140 chr7 19422395 19422865 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -277209 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 129.25-91 chr2 102395944 102396265 + 0.5 NA intron (NM_003855, intron 10 of 10) intron (NM_003855, intron 10 of 10) -22686 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 121.75-175 chr7 32493430 32493720 + 0.5 NA intron (NM_001130710, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 1708 NM_001130710 23658 Hs.424908 NM_012322 ENSG00000106355 LSM5 YER146W LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 150.75-2 chr1 20577794 20578233 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11084 NM_001785 978 Hs.466910 NM_001785 ENSG00000158825 CDA CDD cytidine deaminase protein-coding 161.5-78 chr17 71492523 71492941 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -290553 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 115.25-15 chr1 112110677 112111034 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 120319 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 122.5-231 chr9 16108569 16108934 + 0.5 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 144356 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 147.5-5 chr1 27775223 27775801 + 0.5 NA intron (NM_177424, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 2293 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 128.5-164 chr4 126786622 126786936 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -846178 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 191-8 chr10 81567671 81568097 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -307310 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 136-103 chr3 83206825 83207262 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1220901 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 112.75-160 chr5 15420146 15420394 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79910 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 148.75-18 chr10 28712970 28713488 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -30421 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 127.75-6 chr1 40030849 40031112 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9085 NM_001350479 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 113.25-157 chr7 43859347 43859771 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 9958 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 150-137 chr7 151733029 151733571 + 0.5 NA intron (NM_016203, intron 3 of 15) intron (NM_016203, intron 3 of 15) 2963 NM_001363698 51422 Hs.647072 NM_016203 ENSG00000106617 PRKAG2 AAKG|AAKG2|CMH6|H91620p|WPWS protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 2 protein-coding 126-46 chr13 66447461 66447901 + 0.5 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 229431 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 128.25-118 chr21 37356538 37356943 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8833 NM_001396 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 117.75-49 chr13 44246029 44246478 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50053 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 169.25-72 chr3 48042907 48043342 + 0.5 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) AluSz6|SINE|Alu 45724 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 115.5-164 chr3 67821582 67821885 + 0.5 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) intron (NR_109992, intron 3 of 6) 167036 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 122-123 chr3 179176359 179176690 + 0.5 NA intron (NM_006218, intron 1 of 20) intron (NM_006218, intron 1 of 20) 28167 NM_006218 5290 Hs.553498 NM_006218 ENSG00000121879 PIK3CA CLAPO|CLOVE|CWS5|MCAP|MCM|MCMTC|PI3K|PI3K-alpha|p110-alpha phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha protein-coding 135.5-103 chr2 70738310 70738833 + 0.5 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) L1M6|LINE|L1 29144 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 152.25-48 chr14 33293208 33293616 + 0.5 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 354533 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 151.25-83 chr2 43002137 43002569 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 37190 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 120.5-77 chr15 42845081 42845421 + 0.5 NA intron (NM_173500, intron 3 of 14) intron (NM_173500, intron 3 of 14) 75527 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 145-20 chr10 14322058 14322444 + 0.5 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 8633 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 170.25-98 chr3 77375671 77376070 + 0.5 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 277858 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 120.75-113 chr3 158800435 158800747 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1463 NR_110328 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 129.5-125 chr2 88922977 88923378 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 110807 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 157.25-141 chr7 107191900 107192327 + 0.5 NA intron (NM_001244262, intron 8 of 10) MER68|LTR|ERVL 23110 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 116.5-21 chr10 31900366 31900782 + 0.5 NA intron (NM_001270696, intron 3 of 17) L1MC3|LINE|L1 8352 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 116.75-59 chr14 58320789 58321227 + 0.5 NA intron (NM_002892, intron 7 of 23) L1MC4|LINE|L1 22453 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 129.75-36 chr11 39703485 39703832 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 589472 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 126.25-94 chr2 147593054 147593430 + 0.5 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -251275 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 141.5-108 chr2 149659619 149660133 + 0.5 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) intron (NR_110240, intron 1 of 2) -72101 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 132.75-96 chr2 37812488 37812919 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17008 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 143.75-36 chr11 110458975 110459483 + 0.5 NA intron (NM_004109, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 29281 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 130.75-192 chr8 106247227 106247590 + 0.5 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie -22770 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 118-141 chr5 18412341 18412689 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 605241 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 133.5-283 chr9 96240956 96241318 + 0.5 NA intron (NM_000197, intron 9 of 10) intron (NM_000197, intron 9 of 10) -5326 NR_146524 105376162 Hs.662614 NR_146524 ENSG00000232283 HSD17B3-AS1 - HSD17B3 antisense RNA 1 ncRNA 162.5-140 chr5 60470944 60471500 + 0.5 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -16491 NR_024617 25859 Hs.146312 NM_001039499 ENSG00000152931 PART1 NCRNA00206 prostate androgen-regulated transcript 1 ncRNA 119.25-184 chr7 6143492 6143820 + 0.5 NA intron (NM_032172, intron 8 of 17) intron (NM_032172, intron 8 of 17) 28481 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 144.75-78 chr19 40418393 40418773 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5219 NM_181882 57716 Hs.205457 NM_020956 ENSG00000105227 PRX CMT4F periaxin protein-coding 153-75 chr2 144585559 144586078 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61374 NR_136320 105373656 Hs.734683 NR_136320 LOC105373656 - uncharacterized LOC105373656 ncRNA 276-48 chr8 99294621 99295540 + 0.5 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 241650 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 164.5-27 chr11 10067586 10068034 + 0.5 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) AluJo|SINE|Alu 226397 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 210.5-144 chr9 132328121 132328952 + 0.5 NA exon (NM_001351528, exon 10 of 27) exon (NM_001351528, exon 10 of 27) 26320 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 133-65 chr17 77100282 77100685 + 0.5 NA intron (NM_001204410, intron 2 of 17) AluSx1|SINE|Alu 11066 NR_106997 102466864 NR_106997 ENSG00000284250 MIR6516 hsa-mir-6516 microRNA 6516 ncRNA 117-141 chr5 4933399 4933790 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -100765 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 127.25-96 chr2 174022096 174022423 + 0.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -3021 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 129.5-234 chr8 140008441 140008870 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) intron (NM_001160372, intron 18 of 22) 91880 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 147.5-82 chr17 43481130 43481517 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2542 NM_001322216 1659 Hs.463105 NM_004941 ENSG00000067596 DHX8 DDX8|Dhr2|HRH1|PRP22|PRPF22 DEAH-box helicase 8 protein-coding 121.25-176 chr6 39497401 39497715 + 0.5 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) intron (NM_001289021, intron 12 of 21) -66168 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 182.25-121 chr8 67046222 67046776 + 0.5 NA intron (NM_006837, intron 6 of 7) intron (NM_006837, intron 6 of 7) 15634 NM_006837 10987 Hs.491912 NM_006837 ENSG00000121022 COPS5 CSN5|JAB1|MOV-34|SGN5 COP9 signalosome subunit 5 protein-coding 114-57 chr17 52105401 52105676 + 0.5 NA intron (NM_001082533, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 53176 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 131-136 chr5 72398215 72398606 + 0.5 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 78037 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 133.25-19 chr10 41864458 41864985 + 0.5 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 503324 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 131.75-97 chr18 8204349 8204703 + 0.5 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 162508 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 170-60 chr3 58252536 58252908 + 0.5 NA intron (NM_001320126, intron 2 of 9) intron (NM_001320126, intron 2 of 9) 14930 NM_001320126 57406 Hs.476454 NM_020676 ENSG00000163686 ABHD6 - abhydrolase domain containing 6 protein-coding 113.75-127 chr3 55715759 55716165 + 0.5 NA intron (NR_132749, intron 14 of 17) intron (NR_132749, intron 14 of 17) -56493 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 112.75-7 chr1 76577515 76577805 + 0.5 NA TTS (NM_001160011) TTS (NM_001160011) 201607 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 135.5-102 chr2 69040604 69041021 + 0.5 NA intron (NM_032208, intron 2 of 17) intron (NM_032208, intron 2 of 17) 27668 NM_032208 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 118-86 chr2 96378422 96378830 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 42860 NM_015341 23397 Hs.308045 NM_015341 ENSG00000121152 NCAPH BRRN1|CAP-H|CAPH|MCPH23 non-SMC condensin I complex subunit H protein-coding 135.75-112 chr2 179122248 179122788 + 0.5 NA intron (NM_178123, intron 12 of 17) intron (NM_178123, intron 12 of 17) -72381 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 117.25-58 chr12 93272252 93272531 + 0.5 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) L1MB5|LINE|L1 98025 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 214.75-11 chr10 31517864 31518501 + 0.5 NA intron (NM_001323638, intron 10 of 12) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -118427 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 119-89 chr2 104181660 104182011 + 0.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 226497 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 127.75-116 chr20 9034830 9035286 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33996 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 123.25-3 chr1 33344982 33345308 + 0.5 NA intron (NM_198040, intron 8 of 13) intron (NM_198040, intron 8 of 13) 4754 NM_004427 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 228-82 chr8 107398458 107399261 + 0.5 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) -62344 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 116.5-138 chr20 7370265 7370688 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -1132 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 114.25-160 chr5 158228352 158228659 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 181268 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 119.75-89 chr2 6821339 6821659 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18965 NR_126359 104326052 Hs.7155 NR_126359 NRIR lncRNA-CMPK2 negative regulator of interferon response ncRNA 119.5-169 chr4 98326189 98326450 + 0.5 NA intron (NM_021159, intron 2 of 14) intron (NM_021159, intron 2 of 14) 64935 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 150-102 chr3 194888685 194889058 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -120162 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 165-63 chr2 50594170 50594727 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 101814 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 112.75-3 chr1 43110045 43110351 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -37706 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 137.75-2 chr1 58301427 58301914 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -51123 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 125.25-43 chr12 6656911 6657280 + 0.5 NA intron (NM_016162, intron 1 of 7) AluSz6|SINE|Alu 6024 NM_001127585 51147 Hs.524210 NM_016162 ENSG00000111653 ING4 my036|p29ING4 inhibitor of growth family member 4 protein-coding 143.5-221 chr8 133970285 133970852 + 0.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 84072 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 151.25-14 chr10 24796894 24797411 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -73265 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 112.5-4 chr1 54115213 54115513 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 37818 NM_201546 200008 NM_201546 ENSG00000157211 CDCP2 - CUB domain containing protein 2 protein-coding 166.5-60 chr14 53820414 53820906 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 127824 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 133.75-205 chr9 103655696 103656189 + 0.5 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -330909 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 138-70 chr19 1559933 1560365 + 0.5 NA intron (NM_203304, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 7909 NM_203304 399664 Hs.436495 NM_203304 ENSG00000181588 MEX3D MEX-3D|MEX3|OK/SW-cl.4|RKHD1|RNF193|TINO mex-3 RNA binding family member D protein-coding 132.25-157 chr5 119885555 119885989 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 256213 NM_001163991 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 116.25-235 chr8 127664866 127665310 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 68879 NR_117101 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 141.25-129 chr5 25562392 25562916 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 371701 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 141.5-235 chr8 123779458 123779924 + 0.5 NA intron (NM_144963, intron 6 of 23) intron (NM_144963, intron 6 of 23) 11252 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 137.5-162 chr3 109086394 109086780 + 0.5 NA intron (NM_014429, intron 8 of 27) L1MEi|LINE|L1 -14869 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 142.75-119 chr22 22016742 22017120 + 0.5 NA intron (NR_135291, intron 4 of 6) L1MB4|LINE|L1 27003 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 160-108 chr8 78401516 78401991 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -114587 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 133.5-155 chr3 12748094 12748481 + 0.5 NA intron (NM_018306, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 10972 NM_001284408 55287 Hs.475502 NM_018306 ENSG00000088726 TMEM40 - transmembrane protein 40 protein-coding 142.25-129 chr4 166661917 166662424 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 572256 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 133.25-85 chr18 64195277 64195760 + 0.5 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) -46492 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 184-29 chr15 95042438 95042865 + 0.5 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 187288 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 130.25-167 chr6 7523610 7524045 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -17844 NM_001008844 1832 Hs.519873 NM_004415 ENSG00000096696 DSP DCWHKTA|DP desmoplakin protein-coding 149-13 chr10 69279049 69279583 + 0.5 NA intron (NM_001358263, intron 1 of 20) intron (NM_001358263, intron 1 of 20) 820 NM_001358263 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 153-14 chr10 96251361 96251718 + 0.5 NA intron (NM_013314, intron 1 of 16) intron (NM_013314, intron 1 of 16) 19977 NR_047681 29760 Hs.665244 NM_013314 ENSG00000095585 BLNK AGM4|BASH|BLNK-S|LY57|SLP-65|SLP65|bca B cell linker protein-coding 172.5-129 chr3 120820321 120820774 + 0.5 NA intron (NR_135570, intron 1 of 1) AluSg|SINE|Alu 15810 NR_135571 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 149.25-164 chr7 30431630 30432077 + 0.5 NA intron (NM_006092, intron 12 of 13) AluSx1|SINE|Alu 40968 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 131.25-53 chr13 109091617 109092010 + 0.5 NA intron (NM_015011, intron 27 of 34) intron (NM_015011, intron 27 of 34) 75490 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 138-162 chr8 102357999 102358468 + 0.5 NA intron (NM_001282873, intron 5 of 58) MER58A|DNA|hAT-Charlie 54456 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 173.5-151 chr7 51698511 51699041 + 0.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -305520 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 118.25-180 chr7 29028463 29028876 + 0.5 NA intron (NM_001371256, intron 16 of 16) L1MA4|LINE|L1 48702 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 146.25-17 chr10 101379485 101379945 + 0.5 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) intron (NM_003939, intron 1 of 13) 25550 NM_003939 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 140.75-173 chr7 120616692 120617220 + 0.5 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 241188 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 139.25-201 chr8 113299269 113299731 + 0.5 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 77652 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 136-31 chr12 27973252 27973720 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_198965) promoter-TSS (NM_198965) -753 NM_198965 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 123-70 chr16 34582930 34583248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -201609 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 177.25-83 chr20 57898178 57898669 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -105481 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 115.25-93 chr2 10719813 10720129 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1659 NM_001039362 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 121.25-149 chr4 107059394 107059806 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23287 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 114.75-183 chr7 151859448 151859830 + 0.5 NA intron (NM_016203, intron 1 of 15) intron (NM_016203, intron 1 of 15) -17403 NR_038926 100505483 Hs.649054 NR_038926 PRKAG2-AS1 - PRKAG2 antisense RNA 1 ncRNA 125.5-174 chr3 81204840 81205183 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 211143 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 117-149 chr5 66579030 66579404 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17176 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 154.25-29 chr11 107867694 107868103 + 0.5 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -9111 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 146.75-177 chr9 85055209 85055792 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 349599 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 145.25-25 chr12 312060 312495 + 0.5 NA intron (NM_001042603, intron 20 of 27) intron (NM_001042603, intron 20 of 27) -49404 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 118.25-97 chr2 25767347 25767655 + 0.5 NA intron (NM_001369346, intron 6 of 10) intron (NM_001369346, intron 6 of 10) 27190 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 191.5-103 chr3 184310397 184311065 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3764 NM_001194947 1981 Hs.433750 NM_004953 ENSG00000114867 EIF4G1 EIF-4G1|EIF4F|EIF4G|EIF4GI|P220|PARK18 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 protein-coding 138.25-58 chr16 61390928 61391368 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -335382 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 127-4 chr1 146033287 146033587 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11615 NM_213653 148738 Hs.632436 NM_145277 ENSG00000168509 HJV HFE2|HFE2A|JH|RGMC hemojuvelin BMP co-receptor protein-coding 133.75-76 chr17 40829472 40829836 + 0.5 NA intron (NR_160886, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu -7040 NM_000421 3858 Hs.99936 NM_000421 ENSG00000186395 KRT10 BCIE|BIE|CK10|EHK|K10|KPP keratin 10 protein-coding 165.75-162 chr7 112670330 112670764 + 0.5 NA intron (NR_110158, intron 5 of 7) intron (NR_110158, intron 5 of 7) 48166 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 161.5-29 chr11 27773852 27774425 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52108 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 136.75-97 chr2 73477236 73477658 + 0.5 NA intron (NM_015120, intron 9 of 22) L1MB2|LINE|L1 20344 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 182-105 chr8 84267460 84268158 + 0.5 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 83143 NM_001354322 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 130.75-126 chr3 185081825 185082254 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001025266, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001025266, exon 2 of 2) 71021 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 119.75-187 chr6 132118004 132118432 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2955 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 151.5-197 chr8 129847567 129848106 + 0.5 NA intron (NM_001353307, intron 12 of 13) AluSx|SINE|Alu -61212 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 135-47 chr14 101889351 101889771 + 0.5 NA intron (NM_001161725, intron 7 of 15) L2b|LINE|L2 -75012 NM_001376 1778 Hs.614080 NM_001376 ENSG00000197102 DYNC1H1 CMT2O|DHC1|DHC1a|DNCH1|DNCL|DNECL|DYHC|Dnchc1|HL-3|SMALED1|p22 dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 protein-coding 143-136 chr7 130736903 130737312 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -3074 NM_138693 136259 Hs.125240 NM_138693 ENSG00000266265 KLF14 BTEB5 Kruppel like factor 14 protein-coding 165-64 chr2 55813615 55813945 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 110002 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 140.75-102 chr2 157874800 157875251 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001105) promoter-TSS (NM_001105) -26 NM_001105 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 125.75-112 chr20 35022103 35022493 + 0.5 NA intron (NM_015638, intron 8 of 18) AluSz|SINE|Alu -31826 NR_039912 100616134 NR_039912 ENSG00000283441 MIR499B MIR499A|hsa-mir-499b microRNA 499b ncRNA 140.75-104 chr2 181435909 181436395 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -20740 NM_001316312 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 186.25-20 chr11 113870767 113871298 + 0.5 NA intron (NM_020886, intron 1 of 24) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 4540 NM_001346273 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 159-137 chrX 96496219 96496829 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -158622 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 129.25-37 chr12 104428467 104428901 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -28264 NM_018413 50515 Hs.17569 NM_018413 ENSG00000171310 CHST11 C4ST|C4ST-1|C4ST1|HSA269537|OCBMD carbohydrate sulfotransferase 11 protein-coding 114.75-92 chr2 86130583 86130870 + 0.5 NA exon (NM_017952, exon 15 of 24) exon (NM_017952, exon 15 of 24) -5144 NR_004378 692225 Hs.723087 NR_004378 ENSG00000208772 SNORD94 U94 small nucleolar RNA, C/D box 94 snoRNA 143.5-229 chr9 75803604 75804011 + 0.5 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -86837 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 143-37 chr14 65268956 65269349 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -46805 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 174.5-78 chr16 82965030 82965420 + 0.5 NA intron (NR_110937, intron 1 of 2) intron (NR_110937, intron 1 of 2) 25073 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 115.75-176 chr5 142740717 142741068 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4708 NR_110558 101926975 Hs.638583 NR_110558 ENSG00000236714 LINC01844 - long intergenic non-protein coding RNA 1844 ncRNA 164.5-196 chr7 113264344 113264924 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -146052 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 119.5-211 chr7 33506754 33507152 + 0.5 NA intron (NM_198428, intron 20 of 22) MIRb|SINE|MIR 377389 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 120.75-138 chr5 156682662 156683091 + 0.5 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) intron (NM_001128209, intron 6 of 7) -167419 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 142-162 chr8 106782066 106782476 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -12027 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 166.75-19 chr10 125684627 125685057 + 0.5 NA intron (NR_033848, intron 1 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 1599 NR_033848 283038 Hs.144911 NR_033848 ENSG00000228021 LOC283038 - uncharacterized LOC283038 ncRNA 139.5-217 chr8 106757167 106757494 + 0.5 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu 12914 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 115.5-146 chr2 221589152 221589510 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -15129 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 150-86 chr3 29664204 29664537 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) AluSc|SINE|Alu 269786 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 146.25-60 chr18 12517500 12517817 + 0.5 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) intron (NM_020148, intron 4 of 15) 84884 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 146-94 chr4 33412265 33412811 + 0.5 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 627355 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 125.75-104 chr2 183926920 183927316 + 0.5 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -451857 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 211.25-28 chr15 64980820 64981447 + 0.5 NA intron (NM_001127889, intron 2 of 8) intron (NM_001127889, intron 2 of 8) 8337 NM_001127889 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 131.25-129 chr3 4194326 4194759 + 0.5 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -108762 NM_001243723 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 185-90 chr9 86018681 86019089 + 0.5 NA intron (NM_024635, intron 21 of 22) intron (NM_024635, intron 21 of 22) 77356 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 137-140 chr5 74417208 74417699 + 0.5 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 94967 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 129.25-3 chr1 74235193 74235666 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_015978) promoter-TSS (NM_015978) 42 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 134.25-195 chr9 15849159 15849605 + 0.5 NA intron (NM_001355547, intron 22 of 24) intron (NM_001355547, intron 22 of 24) 285404 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 146.75-171 chr8 137940255 137940671 + 0.5 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 143082 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 134.75-38 chr11 9104008 9104499 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 9890 NR_027713 283102 Hs.689472 NR_027713 ENSG00000213538 KRT8P41 - keratin 8 pseudogene 41 pseudo 125-94 chr22 24097399 24097862 + 0.5 NA intron (NM_012295, intron 25 of 36) L1ME3G|LINE|L1 -83857 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 123.25-92 chr2 26250195 26250614 + 0.5 NA intron (NM_001281512, intron 1 of 14) L1M5|LINE|L1 5465 NM_000183 3032 Hs.515848 NM_000183 ENSG00000138029 HADHB ECHB|MSTP029|MTPB|TP-BETA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit beta protein-coding 146.75-145 chr6 162738743 162739093 + 0.5 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 10948 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 143-4 chr1 105858016 105858355 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 170068 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 121.25-103 chr2 202894218 202894562 + 0.5 NA intron (NM_018256, intron 7 of 12) AluJr4|SINE|Alu -17828 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 136-140 chr7 133003559 133004005 + 0.5 NA intron (NM_001317177, intron 3 of 8) intron (NM_001317177, intron 3 of 8) 31133 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 112.75-208 chr9 85723617 85723964 + 0.5 NA intron (NM_015239, intron 1 of 25) L1PA6|LINE|L1 18239 NM_001286717 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 211.25-52 chr22 26518509 26519163 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 6304 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 169-99 chr7 69021873 69022358 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 575509 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 135-98 chr22 20177507 20177919 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26658 NM_001365892 388849 Hs.454905 NM_001243537 ENSG00000234409 CCDC188 - coiled-coil domain containing 188 protein-coding 138.5-44 chr12 58432202 58432533 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -159335 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 124.75-207 chr8 130522311 130522693 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -78828 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 122.5-150 chr3 68541595 68542050 + 0.5 NA intron (NM_001252216, intron 4 of 4) intron (NM_001252216, intron 4 of 4) 41185 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 138.75-64 chr16 49094045 49094556 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 187538 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 171.75-65 chr18 69480714 69481192 + 0.5 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 11022 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 158-47 chr14 41354531 41355139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -252021 NR_144388 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 171.25-76 chr2 71946213 71946756 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 201378 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 131.5-37 chr12 2420812 2421174 + 0.5 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 151217 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 125-52 chr16 60054000 60054462 + 0.5 NA TTS (NR_110917) TTS (NR_110917) 198878 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 175-137 chrX 21062571 21063096 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -311585 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 162.75-96 chr3 81095415 81095906 + 0.5 NA TTS (NR_132411) TTS (NR_132411) 101792 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 133.25-52 chr13 113188251 113188596 + 0.5 NA 5' UTR (NM_001353095, exon 8 of 15) 5' UTR (NM_001353095, exon 8 of 15) -19770 NM_001278513 8451 Hs.339735 NM_003589 ENSG00000139842 CUL4A - cullin 4A protein-coding 154-122 chr7 26436054 26436584 + 0.5 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) -36901 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 147.5-95 chr2 46883853 46884327 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 31716 NM_001171509 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 117.5-13 chr1 156500012 156500375 + 0.5 NA intron (NM_005920, intron 1 of 11) CpG 582 NM_005920 4209 Hs.314327 NM_005920 ENSG00000116604 MEF2D - myocyte enhancer factor 2D protein-coding 132.25-172 chr7 14716178 14716508 + 0.5 NA intron (NM_001350717, intron 6 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie 125107 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 113.25-131 chr5 20551516 20551934 + 0.5 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 23988 NM_001349558 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 147.5-163 chr4 70317254 70317646 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17531 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 119-206 chr9 73610763 73611149 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 459091 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 126-105 chr2 203011208 203011655 + 0.5 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -3448 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 115.75-153 chr4 66186815 66187239 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -89797 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 116.75-182 chr7 40628183 40628560 + 0.5 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 351568 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 140.25-22 chr10 55824049 55824430 + 0.5 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL -196297 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 156.25-14 chr10 22692507 22692985 + 0.5 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 21362 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 137-87 chr2 216462199 216462613 + 0.5 NA intron (NM_001127207, intron 12 of 17) intron (NM_001127207, intron 12 of 17) -36438 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 208.5-66 chr2 18923415 18924063 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 103232 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 163.25-74 chr2 219919695 219920322 + 0.5 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -13443 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 142-167 chr8 125439807 125440278 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 7833 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 168.75-49 chr15 56885952 56886382 + 0.5 NA TTS (NR_015419) TTS (NR_015419) -31923 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 120.75-160 chr7 85956218 85956574 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 535274 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 130.5-140 chr2 139511720 139512117 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 614594 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 113.5-122 chr2 75361132 75361471 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -161781 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 147.75-92 chr20 62728638 62728966 + 0.5 NA intron (NM_002531, intron 1 of 3) intron (NM_002531, intron 1 of 3) 19966 NM_002531 4923 Hs.590869 NM_002531 ENSG00000101188 NTSR1 NTR neurotensin receptor 1 protein-coding 116.75-136 chr3 151165494 151165833 + 0.5 NA intron (NM_053002, intron 9 of 42) intron (NM_053002, intron 9 of 42) 37553 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 174.25-126 chr6 106419512 106420157 + 0.5 NA intron (NM_001371242, intron 1 of 21) intron (NM_001371242, intron 1 of 21) 37414 NR_134603 105377924 Hs.741855 NR_134603 ENSG00000282408 LOC105377924 - uncharacterized LOC105377924 ncRNA 119-42 chr12 126916413 126916800 + 0.5 NA intron (NR_104646, intron 6 of 6) intron (NR_104646, intron 6 of 6) -41916 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 136.5-194 chr6 53748614 53749002 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46197 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 119.25-39 chr11 60523342 60523817 + 0.5 NA intron (NM_001278320, intron 3 of 4) intron (NM_001278320, intron 3 of 4) 8187 NM_001100909 503497 Hs.523704 NM_001012417 ENSG00000204979 MS4A13 - membrane spanning 4-domains A13 protein-coding 114-132 chr5 60927483 60927755 + 0.5 NA intron (NM_001007233, intron 2 of 12) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 17451 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 112.5-129 chr2 170859755 170860041 + 0.5 NA 3' UTR (NM_000817, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_000817, exon 17 of 17) 43011 NM_000817 2571 Hs.420036 NM_000817 ENSG00000128683 GAD1 CPSQ1|GAD|SCP glutamate decarboxylase 1 protein-coding 153-100 chr3 131104018 131104400 + 0.5 NA intron (NM_001353034, intron 5 of 18) L1P4a|LINE|L1 76481 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 112.75-130 chr3 2575951 2576254 + 0.5 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) AluY|SINE|Alu -316113 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 115.5-236 chr7 113119865 113120203 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1452 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 234.5-90 chr7 56043512 56044316 + 0.5 NA intron (NM_001370522, intron 1 of 8) L1M7|LINE|L1 7530 NM_001370511 5723 Hs.512656 NM_004577 ENSG00000146733 PSPH PSP|PSPHD phosphoserine phosphatase protein-coding 135.5-209 chr9 11535875 11536277 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 922870 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 132.5-113 chr2 49093876 49094247 + 0.5 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 34458 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 118.5-211 chr8 42830441 42830700 + 0.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 12755 NM_018105 55145 Hs.7432 NM_018105 ENSG00000131931 THAP1 DYT6 THAP domain containing 1 protein-coding 181.75-18 chr10 84364715 84365186 + 0.5 NA intron (NM_018999, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 36361 NM_018999 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 142.5-104 chr2 35185129 35185449 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -286116 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 125.75-94 chr2 85351373 85351650 + 0.5 NA intron (NM_017750, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 3017 NM_017750 54884 Hs.440401 NM_017750 ENSG00000042445 RETSAT - retinol saturase protein-coding 127.75-90 chr19 50296019 50296378 + 0.5 NA intron (NM_024729, intron 37 of 40) HAL1M8|LINE|L1 33179 NM_004977 3748 Hs.467146 NM_004977 ENSG00000131398 KCNC3 KSHIIID|KV3.3|SCA13 potassium voltage-gated channel subfamily C member 3 protein-coding 160.5-118 chr3 74257249 74257744 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 263644 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 121.5-259 chr9 14653485 14653813 + 0.5 NA intron (NR_148717, intron 8 of 11) intron (NR_148717, intron 8 of 11) 39783 NM_178566 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 161-32 chr13 79724519 79724915 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79669 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 118-191 chr8 118470809 118471206 + 0.5 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) MER104|DNA|TcMar-Tc2 -149994 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 120.25-201 chr7 52487841 52488171 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -547627 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 127.5-102 chr17 66018500 66018969 + 0.5 NA intron (NM_001353129, intron 16 of 26) intron (NM_001353129, intron 16 of 26) 173158 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 112.25-224 chr8 136641183 136641543 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 110565 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 131-135 chr5 24230018 24230399 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 278860 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 156-8 chr1 177326051 177326546 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25288 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 122.5-86 chr17 71983062 71983397 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 42750 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 114.25-54 chr14 45657248 45657549 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 58204 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 146.5-62 chr14 47011737 47012100 + 0.5 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) 331328 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 123-112 chr2 165268102 165268402 + 0.5 NA intron (NM_001040143, intron 2 of 27) L1PB|LINE|L1 -25803 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 119.5-171 chr4 139753616 139753985 + 0.5 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 87981 NM_002413 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 157.75-71 chr17 78760218 78760839 + 0.5 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21680 NM_001365039 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 181-68 chr3 17093388 17093964 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 160480 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 143.25-23 chr10 118990125 118990610 + 0.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -39347 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 113.75-144 chr4 165651959 165652362 + 0.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -32479 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 135.75-83 chr19 23570089 23570516 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 116910 NM_138330 171392 Hs.264345 NM_138330 ENSG00000197372 ZNF675 TBZF|TIZ zinc finger protein 675 protein-coding 128-107 chr3 180574589 180574990 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27374 NM_001042601 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 153.5-48 chr13 91014135 91014592 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75254 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 149.75-47 chr14 83702140 83702593 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1059734 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 116-37 chr12 83610439 83610785 + 0.5 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 923457 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 143-135 chr7 121526180 121526695 + 0.5 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -130069 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 122.75-141 chr3 182371199 182371630 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 114948 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 119-202 chr8 131206138 131206419 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165369 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 140.5-217 chr7 82358110 82358663 + 0.5 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 85391 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 134.5-191 chr6 71256077 71256376 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32585 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 131.75-203 chr7 84275294 84275608 + 0.5 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -80662 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 125.75-12 chr1 175063924 175064420 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3661 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 150.25-16 chr10 13905116 13905689 + 0.5 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) 66494 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 131.5-23 chr10 30731125 30731607 + 0.5 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 8147 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 122.25-162 chr6 125775779 125776233 + 0.5 NA Intergenic LTR5_Hs|LTR|ERVK -5109 NM_001199619 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 166.5-144 chr4 52179262 52179824 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 128239 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 115.5-227 chr7 22062034 22062384 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -116310 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 127.5-137 chr20 35372884 35373293 + 0.5 NA intron (NM_001184977, intron 3 of 7) intron (NM_001184977, intron 3 of 7) 38885 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 112.25-35 chr11 90543637 90544025 + 0.5 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 12026 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 133.5-41 chr10 100667185 100667495 + 0.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -68056 NM_001304569 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 133.5-2 chr1 25738207 25738516 + 0.5 NA intron (NM_020379, intron 2 of 11) intron (NM_020379, intron 2 of 11) -61832 NM_020451 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 141-53 chr16 70564500 70564912 + 0.5 NA intron (NM_012426, intron 18 of 25) intron (NM_012426, intron 18 of 25) -15189 NM_152456 146433 Hs.461214 NM_152456 ENSG00000157368 IL34 C16orf77|IL-34 interleukin 34 protein-coding 129.5-156 chr3 77702326 77702719 + 0.5 NA Intergenic LTR1E|LTR|ERV1 346441 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 223-63 chr5 38549875 38550580 + 0.5 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) intron (NM_002310, intron 1 of 19) 6419 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 135.25-150 chr4 148564682 148565193 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -120239 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 152.75-2 chr1 33230906 33231352 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -25363 NM_152493 149076 Hs.743358 NM_152493 ENSG00000160094 ZNF362 RN|lin-29 zinc finger protein 362 protein-coding 133-15 chr10 65671075 65671477 + 0.5 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) intron (NR_120647, intron 3 of 5) 99851 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 145-12 chr1 169650992 169651563 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -21153 NM_003005 6403 Hs.73800 NM_003005 ENSG00000174175 SELP CD62|CD62P|GMP140|GRMP|LECAM3|PADGEM|PSEL selectin P protein-coding 122.25-140 chr4 65231465 65231750 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -227107 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 131-140 chr6 36066545 36066900 + 0.5 NA intron (NM_139012, intron 3 of 11) intron (NM_139012, intron 3 of 11) 38914 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 127-65 chr15 27679867 27680248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 419258 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 159.25-61 chr19 18139215 18139533 + 0.5 NA intron (NM_015016, intron 19 of 26) AluSx|SINE|Alu -13789 NR_162071 5296 Hs.371344 NM_005027 ENSG00000105647 PIK3R2 MPPH|MPPH1|P85B|p85|p85-BETA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 2 protein-coding 114.25-33 chr11 113181053 113181333 + 0.5 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 92708 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 119.5-10 chr1 77067743 77068170 + 0.5 NA TTS (NM_001320273) TTS (NM_001320273) 7813 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 152.75-52 chr13 98748520 98748999 + 0.5 NA intron (NM_005073, intron 1 of 22) intron (NM_005073, intron 1 of 22) 3913 NM_005073 6564 Hs.436893 NM_005073 ENSG00000088386 SLC15A1 HPECT1|HPEPT1|PEPT1 solute carrier family 15 member 1 protein-coding 135.75-61 chr14 79263031 79263302 + 0.5 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -16214 NM_138970 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 142.75-74 chr16 71350954 71351456 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7508 NM_007088 794 Hs.106857 NM_001740 ENSG00000172137 CALB2 CAB29|CAL2|CR calbindin 2 protein-coding 113.5-44 chr10 126415730 126416166 + 0.5 NA intron (NR_073453, intron 3 of 3) L1PREC2|LINE|L1 5931 NR_073453 101101772 Hs.562258 NR_073453 ENSG00000235180 LINC00601 - long intergenic non-protein coding RNA 601 ncRNA 121.5-177 chr3 78458035 78458519 + 0.5 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -409314 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 154.25-104 chr3 65089140 65089467 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -401303 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 169.25-34 chr15 69978531 69978941 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 100732 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 117.75-139 chr3 106636158 106636547 + 0.5 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 604286 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 117-66 chr15 66898802 66899206 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57511 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 165.75-81 chr2 51656462 51656960 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 624110 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 133.5-191 chr4 154968416 154968799 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 187102 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 133.25-10 chr1 209712417 209712723 + 0.5 NA intron (NM_181755, intron 5 of 6) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 7724 NM_005525 3290 Hs.195040 NM_005525 ENSG00000117594 HSD11B1 11-DH|11-beta-HSD1|CORTRD2|HDL|HSD11|HSD11B|HSD11L|SDR26C1 hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 1 protein-coding 135.5-110 chr2 137730398 137730894 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 197286 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 123-58 chr15 59001976 59002415 + 0.5 NA intron (NM_001270530, intron 1 of 13) intron (NM_001270530, intron 1 of 13) 14049 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 143.75-121 chr3 113694174 113694723 + 0.5 NA intron (NM_001009899, intron 1 of 6) intron (NM_001009899, intron 1 of 6) 2194 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 135.75-162 chr4 83236546 83237023 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 48011 NM_001358921 27235 Hs.144304 NM_015697 ENSG00000173085 COQ2 CL640|COQ10D1|MSA1|PHB:PPT coenzyme Q2, polyprenyltransferase protein-coding 120-26 chr11 76450633 76450958 + 0.5 NA intron (NM_001300942, intron 2 of 21) AluJb|SINE|Alu 5770 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 162.5-24 chr10 112148161 112148522 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35424 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 158.5-37 chr11 28102865 28103374 + 0.5 NA intron (NM_031217, intron 1 of 16) intron (NM_031217, intron 1 of 16) 5037 NM_031217 81930 Hs.301052 NM_031217 ENSG00000121621 KIF18A MS-KIF18A|PPP1R99 kinesin family member 18A protein-coding 129-43 chr11 115385406 115385831 + 0.5 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -11138 NR_135103 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 124-88 chr2 126554472 126554826 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -101286 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 130.75-87 chr2 35120920 35121430 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -350230 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 120.25-164 chr5 59649453 59649871 + 0.5 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 54041 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 132-34 chr11 115276251 115276559 + 0.5 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -57172 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 146.5-181 chr5 167838782 167839202 + 0.5 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) MIRc|SINE|MIR 84063 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 147.5-75 chr15 96858417 96858941 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75244 NR_158221 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 119-13 chr10 24244691 24244956 + 0.5 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) AluSz6|SINE|Alu -30862 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 157.5-69 chr15 101692188 101692742 + 0.5 NA intron (NM_152334, intron 10 of 18) intron (NM_152334, intron 10 of 18) 32008 NM_152334 123283 Hs.657163 NM_152334 ENSG00000185418 TARSL2 - threonyl-tRNA synthetase like 2 protein-coding 165.75-61 chr17 14220903 14221446 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 15688 NM_001348781 146822 Hs.447556 NM_001007530 ENSG00000223510 CDRT15 - CMT1A duplicated region transcript 15 protein-coding 113.25-117 chr3 189443819 189444203 + 0.5 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -152735 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 120.75-86 chr2 212768992 212769414 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26128 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 131-159 chr7 52505960 52506414 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -529446 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 149.75-37 chr14 42828963 42829388 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1222319 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 158.75-63 chr16 3984061 3984657 + 0.5 NA intron (NM_001116, intron 6 of 10) intron (NM_001116, intron 6 of 10) -33915 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 118.75-115 chr20 49842621 49842993 + 0.5 NA intron (NR_048538, intron 4 of 13) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -21052 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 152-30 chr11 45829258 45829690 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17644 NM_001127457 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 117.5-224 chr7 86021574 86022000 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 600665 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 129-99 chr2 186495939 186496276 + 0.5 NA intron (NM_018471, intron 2 of 9) intron (NM_018471, intron 2 of 9) 9847 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 180.5-98 chr3 112395437 112395808 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 62466 NM_005944 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 114.5-104 chr15 82930247 82930627 + 0.5 NA intron (NM_004839, intron 1 of 8) intron (NM_004839, intron 1 of 8) 22283 NM_199330 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 129-82 chr19 34887192 34887523 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11586 NR_046222 100652909 Hs.374015 NR_046222 ENSG00000271649 LINC00904 - long intergenic non-protein coding RNA 904 ncRNA 213.75-42 chr17 69995153 69995794 + 0.5 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 33766 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 113.5-103 chr18 6723314 6723761 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6179 NM_001366231 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 128.75-205 chr8 117994050 117994445 + 0.5 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -73334 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 117.75-96 chr19 55220660 55221079 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 8395 NM_173804 255043 Hs.135215 NM_173804 ENSG00000180089 TMEM86B - transmembrane protein 86B protein-coding 161.5-166 chr6 99066348 99066789 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58041 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 117-102 chr20 18370628 18370899 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -8286 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 185.5-67 chr17 80000870 80001510 + 0.5 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) intron (NM_019020, intron 3 of 11) 34682 NM_019020 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 183.75-95 chr5 35765028 35765724 + 0.5 NA intron (NM_024867, intron 26 of 36) L1ME3B|LINE|L1 -91515 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 132.75-25 chr10 80513619 80514042 + 0.5 NA intron (NM_030927, intron 6 of 8) MER58B|DNA|hAT-Charlie 22112 NR_120661 101929574 Hs.593663 NR_120661 ENSG00000226659 LOC101929574 - uncharacterized LOC101929574 ncRNA 150.5-112 chr2 222408452 222409044 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15240 NM_001320834 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 155.25-90 chr2 53356085 53356641 + 0.5 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -411420 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 216.75-53 chr4 31682213 31682750 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 175937 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 123-131 chr3 72272798 72273204 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 121744 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 157.75-179 chr8 139386489 139386889 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 316434 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 133.5-32 chr10 61600381 61600727 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -62375 NM_001366909 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 112.75-44 chr12 121305873 121306228 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7742 NM_153500 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 158-72 chr2 55368833 55369210 + 0.5 NA intron (NM_001254943, intron 5 of 33) intron (NM_001254943, intron 5 of 33) 50835 NM_001254943 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 127-38 chr11 115805272 115805600 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -45236 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 127.75-19 chr1 153378505 153378815 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3039 NM_005621 6283 Hs.19413 NM_005621 ENSG00000163221 S100A12 CAAF1|CAGC|CGRP|ENRAGE|MRP-6|MRP6|p6 S100 calcium binding protein A12 protein-coding 140-184 chrX 86481096 86481512 + 0.5 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 218336 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 121-87 chr18 13376345 13376767 + 0.5 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 50978 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-141 chr3 104245881 104246276 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -721962 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 124.75-145 chr3 78784492 78784975 + 0.5 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 234726 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 124.25-69 chr16 47157473 47157923 + 0.5 NA intron (NR_110904, intron 2 of 3) intron (NR_110904, intron 2 of 3) 13630 NR_110904 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 116-33 chr12 17389871 17390109 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 199088 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 127-110 chr20 51229344 51229679 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -206404 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 172.25-125 chr6 105015849 105016284 + 0.5 NA intron (NM_001004317, intron 2 of 3) intron (NM_001004317, intron 2 of 3) 58959 NM_001004317 389421 Hs.23616 NM_001004317 ENSG00000187772 LIN28B CSDD2 lin-28 homolog B protein-coding 143.5-36 chr11 120479163 120479613 + 0.5 NA intron (NM_015313, intron 37 of 40) intron (NM_015313, intron 37 of 40) -32358 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 141-119 chr4 145687443 145687824 + 0.5 NA intron (NM_001080531, intron 1 of 5) intron (NM_001080531, intron 1 of 5) 7429 NM_001080531 646603 NM_001080531 ENSG00000237136 C4orf51 - chromosome 4 open reading frame 51 protein-coding 140-154 chr6 142429271 142429769 + 0.5 NA intron (NM_198569, intron 22 of 24) intron (NM_198569, intron 22 of 24) 127513 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 145-141 chr6 145811861 145812366 + 0.5 NA intron (NM_001348092, intron 1 of 2) intron (NM_001348092, intron 1 of 2) 2682 NM_032145 84085 Hs.421095 NM_032145 ENSG00000118496 FBXO30 Fbx30 F-box protein 30 protein-coding 221-23 chr16 62698970 62699741 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -662917 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 117.25-157 chr4 93283007 93283375 + 0.5 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -545562 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 114.75-56 chr14 84571306 84571619 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -700470 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 128.25-185 chr7 30663770 30664248 + 0.5 NA intron (NM_001202481, intron 7 of 13) intron (NM_001202481, intron 7 of 13) 18447 NM_001883 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 144-23 chr10 108004584 108004923 + 0.5 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 64540 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 220.75-48 chr22 30793739 30794362 + 0.5 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) intron (NM_001282740, intron 1 of 12) -28466 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 126.75-127 chr20 1980699 1981204 + 0.5 NA exon (NM_024411, exon 4 of 4) exon (NM_024411, exon 4 of 4) 11855 NM_001190892 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 132.25-102 chr2 152544945 152545261 + 0.5 NA intron (NM_052905, intron 3 of 25) intron (NM_052905, intron 3 of 25) 172358 NM_001365603 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 140.75-129 chr4 15453847 15454231 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15826 NM_001080522 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 159.75-34 chr13 56988220 56988811 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -152403 NM_001130405 729240 Hs.525056 NM_001130405 ENSG00000229665 PRR20C PRR20|PRR20A|PRR20B|PRR20D|PRR20E proline rich 20C protein-coding 117.25-172 chr5 73170495 73170906 + 0.5 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -2493 NM_153217 134288 Hs.508588 NM_153217 ENSG00000164325 TMEM174 - transmembrane protein 174 protein-coding 151.75-164 chr9 89800514 89800901 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 160924 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 129.75-18 chr1 202247867 202248243 + 0.5 NA intron (NM_001017404, intron 4 of 15) intron (NM_001017404, intron 4 of 15) 33900 NM_001017404 59352 Hs.497402 NM_021636 ENSG00000133067 LGR6 GPCR|VTS20631 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6 protein-coding 121-161 chr5 97570586 97570991 + 0.5 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 66092 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 129.75-84 chr19 37864893 37865339 + 0.5 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -9920 NR_040015 100631378 Hs.726940 NR_040015 ENSG00000225868 LOC100631378 - uncharacterized 100631378 ncRNA 133.5-20 chr1 220509633 220510112 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -18264 NM_018650 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 129.75 chr1 7985486 7985888 + 0.5 NA TTS (NM_007262) TTS (NM_007262) 23976 NM_007262 11315 Hs.419640 NM_007262 ENSG00000116288 PARK7 DJ-1|DJ1|GATD2|HEL-S-67p Parkinsonism associated deglycase protein-coding 161.25-31 chr11 115558403 115558888 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -54230 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 173-128 chr6 166834911 166835555 + 0.5 NA intron (NM_001318936, intron 2 of 22) L1ME3|LINE|L1 27292 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 118.25-95 chr2 12212095 12212397 + 0.5 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 13116 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 128.75-68 chr16 85764618 85764973 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13699 NR_161453 404550 Hs.461655 NM_206967 ENSG00000154102 C16orf74 - chromosome 16 open reading frame 74 protein-coding 122-120 chr3 94156561 94156850 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 93644 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 134.75-210 chr8 73322416 73322834 + 0.5 NA intron (NR_125388, intron 3 of 5) L1ME4a|LINE|L1 28023 NM_172037 157506 Hs.244940 NM_172037 ENSG00000121039 RDH10 SDR16C4 retinol dehydrogenase 10 protein-coding 123.75-36 chr12 22257553 22257911 + 0.5 NA intron (NM_003034, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 76982 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 147-83 chr20 31464572 31464973 + 0.5 NA TTS (NM_001037500) TTS (NM_001037500) 8241 NM_001037500 245937 Hs.381373 NM_001037500 ENSG00000180383 DEFB124 DEFB-24 defensin beta 124 protein-coding 125.25-191 chr7 43315857 43316327 + 0.5 NA intron (NM_001287059, intron 3 of 27) intron (NM_001287059, intron 3 of 27) 165197 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 159.25-64 chr2 21092475 21092975 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31261 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 145.5-74 chr16 77269476 77269930 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 70295 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 126-147 chr5 148365057 148365367 + 0.5 NA intron (NR_105057, intron 2 of 4) MER113A|DNA|hAT-Charlie 18638 NR_105057 102546294 Hs.660461 NR_105057 ENSG00000247199 LOC102546294 - uncharacterized LOC102546294 ncRNA 120-119 chr3 102406584 102407026 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28210 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 125-131 chr5 105238356 105238672 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 139040 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 155.25-156 chr6 94587272 94587666 + 0.5 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu 869166 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 126.5-264 chr9 37318975 37319387 + 0.5 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) L1MD|LINE|L1 -103515 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 178-25 chr14 27738783 27739334 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -65837 NR_148991 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 120.75-156 chr7 36866683 36867163 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 20 of 21) intron (NM_001206480, intron 20 of 21) 52509 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 137-12 chr1 180348129 180348663 + 0.5 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) intron (NM_032360, intron 6 of 7) -73715 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 115-184 chr8 117160236 117160541 + 0.5 NA intron (NM_173851, intron 4 of 7) intron (NM_173851, intron 4 of 7) 25393 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 137.75-214 chr8 133775931 133776344 + 0.5 NA non-coding (NR_125422, exon 3 of 3) non-coding (NR_125422, exon 3 of 3) 1215 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 135-91 chr20 17419072 17419437 + 0.5 NA intron (NM_002594, intron 6 of 11) intron (NM_002594, intron 6 of 11) 112125 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 127-191 chr9 134359725 134360193 + 0.5 NA intron (NM_002957, intron 1 of 9) intron (NM_002957, intron 1 of 9) -19336 NM_001291920 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 158.75-174 chrX 54320429 54321061 + 0.5 NA intron (NM_001002838, intron 2 of 22) AluJr|SINE|Alu 37260 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 120.25-172 chr5 124837087 124837466 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -92164 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 115.5-171 chr3 115970873 115971283 + 0.5 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) -65952 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 194.5-47 chr16 68402057 68402818 + 0.5 NA intron (NM_018667, intron 1 of 8) intron (NM_018667, intron 1 of 8) 46071 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 126.75-252 chr9 86756617 86757108 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 190644 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 160.25-159 chr8 53235731 53236182 + 0.5 NA intron (NM_000912, intron 2 of 3) intron (NM_000912, intron 2 of 3) 15681 NM_000912 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 171.5-21 chr10 115700878 115701534 + 0.5 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) L1PA16|LINE|L1 493583 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 141-140 chr6 120988962 120989427 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 345286 NM_001367760 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 116.5-269 chrX 33971687 33971933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 160520 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 141.75-14 chr1 218536829 218537186 + 0.5 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 26912 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 166.5-121 chr20 50275651 50276253 + 0.5 NA intron (NM_001278655, intron 2 of 3) LTR16C|LTR|ERVL 8466 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 146.5-220 chr8 62620408 62620774 + 0.5 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -357270 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 150-134 chr7 105012755 105013157 + 0.5 NA non-coding (NR_024586, exon 1 of 1) non-coding (NR_024586, exon 1 of 1) 1185 NR_024586 100216545 Hs.631150 NR_024586 KMT2E-AS1 - KMT2E antisense RNA 1 ncRNA 194.75-2 chr1 80752926 80753525 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 111938 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 139.5-185 chr5 155215643 155216097 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 202115 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 163-46 chr16 65335854 65336420 + 0.5 NA intron (NR_027755, intron 7 of 8) intron (NR_027755, intron 7 of 8) -159564 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 159.5-135 chr3 736233 736676 + 0.5 NA intron (NR_110118, intron 1 of 3) L1MC5a|LINE|L1 144349 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 144.5-34 chr10 90055433 90055919 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -98303 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 120-170 chr7 9971023 9971438 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 336960 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 118.5-149 chr4 76935417 76935757 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14165 NM_001306147 55752 Hs.128199 NM_018243 ENSG00000138758 SEPTIN11 SEPT11 septin 11 protein-coding 133.5-240 chr6 152978625 152979070 + 0.5 NA intron (NM_001142522, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 4194 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 147-136 chr7 96369243 96369617 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -47283 NM_001160210 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 128.75-38 chr12 5791224 5791627 + 0.5 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 153834 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 131.75-179 chr6 11077879 11078328 + 0.5 NA non-coding (NR_038963, exon 3 of 3) non-coding (NR_038963, exon 3 of 3) -15731 NM_001135575 221710 Hs.656600 NM_001135575 ENSG00000224531 SMIM13 C6orf228 small integral membrane protein 13 protein-coding 121.75-116 chr3 62413051 62413423 + 0.5 NA intron (NM_003716, intron 28 of 29) intron (NM_003716, intron 28 of 29) -39687 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 120.25-145 chr4 43395442 43395790 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 96927 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 124.25-108 chr2 186599037 186599408 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001144999) promoter-TSS (NM_001144999) -983 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 237.25-46 chr20 35915857 35916518 + 0.5 NA intron (NM_016436, intron 12 of 17) intron (NM_016436, intron 12 of 17) 38439 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 155.5-118 chr22 34172536 34173063 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -249911 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 125.5-109 chr17 73530799 73531243 + 0.5 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) (TCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17338 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 163-109 chr6 157989077 157989429 + 0.5 NA intron (NM_003898, intron 1 of 26) MIR|SINE|MIR 7390 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 155-94 chr4 46282330 46282763 + 0.5 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) intron (NM_001114175, intron 7 of 8) 106833 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 128.5-22 chr10 29272359 29272835 + 0.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -16473 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 128.25-39 chr12 60406428 60406805 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 717246 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 134.5-141 chr3 162642388 162642805 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 660705 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 180.5-171 chrX 152247115 152247585 + 0.5 NA intron (NM_000808, intron 5 of 9) intron (NM_000808, intron 5 of 9) -108772 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 126.25-164 chr5 109982260 109982608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 99252 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 178-59 chr3 6696130 6696616 + 0.5 NA intron (NR_110123, intron 2 of 3) intron (NR_110123, intron 2 of 3) 109076 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 149.25-192 chr9 69574718 69575124 + 0.5 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) L1ME3E|LINE|L1 97450 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 144.75-92 chr2 134552447 134553010 + 0.5 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu 166272 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 117.5-93 chr18 67354838 67355221 + 0.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -161517 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 188.5-75 chr2 84875346 84876057 + 0.5 NA intron (NM_001307978, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 5383 NM_001277053 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 202.5-24 chr11 13629914 13630581 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -38421 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 120-188 chr8 103307563 103307957 + 0.5 NA intron (NM_001317796, intron 2 of 5) intron (NM_001317796, intron 2 of 5) -1218 NR_145795 109623480 NR_145795 SNORD173 - small nucleolar RNA, C/D box 173 snoRNA 119-107 chr21 40523564 40523930 + 0.5 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) LTR1A2|LTR|ERV1 107020 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 115.5-154 chr21 23800243 23800547 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -415560 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 132.5-38 chr11 44223415 44223854 + 0.5 NA intron (NM_207122, intron 10 of 13) L1MD1|LINE|L1 86505 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 117-27 chr11 84403154 84403506 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) MIRc|SINE|MIR -85991 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 120.25-230 chrX 153579081 153579438 + 0.5 NA intron (NM_021949, intron 20 of 20) L2b|LINE|L2 19880 NM_152274 92002 Hs.496943 NM_152274 ENSG00000262919 CCNQ FAM58A cyclin Q protein-coding 123-76 chr16 80484072 80484420 + 0.5 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -56488 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 158.75-79 chr19 32553165 32553663 + 0.5 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu -27776 NM_004708 9141 Hs.443831 NM_004708 ENSG00000105185 PDCD5 TFAR19 programmed cell death 5 protein-coding 150.5-22 chr10 99808007 99808477 + 0.5 NA intron (NM_000392, intron 13 of 31) intron (NM_000392, intron 13 of 31) 25602 NM_000392 1244 Hs.368243 NM_000392 ENSG00000023839 ABCC2 ABC30|CMOAT|DJS|MRP2|cMRP ATP binding cassette subfamily C member 2 protein-coding 155.75-117 chr4 41365738 41366193 + 0.5 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 5158 NM_001330788 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 119.5-141 chr22 36382708 36383168 + 0.5 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) intron (NM_002473, intron 1 of 40) 5129 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 145.5-197 chr9 108873686 108874106 + 0.5 NA intron (NM_001330749, intron 34 of 34) intron (NM_001330749, intron 34 of 34) 11630 NM_006687 10881 Hs.123530 NM_006687 ENSG00000187003 ACTL7A - actin like 7A protein-coding 135-110 chr3 94826226 94826722 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -111789 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 142.75-18 chr10 28482158 28482704 + 0.5 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 13382 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 140-145 chr5 153584271 153584594 + 0.5 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) intron (NM_001258020, intron 3 of 16) 92260 NM_001258022 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 209.75-80 chr5 156885729 156886494 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35816 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 150.5-183 chr6 40120112 40120465 + 0.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -185826 NM_001358531 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 126.25-214 chr8 131857098 131857491 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46799 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 132.5-99 chr18 64083892 64084171 + 0.5 NA intron (NR_027245, intron 3 of 3) intron (NR_027245, intron 3 of 3) -20060 NR_033881 284294 Hs.385642 NR_033881 ENSG00000267134 LINC01924 - long intergenic non-protein coding RNA 1924 ncRNA 180.5-23 chr12 16371286 16371874 + 0.5 NA intron (NM_001267598, intron 3 of 3) MER58D|DNA|hAT-Charlie 18163 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 128.25-14 chr10 26766366 26766837 + 0.5 NA intron (NM_001012752, intron 5 of 9) L2c|LINE|L2 68900 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 133.75-122 chr22 24349931 24350334 + 0.5 NA intron (NM_015330, intron 11 of 16) L2a|LINE|L2 8024 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 167-15 chr1 218418062 218418562 + 0.5 NA intron (NR_138148, intron 2 of 6) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -19321 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 113.75-123 chr3 6773863 6774222 + 0.5 NA intron (NR_110125, intron 2 of 3) intron (NR_110125, intron 2 of 3) 31407 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 115.25-157 chr5 4877084 4877428 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 103775 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 119.5-170 chr4 131079975 131080370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -684666 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 256-61 chr6 52888897 52889722 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 20389 NM_001363542 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 131.75-162 chr5 10561229 10561635 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2638 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 116-50 chr14 92109084 92109425 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2633 NM_001127697 4287 Hs.532632 NM_004993 ENSG00000066427 ATXN3 AT3|ATX3|JOS|MJD|MJD1|SCA3 ataxin 3 protein-coding 136.75-158 chr5 60474146 60474518 + 0.5 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -13381 NR_024617 25859 Hs.146312 NM_001039499 ENSG00000152931 PART1 NCRNA00206 prostate androgen-regulated transcript 1 ncRNA 144.25-163 chr5 155623972 155624357 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 610409 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 170-76 chr5 20970395 20970933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -355129 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 203.25-18 chr11 9872773 9873370 + 0.5 NA intron (NM_030962, intron 17 of 39) AluSc8|SINE|Alu 33929 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 189-13 chr1 170549026 170549692 + 0.5 NA intron (NM_001320252, intron 6 of 6) intron (NM_001320252, intron 6 of 6) -16750 NR_125958 101928650 Hs.676662 NR_125958 GORAB-AS1 - GORAB antisense RNA 1 ncRNA 153.75-47 chr15 59724813 59725277 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -35725 NM_001368057 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 165.75-147 chr6 67846250 67846848 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -208802 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 131.75-36 chr11 10517677 10518100 + 0.5 NA intron (NM_016422, intron 5 of 5) L1ME1|LINE|L1 -8702 NM_001190702 100463486 NM_001190702 ENSG00000255823 MTRNR2L8 HN8 MT-RNR2 like 8 protein-coding 121.25-53 chr14 42774176 42774444 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 1167454 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 113.5-204 chr5 125469833 125470228 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -23231 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 122.75-169 chr5 131943602 131943950 + 0.5 NA intron (NM_001303622, intron 3 of 12) intron (NM_001303622, intron 3 of 12) 1887 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 142.5-184 chr6 11603683 11604201 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 66193 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 115-45 chr12 115378691 115379015 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -694678 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 158.5-123 chr22 22003284 22003703 + 0.5 NA intron (NR_135291, intron 4 of 6) AluSz6|SINE|Alu -20706 NM_001349851 8940 Hs.436401 NM_003935 ENSG00000100038 TOP3B TOP3B1 DNA topoisomerase III beta protein-coding 117.75-152 chr4 42274628 42275046 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 116431 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 145.5-121 chr21 42794541 42795058 + 0.5 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -14805 NR_135517 101928311 Hs.570404 NR_135517 ENSG00000283051 LINC01668 - long intergenic non-protein coding RNA 1668 ncRNA 148.75-173 chr8 132432433 132432971 + 0.5 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 14560 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 172-30 chr12 40337374 40337944 + 0.5 NA intron (NM_198578, intron 40 of 50) intron (NM_198578, intron 40 of 50) -55735 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 142.5-145 chr3 182928825 182929322 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 51465 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 126.75-254 chr9 97342649 97343081 + 0.5 NA intron (NM_001348010, intron 19 of 20) intron (NM_001348010, intron 19 of 20) 20816 NR_031637 100302223 NR_031637 ENSG00000221269 MIR1302-8 MIRN1302-8|hsa-mir-1302-8 microRNA 1302-8 ncRNA 184.25-130 chr9 27580327 27580828 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6711 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 131.25-124 chr22 17252885 17253183 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 13699 NR_038398 27442 Hs.517394 NR_038398 ENSG00000241832 CECR3 - cat eye syndrome chromosome region, candidate 3 ncRNA 135.75-203 chr8 119601153 119601537 + 0.5 NA intron (NM_001330600, intron 10 of 25) intron (NM_001330600, intron 10 of 25) -8337 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 120-103 chr20 52283949 52284228 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -92103 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 133.5-221 chr5 166050196 166050526 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 876009 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 116.75-74 chr17 51444943 51445403 + 0.5 NA non-coding (NR_146897, exon 3 of 3) non-coding (NR_146897, exon 3 of 3) 9746 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 137-70 chr18 51981132 51981669 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -358797 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 130.5-21 chr1 194865069 194865542 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1223410 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 150.75-109 chr2 219032222 219032793 + 0.5 NA exon (NM_001278295, exon 6 of 13) exon (NM_001278295, exon 6 of 13) 9009 NM_001278296 255101 Hs.147762 NM_152389 ENSG00000181378 CFAP65 CCDC108 cilia and flagella associated protein 65 protein-coding 132-57 chr15 60484132 60484646 + 0.5 NA intron (NR_120341, intron 1 of 4) intron (NR_120341, intron 1 of 4) 5211 NR_120339 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 124.25-127 chr3 13178173 13178487 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -104901 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 150.5-9 chr1 110719010 110719518 + 0.5 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -44324 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 180-82 chr3 90301134 90301636 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1193764 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 115.75-232 chr9 133883459 133883730 + 0.5 NA intron (NM_001134398, intron 2 of 29) (CAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 108730 NM_001134398 7410 Hs.369921 NM_003371 ENSG00000160293 VAV2 VAV-2 vav guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 188-89 chr9 73075651 73076275 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75902 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 144-139 chr8 129177299 129177655 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 63763 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 144.75-165 chr7 103428477 103428781 + 0.5 NA intron (NR_135802, intron 2 of 17) AluSz|SINE|Alu 14582 NR_120441 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 160.25-26 chr12 70891124 70891522 + 0.5 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) intron (NM_002849, intron 2 of 13) 29415 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 122.25-15 chr1 208935926 208936359 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36312 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 174.75-119 chr7 94859175 94859783 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48115 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 125-110 chr4 30384805 30385133 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -335400 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 168.5-34 chr11 14007939 14008390 + 0.5 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger 45441 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 138.75-37 chr12 22768580 22768943 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 143590 NM_001039481 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 146.5-128 chr20 61305866 61306190 + 0.5 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) intron (NM_001794, intron 2 of 15) 53767 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 171.25-108 chr4 53731866 53732297 + 0.5 NA intron (NR_125918, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 36180 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 167.5-117 chr3 76070905 76071332 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -285569 NM_001290209 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 139.75-61 chr15 71009172 71009617 + 0.5 NA intron (NM_017691, intron 12 of 15) intron (NM_017691, intron 12 of 15) 116951 NM_001363732 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 177.75-106 chr4 74473159 74473597 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28242 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 135.25-179 chr6 73564930 73565433 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -44149 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 172.75-50 chr17 80778106 80778716 + 0.5 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 27221 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 132.5-119 chr2 71408451 71408793 + 0.5 NA intron (NM_001252613, intron 20 of 27) intron (NM_001252613, intron 20 of 27) -44939 NM_003494 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 128.25-68 chr16 78479651 78480055 + 0.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 380199 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 114-77 chr2 84445911 84446247 + 0.5 NA intron (NM_003849, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 13201 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 120-118 chr3 97441832 97442254 + 0.5 NA intron (NM_001278300, intron 2 of 12) intron (NM_001278300, intron 2 of 12) 2436 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 120.5-21 chr10 28755134 28755402 + 0.5 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) LTR16E2|LTR|ERVL 11618 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 147-133 chr7 85682421 85682881 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 261529 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 118-36 chr12 111618363 111618702 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -18856 NR_132311 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 138.5-33 chr11 36270299 36270741 + 0.5 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 18904 NM_001307937 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 137-68 chr18 3767466 3767781 + 0.5 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) L1MD1|LINE|L1 77735 NM_001242766 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 169.75-156 chr8 117070164 117070649 + 0.5 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -64589 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 166.5-189 chr7 44762186 44762818 + 0.5 NA intron (NM_174929, intron 9 of 16) intron (NM_174929, intron 9 of 16) 6314 NM_174929 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 122.75-6 chr1 63640516 63640990 + 0.5 NA intron (NM_001172818, intron 7 of 10) L3|LINE|CR1 17537 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 137-82 chr2 108964207 108964660 + 0.5 NA intron (NM_022336, intron 1 of 11) intron (NM_022336, intron 1 of 11) 24787 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 116.75-147 chr4 59365218 59365462 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 351767 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 155-124 chr6 125885549 125885924 + 0.5 NA intron (NM_001199621, intron 7 of 14) intron (NM_001199621, intron 7 of 14) -33519 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 113.5-7 chr1 93046043 93046375 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -33026 NM_001164393 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 151.25-183 chr7 158220557 158221116 + 0.5 NA intron (NM_001308267, intron 2 of 21) L1PA16|LINE|L1 311977 NR_030325 693180 NR_030325 ENSG00000207637 MIR595 MIRN595|hsa-mir-595 microRNA 595 ncRNA 159.5-182 chr6 61882999 61883369 + 0.5 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 309054 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 176-56 chr4 140760979 140761658 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4933 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 138.25-106 chr22 28083265 28083574 + 0.5 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -162807 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 136.5-227 chr8 82825887 82826427 + 0.5 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -85947 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 123.75-44 chr12 115357545 115357853 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -673524 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 181.5-49 chr15 62796039 62796627 + 0.5 NA intron (NM_015059, intron 44 of 55) intron (NM_015059, intron 44 of 55) -27624 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 121.5-225 chr6 74110412 74110715 + 0.5 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) AluSp|SINE|Alu 41112 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 127.25-79 chr19 42163777 42164143 + 0.5 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -30447 NR_036208 100422980 NR_036208 ENSG00000266226 MIR4323 - microRNA 4323 ncRNA 190.25-71 chr2 203708748 203709311 + 0.5 NA intron (NM_001243078, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 2390 NM_006139 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 125.25-141 chr4 23636287 23636687 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 244805 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 139.75-29 chr11 123095288 123095722 + 0.5 NA intron (NM_024769, intron 2 of 6) AluSx|SINE|Alu -33369 NM_153201 3312 Hs.180414 NM_006597 ENSG00000109971 HSPA8 HEL-33|HEL-S-72p|HSC54|HSC70|HSC71|HSP71|HSP73|HSPA10|LAP-1|LAP1|NIP71 heat shock protein family A (Hsp70) member 8 protein-coding 135.75-119 chr20 12354143 12354671 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 436514 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 148.5-31 chr10 93335163 93335648 + 0.5 NA intron (NM_013451, intron 41 of 53) intron (NM_013451, intron 41 of 53) 146929 NM_013451 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 132-120 chr3 186527318 186527587 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 16928 NM_017541 1427 Hs.376209 NM_017541 ENSG00000213139 CRYGS CRYG8|CTRCT20 crystallin gamma S protein-coding 131.75-135 chr3 44761837 44762192 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_020696) promoter-TSS (NM_020696) 220 NM_020242 56992 Hs.658939 NM_020242 ENSG00000163808 KIF15 HKLP2|KLP2|KNSL7|NY-BR-62 kinesin family member 15 protein-coding 141-155 chr8 83110457 83110819 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 198534 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 218-18 chr14 78182869 78183539 + 0.5 NA intron (NR_073547, intron 1 of 20) intron (NR_073547, intron 1 of 20) 12831 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 133.5-135 chr20 33887055 33887487 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 75923 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 114.75-201 chr8 139342362 139342772 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 360556 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 143.25-118 chr3 70115256 70115655 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 115711 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 118-137 chr5 6620069 6620518 + 0.5 NA non-coding (NR_037947, exon 6 of 18) non-coding (NR_037947, exon 6 of 18) 12751 NM_017755 54888 Hs.481526 NM_017755 ENSG00000037474 NSUN2 MISU|MRT5|SAKI|TRM4 NOP2/Sun RNA methyltransferase 2 protein-coding 133-69 chr18 296907 297318 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -29065 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 130.5-203 chr5 56407648 56408088 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 73901 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 162.75-20 chr10 129617031 129617491 + 0.5 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 150020 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 181.5-70 chr2 33315514 33315970 + 0.5 NA intron (NM_001166264, intron 20 of 28) AluSq2|SINE|Alu -102774 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 119-115 chr3 35723581 35723932 + 0.5 NA intron (NM_016300, intron 14 of 19) Eulor4|Unknown|Unknown -20720 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 202.75-82 chr4 49114741 49115391 + 0.5 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 128424 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 116.25-207 chr7 24000438 24000814 + 0.5 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -283564 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 126-81 chr19 16618307 16618664 + 0.5 NA intron (NM_004831, intron 1 of 2) intron (NM_004831, intron 1 of 2) 9719 NM_004831 9441 Hs.715040 NM_004831 ENSG00000105085 MED26 CRSP7|CRSP70 mediator complex subunit 26 protein-coding 155.25-149 chr6 40697584 40698015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -110435 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 173-117 chr6 18429582 18430064 + 0.5 NA intron (NM_182757, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 42473 NM_182757 255488 Hs.148741 NM_182757 ENSG00000137393 RNF144B IBRDC2|PIR2|bA528A10.3|p53RFP ring finger protein 144B protein-coding 160.5-106 chr21 33766586 33767012 + 0.5 NA intron (NM_001001132, intron 10 of 29) intron (NM_001001132, intron 10 of 29) 124298 NM_001001132 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 115.75-124 chr20 21852971 21853341 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 147492 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 165.25-62 chr2 20264703 20265284 + 0.5 NA intron (NM_001282790, intron 11 of 18) intron (NM_001282790, intron 11 of 18) -39560 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 154.5-52 chr12 115909349 115909814 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 239073 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 157.5-235 chrX 88001786 88002276 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 484229 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 163.5-217 chr9 38056960 38057339 + 0.5 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) L1ME4a|LINE|L1 12078 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 119.25-117 chr22 35060921 35061369 + 0.5 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -5013 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 123-168 chr6 45020475 45020875 + 0.5 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 177095 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 150.75-151 chr5 68649465 68650026 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 357168 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 165.75-142 chr5 175850224 175850595 + 0.5 NA intron (NM_006650, intron 2 of 4) intron (NM_006650, intron 2 of 4) -21169 NM_001008220 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 118.25-151 chr5 32139845 32140308 + 0.5 NA intron (NM_022130, intron 2 of 3) HAL1|LINE|L1 34243 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 126.5-13 chr1 154082208 154082534 + 0.5 NA intron (NM_001159484, intron 16 of 37) L1MB7|LINE|L1 22221 NR_049883 100847024 NR_049883 ENSG00000263987 MIR5698 - microRNA 5698 ncRNA 139-126 chr6 3915972 3916427 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 66826 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 159.5-157 chr4 13877567 13877970 + 0.5 NA intron (NR_121681, intron 3 of 3) intron (NR_121681, intron 3 of 3) 222589 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 122.75-81 chr19 9267864 9268311 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 17043 NM_001079935 26648 Hs.129832 NM_001079935 ENSG00000237521 OR7E24 HSHT2|OR19-8|OR7E24P|OR7E24Q olfactory receptor family 7 subfamily E member 24 protein-coding 128.75-151 chr5 52778449 52778810 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -9287 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 130-152 chr7 50606664 50607127 + 0.5 NA intron (NM_001350816, intron 12 of 17) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -41490 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 152.75-162 chr9 82547419 82547908 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 515479 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 139.75-138 chr4 107469480 107469759 + 0.5 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 250615 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 154.75-16 chr11 8727805 8728203 + 0.5 NA intron (NM_139157, intron 2 of 18) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -40774 NR_120590 102724784 Hs.613276 NR_120590 LOC102724784 - uncharacterized LOC102724784 ncRNA 144.75-76 chr19 28156951 28157318 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -363194 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 137-5 chr1 84205510 84205949 + 0.5 NA TTS (NM_207578) TTS (NM_207578) 24097 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 120-49 chr14 102629601 102629966 + 0.5 NA intron (NM_015156, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR 37134 NM_015156 23186 Hs.510521 NM_015156 ENSG00000089902 RCOR1 COREST|RCOR REST corepressor 1 protein-coding 191.75-64 chr2 59474791 59475334 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 257354 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 113.25-65 chr16 59692980 59693406 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61998 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 147.5-24 chr10 70098161 70098708 + 0.5 NA intron (NM_018649, intron 6 of 8) L1MC5|LINE|L1 34391 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 134.75-194 chr7 36689671 36690107 + 0.5 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) intron (NM_001637, intron 1 of 20) 34605 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 151.25-95 chr2 189151659 189152020 + 0.5 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) -18728 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 129.25-76 chr18 36049935 36050447 + 0.5 NA intron (NM_001303411, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 17368 NM_018170 55197 Hs.464912 NM_018170 ENSG00000141425 RPRD1A HsT3101|P15RS regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A protein-coding 136-110 chr3 137889435 137889910 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -109144 NM_001002026 51208 Hs.655324 NM_016369 ENSG00000066405 CLDN18 SFTA5|SFTPJ claudin 18 protein-coding 120.25-141 chr4 26005059 26005416 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 91045 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 129.5 chr1 35445796 35446288 + 0.5 NA intron (NM_024874, intron 16 of 20) intron (NM_024874, intron 16 of 20) -79965 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 185.5-64 chr16 47512959 47513480 + 0.5 NA intron (NM_001031835, intron 6 of 31) intron (NM_001031835, intron 6 of 31) 51888 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 151-113 chr5 120226075 120226674 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -237904 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 205.75-57 chr4 111791249 111791787 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -353936 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 176-85 chrX 70485825 70486284 + 0.5 NA intron (NM_020730, intron 4 of 13) L3|LINE|CR1 -30060 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 119.75-17 chr1 230661258 230661670 + 0.5 NA intron (NM_007357, intron 3 of 17) intron (NM_007357, intron 3 of 17) 18983 NM_001145036 22796 Hs.211800 NM_007357 ENSG00000135775 COG2 CDG2Q|LDLC component of oligomeric golgi complex 2 protein-coding 122.5-199 chr6 100928832 100929280 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -47684 NM_001284271 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 182.75-106 chr5 98269934 98270443 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -108949 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 136.5-233 chr8 117881839 117882261 + 0.5 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 38863 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 128.5-229 chr8 141568769 141569198 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61753 NR_102364 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 149-106 chr5 163721741 163722187 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 216345 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 128.75-102 chr2 182830719 182831171 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 35692 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 142.5-203 chr7 17907714 17908225 + 0.5 NA intron (NM_001350862, intron 1 of 25) L2|LINE|L2 32525 NM_001350867 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 149-6 chr1 112301332 112301914 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -94591 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 160.25-81 chr20 37704588 37705102 + 0.5 NA intron (NM_030877, intron 1 of 15) intron (NM_030877, intron 1 of 15) 10815 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 139.5-76 chr16 1985411 1985789 + 0.5 NA intron (NM_005262, intron 2 of 2) intron (NM_005262, intron 2 of 2) 1407 NM_005262 2671 Hs.27184 NM_005262 ENSG00000127554 GFER ALR|ERV1|HERV1|HPO|HPO1|HPO2|HSS growth factor, augmenter of liver regeneration protein-coding 134.75-224 chr8 126579856 126580312 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -21606 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 116.5-199 chr5 65038644 65039060 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 269922 NM_005869 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 139.75-193 chrX 57960159 57960547 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -49720 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 121.25-152 chr4 128710152 128710587 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -99331 NM_024900 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 212.75-104 chr9 112198260 112198822 + 0.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -23244 NM_001282640 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 148-76 chr22 23705289 23705797 + 0.5 NA intron (NR_024448, intron 5 of 11) L1MA6|LINE|L1 9127 NM_001329425 266747 Hs.658997 NM_153615 ENSG00000159496 RGL4 Rgr ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 4 protein-coding 158.75-103 chr20 53031942 53032450 + 0.5 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 59838 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 116.75-128 chr3 89014116 89014524 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93301 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 219.75-13 chr10 95726843 95727489 + 0.5 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) intron (NM_001098175, intron 1 of 9) 15402 NM_001098175 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 246.75-69 chr8 74346698 74347514 + 0.5 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -3277 NM_001362930 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 155.75-72 chr18 66291064 66291375 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 312871 NR_073130 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 151.75-18 chr1 239006402 239006935 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -379900 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 174.75-90 chr4 33203541 33204054 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 836096 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 129.25-86 chr2 19563748 19564213 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -205357 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 146.5-153 chr4 52108415 52108985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57396 NR_144359 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 132.75-165 chr6 62290669 62291139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4677 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 142-46 chr14 26831521 26831954 + 0.5 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -9617 NR_110033 101927062 NR_110033 ENSG00000257845 LINC02294 - long intergenic non-protein coding RNA 2294 ncRNA 119.75-62 chr14 61703888 61704306 + 0.5 NA intron (NM_001243084, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 6475 NM_001243084 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 126.75-246 chr8 111002192 111002558 + 0.5 NA intron (NR_125416, intron 4 of 4) intron (NR_125416, intron 4 of 4) 25058 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 115-52 chr14 73888282 73888554 + 0.5 NA intron (NR_040251, intron 1 of 11) intron (NR_040251, intron 1 of 11) 1559 NM_001242926 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 131.5-45 chr12 40539527 40539937 + 0.5 NA intron (NM_173600, intron 136 of 173) L1PA5|LINE|L1 146338 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 124-18 chr10 91466135 91466598 + 0.5 NA intron (NM_182765, intron 5 of 20) L1MC|LINE|L1 56081 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 151-55 chr2 44178469 44178771 + 0.5 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 9745 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 137.25-154 chr7 85783047 85783369 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 362086 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 134-98 chr2 156242964 156243362 + 0.5 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 11768 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 121.25-209 chrX 50380474 50380757 + 0.5 NA intron (NM_001013742, intron 18 of 27) intron (NM_001013742, intron 18 of 27) 90210 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 119-116 chr3 56129446 56129758 + 0.5 NA intron (NR_132749, intron 6 of 17) intron (NR_132749, intron 6 of 17) -277008 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 158.25-134 chr7 38840074 38840517 + 0.5 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) intron (NM_014396, intron 4 of 28) 68896 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 132.25-104 chr2 163542301 163542813 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 193451 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 112.25-9 chr1 119371754 119372168 + 0.5 NA intron (NM_016527, intron 1 of 7) intron (NM_016527, intron 1 of 7) 3015 NR_046780 100874270 NR_046780 ENSG00000230921 HAO2-IT1 - HAO2 intronic transcript 1 ncRNA 112.25-51 chr13 82680189 82680590 + 0.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 1202004 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 200.5-104 chr4 104925098 104925556 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -220548 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 137.5-119 chr2 66664356 66664747 + 0.5 NA intron (NR_110156, intron 1 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 38676 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 139.25-11 chr1 234623600 234623879 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5572 NR_033927 100302691 Hs.209162 NR_033927 ENSG00000224939 LINC00184 HANC|NCRNA00184 long intergenic non-protein coding RNA 184 ncRNA 128.25-15 chr10 32749631 32749982 + 0.5 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1ME3B|LINE|L1 151666 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 116-180 chr8 138728662 138729065 + 0.5 NA intron (NM_152888, intron 23 of 64) MER5A|DNA|hAT-Charlie 185178 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 175.25-143 chr8 86195562 86196139 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 34531 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 170.75-118 chr6 125119373 125119836 + 0.5 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -34169 NM_001003397 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 116.5-73 chr14 70571031 70571329 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 29510 NM_001284209 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 112.25-25 chr11 6495471 6495817 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1636 NM_173589 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 145.75-57 chr16 79766704 79767117 + 0.5 NA intron (NR_104663, intron 2 of 5) intron (NR_104663, intron 2 of 5) -3561 NR_104660 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 153-109 chr4 168577336 168577880 + 0.5 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) intron (NM_001166108, intron 2 of 21) -53970 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 165-38 chr14 52693979 52694415 + 0.5 NA intron (NM_014584, intron 1 of 15) intron (NM_014584, intron 1 of 15) 1361 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 255.5-69 chr5 170496259 170497224 + 0.5 NA intron (NM_001034838, intron 1 of 7) intron (NM_001034838, intron 1 of 7) -7279 NM_014592 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 143-72 chr2 57876497 57876904 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30951 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 163.75-24 chr11 34090293 34090759 + 0.5 NA intron (NM_005898, intron 13 of 18) intron (NM_005898, intron 13 of 18) -15103 NM_001144030 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 118.5-170 chr5 132388923 132389238 + 0.5 NA intron (NM_003060, intron 6 of 9) intron (NM_003060, intron 6 of 9) -19164 NR_110997 553103 Hs.570908 NR_110997 ENSG00000233006 MIR3936HG SLC22A5-AS1 MIR3936 host gene ncRNA 145.25-69 chr2 36211793 36212237 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 143555 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 126.5-258 chr8 141045909 141046173 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43962 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 211.5-73 chr2 36945257 36945708 + 0.5 NA intron (NM_003162, intron 1 of 17) AluSx3|SINE|Alu 21054 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 115.75-79 chr17 17509854 17510289 + 0.5 NA intron (NM_148173, intron 4 of 6) intron (NM_148173, intron 4 of 6) -13676 NM_016084 51655 Hs.25829 NM_016084 ENSG00000108551 RASD1 AGS1|DEXRAS1|MGC:26290 ras related dexamethasone induced 1 protein-coding 205.25-36 chr16 89701071 89701666 + 0.5 NA intron (NM_152339, intron 1 of 2) CpG-10271 337 NM_152339 124044 Hs.374556 NM_152339 ENSG00000158792 SPATA2L C16orf76|tamo spermatogenesis associated 2 like protein-coding 131-22 chr10 81094961 81095371 + 0.5 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 445369 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 202.25-14 chr10 74129947 74130684 + 0.5 NA intron (NM_207012, intron 5 of 9) intron (NM_207012, intron 5 of 9) 20513 NM_207012 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 116.25-61 chr14 35598966 35599247 + 0.5 NA intron (NM_014990, intron 35 of 40) L1MDa|LINE|L1 64942 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 145-14 chr1 192860371 192860698 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 51495 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 119.75-109 chr2 119430542 119430886 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1140 NM_183240 140738 Hs.26216 NM_183240 ENSG00000171227 TMEM37 PR|PR1 transmembrane protein 37 protein-coding 160.25-115 chr4 128125395 128125881 + 0.5 NA intron (NR_146772, intron 11 of 19) AluSc|SINE|Alu 64326 NM_001278604 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 124.5-97 chr2 11656038 11656335 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 14009 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 134.5-78 chr15 70883377 70883747 + 0.5 NA intron (NM_020147, intron 1 of 2) intron (NM_020147, intron 1 of 2) 8871 NM_020147 56906 Hs.591123 NM_020147 ENSG00000129028 THAP10 - THAP domain containing 10 protein-coding 115.75-37 chr12 5293738 5294130 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50783 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 122.75-66 chr17 52315385 52315761 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -74949 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 174.75-86 chr3 173496156 173496562 + 0.5 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) -88075 NM_001365933 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 137.5-229 chr8 27074669 27075143 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25943 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 125.25-133 chr3 53832090 53832571 + 0.5 NA intron (NM_018397, intron 2 of 8) AluY|SINE|Alu 14089 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 151.25-148 chr5 13446476 13446861 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -413782 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 150-144 chr8 60634319 60634722 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44220 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 127.5-237 chr8 68864716 68864990 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 239337 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 138.5-170 chr6 45907188 45907661 + 0.5 NA intron (NM_001114086, intron 5 of 5) L1PA16|LINE|L1 30173 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 120.75-10 chr1 208900311 208900674 + 0.5 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -71962 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 125.5-111 chr17 75127524 75128011 + 0.5 NA intron (NM_024585, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 3975 NM_014595 30833 Hs.67201 NM_014595 ENSG00000125458 NT5C DNT|DNT1|HEL74|P5N2|PN-I|PN-II|UMPH2|cdN|dNT-1 5', 3'-nucleotidase, cytosolic protein-coding 141.75-159 chr7 17793628 17794047 + 0.5 NA non-coding (NR_146932, exon 25 of 25) non-coding (NR_146932, exon 25 of 25) 146657 NM_001350867 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 134-158 chr6 159261937 159262372 + 0.5 NA intron (NM_032532, intron 19 of 22) intron (NM_032532, intron 19 of 22) -92147 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 132.75-38 chr11 73530717 73531149 + 0.5 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) intron (NM_001286051, intron 1 of 5) 67179 NM_001286050 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 151.25-154 chr5 66128432 66128917 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -15626 NM_001323529 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 143.25-24 chr11 17197159 17197518 + 0.5 NA intron (NM_002645, intron 1 of 32) intron (NM_002645, intron 1 of 32) 10648 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 158.75-71 chr17 52261937 52262402 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -102152 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 153.25-26 chr11 115165157 115165566 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168216 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 146.75-106 chr3 139925329 139925781 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -9630 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 118.75-120 chr22 19864693 19864948 + 0.5 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -9946 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 144.75-105 chr22 24062649 24063112 + 0.5 NA intron (NM_012295, intron 13 of 36) intron (NM_012295, intron 13 of 36) 51510 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 115.5-130 chr2 108540409 108540751 + 0.5 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) intron (NM_001193483, intron 1 of 9) 6225 NM_001193483 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 122.5-27 chr10 90821052 90821475 + 0.5 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) L1M1|LINE|L1 36776 NM_019860 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 134.5-189 chr6 56524849 56525285 + 0.5 NA intron (NM_001144770, intron 61 of 94) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 117822 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 190.25-120 chr8 49059791 49060324 + 0.5 NA intron (NM_001256596, intron 1 of 4) intron (NM_001256596, intron 1 of 4) 5721 NM_001256596 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 141-32 chr11 90180509 90180951 + 0.5 NA intron (NM_001300930, intron 15 of 17) intron (NM_001300930, intron 15 of 17) 42319 NM_012124 26973 Hs.22857 NM_012124 ENSG00000110172 CHORDC1 CHP1 cysteine and histidine rich domain containing 1 protein-coding 145-167 chr9 90546996 90547427 + 0.5 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) intron (NR_034157, intron 1 of 5) 35535 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 152.75-55 chr14 67021323 67021720 + 0.5 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -167919 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 115.25-129 chr3 24196349 24196641 + 0.5 NA intron (NM_001354714, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 45171 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 122-79 chr18 27805317 27805661 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 231152 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 154-42 chr14 98855579 98856075 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 144214 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 117.25-132 chr21 38401565 38401884 + 0.5 NA intron (NM_001243432, intron 7 of 11) intron (NM_001243432, intron 7 of 11) -55648 NR_110545 102724678 Hs.635675 NR_110545 LINC01423 - long intergenic non-protein coding RNA 1423 ncRNA 130.5-88 chr14 44985317 44985836 + 0.5 NA intron (NR_131765, intron 1 of 19) MER1B|DNA|hAT-Charlie 23386 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 122.5-112 chr2 117120730 117121023 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -693815 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 117.25-168 chr5 38968521 38968969 + 0.5 NA intron (NM_001285439, intron 11 of 38) AluJr4|SINE|Alu 105654 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 129.5-87 chr16 6196381 6196693 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 176834 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 139.5-33 chr11 91911328 91911694 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -313523 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 119.25-22 chr10 61860111 61860573 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -41357 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 203-41 chr17 34271863 34272566 + 0.5 NA TTS (NM_006273) TTS (NM_006273) 1993 NM_006273 6354 Hs.251526 NM_006273 ENSG00000108688 CCL7 FIC|MARC|MCP-3|MCP3|NC28|SCYA6|SCYA7 C-C motif chemokine ligand 7 protein-coding 141.5-233 chr8 118347463 118347887 + 0.5 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) MER103C|DNA|hAT-Charlie -235856 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 133-124 chr4 58476349 58476845 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59731 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 138.5-97 chr2 31025772 31026237 + 0.5 NA intron (NM_024572, intron 1 of 14) MLT2C1|LTR|ERVL 103636 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 150.5-206 chr7 38134860 38135337 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -43147 NM_001363345 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 136.5-229 chr8 92001629 92002098 + 0.5 NA intron (NM_004349, intron 5 of 10) intron (NM_004349, intron 5 of 10) 15817 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 128.5-236 chr9 37539858 37540218 + 0.5 NA intron (NM_012166, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 36342 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 145.5-34 chr11 74824906 74825289 + 0.5 NA intron (NM_001098638, intron 4 of 5) L1PA11|LINE|L1 76248 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 140-117 chr3 149542443 149542943 + 0.5 NA intron (NM_001348362, intron 6 of 9) intron (NM_001348362, intron 6 of 9) 67996 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 118-21 chr10 119963104 119963478 + 0.5 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 4778 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 115.5-240 chr8 65153735 65154161 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 26392 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 141-170 chrX 105647607 105648091 + 0.5 NA intron (NM_017416, intron 6 of 10) LTR16B2|LTR|ERVL -174690 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 129.25-74 chr18 21359171 21359551 + 0.5 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) AluSx1|SINE|Alu 117119 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 142.75-86 chr18 6933627 6934045 + 0.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -3967 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 120.25-76 chr18 9479001 9479441 + 0.5 NA intron (NM_006788, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 3708 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 120.5-49 chr12 4466291 4466587 + 0.5 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -20825 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 122.25-186 chr8 68542909 68543257 + 0.5 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) intron (NR_146186, intron 7 of 12) -211592 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 139.25-173 chr7 37187159 37187457 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) L1MB8|LINE|L1 166360 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 219.25-2 chr1 49423876 49424467 + 0.5 NA intron (NR_046839, intron 2 of 3) intron (NR_046839, intron 2 of 3) 47914 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 187.25-40 chr17 47748404 47748968 + 0.5 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 15450 NM_013351 30009 Hs.272409 NM_013351 ENSG00000073861 TBX21 T-PET|T-bet|TBET|TBLYM T-box transcription factor 21 protein-coding 155.75-36 chr12 11441205 11441600 + 0.5 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) L1MB2|LINE|L1 45276 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 143-47 chr16 52321641 52322068 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63290 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 126.75-245 chr8 106397860 106398169 + 0.5 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -49910 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 132-116 chr3 123181070 123181461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19471 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 160.25-67 chr2 26017938 26018408 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15911 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 115.25-211 chr8 110609009 110609281 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 418288 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 190.25-102 chr5 133102110 133102684 + 0.5 NA intron (NM_002154, intron 17 of 18) intron (NM_002154, intron 17 of 18) 50384 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 138.25-43 chr13 43976392 43976839 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -45720 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 121-17 chr10 12015306 12015660 + 0.5 NA intron (NM_080599, intron 3 of 21) AluSx1|SINE|Alu 27326 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 130.25-7 chr1 83536986 83537303 + 0.5 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 91090 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 172-112 chr9 95527051 95527447 + 0.5 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie -10192 NM_001083602 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 119.25-70 chr16 12255412 12255799 + 0.5 NA intron (NM_032167, intron 14 of 20) L1MA9|LINE|L1 278871 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 161.25-185 chr9 93466364 93466820 + 0.5 NA intron (NM_001286723, intron 1 of 9) L1MC4a|LINE|L1 -12991 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 184.25-42 chr16 66569033 66569531 + 0.5 NA intron (NM_052999, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 2843 NM_181296 113540 Hs.15159 NM_052999 ENSG00000089505 CMTM1 CKLFH|CKLFH1|CKLFSF1 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1 protein-coding 143.5-203 chr8 8623301 8623808 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -78383 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 126.5-122 chr2 129172692 129173009 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 101041 NR_122041 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 151.5-144 chr4 120722534 120723075 + 0.5 NA intron (NM_001300824, intron 12 of 13) intron (NM_001300824, intron 12 of 13) 200062 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 165.25-2 chr1 63069039 63069536 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56816 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 156-9 chr1 180977552 180977967 + 0.5 NA intron (NM_005819, intron 7 of 7) intron (NM_005819, intron 7 of 7) -22872 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 135-62 chr17 70693572 70693944 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 508421 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 125.5-136 chr2 182301373 182301811 + 0.5 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -59529 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 146-38 chr14 25248768 25249188 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -198681 NM_001351941 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 117.25-196 chr7 27085396 27085741 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 10432 NM_153620 3198 Hs.67397 NM_005522 ENSG00000105991 HOXA1 BSAS|HOX1|HOX1F homeobox A1 protein-coding 173-19 chr10 93247258 93247821 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 173646 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 144.25-189 chr7 83142680 83143018 + 0.5 NA intron (NM_033026, intron 2 of 24) AluSx|SINE|Alu 20035 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 143.5-144 chr3 86464121 86464591 + 0.5 NA Intergenic (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17587 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 129-74 chr16 58167660 58168019 + 0.5 NA intron (NM_001896, intron 6 of 11) intron (NM_001896, intron 6 of 11) 30267 NM_001896 1459 Hs.82201 NM_001896 ENSG00000070770 CSNK2A2 CK2A2|CK2alpha'|CSNK2A1 casein kinase 2 alpha 2 protein-coding 132.5-173 chr3 161594329 161594620 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 97666 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 134.75-142 chr3 72288965 72289352 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 137901 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 116-157 chr7 93685719 93685999 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -31069 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 149-3 chr1 81472989 81473465 + 0.5 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) 84475 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 228.75-78 chr8 88844498 88845152 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -517342 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 130.25-89 chr2 3072414 3072882 + 0.5 NA intron (NR_110228, intron 3 of 6) intron (NR_110228, intron 3 of 6) 53378 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 171.25-129 chr5 140207920 140208359 + 0.5 NA intron (NM_032412, intron 2 of 2) L1MA2|LINE|L1 32951 NM_032412 84418 Hs.529798 NM_032412 ENSG00000120306 CYSTM1 C5orf32|ORF1-FL49 cysteine rich transmembrane module containing 1 protein-coding 150.75-68 chr15 77471112 77471524 + 0.5 NA intron (NM_001304505, intron 5 of 9) intron (NM_001304505, intron 5 of 9) 50430 NM_001304504 10363 Hs.69594 NM_018200 ENSG00000140382 HMG20A HMGX1|HMGXB1 high mobility group 20A protein-coding 167-71 chr21 31886490 31886906 + 0.5 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) AluSq|SINE|Alu 13678 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 170.25-163 chr9 94193568 94194199 + 0.5 NA intron (NR_160773, intron 2 of 2) L1PB3|LINE|L1 10683 NR_046163 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 212-20 chr13 40974419 40975105 + 0.5 NA intron (NM_001370329, intron 2 of 9) intron (NM_001370329, intron 2 of 9) 7520 NM_001145353 1997 Hs.135646 NM_172373 ENSG00000120690 ELF1 EFTUD1|RIA1 E74 like ETS transcription factor 1 protein-coding 269.5-21 chr18 6785840 6786616 + 0.5 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -48257 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 114.25-87 chr2 19602247 19602666 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -243833 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 117.75-130 chr3 14432136 14432588 + 0.5 NA intron (NM_001134367, intron 2 of 14) intron (NM_001134367, intron 2 of 14) 29756 NR_103507 6533 Hs.529488 NM_003043 ENSG00000131389 SLC6A6 TAUT solute carrier family 6 member 6 protein-coding 117.75-159 chr4 98342202 98342559 + 0.5 NA intron (NM_021159, intron 2 of 14) intron (NM_021159, intron 2 of 14) 80996 NM_001100428 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 140.25-32 chr11 31240954 31241484 + 0.5 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) intron (NM_001367979, intron 9 of 38) 128520 NM_001367979 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 122-152 chr6 9410133 9410600 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 758157 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 133.25-169 chr5 34599396 34599865 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56698 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 144-131 chr8 87250613 87251135 + 0.5 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) L1MA4|LINE|L1 384459 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 137.75-85 chr17 40244540 40245089 + 0.5 NA intron (NM_133264, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 25510 NM_133264 147179 Hs.421622 NM_133264 ENSG00000171475 WIPF2 WICH|WIRE WAS/WASL interacting protein family member 2 protein-coding 120.5-208 chr7 2874240 2874598 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -30111 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 222-5 chr1 113397075 113397848 + 0.5 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 6946 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 124.25-148 chr4 76904440 76904892 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6522 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 137.25-84 chr20 38171028 38171405 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4708 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 200.5-6 chr1 93301449 93301989 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 44092 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 121.75-47 chr14 70145998 70146441 + 0.5 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -40889 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 136.5-134 chr20 52388506 52389009 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -196772 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 116.25-215 chr7 81097789 81098247 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -175629 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 151.5-81 chr2 51413293 51413788 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) intron (NR_135237, intron 4 of 10) 380939 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 163.75-116 chr7 27237003 27237643 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5479 NM_001304520 2128 Hs.369879 NM_001989 ENSG00000106038 EVX1 EVX-1 even-skipped homeobox 1 protein-coding 116.5-23 chr10 51757333 51757722 + 0.5 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -57932 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 127.75-92 chr2 34034145 34034536 + 0.5 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) MLT2B3|LTR|ERVL -32886 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 167.75-132 chr7 48213098 48213560 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 3 of 61) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 41871 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 139-41 chr14 67292624 67293083 + 0.5 NA intron (NM_001256550, intron 4 of 14) intron (NM_001256550, intron 4 of 14) 51418 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 112.5-100 chr18 35074005 35074344 + 0.5 NA intron (NM_001143827, intron 3 of 7) intron (NM_001143827, intron 3 of 7) 32761 NM_001256420 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 150.25-120 chr5 23240036 23240499 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -267342 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 134.25-197 chr9 26583652 26583971 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 308991 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 139.75-135 chr4 68277660 68278038 + 0.5 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -32155 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 134.25-116 chr3 95093668 95094029 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 155585 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 148.75-108 chr3 11814114 11814560 + 0.5 NA intron (NR_135610, intron 7 of 10) HAL1|LINE|L1 32548 NM_001284401 132001 Hs.475472 NM_138807 ENSG00000144559 TAMM41 C3orf31|RAM41|TAM41 TAM41 mitochondrial translocator assembly and maintenance homolog protein-coding 159.5-140 chr3 18655586 18656152 + 0.5 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -210277 NM_001322872 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 147-36 chr15 33582598 33583084 + 0.5 NA intron (NM_001243996, intron 14 of 102) intron (NM_001243996, intron 14 of 102) 271874 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 138.75-186 chr7 109627198 109627543 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 332843 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 128.25-52 chr14 65177033 65177397 + 0.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 45132 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 128.75-55 chr14 31677451 31677885 + 0.5 NA intron (NR_120408, intron 6 of 9) L1M1|LINE|L1 -36901 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 132.75-155 chr5 119216403 119216748 + 0.5 NA intron (NM_001290321, intron 34 of 43) intron (NM_001290321, intron 34 of 43) -52184 NM_001077654 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 137.5-206 chr6 43332024 43332563 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -23467 NM_206922 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 157-6 chr1 173208167 173208552 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1028 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 133.5-112 chr2 58846579 58846946 + 0.5 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 326009 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 137.25-163 chr8 74064729 74065261 + 0.5 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 73603 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 167-55 chr18 6520567 6521025 + 0.5 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 9380 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 150.25-113 chr4 96699966 96700380 + 0.5 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 389470 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 116.5-124 chr2 117231576 117232008 + 0.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -582899 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 145.75-141 chr6 153428149 153428529 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -297057 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 149.25-196 chr9 123993691 123994083 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 15509 NR_135129 100505588 Hs.547168 NR_135129 ENSG00000236668 LOC100505588 - uncharacterized LOC100505588 ncRNA 123-14 chr1 206514405 206514791 + 0.5 NA intron (NM_182664, intron 1 of 4) intron (NM_182664, intron 1 of 4) 7067 NM_182664 83593 Hs.497579 NM_031437 ENSG00000266094 RASSF5 Maxp1|NORE1|NORE1A|NORE1B|RAPL|RASSF3 Ras association domain family member 5 protein-coding 184.75-97 chr7 80385464 80386000 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11293 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 122-49 chr12 53885228 53885704 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53365 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 134.75-20 chr1 240627564 240628088 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15671 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 166.25-21 chr1 247309711 247310130 + 0.5 NA intron (NM_001329733, intron 7 of 9) intron (NM_001329733, intron 7 of 9) 21947 NM_032752 84838 Hs.168677 NM_032752 ENSG00000162714 ZNF496 NIZP1|ZFP496|ZKSCAN17|ZSCAN49 zinc finger protein 496 protein-coding 115.75-101 chr2 66035876 66036252 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 322264 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 113.25-44 chr14 53592545 53592930 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 355747 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 135.25-59 chr13 25536391 25536892 + 0.5 NA intron (NM_016529, intron 6 of 36) intron (NM_016529, intron 6 of 36) 67867 NM_001313741 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 125.75-113 chr20 48406839 48407253 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 47135 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 191.25-40 chr16 63084998 63085576 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1048849 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 115.25-146 chr4 61233469 61233751 + 0.5 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 31438 NM_001371342 159.5-106 chr2 83751669 83752037 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 229039 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 133.25-196 chr7 21374635 21374970 + 0.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -53281 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 129.5-232 chr8 127002129 127002551 + 0.5 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -10814 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 144-45 chr16 12683681 12684164 + 0.5 NA intron (NM_001099455, intron 2 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -36399 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 115.75-42 chr12 42948039 42948295 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -207148 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 160-74 chr4 42422802 42423269 + 0.5 NA intron (NM_001105529, intron 33 of 35) intron (NM_001105529, intron 33 of 35) 25547 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 148.5-16 chr1 205336928 205337241 + 0.5 NA 3' UTR (NM_018203, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_018203, exon 6 of 6) -15339 NM_030952 81788 Hs.497512 NM_030952 ENSG00000163545 NUAK2 SNARK NUAK family kinase 2 protein-coding 144.25-29 chr10 76319140 76319534 + 0.5 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 536576 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 176.5-181 chr8 137456082 137456487 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -42696 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 130-89 chr20 1651224 1651682 + 0.5 NA intron (NM_018556, intron 1 of 5) MER88|LTR|ERVL 6326 NM_080816 55423 Hs.590883 NM_018556 ENSG00000089012 SIRPG CD172g|SIRP-B2|SIRPB2|SIRPgamma|bA77C3.1 signal regulatory protein gamma protein-coding 145.75-16 chr10 88823905 88824408 + 0.5 NA intron (NM_144590, intron 4 of 5) intron (NM_144590, intron 4 of 5) 21426 NM_001128215 340654 Hs.55118 NM_001128215 ENSG00000173239 LIPM LIPL3|bA304I5.1 lipase family member M protein-coding 121.25-173 chr5 171999500 171999925 + 0.5 NA intron (NM_012300, intron 1 of 12) intron (NM_012300, intron 1 of 12) 7161 NM_012300 23291 Hs.484138 NM_012300 ENSG00000072803 FBXW11 BTRC2|BTRCP2|FBW1B|FBXW1B|Fbw11|Hos F-box and WD repeat domain containing 11 protein-coding 147-111 chr5 110404905 110405399 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 108763 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 128.5-206 chr7 40416193 40416528 + 0.5 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 281384 NM_001193312 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 144.5-49 chr12 25724212 25724731 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75893 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 175.25-63 chr2 22703243 22703885 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 167085 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 135.75-46 chr12 65522886 65523300 + 0.5 NA intron (NR_120431, intron 2 of 3) intron (NR_120431, intron 2 of 3) 34218 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 147.75-46 chr16 57830882 57831303 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20455 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 131.75-24 chr10 16150159 16150585 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -286571 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 126.75-5 chr1 98902671 98903144 + 0.5 NA intron (NM_001010861, intron 5 of 5) intron (NM_001010861, intron 5 of 5) -101369 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 118.5-135 chr3 150265953 150266302 + 0.5 NA intron (NR_110186, intron 3 of 3) ORSL|DNA|hAT-Tip100 27427 NR_110167 101927992 Hs.534682 NR_110167 ENSG00000244541 LINC01213 - long intergenic non-protein coding RNA 1213 ncRNA 121.75-181 chr7 85165772 85166132 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44021 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 143.75-62 chr17 16627940 16628501 + 0.5 NA intron (NM_020787, intron 5 of 5) AluSz6|SINE|Alu 25630 NM_020787 57547 Hs.128078 NM_020787 ENSG00000197566 ZNF624 - zinc finger protein 624 protein-coding 112.75-177 chr6 53565508 53565770 + 0.5 NA intron (NR_110840, intron 2 of 3) intron (NR_110840, intron 2 of 3) 7636 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 123.75-55 chr14 34318883 34319176 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 143211 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 124.75-91 chr15 90612701 90613112 + 0.5 NA intron (NM_001042574, intron 6 of 14) intron (NM_001042574, intron 6 of 14) -47328 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 124.75-157 chr4 79953733 79954057 + 0.5 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 119334 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 190.25-67 chr2 115706581 115707097 + 0.5 NA intron (NM_001321912, intron 8 of 25) intron (NM_001321912, intron 8 of 25) 363024 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 159-8 chr10 5929547 5930113 + 0.5 NA intron (NM_178150, intron 19 of 20) intron (NM_178150, intron 19 of 20) 35444 NM_032807 84893 Hs.498543 NM_032807 ENSG00000134452 FBH1 FBXO18|Fbx18|hFBH1 F-box DNA helicase 1 protein-coding 118.75-37 chr11 83490115 83490424 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 21 of 27) L1MC4|LINE|L1 192156 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 119.5-152 chr3 94712409 94712801 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -225658 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 159.75-132 chr5 39602618 39603060 + 0.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 82408 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 128.75-57 chr14 55355145 55355465 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56553 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 164-149 chr9 85931729 85932286 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9135 NM_001321881 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 148.5-109 chr2 143554476 143554961 + 0.5 NA intron (NM_018460, intron 10 of 13) intron (NM_018460, intron 10 of 13) -382349 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 158-152 chr9 78911823 78912450 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 233530 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 169-86 chr6 64054319 64054772 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) intron (NM_001292009, intron 33 of 43) 247709 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 156.5-153 chr5 105505250 105505625 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 405963 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 130.5-81 chr12 92251375 92251747 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 105476 NR_135037 101928617 Hs.434392 NR_135036 LOC101928617 - uncharacterized LOC101928617 ncRNA 119.75-40 chr12 14873034 14873490 + 0.5 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 12592 NM_000900 4256 Hs.365706 NM_000900 ENSG00000111341 MGP GIG36|MGLAP|NTI matrix Gla protein protein-coding 118.5-27 chr10 98611781 98612183 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 9 of 11) intron (NM_021828, intron 9 of 11) -165019 NM_001322480 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 116.25-209 chr7 26731160 26731520 + 0.5 NA intron (NM_003930, intron 6 of 12) intron (NM_003930, intron 6 of 12) 93469 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 119.5-94 chr16 78974902 78975166 + 0.5 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 625703 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 123.25-99 chr2 48756694 48757131 + 0.5 NA intron (NM_001198593, intron 10 of 10) intron (NM_001198593, intron 10 of 10) -1188 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 129.25-214 chr9 27632785 27633114 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -59083 NM_145005 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 122.5-140 chr22 26564039 26564497 + 0.5 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) intron (NM_001362923, intron 1 of 7) 1073 NM_001008566 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 169.5-4 chr1 63421895 63422486 + 0.5 NA intron (NM_013339, intron 12 of 14) (TATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 54563 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 160.25-166 chr9 32527431 32527836 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -1437 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 152.5-125 chr3 188806233 188806617 + 0.5 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) L1MCc|LINE|L1 117644 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 124.75-66 chr13 23571751 23572181 + 0.5 NA intron (NM_001204459, intron 1 of 7) intron (NM_001204459, intron 1 of 7) 1554 NM_148957 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 134-180 chr9 16126406 16126821 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 126494 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 119-150 chr5 118669853 118670209 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 73843 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 139.25-171 chr7 26913602 26914048 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -49235 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 116-115 chr4 45949228 45949526 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 174677 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 194.25-100 chr6 13537980 13538636 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -36221 NM_001193267 23408 Hs.567431 NM_012241 ENSG00000124523 SIRT5 SIR2L5 sirtuin 5 protein-coding 129-124 chr3 182932764 182933172 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 47570 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 123-27 chr10 99251073 99251347 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -15335 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 141-149 chr7 89108378 89108825 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -312864 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 128.5-146 chr3 80168723 80169068 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -400897 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 181.75-120 chr7 50369484 50369924 + 0.5 NA TTS (NM_001291845) TTS (NM_001291845) 50656 NM_001291843 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 159.25-145 chr8 33388142 33388487 + 0.5 NA intron (NM_032664, intron 4 of 4) intron (NM_032664, intron 4 of 4) 84832 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 116-134 chr5 154569735 154570131 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 26139 NR_036094 100422950 NR_036094 ENSG00000264760 MIR3141 mir-3141 microRNA 3141 ncRNA 115.5-30 chr11 5459768 5460116 + 0.5 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) L1PREC2|LINE|L1 6534 NM_001004754 390064 Hs.553733 NM_001004754 ENSG00000187918 OR51I2 OR11-38 olfactory receptor family 51 subfamily I member 2 protein-coding 127-185 chr9 81489480 81489835 + 0.5 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 199878 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 124.25-124 chr22 27519719 27520158 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 209287 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 113-178 chr8 102956097 102956483 + 0.5 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu -64793 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 132.5-47 chr12 1092331 1092758 + 0.5 NA intron (NR_027948, intron 3 of 19) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 64796 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 144.25-23 chr10 24450408 24450798 + 0.5 NA intron (NM_001321681, intron 1 of 13) intron (NM_001321681, intron 1 of 13) 1189 NM_001321681 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 124.25-138 chr3 110975459 110975831 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 94314 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 160-50 chr19 37341763 37342253 + 0.5 NA intron (NR_138117, intron 2 of 5) MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 7359 NM_001329779 284459 Hs.640243 NM_181786 ENSG00000181666 ZNF875 HKR1 zinc finger protein 875 protein-coding 118.25-63 chr14 50088417 50088779 + 0.5 NA intron (NR_131171, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 16445 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 119.75-102 chr2 73242879 73243175 + 0.5 NA exon (NM_006429, exon 4 of 12) exon (NM_006429, exon 4 of 12) 8719 NM_006429 10574 Hs.368149 NM_006429 ENSG00000135624 CCT7 CCTETA|CCTH|NIP7-1|TCP1ETA chaperonin containing TCP1 subunit 7 protein-coding 152.5-111 chr22 46157235 46157783 + 0.5 NA intron (NM_001001928, intron 2 of 7) intron (NM_001001928, intron 2 of 7) 6714 NM_001362873 5465 Hs.103110 NM_005036 ENSG00000186951 PPARA NR1C1|PPAR|PPARalpha|hPPAR peroxisome proliferator activated receptor alpha protein-coding 172.25-33 chr13 30178127 30178617 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25298 NR_138041 102157400 Hs.639879 NR_138041 LINC00384 - long intergenic non-protein coding RNA 384 ncRNA 142.5-19 chr1 201815199 201815574 + 0.5 NA intron (NM_020443, intron 28 of 29) L1MA8|LINE|L1 6775 NR_031599 100302158 NR_031599 ENSG00000221028 MIR1231 MIRN1231|hsa-mir-1231 microRNA 1231 ncRNA 145.5-176 chr6 126874618 126875022 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -243851 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 123-128 chr3 22331473 22331865 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 374530 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 191-37 chr2 104431825 104432271 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2299 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 118.5-70 chr17 47902144 47902544 + 0.5 NA intron (NR_103856, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 6108 NM_003110 6668 Hs.514276 NM_003110 ENSG00000167182 SP2 - Sp2 transcription factor protein-coding 128.5-191 chr6 61214025 61214419 + 0.5 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 -359908 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 133.25-81 chr18 7733672 7734192 + 0.5 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) MER61C|LTR|ERV1 166616 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 167-51 chr17 71482558 71482999 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -280599 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 113.25-133 chr5 32298355 32298626 + 0.5 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) intron (NM_001294344, intron 1 of 13) 14449 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 174.25-106 chr3 180851484 180851941 + 0.5 NA intron (NR_109986, intron 1 of 13) L1MEc|LINE|L1 18466 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 122.5-162 chr4 2728359 2728709 + 0.5 NA intron (NM_001256668, intron 19 of 19) LTR39-int|LTR|ERV1 27802 NM_024309 79155 Hs.368551 NM_024309 ENSG00000168884 TNIP2 ABIN2|FLIP1|KLIP TNFAIP3 interacting protein 2 protein-coding 122.5-157 chr3 138719631 138720004 + 0.5 NA intron (NM_006219, intron 8 of 23) intron (NM_006219, intron 8 of 23) -12196 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 168.5-6 chr1 83085995 83086525 + 0.5 NA non-coding (NR_147074, exon 7 of 11) non-coding (NR_147074, exon 7 of 11) -100052 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 120.5-222 chr7 145301544 145301958 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -465698 NR_146934 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 127.5-197 chr5 114125743 114126075 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -236161 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 113.75-55 chr14 29599157 29599464 + 0.5 NA intron (NM_001330069, intron 15 of 18) intron (NM_001330069, intron 15 of 18) 327786 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 119.25-82 chr18 22672519 22672946 + 0.5 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 114105 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 172.25-74 chr2 183580743 183581280 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 456568 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 154.5-65 chr14 85214185 85214540 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -57570 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 150-112 chr4 151635119 151635549 + 0.5 NA intron (NM_001109977, intron 8 of 13) L1MB2|LINE|L1 125673 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 129.75-89 chr2 21754247 21754652 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -43797 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 155.25-55 chr14 32172456 32172972 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -29331 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 117.25-150 chr3 189627861 189628284 + 0.5 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 -3317 NM_001329144 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 129.25-10 chr1 164044680 164045180 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -514430 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 133.5-182 chr4 63882481 63882856 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 526782 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 117.25-159 chr4 108349436 108349821 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 177508 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 150.75-150 chr5 68241364 68241776 + 0.5 NA intron (NM_181523, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR 25814 NM_181523 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 125.75-107 chr2 199133608 199133972 + 0.5 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 324149 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 133.5-274 chr9 381131 381567 + 0.5 NA intron (NM_001193536, intron 20 of 46) intron (NM_001193536, intron 20 of 46) -88942 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 116.75-83 chr19 36663143 36663479 + 0.5 NA intron (NM_001322821, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 3526 NM_001322825 92283 Hs.590972 NM_153257 ENSG00000197808 ZNF461 GIOT-1|GIOT1|HZF28 zinc finger protein 461 protein-coding 144-99 chr5 38546723 38547039 + 0.5 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) intron (NM_002310, intron 1 of 19) 9765 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 145.5-20 chr10 31525676 31526168 + 0.5 NA intron (NM_001323638, intron 12 of 12) intron (NM_001323638, intron 12 of 12) -126167 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 155-108 chr5 23101318 23101839 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -248234 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 127-102 chr2 121411150 121411528 + 0.5 NA intron (NM_001207051, intron 22 of 37) intron (NM_001207051, intron 22 of 37) -119541 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 149.75-24 chr11 46238392 46238906 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39013 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 173.25-88 chr4 88275847 88276219 + 0.5 NA intron (NM_152542, intron 3 of 6) intron (NM_152542, intron 3 of 6) 8528 NM_152542 152926 Hs.43744 NM_152542 ENSG00000163644 PPM1K BDP|MSUDMV|PP2Ckappa|PP2Cm|PTMP|UG0882E07 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1K protein-coding 145.5-182 chr7 91277168 91277642 + 0.5 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 12972 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 142.25-71 chr17 69166563 69166963 + 0.5 NA intron (NM_080282, intron 26 of 39) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -24868 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 138.5-105 chr2 66286484 66286907 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 71633 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 116.25-27 chr10 112621194 112621607 + 0.5 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) -12770 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 188.25-104 chr7 23290398 23290870 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8705 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 155-73 chr2 231126112 231126576 + 0.5 NA intron (NM_001191037, intron 16 of 23) AluJb|SINE|Alu -1302 NM_000867 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 117.5-44 chr11 80782779 80783227 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -20200 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 133.5-86 chr14 85559260 85559628 + 0.5 NA intron (NR_144387, intron 3 of 4) intron (NR_144387, intron 3 of 4) 26095 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 135.5-149 chr4 61031047 61031527 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 108668 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 125.5-247 chr8 56111450 56111849 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 2333 NM_005372 4342 Hs.533432 NM_005372 ENSG00000172680 MOS MSV MOS proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 127.25-18 chr10 48186331 48186757 + 0.5 NA intron (NM_001018071, intron 17 of 28) THE1A|LTR|ERVL-MaLR -11401 NM_001042512 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 127.75-205 chr9 68647409 68647791 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -57640 NM_003558 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 126.25-75 chr18 68015023 68015472 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -200425 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 130.5-105 chr16 50777702 50778057 + 0.5 NA exon (NM_001042412, exon 7 of 18) exon (NM_001042412, exon 7 of 18) -28793 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 115.25-224 chr9 76360226 76360585 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001190482, exon 37 of 37) 3' UTR (NM_001190482, exon 37 of 37) 34021 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 205.75-24 chr15 23469972 23470583 + 0.5 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -23034 NM_001304388 283685 NM_182561 ENSG00000174450 GOLGA6L2 CT105 golgin A6 family like 2 protein-coding 142.5-134 chr22 17714483 17714958 + 0.5 NA intron (NM_001270733, intron 1 of 1) intron (NM_001270733, intron 1 of 1) 8062 NM_001270733 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 136.5-20 chr10 36447880 36448254 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 669765 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 134.25-149 chr5 140646446 140646913 + 0.5 NA intron (NM_001185012, intron 2 of 2) intron (NM_001185012, intron 2 of 2) 1106 NR_033697 4695 Hs.75914 NM_002488 ENSG00000131495 NDUFA2 B8|CD14|CIB8|MC1DN13 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2 protein-coding 142-24 chr10 121266493 121266876 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 264630 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 119-189 chr7 130008652 130009074 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 42522 NM_001363701 51530 Hs.194157 NM_016478 ENSG00000091732 ZC3HC1 HSPC216|NIPA zinc finger C3HC-type containing 1 protein-coding 120.25-103 chr2 189474169 189474621 + 0.5 NA intron (NM_001303096, intron 20 of 21) intron (NM_001303096, intron 20 of 21) 32921 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 137.25-92 chr3 31816311 31816663 + 0.5 NA intron (NM_001174060, intron 3 of 10) intron (NM_001174060, intron 3 of 10) 112274 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-68 chr15 25632795 25633122 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -193902 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 113-152 chr5 129832648 129833065 + 0.5 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -71609 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 112.75-129 chr22 34157644 34158027 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -234947 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 121.25-56 chr14 54920571 54920935 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17927 NM_001024071 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 148-73 chr21 29940935 29941306 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1068 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 114.75-156 chr5 95951222 95951468 + 0.5 NA intron (NM_012081, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 10506 NM_012081 22936 Hs.192221 NM_012081 ENSG00000118985 ELL2 MRCCAT1 elongation factor for RNA polymerase II 2 protein-coding 129.25-22 chr10 74062452 74062813 + 0.5 NA intron (NM_014000, intron 2 of 21) AluJr|SINE|Alu 64516 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 115-178 chr8 73460139 73460465 + 0.5 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 40228 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 233.25-60 chr5 91532875 91533562 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -149901 NM_020801 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 191.5-98 chr3 100159149 100159766 + 0.5 NA intron (NM_001167924, intron 2 of 9) intron (NM_001167924, intron 2 of 9) -26367 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 121-10 chr1 110145114 110145530 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5172 NM_001010898 388662 Hs.128382 NM_001010898 ENSG00000197106 SLC6A17 MRT48|NTT4 solute carrier family 6 member 17 protein-coding 162-33 chr12 52711129 52711518 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7799 NM_175078 374454 Hs.334989 NM_175078 ENSG00000189182 KRT77 K1B|KRT1B keratin 77 protein-coding 123.75-10 chr1 151297618 151298005 + 0.5 NA intron (NM_001198773, intron 10 of 12) AluSq2|SINE|Alu 15512 NM_020832 57592 Hs.186756 NM_020832 ENSG00000143373 ZNF687 PDB6 zinc finger protein 687 protein-coding 117.25-5 chr1 49290150 49290563 + 0.5 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) intron (NR_136623, intron 2 of 12) 32945 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 144.75-128 chr4 188856761 188857262 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 80354 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 133-109 chr3 121824127 121824511 + 0.5 NA intron (NM_001023571, intron 5 of 11) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 10741 NM_001023570 9657 Hs.604110 NM_001023570 ENSG00000173226 IQCB1 NPHP5|PIQ|SLSN5 IQ motif containing B1 protein-coding 155-39 chr14 63408948 63409334 + 0.5 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) AluSx1|SINE|Alu -90206 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 141.5-85 chr18 73680902 73681415 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 356217 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 201.5-13 chr1 150020347 150021015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9955 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 137-39 chr12 16163851 16164382 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 113569 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 131.75-41 chr11 113619999 113620349 + 0.5 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 86134 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 133-2 chr1 44079709 44080067 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -38933 NM_173484 128209 Hs.567674 NM_173484 ENSG00000171872 KLF17 ZNF393|Zfp393 Kruppel like factor 17 protein-coding 117.75-83 chr17 61062397 61062747 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) intron (NM_001330413, intron 20 of 25) 305132 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 120.5-57 chr12 76265659 76266095 + 0.5 NA intron (NR_146531, intron 1 of 3) intron (NR_146531, intron 1 of 3) 5994 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 163.25-32 chr12 56282174 56282766 + 0.5 NA exon (NM_004077, exon 6 of 11) exon (NM_004077, exon 6 of 11) 15144 NM_001099337 93058 Hs.4096 NM_144576 ENSG00000135469 COQ10A - coenzyme Q10A protein-coding 123.75-136 chr4 82746280 82746693 + 0.5 NA intron (NM_001037582, intron 1 of 4) intron (NM_001037582, intron 1 of 4) 6944 NR_030301 693160 NR_030301 ENSG00000207746 MIR575 MIRN575|hsa-mir-575 microRNA 575 ncRNA 151.25-120 chr3 27466035 27466636 + 0.5 NA intron (NR_135542, intron 1 of 23) AluYe5|SINE|Alu -9557 NM_003615 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 205-53 chr3 135833794 135834377 + 0.5 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -131643 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 133.25-204 chr7 88466767 88467298 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -160138 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 115.75-225 chr8 134832115 134832405 + 0.5 NA Intergenic CpG -5809 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 113-67 chr15 59402151 59402532 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29470 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 149.5-192 chr7 106087513 106088015 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 24548 NM_182715 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 141-99 chr3 29599240 29599733 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) L1M6|LINE|L1 318174 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 130.75-134 chr4 29426916 29427421 + 0.5 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 212876 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 168.75-91 chr3 1295610 1296230 + 0.5 NA intron (NM_001349358, intron 8 of 20) intron (NM_001349358, intron 8 of 20) 202896 NM_001349360 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 112.75-13 chr1 161647259 161647707 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -15520 NM_000570 2215 Hs.372679 NM_000570 ENSG00000162747 FCGR3B CD16|CD16A|CD16b|FCG3|FCGR3|FCGR3A|FCR-10|FCRIII|FCRIIIb Fc fragment of IgG receptor IIIb protein-coding 139.75-189 chr9 94733498 94733868 + 0.5 NA intron (NM_001193331, intron 1 of 7) intron (NM_001193331, intron 1 of 7) 6984 NM_001193331 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 114.5-51 chr11 72558127 72558472 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12357 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 145.75 chr1 37583731 37584229 + 0.5 NA intron (NM_001323624, intron 4 of 14) intron (NM_001323624, intron 4 of 14) 11957 NM_013285 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 152.5-5 chr1 67907894 67908454 + 0.5 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR -74707 NM_018841 55970 Hs.431101 NM_018841 ENSG00000172380 GNG12 - G protein subunit gamma 12 protein-coding 120.25-227 chrX 13571647 13572114 + 0.5 NA intron (NM_015507, intron 1 of 11) intron (NM_015507, intron 1 of 11) 2279 NM_015507 25975 Hs.12844 NM_015507 ENSG00000198759 EGFL6 MAEG|W80 EGF like domain multiple 6 protein-coding 120.75-35 chr13 62003579 62003886 + 0.5 NA non-coding (NR_046995, exon 2 of 2) non-coding (NR_046995, exon 2 of 2) 25816 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 120.25-108 chr20 6401587 6401899 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -24989 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 118.75-214 chr9 117808754 117809073 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 104510 NM_138554 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 136.25-165 chr6 49006773 49007167 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 456283 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 133-153 chr7 23730974 23731502 + 0.5 NA intron (NM_031414, intron 6 of 23) intron (NM_031414, intron 6 of 23) 21019 NM_001260504 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 152.25-108 chr3 162486326 162486745 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 816766 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 178.75-118 chr9 119742897 119743443 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -191890 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 125.5-150 chr20 42034541 42034896 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -416341 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 145.5-186 chr7 126136699 126137128 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -872622 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 198.5-131 chr7 31632282 31632731 + 0.5 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) L3|LINE|CR1 -54511 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 124.25-133 chr3 86632880 86633208 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 151101 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 160.25-6 chr1 247335247 247335715 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3614 NM_001329733 84838 Hs.168677 NM_032752 ENSG00000162714 ZNF496 NIZP1|ZFP496|ZKSCAN17|ZSCAN49 zinc finger protein 496 protein-coding 154.5-105 chr2 142001821 142002297 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 129642 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 153.5-53 chr14 41627589 41628082 + 0.5 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 20979 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 157.25-36 chr13 48272246 48272824 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 31167 NR_046414 100862704 Hs.374221 NR_046414 ENSG00000231473 RB1-DT LINC00441|ncRNA-RB1 RB1 divergent transcript ncRNA 156.75-130 chr5 20647573 20647949 + 0.5 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) L1PA8A|LINE|L1 -32226 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 158.75-157 chr8 53192155 53192665 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 59227 NM_000912 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 150.5-85 chr2 11662525 11663073 + 0.5 NA intron (NM_012344, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 7396 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 185-93 chrX 20111981 20112475 + 0.5 NA intron (NM_152780, intron 1 of 15) intron (NM_152780, intron 1 of 15) 4412 NM_001168467 256714 Hs.127951 NM_152780 ENSG00000184368 MAP7D2 - MAP7 domain containing 2 protein-coding 131-149 chr6 157693528 157693967 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -129499 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 113.5-211 chr6 65542988 65543276 + 0.5 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) AluSx1|SINE|Alu 36672 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 144.75-63 chr16 2465736 2466225 + 0.5 NA non-coding (NR_135198, exon 1 of 1) non-coding (NR_135198, exon 1 of 1) 2013 NR_106826 102465460 NR_106826 ENSG00000274805 MIR6768 hsa-mir-6768 microRNA 6768 ncRNA 153-160 chr8 132758003 132758387 + 0.5 NA intron (NM_144649, intron 2 of 9) intron (NM_144649, intron 2 of 9) 2387 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 122-127 chr4 32118782 32119235 + 0.5 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) AluY|SINE|Alu -96586 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 172.75-17 chr10 104734266 104734934 + 0.5 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -68384 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 125-31 chr11 97446630 97447115 + 0.5 NA Intergenic LTR7C|LTR|ERV1 938447 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 159-84 chr5 19403111 19403470 + 0.5 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 482982 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 135.5-138 chr3 118545304 118545718 + 0.5 NA intron (NR_135547, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 -96257 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 153-47 chr15 71767609 71767988 + 0.5 NA intron (NM_001286429, intron 10 of 11) L1MC5|LINE|L1 -42756 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 217.5-34 chr12 53821287 53821940 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -64579 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 117.75-53 chr14 32730667 32730949 + 0.5 NA intron (NM_004274, intron 9 of 13) intron (NM_004274, intron 9 of 13) -208071 NM_173159 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 140.75-160 chr6 7901097 7901439 + 0.5 NA intron (NM_030810, intron 2 of 9) intron (NM_030810, intron 2 of 9) 8809 NM_001145549 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 128.75-75 chr17 60707217 60707710 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 29612 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 135.5-10 chr1 150385868 150386329 + 0.5 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) intron (NM_015203, intron 1 of 10) 21987 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 124.75-21 chr1 224126730 224127028 + 0.5 NA intron (NR_049764, intron 1 of 3) intron (NR_049764, intron 1 of 3) 12768 NM_015176 23219 Hs.64691 NM_015176 ENSG00000143756 FBXO28 CENP-30|Fbx28 F-box protein 28 protein-coding 186.25-76 chr3 186617932 186618474 + 0.5 NA intron (NM_001622, intron 4 of 6) intron (NM_001622, intron 4 of 6) 5143 NM_001354573 197 Hs.324746 NM_001622 ENSG00000145192 AHSG A2HS|AHS|APMR1|FETUA|HSGA alpha 2-HS glycoprotein protein-coding 202-50 chr4 142291069 142291759 + 0.5 NA intron (NM_001331040, intron 9 of 25) intron (NM_001331040, intron 9 of 25) 555121 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 125-169 chr9 98958654 98959061 + 0.5 NA intron (NM_001855, intron 2 of 41) intron (NM_001855, intron 2 of 41) 14950 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 139.25-52 chr14 64042434 64042818 + 0.5 NA intron (NM_015180, intron 45 of 114) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 52499 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 115.25-105 chr2 151685294 151685645 + 0.5 NA intron (NM_001271208, intron 27 of 182) intron (NM_001271208, intron 27 of 182) 49007 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 132.75-115 chr21 30166673 30167044 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_012131) promoter-TSS (NM_012131) -53 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 161.75-76 chr20 58989828 58990297 + 0.5 NA intron (NM_198976, intron 7 of 14) intron (NM_198976, intron 7 of 14) 8806 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 158.5-191 chr8 88291466 88291976 + 0.5 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 35762 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 159.5-98 chr2 52505328 52505794 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 134913 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 135.5-9 chr1 118137289 118137732 + 0.5 NA intron (NM_206996, intron 3 of 48) intron (NM_206996, intron 3 of 48) 47718 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 177.75-82 chr2 172628038 172628548 + 0.5 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 72203 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 173.75-109 chr3 108114586 108115158 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10192 NR_110030 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 154-73 chr2 120791795 120792251 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_005270) promoter-TSS (NM_005270) -258 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 113.25-142 chr5 127400537 127400957 + 0.5 NA intron (NM_001308121, intron 7 of 13) intron (NM_001308121, intron 7 of 13) 109951 NM_032446 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 137.75-176 chr6 49421725 49422192 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 41295 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 139.25-120 chr3 63331237 63331631 + 0.5 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 53126 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 141-23 chr10 32267458 32267985 + 0.5 NA TTS (NM_025209) TTS (NM_025209) 79437 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 112.75-85 chr19 29694411 29694765 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20468 NM_001031726 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 170.25-44 chr15 80941950 80942482 + 0.5 NA intron (NM_001293304, intron 26 of 29) intron (NM_001293304, intron 26 of 29) 47603 NR_126328 23184 Hs.578450 NM_015154 ENSG00000117899 MESD BOCA|MESDC2 mesoderm development LRP chaperone protein-coding 155.5 chr1 27507420 27507926 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17506 NM_006990 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 190.5-33 chr12 25473858 25474351 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 79179 NM_001256266 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 133-160 chr7 93769691 93770123 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 52979 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 117.75-11 chr1 147142310 147142667 + 0.5 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -28142 NR_103466 644861 Hs.451804 NR_103466 NBPF13P - NBPF member 13, pseudogene pseudo 116.25-7 chr1 51806082 51806486 + 0.5 NA intron (NM_001101662, intron 18 of 30) intron (NM_001101662, intron 18 of 30) 30118 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 112.75-202 chr8 124693716 124693992 + 0.5 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 34619 NM_001363300 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 174.5-59 chr14 33513759 33514159 + 0.5 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -194978 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 123.75-15 chr10 66249298 66249698 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MA2|LINE|L1 -676538 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 117.75-24 chr10 52905479 52905868 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -133973 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 182.5-167 chr8 130104099 130104598 + 0.5 NA intron (NM_018482, intron 24 of 29) LTR10C|LTR|ERV1 -19580 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 145-132 chr5 159147483 159147911 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 47214 NR_109890 101927740 Hs.738721 NR_109890 ENSG00000245812 LINC02202 - long intergenic non-protein coding RNA 2202 ncRNA 161-100 chr5 143025212 143025699 + 0.5 NA intron (NR_146198, intron 12 of 22) intron (NR_146198, intron 12 of 22) -156545 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 221.25-78 chr6 96094239 96095097 + 0.5 NA intron (NM_006581, intron 1 of 2) intron (NM_006581, intron 1 of 2) 78694 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 118-136 chr4 172469910 172470319 + 0.5 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 218803 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 127.25-14 chr10 16341518 16341994 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95187 NM_001261836 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 153.75-91 chr3 89927102 89927636 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 819748 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 113-190 chrX 109254192 109254456 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 227762 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 129.75-141 chr5 25005610 25006098 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165271 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 123.75-194 chr8 120539365 120539746 + 0.5 NA intron (NM_021021, intron 6 of 6) intron (NM_021021, intron 6 of 6) 94136 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 118.5-72 chr17 59817532 59817869 + 0.5 NA intron (NM_001329400, intron 7 of 9) intron (NM_001329400, intron 7 of 9) -23566 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 116.5-106 chr19 57970240 57970601 + 0.5 NA intron (NM_152474, intron 3 of 5) LTR24|LTR|ERV1 4114 NM_152474 147685 Hs.134209 NM_152474 ENSG00000177025 C19orf18 - chromosome 19 open reading frame 18 protein-coding 129.25-11 chr1 200149883 200150281 + 0.5 NA intron (NM_205860, intron 7 of 7) (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 107257 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 169.5-168 chr7 158924637 158925070 + 0.5 NA intron (NM_001350918, intron 19 of 26) AluSx1|SINE|Alu 68295 NM_001350915 55112 Hs.389945 NM_018051 ENSG00000126870 WDR60 FAP163|SRPS6|SRTD8 WD repeat domain 60 protein-coding 192.75-124 chr8 60987244 60987855 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -19801 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 142.5-106 chr2 69608607 69609085 + 0.5 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) L1MB3|LINE|L1 34893 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 145.75-99 chr3 69931103 69931604 + 0.5 NA intron (NM_198159, intron 2 of 9) intron (NM_198159, intron 2 of 9) -5239 NM_198158 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 170.75-60 chr19 39428314 39428805 + 0.5 NA TTS (NM_001351693) TTS (NM_001351693) 7390 NM_001321111 6217 Hs.397609 NM_001020 ENSG00000105193 RPS16 S16 ribosomal protein S16 protein-coding 172.5-142 chr4 71038619 71039068 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 45194 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 155.25-49 chr12 60517167 60517651 + 0.5 NA Intergenic HERVIP10FH-int|LTR|ERV1 828039 NM_004731 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 140.75-44 chr13 59727019 59727300 + 0.5 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) intron (NM_001258366, intron 26 of 26) -285559 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-142 chr3 106317062 106317328 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -447794 NR_135810 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 112.25-98 chr2 111983677 111983974 + 0.5 NA intron (NM_006343, intron 8 of 18) intron (NM_006343, intron 8 of 18) -71444 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 124-39 chr13 60434497 60434934 + 0.5 NA intron (NM_001146070, intron 1 of 13) intron (NM_001146070, intron 1 of 13) 37495 NM_001146070 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 129.5-19 chr10 36795047 36795502 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -330583 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 131.25-112 chr2 209430439 209430893 + 0.5 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 6619 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 144.75-73 chr18 6356124 6356562 + 0.5 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 2687 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 112.25-134 chr3 118962703 118963030 + 0.5 NA intron (NM_001353325, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 19790 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 137-170 chr8 4467257 4467684 + 0.5 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) intron (NM_033225, intron 2 of 69) 527444 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 140.75-172 chr7 105723040 105723579 + 0.5 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR -44147 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 118.25-125 chr3 7715733 7716171 + 0.5 NA intron (NM_181874, intron 10 of 10) intron (NM_181874, intron 10 of 10) -180668 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 118-20 chr10 114467497 114467927 + 0.5 NA intron (NM_001352440, intron 11 of 20) intron (NM_001352440, intron 11 of 20) 59201 NM_001322894 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 156.75-13 chr1 216208150 216208667 + 0.5 NA intron (NM_206933, intron 15 of 71) intron (NM_206933, intron 15 of 71) 135943 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 143.5-21 chr10 33712291 33712808 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 60131 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 125.5-145 chr2 236184644 236185052 + 0.5 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -16462 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 143.25-105 chr20 47435467 47435841 + 0.5 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -23510 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 123.75-33 chr12 1332744 1333071 + 0.5 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) L1PA13|LINE|L1 -167584 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 112.5-99 chr18 34608727 34609036 + 0.5 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 15546 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 119.75-169 chr5 33404266 33404528 + 0.5 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -36299 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 122.25-176 chr7 55848929 55849317 + 0.5 NA intron (NM_207366, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 13629 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 125-71 chr2 106993974 106994406 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -107081 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 119-75 chr19 52695705 52696064 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5303 NM_001348019 55769 Hs.467210 NM_018300 ENSG00000167766 ZNF83 HPF1|ZNF816B zinc finger protein 83 protein-coding 181.75-119 chr7 48334837 48335345 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) intron (NM_152701, intron 27 of 61) 163633 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 147.75-93 chr21 14850370 14850869 + 0.5 NA intron (NR_146322, intron 2 of 3) intron (NR_146322, intron 2 of 3) 68049 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 114.25-100 chr2 119017559 119017835 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 75528 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 181.75-74 chr21 28592877 28593410 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 53825 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 210.25-36 chr19 19554199 19554917 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16293 NM_153221 148113 Hs.279574 NM_153221 ENSG00000160161 CILP2 CLIP-2 cartilage intermediate layer protein 2 protein-coding 115.5-118 chr2 51189645 51189955 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1PA11|LINE|L1 157199 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 204.75-55 chr18 65141333 65141993 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -608589 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 122-45 chr12 5925194 5925657 + 0.5 NA intron (NM_001278597, intron 1 of 25) intron (NM_001278597, intron 1 of 25) 19834 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 144-29 chr11 97915873 97916253 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1104886 NM_014361 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 195.5-49 chr16 56849031 56849576 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001242795, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001242795, exon 20 of 20) -9215 NR_029680 406930 NR_029680 ENSG00000207649 MIR138-2 MIRN138-2|mir-138-2 microRNA 138-2 ncRNA 130.25-62 chr14 82175788 82176103 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -432807 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 122.25-138 chr4 54042514 54042963 + 0.5 NA intron (NM_012110, intron 3 of 5) intron (NM_012110, intron 3 of 5) 21867 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 185.25-108 chr5 155318823 155319324 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 305318 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 151-23 chr11 116589196 116589654 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -49997 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 160.75-50 chr15 65189502 65190141 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4479 NR_133680 10845 Hs.113823 NM_006660 ENSG00000166855 CLPX EPP2 caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit protein-coding 121.75-36 chr12 109129087 109129432 + 0.5 NA intron (NM_001093, intron 1 of 52) intron (NM_001093, intron 1 of 52) 12672 NM_001093 32 Hs.234898 NM_001093 ENSG00000076555 ACACB ACC2|ACCB|HACC275 acetyl-CoA carboxylase beta protein-coding 129.25-97 chr2 156169860 156170348 + 0.5 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 84827 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 157-67 chr2 204240814 204241285 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 304301 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 121.25-172 chr5 171511826 171512130 + 0.5 NA Intergenic (ATGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 92331 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 128.75-172 chr6 67010724 67011011 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1044484 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 129-49 chr12 107304756 107305167 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13473 NM_001018072 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 122-68 chr16 70430741 70431064 + 0.5 NA intron (NM_006927, intron 1 of 6) intron (NM_006927, intron 1 of 6) 8198 NM_006927 6483 Hs.368611 NM_006927 ENSG00000157350 ST3GAL2 Gal-NAc6S|SIAT4B|ST3GALII|ST3GalA.2 ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 protein-coding 142-170 chr8 139217651 139218090 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -303829 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 125.5-209 chr5 131822471 131822923 + 0.5 NA intron (NM_001303622, intron 11 of 12) L1M1|LINE|L1 -25680 NM_133372 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 129-16 chr1 241687696 241688117 + 0.5 NA intron (NM_001367482, intron 8 of 27) intron (NM_001367482, intron 8 of 27) 35625 NM_001367482 128025 Hs.97527 NM_144625 ENSG00000162843 WDR64 - WD repeat domain 64 protein-coding 136.75-104 chr2 126025009 126025373 + 0.5 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 92794 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 157.25-6 chr1 152250495 152250835 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26469 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 132.75-36 chr11 58908326 58908733 + 0.5 NA intron (NM_001354699, intron 2 of 7) intron (NM_001354699, intron 2 of 7) 3131 NM_001354699 92292 Hs.38085 NM_080661 ENSG00000166840 GLYATL1 GATF-C|GNAT glycine-N-acyltransferase like 1 protein-coding 126.25-79 chr2 17461768 17462127 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56493 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 160.5-99 chr2 228278194 228278653 + 0.5 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -96736 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 131.25-49 chr13 65821315 65821729 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -44525 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 191.5-49 chr15 80035900 80036540 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -23348 NM_001242911 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 148.25-66 chr2 13334860 13335361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -328097 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 134-52 chr14 60704100 60704521 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 20041 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 131.75-86 chr16 67246036 67246513 + 0.5 NA intron (NM_013241, intron 1 of 21) CpG 1207 NM_001318202 29109 Hs.95231 NM_013241 ENSG00000135723 FHOD1 FHOS formin homology 2 domain containing 1 protein-coding 119-161 chr6 51181157 51181557 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 362486 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 116.75-33 chr11 28974268 28974712 + 0.5 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -496942 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 118.25-110 chr2 204231642 204232058 + 0.5 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 295102 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 142.25-77 chr18 64387259 64387717 + 0.5 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) intron (NR_033881, intron 5 of 9) -127433 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 121.5-202 chr4 163822251 163822721 + 0.5 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) intron (NM_001166373, intron 3 of 7) -208952 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 186.25-69 chr3 72001027 72001626 + 0.5 NA Intergenic MER87|LTR|ERV1 99129 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 139.75-40 chr12 121018929 121019377 + 0.5 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2666 NM_001286197 64897 Hs.528671 NM_022895 ENSG00000157895 C12orf43 Custos chromosome 12 open reading frame 43 protein-coding 113.75-170 chr7 2830968 2831376 + 0.5 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 13136 NM_007353 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 155.5-127 chr3 68567961 68568365 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 67526 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 153-15 chr10 108214383 108214978 + 0.5 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 -145387 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 125.75-162 chr6 74913469 74913912 + 0.5 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 215092 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 132-127 chr4 84829777 84830135 + 0.5 NA intron (NM_014991, intron 8 of 67) intron (NM_014991, intron 8 of 67) -135660 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 118.25-168 chr6 40559246 40559618 + 0.5 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 27932 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 205.25-57 chr2 172510221 172510936 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -44556 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 188.75-105 chr7 36645862 36646525 + 0.5 NA intron (NM_001177507, intron 3 of 19) intron (NM_001177507, intron 3 of 19) -46073 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 113.25-50 chr14 81387168 81387394 + 0.5 NA intron (NM_001366850, intron 4 of 7) intron (NM_001366850, intron 4 of 7) 40494 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 158.75-168 chr9 28180200 28180591 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 538910 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 171.25-71 chr2 11560234 11560652 + 0.5 NA intron (NM_014668, intron 2 of 32) AluSq2|SINE|Alu 17757 NM_033090 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 119.75-199 chr8 116484676 116484926 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -159742 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 134.75-203 chr7 92742247 92742710 + 0.5 NA intron (NM_001259, intron 3 of 7) intron (NM_001259, intron 3 of 7) 91481 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 129.75-133 chr4 89134032 89134500 + 0.5 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 21449 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 132.75-122 chr3 24315004 24315454 + 0.5 NA intron (NM_001354710, intron 2 of 10) intron (NM_001354710, intron 2 of 10) 163905 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 114.5-46 chr11 10571794 10572169 + 0.5 NA intron (NR_034094, intron 1 of 2) MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR -3316 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 114.75-171 chr7 25526975 25527336 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 135985 NR_157828 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 180-66 chr2 170029925 170030458 + 0.5 NA intron (NM_172070, intron 31 of 38) L1MC5a|LINE|L1 -147956 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 171.25-99 chr3 85860148 85860693 + 0.5 NA intron (NM_001256502, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 -32370 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 152-142 chr7 94379125 94379696 + 0.5 NA intron (NR_147206, intron 5 of 5) intron (NR_147206, intron 5 of 5) 12782 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 117.75-194 chr7 30391388 30391714 + 0.5 NA intron (NR_108081, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 666 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 136.5-223 chr8 59961404 59961742 + 0.5 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 319827 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 198.5-134 chr7 83099999 83100583 + 0.5 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) L1PA13|LINE|L1 62593 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 193.75-114 chr8 10736701 10737364 + 0.5 NA intron (NR_146188, intron 1 of 2) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -6521 NM_031439 83595 Hs.709543 NM_031439 ENSG00000171056 SOX7 - SRY-box transcription factor 7 protein-coding 135.25-86 chr19 9287699 9288086 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 21946 NM_198535 374879 Hs.633842 NM_198535 ENSG00000196110 ZNF699 hang zinc finger protein 699 protein-coding 133.75-2 chr1 57381569 57382019 + 0.5 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) 41318 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 138-42 chr14 71396309 71396842 + 0.5 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -1762 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 183.75-45 chr16 69859141 69859556 + 0.5 NA intron (NM_001270453, intron 3 of 20) AluJo|SINE|Alu 20611 NM_001270453 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 150.5-199 chr7 16609821 16610292 + 0.5 NA intron (NM_020319, intron 6 of 9) intron (NM_020319, intron 6 of 9) 35698 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 127.75-153 chr5 16777313 16777773 + 0.5 NA intron (NM_012334, intron 9 of 40) intron (NM_012334, intron 9 of 40) 158745 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 121-146 chr4 103866907 103867314 + 0.5 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -147125 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 123.25-38 chr11 81061254 81061585 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -298616 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 211-72 chrUn_GL000216v2 5174 5896 + 0.5 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 245.25-48 chr3 114815008 114815867 + 0.5 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) intron (NM_001348805, intron 4 of 10) -56330 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 119.75-94 chr2 26999364 26999750 + 0.5 NA intron (NR_149018, intron 1 of 5) AluSp|SINE|Alu 15031 NR_149018 100129724 Hs.666730 NR_149018 ENSG00000205500 LOC100129724 - uncharacterized LOC100129724 ncRNA 258.25-8 chr10 19210505 19211315 + 0.5 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) intron (NM_001142308, intron 18 of 39) 162109 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 156.25-83 chr20 6513726 6514212 + 0.5 NA intron (NR_109953, intron 3 of 3) L1MA9|LINE|L1 87237 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 128.25-153 chr4 161513094 161513518 + 0.5 NA intron (NM_020116, intron 10 of 15) (GA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -509427 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 148.25-29 chr11 125793906 125794457 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 6054 NM_001129883 100169851 Hs.131278 NM_001129883 ENSG00000236027 PATE3 HEL-127|PATE-DJ prostate and testis expressed 3 protein-coding 119.25-163 chr5 81903432 81903731 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68442 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 122.5-50 chr13 29390025 29390273 + 0.5 NA intron (NM_001033602, intron 6 of 13) (TACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -38511 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 170.5-93 chr2 74658552 74659193 + 0.5 NA intron (NR_073398, intron 4 of 11) intron (NR_073398, intron 4 of 11) 4625 NR_073398 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 145.5-13 chr1 175658090 175658533 + 0.5 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 85284 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 119.5-188 chr5 160283632 160283987 + 0.5 NA intron (NR_131769, intron 2 of 7) L1MA1|LINE|L1 28755 NM_024565 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 149-138 chr9 30031634 30032132 + 0.5 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 376571 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 179-55 chr2 97766698 97767263 + 0.5 NA intron (NM_015348, intron 33 of 40) intron (NM_015348, intron 33 of 40) 32574 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 162.25-156 chr8 77628535 77628935 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 178038 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 128.75-136 chr4 39267295 39267603 + 0.5 NA intron (NM_025132, intron 29 of 36) intron (NM_025132, intron 29 of 36) 84920 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 151-78 chr22 32718915 32719326 + 0.5 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) L2a|LINE|L2 -81696 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 139.5-231 chr9 124826963 124827500 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -26186 NM_001276374 401551 Hs.343383 NM_001045476 ENSG00000136918 WDR38 - WD repeat domain 38 protein-coding 159.5-95 chr2 31980907 31981457 + 0.5 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 29482 NR_126032 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 114.75-105 chr20 45593504 45593821 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -14378 NM_181510 90199 Hs.116128 NM_130896 ENSG00000158901 WFDC8 C20orf170|HEL-S-292|WAP8|dJ461P17.1 WAP four-disulfide core domain 8 protein-coding 147-23 chr12 51011910 51012266 + 0.5 NA intron (NM_001174125, intron 1 of 15) intron (NM_001174125, intron 1 of 15) -2873 NM_001174130 4891 Hs.505545 NM_000617 ENSG00000110911 SLC11A2 AHMIO1|DCT1|DMT1|NRAMP2 solute carrier family 11 member 2 protein-coding 217-44 chr21 24954834 24955446 + 0.5 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) AluSx3|SINE|Alu 114590 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 117.5-128 chr20 47426971 47427258 + 0.5 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -14970 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 139-150 chr8 100022739 100023100 + 0.5 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) AluJo|SINE|Alu 18337 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 132.5-174 chr3 183473926 183474445 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20371 NR_145763 109617007 NR_145763 ENSG00000199363 SNORA63E - small nucleolar RNA, H/ACA box 63E snoRNA 127-87 chr18 3983197 3983532 + 0.5 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 21011 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 144-17 chr10 22642386 22642712 + 0.5 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 71559 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 152-161 chr9 133779987 133780388 + 0.5 NA intron (NM_001134398, intron 20 of 29) intron (NM_001134398, intron 20 of 29) -40232 NM_007101 1757 Hs.198003 NM_007101 ENSG00000123453 SARDH BPR-2|DMGDHL1|SAR|SARD|SDH sarcosine dehydrogenase protein-coding 114.25-88 chr2 37028026 37028421 + 0.5 NA intron (NM_019024, intron 23 of 35) intron (NM_019024, intron 23 of 35) 56149 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 116.25-117 chr2 163184218 163184534 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -345609 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 141.5-133 chr22 20569094 20569481 + 0.5 NA intron (NM_001293234, intron 8 of 16) intron (NM_001293234, intron 8 of 16) 61240 NM_001293237 51586 Hs.517421 NM_015889 ENSG00000099917 MED15 ARC105|CAG7A|CTG7A|PCQAP|TIG-1|TIG1|TNRC7 mediator complex subunit 15 protein-coding 123.5-125 chr3 8423584 8423945 + 0.5 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 77894 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 144.25-186 chr7 31487477 31487865 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -26400 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 119.5-190 chr6 4993180 4993626 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -10413 NR_126015 100129461 Hs.131700 NR_126015 ENSG00000272142 LYRM4-AS1 - LYRM4 antisense RNA 1 ncRNA 159.75-64 chr18 2312601 2313214 + 0.5 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 258598 NM_022840 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 151-71 chr20 62504442 62505023 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -28737 NM_080473 140628 Hs.352250 NM_080473 ENSG00000130700 GATA5 CHTD5|GATAS|bB379O24.1 GATA binding protein 5 protein-coding 146.75-56 chr16 51634376 51634801 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -127931 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 181-118 chr9 114810277 114810704 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -4451 NM_005118 9966 Hs.23349 NM_005118 ENSG00000181634 TNFSF15 TL1|TL1A|TNLG1B|VEGI|VEGI192A TNF superfamily member 15 protein-coding 179.75-137 chr8 130208989 130209420 + 0.5 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) MIRc|SINE|MIR 87329 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 120-125 chr3 174872060 174872531 + 0.5 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 12961 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 136.5-238 chr9 25320474 25320970 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 358136 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 168.5-119 chr3 123287673 123288234 + 0.5 NA intron (NM_183357, intron 19 of 20) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 86010 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 151.25-191 chr8 115743119 115743534 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -74351 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 132.5-26 chr1 217346558 217346997 + 0.5 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -209075 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 142.75-54 chr13 23348532 23348985 + 0.5 NA intron (NM_014363, intron 9 of 9) L2c|LINE|L2 26750 NM_001278055 26278 Hs.159492 NM_014363 ENSG00000151835 SACS ARSACS|DNAJC29|PPP1R138|SPAX6 sacsin molecular chaperone protein-coding 142-140 chr6 49703621 49703996 + 0.5 NA intron (NM_001261822, intron 3 of 8) L1PB1|LINE|L1 9735 NM_001142408 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 150.75-152 chr5 94608924 94609508 + 0.5 NA intron (NM_001145678, intron 1 of 20) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 9388 NM_173665 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 142-47 chr14 32507626 32508087 + 0.5 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 178558 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 126-48 chr14 28744431 28744930 + 0.5 NA intron (NR_125758, intron 2 of 6) intron (NR_125758, intron 2 of 6) 20639 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 148.5-32 chr10 98406779 98407219 + 0.5 NA intron (NM_032709, intron 4 of 15) intron (NM_032709, intron 4 of 15) 8183 NM_032709 84795 Hs.238303 NM_032709 ENSG00000119943 PYROXD2 C10orf33|FP3420|YUEF pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 protein-coding 135.25-172 chr5 172565247 172565679 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6449 NR_146726 105377728 Hs.131465 NR_146726 LINC01944 CTB-54I1.1 long intergenic non-protein coding RNA 1944 ncRNA 217.75-66 chr6 86118081 86118681 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -439648 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 147.25-56 chr2 25566701 25567155 + 0.5 NA intron (NM_001320937, intron 8 of 8) L2|LINE|L2 83294 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 119.25-9 chr1 77231767 77232111 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -12509 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 117-77 chr18 38008244 38008669 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 351321 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 121-193 chr8 121485217 121485597 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153939 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 176-34 chr2 165417160 165417698 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -52269 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 122.25-116 chr22 40540915 40541218 + 0.5 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) intron (NM_020831, intron 3 of 14) -7239 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 152.5-57 chr15 82128125 82128499 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 39718 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 123-159 chr5 112146975 112147402 + 0.5 NA intron (NM_001347887, intron 22 of 23) intron (NM_001347887, intron 22 of 23) -13338 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 145 chr1 12599628 12599970 + 0.5 NA intron (NM_004753, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR -3186 NM_001324370 9249 Hs.289347 NM_004753 ENSG00000162496 DHRS3 DD83.1|RDH17|Rsdr1|SDR1|SDR16C1|retSDR1 dehydrogenase/reductase 3 protein-coding 120.75-8 chr1 160952652 160952966 + 0.5 NA intron (NM_080878, intron 2 of 7) intron (NM_080878, intron 2 of 7) 2000 NM_080878 142683 Hs.385631 NM_080878 ENSG00000158764 ITLN2 HL-2|HL2 intelectin 2 protein-coding 186-9 chr10 31202430 31202868 + 0.5 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 14766 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 309-28 chr3 177395001 177395985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46428 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 116-159 chr7 106757601 106757913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -96599 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 112.25-40 chr11 130627010 130627354 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -39553 NR_107019 102466873 NR_107019 ENSG00000274999 MIR8052 hsa-mir-8052 microRNA 8052 ncRNA 163-74 chr3 105636106 105636517 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 231280 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 123.75-17 chr10 78964973 78965459 + 0.5 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) intron (NR_015429, intron 3 of 7) 102232 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 156.75-132 chr5 42302531 42302918 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -120715 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 132.75-99 chr2 107585736 107586121 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56509 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 119.5-229 chr8 49231940 49232416 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 159834 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 176-8 chr10 91547007 91547522 + 0.5 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 64196 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 158-111 chr5 139360147 139360723 + 0.5 NA intron (NM_001033112, intron 1 of 3) intron (NM_001033112, intron 1 of 3) 18001 NM_001033112 51247 Hs.396644 NM_016480 ENSG00000120727 PAIP2 PAIP-2|PAIP2A poly(A) binding protein interacting protein 2 protein-coding 125.25-70 chr15 63883031 63883527 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12260 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 117.75-121 chr20 1149134 1149470 + 0.5 NA intron (NM_006814, intron 4 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 30700 NM_001323410 9491 Hs.471917 NM_006814 ENSG00000125818 PSMF1 PI31 proteasome inhibitor subunit 1 protein-coding 185.75-85 chr3 23655513 23656189 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -150104 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 134.5-90 chr18 2592648 2593023 + 0.5 NA intron (NM_006101, intron 10 of 16) intron (NM_006101, intron 10 of 16) 21278 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 128.5-136 chr22 27901906 27902224 + 0.5 NA intron (NM_001284278, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 17149 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 116-6 chr1 102387434 102387706 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -390336 NR_110210 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 136.75-122 chr22 42848390 42848927 + 0.5 NA intron (NM_001142293, intron 1 of 14) intron (NM_001142293, intron 1 of 14) 8615 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 123-11 chr1 150687471 150687877 + 0.5 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) intron (NM_018178, intron 2 of 4) 9480 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 170.5-67 chr15 24701502 24701938 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 26326 NM_018958 23742 Hs.649663 NM_018958 ENSG00000185823 NPAP1 C15orf2 nuclear pore associated protein 1 protein-coding 228.5-87 chr5 168668329 168669087 + 0.5 NA intron (NM_003062, intron 35 of 35) AluJr|SINE|Alu -38219 NR_130737 101927969 Hs.661903 NR_130737 LOC101927969 - uncharacterized LOC101927969 ncRNA 132.5 chr1 4843930 4844351 + 0.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 189531 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 159.25-80 chr3 25984144 25984648 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -110701 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 121.75-129 chr4 48526244 48526518 + 0.5 NA intron (NM_015030, intron 53 of 63) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 36129 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 116-10 chr1 244482630 244482911 + 0.5 NA intron (NM_001242340, intron 4 of 18) L1ME3D|LINE|L1 21399 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 158-155 chr9 95266388 95266846 + 0.5 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) intron (NM_001243744, intron 1 of 13) 50637 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 215.75-39 chr15 63400984 63401532 + 0.5 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 11028 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 194.75-3 chr1 85353716 85354184 + 0.5 NA intron (NM_001134445, intron 3 of 6) intron (NM_001134445, intron 3 of 6) 50556 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 168.5-172 chr7 77947384 77947779 + 0.5 NA intron (NM_001366081, intron 14 of 16) AluSx|SINE|Alu 107451 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 211.5-46 chr13 72120509 72121024 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -253562 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 146.5-90 chr18 12739523 12740010 + 0.5 NA non-coding (NR_110763, exon 2 of 2) non-coding (NR_110763, exon 2 of 2) 9656 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 160.75-83 chr2 154005650 154006206 + 0.5 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 61534 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 118-5 chr1 78125533 78125910 + 0.5 NA intron (NM_001304725, intron 4 of 5) intron (NM_001304725, intron 4 of 5) 79755 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 157-125 chr9 34899584 34899950 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4003 NM_001309426 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 158.75-152 chr7 36984121 36984713 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) 695 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 145.75-42 chr14 74938602 74939008 + 0.5 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -15545 NM_001370258 83694 Hs.414481 NM_031464 ENSG00000198208 RPS6KL1 RSKL2 ribosomal protein S6 kinase like 1 protein-coding 118.25-134 chr3 196844825 196845246 + 0.5 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -22821 NM_001308045 205564 Hs.240770 NM_152699 ENSG00000119231 SENP5 - SUMO specific peptidase 5 protein-coding 199.75-63 chr3 64074982 64075534 + 0.5 NA intron (NR_045697, intron 1 of 2) L1MB4|LINE|L1 7294 NR_045697 100652759 Hs.731187 NR_045697 ENSG00000241111 PRICKLE2-AS1 - PRICKLE2 antisense RNA 1 ncRNA 166.5-25 chr10 18753021 18753431 + 0.5 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 93795 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 173-41 chr13 70272283 70272825 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -164061 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 139-27 chr12 18418276 18418605 + 0.5 NA intron (NM_001288774, intron 16 of 32) intron (NM_001288774, intron 16 of 32) 156900 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 127.25-92 chr2 95090670 95090973 + 0.5 NA intron (NR_136152, intron 9 of 10) intron (NR_136152, intron 9 of 10) 30736 NM_001321997 64969 Hs.655259 NM_031902 ENSG00000144029 MRPS5 MRP-S5|S5mt mitochondrial ribosomal protein S5 protein-coding 147-32 chr14 64004256 64004786 + 0.5 NA intron (NM_015180, intron 30 of 114) AluSx|SINE|Alu 90604 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 112.25-101 chr2 136115616 136115965 + 0.5 NA exon (NM_001348059, exon 3 of 3) exon (NM_001348059, exon 3 of 3) 445 NM_001008540 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 187.5-126 chr4 46447757 46448277 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57889 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 113.25-42 chr13 90655937 90656240 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 162800 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 151-74 chr22 24333625 24334175 + 0.5 NA intron (NM_015330, intron 8 of 16) intron (NM_015330, intron 8 of 16) -8208 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 139.25-77 chr19 47567603 47568061 + 0.5 NA intron (NM_001277075, intron 2 of 16) intron (NM_001277075, intron 2 of 16) 5316 NM_001277075 84215 Hs.14161 NM_032255 ENSG00000118156 ZNF541 - zinc finger protein 541 protein-coding 161-3 chr1 88474636 88475168 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -209242 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 213-89 chr7 48030246 48030742 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -1387 NM_001284350 256979 Hs.406741 NM_152782 ENSG00000164744 SUN3 SUNC1 Sad1 and UNC84 domain containing 3 protein-coding 143-147 chr8 102985947 102986383 + 0.5 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -34918 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 141.5-11 chr1 161980081 161980486 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 44182 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 122.25-94 chr2 118014706 118015081 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_019044) promoter-TSS (NM_019044) -823 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 212.75-52 chr2 206535268 206535908 + 0.5 NA intron (NM_003812, intron 4 of 25) L1MB7|LINE|L1 92056 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 119.5-85 chr15 56559072 56559399 + 0.5 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -94098 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 195.75-30 chr11 47716218 47716778 + 0.5 NA TTS (NM_015308).2 TTS (NM_015308).2 -1129 NM_024783 79841 Hs.147377 NM_024783 ENSG00000165923 AGBL2 CCP2 ATP/GTP binding protein like 2 protein-coding 118.25-31 chr10 97858164 97858522 + 0.5 NA intron (NM_001010917, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 8500 NM_001010917 401647 Hs.567524 NM_001010917 ENSG00000155265 GOLGA7B C10orf132|C10orf133|bA451M19.3|bA459F3.4 golgin A7 family member B protein-coding 117-86 chr2 48422526 48422907 + 0.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -18050 NR_024188 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 131.75-38 chr11 76407151 76407492 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001282456, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001282456, exon 2 of 2) 25998 NM_001347884 100506127 Hs.503319 NM_001013634 ENSG00000179240 GVQW3 - GVQW motif containing 3 protein-coding 165.5-80 chr2 104753997 104754442 + 0.5 NA intron (NR_038231, intron 2 of 3) intron (NR_038231, intron 2 of 3) 3500 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 169-19 chr12 58624335 58624872 + 0.5 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 32901 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 139.5-179 chr5 92491815 92492229 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1079321 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 153.75-24 chr11 10912909 10913334 + 0.5 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 54904 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 114.5-247 chr7 109528920 109529295 + 0.5 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 431106 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 147-77 chr2 113052759 113053283 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_014438) promoter-TSS (NM_014438) -154 NM_014438 27177 Hs.278909 NM_014438 ENSG00000136696 IL36B FIL1|FIL1-(ETA)|FIL1H|FILI-(ETA)|IL-1F8|IL-1H2|IL1-ETA|IL1F8|IL1H2 interleukin 36 beta protein-coding 140.5-220 chr7 125382783 125383290 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -118745 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 118.75-78 chr17 58084439 58084910 + 0.5 NA intron (NM_080677, intron 1 of 2) intron (NM_080677, intron 1 of 2) 1255 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 138.25-114 chr3 64803130 64803594 + 0.5 NA intron (NR_038264, intron 2 of 5) intron (NR_038264, intron 2 of 5) -115362 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 130-27 chr11 43197644 43197984 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 71555 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 149.25-67 chr18 44386644 44387031 + 0.5 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) intron (NR_110792, intron 2 of 4) 144860 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 182-56 chr2 39867299 39867848 + 0.5 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -50061 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 157.75-39 chr13 92865959 92866396 + 0.5 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -144563 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 139.75-75 chr17 51009012 51009443 + 0.5 NA intron (NM_001130527, intron 8 of 29) intron (NM_001130527, intron 8 of 29) 37651 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 185.75-27 chr11 112111500 112112034 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 24894 NM_001276506 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 196.25-85 chr3 129303975 129304537 + 0.5 NA intron (NM_001370344, intron 6 of 6) intron (NM_001370344, intron 6 of 6) -12015 NR_026991 339942 Hs.450096 NM_001025468 H1FX-AS1 C3orf47 H1FX antisense RNA 1 ncRNA 180-87 chr3 134094307 134094891 + 0.5 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -36951 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 119.5-71 chr13 93634895 93635304 + 0.5 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 223374 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 115.25-147 chr4 61679509 61679906 + 0.5 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) MIRb|SINE|MIR 477535 NM_001371342 131.25-152 chr3 193561812 193562155 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7088 NM_032279 84239 Hs.674423 NM_032279 ENSG00000127249 ATP13A4 - ATPase 13A4 protein-coding 126.5-152 chr3 49919889 49920225 + 0.5 NA intron (NM_001142501, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 9955 NM_032355 84315 Hs.655014 NM_032355 ENSG00000164077 MON1A SAND1 MON1 homolog A, secretory trafficking associated protein-coding 128.25-225 chr9 111283429 111283770 + 0.5 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12385 NR_106989 102465800 NR_106989 ENSG00000274263 MIR7702 hsa-mir-7702 microRNA 7702 ncRNA 161-40 chr14 57583082 57583704 + 0.5 NA intron (NM_001352016, intron 3 of 3) intron (NM_001352016, intron 3 of 3) -89536 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 139.75-2 chr1 39020100 39020558 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5966 NM_001184979 4725 Hs.632385 NM_004552 ENSG00000168653 NDUFS5 CI-15k|CI15K NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S5 protein-coding 156.25-164 chrX 79938105 79938715 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -76343 NM_001109878 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 131-124 chr3 160291247 160291662 + 0.5 NA intron (NM_001190242, intron 11 of 18) MER21-int|LTR|ERVL 65818 NM_001168214 401097 Hs.729755 NM_001168214 ENSG00000180044 C3orf80 - chromosome 3 open reading frame 80 protein-coding 190.5-161 chr8 116991336 116991921 + 0.5 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 40653 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 133-66 chr17 77328570 77328939 + 0.5 NA intron (NM_006640, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 9239 NM_006640 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 123-151 chr4 141650067 141650369 + 0.5 NA intron (NR_037840, intron 1 of 7) intron (NR_037840, intron 1 of 7) 13635 NR_037840 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 123.75-114 chr3 3632179 3632465 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -167109 NM_020873 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 202.25-62 chr4 173426164 173426719 + 0.5 NA intron (NM_001329597, intron 2 of 3) intron (NM_001329597, intron 2 of 3) -27325 NM_007281 11341 Hs.7122 NM_007281 ENSG00000164106 SCRG1 SCRG-1 stimulator of chondrogenesis 1 protein-coding 148.75-39 chr12 21111493 21111821 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19537 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 135-190 chr8 140992352 140992684 + 0.5 NA intron (NM_001352737, intron 1 of 32) MER5A|DNA|hAT-Charlie 8486 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 123-20 chr10 29076535 29076839 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -212383 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 147.5-132 chr22 25070414 25070829 + 0.5 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 42071 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 132.75-191 chr8 125379210 125379512 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -50997 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 175.5-92 chr2 163804760 163805217 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68980 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 209.25-27 chr13 20308513 20309122 + 0.5 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -76422 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 127.5-154 chr3 120058323 120058785 + 0.5 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 26094 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 115.25-159 chr5 16454445 16454842 + 0.5 NA intron (NM_033414, intron 4 of 5) intron (NM_033414, intron 4 of 5) 11157 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 117.75-167 chr4 188098619 188099007 + 0.5 NA intron (NM_001303419, intron 4 of 7) intron (NM_001303419, intron 4 of 7) 6774 NM_001303419 205860 Hs.276429 NM_173553 ENSG00000179046 TRIML2 SPRYD6 tripartite motif family like 2 protein-coding 114-108 chr3 191405246 191405622 + 0.5 NA Intergenic MST-int|LTR|ERVL-MaLR -20090 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 126.25-162 chr5 95284060 95284516 + 0.5 NA exon (NM_024717, exon 1 of 23) exon (NM_024717, exon 1 of 23) 287 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 128.5-59 chr13 50200731 50201132 + 0.5 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) 28913 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 124.25-204 chr8 113718028 113718320 + 0.5 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -281235 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 136.75-171 chr6 137465474 137465797 + 0.5 NA Intergenic LTR1F1|LTR|ERV1 28759 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 124.25-44 chr12 93671682 93672150 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5455 NR_135147 8738 Hs.38533 NM_003805 ENSG00000169372 CRADD MRT34|RAIDD CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with death domain protein-coding 121-82 chr17 73527359 73527835 + 0.5 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) L2c|LINE|L2 13914 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 127.25-162 chr5 31569779 31570131 + 0.5 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 37654 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 177.75-11 chr1 165506536 165506972 + 0.5 NA intron (NR_026744, intron 4 of 6) intron (NR_026744, intron 4 of 6) -37487 NM_001005214 440699 Hs.664975 NM_001005214 ENSG00000162763 LRRC52 - leucine rich repeat containing 52 protein-coding 127.5-42 chr11 30781285 30781779 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -195179 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 146.75-107 chr3 174467455 174467801 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -391706 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 135-59 chr17 60278445 60278938 + 0.5 NA intron (NM_032582, intron 5 of 33) intron (NM_032582, intron 5 of 33) -47046 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 151.5-115 chr3 38809407 38809804 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -15595 NM_001293307 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 127.75-16 chr1 88871740 88872170 + 0.5 NA intron (NM_001514, intron 2 of 6) AluSq2|SINE|Alu 19612 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 144.25-48 chr12 38785247 38785803 + 0.5 NA intron (NM_153634, intron 6 of 19) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 120066 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 116-27 chr11 73112871 73113179 + 0.5 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) L1MA3|LINE|L1 29293 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 140.75-38 chr12 41858422 41858791 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 94417 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 157.25-99 chr3 159477534 159478105 + 0.5 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1MA7|LINE|L1 195173 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 139-117 chr5 106699150 106699546 + 0.5 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL 311666 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 127.25-48 chr12 59477961 59478387 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -117855 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 160-11 chr10 56273195 56273615 + 0.5 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 87854 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 117.75-72 chr15 98740431 98740840 + 0.5 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -43791 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 156.25-12 chr1 220857698 220858140 + 0.5 NA intron (NR_046901, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 -21524 NM_021958 3142 Hs.74870 NM_021958 ENSG00000136630 HLX HB24|HLX1 H2.0 like homeobox protein-coding 125.75-40 chr12 22578266 22578657 + 0.5 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -33915 NM_014802 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 150.75-45 chr12 13079092 13079472 + 0.5 NA intron (NM_020853, intron 11 of 12) L1PA3|LINE|L1 16393 NM_001368007 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 149-109 chr6 35570080 35570468 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -57378 NM_001289395 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 133.25-88 chr19 57255748 57256185 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001023563, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001023563, exon 4 of 4) 15334 NM_001023563 390980 Hs.22488 NM_001023563 ENSG00000204524 ZNF805 - zinc finger protein 805 protein-coding 151.5-86 chr2 120557030 120557571 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -90951 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 146.75-54 chr16 17309076 17309641 + 0.5 NA intron (NM_022166, intron 2 of 11) L2a|LINE|L2 161602 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 128.25-11 chr1 222653216 222653683 + 0.5 NA intron (NM_001300867, intron 10 of 22) intron (NM_001300867, intron 10 of 22) 9146 NM_001324065 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 140-90 chr20 52329246 52329771 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -137523 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 115.75-155 chr4 74310668 74311033 + 0.5 NA intron (NR_073114, intron 2 of 5) MER2|DNA|TcMar-Tigger 2380 NR_073117 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 126.5-132 chr20 34759796 34760251 + 0.5 NA intron (NM_001242539, intron 3 of 11) AluJr|SINE|Alu 22381 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 114.5-272 chr8 142931871 142932179 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14182 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 116.25-112 chr2 112226762 112227212 + 0.5 NA intron (NM_032494, intron 8 of 8) L1M4|LINE|L1 28055 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 152-94 chr20 52189433 52189828 + 0.5 NA intron (NM_199427, intron 1 of 8) AluSp|SINE|Alu 2149 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 147-88 chr22 24434544 24434967 + 0.5 NA intron (NM_001278497, intron 3 of 3) intron (NM_001278497, intron 3 of 3) 2636 NM_001278497 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 114.25-55 chr14 54221334 54221710 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -175346 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 148.5-159 chr3 173471705 173472116 + 0.5 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) 74166 NM_001365925 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 153.5-80 chr17 71546119 71546673 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -344217 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 123.75-26 chr11 70927751 70928021 + 0.5 NA intron (NM_012309, intron 9 of 24) MLT2B1|LTR|ERVL -55518 NR_037437 100500844 NR_037437 ENSG00000263744 MIR3664 mir-3664 microRNA 3664 ncRNA 156.25-151 chr8 125159543 125160033 + 0.5 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 67928 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 144.5-23 chr1 198175491 198175986 + 0.5 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 18740 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 153.5-35 chr11 85213346 85213850 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) MER4D1|LTR|ERV1 -290177 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 130.75-165 chr6 51371482 51371825 + 0.5 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -250217 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 175.5-59 chr15 64199798 64200262 + 0.5 NA intron (NM_001329605, intron 10 of 12) AluSq2|SINE|Alu -36875 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 144.75-7 chr1 105861290 105861754 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 166731 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 122.75-196 chr8 55341806 55342181 + 0.5 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 113328 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 116-101 chr3 29083822 29084196 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 196930 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 182-59 chr2 49637943 49638594 + 0.5 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 335935 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 120.5-90 chr16 76770799 76771209 + 0.5 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -97932 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 127.25-202 chr7 149410686 149411016 + 0.5 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 50211 NM_015694 27153 Hs.38512 NM_015694 ENSG00000196453 ZNF777 - zinc finger protein 777 protein-coding 159-53 chr2 99100008 99100415 + 0.5 NA intron (NR_146001, intron 9 of 18) L1MEg|LINE|L1 40969 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 171.25-14 chr10 29753291 29753868 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -16643 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 112.75-122 chr20 54379956 54380330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95450 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 146.5-119 chr2 195727629 195727932 + 0.5 NA intron (NM_020342, intron 8 of 9) L1ME1|LINE|L1 70554 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 182.25-31 chr12 127617949 127618463 + 0.5 NA Intergenic AluYh3a3|SINE|Alu 18261 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 208.75-23 chr12 71550746 71551198 + 0.5 NA intron (NM_001277227, intron 4 of 16) intron (NM_001277227, intron 4 of 16) 111174 NM_001277227 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 183-94 chr5 158623988 158624451 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -214446 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 141.5-153 chr3 167030003 167030455 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 131546 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 145-80 chr2 176101899 176102366 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 2330 NM_021193 3238 Hs.450028 NM_021193 ENSG00000170178 HOXD12 HOX4H homeobox D12 protein-coding 140.75-119 chr3 23568527 23568894 + 0.5 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -237245 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 120.75-102 chr22 35107930 35108363 + 0.5 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 41988 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 168.5-187 chr8 124622663 124623122 + 0.5 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) L1MA9|LINE|L1 83769 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 113.75-95 chr2 44092908 44093319 + 0.5 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -75690 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 153-11 chr10 61306985 61307415 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -145439 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 131.5-204 chr6 66231678 66232045 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 443982 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 121.5-101 chr16 74240561 74240822 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -25170 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 155.25-4 chr1 34603574 34603909 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 65953 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 135.5-51 chr13 69470177 69470560 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 248022 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 157-105 chr6 51071112 51071571 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 252470 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 123.25-80 chr17 61685089 61685383 + 0.5 NA intron (NM_032043, intron 19 of 19) MER58A|DNA|hAT-Charlie -94017 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 144.5-196 chr7 4748798 4749345 + 0.5 NA intron (NM_001037165, intron 2 of 8) HAL1|LINE|L1 -26552 NM_014855 9907 Hs.558440 NM_014855 ENSG00000242802 AP5Z1 KIAA0415|SPG48|zeta adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1 protein-coding 129.25-186 chr7 55090747 55091108 + 0.5 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) -18912 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 112.5-101 chr18 63767395 63767730 + 0.5 NA intron (NM_001040147, intron 1 of 7) L1MDb|LINE|L1 -7813 NM_001261831 8710 Hs.138202 NM_003784 ENSG00000166396 SERPINB7 MEGSIN|PPKN|TP55 serpin family B member 7 protein-coding 179.5-85 chr2 12725635 12726219 + 0.5 NA intron (NM_021643, intron 2 of 2) intron (NM_021643, intron 2 of 2) 8991 NR_027303 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 120-35 chr13 82268819 82269184 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -1042018 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 160.25-2 chr1 10180844 10181164 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001105562, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001105562, exon 28 of 28) -29566 NM_183416 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 202.25-60 chr4 112368137 112368813 + 0.5 NA intron (NM_001102406, intron 2 of 15) L1ME3D|LINE|L1 71106 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 122.75-206 chr8 113772550 113772902 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -335787 NM_198123 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 121.25-90 chr2 55693511 55693945 + 0.5 NA exon (NM_033109, exon 1 of 28) exon (NM_033109, exon 1 of 28) 116 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 114-162 chr8 37590178 37590568 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -68987 NR_121621 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 149-19 chr11 111617089 111617468 + 0.5 NA intron (NM_015191, intron 2 of 14) intron (NM_015191, intron 2 of 14) 14829 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 140.25-171 chr6 133243252 133243570 + 0.5 NA intron (NM_172103, intron 1 of 18) intron (NM_172103, intron 1 of 18) 1912 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 116.25-5 chr1 43774152 43774561 + 0.5 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) intron (NM_001270465, intron 2 of 7) -47013 NR_125986 101929592 NR_125986 ENSG00000229444 LOC101929592 - uncharacterized LOC101929592 ncRNA 195.25-68 chr4 65566248 65566768 + 0.5 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 102980 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 150.5-88 chr2 43389790 43390248 + 0.5 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) L2c|LINE|L2 162808 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 139.25-98 chr2 202278895 202279372 + 0.5 NA TTS (NR_145774) TTS (NR_145774) 1020 NR_145774 109616995 NR_145774 ENSG00000212309 SNORD70B - small nucleolar RNA, C/D box 70B snoRNA 126.75-61 chr14 69210256 69210690 + 0.5 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 18707 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 167-75 chr3 30195589 30195941 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -261609 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 131-5 chr1 156213474 156213821 + 0.5 NA TTS (NM_001286184) TTS (NM_001286184) 659 NM_001199661 100527963 Hs.530479 NM_001199661 ENSG00000260238 PMF1-BGLAP PMF-1|PMF1 PMF1-BGLAP readthrough protein-coding 126.25-47 chr14 44572268 44572742 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 65096 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 148.25-46 chr14 86319142 86319546 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 384666 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 130.25-168 chr6 8533269 8533640 + 0.5 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 97831 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 118.25-105 chr2 140318383 140318693 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 82 of 90) intron (NM_018557, intron 82 of 90) 268147 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 181.25-51 chr17 82252365 82252883 + 0.5 NA intron (NR_110578, intron 3 of 8) intron (NR_110578, intron 3 of 8) 15956 NR_106845 102465472 NR_106845 ENSG00000284574 MIR6787 hsa-mir-6787 microRNA 6787 ncRNA 170.25-140 chr6 125520980 125521396 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -153165 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 144-19 chr10 54646443 54646902 + 0.5 NA intron (NR_134503, intron 4 of 5) L1M3|LINE|L1 -38715 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 170.25-2 chr1 30161878 30162330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -124492 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 147.25-148 chr8 118438748 118439119 + 0.5 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -182068 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 126.75-179 chr4 100447740 100448074 + 0.5 NA intron (NM_016242, intron 4 of 11) MER58A|DNA|hAT-Charlie -52660 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 170.5-132 chr4 70686383 70686851 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1915 NM_020368 57050 Hs.322901 NM_020368 ENSG00000132467 UTP3 CRL1|CRLZ1|SAS10 UTP3 small subunit processome component protein-coding 136.5-58 chr12 106983093 106983531 + 0.5 NA intron (NM_001033050, intron 2 of 2) L1MB4|LINE|L1 3834 NM_001033050 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 113.5-199 chr5 114942136 114942506 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -168908 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 136.75-98 chr2 77039449 77039792 + 0.5 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 53655 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 125.25-83 chr18 867223 867509 + 0.5 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -37505 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 140.75-37 chr12 37667687 37668215 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -648823 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 136.75-54 chr14 46135470 46135880 + 0.5 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 71516 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 143.25-99 chr20 26345607 26346029 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -136585 NR_040095 284801 Hs.370699 NR_040095 ENSG00000227195 MIR663AHG - MIR663A host gene ncRNA 145.75-159 chr8 80204653 80205149 + 0.5 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -33337 NR_105035 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 245-64 chr7 16639910 16640686 + 0.5 NA intron (NM_020319, intron 1 of 9) intron (NM_020319, intron 1 of 9) 5456 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 118.25-174 chr6 111984886 111985210 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -69027 NM_003880 8838 Hs.558428 NM_003880 ENSG00000112761 CCN6 LIBC|PPAC|PPD|WISP-3|WISP3 cellular communication network factor 6 protein-coding 138.5-162 chr5 129639012 129639468 + 0.5 NA intron (NM_133638, intron 10 of 22) intron (NM_133638, intron 10 of 22) -108854 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 117.5-140 chr3 73695087 73695546 + 0.5 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -70375 NM_015009 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 120.25-63 chr14 65455564 65455939 + 0.5 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) -15351 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 118.25-200 chr8 105181968 105182393 + 0.5 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -136258 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 225.25-27 chr17 31088576 31089321 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 5477 NR_039886 100616266 NR_039886 ENSG00000265444 MIR4733 - microRNA 4733 ncRNA 124.75-152 chr4 48309131 48309605 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -32161 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 135-32 chr12 69458220 69458651 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -11953 NM_001278355 10818 Hs.593446 NM_006654 ENSG00000166225 FRS2 FRS1A|FRS2A|FRS2alpha|SNT|SNT-1|SNT1 fibroblast growth factor receptor substrate 2 protein-coding 119-125 chr3 137383108 137383581 + 0.5 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -380971 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 125.75-201 chrX 92227448 92227802 + 0.5 NA intron (NM_032969, intron 3 of 5) intron (NM_032969, intron 3 of 5) 392164 NM_001168363 27328 Hs.655673 NM_014522 ENSG00000102290 PCDH11X PCDH-X|PCDH-Y|PCDH11|PCDH11Y|PCDH22|PCDHX|PPP1R119 protocadherin 11 X-linked protein-coding 156.5-211 chrUn_KI270589v1 42315 42780 + 0.5 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 138.5-183 chr7 44554631 44555136 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -13553 NM_001300967 29881 Hs.567486 NM_013389 ENSG00000015520 NPC1L1 LDLCQ7|NPC11L1|SLC65A2 NPC1 like intracellular cholesterol transporter 1 protein-coding 142.25-140 chr6 42301183 42301662 + 0.5 NA intron (NM_001297573, intron 3 of 17) AluSx1|SINE|Alu -83561 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 180.75-43 chr15 47346229 47346628 + 0.5 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) MIR3|SINE|MIR 162339 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 147.25-74 chr22 35325565 35325958 + 0.5 NA intron (NR_156428, intron 5 of 13) intron (NR_156428, intron 5 of 13) -9879 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 113-182 chr8 123955886 123956297 + 0.5 NA intron (NM_001039112, intron 2 of 40) intron (NM_001039112, intron 2 of 40) 84691 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 114.5-139 chr2 115531691 115532135 + 0.5 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) L1ME3A|LINE|L1 188098 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 127.25-110 chr20 57291226 57291686 + 0.5 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -24815 NM_001719 655 Hs.473163 NM_001719 ENSG00000101144 BMP7 OP-1 bone morphogenetic protein 7 protein-coding 116.75-205 chr8 134892355 134892728 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 42606 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 162.25-167 chrX 33747368 33747788 + 0.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 384752 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 162.25-134 chr5 118056109 118056648 + 0.5 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -226196 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 146.75-65 chr18 6241718 6242242 + 0.5 NA intron (NM_001365769, intron 7 of 16) intron (NM_001365769, intron 7 of 16) -14764 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 130-53 chr16 3334875 3335298 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -20803 NM_012368 4993 Hs.258574 NM_012368 ENSG00000168158 OR2C1 OLFmf3|OR2C2P olfactory receptor family 2 subfamily C member 1 protein-coding 202.5-2 chr1 50439440 50440050 + 0.5 NA 3' UTR (NM_007051, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_007051, exon 19 of 19) -16302 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 141.25-105 chr3 15463750 15464269 + 0.5 NA intron (NM_080539, intron 11 of 15) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 32299 NR_036232 100422868 NR_036232 ENSG00000263573 MIR4270 - microRNA 4270 ncRNA 159.5-118 chr2 204508307 204508797 + 0.5 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -36923 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 129.75-20 chr1 219012120 219012546 + 0.5 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) -93822 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 127.25-139 chr4 37459766 37460150 + 0.5 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) L1PA10|LINE|L1 6033 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 221.75-81 chr8 107177583 107178282 + 0.5 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 158583 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 114.5-221 chr5 132826686 132827081 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_133456) promoter-TSS (NM_133456) -573 NM_133456 134549 Hs.519574 NM_133456 ENSG00000164403 SHROOM1 APXL2 shroom family member 1 protein-coding 139.25-31 chr11 75481054 75481349 + 0.5 NA intron (NM_030792, intron 2 of 16) intron (NM_030792, intron 2 of 16) -28874 NM_001351167 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 133.5-85 chr14 85333518 85333921 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53556 NR_135155 105370605 NR_135155 ENSG00000258814 LINC02329 - long intergenic non-protein coding RNA 2329 ncRNA 122.5-99 chr19 29807018 29807299 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -4833 NM_001322262 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 120.75-25 chr11 81448537 81448940 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 442098 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 115.75-97 chr2 30146315 30146711 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001127399) promoter-TSS (NM_001127399) -494 NM_001127400 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 118.25-21 chr1 186733894 186734200 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 53393 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 141.5-142 chr3 67879556 67879930 + 0.5 NA intron (NR_109992, intron 5 of 6) intron (NR_109992, intron 5 of 6) -111849 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 156-127 chr5 172933930 172934367 + 0.5 NA intron (NM_001031711, intron 8 of 9) intron (NM_001031711, intron 8 of 9) 19065 NR_162113 113218510 NR_162113 MIR10523 - microRNA 10523 ncRNA 142.25-4 chr1 56118607 56118891 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 173662 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 126.5-237 chr8 64282722 64283208 + 0.5 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 85593 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 151.75-141 chr7 84183929 84184395 + 0.5 NA intron (NM_006080, intron 1 of 16) intron (NM_006080, intron 1 of 16) 10627 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 123.25-97 chr2 45918649 45919067 + 0.5 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) intron (NM_005400, intron 2 of 14) 267183 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 157.75-133 chr5 42493953 42494406 + 0.5 NA intron (NM_001242401, intron 2 of 10) intron (NM_001242401, intron 2 of 10) -53864 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 147.75-141 chr7 37407106 37407581 + 0.5 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) AluSq4|SINE|Alu 41609 NM_014800 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 112.75-40 chr12 44753334 44753728 + 0.5 NA intron (NM_006159, intron 10 of 20) intron (NM_006159, intron 10 of 20) 122130 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 125-102 chr3 73433506 73433835 + 0.5 NA exon (NM_001303142, exon 1 of 8) exon (NM_001303142, exon 1 of 8) 325 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 134-179 chr8 142258057 142258589 + 0.5 NA intron (NM_001366901, intron 12 of 13) intron (NM_001366901, intron 12 of 13) 59967 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 112.75-46 chr12 132958729 132959089 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2603 NM_183238 100289635 Hs.29698 NM_183238 ENSG00000196458 ZNF605 - zinc finger protein 605 protein-coding 126.75-80 chr16 19748620 19749007 + 0.5 NA intron (NR_130967, intron 5 of 7) intron (NR_130967, intron 5 of 7) -30586 NM_001348529 400506 Hs.585209 NM_001012991 ENSG00000103550 KNOP1 101F10.1|C16orf88|FAM191A|TSG118 lysine rich nucleolar protein 1 protein-coding 116.5-139 chr20 11900844 11901275 + 0.5 NA intron (NM_001282550, intron 1 of 4) intron (NM_001282550, intron 1 of 4) 8566 NM_001282550 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 118.75-17 chr10 12977584 12977958 + 0.5 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) intron (NM_001282658, intron 6 of 6) 23942 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 124.5-4 chr1 26333541 26333921 + 0.5 NA intron (NM_001039775, intron 14 of 19) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -15466 NM_145345 91544 Hs.145061 NM_145345 ENSG00000158062 UBXN11 COA-1|PP2243|SOC|SOCI|UBXD5 UBX domain protein 11 protein-coding 136.5-239 chrX 42225506 42225791 + 0.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -302094 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 165-141 chr8 82707855 82708285 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -204034 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 116.25-202 chr6 144297023 144297432 + 0.5 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) 5490 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 113.25-187 chr9 113782549 113782981 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -93517 NM_133374 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 123-186 chr8 87943044 87943461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -69237 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 113.75-36 chr11 45928627 45928964 + 0.5 NA TTS (NM_001352032) TTS (NM_001352032) 6139 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 195.5-75 chr2 121339499 121340115 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001142274, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_001142274, exon 38 of 38) -54605 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 131.25-8 chr1 73323114 73323636 + 0.5 NA intron (NR_110676, intron 3 of 3) L1PA17|LINE|L1 17205 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 114.5-173 chr3 39366276 39366650 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -16907 NM_001354798 54977 Hs.369615 NM_017875 ENSG00000144659 SLC25A38 SIDBA2 solute carrier family 25 member 38 protein-coding 195-61 chr3 9161542 9162294 + 0.5 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) L1MB3|LINE|L1 -30575 NR_121664 101927416 Hs.475364 NR_121663 ENSG00000228723 SRGAP3-AS2 - SRGAP3 antisense RNA 2 ncRNA 168.75-134 chr7 42654034 42654417 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 52222 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 117.25-57 chr12 87602437 87602821 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -166183 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 154.25-164 chr8 3219554 3219991 + 0.5 NA intron (NM_033225, intron 28 of 69) intron (NM_033225, intron 28 of 69) -491321 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 122.5-163 chr4 14192798 14193192 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 81027 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 136.75-106 chr2 159071232 159071579 + 0.5 NA intron (NM_001350065, intron 4 of 27) intron (NM_001350065, intron 4 of 27) 102765 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 122.5-98 chr19 14634365 14634800 + 0.5 NA intron (NM_032571, intron 11 of 15) MIRc|SINE|MIR 12369 NR_132784 106635534 NR_132784 SNORA104 - small nucleolar RNA, H/ACA box 104 snoRNA 146.5-225 chr8 105754284 105754669 + 0.5 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 306027 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 185-27 chr16 31440592 31441072 + 0.5 NA intron (NM_001353381, intron 1 of 1) intron (NM_001353381, intron 1 of 1) 1957 NM_001136509 283933 Hs.722243 NM_001136509 ENSG00000176723 ZNF843 - zinc finger protein 843 protein-coding 236.25-86 chr8 102917020 102917703 + 0.5 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) intron (NR_126339, intron 2 of 2) 53090 NR_126339 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 112.25-118 chr21 28917064 28917423 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -31870 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 120-149 chr5 128092202 128092499 + 0.5 NA intron (NM_001046, intron 1 of 26) intron (NM_001046, intron 1 of 26) 8584 NM_001256461 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 153-82 chr2 240473013 240473445 + 0.5 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -16529 NR_161169 100130449 Hs.655753 NR_024014 LOC100130449 - uncharacterized LOC100130449 ncRNA 114.25-3 chr1 68083662 68084028 + 0.5 NA intron (NR_040077, intron 3 of 9) intron (NR_040077, intron 3 of 9) -32214 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 124-76 chr19 44660707 44661157 + 0.5 NA intron (NM_006505, intron 6 of 7) intron (NM_006505, intron 6 of 7) -7200 NR_039756 100616355 NR_039756 ENSG00000283673 MIR4531 - microRNA 4531 ncRNA 126.5-93 chr17 61654745 61655068 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -63687 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 160.25-97 chr3 85825297 85825759 + 0.5 NA intron (NR_046752, intron 1 of 3) LTR33|LTR|ERVL 2522 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 156.25-45 chr15 61073336 61073845 + 0.5 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 155712 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 118-119 chr3 136782153 136782518 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -29957 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 127.75-188 chr7 31942161 31942664 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 127995 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 174.5-110 chr20 50309819 50310250 + 0.5 NA TTS (NR_109950) TTS (NR_109950) 11308 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 141.75-117 chr3 70388221 70388737 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -75841 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 125.5 chr1 32544889 32545322 + 0.5 NA intron (NM_001040441, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 5678 NM_001040441 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 157.25-155 chr8 124341934 124342287 + 0.5 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER57A-int|LTR|ERV1 30589 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 178.25-101 chr5 157767311 157767983 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 23935 NM_173491 134353 Hs.23648 NM_173491 ENSG00000155858 LSM11 - LSM11, U7 small nuclear RNA associated protein-coding 112.5-102 chr18 70882226 70882500 + 0.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -231409 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 120.5-237 chr9 7379915 7380318 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 419662 NM_001318059 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 113-133 chr4 68272024 68272400 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -26518 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 130.25-27 chr10 62482571 62482941 + 0.5 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) intron (NM_199451, intron 4 of 7) -37692 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 137.5-224 chr7 101627485 101627895 + 0.5 NA intron (NM_138403, intron 1 of 7) intron (NM_138403, intron 1 of 7) 1606 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 126.5-192 chr5 74032070 74032365 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 218671 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 170-7 chr10 32463284 32463930 + 0.5 NA intron (NR_109827, intron 6 of 8) intron (NR_109827, intron 6 of 8) 17467 NR_109827 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 161.75-63 chr2 68661798 68662405 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 18513 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 114.25-26 chr11 36891680 36892094 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -293608 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 131.75-197 chr7 9977790 9978254 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 343752 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 125.25-37 chr11 68620369 68620683 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -64018 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 135.25-127 chr3 34718411 34718823 + 0.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 675406 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 136.25-171 chr6 139738078 139738385 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -32842 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 119-110 chr22 19533199 19533550 + 0.5 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -8037 NM_001130861 7122 Hs.505337 NM_003277 ENSG00000184113 CLDN5 AWAL|BEC1|CPETRL1|TMDVCF|TMVCF claudin 5 protein-coding 117.25-43 chr11 108369197 108369571 + 0.5 NA TTS (NM_000051) TTS (NM_000051) 98145 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 204.75-76 chr3 96291667 96292449 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67906 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 113.75-76 chr16 59254444 59254852 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 500543 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 127.5-205 chr5 155220039 155220393 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 206461 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 126.75-257 chr9 116707680 116707976 + 0.5 NA intron (NM_014010, intron 15 of 21) LTR53-int|LTR|ERVL 20523 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 134.5-46 chr12 22501162 22501454 + 0.5 NA intron (NM_001286176, intron 10 of 26) intron (NM_001286176, intron 10 of 26) 42889 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 117.75-45 chr12 77022485 77022898 + 0.5 NA 3' UTR (NM_203394, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_203394, exon 13 of 13) 42878 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 176.5-43 chr12 88417519 88418126 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 162649 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 161.5-47 chr12 86450922 86451443 + 0.5 NA intron (NM_013244, intron 1 of 6) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -193883 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 124-108 chr22 24559472 24559888 + 0.5 NA intron (NR_103819, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 3681 NM_004175 6634 Hs.356549 NM_004175 ENSG00000100028 SNRPD3 SMD3|Sm-D3 small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide protein-coding 116.25-86 chr17 80902619 80902890 + 0.5 NA intron (NM_020761, intron 20 of 33) intron (NM_020761, intron 20 of 33) 68459 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 123.25-4 chr1 47949232 47949714 + 0.5 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu 47912 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 117.75-215 chr8 128427180 128427603 + 0.5 NA intron (NR_121672, intron 3 of 7) intron (NR_121672, intron 3 of 7) 137288 NR_121672 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 113.25-16 chr10 7524281 7524556 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 95255 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 117.25-188 chr6 100469128 100469378 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5578 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 195.5-144 chr7 8542692 8543164 + 0.5 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 109319 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 128.75-48 chr12 115582422 115582913 + 0.5 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 565987 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 116.75-137 chr3 163553072 163553470 + 0.5 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -249970 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 115.75-28 chr11 48016469 48016758 + 0.5 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR 36054 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 147.5-23 chr10 58515261 58515707 + 0.5 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 2612 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 163.75-110 chr5 142705587 142706119 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7783 NM_001257205 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 180.5-164 chr9 35799876 35800520 + 0.5 NA intron (NM_003995, intron 4 of 21) intron (NM_003995, intron 4 of 21) 7789 NM_003995 4882 Hs.78518 NM_000907 ENSG00000159899 NPR2 AMDM|ANPRB|ANPb|ECDM|GUC2B|GUCY2B|NPRB|NPRBi|SNSK natriuretic peptide receptor 2 protein-coding 119.5-228 chr8 42276168 42276516 + 0.5 NA intron (NM_001242778, intron 2 of 20) L1MA5|LINE|L1 5040 NM_001242778 3551 Hs.597664 NM_001556 ENSG00000104365 IKBKB IKK-beta|IKK2|IKKB|IMD15|IMD15A|IMD15B|NFKBIKB inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit beta protein-coding 132-55 chr15 47200108 47200514 + 0.5 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) intron (NM_001198999, intron 1 of 19) 16222 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 154.75-13 chr10 74521626 74522120 + 0.5 NA intron (NR_120673, intron 2 of 4) intron (NR_120673, intron 2 of 4) 7451 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 143.25-77 chr18 54258124 54258486 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11174 NM_007195 11201 Hs.438533 NM_007195 ENSG00000101751 POLI RAD30B|RAD3OB|eta2 DNA polymerase iota protein-coding 122-117 chr3 58197981 58198441 + 0.5 NA intron (NM_004944, intron 5 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 12761 NM_004944 1776 Hs.476453 NM_004944 ENSG00000163687 DNASE1L3 DHP2|DNAS1L3|LSD|SLEB16 deoxyribonuclease 1 like 3 protein-coding 123.25-11 chr1 176056431 176056689 + 0.5 NA intron (NM_022457, intron 11 of 19) intron (NM_022457, intron 11 of 19) -88020 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 170.75-128 chr7 132999104 132999642 + 0.5 NA intron (NM_001317177, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 35542 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 156-137 chr6 150285038 150285455 + 0.5 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -83766 NM_001164694 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 128.75-186 chr7 81861255 81861612 + 0.5 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -91386 NM_001010932 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 160-80 chr4 134919873 134920358 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 203444 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 188.25-8 chr10 24473942 24474504 + 0.5 NA intron (NM_001282770, intron 2 of 11) intron (NM_001282770, intron 2 of 11) 7692 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 134-106 chr2 218665321 218665831 + 0.5 NA intron (NM_022453, intron 7 of 9) AluSz|SINE|Alu 5893 NM_001371456 168-111 chr6 78737680 78738088 + 0.5 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -129667 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 165.5-42 chr14 32218049 32218550 + 0.5 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -15030 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 137.25-155 chr7 89079395 89079701 + 0.5 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -283811 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 131.25-163 chr5 65685623 65686092 + 0.5 NA intron (NM_019072, intron 5 of 10) intron (NM_019072, intron 5 of 10) 36252 NM_019072 54557 Hs.482301 NM_019072 ENSG00000197860 SGTB SGT2 small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta protein-coding 127.75-169 chr6 42474204 42474672 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -22214 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 155.25-23 chr10 21723470 21724040 + 0.5 NA intron (NM_001195626, intron 14 of 22) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 189583 NM_001195630 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 114.75-106 chr20 47230140 47230467 + 0.5 NA intron (NM_001281774, intron 17 of 23) AluSz|SINE|Alu 63336 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 152.75-90 chr2 177031243 177031748 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 180916 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 119-99 chr2 226777255 226777687 + 0.5 NA intron (NM_005544, intron 1 of 1) intron (NM_005544, intron 1 of 1) 21319 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 129-81 chr19 15130585 15130900 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4956 NM_006844 10994 Hs.78880 NM_006844 ENSG00000105135 ILVBL 209L8|AHAS|HACL1L|ILV2H ilvB acetolactate synthase like protein-coding 179.25-62 chr17 64201598 64202197 + 0.5 NA intron (NM_018469, intron 2 of 11) intron (NM_018469, intron 2 of 11) 28837 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 182.5-69 chr18 3511974 3512590 + 0.5 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) intron (NM_001242762, intron 7 of 9) 46032 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 143.25-20 chr10 79049004 79049530 + 0.5 NA intron (NR_024429, intron 3 of 7) intron (NR_024429, intron 3 of 7) 18181 NR_015429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 140.5-247 chr9 112345747 112346135 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12277 NM_001163790 9991 Hs.269988 NM_005156 ENSG00000119314 PTBP3 ROD1 polypyrimidine tract binding protein 3 protein-coding 122-193 chr8 135462580 135462927 + 0.5 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR 5297 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 122.25-27 chr10 111543938 111544390 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 429873 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 137-148 chr6 43693776 43694099 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6125 NM_018135 55168 Hs.520149 NM_018135 ENSG00000096080 MRPS18A HumanS18b|MRP-S18-3|MRP-S18-a|MRPS18-3|S18bmt|S18mt-a mitochondrial ribosomal protein S18A protein-coding 124-115 chr3 137293041 137293375 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 335225 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 133.75-103 chr2 150514273 150514662 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26772 NM_005168 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 185.25-34 chr15 64555235 64555807 + 0.5 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 56101 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 136.25-129 chr4 59775800 59776219 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 762436 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 119-2 chr1 35755119 35755501 + 0.5 NA intron (NM_001330490, intron 8 of 24) AluSx|SINE|Alu 14668 NM_022111 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 175.5-158 chr8 61088324 61088731 + 0.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -120779 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 120.25-203 chr7 87473826 87474239 + 0.5 NA intron (NM_018849, intron 2 of 27) intron (NM_018849, intron 2 of 27) 1648 NM_000443 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 116.25-159 chr4 8434238 8434569 + 0.5 NA intron (NM_003501, intron 1 of 17) HERV3-int|LTR|ERV1 6320 NM_003501 8310 Hs.479122 NM_003501 ENSG00000087008 ACOX3 - acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl protein-coding 113.75-136 chr4 53784063 53784458 + 0.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 88359 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 158.25-108 chr5 30727958 30728441 + 0.5 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -465487 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 149.75-92 chr2 169601882 169602340 + 0.5 NA intron (NM_004792, intron 1 of 13) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 17760 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 159.75-73 chr2 26047927 26048412 + 0.5 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) L1MD2|LINE|L1 14085 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 113.75-29 chr10 128206031 128206309 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79747 NM_002417 4288 Hs.80976 NM_002417 ENSG00000148773 MKI67 KIA|MIB-|MIB-1|PPP1R105 marker of proliferation Ki-67 protein-coding 115.5-108 chr19 46858910 46859216 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1934 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 127.25-38 chr12 1374679 1375105 + 0.5 NA intron (NR_027948, intron 16 of 19) intron (NR_027948, intron 16 of 19) -125599 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 127.25-28 chr11 6919016 6919288 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1850 NM_001004684 120775 Hs.446766 NM_001004684 ENSG00000178358 OR2D3 OR11-89 olfactory receptor family 2 subfamily D member 3 protein-coding 117.25-200 chr7 48598728 48599186 + 0.5 NA intron (NM_152701, intron 58 of 61) L1MB8|LINE|L1 -325590 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 116-129 chr5 117500165 117500397 + 0.5 NA intron (NR_046089, intron 3 of 5) intron (NR_046089, intron 3 of 5) 84769 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 118.75-21 chr10 32765825 32766273 + 0.5 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 135423 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 173.5-54 chr17 58651484 58651890 + 0.5 NA intron (NM_031272, intron 2 of 31) intron (NM_031272, intron 2 of 31) 40368 NM_198393 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 122.75-86 chr2 22788380 22788804 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 252113 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 164.5-83 chr18 4564740 4565115 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -109620 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 161.25-102 chr2 214447208 214447806 + 0.5 NA intron (NM_001080500, intron 3 of 3) intron (NM_001080500, intron 3 of 3) 36453 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 113.75-143 chr4 127285466 127285827 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -347311 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 153.5-61 chr14 102082565 102083057 + 0.5 NA intron (NM_001017963, intron 10 of 11) AluSc8|SINE|Alu 4233 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 133.25-133 chr3 50931250 50931694 + 0.5 NA intron (NM_004947, intron 4 of 52) intron (NM_004947, intron 4 of 52) 256392 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 124-103 chr20 46592023 46592468 + 0.5 NA intron (NM_001193340, intron 7 of 12) (CATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -41591 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 120-12 chr1 244188111 244188496 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 135098 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 151.25-13 chr10 19628490 19628922 + 0.5 NA intron (NM_001142308, intron 36 of 39) intron (NM_001142308, intron 36 of 39) 99844 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 113.75-180 chr7 104386191 104386597 + 0.5 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 57738 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 117.75-39 chr11 110891779 110892078 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -178739 NM_001258418 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 145.25-74 chr2 113991776 113992118 + 0.5 NA intron (NR_148508, intron 1 of 1) intron (NR_148508, intron 1 of 1) -11963 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 115.25-35 chr11 40443008 40443306 + 0.5 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -150027 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 174.25-22 chr11 35509101 35509558 + 0.5 NA intron (NM_015430, intron 1 of 11) intron (NM_015430, intron 1 of 11) 16287 NM_015430 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 158.75-156 chr8 18014229 18014643 + 0.5 NA intron (NM_001352648, intron 36 of 39) MER5A|DNA|hAT-Charlie 68760 NM_001363743 427 Hs.527412 NM_004315 ENSG00000104763 ASAH1 AC|ACDase|ASAH|PHP|PHP32|SMAPME N-acylsphingosine amidohydrolase 1 protein-coding 141-159 chr9 20555020 20555325 + 0.5 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) -52830 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 145.25-41 chr14 78073086 78073397 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -97132 NR_158973 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 138.5-34 chr11 42977164 42977604 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 291985 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 162.75-73 chr2 135030209 135030666 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5759 NM_001282883 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 146.75-176 chr9 74751805 74752236 + 0.5 NA intron (NM_017662, intron 29 of 38) L3|LINE|CR1 135327 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 130.25-205 chr8 120975309 120975670 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -163443 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 119.75-183 chr6 114188656 114189093 + 0.5 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) HAL1|LINE|L1 -125997 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 149.5-57 chr14 43392588 43393056 + 0.5 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 1114461 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 135.5-168 chr5 159473969 159474442 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -7929 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 124.25-104 chr2 182501397 182501849 + 0.5 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 20903 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 131.5-176 chr4 62726609 62727052 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -565065 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 118.5-85 chr2 14480670 14480976 + 0.5 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -79865 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 132-36 chr12 18833962 18834340 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 96032 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 162.25-129 chr5 52798077 52798608 + 0.5 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) intron (NM_181501, intron 1 of 28) 10426 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 118.5-45 chr12 65508744 65509151 + 0.5 NA intron (NR_120431, intron 2 of 3) intron (NR_120431, intron 2 of 3) 48364 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 118.75-206 chr8 140133441 140133848 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1MB4|LINE|L1 -33109 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 121-183 chr7 133726111 133726538 + 0.5 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) L2a|LINE|L2 98564 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 150.25-24 chr10 105930588 105931073 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -110497 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 141.25-69 chr17 70793108 70793560 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 408845 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 145.75-100 chr3 73976446 73976830 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 167394 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 156.5-28 chr11 83798884 83799405 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) intron (NM_001142699, intron 17 of 27) -116719 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 151.75-4 chr1 51192275 51192716 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 42601 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 117.75-148 chr4 20427764 20428185 + 0.5 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) MIRb|SINE|MIR 35785 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 169.25-74 chr3 102692053 102692599 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 257311 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 120-70 chr17 29018808 29019175 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12551 NM_001290202 124925 Hs.21837 NM_178860 ENSG00000063015 SEZ6 BSRPC seizure related 6 homolog protein-coding 134-88 chr2 46634376 46634762 + 0.5 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 17354 NM_014171 9419 Hs.133998 NM_014171 ENSG00000119878 CRIPT HSPC139|SSMDF CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain protein-coding 147.75-58 chr18 30356392 30356687 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 57629 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 198-56 chr4 49102983 49103656 + 0.5 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 116677 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 135.25-106 chr2 144791341 144791806 + 0.5 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 123606 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 154.75-21 chr11 57312751 57313342 + 0.5 NA exon (NM_033396, exon 5 of 12) exon (NM_033396, exon 5 of 12) 11906 NM_033396 85456 Hs.530730 NM_033396 ENSG00000149115 TNKS1BP1 TAB182 tankyrase 1 binding protein 1 protein-coding 152.5-16 chr10 52435887 52436375 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 19141 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 152.5-85 chr2 58027834 58028255 + 0.5 NA intron (NM_001288837, intron 3 of 15) intron (NM_001288837, intron 3 of 15) -18598 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 122.75-5 chr1 49873460 49873931 + 0.5 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) MER4C|LTR|ERV1 150259 NM_032785 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 170.25-42 chr15 61592460 61592925 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -137226 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 157.5-183 chr6 152908101 152908614 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 74684 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 147.5-117 chr2 226100820 226101276 + 0.5 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -41746 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 167.5-24 chr10 70914346 70914853 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -24454 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 120.75-145 chr6 56443965 56444348 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -50028 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 145.5-10 chr1 74621039 74621515 + 0.5 NA intron (NM_001002912, intron 7 of 14) intron (NM_001002912, intron 7 of 14) 31542 NR_121670 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 128.75-177 chr6 135369303 135369757 + 0.5 NA intron (NM_017651, intron 22 of 27) L1MEc|LINE|L1 128210 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 152.5-177 chr7 30157476 30158012 + 0.5 NA 3' UTR (NM_152793, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_152793, exon 3 of 3) 22758 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 130.75-14 chr1 238713865 238714287 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -228059 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 127.75-175 chr6 119186026 119186452 + 0.5 NA intron (NM_005907, intron 11 of 12) L3|LINE|CR1 -37046 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 207.75-87 chr4 39355224 39355800 + 0.5 NA intron (NM_001204747, intron 1 of 24) L1ME4b|LINE|L1 10850 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 133.5-265 chr8 98897955 98898455 + 0.5 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) intron (NM_001256312, intron 1 of 12) 44405 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 140-167 chr8 102522244 102522688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -29123 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 123.75-122 chr3 107630377 107630727 + 0.5 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) intron (NM_001276286, intron 2 of 16) 107590 NM_001276286 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 117-107 chr20 53732478 53732832 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 124301 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 168.5-57 chr14 82173553 82173966 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -430621 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 143.75-99 chr2 163622601 163623092 + 0.5 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 113162 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 116.25-49 chr12 47552722 47553119 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 137912 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 201.5-33 chr11 37338086 37338628 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -600244 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 113.5-225 chr8 9252795 9253157 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63977 NR_125431 101929128 NR_125431 ENSG00000248538 LOC101929128 - uncharacterized LOC101929128 ncRNA 133.5-234 chr6 73361644 73362101 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001017361) promoter-TSS (NM_001017361) -786 NM_001017361 154288 Hs.128326 NM_001017361 ENSG00000203908 KHDC3L C6orf221|ECAT1|HYDM2 KH domain containing 3 like, subcortical maternal complex member protein-coding 113.75-155 chr5 66843646 66843921 + 0.5 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) intron (NM_015183, intron 1 of 27) 15010 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 130-43 chr14 66976327 66976701 + 0.5 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -212926 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 121.75-136 chr4 137727514 137727914 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 181983 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 172.5-149 chr4 116895109 116895643 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 190200 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 134-165 chr7 114030075 114030442 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56069 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 126.75-108 chr2 67730086 67730444 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 95297 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 142-164 chr8 109435839 109436283 + 0.5 NA intron (NM_177531, intron 29 of 77) intron (NM_177531, intron 29 of 77) 73600 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 115.75-212 chr8 70845961 70846292 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 176787 NM_001287259 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 112.75-192 chr7 81901513 81901865 + 0.5 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -107488 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 114.25-68 chr16 61059113 61059525 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3553 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 162.75-12 chr10 26836489 26836926 + 0.5 NA intron (NM_001012752, intron 1 of 9) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 24380 NM_001348032 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 163.25-31 chr12 42870790 42871139 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 178748 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 127.25-8 chr1 189625256 189625569 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 850598 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 189.25-76 chr3 59997966 59998630 + 0.5 NA intron (NM_001320901, intron 5 of 6) intron (NM_001320901, intron 5 of 6) 82611 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 116.25-217 chr7 111933928 111934274 + 0.5 NA intron (NM_001363540, intron 12 of 52) intron (NM_001363540, intron 12 of 52) 125596 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 144-28 chr11 82905468 82905928 + 0.5 NA intron (NM_001363481, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 -3958 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 157.5-96 chr2 46515808 46516434 + 0.5 NA intron (NM_001371283, intron 3 of 3) L1MB1|LINE|L1 -26369 NM_012249 23433 Hs.709193 NM_012249 ENSG00000119729 RHOQ ARHQ|HEL-S-42|RASL7A|TC10|TC10A ras homolog family member Q protein-coding 148.75-47 chr12 125915829 125916329 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 67295 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 127.75-91 chr2 31085588 31085964 + 0.5 NA intron (NM_001329095, intron 1 of 15) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 43864 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 148-30 chr14 65720015 65720570 + 0.5 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) L1M1|LINE|L1 249190 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 139-151 chr8 115177717 115178245 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 490032 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 165.25-5 chr1 93082774 93083308 + 0.5 NA intron (NM_001164393, intron 1 of 12) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 3758 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 146.5-130 chr22 20399369 20399819 + 0.5 NA intron (NM_001256525, intron 2 of 4) AluSq2|SINE|Alu 5443 NM_001256525 7625 Hs.517418 NM_003426 ENSG00000185252 ZNF74 COS52|ZFP520|ZNF520|hZNF7 zinc finger protein 74 protein-coding 148.25-154 chr9 74490865 74491303 + 0.5 NA intron (NR_125791, intron 1 of 4) intron (NR_125791, intron 1 of 4) -6251 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 138.5-85 chr18 3459984 3460480 + 0.5 NA TTS (NM_170695) TTS (NM_170695) -6018 NR_110428 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 139.5-64 chr14 55019857 55020330 + 0.5 NA intron (NM_001008396, intron 1 of 24) L2c|LINE|L2 7006 NM_001008396 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 153-58 chr16 85491440 85492034 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -119672 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 113.75-73 chr15 92149106 92149493 + 0.5 NA intron (NR_135775, intron 8 of 10) intron (NR_135775, intron 8 of 10) -244582 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 151.75-86 chr22 31935944 31936410 + 0.5 NA intron (NR_126507, intron 2 of 2) intron (NR_126507, intron 2 of 2) 2277 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 225.75-15 chr10 102296222 102296877 + 0.5 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) AluSg7|SINE|Alu 51017 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 139.5-163 chr4 178146874 178147233 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -239117 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 128.75-22 chr10 83842757 83843129 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -165854 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 128.75-63 chr15 66525839 66526304 + 0.5 NA intron (NM_001287823, intron 7 of 17) intron (NM_001287823, intron 7 of 17) 20745 NM_001287821 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 116.25-136 chr3 36848260 36848584 + 0.5 NA intron (NM_001329998, intron 15 of 23) intron (NM_001329998, intron 15 of 23) -25922 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 126-93 chr2 48076139 48076440 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -170496 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 133.25-82 chr18 22704138 22704640 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 82448 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 150-108 chr4 61565395 61565756 + 0.5 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) AluSq2|SINE|Alu 363403 NM_001371342 168.75-55 chr15 69658899 69659572 + 0.5 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) AluJr|SINE|Alu 67035 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 122.25-20 chr10 19922421 19922731 + 0.5 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 106144 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 114.75-90 chr2 71813395 71813800 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 334265 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 129-27 chr10 102437329 102437809 + 0.5 NA TTS (NR_030169) TTS (NR_030169) 1057 NR_030169 574447 NR_030169 ENSG00000202569 MIR146B MIRN146B|miRNA146B|mir-146b microRNA 146b ncRNA 133-147 chr5 179200698 179201168 + 0.5 NA intron (NM_014244, intron 4 of 21) intron (NM_014244, intron 4 of 21) 140560 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 164-19 chr11 50618086 50618548 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 209170 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 133.25-219 chr8 144418527 144419024 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1931 NM_130849 55630 Hs.521934 NM_017767 ENSG00000147804 SLC39A4 AEZ|AWMS2|ZIP4 solute carrier family 39 member 4 protein-coding 133.5-45 chr11 12779005 12779473 + 0.5 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 104818 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 145.25-90 chr20 63302719 63303144 + 0.5 NA intron (NM_020882, intron 3 of 35) L1MC5a|LINE|L1 9745 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 134.25-144 chr5 74822609 74822940 + 0.5 NA intron (NR_046462, intron 4 of 11) L2c|LINE|L2 -43119 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 141.75-129 chr4 109735603 109736093 + 0.5 NA Intergenic LTR76|LTR|ERV1 -5778 NM_030821 81579 Hs.389452 NM_030821 ENSG00000123739 PLA2G12A GXII|PLA2G12|ROSSY phospholipase A2 group XIIA protein-coding 141-47 chr14 65348476 65348900 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -13505 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 159-132 chr9 101567152 101567675 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27556 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 170.75-22 chr11 115207159 115207600 + 0.5 NA intron (NM_001301045, intron 7 of 10) intron (NM_001301045, intron 7 of 10) -126198 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 122-17 chr1 116949971 116950315 + 0.5 NA intron (NM_020440, intron 4 of 8) intron (NM_020440, intron 4 of 8) 40227 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 115.25-177 chr6 151007491 151007779 + 0.5 NA 5' UTR (NM_001350490, exon 1 of 10) 5' UTR (NM_001350490, exon 1 of 10) 627 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 196.25-28 chr12 133026618 133027213 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001330513, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001330513, exon 5 of 5) 10307 NR_110091 101928597 Hs.638942 NR_110091 ENSG00000246394 ZNF84-DT - ZNF84 divergent transcript ncRNA 195.25-53 chr2 128816601 128817206 + 0.5 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -47697 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 143.5-146 chr3 109199478 109199892 + 0.5 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy 21520 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 138-16 chr11 4214111 4214517 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 27162 NR_047550 100506082 Hs.445705 NR_047550 ENSG00000254480 LINC02749 - long intergenic non-protein coding RNA 2749 ncRNA 139.5 chr1 47432268 47432806 + 0.5 NA non-coding (NR_026878, exon 1 of 1) non-coding (NR_026878, exon 1 of 1) 2104 NR_026878 84793 Hs.127762 NM_032707 ENSG00000237424 FOXD2-AS1 - FOXD2 adjacent opposite strand RNA 1 ncRNA 129-161 chr7 33984165 33984546 + 0.5 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) AluSg|SINE|Alu 78816 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 134.25-44 chr13 66911592 66911971 + 0.5 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) -65608 NR_046636 100874086 Hs.577908 NR_046636 ENSG00000225263 PCDH9-AS3 - PCDH9 antisense RNA 3 ncRNA 157.5-23 chr10 61874478 61874964 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -26978 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 143.75-12 chr10 26283998 26284407 + 0.5 NA intron (NM_000818, intron 12 of 16) MER103C|DNA|hAT-Charlie 67428 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 143.5-149 chr3 137410571 137411045 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -353507 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 142.25-19 chr10 35032830 35033348 + 0.5 NA intron (NM_003591, intron 11 of 20) intron (NM_003591, intron 11 of 20) 41194 NM_001198778 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 169.75-113 chr4 66972101 66972725 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 449587 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 156.25-78 chr2 177501689 177502078 + 0.5 NA intron (NM_003659, intron 14 of 19) AluSg|SINE|Alu 50913 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 123.5-50 chr12 51493740 51494073 + 0.5 NA intron (NM_001039960, intron 20 of 24) intron (NM_001039960, intron 20 of 24) 68789 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 142.75-45 chr12 33376569 33376961 + 0.5 NA 3' UTR (NM_198992, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_198992, exon 7 of 7) 63054 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 165-8 chr1 203536351 203536964 + 0.5 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 42504 NM_014359 26254 Hs.632468 NM_014359 ENSG00000188770 OPTC OPT opticin protein-coding 117.5-14 chr1 183317240 183317615 + 0.5 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu -12553 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 136.25-110 chr20 54489849 54490175 + 0.5 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) L1MC|LINE|L1 14419 NM_001294161 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 114-79 chr2 100609797 100610247 + 0.5 NA TTS (NR_146956) TTS (NR_146956) 6283 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 122.5-113 chr2 133205634 133206031 + 0.5 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) L1M5|LINE|L1 -60363 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 128-181 chrX 122115077 122115471 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 744302 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 153-9 chr10 43084890 43085387 + 0.5 NA intron (NM_020630, intron 1 of 18) intron (NM_020630, intron 1 of 18) 8069 NM_020975 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 129-65 chr14 68631821 68632117 + 0.5 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) -3182 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 114.25-136 chr4 45049058 45049439 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -322614 NM_001270880 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 143.5-50 chr13 46975528 46975931 + 0.5 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -78653 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 136.75-105 chr2 139481610 139481989 + 0.5 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 584475 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 135.5-29 chr10 120311995 120312429 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 43011 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 119.5-114 chr2 29724767 29725149 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 196628 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 164-134 chr8 33881465 33881950 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -281601 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 149.25-26 chr11 13642900 13643400 + 0.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -25518 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 137.75-15 chr1 202664893 202665431 + 0.5 NA intron (NM_177402, intron 1 of 8) intron (NM_177402, intron 1 of 8) -21709 NM_001136504 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 123.25-161 chr5 63435588 63435981 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 526508 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 124.5-81 chr17 57931326 57931666 + 0.5 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) intron (NM_001271875, intron 1 of 10) 23916 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 151-142 chrX 57212421 57213012 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -73961 NM_001353840 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 112.25-170 chr5 116347970 116348388 + 0.5 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 26391 NR_104675 101927190 Hs.639849 NR_104675 LOC101927190 - uncharacterized LOC101927190 ncRNA 145.25-44 chr14 97665232 97665551 + 0.5 NA intron (NR_033943, intron 2 of 3) intron (NR_033943, intron 2 of 3) 21267 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 132-156 chr7 3838358 3838785 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -291114 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 128.5-72 chr15 62935640 62936046 + 0.5 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -106904 NM_001365778 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 146.25-128 chr6 148520618 148521149 + 0.5 NA intron (NM_001346509, intron 3 of 12) intron (NM_001346509, intron 3 of 12) 11732 NM_001346509 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 143.25-152 chr5 180811035 180811547 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001364384) promoter-TSS (NM_001364384) -835 NM_001364384 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 173.5-45 chr15 61392197 61392720 + 0.5 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -163156 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 135.75-92 chr2 40792222 40792681 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -280016 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 126.25-56 chr14 89900493 89900910 + 0.5 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) intron (NM_001284269, intron 5 of 5) 53835 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 119.5-192 chr6 22697756 22698085 + 0.5 NA intron (NR_134614, intron 1 of 2) intron (NR_134614, intron 1 of 2) 20004 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 164.5-90 chr2 34709158 34709648 + 0.5 NA intron (NR_126404, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 31846 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 164.25-46 chr15 65307868 65308395 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 3454 NR_002757 26832 NR_002757 ENSG00000200156 RNU5B-1 RNU5B|RNU5B-1P|U5B1 RNA, U5B small nuclear 1 snRNA 124-125 chr4 84365250 84365703 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -66307 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 130.25-157 chr5 24877343 24877709 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -36943 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 133-135 chr5 40511473 40511834 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -168262 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 156.5-187 chr8 48448309 48448899 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -102963 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 121.5-126 chr2 31696884 31697248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106914 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 152-164 chrX 92280302 92280755 + 0.5 NA intron (NM_032968, intron 4 of 6) (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 445067 NM_001168363 27328 Hs.655673 NM_014522 ENSG00000102290 PCDH11X PCDH-X|PCDH-Y|PCDH11|PCDH11Y|PCDH22|PCDHX|PPP1R119 protocadherin 11 X-linked protein-coding 161.25-82 chr19 37734946 37735417 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15420 NM_032689 84775 Hs.116622 NM_032689 ENSG00000198182 ZNF607 - zinc finger protein 607 protein-coding 181-112 chr8 118323414 118323911 + 0.5 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) AluSz6|SINE|Alu -211843 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 121.5-129 chr2 50206135 50206475 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 141449 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 124-33 chr12 116099118 116099466 + 0.5 NA intron (NM_015335, intron 3 of 30) intron (NM_015335, intron 3 of 30) 49362 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 157-85 chr4 71810802 71811369 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5565 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 158.75-125 chr4 76000935 76001364 + 0.5 NA TTS (NM_002416) TTS (NM_002416) 6360 NM_002416 4283 Hs.77367 NM_002416 ENSG00000138755 CXCL9 CMK|Humig|MIG|SCYB9|crg-10 C-X-C motif chemokine ligand 9 protein-coding 159-47 chr18 72164975 72165481 + 0.5 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 379114 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 127-160 chr7 37641073 37641416 + 0.5 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -42522 NM_181791 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 152-48 chr14 46832518 46832827 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -180891 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 150-5 chr1 76059021 76059584 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -15444 NM_001349107 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 117.5-189 chr5 112404998 112405456 + 0.5 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 14050 NM_001347888 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 121.75-94 chr2 204747915 204748315 + 0.5 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 202640 NM_001302769 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 132.75-133 chr4 12299193 12299579 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 75935 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 115.25-3 chr1 31761565 31761917 + 0.5 NA intron (NM_001294335, intron 1 of 32) intron (NM_001294335, intron 1 of 32) 2309 NM_001364857 576 Hs.524138 NM_001294335 ENSG00000121753 ADGRB2 BAI2 adhesion G protein-coupled receptor B2 protein-coding 113.75-77 chr16 64923938 64924370 + 0.5 NA Intergenic L3|LINE|CR1 197909 NM_001797 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 131-123 chr3 159068604 159068968 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001042706) promoter-TSS (NM_001042706) -466 NM_001042705 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 116.5-100 chr18 9741981 9742437 + 0.5 NA intron (NM_006868, intron 1 of 6) MER110A|LTR|ERV1 33908 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 133.75-144 chr3 178637384 178637851 + 0.5 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 78767 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 144.25-222 chr9 124758916 124759343 + 0.5 NA intron (NM_001278546, intron 1 of 9) intron (NM_001278546, intron 1 of 9) 12182 NM_001278546 2649 Hs.20131 NM_001489 ENSG00000148200 NR6A1 CT150|GCNF|GCNF1|NR61|RTR|hGCNF|hRTR nuclear receptor subfamily 6 group A member 1 protein-coding 147.75-52 chr17 58965898 58966397 + 0.5 NA intron (NM_014906, intron 3 of 6) L1ME4b|LINE|L1 140733 NR_148347 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 117.75-124 chr20 46229295 46229660 + 0.5 NA intron (NM_021248, intron 3 of 11) intron (NM_021248, intron 3 of 11) 79021 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 181.5-98 chr21 26469518 26470063 + 0.5 NA intron (NR_135472, intron 4 of 4) L1MA5A|LINE|L1 63847 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 151.5-72 chr19 48739074 48739431 + 0.5 NA exon (NM_017805, exon 3 of 12) exon (NM_017805, exon 3 of 12) 1358 NM_017805 54922 Hs.233955 NM_017805 ENSG00000105538 RASIP1 RAIN Ras interacting protein 1 protein-coding 166.75-80 chr2 183984394 183985011 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -394273 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 118-112 chr3 72663894 72664305 + 0.5 NA non-coding (NR_135531, exon 1 of 2) non-coding (NR_135531, exon 1 of 2) 150 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 126.75-173 chr4 67995032 67995339 + 0.5 NA intron (NR_033737, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 2254 NR_033737 644759 Hs.646883 NR_033737 ENSG00000229009 TMPRSS11GP - transmembrane serine protease 11G, pseudogene pseudo 141.5 chr1 8608321 8608792 + 0.5 NA intron (NM_001042681, intron 4 of 22) intron (NM_001042681, intron 4 of 22) -113643 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 177.5-3 chr1 33614662 33615205 + 0.5 NA intron (NM_052896, intron 39 of 69) intron (NM_052896, intron 39 of 69) 142288 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 144.5-26 chr10 19178215 19178695 + 0.5 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) intron (NM_001142308, intron 14 of 39) 129654 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 201-40 chr18 8140949 8141594 + 0.5 NA intron (NM_002845, intron 13 of 30) intron (NM_002845, intron 13 of 30) 225763 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 129.25-219 chr9 97300911 97301237 + 0.5 NA intron (NR_036528, intron 14 of 50) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -6263 NM_001348010 100499483 Hs.435629 NM_020893 ENSG00000197816 CCDC180 C9orf174 coiled-coil domain containing 180 protein-coding 160.75-27 chr11 110923624 110924051 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 173481 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 135-67 chr18 33744635 33745074 + 0.5 NA exon (NM_030632, exon 12 of 12) exon (NM_030632, exon 12 of 12) 166635 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 127.75-200 chr8 91980343 91980849 + 0.5 NA intron (NM_004349, intron 8 of 10) intron (NM_004349, intron 8 of 10) 37084 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 133.25-69 chr16 50453774 50454078 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -58793 NR_146572 105371248 NR_146572 ENSG00000261092 LINC02178 - long intergenic non-protein coding RNA 2178 ncRNA 137.25-176 chr9 30983341 30983700 + 0.5 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 397970 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 119.5-123 chr2 67365098 67365418 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -32075 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 173-63 chr2 38614414 38614860 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -11601 NM_001142650 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 117-47 chr13 30377129 30377449 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -3375 NR_024464 100188949 Hs.439791 NR_024464 ENSG00000238121 LINC00426 - long intergenic non-protein coding RNA 426 ncRNA 151.5-154 chr5 98152418 98152937 + 0.5 NA intron (NR_146477, intron 3 of 4) LTR33A|LTR|ERVL 8562 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 134.75-173 chr5 13311176 13311480 + 0.5 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -278442 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 126-57 chr14 73353845 73354343 + 0.5 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) intron (NM_001005743, intron 4 of 12) 104486 NM_001005745 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 116-105 chr3 87101552 87101945 + 0.5 NA intron (NR_104153, intron 1 of 2) intron (NR_104153, intron 1 of 2) 12468 NR_047469 100846978 Hs.570649 NR_047469 ENSG00000281392 LINC00506 - long intergenic non-protein coding RNA 506 ncRNA 120.75-62 chr17 66902762 66903098 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -61777 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 197.5-155 chr8 48445026 48445542 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -106283 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 149.25-130 chr4 76284435 76284843 + 0.5 NA TTS (NM_001242936) TTS (NM_001242936) -21387 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 112.25-223 chr8 131937939 131938307 + 0.5 NA intron (NM_001323557, intron 1 of 22) intron (NM_001323557, intron 1 of 22) 21350 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 125-38 chr13 110780453 110780714 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32501 NR_135280 283486 Hs.447504 NR_135280 ENSG00000259831 LINC00567 - long intergenic non-protein coding RNA 567 ncRNA 113.75-137 chr4 53799280 53799710 + 0.5 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 103594 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 143-117 chr5 88660113 88660562 + 0.5 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) intron (NR_152235, intron 2 of 3) 6602 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 158.25-131 chr7 24957479 24957980 + 0.5 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) 22449 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 124.25-169 chr5 124248542 124248962 + 0.5 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1PB3|LINE|L1 189768 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 140-156 chr7 24756555 24756881 + 0.5 NA intron (NM_004403, intron 1 of 9) intron (NM_004403, intron 1 of 9) 746 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 164.75-120 chr6 6157976 6158406 + 0.5 NA intron (NM_000129, intron 13 of 14) intron (NM_000129, intron 13 of 14) -11143 NR_049863 100847034 NR_049863 ENSG00000283616 MIR5683 - microRNA 5683 ncRNA 131.5-205 chr6 73131239 73131757 + 0.5 NA intron (NM_001160132, intron 9 of 13) intron (NM_001160132, intron 9 of 13) 12016 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 114.25-105 chr2 169143970 169144286 + 0.5 NA intron (NM_004525, intron 70 of 78) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 63021 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 122.75-203 chr8 104763803 104764164 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -174959 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 168.75-28 chr11 84069958 84070467 + 0.5 NA intron (NM_001142699, intron 10 of 27) intron (NM_001142699, intron 10 of 27) 203068 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 163-110 chr7 4017916 4018493 + 0.5 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) intron (NM_152744, intron 17 of 44) -111481 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 118.75-108 chr2 154636075 154636543 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -62272 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 173.25-123 chr8 28281154 28281668 + 0.5 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -35857 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 132.25-159 chr5 141273642 141274093 + 0.5 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 28472 NM_018935 56121 Hs.130757 NM_018935 ENSG00000113248 PCDHB15 PCDH-BETA15 protocadherin beta 15 protein-coding 128.5-127 chr21 19098537 19098944 + 0.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -338928 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 147-47 chr16 29936456 29936833 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -10418 NR_110933 253980 Hs.534590 NM_178863 ENSG00000174943 KCTD13 BACURD1|FKSG86|PDIP1|POLDIP1|hBACURD1 potassium channel tetramerization domain containing 13 protein-coding 123.75-187 chr8 86989705 86990131 + 0.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA3|LINE|L1 123503 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 150.5-106 chr2 180165613 180166078 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -158548 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 115.25-203 chr8 78392111 78392500 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -124035 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 114.25-86 chr2 17626656 17626976 + 0.5 NA intron (NM_001366805, intron 2 of 2) intron (NM_001366805, intron 2 of 2) 86120 NM_001366805 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 121.25-54 chr14 42912714 42913116 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1306059 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 228.25-86 chr8 126373618 126374248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 48438 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 123-59 chr15 61395298 61395561 + 0.5 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -166127 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 136-68 chr2 35960960 35961494 + 0.5 NA Intergenic LTR1F2|LTR|ERV1 394343 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 171.5-30 chr11 116675483 116676088 + 0.5 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 36363 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 195.25-37 chr16 35409647 35410363 + 0.5 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 46474 NR_027079 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 157.25-48 chr16 1773164 1773555 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001300900) promoter-TSS (NM_001300900) 131 NM_001257370 197342 Hs.7247 NM_001010865 ENSG00000197774 EME2 SLX2B|gs125 essential meiotic structure-specific endonuclease subunit 2 protein-coding 142-165 chr8 120492924 120493334 + 0.5 NA intron (NM_022045, intron 13 of 21) intron (NM_022045, intron 13 of 21) 47710 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 118-71 chr18 3690948 3691335 + 0.5 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 87404 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 177.25-130 chr6 125712675 125713289 + 0.5 NA intron (NR_038906, intron 3 of 3) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -36650 NM_012259 23493 Hs.144287 NM_012259 ENSG00000135547 HEY2 CHF1|GRIDLOCK|GRL|HERP1|HESR2|HRT2|bHLHb32 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2 protein-coding 112.5-191 chr5 32870076 32870413 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -77199 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 134.25-54 chr14_GL000225v1_random 751 1175 + 0.5 NA NA LSAU|Satellite|Satellite NA NA 126.75-110 chr2 80684056 80684424 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 370861 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 115-146 chr5 145215051 145215372 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 620131 NM_138492 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 161.25-84 chr2 14682574 14683023 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 50081 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 118.25-149 chr5 25031361 25031760 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 159096 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 119.5-108 chr18 69818124 69818595 + 0.5 NA intron (NM_152721, intron 7 of 7) MLT2C1|LTR|ERVL 129514 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 165.75-46 chr13 94292786 94293316 + 0.5 NA intron (NM_005708, intron 5 of 8) intron (NM_005708, intron 5 of 8) -105060 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 186.5-49 chr16 76348136 76348789 + 0.5 NA intron (NM_001322191, intron 2 of 22) L2-3_Crp|LINE|L2 38610 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 155.25-193 chrX 48839299 48839691 + 0.5 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -3885 NM_013271 27344 Hs.522640 NM_013271 ENSG00000102109 PCSK1N BigLEN|PEN|PROSAAS|SAAS|SCG8|SgVIII proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor protein-coding 180.75-51 chr17 54308937 54309465 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 486274 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 140.5-34 chr11 57705713 57706188 + 0.5 NA intron (NR_157587, intron 1 of 4) intron (NR_157587, intron 1 of 4) 6265 NR_157587 219541 Hs.43619 NM_153450 ENSG00000156603 MED19 DT2P1G7|LCMR1|MED19AS mediator complex subunit 19 protein-coding 152.75-156 chr8 131860342 131860945 + 0.5 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA -43450 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 145.75-156 chr7 129411584 129412000 + 0.5 NA intron (NM_001130720, intron 11 of 16) L1MB7|LINE|L1 -22640 NM_020704 57464 Hs.489988 NM_020704 ENSG00000128578 STRIP2 FAM40B|FAR11B striatin interacting protein 2 protein-coding 153-121 chr5 84484883 84485285 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -100204 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 165 chr1 3517663 3518146 + 0.5 NA intron (NM_001409, intron 5 of 36) intron (NM_001409, intron 5 of 36) 42886 NR_030277 693135 NR_030277 ENSG00000207776 MIR551A MIRN551A|mir-551a microRNA 551a ncRNA 115 chr1 37836412 37836672 + 0.5 NA intron (NM_005955, intron 4 of 10) intron (NM_005955, intron 4 of 10) 23050 NM_005955 4520 Hs.471991 NM_005955 ENSG00000188786 MTF1 MTF-1|ZRF metal regulatory transcription factor 1 protein-coding 134.75-40 chr11 34666128 34666567 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 33781 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 130.25-54 chr13 112956508 112956836 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 11966 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 149-126 chr7 114005975 114006402 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -80139 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 173.5-100 chr3 103396305 103396962 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 127483 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 165.25 chr1 10091006 10091488 + 0.5 NA intron (NM_006048, intron 2 of 26) intron (NM_006048, intron 2 of 26) 58289 NM_006048 10277 Hs.593974 NM_006048 ENSG00000130939 UBE4B E4|HDNB1|UBOX3|UFD2|UFD2A ubiquitination factor E4B protein-coding 122.25-139 chr4 55265507 55265864 + 0.5 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -80557 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 113-168 chr7 68174027 68174395 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 153958 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 128.25-200 chr8 30953489 30953782 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -40627 NM_001350162 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 140.5-39 chr11 96327572 96328045 + 0.5 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -13630 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 185.75-17 chr10 80312737 80313437 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -23429 NM_000429 4143 Hs.282670 NM_000429 ENSG00000151224 MAT1A MAT|MATA1|SAMS|SAMS1 methionine adenosyltransferase 1A protein-coding 155.5-11 chr1 80103408 80103907 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -432098 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 153.5-65 chr15 57612485 57612862 + 0.5 NA intron (NM_001018100, intron 2 of 12) intron (NM_001018100, intron 2 of 12) 20769 NR_104371 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 140.75-124 chr3 157803850 157804326 + 0.5 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 260744 NM_001243729 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 137-17 chr1 218478389 218478763 + 0.5 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) L3|LINE|CR1 -31519 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 122.25-147 chr5 17330336 17330740 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56772 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 140-134 chr5 20655175 20655513 + 0.5 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) intron (NR_149120, intron 1 of 11) -39809 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 137.5-227 chr7 112754280 112754740 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 35883 NM_022484 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 125.75-80 chr19 33347589 33348075 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25877 NM_001806 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 115.5-218 chr6 97461222 97461616 + 0.5 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) intron (NR_110757, intron 1 of 4) 155833 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 122.75-217 chrX 11855383 11855694 + 0.5 NA intron (NM_001368398, intron 1 of 18) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 33099 NM_001368395 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 132.25-65 chr15 79562380 79562877 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 130112 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 131.25-224 chrX 98803743 98804005 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1239339 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 127.75-191 chr7 92634873 92635345 + 0.5 NA intron (NM_001259, intron 5 of 7) intron (NM_001259, intron 5 of 7) -44719 NM_152789 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 158-29 chr11 14852664 14853193 + 0.5 NA intron (NM_000922, intron 12 of 15) L2a|LINE|L2 39277 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 121-132 chr3 100062859 100063274 + 0.5 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 51447 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 131-160 chr7 69362886 69363385 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 234489 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 119.75-79 chr17 67571405 67571876 + 0.5 NA intron (NM_181671, intron 4 of 9) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -100055 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 129.75-120 chr3 12254062 12254499 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -33205 NM_001354666 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 142.5-198 chr6 156345746 156346135 + 0.5 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -32810 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 152-107 chr3 168007498 168007990 + 0.5 NA TTS (NM_014498) TTS (NM_014498) 88180 NM_001308155 27333 Hs.143600 NM_014498 ENSG00000173905 GOLIM4 GIMPC|GOLPH4|GPP130|P138 golgi integral membrane protein 4 protein-coding 129.75-159 chr6 56138408 56138820 + 0.5 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) L2|LINE|L2 -46952 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 124.75-163 chr4 148403712 148404149 + 0.5 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) intron (NM_000901, intron 2 of 8) 38484 NR_148974 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 130-171 chr8 114784041 114784500 + 0.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 883743 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 198.25-14 chr10 82014560 82015092 + 0.5 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 137139 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 150.25-58 chr15 66629581 66630081 + 0.5 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) intron (NR_110372, intron 1 of 4) 47641 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 165.5-189 chr8 40710762 40711122 + 0.5 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) AluSc|SINE|Alu 186884 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 152-81 chr2 41008209 41008698 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -496018 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 118.25-68 chr14 77862633 77862954 + 0.5 NA intron (NM_001366489, intron 4 of 9) intron (NM_001366489, intron 4 of 9) 62684 NM_001142545 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 128.25-164 chr5 116702762 116703098 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 59279 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 122-146 chr5 148666322 148666664 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11966 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 115.75-194 chr7 6220610 6220997 + 0.5 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu -48666 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 130-118 chr4 84860263 84860678 + 0.5 NA exon (NM_014991, exon 4 of 68) exon (NM_014991, exon 4 of 68) -105146 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 157-80 chr4 19540366 19540905 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -711270 NM_001289136 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 144.5-75 chr16 11536055 11536445 + 0.5 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -9003 NM_001370704 400499 Hs.459937 NM_001370704 ENSG00000188897 LOC400499 - putative uncharacterized protein LOC400499 protein-coding 141.75-44 chr12 30821072 30821618 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 25664 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 119-72 chr18 11016251 11016550 + 0.5 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 132362 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 144.75-117 chr4 35875653 35876158 + 0.5 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 368034 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 194.75-55 chr2 67527382 67528063 + 0.5 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 130389 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 127.75-133 chr3 121928285 121928629 + 0.5 NA exon (NM_001145998, exon 14 of 21) exon (NM_001145998, exon 14 of 21) 34056 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 147.5-170 chr4 183536130 183536483 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 30224 NM_001291959 3622 Hs.107153 NM_001564 ENSG00000168556 ING2 ING1L|p33ING2 inhibitor of growth family member 2 protein-coding 127.75-9 chr1 42678278 42678723 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -3918 NM_004559 4904 Hs.473583 NM_004559 ENSG00000065978 YBX1 BP-8|CBF-A|CSDA2|CSDB|DBPB|EFI-A|MDR-NF1|NSEP-1|NSEP1|YB-1|YB1 Y-box binding protein 1 protein-coding 116.75-208 chr9 32478709 32479075 + 0.5 NA intron (NM_014314, intron 12 of 17) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 47304 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 175.75-84 chr3 30629572 30630070 + 0.5 NA intron (NM_001024847, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 23220 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 127-11 chr1 219532145 219532496 + 0.5 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 25004 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 137.75-91 chr18 49898750 49899122 + 0.5 NA intron (NM_001080467, intron 21 of 39) MER5B|DNA|hAT-Charlie 84913 NR_003003 677769 NR_003003 ENSG00000267322 SCARNA17 U91 small Cajal body-specific RNA 17 ncRNA 122.75-28 chr11 26494234 26494615 + 0.5 NA intron (NM_001313727, intron 1 of 23) intron (NM_001313727, intron 1 of 23) 20522 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 136.75 chr1 11317231 11317721 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 44278 NM_013319 29914 Hs.522933 NM_013319 ENSG00000120942 UBIAD1 SCCD|TERE1 UbiA prenyltransferase domain containing 1 protein-coding 143.75-100 chr2 165948061 165948576 + 0.5 NA TTS (NR_038983) TTS (NR_038983) 5458 NM_024753 79809 Hs.310672 NM_024753 ENSG00000123607 TTC21B ATD4|IFT139|IFT139B|JBTS11|NPHP12|Nbla10696|SRTD4|THM1 tetratricopeptide repeat domain 21B protein-coding 155-52 chr18 4086377 4086818 + 0.5 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1MCc|LINE|L1 124244 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 128.5-176 chr5 155797890 155798361 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -528632 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 117-57 chr14 65930090 65930460 + 0.5 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 459173 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 199.5-48 chr15 63368795 63369391 + 0.5 NA intron (NR_135511, intron 2 of 9) intron (NR_135511, intron 2 of 9) 12753 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 187.5-148 chr7 8212459 8212928 + 0.5 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 49359 NM_001350825 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 117.25-134 chr22 33990441 33990821 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -67743 NM_001362949 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 161.5-191 chr8 136225360 136225725 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -305256 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 180.5-141 chr7 80901020 80901735 + 0.5 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 17674 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 113.5-66 chr13 83883885 83884214 + 0.5 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1575 NM_001281503 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 122.75-72 chr17 73234317 73234640 + 0.5 NA intron (NR_110105, intron 2 of 4) AluSc|SINE|Alu 1817 NM_001351265 55028 Hs.12929 NM_017941 ENSG00000141219 C17orf80 HLC-8|MIG3|SPEP1 chromosome 17 open reading frame 80 protein-coding 126.5-47 chr12 18994169 18994579 + 0.5 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -135359 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 192.25-68 chr20 56277944 56278463 + 0.5 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 29471 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 179.25-132 chr6 136137921 136138361 + 0.5 NA intron (NM_018945, intron 3 of 12) intron (NM_018945, intron 3 of 12) -65314 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 112.75-178 chr6 71083278 71083600 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -126379 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 118.25-210 chr8 137723575 137723910 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -310154 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 120.5-72 chr14 62675043 62675457 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 370208 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 123-136 chr3 183751614 183751929 + 0.5 NA intron (NM_001351371, intron 9 of 21) L2a|LINE|L2 41532 NM_001351369 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 116.5-222 chr7 1434189 1434559 + 0.5 NA TTS (NM_182924) TTS (NM_182924) 25096 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 136-80 chr2 194870569 194870975 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 140177 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 114.5-211 chr5 63365781 63366058 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 596373 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 125-141 chr6 130898190 130898565 + 0.5 NA intron (NM_001350320, intron 6 of 15) intron (NM_001350320, intron 6 of 15) 70972 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 153.25-71 chr2 159410998 159411326 + 0.5 NA intron (NM_001329858, intron 13 of 36) AluJr4|SINE|Alu -124459 NM_152528 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 125.75-27 chr10 92727887 92728262 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 38119 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 120.5-69 chr14 28752476 28752904 + 0.5 NA intron (NR_125758, intron 2 of 6) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12629 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 124.75-74 chr14 40831068 40831430 + 0.5 NA Intergenic (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -123462 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 127.25-206 chr8 88922550 88922962 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -595273 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 117-155 chr6 41983693 41984073 + 0.5 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) L1MA9|LINE|L1 -42035 NM_001287427 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 146-100 chr4 135028934 135029245 + 0.5 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 94470 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 151.5-77 chr2 35418405 35418807 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -52799 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 187.5-32 chr11 58499707 58500233 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 8135 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 132.75-60 chr14 55938099 55938461 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -141606 NR_026797 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 192.5-39 chr14 52948204 52948779 + 0.5 NA intron (NM_006832, intron 2 of 14) intron (NM_006832, intron 2 of 14) 2559 NM_001135000 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 150-2 chr1 48348421 48348860 + 0.5 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1MC4a|LINE|L1 123564 NM_019073 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 117-101 chr20 15665243 15665683 + 0.5 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 257851 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 122-34 chr10 99143419 99143884 + 0.5 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 92224 NM_001166244 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 126.75-81 chr16 63302567 63302913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -1266302 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 120.75-56 chr16 8409349 8409824 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 180252 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 187.5-138 chr5 72017219 72017644 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -90044 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 131.5-243 chr8 135600065 135600447 + 0.5 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 142800 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 134.75-78 chr15 68583253 68583615 + 0.5 NA intron (NM_006091, intron 1 of 11) MIR3|SINE|MIR 4441 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 128.5-212 chr7 86802993 86803442 + 0.5 NA intron (NM_001363522, intron 3 of 4) intron (NM_001363522, intron 3 of 4) 159303 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 121.75-101 chr20 47992464 47992933 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2581 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 151.25-160 chr5 168901758 168902208 + 0.5 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) AluSc|SINE|Alu -111244 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 116.25-58 chr13 68981077 68981430 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -95928 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 128.5-192 chr6 68414183 68414517 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -84451 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 135-10 chr10 35109092 35109525 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17533 NM_001881 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 139.25-94 chr2 115491391 115491752 + 0.5 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) LTR19A|LTR|ERV1 147756 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 150.5-200 chr7 23119897 23120314 + 0.5 NA intron (NR_033329, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu 13444 NM_018846 55975 Hs.654817 NM_018846 ENSG00000122550 KLHL7 CISS3|KLHL6|SBBI26 kelch like family member 7 protein-coding 137-6 chr1 93164252 93164741 + 0.5 NA intron (NM_001167830, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 15917 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 121.5-133 chr2 77817002 77817440 + 0.5 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) intron (NR_110288, intron 3 of 3) -98713 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 155.25-114 chr22 47401989 47402357 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 56602 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 117.5-171 chr5 18551539 18551919 + 0.5 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 744455 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 175.5-144 chr7 30720904 30721266 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -20982 NM_001202481 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 138.75-124 chr4 28243101 28243559 + 0.5 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -576252 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 119-144 chr5 33003167 33003587 + 0.5 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 55934 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 146-16 chr10 58657841 58658333 + 0.5 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) L1MC4|LINE|L1 -56928 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 118.25-57 chr13 86888310 86888622 + 0.5 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -23454 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 145-113 chr4 107008383 107008831 + 0.5 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 27706 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 160.5-25 chr11 58252838 58253394 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 15144 NM_207374 81341 Hs.531507 NM_207374 ENSG00000172772 OR10W1 OR10W1P|OR10W1Q|OR11-236|UNQ6469 olfactory receptor family 10 subfamily W member 1 protein-coding 180.25-128 chr9 77474927 77475454 + 0.5 NA intron (NR_121184, intron 2 of 4) intron (NR_121184, intron 2 of 4) 27541 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 119.25-221 chr9 73546227 73546673 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 394585 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 141.5-5 chr1 75721526 75721951 + 0.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -2609 NM_001286044 34 Hs.445040 NM_000016 ENSG00000117054 ACADM ACAD1|MCAD|MCADH acyl-CoA dehydrogenase medium chain protein-coding 175-86 chr3 140690543 140691042 + 0.5 NA intron (NM_152616, intron 3 of 4) intron (NM_152616, intron 3 of 4) 12728 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 115.25-193 chr7 108540414 108540786 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12422 NM_001256011 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 119.5-132 chr2 182629317 182629724 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -86737 NM_001271581 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 131-145 chr6 125974833 125975297 + 0.5 NA intron (NM_138571, intron 4 of 4) intron (NM_138571, intron 4 of 4) -11365 NR_146797 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 150.75-146 chr4 105118301 105118680 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -27385 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 122.25-8 chr1 143224068 143224508 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 198304 NR_027354 645166 Hs.744183 NR_027354 LSP1P5 - LSP1 pseudogene 5 pseudo 138.5-104 chr2 53964436 53964823 + 0.5 NA intron (NM_014614, intron 1 of 46) intron (NM_014614, intron 1 of 46) 6364 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 122.75-95 chr2 98110067 98110443 + 0.5 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) L1MDa|LINE|L1 23088 NM_144992 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 123.5-178 chr5 162548549 162548932 + 0.5 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 481098 NM_000816 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 114.25-213 chrX 152813606 152814037 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 16936 NM_004344 1069 Hs.82794 NM_004344 ENSG00000147400 CETN2 CALT|CEN2 centrin 2 protein-coding 165.75-88 chr2 145918736 145919251 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -668064 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 165-80 chr20 54167984 54168445 + 0.5 NA intron (NM_000782, intron 4 of 11) intron (NM_000782, intron 4 of 11) 5772 NM_001128915 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 144.5-198 chr7 26220058 26220498 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 18533 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 122.75-88 chr2 37000687 37000986 + 0.5 NA intron (NM_019024, intron 32 of 35) intron (NM_019024, intron 32 of 35) -34300 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 125.25-74 chr15 78209078 78209470 + 0.5 NA intron (NM_015162, intron 1 of 13) intron (NM_015162, intron 1 of 13) 25291 NM_001199377 23205 Hs.655760 NM_015162 ENSG00000103740 ACSBG1 BG|BG1|BGM|GR-LACS|LPD acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 protein-coding 124.75-23 chr10 7802378 7802785 + 0.5 NA intron (NM_001001973, intron 7 of 9) intron (NM_001001973, intron 7 of 9) 14404 NM_001001973 509 Hs.271135 NM_005174 ENSG00000165629 ATP5F1C ATP5C|ATP5C1|ATP5CL1 ATP synthase F1 subunit gamma protein-coding 113.25-34 chr12 18031236 18031581 + 0.5 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 58785 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 175.75-97 chr4 160349284 160349789 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -571752 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 142.5-49 chr12 6618952 6619515 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001142961, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001142961, exon 2 of 2) -11854 NM_001363606 1108 Hs.162233 NM_001273 ENSG00000111642 CHD4 CHD-4|Mi-2b|Mi2-BETA|SIHIWES chromodomain helicase DNA binding protein 4 protein-coding 132.75-55 chr13 96266077 96266451 + 0.5 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) -160965 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 123-12 chr1 165911174 165911460 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001363568, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001363568, exon 8 of 8) 3396 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 164-70 chr22 27314718 27315220 + 0.5 NA non-coding (NR_134581, exon 1 of 2) non-coding (NR_134581, exon 1 of 2) 4318 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 143.5-206 chr8 32089815 32090350 + 0.5 NA intron (NR_104156, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 63864 NR_104157 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 116-77 chr19 35434708 35435048 + 0.5 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13379 NM_005306 2867 Hs.248056 NM_005306 ENSG00000126262 FFAR2 FFA2R|GPR43 free fatty acid receptor 2 protein-coding 141.25-48 chr14 50940786 50941185 + 0.5 NA intron (NM_002863, intron 1 of 19) intron (NM_002863, intron 1 of 19) 3498 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 147.5-167 chr4 147802241 147802741 + 0.5 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) intron (NM_024605, intron 1 of 22) 19896 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 181-7 chr1 223062558 223063053 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 80443 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 114-164 chr8 138788469 138788873 + 0.5 NA intron (NM_152888, intron 12 of 64) intron (NM_152888, intron 12 of 64) 125370 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 148.75-81 chr2 50183201 50183781 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 164263 NM_001330091 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 121.75-143 chr5 28589366 28589794 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -301915 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 127.25-83 chr2 19036804 19037137 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9999 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 116-61 chr16 68301864 68302323 + 0.5 NA TTS (NM_001076785) TTS (NM_001076785) 8853 NM_032178 84138 Hs.729520 NM_032178 ENSG00000103061 SLC7A6OS - solute carrier family 7 member 6 opposite strand protein-coding 130.25-49 chr13 28285252 28285639 + 0.5 NA intron (NM_175854, intron 17 of 18) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -146271 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 208-17 chr12 64786640 64787190 + 0.5 NA intron (NM_001330188, intron 2 of 13) AluSq2|SINE|Alu 6160 NM_001330188 23329 Hs.192492 NM_015279 ENSG00000111490 TBC1D30 - TBC1 domain family member 30 protein-coding 118.5-106 chr2 170369101 170369568 + 0.5 NA non-coding (NR_045684, exon 9 of 35) non-coding (NR_045684, exon 9 of 35) -18391 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 119.75-101 chr2 51856879 51857288 + 0.5 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) MIRb|SINE|MIR -513565 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 155-14 chr10 52655505 52656121 + 0.5 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 99591 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 120.25-171 chr5 123044518 123044774 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -7921 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 141-34 chr12 30672410 30672903 + 0.5 NA intron (NM_006390, intron 8 of 24) intron (NM_006390, intron 8 of 24) 4588 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 131.75-101 chr18 77231761 77232121 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17907 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 150.25-67 chr17 63402833 63403346 + 0.5 NA intron (NM_025185, intron 18 of 25) intron (NM_025185, intron 18 of 25) 37178 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 158.75-76 chr18 68882273 68882831 + 0.5 NA intron (NM_001093729, intron 7 of 9) intron (NM_001093729, intron 7 of 9) 84472 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 115-107 chr3 99630084 99630485 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -8310 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 139.5-193 chr6 156312607 156312911 + 0.5 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -65991 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 176.75-80 chr3 71565887 71566425 + 0.5 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 17572 NM_001349340 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 146.25-53 chr17 41905551 41905981 + 0.5 NA intron (NM_198830, intron 8 of 27) intron (NM_198830, intron 8 of 27) 13185 NM_001096 47 Hs.387567 NM_001096 ENSG00000131473 ACLY ACL|ATPCL|CLATP ATP citrate lyase protein-coding 119-69 chr17 75039294 75039717 + 0.5 NA intron (NM_001003785, intron 3 of 4) intron (NM_001003785, intron 3 of 4) 6938 NR_110835 23510 Hs.514468 NM_015353 ENSG00000180901 KCTD2 - potassium channel tetramerization domain containing 2 protein-coding 122.25-166 chr6 141372664 141373075 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 689055 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 187-70 chr4 82747201 82747698 + 0.5 NA intron (NM_001037582, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 5981 NR_030301 693160 NR_030301 ENSG00000207746 MIR575 MIRN575|hsa-mir-575 microRNA 575 ncRNA 122.25-24 chr10 69093661 69094076 + 0.5 NA intron (NM_001321054, intron 1 of 1) AluSc8|SINE|Alu 5765 NM_002727 5552 Hs.1908 NM_002727 ENSG00000122862 SRGN PPG|PRG|PRG1 serglycin protein-coding 143-41 chr14 73956614 73957088 + 0.5 NA intron (NM_182476, intron 4 of 11) intron (NM_182476, intron 4 of 11) 6549 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 145.25-125 chr4 181961198 181961757 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -131504 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 118.5-29 chr10 130297959 130298341 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 161741 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 157-108 chr6 55865000 55865525 + 0.5 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 10328 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 133-29 chr11 134477380 134477706 + 0.5 NA intron (NR_033852, intron 3 of 5) intron (NR_033852, intron 3 of 5) 41061 NR_033852 283177 Hs.504390 NR_033852 LOC283177 - uncharacterized LOC283177 ncRNA 145.75-58 chr16 88374011 88374484 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -53224 NM_001367624 84627 Hs.54925 NM_001127464 ENSG00000225614 ZNF469 BCS|BCS1 zinc finger protein 469 protein-coding 129.75-183 chr8 91388579 91389069 + 0.5 NA intron (NM_134266, intron 15 of 18) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 139505 NM_052832 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 129.25-35 chr11 120176116 120176526 + 0.5 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 7344 NR_159965 107984399 Hs.638417 NR_159965 LOC107984399 - uncharacterized LOC107984399 ncRNA 143.75-37 chr11 112806639 112807123 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -154539 NM_000615 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 127.5-23 chr1 247905873 247906236 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 10467 NM_001001957 343171 Hs.269151 NM_001001957 ENSG00000238243 OR2W3 OR2W3P|OR2W8P|OST718 olfactory receptor family 2 subfamily W member 3 protein-coding 171.25-104 chr3 158363034 158363521 + 0.5 NA intron (NM_001271838, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu -163431 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 134.25-204 chrX 7398185 7398570 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 145904 NM_001320754 412 Hs.522578 NM_000351 ENSG00000101846 STS ARSC|ARSC1|ASC|ES|SSDD|XLI steroid sulfatase protein-coding 139-6 chr1 109515843 109516311 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6350 NM_020703 57463 Hs.12264 NM_020703 ENSG00000181754 AMIGO1 ALI2|AMIGO|AMIGO-1 adhesion molecule with Ig like domain 1 protein-coding 119-126 chr3 146023867 146024200 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 45152 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 126-160 chr6 135050231 135050552 + 0.5 NA intron (NM_006620, intron 2 of 17) intron (NM_006620, intron 2 of 17) 4431 NM_001145158 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 125-98 chr3 23064128 23064606 + 0.5 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 138211 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 131.75-39 chr11 108606570 108606903 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -12968 NM_001308019 23086 Hs.28540 NM_015065 ENSG00000110723 EXPH5 SLAC2-B|SLAC2B exophilin 5 protein-coding 137-167 chr7 130669320 130669807 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_012133) promoter-TSS (NM_012133) -805 NM_001290033 26958 Hs.6421 NM_012133 ENSG00000158623 COPG2 2-COP|gamma-2-COP coatomer protein complex subunit gamma 2 protein-coding 127-25 chr11 27438814 27439297 + 0.5 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) intron (NM_018490, intron 1 of 17) -32676 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 146.25-73 chr2 134710594 134711032 + 0.5 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 8187 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 131-89 chr2 58504436 58504796 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16137 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 126-149 chr5 164875125 164875493 + 0.5 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu 405030 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 138.75-204 chr8 135919988 135920504 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 462790 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 157.75-97 chr2 228564576 228565084 + 0.5 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) intron (NR_151716, intron 1 of 3) 46565 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 163.75-93 chr3 106884752 106885210 + 0.5 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 355657 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 147.25-99 chr4 104415789 104416291 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -74925 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 144.75-179 chr8 106125744 106126145 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -65441 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-126 chr20 41597770 41598168 + 0.5 NA intron (NM_032221, intron 1 of 36) HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 20408 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 145.75-162 chr8 136849044 136849421 + 0.5 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1PA16|LINE|L1 318434 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 134-83 chr19 28744258 28744643 + 0.5 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -16756 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 150-33 chr12 121304256 121304593 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6116 NM_153500 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 158.5-169 chr6 62905908 62906310 + 0.5 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 413868 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 208-23 chr14 81278132 81278783 + 0.5 NA exon (NM_001256430, exon 6 of 8) exon (NM_001256430, exon 6 of 8) -57067 NM_201595 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 116.5-4 chr1 19593386 19593754 + 0.5 NA intron (NR_135054, intron 1 of 1) intron (NR_135054, intron 1 of 1) 3262 NR_135054 105378614 Hs.430098 NR_135054 ENSG00000235185 LOC105378614 - uncharacterized LOC105378614 ncRNA 156.25-114 chr5 11964515 11964931 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60277 NM_001332 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 120-176 chr7 71484165 71484488 + 0.5 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) AluSz|SINE|Alu -176556 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 180.25-100 chr5 109361612 109362295 + 0.5 NA intron (NM_014819, intron 6 of 9) intron (NM_014819, intron 6 of 9) -35584 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 186-51 chr20 6027147 6027847 + 0.5 NA intron (NR_136617, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu 20248 NM_001127458 54675 Hs.743956 NM_019095 ENSG00000088766 CRLS1 C20orf155|CLS|CLS1|GCD10|dJ967N21.6 cardiolipin synthase 1 protein-coding 129.5-187 chr5 105274371 105274867 + 0.5 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 175145 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 115-34 chr11 116367982 116368423 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -271220 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 133.5-286 chrX 63890392 63890709 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -104463 NR_031567 100302115 NR_031567 ENSG00000222532 MIR1468 MIRN1468|hsa-mir-1468|mir-1468 microRNA 1468 ncRNA 130.25-131 chr3 16643662 16643950 + 0.5 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -38383 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 124-181 chrX 38463067 38463392 + 0.5 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR -98249 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 161-19 chr11 17712730 17713206 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -6603 NM_002478 4654 Hs.181768 NM_002478 ENSG00000129152 MYOD1 MYF3|MYOD|PUM|bHLHc1 myogenic differentiation 1 protein-coding 126.75-159 chr3 182843703 182844057 + 0.5 NA intron (NM_014616, intron 8 of 29) intron (NM_014616, intron 8 of 29) 50376 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 124.5-183 chr5 160781398 160781801 + 0.5 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) intron (NM_001366652, intron 2 of 24) 70612 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 227-29 chr18 68681575 68682215 + 0.5 NA intron (NM_019022, intron 13 of 15) L2b|LINE|L2 33213 NM_019022 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 132-52 chr14 75433785 75434171 + 0.5 NA intron (NM_001135049, intron 1 of 3) intron (NM_001135049, intron 1 of 3) 1844 NM_001135049 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 131-121 chr3 145474760 145475123 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 594244 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 173.75-145 chr8 45706617 45707029 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 910820 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 166-25 chr13 32588735 32589225 + 0.5 NA intron (NM_015032, intron 1 of 34) intron (NM_015032, intron 1 of 34) 2528 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 147.5-182 chr6 8448174 8448583 + 0.5 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 12755 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 121.5-25 chr10 25802369 25802650 + 0.5 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 131201 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 114.5-77 chr13 45295427 45295761 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 40853 NR_145985 109616966 NR_145726 ENSG00000253051 SNORA31B - small nucleolar RNA, H/ACA box 31B snoRNA 119.5-7 chr1 63352896 63353358 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14500 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 131.75-72 chr14 85741199 85741501 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -193328 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 139-61 chr19 19304050 19304484 + 0.5 NA intron (NM_172231, intron 4 of 13) L1MC5|LINE|L1 16242 NM_172231 57794 Hs.515274 NM_021164 ENSG00000105705 SUGP1 F23858|RBP|SF4 SURP and G-patch domain containing 1 protein-coding 136.25-4 chr1 51347888 51348297 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2976 NM_001144832 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 137-103 chr3 83903225 83903688 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 966119 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 133-172 chr8 100146492 100147008 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001029860) promoter-TSS (NM_001029860) -933 NM_001029860 286151 Hs.339577 NM_001029860 ENSG00000156509 FBXO43 EMI2|ERP1|FBX43 F-box protein 43 protein-coding 183.5-74 chr2 178734296 178734847 + 0.5 NA exon (NM_001267550, exon 52 of 363) exon (NM_001267550, exon 52 of 363) -42355 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 134-147 chr6 57135925 57136248 + 0.5 NA intron (NM_015555, intron 7 of 13) intron (NM_015555, intron 7 of 13) 36127 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 137.25-132 chr5 121711428 121711897 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -140220 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 116-95 chr20 52563792 52564112 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -56886 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 187.5-117 chr3 96083875 96084352 + 0.5 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -275851 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 124.75-103 chr18 54699243 54699520 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 108222 NM_173629 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 118.25-25 chr1 247568740 247569125 + 0.5 NA intron (NM_145278, intron 4 of 4) L1PA8|LINE|L1 -19428 NM_001001915 81470 Hs.690208 NM_001001915 ENSG00000177489 OR2G2 OR1-32 olfactory receptor family 2 subfamily G member 2 protein-coding 127-171 chr8 40741507 40741865 + 0.5 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) intron (NM_024645, intron 3 of 6) 156140 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 155.25-31 chr10 106393459 106394077 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 253603 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 114.5-94 chr14 64239044 64239299 + 0.5 NA intron (NM_001271877, intron 4 of 5) intron (NM_001271877, intron 4 of 5) 23217 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 139-21 chr10 125146517 125146991 + 0.5 NA intron (NM_001290214, intron 1 of 10) intron (NM_001290214, intron 1 of 10) 12023 NM_001321013 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 119-151 chr5 126157458 126157908 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -21894 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 223.25-66 chr7 5512649 5513508 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_126168) promoter-TSS (NR_126168) 731 NM_001363442 80028 Hs.623974 NM_024963 ENSG00000155034 FBXL18 Fbl18 F-box and leucine rich repeat protein 18 protein-coding 150.25-69 chr19 9381894 9382361 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001202425, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001202425, exon 9 of 9) 5811 NM_001172651 7730 Hs.728944 NM_003451 ENSG00000188629 ZNF177 PIGX zinc finger protein 177 protein-coding 137.5-64 chr14 42701551 42702008 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1094923 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 139.25-164 chr6 102018567 102018934 + 0.5 NA intron (NM_001166247, intron 13 of 16) L1MC1|LINE|L1 619765 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 142.5-111 chr2 116764494 116764826 + 0.5 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -1050031 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 113.75-62 chr14 72020218 72020529 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 86846 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 123-30 chr11 21432067 21432418 + 0.5 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) -760843 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 141-16 chr1 234065599 234066116 + 0.5 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) -148354 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 191.75-79 chr3 56110054 56110573 + 0.5 NA intron (NR_132749, intron 6 of 17) L1ME4c|LINE|L1 -257719 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 123-104 chr2 81999143 81999547 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -532399 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 116.25-228 chr8 92372556 92372937 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -269361 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 140-161 chr7 68578352 68578810 + 0.5 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 558328 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 137-173 chr8 55760190 55760559 + 0.5 NA TTS (NM_001286660) TTS (NM_001286660) 13004 NM_001363176 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 138-108 chr3 166287425 166287791 + 0.5 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -450185 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 136-43 chr15 44510095 44510458 + 0.5 NA intron (NM_016396, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu 26624 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 172-38 chr14 72567426 72567985 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 50885 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 114.5-155 chr2 219659760 219660131 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 32315 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 252-3 chr1 99975008 99975757 + 0.5 NA intron (NM_001271685, intron 1 of 7) intron (NM_001271685, intron 1 of 7) 4865 NM_001271685 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 201.25-5 chr1 50611371 50611990 + 0.5 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) intron (NM_007051, intron 8 of 18) -188237 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 185-6 chr1 174113916 174114443 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 45108 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 120-165 chr6 134285833 134286157 + 0.5 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) LTR64|LTR|ERV1 32063 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 196.75-37 chr13 91614817 91615480 + 0.5 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 216527 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 141.25-19 chr10 30313471 30313899 + 0.5 NA exon (NM_018109, exon 9 of 9) exon (NM_018109, exon 9 of 9) 35653 NM_018109 55149 Hs.173946 NM_018109 ENSG00000107951 MTPAP PAPD1|SPAX4|TENT6 mitochondrial poly(A) polymerase protein-coding 113.25-35 chr12 44974136 44974501 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -60390 NM_001145110 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 138.25-136 chr5 27008676 27009092 + 0.5 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) intron (NM_016279, intron 1 of 11) 29702 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 122-93 chr2 70758651 70759099 + 0.5 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) intron (NM_017482, intron 1 of 12) 8840 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 158-82 chr2 185304698 185305169 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -137861 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 117.25-128 chr20 46914043 46914498 + 0.5 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) intron (NM_172110, intron 1 of 13) 19427 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 122-142 chr5 108174510 108174906 + 0.5 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 207390 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 120.25-122 chr22 26450405 26450739 + 0.5 NA TTS (NM_001349898) TTS (NM_001349898) 21312 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 130.25-122 chr21 45809660 45810097 + 0.5 NA intron (NM_001348243, intron 3 of 15) MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 26541 NR_038876 100129027 Hs.689591 NR_038876 ENSG00000205424 LOC100129027 - uncharacterized LOC100129027 ncRNA 121.25-188 chr7 112960626 112961040 + 0.5 NA intron (NR_110162, intron 4 of 5) intron (NR_110162, intron 4 of 5) -20958 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 139-81 chr2 133868668 133869213 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -250995 NM_001371457 151-89 chr3 178049753 178050147 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 233085 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 128.5-71 chr15 58609439 58609820 + 0.5 NA intron (NM_001320570, intron 13 of 14) intron (NM_001320570, intron 13 of 14) 83978 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 145.25-51 chr17 32560573 32560914 + 0.5 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) AluSg|SINE|Alu 73750 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 136.25-191 chr8 131520842 131521161 + 0.5 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -383092 NR_136616 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 144.25-184 chr7 23564935 23565376 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 21372 NR_002711 1197 Hs.632635 NR_002711 CLK2P1 CLK2P CDC like kinase 2, pseudogene 1 pseudo 115.5-121 chr2 66556210 66556492 + 0.5 NA intron (NM_002398, intron 9 of 12) intron (NM_002398, intron 9 of 12) -17679 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 112.5-62 chr12 116999226 116999535 + 0.5 NA intron (NM_153348, intron 7 of 10) intron (NM_153348, intron 7 of 10) -12043 NR_103809 100506551 Hs.657861 NR_103809 ENSG00000257279 LOC100506551 - uncharacterized LOC100506551 ncRNA 120-41 chr14 45827673 45828054 + 0.5 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -112261 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 113.5-159 chr3 89688432 89688762 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 580976 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 115.5-129 chr2 103491881 103492225 + 0.5 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -507624 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 133-183 chr9 9311295 9311577 + 0.5 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 453418 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 134.75-148 chr3 117812544 117812995 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -121844 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 160.5-79 chr19 33093551 33094036 + 0.5 NA intron (NR_135270, intron 4 of 20) intron (NR_135270, intron 4 of 20) 12612 NM_018025 55094 Hs.466436 NM_018025 ENSG00000076650 GPATCH1 ECGP|GPATC1 G-patch domain containing 1 protein-coding 144.25-82 chr18 52017142 52017670 + 0.5 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -322791 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 136-116 chr4 161627569 161627943 + 0.5 NA intron (NM_001128428, intron 7 of 14) intron (NM_001128428, intron 7 of 14) -394977 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 135.25-41 chr11 24224960 24225268 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -271939 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 129.5-68 chr14 84424841 84425265 + 0.5 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -846879 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 126-140 chr5 50342520 50342865 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 98596 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 140-162 chr7 91110207 91110582 + 0.5 NA intron (NM_012395, intron 11 of 13) intron (NM_012395, intron 11 of 13) -154039 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 114.5-121 chr18 41897942 41898370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -57078 NM_001308020 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 115.25-109 chr2 164154747 164155027 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 413608 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 133.25-128 chr22 47853517 47853884 + 0.5 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) HAL1|LINE|L1 222026 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 123.5-213 chr8 136040176 136040577 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -490422 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 231.5-21 chr12 40269046 40269683 + 0.5 NA intron (NM_198578, intron 14 of 50) intron (NM_198578, intron 14 of 50) 44367 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 232.75-55 chr5 11324702 11325289 + 0.5 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 263922 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 117.5-111 chr2 123130153 123130419 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -56805 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 143.25-70 chr17 54466945 54467316 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -433561 NM_001321173 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 155.5-55 chr14 73108595 73109130 + 0.5 NA intron (NM_021239, intron 13 of 18) intron (NM_021239, intron 13 of 18) -27645 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 116.75-69 chr16 6640693 6641080 + 0.5 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -132923 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 126.75-149 chr3 29019045 29019543 + 0.5 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 261645 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 137-71 chr19 9801374 9801764 + 0.5 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8389 NR_148545 100505555 Hs.445295 NR_148545 ENSG00000196605 LOC100505555 - uncharacterized LOC100505555 ncRNA 159.75-77 chr2 47773425 47773867 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9436 NM_001281493 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 125.75-137 chr4 36032247 36032677 + 0.5 NA intron (NR_146893, intron 35 of 36) intron (NR_146893, intron 35 of 36) 211477 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 120.25-31 chr10 106693124 106693494 + 0.5 NA intron (NM_001206569, intron 9 of 25) MIR|SINE|MIR 471397 NM_001206570 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 116.25-161 chr4 53647041 53647426 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -48668 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 112.75-57 chr14 53337445 53337808 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 184272 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 139.25-209 chr9 81588398 81588851 + 0.5 NA intron (NM_005077, intron 16 of 19) intron (NM_005077, intron 16 of 19) 100911 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 144.5-238 chrX 64199876 64200348 + 0.5 NA intron (NM_152424, intron 1 of 1) intron (NM_152424, intron 1 of 1) 5596 NM_152424 139285 Hs.314225 NM_152424 ENSG00000184675 AMER1 FAM123B|OSCS|WTX APC membrane recruitment protein 1 protein-coding 117.75-196 chr7 32163118 32163452 + 0.5 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -91849 NM_001322055 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 141-134 chr5 116960127 116960560 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -198134 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 138.25 chr1 18910442 18910856 + 0.5 NA intron (NM_001136265, intron 7 of 8) intron (NM_001136265, intron 7 of 8) -7850 NM_001319218 8659 Hs.77448 NM_003748 ENSG00000159423 ALDH4A1 ALDH4|P5CD|P5CDh aldehyde dehydrogenase 4 family member A1 protein-coding 176.25-135 chr8 83009050 83009583 + 0.5 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL 97212 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 117-104 chr20 42318323 42318715 + 0.5 NA intron (NM_133170, intron 11 of 31) intron (NM_133170, intron 11 of 31) -366964 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 129.5-201 chr6 85561406 85561841 + 0.5 NA intron (NM_001350542, intron 4 of 26) intron (NM_001350542, intron 4 of 26) 32235 NM_153816 57231 Hs.485871 NM_020468 ENSG00000135317 SNX14 RGS-PX2|SCAR20 sorting nexin 14 protein-coding 141.25-131 chr5 35264935 35265317 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34639 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 161-109 chr6 137709864 137710258 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28976 NR_121619 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 122.25-110 chr20 51330997 51331311 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 121823 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 117.25-152 chr4 39211557 39211850 + 0.5 NA intron (NM_025132, intron 9 of 36) L1MEf|LINE|L1 29174 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 118.25-87 chr18 22639238 22639700 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 147368 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 121.75-39 chr13 80500920 80501243 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -159955 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 154.5-170 chr7 31461781 31462230 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -52066 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 114.5-152 chr2 196794615 196794925 + 0.5 NA intron (NM_012086, intron 2 of 17) AluSx|SINE|Alu 4913 NM_012086 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 150-19 chr11 2678381 2678703 + 0.5 NA non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) 21456 NR_002728 10984 Hs.604823 NR_002728 ENSG00000269821 KCNQ1OT1 KCNQ1-AS2|KCNQ10T1|Kncq1|KvDMR1|KvLQT1-AS|LIT1|NCRNA00012 KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1 ncRNA 165.25-151 chr9 108167569 108168015 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -678023 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 131-29 chr11 41310058 41310449 + 0.5 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 149383 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 120-152 chr5 153430480 153430895 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -59837 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 128.5-231 chr9 10649391 10649747 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 36363 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 170-19 chr11 87685304 87685712 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 33903 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 113.75-194 chr8 116876108 116876463 + 0.5 NA non-coding (NR_033886, exon 2 of 2) non-coding (NR_033886, exon 2 of 2) -1419 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 141.75-166 chr7 117509972 117510452 + 0.5 NA intron (NM_000492, intron 3 of 26) intron (NM_000492, intron 3 of 26) 30249 NM_000492 1080 Hs.489786 NM_000492 ENSG00000001626 CFTR ABC35|ABCC7|CF|CFTR/MRP|MRP7|TNR-CFTR|dJ760C5.1 CF transmembrane conductance regulator protein-coding 125.5-91 chr15 85860689 85860978 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 35198 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 140.25-16 chr1 237417788 237418119 + 0.5 NA intron (NM_001035, intron 11 of 104) intron (NM_001035, intron 11 of 104) -53166 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 121.25-9 chr1 190796680 190797102 + 0.5 NA intron (NR_033922, intron 4 of 4) L1PA15|LINE|L1 172001 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 134-24 chr10 119904679 119905203 + 0.5 NA intron (NM_007190, intron 4 of 18) AluJb|SINE|Alu 12211 NM_007190 11196 Hs.435004 NM_007190 ENSG00000107651 SEC23IP MSTP053|P125|P125A SEC23 interacting protein protein-coding 190.75-67 chr3 139456373 139456757 + 0.5 NA intron (NM_004164, intron 2 of 3) intron (NM_004164, intron 2 of 3) 19951 NM_004164 5948 Hs.655516 NM_004164 ENSG00000114113 RBP2 CRABP-II|CRBP2|CRBPII|RBPC2 retinol binding protein 2 protein-coding 113-131 chr4 54146834 54147249 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 46878 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 117.25-129 chr20 51917967 51918333 + 0.5 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -55237 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 169.5-156 chr6 157926378 157926779 + 0.5 NA intron (NM_016224, intron 10 of 17) AluJb|SINE|Alu -55285 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 195-14 chr10 71550781 71551456 + 0.5 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) MER125|DNA|DNA -39198 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 224.5-5 chr1 118156218 118156820 + 0.5 NA intron (NM_206996, intron 1 of 48) intron (NM_206996, intron 1 of 48) 28709 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 153.75-144 chr7 96337076 96337551 + 0.5 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -15166 NM_001160210 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 115.75-201 chr7 54050033 54050367 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -238269 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 129-157 chr6 120234383 120234711 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 219368 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 151.5-101 chr21 17906082 17906571 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -11014 NM_001204177 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 148-14 chr11 50589926 50590313 + 0.5 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 180972 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 161.5-71 chr15 101664406 101664781 + 0.5 NA intron (NM_152334, intron 15 of 18) L1ME1|LINE|L1 -12202 NM_001308026 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 137.5-138 chr20 2848777 2849276 + 0.5 NA intron (NM_022575, intron 1 of 23) intron (NM_022575, intron 1 of 23) -7875 NM_001271168 64773 Hs.29341 NM_022760 ENSG00000132635 PCED1A C20orf81|FAM113A|bA12M19.1 PC-esterase domain containing 1A protein-coding 116-53 chr15 74829585 74829990 + 0.5 NA intron (NM_001030005, intron 2 of 2) intron (NM_001030005, intron 2 of 2) 3160 NM_001030005 594855 Hs.187694 NM_001030005 ENSG00000213578 CPLX3 CPX-III|CPXIII|Nbla11589 complexin 3 protein-coding 134.5-116 chr20 47598600 47599056 + 0.5 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) L1MB8|LINE|L1 96941 NM_181659 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 117.25-130 chr20 53795745 53796001 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 79836 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 191.25-93 chr7 12759440 12759888 + 0.5 NA Intergenic X7B_LINE|LINE|CR1 72031 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 119.25-47 chr12 61603869 61604214 + 0.5 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 588798 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 141.5-200 chr6 133284723 133285180 + 0.5 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) L2a|LINE|L2 43452 NM_001301012 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 160.5-63 chr15 67537840 67538333 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4617 NM_002757 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 120.75-174 chr9 27512746 27513167 + 0.5 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) intron (NM_024761, intron 1 of 3) -11358 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 130.75-80 chr18 48984958 48985394 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -34465 NM_005904 4092 Hs.465087 NM_005904 ENSG00000101665 SMAD7 CRCS3|MADH7|MADH8 SMAD family member 7 protein-coding 148.5-229 chr8 109201880 109202255 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 115439 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 161.75-118 chr7 35423108 35423749 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 109573 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 159-59 chr22 35036661 35037068 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -29294 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 115.75-133 chr21 31263302 31263628 + 0.5 NA intron (NM_001353686, intron 4 of 27) intron (NM_001353686, intron 4 of 27) 80889 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 133.5-163 chr3 60231818 60232280 + 0.5 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -151140 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 120.5-148 chr3 143163203 143163490 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 43575 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 113-134 chr4 73340295 73340734 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -63773 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 168.5-167 chr7 21456430 21456913 + 0.5 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) MER50-int|LTR|ERV1 -14387 NR_031594 100302122 NR_031594 ENSG00000221783 MIR1183 MIRN1183|hsa-mir-1183 microRNA 1183 ncRNA 150.5-161 chr5 7449420 7449769 + 0.5 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 53456 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 143-130 chr7 50137538 50137880 + 0.5 NA intron (NM_001161834, intron 5 of 8) L1ME3C|LINE|L1 41623 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 116.25-244 chr9 86518594 86518961 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -164367 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 124.75-142 chr3 29851449 29851793 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 82535 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 117.5-219 chr7 48711993 48712282 + 0.5 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -212410 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 143.75-194 chr9 27186748 27187320 + 0.5 NA intron (NM_001290077, intron 8 of 21) intron (NM_001290077, intron 8 of 21) 77893 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 129-117 chr3 25793847 25794251 + 0.5 NA intron (NM_001145391, intron 3 of 3) intron (NM_001145391, intron 3 of 3) 3959 NM_017897 54995 Hs.55781 NM_017897 ENSG00000151093 OXSM CEM1|FASN2D|KASI|KS 3-oxoacyl-ACP synthase, mitochondrial protein-coding 171.25-143 chr7 53695532 53696083 + 0.5 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) intron (NR_038371, intron 4 of 5) 116124 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 130.25-83 chr18 10793686 10794199 + 0.5 NA intron (NM_022068, intron 13 of 51) intron (NM_022068, intron 13 of 51) -34293 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 150-118 chr5 112778168 112778766 + 0.5 NA intron (NM_001354895, intron 5 of 15) U6|snRNA|snRNA 40582 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 182-79 chr4 47975121 47975627 + 0.5 NA intron (NM_001142564, intron 1 of 9) intron (NM_001142564, intron 1 of 9) 6159 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 132.5-229 chr7 82369761 82370184 + 0.5 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) L1M5|LINE|L1 73805 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 146.75-104 chr3 108046347 108046780 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001777, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001777, exon 11 of 11) 44525 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 116-174 chr8 126210538 126210901 + 0.5 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -114776 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 122.75-15 chr1 202150184 202150495 + 0.5 NA exon (NM_080588, exon 8 of 9) exon (NM_080588, exon 8 of 9) -5596 NM_001256129 127829 Hs.497399 NM_138795 ENSG00000143862 ARL8A ARL10B|GIE2 ADP ribosylation factor like GTPase 8A protein-coding 133.75-158 chr5 9242906 9243361 + 0.5 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -189238 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 116.25-26 chr10 110118565 110118852 + 0.5 NA exon (NM_019903, exon 6 of 14) exon (NM_019903, exon 6 of 14) -88897 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 166-39 chr15 91329707 91330182 + 0.5 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -133395 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 119.75-210 chr9 102229034 102229424 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -290408 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 136.25-13 chr10 54129367 54129895 + 0.5 NA intron (NM_001354411, intron 16 of 34) intron (NM_001354411, intron 16 of 34) -356599 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 133.75-167 chr6 7118943 7119400 + 0.5 NA intron (NM_001003699, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu 11210 NM_001003698 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 115.25-208 chr8 93159211 93159646 + 0.5 NA intron (NR_161372, intron 1 of 2) intron (NR_161372, intron 1 of 2) 7422 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 131.75-113 chr2 211479584 211479993 + 0.5 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) intron (NM_001042599, intron 20 of 26) 862217 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 126.75-4 chr1 84501393 84501882 + 0.5 NA intron (NM_005274, intron 3 of 3) LFSINE_Vert|SINE|tRNA -4749 NM_001310156 100505741 Hs.584956 NM_022354 ENSG00000122432 SPATA1 SP-2|SPAP1 spermatogenesis associated 1 protein-coding 130.5-94 chr14 72197264 72197713 + 0.5 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 263961 NM_001370277 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 192.75-129 chr8 124792005 124792555 + 0.5 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -29705 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 131.25-16 chr1 200265848 200266246 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 107745 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 139-20 chr10 103365799 103366141 + 0.5 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -2006 NM_006951 6877 Hs.96103 NM_006951 ENSG00000148835 TAF5 TAF(II)100|TAF2D|TAFII-100|TAFII100 TATA-box binding protein associated factor 5 protein-coding 117.25-216 chr8 127582702 127583073 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -100748 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 158.75-5 chr1 66555849 66556355 + 0.5 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) intron (NM_001350218, intron 1 of 22) 21949 NM_001350217 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 129-110 chr20 35495863 35496187 + 0.5 NA intron (NM_007186, intron 24 of 34) L2b|LINE|L2 33627 NM_001145350 140873 Hs.158680 NM_080828 ENSG00000125975 C20orf173 dJ477O4.4 chromosome 20 open reading frame 173 protein-coding 114-25 chr10 122867041 122867479 + 0.5 NA intron (NM_152644, intron 1 of 3) L1PA4|LINE|L1 12321 NM_152644 196792 Hs.114648 NM_152644 ENSG00000213185 FAM24B - family with sequence similarity 24 member B protein-coding 116.25-10 chr1 162186077 162186354 + 0.5 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) intron (NM_014697, intron 2 of 9) 29108 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 128-133 chr6 45487515 45488017 + 0.5 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) L2b|LINE|L2 65491 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 124.75-77 chr14 49201143 49201573 + 0.5 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT 385022 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 151-83 chr3 26672844 26673441 + 0.5 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) intron (NM_001317810, intron 2 of 2) -21415 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 129.5-219 chr7 127512349 127512640 + 0.5 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 35611 NR_110024 100506682 Hs.148450 NR_110024 ENSG00000226770 LOC100506682 - uncharacterized LOC100506682 ncRNA 158.75-148 chr6 159183391 159183829 + 0.5 NA intron (NM_032532, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 -13603 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 126.5-191 chr5 73763168 73763455 + 0.5 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -50235 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 125.75-31 chr10 113866908 113867318 + 0.5 NA intron (NM_198514, intron 2 of 10) MER68|LTR|ERVL 12452 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 139.75-101 chr2 140524079 140524358 + 0.5 NA intron (NM_018557, intron 49 of 90) L1PA17|LINE|L1 62467 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 114.25-82 chr18 56544654 56545096 + 0.5 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 93717 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 128-165 chr8 88731621 88732057 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -404356 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 129.5-164 chr3 196709725 196710162 + 0.5 NA intron (NM_032898, intron 1 of 2) intron (NM_032898, intron 1 of 2) 2307 NM_032898 84984 Hs.282800 NM_032898 ENSG00000174007 CEP19 C3orf34|MOSPGF centrosomal protein 19 protein-coding 139.25-135 chr4 40647970 40648363 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -17572 NM_001371114 115.5-234 chr7 103084626 103085056 + 0.5 NA intron (NM_031905, intron 3 of 6) intron (NM_031905, intron 3 of 6) 9701 NM_001161009 83787 Hs.287412 NM_031905 ENSG00000170632 ARMC10 PNAS-112|PNAS112|PSEC0198|SVH armadillo repeat containing 10 protein-coding 123.75-208 chrX 67455401 67455811 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -88415 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 163.5-88 chr2 50146446 50146942 + 0.5 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) -172491 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 132.25-148 chr5 13298225 13298590 + 0.5 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -265521 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 198.75-11 chr10 5193302 5194003 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -3185 NM_001818 1109 Hs.567245 NM_001818 ENSG00000198610 AKR1C4 3-alpha-HSD|C11|CDR|CHDR|DD-4|DD4|HAKRA aldo-keto reductase family 1 member C4 protein-coding 116.25-56 chr12 117816150 117816423 + 0.5 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 152704 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 119.5-98 chr17 32344756 32345146 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2778 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 153-73 chr2 85606150 85606481 + 0.5 NA 3' UTR (NM_001013649, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001013649, exon 4 of 4) 3454 NR_046347 10713 Hs.654745 NM_006590 ENSG00000168883 USP39 65K|CGI-21|HSPC332|SAD1|SNRNP65 ubiquitin specific peptidase 39 protein-coding 129.25-135 chr3 180049084 180049504 + 0.5 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12357 NM_016559 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 132.5-122 chr2 95566384 95566762 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -25428 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 201.75-11 chr10 67614393 67614891 + 0.5 NA intron (NM_001127384, intron 2 of 17) MER1A|DNA|hAT-Charlie 51018 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 162.5-54 chr14 69944029 69944552 + 0.5 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 -33843 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 128-139 chr6 105337937 105338416 + 0.5 NA intron (NM_002726, intron 7 of 14) intron (NM_002726, intron 7 of 14) 64906 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 161.5-46 chr12 63049591 63050110 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 102960 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 136.5-15 chr1 198743480 198743904 + 0.5 NA intron (NM_002838, intron 25 of 32) intron (NM_002838, intron 25 of 32) 104652 NR_052021 5788 Hs.654514 NM_002838 ENSG00000081237 PTPRC B220|CD45|CD45R|GP180|L-CA|LCA|LY5|T200 protein tyrosine phosphatase receptor type C protein-coding 122-134 chr4 171293369 171293669 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 107335 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 148.5-179 chr5 20578611 20579156 + 0.5 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -3170 NM_001349562 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 144-110 chr6 55511090 55511656 + 0.5 NA TTS (NR_109867) TTS (NR_109867) 67841 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 125-160 chr8 92635485 92635921 + 0.5 NA intron (NR_125827, intron 2 of 4) intron (NR_125827, intron 2 of 4) 19791 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 121-120 chr21 46232797 46233266 + 0.5 NA intron (NR_110565, intron 2 of 3) MER21B|LTR|ERVL 3800 NR_110567 114044 Hs.655095 NR_002776 ENSG00000215424 MCM3AP-AS1 C21orf85|MCM3AP-AS|MCM3APAS|MCM3APASB|NCRNA00031 MCM3AP antisense RNA 1 ncRNA 131.75-7 chr1 65941318 65941732 + 0.5 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) L1MEj|LINE|L1 28280 NM_001297441 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 171.25-20 chr10 112443575 112444149 + 0.5 NA intron (NM_001363544, intron 2 of 11) intron (NM_001363544, intron 2 of 11) 3052 NM_022494 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 146.25-64 chr2 15637208 15637596 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 45534 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 122.75-220 chrX 126352693 126353047 + 0.5 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -186581 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 177-11 chr10 82127617 82128165 + 0.5 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 105029 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 138.5-80 chr17 60679242 60679628 + 0.5 NA intron (NM_001330413, intron 1 of 25) (TGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1584 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 150.5-12 chr1 244552243 244552760 + 0.5 NA exon (NM_001242340, exon 6 of 19) exon (NM_001242340, exon 6 of 19) 91130 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 139.25-197 chr8 65273844 65274248 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -93706 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 143.75-153 chr6 45785164 45785510 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 152260 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 128-59 chr17 57820614 57821086 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 29194 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 133.25-42 chr12 59476536 59477036 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -119243 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 124-119 chr4 5795888 5796158 + 0.5 NA intron (NM_001306090, intron 13 of 20) L1MEg|LINE|L1 84822 NM_001306090 2121 Hs.646899 NM_014556 ENSG00000072840 EVC DWF-1|EVC1|EVCL EvC ciliary complex subunit 1 protein-coding 152.5-92 chr2 143608393 143608792 + 0.5 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) intron (NM_018460, intron 11 of 13) -328475 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 120.25-19 chr1 203277230 203277608 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -9733 NR_117097 100506775 Hs.443859 NR_117097 ENSG00000231507 LINC01353 - long intergenic non-protein coding RNA 1353 ncRNA 114.5-162 chr21 21147681 21148028 + 0.5 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) intron (NM_001352597, intron 1 of 10) 692 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 117-164 chr6 159177679 159177972 + 0.5 NA intron (NM_032532, intron 1 of 22) intron (NM_032532, intron 1 of 22) -7818 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 127.25-69 chr16 75475179 75475578 + 0.5 NA 3' UTR (NM_021615, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_021615, exon 3 of 3) -10641 NM_001304998 124491 Hs.487510 NM_145254 ENSG00000166822 TMEM170A TMEM170 transmembrane protein 170A protein-coding 124.75-170 chr5 38990276 38990688 + 0.5 NA intron (NM_001285439, intron 7 of 38) L1PA7|LINE|L1 83917 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 176.75-118 chr8 8543000 8543653 + 0.5 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -156887 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 178.25-123 chr9 3980246 3980845 + 0.5 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 81899 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 133.5-82 chr14 71292811 71293160 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -27491 NM_001354286 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 141.75-2 chr1 37136062 37136604 + 0.5 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -25230 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 132.25-152 chr5 30684355 30684814 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -509102 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 113-164 chr6 123919886 123920194 + 0.5 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 116175 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 173-144 chr8 125720761 125721181 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 230226 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 125.75-61 chr15 80345436 80345765 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -3795 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 142.25-153 chr7 11632551 11633055 + 0.5 NA intron (NM_015204, intron 2 of 26) intron (NM_015204, intron 2 of 26) 199395 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 137.25-165 chr8 83343272 83343662 + 0.5 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -60291 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 141-93 chr21 43703393 43703743 + 0.5 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -15561 NM_003681 8566 Hs.284491 NM_003681 ENSG00000160209 PDXK C21orf124|C21orf97|HEL-S-1a|PKH|PNK|PRED79 pyridoxal kinase protein-coding 118.75-135 chr4 52671479 52671882 + 0.5 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 12274 NR_125363 643783 Hs.631514 NR_125363 ENSG00000248866 USP46-AS1 - USP46 antisense RNA 1 ncRNA 120.75-24 chr11 71278940 71279229 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -54288 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 122-59 chr14 72890992 72891457 + 0.5 NA intron (NM_001280543, intron 1 of 10) intron (NM_001280543, intron 1 of 10) 1425 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 139.75-155 chr6 47357237 47357713 + 0.5 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -47570 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 132.25-164 chr6 26448713 26449207 + 0.5 NA intron (NM_197974, intron 7 of 9) intron (NM_197974, intron 7 of 9) 8456 NM_006994 10384 Hs.167741 NM_006994 ENSG00000111801 BTN3A3 BTF3|BTN3.3 butyrophilin subfamily 3 member A3 protein-coding 120-15 chr10 59971620 59972093 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10943 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 124.25-41 chr12 33187494 33187840 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 252152 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 142-169 chr8 127297269 127297732 + 0.5 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) 52863 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 135.25-61 chr14 47879145 47879552 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -84334 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 146.25-21 chr11 108980669 108981059 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 315795 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 124.5-216 chr8 23538681 23539035 + 0.5 NA intron (NM_001317814, intron 2 of 4) intron (NM_001317814, intron 2 of 4) 9902 NM_016612 51312 Hs.596025 NM_016612 ENSG00000147454 SLC25A37 HT015|MFRN|MFRN1|MSC|MSCP|PRO1278|PRO1584|PRO2217 solute carrier family 25 member 37 protein-coding 128.5-79 chr16 10561975 10562253 + 0.5 NA intron (NM_001424, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 18484 NM_001424 2013 Hs.531561 NM_001424 ENSG00000213853 EMP2 XMP epithelial membrane protein 2 protein-coding 142-39 chr12 113639722 113640086 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 133779 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 126-67 chr15 98497591 98497889 + 0.5 NA intron (NM_182562, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 16596 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 140-137 chr5 75982842 75983164 + 0.5 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -100380 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 130.75-31 chr11 78002093 78002488 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7622 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 163.5-90 chr2 58096760 58097344 + 0.5 NA intron (NM_001130483, intron 7 of 13) L1MC|LINE|L1 50340 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 198.75-49 chr2 155702756 155703427 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 551840 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 113.75-84 chr17 82525059 82525422 + 0.5 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 5508 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 141.5-105 chr2 119281871 119282433 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -33081 NR_046721 100874111 Hs.704682 NR_046721 ENSG00000229867 STEAP3-AS1 - STEAP3 antisense RNA 1 ncRNA 153.5-82 chr18 1792939 1793311 + 0.5 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -433496 NR_023925 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 122.75-188 chr7 93903442 93903811 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2941 NM_001329426 2792 Hs.732212 NM_021955 ENSG00000127928 GNGT1 GNG1 G protein subunit gamma transducin 1 protein-coding 146.25-40 chr15 39735883 39736194 + 0.5 NA intron (NM_152597, intron 8 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46803 NM_152597 161835 Hs.129598 NM_152597 ENSG00000150667 FSIP1 HSD10 fibrous sheath interacting protein 1 protein-coding 144-101 chr5 59605193 59605553 + 0.5 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -17748 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 126.25-190 chr7 116772539 116772854 + 0.5 NA intron (NM_000245, intron 14 of 20) intron (NM_000245, intron 14 of 20) -89891 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 169.75-41 chr13 57915129 57915587 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -250469 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 118.75-142 chr5 1565789 1566212 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 28531 NR_003263 728609 Hs.379186 NR_003263 SDHAP3 SDHACL|SDHAL succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A pseudogene 3 pseudo 183-116 chr8 140162055 140162538 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L2b|LINE|L2 -61761 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 122.75-120 chr22 26638243 26638547 + 0.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 16432 NM_001886 1413 Hs.57690 NM_001886 ENSG00000196431 CRYBA4 CTRCT23|CYRBA4|MCOPCT4 crystallin beta A4 protein-coding 116.75-47 chr12 18150345 18150720 + 0.5 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -60339 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 150.5-7 chr1 108495440 108495797 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 45336 NM_001143987 653149 Hs.712226 NM_001143987 ENSG00000186086 NBPF6 - NBPF member 6 protein-coding 157.25-104 chr4 32877190 32877561 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 526337 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 131.5-250 chr9 128749388 128749755 + 0.5 NA intron (NM_006336, intron 8 of 15) AluSx|SINE|Alu 22356 NM_006336 10444 Hs.147950 NM_006336 ENSG00000160445 ZER1 C9orf60|ZYG|ZYG11BL zyg-11 related cell cycle regulator protein-coding 116.75-91 chr2 29652256 29652692 + 0.5 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MER21B|LTR|ERVL -177097 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 135.5-164 chr5 85645357 85645880 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -636826 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 130.5-26 chr1 218963630 218964048 + 0.5 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) -45328 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 126.25-201 chr8 77741609 77741959 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 291087 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 138-53 chr16 71735168 71735610 + 0.5 NA intron (NM_001128, intron 21 of 22) AluSg|SINE|Alu -10688 NM_015020 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 141-171 chrX 143945834 143946195 + 0.5 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 61943 NM_001012989 389898 Hs.585177 NM_001012989 ENSG00000276380 UBE2NL Li174 ubiquitin conjugating enzyme E2 N like (gene/pseudogene) protein-coding 112.75-78 chr18 5153829 5154269 + 0.5 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 43208 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 168.5-46 chr12 55394432 55394917 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -5855 NM_001005518 403282 Hs.554553 NM_001005518 ENSG00000205328 OR6C65 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 65 protein-coding 118.25-2 chr1 22428023 22428345 + 0.5 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -23667 NM_001330398 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 189.75-46 chr16 27293645 27294123 + 0.5 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -20090 NM_001257406 3566 Hs.513457 NM_000418 ENSG00000077238 IL4R CD124|IL-4RA|IL4RA interleukin 4 receptor protein-coding 144.75-4 chr1 79506975 79507402 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -500458 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 169.75-153 chr8 90231145 90231760 + 0.5 NA intron (NR_051989, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 9964 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 142.25-155 chr7 33504100 33504621 + 0.5 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 374796 NM_198428 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 205.5-64 chr18 79528046 79528715 + 0.5 NA 3' UTR (NM_172387, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_172387, exon 10 of 10) -50902 NR_148949 284240 Hs.448912 NR_148949 LOC284240 - uncharacterized LOC284240 ncRNA 131.25-71 chr16 13991499 13991969 + 0.5 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 24284 NR_110909 101927311 NR_110909 ENSG00000262097 LINC02185 - long intergenic non-protein coding RNA 2185 ncRNA 131-134 chr5 9504311 9504665 + 0.5 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 -6845 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 130-179 chr9 81172865 81173373 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 516416 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 136.5-77 chr15 50944130 50944517 + 0.5 NA non-coding (NR_027642, exon 1 of 1) non-coding (NR_027642, exon 1 of 1) 194 NR_027642 100132724 Hs.730493 NR_027642 DCAF13P3 - DDB1 and CUL4 associated factor 13 pseudogene 3 pseudo 116-148 chr7 15840227 15840493 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 151982 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 152.5-153 chr5 104896226 104896709 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -203007 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 117.25-20 chr1 219915435 219915843 + 0.5 NA non-coding (NR_046437, exon 4 of 4) non-coding (NR_046437, exon 4 of 4) 13012 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 190.25-81 chr22 29005680 29006201 + 0.5 NA intron (NM_001206998, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu 25536 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 119-205 chr9 26785739 26786040 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 106913 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 115.75-226 chr9 72151253 72151552 + 0.5 NA intron (NM_001351571, intron 1 of 13) intron (NM_001351571, intron 1 of 13) 1962 NM_001351573 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 116.5-33 chr11 4739172 4739624 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 30540 NM_001004752 256892 NM_001004752 ENSG00000280021 OR51F1 OR11-21|OR51F1P olfactory receptor family 51 subfamily F member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 123-124 chr3 5459446 5459784 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -209360 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 118.25-133 chr3 185885913 185886351 + 0.5 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 51882 NM_001243879 6434 Hs.533122 NM_004593 ENSG00000136527 TRA2B Htra2-beta|PPP1R156|SFRS10|SRFS10|TRA2-BETA|TRAN2B transformer 2 beta homolog protein-coding 169-120 chrX 153217730 153218104 + 0.5 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 38633 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 121.25-102 chr2 189943589 189943907 + 0.5 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 118981 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 129.75-38 chr11 78302752 78303238 + 0.5 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L1PB1|LINE|L1 38885 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 141.75-99 chr2 108227965 108228348 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -10315 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 139.25 chr1 28493195 28493675 + 0.5 NA intron (NM_023923, intron 12 of 12) AluSq2|SINE|Alu -12508 NR_036473 8420 Hs.469723 NR_002909 ENSG00000242125 SNHG3 NCRNA00014|RNU17C|RNU17D|U17HG|U17HG-A|U17HG-AB small nucleolar RNA host gene 3 ncRNA 179.25-119 chr5 79642335 79643047 + 0.5 NA intron (NM_001349548, intron 8 of 16) intron (NM_001349548, intron 8 of 16) 30250 NM_001114393 167153 Hs.418198 NM_173797 ENSG00000164329 TENT2 APD4|GLD2|PAPD4|TUT2 terminal nucleotidyltransferase 2 protein-coding 150.25-159 chr9 38218819 38219373 + 0.5 NA Intergenic (GTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -149869 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 144.5-190 chr6 108047230 108047607 + 0.5 NA intron (NM_014028, intron 5 of 5) L2b|LINE|L2 27323 NM_014028 28962 Hs.226780 NM_014028 ENSG00000081087 OSTM1 GIPN|GL|HSPC019|OPTB5 osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1 protein-coding 130.75-49 chr13 30025569 30025928 + 0.5 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 83127 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 133.5-57 chr12 1831024 1831391 + 0.5 NA exon (NM_001163925, exon 4 of 5).2 exon (NM_001163925, exon 4 of 5).2 10642 NM_001163926 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 133.5-288 chrX 130556562 130556959 + 0.5 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 61819 NR_027141 55855 Hs.567120 NM_018472 DENND10P1 FAM45B|FAM45BP|HT011 DENND10 pseudogene 1 pseudo 126.75-45 chr12 131211366 131211829 + 0.5 NA intron (NR_026670, intron 4 of 4) MamGypLTR2b|LTR|Gypsy 46586 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 115.75-105 chr2 79882318 79882713 + 0.5 NA intron (NM_001282598, intron 6 of 17) L1PA8A|LINE|L1 -15932 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 115.75-130 chr20 60936703 60937056 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -142185 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 131.5-75 chr15 70209046 70209562 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -111387 NM_001282979 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 160.5-190 chr8 102310000 102310575 + 0.5 NA intron (NM_001282873, intron 20 of 58) intron (NM_001282873, intron 20 of 58) 70836 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 115.5-94 chr17 64003563 64003990 + 0.5 NA exon (NM_001099788, exon 5 of 6) exon (NM_001099788, exon 5 of 6) 3147 NM_000873 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 114.5-10 chr1 101547251 101547646 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 223611 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 128.75-174 chr6 84441942 84442314 + 0.5 NA intron (NR_132100, intron 4 of 4) intron (NR_132100, intron 4 of 4) 32801 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 136.25-7 chr1 110653131 110653589 + 0.5 NA TTS (NR_109846) TTS (NR_109846) 18415 NR_109846 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 222-10 chr10 23624244 23624818 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -70196 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 227-66 chr8 41784517 41785236 + 0.5 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) intron (NM_001142446, intron 1 of 42) 12746 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 185.75-130 chr8 130625761 130626430 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -182421 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 138.75-148 chr5 66956167 66956573 + 0.5 NA intron (NM_015183, intron 3 of 27) L1MC5|LINE|L1 -2703 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 165.5-26 chr11 71081829 71082448 + 0.5 NA intron (NM_012309, intron 7 of 24) intron (NM_012309, intron 7 of 24) 142658 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 150.5-71 chr18 52590406 52590906 + 0.5 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 250459 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 135-14 chr10 63007652 63008040 + 0.5 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -125401 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 148.75-182 chrX 69554540 69554988 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49529 NM_015686 27112 Hs.87619 NM_015686 ENSG00000130054 FAM155B CXorf63|TED|TMEM28|bB57D9.1 family with sequence similarity 155 member B protein-coding 159.75-97 chr21 32055885 32056370 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 30168 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 155-142 chr8 117325792 117326290 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 191046 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 172-51 chr2 43244355 43244764 + 0.5 NA intron (NM_001083953, intron 36 of 37) intron (NM_001083953, intron 36 of 37) 17348 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 167-34 chr13 105838956 105839337 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 132316 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 130.75-133 chr4 21170167 21170529 + 0.5 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 133558 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 116.75-102 chr2 152353656 152353916 + 0.5 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 18612 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 136-76 chr2 108919415 108919921 + 0.5 NA intron (NM_022336, intron 5 of 11) intron (NM_022336, intron 5 of 11) 69552 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 145.75-7 chr1 189424359 189424708 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1051477 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 137.5-37 chr10 118905303 118905646 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -124240 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 114.25-71 chr17 5827226 5827585 + 0.5 NA intron (NR_040000, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 55171 NR_040000 339166 Hs.736088 NR_040000 ENSG00000284837 LOC339166 - uncharacterized LOC339166 ncRNA 203.25-93 chr7 1296346 1296871 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 63736 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 149-143 chr9 121749535 121750122 + 0.5 NA intron (NM_138709, intron 1 of 13) intron (NM_138709, intron 1 of 13) 7043 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 122.25-130 chr3 135973739 135974163 + 0.5 NA intron (NM_001190447, intron 1 of 12) L2-3_Crp|LINE|L2 8223 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 135.25-155 chr5 28517630 28518111 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -230205 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 166.25-12 chr1 119662071 119662585 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14062 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 134-63 chr15 95016918 95017231 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 161711 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 119.75-209 chr9 29600159 29600441 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -386699 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 135-131 chr4 150199618 150199929 + 0.5 NA intron (NM_001040261, intron 5 of 16) intron (NM_001040261, intron 5 of 16) 121328 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 120.75-69 chr18 51965815 51966247 + 0.5 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -374166 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 120.75-134 chr5 11168991 11169410 + 0.5 NA intron (NM_001288715, intron 10 of 20) MER110|LTR|ERV1 -407966 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 157-115 chr8 67702219 67702792 + 0.5 NA intron (NM_020361, intron 1 of 10) MER50|LTR|ERV1 43855 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 163-37 chr14 59662364 59662820 + 0.5 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L1PA7|LINE|L1 -15572 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 152-90 chr2 158600867 158601255 + 0.5 NA intron (NM_001005476, intron 3 of 20) intron (NM_001005476, intron 3 of 20) 133941 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 125.25-18 chr1 231545703 231546149 + 0.5 NA intron (NR_028393, intron 4 of 15) MIRb|SINE|MIR 17257 NM_005999 7257 Hs.13318 NM_005999 ENSG00000116918 TSNAX C3PO|TRAX translin associated factor X protein-coding 164.25-96 chr3 12375417 12375857 + 0.5 NA intron (NM_015869, intron 1 of 6) intron (NM_015869, intron 1 of 6) 24135 NM_015869 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 114.25-116 chr21 32658574 32658899 + 0.5 NA intron (NM_203446, intron 18 of 32) LTR1D1|LTR|ERV1 -45865 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 166-108 chr6 73442244 73442769 + 0.5 NA intron (NM_138441, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 9791 NM_138441 115004 Hs.658405 NM_138441 ENSG00000164430 CGAS C6orf150|MB21D1|h-cGAS cyclic GMP-AMP synthase protein-coding 114.25-163 chr6 44033397 44033729 + 0.5 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu -29913 NR_125865 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 149-130 chr8 90719835 90720206 + 0.5 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -71755 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 122.75-77 chr18 11726024 11726342 + 0.5 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) L1MC2|LINE|L1 -25289 NM_001142339 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 116.25-213 chr7 48065961 48066299 + 0.5 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22473 NM_001287426 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 134.25-33 chr12 32133843 32134354 + 0.5 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 27251 NR_148725 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 136.75-128 chr3 41130442 41130816 + 0.5 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -68876 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 137.75-127 chr22 41999125 41999610 + 0.5 NA intron (NM_152613, intron 1 of 5) intron (NM_152613, intron 1 of 5) 579 NM_152613 164684 Hs.655541 NM_152613 ENSG00000183066 WBP2NL GRAMD7|PAWP WBP2 N-terminal like protein-coding 117.5-22 chr1 229693576 229693908 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 67495 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 243.75-10 chr11 11176112 11176696 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 176846 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 133-116 chr4 21368149 21368550 + 0.5 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -64443 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 115.5-200 chr5 34516909 34517317 + 0.5 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -139215 NM_001145522 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 129-7 chr1 111485205 111485603 + 0.5 NA intron (NM_001081976, intron 5 of 5) intron (NM_001081976, intron 5 of 5) 11420 NM_001300835 128346 Hs.288010 NM_174896 ENSG00000143110 C1orf162 - chromosome 1 open reading frame 162 protein-coding 118-122 chr3 183371417 183371738 + 0.5 NA intron (NM_015078, intron 3 of 29) AluSz|SINE|Alu 56692 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 145-44 chr13 72073442 72073801 + 0.5 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -206417 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 140.75-195 chr9 12472178 12472571 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -221011 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 151-106 chr5 24643741 24644332 + 0.5 NA intron (NM_001362460, intron 1 of 9) intron (NM_001362460, intron 1 of 9) 942 NM_001317222 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 130-34 chr12 44072819 44073172 + 0.5 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) AluSc|SINE|Alu 236914 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 158.5-195 chr8 121042681 121043192 + 0.5 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -230890 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 145.5-148 chr4 101268171 101268568 + 0.5 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) -27497 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 139.25-137 chr4 72390907 72391400 + 0.5 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) L3|LINE|CR1 178068 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 184.75-114 chr9 130263190 130263775 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -2278 NM_001291815 256158 Hs.32194 NM_144655 ENSG00000148357 HMCN2 - hemicentin 2 protein-coding 132.25-32 chr10 62663517 62663949 + 0.5 NA intron (NM_199451, intron 6 of 7) intron (NM_199451, intron 6 of 7) -140987 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 136-146 chr8 69569057 69569498 + 0.5 NA intron (NR_156414, intron 4 of 20) intron (NR_156414, intron 4 of 20) -23623 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 190.75-44 chr17 61018705 61019239 + 0.5 NA intron (NM_001320470, intron 16 of 25) intron (NM_001320470, intron 16 of 25) 341121 NM_001353146 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 116.25-25 chr10 106349669 106349948 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 209643 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 166.25-4 chr1 40156817 40157301 + 0.5 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4328 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 130.5-175 chr3 147130881 147131311 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 209173 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 215-13 chr11 28323528 28324113 + 0.5 NA intron (NM_001113528, intron 6 of 6) intron (NM_001113528, intron 6 of 6) 153728 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 128-177 chr9 85944492 85944845 + 0.5 NA intron (NM_024635, intron 2 of 22) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 3139 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 130.5-157 chr22 21933329 21933828 + 0.5 NA exon (NM_014634, exon 5 of 8) exon (NM_014634, exon 5 of 8) -4659 NR_147620 100286925 Hs.659180 NR_147620 LOC100286925 - uncharacterized LOC100286925 ncRNA 134.25-26 chr11 77390186 77390631 + 0.5 NA intron (NM_001128620, intron 2 of 15) AluSq2|SINE|Alu 83655 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 159.75-119 chr4 104773816 104774435 + 0.5 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -279231 NM_025212 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 118.75-45 chr12 45065340 45065720 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_026583) promoter-TSS (NR_026583) -119 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 164.75-83 chr2 163260661 163261087 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -422107 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 143-93 chr3 107409586 107409998 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -21138 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 223.25-23 chr16 26707166 26707832 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -359428 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 129.5-127 chr2 100773575 100773913 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -46395 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 114.5-117 chr17 76696371 76696664 + 0.5 NA intron (NM_198530, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu -7630 NR_130927 439921 Hs.250723 NM_198530 ENSG00000182534 MXRA7 - matrix remodeling associated 7 protein-coding 113-85 chr2 23074751 23075077 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -310265 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 116.75-49 chr12 31965860 31966312 + 0.5 NA intron (NM_018169, intron 2 of 5) MER30|DNA|hAT-Charlie 6671 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 139.25-130 chr3 183416090 183416380 + 0.5 NA intron (NM_015078, intron 1 of 29) L1M4b|LINE|L1 12034 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 172.5-141 chr4 54267905 54268519 + 0.5 NA intron (NM_001347829, intron 7 of 22) intron (NM_001347829, intron 7 of 22) 34252 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 180-51 chr18 6116619 6117250 + 0.5 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) L1ME3B|LINE|L1 -139810 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 121-73 chr15 71753530 71753914 + 0.5 NA intron (NM_001286429, intron 8 of 11) intron (NM_001286429, intron 8 of 11) -56832 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 175-19 chr11 28723150 28723595 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -245824 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 126.25-54 chr14 85443965 85444292 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 50213 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 136-79 chr2 166308316 166308615 + 0.5 NA intron (NM_001365536, intron 2 of 26) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 67479 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 124.25-9 chr1 92111264 92111614 + 0.5 NA intron (NM_183242, intron 4 of 8) intron (NM_183242, intron 4 of 8) 31094 NM_183242 284697 Hs.676102 NM_183242 ENSG00000189195 BTBD8 - BTB domain containing 8 protein-coding 114.5-98 chr14 83046143 83046478 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 403678 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 124.5-155 chr4 96984255 96984705 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -382446 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 134.75-213 chr8 88156015 88156519 + 0.5 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) L1M6|LINE|L1 171216 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 119-165 chr6 80362192 80362501 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 255675 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 132.5-150 chr21 32005973 32006429 + 0.5 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 80094 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 124-75 chr19 35999198 35999629 + 0.5 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 4225 NM_001042631 644096 Hs.356460 NM_001042631 ENSG00000205138 SDHAF1 LYRM8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 1 protein-coding 118.25-173 chr6 99220294 99220676 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 95876 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 162.75-60 chr18 52753286 52753779 + 0.5 NA intron (NM_005215, intron 2 of 28) intron (NM_005215, intron 2 of 28) 413335 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 139.75-28 chr11 90740533 90740955 + 0.5 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) 128458 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 133.75-136 chr3 105560397 105560789 + 0.5 NA intron (NM_001243280, intron 13 of 14) L1ME2|LINE|L1 193684 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 133.75-78 chr17 61992269 61992732 + 0.5 NA intron (NM_005121, intron 11 of 29) intron (NM_005121, intron 11 of 29) -64518 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 163-83 chr4 70250237 70250675 + 0.5 NA intron (NM_005212, intron 4 of 4) intron (NM_005212, intron 4 of 4) 7840 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 137-74 chr2 45619730 45620096 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -8646 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 131.75-99 chr18 52051371 52051709 + 0.5 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -288657 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 151-40 chr16 24935139 24935722 + 0.5 NA intron (NM_001006634, intron 18 of 19) intron (NM_001006634, intron 18 of 19) 79939 NM_018054 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 162.5-154 chr6 100889222 100889765 + 0.5 NA Intergenic (TGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8121 NM_001284271 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 142-57 chr15 80423672 80424001 + 0.5 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 19454 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 164.75-110 chr4 105066087 105066697 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -79483 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 144-18 chr10 28767206 28767775 + 0.5 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) intron (NR_120652, intron 2 of 3) 23840 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 177.25-15 chr10 49650654 49651316 + 0.5 NA intron (NM_001142929, intron 10 of 14) intron (NM_001142929, intron 10 of 14) -28666 NM_001042427 282966 Hs.131287 NM_182554 ENSG00000178645 C10orf53 - chromosome 10 open reading frame 53 protein-coding 113.5-228 chr8 47662840 47663155 + 0.5 NA intron (NM_001352960, intron 3 of 12) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 3333 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 147.75-161 chr8 125409666 125410204 + 0.5 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -20423 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 131.75-139 chr3 77909562 77909905 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 139230 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 128.25-6 chr1 63031633 63032089 + 0.5 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -19390 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 173.25-84 chr4 32853092 32853489 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 502252 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 129.25-77 chr19 7160204 7160463 + 0.5 NA intron (NM_001079817, intron 9 of 20) AluSq2|SINE|Alu 90630 NM_001044388 79230 Hs.591380 NM_024341 ENSG00000130544 ZNF557 - zinc finger protein 557 protein-coding 117.5-85 chr17 63594608 63595054 + 0.5 NA TTS (NM_005828) TTS (NM_005828) -6064 NM_016360 51204 Hs.174134 NM_016360 ENSG00000136463 TACO1 CCDC44 translational activator of cytochrome c oxidase I protein-coding 175.25-154 chrX 49993147 49993726 + 0.5 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) intron (NM_001127899, intron 3 of 14) -9712 NR_030241 693124 NR_030241 ENSG00000207758 MIR532 MIRN532|hsa-mir-532|mir-532 microRNA 532 ncRNA 138-150 chr7 19302751 19303279 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -157594 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 187.75-58 chr2 218692413 218692963 + 0.5 NA exon (NM_001243313, exon 16 of 27) exon (NM_001243313, exon 16 of 27) -18147 NM_014640 9654 Hs.471405 NM_014640 ENSG00000135912 TTLL4 - tubulin tyrosine ligase like 4 protein-coding 116.25-145 chr3 123903241 123903577 + 0.5 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -19077 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 168.75-126 chr6 108153546 108154077 + 0.5 NA intron (NR_145458, intron 1 of 1) L1ME3D|LINE|L1 -12211 NM_003269 7101 Hs.157688 NM_003269 ENSG00000112333 NR2E1 TLL|TLX|XTLL nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 protein-coding 119.5-112 chr2 27527334 27527774 + 0.5 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 30715 NM_001486 2646 Hs.89771 NM_001486 ENSG00000084734 GCKR FGQTL5|GKRP glucokinase regulator protein-coding 170.75-113 chr6 35651628 35652151 + 0.5 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) 12900 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 113.5-46 chr11 65650751 65651158 + 0.5 NA TTS (NM_153253) TTS (NM_153253) 1762 NR_039709 100616284 NR_039709 ENSG00000265874 MIR4489 mir-4489 microRNA 4489 ncRNA 117.25-66 chr14 42623136 42623500 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 1016462 NM_001346173 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 161.5-10 chr1 182451330 182451882 + 0.5 NA intron (NM_001366934, intron 1 of 22) L2c|LINE|L2 1460 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 114.25-199 chr8 140049405 140049859 + 0.5 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 50903 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 147.25-90 chr3 141173337 141173785 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -58264 NM_001037172 92370 Hs.657887 NM_152282 ENSG00000155893 PXYLP1 ACPL2|HEL124|XYLP 2-phosphoxylose phosphatase 1 protein-coding 148.25-145 chr8 86941732 86942176 + 0.5 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 75539 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 147.5-123 chr20 36007576 36007939 + 0.5 NA intron (NM_001365709, intron 8 of 11) AluJb|SINE|Alu 39167 NM_001365709 140894 Hs.732697 NM_080834 ENSG00000149646 CNBD2 C20orf152|CNMPD1 cyclic nucleotide binding domain containing 2 protein-coding 148.5-113 chr2 158327166 158327718 + 0.5 NA intron (NM_138803, intron 7 of 13) intron (NM_138803, intron 7 of 13) 129311 NM_138803 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 120-157 chr5 165059386 165059831 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 589329 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 123.25-76 chr17 15252131 15252470 + 0.5 NA promoter-TSS (NR_039884) promoter-TSS (NR_039884) -604 NR_039884 100616125 NR_039884 ENSG00000265110 MIR4731 - microRNA 4731 ncRNA 149.75-172 chr9 23662762 23663291 + 0.5 NA intron (NR_121602, intron 3 of 27) intron (NR_121602, intron 3 of 27) 9373 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 126.5-39 chr11 82607917 82608420 + 0.5 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 125696 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 154-113 chr5 160717875 160718267 + 0.5 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) intron (NM_001366652, intron 2 of 24) -32680 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 144.25-89 chr2 8754996 8755296 + 0.5 NA intron (NM_001348732, intron 22 of 28) intron (NM_001348732, intron 22 of 28) 73090 NM_002166 3398 Hs.180919 NM_002166 ENSG00000115738 ID2 GIG8|ID2A|ID2H|bHLHb26 inhibitor of DNA binding 2 protein-coding 160-96 chr6 8002593 8003035 + 0.5 NA intron (NR_037616, intron 4 of 12) (ACACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16712 NR_027712 206426 Hs.676966 NR_027712 PIP5K1P1 - phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 pseudogene 1 pseudo 151.5-22 chr11 20878900 20879354 + 0.5 NA intron (NM_201551, intron 4 of 18) intron (NM_201551, intron 4 of 18) 209541 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 159.25-6 chr1 117584762 117585187 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 20796 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 121-102 chr2 72142521 72142864 + 0.5 NA intron (NM_001277742, intron 1 of 4) intron (NM_001277742, intron 1 of 4) 5170 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 134.25-205 chrX 49700459 49700767 + 0.5 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -4629 NM_003785 8712 Hs.128231 NM_003785 ENSG00000068985 PAGE1 AL5|CT16.3|GAGE-9|GAGEB1|PAGE-1 PAGE family member 1 protein-coding 177.5-107 chr22 23200352 23200906 + 0.5 NA intron (NM_004327, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 20120 NM_004327 613 Hs.517461 NM_004327 ENSG00000186716 BCR ALL|BCR1|CML|D22S11|D22S662|PHL BCR activator of RhoGEF and GTPase protein-coding 113.5-16 chr1 171350547 171350885 + 0.5 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 11820 NR_002719 7151 Hs.661092 NR_002719 TOP1P1 - DNA topoisomerase I pseudogene 1 pseudo 181-5 chr1 160274258 160274921 + 0.5 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 10562 NR_036492 5824 Hs.517232 NM_002857 ENSG00000162735 PEX19 D1S2223E|HK33|PBD12A|PMP1|PMPI|PXF|PXMP1 peroxisomal biogenesis factor 19 protein-coding 132.5-54 chr12 82850652 82851028 + 0.5 NA intron (NM_001320321, intron 1 of 10) AluSc|SINE|Alu 163685 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 113.5-68 chr13 87996239 87996574 + 0.5 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -146461 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 119-85 chr2 62161740 62162145 + 0.5 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -34173 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 121-69 chr15 35402378 35402730 + 0.5 NA intron (NM_080650, intron 6 of 8) intron (NM_080650, intron 6 of 8) -30190 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 133.5-211 chr5 81389916 81390235 + 0.5 NA intron (NM_130767, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu 4059 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 168-21 chr10 132876272 132876891 + 0.5 NA intron (NM_001200049, intron 31 of 57) intron (NM_001200049, intron 31 of 57) 65989 NM_001200049 54777 Hs.298038 NM_017609 ENSG00000171811 CFAP46 C10orf123|C10orf124|C10orf92|C10orf93|TTC40|bA288G11.4|bA288G11.5|bB137A17.2|bB137A17.3 cilia and flagella associated protein 46 protein-coding 121-190 chr8 108366391 108366829 + 0.5 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -76973 NR_138033 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 153.5-19 chr10 55634601 55635095 + 0.5 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6906 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 153-57 chr16 81731355 81731846 + 0.5 NA Intergenic PABL_A|LTR|ERV1 -47691 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 134.5 chr1 19533623 19533924 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -48234 NM_001206541 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 140 chr1 64651402 64651711 + 0.5 NA intron (NM_020925, intron 9 of 26) FRAM|SINE|Alu 71709 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 134.75-44 chr11 92310697 92311222 + 0.5 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) intron (NM_001367949, intron 1 of 27) -41137 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 157.25-63 chr19 34314271 34314712 + 0.5 NA intron (NM_014686, intron 2 of 13) intron (NM_014686, intron 2 of 13) -50249 NM_001289789 2821 Hs.466471 NM_000175 ENSG00000105220 GPI AMF|GNPI|NLK|PGI|PHI|SA-36|SA36 glucose-6-phosphate isomerase protein-coding 164.25-41 chr14 68933589 68934185 + 0.5 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) AluJb|SINE|Alu 45415 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 144.75-90 chr2 124956001 124956525 + 0.5 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 930976 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 128.5-46 chr11 121583454 121583843 + 0.5 NA intron (NM_003105, intron 26 of 47) intron (NM_003105, intron 26 of 47) 131334 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 128-100 chr3 61013060 61013559 + 0.5 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) intron (NR_148922, intron 3 of 3) 238143 NM_001354589 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 117.25-131 chr21 14919618 14919905 + 0.5 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -1093 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 127.25-114 chr22 20848889 20849215 + 0.5 NA intron (NM_058004, intron 1 of 54) L1MB8|LINE|L1 9759 NM_058004 5297 Hs.529438 NM_002650 ENSG00000241973 PI4KA PI4K-ALPHA|PIK4CA|PMGYCHA|pi4K230 phosphatidylinositol 4-kinase alpha protein-coding 140.75-55 chr15 39795994 39796423 + 0.5 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 13302 NR_135665 105370941 Hs.587843 NR_135665 ENSG00000261136 LOC105370941 - uncharacterized LOC105370941 ncRNA 124.5-169 chr5 104341358 104341773 + 0.5 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -757909 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 120-115 chr3 38993640 38994002 + 0.5 NA intron (NM_001349253, intron 2 of 29) intron (NM_001349253, intron 2 of 29) -43260 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 118-189 chr8 106926733 106927076 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -156660 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 117.25-153 chr4 47340120 47340404 + 0.5 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 123440 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 150.75-105 chr2 150565320 150565800 + 0.5 NA intron (NR_110241, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR 6661 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 150.5-150 chr4 67332656 67333025 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 89160 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 143.5-163 chr4 94115445 94115980 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 91844 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 136.5-87 chr17 16525740 16526021 + 0.5 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -33687 NM_001113567 388341 Hs.25425 NM_207387 ENSG00000181350 LRRC75A C17orf76|FAM211A leucine rich repeat containing 75A protein-coding 129.75-110 chr20 45211671 45212156 + 0.5 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 4880 NM_003007 6406 Hs.1968 NM_003007 ENSG00000124233 SEMG1 CT103|SEMG|SGI|dJ172H20.2 semenogelin 1 protein-coding 137.25-174 chr9 28580866 28581399 + 0.5 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 138173 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 174.5-109 chr20 41219364 41219888 + 0.5 NA intron (NM_015035, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 50603 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 150.5-140 chr4 18807004 18807496 + 0.5 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -785375 NM_001365660 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 116.25-100 chr2 20149670 20150060 + 0.5 NA Intergenic L2c|LINE|L2 75265 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 136-39 chr14 49450206 49450616 + 0.5 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 135969 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 137-40 chr12 22919148 22919691 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -256217 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 128.25-76 chr17 72757426 72757755 + 0.5 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) L2b|LINE|L2 -117118 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 114.5-217 chr5 102598102 102598524 + 0.5 NA intron (NR_047462, intron 1 of 1) intron (NR_047462, intron 1 of 1) 16945 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 118.75-150 chr5 51947224 51947682 + 0.5 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -60578 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 148-32 chr14 80967201 80967527 + 0.5 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 11743 NM_001018036 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 131.25-123 chr21 29164175 29164620 + 0.5 NA intron (NM_001286620, intron 4 of 4) intron (NM_001286620, intron 4 of 4) 18820 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 125.25-91 chr19 37760078 37760556 + 0.5 NA intron (NM_152360, intron 5 of 7) L1MC4a|LINE|L1 19273 NM_001172690 126231 Hs.531262 NM_152360 ENSG00000189144 ZNF573 - zinc finger protein 573 protein-coding 136.75-176 chr6 155318729 155319181 + 0.5 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4471 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 126-126 chr4 70069793 70070214 + 0.5 NA intron (NR_003720, intron 2 of 12) intron (NR_003720, intron 2 of 12) 2617 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 136.5-199 chr6 126325033 126325462 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -14542 NM_001012507 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 205.5-147 chr8 86735801 86736406 + 0.5 NA intron (NM_019098, intron 2 of 17) intron (NM_019098, intron 2 of 17) 7572 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 148.5-47 chr12 99267767 99268346 + 0.5 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) MIR|SINE|MIR -112966 NM_001352190 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 185.5-104 chr3 67420520 67421131 + 0.5 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 195361 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 114.5-111 chr17 30108762 30109204 + 0.5 NA TTS (NM_198529) TTS (NM_198529) -7824 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 177.25-144 chr8 130503853 130504285 + 0.5 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -60395 NM_001362925 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 134-101 chr2 167572972 167573289 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -245542 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 217.5-82 chr3 160532000 160532481 + 0.5 NA intron (NM_002268, intron 5 of 16) intron (NM_002268, intron 5 of 16) -17004 NR_003001 677767 Hs.675953 NR_003001 ENSG00000238741 SCARNA7 U90 small Cajal body-specific RNA 7 ncRNA 133-131 chr5 13793445 13793832 + 0.5 NA exon (NM_001369, exon 49 of 79) exon (NM_001369, exon 49 of 79) 150842 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 116.5-35 chr11 62670789 62671045 + 0.5 NA promoter-TSS (NM_001085372) promoter-TSS (NM_001085372) -756 NM_001085372 790955 Hs.569009 NM_001085372 ENSG00000204922 UQCC3 C11orf83|CCDS41658.1|MC3DN9|UNQ655 ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 3 protein-coding 142.5-237 chr9 15846995 15847421 + 0.5 NA intron (NM_001355547, intron 21 of 24) intron (NM_001355547, intron 21 of 24) 283230 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 139.5-16 chr10 81691785 81692227 + 0.5 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -183188 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 124.25-130 chr3 29636525 29636909 + 0.5 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 297439 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 145.5-172 chr6 52301628 52302173 + 0.5 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -17158 NR_158964 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 120.5-27 chr10 86000751 86001217 + 0.5 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) L1ME1|LINE|L1 263804 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 144-142 chr8 132886512 132887051 + 0.5 NA exon (NM_003235, exon 9 of 48) exon (NM_003235, exon 9 of 48) 19823 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 123.5-151 chr4 56285202 56285470 + 0.5 NA intron (NM_020722, intron 3 of 10) intron (NM_020722, intron 3 of 10) 102155 NM_001323892 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 143.5-159 chr4 76451971 76452518 + 0.5 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 17015 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 125.25-193 chr7 67738930 67739284 + 0.5 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -281146 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 147-131 chr7 69437920 69438476 + 0.5 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 159426 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 226-41 chr2 114549729 114550236 + 0.5 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 88405 NM_001178036 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 188.75-57 chr2 99326704 99327304 + 0.5 NA intron (NM_005783, intron 3 of 4) intron (NM_005783, intron 3 of 4) 9329 NM_005783 10190 Hs.536122 NM_005783 ENSG00000115514 TXNDC9 APACD|PHLP3 thioredoxin domain containing 9 protein-coding 129.75-173 chr7 44265274 44265660 + 0.5 NA intron (NM_172081, intron 2 of 18) intron (NM_172081, intron 2 of 18) 60127 NM_172080 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 132-178 chr8 103311088 103311532 + 0.5 NA intron (NM_001317796, intron 2 of 5) intron (NM_001317796, intron 2 of 5) 2332 NR_145795 109623480 NR_145795 SNORD173 - small nucleolar RNA, C/D box 173 snoRNA 167.5-160 chr6 56285346 56285936 + 0.5 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) -38061 NM_030820 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 132.25-37 chr10 116863998 116864413 + 0.5 NA intron (NM_001242699, intron 7 of 13) AluSq2|SINE|Alu -14483 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 131.75-59 chr13 46270620 46271096 + 0.5 NA intron (NM_001282460, intron 9 of 9) intron (NM_001282460, intron 9 of 9) 26986 NR_047493 100861554 Hs.90866 NR_047493 ENSG00000261097 LINC00563 - long intergenic non-protein coding RNA 563 ncRNA 135.25-49 chr12 4034802 4035243 + 0.5 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -161574 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 117.75-184 chr6 35715107 35715483 + 0.5 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) MIR|SINE|MIR 13288 NM_001145775 2289 Hs.407190 NM_004117 ENSG00000096060 FKBP5 AIG6|FKBP51|FKBP54|P54|PPIase|Ptg-10 FKBP prolyl isomerase 5 protein-coding 135-97 chr21 30922134 30922622 + 0.5 NA Intergenic Intergenic -40798 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 136.25-79 chr17 53367006 53367330 + 0.5 NA Intergenic Intergenic 381663 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding